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CAGTAGAATCA
ATGTAAAGTAA
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ATTGTAACAGAGAATCTAGTT------TTTCAATAAAATTTCCCCAAGTAAAAACA
AGTGTAGCAAGAAATCTATTTCATATATTCCATGAAGAGTCAGCGAAATGTAGAAA
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GATAT-----------GCTTTA---------------------TATCCTTCATATAAAATATGTGGTTTTATTTTGGAAAATATTAAATACCTATTTTACGTCCCTCTAAGATGCACATGTAATTGTGTACAATGTATACTCCCATTTAAAAACTAGTATAGTTGTATTAACTTTATTAAAAGCAATGGCTGGA----------GTCTACACACGAAAATAAGTCAAGAATAGTACAACTATTTAAAGAATAACACG-------ATTTGGTTGAAAAAATTTCCTTACGTA-------TGTAAATCG---------ATTAATTATTCAGCGCTTAAGTTTTCTTTTGGGTTAAGTTTTGAACATATAATGTACCTTCTGGT-GTATG----TTAACATAAAATCCAGAATATGCCTTTAGACAGCAGAACGGAAGATATTTATT--TGGTTTACAGTCTTGAATCTAAGCTGTATTTTTGTAGTTTTAATTAAACTTTTGTTTTTAATAATAA
ATTGTTGAGTATGGCAGTTTTAATAATAAACTGTTCGCTCCCTCGTCTGGCATATAAAATATGC------------GCAGATATTGTTAACATTTTTCATATTTCATTAAGACGCA---------GTGTACACAGTATATACGTACTTTATTAGTAA-ATAGTTTAACTA---TTATTCAA--CAAGAGTTGAATATATGAATTGTCCTTATAAGCAATCACGTTA-------------TATGAAAATAATAAAATGTTGTTTTCTTTGGCATAATTAATTTCTCAACAAAATGCTATTGCAAAACGGATTTGGGCATATTCCAATTGGCATTTAGCAATACTTTTTTAGTTCGTTTTATAAAGAAAACGTGGTTAAAAATAGTATGGGCATTACCATCAATGTAGTAATATA------------ATATAGTAATATAATTATCAAAAATTTTCCGTTTTTGTGAAAATCAATGTTTATTTAGATCTGGCAAATTTTATTGTTATAATTATAA
>dbr 70896 71390|58 chr2L 71337 71706 scaffold_15 1949021 1949426 + -1166|0 53
CGGTACCGAAAAATAATTTTAAATAATGTAAATAAATAATGATGCTGAAAATTT
GTGAACTCAAGGCCATAATTAGTTAAAAAAGTTATCAAGTCATCTTAATTATTC
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TAG---------------------CTGTTCATGTTTTTATTTTTTAG------------------TAGTTTAGCGACAATAAAAAAGTGATACGCT----------CGTGTTTCATTATACAATATTTTTGTTAA---TAAATAAAATTATG-GTAAC
TAGGTTATGAAATATGCGGCACGTCTTTGAACGTTTTTTCTTTTAAAAGCCTATGTTATACCAGCTGCCTTAATGACAATATTAAGCTTTTAGACCGTTTGGAAAATGTGTTTTAAATCAAATTATCTAAGCAAAACGTGTGTAAAACAATGTGTAAG
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CTTCT------------------------------TGCACACGACTTAGTCTGCAAT---CAAATTATCATACTTTTGGTCTTTCATGTCTAGCGTATCGGATTATTTTAAGTAAATCTT-------------------ACATTTTAAATT------ATCGATCTCTATAATTGCTAATGTAATAGCATAACTTTTT---TATGCAT--CTAATAGATTAAGCAAAATATT
CTTATACGCTCCAATTTAATTTATATTAATTACAGTGAAAATAATTTTATCTCTAATAACCCAATTTTTACAAATTT---TTTACATGCCTAGTGTGTCGGATTATTTTAAGTAAGTTTTTATGCACACAATATCCAAAGCGCTTTAAATTCAACACAATTACATTCATATATAATATATTAATAATATAATATTTTATAAATGCATACTTCCGACGTTTCGCTATAAATA
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GTCAAAAGACATGTC-------------------AACATTGCTTTCCTTTTATGATATACACGAGCGTTTTGAAAAGCAT----AATCTTTT
GCCCAAAAAGACATCCGGAATTTTTCGCTGATAGAACGTTTATTTTATTCTGTGAATAATTCGTGCGATTGTGCATTCATCTGCAGTATTTT
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TTTTTGTACTTCGTTTGCAGTC------------CGCAGTGATTCAAACTCCACGGTGCTCGGTGAAGA-GTCCACGCACGAAGAATTGT
TTTTTATATTTTGTTTACAGTAGCGTTGAAAGTGGACACCGATCCAGA-TGCAGATCACGCAGAGGAGGCGTCGGCACATGAGGAACTGT
>CG11377 103764 104146|92 chr2L 103948 106836 scaffold_70 8772 11317 - 82412|0 198
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AACCCAAACCGTTTAAAAACGACTCAGC-------AGTGTAATTAACTATCAAAATGTAGTTGTG---TTGAATTTATA---------TATCACAATTTATTTT-----GTATGAGATACAAATGTTTGCTT---CTCACAAAATTTTCA---------CACAACGTAT-----------TACATGTAATAAAACAAAA
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CGGTCGTGCTGGCACATAAACTAAACGAAAAGATTGCAGAGTTGCGACGATCGGATGTCTTCTGGTGGGCTCGTCCAGATTCTAAGACACAAGTCACCTGCGAGTATCTCTTTAACCAGGGATCGGCTGTGCCTAAGCGCGTGCATACTATTGTTGTATCAATGCAGCATTCGGATAAAATTGCGCTGGACACTCTTCGCTCGGAGGTTATGGAAAAGGTAGTTAAAGTTGTCATTCCCGCCAAATACTTTGATGCCAATACCATTGTGCACATAAATCCCTGTGGACTGTTTGTCATTGGCGGTCCAATGGGTGACGCTGGTTTGACCGGCCGTAAAATCATAGTGGACACATATGGCGGCTGGGGTGCACATGGTGGTGGTGCATTTTCCGGTAAGGATTTCACAAAGGTCGATAGGTCAGCGGCTTACGCAGCGCGTTGGGTTGCAAAATCGCTGGTAAAAGCCGGGCTCTGCAAGCGATGCTTGGTGCAGGTCTCGTACGCGATTGGTTTGGCAGAGCCGCTTTCCATAACCGTTTTTGACTACGGCACCTCCCACAAGTCACAAAAGGAACTTCTGGACATTATCAAGCGCAACTTTGACTTACGGCCCGGCATGATTGTCAA
>M(2)21AB 113434 114433|99 chr2L 110368 114426 scaffold_70 15384 19533 - 86578|3316 4485
GGACCTAAACCTGCGCCAGCCGATATACCAGCGAACAAGCACTTATGGACACTTCGGTCGCGCGGGCTTCTCGTGGGAGGAGGCCAAGCCTCTGGAGATTGACAACTGACTAGACGCTGAAGCGTTGCAACCGCAGTCACCATATGCTAAAAGGTCGAAGCTATCCTTATATTCATCAGCGTCAAAATTAACAGATACCCAAGCACCAACGTAATTTTTAGTGTCGTTTTTAAAGCCTAAAGTCAGAGGAGAAGGCGGCATAGGCTTGCCAACTCTTATGGGCTTTCTTCTCTAACTTATGCTGTGCTCTTCGCTATATAATTTAAAC-CATTCTGATGTGTGTAGTCTTCTCACACGGAACTAGTTTTAGTCGTCTTAATACCCGCATATAT--ACCT------AATAGAGAGCTCCA-AAAGAATTGATGAGCTTTAGTTATGCATATACATAGTATAGTGTCGGTCAGTTCA------------------------------GTAAAAATTA-------AAGCAGTAGT----------------------TAGTACCT------CCTTCAATTATCATGCAACTTAATTATGTTGGTGTCTATGGAAATTGTATAAAAC----------AATTAAATCCGTTGCCTAGAAATTATGCAACATTCTCATGTCCCCATTGTAAACTTATTT------------------------------------------------------------TTGTCTCTTTT------AACATTTCTATTTGTT--------------GTATGCGTTGTATATGTTAA-----ACCTAAAGTTTTAAACAACTCGATTGTATGTACATTACACT---CTGTCTTTGTATTTTCTGTAACCAACCATAAGATAATGTATTTTCCTTTACAAAAATATATT----AAAGATAAATATGAAAAGTATAATTTTACCGGTATGCGCAGAATGAAGACTTTAATCGTACAAACAACAGAATTTGCAATGTCTTTACAACCAAATAAAGTCATCATAACCCTGGTTTTTCACAAAAACATAATGAGACAGCGCCCATAAAAAATTACAAATATTTGTGTACAAGAAACCCAATTTTCTTTAAAAGAAATCATTTTTCATATGAATATTGCAATAAATTTCATGA
AGACCTAAATCTACGCCAACCAATTTACCAGCGCACCAGCACGTACGGCCACTTTGGTCGTGATGGTTTCTCATGGGAGCAGGCAAAACATTTGGAAAC---CAATTGACTAGATGCCGAAATGTCGTTGCCACAGCCACCGTGTGCTAAGAAACTAAGG------------------------ACATTAAAAGAAACAATAACAGCAACATAATTTTTAGTTTTTAGTTTAAA----AGAGTAAGTGGCGCCAGCA--ATAGGCTTGGCAGCTTTT-TAGGCTTTCATTTCTTATCTATAA---ACTCTTT-CTTTATAGTTCATACGCATTGTG-TGTATGCAGCAAT-TTATAC-AATTTAGTTGTACGGGTCATAAT---TGCATATATGAACTTACTGTCAGTAAGAAGCTCAATTACCAATTTGAGAGCTTATGTTTT--ATTTGATCAATATGTTACCTACCACATCAAAGCTGTTTTCTTATCCGTTTTCAAAACTTGTATAAAATATTAATATAAATAGTAACCATTCTCATGTTTTGAATATTGTAATACCTTGTGCCCCTTTTACGGGTTTTTAACTTAA-TATTGTGGTGC-------AATTGTATACAACTGGCAATGGGAGATATTTCCCATGTTCAAAAA--ATGTAATAGTTTTCGAATGCCATCATCAACGGATTCAAATGCCAAGTCTGTTATAATTGACATACATTTAGATGGTTCAGACCCGGGCATAGGGTATTGTATGTGTTGAAAAGAGCATTCTTATTTGTTTGTAAATTGCTATGTTGTCTTTTGTCGATGTTGGTATTTAACCAATCTTTTAAACAACCTAATTGTACATTACTTAGACTTACCAAGTTTTGTATTTGC--------------------TGTATTTTCCTTTACAAAAATATATTTTTAAAATACAAGTAAAACATTTTAAAT----------TGCGTTTAATTATG---TTAATATTAATATATACAAATTTAAAAACATATTTACCCATAAACTTAA--ATGGGGGCACAGGTTTATACCAAAAACTGGA-----------CTGTAAAAGA----AAATTTTTTTG-----------CCATTGTCCGTCAAATATAATGTATTTAATATAAATGTCGTGATATACGGTGTGA
>Gs1 133683 134472|111 chr2L 132319 134514 scaffold_70 39427 41624 - 72243|1440 2291
GCTGTGAGCGGTGCAACAGATGTTTAATTTTTTGTACATTATGTTTTA-------------------------TGGAACTGTGAAGCGTATCCGATCATTTGGTTATATTTACATTGAACTGAAGCAAAATTTAGTTTGCTTGTGCA-AAAAAGACAGGAGACCGAGGCACGAAAAGCG-----TGCGCTTAGAATTTAAG--------AACGTGGGTGGGTGGCAAGAAGAACTAAGCTAAAGCGAAATTTCCTTAAAGCGATGGGGCCTCATGAATACTTTGCCATATATCTCACAAACTACGTATATCTATCATTGCTTTAATCTAAATAATAAAAAACATTGTACTCTACGTTAATTTTTTGTACCTTTTAGATCAAACAAACATTTTGGGATCCGACGTTGAATTCGGTCAACGCCATTTTTTGCCCTTAACTTCTTGAACGCACTTTTTTAATAACTCCTAAGAGTTTCTAAATGTAAATTTAAGAAGGAAATATCACTGAAATCGGACGATATGCATATTAATCATTCATATCCATGAGCACGAATACACATATATGTGAAATATGTTTATAAAAACCAATTGTTGATTAGAAGTTGTTAAAAATAAAATACTAAGAAATTAATTTATGTATATA--------TATTG---GTACATATGTATCTCACTTTACGGATCTGTCGCTTCACTTTGTTCGGTAGCATTTTACATCATT---TTACTATATGCTGTTATAATATAAATGTCTAAATACTAGCACTAGCAAAATTAA---AAATTCCATTGAGATACATAAATACATTTTG--AGTAAA----AGCAGAACTGCGTACAAAGCAAAACAC
ATTGTAGGCAGT-----AGGCGTCTTTTGTTTTACAAGTTAGCGTTGAATTTTCAAAGGTGTATATACATAGTTGAAATTGCAGCATGTGGGCGGTCAATCCGAACAATTCGATTTGGGTATAATCAAGAAATATTTTGCTTGTGTATAAAAAGACAGAA----GAGACAAAAGAAGCGTTATATGTGGCTAGCATTTAAGTAAAAAAAAATCAAGAGAGATGAAAGAAATAATAAAACTGAAATAAAA-----GTGAAATGACGTTCGGCCATAATTATGT-----------TTAAAAGTTATGTATA-----------------------AATAAAAAACCTTATA-------------TTTTGTATAATTTATATAATACGTA---TTTTAGTTTATATGCTG--------------CATGATTTTCATTTCATATTCCGA--------TTTTTGTGACTATACAATATACTTATATATACATATACAAAAATAGTGTTTTT------------------TTTTCTTTATT--TGTTTTTTGTTACGAAGATGGGCATATAGAAGATGCCCTAGTTACAG-CATTTGCAGATTAAAAGTCATTAAA--------------GTATGAATTTATGTATATGCCCATGCTTATCGTATTTACATACATACACCCGGGTACGTATTGAGCACAT-ACTCTATCAGATGTTATTGTATACAATTGGCTAATAATGTTGAATTTCAGTACGAATTAACATATTTAAACATGTATAATATCAATTGTAATATCAGCGACCTAAATTAACAAAATTTATTATTAAATTTTATCAAAA------ATAAAGTTGAGCAC
>CG11454 144095 144227|122 chr2L 143395 147005 scaffold_70 51748 55362 - 66009|734 866
GATTTCACCACATTTTCGTCTTTATGTATACCCTAGTCCTTCAGTTACTCAAAACCAAAATCAAAAGTTACCGTCTTTAATCGTTTAATGAGCTGGATATCTGCAGAAAATTATGTATCAAATGAAGCAGTTT
---TGCGCAATA------------------------------AATTGCTTAAA-------------GTTCGTGTTTTTTTTTTTTTATAGTCTTGAATATACAAAGGCG---------TAAATGTAGTA----
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ACGGAGACCCGTTTTTCTTGGTTAGTTTCAC-ATTGTAAAACTGCAAATTGTGTAAAAATAAAATGAG
GCTGCTCACAG------TTGGGAAGAATTGCAAATGTATAGCTGAAATATGTTT-TAAATAAAATAAA
>CG3436 157542 157666|131 chr2L 156731 157542 scaffold_2 920595 921406 + 43124|811 811
C
T
>spen 201415 203251|174 chr2L 187439 203702 scaffold_2 980796 998263 + 366186|15641 18082
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TCGAATCGCAGTCGGTTGGCTTTAACCAGATCTACATTAAAAAACACACAGATATGAAAATTAAAAAAACACCGACTATGTCTCCTCTATAAAAAAAAAGAAAAAACTGCAAGAACAACCACAACAAGAACATCAAGAACAACTGAAACAAATAACACATGTAAAGTAAACAAAAAACCAATCAATAATACAAAAACAACAACAACTACCAACTACAACAAAGCTAAAACAAGTTACGCTCTTCTAGTATTTTAAGTAATTTTAAATAGCGTTTAAACAAAACACAAAAGTTTAAAGAAGCAAAACTAAACAAAAACAAAAAAAAAAAAACAAAAACAAAAAGTAAAGAGAAAAAATGCAAACTTTA-TTGAAATAAATAATTGCAAGAGAAAGAGAGAGAGTTGAGGCCAAGCTCATAAAACAATCGAAATCGATTGATGGCAACTAAAAGAAACCAATGTAAATCCGTAAAACAACCCTCTTAAACAGCCTCCCCCCGCAAATCCTGCAACATAATAAACATTGTGTAAAACGTAAACAAAGCAAAAAGCAGAAGGAAAAAAACTAAAATTGCAAAAATATGTTTGTCCAAATTTTCGTTTCTTTTCTTTTCATAAACATATAATACATAATAATTTTTAACAACATTTTTGAAA--GCTTGCAAAGTATCGTTAAGTTTGATCTCAAGAAAGTTTTTATTTTTTTTGCTTATAATTTAAAATGAAAATGAAATGAAAACAAAACGAAAAGGAAATGTGAAACAACAAAACAAAAAAAAAA--CAACAAATGCTTAAAAAAGAAAACCTAACTGTTTACTGTACTACATACTACTTACTACCATACATACATACATACAAACATATATACCTACTATCCCTATTCGAAAAGAAAATATGAAACAGCAATAACAACAACACACGTTTAAGTTTTTGATTGGTGAACTATTTCACATGCTCACCCACACACAAACACACACACATACGCACGCCCAGTTATTGCTCGCATTTTACAAAGTTTCGTCGCCCTTAATTAAGTAGTTTATTGATTTTGCTCTAGCATTTCGTTTCTATTTATATTCTTAATTTTTTTGTTTTCAATTTGTTCCTCGGCTCCATGTGGTGCGCGTGTGAACCGCCCGTGTC---------GCATTGACCCGAAGAACGCCA--TGAGCGCCACCTGTCGCCAACTGCTGTTAAGCACAATTAGGTTTAAAGATGCGCCCAGAGGCTTTTTTCCTACAATTACAAACATTAAAATAGATACACACACACACACAGACACACAAATATACAAGCACATAAACATACATTTTATACACACACCTACATATAAATTACAATTATT-----AAATATCTATTTAATTATTATAAACAAATATGTTAAGCCAAATATTTTAAAGTTTAGAGACAAGTTTATCAATTTGTTGCTTATATATTTCCCTGTAGAGGGCGCAAGCCGACGACAAAAATGCACTCAACGCAGGC----GCCGCCGCGCTGTTGGCATTTTTGTGGTTGCCTTTGTGCCGATTATTCACTGTTAGCTTTTCCACCTGATTTGCTTGAAAATCGCAACAACAGTTACAGCAACTACAACAACTACAACAACAACAACACCAACTCCACCATCACTGCCACAACACTGTACACGAAACTAATTCAAGCAAAGTTGGGTGTTTCCATTTGTTATCATTTCAATGTTTAGTTCTTTTGCGCGAAACTTTGTAAATTGCCAGGCAGTAGCA-----TTAGAGCGTATTTACACATACAATTATAAACACACACACATAACATACACAAACACAAGCATATATTTTAAGCCCGAAGCTGACTATAAAAGAACACATATACAGACGCCCAATACACAATATACATTATATATGGAAAAGGAAGATGATAAAAACCCTCTGTACACTCCTTAAACTTAAACGT----TTTCACGCCCACTTGTAAATTATGTGAC------------------GAAAAACAAAAGAGAAAGAAAAAAGCAAAA---------------CTGTAAAATATTTAAATTATTTAGCGTCTAAACGATAATTCATGTACATGTAAATACAGTTTAATTAGTGTTTAGCGCGTATTTAGTTGTATGTTTTAAAACTAAAC------------TGTACATTATATAACACGAT-AAAGATACGATTATGAGAGAGATCAGA-------------------------------------------------AGTAAATCGCAAAA-AAGAAAAACATTTTGTCAGTAAACACAACAAGAACAGATG------AAACGCTATTGT-------------TTTAAGACA-TTTTTAGTTATTTT-TAAGTTAATTGATGAAGAAACCGATTAAATTACACTTATTTCTAAGTGAATTAATAAACCAATTCAATAAA
>mRpL10 204718 204782|175 chr2L 203796 204783 scaffold_2 998357 999340 + 31170|936 1006
AAGTCAAAAAAGTCA-AGTTTGTTA-----TATAACAAGAAATCAAAAATTATATAATTGTTTTTCACTCT
TCAT-----AAGTTATAATTTGTTAATAACAATAACAGCGAAAAAATAATTGT-CATTTGTCTTGCATACT
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TTAAAGTGGAATAAAAACGATGGACACCTGGAAAAAACAAAGCCAATAGCCCACAGAAAAGTATGCGCAAATTACGCTGCCCT
TTTGAGCCAGGGGCAAA--------GCCAAAACCATACCAAGCCGAGGGC------ATAAACATGCGCAAACTATTTAGCTCT
>CG11490 209859 210506|179 chr2L 210145 210548 scaffold_2 1004678 1005106 + 7499|0 418
TAGACTATAAGACTTAAAGTTTACTCTCGCATCGAAGCTAAGC----------GAGGCGGGCC--------------------AAGCGGATACACTGATTTATATATTGTATATTATACAT--TTGTACTTTTTTGTAATTATTGTAAGTTCTCTTCCTCACCTCAAAACCAAAACACCCTCATCCTATATTCGATCACCTCTAATTATATAAAGAAATTAGTTC-------TCGTGCCTGTGAACTCAAAA--------CATTTTAGGTATC---ACTTTGCTTTATCGGACTTCAACACGCCTGTCTT------TTTTTTTAAGTTTAG-TCAATTACTGTGAATATACATCCGTATACAAGTACATTACAAATGCATAGCAAAAAGATCTAAAATACAACTCCAAAATTCACACAT
TAGCCTTTAAGACTCAAAGTTTACTATCGTGTCGAGGTGGAGCCCCTTTCGGCGCGGGGGGCTTCGCTGTTGAAGTGCTTTAAATGCTAATGCACAGATTTATACATTGTATATTATACATGTTTGTACGTTTTTGTATTTATTGTAAGTTCTTTTCC--------AAACCCAACCCTACAATTGGCATAAGCGATCGGTCCTCAACAAGTGAAACAACGTATTCAACGATATTTTTGCAGCGAAATTAGAGTTAGACGTCAATTTATCTACCAAAATTTTGATTTATCGCATTGCTAAAAGCAGCTTTTATTGCCTCTAGTTAAGTTAAACTCAATTACTGTGAATATACATGCATATATCTATGAAT------TGCGTAGTAAAAA-----CAAAAACAACCGGAAAA-------AT
>CG11555 274652 274766|244 chr2L 274011 276557 scaffold_2 1094583 1096952 + 74333|692 806
GTTTAGCTTATTTTCCCTTAGGTGACTTCACAACCCCAACTGGCAAAACATGAAGTTTCAATTAAAAAATAAATAAAAGATTCTTTGTCGGGTGACAAATCAGAAATGTATACAC
---TCGTTTTTTTTTTTTTTG------------------------------------------------------------TTTTTTTTGTGGGACAAATCAGAAATGTATACAC
>smo 281515 282167|247 chr2L 278636 281703 scaffold_2 1098523 1101652 + 123013|3032 3223
CAAGACTAAATAAGC-AATTGATGCATTTACTTAAGGTTCAAAAACTCTTACAATATTGTAGTTTTTGTTCTAAGAAATCAAATTGTTAGCGCTGAAAATAATCGTACAATCTTATCTATTTTACGAAATCGTAATATTGTTATG--TTCACTGTTCAACGATTTATAAGAATATATCGCTTCACTAGAATT
---AACTGAACAACTGGAATGATGCATTTACTTAAGTTTCTAAAACTC---CAATCTTCCATTTTGAAGCCCTAAAAA------------CGCATAGATTACGAATACGAAC----------TACGACTACG-AATACTCATAGGAATTAAGTTTTGAAAAGTTTACAAAATCATAT--TTACACTAGAATT
>smo 281515 282167|248 chr2L 281996 283160 scaffold_2 6588175 6589225 - 38278|0 171
TTTTCATTATTTTTCTTTGCCGTGGGTACAGGACTTTAGATTGTAGATTATAGATTTAAGTACGATATAAATAAGCCTCTTGGGCACACAAATCGTACCTCAGAAAGTGCCTTCAAGTTTACAAAATTATACATAATAATTTGTGTAACTAATAAACGATTTTAAATCCTCG
TTTTAATTACTTTTTACT----TAAATTAAAAACATAAGATA------TATACAATGGAGTGTATTTTATAGCAGCCTCT---GCGGACAAACGAACACAATGAACAAATCTCTTGGTTTTCAAA----------------TGAGTAATTGA------GTTTGTTAGTCGCG
>Hop 297050 297413|267 chr2L 295669 297451 scaffold_2 1115639 1117441 + 69796|1485 1892
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AATTAGCGAAACCCTAGAAAACAAGAAATTGGAAAACAACAACAACCAAACAAATCGC------TAACATTCAGGAGACACACATAATACA-------------ACCAATATGCATATACAATGAACGCACTTCTATGTCGCGGTGCGCTGCCACAAAACTAAATACCATGTTGAACCTTAATATTTCTAAATGAGAAACTATCTTGGATAATACCGCAACGCTGACATGACTATAAATTCAGTAAAGAAAATATGAATGATTGAAAACCAACTAAATACAAATACTATTTGTTTTGCAATGTTTGCTTAGTTTATTTACGCAGACGCCGCTGG-----------GATGCCCTGGTTTTTAATTTCATACTACA--AAATATGCTGTAGCTTAGCTCTAAAAGTATAA
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GCGATGCCTGGCACA-CAAATCTCCTCCCTGCCTACCTCCCTCCTCACCCCCCCTTGCTAAACTGTCCAAT------------CGACGGCCTGGCTA---CTAACTCT---CATAGGTATGCCTGGCCGCCAGGC-------------GCCCGGCGCCAGGCCCCAATCTAAAACTATC----TCTCTTAACTAATATAATA--TTTAAAATGAAGAAAATACCATTTTTTGTGTGTGTGATGGCCGCAGTTCAACTGCGT---CGCAAAACTGCAAGCGAAACAAGTAATTTGGTGATCCATGTTGATGTTGTTTATTATCCATATATATATATACATATATATATATATATATATGGCATGCCTAACTATATATATATGTGTGTATATTTTCGTTTG--------TTTTTGTAAGAATGC-ATTTCGCTTGATACAG-GTGATAAAAGGTCAAGC--CAAGTGCTATGTAAATTGAAGGTGGTTAAAGCCACAAAATCGTAACTAAGAAGCATCCGCTG--TATATACATATGCATCTATATA-TATCTATATATATATATATATATATTTATATGTATATGTATATTATAAAATCGGTGTAGCTCGCACGCTGCGCGTTCTCGAGCAATTCTC-----AATCGAACAGCTATAAAAAATTAAAAATTACA
>Pi3K21B 302660 303955|270 chr2L 303277 303476 scaffold_2 1125205 1125355 + -1112|0 199
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GGTGATAAAAGGTCAA------GCCAAGTGCTATGT-----AAATTGAAGGTGGTTAAAGCCACAA--AATCGTAACTA-------AGAAGCATCCGCTGTATATACATATGCATCTATATATATCTATATAT---------ATATATATATATATTTATATGTATATGTAT--------------------ATTATAAA
>Pi3K21B 302660 303955|271 chr2L 303550 305225 scaffold_2 1125429 1127304 + 14364|0 522
ACATT-TCGTCGTGTTCATGTAAATATTCTAAAAACGAA-----ACAAAGAAGCACACGCTTGCAAAACGTTTGCGAAATCAGGTTAA----------GGTTTTGATAACCTAGCCGCAACAGCTTTG------GGGCCCCACCCCTTGCTCTAA--TATTTGTTGTTAT-----ATTATAACTGATTT-AAAGTAGTTTT-AAGTGAAATCTA-------CGTACGTTTAC------------TCGATG----------------------------------------TGATCAGTTGATTGTTGCTAAC-GTTAATTTTCCTTCAATTT--TTTGTCA-------------TTTTTTTGTTCAA-------AAACAAAGCCTTAATTTTTAAAGAG-ATACA--AACACACACACA-ACACATATACACTCAGTCGGAACAAAGAAAAATAAATGTACAAACGAAAAAATGAATTCAAGAGAACTTTACACGCAGATGCAAAAAAAAAAAAAACAAAACA
ACATTGTCGTCTGTTTATTGTAAATATCCCACATATGTATATATATAATTACATATATATATATGTAGTTCTTTGGAAATCGGGTCGATCGTTTGGCTGATTTTGATAATACAGCTGCGATTTATTGAAAAGAAGAGAAACAATTCGACCACCAAATTATTTGTTGTTATTGAAAGTCTTTATTGATTTTGAATTAGTTTTTAAGCACAATTTATAAAATACGTACGTTTAAACCGATCGGTGATCGGTGATCAGCGATCAGTGATCAGTGATCAGTGATCAGTGATAAGTGATCAGTTGTCTGTTGCTAATTGATATCATGAACACAATTTCTTTTGTCAAACATCTAAAGTTCTTTTGTGTTTAGTTTTTCTACACGCTTTTTAAGTCTATAGACAGCATACCTTAACACACACACACGCACACACACACGCA-------CACACACACATACACACACACACG-------------------------CACACACACACAGCAGCAACAAAAACAAAAGT
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ATGTGACAGGATCGGAACGG----------------AAAGAATCGAAAGATAGCTCGTGTT-----ATTCTTCAGTTTTCAGTATTCGCGGCAGTTGTGTTAGGGAAAGAAAAGCAAAAAAGCAAAAAAACAAAAACAACAAGAAGTCTTCGTAGCGATTAGTCTTATAGATCTAAATAACTGTAACTGTAACTGTAGCTGTAACT--GTAACTGTAACTGTAACTGTAACTGTAACTGTAACTGTAACCACGCGTAAAGGGAAACGCGTTTTCTAACTGAACAAACTAGCTATAGTACTCGCGGGCATGTACTATGTCTATCTATTTGAAT------AGCACATGAACTCTATGTCCATGTGTGTGTAGTGTTAACTGTAATAGGCGGTGTATTTATTGTGTATGTGAATGACTCATATGTTTATCAATAGATGATATACTTACAATTATTCTATCTCTAGACCGAACCTTACGGTTTCTTCCTATTCGAACTACGCTGAAACTCTGAGTGTCTAAACCTTTAAGCATAAACTATATAATTTATTTAACAAAAACAAAACCGTAGATGAAAAAGAAATTTATAAACAGTTAGAAATTTATAACCTCACTTAACTTTGAGGTTATGTGACGCAGTCAGCGAGAGAGAGAGAGAAAGACTCTCGCTCTCTTTCGTCTGGCGCGACGTCATGTGCTCCATT--TCTACTATTTAATGTGGTTGTGTGTATTACTTTTTATATCAAGAGTTTACTTTTACATTAATTATTTATATACAATATATATATATATATACACATATATTTAATTTGTTGAATGCTCTCGCACAAGAATGTGACAAGAATCTCG------CGCATTGTAGAACTTAGTGAAGAAG---AAGCACAAGGCTATGCCAACATTTTAGTCAATTTTCCTTTGGTTGGCTTCATTTTTTTCTAGGCATTATACAACTATTTATTTATGCTTGTTTTAGTCACTAAACTTACGACTTTTTTTTTAGTTTAGTATCTACTCAAGGCTCTAATAAATATTCGCTGTCGAGCTGTTTTTTTATTTTAAGAGTCTCTTTTATATTGTTTTGTTCTCTTTAGATTTATGGGCACACTCTCCAACCTGACACACATGCACAAGCACACGCACACACACACACACGCACACAGTCACACAGATGACGCACAGCCTACAACACC--AAATACCAAAAT------GGCGTACGCACAGTTT----------------------GAGCAGCACTG----CGCCAAACTGTG-CACGCTCTTAGCGACAATCAAAAAATGAAAAACAAGAAAATCAAATATAAGCAAAACGTTTAAGTGTTGAACAACGTTCGATT--TTGTGTTATT--ACCGAACTTGATATGAT
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-------TTTAAATCTAAAATTATTGTTAGGTCCTATG-----------------TTAACCCGTGCGC-TAATCGTAATAAAGATAAATACGTAAAATACAAC
GACTCATTCTCGTTATTCAATTGTTCTGCATACCTATACCTATTATCGCTATGACTAATCCCTTACATATATTTGTAATAAAGTTACCTGCTGTAAACAAAAC
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T-TGGTTGCCGATCTATTAAATGTTTCAGATATTTAGTATGCATAATGCTGAAACTTTGGTAACACATTTCAAATTGTTTTCGTTTGCGTTTATT
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TTGCCGGAGCAGCCACAAC
T--CCGCAGCAGCAACAAC
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TCGGCGGGAAACG--------CGCTTTTAATTTAGCCGTAAGCTCCATATGTTTCTAAG--TATTCATTTTTATACACAGATAACTCGTTTAGTATATAACTTGATGCATTTTATTGTTATATTGTATACATGAGCGCAGTCTGGCCCAGGCCCAAGCCCAAGCCCAATTAAGTCTTAATCGAGCAACCTTTTATCGTTAGACCTAAGCATTATAAAGTGCATGCAAAAATATGTTAGTCGCCGGCAAACGGAGACGGAAACGAAAACGGAAACGGATCCAAGCTAAATGGATGACAACCGGCTCACGCTTACATTC-GAACAGTGTAACTGCATCCCAACGTAGTGTGTAAACGATACTAATTATAAAGAATG----------------GCCTTAACAGCGGCTACAATTAATTAAAGCTCCAAAATCGAACTAGAGCTTTTCTTTTCTGG
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AT
AC
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CGCCAAC--AACATCCATCGCGTGTGTGAAGT---------------GAAGTTTTTATTCTCCACAATTTTCGTACACG-TTTTAATGTACACAATGCGAGGAAATAT--AAAATGTTAACTACAA
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AATCGCAGACCTAAGCGACAACAACATGAAAAAAAGGCAGAGCAGAC--------ACACTCAATTCTCTA-----------GTTAACAATGCGAATGTGAATATGAATGTGCTTGGTGGAATTGGT------------GGCATTTT------AGTGGTTGGTGTTTGGTGGTGTTGGTGGGTCAGCCGAGTCCAGAGTTGAGAATTTGCATAGTGCGCGAAGTTGTCGAT-------------CACAGTGTG-------TTG-----ACGGCTGGAA------------GGTAGATTCCAAGACCAGGTTCGACAGGCG----CGCTTCCAGAGAAAAGAAAAGA--------------------AAAGAGAAAAAAACAACAGCCAGTGCAACAGTTAAGG---ACAAAGT-AACAAAAGGGAATACGAAACATAA-----CTAACCTCAAATAGCACACACACTTAAACAGAACCCAGTCTAGTCAATTTAGGTATGGGATTGCTGAGATAAACTCAAATAAACAATGACAAAAACAAAAACAAAAAACTAGCAACAGAAAACAGGAATCAAAAGACAAAAGCAAACAAAAGAACGAAAAGGAAGCAACAATACTCAAGTATAAAATACGA--ACTACTTAATTTAC-AAACTACAAAACAAACAACTTACTTAGTCTAGTTTAGCTAGCTAGTGACCGGCTCTCGTTATCTGAGAGTCCGCTTAACACTTAGATAGGCCC-AGTCGCGATTACTTAAAACTAAAACGCTGAGAGAACTAACTACTTCCGCCCAAAACAACTGTGATTGATATTTTTTTATATTTAAAACTAAACTTACTTTACAAAATACTTAAAATAGTCAACAATGAGGAGAAAAACGC-ACAAAAACTATGCAAA-TTTTTAGTATATAGACAAAACTCGCATTTAAACAGAGAGAGAGAGAAAGAAAGAGAGAGAGCGCCCCCATACACACACACACACACACAC
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TTTTCGTATCCACTTGATTAATTATTCTTTGCTTTCACTTTTCATTGCCTA-TGTATGCATGTATGGCTTTATGGCCTTCAATAAGTCTGTATGGGTCTTTAATCGGTATCAGCCAAACA-------AAAT-------GAATTGCATTTTATAATTTTGTTTACTAGTTT---------------------CTTTTATTGTATAC
>ex 447250 448701|423 chr2L 448465 448823 scaffold_6 4624024 4624363 + -84|0 266
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AT
AT
>CG4164 454386 454654|428 chr2L 454525 454800 scaffold_4 4841358 4841683 - 448|0 177
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TCTAATTTTATTATAAATCTCTCTAAAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACAAAAATTCTACACCAATTCCTACAAGGTGAAATGTAGATATTACTTTTGTGATATACAAATTGTTATTCGATCAAAACGATAATTAAAAGAAAAATGAAAATATATTAACTTCGGCATGCCGAAACTTCA
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TAC--------------GAGTAGAAACAGAGACCAAAGAGTTGCAGAGAGC---------------------------GACAGCGTGAGAGAGAGAGAGAGAGGGAGAGGGG--------AAGAGAGCGAGAGAACA--ACCTAAACC------------CAGTTGGTTTTTTACTTTA----------------------------------------------------------------------------GCCTGCAAATACTAGATTTGTGAACTGTGCTG-TATTTTTGAATTCTACAAAAAAA
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ATAAAAAATAATGGTTATTTAATGGA
ACACACAAAGATAGATATTTCG-GCA
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AAAAAATCTTTCATTTTTTCATAATTGGACTAGAAATATTATTTTAATAATATAGGCTTATACTATTTTTTGAATTGCTCACATAATGTTCAACAAATAATAATAAAATTGTTTA
>MED15 476078 476176|458 chr2L 475866 476408 scaffold_10 1966514 1967034 + -916|229 328
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GAGAGCCAGCTTATGTGGGAGCTGCAGCGCAAGCAGCTGGAATGGTACTACAAGTGCTTCTAA-------CCCGACCACATAAAACGTAACC---------------------ACCAGCACCATCAACACCACCGACAG--GATATCGAAAGTATTTGCGGAGAATCTCCAGCTGT----------------------------GCCGCCTGCAAGGACACGCCGATAGATAGATCCAGAT-TAATCATAACCAGGCAATATAGATATA-CATACATGAAGACAACCACACCTAGATAGATATAGATGTAGATATAGATAAAGATATATACTATATATGTATCTGTACCGTAGAAATCATGACATATAATGCATGCCAAAGCTTACCACTTAGAGAAGAAACCACAATCGAAGTGCAAGAAACTACAAGTTTTCGATATCTATAGCATCTAGAGTTTATCCTGGGGACTATGCTCTCCCACTCTCCAGTTCTCTCTGAGAACCTACCCAAAAACCATTTTGGGTTAAGCGGTAAATAATCCTAA--TAGATCCAATAAT---ATGCATAATTATTATTGTACATCGTGACGCGTCTAAAGCCCACAAAATTATATAACAAATAAAACTGTGTAATTTAAATATATACATATTTATATATATATATATATATATATATATATATATGTATATATATAAATATATATATTTACGTAAATAATATATATGTAATACGTATTTAATAAGAGTGTGCGACAATAAAAGTAATTAATTTATTCAAAATAAAC
>nAcRbeta-21C 546491 547099|562 chr2L 546452 546952 scaffold_6 4752780 4753307 + 14046|40 540
ATGCTAAGTACCCTAAACATC----------------GCAGAATATTA----CCGAACTTACCG----ACCACTCACCGGGCATTCCTATAATTGCAGTAATCTTCTACAGCACCAGCCTGCTGTATCTGAGCGTCTCCACCATCGTCGAGGTTCTAGTTCTGTACCTGGCCACAGGCAAGCACAAGAGGCGCCTGCCGGAGGCGCTGAGAAAGCTGTTGCACGGGCACCTGGGCACGTGGCTGCTGCTCTCGGTGTTCAGCACCACCGGCGAGTCGCAGGCGGAGAAG---------------ACCAAGGAGATGGACGAGCACCCGTACGAGGAGGCGGACGAGCAGGAGTCCAGTCCGCTGGGCATCAACCACACCGAGGTGCCGGGCGCCAAGGCCAACCAGTTCGACTGGGCGCTGCTGGCCACCGCCGTGGACCGCATTTCCTTCGTTTCCTTCAGCCTGGCCTTCCTCATTCTGGCCATCAGGTGCTCCGTGTA
ATG---AGTGTTCGAAGCGCGTGTTGGTTGACTTGAGACAGAGCTTTATTATCTAAACACATTGTTGAGCCACTTACT--------CTTTTTTTATAGTCGTCTTCTACAGCGCCAGCCTGCTGCTGCTTAGCATATCCACTGTTATTGAGGTAGTGGTGCTCTATCTGGCCACGGCCCAGCACAAGCGTCGCGTGCCGGACTTTGTGAAGCGCCTGCTGCACGGCAAACTGGGCAACTGGCTGCTACTCTCGCAGTTCATCAACGTGACTGAGTTGCCCGCCTCGCAGCAGGGCAATGGCGTTGCCAAGGAACTAGATGAGCACGTGTATGATAATGCCGATGATCTGATGACCAGCCCGTTGGACATCAATCCGAGCGAAACGCCGTCGGCGCGCGCCCTTCAGTTCGACTGGGTGCTGCTGGCCACCGCCGTGGATCGACTATGTTTTATTGGCTTCAGCCTGGTCTATATTGTGCTGGCCATCGTTTATTCCATCTA
>nAcRbeta-21C 546491 547099|563 chr2L 546998 547931 scaffold_6 4753986 4755082 + 16763|0 114
TGAACTAGTTTTGCATTTGCGAT-TTCATGTATTTAATGTGTGTGCGAACTTATAATTA-------TTTAATGAT-----GAGACCTCGTATGGAATAAAGGACCTCTGCCGAAT
TGTATTTTTTGTGTGTTTGTTTTGTTCATGT--CCAATTTGAATGTGAACTTAGAATTAAGTACGTTTTAATATTTTGTGGCGAGCTCTATTTAAATAGACGCACGC-ATTAAAA
>CG2794 566330 566479|572 chr2L 564201 566626 scaffold_6 4782253 4784666 + 85444|2152 2314
ATGGTACTTTGAACACCAAAAAGAACGAAGGCATTT--ACTCAGGACG-----TTTTACTTTATTCCTAAGTATTTTCTTACCG--TGTACAAGTTAATG----ATTTGTTAATAAGCCCATCTGAAAGATACAATTAGAGTCTGTATATTGTTATAGAAAAC
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GCGTGGCATACTGCCCTAGGCAATGCACTTTTA---TTTTGCCCTTCTAATACGCACATTCACATTCCAACGAAGCTAAGTAATTTT--AATTGTATTCGTAATTGTAT--TCATTTCGTATTGTCCACTAGTTAGTAGTTATCACTGTATGCCGTCCATTGTGTGTAGTTCGTCCAAGTGCCTTGACAAGCAGTTACAACTTAGGCCTGTTAAAGTTTTAGTCTAGTTTTTGTTTAAAATTCAAACTGAAAGCTTAAAGTTTAATTTCTGT-TCAAAGTTTTAGAGATTTCATTCAGCTTATCATATATTAAAAGACATATCAGTTTTATTTATCAATTTAGCGCTAGAAAGTGAAAGCCCCTTTTATATTTGTGATTTGTCTAGAAACTCGTTAAGGTAT
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ATGACATCCTTG---CAGCCTATTCAAAAAATATGCGCTAAAACTTTAACGTGGCCTTCTTAGCTTTAGTAATTGTACTCGAATCGAATGAGAAATTCTCGAAAATCTTTTTGAAAAGCCCCCTT----TTGGGTCTCCAAAACAGCTCAATAAAGCAGCAATGACGTTTTCTTTGAACGCTCTATTGTGCAATTTTATATATGTATATATG
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ACCAGGCACAG---------CAATTCACATAAGTTAAACTCAAGTGTTA-----GCCTTAGTTCTTCACGCAAATCTCTCACATCAACTCAACAATCCAA--TCAAAATCCACAGAGAT----ACATTTATCAATACATATATCCATAT---AAGTACATGGATAATCGTATT---TGTTTAGTTCTCTAATATCGTGCGTGTTTTAGTTTAGTGAATTTGTCGTTGTAAACA------TAATTTGTATAGCCAAGAACCAGTGA
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AACCCGCTTCCGTTATCCGCTCCAGCTCAAATCGTTTCTATAGTTCAAATATCTGTTGAGTGTCTAAATTTTATGTGTT
GACGTCCCCCCTTTCTC--------------TCTCTACCGTATCCCTAATATATTTTGTGTGTTTGTGTCTTTTCTTTT
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TATTGTAAGTTCAAACAAACACACACACACACACACACGCCCACCCAACATTTTC-CGCCCAAATCCTTGTCAATTAGATGTG-AACACCAAGCAATTATTTTCAAACACGCGCCCGCCACGTCCTCCTCCAGCCAGGGAAAAGAGCGCGCGCGTGTGCAACTGACCAATCATCGGCTTAAAGCAATCAAACGCATTAG------------GATAAGTTACGATACG-----CGTAATCCTTCTACAAG-----------TAGCTAGTCACGAGTTTCCT
>GABA-B-R3 760914 762142|820 chr2L 761564 761605 scaffold_7218 284 320 + 1098|0 41
CTCTGTGTAGAACCTACTCCGCAATGTGATTGACCCTGGGCC
CTCTTCCTAAAACC-----CATAATGTGATTCGACCTAAGCT
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TACCGAAAATTACGTCCTATTTTTTCATAAATTAA---------ATTTTAAGCAGAGCAAACTTTTGTGACACAAATTGATAACTTTTCAACCAAAATTGATAATTTATCAAAAATAATATCGATAAGTTATAGACAAATTACTTAAATCTAGGAATATAAGTTATA
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TTCTGTGTTTTTATGTATTACGAGTAAAGTTGTATCACCTTTCGGAAGACCGAAGAGGAAGTCTAA-AGTAAACGAAGA
TG-------TACATGTGTTA--AATAAAGTTTAGTCAC-------------AAAGAACACGTTTCCCAGTCCACGAGG-
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GACGCTCTGCTCTGTATG---ATTAGAC-TGTAAGAGTGC----AGAAATAAAGGTCGAA
--TGTTAAGCCCTGAACACCCATTGTACATCTAAGAATTCAGTTAGTAGTACAGATTAAA
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CCGCTGTGTAGTCCAGAGGTCGTAGGTTCCCAACTTCCGCAGGCGAACGTTTCAATCATTCTGTGTTT---AAAGTGTATGTTAAGAAACTCATTTGCATTTTTGAAAAAAGTCCCTAGAACTGCCAGTAGAACGTATTGTGTTA-----TCAGC--GAAATAAACTTCCATAAGATACAAGT
CTGTTATACATTCCAGCGATAACATGCAAGCTGTTTTCGCCGGTGCACATTAACATAACGAACCGTTTTCGATTGTGTTCATTCTAGCATTTTTTTG--TTTTAAAGTCTAGGTACTTGAATAAATAAAATAAATAAATGCCTTAAAAGTTCAGCAGGAATAAAATGATAATAAAAGAAAAAA
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GCTTTGG-----AGGAGGAGGAGGATCTTTTAAGCTACAACACCCATATGATAACACAACCTAAACAAATTATTA
GCTACAGTTGTTCGTGCGCCGCAAATGTTTTAAATTATTA---ACATATGAAGAGAAAAACAAAAGAAAATGATA
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>dock 831924 833245|903 chr2L 832591 833277 scaffold_6 5139080 5139944 + 16316|0 847
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TCAAGAAAAAAAAAAAAAGAAAAACTCTAATTGGCAAGTTAAAGCTGCTTGTCTTCTACTTCCACACACAGCCAGTCATTTTTTTGTTAATTTTC--TTCAATTATATAAACATACG-CATACCCATAATAAAAATAATAATAATAATTAAAATAACTAAAGAAAAGCTGTTCTAGCCCCGCATAAATATAAACATAATCAACATCGTACGAAACACACATACTTAAGTGGAGCCTCCCCCTCTAATATATTATAAATAATATATAAATATATATATGATACGCATATAAGCCATACTGTACAGTTGATGATGCAATGCCTAACCTGGGCACACTTTCATATATACATAATTTCTATTTATACCTTACACCTATAATTATTATTATTATTAGTTCATTATTATATTTATAAAGTAGAA-GCCGCGATTTCAGCTTTAA-TTTTGTTTTTAATTATTACATATTGTTTG------AAGTTTTATTTTTCATTTATGCAATAATATTTTGTATTGATTTGTTTTTGATTTAGCTTAAGATTAGTGAGAAGAGAAGAGAAGAGAATATCAATCTGATAATAGGATGGAACGCTGAGTTTTGACCAAAAGGTTGGCTCGTTCGTGGCAGGTTTAACCATAGGGTTTAAATGACTTTCGACTTTATTTCATATGCGAATTTTTAAAATATATAAATATATATATATAAATACATAAAAATATAATGATTATATAATTTATAGTAATTTCAACAATTGCTAAAACCACAACAACTAGTACTAAAAACGAAAGAGAACAAACTAGAAATTATACCGAAACGGAAATGAATAAAAATACA-TCAAATAAATTAAAT
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GACA-TGTATTTCCCTGGAACTCGAGCAATTCGTGTG-GCCACATTTGATCCAGTTGTATATATTGTTCACAAGTGAGACACTGC----------------------------------------------------------------CAAGCTGAATAAACAAGCCGCAAGTGTACACATTTGCTGGAAATTG
AACAGCGAAAGTCGCCGTAATT--GACAATTTCTGCACAGTATTTTTTTTTTATTTTTATTTAATTTCTTTTTGTGGAATTCTACGCTATGTACTTTTGCTAGTCAAGGCAAGACGTGTTGCTACAGCCACTGAAAAAAGTTCAATTTGCAAGCTGAATAAACAGCCGGCAAGTGTACACACATGACCAAA----
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ATTGATTGATTGATTGATTGGGCTGGGTCAGGGCAAACTGCAAATCTTGATTAGACAAGTTTTGGGTGCTTTTTGGTACAATCAATTATTTGG------------CCCGGATCGATCGATTGGTCTGGCGGGCGGGCGGTCGGTCATTCAGTTATAGAGTTGAATTTTTGATTTAGTTTGTTGAAGCCTACCTGCAAATGGAAGGACAAACCGAGGAAGTCGCTGATTGTCGGCGCAGCTCTGACCAGCGGCGGGGCACACGACGATGTGGCAGGCGGGATGGGCCCCAGCGGCAAGACACAGCCCAATTGTACGGCGCATGCGCTCCTCGGAAAGCTGACGCGGCGGCAAGTCGGCTTGGTGTTAAGTATTAAAACTCAACCTAAAAAAAAAAAACAACAGATAAAAACAAAACAAAAAACCGAACATATATCTATAAATCTATGCAATACACGTTAATGATTTAGCT----TATAAGGTATGTAGATGCAGCTTACTAACCTACTACATACAAAAAAAACAAAACAGAAAAACCAAAAATAAATACGACTTTCCTCTAGAAAAATCTACTTTTTCTATTGAAATAAAATATGATATGAAAACTATG
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GACCTACCCGAATCTTCTGCGGAAGATTCAGCTGCATAGATCTCAGACGCGCAACGGAGGCCAAGATTTCCGAAATCGAGTCCCCACATGAAGACTGTATCCAGGT
GACTCATCCGAATCTTCCGAGGAAGATTCGAAAGTATAGATCTC---------ACAGAGCCTCACAGCTTTG------------CACACAAAAACCATACCCATGT
>PNUTS 876738 877050|948 chr2L 876900 877118 scaffold_6 5199238 5199477 + 756|0 167
CGCAGTCTATCCCTAAGTT--TTTAGCCTAAGATCTGGGTT------------CAATTCCCTGCC--CCGCTAACTTTATTATTATGCTGATTAC-CATAAGGTTAAATATTTATAAGTTTAAATTTACACAATTAAATATCAAGTCATATGATGCAAAGCCAATGCA
CACACGCTGCCCCCCAGCCAATGAAGACTGCAGCCTGGGTCGCCACGGAGGAGCACTGCCTCGCCGGCGCCCAACATTAGTTTTATACTGTACATACACACTTATATATATAAATATATATACATATACATATATGTATACTATGTTATCT-ATACAATATCTAT--C
>ninaA 878174 878270|949 chr2L 877224 878337 scaffold_6 5202764 5203880 + 40191|992 1098
----------GGACTTTGGAGTATAAGCTTTATTACTGCACATAAGACTAAGAAGCCCCCATACACTCCGAATGGAATGAAACCCACAATAAATGCATACAAATCTT
CGCCCTCTTTGGCGCTTGTTGTTTTTTTTTTATTCATGCACATAACATT------------TAAATACTAAACATTGTCAGATTTCAAATAAA-------GAATATT
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GTGGAACGATAG-----GCGG----------GATAGCCGGACACCTTTGATG--ACGATCGCATATATGGAAATGGTTG-------------CAAAAGTTAGATTCTAAGTTGAGCAAAAAGTGAAATAAACTTTCGAAAAACA--CAAAA
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GGCGCGCGTCTGAT--------------------GTTTGCCTTGTTTACGAA------CTGTTATTTTT
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TAATTATTAACGCTCAACTGCGTCTCAATCAACAACATTTTATCTGGCACAGTCAGGCATGGCCCGAGACTGCGT
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TCGATGCCAGAGAGAGGTAGCGG------CAGATAATAGATGATAAACAGT-----TATTTTTATATATGCGCAGCA----------------AGCCGGCTACAGCCGTTAGATAACTCTACAGAATTTATACGAAGGACTTGGATACATATATATATATAAAAATTATGTATATCATTTAGCAGCAGCAGAAGGATCAGCATGTAAATAACCCAAGAGAGGCGACCAAAGAAAGTCA-AAAACA---AAAAATTGCAAAA----GAGA-ATTTAAGTGGTTCGATGAACTAGAGCAGCAAA---ACAGAGGGTAT-GCAGCAGTCGATACAGAGAGAACAATAATTAAACTACCTAATTGTTAAGTAAAA
>CG4341 957453 958100|1088 chr2L 957857 959023 scaffold_6 5319390 5320830 + 21543|0 336
TAATGTGCTTAAATATCCGTGTAAAATACTGTAAATATGTGGA--------CACCCACAGGCACCAAGCGAGCTGTGGGTCATATTATTGACTATATATATATATATATACG-------------ATATGAATT------------------GGCTTCT-----------------CGAGATT--GTTTTGTCCGTTGTGTGTACATTTTAGTTAAGCGAATAAAGA--------------------TACCGAT---CAAGAAATGTATGCAT-TGTATAAAGATATGG--CAAGGAG---------CATATAATAAAAACAACAAATTGAAATGAA
TTATGTGCTTAA-TATGAATGTAAATTATTGTAAATATGCAAAACAAAACATGAAAACAAACTCAAAATGATATATTATTACGATTATCGACTATATATATATATGTATGTATATGTTTGACTGTATATGGACTATGCCTAAACATTGTGGTGGCTTCTGGACGAGCCGAGCGGCTCGCAATTCGTTTTTTTGCGTTATGTGTACATTTTAGTTAAGCGAATACAGAATATGAATGTAAAAACAATATACAAATGTCAAAGGAAAGTAAGTATGTATATGGGGACAAGGAACAAGATGAAGCATACATATATAATTAAAGAGAAAAACCTATTTGAA
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GTCGCTCTGAGTGGCTCCTTTGTATTCAAAGTCATGAAATAAAGAGAATTTCAATAACATCCATGTTCGCCATAGAAAT-TAATG
GTCGA---------------CATCTAGAAGGCCACTAAATTTGGGGAGT----AACACATTCCAGCTCTCCAGTGTGTTATTGTT
>CG4415 1038579 1038685|1178 chr2L 1037372 1039338 scaffold_23 2143230 2145202 + 12214|1263 1402
ACAATCCTTTCGGACTTCACTTCTCCTGGTGGATGGCTTGTTCTACAA-----------------GAATGACAATCTCCGGT------------GCCAATGTAGCTCGTACTATATTAAA----TGCCGATCATTTCCTG
GGAAATTTTTCATATTTGTCGTATCTGAACGGATAAA-AATTCAAAAAAAAAAAAAAAATACGATGGATGCCGGTCTACGGTTTATGATTATCCACAAATATAGCACAAATTTTATAAAAATGTTGTAGATCTAGTATTT
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GACGGAGAGAGAGAGAGAGAGAGGGAGAGAGTG-CGGCGACTGCGCCGTGCTC-AATATTTGTAGTTAAACCTGTACGAAAACTGGAGCAGCTGGCCAG------------CTGCCCAGCTGTGCAGCTCGAGCGGATGCTGCGGCT------AGCGAATGGCTATAAACTATAAGAACTCTAGTG-------TTAAAATTATAGCTTACTTACGAACACACACACAAACGAACACACATGCAAACCTACTTATATGTATGTATATATATATATATATATATATATATATTTAATATGCTGCTCTATTGTAAGT--TTGATTGATTGAGAAACAATTTGGCATCAAACAAACACACACATATACACACACATACAGACGCATTGTTTATGCTTTCTTTATAAT--ACAAAACTACCTTATTAATTGATTAAAACATCACCATTTTTTATATGGAATTTAAAGAG---TAGTTTCTTGCTTTTTATC--TTTATATGTATATGTTGTATATGTATTCGTATAAGTCGTATGTGTGCTCACACACACACACACACACACACACATACATGCTCAAAAAATGGACCAACAACTAAATACATAATACTTGGACTATATGTGTATGT
>CG4552 1131954 1132413|1277 chr2L 1129814 1132391 scaffold_6 55358 57899 - 128794|2149 2631
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AGCATCTGTAGAGATCAGGCCATATACATTAGTCAGGCCACATCCCCCCACGAACACACTTCTGTTCACACACACACAC--ACACAGACAT-----GTGCAATGCGTAACGCCCTGTTTCTAGTTATAT---------TTATTGGCAATGTTTTCCTTCCTTCGATTAGATGACAAATTGTAGTCTTAACCTTCTTTTTATACGGATCTTGTTCGATTCATATTGCAAATGTAACATACGACA--CGATACACAACGC----------AAGATCGTTAAAC------------TATCTGACCTTTCAG-------------CTCGATACTTAAATTATAAGTGCAACAAAAAGAAAACGAAAATATAATCCGAAATACATACACCTTA--GAAGCCTTGAGACTTACAACATGTAAA-GATTATAACAA--GATATTTATTGCAACTAAATGAGGTATAAATAAACATGTATTATATTCAAAA
>CG4577 1139957 1141156|1285 chr2L 1139459 1141150 scaffold_6 66219 68247 - 24137|540 2086
GGATCCCACGCGGAGATAGTCTACGTAGTACTTAATGATAGCCACAGGCCCCACGA---------AGAGTA--------------------------TTTCTCGTTTTTTTGAGCATTGAACATA--------------TTGAACATAATCCAAGA----AACCAAAATCCAAATTCAAT--TTCTAATTCAATTATGATAAAGAGCTAGTGTCAAGGTCAACTCGTGTGCAATTTTTGTGTAGAATTTCACTTTCA-AAAAACCCAATGGCGAGAATTAA-----------ACTATTGTTGCATGC------------------AATGTGGTGCGTCAGGAGCATAATC--AATCAGTGTCT----------------AGGATT---------TTGTCCCACG-GAATCCGCACCGAACTAAACCGAATCTATATCTACGC-CACCTAATCCCTGTAAGAAATCGGTGTCTATGT---------------------------ACAACTACTGCAATCTGAAATCCAGCGGAACCGCAACTTGTATCTGTATCTACTTAT--------CGAACTAGAGGCTTCCCGACTAGTACAAAACGA--------------GAGAAGAACGTCAACTATGAATATGA----------------TTATATATAAAAATATGAATACATCTATACATGCAT----ATATCAATCCTAATCGAGCTCAGAAGCGACAAAAGCTCCACTAACCGCTTTAATTTAATCTAAACTTATACTAACTAAAGCTAAAGCCAAAGCCAAGTATTTTGAATGCCATCACATTCCGAACTACACTTTTTATGTAACC--CCGCCGACTTGGGGACAAACGATCTGA---CAATTGATGAGAATTTTAATCGTATTTAGCGAGTA---TCGCAGCTAATATGTTGGTAAAT-TATATATATATATATAT--------AAATATACGTATAC------------AATATGCAAACAATTTG-----------TGGATAAATTTGT-TAAGAAATGGCTCAGGGCAT-AAATATTTTAAATATTCTATGCC------GACGACG---------AAGAGGCGTATT--TTTAATTTGAATAAAATTGTCTGACTGTTTT-CGGTAATAATCAAATATACATACATATGTGTACTATGAATATGGTAAAATAAATTATATTATACAGACTAAAATAAAATAGCGTATATATATATGTGTGTGTGT--------------ATACAATACAGATTATATATAACTATATATATGA-----------------------------------------------ACACTCAAGTAACCTTAATAT---TATATACTTT------------------------------------CCCTCTGAATA-TTTGGCCTTTGATTTACGCCTTAAGTTCTTTGCGTGAACTTAGTTTGAAGATACATTTATTTACAATCAACTGATTTACGATT------AATAAATACGTCTTTGGTTTGAAAA---CCAATCAAAAT
GACCAAGACACTGAAATAGAGCAGGCGAGGTATAGAGCAAGCGAGCGGATGTAAGAGAGAGAGAGAGAGAAAGAAAATAAAAGTTTTCAAGCTGAGCTTTCCGGTTTTATTCAAAGAAGAAAATAATGTCCCCAATCATTTGACCTTTGCCCTAGATTGCAAACGAAAGAAAAATAAAATACATACAATTTAAACAAACTAATTAAAACGAGTCAACG-----TCGCGTGCAATTTTTGTGTAGAGTTTGAATTTGACAAAAACATAAAAAAGAAAAACAACAACAACACGTAATATTATTATATCTATGCATATATAATATCTGAATATTGTATGTCAAGAACATAATCAAAATCAATGTTTTTAAAACACTGACAACAGGGTTGACAAACAATTGTCCAATGCGAACTTACCTATGCCTATACCTAACCTAACTTCAAGTAAACCTAACCACACTTAATCAACAATGTCAATGTCTATTGTCAAGATTTTTGATCCCCAAAAAAAAAACTGTACAATTAAA--CAAAAGAACCGCCAACACTATCAGTATATTATTGTGTAATATCAAAACTAGAGGCTTCCCAAGTAGTACAAAAAAAACCAAAAAAAAAAGGAAAAAAAAAACAACAAAAAACAAAAAAAAAACAAAGAAAATGTTTATCTACAAATGTCAAACAATCTATAGATACTTTACGATAATTACTTTAAACGAGCTCAGCAGCAACAGATTATCTG---------TCAATTTGCTTTAAATGTTTTTTAATTTTTTTTACAAGAAGGCGCCATTACACTG-----TACTACATT-CGAACTATTTACACTGAGCGACTAGCAACATACTTTTATGCGAATGTTGTTAAACCAACTATTTGAAATATCTAT-GCAACTAACAATTATATTAACAACAAATATATATACACACACATATATATATTTATATGATAATCGAGATATATGTATACAATTATTATAATAATATGCATACTATTTGTCAAAAAAAAATATATATATATGTATATGAAGTGGCTCAGCGCATAAAATATTGAAAATATTCTATGCCAATTCAGGCGGCGGCGGCGTACGAAAACCGTGTTAATTTATTTTAATAAAAATTGTCTGACTGTTTTATTGAAAAAACCAAAAAAAAAAAAAAAAACAT----TGGAAAATGGAAAAACGTTTAAAATATACATACTACGATATACATGCATACTTATACATAATTATATACAAATTTATTTAAAAATTTATTACAAATTATAAATAGCTACAAATACAATGTATGTGCCCCCGCATACCATATTACTTATAAAAAATAACAAAAACACTCACAACTAACTAAATTACGTATATATATTTTGAAATATGTATTCTATTTTTTTTTTGTTTTGATTGGCTCATCAAATATTTTGGCCGTTAATTTATG--TTATGGTA-TTATGTGAGCTTAATTTTGAT-TGGTTTTACGTATAA--AACTGATTTATGATTCATTTAAATAAATATATCTTTGGTTTGGAAAACCTCAATTAAAAT
>CG4726 1147076 1147395|1290 chr2L 1146532 1147658 scaffold_6 76245 77347 - 23079|564 913
GCCAACAATCTCGCC--CCGAATCTTCTGCCTCAATTACTCGACGAACTGCTGCTTATTCGGATAACTCTTGGATAAAGCCAGTTCAAAGTG--GAATGGTCAATGCTGGACTGTAAATACCAATTACAAGTGTACAATGCCCACCCTGAATAGCGAATTCATTGAACATACGTTCGCTATTTAGGGCGTGCACTGTAGTTTTTAGATCG--CTGTAAACCAATAGTTAGTAGCCGTATCCAT-----TACGGATA-AACACTTCAGC----CCGCCT------AATGTACTTAACACTCT---TGATTTCAAAAGTT-----GTCTACAAATAAAGCGACGTAATAGTG
ATTTGTAATCTCGCTAGATGAAT-GCCAGCCGCA-----------TATTGCATTTCATTTGCATGAATTTTGAATTTTGTGTAGTTGAAGCACCGAACTGTCGCC-CTGGACTGTAAATAC------------TACAATTACCA------------------------------------------------ATTATAGTTTTTAGTTTATCCTGT-AATTACTAGGTA-TACTCGTATCTGTGCGTCTATGGACATTACATCTATGCTTAACCGCCTAACCAAAATGTACTTAACAAACGACAAGAATTCAAAAGTTTATCCGCATACAGAGTAAATAAAATTATATTG
>CG4749 1149377 1149454|1291 chr2L 1147854 1149476 scaffold_6 78549 80179 - 76062|1550 1628
TTAAATGAAAGTTGTTGGCTGATTAACAAGACTATATAACTGTTGCCCCAATAAATAATAAGAGTTGTA-AACTAAAAA
T---------GCGTTTGGACAGAGCAGAAAACTTTTTAGGTGATATC-----AAATTATAAAATGTACATCATTAAAGG
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GGTCCTAGTATTAGCCACCAG-CCATTCCCCTCCA-----ATCCAACCCTTGACCC-CTGCATTCTGAGCTCGGCTTCATTAAAG-AAATTGTAAATGT-------------ACGTAGCAATAAATCAAGTTCTCATTTTTTTATCTGAT-AAAAAATGCTAGCACCTTGTTTAAATAGAGAATAAAAGTACGAACGGACGAAAGTGAAGTTTTAGATTTAATGC-AATAATAAACGATTACAAAGTAAGGAAAAACACCCCCAGAAATTGTGATACTCCCACAATAATCTGATAAAAAAGTT--TAAATTTTATTAAAT
---CCAAGTATTAGCAGCAAATTCATTCCTCCTCACGCTTGTGCACGCACTGATCCGATCTGTCTTGATCTTGGCTTAATTACGGAAAATTGAATATATATATATATAAATAATGTATAAATTAAACACGTTTCCTTTTTTTTATTTAATAAAAAAATGTTTAAATTTTATTTAAATAGAATATAAAAG-------------------AGTACTTGCTTTTATTCTGATCATCTCCGGATGC-GCTTACATGCATATGCGTGCAAAAGTTTTTTAATTGAATGAAAAGTCTGCTTAAAATGTTGACAAAGTTTCGTGCAT
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GTTCGG
GTTCGG
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GCACATCGTTCGCGTGGGTAGCGACACCCTTATATT---AACTAGTTACCTTAACATTATGTAAAT
ATATTAAGTTA--------AACATGGTCCCTATGTTCTAAACTAATTAAATTAATTTAATATATAT
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AA--------ATTTTTTATGTCCTTACTTTAAGACTGTGTTTACTTT-----GTAATACAAATAATCGTAAAA----------ATTTAAATCTT
AATATATGCTACTTTTAATGCTTTTAATTATTGATTAAATTAGTTATCAAATGACATACATATAATTGCGAAATGTGCATGCTATTTTTTTTTT
>CG14341 1167163 1167213|1303 chr2L 1164472 1168457 scaffold_2 4083341 4087360 + 151408|2813 2869
CGTTTGTGTGTATT------TAGAAAAAAAGTTCTCCAATATATGTATAATTTAGAA
GTATTTATTGTATTAGACCCTCAAAACGACACACTCCAATATAT--AAAATTTAAAA
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ATA-------------------------------------TATTTACAGAAT--------------GCACACTTTATGTCAAGT------ATTCAGTATGCTAATTACTTTCTCCATGACGCGCGCCACTTTCAGGTTG
AAAACAAAAAAACACGTTTCAGTAAGAAGATCAAATTTCCTATTTATAATAAATAATTGTTGATTAGTATAGGTTTCATCTAGTTTTGCCATTTAGAATGCCATTAACCTTATCCATGATACGAGAGACTTTTAAATTA
>CG4887 1177373 1177500|1314 chr2L 1175041 1177668 scaffold_2 4004151 4006796 - 81443|2441 2572
G--AAATTGGTTTTTAGCCGTTTCACATGTTTCATTTCAACTAAAGTCGCCGTTT-AATTCAGCTTTTCAACCG-AAGCAAAAATTATTTCCATATTATATATGAAGCTTCTTGAGCATTGTTTTCCTAACA
ATTTAATTGGTT------------ATATATTTGGTTCGATTTGATGATATCGTTTGAATTGTGCATACAAATTGTTTACCTCAATTTTCATTACGTTACATGTCATACCAATC--GCATAACTTAGCTGAAA
>CG4896 1182287 1182454|1320 chr2L 1179968 1182497 scaffold_2 4004137 4006744 - 78098|2460 2646
GACTCTTCTTAAAGTGTATGATTTTATTCCGCTTGA--ATATAGGGGCATTTAAGCAT---TGTTGTTTACCTCGATTACACTTCC--TCCACCTTGTCGCGTTCATTTAGCATTAGTTGCGA------------AGTTCAAATTGTAAATAGTTCGTAAATACAGTCTCAAATTAGGTTTAAATTT
A---TTTAATTGGTTATAT-ATTTGGTTCGATTTGATGATATCGTTTGAATTGTGCATACAAATTGTTTACCTCAATTTTCATTACGTTACATGTCATACCAATCGCATAAC-TTAGCTGAAATACGTTTACTTTAGTAATCATTGTATATAATAAATATATATAAT-----------TTAATATAT
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ACACATACGTTCATGTATTTTACATGTCAAATGTCATGTAAGTTATTTTCA-TAAGAATAAATAC-TTAATTAGACATAGAATAAAAAAGGAAAAATAAATTACATCATAAAATTC
ATACATTTTCTCATATATCTTGTAAGGCCG--TTTATATAAATTATTTTAGGTAAATCCAAATGCATTACCCATGCCTCCATTGAAAAACGCAA------CTATTTGATATG----
>CG5001 1196444 1196806|1339 chr2L 1196092 1196869 scaffold_2 4022425 4023229 - 18861|355 789
GGAGGGATCACTGGC--CTGATCACTGACCGACGACTCCGATGCACCCGCAGTCC--------TTCGGTGAATCCAGG-------GACTTAGTCATCC-----ATTCAAACGCACTAAA----------------ACCAAACCGAT-CCCATTCATTTTGTAACAACCCA------TCG--AGATCTTGCTCCCATTTTGCTTGTTTTTGTGTTCAGTGAAACATTTGCGCATTTTTTACAGGAACTCCCTCTTAACAATCGGTTGTGC----------------TCATCTGCGCCGCGAACAT-------GTTGC-ATAATATGTATGTTGACCATAGTTATTATATCAT-TAAATCTTAATTTATTTGTCTAAATTAAAGCTAAATTTAATAAAATGACACACACACGCGTACACGTGAAAGAAAAAACAAGC
AGA-TAATAAATAATAAATGCCGCCTTAACCACGACAACGACTCACTCACAACCCGGCAACAGCTCAGTCTATCCAGTCTTCTTCTAGTTAGTCATACTAAAAACTACTACGCAATCAAAAGCTATTATCTGATCATCAAACAAATGAGCATTGAATGTGTCATCATTCAAATTATTCGATATATATCGTTTCGATGCGCATTTCATTTGTGTTGA-TAAAATATTTTACAAAAATTTGCATCATCTAATAATGCTCAATGAACCAAACACGATAAAGAAAAAAAACACATCCAACCCCATCATTCATCCAGTTGCAATAATACATATGTTGATCATAGTTATTATATCGTATAATTCTTAATTTATTTGTCTAAATTAAAGCTACGTATAATAAAA----ACAAACATGTG-------------AAACACAAGT
>CG5011 1201103 1201220|1345 chr2L 1201105 1201276 scaffold_2 2782544 2782710 + 1325|0 118
ACTGAACTGTAATCTAGATCGGTTAATATAGTGTGATATCAACAAATGTACATTTGTGTGTGATTAAAAAATATGCTGCTTTTAAATATATAAACTAACTT---TAGTTAGTCACGCCT
ACGCAGCTGGAATTTCTATCTGCGAATTTA---TGAGCGCTGCGAAACTA--TTTTTATTAGATTAAAAAAGATTTCACATATATATATATATATTTACTTATAGAGTGGCCAACAGCA
>robo3 1293687 1293835|1457 chr2L 1292637 1293687 scaffold_2 4126612 4127707 - 47889|1136 1136
A
A
>a5 1329868 1329904|1505 chr2L 1328993 1330018 scaffold_2 4178232 4179296 - 25661|941 977
TGAATGGAAGGATTGCTAATGCAATGGGTACGGACTT
CGAATAGTGTGACACCTGTTAAAAC---TATGAAAGT
>Cdlc2 1344886 1345144|1532 chr2L 1344605 1344908 scaffold_2 4194920 4195217 - 21055|281 303
ACGCATCTCGACGCCTGATAGCC
------CTTAACCCCAGATGGCC
>CG14346 1368965 1369047|1566 chr2L 1368240 1370085 scaffold_707 3779 5750 - 22644|762 844
TCGCACTGAAACTCAACCTCCTCCCACGGAACTGTGTGCCTCCAAAACATTGTTATAGTCCGGTTTAATAAACTTTGTGACTG
--------AAAATAATGCTTCTAC------ACTCTCTACTACTAATACACT---------CAGTAAAAATGGATTTTTCATTA
>CG33128 1495364 1495458|1742 chr2L 1494007 1495440 scaffold_2 4414020 4415440 - 53318|1371 1456
AGCTTTAACGA---ACGAACAAACGACATGCTTTCTAGGTTAACTCTGCTTATAAAAATACAA------AAAAAAAAATAAATGAT
GCTGCGAACGATTCTCGATGAAAACTCAGTCTACACTGAGTATCATAGCTTAATGGAATGAAATGGAACAATCAAAATTAAACGAT
>Or22a 1522052 1522151|1777 chr2L 1520670 1522906 scaffold_27 1236279 1238412 + 2259|1412 1524
GTTGAGAGGGACGAG-----------CTCTGCTACTATTATATTATATAT-TATATTATATTATATATATATTATTTTATATTATA-TATTGCTGTACCCTAATAAATATTTA
GTTTAAAAATATGAGTATAAGAGTAATCCATTTACGGACAAACAATCTATGTATCTTAAAGTCTTTAAAGCACAACTAGGATTGAATTATTAATGCACCACAGAAAATA--AA
>Or22b 1524160 1524259|1780 chr2L 1523196 1524188 scaffold_27 1238413 1239337 + 9326|995 1023
GTTAAGATATGCAAGCTCTGCTATTATAA
GTTTAGTAAAAATAGCTATTTCCATATAA
>CG31666 1696150 1698632|1996 chr2L 1695407 1697877 scaffold_2 4700208 4702843 - 83184|756 2764
GAAGCAGCCGCAACAGCAGCGGCATCAGTAGTCATGAACGCCAACAAGGAGGCGGCAAAGCAGCGCAAACGTAAAACACTCAAGATGGCACTGGAGAAGTGCATGCAGCGACGGGACGCAATGGTG------GCGGAGACCACCACGGGGGCAGGAGGAGATGGGGCAGAGGCA------GGAGGGGAGTCGGGCGAGGCAGTCGACGGGGCAGGATCGGAAGAGGGAGCCGGTTCAGAGGGCACTGAACCGCTCACCTACGAGCAGCAGCAGCAGCGAATGCACCAGGAGCTGACGCAGCAGATCAGGGCGGCCATGGCGGCGGAACAGG------------------------CCGCCGAGGCGATGGATTCGACCATGAACACCACGGTCAACACCACCACGACGACCACAACCACAACGAACACCACTGGCGCCACCAGTGATGGTTGCAGTGACGCGGAGGCCAGCGATGGTA-------------------GCGATCGAC--------------CCATGGAAGTGGACGAGGACCAGCCACCGGAGCCACAGCCAGGATCTGAGCTCGTTGTAGTGGAGCCCAAGATCGAGGTGCTTTCGGAGTCCGAGGACGAGGAGGATCGACTGCACATGT-----CCGAAGCCGAACCGG---------------------ATATCCAGGCCGAGGCCATTTACGATCACATGCCCAACACGCCCACCAGCCCCCCA--CATATAATACCGCCCAACGATACGCCCACTCTGACCTCCACGCCCAAGGTCAATGTGGA--GCAATAGG--ATGAGGAGAAACGAGGAGATGCCCCC--------------------AGAGGATGCCCCCCAAAGAAGCTGCT--------TAGATTTAGGCTAAG-AATCGATGA--AACGACGGAGTGAAAGATAGACGAGTGA--TTTACGCGC-------------------------GCGCAAAGAAGATGAAA-----CATGACTACTGATGCAACTGCTGTTGCCCTCGGAGACCACCTACGACCAAGCTGGACAAGAAGC-------------CCCAAACTGGGCACATTGATTACTATGATAACTAAACAAGGAAACAAGGAACCTAATGATAAGATGTACCACAC--ACGTGCACGTGTGCACACCAAACACACAGCAAACAGACGGACAGACAAGCGAACACACGAAAAACAGATGGCGAATTTGATGACCACCAACTTTTTGCAGGCATTTTTATTACGAATTTGTGTTTTTGAAGCCAATCACAATTCAAGCAGCAGGCACAAGCAAGAGCAACAAATCCAAACCAAACCAAACCAAACCAATTAATGGCAGTATGAAACAGGACACTCAACCAGAAACCAGAAACAGAACCAGAAATATAGAATTAAATGCAATCCGGCTGAAAAATCGTTTTCAGGGTGCTAATCAAACAATGAA-AAACAAGT------------------GAAACTT----ACGAAACTAACGAAATAGTAATGC-------------------------AAAAAGTTTGAACGTTTTTGATTGGTACCGCCCA---------------AAAAGAGAGAGAGTAGCCAGCAT-ATAGCAAAAACAAAACGTTGAGAATTTGTTTATTCGTGTGTGTTGAGGGAGTAGATCGATGATTAGATTATTGTCGCATATATTTTTGATTTCCT-----ATAGAAACGTCACAGAA-------CTGCAAGTTGCCTCAGATCAAAACGAAACGACAATGCTAAGCCTAAAAACTGAATTAAATAAGACGCGAGTA----ACTATAATTAAACACTGCAAACACATAGCAACA-----------------AACAAACTACAGAGCAACAATAGCAACAACAAAACCGCAACCACAAGTACCTGCAACAATAAAATAGTATAAAA-----ACAAAAGAAACAAAATACAGAATAGAAAAAGAGAAACGCTGAACCTAAAGA
GAAGCGGCCGCAACGGCAGCGGCAGCAGTAGTCATGAGCGCCCACAAGGAGGCGGCAAAGCAGCGTAAACGTAAATCACTCAAAATGGCATTGGAGAAGTGCATGCAGCGGCGGGACGCGATGGCGTCCAGCGTCGATGCGGCGGCGGTGGCAGGCAGCGGGGGCGAAACTGCCACCAGTGGGGGCGCATTAACGGAAGAGGGCGACGAGGAGGCGGCGGCAGCGGCGGCCGCTGC------CAGCGGGCTGCTCAGCTTTGTGCAGCAGCAGCAGCAGGTGCACCAGGAGCTGGCGCTGCAAATCAAGGCGGCCATGGCCGCCGAACAGGAGCAGCACCAGCAGCAGCGCCAGCAGGCCGAGGCAGCGGA---GGCCATGGACACCACGGCCAATACAACGGCAACAACCACAACAACGGGCAACACAACAACAACGACCACAACGGATGGCAGCGATGCGGAGGCTAGTGATGTTAGCGGCAGCGAGGCGGCAGTGCGAGCAACTGCGTCCTCCGCTGCCATGGACATTGATGAG---CCGCTGCGTTCGCCGGAGCCGGAGTCCGAGCTGGTTGTGGTTGAGCCCAAGATAGAGCCGCTCTCGGACAGCGAAGAAGAGCGGGAGCACGAGCAGGAGCAGGAGCGGGAGCGGGAGCGGGATGAGCGTCTATATATCGCAACACCACCGCCGCCGTCAGC--CGCTGAGCTGCACCGCACGCCCAC--GCCCACCAGCCAAATGATGTTGCCACACGAAGCGCCCACATTGACCTCGACGCCCAAGCTCAATGTGGATGTCAATGAGCAGTAAGCAAAACCCGCCACAAGTCCCCCCCCCCACACAAAAAAAAAAAATGAAGACCCCTCGAAGAATTTAATGCCACAAGCAAATATTGATTGAGTGATTGATAAAGAGTGATTGATTGATGTATAGAGAAGAAACGTTTACGCGCAGATCATGAACATCAGATGATCAGAACATGAAGAAGAAGAAGAAGATAATGACTACTGTTGCAACTGTTGTTGCCCTCGGAGACCACCTACAA--AAAGAAAACAAAAATCAAGTCCCAGCCTTTGCAGACTGGGCGAAATGTTTACTATA--AACTAATCTAACTAAC------TTTAAACATAACCCACACCACACTAACACACACGCATGCACAC---ACACA---CACACACACACACAAACACACACACACA-GGTACACAACTGCAGTATTTGATG---------TTTAAATAATGAATTTTATGGACAAATTTAATTTCTGACAACAACAACAAAAACAACACAACAAATTAGCAAAAAAGAAAAAAACAA---AAACATAAATATTTTAATT--------TATTAAAGAG-----------------------------------TATACAACAAATTGCAGTCCGGCTGAAAAATCGTTTTCAGGGTGCTAATTAATTAATAAATAAATAACTAACAAGAAACATGAGCAAGAAACTTGAAAGTAAAAGCAAGAAAATAGTTATGCTTACAAAAAAAAAAGAGAAGTAAATGAAAAGTTTGAACGTTTTTGATTGGTGCCGCCAAACGTAGCTGAAAAGTAAAACAAAAAAAATAACTATAATAATAATAATAATAA-------------TAATTGTTTATGTATTTTGTATAATATAATTCAC-----AATTATTGTTTGAAACATGTTCAATTTGTTTTTTGAAAAAAATAACACTAAAATAACCGCTGCAAGTTGCCTAAAATCAAAGTAAACAAAAGACAAACAGAATTTAAACTATAATTAACAACAAATCAAAACAACAAAATAGCTGCATACTACAACAAACCAACAACAAACTACAAACTACAAACAACAAACTACAAAGCAACAATAGCAACA--AAAACCGTAACCACAAGTACCTGCAATAATTAAATAGTATAAAACAAATACAAAAAAAAAAAAA---AAAACAAAACAAAACAAAAACTAAACTTAAATA
>CG31666 1696150 1698632|1997 chr2L 1697964 1698224 scaffold_2 4702906 4703103 - 1436|0 269
TTTGTCCGGTTTTTTTGTACATAATTTTATTAAATTAATAATACGAAAAGGCAAACGGGGCCAGGAGTGTAGGGCCAAGTGAGGAGACCACTGCTCCACGGCCACCAGGATTCCAGGATTCCAGGATCTGTGCTCGAGGACAGACGAGTTTTGCTTTAAGGATGTAACATTTTGCTTTGTGATTTTCGTATTGTTTTATGATTTCCCTTCCAGTTTAGGC----CTCAAAATTT-----TATACAACTGCTTTTCGGCTACAAAATCTAA
CTTGTCCAG-TTTTTTGTAAATAATTTTATTAAATTTATAACACG-GAAGGCA-----------------AGAAACAAACCAGCTGGCTGACACGCCTTTCCCGCC--------------CCACGCCCCACGCCC----------------------------------CCTCGCTGTGTGTTCTTTGCATTTATATTTAATTT---TTAAACTTTATGTCAAACTCAAAATTCGCACACACGCAGTAACTTTT--GATAAGAAATTTGA
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TAACGAAGTA---AAAACAATTGGTAAATTGGGTGCCTATAAGAAATATAT--AATTAAATGACTACTAGTAAAATTTTATAAACAATG----------AAGAGTATATTTAACGATGAGCGAGAAAAGCAAATAGCAAAGAAAACGTAAAGTAAATATAATTATTTTTTAATTGAATAATTCTAGCCAAGTGT--------GAAACATGTTAATTAACAAACGCAAATATTAC-------GCAAAAACCACTCAAAAACGTTCTCAA-AAACTTGATGGCAACAACAAAGGCAACAAACAGCAATAATTACAGCAACCAAACGAAATTCAAAATC--AAACTTTTGGCACACCTTTGGAAAACATTTTTCTTCGTACAAATGAAAATTC-----------ACCAAAAA----AAAAAAATGA
CAACAAAATAAGTAAAACAATTGGTAAATTGGGTGCCTATAAAAAATATATAAAATTAAACAACTATTAGTAAAATTTTATAAACAAAGTGAAAAAAAAAAAAAAAAATCTAACAAAATGCTTATATATTTAAT--CAAAGAA---GTAAAGTAAA------------------AAAAAAATCTAGCAAAAAATAAATAAGAGAAACTTGTTAAAAGTTAAATGCAACAACAACAACAACAACAAAAACCACTCAAAAACGTTCGCAACAAACTTGACAAAGCAAACAACAACAACAA----CAACAATTACAGCAAAAGACAAAAATTCAAAATCAAAAACTTTTGGCACACCTTTGGAAAACATTTTTCAACAAAAAAACCCAATTTTTTCTTTTCACAACCAAAAACCAGAAAAAAATCG
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--ACTGAGCTGTTGACG---------CCACCGGCGCTAACCGCGTTTATAGG----------------------------------GACAGTAATCGAATTGGCCG----------CATAATTCAATTTCATTATGAGCATTACCAACTACCA---------------AGTAACACAATGCGCATTTCTAGGCATTAAATTTGTTAACAAA------------------------------AAAAAAAAAAAAAAAAAACCATAAAGATTAAT--------AGAAAACTTGTTAAATGAAAGAA--GATA---------AAACGTATGAATGTAAATTGATTGCCCA--GATTTCTACTAACCCCCTCCTCCAACCGCCTTGTTGCAATTTACATAAATTTCCAGTCCACACTCGTATATGTCGCGCCAGCTCTGCCGCCGCCCTTTAGACAGTATCTTTAAGTAACTTTGAGTATTTTGTATCTGTATAATGCATATACAATGTTTTGTATCTGAAAGTCGATGCGAAATTATACGCATTTCGCTTTGCGCGATTCATTTGAAAGCGATTCGATTAGTTTGCATTTGCATTTTTCTTTGGAAACGTTTGCTGCGTTCGAGAATAAATAATTGTGTTTATATATAAAATAAAATAAAATAAATAATGTATGTATGTGTATTCTAACAATAAGAAGCTCGAAGCATAAATTTTACATTATGTACTTTTACTGAAA-CGCT------CTGTATTATGTGA-AAAATACACATTACGTATCGATCAGAGAAATATAATTCTTATTTATGGCCTAACAAAAGCGAAGGTGTCGAAAGACA---TACAAACAAAACCTAATCGATCGTTGGTTCCTATGGCAACATTATATCAGAAA
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CAAAAACCATTGTCATTTGGCATATGGACAAACATTAAAAATCTAGTTTATTTTTATTATTGAATTAATCTGTATAGCGTAAAAAGTGAAGTGTCTAAAACAAACTTTCCTATTTAAAGCTTTGCACTAACT-GGACGG
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G--ATACCATGGCC---------AATGTTTGGTCCATGGCTGCA-----------------ATCCTTT-----TGTACATAGTCGGGTGTCTTTCCATCTCTCCTCGTTTTAAGTTCCAAA---TTCGAAACTACCCTTTTTGTGTTTTTACAATTGATCGACCGATTCGATG-TTAGCTTAGGTATTTATTTA-----------------------------------------------------------------AATATTCTCTGAAAT----------------------------ATTGTACGCAAGAAGGCTTTAGGGTAGC------------------------TTAAATCCAGTT----TAAGTGCTGATATACCAAAAAGGAAGATCAACTGCAACACAATCTCTATAACCCC
GGTATACTCTTGTCGTTTAGTTAGTTGCTTAGCCTA-GGCTGTATATTTAAGTTTAGTTTTATGTTTTATGCGTATACATAG-CTGGTGTCTATAGTTTGTTTATTTTTATTATTTTATTACCGTTTGAGTTTGTTCGTTTTGTTCAAAACCAATT--TCAAATAATTGTATATTTAACTTAACTATTTATTTACATTAAGCTCAAGCAAATTATCCATTTATGTTTCTATGTCTAACTGTTTATCTTGCATCAAAGACAATATTATTATTAATACGAACTATTTATAATAGCATTGGCTTAATTGTACTCAA-CAGGCTTTAGGGTAGTGGATTTTATTCTCCCAGTGTAGCATTAAATTTAGTTTTAATAAGTGCTGATATACCAAAAAGGAA---CGAACAAATTACAAATTCAATACACCC
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ACATTATTTCTGCTTGCAAGAGGAAACTTTGCGAAGTCTC-----ATGACATTGCCTTAAAACTGAGCTAGTTTTCATAAAAACATATAGATGGACATGGTTAT-ATCGATTGTTCGTTTTG-ATCAAGAATCATATGCATTATTAT--GCTTTGA---CTAACTATTTAGTGAAGATATTTTTC------CCTATTTATAC----CTGTCGTTCAGATCAGAAACCTGTCAAATCT--
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AAGTTTCTAAAACTA--------TTTTTAAAAAATACTTTCTTTTTTCTCTGC---TTAGAATCAAATGAACCTGTGA
CGCTCAAAACAACAATAGTTCGCTTGTAAATAAATTTATTATCCTTAATGTGTCAACAACAATGATACGATCCTGTGA
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ACAAACACTGGCTAAGTGGCAAGGGGGCCACCGCGACCAGCAGCACCAATATTGTGGCGCCCCCGGGTGGACCGAGGGCCGGAGGAGCAGCAGGGCCGCAGCAGGTAACCCGACATCTGCCTGG--------------ACAGCCTC-AGACGCAGACCACACTGGGTGGCCAGCTGCAGGAGCGACCTTTTCTGCGGCACCTGGCAATGAATCTGGAGAACGACATGTACTACACGGTGGACTTTAGCGAGAACTCACAGCACTCGCCGTTGATACAGTGAGACTT--------------GGACGAGCGC---------------------------GGCGGATGGCTG----GTCAAATTCAC---------CCCACGCAAAGGGGAGTGAGTGGGTTGGGTTCGGGTGATTGTGTAATTATCTTTGATGCTACTC------GATGAATATTCCAAATATTGAACAGTATTCGA-----TAATAATAAAC---TAAAGAGGTGTGTGAATTAATTTAA--TGATTACGATT---CCGGCTAATGCAAACACAAATATGTATGAGTAATACATGAATCTCTGGCATTCATACATAGGCTTAGCAAACTTGTTTA---TCAAGGTTTATTTTGGCTAAGCACACACA
ACAAACATTGGCTAAGTGGCAAAGTTCTCAATGATCCCA------------CTGCAGCAGCACAGCGTGACCTAACCTCTGCGGCAGCCGGCAATCCGGCACAGTCAACGCGTCATTTGTCCTGCAGGCCAAATAGCAGCAGCCTCCACACCCAGACCACGCTGGGTGGACAACTGCACGAGCGCCCATTCCAGCGGCATCTGGCCATGAATATGGAGAACGACATGTACTACACGGTGGACTTCAGTGAGAACTCGCAGCACTTGCCGCTAATACAGTGAGACCTAGTTGTTGCAGCTGGAACAGGAGCTTTAGCAGCAGCTCGACCCGACGCTAAGGAGGATGGCTGGTTAGTTAAATTCACAAAGAAGCGCCCATTACATGGGTAGAGTAAAGAACGCATTCG-----TCTTGAAAACTTCATTG-TGCTACTCTTGCAGTGCCAGTGCTGACAATATTG-ACAGTACTGAAATTATTAAAAAAAAACTAGTAAATAAAAACTAAAATTAAATAAAGTTGACAACAAATTAACCATTTGATTAAACAACCACAATACATACTAAATGCC----------GTACTCA---ATAGGCTTAACAGCTTGGTGTACTTTTAATGTTTATTTAAGTCGGGCAAATATA
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ATTGTTAACGAAATGTATTGAATTTATAAATCTTAAGCGTAAATTTATTTGATACAAAATGAAAGATACAAAAAAACCAGACAAAATTGAATGAAATATACAAAATACAAAAAACATTTAAACTAATATATGCGTGCGTATGTTTGAAAGTCTACAGAACAGTATAGTCTTATTATTATTTCCTCTGTTGTTACACAACAGTAAGAAAAATACTAACAAAAAAA------AAAACACAAAAAAAAATGATTTACATTTAATTTTGATCTCAAAA------CCATTAAACAAACAAT----------GTGTAGTATGCAAGTATGACGCAACATCTGTTTGCG---------------------TAATTCCAAAATATCAAAATTAAATCTTCACAAAACGA
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TTTGCGGTAATTCAGTGGCGAAAAATTAATATTAAATTAATTTAACCGCAATAATAAATTGTCTA------------GTTAAAAATTAATTTGTGACAAG-----------AGATTATTGTCGCTATATTTGTGGCACACAAAATGCAAAATGTATATTTAAAGGATTGGCCATCGAGGTAATCATAAGCTGTTATTAAACATTAATTATCATAAATTAAAAT--TTGCCATCAGGGCTAATATGTTTATTGTTTGCGGTTTATATATGTGTATTTAAAGCTATTTTTGCAC---AATGAGCGGGATTAAATATATTCCTGTG---GCTGCATTGGCCATGTTGCCATAAACGTGCAAATATTAAAACTGA--AAACTGAACACAACAAATAGATCCAGAAGCAAAAGCA----------AATAAAACTAAAATACTGAGAAAAAAACTTAATTATAAATCAAAGATAACCAGCATTGCTCAACTCTCGGATACGCTGTATTCATATTTATGGTGCTCAGTAACAATATTTGATCATTGTGCCATCATCCAGATAGAGAATATATATGTTTATATATATATATAGATTCTGGAGTGGGAGATGCCTGCTCGATTATAGGGTATCACCTTGTAGTTGTCACTAATTGGGCACTGTTCATAATCAACTTAGGCTTTTTCCCTTTGCGATCACAGTATATTAA-CAATTATTATTGATAAAACTATGTTTGTAATGAAAATGCA-GTAAATAAACAAAATAGTAATA-CATAAAGC--TGACACAGCTAAGCATGAAAAAAAAAACAATCGGAAAAATCTGATACGCAAATGCAACATTTTTAAATAAAAGCAAATCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTCTTTGTGTACATTTAATTAAGAAAATGCAGTGTTCGTT---GATAAAACCAATTTAATTTAGGCAAAGGCAAATAAAAGATTTTCAAAGTAAACTCTAAACAT
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TGTGTAGCGCTTATACTAATTGTTAGGTTACCAATAAATAACAACTAAATG--GGCTAAAACAAACTAATATTTATTAAATCTAATTATCTAAATCACTAAACCGGCAAATGGCAGAGATCAGCAACAAAACTAAAATCAGATCCAACTTATTTCTAATTGATATTCATTAATAGTTATTGTAAAGAATTAATTTGTTTTTAGTCAAGCTTTGTAGCTCTTAAGT--ATTTGCGTATTTGTGAGCGTGCATTTCTTTATCTTTTTCTTTATTATTATTATGTTCTTTTTTTTTTGCTTTGGCCTTTATTAATAGAAAATTCACTTTTGTAAAGTTTGAATTGAATTCTTAGCGCTTTAAGGTTAATAAGC------AATTTA--TATTTGTTAAGTGTTATCTTAGTT-------------------ACGTTCGTCTAAAACGTGGCGTGGCAGAT-TTGTAAAGTACGCCGAA----------CATTCTGTATG-TTTACTTTTTGTTTTTTTTTTCTCTTCCATGCCGAA--AGGCAAAATCCATCGGATTATTGAAAAGTGTTAGCAAGACAAGGCAAATGTT-GTATGCCAATATTTTGCACCTCTTTACTTTATAAGCAAGCATACAAATATACACATATATATATATGTATATATATATATATATATATATATATATATATATATACAATTATCAAGTGCTTCTAATTGTCGGATAATGGC-------AAAAATTA----------------TGGTCAAATTTACATAATTCAATTTCAAAGCACTATTTTCTGTAAAT------TAGAAGTTCATTATTTGATTGTATTGCAAGCACCTA------TACCTAAGGATTGACACTAAATTTATAAAAATATAA-------------TTAAACTCTACATTACAATAATTTACAACTAAACAAAAT
>CG10908 1975188 1975422|2196 chr2L 1975018 1975442 scaffold_18 1722614 1723035 - 3654|173 430
ACTCC------AAGCTGAAACTCGAAACTCTCT-------------AGACTAGACTAATTCCCCTTTTTACGGTTTGGTTTACTCTATTTTCTCACCAAGCTCTTTACTTTTCCAACTATTTTTCGATCACCACTCGATTCTCTGGCGACAGCAATAAGTTAACATGTTAAGTGGAAGGATTGCATTGTGCATTGATGAAATTATATTAAAATATGTGTGTAC--ATAAACAACCAT--TAAAGAAGACAAAAAAGAA
AAACCTTAATTAAGCTTAGTTTACGTGCTATCTTTTTCTACACTAACAACTGTACTGGATCGCAACCTAAC---TCGATCAACCTTGATAACTCATT---TTCTTTACTTT------GAGTTTAGTATCTTTTTTTGAATGTAGAACGTCATTAAGTAA--AAAATGTTAAGCGGCGG-------------ATTGGTAAACAAATAAGAATGCATATTTCTACAAATATACACCCAGGATACAAAATTCTGAATAGGT
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TTCTAGTTTTATATACATACAAAAAACAAAAACAATCAAATT------GGACAGACAGAAGAAGCTACTAGTAAAAACTTTAAACCAAATGCTGAGTTTTTAAGAACAAATATCAGACATGTTTA
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GCAGT----CACCCTCTAAA----TTAACCTCGAAATACTGGGGAGAGCGCACTGAGCACTCCTGATTTTCCTCTCCATTGT-AATCTAATTTAAAATAAATAAATTTACACTTAATTCAGTA
TCAGCTTGATACCATCGAAAACTGTTAAATTCGCAATA-------------ACCGAGCTCT---------------TATTGTCAATCTAATTTAAAATAAAGAAAATAAAATTAACCTTAAAC
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ATATATAGGATAATGGAGAGTAGAGGAGGGGGGTGGCTATAGCCATCGGTTTTTGTCTGCTACGCTACTGTGTTCCTTTCTGTGCGCTTTATATGTCATGCTAGCAACTAAGTGAACTAGTCCGTAAGCCTGCCTAGTGATAATTGCAATTAAATTCAGTCCCTGGCTAGGTATATTATTATCCCTCGGCTGATG--------------ATCCCTTAAGCAATAATAATCACGGATTAGCCGGCGTAGCGTGTGTAGTCAT-AGTCGAGTCAAGATGCAAATTAAAACCGAATATATATCATCATCAAAAGGAATGTGATACTTGTATAATAGACTAATGCAACCTAAGCGTTATGGGAATCTTTTAAACTACCTATCGGTAATTCAAATAAGTAGCCA--TAATTCCGAAAACTACTCTAATTAAC-TGTTAGTTGCGCTGTGTAAAGAGACCCCCGAGAAACCCAAGCTGGTGGCAAACCAAGAGT--TTGTAGCATACTGAACTAAGAACTAATTGTAATCGTTATATTGTCAAAACATTCACAATGAGCAATGTTTATATGCATTTCTTCTATCGAAAATCCAAAT-ATATTAGGCCAAATTCTGGTCCAACTCGA
-----------------------------GAGCTGGAGTTATCCGTGGAATTGT-TTTATTATAC-ACTATGTTCC------TACGCCTTATGTGCCATACGAG-GGCTAGGTAAATT-TTCTAAATAACTGCGTGAAGTTAAAATTCTCTAAGCGCTTTCCATG---------ATTTCCGTGTTCAAACTAATAGAAGAAAAAATAATAATCCTACAGCAATATTTATTTAAAATTCGCTCTAAAAGCAAAGCTCGTTGTGAAACGAGACCAAATGAAAAT-------GAATATATATCATCATCAAAGAGAATGTGATAATTGAATTATAAACTAACGCAAGTTAATCGTAA---ATACTTTTTAGACTA------------TAAAATATTAAGCAAATCGATTGCTTAAAACATTGAAATCAATATCTTATTTGTCTTATTGAACTATTTTCCCAAG----------TAGAGAAAAACGAAATGTTGTTGTGAAATATATTACCAAAAAGCAATGTTTATACTATAAATGTCAAAA-----AAAAACAGCGAAAATGAAATGAG----TTCTCTCAAGCATCTCAATGAAAGTAG----------------------
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GTGGCAGTCGATTTGTGGTCGGTTTGTTGATTAATGTTTAATTCCAGTTAAGCGCCTGCT-TTACCGTCCCCTCCCCCTTTCCATTTGACGACCACGTTGCGTTAAATAGTTACTGTTATTATTAT---TAT-----------TACATACGTATGTATTACTACTGTATACTGTAAACACGAAACACACACTTC---TGTCTG--------TCTATTCCTATGTTCGCA
GTGGTAGTCGATTTGTGGTCAGTTTGTTGATTAATGTTTAATTCCAATTGAGAGCGTCCCGTTGTCGTC--------------------------CGTTACGTT-GATAGTTACTGTTATTATTATACATATACCTACATGCATATATACGTATGTATAAC-----TATAATGTAGACACTATGTTCACATTTCCCTTGTGTGGAATGCATCCTATTCCTGCGTTTGCA
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CTACATACATTT-TCTTTAGGCTTATTTGGCTCAATCCTTGCAATCCATGTTAAGTTTCGGCCTATGCTCTATTCACTGATAAAAAAAACAACCTG------AGATTCACACACACACACACACGCCCGAGCAGAACACATTATGTAGGGTTTGTTGAAAGAAATTAAATTTAAACTTGTT--AGTCAT------------------TCAAACGGTC-------CACAAATAAAT----------CAATATATAAATATATATATACATGCAAATACTTCAGTAATAAACAAGGAATGTAAAGTTTTATGTTCTT-----------------TTATAGTTTTATATAATGTTGTAAATAATTCAAATTGCTGTTGTCATAATTCAAAATAGAAACAAATAATTATTTGGCCATCAGTTGAATATTGT-GAAGTGCAGCTGTTTATGACTGCATAGATAAAGGATTTTAACTTGTAAAGCAATCATTTAG-----------CACA-TAGCAACACACA-------AGAAATAAGGA------ACAACTCTTACAAG-AAACTAAACATGTTAT-ATTTCAAA----AATTGTAACGGCACACTTAAATACATAA--------AATAGCAATAATTGTTGTTAACAAATTTAGAGTAAAAATCCAGCTGCTGTAAACTTGGGTATGTT-TGCAAACTGAATGCAATTTGAGAACAACTACATAAAT-GTAGTTGTGTAAGCGAAAGTTATGTAATGAAGGCGTATAAAGTTTATAAATTATATGATTATATATATAAACATTATATA---TTTAATTAGTTTAATGCAACATGTACTGTATTATATAAAATAAATGCAAAATTATTTAGTGATA
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AACAATTTTTGATATTATATATTTTATTATTTGTGTGCTTTACTTTTGTTAAAGTC------CCAATTTAGGAGCCAAATGCAACAACAACAACCAATTAAAAAAGAAAAGATATATGAGAGAAATGAATTAAGCTAGCGCTAAGATGTATACATCGATCGGGCTCATTGTTAAATATTAAATATCTTATTTAATAAATTTTAAACAAATCCATTTGCTAA--TCTTCAATTATGATGGAATCGAATTAGCTGCTGCGACTACGACTACGGTACCTTTCGCCATTCAAAACTCAGGAACACTTTCAAAGTAAATAAAAGATGTTAAATCAATTAAAATAAAAAAGAAAACCAAAAATCAAAAAACAAATTGCAAAACTTGCAACTTAGTGCCCGGCTTTGTTTTAAATATGAATATTAATGTGCGTGTTAAACAAAAAAAAAAAGCAAATAAAGAAATTCAAGTTGAACTGTTACATGTAAAATAAATCATTTAATTTGCATAA
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AATTTGATTCGAAATAG
AAATTTATCGGACGTGA
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ATG----TTCCCACATGTATTTAATATATATTAATGCACAATTGTACTGACAACATACATAAGTGGTATTCATAAGAATTTTTATTCTTTATTTTGGAAGCACATCTTTATTTTAACATG----TTTTTTAATATTTATCGTTTTCAAAACAAAGAGCTTGTAAGTTCGATTTTAAAATTTCACTTGCTCAAAATAAATTA----AATATTG--TTCAACATTTC
ATGAAGTCTAACAAATGTACTTTGACTTAACTGTTTCACAA----------AAAATATATAA------------------CTTATTATTGCC-----AAGCACAAAATAAAACAAAAACGAAATTTGCTTGAAATTTA-----------------AATTTG--AATTCGAATTTGAAATGTGAAATG--AAACATAACTTACGGCAACCCTGGCTGTAGAGTTAC
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AGAACAGCGAGTCCCGAGGGACCATGGAGAAGATCTGGCTACCCTGATATGCTTATCAGCACGCACCGAACAGAACCTATCCAACCCGAATGCCTTTAACTGT--GTTTACTGTGT----------------ACATTTGCAACTGCAACTAGATACGAACGGCAATGACGCAATGCAACAGAAATT-----TTAGTTTTATTATTTTTGGAATAAACCTTATTTTGTAGTCAACGAC--ATTGATT
TGGGGCTTTAGGAACTTGGGACTATTCAATTTA-CAAGCAATGTATGTAAGTTTA--AGTGGACACTGAAGCAATCATCCAGACGCCCAACGCTCCAAGACTTCAGTTTAATGCATGTATATATATATTAGAACATGTGTATATGTAACCAGCACAGACACAGAAAGGCACAATGCAACATAAATTTAGTGTTAATTTTATT-TTTTTGGAATAAA---TAGTTTTTAGTC-ACGACCAATTGATT
>CG7263 2154898 2155390|2298 chr2L 2155165 2155512 scaffold_2 1403125 1403498 + -1426|0 245
GTCGTAGACAAGCGGGTCTCTGTTGAATTGTG------------TGTAACTTTCGTAATAAACCAAGCACCAGAAAGTTGTTGACAAAAAATTCACCGTACCAACTAAACTGTTCAAATTATTCATTTTCGGTGTTGAAAAATCCGCT-----TTTTGATCCTGAGGCACCCGTTATTTAACTAATCCTAAGAGATTTTGCTTTGATTCTTATTTAA---ATAAATCGTAGGAACTTTGGAACTTA
GCTTTAAAGAACAAAGTTTTTGTTTTGTTAAGAGAAATGATTACTATTATTTTAATTAATAACTGTTCAATAGTACATAGTACATAAAACATTAATTGTACCAA-----------GAGTCTTCTGAGGCCAATGT-----AATCCACGGTCCATTTTAAACCAGGTGCACAAATTGTTGA--------TCAAACATTTAATTGGCACACTGATAAAAAGTATAAATCAAATAATCAAATCAAATTG
>CG15382 2156257 2156791|2299 chr2L 2155573 2156344 scaffold_2 1403573 1404287 + 8290|715 802
AAAAAAAAGTTTAACTATGTATCCTAGGATAACCGCCTGAAACCAATTCTACATTTGTAATTTTACACAAATCAAGATTTTAGAAATC
CTAACA----CCAAAGAGGCTCCCTAGG------------------------AGCTGTGCTTTCGCTTTCATCA--GTTTTTGATTTC
>CG15382 2156257 2156791|2300 chr2L 2156471 2157089 scaffold_2 1404358 1404862 + 4338|0 333
ATTTCAGTTTTCAATTTATTTATTGCATATAAATTTGTTTCCTTTTTTATACATATATAAATTATGTATTGATCGAAAGATAACGTTTTCAATGGAAGAACAGGTATTGTGGCGACACTAGAGTGCTAATTATTAGCTATTGGCGGTGTTTAAACTTAAGGCGTAC-----GAAAAACAAATAGAAA------ATTAACTTTAGCGTAGATCTACACA-ATA-ATTAATAATTACAGTTGCACTACAGGCTAATTGTATGAACGTGCAGCGATGATATCTTCTCCTAACTCTGTTCATTCCGTTTAATGTAATTAATAAAGTGCTTCAAATGTA
ATTTTTATATATATTTTTTTTTATACATATCA---------------TATCGAAAGATAAGGTATTTTTCAATTG-------------------GAAGAACAGGTATTGTGGCGACACTAAAGTGCTAATTATTAGCTATTGGCGGTGTTTAAACTTAGGCATTACACGAAAGAAAACAAACAAAAATTATATATTAATTATAGTATATATATATATGTATATGTGTGTACTTAAATATGC------GGCTAGTT-----AATAATTAATAATTACAGCTT-------GTATGTAGAATTTG-----TATGATAATTATAATGCT--AAATGTG
>mio 2220411 2220625|2375 chr2L 2217345 2220816 scaffold_18 2111532 2114826 + 145218|3096 3336
CTGTCCGGAGCACCCACCATACACAGCCCTTAC--TCGCCCAGGCCATATGCATATGCATTAAGTTGTTGATTTGTTCCAAACGCGTGCGCCTTAAACAAACTCAGAAGTGTTCATTGTACTTAGACAAGG---GATGTGCCCGTAGCATTAGTGT-TTATGACCTACCAGCTTTTAGCTGCTCAATTGCATTTTATACT--------------------TACATTCAAATAAAGGACTAT
CTGCTGTGCCAGACTTTCAACTGCAACACATACAAACGCCCACGCCATATG----------------------------------GTTCGCCTT----AAACTGATAAGTGTTCATTGTACTTAGACGACGGCTGATGAGCCTGTAGCTTTAGTTTCTTATGACCTA-CAGCATTTAGCTGTTCAATTGCATTTTTTACTAATCTAGATCGAGAAAAGCAAACACACAAATACATAACGAA
>CG7082 2225241 2225555|2376 chr2L 2221073 2226218 scaffold_18 2115287 2120273 + 93249|4506 4935
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GGCCTCCTAATTCTAAAAAGTTAGTCTAAGCTAAGGTCTCGCCTTATATATATATATATATATATATATGTATATATATATATATGTATGTTTTCTTAGTTCATTGGACACAAACTGTGAAAAGGCAGCTCCGTACTTCCTTCTTGACGTGTATATACTATTAAAAAGCGTAGTCTGTAAGTTATTTA-CATTTAGTTATTGAAGAAATTTCTTTAATTTATCGCCCGCCAATTGGCTGTTCAATTATGGACATATCATGCGTATGAACAAAACACAATATTTTCTAAGCCAATG-CAAAACAGCAAAATACTTTATTTCTTGTTTATTTAGTAG-ATACGCCATGTTACTT---------AGGCCGAAGCCATACTCTC-------------AGATAAATAAGTTTGTACTCGGCTATTTCATACAATG
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GCGGTTGCCTAA--CTACACACTCCTCCCCAAATCCGGCGACACATTCAGTTAGCTGCACACACACACACAC-ACACACACACACATGCATACCTACCTATACATACCCATTAAAACGTTGGCTACTTGATTTCTTGG--------------------CGAAACGGGTGATTGCA-------ACACGCCCGCTATTCGAGTTTTC---TTCAGCTAACTTTAAAATGACAGTGCGAAGCAAGAGCAGTCTATAGAAGCATCTATATATATGTATATGTATATGTATATATATATACATATCGCTGTAATAACTGATGAAAAATCATTCG---TTTATTTCGTTTTTATTTCATTTCGCAATTAATTTATGTAAACGAAATGCTAGCTAATAGTTGAATTTTATAAACAATCGTATGCCGTATTATTCCATAAATTGTGTTCTGTGTAATTTGAAACTATTTCGGC-ATGCGAATAAA----CATTATATCAAAATTTCATCAGAGTCGTCGTTGCTTAAAAATTATAATAGTAACTAAGTTGTAAGCTGCAAAAAGAAAAAGATAAATTAAAAAACTAAATAATTTGAGCTGCGACAGGTTTTTTGTAATTATATAATA------TTAACACTAATTGTAAGAGCAAATTCTGATGCAACAACAAACATTTGTTTATAAACCTGCAAAATGTGTGTTTACCTAT---------GTTCCAA--TTCTATTAAATTTAAAAAATATTCATTTGTA--TTATGTATAAACAATTTATCTACACACACACACACACACATACGCAGAGACAGTGATTTGAGAAAGGGAGAGAGTGAACATCATAGGCAATGTTTAA---TTAATTGTTA-TGAGTTTCGGGAACATTTAAATCGAAAA--CTTTTCTAAAC-TTACAAAACGAATGAAAAACAAAAACAA-TCTAC------------AAATTTATGTAAATGTAAAATGTGCACGTCAAATAATAATAATTC-TAGATATTTAAAGGCCTAAAATAAAATAAATA
>l(2)s5379 2230127 2231096|2380 chr2L 2231081 2234043 scaffold_18 2125253 2128304 + 105511|0 15
TAAAATATATAACTGA
CCAGCTGAATACATTT
>CG4267 2244362 2244415|2390 chr2L 2243259 2244458 scaffold_18 2144186 2145529 + 31307|1254 1312
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CATTAATATTAATCTGATTATGTGAATAAGCGACAAGAGTAGCCTAGCTGTGAAATATT
>CG4270 2264047 2264085|2417 chr2L 2262979 2264292 scaffold_18 2162436 2163885 + 21419|1248 1294
GTCTTAT-GGCTATGGCTA-------TGGTAATCCTATTCATACATG
ATTTGACAAGCTGCAGCGACATTGATTGCTAATATATTTTATAATTG
>CG4270 2264185 2264239|2417 chr2L 2262979 2264292 scaffold_18 2162436 2163885 + 21419|1395 1449
CTCTGGGATTTTTTGATCAAAATTTTAAGCATAATAAAAGCGTAATCTAGGTCCA
TTAATGTACTATAACATC-------------TGCAATAGTTGTAATACAGGTCCA
>eys 2357878 2358181|2523 chr2L 2356302 2359029 scaffold_18 2283000 2285864 + 47382|1759 2120
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GAATCGACACATGAATCAAAAATACAAAAAGAATAAATAACAAACAACAAATATGAAGAGAACAAATTGTGTAACCTAATATTCGTATATTATTATTGTGAATTACAATTAAATAATTGTGGATGAAATTTCAAGTAAAACTGATAACAAGAAACCAACCCCAAAAAATTTAGAACTAAGCTAAGTGTTAAGGGAGTTTATATTTGCGAGAAAAAAAA-----AACCTCCTTAATCAATTTTAAAATATATACA---------------------GATGGGGGATGGCTGCACGGAGGAAACGA-AATGGAACATAATTTTGTAAATTTTTTAAAAAAACAACTAACAAAAAAAGGAGACAA
>CG4272 2368982 2370114|2531 chr2L 2368948 2369234 scaffold_25 570956 571264 - 282|34 336
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ATCATAATTCCTGCTGTTTGCTTTCTAGTCAAAATATTTTGAGTTGAACCAAGTGCCTCAAATTGTAAATAGA---CTCAGTTTCTAGCCTTAAAACAATTTTTTTTTTGCACTCTAA----ATATTAATTAAATATTTTTAAAAATTATTTTAATACTTTTTTTTTGTCTAAGA-----ATTTATTATTTTTTTTTTTTGCATAATTTAAGTGAATTTTTTTTTTTAGTTTAAGTTGAACTTGAGACCAGTTTATAATATATAAAA-------AATATTATTTTAAGCAAATAATTTTTTTT
>CG4272 2368982 2370114|2532 chr2L 2369358 2371633 scaffold_18 2302151 2304540 + 59520|0 889
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GCATAGTTTTTATAGCAATTTTACACAGCAGAAGACTTAATAATTGTTTAAGTGGCAGCG------------ACGGAATCAAAATCCA--TGTCTAGGATTTATCATTTGTTTCTGGCCAGGCACAGCCTCGGACGTACC-------------------CTACTTCAGTGGCGGCAGGCGTCCATATATGTGCATATATGTAAAATGCATGCTCGCCTTGTATAAATCAGTTTTAATTGTTATAATTCTAATTAGTCT-TAAGCAAACATTGTAATTTAGTCACTTCGTTGATTAGGTTTGGATCCTTTATTTTTCTCAACAATATATCAACTAATATATATATTTACTTTGGCAATTCCTATTGAGAAAATC----------ACCTGCTACTTCCCATTCACGTCTAGCGTTGTTTCAACGAATTTAATCCAGCTGAGCCTTGAACAATTCATGAAAAAAAAATCATTAACTATATATGCATAATTAATTGCAAATATAATTTTATTATTTTTTTTTTTTTAACAGATTTAGCTC-TCAACTAATTTATTGCGTTGCATTTACACTATTTAAAAATATCGTAACTTGCTTTATTTTATTTTTATTTTTCCTATTATTTTCCTGTTGGGCTTATGCCGTCTGCGTT-AAGTATTCATTTAGTTCTTAAGTTCGCGATTT---GACCTTAGCAGATTAGCCCTAATGAACCAATAA----------AAGCAGCAACAGCAACAACAAATATAACATTAGACATGAATTAGTAATATTTATGTATATGCAATTTAATAACAGCTACAAAAAAAAAAAACAAGAAAATAAATAAATAAAACAAGAAGAGAAAAAACGTAAAATGAACTAAATGCAAGTAAAAAGTAAATGCAA
>CG15390 2375640 2375696|2537 chr2L 2374709 2375718 scaffold_2 6589603 6590645 - 35003|969 1026
TGTTACGTTTAATTATGGTTATAGTTTGT-GCCAGCAAATAAACGCTTGTAAAAATA-
TTTTCTAGTTACTAAATGATATATTATACAGTTATTTAATTAATGATTGCCAGAGAAT
>CG9866 2380178 2380514|2540 chr2L 2378287 2380497 scaffold_2 236297 238822 + 50554|2254 2646
TCTGAACCGATGGGGAAGGTCAGATGTGCGGACACGCATCCCTA---------------GTTATATGTTTA----------------------------TACAATACCATGCTATTATGTGCAGCCTCTTCTCTAATGCTAAATTAA--ATTGTAATAATTTTTTAAATTAATTCTTC---ATTTTTTAAAAGTGATAATTATCTTTTAGTTATCTATTAGTTGATTGTATGTAATTCTTTGTTTAT---TCTAATTAATTTAACAATTATACATATTATTTTTCGTG----GCTA---AGCATTATGCTAGGTACTCGTAAATCATTATTTATACACGCTGTAAACTTTTTAA---------------ATACAAGAGCATGCCTAAGTTCAA
---------ATATACATATACATATACACACACACACACATATACAATATACAAAATATGCTATATGCAAAACAAATAATTATGATTATCAATTATGATTATGATACGATACGATTATGTATA-------CCCTAGCGCTATGTTCATTATTTTACACTTTTTTTAAATCAATTTTTTTCATTTTTTTAAAAGTGATACTTAGTTTT--------GGCTACTTGATTGTATGTAGTTTTCTGTTAGTCTATGCACTAAGTTTAAT-----------TTAATTTTGATGTTAAGCTAAACAGCATTATGTTGATAACCC----CCCCTAATTTATACA--GTGTACACTTTTAAATATAACTATATATGTATACAAATGCATGCATACGTTTAA
>CG9867 2383005 2383077|2542 chr2L 2381162 2384787 scaffold_2 6640400 6644248 - 103018|1908 2012
ATTGCCTCAA----TTGTGATT--------AAATGCATTTATTTTGCTTTATGCCAGACCCAAAATAA--------------------ATCGGTATTATACAAAA
TATAGTTTAGCGCTTTGTGATTTGTTTAACCAATGCATTTATTT--ATTTAAACTTGAACTGGTATTATCGATACAATTATACCGACCATCGATAACATGTATTA
>VGlut 2407699 2410668|2567 chr2L 2406901 2407987 scaffold_2 6677890 6678940 - 38883|816 1129
TGGGTTC---GCCATAGGTCACTGATATATATCATAGCTTTTAGTTGTAGTCGGAAATCGTTTGACGTTTATTGTTTGTTCTCGGTGTGCCGTTAAAGTTTTCCCCCCTTTTTCTCTCTATTTGTTGAGTTCCAT---CGATGGAGGGATCCGTGGACCTTTCAGAAGTATATAAATATATAACTAAAGAGTAACGAATTTGT-----CAGCGAATAAGGGGATTCCACA-------TGCCACACTAACACAATGAAACTATGTACCTAACAGAGAAACTACATAT-------GCATACACAGCAATACCGATA
--GAATCAATGCCACAAT---CTGATATAAAT--TAGCTTTTAGTTCTAGTGCAAAA-----AGCCGTTTATTGTTTGTTCCTGATGGG--GTTGA--------------------TTTGTATATAAGATACTATACGCGATATATTTAACAGCAAGACCATTAACTATTCAGCAACTTCAGACCCGAGTCTAACGAATTTCTACATACAAAAAATAACGAAACCAAACAAAACTCTCACGACACTAACACAATGAAACTATGTACCTAACAGAGCAACTACATATTGTACGCGTATACAGAACACGAAAGATA
>VGlut 2407699 2410668|2568 chr2L 2408042 2408572 scaffold_2 6679327 6680035 - 11085|0 725
AAAGCATATATAGTATATACTATTAGGGTCTCGCTTACGCGAA-TTTCTATTTACAAGCTCCGAAATCGAAACTGCAACACAAGATAGGGAAAGAACTGGAAATATATACTCAACACTTGTGTATATCATAAATC-ACATAATCCACACAAAGCC------------------------------TATGATAATTATATT------------TATATCGG-----TATAATCGTATATAC----ATATATAGCCAAAGATTGTTGTTGA----------------------------------------ACTGCGAACTGCAAGTTTTATTACCGTTGATGATATTATCTTCTGTGTAAAGAGAACA---------------------------------------TTTTAATCAAACC------------CAAGCAATTGTTGATGTTCGGCACGAATGATAA----------CCATAAAAAGAACTAGCTA--------------ATCAAAAGTCATATGAATACTCTGTTAACTAATTACTGTT---TATGTTTGTTGATATTATTTAATTCATTGATATTAATGCACCGTATGCTTTTGTGTTTAACTA-------------ACATGAGCAAGGCATGATGTAGGTACTAAAAATAATACTTA-----------AGTAGATAGCCGTAGGCGCATATAACCTCAGACTTGGTCTTCATATGC
AAATCAAATATATAGCCTACTTTTAAG-CATCGCTTCCGCGAAATTTCTATTTACAAGCTCCAGCAT----ATTAATAAACAA-ATCGAAAAATTAAATAAAATA-ATATTTGACATTTGTGTATATCATAAACAGACATAATCCAGACACAAACACAGCACGTCTCAAATCGTTATTGAAATATTATTATAAATAATTTAAAACCATAAATTATATAGTCACTTTATAGCTACATATACTATAATATATAGCGAATTATTGTTGTTAATTATTCAAGTAGCTAAAACATAACAGAAAATGAAAATGAAAGTGAAAGCTGCAAGTTGTATTACCGTTGATGATATT--CTTCTGTGTATGATAAACACCCGGCTCTAAATGTCATTTATATCTAAGCATTAGTAAATTTTAATCTAAACAATTCTAAACAATAAGCAATTGTTGATGTTCGGCACGAATGATAAACTCTAAAACCCATATAAACAAATACTTATGCATTATATAACCACTATAAATCAGATATACATATAGTTATAGTATTTTAGTTCGTTATGTT-GTCGGTACTCTTATATACACACATATATAT-------ATGCTTTTGTATTTGCACATTGGTTCAGCAGGACTTGAATATGGCATGATATAGGTACTAAAACATATACTAGCTTAGTCTGATAGTAGCTAGCATTAGACGCCAATAACCTCAGAATTGGTCTTCATATGC
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>CG17302 2660404 2660830|2890 chr2L 2660707 2660930 scaffold_4 4734709 4734983 + 65|0 139
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AAAGAGCTTCGAAAGATCTTTGATGATTAAAAGTAACCCATTCTAAAAGATTGGAAATCCCCAATTTCTGGTACAGATAA--ATAAAATGTTTTCTAAATATCTTTGAAAGTTTTTATAAAAGCTTAGCTAAAGCATTAA
>CG31690 2719343 2719435|2960 chr2L 2716924 2719511 scaffold_30 1387727 1390545 + 36000|2714 2842
AAATACACTGCTAGAGG----------AATGGAGAATG-----------TAAATAAATTTTAGATAGAAGAGAATATATATTT------TGTAAAAATAAAAAAATGCAAT-GATTGA--------AAG
AGTCGAGGCTCTATAGGTACTAGTTATAATCGGTAATAGTTCAGATTTCCCAATCAA--TGAGAAAGGACAAAAACTAAAAGTGAAACATGCAAAAATAAGAACATGCGATAGATAGACTATATATAAT
>CG31689 2739501 2739833|2979 chr2L 2738440 2740789 scaffold_30 1414956 1417371 + 67628|1076 1446
TGGGGGGGGGGGGGGGGCTTTTAGTATTCGGCTTAATTTGAATCGAATGTGATTTTATGTTACTTATGTATGTATGTATATCGCTTAGTTGCAAGTAAACCCAATCTTTTATATACCGGCGTGTGATACTTTAACAAATGCAACGGACCATTGCAATATGCGAGTGCCAACTGTTGCGGCAACCTCTAAGCATAGCGAATCATAGTTTTTATACTGTT-----------------TATGTATGGATAACTAAC---CTTTATATATGTATGTACGTGTAGTTATTTGTCTAGTTAACCTA-----------ATTGTAAGCGAGACCTGTATGAACAAACAAAATAAACAAG-------AAGCTTAAGCAAA
TTCGTTTTAGTGG------CCTAGTATTGAGCTTAATATAAATTAAATGTGATTTTATGTTACTTAT--------------CGCTTAGTT-CAAGTGAAC----TATATTTTACATCGGCGTGTGATACTTTAACTAATGCTACCTGTTGCTGTACTACATA-----------------CTACGTGTAAACATAGCGAAT-ATAGATTTTATACGGTTATACAATTTTTCATACGCATGTACATACATATAAAGGACTATACATATGTATATATGT-----CATTCGATTAGTTATCAGATAAAATAGGACATAGTAAGAAAA---TTGATGTACGAATAAAATGGACAAGTTAATAGAAAAGAAACTTTA
>Hrs 2743086 2743377|2982 chr2L 2742855 2743111 scaffold_30 1419576 1419909 + 8694|309 334
TCCAAGAGATGTTATTCCATTTGTAT
ACC-AGAATTGTTGCCGCTCTTTTAT
>CG2843 2746882 2746944|2985 chr2L 2745259 2746965 scaffold_30 1423103 1424744 + 56492|1682 1747
ACTAGGATT---CCTTTATTTCGTATGCATTATATGGTTCCGCAACAAATAGATTCAACACTTTTT
ACAAACACTTGGCCGTAAGTCCGTATTGTTTG-------CCTTAGAAAGTAGATTCACGA----TT
>CG9894 2756295 2756606|2994 chr2L 2756241 2767835 scaffold_30 1435598 1447459 + 318105|54 374
TAATAATGTAGTCAAAAATACAAACAAAAACAAACAAAAATTTAAATTAATAATAAATAAAAGTTACAAGCAAAAACAAAACAAAAAAAATATAATAATAAACCAACAAGCAGAAAATAAACCACAACAAGGAGAAAATGAGGAGGAGGAGGAGAAAAAAAC-CACAAAAAAATCGCAAAAGTATATAATTTTTATGTTTAAGAAATAATTTTTTATTTCTTACCTTATTTTAATTGTATTTTATGTGTACTTTTTTTATAAAAAACTACAAAA--------CAAACAAAAATTGTAATTGAAGGCATTTTCGTATAAACG
TAATAATGTAGTCAAAA---CATAAAAAAAAAAACAAAAGCTAAAA----------AAAAAAATTACAA-----AACAAAACAAACAAAAATT-----TAAATTAATAAT----AAATAAAAAGTTACAAGCAAAAAACAAA-------ACCAGAGAAAACCACACAAAAAAATCGCAAAAGTATATAATTCTTATGTTTAAGAAATAATTTTCTATTTCTTATTTTATTTTAATTGTATTTTATGTGTACTTTTTTTATAAAAAAATACAAAAAAAAAAAACAAACAAAAACAAAAAC-AAAGCAATTTTCGCATAGGGC
>Trn-SR 2763212 2763610|2994 chr2L 2756241 2767835 scaffold_30 1435598 1447459 + 318105|7644 8088
TCAGGGAGATGCA-------TGAGTTTGGATTCGGATGATT------------CTGTACATTTTGAATGATGTAT--GTAATGTGGCAAGGGTGCTAG----GAATTTTGTTAA------AAACGCACGTACCCCTCTATTTATAATATAGTTGAATCGATTGTTTGACGTAATAAGTTATATATAATTTGAATTGTACATTTTGAGTGCGG--TCAAGAGATCCTCACAGAATTTAGCAGTAAGTT-ATTTACATCAGCGTGCACTCCTAGCTCTAAGTTTAAA------ACCTAAAATGACTCACAAACAAGCATAGGCATAAGGCAAACCATTAAATATATACCATTTAGATATAATTGACCACATTTGTTC------TGCAAAACACTTGAGTATAATATTTATTTATTGAAAAAGCAATCACAAGACATTGGGCTGGAAG
CCACCAAAATACACCCACTCTGAGCAGAGATCCAGAAAATTATTTATGATGAACTGTACATTTGAAATTATGTATACGCAATGTTGAGCAACCACTGGATACAAGACTTGCCAACTTGCCAGATGCATGCGATCGTATTTATACATTTTACTTTAGTTGGTTA---------------------------GCGTTATTATTGCTGCGTGCGGGTTCCAAAGATCCACACGTAACATA-CAATAAGTTGATTTATTTAAGTGCAC---CTTAGATTTTAATTTAAACAATTGACCTAAAATATATGCTAAAAATGTTTAATGAC----CACAGCGCTCACTAATGTCCACTCAG-----------CCTCTTTGTTCATGAATTGCAAAACTGCATATTTTGAAATTTTCTGAT-----------------GCGTCTGGGC------
>aph-1 2767091 2767154|2994 chr2L 2756241 2767835 scaffold_30 1435598 1447459 + 318105|11733 11816
ACATACTCCTAGTATTAACCGCCT---AGTTAATAGCTTTTGT-ATAACATTA----------------TAAAAAAAAACAAAT
--ATAGTATTAGAGTTAAGTGCATTTCAGCTAAAAGACATTATCCTAACTTTAATTATTTTAAGAACTGTGACATTAAAACGAC
>Taf10 2768544 2768613|2996 chr2L 2768533 2768666 scaffold_14 734450 734625 + 688|11 102
ATTTAGTTAAGCTCTAAAGTTTTGAATTGGGCACACAAATATA----------------------GCTAGTTTTCTTCAAGTTGTAAAAACA
GTTATGGGAAACCTTAAAACTCATAAG-GTTTATAAAAATATACATTTATTTTAATCATTCTTTAACAAACTTTTCTTACTGCCTGACAGGA
>CG2862 2770730 2770904|2998 chr2L 2770132 2771747 scaffold_18 1955974 1957519 - 42637|601 775
GAAGCAGCCGATGGTGCAGCTACCAGATCCAAGATCATTTACACCACAGAGAATTTTTGAAATAAACTATGTGAAATGCTAAAACAAGTTACTTTAAATTCGCCATGTCCATAATTCCTAAAGAAAGCTTCGTTAGAAAAACGTAGTGCTACTTCATTTTTCCATAAATTTTATT
GA----------------------------------GCTTA----------AATGGCTGAGTTAAA----GCGAAACAGAAAAAC-----GCTTTAAA--------------------GAAATAAATACACCTTATTAAAAC--------------------------------T
>Alp23B 2811760 2812147|3025 chr2L 2811800 2812033 scaffold_7 1442777 1443024 - 4163|0 268
CGGACAAATTAGACGTAGACTCCATTTCGCTCCATTTCAGCTAGCATCCAACCATCCAACTACATTTCTCTCCAACTAATTTAAACTCATTTTGCAAAGCATTTACATTAGCGTTGTCATTTAATCGT-AGTTACCTGTAGTGCCTGAGCTGCCACTAGTT-------------GATAGTTAA--------AAGCTAAAGTCAATGTACTTAAGCTCTCGAAGTATG-------------TAGGTAGTTAGCCAATGGCTTCAATTAAT
CGGACAAATTAGAACTAGTTCACA-----------TTCGTACAGCACCCACT-------TCATAGCTTTCTGTAATTAATTTCAATTTATTT--AAATTCATTTTCAATGCATCCGTAATTTAATCGTAAGCTAAATAACTTAAATACGCTGCCATTAGTTTTAGTCGCAGTTAGTTAGTTAATTGAGTTGAAGCTAAAGCGAATGTACTTAAGTGCTCGAACTATGCTTAACTTAACTATATTAAGCTAGCCAATAA-TTCAATTTAT
>CG2973 2839454 2839549|3053 chr2L 2838032 2839539 scaffold_14 193809 195153 - 18288|1556 1641
GTCCTGCTCGTGGCCTACGCACTCCTTGTATATTCCTTCATTGTGCTTCATCTATTGCTAGTTTTTTAAAAAATAAATACAAATTG
ATGA-GCTCATGTTCTGT---CTGCTAATAT---------------TTTACATATTTCTAGTTTTATAAATTTTAAATTATAACTG
>oho23B 2856641 2857000|3077 chr2L 2856081 2856749 scaffold_14 1166415 1167077 + 25672|585 696
GCGTGGCGTACCCATAGCTAGATTTTGATTTGGTAATAAAGCGATTTCCCTTTGTAATTTAACGTATAACGTTCGAAAT---TGTTTTATTTACTTCTGGCATAAACAATGG
ATAAATTGTA--CACAACAA------GAATTGGTAATAAAGTGAATTCCTTTTGT-ATTTAACGTAAGGTCCACTTATTTTGTGTTTTCTTTTAAACCGAAATGAACACTGG
>CG2991 2867668 2868553|3085 chr2L 2865591 2868676 scaffold_7 4229542 4232674 + 77193|2202 3215
GAGGCTACCACACACAT---CAGCTG------AACCCCCA-------------CAGACAAA--------ACATTACTTACTTACTTACCTAGTTTAGCATGCGTTTTG--CACAGGTTTTGCTCAATGCTCAATTATTAGTTTACACATCACACGCGAGGTGGGTCCTAGCACCCGCCTTTCTATCCTCAACCGTGTACATAGGTTTAAAT---CTCTAGCGAGTAGACAAGAAGAGTAGCGAAAAGCGTTTCGATTAACGAGTGAATTTCGTCTCTCAAATTATCATGCAGATTTCCAGAAGCAAAGTGTATTACAA------------------------------------GAAGCCAAATA---------TTACGTAGAATAAGTGTAGGTCAGTATCAATTGCGAAAGCGAAACGGAAACGGAAACAGAAACGAGAACATCCTGAGATTATGATTAC-----GAACGCGTTGCCAAGTAGCCTGAAGAGCGAATAAGCGAGAAGATAGTGCTTAGAT-------GCGCCAGTGA--GTCAGTCC--CCATGCTGATTTATAGTTTATAGTTTTCTTTTATTTACACCTAAATTATGAAAGCATTTTGATTTCCTTCATTT---CATTATCGGTTT-----CATCCATGGATGCAAACAAGAAGCAAGCAAAACACGAGTACTTGGCGAATATTAAATTAAGCAAACAAGTTTTTAATTTGTACTTGATGGAAATACGTTTCTTATTAACCTTTAAGTTTACTCCTTAAGAAACTGATTTGTATAAGCTGCGCCCATATATACATACACACGAACATATATAATATATATATATAAA------------TTTTATTGTAGTTACTACACAAAATTTGTCAAAGCAAAGAAA-----AACAAAACAAAATCCACAAAAGGAAAGAATCCAACATACAATTTAAGTTACCATACAATTTTTGTGATAAAACTA------ACAAATAAAATACAATT-TATAAAACGCAAACT
GGAAACATCACACCCATACACAGTTGCATACAAATCCGTAAGATATATATATGCAGACAGACGACAGACACTATACATACGATTTAGTTTAGATTAGCGCCCGTTTAGCACACATATTTTGCTCAAT--------------------ATCCCCC-----------CCTAAAATTCTTCTTCC--CCGCAAACTGTGTACATAGGTTTTAAGTCATTTTAGTGTTTAGGAAAAACGGTTCGAAAAAAAA---------AACGAGTCAATTTTGTCTCTCAAAGTAGCACGCATTATTCCAAGCGGTACATGTATTAAAACGAAAACGGAAGAAAGAGAAAAGCAAAAGCAAAAGCAAAGCCAAATATTATATAATTTATGTACCACACATATAAGCCAGTATCAATT-----------------ATACACAAATTATCGAGAACGTCTTGAGATTATGATTATGATGAGAACACGTTGCCAAGTAGCTGGAGAAGTTTTTAAAATTAAATA---CGCGTAGGTAACAACGGCACCAGTCAATGTCAGTCTAGCTGAGCATGTTTGTAGTTTTTAGAGTAC--------ACGTTAAGTTCTTAAACACGGCACAGCTAAGTTTATTTGGCGAATATTAATTTAGGAACACACACACACACACACATTTATATACAAAAATACTTGTATT-------CATTATTTT----------TTTTTTAATTTGTATTCAACGCGAATACAGTTCGCAATACACCTTAAGCTTATACTTAACAAATCTAATT--TATAAACCATTTATATATTTATTTATATATATATATATAT-ATATATGTATGTAAAAAGCGCTCACATTTGAATTGT-GTTATTCAAAGCGATTTTGCTAATCAAGCATAGTTTCAACAAATTATCAACAACAAATTGAACACAACATATTTACACCTTAAGCTTATATAC-ATTTTTGTGATAAACCAGTTTAATATAAAAAAAAAACATTTATATCAAATAAAATTC
>CG8813 2870601 2870649|3086 chr2L 2868773 2871697 scaffold_7 4234325 4237368 + 120270|1935 2032
TCGTCCAAAGA--------------CTAGTGCATCTCG-----------------------------AGTCAAATAAATAAAT------GTAATCCCT
TAGTCTTAAAAGTAATCTCTAAACCCTGTTGCTGCTCGGTTTGTACACAACTGTTTGATATGTATAAATTTAAATTAACAAATCGCAGCGTGTTTTGT
>CG8814 2876363 2876410|3090 chr2L 2875025 2877390 scaffold_7 4241007 4243348 + 53252|1489 1538
CGCAGGAAAGCTATACTTGCGGAGGGCGGAAC--ATGTGGTAGTTAAATT
CGGCGCAAGCCATTA-----GAATAGCTTAATCGGTATGGTAGTTAAATT
>CG8814 2876784 2877163|3090 chr2L 2875025 2877390 scaffold_7 4241007 4243348 + 53252|1915 2329
TTATCTTCGGTTACGGGCACGAGCTTGGTCTTTAGCTTTCTTCTATCCTAGAAAGCGCTTCAGTTATTGTAC--AGAGTTGGCCTTATTTATACCTTACTTACCCCCATGGTTATCCAGTTGCAATATCTCTACCCCCTTTTGTACACGTCTATATATGTATATTGAATGTATATTTATTTCGTACACACAAATCGCGACCTTTTTGTCACATTCCCCATCT-------------------GATTTAGTTCGTAAGTCGAATGTTTTGGCAATTTTGTCCAGCAGAAGGCGAGTTTTAGCC--ACCTGAAAGC---GCCGATCTACTGAAA---------ATACGGTTGTAAGCGTATACTTTATTGTGCATTATTTGTTGTTAATTATAATTTTTGTAATAAAGCAAAAAAAAA
ATACTCACGGTTATGGGGACGAGCTTTGTC--TGGCTTGCTTTTATTCTCGAACGCGTTACACTTCTTGTACAGAGAGTTGGCCTTGAATTTAGTTT-------CATAAGTTTAACCAGTTGCAATATGTATATTTTTAATGTAGTCTGTGTGTATATGTACTTTTTATGTTTGTAACAAACGAGCACACATA---AGCTATTAGTGGCACATTCCCCTTATCCTTACCTTACGATCAACATGTTTAGTTTGTAAGACGAAAGTTTTGTGCATTTTGCCCAG-GCTGGGCGCGCTTTTGCTTGGTCCCACAGCGTTGCCTCTTCCCTGCGAGACTGGGGCAAATGGTTGTAAA---ACAATTTG---------ATTTGTTGTTAATTATAA-TTTTGTAATAAAGTCATGTAAAA
>betaggt-II 2880472 2880708|3094 chr2L 2879241 2880671 scaffold_7 4245138 4246479 + 63924|1231 1462
GGGGATTCATCGATTCCACA--------TGCAGCCAGTG---CGTAGCCAATGTGTAGTGCAGCAGACCTCTGACGTAT---------TCCCACGCTAGCGTTTCTTAGTTTTATTTGTAAAAAGACCAAAATTCCA-------TAGCAGGAACACCCTTTCTTTACTCATTTTCTTCGTTATGCATTTACCCCTCTAT-----TATTATTAAATATAGAATATTTTGTATA
GTAGG--CATTGATATTAAGACAAAAGCTATAGCCAATGTTATATGATTAATTTATAA---AGCGGACCTCACGCGTATTATGCTACCTTTCAAGCAAGCCCAAAACAGATTCAAC--TAGACAGATTCACAGTTCATTTTTCTTTGCATCTACTCGCATTTTGAACAATTTATGCTTCTTATGCATTTACATATGTTTAGCTGTATTTTTAAATACATATAATGTTTCATA
>betaggt-II 2880472 2880708|3095 chr2L 2880672 2883457 scaffold_7 4246678 4249589 + 105273|0 36
GCGAACGAAAATCAGCAATAAACAAATATTTTACTTT
GCCAAT-----TCGGTGAAAAATAAAAAATTAAAAAG
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CGACAGCGGCAATATCAACCGCAAACGCAACGGAAGCGTTGGCGGAGGCGGAGGCGAAGGCGGAGACGGAAGC
CAACGGAGGCAGCCGCTGTTCCGGATCCGGCGAAGGGGTACGCGGTGGCAGCGGCAAAGGCGGTGAGGGTGGC
>lilli 2952226 2953077|3186 chr2L 2952304 2952598 scaffold_26 1340548 1340797 - -809|0 299
CAAACGTGTCTAAATGAAAGTCAGGCCAAATTAGCAACTATTATCTACTACAAGCTACTAATTTAGTTAGTCAAGATGAGGAGGAGGAGTAACGAATGAAATGAAATCGAAACCAACAACCTTC-CAACAGAACGATTATAACCACA---ACAAAAACA-ACACAAAAATTTGATTTGTTAATACTTTATAATTTATATATGTATGTAATTGTATATGCACACCATTTACTTATTTCCTTATGCTCAATTTTCGATTGTTTAAGCATGTTAAGCTTTATATTTATGCCTAGTTTTAATTG
GAAACTTGTAT---TTGTATTTAATTTAATTTAAAAATAATTATATCATACAATAGACTAATTTAATTATT-----------------------AATTATAT-AATTCGCGCGCTTCAAGCGCCGCAACTGGACAGATATACACACACACACACACACACACACAACACACCGGGACACAGACACAGAGACACAAATATAAATATTTAGTTGCATGACTTTAAAAATAACT------------ATCCATTAATAACTGTATAA-----------TCTATATAGATAACTAGAGCTAAGAT
>lilli 2952226 2953077|3187 chr2L 2952613 2953031 scaffold_14 2321008 2321338 + 986|0 426
AAAAACAAAAACACACATTAAAAGTTATATTAGCTCTACGTCTAGTCTGTAAGCTCAAAAACGAAAACCCAACCAGCCCACCCCCCCCCCCCCCCGCCCACCCTACCCCCTTTTCCTGTTACCCAAAAACATAAACATTTTAGTTGAATTTTGTTTTCGTATGCGTACAGTAAGGAAGATGAACGGCTTTTTA-AATTGTTTAAGTTTTAGTTAATTTTACTTTGCAGCCTTGGTAAAGAAAAATGTTAGCAA---ATATA-ATTATACATATTATGGCATATATAAAGAAAAGTTATAGTTATAAAT-TCTTTATAATATTTCTATATGAATTATGTTTAACGCAACTATT--TTATTAATTTTAAATTAATTTTTAAAAAGCAATCACAACACGTTTTTAGAACAAAATACATGAATGAAAACAA
AAAAACAAAAACAAAAAATAAAATTAATCGAAAT-----------------------AAAAAAAAAACTCACCTTCTCCAACCGCCCCCGTCTTCTTCCAGCCTACAC-----------------AAAGCGCAGCAATT-----------------------------AATAAAAATGTTAACTCGCCTCCTACAAACGTTCCCGTCT------------CCTCCCAGCCCTCATACAAACCGAAATCAACAATTCACATACATTGTACATAT-ATCGGAAATATACATACA---TAAATATATAAATATATTTTTAATATGCCAAAAAGCA--AAGCGAAAATCAAGTTATAGTCAATAAGCTGAAATTCGTATTAAAAAAACA--TAAAACA-------AAAAAAAAACAAAAGAAAAACAACAA
>Rbp9 2963387 2968441|3198 chr2L 2962948 2963724 scaffold_14 2335521 2336368 + 32804|444 874
TTATTAACCAAGTTGGCTGCTGTTGTCAATGCCAATGCGGCGGCGGCAGCTCTGGCGGCCAATGGTCTAGTCCTCCATAATCATCACCACCACAGCAACATCGGTAGCA------TCAACAATAATAGTAACAAC------AGCAACGGCTGCAGTGCAGCAGCCTTTCCACTTGGCAAATACGTTAACC---------------ACAGCAGCAACAACAGGCAGCACAACATCAACAATAGCACTAGCAACACGAGCAAACAGAAGCCAGCCTCCACGAGCAACA-----------AGCAACAATCAATGGC-GCCAC---------------CTAAGAGATTAGCGAGCAGCACTGCTGCAACAACGG---------------------------------------GGGACTTGGCCGCAACTGCTGC
TTATTAACCAAGTTGGCTGCTGTTGTCAATGCCAATGCGGCGGCAGCGGCGCTGGCTGCCAATAGTTTGGTGCTCAATCACAATCACAACAACAACAATAATTACAACAATCAACACAACAACAACAGCAACAACATCTGTAGCATCAGAAACAACAACGCTGCCCATCAATTTGGCAAGTATGCTAATCACCATAGCAACAACAACAACAACAACAACAGACAACACAACAACAGCAACCAAACTAACAA-ACAA--AAACAGCAGACAACTTCAAGCAGCAGCAGCAGCAGCAACAACAACAAGCACTCGCTGCCGCTTTTGGCTGGAATAACCAAGGCAAATGCAACTGCAACTGCAGCAACGACAGCCACTGCAAACAATCGTCTAAGCAAACCACCAACAAGCAGCAACAACACCATAACAACATT
>Rbp9 2963387 2968441|3199 chr2L 2963725 2963826 scaffold_6 5618871 5618976 + 1805|0 109
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CAGCAACAGCAGCAGCAGCAGCCAGTTGGTGGTTGGAAAGGGGGGAGGAGGTTGTTGTCGTCGGGCCACCCCCAG--TTGTTGTCAT--TTGTTATTGAGCCAACAAAAA
>Rbp9 2963387 2968441|3200 chr2L 2963827 2964735 scaffold_14 2336501 2337620 + 10355|0 1185
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CATATTGAAAACTTCCACGAAATTCATATACAATAAGCCACAAAATCATTTCGAGCTACTGCAACAGCAGCTGCAGCTGCAGCAGGAATTTGCCCAGTTCCTCACAAATGTGGCAAACAGTGCAGCTGGG------AGCGGTGCTTCTGCCACGTCCACTCACAACAGCAGCATTGGCAATGCAGCCAGCGGCTCCAATGCAGCACGCAATGTTGCTGGCAACACGGCATTGCTGGGCAACTCAACAGCAACAGTTGCTGGCAACAAGAACAATAACAACAGCAACAACAACAGCAACAGCAACAGCAATAACAACTACCAATCCTCATTTATGCCATCCTGGTCAAATTGGTTCTTCTAAATGATACTGATTAGCAGCGACTGGTAAATCCCTTTTTATATATTTTCTCTATTCAATTATTTTTTTTTATCTATATATACACATATATATTCATTGTTTTTTTTTTGTATAATAATTTAACAGTTTAACTTTTTGCAAATGTTTTTTAAATTTTTGAGTTAAAGTTTAAAAAAATACTGCATATACTCACTACCTATTCGAGTTAGGAAAATTAGGGTATGATGCAATTTTTATTTCGGGGTTTTTTTTCTCGTGGTTACGTTTAACACAGACATTTTTGAAATTTTGTTGCTACAAATATGAAAGTTATATTTGTTTAATATTGTTTCTTAATTTTGTTCTCTAAATTCGTTAAATTCAGTTTTTCTACCGATTAAAAGGCAAAACTCTGCCATTATATTTTTTTACGAATACCCTC-ACTAAACACACACACACACACACGTCTTTTGTATCTGTGTTTAATTTGCACTAACATCAAAGTCTAGTCGCCTTT-----AGCAAATCGCT------------AAAGCAACCAAAAATG-------TATGGTTAAGTTTTTGTTTGA-----AGAAAGCAACATACTCTAGAAATAGTTTAATAAATTTGGCAGAATGAAAAC---------TGAAAGGCCAAAACCACCAAAAACATGACAAAGA----GAAGAATATTTAAGTCTATTGATAAATGTATAAATACAAAGAAGAAAACAACAAAACAGAACTGAAATACGTTAAAAAAATAAAACGGCAACGTTTGGCATATGGTCGGAACCATTT-----------------AAAGAGAATGGCCCCAAGTTCG
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AGACATACGCGTGTTTATGTTTCATAAATCTAATGTAAAACTTTTGCTAAAAATAAATGGTGTA-TGCATAATACAACAAGTAA----ACCTTTTATTCTCCATTACCATTTGTTCGATTGCCCAGTT---AAACTTCGCCTAGCCACTTTCATACATATGTTAACCATTACCTATCCTTCGGCACTACACTTAAATATAGACTCTCTAAG---ATCTTAACAGGGACATTAGC--------ATGAGGGACAGA--------------------AAGCCGAGAGGAAGGGCCCACGAGAATTTCTTCAAATACAACGAATAAATATTTAAGAAAATTTGAAACC----------------AGCAAGTGGAAATGCAACACCTGTCGAGTCAGAGAGAGA-------------GAGAGAATTCAAATACAAAGTAACCAGCGATTGTAAA--------GCTTAAACAAAAGCCAGCTAA-----GTACGCTAAGCACGCCACTCCAATCGAAGTTAGTTAATATAACTAAAGACAAAGATCAGAACAAAGTCCCTCCCTAGACAA--GCAAGTGAGAAAATGAAATGAAAACTTACAT-----ACATAGA-----TGACAAAACGCGTTTCAGCCTAACGAATTTGTTTAAGCCCAA---CTCAACAGCAATAAAAAAACACAACGTAACGAACAAATTAAACAAATTGCCAAACTAAATAT--------------------------------------------------------AGCAAATTT----------------------TAATAAACAGTAATGGACATGGAATGAGAATGGTTGATAA-----------TTGAAGTT------------------------------TTTCAAGAGCCTGGC-------AATGACAAGTTATGACAAGAC---------AAGTTATAC-ATATGA-----TGGTGCTTCACAGAATTCCTTGTAGAAGAAGTTAAATGCA-----------------------------AAAAATAAATAGTATTTGTAATAT-----------GCAGTTTTATGTTCCCTGTTTTCAAGTTGATCCTTTC-CTTTAAAGTGCCGTGA---------ACCCATTA-------------------------------------TGGAAAAATCGAGATGTTACTCAACATT-TACTATGCTATAT-----CTCTCTATAAAATCTATAAC-TATTTATGAAAA--------------------------------CTATTACATATGATTAACAATATATTGATGTTGTGTATTGCAAATTTTAAATGTTTATAC--ATACATACATACCGCGAAAATTATTATGA----ATACTAATTCATGGCATGCGAATAACGGAAATCCATTTTCATGTATACGTCAAGTAAATTTATTGCATACTACTTAAAAC-TAATTACCATGA-------ACAAATTAT----ATATTCAAGTATATAT---ATTGCGATTATTAGGTATGTA--TGTGTGTAGTGCATAGAGAAACCGAAACGCCAAGCCTCCAATATTTGTAGAGCTCAACGGCTTTTTCTCCCCTACTCCACTAAATCTACTAGAAAATCCAGCAAAAAAGA--------------------------------------AAACCCCACATTACTCACACTCATGCGCAAAAGCTTGACTGAAATTAAAATAGAAATTC--------------TGGCTTTTAAGCGTAAGGTAAATTAGTCATAAAACCTTCC---------AGCAAGTCTCAAATGCAAGTTCAAGAAAACTCAACATAACGT----AAAAGCTATAAG--GAGAACACCAAATGAAACGTTTTTTATACAAGATGTAAAAAATTGAGGCACAATTTTTGGTGCATGCGTG--------TGACACGGCTGATAGCAGACATACATGCATAGACGTGAATGGACATGCTTCGACATGATATCCAGGCATACGCGGTTAAGTGAATGAAAAGCATAAAC---------AACAACAAAAAGCAATCGATTATATACATTTTTTAAGATG-AAATGTTTTATAAAT----------------------------GATAAATACA-AATGGAGGAAAACCAAGAAAGTATTTTAAAAATTTAAATATATACATGAGTAC--TATATACAAAATATTAAATTATATATACATAT--TAAATACTTACTG-----GGTAACGAACAAAAACACCGCACAATAATATACAAAACAAAACGAAATCGAGGAAAGGGAATGGCACGTCAAGATGGGAGAAACATACGTAAATAATAACAAATACCAGAAGAGAATGTTTAACTAAATGCAGAAAAGACT--------------AACGACGAATCGAGAAAACTATGAAACCAGCAAATTTATAATTTTTACATGGAAATCGCAATAATG
ATATATATACATATACATATACGAGTA----AATGTGTAACTCTTGCTTAAAATAAAGATCGTATTGCATTATTATATACTTAAAGACACTTTTTATT---------CAAATATTTAATTATTAAATTCACAACCTTCATCTAATCATGTGT---CATGTGTTAAAACTTCTCCA--ATTCCAAACTATGTTAAACTA-----TTTCTGAATCTATCCTGACGTGAACAGTAGCGAAATCGAATGTGCAACAAAAAATTACAAAATCTATAAACAAACCGAGAGCTAAATATACAGAGAATTT-TTCGAATACAACGAATAAATGTTTAAGAAAAATTTAATGCTATAAAGCCCATATAAACTAAATAGAATTTTAATAACAAT---ATCAAAAAGAAGTTATAACAATAACAAAATAAATGAAACACAAC-TAACAAACAATTTTAAAAAGAAATGACTTAAACAAAAACCAGCTAAAAAATGTA---TATGCACGCCATTCGAA--AAATTTGAGAAAT-------CAGAGAAAATCTCTAACAAATTCCCTCCCTAGAAAATGAAAAGCTAAAAACGTAACTCAAAAAGTACGTGGAAAACAAAAACAAATTGACAAAACGCGTTTCAGCAAAACGAATTTGTTTAAACCAAAAACCCAAACAGCAATTATAAAGGAACAAACAATTA--AAGCAAAACAAATTGCCAAATTAAATATATAAATAAAAACCCAAAACAAAAAAAAAATTAAAAAACTAAAATCAAAATTACAACAGAAAATTTGTATGCAGATGAAAAATTCTTATAAAAAAATAAAACGAGTGAAAAATAAAAGTGATTAAAAAGAACTGTTGAGTAGGAGTTATCGGAACCTTTCGACAAACGATATATGCATTTAAAAAGCCAGGCGAGAGATAACCGCAAA-TATGAGAAAATGTATGATCGAAGTTCTATAACATGAAAACATGGTGCTTGAGAGATTTCCTTGCAAAACTAGTTAAATGTACTAGTCCTTAAAACCAAAAACGAAAAGAGAAATACGAATAGATCTTGTTATATATTCTATTGAAATATTCTTTTATTTTTTTTTTTTTGCTTATACCTTGAGGTTTTAATCACAGTCATATTATTTTATCCATTAGTTTTCTAACCCCTAATTCCTGCGTGTACTTCATCCCTAAATGATTCGCAATGTTGGAACACATTAAACTATGCTATATATTAACTCTATATAAAATCTATAACTTATTTATAAAAAACATAAAAAAACAAAATCAACAACAAAAAAGTATATTATATATGATTAACAATATATTGATGTTGTGTATTGCAAATTTTAAATGTTTATACATATACATACATACCAGAAAAATGATTATAAATATATATTAACTCATGGCAT----AAATCACAAAACACTTTTCATGTATACGTCAAGTAAATTTATTGCA-ACTATTTAAAAAGTAATTAACGAAACAAAACCAAAAATGATAATGATATGTATGTATATTTACGATTACGATTATTAAGTATGTATGTGTGTGTAGTACATAG----------GCCCCAGCCTCCTAATATTTGTAGAGCTAAATGGCTTATTTTCACAAGCACAG--AACTCATTCAGAGACACCAAGTGAAACGAATCATTCATTCGAATCAGTCAGTCATTCGAATCACTTGAGACGCTCGAATACCCATATTCATGCGCAAATGCTTGACTGAAATTAAAAAAAAAAACCAAAAAAAAAACTCGTTGCTTTAATGCG--ATGTA---TAAGAACAAAACCTTCCAAAAGAAAAAAAAAAACAAAAACAAAAGATGAGTAAAATTTGAAGCAGGTTCAAGAAAAACTATAAGAAGAAAACACCAAGAAACCCGATTTTTAT------------AATCAGGCACACACATTTTTGTGCATGTGCGATCTGAATTGGAAAAGGGGAATGCAGA-----ATGCGTA-ATGCAATTAAGTA---------ATGATAACAAAACAAAACAAA--AAACAAAAAAAAAACAGCAACAAATAGAAGAACAACAAAAAGCAATCGATTATATACATTTTTTAAGATGAAAATGTTTTATAAATATAATATATGAAAAAAAAGAAAACTAAGAATAAACAAACAAAAAAAAAAAACCAAGAAAGTATTTTAAAAATTTAAACATATACATGAATACTATATATACAATATATTATATTATATATACATATTATATATACTTAACGGTATTGGTAACGAACAAAAACACCGCACAATAATATACAAAGAAAAATGAA-----------TGAATAATACGTAATGA---------------CAAACCGCAAAGGATCTGATAACAGAAAGTTAAACT-AATGCAAACAAGACTAAAGCAAAAGAATGAAAGAAAAGTGAAAATAACTAAATAACGAGCAACTTTATAATTTTTACATGCAAAACGCAATAATG
>Rbp9 2963387 2968441|3202 chr2L 2966737 2966784 scaffold_6 5619393 5619440 + 1835|0 47
TTAACATTTAAAGAAGACGAAAAACAAAGAGCATATCTTGAAAACAAA
TTAATATTTAAAAAATACGAAAATCGTAATACTTATTTTAAGCATACA
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GGAA-----GAGTATTGAGGAGGGATCTCAAGCAACGGAACGATATCGAAGACACAAAAAT-CGACAAGTTACCACAAATTTT-AACTA---------CCAAGTGAATG--------------------GCTTAATTACGGCACACTTTTATACTTTTACACCAAAACAAAAGAAACGAATCGAAACGAAACAAAAGCAAAAACCAAAGACGTATGTATAAA---TGGCGATCGATTTAACCGTGCAAAATCGTT-----TCTCGATGCACCTTCGCGTTCTGAAGCCAATATGGTTGTGCAAATGCCTGCAGACGCCACCGGAAACGGAAACGTCTGCAGAGCGCCCTCTTTAGGCGGCTTGTAAACGATGCAAACGTGCAACCCTGCAACCGCTGCATCGTTTACACTCGGCTTGAAATGTCTGTTTCTCTCACACAGATCACACACACAC-----CCCACACAGACACA-------------------CTCTCTTATCCTT--ACCCACTAGT--CTCACTTAAATGAATGTTGAATAGCAAGGAAACCCAGTAGTACCACGAGCCACTCGTGTGCAAACGAAACGAAAACGGAAGGAAGTCTAGCAGTTGCGATCTATCTGAGAAGTGTAATTGATGGCTTTTAGGCGTA-GCTACACACATACAAAGAACTGGCGCCCCCAGATCGTTTGAATTATCG
AAAACGAATAAATAACGAAAAG--------AGCATGATGATGAAATCTATAATATATAGATACGAAAAGTTACCACAAATTTTAAACTAAAATGAAAGCTAAACAAATGTAAAACGCGAAACATTCGACGTTTAAATATGGTACACTTTTATACTTTTACACCAAAATATAAG-----------GATAGTGCATACACATATACCTACGTATAATGTCAAAGATCTGGCGATCAAATT-GTCGTCACGTTTTGTTCGTCGTTTCGAGGCACATTCGCGTT-TGAAACCAAAAAGGTTGTGC-AATGCCTGCAGGCGTAAACGGAACCGGAATCGCATTCGGAACTGGTTC--------------------------------------CGACACCTGCAGTGCTC-------TCTTTAAATGTCTCTCTTACACACATACAT-ACATACATACAAATACACACATAAATACAAACAAAACAGAATACACCGCTCTCTCACTCCTAAACTCACCACTTACCTACTTAAACGAGAGTTGAATAGT--------------------CAAATGATCTGTGGGTAAAAGAAAC--------------------------CAACCTATTCAAGAATTTTGATCTAAGTATTTAAATGATGTGCTATACATATTTATGGAATAAGCTTCTAGGCGTAGTTTAACTAACTG
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AAGAACCAGCTATCGATCATATTGCAAGGAATCGAATAACATTTTGTAGTGCAAGTCATCAGTAAGTTGCGGACGGAAATACGCTCTTTATATGTATATGT---TTAAATGTTCAAGCAAGCAAGAAAT------GGAAACACTTAAGATATATTATAAATTAATTA-----AAACCAAATCTTAGTCGAAACGAACTTAGTCAAAGGTACTAATTTTAAGCACTATTGTTAAACGCAAGTCAAAAGGC----------------AACGGATGAAGGAATC--ACTTTAGCCAAAACGG----------AAACAAAAATATTGAATCTTAACTGAATC--TGAAACTCAGAAACTCTAGTGGCATTCGCTCTTTCAAGCTCAA------------CATAAGTTAATG---AACATA-TGAATTCCACATAACAGATTAT--------------AATAATTCAAACTTATTTATAT--TTGTCTATCGGTTAGCTT--GCATAATAC----------------ACTTATGCCACATAT-----------------TACATATGTATGAA---GAACTATGCAACCTTTTTTCTCGTCGTTATAAAAAATAGTCGAAATATTGGTGGACAGTATCGTATTGTAGTAGCTAATATGTATTTACCTTTAATCATCACCGAACAAAACAGAAAACAATTATTCCAATTTAATT--AAAGTGCATAAATTGTATATTGAATTACTGTCGTGTTCTCTCATATGG-----------------ACGCGAAACCTTAAAGTT------------------------TTTCTTCAAATTCGCATTATATTACTTAAAAGACAAAAACCAAGAAACCGAAACAAAACAAAATCACAATATTAAGTGCGGAAAATGTCAAGCAAATTTATATAGCATATTTATGGTATACTCTGTGCAAGATTTATTAAGAATCAATTATACTTCATTATGGATTACTCTGAGAATTTACAAACAACAAACACACAC---------TACACACGATGAATGAAAGCAAAAATTTATTCAAATAAAGCTATGAAATGATGTGTTTAAAAACT
AACAAAAAACTAACAATGAAAAAATATCTATCCAATGAAAATTTCGTAGTGCATGTCATCAGTAAAGTAAATATTGAAAGAAGCTCTCTCTCTATATGTTTGCATTAAATGTTCAAGCAAAAGGAAAACTAACAAAAAAAAAAAGAAGATATATTA--AATTAATTATGTATAAACCAAA-CTTAGTCGAAAACAACTTAGTCAAAGGTACTAATTTTAAGCACTCTTGTTAAATGCAAAGCAAGCAGCATAAGCATTCACTTGAAACGATTGAAGAAAACAGAATTAAAACAATTCGGATTCGAAGAAAAACGGAAATAATGAA---GAAAAGAATAAGTGAAACACAGAA----TACTTGCATTAGTTCTTTCAAGCTCAAGCTCAACATATGCATAATTTAATGTGAAACGTATTTAATTCAGCATAAGATATGATAAAAAAAAAAGAAGAATAATTCAAA-TAATTTCTATTATCGTCTATGGTTTAGCTTACGTATAGTACTTGAAGTCAACATACTAATTATGACAGATATATATATAAGCATATTTATATATATGTGTGTATTTAAACTATGCAG-TTTTTTTCTCGTCGTTAT-AAACATAGTCAAAATATTGGTGGGCCGTATCGTATTGTAGTAGCAAATATTTA-----ACTTAATCAT-GTCAGATAATAGAAACAACAATTATTCCAATTTAATTACAAAGTGCAT-ATTTATCTATTGAATTACTGTCGAATTCTCTCATATGGGCTGTGGATTTAATGCCACGCCCAACCGTACACTGACACAGTCACACACCTTAACCAAATTTCTTCGAATTTTCATTCAATTAACTTAA--ACGAAAACAAAAGAAAGAAAACAA---AAAACCACACAAATATGAAAACAAAAAACGAAACAAATTTATATAGCATATTTATGGTATACTCTGTGCAAGA-TTATTAAAAATCAATTAAACTTCATTATGAATTAATCTGAGAATTTAC-AACAGCAAAAACACACACGAACACACACACAAAATGAAGGAAA-CAACAATTTATTC-AATAAAGCTATGAAATGATGTGTTTAAAAACA
>gammaTub23C 2974605 2974862|3207 chr2L 2973426 2974803 scaffold_7 2186925 2188426 - 58668|1300 1514
TTCG------CTTGTGCCAGAAGAAATGCGTGCCATGCATCTTAACCAATGTATTTTAAAATG----TAATATTCTCCAATGACGATGGGATTCGAAATCCTTAAGTAGTAGTGATAAGACGATTGTTGGTATGACTCGCATGTATGTAAACGCTGTTTCGTCTTTTACGATATTTAA------CGTTCGTATTTCCATTGTTGCAAAATTACAC
GTCATAAACCCTTGTGCC-----ACATATGTGCCATGGTCAAGAAACCAAGTATTCTAAACTTGCTCGAATATACATACATGTGTGTGTGTTTT--AATTATTTATTAATAATTGACACGCAAGGATT-CTAAATCCTTCAAGTATTTATACAGCATAAATTGTTTTAAG-TATCTAATATGTTCGTGTGTATTTCTGTTA----ATAAGTACAC
>gammaTub23C 2974605 2974862|3208 chr2L 2974804 2975335 scaffold_1 4820732 4821205 - -1271|0 58
ATGAGATTTCCCGATCATGTTTAATATGTGACACATTAAATAAAAAACAGTTTTTAAAT
ATAA------TTGGAAACTTATAACGAAATACA-ATTAAGTGGAATA--------GAAT
>CG3165 2978354 2978501|3210 chr2L 2977140 2978490 scaffold_7 2188933 2190248 - 27020|1266 1409
CAAATTCTATTCCAGCATGAACTTCATTTTAAAATGTAATGGATTATTATATTTTTTATAATGTAGGATTTTAATAATTGATTTTTAATGTGTTATTATAAATATTTTTATAATAAGTATATTTGT-------ATAAAAGTGTC
CAGTTTT-------GCATGA---TAGTCTTAACGGTTGACGG-----------TTTTAAATAGCAAAAATTGTAAATGTAATTTTTAAAGTGCTAT-----ATATTTTTATACTTGAACATTTTGTTGAGATCATAAACATGTC
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ACCCGAATACAT
CTCCCATTATAT
>Bem46 2989512 2990094|3221 chr2L 2989527 2989602 scaffold_7 2205156 2205230 - 4092|0 75
GTGTTCAATTGACTGTGTTAACACTGCGAATGGTTTAATACTTATACATATACACACGCATAATATTAATCTGTAT
GTGTTCTATTGACTGTGTTAACACTGC-ATTGGTATATTACCTATGCATATATACGTGTATATTATTATGCTATGT
>Bem46 2989512 2990094|3222 chr2L 2989750 2992757 scaffold_7 2205231 2208184 - 113776|0 386
ATTTC---GATGTTTGCTTGTATTTGTCCTAAGCTATGTTAACCTACTACTTTGCCCGATTGGCGGCCAGTTAAGAGTATAGAAATTGATCAGTATTTCACAAAAAAGTAAACTATTTTCTGGACTGACTCCTACATTGCCAGATTAGTTTATAGAAGCCTTCACCCCT-AGCACGTTAACATTTTGTGCTGGTTCCATTTTTGAAATGTTAAATTAATAACTTGT--TAGG---ATTGCAAAGGAAGCCAGAAAAAGTTATCTTAAGTTTAGACTTAAGTGCGAAGAAAAAG--GAAATTCGAGAAACAAT----AAACTGCAAACAATTGCTAGAATCC---------------------------ACGGAAGTCCTCATCGGCA
ATTATCATGATATTTGCATGTATATG-------------------AGTGTTTTGTATAACTGA-------------------------------ATTGTGCACTAGGTTAAGCTATCTTA------GACGCTTGTAGTTCT------GTTTATGGAGTGGACAAGCCTTGAGAGCGGTA------------GGTTCCATATTTTAAATGTTAAACTACTTATGTATATTAGGTTAATTGTTAACATATAACAGGAGAATTAGTTTTAGATTAGCCTAAACTCTAAATCAGGTTCCGCAACTAAATAAATTATTTTTAAATTGAAAGCA---GCTAAAAACCCAAAAATTTTTCATCACTACTATTTGGATCGAAGTCCTCATCATCA
>CG3558 2998249 2998614|3225 chr2L 2997254 2998792 scaffold_18 2344729 2346356 + 29793|1077 1540
TCGCTTGGAACGGAAAGCTTGTGTATAC---ATATTTTACGGATTTGTTAGCCCTTGTTTGTTTTAACCAGCT--ACTCTTACGAAATTATTCTTTTTAC---CTGTTAAATTTTCGATATT---------------TATATTTTAAAAAACAACTTTTAACGAACAA---TGCAGTTTTGAACAGATTTACAAGTTAATGCACACGGACTCAACTAAAAAAAAAAAAGAGAAACACTCAACGCGTTAAACAAATAGATTTAGGTTAAATGTTTTAAGT---------GAATCGGGAC-------------GGTGGATCTTAAGTGTTCAGATGTAAACAAATATTCTAATTACCAGCCGTACGCA----------AAATTTACAAC-GTTTAT------------------------------AGAGAGAATTATATAACAC-ACATACC--------ATGTA
C------GGACAGGCAGTTATGCAATACACAATGGTTATCTGATTTGTTGGCGTTTATTTA-TTTAACCAGTTCAATTATTTTTTAATTAAACCTATTATTTGCTGTTAAATTATCAATATTGTGTTAGTGTATATGTGTATTTT----AACCAATTCGTACGAACAAAGTCGCACTTTTGAACAGATTTA--------------------TCGCAAAACAAAACAAAACAAAACACTCGTTACTCT----------ATTTAGTCTATAAGGTTAAAGTTGTAAACAAAAATCGTTGCTAGCTGACAAACAGACAATTTTTAAGTGTTCAAATGTAAAAAATTATTCTAATTACAAGCAATAGGCATATACATATTATATATACACCTATATATACATAAAAAAAAAGAAGAGAAGAGTAACCCAGAGAGAATTATACACCACAACATACCATTTAAATATGTA
>CG17265 3015463 3016069|3247 chr2L 3013352 3015643 scaffold_18 1166570 1168894 - 79102|2312 2498
GCCTGCGGAGATAGCCAGGGACGGAGGCAACCTATGGCGGGCTAACGCCTAAACTCTAATGTTAAAAGCTAACTTATGCCGTAATATTTAACCCTAAA--CATTGTACAAAGTTCAAACCACAACCTAAGCTTAA--GCTACCGCTAAAGGCGAAAGAATACTC--AACAAATATTTGGGATGCTCC
GCATTTACATTT----------TTAGACAACACATA--------------------------CAAAAAAAAACTTG-GCTAACAAACTTA---CTAAACGCATTGTACAAAGTTCAAACTATGACTTAGGATTAAGCGCTTTATTTAAA---AAAGAAATACTCAAAATAACTATTTTTTATAATCC
>CG17264 3021228 3021506|3251 chr2L 3019936 3021556 scaffold_18 1172313 1173907 - 35065|1353 1652
TGACTTGCGGGGAT---------ATTAACTTTCATTTCGCTTTAACAAATTATTTT----TCAATTATCGAAATAGAGTTAAGATACTGTGTTTGTGATGACTTAAATACTTCTATTTTATT--------TGTAGGTTGATAGTAACATTCCCTGGATAAATAGTATGTACAAAATTCTTCAACTTATTCGAACTTAGTTAAGACAAACTACAATGATTCAAAATAGTATTCTAAGCGACTTTTACAGCTTTCAATAAATGTCTATGTGAGTTGTTCGCTTGCTTATATTATCGAATTAT
------GCAGCAATTCCACTTTGCCCAACTTTTATTTCGTTTTAGGAAATGCCTTTATTAACACATACATACATATATTTAAG-TATTACAATTGC--TAGCT---GTATTTATATTACATTAAATTTGCTGTGGATGGATGCGAACGAGGCATTTTTGGCAGTCAAATTGGAAATCTTCCTCCGTATGGAATCTTTTTTAAAAAGAAAT----------TAAACTATACCCTAGAAATATTCGGCAGC-TACAGCATATACCCTGGGACAATGTTGCTGCGCATATAT-----------
>CG3542 3026117 3026450|3253 chr2L 3023259 3026527 scaffold_2 3979264 3982651 - 134631|2949 3342
CCAGCTGACAGGCGTTGAGTCAAAGCC-----GACATCGACATCGTGTGGCACTCTCTAGCTCTAGCT-TAAGGAGGATCGGGAGA-----------GGTAGCTAGCCCTGGACTCAGTTGCTGGACAAGTTCTCTTTTCAGTCCTTGCCTTCCACTGCACTCTGC---------------------------TTCGTTTGGTTTAGATACTGTCCTGGTCCCAGCACAA-----ACCACACAGCGAA---CCACAATTGTAATTTCTTAGTC-TCAATAAGTTTCAATGT--ATAAATGAGAATTAAACCTAACGAGTCAAATTTTAAGTTATACGCAAATGATTTTGATTCTGCAT-----CAAAATAAACAAATTACGATAGAAATTACAA
CCAGCT-ACAATCGCAAGATCAAAAGCTAATTAACAACAACAGCAGTTAGCATTAGTCAGCTATAGCCATAATATAGACAGTGCGACAGTGTGCCCTAGTTAATATACGTTGATCCAAGCTCCAGCAACCTAAAAACTTTAGGCCTGCTCTTCGTGGACACGCTATAACGTATTTATGCTATCGCACATATCATTTGCTTTGTTCTGGAAC-ACTCTGGCCCTAGCACAACAAATCCCACACAACGCAGGCAAACAAATGTAAGTTTTTCATCAGCGATAAGTTTGATTGTAAAGAAATTATAAT--ATTATTATAAGACAACAACAAAATAAT------ATTATTTGCACTTTGTGTGACTACAAAATCAACGGATTTATTTATTTATCTAAA
>CG17219 3030396 3030617|3255 chr2L 3029258 3030952 scaffold_2 3986097 3987812 - 26284|1251 1487
AATA-----TATTTTGGAATTATTTATAACACAATTCTTAAACTTTGTAATAATGATAAGAGATCTAAGTTCAAAACA-----TAGCGGTAGCATAAAACAAGTTGGCAGCCCACTTTACACGGGGCACCCTGTAAGGGAGGGACGTTCGTCAGCTGTGTTGTTGTAGTTGTCGTTATTCCGGAGAAATTGTAAGCAAAT-----TCGTTGTACTCCAATAAAACAATTAAAATGGA
AAAAAATACTATCGTGTACTTGCCGATGAT----TTCTTATGCAATTTAAT--TGCTAAG-----------CGAAACACCCTGTGATGGGGGTGGGCAAAGAGTTGGGGTTTTGTTTTTATCGCAAAAC-------------GACG-----CGACTGCGTAAGTACA--------------CGAAAAAATGTTAATAAATATATATTTTAGTTTTCAAATTGAATATTT--------
>CG17257 3032135 3032305|3256 chr2L 3030987 3032232 scaffold_2 3988035 3989310 - 41483|1188 1291
CTACTCACACACCAAAAAGCAAAAAGCACAAGCATGT---CGCTTAGATACTAAAGTATTTCAAATCTTAACGCTGTTCTCGGTAGTC---GTACTTAGTCGTA
TG----------CAACGAGCGAGCATCAGGTACATTTAGAAGCCCGACTACTATAATA-TTAAAGCCCAAATACTATTGATTAAAGCCAAGGTATTTAGTTGTA
>CG17257 3032135 3032305|3257 chr2L 3032271 3035360 scaffold_2 3990060 3993070 - 114137|0 37
AAATAAATATAATTAAGTAACTCAAA---ACGCACAAC
AAATAGACAAAAGCAAGAAAATTAAACAAATTTACAAC
>CG17260 3038689 3038795|3259 chr2L 3037592 3038797 scaffold_2 3995891 3997134 - 46391|1124 1247
CAGATGATCGACTCAAGAACAGCTTA--CTGTGTATGGTTATGTATTTTGTGATTT---CTATTCGAATACGCTTATATTGCTAAAG---------ATTAAATAAATA---AAGTGAAGATGAA
GGTGGGAAC------AGAACAATTTGGTTTTTGTACATATATTTAACTTGTGATGTATATTATTCGAATACGCTTAAATGGCTGCAGATGCTAGTTATGAAATAAATAGACAAATGATAATGAG
>CG17221 3041576 3041625|3261 chr2L 3040344 3041668 scaffold_2 4089302 4090627 + 49385|1264 1314
CAGACTGATATTGTTGTTTCTGTTG-CATTAAAGGCTTGTGTTGGTTAATT
-----TGTTAATCTTGTTACGGGTGATATTTAA----CTTGTTTGCTAATA
>CG17261 3043531 3043595|3263 chr2L 3042993 3044006 scaffold_6 5860859 5861997 - 5285|633 712
----AAGAGAAACCATGGC------TATG-----AAATCTGTTCTGTCCAATAAATAATACAATTGCGAATGGCTTGCAA
GTTCAAATGCAAACGTGGCCGACCGCATGCCCACAAAAAGGGTCGACCCGCGAAAAAGCGCAA-AACGAAT-GCACGCAA
>v(2)k05816 3055488 3055601|3270 chr2L 3055096 3055490 scaffold_6 5870830 5871232 - 14089|407 409
TGG
TAG
>CG3523 3067503 3068184|3275 chr2L 3067617 3068207 scaffold_6 5888456 5889060 - 5716|0 657
ACCACGGAACACATCGACAC-CTAGTTAGCATACTTAGTGAATGAATTTACGTTGTTGAGCTGCAAGGAATGGCTCGCCCCATCCCAGTTACGCACAGCTAGAAGAGATAAGTTAACAGATTGGATTTGCGTCGATCGGATTGAATCTGCCTAACTGCTGTCTTGCAGGGCTGTAGGCTTC---GGTCCAAAATTAAGTCTACAGTCTCTGCGATTCCGGGCAGTTGAAATGATGCAAGATGAGAGGCTCAGTCCATAACACTTAACGCTTTGTGCACCGTACAATTTAGTA----CCCGACATTCCTTGAGAGCTA----GACGGCACCAGACGTCCCAACTTACCAAATATATCTTTTATGCTCTATCTATA---ATGTATGTCGCATA---TTCTAGTTTTA-TTGCCTAGTTGTAAGCCTACAGTTTGTAGTCGCGCATGTAATGAATTTCATTCCTCGAACTAACCCAAGAAAGAGAC--------------------------------------------TACAACATTCGTTATCTCTC--------------------------TTGATGTATAAA-ATAATCGCCCAAAAATTATCACTCATGAATATTGTGGATATTAAAATTACACCATACTAAAAAATAAAAAAA
ACCACAAATTACATTACAGCACAAGCTAGCACATTTAAT-AATGAATTTATACTATTAAGCTAAAAAGAATA--------TATTCAAATTAT-------------------TTTAACATGTCCAAC---AGTTTAGCAAGTCTATGTAATGTAACTGCCGTCTTGCAACGCCTGTGGATACAAAGGTCCAAAAATTAATCCACACGAGTTGCGATTCTGGGCAGTTG----------------------------ATTTTACTAAAATCTTTATGCACATGTAAACATGGGAGAGTGTCAGCATTCCTTGGGAACTACAGCAACGGCAATAGA---TCCAAATAACCAAATATA-AGCGTGTACTATAATTATATGCACATTTGTCACATGCTTTTTTAGCTTTAGTTTTGTAGTTTTAAGAACAAA---------CTCATATGTAACGAGCCACATTCCTCGAATTATATATAAATATATATATATATAACTAATTTATTTATATATATATATATTTATATATATGTGCAGTCCTCGATATTTATCTCCAAAAATAAATAAAAATTGTTGTATTGATATATAAATATGCTTAC---AAAGTTATCACTCATGATTATTGAGGATAT--ATATTCATACATACTAACGAGTAAATAAA
>Tdp1 3162045 3162403|3389 chr2L 3159826 3162048 scaffold_6 5915377 5917735 + 92127|2381 2384
GATT
AATT
>CG3488 3168202 3168999|3398 chr2L 3167991 3168947 scaffold_2 2759119 2760064 - 8615|233 1053
GCCTGGTTGCTATTTTCAC--ACGCATACACGACTATTTAACGCTTCTGTGTCAAAATTGGTTGTCGCTGTCGAATATAAATCTTTGAAGAACCATCGGAACGGAAGAGAGCCCGAAAGACCCCATACATATAGTTCTAACATATGATATCGTTGTGCAGCAATTATAAATTATCAGCCGCGCAAGCATAAATTGATGTATACTTTTGCAAAGTGCATTTAAAACAGA------AATTGTAGTTT-------------------TTTGAGAACGATTTTTATGCTTTTTAATGACTTT---TTGAAGAGCCAAACATACAATGTATCAGTTGAACTCG--------TACCTTAGTTAGTTAACGCGACCACATGTATCCATGTACTTATGTCTAAGCAAATTCCTATTTATTAGCATTTTCCTTTGTGATCTAACAGTTTTTAATTACGTACATTTT-TATATGTGAAATGTAC---ACCACACGCCGCACACAATATAC---------GATGTATGACAGTAATTATAAATTATAAGTCCTCGACCGCACCACAAGCATATAAAATAGCAAGAATATTGCCTTAGTGTAGACCTCGTTTTGTATGTGTGAATATGATTTGAACTATTCATTTTGTACTATGATGCATTTCACGGAAATCAAAGAGAAACCAAATGAAAGTTTGCCCAACGTCGGCTTCATTTTTGTAT-----ACTTTTTCTGAAC-----TTTACCAAGTTGATAGTCAGATTTGTTTACCAATG-TAGTGGAGTGGAGAATATTTATAAATGTA-------------TTTGTAAATGT
ACTCTGTCAAAATTTGTAATGCCGCTGAACTAAAAATGCATTTTGTTTTTGCCAAAATTCCATGTTGCTGTCAA--ATGAGTCTTATACAAA----------------------GTAAAACACAATACATATAAAACCACTATCATATTTGG------------TGTAAACGAG-----GCGGACATTTATATGAATGTAAACTTTTA-AAAGTGCATTTAAAACAGAGCATTGAATTGTATTGTATGGCGTTTAACTGTTTGATTTTGGATACATTTTTTTTTTTTTTGGCAAATTTCAACTGATATATAAAAAGCGAAACGTTTTAGTTAAAACCGTTAATTTATATTATAGTTAG-TAACG----CACATA---CCATGTACTTATTTGTAAG-AAATGCTAATTTAAAAGC---------------CAAAC------TAAACAAGTGCAGTTGAAATAAATTAAATGTCCCTGGCCGCAACCTATAAGTAAATTGCCTTATTGTAGATTTTTATATGTGTATATGATTTACAAGTCCCTTTTTT-----------TATAAAAATATAAATATAT-------ATATATATATATATGTATATATACATATATAAATGTACGTAT--AATATTTACAGTGAAGCATTTT-CAAATCTCAAATAGAG---AAACAAAAATT------------GTCTAATTTTTGTACGTGTAACTTTTCCTCGATGTCTGTTTATTAAATATCAATGGAATGTTGTATACCAAAATTAACAAAGTTCTCTATATTTATATGCGAAGCAATCGGTGTAGTTTGTATTTAT
>CG3488 3168202 3168999|3399 chr2L 3168948 3169182 scaffold_43 520028 520249 - 721|0 52
ATTTATAAATGTATATTGAAAC-AAATAAATAACAGTTGGACAAAAATATTCC
GTTCTAGGAGAAATATAGAATCGAAATAAATTATAATTGAAAAAAAATTCTCA
>CG15406 3311652 3311684|3542 chr2L 3311028 3311672 scaffold_2 4995666 4996321 - 35322|624 655
-----------TTACGCGCGGAATAAAGTTCA
ATCAACCATATTAACGCTCAGTATTAAGTGCA
>CG33281 3326578 3326633|3551 chr2L 3325819 3326606 scaffold_2 5017771 5018567 - 21423|772 800
TACCTATGACTTATATTTAAACCAATTGT
TTAGTTAAGCTAAGCTTGGCAACAACTGT
>CG33281 3326578 3326633|3552 chr2L 3326607 3327111 scaffold_2 5033783 5034278 - -2159|0 34
TATTGCTG--------TTAATAAATCCGCTAAGAA
TTCAGTTGCACAAGCATTGATAAATTGTTTAACGT
>CG3285 3332682 3332878|3559 chr2L 3332680 3333542 scaffold_2 5026497 5027369 - 17276|2 242
TTTGTTTACT----GGAAAGATAATGGGTTATCA-----CACTTGTAGCACCTGTCCGATTAGCCTAAGTCAGTAGTT----------------ATCTTTACGGTCAGAGGATACCAGCCGGATACTTAAGCCGACTCC------------TCAGCGGAAAACC-------CTTTTAGTGGTCAGAGATACGTGGCCAGAGGTAGACTGAATAAAGATCGGGGTGGTATTCTTATTCATAT
TTGAGTTACTTTTTGGTAAGATATTAAATGGTCAGATAACATTCGCTACCAGCATTTCATCAGCTTGATTTACAGGCTTGCATGAGCACGGCTAATCTTTATGGCAACATG----TGCCCCAACAC---AGCAGCCTCCAACCTATTAAAGTCAATGGGAAGCCAGGCGAATTGTTAGTATTCAAATGTGCGGCGACAAAATTACATTAAACCTGGAT-------ATATTTTATTTAATTT
>CG8840 3411107 3411189|3644 chr2L 3411067 3411274 scaffold_57 198349 198532 - 1551|40 127
ATTTAGCATAATTTAATACTTTC-----CGTCTTTCATAAACCAATGGTTTATACTAAATAGTTGGTATGTGAGTTAAATATATACAA
TTTAAGCAC--TTCGATAGCCGCGAGTGCGTCTCCTAATGTCCAACG----CTACCAAA-----------TGCGTT--ATGAATACAT
>CG2772 3447549 3447591|3691 chr2L 3447522 3447670 scaffold_0 5672747 5672908 + -962|35 86
GATGATAAGAT---TTTGA------GCAAAATAAATGTTTTTTCCAAATTAA
GGTCAGACAATAAATCTGAAAACTTGCCAAGCTATTTTATTGCTCAATTTAT
>CG2774 3451568 3452106|3696 chr2L 3449518 3452413 scaffold_6 1631295 1634374 + 79553|2194 2933
CTTTTATTCCGATTATC-GTTGCATTTCCAAAAACTTTTGCATAACCAACAGC------------------------------------TATGCGCGCTATTAACTAATTCTGCGGGACCAAATTCGATCTTAATCTTGCGATTTGGAGCTACAACTTCGCCTTAAGCACTTATCTTGCAAT-----------TTGCCGCCGAAGCTCGTATT--TTTTGGGAA------ACTGCTTCCGATTCCTCTCAAGCAT-----------------------------------------------TTCGCGATGCATTCACAA-------------------------------------TGCCTCTATCTCTTTATTCGTACACAGTAATTATTATCA-----------------------------------GAAAGCTGAAAGTTTGCTACAGACCCAGGG--ATCTGCGTATT------------CTCATTCAAAAATTGTATTCGGTATTATCTAAAACAAAGCCATGGATCTAGTTAGTTAGTTGAAAGTGAAGAAGACTCATTGGCAATTTCCAAATTGAAGTTTATACCATTATT---ATTGGGAAATGGGTTTCCC--TGTTTACTGTTGGTATAATTATGTATTTATATATATATATTCCAATTAAACATTTTGTATCATGACAA------ACAGAGCATTTCAAC-AATAAATTTGTAAATATGTATAGATG
CTTTCATTCAAATCACCAGATGCATTTCCAACA-----TGCTTAACTCACAGCATAGCGGCATTGCGCTTCGTATCTATACCTATCTAATGTGCGTGC-----GTTAATTTTGTGGGACCAATT----------TGTCGTCAACTGGAG-----------------GCGCTGATCTTGAAGTGAAAAAACTTGTTGCCGCTGTTGCTGCTGCTGCCGTTGGGCATTTCCTATCGCTTTAAATTCCTCTCAATAATTGTTACCAAGTGCTGCGATTTTGCTTGCAGATAAAGTTCAACTTTAATTACCGATGCATTCAAACACACATACATACATACACACATATATATATATATATTTATATATATTACTTTATTCGTACACAGTAATTATTATTATTGCAAATTTTGCTTTTATTTTTGTAAATGTATACAAAAAATCAATGTTTATTAGACTTTTGGTGTAATCTACATATCGCAAAGTGCGAAATTATTCTCAATCTATCTACGGTATTATTTAAAAAAAAAACTTCAGTGAAGCCAGTTATT---AAATGAATATGCATGAAAG---------AAATTGAAATGTAATTAAGTGATTGAATTGGGAAAACCTTTTTCCCACGATTGTTGTTGGTTTATATATATATATATTTATGTATATTCGAA--ACACCTTTTGTAACATGACAAAGCAACATATAATACTTTAACAAATAAATTTGTAAATATGTATGTAAG
>sec5 3460272 3460371|3699 chr2L 3457545 3460280 scaffold_6 1639440 1642188 + 155756|2758 2766
GCACATTCC
ACACATTCC
>Pdsw 3467255 3467326|3706 chr2L 3466778 3467261 scaffold_2 5681714 5682208 - 28725|490 500
A----CTCCGC
AAAGCCTTCGC
>Pdsw 3467255 3467326|3707 chr2L 3467295 3467683 scaffold_2 5682260 5682592 - -984|0 33
TTAAAACAAAATATACACG--CCGTAAAACGATA
TTACATAAATATATACACAAACTGTAGAAAAATT
>pgant4 3474931 3475338|3717 chr2L 3475019 3475109 scaffold_2 5685717 5685806 - 2559|0 98
AGTTCATTGTTCGTTGTGAAGGTTTCTGAAAAAAAAAGTTCGCTAAGTAAA--TTCCAT------TTTTCCATTAATTCTTGCCCCATGCATTATTGAT
AGTTCATTGATCGTTGCGAAGGTTTC---------AAGTTCCTTTTCGAAAATTTCCATAGTTTCTTTTACTTTACTCTTACTGCAATGCATTATTGAT
>Thor 3479394 3479621|3723 chr2L 3478988 3479903 scaffold_2 5691586 5692377 - 8845|430 658
GGGGTGTGGCGTGTACACCGCCATGCAGCAACTGCCAAATCCAACTAGTTCTTAGATGCACCCACTAAAACCGATCTTATAAGCTTAGTGTACCCATTAACTAGATGCTAAGTTCTTAGTTCTTCCACCTTGTTTGTTCTCTCGG-TCATATTGACCCCGTTACCTTGTAAAATCGTAGATCTTAAGTAAAATGCAATAAAAAAAAGGCACACATTATTTAAAAGAGAA
TTGCTTTT-------CAATTCCAACGAGCTACTGCCAAAACGCATGCATTC----ATTCAATCA--AAAAAAAATGTTATCAT-------TAGCCATCAATTAG-------------------------TTGTATATTATCACACCTGATATTGATCTTGT----------AGTGTTAGCTCTAAAG---ATTGCCACTAAA------------TTGTTGA--------
>CG17593 3516976 3517111|3759 chr2L 3515712 3517111 scaffold_6 5071161 5072566 - 78881|1284 1427
ATTTGTTT-----CAATTGTGCCATTTGCCGCAAGGAGCGCACCTCATTAACGTACACAAACCGACCATTTGTAGATGTTCCTCTCAAATGCCAGAATAAAGCAATA---TCTATTTGTTTCCTATGGAGCGCCAAAACAAAAA
AAATTATTGCGCCCTGTTGTGCCATCTACTT--GTGCTCGCTCGTCCTCA------------CAACTATTAGCGGTTATTC--CTCAAATGCCACATCAAAGCAATAAAGTATTTGTGTTTCCTATTGAGCGCCAAAAAAAGAA
>CG8851 3522359 3522556|3761 chr2L 3519959 3522633 scaffold_6 5076568 5079246 - 55613|2515 2747
AGGCGACGATCTAAACGGGGATCTGGACTGGACTGCCTAGACCTAGGCACTAGATTGGGCTCATCAGCTGTCCAGGCAACTTGAAGGTACTGC------------------------------TCCCAGCACTTGGACTATGCCATCAAGTTGCCTGGACATTAT-----CAGCCCTTATTAAGCCACCAATTATTTCACTCTAATGATTATGTAAACTCATTTTTAAAAGTA
ACGC-ACGCTTAAGAGCAGAGCCTAAGAAGGATCAGTCACCGTCAGGCACCGTCT----CTATTAAGCGGTTCAAGCAACTTGAGGATATGGCCAGGGTCAGCTAAACGTGATCTGTATAGTTCACTGATTTCTGGGCCATATCATCAAGTTGCTTGCACGCTACATTTGCAGAC--TGTCGCGGCATCTGTTTGTCCATCCCATTGATT-TTCATCTGTGTTGTTTCTATTG
>CG8852 3527261 3527588|3766 chr2L 3527482 3528041 scaffold_6 5085128 5085633 - 6881|0 123
TGCGTTGTTATTATTTGTTAAGTT-TTTAT----AAGTCTAAATTCGATTTAAAATTTCCATTGGAATTCATGCAATCATTTCATAATT------------GGTTTACGAGAGCTCACAACAAT
TGTCTCGTTGTTGTTTGGTGTGTAATTTATCGCAAAGTCTTAAATTTAATTAAAGTCTCTTTATCTATACATGCATCAGTTTTATACTTTAGGAGCTAGCTGGCTTTTTGGATGCAACAACAAT
>drm 3546756 3548086|3783 chr2L 3544989 3547113 scaffold_6 5104465 5106963 - 23671|2073 2605
GCTTAAATACCACATAAAC-ATATATAT-------AAATATATATAAAACCAC---------ACACAGAGCAATATATAAAGTAAAA--------------------------------------CCGATATCTAAGCACCGCAGCACCAACAACA------------GCACGCAATATCACAGCTATATCTTACA---------------------------CACATATAATGAATGAATGGGATCTGATG---------AGGCAACTGCAACA------------------------------------------------CACCCCGCCTACT-----TCTTCATGCACCACTCTCTAAACATATAAATACCTGC-----------AACAGCAGCAACTGCAACATTGCTTAAACCACTAGATGCAATCTACAGCCACGACAA--------GCGATTATAGTGAACGGAATGCTACGTTCAGGTGTTGGTTTTCAATCTATTCGGTTATCTGGTCTATACAATGCACTTG
GCTAAATTATCATAAATACAATATATACGCAAAAAAAATAAAAATAAAAAAACAAAATAGCAACACACAGCAATATAAAATATAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACAAGAAAAAAAGAACACCATCAGATATCTAAGCACCGCAGCACCAACAGCAAAAACAACAACCGCACGCAATATCACAA--ATATTTTATATTAAAGCAATGGAAAATGGGCAAATGTCATATAGATAGAGTTATCGATATTTGTTGGTTATCGGTAATCGATCGCAGCAGCGAGTACAGCACAGCACAGCACAGCATTATACCACCAGCACCAGCACCACCACGCCCACCGCCCACCCTCATGCACCAC-----ACACACACAAGCTTCTTCCTTTTGATGCAATCGTCAGCGACAGCAGCATCAGCAGCAGCAGCTGCTGCAA-CAACAGCTGCAACAAGTGCAACTGCAACGATAAACATCGGAATGCAA---TCGGGTGTTGGTATTCGATA-ATTCGCTTATGTTTATTACACGGTTTGGTTG
>drm 3546756 3548086|3784 chr2L 3547137 3547294 scaffold_6 5107016 5107155 - 4531|0 167
AAACACACATATG----------CAGATGTTGCGCAGGCGCAGCACAACAGCAGCAGTTGCAGCAATGGCAACGGTTGCAACAGTTGCAACGCACATTGCAACAGCAGCCTCCATATTTTCAATAATATTTCCAGAAATCTTCACATGGACACTTGTGGGCGTGGCTG
AAACGTGCACTTGCCACGCCCACCACATGTTGCGCAGGCGCAG--CAGCAGCATCAGCAACAACAACAACAACAACAACAACAATCAGAATTCA--------------------------AAATAATCTTTGCAGAAATTTACACATGAACACCTGTGGGCGTGCCTA
>drm 3546756 3548086|3785 chr2L 3547295 3547339 scaffold_7 4819670 4819705 + 23|0 44
CTTCGGAAAGTGATGAAGGCGGCACCTTAAGGCAGCCTGCAACTT
CT---------GTTGCCGCTGCCGCCTATCAGCTGTCCGCAACGT
>drm 3546756 3548086|3786 chr2L 3547398 3547740 scaffold_7 4819756 4820087 + -595|0 371
GCAGCT-CTTAAAGGTGCCAAATCTGAAGAAATCCACCGC-TTTATGCTTTTAGCT-GCAGACTTAACATCTCTACCTGCAAGTGTTAGCATAACTTCCGAAATTTGAGTTGCAACATC--TAGAAGAAGTCCATTCAATCCTACAAGCA-TCCCACCCATATCAACA-CACCAGCAACAGCAGAAATCAACAGAAGTCCCAGCAAAACTCAGCAA-ACAACTAACAACAACACATGCAACA-CAACAGCAACATGTTGCTGCTAGATTTCTCATATGTGTTGCACGTGCTGCCAGCGAAAGTGCA---ATTAAGCCACAGCTTCTTGGGCTT-----------------TTAAAAGTGCGGGCAACAACAG
GCCGCTGCCTCTAGCTGCCAAGC--------GGCCAGTGCGTTTGTGGCCTCGGCCAGCATGCTGGACAT--------GCAA---------------CAACAACTGGAGGAGCAACAGCAGCAGCAGCAGCAGCAACAACACCACCAGCACTACCTGCAACATCAGCAACATCTGCAACTCCAGCA-TCAGCAGCAGCAGCAGCAA----CTGCAACACCATCAACATCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAACAGCAT----CAGCTGTATCATTATCATGCCACGCATTCGCAGCAGCTGCACGCGCACGAGGCAAGCGCTGGTTTGTTGGATATATCCACATTGTAAATTATTGAATATATATATATAAATTA
>drm 3546756 3548086|3787 chr2L 3547741 3548127 scaffold_6 5107156 5107665 - 4994|0 501
CAACACACAGAGCAGCACACCAGCAACATGCAGCATACAGCATGCGACGCGGATGCAAAATGCAGCATGCAACGTGCGACAACTATCAGC-----------------------------------------------------TGCAATTATCTTGCCTTAAAACATATTACCGATTTACACA---------------------CATACACACACACTCTCGCTTATTTTATGAATAATAAAAATTAATTACAATTTAATA-----------------------------------------------------ATAATATTTAAAATGCAAAAAATCAAAAACAAACACC--GACACACTTACGTCATAAGTATTTGTACTTTAAAATCG-------------------------AAAGAAAAAACACGTTGAAAATGTATTACATAAAATTAATAATAATTAATAATAATAATAATAAAAACAATT--ATTAAATAAATA
CAACAAATAAGCCAGCA-ACCAGCAGCATG------------------GCACATGCAACATGCAGCATGCAACATGCCACATGCCTCAGCAACATTGAAAAGTTAGCTTTGTTTATGTAAAGCACAATTAAGCTCAAGCTTCTTGTGCTTTCCTCGGCCAACAACAAAGCAACAACTTTTGCAACATTACGAGCTTGGCAACACCATTCAATCAATCAATCAATCAATCAATCAATCAT--CAATCAATCAATATTCAATAGACAGCTGCAATTCTCTTGCCTTATAACTCGGAACTTGTGCGATTCTCTCGCTATCTTATTAATAATACAATTAATTACAATTTAATAATAAAACAAAAATAAATCTTAAGTATTTTTATATTAAAATCACAACAACAACAACAAAAACAAAAACAAAAAGCAAACACGTTGAAAATGTATTACCTAA----------AATTTATAATAATAAAAACAAAAACTATTAAACTATATAAATA
>Dot 3621074 3621171|3882 chr2L 3618721 3621969 scaffold_6 5193821 5197063 - 61880|2410 2513
T--CTACTAAGATTTACGCATGACTTGACAATTTCTGTGA----CAACAAATATATATATTAAGCATCGTTAAAAGCGACTTCAGTAGCGCAGACGTTGCATGC
TTCTTGTTTAAATTAACTTGTTAA--ACTGATTTTTGTTAATATAAACAAACATAGAAATTAACTAAGGTCTA----TACTCTAGTAACGTCCCCGCTGCATGC
>CG2818 3716509 3716813|3993 chr2L 3715395 3716859 scaffold_6 5347858 5349407 - 56801|1117 1523
AATTTGAATA---------------------------TCGGAACTGCTCGACTATTTTATACTCATCTTTATGTACGAAAATAACC-GCCCGGCTTGGACCAAAACTCATCAGATTATTAAAT--------------------------------CGGTCATTATCATTTCTTCATTTCGCCACTTAGCTAA-TTGCATTTGATTTTTATAAATAGGCTTA-------TTACAAGT----TACTTAAAATTTGTCCGACCAACGTAGGAACCTTTAAGTGTCTCT---------TTATCGTTTCCTATTTCAACAAAACTGCTCTGTACTTCAGTACTTACGTTCCCAGCAATCTTTAA--AAATACAACT------------TTTACA-------AACAATGGAAA
ACTTTGCATAGCTTTAACTTAAATCATTAACTGCAATCCGAGACAGCT-GATTGAACGATGTTTATTTATATATTTTCTGTGGATCAGTCTGTTCTCAATGGAAGCTCTCCAATTACATAAATATTACAAACACACGTACATGCAAACATACACACACACACACACACGTACTCATTTTCTCGTCTAGCCAATTTGCATTTGCATTTTCTAGTAAATTTTAATTGTTTTTCTAAGTTGCCTACTCAAAACTTTTTCCTACGGTATCCAATTGTTTTTGTTCTTCTATGCACTGATTAACGCTTGTTATTACAGT----CCACTCTATATTCCAATTTTTACGACTT---TTATCTTTTATTGAATGCAACTGCGAAAAATTGATTTACAATAAAATAATTATTAAAA
>Shaw 3727020 3727587|4003 chr2L 3726326 3727129 scaffold_6 5358850 5359591 - 15381|730 840
AGGAGCAGCCCAGCCAAGGATTCAGCCACCTGCTATTTATATTTATCCACGATCCCCATATCCTCCAATAAGCAATATCTATTCGAT-GTCATACAGAGCCTTCGCATACG
AGGATTTGAAATTGGAACAATGGAACATGATGATATT-----------------CTCAAAAATCCCATCAAGCAATATTTAGCCTATAACCATTCTTAACCTTCGCATACG
>CG31959 3759204 3759212|4046 chr2L 3758365 3760154 scaffold_6 5394749 5396553 - 53711|877 885
CCATGAACC
CCGCAAGCC
>bowl 3783285 3784129|4074 chr2L 3781760 3783291 scaffold_6 5420700 5422350 - 55442|1716 1722
AAGTAAA
AAATGGA
>bowl 3783285 3784129|4075 chr2L 3783397 3784175 scaffold_6 5422509 5423379 - 5810|0 890
CAAAAAGTAGTAGTATTCCTAATAAATATATATCTCGGTTGTTTTTTCTGGTATTTCATTTAGAAGGTCTTATGAACAGTTGAATATCATAATGACAAACAGTTATTGTTCCCAATGGTTAAACGAGGATTTATCGTTTTAGACCCACAAGTACATTAAAATA-----AATTTAGATCTAC----------------------AATTTAATACTT-----TTTAGTACAATGTCTAGGCAAGGCAATAGACCTAAACTAAGTAA----------------TAAAATCAGTTAAGCGATAATTGTAA-GCGAAACAAACTCCGTTGT--------TGCATTTTATAGA---GCTCTTATGCGTTAGGATTTTAGCTTAAATCTACCGATTTAAATGTTTAAGCCTT-TAGTACGAGAGTCTATCGATTAGTTTTTAAT--GTGTGGCCCAACACTAAGTGTTGCTGTTT------GCTGAGTGAATTCCAATT--------------------------------TTTTATTTATGTTTCCTTATCCGGTAAGCTAATCTTAATGAGTAAACAAAATCGTTAATCGATTTTGCTGTAGGGAAAAAAATGGTTGAAAGTAAAAGT------------TAGTGTAAAGCAGAGCATAAACAAAAATCCAACTACAAGCAACATTC--------------------CAGTAGAACCTTATGTAA------TTAGGCTTAA----------ATTTTAAG-----AGTTTTGCAGTAGTTAATATAAGCAACCCATAGAATTCCATGGTCTTCCTTCAATTTTAAATGATTTTATTCAAACCATAGCGAGT----TAGTTGATTTCAAATAAAGTATGCATTAATAATGAAAAACAA
CAATAAGAAATACTTTTAACTCTAGATATATATTTAGGT------------------ATATAG-----CTTATGGATCGCAAGCTAAGA-------AAACTGTTGTTG----CATTTGTAGAAT--GGCATTATGCCTTTAGTACACTGAGTACACTTTAGTACATACAATTCAGATTTGCCTAGTTGTGTGTGCTATTCGTACATTTAGTGCATTCCCATTTAGACCAGCCTGATTGCATGTTGATAAGTATGTTTTTAGTACCCTTAGAACATTCCGTTTAGATCAGATTAGTTGTAGGTGTGCTTCAATATTATCAGCATTGTGCTTTTAGCACATTTAGTATAGTCGCTTGTCATCGTTTAGTACATGGCGTAAACCTATT--TTAAAGCATCCTAGTTGTATAATTCGAGAGTCTATCAGTTAGTTGTCGTCTAGTTTAGTCCAACACTAAGTGTTGTTGTTTTCTTTAGCTAACTAGTATCTAATTAAAATCCATACTAAAATACTTGTATACACAACTTTAATTTATGTTTAATT----TGTAAGATAATCTTGATG-----GCAAAATCGTGTCAAGA-TTTACGCTGAGGGAAATAAAGGTTGAAAGTAAAAGTAGCTTAGAGACATGAGATACAACACAAAAAAAAAAAAAAGCTAAACAAAAATAAAATCAAACACGCTCGGCAAATGCAGCCGTAGAATTCCAGTTAAATGTTTATAGGCTTAATTTATAGCATATTTTAAGTATGTATTTTTAGAGTTTTTAGTACAGCCTTC---TAGCATTCCATGGTCTTCCTTCAATTTTAAATGACTTTG-AAAAACCACAATTAATATAAAATATATATTTAAATAAAGTTTGCATT-------GAAATTAA
>CG31960 3785477 3785515|4077 chr2L 3785031 3786191 scaffold_57 71231 72432 - 5087|464 502
TCTACACGCACACGCTTTCTAAATTACAATCATAGTGCA
TTGACATA---ACAATATTCATATTTGGAGCGCAGTGCA
>l(2)k16918 3808242 3809064|4096 chr2L 3807520 3810714 scaffold_23 1909236 1912400 + 67853|722 1727
TGCAGAGCACGCTAACACCAGAGCAGCAGCCGGAAAAGGATCGTCGTCGGATTGGGACGGGGAGCAGGATGGTCAACGGAACGGGGGGCAAATCAAAGACTTTTTATACGAACCAACAACCACAGCAGGACGCTGAAACTGA--AACAGCATTCGGAGGATAACCAG-------------AGTGTCTAGGGGCAGC-TAGTAAAACCCCTAG------------------------------------------ATTATGCAAGCGAGCAGT-TTCAGGATTCAGAT-----TCAAGCGCAAACAGCAGCGGGAA------------------------------------ATATCATCAAATCAAATTATATAAATCTAAAGGTAATTCAAATTTTAACGCAAACCAAAAAACACAAAAAAGAGACAAACCTAAAATTTACAATAGATGCAGCTATTTTTTCACAATTTTAAACTGAA---------AAACTGTAACAAAAACTGTAATGCGAACACGGATCGAAAGTTGAGGAGGACAAACAATAGATTTGTAGAAGCTCCGGGATGTAAAAGATCGAAAGTTGAGTCAAAATTGAGGGTTTAGAGACGGAAAATCATATGCCAGCC---GTATGATAGAAAGGATCACAAGAATTGATTAAAAATATGTTCAAGGAAAAGCTCTGGGTGTAATGAATTAG--ATGATAAAAATC-------------CAGCCAGTGGAAACTGTGAACTGT--------------AAATATTGTAT---TTGTGTGGGAAAAACCAAAAAAAAAAAAAAAATCTTTTGAAGAAT---TGGCATGCCATCGATAGCAGAAAAT----------------GCGATATGGGGATGTAGAACGATAGAATGTATTTAAATTTTTTTAAAAGC----------CGACGAAAAACGTTTGTGCTGATGTGGCAGAAGAC----------TCAAACTTGAAAAAAAAAAAACAGAGACAA
TGTAGAGCGCGCTAACAGCAAAAGAAAACGAAGAAAAGGC--------------------AGAGCA--------AAAGGAA---AAGGCAAATCAAAGACTTTTTATACAAA-CAACAACAGAAACAGAA-ACAGAAACAGAACAACAAC-TGCGAACTGTAAAAAGTACCTAAGCAGCCAGTGTTGATTAACAGCACAGCAATAACACTGGCCAACACAATTAGGCGCACACTACACGATCAAGCGGCCTGACGTCATGCAGGCAAACAATAAACAAAAACCAAACAAATAACAACAACAAACAACAACAACAACAACAAATAACAACAACAAACAACAACAAAATATATATATCATCAAATCAAATTATGTAAAGCTAAACGTAATTCAAGTTTTA----AACAGAAAAAACGCTAACAAAATAACAACTAA------ACAATAGAAGCAGCTATTTTTTCACAATTTTAAACCAAAAATGCAAACAAAACAAAACAAAAAAAAAAAAACCGAGAAAAAAAGAAAACCAAGAGGAAAAAAAAA-------ACAGAAGCAGCAGTTGGCAAAGCTTAGACATAT-----ATAAATCTGTATATACATACATACAAATATATGTATGTCTGTGTATATGTGTGTGGATAGGTGCATGTAACTGTAAATATTGTGTA--------TTTGTGTGCGTTGAGGAAGGCATTTTGAAAATTGGCAAAAGCTACGCTGTTAGCAGGTATTTTAATTTTTTTAAAAACAAAAACAAACAACATATAAATAATATAATACAAAAAAAAAAAAAGAAAAAAACAAAATTAACAATTTGTGGTGTGATGTAGAACGAAGAAGACTCGAAAACTTTAAAGAGCAACAAGAGAAAAAAAAACAAAAAAAAAAAATTATATTTCTATAAAAATGTGTAAAATGCAAAGCAAAATGAAGATAACGAAAAAGCAGAGGACGCTGTTGGCAGCTGACAGCAAGTAGAAGAAGCAGAGGCAG
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TAGTTTGCCCACTGCG-
TATTTTGTTCAGTGCAT
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GGAGGACCAT--TAGTACCGTAGACATTT----------ACTCGACTTGTGTAAATACTGTGTATTTAAATTTATGAGTAAAT-----CCCCTCTAGCCTAGCGTAGTCTAGCCTGTTCAGTCTCAGCG-GCAGCTTCGGGCGATGTTGGCCGGCAGGCGCTAACTGGCCTTGGAATGCCG-TCCGCTGGGCC-ACTGCGTCATAGTCATATTC------------------------------------------GATTTGTTTAGGTTTTTGCAGTGCTGGAATTAAACCAAAGCATA--------------ATTACGCATAGAAATACATTGAGAG-----------------------CTCATACAATTCATC-------CATTAAAGTA-CGCCTAAGTTTGTGTCTTAAGTCTTTTGTT-TAGAGATTTGTA-TTATTGCGCGCG------ATGCGATC------ACTTTCAAAAGATCTTCAAAC--TAGACCATACG--CTCAAAATCACTTAGACCATAAGTTGCATGTAAATA-GTGTTAAATTCGGAGCAGCCGCAGCGACCGCAAACCTAGTTTAAGTTGTAGCACGTAGTTAGTTGCCTAAGCGAAC---GCATAAGTCATTAGTACCATGAACGCGAACATAAACATGAGAATCCAACTTTC-AACATAGTCAAATAAGTTTA----TGTTTAAAAGCTAAGAAGTCAAACATACAATAAATGAAGTAACAAAAT-------ACAAATTCAAA
GCAGAGCTCGCACAGTTTCCTGGAGCCTTAAGCCTGAGCACTCGACTTTCTTAAATACCGTGTATTTGAATGTGCGAGAGTGTGTATACCCGGCTGGGCCTGTGTA---CATAATATTTAAG-TAAGCGTTCGGCTTCGGGCGTTGTTAGCCGCTTGGTTCTAACTGGCCTTTGAATGCTGAACTGCCACGCCTACCGCGTAATAGTCATATACCTTATATACATACATATACAGACATATATATATATATATAGATATCAATATAGGTTTTTGCAGTGCTGGAATTAAACCAAAGCATATTAACATAACGACCATAAAGAACAAAATTAAATTAACAAAAGCAAACAAAAAGAGAAAAATTTTGAAATAATTGTTCGAAATATTATCAATGTAGTTGTTTAGTTCGTGTCTTAAGTCTTTTGTTATAGAGATTTGTATTTTTTGTGCGCACCCATTGGGCGACTTTAAAAACTTTCAAAAGATCTTCAAATTATAGATCGTACGATTTTTGAATTAGTTAAACC-TAGTTTGCATGTACATAGGCATTAAA----AAGCA--------------AATCCTAGTTTTTGTAAGCGCTC-CACATAGAACTTTAAGCGAACATTGTCGTAGTCATTAGCACAACGAAC----------ACATAAGAATACAATTTTTGAATATAGTCACATAAGTTAAATGTTTTTTTAACACTAAGCAGTCAAGTCTACAATAAAAGCAAATACAATATCCAGTAAACCAACATGAA
>Tps1 4392687 4392788|4859 chr2L 4392442 4393201 scaffold_23 181308 182094 - 32469|248 377
GCCCAGATATCCATGCATTATCTATGCATGCCT---CGTAACT---------CAGATAACTTTTAAGATTTTAAGAATAAAGAAAACGGATTTGTAGCTTAAAGA-----AATGTAC-----------AA
GGCCAGA-GTCAATCGAACATATATGCATACATATATATAAATATATATATATATATAATTTGTAAGATCTTAAGAGTAAAGTAAATAAA---ATAAATCAAAAAACCACAATTTACACAATTTCTCAAA
>l(2)k05819 4399734 4400109|4864 chr2L 4397730 4400289 scaffold_6 2482966 2485575 - 77408|2139 2540
GAATCAC----GTCAAAGACTTAGCAA---GCAAAAAGACGT--CAAGG--CTGTATATAACACCACCACTCGACATACTTCTTGCTACTTTTCCGATTCTGACCAACAGTCTGGGTATCCTTAGACGAAGTTGTTTCTGTCAGCATTTGTTCTTAGGTGCAACAT-CGTTATTTTAGCCACTAGTACTTACACATGTTTATTTTAGTTTGTGACACCCCCATCGAGTAACGAACCACACATTTGTTATTCTTGTTTCTAAAACGGTTTGTTTCG-AGTTCCTTGTTTCGATGAGAAAAACCTTTGTGTACTAACATGTAAAAGACTTGCAATTATTGTATGAAATATACGTA----TGGTTA-------AACTGAAGTC--CCATCTTTAAACAAGTAAAA
ATGTAACCAAAACGAAAGACTTGGTAGCTTGGTGTTAGATGTACCAAGGCTCTGTATATATCATAAACCAAACGCTTTCTAATAATTAATAATATGTTGCTTTAGTACATATTGATTAT---------AATTTAATTCTTTAA-----TGTGCCTGTGAATAATTTGTTTTAATCTATTATTTAATGTATGCA-ATATTTTTAATTATTTGTGACATCCGCATTT----------------CTTGTTA-----GCTTTTAAAATGTTCGATTTTATTGTTGCTTGTTCCAATGACAAAAACTTCT-TCTACTAACATTTAAAAGACTTGCAATTATTATATAAATTATACATATTTCTGGTAAATAAAACAAATAAAGACAACTGCGTGTAAATAAGTAAAA
>CG3058 4403865 4403955|4865 chr2L 4400500 4408141 scaffold_6 2486527 2494441 - 198987|3612 3708
GGTGGGTCGCGTACCCCGCCGACTTAGTTTAATGTATCCCATTTAGGCGTAACAAA--TTGA--TGATCCCAAATAGAAGCGACTGTC--TCTTGGC
GTT----------------TAAATTTGTTTAGTACA-ATAGTTTAGGCATTATAAAGCTTGATTTTAGTCCAACATGAAATGTTTGTTGATTTTGGC
>CG12677 4434904 4435060|4915 chr2L 4434527 4435180 scaffold_6 2539903 2540524 - 2825|377 553
ATGGGGATGCCAATTATCCAGATTGTTGCTACCGCAAACTTGAGTGCGACTGAAATTTCTAGT--TACATAATGTGTTTAAATTTAGGTGAAAGTGAATTTTTCAAAACT------------------AACCAACCAGCTAAAATAAAGTTTTGAATAAATCAATTTTACACACAAA
ACTGGGATGCGGAATACCCCAGATGCTGCAAGCGTCATATTGTTTGTGATTGAAATTTGAAATGGGAAATGATTCGTTTAACTATAATAATTAACTCATTTTTGATATTTTCTGTTAAGTGTTTGGTATGCCAACAAAATTAAAT-AAGTGCTACACATTAGTATTTATCGTATAAA
>CG15433 4446641 4446771|4930 chr2L 4444766 4446742 scaffold_6 2558005 2559996 - 99990|1910 2011
GTATAGCGTTAAATGACTGTCTTGGTGGTATGTTGGAGGATTAAATATTTGTATTTTATCACGCTAGGAGCAGTAAGATTTCGCTACTTAAAACTACTCTCT
TTATCGCTCTTAATTTGTCACCTAGATATATGT-----------ATATAATTATTATATAATGCTTGTTGTTCTGGGCTTGAGATAAATAGATATATTCCTT
>CG15434 4455139 4455160|4937 chr2L 4455053 4455754 scaffold_6 2565815 2566478 - 25364|86 107
AACTTACGCTGGAAAACTATGT
AGCG---ACCAGAAGAGTACAG
>CG15435 4461560 4461750|4940 chr2L 4459874 4461813 scaffold_18 279374 281462 + 60260|1854 2056
GTTTTACAAAGTCCTGTTTTTCATGCCGGTGGCTCAATCAAACTAGTAATCATGT--TGACCACTT------TGCATCTGTGTTTTTGTCGTATTGTATTTATTTATTATTTATTTATTTTATTCTGTTTCCATTAGTGATTTAGTTTTGCTT--AGCGGCAATCCATGTTCATTTACAATACATTCTCGAGT--ACTCAAAA
TTTTAGCTTAGTTTCATTTTAT---TCTGTAACATATTTAAGTCTG-AATCATTTCCTTACAATTTATTGTATTCATCTTGTGCATTGTTTTCTTTTATACATTT-TTAGTTTTTATTTTTATACTGTGGCAACTGACTGTCCCTTTGTATGTACATCAACATTGAATGTT--TTCAC-CTGCATCCCTAAGGAAACTTAAAA
>CG15436 4464887 4465081|4944 chr2L 4464843 4465106 scaffold_23 2032612 2032887 + -303|59 293
CCACTACTTTAAAAA-----CACTTGGAAGACATATCT------------------------------TCCATGTGCACTACTTTAAAATGGACAAAAATGATTTTGCTAGATGATAAAATAAGCTAACATATTCATAGGTATTGTAAGAATAAGGCATAAAATTGGTTGGTAATGAATATGCCTATTTTGATATGTTTTATGAT-----GGAATAAAATGTTATTTATATTTGA
CCGCACTGTCCAAAAGCCTTCACTCGCGCTGCCTATCTCAAAACGCACATTGGCACTCATGCCGAGAGTTCGTGTTAACAATTTTAATTTAAA-ACAAATTATTTTTCGAGATACTCAAAGATAATTACATATTTATTTGT--------------------------------ATATATATATATATATTAGTATTTATTCATATAGATAGGAACTAAATATTAAGTA-ATAACA
>CG17840 4467935 4468024|4946 chr2L 4467952 4468146 scaffold_11 1166844 1167016 - 1680|0 73
CAATTGATATTTTAGTTTGTTTTCCCAAAATATATTATATATTATATTA-AGTTAAATAACATCGCTAATCCAA
CAATAAATAAATATATTTATT-------ACTAAACTATATATTATATTATAGATATATA------TTAATTAAA
>CG3355 4652777 4652877|5090 chr2L 4652392 4652832 scaffold_18 2720522 2720983 - 22223|390 461
----------------ATCATTTGGCTAAAAAAAAACTCATTTCCTTGCCTCATTCCTAAGTTATTCTAAAT
GATTTCACAGTCTACCATATTCTGTTGCCATCAAACTTCACTCATTTGACGAACACTTAAATTATTTTAAAT
>CG3355 4652777 4652877|5091 chr2L 4652833 4653059 scaffold_18 2721192 2721440 - 21|0 45
TATTGAAAAAAGAAGTTCACAGCAAATAAATCCATCAA-ATGCTTT
TATTTAAGAAAGAACAGTATATTTGTAAAAGACGTGAACATATTTT
>CG15634 4688789 4688956|5124 chr2L 4687647 4688928 scaffold_18 2759032 2760304 - 47065|1160 1304
TTGGCAAACACATCACATTTTCTTTATACATA-TATAGTCTACTAAGTTTCGTTGAAAGTT---TAAAACTTAAATGGTAA-ATATTATTAGGCTAGAATTAAATACTAATTGTAAACTATATGTTTAGGTAATTTGAATAAATA
TTGCTTGGACTTCCACGCTTCCTTAGTTAAGATTGCACTGAACCAAGTT---CTACAAGTTCCATTATATTCTTATAGTAGTAGATTTTTGTTATAAGTTTTCTCAAAATCCTTAAAATATATGAC--AGTAGTGTCAATATATA
>CG3294 4795955 4795975|5263 chr2L 4795838 4797668 scaffold_2 273831 275628 + 68671|117 137
ACTGCATGCCAAGAGGAAGCC
AGCGCATGT---GTGGACTAC
>CG3294 4796093 4796219|5263 chr2L 4795838 4797668 scaffold_2 273831 275628 + 68671|268 394
GTAACGACTGCGGCTATCTGCACCTGTTTGGCAATCCGAACAACCTGTTCAACACGGAACTGGAGTACACCAGCGGTCCACGCAGTGAACGACGCTCCAGCCAAACTCCAACGGCCAAGACACCCAG
GCTACAGCTGTGGCTATCTCCATTTGTTTCGCAATCCAAACAATTTGTTCAACAGCAGTTTGGAGCCGTACGGCACGCCGGGAAGTGCGCGCTCTGTCAGTCGAACGCCTAAGTCCAAGCAGATCAG
>CG3294 4796287 4796576|5263 chr2L 4795838 4797668 scaffold_2 273831 275628 + 68671|462 768
TTGGGATGAGCACAGCGAGCACGGCAGGAACTGGCGCTGGTCGGCAAGCCCCGAGGTTGAACTGGAAAACTCCAAGGACTTGGGCAACCGAGGTCGGGATCTCAAAA--ACAACCAACAGCGGAATCATCATTCCAGGTCAAGAAGTGACCGGAGTTCCGTGCGCTCTAAAAGAGAGCACAGCTCCTCGGGATCTTCACATGACGATCGCAGA---------------TCAAAGAGGCATCATCATCATCACAACTCCACAACACCCGATCATCAGCACAACCATTGCCAATAAAAACCAAAGTATT
CTGGCATGACAATGAGACGCAGTCGCGCAACTGGCGCTGGTCAGAGAGTCCCGAGCTCGAATTAAAGAACTGCAAATCTTCGAGCAGTAGCAGCAATGAGCGTGAAACTAGAACCAG--GCAAGAGCAT------------AGCCGTAAACGGCATCGTGTCCATTCCAGTCGAGAGTCTGGCCC------------ACATAAGAGTCGCAGTCGTTCTGCGTCCGATTCTAGGCGGGATTATAGTCG------CTCGAGAACACC--------AACACGACGGCGTCTCAAATAAACCAAAGTACT
>CG15629 4815783 4815891|5291 chr2L 4813945 4818494 scaffold_500 3686 8137 - 162090|2063 2171
ACACACAATAGGAATCATCATATGGAATCCATTACCTAAGCTTAAGTTCTTTTTCAAGAGGCGGCATCGTTTCACCTATAATTTTACAATAAACTTAGTTATTTGATTT
CAATATAAAAGAGTTCCAGTTTTAGA--------CTTAAGCTTAAATTTATATTC--------------------------------------------TATTAAATAT
>CG15628 4827573 4828552|5301 chr2L 4826440 4829002 scaffold_2 1388718 1391429 + 93740|1143 2369
GCCAGGTTGGGTTAGGGATACGAGATGCGAGTTGAATGAGATTAGAGATCGATCGGAGCGCTACGCCCACGCAGA---------------ACTTATGCTTAAAGCTGTAAGCACCCA----TTAGGACTCTTTAGGACAG-----------------------------ACAGGACATGGCACACATCAGGTGGCGTTGATTTTTTAAACAATTATAT-------TAACGAGAAAACCAAGAAAT-----------------------------------TGTACGAGTATATTTATAGATGGTATATGAAGCTTCCTCAAACA------------------------------------------GAAAAAAGCGGCGGCGTCGATTGGTGAATGCGGATATTTCGGCCAGAATAATCAAGGGATTTATTTTATATGGGTA----------------------------TTGATTAGGATTCGGTGACAAGAACT-------AAACCTTAACCAGGGGAATTTAAACGATCAAGTGAGGCGCTG-------AAGTCAGACATTTTAAATGGGGAATCGAGGACAAAGAGAGAACATTTTTAATTTTTTGCTAAAAATGCTTTTACAAAAGTGAGCTCCAAGAACGAGCAGAGAACAAAAGCCGAGTGGGGTGGCTCAATGCAAATGCAAATCAAGGAGCGCATCAATTTATTA-AAACTAT----------------------TATATATATTAACTCTATATATCAAATTGTTAAACGAACTAA------------------ACAAGCAACATACACC------------AACTACTTCTCTCTACTGGCTCGCCACGCAAAATCTCTGAACAGGATAATCTCGAATAATCTCGAAACAACCGAAAACCGAAAAACACACGAAAATCTCTCGCTTGGGCCATGGAACAGAGCTATGCACAATTTCCTCTATTTAAAGAAGCCGTTTCAGAATACTACATATATATATTTTTCAAACT--------ATATTGAAT----ACTTTCGATGACCCAAACGAAG---TGCTTTGATTTTAA----ATGGTCGCGTACCAACCAAACATATTTGGATTTATAGGCTTTTTTCAAATTTATATATATACATATAAACCCAAAACCCCATGAAGGGAATACGAAACGAAGCGAAAACCAAACAAAAATACA-AAATAAATATATATTTTACT
---AGTGCGGCTCAAAGAGCTGACACAC-------AGAGAGTTACAGATTGATTGGAGCGCTACGCATATATATATGTATATGGATATGTATATGAACGTAAAGTTGTAAGCACCTAGACCTAGGCGCCCTATAGGGGGGAGGGTATGTCGATTGTACTTATTCATATAACAAAATATAGCAAGGCACAAGTGGCGTTAATTTTTT-AACAATTATATAAAACAACAACAACAACACAAAAAACTAAAATGAATATCTACATAGTATTTACATGCATGTATGTACGAGTATATTTATAGATGGTATATGAAGCTTCCTCACACAAAGCGCAGCGTGTTTTAATACAAAACAAACAAACAAACAAACAAAAAAAACCAAAAAATTGCTAAACGAATGAAGA-ATGTTAGTCGG-------AAAGGATTTATTTTATATATATAACGAAAACTGAAGAAAGACAACAAACGCCTAAATGATATTCTACGTAAAGAACTTAAAAAAAAATAATAATTATATTAAT---AATAGTAATGGAACACGCTGTTTATGATGGTCAGATTTTAGAGATGA------------ACAAAATGAAACTTTTTAATTTTTTGCTATAAATGCTTTTACAAAA-TGGAATCCAACAATTGTCATGAAA---------------ACGGCTCAGTGC--GTACAA---CAGGAGCGTATAAATTTATTATAAACTATTATATTAAAACAAAAAAGTATATATATATATTAACTCTATATATCAAATTGTTAAAAAAAAAAAGAAAGGAAAAAATCTAACACAAACAGAAAACAACTAGAACAAACATAAATACTTCTCT---CTGGCT--CCACGCAAA--CTCAGAACAGGTAGAAATCG----GTTTTGGTACTA--------------------AATGTTTTATGGCAAGGGCCATGCGCATAGGCT--------TTCCCTTTATCTAA-------GCTCTATATATATATATATTTATTTATTTTAGTCTCAAAACTAATTTTCAACATAGATTTGCGATGGCCCAAGCGAAATATTGCTTTGATTTTGAGAGTATGTTATTGTACTTCC----TGCGTTTGGACTTATAGGC-TTTTTCAAATTTATATATACCCAATCAAGCAGAAAA----------------------------AAAACCAACAAAAGATACATATATATACATATATTTTATT
>CG12194 4841009 4841445|5315 chr2L 4838479 4841468 scaffold_23 1788701 1791711 + 85509|2689 3190
------GCATGCTATTG---ATGTCTTGCTGTTGTGTTCTAATCCCATATCCGATGATGACACTTCTCCACTTCAGCCCCTGACTAATTAACGTTCTTTTTCTAAATGTATATTTGCTTTGTGT-ACATGC---CAAAAGCGCGATGCAGTGCCGCCACATGAACAGGCGGCCTTTATTGGGCAACTATGTGCA---------------------------------------ATAGATCGATTCTGTTTGT--------TACTAACCAATAACCAATTGCGATGCTA-ATGCCATTTCCA---CTACACTTGACTTGTTATGCAACTCGGAGCACATTCTGCTAGCCGCACAATCGACGTGGTCATTCGATCTATTTTACTCCTCCTAGCCAACGTTCTATGATGATACATATCAAACTTTAAACTATTGTTATATTTATG-TTCCATTGTGTGTGATAAATAAATTTATGTAAATGTACATTAACCAAATTAAATAACCA
TGGTGTTCAGACTATAGTACATGTTGTATTGGTGTTTATTGATATTGTGCGTG---------TATTACTATATAGATCGCTGAGCAGCTAGCA---TTTTACTAATTCTGTAAAATCTCTCTTTCAAATGCCAACAAAAGCCTCACTAAACGCGGCACTACGGATCGACGGCCTCTATTGGGCAACTAAGCACACATCTATACATATATATATATATATATATATATATATATATAGATATATACTATGCATAGCAAAAATATGTACGATTAACCAA-TGTGATGTTGTTTACCGTCTATAAATCTATCTCTTTAACATTATGT-GTTTGGCACATATCTTACGAACTAATTGCACAAAGTTATTGTTTAACTTATATGTTAACAACAATTGATCCCCCTCTA-----ACATATCAG----CAAACTATTGTTATAATTGTGATTGTAATTTATGTTGT-TATTTTTGTGTATAAATGTATTCTGTGCCCGTT-----GCCA
>CG11927 4849325 4849499|5321 chr2L 4847670 4849326 scaffold_23 1799788 1801566 + 29991|1906 1907
AA
AA
>CG11927 4849325 4849499|5322 chr2L 4849349 4850391 scaffold_23 1801822 1802865 + 46587|0 153
GTCGTGGGTTTTCTTAAACACT---ATCAAATAGCATGGCACATGCACAAAGTTCTGCAATTTTGCAACCATATTTAGCAATTTCTTCTTCATCGTGGATTGACGGCCATTGGCATTTGTATTAAGATAAATGTAACAAAATCAACTTGACACT
GTCACGGATTGATTTGGAAGCTTAGATCAACCGGCG-GGCAGATGC------TTGTGCAGTCCCTTAATCAAGCTCTACAAAAAGAACCTCATCG------------AATACAAATTTGTTT----ATATTTTCAACATATATAACTATATATT
>CG11926 4852456 4852640|5323 chr2L 4850747 4852719 scaffold_23 1803027 1805100 + 87667|1762 2013
GC-------------------------------------TTTAGCGCGCTTCGCTAGGGC-ATTGTGA-----GATATATGACTATTTTTTTATTGCTCCT------CTGCCAATCGAACCAG-GACAAAGTTGTTG-TGCTGCAGTTGTGACGGCGTTTGTTTAACTGA-------ACCTA-------GTATACCA-GAATCACGCATGTACATTTGTAATTTAAAACTTTAAGTAAATT-CTAAAACTT-
GCACCCACTTGTTGATTATAGATGATGTTGATAATGGATGTCAGCCCGCATTTGTATAGCTATAGTGAATGATGACACATAATTAAGTTTTTCGTATGCCTGCTTAAATGTTCAACGAATCCGCCACTTTGTTGTTGATGTTGCGGCTGTAACAACGTCTTAATAACTGATTTTTATACATATACATATGTATATCATTAAATAAGCATGTAAATTTGTAATTTAAAGCCTTAAGTAAACTATTAACACATA
>CG31660 4873626 4873999|5353 chr2L 4872483 4873668 scaffold_23 1844304 1845622 + 20220|1343 1385
GCACAGACCACCCATACACATACTATATACATATAACTATACA
CCAATAAACACACATTTATAAAAAAAAGACACACTAATCTAAA
>CG31660 4873626 4873999|5354 chr2L 4873723 4876243 scaffold_23 1846235 1848910 + 45167|0 279
TTCCGTTTCCATTTCCGTTTCCGTTCCGTTCTCCATTTTCCGTTTGACTTCCTGAGTGTGG---TTTGCGGTGTTTGTTGCATCTTCATAGCTTGCAGGTTCGTTCGCTAGCGTATGATCTATCAATACGTTTACCTGTGGATGCTTTCAAGGGTACGTCACACGACGCCGGCCAGCGGCTGGGCGGAGGATATGCCGGGCTCTGTCTGGGCGATCCGGACATTGGTGAGCTGACCATATCCGAAATGAGTCCCGAGGACATACGCGCCGAACTCAAAAG
TTCGGTTTCCATTTCCGTTTCCGTT---TTCTTCTTTTTTTTTGTACGGTGCTGAGTGTGTGTTTTTGCGGTGTTTGTTGCATCTTCATAGCTTGCAGGTTCGTTCGCTTGCGTATGATCTATCAATGCGTTTACCTGTGGATGCTTTCAAGGGTACCTCACACGATGCCGGGCAGCGCCTCGGCGGCGGCTATGCGGGTCTGTGCCTCGGCGATCCGGACATCGGTGAGCTGACCATATCCGAAATGAGTCCCGAGGATATACGTGCCGAACTCAAAAG
>CG31660 4874058 4874169|5354 chr2L 4873723 4876243 scaffold_23 1846235 1848910 + 45167|356 467
ACTGTATACCCAATTGGAGATAATGAAGAACAAGACTCTGCGGCAGGACAATCCGCACATCAGTAAGCGACGTGGCGGACGCAAGGCGGGTCACCGTCGCTTCTCCCTGCAG
ACTGTACACACAACTGGAGATTTTGAAGAACAAGACACTGCGTCAGGATAATCCGCATATTAGCAAAAGGCGCGGCGGCCGCAAGGCGGGACATCGTCGCTTCTCATTGCAA
>CG31660 4874778 4875249|5354 chr2L 4873723 4876243 scaffold_23 1846235 1848910 + 45167|1230 1781
--------------ATAGCACCACATAAGTCTTATCGAAAACAGA----------TTGCACACGAAACTACAACGAGAAAACACATATCCACC-------------AGTTGTCCATGTGACCC----ACTAAAATATCTCAAA----TTCGCAGGCTCTAAGTGCCAAACACCGCAGCAACAAGCATCATCAGGACATCGAGATCACCGAGGCGGAACCTTCCAGGACGCCCGAGGATTCGGTGTGCAGTGCCGAAGGACCCACGGATACCTATGCGGAAATCTCCGGCGTGTCCCACTCAATGCTCTCTCACTCGATGGTCTCCCACTCCGTGGTCTCGCATTCGAAGTAGG------------GAGTCCTTGCTGGTTCATGGC-----------GGATATTTGAGAATTGTATATAGGTATTAAACGGTACGATACACGTTGGTATGTGTAGATA-ATATGTGAGAAATAGTT----------ATTATATAGCGCAACAACACAAACAATAAAAGAATTACTTTAA-TTTCGCAAAGAAAGAAAAAAAA
ATGCATGTACACCCATAGCACTTGATGTATCTAAGCTAAAACTAAACAGAACCTCTTTAATAATAAAAAACAAATAACTAACAAAAATGCACTAAATTAACTGCTAAATTGTTAGACTAGCCCCATGAATAATATGACGCAAAACCTTTCGCAGGCTTTAAGTGCCAAACATCGCAGCAATAAGCATCATCAGGATATTGAAATAACCGAAGCGGAACCGTCGCGCACGCCCGAGGATTCAGTCTGCAGTGCGGAGGGACCGACAGATACCTATGCCGAAATATCGGGCATATCGCATTCAATGCTATCCCATTCCATGGTCTCCCACTCCGTTGTCTCGCACTCGAAGTAGGCCTTCAAACCACGCGGCCATACT-GTACATAACTCAAGCAAACTAGATATATG----CTATATATAGATATATA-------TATATATATAGATACGTGAATGTATGTAACTGAGAATTAGGTGCAGCATAAAAACAAATAGCGCAACAACACAAACAATAAAAGAATTACTTTAATTTTTGCAATGAGATTGAGCAAA
>CG3008 4885510 4885674|5363 chr2L 4883333 4885596 scaffold_23 1862325 1864588 + 88371|2275 2366
--AACTTCTAAAGT---GTGGACTCATTTAGTTTAGTTTTAAATTGATATTAACAGTTTGGTCACAGAGATTCCATAGTAAAAGATATGATG
CGCGCGTCTGAATTTAAGATAACTATTAAACTTTAACTCTTAAATGTACTTGA---TTTGAATTTATAAAATTCAAAAACAAAATTATGTTG
>CG15625 4891188 4891378|5370 chr2L 4890375 4891190 scaffold_23 1879817 1880663 + 31176|845 847
TGC
CAC
>CG15625 4891188 4891378|5371 chr2L 4891191 4891296 scaffold_27 1121095 1121206 - -129|0 115
GG---TACTTTTTATTTCATAGATATGGT-----ATTCTATATTT--AAGCTATGTAAAGATCACAGTTTATATCACAAAGACAAGTTCTGAATGCGAAAATTTGTGGAATTTCAT
AGATTGTCTCTGTACGATATTAGTGTAGTAAATGATTCAAAATCTGAAAATCATATTAAAATAATAG----AAAAATAAAAACATATACTATATGTATATATTAAAGGGAGCTCGT
>CG15625 4891188 4891378|5372 chr2L 4891297 4891792 scaffold_6 1409612 1410144 + 3626|0 93
CA------TGCTTGCAG---ACTGATCTGCTCTTGGCATCTTAGCTTCTCGTCCAAATAAGCTATTAATAAAA---AAAAAAATCTGTCAAAAC
CAAGCAATTACTTGCAGTTCGTCGATCAGTTTTAAGGAATTT---------TCAATAACATTTATCCATAAAATTTAGAAAGGTCTTT------
>CG3036 4903154 4903889|5388 chr2L 4902615 4903915 scaffold_23 1902359 1903593 + 27581|547 1322
TTGCACATCGCCAGTGAGACTCATTCGGTGCCACTGCTGTTCGTGATGAGCGGAAGGAAATGAGAGCCAAGAGGAAGATATCAACCCACCGGGTATCATCATCCGCACAAGTTAAAGTAGTTGTTACTCCCACATTGAGATTACGGGGCTTTCATTTGGCAATCCCTTAATCAGAGAACTCCAGACCGAAAGGCACCGGACACTCAGTACACAGAGAAAAAC-ATGATATGAAAGACATTATTTTT---ATAGACACTGCATGGTTTTTTTTCGCACAAACACAACACACACAAACAT---CTCATACCCATAAAAAAAAAACCCAAAAACCACTGTACACCGATGCACTCGTCTGC--TAAATGGAAATTG-ACTATATTTATAAGTAATATTTACTTTAGTACGCC-----------TACATATGTAACTGTAGGCGATATGTATGTAGCCTAAATGATTTATAGTATTCTGTATGTCCACAGAGCGCACAGTTGGCTTGGTGGAAGGACCTCATCCTA-------TTTTCGATCCACGATCA-------GCTGCTGTGTCCCATATGTTTCGTTTAATTTATAATATAGCCCATAACTACTGTCTAGCTTAGATGAACAAAATACTTATGCAAGTAGGGAAATACATGAAGATATGCCGATAATGTAGCTACGTTGA-TACAGCATGTAACTTTGTAATATACTTGACTATTTATGTAATTAATTTAAA----CATTTCTAAGTTCATAATAAAGCGTAACTCAGAAAGAAAG
T----CAAAGCCAGATTGAT-------------------TTCAAATTGATTAAAGAAAATGGAAAACTGAAAAGAA------AACCC---------CACCACACACACAAGTTATGGTAGTTTCTACTGCACAATTGAGATTAAAA--------------------TTAAAAACATAATTTTTAACTGGAA-------AATTGTCTGCAAACAGAAGAAAACAAAAACAAACAAGACATTAGTTTTTAGCAAAAAGCTGTAAAGTTTCTATACAAAAAAAAAAAGCAAAAAAAAAAATGACCATGTAGCCAGAATAAG------TAATATTTACTTTAGACTTA---GCTGATATGCATTAAATTGTAGGCGTGGCAAATTAGCAAATTTTTTTTTTGCTATCAGGCCGCAAATTTTTTTAGAATTAAAATCCTTAAATTTATGTACATAGTTTAATTGATTGTCTGTATATTGTTCA--CGTAGTGCACAGAGATTGTTTGCCAGCAAAAAATTGTACAAAAGAAATTTGTAGAGAGAGAAACAAATTTGGATTTTTGTGCACGAAATGTTCTGTTTAATTAGTTAAGTAG------ACTCTTGCATACCT-----------ATTACTCGT---ATTAGCTAATTATATAAATGCATACC------TTAGTTAAGTCGATTAATTCATGTATACT----------TTTATTATTTATGCAATTTATTTATAGATTCTTTTCTAAATTCATAATAAAGATTATCACAGACACGAAA
>Sgs1 4941367 4941424|5425 chr2L 4941341 4941488 scaffold_12 1651865 1652008 + 136|26 88
TCCT--TTAAAAAAGAATCACGTAATTGTTTTATTAAAATGTT---GTCTATTTAAAAAAATA
CCAGAATCGAACAACAACCACGATCCGGTCCTAAAACCACGTCCCAATTGATTTAAAGTGG-A
>CG14044 4944235 4944305|5429 chr2L 4944252 4945839 scaffold_6 1418307 1419694 + 45450|0 62
AATTATATGGGTATTTTGTACATTA-------CTTTAATAAAC--AGTAGGCATAACATTAGT
AATTAAATGCACACATTTCACATTATTGTACACTTTATTGAACCAACCAGGTATGTC--TAAT
>betaggt-I 4947834 4948321|5432 chr2L 4946821 4948798 scaffold_6 1420562 1422386 + 64870|1049 1551
TGGGAAGCCGCACAAAGCACGAGGGGAAAGTTAAAGCACACTATTGTATTTATA---------TTGGCCACATTTTAGCCACGCTTTTTATGCCCTTGCAGTTAGTATAT-TTATTTTATCGAAAAGTTTGTAGCGCAGTGGATGAGGCATTTGCGACCATATAAACTATATATCAGTATCACCAGCGGAGTCGATACGGCCATGTCCGTCTGTCAGTTTCTATGCCAAATAGTCTCTTAGTTTAGCAATCTGCATGAACGGGTCGTTGTTTTTAATCGGTATAAATGTTATAATTACTGCAAGGGTATATAAGTTTCGGCTTGCCGATTCTAGCTTACTTTCTGGTTTACATGTATTTTAATGCAAAAAGCTCGAGCTTTTGGAGAGAGAGATGAATAAGTTAGTATGTTT--ATTGTACAGCCTAAATTAATGTTAACAATGTGTAAGATTAAGCTTAA-AAGTAAATTAAA--GCGTCCCATGCTGAGGCATGTATTTAC
TGGGAA-CTGCACACAAT-------------------------TTGTATTTGTACGCTTATTGCTGGCAATTTTTTGCAAACGCTTTTTAAACATTATTTGTTGAAATCTGGTATTTAAGTAAAAAGTT--------------GAAAACATTAGCTGGATCCTAACGTGTATA--AGTA-----GATTGACTGGGTAACGCGA------------ACTTCTTGTACC--------------TTTAACA------ACGAACAGCTTGTTTTTAT-----GGCATCAACAT---------------------------------------CTTTAACTTTCTTTCTTTCCT------------------------------TTTAGCCAGA---ATATATTAGTTTCTATATTGTACTTGTATAGCTTAAATTAATATTAACAAC-TGTAAGCTTAAGCTAAACAATTGTAATAAACTACGTCC-------------ATATTTA-
>Marcal1 4958224 4958292|5443 chr2L 4955547 4958231 scaffold_23 1542066 1544613 - 86479|2710 2717
ATTGTGTA
ATCGTTTA
>Marcal1 4958224 4958292|5444 chr2L 4958232 4961785 scaffold_23 1546980 1550503 - 126115|0 60
ATGGAATTTAATCCTAGAATGTTTATTGAGTTAATCGTAATAAATTGTATTTGAGAATGTT
ATGTAAGTTTTTGTTGAAGTCTTTTATTGTCTAAC--TAAAGAAATATATATGAAAAATCT
>CG31652 4966275 4966400|5448 chr2L 4965667 4969067 scaffold_2 266823 270090 + 120171|615 750
G----------TTACACATGGCACACCATTTACTCGAATATAATCATGTTGTACCTCTTTCCACTCCTTTGATGTTATAAAAATAAACGACGCGATCCGTTTCGTTTCGTCCTCGCGTATATTTGAAAGTTCCCTA
GCCGTCAGGAATTGAATCGGAAGAAGCAATTACTCGAATGCCTCCTAATTAT-------TATATGCTTTTAATGTTTACTTAATAAATGATA-------TTTCGTCTTGTTCTCGCGTATATTTGAAAATTTTCTA
>CG3756 4970147 4970182|5449 chr2L 4969095 4970715 scaffold_2 270301 271964 + 60869|1065 1114
TTATTTATTTAGTTGT-------TAAAGAAATTAT-------ATTATGTA
ACATAAACATATATTTCTGTATATAAGTAAGTTATGCCTGTCAATATATA
>mRpL28 4975217 4975283|5452 chr2L 4973852 4975298 scaffold_2 6554700 6556146 - 46796|1414 1484
AAAA-GCTGTCCGCGTTTGTTTTTGAT---TTATGTGTTTAGCCTCGAACGAATAAACATAACTTCGGAA-
AGGACGCTACATTCAGTCAGCTACTATTGGTTATATGTTGAACATTAAA--AATTAAAACTCGTCTGGAAT
>CG3792 4978419 4978568|5456 chr2L 4977430 4979419 scaffold_18 1883230 1885116 + 65276|1028 1182
GCAGTGCGGATAGAAGTAACAAAAGTAGAAACAGATATACATAGAGAGATTTGAACTCGAAACATAGGTTGCAACAACTTCTCGACAATGTAGAACAAATATGCGATGTTTAAATAATTGAATTGAATAATTAAATTAAATTGAGTCC-----TA
GTTGTG----------------------------------ATTGAGTAGCGT------------TAAGGTTTAATACTTTCTCGACATAATTGAACAAATATTTAAAA--TAAATAAATGTATTAGCAAATTTAATTAAAACAATGTCTTTTATT
>CG3887 5011863 5012133|5483 chr2L 5011165 5012121 scaffold_2 5460523 5461529 - 34832|731 1048
TAGCATTGGACTGA-----------------CTGGACGGACGGAGGAGCGCGGAAAA-------CAGCAGTTGGACAACACCAAAACA---------------------------GCCGCAGACATCGATTTCCGGCTCTGAACCTAACTTAAACATAAGCTCTTGTCCCGACATTATCCACTTAGCTGTATTTCTGTTTTCACCCCAACTATAGCCTACTCTACACATCCTAAACGCATCCAATCCGAACCGAACAAAATCGCATTTGATCGGATTTAGATGGGAT--------ATAAAGTTCGCTTTAATTTCAAT
TAGTAATGAGCGGAGGTGCCGACAACAACTGCTGAACAACTAGAAGAACACCAAAAAAAAACAGAAGCATTAAAACAAACATAAAAAAAACATATTAAATCGAAAACTGGAAGAGGTTGCAGACGTGGAT------ATTTAGATTTAACTAAAAC----TGTTTTGTCTCTGCGTTACGTAA------ATATTTATGTGTTATCCTTGTTTAT---------------CCTTAAACGTTGTCAACC--------ACAAATTCCCCTCAAGCAAGCTATATATAGTATAAATAATGATAATGTTCGCCTGTCTTTCAGT
>CG3887 5011863 5012133|5484 chr2L 5012122 5012818 scaffold_2 5462189 5462849 - 2882|0 11
CAAACGAAATTT
CAATCAATATTT
>Cg25C 5036738 5037114|5506 chr2L 5036430 5037282 scaffold_2 5490688 5491535 - 23496|308 715
GACCTCCAATCCCAACACAGACACACCCACAGCACAGAGCATAAGTTTAATCTAAATGTAAAGCCTTAAAATTACCAACGAATCGTGTGCACACCCACACGATCACAACACAAACACAAACA---AACAAACCAACACACACACACACATACATACACCGACGAACCAACACTGCTACAAATTCCTTAATCTAACCAAAAAGAAAAAAAAACGGATCCACAAGTCGAAGTGCTAATTACCGACCGACCTGGACCACAATGCCATTTTT----TATCTGCCAATT------------------AATGTTCTAAACAAATGTAAACTGCTTCTAAGTTACGTTACGTATGTTAAGTAAATGAAACAAATAAATAAACTAGCCTCGGTCGTATGTCCAAA------AGTAT
G--------------------------CGGACCACACGCAATAATTTTAATCTAAATGTAATGCCTTAACTATACCAACGA---------ACAAACAAACAAACA-AACAAAAACACACTCACACACCACACAAACACACACACGCACACACACACTAGAACCGAACACCTGCTTACCAAATTCCTTAAACTAACCAAAAAGAAAAA---------CTACAA---GAAGAGAAGACGTTGGACCG-CTCGGAACTCGTTGCCATTTTTTTTGTATCTGCCATTTTTTTACACGTTTTGCCAAAATGTTCTAAACCAATGTAAACTGCTTCTTAGTTACG---AGTAAGTTAAGTAAATCAA--CAACAAATAAACTAGCCT-GGTAATATGTAAAAAAAAAACAGCAT
>SP555 5040061 5040818|5509 chr2L 5039806 5040392 scaffold_2 5495505 5496183 - 16657|255 685
AGCTC----------GGATCGTGTCCGGTCAACGTAA----GCTAAGTTTATAGA-------------------GTACGTCCTCGCCCCCAGGTGAATCAGCTGGAGATGTGCATTATGAATTACGATTTGTA----------------TGAGGCCCGTGAATGATTTTA--GTGCCATCACATATTGGAGTGCCCAATGACTACCAGACGATGCAGTGGCTCCTCTGGG----ACGTGTGCATTTCTCGTAGTAGCTTTAGAGCGTGCTAAGTTTAAGCATTCGGAAT-----TTGTGTGGATAA--------------------TAGTCGTCCGACCTTTTGATTTGTCTTCAT-----------------TTGTAGCGAAAATGTGG--GAAAATAGGCCAATTTGGTGCAATATTTGTGATATAAGA
AGTTCCACTTTGGCTATAGCATATAGGGCATATGTGAATGTGTGTAGCATATAGATATCTATGATAACCAATATGTATGTAT---ATTATAGGTAAATGAGCAGGAGATGTGCATGATTAATTATGATTTAGAAGTGTAAGTCCCGAAGCGTGGCCCGTGAAACTCTCTATTGTGCCATAATTTGGGGGTGTGCACTCTT-TGAAAATATGATGAACCGAGTTCTGTAAATCTCAAGTATGAATTTCAAGCATT--TTTCATGTTACGAAAAGTTT-TTTGTTCACAATTATTATTATGTAAAAAAAAATAAGAGCATAAAAACTCTATTTGTTTTTGTTTGTGATTTTTCTCTCTAACGCTTTCTGTTGAAATTGTAGCAAAAATGTTTCCGGTAATAGGCCAATTAGGTGCAATATTTGTGATATAAGA
>SP555 5040061 5040818|5510 chr2L 5040431 5040594 scaffold_2 5496242 5496464 - 1899|0 234
AGAAAATCGCAAAATAAT---------------CTAGAGCTAAGCA-----------------TATTTTTCGGTACAGACGAGTGTGAAATCTAGTCAAAAAGAACACGCTGCTAAACT---------------AATTTTGTAAA---TTCGC--------AGACAGCAATTAAGGCCTAAGTACTG------------TAATGTAACAAAATGAAAATGTG-TCTAGTCATAAA
AAAAAATTATATAATAATAATAATTTCTGATAACTAAAGCTAAGCAATATAGAATTATACATTTATTTTTTGGT----ACGAGTGTAAAATCTAGTCAAA--------GCTGCTTCACTTTTGTCGAGCCCAAAAAGTCTGTAAAAATTTGGCAGCACATTAGGCAGCTAATAATATTAAGCAAATGTTAATAATTAATTAATTTAAACAAATCAAGTAGCATTCCAGTTGTAAA
>SP555 5040061 5040818|5511 chr2L 5040601 5041914 scaffold_2 5496656 5498082 - 54774|0 233
ATAAAGCAAAGTGTAATTTAGTAAAAATTATTTA-GTACGCTTTATGTAGATTTTTGTTTCT------GTTTATATAAATTACTACACATAATGTAATTGATACATGACGAA-ACAAACGAAATAGTATTGAAAAT--TAAATTCGTAAGAAG----TGCTCAAAAGAATTTGGCGATATTGATTTGCAAT-TGTCACTTGAATTTACATAAATAAA-CATAAATTTACTAACT
ATCAGACAAA---TAATTTAGTAAAAATTATTTATGTATTAATATTGTAGCTTCTTAGTTTTTTTGGTGTCTATATAAATTACTACGATTTATAAATGGGGCATGTGTTAAGTATAATCAAATCTGTAGACAAAGGCATACAACAATAAAAATAATCTATTATATAATATGCACAGATATGCATATACGGTATGTCACATGAATTTGCATAAATAAAACATTAATTTACTAACT
>CG31919 5047779 5048366|5518 chr2L 5047231 5048751 scaffold_2 5504323 5505913 - 28353|562 1234
A-------------GGGCTTGTCA----------------TTCCCCGTTCAACATATTCG-TATTCGTTACGGTTTAAATATCTTTG--TTTATTGAGTCTGTTAACACGTTTTCTATAAAATTGCACCCGATATCGTTGTAAAATCCTACTTAGAAATTGCATACGTCCTTATTTGTTTGCATTGTGTGCGAGATCGATTGTATATGGGAAAA-------------GTAATCTTAACGTTTGCGTAGTCAAATTAACATAGTGG--------ATACATACATCGTTTAAATCTTCTATATAGACTATATACACATGCCTAGTAAACATAAAATGTGCAAGT-----AATTTAGTGAAAACTCTGTGCCCAACAGGATGTGCACACGGAACTCGTTTTGAAAAATGCGAGATTTGCGTGAAAATTCTGTTCAAAATTTGTAATACATCGTAAGAAAATTAATATCACATTGGAGTCCGTGTATC--------GAAGTTGTTAATTAATCTGGCGTTGAAATTG--------AAATTAAGG----------AAACTATTGCAGAACCTTCCTACACACTCGTCGC-CAATTTACAAAAACTATACGCTACCTATCATTATAGCAAACATATAAAACCTATATAATCTGAAAATAAAATTCCTAAAGCGCAATCA
ACATGGACAAAAATGGAGTAGTCAAATAGATTCTAGACGTTTTGTAGCTCTATAAGTTTGATCTATAATAATGTCCAATTGACCTAAATTTTATGGTATATGTTATCATATTTTTTGTAGG--CATATTCTATAGGGCAGTTAGTTCTCATTCGTAA----TATTTGTATGTATATTTTTTTTTTGTAAGCGCAA--AAATGTTTAAAGAGAAACGATACCAATTTCATATTTTATAATTTTTCACAGTTTTCTCTATATAGTTGCCTTTATTGTAAACACGCAGTTAAAGTGTCTTA-----ATTGAATACAAGAATATTGCAAAAGTCAAACTTTGGCATTGTCGAATCTAAAGAACATGTTAAATACATTTAGAC-TACATATGGGTTATAAATAGATAGAT---AGATTCCCGCTATGTGCATGCCTAAA---TGAAATGTTTTTTTATAGTGT-------GCCCAGAAGATCGTGTACCTTCAACTAGACGCATTCAAATACCCTACATTTTCACATACATACACTACACTAAGGGGCAATATACAAACTA-TGCATACCTATGCTACATACGTATTATATAATTCTATAAATATATAAATTACTTAAATAAATACCAGAAATCGCACACAATCATTATTT--AAATAGATT--------CGTTGTTA
>CG14040 5054379 5054577|5521 chr2L 5051156 5055010 scaffold_2 5509609 5513361 - 140633|3352 3589
TGCTGTAGCTTGTCCTAGACGTAATCTTAGACTGTAAATAG----------------------TTGTGGAAAAGTGCCTGCAAATGTTTTAAACGCCAGACGAATGT---ATTTGACCCCAGGCTTTGTGCAATGCAATAGCAACAGGCTTGTAAATACCAAAACTTTTGCTCCTCTAGTTTAAGATTCTTATTTTA--------------ATCAGAACATAAATGCAATCAAACGAA
TAAAATAGTTG---------GTAGTCTTCAAATGTAAATAGAGCTTGTCGGCATTGTGTCTTTGTCTGGAAAAGTGCCTCCCATGGTTGAGAACGTT-GGCGAACGTGCAATTTGAGTTCGTG-TGTGTACA---CGTTTCTTGTAGGTATGTGTATAT--AGCATTTCCCTTCTAGATATTACCATTACTTTTTAAAAATATAAACGAACACCATTACATAAAAAAAAGCAAAACAA
>His3.3A 5055760 5056000|5522 chr2L 5055012 5055931 scaffold_2 5513604 5514569 - 28260|838 1017
ATGCCCATGACCGCCATCTTGGATTGGAAAAGCAGTGGCGGCAAAACTACCAACCCACAGCTGTCGCTTGGAGGGGGGAACTCGGAGCTAGAGGTGGAGGTGGAGAAGCGGAAAACCAAACCCCCGGCCGCAGCTGCCGCCGCTTAGTACTTAGGTCTAT--------CTATACTTACCG
ACA-ACGTGTCCGCCATCTTTAATTAGAAACGCAGCG-----------------CAGTTGCTGCCGCTGACAAATACAACAACAAAGACAACATCGACGTCAGCGTCGCTG----CCAAAT-----GCAGCTGCTGCGGCTGCTTAGCCTTAAGTTTTATAAGATTTCTAATACTTAAAA
>qtc 5070304 5070750|5536 chr2L 5068256 5070827 scaffold_30 1449155 1451874 - 44971|2320 2810
GGTCCTTGTTCGTCGTTACCCATGGCGTATACTTATTATTAACACTTAGATTGCACGCCAAAATGAGCAAAACGATGTCTACGATTTTGGTTCGCGCTAAATTGCATTGTTT--TCAGCTAATTGGCTGGCGGCATTAATTTCAATTTTATTTTGTTAACTGAA--TAATTTTGTTAAA-----------------TTTTGCAGGCGCCCGTGTTAAGTTCTCT------------CTTTGGCAACGAAGTGTATAAAAT-----TTTCCCATAAGTTAATTTTTACGAACATATATATTTTGTGGTCTAAGGCTTAAGGCATACTAGTACGTCCTTTTTATGAAATACGAACATCTTGAGATAAATACAATTTTACAAAATCTACGTAGTTT-----TTGTAGATCTAGC-TAATCAAGTGAGAATAACACCATCATGTTTTGTGGAGTTTCAGTGGAGTTTTAATGGCAAATAAATGAAAAATCTGAGT
A-------------------CAGGGTTTTTATTATGAATTTTTAATTAATTTTTTTTATAGGTTCTGCAAAATAATGTTTTATTTTTTTAGTGCAGCTAAATT-CATTGTTTTGTGTGTTGTTCCGTTAACGAATTTATTTTCAATTTTATTTTGTCATGTAAAATAATTTTTGATAAATTGAGACGTACCGTTCCTTTTGGCGGCAACAACGAAAGATATTGTAAGCAACAACAACAACAACAACAAAAATCAAAAAATGTAAATTTCCTATTCGCTATTTATTTCTAA-------ATTTTGT--TTTAAG----CAAGCATACGAGTACGTCCTTTAGA--------AAGCAAAATAATAAAATTAAGATTTT---AAATGGACCTGGTTTGTCAGTTGAAACTCAGGCATAAGCAGAGTCAAATA-------TAGTTTTGATCGTGTTTCAGTGAAATTTTAATGATAAATAAATGCTAAACTAGTTA
>RpL37A 5071756 5072055|5538 chr2L 5071607 5072161 scaffold_30 63525 64079 + 11801|149 463
ACATAAACGGATCATTAATGATGGAACCATCTAATTGAATGCTCCGCTATGCT---AGCTCCCGTAGTTTTAATCTGACAACGCG-ATTTTCCTGTGGTTTGCGCCGTGCCGGTCATGTGAAAATAAAAAAAAATGTTTTTTACTTTTAACAGTATGCGCAAGTGATGCTTATTTAAGTGGAAAACTAAGTTGGAAAGTTGTGCGAAAACGAATCCAAAATTCCCCCTTTGGCTAGTTATATGG---AAATGATACTTCTGTGCACTCGTGATTTATGTTCTGTGTGCAAAGCTGAGAAGTTCGA--------TT
-------------ATGGCTTATGGGAT-------TTCAATGCTCCGTTACGTTTAAAGTTTCCGTAGTTTTA--TAGACAACACACAATTTTCTGTGGTTTGCGCCGCGCCGGTC-------------GAAAGAGCTGTTATGCTTTATCTAAAAAGCATAAG--------------GTGAAAAACAAAAAAAAAA--------GAAAACAAAAATAAAAATGATTTTTTACTCCAGTAGATGGTAAAAGTGATATTTTCATG-----ATACCCTGTAATCAATGTAAATTGGTAGGAGATTGTACCGATATTTT
>CG5828 5095192 5095439|5562 chr2L 5093957 5095224 scaffold_30 1477471 1478730 - 55645|1258 1291
TCCAGGAGCCACTACGTTCA-TTGTTATCCCTTG
TGCCGGGCCCAGACGATTCATTTGTTATGCAATG
>CG5828 5095192 5095439|5563 chr2L 5095382 5095540 scaffold_30 1479155 1479320 - 1895|0 57
CCCACCCATATAACCGCAAAAAAACTTTTAATAATTAAAAACAAGAATATATAATAAC
CACACGCACACACACGCATAG-----TTTGCTTTTTAATTATGAAAATTATAAATAAC
>CG4230 5098385 5098613|5566 chr2L 5097536 5098894 scaffold_30 368501 369713 - 43245|858 1098
CCAGTGGTGAACAACTATTGCCCCAATCAAGATAAGCGATCTCTGCT---------GCAGCAACAGAAACAACAGCAACAGTACGAAGATAGGCTAAAGCGATTCGTCGGCAACATAGTCCCGCATCCACACAACATCCAAATTAGAACCTACTACATTTTAGTTTACATTCTCCTTAGTGT---TTGGTGTTTTAGATGAAACGCACTTGAGACAACAGATGATGACGACGATGATTATT
CCAGTGGTGAACAACTATTGCCCCAATCAAGATAAGCGATCAATGCTGCTCCTCCAGCGGCAGCAGCAGCAGCAACAACAGTATGAAGATAAGCTAAAGCGATTCGTCGGCAACATAGTC------CCACACAACATCCAAATTAGAACCTATTACATTTTAGTTTACATTCTCTTAAGTGTTTGTTGGTGTTTTAGATGAAACGCAATTGAGACAACAGAT------GACGACGATTATT
>Msp-300 5157985 5158264|5603 chr2L 5153204 5164182 scaffold_2 3489280 3501383 + 263825|5577 5962
-GATGCCACAACCT-------------TAACCATAAGATA-------------------AAGCCAAT------------------------------------CTAGGACTAGAT-----------------------------CAAAGCCAAAGCAGCCACCCCGGCGTCTTC---CGTTTGCCCCTGCCACCGATTTCCTTCTCCCA--GGAACGGTGGCTACGG-TACAACTGTC--AACTGCCGTCATTACTCTAATCAATGAAACATGACCCGTGTTTTAGAATTTACTATTATCTATATATATATATATATATATATATACATACATATATACTATTTTACAGAATAAATTAAATTACCGAATTATATTTATAAAACGCA
AGATGCCGCAAGCTATGGCAAAAACAGTACTTATAAGTCATAATTATATATGTGTATATATACCGATGTATACATATATATAAATATATATATACCATATATACTAGGACTAGATCGCCAAAGAAATGAAATTGAAAACCAAAGCAAAAGCTAAGCAGCCACCGCGGCGTTTCTCGGCGTTTACGGCTGCCACTG-CAACAGTCTCCCAATGTGGCAGGGGCAGCAGCTAAATATGCCAGAGCCGCCGTAACTATTATATTATATAATATATA--------TATATAACGTAC-ATGACCCAAATGCTTAAGAAAATTTACAAAAAAAAAAAAAGA-AAGATTTAAT-------ATTAAACTA------TATATTTTTAAAATGAA
>Msp-300 5205348 5205690|5657 chr2L 5203857 5207125 scaffold_2 3538696 3542137 + 70378|1690 2115
AGCTGTCGAGTTGCAATTGGATTAGTGCAATGAAACACGATCAAAAAAAAAGTCAAGAAACC------CTATACCCTAAGA--AGAACCC----------------------CCTATGAAAAACGCCCTATGAAAA-----AACCCAGT---TTAAAGATGCCTTTTGAAAGCTAAATTTCAAGTAAGAAAAAT--TTAAACAAA----AAAATGTTGAATATCG--AAATGGAA--------GAGTTGTACATTTGTGTAGTTTATCACATTTTG-------------TAATTGTATGTAATTTTATAGTCATTCGATAGCTAGAGGCATTAATAAAACAACCAATTTGTATATAACCT----------ACTGAACCGAACAGACTCGACAAG------CCGAACATGAAACACGTAAAAGAATT
-------TTGTTGTCATTGGATTAGTGCAATAAATTCACAGTAAAAACCAATTAAAGCAAACAACCAAATGTAACCACAGAACAGAATCCGACACGAATATAATATGCCTTTCAAATTAAAAACAACAAATGAAAAGAGACAACCCAATGAATGAAAGAAACCCACAGTATACAAAATT--------GAAAAATTCTTGTACAAGATTTAAGATGTTACCTAGCGTCAAGTCGAGTGTGTTATGTCCTGTAAATTTTTGTAATTTTCCACAATTTGAATGAAAAAAAAAAAACCGTGTATTTTGTT-------TTTGATATCTACAGACAAACATACCGAAATAAATATGTACATAATATATAATGAATAACCAAATCCAACA-ACTCGACGAGCATATACCTATAAAGAAACACTTGATTAAAAA
>Cyp28d1 5212380 5212450|5665 chr2L 5212305 5213339 scaffold_2 4044225 4045286 + 45005|78 155
TTATTCAATAATGTTACGACTTTATATTAAATATAGTTTATCCAGTTGCATACATGTT-------ATATTTCCAAACA
TTATAAAATTA----ACAACGCTTTTTCACATATATTTTGTTTTAATACGTATCTCTGCATTAAAATACGTCGAATTT
>TpnC25D 5218956 5219059|5676 chr2L 5218918 5221651 scaffold_57 325639 328240 + 88965|45 158
AAAAACCACGAACGCTGATAAAACCAACAGAAAATCGAGCT--TTTGGGTTTAATTATAATTTTTTAT---TATTTTTAAATAAA-----TTAACTAACCGCTTTAATACAAAA
ACGAACCAAAAAATCAGCTAAAG---GCAGAAAGTTGACCCCATTTGAAGGAAATTATTGTTTATTATAATTATTTGTAAATAAAAATCGTAATTAAATTGATTGAAGATACAA
>CG14033 5244001 5244239|5694 chr2L 5243513 5244138 scaffold_26 89247 89949 - 12808|579 716
TGCAATCTCTTCAAACAGACCGTCGGCTGTCCCAGATGTGGCCTGGAGTTCAAGGGCCACCAGCTGAAGGCGCATCAATCTCTCTGCCAGGGTCGCAAGAAGCACTAGGACGGCACCTTATACGAACCATACATTAAA
CGCAATCTCTACAAGCAGACCAGCGAGTGTCCCAAGTGTGGTCAGGAGTTGCTCGGCCATCAAATTGAGGCACATCGCAAGCTCTGCAAG---CGCAAGTCGCGCTAGGA-------TTATTTCTACTATACTCTGAA
>Cyp4ac1 5265797 5265899|5706 chr2L 5265003 5266943 scaffold_16 1180137 1182298 + 9657|964 1066
GGAATATTTCCTAGTGTAAGTTTATGGAAAACGGTTTGCCAAAGAGCTTTTATTTGTAATTTGTTTAGAGAAACAAATAAACCAGTAAAACGATTGAAACTCT
AGTAGATCAACTTAAGTAA------AAAAAACTATTCGGC-------------TTAAATTTTCTTTAAAT-----AATAGTTGCTGAAGCTGATTAAGATTTA
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TGCATAATAAATACAAAAATGTTTTCCT
TTC--AATAAAAACAATAACAAAACTCA
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TGCCTTATCTTAGGAACCATATCAAGAATGAAACTGTGATCACCACAGTCAATGCAACAATT
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TAGC
CAGC
>nompC 5362978 5363640|5803 chr2L 5362998 5363799 scaffold_6 280247 281118 - 22277|0 772
GCTGTTTTGGGAACATATTGAG----AAAATAGT----------TAATTAATCTGGAGAACT---TGGCATGCTCTGTAAATCCATCAACTGCCCAGACTTGCATCTTCCAGGTTTTTTC-AGGAAAATAATGTTAGCAATCTGAGGGATACA---ATTTTGTGAAAGTGTATCTCAAAGATGGAA-----GCCTGCCGCCT--------------TCTAGTGTAGTACA--------------GTGCAGAGTAGCTTTAGTGGATTAGCC----GCCTTGAAGTGTGCCCTGCTTTTGTGACCAGTGTTGAGCGAGGCCAAACCAGAAAGTGTTGGTTAACGCATGCTTACAAAACCTTATATATAGAAATCGTTGCTGCATGCTTATATGTCTGTGTTTGTCATTGTCTAGGACTTAAGTCTGAAGAGA-TACACCAATATGGTGGTTAGGTTTTGTATGGTAATTTTGTGATTGCCATC--------------------------------------------------CAAAACAGGCCTCTGAATTTGTGTATTTCTATTATTAACAACCTGATTTTTGCAGCTCTTAAGTTACGTAT-------------TAACAAAGTAAAAACC--TGTAAAATCCGAG-GCTT--CTGTTCACGAAACTCATCC-CGTTTATTCCTTTGTTCTTGTTCTCTCCTATAT--CATGTCTCATCCATCCAACATCGCGCACCTCGCTAACCAATAATAAACTGAACAAAAAAAAAAA
GCTATTTTAAGAATGTTTATAGCTTCAAAATATTATCCCGAATATTTTTAGATTGAAAGAATGTATGGCATATT-------TCCATCAACTGCCCAGACTTGCATCTTCCAGGTTTTTTCCAAGAAATTAA----AGCTATCTGTTAGATACATATACAACGGTAACTTGTATCTGACAGATAAAACACGCGCTTATAGATTAGAAAAAGATTGATTTGTGTGTACTCCAACTAAATTTCGTCTGTGTA-ATTAGCTTTAG--AATTAGTTCAAAGCCT---AGCGAAAGTAGCTTTTGTGACCAGTGTTAAGCAATACGAGTGCC--CAGTGTTGGCAAATGCATGCTTTACAAAC--------------TAACTGCTGCATGTTTCTGTGTCTATGTCTAT----GTTTAAGTCTAAATACAAAAAAAAATATACCAATAAATGCGTGTGGTTTTGTATAGCAATTTCTTGAGTATCTTTAAGATACAAACGTGTGTATAAACAAGTATCTACGGTTAGAAATTGTTGAGCAAAACCAACGTCTACATTTGTATATTTCTCTTATTGA-AATTTCTCAGTTGCAGCGCTTAAGTTAAATATATATGAACAAAAATAAAAGGGAAACAACAAATGTAAATTGTGAACGCTTGAAAAATCATGAAACTCATTTGTGTAAATCGTCGTGTTCTTGTTCTATTCTATATATCATGTCCCA-----CCATCATATCATA------TGATCATT-----------CAATGCGAAAAA
>H15 5415895 5415928|5878 chr2L 5415891 5416916 scaffold_6 345577 346652 - 7217|4 37
GATACAGCTACCAACGAAAACAACTAAACCACCC
AATACAGTTT---AAATAAACAAATATATTAAAA
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GCGGACGGTGGAC----CCAAG-------AAAAACCAGTATTAATCCAAAAAAGCA
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AAACGAAAAGAA--AACCAACTAAGTAAATGTTGTAAATTATTTGTTATACATTAGATCGCTCTCTCTCGCTCTCCCTTTCGCTCTCACTCGCTCTCTTGCATTTTTGTTGTACAAAATTTCCAAAATTTCGACCCGTGTACAGTTT-----ACAAATGTTTAGAAAATTTT-GTACATTAGCTTAGAAATTATTGTAAAAAGTGTTTAAATGTTGTTCGAAAACTCATCTCAGTGTAAAGTTTAAACAAAATT--CTCAACAA--AAGCAAAACTATTAAAAAT---TATTAATAATTAAAG----AAATAATTAAAAGCTGC-TTCACCTA-----TGTAAACACTAAATGTTAGTTATGCTATACAAAAACCCTATATATATAAATAAATATATAATAATAATATATTCCTAGTATTAACA-TAAATTCATAGACGCTTCAGTTAGTTTTATTTATATGAACATTTTAATTTAAGTTTCAACAAAAAATTTTGGAAAACAACAATCAAAAAAAAAATTCTAATAATAT-ATGTTTATTCAGTGTGAAC--------------AAACA-AAAAAATATTTAAAGAAAATTTATTAAACAAA----------------------------ATAAAAAT--ATTAAAAAGTAATA-----ATGTGAAC
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GTCGTATACCTTACAT-----------------ACATTTATTTTGGAACTTTACTC--AATTTGGAATACACAGAAGACACACACACAGATTCAATTAAAGCGTCC--CTCAGTAA
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>CG31915 5530165 5530668|6037 chr2L 5525940 5530455 scaffold_6 497943 502673 - 121947|4510 4858
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AAGCATTTTTA--AAATAGAATTTCCACAATGCCAAATGCCTAGAATTAATCTTACTTAGTTTTAAACATAGTCTGTACCAACTGTGCCTTGTAACGTTAAAGCCTACATTCACTTGACGCAAAATGTTCCATTTAGAAAAAAATCAGTTGCAAAAATTTTATAAACAACGCAAAATGATGTTTCGTGTGGAATGGTTGAACAATTCTTTGG---TTTGAAATT----ATATATGTTTTGTTTACGAAAAGCTGATTTATTATATAAGAAATAATAAGTTTTTTGCGTCAAGTGGATTTAGACCCGCGGGAAAAAATATTGTAC---GTACTCTATATCTCAGCTACCA
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AATATTTCAGCAACATGCCATTGTCGTAGCCATTAAGTAGGTTCTAAACGTTATATAAACTCTCTGACTTTATTCCGCTCACAAGTGATGTGCAAACAGTA
AACATTTTATTAAA----TATTATATTACCCATTCAATATGA---AAGCCTTTTAGAAA------GCCTTTAATTTATTGGTCAGCGACTATAAAACTGTA
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TTTCA-------ATTTTTGCGACCTTGCAAACTGAATTTCTCAATTATTTAGTTTTACACAAATCGAATATTGTATTATTTTGCATTATAAA------ATGTACATAT
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TTATTTAGTTATAAAATTATATTTGAATGGCGAATTTATGCT-------GAAGTTATT--ATGTTTTTTTTTGCATTATTTTGTTAAATAAATTGAATGCAAT--TCATGTATTATAGACTTTTATAATGGCCTGCAAGCCCCGTGCGAATTCGTGCAATATTACTTTGCCCACCTGCACTTCGTTCAGGCCCAGCTCCTCGGCCTCGGCAGCCTGCACCAGGATGCACTCGAGCAACGCTACATTCACGGGCTGTTTGCACACATTCACCTCCTTGGG--CGGCGT------------TGATGGCTGGCTGGCGAAGAGCTGTGCTGGCTGCGGCTTCTTAACCGCAATAGCGGCATTCGGTGGCGGCAATGTGATTAT-ATTCTCCAGATCCAAATCGGGCAGCTGTAG--------AATTTGTGGCGTTGGAGCTACTGG-------CTGTGCGGCCGCACCAAATTGCTGACCGGCAA-----------ATGCCGCTGATCCGGGCGCGGGCTTGAGATGAATATTGATGCCAGCCTTGGCCGCTGCAGCCGCTGCCTTGGCACTCAGCGCAGCGGCGCGTTCACGCTTGGCGGCGAGCGCCGTTTTCTTTGGCGGCGTCG-------CCACAGCCAGCCGCTCTTCGGTGTTGCGGCAGCCTGTA------GATATGTAGATTGCGGAATGTGTAGCCATATGCTTAAGCTGCCATTGGGACTTACCAATGCATTTGCAGTAAATCGAACAGATGGCCATGGATTGATAGCAATCGCAGTAATTTTTAATGCATTGCGAACGCTTGCAGCAGCAGCCTTT--GGGCGCCTGTTGCTTGGGCTGTCGCTTTGATTGCTCTTTGTTAAAGTAATTACCCGACCTTACCTGGGACATTCTATTTTTTTTTTTTTCAAATATTTTCTGCTATACGCCTGACAGCTGCT
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ATAAATGTTTGTATTATATATTAGTTTCGCACTAGTTAATCTATTAAAGCTTAGTCAAACTAATTACATAGTTAAATATATATTTATATATATATTATTTTTAAATTGTACTTGTAATAAAGATAAAATTTGGTAAGTACCT-TCGTTTAACAAGTGTTAATAAATTTTTATGTTTAACAAATATTTAGTTATCGCTACATTTTCTATATATAAATGTATATATGTATATAATATGGCATGGCTTTATGTTATGATATTGTTGTTGTTGTTTTTGTTAATA-ATACTAATCAAAAGCTAA---AAATTGTAAAATAATTTGGCGCTGTTTTATGATCAGGCCCTAGTTACATATGTTTACCTAAATATA
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AATCAAACGCAGCACAACACAACTCTTTCCTCTTTGCTGAACAAGACAAACA-AAATAAGCACACACGAAGATCATAATTTAGAACCCAAAAACACACACACCGAGGTACAGAGATTTATTATTCAGCTAAGTTATTTTTTGTGGCCGCAGCGCCAATTATTTAATCAAAAACATTTGTGTAGAAGACATCCTGAA
TAGCAGCCG-AGCATATAATAA------------TACACAGCCAGACAAGCACACACAAACAACAACAAACAAAACAAACAACAACAACAAATAAACAAAACAAACAGACAGAAGTATATTA-TCAACTAAGTTATTATTTTTTGTGGCTACCCTAAGTAGTAAAAGAAAAAGAATAAGAAAAAAAAAAACGTAAA
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ACGGCGCGAATGTG----ATTCACAAAAGCAAGAAAAAAGCGAAACAAATGAATAAATAA-TATAATTATCAAATATACATAAATACTACGTATAAATTGT---TAGGCAACGTATCGTATAATT------------ATGAAAAGTACATA--------TATATATATATTTATGTAGCTAACGATGTGCTAGCCTCTGTTATAGTTAGTTAAAAAACTGAAAACAAATTCAAAATCACAAGACA-------CATGCAGAACATAAAT
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TAATGC
GAAT--
>Oscillin 5549444 5549614|6051 chr2L 5549411 5549560 scaffold_6 524569 524725 - 3522|37 158
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AGCCTTATGGGTGTACATTCCCAGCTGATAGAGGAGCAAAAGACAGCGAAATCCTAGA-ATTGGCGTGCCTCG-ATCGATTTGGAATCGACCAGGAACAATAATAACAATTAATTTTGTAAA
>Oscillin 5549444 5549614|6052 chr2L 5549561 5549710 scaffold_16 2619205 2619359 + 1080|0 55
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TTAAAACTGCAAGTTATTTAATGTACAACAACCACAATATTGTATTGGCTGGCTCT
>CG14017 5554367 5554552|6057 chr2L 5553918 5554669 scaffold_7 740182 740938 - 285|470 657
ACCATCGTATTCGTGAGCACCCGAGATTCCAAGGGCTTCAATATCTCCGGCTACATCGATTTGGAGCACAGTTTGCGTAGATACAAG-ACCGCTGGATCGAAGTCTCATCCGTGGGCA-GATATTTTCGCCGGTCGCCGCCGCCTGGAGCCCAATCATCAGGATCTAAGCTTCATCAATTGGAGCAAC
ACCATTATCTTCCTGCAAGTACGACAGCGCAATGGCTCCGATATATCGGGATATATTGACTATGCGGACAGCTTGCGTGCCTGTAGCCAGCACATGCTTGGGGCT--ATAAATTGGCGTGCCGTTTTCGAGGGTCGCATTATGCTGCAGCCCGATCGCACCCACTTGAGCTTTTATGACTGGCACAG-
>CG14017 5554757 5555140|6058 chr2L 5554670 5554973 scaffold_2 382463 382818 - 81|103 358
TTGCTGCCAGATCACATTATAATCGAAACATAAATTCAGAATGCACTTC--AACCGATC-----ATCAAAGAGCTTTTACTGG---------CAATCAAAGCATTTTAGAAATCA--AAACAATAT-----------------CGTGATCATGAAACTGGCAGCCAGGGAGAGGATAAACAATCGCCAGACT----GACTGATGCCGCCGACGTCATGGACAAGCGTCGCAGGGAAAATGCGCGAGAGCAAGTTGC
TGGAAATCCGTCAAAATTAAACTTGAAAAAAACATCAAAAGCGCAATTTTAGACCAATTTCGAAATCAAAAAAGTCTGCCAAGATCGAACAACAGCAAGAGCATCACAATATTTGGCACACAATATGAAAAGCCGCTGACAAACATAATTATGG--CTGTATACAAAGAAGAAAATCAACAAAAAAAAAAATTAATAACTAATGCCGCCTACGTCATCGACTA-TGCCACATGGCCAACATGACACACGGCACTGC
>CG14017 5554757 5555140|6059 chr2L 5555006 5558217 scaffold_2 382839 386157 - 138008|0 152
GTGAACTGGAGAGAGCTTCCCATCGGCTGAGATGACATTCTTGGCCGTGCCAGTGAGTTCCGGCAGTCAGTAGGCGTGCGAAGCGCTCCAAGACTGGGTGCTTCCG-TTGCGTGAA-----------------AATAAATTGTGAAGAAGAAA
GCGAATCCGAAAGA--TTGCCAGTTGAAGAGCGGACA-------------CAGTTGGGCCGTGCGGTCAGTGTGCGTGCTTAGCGCTCCAAGACTGGATGCCTGCGGTCGCTTGGACAAGCATCTGAATATATAATAAAACAATACAAAAAAA
>GluRIIA 5558698 5558994|6060 chr2L 5558245 5559458 scaffold_2 386477 387544 - 22972|462 758
GTGGTCGGAATATTGGACGATTGGCGTCTTCTACTTTGGCATTTCATTAGAGAGTCGCATTGGAAATGAGGCACTCCATGGTGTCCACATTGTATATTGTGAGCTATATTTGTAGAATTATTTTAGAACACAGATAGCGCATTTGGGTATATTGAATGTTCTGAAGATTTAACGAAACTTTCAATGAAATAATTTGGATAACTAATTTTAGTAAACTTTTCTGTTGGCTCTAATGTTTTAATAGTTGACAATAATTGATTTTCCTTACAAAGATTTAATAAATAAACATTAAAATAT
TGCATAAG----TTGGAGAATT-----------------TATTTGGTTTCTGAATTGCACTCGTGTTGA-ATAAACCATCTTGTTTTCTAGAGAAATT-CAGGCTAGA-TTGAGTAATGATTGTCTCGCGCATATCGC-----TTAGTATATATATGTATATATATATATATAGAAATTCTAGAGGG--------------------------------------TGTTTTAATTTTTTTATTGGTCACCATATTT--TTTTCATT-------------------------------
>GluRIIB 5563405 5563502|6061 chr2L 5559460 5563523 scaffold_2 387695 391881 - 139653|4211 4325
GGGAGTAAAAAGGCTTGCGAACATTCAGTGAAATACGATTAAGATTAGGATAAGGATATTTTAAAATGGATCCTTTAAAAGC-------------TCTACAT----ACGAAACTT
AGCACTGAACACGCTTGC-AACATTCATTCAAATAGCATT--TCTTATTGTTAAAATATAATAAAATA----TTTTTAGGGCACACAAATGTGAGTTTGCATCAAAACGAAAATT
>CG18266 5598400 5598636|6106 chr2L 5595935 5598446 scaffold_2 442791 445566 - 35602|2814 2861
AATTCC-TTGGAGCGCTCTCACATTCGTTAGTCCATCGCCATTTCACG
AGCTCTATTGGAGCTCT-----AGTCGTT--TTCACCGGCATTTCAAG
>CG7235 5670680 5670842|6206 chr2L 5668932 5670683 scaffold_2 559948 561720 - 102361|1778 1781
TCCT
GCCT
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A--------TAAATAGCTGCGAAAATGTTT
GGCGCAGTTCGACTAGTTATGATTATTGTT
>CG7239 5803844 5804037|6383 chr2L 5801182 5804320 scaffold_2 5633306 5636771 + 62925|3093 3306
ACTCCTTTTCCGACTTTTCATAACCTCAATTTTGGACCGCAGTGCACGAACACTGGTTTTCAGATACTGGATTGCTGCAACATGCCGCTTCGCAGGCTGA-TCGGTGCCACGAAACTTAACA-AAAAACATGCAAAACTGTTTGTAAGATTAAAAAG---------------TAAACTTAAATAATAA---ATATATTTAAATAACGAAAATCG
AAACATTTT-AAATTAAATATAACCC---------------GAGCCCCGATAGCGTTCTATGTTTATTTTACCACTTAAA--------TTAGTTGTCTAAGTCAAAAACAAAAAACAAAAAACAAAAGCCAACAAAAATATTAACAAAATTAAGAAACTATTGAAATTTCTCTAAACGTAAGCAACAATCGACAAAATGATTTAACGATCATGC
>CG9029 5886436 5886616|6458 chr2L 5885509 5886634 scaffold_2 5781093 5782278 + 3175|1035 1246
TGGGTGCATGACCCCACATCAAGGAGCAGCAGCA--GCAGCTTAATCCAACTGGAGCCTGCACACCCACAC------------------ACAAGGGAGACACGCACACATA---TATATATTAATCTTCTGTAT-----TCAATGTATGCAT-TTATGTATTCCAACTTCTAGCATGGGCATTAATAAAATTGCA--AAAAAAATATTTAAA
GGCATAAAAGTCGC-------AAAAGCAGCTTTAAGGCAAATCCACACAACAGCAAGCAGAACACACACACATGCACATACATTTACATATAACAGATATAAGCATATATAGCTTATATAACTATGCTTTATGTACCTATCGCTATATACACATTATGTATTT---CTATCAGCACGGGCGATTAATAAATTGCATTGAAAAAGGAATTTAA
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AC--CGGCCACGCATGACAGTCGA---AATGAAATCAAAATCGATTC-CCTAGCACCTAAGCGCCACCCATCGGTCGTCGTCATATGCGAACTTATTTGTATTCCAAT
ATGGCGCTTGGGCGTGGCATGCTACCGAATGTTATCAAAATCGATGCGCGCAGCATTTAAGCGGCAACAATT-TTTGTCA-CACTTGCAAAAATATTTGTGCTCCAAC
>dsf 5938056 5938767|6506 chr2L 5938217 5938617 scaffold_2 100785 101164 - 5998|0 431
GCTGCAGATGCTATGGTTCGCAGGACG------CCATGTAATGGAGGCGTATGTACTAACCGCGCTCCTCCATTGGCGATGCAGTCCGCGATGATGGCGCACTCCCACACCCACACCCGTACCC---ACACCTTGATTTATCGCCGGCAATGCGTCGGAGTCTCCTTACTTTCGCTTCGTTTTCTAACATTTGTATCCTTATTTTATTTCATCTTTTTCCACGGATTTTTCGTTTTGACTGCCTGGGCGGCACTCTTTATTTATCTTTCATTCGACGTTTTGTCGTCGCTTTTCTAAAAATTCCCCATGTTATTTCA---ACCTGGCAAG-----GACCTCGCAGTCCCATTCCC--------GCGCCCTT-ACTTAC----AAATCACTTCCCATCCCACATCCAGC-AATTCCGTGGTTTGAATTCTTTC
ACTGCAGCTGTGACAATTCACAGCGCAGAGCGTTCATGTAATAGATACA-------TTGCCACGCCCCTTTCCCGCC-------TCCTCCA-----------TCCCACAGGCGCCGCTGGCTGCTTTGCACGTTGATTTATAGCT--CTGTTCGCGAGTTATTCGCTTCTCTTTCTTTTTTTCTAAAATTTTATATATATATAT------ATTTTTTT---CGTGTGTCTCCTCTT----------------CACTTTATTTATCTTTCATTCGACGTTTTGTCGTCGCTTTTCTAAAAATTGCTCATGTTATTTCAGTTGCCTGGCAAGCAGGCGACCTGCCAGCCCCCCCTCCAGCCCCAAGCACCCTTGACCTGCTGCAGCAACAAGCCTCATTCCATGCTTAGCTAGTTTCTTTTTTTGCGCTCTCTC
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GTGTTTCGTTTGCATTGGTTATGGCTCGTTTTCGCCTGTTTATCCCGCTATCCTGA-------TACCCTGCCTTCCCGAAAATCCCC------------------------------CGAA---ATGAGCTTT---GTATTCTCACCTTTAACGTTTGATTTATTATTGTTTCTTTAACTTTTCTTAT---------TTTAAGTTAAT------CTTTTTCCTATGCTAAGTTGATGCACCTTCTGTTTCTGTTTCCGTTTCTTTGATTGTTTCCCTATTATTATTTTATTAATACCTA-----AACTAAGCTTAACTTTAAAATTAATAAAGTGCTAAATAATAAAACTCG
GTGTTGAGTTTTTGTTTCTTGTTTTGCTTTTTGCACAGCTGCACATGATATCTCCAAGAGTTCCGTATTACTTTCCCGTAAATCCCTTCCTGTCTATGCCTACGTCCCACACACACACGAACCCACAACCTTTTGAGTTTTTCCGTATTTTGTGTTTAATTTGCAATTTTATTT----CCCTTCTTGTAACAACCAATTTATGTTAATTAATTGTTTTTAGTTATGCCTATTTAA------ATTTAGTTTTGTGCACTCCTCAATAACTTTTAGCATGTT-TTGTTGATTTAATATATACTTCTGATTAAGTTAACAATTTAATATAACAAAATA-TGAACAATAAAACTCG
>Gpdh 5947891 5948313|6517 chr2L 5947010 5949371 scaffold_2 111769 114457 - 27956|994 1525
ACTGTGTTACACCCAAACAAG----------ATCAGTCAATGTATATTGTAAATACTATATATACCCGCATAGATCAAATCAA--CCAGTCATCTTCACCAAGGCCTATA-AAGCTGGCATTATATAGATATATGCATAAAGTCAGA---------------AAAATCGTTCCA--CGTCAACTGCATTAC----TTTTTCCTCTAATTC-------TCGCAAGTGTTTTT-------CAATGTGTACAGTGCTTAAGTGTTAGATAATCGAACCAAAACAAAGAGTGTCATAATTGTTGAACCTAATTGGAATTGTTAAAATAAATATAAA----TTAAATACAAGTTCTT----TGTACATACCAACCAAAAGTGTTCCCAACTCAT--TTAACATTCA------------------------------------------AAATTGGCAGC--TGCAAATCGGCAAAGAGCAGTACGTACAAAAACTCCA-AAATTAATAAATTTTGCAATTTTCAGTTA------ATC
ACTGTGTTAAACCAAAACAAAAAAATGTTCTAAAAGTTTAATTCGATTGTAAATACTATTTGT----TTATATATCAAGTCAAGTCAAGTCAAGTCCAGTCATACACACACAAAATATTATCATGCACATCCACACACGCATTTGCAACCGATACGTATTCGAAAATCGTTTCCTTCGCCAAGCTCAACACGCATTTTATAATACAACTCGATTCTTTTTAAAATGGTTTTCAAAAACCAATGTAT---GTGTTCATAGGTGAAAATGTC--------------AGTGTCATATTTGTTAAACCAAAATCAGTTTTGTTAAACACGAATAAAGTATTTAAATA-ATGTTTTTGTTCTGTACATATCAAAAGAAA--------AACGCATAATTAGCATTAAAAAAAACATACTTATTTTTGAAATGAAACATATTTTTTGAAGAAATTGGCAGCTATACAAATCGGCAGCGAGCAGTACGTATCAAAATTTGATATACTTATTATTAATTGAATTTTACGTTATTTGTTGTA
>Gpdh 5948420 5949092|6517 chr2L 5947010 5949371 scaffold_2 111769 114457 - 27956|1636 2451
ATCCCCTAAAGAAGCTGAGACGTTTTTAACATTTTTATGCACCACAGAGAATAAATGTATTTTTTCAGCACAACGCCAACTCGATGAA----------TCTTTGGATTCCATTTTCTAA-----------CCAGTTAACTAAAAGGATCGTATAGGTTGTTGCCTTAGTTAGCTTATTGATTTTAATCCAAAACC--ACGCATATCCAACGAACCACGGAAGAAAACTGACAACCA------AAGTCTGCTTTAATTTTAAAATTTAGTTGTTTTCAATTCCAAACTAGCCAAGAAA--CAAACGCAAGTACCTA---ACAAATATATTGTAATTTTGTGGCCACAAGT--AGCCGACGGAGCTGGCGAGAGGATCT---------TAGTATAATTT-TAATCGGACTGCGTAGAC------------ACTAGAATTAAATGATT-------ACCCAAAGGTCGT--------TGCAAAAATAAAA---GCTGAGTAATTAACA--------AGGTTGTTTG--TTTATTTTCTATCACCTAATAAAATGG------------------------------GATC-----ATTCTTTTCTAAAGATAAGTTTATCTGATGACCAATTTGAAAATAAATTTACATACATCCTTACATAGATGG------CGCTAGGTAAAGTTTCTACATGCGCGCCTTTAAGTAATAATTC----AACTATTGCTTACAAGTTTATTTTTTTAATT---GAAAACTTTGTGGTAAATTTGAAGGCAATAAATATAATCATGTATTTAACCCTT---------TGTC
AATATATATTAAAACACAAAT-TTCTAAACGTTTTTATGCACAAAAAACAAAAAAACCA------AAAAAAAAACCAAACACAAGCAAATAGTCATTTTTTTTAGCACACATTTTAAAATCCTCAATACGCCAGCCAACGACAAGAATGGCATA-----------TACATAGGTTGTTAATTTATTGTTAAAATCCAACGCATATCCAGCGAACCACAGAAACGAAC-AAAAACCAATCTTGAAGTCTGCTTTTTGTTTTAACTTAGTTTATAAACGAT---AAATTAGCAAATGAAATTGTGCGCATGTACCTAAAGACAATTGTAAATCAATTTTACAATTACAATTAAAAACAACAGAAGAGGCGTAATAAACGGAACAACAATGGTTTAATTTAAAAATTAAAAACTTAGACATACGGAATTTTATTTGCATTAGTTAATTCTACTGCAATCTAAAGTCGTAAATAAAATGTAAAATAAAAATGTGTTGAATAAATAAAAGACAAAACAAGTACTCTGCATTTATTTTGTAATAGATTTTATAAAGGCTGCAGGGAGTGTTTGAACCGAACCGACTTGATCTTAAAAGTTTGTCAAAAATTTAACTATACAAAATAAATTATTTAAAAAAATGCTTACAAATATGCATATCAAGTTTGAATCCAAGCTGGGCTGAGTTGTGGAAATCGGGTTCTGTAGCCCCAAGGCGAGAAAATGCCTCGCACCTGCTTGTCGCTTTAGTTATGGAAAATGTTTTTGCAATAACAAAAAAAAAGCAAATATTGCCTGATTTATGCCCTAAAATTGGGTATA
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TATTCGTCTATTAGTAAGGGACCAACTATATTCATATCATATCAA--ACCAGACAAATGTATATATAGCTTACTTTGAATA--TGTGTTAATTTGAAATTGAATTGTAAGCATTACCTTAT--------------------------------------CTATTGATCTGCATATATATATATATATA----TCATATTTAACTAAATATATTACAATAATGCCTAGCTTTATAAATTGAAA
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GGATCGAAACGAATCTGACTTGAC--ATCTGAACC----------------TAAGAATAAAGTAATGCTTTCAT
CGCACTGATTGAACGTCATTTGGCTTACCTGATCCAATAAACTGAAAATATTAAGAGAAAAAAAATGCATTATT
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GAGCAAACTATCAATCTTACTATCGTATTTTGTATGTCTTTTAACACGCAATAAAAGGTG---CAAGTCAAACC
ATGCCAGCTA--AATGTCA----------GTGAATATATTTTTATTCGGGTGCAACGGTTTTCCACTTGAAACA
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AATCGGGATTGGATCAGTCAGGTTCAGATATGTTCAATATCA--CCCCTTCCTTCTAAAGGGGACGTCAGCTGCTATGACTTT
AATTGCGTGCAAATACACAAGAATCC-ATCCATTCAATTTGAATCACATTTATCGTTCAGGCGACACGGCCTGCTATGATCTT
>eIF-4a 5985171 5985572|6550 chr2L 5984004 5985822 scaffold_2 166827 168785 - 83616|1282 1757
ATTTTTTCTGCTGAGCCGCAAAACAACTAAGA--------------AAGAATTCTAAAC---AAAAAGTGAGTGAGC---------AAAACAGCAAACAAGAACTGCGAAATCGATAACCGAGCGCAACTATAAATTATTCAAAGATCAACAAGTCAAGTTAAATATTTATTATTCAAATATTAATTCGAAAAGGCAGCCGACCGACCACCCAAAAAAAGGACTAAA----CCAGGACAGAGCAGCAACATCTTCAGCAGCGGC-GCAGCAGCAGTAA-CATCA-GCAGCAGCGGAAGCGGCAGCAACACCACCACCAATTGCCGATTAGCCGG-----------------AACCCCTCTGTATCCATTTAGTTCTCTG---------------------TGTATCATCAATTTTAAAACTGCGTTGTCAACCAGCAACAACAAATATATACAAATATATAAAA---AAAAAAAAA
ATATTT--TGTTGAGCATAAAAAAAAAAAATAATAATAATAAATACAAGAAAAATAAACAAGAAAAAGTGAGTGAGCTACAGCAAAAGAGTTGCGAAAAAAAAGTGCGCAAAATATATTTAAAAACAAA-ATAAGAACTTTAAAACCTA--AAATCACGTTAAATAT---TTATTCAAACAACAATACTAAAA--CAGCAG---GAGCAACAACAACAACAACTGCAGCGGCAAGGCGAAAACTACAACAACAACAACAGCGACAGCAACAACTATAATCATTAGGCAGAGACAGAGACAAGAACAACAACAACAACAACCGCTGGCTGGCTGGCTGGCCCTTTGCCCTTTGCTGCCTCTAATCCTAATTAATTAACCAAACCAACAGAAGAAGACCAGCTGTAACATCAATTTGAATACTGCGTCGTCAACAAGCAACAAACAAT---TAAAAAC-TATAAAAGCTAAAACTGGG
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GCCATC-------------------------------------GATGCTATTCAAGGTTTCCTGCCATGAATGTAATCTCAGCG-TTAGACCTAAA
TCCGACCAAGACAAGCACAGTTTGCGGGCGCGGATGATGCAATGATTTTACTAGCGGTTTCCTGGCATT-ATGTAATCTCAGTGTTTAGAACTAGA
>ifc 5988184 5988858|6555 chr2L 5988668 5988729 scaffold_2 172917 172975 - 2335|0 61
GCAACCAACTACTATTTTTGATAGACTCTTGAAACTGTTACCTAAGAATAAAGTCTAAATAA
GCAGCCAACTA---TTTTTGATAGCCTCTTGTAACTGACATTCAAGTACCAAAAAAAAATGA
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CTTTCATTTCTATTCGTTGCGACGACATTACTC-ATAAGTACGCTTATTTGAGTTTTAAAGTTGTTTGAGTGTTTAAGTTTATTTTATAAAAATAGTAAACAAATT-CGTGTATATAGTATTTAGATATATCAGGTCATAAATGCCAAGAACCT
-----ATTAATAATCGTTAAAACAGTTCAATTCAATTAGGGCTTACGTTTGAATTACTTAGC--TTTCGATGTTGTTGTTTATGTTTTTGTCGTAATTAGCAAATGACGCGTGTATA-TATTTATCACTATCTATTACTAGTCACATAAAGCTT
>CG12393 6050349 6050439|6615 chr2L 6049882 6050464 scaffold_2 836769 837388 - 7252|512 617
TGTAGGAGTGGGCTGCTCCGACAAAAAGCCAATGT------ATTACCCGTTT--TGTGCTAAATCAAA----TACGTTTCAAATGAA---CTATGCTTAATTTCCA
AATATGCAATTGTGTATCATGCATTGGGCCTAAGTTTTTAAATTATACAATTCATGTGCTAAACGAAAAATTTACCTTTTAAAATAATATTTATGTTCGATATCCA
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GTGATTAGATGGTGTGCGGCTTTCC
AGAAATGGGTGTTCTTCAATCCCCC
>CG9135 6053259 6053498|6619 chr2L 6053295 6053488 scaffold_2 841176 841420 - 5832|0 244
CAAACACGTT-----TACCGCTGCCAACAACAATACTGCTCCATGTA---GGAAATTCTCA-----------GAACTGATCATCGAAACTCTGCTGCTACTTATC----GAAAGTGAAACTAAACACAAAAA---------TCCAGCAAAA-------------------TGTATGCTATAAGTTAAAAGATTATTATTACGCTAAACTCGCTATCTACATACTATACGATAATCTCAGAAAACG
CAAACACATTAAGTATACCGCTGCCAACAACAATACTGCTCTATATACATAGATACTATAAAAAAAAAACTTGAACTGATCAACGAAACTCTGCTGCTACTTACTGAAAGAAAGAAAGAAAAAACACAAAAAAAAGAAAACAACAACAAAAGCAATTAACTCATCAACATTTTATACAATAAGTTTAAAGTACTTTACTACTCCGAACTTAACCACCACATCCAAAACTTATATCTCAAATATCG
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TGTGATACTAAACTAAAACC--TTAACATATTTACTTATGACGACACTCGAACCCA-AGGCTATCCCCGTTCTAAGA---------------AACTTGATGATTTTTCTCCATAGCTCCTCTTTGCAATTAGTTGGCACAACGTAAA----AATACAAAAAAAAAAAATAATAATAATAATACTACAAAAAACAAAATGCAAGCGAAATTATACATAATATACATAAATACATA-ATACATACATAGTTTATATAGCTACTATACATAG--GTAGTTGTTAACGCTTATTTACAACACAATGTTAGTATTCCAAAAGTATTGCAAT-------------------------------------------------------CCAAACCAACAAAACACA--------------------TATACGAACTCATTTAGTGACTTGTTTAAAATGTTGTTTAGTCCTT-AAGCTGAAACTAAAAGAAATTACATAAATGCATAATAATATTGTACTATGTTCCTTCTCATAGATAAGCAATAAGT-AACGCTTTAAGCCAAGTTTAACAAACAAATCAAACTAAACATGATCTAAAACTAAACCAAAAACAATTAAACTAAAAATCAAATACATATTTAGCAAATCTACGTACATATAAGAAACAAGAAAAAAAAGAAAATGTAAAAAAAAAAAATTGTATATAAGTGTGTCGAAAAAGCATTCTTTCTACACTTTTTCTAAAATTTTTAATGTTCATTCAACTGAATACCTTTAGATTGAACACCTGCAAAGTTCAATTTATACGCAATA---GAATATATTTCTTACTTTCCAAAAACTGAATGTGTATGTGTGTGTCTCTTATGTAGTACAGTTAATTTTCACTTCCCACTTGGTTCTATGTATTGTCTCTGTCTTTGATGTAATTTTCCATATTATAAAACAAAACAAAAATTTAGTGGTAGATGTTCAATTACGTAGTAGATTGTTTTCATAATTTA-----CAAATTCACTATCGCAATCCGAAACTTAATTATATAT-ATATCTATATATACAAATGTAGAGCGGGCAACTAACGTTAAGTGAAAAGCGCACTTATCAAACTATT-TAACTGGGTAACTGTCAG--ACTTTTGTCTCATAAGCATTTACCTGTTAACTGACTGACGCTGTTAGTTGCGTTAACATTGCATTAACATTTTAAAATTAAACCTAACCTTTCACAGACTCAGCAATAGATAAATGTGTTCTGTTAGCTAATTCTTATTAAT-TTAAACTA--TTTGTAGGACTATTATTTTGTACTCAATTTAAATTTCACAAAAAAAAAAACAAACAAACAAGAAACTAT--AAATGCTATAAATATGCTACTATTTAA
>CG13994 6063567 6063676|6629 chr2L 6063006 6069006 scaffold_2 865425 871457 - 164392|624 747
AATGTATATATATAATTATAAACGTTAACAACATGGAACCAACTAGCAAGCACTCAGATC-TACAAAGACG---GTGTTTTTAGGCAGTAA----------GAACCACTTGGGGATTTGAAATC
CATCTTTTCAT-------TAAAAGCTAACACCA-------AAATGAGCAGTATATAGATTATACATATACATATATGCATGTATGGACTAAATTGTTGATTGTAACAACTGGGCAGC--AACAG
>CG9147 6067563 6067628|6629 chr2L 6063006 6069006 scaffold_2 865425 871457 - 164392|4807 4872
TCCGATAATCGTTGGAAAAATCGTAAACAAACAAAATTCAATTCAGTTCAAGAAAATTCATAACTC
------GGCCACTGGTAGAG-----AACATAAGAAAACTTAGCCAGCGCA----------------
>CG13993 6069767 6069840|6630 chr2L 6069007 6070639 scaffold_2 873273 874924 - 44331|788 885
ACTACAACTCCAAAC--------TGGCATTTATCCCTCAACG--------------CAATTGC--TTATTTATTTTCAATATACTCGTCTAAATTGAA
AATGCATACACAATTACCATTCAAGGCATTTAACAGTCCCCGATGATACGAACAACCATATGCTATTTATTATTTTCAATATAATGGTCAAAATTAAA
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ACACGACA--AGCAGCTAACGGAAAACAACAATCAAATGA------------------CATA---TGAATAAGGCTA-TTTAAATACCAGTTCACT--TGCATAGATGTTCACACA-------------------GGAGA------------TTGGGGTTCATCCGTTTTATTTGTTAGCCGAAATTCGTTGCACCTT--TTCGAA-GCGAAACTAGTTGTTTTACACCAGA----TTGTTTCGGCATTTAAGTTT--------AAATTTATCTATATATTATTGTAGTTTTTTTTGAGTACATCATCATGCTTTTTTCAACAACACACAATGTGGCAACGCACGAATTCCGCCATGGAGGATCAACGGCGCGTATTACTATATTTATATCCCAAAAACAAATTATTTCAATTTGTT-TTGCTTTAACTTATATGTTCAAAATACTGATCA-AACGAAAAACATG-GACAGCTAACGCTGTTAGTAATTATTT----------------ACATATATTTTGTATGAGTGTGTAAAGATTCGAAGAACCAAACAAAGTAAAGTAAAGTTAAATAAAACATTTTGAGAAGG
GGACGGCAGCGACAAATATATAAGAACCACAATCAAATTGACAAGCAACCAGCAAAATCATAAGCTAACTAAGTCTATTTTAAATACACACACACTACTGCACACACACACACACACGCACACGCACACATACACAGAGACTCACATCAGTGTTAAGGCTCA-CATTTTGAATTGTTAA-CAAAATTTGTGACACCCTCGTTGGAACATAAAATTGATTGGTTTACAGTAGATATTTTGATTGGGCCCTTTTCTTTTACAACTACAAATGATCTACACAATA-------TTTTTTATATTTTAAAATTATTTTTTTTCCAA-----------ATTTCAACGTTCGTATT------------ATTAACG-------TTAATGC-------------AGACAATTAGTTAAAATTTGTTGTTGCTTGCGTCAATG----CAAAAT--TGAACAGAGAGAAGATTATGAAACAATTGACGCTGATTATAAGTATTTATACATATAACATCCAATATATATTTTTTATGAAGCTACAAAGA-------AAACGAACAGA--AAATTGTAATTGAATAAAACAAATGAGCAAGG
>CG9162 6079172 6079737|6639 chr2L 6078789 6079330 scaffold_2 891707 892237 - 8085|423 586
ACCGAATGGGCGAGATAGAGAGAGCGAGCGAGAAAAGCAGAAATGCAGGGGCAGATATGTAAGTAGTGTAAGTGCAGGGAGAGCAAAGATACGAAGAGAGTA-----AGGGCGAGAGCGCACTGCCGTTTAATGCAGTTATTATTGACGCAGTCTGTCTACGTG
ACCGCACAAG---------------AAACAAGAAGAGCAGG---GCTAAAGCAGATTGTAACGTAGC-TAAGCGGCGAGGGAGGGCAACACCGAATGCAGCAATAATAGCGTGCGAGAGCGCTAGAGTGCAAGGTCTGTCTCTTTGAGTGTGTTTGTGTGTGTG
>Kr-h1 6095557 6096504|6660 chr2L 6093786 6096146 scaffold_2 919379 921745 - 86618|1924 2567
--------------GGGTCCAAGGCCGATCC--CCAATCAGCATTAAGACTGTCCAAACAAATTCTAACTGAAATTAGCCTAAGTTTTTTCTCTGAGGTTCGGGGTTAGGCCTGGAAAAAGAAAGCATAGAAACGTATGGATATGGCAGTGAGATAGTTTTCCAGCAGCGAAAATGAAAATGCCAAAAGTATTA-AAAAAGGGAAAAATTTGTTTTAAAAT------------------TAATATTACCTCCTATTACGTTTTATTGGCTTGATCCGAGTTTTGTTGAATGTTTGATTTGAAAATAGTTTCACCCATATTGCAAAATTTCATTTTAGTTTGGCATATACAATGTAGGTATAGTTTGTTTTCCTGTGTTGTCCACTT-AGTCAAATTGCAGCAATTGGCATTATGCGTATTAAGCATTAGCATATAACTAAGTTAATTATATATAAAAGATCACTTAACGACGCCCAAACCCAAACCCAAACCCAAATCCAAACCGTACACAATAATAAGTTACGCGCATAACTACATATATACACATATTAATGAGAACGAAAAACCATGGCCATATTGGC-----------------GCTTAATATTTATAAAATACATATAATACTTAT-TTATTATGAACT
TGGAGGCAGCGGCAAGGGCAAGGGCAGCTCCAACTAATCAGCATAAAGACTGTTC-AATAAATTCTAACTGAAATTAGTTTTAGTTT------AAAAATTTAATGTTTAAATTGCATGCAGCAGACCCGTCAATGTTTGTGTTTGTATTTGTTTTCTTTTCTAAGCAGCAA-----GAAATGCCAAAAGTATTATAAAAAAGCAAAAAAATCTTTTAAAACAAAAAGAAGATAAGCAAAAAATTGTATGTCCTATTACGTTT----------ATATACTTTTAGT---ATGTGTATTTTGTTAAATGTTTCGTATATAT-----ATTTTCATTTAATTTT-------------------TAATTTTGTGCGTTGTGTTTTTTGTTTAAGTCACATTGCAACAAC-------------------AATTGGCATTGCACAAAATCAACCACGAAAAAACAACAAC--AACAACACATA--------------------------------ACAATAATAAGCTACGTACATAATGAAATACAATTAAATATTTATGCTAATTAA-------GGCCATATTGGCAATATGCAGCAGCAGCAACTAAATACAATTAATATACAATACATACACATATAATTCTAAACT
>Kr-h1 6095557 6096504|6661 chr2L 6096204 6096465 scaffold_2 921819 922235 - 3815|0 418
TCATGTACCCATC--------------ATTTTATATGCATTTTATACACTAAATAAGGGAAAACTGAGGAA----------------------------AAAGGATCGG-------------------------------------TAACTTTA-------------------------ATTTTAC-ACACGGAGAATATTGAACTGATAAACAAGAAGAAAGCAAGCATAACTACGTTTATAT---------------ACATTTTCAAACCAGAAGATAACAAATA-------------------TAATTAAGAGCGT----------CAGCATAG-----TTTTTGTAAACGCAGAGTTA---ATACATAGATTTAAATTCTAAAATCAAATATTGCATGAAAAAACGCAAATGAAA
TTAAGTGATCATCCAAAATTTAAATCAATTTGATATGCATTTTATATTTGATACAAGCGTAAACTAAAAAACAAAAAAAAAAAAAAACAGAAATAATATAAAGAATTGAAACGAAACGTAAGAAACAAAGATCATGCAACAAAAATTCACTTCAAATGTAAATCACAATTTAATACACTATTTTACTATACGGAGAATAATGAACTGATAAGCAAAGAGCAAGCAAGCATAATTAAGTTTAAATTAAACGCAAATAAAAAAAATTACAAAAAAAAAATAAACAAAAAAAAAAACAAAGCAAAAAGCTATGTAAACGCATATTTAGTGTGCGCCATAAATAATTTTTTGTAAACGCTAAGTAATATACATATAGTTATAAATTGTAGCATGAAATATTTCA--AGCAAGCGCAAGCGAAA
>Kr-h1 6095557 6096504|6662 chr2L 6096466 6099185 scaffold_2 922586 925260 - 81169|0 38
TCTGAAAATCAATAAACAAGCGTGAAATAAACCAATTCG
TATGAAAACCTGCAAACAGGCGGGAAATGTA--------
>stai 6123065 6123905|6702 chr2L 6123444 6124692 scaffold_2 1010044 1011458 - 17504|0 542
TTTAAAATTTCAAATTCTTTTAAAAGTTCACGTTGATTTCAGTTGAAAGTTTAAAACACTTTTTACCTTGAGTTCCAA------------GAATGTTATATTCGTTTTGGATTCATTATTTTCAAAGTCTTAGTCTTGAATG--TTCAAGTTTTTTTTTTTTTTTAATTACTGTGGCAT---CGACTGAGGTATTCTCAAAATAA------TAAGCACGCTGTATTTGCATCT---------ATGAATGGCTTTCGCGAGTAAAAATTTGAAAATGTTTTTAATTAAGT------------TAATGTATACTTTAGTGGTAATTTTAATTTACTAACTTGCAACAACATGATACATATACATGCTGAATATAGTTTTACACTAACAAATAATTTGTTCTTATAAGTTTCGCATTTTCTATCTATAAAATAAATGTCTAACAGAAAAAATACATAAGAAATGCTTATACAA------------------------------------TTCAATAAAAT-CAAATACCATGTAAAACACACGAAA
TTTTAATTTTTAAATTGTT---AATGTGAAAGTCTGTTCAAGTTGATTCTTTAGATCGTTTTTTTATTTTACTTTTCATTTAATACAAATAAAAGTAGTAATTGTTTGATTACCAAGCTTTTCATAACTTATATAAAATATGAATCGAAGTGTTTTTTTTTTACTGATTTGCAGCGCATTTTCGAAAGGAAAAAGTTCAATAGAAATGCCATAAGAAT--TGTATTTGCCTGTCGTTTTCGTATGCTTTGCCTAAAGAAATAAAAAA--AAAAATGATATTAAATAAAAAGTATATATATATATGATATAATTTAACATTAATTTTAATTTATTAATATTGTGTGAAGT--------TGCGAGTTGGACACTTCTTAACATAAATAACAATTTTAT----ATAAGTT-CGCATTTTCTATCTATATAATAAATGTCAAACAGAAAAA-TACATAAGAAATGCTTATATATAAAAAATAAAAATACAAAAAAAAAAACAAAAAAAATCTCAATAAAAAACCAATACAAAGTAAAACAAAACACA
>Arc-p20 6125824 6125913|6706 chr2L 6125861 6127632 scaffold_2 1011664 1013487 - 46373|0 57
AGTATTTCCAAATGGATTCAAGAATAAAGACGG-----ATTTTGTATTATTTACTCGA
AACATTTGCAAA--ACTTGTAGAATAGATGTTGGGTTTAATTTGAATTTCTTATTTAA
>CG9222 6132373 6132484|6712 chr2L 6132060 6132553 scaffold_2 55824 56299 - 15220|337 448
TTGCTACTCGTTTATGGTGCAGTGCAACAAAGCTGAAAAATTTCAACGTTTAGAACTAACAAATATTATAATTTTTCGATTCAAGTCAATAAATATATATTATTAGATTAGC
TATATACATATATATGCCACAGTCCAGT------------TCTCGCTGTT--GTCGTAGCAGAAAAACAAATTTT-------AAGTTAATAAAACTGCTTAATTA-------
>CG13991 6144853 6145011|6728 chr2L 6144524 6144918 scaffold_2 6806560 6806974 + 12814|329 415
CTTACC---------ATATTTTCTAACTCATACAATAGATT------------AAATTTCAAGTTCACTATCAAAATTTTTAGAGCT
TTGACTGAATCAACAATTTTATGCTACTCTTACAACAAATTTACAAAGTTTCCCAGTTTTAAATTTAAAAATAAAATTGCAGGTGCT
>CG13990 6153527 6153701|6736 chr2L 6152986 6153665 scaffold_16086 323 1006 + 18323|556 713
AACTTGACGATGGCTTCCTAATCGAAATCACCAACGAATAGCACTACCTGA------CCCCACCTTGATATTTGTGCCCGAT-----------CGATTCTTTATCATATTTACTAAAATTTC-AATATATGCAAAAGCTAATACAAGCT-TAAAAAAT
AGCGAGTCGCTCACCCGTTTGACAGCACTCCCCATGCATAGGAATGACTAATGACTCCACCATCTTTATAAATATAATTAACTACCTTAAAAACAAGTTGTAATCTACTGATTTAAAATGTCAAAAAAATGCAAAGGCTAATACAGGCCATAAAAAAT
>Ugt37b1 6226748 6226842|6831 chr2L 6226039 6227005 scaffold_14 2995196 2996147 - 20938|713 813
TTAAAAGTTAAA-AAGCCACCTCCTGCCAAATAGTTTTTTAATAGAGCAATATTATAAATATTTATATTAAATTCAAACCATTTTTTATT-----TCGTCT
TTAAAGACTAAATAAATC-----------AATAAATAACTAATA---CCATATTTTGAATCTTATATTTTCGTTCTA--CATTCGTCATTTGCCATCGATG
>Ddr 6322136 6322251|6956 chr2L 6321393 6322311 scaffold_14 285273 286297 + 17458|869 1015
AACATTCTAGG------------CGTAG-AAATACGAATTGAACATGATTTTAGCAGGT------------TATAATTCAATTATCAATTTCGACAGCTATCCGGGAAGAACGTAATTTTAAAGAGAAATGCATGTAGA------GA
AAATGTAAAAGAAAAAAAAAATACGCAGAAAACACGAAACACACGCGATTTTAGCAAACATTTGAAATACATATATATCAAATATTATATGGTACATTTAAATTGAAACTACACGATAAAATAAATAAATAAATGAAAACAATGCGA
>Gef26 6330771 6330830|6963 chr2L 6330718 6338415 scaffold_14 299103 307157 + 228857|61 120
GTGGCCCGCCAAATTTTATGGATAGCACCAAGTGTACCATATGTCCCATGCCACCCATGA
GTGGTCCGCCAAATTTTATGGATAGCACCAAGTGTACCATATGCCCCATGCCACCCATGA
>Cpr 6345888 6346282|6970 chr2L 6344107 6346618 scaffold_14 313872 316480 + 95744|1807 2399
TCT----------------------------------------------------------------------------------GATCCAAAAGCCAACCGATGA--TAAGCGTAAAGTT-TTCTAGTTCACTAAGCTATGTAAGCGTAATT---------TTTGGTTTGGGAACTTCATGCTGCAGTTCAACAAACGAA---TGAGTAACGATTAAGTGTATGTCTAGTGT--AATTGAC--------------------------------------------------------------TCTAGCTTGACCCTGGACTGTTTGATGGGACAAACTGAGATGGAATCTAAGTAATGAAATGAGCGGAGTAACAAGTTAACGATTAAGTAG-CTGTGTACGAGTGCAGATTAGTTAAAGTCCTTTATACGAGCA-----ATTTACTTCGTATTCTC----TTGGTGATTTCAATACAAAAACGAAACATGTTGTGCAATTAAACAAT-------GACATTGCAATTGTATTTTTATA-------AATAAAGAAAAGT-------------ACGGTTGACTTCTATAATAA
TCGCGGCGCGAATACCATTCGCCCCACTCTCACTCCAGATGAGTCACAGTCGCGGAACAATGAAAGCAATGAAAACAAGAAAGAACAACTAAAAGCCACACGTTAACGTAAGCGAAAAGTCGTTGTAGTTAATTAAGCTATATGAAT-TAATTATATATGAAATTGGTTTGGGAACTTCA-GCTGCGGTTCAACAAACGGCGTTCAAGTAACGTTTATGCCTAATTCTAGTGTTAAATTGATTGATTATATAAATATATATATATATATATATATATATATATATATCTATGAATGTATTTATATATAAAATGCCTTTTTATTGTTGTGCAAATCAATTTGATGATGATGTTAATTATGATAATGATGTTTGTAA----TTGTATTTTAAGTAGTTTTTGTATGTATGCA-ATTAATTGAAATGTTCTAACACCACATTTTCATTTAGTTTGTGTGCTTTTTATTGGTGATTTCATAAAACAAATGAAATAATTTGTGCAATTGTACAACAAAATAAAAAATTGTATTTCACTTTCTATACATAAACGATAAATAAAAGTAAAAACATTGCACATGCTTGAGCTAGCTAGCAA
>CG9505 6370100 6370195|6987 chr2L 6367142 6370199 scaffold_14 2735068 2738091 - 51443|3079 3182
GGGATGCCCAGAG---ACGGTCGGTGACTCCCACTGCTAGTCGGTGTATAGCTTTAATTAG--GAACC--CAAGTATTGTGAATAAACTTCTATGCTT-AGCAA
AGAATATATAGAGTATACAATCG--------------TAACTGCTGTATAGCTTTAACTAGTTAAGCCATCAAGTATTGTAAATAAAA--ATATGCTTAAGTAA
>slam 6377165 6377287|6992 chr2L 6373265 6377307 scaffold_14 372098 376353 + 142072|4286 4412
GCGATGGTGCTACC--TCATCGGGATCTGACTTTATTTTAAGATTTTATAAACAATTAGTTCCTAGACATTAACATATAATGTTACAAAGATTTTA--GATAATAAACTTTAAAGAGAAAAGTTAAA
TCCTAACAACTTCCAATCAACAATAATT-ATTTTAATTTGGTAGCATATAAGCA--------------CAAAACATATAATGTTACAAATATTTCAATGCTAATCAACTTT---TTTAAAAGTTAAC
>CG9507 6383353 6383421|6995 chr2L 6380585 6385485 scaffold_14 383504 388750 + 117222|3047 3188
--TAGTTCTCTTTC------------------------CATCTCTCCCACAGGAC----------------------------ATGGCAGGATCCAGTGATGAAT-------------------AAATAAAATCTCACCTAA
AGTCGAACACTTGCCCAATTGGGATTAGGTTAAAAAATCATCTAATTTAAGAAACTAATTCAGCAAATTCCTGATGTCATTTTGTGCCAAGTATCGATTATACATTATCATCAATTGTATATTCAAATAGAGATATATTTAA
>CG9523 6426123 6426373|7039 chr2L 6423464 6426475 scaffold_14 457185 460460 + 73582|3050 3325
--CCCATCTAGATGCATTGATATTAGACAATTC----GTTAATTTATTATTTA--TATGTTTGTGC--------TATATTCTGTAAATTATTGTAAACTTCGAATTACCTACATCAGTAGATGGCTTTAGTGAAGAAAAATAACGA------TGTAATTCTGTGATCATATTTAAGCTAAAAGA--CAACCAAAAAATGT-ACATAATGCACAATCCAACTAACGTGTCCTAATATTTAGTACGATTTTTATAGAATTACATATCCTATAAAACAC
ACCCCATCAGGGTGCCCTGACACC---CAATGCAAAGGCTAACCCAGTGTTTGCTCAAGATTATTAGAAAAATGTATATTTTGTGAGTTTTAGCAA---CAAATTTGTGTATATTTGTAA-----TTTATTCAACAACTAAACCAAGCCGTTTGTCAGACTGTGATCGTATTTAAGTTAAAAGATTTAACCAAAAATTGTAACAAAATGCTTTATCGGA--AGCAT-TGATAATAACTAACGC-------ACAAAGGCAAATA----ATAATGTAT
>CG9526 6458586 6459008|7056 chr2L 6458567 6458792 scaffold_2 4783168 4783361 + -484|19 241
----AGTGTCCAGTTTGTTGCTACCAAATGGGTAGTTTCCATTCAAAACACAACTTC-----CTTTAAGTTTTCCA-------ATAGATATTCTATTAGGGGGAAACCGAAAATTTCTTCCTTGAAATTGTATATTATGATGATCAAACGAATTTCTTCTTAGAGATGTTCTTCTCTACATAAGTCACCATTTTAATTATGTACAAAGTGGTCTTGTTACGCC
GAACATAATACAGGTATTCAGCACGAACCCAAT------TATTTAATAGATAAATTCAACAACTTTCCGTGTTCCATTTATACATAGATGTTGTA-----GAATGTTAGTCAAATTCTTACACCATAAGATATAT-----------AACGAACTTTTTAT--------------------------ATTGTTCAAATTCTTGACAAAAAGCTAACGTTAAACC
>CG9526 6458586 6459008|7057 chr2L 6458793 6460011 scaffold_2 4783694 4784896 + 33463|0 232
TTCTACCCGCTTCCATCCGCACTTCTTCTGGGGAAGGTGATGATATTGATATGGATAAAATCTAAAATTAGATGCTAAAA--AGTTACTAAA--GAAATTTTATTATAGATATACATATATTTTAACCAAAGCCTGTG------AAATTGGAGT----CAAAAGTTATAGAAA---TATAAAATCCCAATATGATCATTCAATTGAAAACTATAATATAAAAGGAAATACACT
TTATACAAACATTCAATTGAACTTATT-----GAAGTATAAAATGGTTATGTAGTTT---TCTAAAATATAATCCTAAAATTAATTAGCGAATGGAATATATATTATTAAAATTCAT----------CAGATCCTATGTTCCGAAAACAAGAGAAAAACAAATGTTAGAAAAAGTTTCTCAGAT---AGTGCAGCTTTATTTTTGAAAACAATA-TATTAAAATTAAAATAC-
>DLP 6487110 6487585|7081 chr2L 6487081 6487550 scaffold_7 4484691 4485210 + -1839|29 562
A-------------------------------------AAGAG------TTATATCCGAAGCCCTAATTAAGTTATTTATTCAATAT-----GTTCAGTTTC------TTCCTGAATACGTTCGGTACATTTTTCAACTCC----CCTTGCTAACACAAATGTTGTAAG-----------GTCGACTATTTATTTT--------------------TGAATGTCAATCCTTAAATTTAAAT-TTTAAGTTTATGCAGAAAAGTTTATATAATTCAAGCATTGATTGAGTTGACAATTTTCATATTTGTTTTTTGCTTTTTTTATAGACATAGACACGTGAAGAACTTTTTCATATAAAAATGTCTTACATTCAAAAATAACTGCCGCCCTTACATTTTTGTGGTTGC--TAATCGT-GGTTACAAATTCCCCTACGCCTATTTATTGTAAAGCCTCCTACCTTTGGGTACAAGCCAGAAAACTACGGTAGTGTATATACGGAATACTACTAGTCTAAGTTAGTCGTATAAAATA
ATGCTTTTTTTACAGTCACCATTTTCCATCACATCAGCAAAATGTTAGTTTATGTTTTTAGTTAGAATTTATTTATTTATCTCATATATAGCGCACAGTTTTGTTATATTTCCATTTACATTAGACGTTGTTTTGCATTCAGTGAATTGAATAACATCTGTATTTTATGTATCATATATTATGTATCATTTATTTTCCATATTATGCAGCACTTTGTGGATGCTGTGCTATATCCTGAGCTATTTTCGTGCGCATAAGAAGCTTGGGATAGTGTAAATATGAAATGCAACTAC--------TATTAATTTTAAGTGTATGTTTTAAAAAAACACTAATGA----------CATA-AGAAATAAATGAAAATTCAAAATAATT------CACATAGTTTTTCAATTGAAATAATTGTCAATCTCTAATTAGCCTTGGATTATACACTTTA-----TTTTATTTT------------AACGAATTTTGCTATTGTTT-TACTCATTTTTAATAATTCACTTTTATCGGACACTATT
>DLP 6487110 6487585|7082 chr2L 6487581 6488619 scaffold_7 4485241 4486270 + 28135|0 4
CGAAA
CGGAG
>CG9543 6490112 6490195|7084 chr2L 6489126 6491517 scaffold_7 4486499 4488914 + 83676|996 1084
ATATAAGAAAAAATTCCAAATATCCAAATTA---ACAAAACCT--TTTGTTCATGTATTAAACTACAATAAAAATTTATTAGAAATGTA
--GCAAAATCATTTACAAAATATTACATTCACGTATAAAACTTTATATGTATATGCATTAAATTACATTACAAATTTATAAGATATATA
>CG31638 6496066 6496986|7087 chr2L 6493968 6496196 scaffold_7 4492407 4494803 + 65629|2377 2534
CTATGGTTCGACAAGCTTGCTGCTGGACGACGAGACGGAGGGTAACAGCGACT------AGGATAACCAGACAAAAGAC-------------ATTTGAGAGACATTAATGGTATTAACC-TTAAGTATTAATTCGCAAGT-------ACTTTAAAGTT
CTATGGCTCGACAAGTTTACTGCTGGACGATGAAACCGAGGGAAATAGCGATTGAGCTCGAGATATATGTACGAAACATATAATTCGATATGATTCTATGGCAGTTTGTGGTATTATCTATTTATTATTAATTCTTAAATTTAATTAACTCTTAAGTT
>CG31638 6496066 6496986|7088 chr2L 6496532 6496968 scaffold_7 4495704 4496267 + 615|0 569
TGCCTTTACTAAAAATGAACAGACTTAATAACAGATATACCGACATATATACG--TATTGAAGCAT--AATACAGGTTCGATGTTTGCGGAATAGCATTTAGTGCCAGAAATCTA-AAGAAATTGTATGAGATTTA----------------GGAAAGCATTGATAGAAATGCTGCTATTTATTAATCGACATTATTGGAAAT-TATACAAGTAATTCTCACTAC----ATATTTCGATATTTTT---GCAGTTGCCTAGTCCGAAATTCTTTTAGTTTTTCAAAAGTCTATCGATATTCAGCGGCATAGTTGAT-----CTTTTACAAAAAAATATATA-------------TACACATTAAACAAAT----------CGGAACTCAAAATATT------TACGTATTATAACATAG-----------CAATATTAGTATTTTA-----------------------------------------------GTTATTGATAAAT--AACAATTTATTAACTATTAAAATTATATAT--AAAATAC--------AAATGATATGCCAATA
TGCTTTAACACAAAATGACT----TTTATATCAGATATACTTACTTATATATGAATACTGCTATATGCAATACAGGTT-ATTGAATATATAAATATATATAGTGCCAGAAATATGTAACAACTTGAATAAGATTGACTTCAATATAAATTTCGATGTGCTTTTAAAATATTGCGAGTTTTTGCCGAGGAACTGAATTCAAAATACGTACATTTGTGCCTCTATTCGATAAAATTACAATTTTTTTTTGGCCACTTTCTAGTCTTTGTTTCTATTGGTTTCTGCAAAAATTCGCAAAATAAATTCGCAAAATAAAATAAAACATTTACGTATTAATTTATAGCAATATTAGTACTACA-ATTAAATATATTATAAACTTACTGAACAAAAAATAATATAATATATATATTTAAACATAAAAGCTGTCTATCAAATTTGGTATGTAACAAATAAATCTTGCGCTTAAAATCTGCTGAAAACTTTCATTTTAAAGGCAATTGAAACATTAACAAATATATTTTCTATAATCAATATATATTCAAGAGACTTGAGAAAAAACTATCTGCCACCA
>CG31637 6526015 6526996|7123 chr2L 6525617 6527600 scaffold_7 4534306 4536484 + 37142|410 1655
AGCGCTCCTAGTGCTGGCCGATCGTTTACGAGAAACTGATATGGATAACTAATTCTTCTACTTGGTACATTTTGATGTGATATCGTCGTGTTGAGCGAGCAAAAAGAAATATGAAAAGAACGGAAGAAGGCAGCGAGATATAGACCGATTGGATGGAGCAACTGGGTGCATTGTGCATTGTGAAAAACTCA---TTCATAGCGGGCACATTT------------------------TTGCTACACACGC-AGACACACTTAACTGAGCAATAGTTCATAATATA---------------TGTAAACTGA-ATATACAATATG--------------AAATGCATAATTTTAGTAATTGGCGAATTTTTGTGTAGAGAGTAAAGCGGTACGAAAACCAGTCGAATATCAGATTTAC----------------ATTTAGGCCTAGAACTTAAGCAAACA--------ATAACTGAAAACTTAGTCTAAATA-------------GGGCTGCGTATAGTGGAATGTTTACTTGGCTTTTTGATGTAAATTATTTAGGCAAACAACTTTTGTAATTT-------------GGCTTAACAAT------------------------------------------GAAATCCAGTGATTTAGCA--TATAACAACCAAAACGTATCA-----CAGAGATATTAAT-------------AAAATACAACGTTTGAAATTAATCGAGATGCAATTATACAACAATGTTTGGCAAACCAAAAACTGTGCAAT--------------ATTATCAAATTGGAAAAACAATTAAATTACCCTAGTATCAATTTAGACACAAATTTT---CTAAAGAAA-ATTCAAATTATAAAAATGTATTAAGAAGAGCAATGGGCACTCAATTCCTACTCATAAGTTTCCTTAGGCATAAATTATTTGTAT------------------------------------GGTTATTTAGTTG-----TAATTGTAATTAAATTGTACTATACTTTATGTCCTTATTATATAAATGAGTTATGTTCGTTT----TCTTTTTCCGAAACGAAGCCCA-----GTTCATCGATAGATACGTTAAAGAG----TAAATGGA---------TGTTTAATAAACAAAAGAATCCAGCAATATTTGCATAAT-----TACACTTATTAAGCAAGATACCAACTGAATAAACAATGAATTATAAAA--------AT
ATCGATTGTGG-------CAATCGAT-------AACTGATAACGATAACTAATTCTTCTACTTGGTACATTTTGTTGTGATATCGTCGTGTTGAGCGAGCAAAAAAAAAAAGGAAACAAA-------------CGAATTATATAGAGAAAAAAAGCATTAACTATGTTAACTGGAAA----GCAAGATTCGATTTATATAGCTGGCACATTTTTTTTAATTTAAATTTTTTTGTTGTTGCTTAACACGCAAAACACACTT-ACTGAGCAATAGTTAATGATATACCACATACGATATACTATATACACATATATACAATACATATACGTTTACGATAAATGCATAATTTTAGTAATTGGCGAA-TTTTGTGTAGA-----------------------TCGAATATCACATTTATATACATATATATATAAATTTAGGCTTAGCACTTAAGCAAACAAATAACTGATAATTTAGAACTTAGTCTAAACAATACATAAAACACGGGCTG-GCATTGAGAAAAATTAA----AAATCCCTATGTAAATTATTTAGGCAAACAACTTTTGTAATTTTCTGCTTATGGAAACCATAAAAATCAAATGCAATAAAAATAAAATTTAAAAAAAAAACGCATAGAAAAAATCCAGTGATTTAGCAATTAAACAAAAGAAAACGTATCAGCAGTAATAAATTTAAATTTAAATTATGTTAAACATAAAATCTTTAAAATAAATGG---------TAAACAAT----TTTGGCAAATCAAA---TGCGCAATAAAAAAAAAAAAACAAAACCAAAATTTAAAAATAAATAACAAATTTGAACAACAATTTAGACGCGAATTTTGGCATAGCGAAATAATCGTATTATAAAA---CGTGAACA--AGCAATGAGCACTCGACTCCTTAGCATAAGTTTT----AGTGTACATTATTTTTATAATAAATTGAATAATAATAAATACATACACATTTACGGTTATTTAGTTGTAATTTAATTGTAATTAATATGTACAATATTTTTTGTCGTTTAT---TAACTAAGTTGAGCTCGTTTCGAATAAATGTTTCATACTAAGCCCAGCAATGTGCATAATTTAATGCAATTAAGTGAATTTAAAACGAAAACTGTATTATTTGATGAACA----AATTTGGCAATATTTGCATAATAAATACAAACAAATAAAACTAATTAGCAATCGAATAAAGAGTAAAACATTTAATATTCCTTAT
>CG11015 6559046 6559308|7172 chr2L 6558936 6559349 scaffold_14 1975842 1976272 + 15631|110 403
AGTTATTATTAATTAATTCAATAAACCAATTAATAACAAAAAC-ACAA------------------------CAACTACTAAGCTAAAAGTCAACCCACTTAGCTGTCCAAATAAACAAACATCAACCCAAAAAAAA--AAAAAAAAACGAAACTGTGAACAGAGAGGAGTGAAAGGGCGGCACAGCTTCCATTTTCA-GATCTGCAAACGTGTT--TTCGAACGCAGCCGAGGAAAATTGCTTAATTAACACAAAAAGCGAACAATAAA-GTCTAAAGAAGAGATTTTGAGTG
AGTTATTATTAATTAATTAAATAAACCAATTAATAACAAAAACGACAAAACACACACACACAAACAAACAACCAACTATTAAGCTAAAAGTCAACAAAA-TAGCTTTCCAAATAAACAAACATCAATCCAAAAGTAATTGAATTGAAGAGAAATGCAAAACCAAATGCAATATGCGCCGCGTCCCGCTACAGTTTTTATTAACAACATAATTCTTAATTTGGAGCTAGCCGAGTTAGTTGCAGCAATGGA---AAAGCGTGTACAAAAAAGGTTTAAATAAATTACTTTAAACA
>CG11043 6560052 6560141|7173 chr2L 6559526 6560089 scaffold_14 1976859 1977450 + 15849|557 603
ATC--------GATCACACAGAGCGCTGTACTTA-ACACGAACACAC
ATCGGACAACGGGACAAATGGAGCGCTGTATCTACACACAAACGCAC
>CG11043 6560052 6560141|7174 chr2L 6560110 6560159 scaffold_14 1977584 1977629 + 2327|0 31
CATTAAACATTGCATGATATTATCAAAACAAA
CATAAAACATTGCATGATATTATC----CAAA
>Ent2 6564074 6564398|7179 chr2L 6563230 6564142 scaffold_14 1982432 1983338 + 32751|848 918
TCTTACATTTATTAGTATGACGCTTACTAACAATTTTCATTGTTCATTGCA--TTGCATTATTTGACACAT
ATTTTCTTTCACTTCAACGA--GTTGCTTTCATTTTCTTTTTTACATTGCATGTTGCTTTAATT-ACACAT
>CG11050 6616514 6617064|7246 chr2L 6616765 6616992 scaffold_15 571641 571853 - 1352|0 231
AGTTCGATTTCCTCTAAGTTAAGCGTAAAGTTGCGGATCGAATTCTATCGATATATTCAATTGATCTGACTAAG-GAATCCAATTGTAAATAACTTAAA---CGAATTGTAGACTATTTAGAAAAAAATTATTGTAAATGTTGTCCTAAAGCAATTTTATTCAGTCAACCGAACGTAAAAATCAAAACAAAAGATCAGAATCAAAATCAAATTAATTGATTTTTTTTTAATA
AATTTGATTTATTACAAATTCTTAATATGTATGCAACCGAAATTCGGC--------TTAGTTGTGCCAACTAAGCGCTTCCAACTGTAAA--GCTTAAGTCTCGAGCT---------TAAAAAAAAAGATATAGATATAGATCTTTAAAACTAAATTAAATTTGACACGCCAATTTTGTTGGCACAGCAAGTTAGCAATTTTAAAACCAAATATTCCGATTTTTTTTAAATA
>CG11050 6616514 6617064|7247 chr2L 6617044 6618117 scaffold_7 4993767 4994903 + 39636|0 20
AAATTATTATTAATATAACAT
AAAATAGTATTTATAAATACT
>CG11098 6654334 6654583|7291 chr2L 6653423 6654618 scaffold_6 312163 313389 + 45251|937 1245
---GGAGCAGGGTGTGCCC-----------------------GTGCAACCAAGTCCTA-----------CCAAGTATAT---TAGACTCAAAACTAGTTCAAATATATTTATTAATCAACGATTATCGAACGGTGGGATCGGGGCGGGTCGGGACGACCTCTCAAACCGAT----------TCCCCAAAACAGGGATCTCAGGAGAGTTCGTG--AACAAC-TAAGAAAACTCCTGTCTCAGCGGTGAATGATATCCAA--GAAAATTGAAACAAATTAAACGCAATGACAAACACAAATCCA----AT
AATGCGGCACTGTGTACTTTACATAAAGCAAAAAAAAAAGAAGGACACCAACATCCTAAAACATTATGTACGAGTAGTTGCAGAAACTCAAAACTAGTTCAAATCTATGTAT-----ATTTATTACTGATCATCGGGTTAACTACGACTAAGAGCGA-CTCACATACTTATATACACACAATTCCCATAATACGAATTTGAGGCATTTTCAAAATAATAACATCAACAATTTGGTGGCTCAATGGCAAATGATATCAAATGGAAAACTAAAATAAACCAAAC---ATTAAAAACACCAAAATATGTTAC
>CG11070 6661700 6662035|7297 chr2L 6658607 6662103 scaffold_6 317275 320759 + 138941|3164 3514
GGTAGCAGCGAACCCGCAGCTGCTGGCTCAGTTGCCCAACCAAAGAGTTAGCTCCACG-GGGATTCGGTTGTTAGGGCAATAA-TCAATGTTTTTTTGTTCATA-AGAATTCCAGTC------ATACATGGTGGTATGTGTATG-----TGCAGTTTTATAATTAGTGGTTTTTAAAATGTATTCTTAATCCATTTTTTCCTGTCAACCGAATTAATTAACAAACAATGTGTACGAATAACATGCAAAGGATAAATTATTGTAGTCATATTTGGTTTTGTGTTCACAATATGTTTACATATATGTTTAAATAAACGGCGTTTCGCTGAAAAAATG-TGTATATTCAATTAA
GCAACCA---AACCCG-----GCTAGGACACGCGCATAACCAAAGAATTAGCTCGTCGTGGGGGTAACCGGATAAGGCTTTAGTTTAATATCAGTTTATCCTTATATAATTCCAGTTTATGTACAATATGTAGGTACATAAATAACCTTTGCAATTTTCCAATTAATGGT--------TGAGTTGGGACTCCAGTT-------------------------------TGTGTAC-----ACGTACGTATTATAAATAATCA----------------------------ATGTAAATATGTTTGTATGATTAGTCGGCATT---CCGAGCGAATGTTTTAAAATCAAATAA
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CGGCTTCAAAAGATTCGCCACAACGACGGTTGGTCTGATGGCCATCGGTATTGGATCGACTGTTATATTCTACACCACCCATCGCCTTGTCATCAAACCCTATCTTCTCGAGAAACGACGCCTGGAAGCCGAGGCCAGTGCGGAGTACCTCTTCCAGCAGGAGGTTCACTCCCAGATTGGCGAGTCAAGACCCAAACGGAGCGAATATTGAGCCAAGGCTGCCAGTGCC--GTCATAG--------ACATCTTTACATAC--TTATAGCCTAGTGAT-TAGTTACCAAATTTCAACGCTGTAACATGGTGAACAATGAATGGACTTTT--ACTTTCTTACCTTCACTTTGGGTGGAGAGGCCCATCTTCTTGTGTTCATTTT--------------------------------------------------AGAGTTAAACAGAA--------------------------------------TGGATTTTTTATGAAAG-----TAATATGAATTGAATAAATAA---------TGAAAAGCACAAATG---------GTTTGAATAAAAGACTAGAAACATAAACA----ATTAAAAATCACT
---------ACAATTTGCCTCAACGACTGTCGGCATGATGGCCATCGCCATCGGATCCACGGCTGTCGTATATTGCACCAATCGTTTTTTAATTAAACCGTATCAGAGTAAAAAGCAACGTTTGGAAGCCGAAGCCTGTGCGGAGTATATATTTCAGCAGGAA------TCCCAGAAGCGTGGATAGA---TCAAATAGATGGCACTT---GTTAACTGTTCCAGATCTTTATAATAGTTTTTCCTATATTTACACATACATTTATAAA-TAGTAACGTAGATAATAGATTTCAATGGAAAAATAATTTGGGCACC---TGAAATTTCGAACTTGTATATCTTCAATTTGCATT-AGATTATCATCATATTGCCTTTTTTTTTACTAGCATACAACATTTGTCTTTTGCAATTTTTACGATCGGTGGATAATATTGTTAAACAACAAAAAAAAATAACAAAATACGCTTTAAGTTGAAGAACCATGGAATTTTAGTGGAAGATTTATGAAATGAATTGGAAAAATGAATGATTAACTGATAAGTACACGTATGTTTACAAATTTGAA-ATAAAAATAAAAACACAAAAACCAAGCCAACAAATAGT
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ACTGTAATAAACTAATATATGAAGTTTTAAATAGGAATAAAATCTATGAAATGTCA-TAATTGTTAATTGCCATTTAAAAGAATTATAATAGTAGCACTATATACCTAAACAAA---------AAAAATCAAATTA
ATT---ACACACGAATATGCATA--------------------TTACAGATTGTTGCCCGTTGTTAAGCGTTGTTGAAGGCAA--ATAACA-----AATTTATAGCGTAACAAATTCTTAATTAAAAATCTTTTTA
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AAAGAAAACCGATTTTAAATTGTT
AAAAGAATTCTGTCTTCGTTTTTA
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TGCAGTTATAGTCCGCCCACAACATCGGTGGATGAGT---------------------------AAAACA---ATCTAAACTAACTTTCAAAAGAGAAAAGCC--AGCACAGCGTCAATATTTCCTAAACGCTGCGAAAGACAACTAATAATGGAGCATATATATATATATATATTTATATATGTGAAATGAGGAAATCGAAATGGAAATGGAAACAAACAGACAAACAACTAAGCCAC-AAAATTCTAACAAGAAAGACGGAACGCAAGAGACTCCCAGGCTCAGAATATACACTGACTGGGCCCAATACCCATACCCCTCCCTTCTTCCCAGCATGATGCACGTCTAATCTA-----TTTATATAAATACACACACGCCTACACACACAGAGATAGTCATATAATCCATTACAAGACAATGTATACAAGACATAGCACATACTCTATATAGGAAATACGTACGTATACACATACAAAGCGTGTATGTAAACAATTTGCACGGGCGCCCTGCTGCCAATGTTGTAGGCATTGTACAAGTTTTAGATGCTAATCATTTTGTAATTGTTTTATTTTAATTAATATTTTTTAATAATAATTTTTTTTTAACAATGTGACATATTTAATTTAGATTGTAGCATTAATTGGGCTTGCAATAGACTAACAGTATTTTGTTTTAGCTGCAGAATATATATATATATATATATATATATATATATATACAGAGAT----GCGTGCTTCAAACCAAATTAGTAACCAAACTTGATTGTTATATAATATGTTATTGACATTATGTACAGTTTATTATTTTGTTTAATGCTATTCAGTTTTTTTTTTTAATATATATTTACATATATATATATATATATATATATGCATATATATACAAGCAAGCTAACATAGTACGCTTCACATATGACA
>CG11221 6755298 6755686|7381 chr2L 6753562 6756159 scaffold_2 6033383 6035952 + 95433|1819 2207
ATTAAGATAAATCTCTAGCAAAGAAATCCCCCCGAGCAAACGGAAAACATAAATATCCTTAGAAACAATTTTGGATTTTTCCAAAGATTTTTGAAAACAAAAAAAAAAAAAAAACAATGAAATCGCTGTGTAAATAAGACGATATCGCCCAATTAGAAAGCGGAACAGGGATGTATATCATCATCCTGAACGGAAACGGTTTGAATTTGTGGATCTATAAGATCGTTTTTGCAGAGCAGAGAAGTCACTGCTCGACGGTTTTTTCTGTTGTTCTGCGAGTGCAAATTGCCAGAACTGAAATTAAGTATAACTTTATATAGATGAATTTTGGTAAAACTAAGTAGTAAGAATTTATAGGATAATACAATAAATCCCGGAGATCAAAAAAG
-------------------------------CTGCGCA------------------CCGTCTAATCTGTTTGGGGTATTTCGAAATTTTTCAGAGATCTATAAGATCAGAAAATT-------TCGTGAAGTAATT------------TCTCATGAAAA--------------TTATATTAT---------TGGGTACGGATT---------ACCCCATAA-------------------------TACTTATAGACGAATTTTTCTGCT---------ATGCACAT----------------------------ATATATATGTATGTAACTACA--TAAGTAGTTGAAATTT-----GTAACAAATTAACCCCAAGAGGTACACAAAA
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G
-
>CG17378 6777796 6778456|7402 chr2L 6777654 6778078 scaffold_399 8338 8692 + 5594|142 427
CAGTAACAATTGTAAAAGTACCTAACAAAATCGAGTTTCAATCTTCGTCTCAACTAAAGCTAAACTTTT--GTCTTAAGTCAGCCGACACCTCGAAACTAATCCTAACTAAAGTAGCAGATCAATGAAGTTTTATCTGAAATCTGGTGTTTTTACTCGCGTTGTCGTAACCGTAAAGATATTAATACGATAGTCATTCTTGTA-ACTGGATTTGAAATATAATGAATGTATGGGGAAATGCTTGTATTTATTTTAACATCTATAAAGACGAATATTATATAATGTT
CAGAAAAAAAAAAGAAAACTATTAACTAAACT---TTTCAAATTTCGTCTCAGCTGAAGCTAAACTTTTTGACTTTAAAGAAAGCTAAACACTTAAATTAATC-----------------TTGATGTAGTTAAAAATGTTAACTCGCATTGTTGACTATATAG--GAAAATGAATGAATCATAAAAATATATACACACTCACACACCAGAT----------ATGTATGTATATTAAAA------TATATATTAAAAAGATAGCAAATATGAAAAGCATACAATATT
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TATATCCGCAAATTGTGATAATAATATTTTGTGATTACTTTATACTATATCAAAAGAGCAAAAAAAAAAACAACAACAACTAAGTTTAGCAAATAAAATAAATATCCCAGAAT------TCACAAAGCAAATTAAATAATGAACTAAACAAATATTCTGTA---ATATCTGTAAT-ATAGGTACAATAATTCACATTTAATAAAAACCTACTAAT-----AAAGTTTAACAATGGTACACAAAACTAAT
>CG11236 6804259 6804372|7430 chr2L 6802713 6804283 scaffold_6 5453001 5454612 - 44405|1618 1648
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CGATCCCAGCTGCAGATAGGTTAGTGTATTA
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C--------------CAAGCGGAGTGGCAA-----------------ACCA-------------AAATCCAAATCCAAATCAACCGCAACCATTGTGCAATAGACGGAAGTGAAAGGCTTCGCTGGGCATTTTCTCAACCGCTTGAAACCGAACTCCAAAGAGAACAGATTAAAACAATTTAAATAATTTTAAGCCAGTC----------------------------------AGTTAAAGAACTATTTCCAATGTTGCCAAAAACTAAA-----------------------AATAGCAAAGAGTTCACAAAATCGAAACCAATTAAAGCCAGCACCATAG------------------TCAGTCTCAAGTTATCATTAAAGCGTAATC----------ACATTGCCATCTTACGAACATAC-----CAAAGTAATCCAGAGCAAAGGAGT----------------------------------------------------------TTCCATGTTTTCACCTATGTATGTCAGTTTGTATTGCTGTGACCCGGGCGGAGGTCAGTTAAAAAATCAAAATCAAGTTAAGAATTTCCATCGATATGAAC-------------TGTGCTGCGTGTCGTCCTTTTGTG-AAATGTAATA---AAACCAAATCCAAACGGAAGAAATC----CAATGAA------------TGAATATGAAAATAAAAGAATTAGAACGCGCGAGGGCAAAACTA-----------------------------AAATGTTCCAAGTTTTCGCTTCTAGATAGTTGTGAAATTTTAACTAAATCGCTGTATTATGCAAACTATTTTGATATTATATCATTCCAATGAATTTAGTCTAATTAATAAATTTTTTAACTTATTTATACATATTATGTGTATGTATGTAAAAACCGCTAAACAAATATATATATATATATATATATTTTCATTTTAATGTTCAACAAACTAATGTATGTAATATTAAAACAACAATTATGAAGACA----AACATTAATCTACATTCTAAGTATTTTTATGTTTTCAAAATAAATTGAATTTATTAAGCAAATGTGAAA
CAGCAACAACTGCAGCAGCGGGAGCAGCAGCCAGCGCCAGTTGCATTACCAGGTCCAGTACCGCATAGCCCAGTCCCAAACAATCGGAATCATTGTGCAATAGCTGCCGACACAATTGGCCGCCGGGCATCCATTT--CCATTTG---CCG------------------TTAACAAAATTTGAATAGTTTAAGCCGAGATTCATCCGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGAGGCAAAAAA--ATTTTCCAGGTTGCCCAAACATAAATAGATGCTTCCCATAAACAACATTATACCAAAGAG---AAACAGTTAAACCAAAATAAAAAACAAATCTTAGGCTCTCTCTCTCTCTCTATCTCTCTCTAATTCTCAGCGCACAGCAAACGAAAAAAAAAATATTACAAAAATAACAACACACATTCTCAAAATTAAACAAAAAAAATAAATAAATAAAAATTCCAAAAAAATTGTTTTTTTGTAAATTAAAATTATATATATATGCATATTCGATATGTTTGTGTGTGCGTGTGTGTTTGTATGATTGTA--TTTGGATTAATTTACATGGAATTTACTGATCAAGAAATATATATATATATATATATACATACATCTTCTTAGCTGCTACACATTAAATATTTAAATAAAAGCAAAAAGTAAATCAAATCAAAAAAAAAAAAAACAAGGCCATGAATCGTGCGTGTATTAAGTGTAAAATGTAATTAAATAAAAAACCAAATACCAAAAATAAAGAAAAGAAAACGAAAAATATTAAGCATAAATGTTCCAAATGTTCGCTTCTAGATAGTTGTGAAATTTTAA-------------------ACGCTATTTTGATATTATATCATTCCAATGAATTTAGTCTAATTAATAAA-TTTTTAACTTATTTATGCATA-TGTGTGTATGTATGTAA--------AAACAAATGC-----TAAATAAATATATTTTCATTTTAAAGTTCAAAAAAAAAA------AAACATAAAAACAAAAATAAAAAACATCATATAAATCTAACATACACTTTAAGTATTTTTATGTTTTC-CAATAAATTAAATTTATTAAGCAA---TTAAA
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GCAAAAGCAAACACAATTTGAATCCTTAGCTTTAGTTATCAAATATT-CAACTGTACCAAGGTTTTTTTACAT---GTTTAACTAGTATTATAATCGTCCACATCTCATTA-GTTCCGCG----CGTGCACATTTCGATGTCATCAAGTTTTATTTTTCTTTGCTGTAACGTATGCTCAACATTCTTGTACCTCTGTGAGATTAAATA--------------GAAGTA---AGATACTTTTTACA---------
>CG10805 6860773 6860864|7506 chr2L 6859614 6860792 scaffold_6 5531333 5532521 - 52694|1169 1188
TTATGGGAGAAGACTTCTCC
GCTCAGGTCAAACCTTCTTC
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CAATCATAACCCTTCTAGTAACCAATTGTGACCCTAGTTTAA-----------------TGTTTTTATCTAGTTATTTATGCGTCGAGCTT----GTCCAACTG-GAGCTTCTCCTACATCTGAGTCCAAGTTTTAGCCTATTTCTCAAAAATT------------------------AATTTTCGTCTATCTAATTTTTTAGTTTTAGAATACTTTTCT----TTAAACAACTGACGCGATTAGTCT---GTAAGCTTTCCAGTACCAAATTCATATTCATGTTAGGTGAGTTCGACTCTTG----TTTAGTTATCAATTTCTGCTCACTGACCCAAATATTTAAAATAGAATCATGTTTCTGTTCTCTGGCATCAATG----------CAAAAAATCGTTGTAACTATATGTAT-----TAC-----GTATGTTTGTATATTATGTAAATGTTCCTTGTAGACG----------------TGATTGA-------------------------GAAGATAATTGTGTAGGAATAATTTTTGAAGTGT---------------TATCATTGTGTGTATAGTTTATGTTACTTTTTGGTGTACGATT-AGAAATTCATATTTGCTT-----CTATTTGCTTGT----TATTTAATAATTAGCGAAATCAAAATA---------------------------ATATGTAACAAGCTTTTAATGATTTGTAAAAGAAAACCAGATATAATAACTATGATACACATATTGTATTT-------AATGTATTGTAAAATATTGACTCTATTTGTATG--------AAATACATATGTATTACAAAGTATTCATATTCAC-
TCAGATGTGGCTCTCAACTAAGCTTATGGAATTTCAATTTAACTCGCAGGCGCTTCAAGTGCTTGAACCTAACCGCTTTTACTATACTTTCCATAACCCATCTACGACTTTTTCCCGCATTCAAAAAGGAGTTTT--TCCAAATCTCGAAAATTCGCCACAAAGTGAAAAAGTGTCCAAATTTCCGAAAGT---AGTTTTTACTTCGAAGAAAATGTACTCCTACTAAAAAGGTATTTAGAAAAAGTTAAAGGAACTTTTCCAAAATCCAATCC-TTCTCATTTTGGG-----ACAAATTTTGGAAATTTGGAAAACAACCTTT-TTGAGTGCCGCAACTTTT---AATATAATTTTCTTAATTAGTTCTTACTTCGACGTAGTTGTATCCAAAAATTTGTTAAGAATATGTGTATGTGTGTACTTATTGTCTGTTTGTACATTATGTAAATGTTCCTTGTAGTCGAGTCGCGTGCATAAACTAATCGGAATATGTAGGCCTCATCAACTATATAAATATATTTATATATATATATATATTGTATCGTATTGAGATTGTTTTCTATATGTGTGTGTATAGTTTATATT--TATTTGACATATGGTTAAGTATTTCATATTTTATTATTACATATTTGCTTGTTATATATTTGATAAATAGCGAAATCAAAATAAATAAATAAATTAAAGTAAATATATGTACAAGTAACAAGCTTTTAAATGATTATAACTAAATACCATAT---ACACACATAATACACATTATGTATTTACGAGTAAATGTATTGTAAAATATTGAATCTATTTGTATGAAAAAAAAAAAAAAACATGTAATAAAATATACTTATGTATACT
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TAGTTTTTTGTGGATAATATGTGTGCAATAAATGTTTATTACTAATATTTTTTGATGATGTCTATATTTCATTATTAAAAATGTATACACA--------------TTTTCGTTGTATCCTGAAGTAAACTACTTATTTCTTTT------GACTAGTTTAAATTTAATTTCACCAATTTAAATATCTTACATATAGATATTCAGA-TAAAATAGATATGATTT
>CG10354 6910893 6911432|7559 chr2L 6911189 6914088 scaffold_6 5588206 5591007 - 93582|0 266
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GGTTGTTATGTTCAAACACAGGAAATGATCGGGAATGTGGTAGAACTGCGGAGAACAATGCAAATATCATATGTAATG-------CATTTGAATTGAATAGCATTCCTTGGAACGTTCTCTCCCTTTGTAGAACATCTGAGAACAATTAAAACAAAATAGATATGCCATTTAAGTGGATAGCATTCGTTTTATTTG-CGAATGGAATGTCCTTAAAAATGTTCGCCTTCAATTTAACATAATAAATAGTTTAATTACGAAAACAATA
>Hrb27C 6925456 6926122|7571 chr2L 6924463 6926163 scaffold_6 5601517 5603395 - 65784|1038 1913
AGAGAGAAGGATCGTGTGGAGGAGAAGTAGGAGTAGCGGAGCA----GAGAGGAGCGGAGTAGCATGTCGTCCTCGGCGAATGATGAAGAAGACAGAAAAGATGGTGGTAATTGTAAGCTAAAGCGTCGTCTGTTCG-----------------------TTTTTATTTCAGATCAGATCAGTTGTTGAAATTAATATTTAAAACTCTTG------------------TACAACTATTATTTAAAGC-----------------------GAAAAAAAATTTAACATGAGAATAA----------------CTAGCG--ACAAGTCAGATTCATAG----------------------------------------------------------------------------ATATACATGTATGTTCTATAGCAGCGAGTATGT---AATTCATAGGCGAAACA--------TCAGCACTCTC-ACCCATTTAGACAAGAGAACATTATTTCTTTCATGCG---------CCTCATAAACACCACACTCA-----ACAAGCATTCTCCTGTACCCCACACTCACCAACAAACCAACCAACCAGCCAGGATCAACTAACAAGATCTTCCCAACCAACTAAAACC-CGTAGACACTTATGATACATGGCATTAACAAGAAACAAAATAGAAATGTGAAGATATAAACGTAATGATTTACAAATATAAAGTTTAGCTAATTAGACACAAGAAGGTCAAGAATAGAGCGCGAAATACCAACACAAAGAACAT---------AAGAACTTAT----AATTTTATTTAAAGAGTAAA-------CAAGTAAAGATCCCCATTAATTACTAAAATTAGTAAA
AAAGCCA--GATCGTGCGT-------GTTGTCGTCTCGTGTCATCCCGCGCGGACC-------CATG-------AGGTGAATGATGAAGAAGACA-AAAAGATGGTGGTAATTGTAAGCTAAAGCGTCGTCTGTTCGTTTCATAATTTTTAAAAAGATATTTTTTATTTGAGATC-GATCACTTGTTGAAATTAATTAATGTAACTCTTGTGTACACAGCAAATAATTTAAAAGCATAATTTAACACACACACGCAAACAAACAAACAAAGAAACAAACACAAACACGGAAATCAGCTTGAATGCAAATCCCTAGCGAAACAAGGCAGGTTTATAGACTAATATATATATATATATATATATAGATAGTATATGTATAAAAGGAAAATATATATGTATATATACGTTTATATATATATATATACATTCTATAGCAATGAGTATGTAAAAATTTATAGGCAACAAAAACCACAGTCAACACTCTCGACTCA--GAGCAACAAGAACATT-----TTTCATGCGCCCTCCCTTCCTCGTCAGAAACATATATATATGTATATGTATATATATATATGTAAATCCTAC---CTAACTAACAACAAAAGCAACAACAAC-AACAA-------CAATCCAACTAAAACCACATATACATGCATATTAAATACGAT--------AACAAAATA-----------ATAGAATTGTGAAGATTTAAAAGTATAAAGTTTAGCCAATTAGACACAAG-------AGAAAAGTGTACGAAATACCAACAAAAGAAGAATAACATTAAAAAGGAATTATAAGAAATTATACTTAAAAAAAAAAAAAAAACAAAACAAACACATCCCTTAACTACTAAAATTAGTAAA
>SA 6954455 6954590|7597 chr2L 6952973 6954577 scaffold_6 5634957 5636548 - 76245|1503 1632
---GACCCATCAGGCAATCAGCCATACACGCGGCTTAAGTGCAAAATCTAATTTTCCGGAAAATCAAGTAGTTGTAAGATTAAAGCTAATATTA----TGTACATAAATACGTTTAAATTATATAAATTA
CCTGTCCTCTGGGGTAATAAAAAAT------------AATATAAAAT-TAACAACCC----ATTCACTTAATTATAAGAATAAAATGTAACTTAAATTTGAACGTAA-----TATTAATTATACAGTTCA
>CG3430 6959040 6959107|7599 chr2L 6956599 6959124 scaffold_6 5638749 5641256 - 86481|2546 2613
GAGGGCCTCTCTTTTATACCATTTAATATTAAGTTTTTATAAATAAAATAGAATTTTTTAAAATTATT
GTACCCCCCAATTCAATAC------ATA-TATATTTATTTAAGCAAA----CGTTTTTT----TTTTT
>Coprox 6965692 6965813|7603 chr2L 6964351 6966142 scaffold_6 328098 329788 + 61774|1357 1488
GCTATTTTTAATTGTTCTTAAGAGGGAACCGGTGCCTTTTGCATTATATTTAAAACTT-AATGTGTACA--------TATTGTAATTG-TTGTTGCAAATAAACATGACAAAATGTTATTGTTTCCTAACTA
------------TATTGTTAAGGTCGAGAAGTTGATATTTATATTTTGTTAATTACTTAAATGGGAATGGTGCCTTTTATGCTAATCGTTTTTTACGAATTA-------AGAATATTTTTGCCTGTACAGTT
>Pcp 7022341 7022473|7648 chr2L 7021179 7022467 scaffold_14 888767 890152 - 24259|1340 1470
TGATCGATGGACGTGAT-TCTTTGGCGGGGCAAGGGGCTGGTCTCTT---CGGCGGCCAGCGGGCGAATCTGTGAATTTTGATCTAAACAATTAATTAAGCCACGAACAATAAATAGAAGTGCTAAGCAAA
GGGGGGCCGGGCCCGAGACCCGGGGCCCGACAGGGAATTGGCAACTTGTAGAGAAGCCAAAACACAAA-CTGTGAA-TTTGATCTAAACAATTAATTAAGCC----ACAATAAATAGAAGTGTTAAGCCAA
>CG3476 7028900 7028959|7652 chr2L 7027666 7029026 scaffold_14 896501 897839 - 43317|1258 1323
ATT------TAAGAATTTGTATTTCAGAGAGGCTGTTTAGAATATTAAATATTGTTTACATATGCG
ACTAAGTTGAAAGGTTCTGGGCCAAAAAGAAGCTATT-----TTTTTAGTGTTGTATA-------A
>CG11266 7037451 7037620|7663 chr2L 7036045 7037618 scaffold_7 2943616 2945181 - 74157|1440 1655
----------GCTGAATGCGTGGGCA---AAAATATTGTTAATATTCGTTACAAGAACTAATTTTTGGTCAAAACATTTTCAATTTTTTTAAAGACTC-----------------------------------GACGCAAGCTGAAAATTAGGGGCACATATTAAAATACAATTAAATACATTTATAAATATATATGAATTTGAAAATTTTAACAT
TGGGCCAGGCGATAGATTTGCAACTATATAATATATTGTTATTATTCGTTA----AACAACAATTTTGTAATAATTTTAACATTTTTTTGAAAGACTCCGAATTTGGGTAATGGCCCTCAGTTAGCTAAAAAAAAAAAAAAACGAAAAAAAAATGGGCACATCAAATTACAATAACATAA----TTAAATATTTATATATTTAATGTGTGCAACAT
>milt 7054557 7056011|7679 chr2L 7049031 7054606 scaffold_7 2956582 2962134 - 162279|5973 6023
A-ACAAATAGCTAATCATTCACAACCTTATTCTTACGCTTGCTGGACTATA
ACACAACAAACCACACACACACACACACACACACACACACACACACACACA
>milt 7054557 7056011|7680 chr2L 7054626 7055824 scaffold_7 2962156 2963282 - 5961|0 1303
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ACACACAGATACATTTAGACATACTACATATACGTATGCAAGCAAGCTCTTTA---AAGCTAAACGCGCCTAAAGCATGATTTCATGAGGCAAGCGAAATAATTATAGTTCGCAGCAAAACCACACGCAAAAAGGGTTTTAAGTTAGTCGCCGCCGCTG----CCGCCATTTTGTTGTTGACTGTCGACGTTATGCAACACTGGCCACGTGGCCCGCTGTCTTAGTGTTTGTAGCTGTGATTTGTAAATAC--TTGTAGTAAAATGTTTAAATTTAGTAGTTTATTATTAATTAAATA-TTCAC------TTGTTTTTGCTTGTGCAACGGCGGAAAATTTGAACAGCAACAGAAGCAACAGAAACCCAGCATATCCTAATATGGTCGTCAG---CAAGATTAACTATATATACTTATATATATATATATATTATTTTTGCCAATTTTGTATTTATTTTCATGTATGTGTTTAATTACGATGCGTAGAATATTA----------ATATTTTATTTTCTCGATAATTCTCTGTATAAA---CTGAAGAGCGTGCGA---TAAGCAAATGTACATAAGAATATTTAA----------------------TTGAAAGTGGACTCGCAAAAAGGT--ATATATATTTTTTTACACATGTATATATATAGTTTACGTTTTT-GCTTTCCAC-----------------TTGCCGACTCTTAC-----------GTATATCACAA-------AATCCAACACTGTCTTTTTACTGCTTACATATT-------CGGTGCTTTTTGTGCAGCCATACAAAAAAAAGGGATAGAAAAGTATGTCCCAATATAAACAATT-TGTTTCTAGTCTTTACTTACGACTCTGTTCTCTCGTTTGGCTATGCTCTAACAATTTTCGATGCATAGCTTCTAAATGCAGTGCACTAAACAGGGTGTAATAAACATTTACTTTAATATTCTAGTTTTACATTTGAACAACTAAATTTTGAGGTG---------AATTAACAGC--------GCTGTTAGCTAA---------------------------CATTCG--------GAACACATGTTACTAGATCACCTTTGGCTAACGGCGTCTGCGTTCTGTTAATGGAGTTTCTATCACAAAAA---ACAATTGAGAAAAAATTTGGTATACTTTGTATTATATT--------ATTACTTTTATTTTGGAGACATGCATATATCACAAATGAAG----------TTATAATAAAG-AGCAACATATATTGACGAAATTTATTTATTTTTTT
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ACAACAATTTGGAACACAAAAAGGATTGTAAAAGTTATTAGTTTTAATTAT---CAATATATTTATTTATATCTGCAAAA-TAAAGAGAACATCGTTAAATACAAAATA
AAAACAATATCAGAGCAAAAAACAAATGTAAAAGATTTTAGTTTTAATTATTATCAAAATATTTATTTACTTATGCAAAAATAAAGAGAACATCGTTAAAT----AATA
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ACCGGCACCGACCCCTTTGTTCAGTCCTAACCATAAAAACGAGCTGAGCTGTTTTG-CATTAATAGAATAAAATCAGTATATTAAGT--------GGAA
TTCGGC--------CCGCGTTCGTACCTAACCACACAATGAGCGTTAACAGTTTAAACTTTAGAAATAAACAATGGATATATTAAGTCTACAACGTGCG
>CG11289 7069543 7069546|7692 chr2L 7068665 7069689 scaffold_23 907667 908715 + 23251|913 916
CTAG
CTAG
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TTATCTGCCTTCTTCTTCGTCATAATGGATTCTCTTTTGTTCAGTGCTCAAAGCGCGCTTGTTAGTCATTTTT-------CTTACGCTTGCTCCTATTTATGTT--TAGTTAAACTTTACGTTAAACG-CTTTAGCGCAAT
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-------GGACACTGCCCGCCTCCAGCCCAGTCCCGT-CCTCTGAAGCCGCCCTCTTCGTTCTTTGTATGTGTTATGTATTT
GTAGGCTGGGCCCCGCCAACTTCCTTCCCAGCACTATATCTCTAAATCTCTGTCCCTCCCTCTCT---CGTACTATCTATCT
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TGTCTACGCTTAACCTTTGTTATTAG-AAGTTAAGAGCCTAGACTAAAGCCTAGTTAAAG--TCCATGACCCGCCCCTAATTCTTAGCTTACACAGC------AGCCTACTCTGACTTTTTAGCAGTATTACATACAATAACATATATATGTCGAATATATATATAAATATATATAGCGAGGACACGACAAGAGGAAAGTGCACAACTTCGTTTTGCCCAGTTTTTAGTTCTATAAGCAATACGCAACGCTAGCAGCAAAATTTTTTTTTGTAAATTAC--GTTTGCTGTTTTGTAGGCCCCGATATGAGTATAGAGTATGTACATAAGTTTAGTCGTAGCTTAGACATAGTTTTTTACAATTTTGAAAGCGCGTTTAAGCCCTGCCCCCTTCCAACT---TCCCTACCCCCTCTACCATTTCCGTTCCAATGAAAAAATTGTACGAAATCATTGAAAACAAGACTGAAATTCAATTGCGCGCACCTGAAACTCTCCCCCTCTCTCT
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AGCGACGTTGATGCTGGCAGCGCTGCTTGCATTCCGCTTTGCCCAGCTGCAAAACGCATGTTAAGCATACGCCGTGTGTTCTCTACGTAACCAGGGCATGAGAAACGAGCATCAGAACGGAACCAGTTCGGCACTTGAACCGTGAACCAGCTCGAAACGTTTCTCCATGCCCGCTGATTTCATAAATA------TATATTGTGTACATAAATAAGTGTATGAGTGTTTAGTGAGTGTGTTTAAAGGTTAAGTTTTTGTCAATAAGTAATTACAACAAAAGCACGCTAGATGGCGCCACACAAACAATTATTTTATTCTGTTATTTCGACTTGGAATTTATGAAATTT-GCACAAAAGAAATTATATAATTTAACTCTTTTTTTGCACAACTGCCGCTACAAAATTACATTTATCTATATTATATGTTGCCCTTTCGGTTGTGCGTTCTAGGTATTACTAA-TAATTAA------TTAATTGGTAATTTAA------TAATTAACTAGCCGACTAATAAAAGTATTTTTAATTAATTTATATTAGCGCATAGACTACATACAATATTGTAAAGTATTAA----AAAGATCGAGAGAAAAACAACAACAAATTGCA----GCAAATGCAA---GACACAAATCAATAAAACAACAAACAACAACAACAAT----
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GCCCC-----------------------------------TACTATA--------------------TACCATTTATACACACTATATCACTATATCGATCGATACTAATCGTAATACGACTACCAATAAAATGTAGAAA-ACGCAAACAACCAGCTATCAT-----CTAGTCTAGGGCCTC-----GGCAAACCACTTAAGCCGCTTAG------------TGGTGTCCA-ATGTGGATACCATCCCACCCCATCCCGCTGGGCGGTTGTGTTCTCCATCTGATGCAACCAATCGGCTTATAGCTGTCTGAGACATAACACTTAACATCGACGGCCCCTGCGAAAAGAGATGAATTATAAGTGCTGCGTAGAAAAGAAATGAAAATTTAATTAAATTAAGGTGACTTCCCTCTCATTCACCAC------CACCGTCCACCGCCGCGACCGCTTT------------------------TCAA-ATGGGTTACTCTAACGGCCTTCCTCCGT---TTCCATTTTCCC--ACAGCCTTCAGGGGATTCCGCGA
ATCTCACACCAATAACCTAATCAAGCAAGGCCCATGTGGGCAATATACTAACTCGTGGGGGTAGCCTTACCAATGCCACATACCAAAT-ACTAC--------ATACTACTCTGCATGCATAT---AATAAAATATCAAAGTAACCAAGCCACAAGTTTACATTAGTGTTAGTCTAGGGTGTCCGGCTGTTGGACAATTTAAGCCGCTTAGTGCCAACATCTTTGGTATCCACCTTTGGCTACCA----GCCCCAAGCCA---------------CCCTCACTGATGCAACCAATCGGCTTACCGCAG--------------------------------CACAAACAGAAATGAATTATAAGTGTTGTATAGAAAATAAATGAAAATTTAATTAAATTAAGGTGACTCCCCGCCCATTGACCGCATTTTTAACTGGCCACTAACCCGCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTCTTTCTCCTCAACATCTCTCTTTCCCACTCCCTCTCTCTTTATCTTTTGTTTTCTTGAACAGCATTTCGGGGCTTCCGCGA
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AATGC---ATTAAATATCTATTTAGTATATTGTCGCTTGCGAGGCAGTGGCTAAGTGGCTTCAATTAAAAGCTTTGTAATTTAATATTTCAAATTATAGTACCCACCATGAGTACTATAGAAGCCATCT
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CTCTCCGAGAGTATCTCTCAGCTGCAATGTCCTATGTAATGTCTTTCATATTATTTATGCGT-----TCACTGT
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AATTTCTAGA---TATTTAATTTAAAA--TTTATTAAATTATTAAA----------ATTTGTTGAAATT---------GATCAGTTAGCTT-AAATCTAAAATTGGTTATGTTAGCATTTTCTTCTTTGTTTTTGTAAGTTTTCATAAAAAAAATAACAGACTACATCATTGTAAATT
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GCCCAAC-GCTAGAGGATATTAAGCCTAAGCTAAATTC-----------CACGCACACTCACACTCA-ACACACATCATAATTACACGT
GCGTTGCGGCTAGCTG-----TAGCTTAAGCTAATTCCACACTCACACACACGCACACGCACACACACACAAACATTATTAGTTCTTGT
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TGTAAA-----TCATAAAGTTTTGGTTTCGTCCTTTGACAAAACAAT--TTACAACATTTAATTTAATACTGTATCAAATAACTTGTGTGTAAACTGATTTTTATAAGTTATTACAGTTAAAAAAAGCATTTGTAAATGCTTTATGTTTTTTTCCGGATAATCAAGCGACAGTTTT----------AAGTGAAATTTGAAATACACAA------ATTTAGCTTCGTTTCTTGATAACAGCATATATAATAATAATGATACAATTA---GGAATTTTTAGTGTGCGAAAGCCATTGCGACTGTCAACATTGAGTTATTCG
>chm 7421961 7422389|8119 chr2L 7421327 7422132 scaffold_6 4903179 4903969 - 27250|653 848
CCACGTGGTTGGAAGCATGCCAGGGCATGCTTTGCAGACGCCGACGA----CGATGACGAATTCTTGGCTCCGAATTCTTGATTTCAACGATT----------TTATTTTTGGGTAGACATCTG----------AAGAACCACATCTCCAGTCCTTCCTTTGCATTTATCCTAGCGGATATATGCATTAATGTAGA
CCACGTGGTTGGAAGCACGCCCAGGTGTGCTTAATGGACTCTTCCTAATTTCCATAGAGACTTCAT--TTTATATATATTGTGTATAGCGCTTAAGACCTCACGTATTTCTTGGTAGCCAATTGATAATAGTGAAAATTCCACAATACCGATATTGATTCTG-----ATTCTGACTTATATATATATATATATATA
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GCG--GACAGAAAC----------GACCCATCACATTTAGAGACTCC-AACGAAAACAAAAAAAGGATA-ACAAATTTAGC------ATCCTCTC
ATTACGACAGAGTCCGCATCGGCTGGCCAGAGAAATTTGTAAATTCAGAACGAAGATGATGTTAACGTATACAAAACTGGCTGCTGGATACTTTC
>CG5261 7429873 7430329|8129 chr2L 7430071 7430351 scaffold_6 4912693 4912940 - 3687|0 265
ATTAAATTGTGTAATTATTGATGTAGTTATTGATGGTCACCGTCGTTGCCATGATTGTAGAAGAGTACACAAAATACTTGAATGATATTCGAATTAACCCACTCACCGAGCTGTAAATTTCCGTTTGATATGCAAAACGTT-------TTTTATGCTTTGTTCGCATATGTTGATCATGATCGAGTATGAAAATGGAAGTAGTTGAAAGTCCAAAGACGCGTTAAATAAACCCAAAACACTCACATGAACTAGCCAATTCTTAAAT
ATTTAATTGTGTTA-AACCGACGTAGTTTTTAGCTGG-ATGATAATCGATATGATTTTACTCAAACACACAA--------------ACCTAAATTGAAC----------ATTGTAAATTTTCGTTAAATATGCATATTATCAACATAATTTTATGCCATA-ACTCATTTGTTGATCATAA---ATAATAACATTGGAATTGGTCCGAAGT---------CGTTCAATAAA--CAAAGCACATGTATGTAGTATCCTATTCTATAAT
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TAGTACAAGGAATAGTCCAAAACTAACCCCCCAAATCCGCACAATCCTCCCTTCCCCC------TTTCGATTCGTATTTTAGTCACTTAAGTTGGGTCATTTGTGATATTGCAAATATTGTCGTAC---GTTAAGTAATAGTCTCTTTGCCC--------TTTAAATGTAAGG-----TTAAG----AAAATTATTCACAATAATTAAAATGATCACGATACAAGCTCATGAGCTAGGCAT-------------------TAAAGTGGA---TACCATATATACTA------TATATTTTGTATAATTGTTATTGAACTAATAAAGATGAAAAAAATGTTGTTAAAATTC
T--------------------------------AATTTGGATAAGTCTTCCATACCTCATTTTTGTTTGATTTCTATCTTAAGTCTGTAAGTTGGGTCATTTGTGATATTGCTAATATTGTTGTACCATTGTAATTTGTAGT-TATTTGCTCCAAAATTGTTTAAAGCTAAAGTGTTATTAAGTTCAAGTATGATCTGCGATA--CGAAACGCACACAACACGCTACATAGAGCAAAGACTTTACTAGGGTTTTTTTTCGTAAGGTATATTGTACTATATATTATAAGTAACTATGTTATGTACATATGTTTCTATGTGTAGCAATAAAATGTAAATTTTGTTACCTTTT
>Cyp4d21 7607499 7607703|8340 chr2L 7605576 7607599 scaffold_62 203404 205486 - 38374|2053 2164
TTGAGTGATACATATTGTTAATAGAATCAAATTTACAT-------TTTTTTGTATTTATTTTATGTTACATGCCAGGA--GCAAACTTAAACTGAAAACT--TGAAGTGGAA
CTTAGCTAGATGTATCTTTA--------AGATTTATATGATATCGGGTTTCGGGTTCCTTTTACAGAGCATTCAAAGATTGTAAGCCTACGTATAAGCCTTCTGCAGGGGAA
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A---------------GTGATGTATCTTGTATCTAATGTT-------TATTTATGTCTCTAT-TATTTCTCTCCACTTGTATTTTC------TTCGCTCGCTATATGTATGATAAATGATGTATTTGTAAATCTTTGTTAGTGGCTAAGTTGTCTAGTTTTTAG--AGTTGTTTGACTATTTGTATGCGC-----GTGAAAATTGTATTTTTT----------------GCAATGAATAAAGTTTAAGATGTGA
ACAGCTAGGATATTAGCTGATGTACATTATATCAAATCTTATACTTATATTAATATTTATATATATCTTTCTCT-TTTGTATCTTTCGAATGCGCGCTCGCTATATGTATGATA---------------------TATTATTGGCTAGATCGTA-AGTTGTTAGTAGATTGTTTGACTATTTTTATGTACCAACTGCCAGACGTGTGTTTGGTACGTGTGTGTCTCGTAGCAAT-AATAAAG-CTAAGATAATA
>Myo28B1 7683968 7684544|8418 chr2L 7683497 7684224 scaffold_114 37259 37990 - 16340|504 761
TATTAAAACGGCTGGAACTG-GACAGTATTCACTCTTAATAGTGGTACTGATCAGTACGATTGGTAAAGGACTTAGAAAGCGCTCTTACCCAACAATTATCCACGCAAAACTGTAAATAAATCTTTTTTTTCTACAAACTTCAGTCAAAAGAACATGTACATTTGATAAAAAGCTTATACAAATTTGCTTCTTGAAAATTGCGCTTTAATTGGGATTCCTTATCTGTATAAAAATATTTTCTTTGCTAATGGCAACAA
T----CAATAGCTGATATTATGAAGATATTCTTCTTCATCTCTTGCA---ATCGTCTCACTTGTGGGCTTTCTTTTGATGCACCTGTACAAATGTTATATCCATGCTGGCTTGTATATATATA-----CTCATATATACTT--------AAAATCGATTCGTTTTGTGATCGTTCT------ATTTGC--CCAAAAGGCTCCCATTTTATAAATGTATATTCTCTGTACAAACCTATTTATTATATTTTTGTAAATAA
>Myo28B1 7689416 7689461|8423 chr2L 7687640 7689436 scaffold_2 1460561 1462513 - 10515|2025 2048
A---TCATAAATTCGGGATAAATA
AAATCGAACAATACGAGCTAACTA
>Myo28B1 7689416 7689461|8424 chr2L 7689437 7691434 scaffold_114 43323 45303 - 48890|0 24
AATCGTGCTCTTACAAGTAGCCCAA
AAGTTTG-GATTATATGTAACCAAG
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ACGATACTGTTACCGCCACTTAACGTGGAACCAATATGG----AAATCGAAGCTTTAAC-AACACCCACTCACATAGTCCCTAAGTTAGCCTAATGAATGCCGTGAACTAAACCTGTTCTAAGTACATCTAACGATGCTAAAGTGTTGCCAATAAAGTGTTATAACGTTTACTAAAACCAGAGCGCAA
TTAGGAGTCGTGCTCCCATCTAGC-TGGAGCCAGCAACGCGATAAACGGAAGCTTTAACAAAAAACCACTCAACTAATTAATAAGCTAGACCTAGAAGAAATGTGAACTAAAA-----CCAATTAATTTTAACGATGCTACAA-GTTGCCAATAAAG----------------AAAACAAAAAC---A
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ATTAATATGTATACGTACATTTTTTATTTGTAACCAATTTACAAAATTTTTACGCATAAAGATTAAATATTTTGGAACAAGGGTACAAAGAGAAAATACAATAGTCTATTTAAGCCAATTATAGTAAATAAAATGACGATACTTAAAAGCAACAATAATTGAAAATTTATATTAATATATAT
------CCGGATACG--------------GTGGCTAA-----AAAA----TAATCATAATAATT------------CCTAAGCTACTAAG---------AATGGTTT-------CTGCTCATATTCAAT----TCATGAT--TTTAAAACATT--TGACAAAATATCTTTTTTATTATATGT
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A
A
>CG7196 7765367 7765716|8517 chr2L 7764753 7765854 scaffold_23 582469 583523 - 19471|627 1008
TGAGAAGCTATAGAATAAAACCATTTTTTACGTTCGGTGGACAGCGGCTGGTC---GTTTAT-CCTGCTGCACCAGTTTTTAGCGAGTTCTACAATATTTGGCAAAATATTTGGTTTCCCATCCATGAGAGTCCAGATATTTCACCAAATCGTGCAAACATC-------AATTAGGCTGGGGTACCTACCACAGT---TTGTTAGACGTCGGAAGAGGTAGCGCAATCGAAAAACGTTAGCTAAA---CTGTCACTC-------AATCTCAGCG--TTTAGGTTGATAACTTGATAACTGTCAATG----GGGTTTAATTAAAGCTGTAACGACTTGATTGTACCCGCATGACAACAAAAATAAAG--CGGCCGAAAAATCC
TGAGGACGCATAAAATATG--CTGTTTTAATAATCGTTTCATCACATTTTATTTCGATCTATACCCGTCTCACCC-TTTTGAACGGG--ACAAATTATTCCCAAAAAAATGGGGTTTTAC-----TCAAATTTCAGA-----CAACAATTTTCAAATACATTTGAAGCAAATTACGT--GATAAATTTCCAAAATGCACGGTTGCAAGATTGAAATTATAGT-TAATCAAAAAGCGTACAGGGAAGGGCTGTCATCCGATACGAAATCTCAGCGAAATAAACCTGTCAAT---ATAAGTGTCAATGCATCAAGTTTAATTAAACCTGTAACAAGTT-----------CAAGATAATAAAACCCACGTACAAATAAAAAATCC
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GGCACAGGATCTGGGATGGAAGCCATTAGCCCACACACAC-ACAGACACAGACACG-ACACTGACAGACACATATGTATACCAAGCATCAATTGTACATTGCTGACAAAGTCGAGCGCTAAACTGGAGAACAACAAGCACTAACAATTAGCCTAACTAATT-TACTAACTACTTAACTTAACCCGTCTAAAAGAGCTAAACGAGCTGAACTAAAAATAC-----------------TTCGTTA---TCTCACTAGGGCTAGAGACCC--------TTGTAAGCCTCCCCTAATTCCAATTGTAGACAA-TTAAAACTTTTATAACTCTCAATGTCTTGTATATACTAACG-----AAATAAACAAAGTTATA-----------------GTA---------------------GCTCGCTCCCTTTTGTTAATTTCATTGTGGTCGTCGCGTGTGCTAATCCAAACAATTCCAAAACGTTGCCATATCACTCTAAAGTCTCGTAACGTCTTCTCGGTCCATTACACTATTATTATAATGAGATAAATGGATCCACAATCCCCAACGCTAAATCAGTG--------TGTATATACGAGAATATTGAAAAT--GTGTGTATTAATATATAAATGTGTACGTGTTAACTACTTACTAACTGAAACTATCTTTAATGTAAAGTCGAGAAGTATATATATATATTTCAAATAAACTTATGAAATAC-
-------GATTCGGAAACAAAAACACAAACACAAACACACGACACACAC-GACACACACACACACACACACATATGTATACCAAGCATCAATTGTATATTGCTGACAAAGTCAAGCGCGTAACTGGAGAACAACAAGCACTAACAATTAGCTAAACTAATTAAACTAACTA---AACTAAACTAACC---AACAATTAGATAATTT----TTTATGTACCTTTTCCCCCCATGCCTTCCGTTACATTCGCACTA-AGCCAATTACCCAACACTAAATGGAGTACATTTCCAACTCTAGTGTTAGACAACTTTAACTTTTTATATCTCTAAATGTGTTGTATATAATTACACCTATACATATACATATATATATATATATATATATATATGTATTTGTATGTGTATATTCAAAGTTTTACTAGTTTATGCAAATATCA----AGTTAATACACATGCCAAT--AAATGTTTCCAA---TCTGTCATATCAATC---GGTGTTGG------TAGTCGAAGTATTATAATGTTAACCTAACCTAGAAAATGGATTGA----GCCTAATTATAAATGAATATTATCTATTGTATGTAC---AAAATCAAATATCAATGTGTATATATATATATATCTATACCTAACCAATAATTCTTAAT---AACTATTTATAA-AAATAACTAATGTGTACGAGATCTTATTGCTAATAAACATATGATAAATA
>Uro 7781246 7781434|8532 chr2L 7780052 7781256 scaffold_13 2899362 2900529 + 50687|1209 1219
ATCGATCTCTG
AGCGATATATG
>CG7164 7782541 7782627|8533 chr2L 7781492 7783108 scaffold_23 605174 606702 - 8213|1111 1197
AATGCAAAGTAAAAAATGAGAAAAAAAAATGATTTAAACTTCGGCAAAAAAAAAATTATTTTCAAAATAAGGCATAAACTACAATAA
----CGCAGCGAAGCGT------CGCAATCGTCTTTGAGTTGGCCAAAAATCAATTTGATAGTTGCACAGGCGGCAAATTAGGTTAA
>CG7154 7785940 7786063|8534 chr2L 7783286 7786172 scaffold_23 606716 609714 - 122877|2807 2953
GAGATCGGGAAATCT----------CCAAGA----------CGCGCGCTATGTTTATAATGTAAGATAAAGAAATTTCTCTAAATTATTTTC--ATATATTCAATGCGT-TGGCACTCTAAATAAAAATTAAGCTAATATTAAAGAA
AAT-TCGCGAGATCCTTCTTGGCGGCAACGATAATTGCCCGCGCGCGCAATGTTAATAATCTTAGTTAAC-AAACTACGCTAAATTATTTTCATATATATTCGAATCGCATTGCATTTTCAATAAAAAAAAA---AAAATAGGAGAA
>r2d2 7801512 7802008|8549 chr2L 7800068 7801811 scaffold_2 3362567 3364324 + 27596|1504 1868
TGCG--------------------------TATAACATTTA-TTCAACTATTCTAGCTTAAAACTAAGTAAACTCGTTTTATTTACACTCTAGAATGCACATATTTCATTTAATCTTACGATTAATACA-ATCTCCACCAATTTGTAGGTGGGAAACATAAAAAAATTATTTTCAAGGTCTTT----------------TAGTAAACATC-TATGTTAACTTTGTACACGATTGAGATAGGTGTAAA---AAATCCAAGGAAATAAGTAAGGGGAGTGGGTACAACAACTT------------TTACTTTCGAGAAGGTATAACATAATGATATTATTAATTACTTTTCGATGC-----CAATAC
TGCGATCAGAAATGCCGGTGTTTCTGTATATATAACATATATTTCAACTAAT---ACTTAAAACTAAATAAA--CGTGTTATTTACAATAAACACTTGAAATAATGCACATGATTATTATATATATATATGTATATATTAATATCTA-----TACTTACAACAACATTGTATGCATAAACTTTGTACGTCGCTTAGACCTAGTAAACGTCGTATAATAAAAATACATAC-------ATATGTTTAAATATAAAAGCGAGAGTTCTGTTAAGGTCGTCATGTACAATCATTTGTTGATGTTCAATCATTTGGGCAAAGGAACGTAATCGCAATAATTATAATTATCCTTATACTTGTAAGCAATAT
>r2d2 7801512 7802008|8550 chr2L 7801812 7802113 scaffold_5 2235944 2236254 - -2340|0 206
CAATGTTAATTCTATTAAAATGTAAAGTATTTATACGGTCCGAACTTATTGTTTGCAACAACTGATTATAAAATATTTGAAGCAATTTACATAAATATGTATTGCACAGTGAAATTAAAAATCTGAACATTTGCCTTTAAAAGGAAT-----GCTAGTA---ATCAAAGACTTACTTGAAACAAATATTTTAAATAATTTGA--CGG
CCATGTTTGGGC----ACGATACGAAACGCT----CGGTACGTACTCA-------CAATAGCT--TTGGAAAATCCT------AACCTAGCGCAACAAAAATCACCAAGTGCCATGACAAAT------ACTTGAGTGTAATTCGAATTGTTAGCTAATCTTTATCAGCAGATCGCTTGATTCAAGTA----AAACTATTAAAACCCC
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ATTGGGAAAC
AGAGGTGGGT
>LanB1 7820462 7820774|8563 chr2L 7820512 7821397 scaffold_2 3384617 3385459 + 3457|0 280
ATTGCGAAATACGAGAATCAA--GTAAAGAACTACAAGAACAACTAG----GAAGGCGACAGTTATT---ATGTAACCACTGTTAAGTT--ACCGTTACGTTTTGTACTCTAAGCGA--AAACCAACACTGCAATGTTAATTTTAAAAATTGAGCGAAAGAAATCGATGCCTTCACTTTTAATGTGTACACACTGAGCTAAGTTTTTCTTATACTATCCCTATACCATTTTGTAATGCAATTAATGTAATTAAAT-AAAACTACT-TAAATGTGG---AAA
ATTGCCATATTTGATAAACAAATGCGAAAAGCAGCAGCAGCAACGAGAAGCGAAGGC-ACAGTTATTTCTATTTAAC-GCCGTTAAGTGTAACCGTTACGTTTTGTACTATAAGCAATCAAATGTTAAATGCAATATTCATTTCAAA----------------TTTATGCC---ATTTTTA-----------TTGAACTAAGTTTTTTTTAAAAAA-CAATACAATATTTTGTAATGCTACGAA----ACTAAATGAAAACTACAATAAATATAATTAAAA
>CG7115 7824884 7825376|8567 chr2L 7823450 7827364 scaffold_2 3386992 3390876 + 140252|1493 2007
AAAACGATAGATAAGAGTGCC--TGCTAAGAAATGCTCTTCAGCTTTTCTCCTAAAAATTTCCTTCTCCCCAAGAAAAACAAACGAAAGTGCCCGAATT-TTTCTAGTTAGGCATTTTGCTAAATACCTTTTGACCTTTTTGTTACTTGTCCAAAGGCAGCGTTCATTCATCCCATTACAGACATGCATACACATTCATCACTCGAAAATGCGT--TCATCATTTGTCTTAATATTAAGGTTGTTT---GTTAGTCAATGTTGTTTTGTTTAAACAAAATATGTTTGCATCCGCCGCCACATTGCCGTGCACTCCGTT--TTTCCAATTCGCACACGAAAATCATCACAGTCACTGACTCAGTCAGGGTAACATCATCACGTAACTATTTATTTAATTTATTT--GTTATACG--------TGTAAAAGAAAACA--TTTTCTAAATGTCGAAATGTTTTTACGAATAAAACAATGCATACGAAACGAGAACATTTCGTTTTGCTACTTAAATTC
-----------CGGGACTGCTCATATACAAAAATGCTCTTAGGCCTCCCTGC---------CCTATTTA--AATAGCAACCTAATAAAGTGCCCAAAATATTTATTAATAAGCATT---CGCGATGCTTTTGTACC-----GTCGCCAGCACGAA--CTATTTTTGTTTA-------------ATGCTGACTCA------------AACTGGGTCGTTTTATATTGTTTTCGCATTAGGATTTTTACAAACTATTTAAAATTGTTA-ATTTGTACAAATTGTTTAGCCA-----CATCTCACGTCAACGCACCTTGTTAACCTCAATTTCCTGTACACCACTCATCA----------------------------AGCTCATAAATATTTATTTAAATTATTTTTGTTATGCACTTGCATTTGTAAACCAAAACAATTTTTTCGAACTTATAAAAAAGTTTACAAATAAAA-------TGCCCAAAAAGTTTACCCAATTGTTCAATTTTAAAGA
>mts 7831807 7832745|8572 chr2L 7831695 7832467 scaffold_2 5519918 5520693 - 11572|131 895
GCTGGATT---GCTC-GCACCT--ACGCAGCTT---ACATTTACACATATTACATCGCATTATAACAACAAGAAGAACCGAAACAATATATAATATATACAAATCCAACCAGCAGCAACAAAATAAACAAAATGGCAAGTGCTGTCGAAAAAAAAACTACCATAAAAAACAACCCAAAACTAAAAACCTCGATGCATTTGTTTTGTGGAGGTCGTTTTAAACAGAGAGCAGTGGAA-----GAGATATTGTATAAACAAAGAAAAAAA----AAGTAACCATAACAGTCGAGAACACAAAAATGCATTGAACAGTTATTGTTGTTGGCCACAGTTTAAAAGAAAAGGAAAAAAC---CGGAAATGTCGC----CAGCGGGGGC---GGCAGGCAGAAAATTTATATCAAAGATAAAGGGGAGGAGCAGAAGGAGAAGCAGTATACAGAAATGATACAATCCAATCGAACCTACCAACCAACCCAGAAACCAAGCAACAAAACCGCAAGCA---------ACAAGAAGAACTACAACTACTTAGCTAAATTTGTTAATTTATAAAAATAACGAACTAAGCGTCGC-AGCAGAAAGCCAGGGAGCAGGAG-------TGATGGATGGATGGACTCATGGATTATGACGTGATGTGTGTGTGGGCGGAAGGGGC-----------------------------------------------TGACAAAGGAC------------TAAACGGGACGAAAGGACGAACGC
GCTGTTTTTGCGCTCGGCACCGAAATGCAGCTTACAACATTTACACA----------CATTATTACATAAAAAAAAAAAGAAAAAGTTTAAAA-------------AAAAATCAACCACAAAAAAAA--------------------AAAACAAAAACACAAAAAAAATAAACAAAAAGCAAAAAGTATGTATG------------GCAAGCCG--TTGAAAGAATAACAATAAGAACAACAACAAACTGCAACAACAAACAGAACAACTATCAATAATTATAACGATTTCG---------ATGCATT------TTATTGTTGTACCCCA-AGACCAAGATCATTTGCGAATGCATACGAGAATGTTGTTCAACAATTGGATATTGGGTGGGGACACAGTTGATATCAGCAGTGCGAGGGCG--------------------------AATAATACAATCCAATCGAACCTACCAACCCAGCAACAACACCAACAACTACAACACCAACAACTACAACTACAACAACAACTACAACTACTTAGCTAAATTTGTTAATTTAT-AAAATAACGAACTAAGCGTCGCAAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGAAGCCAGACATGATGGATGGATG-------------TGA----ATGTGAATGTGGCGGGAAAGGCCTAGAACCGACGGGGGGTTGGGTGGGTTTTGTTTTTTTTTTTCGTTTTTGACATTGGACCTACAACATTTTTGGACAGGAC---ACGGCGGACAC
>mts 7831807 7832745|8573 chr2L 7832542 7832738 scaffold_2 5520699 5520882 - 3883|0 199
AGCAGGAAGATAACGATGAAGCAGCAGCAAAA--AAGTAGGAGCAGTATGTGGCAGGAGCAGCAGCGAACGCCATTGCGATGGGGGAAGCGCGGGGCGGGCCAGCGATTTATATAAAAACAAAAATTATAAA-AAAGAAAATAAGGAAATACAACAAATTTAATATTACTGATTAAAATTAAATAAAAAAAAGCGAATAA
AGCAGGACGACAAAAAAAAAAAAATAGCGACAGCAGCGAGGAACCTTTTGGGGCGGGGGAAG------------GTGTCGTCTGAGCAACAGCGGGCGGTTCAGCGCTTCG---AAAAAAATAAATAAGGAATATATAAAATAAAAAAAAACAAAATA-TTAATAATACTGATTACAATTAAAAAAAAAAAAAACAAGAA
>mts 7831807 7832745|8574 chr2L 7832739 7833088 scaffold_2 5521063 5521433 - 2966|0 6
AACTATT
ACATTTT
>CG14537 7841151 7841262|8588 chr2L 7840246 7841305 scaffold_2 1291319 1292454 + 18001|998 1135
CCCGATCC------TTGGGTT---AAACCCTAACCGCG-CTCCGCTTCG------------AGGGTTTCATTGTACCGCTTAATT----TTCCATGAATAGAGTTTTGACCCGTATTAAATTTCATTTCACCCGCTTT
CCCCACCCCCCCTGTTCACTTCCAAAACACACACCCCGCCTCCAATTCGCACAACCCACAAGGATTTTGGGTTTCGAGCGTCATTTCAATTCCATGAAT-TTGTCTGGTCTTGTATTAAATTACCTTAAAGCACCTTT
>lectin-28C 7857879 7857931|8606 chr2L 7857824 7858929 scaffold_2 5544086 5545121 - 27907|57 109
TAAACAGATATATATAAATATATGTACACATATGTTAAGACTTGCAATGTGAA
AATGCTTTAATGCACAGA-ATATTTACAAATAATTCAATAATAAATCTTTGAA
>CG7231 7986706 7986787|8781 chr2L 7986706 7987222 scaffold_8 4907163 4907662 - 1703|0 81
TATACGTAATTAATATAAGTACGGTAATCAGAGCAATTTTTATACAACTTCCAGAAAACATAATTAAAACTTATACTTTTAT
TTTGCATTTTCATTGTACGTTTGGCAATTCGAACAATTATTATACAATTATCATATAATTTA--------TGAAATTTTCAT
>CG7224 7999551 7999743|8796 chr2L 7998856 8000508 scaffold_2 1466050 1467600 + 51389|728 923
T---GCCCAAATGAAGAGTTCCTTAACTAGTACTTAGACTGTTATTTAAATGCTAGCCATTAAGACTTAAAAACAAATCAAAATGTATACTTGTTTAGTGTAAAAAGAAAATACATGATATTCTTAACGTACAAAAGTTTATTTGCATTGCACTTATTGGGCAGAAACTATTAAAGAATTCAAAATATATCTTTGT
TCCAGCACAAAT---CTGTGCCTTAGTACGTAGTTAGGTTCCTTTTCAAATGTTTAGATTTAAGTTTTAAAAGAAAAACAAATTGTATACTCG---------------------------------ACGCATAATTATTAATATG---------------------------------------------------
>CG7356 8026773 8026901|8818 chr2L 8026541 8030134 scaffold_6 1910324 1913683 + 91748|232 360
GCTATTTCTTTTGTATTTCGTAGTTCATAAGTTATTTGTTGTAAATAATACTATTAATACGTAAACATTTTTTATATAAAAAAAATTCAAAAGATTCTGCGTGATATTTTTCCACGGCTTCTAAACAAA
ACC------------------------CAAGTGA----------------------------AATCCTTCCCTCTGCAAG------------------TCGTGCTTTTTTTGTA---------------
>CG7380 8029963 8030186|8818 chr2L 8026541 8030134 scaffold_6 1910324 1913683 + 91748|3581 3752
GAGGTGGACACACAAGCCATCCGAGTAATTCGATCAAAAGGAATCTGCTAAAGGCATCGGCCAATCATTTTTATTCGCAGTCAACGAAAGTGGCCCAATGCTAGCTAAGCATTTGCCGTGTTCACTGTTAGTATGTATAGCTGTAGGGTGTAATTTAATGTCTAATCCGAAT
AGGATGTG-----AAACTAGTGGAAATTCTCGGACAAG-----------------------CAATTCTCTTTATTCATA--CAATAATAATCTCCACACATT-----GATATATGTTCTGTCAACTGTAATGTAAGCTATCATTAAAATGTAAATTAATGT-TAATTGGAAT
>Cka 8038202 8038517|8826 chr2L 8037079 8039676 scaffold_6 1920449 1923067 + 94572|1123 1474
AAGAGGCGAGACGAGACGAGACGAGACAGACAGACCCACA--TCTCCCTGGCCGCGTCGGATCGAACGAATTCAGAATTCGGAATCCAGAGTGCATATGCAGAGTGCAGAGTGCAGAATCCACAGCCAGTAACTCACAGCTAAGCGATTGCGAGTTCGAGTTAAATAATTATACATACA-------TTATA-------AATATACTATACATATAAATCTAATTATACTTCAACCGAGAACAACAACCAATTATATGCATACAAT-AATAAGAAAGGGAAA--AGAGAACACAACA--------TAAACATAC---------AAATAATTGCTAAAAAAAAAAAAAAAAAAA
GATTAG--------GACTAACCCGATCCCACAATCCCCCGATTCTCCCCTTCTCCATACACTCACACACACCCACA---------------CACACACACACACAGCC-AATGCTG----------CAGCAGCTCTCAGCTAAGCGATTACGAGTTCGAGTTAAATAATTATACATATAAATACACTTATATATATACATTATACTATACATTTAAATCTAATTATA--------------------CAATTATATACAAGAGATGAACAACAAACGCAAATTATGCAACACAACACATTGCTGTATACATACATAAAGCAAAACAAAACAACAACAACAACAAAAAAAAAA
>CG7429 8041799 8041878|8829 chr2L 8041145 8042289 scaffold_6 1924615 1925702 + 30233|659 745
GCTGCCTGGCGCAGAGCGTGATCTGATCTTGTGATATAGCACATGT------TGCTACACCTTGCAATTAAA-CATTTTTTAAAGCT
CCAGC---GCACCTTTAGACAGCCCATATTGTGATATAGCAGACGGAGGGAATGCTACGCTTTTGAATGAAAACAATGGCTTCAATT
>CG7466 8053049 8054328|8834 chr2L 8052998 8053742 scaffold_6 1936054 1936845 + -675|51 828
ACTGGAATCTCCATCAGCACGAACAAACTATA--TGTTAGTCAATGTCTAA---------GAGTCGAACCGAGTTTAATATCTATGCAAGAACGTATTTAAGAGGA---GCATAAAGACATACGT------------------TTAGATATCGGTGTATATGAATAGTGTAGGTAA--TTTTTGTACATAAAGTTTAGATAACGCA----AATAACTAAAATACTATGTGTAC--ATAATATGCAACAAAGGTGTGTTAAACGACAGATTGTGTACGCACAAAT---------CGTCTATCAAGAAGAATAACATACAGGAAATGGATAAAATATTCGATTATAAGCATAA-TATAATGGAATTGGGTCTC---------GAATCTGCAACAGGATACAGCAATGCATTCACGTAGTTTAAAAACAGAACAAATTTTCGGACTGATTTAGATGAATTTTCATTTGGCTAAATATGTAAACTAAAAGATAA----------TTTAAAATAACCCAAATCATAA-GCATCTGGAGCAATGACCTAGTGAAATGTGAAGATGCAGCAGATTAAATTTGATACAGTAAAAAAGTACT-TATAGGAATGTCAATTTTATCGCG-CAACAGAATG-TCGTACAATAACATTTAGAAGCCATATGAAGAACAAA---GAAATCAAGATATACGT----ATTAATTATAGTATACTGAAAGTGTCATAGCAATTAGACGTTGGTGATTCCAAAAACACATAA----GTGCATGTCTGTCGCTCAAA
TCTGAACTCTGGTAAATCAACGACAAAATGTAAGTGTTAATCTATCGTAAATCCCCCCGTGACCCCTGCCCCGTCCCAGCACTAGTGAATTATATATATATATGCACCCGCATATATATATACATAAAATATATATGTATAATTAATATATGTGTATTTGTGCATAGATTAGGCAATTTTTTTGTACATAACGTTTAGCTAACGGGAAATAATACCTAAAA-ACTATAAGATCTGAGAAGAAGAAACAAA-----ACCAAGTGAAAAATCGCA-AAGCAAAAACAATTTCGCACATTTATAAACAAATAGAAATGAAAAGAGAAAAACAAAACAAT-GGTCGTTCGCAAAAGTGGAAAAGTTTCGGGTTTCTTTCGCTTAAAATTCTCAACAAGTTAAAGCGA-----CCGCAGAGAGGCAAAGTC-AGCGAATTTTCGAAACGA---AGA-GCTTCTTGAAGTATCTATAAAAAAAAAAAAAAAAACAACCCGCTCACTTTT----TCATCCAAAGCAAAATGCATTT---GCTTCGATTTGAAGGCATCTCAA-ATGCATTTAACAAAAATT--TCTAGTAAAATTCCAATCCATGAAAGTGTTTATCCGCGTGCGACCATTGACTGCTCTCTTTTTTTTTTTTTTACACTATAAAAAGATCAAACGGGAATTTAAACTATGTCTTAAGCTTAAGTTAAGTATTTC----GTGTATTGTCAATTTGA--TAGGGAAAAACAAAAACTAACTATATCGTGCATTTCTTTATCTCAAA
>CG7466 8053049 8054328|8835 chr2L 8053743 8054118 scaffold_12 574312 574667 + -2072|0 411
TAGGTTTCTTTTTAGATATGTACGATATTATTTGCATACCTAGTATATAATTGTATTGTATAAAGTATTAATTATGATATTCCTTCCCAGTTGTGGTGGCTAGCATTTGCTCAATTAGTTCTTTAGCTCTCTACTG----CGCACTCTTACGCACCGGTGTACCTACTATTTTAA---GAACGAGAAACTATTTTTATGATCAATCCAGTTTTTTACACACACTTGT-------TATGTTTACACAAAAGCTCACTGACACAAAAATGGCTGG---GTAAATTGGAATGATATCCAATTTTGAAATATTTCGAAATATTTCCCAGCTGCACATCACAAACGAACA-------------------AAATCCTACAGAATCTTTCCTAATCTCTGTAACCAAATGGTTGTAAGA
TCGATTCGTTTTCA------------ATTAATTACACAC--AACGAAAAGTTGAACATTCACAAGAACTTACAATA---------CACAATGATGGTGTGTGATGTTCATATGTTTTGTTTATTA--TTGTTATTGTTGTTGCAATTGGCGACAATGAGTCACATGCAACGTTAAATGATACCAGAAATAAATGTTTAGATAGCGC---------ACATACATATGTACAAACGTACGTACACACATACGCACACAAACATATAAATATTTCGCATATACATTG------CATACAGCTTT----TATAACGAA------------TGCACATAGCACACACACCTTATTGCCTCTACTCACCTGTATTCTCCAGCAGCGTTTTGGGCGTATTCGGGCGATTGATGATAATG
>CG7466 8053049 8054328|8836 chr2L 8054119 8071087 scaffold_6 1937762 1955100 + 818535|0 292
AATTCTCACTATATCAATTTAGTTTACAA-----TTCCCTCCCTATAATGTGGTACT--ATTTTTGTATATTTGAGTTTA-CAAAATTAG-AGAAATTTTTAGAACTGATGTATATTA-----------------------GAAATTAATCAATTCGT--------------CCCGTTTTGCAATATATTTATACCC-----------------------TATTTTATA-----------ATTTGTATTTGTTTTT--TTTTGCAATAAAGAAGATATGATA-TATAAACGAA
AATCCTCCACATAAAAACATAATTTTTCAACGTTCTCTCTCTCTCGACTGCTGAACTTTGTTTTTAAACTTTTGCGTTTAACAAGATTAGCAAAAATTTTTAGAACTGAAATTTGTAATTAAGTATACGGATGATATTTACAAAACGAATTATTTGGTAGCTACGTACGTCCCCCTTTTTGCAATATTATTATATATATATAAATAATTATAATGTGTATTATTTTGTATTTATATATCGATTAGTTTTCGTTTTTCGTGTTTCATAAATAAAGTTATGGTAATTCATATGAG
>Trf 8073717 8073949|8839 chr2L 8072970 8074942 scaffold_6 1956322 1958118 + 31966|747 979
TTGTTTCTACACATCCAAATGTTTTTGTTTAGCTTAGTTATATTCCATAACTACAATATTTTTAATATATTTACCTTAACTTTTTTAGTATAAAATGTGAAATGAAACAACTTAATTAATAATTTCCATGGGTAAATTCATAGAAATTGTAAGATTTTATTTTGGCCTTACTAAGCAAATTAATTTTTATTTAAAAAAAACTGTTGTTATTTTAAATAAATTTTTATATATTA
ACTTT---------------ATTGTTGTTTCCTCTAATTA--------AGCTAC----TCTATGATATTGTTAAGTAGGACT----AGCATTTACCGAACAAGTCAACAAAGTAATTTATAAAT----------------------------------ATTTATGCCC-------------ACTTTTTGTAAAAAAAAAAAA-----------AAACAAAA------------
>Bsg 8107885 8109458|8878 chr2L 8107717 8109088 scaffold_6 1991542 1992933 + 19443|169 1536
GTGTGCTACTCTCCAACCCACACACCAACCAACCAACCAACCAACCTACCAACCAATCAACCCCACACCACAACAA-ACAAAATACCAACAACATAAACTGTCAACACCAAATAATATTAAAAATCGGCAAACAAACAAACAAACAA--GAAACAAAACGCAACAGAAGAGGAAAAAGTTGAAATTTTAGTT--TTATACTGCAAATTAAAGACG-TTGAAGCTGCAG--GCGAATGCAGACCAGACACCAACATAACCATACGAAACCAGATACAAATACGGATACGGAGAAGAATCGTACTTACGGACGGACAGACAAACGGACGGAGGTGCGGCAGCTACAACAA------TTAGTAAAATT---TTCTTAGTTAACAATTTCTAATAGTTACCACAATGGGAAACGAAAAATGAATATGAATGAATTTTGTGTTTGACG-------CAAACGGATATGCGATAAATTGAAAAGTTAAATGTTA-AGAAATTATATAGTTTTTGCTAATTTTGTAT---------------------------TATAATGAAGTCCACTGT--------------------GCCTGGAGCGTCGCAAAGAAATTAATAAAATAACGAGACCCAGAGTAGTGAAATGGAGAGTGA--TCCACTAATCGT---TGTGGTTTCT---------------ACTTTTTTTTCGATGTGTGCTAAGCGAAAGCAAATATATTCGTAATCCGTATATTTGTTTCGCCCAAAAACTCTGACAAACACAAAACGGAAACGGAAACACA---AAACGAACGCACACAGACAGCACTCACTCACACCAACACATCCGAGAGTTAAAACAAAATATGTAGTTCTCTAGATATAATATACTATAAACTTAATTCATCGTAAATAT--------------GCCCTATAATTTC------------TTGCTTTATTCAAATCGAAAA------TTCATTTTTCGCTGAGCTTGTTTCTGTTGCTTAAAAAACTACAAACGAAACTTAATGAGAACACGTACACAAATCCTTTCTTTTTATGTCAAA------GTCCAGTCCATAATAT---------TATTACTATCATGTAAAGGAATACGACAAGAAAATGTTATCAACTTTGTTTTTAAGTACTTATTGTTTAATTATATACATTTAAAAG---AAACCCACATTAAAAAAAGA---AAACACCGTAGTCAAAGCAAAAGTTGTCATTTTGCTTTGAGAGATATAAAAAAACACAGAATTA---------ATCGTTACTTATGTATATTATAAATCATTATATAAGCTTATTAATTTCTTGGCAGTGAA-------TAAAACATACACACGAAAACA
GT-TGCCA-------------ACAACAACGA------CAACGACAACAACAACAA--CAAC----AACAACAACAATACAAGAAATCAACAACAACAA----CAACAACAAGCAGTCCACAACAACAAAAACAACAACACCAAATAATTGTAACAACATTTTGAAATGCAGCTTAAAATTTACATTTTAGTTAATAAAACTGCAAATTAAAGACGTTTGAAGCTGCATTCGCAAATGCGCAACAAACA--AACACA--CACACAACAACACACACACA-ACACACACACACAAGCGACGTACTTACA---CTACAGACA-------GCAGCAGCAGCAGCCACAACAACACAATTTAGCAAAATTTTCTTCTTAGTTAACAATTAATATTA-TAAAAACAACAACAAAATATCAATGCACAAAATCATTTGTTGTGTGTGGCGCGCACAACAAAAAGTCCAGCTAAAAAAAAAATAATCATTTTTTATATAACTTTTCTATTTTGTCCCATTTTTTTATTTGTATTATAAATGAATACATATTAAATATGATTTAGTGCACAATTTATTTAGACGCTGGCTCAGGTTTTGCGTGCCACAAAAAAAAAAAAAATAGGATATAAACTATAA-AATAAAATAAAACTTAAATTAAATTTATTGTTTATGTGCTGCCCAAAAAAACAAACACAAAAATTATTAAAATGTGTGCTAAACGAAAGAAAA-ACAAACACAATTTGT-----------GCTTAAAAACT-------------GACAGAAATACACACACACTTACACACACACACACACACA-CCTACACACACTCTTACACACTGAAGCGT-------AGTTTTATAGCCATATAAATACTATATATTAATTATACAAGTATATATATATATATAATAAAAGTATCGCCTTATGATTTCAATGTCGAAAAATTGTTTTGTTAAAAAAAAAGAAAAACTTTTATTGTTTGCTGCGCTTTTGTTTTTTCATTTGTTTTTT---------------------CTTTTTCACAAA-ATTTCCTTTTTGTATCGAGTGCATTATTCAGATCGGAAAGTAGAAGAAGAAAAAAACACAAAAAACAAAAACAAAAAAAGAACATGTTATGAACTTTG-TTTTAAGTACTTATTGTTTAATTCTA---ATTTAAATAATTAGCCACGCCTTGAAACTACACACACACAC---------------------------------ACACACACGCACACACACAAGTTTATCAATCTATATCGTTACTTATGTATATTAT-TATGACTATCTAAGCTTAAAG-----TTGGCAATAAATTTTGTTTATAACAATAACACGACAACA
>Bsg 8107885 8109458|8879 chr2L 8109135 8109237 scaffold_6084 485 609 - -440|0 124
AGAATTATTTGTATATTGTACACAAAAGAGTATTTTCCCCGACACCCAATGCCCCTCAACCCTGCCCCTCTAGTTGCGCACTTTCTGT--------TTTTTCTTG--------------TCGCCT
AAAAGTATTTGTTTTCTTTGCGCACTTTTTCTTTTTGTTTCTATTTCAGTTTTCTTCGGTTTTCCGTTTTCAGTTGTTTTTTTTCTTTCTCTTACATTATTTTTGATTTGATCATAATTTCGTAT
>Bsg 8110509 8110545|8881 chr2L 8110394 8110794 scaffold_4 4255228 4255631 + 562|115 156
AATTCCTAAGTAAAAGAAAGAACACAC-----CGTATAAAAA
AACTTAAAACAAAAAACAAGCCCATATACATGCATATATACA
>CG8668 8133644 8133990|8901 chr2L 8132423 8134132 scaffold_6 2022327 2024013 + 48687|1267 1630
TATTTTAAGTTTAGGGTGTAGTTTTTCCGGTATGAAGAACACAGTGTGGTCTTTCGAGAAAAAAGGGGCGAACATATATG-TAATATGGTAGGAGTAGAGAATGATTAGCAAAGGCAGCTA-TATAGGATTATAAAATTAGACTAGTCTCTAAGTCCTAGAAATATCACAAATTCTGTTGTCGATCTCTGCATCCGCCTATATGCATGCGATCCAACAACGAT------TCGAGTACATTTTAAAACA---TCTGTAGTTTAATTTTAGCATTCTGAATGCCATTATTTAAATGATAATTACTGAGCGATAACTGTGGTTA----TATATTAACAC--TAAATACATTAATGTATATTGAAAGA
TATTTTAGGTTTAAGCTCTGAATTT--------------------------------------AATGTCTATGTTAAATGTTAATGCGATTGGATTAGCGAA-----AGAAAAGGCAGCTAGTGGCAGCAAATAGAAATACTTTAGTTTCTAAGTATTAGGAGGAATGTATCTTATGT-----ATCT----ACTCGCGGATA-ACAAATTATTCGATTTTAATGTACTATCACATATGTTTTTAATTACGTTTTGTAGCCTAATTTTAGCATTATAAATGCCATTAATTATCTAATAATT----AGCTATAACTGTGGTTATAAGTATGTTAACACAACACACACACACACTCATATTTAGA--
>CG31607 8155117 8155607|8922 chr2L 8154943 8156188 scaffold_18 499997 501293 - 8177|174 845
TGATTCTCGTAAAGCGAGTTACCAAGCACCGACTCCGTTTGCTCTATCGCACT-----TACTAAC--------------------------------GCAGGGTTGTATTT------------TAGTGTTTAGCGACTTAAATGTGTAGGAGTCTGTGTGCCAAACCTACGTAGATTCTAAGTCTA-------ATCCTTTTGATA---ATGGCACAAGCTTCCAATAACT-------------------------------------------------------------------------------------------------TCCCAGATGTATTGACAACTGTACTACTGTGTAATTTATGTCCTTAGCTCGTAAGATC---ATTGACTAA-CACCCGACCAATCGCTGC----TCTCTAATCCCAAGTCAGCTATGCTGATCCTTGTATATAGCCGATGTCCCAACGCTTTCCT-TAACCAAAACGCTAGTATAATAATAATGCTCAACAAAACCACACTTGACACTAAACTGTAGTACAAAGGAAATTTTCT----ATATAC------------ATATATGTTTACTGTTTTACAGTTATAAAGTAATAAATGTTTTAGCTTTTTAAGGGTACACAAATAAAACGAAAACGATAAAAATCAAAC
T--------TCAACCGTTAACCCACACATCCAC-AAAATTGCTATTTCACTCTTTTAGTACTAACCAAGTAGTTGGAGTTGAAGCAGCAGCAGAAAAGCAGGGTTGTACTTCATACTAAGTGGTAGTGTTGTATAAATTCAGCGTGTACGGGT-------TCAACAATAAG-GGATCTTCAATTTAGTGGCACATGCTCGTAATATGTATGGC-CGCGCTTAGGCTAGCTTCGATATAAGTTGTTTTGTAGCTAACTATACTATATATACTATATATGTTAATTTAACTCATTCACATTCTCTTTCTACAGCCAGTGTTGTAAAATGTCTCAAGAGT-----CAACTGTACTTATTTA-----TATGTGCTTAGCTT-TAAGTTCTATATTAACAAACCGCCTGACGTTTCATTTTTATGTATATAGCCAAAAAAAAAAAAAACTAAACCCCAAATATAACT----CCTCCACGCTTTCTTCTAACCAAAACGCTAGCCTAATGCTAA--------------ATACTTAACATTAACTTGTAGTACAAA--AATTTGTCTTTAAATATACCTACAGATGCAGATATATGTTTA-TGTTTTACACATTAAAGTAAATAAATG-TTTAGC--TTAAGGGGCCCAC------AATAAAAACAGCAAAACAAAAAC
>CG8506 8161733 8161797|8926 chr2L 8161465 8162341 scaffold_2 6592555 6593474 - 27601|283 375
GCA-----------------------GTATCCTA----CATAGTTA-AATGTATATTCATTCCCTCTATGACAAATTACATGGCTTACGTTAC
ACATGCAAAACTATGTGAATATAGATGTGAACTATAATTATAGTTGCAATATATGTGCATGTGTTATAT-ATATATTATTT---TTACATCCA
>CG8486 8189130 8189610|8951 chr2L 8188924 8190968 scaffold_344 4844 7274 - 45298|221 861
CATAGGCCTAATCCAATCGCTTAACTAAAGTAGAGT-TTGTTTACGTA--TTTATTACGTA--TTGCGTTATCGTAGGTTTCATAG-TCTTTTTTAAACGTTTTTATAA-------GGAGAAAGAGAACACAAATCG-----AAACACAAAAGTACGCATCACCCATTTATACAGTCGTTCGATT--------------------TTTTGTCAAAAGTACTGCCCATGTGTAAAA-------------------------CTGTGTATTTAGTAACTAAGCGAAAAGTG-------------------------TTGATGTTTGTTAAAT--------------------------CAAACAATTGCAAATAA-------------TAGT-----------AAATTATAATTGCCTAATCAAGGAAAT--------AATTTATTTAAGTTACTTCTAAATAAGTGTAAAAATTGAAGATTAAGTGCGAAAATACTAATAATAATGATGAAAACTCATATTCAGGGA-ATTTAGCATTTTACAGAAACCGTAAATATA------ATAACTAA------CCTAAAGCATCCGAGTTATTAAGTAAAAATAGCGATTAAATAATAAATGT-TTTATATTTATAC
CATAGGTCTAATCTAAATGTTTGAGTTAATTAGAATCTTGTTTACGTATGTTTAGTACGTATGTTTCGTTAACGTAGGTTTCATAGTTCTTTTTTAAATTTATACAGAAATTAGTTAGAGAAACAATATACAAAATACACACACACATACACACACACATCACCTAAATACACTTACAATTAATTACAATATTTATGTAGTTAAACTTTGTC--AAGTACTG-CCGTGTGTTAAAAAACCCGTGTAAACGTTAAAGGAATTTGTACACCTACTAATTAGCTAGTTAGTGCGTGTTCTATAGGGCATACAATACCTTTATGCATACTATATAGGAATTGTAACTAAAACCAACAGTCTAACTAATTTTAAGTAAGTGAAAAGTGTTGCAGTGTGTTAACTTAAAACTAAAATTGATTAGCTAAACGAATTGATAGAGAATTTGCCTAAGTTAATACCTAAGTCATATAA------AAGATTAAT------AATATAAATAATAATAATAAGAACTCATATTCAGGGATTTTTAGCATTTTACAAATAACTTTATTGTAAAACGTATAATTAAAATATGCATGAAGCATTCAACTTATTTGTGTAAGTTAAATCATAAAACATATATATATATATATATATAT
>CG8455 8200282 8200651|8957 chr2L 8199043 8202553 scaffold_2 241089 244462 + 131279|1250 1660
TATGTATAAGCATGCCTATACAAGGCATATCCTCTTTTGTGATTTACGCCTGATT--GGGGCTTAGTTTAGACTAGATACGCCAGATTCCAGACTCAGATCCCAGATCCAGATC---------------CAGACAGAGGTCATATCATTCCTGCTGCT--TTGCAACCGCTTAACTATATTCTAGGTGTACAAAATTCGGATAGTATGTATGATCTATTTATTGAATTT--ATCACAGACATTATGCTTGTAAAGTCAAACGGAATACA----TAATGAGACACAGTCTGCTGACTA------------CAAATCGAAAATGCCAAAAAAATAATGCTTGAACAAAGGCTGGAAAGTAAAGAACGGATACAAACAGAACAA----TTAAATAAAGCTATATTATAATACAT
AGTACGTAG---------TACGAAGTATTCATCATTTTGTGATTCATGGCCAAATTAGGGGCTTAATTTAACTAATTTAGGTAGCATAATATGCTAGGATATGCGCTTTTGCTCACAAAATAATTGCAACAAACATTTTTCATATCAATGGCAATGGCAATGGCAACTACTTATATAGTATATAAATATATA------------CATATATG-TATATTTATTAAATTTTTATCACAGACATAATGCTTGCTAAGTCACACGGAATACACTCATTCTGAGAGACAGTATGCTGACTAATTGAACAAGAACAAA-CAAAAATGCCAAAGTAATACGTTTTAA-------CTGGAATTCAACAAACAAACAAAAAAAAAAAAACAGTTTCAATAAAGCTACATAAGTATATAT
>Ssb-c31a 8211835 8211930|8962 chr2L 8211441 8212924 scaffold_2 253911 255260 + 27300|417 513
TTGAAGTTCATCCACATGCCAAACTAAGTCGTAGCCATATGTACTAACTATAGACATATCCACTGAATAAACGTTA-TCTTAAACACTAGTAATTGA
GCCAAAATCAACAACA------------------------------ACAACAACAACAACAAC--AAAAAACATGAGTCATAAG---TAGTACTTAG
>CG8360 8214001 8214134|8964 chr2L 8213746 8214492 scaffold_2 255924 256621 + 13118|259 399
AAAAGAATATCCCAGCCCAGCCCAGCCGGACAGGGTGCAATCCATGTGCAATAGTTTATGTG-ACATCCCATTTATAAT---GTTC---TGTAAACCCACCCCTCGTTATTTGTTGATTGAATAGCTTATACGAGATACGG
GGCGCACCATTC---------------------GTCTTATACCATGTGCAATACAACGTTTGAATATCCCTTATTTAACCAAGTGCAATTGTAAAACTACCCAGCTTTGT------------TAACACATAC-ACATAT-G
>CG8353 8215115 8215240|8965 chr2L 8214657 8215447 scaffold_2 256660 257483 + 16322|474 631
CGACCACTGCAGGCAAGAACCGAAAATAGGCAGAA---GGTAGCTAGGTAAAGGTTGTTTCTCAACCCCTTGCTGCCTCTAATCAATATAATTTTGATCT--------AATCACTTG---------------------CAATAAAGAAAATTACACTA
ATTTCAAGGCTAACATAATCCAAAGGTTTTTCGAATTTGCTAAATAAATAAAA-----------------TATTGACACTAGTAAACAAAATTACTATTTATAAAATAAAAAACCTGATATGGCCAAAATGTTTTGACCAATAAAAAAAA--AAATTT
>CG8349 8216840 8216906|8968 chr2L 8216166 8219100 scaffold_2 258372 261329 + 58242|719 785
AATTTTCATCTAAATAATATCCAGAATTTATTTAATGCAATAAAATTATTCGTTCTAATGTCAATAA
--------TCGAAATATTA------GTTTGTGTAGGGT--TAAAATAA-----------ACCAGCAT
>CG14277 8243293 8243429|8986 chr2L 8242452 8243502 scaffold_6 1672950 1673978 + 32092|872 1017
TGACGGAATCCGA--------TCGTTGGTCTTATGTTTGTATTATGAGTCTTGCAAATCATGTAGTTGTAAATACGAGGGCAA-AAAAAAATTGGTAATGCGGTGCACACACAGTGATTAAATATACAGAAAATACCGAATTGAAA
GCGCTGCCTCAGCCGAGATCTTCATTGATCTGATA-TTATATTATGAGTCTTGCAAAT----TAGCTGTATATTTTCTTTTAATAAACATATTGGTAATGGAGTGCACAC------------------GAGAATCAAGAGTTAAAG
>Scgalpha 8305164 8305376|9079 chr2L 8303415 8309970 scaffold_6 1749284 1755826 + 241627|1804 2060
CAAACATCTCCCCGAGTGCTCTACTGCTGAGGAGTGTTGGATTCGAG-----------------CGCATACAATTTCAATAAGC--------AATATCGAGGAGGAGCGT-TATATCAATTGCAT--AAATACTCACACCTGCCGAA---CTAG-ACAAACCATATCGTAATTATCATTTTATATAGATATGCAAGCATGAAACTAGCCAATTAGTTTGCCATTTAA------GAATAAAGGC------AATCAAAT
CAAACATCGCCGCGAGTGCTCTACTGTTAAAG-GCGCTTCATTTAAATCAAAAGCAATACTCATCAAATTCAACTGCAATTAGCCGGCAGCCAGTATCAAGGGGCCGGGCATATCGTAACCGCATCGAATTATGCATATCTATCAATTATCTAGCGTTATGCGTAGCAAATTTAGTTTAATGTTTAGCTTTGTT-GCAAATAAATAGCAATTTAGTGTGGTAGACAACTTAGTGCACAAAAGCTTACCTATTCAAAG
>CG7840 8306666 8306743|9079 chr2L 8303415 8309970 scaffold_6 1749284 1755826 + 241627|3444 3524
GTCCGAAGACTGGAAACATTTCGCATTTTTGTACAAATAATTTAGTAGTGGAATTTATTA---AAGTCGTTTTACACGCAC
GCTTCAA--TTGGAAA------------TTGTTTTACTAAATTATTTGTGGCATTTATTATTAAACTCGTTTTACACACAC
>CG7818 8309866 8309963|9079 chr2L 8303415 8309970 scaffold_6 1749284 1755826 + 241627|6778 6876
CAGCATTTTTACTCAACAACTGCGTGTA-TTCTAGTGTCTAAGATCAAAAGTTTTTAAGGCTAAGAATAAGATTAACATTAAAGTCTATTGCTGCAGAA
TGG-----TCACT---CCACTGCATGTATTTCTAGTTAATAGGCGCGAAAGTTGTTCA--CTAAACATGCGATTGATCTTGGACACGAATGCAGGATTA
>CG7806 8316674 8317017|9082 chr2L 8312355 8316753 scaffold_6 1758138 1762591 + 188530|4429 4509
CACTAAGTAACGATTATGAACTA-CGAATTGTATATAAGTCAATTGTTACACAATTTTATTTATTACTTTGTTTAATTTTT
CTGTAAATA---ATTGGAAACGATTGAGTTGCTTCCATGT--ACGATTCGATCTGTGTATTTATTGTTTTTTATAATTATT
>CG7806 8316674 8317017|9083 chr2L 8316754 8317414 scaffold_6 1765170 1765876 + 2410|0 331
ATCATACTTGTGTTCCTAACTAACAATTCCATTTTGAGTCACATTCAAAATT----ATGAAATTTGATGAG-----ATCTAGCATCACTTCGCAATTTTTATTTAATTGTACAAATTCAAAC---------TTGATTGACATACTATTTTTGTAGTGAATTTAACA-----AAGCAGTTGA--------ATCCGTTCAATGTGTACAAAAAA--CAAAACGTTATGTTAT-AAATACTACATTATAAAATATAAGACCTGTATTAATTA-------------------------CATGCTGAATAAA---------TGTTGCGACCAAAGAA
AGCATTTTTTTTTTCATTTTTAATATTTTCTTTTTCATGAAACTTTAAGCTTGCTTAAGAAATTGAAGAAATATATATGTATAATGATATATAAATGTATATATACATATATATTTATAAATAAATATATATATATATATACATGAATATTGGGGAGAGTTTACAATATTCAAGCGGATAACGATAATAATCCACACAACTTATTTAATGCATTCTAAACTTTCCGAACTCAAGTTTTCTGTTGTAAAGT-TAAAACTTTGATTAATTATTCTAAAATTAGTATTGCCAACTAGCAAGCTAACTTAACTTTTAGCTTGCTCAAATACAAAAA
>CG7787 8320848 8321285|9086 chr2L 8320384 8320886 scaffold_6 1770241 1770755 + 18122|481 521
CT--GCAGCGATGCCAAACACGTGTGTCCAGTCTCTTGCAA
GTGGGCACTGGTAACAATCGGAGGGGTCCTAT-TCTAGCAA
>CG7787 8320848 8321285|9087 chr2L 8321043 8321273 scaffold_3 5591729 5591952 - 348|0 237
AGTATCTATGCTTTTAGT---GAAGATTCGCTGAACGAATTCGCTGAAAATCCGTGAAATCGAAGGCCTAGTTTGTCGAGTTTAGATTTAAGCGAAATAAAACGTTTTAACGTGCCTGGTTAGCAAATGATTGTGCAAGCATTTTTAAATTAGTAATTATTTAGTTATTTGTTAAAACTTTCGTTTTAAAATCTCAGAA---AACTTAGAAAACACCCTGGTC-ATTAAAAACATCGC
AGTTTGTAAGTTTTAAGTTTTGATATTTTGATCAGCAGAGTTGTT--AAATTTTTTAATGCAATGATTT---TTTTAAAACGAATTTTTAAGGTCGATGACAAGTTTTGATTTGGA-GTTTCGTGAGTATTTTTTTTTGTTCTTTTAGTTTAGTA----TGTAATATTTTAGTTAGATTTTAGATTT----TCTCTGAATTTAATTGATGAACCGATTTGGCCCATTCAAAAAGTTGT
>CG7787 8320848 8321285|9088 chr2L 8321274 8321473 scaffold_6 1771355 1771565 + 6078|0 11
TCTTTTGTATTC
TTTTTTGTATTA
>CG14275 8332694 8332911|9102 chr2L 8332250 8332948 scaffold_6 1785394 1786033 + 13863|453 677
GTCATCGATCAGCTCACCTTCAGCTCCTGCATCCTGTTTTCTCCATTCAAAACGTACCTAATCCTAACTGGTTAAGCTAAGTCTTAAATATTTTGCACTAAGTTCTTTGCTGTTTGCCATATTTAGTTATGTATACGTG--GCAGCTATTTCGCGTTTAGTCTTGTATTCTGTATT-----TTTATATTTAATTACTATAAAAATATAAGCATCGTATTTAAAAG
GGCTGCG--------TCCTGCAACGCTGATGATGAAGTGCATCCATCCAGCGCAAAC---ATTTGAGTT--CCAATCTAA---TCAAATATCTTGCACTA--------TCTATAAGTCTTACGTTACTGTCTTTTCGCGCCGCTGCTTTGCAGAATTAAAATATGTTATTTGTATTTGTAATTTGTATTTCATAACTATGCAAAAACTAAGATACGACT------
>CG7778 8349956 8350197|9128 chr2L 8349887 8350268 scaffold_6 1810696 1811031 + 789|69 312
AGACACGATCATCATCCATTACCC--GGTGCTTTAGTCTAGTATTCCTCGTTTCTTTAAGGCGAACTCACACACTCATCAGTCCGCGCTCATAGTTAAGTGATTCGAAAAGTCGAAAATCGAAAATGTAAATTTAAGATATGCACAAAACCGAAAATCGAAATATATACAATCGTATTTGTATACAAACTTAATCTAACCAAATGTAACGCTCCAGGCGACTTAATAAATAATGTGTAATTATT
AGGAGTGAACAACAGCCACGCCCCCTACCGCTCACCTCCAACTTCACTCGTCTTCCG---------TTCCATTGTCGCCCACTCCAGCCCGGTGTTATTTAGTAC----------ATATTGCTCATTT--GTTTAAGGTACACACAGACACACAAACACACACACAAACACACACACACACACACACAC-------AAACAGATGC-------------ACACACAGACAAACACACAGTCACT
>CG31901 8355078 8355173|9137 chr2L 8354831 8355134 scaffold_6 1818941 1819267 + 6121|252 326
GAGA----------GAGCCGGAGAATACTATGAATGATGTACATATATATTTGTT--------AGTAATTTGAAT
AGCATTCGCAAGCTGTGCTAATGTTTACTCTGTATTATATATATATATGCCTATTCCCCGCTAAGTGATTTGTAT
>CSN8 8365640 8365820|9145 chr2L 8363670 8365745 scaffold_2 2013345 2015337 - 53553|2042 2166
GCCTCAATAA--ATTTCAATACATTTAATTGGATTTTTGTATACATTTG---------AAGAAAAGTTATGGTCACACAG--------CCTGTGTCAATCTAAAAAACACTCGATTAATATCGTT
AATATAAAAATGAATTATTTTTATTTTTTTGGCATTTTCCATTTGCTAGTCGTTAAATGAGGAGTGTTACTGTTTTACCGGGCGAGCAGCTCTGTTAACTAAAAGTA---TCGAGTAGCATCGTT
>CSN8 8366002 8366394|9146 chr2L 8366030 8366587 scaffold_2 2015338 2015830 - 8992|0 376
CCTCTACCGTTGTGTCACTT-GAAGAAAAAAAATATTAATTTGCAC--CAACGACGTACGTTTTTCGTTCGAAAAGAACAGCAATCAGCGGATA-------ATTGTATGGATTCTTAGAAAATTTGCAGCGACGAAATATAGTACCTTGCGAAATTATTTTGTAACCTTGAAGAAGTAAACTGC-GAATCGCCAGAGGGCCAAATAGAAATCTCGTCGTTTGCCTGCAGAATAGAAGAC-CCGATTTTCAGTGCGCTTGTGTTTGTGTGTGAGCAGCAGAAACAGCAGAAAAAATGGCAGCAAGCGACAAATCGGTCGACGATTCACTATATCCCATTGCGGTTCTAATCGATGAACTGAAAAACGAGGACGTTCAG
CTTGTCTCGTTGTGTCATTTCGTAGAATAAAAAAATT--TTTGCACGGAAACGAATCGCATTTTCACT------GGAAAATCAATCAGAGAAAATATTGAAATTGTGGACATTTTCGAATAGGTTGTTATCAAAAAA-------CTGTACGAAGGCATTTAATAAT-----AACTGTAAACAGTTAAATCGTTATTGGGCC---------TCCTGTGTATTTCGTGCGGAATAGAAAAAACCGATTTTTTGTACAATTGTGTGTGTG----------------AGAAAAGAAAATGGCAGCAAGCGACAAATCTGTCGATGATTCTCTTTATCCCATTGCGGTATTAATTGATGAATTGAAAAATGAGGATGTGCAG
>CSN8 8367096 8367249|9148 chr2L 8367072 8371563 scaffold_2 2016158 2020686 - 111138|24 177
CTTCGGTTGAACTCCATCAAGAAACTGTCCACCATTGCACTCGCTTTGGGCGAGGAGCGCACACGGTCCGAGTTGATTCCCTTCCTCACCGAGACCATATACGATGAGGACGAGGTACTGCTGGCCCTGGCCGACCAACTGGGCAACTTTACTA
TTGCGCTTGAACTCGATCAAAAAGCTATCAACAATAGCGCTCGCTTTGGGCGAGGAACGCACACGCTCCGAGCTGATACCCTTCCTAACTGAGACAATATACGATGAAGATGAGGTGCTCTTGGCGTTGGCCGATCAGTTGGGCAATTTTACAA
>CSN8 8367312 8367730|9148 chr2L 8367072 8371563 scaffold_2 2016158 2020686 - 111138|242 660
GTCTCGTTGGTGGGCCAGAGTTTGCCATGTACTTGATTCCGCCCCTCGAGAGTTTGGCCACCGTAGAGGAAACCGTGGTGCGAGACAAGGCTGTGGAATCTCTACGCACCGTGGCCGCTGAGCACAGCGCCCAGGATTTGGAGATCCATGTGGTGCCGACACTGCAGCGATTGGTTTCCGGTGACTGGTTCACCTCACGCACCTCTGCCTGCGGCCTCTTCTCGGTCTGCTATCCACGCGTCACACAGCCAGTGAAGGCCGAGCTGCGCGCCAACTTCCGAAAGCTCTGCCAGGATGAGACACCCATGGTGCGCCGTGCAGCGGCCAACAAGCTGGGCGAGTTTGCCAAGGTCGTTGAGACGGAGTATCTGAAGTCCGATTTGATTCCCAACTTTGTCCAGCTGGCACAGGATGATCAG
GTCTTGTGGGTGGGCCGGAATATGCCATGTACTTGTTACCGCCCCTGGAGAGTTTGGCCACCGTTGAGGAGACGGTGGTACGTGACAAGGCAGTCGAATCTCTGCGCACTGTAGCTGCGGAGCACAGTGCTCTGGATTTGGAGATACATGTGGTGCCGACGCTGCAGCGTTTAGTCTCCGGTGATTGGTTCACCTCGCGCACCTCGGCCTGTGGCCTTTTCTCCGTGTGCTATCCACGCGTCACACAGCCGGTCAAGGCCGAATTGCGTGCCAATTTCCGTAAATTGTGCCAGGATGAGACGCCCATGGTACGACGCGCCGCAGCCAATAAACTAGGCGAATTCGCTAAGGTGGTGGAGACAGAGTATCTCAAATCGGACTTGATACCGAACTTCGTGCAACTGGCGCAGGACGATCAG
>CSN8 8367797 8367871|9148 chr2L 8367072 8371563 scaffold_2 2016158 2020686 - 111138|727 801
GACTCTGTCCGTCTGCTGGCTGTAGAGGCATGCGTAAGCATTGCCCAGCTGCTGCCTCAGGATGATGTAGAGCAC
-ACTCTGTGCGACTGTTAGCTGTGGAGGCGTGCGTCAGCATTGCTCAATTGCTGCCACAGGACGATGTCGAACAT
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CTGGTTCTGCCCACGCTGCGCCAGTGCGCCAGCGACTCTTCCTGGAGGGTGCGTTACATGGTGGCCGAGAAGTTTGTTGATCTGCAAAAGGCTGTGGGCCCAGAGATTACTAGGGTGGACTTGGTGCCTGCCTTCCAGTACTTGCTCAAGGATGCCGAGGCCGAGGTTCGCGCTGCAGTGGCCACCAAGGTGAAGGACTTCTGCGCCAATCTGGACAAGGTCAACCAGGTGCAAATCATCCTTAGTTCCATTTTGCCCTATGTCCGCGATCTTGTCTCGGACCCCAATCCTCATGTGAAGTCAGCTCTGGCCTCAGTGATCATGGGCTTGAGTCCCATGCTGGGCGCCTATCAGACTGTGGAGCAATTGCTCCCCCTGTTCCTTATTCAACTCAAGGATGAGTGCCCAGAAGTGCGCCTAAACATCATCTCAAACCTGGATTGCGTTAACGACGTCATCGGTATCCAGCAACTGTC------------------------------------------------------------------ACAGTCGCTTCTGCCCGCCATCGTCGAGCTGGCCGAGGACTCCAAGTGGCGTGTGCGTCTAGCCATCATCGAGTACATGCCTGCTCTGGCCGGTCAGTTGGGTCAGGAATTCTTTGACCAAAAACTGCGCGGTCTCTGCATGGGATGGCTCAACGATCACGTGTACGCCATTCGTGAGGCAGCCACCCTCAACATGAAGAAGCTCGTCGAGCAGTTCGGAGCTCCCTGGGCCGAACAGGCCATAATTCCAATGATTCTGGTTATGTCGCGCAACAAGAACTATTTGCACA
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TATATAG---------GTTTAATTTGTAATATGTATATTTAAGTAAATAATAACAGCTAAATGTTTATAT
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TCTTATTATCAATTCAAAAAAAAAAAAACAGACCTTGCTCAAAAGTCAGCAAAATATTTTTGCGAGTTCAAAAATGTTTATAACGGTTGTTTTATAACAGTT----GAACTAGGGTAGGC---GCGTTAATAAAACTCTGGCAATTTGTATACCAGAATATTGCATTATAACAGTTTTAGTTATCAACTGA-AGGAGACCCTAGTTCAAAGC-----
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AAATGAAGACGCCAACTAATAAGAGCCA-------------------AAAAGCAGAGCTAAAACTG-----TCGCTAGTAACATTTGGT-TACGCACTACT------CTTAATGAGCATTTAATCGTGTTATATATATATATACATAATAGTGT--GTCAATACTTGTAAGGGATATGTTT
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TTTTTAGATATGTGAACTACTTCAAATATTTACTTGTATACAAGTCAA------AAAGTATTGTTTGCTCTATTTGCAATTTGTATACTCGTAAGAGTTTTTT-------CATGGTTTATTGAAATACAA----TTGTTTGCTACTGCATGTTGCTTGCTTTAAATTTATTTTATCCTGAGAGAGA-TGGGTGTCACCGGCTTATGGAAGCTAATAGAGCCTTGTGGAAAACCAGTGCCTGTGGAGACATTGGAGGGAAAAGTGCTTGCCGTTG
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ATATATCGATTTGGTTGCATCAGGTTGTGAAGGGCTTTCAGGACAACAAGGGATCGGCCCTGAGTAATGCCCATTTACTGGGTCTATTCCATCGTCTCTGTAAATTGCTATACTATCGTGTGCGACCGGTTTTCATTTTCGATGGATGCGTGCCGCAGCTTAAAAGGGACACTATT
ATATTTCCATATGGCTTCATCAGGTTGTCAAAGGTTTTCAAGACAGCAAAGGATCGGCACTGAACAATGCGCACCTTTTGGGCCTATTTCATCGCCTGTGCAAATTACTGTACTACCGTGTGCGGCCGGTGTTCATATTTGATGGCGGCGTGCCGCAACTAAAGCGCGATACAATA
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>Chrac-14 8441024 8442352|9196 chr2L 8438206 8442358 scaffold_7 3416805 3421155 - 117216|3062 4499
GAGATTATCAAAGATGCTGCAGAGGCTCTTAAATCTCAAAAGACCTCAGAAGAACTGCAGGAGTTGGCTACAAACTTAGCTCAGGAGCGAAAGGAACTTGAAATCGAGCGGAATCGGCAAGACCGAATGGGCATGTCCATCAGCCAGCGCATGAGCATCGATTGCCAGGAGCTGCTGCGTCTTTTCGGCATTCCGTACATTGTGGCTCCCATGGAGGCAGAGGCGCAGTGCGCCTTTCTCAATGCCACAGATCTTACCCACGGCACCATCACGGATGATAGTGATATCTGGCTTTTTGGTGGTCGAACTGTCTACAAGAACTTCTTTGCACAAAACAAGCACGTGATGGAATTCCGGGCGGAACAGATCGAGCAAACGTTTAACTGCAACAGGGGTAAACTGATCCAGTTGGCCTGTTTGGTGGGCAGTGACTACACTA--------------------------------------------------------CAGGAATTCATGGCATTGGTGCTGTAACGGCCCTGGAGATTTTGGCCTCCTTTTCCGGACAGGATGCGAA---------------------------------TGGGCCAGG---TATCTGCAATCAATCGGTGCTTCAAACGCTAATCAAGTTCCGCGACTGGTGGCAAGCACACAAGTGCAGCAATCTTCCACCTGGCAGCTCGGCTCGCCTTGCTCTGCGCAAAAAACTTAAGAACATCGAACTGCACGAGGGTTTTCCCAGCGGTGCAGTGGTGGAGGCATATTTAGCGCCCACGATCGACGACAATCGGGATGCATTTAGTTGGGGCACACCGGATGTGGAATCAATCAGAGAATTCACGCGAAAATCTTTCGGCTGGACTACTTCAAAAACGGACGACATTCTGATGCCCGTGATGAAAAAAATTAACGAGAAGAAGATACAGGGTTCCATACGCAACTACTTTACGGCAAAGAGTGCTCTGCGAGTTCAACAACCGCACGTCAGCAAACGTGTCCAATTGGCAATTGACAAGATGTCCGGAAAGATCGA---TGAGACGCCGGAGAAACCGAAGAAGGTGACACGCACAAGACGTGCAAAGGCAGCTCCGCCAACAGATGATGATTTGGCCATCGCGGAT-GTCGCGACAAAAGCTGCCCGTCCCAAACGCGGCAAACGAAAAGCTGCACCTGAATCGGTAGTTTTGGATGGGGAACTTCCTTCCACATCGCAGTCGATACCGAAGCCTGAAAAATGTCCTCGAATACCTAGCAGCGTTGAAGTTATACCTCAAAGGGAAAAGGATCTGGAGCAGATGCGCCTCAATAAAGCAAAGGCGGCAGAGATTCTTAAAAATTCAGCGAAAGCCAAT-------AGGAAATAAGCTTAACAAATCTATT-AAATATAACTTTAT-----AGAAATCATCTA
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>mus201 8442311 8442352|9196 chr2L 8438206 8442358 scaffold_7 3416805 3421155 - 117216|4452 4499
GCTTAACAAATCTATT-AAATATAACTTTAT-----AGAAATCATCTA
TTTCCACATTTTGCTTAAAATATATTTTTATTTCCCCTGTAACTTCTT
>fu2 8466345 8466696|9212 chr2L 8464132 8466414 scaffold_7 3434942 3437296 - 48087|2384 2460
AACAACATATTTACATGTTTAATAAGCT----TAGTTGATAGGTCGGAAAAGTTTTGTAGG---TCAAGGCTGTTTT
AATGGA----------GTTTGATAAGCTATTATTATAGTTAAGTAAAAAGAATATTGAGCGTAATAAAGGTTGTTCT
>d 8488216 8488671|9244 chr2L 8485958 8489253 scaffold_7 3456112 3459777 - 103153|2481 3081
GGACTACTGGTGGAAA---------------CAAACTGGT--TATGATTC-CATTCATTCCATCTG----------------------TTCAACTCTTCCTGATTTT---AGACATCCCATTTCTA----AAAGACTGTAAATATTCCATTTGGTAGATTAAATAACAAGCATTCTGTCTACGAAGCGC------ATGCTAACTGAGGTGCTCTAATTGGCCCCTAACTT------ACGTAGTATTATTATTGTCGCGTTAATAAATAAACGCCAATCGATAGGTTGTAGCTTCAATTACATACCCACAAGTGCCAATCAAATAAGTTCTTCCACCTAAT-------------------------TCATAAGTATTTTACATGTTACTGAGATT------ACATTATTCGCCGTTAAGTAATTAGTTAAGTAAG--------------TTTCAACAACGACATTCA---------TTTTTTATTTTTGA----------------GTTCACTTAAGAATTGTGAATTTTATTAGA------CTAAGGTTCATTTTGTCATTCAAATA------AACGAAGCATGCATTG----AAATATTT
TTGCCTCTGCCAGCAATGCCGCCAGCAATGCCAACATGACCATATCATCCGCGTTGATGTCGACTGGCCAGTCGAATGGGGTGAAAATTTGAAATCACGCTGATCATGCAGGAGACGCCACTTCAGCGACGGAGACTGTAAATAACTGACAT--TAGTTTAAGTGCCTAA-ATTTAAATAATGAATCGCTGAGTTTTGCGAGGACAAACGTATTATGCGTTCCCCAGCGTTGTCCGATGGAGTATTATGTATTTATATTTTTCATATGA--------CAATAGGTTGTAGCTT--------------CCAGTGCCAATCAAGAGAGTTTTTTTTTCCAATAATAATAATCTCTACGGTTTTGTTGTTATATATAGGCTATAAGATACAAACATGTAGTTAGAATAACTCGCTTCTGAAGCCTCTTTTAATTAAGCCCTTATCCGGCTCTCTTCATCATAGCGTGCATTAATAAGGTTTCTCATTGTTGCTCATAGCCTGATTCATGCCCACTTATTCATATGGCAATTTATATAAAAAGTGCTCGATTTAATTTTATCACACATATATTTATTAGTAAGTCATGTTGTGTACATAATGTAC
>CG13088 8490349 8490548|9245 chr2L 8489254 8490384 scaffold_0 7805030 7806194 + 23973|1140 1176
TAGT-CATTTGAAAAGACTTAAATGACATTTCTACCT
TAGCATATTTCAAAA---TTAAATTTTAAATGTGCCT
>CG13089 8516616 8516756|9276 chr2L 8515153 8517331 scaffold_6 5819996 5822118 - 76439|1493 1633
GCATTAACAGTATCAGTATGACGGACAGAATCCAGGAACTTTGTACAGATGCAGAATGCGCTTCCTAATGGCAGCCGAGCATACTCTTAAGATAAGTTAACTCCGAACAATATCAGATTAAACAAAATATTTTATTTGATT
------------------------ACTGAATATGGATACT-----CAAAT--AAAAAGAACATCTTTAT-----------------TCAACATAGA-------CGAGCAAT-----------CATTATAATTAAT----TT
>CG13090 8519029 8519180|9277 chr2L 8517683 8519039 scaffold_6 5822310 5823657 - 53909|1353 1363
TCCGACAAAAC
AGCAAACAAAC
>CG13090 8519029 8519180|9278 chr2L 8519098 8519605 scaffold_1 4237991 4238469 + -708|0 86
TTTTGGTTTTTTTTACCTAAGCTCTTACGTATGTCTTGTTATCATAAATACCAGGCTGGTGTAATAAA----ATGAATAATTCAATT
TTTCAGATCTCGTTATTAAAGTTTCTGAGATTGCCGCG--ATCATTAATAC--GGATGGACGAACGGACGACATGGCTAGTTTGATT
>Acer 8524781 8524991|9282 chr2L 8523441 8528475 scaffold_6 5825399 5830753 - 119882|1344 1563
ACTGAGCCATCCCAAACTTGACTTGAGGTTATTAGAACCCGAAAACAAATATATTGGTTTAGTCTGTCATTAGGAACAAACA---AAATAAACTTGATAAGAACG---ATAATTAATTCACA---GCATATGCGCATTGATATTTAAATTGATATTTATTGTATCGATTCATTCGTATCGTTTCGTTTCGTTTTATTAATAAATTGCCATTACATAATAC
-------------AAACACATATTTCTTTTTTTAGAGCC--------AATGTA------TGTTCTTTCCTTGTATATATATATATATATATATTTTGTACGAAGGCGTATAACTAGTATATATATGCATGTGCGTGCGTTTGTGTGAGTGTGTGTTTG-----------CATGTGTGTGGGCTAGGGTATGCATGCATATATGTATGCA-TGCATGTTA-
>CG17834 8537598 8537932|9301 chr2L 8537922 8538473 scaffold_7 3748367 3748927 + -859|0 10
AGTTTTTAAAC
AATATTTTACA
>CG17834 8541237 8541462|9306 chr2L 8540365 8541248 scaffold_6 5854975 5855826 - 36938|903 914
TCGCACTGCAGA
-CTCTCTGCAAT
>CG17834 8541237 8541462|9307 chr2L 8541249 8541660 scaffold_2 2456397 2456771 - 2268|0 233
TATACATATTTATTTGTTAATCACTTTGTCCATGTTTTTAAT--------GTTTTAAATTTATTAGCCTTTAGTACCTGCTTATGC---GTTTTCTGTATTATCTTCTAAGCAATGACCTTGTCCAAACAATTCCTCAGTATTCAGATGTACTTCATTTTG-----AATTAATGATTGATATT----ACAAAATAAATTGTATTTTACCACAAAAAACAGCGATTAAAGATCCT
TACAAATATTTATTTTAAAATG--TTTATAAAAGATTATAGCTGCGACCAATTTTAATTTGATCACTTTTTGGTACATTTCCTTGACTGGATATGTCAATTTTCATCTG-----------TGATCAGATGA-----AAGTGTTCGTATG--CTTTATTTTATAAGCAATTTATTATATACATTTTGGCCAATGCAAATCTTATCTTGTGACCTGGTTTTGGTATTA----TTTT
>Sema-1a 8666212 8667428|9478 chr2L 8665793 8667630 scaffold_2 4274981 4277068 + 30707|582 1994
TTGATATGCAACACCAAATCGATGCCACTCATCCAGGCCCAGTCTACGCACGCCCAGCCACACCCACAGTCGCACCCGCACCCGCTTCCGCCACC--CGGTCCGACCACGCCCCCAGCA-CAGCCACGCGCCAGAAGTCCAATGATCGGCAGGACATATGCCAAGTCCATGCCCGTGACACCAGTTCAACCGCAATCG---------CCGCTGGCTG---------------------AGACGCCCTCCTATGAGCTCTACGA-ACGCCACTCGGA--------------------TGCGGCCACCTTC---------CACTTTGGGGATGAGGACGATGACGATGATGAT---GAGCACGACCACGAAGACACCTCATCCCTGGCCATGATCACACCGCCGCCGCCCTACGACACTCCGCATCTGATTGCA---------------------------------TCGCCGCCGCTACCGCCGCCTCGTAGATTTCGCTTTGGCAACAGGGAGCTGTTCAGCATGAGTCCAGCCGGAGGTGGAGCCACACCCACCGCCTCGGCAGGCCAACGCGGCAGCAGCGCCATCACGCCCACAAAGTTAAGTGCGGCGGCAGCAGCCATGTTTGCCGCACCCCAAATGGCCACCCAACTCAACCGGAAGTGGGCTCATTTGCAAAGGAAGCGGCGCAGGCGCAACAGCAGCTCCGGCGATTCCAAGGAGCTCGACAAACTGGTCCTGCAATCGGTCGACTGGGATGAGAACGAGATGTACTAGAACGCAGACCAACAATGAGATAGCAG---------AAACACTTTGATTC---------------GGAATTTTAACACCTTTGCATATTTTGA---ATATGACTTCA-----ATTTTAAAATGCGTA----------ATTATGTTCTTATTTTTTAAAGAACGCTTTAGAGAAGTTTTC--------------------------TGCTACCTCAAATAGTACACACAACTCATTTCTAACG--TGGCGCTGAGATATA--GGAATAATCACTCCCCCTTCC--CTAAAACTTAAAGTAGCAATCGAAAAG------ATCATTCAT-TAGCGATAGAAACTGGATGGGGATTTACTTACACACAAAAAGCCAGAGAAGTTATACACGAAG--------TTTATAGTTATATAGCCTTTATACATACTCCCCGATCTGCTAAGTATACACAAGCAAGCATAACATAACATACGTATATATGACTCTATATATACCAATAGATTTCATAGACGATTCACATGGATCGGCT--------ACGCTAAATTAGAGCTGATATTGTTAATTACGATTAGAGAAGAAAAAAACAACAGTTGTAAATATTAATCCTAGAGATGGGAAAGACGTAACGTAATCTAA
TTGATATGTAACACCAAATCGATGCCACTCATCCAGGCGTTGCCCACGC--------CTACGCCTA----------CGCCCACGCCTACAAAACCAATGCACCAAGCACAGGAGCAGCAGCAACCGCACGAGCAAGTGCTGGCCAACAGCAAGCAGCTTGCCAAGTCTATGCCCGTAACGCCCATACAGCCGCAGTCACCCACAGATCCGCAGACTGCCCATTTCATGCTCATGCCGCGCTCGCCATCGTACGAGTTGTACGAGGCGCGACCCGCACTCTTTCGGCATGCCCACTCCGATGCCACATTCCAAATGCAACACTACGACGACGACGAAGACGACAATGATGACTTGGATGACGCCGATGTAGACACATCATCATTGGCCATGATTACGCCGCCGCCGCCCTACGACACGCCGCAGCTGGCAGTAGCTGGTGCGAGTGCCGCCTCCACCTCCAACTCCGCGCCGCCGTTGCCGCCGCCGCGTAGATTTCGTTTCGGCAATCGCGAGCTGTTCAGCATGAGTCC-----------------------------CGGCACGCCCAAAT----CCAATGCCATAACGCCCACAAAACTGAGCGCCGCTGCTGTCGCAATGTTTGCGACGCCGCAAATGG---CCCAGCTGAACCGAAAGTGGGCGCATCTGCAGCGCAAGCGTCGGCGGCGCAACAGCAGCAACGGCGACTCCAAGGAGTTGGATAAGCTCGTCCTGCAGTCCGTCGATTGGGATGAGAATGAGATGTATTAGCGGCTGACCCTTTAATCGATTCACATTTGACAGTCCAACCCCTAAACTCCTAACTGTACTTGTAGCAATCTTAACATATTTATATATATAGATATATATGCCTGCCTATATAGCTCACAAATCGTGTCGGTAGCATGTCAAATTTGTATTTTCTGTAAA-----TTAAATTAGCCTGCGATACACACATACACACACACACCTATGCAATGGCAGACCCCACACACAG-TCACGTAGAATGTTTGGAGTTTATATATACTTATATAATTTTTGCCAATTTTAGATGCGACTTTACATAAATATTACAAAGTGCAGAGGCATTCGTATAGTGAAAATA-------GTGAACTCAAT--CGATCAAAGTGTAAAAGCAGTTATATAGATAAGGGTTGTCTTTAAAATCATAGGGTATTGGAATACA------------AGGAAACTAAATTAAAAACCATTTTATGATCTATTTATTTTATATT---TATATTACAACAAAATACATCAATTATTCAGTTTGAACTCTTTGCAACAGACAAAACATTAAGACGACTTATTTTAATTAC--TCATGTAATTAAGA-----------TATTTATTGACCCAATAATTTTGTTGCCTTAAAGATAATGTTA
>Glt 8676676 8676811|9491 chr2L 8676681 8678858 scaffold_2 2521089 2523081 - 89436|0 133
CAAATCAATGGTCCATATTATAATCATGTGAAACCACCTTTCATAATAATCTTCTATATATCTATAGAAATATGTATATC---GAAAGCTATTGTTTTTGAATAAATACATTTTTGAATTATCGCTTACATCAT
CATGCCAATGAATAATATAATAATGA----------------ATAATAATATAATATTTATTTATGTTAATTTTTATTCCTTAAAACGGTTTTATTTCTTATAAGCAATACTAGTGAGTAGTAAACTAATTC--
>CG9314 8707279 8707442|9536 chr2L 8705650 8707575 scaffold_7 1125202 1127017 - 86999|1629 1798
GATGTATTGAGTCACTTTTTATAAGACTGTGGGCTGTTGAAATATTTGGCGTATTCTTAAAAATTATTATTATTCTTACCAATTATTAATTGGTGTTTAAATCTGGTCTAACGTTCAAAATGTGCCCCAACTGAAGAA------GAGTAAATGAGAAATTTGAAATGTAT
------TCGGGGCAAGCTTCGGAAG----------------------GGTGGATTTCGAA----TATTATAATGCTTGATAATTATAAAAAA------AAAAC------AAATTTTAAAGTATTCCCTA---GAAAAATGTTTTGAAAAAATATTAAATTTAAAATTAAA
>SoxN 8828213 8829670|9668 chr2L 8826459 8829755 scaffold_7 4817652 4821129 + 125941|1852 3540
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GAAATGGCCAGCGCCTATGGAGCCGTGGCCGCGTCTGCAACTGTGTCGCCGCCGCCAACAGCTGCTGGCGCTTATATGCCAGCAGCAGCAGCAGCTGCAGCGGCGGCAGCAGCACAGCAGCAGCAGCAGCAACAGTTGCTGAACGGCCGGCCTAGTCCGACTGCATCTGGTTCGGGTTCGTCGGGCGGTCGCTCCTCGGCGCATTCTAGTGGTCACACTGCCACCGCGCATTCACCCGCCTTGGCGGCGGCT-----GCTG----TTGCCGCTGCCGCCTATCAGCTGTCCGCAACGTCAGCGGCGGCAGCAGCAGCAGCGGCCTCCTCCTCCTCTGCGTCCGCCACGGCCGCTGCCTCTAGCTGCCAAGCGGCCAGTGCGTTTGTGGCCTCGGCCAGCATGCTGGACATGCAACAACAACTGGAGGAGCAACAGCAGCAGCAGCAGCAGCAACAACACCACCAGCACTACCTGCAACATCAGCAACATCTGCAACTCCAGCATCAGCAGCAGCAGCAGCAACTGCAACACCATCAACATCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAACAGCATCAGCTGTATCATTATCAT----GCCACGCATTCGCAGCAGCTGCACGCGCACGAGGCAAGCGCTGGTTTGTTGGATATATCCACATTGTAAATTATTGAATATATATATATAAATTACTCTACACACAAACACACACTCACACACACACACACACATTTAGCGTTAATTGCAAGCGTAACATAAACA-ATTTTTAGCTTTAGTTTTAACAAGATAATTCATTTTAGCACTTGTAATTACAAAATGAATTCAATTG-----ATAAATAAATACAATTATTAAACCTATAAATAAAAGCATTTTACAATTAAGCATACGCACTGTTGTACCATATGAAGCGAACATCTTTCCACAAACACACACACACACACACACACACACACACACATATACACCTCCACATTCCAAAACTTGCATTCCACAACATTTTGGTAAAGAATAAAAAACCTAAACGACAATTGTGTGATACAAAGAAATTGTTGCAAAAAAAAAAAGAAAAAACTAACAAAAACTAAACAAAAAATTGTTTCATGT--TATTTTGATTTCTGTTTTTCTGCGCTGTACAAAAAAACTTTAAAAAATAATTCGAATTTCCACAAAAAAAA------------------------AAATTTAAAACAAAAA--------------------ATGAAAAAA----AAAACAACAAAAAAAAAAGAATCAACCACATTCTATTTTATAGATTCTCTTATACATTAAGTAATTATAATTATTATCTATTATATAAACAATTTAATTATAATTATTAATTATGCTTATGAATACTGCAAAGAAAAACAAAAAGCAAAAATACGAAAAAAAAAACCAATTAATTGTAATAAAACAAAAAT--TATTATTATTATTATTAA----------------AAGGCAAGCATCTACCACATAATACAGAAACAAATTAAATAATAATAATACAACAAAATGTTAGTAAACCTAATGAAAATTTAGTAAAAACAACAAAATGATAAAC---------------TGAAACCAGGCGCAAGGCAAACAAAAAATATTCGAAAAGCAGAAGAAAACTGCAAACAAGCAGCCGGAACGTCTGGCAAAAACAATAAAAACCAG
>CG9483 8867596 8867687|9713 chr2L 8866774 8867597 scaffold_7 4875057 4875847 + 16993|826 827
AT
AT
>Tsp29Fa 8935958 8936107|9798 chr2L 8935107 8935984 scaffold_7 4973177 4974000 + 27990|863 893
GTCCGGAGG----AAATCGATTCTGTAGGAT
ATGATGATGTTAATAAGTAATTTCGTGAAAT
>Tsp29Fa 8935958 8936107|9799 chr2L 8936010 8936527 scaffold_7 4974014 4974585 + -1624|0 116
CGATATTTACTTTAAATTCAATGAT------------GTTCTTGGACATATACTGACATTTACCCTTGCTTGTAAAAATAAATAAATATATTTCTAAACAAAAAAT-------TTAA
CGATCTGAGCTTAAACCTAAGTAACACATTAATAACAATTTTTGTAGCTAT-TTGTGCTTTTCCGCTGCT-----AAATTATTCAAAATATTTGTAAACTTATAATAATTTTATGAA
>Tsp29Fb 8939602 8939746|9806 chr2L 8939104 8939740 scaffold_7 4978436 4979067 + 26382|514 654
GCGGCGACATCGATCGAAGCCATATTTATACAGTATAGCATTCCTTAAAAGATCCCCTTGTATATGTAACTTTTTAATTTGTTAACTTAAAATATATTAAAA--CGAAATAAACGCAGTGGTGTTAGACTACCTGCTAAAA
GCGACAACAACAACAACAACAACAT-------GAATAATATAATGTAAA------------ATATATAATTTGTTAA----TTAACTGAAGCCAAAGCGAGAGTCAAATAAAACGAATCAGTTCCAGACATTGTTCTAGGA
>CG32985 8964600 8964628|9828 chr2L 8962674 8964735 scaffold_14 234021 236090 - 48222|1989 2017
AAATATACTTGGAAGTTCAATAAAACAAG
AATTATA-TTGATACATGTAGAGAACTAG
>CG18088 8970027 8970264|9837 chr2L 8970010 8970190 scaffold_14 235942 236115 - -6|17 180
TTAAGTCTCTTATGTACAAAATAAAGTTTAAGTTTAGTTTAAAACTCCTTACATAAGTTTTCAACTGCATTCCTTTGCTAGCAGCATTCCCAAGCCAGATGAACAAGTTATAAAAAATTTTAAGGGCCAACCGACAGCTTAGGAGAATGAAGTGCTATATAAAT
CCTAGCCAGTTTTTATTATAATTATATTGATACAT-GTAGAGAACTAGTCGGAACAGTTTTCTGTTTCAAATATTAAACAG-AATATTCCCA--CCAAATTAA-AATTTAAAACACATCTCAAATGAATTTAAAGATCTATAAAAAATAAAATCTTAAAAAAGT
>CG18662 8981301 8981437|9849 chr2L 8979616 8981390 scaffold_14 269222 271155 - 10818|1980 2069
AAGGATGTGTACTGACCAATATTTCTGTTTTAAGAAACACTCACTATTGGCTCGACATATTTTTTACAAATTTTGGTCTTACGACTGTGT
A---ATATATAGTGTACGTCAATCCAG-CTAAACAAATATTTAAAAT------------TTTTTTATAAATCTCTAAATTGTATTTGTGT
>CG18661 8998387 8998545|9863 chr2L 8996737 8998395 scaffold_14 289084 290856 - 45916|1799 1807
AGTAGTGCA
GCAAATGCA
>CG18661 8998387 8998545|9864 chr2L 8998428 8999490 scaffold_14 292107 293196 - 29035|0 150
CTCCTAGATAACATCGTTTAT-------------TTTGGCGGCAATAAAGTTTAT---TGTCGTCGAAGTGCCTGCTCATCGAACTAGGCCAAGTGGTCA--------------GAGCGAGAGTGCAGGAATTGACCCTGAAAAC---GCA
CTCTTAGATAACATTGTCGATGACGACGACATCGTCTGTGGGCAATAAATTTTACGAGTATCGGCGACGGATT---------AACTAGGCCAAGTGGATACCTTCGCTATATACACACGCGTGTG-----ATTGACCCTGACAAACAAACG
>Try29F 8999415 8999457|9864 chr2L 8998428 8999490 scaffold_14 292107 293196 - 29035|1032 1091
GATCATT-----------ACTTCATCAAAACTAAA------CTAAATGAATAAAGGGAAT
TTTTGTTCAAATAAAGCAACTTTTTTTAAACTGCATGTGCTCTTGATTAAAATAAG----
>CG9568 9011245 9011344|9871 chr2L 9011236 9011638 scaffold_14 2797770 2798170 + -642|9 131
ACTTATAATCTGACGACGGAGCTAAACAGTATTT-------CAACTACCTTTTGA---TTGTACAATATTTATTTGAATTAAA-AATAAAATCATTTAAGA------------TAACGAACAA
A--TAAATTTCTAAGAAAATGTTATATTATCTTTAATTTCATAAATATTTTTGGACGCTTATGGAATATTCATTCAGATAGAACAATATAACGGTAAAATACTCCTCACTTTTTTGTATACAA
>CG13102 9012844 9014151|9873 chr2L 9012829 9012888 scaffold_14 302138 302195 - 923|20 64
TGTGACTATTAATAAATATGAGCTAGGAGCTATGATATTTTATAT
TGTATTTATTTATTAA-------TCGAACCCATAACATTTTAAAT
>CG13102 9012844 9014151|9874 chr2L 9013056 9013923 scaffold_25 1936519 1937583 + 32202|0 1064
GGAGCCCATTGGGTTGACGGCGTTTGTCTGCAGGTTCTTGAGCAGCATCTGCAGCCACTGCTTGGTGCACGTGTCATGTTGCACGAGCGACGTGAAGGTGCCGTCACGCAGCAGATCCGGCAGACACACTCTAAGTGCACTGCGAGCGC-------------------------------------------------------------------------------GCGCATTTTCCGTAAGTAGTAGATAGCAGCGCACCACATGCTTCAGCACCCGGAGGCATGGAAACTTCAACATATGGATGACCATTTTGCCC------------------------------------------------------------AGGGTGATGGCCACCTGCGAGAAGCGATCGTGGTTCTCGCAAATGTACGTCAGACCCATCTCATCGAGCAGTATCTTCTCAAGGATTGAAGTGGCCGCGATCTTGGTCAGCTTCGATCCCCTGACCATATTGGTCAGACAGTGAGGCACGACCTCGCTCCATATCAGGAAGATGAGGACCTCCGTATCACCGGTCTCGGCCAGAGCATTAATCACGCCCAGCGTGGTCAGGCGCAGCTGCTCGAAGGGCCTGCTCTTGAACGTGGTCGACAAGAAGGGGTACAAGTACATCGGTATCTGGTCCCGCAGGAAGGCCGGGCGAGTCTCCGGATGCGAGGCGACGCACTGTAGCAAAGTCAGGGCGTAGCACACGCGGTTCGACTGGTTGGCCTTCAAAACGGGCGTCGTTATTATGGGGTATATGTTGACGATCTCCTGCAGCAGGGTGCAGGTGGTACCGACGCTTTTCCACAGCATGGGGGCCAGGTCCGCATAGGTGTTCTTGCTCAGCTCCAGCAGAGCGGTCTCCCGCGTGGCAGGATAGGCCAGCTCGATGATCAACTGGTACACCTTC-------------------------------------------------------TCCCGCTCGGC---CTGCTGCTGGGGACTCATTACCGGACTTGGTTCCGCACTCATC
GGCGCCCGGCTGTTGTGCAGCGCCCGGTTCCAAGTTTTTGATGAGCATTTGCAGCCATTGCTTGGTCGATTTATCATCTTGCAGGCACTGCGTGAAGGTGCCGTCGCGCAGCTGATCCGGCAGGCACTGGCCCAACGCCTTGCGTGCGCTGCACCACAGAATAGAAAGAGAAAGAGATAATGTTGAATGCACATGAAAGAGAGCCTATTATCATGCCTGGCACTGACCGTGTATTGTCGGAGAGACGCAGATAACATCGTACAACATGCTTCAGGAGGCGCGCACACGGCTCCTTCGATAGCTGGATGACCATTTTACCCTTTAGAGAGAGAGGGAGAGCATAAATGAGGAACTCAAAGATGGAGCAGGGCCAACTTACCAGGGTGATGGCCACATGCGAGAAGCGCTCGTAGGTCTGACATATATAGGATAGGCCCGACTCGTCGAGCAATATCTTTTGTATGATGAAAGTGGCGACCGTTTTGCTCAGCTCCGAGCCGCTGTCCATAATGGTCAGGCACAAGGGCACAATTTCGGTGGTCAGCAGAAACGTAATCACCTCCTGTTCGTCGGTCTTCACCAGAGCGCCGATAACACCCAGGCTGGTCAGACGCAAATACTCAAAGGGACGTGTTTTCGAAATGGTCGATAGAAAGGGATACAGATAGAGGGGTATCTGGGCCTGCAGGAAGGCGGTGCGGGTTTCCGGATGCGAGGCGACACACTGCCACAGCGCCAGCGCATTGCACACACGATTCGACTGATGGGCGGTCAGTGTGGGTGGCGTTATTGATGGATATATGCTAATTATCTCCTGGAGCAGAGCGCATGCGGTGCCAAAGCTGTTCCAAAGCATTGGCGCCAGATCCGTTTCACGTTTCTTGCTCAGCTCCAGCAGGGCCGTTTCGCGTGTATCCGGATGTGCTAGCTCGTTGATCCATTGGTAAACCTTCAATTGAAACATTTAATACATTTATAGATATACACTCGTATTTAATAGTGACCTTTTCTTGTTCGGTGGGCTGTTGTTGGGGGTTCATGCAGGGGCTCGGCTGTGCGCTCATC
>CG13102 9012844 9014151|9875 chr2L 9014097 9014652 scaffold_43 68381 68953 - 222|0 54
CCAGAGCCGAGGAACGCACGAATGCCATAAATTAATAAATAATTTCTTGTTCGAA
CAAGGGCCTGCTCATACGCGAGCGTCTCAAGCGAAAATATAATTTCTAAATTGAA
>CG12439 9077938 9077988|9956 chr2L 9077229 9078960 scaffold_14 405501 407425 - 10694|736 786
ATTGTTTATTATTTATACAAATTTATGCCAACAGCTGTTGCTACCGCCGTC
ATTGTTTATTATGCACACAAATTTATGCGAACATCTGTTGTTG--------
>CG32982 9163450 9163716|10066 chr2L 9162962 9163930 scaffold_14 525408 526329 - 7134|544 833
CGCCTAAAGGTCTAAA------GATAATCCAAATCGATGGAGAATTGA---TTGCTCCCCCACTAGTTTAATAATGATATAAATTAGTCGGTAAATTAGTCGACTTGATACAAAGTTTTGGAAATTATTTGCATAGAAAATACTTCAACGAAGGTAGAGAATAGTAACTAAATCTTAAC-------TATGTAGTA-----GTACTCGTAGTGTGT-GTGCTCCAATGTC-CAGCTTTATGTAAATGTTTAAATAAAATATACATTAGTAAAAAGCATCTTAATAAAAGAT
CGCTTAAAAGTCTAAGATAAATGATATGTGAGGTCGTAGAACACTTAAAATATGCATTACCATTAGCCCAATAA----GTAGCTTAATGCATAAGTGAATCCATT----------------AAATTAGTCA-ACGGATAATAATTGAATAAAGGAATAATACAGAAATTAGTTATAAGCAAATCCATATGTAATATATATATATATATAATTCGTAGAATTTTAATGCAGCGACTTTAC---AGCGCTTGGTTAACAGATGC------------CAGCGAAATATAATAG
>CG13108 9165221 9165425|10067 chr2L 9164051 9167195 scaffold_14 537294 540689 - 61038|1376 1602
GCTGATTCTTAAAAAAAAAA---------CAACTACTAATTATACACAAAACT-------AACATTTTCATTAGTATTTACAACTAGTTGGCCAAGTTAGGGTTAAACAACAAATTTCCT-TGTAACAGCTATGTGAAAACAGCATTAAATTTAATTTAGAAAATTAAAGAAACTAAGAAAAAAAAAGGAAATCAAAAGGAAA-ACATT----TGAAAATATCAAAT
GATGATCCATAAATTGAAACACTATTAACTTAATATTAATGATATATGAAATGGGTTCTAAACATAATTCCTAGAAGTTAT--TTAGAAAGTCAAGTTAGCCTTAGAAATTGAATTAAAAATGCGATTGCTAT------------TTAAATTGAATTTAGTAAA---AAACAATTTGAATTATCAACTCAATTCGCAACAAAATACATTGATATAATAATTACAATT
>tai 9245809 9246386|10170 chr2L 9245889 9247640 scaffold_2023 209 2299 + 36662|0 587
AAAAACAATAGGAAATCAATGGATGAAAGGCGAAGCATGTACATCTAA----TTAAAAATATTAGCAGCACTAT----------------TTAAAAA-------------ATATATATCTAAATATATTTATTTTATAATACTAGCAAATATTAATTTTAAAGCA----AAATGGGAACCTCGTCTAAAAGAAATCGCGAAAACATAAATACCAGACACAAGCTCTAGTTAAATATTTTGAAAACAGCATAATAACTTCATAAGAAGATGCAAACATGATA---TAAGTAATGCATATTTATTACGTTTAAAGATAAAGCCTAGTACTAAGA-GCTATATATACAAAAGAATGAAAGCAGAAACA---------AAGCATA-------------------------AAACATAAATAATTATGCGTTAAG-----TGCTGGC----CGTTTCGAGGTGTTGTTAA--ATTGATATATGTATATTTAAAGAGAATTAATATTAATATTGCATAACATTTGGAGAGGCGTTG----GCAACGGCAGCAGTTGGCTAAGCTCTAGATATAACGACAAGCGATAATATAATG
AAAAGCGATCGAACGTCTA-----GAAATGTGTAAAATGTATATGTAAAATTTAAATTATATTAGCAGCACTATAAAATAAGCCAAAACGTTAAAAACAAATATATATGTATATATACACAAATATATTTATTAT-TAACACTAGCAAATATTAATTGTAATGCATAAAAAATGGGAACCTCGTCTAAAAAAAATAACAAAAAAAGAAAAATCATTAACAAGCTATAGTTAAATATTTTGAAAGCTGC-TAAAAAATATACAAGAAAACACAAAAAAAAAAAACAAAAAAAAACATATTTATTACGTTTAAACATAAAGATTAG-ACTAAGATGCTATATATACAAA--AACCAACACACATACATATATGTACATGCATATGTATATGTATGTATATATTTATATATATATAAGAAACTGCATGTTAATATTGCGGCTGGCGCAACGTTTCAAGCTGTTGTTTATTATGGAAATATGTATAACACTAAAGATCTAAAAAAAAAAACAAAAAACAAGCGGATCGGCTTTAAATTATAACGGCATTAGT--GTTACG-TTTAACTAAACTAATTAATTAAAAAAAAACG
>Ggamma30A 9291162 9291800|10225 chr2L 9290657 9292460 scaffold_14 705735 707754 - 30170|654 1341
TATTATCGTAAACCACAGAAATACCGCCATAATTATGATAACCAGCCAAACAATAATAATGCAACCCATTCCACGACTCATACCACAACAACAAGAACAACAACAGCAACTGGAACA--GAAAACAATCCATATACCTTTGAGGCA------------CAGCCTCAACATCATCAGCAATTAGATA-CCCCTAGCCAATGTAGCAGCCAAGTTTTGGGGCAGGATTTGGGTGAATCCCCGGATCTGGTGCCGGTAGAGATGCAGCACTACAACAACAACTACTACTACTATTACAACTACAACTTGAGCTATGAGCCGCCGGTCG---------ATCGGTCGCTGGGCGGCGGGGGCAAGCGGAGCATTCAACGTCTGCAGCAACTGGTGCGAAGGACGCGGTACGAGCTGCAGCAATGGCCGCTACTGATGCAGCTGCTCCTGTTCGTCCTTTGGCTAAATGCCAAGTTCTGGCAGCTGGTCAACGAACAGGTGACCTACCGCCGCAGGAGGTGGCACTGAGGGGCGAAGGACATCGGGTG-----------------------TTGCTTGGTATG-AGTTCGATCTAGGCTTAAGTTGTGAAAATTATGCCCACACTCTTACAATCTC-ATCTCAATAAAAATAATCAAAATTCGCTGCGTAGTGGAAGCAGCGAACTTCAGCCAA
TATTATCGCAAACCACAGAAATACCG------TAATGATGAACATCCAAACAA--------CAACCACAATAATAACAATAACAACAACAACAACAACAACAGTAGCAGCAGCAACATTAAAACCAATTCAGCTAACATTACAACAACAGCAACAAATCAGTTCCAAAATAATGA-CAACTATTTAGCGAGCAATCGATGTAGCAGCCAAGCATC---------------CAATTCCCTAGATCTAGTACCGGTAGAGCTGCAGCATTACAACAACAACTACTACTATTATTACAACTACAATTTGAGCTATGCACCGCCGCCGGCAGCACCTCACGAGTGCCTACTCGGGGGGCCCAAGGGG---------CGCCTCCAGCAACTGAAGCGTCGCACACGCCACGAGCTACAACAGTGGCCGCTGCTCATGCAGCTGGTGGTGCTCGTCCTGTGGCTGCATGGCAAATTCTGGCAGATCGTGAACGAGCAGATCCTGATGCACCGCAGGCGCTGGCATTAAGTGGCGAACATCAGCAGAGGCAGAGATATGGAGTTGGGGCAACTTGTTTGGTATGCCGTGAGATCTATGCTTAAGT--TCATAATTATTC---CACTCTTTCCAAGTCAATCTTAATAAATATAATCACAATATGCTGCATACTCTAAAT-----GCTCCCCCCAA
>Cks30A 9331352 9331981|10268 chr2L 9331138 9332180 scaffold_7 332155 333228 - 14800|220 946
ATAACCGGCGGTAGCAGCAGCAGTAGCAACA-ACAACTGCATCAGATACACATACTTCGAAACCACATAGCCTGTAGCACATACCTAT----ATATCCGGCAGCT-----GCTGCCGATA------------TTCTGTATTGGCGGTGGTGGTGGTTGCTGCCAAACAAACAACCAACTGTTGCACAAACATCAACAACATCATCATCATCATCATTATCATAGGTACTCAGGAATCCCCTAGAAACTACTTATTGTGCTGTTTGTGCTTTGTAATACTCTCTTTTTACCATGTTTGCCCCGCATTATTCCCTTTTATATATATAGCACCTAGAGCT---------AATGATAAGTTTGCCATTTGTAATACTCTCTTTTTACCATGTTTGCCCCGCATTATCCCCTTTTATATATGTAGCACCTAGAGCTAATGATGTTTGCCATTTTCGTACACCTTAGTGCCGTTTCCGAATCATTCCTCAAGTTCGCA--------CGAATTTTATCATA-----------CTTT----------ATGTTGCCATTTCGAAACGGAAGCGAAAAGAAGAATTTTGCTCAC-----TTCTTTTAAGCTTAAATG------AAATCTGATTTGTGATCTTGAAATTTTT----AATCAATAATACA-TATGTTTACACATAATATAATG---------------------AACTTAAAATAAATATTTTTAATGT
TAGCCTTACAAAAACACTCCCCGCACACGCACACAAATGCAT-ACATACACAT---------TCACACTACATCTTACATATACGTATAAGCATACATGGAAGCGTTCCAGCTGACGCGACGGCGCAGCTGCTTCTGCGACTGCGCAAATGGTGGTAGCTGC-----------ACAACTGTTGCGGCAGCGGCAGC----TCTTAACCAACAACA-AATCGAACACACGCACGCATACACACTCATACATTTATTCTGCTTTCT----TTAATAATATTCAC------------------------ACACTCACACACACATATACTGCTTAAATCCTGGCACACAAGTGTTTCGTTG--CTTTTGAAATACTCTCCACATATAAATTTCGAAATTATGAATACGTTGCCATATTCCTATTATATAGA---------GTTTGCCATATTTGAAAAATGTATTTCTATAACTGATTC-CGCCTTAAATTTGCATTCCGTTTTGCTTTTAGCCATAGCACAGTGGGCCTTTTAATTGTATAATGCTAAGATCGCGAAACGCACCCAGCGTTATGAAAATTGCCTGCACATTTTCATTTAATATTAAAAGAAAAAAAAATATGATTTGTGATCTTGAAAATTTTTATAAATACATAATGCATTACGTTTAAACATAATATAAAGTTATAAATAAAAAAAAAAAAATACAAAAAATAAATATATTTGTAG-
>Eaat1 9340763 9341625|10276 chr2L 9340538 9342131 scaffold_7 344006 345606 - 20980|260 1194
AGGCAGTCTTCGCTTGGCGCCTATAACCGCAAACGATGAGTGGACATGTCCCGGCTGTGGGCCTGTTTCCACATCCTGCCCAGCAACGATAGCGATAGCGATGACTACGACGACGACGACGAGGAGTTTTAAAGGATCGCCGCAGGATCGTATTGTATCAGCGCTGGAAAGGAGTCATCACGTTTGTTTGCGAATTATTTTGGGTGACCAAGTCGCATCTAATTTTCAGATTGATCAATTTGAAGCAGCTCCTCCGGCAGAGGATAGATATCTGCCAGAGTACAAGTACTAAGCCAGCAACGAATTTAAGTGACACATTCGTTAAATAGTTTGTTTTTTCCAA-AATGAATAGATCGAAAAGCAGCGAGAACAGCAATAAGATTTAAGATGAAAACAACGTAACATTTATCGCCTAAATTAGGGATACTTTCAAGGTGTACATAATTTTTAAATATAATTATATTAAATTGAGTTCAAATTTGCATTACATTCTCCCTATGATTAGTATTACAAT-TGAGCAG-TAAAATTAGTTAA-------------------------ATTCCAAGCAAGCAATCC-CAACTTTAAGCAATTGCATTTGATTAGGTCGCAAATTGTTGAGATTCGTATCTAGTATTTGTTAAA--------------------------ACATATTCTATAACTTTTTGACATAGCAAA-----------------GCGAAACAAAATAATTAAAAAAGACAAATATTTAACAATAGAACACAGATAAATTAACATACTAATAGGTGAAAAGCAAAACCAAATCCAATCCAAATCAAACCACAATTTCAAATGCCGTTACAAGTTCGTGTTCATAGTTGAGCTTTGTAAATACTTAATAGCTTAAGTATACATACATAAAACTTTATGGAAATATTTATATTTAAAGCGTG
AGGCAGTCTTCGCTTGGCGCCTATAATCGCAAACGATGAGTG------------------------TTTGAGGACGAGCACGAGCACGATACCGAGAGCGAGGATGGAATGGAGCATAATGA----TTTGATGTACTCTCGTTATCGTCGGCTTGCCTCA--------------TCAT----TTGTTTTGCGGCTAA----AAGCGGCCAAGACGCACACAATGTCAAG------CAATTTGGAACAGTT------GTAAAAG--------CTGTCA------------CAAAACATCAATGAATTTATTTGAAAC--------GATTGTCTGCAATTAAAGACACTCAAAAGATCAATAAGAAACAGGAAAATAAAAACAAACAAATTTGGATATTA--TTCCATTCAACGTATTAATTA-GCATAC-ATCATGATGTAAATAA-TTATGAATATAATTAAATTGAATTGAGTTCAAATTTAAATTACTTTTTC---ATACTTAGTATTAAAAGAAGAGCAGATAAAACTTGTTACAAACGCCTATGAAACGCAAATATATAGTTCTTGCAATTAACCCATAATTATAAAATAGTACATT---TCAAACCGAAA---GTAGAGATTGTTATATTCCACTCGATGAAAAGCTTCACAAAATATAAAGTAAATGAAAAAATCAATAATTTGTATGAGCAACAAACTTTGTTCAAAAGTTTTGTGTTACAATATTTGAACAAAGAACAAATACAAAACAAAAAAAAAAAGACAAATATAAATATT---------------TAACTTAGTTCGCTCAAA--TATACACAAATATTCAATGCCGTTAAAAGTTCTTGTTCGGAGTTGAGCTTTGTAAATACTTAATAGCTTAAGTATAATTA---AAAATATTAAAGACACACAAAAAAAAAAAACAAA
>CG13110 9350950 9351000|10285 chr2L 9350885 9351043 scaffold_3 5548328 5548466 + 263|65 118
GT-TGCTGTTGCCAT--TTTTGTCAGATTAAATACAGTTTTAAGCATTGCAATT
CTGCACCATTATCATTATTTTGTTACTCTAAAT------------------ATT
>Aldh 9391440 9391679|10337 chr2L 9389784 9392019 scaffold_7 420046 422210 - 90361|1671 1912
GAAGGACCAGATATTTCCTCCAAGAGGGAC-GCTTAATATGGTTCGCCCTACTTAGGTGCTCTAAATTCCGGCGATAATCTACATCTCTATAATGAACATAGTTTTAAATACATCTGTTTGATATACCTAACTACGGCCAGTTTTTGTATTTTTTCCATTCGGTTAGTTTTCTTTAAGTGTACATTTCTATCTAGTACATA-TGTAATGCAGCTATAAATCAGTGCAGGGACCTGGTCAAAC
--------ATGCATTTCCGTCGTGGAAAACTGGTCAATTTAGTCCGGC----------------AAATTGGAAATTGATTT---TCTCTAAGCTTAACGCGCACATTTACTCGTCAATTGGA-------------------TTGCTGTGTATTTTCCATTTGATCTATTTTTACTAACCATAAA-------AAAAAAAATACTGAAATATATTTGAAAATAATTGTATGTACT---TTTAAC
>Fbp2 9427766 9427836|10367 chr2L 9426928 9427832 scaffold_7 465666 466552 - 46854|848 914
ATGGCTTAGTTGAGCGATTATTTGTTAAATCATTTCAAAAAAAAAAATATATAAAAATATTAGGCCT
--GGCGT------------------------ACGTCAAAGAAAAACAAATAAATAAATATTTTGCCT
>Fbp2 9427766 9427836|10368 chr2L 9427833 9427994 scaffold_7 2572414 2572604 + -784|0 3
CCCA
TACA
>scat 9434916 9435341|10373 chr2L 9432864 9435354 scaffold_7 470543 473107 - 106423|2083 2584
GCATTCCGAAGTATTCCA--TATGGTTGCCGCGGAAATCCTCCGACCGCCCAGCCTAGTTCGTCTTCATTGTTTGTTATCCTTGTTTTATTT-ATACAATACCGATTGTCGCGTCCAGTTCAGTCTATCTTGTTTGCCGCTGTACATTGCTTGTACT---TTTATGTTCCGCCCTATAGCAAAAGGAAATTGGA----AATGTATCTCTTTTGTTGCGCACTTTT----------TTAACACTTAAGCTTAAAGTCGATGGAAGGCTTATGATTAAAGAATAGAAAATAATCAACAAATTTCAATG--CGTACAAATCAATGGCGGTAAACGATTCCCTTGTTCCTTTAGTA---------TTATTATCGTTAGCT--------GGATTTCTATTTGGAATA---TATATATTTTTTAATGTTT-----AATTTAATCAGA---------------TGACA-----ACCAA---------TAAATAAAGGAAATCCAAAATT
GCG--CGGTATTATTCCAATTGTGATGGATTTTTAAA--ATCCATTTAACAATCCAATGAAGTCTCTGTTGTTGTCCCCCATTGTCCCCCTTGAGTCCGTTCCGCTCTTTGTTTTTTATTTATGTAAGCCTATTT----TTGTATATTTCCAGTATGAAATTTGTGTTTGTTTTTA----------AATTTGTATAATAATGCAAATCCTTTGTT---CATTCTCTGACCTAGCATTAACAATTAAGCGAAAAGTC-----AAGACATTTGATTTAAGCCAAGTCCATAACTAATCAAATACAATGGCATTACATATAACACGGAATCTACGATTTCTTTATGTAGTTGGGAAAGGGCTCGAAATAATGTTTGGCTTGTCATAAGTACAAATATCTTAAATAGTCCAGCTACCTTTTCCTATTTTTATAAATTTAATGAAAATATTCGGACTGCCTTGACAAATTTAACAAATTTGTTTCTAAATAAAAGAACTGCAGATCT
>numb 9462279 9463293|10406 chr2L 9461670 9462521 scaffold_7 2466798 2467705 + 27425|666 946
GCAGCGATT--GCGGGGTCACCAGGGG---------------GACAAAGTGTGGTTCGCTTGAAAAAAACGTAACTTAGTTTAAAGTTCAGGGGCAGGATCGGGCCAAACAGAGAATCGAACAAAGATGGTTAGATGGATGGCTGGATCGGATGGAGGT----------------TATCAGAGATACTTAACGCAAACATAACTAATGTTGAATATGCATATATAGAAAACATAAACT-----ACAGTTACTCACACGCAAAACGCATCAAGTACAGTAAA
GCAGTGCTTCAGCGAGGGGACGACGGGCTGGGCACGAGGCGATCCAAAGTGTGGTTCACTTG--AAAAACGTAACTTAGTGTAATGT-----GGCA-GACAGCACAGAGCGTTAGATAGATTAAAGATAAATAGAAAGATAA-------AGATAAAGATAAATATACTGCTATTCGATTCCAGGTACTTAACGCAAACAAAACAATTGTTGAA-ATATACTATTAAAGTACATTAACGGCTAAACCGTTCAATTTACGC--TACGCATAAAGTAAAGTTAA
>numb 9462279 9463293|10407 chr2L 9462765 9463144 scaffold_7 2467803 2468294 + 4664|0 516
CACTCAACAATTGACCAAGCTACCAAGTTACCCACGAAAGTCCACCATA-AAGTAAACAACAA-AACAAAAACAAATGGCACCCTC---TAAGCTTAA-------------------------ATGCAAACTCTGTATT-----------------ATACTTTGGTAATGC-------------------------CCTTCCACTACTTGTTGATTGATCCCACTAAGAATAATGAT------------------------------TAGATACATAAATATGTATGTTGATATATAGGAAGCTCTATGT---------------------------CATAGAGCCGATTATTATTTTATCAGTGTCAGTTTTGCGGTACACCGTTTTTATA-----TCAAATCTTTTATTATTTAACTTAATT---TTTAAATCTGTACAAAATGTATTATACTTAAATTATAAATATAATTTAAAAATAAACAAAACGGAAACGTAAAAACTTCAAGTTATTTAA
CACGCCGAATTAGACCAATTTACCAGGTTACCCAC--AAGACCACCTTAGAAAAAAACAACAGCAAGAACAACGAGTGCACTTCTCCATTATGCTTAGTATTTACCTACACACATGCACCTGCATGCA---CCTGCATTCACCTGCATGCACATTCATATGTGGTTAATGTTTATAACTGTTATTCTTGGATGCAGCCTTCCACAACTTCTTGATCGATGACATTCGAGAAATTCACATATACATATGCTGACTACCATACATATCGTACATACATACATACATATATATATATATAATAAAGCTTGTGTATATGTATATCAATTATTCAATATATGTATGCCGAGGGCCAATGTTTTGTC--TGTCACTTTTGATTTACG-CGTCTCTATAAATATGTCAATTTTTTTTAATTTAATTTAAATTAATTTTAAATTGTAC-AAATGTATTATACTTAAATTATAATATTAATTTAACAAAA----------------ATAAACTTCAAGTTAATTCA
>numb 9462279 9463293|10408 chr2L 9463145 9463397 scaffold_4 2510980 2511254 + 407|0 165
ACATAGAAAT---CAAGCAGCTAAACGCA---ATGCAACTAA---GACGATATAGAAATATTGAAATAAATAAAGTTATATAGAA---ACATAT----TGCATATATTATAAAAGACGAAGCCAAATTCGGCAAACAGAAATACA-TTCGATTTGTGCGCTTCTGA
AAGAAAAAATAAACAATCAATGGATCACATACATATGTTTTATCTGAAAAGATGACAAAACTAAAAAAAATAATGGCAAACAAAACTCACAAATCATGTGCAAATATCA-AACATAATATACCATCTTATACATATAGATATTTAATTTTTTTTTTTTGTTGCTAA
>CG33298 9519755 9520714|10457 chr2L 9515989 9519976 scaffold_7 3406684 3410711 - 162491|3917 4174
CAACGATTACCTGATTAAGCGCCAAAATGCAATTCTTCGGCTATCTCAGCGGCAACTAAAATAAGGAAGACG------ACTAGCAACCCCCAAAACTTGTACACATGTGCTTTCGCTCTTAATATGTGGCC-TTCGACACCGATT-------------------------ATTGATAATATT----GCGTTAGTTTAGTTAATCCACTTATCTTAAAAGTACTTAGTAAGCAATTCAAATAATTTGTTTAGCGAATGA
CCTCGATTACCTGATCCAGCGTTAAC--------------------------CAGCAAAAGTGTCAGAAACGTCACTCACTACAAACC-----AACCGTTACCCATGTACTTTAAGTTTAAATATGTGGCCTTTCGACACCGATTAGTATAACTTAAAATAGACAGTTTCATTGACAAACTTCAACACTTTCGTTTATGAAACTCAATGATTATAGCTATATTTAGT-AGAAATTTAAATAGCATGATTGCCGACTAA
>CG33298 9519755 9520714|10458 chr2L 9520014 9520832 scaffold_7 3410734 3411585 - 9700|0 804
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ATTTTAGTTCGAGTTTTGGCTTCAAATTGAATCGGATCAATGTACCACTAAAGTAATATGCATGTAGTCGTTCATGAATATTTATTTGTATATAAGTAGAGATTTAATTTACGTATATATTTAGTGCACATAGCCACGTTACATGGCGTAATTCTAAAAGTAACAACGCAACTCTTATTAAACATAACTGATTAAAATAATACCACGTTGATTTATATGTTTGCATGCAATGCATATGGATTAATTAAGCGTCTTTTACGCATATTTATGTACTATATACCACAAAAGAGAGACGAAATCTTTTAATACTGGACAATTCAAACATTACCGAACTTCAATGTTCGATGTTCGA-GAAAAGGCTGTGATTCTACACTCATGAGAAATATATTTATACATAAGAGAC----------------ACCAATTTACATTA---TTTAGTTTCATTATTTCAAGTATTACGAAAACAAATT-----------GTTTTTACTTTGTTGCATAATCGAATCAATCTTTTATACTTTCCTTTCAAAAAAAATCAAT---------------TTAGTTAATATAATCGTATAGCTGTTCTAAACATTTTACCTTAATTATATGTATATCGTTTTGATAGAGAATCGTATAACAACAATTAAAACTACAAT--AACATTG--------TGTTAA-------------AAAGAAAAAAAAT--TTAGCTGAATATATACATTGTTGAAAAGCAAAATAGAATAAAAACAAAACTTTTAAAAAATAAATGTATATTTAC---TAAAAAAAATACCAAAC
>CG31883 9529515 9529648|10473 chr2L 9529519 9529725 scaffold_14 1637486 1637711 - 2582|0 160
AGAAAATGACTTTA---AAGTGTAACTTAAATGAATGAAAAACATTAACTTTAAAAAATGACTTTAAAGTGTAACTTAAATGAATGAAAAATATT---AAAACATTGTTGATGT-------------------------AATGCTTTTAAAATTTGTTTAG
AAAAAATATCTATATATAAATATAGCCTAAA--AATGAAGAATATGAAGAGCAAAAGCTGACTTTAGATTAGAATATTAATAAATGGAAAATGTTTTAAGAACTTATTTGCCGTTTTTTTTTTTGGTTTGCTTAAAGAGAATGTTAATAAGTGTTTTTTAA
>Oatp30B 9538655 9540045|10484 chr2L 9535959 9539030 scaffold_6 5763142 5766354 - 129176|2894 3332
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CGTAGCAATCTCTCCAATGTCTCACATAGCTTTAAGCTGA----TTCGGTTTGTAACAGCAGCAGAAGCCTATATAAACACATTCCAGGCGTGTGCGTGCGTGCAACCAAACCCTTGTCC---GACTATAT------------TATTTCCTTATAAGTTGTAAC------CAGCTGCTTTACATGTACTTACAACCAAGTGTTCAATTGTACTTTCCTCATAGTGAACAAC--AAACGAAAAATAATGTTTTTTATACAATATTTAAACTG-GTTCACACCGAAGTTC-ACACAGTT--GGAGCATTGCA-ACAATATTTATATATATATATGCATATATATATATATATATATATATATAGTTTATTTATTGTGTAAGCATACTGTAGGAACATATTGTAGTGTTAGCTCCTTGTGATAGGCATATTTTATATTGTAT
>Oatp30B 9538655 9540045|10485 chr2L 9539109 9540107 scaffold_6 5766672 5767810 - 7151|0 1151
ACTTTATGCAATCTCGGTTTCGAAGTTTAACGATTGACTGAGAATCAGT--------TGGCGAAAGAAAAGA----GAAACGAATAGC-GAATTACAATGTT---TTAATAATCCGAACAT-TTAACCATTGTCAATGGAAATTGTGCTGTGAAACAATTTGTGAGTATAGAAAACAAAAATTA-----ACGAAA---ACGTTGAA------TTAGAAAGAAAGTGAAAATACGCTGAATGTAATTCTTATGCAA----------ATACAT------------CATTTAGAGAATCTTTGT--GGACAAAATAGCGA---TGGGTTCGAATGAAGAATAGGTCTGGAATAGTTTTATGAAAAA-------TCCTAAATTCCCTGTTTTAATGGTAGCGAGAAAATCAAGTGTCTAGCCTAGATTTTAAAACCGAATGATGTACTTTAAATGCGATAATGCCTTAAAAATATCAATTAAATATACAC----------------------------------------------------------------------------GCGGATAATATCAGTATCTCAACTGAAATGGGAATTCA-------ATCGATCCATCCGGTTGTTTTCCTACGCACTGCCCGAGTG-----CAAGACCCCCAGTAGTCCTAAGTGATGCAATC-------------TAGGTTAATTAGTAGCAACTATTTCTATGTTTACAC--------------------CAACCAGCCACATACAGTAGGAAAGGAGGCAGAGAGGAGCTCCTCGAGCACTAAATAGATACATCCATA----TAAGAAATATATGTATACAATTGTACGTTAATAAGTACCTACGCGTAGCTAATAATTCGTATCGGGATATGTGTTTGTACA---ACATAACTTATACATTATTGAAGAGCGATTTTAAAACGGAC-TACAGAAA------------------GTGAGTCTTAGGTGCAAA-AGATCATATATATATATATCATATATATGTTTACTCAAAAAGTGTGTTTTAAGGAATACATATTTTTACTTAGAGAAA-TATTGCAAATAAACTAATAAGGACATGTATGAAATGAAAACAATGAGACTCCTAAAATGAAAAACAAA-ATAAACC
ACTTAGTGCAATCTCGGTTTCGAAATGCAA-AATTTATTATGTATAAACAATAACAACAACAACAGAAAAGATGTAAAAACAAATAAAAGGAATACGCAGCTGAACTAACAATATCAATATATTAACAATTGTCAATGGAAATTGTGCTGTGAAATAATGTGTGAGAAAAAAAAGAAGGAATTATAATAACGAAACGAATGTTAAAAAAATTGCAATAATAGAATATAACAAAGCTAAATGAATTTCTATTGCAATCTCTATTTTATGTATGTTGTGCAAAAATATATAAGGAACTCATATCAGAGCCAAATGGCAAAAGTTGGCTCGACTCTCACACAGA-----AGGAGTATTTTGAAAAGAACGAATTCCTTACTTTCCTGTTTT------AGCATAACAATGAAG--------CCACATTTTAATACAAAGTGTCGTACTTTAA--GCGATAATGCCTTAAATATATCAATTAAATATACACAAAATGGAAATGCGTATGCATTTTAGTTAGCAAGTAACTACTTAAGCCCTACTAAGTGTCTGTTGATTAAGTAAATGTAGTTAGTATCTGTTGGATACGTGTAATACAGTTGCATCTGTTTATTGAAGGATTGTCTAGCTTTCGCGATTATTCCACGTGTGATTTCTAATGTTCGATGTAGCGCAATTTGTCGTATTCAATTATTTTCAAATAGATGTATTTACAAAAACCGTTCCGGTGCGTATGCTATAACTTGTATTTAGATAACAACTAAGCATATATCTTAAGTTTACAGCAACAAGTCACATACT--AACATGCAACAATAATAACAATAACAACAACAACAACAAATCGAGCACTCCCTGGCAATGAGCACGTGCTCCACTCCAATA-----------GATATGCAATTATACACTGAAATGATCTGTACAATAT--AAATGGATTTTAAAAACAGACACACACAAACGCACACAGTTTAGCTGCGTGACTATTAGGTGCGACTAAATTAAACATGAA----------AGATATTTA----------GGATTTTAAGAAATGCATATTTTTATTTAGTGAAAATATTGTA--TAACTAAACAA-------TATGAAATGAAAACA-TGAGACTAC----------AACAGATATAAATA
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AGGAATAGAAAGTGTATCGGAAAGTCACTAATCCTTAACTAGGGATAGGATAAGTTTAGTTAGAAGCTTAAGGGGGATCTGAAGC
---AACAGA--------------------AATCCTTAAATCTAAATATAAGAAGTATAGTTAGGTATTCCAGAAATGGTTGATGC
>CG3838 9572966 9573572|10523 chr2L 9573454 9573612 scaffold_7 4042230 4042390 + 2586|0 121
CTAAACTATAGAATCTGTGTACAAATGAATTTCCGTTTGAG--TAAACAAAGAGGGATAAAGAGATAGATCGATATCAAACTGCTGTGTGTAATAATAAACAAATGAAAGTATGGAAA-ATT
CTAGGCTATAAGATTGATGTACAAAATCGTTGCAGATTAGACTTAGGCAATCAGGAGCTAGCAATTTCTAAGCTCACAAACAATCGTGTCAAAGAAT---TAAATGAATGTATGAAAATATT
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ATAGTAC------------------------TTACTCATAGTTCTTAG--------ACCCAGGTTATGTT-----TAGTTTTGAAATCTTAATTTCAAT------GTGTAGCATTGCGTAGCGTTCTTATTGTTTTTTTGGCTAAATATATTAT-AAAAATGTTGATTTGTAA
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GCGCAAACGCAATAACAAATAAACCCACATGCCTCTTCAAATGGATTGTCCCCGCGACCACAAAAAGACAATTCGCTTAGGTGTATCAATGAGTTTTCTTCATACCATTTAGTTAATT-ATGTATTCCATAAGTGCAACGTT
>Trx-2 9615682 9616048|10570 chr2L 9615878 9616608 scaffold_7 4098430 4099183 + -1247|0 186
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AAACGAAAAAATGAGATACAAAAGTGGCTTTAAATGTAACTAAAGTAAAATGTTTGCCTAATTTACTAGCTAGTTAAGACGGGTTCTTTTTGTAACGCAAACTTATTGTAAACGT-TTCACAGCAAACAG---AAGTAAAT---CAAATAAATAAATGTAAAACAAATTCTCCTCCTTGTTTTTTCG
>GlcAT-S 9622428 9623115|10579 chr2L 9621937 9622786 scaffold_7 4107279 4108132 + 19577|506 899
GTCCTATGGTCCAACCCGAATAATACTTATAGACTTTTAGAGCTAAATG-TATAGTTATTCTAAAACAAATCTCG--AATCCACTGCTCGCTGTATTTCC----ATGGAATTTTCCTG--TTCTAGTTATCAGTCGTTTTCGTACTGCACAA---------------TTATATTTTTTTTTTCACAAATTATTGCG--TGGGTGCTGCCTCTCTGTTCTAGATTCTCATAATGA----AAAGTTAA---TAAATTATGCATGTATTGTTAATTAGTTGTAGATAAGTTTGTTCGTGATAGCAATATAGGAAACACAGGGACGGCTACAAAGATAGGTCTTATTTATTTATATCATAATCGCTGACAG--TAGGTTGTAAAAGCAGCTAGGAATG
GTC-------TCAGTTCGAATGAAGGCTA---ACTATTCAACCGTCGTACTATAG-AAGTCTAAGAATACTCCTGACAAAACACGATATGTTGGATTTCCTTAAATGGAAACTCTAGAGTTTCTGATCATC--------TCAAAAGGCACAAGTTATGAAAACTTGTTTTAAATCTTTTTTGCATATTAAATTGTGATTAATTACAATATGCCTATCCGCAGTTCTCATATTTATATTAATGTTAAATGCGAATTGTAGTAACATTGTTAATTAGTTTTAATTA--TTCGTATATGTTTGTGTTGT------------------------GATAAG-CTCGCTTATGTTTATCAAAATTCCTTATAGACTACGTCATTTAACCATATAAGAAGG
>GlcAT-S 9622428 9623115|10580 chr2L 9623008 9623415 scaffold_7 4109078 4109525 + 1490|0 110
TTTTAATGTAAACTTTATGTATACTCTGTAAATCAGTCAATAAGATAGTG---AGTCATAATGTAAAAGAATTAAACGCTAGTTTTATGAAGCTTTCCCAAATGGAATGAA
TTTAAATCTTAACGTTTTTATAATTCAGTGAAATATCCACATAGATTGCTTATGGTCATAA-ATCAAGAAATTAGAAATTTATTTCATT--GTTGATACAAAAAAAATATG
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TTTATAGTCCGCCACAATTAGTTAGCTAGTTC--AGTTATGTCCGTGCAGAATTTAAGGTTTTTCTAATGCATAACCGACAGGCATATTTTGTAAAAATAAATCAAACCATATATAAA
TTTTTATT------TGATTAGATAATTAATTTTACGCTATTTTGGGGCAAAAGGTAGTTTTTGTCAAATAACTCAACAAC------ATTTTGTAAAAATAAATAATATAATGCTGAAA
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TAACCCTTTAGATTTAA--GTGAACATTCGTACAAAGTGGTAATTTCAAATTGAAATTTTGAATAAACATGTGTATTCTT
G-----TTAAGAGGTGACTCTGTAAATGCGTACAAATCTGTAAACT-------GTATCATTAATAAAAAAGTGTATTTTT
>hoip 9700381 9700465|10657 chr2L 9700459 9700707 scaffold_4 2556940 2557181 + 350|0 6
TAATGCA
CAATATA
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GGAC-TATATCCTAAAGATCCCATAGCATTTTATTTCAAACGATTTATCGAACTTGCCCGAGAACAAAAGCGGAGAATGCGACACTCGTGCAGCTGTTTCTAAAAACTTACAAACAAATGAAAAGAAAAAAAAACCGAAAAACATATAAATATAGAGTAATAGGTACTACTTATGACAGACTTGGACTGTGTCAGGGCATATACAATATACG-----AGTACTA--TATATAC---ATATACAAAACTTAGGTT
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ACAGCGAGTGATTAGTGCTTTAAAGTGTGCTCATGATTGCGATTACCAGTCTTAGTTTCTGTGAAATTTTGAGCTCAACTTAAGAGGACTACGTCCGCATTCAAGTATTAGCTACTGCCCAAAGATCGATAATCGAAATAAACCCGAAATTAGTC
CCAAC--------------------------CATGGTGAAGAC--ATAGGTTTCACTTCGGTGTACTTTACAGAGAAAAATAGAA--------TTTGCATCCAAGTATTAGCCTTAGCCAAAGAACCAA------AGATAAACCTAATATTATTC
>CG13117 9737043 9737333|10691 chr2L 9736492 9737125 scaffold_14 1218170 1218770 + 11865|587 669
GCTGCTCTTCCAGTCCCAATCCGAGTTCCAATCCCGAAAACCAAACGAAGGGAGGCCTAATCGATTAACCCATTAAGTGGCAA
TCAGCGCTTCATATATATATATATATATGCATACATATA--TATACATAAACATACGTTATAAATTAACCCATTGTGTGCCAA
>zf30C 9762142 9762377|10722 chr2L 9761707 9762208 scaffold_14 1252823 1253321 + 30862|435 507
CTTCGGAACACATTCATTTAGCGATCCCACTC------AATAAAGATTCTTTTGTAAACGGATGCGTATTCTA
TTTAGG---------TTCTAGCGGTAACACTTTAAACGAATAAAGACGCTTTTGTATATTGACTAAATTTTTA
>zf30C 9762142 9762377|10723 chr2L 9762209 9762475 scaffold_0 5315282 5315583 - -669|0 207
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TGATAAAAGAACTGAGATTTCGCTTTCTCGATCGATTCGAGGCGAAGAGAACGAAAGGTCTGAACCCAATTGACTGACTTACAAAACAAAAATGTTAAATTATCATAAATTAACCAAAATTTAAAACGATTAATAGCTTAGATATTTATTTTTGAAAATGGTGAAGGGTACTTATTTTCTAAAATTATAGTTTACCTAAGAAAATCTT
>und 9765198 9765358|10724 chr2L 9762488 9765574 scaffold_14 1253322 1256445 + 112970|2858 3052
TGGGATGAGGA-ACTGGACAGTGACCGATTT--TCGGCG----ATGTATGGCTTGCATTATA-----------TACGGTTT--TTGATATAAGTTCATTCTATTGTTGATTTTTTGT--------GAGCATGCGCCAACCGAATTATATATACAATGT-ATTATGCTCAG-----AATATAAGCGGAGTGAGATT
AATCATGAATATATCGGAACATGAAACGTTTAAACGGCATTACATTTGTAGCATGCATTACATTAACATTAACTACAGTTTAATTTCTATAAGTTCATGCGATTGTTGAATTTTTGTGTGTGAGAGAGTAAGCGTAAAGCGATTTCAATATACTGTGCAATTGTGTTAAGCAATTCACATAAGCGAACACATATT
>CG4017 9768401 9768729|10728 chr2L 9768346 9768695 scaffold_14 1263475 1263766 + -911|55 357
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--------------GATATTTTGATTAAAAATTTGCGCATTAAACGATTCACAAAGTTTTTCAATAGATTTAATCTCGTTCTCTATTGAT---ATAGTTAAAT---ACAGGTCGAAAAGTGAGAAAGTA----------TACAAATTCAAAGGCCGTGACAATGCTGAAGCCAAGTATAA--GACCTAGCAGGCCGCCAAATGATGCTGCAGATTGTAAAGCCAAAGGA------AACGTTTTTAAATAAACAAAGGATCGAGGTTTTAA-------TTAATG-TGAACTCACCCAGTGCCGA
>CG17633 9770377 9770415|10729 chr2L 9768912 9770425 scaffold_14 1262047 1263574 + 70268|1495 1539
------GCGACACTAATAAAGTACTCACAGCTTTTCGGCATAACT
AAATTTGCG----CATTAAACGATTCACAAAGTTTTTCAATAGAT
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TGGATAGACACGGATCGAT-----TGCACCGGCAGCTGGATCTGCA---CCAAAAGACTGATC--ACCCAAGCTCCATTTGTACAGATAGAAAGTTAGATAAGAGAAGAGGATTCACCGCATCG---CCCGGGCTGAGCTCCACCCTATATTAACTCCTTGTTCCATATTGG----AAATATCGGGATTCAGCTCGG-----TTAGAAAGTTTAAGAGTAGCTGAA----------------------------------AAAAAAAATTACGATTAGTATTGATCAACAAGCAGCATTTGTTTGATTG-AAACAGGTTTAA----ACTAAGTATT-TGTGCAAAGCAATCCAAATCAGAACACAAAAAATAAAATATCTTAAGAAA
GCTCCATACAAGGATCCATAATTGCCCACAGCCACGCCCACCTACAGGCACATAAGACTGATTTGCACCACGTCCCATTTATA-ATTTGTACAGTGAG-CAAAAGTAGAAAA-TCATTGCATCAAACCCTGCATCATGCGACGCTTTTGACTA------TTTTCCACATTGGAAGCAAACACTAAGCGCCAGACCAGGACTTGTAGAGAATATATATGTATATATATATATATATATATATATACACCTATACTATATGTATAAAAACAAACGATTAGTATTGAGCACCAAGCAGCATTTGTTTGATTGAAAACAGGTTTAACTTGATTAAGTATTAAGTTTAAGAAAGCGTAAAACAAAATGTACCCAATGTGAATTTGTACGCAA
>CG4036 9791945 9791958|10753 chr2L 9791747 9796055 scaffold_14 1289511 1293801 + 78044|198 241
CAAAC------------------------------AAGACCAAT
CAAACTGAATGCAGATTGGAAAATGTGCAGAGATGCAAATCTGT
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TTAAAATATTCCGCA--TATATTTTGCCACTTTCG-----GCACCACCAGCTCGAATGCAACTGTGGCACCTTGTGGCGTTGCAACTGCGCTGAAATTGCATATATTTTCTATAAATTATATTTCACAGCAGCAAGCGGCAAAAGTGG------GCTAAGAAAATGTTTCGACAAACTTTGCATTCTC-----AT
TTAAAGTTTCCGTCAGCCACCTTCTGGAACTGTCGAAGCTGTGCAACAAACTTGTCTTGAATTATTGCCCAAAG----GTAGCAACTGC-----AACTGTATAAATT--CTATAAATTATATTATGCAACTGAGGGTGGCAACTCTGGCAACTAGGTAAACAAATGCT---GCAAAGTTATTATTTTTTGGCTGC
>FKBP59 9889991 9890120|10877 chr2L 9889859 9897361 scaffold_6 191565 198853 + 215155|132 324
TTCAGATCGACT-------------AGTGC----TTTAAGAAATATTCC----------CTAGGGTTTATAATCCCACATC--GAAAATCCAGTAATGTAATGAAGAAA-----------TGGTCTTAATGCTTATACGAAATA-----------------------AATATAAACGCTTTGAGAGCTATGTA
TTTATATGCACTCAGCTTGCGGCCCAATGCGCTATTTATGATACATACCAATATTATTATTAATGCTTGTAACCCCAAATTATGGAAAT---GAATGGTAATGAAAATAAATATATCTTGTATTCCTTAGATTTGTATCATATACGTTTACAATTAGCATTGGACGTATTATCACAGCTTACACAGTT-TATT
>Bka 9896041 9896106|10877 chr2L 9889859 9897361 scaffold_6 191565 198853 + 215155|6574 6639
ACCTTTTTTACTTCTTATCCTAAGTGTACATTTTTAAATATATTCTTACATGTAAGCAGCAAGCAA
TCCAAGTTATAAAGATATCTTACATCTATTATTTGTAATGTTTTTTAATATATAAGCATTAAGAAA
>Srp54 9914590 9915044|10891 chr2L 9912921 9915807 scaffold_6 210502 213486 + 101668|1720 2219
ACCTAGA--GAGATTGCATACTA---------CTTTATAATAAATACAGA--ACTTAAGCAACCCCGTCTCCAGTACAACCCGACACCCATTGTCCTCAA-TGAGATTTGTATTTCACTCAACTCTGTCATAGTTTTCAAGTATAAAGTCTAATTAAAACTGAAGCATTTTC----------TTTCGTAATGAAAAAAATAGTACATACAAATATGAATGATATCGGTATCATAGCAGTACAATTTTTTTTAATTTTTTGCCAAGTACGG-----ATTGTTTATTTGGAAACTATAACAATCTTATTGTCTTCTTATTAGGAAAACCCAATACAAATGCAAGTTAAATTAATAAAAAACTTTCTAATGAAGACCAAC--TTTAAAACATTGTATGAT---------CAACATTTTGTAAGGAGTACTTAAGTATGCAAAATT-----GCTTTGATAAATATACATTAAGAACGCATTAAAGAGACTTGTATTTAAAAACT
AGATGGAACAAGATCCTATAATATGAAAATACTTTGATAAGAAATACAAATCAATTAAAAACTAACATTACTTTTGCTATTTAATCAATATCAATGCCAATTTCTATTTGTATTGCGCTC--CTCTGTCCTAG-TTCCAAGTATAAAGTTTAATTCAAAGTCCAGCATTTACACATGTATGTTTATTTAAGTAAAAATATTCAATATACAACTCTAGCCTAAGT---TAACACAAGTTTGCGA--CTCTTTATTTCAGGGCCAAAAATGGGGAGAGCTATTCCGATAAAAATTGTGAAAATTTAA----------GGTGTGAGCACTCACAAAGAACCCAAA----------AAAAAGCTTTCTAGCGTTTGTCACCCATTTCTCACATTTCTAGGTGAAATTCGCCAAAGCTCCGGATGCCGCACAAACAAATCGCAAATTTATCAGCTTAAAGAGATAAAAAATAAT--CGAATT--GTTAACTTGAAGCT-GACCTT
>yip2 9917122 9917221|10892 chr2L 9916027 9920033 scaffold_6 213542 217485 + 149035|1179 1287
TCCTACAGCTTAATGTAATAGGTGCCCTGCATTTACACTTAAATTAGTGCTGAAAATTCCGTTTTAAAAATACCCCGA---------TAGCAATAAAGAAATTATTTT-
---------TTGAGGCGAAGCCAGTTCTGCATTTACGATAAGATTAG------ATGTTTTGATTGAAATATATATAAACTTAAGGACTGATTATAAATAGTTTGTTTTT
>CG4598 9919847 9919967|10892 chr2L 9916027 9920033 scaffold_6 213542 217485 + 149035|4023 4143
TGATTTTAAACGTTTTTATATAGTAATAAAGTTGTTTTGAACCCATTTTATAACGAATTCATAAAACATTTTCTTATTCTACAAATATAATCTTATTCTATAAATATTGATTGAATAACAT
TGCCTTTGAATTTGTAGCTATTCTCATATAATGTTTTTATACACACAATATA-------TATTAAATATGTATATATGC--CATTTAAAAGTTGTATCTGTAAATTTGTATTGGGC----T
>CG4594 9921322 9921470|10893 chr2L 9920422 9921459 scaffold_6 217718 218743 + 16990|916 1058
TACACCTAACTT-----TGTAATTTGTAATGTTGATCTTTTTACGTGCATTTAAACTGGAACTATTCGTCCAAAGTCCCTTAATTTGTTAATTTAAAAAATTGTTTATATGTTAACCTAAAAATAAATAAAATTCCTGATGAT
TGAACTTATATTTCTACTGAAACTTACTGTGTTAATCT------GTGCATTTACAAGGG----------TTAGGGTTTGTTAGTTTT----TGTAAGAAAATCCTTTTATATT--CCTTTTAAATATTAAATTTGTTAGTGAT
>CG4592 9922728 9922752|10894 chr2L 9921528 9922776 scaffold_6 217494 218662 + 21598|1232 1256
CGGACTGTTATAGGAATGTGATCAA
TGAACTTATAT---------TTCTA
>CG4619 9940737 9941311|10911 chr2L 9937074 9941643 scaffold_7 1795919 1800541 - 144252|3950 4537
ATTGTGTGATATAATATGGGGCCATATCGGCCTTCTAGGCTAGTTACAAATCGTAGCTTTATTTAAC-AGTGTTTTATGTACTTGTACATATTATTTAAATATTAATAGCACTAAACATAATGGTCAACAATTAATGTATAATACAAGGAATGGGCTACAGGTGTGTCTCCC------CCAGCTGTCCTATCGGATCGACTTGATCTTGGCCTTCAGCACCACGTAGGACACAAATCGGAAAACCAGGATCATGACTCCCAGCGCGATCACATCGTTCCAGAACTGATCACCCCTCATGGTGATTTCCTCTAAGAATTTCTTTGGATACCTATAAACACAAAGCAGAGTTAG------CGCTTGAGAAAAAGAAAAGTTAGCAGAATCTAATTACCTGTAATGGCAGTACGGCGCCTCCTCGCAGGCCAAGGTACCTCGATCCAAGCCATAAATGGCTGATATGAAGCCCTCAAGTCCATATCTTAAGTATGATATGTGACTGCCCCACCTTAAGTAGCTTGGCAGATCACGCAGGGTCACTCCAAAGCCGGCGAACATCATCATGGGAATCGTTAGCACTGGGGCCA
AACGTGTGATATA----GAGTCTATATGA-----------------------ATAGCTTTAATTAACAAGTTTTTAATGTA---------ATTAATTTAGTAAAAATAACACTAAACGTAATGTTCAACATTTTATGTATAATACAAGGGG------GCAAGTTTATTCCTCGGAAAATCAACGCTC--ATCTGATCGACTTGATCTTTGCTTTAAGCACAATATAGGCACCCAGCCGGAAAAGAAACGTCATAGCGCACAGTGCTATTATATCTGTCCAGAACTTATCGCCAGACATAGTGATCTCCTCCAGAAACTTCTTTGGATATCTGCAAA-ACAAAAGAGCATCAATAAATCTGTTTCAAGATTCATAAATTCAG------CCAATTACCTATAGTGGCAGTAGGGCGCCTCGTTGCACTCCAGAACGCCACGGTCCAGTCCATAGATGGCAGCTATGAAGCCCTCAAGGCCGTAGCGCAAATGGGATATGTTACTGCCCCACTTCAGGTAACTGGGCAGATCGCGCAGTGTGACGCCAAAGCCGGCAAACATCATCATGGGTATAGTCAGCACCGGTGCCA
>CG4709 9956177 9956179|10922 chr2L 9952086 9959173 scaffold_7 1814701 1822040 - 218988|4280 4282
TAA
TTA
>CG4658 9959721 9960170|10924 chr2L 9959427 9960162 scaffold_7 1822250 1823073 - 18463|314 862
TCGCGAC------TGCT----------GCGCATATATGTATTCTAAAAGCAATGGATG--------------GGGAATGCCATTCGAAATGAGGGGCATGCCACATTGAAATTTACTGGGATTTGCTA--TAGTTATGCACTCGCAGCACGAGAAGTAAT-----CACTGGACTGAATTTGTTTTTAA---TTGATGTTGATTGAT------ATTCGGTTTACTTGTTTTTCTTTCTATTATCAGTGTTTAGTACTCGATTTGATTTATG---------TATGT-TCGTAACGAGAATTCCGTGA------------ATGCCTTTAAATGTA--------CTTCGGTCTACT---------TGTGTATCCATGTATATGTCACACATTGTC--TTCGTTTTCGTCAACTTTT----------TCCTTTAGGTCTTCTGT---TATGTTCCGTATCTTTGTTCAAAAATGTAAAAAAGCAAGTATTATGAAAAGACATAGGATT-------CGAAGTGCTTAAACAAATATTTCAATAAATGTTACAAAT
AAGCAACAATTATTGCTGTTGTTGTTGGTGCGTGTATTGATTC-GAAAGCAATTGGTGTGTGCCTTTAATTCGAGAACGCAATTAAAATTAACGAGGA--ATACTTTTAAAAACGATGATACTTATTAGTCATTCGTTCACACGCAGCGCGACAAGAGTTTGCTACCCTGGACTGAAATTGTTTTTTGATTTTTATGTTGTTTGATTAACGAATTTTGTTT-CATGTTTTCCTATGT-TCAACGGCAAATTGAAATCGATTTGATATATATTTTAACGTTATGTGTCGTAATGCCATTTTAATTATACTATTCGATTAGGCTTTTGCTTGTAGTTAAAAGCGTCGTCCTTGTCACCAGTTCTGTATTTTCTTTCATTTTTTTCTCTTCGTCCGCTTGTTTTTGTCAATTTTTAAATGTCAGGTAATTTAGTTTTTCTTTCTATTTCTTCTTTTTCTATTTGTTCTAATCTTAGAATGCAAGTATTATGAAAAGACAAAAAATTTTTTAAATAATAAACATAATCAAATGTTGCAAAAAAGGCTTTAAAT
>RpL13 9968422 9968495|10929 chr2L 9965751 9968510 scaffold_7 1829263 1832028 - 121936|2737 2814
ACCACATCTTAACCTGATCGTTCTGT---CTACAACATCAACCAGAATAAAATCTTAG-TTTTTCTTAAACGTGAATA
ACTGCATCTAGACCTGATAATTCTGTCAACAACAACAACAACCAGAATAAAGTTTTAGTTTTTTCATAAACGTGAATG
>bib 9994659 9995545|10951 chr2L 9992045 9995588 scaffold_7 1852270 1855612 - 89477|2687 3726
AAGCGGCTGTCATGGGGTCCGGTGACAACGCCGCCGCCAGGGATCCACGCC---CTCGCCCTCCAGCCCGGAGGCACCATGACCCTGCACCGCTGCAGCCTAGCCAAGCAGAGCAGTTTGTTTTAG-TCGTAGTCGTACGTAGTAGCATTCGGGCATCGCATCCAAAGGAAATGTACACAA-------------GTCTCAGCCCCATAT------------AGTCTAGCATAGTCCTAGTT--------------------------TAGATAGA------------------CGCAGCATAGCCACATTGTATTAAT--TGAGAGTCAACGCGACGAGGAACTCACACCTAGCAGCAGACAACGACGATGCGATCTAGCAAAGATCATGTACGCTTAAGGAACTAATAAGGGTTATCATTCACCGAAGGCTAGACTAAACGAGTGATCTAGATGATCTAGACTGAAAGACAGGTGCATTTAACTAAGCTACTTCCCTTAAGTTTTGTT--------CAACTCTTCCAA------TATTAATTTTGTCAAAAGAAACTTACCTTTTTTTAAAACAG-----CCTTTTGTTGCAACTCTTAT-----TTGTTTTGGCAAATCATTTGGTTATTCATGTTTCTTGTAAATGCAAAACTAGACTGAACTTACCTAAAGC---ATTTTGTACGTTATATTTCAAAGTTCATACATATATGTATATGTACTCTTCCCATTTTCCGCGGACATTCAA--AGATTTTCGTTTACTTTTCGATTTTAATTTGTAT------------------ATAGTCCATATAGACGT--------AAGCTATTCATGTAAATCTTACAACCCTAGGATCGGAAGTCGATACAAATATA-TGTATATGCTTACTTATTAAAATAGTTGTATTTTCTTAGTGATAAACCCGTTTGCTAATAGTTGT-----------------TAGAGCCTAAGAGAACAGCGCAAATATAT-TGTGTATCAAAATAAAGACAAGTTC----ATCCAAACAAAGAAA
AAGCGGCTCTCCTGGGGTCCCGTAACGACGCCGCCGCCAACAATACACGCCGCACTCGCGATCCATCCCGCCGGCACCATGACCCTGCACAGCTGCAGCCTAGCCAAGCAGAGCAGTTTGTTTTAGCTCACAGCTAACAACAACAGTTGTCCGG----GCATCCAAAGGAAATGTGCGCAAAGTCCTAGCATTTAGCTCAACCCAATACCCAACACGTTTAAGTGCAGTTTAGACTTATTTACCCTAGCTATATACACCTATATATATATATAGAAAGCCTAGAGATAACAATCGAAACATAGCCACAATGTATTAATAATGTACGTCAA-GTAAAACGGAACTCACACCTAGCAACAG-CAACAACAATAACCTTAAGTCACAATAGAATATACGTAACACCCGAATCCTAACTA-----AACCTAATACTATTCTATATCATGGAATAAGCGTATATA---------ACATATTC-TCTTACTAAAGTATACCCCGTACATTTAATTAGGTCTGACAAATTTCCAAGCATTTTTATTAATTTTGTTGTTTTAATTT----TTTTTTTAAATTCGTTAACCCTTTGCTTGGAAATTGTATATTTAATTTTTTGATAATGTATTTAAGTATTCGAATTTGCTTTAA---CAATTTT---TTTATTTAATATAAAGCTCAGTTTACAGCGTCACATTTGTAAAATCTCGACTATTTAAATGCCAAATTTTTAATTTTTTTCTAAAGCCTAAATTAAATTGTTTTATAGAATCACATATAAATTTGTATATACATAAATTCTGATGAATATTTAAAGTAAATGTTACTATTAACGATATTTATGTAAATGGTAGGCTAATATGCCTTAAAGTCGGCATATATATAGCATATATAGGTAA-TATACAAATAA--ATACATTACTCATGATAAATTCTATTTCTATTAATTGTAATACAATGTGTATTGATAACATTGAAAAAGAAAACTAAGATATATACTTATATAAAATACAAGAACTGTTCTGTAACCTAGATAAAAACA
>CG4747 10007767 10007941|10961 chr2L 10007536 10007953 scaffold_7 1869873 1870281 - 15410|239 415
CATTTAGTTAACACGACT-AACGTTTAAACTATGTTTTAT-CAATTAGTTTAAAGCGTACACCGAACAGAACGACAGAACCGACAAACGACTGACTTAAAAAAAAAAAACTAAACAGGACAGTAATAGAAACGCATAACCCTCACTTATTCACCCACCAATCCAAACTGACAGAGGC
CATTTAGTTAACACGACTCACCATTTAAACTATACTTTATACATTTAGTTTAAACCGTACACC----------ACAAGACAAACGAA-AACTGTCAACATACATATAAACTGA--CACACAGCAACACACACACACA---CACACACACACACACACACACACACACACACACATAC
>Trp1 10012494 10013171|10966 chr2L 10012393 10013344 scaffold_7 1882016 1882953 - 9654|101 873
TATGAAGAAACCACAAT--------------------ATATATATATATTATTATTTAATGATCCACATCTAGCTAATTGATAAGACATAGAACAAGAATCACACATCAAGTACATCAGCAAACACACACGATTCCAAGTACAGCGAATTATTGTCCCACAA---GAAATGCGATCGGTGTCGTTATTCTTTAT--TGAAGATTTCCTAATCTG---CTTTAAATTGAGCTTAGGTTTGAGGTTTTGCAATATTTTTTATTGTTGGATGTAGGCTTGCATATGAAACACAATATTTTTAAACGGAATATTATGTGAGACAAAGACATTT--GGTTATGCACCATGCAGTTGGACATCTTTTTTTCGCAAAAGTTCTTAAGCCGTTAAACAAACTACCTATATTTTACCTATTTGTATTCCTATGTTTGTAAATGTATACAGTGGAACGCA---------------------CTAGGCAG-GTGCAAGAAACGATTGCAATTGATAATAATCATAGCGA-------------GTACGTACGTAGATGTGAGCGCATACGTTTCTAT------------------------------GTGCATGAATATTTACTCTACATGTAATTAAAGCAAACTAACAACTTAATGAAATTAGTAGTGTAACACGCAATTAACTATTATATAAATAAAGCTAGGCAATTCTGATCTGATGTGAGAGATATTTGAGCGTTTTTTAGTTCTTGCTCGAACGTTTTATTAAAAAATATACAACATA
-GTGAAAAAAGTGAAACGAAAAACGAATTCATTGAAAATCGATGCTTACTGTATTTAAATGAACCACAT----CCAATTAGTAATAGAAATAGCAGCAATTA-ATATTGATTCCA--AACAGATTGATATATCAGATCTTTCCGCGCATTA-AGTCCAAAAATACAAAATTCAA--------ATTAATTTATGTGGTAAATACGTTTTGATTTGAATTTTCAAATTGTGCCT--------GAATTCACAACATTTCCTACCATAG----------TGCATA--------------CTTAGACAGA----TATATATGGCCTAAGCATTTCGGTTAATGCAGC-TGCAGTTGACTTTTGTTATTGCTAACAGAAAAGAAAGTTATGGCACA--------TTGTTTTGAACAGCAATATTATTGATTTTATAGAAAAATTGCGAGCAACTCAAAGTTCTGTTATGTTTTTATTTTAAACTGAGTGCGAGCAACAATTGCAATTGATAATAATGTTTATGATGTGCATGTGTTTGAATATACAAAAATATATACAAATATACTTATACATTAATATATATACACTTAACGTATATTAAGTGTACGATCATTAACTTTAAATGTAATTAAAGCAACATAGC-----ATTGAAATTAGTAGTGTAA---ACATCTAATTATTA---AAATAAAACTAGGCAATTCCGATATGA------------------------------------GAAATCTTGAAAAAAAAAAAAAAAACAAA
>CG13127 10028967 10029299|10985 chr2L 10029216 10029333 scaffold_7 1896465 1896597 - 1712|0 97
TACTTATGTAAACCAAACTATGTATAATCC--CAATTAAAAATGCTGATGCCC------------AACTAAAACGCCACGGACGGCAAATGAATAGCA
TACTCATCTAATCGAAATCAAACAGACACAAGCAATTAAATATGCAGATACCCTGCCAGCATGCGGACTAAAGTGAAAGAGACA--AAATAAAAGCTA
>CG4778 10038874 10038954|11000 chr2L 10038212 10039839 scaffold_7 1905080 1906675 - 47020|666 748
GCCTGATCCCCCCGACTGTGTTAGTCTTAAGTGAACCCCCCGCTGATTGTCGCCATTAAAAAGCGT--GCAGAAGGTGTACCT
GTCCAAT--TGTCGACTGT-TTAATCTTAAGTTTGCCTTTC-CTGATAACAAATAAAAGAAACATTTGACATATCATGTCCCC
>CG33302 10055873 10055935|11024 chr2L 10054836 10056262 scaffold_7 1918767 1920250 - 33818|1129 1199
A-------TTGGATTATGA-ACGGAAATATTGTTGAAATTAATAAGGAAATGAATAAAATACTTCGAGAAT
AAGTCCGCTTAGATTGTGATCCATATATTTTGTTGAGATTAAAA-------------------CCGTGTAT
>Pen 10059468 10060097|11027 chr2L 10057294 10060135 scaffold_7 1921561 1924452 - 92114|2229 3015
T-----CGCCCACCCCACACATTCCAAACTCCGCTCACACGCC-------------TTACAAACAACTACACCTTCGACCGCGCTCACACACTATGCCATTGTCAAACATACGCATACTCATCATCACATCTTACAAACATTCCCAAACACTTTGGAGGTATGCATGGAAACACAGGCGAATGCATTAGCTTAAAGTCATAATTGAATCGGGTTGGCAAAATCCACTCGCATGAATCCCCATTTAACATACCCGTATT-CCTCGCGTTAGACTAGACTTCACAGATTGCAGCATGGAT-CTTTCTGGCAGTGTTCCTCGTT----------------------------------CACGATGCAACCGCTCGGG---------------------------CAGCTGCGCTGGCTGGGATCCG----------------TGGATCATAGTAT-----TTCCAGAATCCGTCTGTACAGGGGGCA---CCTTATG------TTTGCGTGTACTAGGCTTTTTATTG-GATACGTTTCGAGCTCATTTCGGATATA-------TTTTAGGCTGTTTAGTATTTATTTATGTAT--ACAGGAAACGCTTTT-----AATCCTCCACC------------TTCGCGCAAGCATTACAACAACAACAACAACAACAACAACTCATTCCCTTCACACCAGTGTCCTCATTC-------------------CCGAATCGCATGTTTATATTCAAAGTTGTCAATAAATAATGAATTGTTTGAATGATTAATTAA
TGTGCCCGCCATCAATACACATACAACACAGTACAC-CACACCATTTTTTTTTTGTTCTTATGCGACCGCGCCTAC-ACCATCTACACGCGATGTACACTTTTCGAGTTTGT---CACTCCGAAGCACACTCTAAAA------CCCAATGCCGTAAAGG------CTGAGGAAGAGGCAAATACCT--ACTCTACTATATGACC-AATGCCTATACCTATACCTAAACATAACATTGTTTGTTGTGCATTTCCGCATTGTCCCGCATGCGGCCATG------AAAACGCATCTTAGGCGCGTTCTTG--GTGTTTTTTGTTTTCGCCTGTTAATACACACACTCACACCCAAACACACAGTAAAACCACCCAGTTATCTGAACCACCACTAAACGCCTGCCCAGCTGTGCTGGTAGGCAGGCGGTTGTGATTTCAAGGTTAGAACACAGTATACAAGGTCAGGACGCTGCCTGTTGCGTTTGCATGGCCAAATGAACTGTTTTGAGTGTGCTAA---TTTCATTGAAATAC--------CCTCTTTCGGATATAAATGTATATTTAGGCTGTT---AGTTTATTTATTTATGAACATGTATCGTATTTTGTGAAATCCTCGACCACACAACCGCTTTTCATGCAAGTTTTTCA-----AACAACGAATTTAATAAAT----------------GTGTCCTCATCCTATTGTAAAAAAAAAAGTACTGCCTTGAAGCCTTAAACTGAAAATTGT-GAGGGATAAGCACGAGTCCCAATT-TAAATTAA
>CG4839 10155217 10155510|11124 chr2L 10154653 10155217 scaffold_7 2047315 2047887 - 29529|575 575
A
A
>RpL7 10202059 10202233|11181 chr2L 10201031 10202244 scaffold_7 2159358 2160547 - 64200|1043 1224
GGACTCCTTTTGA---TTTATGTGCTGAAACGACAACTGCAGCGGTTCGATGTAAACAGTGAGAGAAATAAAAGTTACTTTTAT----AAACCCACGAAATGCCGTTCAGTACAAAAACGCAGTGTTTTCGCTTCGATTCGCTGATTTAGTCATTGCGACTTAAATTGGAAAATATCAGTGA
GGCAGCGTTTCGCAGTGTAATAGTTTAAAACAAAAACGGT---------CTGGCAACAGCGAAAGAAATAAAATTAACTCTTTTTATGAAAGTACCAAAATGCCGTTCA----CAAAATCCTGTGTTTTCAC------------ATTTATGGTCGACAAGCTAAAATACAAAATA--AGCGA
>CG4901 10213698 10213723|11198 chr2L 10211352 10213709 scaffold_7 4464169 4466316 + 75447|2357 2368
AATAAAGTACAA
AATAAAGCTCGA
>Pros35 10222409 10222515|11216 chr2L 10222393 10222778 scaffold_3 5242676 5243066 + 1614|16 149
GCATTTATAGGGCTAT----GAAAGCAT------CTTAACCATT-------AAAAATGTAAGATTCAAGGATACAATAAAATTGTT-CATGCATTTGCATAGAT------CCTAAAA---CGGAACAAACTGAA
GCATACTCAATGACATCCTTGATAGCATGAAATACCTGAAAATTCCGAGGAAAAAATGACGGTTTTATGGACT---TAAGCTTGTCATATATATTTGTATATATATTTGTCCTAAAAAGTTGGTAACAATCGGA
>me31B 10242049 10242175|11243 chr2L 10241844 10242161 scaffold_18 2789520 2789835 + 12956|209 321
AACGGATATGCCCTGTGTAACGCTAGTATCTGAAATAGAGTCTAAATCGTGGAATCAATAAAAACAGATGAACTATTTCAGAAATCAAAATTGTATTAAATAAATGGAAAGCA
AAAAGAT-TAATTTAAAAAATAAAAAGATTTGAAAT---GTCTAAAACATGGAAACAATAAATGAAAACTAA-TATTGCAGTAATTGCTTCTTTA-TACATTTATGGTAAGTA
>me31B 10242049 10242175|11244 chr2L 10242162 10242478 scaffold_10 291198 291526 - -2090|0 23
ATTCAATTTTT----------AAA
ATTCAATTTTCTTTTAAGGGAAAT
>CG31717 10251502 10251595|11260 chr2L 10250921 10251624 scaffold_7 277875 278572 + 18264|581 676
CGATAAGTTACGATTGGAACACCGAAAGCAATAGATAATCT--CTAGATCATTATGATAAATGCTTTAACCAAATACATTGTTAATGTTAAATTCA
TTATAATT----GTTAGAAACCTG------ATGAATAATCTTACTAGTACTTGTCAATTAATACTGGCGGATGATTCATTTATTTTTATATGTCGA
>Ror 10254598 10254686|11265 chr2L 10254515 10254762 scaffold_7 5637749 5638003 - 3578|83 181
ACATAAGATTTTACACATACATATGTATTTTCAACGAAATGGA----------CTGTAAAATAAGTAGGTTTAAGAATTTAATAAAACGAATGATATCG
TAAATACATTTGATATCTA-AGAAGCCTCTCAATTAAATTTGATCTGACCATTTTGTAAAGTATTAAGTAATAAGA----AGTAATACGTAAACAATTG
>CG18619 10264964 10265229|11286 chr2L 10264525 10265150 scaffold_18 2679743 2680299 + 13381|443 636
CCAGTTGAGCGAAAGCAACACTCCAACCAACAATGACCAGTTACTTCAGGAACTCGGAATCCTCAAACAAGAATAACCTACATTCTTATTTTTAGCTTAAGAATATTACTTTTATAATAAATGTACGACGGTTACTATTTATATTA-------TTACGAAAATACTGCAGAAATTTTTGTTATTTTCTATATTG
ACAATTGGACGAAAAGACAAGCCCCAGTGAAGTGAATCAGTTGCTTAAAGATATTGGTATTCTTAAACAGGAAATATTTGC----------TTAAATTAAGGAAAGTGGCT-----GCAAATGTTCA--TGCTATAATTTTAATTACTCTTTTTTATAAATATATATTATAATAAATTAATATTTATTTTATTG
>CG4946 10266506 10266570|11287 chr2L 10265362 10266661 scaffold_14 2019626 2021014 - 34469|1278 1342
AAGTAATTCGTACTAGATTGTGATGTAAATATGTATTGTTTATTACAAAATAAATAAGCGAACAC
TAATCATTTTTACAAGC-----ATAAAGATAATTCTAGATT-TTATAACTTTTAAAATCCAAGTC
>CG4953 10268427 10268747|11288 chr2L 10266758 10268490 scaffold_14 1032307 1033971 - 52304|1694 1757
AATTGAATAGATGCAAAAATGTATATTTTAAATTTATGTTAATGTGAAATGGGGTTTTAAGTGA
---TGATTGCTTGAATAAA-----ATTTTAAATGCAAAAGAAAGCCAA------TTGTAAATAA
>CG4953 10268427 10268747|11289 chr2L 10268496 10268932 scaffold_14 1033975 1034414 - -1677|0 278
TAGATATTATAATTTATGTTGTTACTCTATGTAAAACGCCA------TACTTTAATAAAAAAAAAGTCGGCGGTAAAATTTTTAATGAAAATTTGCTGAAATGTCCTTTAGTGTGGTCTTGCGTGCATTATG--------GAATCCTTAATTTCAATTGCATATTTTATATACTTTCTTGTACAAAGATAGTTAGATCTCTCTTTTGTT----------AGCACATAACGAAAAAACTAA---ATAAATAAAAAACATCCCCATGTTCTCACAACAAAT
CAGTCACTATAATGATAAGTATAGAATACCTTAAAAAACTATTAATCTAATTTAATAGCATATAGAATTGAGCCGGATCCTTTAACTGTAACT---AAAAATGTATTTCTGCA-GATTTTGTTTGATTGATAATTTAATTGGCTCCTTACGCACAATTACGCG---TATATTTTTCAATTTGCA---TTTGTAAGTGCTTGCTTCAATTTGAGCTGTCAATCAACCAACTAGTGCACTAAGCTATAAA-AGAAAGCGTGTTTGCTTAAATATCACAGAT
>CG4957 10269874 10269900|11292 chr2L 10269821 10271126 scaffold_7 5786331 5787634 - 18304|53 83
C----TTGTTGAATAAAACGTTGAGTTTAAA
CAACATAAGTAGCTACATTGTTGTGTTTTTG
>CG31873 10271457 10271527|11294 chr2L 10271303 10272442 scaffold_7 736 1820 + 25389|155 239
CATT--------------TTAAACGTGTATATTAATTAAATCTTGATTAAATGGCGCTACTAGTATAGCATAACACATTCACAGC
TATAACTTTAAATTTTAATTAAACGAATATAAAAATAATAATCTCATTAAATTATACT--TAGTATAGCATTACGCATTCACAGC
>CG4968 10307972 10308050|11333 chr2L 10307004 10308072 scaffold_18 153171 154210 - 36937|974 1060
ATTGCTCTCAGTAGTTTCTAGATTACGAAACGATTTATGTATATAAGATGTATAA--------TAAACTACCATTTATTTGCATATA
AGTTGACAATGCAAAAACATGTGTACGACTGTCAGCATACATATATAGTACATAATACTGCTTTAGACTTTAGTCAATTAAGAAATA
>CG4972 10317298 10317575|11348 chr2L 10316376 10317359 scaffold_59 36789 37736 - 25823|936 1000
TAACAAAATGGTATTGAGTATAATATTGCGATTGCGAGTAGGGAAAC---TTATGTTCAAAATTA
CAATGGACCAGTAAAAATTATATTA-------TGTGAATAAGTAAATTAATTATGTATAAATTTA
>CG4972 10317298 10317575|11349 chr2L 10317470 10319372 scaffold_18 2724131 2725782 + 585|0 113
TTTTAAATGAAAATGGCTCCGATTATCATAAGTA--CATTTTT---TGTTTTATTGCGTA--TAAATTTGGTTTATGTTTAATATAAATATT-ATTTGTGTACAGCGTAATTAA
TTTTAAAT--AATTTGATACAACGATTACAAGGATTCAATGTTGAACATTATATTGCAGAATTTAACTTTTTTTATCTTCA---TAAATATTTATTTATAAACATTGTAGCAAC
>CG4995 10324966 10324993|11356 chr2L 10324930 10327259 scaffold_211 9642 11971 - 111506|39 66
AGTATAAATTGTTTAGTACCTTTATAAA
AATATGA---TCTTAAAAGCTTAAAGAC
>CG5037 10332972 10333134|11363 chr2L 10332729 10333073 scaffold_6 42682 43021 + 5748|253 354
AAATATTAACATTAATTTGATAAAATGTTAAGTATCGTGTGAAATTTAAATATACTTAGTGTTCTGCAACTTGTAAAAACAGTCATTTAATATTAAGGAAAC
GATCTTTGATGCTAACTTTATTGTAATTC---CTTTAGATGTAATTAGAATATATTTATTCT-----AACTTAATAAACAAAACTTTTAA----AAAGAAAC
>GATAd 10338409 10338456|11368 chr2L 10337603 10339193 scaffold_7 141489 143012 + 6528|899 946
AACGCCAAATATATTCCCCCTACTCACTTTTCGAAAAAAAAAGAAGAA
AACGCCAAATAAAATTCAAGTAATCA--------------------AG
>SamDC 10340537 10340736|11370 chr2L 10340151 10341455 scaffold_24 203932 204937 - 30142|386 585
CTCCCCATCAAGGCTTTACGGAGGAAGTTACGTATCTGGACTCAATTTTTCCCAACGGAAGATCCTATTGTCTGGGCTCCATGAACCTGGAGTGTTGGTACCTCTACACTTTTAGTCGTTCTGATATCAAAATTACGCCCCAACTTATATCGGATGAGAAAAACGTTGACTCCGATCCAGATCAAACTATTGAAATATTA
GTCCACACAAAGGCTTTTACGAGGAGGTCACCTATTTGGATACCATATTTCCCGAAGGCCGATCGTACTGCTTGGGCTCTATCAATCTGGAATGCTGGTATCTATATACGTTCAGCAAGCCGGAGCTGAAAGCCCTGCCCGATATCATTGTCGAGGAGAACAATATAGACGCTGATCCCGATCAAACCATCGAGATACTT
>SamDC 10341382 10341505|11370 chr2L 10340151 10341455 scaffold_24 203932 204937 - 30142|1239 1312
AATTCCAAAGCCAACAGCAATTGTGATTGTTTTGCGTATGTCTAACAAAATTTATTTTTCGTTCGTTATTAATT
ATTCCCAAATTTATTGTTAATAAAAA-----------------AAAAAAGTTTTTGTTACATTCGAAATTAACT
>CG31715 10342376 10342527|11372 chr2L 10342148 10342495 scaffold_6 18172 18510 + 7990|237 356
TATGTACATGTCATTTTAGGATACAAACCTTATGTTTCAGTATCAAGTACACTTTTAAATACAGTCGTGTATAGCTTTTAAAAATGTCAACTATTTATTTCGATGCTTTGGAAAAATTGA
TGTATAAAAATAATTGTAAAAC---AATTTCAAATT--AAAAACATATGAGCATTTTAATATATTAGAAAAGAAA---CAAGAACATGTAATATTTGTATTTCCATTT---AAAAATTGA
>CG31715 10342376 10342527|11373 chr2L 10342496 10342639 scaffold_14 1042953 1043117 - -1037|0 42
TACAAAAATAT-----------TCCACTTTTATATAAACAAAA
TATTATATTATCGTGAAACCTATCGGATACTATTTGAAATAAA
>Sps2 10343900 10344228|11375 chr2L 10342932 10344282 scaffold_14 1043468 1044883 - 38159|988 1371
TGCCGCTGATAAATTTTGCCGCGACTTTGAAGAAGCTACCAACGGAGAGCAGAAATCCTTTCAAATTGGACATGTTACAGCCGCAAATGAGTCTGATGCAGTTCTGTGCGAAGATGTAGAGTTTATCGAAGTTAGCCTTTA----------GTTAA----------GTGGTGGTAATTAATCATTCAACTTATGAGGATTATTTCTTAAAGGCCTCTGGCTCGGAAATAGTCTGAAC---CTTAT-TGTACACGCGATAATTTTGATGATTAA----------CGAAACCAT---TTAATCGAGTTTGGTTAT----------CGCGAT-----AATAAAATCGTT---TGTCGATTTACAAATCATCGAATCTTATCGAACAA
TGCAGCTGAACAGTTTTGCGAGGAGTTTGAGAAAGTAACGAATGGAGCACAGAAGGCTTTTATTGTTGGTCAAGTTGTGGAAGCCGATAAATCTGCAGTTGAATTGGCAGAAAATGTTGAGCATATCGAGGTTTCTCTTTAAAAAAAAAATGTTAATTTAGTTTTTGTGAAGCGAATTGACTATTCAACTTATGATTACTATTTCATAAAGGCTTCTGGCTGGGAAATATTATGAACGGTTTTATGTGTAAATATAAAATGTTTGATATTTAGTTTGATTCCTTAAAACTATGAATTAACAACGTTTATTTATATATCTGTACTGCGATGTTGCAATAAAGTTTTTCTGTGCCGCGCTACCACTTAAAAAATCGCGACTGTTTA
>CG5045 10357786 10357876|11395 chr2L 10356808 10362625 scaffold_14 2053115 2058802 + 245722|1017 1107
ATTTCCACCTTCCTATAGACCAAAATTCAATCATAAGTTCGAAACAATTTGAATAATTCAGTTTTCCACAGAATATACACTTTCCAAATAC
TCT-----CGTCTGATGCAACAGAAAAGAA----GAGATCCAAACAGTCAAGCTAATTCA---------------------TTGCATTTGT
>CG5056 10367740 10367829|11398 chr2L 10367299 10368056 scaffold_18 2657581 2658314 + 6716|476 570
TAA---GCGAATCGATAACCTTATT-AATTCATACAATTTCTCTGAATAACTTTGTAAGT-TTCAAGTGTACTATATATACATATATGTTATTTG
GAATTGGCACTGCCAAAATTTTGTTGGATTTACA-----TTTGTGAATATTTTAACTTGTATATAAGCGAAATATATTTGAATGAGTGTCATT--
>dpr19 10379171 10379908|11414 chr2L 10378660 10380001 scaffold_18 46365 47576 - 5410|530 1305
AACTTATAATCGATGGTATTTGGAATGGAGCAACTTCAATCATTCGAGGATATTATATTTGAGAATATTTGTTTTAAAATAGAAGATTGTAAATAGATCATTGACATACCATATTGAGATGCCGGCGTGGGCATGGTAAGACATTTAAAGTAATCTAAGAATAAACTGTAAATAGACT--TCCATTACATGCAATGTATTGAATTGAGAAATAAGATGAGAATTCACGAACTTGTTACCACAAAACTTATAAAATGCATACCTATGCCAATAAGTCATGGGGGATTGAAAACCGCATATTTTGATGGTTCATAGTGGTACGTAAGATATAATGTATGCTTAGATGTTCATATTTATTGACT---------GGTACTGGTACTGACATTTTAATGTTACAAACAATGGAATTAGCGTAAAATGATAATGATAAAGCCATACAGATTTGTTACCTAA----TAACTCGGAAAATTTGATCGTCACCTTTAAACTG-------TTATTCTGCTCAGTGTTCGATATTTAGTATATAGATTGATTTATGTAAGCACCTTTAGAAGTATGCTAATTCATATACTGTATGTACAACTGTAAATAAATATTACTTCCGTGAGCGTTTTCAAAAGCGCTGTCTTCAATCCA---------AAATGGGCAGAAGTGCCAGTTTCGTTTTGTTTACCCTCGAATACGGAGTGCAAAACGACTTTT-------AAATTTTGTTGCCGACATAAGAACGTTTTAAATAAACAGATCAATTTTAAGAAA
AACTGTTCGTAAATAGTAATTTTAGTCAGTTGACTTTGGCAATT--------GTATTTTTAAGAA---TTGTATATAAATATAAACTCAT-------------GCATACCATTATGATAT----------TAATATTAAGATATAT-----------AGTTTCAATTGTAAAAGGACTGGCCTATAAGCTACAA------GAATTAGCAACTGA------------------TGTCTCCG-------TGTAGAAAGTATTTCATTGCTAGCCACTTATAAGGTA-----------GTATTTTTTAAGTCAAAAGTTATTCATTGATT----TCTATTCTAAAATAT---CGTCTATTGAATTTAAGTTAAGGTCTCAGTATATAAACTGTGATATAATTTAACATGCAATAAA---AAAATAATATTTCCAAAAAT-TTTAAATCTGTCAGTTAGTCTTTAACCC---AAATCTGA--------TTTAAATTGGTTATAATCGTTCTACCTATTCTT--ATAAGCCGTACATAG------------AGGTACTAACTATATTATGTTAGTTTA-----AGTATTTGCCGCGCCGATAAAAAATAAATTTTTAAGACAAATCCAAATAAGCAATTTCTAATTGATCTTATGGTTAATATTAAAAATCACAAATCTAGCTATTTTTTTTTCTGTGTCAAGGCCGCAACCTTTTTTTTTGGTACAACATTTTTTTTCGGGTA----AATGTTTAGGATAAGTAGAT---------GGAA
>CG5091 10381782 10382865|11416 chr2L 10380889 10381884 scaffold_65 52455 53476 + 19210|929 1039
TTTCTAAGATAAGCATTCCATAACAATATCTACAAC--------ATAAGCCAAAGAAATGTTTGTAAGCCCTTTATCGAGTCTTGTTTTATTTTGTGCCAATTATGTTTAA
TTGTTTAAAAATGTAATGTAAATGTAAATGTAAAGCTTTGTTAACTAAATAAAAAAAATATTTCTTATTTTTCTTTTTGGT----TTTCATTTTGGTTTATTTACAATTAA
>CG5091 10381782 10382865|11417 chr2L 10381890 10382405 scaffold_7 53616 54146 - -132|0 571
GCAGTTAATTCAAGGTGAAATAAGGTATTTGGGTATAAATGGCTTAGTCACTTCCAATACTCTTATAGCCCTTTTCCCGTATCTTATCATGGATTTAATCAGCGTATAGTGTCTACACTATGCACAAA-------GGGTACTAGTGTGGATATAAACCAAAATAATTCAGAATTAATATTGTAAAAAGA-----TTCACTTGCTTAAAATATGTGAATTTTGGTTTTAATCTTATTGAATTTAATTTTAACGCATTTCGAAAGTCGAATGACCCACAAAAGCGACTATTTTGTTGGATAGTGTATCAATGCTTTTGAAGAGATAA--GATAAGATAACTCGTGAAATATTA--GGTGAA---TAATATGTGGGGTTTTGTTCATTGT--------------------GCTCTTGTTAGTTATGTACAGTTAATCGATCGGTGAACACGCCTATAGTTCAATTT------TAGTTGGCAAAAGAA------TTTTGAGAACTATGAATTTAACAAAATCAGCTACGTTAGCTGCTGCGATTT-----TTTGTATCGTTTTGAGCCAAGTTTCT
GCCAATAATTTGAAA-GATATATCTTATTCGTGTAT-----------TTTCTTTTAGTGTTTCTTTAACCCATTTTCTGTATTTTATTCTTAATTTATTTTCTGTGTTGAGCATACGCTCATTTAAAACTAATTTAGAAGCGACTGTCTTTATATACCCTATCCATTTAAAAAGGGT----TAAAAGGAAGTTTCTCATTTGTGCACATGATGTAAGCAAGAGGCTTAA--------AGTGTAATTCATACGTACTT-----------TGTCCTACACAGTCGGGCTAAGAGTTGGCGAGTTGGCGCATTCTTTTGGTAAAAATACCGATATCAT-ACCATTGAAGTTTCATTGTTTAGTTTTGATTTGTGAACTCCTTTTTAATATCTAGCTGAGAGAATATGACAGCTTTTAATTTGCCAATATGGTCTCTCGTGCAGCAAAAAC----AAAATAAAATTTGATCAGTAGATAATAAAGAAAGTACATTTTCCAAGAGAAAGAGTGTCACCAAATTGGTTCCGTTTGTTTGTTCAATTTATTTATTTAT-TCATGTTCAGTTAAATTTCT
>CG5091 10381782 10382865|11418 chr2L 10382425 10382717 scaffold_4 5200762 5201039 + -912|0 312
CCACCACAACCGAGACGCCAAAGGTACC--------ACATAAAGTGTTTAA---TTTTTAA----TTTTCTGAAATTGGTGTGGGTGTGCGTATTACGAATGCAATTGTAAACTGAATAATAAAGCCGATTACATTACCAATGGAATTGATA-----CATATAGTTAGATTTCAAATATCATTTGTGCAACTTAACTAAAAAGATATGTGCATACTGCTGTAAATTAGTGAACAGATTATGTTAAATTGTGTTAAATATTTGTGAAAGTAATAGAATGACTAAATTATATGTATCACTATCAAATTCGTGATA
CTATCGATATCGATATGCTAGCGATACTTGACTATTAAAAAAAGTTGTTAACGCTATTTAAGCATTTTTCGCAAATTGTT---------TGTTTTA-GCAAACAAATAAAAACTAACCCACAGAACAAATTTGAATTTTGCTC-AATTAATAATGCTCGCGTCATTTTGTCTCAA---CGATTCCAGGAACTGAACTCTTAAG-----------CTGAT-TAAATTAACCCATAAGTTTCATAAAATCATG--AAATCTTCG----AATAAAAACAAGTTCAAAGCTAGCGCAAAAGTTTTCAATT---AACA
>CG5091 10381782 10382865|11419 chr2L 10382718 10382953 scaffold_4 743369 743608 - 200|0 159
AGAAAAAGTCTTGCAAAGCTAAATCGATAAAGATGACTCAAAGAAAGACCGAAAAATTCACCACACAAAAAATTTA------------AAAAAAAATGAGAACAGTGTGTAATATAAATAAGTTGTTTAAAAATCGCAATAAAATTTAATTTAATTTCTA
AGATAAAGTGCTGCAAAACACACACAGTAGCAGCTACTGTCACGGTTGCCAACACGGTTGCAGGAGAAAAGATTTATTTCAACCAGAAATAAAAAATATGTGCAACATTTACCATAAATAAAAAGTTACTAACTTATAAAAGTATTTGTTTACATTT---
>CG5096 10384628 10384730|11424 chr2L 10384641 10385092 scaffold_59 54629 55065 - 12994|0 91
TAATAATTAAAGCCTTGAAGCCTTATTATTCTGTTAGAGCGCTGGTAATTTGGCGTAAATCT--GTAAATACACTTACATAAATTAAGTAAA
TGAAAAGTACCAACTTGCAGCACAAGTTTTCCAA-AAAACTTTTTTCATTTCGCGGGAATCTTGAGAAATATGATGGAAAGAGTATTACAAA
>mRpS7 10387475 10387524|11431 chr2L 10386863 10387475 scaffold_59 46430 47033 + 19207|612 612
A
A
>da 10392195 10392786|11436 chr2L 10389594 10393518 scaffold_65 269484 273268 + 64256|2719 3320
CATGCACCACCCAGGAACCCCTTCTGGAAATCGTCGTCGTCCCTCTCTTCCATAAAAACCGAATGTATTGAAGGCTCCGCGGCCAAGTACTCAGATAACTTGGAACTGGAGAATCAGGTTTTAAGCAATATGTTCTGGCGTTGTCGTCCTCCCAAATTGCAACCACAACCCCTACAAAATGTACAACACTTTTAACACACAACAAAACTAAATGAGAAGAAAACAACACACACAAACACACCACACAACAAACAAAACAAAAACAAAAAAAGATGAAAAAAAAACGAAAACAAACGCCCAAATGATTGCCAATCCACACACAGAATTGCTCTTTTTAAAACGATTGTATATAGCTGTTCCATTACGTTTAACCTGGGAAGATCTTTTTCGTTTTTTAGAATGTTTGATTTTAATAATTATTTGTTTTATTTTGTGCGATATCACCGTAGCCATATTTTTTATATACAATTACATGCATACATAACGACATAATTAAGTGAAAATAGTTTTATAATAAAAAAAAACACAA---CACATAGACTTACTTCTATATATTCCCGAGA-------GCTAAGGAATAAATATGTCCATATTAATATTT
CATGATGTCAGCAGTGACCT------AAAACCATCACCA------TCTTCCATTACAGCTCAATTTAACCCACATTCTACA---AAGTACTCATCAGCCTTTGAGCTAGACCAACATTTATTAAGCAATTTTTTGAGACGATATCA-----------TGCAACCCAAACAATTTCTGAAACAACGCCTCCTTT-----------------------------ACAACACCCGCAGTTTTAGCTTATTTTCTACTATC---------------ATGAATTTTAAGC--------------------------ACCTACATATACAATTTGTATCTTT--ATCAATTGTAGATACTTTTT--ATTCCGGTTGACGGGGTAATATTATTTATAGGTTTTTGAAT----------------------TGTAAATCCATACGATAT-------GTTGGACCCTTCTTTTAAACTTTCATTCATTCATAAATTTATAATTAGGTATATTTAGGTT--------AATAAAATCCAATTTCATATATACAGACTTTCTTGTATTCCCCATATTTTTACGACTATATATAAGCAAATGCACGTTAATTTTT
>CG31716 10402771 10402885|11448 chr2L 10402402 10402870 scaffold_6 5978917 5979392 - 14558|385 487
CTA-CAATACATATAAATAATACATTTGTTTACCTGTACTCTTTATTAAATATTTCT--TAAAGTAAATATAGGCAAAATAAAATTCGAATATAATGAAACTA
AAATTAATGTCTGAATATTATAGATTGGTTTACCTGTACTACTTATAAAATACTTATTGTAATACAAACATAGTGAA---AAAAATCGAATATAACAAATCGA
>Ip259 10409547 10409604|11456 chr2L 10408143 10410193 scaffold_6 5986428 5988652 - 79278|1595 1654
CCCCGAAAATGT-CGCTACCTAAT-TTAAGAGTTTGATTTAATAAACAAACATATACAAT
TT----ATATGTAAGATGACTATTATTTGTATCTTGGTTCATTTAATAAAAATAAATAAT
>RpS27A 10410391 10410467|11457 chr2L 10410221 10410471 scaffold_6 5988919 5989168 - 11160|170 247
-TTTTGCTACATAAGATCATGTACGTTTCCAGAAATCAAATAAAGGTAGTAATTGAATAATAAATTCAATCGCTGAAA
GTGCCGGCGCTTTAGATCAGGCAATTATTTCTACTGTAATTAAATGAAATAAATATGAACTAAAATAAGC--CTGAAA
>RfC3 10420553 10420612|11468 chr2L 10419884 10420679 scaffold_14 1031426 1032223 - 20454|708 767
AACAATGTGTACTCCAATAATAGGTTAGAATTAAATTATAAATACAAAAACATAAAACAC
TTGAATTTGTTTGCC-GTAATATATGTAAATTAAACTTAAGCTAC---------------
>CG5168 10425273 10425484|11474 chr2L 10425403 10426179 scaffold_14 2082318 2083114 + 36843|0 87
TCATATAATTGATGTAAAGCAATA-ATCATTGTATGTACGTAT---GCTTACATTCAACACATAAATACACGAATCCATCGA--TTAA
TTACATATCGAGTATATAGCTAGATATCATTGAGTCTTCGTAACAAATCGAATTACGAAGAACCAATTCTCAGATTTACCCACATAAA
>KdelR 10427810 10428159|11478 chr2L 10427346 10428281 scaffold_14 2083977 2084967 + 27847|464 870
GCGGATGATG-----------GATAAGTGCATAGATGTGGGACATTTGTGTTTTGTCGGCACA-CATCATCAATCGACGTCAGAGTAAACAAGC--GAGCGATCCACGGCCCGTTTGACAACGCGTATTTCGTT----CATATTAT--------------------ACAAAAGA------TACATAATCGAGGGGAGCGCCTAAGTTGTAATT---ATTTAATGAGAAATAAACCG-----AAAATCGAAA----GTACACTATAAACTATGCA-ATACCGACATCGTACATTGAAAATGTAACAAATGTATTAATCTCCGTTTTCCGAACTGCACTCACAAATTTTAGAATCCAAAAATATTAAAAAAAAAAATCATTACTCCAGTAAGAGATAACGTTAATTGAC
GCAACAGCAGCCGCAGCAGCTAATAATTCCATTCGTGCGTG-TGTGTGTGTGGTGCCGTCACAGCAGAGCCAGAGGAGGATGAGGCAAAGGATTTGGAGAGAGGAACAGCAATATTGAAGATGTGGACAGTGTTATTACATAGTAGATCTTTGTCGCATAACAGAAACAAAAAATGATATTGTATATCGAAAGGGAACATATTTTTTTTGTTTTACATTTAGTTTAAAATGAAGAGTATAAGAAATTAAAATGTGGCACCAATTAATTTATGCATATACCAAC-----TCAATGCAAATTATTAAAGTATACAAAT----AATGTACAAATTCTATTC----ATTATGATTTCCATCAGCAT---ACAAAACAATTATT----CAGCTATCGTAATTTTTGCTTATC
>CG5188 10429912 10429989|11479 chr2L 10428785 10430907 scaffold_14 2088032 2090263 + 71561|1182 1281
AAT----TTTATGTACATGATGCAATTTTTATT------------------CGTGATTCCCATAAAGTGTTGAATGAGTGCTGGATGGCAGTCTTGTGCA
AACAACGTTTACATAAATAGTG-AATTTTTATTTGAAGGTGTGTACTAAGGCATAGTTGACATAGAATTCTGAATAAACAC-GTATGCCGGCGGCTTGCA
>TfIIB 10432526 10432999|11480 chr2L 10431367 10435361 scaffold_14 2075576 2079534 + 170819|1175 1677
TTCTTTTCGTAGAT-------CCGATGCTCAATACTAACGCTAACGTTAAGTGAAGGAAAATTCCTAATTTAATCACAAATTACGATTTTATTAAATAAAGTTA----GCATAACTAATATTCAAATAGAACTGTTGGACCAATCAGAACATAATTAAATCATTGTTAAATTAA----TTATCTGAGTTAAACCCTTTCAGTTTTTGAA--------CTTTATTCCAATGATTCGTAATACTTTGCTTGC-TTGATTTATTTTTACATTTTTTGTGTATCTTTGGTATAATATAAGCTAATAACCAGAAACAAAAATTGCACACTACGTTTATTTGCCAGTTATTTGCGAAAATAAGTTTAACAAACCACGTACTC-TGTTTATACATAAGCTTTAAGTAATTAGTAATAATATAAATGGATAAAAAATTCGCAAATAAGACGACCAATCTGTAACTTTCAACATTATCAATT-GCAAATAAAGCGGGGCGTTTA---AACGT
AATATCCTGCAACAAAGAATATCGATGCTCAATCATCATTTATACCTTCAG-AAACTAAGTTTGCAAAATTAGCAACATG----GATATACATAAATATGTGTGTAGGGCATGCCTAGTTTTAAGGCAGAATTG-------------ACCATACTTTAATCACAAGAAAAATACGATTTTATTCAAATTAAAACGCCTTAAAATGCAAATGAACTCGCCTTGTTAAAATG-----CAGCACGAAGCTTGCACCAATGTAATT--------------------------AAGATCAGAGAATCAATATATATATATATAGGGAATGACATACAC---------GTTTGCTCAGTGCACTGTAAGAAAATAAATGCTCATGTTGCT------GCTTTAAATAGTTACATTTACTATCA---TATTCAAAATTT---------------AGCTTGTAACTTCTTAATTTATCTTTGAGGAAGTAAA------CATTTATTCAGCAT
>CG5198 10437170 10437317|11482 chr2L 10436085 10437320 scaffold_14 1011962 1013187 - 37448|1133 1289
GCCTTAGTTAACAAATGTTAAATTCTTTGGGTTTTAACATGTTTTCTGCAAATACTTTGTTCTATAATTGTATACTGTAT----ACTTTACAAGAG---GTTTCAATTAGTTTGCACTTGGTTTGGACTTAAAATA--AAATTCATATTCATATTGA
ATAATTGTAAATGCATATAGAAACAGTTGTGTTTTCAATTATTTAAGTCA---GTTGTGTTCTTGACTTGTATAGAATATGAAGAATTAATAAAAGTAATTTTGTAAAAGATAGGTTGTGGTT----CTTAAAATATTAAAATCAAAACTATTTTGT
>CHIP 10439125 10439244|11485 chr2L 10438703 10439275 scaffold_14 1029998 1030607 - 18484|459 607
GTTACTTATTAGTTGGCATTGT-----------------------------CATTGTAATTGATTAGATGTTAGAACCCAGTTCCCATTGTCTAAAAACCAGATAAGTGATAATAAATGTGGATCTGCAATTGAGATTTATATTGTAAA
TTTG-TTGTTTTTTGTAATTATAAACATAAACAACACAAAAAATATATATATATTGTAATTAAATAGCTGTTAGAA-GCAGTT-------------AAATATAAAAG-GTCAAGAAGTATTTCTCTCTATTTATTAAATATGTT-CGGT
>CG6232 10449713 10450082|11493 chr2L 10449701 10450093 scaffold_5 6244243 6244645 - -518|12 414
----AGTTCGTAGTTCGTAAG--------ACTCTTAATTAATTTATAAAACGATTATTTAACCGCCGTGCAGAATAGCTAAAAAAACAAATATTATCAAGCTTTACCCCACGCATTTGACATTTTGTTAACTCTAGAACTTAGTATTTCTGACACTAAAGCTCAAAAAAAAAGCTTGCAGGGAAATGCAAAAGTTAAAAAATATCGATCGAAAAGAATGTATTAACGCAAATCAATAACAACATACTAAAGTAAACTAGATAAAGACTAAAACATATT---ATTTAGTGAAATTAT-----------CATATTCTTAAACGTAACATTAAGAAACGAGAAACGATGTTGTTTCATACGCAACCATATGAATTTCAATA-------AAACAGAGATTAAATGAA
GATCAATTGCCAGCTTGCAAATGGAAATTATTTTAGTTTTATTTAATATTTATTTATTTTATTGTT------AACGAGCAAACACTTAATTATTGTTGGCTTTTATTTTATTTATTT--TTTTTTTTGAATTTTCGTTCGGAAATTGTTTAACGCCTA--CACGAAAATGTCATTTG-------GTGCAAAAGTGACAA---------CAATAAAGACGTATTAAAGCAAAAAAACAACAACAAATTATTGCAAATGAAAGCAACAAAAAAAAATATTTGGAAAAAGAGAAATCATTTCGCATTTCGCACGTTTTCAAAATAAAGCGCCAGCAAATACAAATTATATATATATATATATATATATATATATATATATATGTATGTATATATGGCTGAATAGTA
>Grip75 10485733 10485863|11525 chr2L 10483475 10488761 scaffold_14 2149426 2154734 + 153467|2375 2512
ATACGATG-------TTTTTGCCTAAAGTTGTAGCCGCTTAATGTCTTCTATACGAAAGTCATTTCTGAAAAACAAACAAACGATTAATAAACTGAAGAAAATGTTATATTTTAAATAAACTTTCTTACCTTAACGTT
TTTTAATAAAAACGCCTTCTGCTTAAAGCTGCAAGCGTTTAATGTCATCCATACGGAAATCGCTTCTACAAAAGTGAACAAAAATAAATAATTTGAACAGAAGCATACACCTACGTTAA-----TTTACCTTAATGCC
>CG6144 10489709 10490463|11526 chr2L 10488762 10489970 scaffold_2 4958471 4959714 - 40856|964 1316
GTTCATTCCGCCATTCGATGTTCTTTGGCATTAAAGATTACAGATTACACAGATGTTGACTAGCTGCACGTTAAACGAACCCACTGAAGAGATCCCTGGGAT--CCAAAA---AGAACTATGATAATCTGCAAC------------------CTGAATCTTCCGCTAGATGTTAAAGCACTCCGCACTAGCA-------GCACACTTGTTCGCAA-----------GCAAA----------------------TCCATGTTGGCCCACACAAAAGTGCTTTATTT----------------------------ATACCGCTAGCATTGTGTACATATATATAAATGTTTGTAT
ACTCTTACAATTGTT-GATAAACTTGTTAACTAAA---TGCACACGTTGCGAATGT----------CACGT------AGCCCACTGAAGTCAGCCCACGAGTTGCCAAGGCGCAAAACTGTAACTAACTTAAACTAATATGTATGTTCAACTTTAAATCTTCCGCTAGATATTTAAGCACCACGCACACACACACACACACACACCTTTGAGCAATGTTTCATAATGCAAATTGCGTATTTTTTAAGCAAAGTTTCAGCATTGCCCAC---CAAGTGCTTTATTTTTGGTAACCAAAAAAAGATGTTTACTCAATTATACCAATTATGTACATATATATATAAATATATATAT
>CG6144 10489709 10490463|11527 chr2L 10490377 10491565 scaffold_2 4959821 4961171 - 45862|0 116
GTCCAAGTGTATTTTTGTAACCGTTTTTTCCACCGCGCACCGCAA---AAAAGAGCGAAGAATTGCCAAT----------------AAACGTTATTGTCCACC-----------TAA
GTCCTGTAATATTTTTGTAATC---TTTTTCACTGCGCACCAAAAGACAAAATAGAAAAGTAATTCCAAACCAAATTTGAAATGAAATAAATTGTTGTCCACTGTTGTGCTTGTTAA
>CG6094 10507869 10507918|11543 chr2L 10507100 10507925 scaffold_23 1087564 1088384 - 30858|789 838
TTTTTTATTGGAAATTGTTATACAAAGATGCACATTACACATATACGCTT
TTTTTTTTTTTAAATTA----ACAAAAGTTTTTGTTACATAAACATTGTT
>Lrr47 10518774 10518991|11554 chr2L 10517281 10518878 scaffold_30 991481 993096 - 60048|1529 1647
TTGAATCAGATGGTGTACATTT------TTAGCTATTAGTC------AAAGATTTCT--TTAAATTATTTCACTAAACCACATCATTGATCCAAAATTAATTGGCGCGGAGCACTTATT
GATATTC--TCGATCTACGTTTCATGTGTTGCCTGCCTGTTTTGAAACAAGATTTCGAATCAATTGCTTTTACAAAA---------TGATCTAAAACCTTTAGAAGAAAACGATTTATT
>CG6113 10531408 10531561|11565 chr2L 10528108 10531934 scaffold_30 1007450 1011398 - 47193|3598 3792
AGGGGAATAGAACTATGGTTATAATTTAGTTATTCACAGTATATTATTATTAGTTAG----------GTATTTATTGT------TTAGTAGAAACTA-AGACGATTTA-----------CAACAATTTTACAAC---GATAAAAGCCAATAAAAACAAC------TTACAATTAATACATTTTTAA----TATTA
-----GACAATACCATAGATACTTCTAACTAATTTAGAGTTTTAAATAACTGTTTAGTCTAAGCGCTATACTAACAGTATGAGCTCAATGCACACTATTGGCCATTTATGTATATATATCAAATATTTATTAACTGAGGTTAGAG-CAATAAAAACAGTTGCATGTGATATTTCATATATCTTTTAAGGGGACTT
>CG6138 10567941 10568013|11611 chr2L 10567314 10568090 scaffold_30 1060810 1061732 - 1716|804 877
GCCACATAGTATTTTTCAAAATTATAGTAAGCGGATTGAAGTTTCATACAT-ATTTAATAAATGGTGAATAACA
CAAGTAAACCGCTTGAAAAGATCAGGATCATC--ATTAAATTAAATTGCATCGCTTGATACAC-----CTTACT
>Trim9 10626983 10627374|11676 chr2L 10625379 10628225 scaffold_30 1139463 1142753 - 45481|1803 2286
AGGTGATCGAACCGGGTGGAGAGTAGCAAATTGTGTACATAGAGCTTGACATTTGGCAGTTATCGGTGTCTATATATATATGTTAGCAT------TACCT--------TAATACGAACAATTTACTCAGACAGCTTATACATATATGGGTGTATGTGTACGTGTAGTTTTGGGCAAAGTTCAGCGACATATCT-CCATTTAATCGTATCTCTATTCGTAGTTTTAGGCACTGTTTGTAAAACGCTGCGCCAAATCGGATAGG--------------------------------------------------------------AATTATTCAAAATAATTGAAAGC--ATTTAAAGGT--ATCTCGATGTAAAATACAATAACAAAACTCTCAAT-----------GTTTTTCAACACGAAAATAGAGCCAAAAATCATGCACCGTGCAACAAAAAAAAAGTTATAATAAAATCGCGAACACC
AAGTGTTT---TTTGGGAGGGAGTAGCGAATTGTGTAAATATAGCTTGGCATTTAGTAGTTATCGGTGTCTATATACATATATACTTATATATACTACCCATAGCCAATAGTATAATCTATTAAAACATAAAACACTTACTTATATACTTATGCTTATAACTGTAGTCTCGGGCAAGGTTTAGCGACATATCTACAAACTACTCGTA--TCTATTCAAAACTCTAGGCAACGTTTCTAAAACGCTGAACATAAAAAAATAAACAAAAAAAAAAAAAACAAAAAAACGAAAATTTACTAATTAAACGGCGTTGCTTGAATCAAATAATTATTATAAATAATTGAAAACGAAATTACGTGTAAAATAAGATGAAAATAACAAAAATACAAGTTATAATTGTTTATTTTATTTTTGCAACAC----ACAAAGCCAAAAATCAAGCACCATGCAAAGTAAACCAAA-------------ACGAACA-T
>CG31872 10643376 10643492|11694 chr2L 10642993 10643546 scaffold_912 703 1284 - 1303|398 535
ACTTTTAGCTTACGAATGAAATATTAGCAAATCAATTAATAGATTTGCTTGGCACATATGTGAAATTGCCTTTT------CCTAAGGGCTCGGAAATAAATATAATTTTTA---------------TTAAGGGAAATT
AGCTTTAGTTCAATAATTGAATAT-------ATAATAATAATAATTACTTGCCATATAAACTAATTTGAATATGTGAGCACCTTAGTATCGCTAGTCATTTGTAATTTGTAAGCCGTGAGAGCTTTTTAATGAAAACT
>CG18284 10645751 10645815|11699 chr2L 10645729 10645914 scaffold_1 262164 262366 - 1736|22 93
ATGCTTAGATAACAAATTGTAC-------TCTTAGCTTACAACTGAAATACAATCAAAGCAATTAACTGATT
--GCTTTGCAAACGATTTGCGCGTCAATTTTTTATACAACATGCGAAATGCA-TCAAAGTACATACAAGATT
>CG17098 10654224 10654510|11711 chr2L 10653410 10654768 scaffold_30 1168537 1169757 - 19466|830 1136
TCTTGCGATTGGCGAAGTGAATGGCTGGGAGATATCCGATGAAAAGTAAAGTCAACCCGCAACCGTAATACCAGTCAACGAGGAAAGTGAGGAAGGTGCCGGGAGGAGGTTTTAAAGTACGTGATCTTTGGAAAATATTTCAAAAATAAACAGCATGATGTCTGGAGTTCCCAGTGGCCAAACCAACGTCCTGC--TGCGCTGT---GTGTTATTTGCAATTTATTTTTGA-------TCTAACTACTTTTTTTTATATGTTTTTTAG-------TAGTATAATAA-ATAAACCTCAAAAAACTAAA
---------------AGAAAGAGGCTGGAG-----------------AGGGTCA---CGCAA-------------TAAGGCGGAAGAGGAGGAGTTTATATGAGTGGGTTTCCGTCTCATATTGTATTCAGAGTAT-TTATGAAGAGAGTAAGCA---------GAGCCCCCCGCCCCCAACCAGACATCGGGCCGTGTGCTGTGCCGTATTATTAACAATTTATTTTTTGAACATATTCTAAC-----TTTTTCATATGTTTTCTAATAGACTTTAGTATAATAATATATATATAATATACCTA--
>CG31871 10671180 10671489|11725 chr2L 10670415 10671889 scaffold_30 1188027 1189490 - 33783|799 1164
CTTTGACGC-CGCCTGGCCAAGCTCGTTTCGTTCCACTTCCATATGACTGTGATGACATTTTTAACAATTTA----CCGATCGCAGCAT----CGCCAAGTTCTCCGGCTGGAGGACCGCAGGTGCAATC------ACTCAGGCGCA------ATCCA--------------------------TTCCCATCCATCCAAGAAGCATCCCACAGAGAGCCCCAACTTCGATACGTCCACTTTTTACACCAGA-ATTGTTCGATTCGTCTTCTGTGCTACTCTC----AATACTTTA---ATTTATGTGTACAAATTTATGAGTAACTTTAAATGTACGATTATTTTTAATAA-AAGACATACTTTAA
TTTGTCTGAGCAGCGGGCAAGGTTCTATCTTGTGTAATTTCATTTGACTGTGATGACA-TTTTAACAATTAAAACTTTAATCCCAGCGTCTGCCTCCGACCTATCC--CCGCGGAGCTGCAGATGCCACTACATCAACTCAGGCACGCCCAGCATCCAACCAGAACAATATCATATTCACCCGCTCACCACTCATCC---GATTATCCAACATGAACTCTTGAACCTAATCGAAAAACTCCATTTACCAGATATCAATAAGTACTTTCTGTGTTGCACTCTCTGCAAATATTCTATTTATGTATGTGTACAAATTTATG--------------------TATTTTTAATAATAAAATATATTATAA
>CG17104 10679356 10679525|11737 chr2L 10678975 10679888 scaffold_30 1198730 1199648 - 10973|430 640
GTGGTCAGCACCACACG----------------ACCTTGTCAAGGTCGGACAACTTGCCAT-------------TATGTGGAGATTGATGCTCGGGT----------TGTTTTAGGCAATTTTC--AATTCTAAACGAGTTATAAACAAAAATATTTAAATTTTATGCGACGATCCGCACAGTGTGATAAACCAAAAAAAAAAAAGAAAAA
AGGT---GCACCACACGCAAATTACCAAAAATTACCTTGTGAAGGT----CAACTTGCCATACTAAATCACAAAAATATTTAAATACATTTTCGAGCACAACAAAGGTATCGCGGTGGATTTTCCAAATTCTAAACGAGCTA-AATCA--------TAAATTATAT----------------TGTGATAAACGAAAAGATAGAG-------
>CG17107 10682282 10682405|11742 chr2L 10682365 10682794 scaffold_130 23759 24216 - 147|0 40
CAATAAATATTAAAATGCTAATTCTGTTTTTGGAAATCCAA
CAAAAATTAGTTGACTATTATTTTAGTGTACCAAAGTAGGC
>CG6415 10704908 10704935|11771 chr2L 10703571 10704908 scaffold_30 1228462 1229879 - 56663|1428 1428
A
A
>CG6443 10730203 10730303|11804 chr2L 10729085 10731438 scaffold_6 4395070 4397449 - 80921|1143 1317
-----------------------------TCTAGATTT---------CGTTTAAGTTTGCTGTGTTAACTCAGTCA-CATGTCCATAGTTTGATCGT--TGAAACCACACA-----CACAGTTTCA------AAAT--------ATACAACCGACA--------------ATGTA
TCCCCCGTCTCCCCCAAATAGTTGTAAACTCTAAACTTTACAAAAAACAATTTAGTTTGCTTTACGTTTTCAATCATTGTATCCA---TTTGGTTGTACTGAGACAATTCAGTAGCTGCCGTTTCATTTTACAAATAGTAACTGATATAAATTACACAAAATATTTCAATATGTA
>CG17118 10731268 10731364|11804 chr2L 10729085 10731438 scaffold_6 4395070 4397449 - 80921|2301 2419
GTTACGTTGCACAGTTGCTTGTTTTTATCGTTCTGTTGA------------CACGCGACTGGG-AGTGGCAC---------ATAGTTTAAATTTCCAGTCATAGCAATCATAATCGAAA
TTAAGATTATTTTAATGTTTATGTTAAATGTTCAACTTAGTTTTATTTGTGCACGCAATTGGACAGAGGCATGGCCGAGTAACAGCTAAATTAGTTAGTCGTAG-----ATATATATAA
>CG12299 10740099 10740758|11811 chr2L 10739791 10740531 scaffold_6 4406895 4407622 - 3012|353 810
ATCTAGGTACTAAGATTTGGCCATAGTTTACGAAAGTAATTCATATTTACATTGAAA-GGCACGACAGTTCTTAACTACGTTTGGATCACAAAATGTGCTGACCGCACTTTTTTTATACACTTAATTTTGTTTAATGATGTCGTGTGGTATTACAGAGAAGACAT-----------------TTGTCGGAAGTGTTC-----CAAAAGTACTTAACTCACAGTTTATCGTTGTTAG--GTTACCATGTAGGATTCCCAGAGCACACAACAAACCTTCAAAGTTTCAACTCGGTACGCGAAAGATCAGTTACTTATCTATTAACCATGGAACCACCAAGAACCTTTTTTTTTTTTACTAATCATAAGATCAAAAGCGATTTTGTGAGCATTCCCAGTACAACTTGTGGCACATTTTGGGCAACCGAAAGCGAAATTCCAGTTTTGTATCTCATATCACA
AAGCCGTTA------------CATATATATTAAGAGTTATGCAGTTTCGCACAGGCATTTCACATCAGTTCC---ACACATTCG---CACAGCATG----GATCTAGATTTGTCT------TGAAGTTTTCCGTATGGAATCGGTGGGAATGTCAAACGCGAAACACAAACTCAGTTTAAGATTTTAAGCATTGTTTTCTGGCCATAGTTCTTA--TTATTGCTTATGGTATTTAATCATTATTATTGTAAAACCCAAAACAACACACACAATTGTCAAG---------TGGCGCGC-AGGGCTCTTATGTTTAAATGTT-------------CTATAGACTTGTATGTTTAAGTTTAACCCTACTAAAAATAGTGCTT------GCATTCTTGCAACAGCTT------CAACTT---CCACCGGCTGCTGAA---CCATATCGCATATCATCTCACA
>CG12299 10740099 10740758|11812 chr2L 10740593 10740753 scaffold_6 4407683 4407846 - 3412|0 177
CTTACAAAGATATTACATTTTGTTAGTATTAAGC--CCTACTTTATGCTGCTCATTT------TACATCCCAAGGGAT------ATACCCTTACCCAAGTTGGAGCCACAACGACTCCAACTATTCCACG-TCGCGTATTTCCCAGAATCG--CCTGAAGAGATTACATTAATCGTTA
CTTTAAATGGTATTAAACT---TTAGTATTAAGCTACCTACTGTATGCTGCTCATTTACCGAATGCCCCACAACGAATTGTGGGTCATACTTTCCCGA-----------AATGAATTCCCCTATATTACGAGAGCGCACTTTATTGTGCGGATCCTGAAGAGATTACATTAATCGTTA
>CG6495 10764809 10764972|11836 chr2L 10763453 10764828 scaffold_6 4441819 4443141 - 34238|1426 1449
GCCGG----TTGCCTGCGGATTAG
GGCATAGTCTGTCCTTCGTAGTAA
>CG6495 10764809 10764972|11837 chr2L 10764849 10764968 scaffold_6 4443168 4443300 - 1905|0 136
CGTTGTGTT-----GTTCCACGTGCGGGGAAGCGTGAGGATAT-----ATATATTTACGATTAATTGTG-------TAATGAAAAACGTATTTTATATAAACAAAGATATATCAAATAAAACTAAAACTTAAACATA
CGTTTTGTGTGCCAGTCTCGCGTGGGTTGGGGGCTTTGGACATGTGCCACATGCATCCAAATTAGTGAATTGAAATTAATGTCAAACATATTTTATATAAACAATTATATA-CAAACATAACGAA---TAAAACATA
>CG17086 10854433 10854603|11938 chr2L 10852448 10854467 scaffold_6 4574925 4577106 - 68085|2187 2244
TTG------------------ACTTATGCATAT-----CGGTTAGCTTTATTGGGAAC
GTGGAAACGAAATCAATTTGTACTTATTCATATGTATATCATTAAATTTATTTCAAAC
>Stam 10861522 10862015|11943 chr2L 10859359 10862049 scaffold_6 4580835 4583686 - 86903|2334 2948
GACCGCTGCACTAAAA---------CAGAGACCTTCACTTGGTTCGCTTTGAATTGCCCGAGCAACTTTAAGCTTTGTCTTCATTCTGACAAAAGGATGTCATCGAGTATGTTAGTTTTGGCCAACTTGCCGAGAAACGGAAGTTGTCAAATCTCTGCTATGTACATTTTGAGAAGAGCAATTGTCAGTGAACCAAA--TATGTCGACTATCC-----------TTTAAAATAACGAAAGAAGCCAAATTAATATCAAGTATACCCTTACGAGTTTTCGTTTTTTGTGTTTATATTTGGTCCAACGAAATGATATATTTTTCTGGAAGTAAGGCAATACCAGTCGAAAAAGATA-TATATACCATATAAATAATCTGTATTCA---ACAGCACGTATAACTTTGTATTTAGTGCAG--------------------GGGAG-----------------ATAACTATTATGTATTATGTTTATTGTACGGAT----------TATGATAAATCTAAC-----GAAACGAATCACATTCATTA------------------------------------------AAATCATA-AAAATATACTAAGTAAACACAAT
AACCGTTA-ACTAATAATCCCGCTGTAGTTTCCTTTACTTTGTTTTTGATTAATTTGCCAATTCTATTCTAATATAAACCCCATT---GCAAACTTGTTTCAACTGGAATATTTATTTTTACTTTGATAC-----ATCAGAATTTATCTATTAACTTCCAGCT--TTTATGCTAAAGTTGAATATTTGTTTATCATGTTTATTTTTGTTATTCGATAAGCTTTGTTTGTAATCTCTAAGAA---------AATGTCGGGCAAA-----------------------TGTTTGCATTAGCGCCAAAAA----CTAAGTTTTT----AAATAAGTGAAAGGAAATCTATTTATATACCATATACCCTATAAATA--TTATATTAAAATATATTATGTATAACTCTATATTGAGCGTTGAGCGAAGAACACAGTTTGACGGAAGATCAATCAGAATTCACTATCACTTTTATGTATTATGTTTATTTTACTATTATAATTATGCGATGATAAAAATAACAAGCGGAAACGAATCACATTTATTATGCTGCAAACATTAAAAAGTTGATCAGCCGCAAATGCTGATTAAACAATATAATATATAAAAAGTAATCATAAT
>CG4621 10971805 10971871|12077 chr2L 10970470 10972124 scaffold_13 1274094 1275669 + 55369|1383 1457
TAATGCTATCAATTT------TATAGTTCATTA--AGCTATACGTATTTTTCGAATAAAAAGGTATAAGAAATCA
TGTTAATGTCAATTGAAAACATATAACTTTTTACCAGCTGTTCATATTAT--AAGTTAAAAAAT-CAAGCAGTAA
>CG16743 10973231 10973341|12078 chr2L 10972651 10973266 scaffold_2 764316 764840 + 6520|589 624
TCGCAGTCGAGATACAATGTTACATGAAACTTTAAA
TCGAATTTAAAATGTGAAATGCAATAAAAACCAAAA
>SCAR 10981666 10982396|12087 chr2L 10980791 10982630 scaffold_14 2190520 2192443 + 43365|917 1744
TCCCTGATTAACTCGTTAAAGCCTGACATAATTCTAAAAAACAAAAAGAAGAAGTAATTCCAAAGAGAATTAATCCATACGATGGTCGAAACCAAGCGTGGTATGAAATTGGATTACACAAAAGCACCAAAGCTTT--TCTACCACCCTTTATA-----------CAATATACACCTAATCCTAAATAATAT-------GTCTAAAATCAAAAGTTTCATTGAATTGTATAT--------------------ACACCAACGAGTAATTATCGTTAAATT----AATCGCTATAGTGAACGAACGC-------ATTTGCAT-----TTTAAGCCTAGACGACAATCCAAGGAAAGCGATTTAAAAGACTTGCTAATTTTGTTCGCTTCTTTGGAGTCAAGGTCTGAGTAGATATGGGCTTCTGTATCATAGTAGTCGGTGTTTGGATATTAAATTATAAA-TAATCGATATTATCACTGAACTCAATCCTACCCCAACTTGCAATCGATACGATTA---ATATAAAACATTTATCCAAAATGAAAATTTAGAATTTTGTAAATACAAACACATTAAAATA--TATCGA---ACTCCGTAGCATTTCAGT--ATACTCAACAAGCTATGAAATTGTAT----TATCCTTGTGAAAGTTAA--ATACCTGTATAATTAATA-----AAATATGTTTCACGAATATAAGCAGCCATGAATGTGTGGTTAAGTAAGCA------------------AACATGGATGTATGTAATTTTTCTTTACATAAACTAAAATATACAATAAAAAATA-AAGTAATTATATTCCAAATTA
TCCCTGATGGCTTCGGTTAAACCGGATAAAAATGCAAAAAACAAAAAGAAAAAGTAATTCCAAAGAAAATTGATGCA---GGATGTAAGCACCCAGC---------AGTTGGATTACTACAAAGCGCCAAAGCTTTTATATACCATACTTTATAAGAGTATCTCCCAATATGCATACATACCTAAATACTACAGACTAAACCTTAAATCAAAATCTAATTTGAATTGTACATATTTACACGCATACATACACATACCAA-GAGTAATTATGGCTAATATATGAAATCGCTAACGAAATCAGATATGATTTCAAGTTGCATATACATATATATATATATATATATAGAGGGAGAGGTATTTGTATG---TATTCATATTCGTAGCATGGCTAAGCCTAAGCCTCGTGAGGGAATAAATACTCGTCTCGTTTATGCAAG---ATGCAAAAAAGGATATAAATTGCTTAATCTTGTC------TGCAGTCGTTTTCCAATCT---ATCGCTACCATCAGCCATGTCAGAGATTGATC---GGTACGGACGTAGATAGAAGAAAATGATAATAAAATAAAGTAGCTATTGACTTGCTTTTTGGATATTAAACCGATATTTAACACTTTATAAACTCGAATACAAAATGATTATTAACAATGATTAAACTGGCAAATTTAAAGTTTGTAAATATATAAAATGAAACGAAAAACACATTAACTAATAGAAAAGTCGACAGCATTTTACACACGCTATGAAATTGCAATATATAAAGTATATACCGTTTAACTTACATACATATGCAAGTATATATATATATATATTCGAAA---
>CG12253 10989168 10989241|12090 chr2L 10987833 10989249 scaffold_14 924936 926300 - 32942|1367 1450
-------TAAATAAGAGTTCTTGCAAACAG--AACCCATTACGAATACAATTTGTAACTTTCAGTATTAAAAT-TATTAAAAAC
GCATTTGTAAGTATGATTATTTGTAGATAATTAATTGATCTTCATTTCAGTTTTTGAGCCCAAGCAGAAAAACATTTTGACACC
>CG16833 10994085 10995024|12091 chr2L 10990190 10995770 scaffold_14 928011 933176 - 95807|4001 5000
ACTATACAAAACAAATATGTAGGTCAGGATATTTTTTTTTTTAAATACTACAAGTATCTTAAGTTATTATCCTATTTTATTTATAATAAACCTAATTTGTGAAAGCAAGTGCATATTGCACTGCATTCTATACATACACTAAGTATTTGCCCACGTTTTAATTATTTTGTACACAAAAATACTGTTCTAAAAATCAGTTAAAATATTCATAAATTCTCGACTACTTTTGTTAAATTTTGAGGGCTGTTGGAGATTTATACAATCGTTCTTTTGGCGGTGCCGCGCTCTTTGCCATAGTAAGTCTTATCTGTTGACCACGCAGAGTCAT--CGTAAA-------------------ATAAAATCTCGAATATTAGTAGATAGATGAAAACCAG-TAAGCTTGTTA----TAATATTTGTACTGTC-TTTATTTAAAATATATCCAGGACAACAAA-GTGTATTT------GTCATCTCTACCGGTTAACTACCATAACGTAAAAA----------------TCTTTTGTTTTCTTTACCAGTAATGCATAGGTAAAT--AACGAAGCTTAAATAAAA-------TTACAAGTAGAGGGATGGTCAAATAGTGATGTTCTCTTTTGCCGACAGGCCCCATATGCATATAGTTATAAATCCAGATGTTCTATGTAATTGAAATGTTCCTATAGCA-AATAACTTTTAACAGAAACTGCTCACCGAATCCATATGTATTTCATTGCATTGCGTTGCCTTCTTGTTTGTGTTTTTCTGTTCGACGTTACCATCACTATAATTTCTTTTTATGTCTCTGCGTATATGAAGTATGTTGAAGGTGATCACACTGCATATTCCTTACACCTGAGTCCAGAACAAGACTTTCTTCCAGCGTCAGGTGGGTCTTTAAATGGTAATATACCTCAATCGGCTGTCCATAACTAGCTTTTCCAACGCGCCGACCTCAAATCTTTCACAAAAAAAACAAAAAAAATAAAAAAAAA
CACATACGAAAAAAAAAACAAAAGTAAGAGG------TTTTTATAAAATCCAGATATACCAAATACATATCC---ATTGATGCCAATGAA-------TATAAAACTAAGTATATAGT----------------AAAAGCGGAGAACT--------GTTTAATTAC-------------------------AAATAATTTACATT-----TACGTTCTTAAC----TCTATTGAA-TTTGAGGGCTGTTGGCGAGCTATACAATCATTTTATTGGCGCTGTCGTGCTCTTTACTGTCGTAAGTTCTATCTGTTGACCCCATAGATTCTCTACGTAAATGCTCGATATGCACAGTTGCAAGAATCACAAATGTATACAAATAGGTAGAATCGAATTGTTCTTATTGAAATTAATGTATGTAGAGGCATTTAATCCAAATATACTGAATATATTGAACGTTTACTCTTATAAGTCGTATATTGTGCTTAAGTATCATATTTTATAAACAACCAACAAATTAGGTTTTTCGTTAAATATGAGTATAAAGATTATCTATATTCTACATAGCTTGTTTCAAGAAATTATTTAAATATAAAATGATAGACAA----------TCTCTATAACTGCTGGT-------------TAACTAACTAATCAAAAGT------AAATTAAAGTTTATTTATTGAAGAATAGCCCATGCCAAAAACC--------AAATCGTAAATA---------------------------TTGTGTTTTTATTTTT----TTACTTTCATTA-------ATTTTGTGT---------------ATAGGTGGAAAGTACTAA-------------------------TTAAAGTAAGAACGTAATTCAGTTTCA-GTTGTTCTCT------CAATATAACATAAATTGCGACTTCTAACAAGTACAAGTAATTAATTGGCATTTAGTATCTAAC-------ACTAATATAATACAATACAC
>Nup154 11009760 11009878|12101 chr2L 11004664 11011046 scaffold_14 942397 948891 - 204936|5303 5440
AGCCGTCGGCCTGCGT-TATTTTAATTAA-------------ATTTT-----TGAAAGTGCTGGACTAGACGTTAAGTTTGACTGAGATATATATTGTATTTGTATTAAACATGTTAAATAAATTGATTTCCCCACAG
TGCCTCTGGCTGGCGTATATTGTAGTTATTTTCAAATGATATATTTTATAGATCAAAACAATGGTATAGCTGTTAAGTTTGACTGAGGTATAAAAGATGTACGTGTTATTTA-ATTGAATAT-TTGATGTCTT-ACAA
>dUTPase 11012008 11012138|12104 chr2L 11011986 11012008 scaffold_2 1864951 1864973 + 575|22 22
A
A
>Acp32CD 11016404 11016423|12112 chr2L 11016299 11016468 scaffold_25 593558 593740 - -752|115 140
CACAA------CCGGGAGATCTGACC
GACTATATCTCCTCGTGGCAGGAACA
>Acp32CD 11016490 11016573|12113 chr2L 11016494 11016815 scaffold_25 593795 594077 - 2575|0 83
GTTCGCTCGAGGGACTTTGGAAGAACGCAGACACTTCAATT----GATTTTATCATTAAAATGCCAATAAAATTTTAATACCAA
GTTGCCTTAGTGAAAACAAAAAACACAAAAACAAACCAAGTCCCAGATTCTA----GAAGTTTCC----TAGTTTTAACAACAA
>CG16854 11090420 11090782|12207 chr2L 11089034 11090574 scaffold_2 4555383 4556904 + 16693|1424 1582
GGCAATGGCAATGTAACTGGGAGCTTTCGGGGATGGGGAGGATGTGTTTGACGTCAAAGACTTGAAACCCATTAACGTAGCCTTAGCCATAAAACCTAGTTTATTTCTATGAAATAGCCAATGTTTGTATAAAAATACT----TATCCAATTTTAGCCT
AGGAACATAAATAAACCAAGGTATCTCCATATTCGCTAAGGGTGGACATGGGGCTTTAGTAAGGCAACCGATTCTTACAG-------AATGGAGCTAAAGTTATTTTT-TCAATTAACGCAGGCGTTGATGTCGATAATTTTATATATAATGTTAGCCT
>CG4705 11094838 11095005|12209 chr2L 11091447 11094928 scaffold_2 1971083 1974606 + 142796|3510 3607
TTCAGACCTTGAGTGATGTGCATTCCTTTCAAAAATAATCTTA-CTTAACTTTCTTTCGTCTGTGTGGATATCAAAATAGT------TAGGTGTTTTT
TCCATTGCCGATGCTGTGGGTGGTCCCAACCAGAGTAGCTTTAGATTTGATAGCACTTGACGCTGTGGAAATCAAAATACCTACACATAGATATTTTT
>CG4713 11110436 11110852|12219 chr2L 11109626 11111743 scaffold_2 1998849 2001044 + 61380|865 1405
GGCTAAACAAGAAAATTTAAATAAAATAGGAACGCGTCCCCTTGCGATTGTTCTCGATTAAGTCACTAAGTTATTTGTTTGTAAATATCCCTCACAGAAAATTCAATTTATCTA--------------AGTATGTACGCTTTTGCCGATTCCTTCGCAGGAAGAAGGCATTTATATATTACGAACACA-----ACACATATA--------------------------------------ATGTACTATAAATATCTTTATATATAAATA-ATATATGTATATATGATATTGCCGGCGT-----------------TAAGGCGAAGGCGCAAGTCCAGAAGATTGTGCC-----GGTGAAGTCAGTCCATTCCAA------------------GAGAGACAGATTGAGAGTAGGATCGGTCCAC---TAGCGCCTAGCCGAAACCTGATTATGTTAGCTTTCACAT------------------TGCATAAATATTTTCT---TTTGATTTATAAACTGTTTGT--TGAACTACAACTCCA
GGCTGAACACA----------------------GTGTTGCCTGGACTCTCTTTTCACTTAAAT----------TTTTTTTGTACTTTATCGCAAAACAAAATTTGATGTGTTTATTGCTTAAGACATTGCGCTGAACGCTTTGGCC---TCCCTGG------GTTGGCACTTATGTATTACATAAACATACACACACATACACACGCACGCACATTCACTCACATACACACACACGCGTTATGTACTATATATATATATATATATATATATATATTTGTATAAATATTAATGTATATGAGATAACTATATGTGGAACAAGACGCAG-CGCTGCTCTGAAGTTTTGTGCCCCATTATTTAAACAGTTCCATGCCAAAAGTTTGATAGAGTTGAAGAGTGGGAGATTTGGAGAGAGAGCAGCGCACGCCTTGCGGCCAAGCAAAGCCTGATTATGTTTCATCTAATATGCCCGATATGTTAATAAACCCATAAAATTTATATAAATATGTTTGATAAAGTTGTTGTGCTAAATTATAACTCCA
>CG4738 11128927 11129335|12225 chr2L 11122714 11130457 scaffold_14 2196460 2204309 + 241628|6535 6943
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TTTTTGGTTAAGCGCTCTGCATGTATTGAATGGGCGTAATAAAA-ACTATAATATAATAAT--GTTAGAAATCATCCGTCATTACCAGTTCGGCAAGAAACTTTTTGTATATGTTCATGAATTGGGCCACAAAAGCCTCCAAATGGAATATATGTTTCGCACCGTTCTGCATGCGATGCTCGTATTGTGTAGCGTACTCCAATGTCTTTGCCTTAATCGACATATCACAATTGTTGACCAGTTGCTCCACGAGGCCACGGAAGATTAGATTGGGTGGCACACCCTGCGAAAGTAACTCGTACAAACGATCGCGTATCTTTTCCAGTTTCGCGGGTGTTTGTTCGCTCACAATTTGAGTTGCAGTCTCACGCAGATACACTTGCCAGTCCAGCTCGGCGATCTGCTGCTG
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GAGAGGCGATTTGGGTGTTGCTCCTATCAACCGCATGTCCCAGTGAATGCAGTATTTCCTTATCAGTATCTACCCTTAAATGCACCAGAGCATT
>CG4751 11135488 11136003|12228 chr2L 11135809 11138571 scaffold_14 747823 750637 + 64108|0 212
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CTCTTAAGCGCTTGATGTCTTTAAACATATTATTTATAA-------ACTATTTTAGGTTTAATTACTGCACAAAGGTACTTTAAGTATTTTAAAATAGTACATATACAGACAA---AAACATACATTATAAACTGTAATACACGTAATATATGTACTGCATAATTTCCAATTAACTTTGCCGAAATAAAATATATAAACTAGGTTTTTAGTTT
>hgo 11138481 11138567|12228 chr2L 11135809 11138571 scaffold_14 747823 750637 + 64108|2857 2951
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GTTACAGTCGGTTGCAGACAGTGGAGCATGGGTTACGGGTTAACAACGCTTACATTTATT--TAAGTAT-----TTTGCGATAAAAATGTCCGAT
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TACATTCAGTCTCATACTATTAC-TGTTTTTTGA-----TATC---ATAAGCTTAAA--TACTTATTAACTAGTTTTCAATAGATTGAAATAACTTATCTCACTCTTAATTACAATTTTTATTCGCATAAAATATAATACATAAATTACAAATTTGTTTTGGCCAAACAACTGACGCATTAAAAATAAAAAATTTGTCA
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AATGATACGCGCCATGTGTCATGCATGACAGATCCCGTAG
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GTGGCAATTGCCACTGCG---------------AGCAGCGGAGCTGCAAACAAAGACTGAGTTCGGACTGGAGGCAAAACGTTGAGTTCAACGA
ATGATAATTGTAACTGTGCTGAGCTCGATCGGAAGCTGCAGGATTGCCAACGCGAGCT--GTTCATACGGGAG--AGTATGGTGACTGCATTGA
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AAACAAAAACAACGAGGCATAGCATA-ATGTACAATAAATCTTACTAATGTAGTATTATT---------GTAAAACTACCACCCACCAA-TTTCCGAATAAGCTATACGCCTCGAAATTCTATCAGAGGCAACTGGCTATTTGTTATATTGTTATTTTGTAAATAGCAAC--------TAACCGTGTTAGCTATAGCTAGTCCTCAGTTAGG------------TAATAAGTACATGTGCCAAATGTTTAGAAAATAGAAATAAATAAATATTTAAGTGAATTTATTGAATAATAATTGATTTCATTGAAATTGTTTTGCAGCTTTTAATGTAACGTTTAAATAT--TTGACATTCAAATAA
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TAAGTTGCC----TTGAAAATAAAAGGGACATAATTTAAACAAATTTA--TTAAGGCGCGCATGTCGAGCATTATTTTCAAATGAACACATCTCGACTGAGATGCAGATGTGTCTGATGGAAACAAGGAAAAGCGATTTGTAAATAGTAGCGATAACAAA-------ATGCGATTAATTTCGAGTTTAAGGGTTGCAGTGATAAGATATCGGGCGTCTATCGTTCGACCAC--------CACACTTATATTAAATCTTGTATTAAAAAAAGTTATTCTGCTTAAGTGGGCCATGAATTCGGCAACAAAG
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GTGGGGGAGATATTCACGGCCGCCGGACAGGCGTTCAGCAGACTGGGCGATCTAACCATGCAGCTGCATCCCAATGCGGAGTCGCCATCGGG
GTTGGGGAGATTTTCACGGCAGCGGGTCAAGCATTCAGCAGGCTCGGCGATTTGACAATGCAATTACATCCAAATGCGGAATCTCCGTCCGG
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TAAATGGACAGACGAGGAAATCGACATGTTACACTCGTCCATAATGCGCTTTTCGGACGATCTGAGTAAAATCAGTTTAAGCATTAAAAATCGCACAGT
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>CG4851 11281671 11281929|12362 chr2L 11280411 11282097 scaffold_14 868752 870355 + 36105|1336 1608
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TCAG------------ATTTAACTA----AAGCGAGCAGAAGGCTGTGATTGGAA---TGGTTAAACATTCAATTTTGAACTGATACGAATAAGAGTGCACAATACACCGTACAGG---------TGTATATATGACCT-----------AAAAGCTGTATACTGTCCGCTTTCTTAGAACAATTAACTACTT-------AAATTGTTACAAA----TAGAAAATATTTTGAATGGTACAAGCGATATTTTACTGGAGA--TTAAGACTACAA
>salr 11373210 11373397|12435 chr2L 11371615 11373799 scaffold_14 950951 953231 + 61392|1836 2023
CGTGGATGAGGAGAAGCTGATGAGATCTTAGTCTTGGAACACACATGGTTTTTGTGGAGTACATATCTTGAGCATTACCCTACGCTAAGCTTCTACTAGCACTGACACAAACTCAAACACAACCACCCACACACTTATACGAATATATCCTTTGTGTCTATACAAATATATATATACATAGTACGGTT
C-----TGTAAAAGATCGCCTTACAGTCTA---TTGGAATACACATGGTTTTTGTGGAGTACATATCTTGAGCATAACACTACGCTAAGCTTGATCTAG------------------------------CACACATATACG-ATATATCCTCTGTGTCTATATA-----------CTATAGTATGAGT
>CG4970 11519819 11520358|12581 chr2L 11519809 11520456 scaffold_1 868854 869469 + 4862|10 570
G--TAACAAATAAGCGATGAAATAACCCAGATAAGTCAAATCAGACGTGTCAAAATTG----AACAATAAAAATT-----AAAGTTTTTAATTTATTGGGGCATTTCAAAATTCTATTGAAAATCATATCAAATCGATGGCTTTCTTCCTCATCCGCTTGGCCCTGGTGGCCGGTGCGGTGTATGGAACCCAAGAGCTGGGGATTTGGGAAAGTTCCGACCACACAAAGGTGCTCTTCGAAGGCGCCAAACGGGAGGTGAGTCCCTACGCCGAGGACCTGATGAACCGATTCTGCTGCTGGCGGTGCGACAAGTGCAAGGAGGATGTACAGGTTAAGCCCTGGCAGGAATCCATGGTGGATGCTTGGAACGAGACGATCAAA-AAGACATTCCACGCCTTGGGCGTTCAAGTTCCCTTCTACTACAAACGGTTCTCGGAAGACTTCCAGCAGGGCATCGATGACTTGGTCAACGA---------GAAGGAGGAAATTGATACCAATGCAAAAAAAGGCCCCAAAAAGATAAAATAACCAAGTCACACCTTCAAATATTTTG
GAGTGACAAGTAGGCCAAGAAAAATTCCAATT--------TCAATTATTTCTAGGTTTTATCAAAATTAAAAATTCTTCTAAACATTTGGCACTTTTCGTCCACTACATACAATTTTTGGCAATCGGACCAA--TGGTCATTGTTATACTCGTGAAATTAGCTCTTGTAGCTGGAACAGTATGGCTAACTAAAGAAATAGGTGTTTGGGATGGCCCTGACACGACAGCTGAAATATACGAGGATGTAAAAAGTCAAATAAAACCTTTTGCAGAGGACCTAAAAGAAAGATACTGCTCTAAGTATTGTGGAACGAACAAG---------CCCACAAAGCCATGGCGTGAATCCTTTGTTGATGCTTGGAATGATAGCATAAAAGAAGGCTTTCTAA----CAGCCAATCGATTACCCAAATATTGTTATCGCTTTACAGATGATGTTCAGAAGACTATCAATCAGTTATTTAATGGCAATTCAATGAAGTAGGCGATCATCAAGATGGCAAA------TTCAAAAATAATTCAGACAGAAAATAATACATACAAA-ATTTCG
>CG14929 11520334 11520358|12581 chr2L 11519809 11520456 scaffold_1 868854 869469 + 4862|546 570
CCAAGTCACACCTTCAAATATTTTG
GAAAATAATACATACAAA-ATTTCG
>CG14929 11520457 11521446|12582 chr2L 11521371 11521489 scaffold_29 1369234 1369355 + 2278|0 79
TTATCGAACTCTGTGCG-GTAATCTTTTA---ATTCATTATACATGTTGTTCAGCAAATATATTTTTAAACAAATACCAA
TGATCGTACTTTACACATATAATTTTTTAGAAAATCAGCAAACAATTTTTTAAGTAAATATAT----AGAAAGAAACCTA
>kek2 11624504 11626136|12677 chr2L 11621026 11624622 scaffold_2 3060984 3064869 - 135748|3903 4032
CCCAGCCAGCAGCCAACTGCCAGGGATGAAGCGGCCTTAGACGATTCAGTGGCTCTGTAAATGGC--CAGGCTGATCACCAAAACCACTCATAGCC---------TAAGTTCACCCTTCACTTGTTTCCG
--CAACGTGGCGCT-GCTGCCGGCCAGGATGCTGCCTTAGACGATTCAGTGGCACTGTAAATAGCCGCGCGCTGATGA-CACACTCACACATGCGCATGCTTAAATAAATTTAGTTTGTGCTCGTATCCG
>kek2 11624504 11626136|12678 chr2L 11624623 11624816 scaffold_2 3065083 3065248 - -454|0 200
TCCCGCTGATTTTTTACTTCACTTACATTTTCCCTT----TTCTGTTTGCTGACTTGCCCCAAGAAAAAAGGAAGCAAAACAAA---AAAAGGCAGACCCAAGTTTAACCTAATAATTGGCTGAAAGAGAGAGCTCCGAATGCGAGTCCGAAAAGTAGAAGGGCCAGAAAACCAAATAAAGGGAGAGCAGGAACCGGACCT
TCGCATTAAATATGCGCTTGCCGAATATT--CCTTTAAAATTGAGTATTCCGAATTGAC-----AAGTAGCTAAGTGAACCGAATTTAATATGCTCTTACAGAATGAACCTCATAT--------AATAGAGTATTCCGAATT--------------------GACAAAAAGTTTAATAAACCTGGAATGAGAATGAGCCCT
>kek2 11624504 11626136|12679 chr2L 11624924 11626110 scaffold_2 3065348 3066839 - 13793|0 1524
AATATATTTTTTGTAAATTGCTTC--TGATCGAAA-GTTGAGTTTCAAACAAGAAGTGTTATAGATCAAATAAATCA-------ATATAAGAGGTCAAATTTTGATATTCAAACCATTTCAATTTGTGACTTTA-GTTACAGT-TGCATGAAGTGAGAACCCACAA--AATATCAT--------GACTTTTCCTCTGGACTCTTTG----CGTTTAGAGTATTTGGCAGAACAATAGGCG-GACCTAACCTAATAAAGCCGAAAAACAAAGACGC--CGCTAAACAAAAGCCTC---------------------------------------------------------------TTGTCGTTGTT--TGTTTCTGTTTG-------------------------------------------------CTGCGTGCTTCGAGTGGCAAGCTGGCAGCATTTTATTTCCGCTGATGTAATTGAAAAACTTTTTCATTTAATATAAAGTTTTCAGCAGCTTCCCCGCAGCACAATGGCAAGAAA-------GCGAGGAA-----------AGAAAAAGCAAGGGGACGCAAAGAAATCCCAGGCCTAGAAGACTACTA------------GACATGTGGGGGGGTTCCTATGTGGGC--------------TATGTGTGCTGATTGAGTTGTTGTATTCTCGAAGGCGTTGTTAGTTGACAATCGACGAG----------GAAGTCCCAT------------CCACCCCTTTCTGTGCATCCACTTCACGAGGTTCCGAGTCGGTGGCTCACTTCAGAGCCAAGTG--GCATGTGTTTTCGCCATGGCGACACCTGCTCTCCGTGGCACAAAGGACTCCAACTCGAGGACCCGGCTGTTGA-----------------------ACTGTTGAGCCTTTCAAGGGAAAGGACCAA-----------------GCCGAGAATTCCGGCCGAAAATCGC------------------------GTAGTGTGCTCTAGTTTATGAAATTTTAATTCGGGCCACATCCGCTCCAGAGTTGCATTTAAATAATTTATCGCGTTTATTTTC--------------CATAGA-----ACTTTCTTCGAGTCTGAAACAAACCTTTGTCCTTCACCCTACACCCCACACTCACTTTAGAATTTGATTGTCCCGCCTTAAGTTTGTTGTATTGGATCAAACAGACATC----------AACACGAGTGTTTCCGGGTATCGTTAAAGTAGATATCGTAAATTAG----------ATCGGCTAACATTGTAAGAACTAAC----TAAATTTA--GGATAACCC--CGTTTGAGACTTGTATGTAAATGTAGCCATAGAAATCGTTTAAGCAGACCCCTAGCTTTCCCTTTTAACGTAAAATTTATGTAAAGTGTTCAAGACTTTTCCACTGTAACATAAATCGAAGAAAAATGGAG----------------AAAAGCGGAAATGCTTGGAAAAG
AAAATATATTTTAAAAAATATTTCGATAGTCAAAATAATTTATTTTGTATAGAAACTGATCAAGGTTCAATTAGTAACTCATTTGTTTAGAAAGTTCAATGCC-CTATAGAAAGAACTTGAAAGGAAAAGTTAATGGTATTGTATATATACCTTGTGACCCCATGGTTAATATTTTTGTTGGCAAACTTTTTGCGCAAGTTGCTTGTCCCCGCTGCAAGGGTATAACAAAAGGGCAGAGGCGACCTAACCTAATAAAGCCGAAAAACAAAGACGCGACGCTAAACAAAAGGCTCCGGCTCCAGCCCCGGCTCTAGCCCCGGCTCTGACTTCAGCTTTGGCAGTTGTTATTGTTGTGCTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTAGGACAGACTCCTGCTTCTGTACCGTGCCGCCCGGCCGTCCAGCTATGGCTATGCGTGCCTCGAGTGGCAAGCTGGCAGCATTTTATTTCCGTTGATGTAATTGAAAAAGTTTTTCATTTAATATAAACTTTTCAGCGTCTTGCCCGGGCTCTCAAGCCATAAAAAAGGGCCGCGCAAAATGTTCCTTTTTAAAAGAAACCAGCAAAGCAAAAGAAATGCTAGGCCTATA--CCTACTATTGTTGTGTTGTGTTGTGTGTGCCTGTGTTTGTATGAGTTTGTTGTGGGTTTGTTTGCTTGCCGATTGAGTTG-----CTTTTGGCGGCGTTGTTGGCTGACAATTGACTTGCCTGTGCCCACATGTCACATGTTACAACCGCCCCAGCCCGCTCCACTCGCAGCCCCAATGCAGTGGCAACTCGTCTGCGCACTCCAGACTCAAGTGTCTCGTGTGTTGTTGCCATGACGACACCTGCTTG--GTGACACAAAGGATTTCAAACCT-GGACCGAACTGGGAATGAGCTCAAGTGGCCTACACGGTGCTGTTGAATCCT---AGCCAGAAGGCGGATGCCGTGTAGCTGAAGTGCCAAGTGTTCCGGCC--AAATCGCGAGTGGCATTAAGGGTTTCCTTTTGTATTGTGCTCTAGTTTATGAAATTTTAATTTGGGCCACAGCAGCACCA-AGCTGTATTTAAATTATTTATTGTATTTGTTTTTGTCCTAAGTAAAGACATTGACACACATTTTCCTCAGGTTT---------TTTTTTTGACTAGCTTTAAGGCAACTCTCACAAAACAAACAAATTCTCGGAC---AAGTC--TTATATCAATTCGAAAAGGCGCTTGCCACACAGAGCACAGGTATTTCCGGGTAACAGAGCAGTAGATATCGTAAATAAGTAGCCGTAAAATAAAATACAAATTTAAGAACAAACTGCTTAATTTTAACAAATAACATAATGTTTAAACAATGTAAGTTCATGTAGTTACAGCAAGTGTTAAAAATGGCAAAGGGAATG--ATTCAAGCGGAAAGTGACGAACAACTTTTAAAAAATTTTCATATATTCTAAAAATAAAACGTACATAGAATTATTTTAACTGATTTAAATATTATATAGTTTTGAAACG
>kek2 11624504 11626136|12680 chr2L 11626111 11628378 scaffold_2 3067149 3069436 - 24307|0 33
TATTTTGAAGAAACAAAAAAGAA--------AAA
TATGTTGTAAGAACTAAAACGAATAGCAATAGAA
>CG4983 11653759 11653847|12709 chr2L 11653590 11655289 scaffold_2 3106820 3108599 - 31462|173 271
AAACACATTTCCTTGACAAACAAATTCTTAGTTCATATTTACTGAGAACTGCTAGCTATTAAATAGAA----AAATC------AAATCGAAAATTAAAA
-ATCAATTCTCC------AATGATATGACAATTCATGTTCA--AACAATTCCTGAGCCTTAAGTAAAATTATAAATTTTAGCAAAATCAAAAAACAAAT
>CG14933 11843460 11843778|12894 chr2L 11843721 11843968 scaffold_18 995140 995387 - 7002|0 57
GCATCGGATAATTTTTCATTTTCTGAGGAAAAATGAAGTTCTTGGCTATGATGGCTCT
GCAGCGGCTAATTATCT------CAAGTGAAAATGAAGTCTTTGAATTTGTTGGCTTT
>CG14935 11852445 11852572|12900 chr2L 11850127 11852700 scaffold_18 1004193 1006719 - 77996|2387 2531
CCG--GGAATGGGATTAGAGGAATTACCAGCTGATGGCGGCAAACTTTGCTCTT-TAATTGCATTTCCAGTTCAAAATGTCACGCGATTGAATACATAA---------TGGGGGGAAAATTAATGA-----CCCTCGAGCTGGTA
GCGTAGGCCCAAGATTAACGTACTTTATGGGTTCAATCAATTCAATTTGCTTTGATAAATTTAGATTTAATATTAAATGACATGAGCTTAAAATTAAGGCATTGTGCTTGTGCTGCAAATGAATTAAAGTTCACTTTGCCTCTTG
>Cry 11946411 11946805|12999 chr2L 11943776 11947305 scaffold_18 1103046 1106282 - 64939|2829 3255
ACACTCCGGAACATGGAAATGATTCAA--CCCAATCTTCAACTGAACTCATACGAAACTCCAACCAGCGACCTCAGCGATCTGCCAACCGGACAACGAATATGTTTAGACCATAAG-------------TTCTAGATCGAATCTTGTGTTCACCTAGCCTAGAATCGGGGATTTTGGTAATTCTCTCAGCTTTTCGACCCATCTAATGCATACAGCAAACTCTGCCAAG---------AATCTAACCCAAGCTCTAACGCTTTCCATTCCGCTAACTTTAGTTGTAAGTCTAATTGTTTTTGTGTTAC-TCTATAGTTAG-TCAACTGC---ATCAATGTGAAAATGTAAAAAAAA---TAAACCAGATTATTCAAAGAAGGCTGCTGGACTTCAACTAAGTCGGCATGCTCTTTTGCAAAACTTAA
A-----CGTATGACCAACACAGTCCAAAGTCCAAGCTTCAACTGAACTC------AATTCTTGAC--CGACCTCAATCATTTG-CAATGGAACACTGATTATGTCTAGAACTTAAGCACACAATTTCTACTCTAAGCGAACTTTTGTGTTATGTTAGTCT--TATGTGGGATACGGGTACTTTTTCTATTTGCTTGCTTTCCTAAAAACA------AAACTTCGCCAGAAACTAACCCAATCAAGCTCAAGCTGCAAC-CTGTCTCTGC--CTAACTCTAGCCCTAAGCTTAAATGTTTTTGTGTAACTTTTGTAGTTAGACCAACTGCGTTATTAAACTTACAACAAAAAAAAAAGTGTAAAGCTAAT-----AAAGAAAAC----------CAACGCAACGCGTATG---GATTGTGAAAAACGA
>CG16964 11948467 11948638|13001 chr2L 11948539 11949195 scaffold_18 1109745 1110402 - 5270|0 100
TAAAGAT-AGAAATATTCAAAATATTAATGTTTACAGACAACAACTAAAAATAATTTCAAATCAATAAACTCACCGCAGCCTAGTTAGGCACACAGCAAA-
TAAAGATGAGACAAAGTAAAAACAACGA-------AAACCTTAGCCAAATACCTTAGCGAAGACATAAACAGACA-----CCACGTACACACACCGCAGAC
>CG16969 11990777 11990837|13042 chr2L 11989930 11992725 scaffold_18 1662901 1665684 + 84798|859 933
ATTTAAGCAAACTAG--------------TATTATGTAAATTAGATTTTTAAATACATTATAATTGTGATTTAAA
GCTAACAGAGCCTGGACGTCGTGAGAATTTAGTTCGTAAATAAGAAAACGAAATATAACATA-TTGCTTTATAAA
>escl 11992475 11992819|13042 chr2L 11989930 11992725 scaffold_18 1662901 1665684 + 84798|2618 2905
GATGAGTGTTTCTAGGCTAAAAG-----AATTTTCCTTATCCTTCTAAATCCG-ATACCATATTTAT----------------GTAACCATAGTTATTTTCAGTGTAATGTTTACCTTCAATATTAAGTATGTTATTATGCGTAG----CATTTATATACAATA---CTCATTGTATTGACAATTTATGTTA------AATTATGTTAAAT-TTTTTAACATTAACCAAGATATTTATTCTAT-TCTATTACTTTTTTAATGATCAAATAGCTTCGCAAATATTATCA
GA-------TTCTTATATAAAAATCCTTAGTTTTAGCTATTCATATAAAACAACACAAAACATTTATTAAGTTCATGCAAACAGTAATAACAGCGCATACAAACGTATTAATGAACATTGAAGCTGATTTTG--ACTGGGCATAGACGACATAAACATCCGATAAGTTTTATAGTATTGAATAATCGTATCAAGCATTAAAAATATTAAATATTTTTTATGTTAAGCAATCAATTGAACATATGTATATTTATACATTAATTCAAAAAAAGCGCCAAAAATGTTGCCA
>CG31866 11993984 11994049|13045 chr2L 11993940 11995620 scaffold_18 1153137 1154819 - 24629|44 114
CTTAT-----AAGTTCTAATTATTTTATTATATCAGCTTCTGTAAAAATATATACATTATACGCTAGTGTA
AATATTACAAACCTTTTTTTTATTCTTTAATAACAAATT-TGAAAAAAAAAAACGGTTGCAAGT-------
>CG31864 11996244 11996471|13048 chr2L 11996090 11996386 scaffold_18 1665108 1665406 + 15373|157 299
TCCCAATTTAACAAAGTGTAGCCAGCTGGTTCATCCCAAAAGCAACTCCACCATCCGACAGACTTCCTTCTCCAAAGACGGTTCCATTTTAGTTTGCGTGTGCGACGACAGCACCGTGTGGCGATGGGATCGCGTCAATTAGG
TCCAAATTTGACTAAATGCAGCCAACTTATGCATCCCAAATGCGTATCCACCATAAGACAAACTTCCTTTTCCAAGGATGGCTCCATTCTGATATGCGTGTGCGATGACAGCACCGTTTGGCGCTGGGACCGAATTAATTAAG
>CG31864 11996244 11996471|13049 chr2L 11996387 11999531 scaffold_18 1151693 1154819 - 65658|0 84
ATGAGTGTTTCTAGGCTAAAAGAATTTTCCTTATCCTTCTAAATCCGATACCATATTTATGTAACCATAGTTATTTTCAGTGTAA
ATAAATGTCTCT---TTCAAAGTATTCA----GTCTCTCGAGCTCCGAGCGCATCTCAATATA------------TTCCAGGTAG
>CG31865 11997895 11997960|13049 chr2L 11996387 11999531 scaffold_18 1151693 1154819 - 65658|1565 1635
CTTAT-----AAGTTCTAATTATTTTATTATATCAGCTTCTGTAAAAATATATACATTATACGCTAGTGTA
AATATTACAAACCTTTTTTTTATTCTTTAATAACAAATT-TGAAAAAAAAAAACGGTTGCAAGT-------
>CG12264 12001172 12001244|13051 chr2L 11999725 12002287 scaffold_18 2346512 2349076 + 115612|1479 1560
TGTACTAATATTTA----AGCCGTTACTGTTACACC--ACACTTTGAAAGCGAAGGGAAAATAAATTTGTTGGAA---GAGT
CCCACAAATGTTTATTGGCGCAGTTGCAGCTTAAGCAAATAATTTGAATATATTGCACATTCGACGCAATTGAAAAGTGTGT
>Rh5 12009706 12009846|13062 chr2L 12008178 12009867 scaffold_18 2354105 2355822 + 67069|1609 1749
TGGTACAATTGTCAGATTAACGAAGTGAAAACTTTCTAAAAATCATACGTAATTAAGCTAATTAGTTGTAGGTCGTGCAATGAACTGAAAGAGTTCCAAAAAATACAAACCAAAAAAAGTTGGCATTAAAAAATTATTAAA
TTGAAC-------------ACGGAGTAAGAATATAC--GAATCCATGACATATCAAGCAAGTAA------------GCAATGAACTACAAAAGTTCCAAAAATAGAAAACAAAAAAAAGTTGGCATTAAGAAAGAACTCAA
>l(2)01810 12033532 12034123|13083 chr2L 12032623 12034097 scaffold_18 2379382 2380812 + 54594|911 1548
GGTGGATCGCCAAAAAAAAGTGCCATACATATATGTAT--------------ACATTG-TAATCTA---------------GTTAAAGTGCTGTCTACGCGGATTCTGGAAT---CCGTAATCTGGGATCCGAGTG-GTTCCCAAAAGCAGTGTCATGCTGTATAC-GCAGTGGCTGTTGTTC--AAATTGCTAGTTTTATAGTATTCCCGATCTGGCCGATCC--CTGGCATCAGCGCCAACTAATTAATTTAAGCGAATTTACTTACACTCCCGAACGTCCGCAGTGCTACCATGTTTATCCCTTTTGTTAGCTAGGATAATCCTTA-GCCTAATCCTAATCCTAAACTATACCCCTATGCCGCGCACGCAACGTACTCTCTTAATTATTATTTAGTATTTAAACAAACTGCGATTTCGCATTAAGGATTTCGTGTACCAGAGCTCGTATTGCCGTATTGTAAATCAAAT-----------GATGAAATAAT----------------TTGTACA----TTTTAAATTGTTGATCAATGTGTAAAGTAAAGCGTGTTTTTAGCTGTTCTGTTAAGACATTACTGTTTTTATGATGTTAGT-CAAATAAAGTGTATAAAGCTAATTAAAACTATAAA
---AGGCCACCTACCCAAAGTGCCATAGCCATCGTCATGGAACCTCCCGAAGACATTGTTAATGTACAACGTACATCTTGCGATCAACTATTGCAATTGCTAGTTTTATAGTATGCCAAATTGTCGGCCCCCAGTGCGCTGTCTAACTAAGTATATATATATATATAATAGTATCTATAATCCGTAAGCTTTCAGCTGCAGAG----CCCTAGCCCAACTATCCCGCCCGCCTCAGCTCCGA---------TTAAGCGAATTTACTT----TCTAATATATATGTACT----TTGTGTATTTGCCTGTAGTATGTACCCCTACCCCTTACGCCCA--CCCACTTCTCTCCCACGGCCCTCTGC------AGCCATTTACTCTCTTAATTATTATTTAGTATTTAATCGAA--ACAGATTCAATTTTAGGCTAGTAAAAAGAAAAAGTTAAGTTGATAGATTGT--ATCTAATTTGTTTTGCGAGATGTAAAAACCAACCCAATTTAATTATTGTACGAAATTTTTTAATTGTTGATCAATGTGTAACGT------------------TATCGTTAAAACGTAATTGTTTTTATAATCTTAGTCCAAATAAAGTGCATAAAATAATTCAAAATAATAAA
>CG18788 12035986 12036137|13085 chr2L 12035166 12036190 scaffold_18 2382800 2383824 + 18376|831 1039
GGAGACTT-----------GCTTGTTTTAAGT-TTAATCTTACGCTTAAACATAAGCTACTGG-----ATTTGTCTTAGTGGATTCCTTAGGCAACAGATTCTAGTTTACATATGTAC---CATAATACATGACAA-----------------------------------TTTCTATGCTAAAGCTAGGAGCATAA--ACGTAAACAA
CGAACCTGAGCTCTCAATGGTTAATTACAAATGTTTATATTGC-TTTAAATCTAGGCTAATCTTAACTATTTGCATAGTTGGG--ACTTAGGCAATA--CTATTATTTATATATAGATGATCGTAATACACGAAAGGATACTTAAACGATGTTAGTTTCATTATCGTCGACTTTCATTGTTAAAACTAGGTGCACAATAACTAAAACGG
>CG14945 12051691 12052049|13094 chr2L 12049935 12052509 scaffold_30 203004 205625 + 66267|1817 2228
ATCTTAACTATA------------TGTTCATTAGAAGATGAATCCTTCT-----------------AAAACTTCAAAGTAACAGACCGAATTTGCAATAATACATTTATT-------TGCTAAGCGGTTATGTTTAAACATCAATATGCTCCTTATTGTAC-TGCTAGCTGTGTAGCTTCCCTAAACATGTTACATATTCGTAGT----TTGTTCCCATATAAGCGCATTCACTTATTTCCTGATTGTTTTAACAAAGGAATTCGGATTGTTGCACCTAACCATAGACATAAAAA---------GTAAACTTTTGTGGGAAGTGGGCCAAAAAGGCGGGGGTTTTGCAA---AAACCTGTTAACTGAGGGGATCGCTAAAAAAAAAATAAATACGTACATACGATAAAAACT
TTCCAGACTATAATCCATAAAATCTACTTAAAAAAAGTCATCTCCATTTAGGCCCGACCAGTAAACAAATTCACAAAGCTGCAGGTTACATACACGA-ATAACATTTATTACTTCCATTCGAATAAGCCATGTTTTACAA------------ATTTTGTATATGTTTGGAGTTCAACTT-GATAAATATTTTATACTTAAGAACTAAAGTTTTGCTTATAGATTAGTTTTCCCTAAAAGTGTCACAACTGAGGCAAGTACATACGTATATATATATATATATAAATATATATAAATCTGTATATATAAAC-TGTGTGAGAAATTCCCAATAACTGTGGATGCTTAGCAAATCAAGAGCTTTAGCTAA------TGCCAACACTTGAATTAGTACAAAAATAATACAAAAACT
>CG5317 12057329 12057416|13103 chr2L 12057175 12057438 scaffold_30 211739 211979 + 8536|154 241
AGACCCTAGCCTAGTAAACCCTTAAGTGATTGTTCAACCTCTATAACCCATTCTGTAGCTAAGCCCAATACACATCTATATACAAACG
AAACTTTAACCTAGTAGACTTTTATGTAA------ATTCTTTAAAGCGAA------AACTAAACCAGAAATATAGTTATATATAAATA
>CG5325 12094530 12094635|13132 chr2L 12093690 12094718 scaffold_6 1613635 1614662 + 30256|911 1018
A--CAATCCCCGTTTGACAGGCTGGCGAGGGTGATGGAAACATGTTCCTACCATTCATGGAGGGCATGATGCAGAGCCTGCTCTCGGCGGAGATTCTGTTGCCCAGCA
AATTGTCTCACGAATTCTAGGGTGCCGATGGTGATGGCAATAATTTCCTGCCTTTTATGGAGGGCATGATGCAGAGCCTGCTCTCCGCCGAGATTCTACTGCCTAGCA
>CG5325 12095013 12095252|13133 chr2L 12094764 12099992 scaffold_6 1614966 1620327 + 221670|256 532
TGGCTGACGGAGCACGATAGT--CTCGTGGTGTGCCAATTG-----------GTTAACTGTTGAGTGTTGCACATTTTTTAGGCTAAGGCAAAT---TTGTATTTTATTTTATCACCGACAAAACAATACGGCG----GTCGCTAATGGTTATC---------ACCTCTCTCTTCAATCAAGCTATTATTTTCGTATTAACTGTTGGTT--------TATTAAGTAGTTCTATACCTAAATACAATGCCTCGAAATACACCTAGAGGAAGAAGCGAC
CGGCTTTTGGGGCTGTGTCGTTCCTGGTGGAGTGCCAATGGTCGAGTGCGCCACTATCTGTTGAATGTTGCACATTT---AGGCATAGGGACATCAATTAATTGTAATTTTA--------AACATCATGTGATGATTAGTCTTTGGTGGTTATACATGAGGAGAATTTGTTTTATATTTCCCTTATCGTTTATTTATGTTCTCTACGTAACACAAAATATTAACATATTTCAAATCGAAAGCAAAAGTCTTAAA------CTATAGGAAGAAGCGAC
>Dnmt2 12097673 12097694|13133 chr2L 12094764 12099992 scaffold_6 1614966 1620327 + 221670|2999 3020
AACAAAATACAACATATTTGCT
G------TACATCTTGTGCATT
>Ced-12 12100542 12100839|13134 chr2L 12100039 12104623 scaffold_6 1620362 1624869 + 167267|503 839
GCATAACGAGCA-----------CAATTACTTCAC------GAATTATTCGATTCATTCTAGACTCCCCCATCA---CCCAAGATACATGCCAAAGTGTACACACAACATA-------ATCGTATTCTCCGATCTGATCTTCTACTAGTATTACTTGTGCAATTCCCCGAACACAAAATGAACAAACTGGTGACGGTCACGTCCAAGTGACTAACCGCTGCCTAGCCATTTAGTGAACTTT-----ACACCATTTA----TGATTATAATAGGTATATAATATA--TAGAGAT-CATTAAATAACACATTTTATACATAACAATTTTGTACAAAAA-
AGATACTCAGTATTCGTTTTTATCTATTCTTTTATTTTATTGCAATAATCG-TTCGTTCCAAATTCTTGAAGCATACCCCAAAATACATGCCAAAGTGTACCCATTACATAGAGAAGAACATTTCTCTCCGATCTGATTTAGTATTA-----AACTGTGCAATGTCTAAAC----AAATGAACAAATGGA--GCGGTCAA------------AAGCGCCGCTTAGCCATTTAGTAAACATTTACATACACTTTTAAAAGTTAATTATATTAAGTATATAATATTATTAGAGATTCATTAAATACAACGTTTTATACATAACCATTTTGTACAAAAAG
>Aats-thr 12106763 12106913|13135 chr2L 12104624 12107790 scaffold_6 1625053 1628249 + 148040|2148 2358
G----------------------ACTCTATTTCGAACTATTTATCAAAAGTATACTTAACATTTGCATAGCAAAGCAAGTACGCATTTTTGTTCTTTCTATGTATTTACGCTTACGAAACCGGAATTCACAAATAAAAAAC--------CAAATCCAAACACATT-------TTAAGGTGT-----------------------TTCAAAT
GTCACGCTCCTCCATCAAAATATACTCTATTTATA--TATCCAACATATGTATACCTAGC-TTTGCAAAGCAAACGACCGGCATTTTTCAGTTGTAT-------TTTACGCTTACATTCATGAAATCCTCAAATAAATTATAGTCCCAACAAGGACCGACAAATTGTGAACCTTATGATATGAACCTGGGCTAGATAATTGATATTTAGCT
>CG16996 12110456 12110526|13136 chr2L 12107912 12110467 scaffold_6 1628671 1631305 + 84982|2747 2758
ATAGTCGAGTTT
CGTATAATGTTT
>CG31760 12169382 12170221|13203 chr2L 12168110 12170566 scaffold_2 5304810 5307371 - 53186|1485 2397
TGGCTTCCATCTCCAATCC-CGTTCTGCTTAAC-TTGTGATTATGTTTACACAGTCTTAGAGCTACAACAAACAGTTAGCGAAAAATAAGCCGCTTAAT-GTTTAATATAGTCTTAAATAATGTTTGTGTGTATGTGTCTGTC---------------AAAGTTGTTTAAATATTAAAGGCGTTTATGCGGTAAGTCAAATCATTTCGAACATCATTTCATTGCTTAAACTATTTCAAATGAAGCT------TCCAATATTTATAGAAACCCAGAAATTTTAGCAAATATCCCACCAAATACATTTTTCAAATT----TCTTAGAACTTTTACTTATTTTCTCAAATGAAACAATGA--TATATACATTTCTAAAATATCTTTTCACAAAACTATT-TTATTTGTCGA---ACGCCTGTCTTAATTCACAATTCGAACATTGCCTCTTTTCACTTTTAAGAACGTTTCATCCTTAAACTTAAACTTTCCAGCCGCATAAACGCAAACTTCATGTGTAACCTTTTATTTTCGCTTTTTAGTCATATCCACCCAAATCATTATCCCATCATCCATGATCTCCATCGTTTTTGAAACAGCAGAAAAGTATCAACATTGAGCAAATTTTTCTCACTTCGTTCGGAT--CGACAGAAGGATGTTGTATAGA------------AGAAAGTAGGCAGCC----------AGTTGGTCTGATGGGTCTCATAGAGTCCATCGGAGCCCCTAGGGACTTGGCATTAATAAATCTCATT-TAGCACTCATGCACCTAGCGAAATAAATTGCATTTTCCTTGTTCTCGTTGCACCCATTCATAGGAC--AAATATTATTTGCTTCGTAGCT-----AAATTTACATGATTTTCATGGTCATAAT-------CTTAAAACAAAA
-GGATACC----CCGATCTGCTTTCTGCTTCACTTTGTGATTTTGTTTGCAAAATCTACGAA--ACAACAA-----CAGCAACAACAACAACAGTAATTCGCTTAAACTAGACTTAAATAATGTTTGTGTATATGTCCCTGTCTGTCTGCCTGCCTGTAATATTGTTTA---GCTGGATGCGTTTATGCG------------------------------TGGCAGAGATTCGTGAAAGGAAAGCCCAACGATGCAATTTTT---------TATAAATTTT---AAAT-----ACTTGACATTCTTTGAAAGTTGGACTTTTATGACTTTTACTAATTTC--------AAACAAATACTTAAATTTTTTTTTAAATTATAATT-----AAATTATTCTTATCTCTCGATCTACGCGACGCATAA-TCGCATTTCGC------CCGCTTCAAATTCCTAAATTAATTGTATTT-----------CTGTTCTGCTTCTTAAAC-----------ATGCGCCCAGTTTTAATCGGTTTTCAAACATATT--------------TTCGATCATCCATCAAC-----------AGAACCAAAAGAAAATCA--AACATTGAGCAAACTTTTTTCACTTCGTTCGGATTGTGAAGGAAGAATTTGGTGGAGATACTGGCCTGGTTGGAAGGGGCCAGCTACCTTGTAGAAGGTCATTTGGTAGAGCTCATAGAGCT------ATGCCCTAGGG-CTTAGCCT---GATGTTTCATTATTTCTCTCATGCACCT--TAGCATAAAGTAATTTATTATT----TCGACGCACTCACTCACAGTACTTTGTTGCAATTCGGTTTAGTGCTCTTTAAATTCTAAGTAAT-----TAGTCAAAATTAATTTACTTAACTCAACA
>CG17218 12173604 12174091|13209 chr2L 12173052 12174130 scaffold_6 2948380 2949333 + 27973|558 1064
GTGGATCCACCTGCTTCAGCTGTAGCCAATGCCACGCCCCATTTGCCACAAGGCTGATCAGATAGTATAAACTGTATTAGCATGCTTGCTTGT-GTGTTCAACGTAGATATAAAAACTGAAGAATTCTATAATTGTAACCGAGATATTTAGCAAATATTTTTAAAATTTGTAAATTACCTTAATTAGCAGTAACTTACCTGACGCGCGAACAGTCTTGTGGTGAATGAGCGATGTGTAATCAAGTGCCTTTTCTGTAACGGACTCGTATTGTAACTTAAGCCTGGAATACTATTTCCGTCCAAAAAATATCTTACGCCTATGACATTCCATCTCGTAAACTGAATCTTGTAATACTTTCTATTTTCTACATTTATTTTGTA--ATGTTTTTGCGAAAGATCGCCTAGTTTTAGTCGAC-------TTACAAGTTTTTATTGTAATGCGATGTCAAATAGAACATTTTT------GAATAATTAAAAAAAAAAACGGT-TATAC--AC
CAGCAGCCA----------CTATAGCCAAAGC------------------------------------GAACTGTACCACACTCTCTATGTGTAATTTTCAATGTG-------------------CCTTCAACTCGAACCG-----------AAATGAACTTAACACTTGGAACGCATTTCCGTC--------CTGCCTCTGCGCACGAA------TATAGAAACATATATATATATATATATATACC-------------AATCCCTTTGAAAC----------------ATATCCATTCCA-------CGCGCACATATTCCGTACCATTTA--AGATCAAA--GTGTAATCTCGACTATTTTCT---TATATTTTGTATGCAGTTTTTACAAA----TGTTTAGTTTAAG-CGACGAAAAGTTTACAAA-TTTTATTGTAATGCAATT-----TAGAACATTTTTACAACAGAATAAACCATTTATGTAACAATATATACTAAC
>CG31759 12209911 12210119|13256 chr2L 12208207 12209920 scaffold_9 578770 580521 - 43669|1766 1775
TAAATTTTTG
TTGTTTACTG
>CG31759 12209911 12210119|13257 chr2L 12209923 12210612 scaffold_6 3020021 3020740 - 16993|0 206
CTTGCATATAAGAAAAATT--AAGAATATCTCGGGGATTTCTCAGCATAAATA---AATGTATACGTATGCCAAATA-----CTATGCTTAAATGTAATAATACTCATTTCTTCTTTATATACAAAACAAAATTCGTTCAACAAATCCTGGCCTATTAACAAATGCTTCTTCTCCTTTATAAACTGTGGCATATAAACAAAAAAAAA
CTATCATTTAATAAAAATCTGCAGAGTGT----AAAATCAATTTGCATACATATTCAATCTATAAACATGTCAAATAAGAACCTATGACAGACTACGGCAATTTTAATTAAATATTTATCTA-AATATATAAGTCATTTAAT---TTATGTGCTG--AGCAAATGGTTGTGGT--TAGCACAGTTGCTGCAAATTGCTTAGAAATAT
>aret 12310951 12311093|13406 chr2L 12310633 12311239 scaffold_6 3119612 3120355 + 22362|321 567
AGGCCAC-------------------------------CATCGGCGGCAAGGTTAAACGGAC------------------------------------------ACATCGAGTAGAGGAACACTGAGATTTGT------------GAAAT------------------ATGGAGTAGTCAATGAATGAAGAGTTGCCCGTGTAGAGCGCGTTGCAAGATTTAAACGATGATGCGA-ATGCCAACGTT
TGGTTAAGAAAACAGACAGAGAGAAGAGAACTACGAAGAATCAGCTGCAAGAACAACCTTACCAACTAATATGAACAATAACTACAACAACAACAACAACAACAACAATTGCTAAAAGAGCAACAAGAAATGTTTACCCCAAAAGAAAATAAAATACCAAATTGTCAAATGGAGTAGTCC---AATGAAGAGTTACCCGTGTGGAGCGCGCGTTTAAAGTAAACCAAAAAGTCAAGAAGCCTACGTT
>aret 12312376 12312465|13407 chr2L 12311268 12312872 scaffold_6 3120368 3122172 + 10478|1338 1442
ATGGTAATGTTCTTTGCAAAGTTTCGCC------------ATTTATTTC--ATTTTTGGAAATGCGATGTCAAGTGGTAGCTGAT-GCAAGCCGCCAGTTGAGAG
AAGTTGACGTTTCTT--CAAGTTGCCCTAGAATATTATTAATTTATACCATATTTTTTCGAAGGCCAAGTCAAGTGAT-GCTGCTAACGAGTCAAAAGGTGAGAA
>aret 12312526 12312801|13407 chr2L 12311268 12312872 scaffold_6 3120368 3122172 + 10478|1510 1906
TTTTATGCAAATCGTTCTTACAAGACGCATTGGTCCCTGAAATA-TGTAAATAATATCCGCTTGAGTCTCGAGAATCCTACTAAAGATTGCCTATCCCACTGCTGTC--GCATAAAAATTTCCAAAAACTGTAAATTTGA-----------------------------------------------ATTCCAAAAAAAATATTGGAAA-----------ATCTGTATAAAACCTAATATGCAATCATGTTGTATGATAGCCAAGAA---AGCCATTTT---TTAAGCTTGTAAAGCATACTAATTTTAACAAAGAA------------------------------------------------------AATTTATAAAAATACTAAATATTATT
TTGTTTGC-CGTCGTTCTGTATAGCATTTTTGGTCCCATATATATTGTACATATTATGC-----------------------------TGCCCATCAAATTGCTGTCATACATACAAATTCGCAACAAGTGTAAATTTTAAAAGCCTTGTATTTGTAAAGAAAAACAAACAAACAAAAACGAAAAATACCCCAAAAAAAAAAAAACAAACAAAACAAAACAATGAGAAAACACCTTATATAGAGGATATTTGTAAGATAGCGCAGCATATTGCCATTTTTAATAAAGCTTGCAAAGCAAAAAAACTTTTATAAATAATAAAACGAAGATACAAAACGAACAAACACAAATGACAAACAAAAAAGAACTAAGAAATGAAAACAAAAATATATATAATT
>bru-2 12392027 12392206|13500 chr2L 12391696 12392165 scaffold_6 3230009 3230425 + -295|340 512
GACTTTGCCAAAGGCCCCAAGGGCAAAAGGCACCATCAAAG------GTGGCCGAAAAG---AAGGGGCGTCCCATATACACATACA--------------------TAGTGTATGGTAAAAAAAAGATAGCCCCAATAGCCCGAGG-----TCTGGCAGGTAAACAAATGCA
G-CCACGCCAAGGCCCACAGG----CAGCGCAGCATCAAAGCCTTGCGCTGGCGTAAAGCCTAAGGAAGGCATAAGAATTACTAACAAAAGAGGGGGGACAAGCGAGGAGCGCCTGGTAATACCAAG-TAGCCCCGGGTCACCGAGAAGGGCGCTGGCATGTAAACAAATGCA
>bru-2 12392027 12392206|13501 chr2L 12392192 12393868 scaffold_6 3230762 3232757 + 35570|0 14
TGAAGTTATCCGCAG
TGCACCTGGCCGCAG
>bru-2 12395900 12396040|13503 chr2L 12395349 12397095 scaffold_6 3235350 3237386 + 30764|584 736
GGCCTCCAAATGCCGCCGACCCCTATT-CATC--CTCGCTGAGCGGACTGACAAATGGAGCC---------GCCTACGGAGCCGCATCTCAACCTGTGACCACCAGCGCCCTTCAAGCGGCAGCTGCCGGCGTGACTGGCAAGCAGATCGAGG
GGCCCGCCAGCGCCACAGATCCCTACGGCACCAGCACACTAAGCAGCCTGACCAACGGCGCCAGCGCCGCGGCTTATGGAGCCGC---TCAGTCATTGAATGCCAGCGCCTTGCAGGCAGCCGCCGCGGGCGTGGCAGGCAAACAGATCGAGG
>bru-2 12396293 12397534|13503 chr2L 12395349 12397095 scaffold_6 3235350 3237386 + 30764|1213 2168
GTCCCGATGGCAGCAATCTTTTCATTTATCACCTACCTCAGGAGTTCATTGACACAGATCTCGCGTCGACGTTTCTTCCCTTCGGCAATGTCCTTTCGGCCAAGGTGTTCATCGATAAGCAGACCAACCTGTCGAAGTGTTTCGGCTTTGTGTCCTACGATAATCCCCACTCGGCCAACGCCGCTATCCAGGCGATGCATGGCTTTCAAATCGGCAGCAAGCGGCTGAAGGTCCAACTTAAACGTTCCAAGGATGCGGCTAAGCCGTACTAGGCAGCTAAGAAATGGGCTAAAATGGCTTAAATGGGCGTGGCCATGGAGGCACCCAACAACACCAGCAATTCACAACTAATAGAATGAAACTAGTTTAAACAATTGTGCCTTTTA--AGCAACGTTCTGAAACCAAAGGACCAATTACAAAAATGTATC------TGATAAGTGAACAAAAA-----ACTGAAAATAAATAGAAAGC---------------------------------TTACAAATAAAGTTCTCG--------------------------------AGTGCACAAAAACGAAACGCAAAA--------------------ATCAACCCTACCAAAGAAGTAGCTTAAAAGTTGCATCCCTCTTGTAATCACATTTGCTGAATACCATCAACATTTTCATTAAATCTACCTAACTATTCAACGTGGTCGGCAAACAAATCCTACAAAATAAAAACTAAATGC------------------------ATAAAATACAGAA---ATTGTTAA-----------------CTGCGTTGTGGCGCCAAAGTATTTTTCAAAGCCAAATAGTTAAGCAAACA-GAAGAGTAAAACCAA------TAATGAAGAGAAAAT--GTAACTTGTGCACCAACCAAGAGATAAAACATAGAAAAATAATATC--TAGATTAA
GTCCCGATGGCAGCAATCTGTTTATCTATCATCTACCTCAGGAATTCATAGATACCGATCTCGCCTCGACATTTTTGCCCTTTGGCAATGTGCTATCGGCCAAAGTGTTTATCGATAAGCAAACAAATCTATCGAAATGCTTCGGCTTCGTCTCCTACGACAATCCGCATTCGGCAAATGCGGCCATACAGGCCATGCATGGCTTTCAGATTGGCACAAAGCGCTTGAAGGTGCAGCTAAAGCGGCCAAAGGATTCGGGCAAGCCCTACTAA------------------AAAACAGC--AGGGGGGCGTGGCTA-----ACACACACACACA-CACCGATACACA---AATAGAAATAGTTTAGTTCCA--TATTGTGCCTTTTAGCGTGAAAGTTTTGAAACCAAAGGACCAATTAT-CAAATGTATCTTCTAATGTTAAGGAAAAAAAAAAAAATACAAAAAACAAAAAAAAAACACCAAATATGCAAACGTGGGGCAAGAGTTGGGGGCACAAATAATGTTTTCGCTAGATGCACAGACAGGAATTAAAAACAAGCTAATAAACAAAAAATAAAAACAAAAACAAAAAAACGTATCCACACACAAAACCAACCAAAGAAGTAGCTTAAAAGTTGCATCCGTGTTGTAATCACTTTTGCTGAAAAC------AATTTCTAGTGCAT-TATATTCTTTATCCATGTGGTTGGCAAAAACAGAAAGGAAAAC-AAAACTAAACACGGGAAAAGTCAAAAAGGGGTGAAAACAAAATAAACAATACAATGTTAACCAACACAAAACTGAAGCTGCGTTGTGGCGCCAAAGTA-TTTTCAAAGCCAAATAGTTAAGCAACAATGGAAAATCAAACGAACATTTTCAATGAAAAAAAAACTAATAACACATAAAGTAA-AAAGAGAAAATATATAAACAAATTAAACTAGCAAATTAA
>bru-2 12396293 12397534|13504 chr2L 12397096 12397590 scaffold_6 3237593 3238111 + 1865|0 490
ATTTAAGGAAATAAATATTATAATAAAATGTAGCGGGGCGCAGTCCAACGTAAAAAACATTCGAAATTCCGCTCGTAGTGAG-AAACATTTAAGGAGATAGCTAAAAATAATTCAACTAAAGTAAATTTAATAAAAAA-CATTTTGAAA----CCCAAGTGAACAACTAACTAATTTATCCAGCTAAATGAAAA----TGAAGCTGTTGAAGTTTATTTTAAACTTATAT-TTTATTCATTACGAAAATCTTAACCCAAAACATAAATTGT--------------------------ACTTAAAATG--TTCTTGATGTTAGAGGGCAAAATTA-AATTGAATAAAATCAGACAAATAAATGTAAAATGTAA---TGTAGTTTGT--------AATTAGCTTAACATTTTACTGAAA-GGTATAGAAAACATAAATAAAATCAAGCGGTTTCAAAGATTTACAAATAAAACATATTTAAAAACATATATAA
ATATATAGACATATGTGTAACTATAACCTTTAGTAGTCATAGTTATATGGCACAAAACATTCGAAATTCCGTTCGTAGCGAGCACACATTGCA----------------AATTTCAGTTAAGTCGGCTAAATAAAAGGTCGGTTTAAAAAATTCACCAAAAAAAAACTGAAAAATGT------TTAAAAAAAAAGCCCTGCAGCTACTTAGCTTTAATATAATGTCACACACGTATTTCCTATGTCAGTAGTACTTTAAAACTTAGCCTTTCGTTTCTGAATCTTGGCCTAGGCACAACTTCAATTGATTTCTTGCTTCAAAACAACAATATTATATTTAAATAGTTTTAAACTATTTTGTTAGAAATTTCAAGCTATTATTTGTTTTCAAAAAATTAAAAAAAAAGTGTACTTAAATTGCATAAAAATTACGTATAAATTTA-------CCTATGAAATAGTTCTAATATTTAATAAAAAGGATAAAGAA
>CG6405 12426337 12426440|13542 chr2L 12424845 12427840 scaffold_6 3288050 3291332 + 70130|1588 1725
CACTCAAA--------TTATGAC-CAGTAGTAGAGTTC-CTAGAGCTCACATCAGTATTGCA-GGCACATTCT----------------GGAATCGTAGCA-------AGAGCTTAAATAAAATTGAATTAGGAACAT
GGAACAAGGGAACAGCTTAGCACTCATTTGCATAGCTCGCCCGCGCTTGCCCACAAAACACACGCCACATTATTTATCCCAAATAAACAAGAATCGAAGCAGCTTCGGGCAGCCGAAGTCCAAATACCCTTGCAGACC
>CG6388 12429973 12430031|13543 chr2L 12428155 12430272 scaffold_23 1128938 1131093 + 82403|1857 1939
C---------GACTGCTTCTGTGTCCCAAATT---------TATTTCCAATAATGTTTGTAAAAC------CCAAAACGCAAA
TCCGCTTTCGTTCTGTTGCTCTGTC---AATTTTTATTGCGTCTTTCCAACAAT-TCTGTAAAACAAACCACCAAAAAAAAAA
>Elf 12439565 12440605|13552 chr2L 12437619 12440244 scaffold_23 1140710 1143370 + 107598|2006 2771
ATTGAGCCTAGCTAAATTCGAGCGCCCGCCTTT--CATTGCGATTTTTGAGATAG-------------CATTGCAAGCCCGACGAGA-GAACACAGCCACAGCCACAACAACAGCAACGCC-ACGCCACGCTTTCTTCACATTTG-ACAAATCAACAAAAACAGTACTCAGCAT---CGCTCGAGCTCTCACTCACATTACTTTCA-------------------ACCAGCAATAGCAATCGAT----TATAGAATCCAGATCGAT--------TCAAAACGGAACGGAACGGCAATGTAGGCA-------GGCGAAAAGTTAATTTACA----ACAAGGACGAGTTCGGAGATAGAAACAGAAATGCATTATATACG-------AATTATAAACTATATTATGTAAAACTAAGCAGCAAAATCGGAGGCAGCGAATGCGAAACAAGATGAACTATTTATATATGTATACA-----AAACAAACA-ACTCACACGTATATATGCAAAGAGAGAGAAAGAGT-----TGAAGAAGAGGAGTTGCATTGATAACGATTTTGTTT---GTTG--AGCCCATCTCGCAAGGATATTGAGCACTTGTCGCAGTCGTCGTTTTCTTTTGGTTTACTATTTTGTATAAACTGTAAGCATTAAATAGCCTACACGTACATGCCTAAATCGCGCGCAATACGTGAATTTCTTTAAAATACTAAAACTAAAGCTGCAAGCTACCCAATTTTTGTATTTGTAAGCGAAAGTACGATC
ATTGAGCCTAGCTGAATTCGAGCGCCCGCCTTTTACACTGCGGCTTTATAGCAAACCAAGCACCCCTTCAAAGTATGCCAGACGAGACGATAATTATGAGAAATTTGCCAATGCCAACGCCAACGCCACGCTTTCTACACACACACACACACTTACACACACACTCACTCACACACACATTTAAGATTTTAGTTTCTCCACAATTATTATGTATATGCATAGAGCAACTGCAATAGCGTTTGATAATGTTTAGAGAGAAGATTTATAGCAAGTATCTAAAAAAGAATGAATGAAAATAGGAGAAACAGTTTGGCAAAGACACAGATTTCACGAGAGAGAGAGAAAGCAAAAGAGAGCAAGAGAAATGCATTATATATATATATATAAATATAAACTATATTATGTATAACTAA--AGCATGAGC-----------------------ATGTACTATTTATATATATGTACATACATACACACACACACACAAACACACACACACACACACACACAACACGTACGTATATATTCGAGATATTGTCCGGGTTATGATTACGTTTAAAATTGGCAAAAGAAAACTCAAGCAGAATGAAAA---GCAGCAGACGTCGATTTATT--------------------AGTTGTAAACATTTAA------------GCATCATTATATAGTGCGAGAGTCGTGAATTTTTTAAACAAACTA----CAAAGCTGCAAGCTGAACAATTTTTATATTTATACAAAACAAAACAAAC
>Elf 12439565 12440605|13553 chr2L 12440268 12441391 scaffold_23 1143408 1144724 + 8396|0 435
CTTCCTGTATGCGCCTTTAAATTGCAAATTTGTTAAATAC--------------CCTGCAAAATGCATTA--------------AGATATTTCTGCTCTTCTTTTTAAATGATATAAT---------------------------CTATATGCTTT-AATTTAAGTTTAAGCTTAAAGAACATGGAGTAAAGTCTGT--------------AAAAGCAGAACGGAGAAAATTCAAATTTACGGAAACACCTAATTGTTAATCATTTAAA--------------ACCATTTGATTTTGCTACTTAAAACACATTTGATTTTGTATA--------------ATTTAGTTAATTGAAGAATTCGTGCGAGTTGAACACGAAATCCCATATATGAAAAAATAAAATGCCTTTTGCTACCGAGCAGAAACAAAAACACAAA
CAAATGATAAGCGATAAATAATTGCCAATTCCTCAAATATGTTTTGCTTCTCTGCCTTTGAAATATGTTATGCGCCGCCTAAACGGAAAATTATGTTTGTCATTTTCTGTAATATTACGAACTACTTTTATCAATTTTGTTTCAACGAAATGCTTTAAATTTAAGTTTAAGCTCAAA----ATGATGCAACGGATGCGTGTGCGAGAGAGAGAGGGAGGGATAGAGAGAATC--ATTTTATTTGTTTACTTAACTATTGTTAATATAAATGCTAAAAATGATGAGAATTTCA-CTTGCTACTAAAAACAAA-TTGATTTTTTATATATTTTGTTTAACTACTTAGTTAATTGAAGG--CAACGCAAATCAAACACGAAACGAAATAAACTA------AAAATGCCTTTTGTTTCC---CAAAATCCAAAAACCAAA
>Oatp33Eb 12451928 12452053|13562 chr2L 12451149 12451932 scaffold_23 1159756 1160586 + 28889|836 840
AAGGG
AGTGG
>nub 12627086 12627183|13783 chr2L 12625405 12627212 scaffold_23 1438904 1440698 + 89378|1722 1833
GAGATCAAGGATCGTCTATGGACTGCAAGGGAGGTCACGTTTAGGGACAAAGACAGTGCAATGTGCG------GGATAAATCGAAG---GAAGCTTAGC-----AACAGCAG
GAGCTGGCGGCCAGTGGCAAAATCGCAA-----CTCTAAGATTGGGACACAGACAGTGCAATGTGCGCAGACCATAAAAAACAAAGCGCACAGCTTAACTAACTAGAAGCAG
>nub 12627424 12628135|13784 chr2L 12627213 12627781 scaffold_23 1441045 1441748 + 5465|227 729
GTTCAAAGTCGCAAA-CACATCAAATACTAGCATAATTCTGTACTACGGATAGGTATCGACTCCAAAACAAAA-------------------------------------------------CGGGGTTTGCTT-GTGTTAACTATTAATGGTATTTATTTTAATG---TAATTCTAT---------------------------------TATGAAGATTATTC---------------------AAAATATTGCTGCTTAAGTGAAC--CGCTACTCATTCGGCATTCAAGTTCACTTGCTCAACAACATTTTGTGGATGCATAAGGAAATGGTATTTATTTGCCT------------TGATAAGCAAATGAATTCGACTTCTTTA--TAAGTCTTTTTGGCGT----ATGTGTATTACTAATATTTAAGTACA----------------CTCTTTGCACAATTTTCAAAGTCAA-AATAATGAATTCCTAGCGAATAATT
GTTCAAAGTCGCAAAACACATCAAATATTAGCATAAATTTTAACTATGATTCGGTTTCAAGAACCAATCACACACACGCACACACACACGCACACCCACACACATACACACGCATGTGGCTCTGTGTTTTGTTTTATGTTAACTATTATTGGTATTTATTATAACAAATTAAATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAAAAGAAATACTTGCATAAGAAAAGTAGCGCAAAAATGTCGCTGCTCAAGTGAACGTTGCCTGTGAACTGGAACTT--GTTCACTTGAACACCAACATTTTACG-------CCAAAAATTTCATGCAATTGCCCACTGTGCGCGCACTGTGGGCATATGTATTCAATTTTTGGAAATAAAAATATCCGGTTCTACACGGCGTATGATTAATATTTAAGTAAAGTTTAGCCTAAGACGTCTTTCTGTGTAGATTC--AAGTCAGTAAAAAACAGTTTCTAGCGAATAATT
>nub 12627424 12628135|13785 chr2L 12627825 12628175 scaffold_23 1441808 1442245 + 10481|0 401
TTGTAAGCATATTTATTTTTCGCGTGAATACTGTGATAATCAATTTGAATGA-TTTTAATTTTAA--TAAATGAAAAAGAA--------AACAAAGAAAAACAATATAAACATAAA---CTAACTGTACTTTGTATGTTATGGGCTAGTAAACTAACA-----------CAAAAAACATT--------AATTTAAACCTATCGTAT---------------TTATGTGTAAAAACCGATTGAATTTATGAAACACGAAAATATTTACAATTGTAAAACATGAAA-------------------------------------------TACTAGAATTTTTAAATGTATAACAAAAAGGAAAAAAAAGACAAAATCACAATGAAATAAAATTAATTATCAAAC
TTTTAAGCATATTTATTTTTT-CGTGAATACTGTGATAATCAA-TTGAATGATTTTTAATTTTAATTTAAACAAAAACTAAACAACAACAAAAAACAAAAACAATAAATAAATTAATATTTAGCAGTACTTTGTATGTTATGGGCAAGCAAACTAACAATTCAAGAAATTAAAAAACATTTTAATTTAAATTTAAATATACTATATAAAAAAATATGAAACTTGTAACAGAAAACCAATTGAATTTATCAGAAACACACACATTTGTAATTGTAAATTATAAAAACTAAACAAAAGAGAAGGCAAAAATATATATTAAAACTTGTACTAATAGAATTTTAAAATGTATAAAAATGAAAATTTATTAAAAAAATTAATAAAAAAGTAAA--TAATTATCAAAG
>pdm2 12685826 12686313|13861 chr2L 12685861 12686368 scaffold_23 1545394 1546043 + 4768|0 622
ATCTTGTACATAGTCAGCTTATG----------------------------------CTCCAAATTCTTCCACAA-CATTCCACATGCCAGACTCTCCATATCAAATGCAAACAAT------------GCCATGGATGTATTTAGTAAACTAGGTGATAGCC-AGTCGTATCAGAA--AATCCATTACGAATTTATGAGT-----ACATATAGCTCCA-------GTACACTATACTACCTATTCGTATCTGTATGCATATAGAGTTCCT---AGTTCTAACTAT------------------------TCCCCAAA-----TGCCATACGTGTGTATCTGTTGTGCCCCATATCCCCCATATCCA---------------TTATGC-------------------------CACAAAT-------CAGTCCTCTAGTTGTATTTA---------CTGTACTGTGTATTGACCTAAATGTGTA----TGTATATGTATACCGATGTTGTTGTACGATGTCCAATTGTAAATTGATCTTGAACACACTTAGATCGTAACAT----------------CCAAAAATTTCAATAAAATTATTCCGATAAAATAATTTATAAAAAAA
AGCTTGTATATAGAAAGAGAGAGGGAGGGAGCGAGAGAGCGAAAGAGAGAGAGAGAACTCCAAA-TCTTCCACAAGCATTCCA--------AAACTGCATATCGTATTAACCCAATCCCTTAGCCCCGCCCCTGGCCCTGCCCCTGCCCCTAGGTGATAGTCAAGTCGTATCAGCAGCATTCCATAACGAATTTACGAGTACAGAACATATATATATATATATATATATATTATATTGA----TCGTATGTG--------CAGAGTTCCTCCAAGTTCTAACTATACGACGTTTCTACCACATTCTCTATCCCCCAGCTGTCTGTCGTTCTTGCATATGTCATTAAGTACGTATTCAGCCTGCCCATACATACAGTCATACTTATACACACACACACACACACACACACACACACACATACATATACATTAATTTAAATATATTTAATATTAAACCTAGACTATGTAACATACTATCTATATAATACTATATATATAAAATGATATTGTTGTACAATGTCCAATTGTAAATTGATCT---GAACTCTTAGATCTTAACACACACAGAAACGCAAAAACAAAAATTTCAATAAAAATTATTTAAAAACTTAATTGATTGCAAAA
>PICK1 12698822 12698917|13876 chr2L 12696447 12699191 scaffold_23 1561977 1564645 + 84581|2443 2539
GCTACTTAGTACAAATATTAAGTAATGTGTTAGATAAATATTAAATGTTTCAGTA-TTTGGTGTAGATATCAAAAAATATTAAAAGCCTTTCAATTT
ACTTTTTTTT-----------------------------------TTTTTTAGTATTTTTGTGCAAATATAAAAAGTGTTGAAAAACCAATTAATTT
>CG12292 12706448 12706683|13883 chr2L 12705552 12706623 scaffold_23 1572021 1573066 + 54414|901 1076
CACAAGCAGCGCTACCAGGTCTAGTTACATCCCTTGCAGCGGCTGACCTGAAGACAAGGTTGCTTTACTCCGTAAACGAGGCATTGGTCCAAATATCTGTGCATATCACCTGCAATCACTTTCATCTCATCATTTCCATTTATTGTTCCTTCACTCTTGTTATTCATACATTCGCT
CACAAGCAGCGCTATCAAGTTTAGTTATTCCCC---------ATGGCCCAAA----------CTTGACTCC---AACCAACCAC--ATTCAAATTGCAATCCAAA------AAAACCATATCAAACGCATCA-TACCATTGATTGTTCCTTCATTTTTGTTAATCACACTTTCGTT
>CG6180 12708545 12708684|13885 chr2L 12707648 12708714 scaffold_23 1573769 1574861 + 33589|940 1109
TTTCTACGCCAAAAACCATGCTTATAT---------------------AAGCCAGTCTGAATTGGATTCAAATCTA-TTGTAACCTAGA-----AATTAAAGACACCTATGAACACTCTGTGAAACCCTCTGTTGCTGGCAATAAAATT---GTTAAAGACATATTAACT
-----AGACCAAGAGTTTTCCTTGCATTTCTCTAGATTACATAATGTGAAGCACATTTGTTTTTTTTTTTTATTAACTTGTAATTTGAAATTGTAATTGGAGCCAGATTCGAATCATAGACGAAG--GTCTGTT--TGGCAATAAAAATTGCGGCAGCTGCATTTTGAAT
>CG6214 12744172 12744809|13917 chr2L 12744152 12744546 scaffold_23 1605453 1605966 + 4313|20 531
GATCCATGAATGTTAACTTGAAACTCCACGAAACTCAAACGGAAGAGTGAGTGCCCCAAAACAACAAACTTTAGGAATATAGATGTACGAAAAGAAAATCATTCAACGGTAGCTTTAAGCCATTT----GGCACTGACA---------------------------GCTCTACCTCATGG-------------CTAGAACA-----AGCAACTATGA-GACAAAGCAAGCA--AACAAACACAACAATGGAACAATAA-------GCGAAAGAAATTAGCAAATACCAACTAAATGTTCATTAGACTAAGCGAAATAATTCAAGCCAGTTGCGCCTTCGTCGGTTACGCT------------------ATGTTCGTTTTTAT---------------------------------------TATGTATATGTATGTATTTACATAG-------TCAAGTGTATTTTTCTAT---------TGTCTAT-TGTACTTAGTTT----TCTATGCA
-------GTATTTTAGCATAAACATGGACGAAACTCATAAAAAAAAGTGTG-GCCAAAAAACAACAAAACAAAATGAACTAGAACTA--GTTAGGCCGCAATTGAACGCTAGCTTTTAATCAATTTAGCAACACTGGAAAATATTTAAAAGAAATAACGTTAAAGTGCTCTACCTCAGCGGAAGCAACAACTACAAAAACAACTACAACAACTATGGCAACAACAATAGCAACAACAATAACAACAAC--AACAACAATTTGTGTGTGCGTGCAATTAGTAAATACCATTAAAATGTTCATTAGCTTAAGTCAAAAAGTTGAA-----TAATGCGCTCGCAGGTCTCTTTTGGTACATTTCATCTAAAATGTACTTTTATATGTATATATATATATATATATACATATATTTATATATATGTACGTATGTGTATGTACTTACCTAGGTTCGTTTTATGTGTATGTTTGTATATATGTGCATGGCCATATATAGTTAGTGTATACTCTACACA
>CG6214 12744172 12744809|13918 chr2L 12744574 12744776 scaffold_23 1606000 1606190 + 3146|0 214
GGCAAGTTGGAGCATTATACCGTAAAGAAAAAAAATAACTCTTATGTATGCCACATATTT------ATGTACTTAAATTAACAAATCAGAAGATTGAGATACTACTTAAACTCCCTCAAGAATTTTTGCCTTCAACTGATAAGATCAGTACGA---AAAACGGTCAATGTAGTTAAATCAATTTATTGAAAC---TTTTGTAGATTGTATACTTA
TGCCAGTTTACATGTTA------AAAAAAAAATAATAACCGAAAAGCGTCCGACTTAATCACGCAAACGTACTTAAA----------ATATGAATGAAAGAAAAC--AAAACCTCTTAAGAA--TTTGCCTTCAAATGATTAAATCAGTAAGCTATTAAATGCCCA--GTAGTTAATTAGATT--TTGCAACATTTTTTGTAAAATGTGTACTTA
>CG6214 12744172 12744809|13919 chr2L 12744780 12745038 scaffold_17 1395322 1395594 - 1358|0 29
CAAAAATAAACAAAACAAAATCCCAATGA-
AAAAAAAAAACAAAAAAAAATTACTATAAA
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>ACXA 12925262 12925453|14138 chr2L 12925219 12925456 scaffold_8 4652013 4652281 - -2051|50 268
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TATGTATATAAAATTGTATTAAACACTGTACAGATAATATAGAACGTGATGAAACTAACCCATATACTATATTATATGACG-GTAATTAAAATGACCGTTAGAAAAATAAGTTCCTGCATGAAAAACTTTTTTATACAAA-----ACAGAAAAACGCGATTGCTATTATTGCATGGAACAAGTTATTGTTTATCAAAAAATAAGTATTATTTATATGTT
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AG--CGTGTTGTCCGTACTTTTACAACCTAATCTTATA-TTGTTATGTAGTTAACTTTTAAAACAAAAAAAATATTGCGTACAGTCAGTACAGAGTACCGTCAAAACAACAATTCCGTGCAACA----ACAAAAGATTCCAAGCGTCCACAAAACTATTGTTAACATTCCTGAAATATATTTTATTATTATTATTTTTTTTTTTGATGTAGTCGGAAAGAAGAATACACACATTCCGGCCTGCGGTTGCGACTT--CTTTACCCGCCTGTCGGCTGCCCCCGGCTGACAAACAGCCAGAACAACAATA-ACAACAACAACTAACTAACGTCCTTCTATGTACTTCCATTACCAATACATGTACACACACATACGCACACTCACACAAACGAGTACATACATACACGAACACGCACACGCACACACAAAACACGCAGATACAAATGCATGC----ATAGTATTATTGTTTAATGAATGGAAATTCTTTTGTTTATTTGTG-AAAAAGTCATGTTTTCTCTTTGTTTGTTTGTTAAACTTATGTAAATATTTAAAGTATGAAATATTAAATGTACGAATAAAGTGCAAACAACAAATACATTTAATGTAATTGAAA
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ATT
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AGTGCTCAAAGCTCAAATTGTATG--CATTTTGTAGCTAATTAGTTTTTAATTATTATTTACGAAATATCAATTATTTAAAATGCTGTTTCCAAATAA-TTACTGTGCTTATTCAATTGTCAGCAATTTTCGGCAAGAATTGTTACTCGAACAAAACGAAATTCATATTTATTTATG----------TGAAAAAAAAAACATCTTTAAATTTACAGATGTTCAAATATTTCAAAATTATTAAACTGTAATGA-ATAA
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ATATATTAATTGCGTTTACATATTTTTAATAA----CCAATAATGTATTA
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ATTCAGCCCAACAACAACAACAACAATACGTGCCACCCAGTGAACAGCAGGCGCCGGAACCGAAGAAGTACACGGGCAGCGCAATACCGAGTCGATCATTTAAAATTTTACAGGCAATGACAACACCAGAGAATGCCG
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GACCTGGTCAATCGGATCTATAATTATTTCTCAACGCCATAGAAATCAATTATAGCAACTCAACAGCATCATAAAGAAATCGAAACGAAACTGAATATTAATCAGATTGCTTGTTATAGTTATGTAGTTTAAGTACCAGACACTCTGAGGATCGCCACAATCAAATA--ACTTGGGAACGGG---------AACAAGTTTTTAGTAAAATTTCTTTACACTAACAAACATCATTGTAACTGAGAATCGAAAGTTTTT-----ATTGTTGAACGCGATTTGGTAGCAGCACTAAAACCATACAAAACAATTCTAACACAACT-ACGAA-GCAAATAGCGAAAGCGAATATATACTAATCCTAAAAGTTAAG-ATAAAGAATGC------------------------AGGTGCAATGAGGTAGCAACGAAACGAAACAAAATC-----CAAGAAATCGACTAT----GCTTGATATGTATCCGGATAACACGAAAGCGCACATCAAACACGACTAATAAT----ATATTAAATATTTTTGTT----------------------------------ACTTGCGA---ACAATATTATTTCATTTATGA-ATATTATCTTTTGTTTGTCATCAATATTTAT--------TATTT-TACTTA----GTTCGTATGCATACGAACGTTCTGCACA-TTTATTTGAA---TATTATTATTTGATACATAAATAAACTATATT
GCCCTGGACAATCGGATCTATAATTATTTCTCAAAACCATAGAAATCAATTATAGCCTGACAACAGACT-----------------------------------------TTGTCCT-------TAGTTTAAGTACCAG-CACACTTAGGATCAACACAGTCAGATATACCTTGGGAACGGGCCCTGCAGTAATAGTTTTTTAGTGGAATTTCATCAAACTAACG--TAGCATAGTAGTTGAGATGGAAATGTATTTCTTCAATTGTTAATCGCGATTTGGTAGCAGCACTAAAACC------------TCTAACAAAACTTACGAACACTACTAGCGAA-GCGAATCATTACTAACCTTGACTCTTTAGTATGTAAAATGTTTACACGAGAGAGAACTAACCCTTAGACGCATTGAGGTAACAACGAAACGAAAACAACGCAATGACAGCAAATCGACCAATCAAACATAATATTTATCCGGATAATGCGAGAGTGCATCTTAAAAACGATTAATACTTATAAAAATAAATAATTTTGGTTTAAGTAATCTTTGTGTGTTGTCTTCATCAAGCGACATTTGATTTAGAACACCTTTTCATTTTTAACAAGATAGTTTTTGTTTGTCATAGTTATTTATACAAAACATATACATACATATGGTATTCGTATGCATACGAATTTGTTATAAAATCTATATGACGACTATTATTATTTCATACTCA-------TATATT
>CG6116 13289291 13289561|14506 chr2L 13289098 13290561 scaffold_7 2317090 2318584 - 2689|193 557
GCT---------------------AATGCACCCAAAAGTGT-------TATATTTCCAGCGTTTATAT---------------------CCAATATCCAAGATAGCAT-------------------TGTTTAGC--GGCTCCTCCTCAGCGGGTTTCTTG----GTATTGGCCGCGTA------TTGTA----TACTTTTAAATTATAAAAGTCAATGGTGAAGTATATGTGAACGGTAGTCCATTGCGATAATA--------TTATTTTTAGTTGTTTAAGATCTCTGTGTAAATTCCCTTTTATTGTTTGTTTGCTAA--TATAAGCTACGAATAAAGATTAAATATTTTATACATGACAAA
GATAAGATTTGTGTGCTGCGGTTCAATATAACCATATATTTACATAAACATAATACAAGTATCTATATTTATATAAACTGTCGTAAAGCCCCATAAACAAAGCAATGTGTTTATTGGTTGTGCTGAGTTTTTAGCAAAATTTATTTTCACTAGATTGCTTTTAACGTATTATGTACTTGAAACACTTGTATATTTATTTTTAAATTATAGAATGCTTTGGTAAGCAAACTACAAGC--TGGTTTAATGTCTGCATATTTACTTGTTTTTTTTTTTTAAATAAGATCTCGTTGTAAATTCCCGTTTTTTGTTTAAATGGTAAATCATAAGATGCATATAAAATATATAAAATTGATTAA--ATAAA
>CG31729 13301066 13301660|14512 chr2L 13295805 13301739 scaffold_7 2325312 2331443 - 208517|5638 6248
ATGGCGGCCTGGCAAATGAAATACAAATTACACATTATCCTGACTATAATTTCCATTTAGTTCTGTTCACAATTTTAACATTCTTTGTTATTTACCACTTGATGAGTTGTT--CTTTGAACTTGGCAACCATCCCACAACTATTCTTT--GTTTTGCCAATACCCGCACCAATCCCAAATATACGTGATATCAGGTTAAACTCCCCATCTTCGACACTACACTTTTCACTATGGTATTTTTGTTTAATTTTTAAAGTTACACAAAATACAAAAGAAGAAGTGATTCGATAATTGTAATTTGAATCAAACCGATTCTTATTTTTAAGCGTGAGGCGTAAAAGTTTTAAAATATCCTTCAGTTTTGTATACCTGTGTGTATTTGATTAATATTTAAGTCGCAA-AAACCAAATTATGTTACTAATTATTTAAAGATAAAATAAA-------TTAATGATAATTGTAACTATGACTAATAATGAAATCAATTACCATGGTATAAGAATTAAAATGTAAAACAAAAAATATAGATTTTGTATAAGGATTTAGAAATTGCATTGCATTGTGTAATAA--TAATAATAAATAAAAATATGCATATATTAAT--TATT
ATACGGAATAGGCTGA------GCCAGCGACGAATTTTC--AGTTACAAAATTAAATATCTCCTTTTTTAAATTGCTTTGCACTTTTGTACGCTTAACTTAA-AAGTTCTTGACTTTGTTTTTGCCTAACATTTTGTTATTTTTGTCCAAGTTCTGCCAA---CCATACACAACCCCCCCATACGTGATATAAAGTGTAATTACTTAACCTACGCAGTCTCCCTTTGTATGT-TTATGTTTGTATAATTT---AAATTACACAAAA---------------------------GTGAAGTGAATGAAAAGG-------------AACGTGA----------------------------TTATGTATACATTTAAATG-ATGATTACTTTTTAAGGCGCAGTAAACCAAATTATGTTACTAATTATTTAATAATAAAGTAAAAATAAATGTAAAAGTAAATGTATCTATGGCTAAAACAGAAATCAATTATAAATGTGTGAAACTAAAAGAAACCAACCGACAA-ATAGATTTTGTATTAAGTATTAAAAATCGA--TGCATATATTAATAAATTTATGATAACTAAACTTTCTTCAAGATTAATACTGGC
>CG16825 13307687 13307807|14517 chr2L 13306068 13308308 scaffold_7 2337457 2339704 - 42080|1769 1890
GATATGGTGATTTCTTGGCTGCCATTTTTGTGGTTTAGATTTTTTATAAGTCTTTCTAAGTGCTGTGCACAATTAA-ATTATGTGTCGCAAAATTTTTTGTTATTCCTCAATTAAAACCCCC
GCCGTGGCGTTTT-------GCCAT--------------------------------AAGCGAT-----CGGTTAGCATCACGTATGG----------------------------------
>CG16826 13348823 13348959|14576 chr2L 13347409 13348962 scaffold_7 2397207 2398709 - 377|1455 1593
GATTTCGGGGAGTCATCCAGTAATGAATATGACAACTCCAGCAATGACGACGAATCCTCATGGAAATATTTACAAGAACGTATAGTGTATTTTAGGTGTCGG--GTAGAAGCAGCAAAATAAATTACTCTAATGCAACT
GCATCCGATGACGCATCCTCAACGGAATCAGACGACG-CGTCA-----GACGCGTCCTCCT-------TTTTCGGCGATATACTGTCCAAGCTTGGTGATGGAAGTAGGAGTCTCTTCGAGAGCATTTTTAATGCAACG
>CG6523 13367309 13367410|14595 chr2L 13366342 13369321 scaffold_7 2425811 2428731 - 84763|1003 1114
TTCCATCGGATTGCATCTACTCCTACAGACACCATAAACCAGAAACAAATTTTTAGCTAGATCCTTAGACTTTTTAATGGTTTAATAAAGGA----------TTTTTGCTAC
GCTAAACGAAT-------AAATGAACAAACATCGCTTCTCACAAACCAAT----------AATGTCCAACTTTTATAAGCAAAAATAAACGAAAACATAAATTTTTTGAGAA
>CG31855 13369731 13369997|14596 chr2L 13369398 13369978 scaffold_7 2429623 2430179 - 16582|336 595
GCTGGGCGGCAGGACCTTAAGCCAAGCACCCGATGGACATCCCCACGCAGCACTACTATCCCGAGCGAACACGCAGCCGCCACCATTCATTTACACTCATATACATATATA-TTAAATAAAATATACTAAGTACAAAGGAGTTGCAGTCGAACGGTCCTTT------CAAAGTTTTGTATCACGCTGATCATTGGTCGAAAGCCC--CAGTATTTCTTTAGATTTCAGTTGTACC-CAAATTAACACAGCT--AAATAAT
----GGCAGCCACACACTCAAACATGCA--TAATTCACATCTGAACT--------CTGTGGAGAGCAAACA-----CTACCATAAAACATTAAGATATAT-CCCATTTATGTTTAAAATAAATACGCTAGAAAGTAACTAACTAGAACCGTATATTATATTGGTTGGCGAATTGTTCGATCA----GATAATGAATC---AGCCCATCAGCATATACAT---TTTCGAATATGTCGTAAATTCTCATCATTTCAAATAAT
>CG6565 13375841 13376182|14598 chr2L 13371465 13375850 scaffold_7 2431045 2435590 - 128480|4803 4812
CTCCTTTACC
AAGCTGCAGT
>CG6565 13375841 13376182|14599 chr2L 13375925 13379386 scaffold_7 2435678 2438948 - 97353|0 346
CCCAGTTCCATCTTATGTT---CATCCCTTCGATCGGCTTTAAAATTCAGGCGA--------GAGAAATCGA--------------------AACCA-----TTGAACATCAGAGCAAGTGTGCAATA------------------GGTGGAAGTTTTGCTCTTAA--CATGAGTGCCACTTTGATGAGAAAC---TTAAAAATAAATATATACCTATAT-------------------TAGCTATATGGCTAAACCAAAATATT--TTAAGTTTAGAAATT-------GTTTTAAACG--CAAATAGAAATTATTGAAATTAATTGTACAATAAAAGAAACGAAAA
CCCCTTATCATCTTATGTTGTAAATCATTTATAAGTACATACATATAGAAGCAATGAACAATTAGGGATCGATCATCCAGTTTCTAGAACTTAACAAATTATTTCATCAACTGTGCAAATGTGCAATAAAATAGCATTCGCAACTTGGAGGCATTTAAAATGTTGAATCTTGTGTGCCACACTAA--AGAACCCGATTATACATAGCTACATACATGTACAACACGTATAAAAAATTTACATATATATATTTTACCAAAAACCCTGATTAAGTTTAGAACTTTGTTTTCTTTTTAAACAATTTATCAGAAATTATAAAAATTATACATACA--CACACATGTAAAAA
>beta'Cop 13382182 13382391|14600 chr2L 13379484 13382477 scaffold_7 2439237 2442221 - 140364|2751 3039
GACGGA---------AGATCACAGCCAG--ATCTAGAATACCATTTAAA----CTA-----TCGTTTACTGCTACGGGAGTCCCACATTTCGTGC------ATTTCGAGCCACAGAATTC-------------------CGCGCATGCATTCACATTTGATTTGATTGAATGT-TGTTT--------------------------AAATATATATCTATTAATAATATGTACAACAGTAATGGAGCAAA-------CACTGCAATAAATACTTATACAACAATTTCAAA
ATGCGATAGCTATCCAGAGCACACGCTGTATTCGATAATATGGATTAGAAATGCTGTAAATTCTTTTGTTGATTCGGAATACCTGCAGCAAATGTCACAGAATCGAAAGCTACAAATTCCACAAACACACACACACACATACGCATGCATTCAGTTTTGATTTGATTGTATGCATGTTTCCCGTGCATTAATTATAAAAATTAAAAAAATTATATATATATATATTATGTACAACAATTATGCAGCAACATCCAATCACAATAATAAA-ATATATTTAAAAATGTGAAA
>CG6866 13385233 13385674|14601 chr2L 13382637 13385282 scaffold_7 2442232 2444978 - 69192|2921 2970
GGGGTGCAGCCAACTGAATAGCAAAATCTGAACGCACACCACGACCACGA
G----TCAG-CAACTGAATAGCAAAATCTGAACGCACATAACGACGATGA
>CG6866 13385233 13385674|14602 chr2L 13385383 13385590 scaffold_30 1282829 1283043 - -659|0 229
ATGTTACATATATATATATATATATTTTGTTTCTTTTCCACCGATTCCTTTGAT--------TAGGCAGTTGTATTTGTTAACTGCATATGTAAATGTTCATATATGTACTACACTTACCG---ATGAATGTATGTACGCTTGCAAATACAGACAAGCGTGTAATCGATATTGGAATCTTCTAGTC----GCTTTCAAATTCTGAAAAACGTAAA-------ACGGCAGA
ATATTAAATGTGTCT-TATACATAAT------ATTTTACACTTATGTATTTCATACAACACGTAGAGAATATTACACATTAAC---ACAAATAAAT--TTGTATTTTTACTGTACAAACTAGATATTAATTTAGTTTTTTTTCCGACTGTGGAAAA---TGCTATAGCTATGAAAATCATGGGGTCTAGAATTTTATAAGTTGGGTCAACAAATATTGATGTAAGTCAAT
>CG6866 13385233 13385674|14603 chr2L 13385591 13387312 scaffold_7 2445471 2447336 - 51647|0 89
TAAAACTAGGTTTAAGGTAGACTACGTGCTAGTTTG------CGAAGGAAAAAGGCTTATGAATATAATCGGTATTTGGTAATCGCTACT
TAAAACTGCTATCAAGGAAGTAAACTTGC-ATTTTAATGGAACAAGGAAGAGAAACATATTATCTAAAGCAGCAGAGGTTGCACGCAGCT
>CG7099 13393723 13393962|14605 chr2L 13391306 13393725 scaffold_7 5207882 5210483 - 69767|2626 2628
GAT
AAT
>CG7099 13393723 13393962|14606 chr2L 13393749 13393925 scaffold_7 2451066 2451255 - 957|0 190
TAGTTTAGGTTGCACTAATTCAATGACTTT--------------TCTTAGATTGTAAGATCAAATTCCATTGATTTCGTTTTGTCTCTGATTACGATTGTTAGTTTCTTTTTTTCTATAAACTGAAGTCTTCAGTTCGTTTATCAATTATTTTTTTATCCTGTCCAACCTATTCATTTTACATAGTTTTTT
TAGCCTGAGATACAC-AATTCAATTACATCAAAGGAAAACACAATCTAAGAATATCAAACTGAAATATTCTAAATAAACTGCGCCTGTATTCAATATTGGTAAGTTTATTTTTTCTCTACATTTGGATACTGTAACTGTTACTTAAGTTTCCTGATGCGCTGATGCGTGCGTTCTTTTCGCATTCTGTTTT
>CG7110 13410560 13411047|14617 chr2L 13410472 13411163 scaffold_7 5223042 5223741 - 8101|101 640
CTCAAGTGGGAGCCATAAGAAAACAATTGCAGGCAGCACGATTCTTTGACGAT---------GAAGTTGATCCG--GATGATTATTAATGAGGTGTCAACCACTCGTTTTCAGAATAACGAAAATGATTGGATTGACAGCTCTTTTAAACCGAGCAAAACGAAT-TTAAATATTTTTGATGTCT----TCACATTTGCCATTATTATTTCACACTTATTTCATTTTGT-----------------------AAACAACTCATGTAGTTATAACTTTATAGTGAGCTGGTTCCAAGTGCTTCGGCTGTTTCATTCAGCGA------CTCTAATACA--TAAGGCATAAAGTTTGTTAACGTTTATTAATCTTATTTTAACAGAAATCTATTAACTGAAAATG----TTTAAACGAGATAAAGTCAACAATTAAAGAGGAACTTACCGGAATTTTCTAACAAGTTGTTAAATTTCTTAA-AATTATGTATTTAGGTATGGATCAATAAAACAATAATTTTATTGAAGCTAATCAAATTTTTG
CCCAAGTGGGCGCCATACGTAAACAGCTGCAGGCGGCGCGTTTCTTTGACGATGTCCAGGACGAAGTCGACTAAGCGAAAGCTAATAGCAATTTTTCAACTA----TGTTCGAAAAATTG--TCTGTTTAGTTTA------CATTCAGTTTGAATAACTTTAGTATTGACTATTTTTAATATTTCACGTTTCATTTTCACACATTATTTTA---TCATTTCAATTCGTACTCCACATTCGACTATCCAATCAAACTACCCCCTGAGATATA--TATAATATGATATGAGACCATGTGCTTCTGCTGTTTTGCGCAGCAATTGAATTTATAATACATTTAAGCCATAAAGTTTGTTAATG-------------TTTTTACAAATATATATATATAGACAATGATAATTTAACTAAATTAAATTATTCTATTGTGAATTGGCATATCGGC-------------TTGTTAAAGTTGACAATAAATGGATATTT-TATAAAAAACAA-AAAAAAATACCTTAATCTTAGTT--TCAAAGTTTTT
>CG16848 13413358 13413718|14620 chr2L 13412462 13413686 scaffold_7 5225798 5227069 - 20420|928 1331
TCATTGGCCAAAGT---TCAGGTCAAGCGCAAAGTTTCTGGCT-----------------------CTGCTCTTGACTTGATTTTCTT---TTAATTTTTTCCCGACCCAAAACGAGAC-------AAAGTGGAGCAGCAAGTGTCAGC-TAACTGGGCCG---------------ACAATTCTTCGT----TGAGACCCCATTTCACTTGTTCACATTTCGCATATCACACAATTCGAATAA---------CTTGAACAAACCGGCCTAGCCCCTTATACAACTTTTAACTACTGTATAAGAGAAATGCTAGTAAAAGTTTTAGATATTTGGTGAGTTTTGTCAAAGCTTTTCGC--------TGCAAAAGCT--CAGGAACTCTGTGTTCTTAAGTGTTGAA
TAAAAGTACAAAATAGATCAAGTCAAATTCAAGTTTTTCCATTTTTTGCATATATGTATAAATATATTTTTTTTAATTTGAATTTTGTTGGTCAAAGTTTTCTTTTTTCAACTTGCGAATGCTTTGCAATTGGAGCAGCAAGTGTCCACAAAACTGGGTCACACACAAACATATGCACACTCTTTCGTACACACACACACCATATATTTTGTTTGCCATTCGCGCTTATCAGAGCCCATATTATAATATATTTTTGTATAA---GAGCTAG-----------AATATTGAGTA--GTATAAGAGAAATTCGTGTGGTGAGTATAGGTATC--ATAAG----GTGAAAGCGCATTGAATTGATAGGGCAAAACTTAACAAAATATTTATATTGTTATGCGCCAAC
>CG16848 13413358 13413718|14621 chr2L 13413687 13414451 scaffold_7 5227967 5228748 - 8656|0 31
ATTTTGATGTATTAAATTAACTATTTGTTTAT
ATTTGGAGAAATTACTTTACTTATTTATTAAT
>Tehao 13439265 13440955|14645 chr2L 13436370 13439573 scaffold_7 5281758 5284703 - 58944|2941 3270
GGCTTGAATAAAATGTAAGATATTTTAGATGAATATACTCACTCGCTTTCAGTTGAGATTCTCGTAGAGATCCCCCTTGGCGAGGCAAACTTGGGCCTTAAA---AGCTAATTTGCATGCCTTGCTTAAAGTTCTAAAGTTATTATGACTATTTAAAAAG-------TATTGATA-CATACATCATAAGTAATTTAATTTATTTTTAAGCAAACTAATGACCTTACGATTTTGTTTCCAATTTTCCGGAAATTA-TATATTTACAACGTAATTTTACAAGT------AATATTT---ACAAATTAATAATAATGTCAATAAAATAAAAAA
TATGTTCCCAAAATATATCA-ACCTTTGATTAAT-TAAACACATAACTTTAGTTCTAGTTATTTTTCA-----------------TAAGCTTATGCTATAAATTTAGGTAATCT---TATCTTAACTCA--TTCTAAGATAATTTAAGATACTCGATAGGGAAGACTTATTTATAGCATAGCTTAT-ATTTCTTTAATTAAATTTAAAGAAAATACTTCTTAATATTCTTTAGCGGGCATTCGCTTTAACATTGTTAAATTTTTTAAGCAATTTTGAAGGTCCTCGAAGTACTTTAAGCCGATTATTAGTAAT-TCGGCATAGTCATAAA
>Tehao 13439265 13440955|14646 chr2L 13440264 13440413 scaffold_7 5286026 5286171 - 686|0 152
AAAATGCCATTTGGCCTTAAATGA---ATTTTAACAGCTGATGTGTGCATAAATAAACATGAACTGCTGCTCTTCTGCATGACTAAAAATTAATTTTTCCAAAGCTGCACGCTTTTATTCCACATTATTATTTGCCAAAGTCACCACATCATA
AAATTGCCAATTTATATTAATTGCTTCATTTAACTATTTAATTATAGCTTGAACAAGCAATAAGCTCTAAGCTGTTATACTTCTCAACATG-----TTATACTGTTATATTGTTATATGTAAGATTATTATTTGT--AATTGGCCATTTAATA
>Tehao 13439265 13440955|14647 chr2L 13440449 13440948 scaffold_7 5286221 5286659 - 7597|0 507
TATACGGGCTTAAATATTTATTCAGTCACATGCTTTAAGCAGCCCTCATAGCCTCATCTTCAAACTCTAATTATCCACTTCGGTAATTGCGCTGGCCTTCATTGCTCAGTTGAGTCGAGCACTGGAGCCCTTTCCCCAAATAGGCCGATTCAGGCCCAAAGTGGCGAGCCAAGCCAATTCCCAGCCAGATATAAGTGAAAAT--ATATGTAATAACCAAGAGGGCAGAGAAAAA----CATTTGGCCAACTTGCGCTCCCTACACTGTCAGCCCTTTTTTTTTTTTGCCGCACGATTGCGTGACCTTTTGTCCACCCACCACCCACAAGCCACCATCAAAGTGGGTGGTTTGGTTGGTTCTGCAGAGCGTCTTTGAAGATTCATTGCCTGCCCGCTGGCCAACACTTTGTGGGCGAGTCGAACAAAAGAGTGAGGGTCATGGGGCAAGGGACA--AAGCTAGAACACTTATTTATAACGCTTGGTCTTTAAACTTAAAAACTGAAATA
TAAACTAACTTAAATATTTATTCAGTCACATGCTCCAA--AACGGGCCTAGACCCAAGGTCAGACCCTAATTATCCACTTCAATAATGTTGGTGGCCTTCAAAGC--------GTCGAGTACAGA------------GAATAGG-------------AAAATAGCGGGAAACGGCTACCACCCGCCCAGCGCAAGTGGCAGCCAACTTTTACGCAGCTAGTGAATATAGAAAAAATGTAATTTTGCCAAGTCTCGCT-TTTATGCTGTCAGCCCTTTTGGCT---------ACAATTGCTTGGCCTTTTGGGCATCAAC----------TTTCATTGAAAGTGTGTGTGTGTGTGAGAGTTCAAGTGGGTC-TGGAAGATTCATTGGCCGCCCATCGGCCAATGTTTCGGGGGCGTTTA------------AAGTGTCATAAAGCAAATGCCATTTAGCGTAGGCAAATATTT-TAAGTTCAGAGCTTACATTTTGAACACTAAAATA
>CG31846 13484612 13485098|14677 chr2L 13483194 13487774 scaffold_7 5335531 5340274 - 70449|1484 2022
CGCAGTTTTTCAAACGCCACAGCTACAGAAAAACCCCCCAAAAAACCAACCACCACAAGAACTACAGCACTACACATAGGGATCTGTTTTGAAAAAGAACAGATACCAGAATTAACATAAATATTACTCTTTGCTTCTAT--------------TTCTATACTCCTCCTCTTTGTGCCTATCAGTACGTTC------------TCGTAGTTGTTGAGAAAGTTG--------------AGAAAGTAACCGTAACCGTAATCGGACTGAATGCACGCCTCTTTTTTGATGCTGCCC--TCGAC-GATCGACATAACGCGCA---------GACTTCGTGACATTTAGTTTTGGACGTTATTAAGCTCCTAAACCTGTATTCTGTGTCATCCCATTGATTTCGAACTGTGAACGCAACCCCAACGTATACGCAATCACTGACGTTACGCATACGCACCGTTGTACAACGGACAACTGACGTATAAAACATAAATACAAGAACTAAGAACTTTAACCGTTAACCAAAAGAACAAAAAAACAA
CGCAGTTCCTCAAC------------------------------ACCAACTAT-ACAACAATAACAGCACAACACTTAGAGA---------AAAAACAATATTTAT--------ACTTAAATA---CTCGTTGCTTCTATATACATATATATATTTCTATAATCCTCCTCCTTGTGCCTAATCGAACGTGCGCTCATATTACGTTTTATTTATTTCGTACGTTATTATGGCTGTGCGCATAACGTAACCGTTAACGTGAC--AATTTGTTACGCAATTATGTGTTGGCACATGCAAATCGATTGATTGACGGAACTTGAACTCGGTATTGTTAACGTGACTTTTAGTTTTG-ACGTTTTTAAGCTCCTAAAC--GTAACCTGTATCATCCCATTGATTTCGTACTG--------------ACGTTGACGTTAAAAAGGC--TTACGCAAACACACGTTTTGACA-------------GTTTAAACCCGTACAACAAG-----------------------CAAAACAACAACAACAAA-
>CG31847 13499056 13500424|14689 chr2L 13497686 13500690 scaffold_7 5354073 5357125 - 50175|1498 3045
A----ATTAAATGG-----GATTTAGTTACGTTTTTAGTTAGCCAC---------CAGGTCTATATATATGTATATGTCTAGGTTCTAGAAGCGCGTGTGCATGTGCAACAGGATGAGTGTCTGCGTGTGTGGTGAGCTGTGTGTGAGTGATGGTGAATGGTTAAGATCGACTAGAGTTTAGATACCTATGTACCCTAAAACTATCTTTTGAATGTGCCACA--------GGAACCACTAAGAGAAACGAATACACCCCTTAACTGAATCTCTACCAAGAAGTCATGTTC---------------TGAAACATAAATCAAGTAAAT--TATATTTAAAACAAAAGCTACAATTAGGTACATCAATTGGCTAAACTTTAATCATCAATCAATAAGACTCTATAATTACCAATCAGAACATGTCGCTATTATTTCCATTCAACTCCGCAAC------TCGCTTTCAGTGTCTAATCGAGTATATTTCCCGAGGCTTAACTCCTCTATTCTTCGCAAGCCACTTGATTTCCCTGCCCATCTTTTGGA--TGTATCATCCAATCTATAGCTAACGAATATTTTCCCAACATTCTAGA---------TCTGTGTG---------------TCAGGCTTTAGGTGGC-ATATTATACGCC-CGTGCTCAGCAA----AATGTTGCCAACCTGCGCTGTTCGAAGCTATCCCAAATTGAAAACAAAAACTAAAAACATAGCCAGGGTATTATAAAGTTTGTATACCAAACATATCGTTAACTAAATACACAAA-------CGAACAATTTAAAAAAGAAAACCAATTAT-------AATATGAAACAAAGAAAGGTAAACTTGGAGCGTCGTCC---TAATTAATAAAAACTAATATAAACAAACTAAAAACCCAATTAGATATGTACGAATAAAGTTTGGG---------GTATAAAACTAAATGGA-AAGAAGCGCAAACATTAGTATCTGGTAAATGTGCGGGTGTTTTCAAAAAATACAAATAA-----------ACCCA--AACAGTTTAAAAAGTATTATGCAATCGCTGGAGAGCTCTCCAAAACATACAAAATAAGAATTCTCAAATTCTGCGAAA----CTCTGTAAAGACTTTAATTCGATTC-CAAAGCAAAACTGAAACTAT-TCCCGATATTT-----GTAATATCTTTCCGTTTCGACAGCACTTTTTGAAGCTATTGCTAAATTTCAAAGAATATAATTGCTTGCTGTTTCAACC--------CAAAGAAAAGTGAGCCGAGTAATAATTAAAACGAA-------CATAAAACCGAATACAATAGAATCGAATGTGGCCGTTAAATTATAAAAGAAGCGAAAATAATTA---------AAGGTAACATCCCAGAAACT---AAATGTGTAAA-------ATGCATGTACAGCAAACAAAGCAGCAGCAAGAT-------ATAGAAA---ATAATAAACAAACTTTATGAATTAGTATGTATGTATAC---TATATGTGCAGAAATAAAAATGAAATATAT
ATGCGAGAAAGTGGATACAATTTTAGTTAGGATTTCATGCAGCTACAACCTATAATAAATATAAATGAGTGTATATGTCTCTGTTCCAT-------------------------TGAGTATGTGTGTG----------TGTGTGAGAGAGATTTTG-----------------GGGGTGTGTGTAGCTA-----CTTAACAGTCTCTCTTGAATGTGCCACAAACATCATGAAACCAAATAATAAAATGAAGAAAACGATTCCGTAAAAC---GCCTGACAGTCATGTGAAGGATTTCCTAAGAGCGAAATATATATTTGGTTTTTCCCATATTTAAAAT-ATATTTTCATGAAATAACTTTAGCTGTTCATATTTTCGTTTTCAGT---------TTTAGAACTACCCGTTAG--TATTAAGTTTAAGTTTTCAGAAAATTTCCTAACAATTTTCTGCTTTTTAAGTTTTGTTGA--ATTCGACGCGTGGCTGACAACCTATA---------------CAGCTTTCAGTGTCTATTTTCTAGAGCTTGCTCCTCTGATTAAAAATGGACATATACTTTGGCAATTTTCAAGCGCACTCCTTTCTATACAAAAACTGTTGAAAATTCACGTTTTCTGTGGCAACATATTTCGCCAAATGCTCAGCAAGTAGAAAATTGCCAAGTCGCGCTCTCTAAAGCTATACCTTAAT--------------------TAGTCAGGGTATTATAAAGTTTGTATACC-AACATATCGTTAAATAAATATACAACATATAATAGAATATTTATAAAAAATTAACTAAGCATTGAAAAAGATAGCGAACAGAGAAAG-----------CCGTCGTCCATTTGATCAACAAATATAGCTAAGATTCAATCAAGATTTATGCATGGGCAGTACGA--AAAGTAAGCAACCCACATTATATATAATTAATTAGATATGTAACCCAAAATTGAATGTC-------GATGTAGTTGAATGTAAAAAAGACATATAACTAATATAATGACCCAGTAGCAACTGAAAAAAAATCAC---ATCGAT------------------TGCAACACGAGAGTCTTAAAAATATGTTAAAGGAGCTCT-TAAGGGGTATAATCGTACAAGAAAAGTAATGTTTCAACTATGTTTAAACATTTCTGAAGTGATGTATTTTGAT-------GAACTTATTTTTATTTTTCTTCAATTTTTTAAAAGTTTTATGTTTACTTCTTAAGCCACCTGTTTAAAAAAAAATTGCAACATTCGAGAATCTCCACAAAAGTTACTCATTCAACCAAA-GCAGAAGAATTGAA---------CAAATTCTTAAAAAAAAGTATTAGATTATATCAAAATAGGAAAGCAAACCAAAAGCTATGAAACGGGCAAATAATAGGAAACATGTAAAACCCAGAGAGAAAAATCCAAATGCAACTAATTGAGAATTATAATAAAAACGATATATGAATTAGTATGTATGTCCGTATATGTATGTGCA-AAATAAAAAAAAAAGGCAT
>CG16852 13541575 13541647|14727 chr2L 13541166 13541997 scaffold_14 1145142 1146028 + 13581|434 530
TTGTAATAAGAATGATTCGT-TTTGCACGTGATTGTATGAG--------------TAAAAATGCAGTAAAC---------AGAATTAGCAGAACAGA
TTAAGCAGACACTGGCTCGCATCCGTGCGCAGCCGCGAGCGGTCCCAAAACTCGATTGATGTGTAGTTAATTATTTGTCGATAATTA----AACGCA
>CG16853 13543558 13543560|14728 chr2L 13542174 13543585 scaffold_14 1146471 1148050 + 8795|1654 1656
TCT
TCC
>kuz 13636650 13636843|14844 chr2L 13634524 13636844 scaffold_7 605163 607458 - 104597|2249 2445
GAGCGGAACCATCACATTGCCATACACAACACTGAA-CGAAATATAGCCCCGAACCCAAAATATCAAATGCAACCACATATAGAATCGCCCGCTGCTAGTCATCGAA-CTACATGTATGAGTTGTTGCTTC-CCATCCACCGACAAACACAAACAGAAAAGAAATTATAATGATATTTCATTTAATCGATGCAATTG
------AAGAAACAAACGGGCATGGAACGCGTGGAATTGGAAC---GCCTCAAACATGCCATATTGAAT---ACTAAATA--------CCCAGCACATGCCTCCAAACCCACGCGCTTGCGTGCCTTTTCCACTATTCCACGAAACGCTTTCCCCCATCAGAATTCG-------------------CTAAGCAATTG
>kuz 13637288 13638263|14845 chr2L 13636845 13637288 scaffold_14 1315840 1316327 + 1187|516 516
G
G
>kuz 13637288 13638263|14846 chr2L 13637289 13638582 scaffold_7 608399 609746 - 34487|0 1072
CGTCGCGCC---GCCTCCGCTACAAGTAAGCTTTAGTCGGCCGACATCGTTGCACGAGCAACAGC---AGCAGCAACATC---------------ATCTGCAGCAGCAGCAGCAGCATCAGCAGCAACTGGAG---------CCGCAGCAGCAGCACGCCTATGCCGATGCTTATGCGGCCTTGGGACGGGGCCAGTATGAGTCCACCACGCGGGCGCCCAACAACAGCAAGGTTTGACAGCCAAAAGTAGCAATGGAGCGCCACAAAAGGCCAAAGGCTAAGCGACTCAAGCAGCAGAAGGAGCCGCATACACAGCAAACAACAACACAGCAACAAAAGCAAAAACAACATAAATCAAATGAACTCAAATTAAATGTAAATGTAATTTTTATGCTAATTATTTTTATTTAAACAGTGT------TTGTATGCCACAAGGGAAAA---CAGCCAGCAACAAAAAGAAAAATACAAAAATAACACAAAAAAGGAGAAAAATTTCGTAATACAGAAAAAGCTGAAAGTGAATGATATTTTTGATTAACTAAATTAAAATGAAAATACGAATGCAAATTATGAATAATAAAAGTAATTAAAAACGACAACATGCATAATACATATAAA---------------GTTGCAAGTTGCATATATATACATTTGTATGTATATAT--------------TTATTATGGATACACAATTATTAAATAGCAGCAGCCACAACAAACAAGTAATATACATGAAGAAAAACTAAGGTTTAATTGTATGAGA-----AAGCATTCTATATGTCGGTGAGATTTCTAAGCGCTAGGCCGAAATACAAAATTAATTACACACTTGAATAACAAAATGT---GTTTTGTACAAAAAAAATGAA----ATAAACAAAAACAG-------------TGCGAATTAATTAAGCGTCATTATAAAAAAAAGAACGGAAACAACAAAGCATTTAAATTGTATTTATCTGTACCGAAGGCTAAACGTTTATTTAAAGCCGTCAAAATTGCATTTGTAAACTAGCAAA-----ACAAAAAAAAAACGATGAAAAC
CGTCGCGCCCCCGCCGCCGCTTCAAGTAAGCTATAGTCGACCGACATCGCTGCATGAGCAACAACCACAACAGCAACAGCCGCGGGAGGAGCTGCACCAGCAGCAACAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGGAGGCAGAGCAACAACAACAGCAACACGCCTATTCCGACGCCTATGCGGCTTTGGGGCGTGGCCAGTATGAGTCGACGACGCGGGCGCCCAACAATGGCAAAGTTTGACAACCAAAATTAAAGTCGGAGCGCCAAAAAAAGCCAAAAGCAAAGCGACAAAAACAACAG------------------------------CAACAACAACAACAACAAGAACAAAAATCAAATGAACTCAAATTAAATGTAAATGTAATTTTTATGCTAATTATTTTTATTTAAACAAGCTGATAAATTGAATGATGAAAAAAAAAAACGCAGACAGAGAGTAAAGCAAAAATTTCATATGAACCAACAAAGGAAGAGG----------TAAAAAAAAAATAAAACATGAACGATATTTTTGATTAAATTAATTGATATGA------GAATGCAAATCATTATTATTATAAATAATTAAAAA-GGCAGATTGCATCATATATATATATATATATATATATATATAGTGAATAACAGAAATATATATATGTATACATACATAAACATAAATATAATGATTGTGCGTACTTATTTACAAAGCAGCATGAATAAAAACAAAATTGAAATGTGCGC-AAGAACAACACAAAGATATTTATAAAACATATTTAAATACTTTAAATGTCGAACATTTACTAAAGAGCCAAGGCAAGA---AAAATTAATTACATTTCCCAAAGCGCAAACATATGGTTTTGTACAAAAAAAATAAATAACAAAAATAAAAACAACACGAAGAAAAACTGCAAATTAATTAAGCGGC----------------------TGGCAATGCATTTAAATTGTATTTAATTGTACTAAGGGCCAAAACTTTGATTAAAGCCGACGAAACTGCATTTGTAAACTAAAAAATTCAAAAAAAAAAAAAGGTAGGAAAAC
>CG18507 13669776 13669844|14888 chr2L 13668683 13669952 scaffold_7 638774 640195 - 58845|1258 1336
TCCCTGAC----------ATGTAATCCTCAAAAAATGTTTCGTTTCTTAGATTGCCGAGAATCTATTAAATGCCTAGCC
GCGTGGCCGATAGCGATAATGTCGACATATCGCAGTTCTTCCTTTCCGTGTTTGCT---------------------CC
>CG18507 13670666 13670854|14889 chr2L 13670149 13671883 scaffold_7 640196 642050 - 24174|533 819
ATCTTGTTGTTC---TTGTGAATG-------------------------------TCTGTGTGC-----TGTAACTAAATGAATTTACCGAGAGGCTTTGTTTGG-------------AACCCA-----------TGAATTTATATAACAATCCTACAATCGCGTGATGCTACATGGAT-------------AAACTTCCTACTTTTCC---------ACCTATTATGC-------------CAATGATCGACTCTCTTTCGTTTCAGATGTTAGCCCCTAGGGCTG
AGAATAATATTCAATTCATGAATACTATCTCGACATGTGTACATACTATGCATGTTCTATGTCCTTGAATGTTACATAATGAATTTGCTGATACAGGTACTTTAGCTAATTAATACCAAGCCCATATTAGCCAGCTGCTTTTAAATAAGTTTCTCTTATTTGCCTTGACATACGAAAATACCAAAAAATACCAAATTTGTTGCTTTCCCGAATTGCTTGAATATTGTGCACAAACAAAATAGAAACTATAAACTCTCTCTCGTTTCAGATGTTAGTCCATA--GCCA
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GAAGTT-------------------------------------------------------------------------------------------CCCCTCACAGA---TATAAG-ACTAACTGCCCGATCCACCGATTCGATACA--------------CACACAAATAAATTATG-ATTCTAACGAAA
GTATTTGACCACAAACGGACTCATCGATGCACACACTCACCGATTAACTTAGGCACACACACACACACACACACACACACACAGAGGCACACACATAACACACACAAAACGTACAAGAACGAACTGATTTATGTACATATGTGCTATACTATCTTTCAAACCCCCTCAAGTAAAATATATATTTTCACATTT
>CG7364 13773484 13773905|15020 chr2L 13771362 13773886 scaffold_7 679344 681853 + 116763|2139 2571
GCTGTGTCACCCACTCGTCACGCTGTACACCAAACTATCCTTGCAATATCATTCGATCATAA-ATATATT---TATAGAGCAACTGAACCCAGTCTCGTCCAG----CTGCAGAAATCAATATAAACAAAACGGAAACTAAGC----GAAAACTCGACGACTCAGCCATGTGAGCTA-ACTTCCCCTTCTTGTCCCCAGCTGCA-GAAAGTCACCCACTAAGTAACCATTTACTAAGTCAAAACGCTAAATTCAGCAAGTACGTTTTGGAACCCCGGAAGTGACTCGATTTGCAGGAGCGTGAGCGTTGCGTTTTAGAAT-CAATCTAGAAATGCCTAATTTATATATGTA-TGTAA-------------AGAATCTAATCTAAGCAACTGATATAAAACAAACAAAAATCAAATAAA-CTAAGCTTAATGTA
GACATCACACTGGCACACTATGCTGTACACCAAACTATCCCTGCAATATCATTTGATCGTAATACTTATTGCGTATAATATAAATATGTGAAAGAACGCCTAGCAGTCTGCAAAAGGCCATGT--GTAAAATCTTGTTTAAGCTGTTTAGCTCTCAACT-CTCAACTAAGTCTGCTATAAGTTTCCTTTTTGCCTGCTGATGCGCTTTAATTACCGACAAAACGCCGATTGAGAAACTTAAGAGTTTAGTT------------------------GGGCGTCGCTCAAATT------GCGAGTGCATTGCG---TAGGGTACATTATAGAAACGCCTAATTTATATATGTATTGTAAAAAAAAAAAAACGAAAACCTAATCTAAGATAA-AACATAAAACCA--AGAAATCTAATAAACCTAAGCTAATTATA
>CG31845 13777656 13777831|15026 chr2L 13777227 13778480 scaffold_7 686539 687816 + 6840|468 685
CCAACGCACAGCACAGCACACCGTGGGCTTGCGTAAGTT-------------------------------CGGGCTTAAAGTTTG-----------GCCAACGCGGCGTATGAGCAATGTTTAAAGGGTGCTACCTGACAGAGTTCAGTCCACTCACCTGACAAACAACTGCTCCTGATTGTTTACCCGCCAGGACACGACCGTCGCACCTGCAAACA
--------CACCGTTAGTTACGGTGGACTTGCGTAAGTTGCTTCAACTTCAAACGGCTGCCCGTGCGCTTTGGACTTAAAGCGCGTGGTTCCCTCCGCCAATGCGGCGTATGCGTAATATTTAAAA-------------------------ACTTACCTGACAAACAACTGTTCCTGATTATTAACACGCCAAGACACAACTGTGGCGCCTGTAAAAA
>p38b 13782098 13782617|15030 chr2L 13780937 13782130 scaffold_7 689800 691004 + 62750|1184 1216
TCCCGGCCGCCATCCCTCTCCGTTCAATGATGC
CGGAGGCAGAGACGTCAAGTCTATGAACGATGC
>p38b 13782098 13782617|15031 chr2L 13782348 13782471 scaffold_7 691005 691119 + 3546|0 128
TATAGAAATAGCGATTGAACTAGGTGCATGCCTGAAATGTAGCCAT----TCGGAAATGTTTCCAAAAATCAATCAGAGTCACAGCCTTAATGTCCAGTTCAACTTTAGATTTGGTGTCGGT-TTTAAC
TACAAATTTAGTTATTAAAATATGAGAGTCC---AATTGTATTCGTAATTTCATAACTGTTTCAAAAAC-------AAGTCACAGCCTTAATGTCCAGTTCAACTT----TTTGGTGTTGGTGTTTAAC
>p38b 13782098 13782617|15032 chr2L 13782472 13783467 scaffold_7 691356 692475 + 21788|0 167
ACGCA---------GTTCTTGTGAATAATCCTGTAAATGTGAGTGTACATGTACATCGTAGTTCGTAAGCGAACGCATCTAGCGGCCAGTAACTATAAAAAAGAGCACTAGTGTCT------ACGTTGAATCCAAATAAATGTGCTATGTA-------TTTTAAAAAA
ATGTAAATGTATGTATATTTATGTACAAGTCTTCAAAGTGCAGTAGGTAGCTATATAG----CCATAGAAGAGCACA-----AGCTCTGCATTAATAAAAAATAATGCTATTGTATTTACAAAAGTGCAGTTCAAACCAAAACATTTTGCATTTTTACTTTTACAATA
>CG31731 13790302 13790569|15039 chr2L 13788777 13799647 scaffold_7 698737 710040 + 379527|1555 1828
GCCAGATAGTCGGAGTGTCGGAGTATCAAGTAAGATAAGCAGAAGACGGGCGTCGTACATTT-CATTATTTCCCTCAAATATGGAACTTTTATGAATCTCTATCCGGTGGGAATAATCTACTTAATGTATTTAGGGACTAATAAA---ACCAAACAAACACCTTCGACATGGGTATATAAAACTAAAATATAAAAGTAAGATATAACTAGT--ACGACAAATAAATAATATTTTTTATTTATATTATAATAAATATTTCTACATAATATTTGAT
GCGTCCCATGCGTAGTAGAGCGTTGCCCGTTACTGGCTATGGTA-ACGATCATTTTAGCTGTACATTATTCACAGCATAAGTGCA-------------------CAATGGAAGTGCACAA----ATGTGCTTTTGATTTTGTCAGTTTACCAAACAAATC------ATATAGACGGGCAGGATTAAATAATTAAAG----ATCCTGCCCGTGGACTATATATGAATTATTTGTCAGAACCAAACGATTATACGCTCATCTT--TAATTACCGAC
>CG16863 13793136 13793266|15039 chr2L 13788777 13799647 scaffold_7 698737 710040 + 379527|4598 4728
CGTAGTCCATAATCAATCCAAACCTAAGTTGAGCACTGTGTTTTTGTACCCCTTTTATTAACTAATTTATTAATTTACATTTACAATAATGCGAACTATAAAATACATTTTTTAACTTTTTAGCTTCTCAA
-----TACATAAACA--------------------------------------TCTATTAAAAAAAATATT------------------------TTAGAAAAT---TTTTATCACTATTAAGAT------
>CG7578 13799146 13799681|15039 chr2L 13788777 13799647 scaffold_7 698737 710040 + 379527|11071 11697
TCACGG-----------AGGAGCCGCAGCCACCTGGCTA-GCTGACTCGGCCATGTTAATAGATCGATTCCCGATCCACCCGAAATCCCCTCA-------------AATCGTAGTTCATAGTGGGCCCTCTGGT------TCCCTCGGCTTTGTTGTTATGTTG--------------GCACTTAA--TCATTC-ATACAAGTATA---TATATTTTTATTATATTTATAAACA-----ATACATAGTCA---GAATGTAATGTTTA---CTAGGTTTAACGAGAAATGTTGTTGTTTTTATATATATATATAAATATATATATATATATATATG-TATATGTATATGCATATGTACATACCCCTGGGTATGCTATGTAAGGCTTTAACGTGTGCGTGTG----------------------------TATAGTTTCCTTCAGTTACGAATTTGGATTTTGT----------TTCCCCGGTGTAACA------TTCACCCAC--------------TATCGATTAGTGTGTAGCGTAGATTAATGGATTAAACCAGCATTGTGCGCC---GCCTGTATATTGCTAGTGTTAATTTAAATCAAAATCTATA-TATAAATATATATATT
TCAAGGTGCGCGCACTTAAGAGCGACACGGGCACTGCTACGCTGACTTGGCAGGGTTGAAAGGCATCAACCCTCTCCACCT---ACCCCTTTATACACACACACACACCCACAACCAACTGGTTACCCACTAGTTATCCATATCCTGGCTTTGTTGTTATGTTGTTTAGTTTATTGTCACATTTGGCCCCATTCTCCGCAAGCAGAGTTTATA-TTTTATTATATTTATGTATATAAATGTATACATTTATGCGATCGTAAAGTTTATACCTAGGTTTAAACA-AAATGTTGTTGTTTTTTACCATGT---TACACACATATACACACTCGCATGCTGGGTGTGTGTGTATTTGAGCGTGC----GCGCGCGCTA---AATGCTTTAAAGTGTATGTGTATCGGTTTATGTGCCACACACATATGTGTTATAAACCCCTTAGTTTATCCTTTTCTTTCTGGGAAACGCAAAATTCGTTGGTGTAACCATTCATTTAATCCACTATTATTATATCTTTATCTATTATTGTATAGCATAAA-TAATGA--TAAATCA-TATGCTACACTTTAGCCTGTATATTGCTAGTTTTAATTTAAATCAAATTATATATTACAAATATATCTATT
>CG7578 13799146 13799681|15040 chr2L 13799648 13799966 scaffold_41 674586 674948 - 815|0 33
TCAAATATACAATATAAATCTATTACCAATGCCA
CTAATTGTAGCATATGAACCAAACCTAATTCTTG
>CAH1 13809655 13809997|15054 chr2L 13808803 13810015 scaffold_7 726366 727677 + 59231|854 1306
------GTCGGTGGAT--GTTGGACAA-CTAAGTCCTTGGATAGTCAACGGATTCGAGTGTCGTATGATTAGCTTT----------------------------------------------------------------TCGCACCCACACATCACATCCGTACGCCACG------------------------AGCTGGACCGGCACATCTCCATTGTTCAATTCTCGTCTTTAGTTCGTACGCCCAGCAAGAGCATACCTCCTATATGTGCATC--CGTATCCGTATTCGCATCAGTGGATGCTTAGCTGTAACCTTAA--TTGTACATGTACGCCTG-TTCGTTTGTTTGTCTGTTAAACGTTTGCAAAATGACAATTAGATTTATGT--------TATTATGGTATTATAAACTAAATATAACACGCTTAGATGTTGCATATGATAAC
GCAGGCGTCGTTGGATTGGTCGCACGGTCAAAGTCATTGGATA--------AATCGA--GTCGTATGCTTAGCTATATATATATTTATATATATATATATTCATATACACCGCCTGCACCGTAGTAGCGAATCGGTTGAGCTGCTCTGACCCACCACCAATAAACACCCCGTTCCCGTCTCCTCCCATATCATATACCCAGAGCAGCAGATGCCCATTGTTAATGTCTCGT-TTTAGTTTTTATTACTTTATATAGCAAAC-----ACTTGTACCTCTTTATATATGTATTTGCTTGTCTAACTGTGTATTTGTATCTTGTATCTTGTTACTGTACGAGTGCTTTGTACGTTTGTTTGTTAAACATTTGCTAAATGACAATTAGATTAATGTGTATTACACTTTACGGTATTAAAAAATAAATATATTACTATTAGATGTTGCATATTGAAAA
>Sos 13819379 13819826|15060 chr2L 13816754 13819829 scaffold_7 740929 743985 + 110472|2864 3337
TTTAAATTGCCTGGCGATGTGATA-AGGACGAAAAC----TACGAGTATGATCCGTAAGATT-----CAAAGTTGCGAGCACTGCTTGAG-------------TGCAGATATATATATGAGAGAACGGAACGTGAGATATATATATATATATATACATATATACGTAGGCGCAGTTTATGTA--TTCTAGTATGAAACGAGTTGGAACCGCTGATTTAGATTATTCGCCACTCATTTAACAAGGTAGAACAGACAGACAGACAAAATACGCTCTCATTTACACACAACAGGCACGCGCATATGGATAGGAATGCAGGACACACAAACCAAGCAAGCAACCAAGCAACCAACAAGAAATGCAAACAAGAAATTATGTTATTATATAATTACTATTATAAATATTTGTAAATATCGAGAACATTGTATTGATCGTAGAACGT-AAAACAATAAAGTATAACCCTATTGTTAGACAC
TATTTATTGCCTGGCGATGTGTGATAGGACTAAAACAAAAAACGAGAGAATACCACAGAATTAGAGAAAACGTGGCAGCAAGTGCATAGGAAATAGGAAATAAAACAGATATAGATACACAAAACAGCAAAACAAAA---AAACAAAAAAACAACAATGTATATGTATGTGTATTCAATGAGATATATAGTATGGACCGAGTTAAACGCGACGATTT---TTATTCGAAACTC--------------AAAAAACAAAAAAAAAAAAAACATTTT-------------------------------------------------------------------------------------CAAGTGAAAATTTCTGTTATTATATTAATTATATGATAAACAATTGTAAATATCGAGAACATTGTATTGATCGTAGCCCGTAAAAACAATAAAATATAACATTACTGTTAGAGAT
>b 13823712 13823894|15064 chr2L 13823073 13823906 scaffold_7 749883 750729 + 39467|646 855
ACGGTGACGCGGCGATGGCATGTTATGAGGTTAGGTGTTGACAACATTCTCTTTAGGCTTACGCCGATTGTATCTTCTAGTGTATGGT----TAACTAATACT-ACTCACGTTT--------GTATATT-----TTTCTGGATGTTAAG------TATTACCAAAAACAAAGAACAA---AAATACATATTTATAGGTCATTTCATTTAG
GGGCTGCCAAGAT-----------------TCATGTATTATGAACATTCTTCTTAGGCATATGA----TGTACATACTTATATATGGTATTATAACTGGTATTAACTCGCGATTATTTTATCATGTATTCAAAATTTTAATATATTAAGCTGCTACAATAATAAAGACATAGAACAAGTTAAGCACTTGGTTGAAAGGACCTCAATATAT
>Orc5 13831473 13831580|15069 chr2L 13830436 13831489 scaffold_7 759430 760484 + 52768|1055 1071
CCCCTGGTTGTTTTTTT
TCTTCTATGGATTGTAT
>Orc5 13831473 13831580|15070 chr2L 13831490 13832283 scaffold_7 760646 761379 + 23159|0 90
TAGTTTTTAAATATATTTAATAAATAGTCCGGTACATCGCTTATGTGTATGGTCTCCGCCAGCCTTGTGTCCCGGCTGCGCAACTGCATCA
TAGTTTCTAAAAATATTTAACAAATAGTCGGGTAAATCGCTTATGTGCACGGTCTCCGCCAGCTGCGTGTCGCGGCTGCGCAACTGCAGCA
>RpII33 13833834 13834306|15072 chr2L 13833102 13835087 scaffold_7 762244 764306 + 74014|822 1304
GGAGGACAACGAGTACGGCGAGAGCAACGATGAGATCCTCATAATTAAGCTGCGCAAGGGGCAGGAGCTGAAGCTGCGCGCCTACGCCAAGAAGGGATTTGGCAAGGAGCACGCCAAGTGGAATCCTACCGCAGGCGTGTGCTTCGAGTATGATCCGGACAACTCCATGCGACACACTCTGTATCCCAAACCTGATGAGTGGCCAAAGAGCGAGCACACCGAACTGGAGGACGACCAGTACGAGGCGCCCTACAACTGGGAAGCCAAGCCAAACAAGTTCTTCTTCAACGTCGAATCCGCCGGTGCCCTTAAGCCTGAGAACATTGTGGTCATGGGTGTGCAGGTGCTGAAGAACAAGCTGTCAAACCTGCAGACGCAACTCAGCCACGAGTCCCAAAACGATGCATTGGCCGTTTGA----------TTTACATATAACAAGTTTATTTTAAGTTTATAAAAGATGTTCCGCCTAATCCTTG
GGAGGACAACGAATATGGCGAGAGCACTGACGAGATACTGATAATCAAACTGCGAAAGGGACAAGAGCTTAAGCTACGCGCTTATGCCAAAAAGGGCTTCGGCAAGGAGCACGCCAAATGGAATCCCACAGCGGGTGTTTGCTTTGAATACGATCCGGATAATTCGATGCGACACACGCTCTATCCGAAGCCCGATGAGTGGCCGAAAAGTGAGCATACTGAGCTGGAGGATGACCAGTATGAGGCACCATATAATTGGGAGGCCAAACCAAATAAATTTTTCTTTAATGTGGAATCTTCGGGAGCTTTAAAGCCCGAAAATATTGTCATAATGGGCGTGCAGGTGCTAAAGAACAAGCTCTCCAATCTACAGACGCAACTCAGCCACGAGTCGCAAAACGATGCGCTTGCGGTCTAAAAACAATCCTTTTTTGTATATTTAGTTTAT----AACATAAAACGGA------GCCTAATCCTTA
>CG7916 13847767 13847800|15084 chr2L 13846364 13849007 scaffold_7 780432 783014 + 84830|1479 1512
GGCAACACCAGCCAATAAAAAGCAATTCAAACGA
--CCAAAGCAACCAATAAA---CCATGTGTACGC
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ACTATGG
ATCACAG
>CG7968 13850234 13850327|15086 chr2L 13849286 13851562 scaffold_7 783676 786039 + 36949|1000 1132
AGTGCTGACAAAA---------------ACGATTGCCAGGTG------------TTCCCTGTGCTTAAATG-------TAAAAATAATC-----ATTAATAATCATTTGATAAGAAATTAAAAGGAACTACTT
AGTGCTGAAGAACTGAAGCTTAGTTTATGCAAAAGAAAGGTGGAAGTGGGGGGTTTCCTTGTATTGAAAAGATTTACATAAATGTTATCTTTCGATTAA-ACTTGTTTCACAAATCTGCTAAGGTATTTAGTT
>cenG1A 13897750 13898715|15126 chr2L 13896771 13898753 scaffold_7 837913 840187 + 65145|994 2282
A-------------------------TTAGTTAAAATTGAAA-----TAAGATAAGCGTGAATTT----------TCATAACAGTTGTACAATTCATTA-----GTTT----TTGTTGTTCATGACGGACTTAGTTT--AAATTCGAGCGTAAA------------------AAATGTATA-------------------GCGTTTAGTGTTTAGGTTTT-----------------------------AGGAATGTTGTGCAAATGTTTAATATTATTATTATTTGGCAAGTGTTGAATGGAAATTCACAAGTTTTATTTATG-TTTTCTTTTAG-TTTGTTTAGTTCTTAAGACATG-------------GAAACCTGTACAGCCTTGTTGTAATCTCAAGTGT----ATAATTTATTATTTTCGTATTA----------CGTGA--AACTATTATTATTGTTTTTTTTTTATAGTGTGCAGGTTTTT----------AAATCGTTTGCAAAACAAT-TATTTAGTAGCTA-----------TTGTAACTTTCGACAACCATCAGCAGATTGCAAAAGACTTCACGTAACAAAAAACATACTTATACAACCTAAACAATAGATAAAAGCTGATGCAAA--------------------ATATACG--TATAAACGAAATGAATCTAAGATTAAAGCCAAAAACAA-------------ACTTATGCTAAACAA-----TATACACGAACATATATATATATATACAT---TATATACATACAT-----------AGTTGAAATTGCTTGATAATCGGTTTAAACAAATGAACACGCCCAAAATGTAGCTTATGCAGA---ACCAAAATC--ACAAAAT-TCTTTGCTATATAAATTCCAAACAGAAATAAC-----------TCGTTTTAGAT----------ATTATACTG--------------CGGAAAAAATTG--GATTCTGATTGTATGAC------GGAATCTGGGTAGACA-----------AAAATTTAATTGAAAGTATTTCAAAACTATTATACAAAATAGTTATAAATCAATCTAAATATTAC-----TATATGTATACAC----CCCTATGTATTGTGTACGCTATTTGTAC-------GAATTACAA--ACCACAAAACGTGAC-AAACTCAATCTAATTGGA-AGGAAAAGTAGCA--CACAAA-AACCACAAAAGAAAAAAACC--------------CCTTCAATAAAAATCTATTAAACATTTTA--AA
AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACGCATAGTTAAATTTTATAATCTTCAAAACAAGTTTGTTTTTTTTTTTTAAATTGTATTAATTGTAAAATTCATAAAATATGTTTAATCTGTTTGTTCGTAAT--AATTAGTTTTAAAAAGTAAGCGTAAATTTCTCGCTGTGTATAGCAAAAGTATAATTGGGCAAGTTTTGAATGACGCTTAGTTTTATAGTTCTAAAACAAAAAGAAAAACAAAAAAAAAAAAAAAAATATTG---AAATGTGCAAATTATTTTTTTTCTAGCCCGCTTTGAA---AAATTAGT--TTTTTATCTACGATTGTTTTTTAGTTTTGTTTTGCTTTTTAAGTACGCTTAATAATAGGCACAATCTGTACAGTCTTGTTGTAATCTCAAGTTTTGAATTAATTTATTATTTGCGTATTGTAACTATTATCATTATTAGTTATTATTATTATTGTTTTTAAATTGTGTGCAGGTTGTTTTTTTTCTTAATGTCGTTTGCAAAACAACAAATTAAGTAATTATGTAATTTGCTTTTTAATTAATTATTAACTTTAGGAAAACAAGAAAAGGTTCTCTTATATAAAATTACA-TTAT---GCCTAAAAAA-----AATAGCTGATGAAAAAAATCAACAAAACCAACAATATATACGTATATAAACATAGTGAATCTAAGACTAAAGCCAAAAACAACTTATTACACTATATCTATACATAAAAAAATTCTATATATAAATATATATACATATATATATAAATATATATATATATATATATACAAAAGTTGAAATTGCTTGATAATCGGTTAA--------AACACGCTTAACTTGTAGTTTATGCAAAAATACAAAAACCAAACAAAATAAAATTGCTAACAATATTCCAAAATAGAAAAACCTTCAAAATATTCATTAAAGATGTGAGCATTGATTTTATTGGAATCGAAGCAGTTAGAAATGAAATGACGATTTACATTATATATCTATCTAAAAATATATATATATATATTCTAGGAGGAAACACACTTCAAAGTATTTGAAAATAATTATACAATATAGTTAAAAAATTCTATAAAAATTATATATATGTATGTATACACCCTGCCTCCCTTATTATGTACGCTATTTGTACCACCTTGGAAGCATAAACACAACAAAACGTGACAAAACTCAATTTAATTGGATATAAAAGGCAACAGGCACAAAGAAACACAAAAAAGAAAAACCATAAAAAAATGAAATAAAAAATAAAAATTAATTAAACATTACACCAA
>Ance 13909110 13909172|15140 chr2L 13907424 13909166 scaffold_7 851499 853260 + 80522|1727 1801
-----------TTCAAATGATTTT---AGTGTTCTCACACACAGTTCATTG----CTCAATAAAGTTTAACAATA
ATACGAGTGTCTCCCAACAATTTCTAAAGTTCTTTTGCTCCAAGTTCGTCGTAGCTTTGATAATGTGCAGTATTA
>CG31766 13955581 13955757|15183 chr2L 13954300 13955758 scaffold_7 923363 924655 + 22780|1337 1522
AATTCTGT-----CGTTTACATGCTAACGTTAAGAATATGTAAACAAAACAGTCAGACAAATTGTTGTTCCACTTAATACTTCCGCTT--ATTCAAGTCGCACCTATAACTAAGTTGAACTTGAATCAATGCCAAAAAATACACACACACAATTCTAAAATTAAA--TAAACAAAAAAAAAAAAAA
AAATCAATATATATATTTATATG-------TATATATGTGTGTATA---------------------------TTAAT--TTCCGCTTTAATTCAAGTC------------AAGTTGAACTTGAATCAATGCCAAAA-----------ACAATTTGAAAATAAAATCTAATCAAATGCATAAATGA
>CG33119 13965053 13965088|15194 chr2L 13964790 13965422 scaffold_7 945731 946381 + 23634|267 305
TCCAAGACGAAACAATAAAGTGCGAAAGTCT---AAGTT
TTTAAGTGACATTTGAAAAGTGCAAAACAATCGAAAATT
>Cyp28a5 13979380 13979573|15210 chr2L 13976847 13979393 scaffold_2 581717 584149 - 53380|2649 2662
AGATTCAATTACTT
TGAAGCTCTAACTT
>Cyp28a5 13979380 13979573|15211 chr2L 13979400 13979579 scaffold_31 48700 48867 - 67|0 183
TCCCCACCAGCGA------CGGAAACTAATGTGAAAATTGAGTGGCGTAGTTCCCCAGTCTATTTTTACAGAATATTTGATATGTA----TACCCAGTGGTACACTTAAGCTCGCAATTGGCTGACTTTGTTATTGCATATGTATATTTGTTGTTTCTATATTAAATATATTTCGTATATAAAA
CCGAAGACAGTGAGTGTATTGTAGATGAGTGTG---CTCGACTAGCCGAATGCCCTGTACTGTTGCTTCGGATTATTCT-TGTGCAATAGTGCTCACGTGTACATAGAA----GTATTTTTTTTTTTTTTTTGTTGCATA---------ATTGGTTACATAAC-----TATTGCATATACAATA
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AACAAACACAAAAACAAACACTGTAAAACCAAAAAAGAAAATTTGTTTTGTTACCAATCGGCAGAGAGCTATGCAACTTGAGCTTTAAACATGAAATGAATTTAACGGACTTACAAGCC-ATTGAGTGCCAGCTTTTAACTAATATATACGCCTGTATATATATATATATATATATATATACCTAAACTACTTGTACGATATATAGAGAAATTTTAGATAAAACAACATCCACTCAATTGGTATGAGTGCGATATGATGATGAGGTTGATGTTATTATTGAGCTTGATGTTAATTATATGATGAACGACTAATTTTTTCCATCAAAACTATATAGATCTTTAGCGCATAAGTTTTAAATTTTATGT--TAATTTGTTTTACTTATTGAAACGCAAA-GAAAATTATATACTCTTATTGTTTGAATTACTACAATAAATTTTTA--------------C
>CG4500 14029240 14029372|15267 chr2L 14026921 14029488 scaffold_7 1065110 1067586 + 75022|2357 2495
ATGTTATCTCTCAAATGGATTTCTT---AACCTAGGTTTAAATTTTATTTTACTCG---ATCGCTTACATTGTATTGATTAATTACGAAATTCTCTTATTATTTACTGCATTACGAACTGAATATATTTGTTATTAAAA
TTTATAT-----AAATATTTGTATTTAGCACCTAGGCTTTAAATT-------CTCGGACATTGTTTAAGCAGCTTTGTTTAATTATA-------CTTTACATATAC--AATTACTTATATAGTAT-TTAGTAGTTAAAG
>CG16876 14048765 14048863|15293 chr2L 14047457 14048887 scaffold_7 1106886 1108306 + 32161|1374 1491
------------AGGGGTCAGGTTCATCCCTTGGCGTTG-------GGCTGTGTTATATCAACATTGATTGTTAATTTTTAATCATTTAAATCATTCGAGAATAAAGCGTATCATAAT
GCGCAGTTACAGAAGCAACAGATGCAGCTGGAGGCAATAGTAAGGCGTCTGTGTTACTGGAGTATTGATTGTT--------ACCACCTAAGTT----------------TATCATAAT
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CCATATGGGCGAGGTGGTTATTGTTATTGGTTTTATTATAAAATCAATTTGTTAATTATTAAATTAATAACGAAACTCTTTAAGTAA----------ATTAAAACTAAAAAGACA----CTAAAAAAGC--ACAAAAAAATAGGAAAATACATGATAAAAACCATCAACTAAATAATACATCCAAGAAAAACCAAAACAAAAAAAACAAAAA
CCATATGGGCGAGGTGGTTATTGTTATTGGTTTTATTATAAAATCAATTTGTTAATTATTAAATTAATAACGAAACTTTTTAAGTAAATCTAAAAACATTAAAAAAAAAAAACCAAAATCTAAAAAAGCTAACAAAAAAAGAGAAAAAACACTTATAAAAACCATTGACTAAATAATA---CCAAGAAAAAACCA---AAAAAAAGCATAAA
>wb 14324725 14324838|15613 chr2L 14324660 14325888 scaffold_7 1531993 1533241 + 61344|66 179
TAATCCCTTCTTGGGATGTATGAAGGATGTCCAGGTAAATGGCGAGACCTACGATCCTCTGGAGAGCTCAAGCTACTACGGTGTGGAGCCTTCCTGCAAGAACATGATTACCAA
CAATCCTTTCCTTGGCTGCATGATGGATGTGCAGGTGAATGGCGAGACTTACGATCCGCTCGAAAGTTCCACATACTTTGGCGTGGAGTCCTCCTGCAAGGACATGATTACCAA
>wb 14324897 14325554|15613 chr2L 14324660 14325888 scaffold_7 1531993 1533241 + 61344|247 904
GGCTGGTTTCTCGGGCAATGGTTACTTGGAGCTGCCATCGCAGTCACTACGAAAGCGCTCCAATACCGCTTTGGTGTTCCGCACCCTTCAGCCCGATTGCCTGCTGCTCCTTGCTGCCTATCCGCCTGAGATCCTGGGCGACTATGATGCTAAGGACATTAAGGGCAACTTCTCCATTAGCCTGGTCGATGGTCAATTGCATGTTTGGGTTAACTCTGGTCGCAGCTTCATCAAGATGTCCTCGAACTCCAGTCAGATGAACGATGGCGAGTTTCACGTGGTACATTTGATCAAGACCGGTCGCAAGCTGGAGCTGATGGTGGACGATGAGCTGCAAGAGATTCGCAATCTAAACGGCAATCCCACGGTGGTCAGCCTGCCGAGGGATGCAGGTGGCCTGTATATAGGTGGAGCTCCGCCGCACGAAAGTTATACGCCATTGGCGCCGACTTTTGTAAATCTAGAAGGAGCCATTCGGGATGTGGTGTTCAACAATCGGACCATTAACTTTAACGATGCCCTGACCTTTGCCAACGTCCAGATTGGACGTAATGGTCCACTGATGGGCAGTCTGAAAGGAGGACTGTACGATGTCCTCCTGAAAACCGAACCCATGATTGGAAAGAGTTTTACGGCCTCGCCTGAGGGCTGCAAGCGG
AGCTGGCTTTACCGGCAATGGTTACCTGGAGCTGCCATCGCAGTCGCTACGCAAACGCGCCAACACTGGCCTTGTTTTCCGCACACTGCAAGCCGATTGTTTGCTGCTGTTGGCCGCCTATCCGCCTGAAGTGCTGGCCGACTACGATGACAAAGATATTAAGGGCAACTATTCGATGAGTCTGGTCGATGGTCAGCTGCAGGTGTGGATTAATTCGGGACGCAGCTTCATCAAAATGTTCTCCAATGCAAGTCAGCTGAACGATGGCGAACTGCATGTCATCAATCTTATCAAGACTGGGCGCCGCCTGGAGCTGATGGTGGACGATGAACTGCAGGAGGTGCGCAGCCTAACGGGCACGCCCTCACTTGTTAGCCTGCCACAGGAAGCTGGGGGTCTATATATAGGCGGCGCACCACCTCATGAAATTTACACTCCCCTGGCGCCCACATTTGTAAAGCTCGAGGGCGCTGTCCGGGATGTAGTGTTCAATAATCGTACGATTAATTTTAATGATGCTTTGACCTTTGCCAATGTGCAGATTGGACGCAATGGTCCGGTCATGGGCAGCCTCAAGGGCGCCCTCTACGATGTGCTGCTCAAGACGGAGCCGATGATTGGCAAGAGTTTTACCGCCTCGCCGGAAGGCTGCAAGCGG
>wb 14326435 14327053|15614 chr2L 14326020 14328186 scaffold_7 1533725 1536038 + 83635|512 1130
ATCGGCAGCTATTCCTACGAGCCGAATGCATTCAAGTTTGGAGACGATATCTATAGCTATTCGCAGCTGAAGCTACCGGAGCGTCATTTCTGGCAGCGCAACTTCCATCTGAGCTTCGATTTCCGCTCCTTCTATCCCAATGGAATGCTCTACTTGTCGCCGGGAAGCAAGGAGAAACCCAAGCACTACGTGGCTCTCGTCCTCAAGGACGGACAGCTGGTCCTGGTGGTGCGAGGTCGTCGGCGCGAGGAACTCCAGTTGACCGCCAAGTTAAACGATGGCGAATGGCACCGGGTGACGATTAGCTGTCACGATCGCAAGGTCACCATGTCGGTGGAAATAGGACGTACAGATCAAAAGACTTCCGCCCAGATGAAGCTGCCCAAGAAGATTGGCGCCTCTCAGCTTTTGCTGGTTGGTGGGCTACCACAGTCTCCAGTCAAGGTCTCCTCCGATCTCTATGTCCGTCTGGAACCATTCAAGGGTTGTCTGCGCCGGGTGAGCATCAACAACAACACCCAGGATCTGGCCCGACCCGGCAAACATTCGAATGTGGGTCAGTGCTTTCCCACGGTGGAGAGAGGCAGTTACTTTCCCGGCGATGCCTATGCCATTTACA
ATTGGCAGCTACTCCTACGAACCGAATGCCTTCAAGTTTGGCGACGAGCTTTATAGCTATGCGCAGCTGAAGCTGCCGGAGCGACACTTTTGGCAGCGCAACTTTCAGCTGAGCTTTGATTTCCGCTCCTTCTATCCCAATGGCATGCTCTATTTGTCGCCGGGCAGCAAGGAGAAACCCAAGCATTATGTGGCCCTGCTCCTGAAGGATGGCCAACTGGTGTTGATTGTGCGCGGACGACGCCGCGAGGAGCTGCTGCTTACGGCAAAGCTAAACGATGGTGAATGGCATCGTGTGACCATCAGTTGCCACGAGCGCAAGGTCACGCTGAGCGTAGAGATTGGACGTACAGATCAAAAGACCTCGGCACAAATGAAGGTGCCCAAAAAAATAGGCGCATCACAGCTGCTGCTGGTCGGTGGCCTGCCCCAGGCGCCCGTCAAGGTGCCTTCAGAGCTGTACATGCGACTAGAGGCATTTAAAGGCTGTCTGCGTCGCGTGAATATTAACAATAGCACACAGGATCTGGCACGTCCGGGCAAGCACGCAAATGTGGGTCAATGTTTTCCAACCGTCGAGCGCGGCAGCTACTTCCCAGGCGATGCCTATGCCATATACA
>wb 14327110 14327243|15614 chr2L 14326020 14328186 scaffold_7 1533725 1536038 + 83635|1208 1341
AGAAAAACTTCAATGTGGGCAAGTATCTCGATCTGGAAACGGAGTTTAGGACCTCGGAGCTATCGGGCATTCTGCTGAGTGTCTCTGATCCAAATGGATTCCCAGCGCTTTCACTGGAACTGCATAATGGCAAT
AAAAAAACTTTCATGTGGCCAAATATCTGGAATTGGAAATGGAATTTCGGACCTCTGAGCTCTCCGGCATATTGCTGAGCGTTTCCGAACCAAGCGGTTTTCCCGCACTCTCCCTGGAGCTCAGCAATGGCAAT
>wb 14327301 14327529|15614 chr2L 14326020 14328186 scaffold_7 1533725 1536038 + 83635|1410 1638
ATAATATTCTCTTGCGATCCTGGAAACGGAGCGCCCATGCGTGTGGAGTCATCACTGCCCACCAAATATGCCCTATGTGACAACAAATGGCATAATATTTCAGCTCTCTACGATGGCGAACAGATTGTCCTGCGCATCGATCAATTGCCAGCCGTGATCAGTGTGGGTAATCAGGGGAATGCTGGAAAGGTGCAAACCCGATCCCCGCTCTATATTGGCGGTTTGCCAG
ATCGTTTTCTCTTGTGACCTGGGCGATGGTGTGCCATTCCGTGTGGAGTCCACGCTGCCAAACAAATATGCGCTCTGCGACAACAAATGGCATAATATATCCGCGCTCTATGATGGCGAACAGATTGCGCTTAGGATTGATCAGCTGCCGGCCACGATCAGCATGTCAAATGAACGCAATGTGGGCAAAGTGCAAACACGTTCGCCCCTCTACATAGGCGGTCTGCCAG
>wb 14327597 14328265|15614 chr2L 14326020 14328186 scaffold_7 1533725 1536038 + 83635|1715 2392
AGAGTGCTCCCAGTGGTTCACTGATATCGCGGGAGAACTTCAAGGGCTGCATCCGGCACGTGTCCATACGGAACGAGAGACGCGACTGGATCGAGATGGAGGACCTGAGGAACGTGCTGCTCAGCGAGTGCCTCGTGTCCAGCGATGAG-AGCTGAAGATCGATGTCCGAATTCCGGACAGCTTTCCGGGCGCATCTGGTTCCTGT----TGACGCCACACCAAAACTTTTTCCAAATGTATTGTGATCAATAACGAGT----TTAGAGCCA---------------CCTATTTATAGC----CCTTCACTGCCATATAAG------TTAGGTTACTGTAGGATTAGCTTTGAATGTTTATATATAATTAACTACGACTTCTATTGCCAGTGACTGCATTTTGTACTTTGCAATCT---------------GATTCATAATTTATTTTCGTATTTATACATTACTTTCATTATTTATTTTATGTT--TTTAAAGAGGCTTTAAGTTTGT------ATTTCATTTGGCATACGGCTTA---TCAAAAATTGTGT-----TTATCGAATCTCCAGTTTGTACAG------TGCGCAACGAAATTTA------------CTTAAGTAGCTATAACTCATC-----ATTATTTTCATTTGTAAATAGAACTGCCATTTAGCT
ATGTTGCACCCAGCGGCTGTTTGCTGGCGCGTGATAATTTCAAGGGCTGCATACGCAATGTTTCTATACGCAACGAGAGACGCGATTGGATCGATATGGATGATCTGCACAATGTGCTGCTCAGCGAATGTCTCGTGTCCAGCGATGAGTAGCTA-----------CTGATTGCCGGGATGCTTTC--------TCTGGTTCCTGTTTGATGATGCCACACCAAAACTTTTTCCAAATGTATTGTGATCAATTATGAGTTTTATTTAAGCCATAGACTTAGACAACGTCCAGTTATAGTTGCATATCCACTGCCATATAAGTAATATTTATATAGCTATACGATTCGGCT----TGTGCACGCACAAGT---------TTTCATTGCCAGTGACTGCATTTTA-ATTTTATTATATTAACTAGGCCCCACAAATTTTTAATTTATTTTATCTTTTA---------------ATTTATTATGTTTTACTTTAAAGAGGCTTTAAGTTTGCAAATCGATTTTATTTCAAATTTTATTTAAACACCCAAACTATGTACTTGTTAATGAATCTCCCACTTGTACAGTACTTATGCGCATATCTATTTATAAAATAAGTATTTCAATTAGCTGTATTTAATTAAATAATTATACTCATTTGTACAT--AACAGCCATTTAATT
>wb 14327597 14328265|15615 chr2L 14328187 14329263 scaffold_7 1536191 1537274 + 10703|0 78
TGTATTCATTGTAGCACCTATGCTTATGTAATATTTCCAGACTAATAAAATAAAATAAAAACCTATTATCTAAATGAAA
TATATCAATTTCAACAATTTTA----------ACAGACAGACAAATGCAATTTTGTAAAGATCTATCTTTTG-------
>CG15287 14333776 14333867|15619 chr2L 14332693 14334578 scaffold_7 1542551 1544571 + 31911|1160 1260
-TCACGTTTTGTAACGC-------ATAAAATGGGAATTAAAGATTTTAGGCTTTAAGGCTTAACAATCTGAATAAATTTTCCAAATAACATGTATA-GCAA
AACTCTTTTTGTGTTGCAAATAATATGAAGTGTGTAATAAATATTTTGAA----AACACTCAACAAAAACTAAAAATACTATAAATAAATTTTTTCTGCTT
>CG15286 14339937 14340080|15626 chr2L 14338934 14340011 scaffold_7 1551337 1552380 + -1365|1099 1174
TCCATCAGAAACTGTTTTGTGTACAATTTATAGCAGTTCTTA-TACCCTTTGTATTCGTTAAATTTCCTGTTCATA
TGCTAGAGAAATTGACACTCGTCAAGTTTTGATTCGTTTTGGTTAACTGTCGAATGCAGCAAAACTTTCGTTGATA
>CG33090 14345341 14345802|15631 chr2L 14342762 14345804 scaffold_7 1556145 1559368 + 158040|2706 3271
GTCGAGAGTACAATCT-----------------------------AATCCGAAGT---CTACACAACCAAAGATATTTCTAAGCCAGCACAAAGATTTTCTTAGCGTTTAGTTCGATTCTTCTTTTGAGGCTGAATGTGTAACGAGCTTATCGAGATGGT------GCGAGTC---------GAGGAAGATGTTGTCTCTGAAGTGGTTTTCAAATTTATAGCTTTATCTGTACTTTTAAGCTGTG-GAATCTGTTGGCGCTTACTCCATGTCTTCTCTAGCTTTAAAGCCAGT------CACAAATC------------------AAACTGCTACTCTCTGTTGAAGTACAACTACGCAATGGTATTCAAATGGAGCACAAGTCGTATTTAGATGTTAGCTAAGAGAAATATTTAAATCAATTATAAATGT-------TTTAATTAATTATTAATGTCATAAGCATATATG------------------TATTTCAATGTGTAAGCAGTTGCTGTCTGCAATAAATGTG---ACCGAGTTGTCAGAAATA----ATTTATTTAGA
TTCCAAAGTACAATCTTTATAACTAGTTGATTTACATCTATATACAATTACAAATGCGCTAC-CAACCAAAGATATTTCTAAGCTATCACACAAAGGTTCTTAGCTTTTAGTTT-----------------------TTTAACGAGCTTATTTGGCGGTTCTTAAAGCGCCCCAAAATTTGAAAGAAAAAGGTATTCACAAATGTTTAAACAAAAGCTTTATATTTAACTATA--TTTAAACTAAGTTCAGCCGGTTGCTTGTTCTCAATGTCTTCTCTAGCTACTAAGTCTGTTCGAAACACAAATCAATCGATGGGCACTTGCTAAATCGCTGTTCTGT-TCCAAGTACAATTATTGAAAGGTATTCACAAAGAGCACAAAACATATTTAAATGTTAGCTAAGCATGCTGTTTACATTTAAAACACGCATTATGCTGTTTCATTAATTATATATATAA-ATGTATTTATGTCTATTAAATAAGCCAATTATTCAAATATTTAAATTGTTGTTGTCGAAAATAAATGCGTCAACAGAAATGTGGAAAAAATAACAATTATTTAGT
>Rab14 14358184 14358400|15644 chr2L 14357517 14358759 scaffold_7 1574333 1575610 + 39387|677 981
ATGAATGATGGAACCTAACTTTACGCA-AAACCTAGTTAT--ACAAATCAACTTTTATTTTTAGC-CGACTCGTAATC-TACCGATGCCC---------------------------------------------AAGCAAAAACCA---ATGTATGTAGTTAAATAATTCGATTAAGCATC---AATGTGTGAGCCAACAAC-----------AGCGACAGCAAC------------------CACAAAAAAAAAAAAAAACAGAAAAAGAAA-ATATAAAGTC--CTTTCGCTTAATAAGACG
ATGTAT---------TAACTTTATTTACACACATAGTTATAAACAATCGAAATTTAATATTTAGTGCAACTCATAATCATATTGATTTCTTATCTATCTAAAACCAACACGTAAACAAATATGCAATGATAATGAAAACAAAAAATACATATGTATGTAGTTAAATGATTGGATTAAGTCGTGAAAAAGTGTGAACAAACAACCAAAATATATAAACGTCCCCGACATTTAGATATCTGTGTAATATCTAGTAAGCTATTGATAGAAAATTAAATAGCTAAATTCAACTGTTGCATTACATCTCA
>Pgant35A 14361279 14361443|15646 chr2L 14359244 14364675 scaffold_7 1575981 1581294 + 222863|2039 2217
GCGATTCGCTCGGATCG------AATAATT---CCGATTGCAATATTAGACTGATAACTG--TTTAGGGCAAAG-TGTATTATGTTT-AAATAGCCAGTATTTTTTCATCAAACTTTTTTTTTTTAATAAATATGATCAAAATGTTG-ATGGTGCAGTTTGATTAATGGCCAATGGTGG
ACGGCGCAGTCGGTCCGTCATGCAATAATTAGACTGAAGTTAGTCTCTAAGTATAAGCTGTTTTTTTGTCAATGCTGTATTAAGTTTCGAATAGTCAGTATTTTTGCACAAAA--GTATATTTTTAACAATCA--ATGACAATGGTGAATGCTACAATTCAAGAAAAATCAAAT-----
>spel1 14364660 14365699|15646 chr2L 14359244 14364675 scaffold_7 1575981 1581294 + 222863|5511 5526
TAAATGTTGTGGCATT
ATTTTATAGTAATATT
>spel1 14364660 14365699|15647 chr2L 14364676 14365228 scaffold_7 1582206 1582758 + 32824|0 552
TTGCAGACTGCCACTGACAAATCCTTGGTAATCATAGACGAACTTGGTCGTGGCACTTCCACGTACGAAGGTTGCGGCATCGCCTGGTCCATTGCTGAACATCTGGCCAAGGAGACCAAGTGCTTCACTTTGTTCGCCACTCATTTTCACGAGATAACCAAGCTGGCGGAGACCCTGTCTACGGTTAAAAACTGTCATATGGCCGCAGTTGCGGATGCTGATGACTTTACTCTGCTGTATCAAGTGCGTTCGGGGGTCATGGAAAAAAGCTTTGGCATTCAGGTGGCGCGATTGGCCAATTTTCCCGAGCATGTCGTCCAAAACGCGCAGGAGGTGTACAATGAGTTCGAGGACGAGCATGTGGACAAGCAGAAGAAAGAGGATAAGGCACTGCTGGAAAAGATTCAAGTGGCTATTCAACAGCTGTCAACAGCCGGGAACAACGTGGACATTAACGTGGAGGATTTGACCCAGCTGGTCACCCAGTTTACGAAGGATATCGAGCAGCTGGATAGTGATTACTTCAAATCTGTGCTGGCCACTAGTGAGGCTT
TCGCAGACTGCAACGGAGAAATCACTAGTTATCATTGATGAGCTGGGACGCGGCACATCCACATATGAGGGCTGTGGCATAGCCTGGTCGATAGCCGAGCATTTGGCAAAACAAACGAAATGCTTTACGCTCTTTGCAACACATTTTCACGAGATCACCAAACTGGCCGAAACATTACCAACGGTTAAAAACGTTCACATGGCTGCTGTGGCGGACGAGGATAACTTCACGCTGCTGTATCAGGTGCGGCCGGGTGTCATGGAGAAGAGCTTTGGCATACAGGTTGCACGACTGGCCAATTTTCCGGAGCATGTGGTACAAAATGCGCAAGAGGTGTACAATGAGTTCGAGGACGAACATGCGGGCAAGCAAAGTGAGGCGGATAAGGCGCTGCTGGATAAGATACAAGTGGCCATAGAACAGCTATCAACGGCTGGCAATAATACGGATATCAATGTGGAGGATCTAACACAGCTGGTGGCCAAGTTTGCCAAGGATATTAAACAGCTGGACAGCGATTATTTCAAGACTGTGCTAACCAGCAGCGAGGTTT
>noc 14493162 14494019|15791 chr2L 14491345 14494294 scaffold_7 3126483 3129650 - 93750|1887 2976
AGTGACTTCCACAAGAGTTAAATACCAAAAAA----------AAGGGGATTA--CGTTGAAGAGACAACCAGAGATATAGAATGA-------------------------AACCATTTCCA--AACCCTGT---------------TTGAGATACTTTCATGGAAAACAAAAAAGATAA------AAGCACAAAACGATTGCAAAGGCTGACACATCTCTGGCTTTTGCGCTATTCTGTGATACTAAACTGTAG-TTTAAAGAGCGCTAGTTACACTTAAGTTTCG-----------------------------CAAACAGAAAATAATCA-ACCACCTAAAGAAC----AGTAGTAGCCGC-------AAAAATAGCAGGA-----TCACTCTC--------TTCTATCATCGTAAATGTCTACATTGTTAGGTAAAAAGAAGTGCAGC---------CAACACGAAGTTCACTCACTCTTATTTGTTCTCAAAGTTCAACCAAAGTTTTT-TAAGTCTTAGCCA----------------------------GAACACATTC----------TACAACT-TCCAATTTTGTTAATGAAGA---ACCCATTGCTGAGATGTTCAAACATTGTTTTAGTTTAACTTCGCT--------TTAAGTTCTATTAACTATTAT-TACGATTATCTGCAAGCATACAACAAACCAACAATTGAAATAATGTTCTTTAAGTCAACT---TATATTTAAAGTA---AGTGTAATGAATATTTGTAATACC-----------AACCAATCAGAGATAAAAAATTAAAAAAAAATAATAATAA---TTACGAAAAATA---AAAATGAATATTTCA--TATAATTATGTACTGTGTGTAAATTCTATAAATATAAACT--AGATTTGCTATTTACTCCTTGATGTACGC----AAACCACA----ATACGATCTACACAAGAAGCCACGGAATATCAAACAA--------AAATAACTTAAACTACATGCAACACATTCGTATAAAACTGAGAAATATACAAGAAAAAACAA-------------TTTTTAGAAGCAT
G-------CGGCACGTCTTGGATACCAAATAAAGTAGGAAGCAAGGCGGTTAAGTGTTGTGCAACGATCGAAAAACATAGACAGATTGATAGTGTTGCAAACACAGCAACAACAAGTTACAACAGCTCTGTTTTATAATATAAATATTGAAATGATTTCAAAAACAAAAAAAAAGAAAAAGAAACAAGAAGAAAAAGATTATTAGTGTAACGCTGTCAGCGGCGTT--CGCTGTTCTGTGATACTAAACTGTAGATTTGTCGAGCGCTAGTTACGTTTAAGTTTCAGATAACCACAGATACTACAACAGAGAATCCAAAAGCAAAATAATAATATCCATTAAAATATTTCAAGTCGTAGTTACAGTTATAAAAAAAAGAAGAATTTGCTCAGTTTTTGTTTGCATTACATTAACATGGATTTCGATTTCAATTTGAATCAAACATAGCGACATTGTTTTTTAACATTAATTT--TTAAGACGCGTTTGTTCTCAAAGTTCAACCAAAGTTTTTCTATGACTT--CCAATTTCTCCCGCGACCTACATATATATATAAATACATTTATGCAAATCGTATAATTATCAGGTTTTGTTTACTTATGTATACACATTTAACTGATGTTTAAGCTTTGTTTAATTTTAATTTGTCTAGGCTAAACTTAGTTC--TTAATTATTATATACATACATGTACGGATA-ATAATATGATTACAAATTCAATAATGT--TTTAAGTCACCTACACATATGTAAACTACTGCGTATAATAA--AACTGTAATAACAAAAAACAAAGAACAAAGCAAAAAACAAAAAAAAAAAACAAACAAAAAAAAAATTTTAAAAAAATATACAAAAAGAAGATTTCATGTATAATTATTTACTGTGTATCAACTCAATGCATATAAATTAAAAACTCGCGA-TTACTTCTCAATGTATGCCACACAGCCCCAACATATGCAAGCTACAAAGGCAGCAACAATATATTTAAAAGTGCGCAGTAAATAAAT--AAGTACACGCAAACAATTCATATGGA--CAACAAATATACAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACATTTTATAAAAATAC
>Adh 14617245 14617643|15932 chr2L 14615956 14617452 scaffold_463 5928 7402 - 39837|1309 1551
GAAGTGATACTCCCAAAAAAAAAAAAAAACATAACATTAGTTCATAGGGTTCTGCGAACCAGAAGAT-ATTCA-----------CGCAAGGCAATAAGGCTGATTCGATGCACACTCACATTCTTCTCCTAATACGATAATAAAACTTTC--------------CATGAA---------AAATATGGAAAAATATATGAAAATTGAGAAATCCAAAAAACTGATAAACGCTCTACTTAATTAA
ACCATTCAAATCCGAGCAAGGAGCATCTGCATTTAAAAAACCCATAGTCTCTAGGCGACCAATATCTGATTCAACGTACAAATTCGTAATTGGTTAGGGTTGAATCT-TACGGAACTAAATTCTTATAAAAGGCTGAACATATATCATTCAAATCATTCTGATGTACGAATTCACACGCACATATTGTGTAATATGGAATTCTGAATATAACCAAAAAATAAAAATCTGATTTAATGAATTAA
>Adh 14617245 14617643|15933 chr2L 14617453 14617649 scaffold_7 2571212 2571413 + 5448|0 199
AATAGATAAATGGGAGCGGCAGGAATGG----CGGAGCATGGCCAAGTT-----CCTCCGCCAATCAGTCGTAAAACAGAAGTCGTGGAAAGCGGATAGAAAGAATGTTCGATTTGACGGGCAAGCATGTCTGCTATGTGGCGGATTGCGGAGGAATTGCACTGGAGACCAGCAAGGTTCTCATGACCAAGAATATAGCG
ATAAAAAGCATAAGAAAATTTGAACTAGGTTACGCGTTATGCACAATTCGAACAATTCGAAAGCTCAGTGATTAAATAGAAGACGT----AACGTTCAGTAAATATGTTCGATTTGACGGGCAAACACGTCTGCTATGTGGCCGATTGTGGAGGTATTACCTTAGAGGCATGCAAAGTGCTGATGAGCAAAAATATTGCA
>Adh 14618070 14618474|15934 chr2L 14618035 14619150 scaffold_7 2571578 2572664 + 37738|35 439
AAACTGGCCATTTTACAGAGTACGGAAAATCCCCAGGCCATCGCTCAGTTGCAGTCGATAAAGCCGAGTACCCAAATATTTTTCTGGACCTACGACGTGACCATGGCAAGGGAAGATATGAAGAAGTACTTCGATGAGGTGATGGTCCAAATGGACTACATCGATGTCCTGATCAATGGTGCTACGCTGTGCGATGAAAATAACATTGATGCCACCATCAATACAAATCTAACGGGAATGATGAACACTGTGGCCACAGTGTTACCCTATATGGACAGAAAAATGGGAGGAACTGGTGGGCTAATTGTGAACGTCACTTCGGTCATTGGATTGGACCCTTCGCCGGTTTTCTGCGCATATAGTGCATCCAAATTCGGTGTAATTGGATTTACCAGAAGTCTAGCG
AAACTTGCCATTCTTCATAGCGTGGAGAATCCGCAGGCTATTGCTCAACTGCAATCTATTAAGCACAGCACGCAAATCTTTTTCTGGACCTATGATGTAACAATGGCAAGGGAGGATATGAAGCAATACTTTGATGAAGTCATGGTGCAAATGGACTACATCGACGTGCTCATCAATGGGGCGACCCTGTGCGATGAGCAGGACATTGATGCAACAGTGAATACAAATCTTACCGGAATGATGAACACTTGCGCCACGGTGCTGCCATATATGGACAAAAAGCAGTTGGGAAAGGGCGGAATGATTGTAAATGTGACTTCAGTCGTCGGGCTGGATCCATCCCCAGTATTTTGTGCCTACAGCGCATCAAAATTTGGTGTTATAGGATTCACTAGAAGTTTAGCG
>Adh 14618526 14618902|15934 chr2L 14618035 14619150 scaffold_7 2571578 2572664 + 37738|503 879
GACCCTCTTTACTATTCCCAAAACGGGGTAGCTGTGATGGCGGTTTGTTGTGGTCCTACAAGGGTCTTTGTGGACCGGGAACTGAAAGCGTTTTTGGAATACGGACAATCCTTTGCCGATCGCCTGCGGCGAGCGCCCTGCCAATCGACATCGGTTTGTGGTCAGAATATTGTCAATGCCATCGAGAGATCGGAGAATGGTCAGATATGGATTGCGGATAAGGGTGGACTCGAGTTGGTCAAATTGCATTGGTACTGGCACATGGCCGACCAGTTCGTGCACTATATGCAGAGCAATGATGAAGAGGATCAAGATTGAATTCGAATCAAATAAAATAATGCTTTACGCAAAAAGTAGGCAATTCATTTTCCTATGAT
GATCCACTGTATTACTCCCAAAATGGGGTCGCTGTCATGGCGGTTTGTTGTGGACCCACCAAACTCTTCGTGGATCGAGAGCTCACCGCCTTTCTCAGCTATGGACAATCCTTTGCCGACCGCCTACGTAGCGCTCCTTGCCAGTCGACGACTATCTGTGCTAAGAACATTGTCAAGGCGATTGAGTGTGGTAAAAATGGACAGATTTGGATAGCCGACAAGGGAGGACTGGAGCTCGTCAAGTTGCACTGGTATTGGCACATGGCCGACCAATTGCTGCATTATATGCAGAGACCCAACGAGGAGAAGGAGGA-------CGAAAACGATTAGATGA--CCTTACACAA--------CATTTCA----------AT
>Adhr 14618844 14618902|15934 chr2L 14618035 14619150 scaffold_7 2571578 2572664 + 37738|821 879
ATTCGAATCAAATAAAATAATGCTTTACGCAAAAAGTAGGCAATTCATTTTCCTATGAT
---CGAAAACGATTAGATGA--CCTTACACAA--------CATTTCA----------AT
>CG15282 14713053 14713267|16024 chr2L 14712966 14713308 scaffold_2 4881120 4881476 + 3042|138 362
GGCTGTTACTTTAGTTCCTCGACTAAAAATTAAAATAAATTATTTGAACGTATTAGTATAACAAACACAAAACAGTTTT--TGTTTTTAAATACTCATTTACATGTTTTGACAATGGCTTATTGTAGGCCT-TTAGATCGACAGAGATTTTATTAATGAGTAACCTTCATTTATTTCGCTTGCTTA-------TAAATACGTTTGGGTTTATTTTTTTGGACATA
GGCTTTT--TTTAGCGCATAGTTTAAAA--------------------------------------ACAAATCAGTTTTAATACTTTTGAATTGTAGCGCCAATA----AACAACTGCTTGCAGGAAATCTGTCAAGCAGTTACTGATGTAATTTATTCGTAACTAAGCAGTGCGCTGCTTGCTTAGCTCAGGTCCTTACATTCGCATTTGGCCCATAGAGGGCA
>CG15281 14739561 14739789|16057 chr2L 14739368 14739666 scaffold_2 1873842 1874190 - 9318|253 365
T-----AAAATAATATTTTCCAAATTTAAAAACCCTTAAATTA--GTTAAGTTTTTAATGTCGCAACACAAAATGTACAGAAATTACTATTTACAATAGCTAAAAAGCCGATG
TCAATAAAGATAAAGCTTAGCCTGATAACTCAAACCTAACTTGTCATTTGGTGTGTTTTGTTGT---------TGTGCATGAAT--CCACTTGAAATGGGTAACAGGCAGATG
>CG15281 14739561 14739789|16058 chr2L 14739667 14739802 scaffold_2 1880258 1880413 - -120|0 147
T----ATTTTCTTCTTTCACGTAAATTCTTGTAAGTTTA---GTAAAGCAACAGTTAGAGTTGTTAAAATTTTACACAA--------GCAGCGGAGT---------TTTTCGTTTCCTATTATATTATATT-ATTATATTATAATATA
TCGAAATCTTGTTCTCTTG-GTATATCTGGGTATTTGTGTGCGTAAAATTATGTTTAAATGTGTGGACAGCTTGTTCAGTGTATCTTTCAGTGGAATGGCTAATAGTTTCATTTTCATATTATGCGACTTTGACTATGCTTCA----A
>CG4701 14763091 14763153|16092 chr2L 14763091 14763259 scaffold_7 25408 25595 + 190|0 77
GGGTGCCGTTTTGGG---------------TATTGATGAGCATAAAATCGGCAATAAAAGCTTCGTTATGTGCTTCAT
ATATTTCGCTTCAAAAATGTTAATATTTCTTATTTCCAAATATAAAAACGATATAAA----TACGTCTTTTGTTTAAA
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AAATCGTGGTGTCTACCAATTCCATCGACAGAAAACATTATTTATGA-----AATAAACATATTATATTAGTTATTCTAT
GCA----------------------CAATGAAACACATAGTTTTTCACTCATAGAACCCAACTAATATTAAGTATTATAT
>NC2beta 15004399 15004467|16399 chr2L 15003710 15004448 scaffold_2 5319418 5320130 + 29853|725 774
TAGGAAATAGTCTTTCTATGAGCTTAGTGTAGATTTAATCTTAAAATATA
-------------------------AGTGCTGGCTTCGTCAGCAAACCCA
>l(2)35Bd 15007288 15007701|16400 chr2L 15004523 15007712 scaffold_2 5320166 5323410 + 96325|2948 3369
TTATTGCCAAAA-ACATTCACGTTATAGACTATTATTCTGTACCCGTG---GCTTAGCACTTTTAAAGTTTATACTCGAAAGCATGAACAGATTATTAATTTCAGAAAAGATTAGCTCCGTAGGTTACAATTCGTAAAACTAAGGGTATGTTTGTTTGTGTTCATAGGTTTCAATTC--AAATTTTATTGTCCAGTCTAGGAGATATTTAACAAATTTACGAGAAAGCCACCAACCATCAAGCTACGAAATTTCAATGTAAATCGAGAATGTCATTTTGCTAATAAAAATTTTTAATTTAGAAAATTTTATTTACTATTGAGTCCGTACTATAGTTAGAAGAGACGT--ATTTATAAATATTACAGAATATTTCGTAAGCTAAATAATGAAAACTAATAAAATGACTTCAATGGAAAAATCA
TGATTCCCAAAAGACGCGCATAT----ATCTATATTTATATATATATATATACTAAGCGCATCGAAAGTTTTGTTCAGATACCGGGGTTTTTTTTTTAAT----------------------GGTTTGAATTTACAACATACTCAGCATAATCA-----GAGCATATATTTTAAGTTGGAAAGTGTATTT---------GAAAGCTTTTAACG---TTAATATAAAAAAAGTTGCAGTTAAACAACGAAA-------ATATTACAAAAGTATTAAAATGATTATCAAAAGTTCGAATGTACAAGAGAAAACTTAATA-----TCCATGCAATTTTC----GAGACTTCACGTTAAAAATATTAAATACCATTTACGATTCATTATAATAATATCGGAATTGCTGAGTTTAATTAAAATATTT
>CG33310 15025442 15025442|16422 chr2L 15025407 15026619 scaffold_2 5339172 5340497 + 63092|35 35
A
A
>yellow-c 15033658 15033771|16429 chr2L 15032508 15033917 scaffold_2 5347396 5348785 + 70137|1156 1271
TCACTTGGATAT--TTAAATCTACATGCTGTGTTTATGACGCGGTGCATTTTTGTATTTACATTATGACATTATTGTTTGTTAGTAAGTCAGCTTAATAAACTATTTGAAATGTGA
GCCTTTGATTGTGCGCAAATTGATTTGTTTTCTCTTTAAT------TAATTTTATATTTA-ATTATGAAATTATATTCACTTAATAA--------AGTGTCCAAGTCTATATGTGC
>Su(H) 15038548 15039264|16436 chr2L 15038216 15039194 scaffold_2 5354005 5355000 + 19195|374 1088
GTGCAGGATTATTGC-----------ATCGCACACA----TATGTATCCTAAGTTATTTATAG---------------------TTTTTATCGAAGACCTTAGTTTGTAGATTGACAATTTTTCTCATACTAATTTTCAACCCCTCGTGACGTAA----ACCAAAATGTGTCCCCTTCTCTCTAAAGTGAATCATACTTTACACATGTATCTAGTGCTAGTTCGGAACCAATAGAATTGTAAATGACACATAAAACTCTGTACATAACTCGAAA-AGCTCACTGACATACATACATACATTTGTATGTGCATGAATATACCTTTACACAAAACATGTAATTCTAGTTAAATATACAATTGATGTAAGTTTATAGACGATTTTTAGATGCGGTTGAAATATTTATGATTTTC-----TTTGCTATGAATTTCCAAAGATCTAAATGAAAAAAA-----------AAAATACTGCGAAATGCATCGGAAATTTTTATTATACACAAGCCAGTAGCCACGCTACAAAAACATTCCATTTCCCTCTTTAGCTTTCTAAAAAGTCGAAGACAAAGTCAAAAAGGGAAAAATTTGTTTCTGTACATACAGTTTTGTTGCATTTTTTTATTAACTTTGGAAATTCGTAGCATTAA-----------AAATCCCAATAAAATATTTTGTAAAATAAAATCGCAACAAGACAAAACAGCGATTT
GTGCGGCAGTATTGCTATTATTTGCAATTTCATATACATTTATTTATGCCAAGTTATTTAAAGTTCGTCTAGCACATATTTAGTTTTTTATACACATGCTTAGTTCTTAAGTTCTTCACTCTCCCCCT-CCCCTCCTCACACTCTCTCAATGCGAGGCGAACAAAACGAACACCAATTTC----AAGTTGACCAATATTATCAT---TTTGTAGTGCTAG-CCGGTACCAATAGATGTATAAATGCAAAATATATATTTGTAAATAACTCGAAAGAGCTCACTGACATAAAGAATT-----------------------------------AAATGTAACTCTAGTTAAATATAC-ATTTATAT-AGTATATAGAAGATTT---GATCTATATGCTGGGCCTATGCGTTGTGCCAACTTAATTGGATCGTCCATACATTTATATATATAACAATTGTTTGCTTAACATCTTGTACAACATTCCAACAATTTATATCAAGCGCAA--CATAAGCCCAGCATTAGA------CCACATACATATATATATATATAAA----------------TAAGTATATATATATATATTACAAAGCATATACTTTTGTAAGATAACTGAATGAA-----GAAAGTTGTAAGCCTAAGAGAAACCCCTAAATCTAAATAAA------TACCAGAACAAACATCAACTATGTCAGCTAACAATTT
>Su(H) 15038548 15039264|16437 chr2L 15039213 15039719 scaffold_2 5355035 5355570 + 10935|0 51
TGCCTAACATAAATAAAAAAAAGAAATCCCAAATGATGACAAAGAATAATCA
TGCTTTAAAGAGGCAAAAACAAAAA---CGAAA----AAAAAAGAAGCTACA
>vas 15070093 15070240|16474 chr2L 15070120 15071238 scaffold_2 5386850 5388054 + 3464|0 128
TAAATGTAATGCAGTAATTGATGTAATTAGTTAAATAAGTTAGATATTAATAACATATTAATTATATGTATTAT--------AACGCATATAATAATAAAATGCATATTTAGGATATGCAAGCCATTCG
TAAATCTTATATACCAATTGATATA-----TACAAAAAAAAAAAAAACAATATTATATGAGTTACATATAATTTGTATTGGCAATGCA---AATAATGAATGTTGCATTCAAACTAATCATTTCATTAA
>CG15270 15091659 15092844|16501 chr2L 15091159 15092460 scaffold_2 5423694 5425081 + 22797|540 1474
GCTAATAAATATCAAGATTGATGGCCACCCTTTC---GCACACTTTGTAAATAG-TTTTCTATGCACCCGCCCCCATTAAGTCGAGATTTTA-----------TCAAAGTTACTGATGATATATGAGCAAATTTGCTGAATGTGTGTCTTGTCCAGAGTTGGAAGAAACTAATTAACT-----ATATATAGTGGTTACCATATAGAAAATTAAGTTACTCAAACAATAGGTCGACAAGATTCGAACTTTATTTGGTCCAAAGCTAAACAATACAGAATTTGAATGAAATTTGCCT--------GTAGGTTAATAATATTAAGT----------TACCGGCAAATTTCATTTAGATTTTCTAACGT--------------TTAGTCTTGGTCTGTTTTTTTTTTTGGTTTC--GTTTTCCAGT------------------------------GAAAACCGAGCAATTTTTCCAAAACCATTTCATATACAAATTTAT-CAAAGTTTTGTATGAATG------------GAGTTCATTTGAATACAAAACTAAATAATGTTT----------------------ATGGCAACTTAGACTTT-CGGGTACAGTGCAATA----GAAGTGCATACATAGAAATTGTAGTATGCAAAGAAA-ACAATACTTTTTAA-GAGTTGTGAAACGAATTTTGTGTTAGCGTTTTAGCTGTTAATTCGTTTTCGTAGTCATTGTTGCTTAGCGTTTAGTCGTATAAATCACTTTGTTACACACAAAATGTTGAAAATGTTAAATTTGCATTTATGTTGCCAGTGAGCGGATACTTAATAATTACGCAATCGCTAACACTCTCACACGATAATCGAAATCAGACAAAACAACGACACGCATAACTGTGAGATA-------ATATCGTCCATTGTTCCTTCCATATA
GCTTA-----ACTAAAATCGAATACTAGCTATCCCGAGCGCACATTGTAAATAGTTTTTCTATGCA--CAACCCCATCTAGTCCATGTTTTAAACGATCTTTCACTAACATATTGATG--ATATGAGC-AATTTGCTGAATGTGTGTCTTGTCCAGAGTTGGAAGCAACTAACTAACTTATACATATGTACTTAATGGTAAACACAATAACAAGTAATT--AACAAAAGT-------AATTAACACATTATGTGGCTAACACAAAACAAACAAAGAA---AAAAACATTTCGCATTTGAAATGGTGCATTAAATGTTTTTAGTCCATTTTTCACACTCGCAAATCGCATAAATATTTGTCAAATTAAGCAAATGTGAAATGAATTTTGTTTAGCGTTTTTAAGCCGTTACAAGTTTTTTGGTAGCCAAAATGTTGTAAGCCTAGAGCTAAAAAAAAATGATAAAAAATAACCAAAACCATTT--GTTAAAAGTTGATGTTACGTTTTGCATTTATGTTGCCGGAGTAAGCGATTACTT-AATACTAATATTACTAATATTTGTCTACTTAACAGAGTGCTGCAATGAGTACTTTTATTTTGCGTGTTCCTTTCAATATTTTAACATACATATATTTATTTTATAATATTTTTGCAGGCACGCTACTCATAAACGCACTGATAAGTTAACTT-------GCGCCTCAGCTTT-------GTATCACACGCATGAGTACTACTTGTTCGAGCTGAATACTCATTT-----CAAACCAGATTACG----------CTTTGAATACTCGTTG-CAGTTATCTACTTCTC-----TTAAGCAATCAA-AAGACATAAACAT-ACACACAGAAACACAC-ACACAACGACACG----ACTGTGATGCGTTCGCATATGTCGTCCATTGTTCCTTCCATATA
>CG15270 15091659 15092844|16502 chr2L 15092521 15092840 scaffold_2 5425160 5425462 + 1616|0 328
ACTAAATGCAGCTAGCTATAAACGCTGAAAACTACATATTACTTGCTGCATTGTTTTTTTCTCGTTTTTCTATGTGTGGTCCTAGCTTGATCGAAGAGAAAACGAAAAAAAAAAAATTGCA-CACTT------TATCAACAGTCTAGTCAAAGGATCTACACTTTAACATAGATGCACCCAAACACAACGGCTATTTGTAAATATATTGTAGGGACTAAGTGTAATTTAAATGAGGTATACAAATTATATTAATGTAATAATTAAACGTGCTCTTGTGTTGAACAAAAATTTCAAGTAAAGCCATTCAAT--AAAGAAATTGTATTTGA
ACTAAACAAATCTATTTACAAGAATTCAAATTCAACAACAGCTTTCCGTAAGCTATTCAAACTATTTTTGTTCATTAAAT----GCTTGAGC----------TGAAACACGAGTATTTGTAGTACTTAGGCCATGCCCACACACACACAAAGGGACACACACACAGGCACAACTCTAC-------CGATGGATATTTGTACATAATATTTAGCATTTAAGTG-----TCAACGAGAAATTTACACGAAAATATTGAAATATAATTATGTGCTCTTGTGTTGAAAACGAAAAATATATGAAACGAATTAGGTAAAAGCAAATGTATTTGA
>CG15270 15091659 15092844|16503 chr2L 15092841 15093429 scaffold_2 1393790 1394302 - 1328|0 3
CTGG
ATAA
>stc 15113585 15113999|16527 chr2L 15113002 15114270 scaffold_2 5454024 5455472 + 11478|734 1205
-----ATCAA-----------ATCCGTG-TGGTATACAGAGATATTAAATATATTAAATCGTTGGCGCTGGAAAATAATAGTTAAAAATGGATAGATAATGCAAATGGAAGCCTGGATGTGGAAGACTTA----TTGATTGAACCTAAATGAGGAAAATTTTGTGGATG-------------CGCTGCGAGGACAATACAGAAGGATAATTGCCGTTACCACGTATATTTTGTAAATTATAACAAATGTTAGTTGAACCCTAGAATGCTAAATGTTGAATACTTGAATATGGAGTGAACTGGATAAGCAGGCACAAATGTGAAGAATCATGTTAACCAAT------CTGTTGTACGATGAATTTATCCAAAAGCGAAACCTTCTGGCCACGTTGCATCTAAATACAA-------AGGAAAGCGATAGATGAGAAGGATAAA---TAAATGAG---TAAATAGAGCA----GA
CAGGCAACAATTCATTCGTTTATCCTTGACAATACACGAACACATTTAGCAGAGTTTATC--------------AAAAGAGAGAGAGAGGGGCAG-----------GGAGATCTCTTTGTAAATCTCTTAAAACTAGCCTGAACATAATTGA--AAAATTTCTAAAACGTTAGTTCAAATATTGTTGCATGGACAATGTTAAAGTAAAA--------------GAAAGGTTGCAGGATATACCAAATG--------AACATAAAGGAAAAAGTGTGGAAAAC---AATACTAA---AACAAAAAAAACGGGCAAAATTGGAAA-----CTGTTAATCAACTTTCAACTGTTTTATGATGAATTTATATAAAGCTGAATCCTT-TGACTACGTTGCAAACAATAATAAACAAAATAAGGAAGCGATGTA-AAAAAGGAAATATTTTAAATGTGAGCTAAAGAAAACCTTGTGA
>CG31830 15283717 15283996|16736 chr2L 15283783 15284231 scaffold_18 2426254 2426758 - 8706|0 240
TCTCCTCACG-TTGGCGCTAATGCAAAT--------GTGAAAAGGCATTTTGTGAGCCAAAATGAGGTTGTTGTCGTGCCACTGACAATCTAATTAGAATACAAAATGCTTTTAGAGGCAACTGCAACTTTGGCTTGAGCTCTTGCTCCTTAGCTTCATGCCCAGTGGGTCTTCAGTGGGTTTCAAGTTCATGGTGTTGACATATGTAGCTGG--TGGTTGGA----------------TA
TCGCTTCATGGTTGGCGCTAATGCAAATCTTTGTGTGTGCTCAGGCATTTTG-GAGC-AAAATGAGGTTGTTGTCGTGCCGTTGACAATCTAATTAGAATACAAAATGCTTTTAGC--------CAACTTGCG-----------------------------------------ACCAGGTTTCAAGTTCATGGTGTTGACATATGTAGCTGGCATCGCCGCAGCTTCAGCTTTCAACTCA
>ms(2)35Ci 15289191 15289381|16743 chr2L 15289233 15289415 scaffold_18 395087 395321 + 5624|0 211
CGCAGCATGTAGCATTTTGTGGTGCGCGATTAGGCGCGAAAATTTATTTGGAAAATGTTGCGCAATCCGC---------------GCCGTGCATAAATCGTGG----CCAATTGTCACCAG----------CGGATTGGCAACC------GAACCTCAGCGACCTGCGT----------------------------TTAATTATCGCCCCG
CACAGCGTGTAGCATTTTGTGC--CGTGATTAAACGC--AAATTTATTAGACAAATGTTGCGCAATTGGTCGCCAGCATCAGGCTGCAGCGCATAAATCGTGCGGGCCCAATTGTCACCAGGCTCCAATTCAGGCTTTACACCCAGCCTAGAGCTTCAGCTTCATATGTGTATGTATGTATATGCAGAGTCTTTGGCTTAATTATCGCCGCA
>ms(2)35Ci 15289412 15289472|16743 chr2L 15289233 15289415 scaffold_18 395087 395321 + 5624|242 245
TTGA
TTGA
>esg 15331436 15332079|16809 chr2L 15329746 15332922 scaffold_18 444786 448274 + 62010|1875 2784
G----------------GCAATATATTTATATATACATTATATAGCTGAGATCCCAGCCATGTTCCACCAAAAATTAGTTCCTAGCTCT------------CTTAGGCGGCTCCAAGTT---CCCGAAACTCCCA-GTGCAGACACACAACTTCAAGCAGAA----------------------------------TTTCACTTGTTTTTTAATTTCTAGTCAGCATTTTCTCCCAGAAGAGAGAAAATTAAAAATTAC----------------GTTTTAATTTGTACAATCCGGCAACATTT-TTGTAACCACCACCACCAATTTGAATAGTTTGAACCAT-----TTTAAAATGTGTGCCCATAATATATCCTAAAGATGAACT-TTGTAAAGTATTCTTCGATTTATCCTGTACATA-ATGTATTA--------TGTCTAACTGT--AGACTCTAAGCTGAACAAATGA----------------------------------------AACGCCAGACAATCA--ATCGTAAGCAAGACATACATCTCTATAT---TTTATACGATAGTATTTTTAGCCTAGCTGTA--------------AAAACCGTAAAC---------------------------------------TATTTTTGAT----ATGACCACTACTTTTTCGCGTACACATTGAAAATGTTCTAC-----------------TGTAGCTT---AAGTGAAGATAAGCAAACAACACATACATATATTTTGATACGAAAATGTTTTGTAATTCTAAGTAATTTATTGCAT-------------------------------------CAAGCGAA-------GAAAGAAGGAAATACATTTTATTTACATACAAAAAAAAAACA
GCTCCCAGCTCCACCTCGTCGTA-GTTCATCATCGCATTACAACGTT-CTACACAAGCCATGTTCCACCAAAAATTAGTTCCTAGCTCGAGAGTAAGCGGAAGCCGGCAGCTCCAAGACAAATCCAAGACACACACACACACACATGCACGCACAACCAGAAAAACACACACCCAGTGAAACGTTAAAATTTTTATTTTATTTTATTTTTTATTTTCTAGTCAACATTTTCTTT---GCAAGAGAAAATCAAAAAACAAAACAAAACAAAAAAAGAACAAAATATATGTAATTTTCAAGAATTTCTTAAAATTACAATTGCAAATTCG--TTTCTTAAACCCTAGATATCTTTAGTGTGTCTCAAT--------CCTAAGCCGAACTAATGTGAAGTAT--TTGCAAGTGTCCTGTACATATAGGTATTACGCCCCGGCGTCTAACTGTAAAGACTCTAA---GAGCAAACGACGAGCCGCAACCTGTAAAACTTTAAAACTGTAAAACTAGCAACTCGAAACTATGATTATGACAAAGAAATCGTATATATTTGTATCTCTTTTTATTATAGTA-TTTTAGCATAGCTCTAGCTTGTACTTATATATACCTTTATATATATACATATATATATATATATATATATATATATATATATATTTTTGATATCCATGACGAA-ACTATTT---GCATACATTGAAAATGTGCTATACATACAAATTTTTAGATGTAAACTGAAAAACAAAAAAAAAAAAGAAACAGA-ACAAATATTTTGATATAAAAATGTTTTATAATTTTAAGTAATTTATTACACGGTATAAAAGAAACCGCAACAAATACAAAACAATCAACAAGAAAAAAAAAGCAAAAAAAAAAAATACA-TTTATTTACATACAAAAAACATTTA
>CG4161 15430839 15431179|16939 chr2L 15430820 15431408 scaffold_18 562357 562977 + 4756|21 429
ATGAGTGCAAATTTGTCAGTTGA--------AAATCGAATGGCCTCGTTACACCCACT---------CGGAATCAGG---TTGTT-------------TGCAA---GTGCTTCTCTCTCTCAAAAAAACAAAAAGCCCGAGGGATCGTTTGGGCCCGGCTCTAACAGCGACTCTCTTTCCGGCCAATTGCCGCTTGACTAATGCTGTGGTTTTTATAGATGGCGCGCACATGCGCACCCATTT-----------------GTCCTGACGACTCC------------CAATTTGGAAATGGAAAGTTGCCACACCGCCAAATGTTGCCAAAGGCGTGAATTCAAGGCAGCAAAAAAATATGAAAATTA---AATATGTGCTGATTAAATTGATTGTCTTTCGAAATCAAA
ATGAGCCCAAATTTGTCAGCGCACTTTGCCCAAATCAAACTGCATCGTTACGCCCACCAACTGCGCATGGAGGCAGGAATTTGTTCATTTTGGCTCCGTGCCACCTGCATTTCTCCGGCCTAAGCTAATCTAGACCTGGCCAGACCT----GGCCGGGCCTGCCCAGCGGC-------CCGGCCAATTGGCGTGTGACTAATGCTGTTGGTTTTATTGATGTGGCGCACATGCGCAGCTATTTTTATGCGAGGAGCTGCCGGCGTAGAGAGTCTTTTTTTAGCCGACCAATTGAAAATGGAAAGTTGTGA--------------------------AAATCAACATATGAAAGATGTGCGAAATTTAACTAATATGTGTAATTTATATGCCTTTACGATTGAAGTCA--
>Tim17b2 15481297 15481419|16995 chr2L 15480474 15481519 scaffold_18 609611 610704 + 17946|866 1022
ATTCCGATTTTTCTTGTCTGGGTATATTAATACGTAGTCCTTTTTGATTTTCATAAGTG--CTAGATTTAGCAATATTCCATTT---------------------------GAAAAATTCGATGACAATAAAATA-----TGGACAAAATTGCAGTA
ATT--GAATTTGTTGACTTTTTTAACTTA----GCCATCCATTATGACTCTGATACGTGGCTAAGTCTTAGCAAAATTTTTTTTTATGGTTCTGAGCCCATCTGGCTAAAGGAAAAATAC----ATGATGAAGTACTCGTCAGATAAAATTGAAGGA
>lace 15499845 15500947|17013 chr2L 15497939 15500591 scaffold_18 630075 632689 + 85245|1936 2786
-----AATCACACGC------------ACACACATAGAAGTTAAGCTTGGGGAAATGGTAACCTCCCCGATTGGTA--AACCAAAACTACA------ACACAGTCCAGATAGTGCTAAATCAATCACGAACG-GTGGCTTACATTGACCAAGTTTCAGTTGCACTGGGCTTCTATTTATGACTAATTCTCTGGTTATATGCCTTAAAAGGGAAGATCACTACAGCAACAGAAACAA-----------AACACTACAGCA-----CATAGCTTAA--ATGAT-AAAATATTATTAAT--------------------------TATTTAGCATTTACCTCTACGTAGTTGTTATTGTATAT-GTAAAATCCAATCGTCTTCTTTGGTCGGCTGCTGCA--------------TTTTAAGTATTTATAGAAGAGAAAATGACAGCGCAATGTATTGGGCAAATCAGGGTTT--GGTTAC-------------TTTTATAGCTAAGCTAAGGGAAGCCCCTTTTTCGTGGGAAAGCCTCGAGCACCTCGCTTCTACCAATTAAGCATACTAAGCTGAGCCAAATGTAACGTCTAAAGAGTCAGCGATACAATTGTAAATCACTATTTGGGTAAGTCTTCGGGGGACCCAAAAATTGGGTCAACTTTAGGGCATTGTCAGGAAATATATATGTATAATAATTATGTATTATTGATCTTATTTTTCCACCAAAAAAATAAAGAAATTGTTGCTTTATCTAATAAACTATATTGGAATAGCTTACTG---TAAAAGTATTCACTGTACGGGATTCTTAAGTCTACTAGTGTAAATATTTATTTAAAATATATAAAAC
ACTCTAAGCACACACATGCACCACACAACACACACATTTAGTACTTTAAGTAGAAAGTTGTCCTCAGTTATTGGAACCAGCCCAAGGCACAAACTGTATTCGGCACAGAACGAGTTTCAGCCGCCAGACTCGAGTCGTTGATA-TGGTGAAGCT--ATTTACAATGGACATGTTGTTGTGGCTTAACTTTTGACTAATCCCC----AAGGGACTCTGCCTAAAACACTAAAAAGAAATCGATGAAACAGCACTACAACAACATGCATAGCTTTATTATGATGAAAATAATAATAATAATAACAATAATTAATAACTATTGTATATTTAGCATTTAACTCTTCATAGTTGTTATGGTATTTCGTAATATT------TCCGATGTCTTCAGCTGCTGCACATATTTTCTTCTCTTTTAAGTA-GTAAGGAAGTGAAA----------AATGTATTATGATCATCAAGTTTTTCAGTTATACAAATGCGTATACTCTATAAGCTAGCCAGATTCCGCAGCTGCTCC-------AACATCGCGCACCTCGCCTTAAAAGATTCAAAATGCCAAGCCAAACCAAATGGAA-ATATTCAAATGCAACCAGTTAACATAAAAACTTAAAAGGCGTGGCAGTTCCAGAAATATAAGCATTACTTC-----------------------TATGTTTGTGTA-----TATGTATTAAACATTTTATTTTTCTA--ATAATAATAAATA------------TTATGAAAACTTCCAGCTTAACAACGTGATGTGATAAAAGCATTCAATTTCTGAAGGTGTTATGCGATTTTCTGCAAGTGCT--TTTAGAATACGCAAAAC
>CG7631 15625440 15625445|17156 chr2L 15624529 15625686 scaffold_18 2003524 2004701 - 27244|937 942
AAATAG
ATAAAA
>CG18480 15628024 15628554|17158 chr2L 15627592 15628155 scaffold_18 814637 815171 + 17993|432 573
AGGGAGTATCTTTTTAATATAGCCAAACATTCGTATAAGCTAAAAGTAATCTAAGTTATCGCTCTTCTCGACCTCAATTATTTACTATTCAAATCTATATGAGATAATT------ACAAATTTAAAGTCT----AATCATTT
AT--------------ATCGAGCCAAA---TCGTGCTCCCTTAAAT--ACCCAAGCAGTAGGC-------------ATTATCTAAT----AAATCTTTAAGAAAGACTTAAGGCAACATCTTTATAGTTTACAAAAGCATTT
>CG18480 15628024 15628554|17159 chr2L 15628420 15629302 scaffold_18 815172 816119 + 12147|0 137
TCATTTTACACACAAAAATATCAATTGGGGAATTCCAGCATTTTTGCTTCTCGTTTTGGATA---AGCATTACTTTTACAAGACTTGGACTTGCAGCTGCAACAAATCGCAATAAAAACTTTTGACAAAACTATCAAA
TTTTGTTTCATACCAAAATATCAATTGGGGATTCCT----TTTTTGCTTCTCTCTTTTTTTTTGTAGCATTACTTTTACACGACT-------------GCAACAAATCGCAATAAAAACTTTTGACAAAACTATCAAA
>l(2)35Df 15751507 15751834|17308 chr2L 15751517 15751951 scaffold_17 370046 370497 + -1480|0 347
AAATCTATTTTAAGGCCTAACTTCCACTTCCGTTCCAATCGTA--TTTTATTGAAATCGGA--TTTGTTCTTTAGATCCA--TTAAGCTATTTTCTAGCTTGATGTTTGGTTATAGATTTAGTTTTGAAACACAAACACGAAT---AACTCTGCTATAAGATTTCCGAACCTTGCAATTATTCCTTGATTTAACATATCGACTCAAAAGGTCGAAATATTTGAACCCTAACAACCTTTGTAAATTTA---------------------TTTAATGATAAAATGTTAATTTTATCCACGGTTAATAAAATAAATATGACCATGAGATCTAACATCTATTTACTTAGAAA
GAGGCAATTTGATTGC--AATATTTATTTATGCATCGCTCGCAAATGTCACAGAGTTCACACGTTTCTAATTTAAAATAAAACTAATCAGTGTTTTATTTTGAAATTTATTCGTTGTCGCGATCTCATGGAACTAAACTGAATTTGACCTCGATTATTATA------------GCAATTATTTTATT-TTTAAAGTATAAGC---AAAGGT--ATATAAATAAAGTTTAA-AATCTGTATAGAATAAAATATAATGAAATGGACTATTTTCAATTTGAAAATGTTGCAGCAATCATTCGCAAATGTAATATATATGTATATATATTCAATTATGAATAAAGGTAACAA
>CG3793 15761641 15762057|17318 chr2L 15760558 15762039 scaffold_7 2970034 2971535 + 48455|1099 1558
GAGTGAGTGAAGGTGGAAG-----GGATAGAGAGCCAACCTACTTGGA----TGCACTATTTATTGACTCTGCTCG-------GTTTGGAGGAAGGCCATGCCAAAATATTTTGCTTCTCAACGTGTTAACCTAAACAGCAAGTAATTAAAGAGAAACCATCGAAATCAAAACATGTTTAGATATTTATCCTACACAGAGACCCACTCACAAATGATCTAATTTGTATTAATTTAGTTGTTCCTTATATT-----TTTTTCTCTTGTTACA--TTTTTATTATTTAATCGCTTAATATTTACTATTTTATCACCGAGTTGTGGC-ACAAAATATTGATAGGTGATCAATATGCCATTC----------ATTCATTCCCCA---------ATTTAAGTGTGCGTTTAAAT-----------------TGTAAATGTATTTTGAAATT-ATTAAAAAAAAAA
AG------GAAGCCTGGAGTTCTTGGCTGCACTGCAAAACAACTTTAACATTTGTATTTTGTATGCACTTGCCGCATGCAATCGTTACACAGATTGCGTTAACAAATTATAATGTATTTAATGTTTGTAATTCACACATACACT-------GAGAAA-CACCTACTTGCAA-----TGTACATAATTGGCATTGCTTATGCCCCATTTATAAATTCTTAAGTGTACTTTAATTAAGAT-TGGCTAACATTTGAAATTGTTCGTTCCTTAAAGCTTTTTATTGCTAA---GCTTAGTTCTTCCTCTCCC---------TTTTGGCTACATAATTTATATTTGCAAAGAATATGTACTGCACCAACGAAAATTTATTAATCAAATGAAATGATTCAATTGATTGTTTAATTCATTGTCCTGTGGGCGCTGTAAATGTATTTTGAAATTCATTAAAAAACAAA
>CG3793 15761641 15762057|17319 chr2L 15762040 15762486 scaffold_27 987429 987809 + -1272|0 17
CCAACTTAAATGCAAAAA
CGAA--TAGTCACAATCC
>Tektin-A 15852206 15852383|17443 chr2L 15852250 15852541 scaffold_7 2147608 2147926 + 18|0 150
AACACACAATTTGCAAAGAGATCTAAATTACCCAGTGCT-------------CCTTTAAAGG---GGAAAGCTTTTACGATTATTCACATTCAAAATTTGCAAGTGAATAAATTTTTGAATAAATGAAAAGCTGTTCAGTATACGTAA-AA
AAAGCACAATTTGCATTATAACTCAAAGCCTCAACTGCCAGACCCTCAGATACATTTACAGATACGAAAAGCCT--ACAAT-----GCATTCCATATTGGCATGTAAA---ATTCCT--ATAAATGTAAGGGAAATCTATAAGAACAATAA
>CG13244 15913285 15913536|17524 chr2L 15912836 15913815 scaffold_7 3747604 3748670 - 12909|461 802
GACGCCAAGAGGAGTGGGATATTTGGAAGGAACTTTGAGATTTGACG----------------------------GCATGACAACCAAACCAATTGATTAATGGCGGGCTGGGCGGAAACTGTTCGCAATAAAGAGA------TCTCTCGCTTTTCCTCTTAAGTCACCCAGGTAAC------ACCACTCCGATTCGC----------------------ACATAATTTTCGCATAAATTGTCAAATG-TTTAAAGCCTTGCCA---CTGAGCAACAGCCAA-----------GGTAACCTA--------AGCCTTCGGATT-AAATTTATTGCT----CCT
GATAC-----GGACCTGAATGTCTGGTATGAAGCCTGACATTGGGTTCCCCATCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTACATGATATGGCAACTAATTGATTGATGGTA-------CGTCCACAGTTTTCAATAAAGGACATGCTTTATTTAGCTTGAGATTGTGTGTTGCC-AGGCAACTTGAGCATTGCCTCGTTTCGCTACGCTTTTTCGCTCAATTGTCACATAATTTTCGCATAAATTATCAAATAATTTAAAGCCCACCCAGCCCCAGGCAACCACAAACGATTGCGTGAGGTAACCCAGCGCAATGAGGCATCAAATTCAAATTTATTGCTTTGGCTT
>CG31736 15965037 15965047|17590 chr2L 15964810 15965250 scaffold_7 3816196 3816613 - 14747|230 240
TTCACTTACAT
TTCACTTACAT
>CG13245 16001282 16001396|17636 chr2L 16000410 16002440 scaffold_7 3874683 3876902 - 12779|1059 1207
ACGCCAGGAGGAAATGCGGTCTTATACTA-----CTAAAATTATCAGTGTAGATCTTCTTGTACCAGCCAT-----TTCCATG------------GGAAACCAATA---AAAATTTG---------AGGGACTAATACTGACTAAGTAA
ACTTCAGCAGAAGATG-GTTCTAAGAAAAAAGACTGAAAAACAACTTTACACAACACCTTGCTTCAGCAATAAATTTGCCATGCTTTATACTAAAATAAACCATTTTTTAAACTTTGGTGCAAGATATGGAAGAGAAACCATTGAGTAT
>beat-Ic 16035460 16036976|17681 chr2L 16034797 16035577 scaffold_7 3925496 3926353 - 15798|780 907
TGCCGAATTGATGATGAAATCCATTTTCGAAAGTAGCTTAAGGTGCTCGCCA----CCGTGCAAAATAGCCAGTATATGGCTCTTTTCCT------TTCGCACCCGAATTGTTGAAGGGCATAATTAA
TGCTGAATTAATGATGAAATGCATTCCGGAAAGTAGCTTAAGGTGCTGCACATTTCTCTTAACCAACACGCCATATTTGTTTTTTTCTCTTATTTGTTTTCATGCGAGTAGT--AGCGCAATAATTAA
>beat-Ic 16035460 16036976|17682 chr2L 16035901 16037244 scaffold_7 3927433 3928686 - 7835|0 1152
TCACATTACTTCCATTAACTATGTGAAACTGTTCTGTTCACTGTTAAAATTAAATATCTATTTGTCATATTTATTATTTTGTAAAAATAGTAACACATTTTATTTTCAGCTAGACACACTTTTCAGACAATAATATCAACTCAATAAGCATATATGAATGCTACAGCAAGGTATTTTCACTTTTTATTC-CCGATACTTTCGAACAGATCTTTACTGTAAAAAATAAAAGATCACAATAAGCCACGACAAATGGCTCTCAGTGAAGAGAACATTAAGAGATGCGGAAAGTCAAACCAAAAATGCACAGTTGCCTGGGCACTGGGCACGTACAGGGTGAGAAAATGCGTGTGCTCAGTCACTGAAAATCAAAATGTACTTAGAATAAATACTATGTACTTCAAACTCTTATGTTATATATCAAGCGTTAAATATATTCAAATAAAAAATCAAAAAGTTATAGGAATTGTGCACAGTGTACAGCAAGCTGAACTTTAG-ACTGCACTTGAGCTTAGCTTTCGGGTACCGTAGTGCATTTTAAAGTGGGGTTTTGACAGCTTCAAAATTGTAAACAACCGAATATAATTTAAGTCAATACTAATACCCGTTACTTTTAGAGTAAAAGAGTGTTCTAG-ATTAGTGGAATCG-TTTGTAACATTATAAGGTATTCATCTGAGTAACGGGTATCTTATAGTCGAGAGAATCGACTATAACTTTATTTTGTTTGTTTTCTCCTTTCAGAATGAAGAAGACAT-----TATGTCAATGTGTAAATAAAAGCTTAAA-ACCAAGCACAAAATTAATATTTTGTAACATCCACTGTACAGAAAGGAACTTTTTACGGTTGTGGAAATGAAAAGCAAAATTAATTATTATA-----------GCAAGCGTTTATTTGTAGA---AAACAACGAATACATAGAGCAAATT----AAAACG----AAAAAGAATCTTTATTTTCAAGTCTTGTTTCGGCAATATTAAAACTCGATGAAAGCAAAAGAATTATTTGAACATTTTTGGCCAACAAAAATCCAGCGGTAAATAGTTCCTTTACCTTAAACAC-AATTCAATGT-----------------------ATGCAATGGGTAATCG---------------------TAGCC
TTATATCGCTTCCACACACTTTGTCAGTCTGTTGT--------------TTATTTATTTTTTAGCAGGACTTTTTTTGTTATGAGAAAA--AATACATTTTTTTTAAAAACAAACCTTCGCTTCGTACAAACACCTTACTTTAGTTA-------------------------ATTTTTATATCTTATTTTCCAACAC------AAGGCATTTTGTTGTGAGAAAAAAACAATTTCCTTGG----CTGCAGGCTGCACACTTAATTGAAGATATTTAAAGA------------GAGCAAATATACACATGTTTTTGTAT----GGCA------------------GCGAGCTTTCCTTCAC---AAATTGCGATCACATGTTAATACATAACATTAACTTAAGCCGCACA----------CAAACG------------AAAGAGAACTGTGAAAAGCTTTTGCGGTCAAACTC---------TAATCTGATCTTCAACGTTGCACTTGAGCTTAGCTTTTATATATCGTAGTGCAGTTTACAGAAGAG--------------AAAGAGGAAACGCAAGAA-----------------------------GCTTTTCATATAA------TTTCTAGTGTTTGCGCAGTTAATTTGTAA----ATAAAGT--------------------TCTGCTAAACATGAGAATGGAAGAAA----------------------CAAACAAAATGAAAAACAAATATATATATATGTATCTGTATATGTAAGCTGGTATAATAATAACAAGATTA--------------------TATAGAAAGGAACTTTTTACGGTTTTGGAAGC---ACGCAAAATTAATTACAAAAAAAAAATATAAGTAACTTTTAATTTGTAGACGCAAAAAAAGGTGAATTACAGCAAATTCAATGAAACGCTTAAACAAAAATCT----------GTTTTATTTCAGCAAACTAAAAAC--------AACTACA-AATTATTT-AACATTTTTGGCAAACAAAAATCCAACGGTAAATAGTTCCTTTGCCTTATAAATGAAATCGATGTAACTGTAATTTGGAAGCATGGAAACGCAAAATGTAAATGAAATAAAAGCTCTTGGGAAATTAATT
>BicC 16044135 16044555|17690 chr2L 16044112 16044297 scaffold_7 2890530 2890701 + 1456|23 192
TCCGCTCCTGTCG-------TTCGACCCCATTGCCTCGAATTCTTTTTTTCTTTTTTTTTTTGCATGCCCATTTATTTGGTAGTCGTAAGATCAAGAGAATCGGAACGGTAAAAAGTATAGGAAGAAGTCAGGAAGAAAATGGCAACTCCCTGGGCGAATAGCTTTCCCG
TCTGAGTCTGTTGCTCTCTCTTCGCACAGGACGCAAAGTATTCTCTTTTTTTTTTTGTTTTTG---------TCATTGACCTGTTGTGGAAGTGAAAGACTCAAAATACTCGAAATAATAACGAGAATTTAGGCTGAAA------------CAAAAGAAAATCTTTCACT
>BicC 16044135 16044555|17691 chr2L 16044499 16044627 scaffold_7 1832417 1832576 + 2214|0 73
GAAATCTA-ACTAAACGAAATCA------CTTGTTGTAAGAAATGAATTTA----------TGTAAACTAACTG
GAAACCTACACTCAAAAAAAGGAGCATATTTTGCAGCACTAAATAAATTCGAATGCTACGCCGCATACAAAAAA
>beat-Ia 16076827 16077617|17737 chr2L 16075618 16077627 scaffold_7 4007047 4008964 - 38079|1252 2152
TTCAATTGTCACACAACTCCAGTGCCATTCGCCAGGGGTAGAAATTA------AAGTGGAG----TCCAGTGAAAGCTATAGTTAGAG-----GATGTTGGAGGAGAGTTCAGCCCAAGGCCAAGACCCAGAAGCAACTGCAGGATGTATCTAAAGTACTTACACTAACAAGACACCAGACACTCGTTTCAGCTAGCTCAAAGTAACTTCAAATGCATTTAGGG-GAAGAATACAAAGCATACAGAGACAATGTAAACC----------------AGATACGCGATATACAAGCAAAACGCCAGTTCATCATAAATGCAACGATATCTAT---------------TTGTTTGACTTTCCTAGGATGGAGATGGTCAGGAGGTTAACGCTTTTGACAGCTTTCAAAAATAAGATTTCTTG-----TATTTCTCATAATGCTAATTTAATTCCAAAACCTCTCCAGAGATAATTTCCCAAAGCAAATGAAAAATGTTGTGCTAAGCTTTTAAATTTAGGTTCTCTATACATTTA--------------------TATTTATATATC-AAAGTCAAGATTATTTATA---AAACCTATAAATGATATTTATATATATATA-TGTATATGTTCTATATAAAAACAAAATTATAA-------CATATTGCGCCTAAATGTATTTGC-------------------CCCAAAAAGAGAACGAAACATAGGGCAAGAGTAAGCAATTAGGTCTTAAGTCTAAATAT-TGCCTATATATGTAAAAGTATATATGTAT-TGTAATTGTATATATTATATAAAAGAAGCGAAACACAAAGG---TCGAGACATGTATGAT--ATAAGAATTTACGGTAGATAATCAAAATAAAAAACGAAAGCGAGGAATA
TTCAATTGTCACGTAATTCTTGTGCCACACTTCAGGGAGGGTCAAAAGGCAGCAGGCGGAGATGCACCAGCGGCAGCAGCAGCAACAGAGGCAGGCAGCAAAGTAGGCTTCAGCCCTAGGCAACAGC----AAGTAACTGCTAAATGTATCTAAAATATTTACACCCA-AATACA-CAGACACCAGTTTCAGCTAGCTCAAAGTAACTTCAAAGGCATTCAAAACTAACAACAAACATTGTGCAGATACATTTCTATTCATTTCATTTTTCTAAAAAATAGGCAAAAATTGAACAAAAAGAAAT----ACTTAAATTTATCGATAGGTTTCGATAAGCAAACAGATTATTTTCTTTGCCGAG--CCGAGCCAATTACCCTGTTA---CACTTGCCTACATACCTAAACGGAACCACTTGCGAGCTGGTTCTTTTTCTGATTTATACACTATAAAATATAAACGAAAAAGATTT---GAAG-------AAAATGTTGTGCTAAGCTTTTCACTTTA---TTTCTTTACAATTAAATACATAAACAAATATATTTATTTGTATAACGAAAGTAAAAATTATTTATGTATGAGTATATAAATGATGGATCTTTATATGTACCATATAAAGT-TATATACATTCATACATATAATCGTATGTGAATTATGCCTAATTGTAATTTCACACACACATACACACAAATCCAAAAAGAGTA--AAATTTAAAGAA-----GAGCAATTAAGTTATAAGTATATAAATACGCCTATGTATGTAAAATCATATATATATATATAATTGTATATAATATAAAGCAAAACCAAAAAAAAAAGGAAAACGTAAATTGTATAATTGATAAGTATTTACGGTAGATAATCAAAA-ATAAAACGAGCGACAAAAAAA
>CG4892 16130218 16130341|17812 chr2L 16129424 16130506 scaffold_7 4091856 4092885 - 11235|840 966
---CCGTATCACGATGATATACTCTTTAAACTTACCGTTTCTGTTGTTCACTATGTTTAACGATATCAATTTTTCTGGTCGATCTGATGCGGGGTGCCTCGATTAAATAAAATTGAAAGCAATCAGC
TTTTCGTATTTC-ATTATCCGTTCTTCTAGTTAACACTTTTTA--------AATTTGCAACGATTAAAGCTT---------------------GAGTCCCGATAAA---------AAAGTACACAAC
>Ca-alpha1D 16185015 16185084|17847 chr2L 16184928 16186473 scaffold_7 4150135 4151642 - 45479|88 157
TCCCTACGATCAGCGTCGTTTACCAACTTCATCTGATATGAACGGTCTAGCCGAATCATTGATTGGAGGG
TCCCTACGATCAGCGTCGTTTACCAACTTCATCTGAAATGAACGGCCTAGCCGAATCATTAATTGGAGGG
>Ca-alpha1D 16185140 16186015|17847 chr2L 16184928 16186473 scaffold_7 4150135 4151642 - 45479|219 1150
GTACTCGCCGCTGAGGGATTGGGTAAATACTGCGACTCCGAGTTCGTGGGGACTGCTGCACGGGAGATGCGCGAGGCGCTGGACATGACGCCCGAGGAAATGAACCTGGCCGCCCACCAGATCCTCTCTAACGAGCACTCGCTGAGTCTGATCGGCAGTAGCAATGGTAGCATCTTCGGTGGATCCGCCGGTGGCCTGGGAGGGGCTGGATCTGGAGGTGTGGGTGGATTGGGCGGTAGTAGCAGCATTCGCAACGCTTTCGGCGGAAGCGGAAGTGGACCGTCCTCACTGTCGCCGCAACATCAGCCTTACTCGGGCACTCTGAACTCACCACCGATTCCGGATAATCGTCTGAGACGTGTTGCCACAGTCACGACCACAAACAATAACAATAAGTCCCAAGTTAGCCAAAACAAT------TCGAATAGCTTAAATGTTAGGGCTAATGCC------------AATAGCCAAATGAACATGTCACCAACTGGACA---------------------ACCAGTGCAGCAACAATCGCC------------GCTAAGAGGACAGGGCAATCAGACTTACTCCTCATAGCACCCACATTGTAAGCTATACATACAGAATGTCTTCTTGATGGAACTTTAAGTGTGCATTCAGCGCAAGCTGAGGTTTATTGGCTAATTTATTTGT-TATTTTTAGCGAAGAAAAACA-CATTAGTCTTAGCATCGGGAATTGTTATATTTGAATTGTTCGCACACACACAAGCGGGAACCAAACCAACAAAACTTGTATAACTTGTATAAAGAAAATCAGCTAATTGTATATGTATAAATATATTAATGTT--TTTGCCTTTTTGAGAA-ATCTATCGTGGGCCTTCGTCCTCTAACGAGCCAGAAAACCAAAAAACCAACAACACTAAACTGAACAAATTAA
GTACTCGCCGCTGAGGGTCTAGGAAAATATTGTGATTCAGAATTTGTGGGCACAGCTGCACGGGAGATGCGTGAGGCGCTGGATATGACGCCCGAGGAAATGAATTGGGCTGCCCATCAGATTTTATCGAATGAGCATTCGATGAGTCTTCTTGGCAGCAGCAATGGCAGCATCTTTGGTGGTGCTGGCGGTG------------------CTGGTGGTGGTGGT------GGTGGCAGCAGCAGCATTGCTGGTGCATTTGGTGGCAGCGCCAGTGGACCATCATCATTATCGCCAATGCATCAG---GGATCGGGCACTTTACAATCACCACCGATACCAGATAATCGTCTAAGACGAGTTGCCACAATATCGACCAC---TAATAATAATAAGTCTCAATTTAGCCAAAATAATAATAACACTAATAATATAAATAGTAGAACTAATGCAGCAACGCCTACGACTAGCCAAAGAAACATGTCACCCACACAACAACAACAAATGGAACTGCAACTACAAAAACAACAACAATCGCCTGAGCATAACTTGGGCAGTGGTCAGGGCTATC---CTGCCACCTCATAGCATACAAACTGCAGTCCATACATGCAAAATGTCTTCTTAATGGAATTTTAAATG----------------TAACATTAATGAACTTTTTTTTTTGTATAATTTTTGAGAAAAAATACAGCACTAGTCATAG----------------------ATAATTCAAGTCAAAAAAAAAAAAAAACAAAGCAACATTA--TGCAAATCTTGTAAAAA----------TTATTGTATGTACTTACTTATATAATTAATGGTTTGCCTTTTTGATAACGTCTATGATGGTTTATCGTCCTGTA------TGAAGAACCAATAAAT-----------AAATGAAAAAAAAAA
>CG31819 16209167 16209236|17875 chr2L 16207798 16209340 scaffold_5 1555546 1557100 + 17330|1409 1481
TACTGTAGAGTTATAGTATCCATAGC---TGTTTTACAAATATTCTAAATAAATATATATATTTTTCTCCAAA
ATATCTAGATTATGAGCACCGTGAGCATGATTTCTCCATGATTTCTCTATGAAGAGAAAAATCGTTTGAAAAA
>CG4930 16255192 16255362|17922 chr2L 16254040 16255256 scaffold_7 2983307 2984510 - 34429|1177 1241
TAGTGCATCTTTCATGACTGAAGGATTGTTTCCTTATGTACTAAAACACCTATTCTGGTCGTAAT
TAATGCGAATGCAATCTCT----ATTGGTAACTTTTCATATTAGAAAACATTTCCAAATTGTAAT
>CG4930 16255192 16255362|17923 chr2L 16255257 16257241 scaffold_7 2985267 2987112 - 35510|0 119
CTCTGAAGGCACACACAGTAAAGCATTTCAATAT--------CTGAATTATGTTTCGAAATGTTAGAAATT----GTTTAA--AAATGAATAAAATGATAAGTATTTTATAACTGTTCTC
CTATGGGAGCA-ATATTATATAGCATATCGATATGACAAGACTTGGTTCCAGTCTAAGCATGGCAAAACTCTTAAGTGTAATCAAAAACATAAAAAGACAAAAGTTTTCTAATT-TTCGA
>pkaap 16286709 16287126|17961 chr2L 16284347 16287151 scaffold_2 2012318 2015113 + 66502|2481 3102
TGTGCTTTACCATTACG--------------GAATTTATTTCATATTTA---------------------TTCTCATTC--------------------TTTTACAAAT-------TACTCTTT-----------TTTGCGAGAATCTCCACGACATGTGCACAAA---GAAGAAGTC----------GCAACAGAAGCTCTCTC-------TAG-----TACCCTCTCCTTATGTAC-AAATTGTGTTGAAC--------AAATCAAATACTTTACTTT------AACTTATTTTAATTAATGCTATGGGCTTTGAAAGC-------GCATTATT-AACTAAACT--------ATCGCTCGCTCATTTGTTATTTACAGCA-ACA-----------------GAAGGCAAAACTC--------------------AAATAT--------------GAAATAGAAGCTAAGTTA---------CTTCATTCCGTTTAAATATGATTAAACAATTGTATAACATAATA-------ATGTATATGAATATTTTTGCATACTGATGATACACTACCAAGGAAGATTTATTGTTATGAATAAACTTTTTC-------AGTAACCAA
TATTTATTTAGTTTATATACACAAACGAAACAAATTTATTTATAATTTGGCGCTCAAATATTTGAGGAATCTCGCATGCAGAGTTGCGATAGCATCTATTTTGATAGATCGACAGCCACTTTTTTAAAGCGGCTGTTGGCAACACTGTTCA--ACAAGTGCACAAATCGAACGAAAGCTCTCTTAAATGCAACA-ATGTTCTCTCCCTCTCTTAGACGCTTGCTCTCTTTTAAGCTACTATACTCTTTTTAAAGACTACTGAAAACAGATGTTTGATTGTTTGTGAAACTTAAGTTATT------CATGAACTTTGAAAGTTTTTAAAGCTTTCTTAAACAAAACTTTCTCTTGCTCACTCGCTCATTTGTTATGTAAAGCACACACACACACACACACGCACGCACGCAAGTTTCCTTGATTTCGTACCTACAAAAAATATCTTACTGACATTACAAAAACAAAGCATATTTAAACTTGTACTTTCATTCCGCAT-GTTTTGCTTAATTTTATGTAGTATAAAATATTTATGCATATACATAAATATTTTTGCATAC---TAAAACACTATATAACAAAA-TAATTGTTACAAATAAACTTTTTTCTATGGAAATTTCAAT
>CG17328 16297538 16297690|17974 chr2L 16297103 16297572 scaffold_2 2024750 2025278 + 20111|501 535
AGTATAGCTACGAAGATTTATCTTAATCATAATTA
AA-------ACTAAAATACATGATTAACATATATG
>CG17328 16297538 16297690|17975 chr2L 16297573 16301435 scaffold_2 2025506 2029389 + 30277|0 138
TTGTTTTAGATTATGTTTT-GATATT--GAACACTTTTATTTAG----------------TTTGTCTATATAAAATGGAATA--TTTTGTCATGTTTGCTTTTATATCTTTACAATAAATACATGTAGAAATTTGGCAA
TTTTTATAAGTTATTTTTTTAATATTATGAACACTTTTATTTAAGCATTACATATGCATATATGTATATATAAAATGGAATTGTTTTTGTCATATTTGCTTTGTATTCGTTTTGTACAATAAATATAAAAATTTGGCAA
>c(2)M 16301409 16301870|17975 chr2L 16297573 16301435 scaffold_2 2025506 2029389 + 30277|4170 4200
ATATTTTTAGATA----ATTTTTTTCAAGAT
ATTTTTTTGGGCGAAGCATCTAATTCAAGCT
>c(2)M 16301409 16301870|17976 chr2L 16301627 16302282 scaffold_2 2029390 2030005 + 24593|0 246
TTGAAAAATTCTATAGAT-GTTACT-TGTTGCTGTCTATAAAAATAGTTTTTTTTTCATTATCATATTAGTTTCGTGTACCCATTAAAAGTTGTTTGTTATCTTTGTTACTATTACGTTATCGTAGCTATAATTCATTAACATTTGGAGTAATTCTCTAAACCGTAATT-GTTGTCTTTGTTACAAAATCTCAATTTCTCTGACAACACCAAAAAATAAACAAGTTACAAAAACAAAGGAATACAGA
TCGGGAAGTTCAATTAATTACTACTCTATTGCT-----TATATATTGTTTTTCTTTTCTTTT--------TTTTTTTTATGTATAAAAACTCGTT------CCTTGTTAT-----CGTTATCATAACTATAATTCATTAACACTTTT-GTAATTCTCTAAATCGTTCTTTGTTATCTTTTGTCTTAAACTTCTGTACTT-----AATCCCAGGACA----------ACCAAAATATATGAA-ACAAA
>Syx5 16305061 16305202|17977 chr2L 16302426 16306610 scaffold_2 2030006 2034225 + 108941|2866 3010
TCAAACGCCAGTTGCCCATTAAAAGCCCCATGTACCTATCCATGTATACAGCTTTTTATTTTAATCAAGATTCAATCACAA--TATTGTTTATTCCAAGCTGTGGCCTCCCGAAACGATTGTA-AAATAAAGTTATAAATACGTT
TTAA------------TGCTAAATACCCCAAACCCTGCCCCG-----------------------CTCGATTCAATTCTAAATTATTGTGAATAC------ATGGCAT----ATACACATATATATATATGTATATAAATATATT
>fzy 16308757 16309026|17978 chr2L 16306647 16310072 scaffold_2 2034520 2038240 + 97448|2184 2461
TATGCTCAGACCTTTAGAACTGTTTTTACCCCCTTGATTGCTAAGTTTAAGCTTCAATACTTACTACTGGTATGTTTTCCAGACTAGACAATTATTTCTTGAATGCAT-ATCCAATTTTTATGTTC--TCGTTTAATGTTTCGTACTTTGTAATTACGGA----TAAATCTCTGATTATGTGCCCCCGCCGACGATATATGAATAATTAAATTTTGTCAGTTACTTTTATTGCTTAGAGTTAAGTTTGTGT-GCGTATAAATAAAATGCTTGACATTC
T-TGATCGATCCATTGA------------CCCATTGACTGGCAG----AAACTGAACT-----------GCATTTTGTTTAAACTAG-CGACAAATTCATTATTTTATGATAAGATTCTTGTAGGCAGCCAATTGATGTTTTTT-TTTTATAAGTATGTGACTTTCAATATTTGA-TATGTGTATTTTCTA--TATATTTAAGTTTGTGCATTTTATATATATTATGTATTTATAAATTTAAAATTGATGTAACATATAAATAAAATGCTTGCCATAC
>CG4278 16323965 16324060|17996 chr2L 16322551 16325111 scaffold_2 2055114 2057700 + 64353|1532 1627
CTTTGATCTTATAAGCATTTTTTGTTTAACAATGCATTTTCTGGCGCATCCATAAAGGTTACAAATAAACTAAAGGATTTAACTTTCTTAACTTCT
----------ATATAGATTGCATTTGGAGCAGTGTAT-----------------------ACAATAAAACAAAAAGGA--AACCTATTTAA-----
>CG4440 16326236 16326298|17997 chr2L 16325904 16326310 scaffold_2 4880873 4881358 + 3714|456 521
ATACTAATGAACTGATAATTTGTCTTATATGTAAATTTATTAAAAAACTAAAT---GGAAATCTAC
AAACAAATCAGTTT-TAATACTTTTGAATTGTAGCGCCAATAAACAACTGCTTGCAGGAAATCTGT
>CG4455 16349483 16350478|18010 chr2L 16348819 16349485 scaffold_18 1207507 1208147 - 10839|720 722
TTC
ATC
>CG4455 16349483 16350478|18011 chr2L 16349835 16350698 scaffold_0 3097345 3098198 - -1424|0 696
GACTGTTTCTTTATCTGTTGTTTCTCTTAA--TCCCGGGCTCAACAAGTTT--GGCCTGTCCTCTGGCCCTTTTTCCTTGTCCCTCCTGCATCTTTGGCCTTTTTTTATTTCTTTTAATGCAGGTAGTTTTAGCCGTTTACTCACCGCTTTGTTCTCTGTTCATTTTTTTTGTGGGACAGAGCCAAATTGTGGCAATTGAGTCACGTTGCCTGGTTGTTTCTTTCGAAATCCAAGGGAATTTAGCGATCTTTTTTATACCGTCTTCACGCAACCCAATTTGCATTAAGAATCCGAATCGTACTAACAGACGAACTCTTCGTGATGCCTCGAATTTTGCACTACATTTTAAAAC-----GCCGA------TTCCCGTCCCTTTATATACACAGGTTGTACTTAAATCGAAACCAAGTACTTAATA---------ATTGTACCATGCCAATCATAGTTTA----------AGCGCCAATCTGCCGCCACGAATACATTTAAGAAATCTTCAGTTTGTGCATTTAGACCAGCATGAGTATCCTTCTATATATTGTGTCAAAAAAAACGTTTTTAGACGTTATATAGCATTAAGTCTATCAAAGTTTATATACAAATCTTTTTGGACATTTT---------TATGTGAGTTTTAC-------ATAAAATAAATGGTT---TTACCTCACCCAACGGTAAAA
GGTTGTATTTTTATTTTTAGCCCTCCGGAAATTGTTATGCTTAATGGCTTTTCAGTTTACGTTTTAGTTGCTTTTTATTGTGCT------GTGCTGTGCTGTGTTTTGTTGCTGCTGCTGTTGGCGTCTTTAATC-----TTAACTGCTTTATGATTTATTTAGATTCGGTTTCATATATATTTTTAGAACATCAATAGCTC----TTAGCTTGTTGTTAACAATTAAAGTCGCTGGAATTAATTAGTCTCAGTTCTAGCAGTTTCATTAGATATGGTT--------------GCATCTTCTTACACCCTGTAATATGGGTAAGAGGTCATCTTTTGTGCGAGCTCTTAAAATTTATTGCAGAAATATTTCCGTGTTCCTCTTCAGACCTAGACAGAGTATCAGCT--AGTCGGGTACTTACCATTTTAGAGTATTTTTGCTAGCTTACCGTAGATTTTACATGTGGTAAAGTTAATTTGCTGTCAGGGGCTTTTTTACAGTATCTTTTGGTGGC----TTAGACTTGAAGTAGT-TACTGCTTTAGATC-----------AATATCTAAAGCCGTTGTGGGAAATTGAGTTTGCCAAAGTTTTATTACATCTTTTTTAGGGCATCTTTCTGCTCGCTGTGTGTGTATTAATGTGGGGATTAAGCAAACGGTTGTGGTAAGGTATTAAGTTATAGAA
>jhamt 16362806 16362906|18033 chr2L 16361532 16363646 scaffold_18 1218817 1221030 - 26528|1330 1437
TTTTATTTTACAAATTAACAGTAATTGCATTTGTTAACAGAGTCTATTAATGCCAAATA---ATGTA----CTTAATTTAAATACTTTAAATATACAAAGTTCCAACA
---CATTAGATGGGAGGGCAG-AATAGAAGAGGATAGGTAGCTTGATCAATG-TAAGTATGTATGTAGTAGCTAAAAATAAACTATTAATATTATAGAATTTTCAACA
>Idgf1 16442649 16442776|18132 chr2L 16441073 16442650 scaffold_18 1311241 1312807 - 57084|1607 1608
AT
AT
>Idgf1 16442649 16442776|18133 chr2L 16442651 16442984 scaffold_1 4691907 4692194 - -1747|0 127
GATTTGTTTGTTAAGCCTAACAAA--GCCATATATTTTAAGTTTTCTAATAAATGTTTCATTTGAATTACAAATATTGAAGCGCATGTTTGCGGTTGAACACATTATTTAATAATCGGTCTCAGTGAG
TATATG-----AAATCATAACAACATGTTTTGTAATTGAATATAGAAAATAAATGTTTAATGT-ATCTAAAAATTTTCAAATGAAT-------GAAGAAGAGCTTACAGAGCTATCG-----------
>Idgf2 16446388 16446429|18135 chr2L 16445112 16447869 scaffold_18 1315493 1318053 - 80319|1276 1317
AACGAAACATAACATTTAATACTTTAAATAAACAATTATCAA
-------------ATTGAATTGTGTTCATATAAAGCTCATAT
>Idgf3 16448779 16449105|18136 chr2L 16448073 16450091 scaffold_18 1318068 1319935 - 25004|706 1032
GCCGACTTCTCTAAGCCAACTTCTCTAAGCCAACTTCTCCAGTCCAGACCATAAAGACATCTCCAGCACGCAAATGTCACAAGAAAAGTTGGTGAAGCGGAGCTGGGAGGGAACAAATGTCACCCTTTCGGTGCCTAAAAGGCCTCCTTCTGTGTCTGTCCCTTTTTGCAAATTAATTACAAAGTTGTAAACTAAAATGCACCGCAAATTAATTCGATGGGCTTGGTCCTCAAATGGGAAGGGAGATGAAGGAAACTGATATGTAGTGAGAGAAAAGAGGTAGTGCTAAATGGAACTTAATTCTATTCCACATATTATTCTATATAT
T-------------GTCTACCTTTGCATATATACATATCAAGT-----------AGCCCTTTTC------CAAATGTCAC----CAAGTT------GCGCCGCCG---------------------------GCCGCCGAGGCTGGCCCCAGTGTGTGTCC--TCTTGCTAATTAATTACAAAGTTGTAAACTAAAATGCGCCGCAAATTATTTCATTGGCCTGGACAC---------------AACTACTGCAACT-ACATGTGGT---------ATAGTAGTGTT------CGCTTGACTCGCTCCCTGG-------CTATGGAT
>Tpr2 16502947 16503281|18194 chr2L 16501410 16503551 scaffold_18 1372824 1374828 - 83081|1564 1902
GATCCCAACGAGTGTTGTTCACCACCACAGAGAAGAAGACCATCTCAATCCCATACTTTCTGCCTCATCCGAAACCAACATACAGCAGCGCACAAATTTTGAACTC----TTTTACATATTTCTTTTCCAAAAAGCAAGAAAATACCACATTTTGATTATGTTAACGAATGAATATATGCCAAGTTATTTGAAAAAATATTCTAAATCAAAATAATGCAACTAAATTTCCAGTGTAAGTTCACATTTTTAAATGTTCTTTCTTGGATTTTTTTTTCGGCAACATTAATAAATCATGGGAGATTTGTGTTAAATAAACAGAAATATACATATAAAAATAT
G--------------------CCACCGCAGGACAGGCAGACA--------CAATCTTGCCAGCCACATC------------------ATGCACAAATCGGAGTCTTTGCATTTTACACACTTACTTT--------------------------------------------AATTTGTCCCAA------CGCAAAACACTTAAAACCCGACATCAGCCAG------TTTCAATAT---------TTCTGGGGTTTTCCTTCTTT--TTTTTTGTTAGGCGTTTC---------------GCTTTCTCTTTTGGCATGCAAAACATA-ATTTAAAGGTAA
>CG31816 16539105 16539194|18249 chr2L 16538918 16539184 scaffold_18 1401508 1401784 - 4335|189 279
AAGC--GACAAAA---TAATGAGGACAGCGAAATTATT-----CCTATTCCATTTTTAAGGGAATATACAGTTATTAAAAT-AAAATATTT
TTACTGGCCAAAAGCTTTACGTTGATAACGGTATTATCGAAGACACACACCATTCGCGTGCAAGCTTTTGGCTATTAAAATCACAACATTT
>CG31816 16539105 16539194|18250 chr2L 16539185 16539500 scaffold_2 4808560 4808847 + 169|0 9
TCATACCCAA
TTATG----A
>CG31738 16657708 16657955|18395 chr2L 16653767 16658382 scaffold_18 1462853 1467573 - 139102|4060 4343
AAAGATACGAGATTCAAACAAATGGCGCCCAACGTGGAGTACCACAGGATTTGAAGGCAAAACGAAAGGAGAACAGTAAAACAAAACAAAAAACAAATATGAAACACTTTATGTCTCAAAGAAGTGATTTAAACC-ATTAGTTGTAA-------------------TTATGTATTTTTTATATATTTACCCTAACTGAATGAAACAAAATCAAATTGTATATTGTCTAATTTTAAACA--AAACAAACATAACAGGAAATCAAAAA--------------AAAA
GCTGGT-----GTTCA---------CGGCGAACGCG----ACTCCACACTGTAAAGGT------------------TAACACAAATC----------------CCAATTGGTGTCTCAAA-AAGTGATTTCCATTGACTAGCTGTAAATCACTTGCATTTGTTTTCTTTTTTATTTTTTATATGTATGTATGTATGTATATATATAAAAATCCATTGTACATCTCCAAAATATAAAAAGGAAACAACAATAACACACACACACACACACACACACACATTCACA
>her 16674905 16675861|18411 chr2L 16675483 16675880 scaffold_12 737748 738104 - 722|0 393
TAGATCGACTCGGCTATTGATTCTGATCAAGAATATATACTTAT---ATATAAATAT------ATACACTTTATATAGTCGGAAACGCTTTCTTCTGCATGTTACATACTTTTCAACGAATCTAGTATACCCTTTTACTCTACGAGTAACGAGTATAT------TTTAGGAATTGTGTTATTCAATAAATTGTGTGTTGAAAATGTCTACACTACGATCGATTATTGAAGAAAAAATAAATTCAATGAAAATTAAAAACAATTAGTCAATAATTATATATTATTTTAAATATGACTATTTATAGTACCGGATAATAATCATATTTAAAAAAGTGTATTTAATATTAACAGCTAAATACTGTAATGATTTTAAGCTAAATACAAATAAAATCAGC
TGAATTGATTTAGTT--TGACATTCATTTGGAATCCATGCCAGCCCAATACAAATATGCATCAAAACATTTTCTATAGCTTTAAATG------TATATTAATCAAACATTGATCAACTTATGTAAAAC-----TAGAGTCTATGTATAA---ACATATAGAATGTTTATAAATTGTGTGTTTGATAAAACGCTG-------AATATTTCCACTAATGTTTTTTATT------ATAATCATTTTGTTT----TTCAAAATA--TACTCAAATATCAAAA--TGATTTAAATGTG-TAGTTAATCGTACATG-TAATTGCCGAAGCTTAAAGACCGCACATTAAATAAAA-----------GAAAAAACTTTAAA------ACACACAAAATTGAT
>grp 16695571 16695859|18434 chr2L 16694333 16695916 scaffold_18 1490765 1492295 - 55327|1275 1588
CTTTTAGTTTCATTCGAACTTAAAATCCTGTCTTGTCTTGTATTCGGTTATATTTACATTTGTCTAGCCTGTAAGAGCAACTCATGCATCACCTTCGATCAGAATCATCTAAAATTCTCAATGTGCTAACTTATTTTTAATTCATTGCATTGTTTACGAGTACGTTGTGTATTGCTAAGCGGGCTCTCATTCGATTTTAATTTTGTTGAATTTTAAAGCAAAAGTCGAGTATTGAAAACTAGTT---TAAATGTTATCGAACAATAAATC--------TTATG--------------CGATTTTGAGTAGAAAA
ATTTAAGTACTCATAAGACATCGAGTTCT--------TTAAATTAGCCTAT-----CATTTGT-----TTGTAATCACAATTCATGTGTC---------------------------------TTTTAACTTTTTTAC--------------TTTATGCACAGAATAGGTATTTCAAAAAGAGT----------TTTTAGTTTTGTTAAATGTTGAA--------TAAGTATTTTACTGTAGTTAGCTAAACGTTATGAAACAATAAATTGACACTGATTATGACGACATTTAAACAAAATTCAGAACTGTAAA
>Cyt-c-d 16715382 16715571|18462 chr2L 16714991 16715537 scaffold_2 3419186 3419712 - 17553|400 556
AATCGCCTGCGAAACAACAAGATCGGCCACCATGCTATCCAGAAAACTGCGCTTAAAGACTACAAACATATTCAAAAGATGACGTATTTCACTTGGATTTCGAAACTTTGATTGGGAATGGTC-GAGCTCAAATACATTTCAAAAAGGTTTACTTTC
TA-----AGGGACACAACAAAAAAAAAGAAAAAAACAAAACAAAAACTGGGGAGGGTGCCATCTAAAATAGTTAAATAGT------TTCGATTTATTTTTTATTAATATTATGGAATACAATTAAAGCTCACATACACCATCAAA---TTTATTTTC
>Cyt-c-p 16718306 16718588|18465 chr2L 16717927 16718612 scaffold_2 3421932 3422650 - 35715|379 699
TGGTGCTGTC-----CATCAACTTACC---------CACAACCACTGCAG-GATGTCAAACTGTATTATTGTGTTCAGTCACAGTCC---------------------GGCACGCAAATGCAGCAGCAGCAACAACTACAACTACAAATCAACATAGTACAGACCTAAAGAACTACAATTATGTTAATTATAAAGTTTAAATAGGACAATT-TATTATTTAATTTAAATAAAAAGTGGA-ATATTTAATTCAAACCCGATGAGAATTGTGACATCCACAAAAAAGTTAAATAATAAAAAAAGAACTAAAAAATGATATAAA
AGTTGAGGCCATCTGCATCCATATCCTAAACACCAGCACCACCACCTTAGCGACAGGAAACTGTATTACGGGTGTCAGTATCGCCTCCGAGCTGATCTTGACGATGATGGCACGTATTCGGGTCA----CAATAATAACAACTAATTTAAAACAGAATACTGAAC-ATAAAAATACAATTATGTTAATTTTAAAGTTTAAATAGGACAATTACATTATTTAATT----TATAAAGTGGATATAACTAATTTAAAGCCGAATA-AATTGTGACGCCCACGAGA----TAAATAACAACAAATTAAAT-AAAAACAATATAAA
>CG17904 16729497 16729969|18478 chr2L 16728288 16729569 scaffold_30 104096 105371 + 50054|1236 1308
GAATAAGTTAAAGACCACTCAGTTTTTAAATAAAAAAAAAGATGCCTGTACAATTTTATGTAACATTTATTAT
TTGTTTATTATGATTTGTACTGTTT-------ATTAAAGTTATGCGTATA-GATATTAT-TAATATTAATTAT
>CG17904 16729497 16729969|18479 chr2L 16729716 16738153 scaffold_30 105380 113798 + 281627|0 261
TAGGTTGGAGTTAAACATTAAGTATGGCTGGGGAAGATGGCGGGCTTGCTAGGGACACATCCGTGGTTACTCTTCCCGTGGCATCTGACGGTTGAGCAGCAACCTCAGTGGCG------GCCTGTTTCAGATTTTGCGCGAGTATTGTGTCCCTCACCGTACTTTCCAAGGGCGGCGCAAATGTGGTATCCCTCCCCAACTCACTAATCAAGCGGACTATTTGCTCTGACGGCGGCGATTG--GCTCTTCTTCGTGGGGGTA
TAGATGGCTCCTAGGCATTTATGGGCGCTGCGGCGGCTAGCGGACTTTGAATGGACATCTCACTGGCGCC------------------------AGCGGCCACTTCATTGACACTAATCTCCTCCTGCACCACATGCGTGA------------TCGCTGTGCTCTCGAGCCGCGGCGCAAACGTTGTATCCCGGCCGCACATTCTAG------ATTCTATTT---CCGCCTGCAGCTGTTGCTGCGTTGCCTCCAGCTGTTG
>CG17905 16738155 16738543|18480 chr2L 16738485 16739075 scaffold_30 115685 116257 + 22094|0 62
AAGAACTAATTTATACGTATGTATGTCTCCGCTAAATATATTT----AAACCGATTTCCAAAA
AATAAATATTTTTCATTAATTTAAATGCTTGCAAAACGTATTTTTATAAACC--TTTGTACGC
>CG17912 16741082 16741494|18483 chr2L 16740608 16741586 scaffold_30 117983 119134 + 17586|558 1084
ACAGACCGTGACGGA-AACGACTTCCACTGATTAACAGGAAATGACAAGCACA-ACGGAC----TGAAACG---AGGACGTGTAAAAAAGACAATTTCCTCCAAAAAAAGAAAAATA-ATGAAAGAATAAATGTAATTGCACATAAAAAAACCTGACCCAATTTCGACTGCATTTTAAGAGAAT-------------------------GCATTCAGCATTCTAACAGAATTCCATTTTTCCA-------AACTGGACAC------TTTTATACATTTACTCTGCGCA-GATCGCAAA--------------------------TTGCGACAGCGGAAGTTACGTTTAGACGACCACAGCGTACGAGAGCAAACAGATTACGAGAATCACACAATACGAAACAACATTAAAAAGAAAAGAAAACTT-----------------------------------TTTTTAGCATATAGTATGATATATGTCTGTACAA-TTTTTAATTAAA---AAAAATTAATGGCAAC
GCAGACGCAGACGCACAGACACCGACATGGACTTGTACAAAA-GACAAAAACACACAGACATTGCGAAACACTTGCAACATTTAATACACACA--------CACACATATATATATATATATATACATATATATATTTATATATATATATGCATAAC---AATTCAGATGCAGATCTACAAAATTAACTGAGACTGTGTCGTGTTTAACGCGTTGCGCATTTTAAT--AATTCCAATTATACATCCACGCAACTATACGCTGGACATTATATAGTTTTATTTTTTTTATTATCGCATATGAAGCGACTTTTGGTTCAATTATTTTTGCAATTTCGAAGAATGCGTGC--ACGACCACAGAAAACGGCCGACAATGGAACACGGAAAGAGTTTTACAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTAAAGGAATAGAAAACAACATAAAAACCAGATTAACAATTTAGCATATAGTATGATATATGTCTGTACAATTTTTTAATTAAACATACAAATTAATGGCAAC
>yellow-b 16753995 16754212|18494 chr2L 16752839 16754656 scaffold_30 132834 134527 + 53120|1161 1378
ATTCCCGCAGCGGTACAAAAGTATCTTGCGCACTTGCGAACGAAAATGTTTTATGTTTTTCAAGAACAGAGAACTTGAAAAATTTCTGTAATTTTAGCATTTTCACTGATTTCTTAAACGTACGAAATATTTTTATTTGAGTGCAATTGTAATCTGTTAAGATGTAGGCTTAGAAAACTTAAACGTTGTACGTGAAGTTGATTAAATGTAAGAAGTGT
GCGCCC----TGCTGCTCGGCTGCTGTCTACAGCTGCGCTCCTGGCTGCTCTA--------AAGGTCAG----------------------------------------CCCCTTGTATATACAACAACAATATATTCCAATGC-GCTGTTATATAATTAAATGTAGTTTTCT--AGCTTGTAGTTT----------TTGAATAAATATAAGAAATTT
>Mhc 16783014 16783486|18504 chr2L 16782223 16784719 scaffold_30 165693 168651 + 86087|813 1493
GCCTGAGGCATCACC-----------ATCGAATAAAAAATCTATATAGCGATCCA--------ATTATGGTTCATTTACG------------------------ATAATGAGAGAACAAAAACCATGCAAAGAGAATTATAGCTTATAAGAATTATTATAAAATAAATACTAATAACAATAATATAGATGCATCACATGACATTCGCTAGCAGACAAAAATGTATAAATTAGAGGCCACCCCAATCA-------------------------------------------------------------------------------------AAAATCAATGGATCAATTCATCG---------------AATACCAACCAAGAATGCGTTCATTTTGACAGAAAACCAGACAAAAAGCCAAAAAAATATTGCAAATAAA-AAAGCAAGCAACCAACGCAGCACCAGGCTAAATCAATCGAA-ATGCTTTCTTTACCAC----------------------TATTTACAAAAAAGAGAAAAAACAATACTATTCTTCCACTATATTATTATAAA--------------------------------------CTGTATTTGTACATGTGTACTGCAGCCGACAGCGTCAAAG---GGCCGCAAGAGCGCGCTGCTGGAGCA
ATTTGAGGCACAACCAAAAATGAAAAATCAAATATAAAAACTAAAAAAAAAAACACAAAATCTATTATGGTTCAATTATGTGTAAACAAACAAAAAAAAAAAAAGAAATGAGAGAACAAAAA-CATGCAAAGAGAATTATAGCTTATAAGAAT-----TAATATATATAC-AATAATAATAATATAGATGCATCATACGACATTCGGTAGAACAGAGAATTGT---AATTAGAGGCACAACCCACCACATGCTAACGCACCTGGGCGAAAAAAAGAAACGAACCAGATAATTCAAATATAAAACCGCAAGAAAGAAATGAAAGATGATCGATAACATCAATCTATCGATACATCGATCCATCGATAAGCTAGTACCAACCAAAAATGCGTTCATTTTGACAATTTTTCTAACTA-----TGAAGATCAACAGCAAGTAAATCAATCAAGCAATC-----------------AATCAATCGACTTTGCTTTCTCTACAACCATACTGCATACAATATATATATATTTATATATATATATATATACAAAACTATTCTTCCACTATATTATTAAAAAAAAACCAACCACATATATATATATATATATATATGTATATGTATTTGTACATGTGTACTGCAGCCTACAGCGTCAAGGGGTGGCCGCTAGAGTGCGCT-CTGGAGCA
>Mhc 16783950 16784695|18504 chr2L 16782223 16784719 scaffold_30 165693 168651 + 86087|2216 3086
CCCCGTGCGACGTCCGTTAGGCCACAATTCGACGGATTGGCCTTCCCACCAAGATTCGACCTTGCTCCTGAAAACGAATTCTAAATGCCATTTCATTTTTTAATTTATTTTAAATGATATTTCATAATGATTATGTTTATGATTTTAA-TTTAATTTCTTAATTTAAAAACAAAATAATAAAACTATAACAAAATAAATATCGAAAACGACGGGAGGCAAACCACCAACAACGCCAGATGCACTTAGGCAAAAAAATAAAA-------------------TCATAT--------AACAACAATCG--------------------------------------------ATCACCATCGATTAGCATACATAATACATAAGTGA------TCAGTAACAGGCTATTGTGTAAGCGCGACATTTGCCATGGGGACACTGCTCGCTGGACCTGTATTTGTATTTGTATTTATATATTTTTATACAACTTTCGAAATGCATTCAACCAACTAACTATGAAAGAACCATCGACTCTCAACCGAACAACATGAGAATAATCGCGAAACGTGAGCCCCGTCA----------AAATGAAGGCCCCGC-------GGAGGTGTCCGCCGGTAAATGTCG------------CCCGCAGTTCGAATATT----------TTGCTCTATATGTACTCCCAATATTGTTTGTCATGCAGACCAGACAAGACTTACGGACG------ACACGAGCTACACACTGCGCTTATGTTTATGTTTAA--CTCTGACTCTATCTAACAATGATAGGGAGATAAGATCATCACTTGACACTAAATGAAAAGTATACAAAAAAGGAACAAAATAAATGTAAATCAATTT
CCCCGTGCGACATCCGTTAGGCCACAATTCGACGGATTGGCTTTCCCACCAAGATTCGACCTTGCTCCTGAAAACGAATTCTAAATGCCATTTCATTTTTTAATTTATTTTAAATGATATTTCATAATGATTATGTTTATGATTTAAAGCTTAATTTCTTAATTT--AAACAAAATAATAAAACTATAACAAAATATATATCG-AAACGACGGGAGGCAAA----------------ATGCACTTAGGCAAAAAAGTAAAAAAAAAAAACTATTAAAAACTCAAACCGGGCCCAAACAATAATGGTCTTAAGACCCCCTGTTAAAAACAACAACAAAATCAGTTGAAACAACAACAACGATCGACATACATAAGTTCTCTGTGAGGGGAGTTGGTAGCAG----CTTTGTAAGCGCGACATTTGCT-TTCGGACATTTCCCG--AGACCTGTTATTGTATT--------TATATTTTTATACAACTTTCAAAACGCATTCAACAAACGA--CAAAAAAAAACAAACACACAAAAACCATGCATTACAACAACAA---------ATGATCCCCGTCAAGTGTGAGTTAAAAATAGGCCCCAAAGGGGAGGGAAGTGTCCACCAGGAAATGTCGCAGTTTCACTATCTAACATATCGAATTGTGTCAATGTAATTTTCTTATATGTACACCCAA---------TTCTACAGACCAA--TAGACAAACAGACAGCATACACACTCGCATCGCATTGCGCTTATGTTTATGTTAAATTTTTTAATTTTATCAACACATTATAAGATTAAAAGATCAAAACT-----ACAATTAAAAAGTATACAAAAAAGGAACAAAATAAATGTAAATCAATTT
>Ugt36Bc 16797448 16797514|18514 chr2L 16796527 16797504 scaffold_30 188122 189131 + 39188|931 1010
--------GTTGGAAATATAGAAATTTTAACTAAT---------------TTATACTTAAAAGATTAAAAAAAAAAAAAT
TACTATTTATTGTAAATAAGACGATATAAGATAATACGACGTTTTTTTAATTGTAACTAAGCAATACAACGACAATAAAT
>Ugt36Bc 16797448 16797514|18515 chr2L 16797505 16797855 scaffold_30 185290 185644 + -1656|0 20
AGTAAAA-----------CCA
AAGTAAAGAATGCTGTGTTCA
>CG33312 16803453 16803684|18528 chr2L 16802903 16803872 scaffold_18 2394346 2395445 + 9407|710 992
AAGTGAAATTTACTG-----AATGAAATGAAATGTCTTCTGGCCAGCCTCACTGTCTGGC-------------CGATTGGCTTTGT------------GTTTGATTATTGATTTGTGACTATTGTCGG-----CAAGGAAGCGACTGCAAATTAGATTGCCGTTCCAAAAG----------GATTAAGAAATAACCTACTACGAGTACAAATTATAAAAGACTT----GACTCGCGG--AACCGCTAAAATATTTGTTCCTGTGCCAGTGACATTGTCGATTG
AAGTGAAATTTACTGAATGAAATGAAATGAAATGTTTGCTAGCCCCCAGCAATTGCCAACGGAATTGGGAATGGGATTGGGATAGCGTTAAAGCCAAAGTTTAATAATTCGCTTGTGACTA-TATCAGCCAGTCAAGGAAATGACTGCACAT---------GTTTTAAACGTCAAGTGTTAAATCCAAGACCAAAAGAGAAGGATTATACGATCAAGTAGGCTCTATAGATCTACAGCCAGTCAATTGTGTTTGTGTTCATTTCCCAGCGACCCCATTGTATG
>mdy 16822646 16822920|18545 chr2L 16820717 16823826 scaffold_18 2411083 2414161 + 68487|2005 2298
GTTTCAAAAAAGGTTAACATTTAAAAATGGAGCAACACTGAAATATCTGCATCGGTCGGGTCCGTGTACTTTTCGTAATTTATAAGCCAGAATGCAAGTTAAGAAGGAAACTTGTGATTGCCAATTTACAAAGCATATTTTGTATGACTTTTGCACATGCATGTAGTACTGATTAACACAAATAGATTGTTATTGAATGCA-TTTGTTAATGAATTTAAGTGTCATGTAAATAAATCAAATT----TTAAACTAAA-------TAAAATGTT-------TTTAATTTTTAAATT
ACTTT------GGGTAATAT---------------------------------AATCAGGTC--TGTACTTTT--TTAATGATAAGCCA-AATGCAAGTT---GAGGAAACTTG---ATGCC-ACATACAAGTCA-ATTTTGTAG---TTCTGAA----CGAGTAGTACTGAGTAACATAAATCGATTGTTATTTAATGCATTTTGTTAATGATTTTAGGCATTATGTAAATAAAGAAAATGGATATTGAGTTGCATTAGTTTTAAAATTTTGTTCGCCTTCAGTTTGTAACTA
>CG31739 16827308 16827634|18547 chr2L 16824783 16829260 scaffold_18 2415719 2420421 + 154984|2680 3085
AGCGGCGACTT----------AGTAACATTACGGATA-----ACGAATTAGCATTTTACGTGTAAGCTC----------TGTGGTCAGGACGG--AGGATGGCAGCTGGCGTGGAAATTGGTCGGATATTC-AGATAACACGACATTCGGGTC--GGGTCAATTAACTAA---------------------CGAATCCCATT--------TTATACA------------CACAGTTGTATACCAAAAAGGTTAATATATATACCCACCATGGATCTTCACAACGGACTTCAATACACGAATACATCTTGAG---CCGGAAGTCCACATTCTTAAAATCCATTTGAAATTATTATGGCAACAAATTTATTACAATTTACAAAATATACA-----AAACTGCTATTGT
GACGCCTCATTTCGCAAGACGAGCAACAGCGGAGATAAAGATACGACTTAACATTTTATCCATAAGCTCAAATAACACATGTAG-CGGCATGTTCAGGATGCCGAC-----TAGAAAGTCAACAAACAACCAAGATGTCACCGCTCCAATGCCTAAAGTCAGTCAAACAAATGCAGTGTGGCGCCAGAGGGCGGATCCTATTAAATTGTATTGTAAATGCCATTGGGAGCGCAGTTTTGTGCTCTCTGGTTTAAT-----TGCCCATC---TATCCTTGCAAC----------CCCCGGATGCTCTTCGCGCGCCCGCCCACCAACATTCGT-AAGTCCATTTTTAATTA-TATGGC----GATTTATTACAATTTACAACATAATTATGTACGAACTGCTATTGT
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TTTT-------ATTGATAGAGTTCTTAGTTTCGAGCAGAAGCTATACGATGATGATTTCAAGA---ATGAGAAAACGGAATAAAAACTGTAAAGCTTCAGAGCGGAACA
TTATGAATACGATATATACAGATATACTATTACTTAAGAGTTTGAACCAAGATGATTGCAAAATGCGTAAGAAAAAGAATAAAAAGTTGTAAAGCTTCCGAGCGGCACG
>CG31743 16881955 16882252|18602 chr2L 16880370 16882320 scaffold_18 1951413 1953448 - 38907|1689 2073
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TTACTTACTAAATATATATATATGTTATATGTATTTATTAAAGTGATTTACAGCATCCGAATCATTTATACTGTGACCATGACGCTTTCCCCTGGAAATCTTTGTGATTTTAGCAATATTTAGTTTTACAGATACTTGCTAATAGTTTTGTAATTGTAAGTTTCTTATTTAATCAGCGGCATGCGAATATTAGCTTAGAATATTATAAATA---------GTAC-AATATTAGGGAGGTTTTATG-TTGTAAATAACAAAGGAATAACTCAAATATTAATATTCTACAACCCATACATAAATTAATTTGTATTCTAAACAAATCGTGTGTTCGGCAAATATGTGTTTATATGTTTGTCTTATATATGAAGTATTTTTATTCCACA
>CG4841 16912494 16912981|18624 chr2L 16907619 16912930 scaffold_23 1580997 1586375 - 240296|5044 5585
CCATGGCAGAGT----AGC-------------ATCTATGACAGTTGAC-----------------AATTACCC----AAAGTC--CTTCG----ATTTAGTCTAAGTAGCGATGTATAGATTTTTCAAACGTGTAAAGTTTTTATTATT------TATTAC-----CCTGGTTGACCTAGC-----------ATGCTTTAAGATTGAA----------------------ACTGGCGGTATTATG-----------------TGGCCAGTATGGCAGCTTCATATATAATGTAAATGGTTTGCTCTCGTTCCCCTTCTTTTTAAGCGTATCTGTATACTCTTTCTATAGGTGTAACGTCAAGTGCTTCGTGTAATTTGCTCAATTTTTGCGCTTTGTAATTATCATTACATCGTTTTGTTATTTTAGAAATTACTAGCAACAATGAGCAGAGCAATGTGTTTAAACTATAAGTAGCTCTAATTCAATATACACAAATACTTATATTATTATATAAAAAATGTGTAAGTGTATCCATAAGTAA
CTGGGGCCCAGTTAACAGCCGAATGGGACGTTATCCATGACAACTGGCCATTGTGTATGTTTATTAATTAGCTTTAAAAAGTTAGCTTAGCGATATTTAGTCCATGTAATTGTTGTAATATTTGTGATTTGTGTGATTTTTGTGTAATTTGAGTGTATTTCGATTTCCTGTCTAAGATCGCAAACATTTCCTATGCTCTGCAAAGGAAATTCTTTTATTACACTCAAAATACTCGTTATATTATTATTATAATTCTTATAACTGGCCAACCGGGCAGCTTTGTTCA-ATTGTAAATTGTTTGCTCGCGT----CTTCTATTCCGA-------------------TTTAGGTGTAACGTCAAGTGCTTCGCGTAGTTTGCTCAATTTTAGCGCTTTGTAATT--------ATCTTTTTGTTTACTAAGTGAT------------TGTGCAGAGCCA-ATGTTTAAACTTTAACTA----------------------------------TTTAAACAAACTGTGTAAGTTTCTAAATAGGCAA
>CG31806 16981463 16981546|18703 chr2L 16979960 16981495 scaffold_23 1669496 1670909 - 23002|1563 1595
AAAACTGATTTTCAGATGTATAACAATAATTAA
CGAAATGAGGCCAAATTGT----CAATAGTTCA
>CLIP-190 17405335 17405628|19285 chr2L 17404975 17406133 scaffold_23 2149566 2150689 - 32483|407 710
TTAGCTCTAGTTAAATTCTATTATTTCCATTT-------TACTTTGTTTTAGACTCTATAGCATAACCATATTGCGAGATCTATCAGATGAGA---TACTTTTACCTCAGCAGAGCTTCACTCAATCACACAAAGAAATTTCTCTACTTAAAATTGTGATCTTGCGTTATGCACACATCCATGGATAGTAGTCTATTTTAAATTGTTTTTATTTATTGAATGCGATTCGTGGCAAACACACAATCGGTTGTTTTCGTAATTTTTGAGTGTAAACATAGTGTAAAAAATAAAATCAAGAACGTGG
--AGCTAAGAT--ATTTTTGTTGGTTGTTTATACATAGATATTTTGTACGACAGTTGTTCTTGTAATCGTAAAGCGA-ATCAATTGTTTGGGAACATACTTT-ACCTCTGC-------------------CACCGGATTTTCGA-----------GTGGGATTATGTTTCGCAC-----------TAACATTCTCCGTTAAA--ATTTTGTGTTACCG--CGCGATT---GGATATTTTAAAGTGTTTTCTTTTTAAATTATTTATTTACACAAATAGTG---AAAATATTTCCG---------
>CG15141 17409101 17409434|19286 chr2L 17406174 17410553 scaffold_23 2150718 2154919 - 105868|3038 3382
ACAGTTAGCACTCTATATTACTCTAGTATTACCCACATTCCCCCATGAAAGCGAAACATACATACATACATCATGTAAATTCTAAAGTT--ATATTTTATTTAAACAATAATCATTTTCAATTCACTTTTGTCAATAACGAAAAGTCGTAACA------AGGCATCGGGCAATGAGATTCGCATTTCCCTCATTAAATTTATGTACATTGCGGTAAAATAGAATTATATAAGACAGGTTTTGTGTTGAAGTTCATTTTGGATTGAGACCTTTTTACATGTAGCTCTAATTGGTTAATTTCCGATATAT---TTTATGAAATATATGTACACTAGTATTTAGCAAA
AC-----GTACAC-ATATTTACCTATTG-----AGTATTCC----TGGTAGTTATATTTACGTATAAACATTCCCCAAATTATGGAATTTAATGTACAATCTAAA-ATTTATGGTCTTCA------TATATTTCACAACAACAATTCGCAACATTTTCGGAGCAT-ACGAAATGAGATTCAAGCTTGTGGC---AACTATATCTAAATAGC-----CAAATATCTATGTACAACTGGCTCTGCGAATA-------------------------TACACGTAAC-------------------ATATATACATATATACTATACATATGTATTATCATTT--CTAT
>Sgt 17470513 17470702|19351 chr2L 17469482 17473938 scaffold_6 2071747 2076561 + 136170|1118 1338
AAGTGGATAGAATCCCGATCCCCGATCCCTGCCTGGATCG-GCGGCACACAG-----ATTAAGTTGTTAAGCTGAAACTATAAATGTATTTATAATGTTT-AAATGGCTTCTATTACGCATACATACATACATACATATACATTTTTATCC---AATGGAAATAAATAAATGA--CCGTGCAAATTGCCGCTGTT-------------------CCAATCG
GTGTGTGTGCATCGTTTTAGAGTTAACCGAGCGCGATTCGAGCGCTATATAAAATGTACTAAGTT-TTAAGCTGAAATAAATTGTGT-----TAATGTTTAAAAAGGCTTACAATAGACACACACACACACACACATATACACATATATTTATAATTGCTAATAAATGAATAAACACACACAAAGTGCCTCGTTTACTGGTTTCGAAATACAAACCAATCG
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A
A
>CG5131 17481432 17481553|19357 chr2L 17480416 17484351 scaffold_6 2082672 2086584 + 126933|1045 1172
ATTGCTTTATATATGCCTTTTCTTTTTTAAGTACCCACCCCCACACAATGTTAAATAAAACTATGTTTTAAG------CTCGGGACATTTTGAATGTCACACGGCCAGACGGTTTTATATTTAAACCT
ACGGTTGTACAAATGTTTTAT---------------ACAACGGAAAAAAAACCAATAAAATTATATTTTAAGAATTTACCAAGGGCAATTATTGCAATGCATTATTAAACA--TTGAATTTGAAACGT
>Dhc36C 17521384 17521446|19390 chr2L 17520864 17521423 scaffold_6 2128631 2129202 + 28421|520 571
-------GGATTGTACATTACTTTCGAT-----TGAACTAAATATATTTTTT
ATTGTGCGGACTTTCAAGCAGGTTCGGTATATATGTACTCTATATATTTTCT
>Oli 17586928 17587196|19473 chr2L 17584975 17587186 scaffold_6 2215100 2217588 + 42404|2347 2637
ATAGGAGTG-GGGGCCACCATAAACTATGGTT---------CAACTGATAAGCAATCCATTAATGAGCAATACTTTTAAGTCAATTGGAAAGCAAATGCCAAATACTTGTGTACTAGTCAGACGAAAGGAGGTTGATAAGGAGCCTCTTATCAGAGCAGCCAAGTGAAAATCTGTTCAGTGATATTTATTTTTGTCATAAGCATTTCTTATTTATGCATTTACC--------------CAATGTCAACCAATATGTGTAAGATGAATATTACCG--------AATAAAGTA
AGTTAAATGCTGCTCCACTAGAAGAAGCTGTTTGCCATTAACAAGAGAGAAGCAATACGTTTATG---------TTTAAGTCAATTGAAGA------GCCAAATAATTGTGTACTAGTCAGGC--CAGAAGGT-------------------------------TGAGCATCTGTTAAGTGATATTTAGTTCTTTTATAAGCATTTCC--TTTATGCATTTACATATATACTATAATGTAATGTCTGTATAGAT-TGTAAGGCGAATATAATCAGTACGCGCAATAAAATA
>CG5674 17968053 17970799|19960 chr2L 17967786 17968971 scaffold_6 2751563 2752993 + 47583|388 1448
G---GGGTAGGGGCTTA--GAAGATCCCAGGACCGTTGA--------CACTTCTTGAACCCTCCAAACCAGA---CAAACTCCCACAGTTTCTGTGACCTAAAACACTATGCTTTAATATGTTTTCCCCCATTCTGTTTCTGTATGCGCCTACAGTTGACCCCCGATGAGGAGCTGCGACTGAAAATGATCCAAAGGGAGCGGGATCGAGAAAGGAAACGAATCAAGCGAATGAATCCGGAGTACAGAAGGCTGGAGCAGGAACGTGACAGGGATAGGAAAAAGGCTCGTAGGGCCAACGAGGCCTTCAGGCAGCTGGAAAAGCTAAGGGATAAGATCCGAAAGGATCGAAAGAAGGGCTTGCTTGTCACGGATCCGACGCAGCTGCCGCCGGAATTCGCAGCCATGATACCGCCAGTGCCTGTGGTTAAGCCCGAAGTAGGTGTGTCACCAGCCCCGCCCCCAGGCCAGCAGCAACCCACGCCACAGCTGCAGCAACAGCAGCAGCAACAGTTGCAGCAACACCAGCAGGTGCC---------ACAGCAACAGCAGCAGCATCAGCAGCCTCCGCCCACGCATCTGCAGGAGCAGCAGTTGAGTCACCAGCTCGCGCATCAGCGGAACCGAATGATGTCTAGCCA------------------------------------ACTCACCCAACTGGC---------------------------------CACGCCCCCCGCCCATG------CCTCGCACCTACAGCAGCTGAATAAGTTGCAGCAACTCTACCCGCCACGCAGCTTTGGCCACCCCGCTTTACCTATCGCTGGTGTGACGCTGATGCCGCAGCTTTGTCATCCCATCCTGCATCAGAACCTCAGCGCTACTCTGTATGCAGGTCCACCGAATGGCATCAAGCAGGAGTATGGACAGGATAT------------------------------------------CTCCGCCTCGGCTATGGCTGCTGCGCAGGCGGCGGCACTGGCCTCGCTGAGGAATCCGCAACAGCAGCAGCAACAG
ACCTGGGTTGGGGTTTACTTTAGTTTTTTCGTTTGTTAAATTTACCACACGACTGCTGACCTTCAATACAGAGTACAATATCCCCCAATTGCTTGAGCCAGCCACATTGTGCTTTAATAAGTTTTCCCCGCTTCTATTCG-------ACTTTCAGTTGACGCCCGAGGAGGAGCTGCGCCAGAAGATGATACAGCGGGAACGGGATCGCGAACGGAAACGAATCAAACGCATGAATCCCGAATATCGCCGTTTGGAGCAGGAGCGTGATCGTGATCGAAAGAAGGCGAGACGCGCCAACGAGGCGTTCCGGCAGCTGGAAAAGCTACGTGATAAGATACGCAAGGAGCGTAAGAAGGGTCTCCTGGTGACTGATCCCACACAATTGCCGCCCGAATTTGCGGGCATTATACCGCCAGTGCCT---GTTGAGCCTGAGGTGATTATATCGACGCCGCAGACACAGCAACAACAGCAACAACAACAACAACAACAGCAGCAGCAGCAACAACATCAGCAGCAGCAGCAGCAGCCATCCACACACCACCAACAACAACAGCAACAGCAGCAGCATCAGCTTG-----CCGCAGCAGCAGCAGCGGCGGCGGCAGCGCAT-CAGCAGCGACGCCGCAACATGTCCGCCCATATGCCAATGGCGACGTCCGGTCTGAACAGCGCCACGCTGACGCAGCTAACGGCGGCAGCGGCGGCGGGCAATGCGGCCATGCATACGCCCGCTGGTCATGCCACGCCCACGCATCTACAGCAGCTGAATAAGCTGCAACAACTGTATCCGCCGCCCAGCTTTGGGCATCCCGCCCTGCCCATAGCCGGCGTCACGCTGATGCCACAGCTCTGCCATCCCATATTGCATCAGAATTTGGGCGCCACACTGTATCCGGCGCCACCGAATGGCATCAAGCAGGAGTACGGCCAGGATGTGAGCAGTTTAAGCGCTGCAGCGGCGGCCGCTGCTGCCACAAGTTCTGCCTCGGCCGTGGCCGCCGCACAGGCGGCGGCGCTGGCTTCGCTGCGGGGCGGACCGCAGCAGCAGCAGCAG
>CG5674 17968053 17970799|19961 chr2L 17968998 17969385 scaffold_6 2753021 2753338 + 11324|0 403
CGAACCGGAGATAGTTCTCCAGACAGGTCCCGATGTAAATCCCGCCCAGCCACCTCCGCAGCAACAGCATCTTTTCAGCGCCCATCAGCACCAGCAGCAGCAACAGCAGCAGCAGCAGCAGCAACATCATCTGCAGCAGCAACAGCACTGCAACATGTTCCAGCATATGGCCCCTCAGGCGCACATGCAACACATGCGCTCACTGCCGCCTCCGCCGCCGCCCCCCTCGCTGACCTTGCCACCCCTGCCGCCCCCGCCACCTACAACTCACCAGCAACAACAGCAACCTGCGCCGCC---------ACAGCAACTGCAACATGCTCCGCAGTGAGCGATT------CTCGCCTGTAGTTC-TAAGCTCAACCCTCTAGCCAGCTAAACGCATCCGAAAGTTTGA
CGCACCAG--------------------------------------CAGCAACAGCAGCAGCAACATCATCT---------------GCAACAGCAGCAACAACAGCAGCAGCAGCAG------------------------CAGCATTGCAACATGTTCCAGCACATGGCGCCACAGGCGCACATGCAGCACATGCGTGCCGCGCCGCTACCGCCACCGCCCACCG---TGGCGCTGCCACCGCCACCGCCGCCGCCGGCGACGCATCAGCAGCAGCCGCCACAGCCGCCGCCGCCGTCGCAGCAGCAACAGTTGCAACATGCGCAGCAATGAGAGAATTATGCACTCGACTTTAGTTCTTAAGCTCAA----CTAGCCA--CAAACGCATTTCAAATTTCAA
>CG5674 17968053 17970799|19962 chr2L 17970100 17970402 scaffold_2594 1217 1529 - 1334|0 324
TATTTTTCTCAAAACAATTCAGTTTTATCAATAGGACACAGCAAATCTTCCCTACTTTTTGTTCGAATTATATGCAAAAACAATTGCCATTTTAAATCCTATTTACATTGTCGTCAAAAATAGTTTATTTTGTATCTTTGGACTAAAAACACATTGTGATAAA---ATGCACCATGAGCTTTAGAGCAGGTGCCAAAACATAAAATTT------TCCTGTAATTCCTCA-------TTCATTTTAGGTTGGTAGATTATTGGTTTTCCTA-----CAACGACTCT-TATTCCTATTTTGTCACAACTCCAATAGATGTGTGCCAA
TATTCTTCTCAAAACATTCCGGCTCTTCTGCCTGGACACAACTGGATTCATTAAATTTTTTATCGAATTTTGTG---ATACAATTATTA-GTTATATTTGTTTTTCATTTTTGTTTGCAAT--TTTCTTATCTGCATAGAGTATAACATAAAAATTTGAAAAGCTCATGCG-CAGCAGCTACGCAGCTGAAGTGAAAATTTCAACTGTAATACGCACTGTTATACATTAAGAAAGCATCATTTTTGATTTGCAGTTCATTTTTCAATCTACTTAGCACTGGGGCTATATATAAATTTTATTGCAAT-----TAACTGTGCGCATA
>CG5674 17968053 17970799|19963 chr2L 17970406 17970819 scaffold_6 2754003 2754461 + 10052|0 462
CTCATACGCACACACTCGCACTGAAACACACCCATGTTTATTTTAAAGTATGTTAAG-------TAGACGCCATTTTAAAAATGCCGATACGTATTATGTTGCGTTACGCAATCCGCATTACGTTTCTTAAGTGCTTAAG--GGCTTCCCCGTCATAACTTTTTATGTCGTCATCGTTTCAAGCATTTCTCTGTTTTTTAGATATGTACGTATATTGTTT-----AGCTAAGTGATAGGAGAC---------------------ACAATACTTGCAAGTTTAGGAT--GATACGATCTACAATACGAA------TTAACGATAAC-TGTATACC-TATATGATATA----------ATGATATA------------GTATGGCCAGCCGCAAAATAATTATTACGAATTTATGCGCAGAAAAGAGCAAAATATA--AACAGCAAGCGATTGCTGAAAATGGAA
CGCACACACACACACACACAC-AAAACAGACTCATGTTCAATTTAA-GAATGGAGAGAGACTCTTTGACGTCATTTATAAAATGACGTTACGTTGTGTATTACACTTACTACGTTACGTTACGTTACGTTATTGTTTTAGTGGGCTTCCCT-------CATTTTATATC---ATCGTTTTGAGCATTTCTAAGTT----------ATAAGTACTTTGTTTTTGGTAGCTAAGTGATAGGGGATGCATTTGCCCATCCGTACAATACAATACTTGCAACATTAAGATACGATACGATATATGATAATTGATATGTTTAAAAATAATATATATATCACATACGATATATACATATATTATGATATACATGGTCATGGTATATGACAAGCCGCAAA-TAGTTATTACGAATTTATGCGCAGGTACGAGCAAAATATATTAGCAA-AAGCTGTTGCTAAACACTGAA
>CG5681 17984065 17984147|19976 chr2L 17983920 17984415 scaffold_19 1016045 1016509 - 257|149 231
TCTGAGCGCAAGTCATTAAAAAAAAAAACTCCATTTATTAAAAATAATATGAAAACTAATCATGGTGCAGGGGATACAATTAT
TCGAAATTCAAGTCGTAATGCAAA--------------TCATAATCATGC-CAAGCCAATTAAAGTGCAGG-----CAATTAT
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AGCGC
AGGGC
>PFE 18065323 18066178|20066 chr2L 18064598 18065561 scaffold_6 2861229 2862314 + 35771|812 1103
CCCAGGGGCC---CATCGGGAGCCACCGCGTCCT---------CATCAGCTACGAAGTTTGCCCAGCAAACAGTTGGCACGACACCGACGTAAGCCGCCGGAGAGTTGGAT--TTGC--------------------AGTGTGCAACG---GGACGACGGGGCGTATAATTAATGGCCATGC----------------GGGGTCACATTGAAGTGCAGTAATTAGGATTTGAGTTCGCAATTAAGTTCATTAATCACTCCAGACGATCATCATCAAATTTGGCCTTTCCCCG
CCCAGGGGCTTGGCAGCAGCAGCAGCCTCGGCCTCAACCGCAGCATCAGCGGGTAAGTTTGCCAAGCAAACGATGAGCACGACACCGACGTAAGTCGCAGGAGAGTTGCCTGGTTGCATAGCCACAGCCATGGCCATAGTGTGGCATGGTTGGCAAACGGGTCGTATAATTAATGACAGTGCGCTGGGCATTATTTTTGGGGTCAAATTGAAGTAAAGTAATTAGGATTTGAGTTTGTAATTAAGTACATTAATCATT---GGCGCGCAT------GTGTTGCGCTCTCCCG
>PFE 18065323 18066178|20067 chr2L 18065583 18066370 scaffold_6 2862486 2863518 + 7549|0 758
TACTGCCATTTTCACAATTAACGAA--------------------CTTTACCAGTGTTTCACTAAGATACTTGTAACTTAATTTTAAT---GTTTTTTATA---------TGCGCATCTGT----ATATAAAAT-----------TTGTCTACATTTAGGTAAAGTACACACGATTCA-----TTTCGACACATTTCAAATGTGATAAAACCGAGCGTATTCTGTAAATAAGTATTAACGCAAGCGAACCATAAAAACTAA--GGTGTTAAATGTGTAAGCGAAAAAATGATAAATTTGTATATTTGGCCAATGCGATTCAAAATTGAGCAGCCGCTGTTT-------------------GAGAATTTAAA---------------------------------AGTATACATTAATATAGCACGTAGTTAGTGGCATAGATTTCCAAGACACATA---CAAAACCTACAATATATAGAA---CTAGCATGTAAGGCATGTCAAAGTATATTGTTCAAACCCAAAACCAGCAGAAGTTGGCAATCATTTGAATG----AAACCCAACTAGG-AGCCCAAACGATTTTCGGTTCTCCCCTCGAATCAA--TAACAGAACTTGGCATTTTCACGTATCCT---------------TAAGTCGGAAAATTGTATTTATTTTACACAGCAA-------TAACCGT-AATCCATAATAAAGTGTGACTGTTTATGAAA---------------------CCAAA
TACTGCCATTTTC-CGGTTAATGAAAATATTGCGCATACGCAGCGTATTACCAGCGTTTCATTAAAATATTTGTAGTTTGATTTTGAACAATTTTTTTATAACATATAACTCTGCATCTGTGTGTATATAAAAAAGTGGACAGCATTGTGCACACTTATAATAAAAACAAAACAATAAAAAATTAAATACACATTTCACATGTGATAAAACTAA----ATTTTGTATATA-----TAAATAAAACAACAAACATAAACTAAATGGAATTCCTTCTTCCAACTAAAAA--TACAAATT-GTATATTTGGCGTTAGCGATTTAAAATTGAGCAGCCGCTGTTTTGCTAGGTTACAATTAAAAGAAAAATAAAACAAAAACTAATGTTAAATTATAATCTTAAGCCTAAGGTATATAAAATTAGCACGTAGCTAGTTGCATAGATTTTAAACACATATATATTAAAATCAATTAAATATAAGAAATATAAAAATTAAACAATATTAATATACAAAAAAAAGAAAAAAATCAAGAAAAAA--AACAATCATTTAAATGCTCACAACCCAACCAGTCAACCCAAACGATTTTTTTTATTTAACTTAACATAAACCAAAATAAAGCGGCAGTTCTCTGAATTGTATTTAACTTTTTTAACAGCTACTAAAACTATAATTATGTTCAACAACAAAACAGTTTAACAATAAATCAGTAATAAAGTGTCACAGTTTATAGAAAATACTAAATGGAAGCAATATAAAAA
>Arr1 18076124 18076352|20081 chr2L 18076066 18076298 scaffold_6 2877003 2877247 + 9436|58 256
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AC--ATGCAGCTACCTCAACTTAATCGAATACAAAGTGCATATATTTATATAGAAATGTTTAATCAAAGTGTTATATAATATTAACGAAAATCC-----AAAGCTGATGTTGCTGAAATGTTCTGAACTGCAGTCGTCGAAACTTTTCTTACTTAACAAATCCATTCGCAATA-----TATGTGTGTATGTGTATTATA
>ninaD 18079390 18079537|20084 chr2L 18077357 18080631 scaffold_6 2879041 2882267 + 75520|2086 2248
TTTAGTATTAACATTTTTTTTAATGAGCAGCACACGGATGTGATTCAAAAAACATATATGTGATAAATAACTCTAAAC---------------ATTTTTTATTCTAGCTTTAAAATATAAAACTTCTAAACAACTGAAAAAATTAATAAAATTTAAAAAACTC
--CAGTTCCAAAATAATGCTTCGCGCTAAAAAAGCTGATGCACTCT----AATATCTGTTCGATATACAAATTTTAAAATTTAACAAAAAGTGATTTTTGGATTGTGATTCATATTATTAATTTTCTA---AATTTATAAAATAAGCGTGATTTGAAAAAA-A
>CG5755 18093974 18093995|20094 chr2L 18092741 18094002 scaffold_46 23017 24470 - 41885|1428 1449
AGACCTGTTTGTATATCTTAAA
GGCTTGGTTTG---ATTTTCAA
>CG5758 18124874 18125793|20122 chr2L 18124224 18125070 scaffold_6 2936762 2937601 + 35509|666 871
AGGGCGGGA--TCATGACAGCTGGGTTAGTGTCAGAGTATATATATCGCGATGGTAAATGCGAAAA-------TAACACAGGCGGCACTTTGAGATTGTTTTTGGGATCCCTCAATCGGCCTTCGAGTCTTGTATCAGTCTATTTCCGAAGTAGGAGACATTCCAGGCCCTTCGACAATTAGTCTATTGTCGCTTTATATTATTTT
ATGAACACAAGTCGTGAATTATCGATCGATGGCAAGG---GTATGTCAGGCCGAGCTGTGCGGGAATCATTTTTGATATGTGTGGGTTTTTAATGATGTGAGTGGACGCGCTTAA--------AGCGTTTTGTA------TAGTTCTGAG------------CTAATTTTTGTAACGATTTTTTTTTAGTTAGTTTTTAGTTTTGT
>CG5758 18124874 18125793|20123 chr2L 18125222 18125575 scaffold_6 2937605 2937950 + 8106|0 379
TGTATGTTTTAAGTTTAGCATTGAA--CGAGGCGGTGAAACGAAGTATACTACAAAGTCAACATCAAGAGCAGCAGCAGCAGCGACAACAGCAAATATATAAAATCTAATCCTAAAGAACTTATCAGCGATTTAGACAAAGCTTGTAG----ACATAGCGAGAAATTGCAGCC-------AACAAATTACTACAAATATTTAAAG----AGTAAACGAGTAAGAATAAAGCATTCCCGTAATATTGGATTTAGAAGCAAAATTTCAAAAAA----TATAAAAATATACGTA-TAC---TATGCACATTAGCGCTCATC-AGTGTTTATGCTTTTTTGAGTCTATCCATATGAGGGAGCATAGGAAAACATATCGGCTAAA
TGTACATTTTAAGTT-AGCATTGAAAATGAGGCGGTGAAACGAAGTATACTACAGAAGAAA----AGAAGAAGTGAATTAATGAATGGCAACAAATATA---AACGTAATCCTAAAGAACTTATCAGCAATTCCAATGAAGCTTGTAGATCTACGTAGCGACAAATTGCAATTACACGAAAACAAAAAAAAACCAATATACAAAAACTTAGAAACGGAATTTAAACAAAAAAAT----TAAAATTAACATTC-AAACAAAAATTCAATATATACGTATATTAAAATATGTACTACATATATGCAATTAGACGCTCTTTGGGTGTGAATGCTTTTTTTAA---------------------GAGACAACATATCGGCTAAA
>CG5758 18124874 18125793|20124 chr2L 18125582 18126430 scaffold_6 2938050 2938998 + 8474|0 253
AATCGAGCCTAGAGCGACCAAAATTCAAACGCAAAAATCCCTGGCATGATATATCTATAGAACGAGTATATTACGAACAGATATTGTATTTTTTAATTTACGGTATTGATATTTAA--TGTATCTGTGTATATGAACAACA--------------AAGCAATGAGAACGGAGCA--TCCAATTTTATAATAGTTTGTTAAAATAAAAACAAAAATCT------------------------TCCAGAAAAATAA
AATCGGGCATATATATATATATATATATATACATATACATATATGTATATCTATATTGAATACGAGTATATTATG-ACAGATA-TGTATTTTTTAGTTTATAATAATTATATTATATCTGTATCTGTGTATATGAACAACAACAACAACAAGAAGAAGTAATGAGAATGAAAAACTTGCAATTTTATAATAGTTTGTTAAAATAAAAATAAAACGATAAAAACACAAAAGCAAAACAAAAACACAACAAAATCG
>CG5783 18153037 18153091|20152 chr2L 18152736 18154469 scaffold_6 3732387 3734219 + 56538|309 422
TTG-----------------------------------GTGTTTAAATGTC------------------------TGTATTAAAATATTACGACTTTCGGTTGTATATGAATAC
ATGCCCCTGTCCATGCCCGGGCCCTAGCTTTATGTATAATACATAAATTACATTCATTATAAATATAATATACGATATAATAAAACACTACGACT----ATTGTATATGAATAC
>CG5790 18293076 18293206|20334 chr2L 18293169 18293394 scaffold_6 2043258 2043506 - 488|0 40
AAAATTGTATTGTGCACA---AACCAAAAAAAAAAAAAAAA
AAAACTTTCTCGTGAAAATTTACTCAGCATATAAACAAAAT
>CG31749 18382494 18383033|20454 chr2L 18382052 18383700 scaffold_6 4079189 4081026 + 22278|442 1139
TATATATCCTTACCACACTTTGCTCTCAAATAGTTGCTCTCTCAAAAAAGTTACACAAATCTCAAAAGGCGCACAACAAAAAGTTAT-CTATAATTTTATTATAAACGAAACAAATGCAACAATTTACCTTAGGCCAAGTAATTT--TAAG-----TGACCAATTTTCGCG-------------AAATCGCGATTCTCTCAAACCC-----TTGAATTTCCCTTTGTCCACT-------CGAAAATAACTAAAACAAAACTCTAATAATATACAAATTACGAATAATAAAACAACAATGTCCCATTTATTGTAATATATTTTGTCCAGCAATATTGATGTTCATCCATGTATTTATTTAAGCTATAAGAGCTGCCAGCATTTT----GCATTTTGCGTTT--TCTAATTTTTATTTTTTGTCGATTGGCAATT----------TCAATCAATTC-------------------------------------GAACGCGGC--------GAACAACGCAAATTA--------------------------------GAAAATTAAACATGCCTATGATTTATTTTAATTAGT-----------TATCCGCTT--------CACACTTGTGTTTTTTTATGTTCTTTGGTAATTTTAGCAA---GACGAAACAAAT--AAACGAAA--------ACATGA
TAAACGCTCTC------TATTCCGCTCAGATA-----TCTC-----AAAGGCGCACAAAACATATAAGCAAAAAAAAGAAAAACAATACAAAAATTAAATGAAAAATTAAGAAGAACTAAGAA------CTAGGCCAAGTATTTGCATAAGCTCTCTGTCTATTTCTCATAAGTTAAAGTTTACAACTCGGAATCTCCTGGAATCTCGCAATTAAAGCACACGCCGTCCGCGCTCAGAACGAATATTTTGTACACTTTAATCTTGTATATCACAAATTATATTTTGTAAAATAAT-TTTTCACATTT-TCTTAAAATATT---GCCAGCAA--------TTAATTTATTTTATGCTCTGACCTGCCAGCGTTTTTTGCATTTTTTTCGAATATTGTTTTTTATATAATTTTTTTCGTGTCTTGCTCAACAACTTATTAGTTGATAAATCAAAGCATATATATATATATTATTTATATACTAAAAAAAAAAAAAACTTGGCTTGAATAAGAAGAAAACAAAATACCACACACACATTTATATAAATATAAATCTATATAAATTAAATAGTTTTAAAACTTAAACAAATTGGCTAAAAAAAAAATATTAATTTAAAATGCACACACTT---TATTTTTCAGTTCTTT-GTAAGTTTAGTAATTTGTTTAAACAAATGAAAACGAAACGAAACATATTTTA
>Fas3 18388039 18388064|20460 chr2L 18387742 18388118 scaffold_6 4085691 4086119 + 5668|337 386
AG------------------------AAAAGCAAAAAGCATATGAAAAAG
AATGCATATATTTTAAAGCAAAATACAGCAACAAAAAGCAAACAAACAAG
>Fas3 18388174 18388519|20461 chr2L 18388142 18389388 scaffold_6 4086747 4088132 + 25775|32 442
CAAGACAAACAACTCGTCTATGCTGAACTTGTACTAAAGCCAGCCAATGAGGCGACACCA---GCAACAACACCAGCGCCAACAACAGCAGCAGCAACAACA---------ACAACGCCGGAGGG--------CTCTGGA-GCCGGGGTCAAAAGTTCAACGGAATACGCCGAAATAGTCTATGTGCAAAAGGGAGGCGAAGGAAAAAAATAATCTAGCCCATCAATATAAAAATCCCTGGGAGGCTGACACAGTAACAA-ATACAGATG-------------AATGCACAAAAATTAAGGAGCAGAAACGTAAACACAAACCCAGTG------------------CAGCATAAAAGTAAACTCTACGATGATATTAAGAATGCAAA------------AAAAAAAAAAAA
CAAGACAAACAACTCGTCTATGCTGAACTTGTACTGAAGCCCGCCCATGAGAAGACAGCAGCTGCCACAACAACAACAACAACAACCGCAGCAGCAACAACACCAGCAAACACAACAACAACAAGTGCAACACCTTTGGATGCAGCTGCCAAAAATGCAACTGAATATGCCGAAATAGTTTATGTGCAAAAG---GGCGAAGGCAAAAAATAAAATACTCA------ACAAAATGCCCAATGAGGCTGCAGCAACAACAACACGAAGAAGAAGAGGAAGAAGAAACGCAGCAACATTTAGAAAAAAAAAACAAAATAAATATATTGTGAGCTACAAGAAAAAAAAACAACACAAACAAAAGCCCAATGCGTAAACATAAAACATAAAACATTTAATATTAAAATAAACAAA
>CG10174 18451089 18451261|20540 chr2L 18450973 18451198 scaffold_10 222870 223083 - 6569|116 227
GAGCACTCCAGACCCA--TATGTACACCACACATAATCGACATCCAAAGACGCCCAGCGCCTAATAGTGATAACATGATAACAACAGCACGGCAGTGGGACTCAGAAAAAAG
GAAAGCCACAACAACAGCCAACAGCAACCAGCAGCAACAACATCCAAAGATG--CAGCCCTAGAT-----CAACACAACAACTACG--ACGACA-----ACTTAAAAAGACG
>CG10174 18451089 18451261|20541 chr2L 18451229 18451314 scaffold_10 223102 223191 - 1498|0 32
CGTCAGCGAATACAAAAGTTAATACAAGACAAA
CGTCAATCAAGCATAAAAATCATACAAAA-AAA
>CG10176 18483128 18483639|20590 chr2L 18482472 18483284 scaffold_6 4230198 4230971 + 20327|671 828
GGCCATACAAGTACTTGAAAACTCTTACTTCTAAATCAGTCCAGCGAAAGCAA-AATGTGCACCACATTAAAACTAGTGATATTTTTCATAGTTATTAAGCAAGAAGTCTTCTATCAATATGGAATATATACGCATATCTGTAGAATATAAACCTTAA
TGAATTTCTCATCC---GGAATTGTCATCACAAA-------CATTACGAGCAACAATGTGCATCAGATTGAAACTAGTGATATTTTGTATATT--TTGAAAAACATGTTTTCCATTGATATTGAAGA---ACGC-------TGAAATACATTACTTTA
>CG10176 18483128 18483639|20591 chr2L 18483427 18485713 scaffold_6 4230972 4233270 + 88654|0 223
ACAACATCACAACTATGAACGAAGAGACATATTTATAACTGTTAAGAAATATATTTATAATGTTCAAT--TTATTATCATGTTAAGTTTTTTA--TGTGGAAAAGTTTTGTAAAT--GGTAATATGGGGGAAAACCAATTCATTCGCAATCACCACAAACGTTTCT---CAACACACTTC--CATCCGGTTAAAATAATTACGAATGCGAAATAAATCTTCCTG
AGAATATTATGGCCTTGAATATAAATACACAT------------------ACTTTTATAACATTCAAAAATTGCTAGATCGTTAAGCAGTTCGATTTTCGATAAATTGTGGCGGCCGGGCGATTTTTATTGAGAGCAGTTAATCAACA-----CATAAACTGTTATGTGCGATAAATTGTGGCGGCTGGTTGATGCACTTATCAGTGTTGG-TAAATGCAGTTA
>CG10211 18527589 18527711|20629 chr2L 18524426 18527950 scaffold_6 4302167 4305585 + 180268|3198 3321
GCTGGAGGGCACTCCACCCTGCAAAGTGGAGGACGGAGTGAATCATCAACTTTGGGTGCGGAGTAAGCAGAAGCTACAAATTTTGAGACGCATTTTGTAAATAAATCTTGCGTT-TGTACATAA
---AAAGGGCAACCC---------------------------------------------GAGAAAGCAG---------GCTTTCGTACATGTTTTGTAAATAACTATTGCGTTCTTTACATTA
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TTACGTATTTTA
TTACGTATTATA
>CG15160 18590139 18591360|20700 chr2L 18590568 18591928 scaffold_6 4407815 4409203 + 2156|0 895
AAAGACTTTACACTTACACCCTCGACTTAACTTATG---TTTGTGTGTTGACATAGATTAAGCATATAGTGTATGATTAGTTAATGCCTTCGCCTTTAGTTCCTAGTGCTAAACATAGACACTAGTAATTGTAAATAGTTATAACGAAAAGTAGTCCAAAAATTAATTGTTAAC----------------GTAATTCAAAAGTTCTATACTCTTTACTTATGGTCAATG---ATATTAACTTTTTAAATATATATCGATTTG----------------------AATTTCATTTTAACAACTTTATA----ATGAAAATCGA---------AATATAATGGTAATAAAAAACACTTTTCAGCAATCGTTCAGATCGTTG--------------TAATGGCATTTTTAG---AACTATGT----TTTCCGATCTTCGTT----ATTTTTAAATTTAGTATAT-----ATCGATTGAATAAATATTTTTGGATTACCAACGATCCAGTTTAAGCCATCTCAAGTTTTGCTAATTTTATGAAAACGGGCTAT----AATATTTCTATTGGTGGCATTCACATCCATCGATCGTTGAAATC--AAAGTATCACTAAAAATGTTACAATGATCTGACTTATTTCAAGAAAAATATATAGTTCTCGACAATTACATTAACATCCTGCCCATTTGAAAACCATTTATTGACCACCTAGTTAGTTTACTATATACTATCTTACTTATTTCGTTGTGCATTCTATTCCAGACTTATTGAAGAGCAATTTCTCAGATTTCTGTG----GACTCAAGCTATACACCATAGTTATAGTAAGCTAAGTTAACAATC------TGTATTTAGTTTTATAAATACAAACATCAATGTGATATTTGCAATTG
AATGTTTTTAAGTTTACAG--TTGCCTTAGCTCATAGATCTTATATACTATTAAAATATAAATGCCTAACATTTAGTTAACTTGAAACATTGCTTTTAGTTTTCAGCACTAGACGTAAGCGAAGCATATTGTAAATATATATAAATGTAATTATATTAGTAACTAAATTGTATCTACTATATAAACTTCGGTCATGCCAAAGTTTTATGCTCTTCACTAAATGTTTACACATACAAGAAATATTTAAAATAATAACCCTCTGTTCGGTAATAACAAAACCATAAAATCTCGTTAAAAGAATTTCAAATTAAATAAAGATTGATTTCTTTTAAATATTTACTCAACACAAAGGACTGTTAGGGGG--GCCTAGCTCATAGACAAGGACGATCCTTAAAGATCTTTTCGACTTAACTATTTGGAATGACTGAGCTCCATTTTGGAGCGTGAAATTTGACATATTCCAAACTGACTTCAAGACTGATTCAAGTTTCTTTCCGA---AAACTAGATCTATTCAAGGACTCTTGACTTTTTGGG--TGGGCTATGCCGAACAGAAGCTTAAGTTTCGTTTAGACAAATCTGACGTCCAAATCTCGAACTCGAACTCGACCTCTTATAAT-CTCTAAGT-------ACAAAACCATAAGCAATACAAAAATCATATCGTCA-AATGCGAAAACTAAAACTATTTGTGAAGAAATTAAAAAAAATAAATATTTATATATGAAAGACTCAGTTGAGCGGCAAAGTC-ATATGTGTAGTTGTATAGTATGCTAGTTATATATACTAAATCTTAGTCTATATATTATGCTTAAGCGTAGTTAAGTTAAGTTTCGTGTTGCGTATTTAGTTGTATAAATACAAACCATAATGTGATATTTAAAATTT
>CG10333 18605385 18605487|20714 chr2L 18602779 18605434 scaffold_6 4424570 4427258 + 134572|2681 2740
ATTTGGCAAATTCTAAGCAGAACTACTTTAG----------GTTAAAATTTAAAACTAAT
GTTCATTAAAAACCTAATCGTTCGGCATTAATAAAAAAAATATTAAAATTTAAAACAAGT
>MESR3 18656981 18657716|20773 chr2L 18656073 18658206 scaffold_6 4488413 4490586 + 65769|916 1796
GTAGGGTCGGGCGCGTGGATCTGGAACACGAGCGCCCTATGGTGGCAGAACTGAATCTGCCT-----------------------CGAAGCCACAACCCAACACAACCACGAAGAAATCCAGGAAAAACCAACCCT-----------------TAGTTCGTATGGCTAGTT-------ATAGATCCATTTGTTA--------TAGGCCTAAGT--TATGCCAATGTGCGATCCGA------GTGCGGAACTCGGCCAACACATTTATCTGTGATACGATTTAGGCGTCTTTACT-TTAGAGA---------GGGATACTGATAACA-CAATTTGATAAAGAACATTTTTAAACGAAGAACATAGCAAATGAAGCGAGAGTTTTTGCAAGTTATTAAAACATATTAAGCGATTA---------ACGTTTGTCGATAAGCAAGTTTTTTGTAAAACCTTTTCTAATATCACACATATACCCTTATGCATAA------TTATATTCGTAC---------CATATAGTCCTGATATCTATCGAGTAATCTTTATGTCCACACTCGAAGGCACTGCGAATGATTTTGATGCCTGAAAAGCTTGCTTTCCTATCGGATTAT----TGACTAAGC-------CCAGACAAAGATACAAAAACAGTTTTTTGAAATCTATGTAT-CATATAACACACATAAATATATATGCTATATTACACCTATCTATATAT---------------------TATATATAGCTCTAAGCATTACATCATAGCCACTTGTCTGTATGAACTTCATATT--------------TTGCCTGTGCAAAACAATCGCGAGAATCAAATAAAGCTGACAAAGAGAGCCAATTAAATGTGAAAA
TCAGGGTCGGGCGCGTGGATCTGGAACACGAGCGCCCTCTGGTGGCAGAATTAAAGCCCCACACAACAATTTATACAAATTAAAACAAAGCTCCAGTACCCCAAAAAAAAAAATAAACAAACAAAAAAATCACCCCATATATATATAATGGTATAGTTTCTAGTTCTATTTGTATCTAATATATATATTTGTTATAGCCCGTTAGGCCTAAGTTATATGCCAATGTGCGTGCTGCACAGCTGTGTGGATCGCG-------CATTTATCTGTGATACCATTTAGGCGTCTATATTCCTAGACATTAGCATTCGGAATATTGGCAAAATCAAACAGAAAAATAAAAACACAAAA--AAAAACATACAATATTAACAACATATATAAATAAACTAAACTAAAGGAGAAATCGATTAGTTTAAGACAATTCGAACGATAGGCGAGTTT----TATAAAGTTTTCTAATAGCGTCAACATGCATCTATCTATAAAACAATATATATGCATACATATATATACATATATATACGATAAATGGTTTGTAGCTATAGCGTGTATGTTTGTATTT--------TGCATTTGCTGCATAGAAA-------TTCATATAAGTCCACATGGTCACTAAGCTTGTTTTCTTAACAAAATTTTACTAACTGTTTT-----ACATATGCATACATATAATACATATATATATATAACACATTTGGTACACATATATATATCTATGACTATTACTGATCGTATGTACATAGCTCTAAGCATTACACATTCAAAAAT------CAAAAACTTTGTATTTCTTAATCGTCAAATTGCATACGCAAA-----TGTCAAAATCAAATAAAGCTGATCAAAAAAA------GAATACAAAAA
>CG31751 18679195 18679646|20795 chr2L 18676265 18679383 scaffold_6 1878141 1881275 + 107192|3042 3266
TATAAAA---------TTCCGTTAGGCTTTTCCGTTTTTTAAA--GGTATTTTAACTGATTTT-------------CAATCCAGCTATTCTGGT-----TGTTGAAGATTTTGTATGTTATGTTTTCCAT-TAGGTAACGAGGGTCAGATAAAATTGTCACAGCCA--ATATATAGAGTATAATGAAGCATTTTCTAAGATATTAAA----TACATTTGCAATTA
GCCCAGAGCTGAATCCTTCCGTCCGCAACTAAACTTTGGTCAATTAGTATTTTCAATTATGCGCGAAAAACAAAAACAAACAAACTTTCCAGGTTTTTGTATTGAAAATTTCGCATTTTACTTTATTTGTATATGTA-----------TTATTATTATTATTATTATTATATATAAACTTTCATAATTTACATTAAAACTTGTTAAACAGTTAAATGTACAAATA
>CG31751 18679195 18679646|20796 chr2L 18679460 18679705 scaffold_6 1881340 1881613 + 985|0 222
TCATTGGAA--AATCAATTGAGGC--CTGTTAAATAAACCCATTGTCAATT------ATTAGAATTTCATTTACATATCA-CCTGTGCAAAAT-AAGTTGCAAGTCCAAGTATTGATTGCATT--------------------TCGTTGCTTTACAATTT----ACTTTATCCTGTATATTATTATCGTTATCTTTACAATAAAACTTGTTAAACAAATACAA
TTATTGCAATTAATTTAGTGGAGCTGCGGCAAATTGAACTAATTAACAGCTACGTTAATTACAATCTATTTTAATTGTTATCTTATACAAAGTAAAATTGCAAGG-CAAATGTTATTTGCAATAAACATGCGCATCGAGCGAATTGCTGTGTACAAATTTCAAGAATACAAAATATATATTGCTAGGTTTTAATTTAT-----------TTATACATATATAT
>CG10336 18686647 18686835|20801 chr2L 18685417 18689506 scaffold_6 1886788 1890792 + 142655|1283 1471
TGTATATTTATGATATAAAAACGCATATTTTTATAATTTTCAAAGGATAATTTATAAAAATAAATGAATAAGCTACGTTGAAAGTTAATGCGCGGTACTTAATATCTAAATTGATTTTTCTGTACTTCGATCTTTGATGAATATCACTTTAAATATACCCTTAATCGTATTAAAACCACTCGCATTAGT
------------ATAGTGAAAC--------------------AAGGATATTCTTCAAAAAGAAATTGTTATTTATTGTAGA-----------------TTAAGAAATAAATTAAGATTCGTATAGAAGGATTTT------ACAGTCGTCTATATATATGTATGTATATATATA----------------
>CG10338 18693815 18694500|20807 chr2L 18692486 18694545 scaffold_6 1892939 1895072 + 75973|1336 2167
GAGAATGGTGACTTTGATTGCTA--------------GATTTTGACCTTAGTTGCTTGCTTTGACCTGAA------GAATTAATTTCATTAGACTTCATTAT-----------------CATTCTCACATATCTCACATGGCTACCATAGAGCGAAAACATTGATATTAACTAAGTGCT------ATTGATATTTAC-----CTAGATTTAGCTTTGTGAATCTCGTTCGCACTTG---------------------------------------AACATCTTCCAAC----TAACTCTGCCTTAGCACAAAGTAATGTTTGTAACCGATATTTGATAAGCTAATTTCGCCCTGCTTTTACCCATGAATTTATCGGAAGACATTGTTTCAATT------ATTAGCTGCTACTAGGACTAAAGGAGACACAAAAGAAAATCAAGAAACTATTTTGTAAGGACTTATTGTAAGTATGCACTTCGATATTTCGAGAGCATACAATACATTTTTAGATATTAGTCATGAAGAATCTCACAACGAACTACGGAAAACCCGTTTCAATTGCATTCTGAGCAAAAAGTGTACAAAGTTTTAAGCTTT-----------------------------TTTTAATGCTAAATGTGCAATAGTAAGTTAAATATTAGCTTCGAGTATATACGGAATAAGTTGGCGTCCATTTTTGCTTAACTAAAAT------GCTTTTCAATGAATGCAATAT--ATGAATTGTGTGCATACCGT--------CTCACCACGCAAATGATTTTAAC---GAAACAAATAAAAGTAAACAAT-TTTAAGGAC
GGAACCGAC--CTATGCCCACCAATTGGACCAAAGATGATGCAGCGCTAAGATGCTTGCTATTAACGATATTATTTGAGTTTTTTTTAGCCTAGTACGTTCTAACAACATACACACATACATTCTCACATATCTCACATA---ACCGTAAGGC--AAACGTTGATATTAGCAAATTATTGCGATAATACATATTTACACATTATAGATTTAGTCACATGACACTCATGCGCATCTATCTGAAAATATTTTGAAAAACATTCGAATATAATAATGTAACATCTTCCAACTATGTAACTCTGCCTTAGCACAAAGTAACGTTTG-AACCGATATTTAATAAGATA--TTCAAGAAGC--CCAACCCGGACTATCTTTAAAG-CAT--TTTCAATTCAAAGGATGTGCTGAT-TTAGGACTCAAAAATTAAAAAAAAAAAAATAATAATCTATTTTGTAATAACTTAC----------CACTTGTATATTTCGAGGAGGTAC------TTTTTACCAA------AAGAAAAACTGCGCAACGAAC-------GAGCCGCTTCAATTGTAACCCA---TAAAATTGTACAAAGTTTTTAATCTTAATTTAATTGGAATGCACTGTAGAGTGCCATTTTATATAAAACGTGTAATA-----TTATTTATAAGCTTTGAATATAATTTTAATAATT--------ATTTTCGCAAACAGCAAGTCCATTAGCTTAGCACTTAATACTAGCTTGATAAATGCTTTTTATATTATGCGAAATAGTAAAAAAGCAATTGATTTTAATAGAAGAATAAATAAAATTCTTCGACATTTTATGCA
>CG10341 18696518 18696574|20808 chr2L 18694750 18696883 scaffold_6 1896135 1898291 + 46475|1867 1929
AGATAGGTATGACAATTCAGTGAATTACTTTTATTATTCCAATAAAAAA------TCTTTATC
AACTTAATGCGCCTATT-------TTATTTACTTTATTCCAATAAAAAAAAATATTTGTAAAC
>CG10343 18700266 18700386|20811 chr2L 18699823 18700364 scaffold_6 1901951 1902505 + 19795|452 567
----AATGCCTACCAACTAAA----------AATAGGAGTAATAACATCGAGGAAACCTTA---AATTGAAATCAAAAGCCAATACTATTTTATGTGATAGAATAAACGCGAGTAA
CGACGACGCCTGCCAAATCAACTAGTTAGCTAATTACAATATCAAAAGCTTGGCACTCGTAACGAATTCAATCAAAAAGTCA--AATGTGATCTGTGCTCATGTGTACGCCATTAA
>Grip71 18706984 18707234|20817 chr2L 18705455 18707669 scaffold_2 1491279 1493564 + 59044|1725 1980
AACGAGGGGGAGACATGTTAATAATTAATTGAAACATTGTTATTATTGTATTTAATTTATTGTTATTATCAACTATTAGTAACATTTTTCAAAATAGGTTTTGGCGTCTCATGAGTT-TTATGTAAATTTTAATTCGTTAATCGATCCATTTAGATATTTTACAAATGTTTTAGAATATTTACCTCGGTCTATAAAATGTTTTTGAATTCGTTATTAATATAG----TGCTGCCAAAAGTGTAATGCGATAAGAAA
AGCGAGCGCGAGA--------------GCTCAGAAGCTGGTGATGCTTAAAGCAATATTTTGGTTTTTAAAATTGTTCGTAA-ATTTGTAAA--------TTACTGCTGCATTATTTATCGTGTATATTATA-------------------TAGATACATAGTAATTGTTTAAGGCTCACT--TTCTGTATGCCAATTGTAGCTGGTGCTGCTGCTCCTGCTGCAGTTGCTCCGCCGCGCTTAGTCTGACGGGCAT
>CG17325 18809624 18809870|20945 chr2L 18809221 18810057 scaffold_6 2438338 2439206 - 20334|438 711
GAGACGGATAGGGATGTGGATGCACGTCGTCGCTGGAGAGACCGCATTGGAGGAGGGATATACCACTACTCGTACGATGACGATTGCTTGTCACCATACTTAAATGCAATAAATTCAATTTGAACAAATTTCCACATATTAATTAAGTTTCATAAATCGCAGTAGTCACGTGCTGGGGCCGGGGAAATTTATTTATTGCAACTTTTTTAT-------------TTTGCCAAATTAAATTA--------------CCCCAACTAAGCCTGCGAGC
-AGCCTCATGATGTTGTCGATG-ATGTTTTT---------------------AATAAATATATAAT------------------------------TTCATATATATATCAAATTAATTGTGA---------CGCCTGTT--TTAA--CTCATAAATCGC---AGTCACGTGTCGCTGCATACAATTTTCATATGTTTCTTTTTTTTTTTCTTTGGATTTTCCTCTGGCAAATTAAATTATTAGCAAACGTTCCCCTCGCCAAAGCCGACGG--
>CG17324 18818478 18818509|20959 chr2L 18818116 18818479 scaffold_6 2461076 2461424 - 5178|363 364
AT
AT
>CG17324 18818478 18818509|20960 chr2L 18818480 18818920 scaffold_3 2345441 2345841 + -1406|0 30
GTTTATTTGGTTCA-ATGAACTTGAGATTTA
CTCAATATAAATAATATATAGTAGGTATTAA
>CG17323 18822133 18822483|20966 chr2L 18821839 18824813 scaffold_6 2466242 2469406 - 50972|303 708
CTCGACTCATCCCTGCACAGCTTCGTTTGTGGTCTATGTGATATTTTATATGT-----TCTGTGTAAGACATTTTTAATTCTAAAGACGCCTCCCCCACGGACTGTATCTAGATGTAATCCTAGCGACGCCAAATTAATTT-------------------AATGTTTGATACTAT---TGGGATTTACCCGA-------TTAAAACGAACGTAGTTTTCGAATAT---TGTATCTAGTACGGGAATATTATTAAAATAATGTTATAATGTTGTAATGAACAACTGCAAGGAACAACTTATTTTTAAATGA----ATGGAAATGAACATAT-------TAGAAGAA---ATATAATATCTGAAAATTGTTTCTA----GTACGGAAATAAATAAAGTTTTTAAAATA
ATCGATTTGATCCT---TAGCTTTGT-------CTATGTGATATTTTCCATGTGAACGTCTGTTAGTGTCCTAATTTAGTTTAGTGACTCCCGCTCCTAAAA----GTTTAGATATAAAGTTGGAAATGTTGTGCTTATACGTTTAGCTTGTATCTAGAGAATGTTAGATATGGGATATGGGATAAACACGTGAGCTCTCCAAAAGAAACCTAATAATAATCTATAAACATGTATAGACTGGGATACTTGTCCAAAAAGAAATCTAA---------GATCAGTTGAAAGACAATATAAATGTTTGTATGACCATATAGAAATATTTATATGACCACATAGAAATGTTTATATGACCATATAGAAATGTTTATATAGGATCTGTTCATTAATAA--TTCTTTAATTA
>CG17322 18824794 18824993|20966 chr2L 18821839 18824813 scaffold_6 2466242 2469406 - 50972|3228 3252
GCCCAATCAA-----TAGATTACTG
ATACAGTGAATGCTCTAGACTAACG
>CG17322 18824794 18824993|20967 chr2L 18824842 18826526 scaffold_6 2470437 2472123 - 84168|0 157
TTAAACTATGAAACAATAGATTGCTAAGTCAAATACGTGTGATACATTATTAGAAACCAAAATACATTTTACCAGAACAGAATTGGCAAGAACCA------GTTTAAGTTTTATATAAAGCAGTTCCCGTTTAATAAAAATATTTACAAAATCAAGAT
TTGAATTCAAAACTGTTAATTTACTGGTTTTAAGATTATAAAAACCATAATAATAAAGAAAAAAATTATTACACATACATAAT-----AGAACCACAATGCGCTTAAAGAATATAAAATACAATGCA--------ACATATATTTACAAAATCAAA--
>ScpX 18829425 18829562|20968 chr2L 18827167 18829555 scaffold_23 193995 196317 - 105767|2307 2445
GCTCCTC-----TTCTTGTGCAATGCAGCATCTTGGTGGCTTTGGATCTGTTAAACCTAGTTATATGAATATATCCAGCATACGCTTTTTATACGACTTTTGTATTATTTCTCTAG--ATTAAAC-TGTTATTTTCGTA
ATATTCCAAGCATTCCCTTGGCCTTTGCCACTATCCTTGGTTTGGTTTACTTAAACGTAGCT---TAAATTTGGTTTATATCTACATTTGAT---TCTTATGTATTATTT-TCTAGCTATTAAATATTTGATTTTTGTA
>CG17321 18850434 18851047|20991 chr2L 18850229 18854422 scaffold_2 6403168 6407336 - 138898|217 981
TAGTTCTTAATGCCTCAGCCAGACGAAGGACACAGCAGGGAGAGCTTGGCCAGGCGTCCAAGGAAGGGGAATAGTTACAGAGATCTCTAAGCCATTAAATTCGGGAAAATCAATTGGAAGCATGTTGCAGCACTTTGGTCGACGTAGAAAGTGAACGAACACAACGGACAAAATTGTTAATTAGTTTAAAACCACACGCGAAACTCGTCGGAATTAGAAGTTGAGACACCAAGAGAGGAAATATTTAAGCAGCCGAGCAAAGCAAACAATAATAAATTTAATATATAT-TGTGTGTAT------GTGTACTACGAGCCGAGAGAGAAATTTAAAGAATTTAAGCCA-----------------------CAAGAAATTTGAAA------------------------CGCAGATCAACCTGATCTACGCC--CATTTGATTAGTTATACGAACACCAAC---------------------------ACCCTTG-----------------------AAATTGGT--CAATGTCGAGCTATAACTAAAAAGGATAT---TAAATTGGTAACTATACG-----GTATCAAGGTAACGCGCGGAAATTGCAAGCAAAATTGAA----GATTAGAA-------------------------TTGGAAGA-----TTACAAT-GAGCATGGACATGGAAATCAACTTGTTATAAACGTAGTTTTGCTTATTTTTTAATAAAAACAACTAATTCAAGAAAAACAAAATCAA
TAGTTTTTA-TTCCTCAACGACATGAAATTTATA--------------------TGAACACAAAAAGTCAACTCAAACTTTGTCCACTACATATTTCAACTATAGAAAA--AGTTGAG--------GTTGCATTTGGGTCAATGTAAAA----------------GAAACAAATTGTTGATTAGTTTAAACAAAGAAGCAAAACTCGTCA-----AGAAGTTTAAA--------AAGAAAACGC---------------AAGCAAACAATAATAAATTTAATATCTGTGTGTGTGTATAACAAGGTAAATTACGAGC------AGAACTTTAAAGAATTTAAACCAAGATGAACAAATTGTACGACAACTAAAAAATATAACGTTAAATGGCATAAAGTATAATTGTCGCATAGGACCCGAAACTTGAACAACATTTGGTTAGTTGTACAAAATTTAATGTTAGTCAAAAAAGATTACTGAAAATAACCCTAATTTAAAGGTGAAGAAACACAAAAAAATTGGCAACGCTTTGGGCCAATTGCACAAATATATATATATATATATATACATATATGTATATATATAAAAG-AATTCACAAAATTTTACGGCAAATTCGAATGCAGACAAGAAACAAATATATGAGATGCAAAATAAATTTAAAGAGTCGCCTACAATTGAGCATGGAAATGGAAATCAACTTGTTATAAACGTAGTTTTGCTTATTTTTTAATAAAAACAA-TAATTCATGAAAATCCACGAAAA
>CG10428 18946854 18946907|21123 chr2L 18944805 18946971 scaffold_6 4134691 4136763 - 77983|2096 2153
ACT-TACAATCTGCCACTG--AGACAAAATAAATGCCTTTTTG-ATATGTTTTAAACC
GTTATGCATTTATGCAAGGTTAAACTAAATATATGTATTTTCGTATATATGTAAA---
>CG18398 18967912 18967935|21143 chr2L 18964796 18973046 scaffold_6 4155764 4164052 - 190309|3218 3249
AGGCT--------ATCTTAGAAACCTACACAA
GGCTTCACTAGAAATATAAGATACCCATATAT
>CG15168 18984181 18984219|21156 chr2L 18983662 18985702 scaffold_6 4177948 4179978 - 56186|540 599
GAGACCT---------------------TTCTTTTAAGTTCTGCTATCCTTTTATTTATA
GAGGACGAGTAGCTACATCAACTATATATCCATTTAAAGCCGGCTTACAAC--ATGTCTA
>CG31793 19003983 19004160|21179 chr2L 19003970 19004236 scaffold_35 1008132 1008404 - 274|13 206
AGCTAACATTTTTATCATATTAATGTGTTTGTCTACGTAATGTATATTGGGCCCAATTGTAATGGAAAGGGAATT----------TCGTGGTCATAGATTC----AGTTTTATAGAATACAAAACGTTTGTACTTAAGGGAGTAAAGCAA--AATGACAATGTTTTCTTTTAAATAAAATGCTACTTAAACAAC
AGCTAAAAACTGCCTAAAATCAACA-ATTTGT---TGTATTGCATTTAAAATCAAAATAAACCAATTAAAGTATTATCTTCAAGATTACTTTAATAAATCCCAGAATATTTATAGTACATGAAATGTTTCAATTTAATG--ATAATCCAACCGATGGCAATTTTTTCAC---AATACATAAATACTTAAATTTT
>Side 19026393 19026716|21204 chr2L 19026495 19026592 scaffold_2 1994202 1994314 - 1763|0 113
AAGTAGAGGATGACACC-TATTGTTA--TTACCGCTCGTCTGTGTAGCTCC----------TGCATCTCTCCAAATTGCATTTCCAACCTGTGCCAACGCCCAA---GACTCTC
AAAAAAAACAAGACACCCTATTGTTAAGCTCCTGCTCGTATATGGGAATTCATGCACGAGATGCGAATTTTTAAAT-GCATTTTTCACGTGTGCCAATGCTAAAAAAGACTCTA
>Side 19026393 19026716|21205 chr2L 19026618 19026865 scaffold_2 1994352 1994601 - 1479|0 118
AGAGCTACCCTTTCATTTATGTATG----------CATTTGT-TTTTGCCCTGA-ACTCTGCGTTAAATGTATTTAATTCAATACATAAAGCAAAAAT--------ATTTACAAAAAAA
AAAACTACACGATCATAATTGTATAATTCCAGAACTATTTATGTTTTGTCCAAATACCTTGCGTAAAATGTATCAAATACTGAAATTAAAACAACAATAATGTTAAATCTATAACGAGA
>CG17492 19037052 19037470|21210 chr2L 19034741 19039355 scaffold_2 4850775 4855433 + 167388|2453 2928
ACGGCGGTAACGGAAACGAAAGAAAAGCAAAGGCGGCAGGATCAGCAGCAATTCAAACAGCAACCAAAGTGGCTTGTATATATAC-ATACA-----CAAAACAAACACACACTCAC-------ATTGCCGTGTCATGTGCAAATCGAAATTATTATTTATTGATCACAAAC-----------GAAATTTACGAGTTCTTTTTTAATCGGTTCATCATCGGCATCGTCGCAACACGCAACAAATTAATGT--------------------GCACCTTCTCGTGTCTAGT-TATTAGCCCCGTTTAACCATGTCTGGTAACGATAAATACATAGGAAACTAACTAAA-GCATACAAATATTTAATA------GTCATTTAAATGCAAATA---TACAAATATAAAATTATT--TAATTGAGTGAATTTCAATCGATGTCGGTGGTTAGCCTACAGAAAATAAAGATACTTTATTTCTG
GC----------------------------ACTCGGTGCACTC--TAGCAATAC-----GCAACCAAAGTGGCTTGTATATACACCATAAAGATGTTAAAATTTATATATTATCAAGGATTTAAGTGGCGTGTCATCAACAGCT-GATACTATCATTCGTT--CCACAACCCATGCTTGAGTTAAATTCCCAAGTTTATTATTTAT----TAAACAACAACAATTATTTTGCACGCACCATACCCACGCACACATACACACGCACGCACGCACACACACGTCTATAGTCTATTAGCATCGTTTAAC-------GACAACGA-----------AAACCCAACTAAATACGATTAGATGATTAATAATATAAGCATTTTAATTGCAATTGAGCTGTATATTGGGAATTATCGCTAAATAAG---ACTTCGAGTCGTTCTGATCTTCAAATTACA--ACATAAAAATCACACCTGGCTG
>Catsup 19039280 19039543|21210 chr2L 19034741 19039355 scaffold_2 4850775 4855433 + 167388|4823 4904
TATCAA------AATTGTGGAAAGTTAACACAAAAAAGATCTAATTGCATGTACTGAAAGTGTGCCGCAAACAATTTGAAAG
TTTCAGCCGCAGAGCAGCCGAATAGTTTCGTAAATATGGC----TCGTATGTACTT--------CCAAAACAAATTTGAGGG
>Catsup 19039280 19039543|21211 chr2L 19039452 19048162 scaffold_2 4855529 4864275 + 202047|0 93
GCGGCGTTATTTAAGATTTTTTAAGCCTTCCAAATTTGTGCTTCACTTCGAAATGAAATTTTTATAAATAGTCAAA--ATTACACTGTAAAAAG
GCGGTGTTTTTTAGCGTCTAT--ATCATGCATAACATTTGTTTT--------------CTTTTTCAAAAAGTCAAGCTGTAATGATACAAAATA
>CG10473 19044026 19044562|21211 chr2L 19039452 19048162 scaffold_2 4855529 4864275 + 202047|4950 5568
GCGGAGGCT-----------TGAGATTGAGCAAATA-------------AATGTTGATATCTCA----AAAACTAAATCAACATATAAAAAAAAACTTCAAGAAACAGCAACTAAAACTTCAGCAGGGTCTCATCACCACCCGAATAATTTCAAT---TCTTTTCTTTCGAGC-------GTTTTGCGTTCCCAATTAGGCCGACGTTTGTAATATTCAACTTGAACTGAACCGACTTCAAATTGAATACTTTCGCC--AACGTCTCATCCAC--ATTCTGATTTTGAGATTTCAAACTCTCTTTTCTTCGTTATTTTTCTCATTGTTGTTGTTCCATATATATATAGCATATATATTTCCATATATATATATATAACCTGATTTGATTTCTTTCCTCAAATGTAGCATTTTACAGCGCC-TAACGTCACCTC--ACCCCAAAACGAAACCACAGCAACCAGAAATGCGCCGGCATCAGATCAGCATCAACGCCATGGAAACTTACCA-------------TCGGACTCTTGAAACTACTGCAGCAAGTT------------------------ACCATGCTTATATCTATTCAATAAACAAACATAAAATAATTGATT
ACAGTAACTAAGTGAACTACCGAAATAAAACAAAAACAAATGAAGTCAAAACGATGACAAAACATTTTAAAACAACAACATAAGGAAGAAAAAAA----AAAAAACAGCAAGCAAA--TACGGCAG---------------CAATTCATTTCAGTGGTTTTTCTCATCAAAGCCCAACATTTTTTATTTTGCCATTTGTTCTGA--GTTAAAATATTCAACTTGAAGTCAGTGTACTTCAATTTGAATATTTTTCCCCTAATGACTCGACAAAGAAACCTAACAATGAGATTTCAATTTCTTTTTTTTCCTCCCCCTTCTCTATT--TGCTGTTCTATATATACCTA---TATATAT----ATATATACATACATAACTTGATTTGATTTCTTTCC-CAAATGTAGCTTTTTACAGCGCAACAACTACAGCTTCAACTCCCCAACAACAGAACAGCA--------------GGCGTCAG-TCAATAGTACGGCAATCGCGACCTATTGGATTTGTCTCTGTCCGGAGTCCTAAAACTCTAGCCGCAAGTGTTTGATTTCGCCTATTCATACATAACTATATAAATATATATTTAAACAACAAATGCAAATTAATTAATT
>CG10470 19045764 19045815|21211 chr2L 19039452 19048162 scaffold_2 4855529 4864275 + 202047|6822 6886
TTCAAATTCATTAATTAAATTGTTGCATTT---------AGTTTTAATG----CACCATCAACAA
TAGGATTTTGC--GTTGGCTTTTTTTTTTTTGTAGCGAAAATTTCATTGGTTTCAGAAGTAATAA
>Dox-A2 19049529 19049610|21212 chr2L 19048186 19051505 scaffold_2 4864305 4867584 + 106966|1343 1425
GCGGCTGATTCTGCAAATTAATTTGTGCTTGCATTCAT-TTTTATAGAAATATAATCCGCAATTAAATAAGTTACAATAATTT
GCGCATGCT-------ATGCACTCAAACATATATTAATATTTCATAGATGTGTGAAC--CAATTAACATAATAAAATTCATTT
>CG10492 19053450 19054752|21213 chr2L 19051547 19053628 scaffold_2 4868092 4870387 + 47896|2213 2458
TACGGAGGGACCGTATATTA----------------------------------------------ACGTACATATATGGAAATATTATTACTGC-TAT-----------------ATTAATGATTATGCATAATCCTTACCTACTTATACGAATTACCATTTATTATGATTGT-GTAGTGCGGAAATCAAATTTCTCGCCTTT-GCCACGTCTCTTAGTTCCGTAAGCCTCT-CAATTCGCGTTA
GCCA-------TGTATATTAAAATCACAGACACCCCCCCTTCCCCTACCCCCACACACACCTATACACATATATATATATATATATAATTAATACATATATATATATATATATATAATTAATACTTAT-TGTAATTCTTAACTACTTACACAATTGAACATTTATAGCGTTTGTAAAAGTGCGGAAATCAAATTTCACGCCTTTAGCCACGTCTCTTAGCTTAAGACATTTTTGCAAATTGCGTTA
>CG10492 19053450 19054752|21214 chr2L 19054011 19054808 scaffold_2 4870922 4871747 + 8591|0 862
AGAGGGGATTGGAGTTGCCCAGGAAAACAGA-ACACACGTAGCATAC----GGATTAACTAGCAAATATATTAAAATTGATTATGTGTATAAACAAACGAGTGTAGCAGCACAGTGTGCATAGTTAAC--CGACTTCTGATTCCAACCGAGCCCTCTGATCTACTAACACCCTGTACTCTAGTTACTCCGCCATCTATTTATTTGCTGCTCCTTTGTTTAAACATGTATTTTTAGCAATGTTTTTT---TTGTACTTTATATAAATACCAACATACTTATATACACACATATATATATATATATTACATTATATATATATATATTATTTTAAAGCAAACAATCGTATATGATACACTCTTATGTGGATAGGGCGTACGTTAC-TGCTAAGCACTCTGTCTAATGATTATTTTATGTACTCACAACTTGAACCCCGA---TGGGCAAC------------TGTATATGAAC-TGTGTATGAAC------------TGGTCAAGTTAGAG---AAATAACCGTTAAGGTCACGCCAAAACCGCCCACGGTTGACCACAAAATACAATTGCCTGCCCTTAGTTTCTT-----------------ATGTATAGA-CGTTGTTAAAATTTTG-------------------------------TAAAGTCAGCAGACGAAC---TGCAAGGTA----------ATGAAAATAGAAGCAAATGAT-------TTACATGAAATACACACTCTTCTGAGTTTGCTGCTAATGCGTAGG--CATGACAAACAATTATTATATTTCATTGAAATAATAAAAACAAATTGTTTCTAAAATTCGAGT--------AACAAACACAAAGCTACAA
AAAAGAGCGTAGTGTAGCACACACACACACACACACTCACACCATACTCGCGCACGCACACGCACTTAACTCTTAATTGAGAGTGAGAGCGCGCGCGCGAGTGAGAGAG---AATGTGCTTAGTTAACGTTAACTATTAATCTAATTATA------------ACTACAATTTTTCATACTAGTAATT-----ATTTATTT--TTGCTGCTTCTTTGTTTAAACAGAT---TTTAGAATTGGTTTTTACATTGTA--TTATATAGATTATGATATATATATATATGTGTGCGTATACACATATAC------ATATATACCTACAC--------------AAAACATATATAATA-----------GAATATGGCGTATATTATGTATAAAACGCGTTACTTTATTTTT-TTTTATATTAATATAACCTCGTACTTGACCATAGGTAATGCAAAAACAATACGTATAAAAATATATGTATATATAGAGTTAATTTATGGCCAAGTTGAGATTTATGTAATGGCTTAGATCACGCC---------CACAGTT------AGAACCTAAATGCCTGCGTTTTTTTTTTTTTTGTTTTGGTTACGTTATGTAAAAAACGTTGTTACCTTTTTTATGGAGCAAAAACCTACAAAAAAAAAAAAACGAAATTAAGAAGAAAAACAAATGCAAATCATCCAGCAAAAACAAAAACAAAAACAAACAATATTGAAATGAAATGAAATACATTATTAAAAGAGTTT-CTGCTAATGCGTAAGTGCATGACAAATGATTATTATATTTCAGTGAAAAATAAAAAACAAATTGTTTCTTAAATTCGTGTAAACAAAAAAAAAACACAAAGCTAAAA
>CG10495 19060563 19060655|21219 chr2L 19059302 19063634 scaffold_7 2167681 2172052 - 121537|1275 1376
ATTGTTTTGTAAATAGAT---------CTTTAGTTTGGTGGGGTATAGATTTTGTACAAGACAAATAGGTTGATATCTAATATATGTAAACATTGTATAGTG
--TGTTTGAAAAATAAATAAGCTAGTAATAAGGTTACTTGTGACATTTACTGTTTTCAAACTAAAGA-------AACTATTATTTTCA---ATTGTGCTGT-
>amd 19109941 19110039|21277 chr2L 19108708 19109958 scaffold_7 3049281 3050547 + 58411|1239 1266
----------GAAAAACGGATAAACTAT
TATTGCAATTAAAAAATACATAATCGAT
>CG10561 19112342 19112500|21278 chr2L 19110625 19112513 scaffold_7 3051025 3052943 + 59301|1800 1963
GTGCAATGGGAAATCCGAATGGGCTGCTAAATTGTACAGTGTATATCAACACGAAAACTAGTCAAAATTTATAGTTACAATTCGTTTGTATTT-TTAAGCAGAATACATTTGTTTTAATTAGGCGCATAACGTTAACAATAAAAATCATG----AACAACATCA
GTATAATCTCACACTCGTA------GTTAAAT------GCTCGTACAAAAAAAGATTCTAGTCAAAATTCATAGTTACAAAA-----GTATTGGTTAAATAGTAA---------TTAATTAAGCACATT-TATTAAATACGAGTAGCATGTAAAAACAACAATA
>CG10563 19124891 19125255|21284 chr2L 19119007 19124935 scaffold_7 3060236 3066196 + 270954|6088 6155
ATGGA-----------------------AACGCTGACTGAAATGATTATAGCATAGGATGTAAATTGT
TCTGATTATATGCGCGATCTCTTACAATAAGACAAACTAAAATAGTTTTAGCTGTGATCACAAATAGT
>brat 19167189 19168501|21328 chr2L 19164033 19168338 scaffold_7 3094756 3099199 + 178060|3312 4765
ACACA------------------------------------------------------------------------------------------CAGACACACACACTCCATGGATGTGAGTCCGGAAAGGAGGAGGATCTGTGGTCCGGCACTCACTACTTCTATAGGCTAAGTTCTCAATAGTCTGACTTGCTCGGTCTCTCCAGCTCTAATTCTAAATCTACACAATCGAAGTTGAAATCGAAATCTATAAGATCCCTACTATCTCCCCCGATCTGTC---------ATCTCTCATAGCCT-------------TAGACTTTGCTCGCTATGT----AATAACACACACGCACACTGTTGGAATGATTTTTATTAT----CTTTTAAATTATTGTTGAATTTTGTTTTATTTTTTTTATATATATTTACAC--TGTTAAG-CTTAGTTTTTATTTGTGCGTACTTGTTTATGATAAATATATATTA----TGTGTATTCATGTTCATGTTCAAA---------------------TCGGATAGTGCCGCCGCCTCTCTATATCTTTGCACACTTCTCACTTCAAACCCTCGTATCTCTATCTCGCGTGCAAGTCGTATTTTCAACAAACACAAGCAAACAACCGAAACAAACAAAAAAAATGACACTTTTT------AACTATATATAGTAGATACCAGAAG--AAATCCCTCCACTTTTTTTATGTTCGTTGCCGACTGCAAGGAAAAAAAAGGAAAAAAATTATGAAAAAAAGAAGTTGGTATA----------------------------AAATAAACTTAAC---AAATAACCGCCAACAAAATGGAGCC---------GCGTATCGAGCATTAATTAATTAATAATTGATTGTAATTTTTAGATATATGATTGCGCAAATTGTTTGTTATTATTATTTTTGATTGCAT------------------------------AAACATTTGATACAT-TATATATTATATAGCTGTTTTTTACGTTTATAAATTA-TTTTTGATTATACC--ACTTATTGATTAC-------TGATTATTTATATTTATATACATTAATTAATTATCCT-------------------------------------------CTAAGACATGTTTGCTACTTTTATACGAAATCAACCGAACCCAAAACCGAACCGCGACACAAACAACAATTCACAA--TTTTTATACTCGCTTAGAATTTATGTTTTCCATTGTT---TTATTGTAACCACGACAGCGGAAAGAAAAGATGGAATTACCTACCTACAC-----------CGTAATAATAATGCAGA---CAAAAACC---CACTGGCGATTCTTTAATTTAATTTAAACAAAAAC--AACTGAACGCACTGAGAATAGTTGAAATTTTTGTTCTTGATTGTTGAAC
GCAGAGAGCCTTGACAAAACACATATAGAAAAAAAACAAAAAAAAAAAAAAACGACAAGAAAAACATGCAGAAAATATACAAAAACAGACGACGCCAGAAATTCGGAATTCAGAACTTTGAATTCGAAAAAAAAAAAATAAT------------------------TAAAACAAGTTGGCAGT--TCTGACTTGCGCG------CGCGCTCTTCTCTAAAGTCT-----------------ATCGCTCTCTCT----CTCTCTCTATCTCTCTCTTTCTGCCTCTGTCGCTGTCTCTCATAGCATAGCATAGCATAGCAAGAACTCTCTCTCTCTCTTTTATATATTATATATACTTACTAT-------ATTTTTATTATTACCTTTTTAAATTATTGTTGAATTTTGTTT-----------------TTTACACTGTGTTAAGACTTAACGTATGTTTTTTTTTTTTTTTATATT-TTATTATATTTTATTTTTGTGTATTACCATTTTTGTTTAAATTGTTCACAAAAAAAAAAAACTCGAATGGCGCCTCCGCCAC-----------GCCCTCTTGGCAGT--------------------------TGCAAGTC---TCTTC------------------------------------AGTGACATTTCGTTTTAAAAATAATACACAAAATATACCAGAAAGCAAATCCCTCCAC--TTTTTATGTTCGCT-----CGTCAAACAAAAAAAATAAAAAAACAAAAACAAAAAAAAAAATTACATAAAAACAAATGATTACAATTACAAAAAAGAAAAAAAGCTAATTTAAAATAATTGCTTGAACAATTGAATTTACACACAAGTAGATCGAGCATAAACAAATACTTTATTGATTGTAATTTTAAG------TAATGCGC-AATTGTTTG---TTATTATTTTTGATTGCATATAAACAACAAGAAAATGAAAAAGAATGAGAAATTTTTGATATATATATATATTG---AACTGTTTTTTATGTTTATAAATTATTTTTTGATTGTAGTAAACTTATTGATTACTGATTAATGATTATTTATATTCATATATGTATTTTTATTATTATTATTATTATTATTACGACAAACTTATTATTATTATTATTACTATTATGAAATTTTTGCTACTTTTTTAC-----CAACAAAACACAAAACAAAAC-----------CAACAACACACAACTTTTTTATACTCGCTTAGCTTTTATGTTT--CATTGTTTGATTATTATTATCATTATTATTATTATTATTAATATCATTA-GTGCTTAAACGAAACACAACATGAAATAATAATTAATACTTCAAAAAGCAGACATTGCCGCTTCTT--AATTTGTAAACACAACAACTAAACTAAACGCACTGAAAATAGCTGAAATTATTCTTCTTAATTGTTGATT
>brat 19167189 19168501|21329 chr2L 19168339 19168746 scaffold_7 3099332 3099767 + 2625|0 220
TATTTTTTG--TTTAGGCATTTATATTTTAAAATAATTTCTTCGTTCGCAAGGAAGACGGACGAATTTGTTGTTTTGCCCCAAAATAT------------------ATTACTATATTATATGCGAAAATTATTTGTTGTCAA----------ATTGAATTTAAATAAACATGGAA---------AAATGTGT-------------------ATATCAAACG
TATTTTTTGTTTTTAGGTTTTGTTTTATTTAAGCGTTTTGCTTAAACGATTTGACGCTCAATAAAATTGTCAAATTGTTGTTAAACATTTAAAGAAGAAGAAGAAAACTACAATTTAAAAAAAAAAAACTATTTGTTATTAGTGTAGTATGCATCAGATTGAAATATGAATACAATTAATTAGTAGATGTTTTTTCTGCTGGTGGCAAACGATATAAAAAA
>pigeon 19185515 19185867|21346 chr2L 19182637 19187248 scaffold_7 3116502 3121297 + 131528|2968 3477
ATTTAATGTTAAGAGT--AACTAATGAAGTATTGTGTCAAATTA--TCAAGTACTTA----------------GCCAAGGCCAGTTTGCAAATATTCCAAAG-----------ATTTGATTTGT---------------------------CAAATGTATTAGTTA----AGATTCTTCTCGTGCAGC--------------TTTGATTTTTGTTAGGGTTCTTCTGTGTGCTTTTAGTATTAATTT--------------TCTGTTCCTATTATTTGTGTAACGACTGATACACATTCCAAGTCTGT-----------------------AATTATAAAT-------TATTTATGTTGTTAATTGATGTACCTAAAATCATGTACGTAT-----TTATATATTCTGTACTT--------ATTTATTTTATGCTTCTGCAAGCTT----CTGTCTCTCTTTCTGTAATAAACTAACGAT--------------------TTATAAAGTAT
ATAATCTATTGAGGCTTCTACTACTG-CGTCCTGTGCCCAATTAATTGAATTATTTATGTTATATGAATGTTGGCCAAAATAGTGTGTCAAATGTCTAAAAGTAAGGATGAGTATTCAATTCATATATTCAACCTTATCGCCATATTTCTACAATAGTATTGAATGTCGCAAATTATGCTAATGTAATCCCTGTATGATCTATTTGATATTTATTTGTACATTCCCACATGCCTCTGTTATTTAGTTAAATCCAAAATGTATTTTTTTTTATTATTTATTTAAAATGTATTATACAAAGATAGTACGTATATCTATGTGACAGAAAGTTACAATTAAAAATACAGCTCTATAATACTTGAATCTTGTTTTAAATAAAGTCGTTGACACTTGGATCTTACATATAGTATCTTTCCCCTCAAATTTCCCCTTTGCAACGATAACTGTTATACGGCAGCGCTTAGTACCTAAAATTGACAATAGGCGGCGCAACAGCATCCACAATAAAGTTT
>drl 19203667 19204544|21361 chr2L 19201596 19204848 scaffold_7 3134992 3138324 + 119760|2122 3127
CCAGCGGTGCTGAAGCATGCCAAGACCTGTAAATATAACAAGAGGCGACGTCGCAAGATTTTCCAACAGACCACGTCGTCCACTCTGTTCCCAAAGACATA-TTAAATGGTAGCGCCTAA---------------------------------------AAACTGGGGTTCGTAGCAGCTCCCCAGGCATAAATGTACGAACGACTTATGAGAAGATGTGGAGGGCGGAC------GGTGAACGGTGAAGCGGCCTGAAAACGTCTA-----TCCACATAACTCCTAGTTATATATTTAGTCAGTAAGGAC----ATGTGACATTTC---AATGCAAGAATTAGGATTATCTGAAAAACATAAACACACCCTATGAACTCCCCTGTTAAGAAAAACACAAATGTTCTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAATTAAGAGCCAAGGCCCAGTAAAATTGATACTAAGAGAATCCTTGAAAAAATCCACAATGAATTAAA----ATAAATAGCAAATATTGATATACAAAT-CGTAGCTAAAA--CAGATCCATTAAATCAGAACCCCACGAAAAACCAGTGCTAGGATAGGACCCAAAAAATA-TGTCGTAGTTTAACAGAGAGCGTTGCAAGTTTGCCATTAT-AATGGGATACCAATACGATACCGATACATATATC------TATGTATGGACATGTATTCAAGTGTG--------TGTTTATGTCTAAGAACCGTAGTGCTAGTAAGACTCGAA------ATATTTATCTAATGTTAGTGCACATACG-----------------ACCCCAAAATCCTTAACCCTAAGTTACCGCCTCCTTGTACGCGTAGTGCAGTC---TCGAG---------------------TTGTAAGTTTTTGTGTAATATACTTAAGCAGTTTGCATTAGTTCTTAAGTTACTCTTATGGTTTTCTATGGCAGAGACACAAAAGAAAACGATTTCAATAAACGTCCGTGCATAATATTT
CCTGCGGTAATGAAGCACACCAAGACCTGTAAATATAACAAAAGGCGACGTCGTAAGATTTCGCAGCAAACGATGTCCGCAACTCTGTTCCCAAAGACATATTTAAATTAAAGCGCCTAAGGGGCGTCTAAGAAGCGATAATGTGGGAGATATGGATACGAGTGAGGGCCCACTGTTGTCCCCCACA-ATAAAT-----AGTTACTTACTAATTGTAGTAGTCGCTGGACCGATTGGAGGCAACATACCACGGTTCAGAAAAGTCGCAAAGTTGTGCACTGCACCATATTAAGCAGTTAGGTTATTAGGACTAGGATAGGATATTATGAAAATCGAAAAACAAGTGACATTTAAATGCAAGAAACATAGTAGTTGAAC------GTAAACACCAGAATACATTTT-----------AACGAGACACATTCACGAAAGAAAACCCAGTTAA------------GGATTCCCTGAGAATCCCCAC-ATAAGCTAAATCATTTGGATAACATAACATTATATATAGATACATAGCTAAAGACAAGACCCAT--AATAAGGTACAC------AACC----CTAGGCTAGGCGTATACGAGTGTTGGCCTGGTTTATCGGGACACTTTGGAGGAGCTCGGGCATAAATTCGACGTTTATA-AACAGCAAAATATATATTATCGAATATCTATGTAAATGTATTTATATGTGTATGTATATGTATATGACTAAGAG-CGTAGTGCTAG-AAAACTCGAATCTAATGTATTTAATTAATGTTAATGACTTCATGTCGAAATCCAACGGTGCACTACAGAACTTCCCTATTTAGTTCACCAGCATCCAAGATCCCAGGGACTGTCGAGTCGAGCCTAAAAATTTTTTTTGTTACTTGAAAGTTT---TGTAATATACTTAAGCATTTCGCATTAGTTTTATGTTCCCCTTTATGAGTTTTATTTTAAGAATAACGAAAGAAAACGATTTCAATAAACGTCCGTGCATGAAATTC
>CG10750 19297469 19297529|21455 chr2L 19296218 19297557 scaffold_7 3225513 3226877 + 37934|1291 1362
TCGGAAAATATAA----TATTTTTCATGGAGCA-------TAAATAAATAAATAAATGATTTTAAATCCTTT
GTTGAAGACTTAAAGATTATTGATTATTGCGCGACTCTGTTATGTGAATAAAGA--------TTAAAGCTTT
>CG17350 19378944 19379201|21523 chr2L 19378681 19379061 scaffold_7 3296823 3297195 + 10770|269 394
GGAAAAGCCCTCCGCTTTAACCAGTTTTCACAACTTTGTAAAGTTAGGTAATGCAGAAATATATTTAAAATAGAACTTTAGTTTAGTCTCTTTAGAAATATT--------ATTTTACTTATTTAAA
TAGACTCATCTACTGTTCAAA-------TACACTGCTCGAAAAGTGCTTAGTGTTAACATGGCCTTGTAATCGAATCATAATTGTTGCTTAATAGACAAATTTACTGAACAATTAAATTATCTAAA
>Lectin-galC1 19414019 19414207|21554 chr2L 19413536 19414115 scaffold_7 4403720 4404279 + 3967|500 597
AGTACTTCACAAACCTCTTCCATTTCAGAAGTTTGACTTTATAGTTTTGCAATGAAGGGGAACCACCGGAATAC-TATTTTCTTGAGCAGCCATAAAA
GATACTTTGTATACCCTTAAAG----AGAGAATTGCCTGTGCAACTT--------------ACATACAAAGTACATATATTCTTGATCAGATTTAACA
>CG13085 19426060 19426199|21571 chr2L 19426151 19426320 scaffold_38 877233 877393 - 1206|0 52
CTATGCAAGAGATTGCAATTGCATTTA----AAATACACACTCAAACAAATGT
CTATACAAGCGAAAGCATAATTAATAACAAGAAATACACACCCAAACACATAA
>CG9987 19428281 19428373|21573 chr2L 19428051 19428388 scaffold_7 3342085 3342453 + 15399|230 354
GTCTAA--------TTTATTA------------------TTGTGATTAAGTCAATAAACATTTGGTCCGATGGCTG-----TCAATTTAGTTAATAACGAATTAA-AATTTTTATAGAATTTGTT
ATCCCACGCCACCTTTTATTACTACCAAGAACGATATGCTTGACATTAAATCGATGGATACCTTAT-CGCTTATTGATTCTTCAGATAGGTGAAGAAGGAGATAATAATATAGACAGCATATATA
>Rab9 19431236 19431771|21578 chr2L 19430501 19431336 scaffold_7 3345009 3345871 + 27609|791 893
GCAGACAGACAGGAGCTGTCAGGAAACTTACGCTTAATTTAACCACTCACCCCGCCGGGTTGACCTTCAG--ATTCAATGCATTCCAGTCCGCGGAGGGGCAG
GCGGGATGTGGGGAGT-------ATGGCTACGTTTATTTTTGTTTTTTTTTTTTTACTGCTTAGCCAGAGGCATTCAGTACATTCCAGCCAAGTGGGTGACAG
>Rab9 19431236 19431771|21579 chr2L 19431558 19433076 scaffold_7 3346680 3348086 + 43741|0 229
ATGAAATACTCTTATAACAAT-----------CGTATATAAGCTTTACCATAACCAAGTGTCTTGCTTGAGGAAAGCAAGCTTTAGGTGTCTAATGTACTACGCATAAGGCAATCAGAATGTAATCACTACATTTTTTCCTTATATATTGCATAATTTCGGAGTGCCTTAAGTGTGTTTATCTGATGTGAAAGCTGGGAACAAACGAATAAATATGAA-----TACCGCA
ATTAAATATTTTTAAAACAATATGACTTGCTTTGTATAACGGTATTTCTACCACTTAAAATCTTACCTATATTAAAGAAAATATAGGTAATCTATCTAT-------------ATAAAAACTTAATTGTAACGTATTTG--------AATGAATAAACTCTA--CAAATAAAGTGAATT------ATGTGGAATATCCGAGTGTTTCATTAACTTTTCAACTTTTAATATA
>RanGap 19443168 19443251|21586 chr2L 19440972 19443320 scaffold_7 600132 602731 + 58974|2452 2560
AGAG---AATTAGAGAAGA---------GATTACCTTTATTTCCCA-------------CTTTCCGATTTGTGTAGCTTTCGCGAATAAAAACGTATTATTCCTAACCC
AGTGTGCCATTAAAAACGATTTACAAAGGATT--TTTCGGGTCCTACAAGCACGAAAAGCTTCAAGAGTTATTTTATATT--TTAATAAATAAGTATATTCAAATGCTT
>CG31699 19449013 19449220|21589 chr2L 19448855 19450863 scaffold_7 610714 612604 + -5184|167 403
AGG-----------CCCAAAATTAGCTAAA------TGTCTATACCGGTATCGCCATTTTTAATTTGCAA--GCGACGCCACCG---AAAAATTGCTATATCC----ATCATATTAAAG---GATTAATTAGACAGGGCTCTTAGGTTCTACGGTACAGCCAATTCTACGATTATGATTCAGCACTTTCTGCTTACCTGGTTAAAAAATTGCCAAGTATTTGTGGCCTTTTCTTGCT
AGGTATTTCGCATACACAACTTACGCACAAAAATTCTATCTACATGGGCAGCGCCATTTTTAATTTGCAAATGCGACGCCAACGGGTAAAAAGAGTTTAATTCTCAACTCACATAAAAGAAAGACCCATTAGATAGTTTGCATTAACTC----GTTCCATTCATTTTAAATATACCAAACACCATTTT--GCTCACCTTTTTAGTTGTTTGTGTAAATTTTGTGTCTGCTTT-----
>CG10026 19453523 19453655|21592 chr2L 19452729 19453663 scaffold_7 615230 616187 + 32991|843 982
GCTTCATGCCTTGTT-----TAAAATGATATGCTTGATACTTGTATTTTTGTACTACATATATGTTAAGTAATGATACCAGAATCAATTGAAGCAAAGTAGGTGATATTTTAAATATTAAAGAATTTCGAAA--ATTACT
GTTTAATGCTCTCTTAAATATTAAATAATCTTCTTAAAAGCTCAATTTCAATTTTAAGGACACAGT-----ATGAATTAAGAATAAAT--ATATAAAATA-ATGATTTTTTGTAAAT--ACAGATTTCGTAATCATTTTT
>CG18094 19487559 19487613|21630 chr2L 19484538 19487604 scaffold_7 655743 658806 + 57376|3162 3207
TAAAAGAATATAGTTTTAATAGAAAATATATATATTTCCTCTTGCG
------AAAATAATTT-------AAATATGTATATAAACTGTTTTG
>CG18094 19487559 19487613|21631 chr2L 19487605 19488940 scaffold_7 659015 660341 + 36945|0 8
CTACAACAA
CTAAATCAA
>CG10084 19493314 19493916|21633 chr2L 19489622 19493411 scaffold_7 661076 664977 + 119807|4019 4121
TCCATCGCCCTCCGCTGTTGAGGCGGCCGGGAAAGTTCCGTGGGGCTCACAAGTGTTAGGAAACCCTTAAC-----ATGTATTTGTTGTTATTCTATATCTAA
TGTAACGCCATGCGCTGCTCCTAGTGGCTGGTTACCTCCATGCGGCTCATAATCGTTAGAAAAGCATTAACTGTATTTCTATTTGTTGTTATTCTATATCCAA
>CG10084 19493314 19493916|21634 chr2L 19493428 19493512 scaffold_7 665193 665275 + 2782|0 86
AGTGCTGAGAATGAACGAACACTTTGCACACTTCAATTAAACGCTCTAAATATTACTAATATTTTACTGAACATA--AGTTATGAAT
AGAGCTAATAATCGATATACGTCTTAAA---TTAAAAGAAACGCTCTTAATATTACTAATATTT-ACGGAATATATAAGTTATAAAT
>CG10084 19493314 19493916|21635 chr2L 19493524 19495541 scaffold_7 665300 667436 + 71103|0 440
ACGAATGAGTTTAGCTAAGC--CTA-----AGTCCGAAAT-AACAACACTGAAACTACAACTTCAACAGCGAAATGCAACCAAACT----------------CCAAGGCTCGATGCGAAA-AAGCGCGAGACAAA-ACATTGGTTAAA-GATCGTGAACTA------CCTTTGTATTTACACATTTTTCACTCTATCCTTTTCTTATATACAAATATATATACGCGGATATATAATTGTTAAGATTTTATGTTGAGTTAAAACGATAAAACACTAAAAGAACAAAAAAATTGCAAAGAAAAAATCCCCAAAAACAAGCGCAATGAAAGTCAAAAAAAGAAAAAAATCGTAGCAACGTGAATGCAAAACAGCAAGTTATATAGAGAGATATAATAAATAAA----ATAGTTTCGTATTT-----------CAGGAGAAACAA
ACGACTGCAATTAGCTAAGCGCCTATATATAGTCCACAATTAACAAGAGCCGTA-TATAACATCAATAACAAACAACAACAAAATTAGAACAGAAACAACAACTACACAACTATGCGTTATAAATGCAAAACAAATGCATTGATTAAGCAATCTTATATTAGGTACTTCTTTGTATTTACATACTTTTCCCGCTATCCTT------------------------------------------------ATGTTCAGATAAAAC---AAAAAACAAAAAAAGCAAAAAATTACTAAACAAAAAAATGGTAAAAGCAA-----ATCAAAGTTAAAACAAAAAA-------CAGCAACGTGAATACAAAA--GCAAGTTATAGAGAGAG-TATAATAAATAAAGTAAATAGTTTCGTATTTGCTATTAATTTCACATAAAACAA
>Top3alpha 19498096 19498197|21637 chr2L 19497566 19498733 scaffold_7 670044 671332 + 2916|634 789
T---------------------------------CAAGCGAC-----------GTGGATATTGCCACAGAACGGATGTGGGAAGATGT-----ATTTGTATGTACATT----GTATAAAGTGAAAATAAAAAAGTTGTTTTTAT-GAAATAAAACC
TTATATTCAATTTAATTTTAAACATTTATTGGAGCAAGCAACAGATATCGGTTATGTATATAGCTGCATAGCGCAAAAAAATAGATATGTAACATACACACGCACAGTTAAGGTACACATTCTGTATATAAAATTTATGTGTGTCGTAAATTGATC
>CG10132 19521171 19521383|21646 chr2L 19518310 19524462 scaffold_7 2893194 2899442 + 229719|2900 3149
-----------------ATCAATTAACGCTAGTTATCATTATTCAAATTATAAATGAAGCATA---ACAGGGTGCTAGACCGAGGAAGGCAGAACTCTGAATTATTATAAATATGGCAAACAAA----TTTCTCATGCATAATTCATTAGATGTATGTAAAATTCTTTGAGCAAATCTTACCAAATGTACAAA--GCAAAGAAAAT--CCAAAGAACATTAAA---------AATTTAAAAATCTACCCA
TGGGGTCAGATACCTGGATCAATTAACATTAGATATCATTATTCAAATTA------AAACATACATATATGAAACAAATGAAAAGAAATTATAATTCCGAATGA-TATAAATATCACAAAAAAAGAATCTTCTCATGCATAATTCATTAGTTGTATGTAAAATTCTT----AAAAACTTACCACATGTACAAAAGGCTAAGCAAATAACCAAAAAATAACAAATACAAATTTCATTAAGTCATCTATGTA
>CG10137 19528600 19528921|21648 chr2L 19526601 19529838 scaffold_7 2900809 2903920 + 85176|2067 2427
AAAGCGTACACTTAATCGATCTATTGGCCTAGCGAATTAGCGAATTTATTAGAGCAACTATTCTAGTCAGGATACCTACTCAAGGAAGCTATCTAATTTCAGTCG-------CAGCAGCCGAACTCATTTAGTTAAACAACTAAACCAATTCGTT-TCTCACTCAGAGCACTTAAGTTAGTCACATTTTGTTAAGCCGATTAGTTAG----------ATCTATTATGTGCATTCTTT----------------TGTATTTTTTGTACGCAATGTGATTTGTTAA----ATGTAACGAGAATTTTTGAAACGTCCTTACAATAAATAAAGCCCATCCATA-CCGTTTTAAACATGAATTTGA
ACA-------------------AATATCCTAGGACA-----AAAGTCATC--AATAACCATCCT-----------CTCATTAGGGAATATTCACAACTTTGAGCGAGTTTATCACAAGCCAACGGCCATTAGCGTAAT--TTAAATCAATTTTTTATTACATACATTGCATTTA----GAGCAAATTTTGTTATGAGACCTGGTTAACACCAACATTACTTATGCTTTATATTTTGTTAAATTTATTTAAGTATATATGTTTTCTACGCAATGTGATTTGTTAACTTTACATAACACGAATTTCC-AAACGTCCTACATAAAAATAAAGCCAATCGACAGTAATTTTAAATATGAATTTAA
>CG31697 19531927 19532036|21651 chr2L 19532019 19532760 scaffold_7 2908587 2909261 + 12228|0 17
AATAGTGACCAAATGACA
AATATTAATTATATAAAT
>CG33116 19532395 19533294|21651 chr2L 19532019 19532760 scaffold_7 2908587 2909261 + 12228|379 760
GGCATCGGATTGCGCTATTTTGGATTAGTTGCGAGTTATTTTGCAAGTTTTTCTGTATATCAAGGAGGCTGTTTAGTTAAACAATTCTTGTGAGAT--TATGTATA-ATTTGTCTTAGTTAGAATATATCTAAAAAATTGACTTTATATTAGTGCTACAATAACATTG----GAGCCATTTCGGCACATTTCCAATGACTATTCACGTAATGCTCTCTTCCAATGATAATTTTT---------AAACTCGGTTTACGGTTAAATTCCCACTTGACGTTATCTGTAATCCGTATTGTATCCAAACTTCAAAGACCCCTTGTAGATCGATTGAATTTACGAGTAATCATGACAAGTGATCTAATCTGCTGCTAAGATATCCAAT
AGGATTAGGCTAAACGCATTTGGTCAAAT---------TTCTGGATGTGTTTCGAT-TATCCCGGAGGCTGTCGAAGCATGTGTGCGACGTGAGCTGCTACGTAAATATTTGTGCTACTTAACGCTTTCTCAACCAA--------ATGCTCGGGCAGCAAGGACCTTGAGTTAAACTATCTGGATATACTTGTAA-----ATCGACTTAGCTATTCCTTTTATTAATGTTTATTGGAAAACAAAAACTCGCTTATCCCAAAGTATTCCATCTTA---TATGTGTAATCGATA-----------------------ATTATCGATCGATTAATTGCAGCACTCTCCTTGAAACAGGTTTTGGCTTTCAACTGGGAGAACTATC
>CG33116 19532395 19533294|21652 chr2L 19532900 19533291 scaffold_7 2909378 2909788 + 2130|0 438
ATCCTTCTAATTAAAAACGCTCGCTTCCGCTGACCTTGAATAGCAATCAATGTTTTATATTCG--TCTAGAATAAT----TATCTCCA---TGCTTAATT--------TTATTTTGT-----TTCCATTGTACATTGT--TTGAAAT---GCTCCACAAACACGAATACACGAAA-------CGA------------ACTTTTCTAACTAA-ATAACCGCAAAGACCTCTAATTATTTAAACACATAAGCATATTCGTTACTTTTAAACTTAAACCGAAACCCAATGTCATTCAACTGTAATGTGACGTCGTCCATAGCGCCACTGCACGCTTTATTGTATGGAATCTATTCATGTACCCCCCAAACGGGCTACCCCCCGCCCCAGTACACATTGTGTTAAAGACAAGACAGTATACAAATAAAAAAAAAAAGTATTTT
AACAATCTAATTATTAAATTATTTATATGCCAGTGTTTTATATTCATTGTCGTATTACTTTCAATTCTAGTATAATGGCATAGCTTAAATGTGCTTAATTTATTTGTATTATTTTGTAATTGTTATAGTTTATATTGTGCTTAAAACAGAGGCCCACACA-AAAAATACAACAAATTCTAGCCGAATGCTGATCATGACATGTTTAATTAAGACAACCGCCAAGACCTCTAATTATTTTATCGCATA-----CTATGTAATTATTA---TTTAAACAAATAATTATGT-ATACTACT-TAATATGTGGTCGCTGTATACGCCACAA--------ACTGAATTAATTATGTT----TAACTGTAAATGTCGCTTCCCCCTTCCTGAA-----ACTGTGCAAAAGACAAGAAAACTTTTAAACATAATAATAAACTATATT
>CG13082 19535559 19535839|21654 chr2L 19534240 19535995 scaffold_7 2910519 2912370 + 38415|1430 1764
G--------------CGGAGGAGTGAG--AACGCCAGACTGCCAGCTTAAATGTTA-----------GTTTCATACATTGCACACTCTAGAATTAAGCCGACGAAATTGTCTTATTAATAAATACGAAAACATAATCGACATTGAGATTAAACTGCTCGTTAGTAGGAGCAAATATGGGAGATGATTTATTTGCGACTAACATTAAGCACCATTACATGGCTAATA-------ACTTTTTGTTAATAGTTAGCTTCA------------GATTGCAAATCACCTT----CTATGTAGATGCTCCAACGGCGGAAGTGGGCACTGGA----TCTAA
GACTGAGTTACTTTCCAGACTGCTAAGCAAAAGCGAATATATTAGGCTAAATATGACGATAAATGCGATTTTTTACAAAGCA----TTAGATTTAAGCTACAAACATATACACAATACAATAAACAAACAGAAAATTGAAATTCAAATTAAGCGCC----------AAGCGGTCATGTTAATTACTAATGTTAATGTTAACATTAACCATA--TACACAAATAATAAAAAAATACTTTAAATTCAAATTTAGCGCCAAGCGGTCATGTTAATTGCTAATGTTATTGATAACATTGAGTGTTTTTGTAGCCGGAAGCCAGTGTGAGAGAGTGCTAA
>ref(2)P 19541232 19541477|21655 chr2L 19536410 19541650 scaffold_7 2912816 2918180 + 29637|5385 5630
ATATTCATATTCAATATCGATATATCTACAATGTATCTTCAATATCTATAGAACCCAATGAAAAAGGGATTTTACTTTATCGTATCAGTTTACTACGTAGCTTAGTTTTTCTGTGGTGCTAGATTTATCTCGTAGCCAAAATAAATGTGAAAATAGATATATGTTATGTTTTAAATAATCAACAAAATGTTATCGTATATATATGTATGTGTGAAATTGCAATAAAGGCACAAAGTAAAATGATTT
----TTCCATTTAAAATTA-------------------TCAATTTTAATCAACGACAAGTTATAATTGTTTCGGGCTGAATTTGTCAGTTTTTT---TGGTTTA---TTTCTGGTGAATTGTTTTCATTTATTATACCAAACGAAAGTT-ACGCGGATATAT------------ATAATC----------TATAGTATATGTATGTATGTGTATATGTGT-ATGTGGCAACTAATCAAAAC-----
>TepIV 19552331 19552384|21670 chr2L 19550820 19552352 scaffold_6 5373169 5374769 + 3536|1707 1728
AGTATCCAAACCAAAAGGAATC
AAGGCCGAGA--AACGGGAATC
>TepIV 19552331 19552384|21671 chr2L 19552353 19552445 scaffold_7 2931624 2931728 + 224|0 33
ATTAATACTTTCT--ATCCTTACTTAAAATAAAA
ATTAATTGGATCTAAATGCATAAACGAATAAAAA
>CG13077 19563226 19563288|21688 chr2L 19562913 19563231 scaffold_7 2938974 2939292 + 17160|313 318
ATAGGA
TCAAGA
>Lar 19726092 19727491|21833 chr2L 19720013 19729296 scaffold_14 1561769 1571338 + 329693|6395 8099
GTGCATTTCTC------------------------AATGGGATTGCCAGGTCCACAGAGCTAAAATCTCATCGACCCTGCGTTC---------GTTGCATACTTATTTCGAACTCTACGCATAATACGCATTTACGATATACACGGATATCATAACTCTAAAGTATTATAGCCAGCTACTGCCCAC---ACTTACTTAATACACCTATA----CTTATATACGTGGATATGTTTAGTTGA-----TAAGCGCACCCCCGCCCGCAGGTTATGTTACCATTACGAT---------TCTTTGGGGGACTCGATCTTATATATTGCGTTCTATTTTATTGATAATGTAAACTAAAGAAGACTGTTACACGTTTAATTATCAAAACCTTATATATCAACCCACATGCACTTCTATGTACGAGTATGTGCAT---------------CAAGATTTGCTCG--CTAATGGAGAAGGATGTCAATCAACTTGTTGTTGTTC-GTGGTACTGCCGCCGGAGTGACCATGAATGAGGGGCGCCACTGG-AAACCGATACATATTTGAACTAAGGACTTGGTAGCTATT-AGTCTTACCGCCTAAATCGAATCTCGAACGGAAGCAAAGGGTCGAAAGTAGAAGCCATTTTAAGTA---AATCGAAAACTTCTGGCGATTTGGCGCAA-ACTCCAGACGCT----------ATTATAATATATAATACAATCAATCAAACACTGCTATG-TTAATCAGTTTTCATGCCTTGGTTA-----------------------------ATGGAAACCAGTATA-------AACG--------------GTCCGTGCAATTAGTCAAAAGTCTTGCATAGCGCATATTTTATAAGGCAGCTAGATT---------------CTAAAATTAGTTTTCAAACACAACTTACGTTTTGATCTCCCCGCAAAAGATGACGA----ACCT-------TATGGACTGATCGATGTCTTGGTAGCTAACAGACAGTTCAAATTTCAAAGACCATTATGATAGATCACATACGCAACTTCCAGCCAAGCAGCTATTTTAACTTCAACCTCATTCCCTCGACTTCTATTCAGTTCCCTAGTACATTCCTGTATATACCACAGTCGATACCCGAGCTAGCCACTTATGTATGTGTAATTTAGATTGAAAAGCTATGAAAAGTTATTGTACCTAAGGTGTATGAAGA------CATAGAGAAT-AACCGAGCGAACA-------GATTAGAATGATAACTGTAGATATGTACTGTAGCATA-TAATTTTTA----------CCATAAAATAGAGCGACACACGCGGTTATAAATAAACATAAACATAAAATCGAGACATTGGCAATAGTTCTTAAGGTACATAATAATGTATATAA----CTGATAAGCTGTTTTGCAAAACGTTTGAATTCGGCCTCGTAACTATACATAAATATATAAAGAGTTAGCAAGCAAATGCTTAAAAGCAAACACTA--------------AATTATTAGCTGAAACACATGTTAAACAACCATAGT----CATATGTAAACTAAATATTTATACG---------------------------------------------------------------------------------------------AAATAAAGGTATTTGTTATAACTA
AGGAGTTGAGCAGGAAAAGGAGGAGGAGGAGCAGAAGTTGGA--GTCCGGGCTACAGAGCAAAAACGTTGTCAACTTTAAGTTCATGTTAAATGTTGCATGTTCGTTTTCAACTGTACGCATAAAACGCATTTATGATATACACGGATACCTTAACTTTAAAGTATTATAGCCAGATACTGCCCACAATACTTACTT-ATAC-TCTATAGTATATTGTATACAACAATTTGTATAATTCAAATTTTAAGCAACCACTT-------AATTCTGTCCCTATTTTGATCAGTTACTCTTGTTTTACCCCTCAGTCT--TTTGCTACGTTTGTTTTCGT--ATAATGTAAACTCAAAAAGACTGTTACAAGTTTAATTATCAGTAATTTATACTTAAATGCATATATCCCTATATGTACATATGTATGCATATATATATGTGCATACAGTTTTTGCTCGAACTAAT---CAAAGTAGTCAATCAACTTGTTGTGGTGCGGCGGCGCCTCCATAAAAGCGACCAC------------CCACTGGTAAACCTATACATATTTGAACTAAGGACTTGGTAGCTTTTAAAACTTACCGCCTAAA-CGAATCTCGAG-AAAAGCATAAGTTAAAGTCAACTAGTTGTCAGAAGCATGGAGTTCAAATCCCC-----ATTTATCATAACATTCTAGACTATATGTGCATGCATTTGTGTGTGTACAACAATCAATCAAA------TATGTTTAATATGTTTTTATACTTGACATACTTAAAAAGTCCGCTTAGGCTCTATATATATAAAAGCAAATATATATATATAACGCAAAAGCAAATGTAAACCGTGCAATTAGTCAAAAGTCTTGCGTAGTGTATATCTTATAAGGCAGCTAGTTTTAATTAGTTTATAGATTAAGTTCAGTTATCAGGCATGTTTTATATTCTATTACATTCCCCAAATATGCTTACATCAGCTGTCCAGATATGTAAAACTCTAGGTCTTTGTACTTTA--------TTAAGT-----AAGTCATTTTATTCTACCAGCTTTCTCATTCCTGCCCAAGCA-TAATTCTAAGTTAACCATTTTTAATTTGTTTTATA-----------ATTACATTCCTGTATATACCACA----------AAGCC--CTACAGCTATACGAGTAAATAGGATCCTACAACTA--GAAAATTATGGTACCTAAAGTGTATGAAAAAGACAGCATAGATAATAAACCCAGCAGATAAAGAAACGAGTAATAAGATAACTGTAGATATGTATTGTAGAATACTAATACTTATATGTTACGTCTATACTATTATAAAAGGCACCCATTTATACCTATAAAGCTACACTACAATATGGCATTATGAACAT------AGAATTATTATAATGTACATACATATTTGATATGCAGTTCTATGGGGCGATAGTATT----------------------TATAAACGATGTTAGCAAGCAAATGCATAAAAGCAAATAATATTAAATTGAATAATAATTATTAGCCG-AACACATGTTAAACAACAATTGTAATACGTATGTACACTACAGATATTAACGCATTGTGCATAATGCATTATAGATATAAAACACATACACACACTGACAGACACACATATATACACACCCACACACCCACACACACACACACACACACATATGTATCTGTTATAACAA
>CG10447 19732653 19733022|21838 chr2L 19731404 19732837 scaffold_14 1573942 1575579 + 26478|1490 1677
CCCCTTTCTTACTTACCCTGTTAGTTAAGGTTCTTTTGACATTAAGGAAATATTTGTCTAATTCAAAGTGTTTTGTTTAATCCTAACAGTACACCTTGATTGACTATTTAAGTTAATATTATCATTACTATTCTTTCTGAT---TATTTAATTTTTTATTTTGTATATATGATATATGATTTTATTTT
CTATCTATTATGGGGGCTTATTATTTAAGTTTTTGGTACTCTTGCAGAGGCTATTATAATCTCGAAAGAATTGTACACATTTCCATTATTGTA--TTAATAACATAGCCATGTCCGTCTGAATGTTTCTATACAAACTAGTCTCTGTTTAAAGCTATCCCTTTGAAACTTTA-GTAGGGTCTTATTTT
>CG10463 19756843 19756915|21847 chr2L 19754835 19757031 scaffold_14 1593217 1595383 + 87507|2046 2127
---------GTTTCTTTCGTGTGTAAATTTGTATTTTTGAATTTATGCGTAGTCTGACATAATTAAATTTATAATTTAAATG
CGAAACGAAGAGGCCCTAAGAAACTAAGTTTAATTGTTAAA--GAATCAAAGTTTGGTATAGCTTGGATTTAGGCATAAAGT
>CG10466 19788679 19788775|21879 chr2L 19787005 19788721 scaffold_14 1630909 1632594 + 27694|1917 1959
TAAGATAAGGTTAGCTTAAACATAGCAAAGCATGCAAACAGAA
TAAAGCAGGAAAAAACCAAGCGCAGCAAGAGCTCCAAGGAGAA
>CG33316 19946432 19946550|22079 chr2L 19946265 19948828 scaffold_14 1835182 1838083 + 14152|171 343
CATTATTTCG--------------------------TCGGCGAGGCAGCAGAGGCAAG---------------------------TGTACAAATAATGGAG-CCGCAATCGCGATCTTTCACCAGCCACTGGGACAGAGTCTTCCATTCTTGAAAAAGCAAAAAAAAAAAAAA
CAAATTTGTGCAATGCCGCGAAATTGCAAAGCGCAATCGCTGAGAAACGAGAATTGAGAAGCTTTGCAGCTATACAGAGAAGTCTTGTGCAAATAATGGAAACTACAATCTTTGTCTTTCACCAGCCACTGT-CCAGAGT--TCGATCTCTGAGGCGGCTCAAGATCAAAGAC
>CG10664 19955817 19955994|22086 chr2L 19954856 19955931 scaffold_14 1846458 1847474 + 37288|980 1112
GTGCG--CTGTCGTTAAAT--AATTCCGCGATTGTGTGTGATT-------AAGTTAGCCGACGTCTATGTGTATTAAGT----AAAAGCAA---GATAGTCGAAATTAAAGTTATGGCTGCTGCCTAAATCAA
ACGCAGTCCGCCGTAGAATGCAATTCCATGTTGTAAAGTAATTAAGCGAAAAGTGAGGCGACGTCTATGT---TTAAGTGGCCACAAGCAAAATAATAGTTGAAATTAAAATAATGGCCGCTGCCAAACCCAA
>CG10664 19955817 19955994|22087 chr2L 19955932 19956113 scaffold_5 1767186 1767374 + -431|0 65
TCGATCTTGGGTCAGTCATCAGTTTCTGCTAGGAAACCAGCCTCAATGATCCGTT---TTAAGAGC
CCCA--------CAACCACCCACACCC--------ACCCACATTAATAACATGTTGAGCTTCGTAC
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AACTAATAAATAAGAATTCTTAATACTAGCTTGATTATAAGCAATCGTGTACAATAAATTAAAAATAATGTAAAAAGTCTACTTTCGCATTGCCGAATATT-AAATACTCTTGCCGA-ATATTAAATACTTGTAAGGCTCT
>CG10680 19961211 19961699|22090 chr2L 19960741 19962880 scaffold_14 1852168 1854227 + -5419|491 1082
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AAATAGAGTTTCCAGGAACTCAATTTTTCGAACCTTTCTAAAATTATTGAAATACTCAGAGTAAAAATAAATCGCAGATTAATACGTAGTTGATAGCCTAGCTGATAGGAATTATAAATCAGATCCGCATTTTTGAATACAACAACAAGGTCAAAATCCATAAATGATAATCGCGAATGAAACGTAAATAATAACATATATTTTGATTTAAGTACGTAGAATACTTAATTTACCGCAGGCATGAACTAAACATT--TTGTTTTGATGTCAATTATAAAAGTTCAGAAAATC--------CGACTAAGGCCGGAGAGC----------GAAATTCTTATTTTAAGACTTTTTGTATTATC----AAGAAATTCC------------CCAAAACAAGACTAGAATGCA-----TTGTTAAAGTATCGTGTAC--------------TTAAATTAGTTTCAAAAAATATTCATATATAA----TTGAAAATCATTCAAGAACAAAATAGAGACC-----------ATTTTAATAACCA------------TTAAAATAAAATATTAAATTTTTCTGTGTGTGGAAAGCAAACTAC
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ATACAAAAATGTTGCTAAAATCTGAAAAATGGAAATGAACAAAAGGACA-AAGCAAACTCACTGATAACAACAATTGGGCGGAAAAACCAACA---CACACACACAATACACACACACACACTAAATGGAACCTACTTATTTCAAACACTCAACTGAGGGACAGTTTTTGAAGGCATCTACGGTAAGCGCAGGGAGCTAAGGACACAGGCTAAAGAATACATACATATAAAC-CATATACTATATAAACATATATGCATAACCGAATACGCGTACACTTTAATTTTGTG---CAGCTATTTACTAAAGAGTACTAAACTCTATAGGAAATTTAGCC---CATGAACTTTAATAAGTTGCTGGCAAGTTATATACCAAAAAATTAATAAATTAAATTTTAAAAAAAAATATATATATATATATAAATATATATGGAAATATTTTAAATAATATTTTATTATTTGAATAATTTATTATTTTAACATTTAAATATTTTATCTAATGATAATCTAATACGTTTCATTATGATAGTGTTATAT-TTTGACAATTTCTAATATTTACTTATATATTTTTTGGTATTCTTTGAAACTTCTTCTAATTTGCTGTGTAGTTCGTTTTGACTAGCCTTATAGAAAGTTTCCCAGGCCACAATCCTAACAAGCTCAATTAAATTGCCTCTCTAACACGTCAATCGT-------AATACCAGAATAAATGTATATAACGACAAACGCAAAACAGTTTTTAAAATGTAGCGCAAATTTGTTATAATCAAAAAATTATAAAAAAAAAAAGAAAAAAGAAATAAGAAGAGAAATGAAGAAAAATATTGAAAAATATGTAAAAC-CGTATTATTTTGT-------TTAAATCTTAAGCGAACTCTA--TTAAAGTTATGATGAAAATGTTTAAAAAACATTTAAAGGCCCCCGAAAGGTGTATTACTGCAACAATTGTTATATTTCTGTGTGCTAAAAAGAAT-TATATACATTTATCTACTACTATATTAAATGAGTATATAAAATACTACATGCATACATATAAAATTATAAACAAAAATATTTGTCTACTAAATGTATTGAAATTTTATTGATGTACTTTTAACAAAACCAAAAACAAAAAAACCAAAAATCAAATAAAAAGAAAAAATATGCAAAAAAACAAAAAAAAAAAATAATAACAAGACAAATTCAACTTAAAACTGACCGTCGAATAACAGAACAAGTTTTGTATATTTTATTTACACCATCATTGAAAGTACGACACAACCTATTTAATTATAATTGTTTTACTAATGAAATGTCTTAATATAATCTATCATACTAATTAATATATTAGGGGTACTAGGAGTGCAGAGGCAAAGGCAAAGGCAAAGGCGACAATTTTCGGAAAATTGTCCAAACAGTTTCTCCACGCAGCAAGCGATATATTGTACGAGTAT-TAATTATATATGCATCTAACAAACTG-----TCATGAATGTAAATAATAT-GCAGAATGCTGAATACACGCAA-AATATTTTACCCGATATAAAAGATACATACTATATCCTACAAAATACAGTATAATAAATGGTGAAACTCTGTAGGGAGTGAACAAAAAAAACCAT
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------------------------TAATA---GAGAGCTGAA--GTGAAAAAGTTTTAATTTTCTGGAAAAATTAATCAA-AACATTTTTCCCCATTGCGCATAGAAGCCGCAAAGACAGCCCCACTTTACTTAAATGATTCCCCACTGAA---AAGCATTTTTTTTCCTGAGGTTGTTTAATTTTATATGTTGTTTAGTTTAAGTTT
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G----GACGATTGCGCCGGAATGGAGAGCTGGCAGAGAAGTGACCAAAGACCAAGC-----------GATAATATCGTACATGCTTTA---AAACCATACACAATTATTGTAAAATTGCGGCAACGTAATTGTAGCGCACACTTTTTATATAGTTGAAACAGTTTATTAGCCATAGATGTATTTATATTAAGCAAACGAATCGGATTCGCGGTTGTACCCAAAAGAGATAAGTCTGTTAACG------CCTTAAGATTCG---------GTGCACCTGAAC-------ACTTGG-GCCTAAAACAATAATAGTAGCGCCCTGCTTAGTCCATA-AATGAATGGGCGATTGCTCCGTG-------GAACTATTGTAGAAAGACAT--ATCTAAATGATGTTTATTGTTCCGTCTATCCCCTAAAATGAGTTTAATC-----------------------------AAAGTCTTCTAACCCGTTCTATGAGTATGAGTTACCATCAGACTGTGATATGTTATGAACTAATTCA--------TCCCATGACTTCCAG----------AACAAATGGTTCCTACGC-------------------TTTCCCAAAGAGACAAAAAA---------------------------TCGTATTAGGTTGTCAGTACCTGAATTTGTTAATTGTCTAATTTACGCAAACTAA--CCAACTAACACCTACACTTATTCTGGATTGGAAATC----------------TACTAGCATGTAGC--AGTAACCACAACTAA----------------AACACTAAACAAAGTAGAGATCGTTGCTCAAAGTATTATGCAATCCAAATCATTCAACCCGCTACCTTGCTGATTCCACAGATTCGAAAGATTGGCTCGTCTACTGCAGTCTGTACATGCAGGACTATGACTAT-GACTACAA-----GCACCGAAAGAACTAAGGCAAGAAATCGGGTGGAGAGCCTTCTCCAAACAGAGACATACAC-AGCG
GTTGCGACAAGCAAACC-AAATGCCATGACAGACCAAATGTGAAATGAAACCAAATTTAACAAATAAGACACTTACAGAAATGCTTTAGCTAGTTCGTA---AATTATCATGTATTTTTAG--ACCTTAGTGCGCAACACAATATTTAACTAGTTGTCAAATTGTATTAGTCA-AATTGT----------AGCTAATTCGTTTGATTGGTAACTGGA--------GGTTAAGGCTGTTAAAGTATTAATCCTAAGATTTGTTTGAACTAATGTACATTAACCTGTATTGCTTAGCATCTAGTATATGGAGCATAGTTATCTATATGGTATATATGGTATATCTGGTACTGCCCCACACATATCCCAAAGATCCTAAAAAGTCATTCAACTAACTGCT-----------TGTAAGTCCACTAATATGGTTGCAGTCAGGTGCGCAATGGCAACAGACTCGAAACAAAACTCGTTTTGCCCAATCT----GTATGAA-------CAGGCTGTGATATGTTAT--ACTGACTCATTATGCACTCCGGAGACTTCCAGCAAAAAAAAAGACAAATAAAATATATATAAATAATAAAAACCGTATATGAGTGAAGAAGAAAAAAAATAATTCGTTCCTACATTCTTAATTTCGTCGAAATGTTTTATGGGTACCTGAACTGTCTGACTGCCTTATATGAGTACGATAAACCCGATTGTTTTGTTCTCGAGTCTCGCAAAAAAAGTCTTTTTATGGCCATTGTTCCTTGACTGCAGCCACGTAGCCACTAATCAGCACATGCATAAGACTAGTACTAATCCACGTAGTTTTGTTTTTTGGACCAATTGCGAATT-----TCCCTAAACGCATACAATTGCTGATCCCACAGATTCGAAAGATTGGCACATCTACTGCAGCTTATACGTGCAGGATTACGACAACGGGCTAAGAGCTCTGCGCTGAAAGTCTTAATACTATTTA---------------GCTCTAAAATGCGCCATACACAAACG
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>neb 20085502 20085635|22212 chr2L 20085601 20087002 scaffold_7 4619347 4620699 + 42356|0 36
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ACATTTAAGTTCATTTATTGCGAACATTGCAGAAAAG
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GGGTACATTGT-----GTACACATAGTG
GTGTGTCATGTAAATCGTACAACAAAAA
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TTTATTATTTACGGTATG----TATTCAAATATCATATTGGTATCTAGAAACCAATTA----GGA
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ATCCCTGATCTTACGACACGCTT---TCCTTTAAACGGTGACTTCTGA
----ACACGCTTATAACATGCTGATACACGGCAAACGGTGACTTCTTA
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TCGTTTGTTTAAACCTGGCCTATTTTATGATATGCGAACAACTACCGCTAATGAATTATGAATTATGTTTTATGATTTTGT------------------TAACAAAATCAAATGTATTATATTTTGCCA---AACGCACTAAGAACAAATGGGAACCGACTTGATAATATATATATATATATATATATATATAAAGATGAAATATATATAGTTGGTTGGAGAGCAGTTGGTGTGGGCGCAGGCTGAAGAC----------AATTGATG-CCGGTTAAGGATATGCACACACACACGCACACACACACACACACAGACACAAAAACGAACACACACAACTGGAAGAAATAATCTCGAAATATTTGTAATAACAACAAATACACA---ACAAATTTAAAGAAGATAACTTTA
>spir 20334763 20335988|22395 chr2L 20332997 20334780 scaffold_18 2522939 2524587 - 73273|1835 1855
G---CGGGAATCAGATCAGAG
AACTCGTTAACCAGATTAAGG
>spir 20334763 20335988|22396 chr2L 20334781 20334986 scaffold_23 2045917 2046146 + -1320|0 233
ATAGGATAACTCCGCAGTGCGTTTGAAGACCGTAGGATGGTTGCAATGGAGTTCTAACGACTGACTTGGCTCTACATCGCTATACATACT--ACCATTGACTACATGACACTGATGA--TGACTCATTGACAGAC-AACAGACGCTATTTGATTACTGA-----------CCACATTCCTTACCTGTGAGAATTTTCAGTTTCAGCGCGGCTGTTTT------------AGGGC
ACGAGCTAATTGAACGGCGC-TCCTATGGCGAGATTTTGAATCCACTGCAAGCC--ATCACTGAGGTGAATCAACATTTCCAGCAGTACTCGGACATTGACGAAATCAAGGT-ATGAACCGAATCATTTATAATCAAATAGGGGCCAATTAATCACACACATTTTGTATTCCAGAATCTCTCTCAGAGTGTGGATAAAATTCAAGTAACGCTGGCTCAGCAAATAACAGAGGAT
>spir 20334763 20335988|22397 chr2L 20334987 20335361 scaffold_18 2524609 2525078 - 5658|0 483
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CTACATAACACATAT-TATATATAGCTAT-ATAAATATACACATGCATATTTTGGATGGACTGTTGTATACATAAGATGGAGAGGAAGACAAGCAGAGAGTTTGAGTTGAAGCCAGCGCCTGGATATCGTTGTAAATCGTTAGATCGTGTTAGCCTAGT-AATAAGTAAACAAGAATCCCTAGCAAAAACGGAAGGCAACGCTGTATATTTCTTCTTCCGACTA----GGAAATAGCTTGAGCGCGCACCCCACCATACACACACACACACACACACACACATACTCGTAGATACTCTACAGATACTACATAAACATATACATACATACATATATATATATATATACACATATAGATAAAGAAAATGGAAAACGTGCGATATGCGATACGATGACGTTGTTTGTAATTGTTTAATTTATGTATAAATGTTGATTAAGTC-------TCGTATAACTCGTATCTACATATGACAAATGCACAGAC
>spir 20334763 20335988|22398 chr2L 20335475 20337967 scaffold_18 2525233 2527888 - 56451|0 697
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CTATGTAAAATA-TAAAAGAAACCGAAAACGGATACC------------CACTGAAACAAAACCCGCCGCTGCTTTCAGCTTTAA-----ACTAAGAAATCCTCTTTTTGTTTTGGCAACCTAGGCAGCTGGTCAATACAGAGAGAATGTGTACCAAAAATAACTAAAAAAAAAAATTTATACAATTATTTAATTAACTAAAATGAACCTTAGTAGTTGCAAAAGCATATAATCCTATATATTTATTTGTGTATTTGTGAGTGACTTTGTGGACGACAATACGCCAACTGCATGTACAATTGTTGAGCAGCTG-TTCTAGC-TACTAT------ATCTAACCAG---------------TTAAGAGATTCGCTTGTTTATTA----------------------------------TTTAGGCAATGCAATTTATAAACAATACATATTTA-TTATATATAAT---------GATCTTTCGACGATTTTTAGCTCCTACATTTATTCATAATTTTGTAATCGTTTA-----------AGATCTTGGTGTGTGTGAACTGTATGTCCATCGGA--------AGTTTGTCTATTTGATT---------CTGTACAAGTATTGAAATTTGATAAAT--AGGTATAAGAAAAAACAAA-------------------------------GAAAAAAAACAAGAACAAAACTCTGAAAATGTGCCAATGTTTTAGTATTTCAACTAAAACAGAACGTAAATCAACGCTC--AATGTTGTATTTATTGTGTA----------GTAAATTCAATTA--AAACGTGTATACAAAATAAAAAGAAA
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TGCGCTCAGTATAATTAGTTGTTTTTATATATAAAAATATAAAAATAAAATTGTGTATTAAAAACAAACAAAAAAAAAAAAGAAAGTAAAACAAGAGAAAAACCGCAGAATTTTGGCTAATGTTTCCACAACTAAATGGTGAAAATA----AACCCAAACCGTAAATGAAAGTAAGAGAAAGTATTCCAAA---------ATAGCTAAATCTAAGAACCGGAGCAAGTTAATGAACAATGATAAAAAAAAACTAAAAATATAAATAGTTATGCGTTATT---TAAATTGTATGTGACTGTGTGTGTTTGTCGAGTCAGAAACAGAGAATATGTGAAACAGAATCAGCGT----GAAAATTTGTTACAGTCAGCGCCAAAAGTCAGCG-TACACATTATGTATATCAAAACTAAAGAATTGTCA----AAATGAAACATTTTAAACTAATTGCCTAATAAATCTAAGTGAA-AAAACGAATGTCGCAAACAATACAAACAATCTGTTAATGTCGCAATTGTCGAAATGCTGCCCAAAATCAGACAACCCAACTAGCCTGTATGTGTAGAGTATTAAAAAGAAAAAACAAAATCAAAAACAAA----AACTACTTAAAGAACTTTGATACATTAAT--AAATCCAAAAAAATGAACTAATTGCAATCCAAAAGCGAAAATATAAGATAAAAAGA
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ATCCCCACAAATCTGACTCAGATTCAGATTTAGATAGCGATTCAGATT
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CAGTGGATCCGAAAGT
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--AAATGTACACCTG----ACACATTTATGTTAG---TTGTGAATTATATTGAAAATTATTTTATTAATGCGTTGAGCAATGATGATGTGCTTTAAATCAAGGCTATGAACAAAAACGGTTCGAACCGGGAATTCCCATTTTTATTGTACTTTTAGAGA----AATCTTGAACCGAACCATT
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ATATTTTCGGATTTTCCGAATGCAAA--AACTATTGTGATCTTGAAGGATTCATGCCCAAATTTGAAGTACTTTTATTAGTTAACATTAAATTGCAGCGGTTGAATTA-TTTGAAATTCTTGTGATAACCAAATGATACATTGTTAAATAAATAACTCGGTCGATTTC-TCTTTATACTTT
-----TTCGGGCGATTCCACTGACAAGCAACACCTGCCCGATGATAGAATGCCAGCCATGAACAAGCACACCGATACCGTTGAGCACC-TGCTGCAGCAGTCGAAATGCTTTGAAA---ATGTTAAAGAAAAGTAGCGCGT---------ACCAAATCGGTCACTTTCAGTTTTTTAGTCC
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GTTTTGTTG---ATTCAGA-TTAGTCACATGAAAGGTC--TCTGACTGCCATGTAAA-----------TCATAAGTA-------ATAAGCAATTTCATTTGTTGGCCAATTAAGATCCGAAAGTTGTACATGTTTTAAGCAAGTTAT-GTGTCCGTAGCAGAGTCCGAATCGCAATATCTATTTATATAATAAA-------------------AACCTAAAAAAAAAAA
GTTTTGTTAGTTATTCACAGTTAATCTGATGAGAAGTCAGTTTAAATGTTGGGCATACACGAATATGTTCACAAATATGTATCTGAAAGCAATTTAAATTGTTAGCCAGTTAAGA-ACATTAGCTGCGGATTTTTTAAAAAAGAAGTTATATCAACTGCAGTGTCCAATTAGCAATTTCTATTTATATAATAAAACATAAAATGTTAGTCAATAGCAACAAAACAAAAG
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AAAGGAGAAACCAAAGACAC--CAAATGTTTCGTCAAATAGAGTTTATTGCTTTTACACTACAGTTATTCACACATTTCATTGGCATAATTTCTTTAGCAACAATCTTAATATGTAGTTCATTATGATACATGTGTATTGCCCCGGTAATTGTATAAAAATATTTTTTAAACACGAG
AAAGGTGGCTCCGGAAACTCTGCAAATGT---------------------------------ACTTATTAAC-----------------------------TATTTTTAAAAAGTTGCCGTCAAAACTGCGCATTTATTT--------ATTGTATAAAAATATTGT--AAATACATA
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TCTTTAACGTAGAACAATTAGCAAAGACAATTTACGTTTTGTAAATAAATGTTAATTGTATTTAGTTATAAATAAAGACTAAACTATTAACTAATT--GTATGTAGAAATTGC--TAAG---AATAACAAACTAAATGTGTGGCAACAA
AAATTAATTTTG------TAGTGA------------TTTTATAAATAAATGTTATCTGCTTTTACTT-TAAATAAACGTACGATTTATAATTATTTCAATATGTAATGGCTGTAATAAGGCTAATAACAAACTAA---TACAGCGACAA
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AC----GGGCATATCATGAAAGTGCAAGAATATT----TTATTTGCCTT--------------TACTTTGTAAGTTAACAATAAATGTTT--ACTTTTTTATATCTGAATTTGTAAAGCAACTACATATATTCCTATTGAAACTTGGCTGAATATCGTGAAAGAGTAAGATTTCTGTAGGTCATTAAATTATTTATTTTATCATGCTG-AAATAAAAT
CCTTAGGGGCACA-----AAATTCTACACTTATTATTATTATTTGTACTATATCTTAAATAAATATTTTGTATAAAAACAAAAAGTCTTTAAATCTTGTTACATATCAA---ACAATACCCTTCCA---GTTGCTTTTTAAATCAAACGTAA-ATTGAAATCGAATGTGAT-----TAATCGATTCCGATATCTGGTTTAGCATGCTGCCGATAAAAT
>ik2 20666365 20666901|22770 chr2L 20666696 20667040 scaffold_41 30611 30966 + 7711|0 218
ACATTCTCTAAACAAGTTTACTTTTGACGAAACTGATGATGATGACTCTTGCGAATGTTG--GCTCCGTTGTG----TTGCTGTCGCTGGGAATG-------TGATCTTGTGGGTCCATGTTCGCCGGCATCGGCCCGGCGCAAAACTTCGGCGTAGGATAAGTCTAACTTTTTAAGTTTATGTAAGTCTTGCGATACCGTGTTATGATAAAACTCGAC
AAATTATACAAATACAGATAATTATACATAAGCT--TAGCGACGATTGTTCTGACTTTTGTTGTTCCAGCGTGACTGTTGCATTCGTTGCACACGCATCGGCTGACTTTG-------ATGCTCGCATGCATCAGCACGGCGCAATACTTCGGCGTAAGAGAGATCGAGCCGTTTGAGCTTGTGGAATTCTTGGGACACCGTATTTGGGTGAAATTCAAC
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TATATAAGACTGCCAATTGGAATTTAACT-------TATAAGTAATTATGATTCTCAGAAGTTAACCAAATGTCTTTGGTTAAGACAC---TTGTAATAGAA-----------AAAACAAATAATCTTTACAAAGCAGAACAGACAAAACATTTTAATGCAGCTTTCAATTCCCAGACACCTAAAATA
-----ATGACTATT--------TTTAACTGTATGTGTATATATTATAATTATTTGTATATTTTATGTAAGTCCATTTAAGCATAAAACGTTTTGTAATAAAATAAAATTTACGAAAACAATTGTGTCTTATCGAACTCA--AAACGAAACGTTT-------GCGACAACTGCTTGAAGACTTTGAAGA
>CG2617 20670867 20671225|22773 chr2L 20671034 20671877 scaffold_18 1842382 1843198 - 1777|0 191
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TCAAG--AAAAAAGTTAAACAGTTTTAT--------TTGAAATCAGTGATAGTATACA-----TTGTGAATATATATATG-------------ATTTT---TAGAACTAAATTGCTCAAAAGTCATATAGAAAAATAGAATAGGTTT--------------------ATGCTTAATTCTTTATTAAATCGAA
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GCC-ACCTGCTAGAGGTTAATGTTTCTTCGCTTCCCACCAGACCCTCAAGATTGTGTGTAATGCAGTGAAAGTG
TTTGGTCTTTTAGTTGTTAATATGTTCCC------------ACCCCCAA---TGTATGT-ACGCAGCCAAACTG
>Fs(2)Ket 20726785 20727372|22824 chr2L 20726740 20727041 scaffold_18 1897778 1898060 - 4909|57 318
TCCAGTCCGAATTCTCTGATTAAAAGAATCTATCTGCTAA---GTTTGTCCGATCTATTGTTGCTGTGCAACTTCTAAATGCTAAGACCA-CTTGTTTATAAAACTCCCTACCCACTAGCTGTAAGTTCAATTCGATCCACTGTTTCGACT-CAATATTTTAATTAAGGTCTGTTAATATTCGTGTGAGTTTAATTATCCCTTACCTATGCCTATTGTCCTCGATCCGTAATGCAAATCCCAAAACGAACTACCCATTGACT
TCCAGTCCGAATTCG--AATTCGAAAATTCTATCTGCAAGTTTGTTTGTCCGATTTATTGTTGCTGTGCGACGCCTAAAGTTTAAGACAATTTTGTTTGTAAA-----------TTTAATTATAAGCCAAATC-------CTGCTATGATTACGATATTTATATTG--------TTATTTTTGTGTGAGACCATTAGTAAATTCGATATTTC------CTAAGAAGCGTTATCAAAGTCCCATTACCAATTA--CATAGACT
>Fs(2)Ket 20726785 20727372|22825 chr2L 20727118 20727814 scaffold_18 1898130 1899035 - -452|0 292
CAACCAGCGCTTTGTTAACCCGATTTTAAGCATT----ACCAAAAACCAAACGTTGCTGTTACTCAAATTATGTAAAATTCACAATTACTTATAAAAATCGGTAGAAAATAATTGATTTGATAAGAACAAATACATTGAATGCATTGCTGCCCCCTTTGGAAACATTAACTT-GTAGCGGATTTAAGAGCCAC-----ACTTTAGGATCTAAGAACTCATGTATCTACCCTACTAGCTCACTAGCGCAACA----------------------------AAAAAAAAATATAA
CAAACAG---------AACCCGATTTTATACATTGAAAAACAAAAAAAAAAAA------------AACTTAAAGAAACAAAACTACAAACGAAAAAGAACAACAAAAAACAAGAGTGCAAACAAGAAAAGTTATTCAAAATAATGTCCAAGTCTCTATTGAGTTGTTAATGTAAGAACAAAATCGGTAACAATATATAATTATATAACATAAAAACCAATACACCTAAA--ACTAACTAAAATACATAGCAATATTGGATAAAATTGTCTTATGGCTGCAAACATACATTTAT
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A--AGTTGC----------------------------ATTTACTGATTTTGTTAT-TGCATCACTAGTTTACACCTATAATTTATTATTACGCTATAC-------------------AATGTTTTGC-TAACAATAAACTACAACA--------CCAA
GTTAGCTGCTGACAGCTAATACTCCTTGTCATCCTTAATTTATATACTTTTTGATATACATTAA-AATGTACACATATATTTTGGTATCAATTTGAACTGAACTACTTCGATTTGTGAATGTTTAACATAAATTTAATCGATAACATAATAAACCCAT
>dia 20754184 20755116|22837 chr2L 20752874 20754393 scaffold_831 534 2033 + 77054|1325 1543
AA---GTAATGGAACGAGCAATTCCCCTCTGTACATATATAAATAGATATCTGTAGCGATA--TAAGGGCCTGGGCTCATTAGCCGTGAGTCCGTGTGCGTCGCCTTGCTTGCATATCAAC--TCAATTGGCGTGTCCAAGAGATTTGACGAATTGGATGCCCAGCAGGAAGGACTGTATC--AAGAGCCGCAAAGTACTAATTAACTGGAACTAGAGT
TATGGGCATTTGATTAAACGG-----CCGTGTATATATATATATAAATAGACGTATAGACAACTAAGTGCTTAG---------------------ATCTGTAGCCTTGTTT--ATATCAGCCACAAACTGGAG---CTAAGTGAAGCTATTCAAAGATCGCCAGACAGCA---ACTAAATTGGAACAGCCGCAAAATACTAGATAAATCGGTCTATAAT
>dia 20754184 20755116|22838 chr2L 20754486 20754748 scaffold_45 196970 197240 + -993|0 276
TTAATTGATTGTTTAATAAATAACATTTTGTTTAGAATTTATA---ATATGCAAATA-ACACATACAAGATCACTTTTATTTAATTAAAATGATTGGCAGGCCT-TTTAATTTCAGCTGTACATTTTATTTTACTGCTATGACTGTCCCAATAT---------TAAAGTACCAATTTTACAAGTCGAATATACTATAAAAAAACTTCTAGTTGAAACTAAATTCATGTCAAGAAATTAGCAATGCATATCGATGAAAACTCCAACTTCGCTACCTAT
TTAATTAATTAAATTACAAATTACAGCTACAGCAAGCTCTACATGAATATACATATACATATATATAAATATATATATATGTATATATATGTATTAATATATATATTTTGTTGCTGCTTTATATACT-TATTGTTGGTTTGCCTTTAATTATATATTTATATTTAATTTACATTTTATGCAGTTTTTATTTTGTGTGTGTGTGTGTTTTTTTTAATTTAACATTTTGTTTTGCGCTT-----TTTATTTTAATATTAATTTAGCCTAAGTTATTTGT
>dia 20754184 20755116|22839 chr2L 20754749 20755094 scaffold_831 2092 2413 + 4381|0 354
ACGAAAAAACTAAATATATAGATATTTTTGATACGCTTTTACTTCTGAAATTATGTCGTTGTAAGTCTAAATACTTAAAAATGAAACTGAAAGCAACTTTAAGATTTATCTGTATCTTGTGGTCTTTACATACTGTATTCCTA------TTTTACTGTGGCATGTTCCAATCATTTTGCTGTGCACTTCGTTTTCGAGGCACTCAGTAGAGCAGAGGCGAGATTTATATCAAAGCAAAATTCCTTTTGTATTTAATTTGTTTTTAAG-CGAAACTTTTTTGAACTTGTTTACCTTAAAATCCTATTTTAATCCGCGCTATACATAACA--TTGTTAATAAATGTCTATTTTTCGA
ATGCAGCAGCGATAAATACATATATTTTTGATACGCTTTT--TTGAGCAACATTTTCG----------AAACATTTGTTCATTTGG-TCAAGACACCATT----TTTGTTCACACGCTTTTGGCTCTATTGATTCCTTTTTTAAATAGATTTTATTGTTGTTTAT--CATGTGAATTGTTGTGCACTTCGTTTTCGGGGCACC------AGAACAAACGATCTTAACATTATGG---AATTCCTCTTGTATTTAATTTGATCCCAAGACGCATTCTTCTTTGACTATTCTATTTTAA---CTCGTTTATCTGCCTGCTAAATTTAACAGCTGGTTAAT--ATGTCTATCTATCTA
>cad 20769874 20770735|22860 chr2L 20769374 20770053 scaffold_6916 752 1371 - 31757|506 685
CACGACCATTCCTGTTATGCGGCGAGCGGCGACAGTAACAACTACATGGAGCCCCATCATCCGCTGCTGGGTGGTAGCGAGCGGGGTGGAGTAGGAGGCGTAGGAGGCGTAGGAGGAGGAGGCGGACAACCGTGCGATGTGTCCTTCAGTGCTCCCGCTCTCGCCTTGGACTTGGCTTAA
CATGATTAT------------GCAGGCGCCG---------------TTGAGCC---------------GAATAGCTATGAAAGCAGCGGGGGAGGCAGCGGGGGAGGCAGCGGGGGCGGCAGC-TATGGCTATGCAGCGTGTC--------CACGTGATCTGGCCGTGGATTTGGCTTAA
>cad 20769874 20770735|22861 chr2L 20770128 20770898 scaffold_6 2058198 2059169 + 3053|0 813
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GCCGTCGTCGACCTTTGAATATTGCACGTTGTTAATTTTTGTGATTGTATATTCACGGCGTTCGTGGCACGCCTCCTGGCTGGCCACGCCCACAGCGGCACAAATTTCATTGCATAACTTTGTGGCCCAATTGTATGTAATATGTTTTTATTTTTTTTTTCTTGGTTTTTTGTTCTAGTTAATGTTTAAAATGTAAGCGCAAGATTTGATTAGTTAGCATCGAGACACACACACACACACACACACGCACACACATATATATATATATAAAGTATTGCAGAAACAAATCCATCAGAAAAGAAAAAAAAAACATTTAAATTAATATTTAAACAATATGTTAAGCCGTCCCGCTTGTCTTATTGCTTTTAAACAAAAACACAAACTATATTATAATTTAGTTAATATTGAGAAAGTTTTTAATATTTTGGTGCAATTTGATTACACA-CACACACACACACACACACATGTAAATATGTAACAGAACACAAGTTTTAACGTTTATTACTTAAATGCG--GTAATAACAATTAGT--TAGTTACTAGACTAAATTGAATTTAATGTTAATAACAGCAAAAAGCAACAGCACAAAGCACAAACACACACACACACACACACACACACACATACATATTTTGTGCACAACAAATTAAATATATAATCTAAGTA-ATTATTGCATATCAACATTTGTGGCACACGTGCTTGTAATTTAATGTTTAGTTAATTAATTTATGTA-----AAATCCATGT-----GCTATTTGAATTAAACAAAAATAAAATTTAAAAGAAAAACAAACAACAAACAAAATGA
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GTCCCTGCAAATGAAGTTGCTAAATGCCTGGCATT-CAGCCTT----TAAACTCTAAGACACTCTTAAGATCAGCAAATAAAATATATTTTGGTGCGACCAGCTAGAGGTAAACAAAATTCACCATTTCTTTGAGCCAAATTTATTCGTATTTCGTTTGTTTAACTCCACATCAATACATTTAACTAGTTCGT---TAAACTTACACATTTTATTCAAACAAATCTAAAAACTACACGAAAATATTGGCAGAAGGTTGTTGTACTGAGGAGATTCGTTAAAATAATAAACTGAAGAGATATGCGTTGACATCATTCATTATTTGTAAAAATAAAACAAGAGATGGTAAAATGGACGAATTCGTTTCGTAAAATTAGGCTTATACTTAAGGAAAACTGAATTGTAAACGGAGGGCGCATTTCAACTTATACAAACATTGCATATATACATGATTTATATTTAAAGAGGAAAATGACAGTAATTGAGATAAACATAGTTAATAAAACGCATTACATTCCTCAAGCAAAACACGTCTAATCAACA--------ATAAATATTGAAATCGCTAGCGTTTTAA
AT-----------AGATCTATAACTTTTTTACATTACCATCTTATAATAAAAACTGTAACAGCCCTTGCTTCACAAAGTGGAATCTG------------CAGCGCGAA----------------ACTTCTTTGAGCCAAATGCACACAT---TTATTTGT---------CATCAA--CATTTTGCTAATTATCGCACAAACTTAGACATTTTACTCAAACATA------------------------------------------------ACGTATTTCAACTAAAAACTATAAAGA-ATATATTGGCAGAGTT-------------------------------------------TTGGTTTC-TAAAATTATACGTA--------GAAGAATCGGTTGTACTCGAGAGATTCATT--AAATTATATACGTAATGCATACAAAAAAAAT--------AAAGAGCAAAAAGTT-GCCTTTAAAAAAGGCATGG-----AAAAC------CGTTTTT-----AAAAAATATATAATTAAAATAGGGAGCATACAAATTAAAAAC---AGC-TTGCAA
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GG
AA
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CTGTAATCCTCAGCCTATTTAATGTTTAGTTTTAGTAAGAGACCTAACCAAA-TTATGTGTAAGGAAACCATGTGTTTTA----TATGTTAACTTTGTGAGCGGTTTTCATTTTGATATTATGCAAAACTAGAGTTGAT-------TATTATAATTAAAAAT-----GTACACCTAGACTAAGCCATTTACTTGTTTAGTTTGTTAGTCCTTATCTCTAATCTAAGTTGAAGCT-----------TTCTTGCGCTAAATTCGTTGTGTATA-AACCAAGTGTATAAAGTTTTAGTTTCTAAAAGGACCCCATTTCTTCCGAAAACA-----ACAAAAAAGAAAA
CTGTAATCTTT-GAAAATCTAATCTTTAGTTGT-------GACCCAACCAAATTTCTGTTTAATTAACTCGAAAGTTTTATGTGTGTGTTAACCATCAAATAGTTCTTTTTATTTAACTCGAAGAACGTTAAGGTTAATATTTTGATATTGATATTATTAATTGATAGTTCATAAGCACTAAGTTGATGTCTAGTTTA-TCTTTTGTTCTATGTTAATGACGAAAGTTTATGATAATTATTATTATTATTATGATTTCTGCTGTGCGTGTATAAAAAAATGTATAAAGTTTTAGTTGTTTAAAGCATTTC--TTCTTCCAAAAAAGATCTTACGAATTGGCTGA
>CG9331 20815209 20815339|22911 chr2L 20815084 20815216 scaffold_30 674883 675015 - 8222|125 132
TAAATTCA
GAAAAGCA
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------GAA--CATGCAAA-ATTTGAATGGAAGAAACTTTACCTGT
ACTGAGGAACCCAGGCAAATATTAAAACAATATATATATTAGTTGT
>CG31676 20836377 20836775|22932 chr2L 20836052 20836381 scaffold_30 693422 693754 - 10821|339 343
GCCAA
GTTAA
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GCTCTCGTAACCCACGTTAAGTATACATTTTGCCAGGCAAATCAAGAGTAATTGTCTCACATCACTGCGCTTGACATTG----------------------CATTTGATTTGAGGAGCGTTCGTT----------TGCCTTCTTCATGCTGTGGTGCTGTTTGTATCCTCATTTATGGTCTGCAAGCGGAAATGAGTTCAGTCTTT----------CATTCAATTGGCGGAATTCGTTAATTGGCAACCACGCAAATTCAAAATATTCGCAAAACTCCCTTTTTGCGAATCGCAATGACGTTTGACCC-CGTCAATTGAGCGTAGGATTTG
GCCCACGTAACCT---TAAATTTTTTAATTTCAAAAGCAAATCAAAAATAATTGTCTCACATCATTGCGCTTGACATTGTGCAAGCTACAAAGATAAAATCTACACAATTGGATGAGC---CGTTGAGTTCCCGATGCGTCATTCAAATTGTGGTTCGG----------CAGTCGCAGC---AGAACGGAAATGAGTTCAGTTCTGAGACTGCCCACATTTAAGAATTGTCTCTGAGTAATTGCCGACCACGCA-----AAAATGTCAG------TGCCT-----------GCGCTGACATTTGACCCAAGTCAATTGAGTCTTTGATTTG
>CG14402 20837810 20838581|22935 chr2L 20838517 20839146 scaffold_30 696309 697130 - 10833|0 77
AAATAAATATATAAAAT---GGGTGGCAGCTAGGC----------TTTTGGCCATTTAAACTTGTCGCACGGCTTTT-
AAATAAATATAAAAAATAATGGGTGGTAACTATGCCAGAAAAACGTTTTGGCCATTTAAAGTTGTCGCACGGCTTTTC
>CG9335 20844229 20844706|22941 chr2L 20843449 20844666 scaffold_30 715883 717140 - 24909|870 1328
GCAAAAGATCCCCAGGTCGATTTTC------AGTTGGAACGTGATATTTTGCCTGGCTCTCGGGCCGA--GCTGTTGCTGATTTACATTTGCGTTTAGCTCGAATTAACTTAGTTTCGGGGACACTTGCCCCCCACTCATTAGCTTACATTCAAATGGAAGTTTAGGGTTCGATTATAGGTTTATAGTTTGCCTGGCCGAGTGCCGATGTTTGCCAAGCTCAAAGCTCA-------AATTCCGAATGAAATCCAATTCAAACATTTACCAAACAACACAA---TACCATAACGAAAG---AAATTATAAATAGATGAAACAATAATCAGTAGAGATTAAACCCCCAAGCACAGTAAATACTCACTTATTAGTCTATGTACAACATGATATTTTAATGTAAAGAACACAAGCCCTCACCTATGTAATTATCTCAGAAGCTAGACAAACAGAAACACACAC
GCGGCAGTCGCTTCAATCGTATCTCTATTTTAGTTGGAACGTGATATTTTGTTTAGCCCCAAATGCTAAGGCATTTGCTGATTAACTTTAATAATTTTC-----TTAGTTTAGTTTTAGATGTATT--------ATTCCTTTGAAGTCCTTTTATGTTAAGCCTGTATTCTAATTTATTATTTATAG-----------------AGATATTTTCTAA-TTCATAATTTGCCTTAATAATTTTAAATAAAA--CAATAAATGGATAAACAAATTAGTACTAGCTTAGCTTAATAGGAGTATTAACTACAACCACAACAAGCCACGCTCTATAATAGATATACCCATAA--ATAATAATAATAAAACTATGAAACAATATTTTAAATG----TACAAGTCAAACACCGCATGCATTCTCAAATGTATTTATCAC---AGTTATATAAGCCGAAAAAAACAC
>CG9336 20848484 20848610|22949 chr2L 20848222 20848647 scaffold_30 721587 721985 - 14289|263 390
ATCTTAACTAGCTAGTAAATTACCTGTGCGTAGTATTTAACGATCTTGTTCTCTGGAAAT-TTCTTCTAAATTTGTTTTAATAATAAATGCACGACGAATGGTTGTCATAGCAACATGCCAAACTATA
ATCT-------CTAGTATTTGGCTT-----TAGTTCTTAATT-TTTGGTTGTATTTAAGTATTTTTCTGTATCAACTGCAATTTTGAGTTTGC--CCCATAGTTGTAAAATAATCTCGTTTAAATTTG
>CG9338 20854738 20854904|22962 chr2L 20854253 20854936 scaffold_30 727847 728594 - 10009|534 747
ACG----AGGAG----CAGTTTGTAGTACCGCTGAGCTATCCCAAAC---ATATCGAACTTG-CTGTTGGGAAGCCAGACCCATGGAGCTGCTTTAGTCACCTTTGAATCTCTTGTAATTGTTACACC--------------CTTTTAAACTG------------TTTTCGCCCACATTAAATGTCGCTTTATTTATGTG---------AAGAT
ATATAACTGGAGCATTCAGCTTCCAATCCCGA------ATCGGAAACTTAACATTCAACATGTCTCTTATGTA-------TCATGAAATTTTGTATATCATTATTGAAATTTTAA-----GTTAAATCACAAAAGGAAACGTATTTTAAAGTGAATTAAAACAGCTTTTATACCAAATTAAATTTCAGTTTTTTTTTATGAATTAAACAAAAGT
>CG31675 20856931 20857243|22964 chr2L 20855930 20857281 scaffold_30 730702 732192 - 10715|1163 1505
GGCGACAGGAGACGAAGTGGAAATGTGGAAATGTGGAGCGTGAAATGAACATTAAAAGGCACAGTAGCTTAAGTAAACCTAGTTCAATTTAGATGTATTCCCAAGGCCCAG------GACTA-----------TCAATTAGTAAAGCCCACATTAGTAGAGCACACCATCCACAAAACCGTTTAGCCAAATCTGCCCGGCCCACTGTATTAATGGCTAATCAACGCCGAACATGGCGTATGAGCAA--------CATCAGCACACCGAAATGAGCCGAAAAGCTGGCAAACAAATTTCGAACG-----ATCCAAATACAAACTAATAAAAACTAATTTTACAC
GGCTGCAGG-------GTGGCCAACGGGACGTATGAGGCATGTTTAAGGCATTAG-----ACATAAGTTGTTGTTGTTCTTAGTTTGTTGTTATATATGGCCATGGCCAAGAAAGCCGAGTAAGCGCCAAAGGCCAGCTAATAAAATCGAAATTATTATAGAATAAAGC---GAAAATTGTTT------ATTTGTGC-GCGCAATGAACTCTCGGGGCAGAGGCGTC-----TGGGGCATGAACAAGGGCGCGCCGCCCACACACACACACACACACACACACACACACACATAGCATACACACACTCATGCAGGCACACAC-AATAGCGACGTGTATTTTGC
>betaInt-nu 21044799 21045637|23176 chr2L 21043379 21045511 scaffold_30 925905 927965 - 44976|1426 2238
CATGAAAAATGTTTTTTTTTTAAGATATTAGATTGTACTTTGACTTAAAATTTTCTTCAAAATTTGTGTA-TACCCGTTACT--CGTAGAGTGAAATTATACACTAGATTCGCGTTGAAAAGTATGTAACCGGTAGAAGTAAGCGTTTCCGTTCATATTTTAGTTTTAGTTTATTTTCTTGATCACAATACATAGCCG----------------AATTGATCTGGCC-------TTGTCTGTCCGTCCGTCCGTTTGTTTTTTTTTTTTTCTAATTTTGTTCCCATTTTCTGTCGGTATTCCAAAAAATCTCTC-----CTTCGCATTTTTACTTGATGAGTAATGGATAGCTGATATTC-----------GGTTAACTCGACTATAGCAT---TCTCTCTTGTTTTTAAGCTATTGTAACTCAAGAATTACGAGTTCACGAAGACATTAATACAAATATAAATTTTAGGTGTTTATTAAAAAGTA-----TTAGCCCCGTTCAGAAATAACATTCCAATTC--CAAGACTGGTCACAACAATAGCACTAT----------------TAAGATCAATAATT----------TTATATAATATATTTAGAACATAAATTTGTTTTTTATACATAGA-------AATTATATGAATTAGTTCAAAAACTCGTGTATATCTACGCTAAATGAGCTAAAATTTATTACAGCTAAAAAACGAGTAAACGTATAACAAAGTTAGCTTTCAGTTTTCGTATTGGACAGCTCCTTTCAGC---------------GATTGTATTCATATAAGTACAAAAAT
--------------------------------------------TTGCAAGTCTCGCCAAATTACATGTATTATCTGGTATTACCTTAGAGTATATATATTGGCTAGATTATTG--GGTCAGCATGTACC-----------AAAGCTTTAGATAATA---CAGCTCAAATGTCTACATATGTTTACAATGCACAATGGGGACAACGAGAGAGACAATTGAGAACTCCAAACGAGTAGCCTGGCA--TCAAACTTTAGATACTTATTGCATTAAACTTAAGTTTAAGCTTATG--AATAACTTAACATAACTCTTAATAAATCAGTATCTTATATTAA--AGTATTATATGATATATTTTTCAATTGTAGAAAGTCAACTTGGCCTTTGCGTTGCTCTCTCTTGTATATCAAATATTTT---------------------------CATAAATACTATTATAATTTTT---TTTTTATTAACATTTAATACTTTAACATTTTTATGTTAATAATTTCGAATGCTGCCTGTACGTTAACAGCATTAACAATATTTCTGTAAAATAAAACTCAGAACAATATTTAATTATTTTCATACATCATATTTTTTGTATATTATTTTATATTTTTCAAATAGATTCGTTTTTTTCGATAAATTATTTGTATAGTAGCATTAACTAAACATTCGATGCACACAAAATGGTATTAGCTAAGAAATATGAAAACTTTT-------TCAACTTGTA-TTTGTATATTTGACAAATGGTTTTGCCTGCTAACTAAGTTTTAATTGAGTTATTATTAGTAAAATAAT
>betaInt-nu 21044799 21045637|23177 chr2L 21045609 21047897 scaffold_30 928207 930685 - 44079|0 28
TACAAAAATACAATTCGATTAATTAAGG-
TACAAAAATACGAATCAGCATTTTAAAGA
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CAGTCGGAGTCCTCCGAAGAGGAGGGCGAAGATCTGTTTCACGAGGACTTCAATGTACGCGACTACGATGAGGATGATGCCAATGACGATTGCTGGACTGACTAGCTGGCAGCCTTTGTGTGACGCCTTTTTAA-----TGTAGCTAGGCTTTTAACTATTAGAATGCGGATTATCAATGACGAATCTTGCTTGAAGCTA-GTATTATACAAACTATACACTTA--TATATTTATGTATGCCATCATTCTAGCTAGAGTCTATATATATACAAACAAAT--CTATATGTTTCT-----------AGTTTCTAATAAATAATGCATGTCCAAATAGTTGTACG
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TCCCCATGGGATCTATTGGGCTGCCCCCGTGGGAGCGTTCGTGTTGAT--------------TTTTGTGATTTTTATAAAAGACTTAATTATATAATTATCGTTTAGCTGTAGCG----ACAAACTGTAAACGTTTATTTCTTTTTTCTTTTGACCTTTTGTTTTTGCCCACACACAAAAACGCACAAATCTCTCTACTATTATATATATACGTATATATATATATATATATATATATATATATATATATATTTGGCATATAG-TCTAATGTGTTCCTTTTTATGGATAGCCGACCGCCCTGCCCGCCCGCCCTGCCTCGTTTACTTAAGCTGACAACGCACTGAAAAAACTCTTGTTTCTTTTTTTTTATAGTTT---TGCTTTA-------AATG-----AAAATATGTAATCTATTTTTTAGGGCATTT-----------------GCTCCAAACGAATTCAATGAAAATAAACCTTGTTTGTTATTA---ACAAA
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---------CTTTTAAGTTTATTTAGTATT---------GTAATTTAATAAAAA----AAAAAATAATTGATA
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TTTACTAC-TTAGTTGTTACAC------TCGTGACTTAGCTTTTAGTTAAAT----AAATATACGAATTCAATTGTACTCGCGCTGTGCTTGTTTCACCGCCTGCAAGGCGTAGCACATCTGGTTGTTGTTGATCCATCGCCAGGTGTTGCTCCAAAAGTCGTAGGTGCTTCCATTTACCAACACCGTCTGACAGTTCACTGCAGATGAACGAGAGAATAAAGAATAGCCTAATC---TG
ACTATCATATTCTTTATAACATATGACATAGGAGTTTAGCTTTTAGATATATTGTACAATAAATTTGATCAGCTGCTTTCGGTTGGCATCTGTTTAACGGCCTGCAGCGCGTAGCACAATTGTGTGGAGTTTATCCAGCGCCAAGTGTTACGCCAAAAGTCGTAGGTGCTGCCATTGACGAGCACCGTCTGACAATTCACTGCAAGTACAAGC---ATTAACGTTTAACTATATCCATTC
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GGCAATGCCTGGCATTTGCACTATTTTTTGACTGGCAAGCTTATCAATCTGACGTC-ATTTTATTTCA-------TAGCTTTTCACCACATTTTGATAACAGTATTTCTTATGCTTTATATTTGCACATCATGCACAGTTTTAAACAAAGTACTGCGCTATTTT----------GTTATCTAAATATATAAACTGT
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GCTACTGACCCCCCTCTCGAGTCGCCTCCCACACATACACACAGCACACACACACACACTCAAGACACGAACACATGCATATAGATACTTATATACGCCCGACATGA-AACGCAAGCAATCAAATTATGGTATTCTTTTTTTTCAATCTATATATCATATTTAATTTTTTCTGGCGAGTTGCTTTTTGCTTTTTTTTATTCAGTGTCGAAAGTGC-----TAATAGTAAAAGTTATGTAATCGAAACATAAATCGAGACATTGTGAAACAGTTTTATATATATA--TATATACAATTATACATACATAAATTAT---------TATATTTAGTTGAACTTTGTTTTTTTGCTAATTTGTT---------------------------------TGCTGCGAATGCGAATAAAATTTATTGTAATATGTATGAAAT
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CATGGGGTTCGTCTACTTTCTTGTATTTTAAATATAT----ATATATATACTAAAAAAAAATTACCCGGCATCGTCCGGGTTAAAAACTGCGCCATTTTTCGAATACCCATCATACGTCTATGCATTCGCCCACATTTAACTATTAACCAATATAATAAATGAATATACAAATTGACAATTGCTACTAGATTAGAACCGCCGATGTCCCGATTGTTTGTCCGACGATAAAGTTTAAATATTTAAAATTCTCGTGGTAATCTTAACTCTTGATATAATCCGGACCTTCAGCTTCGTATCTCTAACAGTTAGAACAAATTTTTAATTTTATATATATATTTATATTGAATATTATTATATATAAATGGCATACAAATTTATATTAATATATTATATA-CAGTCTAGTT---TTTGGCATA----TACATCAATAAGTACAAATGGTCAAATTTCTTATATATAT
>clumsy 21198406 21198674|23302 chr2L 21198395 21198656 scaffold_22 1385235 1385503 + 3277|11 278
ATTCTCCGTATCGCAAACAGATCAGTGCGGCAGTGCTGAAGTTGGGCGAACTTGGACAGCTGGCGGAACTAAAGCGAAAGTGGTGGAAGGAGATGCACGGCGGCGGGAACT-----GCGAAAAGAGCGACGAAGATGGGGGAGACACGCCA--GAGCTTGGATTGGAAAACGTGGGTGGAGTCTTCCTGGTGCT------TGGTCTCGGCTTGCTTTCAGCAATGGTTTTGGGATGCACGGAATTTCTATGGA----ACGTGAAATCG
ATTCGCCTTATCGCACTGCCATCAATAGCGTCATACTCAAGCTGCAGGAGGAGGGCAAATTGCATATACTGAAAACCAAATGGTGGAAGGAGAAACGCGGTGGTGGCAAGTGTCGCGTGGAAACCTCTAAGTCATCGTCGGCG----GCCAATGAGCTGGGACTGGCCAATGTGGGTGGCGTCTTTGTGGTCCTAATGGGCGGCATGGGCGTGGCCTGTGTCATAGCC---GTATGC---GAGTTTGTGTGGAAGTCACGCAAAGTCG
>clumsy 21198406 21198674|23303 chr2L 21198657 21199631 scaffold_2 6448014 6448932 + 10923|0 17
GTAGCAATTGAAGAAAAG
GTAGCCATCGAGGAGAAG
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ATCTCGCTTAAGGAGGCGCTCAAGGCGGAGGTGATGTTTGCGTTATGCATCTGGATAACCACCAAACCGGTGCACGCCAGCGTCGGCTCCAGCAGCTCATCCTCAACGTCTTCCAGCTCATCATCCAAATCCAAGTCGCATTCAATGCGTTCCAAGTCTTTGGCCGTATCCAGCAAGAGTCTAAAGAGCGCCGGTGATCACGATGCAGAGTCCTCCGTGCACAGTCGGCTTAAGAAGATTGGATCTATGTTTTCGCTTAAATCTCAAAAGGCCTCAACGCCTCCCATTGAAATTGGTTGGAAATCTGATAAATCCACACAAATGAGTATTGAACCCACACCGCCGGTGGAGGA------GGTGGAGGAGGAGGAGGAACGTCCACCAGAACGACGCCATCGTCATCATCATCATCATCACCATCATCATCATTATCAACAACGTCAGCAAGAACAGGAGCCAACTTTGGATCAGCGTGCCAGCAAATTGAGCAACGGCGTTTGAACAGTTCTTAACTGACTTTGGAACCTTACGAAACAGTTTTTTGGGCCATTTTGTGACTTTGTTAATGGA-GCTTCTCTACTCTAATTATATTATTTAATTCGCTTCTCAAATAGCAAAATTTAAGCTTGTTT--------AATATTAAAAAAA-AAAAAATACCAA--AAATGC--
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ATACTCGGGAGCTGGCGCAGGAGCAGAGTAAACTGGAGCT---------GGGGCAGGAGCAGAGTATACCGGAGCTGGCGCAGGAGCAGAATACACTGGGGCG------GGAGCAGGGATGTCTTGAACAGGAGGCAGATACTCCGAAACGGGTGCTGGTGCGGGAGCAGAGTAGACTGGAGCTGGGGCTGGAGCGGAGTAAACAGGAGCAGGTGCAGGAGCGGAGTAAACGGGAGCTGGAGCCGGAGCTGGAATGTCCTGGACGGGAGGCAAGTACTCAG---------GAGCTGGCGCAGGAGCAGAGTAAACTGGAGCTGGGGCAGGAGCAGAGTAAACTGGAGCTGGAGCAGGAGCAGAATAAACAGGA------GCTGGAGCTGGGATGTCTTGAACAGGAGGCAGGTACTCCGAAACAGGTGCTGGTGCCGGAGCGGAGTAGACTGGGGCTGGGGCTGGAGCGGAGTAAACAGGAGCAGGCGCAGGAGCAGAGTACACAGGAGCTGGAGCCGGCGCAGAT-----ATCACCTCCT---GAACGGGTGGCAGATAAGCTGGAGCTGGAGCCGAGGGGATGTTGAAGGTCGGCGTGGGCTTGTT------GTAGCTATAACCACTGCCCAGGTTAAGGTGGGAAACATCGGCGGAGGCCAAGGCGATGGCGCACACAGCGAAGACGAAGAGTTTCT--------------AAAATAAGCGGAA-----ATTTAAGGGTC----AAGTGAGCGATCGGGATCCCCGACATCTTGA-CGGTTGGCCAAGGCGAGCGGTTGAGCAAGGCCAACGGCTTTCTTGATC-------------------------GAAGTTGTG-ACCAGTGGACAGTTTACTCACCATTGTTATTGAT-TTGTTG-----GTCGGGCTTTTAAAGTTCGTTGGATTT--GCTTTGGCAAGCTCTTGTCGCAAGACGCTCAAGCTGAATGATGTCGAACTGCAGATGGGCCCGCACTTTTATACCAAAAGCCATGC
GTACT------CAGGTGCGGGATAAGAGGGAGCTGGAGCGCTGTATTCGGGTGCGGGAGCTGAGTAGACAGGAGCTGGAGCAGGTGCCGAGTAGACTGGAGCGGGCGCCGGAGCATGAATGTCCTGTACAGGTGGCAGGTACT------------------CGGGAGCAGGCT------GAACTGGAGCAGGAGCGCTGTA------TTCAGGTGCCGGAGCCGAGAAGACTGGAGCTGGAGCAGGAGCAGAGTAAGCTGGAGCAGGTGGCAGATACTCGGGTGCAGGCTGAACTGGAGCTGGAGCACTGTATTCGGGAGCT------GGAGCCGAGTAGACTGGAGCTGGAGCTGGTGCCGAGTAGACTGGAGCGGGTGCGGGAGCCGGAAAATCTTGCACAGGTGGCAGATACT------CAGGTGCAGGTGCGGGCGCCGAGTACGATGGGCCCGGAGGTGGCGCCGAGTACGATGGACCCGGAGCTGGCGCCGAGTATGATGGACCCGGAGCTGGCGCCGAGTAAGAAGCGCCCGCTGACGAACGGATGTCA--------------------------ATGTCAAACGACTGACTTGGCCTCTCGTACGAGTAGCCATTGTTACCGCCCAGATTCAGGTGCGAGACATCGGCCGCCACCGCGGCAATGGCGCACACAGCCAAAACGAAGAATTTCTGCAAAGCACGATCAAAAGCAATTAAAAAAACTATTTAAAATCCGTGGACGCGTGCGATTAGTGTGTGTGACTAGTTAATTGGCGGGCCAATGTTAAAGGCAAACTAGATTTAAGGTCAGCCTCAAGCATTTTGATGGATGTGTGCGTGTGTGGAAATTGTGCACTTGTTGTTGTTGTGCTCACCATTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGCTACGCTTGTAAAGCTTGCTGGATTTTAGCTTTTCGACGCTTTTGACCAAAAGACCAGACGCTGAATGATGGCCAGCAGCAGATGCGCCCGCGTTTATATACCCCAAAACTTAC
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CAAATGTTGTGGGCCATGGAACGCTGTCGGCGCCATTGTTGGGGTTAAGACGGACATAAAAGTTTTATATGATTAGTATTAG-TATGTCTATGCGTAGCTCTAAGTGCTCTATGTGTAAGCTCTGGAAAACATGTGCCTAAAATATGAACCTACCGCCAACACAGCAACAACAACAACAACGACAACATCAACAACAACAACAACTAGAGAAGAGCATTAAAACCCAGCGCGAAATTGCCAAATTTTTGAATAAAACATATATCTGTATATTGTGTATGCAAAAGTTGTTGTATGTGCGTTTGTTGCTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTGCGGCCTAAGTTC-----ATTAAATTATATAAAGTTTTTGCTATGTATACATATATATGGATTATGTATAGT---AACTAAAGCACACATGGAAAATGAAAAGACTAAG-AAATTTATTTAACTTAAATATTAAAATGCAAAATCAAATTCTAATGTTTAGTTCAAGTAATCAAACAAAACAAAACATAAAAAAAAAAAATACAAAAAAAAAAAACAACAAGAAATATAGCAGCTAATGGTTTTTTAAATGCATATATTGTGTATTGAAAACGACGAGTAAATCGAAAATTAAAGAATATTTTTTAAATAAAATGCCAAAACCGAAATTGGTTTAAATGAGAGCTGCT-AGATTTTCGAACTTCATATA--------TAAAACGTGAACGA--GAAATCCATTTTTAAATGTTGTAGCATTTAGTTTTAGTGCAATTTCACATGTCTACTTATATATCGATATATCGATGTACATATATACATATATATTTAAATCTATATATATATATATATATATAGAGCGAGAGAGAGAGAGAGAAAGAGAGGGAGGCCTCAAATGGCCGGCAGGAAAATACAGAAAAGGGAAAACTATACAAGAAAAGACCACTCGATTCAATTGCCGCCTCAATGTGGCAGGGCGTGGCAAAAACTATTCCAGTGATGCTATTTGTTGCATAAAAAACATAAACAAACAAACAAAAAAAACACACACACACACACACACACACAGAAAAACAAAAACAAACTACATAAATCAAATTTATACTTTTGTCATTACACATACTGATAAACCACATATGAATATTTGTATCTGTATTCGTATTTGAATTGTATTTTGTATTCTTTAATTAATGTTTTAATATTATATTTATATATAATATATATATATATATATATATAGATGTGTGTGCGTGCATATGTGCGCACATATAATTTGTTTTATTGTAATTTTACTTAATAGCTGAAGCAAATCCTGTAACAGGATTTAAAACATTTAAAT-TACATACAGTTATATTTTTAATTGTCAACGCATAAACAAACCTAGAT-------TATATAGCCTGCATATATATATAATGTCAATATGTGTGTGTACGTTAACTATAAAACTTCCAGCCCCACCAGCAAATCGCAAGCAAACAAAACAAAACTATATATAATTCCAATAATTTCAAAATGAAATATGCAACAGAAACATAAACATTAAAACGTTG-CTACGCACAATTGGCCAGGTG----AGGAATATGTCCT-CAGTATTGACCTGTGATTGAAATGTTAGTTAAAAAAAAAAAGAAGATAAACTAAAAATTGAGATTAAGTATCCGCTATCACAGTATCTAAATTTTGA-TTGTTCGTGCAGTTT--TCTTTATATATGCCATCTGCATTTTGTCCACAGCAGAGGCTTTTGAAAATTACAAATAACAAATTTCA-ATTG-----------CTGCCTGGCCTCGTGTTGATGCGTAAATTGTAAACCTAAAG--TAAATGCAAATAGTTAAATGTTAATTT---AATGAATGGTCTAACTAAATATCAATATACCATATACCATAGTTAAATGCAATTGTAAAATGATAATCAAATCAAAATTAATTTATAGTTTGTCCACAACAATCGAAAATTGTAGCAGCTAAAAGCG---ACAAGGAAAGCCGCCAAATCATTTTGTAAATACATTTTGAAATGTTCATTTTTAGTTTTGCAGCATTTTGAAATTTTACTATTTAGGTTATTTGCTTAAATAGTTAAAGTTGCGCTATGA------TGTTTAATATGTGAAATTCAAAATTATTTTTGAGCTCATTTGAGCTCGGTTCTTGTGCTTGCTTGTGTGCTTTGGTGCTACTTTTTTCAACTACTCATC-CATAGTAAATATTTTATTTCATT----TTTTTAATAATTGTAATAACTGAAATTCAAGTGAAACAACAATTAAACATTTTTAATTGTCAATGCAATATTTTGTAATAAACAT
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TAGTATCCGAGACTCACAACTCCTTTT--TAAAAT-TAATTAGAAGACT----------------------------------TATTGATCAATTAAA
TAG----CGATTCTTGTGTGTATGTTTCGTAAAATGTATTTAGAAGACTAAAACAAACCCACAACAACAACAAAATACAACAATAGTAAGAAAAAAAC
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TAAATTTTGTTTGAGTTTATGTTCAATTACAATTGCATCATTAATTTGTCTTTTAATCATGTCTACAATTTGCACATTTTATACAATACCCATCACCACGTGTAAGAA
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TTTGCTAGTTCACTAAACAACAAAAAAACAGCGTATACATTTGTAAATACTCGAAACCAAACGTCCTTTTCAGGACGACCAAA--AATGTCAAAAAAGAGATTATCTTTTCA
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ACGTTTCAAAGGCTA---AGCTAAAAACCTACATGTACA----TAAAATCGTCAATCAAACCGTCCTTTTCAGGACGACCAAATTATTACCAAAGAATTGAAAAATTTTTTA
TTTGCTAGTTCACTAAACAACAAAAAAACAGCGTATACATTTGTAAATACTCGAAACCAAACGTCCTTTTCAGGACGACCAAA--AATGTCAAAAAAGAGATTATCTTTTCA
>His2A:CG33829 21466204 21466362|23567 chr2L 21466346 21467816 scaffold_1633 1630 3036 - 55220|0 16
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ACGTTTCAAAGGCTA---AGCTAAAAACCTACATGTACA----TAAAATCGTCAATCAAACCGTCCTTTTCAGGACGACCAAATTATTACCAAAGAATTGAAAAATTTTTTA
TTTGCTAGTTCACTAAACAACAAAAAAACAGCGTATACATTTGTAAATACTCGAAACCAAACGTCCTTTTCAGGACGACCAAA--AATGTCAAAAAAGAGATTATCTTTTCA
>His2A:CG33832 21471247 21471405|23574 chr2L 21471389 21472880 scaffold_1633 1630 3053 - 55343|0 16
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>His1:CG33837 21480064 21480156|23583 chr2L 21479440 21480264 scaffold_18 1196323 1197119 - 25123|648 744
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>His2A:CG33838 21481443 21481601|23585 chr2L 21481585 21483055 scaffold_1633 1630 3036 - 55213|0 16
TTATTAACGTAAAGATG
TTATTCACCTAA----G
>His1:CG33840 21485109 21485201|23590 chr2L 21484485 21485309 scaffold_18 1196323 1197119 - 25123|648 744
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>His2A:CG33841 21486488 21486646|23592 chr2L 21486630 21488100 scaffold_1633 1630 3036 - 55071|0 16
TTATTAACGTAAAGATG
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TTATTAACGTAAAGATG
TTATTCACCTAA----G
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ACGTTTCAAAGGCTAAGCTAAAAA-------CCTACATGTACATAAAATCGTCAATCAAACCGTCCTTTTCAGGACGACCAAATTATTACCAAAGA
TTTGCTAGTTCACTAAACAAAAAAAAAACAGCGTATACATTTGTAAATACTCGAAACCAAACGTCCTTTTCAGGACGACCAAA--AATGTCAAAAA
>His2A:CG33847 21496586 21496744|23603 chr2L 21496675 21498198 scaffold_1633 1615 3036 - 53650|0 69
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AAAGAGATTATCTTT--------------------------------------TTATTCACCTAA----G
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ACGTTTCAAAGGCTA---AGCTAAAAACCTACATGTACA----TAAAATCGTCAATCAAACCGTCCTTTTCAGGACGACCAAATTATTACCAAAGAATTGAAAAATTTTTTA
TTTGCTAGTTCACTAAACAACAAAAAAACAGCGTATACATTTGTAAATACTCGAAACCAAACGTCCTTTTCAGGACGACCAAA--AATGTCAAAAAAGAGATTATCTTTTCA
>His2A:CG33850 21501630 21501788|23609 chr2L 21501772 21503242 scaffold_1633 1630 3036 - 55130|0 16
TTATTAACGTAAAGATG
TTATTCACCTAA----G
>His1:CG33852 21505296 21505388|23613 chr2L 21504399 21505460 scaffold_18 1182676 1183711 - 32565|936 1036
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TAATTTGAAA-----------TTGCTAACTGCTCGTCAGCA------------TATGCAAATTTCTAATACTGAAATTTGTTTTGACCACAAAGCCCTTTT
>His2A:CG33853 21506675 21506833|23616 chr2L 21506574 21507047 scaffold_1633 1420 1811 - 2954|101 270
ACGTTTCAAAG---GCTAAGCTAAAAAC----CTACATGTACATA---AAATCGTC-AATCAAACCGTCCTTTTCAGGACGACCAAATTATTACCAAAGAATTGAAAAATTTTTTAGCTTGGCAATTTCTTGTAATTAGTAAATCATAAAGAATTATTAACGTAAAGATG
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ACGTTTCAAAGGCTA---AGCTAAAAACCTACATGTACA----TAAAATCGTCAATCAAACCGTCCTTTTCAGGACGACCAAATTATTACCAAAGAATTGAAAAATTTTTTA
TTTGCTAGTTCACTAAACAACAAAAAAACAGCGTATACATTTGTAAATACTCGAAACCAAACGTCCTTTTCAGGACGACCAAA--AATGTCAAAAAAGAGATTATCTTTTCA
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TTATTAACGTAAAGATG
TTATTCACCTAA----G
>His1:CG33858 21514982 21515074|23619 chr2L 21511891 21516465 scaffold_18 1190324 1194967 - 140617|3275 3375
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TAATTTGAAA-----------TTGCTAACTGCTCGTCAGCA------------TATGCAAATTTCTAATACTGAAATTTGTTTTACCACAAAGCCCCTTTT
>His2A:CG33859 21516361 21516519|23619 chr2L 21511891 21516465 scaffold_18 1190324 1194967 - 140617|4787 4898
ACGTTTCAAAGGCTA---AGCTAAAAACCTACATGTACA----TAAAATCGTCAATCAAACCGTCCTTTTCAGGACGACCAAATTATTACCAAAGAATTGAAAAATTTTTTA
TTTGCTAGTTCACTAAACAACAAAAAAACAGCGTATACATTTGTAAATACTCGAAACCAAACGTCCTTTTCAGGACGACCAAA--AATGTCAAAAAAGAGATTATCTTTTCA
>His2A:CG33859 21516361 21516519|23620 chr2L 21516503 21516733 scaffold_1633 1630 1811 - -1430|0 16
TTATTAACGTAAAGATG
TTATTCACCTAA----G
>His1:CG33861 21519825 21519917|23622 chr2L 21519201 21520025 scaffold_18 1196323 1197119 - 25365|648 744
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TAATTTGAAA-----------TTGCTAACTGCTCGTCAGCATA--TGCAAATTTCTAAT-------ACTGAAATTTGTTATACCACAAAGCCCTTTT
>His2A:CG33862 21521204 21521362|23623 chr2L 21520026 21521308 scaffold_18 1193573 1194967 - 54744|1300 1411
ACGTTTCAAAGGCTA---AGCTAAAAACCTACATGTACA----TAAAATCGTCAATCAAACCGTCCTTTTCAGGACGACCAAATTATTACCAAAGAATTGAAAAATTTTTTA
TTTGCTAGTTCACTAAACAACAAAAAAACAGCGTATACATTTGTAAATACTCGAAACCAAACGTCCTTTTCAGGACGACCAAA--AATGTCAAAAAAGAGATTATCTTTTCA
>His2A:CG33862 21521204 21521362|23624 chr2L 21521346 21522816 scaffold_1633 1630 3036 - 55130|0 16
TTATTAACGTAAAGATG
TTATTCACCTAA----G
>His1:CG33864 21524869 21524961|23629 chr2L 21524245 21525069 scaffold_18 1196323 1197119 - 25123|648 744
-ATTGTGAAAAAGTGCAGTATTTGGTACATGTTCGCAATTAAAATTTTAGATTTATGATTTATAGATCTGAAATTTGTTTAAAC---AAGTCCTTTT
TAATTTGAAA-----------TTGCTAACTGCTCGTCAGCATA--TGCAAATTTCTAAT-------ACTGAAATTTGTTATACCACAAAGCCCTTTT
>His2A:CG33865 21526248 21526406|23631 chr2L 21526147 21527041 scaffold_1633 1420 2224 - 28070|101 270
ACGTTTCAAAG---GCTAAGCTAAAAAC----CTACATGTACATA---AAATCGTC-AATCAAACCGTCCTTTTCAGGACGACCAAATTATTACCAAAGAATTGAAAAATTTTTTAGCTTGGCAATTTCTTGTAATTAGTAAATCATAAAGAATTATTAACGTAAAGATG
---TTTGATAGTTCACTTAACTAAAAAAAAAACAGCGTATACATTTGTAAATAGTCGAAACCAAGCGTCCTTTTCAGGACAACCCAA--AATGTTAAAAAAAAGAGATTATCTTT--------------------------------------TTATTCACCTAA----G
>CG3305 21564177 21564707|23648 chr2L 21563808 21564255 scaffold_7 1156841 1157304 - 15898|379 465
TAG---AAGGACA-----TCAGCTTAATTGGGCAGGTTGCGAATCAAAGGAGTATGGACAGCAAATTGTTAGAGAGAAATTTAAGAT
TAGGGCAAGGATAGCTACGCAGCGAGAACGGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGGGAGGGAGAGAAGAGAGAGAAAGGAACGGAAGAT
>Ac3 21625370 21625379|23695 chr2L 21625229 21625973 scaffold_14 49294 50146 - 27956|141 150
AGGCCATTAA
AGGCCATCAA
>Ac3 21625551 21625709|23695 chr2L 21625229 21625973 scaffold_14 49294 50146 - 27956|367 525
GTATGTGCAGCAGAAGGCCAACTCACCTGTTGACATGCGAGTAGGCATTCACACTGGAGCCGTGCTCGCTGGAATTCTTGGGCAGCGACAGTGGCAGTTTGATGTTTACTCTAAGGACGTAGAGCTGGCTAATAAAATGGAATCGAGCGGAAAGGCTGG
GTATGTGCAACAGAAGGCAAACTCACCTGTTGATATGCGTGTGGGCATACACACGGGTGCTGTCCTGGCTGGCATACTCGGTCAGCGTCAGTGGCAGTTTGACGTTTACTCCAAGGACGTTGAGCTGGCTAATAAAATGGAATCCAGCGGCAAGGCCGG
>Ac3 21625823 21625961|23695 chr2L 21625229 21625973 scaffold_14 49294 50146 - 27956|707 845
ACGCGTTCACATTTCGGACAAAACGCTTGCCTTTCTGAACGGCGAATTCGAAGTGGAGGCCGCCTTTGGAGAGAAACGAGAGGAGTTGTTGCGTATTGCTGGGCTAAAGACGTATTTTATCACCAAAGTAGTTAAAGCG
ACGCGTGCATATTTCCGACAAGACTTTGGCCTTTCTCAATGGCGAGTTCGAGGTGGAACCGGCCTTTGGTGAGAAGCGCGAAGAGTTGCTGCGCATTGCTGGTCTGAAGACCTATTTCATTACCAAAGTGGTTAAGCCG
>Ac3 21626834 21627096|23698 chr2L 21626805 21627612 scaffold_14 50179 50922 - 33331|36 313
TTTGCATCGCCATGTGCCAAAAAAATAAATGAAACCCAGGCTGAAATTGCACACCCCAATCCTAAT----------GGATCGACGAC-----CGATATTGTATCAGATGAAGATGACAACGATGCCACATTAGACGACGAAGAGCTCCTGGCGCAGAATTCTGTATCCAATGGACACCAAATAGGGATTGCAGTGACTGCAGATGAAGAGGAGCAGGTGAAATTGGAGAACTTTAAACAACGACTGAAAGATGAGCTGGTAACGCGCGACGGACATGA
TTCGCCTCGCCTTGCGCCAAGAAAATCCACGAAACCAAAGCAGAAAATGGCAATCATAGTCCGGATTCTAATGCCAGCAGCAACGATAGCAACGAAAATGT------CGACGATGACAATGATGCCACAGTGGATGACGAGGAGCTATTGGCGCAGAGTGTTGTACTCAATGGACACAGCCCAA------CAGCGGCTGAAGATGAGGAAGAACAAATCAAGCTCGAGAACTTTAAGCAGCGTCTAAAAGATGAGCTCGTAACGCGAGATGGACATGA
>Ac3 21627235 21627598|23698 chr2L 21626805 21627612 scaffold_14 50179 50922 - 33331|452 815
AAACCTAACCAAGGACACTAACATATTCTTGCGCTTCAAAAACCCCCAGCTGGAGCAACTGTATGCCGTATATAGAGAGCCGTACAGTTCACTTCCACTTCTTGCCGCTCTTCTAGTGCAGTGCATTGATGTGCTGTACTCATACTTAGTTCTCCCGAGATCTACACTCCACTTCATTAATATAGCTGCTCCGTTGGTGCCGATCGCAATGCTGGTAGTGATCAGCCTTGCCGAGAGCTTTAGCGGCATGCTGCCCAAGTTTTTTGTAGATGTCAGCAAGCGCTTCAATGACATAACCTTTGTTCGCGAGCTGGCAGCCATAATTATTGCACTCACCATTGGCTTCAGTAACGTAATCGACATG
AAACCTGACTAAGGACACGAACATCTTCTTGCGCTTCAAGAATCTGCAGCTGGAGCAGGCCTATGCCGTCTATCGGGAACCGTATAGTTCGCTGCCCTTGCTGGCCGCTTTGTTGGTGCAGTGCATCGATGTGCTGTACTCCTATCTGGTGTTGCCGCGCTCCACGCTGCATTTCATTAACATTGCCGCACCGCTGGTGCCCATTGCCATGCTGGTGGCCATAAGCATTGCGGAAAGCTTTAGTGGCATGCTGCCCAAGTTCTTTGTGGATGTGAGCAAGCGCTTCAATGACATTACCTTCGTGCGCGAGCTGGCAGCCATAATTATAGCACTTACCATTGGCCTCAGCAATGTCATCGACATG
>Ac3 21628321 21628606|23701 chr2L 21628287 21628928 scaffold_14 51246 51875 - 21844|35 320
TTCTTTTTCGTCACCTTCGTGCGTACCGAGCATATTGTGAGTGAAAGCGAGTTCAATGTAACGGCTAGCCTAGAAAGCGATATAAACTTGGTGGTGGAGGGGATGGTCACCGCAGAGCACCTACTTCCCGCATCGTTTGTGGAACAAATGCGAGATGCTGTGCCTACGGAACGAGTTCTGTATCCGTCCTACTTAAGTAACTTCGGAGTACTCATATTAATTGCGATTGCCGTGATTGCCCAACTTACTCATCTCACAAAGATTTTGCTACTATTGTCCATTGCAG
TTCTTCTTCGTTACCTTCGTGCGCACCGAGCACATTGTCAGCGAGAGCGAATTCAATGCCACGGCCGGCTT------------------------GGAGGAGGTTGTCACCGCCGAGCACCTGCTGCCCGAATCGTTTGTGGAGCAAATGCGCGAGGCGGTGCCCACCGAACGTGTCCTATATCCGTCCTATTTGAGCAACTTCAGTGTCCTCATACTCATTGCAATTGCTGTGATTGCTCAGCTCACGCATTTAACCAAGATTCTTCTGCTGTTGTCCATTGCGG
>Ac3 21628666 21628738|23701 chr2L 21628287 21628928 scaffold_14 51246 51875 - 21844|399 471
CTCTGCATTGCTATTTCAATATATTCATCATGCAGGATCTTTATGCTCTAGAGGATGATTTCGAACATCAACC
CTCTGCATTGCTATTTCAATGTGTGCATCATGCAGGACTTGTACGCTCTGGAAGACGATCTGGCACATCAGCC
>Ac3 21628842 21628917|23701 chr2L 21628287 21628928 scaffold_14 51246 51875 - 21844|585 660
TATTATATCTACGCGATATGCCGCTTCAGGACTTTTGCTTGTGGCTGCTCTGGCGTTAAGCACCTTGGCAAGACAC
GCTCATATCAACACGCTATTGTGCCTCGGGTCTGCTTCTGGTCGCCGCATTGTCTCTCAGTTTTCTCGCCCGGCAT
>Ac3 21628972 21629197|23702 chr2L 21628970 21629253 scaffold_14 52208 52495 - 15478|2 227
ATGGACCACGAGGATAGGGTAATATTCAAGTGGAAAACCGAGGTGGCTGAGCAAAAGGAGACCGCAAACGACATGAGGCAGCGAAATGAGGCTTTGGTCTACAATGTCTTACCTGTTCATGTGGCAGAGCACTTCATGAAGAACACTAAACGCTCTCATGATGATCTTTATTCCCAGAGCTATGCTGAAGTGGGCGTATTATTTGCCAGCATGCCGAACTTTTCTG
ATGGACCACGAGGATCGTGTTATATTCAAATGGAAAACCGAGGTGGCCGAGCAAAAGGAAACCGCCAACGATATGCGTCAGCGTAATGAGGCTTTGGTCTACAATGTGCTGCCCGTGCATGTGGCCGAGCACTTTATGAAGAACGCCAAGCGTTCCCATGATGATCTCTACTCCCAAAGCTATGCCGAGGTGGGTGTGCTGTTCGCCAGCATGCCCAACTTTTCAG
>Ac3 21630763 21630845|23705 chr2L 21630761 21630885 scaffold_14 52496 52618 - 6074|2 84
ATTTCTATTCCGAAGAAACAGTAAACAACCAGGGCTTGGAATGTTTACGTTTTCTCAATGAGGTCATCTCAGATTTTGATGCA
ATTTCTACTCGGAGGAAACAGTTAACAATCAGGGCCTGGAGTGCCTGCGTTTTCTGAATGAGGTCATCTCTGATTTCGACGCG
>Ac3 21631357 21631812|23707 chr2L 21631333 21631836 scaffold_14 52619 53127 - 28598|28 483
TTGTTGGAGCTGCCACAATTCCAAGACATCATCAAAATAAAAACTATTGGTTCGACATATATGGCTGCCAGTGGGATAAATGTGCAAAGGACTGTCCGAAATGACGCCCCAATTACAGAACGGTGGTCTCACTTAGCGATTTTGGTGGAGTTCGCACTGGAACTGAAGCACGCATTGCAAAGCATCAACGAGCAGTCGTTTAACCACTTCGTCCTTAAGATGGGGATCAATCATGGACCGATCACGGCTGGCGTTATTGGCGCACGTAAACCGCATTACGACATCTGGGGTAATACGGTGAATGTGGCATCGCGAATGGAAAGCACAGGAAAGGCGGGCGCCATTCAGGTCACGGAAGAGACGTGCAATATTTTACGGCTCTTTGGTTACACCTTCCTTCAGCGTGGCCTGGTAGCGGTCAAGGGAAAAGGACAGCTGATGACATTTTATCTGCAG
CTGCTGGAGCTGCCCCAGTTTCAAGACATCATTAAAATCAAGACTATTGGTTCGACTTACATGGCCGCCAGTGGCATCAATTTGCAGCGAAATCTCCGTAATGATGCTCCCATTACCGAACGCTGGTCCCATCTGGCTCTGCTAGTGGAGTTTGCGCTGGAGCTCAAGCATGCGCTGCACGGCATCAACGAGCAGTCGTTCAATCATTTCGTGCTTAAAATGGGCATCAATCATGGACCCATTACGGCTGGTGTGATTGGCGCTCGGAAGCCGCACTACGATATCTGGGGCAATACGGTGAATGTGGCCTCGCGCATGGAGAGCACCGGCAAAGCGGGCGCCATTCAGGTAACCGAGGAGACCTGCAATATCCTGGAGCAATTCGGTTATACGTTTCAGCAGCGCGGCCTGGTGGCAGTCAAGGGCAAGGGTCAGCTGATGACCTACTATTTGCAG
>Ac3 21634188 21635560|23711 chr2L 21634192 21635233 scaffold_14 53184 54259 - 3648|0 1153
AGTCCCAGTCGAGTGCTGAACCGGTAGCATCCGGCGTAGTCGTGCTCAATGGGCAGGATTCATCTGCTGTAGAATCCACAAGCGAACTGGAGGCCTCAGACATTAAAATGCCCTTGCTGAAGATGAATGGCCCAGAGCAATCGTTGGAAATCGACCAAGATCGAAGCTTAAGAAATGACAGTGCTGGCCAAGAGAGTGTGGCAGAATGTCAGTCTTTGCTAGAATAGTAAGCTTGTCATATTTATGATTTTCATT-CTTTGTGAACATTTAGG-----ATGAGTGGATGTGTATGCGTGTGAGTGGCCGTGTTAAAAAAACAAGAGTTAACTATTTTGAAGAAATTATTTTTGC----AATAAGTTAGGTTTTGCCTCAGTGTTCGTGTGATATT---CCATGCAAGATGATTAATAA-----AATAAATAAGCAAAATTCGAAA--------------TTAGTTA-----ACATAATAG--ATTTGCT---------TTTGTAAACTGTGTACCTAAAACAAGAAATATATCTATCTTCTAAGTATATTTTTGTATGTTTAGTATTTTCAGTTATTCTAAACCATAGTTCGTTTAAAAAAATTTGACATTT--TCGAAGCT----------CTGTAATAT-TTAAGTGATTCGCTTTGCAGC--TAATTGATGTGCAGATTAGCATCTCAATGTGTAAAATATATATATCCGCATTATAGTTAAAACCAAAATTACGATATAAATAACA-TTGCA--------GTTATAGAAATATAGAATTTATATTAGTTGAGAGTCCAAATCCCACCAT-------------ATACAA------CTAAAACCCACGTGTCAGTCCAAATTGAGAACAAAAGATACTACAATTAATTAGTAAAAAAGTATTAAATATAAAAATGGAAATGAAATCAAAGAACAAAAAT-ATAATCC--TTAGAATGCGTTCTTGGACGTCGTCAACCAACATTATACCTTCA--TATATATAGAAATATTTAA--------------ATTAAAACAAACTTATTAGCATTGCATGCTTTTTAAAACATTGCAACGAATTTTAGCAAACAAACG-AAATTAATTATCAAAAGTTGCA-AAATAAACAAGGAACTTGACCTAAAATCTTTTGA
AGCCCAAGGCGGCCGTAGAGCTG----CATGAGCCGGAGGCAGTGCCAGCGGCCGCG--CCACTTAGTCTGGACTGCAGCGCAGAGCTGGAGGC---GGATATTAAGACGCCGCTGCTAAAGCTCAAGGCACAGGATGCAGCAACGGAAACCAATCCGGAAACGTGTTTGGGCAAT---------------GGAACCTTGGCCGAATCTCAATCGTTGTTGGAGTAAAACGATTGCATTTTCTACGAGACATATTGATGTGTGTGCGTGTGTGTGTGCTTGAGTGAGTGTGTATGTGTGTGATCATGAGCGTGAACATAA----AGTTAACTGTTATACTACTGTTATACTTACTACTACTACATTTGG-TTTGCCT--ATATTCGTGTGATATTCTGCTATGTGAAGTACCCAAAAAAAAGGAAAAAAAAGGAAACATTTAAAGAAAAATCGTACTCTTTAGTTGTATATTTATAACTGGTATTTGCTTTTGAAAAGTTTGTAAACTGTGTACCTAA------AAATTTATAACTAAACTAAGTA--------------------TTTGAATTATTGTGAGCGGT--TTTGTTTCAAACAAATTGTTATTCAATTTAAATTATATTAACAACTGTAACATAACAAATTATTTGCTTAATAACATTAGTCGATGTGTAGTTGAAAACAAAGAATCTTAACATCAATTTATAATTAATCTTAGGAATTTAAAAATAGTCATATATATACTACTTGCATCAATTTCGCAACAAAAAAAAAAAAAATAAGTCAACAAAACAAGTAAATCTCAATGTGAACAGATTTTGCATACAAAATGCGCTTAAACCTAACTATAAAT--GAATTAACAACAAA------TACAAAC-----GCAAACATGCATT--ATGCAAATATGTAGACTAAGTCGAGATATTTACATAATAATACATTTAAATTGAGAATCCGTATCCCACCACACAAAATGCAACCCACAAGCAAGTCCAAAAACAGTTAAAATGTATGTACTATACTTATGCTAAATAATTATAATCGTATAGTTAATATAGCAATAGTAGGCA----ACCAAAGAAGGGCAAATGATTTGACGAAATCGGCATGAATATTACAAAAACTGAACATAGACTTCTCTTA
>Ac3 21634188 21635560|23712 chr2L 21635283 21635788 scaffold_14 54538 55051 - -133|0 295
TGATGGTTTAAGGCATGACAATCAAGATGAA---TAAACACTATACAAATGATTG-GGTTAGCTCGAAATTCCACAGTTTAAAAACA-----CTATGAACTATTTTTAAAACAT-----ACATTTTATTGAATGATTTTAGAAGATTGGGTCGTTGTGTTGGTTTCTTCATGGAACCTTAATGTGAAATAAGGTTTTATTTCATTAAATATAAATTAACTAA-GATATAAATTATT--TAAAACCTACCAAATATAGCAA-ATTTTAGAGAAATAAATAAAATTATTTAAGACAAA
TAATGGCTTAAAGCATGACAATCAACGAAAATTGTGTAAGTTAAAGGCATGACGATGATTGACCCGCTGTTTCCAACATTAAAATTATGTTTTTATTTAAAATTTGAAAATAACTAGCAAAATTAAAAACAATACTTGTAAAAGTTTAAGT-GTTGTGTT--TTAAGCTATTAACTGTAAATCTAACATTGCACTTT---------TATATAATTTAAATAACAATAAAAACAATTAGCGAATTATAGGGAAAATAAAAAGAAACTAAATAAATCTACATAAATATGTATTAAACA
>cul-2 21650414 21650811|23722 chr2L 21650091 21651420 scaffold_14 58899 60335 - 15686|341 941
ACTGCGG-------------------TAGAGATTTTT----------------TATTCTTAAAC--AAGAACCTTCCCGGA--------------CAACAACCTCCCATACACACAACTGACGCTA-------------------ACCAAGCGGCTTATTTTGTCTAAAA------------------------AGAACTACCTACAATGTTA-------------AAAAAAGAAATCAAA----------------------------------------------AGGTCAAGCAA----------------TTTGAGTTTTGTTATTTTTGTGGTCATAGC--ATATTGGTATGAAAGGTGTGTGGAAATCAAACGACGTTACTGATACTTTTAATTTAGCTTAGTTAGTT---GATCCATTTTGATTTAATGCGTGTGTCCTA--TTCAATTGTAGATATAATATA--TTTCTTTATGTATTGTATATTTATCTGGTTT---------TATTAACACACGCACAAAC-CAGAA---------------TAATGTGCTGGAAAATGTATAATAAATCCCAAAAAATGTCTAAAAATAT
ACTGCGAACTCGGCTCGGACAGCTACTAGAGATTATTACAAAAAGAAAAAAGCAAAGCATAAACAAAAGAACCTTCACTAATTGAATTCACAATGCAAAAACC-CATACACACACTATTAATTGTAATACCTTGTAATACATTGTACCAA--GGCATATTTTGTTAAACATTTTAAAAATTCATGACACGCATTACAACAACCAAAACTATGATATCTCTTCTGATAAACAATAACTGAAACCTTATTTGATAGTATGTCAAAAGTAATTCTGAATTGAAGTCCTTGAGGTAATGCAATCAATATTTGTTTGTTTTTGTGTGTTTTTTCTTTTTTGATCCTAACTAATCCTAAAACAAAAGGCGTATATAAGATGTGCG-CATTACTGATACTTTTAG-CTAGTTTATTTAGTTTTGTAACGAGTTTCTTTTGGCGCGTGTGTTTTATTTTTTAATGCGGCAATAGTATAATTTTCTTTATGAATTGTATATTTATCTGGTTCACACATACACACCCACACACACACACACACAGAACACACGCACTAAAACCAAATTGCAAGCGAATGTGTAATAAAAAAAAAAAAACAACAACAACAAC
>CG31619 21707731 21707868|23760 chr2L 21707842 21707914 scaffold_36 656727 656805 + 1334|0 26
GCTAATAAATAACGCCGCACTTAATAA
GCTCAGAAAAAACGC---GCTTTATAA
>CG31619 21715767 21716644|23771 chr2L 21715560 21716435 scaffold_14 158487 159283 - 5150|207 905
CTCCGCTGCGGCTTACCAAAATAGCAAGGATAT-TTTAAGAACTCAACAAGCAATTACCCTAGGTACCGTAATAAACGTTTAAGCGTATATAACTTATCCATATGTATGCCACATCCGCACTTACA--TGAATTT----AGCTTAATAT-AGTGTCAAAGGCCAATTAAAAGCACTTGTATCTGAAGTAAGCTTAAAGAAGCT----TAAGCTTAAATAAGATCTGCTGTGACCTGTTCTCGAAAGGGTCATCGATTACACATTATGCATTACTTCATAACTATGAAGCACTGAAGCACAGATGAAATCACTAAAAAGAAAAAGAGAAGTCCGCACTATTACCTGGTGCCATTGAAACCGTATATAAATGTGTAAATATAGAGAAGGACAAATGACATCCATTGTCGGTTCATAGCACTGAAATTAGCTTCGATTACCACTTAGAAT--------TTTGTAAATAAATCG----GATTTCTTTCTAAATCAACACTTCATTTAAAGGCAAGTCAGGTAATTAAATGAACGTCGAACTATTTGGAATACTTATAAACGCCTAATT-----GTAATTAGTTTTATATGGAAATATTGTTTTTATATATACAACTTAAATA-GAAACACTAGATAAACTCTAAATAATACTGCAAGATACTATAGCTAACTATCGCCGAATATATCGCAATTGTTAAAGCGT
ATGTGCTGCGACTACCAAATAGAAGAAATAAATGTCGAAGAAATCAGCAAGCAATTACTATAAGTACAGTTA-----GGGTAATCCTATATAGCATG-------GTATA-GAAACTCGAACCCATAACTGAAATTTTGAATTCGAATATGACTAACAAGGACGAGTGCAATTTAGTTGATAGTTAAATATGATTGGGAAAATTGTAATGAGAGTAATGCAGATC------AATTTGAGGATAAAGCAAATATCGTTTCAATTTT-----TGTCTACATAAATAAGCAAC----AGGTACAGATACAGATAC-----AGATAAAGATAAAGATGCA---------GATGC----AGATATGCATTTAAATGTGTGCAGA---ACAGGAGCAAATATTTACAACTATTCGTAAACTAAGCGCAAATTATGTTTAGATATGCCCAAAAGCAATCCATGCTGGCAAATAAATTGCCAAGATTTATTATATATCGATTATATAATATGCTTATATGTGGGATATATAAA----------------TATAAAATTTATAATCGTCTGATTTGGCAGCGAGTAGTTTGTCCC--AAAGGCGGCTTTGCTTTAAGCAATTCCAACATTAAATACTAAA-AGTATTTGATAAATATTGCAAG-TAATACAGAAATCATTCG-------GATC-CAACCGCTAAAGCGT
>CG31619 21715767 21716644|23772 chr2L 21716436 21716654 scaffold_14 160128 160309 - 2033|0 216
AACTAAATATATAAGCTGTTAAGGGAAAGTTATTATTAATGAGC-----CCACGAGT--AAATGCA-ACAGTAACCAATATCAAACGCCTACAGACCGAAGCAAAACTAAACACTATCGCAGCTCAAAAAATTGCATAGCTCAGCAAGGATATAACAAATTTGAGATGCATTGTACAAAAATTGGAACATGTTTGGAATAAATATTTATTAAATACC
AATCGAATATTTAAATTGTTAAGTAAAGGTTATAAATAAATTACATATACAACAATTTAAAATGCATACCATAACCAATGTTAAACG--TACATATACACACTCACTCACACACACACAACACTTACCAATTTACACA----------CACATAACATA--------GCATTATATAAAAA-------------------------AATTAAATACA
>CG1416 21748217 21748508|23796 chr2L 21748121 21748633 scaffold_2 4364171 4364725 + 5585|96 463
GAGGACGCTTCTAGTGCGGATTG-CACTGA--ATGATTGAGGGCTTGGTGTATGGCGGATTATCGAAGGATTATTATTTGTATTCAACCTAGAGTACTGCGA---GAATTTCATTTCCAATCATAACTGTAATTTCTGTTTATC------CTTAGAGGCTTTTTCAAATCCT----------CTTAGGTATATCGATCGAA--------------CTGGAAAGTCCGCGGCTCGCTA-----------AAAAAACACATTACTT---ACAAAAAATCG-------------------AATACAATTCAGGCATTCGACATTGATTTCACACATTG-AGAAAC-----AATAAAC-AATAATTTAAAAC
---GCTGCACCATGAGCACATGGACACTGGCCAGGCCTAAATGCTT------------ATTATCACACGAGT----------TCCATTCTACAGCGCTGCAAATTGATTTTCACCACC--TTTAAGCTATCATTTCTGTGCGGCTGCGCACCGGCGCACTTTGTTAACACTTGAATACGGTATTTAAATTTATAGACGGAAACACTGTTCGACAGCAGCAGCAGCAGCAGCTCAGCAGCAGCAGCAGTAACAAAAATATTAAATAAAACAACAAATCAGGTCATTTAGTCATTGTTCAATCTATGCCACACACTCGACACTGA-TTCACACCTAATATAAACGGCGAAATAAATGAAAAATCTTAATG
>tsh 21823776 21824234|23882 chr2L 21820838 21824629 scaffold_2 4458061 4461853 + 116545|3148 3611
GTCCGCGAGCTGAGACGAAAAGA---GAAACCGAATCATTTGCCTTGTTTTCGTTGTTTCGAGCAAAACGCATTT-TCAACATTTTTTGGTTTGTCAGCGCCTTGCCTTCGCCCCGAATCTAAACACC-CTCCCCCAGCGCCAGTCGGGGTTTTGAGTTCAGGGTGGCTTTGGCCTGGTGAACCGAGATTCAAGTCAAAGTGCCACGGATAGAGCCACTGGATGCATCTGTCTTTAAAAGTATGGCGGGCATGATTTGTTTTAACTGGACAAAGGAACAAGTATAAACAGAAGAATCCGCCTTGGAAACTGGGAAATTTTGCGATGATTGTGACGATTGTGTTAACGACTGTACAGAATGGTATAATACTCGATACAGTGAGGGTGCTATCTTGGCCCAGCATGATTCCTGCCACGTTCAGTTCCACTGGCCCTTCAGCAAGCCCTTAGGCCTACTTTTTCAAG
A-----AAGTGGGCACGCCAAGAATTGCCACCGAATA---------TTTTTCGTTGTTTCGAACAAAAGATTTTTATCAACCTTTTT--GTTTGCCA-CGCTTGGCGCGCGCGC---------GCGCCACTTACCCCTCGCCG--TGGGGCGTGGCGTGGCGGGGGG----GGCAAAGTCAAGCGACTCTTCATTCAG-----TACGAACCAGACCATATATAATATATATTCTTATA--TATGATG------------TCAGATCGATCGAAAGGATATTTCGACAAAACGCAGCGCGTCGCGGCAGTTGGGCA----------------GCCGTTTCTGTCTGCCGGGAAACACAA------------------------------ATTTCGCCGCCCACTGGCACGCGCCACGCCCA--CACGACAGCCATGCAAC-------TGGGCCGACTTTTTCAAG
>tsh 21824410 21824606|23882 chr2L 21820838 21824629 scaffold_2 4458061 4461853 + 116545|3793 4066
GATAGAAATCAGAAAGCGCCATTTGAATTCCTTGAAAGACT---GGTTCTATCTGCTGATCGGAG--------------------------ATTGAACGGAAACTGGACGAACCCTACACCCGAAAACACGA---------------------------------------------GTCCTTGTTGGGGATGTCACATGCCAAGGCGAAAAGATATAAAATTGGATAAG-AAAACATTGTGATCAAATACAAGATAAA--AGTTTTTATGCAA
GATCG--TTTAATCTGCGCCTCGTGACATCCTTGAAAGACTTTGGCATCTGTCAGCTGAACCGGGCGTTGTTTCTCTTTAACTTTGGGCTCATTGCCCAGAAATCAATTGAAATTTAGAAAAGAAAAAAGAAAAAATACCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACAATAAGAAAAAGGCCCTTCTCAGGGCTGCCAAACGCCTGGGCAAAGAGA-ATGAAATTGGAAAAATGAATCATTGTGATCAAA------ATAAACCGACTTTTATTGAA
>CG1428 21895800 21895925|23965 chr2L 21894154 21895860 scaffold_2 4557241 4559012 + 15718|1738 1808
GAGATGTATT-TGGTGGACTGA---------TTTAAAATATAGACCACTAAAAGGATGCTCAAAGTATAGT
GGAATTTATTATGATAAGCTAAACAAGCTCGTTTAAGAGAGAGATTTGTAACCGCAAAATTAAGGGATTGT
>CG11634 21904895 21905041|23971 chr2L 21902958 21905164 scaffold_2 4566200 4568718 + 22920|2245 2449
TATTGG--AATGACTTCCACGACTTCCCCTTTC---------------------------ATCCGATTTCGCAAAAGTGCTTG------------GCAGAT-----TCAAAATTTAAAGTTATTTTGGGTGT------------TTTTATGGTTATTAACGTTCATGATGCGTGCCAATATACAATGTAAGTGCAGCTGTCAGCG
CCTTGGCTGCCAGCTTCCTCACTATCACCTTTTGGCTGGCGCGTTTCGGGAGTTTCCGAGATACAAATTCGTTCAATTGTTTATGCCAAAAATATATAAATTTCCATCAATATTTCGCGTTATTTTTGGATCAATGATAAGGCATTTTATGCTAATTGACTTTGATGATG-ATGC---GATCGAATATGATGGCAGCTGTCAGCG
>tiptop 22011522 22011906|24083 chr2L 22010948 22011587 scaffold_2 4696026 4696675 + 23927|604 681
ACTGCTGAAGAACGGAGAACTTGTAGAGAAGAGATGTCA------TCCATG------AAAACAGTAGAAGAATCTATT
ACG--TAAGCAATGGAGGG---GGGGGGGGGAGAGGTCAACTTACGCTATGCAACAAAAAAAACTAGAAGTGTTAATT
>tiptop 22011522 22011906|24084 chr2L 22011832 22013345 scaffold_2 4696676 4698489 + 11978|0 88
GTCGATGCCTGTTAAACAAACTTTAG-CAATCCGTTTGC--AAATTTCTAAACAA----CTGCATTGATTTGTGATCA-------TTAT
GTTCTTAATTGTGTTGCATAGTGTAATCGATGCTTCAGCTGAAACTCTTACGCAGAGCTCTGCATTGATTC-CGATCAAAGAGAACGAA
>CG3651 22112533 22112713|24161 chr2L 22112359 22112616 scaffold_14 477839 478128 + 6883|204 293
GACGTATT-TGCACAAC-CACTCATTTATTTTCACATTAAGCCGGATACACATCATCTCTCTAGAAG----TGCTTAGCCCAGTTTTATT
GAGCCGCCACACACAACACACACACACA---CAACAACAACACACACACACA-CACCACTTCAAAGGTTTATGCGTAGCTGCGTTTTGTT
>CG3651 22112533 22112713|24162 chr2L 22112617 22112638 scaffold_18 1444567 1444588 - 685|0 21
GTTTAATTTTTTTTAATAAGTC
GTCTATCTTTCACTTAAAAGTC
>CG3651 22112533 22112713|24163 chr2L 22112705 22112914 scaffold_18 1444641 1444822 - 2630|0 8
CTCCGCTCT
ATCTGCTCT
>CG6448 22146338 22147328|24203 chr2L 22146086 22147663 scaffold_14 536625 538379 + 2357|275 1505
TA-GTTTGCCAGAGTAGA---AATACTGGTAACCGGCAGTTTATGCTTTTTGTTTGGTGCACGGCATTTTTGTAGCCTA--------------TCTGCAAACAGTAAATTAAT------TGTGTGAACACGTAGGCATCCACACCTTTATTCCGTATAAAAATCATCAGCCTATATGAAC------------GCAAAAAAAATATTTTTATTTATCTTCTAT---------------------------------AGTGGATCTTAAT------TGTTTTACATTTAATTATTAATTTATTAAATTCAAAGGAGCAGAAACTTTTGCTCTTCTAATTATTTATCGAATACTCATGATTTGC--CTTTGCCTCGGGTATAGAAAATTGTAGATT---------------TGGGCAGAAAACCATATCCGTTACTTCTGCAGTAAAATGTCAAA----TAGATCCGCGGAAAAAAATGTAATAGGTAGAAATATGTCTGTCACGTCTGTCCG-----TATTTCCAT-------TTGTATAAACTTAGCGATAAGATTA------------------GGCATGCA---AATCGCTTTCATAATATTGGCATGAATA-----ATTTTTGATATTTAAATTGGCATTTGTTTTTCTTGCTTAATTCTTAATAT--TTGTCACGAAAAACACTTTCCCACCATCATTTAACGCCCACAAACTTT------ACAACTATGGGCCGATAAATTGTTCGAATGGCACTATTACTT---TAAAAGTTT-TAATGACGTATCATGACATAATT-------------GCGTCAAATACTTATGAGCAGATAGCTGAGTAACGGGTATACAATAGTCGAGGAACTCGACTATAGCCTAACTCTTTTACATT--------TCAATTAAACAAC-----GAAATATGTACTAAGCCTTTCTTCTAATTTAATGATCAAACGAGACTAGAAACCCATCTTTACTTTAAATATGTGCCCAATTGATTAATAAACCCAAAATGAGACCACTAA---GAATAAAATT-------GAACGCATGTCTTTATATGATTTGTTAGTTATGTGCA---TTTTATATTTTA-------------------ATATGA----------CTATACACAA--------AATCGGGC-TAATCTTTGGTATTTGTTTCTATAATAAAGTCCAAATTCTATT-----------------AT
CCTGCTGGCGTGCTTAGATTTGATCTAGTTTATATCCATTTGATTTGTTTTATTTCAACAACAAAAATTTGATATCACAAATTTGTTTTCTAATGTGCACAAAAATCACCAATGAGAAATGCCTAAATATATGTGCATACACATATGTAACATATGTATGGTAGCTAAGCGTACATATATTTTTTTTGATATGTAGCTAAAATCCTTATGATTTTTTTAGACGCACACACAACGACCCAAACACACACACACACAAATGTAGCTTGAAATGCAATTTTCTACATTTGATTTTTTATCG--TAA---CAAAGAAATTGAATTATTTTATACACTAGGTGCTAAGTGCAAATGCATTTTAGGCTACTTTTCT----GTTTTAACGATTGTAAATTACGAGAAACTGCAAATAGAGAGAACAACATTTACAC-ACATTCATTTTAAATTGACCAACTTTTTGATTTTTTATATCAAATGCAAAACGTACATGAGTAATTTTTA-GTGTTTACAAAACCTATTTTAATAAATTTACTATTTAATTTTAATGATTAATTTTTAATAAACACACAGCTATGGCATACAGTTAATTAATATTGTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTGTCATAATCCGCATTA------------TAATTATTATTATCATTATTATGATTATAACT-----ATTATTATTGTACTCTCGTCCCTTCTTGTCACATAACTTTATGCAATTCAATTGTTC--ATAGCATACTTATCTGCGCATAAGTTTGTTATGATTCTCATTGGCATAACTCATTTGAAATTCAGTTAAAAATTCTCATGCACA---ACCCAAACATCA---ATTCGTCATTTGGAATTTTCAATTTTAGGCTTGGTTTTTAAAATTAGAAAAATTCACGTACCTAACCACCCAAAACATAAAACAGACTTGTTTT------TAACAACATAGCGTG-CTATAAATTTGATTTCTTTTTATATATTTATACAATGATGTATTATCATTTAAATGCAACGAACGATTCGAAGAGATTTCTATTTCGATCACATACTTGTCTG-GGTATATAATTTTTGTAAAAATTTTTATAATTTATATAAAAAAAAAAAAAAAGATATGATATCGAAGTGCTTTATATAACGACTACAAAGCGGGCACAGCCCTCGCTAATGGTGGCTACAATAAAAACTAAACTATATTTTATACAAAAAATCTTTAT
>Tif-IA 22245773 22245854|24287 chr2L 22245217 22245789 scaffold_14 678609 679179 + 17642|564 580
TTTTACGAATAAGTCGT
TTTAACCAATAAAATGT
>CG17018 22356037 22356369|24340 chr2L 22352968 22356225 scaffold_14 728827 732263 + 96856|3292 3488
-TCACAACTCATACTTCCATTGTCAAAATAACTTAATGTAATAACAATAATAATTATTTAATGTGCT-------CATTTATAAATTCACTTAAATGACTTCCTAAGAATGCAAATAAGAAACAATTTTCCAATAATTGTAATTATTTTGTGTTAAGAAAAATTTTTTAACTTTATTGTAAGTAAATTTTATTATATA
GTAGCAACGAATTCTAAAA----CAAAAGAAGTT-------TAGAACTTATAATTTCGTAATATATTTTACGTACGACTGCGGAAGCGTTGAAACGTTTTGTATAGGTTCCTGGTGAGCCTTAAAATTGTCACAATTTAATTTACTTTCCATCAAGAAAA--TGTTTATCTTTATTA-----AATTCCTATTATATA
>l(2)gl 9836 11214|4 chr2L 9442 9897 scaffold_4 5382183 5382594 + 1731|407 473
AAAGTATATAATTGAGTATTTAGCTTAGGATTA-----TTAATAAAACATGTATTTTATTTAACAAA
AAAGTTTTTACTTTGGTTTTTA--TTAGAATTAGTTGATTATTGATGAATATATTTCATATT-----
>l(2)gl 9836 11214|5 chr2L 10175 11121 scaffold_1 3063957 3064895 - -1699|0 1040
TACAAACATGTCTCACTAAAAATCGAA---CGGGGACAGCAAAATAGGAACGCAAAAAAATTAAATTAAATTAA-----ACGCGATTTACATACAAACAGAAATGACAGAATGATAATATAAAATATTCATTTTTTATTTGGCTTAAGCGATGTTGTTGTTCCAAAACCATATAATTATTTATGAT-----TTTATGTAATGTT---------------------------TTCATGTATTTTCGCGTAGTGACTTTATACCCTTTACCCGTATGATGAAACGAAACATGAT-ATTTGTAGAAAGGTACAAAGGATAAAAGTTGACATTTAAGGCCGATTGTAAAATATTAAAACGCAACCTGGAT---AACATGCCGATTAATTACTTCTGTTCGTCCGTATAAACACAAATACCGATAAATTGGTCCGTCCCCATTTAAT-AAATTGTATATTAAAATGGTC-------TTTATTTTGGATAAATAATTCAAAT---TATA------TAGGAACATTTGGGTTTTAAGGGATAGAAACAGCGCTGGTGTCTTTCATTTCCGTTCGTATGACCGTTCAAAGATTATAAAAAAATTGTCGTGCCCACATTTTTT----AAATTTCTT----TTATTTTCGGTTAAAATAT------TGTGATACAAAAAAATGCCCTTACAAAATTAGGACAACAACAATTTGCTTTATTATG-ATGAACAAATTAGGAGTACAAAAAATAGCCTGATGCAAGGATGGGGAGAAAAAAGACCTTGAAGTTCAAAAGAATTTGTTGTATCAAATCCTCAATAAGAAAACTACTTAAAATTA-AAAGCGTGTTTC---AAATTAATTGTAGAATATTTCGTAAAATGAAATTGCAAACTTTTTT-----AGCACGAAATTACATGTATTTAATTCTTTGGCTAATACGTC--AGTTAAAAAAGGCTACATTTTGATGATACTCACAAATGTAATTTTTGCATTCT-------ACACAGGTGCAATTAAAAAATTATGGTTTTTATGAGTTTTA
TAC-------TTTAAATAGAAAGCAAAAAACATCAACAGAGAAATATAATCTCACATTTACTAAACAAAATTATTAGTTATGCTATCTAAATACTTACAGCTAGCACAAATTAAAAGCACAAAA-ATTTGTAGAAAATAAACCTCAAAGAAAATTAC----CCCAAAAAATATAAATAGCAATAATAAAAATTAATATAATAATAATAATACAAATAAATAATAATAATAATTTAAATACTAACTCATAATATTGCTAT----TTTATTCAAATATTTAATTCAGCTTTCTTCATTCTTTCAAACTTATAAAAACTACGAAAAAAAAATATAAATTAATCATAAAATACTTAGATTTAATTTGAATTTTAAGGTACGAGTAGATAACCG--------------AAATGTAAATA---------------------ATTAAATGAAATTAAATTTTAAAAAAATCAAAAATATTAATTACCTATCAAAGATTAAAATGTTTATACAACTTTATCAAAAGTTTAATATTATTAGGTTATAATTATTTTG----CTTTAATTATGATT--TATGATAATTTTAATAT-----AAAAGCGATCG-------GTTTTTTCGTGAAATAGCTTAAAGTCAAATTCCGTAAAATTATGATTACTGTTAAAAAAAAAAATGCTCTTACAATAATAAAATAACACTGACATTATTTATTAGGAATTGATTTATTATATATTTATAAAATATCTTAC-------------AAATTAAAGACCTCCAGAT-----AATATTCCTTTATTCAATTCCAAAATTATTGAA------AAAATAATAAAGAGATTTTCGATAGATTTCTTTTCAAATGCATTGT--ATTTAAAGTAAAGAGATCTTTAGTAAAGCACATAATCGCA---ATTCACATTTCGTGATGTCATGGCAAAGTTTAAAAGAAAAGTAAAAAGA-AACCCTTAGAAATGTCAATT---CATTCTTCAATGGACATAGGTCCACATTATTGATACAGTTTTTCTTGAGATTCA
>l(2)gl 9836 11214|6 chr2L 11122 12972 scaffold_85 1886 3842 + 52048|0 96
CATTGACAGAAGCCGTAACCTACTAATTATTTTAT----ACCTTTACAGAAATACGACGCAAACGAGTACTAGTCCTGATGTAATTTAATCTATAAT
GATTTATTAAAACATCCTCGTAAGAA--ACTTTATAAAAACTTTAAAACAAACACTTCACGGTCGAAGACAAATAAT-ATATATACTAATTTTCAAT
>CG31973 25402 26520|21 chr2L 25316 27612 scaffold_85 2603 5048 - 51273|94 1437
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AACTGAGGATTCTTAATCTAGACATGCCAGTTAAACCACGCCTATGCTATTAGTAACCTACTGTTCGTCTTGATGTGAGCTTTGAACACAGAGGAACAATTGGAATGCAATAGTAGATATTGTCATAAGTAAT--AGTCCAAAATACGGTATTCACTCGTTGATATGTTCTTTATATTATATTTATACTATAGCCAATTTGTTGAAGGGCATGAAAAAATGTATTTAATATTTTGATGACATGTTACTTAAATTTATTTATTCCCTTATGATAGACTTATGTATGTGTACTGTATATTCCTATAGTTTGCTACTCCCATGGAAATTTGTATAAGTACATTCAAAATGCAATATTAGTATAATACTTTGTACATGTAAAAGTTACTAACGTAATTATAGATTTCCATTTAAAT--TTAAAAAAGAAAAGCG------------CGTGTTTTAGGACTTTATAAAACTGAGGGGCAATACTCTTTTTTGTGGTTGATTTAATTTGTGATACATACTTTTTCATCTAAATATGTGTCTCTAAATATGTCAATAATTATCTGAAACCAGGCAGTAAATAATTTTAAC--ATTTTA---ATAAACAAATGTGTCTAAGCATTTTTTTTTATGTTCAACCTTGTATATAACATTTTAATTAAAATCCGGTGAAGGGGCCTAA-TAATCTTGGGTATATATATCACTCTATATTTTCTAACTATGATTT--ATTTTCAGAAAAATTCTTATCATACTATTATAAAACTAAAGATTTTATGTGCTTTCCATGTTACAATATCAAGAGCTCACGAAATCATATATATTATCATTTCTGAATTTATAACATTTATCGCATCATTCTAGCTTAAAGCATGATTTATATCATT----TTGACTAACGGTACTATTAAAGAGCTTAAACTATAAGAACTTACGTCTTGAACAGACTTTTTTTAGGCACCTAATGAAATGTATAATCCAATTAATGACCC-ATTTGTAACGGGAACCGCAGAAAAAAATCAAATCATAATGTCAGACTAGACTAGTAAATCCATGCAAAGTTTTAAGAAATTTGCGAGCCTA--GCGAATATTTTAACATTTAAGCTGTTAGTACTCATACGAAAGTATTAGATGGATTTGTAATTCTGCAAACTTAAAATAAAAAATCATTAAGATTAATTAATATTTAATTTAAGTATATTGTATGTATGTGGACACATAAAAAAT----TGTAAAGCTGAA-------CGCAGTTCAAAAAGTTTAATTTTACCAACGAGTGAATTATGTATTTTGTGCTAATAATTGTAAAACATGTAA----AATAAAAAAACAACGTAAGTC
>net 82456 83267|67 chr2L 81969 84308 scaffold_85 66109 68414 - 32771|553 1443
TCTGTCCAGTTTCGTGGATAACTT---ACTTTTTTAGACTTTAAATGCGACTGAT-----TTCTGCTATTTTTTTAAATATT--------TGTGCTTAAGCTTAGA--TTAATCTGCATACAGCATTCC----TATCCACATGCTTTGATTCTTTGCCAGAAGTGGCCTAATAGCTTTAAAAGTTTTCAAGGCTTTGTTAGATATACAGACTTCATGAGTTTAAA-----AAAAAAATTTTTAAGTATGCCTGCATACAATTTGTATT-TGAT--ATTGACATTGTTATGAATAAATACTAGCGATGTGATCATAATTTAA-------TCTCTACCTACAG-------------------AAACATTTTAGTCAGTACAAAAAGTCAACGCCATCTATGTACGAGTG-TATAAAAAGACAATAATCGGCATCCTTAAAACCTATGTAA----ATGACAATAATGTAAACTATATATTTACCTAAAAAAGTTTCAGTTTCTTGTTTCAAACAGGATTTTTATATCAATT--------TACAAGTTTTTAAAAGAAGCTTTGCCAAAATGTTGTAATTTCACCATCAACTTTAGTTACCTTAGGACTGAATATGAAAATGTATATTTTTTTACATGTACCTCTATAATAAGATCAATTCTTCTTTTACGAATTGCATACAACAGAGATAATCAGTAGTAATTAAAAATCCGTAGTTACGAAATTAAATAAAGAATTTAACA----AATTTCAGTTTATGTAAGTAACTGTAGACGTTTCCTCTTCAATTGTAATCTCATTGTTTTGTATACATTGATATATTTGTACCCATGTATACATTCATAAGTGTACGTGCCATAGAATCAG------GAAATACACAAAACTTACTAT
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-AATTAAGCCGTGCATCGGCTAAGTGGCTGGCTGTGTACAAATATCTGAGTGTCCAAAGTA--TTTAGTATATGTAAGGAAATGCGTTGTCGCAGAAAAGTTATTCATATTCCTATACCCTGTATT----GAAATTTTATTTACAAAATGTGTATATTTATTGTGTGTGACGGTGGTGGTGTATCTCGTTGAGGTGTTTATATTTACGTATTTATAGTTGTT---GCACAGCAGCAGTATTTTACTTAT-TCATAAT------TTTAATAATTCGC------CATTTTTGTAAT---CACGGTAG-TGATCCAAACAGGAAGAATTTTAAGCTTTATACAGATCA-------GGTAATTTTGTTTTATTACATGTA-----------ATACGTTGTG---------TGAAAATTTTGTGAG---AAGCAAACATTTGTATCTCATAC-----AAAATAAATTGTGATA---------TATAAATTCAA---CACAACTACATTTTGATAGTTAATTACACT-------GCTGAGTCGTTTTT
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TTTTATTTCGGCATCCTTAAAATTCTTATTTCTCCTTA
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CTATGGCAGATCAAGATCTGTACAGCATAGGTTTAGTATCCAAAGCCACTGGAAGCTTACAGGATTAGGGTGTTCGCTAATAAATTAGAGTCAAGTATTAAGAATAATTATACAGTACACTAATAAAACACAATACACCAC
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CGATATTATTGTTA
CTGTTTTGTTTTGA
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TAGTATGCAAGACAAATG-ACAATTATTTTTTCGCTGTTATTGTTATTAACAAA
>CG11617 204735 205043|176 chr2L 204845 204935 scaffold_42 594109 594203 + 2107|0 94
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TACAGTTCGTTACGAACCTTTGGCGTGTTTTTTTTTCTTCAATTTTAAAGTAATTTAACTACAACTATTCAAACATTTATAGACACTAGAAGGAT
>CG11617 204735 205043|177 chr2L 204971 206228 scaffold_2 999357 1000726 + 42062|0 73
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CTCCTAGACGGGACGCCACTGACGCCATCATTCCAG--------------GCCGTTGGAAGAGTGCAATCTAGT
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TGTACTCGGTATGTCCTATATACATATAAATATATACATATTCACATATACATACATATATATATATATATATACACACATATATATATATATATATATATATTGACGTTGTCGTCAAAT--------CGCTT-----------TTAATTTTATAATTTTAATTATGT--------AATTAGTAAAACA-------ATTTATATTGCATAAGTTTTAATTTGTA--TTTTGTATGTTTTTAAAAATGAATTGAAACCAAGCAACAAC-AACAACAACAAAAACAACCACACGAAAACACAACAAAATTGTTTATTGACAAATCGATTATTTTTTTTAAATACAATTATATCAATA
>kis 210732 212184|181 chr2L 211201 211342 scaffold_2 1007614 1007733 + 1438|0 144
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AAACCTGTACATA-TTTTAGTATCTTTAATGGATCTTTAATCATCAAATCGGATCAAATCGGATCGTATCAG------------------------AATCCCAATTCATGTATTTGCACTCCATTTGTTTGATTTCATATTTATA
>kis 210732 212184|182 chr2L 211991 214983 scaffold_2 1008572 1011662 + 105553|0 220
GTA-----TTGCGCAGATCCGAGCGCCAGCG-CTAGCAGAATGACA--CGGCCCATACTAAGGGCCGGAGAAAATCGC-------GTAGAGGAGAAGCCAATCCGGCCAATA-------CATGCAAGTCACCGGAGCAGAAAATCAA---CAACAGAAAGATG--ATGAGAAACCAGCTGCAGATGCGGATGCAAACGAGATCGAGGCGAAATTTAAATGC
GTAAAGCGACGCGCCTAGCCAGACGACAGCGCCCCGCCGGTGGGCGCCCGAACCAGACAGGGCAACAAAAGCAACAACAACAACAACAGCAACAAAAACAATAAAAACAACAAAAAGAGCAAAAATGATAACAAAAAGAGAAACCAAAAGCAACGGAAAAAGGCCACGAAGAAGCAGAAGCAGAAGCAAAATGAGAAGAGAAAGAGCCAAACGAGTAATGC
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CCTTTAACTAAAATACATCAGCTTTTTT------AAT
CATTCAATTTAATTTGAAAACTTTTTGTGTAAGCAAT
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CCTTAAACCTGTACTTTAGGAAACACCCTTC----TTGTTTTTGTTTCTATGACTGCGAATAAAAAAAA
TTTGTACCGTCTAATGTAGGAAATTGCTTGCATTGTTGTTCCTATTCCTTTCTGTACAATTAAAAAAAA
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GTGTAAATTTGTTCAAGTACATACATGAATAGATAAGCATAAAACTAATTTTAATATAAA
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GGCACGCGACTAACAAAC------TCAATTACTCA----------------TTTGAAAACCAAGAGATTTGTTCATTGTGTTCGTTTGTCCGC---AGAGGCTGCTATAAAATACACTCCATTGTATA------TATCTTATGTTTTTAATTTA----AGTAAAAAGTAATTAAAA
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----------CGAAACCAAGGAATGAAACACAAATTCGTATG-----ACAGATTTTATAGCTTTAGCTAGCCTGGAATGGGAAGATCCTCT-TTCTATATATAT
>U2af38 293337 293621|264 chr2L 293311 294417 scaffold_2 1113339 1114487 + 45550|26 348
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TGGTCC---AAAATTTGTTTGGACTTCGGACTATCAACTACGTTATTGGTGGCAA-TGTGAGAAAACGAAACG---CCGCAGTATCG-------TCGTGTATTTCTCAACTCTTCACAGTCGACATTTGTTTTTTTATGATTT---AGCGCATGGGGTG--------------------------------TCCACCACACATAATGTACAAACCAGCCGTGACACGATGTGAATTATTTGATCGAGCGCCCATTAGAATTGTAATTACTTATACACACATTCGTAATAATAAAATTGAGTAATAATTATA----AAGATATA
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TAGAAGGTACCAAGTCTAAATTACCTTATGCA
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GCATACGCACCTTTGGCTTTTTGGCATACTGTCCGGTGCGCACATCGCGTATTGTGGCAATATCCAGTATGTCGAGCTCATTGTTTTGATCGACCCAATATAGAAAAAATCCTTTGGCATCCACACGCATCGTCACCGGCGTACCACTGCCCGAATCCTGCAAT------GGAAAATCGATGAAAAAACAAATGTCTTAGTGCAAGATCTGTGTATGAGGTTTTTTTGTAGT----------AATAAAAATGAAA-----------TTCCATTTGCGCCCAAATCTCTGTTGAC-TGCGGTTCGTTCAACTCGTCGAGA
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-----CCGTCGAA---------TCCATGGTGCCTTAGAAATCTTTGTTTACATTTTAAACTATCTATAGCTAATTATATGTATATATTTTTTTACCCGTAACAAACGTCCCATTTTGTGTCCGTGTGATTTCCTGAAACGTAATGCTCCAAAATTTGCCAATGTCTGTAAGACTTTAGACATATCTAGACGAACTTATTTGTGTTAACATTTTAC------AATCGGTTTTCATTGTTTCTATTGTTACCTGTAAGTTTTATGACGTGTCCTTAATTGGCCACATTTTGTATGTATATAGGTTTTAAAAATCAAGA----------------ATAAAATTCGTTTTTTATTTTAAGG------------------------------TAA
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TAATCACTGTTGAGCAACTTAAA--------------ATTTATTAACGATAGGAAAAATTTCCCTATTGAAGAAAACG-AAGCAAAAATTTCAGAATATTAT-----------------TATACTTATAGCAGAATTTTTTGAATGATTCTGGGTAATATTACGTTTCGTTTGTGTACCATAGATAAACTGAGAGGGGCTA------CTTCATGTTGTGCCGCTTCCTGAAGAGAAAGCGATCTTTGTAGCACCAAGTATTAACTAATCTGAAGCAGCAGCAGCAGTAGCCGCCAGCCATAAATCTGCTAATGACTCTCTTCAAATGCGAGACGGCTGCCGATAAAGAACAAAGAATTGTAAACTAAAATATACA----------CTATATAGATACTGATACTGAAAACCGATAATGGAAACTGACA---TCAAATACTTATTACCATTAAACTCTCGATCCTTTCGTAAAAACCAATGTGCATGACAGCTGGAAATTTAGGCATTTCCAAAGTGCAATAGTTAAATGTTACAAAATTCCACACAAATTCCATTTAACACTCACAGACAAAACAAAAGCAACTGCAAGAGCAA--------GAAAACCAAGCCACAACTACATATAGCAAGTGCAGGAATTTAACTGTAAACGTAAACCAATATGTATTTAAATAAATATAAATTGAAACCATTTGAAA
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>alpha-Adaptin 408022 409387|377 chr2L 408663 412692 scaffold_6 4572856 4576924 + 177340|0 1002
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ATCAGGCAGACAATCGTCTAAGTGGGGGATATG----------TCTAGGGAGCTACTGCAGCAAACCACATTTACAGAATGCACAAT-CCAATCACCTAGAGAATGATATCAAATCAAAGTATATAATGACGTGTTTCCTCGAACCTAAATGCGGGCTATGTTTAAGCCATTAATTGTGCTACGTATTTGTATGCCACGCCCACGACCACGCCTCTTCACATGTTTACCTCCTCTACTAGCACACACCAACACACACACATAGACACACACCTATTATACTATACTGCAGTGAGTTTTGCTTTCCCATTTTCAGCGCATGCAATTTTTCACATGTTTTATATATTTCTTAACGCGCTAGTTGTTAAAATGCGTCTGATTTTCCATTTTCAATATACTTATTATTATTATTATTATTTTTTGTAATTGCTAACGAGAGAGAATTCTTTGTAAATGTTAAGCTCAAAAAGTTCAT----------TAGTAAAACATAATTAGATTATGT-----TGTATGACAA--------------------------GCATTAGCAGTTGGATATTACTATATATATATATATTTATATATATAAAACAGATTCATACAAGCATACATGCATATACCTAGTATATATATATATATATAAATACACACACACATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAAACATTGTTGTAATAAAGCAGCAAA----AGAAACAAATTATAAACA-ATTTATAAATGGAATGATATAAATACAAAAATCGTTATGTTATTAACAACAAAT-TATTACGCAT---AAAGGCATAAAAAGAAAATAAATTCAATGTTTAGTGTTTTTTGATTGTGAGATTGTGAGATTGTGGAGAAAAGTGCGTAGGTCCTTGAGGAATTAGTAGAAGTAGCAGCTGGCGCCGTAAATCTCATTAAATGATAGACAAATAATTAGATGGTGAAAATCACAAACAAATTTTTTCGAT
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ATATATGGCAAAAATTTTACATTTTCTCAAAGATCACATTCCTCAATTTAGCCATAGACTTTTAGTCGAGAAAAATCTACGCAAATATTTG--TGACATCCATCAAAAACTCAAATTAATTTTTGCACGCACACTAACACATCCAAAAAAACAGTGGGGGATTATTAATCGAA-CAAAAAATAATAAACAAAGTGGATACAAAAA
GTATACAATAAAAG---------------------AAACTAGTAAACAAAATTATAAAATGCAATTC-------ATTT-------TGTTTGGCTGATACCGATTAAAGACCCATACAGACTTATTGAAGGCCATAAAGCCATACATGCATACA-TAGGCAATGAAAAGTGAAAGCAAAGAATAATTAATCAAGTGGATACGAAAA
>crq 448254 449020|423 chr2L 448465 448823 scaffold_6 4624024 4624363 + -84|0 388
TAAAAAAAAAACCTTACTCTATCTGCATATTACACGAATCATTCACAAGTTGAAACTTTCTGTTTGAGACTTAAGTTATCGTACTTGATAAACAATACTTCATACAACTAAAACACTCCGTGCATTTTATTTTAACGTTTTTATTTGAATTTTCATTTATTTTGAAAAGATAGTTTTTTACAATTTCTGTATGCTTTTCTGCAGGACTTTTACTTATCGTATACGATTGTTG-GATGCTTTAACGATTTGCTTTATAA----ATGCATTATTCAAATGTTGTTTTGTAAATTAATAAATA-----AAAATAATTGTATACGTATATATATTTATTTATAT--------------------ATATGTATATATATTGGTGTATATGTAAG
TAAACACACACACACACCCTAT-----TGTTAAGTACAATATATACA---TGGACTCTTTGATGTATGACCAAAACTG------------------ACTCCCACCCTCCCAAATGTTATGAAC---TTGCCTCAACATT----------CCATTGTCTGTTCTGAAGCAACAA-TTTGTACATTAACTATAAACAAT-----AGTAATAGTATTTGTAACACGCTCTCTCTGAGAAGC----AAGGTTTAATTAATCATGATTTTTATTACTCATATATATATATGTATATATATATATATATATATAGTACACATACACGTATAGATAGTTATTTCTATTTTGGCACCGACTGCTGCACATATATATGTATATATATGTTTATGCAAG
>crq 448254 449020|424 chr2L 448870 450956 scaffold_6 4624402 4626348 + 72403|0 165
AGCAAAATAGTTTTTAAGCTT-------TGCCAAA-GTGCCAGGAATT--GTTAAC-TCTCCTAGTTCATTCTGAT-AGTCGCCCGTCAAATGCTGTTCTTTGTCAGTT--ATGCGTTATGTAATATGTAAG-TGATACGAATCGACGTTCGTCTTGCAGTTTGTG
TGGCAGCTGCTTAATACACTTACTAAAATGCCAAATGTGCCAGGACACAAGTTAACGTTTGCTAGTTCATTCATATAAGTCGC------ATTGTTGTTGTTTTTCTGTTGCATACAGTTGCCATTTTATAAGTTGATAGCAACCGATATATA---TGCCGATCGTG
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GAAGAGCAATGCGAGCAGCATCAGAACCAATCTCAGCCC--CACAGTAT-CGCCAGCTAAACAGAGATGAATTCCCACCAAATTTCAAAACAAATTAACATCTGAGTCAAATTCGAAATGCCTTCTCGCTCTCATGTAGCTGGTGTAGACTTAAGCTTAGTTAGGAGCTAGATCTTGTCACCGTTTTGTGCATATATCAACTTCAAATTCAATA-----CGTAATACCCAAATCGGATA--------GATGCCACTTCTTTCCAGGAGCACACAGCACACTTCTTATCTAAGCGATCTTCTTCAGATTAATATTCTGAATATCCCTAGTGTTTGTACATACTATAAAGAGACGCATTCGGCGTCCAACATCTGTGATATTTAAGTTTTCTTAACTCTTT-TCTATTGTACCATAGTTGTCAGTGTAATTCTCTTAAGCTAAAACACACACAATTGTATTTATTGCTAAATGTGAAAAAAAGAA--AATGAAAACAAATAGAATAATGGATCATCGCACGATTCCAATCTCAACAAATGAAAA----------TATACATATTTTCCAAAGAA--AACTAAA
GACGGACCA------------------CAATCTCATCTCGACACAGTATGAACCAGCTCAA-------------TCACAAAACT--GGAGCACATCCATATGCGGGCCAGCT--------------------------GGCGTTATAGTTTAAGACCTAGTTAAGAGCTATTTCTTGTCATCGT--------TATTCTAGATTCATATTACACAATTGTCCTTATGTCCTTAT-GGATATGCTGCACAACACAACATGTTTCCA---------AGCACACATTTTAGTTTAGAGCTC---------------TTCTGATAATACCTAGTGCATATATATACTATATA-----CTATATAGCTACGA--TTCTGTGATATTTAAGTTTTCTTAACTCTTTCTCTATTGTACAATAATTAACGCTCTTACATTTTTTTG-TAATCTTAACGAAATTGTATTTATTGCATCATGTGAAGAAAAGAAGCATGGAAAATACCTGGTACAAAG-------CCAAGGTACAAATCTCAAGAAAACAAAAAAACAATACGAAAATATATTTTCCATATAAATATTTAAC
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AGCCGGGAGGACGCAACATCCGAACAACATCCCCACTCGTTCCATCGTAAATGTCTTCTGCAGCTAGCCAAGCTCCCTTTCGTTTCGATATGGCTTCTCCATCTACCGCAGTCCATAGCTCATATGGACTAACACCGCTACAAAAGACGATTCACTTACTGAGTTAGTTATGTACGTTCCTTGGCCAGGCACAACAATCTTATTTAGTTCGGTTAGGTTACAATTGTAGAAAATGTTCCCTCGACTTTTTTACCGCAATCAATTTAAATATG--TATTTCAAATATTTCTGTGGCTCCGCACAGGAGGCTTATATGTTTAAGAACAGTTTAGATACAAATATATTCCAATTTTTGTAAACAGTGCAAT--TTTGACTACGAATTCTACATTGCAT----TTCTTAAAAC------TAATGCAGTAATTTGTGTAAACAGTAATGCGAATAAATTTTAAT--TCTAACGTTTAATTAAACTA
TTCATTTAA----TGAATTCCAAGCGCCGTTTCCAC---------------------CAGCAAGCAGC--AGCCCGC----------GTACAAGTCTTCTATTTTTGGCTAGTAACAAGTAATAAGCACTA---------------------CATTTTTTTAATTTTTATTTTGCGTTTTGT-----------------TTTCTTTCTTAAATTAGCTTCCATCTATGCTTAATGCAA----------TTTACTGCAATCAATTTATAAAAGACGATTTTGACTATT-AGGAAGTTAGGCATGTTCCTCCTTTCTGTTCGATTA-GGTTTTATTAATAAGAGAT--CATTTTTTGCAAA---TCCAATCTTTTTATACCAAAATCAAAAGTCCATAATTCTATTTAAATGAACTGTAACAAAATTACATCTAAGAACAATAAC---AATAAATTGAAATATTCCAAATACTAAATGGATGG
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CAAAT----CATTAACTTGTACA--CGGTAAGAAAATACTTAGGAATAAAGTAAAA-----CGTCCTGAGT--
CAAGCATGCTATGTACATATAGAATCGATATATACTTATATATGTATTTAATTAAAGTTGGTACCCTGAATTT
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TGATCAAAGCGGACCAAGACCACTCAAAGATGTAGTAGAAGTTCCAATCTCATTGCAATGAGACACTTTTGTATTATCGTCTAAGCCAAATGATTAGTCCACAGTAGA
C-----AGGCATCCACGGACTCCTC-------TTCCAGCTGGTCCAAC------------ACACATACTTGTATTAATG-CTAAGCCAAAAGATTAATTCGCAGCTGA
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G-----------------------CCTGAGAAGAAATCTATGTAAATA-----TTTGCAGCGGCGCTTCAATTT--TGTTTTGTATATAAATAAGAGAACTAAAAAACAAACT
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TGCAATCGCAGTA----ACGACAACAAAGCCAACAAAGACTCTCTGA--AATGCG------------------AGGAGCAGCAGG---------------AGCCGGAACAGCCATACGTTGTAAGCATTT--------------------------------AGAGCCTAGAATAACAACCGAACTCGAACCGAATACACTCGAATCTGTTTCCGTAGCTTATAAGAA----TATATAAACTGTAGCTGTA-GCGTAGGA-CTAAACTACTTTT----------------------ATCG--------------------GAGCAAACCAAGTGCACTTAGGCAGCAGGTCATCCCTGTTTAAAGGGGATCAGA-----------------------------TCCGGCTGCATCTCACATTTCC-ATTCC-----------------AATCCATAT----------------------------------------------GACGGTGAGATGCGAAAAA-------------------------------TTGTAAAAAGTTGTTTTTAGTAACCAATGGGGGGAAAAGAAAAGAAACCCTTGTATAAAACT-----------GAATTGAAATAACGAAGCAAAGAATGAAAACGAAATATATTTAAGTATTTTTTTAGGTATACCCTAGTTATTAGTTATTATATATGTACATGTAAAGCTATGG-----ATCATAGTGTATGTTCAC-TTGTGTGTGATGCTACTTGTGTAATT-CTTTACGTTCTAGCAAAAAACTGTAAAAATGTTAAACAGTCTAAGGA----------------------TCCACTA------------TCTGCTAAGCCAATAGTTTGTATTAGCTAAACGAAAGCAAGAGAATAAATATTTAA-ATAAT
TACGATTGTAGTAGTAAACGACCACAAAGCCAACAAAGACTCTCTGATAAATACGCTTGGTTGGCCGCCTCGAAGCGCCAACGGGCCCCAACAGACAAAAAGCCAAGCCAGCCATAAGTTGTAAGCATTTCTTAAAAGCTAAAAGATACAGAAATAAAAAAAAAAAAAAAAAACAAGAACGAAAAACGAAATAAAAATAAACGTAGACCTTAACGTAGTACGTAATAAGTAGTACGTAAAACGTAGAGTTAAGCATAGGAACTAAACTAGTTTTTCGCAGCGACGCATCGCATTGCATCGCAACGAAAGGAAACGCGACTAAACGAACCAAGTGCACTTAAACCATTAAACATTACCATTTAGAATCGAACAAGAAGAAGAATAAGCAAGGCTCGCTCGCATGTCTGCCTCCATTCCCCATTCCCCATTCCCCTTACCCATGCCCCATACCCCATACCCATAATATCGCGCATTATCAAAATAAAGAGAATAATCAACTGAGATACCGAGAATTGCGGAGAAAGAGTGTAGAGTGTTGTGTCAGGGGAGGAATTTGTAAAAAGTTGTTTTTAGTAATCATTGGAGAG-------------CCCTTGTAAATGTTTTTCCACACGAAGAGCTTACATATATACCATATATATATATACGGTATACGATTAACGATATTT---GTTTTAC----GATATTCGATTTTAAGTTTAGGC-TCCTAAGCTGTAGTTAGTTTCTTAGTTATTTTTCACTTTATGTGTGATGCTACTTATGTAATTGCCTTACGATCTAGC--AAAGCTGTAAAAATT---AAAAATCTAAATAAAAATATATATACTTTGTATTGCCCATTAGATCGTTAGCATTATGTTTAAGCCTTAGCTGTTAATAGCGAAAGAAAATCAA-AAAATAAATACAAAATATACT
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TCGAGCACTGGAGCTGTATATCCATCC-------------------------------------------------------------------------------------------------ATATAGTATTAATTGAGCCACCCCACTCACCCATACACCCACACAAACACAGAAGCACACATCGATACACTCACACTTATTTAAATTGCTGTATATATA-------ACATACATTACCCTCTAAGTAAC
CCAGGAACTGCAGCCGCA-ATCCTCCCCCCAAAATCTGTGTGATCACCATTTAGAGTTTAGCATAGCGTACTTAGTTCTAGTTAGTGCCAGAGACTTGAATTTGAATGGAGCGCAGCTGCACATGCATAGTATTACTTGCACCACACCACCCTCACACACACACACACATATACATCAACACACATACATGCACACGCACATACGCACACTTACATACATATAAATATGCACACACAACAGGGTCTCAGCAAC
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AGCAAAGGACGAAAAAACGCTGAGCGCGGGATTTTTTGGGATCCATCCTGGGAACTATGTGCATAATCT--ATGGGTATTATTTTGTAAGCTCGATTGTGATGGGGTCACCAAGCTGATTTGTTTT----ATAATGTTGTTTA----------------TTTATACGTTATATATGTGTTGTTTGGGAATATTATGAGAGATCAATGTTTAAGTTGAT--------TGAGGAGGGATTGAAAG-GTAGAATCGCAGGTTGTACAAGAAGCTGGCCTAGATTTAGTTTTAGTTGACCTCCTATTTTCCCGAAACTCACGTTTGGTTATACGCCCCTGATAAACAATTAACAACTAATGGCTATGGAATATCACTTACCAATTACTCATTTTCAGTTACTGATAC-------CAAATATCACACATGCATTCGTAGACTGATAGCAGACTTAGTAGCGATA-ACTAATATGTATCTGCATATATGCAATACTTACTAACCAATATCCGACATTCGATTTGTACGCGGACGCATACGCTGAATACAATAAAGTTA-------------------------------TTATATACCACCTA
AGAAGATAAAGAAAAAACAAACA---------TTTTTGTGATGTGTTTTA--AACTATATGCATAATCTTTATGGGTATTATTTAATAAGCGC--------CTCGGTCGGCTAGGCGACCTATTTTTGTGATTGTGTCATTGACGGCGAGAGTGGAAAGTTTATA----ATATATTTATGATTTATGACAATTTTCTAATATATATCTATAACTTTATGTACTATATATCTATGATTTCAAAGTGCAAATGCGCAGGTTGTAAACGAAGTTGGCCTAGTTTTAGATTTAGTTA-------------------------TTTAGTTATTCGAGCC-------CACCT--CAGTTAGAGTCCTTCAACTTTTCTTTTCTTAACACTCACATATATGTACACATATATATGATTATATAACCCTTATGCATACGTAGACTGATAGTAGTATTAGTGTGATTATATTGAAACATATATACTTACTTATAAAGCAAACTAAACCATATCCAACATTCGATTTGT------ACGCATATGCTGAATACAATAAAAATACAGAAAGTTATAATGTCAATCTGCATTCGATTTATAT-CTATCTA
>Eaat2 737211 738268|791 chr2L 737738 738441 scaffold_6 5009432 5010108 + 13996|0 569
GACATGCCCGCTGGCACCCCCAATGGACATGGACATGGACATGGACACCACGATGGAGGACTTCTCGAGGGGCAGACCGAGTTGGAGACGAGCAGCAAGTGCGTTATGACAA-TGACGGACTCGGTGGTGGTGGACATTAGTGCGGTGATGAATAACGTGAACCTGCAGCAGGAGCATTGTAACCGCAGGGTCTAGGATGTTTTGAACAGCCCAGATTCGATTTTAGTTCGTCAGCATCAGCTC-TATAGTCCCAGTAGC--GCCAC------CACCACAATTACAACACATATGATATTCACCACCAATAGACCGCAGTGTTCCCCAACAAAC------AAATTTTTGATATAG--GATCTTTAAACAACAAATGATCGGATATATATCGAGA-----------GACTGTCTGACGAACCCACCCGCATTGAATTTACTCCTCTTTTGGACCAGTGTCGATAGCAATTAATTAGCCTGAACACTTAAAGGACTCCGCATACGTAAATATGGA-------ATATTCATCTTGTAGGACTCGCATAAGAATAT---TATATGCCACATGTA
GATCTGCCCGCTGGCACGCCCAATGGACTGC---------------------ATGTTGGCCTGCTCGAGGGTCAAACGGAGCTGGAATCGCCCGGCAAATGC-------CAGTTGAACGATGCTGTCGTCGTGGACATGAACGCCGTCATGAACAATGTGAATCTGCAGCAGGAGCAGAGCAATCGACGGGTCTAAG--------------CCGGATATGGATGCAGTATG-CAGCACCAGCACGTAGAGTACCACCAATAGACCACAGTGTTCCCCCCAATAACAACA---ACAACAGTAACAAC-----AACAACAACACCTTTTGAAAGACTTTTTTTGATTTTTGATGAAGCCACTTTTCAGCGAAAAAATAGACAAAAACATTTTTAGAAATATGAATCCAACTGTTTGA-GAGACTGTCCAAATAGAATTTAGCTATGATTTGAGCCCACCCCGAAAGAAA-TAAGAAGAAGAAAC---TAAAGTATATCATATATATACACACACACACACATATATACATCATAT---------ATATGTATATATATATATG-CACTTGTA
>Eaat2 738321 738435|791 chr2L 737738 738441 scaffold_6 5009432 5010108 + 13996|631 745
GGATCGGATTCGCACCACCAATAATATGCTGGGTGACTGCTACACTGCTGCCGTAGTCGAGGAGTTGTCGCGAAAGGAGTTGATGGCTTTGGATGCCGCTTCCGTTAACTATCAG
AGATCGCATTCGCACCACCAACAACATGCTCGGGGATTGCTATGCCGCCGCCGTCGTCGAGGAGCTGTCCCGCAAGGAGTTGATGGCTCTGGATGCCGCTGCTGTCAATTATCAG
>Eaat2 738504 738555|792 chr2L 738501 738880 scaffold_6 5010556 5010929 + 21732|3 54
TGCGCCTGTTCAGGATGTCACGCTGCTCTTCGCCGTGGACTGGTTTGTGTGA
TGCACCCGTTCAGGATGTGACGCTGCTCTTCGCCGTGGATTGGTTTGTGTAA
>Pkg21D 786153 786259|852 chr2L 786254 788201 scaffold_6 5073537 5075490 + 108012|0 5
GCCCAT
CTTTAT
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AAGGGACTTGGGAAAGTATTATAAGACCTTCTGGAGGTCCAGGAGGACCTGGGGATCTCAATAAAACTCTTCGTTTACT-TTAGACTTCCTCTTCGGTCTTCCGAAAGGTGATACAACTTTACTCGTAATACATAAAAACACAGAA
AG-----CTGGTA----ATAATAA-------TCGAGAATCAGTAAAATATATG---------------CCTCGTGGACTGGGAAACGTGTTCTTT-------------GTGACTAAACTTTATT--TAACACATGTA-------CA
>CG15880 817196 817235|890 chr2L 811556 817223 scaffold_6 5112309 5117994 + 186586|5923 5951
TGGAAGGATGTCTACA-ATTCTAATCCCC
TAGAAAAATATGTATTTATTCTATTCTTT
>CG3876 818075 818506|892 chr2L 817953 818379 scaffold_3 2752302 2752733 + -77|128 456
TTACGAGGGATTCCGAGAGGAGACGATTC-AGTATGACAGGATCTGATGCATACACACGCTTTTAGCTTTAG--GCTCTAACACGATTTTACACCTAAAGGATCTAGTTAAATTCGAACCGAGTTCCATCATTATGTAGTGCATTATTTA-TACACATACTCATTTAGGAACAAGGCTTCAATAAGGTTTT--ATTTTATACGTACTGAATTTGCTTTTATTGGCTTCTAATGT---------------TCTAATTCAT---TATTTTGTAAGTCTAAAATTGTATTTATTAGAATTCAGATAAATTAACTTTTTAATTGCTTCCAATT
TTA--AATAAATCCGCCAGGACTTGATTTGAATTTGGCTGCTGCTTTTA-ACACACATGTATTCAAATGAAAAAGCATAAAGTTGGCTTTTCCCTTTGAGAATTGA-------CCAGACCAGAATAGCCCATCGAGCCCCAAATGATTTAATATGTATA---------GAGCCAAACTTTATTAGAATTTTCAATGATATGAGGTCAGAACTTTCATGC-CTGGGTCCTCATATGCATATGGGAAGTTGCCCAATTAATAAATATTTTGGCAG-CTAAACGTACAATAATTGAGATACATATTTGCAAACTTTTAATTTGTAAGTGCTT
>CG3876 818075 818506|893 chr2L 818380 821021 scaffold_6 5119178 5121646 + 86577|0 128
ACCAATGAACTAGATCAAACCCAGCCTGCGCCGCCATTTCAGCCAGCCAGTCGTCCTCGAGTATTG--TGTACATACGCGGTATTAGCTTAAGCTCAATGTTTACTTAATTTTACCAAAAGGAAATTGC
A------------------------CTGCTCCAC--GTCCAGCGACCGTATCTCCGGCGTATTCTGTATATACATATGCGGTATTAGCTTAAGCTCAAAGTTTACTTAATTTTATTTAA--GAAATCAC
>CG3862 824326 824432|898 chr2L 823968 825769 scaffold_6 5125891 5127766 + 72301|484 590
ATTAAGCTGTTTGTTTTAGATTAGTTAACTTAAAGTATACTCTAGTCGAAAATACTATTGCCAGTGGCAGCCCAACCAATAAAGATCACACTGCTAAAGATCACAAA
AT----------------------------------------------AAACCACAATTAT--------------------------------TTAAAGATCACAAA
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ACACTCTGTTATTTGTTTTATCCATCCTCGTACTTGT--------CTTTGTCCCATTT-----------------AGCACTTTCGTTGCG---GATAAGAACTTTGTCAGTTATTGATTGTGTGGCCTTAATAAGATTATAAAACTAAATATTATAACGTACGACTATAC-ATATAC----------GGATACAGATACAGATTCAGACACAGTTAGTACAGATACAGATATACATATACGCTTTTGTACCT-AATGAATTGCTTCTTGTTT---CCATTGCTAATCATCTGCTTTTCGTGTGCTAATTTTATACACTAGTACGTGCGATATCGGCCGTGCA---------GATAGATTGCTCAGCTCGCGAGTCAAGCCTCTTTTGGTTGCACCCACGGCA-----GACATTTGTACATATAC-------TGTCTGATTGTAAGCC--TCGTGTAATACCTCCAT--------------TAACACCACTCCCCCACCACCCATCCATCGAACCCCGAATCCATGACTCAATTCACTGCTCACATGTCCA--------------------TGCCCAT-----GCCTTAACG--TGTCAAACATTA--TCGAAGCCTTA----AAGTTATTTAAAACTACGAAATTTCAATAAAAACAAATAAGAACGCTATC
ATACTCTATCTTTAGCATTGTCA--TCGCATACTTGTTGTCAGCTCTCTGCCCTATTTCTTTGGGCTTTTCTTTCAACTCGCTTGTTTCGCTCTACGAAACTCTTGTCAGTTCTTGATTGTGTGGCCTTAATAAGATTATAAAACTGTTCATTAAAACTAACTATCATATAATATACTTACCTAATATGATATACATATATATCTATATATA-CGAGTACATGTA-----ATACATATATGCTTTTGTACCTAAATTAAATGCTTCTTGTTTTAATAATTGTTAATCAAC---------TATGATAA----ATAAACCACAACCAACCAACACACACACACACTTAGAAGGGTTAGTTTGCTCAACACAAGAAGTTAAAGTTTGTTAATTGCGATGATAAAAAAAATAAAATTTATATATATATATATATATATCTCTTTATATACTTATCAACAAGTATATATATGTTATGATATAGCGTGACATCATTGCTGAAAAAAGAAAGAATCAAAAC---AATATAGGGATTGTTTGAATAAT-ACGAGTCCAAATAAGAAGCAAGTTGAATTTTTCCATATTTAGCTTTAGCGTATGTCAAACATTATCTCGAAGCCTTAAAACAAATTATTTAAATTTAC-AACTTTCAATAAAAACTAAGACAAACAAAAAA
>drongo 833584 834544|905 chr2L 834195 834605 scaffold_6 5143416 5143963 + 2650|0 509
GACTCA-------------------ACC--------------------------CGGGAGAATCCGCC------------------------------TCGCGCCACCTGGCAGAGGCGCTGAGCCAGCGAACAAAGAGCAGACGCGG--------------------------------AGGAACCGAACCGAAATTAGTCCATTTTACTAACAATAGCGTTA--------------------ATCTATGTATACATA-----ATGCACGCCGGAGAGCAC-TCTTTGTGTACATAGCCCAAATATGTACACCCGAAA---------GGCTCCACGCTGA--CGCTAGTCCTC---GCGGATGGCGGAG-------------GCGGACTGGGGCGTTGATATATTCTTTTACATGGTAACTCTACTCTAACGTTTACGGATACGGATATTTGTATTTGCCGTTTGCCCTAGAACTCTATACTTGTACTAAGCGCCCATGAACACTTCAT
GATTCAGAATCGTGTGGAGCACAGGACCAAAAGCGGGAGCGGGAGCGAAAGCAGAAGGAGCACCAGCCGAAGCAACAGGGCCAACAGCAGCAGCAGGAGCTCACATCATGGCTGAGGCGTTGAAGC--TGAACAGTGAAAAGCCGCTGAACAAAAATATTTAAAGCAAAAAAAATGAAGCAAAAAGTGAAACGAAATTAGTCCATTTTACGAACAATAGCTATAAAACTATAAAGTATACATACATGTGTATATACATAGGCATATGCATATGTGTGTGTGTGTGTATGTGTATATATAGTATATATTTATATAGATAACGTAGTCTGTGCTACATGCTGAATTGGTATCCATTTGAACGGATCGTGCAATATATATATACCCATATATATGTATATATATATATTCTTTTACAAAA-------GCTCTAACTCTC----ATATGCATATTTATA--------CGGCAAAAGCACAC-ATACATATGC-ACACACAGATATATACTTTAT
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AGGAGATTTCCAAAACCCA---AAATATA-----ATAACGAATAGTTGACCTTGACCTAT-----GACATATGACAGAGCTGATGCGAAAAGGAATCGAACGAATGAACCCTACATATAATCGTAGCTT--ATATTTTCGTTTCGATTTGTATATGTGTGTTTTTATTCTAAAATGGAAACTCGAAACTAACCATAAGACTAACTATAAGTTGTACTTC--ATCGAAGTTTAGCCAAACACACACACACACACACACACATACTCAGCATCACAGTAGAGCGGGAAGTAAGTAGTGCATA-CCCAATGGTATATATATTGTTTATAAAAGAGTGTGGACTGGCGGCGAAAGCAATCAATTGTTTTAATAAAGCCTGGTCCTTGCAATAACTAAAGG
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TAGGCGCCTTAACTTAGTTTATAAGTTGAATCAATTCTTT----------------------GC
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GTTAG-CGGAAATATTC-------TTTATTTGAAATCTGACAATGTTTAGTATTTA------------AATGTTATGTGCATGAATAAAAAAAAAACAACAAGCGC
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ATGCTTTTTCAGGCATACTAAAACACTAACACTACATACACACACACACTCACACACACACACACACAGACAGAGAAAAACAAC---------ACATCTACATGCACACAACAGAACACAAGAAAATACTATCAAATACTAAATGAATTCCCCACTCAGGCATGACCCTTTGAATGTTTCAAAAGGACAATTAGATAAATGTAAAACAGGAACTTAGCAATGAACACATGGTTTAATTGCGGTATATTAAAAATACTGCAGCACACGCTACACTGGACACCAAACAAGGAACAGCCACAAAGATACAAATGACTACAAAAGATACCCAAATGACTAAAGATAATACAAACTAGTTAAGTAAGTGCAAATTATTCAAAAACCAAAAAAAAAAAAAAAACAAAACAAAAAATACATTAAATATAAAAATAAATACCAAAAATGAATGAATGAGTAGCAAAGAAGTTGATTTGAAAAATGCCGCAAAAGAAGATGTAACCTAATGCAAAGCAACAAAAAAAATACTGGAAAAAATACCCATTAAAAATACTAAATATTTAACAGTTTTCTGTAGCAGTTGGTGTTAA--ATTACATAAATGAGTTATTTGTAGTTTAAAAAGGAAAAAAACAAAAAACAAACCAAAAACAAAATAACTTTTTGAAAACCAAATGTCAACCAAATAATATTAAGAGAATATTCTAAAACAAAAATTTACCTAGACGCAAG--ATTTATTTGTTAGCA--TTTCCTTCGTTACAAAAAACAACGTTTCATTAAAAACTAAAACTAAATTTTCAC-ACACAACA--CAAAAGCAAATGAAAAA-CAATATTACAATAACTGTGGCAAGCCC-AACAACAGCTCGCGGCTTGCAAAAATCTCCAAATATAAAAAACTTATTAACGTGGTAGAAAGTATTAAAGAC----------ATATTTAAAGTTTACAGTTTAAAAAAAAAAAACAAAAAACAAATAAATATTTCGTAGTGCGTT----------TTTTCCATTCATTTAACAAACGTTTTTTCAGTGTTAATTAAATACA---AATTACAAGCAAAATATTTCCAAT-----TGTTCTTCGACAAAACAAATTAAATAAGTGTACGAAAAAAAAAAAATGAAAAGGAAGACATTGAAGCAAAACAACTCTAAATGTATTGTAGTAAAAAGCGTAAAACATATATACATATATCTATAAAAGACAATTATTGATGTATATTT-----------GACATAATAATATTATCTTAAAAGTAA---------AAACAACAACCATGCGTAGAAAATTGAACGGAACTTACACATAACACACAAGAAAGAAAAAAAAAAAACAAAAACGAAGAAGAAGAAGAAGAGATGAAAAAGAAAATATATAAATTAAATACAATATATATATTAAT-ATAAATATGAAAGGCATATATATATATACGATTATATATATTTAGAAATAACATATTCACAGCATACAATATACGATATGTATGGGTGCATTATTCAGGCACAGAATTTATCATTTCCTTCAG-CTATTTTCATTGATGGTGTAACATAGATATACAAAAACAAAAACAAAAATTTG
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CAGAAAATCCAAAAAAAAAAAAAAACTACTA
CAGAAAATCAAAAAAAAAAAAAAAAAAACTA
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GTTTGCAAAGAAACACCCAAGATGAATACATAGTTGGTTTAGGAGCGTGTTTCACACACATAT----ATGTATGAAGGAAAGAAAAACAT
>ia2 1012913 1013952|1151 chr2L 1012667 1014739 scaffold_421 4329 6640 + 52737|296 1604
GCC-----------AATCCGATCCAGGATCGGGTTGAAGGTTAAGCCTCAGGTTA----ATGATTGTTGCAGCGTTTCGGGGGTCTT---TTCAGTTCGTATAGTTAGTAATGA--ATTGA--GTTTTTGCATTCGACTTTGATTTGGCGTGAGCACTTGGAAGGTTCGAAAAAGGCTTCACGAGATTGTCAGTAGGAGGACAT-------------------------TTTATATTCGGTTATCTACACCGCGCCGATG------------------AGCACAAC---------------------------------GACCGCCGGGATGGGCATCCCCCGGACGTGC-----------CACGCTGCCCCGG--TCTGCACCAGCCCGTGAGACCCGGGGTGCGTCCATGTGGGCGGATTCTCGAGCG--------GCGGAGCTGTGCGGCGCAAGCAACTATAGAAACGCACGATAT---------ATATAAATATAGCATATTTGAGTGT---TAAAGGATATACAAGAATATTTACAGCCATGCCATAGCTTACAACCTAAAT-TATATTATTATATACATGTCTAGGTGTTAAGCA-TTGAATTCAATTATGAG-GCATTTTACTTACTCGTACATTACTCGATATCGATGTTGGCATTAA-------------------------ACTTTAA--------CTCTAATCGATGTGCTTGAAA-AACCAGC--AAATGAACGACAACAATCGCTGAACGGTATACATATGCCAAGCCAGACAGAACTAGAACACGAAATACACTGAGAAAAACGAAAGTAGACTTCACAGGCCCACACTGAACCACTCACATACCCAGATACATATACAAGA-CACACATATACATACA-AGAATACA-AGAAAAGATTGCAAAATTTGTACCTAA-----------------------------------CAAAGTTCTATTTACAACATGAAACGAGAGAGTTTGGTGAGGAGCAACCTATTGATGTGTATGACAATTAATTATACAAG--------GATATAATCACACTTAACAAA------------------TATATTTGTATACAAAACATATATTATTCATATACAATATGGTGAATGTCATTATCTAT-----------------------CTAACCAGCA-------TGGGCTCGATATTCGAAGCGAA-----TCGGGCCGTGTTTTACCAGACCATATGTATGTGTGCGAGAAGTCAAGAAATTGTTCAGTTATCAATCGTAACAAACGTACACTTTTTACC
AACAACAACAACAAAATAATAATCAAAAACAAAACAAAAAACATCTTTTAGTTCAAATCACGTTTGTTGCAGCGTTTCGGGGGTCTCTAATTTAGTTGTTGTAGTTAGTATTAAAGATTAACGGTTTTTGT-TTCAAATATACTTTGGTCTAAGCACTTGGCAGGTTCGAAAAAGGCAAAACATGGTCGGCTAGCGTTGGAAATACAATTTTATCTCGTTCAGTTACTATATATATACCAATATACACACTATACAAATGTGTATTTAGCCTATGTTCAGCACAAATCGCACTAAGCAAACAAAAAAAAACCTGTTGGGAACAACCGTGCAACGCTGCCGCAACACTTGCCACATGGCCGGCACGCGGCTCCGGGTGCAACACCAGCCCGTGACATTCGGAGCGCGTCTCTG-GTGTTGGTTTTCAAGTGTGTGTTGTGCGGCGTTGTGCGGT-CCAGCAAAT---GAAATGCAC-ATATTTTAAACTAGTACATATATA-CATATTTATATATATATAAACGATATAGGAAAACATATTTGAGTGTTATACAGGACAAAAGTTATTTATATATATATACATATGTGTGTAGATGTTAAGCATTTAAATTCAATTATGAATGCATTTGACAT----------------ATATCGATGTTGGCATAAAATACGATACCATATGAATACCCTGTACTTTTATGTAAACTCTCTAATCGATGTGCTTGAAATAACCAGCGGAAATACAAGAAAACA-------AATGGTATACATATGCC-------GCAAAAACCAAACAC-AAACACAAACACACATACACACGTAGAC-------ACACACATGCCACATGCCACATACAC--ATACATATACAAGAGCAGACATATACATATACATACCGCATACAAATGAATGCAAAATTTGTACCTAAACAAACAGAAAAAGAAAAAAAAAACAAACTAAACTCAAAGTTCTATTTACAACA-GATACAAGACG-----------------CTATTGATGTGTATGACAATTAATTATACAAGTTTATTATTATATACTTATATTGAACGAGAAAACAAAAACAAAATATTATAAATATATATACAATATACATTATTCATATACAATATGGTGAGTGTCAATATTTATATATAAAACTTATGTCTTATCGACTAACTACAAAAATATCTGCGTGTAATTTTCCAA-CAAACATATTTGAATATTGTTTTACCAAACCATATGTGTGCG---------------AATTTTATATATACCTAT----------ATATATTCTATTCT
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ATTTATATACATACATACACATATAGTCCAAGTATTATGTATTTAGTTGTTGGTCCATTTTTTGAGCATGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGCACACATACGACTTATACGAATACATATACAACATATACATATAAA--GATAAAAAGCAAGAAACTA---CTCTTTAAATTCCATATAAAAAATGGTGATGTTTTAATCAATTAATAAGGTAGTTTTGT--ATTATAAAGAAAGCATAAACAATGCGTCTGTATGTGTGTGTATATGTGTGTGTTTGTTTGATGCCAAATTGTTTCTCAATCAATCAA--ACTTACAATAGAGCAGCATATTAAATATAT
>CG4629 1083090 1084018|1231 chr2L 1083990 1084842 scaffold_658 2894 3744 + 42916|0 28
GACATCCGAAAATAGTTGTTGAATGTTCA
GCCATCAA--------TCTTGAATGTCTA
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ATTCGACTAGCTATACAAATGT-----TGCCTAACTAAAGTCATTTCGTTTAAGATTAAGACTCTGTTAAATTTGTTGAACAATTCGATGCTTTTAAAACCAAAAATGATAAAT--CCTTAAAAACAAAACTAGAAGAAAGATCGGTCTGTGCAGCAGCAGCAAATGTGATTTTGTAAGAGT--TTACACTTAAAACACTTAATATTATATTTATTA----AT
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>smi21F 1114652 1115733|1262 chr2L 1115079 1115974 scaffold_6 29076 30062 - 11518|0 758
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>Iris 1132330 1132477|1277 chr2L 1129814 1132391 scaffold_6 55358 57899 - 128794|2568 2631
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TTTTGAATATAATACATGTTTATTTATACCTCATTTAGTTGCAATAAATATC--TTGTTATAAT
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GTATGTTAAATATAAAGGTACCTTTTTAGTT-T
GCATAACAAATATTCAATTTTTCCTTTAATGAT
>capt 1151678 1152031|1293 chr2L 1150759 1151706 scaffold_6 82031 83007 - 39458|980 1010
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ATGCACGAAACTTTGTCAACATTTTAAGCAG
>capt 1151678 1152031|1294 chr2L 1151759 1153731 scaffold_6 83052 85117 - 80787|0 383
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AGCGGCTGAGCGCCGGAGATGACA--CTTGAACGAAAAGCAATACAAT--ACTTTTAACCATAGCGCTTAAGTCTGCCCACTTACA
AGCG---------CAGGGTTCGCAAGCAGGAAACAAAATACATACAATAAAAACCTAACACTAGCAGCTAAGTAAACGAACTTACA
>Plap 1167169 1167242|1303 chr2L 1164472 1168457 scaffold_2 4083341 4087360 + 151408|2819 2898
GATCTCCGCCAAGCAACTTCTTATGATCATTCTAAATTATACATATATTGGAGAACTTTTTTTCTA------AATACACA
GATCT-GGCGTTGCACGCATTTAT-----TTTTAAATTTT--ATATATTGGAGTGTGTCGTTTTGAGGGTCTAATACAAT
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CATAAAGTGTGC--------------ATTCTGTAAATA-------------------------------------TATTTAGCCCCAACTGA
TGAAACCTATACTAATCAACAATTATTTATTATAAATAGGAAATTTGATCTTCTTACTGAAACGTGTTTTTTTGTTTTTTAGCCCCAACTTA
>CG5126 1182291 1182494|1320 chr2L 1179968 1182497 scaffold_2 4004137 4006744 - 78098|2464 2686
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ATCACTTTTCACGTTTGAACACAAAACTCACTTAACTTTCATATATTAA-----------ATTATATATATTTATTATATACAATGATTACTAAAGTAAACGTATTTCAGCTAA-GTTATGCGATTGGTATGACATGTAACGTAATGAAAATTGAGGTAAACAATTTGTATGCACAATTCAAACGATATCATCAAATCGAACCAAAT-ATATAACCAATTAAA
>CG31924 1354098 1354180|1545 chr2L 1353718 1354615 scaffold_6 2565643 2566487 - 7413|415 498
GATATATGTATCATGTAGTTTGAAATCAAATGTTACACCA-TGTCAATAAATACAAATATAGGAACCATTGTTTCTAGTGTAAA
-----ATTTATCAATTAATTTG------TATGTTTGACCATTGTCGCT---------------TATCCGTGTACCTAGTATA--
>CG5565 1354950 1354973|1547 chr2L 1354898 1355924 scaffold_2 4207441 4208390 - 12242|56 79
TCCCTAGCACTCTAAATTGATCCG
---ATAGCGCTGTAAATT------
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GAATGGCTCCGACGCCTCTACGAGCGTCTCTACGACATTTTTATGAACTTCCTAAGTTACTAAGTGTCATG--TTATCACAG
GATTGGCTCCGGCGCTTCAACGAGCGTCTCTTCGATATATTCATGAACTTCTTAAACAACTAAATGCAACGGTTTATAGCAG
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TAAATCAACCATGCTTTTTATATGCAAA--------GTATTTCTTGACCCTCCAAAATTCACTGCACTGAACTTTGCTTGT--TCCCTGCTGCGTTTGTCACAAATGAGAAATGTGACCAAGACTGAGA------------------------CTGACAGAGTGCGAGATTCGTGTGAGGATTACATTTAGTTTGATTAGTATTACAAGGTTTCGTTTCTA------TGTGAAGAAAGCCGAG----CTCTTAAC---TCTGAGCCG---TCGGCCCTATGCTAGTGATAGACATATTAC------------TCTTTCTCCATCTCTCCAGCTCAATCTATCTCTACTCGCGCTAATCTCCGACTAGGAACTGCTTT-CGTTAAACTTTAGGCTAAGGTAGCTATAGCAA-AGATCACTGTAAATTAAAAAAAAAAAAAAAC
CAACTTAAGCGTAATGCTCTGCTGCGAATTTGATTTATGTGTTTTGTTATAACTAAATT-ACTCGAATGATTTTTAATGCCCATCCTAAGTGCATTTGTCACTAATGC----TGTGACTAAGACTGAGAGCATTTGTGAGTTAAGTTAATAATTTTTTAAAAGGCAAGGAAAGCAAGAGAATTACTCTTA----------------AAGGTTTCGTTCTTCAACTACTCATAACCAAGCTGAGTTGACTGTTAACCAATCCAAGCAGCGATTGGCTCTATGCTAGTGATAGACTAACTACCCACACACACTATCTGTCTCCCTCCCTCGCTCTCTATCTTGCTAT-CCCTCTCTC-TCTCTCTCT-----CTGCTTTACTGCGCAGTTTAGGCT----TAGTTTTAGCGATAGATGATTGTAAAT------GTTAATGAAAC
>lea 1380888 1381611|1583 chr2L 1381268 1382721 scaffold_2 4244344 4245864 - 55103|0 406
CCTTTGCTCCCTGGTTCATCCTTGGGCCAGTCTCAGTCCAAATCCCAGTCGCAGTCGCAGTCCCAGAGTGATCTGCAGTCCCAGGAACAACTCTACGCTCGGGAAGTGCGGGAATTACTCGCCTGGTGCGAACGCTTCAACAACGGTGGAGTGGAGAACTTTGAGTAGCCTGGTTAGGAAGGGTATTTGGAGGG--------------GAATGTGCTGA----------------------------AGGCAAG--ATTTTGCG-------AAAGAAAGGGTATACGCATTAAAAAGCTGGGCAGGATCAAGGAACAGGTGAAA--CGAATGGTGTGGTGGGTTGAATA--CTTGTGTTTTTTAAAACATTTAATTTG--------AAATTTTAAATCTAAACAAAT
CCCCAG----CTGGGTCAGCTGTCGG-----------------CCCAGACGCAGGCG------------------------CAGGAGCAGCTGTACGCGCGGGAAGTGCGCGAGCTGCTCGCTTGGTGCGAGCGCTTTAACAACGGTGGCGCAGAGAACTTTGAGTAAGC-GAATAACTTGGGCATCTATTGGACATGGTCGCATACTGCTTGCGCTGACTGTTGACAGTGCTTTCAAGTTGAGTTCAGGCGAGTCAGTTTACTGTTAGGCATAGAAACCATATA---ATTAAATAGA-GAGAAGTATAAAGAGCCAGGTGAAAGCTTTACGTTGAGCTTAATTACATAAGCTAAAGTTTTCTTAAAGCTCTCATTTGCTTGCCATAAATTCTTTTTTTTATCAAAT
>CG31925 1473350 1473566|1712 chr2L 1473322 1473516 scaffold_2 4373504 4373672 - 8503|28 198
TGCCCCGCTCTCCCGGT----TTTGAACTTATGAAAAATCATTAAAATTATTACATTTGGCTTGCCGACACCTTTTTGCCCGCGTGCCGGGCAGAAAGACAAACGATACAGCGTTCCGAGGGCCGATTCGTGACATTTGTGCGGGGATTAGACCCACAACTGTCACACATT
TACCTCGATCTACGCGTGGACTTTGCATTTATGAAAAATCATTAAAATTATTACATTTGGCTTGCTGACACC-TCGTGCCCGCACG-----------GACACACAA-----------------CAATTCATGACATTTGTGCGGAGATTAGCCCAACAACTGTCACACATT
>CG18131 1498449 1498665|1747 chr2L 1498494 1498642 scaffold_2 4415441 4415592 - 894|0 160
TTTCCTAATGTCCAATCGATCGGAAT-TAACGCCCATTAACAATTCA---CATTTATTTGTCCAACTTTTACAATGTAATTGAATTTTTTTCTGTCATTGCCATTTATACAATTGGTAATATTTGTTTACCAAATTATAGT--------CCGAATATTTTT
TTTTTTTGAGTCCAACACACGAAAATAGAATGTTTCTTTGCCATTCGATCCACTTGTTTATTTAG-TTAAATAATAGATATGATTTTTTTT-------TGTATTTTTTATAAT-GATAATTTTAGTTTGCAGTTGTTTGGTGTAATTTTTCAAACATTTTT
>halo 1517532 1517731|1769 chr2L 1517533 1518061 scaffold_2 4440740 4441238 - 15936|0 201
AGTCCGATTAAATGGAACTCCAGAATCTAATCGCCCATCTAAACGCTATCGTATTCATATACACACCCCCCCAACTATACTTACATACTCTGAGCATGTGAAATTAGATCGTAAGCAATGTCTCCTCAAGTTTCTAAAACTC---CATAAGCCATACTAACCATACTAAGTCTATCTGAAATAAAAACAAAAATTAAAAATT
AGCCCG--TAAA--GAACAGCAGCAGATAACTGTGTACAACAACAACA--------------AAAAATAACAAAAAAAAAAAACATACTCCAAGCATGTCAAC----AACTTAGTTAATAAGATCGCAAGTTTCTAAAACTCAGTTGTAAGCTGAACT---TATATCAA----ATATGTAATTAAATGGAAAACTAATATTT
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GAGGGA
ACAGGA
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AGGAGCTGTTATCGTTTAAGC----CCCCAACTGC-----ATAGTGAATGGATCGATGTAAATTAATAAATACAACCAAACAGAACGACCGAG
AAGAGTTGTTTACGTTTAAGCAAAGCCCCTGCGACAGCATATAGAGAATGGATTGATGTAAATTAATAAA---AACCACACCAAA--------
>CG17660 1707132 1707771|2000 chr2L 1701802 1709338 scaffold_2 4707285 4715609 - 172295|6397 7225
GCTGTG----ACTTTCGCTGG--ACCGAAGAGACTTTT-----TACGCATAT------------TTTTGCACATTTTC----------------ACGCAACCGTGTCTCCCG-------CCAGCAGCTATGTATTTTTTAGT--TCTATCCGCCATTGAGGAGGAAAACCC-CTTATTGCTGCGCTGCGCTGACACT----GATCTTCCAATTTCGAGAACCGTCTGTCCGGCCA-----------CGCCTTCTGAGC----CCGTGTAAAATAATGTATGTAAT----CGTAGTTCCTTCTACGCGCACGTCCTCCCCCCCTCTAAATAAACCTAACTTATTCATAATACCTAGCCTAAGTTGTAGATACCTAT-GCGACGATCC-------------GAGAACTTAA---------TTTAAAAAC--TTCGACTTGAATTCT---TGTGCTGCTGCCCCTAACTACACTCGCAAAGGTGTATG---------------AGTGAGCTGTTG-------GTG-------GTCGCCTCATTGTATGTATATAGCT-GGTAACACAAGACGAAACGA---TCTATATAAATCTACGAGTATAT-----TCTGTAATAACTATGATA------------------AAACGCG-ACTATGCAAAGATTAAAAGTAATTGTCTAAGTAAGCACACAATCGTTTGC----------------GTCACACACCTCAAGGTATTTAATT--------ACATATTTTTAATCAAA---CGGTCTCCGA-TTTTCATAAATAAATGCAAACGTATCTTAAAGGTAGCCATG----AACC
GCTGCTTGCCACGTCTGCTGTGTACCTAAGAGACTTTTACATATATGGATATATATTATCTATGTGTTGCACATTTATTTATAGCTACTATTGAACGCACCAATGACAGCCGAAGAGTATTAATTGCTGGACTTCTACTGCTCTTCTACCGGCCATCATGTAGCCCACTTCTCCTAATGCTATCCTCAAATATCACTCGCTTGTTTTCCAAC--CACGAATCACATTTTCAGTCAGTCAAAAAGTACGTCCTACGAGCATCCCCGTGTAAAATATTGTATCTAAAACAACGTAATCTAATTTTCGGAC---------CCCTAACTAAATAAATCTAACTTATTCGTAATCACTAGTTTAAGTTGTAGATATCTAGAGCGACGAATTACTTGTTAGTATTGAAAACTGAAAACGATTCTTCTGATAATAGTTCTATTATAATTCTCTATATACTTTATCATTCATGCACACACGCACACACACACACACACACACACACACAATGTGTTGCTATCAATACGTGCATCAATGTTGTCGCGTTATTTGTATATAGTTTGATAATACAACAAGGAAAGAGTATTTATAAAGATATATATATATATATATGTGTGTAATAATCATGATAAAAGAAAACATATGAACGAAACGCATAACAGGAAAATATTTCAATTCGATTTACCGATTAAAATGTATTTGTATTCATGGATTTGATATAAGGCCACACATCTAATCTTATTAAAAATGAAAGAAACACATTGTAACTTGTAGCGCAGTTTGCGACTTTTCATAAAAA----------TAAATAAAGCATAGCCATACCAAACCA
>CG17657 1711299 1711751|2002 chr2L 1710441 1711404 scaffold_2 1361349 1362237 + 32793|873 996
CCGTCCCAGTTAGTGCAAAGCTTTAAATAGGAAAGTTTTACTCATAGG-TTCTCTATACTCTTTACACAGGTTA-CTCATTAA--------AGCTAAGCATTAAATGTTTG--------CCAAA
CCGTCC-AGTTAGTGCAAAGCTTTAAATAGGAAAGTTTGTTTTAGACACTTCACTTTTTACGCTATACAGATTAATTCAATAATAAAAATAAACTAGATTTTTAATGTTTGTCCATATGCCAAA
>CG17657 1711299 1711751|2003 chr2L 1711676 1714801 scaffold_2 1362238 1365208 + 131257|0 80
TAAT-----TCATAGTGCAATTCCCAGGCGTACACCACACAACGGTTAAGCGCTGCGTCTTCCAATCGTTTGTAACTATTG
GAGTTTATATCATAGTGCAAT--CAATTAGTTTAGGTGAATGTAGCTTAGAGATGCGTCTTCCA----TGTGTAAACGTTG
>CG18317 1716888 1717102|2005 chr2L 1716185 1717425 scaffold_2 1366225 1367655 + 25807|911 1147
ATGCCTTTCAAA-------GGACT-------GGAGAAGGAGTAACCCAATCTGTGCATATGTAGACGCGACTGCTGCAACTTTATGTAATTTTATCCC--------TCGTTTTTAAACGATCCAAACCAACGAGCGCAAATTCTTAGTTAACTAGCTTCTAAGTCAGATATGAAACGAACTCGATAGACTTAAGACGTTAGACGTTGAACGTTGGCCAACCAATCGAAAAAAAAAAA
ACGCCTATTATATACCCCCGGACTAGTTAACAGCGAGGAGGATACCCAATCTGTGCATATATAGACGCGACTGCTGCAACTTAATGTAATTGTAATTTAAATATGGTTTTTTCTAGACGATTT-AACCAACGAGCGC-AACACTTGGTTAATTAGCTCCTAAG--------GCAACGAACTCGAGAGACTTGAGACGTTA-ATATTGAA--------AAACGTTAAACGCACGAATT
>Eno 1724971 1725340|2013 chr2L 1724496 1726676 scaffold_18 1492421 1494568 - 95223|505 888
GCGCAGGGCACTTCGAAATTCCAACCACACCA---GCCCCATCGAATGAGATCTGGATCTTGGAGAGGGAGCTGGACGCAGTAGATCCATGGAAAGGCGGC-----GGTGCACGTGTTCGTCAACCTTTTACGTTCGGAACTTGTGTCTGGCGCACAAATACATCAGAATTAAACTACCAAACCCATTTGCTGTCTCTATGCTTCGTTCTT--AGACATTATTAATTAATGCTAA----ACCTTGATCTAATCATTATTTATAAACAAAAGAATAAAAAACACTATGTGCAAGATATTCGTTCAGTTGCCGAGAGCTTTGAATATCTTCAATGTAATCGCTGTAATCGTTATGAAATTATAAATTGATCTACACAAACACCAAA
ATATC-GCCACTTATAAATTCCAACAACACCAAGCACCCATTCGAATGAAAACCGACAGTGACA-----AGCTAAACA------------GGAGAGGTGTCAATTTGGTGTACGTGTTCGTCAACCTTT--------ACATTTGTGTCTGGCGCACAAAAA----GTAACCAATTTAAAAAACCCAAATAT--------TGCTTCGTTATTAGAGACACTATT-ATTACTGTTACCATTACTATGATCTACTCATTATTTATAAACTTATGTATGGGCTACA------AGTAGATTTCTAATCAGTCATGACGGCTCTTGAG-----CCAAT---ATCATTGTGAACATTTTA----TATAGATTGACCTCTAC----------
>CG17712 1750687 1750870|2033 chr2L 1750376 1752026 scaffold_18 1520976 1522498 - 65108|312 501
GGGAGTCTGTATTACATAGGTGCAATATATGAATGATTCCACTATATATTTTTTATATAATGTACGTGTTTAGTCTTTAAGCGTTCAAAAGATTCAGGCTTTCCAGCCGGCGTCATCTTCATCAATGTATTTAACTTATTTGTACGGCATCAGCATTTTGCAACTAATAAAA------TTGATTTGTTAG
ATGGG--------------------------------------------------------ATGCGCCTTTAAACTTTGAAC--------------------------------------------GTATTTAACTTATTGTTTCGGCATTTACATTTTGC-ATTAATAAACCACCTTTAGATTTTTAAG
>CG31663 1858609 1858827|2091 chr2L 1857768 1859332 scaffold_18 1584285 1585925 - 6196|1037 1290
TGGACTGC-CAACCCAATTCTCTGACCTGCCACACGTGGCGTATGAGTGATATTAACAAACCGAATGCGA-GATAAATGAAGAG--------AAATATGAAATTGATAAA------------CGAGAACTATTGTTTAGTTGTACATGTGTGGTTT----ATGTTATATAA---------ATGTGTATGTCTATGTATAAATTATGCAAGAAGTGAAAAACTGAATAAACTAAAAACTGTTGAAAACACAATCG
TGGGTTGTGTTAGCCAACCAATTGATGCG-TACTTGGGGCGTA-GAGTGATATTACAAGACACATTGAAATTATAAATGAAAAAACAACAACAAAAATGAAAGCAATAAAATAGGCACTACTTGAGAGATATTG---AATACGGCTTGTGTGGCATTTAAATGTTAAACAATTTATTGTTAGTTGTACATTTGT-TACGAA-TATGTTATATTATAATATGCGAATAAACAAAAAATCGTTGAAAAC-------
>CG31670 1950235 1951055|2166 chr2L 1950243 1953011 scaffold_18 1688552 1691473 - 92208|0 945
CAGCGATACTATGCGGAAAGCTTGAACAGCTCCACGGGGTCGACCTCGACG-----------------ACCAGCTCC----------------ACGGTGACCACCACCACCACGGCCATATCC---TCGATGGCCAC---------------CTCCAGGAGCGATCTGCTGATCGACTGACTGCAGTTTGTGGCAGCGGCGGCCGCTGCGA---------------GCAGCTCGAATTCCGGGCAGGATACCGGCGAATCCCCGTCCCCGGAGCTCGGATGCACTGCTCTGGGCAGTGCTGTCCGCGCACTGAACGGTCTCTTCTAGGCAGAAGGACCCCTGTCCACCTCCACCCACCCCGCAGAACCTCAGCAGCCACCAAATGGTTT-----CAACTTGTGCAATA--------------CCCCACTCAGAAGATGATGATGACGATGATGATCCCAACGCTCAGCCCACA------------------------TCTCCAAGCAGC---------ATTTTGTACATAGCGTATCCCTAAGAAGTCTCACAGAACACTCTACTTAAGCAGCTCTCTCGATGTATAGATGTAG------TTAAAGGATTTACCTAGTTAGTCGCCAATACCGAAAGCCCTGAGTTCCGTGTAGACACGCTACACAGATCCTCCAGGACACGTTTCGATATAGAAAAAGGTGTTTTTAACATTGCGTTACAGCTTTTTGGGGTCT-GTCAA---CCGATATACATAGATGGAAATGTATCTTAGAGTTGCAC---TAGATATCCGTA-CGTACTCTATCCCTAAGTGTCTGTGTAACCCAACGCAAATTAA-TGAAATTGAGAAACATTTTAACAAAGATCCATGAATGCATTGTATTTGTTTAGGTCTTAAGTGATATTATTGATACTGTTTAAGCAATAAACCAATTCTTCAAT
CAGAGATACTATGCGGAAAACCTTGCCAGTTGCACGGCAACGGTAACGGCATCGTCATCAGCATCAGCATCAGCGCCGGCAGCGGCGGCGGCGGCGGTGGTCACGAGTTCTTTGTCCAAAACAATGCCAACGGCAACCAAGTCCGGCACAAGCTTGAGCAGCGATCTGCTGATCGATTGACTGCAGCTCGTGTCGGCAGCGGCAGGTGCCACAGTCCCACAGGAAGGTGCCACGTGTGGCCAGGGGGAAGCACGTGATGCCGCCTCGCCGGAGCTCAGCTGCACGACTCTGGGCAATGCTGTGCGTGCGCTAAATGGTCTCTTCT-----GAATG------------------CGTCCCCGGAATTTGTCTGCC-CCACCAAATGGTTTCAACACAACCTGTGCAATATTCAATATACAATCCCTCACTCA-AAAATGAAAAAGA--ATGTCGAGCTATCTATGCAGCACATAGGCTAGGAAAATAGTATGTGTGATTTTAAGAGCAAATTAATGTCGATTTTATTTATACA--ATTGAAAATAAGTAACTTAATTGTTTGTTGACAAGATGCACTCTCAAGTCATACGCGTATCTTGCCTCAATCTAATTAATAAGTGTGTATTAAAGTTAGTTAGTACGAAATGCAGCCCGGAC-CGATTC-CCGATTCCCCGGGCGTCGTTC--ATATAGGAAA--------TTAAATCTGCATGTCGAATTGTAAATGTATCATTAAGTTCAAGGATTCAAAAATAAAAATATAAACAACAACTAAACATACAAATATCAGCATCATACTAAGTATATGTATATTTATGTATT----TATGGATTGGTTGAAATGGAATCAAATTTTATC----------GAGATCATTGAAATTGTTTAGAACTTAAGTGAAATTATTGATCATGTTTAAGCAATAAATCAATTCTTCAAT
>Got2 1984512 1984705|2201 chr2L 1982297 1984522 scaffold_18 1731106 1733416 - 93810|2318 2328
AAAATGTTAGT
AAAGTTTCGGT
>Got2 1984512 1984705|2202 chr2L 1984523 1986112 scaffold_18 1735883 1737358 - 69863|0 186
GGAGGACCAGTGG--AGATCGAAGTGGAG--ATGGAGTTTCTGTAGTACCTTCTAATCGGCACTTGTACGAATTTTCTAGCACCAACGAAATTGCGAAGTCTAGATAAGCCAATGCATTTTGCACACTCTCTATCCATATCTCTGTATATAAGCTAAATGATCTGCCTTTTAAAAAATAAAGCATTT
ATAATGCTAGTGGACAGATCGTTATGAAGCCCTTTATTTGCTTTTGTACGCATTTATAGCTACTTCTTGCAGTTAATTAGTTACAAC--AATTGC-----------------------CTTACAC-----CTATC-------CTGTACATACGAAAAAT-ATCTGCCTTT---GAAATAAAGCATTT
>CG15353 2006754 2006903|2218 chr2L 2006698 2007245 scaffold_18 1753131 1753704 - 6887|64 237
ACTCAATATCCGGATTCACCGAATCAAACCCTTTCGA--CATGGA----CATGGACAAGCAGTTTGATTT------ACTTTATACAAAAACTTTGGTATATATT-----TCATTTCTG-------AAGAACAATAAATAAATTGAAATCATACAATTCAAACTCTAAATATGTA
AATGA--CTTCTAAATGATGACAATAAAGTTTTTCAAGCTATAGAACAGCATTTAAGAGTATTATGCTTTTTACACATTTCTTTTAAGAAGTCAAATAAATGTCAAAAGTCATATATGCTAGGACAATAGCAAGAAATATATGCAAGCAATATAACACATATCCGAAAAGGATT
>CG4259 2128215 2128332|2282 chr2L 2128068 2129032 scaffold_7 3635811 3636840 - 3851|173 302
AAACTAAAGCCTTAGGCAGTTAGCCAGTTATTTATTAAATCTTTATT---CGGAGAATCAGAAAAG-AGAGCAAA----TAGTTAT----CTGCAGTTATTTCCTAAATAAAATGTGGCCTGTGTCCAAT
CAACTGAATACTTCGATAG---GCAAATGCATTCGAAAAACTTAACTAAGCTGTAAATTTGACATGCAGTTCAAAATTGGACTTATCATCCTATAATTCCATCTGAAGTAGAAT------TTTCATAAAT
>tho2 2137350 2137668|2288 chr2L 2137280 2138394 scaffold_23 1769936 1770999 + 22110|70 391
TTGCACTCCGGGCTTTTGCTTGCCCGTTCCGTGCATTGTGAAGCGCATTTTGTTTAACTTTTAAAGAATTTGGAATGGCCTTTCCATCCATTGTAGCAAAGAACGAAACTACTTTTGAAATGTTTACAAGTTTTAGTGACTATTTTAAAACAGAGATCCAAACAATTACATTGTAAAAATGACTACATTTTTGTGTTGTTTACTAAACGGGAACTGTAATAGCCATAATATTTGTATAAAAAGTTCATTCCCCAAATAGATGTTCAGATTGTCTTTAAAACAAATAATAAATT---GTTCATTTGCAATGAGATTAAGATGT
ACGCATGCGGGAAAGCATCTCTTCC------CGTATTGTGAAGCGCATTTGATTTAAGAATAAAAAA---TAGAA------------------AAACAAAAAACGAA-----------------TACAA-TTTTATTTACTATTTTAACGTAAA----CTGAAAACTAATTTGTGAAAATT-TTACAATTTTCTAATATCT----AGCGTAAAAAGTAAATAACAAAATA----AACACAATGTAAAGTTAACAAATAACTATTTCAACTATTTAAAAAAAAAAAAAAGAATGAAAGCTCAATT-TATTGTTACTAAATTGC
>CG11723 2145491 2145899|2292 chr2L 2145894 2147024 scaffold_2 1393363 1394467 + 21181|0 5
AGACTT
GGATTT
>aop 2156484 2158164|2300 chr2L 2156471 2157089 scaffold_2 1404358 1404862 + 4338|13 639
TACACTGCAACAAGAAACACGGATAGAAAAACATTGGCTTCCATTTTAATATAGCAATGATGATACACACAAGCATATATGTATACACATTAGTTTTCTATTGCTCTTAATTTTATTTTTAT-TATTTGTACGCTAGTTTAAGTGGCTGCAATCGCTGTGGCAGCAAATGAAGGTGTTCATTTAAGCATTAACAACTTTAGTTTGTAAAACGCTTACGATCTTACCACC-------ACACTTCCACAACCCACCACCACCCACAACGCACTCACCCGCTAAAAACACAATGAAACAATAGAAAATGTACATTTGAAGCACTTTATTAATTACATTAAACGGAATGAACAGAGTTAGGAGAAGATATCATCGCTGCACGTTCATACAATTAGCCTGTAGTGCAACTGTAATTATTAAT-TAT-TGTGTAGATCTACGCTAAAGTTAAT------TTTCTATTTGTTTTTC-----GTACGCCTTAAGTTTAAACACCGCCAATAGCTAATAATTAGCACTCTAGTGTCGCCACAATACCTGTTCTTCCATTGAAAACGTTATCTTTCGATCAATACATAATTTATATATGTATAAAAAAGGAAACAAATTTATATGCAATAAATAAAT
TTCATTTCAACA-------------------------------TTTTGGCCAGGCAATTAAAACATATATAT---TTTATAATAATACATTGGCTTCC----ACACACAAC---ATTTTTACGTACTTGTA-GTTAGTTT--------TTAATTGTTAGTGCATAAGCAAAAGGTGTTCA------AAAAAACAATTTCTTTTTTATAAACATT---GATCTTAACTTTTTTTTGTACATTTTCAAGGCACTTTATTAATTAACACACACACACAC-------ACACACTTACACA----------CACATTT--AGCATTATAATTATCATA-----CAAATTCTACATAC-------AAGCTGTAATTATTAATTATT-----AACTAGCC------GCATATTTAAGTACACACATATACATATATATATATACTATAATTAATATATAATTTTTGTTTGTTTTCTTTCGTGTAATGCCTAAGTTTAAACACCGCCAATAGCTAATAATTAGCACTTTAGTGTCGCCACAATACCTGTTCTTC-------------------CAATTGAAAAATACCTTATCTTTCGATA---------------TGATATGTATAAAAAAAAA
>aop 2156484 2158164|2301 chr2L 2157200 2157781 scaffold_2 1404953 1405429 + 5963|0 616
ACTTTCTGTACATAGAAATCACATCTGCATAAACCA-ACAAACAATCATACATAAATACATTTATTTTATACATCAAGCGTATTTATTAAGCTAAGCTAAGCAAGAGCAGAGTGCATGTAATTTCGTTGT-TGTAAGTAGATTTC-----TTGAGCCGGCGCAGCGCAGCCTTCGA------------TTATGTGCCAATTT--CTACATTTATCAAACAAAAACATAAACAAAAATATGCCTAACCATAATCAATCGTATAAGT--AATAAGTAGCGAA------TAAGGAGTAGAAATTAGCCAGTAGCTTAGACCGTAAGTGTTGCCACCTTTGAGCTTTACAAATGTTGCCTCAACAA-TGGTTTCAAATTTATGAAAACGAAAAAAAAGA-----ACAAAAAACAAACAAATATTGTTAAAATCTAAAGAGAGAATGTGAAGGAAATATGAAATTTGAATTGTTGTCGAAATTGTTAATTAATATACAAATCAGCATAGAAAGAGTTTTTGTATACAACAAGACAAATTGATTTCGTGTGATAACAACAGAATTATCTTTGATTCACATTGGCTGAATGCTAACGAAACCAGAGCAGTTCCAAAAAGCCATC
ACATTTTATACATTTAAATC---TATGCATAAGTTACACACACACACACACACAGACGCACAC---TCACACATT-----------------------------------------TGTAATTTGATTATATTTAAGTAGTTTTTCTTATTTGGATCGGCGCAGCGCAGCCTTCAACGATTTACAGAGTTATGTGCCAATTTTTCTACAT------------------AATAAAACTAAGCTTAACAATTATTAAATTTAAAAAACAAACACACACCGACACACACCAACACACACAAACACACACACACCTTAGCCTGTAAGTGTTGTCACCTTTGAGCTTTACAA-TGTTGCCTCAACAAATGGTTTCACGT-----AACATGGAAAACAAAATTGTTAGAAAATATATACAAAAAAA---AAAAAATAAAAAAAAAAAAATAAACAAAAATGAAAGA---------------------AATTAATATA-AAATTAATTAAATAAGAGCATTTG-------------AAATTGTT------------------AATTATAATTAATATATAT-------ACACACACGGA----GAGAAATTC--AAACGCCATT
>aop 2156484 2158164|2302 chr2L 2158008 2159278 scaffold_2 1405639 1406990 + 43527|0 159
GAGGAGAAGTGTCCTGAGACAATCACCGCACTACATCCATCTTCCACTCCCTCCTGAACACACACA-ACATTACCTGAGCTAAATAATGTGGGACCAGCACAACAAGCGCACAGACACATAGACAGACACTCTGCTGGATAAA--ATTCTGGATGCCTTT
---------------GGCACAACCACC-----------------CACCCACCCATCCACACACACACACACATGCACAGATGCACTATG-ACAATCAGC----CACACCCACACACACGCCCACA---ACTTTACCTGAGCAATAAATGCAGCTGCCTTT
>CG10874 2189913 2190422|2341 chr2L 2189789 2191277 scaffold_2 1441736 1443159 + 34739|129 705
GATTTGGCCCAGCCGCAGGCC------------TGGGATCAACGCCTGCTCTGGCTCTGAGCACACCTATGGGGAAACGAGGAATGCCAAAGTGGAGCTGGATTGGGATTTCACACAAGACTAGCGACTTTTCGACGGTGCGGACAGTTGGGATACTGTGTAAATATTTTAAGTTGTACGCTTAAGTGGGCGGA--TTCGATGGGCTTCTCA-TGCTAAATAGTTTAGCGAACTCGCAGTGATTGTGAAACTAATTTAGATTGTCTTCGCGTAGCCA---TAGCCATAGCGTTAAATT----ATTAC-TATAATAGACCAAGGGTGCCAAGGGGTGGTGCTAAAACGAA--TTATTTCATTGCAATTCGATTCGACTCGATTTGATTG---------ATGTGTGTGCTGCAG------------GTTATCAGGCTTCGATAATGATGCGAATCTGTTCCGCTTATTG----TTTGTTATAGTTATTTGCAATATACATAGACACCTAATCATACACATGTACGAAACTCGGACCCATTAAAGTTATCATTTTTATA-----------------AATA
GATTTGGCCAAACTGCAGCCAGCATCCACACTGTACGATCGACTGCTGCTGCTGCTCTGATC------------------------------CGGCACTGGGCAGTG-TACGATAAAAAAACAGCTGCT-----AGGGCCCAG----------CACTTTGTGTACA---TAAGTTTTATGTTTAATTTGTACGATTTTTGATAAGCTTCCAATTTCTACATATACTAGTTAA---GCAGTGATTGTGA-----------ATTATTTTAGTGTTACAATTTTTGCTAGACAATTTAAGTGCACATTACTTATATATAAACATATATGCATATATATATATTTTACATGTAGCTTAGTGTAGTCGAATAGTTTACTACTC--TTTGACGGTGCCAACACAGGAATGCACTACAACAGCTTTTTTCCACTGACAAGCTTCGATTTTACTG-AAATCTGTTCAATTAATTATTGTTTTGTTATAGTTATTTGCAATATAAACAA--------------------ACGAAAAAAAAAACATTAAAAGTTATCACTTTTATATAACTGAAATTCAATGCAATT
>CG10874 2190707 2190771|2341 chr2L 2189789 2191277 scaffold_2 1441736 1443159 + 34739|990 1054
GCACATGGAAAGAGCTCTCCTCGGACTGCTGGACGACTTTCACTCCGGCAAGCTGAGGGCATTCG
GCATATGGAGCGTGCGCTGCTGGGACTACTCGATGACTTTCATTCCGGCAAACTGAAGGCATTTG
>CG15385 2209572 2210248|2370 chr2L 2209321 2209586 scaffold_23 843681 843981 + -1578|304 323
GTTCTCG-----AATTTTAA
TTTCTTTTCATTAATTATAT
>CG15385 2209572 2210248|2371 chr2L 2209587 2211545 scaffold_2 1457348 1459307 + 54207|0 789
CAGCCCGCCCAGGTGATGAGTAGGAGATCCC----------TTTTATAAAACTGTGATAAGTAGTTTAGATGCCACACATGAAAAGAAGAGCACTATGTCCAGTCTTATCCCGAACTGGAAA--------CGACCGCTTATTAGCGATGTTATCTAATTAGTTGGAATTTAGTTAATGCATTCAACTTGTTGATCCACAAATC---GAAAACGA-----------TACATATCAATGGAGCA--CTTGTTAGACTATAAGAACC----TCTTTCTAAAAATCTAGCAATACGGAAA----TGAAACTTGATGTCGCAA-------------------ACATATC--------AGCTTTTTGAAGTTTATTATA---------AAAAAAATCTTAGGAAAACCCT----------TCCACAAATTTTAGCATTTATAACATAT--------TTTTATGAACATATCAAAGCAAAG--------AGTAAAAGAACTCTAGGAAGATGCGAATTTTTAGTTCTTGATTAAATACC--GTAAAATA-------ACAATTTTTTAATATACATATAAATAATTAGCAAATAAAAAATTTCAAAATTTCCACGAATTCGTTAAATCTAAATTGAGATCTTA---TAAGCATACTATTAATATTATT-------AATATCCATCTGGAAACAAC-----ACAAAAAACCGAAACGCAAACATATCATGCCCAAAGTAATATTTTTAAGAGATAAATTGTAAATGTGGATACTACAGAAGTTTTAAATTGAAATAAAT
ATGGGCGCC---------------GGATTCCATTCCCGGTACTTTGTTGAACTGTGATAAGTAGT----------------AAAGGGAGAAAGC----CCCAATCCCAGCCACAACCGGGCATATCAAGTCGATCGCACACTA-TGGCATAAGTATATTAGCAGAATTCTAGCTAAGTCGT--AACTCCTAGACCCATAAGTCCCGACAAACGACATAGATCCTTTACATATCTCTAGCTTAAGTTCTTTGAGGTATAATATCTCGTATATTGGCAGAATTCTAGCCAAGTCGTAACTCCTAGATCCATAAGTCCCGACAAACGACATAGATCCTTTACATATCTCTAGCTTAAGTTCTCGAGGTATAATATCTCGTATATTGGCAGAATTCTAGCCAAGTCGTAACTCCTAGATCCATAAGTCCCGACAAACGATGCATATCAGTGCAATCCTGCACATATCTCTAGGCTAAGTTCTCTGAGGTATAATACCTCTACGTATGT-----CTCTTACATATCAGCAACATATCATGTGCAACATTTACCTACAGTTTTCAACTATATATATACATA-----TATATTATACATATACAACTTTTGGCGAGTTAAGT--ATTTAAAT--AAATGTTAACCCAAGCGAATAAATAGTATCATTCGACAGGCATTGATATCTATAGATATCTATAGATGAAAAAAATAAATAAAATTATATCAT--CTAACATACGACTT--------TGCATTCCATATTTAAAAAAAAAAAAAATTATGCGGCGAAATGAGT
>Uch 2212738 2212969|2372 chr2L 2211571 2213563 scaffold_2 1459986 1461760 + 44604|1239 1470
GGTGGAACTAATCCCATAACTGAGAACCACCAAGATCCCGGATCTGCCAGACTATATATTTATATATCCAACATATTTTAAACCAGGCTGCAAAGGCGAACGAAGCCCCGCCTTTCAGCCGGTCAATAGTTTACGCATATTTATTCCGCATTGAGCCAAAGCCGCATATGTATTGGGAACACCATGATTGTTATTAAAGAGTGCACTCTAGCTTGATGCTAAGCTTATTCTG
---AGAGCCCACCCAATCATCTAAAAT------------------------ATATATATATATATATCTATTATAT--------------------------GATCTCCGATCTATACACA----------TACGCCTATTTATATATTTGTAAGGCCACGTTAGAAACGCTTCTGG----CCATCATTATACGCATA--------TTTAACCCGCACTTGAATGTATTTCG
>CG10880 2214972 2215330|2374 chr2L 2214358 2217237 scaffold_2 1462790 1465702 + 54014|623 1155
AAA------------------------------------------------AAACGCACAACGATGCATTTAATAGTTACATTCCGATTTTCTCA--TAGGACCTAAGTTTATAGAATTTACTTATTACTTCTT---TAAGCATTCGCTT---AATCT------------------------------------------------------AAAGCTGTAATGAAGTTTTACT-------------------GCCCAACATGAACATTTGATAGAAACCATATGTTGTATTAAGTTGAAAAATTGT-TTAATTTATT------------------GCCTTAAA------------------------CTGACTTCTTCGGCAAGGAGAAGAAACCCCAGATGGACATAGGAGTCCACGTGCTCGGGAAATTCCCATAAAGTTGTGTGCGCAATGAGCTGGCTTCTTTCAGTCGAGTGAGCAATGTTACCTATAAGAA--AAGTAACATGATTATATTTAAGATGGTAAATCG
AACATTCTTTTGTATTTGCAGAAAATTCTGCTCTAGAAATTACTAGACTATAAGCACATTCCATTTGAAATAACAAAAACATTTCCACTTTTTAAGGTAATCTCTAAGACT-TCGAATATATATATGCTTTCTTTGGTAAGCATGCACTTTGAAATCTCATAGTTAAAATCATTGTAACCCTTTAGTATTAAGGAAGACTCTATAAGGCACAAAAAGTGTAATGTTATTTAACTAAAACTCGAATATGTTTAAGCTTAAAGTTGAAATCTTTTA-ATACAAAATTTAACATAACATTTAAAATTTACAATAATATATTCAAAGCAGATTTAACTGCGCTTTCAATCAAGAATGGCCACTCACTTTCGTCTGACCTCCTCGGCGAGCAGCAGAAACACCAAGTTCACATAGGCATCAACATGTTCGGGGAACTCCCAGGCCGTGGTGTACGAGATTAGTTTGCCCCGGCAAGTGCTGTGCGCTATGTTTTCTGTTGGTGTTCAATAACAAGAT-----------------ATGG
>CG15386 2216510 2216574|2374 chr2L 2214358 2217237 scaffold_2 1462790 1465702 + 54014|2346 2411
GATAGTTAGGA-AGCTTAATCGTCATCAATTTATCAATTTGTTATACTTTTTAAATACAAATGTTA
GATAACTAGACTAGATTCTTTGTAAATAATTTGTTAATT-GCAATGTTATAGAAATACTAATTTTG
>CG10882 2231777 2232047|2380 chr2L 2231081 2234043 scaffold_18 2125253 2128304 + 105511|893 1182
CACGCCGGCTA-----------CTCCGGCACATACAAGC-------CCGAGCAGCGATGGGCGGACAGTTATTCCCAAAACAGGGCTCGGATGCGTCGTCTGTCGTCCATGCGCAGTCGCCTCGGAAAATAAGAAATGCAAAGGGTTTAGGATCAGAAGCAGAAACTGGCGCTGAAAGCTGTTGGAACTTCAATTATATTTACATCAAAATACATATACATATATATTAATTAATGGCTATCATTTCGAGCGTATCAATTCTTCCATTAA-TTTTATTAAAGTTTTCATA
CACGTAGGCAACACGTACAAATCGCCGGCTGTCAGCAGCATTGCAACTGACGAGCGCTGGTCCAGAAGCTATTCGCAGAATCGGGCGCGCATGCGTCGCCTCTCAC---TGAACAGTCGTCGGTTTAAATGAGCGTGTTGACATATTTATAGCATAGAGCAGA-------------------TTAAACTTCAATTATACATACAT--ATATACATATATATAAACATATATCTGCGAC-ATCATTTCGCGAGTTACAAATCTTCCATTAACTTTTATTATACTTTCCACA
>CG17012 2254175 2254272|2403 chr2L 2253913 2255064 scaffold_18 2153093 2154270 + 8032|263 364
TTTACGACATTCCAACTTAACGTTCGCAGCAACAATTACTGTTGTTCATAAATCAAGTTTTATAAAATAAATACATTGAATAATTTTACAAA----ACTACA
TCAACTAC-TTCGAAGTCAAAGCCTTCAGCTTTAACTACTACTATGAAAAAACCA--TTAACTACAATAATACCTGTTACTACTGCTGCAGAAGATATTACA
>CG9967 2308758 2308882|2463 chr2L 2308853 2310428 scaffold_18 2219259 2220918 + 30800|0 29
TTAATCGATTAGATAGAAATTGTGTTTGCA
TCGAAACTTTACAAAAAAATTGAGATGGCA
>Rab5 2359546 2360393|2525 chr2L 2359287 2361428 scaffold_18 2289058 2291571 + 63979|308 1389
AAAATGAAATTTCCAACGAGAGATTTGAAAAGTTTATGCTGATAATTATAAATAAAAAAATTATTTAAAAATTCAACAGAATCAGAAAGAAATACCTAAAGCCGGCT-CTCGCAGGGG--ACGAATTTCATTT--GAGAGCCACGAAACCAATAATGATAAAGACCACATAAGAATTATAAGCATTAAACAAAGGAGCTCCCAT-------------------------------TCCCAACATAAACGA-AAGTTGCAATTAAAGAAAGTTAGTT---ACAAATTCCCACA--CCCGATTTCCCCCATTACGCTCGATATCTGTCCAAAAAATATACAA-----GCAAACTGACACTCACGCAATTGAGC-TAAAATATCAGTA----TAATTCCA----ACATAA--ACCATTTCAAATAAC-------------------------------AACGCAAATTAA--TAATGAAAACTAAACATGA--GAAGAAAGCGCAGGGTTTTTGGAGATTTCATCGTGTCGTAGAAA-GTTTGAAATCGTATTGTATAAAA-AAAAGAGAGAAACCCCGAAACCAACTAAGCGAGCAAAGAATATTTGTAAAGATTACATGTCGTGTAAGATTCTGAGCATTAAGTAAGG-------------GGCAGATTCCAGTTGCAGTTGTTCTCAGCAGCGTTCCAA------------ATAAAACAAACAAAACAAACAAACACCACAAGGAGCAAAT----------------------------------------------------------GTTCAGGCCAGCGGCTGAAGATCCTCGCTCG-CCTCGGTTTGTGGCAATGTGTGTGTCTCTACGGCTCCGGAGCTCGGACTCCAGATCCGGATACGGACGCGGATGATTCGACTCCGGGTCGCGGCGGACACGTGTGATAGTTGCAATTTATATAAATTATATATACACAT-----------------ATGAAAAT-------------------------------------GAAGGAAAACGAAAACCACAAAAA-AAAAAAGAAAACCAA
AAAATAAAATTTCCAACGAGAGATTTGAAAAGTTTATGCTGATAATTATAAAT-AAAAAATTATTTAAAATTT----------------AAAAACCTAAAGCCGGCTGCTCATAGGGGCAAACAATTTAATTTTCATAATTGATGATAATGATGATGATGATG-----ATGATGATTATGATGATGAAAGAAAAAAAAAACCATAAAGATAATATTAATTATAAATTAAATTAAATGGAAACAAAAACAACAAAACGTAAAAGCAAAAAGTTAGTTTAAATAAATACACATAGCCCCGTTAACACCAACCGC-----AAATGTATCAGAAACAAAAACAAAAACGGAAAACAAAAATACAAAAAAGCGCTCTTATAATATTTCTATCTCTGGTCCCATAGTTCATAACCGCCATTTTAGAGAGCTCCTTCAACTTTCATCTCAACCGAATGCGAAGACGCATTTTAAATAAATTAAAAGTAAACATTAACGAAGCGAATTAATTAATTCAAGAGTACACGTCGTATTGTAGAAACGTTTCAAATTGAATTGTATAAAACAAAAGCGAGAAACAT--------GCTAAGAAAGTAAATAAAGTTTA-------CACATTTCATGTAAG-TTTGAGGAATCATGTATGGGTATCCGAAACCAGAGAAATTCCAGTTGCAGTCGTTTTCAGCAGCGTTCCAATAAAACTTAAATACAATAAAAAAAAAAAAAACAAAAAACAAAAAAATAAAATACAAAATGGAAAAATATGAAAACAAAACCGAAGATCAGTTCAATTTTGGTTCAGTTCGGTTCAGATCAGTAGTTGAAGAT--TTGCTCGTCCTCGATCTGTGGCAATGTGTGTGCCTATCCGGCT---------------------------------------------GTCTCGGCTGCGATGGGCACGTGTGATAGTTGCAATTTATATAAATTATATATATATATATATATACACATGAAAAATGAAAATCCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACGATTGAAAATAAGAAAAGGAAAAAGAAAGAAAAAAAAACAAAAAATGAAAGAAA
>Rab5 2360456 2360468|2525 chr2L 2359287 2361428 scaffold_18 2289058 2291571 + 63979|1479 1491
TGTCCCTTCGTAG
TGTCCCTTTGTAG
>CG3597 2370156 2370268|2532 chr2L 2369358 2371633 scaffold_18 2302151 2304540 + 59520|998 1156
GCTGTGAAGAAGTCTTAGTAATTAATAAATAA----TTGAATTACATCATCA---------ATACTTGTTA--CAATAACCAAG-------------TTGAATCTACAAAC-TATCT-----------------TTAAAATACAATGATACTTCATACG
TCGGCCGGGAAGTGTAGAGAGATGAAGCGTGAGATTTTGTTTTATATAGTCATAGAACTTTTTTCCTGTTAACCAACAACAAATTAGACAAATACGCTTAAATATACAAATGTAACTTACTTGTTTCGTTCAACTTTGAATACAA-AATAGCGTATATT
>CG3557 2384761 2384831|2542 chr2L 2381162 2384787 scaffold_2 6640400 6644248 - 103018|3891 3921
AAAAATAA----ACTTTCACCCGTACTTTGT
AAATATAATATTACTTTCATTAGTTATCTCA
>CG31948 2415438 2415502|2572 chr2L 2414550 2415485 scaffold_2 6689865 6691070 - 5599|1207 1257
ATAATATGTATTCTATTTAT---AAGCTACAAATATATATAAATACTAAAA
ATAGTTTTTTTTCAATTTTTTCAAAATTGAGAACAGCTCCAATAACCAAAA
>Slh 2490205 2490345|2672 chr2L 2489808 2493477 scaffold_2 6798047 6801852 - 150281|411 585
GAGCGGCTGCTCCGATTCCATTGCTGCTGAGCGG-------AGTGGACCGGGTTTTGGTTGCA----------TGTGCATGGGTGTCTGTGTGGCTTCTTT-----------------CGTTTACTTTAAGCATATCCAAAAATAAATTAAATGCCAGGCAAAAAAGAGAAGCAA
GAGTGGCTGCTTAACTTTCACTGCTGCTGAGCGGTCGGGGATAAGGACGGGAATGAGACAACAACAGGAACTGTGTGTGTGTGCATGTGTGTGACTTTTTCTTATATATACATATATATATATATATTAAGCATATCCAAAAATAAATGAAATGCAAGGCAAAAAGTGGA-----
>CG3515 2551144 2551396|2759 chr2L 2550988 2551282 scaffold_30 37184 37466 + 5350|174 328
CCTTATGCTTTTGAGACACAAA----------------TTGTTGAGTTTTGCCAGCAAATTGCACAGCTGGCTGCGTTCGACTCCGAAAAGGAGTTCCTGGTGTGGTGTGCAAACTTTTGGCCAAGTTTCGGCTGTGTGTATATGTTCTCCTGCA
CCTTTTTCCTTTGAGACACACAAACGCACACACACACATTGTCGGATTTTGCCAGCAAATTGCACAGCTGGCTG-----GACTTCGA-----------------GCTGCGC----------TCAGTTGGAGACTGGTTGCATAC-TTTGGTGGCA
>Cyp309a2 2564882 2565084|2776 chr2L 2564829 2565569 scaffold_30 53482 54242 + 20352|74 287
ACTTG-------TATTGTTATCA--CTATATATTGCCAGCTTTCAC--TGATTAAATATTGTGAAATTATTAGAGTACGGTGATAGCAATGTGAATCCCATATAATTTACTGCAGCTAATCAAAGCCAGAACTTACCTCTCCAACAAAATCTTATCTGCAAGGTACTTGCACTGTGCCAAACAAATTAAACAACATACGTAGATGATTGTAAAA
AGTTTACCTAGCTACTGTTACCACGCGATACAAGTGTAGTTATCGCATGTGTCGAATCTCGAAAAGTAATTAGAA-ATGATTATAAGTGCGTG-----CATAAATTCAATTGTTATTTATAAA------AAGATACC------------CCTTACTCGTGGGGTATATTTGTTTTG--GAACGTGTTGAACAGC--ACTTGGCATAATGCAATA
>Rad1 2573424 2573482|2778 chr2L 2572309 2573554 scaffold_30 58908 60149 + 24119|1177 1240
ACCGAAACTA----CTAGGTAGCTAATAAAATAGAACTTTAAAATATTG-CTAAAATCTTGAAA
ACTTAAAATATGCTCTAAATTTTTTTTAAAAAATATATATATTACACGGACTGATTCCTTGTAA
>insv 2575276 2575450|2780 chr2L 2575188 2576726 scaffold_30 1173163 1174783 + 39643|89 273
ATGTATTAGTAGAAATTTGTTAGCACTTAATCATTAATGACTTAGAATAGCACCAAAAACGG---CTGTAATGCCCGCACAAACTCTCACAATCCATAGATAGTAGAGCACTACATCGAACTAACGTGTAGC----AGATTTTTAAAGATCTCGAAGATGATTTTACCA---ATCCGAACCAAAA
A-GTTTAAGTTTATATATATATATATATATATAT-----ACATATATATATATCTAAGACGGGAAGGGTTTTCCCCTTCCAAATACCAAAAAGTATCCGACTGCAAAGTTAAGCAAATAGGTATTCCGTAACTGTTAGCCCTAGAAAAGCCCTACCAACAACTTTGTCATTTGTACAAAACTGAA
>CG3214 2579244 2579355|2783 chr2L 2577472 2580032 scaffold_30 1176352 1178845 + 46241|1952 2067
TGTGGCATAGCTTATAATTATTTTTAAATTCA--AGTGCAAATGGCTGCGATTGATGAGAACACCCGATCGAGTTAATAAACCCAATTTTGTTGACTCTGCACTCGAA--GAACAA
CTGCTCCAAGCAAACA------TAGAAATTCGTTAGCATAGATGGTTATTATT---------------------TAAAAAATTAAA---------------ATGCGAATGGAACAC
>Drp1 2581437 2581781|2785 chr2L 2581442 2582410 scaffold_30 1203148 1204240 + 35628|0 462
-CTGGTCAGCGATTGGAGCAACCCGTTTCGACTTAATAATCCCCGCATATAAGCAACATAAAAACTATTTATTGAAGAC-----------GCGTTCAAAGAGAACGAA-----CTCCTTTGTTAAATGTTCCCCCTACCG--AGCACTGAAA---TATCATCAAATT--GCATGCGACCC---CCAAA--------------------------------------------TTCTGGGCCTTTCATTTAGCCAACTCG-----------------------------CATTT-----CTATTCGCCTGGCATTTGTCTATCAT------------CGAGCCTCTCCG--CTTTTTAAATTAATAAGAAGTTGTAGACGCCGTGATTGGTTTG-ATTAGGTTACTCAAAGCACTTATTACAC-ATTGAATAGTCAAATAAAG-CAGAAA--AGGTTGATTCAA
CCAGATATGATATTGGAG---CCAGTTTCGACTTAATATCCCCAGAAATTATGAAGC------ACTATTTATTGAAAACAACTAGAAACTACTATCAGAAAACCCGAAGTTATCCGCTTTGTTGAATGTTTCCCAAAACATTAGCGCTTTACATTTAGCACCAAATTCAGAATACGGGCTAAACCAGACCATAATATAATAGATTTAAGTATATTTAAAACATTTCTTCGTTTTCTTATCGCTGCATTTTGAAGAGTCGTCAGCAGGGAGACAAGCATCTATGTATTTCATTTTCTACCTAGACGCCTAGCATTTCTCCCCCGTTCATCAGATTTACGAAGCCATTTGACCATCTTGCATGTGAAATGAGTTGT---CATCGTGATTGGTTTATTTTAAGTTAATCAAATTCCCTATTACACTTTTGAATAGTCAAATAAAGTCAGAAAATATGTTGATTAAA
>Pgk 2746880 2747011|2985 chr2L 2745259 2746965 scaffold_30 1423103 1424744 + 56492|1673 1768
GTAAGCACAAACCACGACGTTAAAAAGTGTTGAATCTATTTGTTGCGGAACCATATAATGCATACGAAATAAAGG---AATCCTAGTT-------T
GAATGCATGGGCCATGGACTTAA----TCGTGAATCTACTTTCTAAGG-------CAAACAATACGGACTTACGGCCAAGTGTTTGTCCGGAAGCT
>Pgk 2746880 2747011|2986 chr2L 2746966 2748756 scaffold_30 1425143 1426954 + 92416|0 58
GC-------------GTACATATATACGGTATATTAATGTTAATCGCATCGTTTACCTT
CTGGCCCAAGCCCCAGTCTATAAATACCCAAGATTATCTCTCACTGAAATATTAATCTT
>snapin 2758427 2759242|2994 chr2L 2756241 2767835 scaffold_30 1435598 1447459 + 318105|2611 3452
ATCCAATTACTGTTCGTCATGGAGACGCCCTACACCGACCACTTGAGCCCAGAAGATTTCGAGCACGTTTACGAGCCAGCGGAGGACTCGTTCCTGCTGCTGGATGCCCTGGAAAAGGATCTGGAGTACCTGGACCGGCTACAGCCGAGTCTCTGCGTCGAACTGGGCTCCGGTTCGGGTGTGATCATCACGGCGCTGGCCAAGAAACTGGCTGGCTTTTCGCTGTGCCTAGCTACGGATATCAATCCCAAAGCCTGCAATGCCACTCGAAGAACTGCGACTCGGAATGGCGCTCGCTTGGATAGCATTCGCTGCAGCCTAGCGGATGCACTGCGTCCGCGATCCGTGGACGTGCTGCTCTTCAATCCGCCCTATGTAGTCACCAGTGACGAGGAGCTG------CAGACGCAACAGTTCGATTCGCACAGCGAATC-CTCAACGGATCGCAATCTGGTTTTCTCCTGGGCTGGTGGACAGGACGGGCGACGCGTCACGGACATTCTACTCAAGCAATTGGATGACATTCTTTCGCCTCGAGGCGTGCTCTACCTACTCCTGCTGCGGGAGAACAAGCCGGAGGAGATTATCAAATACTTAGAGGGCCTCCAGTTCCGGGCTGTTAAGTTCATGGAGCGACGCATTCCTGGCGAGCATTTGTGCATACTGAAGGTCACCAGGTACTTGGCATCA---TCATGACT-----CGTGCAATAGCATCAA-ATTAAAGTTGTATTTTAAT----TAAAAGATAAACTTTTTTAGGCGTTTATTCTTAAATTTGATACTAAATAATATGGAGAATAA------TTTTAATAAAAGTTGAAATAAATG
ACACA-------------ATGGAGACGCCGCACACCGAGCATCTCTCCTCGGTCGATTACGAGCACGTCTATGAGCCGGCGGAGGATTCTTTTTTGTTGCTCGACGCTCTGGAGTCGGATCTTAAGTTCCTGGACAAGCTACAGCCTCGCCTATGCGTTGAGATTGGCTCTGGCAGCGGCATCATTATCACAGCACTCGCCAAACACTTCGCCCACACCTCGATCTGCCTGGCCACGGACATCAATCCACGTGCCTGCAATGCCACAAAACGCACGGCGTCCCGCAACGGCGCCCGCTTGGACAGCGTACGCTGTAATCTGGCGGCTGCACTGCGTCGGCGCAGCGTGGACTTGCTGCTCTTTAATCCGCCGTATGTGGTAACCAGCGACGAGGAGCTGCACTGCCAAACATTGATGTCCGACCAG-GCGGCGAATAGCGCAACGCAGCGCAATCTTGTCTACTCGTGGGCAGGGGGCAGAGATGGGCGGCGCGTGATCGACATTTTACTGGAGCAATTGGAGGACATACTCTCGCCCAGCGGCGTTCTCTATTTGCTGCTGCTGCGCGAGAACAAGCCCGACGAAATAATCAAGCAACTAGCTAACCTCAAGTTTAAGGCTGTCAAATACATGGAACGGCGCATTCCCGGCGAATATCTGTACATACTTAAAGTGACCAGAGACCCAGATTGAGGTGCTTGTCTATTAAAGTGCAATCCCTACGATATAAATGTTTAATTTTGATCTACTTACGGATAAA---TTGAAGGCTGTAATTGAAATAGTTGTCGCTGGTTTGTGTCCACGCTAAGCGGCTTATCGATAGACGTTTCAATCGATA
>CG9960 2758427 2758549|2994 chr2L 2756241 2767835 scaffold_30 1435598 1447459 + 318105|2611 2749
CT-----CGTGCAATAGCATCAA-ATTAAAGTTGTATTTTAAT----TAAAAGATAAACTTTTTTAGGCGTTTATTCTTAAATTTGATACTAAATAATATGGAGAATAA------TTTTAATAAAAGTTGAAATAAATG
CTATTAAAGTGCAATCCCTACGATATAAATGTTTAATTTTGATCTACTTACGGATAAA---TTGAAGGCTGTAATTGAAATAGTTGTCGCTGGTTTGTGTCCACGCTAAGCGGCTTATCGATAGACGTTTCAATCGATA
>CG3077 2764067 2764305|2994 chr2L 2756241 2767835 scaffold_30 1435598 1447459 + 318105|8569 8839
ATCGTGAATCTCCGCTACA---ATTTTCATCCATTAGTTTAATATTTTGTTCTGTAGTCTTTAGCTGTCCGGCGAAAAGTGCAATTAGATAATGT---GTGCAATTAGTTTTAAGGT-------------GAAAGAAGTATTT----ATCAACCTTTG--AGGTAGAGCCCATATGTACCCCCTTTGTCCTCCAAAGTAGTCCGTTCGTGCGAACAATGTGTCACAAA---GCATAACCAATTTAAGACAACAATTAAAAAAAA----AAA
ATCACA---------TACACATACTCACACTCATA-------------GAGCCGTAG-----AGCTA---AGCAAAAAGTGCAATTAGTAAATTTATCGTGCAATTAGTATTAATGTATGTCACATTTATGTAACATGTACTTCGTCACACGCCCTCGTCACGACGTCCCCTTATGTATTGTTTTTTTTTTTATAGAAATATCGTGAGT--------TGTGTCGCCTATTTATATACCCTTACCGTGATTGTAACTATATCGAATGCTAAA
>Taf10b 2767281 2767336|2994 chr2L 2756241 2767835 scaffold_30 1435598 1447459 + 318105|11950 12005
ATAATGGCATGCATTGTAGTAGTTTTTTTCTCATTAAAAATAATGTATCTTAAGAT
AACTAGGCA---AATGCATATTTAATTATTTCGTTAAGCTAAGCCCATGAAAATGT
>colt 2768590 2768644|2996 chr2L 2768533 2768666 scaffold_14 734450 734625 + 688|79 154
TT-----TGTCTAA----------------TAAAGAAAGTGCCTCGCTAAAATGTTTTTACAACTTGAAGAAAACT
TTGAACATTTTTAAATTTTATTTTCGTCATCACAGGTAGTACCAGGTTAAAATCCTGTCAGGCAGTAAGAAAAGTT
>syt 2780741 2782839|3002 chr2L 2780490 2780839 scaffold_7 2332888 2333205 - -1610|254 352
ATTCACACACACACACACACACCCACAAACACATATGTATTATGTATTAAAGAAATGGTAAATTACTAACCAAAATCGAAGCCTAACCACAACAGCAAC
AATTAAACA-----------------AATTAAATGCGAAATAAAAACAAAACGAACACTGATATTCTA--CAAAGCGAAACTCAAAGTTGCATATTCGA
>syt 2783041 2783067|3004 chr2L 2783031 2790692 scaffold_18 1962853 1971323 - 101592|10 36
GGCGGCAACATGGATAACCAAATGCAG
A--CGCTACATTGCTGA-TAACTCCAG
>CG3131 2816006 2816341|3030 chr2L 2815972 2819622 scaffold_14 164971 168775 - 213477|34 472
GTGTGC-TGCG-TTGGATGTATTCAAATTT---TTCACCTGCCACCTTCCCTGTCTTCCCCCTGCCTGTGTATCCCCCTCAACGAAA-----------GCGAATTCTAACCGTA------AGATTCATTCATT---AGTTTTAGCGAATTCGGCTGCTCAAACATACAACTTAAATCTTCTTTAATCGTAGGCTAAT------------------CGTACAATCATAATTTAGTCAAGTTTTGC---TAAGTGCGTTAAGAAAATGTATCCCATTG-----TAAC-AAAATCACTGCAATCATAGCAAGAACAACAAAAAGGCC---------------------------------------------------TCTATATGTATATGTGTATTTATTGAAAATATGATTTGTTATCAGTTTTTGTAAACCGTTCACA
GTCTGCGTACGCCTAACTCTACTCAACTCTACAATTATCTGCCAACTACTATACAATCACAACAC------AGCACAAAAAACAAAACGGATTATCTTACGAATATTATGAATAGTATTTAGTTTCATTCATTCAGCATTTAAGCGAATTTAGTAGCACCCCCTGCCCACTCCTTTCCTCGTGTACTGTTAATTTACTTAACTATCTCTCACGTATGTAACTTCATAAATTAGTCATGTTCTACAATTTAGTGCATTATGAAAAT---TTCCATTGATGTTTAGCTACAATCACAAC-ACAACAACAAAAACAATACAGCGGCCCTTACTCCATATACTTATACCTATGTATGTATGTGTATGTGTATGTGTATGTGTATATGTATATGTGTATTTATTGAAAATATGATTTGTTATCAGTTTTTGTAAACCGTTCGCA
>CG3123 2823545 2823599|3035 chr2L 2823454 2825170 scaffold_2 4852712 4854450 - 8849|91 145
TCGATCAATTATAAGTTGTAAAAAGAAATTGGATACATTTTTCTCAACAATGTTA
----TCACAGATAAGCGTTAAACCCTATTTAAAGACTTTTATGCCCCATACGTAG
>CG18558 2842578 2842634|3058 chr2L 2842400 2843051 scaffold_14 199096 199737 - 2747|185 248
TTATATATAATATAGTATTTTAAATATACAT-----GCATTTATACTACATA--ACAAATGAAA
TGGAATTTAGCTAGATTTTTTTAACATGCTTCAAGAGGAATCAGCCAAAAGACTGCAAATGGAG
>CG31694 2868627 2869170|3085 chr2L 2865591 2868676 scaffold_7 4229542 4232674 + 77193|3289 3338
TACATATATTTTGTAGTAAATAAGTGTAAAATAAAGTTTAGGCTTAAACG
TACACACATTTTTAATGGGTTCAGGGTATACAAATAT-----CCTAGACT
>CG31694 2868627 2869170|3086 chr2L 2868773 2871697 scaffold_7 4234325 4237368 + 120270|0 456
ACCTGTGCTTCACCCACCAACCGTTCCCATCCACAGACACCCAAACCAACCATCTCAAACC----------------------------CCGTTAGCCAACTCT--GGACT------TACTAGTTGAATTGTTTCTAATTTTAGCTTGAACCAGGCAAAGCGTCGCCAAAGCTGAAGAACTAAGTCTAAATTTAGGATAATTCAGTGTAATCTACAAAATTTCTCTAGTTTATTAACCACATGTTGGAGCCATTGTTTGAATATTATGAAATATTTATTGCGTGCACGCACAGTGG---TTGTTTATCAGTAAGTGCATGGC------TGGCTCCAGCTTGGATCTTATTCTTTGTGAATTTAAATTAACACTGCGAT-TGTTACGACTGGCATTTACGCTTTGCGA---TTTGGGTTAACCTCTTTT----------GTTGTTGATCTTTTTAAAT
GCTC--------CCCTGCTGCCGCCTCCAGTTAACAACAACCTGGCTGGCAATATCCTAGCATACATATATATCAATATGAGCACTCATCCATTCGCCGAATCCCAGGACTGGCGCCCATTAGTTGAATTGTTTTACGTAGTCCATGAAAC--GGCGTAGCGTACCAAAAGCTGCATCAGTCGCTCTAAATTAAGGCACTTTCGGCCAAGTT----ATATTTCTCGACTAAATTCAAATAGTTTTCTAGCAACT-----AAAAATAAAAGATATTTAGCTTGTA-GCTTTCAGTCGATTTAGCATATATATATATATATCGCATCTTATATTATTAGCTAGTAATGTGATCTATGAAATTGAATTTTGGCATTAAATTGTGTGCCAGCTTGAA---GGACTGTGTGAATTTTTAGTTTAGTCTCTATTTTTTCTTTACGTTGTTGATCTTTTCAAAT
>Prx6005 2877091 2877187|3090 chr2L 2875025 2877390 scaffold_7 4241007 4243348 + 53252|2257 2359
TGGATGACAAGCG---TGCG---CTCTCACTTTTTTTTTGCTTTATTACAAAAATTATAATTAACAACAAATAATGCACAATAAAGTATACGCTTACAACCGT
TCCAGGACAGCCGAATTGTGATATTCTGCATTTTACATGACTTTATTACAAAA-TTATAATTAACAACAAAT---------CAAATTGT---TTTACAACCAT
>NTPase 2880706 2881227|3095 chr2L 2880672 2883457 scaffold_7 4246678 4249589 + 105273|34 591
TGCTCC-TCCATTAGTCCGTAGTTGAAGACATAAATTTTAAACGGATTGTTAGCTGAAATTGTTTATAGAGTGCCTTAGACGTGCATCG-AGTATACTACAATCACAACACACCGCACACACCGCACACACCACACACACACA---GAACACACACTCGGACATTGTCCACAGCATATGTATGATGTGGTCGATTAATATTTGTTTGTGCTCTGCAAGATTCGTTTCAATTGCCTCTAATTG--AGCTAACCCAT------------------------ACACGGTGACTACACTTAG--CGTTTAGTTTGTAATTCCAATTTTGTGTGATT-CGCCATATTTGTAATGCAGTT-TTTTGCCAACTTCTTAACTAATTAGTCCCTACACTCGTATCGTATCCTCATGTACATAAATTTACACAATGATATGTATTTACCTAATATGTATAACGACCTAGACTACTAGC-CGCAAACATTTCACACGGTTTTTCACACATGCAAATGTTAGTTTAGTTATCTTTGCAAATAAATCAAATGTTAACTGATCTGAATTAAA
TTCTCCTTCTATTAGTGTGTAGGCGAATATATAAA---------------TAGCTGAAATTGTTTCTAGAGTGCCTTAGACGTGCATCGAAGTATACTACACACACA--------CACACA-CACACACA-CACACACACACATTCGCACACACACATAGACA--GCCTTCTGC------------TGGCCAGTTAATATATTTATGCGCTAT---AAATTCATTTCAATTGTCTTTAATTGAAAGCGAATTCATTTATTTGTCATTTATATAAGGGCCGCACTGTGACTACACTACGTTCTTCTAGTTTATAATTCAGATTTTGTGTGATTATATTTTCTTTTGTATGTAATTAATATGCCA---CGATATCGTATTAGT-CTTACACTTG-ATATTTTCCTAATGTATATATATATATATTAT-CTGCATACATATCTAATTTTTAAATTGTTTAATATTAAAAATATATAAAAATTT---GTAATTTTACACGCATATTA--------TTTGTTATTTTAAAAACAAAATAAAATTGT---TGAATTGGATACTT
>Ts 2968293 2968604|3204 chr2L 2967519 2968464 scaffold_14 2341204 2342286 + 32435|931 1111
ATTATTATAGTCTTCACGGAAACAGTTTTTAAACACATCATTTCATAGCTTTATTTGAATAAATTTTTGCTTTCATTCATCGTGTGTA---------GTGTGTGTTTGTTGTTTGTAAATTCTCAGAGTAATCCATAATGAAGTATAATTGATTCTTAATAAATCTTGCACAGAGTATACC
ATGATTAATGAATTTGCCGAAATTGTTTTTAAACACATCATTTCATAGCTTTATT-GAATAAATTGTTG-TTTCCTTCATTTTGTGTGTGTGTTCGTGTGTGTTTTTGCTGTT-GTAAATTCTCAGATTAATTCATAATGAAGTTTAATTGATTTTTAATAA-TCTTGCACAGAGTATACC
>Rrp1 2969773 2969991|3206 chr2L 2969716 2973399 scaffold_7 2183511 2186894 - 60894|57 279
-ATGTACACTTCGTTTGTGTTTAAATGTACTTCTGGATTCGTCATTATTACTTTGTTTCCTCTCCATATATGGTTTTTATTGTATTTGATTATCCATCGCTGTAGAAATTGTACGTCCCTA-TCTAATCATTTCAAAATGCCATTACTCTATTACATTCTGTCATAG--ATCCACCATCAAAATT-CGTATTTTTTTAATAAAGTGAGCTACTGCCCCACGTT
CAT---CAATACATGCATAATTACATG-------------------------------------CATATATACATATTGTTTTATTCAATT-------------GAATTTATTTTTTTCTATTCCCATCGTTTCAAAATTATGCCCCATTGTCATTGTTTGTAATAGTTATTTATGATCAATATTACGTGTGTCCTTGCTGGCGTTAA--------TCACGCA
>CG9641 2974854 2975079|3208 chr2L 2974804 2975335 scaffold_1 4820732 4821205 - -1271|50 286
GAACATTTTAAACTGAATAACACACCCTAAACATATTTGACATACGAAATGACATGACAACGGAACAAGGACAGCAGTATCGTGCAG---------CTTCACAAGTGAATTCTCACTGCAATATCAGTTCATACTGCCTCAAGTCG--ACATTAACCATAAGGATTTCATATTATAAAATACACCAAAGAAATATGTAATATACTTCTCAATAAACACTCACTACCACATTTAAAAA
AATAATTATAATAATGATAACAATAATTAAACAAAAACGAT--------TCAAATGAGATTCAGCTCCGCACAGCATTAGTTTGTAGTGAACACGCCCACATAAATGCACTCACGTT----TGTAGCTTCTTAGTTCATCCAGTTTTCACACAAACACAAATTGATTAATTTTATTACATACTT------AATAATTACTATACTT----ATATATGCGCGCCGCTGTATTC-----
>CG9641 2975151 2975177|3208 chr2L 2974804 2975335 scaffold_1 4820732 4821205 - -1271|360 386
GCAAGCCGATGGGTAACGGGATTCATG
------------GCAACCAGCTCCAAT
>CG9643 2978526 2978545|3211 chr2L 2978533 2979245 scaffold_1 2925166 2925867 - 28802|0 12
ACATGTTGTATCT
ATCAAATGCATTT
>Chd1 2979697 2980175|3212 chr2L 2979331 2980295 scaffold_7 2193798 2194777 - 11225|399 983
GGAGTCAGCTCTGGGGGCCGACTGTCGATTGTACATAAAACACTTAGACTTAAGCCCGGCTG----------GCGGGCCATCGTGTCCTGGCCAGCC------------ACTCGACACAGTA--------------------AAACCAACCCGCATAC-------------------------------AGTACG-----------TTAAG-------CGTAGCTCCATACACCTGTACAAGTAATTCCTAGCAGCTAACTATAC----TTCTATAAAT---GACTATACATCCGATCGCACAGAGGGCCGGCATTGCAT-CATCCAGGGTTTAGTGGCAATACCTGCAACC----TAATCTTA-GACTTTCCGTGTATAAATCGTAGCGTAGGCTTTAA--CTCGTCCTTCATCATTGCGGAACATCGTTTTTATACTGGCCAACTGCACGGAAGATGCGGCTGGCTGCGAATGCATGCTGTGTGGTTTATTAGGTGGCCCACGGTGCGAACCAGTCGTTCAAAAGCTTTTAAACCAACAACAAATTCTCACTATATTTAAACACTATCATCATATGATTGTAA
GGAGG-AGCAAACGTCGCTAGTTATTGTATATACATATA--GGTTAGTTTTAAGTTTGGCTGTGGTGTCTGTGTAGGGCGCTGCTATTTGATAAGTCTTTTCGTAACGATCTTGACACAATGCAAGAGGAATACGCTCACACACACACACCTACATACAAAGGCAAACAAATAAATCACAAGCAATCAGAATACGCATGATACAGATTAGGAAACATACATAGCT--AAACATATGTACAAGTAATATATAGCAGCTATTTATAAATTGTACTGTAAATTTAAATTATATAT-GAACCGCA-----------TATTGCGTACATGGCGGCGTTTCGGGCAAATCACGTAAATAAGATAATTTTACAATTTCCCTTGTATAA-----AGCATAGGCTTTAAGTTTTGTTCTTT-----------ACACCCTTTTTATACTG-----------------TACAGTTAATTACGGGCATATGCCACTT------------------------TAACAAGTCTTTTGAAAGCTTTGAATATAACAA-AAATTCTCACTATATTTATAAAC------------ACAACAA
>okr 2989592 2990066|3221 chr2L 2989527 2989602 scaffold_7 2205156 2205230 - 4092|65 75
ATACAGATTAA
ACATAGCATAA
>okr 2989592 2990066|3222 chr2L 2989750 2992757 scaffold_7 2205231 2208184 - 113776|0 331
CAATTGTTTGCAGTTT----ATTGTTTCTCGAATTTC--CTTTTTCTTCGCACTTAAGTCTAAACTTAAGATAACTTTTTCTGGCTTCCTTTGCAAT---CCTA--ACAAGTTATTAATTTAACATTTCAAAAATGGAACCAGCACAAAATGTTAACGTGCT-AGGGGTGAAGGCTTCTATAAACTAATCTGGCAATGTAGGAGTCAGTCCAGAAAATAGTTTACTTTTTTGTGAAATACTGATCAATTTCTATACTCTTAACTGGCCGCCAATCGGGCAAAGTAGTAGGTTAACATAGCTTAGGACAAATACAAGCAAACATC---GAAAT
C---TGCTTTCAATTTAAAAATAATTTATTTAGTTGCGGAACCTGATTTAGAGTTTAGGCTAATCTAAAACTAATTCTCCTGTTATATGTTAACAATTAACCTAATATACATAAGTAGTTTAACATTTAAAATATGGAACC------------TACCGCTCTCAAGGCTTGTCCACTCCATAAAC------AGAACTACAAGCGTC------TAAGATAGCTTAACCTAGTGCACAAT-------------------------------TCAGTTATACAAAACACT-------------------CATATACATGCAAATATCATGATAAT
>CG17224 3016591 3016775|3248 chr2L 3016157 3016633 scaffold_18 1169838 1170256 - 2190|455 497
TAGAAGATCATTCCATAAATACAACAATTGATTGCTGTAAAAT
TATAAAATTATTTAATTGAATCCGTGTTTAAT-------AAAT
>CG17224 3016591 3016775|3249 chr2L 3016672 3018167 scaffold_20 2458299 2459807 - 28005|0 103
ATCCTCTAGAATAACACATCTTCTTTGAAGTTTTACAATATTGGATTACAATAAAACTGCATGCTGCACTTTGCTCTGTGCCATTCCAGCTAACCAGAGACAGA
AATCAATA-AATGTCATATGTTTATGATTGTCTCATTGTATT-TCCTGTATTAAGA--GCTTGTTG----TTGTTAT-TGCCACTCTTGTTACTCTGCGGCAGA
>%26agr%3B4GT1 3021306 3021785|3251 chr2L 3019936 3021556 scaffold_18 1172313 1173907 - 35065|1444 1702
ACCTCTCCGATTGCACATTATATATATGTATTTAAATACTGATTGTGAATATAATTCGATAATATAAGCAAGCGAACAACTCACATAGACATTTATTGAAAGCTGTAAAAGTCGCTTAGAATACTATTTTGAATCATTGTAGTTTGTCTTAACTAAGTTCGAATAAGTTGAAGAATTTTGTACATACTATTTATCCAGGGAATGTTACTATCAACCTACA--------AATAAAATAGAAGTATTTAAGTCATCACAAA
ACGTCTCCAA--ACAGATTAACCGGGTGGGTTCAAGAACCGCTTATGGA------------ATATATGCGCAGCAACATTGTCCCAGGGTATATGCTGTA-GCTGCCGAATATTTCTAGGGTATAGTTTA----------ATTTCTTTTTAAAAAAGATTCCATACGGAGGAAGATTTCCAATTTGACTGCCAAAAATGCCTCGTTCGCATCCATCCACAGCAAATTTAATGTAATATAAATAC---AGCTA--GCAAT
>CG3605 3026528 3026604|3254 chr2L 3026528 3029154 scaffold_2 3983348 3985989 - 118155|0 92
TTTGACAACAAGAAATACAACTTTTCCATTTGTGCGATTGT------------CAAGGATGTCATTAAA----CATAGTAAAAACTACAATAA
T---ACAACAATATTCGCAGTGCTTCTGTAAGCGCATTTGCTGTTTCAAGATACAAGATTGTCATTAAAAAATAATAGTAAACATTTTAAAAA
>CG17259 3035491 3035644|3258 chr2L 3035410 3037230 scaffold_2 3993510 3995321 - 100619|88 256
GCCTAAAGTTCACATAATTTACTA--------------CGAAATATACTGC-TAAACTAAGCTTGCAAAGTCCACAAAATTTTTGTTACTTATCGACTTATCTAATATTTATGGCATTTATAGAAACTTTATAACGATTAAACTGGATCAAGCTGTGCTTTGAATGCAA
GCCTAAATCCTGCCTAATCCACTAGCCGCCCGCTCTCGCTCCATACTCAGCATAAACTAAGCTTTC-AAGTCCAAAA---TTGTGTTACTACTC--CTTATGT-ATATTTATTGCATATATTGCAAACGTTTTGTTATTAAATCGGAAC---TTGCGCTTCAAA---AT
>toc 3068339 3069713|3276 chr2L 3068339 3070775 scaffold_6 5763159 5765994 + 41796|0 1751
-ATGCTGCCTACGAGGAGCA------CGTCGACCAGATTGCCGAGGCGGCTGAAGAGGCTTACGAGAGCGAGGACATTGAGGAGGATCACGATGAGCTGATCGTGGG------------CGAGGAGCAG---------------CCGGAGCACAGCGACAGCGATGATAGCTTCTAAAGC-GCTAAAACCAATTTGTAAAACAAAATAATGAG--GCAGTTAGAGTCGGC--ACTTGCGGCGAAGGTGGAAGTCATAGTCGGAAGCATAGCTTAGCGTTTTCACTTCTATAGACCCCGTACATAAACTATTAAGATACACAAAAATATATAA---TGCTAATTCGTACGTTCTTAA-------CTGAAATGATTGTGT------------AAATAAT-TGCATTTAGCAGTATGGTAGCTCATAGAAGGCGCTCATGAAATATAATAATAATCTAACAATTAG----TCGAGCACAGCAAGCGGAGCCGTCACAGC--------AAC--------------TGGGGGGGAATTGAAAAACATAAATGAGGGAAGTACTTTTTTAAACGGGCG-----CGGACGAGGATCGAAGCCACACACAAAGCTAAAC------CAAGTTTAGAGCGGTATAGCTGC-GTAT----TTAGAACAGT----------TTCAAACTAC----ACAGAAATCAGTAATGGGGGTAGCATTTAGATGAAGCAGTA------------------------------------------------------------------------TGAATATTTGCATAAAAC------------------CAACCAACTTATT-ACTATACCACACACTATAAGTATTTGTATGACTAGCGATATTGATATTGTATTCTAACC--------------GCAACTCGCAATCTC----------CGATGTCGAACATGTTACTCG---ATCCAA-------------TCCAGATGCTAACCTCTCTTGAGCTCAAATAT--------------------------------------------AGCACTCACTTGATGTCCTTAA-TTGAAAACCTAATGCCCGCTATTTGTGGACCAGGTGAGGTATCCGCCCCCTGCCACGCCTATATTATAATGTACCAATTAGAGTGTCA-GAGGTCTGAAGCTGCATCGCCGACCGAGC--TAAGCTTTAATT-------------TGTGTTTTAT-ATATGTAT------GTATTTATTATTTAGTCTTTAATGCC----TTATGAAAGCGTTAAATAAATGCAAGAAATTGAAATCACTTAGTTCGTATGGAATGAGTTATATATTAGTTCTAGCCTAACTACATTAGTTTATGTTAC-GTTTTTATTTTGTTATCATTG-----------------AATTGTGTCCGAAATATGCGAGTTTTATATGTATAGGTT--CAGGATACGC-TAATTTTGTAACATGCAGCATTGTCATTAACTTTTAAGTA-------------TGTTATTTTTATTATGTGTGAGATATTAAGAGCTCCCGGCACC--------CAACAAAATGAATATTATGTAAGAGACGGTG-CGGAAACTGTCAGAAAAAAA-----------GTTGCAAGAGAAAATAAGTAAAATGGTA---CAGTTAAAAAATCACAATAAATATTTTTTGCTAAATAATTTCAAAACCCTTAAATAAATAAGTAATTGTTTCAAAAAA
GATGTGGGCTACGAGGAACGGGCCGTCATCGAGCAAATAGCCGAGGCAGCCGAAGAGGCTTATGAAAT---GGACGCCGATGCGCAGCAGGAGGATCTAATTGTGGGCGGCGACGACGACGAGGAGGAGGACGCGGACGCGGACGTGGAGGACGATTACGATGATGATAGCTTTTAAAGCAGGCGCGCATAAATTGTAGAACAATTCGATGGGCAACAACAAAACTAAACTAAACTAAAGCAAAGCTTGGCGACAGAGTC--AAGAATGTTTAAAAAATTAAATGAACAGAAAAACAAAACGCTAGAAATAAGCCTAAACAAATTTGGATGAATTTGCT-GTAAATAAGTTCATAAAGGGGCGCTTCAATGGATGAGCTTTTGGCGAGGACAACAATATACATATATATATCTGGATTTTCATTTGCGGCTATGATTAGAAAAGAGATACATATTACACCTAGATACATGAACACAGCAAGCGGATCCGTCACAGTCTTAAGAGAACTCCATATGGATTGATAGAAGAGAGAAGAAAAAGAAAACCAAGCCAATCACCACAAAGAACATGTGTTATATGTAACACAGTTAACGTTTCGTAAAAATCAAAAATTGATGCAAAATAATAACAGTATAACAGTAGTATAAAAGTATAACAGTAGAGCAACTCTTCGAACTACTTCAATGAGAATACAAAATAAAAAAAGTATATATTTAAAACAAAAATTGTTTCAAATACGGTCAAATACGCTATCCGAGTGCACATATTGAGTACGTACCGTATCTAATGAGAGGGTTAGGCATTTAGCTCAAACAGTATATTAATATATTTGCATTCAACTTATTAACTATACAATACAC---ATTTATATCTATACATATGCATATTATAATGGTATTCTAACCTTAAAGAATGTGGAGTAACTCGAGATATCGTACATATATATATGAAAATAATGTTAACCGGAAATCCAAAATAAGTCTAGCCCCCACATATTACCC---ATTGAGCTCAAACGGAAAAGTTAAGTAACAAAAAAAAAAAAAAAAAGGAAAAGAAAAGAAAAACTCACTTGATGTCCTTAATTTAAAAATCTAAAGCCCGCTATGGAAGG---GGCTTAAGTACC--------------CCTATTTAATATCTAAAATTGTAAAATCTTACGAAGTTCTCCGCTGTAAAACT--TCGAACCTTAAGCTTTAATTAATTTTGTGCGAGTGTTTTTTGTGAAATTTATTGAGCCTTATTTATTATTTAGTTTTTAGAATTCAGATTTAAAAAGAGCAACATCTATGTTAATTGATTAACTAGCCTA-TACATATAGA---TATTACATTTAGTTTTTAGTTTTTAGCATTTAGTTAACTTTACAGTTTTTAATTTGTTATCATTGATTGTATCTGTATCCGTAAATGTATCGAAATCTTGCAAGTCTTATATGTGTAAGCTAAAAGGAACCGCAAAAGTTTATAACACGCAGCATTGTCATTAATTTTTAAGTACTATTCAGATACTCTATATTATTTTTATGTGTGAG------------CCCAGCAGCAGCAACAACAACAACAAGAACAACTGAACAGAAATTGTGTCTATATCTATAAGAAAAGAAAGAAAGATCAGATTATATAACAGTATAACACAAATTGCAATCCAAGCAAAAATCTACAGC--ATATTTTTTGCTAAATACTTTCAAAAACCTAAAATAAAATAGTAATTGTTTCAAAAAA
>CG12400 3145125 3145199|3369 chr2L 3144765 3147854 scaffold_6 5893329 5896636 + 50006|458 554
GTG----------------GATCTA------AATCTTTGTTGTCAAACGAACGATGGAAGTAGTTAATAAAACAGCTTTAATTGTAAAACATATGAA
GTGCTCGGTGCTGCGTAAAGGTGTACGGATTGAGCCCTGCCTTAAAACGACACAT-------TTTAGTTAAACTGCTCTAATTGTAATACATATGAA
>Mad 3146484 3147418|3369 chr2L 3144765 3147854 scaffold_6 5893329 5896636 + 50006|1994 3066
GCTTAAGATGAGGCTCGAGTCCTCAATGGAGACGGAA-------GAGAAGGAACACAAAACCGGTAGCTAAATGATGAGTGCGTGTGAGTGAAAGCTAAGT-GTGAAAAGACGTAGAGAACACAGGACAATGGAGAGAGCATAGGTCTGTAGGCCTGAGGATGGAGGTCCATGCCACTCAGTCGCAGATTTATATAGATG-------------------ATGTAC-----------------------GGCAGCTACTCCAATACCCGCCCTTTGCCCA---------------TATTTTATAGTTT-ATCGTATGATTTTCTATGCGAATGTCATTCCTAACGCTAAAACAGAGTAATGAAAATGGACA------GCGAGCTAAGAAACCAATTACAAAATG------GTATAACTAT-------------TTACAATGATCTACA----TGCTATAATATTAATGATCTATGCCCATTGGCAAAACAGTTCTTGTTCAAGTCTATTTCAAGTGCTAATTATGTGTCATTGCAAAACTGCTTT--AAATATAAAAACACATTGAATTAATCCTACCAACTTTAATTACATAAGGAACAAGTAACTTACGTAGGGATATGAAAACACTTATTGCA-ATACATTTCTTAAAATGATTTTGAAGAAGCCCTAGCTTATGTTTTATTTTTCTCATTTGCGGTTCGCCTTGGATCAACGAATTCAATGTTCAATATAGTTGATTTAAATATATATATGGTTTAACTAATTTTAAGTTGCAAACAAATCGAAAACATCAAACAAGAAAAGATACCAGCGAAATTTAAGAATGGAAAAATGCTACTGAATCAATACGTTTTCCCAGACAATGATCTTTTGTTATCTTAAGTAAAACT--AATATTGTTTA-----GACCACGAG------------AAAATTGCC---TTTTTATATAAATATACATGTATAACTTTACTCTAGTTATCGTAAGCTTATGATTTTCTCTGATTTTGTTTTGAATTACACTTTTGTGCGCAGA------AAAATAAGTAGACGATAAT------------
GATAAAGACAA---------CTTAAATGGAAACTATATTCAAGCAAGAAGGAAGGAAAACCCAACACACACAC-ACACACACACATAGATGATGATGATATAGCTAAAAGACGTA--------ATGCCGTTAGCTGAGCCCTATGCCTAAATATTTGTGTGCGTGTATATATGCCTTACAAACCGATATATATATATATATATACACTTATATATATATATGTACCTAGATATATATATATATATATAGACAGCTACTCA---ACCCGCCTCTCGCCCACTACACATACTTATCTATTTTATAGTTTAAACATATGATTTTCTACGCGAATGTCATTCCTTATGCAAAAGAAGAAGAAGAAAAAAACACAGTTAATGCAAGCGA--AAACGAACTAAAGTTTGATCTATATACAACTATTGTACTATTACTATTATAATTATTATTATTATTATTATTATGATAATGATATATGCCCATTGGCAAA-----TGTTGTTCAAGTCTATTTCAAGTGCTACTTATGTGTCATTGC-GAATTGCTTTTAAAGAATAGCAAAGCAACAGAATAAACC---------TAAATATATA--------------TATATATATATATATATATATATATAGTATATACATATATAAA----------------------------TCAAATTATACTTATGTGTAGGGCAAGTTT--TAAACAACTTTTATG--CAATACATTTCTTGAAAA-------------------------------AAAAAAAACAAAAACA--AAACAAAAAACAAAACAAAAACAACAAAAAAAGAGAAAAACACAACACAAAAGTTACGCTTAACTAATTGATGATCTTGTTTATGTTTAAGTACAATTTGAAAAAAGTTAATGAATAACCGAAAGAAAGAAAAAACAAAAATTGACAAAACACAATTTAATTTTAAACATTTTGC-TTAGTTTAGTTAACAT---TTTCTGTTCTCGTTTAATTATTTGTTTCA--ACAATTTT-TTCGCTGGTTTTTTGAAAAAAACACACGATGATTTTCTTTGTGCC
>CG31698 3173270 3173302|3405 chr2L 3173087 3173319 scaffold_5 5607046 5607258 + -247|205 237
TGCGGTCAATAAAGGGTATTAAAAAAAATTAAA
TAC--TTATTAACTAGTTTTCAATAGATTGAAA
>CG9664 3291245 3292112|3520 chr2L 3291163 3291339 scaffold_7 1799646 1799811 - 183|82 181
TCGGTGATATGGTTAGTTAGGAATCTGGCCCT---TAACAAATGTAAGGGAGATTGTTAGTGAATGGCTAATAAAGTGTTACGATTGTTAAACT--TTTT
GCGTTGATTTTCCGAGGAATAAACTTGCCCCCTTGTATTATACATAAAA--------TGTTGAACATTACGTTTAGTGTTATTTTTACTAAATTAATTAC
>CG9664 3291245 3292112|3521 chr2L 3291340 3293057 scaffold_6 2692692 2694444 - 62572|0 772
TTTGCTGTCCAAATGCGTCTGGTGATGCACGTGGTGGTGGCCCTGCTCTTGGGCGTTGTCTACTGGCAGATAGGTGGCGATGCACAGAAAATCGTGTCCAATGTATCCTGCCTGTTTTTTGTGATACTCTTCGTGTTCGCCGGCAATGCCATGCCCTCGATCCTGCTGTGCATGCAGGACTCGGCGGTGTTCATCAGGGAGTACTACAACGGATGGTACTCCCTGGGAGCCTACTATCTGTCCAAGGTCCTGGCCGATCTGCCCCTGCAGCTGACTTGTCCCACAATGTTCATCAGCATCGGCTACTTCATGACGGGTCAGCCACCGGAATTCCAACGATTTGCCATGTGCTGGGCCCTGTGCGTGATGACCGCCTTCATTGGCCACTTCATCGGGGTGATCGCAGGCTCCCTGTTCACCATGCAGTTGGCCATATTCCTGGTGCCCAGTGCCACCATTCCGTTCCTCCTGTTCTCCGGCTTCTTTATTCGGCTGAACGAGCTCTCCTGGTTTCTGCGCCCCATCTGCGACGTGTCCTTCTTCAGGTACATCTTCGAGGGTCTGATGCGAGCCATCTATGGATACGATCGCGGGGAACTGGAGTGCTATGCCACAAGCAACTTCTGCTATTACAGAACGGCGGAGCAGTTCCTCAAGGACTTCCAGATGGAGGGCAATGAGTTCGATTGGGATATGGCTGTCCTGGGAATATTTCTCATCCTCCTGCTGCTAGCCTTCTTTGTAACCCTGAACGCAGTCATCCGGCGAGCTCT
ATTGCCGTGCAGTTGCGTGTGGCCATGCACATTGTGGTTGCCCTGCTGCTGGGCGTGGTCTATTGGCAGATCGGCAATGATGCCGCCAAGGTTATCAGTAATGTATCCTGCATGTTTTTCATTATACTGTTTGTGTTCTCGGGCAACGCCATGCCCTCCATTCTGCTCTGCCTGCAGGACTCGCCCGTGTTCATCAGGGAATACTACAACGGCTGGTATTCGCTGAAGGCCTACTACATATCCAAAGTGCTCGCCGATTTGCCACTGCAACTAATCTGTCCGACTTTATTCATTAGCATCGGCTTCTTTATGACCGGCCAGCCGCCGGAGCTGGGCCGTTTCGCCATGTGCTGGAGCATATGCGTGCTGACCGCCTTTATTGGACACTTTATTGGCGTAATTGCTGGCACTTTGTTGCCCATGCAGTTGGCCATATTTATAGTGCCCAGCATATCCATACCGTTTCTGCTGTTCTCTGGATTTTTTATACGGATGCGTGAATTGTCCTGGTTTCTGCGGCCCATTTGTGACGTATCCTTTTTCCGATACATCTTCGAGGGTCTCATGCGCGCCGTTTATGGCTATGGACGCGGCGATTTGCCGTGTCAT----CAGG--ATTTCTGTTTTCACAAGTCATCGGAACAGTTTCTCAAATATTTCGACATGTCCGGCGATAGCGTTAACGAGGATATACTCGTCCTGGGCCTGTTCCTGCTGGTGCTGCTGATCGCCTTCAATCTGTCCCTGCATGTGTGCATTCGACGTGCTCT
>CG9664 3292174 3292533|3521 chr2L 3291340 3293057 scaffold_6 2692692 2694444 - 62572|836 1218
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TACGATACTGTGCCGGGACGGGCCCCACCCGA--TGCCACATTCCGCACACAGTCGATACAGTTTGTTTTATATATAGATGACACATATATATATATATATATATATATATATATTTATAGAGGTGTACAAGTGCGGGTATATTTATGATTTC--TTTTAGCATTTAATTGAGAGAACC--ATGTGCCAAAGAATTGAACAGC--GTTTAGCATAAGGAGAAATCGTGATATACAT-------ACATACTTATTTTATCTATACCCA-ACACCAATTCACAATTCCCTAGCAGCCGTATATATATATATTTATACGCTTTATATATATATATATATACAATACCCTTAGCATAGC---------CCTGTATTCTCTGTACAATCGTATTAATGACACACCATCATCGACTA----------TTGCTTAGTTTTAAG--------CGCATGTACATATTT-----TATTAAGCTCAAAATAATTTGTC-TGAA----------
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AAACAGACAGAGAAACGGTAATCTTTTGAAT--TTTATTAATACTCTGAAGTAACGA-ATAAACGCTTAATAAAGACTAACAATAAAATATGAAATACA
GTAAGAACAACAAAGCTGAGTTTTTCTGACGCATTTATTAAAATCCTT--GTTGCGATATTTTCGCTCAT---ATATTGACAGTAGAGTGT-------A
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TA------------------------------------------AACCTGACAACGAACCAGTGATACGTAATTAGTGTAGCATGTGTAAATCCTATATTAAATCCACCAAACTAATTAATATCCCTACATGTTGAACAAATTTCGAAACGTGCGCCCAATTTTGTGATTCAATATTCAAAAAGCCACATTTATTATATTATATTATAATATCTACTATATTTAGT-TTATTTATAAACAATTTATCTATATATACTTTTATGTATATGGCAAACGGCAGGCGCTATACCCAAAATTTGTTGTTTGTTGCATATTGTAAACAGCAATTTTTGTTTTTGTTTTATGCATTTTAATTGTTAGCCATTTATCCTAAATCTTATTATTATTATTATTATCATATTATTATCATTATTATGTTGCTGCTAAAGAAAATGTTTGTTTTGCATATGCGAAAAATA------------------------TGTTTTAATGTACGTTTT-AAATCCAAAAGTAATGCAAATTCAACAGCCCATATTATAATTCTATATATTCTTATTATAATCGCATATCGCACATATTGTACTACATATATATATATATATATATATATATATATGTATATTGAATATGCTAGAAACTTTTGTAGATTTTTGCAAA--TTTTTTCACTTGGGAAAAAACACTGTGATTTAGTATGCTAGTTTTTTAATTAGTTTTAAGTTGGCTGCCTAA---------------------------------AACCATGTAAAGCACACACATCAACAAATT------------------------GTATAAACATTATTAGTATGTTTACAATAACTAATTATATGTAATTAAATTTATTTAATGTAACATACATGAAAA-ATATGCCGAAAAA--TA
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TGTGCGAATTCTATGTGAAAAATTAAAAGAAATGAAATGAAAATTATGAAGTGCTAATACATTAAATGTTGGCCGAACTCTACACATAAAATAAACAACAACAAAAATAAATAAAAAAAAAAACTAGGC-GTTAAATTTAGGCCGTTGC-GAATTGGT----------------------------TAAAAGAAAACAT-----------------AATGTTAAGCTGCTGTCTTGAAGAAATTTTAATTTATTATAAAATGAAAAATCAATAAACTACAATGAT
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CAATATTTGATTTTAGCAATCTTACATATAATTTTATTTAGCTTGAATTTTGTATATTAGCA------CATT---TCTTAATTATTTCCTTATTTCTATCTGTCT------TAACTTTTGCGCTTTACTTTAATGCGCTTTAAATGCCAACTATAATTATTTGTTAATTTACTTTATGATTTATCTAACAAATTGATTTTGTTTTGTTTTTATTTCAGACTGAAAAGACTTTGGCTGAAGTCATGATACCCTAGGCAGCCCTTTCAGCACAAGAATC---CACAACTCACAAGCCAACCCCCCCCCCCCCTTCCCCTCCCTGCACCCCTCTGCAACAACAACAACAACAACAACAACAAATATAAACACAACAATAGTTAGTTCCTGTTGTTAATTCCGAACACACAGCCACCAAAAAAT-TGAAATTGAATTTCGAA----------ATGTAGTCACAAAACTAG-------CGAAAAAACTTTGTG---TTATATTGGTAAGTTTTTTTTCCAATTTGGCTATAAGTAGTAAAGCTTTTAGTTGCGCCTTTCAGTTAATCTATGTATTTATATATAATGAATTTACATTTTATATTCTAATTTAAGTCTTAATTCATAAATTTGTTTTACGGGCTGCATTTATGTTTATGTCGTTGTTT--TAGGCTTTAGAGCCTTCAAACGAATTCTCAAAGTATTTCAAACAAACTTCACTCACACACACACACACACACTCACTCACTCACACACACTCACATACATGCCAGCAACAAAGAAGAAAATTTATGGGTAAGCGCCTTGAATTTTTGTTTTAGAAAATTCACTTCAACAACAACAATTCAATGTGAAACAAAAAACATTTTGCGAGAAAAAAAAAACCCGAAAATAAAAATTTATCTAAATTTTTTGTAATTTTGATATAAATTATACCCC---GTTAAGCAAACGAAACTAAAAACAATGCAAAAATAT-----TTGTGCACAATATTTTTGTAAAAAAAAAAACAAAAAAATAATCTATGGAAATCTTTTTCTAAATTTTACTGCGATTTTTCCGTTTTTTTCT----TTTGTAAGAACTCTTTAACTC------GTTTTTGGCGCCCCGTTTTACAGTCGAAGCAGA----AATAACTAAAAAAGAAAAAGAAACTTACAAAACTTGAATAAATGCGTAGCATAATTGATAAAATCGTGTAAAACCCAATGGCTT----ATTACATATATACACCATATATATATACGAGTACTACTTATAGATCCAAGTATTCTTAGTTTGTAGCTGTTGCATTTTAATGT
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GCATC
GCAGC
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GAAACTAATGAGCAAATGCAGGAATCGACCAACTAAATAGAAAAAATTACGATACGACAAGAAATTGAGGCTCCCTGAAAAATGACGTTCTGCTGGCAAGGAAAAAGTGGGAGTGTAGGTCGTGATATATAAGTTACAACTATTCGGATTTGATGACGTTGATGATAATGATGTTGTATGTGGTTTCTATGTTTGAAATACGGT-------TAACCACACACACATATATACTCA--GTTACACAGAAATACACACACACAAACTTAAATACGACAAGTACAAGAATGGGTTTATATATAAAAGTAAAACAA-------GAAAAACAAAAGTTTCAACTATACCATATTTAAGTTAAAGTTGGATGTGTATAAGTCTAGCCGTTGCGGCTAAAAATTGTTAAAATGCATTGGCATATATATTTACATATGTATATGTGCATATGTAAATGTATTCTTTTCCAACACAATGCATACAAAAAAAATAAAAACACGTACTTAGACTGATTAATTTTTTGTATATGTAAAAAAAAAAAAATATTTAAAAAATATATTAAAAAATACATATATGTATTACGCATGTACTCGTACAATACTTTTCGCAAACTGCTTAAGAACTCAACATTAATTTCCATTGCCCAACACTAAACTCAGCTCAACTCAACTTAACTCAAATCAACTCAACTCAATTTTTAACACACATTC-CTCAAGTCAATTAACCGTTGAAAGCAAACACTTTTCATTTAGCTGGCAGCCGAACATAGAGCAGAAAACCAATTCCAACTATTCAGAGAATAAAACTAACAAGAAAATAAATAAGAAAACTGGAACAAAAGAAGCAAAAGACGCAGCAGTGGGAGAGAGAGAAAAATGTTATCATTAGTTTTAGTTATAAATTTAAGTACATAAAACCTTAAAAAAAAAAAAAAAAGAACA-ACAACAAATTTAAGTGTATATATTA--------TTATTGTTTAAAGCAAGGCCAAACTGAAAAAAAATTACAACAAAAAATTTTTTTTTAATT--TTTATTATTCAATTGCTCGCAAATAATTTATTGAAAATTTCCAATTTCATCATAAAAGGAAACATGCTTTTCTACTTAACAGAAACACACACGAACGAGCATTTAAATTGCGCATATTGTTGAGCCTTTTGTTTATGTCCAAAGCAATTTGACATTCCATTTACTTTATTTTTTCTATTTTATGTATAAAATGATTGTTAATTTTGATGAGTTTTCTCTTTTGTTGTTGTTGTGTGTAAATGAATTTTGCTAGTT---TTATGAAACGAAAGGGGAAA---ATTTGAAAATCCAGAGAAGAAAAGAAAAAAACCAAATACGAGTATTGTATATTTATTTGCCCGCATACAGTGCGTACGCGTAATAAATTGAAATGCGTTTTTAATTTACGTCAAATAAAAATTGCAAAAAGAATTATAAAACTAAATACGAAATGTGGTTTTATTCTACACCAAAATC
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TATACAGAATATGTTATCCCTATGTATTCCCAATTCCTATGTATGTATTTATAAACCTAAGCAATTCAACATGTATATTACAGTTTGTTCTAACCA-AGTAGAGCTAAT-------------------------------AAATGAGCCAGTTTCTACAAATTGGGAAACTGGCTCATTTTGAATTATTTTTGCTAAGCAGCCTTAAGCGTGCTGAGAATGTGACGAAGTCAACATAAATTATCAACATTAAATATAAATT
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AGTTTTAAGCAACATTTTTTTT--ATAGGCTAAGAACCTTTTTTTGAGCA---TGAAACCTTATTTTTTTGAGCATGAACCTTTTTTTTGAGCACGTGAAAGTCAAACATTTTTTTTTTCTTAATTTAAGATTGTGTATACTCGGAATTATGAAAGCCAGTTGCAATAAAAATATTTGTTTGCAAATT-TAAATAAAGAGATTTATCTAACGACGAATTCAGATTGTAAATTTAAAAATATTCTTGCAAGAGTATTGCAAACCAAGCTCGAAAGCTAAA
>msl-2 3462213 3463265|3701 chr2L 3462416 3463077 scaffold_24 1289819 1290343 + 639|0 682
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GCAA
GCAA
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>CG3238 3467416 3467850|3708 chr2L 3467805 3468916 scaffold_2 5682724 5683828 - 55771|0 52
GCTCGAAAGTAATCT-------AAGATAGCGTAATTCTAGAAAGCTTGAACAA
TACCGCGACTGATCTTTTAGCAACAAATTCGTAGCTCGTAAGGACTGAAACAA
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TAAATGGGCAGTTCCTGGTTCAAATAGTGCAAATATACACACAT-----AAATCTATTTAC-ACGTTTAAGAAAGAAGAGC------GACCGGTGTCCATCCACCAAAAACCATCTGTATGTATAT--------------------------------CCTTAGTCAT-------AAGTTATGCTTAGC-------AGTAATAAAGCTTTCCCTGTAGC----------------------------------------------------------------------------------------------C
TAAATGGGCAGTTCCTGGATGAAATAGTGCAAATATACACATACCATGAAAATATTTTTACAATATCCATGAAATATTCGTATGTTAGATTAAATTTTATTT-TAAGAAACAATTTTTGTGCATATATGCATTACAAACATATTACAAACAACAAATCTCTTTGTTAAGCTATTAAAAATATCCTTAGATATTGTAACTAATAAAGCTTTCCGTGTAGTAATCAATGTTTTACGATTTACTCTGTATTGCATTGGCCTCGCTGAGAAACCCAGATCCGCCATGGGCCCACACGCTGTGCGACTAAACAAATGAC
>tim 3493986 3494621|3738 chr2L 3494551 3494921 scaffold_6 5045476 5046013 - 7427|0 70
CAGCGACAATGTCTCTTTGGCCTCGGACCTGACCAGAATGTATGTGAGCGATGAGGACGATCGACTTGAGC
CAGCGACAATGTGTCAGTGGCCTCGGACTTGACCCGCATGTATGTCAGCGATGAGGATGAGAAACATGAGC
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CATTGGCTCCTCGTCGACAACCGTGGACGATGAGGGATTTGGCAAGTCCATCAGTGCAGCCACTTCGCAGGCGGCGAGCACCTCCATGAGCACGGTTAATCCCACAACCACTTTGAGCC---TGAACATGCTAAACACCTTCA----TGGGAAGCCAC--AACGAGAACAGCAGCAGTTCTGGTTGCGGGGGCACCGTCTCCTCCCTGTCCATGGTGGCTCTGATGAGCACCGGCGCGGCAGGCGGAGGAGGTAACACCTCCGGGCTGGAAATGGATGTGGACGCCTCCATGAAGTCCTCGTTCGAGCGGCTGGAGGTAAACGGATCGCACTTCTCGCGGGCCAACAACTTGGACCAGGAGTACAGTGCCATGGTGGCATCTGTGTACGAAAAGGAGAAGGAATTAAA
CACCAGTACCAGCACAATGATTGCCGATGACGAGAT------CAAGTCAT---ATGCCTCCATGGCTCAGGCTTCACATACAAAGCTGAACGCCGGCTATCCGACTAGTACGTTGGTCTGTATGAACAAGTTGAGCAACTGCAGCTTCGCGGCGCCACCGAATGAGAACAGCAGCAGCTCCGGCTGTGGCGGCACTGCATCTTCGATGTCAATGCCAAATATG--------------------------------------CCGGATGGAAATT----CGGATGCGTTGATGAAGACGTCGTTTGAGCGGCTGGCGGTGACGGGCGCACGCTACTTGCGGCCCAGCAATACGGATCAGGATTACAGCGCCTTGGTGGCATCGGTCTACGAAAACGAGTTTG---CCAA
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ATACACACCAGATCCCACGCCTCCAGTGCCCAACTGGCTGCAGTTGGTCATGCGCAGCAAATGCAATCATCGCACAGGTCCGTCTGGTGATCCCAGCGATTG
ATACACGCCGGATCCGACACCGCCCGTGCCCAGTTGGCTGCAGTTGGTCATGCGCAGCAAATGCAGCAAGCGACGCAGTCCAGCCACAGACGCCAGCGATTG
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TGTATATACCGTTATCAACAATTTTTGCTCTCTCTCTGTGTG----AAATTTTGATCATGGGAATCTCGCCCG-------------------------------------AAACCGAATCCAAATCCGTG--CTTCCATCCATTCCCA-----------------TTCTC--------------ATTGTGTGTCCGTCGGTGTATCTCGATATGCTGTGTGCCTCTCTCCTTCTCCTCCTTCTGGGCTCTTATAGTCAACCTCAAGTTCGACGCCAGTGAACTGGAGGATGCGACGGCGTCGAGTCCGTCGCGTTACCACCACACCGGACCCCGCAACTCGCTCAGCTCGGTAAGCAGCCTGGACGTGGATCTCGGCGATACCGAGGAGCTGGCCCTTATACCCGAGGTGGATGCGGCCGTGGAGAAGGCACACGCCATGGCATCCACGCCATCGCCCAGCGAGATTTTCGCGGTTCCCAAGACGAAGCACTGCAACTCGATCATCAG
TGTATATACCGTTATCAATAATTTTGGCTCTCTATGTTGATGACACAAATTTTGATTATGGGAATCTCGCCCGTCCCTCGCTCCTCGCATCGTCAATACGCACAAAATATCAAACAATTCCATTTGCATGAACCCCATTTCATACCCACCCCGCCCCCTAAAAATTTCTCTGACTGTGGCTGAATGTGTGTGTCAATCGGTGTATTTCGATATGCTCTGTGCCTCTCT--TTCTCCTCATTTTCGGCTCTTATAGTGACGCTCAAGTTTGATCCTCGCGATCTGGAGGATGCTCC---------CCCGTCGCG---CCATCACACCGGCGCCCGCAACTCGCTCAGCTCGATTAGCAGCCTGGAGGCTGATTTCGGCGATTCTGAGGGCCTGGCACTCATACCCGAAGTGGATCCAGCTGTGGAGAAGGCAGCAGCAGCGGCTTCTGCTATACCAAACAATGAAATATTTGCCTTGCCCAGGGTAAAGCACTGCAACTCCATCATCAG
>tim 3501040 3501167|3747 chr2L 3500711 3502129 scaffold_6 5053025 5054315 - 48300|335 465
-GATTTCAGAAGATTT---CCTTGAAGCAATATATTTAATAAGGGTATAAGCAATATAATCTTTGATCTAAGATACAACTAACATAAGCAATAAACATAACATTTTTAACATTTGTGGACCATAAGAACAA
AAATTTTAAGAGATCTTTACTGTGAAGATGGGGTCTCGATCAG------ATCGATAT--TGTTTAATCGAACTGTCTGCTTAAATGAACTCTAGTTTCAAAATTTTCAAGACTT-----------TGACAA
>CG33123 3510477 3510588|3756 chr2L 3510363 3512863 scaffold_6 5065891 5068403 - 121059|117 234
GTCAAAACGGCATCACAAGCCAAACTAACTTATTCATAGA-----ATGAAATTAAAATGTTGTAAAACACAAATAATGGCTATTAAAATGTACTGTGAGTTGGT-TGTGCCCAATTTA
AGAACATCTACGTT-CTGGTCACGCGTCTTAATTTATAAATGATTTTGGAATTGGAACATTGTAAA--ACAGTTGTTGGCTATAAATGAATACCTTACTATACTATGTGC----TTTA
>CG3213 3517268 3517432|3760 chr2L 3517429 3519725 scaffold_6 5073286 5075663 - 96414|0 3
ATGG
CCGG
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TCTTCCTCAGCTGATTCCTCACTCTTTGATACCCACTCAATAAAATAAAATCTCAATTGCAGCTCTCATGAATACGAATCCCTCCAT--------------------TTCGTAATCGTAATCTTAGTACGACTAA------ACAGCATTTAGTTTAGTGTAAGTTTAGCCTTAGCTACTTTGGTTTAAGCC-------------------------TTGGATATTTGTGACGTAAGCATAGCAGGAAAGTTTGACTTTGCGTAAATTAAC--GTTAGATATTAAGT------TAAATTGTGGACTCTTAATGTACGATCGAATAAAAGACAATAGCTTAAAGGAAA
GCTCCTT-----------TCAAGAAAGGAAGCGCTCTC--------AAAATCTCATTTGCAGCTCTCAACAATTCGAATCCCTCCACAATGTGTCTGATCTGTGTTGCTCGTACTCGTGGCCTTTAAGTTGCTTACAGCTTACAGCATTTAATTTAGTTTTAGCTTG----TGACTAATTATGGTTAAGCTACTGATATTTCTAGCTGGTAATCTATTGGATATTTGAAACATAGAAATATATCGAAAGTTTGACTTTATTTGGATATACTTATTATATATAGAGTATTAAGTAAATTGTGGACTTTTATCGTAAAATCGAATAAATGAT-ATAGTTTAATAGAAA
>odd 3604222 3604993|3867 chr2L 3604111 3607571 scaffold_6 5174606 5178346 - 88606|118 1046
ATTGAAGGACCAGCGAAACCCGGTATCCGGTTTCTTTTGAGACATTCTAAAAG-----AGATTCAGAGAGCTGGACGTCCGCCAGGCATGGGAAATGCCTGGAATGGAA--------AACCAAGCGAGTCC------------AGCCCGCATTCTGGCCAAAGGTGCAAGTGGAAAATCCTC---GCCAGCAA---CTCGTAATCG----CAACCCAGTGAGCAGAAG-------------AGTCATCCTCCGTGCAATCGGTTCTATGTA-----GCAGATCC------------------CAATTGCGTTAAAC--------AAATGCCAAAGTCAAATAGCA-GAGGAAAACTGATGAAAAATCCAATGAAAAGTATTGCTAGCACAAGCCTCCTACAAATCGATTCCAAAACAC-------ACACACACACACACAACTGTAAACTATAAACTTTAATA--AATAGCACATAATTTATATTGTAAT----------------CTAAC--TATTATTGTATGTACCTTATAGT-CGTAGTAGCC-CATTCAGTTCGTAGTGCTTATGGAGTAAACCAAATGTTATGTTACAATAGCTCAATCAAACAAACCTCAAACCCGCTTTGGTTATTGAAAGACTG-------------------TTTTAATTATTATATTTAAATAGTACTTGAATAAATCAATCGATCGATTGTGTAATGTTAAACCCCGACGAGTGTCATGATTACTTACTGTTTAGACTTAACAACTTAATTGTCGCTATA-GCAATTGT-----GACT---------ATGCACAACGATCTCATTGTC----GTCTATATGTATGTCTGAAACATTCGTATTGATATGAAGTTATCACAAAAATA-----CGTAA---ATATAAACGCAAAGTAATTTT--CAACTG
ATTGGG----CAGCTGGTCGCAATTTATTGGTTTT------ACGTTCAGGATGCACGCACATCCAGAATTCTGAGCG-CCGCCAGGCATGGGAAGTGCCTGGCCTGGAGTCGCAGTCAGCTCAGCAGCGCCGCCCAGTTCGAGAGTACGTGTTCGAGTTCGAGTTGCAG--GGAACGCCCCCCTGCCCAGCCACCGCTCGCCGTCGTCGCCGCCCCAGTGAACCACAGACAGTTCCGAACCAGTCACAACTAGCCCAATCGGCTCTATATATACTTACAAACCCGATCTTATATAGCTGTCGCATTGGCGCTAAACACACTGCAAGATGCCAAAGCAAAACAAAATGAAATAAACAAATGAGAACT-TAGTAAAAAGTATT-----------CCTCCCACAGAACGATTCCAAAATACGGCATTAAAGAGTACTTTTGCCTCACTATATTTTAAGCATAAGTAGTATGAGTATTTCAACCATTTAGTAATGAGTAGTATCAAGTTCTTAGTTATATAATCGTATGTACCTTATAGCATGTAGTAGCCGCATTCAGTTTGTAATAC-----------ACACAATACCAATTCCCGGAGAC-----------AACCTCAGACCTCTATTGGTTATTCAAAGACTGTACAATTATTTGTTTGTTTTTTTACTGAATATATTTTATAAATACACAAGTACTTAAATCAATCCAATG-----TGTTAATTTTAGTTAAGTGTTATGCTTGTTT-----------CTAATAACAAATCTTGAGTTCTATACATTTGTAGGCCGACCCGCACACAAAGACACAACGATCTCATTATCTTAGGTCTAGATACATAT-----ACAT--ATATGCATGTGCTG-TATCATAAAAAAAGCTATTGTAAAATATATGAATTACGAGTAATTGTAAAAACTG
>for 3622074 3622777|3883 chr2L 3622025 3623884 scaffold_6 5211112 5213163 - 78894|51 948
GGAGAATCAGAACCCGT---TTCCTAGACGATGCTCTCTAAACGCTTCTGCTGCAGAAAACCAGGAGGATATGAAAGCCAGGGAAGA-----AAAATTGATCTTA---AGTGCGCCATATGTACGCCAAAGCCAACAGCAACAGTCAG------------------------CAGCTCGCA-TCGAAAAGC------------------------------TGCC------ACAAAAAAAAACAAAGAAACGTAGCAGTCGCAAGGTCAAGGGCCGACACAAAAGCACAATCATCCATCGTCGTAGCTCCATTTGAGATTTATAGATACGTCTCCGTGATGTTATAACCATGA--------TGTGCAACGCAATGAATTTATTAACGAGTTTAT-AACTATTATTTTATAATGA-----GGATATATG-TGTCTAGTTCGCTTGGAATTGATGTAAATTGTAAGTAGGT--CTGTGACTCTGTTTCAGAGCTCTGTTAGCCATGTGCATTGTATAAA----TTCAGCTATTTGTATCTATTAAATATTTTTAACATAATTATT-------------------------------------ACACATCATTGTTAAAGCATACAAATCGGGTTGCCTTATAGTCTGTAAGAGAACATTTGAAAGCAACATTTGACCAAGATCTTC-----CGTCACACATTTCTTAAAATTCTATGTGGCCTCTCTACTGTCTT----------------------------------------------TCATTAGTCTTAGCGATCATGTCTATTATATTTACGAATAA-------CATGCCCTTTT-AATTGTCTTTTTTAAGTAAA-TCAGCTAGAAATTGAATA---AACAAATTGATCCG-AT
GTAGAATTGACGTATGGGAATTTTTTGACGCTGCTCTCTAGCGACTTTTGTCGCGCAGCTGCTGCAACTTGTGACAGATAATGATAATCGATCTAATGGATCTTAACTAGTGCGCCATTTGTACGCCAAAG-CAATAGTCAGGGTCAGACTTTAGGACGAAAGCTGATCCCCCAAGTAGCAGTCGCAACGCCTAGGGTCCTCATACAAATAGATCATGTCGTGCCCAGATAAGAAAAAAAAACAAACAAAACAACAACAAACAAACACACCCAGCCACACACCCGCACACACACCCATGAAAACGGCTC--------------AAGCATGTCTCAGAGATCTGATTATCATCATAAAACATTGTGCAACACTATGAATTTATTAACGAGTTTATAAACTATTATTATGTAAAGATTGTGAAATCTATATTTTCTAGTTCATTGGATGTCGATAGAAATTGTAAGTAGGTTCCTGTGTC-CTGGCATTCATCTGTTCCGGCCATGTGCATTGTGTAAATTGTTTTCTCTCTCTCTATCTATATAAAATTAAAATTATAATTGTTAAATGTACCAAGTGCAAACACACACACACACACATACACACACATATACATATACATACAAATCGGGTTGCCTTATAGCCTGTA--AGCAGATTTTATACAATTATATGACCAAGACCCTCATGCTCATAACATATTTCTT---GTTCTTCTTCATTTATCTATCATTTTAATGTTTCTGAACAATCGTGGATCTACATGCGAATTATTCTTCCAATCATTAGCCTTAAACATCAT-CATATTCTATATATAAATGAGCTAAATAACGCCTTTTTCAATTCTCTTTTTTAAGTAAACTGAGCTAGAAATTAAATAAATAACAAATTTATGCGCCT
>CG16704 3692127 3692185|3963 chr2L 3691744 3693397 scaffold_6 5319306 5320993 - 16467|409 498
GTGCCCATTTGGTT---------GTGAATAA------------------AGTTGGAAGTTCGGTTTTGT----TATCCTAATGTGATCAT
ATGCTTGTTTTGCTTTATAATTAATAAATAAATATATATAAAATAACTTAATTGAGAATTATGTGTTTTCTAATTTCGTAATAGGTATAT
>CG16713 3695028 3695052|3969 chr2L 3694828 3695062 scaffold_6 701827 702042 + -1953|207 231
-ATTACGTGAATCAAAAATTGAAAG
TGTAGACAGCATGATAGGTTAACTT
>CG16712 3696238 3696289|3972 chr2L 3696095 3696241 scaffold_6 5323200 5323328 - -184|145 148
ATAA
AGCA
>CG16712 3696238 3696289|3973 chr2L 3696242 3696802 scaffold_6 5325793 5326366 - 12362|0 62
ATTTG----------ACCT---CTATGCTCTACAAAAT--ATTCAATAAATGATTTTCGATAA
GATTGCAAAATGGAAACTTGTGCTGTGTCTTAATAAATAAATTCGTTGAATGAAATTTAAAAA
>CG10031 3698555 3698585|3975 chr2L 3698180 3699093 scaffold_6 5328552 5329442 - 10700|393 430
TCCATTGATGGCGGTCACAAAATAC-------GAGATT
CTTAAGTTCAACGAATCCACAATACTTTCATGGCCATT
>CG31778 3704106 3704418|3982 chr2L 3704040 3704364 scaffold_6 682581 682940 + -2620|79 368
TTAGTCGAA------TGTAATTATATTATTTCAATTTTCGATGGTGAAATTTGTTAAAC--------CTGAGAATAGTTTCTGCAAACTTTTTTTTAT------TTTTATACGCACA--TCAAACTGGTTTTTATACTCGAATTAAAATTTATTTTGTTATATATTTTTGTTAATAAGAAACATTGAAAATCCAGTTGGAGTTTGAAATACTCTAACCCTAAGATTGAATGAATATCTAGGATGTTGCCTCAATAACA---------CAACATAGAATATTTGGAAACAT
CAAGCGGAAACAAGCTTCGATTCACTCGTGTCTAATTTTAATAATCAAATTTAAAGCATGCATTTTTCTTGTGGTAATAAATACAAAAGTCTTTCTATCTATTCTTTTATAGTTATAGTTGAGAGCGGATTTTGATTACACACAGGAGCTTAGCTTTTGAGGGAT----GGTGAAAGGATACCGTGCCGTGCCATAATGAGTCGAAAGCGTGTGCACCCAAATACC---TCTATATTTCACAGCATAAGTAAAGAACAGTATAGACCAATCATGATCTCATTGAACACCT
>CG31778 3704106 3704418|3983 chr2L 3704365 3705624 scaffold_6 5332868 5333978 - 7723|0 53
ACACACCAAAAGGGAAAGAAAATACCCTTAGTTGTTAATTGTCACGTGCCTTAT
ATATAAGCACTTACAATAGCAGTAGTCGTAGTTGTTATTCATGTCTTTCATCAT
>CG31777 3706543 3706579|3985 chr2L 3706101 3707066 scaffold_6 5334440 5335283 - 8256|482 518
TATAAATAAATACGTAAACAAATGTACCCACAATGAA
GGCGTCTCAATAAACAGATCTGTATGCCTACTATAA-
>cutlet 3707226 3707353|3986 chr2L 3707272 3708448 scaffold_6 5339950 5341230 - 31880|0 81
CCCACATCTATTGATTTCCCACTCAAGACTTTTACCCTATTTATTAACTGAAATAATACACAAAAAACCATATATTTCTTAC
TATACATATGTTGTTATTAGAATAAAAATATTTA------TTACTAGCTGATAT-TCACCGACAAAAACGTGTTTTTCGTAC
>CG3407 3810799 3810993|4097 chr2L 3810809 3811515 scaffold_23 1913497 1914159 + 22729|0 189
CCATGCTGTGCCAAGGTTTCTTCAAAGTAGTAT-----AAGTCTAAGTCTATTGTACGCACTTTTGTACAAGTTCTGTAAATAACTGAGATCGTATTAAGTATTTATGGAGAAAGAAAATCACGTGTAAGAGAGCTTCAAGTTTAAGAAAATTCCACTTTAAAGTCAACTCTTGAATAAATCTGTACATT
CCGAAC---AAAAAGGCTTCCACAAAATAGTATTAACAAACACACAGCCTACGATGTGTGTGTGTGTGTGTAGAATGTAAATAGAGGAAA------------------AGGAAAAAAAGAAGCTTGTAA-------TTAACTTAAGTAGAGCTACGATTGGATATATAATCCTAAACAAGGTTATCAATT
>CG31957 3871513 3871552|4180 chr2L 3868377 3871920 scaffold_2 446943 450500 + 130355|3302 3341
ACGATGTACAAACACACACATAGTTAGGTTATTTACAAAT
GCGCTG----AAGACTGAGATTGC-AGTGCATTTGTGATT
>capu 3872658 3872829|4182 chr2L 3872816 3874794 scaffold_2 450995 452986 + 80134|0 13
TTGCCTCAATTGAA
TT--CTTAGTCCAA
>fred 3905513 3905587|4234 chr2L 3905307 3905726 scaffold_2 492837 493267 + 9868|224 330
CGGATATAATACAGGATTTGGCAAATTAAACTAATTGCCAGTTGAGAGA-----CAACAAGAAC---------------------------AAGATAAAACAAAAAA
CGGACATTATACAGGATTTAGCAAATTAAACTAATTGCCAGTTAAGAGACATAGCAACAACAACAACAACCAATTGCAACCAGAAAATATGAAAATAAAATGAATAT
>fred 3910989 3911336|4247 chr2L 3910852 3911583 scaffold_2 504648 505363 + 16338|145 528
GGTCAAGCAGC---AATTCGAACG---------AGAATAACTACAGTAATGCCAGGGATCTGTCGCAGGAGGCATTGTGGCGCCTCCAAATGGCCACCGCCCAGTCGCAACAGATTTACGTGG---AGCGACCACCGTCGGCATTCAGTGGCCTGGTCGACTATAGTGGCTATTCGCCGCACATCCCCACGGTGACCAGTTCGCTCAGCCAACAGAGTTT--------------------CAGTCCAAC-GCAGCAATTAGCGCCCCACGAAATGCTGCAGGCCGCCCAGCGTTACGGAACTTTGAGGAAATCCGGAAAACAACCGCCTCTTCCCCCGCAGCGAAAGGATATGCAGCAGCAGGCGAAGCCACCTCAGCAAATGG
GGTCGAACAACGTGAACGCCAGCGGCAGCCAGGAGAACAACTACAGCAATGCACGCGATCTGTCACAGGAGGCGCTCTGGCGCCTCCAACTGGCCGCGGCTCAAAGCCAACAAATCTATGTCGAACAGCGACCACCATCCGCATTCAGCGGCTTGATGGACTATGCCGGCTAT---CCGCACATAAGCACGGTGACCAGTTCGCTTAGCCAGCAAAGTTTTGGACAGCAGCAGCCAGGGACAAGCCAGCAGCAGCCGCTGGCGCCGCACGAGATGCTGCAGGCGGCGCAACGCTATGGAACGCTGCGCAAGTCC---AAGCAACCACCGCTGCCGCCGCAGCGCAAGGAT---CAACAGCAACAGCAGCAGCAACAACAGCTAG
>CG31773 3911790 3911903|4248 chr2L 3911596 3914406 scaffold_2 505655 508496 + 54996|201 323
AAAT---------ATAGGCTTAGAGAATTTTCCTATGTTTTATTCGCCTTAAATTTCGTCGTGGTTTACGTTTACTTGTCTCTTTTTTTGTATATAAATACAATTGTAAAAATGTTTTTTAAA
AAATACTTTCAACACAGATCTAAAAATTAGACCCCTA----GCAGTCCTTTAATCAAGCATATGGTTATGCAATCCAGTTACTGTATTTATGTATATGTATACTTAAAATTCTAGTTATCGTT
>fred 3914728 3915096|4249 chr2L 3914407 3915246 scaffold_2 508994 509958 + 12351|382 775
GACCACTTGAGGCGACACC-------ACCAACATGCAACATCAGCGGCGGCAGCAGCAGCAACAGCGGCATTAACCCAATGCAGCAGCAACATTCAGCACGCGCCAATCTAACGAACCAACCCACCATCGCCACTGCCAGCTCCACCAACAACTACAACAACCACTTGAACAACACCAACATCGCCCACACCACCAACAACACCAACAACTGCACCACCCTGAAACGCGGCCACTTGGGAAATAGGGAGAGAGAGCGGG----------------AAAGATGC--CAGGTAACCGCAGCCACGGCGGCAACAACAACGGCACTGGCAACCACCATAACAACAACATCTCGCAATGCCAAGGCAGCAACAACAACAACAACACTAGCCATTACAG
GACCACTTGAGGCGACACCCGTTCCAGCCAACCTACA--AGCAGCTGCTGCAGCAGCAGCACGCGC-----------------------------------CGCCAAGCTAACGAAGCAGCCCACCACCAGCAAT-------------ACAACCACCACCCCCACT--ACCACCAGCAACTCCACCGGCAACAACAACAAGACGAGCAACAACTCCACCTTAAAGCGTGGCAGCCTTGGCCAGGTGAGGGGACAACAGGTACAGCAGCAGCAGAAACAGTTGCAGCAGGTGACCGCAGCCACGGCAGCCACCACCACAGCGCTTGCAACGACAATTACAACAACATCACGTAATGCCAAAACCGCAACAACAACAACAACGCTCGCCATCACAG
>CG31961 4186245 4186415|4665 chr2L 4185736 4187474 scaffold_2 899951 901620 + 44702|536 724
TGGCGGCATCGGCGG---------------CTGCTCCTCGGTTGGCTAGCCTACGGCATCATCCTCGGTTGGCTGCTCTGGGAAATGCTGCTGCGGCC-CTCAGTTACAGGCCCAAAATCTAATCCTCGATCTGTGTAATTAGCT-ATAAGCGTGTTGATTAA-ATAACCATTATGTAAAAAACAAAAA
TGTTGGCATCGGCGGAGGCGGCTGCTCCTCCTGCTCGTCACGCTGCTCGCCTACGCCTTTCCTCTGGGCTGGCTGCTCATGGAGCTGCTGATGCCGCTGCCCAGCAACA----TAACGTGTA---------CTGTGTAAATAGCTCGTAAGCCCAATAAATAATCCAAGTTGAATGTTGATACATAAAA
>CG3714 4189497 4189941|4668 chr2L 4189295 4192089 scaffold_2 907218 909970 + 57011|259 791
TCTATATAAGGAGGATCTGGCAAGGATGCGCTA------AAACATTTCCGAGAAATTTACTTACCTTTGGTTTTCAATATTTGTTGGCCTCGATTTTGGGGTCGTGGTGGATTAGTTTTTTTTTTAGTCAATTGCTGGTCATATGCATT------------------------------------------------GTAGAGCTGGAAC----------------TCGTTCCGTCACACGAGGATTTCCCGCTGACTAT--GAAGCACAAACTCCCACGCAATTTA---GCGAGTGAATTTCAAATCAATAGTTTTAACGTGTTTATCTAATATTTACTACTACT--ACTACT--ACTACTATGTA-------AAACGCACATCATATTCAGGAATGTGTAATGTGCCTTAAACGAGAAGCGGAAGCGGAATTAGAATCAGGATGCACAGGAATCACGAACCCAAATCGAGTTACTAAGTT--ACAACCAAATATCGGAACGGAATAAATATGTCTTTAATATTTTTCTAGT
TCTATATAAGCAGCCGCCGCGTTGGCCGCCGTACGAATTACGAATTCCGCAGAAAATTCTACGCCCATAGCAC---ACATTTATTTGGTCTAA--------TCGCAATG---------CGATTTTAGTCATTTGCTGGTCATATGCATTAATTGTAAACATTTGGAATAGTTGACGATTCCAAAAAAAAAACAAAAAAAAAAACAGAAACTAACTAAAAAAATTGTTTGTAGCGTGACATTTGAAACT-AAGCCGATTTTTCGATGTGCAAAATTATGTGTGTTTTGCGCACAAATTCATTTAGTACCAACCAATAAACCATATGTAGCTTATACATAGTGATTCTTAACTCTTAAATTTCTATATACATATATAAACGCACATCATATTCAGGAATGTGTCATGTGCCTTACACAAAAAT--------------------------------ATCGTAAACTGTAACCAAATACTTAAGTGGAAAAACGAAAAGCTGG------------ATGTATTTAATATTTT--TAGT
>ft 4198402 4199131|4674 chr2L 4198352 4198967 scaffold_70 60992 61606 - 5264|55 685
TTTGTAAATTTTGTGTAAAGCTATATCATTTCATAGTAGATCCTAAGTAATGCCATTTTATTTTGCAATGTACAACGAAAACGTAACGAGGATAGGTAGTAAGTTAAACAAAGTGTAGAATCGTGCATATGTCGGAAAATAAGCAACTAATCTTATGAG----AACGCCTTGTATCAAGGTCAACCATCCTAAAGTGCACTTTCTGTTAAGGGTTCGAA---------------------------------AGTAAAAAAAAAAACAATAACGACTGATATG---------------TACTTCCGTACATTATTAACACACCCAGTTAATTTCAATTGCTGATTATTTCGATTTCTGTACTTGTGTATATGTTTTCCGAGTGCTATATTAAGATAGTTTCAGCACCAGTGTGTATTGATTTGTGTCGCCATTTAAGTACATTCTAACATTGCTC--TAATTTATTGACAA-----TCTCGCCAACATTCCCTAACTGCCTTAGTCGTACTTATA----GATAATTAATGTCAGAGATACTTCGCATTCCTCTAGATATAAACTCAAACACCTTGT--ATATGTATGTAATTCGTAGTGAAATGTTATTAAATACATATTAACCATCATAT
TATGTATATTAAGCGCAAGACTTTAACCCTT--TACTAG-TGTTAAGCGTCGCCATTTCATTTTGTAATGTACAACGAAAATGTATC--------GTTATTATTTAAGCTAAGTTTCTATTAACTATTGCATTGATATTTATGAAATTTTACTTTAAAACCTTAACACCTTGTATCAAGGTTACTCATCCT-AAGTGCA-TATCCATATAGGATTCTAACATAATTGTACTGACTGATATGCATTTGCCAATAGTAAAGCAAAGGCCAACAAAAGCTGGTTGGAAAGTGTAGTTTGAATAACTTAGTAC-TTCTTGAATTATACTCTTAGTTT---TTAGTAATCAAAT-AACTTCTGTAAATGTATGTATTT-------GTGCTATATTAAAATAG-TTCAGCTAAACTATTTATT----------GCCATTTAAGTACATTATAAACTCTCTCATTAGTACATTATAAACTCTCTCTCGCCAGCATT-------TTTACTAGTTATACTAATAATATGAGACTTAAGGT--------------ATGCAACTAAA---ACTTTCAAACAATTAGCTAGCTAAAATATAGTTAGTTTTTGTATGTTAC--AATAAATATAAAT--------
>ft 4198402 4199131|4675 chr2L 4199080 4209795 scaffold_70 61607 72242 - 416617|0 51
TATATGTTGTGTATGCTCTTCAACGAAAGTTAAAGTGTTCCTAAAGTCTGAG
AATA------------------------------------CTCAGGACCGAG
>CG3702 4224650 4224883|4687 chr2L 4224634 4226707 scaffold_70 91204 93384 - 103103|16 314
AAGGAGTGCAGAGCTGTGACCACAGTATGCATTAGCATTAGA--------------AGACGCAATACCATATACTCCACTCCCCCAATATGTATGTAATCACTA-----------------------------------TCCAGTATACATAGTCAA--GTAA---TCCCGATAGAATCAT-------TCTTAGGGCTAATTGTATGTACGTATGTTTGTGT-TTTTGTTTTCCCCTGCCCTCCGCGCTTCTCGCAGCGTTGGAAGATCTAATAAATTAAGCGTGAGATG---ATCCAT
ATG---------GCCGTGCATCCAG---GCATGCGCGTTAGAACAATTTTAACGGCAGTTATAATAATACATAAT--AATACTTGTATATGTATGCAAGAACTAGCGTACATACACACATATATGCAGCAAAAATCAGTTTCAGTATACATAGTCAACGGTGAATTGCCCGTCGTAGTTACGAACATATTCTAGCAGTAATT-TATATATGTATGTATGTGTATTTTGTTTGTTTTTGGGCCAACGGTGGTCCATAGCATTGGCTACTGAAATAAATTCAGTGTGAGAAGTACGTACAT
>CG17612 4380508 4380782|4848 chr2L 4378840 4380801 scaffold_23 164766 166848 - 95191|1797 2105
CATAAATATTATAATATCT-----ATATAAGAAAACCCCCACAAG-------------CAAATAAACAGAACCAGTTTGAATTTGT-------ATTTTGTTACTTCATTTATTGTATGTTTGACTTCTTAGCTTTTAAACA----TAAACTTATTTGACTATGTT-GAAAGTTGGATTCTCATGTTTATGTTCGCGTTCATGGTACTAATGACTTATGC---GTTCGCTTAGGCAACTAACTACGTGCTACAACTTAAACTAGGTTTGCGGTCGCTGCGGCTGCTCCGAATTTAACAC-TATTTACATG
AGTAAATTCTATGATAAATGACAAACAAAAAAAAAAAACCAAAAATTGTAAAACAAAACGAATAATGAAAAGCATTTCATGTTGGTTTACTGGATATTGTATTTGCTTTTATTGTAGACTTGACTGCTTAGTGTTAAAAAAACATTTAACTTATGTGACTATATTCAAAAATTGTATTCTTATGT----------GTTCGTTGTGCTAATGACTACGACAATGTTCGCTTAAAGTTCTATGTG-GAGCGCTTACAAAAACTAGGATT--------------TGCTT----TTTAATGCCTATGTACATG
>CG3338 4382920 4383136|4851 chr2L 4382858 4383113 scaffold_23 167177 167447 - -244|62 277
AAATCATTCCACTAAGTTAGCTTTAGTTT--GACAATATCGGTTAATGATTAGTTGCTTAATTTATT--AGGTCTATCCGGTTTATATGGTTGGTATGTTTTAAGACAGCTATGGAACATTCG-----ATTTTGTATTATTCGCAATCCATCCGCCTATTTTAAATATTTT------------TTATTAAATGTCTGGCTT-CTGTTAAACAAAAT
AAAACATTCCATT-AGTTCGATGTAATTTTAAACAGCAGCAGCAGATGTTCCACATTTCAACGAATCGAAAGCCTAACTTGAAGTTAGTATTTGTTTCTTAAAGAATTTACAATGAATATTTGGAGATACTTTAAAGAATGTCAAGGCTAT----TTATTTTCATGATTGTCAAGTAACAAAATTATTGAATAACTTGTGTAATATTTAAGAAAGT
>CG3338 4382920 4383136|4852 chr2L 4383133 4384078 scaffold_23 167479 168455 - 53197|0 3
TTAA
TCAA
>CG18013 4386176 4386338|4853 chr2L 4384079 4386252 scaffold_23 168942 171163 - 105170|2158 2267
ACCTCTCAAAAGTTCAAAAATATT--TGTATGCTTAAAATTAAAT-ATAAATGCTTTCAGAAA-------------------------ATTAAAAAAAGTAATT-----A
ATCTTGTAAAGGCAGATAAGTCTTGTTTTATGCTTAAAGTCAATTTATAAATGGGCTTAAACATGCTGTTGCGCAGTAAAATTGATGCATAAAAAAAAGCAAATTGGCAA
>CG18013 4386176 4386338|4854 chr2L 4386297 4388422 scaffold_23 173107 175108 - 36542|0 44
TTATTCCAGTCAAACAACATTGTTGGGA---ACATTTAAGATAAT
CTGTTC-------ATGATGTCGCTCAGACGTAAGTTTAAGTTAAT
>CG3652 4392770 4392875|4859 chr2L 4392442 4393201 scaffold_23 181308 182094 - 32469|343 472
TCCAATCTATGACGCCTCGTTTAGTGATTAGTTCGTAAAGAAAACAGTGCACGTTCCATAGCGTAACCAAA--------AAAAAACCGAAAACAATT-----------GTACATT-----TCTTTAAGCT
T------TATTAGTTTAAGTTTATTAACTGAACCGCAA-------------CTTTCCATAGCATAACCAAATCGATTGTAAATTAACGTATTTAATTTGAGAAATTGTGTAAATTGTGGTTTTTTGATTT
>morgue 4442870 4443069|4928 chr2L 4442229 4442893 scaffold_6 2554850 2555553 - 20636|694 729
TATAATAAATGTATGCTTTA------------AGTT
TATATAGATTATATGTTTTACAGCTAGATTACAATT
>morgue 4442870 4443069|4929 chr2L 4442894 4444662 scaffold_6 2555799 2557621 - 72649|0 217
AAGATCAAAAGCCC-TCCAAGGA--------------CAATGGACTGAAAGTTGGAAAC--------TACCCCTCTTTACGTTG-TAACTACATATGCCTGT----------------GTATTTAGCTTAGTTGTGCCATCTGGATTGTTTATTTTGGCCTCCCCTCTCACTTTTCCTGCGCTCCAGGTTGAAACGTAGTCGAAATTA--CTTAACCT
TGAAGCAATATCTTAGCCAAGTAGCCTTGTTTTGCTTTCATGGACTGAATGTTGGAAACATCTAAGACACCCTCAATTAAGTTGTTTTTTGTATATTTATGTAACTATTACCATAAACGTATTTAGTTTAATGCTGCCA---------TTTATATTGGCCTCATCCC-----------------------ATAATATAGTCAAAATTATGCTTAATAT
>CG15438 4446662 4446987|4930 chr2L 4444766 4446742 scaffold_6 2558005 2559996 - 99990|1931 2011
AGAGAGTAGTTTTAAGTAGCGAAATCTTACTGCTCCTAGCGTGATAAAATACAAATATTTAATCCTCCAACATACCACCAA
AAGGAATATATCTATTTATCTCAAGCCCAGAACAACAAGCATTATATAATAATTATAT-----------ACATATATCTAG
>CG15438 4446662 4446987|4931 chr2L 4446859 4448797 scaffold_18 1904506 1906518 + 80569|0 140
CATTCTCTTGCACACTTTCCTCA----GAAAAACTAACCTATTTATTTATGTGTGGGGTATATTGGAGTGGATCGATTTATGTTCATGCTGCTTATATTATTTAGTATACACGTTT--------ATGATTGACGATCATTT
CATTCTCTTG-ACGATTTCCATGTGGTGAAAAA------TATTTATTAAAATGT---GTAGATAGTTTAGGTTTAGTTTATGATTTCCATAAATCTGATATCAAATCTGAGTGTTTGAATAAAAATGCCAAACGATTATTT
>CG15439 4449289 4449515|4932 chr2L 4449119 4450289 scaffold_6 2560435 2561593 - 34449|174 415
AAGCAAACATGATTTTTACGT------AGATTTTGTACCATTAATATCATTAGGTCCGTGCGA-TATTTACAAAACTAAAATTGAATACACAAAATAAAATAAGTAAGACACATTCAT-ATTAAAAATAAAATATTGACCA-AATTGTAATTTGTCACTCGCTGAATTGTTCGGCTCAGTTATTTAACATATTTATAAATACATTTA--TTAATAAAAACCATATAAATA----TTACCGAA
TAACTAATTAGTTTTCTACGTATACAAATATTATTTATAATTAGGCTTTTCCAGACAGCCCAAGTATTTACGATTTTTAAA-TGAATGGTCGGAACGATAATGTCTAGCCAGAATTGTAACTATATATATATTCATATTCATAATCATAATTCTTTGACTGCCCCACACTATGCC-----TATTGACTATCATAATAAATGAATTTCATTCAGGTAATATCATAACAAGAATGTTCAAAGAA
>CG15440 4453167 4453290|4934 chr2L 4450767 4454939 scaffold_6 2561666 2565708 - 162834|2468 2599
GATACTTATCTACTATATTTATAGCTTACTATAATTACAGCTTAGATATAAGCAAAAAATATAAAAGCCTG-ACTTGTAGCGT---ATTATTGTTTTTGAGCCTGCTATAAACTTTT----ATGCTCCTGAA
ATT--TTAGTTATAATATTAATAATAAACAAT--------TTTATATATAA-----AATTATAAAAAACTGCATCTGTGTTGTCAAGTTTTTGTAAAAAACAAGGCTAACATTTTTTTTAAATATTGCCGCA
>Gs1l 4455221 4455325|4937 chr2L 4455053 4455754 scaffold_6 2565815 2566478 - 25364|182 286
ACTTAATGGCTGACGTACTTTTTGTAGCTAAAAGATGCTATTGCTGTAATTGGAAATCGATGTACCTACCAAGAAAATGAATTTAAGTGTAAATGTTATCCCATA
TTTGTATGTTTGAC-----CATTGTCGCTTA-------------------------TCCGTGTACCTA------------------GTATAATTACTAAGCC-TA
>RpL27A 4457176 4457289|4938 chr2L 4455836 4458704 scaffold_6 2566831 2569966 - 64279|1555 1728
ATTCCTCCTCTACAGAAGAAAAAAGCAAGTGGAC----TACATTCGACCATCAAAAATGTATTTGTTTTTTAATAAATTTAAAAGAAAAACAAG----------------------------------TATTTGCTATTCCGACAAAATGTG----------------------
ATTCCTCTTCT---------GATTGCAACTGAACGTAATACATTCGACCATCATAAATGTATTTGTTTTTTAATAAATTTAAAAGAAAAAAAAAAACAATTTATTGTGTATTCATATTTCTGCTGTGCTCTTTGTTGTTGTTGCACCTTGTGACGTCGGGGGTGATTTATTGCA
>RpL27A 4457375 4457380|4938 chr2L 4455836 4458704 scaffold_6 2566831 2569966 - 64279|1819 1824
GTTAAG
GTTTAA
>CG15443 4461631 4461823|4940 chr2L 4459874 4461813 scaffold_18 279374 281462 + 60260|1933 2134
AAGAATA---AGTCTTGCAA--ATCTCTTTATTGG---TCTTAGAGTACATATAAATATAAAGCC-------ACGGACTTTTGAGT--ACTCGAGAATGTATTGTAAATGAACATGGATTGCCGCT--AAGCAAAACTAAATCACTAATGGAAACAGAATAAAATAAATAAATAATAAATAAATACAATACGACAAAAACAC
AAGGATATATAGCCCTGAAATGGCTTGTTTATTCGGCATCTTATGGTTTTTATAAATATAGAAATGTTTTATAAATACTTTTAAGTTTCCTTAGGGATGCAG-GTGAA--AACATTCAATGTTGATGTACATACAAAGGGACAGTCAGTTGCCACAGTATAAAAATAAAAACTAA-AAATGTATAAAAGAAAACAATGCACA
>CG15443 4461631 4461823|4941 chr2L 4461814 4462955 scaffold_18 281769 282950 + 25371|0 11
GC--TTATGGTT
CCAGGTATAGTT
>ine 4467986 4468133|4946 chr2L 4467952 4468146 scaffold_11 1166844 1167016 - 1680|34 182
CTGTTAGGAACCTCTCCCAACAATAGCCATTTCCGAGTATTTTTAACGAATCACTTGTGTAAGTTAAATGCAGAAATTAAAGTATTTAAATAAATTCTAGAGCGAGACATTGGATTAGCGATGTTATTTAACT-TAATATAATATATAA
CTTTTAGGAAGCTTTCCCAGTA----CGCTGCGCGAATACTCTGAGTG---CATTTAAAAGCTTTAACGGCCACCATTGTGCAA--TAAATACATT-TATAATATAATATTTAATTAA------TATATATCTATAATATAATATATAG
>dp 4479471 4479537|4957 chr2L 4477452 4487353 scaffold_18 2551129 2560914 - 451521|2190 2277
-CGTAACG--------TAACAATACACTGATACAC-------------AACACCTAGCTATATCTTTAGTATGTAAGAGAATCGAATG
CCGTAAAGTAAACTAATAACAAAACAACCATAGACAAAACAAAACAAAAACACCTAGCTATAATAATAGTATGTAA------------
>Taf12L 4700941 4700991|5140 chr2L 4700866 4701477 scaffold_30 1494577 1495177 + 7933|87 139
ATGTCCAATAAAGGGAAAAATAATGTAGAATTTGAAAATTGTGGAA--TGAAT
ACGAACAAGCACTGATTAGTTAATGGATCAGATAAAAATTCTTCAAATTAGAT
>CG3244 4796584 4797075|5263 chr2L 4795838 4797668 scaffold_2 273831 275628 + 68671|776 1343
AGCGGCTCGCTGGGCGTTCGCTGTTTGCCTAATTTTAAAGCTACTTATTATAATATTCCTTAAACGAG---TTTTTGTATAATTTTTGTTTGTATGTGTACGACGAAAACGGAAGAAAGCAAGACAAATAGACTTTAGAATTTAC---------AATTTCCGATCCTACAAACACCACAAAACCACCCACCCACC---AAATCCACAATACTGCTTTCATCACACCTTAGCACCCAGCACTTAGTCTCACTTCTCCTTCCTCCCTACCTTCGAAACTGCCAATTTTACGCGTAGAATTCTATTCCGTTGTAAACAGTTGAGTCGTTTTCAGATCGCACCTTAAATATTTATAGGCAATCCTAAATTGCAAGTGTTTCGCTCTGACCCACTGTCTGTCATTCAAGCAAGAAATTCGGAATCTCTTTAGTATTTTGTTT---------------------------------------------------GAGACACTCATGTT----TTGTCC------ACAAAGAGATTGAATAAAATTTTGTAAAGATCCCATAAAAAAGAAAACAC
GAAGTTTAAATGCTTCTGCATTGTTTGTGTAATTTTAAAGCTACTTATTATAATACTCCCTAAATGAGTTCTTTTTGTATAATTTT--GTTTTATGTGTACGACGAATGT--------GCAAGACAAATAGACTTTAGAATTTATAAAAAAAAAAAACCCCGATCTTACATATA-TAGACATCTAGAGACATGCCGGAAAATTCACAAAAC-------------CCT----------------------------------------CTTCGTAACTGCCAATTTTACACGTAGAACTCGATTTTTTTGAAA----CTAAACTATTTCCTTCCTACAAATT--GTATTTATATAAAATTGTTAAGTACGACTATTT-----------ACTGGAAATTCGCTACGC------CCCAAAATCTCTTTGGTATTTTAGTTCAAAACAAAAAGAAAAAAAAAAAAAACAGAACAAGAAAAGGAAAGAGAAAAGAAAAACTTACCATTCGATTGCCCTGCAAAACAAAGAGATTGAATAAAATGTTGTAA--TTCATAAAAAAAAAATAACAA
>CG3225 4815613 4815857|5291 chr2L 4813945 4818494 scaffold_500 3686 8137 - 162090|1886 2137
GTGAAACGATGCCGCCTCTTGAAAAAGAACTTAAGCTTAGGTAATGGATTCCATATGATGATTCCTATTGTGTGTTTAACCAGCGGCGACGCGCCCTCGTCCCTGAAACATCATCATAGACTCGGGTCCACGGATGACACGCGACATCAGCTCCCAGCACATTTTGGCGGGCAAAAGACTGAGAAAA----CCAGCATTAATTACATTGTATATA-ACTATG--TTAAATAGACTACTTACCATTTGAGAGG
--------------------GAATATAAATTTAAGCTTAAG--------TCTAAAACTGGAACTCTTTTATATTGCTAGCCGGCGGCGACGCGTCCGCGACCCTGGAACATCATCATGGACTCGGGACCGCGAATGACGCGCGACATCAGCTCCCAGCACATTTTGGCCGGCAGCAAGCTGGAAGCAAGATTCAAGATTATTAAGATTCGATATAGATTACGGATTGTATATA-TATTTACCACTTAAGCGG
>CG3225 4815916 4815941|5291 chr2L 4813945 4818494 scaffold_500 3686 8137 - 162090|2196 2221
CAGGAACTAAAGCCTTAATGATAGGT
CAGCGGGTAA----------------
>CG2976 4829431 4829483|5302 chr2L 4829184 4830421 scaffold_2 1391430 1392586 + 44994|251 303
CAGCAGTTGTCCAGGTTACAAATCCATTATTGCTTAGTTTTAAGCCACATACG
CAGCAGCAATAGAGAAGA-------GTTGTT-CCTAGTTTTGGACTATGTAC-
>CG15626 4835333 4835739|5310 chr2L 4835322 4835910 scaffold_23 1785845 1786359 + 10603|11 441
GATTTATGCTTATACACGCA-----ACGTAGGCTTTAGCTATATATAATTCGATCTGTGTA-----ATCTACGTATCATCTACCTATCTA------------ACCATCGTGAACTGTGTAAGTTAAAGATAACTCTAGGTCTACGCATAATGACAATGTTCGCTAGTCGACAACGCCACCGCCACCACCACCACCAACACAACGCCCTATTCGGAATGGGCATGACTATATATATATAGACTATAGAGTGGCTATATCTGAAATGCG-GCTCGCGCAA-CTGCTGCATAATCGTTTACATGTTTATTTTAGTCGTCGTTTTTCTCTTTAATTTTTGCTCGTAGGGTGATATGCTCTACACTAGAAATTACGTCGGGCGTAAAGTTCGTTAAATGTATAATTAATCAAAAATAAAATTAATTTTGTACTTTC
GATTTTTGTGCACACGCACACACACACATATACTTGA-CTAC-TATCATAAGGCATAGGCATTAGTATGTATGTAT-ATATACCTATATATATTCAAGTACTGCGATC--GAACTGTGTATGTTAAATTTAAATTTAGGTCTACGCATAATGACAATGCACGCTAGTCGGTA-----------------GTCGACAGCGCAGTGCACAACTGGTAGC-----TAACTTTATCTAT-------------TGTTTGTATCTAAGATAAACACACGCCCAATCTGCTGCCCAAGATTTTATTTGGTTACCATA--------TTCTCTCTCTGATT-------------GGGTATTC-------------------------AAAAGTTTCATAAATATGTAAT-----AAAAAT-------TTTTTGTAATTTC
>CG2950 4842095 4842233|5316 chr2L 4841469 4843248 scaffold_23 1791983 1794045 + 13979|751 967
AGCCATCAATCGAG--------------------CGGCTCGAACTGACAA---------------TATAGAGTGTCCCGGGGTGAAGTGCCT-------------GCTCCCAGACGGAGCTGCAG---------------TATGCTT-----CAATGCTTTTGGCCATGGC----------CACATCTAACAATCGCAAACTCAAAACGACCAAAAC
AATCAACGATTTAGTTATTGTTAAAGAATAGTAACAAACCAATCCGACAATAGCTAATCTTTATGTATGGACAGTTGTCTGTTTGAGAGACTCAGCTTAATGGAAGCCCCCAAAAAAAATTTCAGACTAACTTTCATCTTTCTGTTTTTGTACTATGCTTTTAGCTTTAGCGTGTCACGTACATTTCTTAATATTATGAACGACCAAAAATGAAAAA
>mRpS2 4849439 4849511|5322 chr2L 4849349 4850391 scaffold_23 1801822 1802865 + 46587|93 165
TAGCCAAGTAGTAGTGTCAAGTTGATTTTGTTACATTTATCTTAATACAAATGCCAATGGCCGTCAATCCACG
AAGCTAAGC-TTAATATATAGTTATATATGTTGAAAATAT----AAACAAATTTGTATT------------CG
>Cf2 4877289 4879020|5356 chr2L 4876888 4877855 scaffold_23 1852142 1853269 + 16521|448 1180
TTTTACAAAATTTGCATTTTTT-AACGCAAAAC---AAAAAGTATTTAA----------GGCAAATCGAAATG-----AGAAATCTACGCTAAACGCAACACAGCTTTATGCGCCAAACTAG----AAGATTAAAAAAAAATTA--------------------------ACATAACGATCTACACAATTGA-----TACTTTTGATAAAAAGAAAGCTTCA---------------------------------------------------------------AGTTGTTTTTGTAATAT------ATATAAATATGGATTGATCATTTTTACGACTACTTAAACGCGTTTTTTTAAACCAGCAAATGATTACTTGCAAGAGTTGTACGTACTAAA-ATCGACTAAAACT-TAAACTAAAACTGTAGCAA------AACCAAAACCA-------TGTACATTTTT---ATAAC-----ATAGTGTTATATAATTATAAAGTATGCAAATATATAAACCTGTATCTAA--TATTAATGCATAATACACTCAAACAAATTGTCTACCTAATG-----GCACATAG--CACAGCAACAAAC--GATGCGCAGCGCATGTAAAACCAAAATAAATTCTAAGTACTAAAC----TATTGTAATTC-----TTTAAGTTTTAAATAAACCGTGAAGAGTTGACGATCAAAAGCAAACAGCAAAACGCTAAATGCAGC
TCTTTCAAG---CGCATTTTCGAAACGCAAGACAAAAAAAAGTATTTAAGTGCAAAATTGATAAAACGAAAAGCAACAAAAATTCTATGCAAAACGCAACACAGCTTTACGCGCCAAACTAGTTTAAAAAACAACAACAAAATATACAATATATATATATATATATATATACATATATATATATAAAGTCTAATAACAATTTTTGATAAAACTAAGCTTTTAAAAAATAAAAAAAAACAAAAGTAAACAGTCGTAACGTAACAAGCTTATACGCATAATAATTATAATTGTTTTTGTAATATATGATAATAATAATAATAATTAGTTATTAAAACG-------AAAGGAAACATTTTTAATCAATTAAT--TTACTTGCA--AGTTGTATGTACTAAACAAATATGAAAACTAAAAACTAAAACTGTAGCAAAAAGTCAACCAAAACCAATTAAATTGTACATTTTTTACAAAACCAGATATAGTGTTATATAAATGTATAATGTACATCTATATATATATATATATAAACTATTA----TTAATACACTCAAACAAAAAGTCTACCTAAAATGCACACACATAGGCACCAGCAACAAAACGAATGCGCAGCGCATGTAAAACCAAAATAATTATTAAGTAATTAACTAATTATTGTAATTTTTTTATTTAAGTTTTAATAAAAC------AAGTTGACGATCAAAAGCAACCAACAAAAA---AAAAGGAAA
>Cf2 4877289 4879020|5357 chr2L 4877894 4878852 scaffold_23 1853314 1854271 + 9057|0 1071
GAACTGC--AGCGGAAACGGGATGAGCAAACCATAAATGAAAGACCAT-TTCAAAGACGAGACACACTCACGTAGACGGGAGTTATGCAACTGCAGCGGATGCAACAACTGCAACCAACGACTGGCAAATCTCTTCGCAGTGCTGCTAGATTAAATTACTAAATTAGATACATACCTTCAGTTCGGTTAACACAGAAGCAGAAGCAGAAACAGA-------------------TTTGTACTAAATTAGCATACAGTTCGTAGAATGTTTAA----GTTATTGCAATCGATTTTTGATTCTTATTACTATTTGGTTATGTAGATGTTTTGCAATTTTTATTTTT-----TATACACCTATGTATA----------------TCGTATA---TAATATTTTGTTATTCTATGAGATTTTATATGGTGACTCCATAGCGCACACTCACTTACGCGCGGCGCTATACAGACACACACACAAACACACACACACCCAAAACTACACACAACACACATATATTATTTATAAAGAGAGAG-AAAATATTTTTACTCATATACTTTGTGGCAATATTATTTTTATTACTTCCTTAAATTGTTTGTAAATGTTACTGAAAGCAGCAAAACAAAAAGAAAAAGGTAAACTCATGTCTACGCGCAAAACTTAAATTATT--------------TTTATAAATTATACATCTATTTTATTCGAACTCAAAACAACACAAAA--------------------------------------TTATTTATTTTTACG---TGAAAGA------ACGTTTTTCAAAATTTCGACTCGTAGCGGAAATGACAAAGGACCAATACGAAATTTAGTCATTTCTCAATTATTTGCACACGAGCAGGATCTCGTTTGTTTTGGCTTTAAAAATTTATTTACTTTTAATTAACTAAATGATCTAATCATTTTAGCTTGTTTTTATTGATGAATGTTAACCATTGTTTA-TTTTTTAAATTATTTAAGTTGAAAGCGCTGCTTTTGTTTGTTAAACTAAACTAAACTAAACAGTGAGATTGTATAAAACTTTAAA
GAACTGAAGAGTGGAAAGATGGAGAGCAA--CTGTAATGAAAGACGTTCTTTAAAGAC----------------GACAAGAATT-------TGGGGCGCGGATCACAA--GCAACCAACGACTGGCAAA--TCTTCAAAGTGCTGCTAGACT------CTAAATTAGA---ATTTTTGCTATCAAAAAGAAACAGAAAAAAATGAAAAAAAAAAAAAAAAGATAAACTTACTTATAGTAACAAATTGTAATACAACAACAATGGCGTTTTCTATTGTTAAGTTTAACGATATTTGATTTTCCTT-CTCTTTCTTTATATATATATATATATATATATATATATACACATATATATATATATATATATGAACTTTGTCATGTCGTATAAGTCATAATTTTGTTATTCTCTGAGATTTTA-ATGCATATTTTATTTTGTAT-CGTAATCGTTAAATACTTTTTATAG-CGCACACAAAAACACACACACATC---------------------TATATTATTTATGCATATAAAGTGAAATACCTTTTTTTATATATATATAAAAAAAAAAATCTTATTTTATGTTTTAAACTTGTTTCA---------------AGCTAAAACTCATGTTGACGATATTCTT-TAACTACGCGCAAAACTTAAATTAATTTGTTTTATAAACATTTAAATATTACACGCACACTTAATTCGAACAAAGAAAAACAAAAAAAAAAAAAAACAAAAACAAAACAAAAAACAAACCCCAAGTTATTTATTCTCATGCATTGAAAAATATGATGAATTTTTCAAAATTTTTACTC--AGTTAAAACGAAACAAAAACAAAAAAAAA-----ACGCTTTTGCTTAATTTGCATACGAGCAGGATCTCGTTAG-TTTGGCTTT--AAATTTATTTACGATGTATAAA--AAATGATATGGAAATTATG---TTTTAAAACTAATTACAATTAA-TATTGTTTAGTTTGTTTGTTTATTTG------------TTTTTTTTCTACTTAAATTTAACT--GCTTAAC--TGGTTTTGTAC---ATTCTAAA
>Cf2 4877289 4879020|5358 chr2L 4878989 4879501 scaffold_23 1854364 1854954 + 18814|0 31
GGAAGGCCGGGCGGTGGCCGCCAGTTACCCGT
GATAGGCCCAGCGGTGGCCGGACCATAATAGT
>CG2837 4904068 4904222|5389 chr2L 4903916 4905033 scaffold_23 1092895 1093939 - 22589|165 320
GTTGTGCGCTTA-TCTAGTTACTAATTAACCTCTATATACAAATACTTGTGTATTTGGGTGCTTAGCAAATCTGTGTGTAGTATGGCTTAGCTATCTTTTGTAAATAATATTATAAATAAAACTTAATTTAGTGAATCGCTTTATTGAACAGCCTG
CTTGTAACCTAACTCTAAATTTTACATATTTAGTGTGTAAATATGC-----------GGGGTTTATCAAA---------AGTA--------------TTTGTAA--------ATAAATCAAGTTTTGTCAGTTCGGTTGCTGCA--GAATATTTTA
>hoe1 4908745 4909169|5395 chr2L 4908369 4909275 scaffold_23 1101471 1102518 - 10937|407 971
TGAAGG------GCCCCCA-----------------------------TGGATGAAGGAGTTGACTGTGTCGATTCGC-AACAAGGCGCACTGTACCTCGTTACCTAACG---------GACAGAAACTGTTCCGGATGCCACAGACAT-CCGGTTTCCGATGCCG-------------------GAAGCAGCTCCAAGCTGGATGGGAATCAACTCCT-TATGCGATTGTCATAAGTGTTGGTTCCGGGTAAGCAGA------GGGAAACGGAAACGAAGAATATTACATGAAAAT----ACATTTATTTTTACACGTCGTTGTTAGTGTAGTGTGTAGC---ATAAATAACATAACAAACAACAACAATTAAGAG---------------AATTAAA--ATAAATATAAA--TTAATTATTTACAAT-----------------------TAATACTGTCGCTGAACTGTGAAACAATTGTTAAATGTTAAATGTATGAATACGAATC------AAATATAAACGAAACAAATA-------------AACTAATTTAAACAGC
TAAAAGCCCATCCCCCCCACCCTCCCCCTCTCCACCCAACACAACATTTGCGGCATGGAATTGACTGTGTCGATTTTTGAACAAGGCGCACTTTACCTCGTTACCTACAGCAAAAATAAAAAAAAAAATGTTAAACATTCGACACTAATGAAAATATCAGCTGCAGTTCGAAAGAAAAGAGAATCGAAAAAGCAGGAAAAAAAAACACAACCAATTTCTAAATACAAGCAGCATA--------CTCTGAGTATGCTAAATATACGAGACAAGAAATAAAATAAAATAAAATAAAAATAAACACATTTATTTTTACACATCGTTGTTAGTGTAGTGCGTAGTCTAATAAGAAAAAAAATATATAAGAAAAACTAAAAACAAAACACGAAGAACAATTAAATTATAAATGTAAAATATAATTATTAAAAATAAAAATAAAATATAATAATTATACAAAAATGTCGCTGAACTGTGAAACAATTGTTATATGTTTTATGTACGATTAATAATTATCAAAAAATAATATTTAAATTAATATCGCTCTCGTATTAATTTATTTAAAAAAA
>mRpL24 4944256 4944300|5429 chr2L 4944252 4945839 scaffold_6 1418307 1419694 + 45450|4 57
TGTTATGCCTACT--GTTTATTAAAG-------TAATGTACAAAATACCCATAT
-GACATACCTGGTTGGTTCAATAAAGTGTACAATAATGTGAAATGTGTGCATTT
>CG8873 4948202 4948587|5432 chr2L 4946821 4948798 scaffold_6 1420562 1422386 + 64870|1427 1842
-CCACACTTCGTTCTCCCTCTTCC---------------GCAGTGCCCTCACCTCCAGTTGCCCGCTGCTGCAGTCACTGATGGTGCAGCGCTGCCCATTGGTCACCGAGCGTGTGCTCGCCCCACTTCGTGGACGGGTCCACATCGATCGGCCCGGCATGGGCTACATGCCAACTGTGCAACATCACCGCCTGTTCCTGCAGGTTTGAGATTAATTCTGATTCCGGGCCAATATTACCAATGTACCAAGGAGGCTTTCGAGGCTATC----------CAATACTTTTGCTGTAAATACATGCCTCAGCATGGGACGC--TTTAATTTACTT-TTAAGCTTAATCTTACACATTGTTAACATTAATTTAGGCTGTACAAT--AAACATACTAACTTATTCATCTCTCTCTCCAAAA
TCCACATCACTTTCTCTCTCTCTCTCTCTCCTGTTAACTACAGTGCCCTGACCAAGAGCTGCCCACTGCTGCAGTCCCTGATGGTGCAACGTTGTCCATTGGTCACTGAGCGCGTGCTGGCGCCCCTGCGCGGACGCATGCACATCGATCGGCCGAGCATGGGCTACAATCTGCCCGCACTGCAGCATCGCTTGTACCTGCAGGTATGAAACAA---CTGAATA--------------------ACCCATGGGTCTATTGAGGCTATCGTCAGACGAGCGACATCTTTG---TAAATAT-------------GGACGTAGTTTATTACAATTGTTTAGCTTAAGCTTACA-GTTGTTAATATTAATTTAAGCTATACAAGTACAATATAGAAACTAATATAT---TCTGGCTAAA-
>Jon25Biii 4949947 4949971|5434 chr2L 4949810 4949957 scaffold_9 1082410 1082566 + -19|147 166
TCG---------ATCATTTT
TTGAAGGCACAAACAATTTT
>Jon25Biii 4949947 4949971|5435 chr2L 4949958 4951089 scaffold_9 4031532 4032655 - 40657|0 15
TT--TTTCTAAATAAA
ACAATTATTGAATAAA
>Jon25Bii 4952250 4952283|5437 chr2L 4951775 4952747 scaffold_9 4036579 4037642 - 15501|564 597
-TTCGTTCTCGAAATAAACCCTTCTGCATTTAAT
ATTAAACATCAAATAAAATTGATTTGAATGCATT
>Jon25Bi 4954071 4954322|5440 chr2L 4953249 4954252 scaffold_9 1118271 1119199 + -4666|891 1093
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TTCGTATATAGCTTATAACTTCTTTAAGACTATCTATAACATT-----GCCTTTTCCCCAAAATCCATAATTTAAA----------TATAAATAAAAAATTATTAACTTCATTTTAGGTTTATCCACTTTGACCTAAAAACATTTTTCAATTATCGAACAATTGG-----AGAGCACATTAATAAG--------ATAAAGTCG
>Jon25Bi 4954071 4954322|5441 chr2L 4954253 4955085 scaffold_9 4046107 4046922 - 47056|0 70
GCTTGATTATCTTTATTTTTAAATAAACGAAATGCATAACAATTAATTTGACGCCTT-TATGTTTCTGGTT
GTTGG--TATCTTGA---TCAAAT-------ATATATATGAATTGCTTGGAAACTTTGTATGTGATTAGTT
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TCCCCAT-CAGTAGTAGTT-------ATTAGTTC------------CACATCTTTCGTGAATGCGCCATGTACATGTGCATAGAAAATTTTCAAATATACGCGAGAACAAGACGAAA-------TATCATTTATTAAGTAAACATTAAAAGCATATA-------ATAATTAGGAGGCATTCGAGTAATTGCTTCTTCCGATTCAATTCCTGACGGCTTAGAAGAAGGAA
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------------------------------------------ATGTATGGCGTTGCCACACTGCTGTTATTTCAT----------------ATTAAAATTTTGTTTTGTATC-----------AAGTT-------------------GGCAGCGCTAAGCA--------TAACAGCCCCGTTCAA-
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GCTTACAATTTATATCAAGCTGTCT-----TATGTACATAAT-------ATAATTTCTTTA-------ACAACTAAATAAATAACTATTCTGCCTCAA
CCCTAAACTTATTATCAAGTTATATATAATTATATATATATTGACAGGCATAACTTACTTATATACAGAAATATATGTTTATGTTTATTCCGCCTCGA
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--------TGGGATGTATCACGACTTGGCATAAACT--GGCACAAAGTTTGATTTATACATATATACATATATATAGGATATAGACTTA------AGTATTTAAAGT----GTTTTGTGTATGTGTGT-----TTCTCGACGGGATTTGCAATCATTCCTTTGTTTTCTATGCCGTAGATGTCTCTGTGTGGTCTTTCCTTAAATGTTTTTTTTTTTGTAATTTTTATCTACATCTAACGAATAAATATGTTTAAAATACGAAC
>CG8891 4978484 4978565|5456 chr2L 4977430 4979419 scaffold_18 1883230 1885116 + 65276|1093 1174
GACTCAATTTAATTTAATTATTCAATTCAATTATTTAAACATCGCATATTTGTTCTACATTGTCGAGAAGTTGTTGCAACCT
ACATTGTTTTAATTAAATTTGCTAATACATTTATTTA--TTTTAAATATTTGTTCAATTATGTCGAGAAAGTATTAAACCTT
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CTGTTTACATCGGCGATTTGCTATAATATTTATTTCACGTTATTTGTC---------------TTATCCTTCTACTACACATGAATTAAATACCTACATATATTAAAT--------TAATAATAAGGGAATAATAAATAAAATCATGAACATACGCTA
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AAAGCAACAACAATAACAACAGCAACAGCAACAGCAACAACATGTTTATTTATTTATTAAGCATTATTTGAATGG-TTTAATATTCATCCGGGGCATAACAATTAAATACATATATTCAATTGTATAATTACAATTTTCAAACAAAAAAACAACAACAAGAACGAACAACATCTTGCTATTGTGAACCCAAAACATAAAACTAAAACTAAAAAAAAAAGAAAAAACATTTAAGTAAAGAATATCAACTCGTAGCAGTTT-AAACATTGTCCAAGTGTCTTTAAGTTTTTTAAACGAACGAAACCAATTTGAAATTCAGATGAAACAAAAACAAACAAAACTGTTTAGAAAAATGAAATGAAAACAACAAAAAAAACAACAACAAAAACACAGCCACAGCAATGCAATTAAACGCTTCCTCAGTTTCCAAACAATTTCTTTCGAGACTCTTAACGAAAAGCAAACTTTTTAATACATTTACGATTTAGTTAAAATATGCATACGAAAAGAAAACTATGCAAAAGTCTTTTGAAAACAAGAAAAAAAAAAAACAATCAACATTTTACACCCATTTTTATTAGCTTTTTTTCTAATTAAAAACTCTTTGCTTTAGTTCTAATTTTA--ATTTTGTTGATTTCTT--------------------------TTTTTTTGATAAAAAAAAAAATCAAAA-----TAAAAAACAAGTGAAGTAAACAATTACAAACAATTAT
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GCATGGTTGT
ATTTGGTTGT
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ATGCACAGCTCCGTTTACGTACTAAGTAGCAGTTAAATAA------TAAATAATT----------------------------------AAGTCTAAGTCGC-TAACACAAATAGAAACCCCCCACC------------------CTTTGGGGACGCAATCTAATCTAATGTCGAAACAAAAA------------TGAGCAAAAATACCAAAAAAGAAGATTTCTAGTGTAGAGCGAGGCGAGAGAACAACAACAACTTCCACTGTCATAATCCACTGCCCCCCACCCAGCATGATGTAATCCAGCTCTTGAATTTTCCTCTAAGGGATTACAGCTTAACACACAACACACAACGCGAAACAAAACCCAG-TTTTTGATAAATAAAAATTTACACATCATAAAAGT
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A------CCATATCACGAATTTGCTAGAA-GAATCTGTGCTTAGTATTGTATTTTATTCATTTAGTTAGTAAATTAATGTTTTATTTATGCAAATTCATGTGACATACCGTATATGCATATCTGTGCATATTATATAATAGATTATTTTTATTGTTGTATGCCTTTGTCTACAGATTTGATTATACTTAACACATGCCCCATTTATAAATCGTAGTAATTTATATAGACACCAAAAAAACTAAGAAGCTACAATATTA
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AAT--TGCATTTGCTACAACAAAGGAAAACAAAAACCAACCCCCAAAAAAACATAAATCACATCCATACAATCTACCAATACCCACACACTAACACAGAAGTAAAATAAAAACTGCGTTTTCGTTTTGAGCAAAGTTTTTCATAAAACAA-
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CTACCA
TTGGTA
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CTAG------------------------------------------CCAGCTAAACGGATTAACTAA-AACTAAACTTAGAACTTCCAATATGTGTTTAACTGTTAACTAGGTTGCCAGCAGGAGGAGAGGATGAAAACAGGAGCATGATAAAAAGCAGGCGTTAGGAGCCAGGCGTAGGATAAGGAGAAGGAGCTGAGTTACTAGCAAGGATTTCAAGCATTTTTTTCTCCTCTGTTAAATTTATTCAC-TAAGTTTTAGTCTAAGATGATAGTTTTTTCTGTATCTGTGTGCGTGTGTCGCCGACTGTCTTCCCAA----TTGATGTGCGTGCGTGCGTGTGTGTGTTTCTGTGTGTATAGATGTATACATAAGTGCTCATTTGCATATATATATATATATATATATATACATATGTATGTGTGCGTTTAGTTTTATGTACCATAATGCATAGATTTGTAATATATACGTATACATATTTACCTAGCCCCGACCAAGTACCAACAAATTGGCATTTAAATGACA--ATGTGCTTCACAAGGAATACAACAACAAAAAGAAAAGA----------------ACTAACTAACTAACTACAACTAATATGTGTCATAGCAGAACGACTAAACCAAGTTAAACATACACCCACATATATAATATATGCTTAAAAGCAGAGCAGCCCGGGCCACATTCCCCTAGCTCTAATAACTATCGGGCGTTGTGTTGTAACACATATATATATATATATATTTATATATATATATGTATTGATACATTAAAGATTTAAGTTTATTAACTTTGTTAAT--TTCGACCCGCTTCGCTTTGTACCAAATGATA-AAAATCTAATTCTTGTTAAAAATCAAAAATGCGCTGCATTTCCATATCATAAACAACA-----ACAAAAATGCTTCTAAAAAAAAATCATAATCATAAACAAACAAAAATTCTTTCCAAAAACATGAAACAAAAATTTAAATAAAATGCACGCATATCATAAA-ACAGTGTAAAAAAAAAAAAGAAA---ATATTTAATTAAGGCCCAAACATATACATATATCACATATATTTATGGATGATATGCATATACGTATAAAAAATGTACATAATTTAGAGAGTAGCTATTAAAAATATACATTTAAATGAATTATTTATAT-TTATATATATTATGTGTGTGTATGCG--------AAAATTGTACTATAAATTGCATTTAGTATAAGGTATTTCTCTAAGTTCGAATTTAGAGTTTAGACTTAGTCGAAAGTTTTGCATCAACTAAAACGTAGCTCCAAAAAGAAAAAAAACACCAACAGCTCTTAAAAAAAAAAAACAACTAAAAACAAATTGTGCTCAAATT--------TTACGCTATTTT---TGCTGTTGTGTAAATATTT----AAACATGTATTCAAAAGT-------CTAACCTGATCTAAAAATGATATCCCAAAATATCCACCCACACACACACACATATATATATATATATTTATATATACACAACAAATCTATAA-----AAGCCAAGTAAAACGTTTTAGCTAAATTAATTTTAAAAA------------GAAAACCATATACATATATAGTAATAGAGACGATATATATATATACATATATATATATATATATATGTATATATATATACACATGGTGACGGTGCAATTTTAATTTTAGCCTTAACTTTAGCTA--AACCAGATCCAATCA----------TGCAACGACTGGCGACAG--------------------------------------------GCTGGACGACATCCAAAATCTCCTATTTA------------------------------------GTTTAGCTAAATATTATTCGTAATTCTTTCGTTTGTTTGTAAACTCTATCCAAAAGTA----------ACAAGAGA-----------------AACTTCAAGCCAC-----------CAAGTCGCAAGATGTCATTTTTTTTGTTCAATTAGAAACTTTTTAAATTTTATAAATAAAACTGATGGAAACGAATGAAAAACTATAAAAAAAAAAACA
>CG8680 5099494 5099601|5569 chr2L 5099413 5100371 scaffold_30 370592 371540 - 18137|85 192
GGAAACCATAGTGGCCAATAGATTTTAGCTAAAACACCTTTCTATCCTGTTGCGCTAGCTTGAACTAAACTAAACTAAATAAAATTAGAACACCAAAAAGCTAATCAT
-GAAGCATTGCCGGGCCAT---------CCGAGGAAGCAGTTAATACCATTGAGCTAGTTGAATATGTATACAAATAAAAGGAAAAGTTATACCTAACA---AGACAC
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GTGTATGATTCTCTCCTACAAATTTTAAGTATTTCTTTCCCGTCTTTAAAGTAGAAATTCGACGTATTTTAATGCAGAGATACGTATTAAAACAAAATATATGTGAAAAAGCGTTGT--
>tkv 5218996 5220092|5676 chr2L 5218918 5221651 scaffold_57 325639 328240 + 88965|85 1283
-CAGCTGTTTGTAGTCTCGTTTT---------AGGTTTAACCTAAGTTGCATTTAGTT--------TTCTGTTTTTGTTCAA-------CTTCTGTTG--AATACGCAGTTCCGACCTTTTGTCCGGAAATTCATAGTTAGGTTCTAATCGTAAGTTGCTTGTACGTGAGCGGAGTAAAGCAGAGGATCCTTCAGAGGTGCCTATACTACGGTTACTTAAACCGTCGCACTGATTGTAAGCTAGAGTTTAGATATAAGTTGGCAGGAGCTAGTTACTAAGGCCCCTTGCAAAATCTTTGGTTAGAAAAATGCTTTAACTATTTGAGAAATATAGGGAGTATTTTGG-ATGACACC-TATTCATGTCGATGTACATAAATATGAGATCAAAACAAAAAATCAATCGAAAGAATCGAAATTTATATGTAACATACATTAATTTTTGTGCCAGCTTTTGTACGCTTT----------------AACTAAACGAGTTAAGTCGCCCATTCTTTGACCCCCGA---GGCTTTAGCCTCAACATAGAACATGT---CCTTATATGTTT-----TGTTTGTATCTAGTGTTTAAGTGTAAACTTTGCAGACTTTGTGCAAGTAAATGCTGCCTTTTGTAAAATCCACGGAATTAGTTGCCTTAAGACAAAGTGTAAAGACAGGAGCCAACAGACAGGAGCCCGACTCCCTTCCTCCCCTTTTAGTAGCACATATTTTTGTATTTATAACCAGAGATATATAGAACTGGCAGTTGCGTATCTCGAGAAGTGCACTTGTGTCGGCTCTTTTGTTTTGTGTAAATAGCAAAGATGTTTATAGGCCGCTAACCATACATATATATAGTATATATA--------------TTATATATT---ATCGTTATAAGCGATTC------------TGTAAATACTATATATGTATCTTTATCTGTAACCGTTTAACTTATAT---CTTATCGTTC--TTATCATGTA---ACCTTGTTTAAGCTAGAGTTAGATGACTAGCCTGTAAGAGCAACAAGTAAACTATATGAACTAGATGGATATGTATCTTTCAGTTTTTTTTCTGTTTCATTATTACTGCTCGCAGACCACAAGAACTAAAGTTTTGTATTAAAGCGGTTAGTTAA-----TTTATTTAAAAATA---ATAAAAAATTATAATTAAACCCAAA--A
TCAATAGTTTGTTAGTTCGCTGTAGTCCCTACAGGTTTGACCTAAGTTGCATTTATATAATCACCAACTTGTTTCCGTTTAAATCGTTTCTTTTTTTGTCCATTCGCGTGTAAGAAAATTGGTTC---ACTTTATAGC----ATCCAATT-TGGTTTGGTTTTTCG-------------ATATAGAATTT-------GTGCCTAC-TTGTAATCACATTAAGAGCCGTACTGATTGTATGTTAGACT---AAGTTCATTTGTTGTTAGTTTATCGATAAGG--CCGTAGATAATCATTGGTTTG-AAAATGCTTTAACTATTTGAGAAATCT--------TTTTGATACAATACTATATTCACGT---------TCAATCTGTCCACACAATCGATGATGGGCCCAAA----CGAAATGTATGTGTAG-ATTTTTTTTTTTCTGTGCCAGCTTGTGTATACTTTTGGGGTATAACTATAAAATTAACTAGGCTAAGTTGACAAGCATCTAACCTAATGAATGGTTTTTGTGAATTTGTAGTGCGAGTAAACGTGGCAAGTTCCAAAATATTTGTAAACAAGTTATAAGT-----CCTTGCCCAC--AGTGCAAGGTAATGCTGCCTTATGTAAAAT-----------GTAGACT--------AGCGTAAATACA-----------------------------------------------------TTTAGTATGTAGAA----AGAAATGCCG-GCAAACAATT---TGTCCAGCGTAGT----TTTTAGCGGCTGCTTCAATTAGAATAGATACCA------------------TATACATACATACATATAGGGAATATACATTTAGATCTAAGTTATATGTTTGACTTGTGGAAAGATATTTGAAGGTGCAACATTTAAAAACGTTTCAATTATATTAACCTTTAACTCTTT-GTTTATGTATGCTTAGTGTCCAACTATGGCGTACACACGTTCTTGAAGTTATATTTTGGC--------------ATTAACAACTTAGCTTTAAGA-------------GCAACTTTATGGATTTTACTTGATTTGTTTTCGTTGTACGC----------AACCGAAGTTGTATCTTCAATCAATTTAATTACGATTTTTATTTACAAATAATTATAATAAACAATAATTTCCTTCAAATGG
>Bsg25D 5271724 5274014|5714 chr2L 5271097 5273880 scaffold_6 44263 46907 + 32965|757 3017
CCTTTTAATTGTATGTTTGTGCTTGTTTAATAAATATAATTTATATTCATATAGAA-------ATTCATCACATTATCGAAATTCATTGATTTATG-ATTTCAATAAATATACATTTAATA-----------TTTTACAAAAAAATTAC---TCTTTTTCGGTTATGAA-------------ATTGGCTGCTGGAAATGGTTTTGTTTGCTTATTTTTCACATTTGTATCATTACACGTTTTCATTTTG-----CATCTTTATGTTTAACAATTCGTTCAAAGTCGTTTTTATTTTGTAAATCATGCCAATTTAATGGTCCCTTAAACAGCAATAACCTCACCACTTCGGAAACATCCATCTTTAGCACTACACCCTTCGAAAGCTCTCAGTCGGGTCCTTCGCCCACGAACAGTGGCAACAGCAACGCCTACGGCGCCAA-------TCCCGGCCCAGCTCCGATCAGCAAGCCCAAGCGGTCCCAGAGTCCCCAACAGGCGGCTGCATCGGAGGGAGAGATAGCCGATTGCGAGACGTCGTCGACGGCGTCCGGCAAAAGCTTCGA---------------ATCCAACAGTAAAACGTCTTGCCTTAGCCACGAGAAGTGCAGCAGTCCGTCGGCACTGAAGGAGGAACTGAAGCGCCTTAAGTTCTTCGAGCTCTCCCTCAAGGAGCAAATCAAGGATCTGAGTCTGCAGCGGGACGGTCTGGTCATGGAACTGCAGCAGTTGCAGGAGGCGCGACCCGTGCTCGAGAAGGCCTATGCGGTGAGCCATAGACTTTGTTGATCAGGGAACATATTCT-----AATCGTATCTGTGGACTCTTCTTTAGCGAACAACGCATCCAACGCTTCAGCAGCGACTGAACCAATTGGAGCTGCGAAATCGCCATCTGCAGAATGTCATCAAGCAGCAGCAGCATTACACGGAGTCCCTGATGCAGCGTAAGTTGAAGAA---------ACTACCTACTGACCAAGAATGATAATGTAATATTTATTCATTAGAATCCTGGCGGCAGCATCAAGTGGAGCTCAACGATTTGCATAGCCGAATCGAGACCCAGGGTGTTTTACTGGCCGATCAGACACAGCGATTGCAGAGTGCCGACATCCTGGTGAAGGATCTATATGTGGAGAACTCCCATCTGACGGCTACGGTGCAGCGGTTGGAGCAGCAACGAGCTAGGGTGAACCTCATTCACCAGCAGCAGCAACAGCAGCGCCTTGTGGGCG------GTGGACTGCCTGGCATGCCTTAGTTTGCCCCACCGGCAAACGTATATAGTTTATAGATAATTATGAAAAAGACAAACCTGAGGAGGGAGTGGTGCTCAGCATCGGCAGAC-ATCGAACATGCACCTAACCATAGATCCTTATGAATGTTTAGACATATACAATTCTCGGTAGATTAAGTTTGCATACCCGTCGTATTCGTATTCGTACGTTGCGTTTTTTTTGTGAATGAATGTGAATCCATGTTGTTCGACACGAGAGCACAGCAGCAATAACTAAAGTGACTTTAAACTAAACTTAAACTCACCCACGCGCAAATGAGGAACAATCCACACTAGTGTACCAATTTGTAACACATCTAGTAATCGAATCGACTAAACTATTTACACGAGCTACAGGCATATATACTCGATTGGACATATACGATGAAGTACCCACGTAGTATATGTTCGTGCAATGTTGACCTTACTAATTGACTACTGAAACAGTTATCGTATATTAATTATATTAGAAGAAACAGTATTTTAAATTTGTTATGCGTCTGAGTAGGCGAGCACGTTTATCAATGTTTATCACGTGCCCAATCAAATGCATCGGAATTGTTGTT--AATTTTATTGATAGAGAAAATGGAAATGAGCGTAAAAAATGATCTATGATATTGATATTGATGTAATATTTAACGACAAAAGACCTGTAAAGCTGTAACCATACACACGAATCTATGTATTTAAATTGCGATCTAAGTTAGCCAATACTCTTCAATATTGCTTTTGCGAACGCGACTTTTTGTTATATCTTCATTCGTCCCAATAACTC--ACTCGATTTATATGTAAAGAAAAAAAAACTCAACCTCAATCACACGATATCGTGTAATCAGTGCTTAAATCAATACTTTCGATCAAAATAGAAGTTTACTTTTTAAAAGTATAAA----------AAATAAT-------ACAACAAAAAAACCAAATATACAATTATTTATAAAACCAAAT
CCTTCTGCCTGCCATTTTGCGCAAATATATTAGACCC--TTTTTACCCATTTTCAATGGGTTCGTTTACTGCGGTCTGAGAACTTATTGGTCTACGCATTTTTAGGTATTTAATTTGTACACAAGGCCGAACTTTTAAAGCGAGATTATAGATAATTTTACGTTATACATACAAATGTACGGGTTTATTGATCTAAAGCTTATTGTTT--TTGCTCTTGTGATGTGTGCTGTCGAACGGTTTAGTTTAGTTTTCCATCATTA-GCTTACCAATT--TTTAAA--------CACTAAATAAATCCTTTGTTTT----------------AGAAACAATCTTACTACGTCGACGACATCCATATTTAGTACCACGCCTCGAGGCACTTTATCCTCGGGCCAATCACCCACAAACAGTGATA----CAAAATATACTTCGTCAACAAGTGTTTGTACGCCGGCGCCCATTTGCAAGCCCAAATGTTC------------------------GTCGGAAGGCGAAATCGCGGATAGTGAGACCTCATCAACTGCATCGAACAAGAGCTTTGATTCGCACAGCGTTGTGTCCACCAGCAAAGCGTCTTGCTTCAGTCATGAAAAGTGCAGTAGTCCAAGTGCTCTGAAGGAGGAACTGAAACGTCTTAAGTTCTTTGAGCTTTCACTCAAGGAGCAGATAAAGGATCTGAGTCTGCAACGTGACGGTTTGGTCATGGAATTGCAACAGTTGCAGGAAGCACGTCCTGTTCTTCAGAAAGCATATGCGGTAAGAT-----CGTTGATAATAAGGCATTATCTTTTATTTAAACTGCTCCTTTTTATTCTTAAACAGCGAACAACACATCCGACGCTTCAGCAGCGACTTAATCAGCTAGAGCTGCGGAATCGTCATTTACAGAATGTGGTTAAGCAACAGCAGAAATATACCGAGACTCTGATGCAGCGTAAGTGTAACAAGCAATTCTTACTATTGACTGATTAATTGCCATAA------ATTTAATCCATAGAATCCTGGCGACAGCATCAAGTGGATCTCAACGAGTTGCACGGTCGTATTGAAGCACAGGCTGTCCTGATTGCCGATCAGACGCAGCGTCTTCAGAACGCCGATATTCTTGTGAAGGATTTGTATGTGGAGAATTCGCATTTGACCGCTAATGTTCAGCGACTCGAGCAGCAGAGAGCACGCGTTAATCTCATTCATCAACAGCAACAGAAACAGCACCATGTGCCTGCCTTAAGCGATCCATCTGGAATTCCGTAG-----------GAGAAACGCAC--------CAGAGATTAAATGAAAAGACACATCGAAGTAAT--ACGATAATATGTACCAATACACTAGGCAACATTAATGCAGTGAT--ATTCTTCAGAGTATTT----ACATGATATTTTCTT--------GTTTGTATTCACA-CATATATATAATTATA---TATGTTCTCGATATGACTAAATGT---TTTTTGCTGC--------AGAGCAC-----------CTAAAG-------AAGCAGAAC------------------------GGAACAATCGAC-----TGTACCGATTTTTATATCAT---------AAATCTACTAA-----------------------------------------------TTGAACTTCATATTTGGTATA------TACATTGTTGAACGTATAAAT---CAATTGATATAGTTAACG-----AAATAATAT------AGATAACATTTTAAATTGGTTAAAAA--------------------TATCAAAGTTTA--------CCATTCGCATATAT----ATTGTTATTTCAATGGTATTCAAGTAAAAAA-------------AAAAAA--------------GACGTCAAAGTAAC------------TAGACTTGTAATGCTATTATCGTAAA-------ATATGTATTTATTTTGCATATTAATTTAGTTAATA-----------------TGCAATCG-----TTTTGTCAAATATTTATGTATTAACATATTTACGAACCAATTAATTTGTAAATGCTCGATG--TACACCTTAATTGTATGTTA-----TGATCTGTGCTT--GTTAATG--TACGAACAAAACATTAAACTATTTTATAAAACCAAAAACGAAAAGTTTAAATATTTTTGCTGATATCAGCTGTGTGGGATATTTCAATATTCGCAATATGAATA
>Bsg25D 5271724 5274014|5715 chr2L 5273881 5275812 scaffold_6 47580 49513 + 64382|0 133
GTATGAGAAGCCTCTCGGTGTGTCCTTGGTGTGAGCATCCCTGTGTCTTCCTCATAATTTGCACTGTATGTCCTGTATATATGTTTCAGTTTTGTCCCTCACATCTAACCATGTCTAATATAAGCTAATTTAAT
GTACAGCGCGGCTCTTGCCA-GTCCT--------GCTTTTCTATGT--------------------------ATGTATATGTGTTTATGTGTCG---------------CGTCGTTATAATGTTCTGATCTTAT
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GTGCAGTGGTGTCAAGGAGTTTGGGATCGATCAGTCGTGAAACAATCTTATCATGTACCTTTTTACACGAAAACTCAGACCACA----------GACAAAGGAAACACTCTCACACGATGAAAACA-GAACCCAACCGAAGCTAACAAATCTACCAAAAAGTTTATGGCCAAATCAACGTTTTCC
GACCAGACTGAACAAGCTAGCTGA----AAACAATCTTGAAAC------------------------TGGAAAAGAAGATCACAACAAAAAGACAACAAATGAAACCCAACCGAATGATGAAACTACAAAATTAACTTAATCGAAC-----------AATGTGTTTGGCCAAATCAAAGTTTTCC
>CG14023 5316240 5317812|5759 chr2L 5315249 5317345 scaffold_6 92411 94333 + 33844|1106 2276
GCGCGATGCCGGCGACG-TACTCAACATTGTACAGCTCAGCAACGATT-TGGGATTGAGTTTTCAGGAGTTCGCCAGCGAGGCGACAACGGCGGATGAGCAGCGCTCCGCCAGTAGCAGCTCACCGCAGCTGGCGTAGTGGAGTCG---------------------GATTAC-----------GGACGGCT-----ACTTGTATATAT----------CACACGCAC-TGATACCGAACGCTTTCGTTTGT---AGTTCTTAGCCCTAGTTTCCGTTGAGGATTATTTTGTATAGTTAGTGGTAGCCACAA-GTTGCAATAATGTTGCGTCTCATAGCGAGCAACATCACACCCAGACACACTCTCTCACACATACACACAAACACCCACCCATACACACATACTGCAGACAGACGGTTGCAAGCGCCGATTTACGCCTTTGTTAACACTTTGTTTTCTGCCCCCCAGTCCGAGCTTATCCGCCAATCACCCCTT--CTCATCTGGCACTGCTATTACTCCCCAAAAAAATCCACCCATTGGAAAT-GATTTGCTAGTCATGTGAAACAGGCAATTTAATGTATAGCTCAGAAGATGAAATTTGAACAAATTAGTTGAGTAACGTATTTGAGAAGCTCCCATAAACACTAACATAGAATATAGTTGGCCGAAACTGAAAAAACAAACATCTCCAAACTCTCACGCATGCATAGTTTAATTTGAAATTTGAAAATGAAAATGAAAAATCCTATTTCCATGGACCGCTCTGTAAATATTTGGATACTTCTACTTCACGATGCAACATGAACACATTTCTAGCATTAGGTTGTCCTACTTTTAAGCGCTGCGCCCAGTCGAAAGTCTATAAGAAGCTGATCC--GTTGGATCGAGCAGATCAGAGCAGACCACACGTTAACATTAGGTTTTATATTTTTGTAACCTTTAACATACGAATACAATACAGTACAGTACATACAGATATATATAAATATATATATATATATAGCGTATTAGTTTCCGTAAGCTTGCGTTGTTTCG-----AAAATTTGTTTTTTAGTTTTAAATGCTTTAGGCTAAGGACAGTAATCTTAACGCGAATTCTTTACCAACAATATATGCACAT-GGAAACCTATGCAATAAGTTAGTCAAAAATGTAAAAAGGCCAA
GTGTGATGTTAGCGAAGGTTTTCAACATGGTGCCGCTTAGCAACAATTCTTTGATTAAG-TTTCAGGAATCCGTTCCGGACTTGAGCGTGACGGGCGATGATCGTTCTGTCGGCAGTAGCTCATCGCAAACGGCATAACGGCGTCGTTTTGAATTGTTGAAAGAATTGTTTACCATGCTTCGTTTAACGGCTCTGAGCTCTGTACATAGCTTAAACTCACACAAGCACACAAAAGCCAATTCTTTTGTTTGTAAAAAGTTTTTGTAAAGGTTTTCCTTGAATA----TTTGTATAGTTAGTTGTAAACACAAGGTTGCAATAATGTTGCATCTC-TGACGAGCAGCATCACAC------------------------------ACATAAATCCATG------------------------------------------TTTCACTTATATTTTTAATTTTG------------------------AAACAACCCTTTACTAATTGAGCGCTACTTTTCATC--------AAATGTCCCATGGTTAATAGATTTGCTAGTCAAGTGAAACAGACAATTT-ATGTGAAGATCAAAAAATGTATTTTGAACAAATTAGATGAAAATCAAATATGTGCAGA-------------AATGTATAACAAAGTAGTT---AACTCAAACAACA-----CCCTAA-----CACGCATGCGTATTTTCATT-------------------------------TTCTCATCTAAGCTCTTGTATATACTTTAGACATTATTCTAATAAATGCAACATAAACTCATTTA-AGAATATAAATAATTTACT---------------------ACGGTTTATCCTAA--TGATTCAAGCTTAAGATTGCAAAACAAATCAGACCATACTTTTATAT----TTTTATTTTTATTCTATTTTAAGTATATGCACACG------------AAATATAGATA---ATAGTTCT---------TATAGTTTTTTA---TGCAAACGTTTGCGTTGTTTCGAAAAAAAAATTTGTTTTTTAGTTTTAAACGCTC-------------ATAATATTAACGAAAATTCTCTAC---CAATATATGCACATAAAAAACCTCTGCAATAAGTTAGTC-----------AAGGCAAA
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CAGCAGTGCCGCGGATGTTGAGGTGGATGAGGTGCTGATGCCGGAGCTGGACAATGCCACGGCCTTGGACTGCGCCAGCTTTGTCGACTACGATGAGTTCAATCTGTGCCTGAACAACATCCTCAGCGAGGAGGACGA
CAGCGCTGAC-----TGTCGATGCGGTCAGCCTGCTTATGCCAGATTTGAGCAATGCCACAGCTTTAGATTGCGGCAACTTTGTAGACTACGATGAGTTCAACATGTGTTTGAATAATCTACTTAGTGAGAAGGACGA
>CG14023 5316240 5317812|5761 chr2L 5317632 5317678 scaffold_6 94672 94718 + 2445|0 46
CAGCAGCAGCTTTCCTTTAGCCCAGGCGCAGGACGAGGACGGTGATG
CAGCACTAGTTTCCCTTTGGACCAGGCGCAAAACGTTGAAGGCGACG
>CG14023 5316240 5317812|5762 chr2L 5317735 5319951 scaffold_6 94745 96995 + 46595|0 77
CCAGAGTTTTGCGCCTTGGCTAAAGGCTTGAACCATCCGAGCGATGCACACGAAGACGATCTGCTGGAGCTATTCAAA
CCAGAGTTTTGCGCCTTGGCTAAGGGAATTAATCAGGCAAACGATGCTGACGAGGACGAATTGGTTGAGCTGATCGAA
>CG14022 5327978 5328074|5768 chr2L 5327188 5328506 scaffold_6 107365 108626 + 33420|832 928
-TGTGGTCCGGTTTGTGTGGCCTTATAGTTTTGTGTGTTTGTTTTGTGCATTACTTGGCTAAGTTTGTAAATACGAGTAAATAATAAAGAATTTAAT
TTGTTGTCCCATGTCTATAGTCTTTTTTTCTTTTGTGTTTGTTTTGTGCACTATTTCGATAAGTTACTAGAAACCATTTAATA--AATGATTTTTAT
>CG14021 5330468 5330867|5773 chr2L 5330521 5331669 scaffold_6 110153 111301 + 32201|0 366
GAATTCGGAT--TCCAGGCGCATGGCTAGCGTTTCTATGTCTAGTTGGTAACCTAGTTGTAATCGCCTAAGCTTAATCGTATTGAGCTTACTTAAGAGTCAGTTGTTTAGCATTAACCATAGATGTGGTCTCTATCCCGATCGCAAATCCCA----AAACTGTACAGAAATTTAAGGATCGACGTATCTAGA-GTTTAAGTATATATGCATTTTTCACAGCAGGTTTATGTTTTTCGAATTTTAACCTGGTG--ACGAAGGCA-ACCTCACCCACTC-------ACATTTTAGCTAAGTGTTTAGCTAACGATTCAATTACGAGTATAAACAT---TGTACATTGGTATTTTCATATATCGCAAGCA
GAATCTGAACAATCAGTTCGCGTGTCTAGATTTCATATG-CCATATGCACGCATTGTGGTATTTAACTAATTTTA-----AATCAATTAACTTAAGTTTAGCATACTTAACAGCAGCCCGGCCTGTTG-----GGCTCGTCAGTTATTTCCATATCGAATTGTACA-AAATTCAATCGATTATGCCTATACATATATACATATATATATATATATATATGTGTGTGTGTGGTATACTTACATCAAATCGTTGGTACAAATTCACAGCTTTTCCTCTCCTTTTGTACATTATGCATTGCAATTTAGCTTTCGCTTTC--------TATAAACATTCATTTCAAATAAAATCTTCTTATCTATCATGCA
>CG31647 5435579 5436680|5906 chr2L 5435673 5436164 scaffold_6 373699 374104 - 9160|0 501
AGCT--TTTTCAGTGCCCATGCAACCTTGTTGCAATTAGTTTTTGCATCACCACCCAGCGAGTAACGAGTAACCGTGGCGTATCATCTTACCTTTTGGGCCAACCTTGAACTGGCCAAGACAGAGGCCCTAAATCTGGCTCTTTTCAGCTCTTCAGCCTTTCAGCTCTCCAGTGAGCCACATGACGCGACTTGGCAGCAACTGCAGCTCATCTCGGTTCAGTTCGGGCAGACTTCCGTGTAATTAAGTGGCGTTCACAATGCGCTC--CACCACCCATTGTGTGCTGGATTTCAGACAGAACCAGGATCCTCCCTTCACCAGCCCCATCTCCTTGGCCATGATCTCGTGCCCCACAGATGGCCCCACAAGCAAATTCTTTGTGAAGGCCCAGACAAGCGAATGCACATGACTTCAACGAG-GAGACGTCGTCGCAAACTGGATTTG-----GGCGCCAGTTAGGCACAATGGGTAGGATGTCTCTAACGCAGAGTCTTCGAA
AGCCGGCTTGCAGCACGT-TGCAAGCTTGTTGCAATTAGTTTTTGCATCACCACCCAGCGAGTGATTCGTA--TGCTGGATATCAGTTTACCAC---GCTCAACCTTGAACCG-------------------------------CCAACTC----GCCACAAAGCGAAAGAGGGAACCAT-TAAATCGACTTGGCAGCTAC--CAGCT--------TGCAGCTGAGGCAAACTTCCGTGTAATTAAGTGGCATACACAATGGGCCCAGCACCACCCATTGTGTGGGGCAGCTCAGA------------GCTCAGAGCACAGACTCCATC-------------------------CAAACTGAGCTGCA--CAAACGTTTTGTGAAGGCCCAGACAAGCGTATGCACATGATTTCAACAAGCGAGACG-AGCAGCAGTCGGGTCCTGTCGTCTGTGCCAGAGCGGCGCCA-GAGTTGGTTGGC---AACAAAAAGATATCGCA
>CG31647 5435579 5436680|5907 chr2L 5436426 5436558 scaffold_6 374105 374279 - 6959|0 174
GGGGAGACGCGTGCTCAAGGCGTGAATACCATCGTCAACAAGCTAGCACCT---------------CTCGCTCTGAATTATTGCTGAAATATTTGCTGATTTATTGGCACCAA---------------------------CTCGCTTGTTGCACTTGGCACGCCATGTGCGTGTT
GGGCAGACGCGTGCTTTAGGCGTGAATACCAGCGTCAACAGGCTAGCACCTGAGCCCCAGGATCGGCGCAAACTGAATTATTGCTGAAATATTTGCTGATTTATTGGCTGAGATACATTTTGTTGCTGTTGTTGCTGTTGCTGGCACTTGGCACTTGGCACGTCATATGCGTGTT
>CG31647 5435579 5436680|5908 chr2L 5436559 5436886 scaffold_6 374558 374930 - 5783|0 121
TTAATCGCCATGAGCCAGATCCTAGCTGCCTTTTATTAATTACGATCCAGCTCCAGATCGAGTGCGTATATGGATGTGGACATGGATGTGGATGTGGATATGGACATGGATGTGAATGTCTC
GCTCTC-----GAACTGGACTCT--CTGTTTCTTTCTGTTTGGG-----------GCTCGCTTGATTAATCGCAAATGGCGCGAGAAGCGAATTGTGAAAAGGGTTTCGCTGC--ATGTCCT
>CG7382 5518893 5518985|6033 chr2L 5517746 5519463 scaffold_6 491281 492999 - 73303|1165 1264
GCGGATCCTTCCGA----TCTTCTGCTCTCCTCTTAAATTCTCTGTACATTTGTTAT---ATTTATTATTTGACTGACAATGAAATTGCATTGGGTAACC
GAAATCCCCCACAAGACATCATCCGCGCACCGCTTAAATTCTTTGTATAATTGTTGTTTAATTTACACATTGACTGA------AATTGTAATATGTG---
>CG7371 5521280 5521377|6035 chr2L 5521003 5523858 scaffold_6 494752 497580 - 130522|288 404
-GGACGCTTTAATTGAATCTGTGTGTGTGTCTTCTGTGTATTCCAAATT--GAGTAAAGTTCCAAAATAAATGT-----------------ATGTAAGGTATACGACTTAATCCTCA
TGGACG-TTTAAAAGAAC-----------TTTAATGAACATTCCGAAATAAAAATATGAAACTAATATAAATGTTGAGGAGGCTGCCGACAATTGAGAGTATGCATATTATTCCTCA
>CG7277 5530617 5530713|6038 chr2L 5530568 5532258 scaffold_6 503016 504700 - 64058|49 145
AACAGGGACAATAAATGGGGAAATGGAAATTAAATTTTAAGTGTTTACTGTTTGCACATCACTTGTGAGCGGAATAAAGTCAGAGAGTTTATATAAC
GACGGGTGT--------GGGCCATGT---TTTATCTTTAAGTGTTTACAGTTTTATAGTCGCTGACCAATAAATTAAAGGC------TTTCTAAAAG
>CG14015 5536845 5537459|6042 chr2L 5536822 5539459 scaffold_6 510949 513586 - 73839|23 725
GAGCGCAC---CAAGTGGGACTAGTTAGGAGCGCAGCGGAGATAATCCTAGTTACTTTAGAAGCAATAGCAACGATTGCAGGCCACTCAATTACTTTCCAACTGTTAAGAAGTCTTCTGCTGCACACATTTACACACTGCATAAATATATCGTTTTGATAGTGATATTTTTGAAAACGCGCGCCCAAATGTCGAGTTTTTTGGCGGGAAATGCAACGCACTTCATTCCAATTACATAAGTAATTTA--AGTACTAAACGCCAATCAAAAAAAGAGAATTTTGAGAAGAGGTTTGAGTTGGTTTCG---CTGCCAAATCACTCGACACAGAATATATATGAAAGGAAAGCAATTACAATTGATATCAATTAATA-ATGTAACT-----CTTTTTATTACA--------------TCTATAATATAAAATAGCTTTCAATTATCGTAGACTAAACGAGTAGAGGAGAACAATATCATAACTTAATGCCATGCCATATTATGTAGACAC-----------CAAAGGAAAT-----------TATCTATGTTATAACGATATAAAC---TAGACACTTGTTAAACGATTGGTACTTAACAAATTTTAACTTTATTACCAGTACGACATATAAATACTTTAT-----------------------------------CTAAGCTTTAATAGTTTAGTGCCCACAATAT
GA-CGGACGCTTATGCGTGTGCAATT-----CGTGATCAAGGAAATC------ACCAAAGAACTCATATCGTCGATT-----CAATTTGTTGCCTTACCCATGGAGGAGGAGCAGTCAGTCGTA-GCTTCCATTTGATGCACGTGCAAAATGTGC-----GTGTTTACTTTAAAAGCA-----------ATCAATTGCAATTGCCGGAAA---AAATTACTTTCTTACTGTTA-ACAAGTCTTCTACTACAAAAAAAAAACAACTAAAAAATGCCTATAT--AGCAACTATTACAATTATCTATGTATCTGCCAAA-AATTATAGAAAAAGTCTATTTAAAGTGCAAGCAAT----ATATATTTAGGTAAACATATGTAACTAGGGCCTGATCATAAAACAGCGCCAAATTATTTTACAATTT---TTAGCTTTTGATTAGTAT-TATTAACAAAAACAACAACAACAATATCATAACATAAAGCCATGCCATATTATATACATATATACATTTATATATAGAAAATGTAGCGATAACTAAATATTTGTTAAACATAAAAATTTATTAACACTTGTTAAACGA-AGGTACTTACCAAATTTTATCTTTATTACAAGTACAATTTAAAAATAATATATATATAAATATATATTTAACTATGTAATTAGTTTGACTAAGCTTTAATAGATTAACTAGTGCGAAAC
>Hel25E 5539326 5539630|6042 chr2L 5536822 5539459 scaffold_6 510949 513586 - 73839|2677 2817
ACCCACTTGTTTCACATTTCCGTTTAAACTATTTTATTTGTGAAAATTTCTGGGGCATATTCCCT-----TAAATAACTTAGCAATATTAATGTGTACAATATTATAAATCAAC--TCACAATAAAATGTCCAAAAAAAAT
AACC-------TAATACTTGCTGCTAGACA-------TTATGTAGATCTTCGTTTCAGGCTCCCTGAGTATAAATATTTTCTCCTACCTAATATTC----TATTGTGAATGATCAGTAAATATATAATTTGCCAAGGAAAT
>Hel25E 5539326 5539630|6043 chr2L 5539460 5540838 scaffold_6 514129 515652 - 46888|0 179
AGCTCGAAG-------GTGCATGTTA-ATCGGAACAAGACTATGCACTTCGAATAGATACAAACCTAAAACCTTTTTTA-AAACTCTACTTTATAACTAAATAAAAACTATTCAGACAATGTGTTGACAAACAAAAACGGAATTATAAGTAATGTATTTATTTTGGGAATGGATTCTAAA
AGCGCGTGGAACATCAGAACATTTAAGATCAGCATAAGAC--AGTAATGCAACTATATAACAAAAGATACCAATTTTTATAAAATTTACTTTATAACTAATAAAATACAATCCAAACAACGTGTTAATGTAAAATAATATAAATGC-ATTTGTTTGGTTGCTTCAGAAATGAATTTTAAA
>CG14014 5549709 5549820|6052 chr2L 5549561 5549710 scaffold_16 2619205 2619359 + 1080|154 155
TG
TT
>CG14014 5549709 5549820|6053 chr2L 5549723 5550866 scaffold_6 524726 525854 - 37083|0 115
CG-GACCCTTCTTGAATGGCATAGCCACCACTTTTATACCC----CTTATA---GTGTACACATATTTGTAATTA----------TAGAACATTTAGATAATAAAATGGAAACCAC
CGTGGCTGTTGTTAGATCA---GTCTCCCACTCTCATCCTCTCTTTTTATATATGTAAAAATATATTTGTAAGCATTAACATAAGTAGTTTGTATAAAAATTAAAATGCATAACAC
>CG7251 5587143 5587268|6095 chr2L 5587064 5587296 scaffold_45 492311 492512 + 2787|79 205
TCCTCTCCGTTCAGATTTAAGATGTCAAAGCAAAACTTTTTTGGCGACTCCAAATGTACAGAAATTATTTAGATATAAAAACAGTGA-TGTTAAAATATACACCGACAGGGTTTAGAAACTAAAACG
TACTTGCTATTTAAATGTTAATTTTCAAAGTAAATTTCTTTTGACAACCCCAAATATA------------------AAAAGCCATGAGTATTTAAGT---------CAAGGACGCGCGACTAGAAGA
>CG31646 5626282 5626920|6146 chr2L 5626348 5627149 scaffold_2 487144 488042 - 6868|0 688
AAA------------------------GTGTACAAAAATGGCATATATATAACCGATGT--TAGTCTAACTAAGATAAA--CTACTTTGTAAGC-AATACCCTTATAAATCGTGTTGGCCGAA---------------GAACTATTATTTTTGTGCTATGTGGAAAGTTG--CTTACTGTAAAAAGTTGTTGATGTTTA--AGGTAAAACTAAAATTTAAGTCGCATTTTG----------------------------AAGAAGTTCATGGGAACTGGGATTCGCAACGGAAATACAAAGTATTAGAATATAAAACATAAGG-------------GCTTAAACCAAAGAATGTTTTAGGCCAAGTGCATCAGTTGCTGTTTATATTTCTGGCGAAATACTTGCAAATTTCTATTATTTGGACTTGAATTGAACTTTACAAGAGCGAAAGTATAAATAGCAGC---AGGTGCGCGTGTCTACAGCATGAGACTCGAAGCGAGTTTAGATCTAAGTCACCGA------AATCAGTTGAAACAAAAAAATATTTTTACTATTAGCCCAGTTCTAGCTTAGTTTCCAAGCACTGCAA-----GCTGTATA-ATAACTATTA-------CATAAACAATTTCATCATGATTTAAGTAAAAAT-----AAAATGCCGTCTTAAATCTTGTAAAC
AAATGTGTAGCAAACTTTAAGTGTAATTTGTACAAAAGCAACAAAAATA-AAATGATGTCGTAATC---CTAAGCGAAATCCTAGTTTGTAAGCGAAAAATGTCACATGTCGATTTGGTCACACGGAAAATGTTAGTTGACATTTTTATTTAGTGCTTAATTCGAAATTGAAATAAATGTAAAAAGTTGTTGTTGTTTAGCGCGTAAGTTGAAAAGGGTTTTCGAATGCTGTCCGCACACAAACACGCACACACACACACACAAACACACAGGTTCTGATAGATACAACGGAAATACAAAGTATTAGCATGTAAAATTCGATGCGAATCGCAATTTGCAAATTACATAGACGTCTTTAAGCTTA--GCATTGACTACGGTTTGTGTATAT---GAAATAGGTACAA----CAGCTAACGAACCACAACTTAAA----ACTAAAACTAAAACTAAAACCGAAACTAAAGCTACATTTAAATCTAGGCTAAGTC-----GAGTGGTTAAA-CAAAGTCAACCAACTGTCAATGAAATGTTGCTAGAGCCCATTTTATTTA--AGACTCATGTAAGCTTCTTTTACGTGCACCGCAACATTGTTTATATATATAAATATAAATATACGTATATATATTGTAATTTTAATTTCAAAAGAAACAAATAAAAATGCCGTCTTTAATTATTTAAAC
>CG11149 5718121 5718400|6279 chr2L 5718116 5718622 scaffold_2 644398 644873 - 8417|5 298
CATTACTTTGATAATATAACAAATAA-----TGTAAT-TAATGAATTTATGCCCCATCTAAGTTATGCCTTTATAGGAAAAAGAGTCTATTCTTTTTAC-----TACTTAAACCGAGTAGTATGTATATTTTGAACTTAATG-CTCACTGCTTGCTATTCATCAATGTGAAAATATATTATATTTTATACAATTAGAT-AATAAG-ACCTAATGGATACAATTCCCTATACCTTGGGAAACTGATTGCTCCGCTGTTTCATGTAGTACAATATATAGAACATAAATTTTAAATT
CA----CGTGGAGACGCGACAGGCAAATGCTTGTGATGCAAGTGATATAAACTTAACATTAGTTGTAA----ATATTTAAAATAGT-TATTTTTGTTGCGTTCATATTTAA-------AATATGTTTTCATTAGGGAAAGGGACACGATTCTGTTTATCTACTGTTACGAAAGCG---------CTAAATAATTAAATAAATAAGTATTTGATAGA-AAATTTTGTTATAATTATGTAA-----------------TAAGTAAAATAAAATTTATAAAAAAAAATGTACAAATT
>CG11147 5733675 5734128|6296 chr2L 5733104 5733686 scaffold_2 666473 667135 - 13133|695 706
TAAACCTAAATT
TGCATTTACATT
>CG11147 5733675 5734128|6297 chr2L 5733687 5736151 scaffold_2 667337 669875 - 91287|0 618
TTTTGGACAATGGGCTAAACTTTAATATTCGGGGGCCTTTCATTT---AGTTGTAACGTTTTAGCATTTTTTGATAGGTGA---TCTATGTATGTGCA-----------TATCGTTTTAATTTAATAACTATCGGAAGCATATCACTCGCATGTTGTAGACTC----TCATCACACAA--GGAAACACATTC---------------------------------------ATACCAACGAA----TTGTAACA-------------------TATTTTTAGGCA---ACGTTCTATATACTGCA-----------------CTAAAAGTATCATAAGGTTTTAAGGGTGTCTCACAAAAAAATATTTATAATACACAGGACA-----------ACAAATCGTACTCATTGACAAGCAC-AAATTTCGTA------------TTTCATTATTTGATCAACTCACG----------AAAATTAGAACAAATCCATACATTT-----TTATTCACATCGTATGCGCGTGAATTTTG---------------------TATATTAAATTGTGA------------AATTATGTAAATCGAAATTTCAAATCAACCAAAAATA
T---------GGGGCTGTA-TTCAATATTTGGGG--TTACCATCTAGAAGTCGTAGCGTATTACAATTTCCCTTTAGGCGATTTTCTATATATGTATATTGTGTTATAGTATCTATATAATTTAATAATTATCGGAAGCATATCACTCGCATGTCGCAGACTCTCTTTCATCATCAAAATAAAAACTCATTCGATGCATTGTTAGCCAGACTACGTTCGGGTTGCCTAGGGATATCAAGAGAGCTCTTGTACTAATAAATGAATGACGTTTTCTTTTTTTATGTATGTATGTACTAAATTCGGCAACCCAACGATAGATTGGTTTAAAAGATC-TAAGGTCTAAGGGGTGTCTCAC--ACAAATATTTATAGTACATAGCACACATTTGAATTCATGAACGAAACGTTTGAACATGTACTAAATTTAGTACATTTAGTACATTCTTATTATAATACCAACCTATGTAAATAGCCCAAAATCAGAAAGGGATAGCACATATTATCATTATAAAAAAAATATGCGTAAGATTTTAGCACGCGTTCCACTATACGAACTGTTCTAAAGTGTTGTTCTAAAATGATAATTCTTTAAAACGAAATTTTAAAACTACCAAAAAGA
>CG11142 5763460 5763597|6335 chr2L 5762550 5764498 scaffold_7 1444533 1446555 - 87431|931 1088
-TCAATCCAGTTGTGATTTTTCCCATGCA---CATGCCATATGGCGATAGGTTGCTCGAGTTTTCTAGTCTGTAGTTAAAGA----------ATTTGGCAAACTGATTGTTGACATTTTGCGCGTCGAAATAAAAAAAA-------AAAAGGAAAAAC
CTAAAGTTAAATCAGATTGTGGATATGCAAAGCACGCC------CAACGGGCTGCTCGAGTTTTCTAGTCTGTAGCTAAGGGTCTTGTGCCCGTTTATTATTGTAACTTTTGCCATGTTGCCAATAAAAATTCAGATAATTTTTGTAAAGAGTTTGTT
>CG9171 5768245 5769074|6338 chr2L 5766962 5768583 scaffold_7 1450360 1452403 - 6785|1674 2110
CATTATTTTCGTATACCGGG------GCGAGTTTCCTAGACATCAGCAA--AACAAACAGTC-TTACCACTTTTTTGTGTTTTATATATTTCCGCATTAAAGG--------------CATAGATTAAACAATGTTTTTTGGGCAATGTAGACTTACTGCAAAGAC--------CAAAATTTAGATTAGACCGATACCGGGCCAAAACAATT------CCAACGTTAAATATTTGACTTGATTAGCAGAGTAGG----------AATCATTGAATTG--AAACGTATTAAATAGACTTTGAGAGTTAAAGCGTAATAG-TAATAATGATAAAGACAAGTTT------CAAACAAAAAAAAACACAATTAC------------------------TATTAAAATTTATACAAGAA------------------ACACAC
CATTATCCCATTATAACGAATAACATACAATTTTACTATTTACCAGCTGCCATCAAATGGTTGTTAGGTGGATTAGCTCTTCAAGATATTTACATATTTATAGAGATTCCTAGCCACAATAGTCTAACCATTTATATTTGTACGTAGGTCACCAACTGGACCGTCTATCGTCTTAAGTTTCAAAGCGAATAGAAAGGGCAACAAATAGGTTTAGAAACTAATTTTAAA-ATTAGACAGCAACAATAGAAGAAGCCGCTACAAAAAAGGTTTAATTATTACAAGAATTAAATAGACTTGAGAAATTGCAAAAAAAGAATTAAAAACGTTTAAACTTAGAATGCTGAATAAATAAAAAAAAAAATACATACGTATAATGCGTACAGACTTACGAGTATAAAGAACTAAAAGAGAATATAACAAAAATGCAATTATACAA
>CG9171 5768245 5769074|6339 chr2L 5768603 5768767 scaffold_7 1452415 1452630 - 1659|0 215
AGAGACCTGGGTTATGCGGTGTCCAC----------CACTCATAGGCAGTCATTATCAGTTACTTTTAGTC------------------TAGGCCA-TAAACTTAAGTTGAAC----GTTATTTAGTTGAATTTTC---CATATACATTCATT--AACGAGTTAAAAATA-------------GTTTTTATTGGATATTCTTTTCAAAATACTCAA
AAAGGCCTCTGTTGTCCACGGGCTGCATTGACTTTTTGCTCACGGGCAGTCATTATGATTTAGTTGTAGTCCTACTTCCAATTATTATTTAAGCCATTTAATTTATGTCCTGCCTAAGTTAGTTAGCCGATTTATCGTGAATGGAATTTCATTACAATTAGTTACAGTTATGTCTTAATTTCCGCTTTCCTTCAACAATTTTCGTGGAATACTCAA
>CG9171 5768245 5769074|6340 chr2L 5768829 5769996 scaffold_7 1452677 1453805 - 37137|0 271
GACGTGTAACGCCATGGGGGCCTATTGGGTTTTACCGCGTTCTGGGT-TATCTTTTTCTACTCT--------GCAAAGCCTTGAGAGCATGGCTTACATAGACTTAACGTAGTTAAATGTGGCTTTTAGGTATCATGGTGTATTCCATTTAGCTGGCCA-------TTCTTAAGTTGGAACTAG----ACGTCA-AGTAAGCAGTCGGCCCTTTTGATAGAGCGTGCTTAAG-AATACACGCCCAAAATTGATTCAC----TTCCAAGAAAT
AA----------------------------------GAGTTCGGAGCGGGTGTTTTTCTACTCTATGCATAAGCGAAGCCTTAGGAGCACGGCTTAAGTACGTAAAACGTAGCTAGTTGTTGGTTCTTTTTGTAAATGCCGATTAAAGTTAGTTAGCCAGGAGCTGCCATACAGCTGGAATGGGTGAATCCTCACCGGAAACAGCTGA----------AGAGTTTTCTTAAGCGCTTTGATCTTCACATTGGCTCATATCGTTTCAAGCAAT
>CG14005 5800514 5800869|6382 chr2L 5800758 5801147 scaffold_2 5632873 5633265 + 3137|0 134
TCCCGACTACTAGCACCACGTGGTAAGG----ACATTGTATGACAGCTTTAGCTTTAAGTTGGG---------AATAGAGTCG---------CGGCGCTCGACCCTGTGTATGTTTTTCAATT-CGTTCCTTTCT
CCAAACGTTTGACAAACGACTAGTTAGGTTAAAAGATGAATTGAAGGTTAAGCTTTAATTTCGAGCAGCTGCCAATGAAATTGAATGATCTCCGGCGCTGGCTTTTG-----GTTTCTCTTTTGCGTTCCTTTAT
>CG31644 5817892 5818047|6392 chr2L 5817883 5818493 scaffold_2 1139892 1140537 - 8146|9 180
ATCAAGGTACCGACAGTATCT----------TATCTCAATTCCCATTGAACACCATATAGACAAATTAACCATGTAACCCCTTGTCGACACACCTCCTAAATGGAAA------TCAAAATTTACATGAACTAGTTAACACATTGCATTACAAATAAATTGGAGCATTGCAAA
GTATCGATTTCTTGACTATGTGAGGAACAAATGAAACAATTCAAACGGGGCGCAAAATATGAAACTTAACAAAA---------ATTTACACAATGCATCAATGGAAAGGAAATCCACAACGCAAATGAATT--CTAAGAAATTG-----TAAACTCAGCAAAACTATGAATA
>CG8965 5859762 5860179|6425 chr2L 5859076 5861218 scaffold_2 5740465 5742736 + 60184|871 1318
CGATTGGGTCAGT--GGGAGTGGAACCTGTACAAAGGACGAGTATGCCACTAGGATCGTCTGATGAGACCCAAAAATTAGAAA------AGAAATCGAGTACCGTTTGGACCAAAGATGCATTTGTAGTTTAAGCCGTTAGAGTGGGAAATGTAAATAGGAAATATGCCTGCGAGTAATGTATCCTAAGATTAGTTACGATTAGTTTAGTTTTTCCTTACGCTACAAAAGATACTTTGTCCC-TAGTGTAATGCAAAGAAACCATCTGCTAACAATCCCAA---ATGAAAGGAGTC--TATAGCTTAACGCTTTAGTCCCGCAACTAAAGCTTCGATAAGAGTATGAATCTG---------AATAGCTTGTGGCTAACATTCGTGTAAAAACCAAAAGATATTGTAATAATA-------AGAACTAATTATGTACAACCTGACCACAC
CGCTGGCTCCAGCCAAGCCGTGCGCGTTGTACATAGGAGAAGAA-------AGGAAAG---GAAGAGAGCAGGAGA--GGAAATCCCCCAAAAAACGAGTACCGTTTGGACCAAAGATGCATTTGTAGTTTAAGTCCT-------AGGCATGTATATAT---ATATGTATA-GAGTTAAGCACCCGAGGA------------AGATTCGCTTT------------------TAGTATGTCCAGCAGAGGAAGGCAACTAAAACAAATT----CAATCCAAGGATACAAAAGGAGTCTATATAGCTTAAGGCTTTAGTCGCGTAGCTAAAGCTAAACTAAGTCTAAGATCTTGGCACCTAACAAAGCCTAACACATAAGATAAATGTAGAAACCAAAAGATATTCTAATAATGCACTCACAAATATAAACAAAGAAAACCTGA----AA
>Acp26Ab 5892298 5892503|6466 chr2L 5892170 5892388 scaffold_5434 1087 1309 - 1148|130 249
ATATAATAACCCAAATAAAGTAT-------TTACCATATTATAATGGACATGGACTCTAAGAAGC-------------TTTTGAAATAAGA---------GTTCCGATATTTTCCAAAGC
ATACGGCTGCACAAATACATTATACCCCTTTTACCCATTTTTAATGGGTTCAGGCTTTAAAAAGGCGAACACAATCAGTCAATAAATAAAATCTTACCGTGTTGCG---TTTCCTGGAGC
>CG9021 5903359 5903580|6478 chr2L 5903198 5903409 scaffold_365 2100 2270 - 729|162 212
TCCAGACAAAAATCGTATAAATAGAATCCCTTAAATTTCATTGTAAGATCT
TCCAGATTTATTTCATGTACTTAAGTTCTGTTATATTTTCTTTTAGCTTCC
>CG9021 5903359 5903580|6479 chr2L 5903410 5904375 scaffold_2 5803176 5804132 + 15619|0 175
GTGACGAAAGTCTCTACAGTTTCTTCCTTTTCATTTG--TAGCTCATTAGATCGAACTATCTAGATACTTTTTACTTTTTTTTTAACTTAAAGCAAAGATTGAAATTCTAAAGAATAATTTCAAGTAACAGCTTCAAGCCTGTGATTAACTACTTTTTA---TTTCAAAGTATATT
GTGGCTGAGTTTGCGACGAATAATAGCCATCAATTTTGCTAGCTATTTATAAAATAATATTT---CTCATATCGATATCTTTTTCAATTAACGCAAATAATAAACTTTT-GTGAATA--TTCTGCTAGCAG------GTATTTGCCAAAATGCTCTTAAAATTTGCAAAACCTATT
>CG14000 5908906 5909047|6483 chr2L 5908327 5908968 scaffold_2 65323 65963 - 27567|609 671
AAGATACTATAGCAGTTTATAAATGAAACATACCTGTATGAGAGATACGTCTCCATTGGCCAA
AAGATACTTTTACA-TCTGAACTTCAAGCTAACCTGTATGAGCGAGACATCGCCATTGGCCAA
>CG9016 5922904 5923213|6490 chr2L 5922634 5923014 scaffold_2 80668 81051 - 1745|299 415
TCTACACTTACCATCTACACTTAC------CATCTACACTTACCATCTAGACTTACCATCTACACTTTCCACATACACTTTCCATTCACGCATAAATTACCAATATCCCCGACGAAC
TCTGCCCATAATATACAGACATATGTTGCTCATATACACCCATCGCCCCGAATGA--------GACTTATATATAGACGCTCAATCTTCCCGGAAAATTCC----TGCGCTGTGAAA
>CG9016 5922904 5923213|6491 chr2L 5923178 5924439 scaffold_2 82350 83738 - 15006|0 36
CACCAAAGAGT-TAGCGCTTCCCAGACCTGCAAATCG
CAATAAAGAGCATGACGCTTCCATATCCGGCAAATCG
>Vm26Aa 5959699 5959833|6525 chr2L 5959684 5960612 scaffold_2 131606 132482 - 27342|15 163
-CACCTGCTCC--GACTGCGACTGCGATCATCGCCCAAGGACCACGAACCGACTGCCGAGAAACATAAGCTTTGATGGATTTGACAAAAAATATACCCAAAA---ATATGTACTGCAATTAAAT---------CACTAAAAAAAAGCTA
CCATAAACCTCGAGACTTGAACTTGACACGGCTTCCAAAG------------CTGCCGGGAAACAAAAATCTTAGCTATGCTCACAGAAAATGTACAAAAAAAATATATGCATTA-AATTAAATGGACATTCCCATAAAAAAAAGGCCA
>chic 5972900 5973576|6540 chr2L 5972686 5974541 scaffold_2 157219 159164 - 24950|282 1005
GAGA------ATAGATCAACACAAACAC--CCCCATCAACCACAACAACAACAAC-ACACACACACCAACAACTACAACTACAACAACAACAGCAGCAACAAATTTGATAAGAGCGAACCGTAAATGAACT---------------AATAACACATAAAAAGTAATTATTAATATTTAAATTTATGGGAAAAGAAAAACCAACGGCCAAGAAAGAATTTGCGGTTTTTTGTGTGTAGCAG------------AGGAAATGGATCGA-GTAAAAATGCATATGCTTGAAAGAAAAAAAAAATGTCAAAAAACGCAAATAACTACCCAA-----CTACAAAAAAATTATAAATTTCTGCATTATTATATTTAAAACTTTTTGGTTTATACGATAAAAATAAAAGGAAAACACAAAACTATAAAACGCCCCAATCAATAGTTAAGAATTCAGTCCTCAGCTTTGAACGAAATTTACAAAAACAAAAAAATCATAAAAAAAAGAATAAAACAAAAAAAAATAAGAACATGTATTCGGCAACCTAAATTGTAAGCGAAAAGAACTGCAAATGCAACCAAACCAACCGAAAATCGAAAAATTAACAGATTAACAACCGAGAACAACAACGCAAAGCAACGCAGGCATTTTTTGGAACGATTTTTTTGTATAGCAATAT-TTACACA-ACCGATACA---GTTTATGTATACTCGTACATAAATCCACACG
AAAATAAAATATAAAACAACAACAATACAACACCATCAACAACAACAACAACAACAACAAACACACCAACAACAACA----------------CAGCAACAAATTCGATAAGA---AAGCGTAAATGAACTAAATAACTAAAAAAAAAAAAAACAAGAAAAGTAATTATTAATATTTAAATTTATGAGAAA------------TGCCAAGAAACATTTTGAGGTAATTGTGGTCAAATAAATCAGAAACTTCAGCAGAGAAACCAATGTCAAAAAAAAAATGCATTAAAACCAACAACAACAACAACAAC--AAAGTAATTACCCAAATGACCTACAACAAAATTATAAATTTCTGCATAATTATATTTAAACATTTTTGGTTCATACGATAAAAATAATAAAAAAAAAAA--------------------------------------------------AACAAAA---ACAAAAACAAAAAA-----CAAACAAAATCTTAAACTCAACATAAGAAAAAAACGTATTGGAAAGCAT--TTTGTAAGCAACAAG----------------------------------AAAATT---------------------AACAACGCAAAGCAACGCAGGCAAATTTTTGAA-AACTTTTTTGTACAGCAATCTAGTACATATATATATACATACATATATATATATATATATATATATATATACA
>lid 5990441 5990641|6557 chr2L 5989502 5990558 scaffold_2 174639 175922 - 19747|1200 1351
CGTCTACCGGTATTTACTAAGTTT---------------------------------AGTAAAGTCACTTGAGAGTTTT-TGTAGTACATATTTACCAATTATCGCTATATTTACGCATTAACAACGTAAAACACATTTGAAAGAAAACGTC
CGTTAAACGGTATTTACTAAGTTTTAGTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAAAAAGTCACTTAAACGTTTTGTGTAGTACATATTTACTAATTATTGCTATTATAACGCA------------AACGTATTTCAAAATGCAAATA
>lid 5990441 5990641|6558 chr2L 5990559 5993393 scaffold_2 176090 179044 - 121575|0 82
AGTAACGTATATAGAGTCCAGGAGGTGCAGTAACAGCCGATTGTGTTTTACGCATGATGTACTACTAAATACCCGATAAAGGC
A-----------------------CTGCAGAAAATGTGGATTGGATCGCAAGCAAAACCAACAACAACAACAACAACAAGAAC
>Gal 6003574 6003761|6567 chr2L 6002208 6005859 scaffold_2 190244 193898 - 86765|1587 1826
TGAGCCTTGTATGCATTGTTATTCC-----------------GTATTTCT---------TTATTAGAAGC-GTTTTTGATTGATACTTGTGTCAACAACCTTCGTTAAGCTTTATTATAAATT--TTCTAACTCTTATAAATCTATGTTTATATAC---GCCTTAATAAATGCTGTTGATCT----------GTGCTTGACTGACTCTT------ATCGATCTCCAGCTT----ATTTTC
AGAATC---CAGGCGTTGTTTTTTTTTTATTATAATTTACAAGCGTTTCTTTATTCGTATTATTAGAAGCAGTTATTGATTGACCA------CAACAACCTT-GTCAAGCTATAATATTTGCTAATCTTAGCTGTTAT-----TATTACAATAAACATTGCTTAATTAATTACATTTTATTTTATTTAGCTCGTTATCAATTGACTTTTTCGGTAAACGCTATAAAACTTGAGAAATTTC
>CG9098 6007357 6007907|6570 chr2L 6006525 6008580 scaffold_2 194764 197073 - 32116|1018 1737
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ACTCTACAACAACGATATTATATGGACTCTAGTGTGTAGGCTGATAACACTTAACACAATCAAAAATTTATACTTCTAAGTCCTTGTACTAGTCCTTTAGTCCTTCTATATCCCAGCTCTCCCACAATTTCGCTCTAACCCACTGT-------AATTTCGTGCTGTTTCTACCTCAGCCAATGTGTGTATAATTTTATACAAAAGCAAAATAGAAGCACTTT-TGTTACAGTTCAAATAATTTATAAAAATAACAAAATGAAAACATATTTAAAATTTAGTTAAGCCAAGGAAACTAATTAGTATTGTTAAAACACTCCTTCAATTAACAATAACAATAACAATTTCAAGCTGGACGTAATCAAAATGTATTAACAACTAAATATAGTCATATGTTGATTCTCTGAGAGAGTTGGCATTATCCAATATATTGAAGCACACTACCAAAGGCATTTATAGTCTAGTACTTAACA-------CATATATTCAACTAAATAAAGTATTATACATACTATAGATTCGACAATATACACTTAATCAA---------------ACGCATCTTTGTACGCGCATAAACACACATATATATAAATTGAAACAAGTGTAAACCACTTACTGATGATATAATATAATTTTTTGCAATTTTATAAGTGATAGTGCGGTAAACTATAATAAAGAAAATAAAGGAAACGTTTGAACCACTTCGAAATACATAAA
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AGCCGCCTAT-------GTAGATAGCTCCGTTTACACGTGTAAAATGCCATGTAG----ATGTATTTATTCCTTCATTGCT------AGTTGTAATGTAATGTAAAGTAGACAGATACTGCACAAAGT-----------GAACTTAAATTATTTCAATCTGTAAGATAATCTAAACGTT-TATGTGTA--AACTATTTAAAATAAATTCTCTAGTAAAATGAACTTGTG
AATCGTATATTGATTAGTTATATAGTTTGTTGTTCACGTTCAAATTTAGATTTAGCATAAGATATATAGACGTCTATTTTTTGGGTAAGTCATTAAGCAGCGTATTTAATTTATATAAAACACGAATTTTATTTATTGAAAACTTAAAAAATT---ATATTTAATGAATAATAAATGTTATATGTACAACAATTATTTGCTGCAAATATTTTTTTATGAACTGCTCGCG
>CG9107 6023370 6023608|6590 chr2L 6023148 6023609 scaffold_2 218853 219356 - 12680|245 523
TCCGTACGCATAGGTTAAGCATCGAATAAAA-----CTTCTTTATGACACCAGAACGACCCCGAATGCAAGATCCA----GGATCCAACGGTCCGACCGCAGAT--AAATCCTCATAAATTCGCCGATGCCATTGACACT--GCCGCGACCGAATCCTGACCAACGCCACGACCAAATCCCACAGCAATGCCATAACTTATC----CCGACCGCAGT----------------GAGGGGCATAAAAGCTTATAAAAAGCGAGCAACAAA-------AAA
TGTGCAAGCAAAGGTGAAAAGTTGAAATAAATGTTGCATGTTTGTGTTC----GGCGAATTTGTGCGCAGAGTCGAATATGAGTTGCATGACACGACCGCTGGCCAAAATCCTCATAAATTT----ATGGCATTGACACTTTGCCACGACTAAATCCTGGCC--TGGCCTGCCATAATTTCATGGCAATGCCATAACTTATATAAGCCAGCCGCAGTTGTGCGCGGACCCGGAGGTGGCCATAAAAGCGCATAAAAAGCAAACAAAAAGCCCGAAGAAA
>CG9109 6025863 6025950|6593 chr2L 6025396 6026452 scaffold_2 221634 222631 - 935|531 627
TTTAATGACTAGACACATCCAATGCAGTGCGGCACACTTAAAATTTATTTGTAAAAATTCTTGAAAAT---------TAAAGAGAAATATAAAAAAA
------------------------CAGCGCATAATATT--AATGCTGTTTGTAAAAATT-TTGAAATTATGCGCACGTACAGCAAAAAGTTACACAA
>CG9109 6031284 6031303|6601 chr2L 6031055 6032564 scaffold_2 231153 232805 - 30161|346 374
GCCGCTCTGAGGTGAG---------TGGG
TTTCAGATCAGGTGAGAATATTAACTGAA
>myotubularin 6034795 6034896|6606 chr2L 6034861 6036811 scaffold_2 238079 240067 - 119317|0 45
TAGTATTGCTT----------TTTTATTCCCCCTACTTGTACGCAT
TAGTATTTTGTTTAATGTTTATTTTCCTGCTCCAACTAGTTCCCAT
>ade2 6041178 6041313|6609 chr2L 6040921 6041313 scaffold_2 825044 825435 - 13489|258 399
ATATTCTAGATGAATTGAAAGC----AGTTAAAT-AGGTTCTTGGCATTTATGACCTGATATATCTAAATACTATATACACG-AATTTGTTTACTATTTTTATAAAATAAACTTAAACACTCAAACAACTTTAAAACTCAAA
AAACTTCTCTTAAATCGCAAACTATGATTTAAATCAAGCTTTATGTGACTAGTAATAGATAGTGATAAATA-TATACACGCGTCATTTGCTAATTACGACAAAAACATAAACAACAACATCGAAA--GCTAAGTAATTCAAA
>slmo 6046654 6047052|6612 chr2L 6046911 6048273 scaffold_2 833081 834643 - 42622|0 178
GTG----TCGACAAGGCGAC--AGTGCAAGGTCGCGCGGGGGCTGTTCA--CTAGTGAAT---TATT-----TAGATGGCGCGCGGTCG--------TCGTTTTAGTACAACTA-------------ATTAATCGATGGCACGATGGACATGGACAGCAACATGTGGGACAGCAACACC
ATGTATATAGAAAAGGCGGTTAGCTCCATGCGTATGTGGGGACTGTTGGGCGTAGTGAATAGGAATTTACCGTAGTAGGCGCAACGTCGGGTACGCTGCTTTGTAGTACAGCAACAACAACAACAATAACAAACAAACAAACGGT--ACATAGAT-GCAACAATTACAACAACAACAAC
>CG9140 6060835 6060936|6627 chr2L 6058754 6062748 scaffold_2 861246 865322 - 131512|2336 2438
GATACAAAGTTATAGCTAATTTTA-TTGATTTCATTAACCAGAGCGCGACTTGATGCCTATAAAGTGTATAGTTCTCTAAACGTTTCAATAAGCCTAATTTTT
TTAATAATGTTATAGCTAATTATATTTGATTTCATTTAACCGCGCGTCGTTT-ATGCAAATAAAGTGTAAAGTTCTCTAAAT-TACAAATAAATGTAA-TTAT
>CG9144 6063562 6063687|6629 chr2L 6063006 6069006 scaffold_2 865425 871457 - 164392|619 758
TGACTGCATACGATTTCAAATCCCCAAGTGGTTC----------TTACTGCCTAAAAACAC---CGTCTTTGTA-GATCTGAGTGCTTGCTAGTTGGTTCCATGTTGTTAACGTTTATAATTATATATATACATTCTACG
TGCCTGTGTACCTGTT--GCTGCCCAGTTGTTACAATCAACAATTTAGTCCATACATGCATATATGTATATGTATAATCTATATACTGCTCATTT-------TGGTGTTAGCTTTTA-------ATGAAAAGATGCAAAT
>CG9154 6069782 6069807|6630 chr2L 6069007 6070639 scaffold_2 873273 874924 - 44331|803 850
GCAATTG--------------CGTTGAGGGATAAATGCCA--------
GCATATGGTTGTTCGTATCATCGGGGACTGTTAAATGCCTTGAATGGT
>CG9175 6096695 6097167|6662 chr2L 6096466 6099185 scaffold_2 922586 925260 - 81169|238 722
TGCTCAATGGCCAGAAGAGAGTTATTCGATTTGCATTATTAGTTTGTAAACAGGGTTTAGTTTTCTGCAATAAGCCACAACTCCTCCCCCCCCCAGCACTCCCAGCGTCGTCCCACCCCTCCTCCATCATGTTAATTAGTTTAAGTGCATAG-------TTTGTGCCGGCTGCCTTATCTCTTATACTAATTGCAATGTTTGCTTAGTTGTATCATAATTTGTTTATCTCTCTAGCCACCGCAAACGAAGCCTTGCTCGTTTGGCAGCTTTGCCCGTTGTACATGATT--TTTAAAATTTAATTAATATTTCATTTATACAAAGGCAGACAGGAAAACTGACTGCGTCTAGTTGAAGCAGTCAAATGAATTGTAAAACCATTTTTATAATCAAAATGT---TAGCTAATCGAACTGTGGTGGGTTTAGCACACCATTCGTATAGTCACAAGTGAATGATATATAAAAATGCATTCAGTAATGAAA
TGCTCGACCGGCTAAA---------TCAATTTGCATTATTAGTTCATAAACAATGTTTAGTTT--TGTAATAGGCTACACTCTCCTACACCACCATCACCCACATGAACCTAGCTCCC------------ACTAATTATTTTAAGTGTATAGTTGTTTTTTTGTGTCGGCTGCCTTATCTCTTACACTCACCGTAGCTTTCGTT--ATTGTATCATAATT------TTGCTTCAATTATCTCAAA-------TTTATCGTT---CATAATTGTTATATGACAGTAATTAGCTTGCAATCGAATTGATATTTGATTATTATAA--------AAAAAAAATAATAGA----AATTAAGACAGGTGAATGAACTGCAGTTATATAGCAATAAATGGAATATACATAACGAA--AAACTGTGAATATTTACTTACAC------GTTAATACCTTATGTAAGGCA-ATAATAATGTTGCCGTTAAAAAAT
>CG9226 6125879 6125931|6706 chr2L 6125861 6127632 scaffold_2 1011664 1013487 - 46373|18 75
CATATAAAACTGGTGTAGTCGAGTAAATAATACAAAAT-----CCGTCTTTATTCTTG
TAAAAAAAAATAAC-TATTTAAATAAGAAATTCAAATTAAACCCAACATCTATTCTAC
>CG9227 6127866 6127910|6707 chr2L 6127669 6130021 scaffold_2 6761401 6763873 + 38199|232 276
AATAATGTTTGGACGTATGAGATTTTTAGAATAAAAACTAAAAAA
AAGGGTTCTGAGTTCTATTACAGACTTAGGATACATTTTATAAAA
>CG31639 6154644 6154698|6737 chr2L 6154154 6154911 scaffold_14 7371 8338 + 7810|613 742
GCTTCAGAAGGATATCAGAA------------ACGTGTGAGCCATTCCCCAAGAAATTT--AATA-------------------------------------------------------------CCAG
GCTTTGGAAAGAAATTAGGAGGAGCAACCGCTACGCCCGACACTTTTCGAAACAAGATCGGAATAGACGCCTATTTGTGTCCTGGGTTACAGGCTGTGCTCTGCGGAAAGGCAGCAAACCAACCAGCAAG
>Pez 6332876 6333292|6963 chr2L 6330718 6338415 scaffold_14 299103 307157 + 228857|2542 2986
GGTTCTAAAGAATATGGAAAACTTG-GCAAGAAGTATTTTTCTTTGTTTAAGCTTAA-ATTGTTTATATCGAACAAATTTCCTTTAGTTCTCGTTTTAAAAAATCAGTACAACTCCGTTCAGCAATTTTATATTTCTACTGGCAGCTGTTGTCCCTATAATCGTTAAATTTTAATACCA-----ACTAGTTTTTAAGCTCTAGATTTGTTATAAAAACAGAACCCCCCACAATGGCCACTTTATAGA-------TACATACATAAATATAAAAGTAGCGGATAGGTAGTTGTTTTGGCAAGCCAGTAAAAATGCCAGTTAACTAACCACAGCCACAACAATT--------------GGGCTTAGGTTTAAAGCCGAACTATTTATACATGTGTATTTTAATAAATTTCGAAATAAAAACAATAACAAATTGATAAAAAGCAATAA
----------AAACTGAATCACTTGCTCCAATAGTATTTCTC---ATTTAAGTCTAATCTTATGAATAGCGAGAGAG-------------------AAAAGAAAACGAACAAC------------TTTTGGGTAACCACAAAGACTTGGTTTC---ATATTCATTTCATGTAACAATAAGTAACACGATTTTTCCA-------ATATGTGGCAGCTATAAACCACCATACTATGATCATTTTGTCAAATTACTTTGTGATCCTAAATTTGTATGCTTAAGATTCAGAATTTGTT----------ACCAAAATTTAAGCGCTCCACCCAATGCAAAACAAATTTTGTATTAATCATAGTGCTTAGGTTTAAAGCCAAATTATTTATACATTCT--TTTTAATGAA---CCAATTGATATGCATAACGCA---ACGCAAAGCAATAA
>CG9497 6346542 6346673|6970 chr2L 6344107 6346618 scaffold_14 313872 316480 + 95744|2677 2753
TTTACAAATATGTATTTAATGATTTAACATTTCGTTCATTTGTAAATACAAATAATCTGGTTTAAAGTTTCAAAAAC
TTTACAGATAT------------TGCACATAT-----ATTTACACATTAAAATAAAGTT-TTTAAAGAATTACGCGC
>CG9497 6346542 6346673|6971 chr2L 6346673 6347395 scaffold_14 316531 317253 + 36122|0 0
A
A
>CG9498 6349393 6349558|6973 chr2L 6349359 6349554 scaffold_3 1676591 1676780 - 746|34 208
TGGCATGAGTATTATAATGGTTGGGGTTCTGTGATATAAATGGAGGCTC--TTCCAAGGCAC----ACATCCTTGATATAGCTATATTAGCTTTCGGCCTGAGAATGTAAATGTTTTGGATTGATTAAAGTACCAAACCTGACTTCAATGCA-------ATAAATCAAACTAACG
TGTCAAGGGT----TGCTGGATGCAGATCAGTAATTCGGGTTGGGATTCCGTTTTCAGTTTCTTGTACATTCTTCTTATAGCCAAATATCATTTATTTCATTTAACTTACATATC----ATTAATTTAGGGCACA---TTGACTTTAATACGTATACATATAAATTATATTTACG
>CG9498 6349393 6349558|6974 chr2L 6349555 6351425 scaffold_14 322529 324320 + 64947|0 3
AAAG
ACAG
>CG9511 6395853 6395887|7014 chr2L 6395782 6397336 scaffold_14 408248 409853 + 40971|74 108
GATGACATTTATAATAAAACCAAACTTTGCTACTT
GGATCAAGAAATTATAAAATAAATATACACCAATA
>Tig 6415257 6415435|7034 chr2L 6412966 6415459 scaffold_14 445364 448053 + 27188|2589 2798
AGGTCAAACCAATTAACTGCCATTCATCAACGGACTGTTGTTAGTCAGAACTAAAAAGTTACTACCCGAGAGGAAACTCTCAACTAATACAAATCTTAAT-----------------ATTTTCTACAAATCTTTCTTTAATCCTCTTAGTTTAAGACACAAATAAA--------------TGACATTTACTGTGCAGCGAAAATAGTGAA
AACTCGATTC-------TGCCAT------AAAGACTTAAGTGCATCAAAACCAACCGAAACGAGCCCAAAAAAAAAAAAAAAACAAAAACAAAAACGAATCACAAATGTGGATATACATTTTCTACAAACGTTTCTTTAATCAGTTTAGTTTAGTCTTTAAAGGAAAAGATTTTTGCCGGTGACAGTTGAACCGCAACCACTACTAAATA
>CG9527 6445070 6445118|7040 chr2L 6445066 6446701 scaffold_14 461446 463036 + 71309|4 60
ACTCACTGTAAAATCCCA--------AATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGT
AATTGCAAAAGAACCTTAAGGAAACCAAAAACAAGTCTTAAATCATTATATTCTCTT
>CG9528 6448801 6449851|7044 chr2L 6448778 6449162 scaffold_14 465504 465804 + 635|23 393
GTCAGATTATAATTATAAATGTAAAAT-TGTATTTTAAACATTCGAATGCAGAACGTTTTTGATTGCACACTAATTACCCCGTCATTTGTACGCCCTTAATTGCTAATATCAATCAATCTCCAAAGTGTTTTTAAAATCAA------AAAAGGCAACTTCAGTGTGTTTTTTTGGTTATTATTTATTGTATTAAAAACGAATTACTATGCGGATGTTTACAAT--TTAGTTTTATAAATAATCTGACGTGTATTGTAAGAATAAACTGACAAGCCAATAACGAAGGAAAAATGAGTGCATGTTAACTAAGTGTGTAAGTTGTATTAAGAACGTAATCAAATAAATGCTATTAGATCAATTACATGTACATA
TCGGGGTCTAAAACGTAAAAGAAAAATATACATTTTTAGC---CTATTGCTATAATTTTTTAAT---AAACGA------TCATCATAAGTAC-------------AATATCATTAAAATTCCGTTTAGACTACGAAATTAATGCTGCAAAAAGAAG------------TTAGCGATAAACATTTAAAGT----------------TAAGCGCATATTAATGATAATCAACAATATAAACAATATATAGAATTTTATTTAAATA----GCCAAGCGAATGCCG-------------TGCATGTTACCTAATTGTGTAAGTTGAAATAAAAATG-----------------------CAAGTACATGTATATG
>CG9528 6448801 6449851|7045 chr2L 6449270 6450188 scaffold_14 465805 466842 + 28557|0 730
TATGAGAAAGCCGGGGATGGCGGAACGAAC-----GGCGCCGAATGGAGATCCCCGGCATTGGAGGAGCCCA----TAGCGGCGGAC------ATTCTCACGGGCACCCTGATGGAGAAGAGCCTGAATCTATTTGAAACGCCGGACGTATTCTTTTAAGACCG-AAAGTGGTAATATCTTGTGTTTTAGTTGTCTTTAGTTGTTTAGCAGAATG-TTAGTTTGATTTTAAATTGTAT------TTAGCTCAAATAGGCCATTTA--------------TTTCCTTTTAAATTTATTATAT-TCATTCAATATATACAAGCATTCATAT-------------------------------TATTGATAATCTTAAGAA------------------------AATTAGAA------------ATATCAGCGGTTTAAATGAGCAACACCAAAATATCACGCA------ACGTTTTATTTGAATCGTCAATTTGAAT-TTTTCGTAAGCAGCTCTATAAATGAAGTTTTAATGCG---------TACATATATATGTAAAAGCGACGTAATTTTTATAGCT--------TTTTCTAATGGAACATTTTTTAGCAACAAT----------TAAGGAACTTATTGCG---ATTGCGCA-----GCCACTGAAACGAAAATAGAAAAAATTGAAATTG--TAATCAATAACTACGTGTTACCTAATTAGTTTAAT
TATGAGTCGAATGCGCATAGTGGCGTTGACTCTCAGGC----AACAACGTCGCCCGGCGCGCGGGGCGTCCAGGAGGAGCAGGGGATTTGGGACTATTGTCGGGCACACTGAT-GAGAAGAGTTTGAATCTATTTGACACGCCGGATATATTTTTTTAGGCCCATAAATTTGCAATCTCTTTTAGTTTA-------------ATTTAGCAAAAAGTTTAGTTTGGTTTT-AATTGTATTTCGTATTAGCACAATTTTGCCGTTTAATTGTTTTGTCTATTTATCTGTTTATTTTATAGTATATCAATCAATATACATATATATATATATATATATATATATATACATATATACATATATATATATATATTTGTAACAATGTGAAGCCAAAACGAAATTTGTGAATTAGGACTTTTTACATACATATATACGGTTGTATCAGATGATTC--AAATATCACGTACTTTTCACATTCATTTGAAAACGTCAATTAGTCCATTTTAGCAAGTACATAAATTATAGATGCTTTAATACAACACACACTTATAAATGAATACAAAAGCAACGTAATATTTGTAGCGCAGCTAAATTTTTTAAT---AATTTTTTTAATAATAGTATCAACAAAATAACGAAATTATGCCACACGTTGTGCGCCTTTGACGCTAGAGCAAAAATTATGAGATTTACAAATATCTAATCAATGACTACATGTTACCTAATTAGTTTAAT
>CG16947 6459079 6459527|7057 chr2L 6458793 6460011 scaffold_2 4783694 4784896 + 33463|306 797
TATCCACCCGATTCAAACCACAGC---------ATCAGCATCCGCATCTATATTCGCATCAGCAACAGGAAA--CCTCTTGCCATGCTACCCACACATCTGAGGACACTGATTTGTTAGCTCAAGACAACACAACTGAAATCGAAACGCATTGAATTTAGATCAAATTCGAGCTGGTATCGAATATTAACCA--------TACAAA----CAAACATAAACAAAAGGCT---------CCCTAAATGATTTAAATATTGGTCTGGTCCCCTTAAGATTTAAAAATATCAATTAGTTTTTATGGAAATAGTTAGTTTCAATCGTA-----ATAGGCATT--TAAAAAACATTTTACCCTAATTGAGTTTTTAAATCTCCAGAGGATTTCAACGCACCAATATTTTGTACACAACACACATTGTTAAATTTAAATTTTCACTCGAATT--TCAAGTATTCTATTTTGCAAAAATTATTTTGTGTAAATCTC--G
----CGCTCGCTTACGCCCGCGCCTCTGTGGTATTTGGCAGACACAAGCATAACCTA--CCGCAACAGGAAATCTCTCTTGCCATGCT----CCACATTTGAAGAAACTAAATTT-------------ATGAAACTGAAATCGAAACGCATTGAATTTAGACCAAATTCGAGCTGGTATCGAATATAAATTAAAAACAATTACAAAATCCTTAATCTAAATATAGAGCTAATGGAGACCATCAATTGGCTTAAGTATTCTTTT------CTTTAGATAATTACATA-CAACAAGTCGACATAAAATTATTCGCATTCAGTAGAACAAATCGAAGCACTAACAATAATCTTTCCACTCGAATTTTATTAT--AATTGCTTGTATTATTCATA----------TCTATATACATCTCGAATTTTTCCTTTT---TTTCAAAGTGCATTGCTCAATCAATCTCAATACCAGCATTTTTTTTGTATAAATCTTTAG
>CG9531 6466217 6466523|7063 chr2L 6466017 6466770 scaffold_14 1417551 1418242 + 14673|212 538
GCGA-----GATTGCGCCATAGACAGGACGGAATGCTATGACTTTGA-CAATGCAATTAGCTATAACGTTGCCCATGCATTTAGCTGTGATTTGATTTAAGACCAGACATACCTGCACGCTGCCC-AGAGACTCACAC---CTATATAAACAGAATATATAGCGCTATTAATCCTTAAGTTTCGTCTCTGAATCTTTTAGCAACAACCGCAGGCGGTATTACTTCACAAATATACCTGTATAAATTGCACAATGCAATTAGCTGTTTGATTTATGACCATATTATTA----------TCAGTATACAAAAACCACAACGACTTTTAC
GCGACGACGACTTGGGCCTCCATTTAAACTAGCTCATTTGGACATGATTAATGCAATTAGAATTA--GTCGCAAATGCATCTATCTGTGATTT------------GACCTACATACAAGCTGCCTGAGAGGCTGAGATATACCATATATATAT-ATATATAG----ATAAACATTTGTGT-------------------------------------------------ATATATATAGATAATTTATGGATTGCATTGAGCATTTCGCTTCTGGCGCATGCAAACAAAGACGCATTTCAGAGTACGAAAACAATAGGCATTTCGAA
>CG9535 6468538 6468844|7068 chr2L 6468459 6469973 scaffold_7 4467009 4468509 + 70396|79 421
GATGTAGGGGATCT----------------GCATGGACGCATAGACTGATGGACGGATAGTAGTCGTTTCGATTATTTGTAAATCTTTCGTATACCGTTGATGAACTTTATGATTCCCCAAACTGTAGTTAGTGCACGGAAATTCCATTGATTTCAGTACTTAAAGGAGACT--TGTAAAAATTT-GTTACCTATTGTGTCCGTTGATTTATTTTTCGTTTTTGAAATA-----------ATTGTGCAATCGTAATGTGAATATATACA-----ATATATAGAACATGTAATGATATGAATA-TTTTAATATGTTGTAAAATACAAAAATTATTAGTACGGCC
ACCCAAGTACCCCTCCCCCTCCTCTCACACACACACAAACATACACATATGTACATATAG--------------ACTGATAAATGT---GGATAGTTTCTGTTAAAAATTTGGTTCAGCTAGGTCAA---AGAGCACGAAAATTCCATAGTTTTCAGTACTTAAGAGCAACTACTCTATAAATTTGGTTGTCCTTCTTTTTCATTTTTGTTCTTGTCTTTGTTTATATACTTTTCCATTGATTGTGCAATCATAATGTGAATATACCTATATCTAAAAAGAAAATATACAAT-ATATGCATATTTTTAATATA-TATTAAATACAA--------------TTT
>CG9536 6474434 6474798|7072 chr2L 6473734 6475855 scaffold_7 4472934 4474811 + 39656|742 1171
ACAGTGATTCTATGCATATATTAATGAATTTTT--GATATTTAAACGAATGATCTAATGATTTACGCCCATGTTTTGTATGATTCTGCATCAAGTACGTACCCCCCATCAGTGTTC----CCATTTTGT---AATTACCGTTCGTGT--GTTTCGTAGTGTCCTGTAGACTTACGCTTGCTTGCTGCGCACACCGCCGGCCATGCTGCTAGGAGCGGCGGAGTAATATGAGATCAGCCTAAACCAATACCTTCCGGGCGTTATGAAAATACTAGAGCCCTTACATAGATG----------------------------------------------CATACTTTCTGTTGTAGTCCTTACATGTAATTGAAAA---TGATGCTTTATTTAGTTAATA-----ACTGTAAATATATTTAAAACTCCGAAAA
ACAGT--TTATATTTTAACATAAATGAATTTTTTGGATATTGA----AATGATCT----GCTTATGATTAT-TTTTGTATGA--CTGTAACAAGTGCG--CTCCTTAATTGTATTTAACGTTATTTTGCTTAAATTAACATACATGTAGATTTCTAATTGCCAGCTTGGCTTAGCCTTTC--------CCCACTG-AGGCAACGCCCCTGAAAGCGCAAGAG---------------------------------------------------GAGACCTTCCATCAATGTAGCGCCTATTGTAGTACCTACATTCGTGCATATATATAATACAAGCAAAATTTCTGTTGTAGTGTTTACATGTATTGAGAAAAACCAATGCTTTATTTAGTTTATAACATTACTGTAAATATATTTAAAAGCCCAAAAA
>Sec61alpha 6477178 6477633|7074 chr2L 6476907 6481084 scaffold_7 4475774 4480012 + 120343|302 837
GCAGT-------CAAGAAGATCACCTGCGATCCAATCAGCAACAACT----AATACTTCATCATACTTCCCATACGCTCGCTCCCATTAAAACAA------------------------ACTTAATAACCTGCTTTGTTTTTTTCGTCGTCTGTCAAAACAACCACAGTAAGCGTAAATTGTAAGGCCTTTGGCTGCTATTTTTCATCTTCCCAACCAATAGA---AGCGTACATAAAAGCGGATGAGAGACCCTTTATTTTGAATAGTTT------TTAGTTGTATTCAA-----------ATGTGAGACTACATTGCTTGAGTTCAATATTTCTGCGAATTGATTGAATTTCAATGCAATTACTTGTTTTAATATTAAATCAATTGAATTATACTTTAAATACAACGTGAAATGGAGACATTGAAATTATTAAA-GCGAAGA------TGTACATCAAACGAAC--------------ACATGCATACAAATTGTC---ATAATAAAACGTAAATTAGAT-AACTTTTTTAAAT
GCAGTTCAAATCCAAACTTTCAACATGAAATTATAACAATAACAGCTAACAAATACTTCATCATACTTCTCACATGTCAGCTCGCTTTGCCCCTGCCCCGCCCCGACCTCCTCGCGTCTACCTATTAAGCAAATTAACGTTTTTGTATGGTTTTTAAATT--CCACGATAGGGCCTAATTTTAAGGCTATTTGCTGCCGTATTTAGCTGGCCTGGGCAAAAAATATTGTTTGTGTTAAATGCGACAAGAA---CTTTAGTTTGAATAGTTTTATTAGTTTGTATCATTAAAAAAAAAAAAATATGTGAGACTTTATTGCTTAAGTTCAATATTTCGCTGAATTGATTGAATTTCAATGCAATCCATTGTTTTAAAG-------GAGTGTAATATAATT---ATAGAACATCGATTACACG---TGGAATTATTAAACACGATGAATAATGAGTACATGAAACGAACATTAAAATCACGCAACATGCATACAAATTGTCATTATAATAAAACGTAAATTAGATAAACTTTTTTAATT
>CG9542 6487562 6487596|7082 chr2L 6487581 6488619 scaffold_7 4485241 4486270 + 28135|0 15
ACTAGGCGCAGTTTCG
GCTGCAGGCTACTCCG
>CG9548 6490151 6490215|7084 chr2L 6489126 6491517 scaffold_7 4486499 4488914 + 83676|1038 1109
TCTGCT-----CTCCGCTACCTCAATACATTTCTAATAAATTTTTATTGTAGTTTAATACATGAACAAA--A
CGTACTGAAGACTACCTTATCTATATATATATCTTATAAATTTGTAATGTAATTTAATGCATATACATATAA
>CG9547 6492972 6493060|7086 chr2L 6492379 6493967 scaffold_7 4490182 4491849 + 74303|617 761
TGTACTTGTTTC-------------------GAAAATCATAAAGTACTGCATTTACCAATTTGTTTTATGTCGA-------------------AGTGTCAATGTGAAT---------------AAATG---TTAATCAAACCGAA
TATCTATGTTTCTAGTTTATAAATTAAGCTAGGCAAACAAAATAAAAAGCAATATTCAATTCGTTTCTAGCCAAGAGATGTTAACACTTTCCTAGTATTAAATCGAATTTTATATTAAAGACAAAACGGCTGCAACCAAAACAAA
>eya 6527449 6528009|7123 chr2L 6525617 6527600 scaffold_7 4534306 4536484 + 37142|2152 2318
AATTATAATGAGTATAAATAATTCGACAAAGCCGTAGTATTCAAATTTTAAATAACTATTATATAGCTGCATATATTAAACTAT-----ATTTAAAATATAAAACCAAGTAATAAAAGAGCAAA----------TCCAACAGCAACGCACTCTATTAAAGCATAAGC
AATTTTGAAGAATATGGACATTTTAA-AAGATTTTATAACTTAGATTAAGAAAATTGCTCAAGTCACTG---ATATTAAAATATCAATAATTACAAACATAACAATAATAATTAAACAAATTAAAATGTTAATGTTAAACACTAACTAACTTACACGAATAACAAGC
>eya 6527449 6528009|7124 chr2L 6527602 6528520 scaffold_14 1933140 1934263 + 39039|0 643
AAG----------------------GCCAAACTGTAAGGGATT------------CGAAGCGGTTTTGAGTACAAACAGC------------------------------------------------------AAAATGTTTAATTAATTTATTAAAATATGTATGTGTGTGTGTGCGTGTGAGACAAGCAACAAATGAAAACTGTAAACCAGCGCAAAATAATTTAATTATTTTGTT---TAAACATTTATCATTTAACGCCAAGACTTT--TTGTATTATATAGTTTTTAA--ACACCTAATCAACGATCGTAACAATTCTCGCAC----------------GAAGTTGTTCAAGTGTATAATTAACAA----GTAAATAAAT------------------------------------TAACGATATACATACATACGTACGTATTTAGCACCCTAGAGTAG-CAAATAATA-----------------------ACAGACCGATACGCATC----------------------------CTGGCTGGAGAAG---------------------CGGAGCAAACACAACAAAAAT----------TAGTTTAAAG--TTCTTAGTTTAAAAGCCGAAGCA
AAGGCTTATGGCGTTCAGAAACGCTGCCAAATCGCTAGCGTTTTCTGTGCGTTTCTCGTGCAGTTTTGAGTACAAAAAAAAAAGAAAAAAAAAAAAACGAGATGAAAAGGAAGAAAAAAAAAACAAAATAAAAGAAAATGGGAAAGTACTTTA-------ATTTATTTATGTATATGTGTGTGAGAC------------AAAACTGTAAACCAGCGCAAAATAATTTAATTATTTTGTTAACAAACCAATTATTCATTAATGCCAAGACTTTTATTGTATTATATAGTTTTTTCTTAAATTTAATCAA----CACAACAATTTTCGAGCAGCGAGCGGCAATTGGGAAATTGTTTAATTCTATAACTAAATGTATTGTAAATTAATGACTAACTTTGTCCAGACGACAAAATACCCTATAAATAACTATATATATATATATATACGTATCTAGCACATTAGAGTAGATAAACAATAGAATGGCAGAAAAAAATAGAAGGAGAGAGCGAGAGAGAGCGAGAAAGAGAGAGAGAGAGAGCGGAGCAATGGCAAAAGATGAGAAAATGAAAGAGCAAAAACCGGAGCAACCACAACAAAAATAAATAAAACGTAGTTTAATGGTTTTTTAGTTTACAAATCAAAGAA
>CG9596 6560128 6560172|7174 chr2L 6560110 6560159 scaffold_14 1977584 1977629 + 2327|18 49
AACAAATACATGTAAGCCTTTGTTTTGATAAT
AATAAATAGATGTCCAATTTTG----GATAAT
>CG9596 6560128 6560172|7175 chr2L 6560171 6560572 scaffold_14 1978075 1978491 + 18166|0 1
TT
CT
>CG11319 6568390 6568865|7184 chr2L 6567744 6569451 scaffold_14 1988561 1990450 + 30194|740 1310
CCTTACCGTAAACTAAATGGGAAATTCTAAGAACGAGCATAGTAGT--AACTCAATAAC-------------TCCTAGAGAGCTCAAATG------GCCAATGGGCAGATATGGA--------AATCTATCCTAA-------CCAACGAAATCGAATACAAGTTGTTAGTTATGTTGTTTAATGTAAATAAGCTTTAAGGTGGCTAGCTCAATTCAATT---ACTTTGTTTACTCCTTTCGTTAATGAG-TGTTTGGAAATTAATTACTTAAGCCGAATTACTTACTTAAGCGAAAACAAAACCTTTGTGATCCAACAAGTTTCTTCTCTTCCATGAAGC--------------------AAAACCAAACTAACCAAT-----ATAATAAT--ATGAATTTAAAATTAAT--------ATGTAATTACATTGACTTAATTAGCTGAGACGTTCAATAATTTCGCCTGGCATTTAGTAATGGAAATCGTGAAAAGCGGAAATACCTAAAA------TATATATG-------------AAAGCATGAA-GCCAAAAAGCAAACTGAAAAGCAA
CCTTA----AAACGAAACAAAACAAAACAAAAACAAAAACAAAAATGAAAAACAAGAACAAAACATTGAAAATGAGCGTGAACTAAAATGCGAAACTCTATTTGTAGGGTCTCGATTGTTTCAAATTAAGCCTAAGCATAAACCAACGAAAAACTATGGCACTTGTTAGTTATGTT---TAATGTAAATAAGCTTTAAAACGGTTACTTAACTTTTACTCATACTTGATTTA----TTTTGTTATTAGGACGTTTGACAAAAACCTACTTA-----------------------------------TGTGATCCAACAA-TTTCTTCTCTTCCATGAAGCTACAAACAAAAAAAGAAAAAAAAAAGAAAAAAACAAATGAAAAACAATTATTAACGAAATTAATATAAATTACCAATTATGTAAT-ACATTGACTTAATTAGCTGAGAGGTTAAATAATTTCGCCAGGCATTTAGCAA----ACTCAAAAAAAAAGAAAAAATCCAAAAGGAATATATATATACATACAATAAACCAAAGCATGAAAGCCAAGAATAATAATAAAAAATAA
>CG11319 6572196 6572485|7187 chr2L 6572035 6572272 scaffold_14 1993171 1993362 + 4559|172 248
TAAATGGCATTTTGTGTAAAATTAATAAGCAAAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCGAAATGCGAAATGCGAAATGCCAA
TAAATTGCGCTTTGTACAAAAT-AATAAGCAAC----------------------------AAAT---AAATGCTAA
>CG11319 6572196 6572485|7188 chr2L 6572273 6574097 scaffold_14 1993535 1995264 + 16086|0 248
ACTTAAATTAT----------GGCAGCAGAAAA---------TTCTGATAACAAAAGTATGGAACACAACAAACTTCAACCGGAACGTGCGAACGAAATGTTTTTCTGTAAATTGCATTCAATGTGATTTATCATGAACACACCCACGACACTCACATACACAG-----CAAGCGGCTA-AATGGCAACTCAAATAGCCAAACGGCGGCGGCGAC-----------GGCAAAAAAAGCAACAACTAAGT
A-TTGCAGCATCAACAGCATAAGCAGCAGAATAAAAATTTTTTTTTGATTACAGCAGTGCGAA--GCAATAAAC-GAAACCGAAAAGTGCGAGAAAGGCGTGTTAAAAGAAAG--------------------ACACACACACACAC-ACACACACACACACAGTTGTACACACTGCAGTATTTGCAGTAAATATCGATATGCGATTCCATTGACAATTTTCGAAAGGTAAATATATCGATAAATAATT
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GGAGATAA--TAACCATCGAACTGAAA---------------------CTTATAATTATAATGATCCAGCCAGCCATTTGGCTCATATTGTGGCTCATCATAAGCTGGCTAGCATTTTTA---------TTCGATTAGCTATGAACCTAA-GAAGTATTTTAACTTTACC-----------------AATGCGAATCTTATAAAAGATTCAGCTCATAATGCCACTTA------------------------AGATATTACGTA-----------------AGCTTATCACAATATCATTTGCACTTAAAACAACAATAAAA----GCTATCTGTGTAGATTTAGAA-AAGTGAA
GTAGTTAAGGTATCCAAAGAAACGGAAGAACTTTAAGATCAATGTTATCTTTGAATTTTAAACA-CGAATTAACTCTATGAGACTTATTAAACAACATTTTAAGAAGAACCG-ATTTTTAACAAAATATTTCAATAAATTATCAAATGAATGAAATATTAAAATTGTTCTGCATTTTTGTAAATTTGAAGCCTAAACTTAAAGGAAATTAAGAAAAAATCGCTCCTTACTTTTTAAAGACCTGCTCGCTTGTGGATAGCACATATCCACGAGATTACTTTGAAAATAACTCAATCTTTATATCTGTGAAAACAACGATAAAAATATGGTATTGGTACACATTCTGAAGAAGGTAA
>CG31635 6635545 6635647|7272 chr2L 6635478 6637253 scaffold_6 285757 287679 + 39841|67 169
TTGTTTTTTATGTAATTTATATGTATATACAAAGGGGATAATTCTAGTCATAAAGGAACCATAATATTTGAAGAATTCTCTATAAATGTTCCATTTTAATAAT
TCAAAAGTCAT-TAATTT-TTTCTCAATTCTAAACTGAT--TCCCAGCTGAAATCGGATTGT-ATGTAGGAAATATTATGTAATTGTGATCCGTTTCCGTGCT
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AATAGTTGAAGCTAGAAAGTTT------------TTTAAATGT------ATTGTTTTATTATAGAAATACTTGTTAAATTTTATATAGATCAGCCGCTGTTTTTTGACAAAACAAAAAAAAGAAGGAAT-AATATAGCATAGGTAAAAAAGAAC
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AGATT------GGATTTAATAAAACATATGCTGTCGA----TTTGCA
ATATTTGAAAAGAATTTAAACAAACAATTTCTGTGGAATTTTTTGCC
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TTTC----GCTCGAGG
TTCCTAGAGCTAGAGG
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ACAT----AACGATTTGATTCTAGAGTAACACAATCAATAAACACAAAAACTATA
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AAAGTTAGAAAACTATTTGTTGGCTTGGTTTTTGTGTTTTTATTTTTAT-TTCAAATTTGTAAACATACGTGTACTTATCAGTTAATCATTCATTTTTCCAATTCATTTCATAAATCTTCCACTAAAATTCCATGGTTCTTCAACTTAAAGCGTATTTTGTTATTTTTTTTTGTTGTTTAACAATATTATCCACCGATCGTAAAAATTGCAAAAGACAAATGTTGTATGCTAGTAAAAAAAAAGGCAATATGATGATAATCT-AATGCAAATTGAAGATA
>CG11329 6676729 6676840|7308 chr2L 6676706 6677570 scaffold_6 352100 353016 + 20124|36 176
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TCACAGATAGAGTATGTATTTTTTTAAAATTTAAAATAATACTCATTTTTAAATACTAAGATCAACTGCCTGCCATTTCCAAACAATTGTTATCTAATAAAATTTAATAAATAATATATAGATATGCTGTGGAAGGAGAAA
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GTTACAGCCGAACATGGAAATGTTCATATCTAAGTTGA-------TTTGTTGCTACATACATATTTATGCAATTGGTCTCATTTCAAGTGAACAAATTTAATGC-GTACAAATTAGATTTTTATTTTGGAATCTTTTGTTTGTTTTAGTTCTTAAGACATTGTGATTTGG-ATTCTAGTTAT------CAGTCAATGAGTTAGTTTAATGATCTTTTTGTT------------AAAAGTTA-AATATTGATTCTTGCTTTTAAG-------------GTGTTTTTTTTTTTAATA----AATTTACATAATTGTTTATATTATTTAATTATCTAGAATAATTATTTTTCTTTTTTTCCATGAAGGGATATATAAATAATTTTACCCTAAGCTGTAATTA-ACATGGAAACACAAAAATCTGAAAATGTGTAAAATTTTAATA-TTAAATAAAATACTCATAGCTTTATTATATTCCCCTTTTTCTTTTTATTTGAAACCGCTGCTACATTTTATTGCCACCGAAAATCGAATATATATATATATATATATACATTTTAAAAATTATTAAACTGTTCTTCAAAATCGTACCAAAACACAAATGTTTAGATGGAAATCCTGGAGCATGTTCAAAGTCCGGTATCGACGAGAATCAGGCTATTAGGATTTTATGGCAAGAAGTTATAGG----AACTATAGAAAAACTATAGAACTATTAAGAAGAACCCCTTCAATTTTGATTTTTTTTTACGGTAGTCTTACATTTCTTTTGACATACTATTAACACATAGAGAATGCTTTCAAAATTGCCGAACAATAATTAGTGTAAATAAATATATTTTAAACAGCTTTAG--ATATGTATTTGCGTTTTCAAATTATACAAAATTTTGCAAAAC--ATTTACATATATATTTTGTTCATGTATATTAATGTGTGATTCGCGGTGTTTGCACGATAAAAATACACAAATGTAAGAATATTCGGTTTTAATATTCAATATTCTGTCTATTAAACACTATTAAAACATACTTGATTTTAATTAAAGAAAAACTCTTATAGACATTGAAAATATTAATTGTTGTGCTATGAATTTGTAAGTTTCAAATCAATAAAACCA---
>Nhe3 6678912 6679193|7309 chr2L 6677797 6680807 scaffold_6 353417 356943 + 41398|1331 1767
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TCTCGAAAACGAAACGTATTTATTAACCTTTAAACGAATTTAACAGAACAAATGATACGATTTGTCTATTAATCAAATGTTTCGATTCTTATGCTTTTGCAATTTGTCCAATTTTTAGTTGTGTTCTTTCAGTTTGTTTATTTAACGAACATTACTGACAACTAGGCAAATAACAAGACTTGGTAACACCCCGTGATAAACGTTCGCATGTTGTCGGCCTGTCCGATCGCACAAATACTTATTATATGAGAACAAAACCGGTTGAGGGTATTTTCCCCAATTACCTTTCGGTTGACTTGGGAATTTATACGTATTGTTAGCTTTTTAAGGCACAAGCACAATAATTGAAGAGGCTTTTTTTCCGTATTTTATAATTATTATTTATGTTTATGTATCTCACAATCTAATTTCTTAGAACCTAACATGCGACTAACCAT
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ATAAATGAGTTGCCAATCCAGT
ATAGATGTGGCATTAGTTCAA-
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GCAGAGCC-----CAGCCGCGGTATTTATATCTGGTTTCTGTC
>Tsp 6689618 6690050|7316 chr2L 6686884 6690595 scaffold_2 6524037 6527821 + 105648|2865 3425
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ATCAGATCAGACTAGAATTTAATTATAAATTCGAGTAATTTA-GAGACAGAG---------AGCGAGTGCGAGAGCG-ACAGAGAGCACATAATTAATCACTTAT-----AAATAGTCATAAGTTGTAAGCTCTATGAATGGC-AATCGAAATAATTCAAAGTATTAGCAACGTTTCGCCCCCCCCTAAACAATAAATCACAAAAGTACTTACAA---AAAATCATAACA-AATACAATTAAATTAAATCAACTTAAAAAAAAAAAAAAACAAATAGTAAATACTCTAATAATACTTGGAAAAAGAAATCAA----CCAGAAAGTGGAGTTTATAAGCGTGTTACGAAATTTGTTTTCCCCTCTCTGTAATGCC--------TGAAATGAGATGTGAATAAAATTATACAGTATATTTTTCAAAAACATCAAATTAAATTTGTTTTATTTGAACAAAACCAAACAACAAAAAACATACGTTTTTAAAAGCTTCAATTAGCACAGTGCGTCTGCGTTTTGGATACATTTTTGGTAAATAAAATTCA--ATTCGTCATTTA--
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TATATATCATTTCAGATGTGGCGACTCCATCGAATTGACCAGTGTGGTCAAGTAGACATCACATGGAG---------CAAATGGA--------------GCTCCGAGAGC--AACTGGATCAATTAAGCGATCTGCTAATGTTCAA-----CTGGAGGAGTCGGCTTGGAACAAAGGGC--ATTTAATTTGCTAACCAGCTTAGTTCGGAATTTTCGTCATAAATTCTTTTGGCATTTGCATTTAGCTAGTGACAAATTAAATCGTTTTCAAGTCCACGAACGCCAAAGCAGCAAAGATATAAATTTCGATTTCTAAAACGCTTTGTATTGAACCATCAAAATGCTTGGTAGGCAAAGCTATCGCCTAGGAAATACGATTAAGATGTAATGCCGCTTACTGTTAGATATACTCTAGTTAGTCGGATTATTGCTTAATTTAAAATAATTTATTCAT--AACAAATAATTATAAACGAAATTG-AATAAATGGATCTTGAAAATTATAGAAAA
TGTGTGTACTTTCAGTTGTGGCGACTCGATTGAAGTGGCTAGTGTGG---AGAAGACATAAAGTACAGGGTATCTGCCAAATAGATTCAATGACAACTCGCATCGACAGCGGAAACGACTTAATTAAGAG--TTGCTACCGTTTTATTTTTCTTGAAG---CGGCTCGGAACAAAAGGCTTATTTAATTTGCTTGCGAGTTTTTTT-----TTTTC-------------------TTTGCATTTA---AGTTACACATTTAAATGTTAATCACAACAAATATGCCCGAGCAGATCAAAAATATACTTTGG--TCTAGGCCGTTAAATGTTTGAAAAAAAAAA----------AAAAAGCTATC----ATACAATACGCTTAAGACGTAACAGCGCGTAATATTAG--ATACTCTAGTTAGTTGGCTTATTGCTTAATTTAAATTAATTTATTCATAAAACAGAATATCATATGTAAAATTATAGAAAATAACGAACAACAACAATTGACAA
>GRHR 6711282 6712342|7342 chr2L 6712187 6712681 scaffold_2 6555423 6555856 + 11151|0 162
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-----------ACGCCCATCATTTGCCT---------CAAGTAATGTC--GTCTCGCTGCCGTTTTACCTTTTTGTGTCGTCC--CCCATCATCAACTTCACTTTTCATTTAGCTTTTCGCACAGTTGTCGGCATAAATT--GTTTTATGTTGCGGTCTAAAT
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GTTTCAGCGCAGGAACAGACTACAATGGCAACCACTAAAACAACGACAACATCGACAACAACAACA---ACAACTAGCAAACGTTATTTAAGCAATTTTCTAACGGCTGAGGCGGAGAGCACACTCTCCAATGTCACATCCATACACACACAGCTGCAATCGTCGCTTTACGAGACACAGAACACGGCACAGCTGAAGGCGTTGGATAAACACTCAGCGCTATTGCAGGAGCTGCATCAGCGACAGCTGCAGACTGCAAACAGCTCTGCTCTCACTGATGCAGCTGCCTCCAGTGGCGCTGCTGCTGGCACCAAAACTGCCACCATACTCGTTTCCAAATCGAAAACCAAAACTGGGCTGCCCCTGTTGCTGAAAAATTCCATTAACAATTAGGGAAA---CAAAAAAGGAAACCAATA------ATTAGACGACTCTTTGCATT----TTTTTGTAATCTTTCTATTTGGTAGTTTGTATACAAAAACA-----AAACGGCAACAACAGTA----------ACTCACGCCCCCCATACACTGACAAACACACACACACACTCATTGTA
>homer 6720997 6721023|7348 chr2L 6719366 6722490 scaffold_2 6565357 6568648 + 111474|1826 1852
GACACAGAGTTGGCGTTTATGCGAAAG
GACGCCGAGTTGG-GTGCACACAGAAA
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TAACACTAAAACAAGCTGCCAGT----GACTTTTGAAATAAAG
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ATTTTAATAAAGAACAGAGAATATAAG---A
AATGTAAAAAAAAAAAGAAGCAATATTTCCA
>nrv1 6778554 6779372|7404 chr2L 6778585 6780381 scaffold_2 6064637 6066513 + 39433|0 872
GTGCGGGGAATGGGAATCATGTCGCCAACTTGTGATCGCAGCAGCAAATACTAGCCGTATTCTGGGCGAGGATATGGCAAACCGCGT-CGGAGACCAACTACCACCTACCTTACTGAAAGAGATATACACATATGCAGATATAGATATATATATATATATATGGAATGAGCT--AGCGACCTTAGGTTTTCAAGTGTATTGTATATATTTATACGAAGG----------AATGATCCG-ACCGATCGTCAATTGAACTCTG--AACATCTGGCCTAATAGAGAAATA----GAAAGTCGAAAATCTTGAAATT------AAAGTTCAAATCGTACACACGCAATTGTTGTT----ATAGCTTTTAGCTTGTCTATTGCTATCAGTTATTATTATTAATATTTATCATATTATTTCATTATGAATTCTTGTAATTACGATCATTATTTTCTGTCAGTTGTATTTAGTTTTAATTTATAAATGTTGAAACATGCCCGAAAAATTCTTTGTTTCCCGCACA-----TCGCCTAGGC----------TTGTTCAATTTGTACAAAGAAGCAACTAAA-------------TAAATTATAATTGTTAAATGT-------ATGCAAATC-------ATG-GAGAACGAAACATTTTGATCTAAGCTGAATGTCGATTATTTTTTTTTCAAACTGGAAAGTATTCAAGAACCTCTAAGTA-GTGCAA----TTTTTAAAGCAACAACCACAGTAACTAAGAAATTCCAGTCTTATTTATGCGACTAACAAATCAAAATTTTAATTTATTTTAAACATATTTCATTCAC-------ACAAAAAAATAAAAAGAAGTTAAGCGAATAATGTTTTTGCGTTGT
GCGAACGGTTTGTTAAGCTAGAAG--AACTTGTGATTGCAACAACCTAAGCTAGCCTTATGC--------------GAAATTCTCGTCCCGAGACCAACTACAACA------ACAACAACAACAACAAGAATGAGGAGAAGAAGAAAAGTTAATTTTTA--------GAGCTTAGGCGCCTTCAAGTCTT-AAATGTATTGTATATATTTATATGAAGAGAAACAAAATAACAACGCGCACCTATAACAAAATCAGCCCCGAAAAAAAAAGAATTATAATAGAAATATTACAAAAAAAAAAAAAACCGAAATTTTCACAAAAGTTCAAATCGTACACCCGTAATTGTTGTTATACATAGCTTCCGGCTTTTCTATTGCTATAAGTTAATAATTACAATAATATAAACATTATAATTTTATAGATTCTTGTAAAGCATATGGTTAATT--TGTCAGTTGTATTTAGTTTGTATTTATGTACTATGTTATTAATGCCATTTAATTTTGTTCTCCAGTCCAAGTACTCCAATATGCCAGCAGCATACTTTTTAATTTTAAAAATATAGAAATCAAACCTTTTCTTTTTTTAAGTTGTTA-CATTAAATTTCAGCAAAATGCAAATTTGTAAAAATGCGAGAAAAAAAAACCTCAG--CAAGCT--ACGTAAATAATTTATTTGTTATAT--AACAATTGCCACGCCTCTGTAAGGATGTGTAAAAAGTATTGAAAACAACAACAACAAAAAACAAAAA--------------------ACTAAAAAACATATACATATATATCCTTTAGTGAAATTTTAGTCATAGCAGCAACAATAACATAAACAAATTCCAGGCATATTCTTGTTTTACATTTT
>nrv2 6789761 6790638|7415 chr2L 6789616 6791330 scaffold_2 6083231 6085001 + 21579|192 1197
ATTGTACCACACTATTACAACATAACATAATAGCAAACACAATAACAAGAATCTCCGATTAACAAGAATCTCGGTATCAGAGGT---GTGTGAGGACGATA---------AGTCTCGTCTAAGACAATCCTACCAGAGGCAAACCACCAGATGTTGTAGTGAAGATTGTGAAAGGTTCAG---------ATTTTCGAATGTCATTAAAAATCCAAATTATTTAAACTTGTTT--------------TCCGCGTTATAAAGCATACAAAATATATAT-------TCAAGACT----TGCAACGCCTATAAACATACAAATTTTGAATTCCAATAACTTTTT---------------ATGCACTTTACGATGAAA----------------GTTAGACGTAAGATTGTAAAGCTAAACCAC------CAAGATGGGAACTCAATGGAC-AGGATGGAACTAAACCAGCCTGAATCTCGTTTGGCGCTGACCAGTAA--------ATTTGGCGCTGACCAGTAAATAGTAAATCAATCAAATGCAACAA------------ATTTACAGCAATTAATCCAAACTGCCATTTCCAATGAATTAACAAACGAATCCCTAGATATTACAAATTTATAAAGAAAATTTAAGAATCATTTTTGAGTCTGCCGCTATGTAA--------CATGTAACCGAAAACAGACCAATTTTGTCTACCAAAAATCTAAATATTTAC-AGCT--AGCTTCAGAATTTACCATATTTATTAATAACTTAGTCAAAAGTGAAGCCTATATACATATACATCACATTTTGATAGACGACAAAAGTGCAACATTTGGAAAACAGAAAATCGTAACTTCGGTTAACTTGTAAGCTTATGATATAATAATTGCGAAGATTGAAATTTAAGGAAATAAATTG-AGACGGCTAAGAGACACAAAACACTTTCAATTCCTTTTCAA-----------TAAAAATCAAATGAAAGTAGTCAG-AAAAGCAAA
GCTGCACGTTA--AGTGGAACTCA-------AGCAGATGAGATATCAA------TCAAGTAAAGGACGCTGCTTTGTCTTATGTAGAGCGTGAAATCAACACCAAAATGCAGTTTTTTCCTAAGAAATACTATAATA--TAACAGACCATAAATTATATACAAGAAC---AAAGACACCGACAACAAACATTTTTGGAT-------ACAAAACAAATTTTTGAATGTAGCTTCTTCTTATACAAAATACGATTTAAAAAGGATTATATATATATATATATATAGCAAGAATGTAGTCTAGCGCCTAAGAGGATTT---CTTTAAATTACGAGCGATTTTTGCATAAAATATAAAAACAAATTATATTATTAAATTGAAATTATAATAATTTTAAATTAATTATAATAATGCTGAATGCCGTTTTGTGAAATGAAAACTCGATAGTTGAAAAATGAAAGAAGCAAACCCTAAACT--TTAAATGCTAGCCAAGTACGAATCTCATTTAGCGCTGTTCCA-AAATA--AAACGACACAAATTTACGAATGTTTATTGCTTATTTTCAATTACAAATCTAAACTGCCATTACAAAAACAACAACAACAAAAAAGACACA-ATCACACATTAGTTAACAA-----------CAATTGCAAGTTAACAATAATATAAAGAAAAACCTTTTGACCAAAAAAAAAAAAA--------AATGAAAAAGAAACTTTGTACGAACTAAAGCTGCAG-----------CTGACCAATTTCGTAGCCAAATACCAATTTTTTATTA--GCCCAACAATTTTT------CAACTAGTTTATAGCTTTTATTAAAAAAAAAAACGTTACTCCAATTTAACAAAAACAATCTGATATACTTATATACAAAAC--AGATCTTATAAAATGTTTTACATATTTACAATCTATTCATATAAATCTAACCCACATGTCAAAGTGAAATGTTTAACAATCAAATGCGA--AATCAACAAACACAAA
>CG17376 6799939 6800111|7425 chr2L 6799605 6800039 scaffold_473 342 762 + 6639|355 460
TGTGTAACACGTTTTGGTTAGCAACTCGATCGGATGCATCTATCACCAATATGCAGATT-----TTTAGGCTTTAAATATTAATAAATATAAGAAATCGAACCACT
TTTGTAAGACACTTAAAATATATAGTACACTAGATTCACGCAGAGTAGATATAAAAATTACAAATTTTATTGTTACGTCCTAACAAACATTATATATTTAAATATT
>CG17377 6801363 6801650|7428 chr2L 6801379 6801545 scaffold_10 2059581 2059765 - 1470|0 193
AAATTGAAGTTGGCTTAAATCAAGATTTAGCCAGCTGCGGAATACCCATTACT---------AGAAGGG-----------------CTCGAAGCTATTTGGGAACCCATGTGCAA-TTCGTCAGACGGTCTTGATTTAAACACAAAATCATATGTTGGTATCTGGAATCTATTTGGCATTAAATTACAAATAAA
AAACTAAAGGCTGGTTAAATCATAAGTCAGCCAACTGCCAAGTGCCACCTGCTGTTGAGCCCAAAAGGGCTGCAACAAATCAATGTCTCACAGACCTTTGCCAACTTCTTGGCAAGCTCAGCAAATAATGTAAGTGTAAGTAAA----TATAAATTGTTAT-----AGCAATTTAGCAATGTGCGAAAAATGAA
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TA
TA
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TCCCGCTTCCGATTCGCTCCACTTGTTGTGTCAAGA-ATAATGTTGGTTGTTTTCTTATTGTACACTAGATTAAGCGGATTCTGCATTCCGAATAAATGAGTAAGTTAATGAACAGCGAATTCTTTAACTAA
TTTCGCGTCCTGCTCCAGTTTTTTGTTGGACTAAGATATAATGTTGATTGTTATTATACAGTATTTAGCAT--AGTGGAGT-TGCATTCCAAATAAAT-AATAAG------------------TTTAAATTG
>wee 6911338 6911700|7559 chr2L 6911189 6914088 scaffold_6 5588206 5591007 - 93582|160 622
TAA-GCTCGCAACAGATGCCGAA--CCGATAGCTAAACTCTTCCGAATCGAACGTGAACTAAGCTCACATT-GTGTTACCTTTTAAGCGTAT-TCATAT-----AATCGATACATATTTCT-------AACTATTCGCTTTCGTTTAAGCTCATG----GATTTT----------------------------GAAGCATTCG-TAAATATAATCTATATATTTTTCAAGCTCAGTGAACTTTTCCCTGTTAAGAAA---GCACAA------------------------TCGTTTTAAGAAAAGCCC------CTTGTAAACTTTAAGATTCTCGCATAGTTGTAA-----TGAGTATTGTTTTCGAAATTAAAATATTTATTATGTTACATGGAAATCGAAA-----TAATAACATTCCATTCGTTAAATATAGCGAATGCTATTCCATAAA-------AA
CAATATTTACAATTTCAGCTATACGCCGGCA-CTAAACTCTTCCGCATTCAAAGTGAACTAAGCTCACATTCTTGTTAA--TTTAAGCATGTATCGTAGCTATAAGTTGTTGCTAATTTCGATTTGCAAACGCCTCAAAATCGTTGAGGGTTCTGTTCCTATTCTATCAACAAAAAAAAAAAAAAGAAAAAAGAAAACAGCGGATGAATGCTCTATCTATATTTCTCAA-CTCAGTGAAATTTCTTGAATAAAAAAAGACGCGTAATAAGGTATTGCCTTTAATCTTAATTTTTTTTTATAAAAACCCAACATTTTTGTATATATATATATTGAGTTATAACTGTAAAATAGTATGTATTGTTTTCGTAATTAAACTATTTATTATGTTAAATTGAAGGCGAACATTTTTAAGGACATTCCATTCG-CAAATAAAACGAATGCTATCCACTTAAATGGCATAT
>xl6 6914300 6915042|7560 chr2L 6914176 6914566 scaffold_6 5591252 5591653 - 7940|135 434
CCATTTTCATGTCAATTTTAC-----------------ACAATTTTCAATTTATGCAACACAACAACTTGATT---ATTTGACTCCAATCTCTGTATGATGTGTTTCTA----TATTCGTAATAATTAAGTATTGCAACAGTGCATAATAATTATTCATACATTGATGTCATAGTTAAGTATTAAAAAAATACATATGTATGGATTCTT-GAGATGTGTGTTTGAATTATGTAGCAAATGCGCTGAACAC-TAAAATACA--GATATTCAATCAATAAATTAAATGCC-----AAAATTA
CTATCCTCATGTCAATTTTATGATGTAACTTATCACTGAAACCTTTTAATCTTGAACACAGAATGCCCGAAATGATATTTCACTTCAAGTT-TGTAAGGTGTTTTTTTAAAAATATTCATATTAATTAAGCAAAATTATTGCAAATTCAGATTTCTCATACATT-ACGTCATAGTTAAGTATTATAATAATA---ATGTATGAATTTTTTGAAATGCGTATTTG---TATGTAGCAGATGCGTAGAGAACCTACAATACATTAATATTCAATCAATAAATCAAATGCCAAAAAAAAATTG
>xl6 6914300 6915042|7561 chr2L 6914611 6915409 scaffold_6 5591836 5592611 - 17290|0 505
CGACAGCGAACGGATGCAGACGGAGCCCGACATGCGATGATGAGGGCCGGAGCTGCAACCCCCCGATGAATCCGGCGAGAT------GGGCTCTCCACGCACTGGACTCTAATCCTCATTCCCAAAAGAAACAACCTCACGTGTAACAAGACAGATT-CCCAAATAC-TTTTTCATGCAGTATCCATCTAAGGTTTTTAGTTGTCCAAAACCATATTAGTTAAGGGTTTTAATTTATAGTGGAACTCGAGTTTGCATATTTA-----------GGTATTCTAATGTTCCAACA-----CAA--CAACAAATACAAGCACAC---GCAGAACAAAGGAGAGCGCTTCGGAAAATCATTTG----------ACGGAAGGAAATT--------TAAGATATAGAAATGTATCGGCAGCCGCAGATTAA-----------------CGATCTAGTCA------GGATTGCTATGTAAATTGATTTGCCTTG----GATTTTATTTTGCTT
---CATTGGAAGGAT-------------------------------------------------TATCAATTTGGCCATTTACAATAGGGCTCAACCTGCTC-----------CTTCATTCCTGAAACCAACACACAAGCACCCAAGCACCCAAATTACATTAATATGTTCGTCAGGCAG--------TAAATCATTTAGTTGCCCACATTC---TTAGCTTAGAA-TATAATCTATAGTTTAATATAAATGCATACATATACTCTTTCCTCCTTTTTTTTAATCTCCTCACGATTCCCAATTCAACTGAGCAAAGCACGCCAGGCAGAACAAATT---GTGCGTTTGATTATTTTGTGTCCATATCACACTACAGGAAATTCTAAAAAACAAAATCAAAAACAAAAACAACAACAACAGATCGAATCCGCCTCCAGAAAGTCGATCTAGTCATGCTGCAGATTAC-ATTTATGTTTATCTGTCGTGAACAAATATGTTTTTGCTT
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-TTCCCACCTTGACTAGTTAGTAGGCCTTAAGTTTTAGCATCATAGGTTACCTTACTGTAAAGTATAGGATTTTATAATTACCAAAACGATTAAAGTTTCCGGTG--TACATTAGAAATAAAATGTAATATTTGCATAACAAAATACAAAT
ACTTACAATGGGGCTTATTAATAGTGCTTAGGTTT-------ATAGTTCTTATTA----GCAGTATATAGTTTTACAATCATGATTACACTTTTATTTGTTGTCTACTACATTAGAAATAAAAAATGTAATTTTCAAGGCAGAAATCAAAC
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TAGGTGCTGCTGT-GCAACGTTGTTGATTCGTTTGGTCTTCATT-----------TGAATCGTATTTACTC--------------------------------------ACCCACTCACAAAACAGGCCGCGCACGAAGAGGGCCCACA---------------------------------TAACCTGCATTAGCTCTTAGCGATTGATAATCTCTAAGTAATTTATACATAATACGAATTTCAACATATTGTCCATACGCATTGAGAACAATGAAGTTTATTATTTAAAACGAGGTAAACACACTCACACCCACACAAATGTAATGTACAATGTACCCTGTCGATTTTATGGTTTGCTAAATAAATTCC--AATACAAATCGG-----------------GGAATAACCAAAGGAATGA
TAGGTGCTGATACAGCAATGT--CTGGATCGCATTGTCGTCATTGTCATCTCCAGTCAATCATTGTTAATTTGTAATCGCTAAGCAGCACATCTTTGATTTCCGGCGAAACGCATTCATCTAATTAACAACACACAAAGA-AACCAACACTCAATCATATGTACACCCATTAATTATATAGTTACTCTGCATTAGTTCATAGCGACTAATAATCTCTAAGTAATTTATACATA----------------------CATACATACAAGTCTCATCGAAATCTA----------------ATACACACTCACACTC-------TATAATCCATGTTGTACTATGTCGA-CTTATGATTT-CTTAATAAATACCATAATAGAAACTGATTGAATTGTGATTTGATGCGATTTTCATCAATGTGA
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TCGCAATCTCGTGATCTTTAGTCTGTGCATCCCTACGCCCG-----------------------------ATGTACCAT--------------GCTATTCCTCTACCTCTGTTTTATCTACCACTTTGAATGACA-AAACCTTTGCTGTTTGTACTT--------AAA------------TAGGTACTTAAATAGACATAACTAGAT--TTATGTATGCATGA-----------------TCGTTTAAGAACATAGCATTAT-GTCCATTCTACG-----------------CTAAGTCTTCCATTTTTCGCGATAAGATCAAAATCTGTACTGATAGCTTCTTAATGACCTATACAAAAATGACAATAAAGCTTGTAGCTTCACCTTTTAACCTT
-------CTCGTGATCTTTAGTCTATATTCACATATATATGTATATATATATATATTTATATATATATATATATACCATATATCTGTATGTACGCTATTCCTCTACCTCTACTTT---TTAAACTTCAAATGACATCTACTTAAACAGTTTGTACTTGTGTATACAAATGCTTTAGCTCCTAAGTACTTAATTAGTTTTCTACAATTTATTATATATGTATTACATATATGGAGCGTGTTTAGCTCAAATGTGCATTTTTATAGTCTAGTTTATGGACATACGCATAACATAGTTAGTCTTCCACATTTTGATATAAGTTGAAATTCTGTACTGATAGCTTCATAGT--TTTATAAAAAAATGACAATAAAATTTG----CTAACTTTCCGAAAAA
>CG9207 6949310 6949374|7595 chr2L 6949139 6950616 scaffold_6 5630332 5631790 - 41605|198 266
AATGTGCATAATTCTCTATAGAAATAATC----TAAAAATTATTAATTAAATAAAATATTGGAAAATGT
ATTCTTAATTA--------AGAAATATTCATTTTAAGTGTATCTAATAAAGT---ATGTTGTAGAATAC
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AAATTAAATATAAAGAGAATAATTTTAAAAAATTCTATTTTATTTATAAAAACTTAATATTAAATGGTATAAAAGAGAGGCCCTCTTAATTGCGCAATTGGGCAGATGATTTCGGCAGAGATTGAATACGCTGGCGACGCTTTGCTTCGAACTCCGTAGCCAGCTGCCATGTTTCTTTGTCCAACGTATCCTTCCCCCGGGCGATGCCCAGCAGCCGTGAGAGGACCAGCAATCCATGCAGATCATCGGCATTACTTTTGACATTAGCTTTACGCATGTCCACGAAATCCTG
AAAATAAAATTACAAAAAAAAA----AAAAAACG----TTTGCTTAAATAAATATA-TAT------GTATTGAATTGGGGGGTACCTAATTGCGCATGGGAACGCTTGACTTGGGCAATGCTTGCAGCCGCTGGCGACGTTTTGATTCAAACTCGGTGGCCAGGTGCCAGGTTTCCTTATCCAGCGCCCCGTTGCCGCGCGCAATGCCCAAAAGACGCGACAAAACCAACAGACCATGCAAATCATCAGCATTGCTCTTCACATTCGCCTTGCGCATGTCCACAAAGTGCTG
>CG9200 6958833 6959182|7600 chr2L 6959125 6960243 scaffold_6 321335 322419 + 37140|0 60
CGCTCCTAGAGTCCCATTTACTTGAGTACTAAATTACTAG---ACTTGCCTGTAAAGCTAC
TAC----AAAAACACACGCAGCTAAGCTTCGAAGCATTCGTCAAATTGTGTAAGTAGTTAA
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GGCCCAT----------------AAAAGTACTTCAC----GCTCCTTGACTAAATATTGCAACGA-----------------------TAATAAATGTATTGT--------------GTAACTAGTG----CTAGT
TTATTATTGATAAACGCAACAAGAGAAGGTTTTCACATGGGATTCGTAACAATTTCATAAAGCGAATCACGTTTTGTTTTTAAGTTTATAACAAATACACACTAAGATACAACACAGGCAACAATTATTAACTAGT
>smt3 6966776 6967027|7606 chr2L 6966781 6967440 scaffold_6 330308 330965 + 22269|0 280
GATTAC------------TTAGTTAAGTTAGTTACTCCTC-TTACAACTACACACTTAAAACGAAAAAGAAAAAAATACAAGAAAAACCACAAAAGCAAAAAC------ACAACAACAACAACATGAAGAATCCAACAAACCAGGCCCTAAGAATCGATTGAATATGCTTTTAGTACAACTGTAGATTCTAAATGCG---------------TCTGTGTGCGTAAATAACAAAAACATTTGCAGACAAGAAAATGGTAAATAAAGCATTTTATAAACTACA
ATATATACTTGTATGAATGTAGTTAAGCTAGTTACTCTTCATTTTAACGACA-----ACAACAAAAACAGCAGCAGCAGCAACAACAACAATTAAGCGAACATTATTCTACATAAATAAACAAAAGAAAAAT--ATCAATTCTGTTGTTCAGTTTGGTTTTTTTTTTTTTTGTACACAATGAAAACAACTAAAAGAAGTATCCACATAAAGATCTAGATATTTGATTAAAAAAAAA----GTAAGCAAAAAACTGGAAAATAAAGCATTTTGTAAACTATA
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CTGTGAGTCGCAACTATTTATTCATTCGA-----------------------------CTCCGAGGCACCCCAATCCTGGAGAGCCTAACCGTA------GCTAT----CCATTTTACACAGAAA----------------------ATTTTAAGGTACCACTTGGAGGAGGGCCAAGTAGAACAAGATTATAG--------------------AAAACCCGACCGCTAAACGCAGAATCCGCTAATG------------TGTGCGTAGCTTAAAT-CACTTAAATTTATAAGTAACTCTTAACAAATGAATATGAAAACAGTAAGTAAAA-TAAAGCT
CGATTGTTTTTAAATATTTATTCAATTGAAATTTGAAATTCATAGCGAATCAGCGAAACAGTGGGACGATGCAGTTCGGAAACAACGAAGCGTAAGACATGCTGTAAGTCCGATTTAAGCTGGGAGAGCACTTTTCAAATTCGATTTATTTAAATTTATCA--TGAAAGCAAAACAAGTAAAAAAAAAACAAAGTAATAACTAAACAGAACAAAACAAAACAAACACAAAAACGTAAATCAACAAAAAAAAAATAATAATTGTGCATAGCTTAAATACGTTTAAATATGTAAGTAAATCTTAACAATTGAA-ATGAAGA--GTAAGTAAAAATAAATCA
>snRNP70K 6969825 6970115|7611 chr2L 6970095 6970953 scaffold_6 333633 334513 + 39308|0 20
AGTCATGGAGCGATGTGTCAA
AGTCTGTCATCGATGCAACAA
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ATGTC--CATGCAAAACC-------TTTAAGACAGC---------------TCTTCAATTCGTAGAGCTTCATATCAA---TGACATGATTAT--TTTATAATATGCA--TATATGTAAATATTGATAA-----------------ATAAATTTAACCCTATAATTGTTGCTGCTAGAACCGATCATACAATATGGAAAAATCCTAGAGCAGCAATCGGAAAAAT--T
>ade3 7018085 7018144|7645 chr2L 7017540 7018428 scaffold_14 884471 885326 - 32139|548 613
TTACAAGTGGATCACATCATGCATCAAGACTCAGTTCAAATAAAGC------AACCAAGATTTTAA
ATGTAAAAAAAC---------------GACTCAGTTAAGCCAGAGGTTGGCGAGCCAAG-------
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CAGACTGCGGCAATGGAGCAAGTCCTGTCTATTTCAATAACTTCTAATTTTCAACTTGGTACTTCGATTCCAAATGCATGTTTCTACATATATATATATATAAAAATTAAAATCAAACGAAAAGCGCAACCCACGCGGCATTCTGAGATTCAA------------TGTCGCCACAGATTTGCACTCAGGTTCGATGTGGCGCGTTTTCGTTGATCTACCCACTGGCTAGACCCGAGGAGTATCCACAACTATCTTAAACAAATTTTATGACGGACTATGGTAGATATTTTGTAAA--TTTACAACTCACACCACAAAAT------TTTGTATAATGCATACTAATAA----------AACGAAA-CGGTAATTTTAAAA
CAGGCGCCTGGACGCAACAAAAATTCTTTTATTTCTATTA----------------------TCCCATGCCAATTGAACG------CATGCAT-------TCAAAATT----------------------------GTCATTCTGAGATTGCATTAAGTAATTTTTTTTGCTTTATATTT--ATTCATTTTGTTTGTGGCACA---TCGTAACGCT----------------------GCAGCAACCACTAT-GTAAACAAA-TTTATGACGGAGTTTGGTAGTTATCTTGTAAATTTTTACAAACAACAACAAAAAACAATACAATTTTTTAATGCCTACTAATAATAATAATAATAACAAAACCAACAAATGCAAAA
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GAAACTAGCTGTCAATGACTAAGGATGCTAAATATTTGTGTTACAAGAACTCCATTGGAGGTGT---TTAAGACCGCCTGATTTTCTTGATTTGTATTATATAGACGTATGTATT------------GATCTGATTATGGATCGTTTACCAAGTGAGCATCACAGCCAATGCTACGAAGAA-------TTTATGATATCAAAAATGCTAGACTCACCATTTAGTTTATTTCAATTAATTCCCAAGGAGTATTGCATGTTTTATACATTACATTTTTTGTATACATACACAATTTATGCATATTTATTTGCAATTATTTTTACATATTTTTACGATTAATGTGCAATCTTTGGTAATGCAATTTTTAAATGAT----------ATTCGTAATAGTGTTTAAGGTGATTTTATGACATTCCAAAAATTA----AGAATTAGAAACTATGAATAGACCAGAAAGCTGAATAAAAAATAAACTAAATACAAGTAAAATGGAAAAGA
GAAATCAACT--CAATGACTATGGATGCTAAATATTTGTGTTA----AACTCCTTTGGATGTGTAGTCTTAGTAAGCCTGATTTTCTCTTTTAGTATTATAT-----TATTTGTTATAATCGATCTGGGTCTGAGTCTGGATCGCAT---------GCATCACAGTTTGTGCTTTAATTTAATGTCTATTGATAATATCAACAATGCAATGCACAT-------TTTGTTTTTATTTATCT----AGAGTATTAC-TGGTGTATTTACAATATTTTTTATATGTTTATGCAA---ATGCGTATTTGTT-ACACTCTTTTTTTTAT----CAATAATTTAAGTGTA-----------TGCAATTT--AAATGATTTACACGCGTACTTGTAATAGTGTATAAGACGATTTTATGACATTCCAAATATTAACGTAGTTCTATATGAAATAAATA---CCGAAAACGTCAAAAGGAATAAGCCTATTTGTAATTAAATAAACCATA
>Rab30 7030480 7031433|7657 chr2L 7031136 7031399 scaffold_9 2563500 2563751 - 144|0 275
ATCTGTAACTTGTTAAGGACTAATCGTGATATTCCATTTATCTTTTATTACCACA-----ATGCTCCCACATTCTAACACATACATACATATGTTAAAT-------TTTGTTTTTATAAGCATGATTATGACGTGATCGTTTGCCTTTGTCTTTGTAACGATTCCTATTAGATTGTTAAAACACATCGGCTTCAAATACCTTTAAATGTAAAGGTATTTAGAGCAATTCTCTTCGCTTTCACTAAACTACGATAACAACAAACATTTAAAGTACAA
ATCTCCAATCGATTTGGTTTTCGTTCTCTTTTTTCACTTTTATTTTGTGATCATATTTTCGTGTGGCTATAATTTAGTATTTATATATATAT-TTATATATACACATATATATTTATATATATGTTTTAATCTTGAAACTGTTAATTGTTTTGTGTGCAAACTTAATTTATTCATTTAACATACAT-------ACAAACATTCATATTTATATTTATTTTGG----------------TGGCTAGAGTACAAAACAATCTCACACATCAAATGCAA
>Rab30 7030480 7031433|7658 chr2L 7031400 7031674 scaffold_7 2938788 2939073 - 14411|0 39
GCAG------CTGCAAACTGAACTGGAAGCTGAGCAGCTA
GCAGGGACAACAGCAAAGACAGGCGGCAGCT-ATCAGCTA
>CG31907 7059235 7059434|7684 chr2L 7057750 7059239 scaffold_23 894777 896218 + 74055|1531 1535
GTTAA
GTCAC
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TATACTGATTTTATTCTATTAATG-CAAAACA
TATATCCATTGTTTATTTCTAAAGTTTAAACT
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TCTTTAAAAATAAATTAAATAGATTCCCATGTTCCAATCAGAA-GTATTGA---CAAGCAACATTCGAGTGTACTTAAGTTATTGTCGATTAAG-TTGACCTCCTAGCTACTTATTT
CATTTAAAAAAAAAGTTT-CGGATTCGGAAATGCCGAGCAAAAAGTATTGAAACCAACTAACATTCAATTGTACTTAAGTT--TCGCGTTTAAGCTTCAGCTCTAAACTTATTATAA
>Pvf2 7069578 7070160|7693 chr2L 7069690 7070896 scaffold_23 908967 910161 + 1781|0 538
ACCAAATTCCCAT---TGAAAGAATGA-AAACGCCAGAACTTAAATCTACATTATAAAGTTCATGGCATTTGAAGAAAAACTGTGTTTAAATATACGCAATGGCCATAGAACAAAGAAATCCAGAAATCCGAACTGTTCGTTCGGATAAGCGAGCAAA----CTAAAGGCATACTATGTTTGGTTGTTAGTATTATGAGTAATAATATTATAATATTAAAGACCGATTCAAATTCATATTTGGACCAAGTGATTACTT----TACAGAAAA------TACACTTAAAATGTAATCTTAATTAAGCTGAGTTTAAGATGCCAGT---------------GAAACTAGATAAAATC-----AGACATTGAGAACTGAA-AGTATTAGTTCTTT------TGGACTTTTTTGAAAGA------GTCTACAGTGTTTTATTTATTAAAATCATAAGAATCTGTC--GAACTCAAAATCACTGTAACGCTTTCATAGAAAAGTTCTT---------------AAGTAACTGTCATTTTCGGTCC
ACTACATTTACTTACCTAAATGCACAACAAACACAAGCATC---GTCCATAGTCGGCAGTTCATGCAACCAGAAGTAATAC-------AAATCT-CATAAAATGCATGGCACAAGGTGCTCC--GATTCCGGTTTTCACATTC-AATATCTTTCCAAAACTTTTGAAAACCTGCGA-----------CAAGATAAAAAGTTAAAAAGTTA-AATATTTAAGAAAAGTT----TTTAAGTTTTAAGTAAAATATTTTTCGAAGTAGAGAAACTTTTTTTGTACCTTTTATCTAATGCAAATTAATTCCGGTTCACGGTTCAATTTAATTATTATTTTCCAAAACTTTTGAAAATCTGCAAATAGATAAAAAATTGAACAAAATTAGTTTGTTTTCGAATGAAATATTTAAGAAAAACGCATATTTAAGGTGAATATTTTTTTAAAAATAGAAAAGGTTTTTAAGAACGTACCTTTCATCTGAAGTTGAGTTAAAAAAATTAATTTGGAATTAGTGGGAACGTTCCTTTCATCTGAGGTCA
>Pvf3 7132392 7132693|7773 chr2L 7132045 7132598 scaffold_2 5342765 5343260 + 1016|354 572
TGTGTTCTCATATATTTGTTT------TGTTCCTGCAGATGTTTTGCGTTTGTGACCTCACAATTTGAGTTTCCAGTAAGCTTTATTTCCATTTTCTGCTATTTATGGCCTTTAATTCCTCTTATTT------AATTTTCTATTACATTTAGTTACGTAAAATGTAATACAATTAAGATTTAGTATTTTAAATAAAACTATTATAAAAAATCAATGCTA
TGTATATATATATATGTGCATCATGAATGTTTGTGTAATTGTAATTTGTTCATCATCTTTCATTGTGTGTGTGTAT--AGTTTTATTTCATTTAACGGCT-----TAGATTTTAAAGTCTTTCATTTCGTAGGAATTTGATGTTGTCTATGTTT----------TGCTTTTTCTTTCATTTCATTTTTGTTATAGCACTTTTCGTGATGAATAAGAGTG
>CG4502 7194908 7195555|7866 chr2L 7194893 7196893 scaffold_6 4608435 4610396 - 50387|15 723
GCGCCGCATTCCGGACCG-CAAG---GAAACTCAGCTCAGATGCTC-TGCGTTTGCCAACACAACC---------AATGCAATTTAATAATCAGCCACCCAGCCAAGTTCGCTCATAGTAATACATCAAGACATTTATC-CATCTTTATACT---------CTCTGTTTCATCTACTT-GTCAAGTAAC----GAACGATTTCAATTGCAAACCATCCAAAGCAACAAGACGAACTCCCAGAAACAAACAAACATGAAAAAACAAAACATCTAAATAAAACAAACTAAAAACGCGCATCAAGCAACAAATTTGCTTAAAATGTAACTCTAGCTCGTAGTCATCAGTAAATAGGAAGTTTCGCCGAATACAAAATGGATATTTAAGTATTATTAGTTAAACAGGAACAAAA------------AAAAAAAACAAGTACGATGAACACCACTTTTCCACTATAATTTCCTTCGTCTAGCGCATATTAAGTTATATAAGATTTACAGAATCAATTAGT---------CTGA-------TATCTTGGTTCGACTGTGTTATAATTTGTTGTGATTTTTGTTGAACTTAAACAAACCGTGAATAAACCAAATTACAACATCAGCTTGTAAACATAAGTGTGTTCCTCGAACTTCGCACTTTCATTCTAAGCTATGCATA----ATAAATAAATCTAACATGTGTCTATTATCGC
GGATGCAGTCCCAGATGGACAAGCCCGCCGCTCGCCATAGCAGCTCATGCGTTTGCCAACTTAGTCAACTAAATGAATGCAACTCGATTTCCATTTAAC--ATAAACACCGCTCATTACGATACTACAAAATAGTTGTAGGATGCTTACACTGAAAATTGATTTCATTTCTTTTATTTAGTTAAATAACATGTAAACGATTTCAATTGT---------------------------------------------CGTAAATGAATACCATCCAG-------GAGGTAGAAGAGGAAACTAACAAAGAAATTAGCTTAAAATGTAA-TTTAGCTGTAGAACACCCAT-----GGAAATTACACAAAA-ACAAAATAATAATATTAATAATAATAAAAGGAAAGTATTATAACTTCATTAAGTTGGAAGAAACTATT----TAAGTTCCACATTACTAATACATTT-------------ATATATATATATATATATTATTTACAGCATATATTAGTTAATGCAAACTAAATGAGAGCATCTCGGAATGTGT-TATTATAATTAGTTGTGATTTTTATTAAGTT--------------AAAAACCAAATTACAGATCTAGCCTACATACATATATAAGT--------ATGAACATTTTC---TTAAGTTTCGCATATAGTAAATATAAATATATTAAATGTCTCTATGTGT
>CG13784 7205250 7206347|7873 chr2L 7203314 7205833 scaffold_534 2682 5447 + 2636|2363 3008
TATCTAAGGAGTGGTATAACGAAAACCAAAATTCATAAAGCTGTTCA----ATTTGTTGTTATTCGGGGGTAACAAAAACCAAGATGAGGATGTAGAAAAGGCAGACCTAGTTTATACACACTAGAACATAAAACCAATGTACATTACTTCTTATGTGAGATGCAGCTACAAAAATTAGCTTACAATGTAAACTAGTTTTAAAC-----ATTTAGTTTCGGACAATGTGAATTTAAAGAAAAGGGTTTCAGCTGGGGAAGGGACCAAGCC--------AGAGTTGACACAGCCTTCAAGTTTTCCAAAATCCACGCAGAGACATATCCAC------------ATTGTGCAAATTTCTCGCCAAGAAAACTTCCCTCAGCT--CGGGCCTTGAACCTTGTTTAGATTTAACATTATAAATCGTCATTGTTTTTCGTACGTCGTTAGTCGAATTAATTTTGTAGCCCTGTAAGTTCA---ATTTGTATTAAAATCAACAAAATCAAACTTTAATCTCGATATTA------TTCTTTAAAGA--------------ATTTTTTAATTGTATAA-TTTCCTAGCAGAATTTATTAGCTAAG-------ATCTATAAAAAATTATACGAAAATAAACGAAACCCAAGCAAA
TATCCAA-------------------------TTGTTTAGCTGTTCACATTATATGTTGTTATTCGGGGGTTCCCCA-------------ATGCAGAAGAG--------AGTTCAGATCCAAT-GTACATTATATAAAAGTATATTTCTTGTGAACTGATCAGC--CTTTAGCCAATATCTTTTTGTATATGTGTGTGTGTAATTATTATTTTAGTTTTGAACTATGTGAATTTAA-------TGCCTCGTCCGGAGCGAGCCCCGAGCCGCCCCAAAACAATTGGCCTAGTGTT--AGTT-----AGCTTAGGAGACAGACATATCTATTCAACAAAAAAAATAATATAAATTTATCTTTA-------TGCTGCTGGCTAACGGGCTTTTAGGTTTG---GGGCGTGGCGGGGCGGGTCAGTTCAGTTCGTACAATTTTCTTAGTCAATT---TCTCGTAGCCAAGTAAGTTGAAGCATGCATAATTAATGTAAAAACAT-AAAGGCAAATCTCGATATTAAAAAAGTTAATAAACAAAAGAAGAAGAATACATTTATAAATTTAATGATTTTTCTAGCAGAATTTATTAGCTAAGTCGTTAAGTATGTGTAAATTAAAATAAAACCAAAAGCGA--CAAACGAA
>CG13784 7205250 7206347|7874 chr2L 7205937 7208124 scaffold_534 5511 7829 + 49157|0 437
CGAAGTGTCTCGCTGGTCGCCTGGCCAGCAATCGATGTGAATGCCTTGCTGCAGCAGACCATA---AGGAAATCAGCTGTGCTGCAGGAGACA---CCAGT------GCGCAGGAAAACCACTGCCAA------------AAGGGGTTCGGGAACAACGGGAAGCAATGACTCCTCCACGGCCACATTAACAGCCAGTGTTGTGACGGTAGCCAAATTTCCAGGAACTGGACTAGTCAGCACTGTCACCAGTTTGAATGGATGTGGAACCACCTATAGCTACACCACCACCACGGCTGCACCCTTGAATCTTGCAGCTTCCAGCAAGAAG---AACACCAAGTACTCGCCGGTACCAAACTCCGAGGCCTATCAGTGCGATCCACTGCAGCAAAGCTCGACGGAGATCATCTTATAACTCATGCAAACATACCTCTGC
CGAAGCGTCTCGCTGGTCGCCTGGCCAGCCATCGATGTCAACGCCCTGCTGCAGCAGACCATACGCAAGACAGCAGCCGTGCTGCAGGAGACAACGCCAGTCAAGCGTCGCATGCCGCTCACGCCCCAGCTGCCACGTCCAGGCGTTCCGGCGCCGCCGGGCAGCAACGACAGCTCCTCGGCCACCCTAACGCCCAGCATCATCAGCGT---CAAGCAGCCA------------------ACCGCC------------------GTAACCACACGCAACGGCATTACCAATACATCAAT--------CTCTGCCAGCTGTGCGCACGTTGCGCGGCAGCAAATATTCGCCGGTGGCG---------------------GATCCGCTGCAGCGACGCTCCCAGGAGATCATACTCTAAAGCTGGC--ACCTACCTCTGC
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ATACTGGAATACTAGATACATAATAGATACCTAGGAAACTAAAACATTACTAGCATCCGTACGAAACTAA--TTAAATTCATTACCTAATGCTCCATAATGTTAACAAAAGTGCTTAAATGTGAAAGCTCAAAATTTTGCAAGTAATTATGACGATTTCATATCCA--AATATGCCATTTTTGAGCAATAAATCAATCATGAAAGGCAAAACGAA----
AGTTTCACCTATTAATTGTTTCACCCATGCGGATGGATTTGACAAA--ATCAGTAT-GGTAAAAAAATAATTTTCTATTTCTGACC-ATTTTTCGAGTAAATCAACAAAAGGGGTT-----------CTAATTAGTTTTTTACTCAACGTG--GATTGCGTGAAAATTAATATTTCCCCCTCAAGAAGCGGATTGCCGAAAGCAGTGAAATCGCATCCG
>CG4567 7220272 7220532|7888 chr2L 7219319 7225069 scaffold_6 4640973 4646702 - 145632|1028 1365
GTTTTAACTTAATCTATTTTTAATTACCATCTCTATCAAATCGAAATGTTATTGTGTCACCCCTATTTTTGCTTAGTTAAATTTTATTTCATACAACAATTTTCAGTTTTCACTGTGATAAATG----------------------CGAAGTGTACAGTTATTTGTATAATAAAAC----------------AAGATTCAACAAAAATCGGTATACTTAATTAATC------------ACAGCTTGTTGATATCAGTTGAATTTTTCGTC-----TTATTTTTCT----------------TTGAAAATGAAATAT------ATATATAAATTAATAC
TCATTTCGTTCGCTTAGCTTAAATTCTAG----TGTTAAAGTCGAATGT----------------TTTTTGCATAGTTTAATTTTATTTCATACAAAAATCTTTAGTTTTTACTGTGATAATCGTTGCATAATATAAAATCAATGACAATTTGTACAGATTTTTCTAAAATAAAACTTCCAATAAATGTTCATGAATTGAAAATAAATTCTTAAATTTGTCCGAACCAACGGAAAAATACCGTTAGTTTGGAATACTTGGGGTTTTCGTTGACCATAATTAATATGAAAAGTACTGAAAAATCGAAAACAAGGTGTTGCTCAATAAACAAAAAAACTG
>Ndae1 7226817 7226914|7890 chr2L 7226472 7227343 scaffold_6 4647775 4648773 - 23119|484 604
AAGCACACACCTAGACAAGCAC-ACCAACCAACCATTGAACACAACCACAAACACACCAACACCAACACAACGCAGCCCAAACAAAAGAGAAATGAAAA----------------------
ACAC-CGCACCGAGTTTGGCACAAACACTCAAAAAAAAAAAAAAATAGGAAACACCACACAGCAAACAACACACTACACACACCAAACACTATTGAAAACGACAACACGCTGATAATCTGG
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GACACA--------CACACAAAGAACAACA-----------GAAAAGCAGAAGCTAACAA-AACACACAGCAACAAAAACG--------AAAAATAAAAACAAAAAACAAAAACAATTTTAATAAGTATTTAAACATACAAAACAAACC
CACACACCATCACGCATATGAACAACAACAACAACAACAACAACAAGCAGAAGCTAACAAGAACACACCGCAACAAAAATAATTTTAATAAGTATTTAAACATAAAAACAAACCAA---AAACATGCAAAAAAAAAAACAAAACAAAAA
>Wnt4 7255460 7256003|7911 chr2L 7255581 7255653 scaffold_6 1224844 1224916 + 1623|0 72
TCGCAAAGAAAAAATCTCAAAAAAAAATCGCAAAACTTTATTTAGCAAAACGGAAAACCAACAAAAAAACACG
TAGCCCAAAAATAATTTCAGAAAAAAAAAGCAGAGAGATATCCATTGAATGAGAAAACTGTTAATGAGAAATG
>Wnt4 7255460 7256003|7912 chr2L 7255693 7256217 scaffold_6 1234129 1234648 + 2167|0 342
ACGGGGTGCCATCTCTCG--------CAGACTTTCT-TTGCCCC--------GTCTCCGTCACTTTCTATCCCTCTACTGTGCT----CTTTGAAAATGTAATTTGTAAAGTTTTTTTCTACCTTTATGGCTTGTAATTTTTTTCCATTCCTAACAAATATTACTGAAATGATAAGCAAAAAGAACGAATGCAGAACGATAGAGATCGATCAGAAAGCTAAGGCTTAGCTAAAGGCCA-AACTCACC----------AGCTCACACACACACACACACATACTCAAATGCATAGACACACACAGTCACACAGACACACACAAGCGCATACATGCATCTATCTA
GGGCCACCCAATCCCCCGTATCTTAACAGCCTGTCTAACGTCCCAAACTAGAGTGTCCCAAACTCCCTCTCCCCCTCCCCAGCTCCAACTTTGTGTATGTGTTATGTA------TTGTCTACGCTTAACCTTTGTTATT-------------------------AGAAGTTAAGAGCCTAGA-----------------------------------CTAAAGCCTAGTTAAAGTCCATGACCCGCCCCTAATTCTTAGCTTACACAGCAGCCTACTCTGACTTTTTAGCAGTATTACATACAATAACATATATATGT-CGAATATATATATAAATATATATA
>CG5149 7384486 7384886|8084 chr2L 7384458 7384867 scaffold_6 4846733 4847166 - 9420|29 480
AGGAAAAAGTTTTGTTTTATCA---TCGAGAATTTGTGAGACCATGCCCGATATGGGTGTGCAGTTAATGATTCAATTCAGTTTCCTTAGCTTTTTTGCAATCCCTATCGAACACAC---AAAAAAAGTCCTGCGAACAAAAGAGTATTTGTTCAATCCATTCCTATAAACGTTTTTGTTTAGGTATTAATGTTT-----------------------------------------------------------ATATATACAATGTATAATGGATATAGTTTATGAAATACTGAGAGTATTGTTGTTGCGTTTTAGATCTTAAAGTGAGAAAAGTAAATCATTTAAATGATGTAACAAAGAAGCAAGCATAATAAGCAATGTTAATTCGTCGAA-----TTTTTCCCATTTTTATCCTACGTCAATAAAATGCAAATTAATTGCTGAATTT
AAGTAAATGTTCGGTTTTAACACGTTCAAGAATTTATAGCACTATATCTTTTTTGGGTGTGCGGTTAAAACCTTTACATATTTACTTTAGCCAT-----AAAAACCTTCCTACACACTTTAAAACAAATCCTGTATACAAGAAAGTGTTTGTTCTTTCCATTCCTTTAAAC--TTTTGTTAATGCAATAATGTATTAATATAATATAGCTATATATATATATATATATATATATATATATATATATATGTATACGTATAAACAATGTATTATGCATAGTGTCTATGTAATACTGAAAGTATTGTTGTTGCGTTTTAGGACTACAAGTG----AAATGAATCGTTCAA---------------------------AAGCAATGTAATATCGTCGTAAACCTCTTTTTCTGTGTTTA---------AATAAATCGCAAATTATTTGCCGAACTC
>CG5149 7384486 7384886|8085 chr2L 7384886 7386208 scaffold_6 4847189 4848613 - 48608|0 0
T
T
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AGTGGAATTTTATGCAGGGTGGGTCGAGCTTAGTTAGTCAAAATATGTAGCGACAAATATATAATTATATAGCTAGATGTTATTGTCATGG
ACTGGTGTCC-----------------ATTTAGTTAGTCCAA--ATGTTGCGCCAAATATA----TTTATAGCTAAATGTTCATATATTTA
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ATGGTCTACAGACGCGGG
AGCGACGACAGCCACAGG
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TTGGCCCCATTTCAATACTACACTGACATTCGCATCCTACATTGACATTAGCTTAACTTTATGCTTGTAAATACTTTCAATATGTGTTTGCTTAGTTCGTAACATTTTGGCAATAAACTAGTTACATAATACTATAA
TT-------CATCAAAAGTCCTTGGGCAGC--CAGCCCA-----ACATTAGTTAATGTGTGTAATTATAAA----TTAAATAACATTTTGATTAGTTCTTAGCA-CTTGACAATAAACTAGTTACATAATGCAATAA
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TCAAATAAAATCTTCAACTACAAAGGAAATT
TTTGATAAAATTATTTTCTAAAAATCATAGG
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ACAGAACCGCCACATTCACGCCATTTAGATAGTTAAGCCGTCCTAGTGCTTTAGTCGTAGCTCATAGT---TTAGTG--------ACACTC----------------------------------------------------------TAAAACACCCAACTGAAAATTGCAAGCATTCCC--GTGCCTATGCCAAAGATTAGATAGCCTTCGAA------GTCGAAACGTC-TGGT---GGACTTCGCTTAGCTAACGAATACTCTTTTTACATTCCTTAGTTATTAGATATGTTTTGTATTAAAATGATTTCTT
ACGGAGTTAACA--------------GGATCAACTAGCCGTCCTAGTGCTTTA-TCATAGTTAATAGTCAGTTAGTGTAGGAAAAACATGCATATTATATAAATATATGTATAAGCATATATATAAATATGTCCCTCATCCTGTTTGGATACAGCTCCTCATTCCGGAGTACATACATGCATAGGTGGCAATGCCAAAGATTATATAGCTGCGGGGAGAGTTGTATGAATGCCATGGCATGGCATATTGCATAGCTAACGAATACTCTTTCTACATC------TTAATAAATATATATAGTTTTAGAATTGTATTTG
>Gr28a 7452525 7452540|8151 chr2L 7450870 7453334 scaffold_6 4941821 4944456 - 40438|1941 1957
TTAAAATTAT-ATATAC
-TACAATTGTAAAATCA
>CG15819 7472505 7473645|8175 chr2L 7472697 7474542 scaffold_6 4979230 4981183 - 49145|0 1134
GTCC-------AACGAAATCATAATAAGATATCAAAATTCTGAAACTCAGTCACCCACACGCACGGCTAACCAGAAACCAAACCGATTGTTGAAGTATTCAAATAACACGAGCCCGATACGTAGGCGTAGAGATTGTAATGCGTTATCGTAACCACAACGTAG--TCATAACATA--------GGCTCTCTTGGTGTTCCTTTGT-TTGAAGTT--GTCGTTGA---------------ATTTGAAATTGTC-------TTGCGGCAGGTAAAGCTCGATTTTGGGCTTA----ATGGTTTGCGCCT---------CGGCTGA--GGAAATCCCCATGTGACTAACACCA--------------CAAAAAACATAAACAATCCAAATTTGGTGGCTTTTAATCCGAACCGAAACTAACCGTAAGCGCTTTCTGACAAAATTCGGCTAATCTAACTAAATGTTCTGTGACATTTATTAACGAGTTTGTATTAACGAGTTTGTAATTCTCCCGTTTTAGGACCGTATTTT---GTTGATCAAA----ATACCAGCAACAGCACCCACCAC-CACAGTTCCCACATAAAC-ACACAGA------------ACTCCACACACCATTCATAACCGATAACCGAACA-------ATATATTCTGTGCTAAACG--------------------ACCAGTTCCATAAGTTCCAGTTAACCGATATTACATATTACTTGTTAATTTGACTATGCTTAAG--CGACTATGATTTAGATTCCCACTTTATTGTTGTTAGATTTTTATGTTGGACAATTATAATTACAAAAAATATGTGTACATTTTTTCATAGCATGCAAGAAATCGAGAGGAGCCTGAAAATAGTTTTA----------AATTTAGGCTTAAAACTTGTATATTATTATTATTATTTTAATTTGAGTCCTTAAATTA-ATTTTATTG--------------------------------------AGCTATCGGCTAATGATGCACTTTACGCAACCTA---------TACCAGTTA-------CTTTATTAGATCAAATCTGCTAACTTTGTGTCTTCTTCAGAACTCCAAATGGCTAAGGAATCGTTTGATAATTGAATTAT
GTTCAAAACCAAACAAAAACAAAAACAGTTAAAACAAATACCAA---CCAATACCAATACCAATACCAATACCAATACCAATACCAATACCAAAATACACACATACTAC---------------GCACAGCTACTAAAAACGGTTTTAACAAAAGCAACGTAGAAGCATAAATTGTAGCTTTTAACTTGTTTGGTGTTCCTTTGTAATGATGTTTGATCTTTGATCTTTGACCTTTGATGTTTGATGTTGTCGTTGTTGTTGTGGCAGGTAAACTCTGAAATTCGCCCCATACCTTGGTTTGTGTCTCTCATCTAACGGCTAAACGCACGCATACATATGACTAACGCCCAGGTATTTGGCCATCACTAAACAAAACTAATCTTA--TTAAGCAATTGATATACTTAAAAAAAAAAAACGTAA---TTAGCTGTACTAATTGCTTAAACCCTACCGAAAAGCCAGCCA-----ATTCACGCATTTA-ATTCAAATTTTTG----TTTTCTGTTTTAGGTTTTGGTTTTGCCGTTTATTAAAGTCCATGCAAACACCAGCAAATGCCACATATAAATCCCACACAAACAATACAGCATATAGCAGTATACTATATATACGATATACAATATATA--CGAACACGCACACATCCACCACACGATAAACGAAATTGTAACTAATGTTTCCACCAGTTGACCAAGTTCCAGTACAC----ATGAGA-AACACTTGTTAATT--------CATAAACCCGATTAGCATAACGAAT--TATTTAATTGTTGTTAAATTTT-------------------------AAGTAAATTCATATTTGTATATA-CATCTAAGAACTTAATTTTGAATGTACATTATTTTTATTGATTTTTTATTTCATTTTTA----TTTTATTTTATTTTTTTTTTTTTTTTTTGTGTATTTTACGCATAATTTATTGTTACACGTACGATATTTCCAGTGTGAAGCATGACTAAAAAAAACCTGATATAAATTTAAATTCCTAAACTTACTTCCTGTTTAACACTCAATGCGTCCCTTATTAGATAAAATCTGCTAGCTTTGTGTCTTC---------------AACTTACAAATTGTTTGATAATGAAATTAT
>Pbprp5 7496867 7496897|8192 chr2L 7496831 7497489 scaffold_14 606417 607084 + 21435|38 68
TCATTGATGCAGCGCTACCCACCTGGACACG
TTAATTAGCCAAAGGCAGGCA----GGAACT
>Rapgap1 7497805 7499024|8193 chr2L 7497759 7501557 scaffold_30 984704 988763 + 147416|46 1640
GCGTATAACGCAAA------------CCTTTGATAAACCAATGG--ATGAGGCAGGAAGGCAGGAATAGGAGTAACCACTGTGCCGTGTATAACACTTTGGAGAAAGGGATCGCAGAGTCGTTTGGAGAGTTGAATAGCAGACAGTTGGCGTAGCCCTCAAAACCCCAAGACCCCCAAAACAAAAACAAAACAAAAACTGTATTATATTTAGTTTACGTAGCTGT-------------AGAT--GTAGATCCCCGCAGATCGGAC--AGGTAGCAGCAGGCATGCCCATGGACAAGTTATT-----------ATATAAACTACATACA-----------AACAGTTACAAACTAAACTAA---------ACAAAGCGATAAAACAGCAAATGAAA------ACAGAACACAAAACTCAAAAAAGTACACCAAATATATAA--TATAAGTCTTTAAGCATATTTAACGCAAGAATAACAACCCTAACCGTACATCATAATCCCCCAAACCAATTCCAGAACCCATCCCAACTTTAACCTAAGTAGAAAGCGATCAATCACAATGCATCACACAGAGATCGATATCGA------TATATTATGATAATAATCACAAATGAAACAAAAACCAATGTAGCAA----------AGTTTTGAGGTTTACAAAACCGTTAC-------TCGTTC--------------------------------------GTTAATCGCA----------------CTCGTAA-----------ACTGTTACTGTTGCCGTGACTGCTA---CTGTGACTCTCGCTTCA--CATTTCATACC------------------------------------------------------------CATAATGGAAGATAACTAAATTATGATCGATATATGATTTTACATTTAAACAC------------------------------TTTACAAAAATCACT---------CTGCGA--AATAAAGAAGAAAGAG-----------AGGGAACTCTTAAC-CTTAAGTTTAAGTTGCTTTAAATACTTTTACCTAAACTGTATGTTAATTAATTATGACTTAAGTTTAACCAAACGCAAAAACCACAACATCAATGAATTGATGACTCACGAATAGAATTTGCATGCCGCATTCAATGTATATATATGTAGGAGCGATGTATAATTCTCGATCC----ACATACGGATCTGTCGAAATTAATTATGACTATTTTATTTTCTAATCGATTACTGAAATACCAATA-------ACCGACAAATG---------------------AAAGCCACGCAAATT------------------AAAACCAAGCAAGTG---------GTATATGGGAAATGAATTCCAAAAG-------CAAAAGTTACACGCAATCATT--------AATTTTGTCTTTGAAATCTATCCGATAAGTACCGCGAATAATTGTTTTTGTTGAGATGCATTATCATTTTTATTGTGTAAAGTATAAAAAACCAACAA------------------ATATATGCAAAATATATGGAATATATAC-------
GCGTCTAACGCGAAAAAAGCACCCCCCCATTTGAGAGCTAAGGGGAAAGCGGAGAGAAAGGAAGAGCAGAAGGAACCACTGTGCCGTGTCTAACACCTTGGA---------------------------------------AGCGTCGGGGCAGCCC----------------------------------------CTGTATTATATTTAGTTTGCATAGCTGTTGGGAACTCGAAGAGATCGTTGGAAACGCGGAGATTGAGCTTAAGTTGTGGTCGAGCGGGGGACAGAATTATTATTACCGTTAGTAGATATATACTATATAAATATATATGTATAACAGTTACAAACTAAACAAAAACAACAAGAAGAAGAAAAGAAGAAGTAGGAGAAAAAAATCACAGAACACAAAACTCAAAAAGTTACACCAAATATATAGTCTATAAGTCTTTAAGCATATTTAACGC---AATGTTAACCCTAACC-----CCAAAATTTCCCA---CAGACGCAAAACTAATCC-----TTATCATAAGTAGAAAGAGAGAG---ACGAAGAGAGAGAGAGAGAGAGCTATCGATTAGCGTACATCACAGTTACAGTTACAGTTACAATAACATTTACAGTTAGAGTTACAGTTTCAGGTTAAAAGTTCACGTAATAGCTGCATACAAATTATTCCACAATAATCAACACGATTAAATTAAATGAAATATCTAATTAGTAGCAAAGTTTTGTGTAGCGTTTCGCAAAATCTGGCTACACCGTTTTCGTAGTCGCACCTGGCAACCCTGTGACGCTCGTTTAATTCATCACAAACCTCATCAGCAATTAATAACCAATTACAAGAGTAAAAAAAAAATAACAAGATACAAGAAAAACATAACGAAAGCTAACTAAATTAATATATATATTAAAATATACATTTACATATATGTATATCGATTATGTGTGTGTTTTAAGGTTTAAAACCCTCGATAGTTTTTAGCTGCAATCGATAAATAATAAACAAACCAACAAACCAACCAACTCTTAACAATTAAGTTTAAGTTGCTTTAAATACTTC------AAAATTACTTTAATT-------ATTTAAGTT-----GAGCGCAGCAG-----------------------------------------ACGCTGCTTTT--TGTACATATTATTTTTACAAAAGCATAATTCTCGATCAATTGATCTATCGATCTAACGCAATTAACTATG--CAATTTAACGACTAGTTAATAAAAGAAGTACACAAAAAACGATATCGATAAACGATTTAGCCCAGAAATAGTGCAAAAGTTTCGTATAATTTTGAGCAAAGTGGCAAAAATACAAAGCAAATGAACACACATACATTTAGCACACAGAATCAAAGAGTTCTTATCGAGTTTTCGACACAATTATGCAAAAAGAAAATTTATCTATGAATTCTACC--ATAAGTACCACA---AATTGTTTTTGTTGAGAAGCATCATCATTTTTAATGTG-------TAAAAAACCAACAAATATACATATATTATTATATATATGCAAAATATATGGAATATATACATACAAA
>Slob 7647035 7647226|8389 chr2L 7646713 7649125 scaffold_23 2210403 2212921 - 35351|363 581
ACCAATCCA---------AAACGAACCGAACCAAAACCAAAGAAATC---CGAACCCGAACCCAAA----ACCAACAATGAACAACTCACAAAGAATATC-TCACAATTCAAATTTACAAAACGAATATCGTGTGAAATAAAACCCAAATGAATACCTGAATAAAATTAAATAAAATCAATATACAAACCGATAAAGCAAAT----------ACATAAT
ACCAACCAACCAATCAATCAATCAATCAACCAAGATGCAAACAGAACAAACGAATATGAAATTAAAAAATATCCACAACAAATCACTCACAAATACAATTACCCCAATTACAAAGTGTAAGACCAA----ATGGCAAATGAAAA------GAATACCTGAATAAAAATAA--AAACATAAAAAACAAACTGACAGCGCAATTTGTATCAATCACAACAA
>CG18585 7689366 7689446|8423 chr2L 7687640 7689436 scaffold_2 1460561 1462513 - 10515|1973 2048
TATTTATCCCGAATTTATGA---TTTATTCGTGTTCATTAAAAT--ACTTAACATAAGAGGCCAGCAAATCGTCCA
TAGTTAGCTCGTATTGTTCGATTTTTGTTCATATTGGTCAACATCAAAGATATATATGAAGTTAGCAGATCGTCCA
>CG18585 7689366 7689446|8424 chr2L 7689437 7691434 scaffold_114 43323 45303 - 48890|0 9
GAGCACGATT
TC-CAAACTT
>TepII 7693800 7693907|8427 chr2L 7693581 7693895 scaffold_70 6417 6718 + -864|248 343
AAACGATGGTGTAAACATTTGTAAGAAGTATCAACAGACCTCCCTTCGAAAATATTAAATAAAAAACAAATATTGTGAGCATTCAAATAAATAACA
AAATTA----ATATACAGTTGT-----------------------------TCATTGTCTAAATTGCTAGAATTCAAAGCAAAGACATGAATATCA
>TepII 7693800 7693907|8428 chr2L 7693897 7695406 scaffold_6 633660 635268 - 8886|0 10
GATCCCAGAGT
GAAACGGGAAT
>CG13795 7723310 7723555|8471 chr2L 7723528 7724132 scaffold_6 5380116 5380722 + 17736|0 27
TTACTGATGCACTTAGAAATGTACTAAA
-TGTTGATGAGCTTTGAGATTTGTTAAA
>CG31904 7734411 7734663|8483 chr2L 7734141 7735237 scaffold_6 5396985 5398084 + 16018|293 608
CACCTGAACAGGATCCTTTCATACCTGTCCCGAAAAAAAGGAGTCA----------TCAAAATTCTCTTCCG-ACCTAAGCACC------CGGCCACGTTTGTGGTTGCCTATTTCTCTCGCTTACCTATTTATTTA-----------------GCATACATTTTCCAAGCATCCTGTGAAAAAACCATCACAAGTTTTCTTCGAACGGAATGCCAAGTGCATTCTGGAAGGAAATGCTTGTACATCTACATAATGCCAATAAAG---------------AAAAT-------GTAACTAAAGTATAAA-------C
CATCTAAAT--TTTCCTTTCGAACGCACTCGCTAAAATCTCGCTCGCTCTATTTATTCAAAAGCCATTTTCGTAACAAAGTGACAAAAGAAAATCAACTATGAAATCGACTTTCTTTCTAGATAATAAATCTATTTAAAAAAGTTCAAATCAACGAATTTTTCTTACAATTATTTTGTG--TTAATTTTCAAGAGTTTCTAGTCATTAATTAAGCTAGAATGTTTCTTTCGCAAATACTTTAAACTTTCCAGAGTTCCCAGAAAGGATTAAAGCTTTCTTAAAATTTCTGTAATAATTCAATAATAAATAACACCT
>Acp1 7740552 7740955|8487 chr2L 7740281 7741702 scaffold_6 5396985 5398349 + 21133|294 760
GGAGTATACCGCCTTCAATCCCTTTGTCGATCGGACCATTGCCTCTGCCACGGATACTGCCATTGATGGGGAAGTCGAACTTTAGACCCCTCAACACGTTATGTAAATACATTGTATATATAGCCATATATAGACAGGGTACTCGCACCTAGCACCTGAACAGGATCCTTTCATACCTGTCCCGAAAAAAAGGAGTCA----------TCAAAATTCTCTTCCG-ACCTAAGCACC------CGGCCACGTTTGTGGTTGCCTATTTCTCTCGCTTACCTATTTATTTA-----------------GCATACATTTTCCAAGCATCCTGTGAAAAAACCATCACAAGTTTTCTTCGAACGGAATGCCAAGTGCATTCTGGAAGGAAATGCTTGTACATCTACATAATGCCAATAAAG---------------AAAAT-------GTAACTAAAGTATAAA-------
T-----TACGGACTT-------TTCACCAATTGATCCGCCCCAATGGAAAAGAATATTG----TAATGAAAAA-------------------------TGTTGTAAATAC-TTGTAT--------ACTCATAAACAGGGTTCTCGCACCGGCCATCTAAAT--TTTCCTTTCGAACGCACTCGCTAAAATCTCGCTCGCTCTATTTATTCAAAAGCCATTTTCGTAACAAAGTGACAAAAGAAAATCAACTATGAAATCGACTTTCTTTCTAGATAATAAATCTATTTAAAAAAGTTCAAATCAACGAATTTTTCTTACAATTATTTTGTG--TTAATTTTCAAGAGTTTCTAGTCATTAATTAAGCTAGAATGTTTCTTTCGCAAATACTTTAAACTTTCCAGAGTTCCCAGAAAGGATTAAAGCTTTCTTAAAATTTCTGTAATAATTCAATAATAAATAACACC
>CG7214 7743677 7744207|8491 chr2L 7743624 7745230 scaffold_6 5400730 5402578 + 42134|61 776
GTCGGGAGTGACGGATAAACC-------ATACCCAAACCGATGCCAAACG----GAGCGGATGGATGGCAGTATCAC-------------------------------------------------TGATCTCCACCTGCTTCAGCGACTTCCCACGACTACTCCAACCGGATGAATACCCATCTCTCTCTGTACAC-TTATTGTTAAGCACACCGCTCTTAGTCCC-------AACCCCCTCG----ATACGAACACGATCCTGATCTTGGGTCCATGTCCATATCCTCTGGACATTTTC--------CAACGCACTCA------------------------------GCAATATATAAGTC---CAACAGCAATTACAACAACTACAACA-----AACCAACAAACGACAGCATGTTAATTTTCTTTT--TTGAGAACT--------------CTTTCAATACTTCCCATCTGCTATCCTGTCTTCCTCTTCTT--TACATCTATCACTATATACTTCTTATATCTATCACTATCTGGCATATCGCCC--------------TAGATATGCCCTGTCAACCTGTAAATATCC------------CATTGTAATCTAGTAATCTGCAACAATGTAAAGATTGACG-AAAACGTTATAAATAAAAGCAATCAGCGTTT---TTTATACGACA-------------------TAAA
GCCAAAAAAAAAAAACAACCCACATCAAATAACAAAACGAATGCCAAATGAAGTGAGCAGCTGGCGGGCAGGACAACACAGTCGGGATCACCGTGCAATTGGCCAACCAGTTGTTGTCTAACTCTACGCTATCCACTTCTTTCCACGA-TTTTAACGACT-CTCTACTCGGATACTCTACCACCACCACAGCCACCCATTATTCTTAAGCACACCGCTCTTAGTCCCGTTTGCGAGCCATTGCGGGGCATCTGCGGGCGACTC---------GTCCGCCTGCGGATTCCCTGGACTGGTTCACACCAAAACACGCACTCACTCACGCGCACATTTGAGTTAGTTCTGTGTTCAGCAAATAAGTCCAACAACAGCAACAACAACAATTACAACAACTACAACCAACAAATAACAGCATGTTAATTTCTTATTACTTGAGAACTTTACAAAACACCAGCTTTTCCGACTTTCCCTCTA----TCTATCGCCCCCATCTTTATATATTTGCAACAATATACT--TTCTATCTATCACAATCTATTCCTTTATTCCTTTCAAAAATTTGTACATATTCGGTGTATATATATATATATACATACATACACATAAACTTATTGTAGTAATTTGCAACAATTGTAAGATTGACGAAAAACGTTTTAAATAAACTCATTCAGCGTTTTTATTTATGCGAAAAATTTAAGGATTTCATTTCAAGA
>CG7203 7752168 7752430|8499 chr2L 7752142 7752840 scaffold_23 524795 525543 - 19663|26 339
TCAC---CTGAAATGACTTCTGGATTACCCCTACATTGATCCTGACCGCCACTTGCTCGCATCTTTACCACATTTTTTGGTTTTTTAAGTTACCGAAAGGTCTGTCC---------TCTGCTGAGATCCCGTT--GGGTTCTCATTTCTTCAGCAA------TCTAAGTCAATCCTATCCAGTCTATCGCTTTCCGCTTTACTCTCTG---GTCTAT--------ATTTATCCACC--CCGCTGTTGTCACATG-------GAAATTTGTTTC-----------TTTTTGAATAAAAAAATGTTATTAAAACAG
TCACACTCTGGGATTACAATTGCAACAGCCCTGCCTTTGACCTTGCCATCGATT-----CGTTTTTAGTTTCCTTTGTTTTTTGTTTATTTCCCAAAAGG-CTATCCCACGCACATCTTACTGCCATCTAAGTCAGGCTTCGCCTCTTATCAGCAGCTGCGCTTTGGCCAGCTCCTCTCCTACTCTACTTATTCTGGTCTTCTTTATGTACTTCTATTCCTTACGATCTGTTAACCAAATGATATCCTCACATGCACATGAAAATTTTGTTTCAAAATAAATATGTTTAAAATCAAAATAAATTTTTTACTCAT
>CG7149 7786157 7786899|8534 chr2L 7783286 7786172 scaffold_23 606716 609714 - 122877|3047 3063
GTATTTGCTAGGT-AAT
ACAT---CGAGGTGAAT
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AACT-AATTACATACTAACTAGAAAAAAAAAACAAAAA-CAAAAACAATCAAAACAAAACAAATTCAACGAAATACGAAAATACCAAAAGGGTTGCCATTTTGTATGTG-------ATATAAATGTGGGTGTTACAAAATTCTCTTTCGCCTCGCTCTGGTCTATATT-TAAGTGAACCATAC-----TCAATACATTAGGTCT-CATGCGCCGCATAACGT------TATGGTAAAGTTCACCTTAGAGTTATTCCTTAATCTAA--CCTAGACTAAGTATATAAA--TACTAAATATCAATATTTATTTATTTATAATTTGCTGAGTACTTAGTGCATGTAATGAGGCAGCTGCAAATCGCATG-TGACATG-----ACCTAAC-------CCAACTGCATGTTCCGATAAGTATTCCACATAATATGCATTGCGATAG--------TGTAG-----AATCTATAAAAGCGACAAGTCCACACTGAGAGT--------CCGCATTATGA-TTTCTGTAGATAACTAAACCGCCTGGCAACGCTGTGCAGGAACTGACCGAGACCAATGAAGTCACAAAACGCACGGAGACCACTGAAGAAGTGTAAACGGAAAAGCC---------ATTGGATTGTTTTCCACATTCAATTTCCGTTCTTTAGTACAGTTGTG-TAAACGTTTTCTTTATTTTAGTCTAAG-TTGAAGTCGTACCAAAAATGTTACCGTTAAGATATGAAAACAAAAAGCTTACGATGTGCCTTATTCCAAGTC
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AGGAT
AGGCT
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AC----GGACTTTATATTTGACATAGCCTGTATTAATTGATTGCAAATTGATTTGTTTTTTATGCCAAAAC---AATAAATATAAAGCGACACTTGTAAAAA
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GGGCCTGGCCTCCAAGCGGCACAAGTTACAAGTTCAGCGCCGAATGCTTTTCCATTTAATGGCGCTATATACCTTAAAATTATATATACCAAATACATATATATATATATAGATATATGTGCATTATGCAGCCCCGTTTTAATGCGCTACAAACACAGCTACAAATGTACATTTAATTGTT---AACTTAATCGTTGTTTAC--CTTATGAT------CGAAAACAATAAAAGAAAAAACCATTTTCAATGCAATCTGCTGGCGCGAGTCTC
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ATTACCTGACTCTGAGCAATTAATACATAAACAAT---TGATAAATGTAATTGAGACAAGTAATTG---TAGGTAGAATGCCACTGAATGTATTTTAGTTGTTGTTAAGTAGACCTTACGTAAGCCCTAATCGGTAGCTCTAATTATGAACAATTCTACACATAGTTAAGATTTTATCCGAGCCATATGTATATCTCCACTATTCTCTATATCCCCTCCATCAACATGCGATATTACTCAGCCTCCATTT-TTATTGTACGGTAATTATAAACGTAATTGTAAAACGATT-CAAGTGAATAAAGTCTATGCAAATATT
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AATTAGACAGAAATTTTTGTAGTTCCAATTGCCCAGCAGCTCTCAGCTGGCAATAAAATT--------------------
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GC------------------TTAATTCTCGTAAAACTAA-TAAAAAAACCATACATC------ATAAGTGATTTAATTGTAAG--------CCGAAAGGTTATCCACAATAAAATGAAACAACTTTT
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G--TAGACCCCCGGCCCGGCCCGCTCCGCCCCGCCCCTTCTAGCACCAAGCAGCTGCCGCAAACGCATTGCAATTAACAGTTAGAACTTAGCTCATATAGTCGTCTCTTTCACA-------------CACACACACACACACACAGC-------------------------AAGCTAGCTAAGCTTAGCTTAAATCTTT----------AAGAAACCAAC-----------AAAAAATGTTTAAAAATTATGCTCAAT-----GCTTAACGCACATGAAATACCCTAT------CGCAGGGTATG---------------CTGCGATAAAAACGAA-----AAAGAAAAC--------ACACGACATTTT--TCAACACTTTCTCTA---AACATTTTGTATAGCTT-GTTTTGATC-TCACGTATAACACAAAATTTGTTAGGCTTCCAAA------TTTG---TTCTGTTCTATAGAAACTAATTCTAAATATGTTATACTATTATTTTGTTAAAAAAAAATTTCTTCAACTTTGCT---------------------GCAGAAGTTATC--AACATTGAAACCAAAGCTTTAAA-------TAAACAAC-------------------AAAAAAAAAAAAACTAAAAAC------------------------AAAACAAAAAATAAAAGTT
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TACAAA---CAATAAATGTCGTACTTAAAT--TTGAAATATTACGAACAACT----------------TTTTCGAAAACTACTTTTACAAAAATGACCAAAAAAAAAAAAACTTTACACGCAA
>CG7228 7987105 7987876|8782 chr2L 7987289 7988437 scaffold_18 932623 933801 - 17192|0 673
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TATACATATATCGTTGCATCTTG-CATTTTCAATATATTGCCTTAGGGGA---GCCAAAGACATACT--CCGCGCCACGTCT------------------CGCCATTAAAACAC---------AACAGACGTTAGTTAGTTGATTGATGTTGCCTTTTGTCGA-GTTGCCGCATTCATAGCATTAAATACGTACTATCCCTCCACATACACACATATCCATTCGTACAAAAATC-CATCATGCTCATATAGTTTCCTCACACCAAACAGCACCAACATACATAATACATACATGCTGCTGGAGTATAGAGAGAGATTGATAAGATTATTTATTAATTAGTGCCAAAAAGTGAATGA---------TAAAAAGTCATCGACTATTTTAGTA-GCTTAACTTAACTGTATATA-AGTGATT--ATTCTAGCTCCAAAGCTATCAATCCCCTTG----TATAAATTTAAACTGCGCACGTCCAAAGTATTTTTATATTATATATTTATATACATATATAAATTTAATGCATACTTTTTTTTTTAGTTAGCTTTTATACAACGCGGCTCCA-ATTCGCGTACGCATTCAAATGAAGTGATACAAAGCTTA------------AACGCATAAATCGAGCATTCTCCAGTGAATACACGCGTAACATAAAAAAACAAAGA
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AATTCAAATGCAGTTCTCATCATATTTAAAGAAATTGATAACCCAATCTAAACACTAATCAGGATTAGCTGCCGCTATCCGTTTATAAGCGTATATATCTAACTATATGCATATACTTATATATTTATCACCTAAAACTATTTAATCAAT-AAAATTATTCGTTTGCACAATGAAATCCCGCACTTTTTGTTTTTTTTTTTGTATACATA----------TTACTCATAT
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GCATTTGTATGGA---GGATAGGCGGGAGGTTAA----------------------------TCGTTTTTAGTTGTTTAAGTCACTGTCCTTTTGAATATATATTAATATAATACATA-----------TTTATTTTAACTCCGCATAATTTAGAAATCGAAAACAAAACATGTTATATATG---ATATATGCTTTTTGTCCCACTCGCCTTCCCTATAAGCCCCTTATATATTTGTAAAAGTA--TTGTAGTAAAA--ACTAAGTATATTATTATATTATCTATTTACACAAGTTCACAGTTGCAGCTGTCAAGAGCTTAGCGGCTCGATAAGATAAACTGCCCCAACAAACCGGTTAACCTACT-ATGCAGCAGCCTTATCTGACAAATATTTCTTTAGTACCTTGGT-GAGACGCTGTTTACTGATATGATATAAAAAAAACTATTTG----------ACAACTA---------AACATTGAGCTATGCGTGTAGCGCATTTTAAAGAACCTACCTAGAAAAACAAATAGACTTGCGTGTTATCTGAATCAAATATTAACACTTAATCA----GCAA-----CAACTTTGTAGTGACGTTTTTAAATAAAGCAAAATTTATTATCGCATT
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GTTGACATTTGGATACAA----TCTCTTAGACCCA-----------TTTCGTTTTTGCATTCTATACTTATAAATGCTTAGAGACAATTTATTTAACTATGTTATTTGTTAGCAAAATCATACAAAGAATTTTTAAAATGTGCAACGCTAACCTGGTTAATGGTTTTATGAAATTTAGAAGTCTTGCATTGTCAGAATAACGTACGAAAACAATTTGCAATTGAACGATGTTCCAGGGAGAACATTTCATGACTTTATATATAAACATACTGCAT----ATCCACTCTGTGCTGTTGTTCTTTTTGTAATA----------------TAACTTTGTAATTTGTATGCTAATTAAATGTGTATTTCTATTAA--TATCAAATAA
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ATATTTTGTTGCAAT
ATATTTCAGGTAAAT
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TAACCCCGAGCTGCACTTTAAGCAAGCTCTAGACTTGGACGGCATCTTGGCGGAAGCGTTCGCAATGTACTGCAAGGACAACAACATACAGCATCAACCAAAA---CCAGAGCATGA------GCAGACCAAAAATGAGGATCTCAAGGCTTTCTATTCGTTGCCATATTCCGAGACCACGGGCTATTTGGCTCGCGCCGCGGTCAACAAGGTTTTGCAGGGTGGCATCTTCTCCACCAATGAAGAGGATGTTCAGCTCGATGGCGATCGTTTGCACGACGACAACTGTAAGGTATCCTAAGCCAAGGAAATCCGGACTTAGATTATGTACATAGCACAGTTTGACATATTTTCGT------AGTACT-GACCCACCAT------TAGCTCGAATGTTGTAGCTATTTTATTCTGTTATTCTAATTTAACTTGTCTCTCTCTGTGTCCCTCGCCGTTCGCCTAGTTCTTAATTAAATGTTATGT
CAATCCCGAGCTGCATTTCAAGCAGGCGCTGGATTTGGATGGCATCATTGCCGAAGCCTTTGCCATGTACTGTAAGGACAACAACATACAGCATCAGCCGAAATCGTCGGAGCACCAGGCTCTGCCAAACAAGCAGGAGGATCTTACCGCCTTCTATTCGCTGCCCTACTCGGAGACCACGGGCTATTTGGCGCGGGCGGCTGTTAACAAAGTGCTTCAGGGCGGCGTCTTCTCGACAGCCGAGGATGGTGTGCAGCTCGATGGGGATCACTTGCACGATGACAATTGCAAAGTGTCCTAAGACGAGG--TCCTTTATTTCACTTTTGTACATAGCATAGTACAGCATATCCTTGTTGACCAAAAACTAAAACCGCAATCCAAAGTAGTTCGAAT-TTGTAGC----CTATTC---TATTTCATTTTAATGTGTGCCACCAT------CTTCTTGTCCTTTTAGTTTATAATTAAATGTTATCT
>CG8475 8191485 8191757|8952 chr2L 8190969 8193626 scaffold_344 7613 10300 - 125110|546 818
GCTCACTACCCTACAACGTCGTCAACTGGAGGGATGCTTGTGCCGTGTGCCAAAACATTTTTATAACAAAATCTGGGAAATCCTACAGCGAACCCCTCAAGGCATACTGACCCAGGGGCATCATTTGCCAGCCACGCCCACACTAACCAACATGAGCCGCGGCGAGTTGACCTTCAATCTGCTGGTCGAGGAAACTCTGATTTGCATTGACCGTCCGGAAAGGCGTCAGATAACCGTGGAGCTTTTGTGCATTGTGGCCACCATTCTTAATCG
ACTTACAACACTGCAGCGACGCCAGCTGGAGGGCTGCCTGTGCCGCGTGCCGAAGCACTTCTATAACAAGATCTGGGAGATTCTGCAGCGCACGCCACAGGGCATATTGACGCAGGGTCATCATTTGCCAGCAACACCTACGCTGACCAGCATGAGTCGCGGCGAATTGACCTTCAATTTGCTGGTTGAGGAGACGCTCATCTGCATTGATCGTCCGGAGCGACGTCAGATTACCGTCGAGCTACTCTGCATTGTGGCCACCATTCTGAATCG
>CG8475 8191813 8192429|8952 chr2L 8190969 8193626 scaffold_344 7613 10300 - 125110|880 1496
CACTTCGATACCAAACCCACGCCGGATATCATCAACGCACTACGTAGCACGGATTCCATTTACTGTTTGTGCCAATTGTGGGGTATTATTCTCAACCGCGAGGGTCCTCATTTTGAGGTAAACGGTCTGAACGTAAACACGGCCTTGACGCAGCTATACCATCGCGCTGGTTCCTTGCGCTACTGGCGTGCCGTGCGATACTGTTCCTCTCTTCTTCACCACATTGTGGACTCCATTAGTCCATTTATCACCACTGTGTTGGTGAATGGCAAGGAGCTCACAGTGGGCATCATTGGCCAGAAGGAGACGGTATTCGACAAGCCAATGACGCCGGCGGAGATTCAAAATGTCATGTACACGAGTGTCCAACCCTACGACGTCATCCAGGCAGTGTTGCAGCAGGAAGTGGTTCTGTATTGTGGCCGTTTAATAGCCACCAATCCATCAATGTTTCGTGGCATATTAAAAATTCGCATTGGTTGGGTACTGGAGGCCATGCGCATCTATTTACAAATCTCAGGACAACAGAGCATTGATGTTGACAACCTTTCGCCCTTCCAAGTCCGCATACTTCTTCAGAAAGTCTTAACCGTCAGCGAATGGGCTGTAGAAGAAAA
CACTTTGACAGCAAGCCCACGCCTGATATTATCAACGCGCTGCGCAACACTGAATCCATCTATTGCCTGTGCCAACTGTGGGGCATTCTGCTCAATCGCGAGGGCTCCCACTTTGAGGTTAACGGCCTCAATGTGAGTACTGCGCTCACGCAGCTCTATCATCGCGCAGGCTCTTTGCGCTATTGGCGCGCCGTGCGCTACTGTTCCTCTTTGCTGCATCACATTGTGGACTCAATCAGTCCGTTTATAACCACTGTGCTTGTAAATGGCAAGGAGCTAACCGTGGGCATCATTGGCCAAAAGGAGACAGTCTTCGATAAGCCGATGACGCCCGCCGAGATTCAGAATGTTATGTACACCAGCGTGCAGCCATATAATGTGATTCAGGCGGTGCTGCAGCAGGAGGTGGTTTTATATTGCGGCCGTCTTATAGCCACAAATCCGTCCATGTTTCGTGGCATATTGAAAATACGCATAGGCTGGGTGCTTGAAGCCATGCGCATCTATTTGCAAATCTCTGGACAACAAAGCATTGACGTAGACAATTTGTCGCCCTTCCAGGTGCGCATTCTCCTGCAGAAGGTGCTCACTGTCAGTGAATGGGCCGTTGAGGAAAA
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GTGGAACCTGTGCAAATCTGGAGCTCTACAGAGCTCATTAAAGTATATCAACATCTCGGAGTTAACAACAAGGTTGGCCTGTCCGGTCGTCCATGCAGACCGGTGGGTTCTTTGGGCACCAGCAAGGTGTATCGCATCTGCGGCATGACCGTCCTCTGCTATCCACTAATCTTTGAGGTCTCCGACTTTTATCTCTACCGGGACATGGCTCTACTTATCGATGACATCAAGACAGAGCTACAGTTTGTGGGCAAGTACTGGCGGCTATCGGGCAGACCTACAGTTTGTCTGCTTATTCGCGAGGAGCACATGCGTGATCCGCAGTTTAAGGAGATGCTCGACCTGCTGGCCATGCTCAAAAAGGGCTACTGCGATGGCATGAAAGTTCGCATCGGTCGTCTACAGAATCTGATTAGCAGCTCGTGCATCGAGCATCTTGACTTTATGAACCAAAGTGATCTGACCGACAACGAGAATGCGTTCTCGCAGATAAACCATGAGTATATTGGCTACCAATCGCTAACAGATGTGCCCAAAGCTCTGACATATGTGGAGGAAAAGATTTCTGTTGCG
GTGGAGCCTGTGCAAATCTGGAGCTCCACGGAGCTGATCAAAGTCTATCAGCATCTGGGTGTCAATCACAAGGTGGGCCTATCAGGTCGTCCCTCGCGCCCAGTTGGTTCGCTCGGCACCAGCAAAGTCTATCGCATCTGCGGCATGACCGTACTCTGCTATCCGCTAATTTTTGAGGTGTCCGATTTTTATTTATATCGTGACATGGCGCTTTTGATCGACGATATCAAAACGGAGCTGCAATTTGTGGGCAAGTACTGGCGACTGTCCGGCAGGCCCACAGTCTGCCTGCTAATACGTGAGGAGCACATGCGTGATCCGCAGTTTAAGGAAATGCTTGATCTGCTTGCCATGCTCAAAAAGGGCTACTGCGATGGCATGAAAGTGCGCATTGGCCGACTCCAGAATCTTATCAGCAGCTCCTGCATCGAGCATTTGGATTTCATGAACCAAAGCGATCTAACAGACAACGAGAATGCATTCTCACAAATCAATCACGAATATATAGGTTATCAATCACTGACAGATGTGCCCAAGGCCCTTACCTATGTCGAGGAGAAGATTTCCGTGGCG
>CG8475 8193121 8194921|8952 chr2L 8190969 8193626 scaffold_344 7613 10300 - 125110|2197 2759
TTTTGATAGGGAACT-------CTAATCGGCAAAAATATATCAATTGGAAATATCCTAAAAAAAACGTA--TGATACATTTTTCCAAATTCAATCCCAAATT------------------TACTAATGGGGGTTTCAAATTGTAAGATATTATAAAATTCTAATATTTGTTTGGCATGTTAATATACTCCAACTGTTACTTAA-ACTCTCCCAAATCCCGCACT-CTTATCCCTCTGCTAGTATTTCCCTG------ATCCTTTCTTCAATTTATGTTTACCTTTGTGTGTTTTTGCATTTTGGCATCTGGCTAGTACAAATTTTC---TTGTCATGTGATTAAAACCCAAGAATATTGAATTGGCCTCATGCAT----------CCTAACAT-ATAATATTGT-TCGAAAATGCCTCTTCTCATAATACCTTGGT-------AATCCTTACAGGGCACAGCCACTGATCTTGTGGTGCAGATTGTCCTGATTGCCGAGTCCATGCGACTGCAGGCTATGATGGCCACCTATGGCATTCAAACACAAACCCCCCATGAGGTAA
TTTTAATACACAATTGCCTGAACTAATGATTATTAATTTA-CAATT--AAATACTCTAAACTAGCTGTAAGTAATATATTTCTGTACAGTTTGTTACCAGTTATTTTTTCTCTCTCTCTTTAGTGTTATGTGTTTCCGGC------ATGTTTTAAGCCCTCAACACCTCTTGT-----TCTATATGCTCCACCTTTTTTTTCCCACCTTCCTTTCTCTGTCACTGTTTGACTCTCCGCTAGCAT---CCTGTGTGCCACCAATTGTTTTATTGATTGTTATGCTAAT-TGTTTATGCATTTTGGCATTTGGCTAGTACAATTTTTTACATTTCCATGTAAA-----------------GAATTGGCTATATGCATTTTCTAACTGCTTAACACCAGAAGATTGTGTCTTAAATATCATTACT-----TACCTTTGTTTCTGCGCATCCTTACAGGGCACCGCCACAGATTTGGTGGTGCAAATAGTGCTTATCGCCGAGTCCATGCGTCTGCAGGCCATGATGGCCACCTATGGCATACAGACTCAAACGCCGCATGAGGTAA
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GATTGTACTTAACCATCAAAGCAAGCTATTAATAGTTAGTCAAAATTGA--TTAATATGTTTT------TGATTTATTTTTGCTACAT------CGTTTTTAATTTAACATTTTTTTTTGCGGGACGCAAATACTTCAACAAAATTTATCAGAAAAGTCCGCACATATTTGCTATAAAAAATATAGTTGCAAAAATTAAATGAAATTGTTTCCACTAATTAAATGCCCATTGTTAAATGTACATATACATATTTATTTTTCAACTAAAAAAAACCCAAAAATGAAATAGAAACGACGCGTACCGCTAATATTGGATGCAATGCAGGTAATTAGT-GGTTATATTGTGCGGGTCCTGAGCTAAGAATCTCATCT
>CG8475 8193121 8194921|8954 chr2L 8193961 8196416 scaffold_2 6636329 6638772 - 82836|0 1077
ACATCGTTATTTCTGAAAGATGAAAGAAGTTAAGAAACTATGATTTCTCCTTTTGCCATTGGAAAGACATTTCATAGCGTCGGTTTAAAAGGGTTC--CTACTTGCCTATATGGGAGTTTTCGCTTCTGCCGCCGCTGCCGCTGATGAGTTTTGTGTGTCTGCCGTGTG-----TGTCT-----GCGTTCGATCTCAATTGGAATACTTTACACATAAGTTGTT-------TTTTGCCTAAGTACATTAGATGG--GTTTAGT--TTATAATTGGCTCTTGATATTTAATTCTATATACA-TCTATTCATTCTCTACTAC-------------CAACCACTACC-CAATACTACTGCTACCACAC------------------GTCTATATATCCAAAATGATCAAAATCAAATCCCAAA---TTGTATTATAATTGGTT---------TCGTAAAAACAGGGCAAAGCTATTGACGAAAAACACAAAGTAAGTAGATGCCCTGCTGTACCAACATATTTTATTGATTTCTAAATTCAAAATTATCTA----AAACCTAAATTATGCGTATGTGTACAAACTAAATTTTGCTTTTTAAGACCACAGACACATTAGCACAAAAGATCACTACCTAGTTTACATTGTGGCTTTTCATGTTCGGCAAGACACACTGATCGAAAATATATAACTATG------ACACGCTTTACGATCAAATC-AAATCACACACACCTACACTATAGAAATGATTATTTGCCTATTTTCAGTATAAATTATT---------ATTTCTGTATTCCCGTTTTATTTGTATATAGTGAACAAATTCTTTTTGGTATCTAAATCAAAAGT-TTTCTCTCTACTCTTTTCGGTTTCTTTTCCT-------------------CCTTATATACCTATCAATATACTGCATATTTTGTT---TAAAAAATGAACATAAACACACGCTCTATAGGCTAAACCGGGCACTGTAAGTAATTGTCA---CCAGATTTTGGGTTTATTTACGTAGTTTGCAGTTCCTA---ATTTATTATGTAATTAACCCAATGGCCGCATA
AC------------------------------AAAAAATATACATT-----------------AATATATACCACTGAACCGGGGGATAAGGGCTCAGCTAACTGCC---------------------GGCGCCGCTGCTGC-------GTTTCTGTGTCTGCTGTGTGTTCGCTGTCTAATTGGTATTCGATTTAATTTGTAATGTTT----CTTTAGTTTCTATTATACTTTGGGTTAAGTAATTGAATTGGCTGTTTAATACTACTTATCATATATGAATATATACATATATATATATTTTGTCCATTCTCTACTACCACATATATACAACAATTACTACTACACTACTACTGCTCCAATACCCAAAACAAAACCAAAAACTATATATACCCACAAC--CCATAAACAAACCCCAAACATTTGTAATTCTATCGGTTGGCATACACTATTATAAACAGGGCAAAGCTTTCGATGATAAACACAAAGTAAGTAG------------CCCAA------------ATTCCTATACAACAAATTACTCGCACTCAATCTGATCGATCTATCGATCTATTGTCAAAATTAAAACTTTTATG------------TTAAAAAAAAAGA--AGCGCTTCTTTAATTTTTTGTTATTAGATGTTTTGCACA--TTTTTTATCCAAATTTTATTATTTTGCGACACACACACACTAAGCACTGATCGAAGGTATGCGTATATATA-TATAGTATTGTGTATATATATGACATTATTTTGATCAATCCCTGCAGGAAATTGTATACTGCGGTTCGAATGATTGAAAGACAGCAAACTGTCTAAGACAAGCAGGTCTTAAATAATGCAGTTTTTTTTTTATAGATTATTTATTTAAGACAAATAGCCCACACATTCTATAACCCTTTCAGAAGAAGGTAAATTTTGTTTTCTTAAATTTGGATCTGAATATACTTAATATAATTT----------CTTCATGTAGTTTTTATTGCCAGGGTTTTAATAAATTGAACAGAATTGAGGTTTTCGAATATTTCAGATGTACCAAAAGTAATGTCCACGTA
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-ATAGACGAACCAGAACTTCCTGTGCCAAACTAATGGAATTGATGGCATTGAATTCCACACCCTGTTTTGTTAGCATAGT----TTGTAGTTGTAGTTGCTTTGT-------GGTAGTTA--CCTTATAGA----TAGCCTAGTC--TAGTACAA--TGTGATCCAGATATTGGAAGA------CATAAACCGAA-----------GTACAGGAACCTATGAATCTGCAT-CTCAGAATACAGAGTGCACAATCATTAACGTTATATAGTAAATGTATTATAATATAGCTTTATTTAA----TTGTTCTGTTTGTATCCGTTCTTTACTTTCCAGCCTTTGTTCAAGCATTATTTTTTTGGCATTTTCGATTTG------------TAGTCAGCAGACTGTGTCTCATTA----TGTATTCCGTTTGACTTTACAAGCATAATGTCTGTGAT--AAATTCAATAAATAGATCATACATACT
TGTATATATACCCTAAAATGGAATGGTTAGCAGAAGAAGAAAAAAAAAAAAATTCCCAAACAATACGTTGTGGACAAGCTCTAATCGGAGACGCAGCTCCTACATTCTATAAGTTAGTTAAGCCTAACATAATCTTAGTTTAGTAAGTAGTACAAATTGCAGTTCGGTTTTGTGAAAAGACGCGCACAAGCACAACGTGTAACATGGTACAGGAATTTATGAATCTGCATACACAAGTTGTTTGTTGTATTATTATT------------TATATATATACTTATGTAGCTTTATTGAAACTGTTTTTTTTTTTTTGTTTGTTTGTTGAATTCCAG-------TTAAAACGTATTACTTTGGCATTTTTG-TTTGTTCTTGTTCAATTAGTCAGCATACTGTCTCTCAGAATGAGTGTATTCCGTGTGACTTAGCAAGCATTATGTCTGTGATAAAAATTTAATAAATATA-CATATATG--
>Su(var)205 8209626 8209834|8961 chr2L 8209832 8211132 scaffold_2 252548 253774 + 24308|0 2
ACA
GTA
>CG8372 8212039 8212118|8962 chr2L 8211441 8212924 scaffold_2 253911 255260 + 27300|622 701
TATTCATATCTATATCAAATGCTATCAATGTACAAATCTATGTACATATGACGTCCAATAAAGGATTCATTCATTTATGT
GGC------------------CTACCAATTAATTCAGTTAATCAAAAAT-ATGCCTAAACAAG---------ATCAATGT
>CG8292 8216854 8216973|8968 chr2L 8216166 8219100 scaffold_2 258372 261329 + 58242|733 852
TTCTCTACACATTGTTTTGACTTTTTGTCAAGTTAATCAGATCGCTAACTTAAATTATTTGCAATACTTATTGACATTAGAACGAATAATTTTATTGCATTAAATAAATTCTGGATATTA
------ACACGCAGTTTGAATT-----------------------TGATTTGAAATA-GCGAAATATATGCTGGT-----------TTATTTTA--ACCCTACACAAAC------TAATA
>Snx6 8218066 8218410|8968 chr2L 8216166 8219100 scaffold_2 258372 261329 + 58242|1993 2395
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AT------GCCGA---CAGGCTAGGCATAA---------TCATCTGCACATTGTTTACACACCATTATTAGCCAAGGGCCTCC---------------------AAGGAGTAAATCAATTGGTTT-TTGCTAAGCAAACAGTTTTATTATCTCTTATCTACATATTATTATTAAATGCATATGCATATACGTATACATATATGGCATATGTAAGATCTAGCTAATGCTTTGAATGTATATGCATTTCCGAATATGAATTTGTTTGTGAAACAGATCGCTTTTATATATGTATGTATATTGTATAACGAGCATTCCTCT-------ATGAACTTTAC-----TATTATATGAACA-TTGAATTCTAAATATAAAATTATATACAATAATCTTTTTGAAAACTGT
>Spn2 8240415 8240464|8985 chr2L 8240250 8242153 scaffold_3 1985889 1987777 + -1049|177 227
AATGTACTATTTCTTATCAATAATAA-ATGGAAATTGTATTATACTTTATT
AAGGTGAGAATAAACAGTGGCGATAATATGAAAAT--AAATACAATTTATT
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ATGAAGCTGAAAGCTGAAGCTGAAGCTGAAGCTCTTCCACTTACCAAATCCTCACTCTGCCCAAGACGGTCT----------------------------TCGATGAACAGCTTCCTTACCTTAACT----------ACACTACCTTCGCTACTCGTATC--GGACTAACCATAAGTTTTAATTGTTTCTCAAACGTATTTGTAAGCCGAAAGTGTTGTGGAATGTTACAATTGTATACACTGATATATAAAGAGATATTACTAATATA
----------------------------GAACTCCTGGACTCCCAA----CTCGCCCTGCTCAAGATGGTCTCACCCCCCCAAAAAAAAAACACGTAACATAACAAAACAGCTTCCACACTTTCAGTTGCAGCTCAGACTCAACTTTTTGTGCCTAGAGCCTAGACTAACGTTAAGATTTGATATTTTTTGAATTCTATATTTTAAGCTAAAGTGTTGTAAAATGTT-TAAATATATAC---------------GGTATTACTAA----
>CG8086 8244545 8244585|8987 chr2L 8244090 8244765 scaffold_6 1674256 1674942 + 10300|505 569
GAATG--TATTTTGCCA----------------------TTAAATTCATTTGGTCAACACATCAT
ATTTGAGCGTTTTAGCAAAAGCACAAACAACAAATCAAATGAAAATCAACTGAATATGACATTTT
>Btk29A 8259504 8260537|9009 chr2L 8259352 8260679 scaffold_638 4949 6429 - 19705|214 1436
GGAGCGGACCAGATTGCGGCACCCATCGCCTGAAATT--------AACACGCACTGA---------------------ACACACTGAAGCATCTTAAGATATTGAAGA-ACGTTA----------AAGGCATTACATTTAAGGTTACAAAAGCGGCGAAAGAAAGATATATTTAGAT---------TTATACATATATGTATATGAAGCATAAGATTTAGTTA-AGCGCGAGCCAGTTTACATTACGGCACAAGCCCCATATGATTATGGTATATTTGGATTATATG-ATAGAGCTAGAGCTGAG---CAAATGATATCATTATGTTTAT-----GAACGCGTTAACTGTTAGACAATG---------AGATACGAAGCGCA-ACAACTGACAGTCACATATAGTAACTATATTAAATGAGAAAACGGAAATGCAT---------------TAAAGTATAGAGAACTGTAGTTAATAGTCAAATTTTTGATACATTTCACATACCGAAAGCGATATAAAAAAATTATAACGATACATGCATATG------ATACGATATT-----------------TAAATGTGCTTTTTTAAATAGCGAGCCACTGTGCTAAGTAAAATATGATTATCTCTAAAGAATGATAGAAACAAACAAACAAGAAAACTGATTATGCATTAAATATTAAATGTAAGCCTCAAGTCGAAAGCGAAATGTTTGCACAACTGATA---AAGGATGAAGGAACCGAAGGATGATAAGAAAAGAGTTCGCCAAGAAACATAAACGA-----TTTTTAGACTAGATTTGTACGTGCGTAGTTTAAGTTTTGTGATTTATTGTTTAATTCT--TGCAGACGATTTTTAT---------TTTTATTTAATTTTGATCTTGCGATGGCATCACCCACGCTC-ACAGTATGAATCAAGTACGGTATAATTACGAGAAATTTATACGT-TATGCTTTATATTTTAACTGAATTCTTTCGTTTTTTTG----------CAATGTCTATGCG-------------------------ATATAAATCTATATATCTATACACATATTTTACCCTATTTTTATG-AACGTTTTACTTAATTAATTTT-----ATCATTTGATTAAGCAACCAGAAATGCAAAAGAGAAAAGAAAAAACAGAAAAT-CAAATAAAATGTACGATAAACA-------------------TTTA
GATGCGGATGCGAATGGGATGGCAATGGATCGACTCTGGTCTGGGATCACGCACTGATTAGCAAACCAACATAAATATATACAACTAAATAT-TAACTATATTTGAGATATGCTATTCAGATATGAAGGCATTA-ACTTAAG--TAACAAAGC----AAAGCAAATTATGTTTGGATCGTGCATAGTTTTTCAAATATGTATGAACAGAA-AAGTTGTAGTTGCAGCTAAAGATTATTCACAAT---------------TATATTTATAACACACTTTATATATATATATACATATATATATGAGCTACAAATGATATCATTATGTTTATATATAAATCGAATTAGATGTGTGTATATGTATGTGCAAGGTTATAGAGCGCGTTTAACTG------GCATACAGAAGCGAAAGCAAAAGAAAAACATTAACTATATATATATATATATATATGGATTATAGTTAACTGTAGCAAATAGTCAAATTTTTGATACATTTCATAACAAATATACGATATGCATACAAAATATATATGTATGCAGACACACAATATACGATACTACGCAAATACATACACATATATATATTTATATATATAACTGTGCTTTTTATTAAGTAA---------GTTTATATAGAAAAAAAGAAAAATAACAACAATACATTTTATAATG-----AAAACTGAATCTAA----------GAAAACTGATTAAACGTAAAATTAATATTTAAGCA--AAAGTCTCGAAA------AAAAAAGGAAATACACAAAAAAAAAAATCGGCAAATTTGTTAGTTTAGAATTTTACGTGCTTAGTTTAAGTTTTGTGATTTATTGTTTAAACATTATGCAG-CGATTTGTATGCAGCGCAGTTTCATTTAATTTTTCT-------TAATTTTAACCAAACTCAACAATTTATA--------ATTATAATTATTATTATTCTGCCCGTGCATGC---AAATTTTAAATGGATTCTTAATTTCTTATGCACATGCTACCAATATATATATATATATAAACATGCATACATACACACATACATACGTATATATATATATATATATTTTA-TCTATTTTTATGAAAAGTTTTACTTAATTAATTTTTAAAGAACGCTCGCCTAAGCCAC--------------AAACAAACGAAAACAGAAAATACAAATAAAATGTATTATGAAAATAATATTTGAATTTTTGTGTTCA
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TGTGGACTTGGAGGGCATCTCATTCCCAATATTAA---CTAGCATTTTGTGTCGAACTTACTCCGCTGTCGTGCATTACCAAAACTCTTTTAACTCTAAACTCTATTTTTGTAGGCCTGATAAAGTGTAACGAATTCTAGCTAGTTAAGTACTTAAGTACAGTATTTTTTCAAATAAAAAATAATTGATTTGAAT
--------TAGATGATACGCCGAACCTAGTGCTAAGGGCACGCATTTAATTGTGTAATT-----GCTTTTGTTCACTA--AAAAC-----TAAAACTAAA---------------------------TAACTTATTA-----AATTAAGT------GCACAGTATTTT--------AAAAATCTTGAATT-----
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AATCGACTGCAGTCC-------TGTTCCAGTTCAA-GTTCAC--CCTATATCGTTTTTGTAGTTAAAATCACCAGCGAGCA-------------CACATTTTTCGTGCGTGTAAAACGACTT---TAATAAATTCCACTACTAAATTATTTGTACAAAAATGCGAAA
AATCAATTGACGCCCAAAGATAGGTTCAAGTGGAACGTTCACGTTTTATATAGTTCGAATTGACAAAAACAACAACAACAACAACAACAGCAAGCACATTGTATGTGTGTGTAAAACGAGTTTAATAATAAATGCCACAAATAATTTAGTAAAACAA----------
>CG7810 8309869 8310028|9079 chr2L 8303415 8309970 scaffold_6 1749284 1755826 + 241627|6781 6883
CTCAGCATTCTGCAGCAATAGACTTTAATGTTAATCTTATTCTTAGCCTTAAAAACTTTTGATCTTAGACACTAGAA-TACACGCAGTTGTTGAGTAAAAATG
CTGAGACTAATCCTGCATTCGTGTCCAAGATCAATCGCATGTTTAG--TGAACAACTTTCGCGCCTATTAACTAGAAATACATGCAGTGG---AGTGA-----
>CG7795 8316707 8317354|9082 chr2L 8312355 8316753 scaffold_6 1758138 1762591 + 188530|4463 4509
AAAAATTAAACAAAGTAATAAATAAAATTGTGTAACAATTGACTTAT
AATAATTATAAAAAACAATAAATACACAGATCGAATCGT--ACATGG
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ATGTACACGGACGAGAACCTCCTCTACTACATTGATCTCTACGAGCGCTCTGTGAACGACATGCTTTCCAAGCCGCCACATTATCCCAACCAGTTTGATCACATCATGGGCAGGCCAGGCGAAAAGCTCTTCAACTATGAAATCTAAGTGAAAAAGTATTGA--CGGTTGAGATTATCAACTGAAATTTAAACGATTTATGCCACTTATTTAGCATTTACACGCGTGGGTTGAGTAGATTCATTAATTTTCGAAATCAGTGAATTGAGGCAAATTTTGACAAATCCATGCTTTAATGTTAATTGACATTAAATCAGATTCATTAATACCATAACTCCCGTTCTTTGGTCGCAACA---------TTTATTCAGCATG-------------------------TAATTAATACAGGTCTTATATTTTATAATGTAGTATTT-ATAACATAACGTTTTG--TTTTTTGTACACATTGAACGGAT--------TCAACTGCTT-----TGTTAAATTCACTACAAAAATAGTATGTCAATCAA---------GTTTGAATTTGTACAATTAAATAAAAATTGCGAAGTGATGCTAGAT-----CTCATCAAATTTCAT----AATTTTGAATGTGACTCAAAATGGAATTGTTAGTTAGGAACACAAGTATGAT
GATCATACCAACATGGACTTGCGCCTTTATACGGCTCTCTATGAGCGCTCCATCAACGAGATGCTGAGCAAGAATCCGTATCATCCGGAACAGTTTGAGCATATCACTGGAGAGCCCGGCGAGAAGCTTTTCAACTA-GACACCAAATTTAATAACGATTTATTTTTTTTTTATTTTTAACCAATTTTGAGCCAATTT----CAAGGAAGGCAAATTAACACGCGGAAGCTTA-------CATTATTCGCCCAAA---------------AAACATTGTTAAGCCTAGACCAAATTGCAAATTGGTTTTAGTTT--ATTAATTAATTTGATTTTTTTTTTTTTTGTATTTGAGCAAGCTAAAAGTTAAGTTAGCTTGCTAGTTGGCAATACTAATTTTAGAATAATTAATCAAAGTTTTA-ACTTTACAACAGAAAACTTGAGTTCGGAAAGTTTAGAATGCATTAAATAAGTTGTGTGGATTATTATCGTTATCCGCTTGAATATTGTAAACTCTCCCCAATATTCATGTATATATATATATATATTTATTTATAAATATATATGTATATATACATTTATATATCATTATACATATATATTTCTTCAATTTCTTAAGCAAGCTTAAAGTTTCATGAAAAAGAAAATATTAAAAATGAAAAAAAAAATGCT
>CG7795 8317524 8317538|9084 chr2L 8317415 8318943 scaffold_6 1766255 1768021 + 40753|112 126
TGTATCCAATCCAAG
CGTATCCATGCCAAG
>CG7781 8321276 8322241|9088 chr2L 8321274 8321473 scaffold_6 1771355 1771565 + 6078|2 227
CAGATTGCAGAATCAAAGAAATACATTAAAACGTTACACAAACCGAAGCAACAAA-------TACATTGTTTTTAGTT--------------CTTTTAGCAAA--ATAACA-GTTTATA----GTAAAAAATTTTTTAGTTAAGAATCTCCTCTTAAATGCAATATTTGTAATGCAATAAAATTGTAAAATGTTTAAAGTGAAAAACAATAAATATGAATACAAAA
CAGGCTGTAGAATTAAACACAAGAAT-----CGTTATAGAAACCAGAGCCATAAAAAAAAATTACACAAATTTTAGTTTAAATTGTAAGCCACATTTTGCAAAGGACAACAAGTTTAAATAGTGTGACAAGTGTTTTAGTTAAGAAACTCCTCTTAAATGCAAT-----------AAAACTTTTAAAAAATGTTTAAA-CGAAAAACAATAAATATTAATACAAAA
>CG7781 8321276 8322241|9089 chr2L 8321592 8323190 scaffold_6 1772016 1773633 + 25828|0 729
CTCTGGCCCAGCC--TGATTTTGTAACAT-TTTTTGAATGGAGAACCGTAAAAGCTTTATACAAAGTATTAAATAATAACATAACTCCCTAACTAGAAGTGTATATAAAAAAACCAAAGAGAGCATGTA----------AACAATTGGCCAATATAATCGTTCAAATCTTTTTACATTAACAGGCATTTTGCAAACTAACGTATTAAACGAAATCAAGGAAAATAACGATTAAATAAAACTAAAACCTACCGCAGTTGA--------AAGTATTAAACAAATCGAAAATAA-----------CGAATAAGTCAAAGAT------------GGCCACAAAAGCTAACGATGTTAAAAATTAAGGCTACCCACAAAATAAAA-----GTAGTACAT--------AATAAATGTTAACACTCTTCGCCTTAGTTTGTCTATTTTTATTTAACACAAGACTCGAACTAAATTTCGGCAATAGCTAACATTAAAAAATTAAACAATTTTAACGTAATGC-TCAACGAGGCGAACACTTCATAGAATAATTAGCAAGCAATTGGGTCGAAGGTCGT----CCCTGGAT--AATCCAAAATGATAGTTGTGACACGCTTAGGGGCGACGACCACGCCCAGCCCACATCTCCGCACTCCCAAGGGGAAAAACACTCGTT--------GTTGTAACCAACTGCCAAA--------AAGGATAACTTTGAAGTCGTTTCA
CTCGATTCCAGCCAATATTTTTTTCTCCTATATCTCAATGTCCTACGGCAAAAGCTTTAT----------------TATGAAAACTCTTTGATT----GTATATAAAAACAAAAGGAAAATAATAAGGAAAATAACAATAAAAATTGGCCAATAAAAGCA--------TATTTCAAATAACAAGAATTCTG-AAACAAAAGTATTA-------------AAAATAAATTTTTAA-------AAAACCTACCGCAGTTAATGAAAAATAAGTATTCAAAGCCCCACTAATAAAAGCGATTAATTAAATAAATATAAAATTGTTGTAACTAAGGCTATAAATACAAAT-ATATAAAGAAAAGAAATTTTAAACAAATTAACGAAACCGTAGTACATACATATAAAATAAATGTTAACACT-TTTGTCTGAGTTGGCTTTTTTTTATTTTCATAAGAACTTTTTCTAAAAAT---GAAAAACTAACAACAAAAACACAGACAA-CTAAAGAAAATGCGTAAATTAAACGAAC---TCTTAGTTCAATTGAAATCAAATGAAAATGAAAATTGCCGCGCCCCAAATTAAATCCTTTAGGCTAAGCTAAGCCCGCTT-----CAAGGACAACAC----GCCTCAT----GCACTCAAAAAAAAAAAAATAAATAACTAAAGAAAATTCTAAACAACTGCCAAACGAAACGGAAAAACAACCACAAATACATTGCA
>CG7781 8322309 8322487|9089 chr2L 8321592 8323190 scaffold_6 1772016 1773633 + 25828|797 982
-GACGAAAATATCGA---GGGTGTCCCTCAGT----TGTTTTTGTTTGTTTTATCGATGCATCCACCCAGTTTTTCTTTCGTATTGCTGCTGCTGACTCTTTGACTTCTGTGACACTTTCACCGCTTTCTCCCGCCCCCCTTCACATCATTAACAAGGTCCACTCGCAGAGCTGCTCCAGAGTCAG
TGTCCATCGTTTCGGATTGGGCGACGCTTCATTTTCTGTTTCTCTTTGTTTTTCCAACATGTCGTC---GTTTGTTTTTC--------CCTAGAAAATC-CTAAGTTCTGTGCCA-TTTCCCAGCCGTCTC--------------------AGCAATTTTCATCCCCGCAGCTGCTACAATCTCGG
>CG7627 8355674 8355935|9139 chr2L 8355516 8359843 scaffold_2 2005352 2009850 - 177669|167 519
GAATCAGCTATTATGTG------------TTTGTCA----------CCGAATCTTTAGCTGGCTAATCATAGTTTAAGTAATC-------ATAATGTTTTTGAATG---------TGTTATTTTGTGTGAATGTATATATGTTTTTCCGTG----------------TGTGTGTGTTAAAAACTTTATATATG-TAACTTAAAAACTGTATAGGAAACCTTTGTTT--------AATCT--ACTATTTGTATTTATTAAACATTCACTAAGAG---CAA-----AGATGTGCCTTAAAAAATAA-----------------ATGAAATATTTTCTCTGTTCCTAAT-CTACAA
AGTCAGGCAACATTGTACGTATCTGGGATTTTATCATAGTGAGGACCCGCATCCCAGGATGGCCCTTCG-AATGTAAATAAACTCATCCAATTCCAGTTTCTAATACAATATTCCTTTAATTTTATATGTACTTATATGTATGTGCCTATATTATATTATATTATATTGTTAATGTTTATATATTTCCATATATTAAGTGTAAAAATGCA-AGGAATTCAGTGCCTTCAAAATAAATGTGAACTATTTGTGTACTTAAAACATAAACTAAGAATTTCAAGAATCAGTTGAGCGTCGGAAAATCAAGTAGAAAGGAGACGTGATAAACAATTAACGCTGCGCCAAAGATTAAAA
>RpS13 8363692 8363820|9145 chr2L 8363670 8365745 scaffold_2 2013345 2015337 - 53553|23 159
GTTCTT-GATTCGCTAGTTGGTAGTTTGTTTTCAAGTCTTGCGGGGTCCTACATTTC--CATCAATGTACAACCAATAAACCCAACAAAT-----AAAACTGGAAATCGGAACTATTTTATAGACTAAACAAATTAT
ATTTTCAAATATGTGAGT--GCATTCACTGTACAAGATGTACGTGA----ACAACACAAAAGGAAAATAAAACTAAAATATTAAAAAAATAAATAAAAACAAACAAACAGAA-TAATCTGTAGG-TGAATAAAATGT
>CG13390 8375501 8375561|9151 chr2L 8373529 8376689 scaffold_2 2022216 2025414 - 138551|2060 2121
AGGCCTCTGTTTATGTTA-TGTTGATTTATTATTTATAAATTAAATTGTAATCTTATAAGCT
TCGATTTTCTAAATATAAACATTTAGCTGTTATTATTTACTTAAATATACATATTACAAATT
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GAGCATAAAGGATTCGAAAGCGGCAAGACCTTC-AATTACTCACAATTTTGATACACAACTATGCTTA-ATCTTAATCCGTTGATCTGTTTTAAACA----GCATTTCAGATGAATTTTTACGGCTATTTATA---AAATAA----AAGCATTTATACACTAAATTAATTAC--------ATAA
-ATCGCATCCAATACCACATTTGCATACTCAACAAACTATTCATA----TTACACGAGACAAAAAATATATTGTAGACTGTTGCGAACGGTCAAACAAGCTGCATTTCAAGTGAACTTTTGC--TTATTTATATATAAATAATATTAAACATTTAT-CAATTTTCTAATTATTGGCGAAAAAAA
>CG13393 8383611 8383673|9153 chr2L 8381906 8385088 scaffold_7 3498719 3501640 - 56547|1800 1890
CAAA---------------GCTACAA-ACATTCTGATATTCTCGGATATATTTATAAATAAAATGTAACTCTAA------------TTGTA
CTTATAAGTAAAATACGCTGTTACAATCCATTCTTCATTTATACGCTATGATTAAATGTATAATTTAACATTAAGAGAATCTGTTGTTATT
>CG13394 8388727 8388828|9158 chr2L 8387834 8388796 scaffold_7 3506453 3507541 - 15498|1057 1126
TATAAACATTATATTAATTATTGTCTTTGTTACCGATTGAACTATTAAAGAACATTTGTTGATACACCGA
TGTGAGAACTATAT--ATCAGAGTGCTCCTCACAACTAGGCATATTTCACAGCATATGTAGCTGTACGTG
>Acp29AB 8392466 8392506|9164 chr2L 8392396 8392552 scaffold_2 4362731 4362901 + -62|73 117
ACATAAAGAAAATATTGTTTTGTAGCTTGAATAAAAA----AAAA
AAATCATAAAGTTTTGGTTTCGTCCTTTGACAAAACAATTTACAA
>Peritrophin-15a 8395661 8395712|9168 chr2L 8395595 8395926 scaffold_7 3508740 3509068 - 3003|66 118
TTGCATTTTTAATAACAACAAAAATGAAAATATATGGCAA-ACTAAATGATTA
CGGCTTCTTT--CAGCACTCAAATTGCAAATAAATTCAAATGCTATGTGACCA
>fy 8401446 8401713|9171 chr2L 8401560 8403707 scaffold_7 2977050 2979054 + 46427|0 154
TACGATATTTCTTTCTAAGCCTA-AAGACTGATTTTTGTTACTACTTTTCCATGAAATAATGTTTTTTTTTAAATGACATTATATTTAACGAACAATAGGGTACAACTCCTTTTCTAAAGTTAAGCGTAATTTTTGACAAATCTTATATGTATAT
TGAGCTTATGATCACCGAGCTTATAAGACTGATGATTGGAA-------TCCTTAAAATGGGCTC---------AAAATACTTTATTTA---------------------CATTTC-----GTAGGAGTAATTTTCTACATTGCTTGTATTTATAT
>CG13397 8409051 8409128|9176 chr2L 8406919 8411688 scaffold_7 2984039 2988939 + 144257|2324 2421
TT-GTATCTACCTATA---GTTCAATACAACTGCCACAACAAACGTTTAA---TAAACTTT--------TCTCTAAAATTGACTTTAA-----ATATT
TTCAGATCGAGCAGTAAATGTTTGAGAAAACTGTTAACAATAAAATGTAAGCTTCAGTTTTGCGTTTTATTTATAAAAATAATTATAATTCTTGTGTT
>CG13398 8412411 8413550|9177 chr2L 8411842 8412886 scaffold_7 2989121 2990160 + 924|609 1162
GAGGTTGAAAAGAACGTGTTGCACAACGAATTTACTGCACGAGAT-------------TGTGGTAAAGTGAAATTTGAAGAGTGATTTGTCCAAAGATA-----------------TGTTTGCTTCCAACTGCGCCAAGCTAAAACGCAAACGATTAACAATATTATAACCAGGTTGTTTTTTGTAGTCAGTACAGTAAACTCACACAGCCAAAAAACCAAAACACATAGACATGAATTGCATACGTACATA-ACTTGTATTTAAGGATATTAACAATAGCATTACTTAGCG-------ATTAGTTGATTTGTGTAATTGCCAGC------------GGCTGTTTAGAGCTAGTCATTTTT---GATTTTGTGCATATAAA---------ATAGTGA----GCAACACGAAAGGCTTTTAACATTAAAATTGTACATGGTAGATATGGTAAGAGTAGCTCATAAGCACCAGAAGATACATCATCGACGTACACGTACGTTTGTT--GTTGGCCAA-----GGCTTTGAAATTGTA-----TTCTGTTGCCAAAC
GAATTGGAAAAG-----GCAGCACAACGAATTTACCACAAGCAAAAAAAAGGATAACATATGTTTAACTTATTCGTTAGGTTGGCCTTGGCAAATGGCAATGGAACGCCCCGCAGCTATTTGCCTC-----GAGCCTAAACACAACCAAAGCCAGCCACAA-ATCGCAATCAGGTTGTTT--------CAATTTA-TGTACTTACGCA------AACGCATACTATATATATATA-----TATACATATTTATAGTTATATT----AATATTAATATTTATATTTAATTGTGCACATGCATAGATATATTTAAGTATTTTTACACACACACACACAGGGCTGTTTAGTGCTAGTCGTTTTTTAGAATGTTGTGCAAATTAATGTTTTTTTATTGTGAAAATGCAACACGAAAGGCTTTTAA-------ATTGTATAAATTACATAC----------------------------ATACAT----GATGTACTCGT-TGGTTGTTAAGTTAACCAAATAGTGTTTATTCAAATGTACATCGTTTTCTTGTTAATA
>CG13398 8412411 8413550|9178 chr2L 8413385 8413507 scaffold_28 782895 783035 + 1301|0 155
GCACAACGAATTTACAGAAAGCATAATGGACACCAGATCGCTGGCGAAATGGATCTAACCCCA---------------CATTTATTTGTGCCAAA---TCTGAG---------------TACCAAAAAGATGTAAGGAGCTTTTGAAAGAAAAATC
AAACTAGAAATTTC---AAAGCTTTATTAACTCTAGAC------------GGAACTAAGCCCATGCGTTGCACAAATACATACATATGTGCAGAAATATCTGAAGACTGTGCAAGAAACTACGAAAAAGATTTCAGGAGCATTTTATATAGAAATC
>CG13398 8412411 8413550|9179 chr2L 8413508 8414884 scaffold_7 2990678 2992132 + 30782|0 43
ATTGGAGGCAGC-AGGAATAGGATTGGTGGAGGAGACCGCGAGT
AACGAACGAAGAGAGGAACAAGGGTCGTAAGGAGGAGCAAGAGT
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TTGATTTGGAAAC--AATTTGGTTTCAC------CTATATAAGCCTCCTCTTTGTTGGATGGCAAATTCTTGTTGACCATATTTCTTTACGTTGCGCAGCGTAAAATTAACGCTTTAATTTATTGAAT-ACATTTAGTGTACTTAGTAGGAT-TTTCTATTTAGTTGCAAAAGACGCACAAGTTAGTATTTGCTTTTCTTTATCATTTCTTAGTTTCGTTTGTTTCGCTTTTGAAGCTTTCGTTGGAGCTTTTGTAGTTTGTTT-GTAGTAACATTTTGTTACGTTAAATTAACCATTACGAAATATAATGTAATCTTAGCGCTTACTCCAGTTACCAGGACAAGTGATTATTTTCGTAACACTCTGTTAC-------------------ATTGTGTATA----------TTGTAAAGAAAAACTATTTTGGTAGTGTATTAAAGAAGAGGATTGGGACTCGACTCGAAACAGAATTAAAACATTC
TTGATTTGGAAACGTATTTTTGTTTCATGATTTGTTATAAATGCC------------AATTGAAGCATTTTTGTAAGATTCTTTCTTAACGTTGCGCA-----------ACGCTTTAATTTATTTAATTACATATAATTTGTTTTGTAAATTCTTTGTATTTAGTTGCAAAATAAGAGC------------GCTCTTT----------------------------GCTTTAGAAGCTTCGTTTTAAGCTTAGTAGATTTGTTTTGTAGTAACATTTTGTTACGCTAT-TTAGTATGTATTTAATAT--TTAAACTTTAGCGTTTATCACTGTTA----------TTATTATTTTTGTAACACTTTGTTACGCAACAAAATCAAACAAATATTGTAATTAATTCTTGTATTTATGAACAAATACT--TTTTGTAATGCATTAAA-------ATCGGGACTCAA--------AAGTTTATAAAACTT
>grk 8431086 8431541|9193 chr2L 8431532 8432647 scaffold_7 3011269 3012378 + 8999|0 28
GA-------------------TTTAGAAT
AAACAAATATCGGGATCGGAGTTTGGAAT
>D12 8434058 8434208|9195 chr2L 8433758 8438071 scaffold_7 3412088 3416256 - 68337|312 462
TGTGCAGTTGCCATTGTTTTGAATTTATTTTTTATCAAGTCCGCGTCATAGTTCAAATTCTACTGGGATATTAGTTGATATCTAATTAGAGCCTTGTACTCGTTGGTAAGCATAAATCTAAGCAATAAATTAACTAAATTAATGTCCGAAG
TCAATATATGTTCTCGTTTACCATTCGTC-------------------TAGTTCTAAACCCTGTGGGATATT-----ATAGATAAATAGG---------TTATCTCTAAG--TAAACGTATGTTATGTATTTAATAAATTAATTT------
>U26 8445861 8445986|9204 chr2L 8445949 8448708 scaffold_7 3423705 3426479 - 84545|0 37
AATTTACTTGTATAACTACAATTTAAGCACAATGTCCA
TATGTATGTATATTTCTAGAATTCGTGATCAACAGTCA
>U26 8446051 8446091|9204 chr2L 8445949 8448708 scaffold_7 3423705 3426479 - 84545|103 144
ATATCAACTGCAACTGATACATTTCCATTTACAAT-CAACTT
A-ATAAGAAGAAAAAGA---------ATTTAGAATACAAC--
>fu12 8449683 8450088|9206 chr2L 8450052 8450969 scaffold_7 3428453 3429360 - 39885|0 36
GACTGGATAGGTTACGATCAAACTCAGGTTATAAAAA
AAAAAGATATAGTA-GTCTAAGCTCAGGTTACACACA
>Dh31 8492179 8492666|9248 chr2L 8492140 8493480 scaffold_7 3462883 3464241 - 15682|39 636
GGCGTC--TGGATGAGACCGGGCTG---------------------------CGAATCCTGTGAACGTTGAGG----------------------ACGAACGTCA---ACTTTTTCCACCTA------AACTTGGCCCATACTTTGATACTTTCCTAGAT----------------CTTTCATTTGCATTACGTTTAATTGTT--TGTTATTCATTGTACATAAATATTTATTACGGAAATGTCCTCATGCAATTCATCAAAATTTTTTTTCCCTTCAAGAGTTATACGAAAATAATATTCAA-----CAGATATCGAAATTATATATACCAAAGGCGAAT------AAAAGCGTTAAACTGTTGCTCCGAAAGAAAAAATGTTGAAAACAATTTATGCA-------------AATTTTCATCCCAGATTTAACTCAGTGCTAATTGCTCGTTTTAACCCGAAAATATGGAAGAAAGGTAAA------GAGAGAAGGGAGAAATTTAAATA-AATATATCCTAAATATATATTCAAGTGTAAGCATAATCGCGCAAAAAATCTTTAACTAGGTATGTCTTA-CATAAACTAACAAAAA
ATGGGCGATGACTATGACCACGATAATGTCTGACTTAAAACAAAAAAAAAACCGAATTCCTTAAAAGCTACAAGAAATTAACAACAGATATTGTTACGATTGCCACTGACTTTATTATTCTAATGTACAATTTAAGGCGTTTGCCAAAACTTTTCGCAATCAGTTGAACTAAAACCCATTTAATTACGTGACGATTGATACTTCCTCTAACGCATTGTATATACATATTAATTGC---AATTTCTATGTATAACATACA-----------TTCATTAAACAAAGAGACGTATGTTATATCCGAATATTCGCGTTTTAGTTTTAAAAATTCCGAAAAAAAACATTTGAAAAAGCATTAAATTGTTGCTCC---------ACTGTT-AAATGAATTTATGCACGCTCAATCTTTTAATATTAAGATCATAATCCACTCTCGCTCTCGCGCTCGTCTTAATGCCTAAATC---GAAAAATATAACCTATTTAGTAAAATGTAGAAA--CAAGTACAATACAAGCTATAACAAAATTGAACTGTAATTAAACTCGCGCAAAAAATCTTTTAATAGGTATGCCTTAGTATTAACACACAAAA-
>CG13095 8495108 8495149|9253 chr2L 8494956 8495123 scaffold_2 2418422 2418589 + -1668|161 176
AAAGAAACGAGCTCTT
AATTCAATTGGA---A
>CG13096 8509248 8509374|9272 chr2L 8509371 8509528 scaffold_16 2294223 2294378 - 644|0 3
TACG
TGCG
>CG13097 8512169 8512592|9274 chr2L 8510507 8512465 scaffold_7 3488584 3490220 - 22707|1712 2009
AATATCTTTAGCATGTACTGTGTGTCTGGGGAGTCCCCAATTTGGTGCTCCATGGGAGATGCCATGTGTCG-GTACTTTTAATGTTCCATGTGCGCGGATCCATCGTATGTGTATGTGATGCGTGGGCGCTTTGTGTGTGGCGGCGTGTGAGTCAAGGACATTCTGTGTCCTGTTGAGGCGATTAGGCACGCGTGCAGCTTGCGGAATTTGACTATTCTTAGAATTATTTACTTAAAATAACTGTTTGCTATGTAAATAGTACCCTAATTAAAGAAAGCAAAGCAAGTAACGTAGCCA
AGTTTCTGCAGC-TACGCTGGGTTTCTAGGAAA-CTATAATTTGAGGCACCATGGGAGATGGCACGCGTCGAGCAGTCCAAATTTT------------------------------------GTGGGCG---TGTGTATTCC-----------CAAGGACAT-----GGCCTG---GGGCAATTAGGCACTTGTGCCA-TCGCAAAATTGGGATATTTTTAG---TCGACCTTTAAAGTAATAGG--AGTATGATAAT-----CCTATTTAAGGCGTGCGAA-----TGACGCA--CA
>CG13097 8512169 8512592|9275 chr2L 8512532 8515012 scaffold_7 3490868 3493258 - 72084|0 63
ACGTACACGCTAGGACTCCTTCATATTGTAATTGCCT---TAAGCCAGCAAAGTTTTCTCGTCT
CCACATAAATTA-----CTTTTAAATGATAATTATATACATAAATTATCAAATTTATTACATTT
>mRpL51 8516754 8516767|9276 chr2L 8515153 8517331 scaffold_6 5819996 5822118 - 76439|1631 1644
AAAACCATTACAAT
-----TCTTACAA-
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CAAAACCCGTTCTTGGACTAAG----CCAA-----------GTTCAAGAACATAAGCAGATTTAC--ATAGCAGCCGCTGCCA--ACACTTCGGAAAGGGTCAATTAGACGACATTTCTTCAAGAGTCAATTCAAATTCAAGTGCAGAAAGATCCCACACACACAACACTCACTCTATCAACTCAACTA---TCAACTCATAAAGCTTGCCATGGTCCCTCGTTC----TTGATATTGAATCTCGAAACATATGAACGGTTTATAAATGTTTTTTGCAAAA-CGATGAAAATGTCTTTGAATGTAAGCGTACCACTTTTCACGTTTAATATT--AAATAATAAACACAAAAAATTTGTATTCAATAATAATCGCTAAGTAGTAAAGGATAAGATCCTT----------------------ATATGCATCTATGTAT-TACTCAAATTGTATA---------AACATAAATCTAAAATGCT----TGAAATT----CCGCATCGAAT-------------------------------TCATAGATCTAGT-------TATATTATTTGCGTTGACTCTGAA----ATGTTTTGTTAGAATG------------------CATACTATCCAACAACAAAAACTAA--------ATCAAATTGTTCCAACTCATGTAGCACTAACCAAAACTAAACTCTTGGCCTATACATATGAA---TATCTGGATTGAT------TTTATAGCCCTGTTA----------------------AGACTTAGTTTCGTAATGGC--------------GTATCGATTGGA--------AAATTATATATTACGAA-CATGTATCTGCATC-----------TCAAAAGCAAAATCTAGCTGA--TCTTACTGTTAGTCCAATAATCCTATCATTAAAAATACAACAACAAAAAAAACTAGG----------------------------CATATATATG----------TAAAGCTCAAGTATTGGAGCAAATCCC---CCGAGCAGTTGTGCAGTGCGTTTCAGATCTAT--AAGTCAGTTGCATGTTCCGCGAAGCAGAAAACCATTTT------------AAACTAGTTTCGGTTGTATATTTTTCCAATTTGTTCAAAAATCTTACTCCGCAATCATGGATAACTGCCTTGTAAATGTGGAACGCATTGCATATAATATTTATATTCTAAATACATATACAATTTTTACCAAGTAACAGTTACATTGATGAAAATGCAGTAGATAC-CATCGGTATCTCCCATATCACAAG--------CATAAAGCGGGAGATTGCGAAATGAAAACAGA---TTTACAT-------ATATTACCTAATCAAAAATGATACAATTTCCAATATTTATTGTTAGTT-----------CTTAGATTGTTTT----------------------ATTTCTCAAAACAAATTCCTTATAATCTACTAAAATTAAAT------CACCCTATGAAGTT
CAAAACCCATTCTTGGACTAAGTATGCTAAACGCGTATTTGGTTCGAGAA-------GGCTCTATCGAAAATAGATACTACCATAACATTTCTGAAAAG-TCAATTGCAC---ATTTATCCAGGAGTCAATT-------------AGCAAG------------CAACACCTA-------AGGCCAGCTGAGGGCGACTTGTGATCTTTACTTGGATGGCTTGCTCGACACAAACATTCAAGCTC------------CATTTCGTTCTGGATTTATACAAAATCGATG--------TTGGGCCAACGTCAAGCAACTTTGAATGGTTAAAATTTTGAATAGGAAA----------TTGTATTCAATAATAATCTTCAAATAGTCTGGGATAAAATCCTTTGATAAGAACTACGTAAATTGCATATTTATACATATTTATAATCTATTTGTATATTACCCGTACACATACAACTTAATTGCTGCTTTGAAACAGAAACTGCATCGAACAGAGGATGCGAAATCATGCTTGTGGCAGAAGTCTTGGATCTAAAATATCTACATAACATTTGCAATGATAGCGAACATAACAATTTATTAAATTAACTATTGTGCTAATTGGACCTATTATTAAATGAAAAAAAAAAATACTGTATAACAAAGCATACTCACTCAT-TAGAATTAACCAAATCCGAACTCGCGGTCTAGA-ACATTAAATCTATCCAATTTAATGTATACTTTTTTTCTTTGTTATTTTCCAGTGTTAAATGCGATGATTCTTAATTTGTTATTGACAACAATTGTGTCAAGCTTCGCATAGATACACTCGGACTCAGACTTGACAAAACACTCACCTTCATCAAACCAATTTGGTAAACACATAATCATCCTCAATTCTTACCGTTCGTCTGACTGTCCTACTTGTCAGCTTTAAAGTATAGATCAAACTAGAGCCAGCTGATCTTAGTCCACACGCTTATCACATAGGTGCTTCTAAGAATAAACATTAAATAT-AAACTGTATACCATACTGGGAAAACGATCGATGTAAT-CAAAGCTATCAAAGCAAATTGTTTGTAAACAGAAAAGGAAAATTACATTTCTCATGAGACAAAACTTTTCCCAGCTATATATT---------------AGACGTTTCATTAGCACTCATTT-TAAAGACTTTTGCGTTGTTTCATGTAT-GTATATATTATTAAAACCTTTAA-ACAGGCGAGAGTTCAACAAAAGAGAA-------CGATCAAAATGTATCAGAGAAATGTCTGTAGAGCAGACAATATATAGGAATATTTAAAAAGCCTAAGATTGATTTATTAATTTATAGCGCTTATATTTGGATTATACTTCCTGTTCACACGTTTCATAACTTGCACT-TTAATTAATAATTATAAAAAAGCATTTAAACAGTTTTTGGAGACCAACTGAGTTCGAAGATTTATAAAATTCAAATACCCGTACTTGTCGAAACTTTATTATGTTGCATTCAAGGAATTC
>CG9296 8684815 8685347|9507 chr2L 8684019 8686169 scaffold_2 4304247 4306394 + 29506|860 1421
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GC-TGTGTGGGCGCCACACCAACGCACGGACACACACACAAACACCCACACACACCCACAAAATCTCCCA------CTGTCAGGTGTTCGTCAT-ATATATTGATCTGCTGCGGCTGCG-GCTGCGGCGGGTGTGTTCATTCTTCTGCATTGCCGC-AACGAGAAATAGTTCATGAAATGTT--CTCAATTTAA----------ATCGTATCAGCTTGCCAATGAATTGTTATT--------TCTGGATAAGATGCAGGGCCATTTATTTGG----------------GCATTTCTATGCAATTATTTTTT-----CTGCGTTTTTTAAGCTAGTGAAAACCATCATACATACATACATATAATGAAACTAGACTAATGCATTTTAATATCTAATTATTATTTAAAATGATTGTTTAACTTATTAATAAAGTATTAACGAATGTAATACAAATATGTACAAATACCTTGAGCC---CAACCGATGTTCCTACTTTTATCTGTGTTATATTTATTTAATACGACCTCCGTTGACCTGTGAGCAAAAGCAAAT-------TAAG
>Hnf4 8687281 8687777|9510 chr2L 8687245 8688453 scaffold_7 4651689 4652869 + 30788|36 601
AAG----AATAACGAACGGTGCA-ATATGCAGTTTGCAATAGGACACCCCTTAAGCACACAACCCAT-ACACATACAGGCCCTCTCTTGCTGTACTCCCCACCAAGTGCTATATAGAGATGAAATTGAAATGAAGAACTTACTTAATTGTTA-TGCCTTGAACCATTTTGATAC--TTTTTATTAGTC-CTAAGTAGGTATTTTGGAAATTGTTGCTTAATTTTTAATGTTTAACGCAGTTGCAATATATTTTTG-----GAGTCATATTTTGCTCAAG---------------AAGTTTATTATATACAATTATACTATA-TATATACACCATTTAGCATGTACTG-----AGTTTGTTGGTTATTTGGTTATCTTATACTTGTGCGTGGATCACAAAACATTCATATAAGGCCATGCAATATATTGTTTTAGGTTAGGGTGTTGTCTAGATTATGCTGAAA-----------GTGTAATATATATTTAATTTTAAA-CAAAGAACTATTTTTATATGAA---------------------TATGTATAATATACAAACTATTTC
CTGGTGCAATAATCTTAGCTACACACATACACTACTCTACTTCCCAATCCTGCTGTCTCCTCCCCATCACCTCTACAGGCCCCGTCTTGCTAG-----CTGCTAAGTGCTAAAAAAAAATCAA----AACACAAAAACTTACTTAATTGTTATTGCCTTGAACT-TTTTGATACCGTTTTTATTAGACTTTAAGTAGGTATTTTGGAAATTGTTGCTTATTTTGTAAAAC---ACGCAATTGCAATCTATTTTTATACATGATTATGATTTTTTTTGAGCTGAAATGAAAAAGAAAATCAAGTCAAAGGATTTGCTCTAAAGTTTATACTAAACATAGCACGTACTGTTGTCAGTTTGTTGGTTATCT--TTATTATACATAT-TATGCAGAT------ATATGTATATA----TATGCAATACTTTGTTTTAGGTTAGGGTGTTGTTTAG--TAGTATAAAATATATAAGTACGTTTAATCGATAGTTGATGAAAAATTGAAGAACTATTTTTATATGAATATATATATAAATATATACTGTATGTATAAAATACAAAATAATT-
>raw 8709870 8710434|9537 chr2L 8708347 8710706 scaffold_7 4678875 4681742 + 24992|2107 2771
-TCGTACCTGTATTTAAGTTCCAGCACGTGACAA--TTTAAGCTTATCTTTAAGTCTAAGGATTAGTGCAATTT-------------------------ACGTTCTACTCTTAACCCCCACTAACTT---AAATGGTGTC-TGATCGTATTCGGA--------GAACACTCTTCTACCTAGTTAACGCTA--------TACGTAATA----------------TTATATAGATGA-----TACAAATA----------------------ACAAGTGTAAAACCACTAAAATGTCGTCGCCCAGAGAGCGCATTTCATAACCTTATGGAGAAAGTCTTGCATTCAGCTCCACTCTCTCTATGATCGCTATAAGCTATTTGCTTTATGCTAATTTATTATTTATTTAAC--ACCATACGCGTG---GTACATGTGCTAAATTAAA----TGTAAATATTCGAACGTGTACAATTCTTAGTGCATATATGTACAATGAAACACCAACTAAAATATATATATATATTATAATCATAGTGAGCATTCAGATCTAAAATAATATCTATATAAAAGCCCCATCATGTATATGTATACCCATAGTGACCCACTGTA-CCAGTTAGCTGGCAAAAAATATCTCAATAAACCAATTTTTCTAACATTTGATTGG
TTCGTACCTG--TTTCAGTTGCAGCACGTGACAATTTTTAAGC-------TAAATCTAATACTTAGTGCAATTTATATATTTGTTTTTTTTTTTTTTTAACGTCTTAACTTTAAACAAAATTTACTTAACAAAGTGTGTCTTAATTGTATTTAAGTCTAATCCAAATTCTATGCTATGCAAACTGTACTAAACTTTGCTACGCATTACTGTTCCCACTATGCTTTATTTAAATGAATATCTACAAATACGTAATATACCATAATTATTGTAAAAGTGTAAATGAAAT---ATGTCGTTGCCCAGGAAGCGCATTTCAAAAC----------------------------------------AACAACGGAAAGCATTATGCTTTATGCTAATTTATTATTTATTTAACATACCATAATTGTACACGTTCATGTGCTAAATTGAACAACTGTAAATATTATAAATATAAATATTCGTATGAGAAGCGTGTTAAATG------TAAGTAAAGAATTCAAATATATTTTATATTTAGTGAGCA--------TAAAACCATATACACATA-----CTTAAAATACATAATAAT----TTAGTGGCCCACTGTACCCAGTTCGCAGGC-AAAAATATCTCAATAAA-CAAGTTTTCTAACAT--------
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AGCTGCGTC----ATAAATACTGCAAA-AATAT-----GTATTAAATTATTCGAAAA-TATTTTAACGAA
GACTTCGTCGACAATAAACAATTTAAGTAATATCAGTGTTACCACATTATTCGCCGATTATTTCAGCTAA
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TTGTATTTCAATGAAAATCAAAGAAATAAATAAAATTATGTCTGAATAAAAACACT
TAGGACTTCGTCGACAAT-----AAACAATTTAAGTAATATCAGTGTTACCACATT
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ACCAACGTTCTCAATGCAGTATTTCATGAAATGTAAATAATTTAATAAATAAATTCAATGTCGAAAATCTA
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AAAAAAACCAAAACAAATTTATTTTAACCACTGTGCTCGAGTTCCTTCAACTAAAAACGTCGCATCATTT---TGACTCTATCGTTTAAACAAGCGGCCATAAAGTCATTTGGAAAAGTAACGTATATTTTCAAAGATAAGGCCATGATTATACAAACCAACGAAGCACAATAAATCGAAAATATATGCACGATTATTTTTTTTATAGAATTAAATAACATGAGCTGCTCGCATTCAGTGCACAATCGTCAACGCGAAACAACACAGCTAAATGACGCAGAGGCCGCAAGAAAACCAAAGCCACAACTCCTATAAGCTGTGGGGTGGACGTTTCAGTGAGAAGCCCAACGAGGCGTTGCAGGAGCTGAACAACAGTCTGCCCCAAGATGCCCGCCTATATGCAGATGATTTGGATGCGAGCAAGGCGTATGCGGAGGCGCTGATGCGTGCGGGTCATTTGAATGCCACCGAATGCGATAAGCTGGTCAAGAGTCTGGAGATAATACGTTACGATTGGGTTGAACGCCTCGTCAAGTTTGAGCCCAGCGACGAGGATGTTCACACAGTGAACGAGCGCCTGCTGGTTGCGCTAACCGGCGAGCTGGGCAAGCGCCTGCACACGGGACGCAGCCGCAATGACCAGGTGGTCACCGACATGAAGCTCTGGCTGCGCAAGGCCATACGCGAGACGCTGAGCCGGCTGCGTCTGCTGATTGAATCGATTGTGTCGCAATCCGAGTCGCATCTGGGCGTGCTTATGCCAGGCTATACGCACCTGCAGCGCGCACAGCCCGTTCAATTCTCCCACTGGTTACTCTCGCACGCTTTCGCTCTGCGCGAGGATTGCCAACGCCTGGCTGAGCTGCGGGAACGCTCAAATGTTTTGCCACTGGGTAGCGGTGCCGTTGCCGGCAATCCTTTGGGCATTGATCGCATTTGGCTGGCGGAGCGTCTTGGTTTTGCTGCAGTTACGGGCAATAGCATGCATGCAGTGGGAGATCGCGATTTTGTAG
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AAGCAAGTATCGTCA--GTCGCGCTTATCACAATCCA--CATCTGTAATCT-TGC--------ACGTCAGAGGCTACAC---TTAAAGTGCTGGTGTTCTATGTATGTAGTTGATAAGGCGTCGTAT--TTGTGTTTTTAATTGTTTGTTTTTGTTTGCTTGTAGACTAAGTCAAGAGTACAAATTAAAAAAATAACAAAAACTAGCGGCGTTTT
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GATT--TGATCACAGTTTTGTACTCTAGGAATTTTGTGATATTCTCCTATTGAGATA---ATCGAGTGATAAACGCGGCCATGA-----TTGATCATATGGCAGGCCCAGAAATAAAATCATTTTCGTATGCCCATTAACATGCATGAAATTTACCACA--GTCTGAATCCATGTGTAACCAAAA--CAAATCAACTGAATATTCATAAAAGGAGATACTATATAATTTTGTAGGCCAGCATCTAAGTCTAAGACTCAAGCA--TTTAGGTT-----AGAAAAACAACAAAAGAACTATATAAAATTGCTTAAGAAAAAAGAACATAAAAATATATATATATATAAA--AATCTTTGTACAAATAGATAGTGCTATATTAATCTTAAGTTAAATA---TAGTTTTGTAATCTAGTATAACTTTTATA-TAAGCGAATCATAATATAGTTCTAGACATCATTTAA--ATTTGATTGAGATCATTTTTTTGTAACACAAACAAAGATTAAACTTGACCAAGATAAAATATAACCATTTTATTTTTCGGGTTTTATCCGCTACAATTTGATTGCATTAA
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CTGGAGAGCAGAAGCCAAAGAGTTAAGCTGTGCTCACACCTGTTAG--ACATCTGGCCAAAT
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G---GTTAGCCCCTGTCTTCAGCACTGACTATTACACCATCACACAACTGCACTCA---CATAGTTTTAAGTAGTACCGCCCGCATTTTGTTGTAATTTTCATTTAGTTACATACAT-TACACACAACACACACACACAAACACACACACTAGCATTTATTTATATCAATTCGTAGCTGTACAGACTAAATTATTGTTATTTAG-TAAGTACCGGCTATGCGGCTAGACTAAGTTTTTGCTGGTTCCTTTATGCCAAAGCAACATCCTATTGCTCTGGCAATATTTTAATTGTGTAAACAATTGAATAAAGCCTGTT--ACTATGGAATCCATAGTAGAAAGAAATTGT-TGAAAAAATAACAAGAGCACAACGCTGCCAAAATTTGATCGAATCAAATTTAAAATGGTAT------------TTTATAT
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TACTCACCAAAATAAGATTGATTGAAGTAGTAAATAGTAGCGATTACAGCCCCGTAAGTGCAGGTAAATAGACACAGTGTAAATCCCCAATCCGTGAGATAAATAAACCATCGACCGCCATT
TTCTTACCAAAGTAGCTGGGCCTTATAAAGTATATGGTGGCTATTACGGCGCCATAGGCGCAGGCATAGAAACACAAAGTGAATCCCCAATCGGTCAGATAGATGAACCACGTGCCCTCCTT
>alien 8994670 8995538|9860 chr2L 8994792 8995327 scaffold_14 2835631 2836289 + -1726|0 680
GCAAAAGTAATATTAAGCT-------GAAAGTTGGATAAGATTGCATAGCTCTACTTACATGTCGGTTCCGCCGGCCCAATAGTAAAT--AAGGGAATGCATCAAGAATA----TGAGCACCACCGAAAAGGGATACACAAAGTGCATAAGACGGTTAGGATAAGCCACCATAAAGCAGTCGAAGACCATGCAGATCGAGTTGAATGCA----------------TGGCACCACAAGTTGTAAAGCTCACCTGC--CACTTCTGGCATGGCTAAGAGA----GATTAAATTGGGTCTTAATGAAAGTGTAATATAGATTTTAAGATCTTTGCTTACTTAATGATAGAGC-TGC-CCAGAAGACGGTGGTAATCAACATGGATAGTACCGAAGTGGTGTAGTGTGAGATCCAGTAAATT-------------TTCAGAGCACAATGTCCGGGAGCTGA-------------AAGTG--------TTATTATAGACTGCCCGATTTAATACTTTTCTTGCATACACAACTA------------------AACTAAAACTT-------------AGTCA------AAGTAAAAGTGTATTTAGATTTGCAGAATTGAAACTTATTACA------------------------GTCCCATTACAA-------------CGACTAA
GTGCAAATAGTATACAATTACTATGGGCAACTTGAGTTGGAATCGTTAACTC-----ACTTGTTGATGCCGCCGGCCAGTTGATATATGTACGAGAATATGGCATAGATAATGCCGAACAATACTGGCA-GAAATAC-----GTGCAGCAATCGCAACGGATGTGCCACAATCCACAGATCAATGAACATGCAAATGGAGTTGAATGCATGGGTGAGTACATTTGTGGCATCCAAAGT----ACTTTCATTGGCTGCAATCCAAACAGAGAAAACAGAATGGGATAACATTGGGTTGGGTTTACCTATAAAAATAAAAATCAAGCACTTGCC-------ATCGTAGAGTATGCTCCAGTAGATAATTGTGATGACAATCGATAAGACTAGCGTAATAATATGCATGCTCCAGTAAATCCGAAAAGGGCTCGTCCAGGCCTGCATATTGAGCAGCTTATCTATGGATTATGAAATGAAAACCAATTAAAATTAAGTCCGAAATTTAAAAAATATATTTTATAGAAATTTATGCTTCTGTAGATCTTCTAATTAATATTTTCATTGGTTAATCCGTCAGTTTTTATTTTGAATTATTTTTTTATTCTTAAAATTATTGTTTTTAATAAATAAAAGCGTTGTCGTGGAGTATGCTCGACTACAAAATTCCCTGTTCCCCTTAAA
>alien 8994670 8995538|9861 chr2L 8995328 8995435 scaffold_14 286257 286359 - 3355|0 107
CACGAGGGAAAAGCAACAGATCAATGCCAAACTCGCGCAAACGAATCCAATCGCCAGACCAGGTCGAGCCCAGTCCAGGGCGAAGTAGATGAAGCGATTTCCGTCGCT
CACAAAAGATTAGCGCTAAAACAATGCAGC-----CACAAACGCTGCCAATGGCCAAACCCGGCCTCTCCCAGTCCAGAATAAAGTATATGAACCGATTACCAAAGCT
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ATAT
ATTT
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TAT----TTTTTTATATT
ATTAGGGTATTACAAATT
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CCCGAAAAAGTGCAGCATTGATTTTGTGTCTCATGCATAACAGTTTCGGGCGTTGCCAAAACTTGGCTTAAAGAAAACTGTGGGGAATAAAAAATGAGGCACACAGAAATTTATCGACCTTCGCTGCTCGCCCCTCTCGTACAGCCGTCAACGTGCTCAGCTTCCATTTTTCCAGTTGCTAAATCTATTGACAGCAGCCCCAAACAAACTGCATAACAACTGCGCAAATA
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CCGGCCAAAA---------TACCCGCCTGCCCCATCAAGCACCCTCAGC-ACAGATCAGTGCAAATT---TTTTGC-----TGTCTCCCAGAGACATTAAAACGAAAACGAAAACAAAAAGAAAACCTCTACGAATTCAGTCAAAATAATGCCCATATACAATTTGTATTGCAATCGAACTACCAAAGTAACAAATTGT
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CTGCCCAAACGTCGAAAGCCTACAAACATAAATTTTTAATCTATATATATATATATATTCCTAATCTATATACATACGTATTTTATGTTCGTTTAGTTTAAGTTCATTTTGCAGTTGCTAATCCATTTTTTAAAGTGTATTCTAAAATTAAGTTGGTCCCAAGTTAATAAAAATTCAAATGTTCAATCGCAGCAGGCGCAGAAGCTGTCAATTCTCAACTCTTAAGT-ATTTAAA---AACGGTTTCAGTACAAATTCGA
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ATAGATATGGTTCGGTTCTTTGGTGGATGGGTGCACGTTTTCAGCCGACATGGGTCACGCCGACAAGGTATCTATCAGCTCCACAACTCCAACCAGCATCTTTTAACCTAATTTCAGCTTCGCTGTGCGGCTGTGGCCCACAAAAAAAAGAAGAAAAAAAAAAACAAGAGAAACGAATACCC--AATAAAAACTTGAAAAATCTAAAAACTATAAAAACATC
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CTGTTGAAGTTGTC-GACAATTAA-ATTAAAGTTTACCGTGTAAT-TTTCCAT
TTGTTGAAGTTTTCAGCCTATTAATAATAAACTATATCATGTAATATTTTCAT
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ATCCGATCCAATCCGATCCCAGCCTCCGTAGAGCCGCTAACGAAATTTAGCTTTTAGTGCGAAGATA-AGTCGTGT-CCTTGTGCATTTCTCTCAGAAAGGAAACCTATTGTGG
A------------CGACAACAATAT--------------ACGAAATTTAGC-TTTAAAGTGAATTTGTAGCCTTATATCTTATGCATTTCTCTCACTAAA------TACTTTGG
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ATCGAAACACTCAAGCGTTGTTCTAGTCTCTAGTTGATCCACATCTCTTGCCTCGGCCGGTTGCGCACACTCCAAGTTATGATCCTCCCCCTGCTTGTTGGTTTTGTCTTTATATTTGTCTTTCATGTTTCTAGCTCTTAGTCAATGAGAACATTTGTTTCCCAGCTATTCCAAAGTTTTAACTTAAGTGCATATATAAGTATATTTAGTCTGTTAGTTATCTAAGCGAGAAGCACCCACCTATTTATGAA--TTTTTGTATT-----ACAATTTTGAAAATAAAAACTA
>CG31882 9624583 9624857|10583 chr2L 9624570 9624754 scaffold_7 4117181 4117362 + 3318|13 193
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TCTTTTCTTTGCCCACTTTTTGCAGTTTATCACCGAAGTGCACGCTATGGCAACGTTGTTGGTAGCATACGCGGCGTATGAGTTATCTG-ACCATTTTGAGTCTC------ATCCGTATGCCACAGCTTGCGGGTTGCATTTTAAGTTTAAGTGGCGCAAAATCACCGC-----CTGCAGA
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TAATTTTTAAATTAAATACAAAAAGTTAAATGTAACACAAAA----------------ATTATGGCGCACACAGTGTGCTTGACAAAAAAAAACAAAAA
TAATTTATAAATTTAACA---AAAGTAAAATGTAAAAAAAAAGAAAAAAAAACAAAAAATTATGGCGCACTTAGTGTGCTTGAAAAAAAAAACCAACTA
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CAATGGAACTTTTACTCTCCCAAAACTGGTGAACGTTATTTGGAAACCAGAACCAGAACCTCAACTGCAACAACAACTAAAATGTTCATAATTAAAAAAAAAAAAAAACAAATGATTTCAACTAATGTCATTACAGCAGCTGAAATAACTGGGAGTCA----GAAAAACAACAACAACAACAACAATGTAATAGGTAACTA-AAATTTATGGCATACACATAAATAATCATTCATAACATATAGCGTATAGTATAACCACGAGACTACAGATATTTAGTTGTAAAGTACATAGTTTAGTT-----------------------------------CGTCAGAAAAAGGAAAAGAAAAACAAAAATCTAAAGATTACC----AAATGCGTCTAGAGAATCATACAAAGGCGAAACAAGAACTTCGGTAAAT------GGGCTAAAGAATTTGTTTT--TTATTATCAGCTG-GCAACACA---CCAACAACAGCAGCAGCAACAACAACAACACATTGTGAAAGTATGAAACGCTTTA
>Pka-C1 9696191 9696504|10654 chr2L 9696176 9698278 scaffold_7 4213536 4215764 + 101272|15 377
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GCGAAGAGTCTGCTCGGG---GGGATCTGTGTCTTGAT-TTAGGTTTAAATAATAAACAACGAAAATGTAAATGAAACTGAATGGAATATAATTT---TATTTCGTATTCGAGA
ACGGCTAGCTCGCGCTATTCCAGAACCTGTGTCTTGATCTTAGTCTTAGCTTGTACCCAATAAAAATACAAA--------AATGTA--ATAACTTAGCGAGTCCTTGCACGATA
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ATAAAAATACATAAACAAGTAAAAAGTAAATAAATATAAAGATTTTTTTAACAAATCCCATATAATT----AATTTTCTCTATTACGAATAAATTCCGAAAC--GTGTTTTTATAAGGAAA
ATAATAGTACAAATTCAAATAAAA----------TATGTATATTTTTTGATTATTTTATTTTTAATTTTATGATTTGCTGCGCAACGACTGTAAATCGAATCTAAAGATTTTCTTAGGTAA
>Taf11 9762361 9762521|10724 chr2L 9762488 9765574 scaffold_14 1253322 1256445 + 112970|0 33
CGAGTCGAGACATTAAGAAATATAGTTTGTAAGG
ACAGTAGG---ATTAAG-TTTGTAGTTCGTAAGT
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CTACTCTTAAACTTTCTAA-----CCGAGCTGAATCCCGATATTT----CCAATATGGAACAAGGAGTTAATATAGGGTGGAGCTCAGCCCGGG---CGATGCGGTGAATCCTCTTCTCTTATCTAACTTTCTATCTGTACAAATGGAGCTTGGGT--GATCAGTCTTTTGG---TGCAGATCCAGCTGCCGGTGCA-----ATCGATCCGTGTCTATCCATTAGATTTTAAGGCAGCTGCGATGGGAGCCACAGCGGGCGTAGACCTCCTCGAAGGAGCGGATGAGCTCGTCCATTCCGCGTAGCAGACCCTCCTCTCGGTTTCCAGGCGCCCAAGCACTTCGATGGTCCACCCTCACATGGGGTGGCAGCTCCCGGCACTTGGCGAAGTCAATTAGCCAAACGCCAACGCGATCGTCATCGTAGACGATAAAGATGCTGGAGCCAATGATCTCGTGGCTGGCGAAGAAGGTCGACTGTTCGATGACCAGGCGCATGTGCTTTAGTCGCTTCAGCAGCTCCTTTTGCACGGATCGCCGAGCAGCCAGAAACTGTTCGATCGTCTGGGCAATCTGCTCGCTGCTTCGGCACGTCTTCAAATCCTTGACAGGCGGTCGTCCGCGCAGACGCAGTGCTTCGATCCGGAAACCCTTGGAGTGGGAGGAGGACAGGGACTCCCGGAATGTCATGTACCGCAGCTTGGTGATCGCTCGTGCCTCGTGCTCCGCAGGCGTGGGAGCTCCCGCATCCACGGCGATCATCTTCTGGTAGAGGTCCGGTCTGAGCGTGGCATTGCTGACCTCCGATTCGAGAAAGGTGCGGCTGCCCATCTTGATGTCCATCACACACGGATCCCGAAAGCCAGCCAGCAGATCCTGCAGCTCAATAAAGTGCTGTGATTGCATCTCCTGTATTCCAAAGTAGGCGGGCACTATCTGAGCGGTCTGTGGTTCCTTGCAGATCAGTCGGTAGGCATGTACTTCGCTATCCTCCAGTCCTGAGATCCGTTTGCGCACTATTCCAGTCGATGTGGGAACAATGCTGCAAAATAAGAATAATAGTAGCAGTTAGTAAATTGACTAATAAAATGTTTGTTTTCAAAACAAAATTTAAG
ATACATATATATTCTCTACAAGTCCTGGTCTGGCGCTTAGTGTTTGCTTCCAATGTGGAAAA------TAGTCAAAAGCGTCGCATGATGCAGGGTTTGATGCAATGA-TTTTCTACTTTTG-CTCACTGTACAAAT-TATAAATGGGACGTGGTGCAAATCAGTCTTATGTGCCTGTAGGTGGGCGTGGCTGTGGGCAATTATGGATCCTTGTATGGAGCTCAGATCTTCAGACAGCTGCGATGATTGCCGCTGCGCGCATAGACCTCCTCGAAGGCATGTATCAGCTCGTCCATGCCACGGAGCAGACCCTCCTCGCGATTGCCAGGTTGCCAGGGACTGCGATGATTGACGCTCAACTGTGGCGGCAGCTGCCGCGATTTGGCAAAGTCTATCAGCCAGGCGCCGACGCGCTGGTCATCGTAGACAATAAATAAACTGGAGCCGATGATCTCGTGGCGACTGAAGAATGCCGACTGCTCGATGACGAGACGCATGTGCTTGAGCCGTTTCAGCAGCTCCTTTTGCACGGACCTGCGTGCGGCCAGGAACTGTTCGATGGTCTGTGAGATTTGCTCGCTGCTGCGACAAGTCTTGAGATCCTTCAGGGGTGAACGTCCGCGCAGACGCAACGCCTCAATACGAAAGCCCTTGCTCTGCGACGAGGATAACGATTCGCGGAAGAGCATGTAACGCAGCTTGGTGATCGCCTGTGCCTCGTGCTCGGCGGGCGTCGGTGCACTGGCATCCACGGCAATCATTTTCTGATACAAATCCGGACGCAGCGTTTTGTTGCTGACCTCCGACTCCAGAAATGTGCGAGTGCCGAGCTTAATGTCCATCACACACGGATCCTTGAAGCCCGCCAGCAGATCCTGCAGCTCGATATAGTGCTGTGAATGCAGCTCGCGCAGTCCAAAGTAGCCGGGCACAATCTGTGAAGTTTTGGGCTCCTGCGAGATCATCTGATAGGCAAGCACCTCGCTGTCATCGATGCCAACGATGCGTTTGCGCACAATGCCCGTTGTGGTGGGCACAATGCT--AAAGTGGGAAGAGAAG--------ACAAAACCGATTGATTAGACTATGATTTTTTGAGCA---------
>CG18854 9788783 9789272|10749 chr2L 9788861 9789134 scaffold_19 1816643 1816925 - 2557|0 294
TATGTCGGCAATCCTGGCCTTGACGATCTTAGTCAATTCGCGCAGCTCCTTAACATCAACGTTCTTCTG-------AGTT---------ACATTTCGATTAGTGCATCGCAAGCCAGATTCTTGCTTGGCTCTCAGGAATCATCCTTTGGCCCATAG-TTTTCCATCTGATCTTGAACATTTCGCC---CTCCTTGGTGGCTACATGATAAATCAT-TTTTCCACCTCCCTTTGCTTCTCTGAGTCGGTTGAAGCGTTGGCTTTCTTGGTGCCGGCGGTCGGTCGACCACGTACC
TGTCTCGTTGACCAAGCGCTTCGTCTTCTTCGGCGATTCGCGTAAATGTTTCACATCGACATTACGCTGCTCATCCAGTCCCTTTTTGAACTTTTCAATGAGGCCCTCGCAGGACAAATTGGACTCGGGCTCCCAGGTATCCTCTTTGGCACCGAAGCCCTTCCAGCGTATGCGATACAGGCCGCCGTGCTCATCATCATCAACAAAATCGAGTATGCGTTCCACTGCCCATTCCTTATCGGGATCGCTT------TCCACTTTCTTATT------TGTCTTGCGTCCACGTCCC
>CG13123 9791962 9791981|10753 chr2L 9791747 9796055 scaffold_14 1289511 1293801 + 78044|245 266
TAA--AGATTATATTACATAGT
TAAATAAATTAATTACCGGAGA
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GGACGCTCAATTTAGACACGTTAAGCTACACACACACACACACATACGCATATACGACCCATGCTGTATATGTGGGGATGCCTAGTTAAGTTCTTTTCCAAAACAACAAA---TAGAGAAGCTGCTTTGCAAAAAAGCAAAAAAAAATAAA----------------------------
>CG5924 9891255 9891350|10877 chr2L 9889859 9897361 scaffold_6 191565 198853 + 215155|1518 1664
TTAGTAAGGCATTT-------------------------------GTTGTACTATAGGTTATAAT----------------TATTCTGTTGTCTATGGTTAGTTTAGTCTTAA---GTGCATCCTTTGATAAACTG-CATCACGTTG
TTTCAAATACGTTTATAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCAATTATTCTATGCGTGCTAAGCTTAAACGTTGAACTATCTATTAATGCATATTATTTACTTAAAACTAATTTGTAAATC-----ACAAACCGATGCTATGTTG
>sop 9896263 9896326|10877 chr2L 9889859 9897361 scaffold_6 191565 198853 + 215155|6799 6862
GTGAACACTTTCGAGGCCAATCAATCCAGAGTTTTTGAATAAAGTCATAAACTTTTAAATGTAA
G-----ATCATCGTG--------AACCAGATTTTTTGAATAAA--CAAAACTTCTATAATATAT
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---------TTCGGGCTCGGTAC------GGGATTTGAGAATCGGACGCAATTTGTTGCAATAAGTAACC---AGACATTATTATTGTGGTCGAATTGCATTTAGGCGCAGTCCTCAGTGCAAAACGCA---ACTATTTATCGTACTCCGCGCAGTACCATAGTCCATAAGCAATATTTATTTTCGGAACC-CTAGATAGATCGACTAACACCCAGGCATAATAATTATACACGCACATTTCTACCAGCCCAATTCGGCGACATTTGTGGAAAGCAGCTCATTTACAATCACGCGTCCCACTCTGGTAGAACTTATGATTCTGC--CTATGTAAGGCTCAATTTATACTATGTGAATCCATATTATTTATGTGTAATAAATACTACTACTAGTC
>CG5899 9908828 9909238|10888 chr2L 9908797 9911154 scaffold_6 206349 208781 + 96226|34 486
GCATTCTCGTTGTCCTCGTTCTCGTCCTTGTCCCCACCTCCGTATTTATTCTGCGCGAGCATTTGATCAACTT---------GGTCTAATCGTCCTACCGCTGTCAAATCCTGTTAACATCGTTTG-----AATTATTCTAA-CAATATTGTATTTGTATATTTTTTAAACTTGTATGCAAGGAGAGATTTGGTGTATGGTATGCCAAAAGTGGATCATAAATCGAGTTAGTAATTTTTCACCGTTGAGGC--GACATTAGTTTTTC-TTCA---------------TTAGTAACAGCAACATTTCCACGATAAACCAAG--GCAGACAAGTTA---ATATTCTTGTTTTATTGATTTGTCATCATGATTAGTTTTCATTTCTGTAATTTCTGTTTATGTATCGAATTGAAACTATTGTTATAAGGATA---AAGATCATTTTGTGTACGAA-
ACAGCCGCTATAGCGACACACTT-TCCATTTTCCAAGAACACTATTTTTTGT-----AGCGTTTCATTTACTTTTTTTTAAATGTATACTTAAATTATTGGCGGGCAAT-TTGCTCATATCATTTGCGTGTATTTATAAGAATCAATATTGTATTAAATTATAAATTAAAATATATTCAAATTTAAGCTCAGATATTGGCTATTCGAAATGGGGTTTAAAGTTAAATGTTGAAATGTCTGTAAAGTGCGGCAAGGGAATAGTTTTTCATTCAGCATAAAGTTTTGTTTAAACAAAAAAAACATACTCATACTGCTTTTGGCTGTAGAAAAGATATGTTCATACTTACTGTAGAAATCATAAATAACAAGTAG-CTACAATTATTTGAGTTATTCTAAAATATGCACATG-CATAATTGTT-TAACAATAGATGAAGTCAATTAAAATACTACT
>CG5885 9917221 9917442|10892 chr2L 9916027 9920033 scaffold_6 213542 217485 + 149035|1287 1533
GCGAATGTGCAGCCATGTCATCCCATGTTCATGTACTCGTAATGTAAGGCCCTTCAAGAGATTT---CCTGGTACAGCGGGCTG-GTCCTTCATCCGCCA-ACCCCCGTCCCATT--------GGCGTTTCCAGCAGTGCGAGCATAGAAATTTTATAGTATAAACACCAACTTGTCTTTCTTGTAGAAAGCTGATCAA---CTTCCATTCGCTGC-TGATTGAATAAATTGTAAAGAT--------
ACAA----------------------TTTCATGTACTCGTATTGTTAGGCCCATTAAGAGATTCTTACCTTAAAGTGCGAGCAACAGATTCCATTTATCATACTCGCATCTTGTCTTGATGTAAACATTTTAGCTATTTCGAAAATATCAGTTTTATAATGAAATG------TTGTCTTTCTTGTAGAAAGCTTTACAAACACTTCCATGTGCAAAATGTTTAAATAAATTTGTAAAACCCAAAACA
>CG13125 9922737 9922793|10894 chr2L 9921528 9922776 scaffold_6 217494 218662 + 21598|1241 1280
ACATACATATACAATAAATGCAATTTGATCACATTCCTAT
ACAGATTAACACAGTAAGTTTCAGTAGAA---------AT
>CG13125 9922737 9922793|10895 chr2L 9922777 9924582 scaffold_6 218920 220653 + 54484|0 16
CATTTTAATAAAAATTT
CGGT------AAAATTT
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GGAG--CGTAGGCAT-CAGTCTG-GTGACCGTCGCACCTTTTCTTGTTAACAGCTTTTGCTTTT-TTTTTTACCTCAG---------TGGCTATTTGCCTGCGACACAGACCATGCACTC-GTTTTCATTGTTGTAATTGTGTTCTATATTATTTTT------------ATTATTTTAAGGACGAGCTGTGGTGCTGAGAG-----------------------------------------------CAGGCAAAGCACAGCCAATAGATTCAACGTTTTCA-------------AAATTGCCAATTAC-------TGAACA-CATACGGCTCTATATAGTACAATACGCTAGCGATTTACTT-AACCTTTTCTACATAAAGAATTCATATGTGAGACAAATGATTATGTGTAGTGCGTCGTATTGTTGTCACA-GCTGAACGATTAACAAAAAAGAAGA-AAAAAAAAAAAAGAAAACCAAAAAGATGTCAGTGAAATACATATGTAATCTATTTGCAATTTTTTGATATTTCAAGAAAACATAGAAATCAGCTGAAATCGATAATAAAAAACTTTAGAAATGCCAAAAGTTGAATA----TTATTA
GGTGTCCTTCAGCACACAGTGGGCGTTCCCTTTGTCCTTTTTTGTTTTACTTTTTTTTGGTTTTATTTTTTTTCTTAAACCACGTTTTGTCGCCTTGCTTGCGATTAAAAGCAGTCGAACGGGTTTCATTGTTGTAATTATATTTTAT-TTGTTTTTGAAAAGCGTTTGATTGTTTTGAATGCAAGC-AAGGTGTTATTAGGTTGACCCATGTTTTTAACATACTACATACACATGCAGACATCCAGACAGGCAAACATAAATTTATAAACTAGTTTTGTTTATTGAATGAAAAACAAATGGCCAACTTCTTCGATTTAAATATTATATAGCTCTTTATAGAACAATATGCTAGCAACTTACTTAAATCTTTTATACATAC--GATACATATGTGAGTCGAATGAATATGTGTAGTGCGTCATATTGTTGCAAAAGGCTAAAATATATATATATAAAAGGCTATAAAATATGCAAAACATCAACAAGATATC-GCGAAA---------AATGTACTCCCAAACCTTTGCTA---CAAGAA-------ACATTAAACAAAATTGATAATAAAGCGTTTCGTATAC----AAAATTGTGTACTTCTTTCTT
>CG31713 9938233 9938251|10911 chr2L 9937074 9941643 scaffold_7 1795919 1800541 - 144252|1278 1296
ACTGAAAACAATTGCCGGT
AATCGGACCGGCTGCGGAT
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GACAGCTGG------GGGAGACACACCTGTAGCCCATTCCTTGTATTATACATTAATTGTTGACCATTATGTTTAGTGCTATTAATATTTAAATAATATGTACAAGTACATAAAACACT-GTTAAATAAAGCTACGATTTGTAACTAGCCTAGAA
GAGCGTTGATTTTCCGAGGAATAAACTTGC------CCCCTTGTATTATACATAAAATGTTGAACATTACGTTTAGTGTTATTTTTACTAAATTAAT---------TACATTAAAAACTTGTTAATTAAAGCTAT--------------------
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TCTAAGATGTTGAACCAATTATATTAGGCATA-----------AAGTCACGACCTGAAGCTAATTGAT----------ACTAAAACTGGCATCCAATTAGTTGACTTAATTATGTGCAAACAAATCGTTGCG-GGTGGAGCTGAATTTAATTAAACAGTTGCATTTAAGTTAACCATACAA
TTTTAAAAATTG------TTATATCATGAATATCATGTTGTTTACGCTACAAGCTCTCCCTAATTGATTTGCTTCAAAACCCGAGCTAACATTC----TGTGGCTTTAATTATATACAAACAAATCGTTGCGCAGCGTAAATTTTGTTAATTATTTAGTTGCATTT---------------
>CG5846 9956148 9956288|10922 chr2L 9952086 9959173 scaffold_7 1814701 1822040 - 218988|4250 4391
TTGTGCGTAGATAATAATTAGGATATTCTTAATCATTTTTAAATTTTGTTTTTGTCAATAATAGATGTTGGAAACCCACGATACCTCCCTAAATTCTTTAAAACACTCATTATT-AAAACTCAAACATTTTATTCTTGCTTT
AGAAATATACATGAGATTTA-------------------TAGATTAT-------------ATAGATGTAAGAAAA--------------TAAAT-----GAACTGATCATAATTCAGAACTCAAACATTTTATTTTTACTCT
>CG5850 9960449 9961354|10925 chr2L 9960306 9962075 scaffold_7 1823755 1825682 - 49044|163 1238
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CAACGCT------------------------ATCAGCATCAGCACAT---CGATGTGCTCGAAGATGGTGACGATGTAGAAATTAGTCAAAATTTGAATGCCTCATCGCTGAGTGCATCGCTGTCCGTTTCATTTGGCATGTCAAGTAGCTTAAAATTCAGCGCCACGTGCAGCAACCAAACTGCATCCGAGTGGTCCAACTCAACGGGCGGGGACGATGACAACGATGACGACGATGACGATGACGACGATGAAGACGAAGACGATGAGGATGACGCTGATGATGATATAGAGAATGGAGAGAATGTTGAACAGATGCCGATTGTGGTTGTTGCATCGACGACGCGTCGTCGACGAGACAGAGAGTACATCACCTAGACCCATT---TTTAAATTGCAGTAGCGATATTTATTCTGTTTATATACTTATCAGTTAATTTGATTACTCACTCAATTATTATTTGGTCAATCGATTGGCAAACATAAATTCCTTTGTAATTAAGCTTAATACTCACATATATTTTTCTC-TTCTGGCAACCCAATCAAATTGGGAAATTCTAAATTGCGTGGCCTTAGTTTTGAATGCGAAAGCAACAACTGATTTTATAAAAAAGCTGCATATATAATCGGTTTAGAGATTCATTCAATTCCAACGAATCTTCATAAAACATATGTAAATCTATATGCAAAGGGAAGCGATAGTTTTTCTTAAACATATATATATATATTTATAGATTA---GGCTCGAACGTTTT----ATACATTAAACTTCAAAATCATAGGCAATTATAAATTCTACGAAAATTATACACTTATACAAATGCAGATAGTTAGACACGACGCTATGGTGACTGTCGGTAGTT-TGTACTTTTATTAGGCTAGTAATACCCTGTACCCTCGTATTTGTGCTCGTATGTTGCTTAGTAGATAAATTGATACATACCCTTAAAGCAAAAGATTGTGAATGGAGTGACT---GCCGGTCAGAAAAGGGCGTAACTTATATTGA-----AAACATATATTGTATATTAACTTATGTAATTCTCAATAATATAATTATGCAAATTCTTA
>Dref 9964147 9964544|10928 chr2L 9964204 9965671 scaffold_7 1827505 1828964 - 44594|0 345
TCTGCACTGGCGACTACTGTTTCTTATAATGCAAATACTTTTTAATTACTTTTAACGTAATCCGATCTTGTGTATATGAAAATGACTACCAGGGGCGAGGCAAATAGTAATAGCGATTCCGCAGTACTTTTAACCAAAAGACAGCCTTGGGACGTACACGGAACATCTTAAGTTATCGACGTATAAATGTTAAG--GGAACATTTTGACATCATATATTCAAATC--AAACAGATAATCTAAGAATATTTGTTTAATAAATCCATAACGAAAAAATATCACGCTTATCAAGCTCACTTGTAAATCCCCTTATATCCATTTCAAGAGAACTAATTAAAT-ACTTAAC
----TAAAGGACACTA--------TATA----------TGTTTAATAGCTTTTAATAT-------TTTTATCTGCAT---------------GGGATATGCA-----TATTTGTAATTCTATAATTCTTTAATCTGTAA-------TTAAAATACATATATAATATCAAGAGGAAAT------TAAATTTTGAGCAGGGGGAAGTTGGTGTAAAATGTTAAAATTTGGGGAAATTATTACAGAAATGTTAATACAACAAAT-----AAGAAAAAGTATAAAG--TACCAA------TAGCAACTCTGTCTGCGTCAGTGTTGA-AAAATTATGCAAATGACTTGAC
>CG13130 9983661 9983697|10939 chr2L 9982880 9983963 scaffold_7 1841484 1842578 - 9767|916 952
TAAATTAAAACACATCCATTATAGATTACAAGATGAA
TATTTTAAGA------------AGTTCTTGATATTTA
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ACATTTTACAGTTTTTTGGTAAAATAAT
AAATTAGAGAGTATTTTAGGCAAGTTCT
>CG31714 10064340 10064797|11033 chr2L 10064118 10065325 scaffold_7 1929432 1930683 - 24553|263 770
CAATATCCGTGAGTTGGATGGCATTTGTAGG------CCAAATGCCCACACTAAGATGCATTTAAGAGGCTTCGTTTTTCTATCAACAGA----TGTA-----CATATGTGTAAATCAAATTTCGAAACTAAACTACA--GTAAAAAACAAATCTCTGTGAATATTCTA--TCTAAGTATGCATCGGATATA-GATACCAAATATGGATAACAATCAGTTTAGCAGCTCCTG-------------------GTTTTACCAATTT-----TTTATCAAATAAGACCATCCAATTTTCAGTTCTA---TCAATTCATGAAATGTTCAAAGTTACTGTCCTTCAAAGTGATTTAGGCATCAATCAACCTAGACTCATA---TTTAGAACACAATTTAAAGTTTACATCATATGGCATATGTAAAACGAATTGAATGAATTTAAACTTAGGATAACTTTTTAGCTAGATTTACAAAAAGCCTATTGTGGAGAATACAATGAGAACGAAATTG
CAA-AGCAGCAAATTA-----TAATTGGAGAATCCCTCAATCTGCCCAGAGAAAAATA-------------TTGTGGCTTGATGAGCAGAATAGTGTAAATACCCTATGTATGTCTCCAGAAGCAAATGTAATTTATCATGTAAATAACTAA---CTAAAAATATTTAAAATTTACATATTCAACTCGTTTACGATTGCAA---TTGAAAAGAATTATTTTTGAAAAGTCAAATTCATAACTTTCGTAAATGTTTTATTCATTCATTCGTTTGTTTTGTAAGAACCGTTCACGTTTAGTTTTAAAACCTACTTGT-AAATATATGAAGTTAATTGTATT----GTAATACACACACCA-TCAAATCAAATATAGAAGCTCTGTAAGTGACATTAAGAATCAAACTTCAAGTCATCT---AAGCAAAATGAAAGAATTTAAAGTAAAAACAATTTTTTAGCTAGATTTACAAACA--------TTAATAAGTTAAAGTAACTCAATATA
>Sur 10182557 10182783|11153 chr2L 10182617 10183212 scaffold_7 2106882 2107468 - 17135|0 170
ATCCTAGCTAATTGTGTCATACAGGCGTTCTTAAGTGCATGTGTAGTGCACTTTTCCTAAAGAAGGACTTATCTACTTAATATATGTATAAATCTTCAGTGTATTTGCGAAAGCCTCTATCCACATATGATGTATTTCCAAGTA----TTTTTTACTAGTCATGTTTAGTT
TGGCAAGCTCTTAGAGATCTACAG-------TAAAGCTGTTTGAATTGTCTGGCTACAAATGCATTGGATTTCTGGTTGTTCTATGCCAAGTATTTAATTGTTTTGCCTAAGTACTTTTATCATTTATAATTTGAGATCAAATGGATTTGTTTTCTGTGCCTTAGTTAGTT
>CG18145 10199396 10199831|11179 chr2L 10199211 10199441 scaffold_7 2156945 2157209 - 165|222 267
AAAATAAATCAGGTGCGAGACTAAGTTTGATTTATGAATATAAAAC
AAAATATATATGGT---AGTCTGACTTTAGTGTCAGTTGGTAATAC
>CG18145 10199396 10199831|11180 chr2L 10199715 10200550 scaffold_7 2158374 2159227 - 14513|0 128
GTCGTTTATGGAGCTGGTTTCTACCGCTGACTGCTGATAGCTA--------GTTTAAAGGAGTTTATTAGTTATAATAAGA-TAAGTTACATAAGTTAAACTT---CAGACAGTCTTATCAGTTTGGAA
-----CAAATAATCTTCATTTTGTCGCTGGCTTTTTGTATTTGCGAGGTATGTTTAAGTTTGTAAATAAATTAAGAAAACATTGAATTATAAAAACGCCATTTATGTATGTACTTCTGTCAGCTTAGGA
>CG5739 10202515 10202977|11182 chr2L 10202277 10203125 scaffold_7 2163042 2163904 - 5302|247 797
AGAACTTTAAGCCATTCGATTTGGAGGAGTACTGGGGCCAGCGCCTGGTGCAGAACATCCATGTGACCACCAC------GCAGGCCGGTGGACACCAGTAGAAGCGGGAATCTGAACAGC--GGACAACGGCATGTGCTCCATGTGGTAACGATTAATTAAATTATACATTTAAAAAG-GGTGCCAGCTTCCTCCCGATTATT----GACTAATTTCCATGCTATTGGAA---TTTACAA---------------------------------TTTATGTTTGTTTGCTAACTGCTTTGGACTATTGTGTGTGTAA---------------AAAAAAAAAAAACGATTTAAATCCACTGCCAGCTGAAAGGCAAACCA------------------------TGATTCAATAAAGTGTACATTGGCAAACGATTTTTATCCCTGGCACCCTGAATCTAGCTTGCTATCTGCATTTAAGTGTTGTGCACTAAGCGCGCTTAAAATTTGACCAGAACAACAATAAACAATCTAGAGCGTAGACAAATTAACAA
AAAATTTTAAGCCATTCAATCTGGAGGAGTACTGGGGTCAGCGCCTGGTACAGAATATACATGTAACCACAACACATCAGTAGGGAGGAATGCACAAATCAACAC---AATCTATAAAACAGAGACAATGGCGCATAATA---ACGTTAGCATATAAACTAAGTACATATGTAAAATGCTTTATAAACAACCACACATATGTTTTGAAAACAATTTACCAGCAAATGGCATATTTTGTAAACGGATTGCTGTTTCTACATTTACTTCGATGCTTTTGTATTTATTCGCGATTCGTTTCATGTGAAAGTATTTGCAATACTTTGCAACTTTCACTATTATCAAATGCATTGCAAACACTGCCAGCTGTGAGGCAAAAAATATATATTAACCATTTCATTAATTTGATTTCAAACGGCATCCA---ACAAACAATTGTTAATTGT------CTGCGTATTACTGACCATTTCGA---AATTGTTTTGAAACAGAT-TTTTAAGAATGCGACCAACTCTGAATT---CCATACAAATCGCAAGAAAATAAACA-
>CG5734 10204757 10205368|11185 chr2L 10204473 10205056 scaffold_3 1182730 1183284 - 1316|296 629
TATATCTAGATCTACGTGTTGAACTATTGTAAATG-ATCTGTAAATGGATGCTCGA-------------CGGATACTTTTATC-------TCTTTTATCATTTCTTGTA--TTGTAATATATGTACGTGGAACTT-TCTTTACTTTAGA-GATAGTTGAAAATATGTTATGCAT-TTTACAAAAATAAATGTACTGATGACTATGGCATCCGGAACGAGTCCAACCGGATATTTCAAGCAAAAAAGAAAAAGAAACTAAACAATGAAC--------TATGAATGTACATTCCCTTATCTGTTGACTCACTTCCAAATAAATGACAAAAATGTTT
TATATATATATATATATATTTATTTATATTATATGTATCTGTGTACCAAAGCTGGCTTAAAGATTTGGTCGCATCGCTTTATTATACTTATTTTTTACATTTTTTGGTAATTTTTATTGGTTTTACGTTTGATTTCTATTTACTTTTGTTGCTTTTTGTTCATATTATATTTATATTTGTTGTTCTACAT---TTCAAGACTATCGTAGCCG----------ATCCATATATT------------GTCCAACAAACTGAATAATGTGTATTTTTCGTATATTTTTCTATTTCTCCTTTTTTTAACTCGCTTCGAAAAAAAAAACAATACCAATA
>CG5731 10207082 10207310|11187 chr2L 10207034 10207222 scaffold_7 2167125 2167312 - 603|53 203
ACTGACAATTTAATAAAATATTCT-CTAGTGTATAGGTTCAACATT-AAATACTCACAC-------AATTTATAATGAATATTATTTCTAAGCCTCTACAAGCCAATGTTTAGGTTTACAT-ATATATCTAATAAAAGTAATCAAATTAAA
ACAGCCAATTTTTACAGACATTTAATTATTGTAGTGAGTCAGGATTTAAATATTCAAATTGTATGAAATTTTAAAATAATTTAATTTTTACCCATCTCAATAGCGTTTCTTGGGCTAGCATTAAATATCGA----------------TAGA
>CG5731 10207082 10207310|11188 chr2L 10207223 10207336 scaffold_6 5963143 5963270 - 448|0 101
ATGCA-ATATGTTTGTTGA---GATCGCCTATGA-------TAATATT---ATTTGATATTAATTTAACCATAACTTGAATTCAACCCTTTCTGCGTTAGCG
ATACATAAATATTTGACAAAACGATTGCATATTAACTAAATTAATATGCAAAATAAATACATATTTTACGATAATAGCATTACAAGTCTAGTTACTTTGACG
>CG5727 10209853 10209994|11195 chr2L 10209804 10209902 scaffold_354 10392 10507 - 1273|49 115
TGCATTGTTGTAAAGGTAGAAACACAATAAATGAGCA-----------------CTTTATCACATAT
TGCACCGTTCCTAAGACTATATCATTAAAAATCAGAAACGCGTATTTGGGTAGACCCAAGTTCTCAT
>CG5727 10209853 10209994|11196 chr2L 10209903 10210621 scaffold_6 5963634 5964337 - 14813|0 91
CCAAATAAATATACAAATTCCAGATATATAGTAAATAAGTTTTAATAAAATGTAAGCAAAACTGATATATTTTTTGTTTATTTCGTATATAA
TTAATCGTATGT---TGTGCC--------AATAAATTGATCTTCATATAATGCAATGGCAACACAAATATTTGGTGGCTGCTTTTCAAACAA
>NPC1 10213828 10213972|11199 chr2L 10213823 10214050 scaffold_29 764464 764701 - 2859|5 156
ATCAATCCCATAGTTGTATTGTAATAATCTCAAAAAATATTTTAAATGTTAACTGGTTAAGGTAATAAATAATAACAAATG--AAAGTCGCGTTTTGTATATTTTTTGTTAAACTTATTGTT-----ATTTTTTTGCAACCAAAATAAAAAA
AGCAATAGGATA--TGTACCTTAATAATTCTCAAAAATATTTAAGATATTAATTGAAAACCCAATGAGATGATGATAAATGATAAAAACATATATTGGATACTTCTT-CAACATTCATCTTTAGCGGACTTCTCCGTTAGCAAGATAAAAAA
>CG5708 10224664 10224759|11218 chr2L 10224642 10224922 scaffold_83 40792 41081 + 9978|22 126
TCAAACTTAATGTC---ACATAAAATATACATATATTTTAGAACATAGTTCATATTTTTAAATTACCTA---TAAAAATGTA---ATTAAATCATAATATAAAAC
TATAATTAAACATTTTAATTTTAATAAAACATAAATTTAAGACCATAGTTCATTATTTGTATTTCTATATTTTAAAATTCTAAATATTAAAACAACTATCAAAGG
>CG5694 10227760 10227860|11224 chr2L 10227810 10229143 scaffold_6 6004351 6005656 - 39413|0 54
ACATTTTAATCCATAGTTAAGTTAAGAAAT----TGTTATTTTACAAGAAAACCT
GAATAGCAAGTA--AGTTTGATTAAGTAATATAATGTTATTTCATATAATAAACT
>chico 10242510 10242636|11245 chr2L 10242479 10242891 scaffold_56 344950 345335 - 5857|31 161
AGTTTTGAAATTTATGACCCTATCCTATATATATGATTTGTTTAATATTGTACATTTATTGTAAATATTCTGACAAGCAAAGCTTACAATTTTGGATGCTAATAA----ATAAATTTTATTTAAATTATAA
---TCTAAAATCTATA--CGTATACATAATAAATACTTTTTTTTAAAGTAAAAAGCGAGTAAAAATTTTATGA-ACAAAATGATTATA-----GCATGATAATAATACTTTAAAAACCCTTCAAATTGATA
>bsk 10247485 10247647|11255 chr2L 10247470 10247846 scaffold_18 2758928 2759279 + 9409|15 181
AGAACGACT-TTTTCCTCCTTAGTCAGTCACAAGAAAACTAAAGCTTACCAACAATACGGCGTGTATTGTTAAATTATTACAACAAATAAAATATTCAAATTGTATTTAAAAATATAGTAACC---ATTAAAAAATAAAATCAATATGCGAAACTTTGTAATTTCTT
AGCAAAATTAATTTGTTGATAAGACAGTTAT--TTAGCCTTACATCTATCAACAATACAAC-------------------------------------AATTTTATTAATATTTATAGTAATCACAACTACAAATAAAAATCATAATGTTTAA---TGTACTTATGT
>CG5676 10254604 10254831|11265 chr2L 10254515 10254762 scaffold_7 5637749 5638003 - 3578|89 263
TAAAGTTACAAAAAAGGTAATTTAAT-----CGAAAATCA-ATTGGTTCTTTCCCAAAACATCTCAACACTCTTCGGGTTTTCGATATCATTCGTTTTATTAAATTCTTAAACCTACTTATTTTACAG----------TCCATTTCGTTGAAAATACATATGTATGTGTAAAATC
TGGAGCAGTAAAGAAAATATTCTATTTATTTCGATGATTAGAATTTTTCGTTATCAGTATAACT----GCCTTCCATATTTTCAATTGTTTACGTATTACT----TCTTATTACTTAATACTTTACAAAATGGTCAGATCAAATTTAATTGAGAGGCTTCT-TAGATATCAAATG
>Pten 10256318 10256506|11271 chr2L 10256328 10256688 scaffold_18 107304 107651 - 4252|0 189
GTGAATCAACATACCTGTAATCAATGCTTATTACGGACTTATAATTCTTGGTGATTTA---GCAAAGTAATTAAAATTGCTAAGTAATTGGCT-----AATCTATTCGAATTTGTAAATATACTGTATGATATTTA---TTTAAGTAGTTTTAACAATTATTTTAAATAAACTCATGTACATTTTGTATT
GTGAATCAACATACCTTTAAATAAATTGTATTTTGGACCTTCTTTTCTCGGAGATCTACAGATATTTTAATAATAGCTGCTAA-CATTTGTTTTTATAAATGTATCTGAATTTGTAAATAT--------ATATTTAGATTTAAAATAG----AATTATTATTATAAATTAAAT----TTCTTTTTGGATT
>Rsf1 10262426 10262815|11280 chr2L 10262389 10262534 scaffold_1 2426521 2426670 + -23|41 149
ACGTAGAAAACTAGTAAGAAAAATACGCTAAGACTCGAACAACGTCAAACCAAAATCTAGAAGTACGCAATTTTAATAAAGGAAATGCGGAACAGTTTCTCGTATACAT
TATATGTACTATATTATGAAAAATATGGCGAAAATGAAACAAAACAAAACAATAAATAATTAAACGAAAAATATATTTATATAAACATCAAACATAATTTCTTAGCATT
>Rsf1 10262426 10262815|11281 chr2L 10262535 10262659 scaffold_14 1032139 1032287 - 1513|0 149
ACAACAACAACAGAATGATAAAAAAAAAAGAAAAAACAAAAAACT----GATAGTCGTC----GTCTCTTCATTATTTATTTAACGAATACCCATTA----------ACATGACAATTGC-------AAGCACGTAAAATTTAAGTTATA
ATGACAGCAAGGTGACGATATATATCGTTAATATCATAAAAACCTCGACGATTATTATCTTGAATCCCTTCATTATTATTTAAACGAATTCCAATTATCGGCTTACTACATG-CATTTTCATTAAATAAGTAGCTTAAGTTTAATTTACA
>Rsf1 10262426 10262815|11282 chr2L 10262801 10262866 scaffold_18 127678 127742 - 2865|0 14
TGACAACACCACTCA
-AACCCAACCATTCA
>trk 10271443 10271501|11294 chr2L 10271303 10272442 scaffold_7 736 1820 + 25389|140 213
TAGCGCCATTTAATCAAGATTTAATTAATATACACGTTTAA--------------AATGTCAACAAAAAAC-TT
-AGTATAATTTAATGAGATTATTATTTTTATATTCGTTTAATTAAAATTTAAAGTTATATTCACAAAAAACGGC
>CG5640 10272652 10272711|11295 chr2L 10272589 10272993 scaffold_18 2708436 2708838 + 11112|67 126
TTGTAATACGAGGAATCATTTTAAGTAATGCAGATTTAATATATGTATATTTTACAACGT
TTAACTTAATTAACATAATATTAAA-AATATTTTATTATATTGTACGTTTTTTACACCGA
>CG5604 10281943 10281996|11309 chr2L 10281714 10287972 scaffold_18 2640422 2646599 + 228950|229 285
ACGATTTATTGTACTCGATATTCAAGTTAA-TAAAATTTGAACC--TTTTGTTATTT
AAAAGTGTGTTTATTT-ACATT---GTTAATTAAAATTTGAACCGGTTTAGATATTT
>CYLD 10295856 10295916|11320 chr2L 10295756 10296152 scaffold_18 174122 174515 - 9955|106 171
AGCAAATTTATCAAT-----AAATTAAATGAATGCAATAAAATTTTTGTAAAAATCACATGTGAAA
TGATTTTTTTTTAATGTTAAAATATATTTTGAGCCAATAAACAATTTAAAATAATGCAATATTACC
>CYLD 10296388 10296398|11321 chr2L 10296160 10296565 scaffold_18 174796 175200 - 16674|228 238
-TGAAAACCAA
TTGACAAACA-
>nmd 10302592 10302670|11328 chr2L 10302387 10303873 scaffold_7 5777550 5778985 - 43086|205 283
GCTGACCATTGTTTATTCAAGCTCCCGATATATCCAACTTAAATTTGTATAATAAACTTTTTATTTGCCTTTCGAGAGG
-----------TTTATT---------------TTGAACGTATATTTCGCTTCAAAAATGTTAATATTTCTT--------
>CG5390 10304063 10304161|11329 chr2L 10303975 10305534 scaffold_18 2664970 2666469 + 41292|90 197
GAG-----CAAAATTGTCACTTGAATTTGTGGGTTTTAATCTTCATGCTTCACAATGCTCTCACTTAATATATGC----CCAATATGTTAATACTCAAAATTAAAAAA
GCGATATACGAAACATTTATATAA-------------------CAAACTTAAAAATGTTTT---TCAAATTGTGCGATGACAAAATAAGCA-ACAAAAAATTAAATAA
>Cdk5alpha 10308124 10308333|11334 chr2L 10308166 10308544 scaffold_65 251221 251595 - 12190|0 167
CGGATGGACGACCGGGAGATTATTGTCAACCTCTCATTGTCTGCGCATCGCCAGAAATTTCCGGATGAAATGATGGCGAAGTACCGTTAATAAAACTTAATATTTTATAAAACATTAGACAATTTCATTATGTCACTATCACAATCGTTCAAATCAAATAATAAAGAT
CGGAAAAATGACCAACACGTAGCAGTGCGACTCACATTGTCTACATACCAGCAAAATTTTCAAGATAAAAAAAATCAGAAATAGTGGTAAACAAATAAAACA-TTTATATTGCGTTAGCAAATTTC--TTTGTCACCATCACACTTGTTCAAATAAAAATGTGAAGAT
>CG5385 10311169 10311329|11338 chr2L 10311323 10311852 scaffold_18 130833 131378 - 3100|0 6
AAATTAT
AAAATGT
>CG5384 10312316 10312383|11340 chr2L 10312321 10313287 scaffold_18 135332 136322 - 39581|0 66
GTAATTGTGTTAACGTCATTACATTTGTATTGTTAATATA----ATAATTCTGAATAAATAACCAAA
TTTTTTCTATTCAGGT--TTGCAAACTGATTGTTAATCCATTTTATAAATCTATATGATTAAAGAAA
>CG5381 10317494 10317588|11349 chr2L 10317470 10319372 scaffold_18 2724131 2725782 + 585|24 128
TTAATGAG--TGCAATTAATTACGCTGTACACAAAT-AATATTTATATTAAACATAAACCAAATTTA--TACGCAATAAAACA---AAAAATG--TACTTATGAT
TAAATGATCCTTAAAGTTGCTACAATGTTTATAAATAAATATTTA---TGAAGATAAAAAAAGTTAAATTCTGCAATATAATGTTCAACATTGAATCCTTGTAAT
>RnrL 10325018 10325098|11356 chr2L 10324930 10327259 scaffold_211 9642 11971 - 111506|91 171
AAGCATTCACATAGACTAATATATTGTATTTAATTGTAATATCACTACGTTGAAATAAACTTAAATTATGAATAATTCAAA
TAATATGTCGACTACCTATTGT-TCACATCTATCGCTTATATCTTTATGTAATAAGAAGATT--CTTATAATAAATAAAAC
>CG5375 10328383 10328410|11358 chr2L 10327681 10328486 scaffold_248 7490 8279 + 7006|757 785
TGTTTTCCAACAGCAATCTGGACA-GCAA
TATTATTATATATATATATATATATATAT
>CG5366 10358162 10358306|11395 chr2L 10356808 10362625 scaffold_14 2053115 2058802 + 245722|1397 1556
AAGGGA------AACTTGGTTTCAAATTCCTTTACTTAATTAA--------GAATATGCGTTTGCGCACAAACAAGTATCTCTTTTTCTGATATAGCTTTTAAATTTTCTAA-TAAGAAATAAATGCAGATCGACTTGAAAGAGTTAATTAGTAAACAGT
GTTGTGTTAAATAGCGCTGTTCTATGAATTTTAATTTTATTAATAATAATGTAATAAGAATGTGTGAACACAAACGTATCG-TCTATCTGATACAGCCATTAGTTTTTTTAACTAAGCAATAAA-----ATCGATTTGTAAT------------------
>CG33303 10372955 10374300|11404 chr2L 10373201 10373961 scaffold_5 5924620 5925448 - 1941|0 877
ACATATGCATTAGTG------GTTATAAAATTGTTAGA----------AAAAATGGATT----AATCAATGTGAAAAATTAGTA-ATTTAAGTGATAAACAAAACAATACAAATCAAAAAGGCCATTAAGCTGTGAATCGAAAACAATTTGACAATGTGCTTTTGTACTTTTTGTTATGAAGGCATGAGTGGAAAAT-------------CGATAAA-GCAATTTTCGGTCTGTAAACAGGCTTAACAGAAATAAAGATGAAGTGAAAAATCA-GTAAAATGCATTTATAAAACTAATTCCATCGAACCTGCCAAAGTGAG--------TTCAAAGTGTATGCTTTCATAAATAATAATAATGCATGTTTTTAAACACATTATAACAGTCTGAATATAATTATGTATACCAATCTCAGTACATATTTTTTTTGCTCATACCGGAAATTATGTTTAATAATATGATATACGAAATATATATG-ATATATATGCATATTTGGAAATCTTAAGAGTAGACATATTTAATGTTCGAAATA---------GAACTTCCAGTTTTGATGGCA-----------------------GCACAAGTATTTCAGAT-TACTCATGTGCGCCCTTGGCCCTTTTTTTTAAATGTTT-------------GTATCCCAAATAGAGATTTGGCGGATAAACGAAAACTTTAAAGAAGTAATCCTAA-------------CTTCATTTTTCTAAAAGTTTATAAAA---------ATA-CATGCAAAAACCATAAA-AGATTAATAATTAAAAATAGTATTGAATAGTAACTTTAACTTTAACTTTACAAATCTACCTATAGAAATATAGCAAACATTTG--CTGTTATTAA
ACACAGACACGAGTGCACACAGTCACAAAATAGTCAAATTTCTAAACTAAAACTGGCCGCGAAAACTAATATTAAAAATAATTATAATTAAGCAGTCGA-AAAACAAAACAGAAAAAAAAAACAATAAAACTATATGCAAAAAAAATATAGAAAGCAAGCGATTAAAACAAATTTGATAAATGCATAAGCAAAAAATATAGCATGCAAAACGATAAATACATTTTTTGCTCAGTATTATGTTTTAAACTAAATTTAAGTGAGTTATTGTATCCTGTTTTTTTTTTTTTTTTATTTAACACCCTTTTCTTTTGCAAAAGAAAAACAAATTTGCAAAAGAAACGCTATC-CAAATA--------GTATATTTTTAAATGTA-TATATACATCTATATATATATATATATATATATATATATATATATATAT---------------AAATATGC---ATATAAAAATATACTATATATATATATACATATAAACAAATTGAAAATTTTTTA----------ATTTCGTGTTGGAGCTGCATTATCTTAAACCTCC--CTTCGATTGCAATTATTATTATTTTAATAATGTTGCATAAGCACAATATACAGACACATATATTTTTTTG----TTTTATTTAAATGTTTTACGTAAATATAATCAAATCAAAACAAAATGCAAAAAAAAAAACAAAACAAAACAAAAATAATATTAATGCATACAATTTTCTTTTTTTTTTTCTTAGTTGATTAAGTAGTTCATTATATTATGTAAAATATATAAATAAATAAATGAATATAAATATT-TGATATGGTAGCT---GATTTCAATTTGAATATAGTTTTTTCATAATATAAAAAATATTTATCCAATTATTAA
>CG33303 10372955 10374300|11405 chr2L 10374223 10375730 scaffold_56 196972 198487 - 40758|0 77
GTAAATCTTTAGATTTCCTCTAAATTTAGTCACTCATCAGATTGTAAAAGATCAAAATGAAACAAAACTACTATTTTG
TTAGACATTAATATCTAAAATATGTTCTTTTATTTACGAAAATCAAATAAAAAGCAATACATTAACATTACTTGTTTG
>cdc2 10384739 10384841|11424 chr2L 10384641 10385092 scaffold_59 54629 55065 - 12994|100 214
CGTTCGGTATTCTCGTTTGACTTTA-ACTAAGAATTTTAAAACAAGAGATCTTGGTATCTAATCTAAAGCAAAA---TAGCCGT-AAATAAAAC-------TAAGGGTGTAAAAC
-------------------ATTTTAGAGTAAGATTTTCAGAATGCTACATTTTATACGTAAATCTAAAATAAACTTTTACCCATGAAGTAAAGCGCTATCATTAAAATAAAATAT
>CG5362 10393847 10393933|11437 chr2L 10393816 10394975 scaffold_18 157145 158337 - 50399|31 141
TGCGATCCTTAAACGTTAATTACTAACATCATA-----------------------GTTGTGCATTTAGGAACAAAGTTCATGGCAATAAAAGTTTTGTAAATAGC-TCTG
GGAGCTTCT---GTGCCAATTGCATATTTTGTGTTTGTTTGACAGCTATTTTACGTGTTATGCATTTATAAA--------ATGTTTATACAATGTTTGTAAATAATATAAA
>CG33677 10403195 10403556|11449 chr2L 10403178 10403702 scaffold_14 1010978 1011450 - 9903|17 381
GATGGCGATCGGTTTTGGCGCATGCCCGAATGTTATATCCGCGGGAGCACCATCAAATATCTGCGAATCCCCGACGAAGTAATCGACATGGTCAAGGAGGACGCGCAGGCCAAGTCAAGGAATCGCACAGAGATGAACAAAAACCGCGGCGGCAACTCGTCGCAAAATCAGCGCGGCGGACGTCCTGGTGGCGGCAACCGCAACAATGTCGGCAATCGTCCCGGCCAGGGATACGGAGGTGCTGCTAACAACGCGATGCGCCTGGGTGGCGCTGCTGGCCAAGGGAACCGTCTGCCC---CACGCCGCCAAAAATAGGAAATAGTTCTTCGGATCGTAGTAATAAATTCTTTTCAACCATTTCAA
GATGGAGACCGGTTTTGGCGCATGCCGGAATGCTTCATACGTGGAAGTACAATTAAGTATTTACGTATTCCAGATGAAGTTATTGACATGGTAAAGGAGGATGCACAGGCTAAATCGCGAAATCGCGCCGAAATGAACAAGAACCGTGGCGGCAATTCCTCACAGAACCAAAACCAACGTGCACCTCGAAGCGGGAACCGAAATAGTTTCGGTATTCGCAGTGGGCCCAGTGGTGGAGGGCTGGGGAATGGCGGTATGCGT---GCTGGTAATTCGGGGCAAGGAAATCGTCCACCCATGCAGGGCAACAAGCTTAGAAAGTAAT-----ATAATGTAATATTAAAAATGATTAAA--ATTGCGA
>CG17768 10403195 10403235|11449 chr2L 10403178 10403702 scaffold_14 1010978 1011450 - 9903|17 57
TTCTTCGGATCGTAGTAATAAATTCTTTTCAACCATTTCAA
T-----ATAATGTAATATTAAAAATGATTAAA--ATTGCGA
>CG33677 10403730 10403828|11450 chr2L 10403717 10403900 scaffold_6 5984162 5984339 - 1074|13 111
TTGGTGGAGCTGAAAAATGGTGAAACATACAATGGTCACCTGGTTAGTTGCGACTCGTGGATGAATATTAATCTGCGCGATGTTATTTGCACCTCAAAG
---ACAAATTGAAAAGGCAGAGATAAATACAATAGTTACCTATATATTTACAAATTATAGATTGATGAC-ATCCATTTTAAGACTTTTATACATAAATG
>CG33677 10403891 10403932|11450 chr2L 10403717 10403900 scaffold_6 5984162 5984339 - 1074|175 184
CCATCCCATG
CCAGTCAGTT
>CG33677 10403891 10403932|11451 chr2L 10403901 10404036 scaffold_14 1011633 1011788 - 3194|0 31
CTGCCACTTTCACTTTTAAAAACAGCACAGAG
CTGCCGTTATCACTCTTAAAAACAGCACAAAG
>CG33677 10403993 10404384|11451 chr2L 10403901 10404036 scaffold_14 1011633 1011788 - 3194|102 160
GATTTCATGTTATCGCTG---TATTAATCGATTACTTCACGAAAAT------------G
GAAAACTTTTCATCTCTGAGATACTCATTGGTTATTTTATAAAAATAATATAAAAAATG
>CG33677 10403993 10404384|11452 chr2L 10404043 10404084 scaffold_14 1011797 1011835 - 1218|0 41
TGTGTTTCATATTCATTTCGTTCCAACAAAGTGATTGACATC
TGTGGTTCATA--AAGTTCATTCCAATAT-GCGATTGATATA
>CG33677 10403993 10404384|11453 chr2L 10404360 10405503 scaffold_14 1017535 1018640 - 22950|0 24
GTTACATGTTTTTTTTATCCATTTG
-------GTTTTAGTTACTTAATTG
>CG5355 10410529 10410636|11458 chr2L 10410607 10413223 scaffold_6 24177 26896 + 101397|0 32
GTGGTTAAC-CATAAACAA--ATTGCATTTCTC
TTTGTAAATATATAGGTAACTATTGTATTTATC
>SmB 10425483 10425527|11474 chr2L 10425403 10426179 scaffold_14 2082318 2083114 + 36843|86 148
GTA------------------TAAAGTACAATCTAATAAAAACTCATTTAGAAAACACCACTT
TTAACAGCATCCGTTTATCTTTATAGTA-AATAAAATAAAATTTGAGTCAGTAATTGGCTTTT
>CG5343 10429920 10430058|11479 chr2L 10428785 10430907 scaffold_14 2088032 2090263 + 71561|1194 1395
ATTC-------------------TGTATGCATCATCAATCAATTAGAGCACCTAACCAGACG-GAGTCGACGA-----------TTAAAA-------CGGCACAAAA-------TGCACAAGACTGCCATCCAGCACTCATTCAACACTTTATGGGAATCACG------------------AATAAAAATTGCATCATGTAC
ATTTAGCCGTCGATCTAATGAAATATATGCTCACATATTCAACTATAGTACATAGCCAACCAAGAGTCAGCGAATATTCAACTTTTAACAATCACTTTAATACAAAAATTTTCATGCAAGCCGCCGGCATAC-GTGTTTATTCAGAATTCTATGTCAACTATGCCTTAGTACACACCTTCAAATAAAAATT-CACTATTTAT
>CG5337 10432677 10433154|11480 chr2L 10431367 10435361 scaffold_14 2075576 2079534 + 170819|1337 1836
TTATCTAATATATACACTGTTTAAACTCAGCAATAACTATTGTTGGCGACTGATATAATTCGTCATTAACTATTAACTATTAGCACATGTATTATGCTTTGGAATTATTA-GTTTGCTGCCCTGCTTGGCTCTCTAAATGAATTTAGCCATTTA---CTACGTT---TAAACGCCCCGCTTTATTTGC-AATTGATAATGTTGAAAGTTACAGATTGGTCGTCTTATTTGCGAATTTTTTATCCATTTATATTATTACTAATTACTTAAAGCTTATGTATAAACA-GAGTACGTGGTTTGTTAAACTTATTTTCGCAAATAACTGGCAAATAAACGTAGTGTGCAATTTTTGTTTCTGGTTATTAGCTTATATTATACCAAAGATACACAAAAAATGTAAAAATAAATCAA-GCAAGCAAAGTATTACGAATCATTGGAATAAAG--------TTCAAAAACTGAAAGGGTTTAACTCAGATAA----TTAATTTAACAA
TT----------TATGTGGCTT------------------------CTACTGTTGTATATCG--AGTTACTCTTACTTATTTATAC-TATATTACAATTATGTGTTATAATGAAAGCTTTTAAGCGAGTGCTTCTAAATATACTATATTATATATGCCTATGCTGAATAAATG------TTTACTTCCTCAAAGATAAATTAAGAAGTTACAAGCT---------------AAATTTTGAATA---TGATAGTAAATGTAACTATTTAAAGC------AGCAACATGAGCATTTATTTTCTTACAGTGCACTGAGCAAAC---------GTGTATGTCATTCCCTATATATATATATATTGATTCTCTGATCTT--------------------------AATTACATTGGTGCAAGCTTCGTGCTG-----CATTTTAACAAGGCGAGTTCATTTGCATTTTAAGGCGTTTTAATTTGAATAAAATCGTATTTTTCTTG
>RluA-1 10463336 10463810|11499 chr2L 10463357 10463769 scaffold_14 956526 956945 - 3687|0 453
TCAAACAAAATTCTATATATCATACATAAAAGAT---GTGCCTTTAAGATTGG---------ATAGCATGCGTACGCTTTTGTTAATGCGTTATACGATAAT-----ATTTACTATATA-------CACAAAGGCGTTTAGATCGATTGTATTAAAATATATATAAATATATATATTCTAGGATCCTATCAAAGTTC--ACAATCAACCA--CAAATAGGCTAATACA----AGAGCTGAAAAGACGTGCAAATAAATTCGAAGCTTTTACTACAAAATATTAGGTATATTTATATGTATACAAGACATGCACTTATCTGAATTAATGATATGTGAAAGGCAATATATTATTATACTGTAATCG-GAATAGACAACTTTATAGAAATTAGTTTATATGAGTGTAAAGCAAAAATCATAT--------ACGGAAAAAGTGAATATAAATAAAATT
TCAAGCAAA-TTCTAAATATCATATTTAAGAAAAACAGTGCCTTTCAGATTGGTATATATAAATAATACAAATATTCATATATAGATGCACTGACAAATAATCCCCAAATTGCTTTAGATGTATTTCTCATAGTCAATTTTATTGGTATTAGAAAAAT-----TAGATGTATATCACCAAA------ATCAAAATACTGCAAGCCAACTAATCAAACTATGTAATACACATAAGAGCTGAAAAGACATGCAATACTATTTCAATTTTTCATTACACA--ATTAGTTATATAGATACATA---AGTATATACATTAATCAGGAGAATCGA---------------AAACAATTTCACGGGAATTGAGAAGAGATTCGCAAACAGAAGGT--TCCATATCACCTTAACAAGAACCTCATATCCCATAAAATTAAGAAAGCAAATGCAAATCAAACT
>RluA-1 10463336 10463810|11500 chr2L 10463775 10463824 scaffold_14 957138 957175 - -259|0 35
GTATACAATAGTGCATATGTTAGCAACCAAACAGAC
--------CGCTGAAAAAGTTGTAAATTAAATAGAT
>CG7456 10485535 10485747|11525 chr2L 10483475 10488761 scaffold_14 2149426 2154734 + 153467|2171 2396
GCAAAAA-------CATCGTATTCATGCGGACGTATTATGA------CTGGCACTGAACCAACAATTGAAATCCAAACGCAAAAGCAGCTGCGAAAGCGGACCCAAACAAGAAGCTGATTTTACATCGACTAATAGTTGGATAAGGCTCGCAATTTGAACACCAAAACTATAAGAAAACAACGTTTTATTATTATACAATAATAACCCACTTATCCAAAATGTAAA
GCAGAAGGCGTTTTTATTAAAATGATGATGCTACGTTTTCAGTTCTCTTTACGCTAAACCAACGATTGAAATCCAATCTTAATAAGAACTGCGAAAGCGGACCGAAACTGGATGCACTTTTAATGTTAACCAATAATTTAATTAATCCCGATATGGCAATGTTAAATCTATAAAAATAT------------TTAAGAAATATAAACATATATAAATGAACTTTGCT
>Myo31DF 10491682 10492330|11528 chr2L 10491740 10495167 scaffold_2 4962126 4965681 - 152349|0 758
GCGGAATCAACTCCGCCCAACTGTATTGTAAATTATGGAACCTAGT---TTTAAGA---CTGGGCTCATCACCCTCTTTTCTACTTGTGACCCATGTGTCCCACCAAGGACATGACGACT---CTGTGTATACCGTGCCTTCCGCCAAACACCCGCTTTGTAGTTTTTAATACGTCATTCTATAGTTAGTCCTATCTGTTTATCTGTTCTGTGTGTGACGA-----------CATGA-------------------------------TTGTAAT----------------------------TTTGTACATTTTTCTATTA---------------TGCGTATGCG-------TTAAGGCGATA---------TTTATTTAACA--TCCATGTGAGAGGAATACCACCTCC--------GCCGGTTGAGCTGGCCGACGAAAAGAACGAAAAGTATTAAATGTACTTTGTGCATTTCTTCAAATATGATTCACAGCACACAAGAAACCATTTGTA----------------------ACGATCAGTAA-----------AATGTTTGTACTTAAAGCGAAAGATCACAAACATATGTGTGCCATTTGCAAATAT---TATTGAAATAATATATGAAATAAAAGATGTAAACTTTGTACTTGAGAA-----AGCTGGTTAA--TGACTATTTTTTTATATCAAT-----AAGTTAAAGAGAAGTTAACTTACCAAACATAAGCATAATGTGCATAAGTT
GGTGAAACAAAGTTAAAGAACC-CAATGTAAATTAACTAGGCTAGTACATTTGTGAGCCTTGGACGTTTGTCCCACTCTACTTCAATTCACCTG-------CAACGTGTACTTGAACCTTCTCCTGTGTATGCTGTGCCTTCTGCCAA----CTCCTTTGTAGTTATAGTCAGATCCGTATTGAG-AAGTTTGTTTCCCTTGTGTGTTGTATGTTTGATAACTGAAAACCTGCATGAGGTCTCCTTAAGTAAACCAAAATATTTTATGTTATAGTCACAAAAAATAAACAATAACATCAACGATTTGTATATTTTTCTATTAATTTATAATTAAATTTGTGTATTTGTAAACAATTAAGGCAAAAGCGAGAGCCTTCAAATAACACCTCCAGAATAGAGAGATGGCAACTTCGTTATAAAGCTGGTTGAGTCGGCTTC-------GATAAAAAGTATTAAATGTACTTTGTGCATTTGTCAACTTTAGCTTTTAAGCAATTATTAACTGATTTATGTTTGTATTTAATGAAAATGCACACAAACCGCAAAAACGCAAAGTAATTTTTGTACTTAAAAC--AAATTCAATTTTGAAAGTGTGCCATTTGCAAATATTTCTATTCTATTATTATTGTCAACTATTTATAAAAGTACTATAAATAAAAGTGTATAAATGGTAAAATTCATTTGTTTACTATGTTAATTTTTAAAATTAGCGAAAATT--AGTTATCGAAATTCGCAATTTTATATATATATT
>CG7384 10507857 10508086|11543 chr2L 10507100 10507925 scaffold_23 1087564 1088384 - 30858|773 845
CATAGTTAAGCGTATATGTGTAATGTGCATCTTTGTATAACAATTTCCAATAAAAAAC----TACAAGTCTAA
CGTACCGAACAATGTTTATGTAACAAAAACTTTTGT----TAATTTAAAAAAAAAAATCATTTAAAAATCTAT
>Fatp 10511252 10511666|11549 chr2L 10511264 10513609 scaffold_30 984671 987045 - 110695|0 488
GAGCTGCAA-------------TAGAGTTGTGTCTGAACCTTGCCTTTTGCCCAATATGCTGTTAATTAGTTTGTAAGGCTAAGTGTAGTAGAGGAAAATCGGGGGAAATCGGCAGCAAAGATCATTCAGCCTAGGAGAGATG----CATCCGAAGCACATTTCCATGTCAACAATGCACTTTTGTATATCGTAAGCATATATATATCGTATATCGTAAACGTAGTTGTATCTGCATTTGTGTAGATGATAGCCTCCTATACGCATTTCA-ATTGTTTTTAGCGTGCTAAAGAACCTTGT-TAAATGCAAT-----------------------------TTCAGCTATTGTTTAGTCAGT--TTTAGTGGCATTTACACTTCCATTCTCGTTGCGTTTCGTTTTTGCCTGTACATATGAGAAGCTCTGATGTTTTTG------------------------------------TATCAAATAAAGTTT
GGACTGTAATTACCGCTCTCTTTAGGGTTCTTTTTCTTTGGTGACTTTACACCCTAATGCTGTTAATTAATTTGTAAG-----------------------------CGTCTTCACCAACCATTCCCCATTTTCGGGCTTGTGCACACATCCAAAGCTTA----------------GCACTTTTGTATA-------CATATATGTATCTAGTAT-------ATAGTTG-------ATTTGTGCATTTTTTTTTTTTAGAAACGCATTTTATATTGTTTTGTATACGTAGCAAAGCTTTGTCTAAGTGCAATTCGTATGTGCGAGTGAGTGTGCGTGTATGTTTGTATATCTTATTGTTAGTCGTTTAGTAGCATTTTTTTTTAC---CACATACCATTTTA-TGTAGCCTGTACATATGAGCAGCCAATTGGTTTCTGTCCTTTATTCCATTAAACTCTATGACCCAGCGTATCTATCAAATAAAGTTC
>CG7363 10575856 10576427|11627 chr2L 10575671 10575973 scaffold_30 1073486 1073833 - 2858|221 373
ACGCCCCGCGGTATGCAACAGTATTTCTGTGCTTTGTATATGCCACAA-----------------ACCTTAAATTTTCGCCACTTCTGTTTTGCATGTCG-------AAATAAAAGCAAAGA-----------CAATGAGAATTGACCCAAAT
ACGCCCAATTGTATGCAACATTGTGTTGGTTGTTTTTTTCTTTCTTTCTGGATTTTTGTATTTTTAACTTAAATTTGTGCCACTTCTGTTTTGCATGTTGCTGGGGCACACAACAACAAAAAACACCGAATCGCGCCCAAAACTGACCCAAAT
>CG7329 10629352 10629498|11678 chr2L 10629263 10629444 scaffold_9 1877326 1877487 - 135|91 187
TGTTCAATGTCAAATGAATTAAGTCACATGTTT----TTGAAATAAAAAGTGTATGTCAATACATCAAGCTCAATGAAAATGCTCTCAAGCCATTGC
TGCTGAATGTCAGGC----CAAGACA-ATGTTCGCCATAAAAGCAAACGGAGCATGTCAA------AAGCAATTTATGTGTGCGGCCAGGCCAAGGC
>CG7299 10683761 10683838|11744 chr2L 10683190 10683953 scaffold_30 1205202 1206046 - -1461|628 708
GCC-AACAGATCCGAATTTATTCACTGAGTAGATT--TTTAATATTTATAAAAATAAAAATAAAAAACACAAAACTATGAA
ACCGAACTGAAAAGAATTGTTAAAGTGAATTAGTTTATTTTTTATTTAT-AAATTAAATATGAAGAAAAAATGATT-TTTG
>CG7296 10686376 10686461|11747 chr2L 10685274 10687121 scaffold_30 1206961 1208660 - 5899|1182 1269
ACCGATCCAAACTATACTGGTAT-TTGGAGTTAAGCGATAAGAAATGACTGTGAATAAAACCTAAATAAA-TTAAAATTATATACAAG
GCCATATAAGATCTGACTTGTATATCTTAAATAACTAAGAGTTAATTAATGTGAATAAAAAATGATGAAGCTTAATCTTATTTAAGAA
>CG7294 10688727 10688812|11750 chr2L 10688603 10688799 scaffold_30 1212756 1213003 - 866|151 252
GGATTATCTAGAA-GTTAAGTTATTGTTAATGTTAA---------AAAAGTCTGAAA---TAAAAAAATTTTAAAAC----------------CCACAAAAA
AGATTTTACAAAATGTTAACTTA--GTTAGTTATAAGCTATGTTTAAAAGTCTGAAAATTAAAACAAAATTCAATACCATCTATTTGTCGTTTCTATAAAAA
>CG7294 10688727 10688812|11751 chr2L 10688804 10689390 scaffold_30 1213028 1213653 - 11459|0 8
GCTGCCAGA
AATGCTTAA
>CG17108 10692938 10693031|11758 chr2L 10692866 10692988 scaffold_1 6642832 6642956 - 1586|72 124
GCTTAAAGTATTACATCAAAACCGATCAA--ATATAGTTTTTGTACTCAACAA
GCTTCATGCATTTGGTATACATCGGCCACCTGTATAATTCTAATATTATACAA
>Lip1 10699405 10699587|11764 chr2L 10699339 10699485 scaffold_912 4769 4896 + 333|67 147
CGTGCGTAAAATTATCACATAGAGTGTCGATTTCAGATTCATATTAAAAATAACGAAGCCACTTGGCAGTACCAATTTAAA
CTTGTATGAGATTAACA------------ACTTTTAGCTCATTGT-----TCATAAATCCATCTAATCATATTTAGTT---
>Lip1 10699405 10699587|11765 chr2L 10699494 10700232 scaffold_30 1223343 1224099 - 31023|0 96
-TGTGTTACCTCTTCTTGGACATA---TTTATTTTGTAACTATAAGTATTTATTTCTACAATAATATTATAAACAAAACTCTGTGCTTCGTATTTAT
ATATAATACTTATTTATTTATTTGCCTTTTCTTGTGTAGCTTTAAATA--------TGGAATAGATATTTGCATAAAACTGTACGCTTTTTAAATAT
>CG6750 10731428 10731530|11804 chr2L 10729085 10731438 scaffold_6 4395070 4397449 - 80921|2491 2501
AATGGGAAACC
AAGGGAAAGTC
>CG6750 10731428 10731530|11805 chr2L 10731439 10732465 scaffold_6 4397607 4398697 - 45993|0 113
-TAAGTTATGTA--------TTTTAGCAAATT--------CACAATGTAACAAAGTA------GATTTTGTTTCGAGTCAGAGAGGGTTAAAATAAAGCAAGTTGTGTGACTAC
GTGAGTTTTGTAAGGTTATCTATTAGCAAAATTTAGACGACGTATTTTAACAAAAAAAAAACCAAATTTGTTTTGAGTC---GAGTCTTGCAATAAATAAACTATTATGTCTAC
>Nup170 10733294 10733343|11806 chr2L 10732738 10736166 scaffold_6 4399550 4403227 - 113408|656 725
CAATCCTAGTACATTTGT---------------GTGTTTTGCGATTACATTC-----TAACTTTAAACGT
CTATCTTATTATTTAAGTGAACGGTGCGCAACAGCGATTTATTATTATAGTTTTATGTAATTTTAAACAT
>CG6729 10740786 10740878|11813 chr2L 10740841 10743864 scaffold_6 4408183 4411270 - 112330|0 45
GAGTCCACACAAATGAATACA--------ATAAAAACCATTATGAT
GAATTTATGAAAAAGAAAACATAATTTGCATAAAAATCAATAAAAT
>CG17124 10744075 10745487|11814 chr2L 10744023 10746401 scaffold_6 4411837 4414622 - 37055|54 1834
ATCGCCGATGCCTCATT--------------------------------------------TGAAAAATCATCCAGCAGACC----TACACATACATAC--ATATATACTATGCAGATAAAGAAAAAGAATTAACAAAACCTAGATGATTAAGTTTAGC----TTGGAACGCA---AAGAACAAAGAATTCTTGAGATCTACCTATTCGAACACTGTGTTGATTTTCTCTATGTACTTTAGTTGTTAGTTTG-----TATCTTTGCGCTGATTAATTTGAAGTCTAACCTAATTTAAGCTAC---CCAAGAAAATGATAAACATGATGAAGATCGTTAGCCGTAAGCTTATGGTGTAATGCCGCCGAAAACATAATACTTCATCAATTTTGTGATGATATTTTTTTAAT-----AAAACACAAACATGATATGATATGCCCCGAAAAAGCAAA---------AGCAAATGTTC---AGCTACAACTGAATTGAAAAC---CATGGCAAAAGGAT----------AAGCCTGTGTAGTTAATGAAATACGATTAGATCCAATCTTGAGTGGATTCCAATTTCAATCCACTCGAACCACTCCGGTTGTTTTGCAAAACTAGTTTATTTGCATGTGTGTGCTTCATT----------------------------TAGCCCCCTATC----TATAT---------AGACCCATGAATATCATAACTA-----------------------TGAGTAT---------CTTAATAAACATTTTTGTATGTAAAGTGTG-CGATCACCAAGTCAAAGATGAAAGCTCAGGTTCACTGCCAAAACGTGGAGGAGGAAGGTCTTGTATGCGCAGTCAACAAGTACAAACGGATATGGAATACAGAAGCACAGTA---------CGGCCTGGCAAAACGGAATTTTAACCACACATCAAAAAAC--------------------TTTGTTCTCGAAT---TAAAAGGAACAT----------------------------------TATTCACAACCTATAAGAAACAGCTGCATTTTAGAAAACCCAGACTACACGAAATAGTTGTAAATAAAATAATTAACGAA-------------TCCCATACAGCTC------------------GATTCTCAAAA---------------ATTTGTAAATACCCACGAAAAGCATCAACACTTCTTCACTCCACGGAATCTACACCTCTTTGTAGTAGTGTCTAAACAATTTGTAGCAATCGAAACATAACGTAAAAGTATTTTAATTGTGCTCAACAAAGGCGGAGGAGAA--AAGATACGCTATTATGATTCAGCTTTAGCAC---------------ACCTAGACTATCGAACCCTATTTCTCTCTACCAGATCGTAAAC-----------------------GTATTAGTATCTTCTTAAAAATTGCTATTTGCATACTAGTATCAACAAATTAATCAC---CGCATTATTCCATTGCAACATTAAG---AGAACGCATAAAACGATTATTTAAGCG------AGTTTAGCATTAAAGCAT-------TCACACCTAATCATGCACATAACTCTCATTTA---------------------------AAAGCAAATCGAAAAGCACACACAAAAACGTACGCTAAAATAGTGCGGAGAGCTGTAATGAAGGGCTAGCGGAAAATATTTATAAAACGCAAAAGAAAAGTTTACAATAAAGATTTAATTGCTTTAGAC-AAC
ATCGCCGGCTCTTCAATAAATACAAAATATAATAAAAAAAAAATAAAAAAAAATAATAAGAAAAGAAATCATTAAACATAATGTAATACATATATATACTAACATATAATATGCA---AGCGAAATACAATTTAC-----------TTTTAAGTTTAGCTGCTTTAAGATCCACACAAGAACAAAGAATAAAACCGAAATATC-ATTTTTTTTTTATTCAGAATTTTTTCATTTAGGACTTTTGCTTGTTTGAAATCTGTATTTGCAAAGTTTAGT-----------CTTAATTTAAAGAACACACCGATAAAATGC--------------ATCGTTAGCCATAAGAATACAA---------ATTTAAATCATG--ACTTCATCAATTTTGTGATGATATTTCATAAATTAACAAATATATATATATATAAATATATGTATGTACATTATACATATGTGTATAGTAAATGGCCTGAAACTAATACGAAATTGTTTATTTGTAATGCAAAATGAGTTTTTTCGGAAAGCGTGTGTAGT-----AAAAACTAGTAAAACAAAGTTCAAAAAAA---------AAAACTACAGTAAACACTCTGGTTGTTGCAAATGATTTTGTTTTTTGCCTACGTCTGCTTAATTGTATTTGTTTTTTTAACAAATCATTAAACAATTTTCTATCGTAATATATGTTATTGTCATGTGCTTGAATATTGTAGCTACCCGAAAATGATTTGAATAAAATTGTGTACAAGACGATATTTAATGGAAATGTTTG--TGTAAAGTAAATCGAACACGTAAACAAAGATGTAAGCTCAGGTTCACTGCCAAAACGTGGAGTAGGAATGATGCGAAAAAAAAGCCGCTAAAAACTAAAATTAACCGAAAGCAAAAGTAAAAAAATAAACAAGAAATTGTGCAAGATAAAATATAAAAGCCGGGCAAAAAAATAGCATTAGTTTTTATTTTTATTTGTTTTTAATTGTATTAAAGGAACTTCTTTAGATGTTCCAGTGAGCCGACAGTTGCAATACATACACAATATTTGAAGCACAAA-GAATTTCATAATCTTTAATTTTCACAA------TGTAAATAAAATGTCAAAGAAACTCAACACAATACTCCCATTAAACTCAACATAAAGCATAAAATGAATTTTGAAAAACTTCCAATCAAATTATTTGTAAATACCTTGATGAAGCATTCG-AGATCTTCACTCCACGACAT-------TCTTTGTAGTAGT-TATTAGTACTTACTAGCAATTGAAATCTAACATACAAGTATTTTAAATGTGCTCAACATGGCAAAAGCAAAAGCAACATACATTTTAAAACACCATTTTAAGCACTTTGATAGCTCTTGAAATTAGCGGATAATGCACTCTTCTATGATACTATATTGTATGCTCTATTAATTATGCCCACGCATAGCATAAGTAAACTCTCTAAACATGCTCTTTGCATA--AATATAATAATATTAAAAACACATAAATCATTTTAGGTGCTCATTTAGCCAAACACGCATA-----CTTAATTCAGCATTATATAGCTCCAAATTTAAACATTTATACATTATACTTAATCATGCACTTTACTCTCGTTTAACATTGACAATTGATGCAAAAATATGGAAAGCAAACAAAAATACACACACGCTATGGCATACGGAA--AATACGGAAAGCTGTAA-----GGTATGCTTAAAGTATTTAATAAA-------------------------ATTTAATTGCTTTAGACAAAC
>UbcD2 10765562 10766117|11838 chr2L 10765023 10766991 scaffold_6 4443955 4445946 - 54842|563 1241
TGCGTAAGTTTTGGCAACGTGCATGTACCACAAACCGAAAACTGCAACAACAGAAACGAAAATTCGCATCTTGCAACGGAGAAAGTCTATTTTATAAATATATATTAAAGTACGATAACTACTAAATTAACAGTA----ACAACTACCGTAACACGAAAAGCAACCGCCAACAGCCAGTCGATCCAAT----------------CCAATCTAAATTCAGTCTATATTTATATC---------ACGTTA-------ATACAGAAGTT----------------------------GTAAAAAAA----AAAAAACATTTGGAGATTTCTTGAGTTGTATTTTTCGGAAACTAGTTTTGTTTTTAATTCGCTTAGCAACCGAAAACATTGTAA---------CGAGTCACATTCGATGAAAAACTG-----------------------CATCATG-AATTGCACATTGACATATTAAACTATAAACTATTCAACTGCAT-AATAAATATAAATACAATTAGTTTACATTA----TATGTGTACAGTGTTAAGTGAAAATGGAGCTAAACGAGTAAAGAGA---AAAGCCTATTTTAAT--GCGTAATGCGTAATATTAATGCAACCAAT--------GTCAGGGCAGTAAACTTCGTAA----AAGATGATTTTCATTCA
TGCGCAAGTCCTAGCATTATACACGTACCAC-------ACGCTGCAGCA--AAAAACGAAAATTCGCA-------------------AATTATAAATAAATATATTAAAGTACGCTAACTATTAACTTAACAACATAACACAACAACAGGAAAC--AACAACAATAGTTAAAACGTATCCCATTCAACAAAAAAAAAAAAAGCAACAAAAAAAATTCTTTCTGTAATTGTAACTTTATCAATACGCTAAACACACACAAACAAGTTTGAGAGATATGTATAATTGTTTATACGAGCAGAAAAAGTGTAAAAACAATTTTAACCACTTGTAAGTTGCG-TGTTCAAAATTTCGTTTGATTGTGAAGCAACACAGAAATACAAAAAAAAAAAAAAAAGAAATCAATTGAAACAAAAGGAAACACTGAATATATTGAACCATAATCAACACATCATTCAACTTCACATTGGCATATTTACTAATCAACCACATAAATAAATAAATAATTATAAATAAAATTAGTTTACATTACGAGTATCTGTACAGTGTTAAGTAAAAATGGAGCTAAACAATTAACAACAAACAAAGCCTATTTTAGTAAATATACTTATTAACACAAACGAAACAAATAACAAATCGTCAGGGCAGCAAATTTCGTAATTTTGAGCAAATTTTCGATTA
>CG6724 10768203 10768286|11839 chr2L 10768187 10769829 scaffold_6 4447317 4448956 - 77170|16 111
TCCCAAAACTT----GTAAACTTTTTATAAATACAAA--ACTA------GTTTAAACTTTAAAGTAAATATTGAAAGATTTTACATCTGGGGTGTT
----AAAATGTTGACGTATACAATTAATATATAGTAACTGCTAGACGCCGCTTAG--TTTAAATAAAATGTCCAATATTTTTTTGTTT------TT
>Nos 10804269 10804626|11886 chr2L 10804104 10804632 scaffold_6 4498274 4498831 - 6122|172 590
GACGAAAGTCGCTACCACGAGGACATCTTTGGCATCACGCTGCGAACGGCTGAGATACACACAAAGTCAAGGGCCACGGCCAGGATACGAATGGCCTCCCAGCCATAAGGATAGATATTCGAAGTAA-TCAA------AATAGGAGGG--------------TGACATATCCAAATTCAAGAGGAATACCAAGCACTTGCTCTTTTTTTTCTTCCATATTCAAATGCAATTAAATATTGTCGCTTTGT--------TCATTACATATTCGTATGAATAAC--GTTTAAATAAATTACATTTTATTATTGATTCTAATGT-ACAAAT----------CAATTGTGAAATCAAAATCTAAATGTTAAAA---------------TATATTTCAAATAAACGAATCGAAAAAGAA----ATC
GACGAGAATCGCTATCATGAGGACATCTTTGGCATCACGCTGCGCACAGCCGAGATACACACAAAGTCACGTGCGACCGCAAGGATTCGTATGGCATCGCAGCCAT-AGTAAGGATAACAGAAATAACTCAACTCTCGAACGGCACGGAATTTGTTTTGCTTTGAGACTTACCTGTTTAAGCGGCAT--CAAG------------------TTTCAGATTAAA---CAGTCTAAAGTGATCGAAATGCACAAAGCATTATTAAATATTC--ATAAATAATTAGCTAAAGCAAATCCCAATTTTGCCTAGATTCAAATTTGATAAATAATCAGCGAACAGCTTTAAACTAAAACTGCATAAATTAAAAACAGGCAGCAAAGTGTGTTATTTGTGTAAAAGTATTAACAAAAACTATTTTT
>Nos 10804830 10804896|11888 chr2L 10804738 10805345 scaffold_6 4499507 4500120 - 5566|123 189
GAAGTGCATTGCCGGCAAAGAGCAGAAAAGCGAGGCGGAAGTTGAGACATTTTTGCTAACACTGCGG
GAAATGTATTGCCGGCAAGGAGCAGAAGACCGAGGCGGAAGTTGAGACATTTTTGCTCACATTGCGC
>Nos 10805619 10805743|11889 chr2L 10805371 10805749 scaffold_6 4500151 4500552 - 12122|292 416
ACATATGTGCAGGACCTGATTGAGCAGGAATTCGATTCGTTGTACCAGTTGATTGTCCAGGAGCGGGGCCACATCTACGTCTGCGGCGATGTCACAATGGCCGAGCATGTGTACCAGACCATCAG
ACATATGTACAGGATCTGATTGAACAGGAATTTGATGCGTTGTACAATTTGATTGTGCTGGAGCGGGGCCATGTGTATGTGTGCGGCGATGTCACAATGGCCGAGCATGTTTACCAGACCATCAG
>Nos 10805985 10807127|11890 chr2L 10805887 10808589 scaffold_6 4501344 4504062 - 101762|110 1252
TTGGCCTGCGAGACCTTCTGCCTGGATCCAGAGGAGAGCCTTTCGGATGCCTCGCTAGCCCTGCAGAACGATTCGCTGACTGTGAATACGGTGCGCCTGGTGCCGTCGGCGAATAAGGGATCCCTGGACAGCAGTTTATCCAAGTACCACAACAAGAAGGTGCACTGCTGCAAGGCGAAGGCGAAGCCCCACAATTTGACCCGTTTGAGTGAGGGAGCCAAGACAACGATGCTGCTGGAGATCTGTGCACCTGGCTTGGAGTACGAGCCGGGTGATCATGTGGGCATCTTTCCGGCGAATCGAACGGAACTGGTCGACGGACTGCTAAATCGACTGGTGGGTGTGGATAATCCCGACGAGGTGCTGCAGTTGCAATTGCTAAAGGAAAAGCAGACATCGAATGGTATATTCAAGTGCTGGGAGCCGCACGACAAAATACCGCCGGATACTCTAAGGAATCTTCTGGCCCGATTCTTTGATCTGACCACTCCGCCATCGCGACAGTTGCTCACCCTGCTGGCAGGATTCTGTGAGGATACCGCGGACAAGGAGCGGCTGGAGTTGCTGGTCAACGATTCGTCGGCCTACGAGGACTGGCGGCACTGGCGGCTGCCCCATCTGCTGGACGTTCTCGAGGAGTTCCCCTCGTGCCGACCACCGGCTCCCCTTCTGCTTGCCCAACTAACGCCGCTGCAGCCTCGCTTCTATTCCATTTCTTCGTCGCCGCGCCGCGTTAGTGACGAAATCCACCTCACGGTGGCCATCGTGAAGTACCGCTGTGAAGATGGCCAGGGAGACGAGCGGTATGGCGTGTGCTCTAACTATCTATCCGGCTTGCGGGCAGACGACGAGCTGTTCATGTTCGTGAGGAGCGCCTTGGGCTTCCATTTGCCCAGCGATCGGAGTCGTCCCATTATTCTGATTGGTCCTGGCACAGGAATAGCTCCATTCCGCTCCTTTTGGCAGGAGTTCCAGGTGCTAAGCGACCTTGATCCCACGGCCAAATTGCCCAAGATGTGGCTCTTCTTTGGCTGCCGTAATCGGGATGTCGATTTGTACGCCGAGGAGAAGGCAGAGCTACAGAAGGATCAAATCCTAGACCGAGTTTTTCTCGCTCTGTCCAGGGAGCAGGCCATTCCGAAG
CTAGCCTGTGAGACCTTCTGTTTGGATCCGGATCAAAGTCTGTCAGATGCATCGCTGGCGCTGCAAAACGAATCCCTAACCGTGAACAATGTGCGTCTGGTGCCATCTGTCAGCAGGGTCTCGCTGGACAGTGCGCTGTCCAAGTATCACAACAAGAAGGTGCACTGCTTGAAGATCAAGGCGCAGCCGCATAATCTCACCAAGCTGAGCGAGGGCGCCAAGACCACCATGCTGCTGGAGATATGTGCACCTGGCCTGGAATATGAGCCCGGCGATCATGTGGGCATTTTTCCAGCGAACCGCACACAGCTGGTGGACGGACTGCTGGAGCGTCTGGTGGGCGTTGAGAATCCCGACGAGGTGTTGCAGCTGCAGCTGCTCAAAGAGAAGCAGACCTCGAATGGCATCTTCAAGTGCTGGGAGCAGCATGACAAAATACCCGCCGATACGCTGCGAAATTTACTGGCGCGTTTCTTTGATCTAACGACACCGCCATCGAGGCAGCTGCTCACCCTGCTCTCCGGCTTCTGCGATGACAATGCGGACAGGGAGCGGCTGCAGCTGCTCGTAAATGATTCGTCGGCCTATGAGGATTGGCGTCATTGGCGTTTGCCGCATCTGTTGGATGTGCTGGAGGAGTTTCCCTCGTGCCGGCCGCCCGCCTCCTTGGTGCTGGCCAATTTGACCCCATTGCAGCCACGTTTCTACTCGATCTCCTCGTCGCCACGTCGCGTCAGCGACGAGATTCACCTGACCGTGGCCATTGTCAGGTATCGCAGCGAGGATGGTCAGGGCGAAGAGCGCTTCGGCGTCTGCTCCAACTATTTGGCCGGACTGCGAGCTGGCGACGAGCTGTTCATGTTCGTGCGCAGCGCCTTGGGCTTCCATTTGCCCGCGGATCGCAGTCGTCCTGTGGTGCTCATCGGACCTGGCACTGGCATTGCTCCATTTCGCTCCTTTTGGCAGGAGTTTCAGGTGCTGCGCGAAGTGGATACGGCGACAACGTTGCCAAAGCTCTGGCTCTTCTTTGGCTGTCGCAATCGCGATGTGGATCTCTATGCCGAGGAGAAGGCCCAACTGCTGCAGGAGCAAATCATGGATCGTGTATTTCTGGCACTGTCCAGGGAACCAGATATACCCAAG
>Nos 10807291 10807624|11890 chr2L 10805887 10808589 scaffold_6 4501344 4504062 - 101762|1510 1843
CATTGGCTCGTCAAAGTCCTTCATGAAGGCCAGCTCGCGGCAGGAGTTCATGAAGCTGCCACTGCAACAGGTGAAGAGAATCGACCGCTGGGACTCGCTGCGGGGCTCCACCTCGGACACCTTCACCGAGGAGACCTTTGGCCCCCTCTCCAATGTCCGGTTCGCCGTTTTTGCCCTCGGCTCCTCGGCCTATCCAAATTTCTGCGCCTTCGGTCAGTATGTGGACAACATTCTGGGCGAGCTGGGCGGCGAACGCCTGCTGAGGGTGGCCTACGGCGACGAGATGTGCGGACAGGAGCAGTCGTTCCGGAAGTGGGCGCCCGAGGTATTCAAG
CGTCAGCTCGTCCAAGTCCTTCATGAAGGCCAATTCGAGGCAGGAATTCATGAAACTGCCGCTGCAACAAGTCAAGAAGATCGACCGCTGGGATTCGCTGCGCGGCTCCACTTCGGACACGTTCACAGATGAAACCTTTGGCCCGCTCTCCAATGTGCGATTCGCCGTCTTTGCGCTCGGCTCCTCGGCCTATCCGAACTTCTGCGCCTTTGGCCAGTATGTGGACAACATTCTGGGCGAGCTGGGCGGCGAGCGTCTGCTAAAGGTTGCCTACGGCGATGAGATGTGCGGACAAGAGCAGTCGTTCCGCAAGTGGGCACCCGAGGTGTTCAAG
>Nos 10812287 10813285|11896 chr2L 10812102 10812592 scaffold_6 4508699 4509267 - 17586|263 581
GCACTAAATT-GTTAATTCATTTAGATATATTGCATGTCCGACTACGATATATCCTCCATTGAGCACGAGGCATTGTTAATTGTTGTGGCCTCCACCTTTGGCAACGGTGATCCGCCCGAAAACGGCGAGGTAAGTACTCC---------CCCCCGCAAGGATCATACTGAACTAATTAATGGATTAGGCCC---AGCCGCCTTCTAATGACCCGAAATGTGAACTTTAACTTTTCGCCCCTGCCACGCAGCTTTTCTCCCAGGAATTGTATGCGATGCGTGTCCAGGAGTCTTCCGAGCATGGATTGCAGGACTCCAG
ATACTAAATTTGTTTATTCATTTAGATATATTGCATGTCCGATTACGATATATCCTCCATTGAGCATGAGGCGTTGCTAATTGTTGTTGCCTCCACCTTTGGCAACGGAGATCCGCCGGAAAATGGCGAGGTAAGCTAACCGAAACTGTTGTCCATTGATCATCAGGCCCACTTAATTAATGTATTCGACGTTGAAGTTTCCTACTAATGACATCAAATGCGAACTTTGTGCTT-------------ACAGCTGTTCTCACAGGAATTGTATGCCATGCGTGTGCAGGAGTCGGGCGAGCACAGCCTGCAGGATTCCAG
>Nos 10812287 10813285|11897 chr2L 10812643 10812689 scaffold_6 4509298 4509348 - 2136|0 50
TGCGTGTTTTG----GGCCGAGTATCTAATGACCACAAAAGTGTTTGGCTA
TGCGTGTTTTAACCAGGTCAAGTTACTAATGAACAGAAAAGTGTTGGTTTA
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ATGGCACATCTGGCAGGCGCTCAATTTTTATCAAGG---ATATCTTGAATAAAA-ACTAGAACATATATTAAATTTAAATTGTATAAAGTTGAAGC---------AAATTATTGAAAGCATGACTA-----CATGCAAATATTAAGCATACATAATTTTAAACAAAAGCAGCCTTAATTTGACATTAAAAAA--------------------------GTCGCTGCGGACTATCCGAAAATAAACTGCAACCTGCGACCTATCGTAAA------TGCCACATTATACAAATTAGCATAAGCCCAAAATGTGCCTGGAAA---------TTTGGCAGCTTAGTGTCCAGCCG
>Nos 10813301 10813445|11899 chr2L 10813293 10813748 scaffold_6 4510360 4510906 - 12602|8 152
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TGCTGTGAAATTTACATCGAAATTATTTGGACGCGCTCTGTCGAAACGCATCAAAGCAACGGTTCTATATGCCACCGAGACGGGCAAATCGGAGCAATATGCCAAGCAATTGTGCGAACTACTGGGACATGCGTTCAATGCACAG
>Nos 10816024 10816233|11901 chr2L 10814421 10816385 scaffold_6 4511257 4513178 - 26670|1731 1940
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GAATGGCTGCCCAGCGGATTGGATATGGATTGTGCCGCCACTATCTGGTTCCATAACGCCCGTTTTTCATCAGGAGATGGCGCTGTATTATTTGAAGCCCTCGTTTGAGTATCAGGATCCCGCCTGGCGCACGCACATCTGGAAAAAGGGACGCGGCGAAAGCAAAGGCAAAAAGCCGAGACGTAAATTCAATTTTAAACAAATCGCTCG
>Nos 10816963 10817144|11902 chr2L 10816558 10817928 scaffold_6 4514090 4515436 - 20268|429 610
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ACTGTGGCGCTGAAAATGAATTTGGATACGCGAACGCCGACATCGCTGTGGAAGGACAAGGCCGTTGTGGAAATGAATATTGCTGTGCTGCATTCATATCAAAGTCGGAATGTGACCATTGTGGATCATCACACGGCCAGCGAGAGTTTTATGAAGCACTTCGAGAACGAGTCCAAGCTAAG
>Nos 10818392 10818566|11903 chr2L 10818148 10818569 scaffold_6 4516192 4516618 - 16640|274 448
ATTCGAATGGTTCTCGGATCTGGGACTGCGATGGTACGCCCTGCCCGCCGTATCCAGTATGCTGTTCGATGTGGGCGGCATTCAGTTTACGGCCACCACATTCAGTGGTTGGTACATGTCGACAGAGATTGGCAGCCGGAATTTATGCGACACAAATCGCCGCAATATGCTGGAG
ATTCGAATGGTTCACGGATCTGGGCCTGCGCTGGTATGCCCTGCCCGCCGTATCCAGCATGCTGTTCGATGTGGGCGGCATACAGTTTACGGCCACCACATTTAGCGGTTGGTACATGTCCACGGAGATTGGCTGCCGGAATTTATGCGACACGAATCGTCGCAATATGCTCGAG
>Nos 10822107 10822246|11906 chr2L 10822078 10822882 scaffold_6 4516765 4517422 - 17661|29 168
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GTCTGCTCTAAACTGGGCTGGAAGGGCAAGGGCACGGAATGGGACATATTGCCGCTGGTGGTCTCTGCCAATGGTCACGATCCGGACTACTTTGATTACCCGCTGGAGCTGATACTAGAAGTTCCGCTGAGTCATCCCAA
>Nos 10822968 10823109|11907 chr2L 10822954 10823756 scaffold_6 4518033 4518973 - 7992|14 155
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ATCCGCCATCACAATATTTCCACAGCGCACCGATGCCCGACACGATTATCGCATATGGAACAATCAGCTCATATCATATGCGGCCTATAAAATGCCCGACGGCAAGATAATTGGAGATCCCATGAATATGGAGTTTACAGAG
>Nos 10823761 10823852|11908 chr2L 10823757 10824035 scaffold_6 4519156 4519467 - 6215|4 95
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GTTTTCGACTGTCGTTATGTGACCACAACGAGCGGAATGTTCGAGGCAATTTGCAATCACATCAAATATGCAACAAATAAAGGAAATCTCAG
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CTCCTCGTCCGCCGCCCACGACACGCGCTGGAAACAGGTGCGACAGAGCATTGAAACAACGGGACATTATCAGTTAACTGAAACCGAGCTAATTTATGGCGCCAAATTAGCCTGGCGCAATTCTTCCCGCTGCATTGGTCGCATCCAATGGTCAAAGCTCCAG
>Nos 10825949 10826042|11914 chr2L 10825668 10826270 scaffold_6 4522889 4523485 - 21630|281 374
ACATTGGCAATGCGGCGGTGGAGGCCAGGAAATCCGATCTGATCCTCGAACACGCCAAGGACTTCCTCGAGCAGTACTTTACATCGATAAAGCG
ACATCGGCAATGCGCCGGTCGAGGCGCGCAAATCGGATTTGGTGCTGGAGCACGCCAAGGATTTTCTGGATCAATACTTCACCTCCATTAAGCG
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CCGTTTGAAATAACAATTTAGCAATGCGGCATA-CGTTTGGCTCTCGTAACTGAAG------GCCAGCGT-------------------AACGACGGAAC-ATCTTTTCAGGTTTTAGGAGTGGTTACTACCAAA-----GCAAAAACAAAAAGTTAAAGTG-----AAATCCATCAAAATAATCAATCTCCAAGTTGAACGAAACTTTTAAATGGGTTTCTTA-----------AATTAAAAGAAACAATGACAATTTCAAGTGCAAGTGATAAAAAATGTGAATCCCTTACCCATCTAAAAACTGAACAGAACAAAGCAAAAGTGAAAGCCTATTAACCAT-AATATTAACAAAGAAAACAAAAAAAAACAAACAACACCTGCAACAAATAACAATTAACACATCAAACAAAAATCTAGGCTCAAAACAGAGTCTAAACAATTACGGCTGGCCACAATGCCGATATTTGTTTTTGATTGTTTTTTTTTATATACCACCTTTTA---TCATATTTAAAAGAATTATTTTTAAGCCTTAGCTTTAACGTTTATT----TGTTTAAATTATTGAAAAAAGGTTTCCACTAATGTCTTGTCTCTCTATTGTATACCTGTATATATACAACATCACGAACACCATCATCCAACCAACATCATCAACAACAACAACAACAACAAGAACAATTATCGCAACAGCATGGAGACAAG--CGCCGAAAAAACAACATCCCAACTAGCCGGCTATCATACGGCGGACTCCACA-------ATCTATCGTCAC-----ATCGACG-------TCAGCAA-TAATCGCAACTGCTCGGGACTTGTAAGCTCTTCCAATTTTAAACTGTCAAACAAAAGCAAAAAAAAAAAAGTTAAATATAATATGTATGTTAAGTGAGATTATTGAAGATTCCAAATGGATATCGCAAATTTATGAATAGCAATAACAATTGGCTATATTAGTTAATTTGTGTTCAGTGGGGGGCCATCTAGGGTATATATATATATATTATATATATTTATTCACATAGATTAGGTTAGTTTTAAGCACAACTTTTTTGTTGTTCATTTATGCTAAGGTTAATTGTTGTAGTTTTTTTTTTAATTTTGATGAATGTTGAAAAAATCAAATCGAAATCAATTGAGAATTTCAACGCATTTTTCAGCTGCTAATCACAAAAAATGCGTCC--GTTGCATGCAAAAAGTGAAATAAAAACGCGCTTTTAAAATCTA---TTAAAAAAAAAT
>CG6700 10837729 10839315|11926 chr2L 10839313 10839746 scaffold_6 4552266 4552702 - 24262|0 2
ATC
AGC
>CG31722 10843011 10843381|11929 chr2L 10842936 10843642 scaffold_6 4560894 4561599 - 15997|76 447
CGAGAATTTCGAGGATCTTCGAGGCTCGATCTTCCAAAGGATCGGCGAAGCCTGGGCCTTTGCCATCAAGACGAATCTCTACAGTTCGGAAAATGTGAAACAGTTTGCCATTGGGGTTCAGTACGACTTCCAGAATGGCACCATGGTGAAGGCCAAGCTGCGGGAGGACTCCAGAATGGGGTTCGTCTACCAATCAAAGATTGGGGAGAACATCGATGTTGGCTATCACTTGGCCTTCGATGGAGTAGATCCCATTGGTGGAGCCCATAGGATTGGCGTTTCCTGGGGTTTTCACTGTTGAAAAGA-ATGGTTTACTATGTACTATGATTTTACTATACATGATTAATATAAATAAATAATTTGTATACAAA
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>CG31722 10843440 10843670|11929 chr2L 10842936 10843642 scaffold_6 4560894 4561599 - 15997|512 714
GGGTTGGAGCGCGATCCCGTGAAGGTGGAACTGGTGGTGCCTCTGTACAACGAACCCCTATTTCTGGGCTATGTCCTGGTGGCGCCTGTAGAGAATTGGGTGCTGGGATATCGAACGGAGTACAACTTTGACGAAAAGGGATTCGATAAGCACGCCCTGTGCCTGGGCTACAATAATGGGAGGACCGAAGTGGGTCTAAAACT
GGTTTAGAGCGATCACCCATCAAAATGGATGTGATCGTACCAATTTTGAAGTCACCGAAACTAATGGGCTATGTGGTTCTACAACCGCTGCAGAACTATTTATTGGGCTATCGAGCGGTCTACGACTTTGACAATATGGGCTTTGACATGCACGCGTTATGCGTGGGCTTTAATAACGGTAGCTCCGAATTGAGCCTAAAATT
>CG31722 10843739 10844449|11930 chr2L 10843733 10844346 scaffold_6 4562248 4562806 - 4757|6 621
AAATTTTAAATTTATACCTATTTATTTTTGCTATTTTTTTAAAGTATTTTCAAAATGACAAATATGAAGCAACGGCTGCGCAACTTGTTTCGCCGGAACAAAATGCGCGCACGGCCCACTACAGTGGCCAGTGATGCGAATAAGGAGCAGCCGGAGCCACCTAAGCAGGAGCCAAGCAAACAGAAGAAAACTAAGCAGGATGCCTCCAAGCAGGAGCCACCTAAGCAGGAAGAGCCCGAAAAGCCACCCAAGGAAGTCGAAGTGGAGATAATACCCTCGCCAACGTCAGAGGGCGAAATGCCCACCTACTTCCATGTGGGCGCCTTGGCGAAGGATTGCCTCATCAATGGCTTCAAGATCGGCGCATGGCAGATGCACTGCAGCAC---GCGAACCGATAA---TGACTTCTATCTGAACACCTTCGGCGAGGGCTATCCCACCATGAAGAACGTATTTGGCGGCATGGAGGTGTTCAAGGAAGTGGGCAACTACAGCACGTCCCTCGGCTGGTTCACC--AACAATGATCTTCTCTCGGAGATCGCTGTGCGCGGCATGAACTTTGGCAGTCGATTGTATGGACTGCTCAAGTCAACAATTGGCACAAAAGACGA
AAATTCAGAACGTAGACAGA---AATTTTAGTATTCTTTTGG----TTTTTAAGATATTTTATATAAATTAACAGTTAATAAGTTTAT---------ACAAAATGTCCATATGGAAAAAAAAATGTTTCAAGAAAAAGAAGAAGGAGGAACCAGTG--GTCGAAGAAGAAACAGATGAGTCTAAAAATAA--------GACGTCCTCAA-------------AAACTGAAGACGACAGTAAAGTTTC-------------GGATGAGGTAATACCTCCACCCCCGTTAGAGGGGGAAATGGCAACATATTTTCACATCGGTGGATGGGCCAAGGAATGTTTGATAACCGGCTATAAAATTGGTGCCTGGCATTTTGACTGTACCACTCAACTAACCGACAAACTTGGCATATAT------AGTTTTGGCAACGGCAAGCCCAACTATTACGGTGTCTCCGGCGGAGTTGGTCTTCGCGAGAAGTTAGGCATCTTCCATATGT-----GTCAGGCTTACCATACCAATGCCTACGTCGGTGCGTTTGGAGTGCGTTCCACAGTCGTCGGCTGTTTAGCCAATGCCATGCTGCGCGGAACATACGGTCCCCACGACGA
>Porin2 10845783 10845887|11933 chr2L 10845529 10847284 scaffold_6 4568326 4570154 - 28430|272 404
AATGACTGCCAATCAC----------------TTAACGATTTCAATTTCTAAATTTAT------TTTTAAGTTTATCTTTATTCAAAT---GACAAATATATTTT---GTTCTTCATAATGGCAATATAACAA
CAGTTGTCCCTATCGCCACTATTTTATTTCTGTTACCAATTTACAGTTTTAAATTTATGTCCTGTTTTAGTATCTGCGGCAATTAAATCAAGACAAAGATACTTTAAAATTCTGCAAAACG-------AACGA
>porin 10847227 10847867|11933 chr2L 10845529 10847284 scaffold_6 4568326 4570154 - 28430|1840 1899
AATAACAATCTT--TACCTTTTCGTTGTGCATTTACCTGAGAAATAAATCGAGAAGAAAT
AATAAATACATTAACACTGTTGCGGTGTGCATTTAAATTCAAAAC--------AGGAGAA
>porin 10847227 10847867|11934 chr2L 10847364 10849364 scaffold_6 4570218 4572184 - 63455|0 512
GTCCGTGGTTTTCCGCTAGTCGTGAAATCCTTGAACGTTGTC--TAACATCCCCACACGCCCAACAACAACAACAACAAC-AATAACAGCAGCCAGACAAGTGCAGAAACAACAAC-----AAGATCAAACAAAATAAAAGATACGATATTCTTTAAAAACAAACAACACACAGTCAAATATAAAGAGAATCTGCACATCTTAGCGATTCGATTGGATTGGATTAGTTGTCAGCCGGCCATCACCACATCCGCCCATTCCCTGCCCCAGCCACGCGAATCTGCAGGAGAGACACTGCCAAACAAACGATGCAGGGGGATGGATGGGTGGTGCAATCGATGGGTCGGTCAGGTCAGTCCGTCGTCGTTGGATGTAGCTTTGATTAGTGCATTGAATATTAGCGAAATTGTTGTTGACAAA-AGTGCAGTAAAAATACATTTACCTATTAAACGAAAAAAAAAAACAAAATGGAAAAGACGGAATATTATGGCTCAAAAGGCATTGCATTTTTTT
GT---TAGTTCAAGATAAATAGCTGAAT------GCGCTGCCAGCAATATGCATACAGTACTAAAAACACC--CAACAACAAACATTAACAACAAAATAACAGCAAGAACAACAACAAACAAAAGAGAAACAAATTAAAAG-TGTAACAACAATAAAACACAAAAAAAATTAATACACATAACACAAGAATCTTCATGT---------------------------TTAGCAAGCATTTGCCAACAAATCGGCCC-----------------------------------------------------------GGGAT---CGGAGCTTGCTACCGA------------------------TCGTTGGACGTAGTCTTGTTTAGTACATAGCTAAATA-CATATTTATTGTTGGCAAACAGTGAAATACATA---ATTTACCTATTAAAACAAAACGAAAAAAAAA----AAAAAACAAAGTGTTA------AACAAGCTCTGCATTATTTT
>Dnz1 10854433 10855186|11938 chr2L 10852448 10854467 scaffold_6 4574925 4577106 - 68085|2187 2244
GTTCCCAATAAAGCTAACCG-----ATATGCATAAGT------------------CAA
GTTTGAAATAAATTTAATGATATACATATGAATAAGTACAAATTGATTTCGTTTCCAC
>Dnz1 10854433 10855186|11939 chr2L 10854903 10856439 scaffold_6 4577743 4579175 - 47956|0 344
-GTCAGGA-----AATATTCTTTATATTTTGTCCTTGCGTTTGCTGTGCG----------------GCTAAAAGAGCCCCCGAG----------TGTTTTTAGTTTTTAATCA-ATGTGTGTGTGATT--ATTTTTAAACGACCTATCCCCCTGCCCGCAGCCAG---------------TCAAATTGAATCGTA--------TTTCGTTTTGTGTATTATATGC--AGATTCCAAC--TTAATTTATGCTTTAGTTTATAATGTTTTAAAATTATAAATACATAGAAAGCAGCAGCGTGGCGGCCAACAGGAGCATACTCAAAATGAACACGGCTATTTTGTAA
TGTGATAAATTCTATTATTTTGTATGTATTATAAATGTATTTTATGTACGCGAGCGCGTGTTCGTATTTGTGACAGTCCCACAAAATCAATTTCTCTTTTTGTTTTATATTTATATCTTCGTGTGATTTCTTTTTTATCTGAAAAGTTCTGAAGCTCCCACCCAGCTATCCCCATAACTCTCACCTTGACTCCAAGCTACAGTTTTGCTTGTGTGTATTATATGCAAAGATTCCAATAATTAATTAACACTTTAGTTAATAATT------AATTAT------------TGCACCA-------GGCGAGCCAAAACATACTCAACAGAAACTCAATATTTTTTTAA
>ial 10856788 10856872|11940 chr2L 10856654 10857012 scaffold_6 1449472 1449781 + 4691|134 223
CTGGTTTCGAGTTTGCATTGTGTAACGACTTATTTCAGATTTTAC-----TTTTATGTTTAATAAACGGTTTATAAGATTTAATGAAGTT
CCAGCCCC--------------TCAACACTTCATTTAGATTACATATGGATTTTGTCTCTTGTAATAAATTAATAAAAATGTTTTAAATT
>CG7309 10906270 10906694|11999 chr2L 10906255 10906708 scaffold_39 64385 64820 + -683|15 474
ATTCAACTAATTTCAACTTCAT-----TTCAGTTCAGCCATCCAAATTTCCGTTTCGA-----------TTTCTCTCA-ACCGCATTTGATAAAATTACCAAGTAAACACCACTGCAATGCGGT---GTGTAGAGCAATCTTGTTGACACGTTTAGCATACAAAATCGGAGATGGAACTGGATTTGGACGAGATTGGGATGGCTCGGCAACAGCTGGTCCACGAAAATTCAGCTCCACGGACAGGTG-ATGGCAAAACAAAATGCTGCTGCTGTGGCAGTAACTTTTAGAAAAATATAAGGACGAAAGAAAGGATCAAACAGCAAACAAACCAACAAAAAAGAACTGGATAAAGTTTCTGAGCCAAAATTTTTTG------AAATTCATTTCAAATTGTGA---TGTACATGTT--TCAAAACGTAGCCATTGCCAATTAA-AGCAACTTAAA--TTTGG
AGTGAA--AATTTCAGCTTCCTAGTCAGTCAGTCAGGTCAAACAGTTTTATATATAGAAAAATATAGTCTTTCCCTAATATCCAAACTGCTTGCATTAACGTATAGAT----CTACATTTCCTTAAAGTGTAGGGC--------------GCTTCATATACA----------TATCACTGACT----------------------------AACTGATGTATGTATGTGCA----CATACACATGTGTATAGCAAATAACAAATGTATTATTGTTATGTGTGCGTGGATAAAGCTAGTGGGGCTAAGAAAAACAATAAAAATCAAACAAACCAAACCAAAAAAATTAAATGCATTTACAAAAATTATATTTATTGATCAATAAGTACATTACGCATTAAGAACTTGTCTAGGTCCATCATACAGTGGCTGATACCAAATAATAACGGATCAAAGCGTTCG
>CG33129 10965140 10965604|12070 chr2L 10964854 10965365 scaffold_23 859881 860375 + -312|309 549
GTACACTAACAATCTAGTAAATTCAACCTCGATACTGATAAATT--------AGTGAAAGACACGAGAAATTTTCTGTTGTAAAACATGTGTTTAAACATTTTTCTCCAAGTTGAGAAAACATTATTTTTAAATT-------CGTTTACAACGGCATGAGAGTTTTGTGAAAAGTTCTACCATTGAAATTTTGTAATTGTAATTATTAAAGTGCGTTTTTTGTGGCGATGCGCGAAGTGTT
ATACATTTACAAT-TAGTAAATTAAACAC--ATAATCAGCATTTAGTTGTAAAGTGAAAAAAGCAAAAACTAACTAACTAAAAAAAAAACATTTGTATATCTTGTAAATGAGCTCGCGAGCATTTTTTGTAAAATTTTTGCACGTTTCGGTCAGAATGAAAAAAAAAAACATAATAATAATAATTGAGTTCTTTGTGTG---TTTGGAAAACGCGTCGCGAGTTTCGTTTCACGCAATAAT
>CG33129 10965140 10965604|12071 chr2L 10965414 10965728 scaffold_23 860449 860810 + 10057|0 237
TTTTAAGCGTCAGGAACGCTTACT-------TCTCGAACAGCAACATCATCAGCAGCTGCAGCA--GATGCAAA-----------CAGAATACGCGTCATAGTAA---------ATAGTGAA---------GGAAGCCCTAATTTTTCGCAAAAAGTTAAAAAACCGGAAAATG---------TTCTATAAGTCGAAACTCAAGAAGTCATTCACATTTATCAACAACTTCTCGTCAA
TTCTAAGCGTCCGGCACGTTTAGTAACAAACACTTAAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACTCAAACAACAACAACCCAAACAACGCGTCATAGTCAAAGCAATTTATAGCGAAAACCCATTTAAATGCAATCTTTTTCGGCAAAAACAAAAACAATATATATATATATTTATATTTATATTATAAGCAACAGCAAATGTAATCCCCGCCCAACAAAAATCCCTCCCCTG
>abo 10973442 10973535|12079 chr2L 10973382 10975241 scaffold_16 134355 136305 + 44011|60 160
ACTGCCTAATATGTACATACATGATTTTGTACATTTGTGTATAAAACATATTCAAGTACCTTTTA-------TATTATGAAATATATGTGATACTAAAATA
ACTGAATGTTATCTTAATATAATGTTATATAGTTTTATG---AAAGGATAT----GTGCTCGTTAAGGCAATTATTGTTTAATATTTTTG-TACAAAACTG
>l(2)06225 10975533 10975901|12080 chr2L 10975310 10976571 scaffold_14 2184115 2185435 + 16031|230 685
GCTTACTATAGTCTCCGCTTGGCAGTCACTGGAATGGGCAACGTAATCCCTAACAGATGTGTATATTTATATGTCTGCGAACATTTCGACTCTGAATAAAGTGAA--------ATAGTAATTTAAAATTCCGAAA------ATTTTCGAAAAATACATT--------GTTTTTTGAAAACCGTTAGAACGTTTGCGCGGG-ATTTGTGTA-AGCTAAAG-----------ATGAGGTGATGTAAAACCAAGTTTGGAATTAAAAGTTGACGATATT-TAATGATAAAAATTAAAAAAATATATGTAATGTTATACATCAAATGT--------TTATGAAACGGTGTCGTAATCAAAGAGGCTAATGGTT-CAGAAATAC--------------------------------ATAATATACTTAG-----AGCATTTA-----AAAGCACTCAAGAA
ATTTAC---AGTTACGAAAAATTAGCGAATGACAAATGATTTGGCATCACTAACGATTATGTATGTAAACGAAT----AAAAGTTTCAAATTTAAATGTAATAAATAATATAGATATTAATTTGTGAGTGAATACGCACTTATATTCAAAGGACGAATTATCTCGAAGCTTGGTGGAAAATAATAATATAATTGTGTGAGCATGTATGTGCACCTAAAGCATTTTTCTATATG-GACTACGTTAAGATGGTCTTTAATCTCCAACTTGCCGACACTAGAATATCAACAATCAGTCAGAGATTGATACTATTTTTCGCACAATTTTAGATATCTTGAAGAACGAAATCGTTTACAGCTATGCCTCTGGTCGCAGACAAGCAAAGTCCTTTATCAGCGCAGCTTGTCGTCCTGATCATATTTTTATCCCGCAGGATTTACGTTCAATGCGCTC----G
>piwi 10982205 10982657|12087 chr2L 10980791 10982630 scaffold_14 2190520 2192443 + 43365|1521 2009
ATCCTTACTAAGAGGCCATATA---TGAAACT--AGCCCAGACATTTATACTTTTTC-----------AATACTTTC---TTACTTTTGCTAAGCACTTCAGCATTTATGAC-------TAAATATTTTGTATTTGAAATGCATTACTGCTCTTTTTTCAAACAAAAGCAAAATTGAGGATTAAGATTCTGGTATTTAAGCATAAGACCAGAGGAAATTCCCAAACAAA-----CATTTAAAGTTATCTATCAAGACATGTTCATTAATTTGGAATATAATTACTT-TATTTTTTATTGTATATTTTAGTTTATGTAAAGAAAAATTACATACATCCATGTT------------------TGCTTACTTAACCACACATTCATGGCTGCTTATATTCGTGAAACATATTT-----TATTAATTATACAGGTAT--TTAACTTTCACAAGGATA----ATACAATTTCATAGCTTGTTGAGTAT--ACTG
ATGCTTACTGGCGAACAATCTAGCCTAAAACTTAAGATTAGGAATATACTCTTTTATGATTTAATTGGAATACTTTTATTTTAAATTAGATAAAATATACAACAATTATTACATATGCATATATCCATTATATTTGTAATAAGCT----------TTTCAAACAAAAAAAATA------------ATACACGGCATTACGCACGAG-CCAGTATATATTT---AGCAAAGGTTTCAGTTAAGATTATGTATTA---------------TTTCGAATATATATATATATATACTTGCATATGTATGTAAGTTAAACGGTATATACTTTATATATTGCAATTTCATAGCGTGTGTAAAATGCTGTCGACTTTTCTATTAGTTAATGTGTTTTTCGTTTCATTTTATATATTTACAAACTTTAAATTTGCCAGTTTAATCATTGTTAATAATCATTTTGTATTCGAGTTTATAAAGTGTTAAATATCGGTTT
>piwi 10982205 10982657|12088 chr2L 10982631 10984369 scaffold_14 919687 921381 - 53071|0 26
TTGGATATAATTTAGAATGGAGTATTA
TTTTAT---ATTTTGAGTGAAATAATA
>aub 10997816 10997931|12095 chr2L 10997475 10997908 scaffold_14 935709 936133 - -124|375 469
TTAACAATTTTACGAT-TTGATATATGTATGTAGATATGTACAT-CATTTGAATTTAATAAAGGTATTGCACATTTATTGTCTACCAATCTGAAA
TGAATAAATATACTATGTTTGTATGTATGTGCATATATGTACATACAT---ACTTTATCCAGTTTGCTTCACACTTTTCATACATTTACAGAAAA
>aub 10997816 10997931|12096 chr2L 10997929 11000660 scaffold_14 2163196 2166084 + 91022|0 2
AAC
TGC
>RpL9 11002833 11002906|12099 chr2L 11002823 11003293 scaffold_14 941112 941584 - 23896|10 85
ACTTTTGGAATGTGTTTCAACCTAAAATGTTAATA--AAAAAAAACCAACGGCCGAAACTTTCAATAAGAAATTTA
TGACATCCATTGTGCTTCAATTAAAAGTTTTAATAATAAAAGAAAACGCTGATGTAAACTTTACGACCTACACTTT
>Art8 11009821 11009910|12101 chr2L 11004664 11011046 scaffold_14 942397 948891 - 204936|5383 5472
GTTACATGCCATCTCGGAATCCGAACAACGATCTGTGGGGAAATCAATTTATTTAACATGTTTAATACAAATACAATATATATCTCAGTC
TTTATGTG--AGTTGAGTATGAGTTGCTCAGTTTGT-AAGACATCAA-ATATTCAAT-TAAATAACACGTACATCTTTTATACCTCAGTC
>Samuel 11014031 11014199|12109 chr2L 11013944 11014738 scaffold_2 1869001 1869853 + 26507|94 319
TTAGCAGC--------------------------------------------GATCCTGTCCACATACGTATT-------------TATGCTAACTAAATTGCATTTCACCTGCTAAAATGCTGAACCAAATGAGCTTTCAACACAATTAAGAAAGGAATAAGAGAATAAAAAATAGACAGGCAGACAGGCGCCTCGGATTGGGAGAGAAATACCTATTGTATAAA
TTATTTGTCACAATCGAAATTAAATCAAAATAAACAAATATCAAATTAACAAAATAATATATATATACATAGTTTTATATAGTTTATATGCTAAC-AAATTGCATTTCAACTGC--AAATGTTGTACCAAATGAGCTTTCAA------------------ATGAAAAGAAAAAACACATAAG-----------------------------TACTAATT---TAAA
>Ast-C 11076152 11076734|12195 chr2L 11075865 11077853 scaffold_2 1947760 1949856 + 20519|330 987
GTTCCCGGACAGTGGGAAGAATATC--------CGGAACCCAGAGCTCTTGGTTAAACTAACAATT--CAAGCATTTCAACAAACCAAAACCAAAAAAATAAGCCACAACACAAAGATTAGCATAATGGATAAACGCAAATGTTTAGAGCAATTAAACTAAAGCTAAGACTCAACTATATCCATATACATATATATACAACTTATCCTTTGAATGTCTACGA-AACGTATGAAAAAATGTTCGTTCCATTGTAGTTGCCAAAAAAAAAAAATAAATTATGTACCTATTT---ATTTGAATATTAGCACAAAAGTTTGAAATTTAAATATTTCGTTTCTTGA--------TTTACGCTTTGCATATGGTGTGGTAAAATAAAATACAATGCTT-----------CAATAAGCTATTTATATAT---------------TAAAACTGCATTCCTCAATGTGTGTG---------------CTTTTGTAAATTTAAGTGTCCCAGCTAATGTATAATACAAGTAATTAGAACAAC---AAACAGGAATGCAAACTTGGTGTCATCTAATACCTCCTACACAAAACTATACATGTAAAATATC----TTTCTAAATA-----AAAGTTATAAATATTTACGAATAAACTAAATGCGACCAAA
GTTTTTG------TGGAGAACCATCACAAACAGCACAAACCAACTAACTTAAACAGAAAAATAAATAACAGCCCTTTTGAGAAATTAACATTTCAAACATGAAATATTAC--------TAGCCTAATT--CCAATGCCAATATTTAGTGCGATT-AACTAAAGTTAAGACTCAA--GCTTCTATATAAATGTCTATTCAA---AATTCTTAAACAGCAACAACAACAT------AAATATATACTATTTAATACTT--------ATATTAATCAACTTTGCACACAAATGAGGTTTATGTTTTTGCACATGGTTTTCGTTTT----TATTGCGATCCTTTAAAGAAACCTTTGC---TTGCATATGGTGTGGTAAAATAATATACAATATATACTAAAAAAAAAAATAATATATATATGTATATGTGCATAAATTAACAAACGTGTATTAA-CAATATTTATGTAACGTTGAAATTTCCTTTTGTAAATTAAGTGTTTCAAGCTTTTGTATAATAAATATATATACCATATATTGAAGCCGAAAGGATAAATGAATAGAGTCACACACTT-----ATATAACTATCTATGTAAAATATTAACACATTAAACTATTAATAAAGTTATATAAATATATATTTAAAAGAAATGC-----AC
>CG6181 11095353 11095687|12210 chr2L 11095064 11097056 scaffold_2 1975547 1977684 + 70306|347 807
TATCAAGAGAACTATAACCTGGCCAGTGGCTGGTTTTGATAGATTACCCATCCGATCCCCATCCAAGATAGTTAATCTATGACCACAAACACATTTATAAATACACGCTTGTAGTTAAGTCCAAAAAGAAGTTAGTATGCTAAAA--------AGCTCTCAGCT--AAGTTCATCCCTTAAA-------------------------------------------AAGTTGAAA--TTGAATCTATGCCTTTCAT----TTTATTGTT--TATTTGTTTTGTGCGTGATTT----GTTTATAGTAAGGCCGTATATCTA-----------ATGTTTATGTCGCTATATC------------------AAAATTGTA-----------------TTATCT----TTATAATGATTCGCCTACTAAATTG-----------CAATATATTTTTTTATTATTTT
TATTGCGATACTGCTGCAATTGCCAGTGGTTGGCACTGACAA-----CAACTCGAACCCAAACCCAAGC--CCCATGCACAGACACCCACACAGACATACGGACACGTTTGTAGTTAAGC--------AGGTCATCCCGATAGAACCGTTTCTAGCTCT-AGCTTCAATTTGAACTCTTATACCTTTCCCTTTCAATATATCCTAACTGTCCAATTTGACAACGTAAGCTGAAAGTTTTAGCCACAATTTTTCATACAGTTTTTCGTTACTATTTGTTTTGTGTGCGTTTCTTTGTTTTATTTTATAATTTTATATTTAGATCTTAACTCATGTTCTCGTCACGATATTGTGTTTTCCAACAACAGAAAAATAGGAAAAAGTGAGGAACGTGCTTATCTAGCGTGATCATCAATTGC--AATAAGTTAACCTTTTTTATACATATATATATATATAATTTT
>CG6192 11100959 11102626|12214 chr2L 11100620 11101710 scaffold_2 1988489 1989838 + 13698|416 1440
ATGAAA--CTGCCACAAAGTGGT-CCAATCCCAGGTGTAATATTTCCTGCTGCGAAGACATTT----------------------------------------TACTTCTCCATTT---------------------------------------GCTATTTATTA-CTGTT--TTGTGTATGCCTCGAAAAT---------------------------GTCCCTTCTATTCATTCCGGCAATGAAAATTAAAAACCACAAAAAAAACATTAACTCAAAAATAAGAACTACAAAAAACGAACCTAAAAAGAAGCCAGGCTTAA-TGTTTAAGTATTAGAAAAGTGAAAGGT---------------AAAAAATCGATAAAGAAA---------------TTCATTTCCTTGAAAGCTTAGCTTAGGTTTTTCAAAAAATATATACATCTTAATATATTTTCTATCTGTATAGTGTACACGATAAAACACAATAACACTTGATATTATCTACAATTACCAAAATT--------TCTTTCTACCG----------------AAACAGGAGACAAA----------------TTTGATTTACTCGGACCACTGATTCTGTACGTATATGCTAACTTTGAATTTAT---------------CAGACATACCGGCATATATCACATC------------------------TTTTGCATATTTAAACCATTAGATATATGAGTTTT----------------------------------TCTTCAACTTGTTAAACATTTTCAATGACCTACCACCACACAC-AATCACA----CAAGAGAAACGAAACAAAATGTAATATGAAAAGAAAAAGTGATATTGAAACACTATGTAAACATATTATTACGTCGCTGCGTAATCAATGTGTATTGTTTTGATGGATATACATCTCTATGAATAAAGATAAATGTATTAAGTTGATGTTA------------AAATGCAATAAAACGAAAGTGCAACCGAAAC
ATGATATGCATCCACAAAGTGGCGTCAATCGTATTTGAAAATTGCAACACTCATAAAGCATTTGTTTGGCTGATAGAAAAAAAACACACACACACACACACACCATTTTTCAATCTTTGCTATATTACATTTAGTATGCCCAAAGGCAATAAATCATTATTTATTAACTATTAATTTTGAATAACTCGAAACCTGGCTCCACCAGGAAATACAAATCCTCGACCTTCTCATTCATTCCGGCAATGAAAAACAAAATT-------ATAATGTTGTGCTAAAAGTTGTAACTTTCG----------------TAAGCCAGGCTTAAATGTTTAAGTATTAAAGAAGTTAAAATTTATTATGAAAACAAAAAGAAAACCATGATAAAACACATGCAAACCAATTTCATTTCCTTGAAAGCTTAGCTTAGGTTT----AGTAATTT-----TTCAAAACTATTTTCTAT-------GTATACACAA---------------ATTGATATTATGTAAATTTATCAAATTTCGTAGGCATTTGTATAAAGTTATAAAACAAATGGAAAACACAAGAAAAAAAAAAAAAAACAATTATTTAATTTAC-CGGACCATAAGT-----------ATGCTAACTTCGAATTTATAAGATGATATATCAGCAGACGTACTTGCGAGTATATCATCATGTGAATATGCGTCCGCATTTTCTTTTGCATACTTAAACTATTAAATATATAGTGATTGTATATTATTTCTCTTGTCATCAAACAAAATAAATCTTCAACTTGTTAAACATTTTCAAAGATATACAACTACAAACTGATTGCAGTGTTTGAAAAAGTAAGACAAAC---------AAAAACAAAAGTGATATTGAG-CACTATGTAAACATATTGTTACGTTGCAGCGTAATAAATGCGTATTGTTTTGAGCGATATACATCTACAAAAATAAAAATGAATGTATTA-GTTGATGTTACAAATGCTAAAAAAAGGCAATAAATAATATGCTCTAAAGAAAT
>CG6192 11100959 11102626|12215 chr2L 11101745 11102049 scaffold_2 1989877 1990200 + 4503|0 339
TCTATGTAACTACCATTTGTTTACTCAAGAGCTTGCTCAGTCTTAAGCGGGTAGAAACACCAGCGATGGATCTGATAGCTCGTCCGTTTATGCATTGAAGTTGCTAATTTAATTTGTAGGCTAGTTAAATCTCAA----------GAACACAAAACAAAT----CATGCGAG-------AACAACAACAATAATGCCGCCTCTATAGATA----TTTATGCAGATCGATTTATATATGTATGTATAT-GTATATTTAGAGATATATGTATATGCGCTTCTCCTAATTGTTACGAGTAAATG---------ACACACAATTCTTTCGCTTGACAGCCACTC
TTTTTGTTGTTTCTGTTTGTTGCATGCAGCGCATA-TAACACACATCTATTTAGAAGAGCAGACGA-ATTTCGTTTAGCACG-CTGCTTATTATTATGTTTCGCTAATTTAATT-GTAGGCTAGTTAAATCTCAATTTTAAAAATGAATGAAAAGTAAATTTGTCATGCAAGCAACAATAACAATAACAATAATGCCGCCTCTATAGATACATATTTATGCAGATCAATTTATGTATACTTCTCTTTAGCGCACACAGAGCTAATGGAA------------CTAATTGTTAAACGTAAATGTGTAAATGTAAATGAGAAATGTTCGCTTTATAAACAAAC
>CG6192 11100959 11102626|12216 chr2L 11102621 11103583 scaffold_2 1990201 1991236 + 30388|0 5
GCAGCG
GCAGCG
>CG6201 11110557 11110841|12219 chr2L 11109626 11111743 scaffold_2 1998849 2001044 + 61380|1000 1394
TTCA--ACAAACAGTTTATAAATCAAA---AGAAAATATTTATGCA------------------ATGTGAAAGCTAACATAATCAGGTTTCGGCTAGGCGCTA---GTGGACCGATCCTACTCTCAATCTGTCTCTC------------------TTGGAATGGACTGACTTCACC-----GGCACAATCTTCTGGACTTGCGCCTTCGCCTTA-----------------ACGCCGGCAATATCATATATACATATAT-TATTTATATATAAAGATATTTATAGTACAT--------------------------------------TATATGTGT-----TGTGTTCGTAATATATAAATGCCTTCTTCCTGCGAAGGAATCGGCAAAAGCGT
TTTAGCACAACAACTTTATCAAACATATTTATATAAATTTTATGGGTTTATTAACATATCGGGCATATTAGATGAAACATAATCAGGCTTTGCTTGGCCGCAAGGCGTGCGCTGCTCTCTCTCCAAATCTCCCACTCTTCAACTCTATCAAACTTTTGGCATGGAACTGTTTAAATAATGGGGCACAAAACTTCAGAGCAGCG-CTGCGTCTTGTTCCACATATAGTTATCTCATATACATTAATATTTATACAAATATATATATATATATATATATATATATAGTACATAACGCGTGTGTGTGTATGTGAGTGAATGTGCGTGCGTGTGTATGTGTGTGTATGTTTATGTAATACATAAGTGCCAAC------CCAGGGA---GGCCAAAGCGT
>CG6230 11115636 11116135|12222 chr2L 11114038 11120315 scaffold_2 2005600 2012068 + 235044|1745 2321
GACCATTTTATACTAAATACTAGAAAAGTAAT-----------GTGAAAGCAG-GCGCAAGCCGTAC-------GTTCCACTAGAGAAACCCCTTTCGTTTTTATTTGTACCCCCATAA----TGATGAATAACAA-----------AACGTAATATTATGGCGTCGGTTTCATAAATATTGAAATTCTTCAT-----CTAAGAATCAACATAATGCATTT---------AAGGTGTATTATCAG---GCAAGTGTATTATCGG----------GCATCCTATATCATTTTATTTTGACAAATTGAGATCTTTCGATTTTTTCGACTCTCCCG----------------TATATGCGATTAGTGAAATTGTCGTAATATTTGTAATGCTAATAAAAATAGAGAAAAGTTCGAAAGCCGCGATGCATATTTATCAAATACTTTTGATATAGGTTACATTTAAGTTTGTTCTGGTACAGGATCCTCTACTTTCGAGTCTTCGAGCTGTTTGAACTGAATCAAGATTACCAAGTATGTTGTGACGGCCGAAAATATCTGAAAATAAACAGCAAATACACA
TACTGGTACATAA-----ACTAAGAAGTTAACCACACGACTAAGTCACAGCAGCATTCAAAGCGTACATATATAGCCCCACAAAAAATATGAGTATATTTTGAATAACTATTCCCACTACTTTTGATGAATATCAATCTTAAATTTGTAAGTTGTAACCTATTATATCTTTTCTCGCCACTTGAATGCTGCATTTGTATTAAAACTTAGAGTGGTTCATTTTTTTTGGCGTCGGTTTCTTAATTGTTTTTAAATTTACGATGAGTTCAAATAATGCATTTTTTTTGTTCATGTATTTGAAAGTTTTGTGCGCTTGATTTGTCGAACTATCGAGTATATATATAAATGAATATATGCAGCTAGTTCAATTTGCGTAAGATTTGTAATGGTAATAAATATAGCTAATAAATTAAAA----CAGTATATA---------------------AATTTAAATTTAGTTCGTTTCCTGTAATTGTTCCTCCAATTTCGAATCCTCGAGCTGTTTAAATTGTATCAAAATGACCAAATAAGTGGTGACAGCTGAAAAGATCTGAG---AAACACTTAATGCA--
>CG14921 11120641 11120742|12223 chr2L 11120680 11121298 scaffold_14 2192462 2193178 + 19004|0 118
GCGTTACA-----------------------------TGTCAATTAGCGCGTGCGTGCGAGACTGTGC---------------TAATATTCCTA------------TTTTATTATTGCA
AAATTATAAAAAAAAAAATGGGTGGATGTGTAGTGTGTGTACATGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTGAGTACATGTGTGTGGGTGCAATAATTCTAGCTAACAATGTTTTTTTTTTTTGCA
>Csl4 11122564 11122801|12225 chr2L 11122714 11130457 scaffold_14 2196460 2204309 + 241628|0 93
GGT-CAATCGCATGTTAATCAGAAGC---TTAAATTCATTTGTG--GAACTAAAAATGTTTTAGTAAGTGATTATTAGCCAAATAATTATATGT
AACATAATGTAACATTA--CAGAAGTAAGTCTAGTATATTTATAATGTACCAGAAATATTTTTAC-----ATTATTAGC---ATATTTCTATAT
>RfC38 11128930 11128990|12225 chr2L 11122714 11130457 scaffold_14 2196460 2204309 + 241628|6538 6598
ACGATTTACACGCTTTAGCATTTAATTCAAAAAACTTATTAAATAAACTGATTTAAACGAA
C--ATTATTATATTATAGT-TTTTATTACGCCCATTCAATACATGCAGAGCGCTTAACCAA
>CG31867 11144579 11144728|12233 chr2L 11144572 11144640 scaffold_14 755643 755711 + 1606|7 68
TTATTTGATAGAAGCAATGTTATCGTGTACATTTTATAAATGCAGTAAACGAAATTTTAATC
TTTCTTGATAGAAATTTTCCTTATCTGTGCTTTTATTAATCACGTTAACGGAAAGTTTAGCA
>CG6287 11151506 11151670|12243 chr2L 11151090 11151647 scaffold_3 5840354 5840928 + -338|445 617
TCAGCACATTCTAAATTCGATATTCAGCATTTATAAATAAATAAGTTTACAACCAGGGAT---------------GTAAACAACGTAAAAACCAAA----ATACACAAGTAAAAATAAAAAGAA-----GAAGAGTTTTCTTAAAATACTCTCAGAT-------CTAAATATT
TAAACATATTCTTATGTAGGCATTTTGAATTTTTATTTATCTAAAAATACATTTAAGTGTTTCAATTGTAAATTATTAAAGAAATTAAAAACAAAATAATATGCAGAAGAGACCACATGCAGCATGTGCTAAGAGTTTCCATTTATCACTGTAAAATTATGTAATTAAATTCG
>CG6287 11151506 11151670|12244 chr2L 11151667 11152941 scaffold_14 758995 760156 + 43825|0 3
AGCA
TGCA
>Ca-beta 11160245 11160336|12254 chr2L 11159246 11161931 scaffold_14 768272 770891 + 39435|1132 1223
GAGGAACCTCTTACCAGCACAGCCGCCGACAACCGACCTCGGTACGCCACCAGGAGCGCGGCGGAGGGGTGGGCGCAGGCGGCGGAGGTGGA
GAGGTGCCTCTTACCATCATAGCCGTCG---TCCGGCCTCAGGACGACATCAGGAGCGCAGC------GTGGGC---AGCGGCGGAGTTGGC
>Ca-beta 11161068 11161264|12254 chr2L 11159246 11161931 scaffold_14 768272 770891 + 39435|1980 2195
ACTGCCGCAATCCGCGCC---AAACCCGATTTCTCACATTCTTCCGGGTGTTTTCCTAGATCAGCTCAACTCAACCCAAATCAGCTCAGTTATAATATATACTATATATATATGTACATGTATTCCGTTATTGTCGAACCTTATGTTTTCACCATTTCAAGTTGCAA-AAGCAAATCATCTAA----------TCGTTTAGAT-----CTGGTTTA
TGTCCTCTCGTCCTCGTCCTTCTACTTGA-TTCCCACATTGCT-CGGGTCCAGTCTAAG----GCTCAGGCAA---CAACTCAGTTCAGTCAAATAGTTTGATATCTTGTCTTGTTTATTGAATATTTTATTGCCG-----------TTCATCATTTCAAGTTAGAATCCTCAACTCATTCAAATTGTATTCGTTATTAAGATACATGTTGGCTTA
>Ca-beta 11164224 11165387|12255 chr2L 11161968 11164583 scaffold_14 771129 773745 + 72661|2457 2827
TACTCAGCTGTAGTTGATAAAGCTTAATACATTCTTAAATTAACTTTACAA-----CTTTATCAGAACAGATCTAATCAGTTATTATATTTCAACTTTTTAACTGAATCTTTTCAATTTTCGTAAGTAAAATATTCTATAAACTGAATCAATCAGACAAACTCATTCCAAAATTCGTATCATCTGTCCGTAAAACTCTGTTTTTTGGCTAATTTGTAATGTCCTGCTAACCGAAACCCGTACTTAGTTA-----TAGAAATCTGTGTAAATTGAAAGCAAACAGAACACTTCATA-CACCCTCGAGTTGGCATTTTAAACAGCATTAAATGGTGCGTAGACCGGTTTTAAAGGAAAAAAGCAAAAAAAAAA
TACGCAA-TATGTTTAAGAAAATATGATACGAT----AATTATTACTACAAAATTGTTTTTTTATAATGCATAAAAACAAATCTTAAATATGA---TTTTGAGTGATTTCTTTAAGC------------GATATTATTAGCAATAGATACATTGGGCGTTGTTATTT-----TTTTTTTTGTTTG---GTTACGCCCCTACTTTCGCTAAATGTAGAATTTATCTCTAGATGGATAGACATGTTAGCCAATCACTTCATATATCCTTAGACTTAAGGTATGCTTTAGGCTGAATTTCATCCTCGAGTTGGCATTTCAA-CAGCACTTCATATCGCGTGGTACGGTTGCAATTT------------------
>Ca-beta 11164224 11165387|12256 chr2L 11164652 11166150 scaffold_14 773821 775348 + 44783|0 862
TTATGAGCATCC---ATAGGTCCGACAGACGGATGC---CGAGCCCGACTCGAGCTCA-----------------------TCGATGTCTATTG----------------------TAATTGGACGCGT---GTTTTA----------------TGATTTTCA-------------TTTCAAAGCGAACCAAATCAGATTC-----------CAGACCATATTGAA----------AAAAAAAAGAAAAAAAGAAAATGTGGGCCAAGCTAAATTCCCGTAATTTTGTAC-TTTTGTGTTTGATCTAATTATATATCATGTGACATTCATATAAACCGAGTGCAAGTTAATGCTTACTTATATCAACGAC-TTCACCCGGCAATCCGATGCAAATCCGTCCCTAGTTATGCAAACGGCCCATTTATCGGCCTAGAGCTAGCCCTAGATCCCAGCATGAAAGCCGAATCCACCAGCAGATCGGTCTAGACTGCTTGATATTCCCGTTTTAGACCCAAATTCACCACTGTAAACACACAAAAGTACACACCTTACCAGCTTCAATAGCCACGATTTTCTCCGTTCCTAGTTTGTCTAAATCAAAGCTCCTCGTTCATGGTCTGCTTGTAAACTAACCAATTAGCCAATGTGAACAC-TATTAAATGCACTCAAACTCTCTTTTATCTAACACAAAACTGTTGACAACACTAACCAA-------ATGAACAACCACAACGCGA------------CCCAAGATCCCTACAGTACAACACCGCGCAAGAAAAACAAAGGTTTGTCCACGTCTCTCATCAGAATCTCAGAAA-TCCATTTCAATCGCAAAAATATCGCTAGCTCTTTC
CTATTATTATTCCACATACGTACTACAAATCTATACACGTGAGTGCGTCTCTCGATCAGCTCAGTACAACAACCAAGGTACTCCAAACCGATTGGCATCAATCACAAAGGACACAATTATAAGACACGGCTAATTTTGAGCTGAATCCAACAGTTGATCTTCAACCAGCTATGATCGTCCGATATGATTTACAACTGACTCGTAGTTTGCCGCGTACCGTTTTGAATTTTCATTTAGAAAAATCTGAATTTGGCAACACTGGGCTA--CAAAATTGCCGTAATTTCGTAAATTTTGTGTTCTATTTT------TATCATGCTACATCCACATAATGAAACCGCAA-TAAGCAATTA--TATTTCACCAGCATTTGCCAAATGGTCCAGTCCAAAACTG-ACATAGATGT---------------------------CTAACACTCTCTCCT-GCATGATAG-----TCACTCAACAAATTGGTCTAGA----------------------ACACATATCACACAACACGCCCACACGCAAACTCAAGCCTTTTCTTTTT---TAGAGACAACTTACAGC---------------------ACGCTCCT-ATTCATATCCTACT------ATAACTGTGTATAGTAAGAAAAAACGTATTAACTGCACTTAA-CTCTCTTTTACCTCACACAACAATAATTATAACCATATCCAACAACAACAATAATACCAACTACGTGATAAAAACGTGTTCCAAAGACCCCTATAGTACTACACCGCGCAAGAAACA---AGGTTTGTCCACGTCTCTCATCTGGTAATCAGAAAATGCATATTCAATTCAACAAAATCTTGTGCTCGTCA
>Vm32E 11171229 11171283|12262 chr2L 11170223 11171642 scaffold_14 778228 779686 + 1761|1176 1244
TGGCAAAAAAAAATTCATGTGAAGAATGT---TTTCGAATTAA-----------ATCCGTCTATGCTTT
TTGCCAATGCCAGACAACCCCAAGAATATGAATTTTGTATCTACGTATCTTAGTATCTGAAAGTCCCTT
>cmet 11260823 11261949|12346 chr2L 11253893 11261097 scaffold_14 850210 858321 + 121903|8293 8631
AGTAAAACACACATTG-----TCTTCATAACGCGGCTTTATTGTAATGTCAATAAATATTTATATAACTTTCTAAGCACATGAATGTCTACTTATATTGCTTATGTAAC--GACTTTAACTAATATATTTTATTCTAACGTCTTAACCAAATCGCAT-----------------------------TAGCCATAAATGC--ATTTCAAGCCTAAAAATGCAATCTATTGCACTCCGCT------------TGCGCCAAAATTTGGGCGAGAGTGAGAGGAAAAAGTGTCTAGAACCAAATAAAACTT--------------TAAACCGGGTAATAAAAA
AATTAAACAC-CATTGGTTGTTCTTTATAACGCAGATTTATTGTAATTTTAATAAATATTAATA--ACCTTCTAAGCACATGGATCTCTACTTAAATTGCTTATGTAACTTGTATTTATCTAACTCATTTTATTCTAGCGACTTAACTGCATTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATGTGTGAGTTGCCATAAATTCTTATTCGAATTATACAAATGCAAAA-ATTGCACTCTGTTGCACTGTTTAAATGAAGCAAAATAAAAGCACT--TGACGTTAATAAATGTTT----TCAAATGAAACATAGGCATCACATTGCGAAACAGGAAGATAATAA
>cmet 11260823 11261949|12347 chr2L 11261244 11263303 scaffold_14 2237589 2239706 - 13605|0 730
GCTTTTCATTCGTGAAAGTCAAGTGACGGCACTAAAGATGGAGCTGGACCATCATCCGCTGAAGGATGAGAATGCGCAACTAACGAAGCGAGTTATTGAGGAGCAAGACAAGGCAAAGGTTGAGCAGAAACGGCTTAAAATGAAACTTCAAGATCTTAATGCTAGGATTAATGACCTCACTACGGCATCAGCCAAGGAACCAGAATCTAACCAAATGGCACAA--GCAGCTAAACCTGCTACCGTAGCCGCTCAAACTCAGACGGAATCCGATCTTGAGACAATCCTTGAGAAAACGAACGTAAAGTATCAGGAAGCGGTTCGCATGTTGCGCTACCGTTACCATCTCATCCAGGAACTGAAAGAGAAACTTAGGCAAAACGAAAACAGTGATACCTCGAATATTACCTCACTCTCAGCTGGACAAACCAGTGCATTGAAGGTTGCTATTTCGAATCGTT--ACTCAAGTAGTTCTTATATAAAA--TATTGTTTTTGCAGGCACAGTGTGAGTCCCAAAAGAAGGAAATTTTGGCAATCAAATATAAGTATGAAGCCGCCAAGCGAATTTTGGCGATTCGAAATGATGATTTGGATGCTCTGCGGGAAAAACTCGCGAAATATGAAACAACTACATCAGATAAATAAGTCA----------CTAGGTATTATA----TTTGTGTAC-----ATATGTGTATGTGTTTGGGCTTAGGTTAATTTTGGGTGT
GCTGTTCATACGGGAGAGTATGGTGACTGCATTGAACTTTGAATTAAAGAACCATCCGCTCAAGGAGGAGACAGCCATCTTAAAAAGACGTATCCAGGAGGAGCAGGCCAAGGCGCGTGATGAAATCAAGCGCCTGAAGCAAAAGAACATAGATCTTATGAACAAGGT--GCAAGCATATT-CAGCATCTGCC--GCCATCACGGCCAGTGCCCAGTGCACAGTTTCGGCCAAGCAGACAACTGTTG------AGACGCAAACGGATTCCGACTTGGAGACGATTATAAGAAAAACCAATGAGAAATACAATGACTCTTTGCAACTATGTCGCTATCGTTATAATAAAATTAGAGAATTAGAGAGAGAACTGAATGAAAACAACAAC------------AACATTTCATCCCAGACTGCTGGTCAAATTATTGCACTTAAGGTATGTTTCTTCACGTGTCAAATTCACATCAGCCTTAATTCAAATTTGTAATGATTCCAGTCACAATTGGAGTCGCAGAAGAAAGAAATTCGTACCCTCACCAATAAATATGAGTTCGCCAAAAGAGCACTTAAAATGCGCCGAGATGAAAATAATGAGCTGCGGCAAA---TCGCTGGCACCGACGTTCCAGCATCCTCTAAATAAGTCAACTGCTTCCCCCTGGTATTATAACGTTTAGTGATTAAGTGATGTGTGTATATATTTAATTTT--GTTTATTAAAGCTGT
>salm 11434311 11435894|12509 chr2L 11434079 11436103 scaffold_14 1000889 1002937 + 21784|281 2068
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-GCAGTCCAACGCAATATTAGT-TGTTAAATATATTCCAATATTTATAAATATACCTACCCTTAAAGGCATAAAGTTTAATTATACTATAAACTTTTGAAAAACG--CAA
TTCAATCCCAAATAATATCATTAGGATTAATATA-------ATTAATACCTTTTTGTGCT-----AGATCCAAA----AATTAAACAATTAGCAAGTAGAAATGGGTCTG
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AATAATCGAAATCTTTAAAATTATAATACTTTTATTACATTGGCAACTGTCAATTTATCGACGAGTTTGTGAATATTTTTAATGTTAATTACC
GAAAACCCAAACGTGTAAGA----AATTTATATGCCATATTGATGGTCATGTATTTGT--ACAAATCTGATAA-----------------ACC
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>CG31706 11529521 11529548|12591 chr2L 11528622 11530210 scaffold_2 2967339 2968883 - 6206|977 1004
GTTAAATAAAGCGAACTAAAGATTTAAA
GCTAAGGATTGT-ATCTAATTATTCAAA
>CG15841 11591338 11591359|12639 chr2L 11590799 11591461 scaffold_2 3026874 3027542 - 9877|610 631
ATCATTTTCGTTTTTATTGTGA
ATCAAATTGGTTTTTATTGTGC
>CG6555 11591338 11591524|12639 chr2L 11590799 11591461 scaffold_2 3026874 3027542 - 9877|610 735
GCACTTCTCAAG-GCTGTAACAAAAACTGCACTCTGTTTTTATAAATACAAATATCCACAAATATCTGGTCTTAACATGGCAAC-ATTTCAAGTCTTCCAATAAATCATTTTCGTTTTTATTGTGA
GCGGTTGTCAGGTGCGTTGACAAAAAGTGTACTTCATTTTTATA--------TGGCCACAATTGC--GGCGTTAACATGGCAGCCATGTTTAAGCTGTTCATAAATCAAATTGGTTTTTATTGTGC
>CG6555 11591338 11591524|12640 chr2L 11591462 11591793 scaffold_2 3028334 3028671 - 228|0 66
AGCATCTATAGAAATCAAAGAAGGATCTTGTATATGGAAG----TGGAAATGTGGTTCAAAATATCA
TATTTC-AAAGAAATC--------ACTTGACATTTGAAAACTGTTAAAAATATGTTTAAGAAAAAAA
>Tsp33B 11791025 11791092|12854 chr2L 11791022 11791419 scaffold_2 3276226 3276576 - 8022|3 71
TATTGTGCTTAATTTTACTTTTATATTTTATATTAATTTAATTAAATTTACGAATTTGAGTTA-ACTTC
CGTTATG-TTATCCATATATATATATATATTTTTTAATCACTTGATTTGTCAGTTTTAATTTATACTTT
>CG14937 11792402 11792630|12856 chr2L 11792431 11792563 scaffold_18 944191 944345 - 592|0 154
AATATAGT-TAAGTGTATACATTTATCAACTGCTTACCAAATAAAAAGATGTAAATATACAT-ATTTGTAAAGCGATT---------------TTTCAATGCATCATTGTTTTTACTGCCCTTAGGGATAAAAAAAA-----TTAAATTCAAGTT
ATCATAGTATATATATATATATATATTGACTTAAGACTGAATGGAAAGCGAAAAGGATTTGTCGCTTTGGAGGCGATTACATTAATTGAAAAATTTAAGAGACTTATTATTATCTCTCGCAGTTAACTTATAACTAATTGGTTTAAATTCAAATT
>CG14937 11792402 11792630|12857 chr2L 11792597 11794215 scaffold_18 944374 946051 - 45738|0 33
ACCGCTGCCCCATGAGTGGGATATGCTCCAACTG
TTTGTTACC--------------TGTGCCAACTG
>crol 11794327 11797124|12858 chr2L 11794344 11796629 scaffold_18 946574 949053 - 21985|0 2724
TGGAAACTCAACGAGATATGTGTCCCAATCGCAAGCAAATTAAACACTCCTCAATTAGTCTGCCGCCGCCAGCTTTAACGTGCAATACGA--------ATCATCTCATAGTTTGTTCTTGGTATCTCTCCCTTTTATGTGTATCTTTAA------TGCTTAGGCGCTTAGCGTCTA--------ATTTTATTCACGTGTTTTCTACATTTTTGAAATGTGTGCCAGGCGGCGCGTGACTTTGTTTGGGTCGATCGATATGGTTTTTGTGATATCCGATTGTTCCTTAGCTGCGCTCAGTGAATCAAA---TGGATCCGAAGACCAATCCGTCTCAGGCAATTTTCTCGCTAGACACTTAAAGTTAAGGGGTTTTTGTTGCCGTAACCAGCAGAAGCGCACCATCTTGTATTTTTA---TTGTGTTTTGACTAAGTTATGATTAT--ATCCATATGGAGCGACATTCATAGA--------AAGCATCCTCAT-------------CATACATAAACATATGCAGATATGCATAGGCATACAATTATAATATATACTTATAGTTTGTAAATAACACGCAACAAGACCCTTGGAAATCTATCGAAAATTATTATCACAACTGTATTATTTT-TGCATTTTCCAAGGAGGAACATTAATAACGAGCTAAC----------GCGCGAAAACTTTCACATATATTGGCCAAGTGTAGTCCTTA-------ACCCAGTTTACAATATATCGAGCC--------CTGAAAGTGGGGCT------------------------GTGATGATTATGA------------GATATATATA----------------CAATTATATGACAGTGGAAACAGAAGCAGCATAACGGCAGACCCA-------ACTAACGAGA--TAATGAAAAGGGATTAAACAAA----CAAGTTATTATATTTAATGTTAGTTGAACTACTAAAAGTAATGATTGAAAGCACGGATCGAAGGAATGGAGATAGGAGTTCCCGCGTGGGAGTGCGAGTAGTTTTTAGTTG------------------GGCGCGTCGCCCAATCATTATGATTACAATTACAATTACGATTATGATATATGGAATACTAAACCTATAACAACAAGTTATTACCCC----------------------ACTATTAAAGTTAACAA-----GCAACAACAACAACAACCCATACATATACATATATACGACTAGGCACAACTCTAAAATTAATTATAACCCTTAACTGTGCTTGTGTTGAAAACAACAAACATTAAGAACAAGTTTAAGCCGTAACGAAATAAAAGAAAGTGAAACAATTAACGAGAAATCCCCAAGCGCCACAAGCAACAACATATCTGCTTTAAATTTTAC-------AAAAAAGGAAGAGAAATCT------AAAAAAAAGTATATTAAAC--------ACGAGTCAAAGTTTAATAATTTAGTAAGAAAACAATACACAGACAAACTGACAGACACACGACCCACACATTATGCTTCCTTTTAAATGCAACATTTTATACATTTAATTATCGAGAATTAAATGCTTAAAATACAATTTTAATTTAATTTAACAAACTGTAACTGTACACGAATAA----------ACGGAAAATGTAAAAC----------TGTTTG------------TTTAACCATTTAAAGACAGAA--------CTTGGTTTTATTTAACCTAATTTTATTGATTCACGATCATCGCAGCAAAGTGCACATTTTGAATA--CACTTAGAATGCAGGGAACAATTGAAAATTGAAAATGAAATTATCATTGATATGCATGT-ATTTTGCTTTCACACTGAAAATAATTGTTTTCGAAGTCGCAAACAC------ACACTATCACACGTCTATAATTATGTAGTTGAGTATCCGTGTTAGTTTTTGGGTGTTTTTGGATTTTTGGTGATGTGTATAGAGCG-CAGTATATAGAA----------------------TGCATATAGAGATATATA-------------------------------TTATTGTA-------CGATTATTGA------CTAATATATAACGGATATGTATGT-GTAGTACGTGAAAGGCA---AGTTTATGGAGACAATTCACTTGTGTTGCAA-TATTAATGAACAAACGAAATAATT-----TACTTGTAAGTTGCGTAGTGCAAGCCGTGAG-----------AATAGAGGTAACTTTCTCCACAACCCACACTCACTGATCGACAGACACATACCCATTAACCTTAATGATTAAACGCTGGGACAGCGG------------CAAAAATGTTTCCTAGGAGAAAAATTAAC-------------AGAAGCTGAAG--------------------AAAACGC-----TTGGAATGCCCCAATTAAC----GTAAACATTAAAAGCAACAAACAGTAACAATACTAAA----------------------------TAGAAACAATAATGTACTATAAATCAGATACAATACA-ACACTATATATACCTAAAATATATATGCCTATA-CGACA---GAAATTGGACAACAAA---TGAAATATATATAT-ATATAGTATATATTGTACAAGTTA---CGAGTAAAATGTAATTAAAATTTATGAAGTAGTAAGCACTAAACAAAACAAATAAATGAGCAGCAAAA
CTTGAACCCGATGA--TGTGTCTCCC---CCCTTACCTATTACCCAACTCTC---CAGTCAGGCGCCTGCTTGCGCAACGTGCAATACAAGAAAAGAAAACATCTCATAGTTT---------------CCCTTCATTGT---TCTCTAACCGATCTTTTTAGGCGCTTAGCGTCTATATAATATATATTTTTCACGTCTCTGTTACATTTATGAAATGTACGCGTAACGACG-------GCGCTAGGGCTGGCTGTTAG-----CTGTGCTATCGG-------CCAAGTTAGCGAGAGTTCATCAATGGTTGGGTTCAAAAA-------GTTGTAATCAGTTTTTTTTTT--------------------TTTTAGTT--------CGGCG------------CCTGTATTTTTAACATTATGTTTC-ATTAAGTTATGCATAGGAAGTGAGAGAGAGAGACATTCATATATTCTTACACGGCATCCTCATACCATACAACTATCATAAATATATATTTATATATATATATATATATACATGTATCAATTATAC--ATACTTTGTATATAAACTGCAGCAAAACATTGAGATAT-TGTCGGAAATTTTT---------GTATTATTTTGTGCATTTTGTAAGACAAAGTAT--GTAGCGAAACAGCTTAAACAGTTATGCATACATTTACATATAAACTACACAAATATTATGCTAATAGCAGCGCCCAGTTAATA-TATATCAAACCACCCTCCTCTTAACCTTCAGCCCCGTTAACGTTTAAGTCCGACAAATTGTTGCCTATGAATGGAAAACTTTGTTATATAGGGCAAGGCGTATTAGAGAAGTTAACTAACAA-GTGAGTTGAAGTGGAATAATCGTAGGCTAAGTCAAGAACTAACGAGAGATGAGAGAAACGCAAAAAAGAAAATTATATATTATTATATTTAATGTTAGTTGAACTACTAAGAAGAATTA----------AGATTGATTATAATGAGACAAAAG------AGCGAAAGTG-AATTAGTTATTAGTTACATCTACGAAATGTGTGTGTAGAGCAGCGCACGCGCTATAATTATAATTATAATTACGATTACGATATG----ACAAGAAAACTAAGCGATGAAGTTATAACCTCCTCCCCCCACACAACACTACACACTATTAAAGTTAACAACAACATTAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAAAGCTAGGCACAACTCTACAATTAAATATAACAATTA-CTGTGCTTATGTTGAAAACAGCAA----------CAAATT--------------ATAGAAGAA-----------------GCAAGCCCCAAGCGCCACAAGCAACAACATATCTGCTTTAAATTTTACACAAACAAAAAAGGAAAGAGAAAACGACAACAACAAAAAAATAAAATAAATAATATTAGATGAGTC-AAGTTTATTAATAT------------TTAAACACACACTCTCACA-----------CACACATAATGCTTCCTTTTAAATGCAACATTTTATTAATTTAATATTT--TAATTAAAC------CATATAA-TTTAAATTAACCAGAAAAACTGTACATGTACACAAATAAAACATCATACACAAAAAAAAAAAAACAATAAAGTATTTTTTGGTTTTACTTTGATTTAATTTAATAAAAACAAAAATACATTTCGTGTTTTTATTTTTAAGGCATTTATTG-------------GCAGCGACAGAAGTTTTATAAATATGTACTAAGAATGCAGGGAACAATTGAAAATTGTAAAAAAAAAAAAAATACAAACAAAAACAAATGTGCGCATAAATTA-----AATTATTTAAGCAAAAACAAAAACTTGACGAAGTTTTCACAGATTTCTGATTGCATAACGAA----TCGCTTTAGT---------CTAATGTATTTTTATAAGAGAAAATACAGAGTCAAAATAAGGAAAAACCTTTGTGAAAACTTCGTCTAAATGTGGAGACACACACACACACACACAAGCAAACATGTTTAAGTAGTTGTTTTAGCCGTGTTAGTTTTTGGTGTTTTTTAAAATAGATTGGTGATGTGTATAATAGAGCGCTGTATGCATATAGAGTATATATATATATTATATATTATACGATTATTAACTAATACATTAACTGATCAACTGTATTTGTAGCAAGCGAATGGCAATTTTAAAGTATGTACCAACAACAAACTCAAATTGTGTTGCA----ATATTTAATAAACAA-AGAAACAAACAGATTTATTTGTAAGTTTGCGTATTGCATAAATCGATTATGGCTTAACACACATCATTTACACGATAATAATTATTATGATTATTAACAATAAGCTGCAGGTGTCGAGAAATGTTTCCTAAAAACGCAGCCAATTGATTGCAACAACAAACAAATGAAAAGAAAAAAAAAAAGGAACAGAAAAATAATTAAAACATAAACCAATAACAATACTAAGTAATTAGAAACAATAATGTACTATAATGCAGATACAATATATACACTATATATACCTACA--ATATATGCCTATACCGACAAATGAAATTGAATGAATAATATTACATTATACATACAACATAGAATATATTGTAAAAGTTAAATCTAACTAAATAC-ATACAAATTAAAGACGTAGTAAGCACCAAAC-AAATAAATAAAAAAACTAAAAAA
>crol 11794327 11797124|12859 chr2L 11796636 11796824 scaffold_5 5568051 5568235 + 1331|0 196
GTGTCGATTTTTAAAGCAAGCG---TGTGTGGTAAATATTACTTTTAGGACGAAATGGCACAGTATTGCCTTTAAAATGTCCAGTCTTCTAAAGCCCCAAAATTTAATTGATGGTAATTAAATATTTTGTTATCAATTATTAAGATTTTAATTCGTGAAAT---ATTTTAAA--TCAAGTAATTTAAAATAATCAAA
GTTTCAGTTAGGAAACCGAGAGATATGTGTGTCAATAAATTGGTTGAGCTCTTAATTACCCAAAATTGTGTGTGCAA---CAAATTTGATAATG----AAAACTAAACAGTTTCTAGTTACGTATTCTGTC-----TTTTTAGGTTAGGATTTCATGAAATAACATTTGAAAATTTCTGAAATTTAAAAGTATCAAA
>crol 11794327 11797124|12860 chr2L 11796873 11798104 scaffold_18 949054 950271 - 62077|0 272
CAGTAGCCCCTCCTGCACGGCTACACTCCCACCACAGCCCACTCCAGCAGCACGACCAGCACCTCAATAGCTGCCACAGCGGCCACTGCGTCGTCGCAAGCGGCGTGGTGAAGGCATGCGTGCCACCAGTGAGCCAGTGCTAGTGAGCCGAGCTGACGCGACTTCTCTAGATAGGACACACATCATAACAAGCGCACCCCATATAAGCAGCTAGTTGTATGTACAATA-----------------GTTTT----AGCAGCGCGCTGGTTACGC
CAGTAGCCCCTGCTGCCTGGCTACCCGACGACGGCGGC------------------------------GGCGGCCACAACAGCCACAACACAGTGGTAAAAAGA-----AAAAGCACACAAA--ATCCGGCGGCCAATCGAAGCAACTGAAGGCAACA--------------ACAATCCACAT-------------CCACACATAAGCAGCTAGTTATACATATAAAACATATTCATTTATATATATTTTATAAAGCCGCGCGCTGGTTACGC
>CG14939 11810092 11811116|12870 chr2L 11807418 11812727 scaffold_18 961550 966852 - 100540|3005 4121
TTTATATTAGCTTACTAAAACCGAACAACCA-------------ACCAACAGCAGCAATGAGATCCGTACTCTGTAGTCCGTAGTCCGATCGAACGTCATTTGAGAACCGTAGCTCTGCGCTGA---ATCAGATTTTGCACACAGATTCAGATACATTTCGTAGGCCACCCGGTTGCATAAGCTTTTGCGGGTGGCTTTTTAGCCAGCACACAGACTCTAAAAGGAACACCC-----AAATACGTGCAGAAAGAATCAC---AGTCTTATATACAATATATACATACACGAAGAAAAGCGTTTTAACCACACGTCTCGAATTAAGGACCACTTTTTACATATACGTACATGCGATCGA-------------------TGTAT------GTAAGCGAAACTACCGA-TGCAGTCATGGATTTGGATGATGATTTTAAACAGAGACACAGAAGTACTACTACAGCAACGCGTAACCAATTGCCAAA-----CGAAAGATCACAGAAGCAGAAAGAGATACAGAAACCTAAACCGAACAGTAGAGAATTGTTTGTACAAAACGGCTTAAATA-----------ATATTGTAATTGACTTGGCCACCTAATCCAGCTGGCATCTAAGCAATTTAATCTCAACGGTTGGCCACGGCCACCAAATTGTCATTTACTTAGCGCGTCCGCGCC------CAAAAAAAGAAAAGAAAAACATT-TCCCTGTACATTTGTTACGAATTTAATTTGTTTACCTTACATCCATGTTTTCTTAATAACTCAATATGATTTCGTGTGATTCTTATATAGTTTCCATTTAGCTTTATATACG-----ATGAACGATATT---CGGCTTCCC-----------CGCGTCAGGCTTCAGGCACAAATCGATTTTCTGGGGGCGCGGCCTGCGGCAAGTTGATTTGTTTTTTTTTGGTTCTTAGCATTAGAAAAACAAACAAAATCCGAGCGAGAGTTGCAAGGAGCACAGCGCAATATTAACCCAAAAGATTTGTGAGTAAATTAATGTACTAGACATATAAGGATACGAATTATATGCAAAATGTATTTTATTTTGTAATTTATTTTACGATAAAGCTAAATAAAAGCAAATC
TTTATATTAGCCTATTAAAAACTTATATCTATATTCAATTCTGTAGAAACCGTAGCGGT----TCCATACTGTCCTTTCCACAAACAAACTGAA---------ACGATCGCGCCTGTAAGTGTAACTATCACCATTTG--TTTAATTTCTACTGCATTTCGATGAACA-----TTTCGCAAGACTTCAAAAACACACATCTAACAAGAAAGCACAACCAAAACAAAACATTTACTAAAAAAAGAAAAAGAAAACATAACGAAAATCTTACACTC---ACACACACACAC--------------------CAAGTCTCGAATTAAGGACCACTTTTTATATATATACA-ATGGTATAGAATGCTTGTTCTAGCATATTTGTATATTATCGTAGGCGAAACTAGCGATTGCAGTCAAGGATTTG---GATGATTTTA-------ACATATGCCTACAACTAGAGGAGCGCGTAACCAATTGCCAAAAATATTGAAATGAAAAATAAACATAAA-----ACAAAAAAGTTAACTCAA----AGAAATTGCCCTGTATAAAAT-GCTTGAATATTAAATATTGTATTTTGTAATTGGTTTAGTCACTTAA--------ATAACAAATCGAATTAATCTCAATGGAT-TCCAAGGTGACTAATCCAAAATGAATTTTTAGCAACTGCGCCCCAAAACAAAAACACAAAAAAAAAACATTATTTTTGTACATGTGTTACGAATTTTTTTGGTTTTCCTTAATTTCAATT---------------ATGTGATTTCTTATAGATTTGTCTTAGGTCCTATATATATATATATATATATATACGAACGATCGCTAACGGCTTCCTTGGCCACAATGCAAACTATGCTTAGGGCGCAGCACAATTAT---GGGGCGTGGCCTGCGTCAAAATGGATACATCTGTTTTGGTTTATACTAACATAAAAA--------------------------------ACAGCGCAATATTAACCC--AAGATTTGTGAGTACATTAATAT-TTAGTCACATAAGAATACGAATTATATGC-AAATGTATTTTATTTTGTAATTTATTTTACGATAACGCGAAATAAAA-CAAATC
>Pde1c 11814825 11816557|12872 chr2L 11814132 11814842 scaffold_18 967863 968493 - 8724|735 752
AACGGATATATATAAATA
AACAATAACATACAAATG
>Pde1c 11814825 11816557|12873 chr2L 11815016 11818497 scaffold_18 968877 972347 - 78100|0 1774
GGGGACAATTGCGCCACCTGGCGGCCAGCGGCCAACTGAATCGGAAAACTAATGCGGAAAAACGGAACACAAGAGGAAACTTT-----GATGGCTACACTGAGAGAAACCGAGGAACGAACGAAGCTGCAAGAATATTGTTTACTAAGCTTAGAATCAGCCTAGAATTATTGATAACAAAACGCTTCAAATGCGCTCTCTATGTGAATTGTGGTAGAGTTAGAATAAACGTACATCATCTATACGCA-----------TAGGTACATT----AATATCGATATATATG-TATAA-ATACTGTTTACTT-------TGTTGTTGCAAAAGGAAGAAGCAAATTGATAAATATGAAAATATTAGGGCCAAGCACAAATACAAACGAACAGTGGAGAAAAAAAGAACGCGTAGATGTAAATAGCAAAGGAGTTCAACTGAAATTTGTTGTGAATTTGTTAGTTCGTT---------------GCGAGCATTTATATTTAGAATTCAGTTGTACTTGTG------TTGTACTTGATTAGTTTTAGTCAAATGTGGAATTTATCGTA----TGATTTGTCTAAGTTCGATGTACGCAAT-ATCGTTTCTAATTAAATACATATATA-TTTTTGTAATCGTTTCTACCTTTTATTTTTGCCCTTAGTTTTTTGT----GTGTTTGCATTTACCAAGCATTCGAATTGCTCAATTAAACGAGTGGTTTTTCAAGAAAGGAACGACAGACGCGTCGATCTGTCTAGATATTAAGTACCTAACTAAAAGCTAAACCAAAAAATACCTGA-----CAACTAGCTATACGACTTGTATATACTCTACACCAACCCCTAACAGACTTTCCCCACAAGAAAAAGAAAAACCAAAAATCCAAGAAGAAGGCAAAGATTTCAAAAACTTTCCACTCTACAAATGCACATAGCTACCTATACGATGGGATATATAATATTTAT---TGTTAAGAA----TATAATAGT----CACGTTTCTACAAAA-------CATATTTATTTTTATACATGAGCGCGG---------------GACAAAAGTGAGAGCAGAAAG-------------------------------------TGGAGGGCTTGAGTCGCAGGAGGATTTGATTTCCTTTCGTTTCGGTTTTCCTTTTCCTT--------------AATCAACTTGAAATGTTTTCAAACGTTTTTCAAAATGTCTGATAGCGGGACCATTCTTTTAAGATTTACCACTGCTCTTT--------------ACCAATTTGAGCAGGGCGAAAATCGTAGGGAAATTCGAGGT--GGAAAAGCCGCCGAGCGAT----------------AGCAGCAGAAAGTCAAAGGGCAGTGGTAAAAGTGCTTAGCAGTAAGGTACCAAATTATCAGCTGAAATTGGGATCATAGCTTTATTAAGGTAGTCGATAAATGTACGAACAAATCGTGGT---------TGCAGATGTGTATAGCGGATGTCTACTAGTAGCCATAGCCACA-----------AATTAAAAACAAACACGAACAGAACAGACAGAACAAACAAACGTACACAGCAGATTAATCTACTCCTAAACATTA------ATGGGATA-AATATAGCGCCAGAATACCTATTATGCGGA----------CCGTAAATATTATTGAACAACCAGTGT-------ATGTTA-----GTGTATATCAAAC---TTGAACGCTCAAAGCGATGCGCATGCATATATCGTATA
----------------CCTAGCGATAAGCGATAAGAGATAAGAGATAACCA------------GATACATAGATACAATCTCTGCACAGATAATAAAACCAACAACAA-CAACTAACTAACTAATTAGCAACCATAT--TTAACTA---TATGAATAACTCGAAAATT--------------GTATAAATTATGTTGATTAACAAAATATTGGTAGAGATCAGATAATGAAAAATCAGCAAATATCACAAAAAAAAACTAAGTAAATTTCTGAATGT-ACTATATACGATATAATATATTATTTGCTTGCAACTAGTTTGTTAAAAAGGGGAGAAAC---------CCTAAACAAATATTAGCG-TAAACATTTTT-----CTCACAATGT--------------------TGTAAATAG-------------CTGGCATTTGTAGGAGATTATTTGGTTTGTTTTTTTTTTTTCAAGAATAAGCATTTACTT----AGCTTAGTTCATCGATTGAAATACTTATACTTACCCAATATAAGTATATATTATTATTAATTTTAATTTTAATTTCTTAAGTTTTGGAATCTATTGTAAAAGTATTTTATTAAAAAAAAATGTATTTTTTATAATTTACTTTTAGTATTTTTTTCTCTTTGGTTTTTTTGTTTCAATACTAAAATTTGCTCAATTTTGGAGTTACGCACGAAGGCGAACGGATTTTAA----------------------GAGCTGGCTAGATCTTAAGTAC-----------CTAAACTAAAAAATACCTGAAAAACTAACTAGCTATACAACTTGTGTTAATATCTAAAAGACCTCTAACAGACTATCTAAACCAAAAAAAAAAAAA-------------AAAAAAAGAAATCTTTACTTGAATTTCC-CTCAACATATGCACA-GGCTACCTAC--------ATATATCGTGTGCAGGCATGTTAAGAATAATTATAATAATGGAACACACTTCATCCAAAAGTGTAGCATATTTATTTTTATACGTGAACAAGGCTTATGTTTACAAAAAAAAAAAAAAAAACCAAAAAGAAAAACCAAAAAAAAAAAAATAATAGCATTATTGAGCTAGCACAGTTAATATGTTAGACGATTCT-TTTCTTTAAGTTCTTGTCTGTATTTTTCTCGTATTCGAAGAGGAATCCAAACTAAAATGTTTT-AAACGTTTTTCAAAATGTCTGATAGCGGGACCATTCTTTTAAGATTTACCAGTGTTCTTTGCACAGCGACAGCGACAGAAAAAAATAATGGGAATTTCCTCTGGGCATTTGGGCCTGGGAACAGTTATTGTGCGCTCCCTGCCGTTTTTACGAACGGCAACGGGTTAAAGAGCAGTGGTAAATGTGCTTAGCGGTAAGGTACCAAATTATCAGCTGAAATTGGGATCATAGCTTTATTAAGGTAGTAAATACTTGTAATTAACTACTGTAGTTGGTAACAGTGCATATGCGCTACACGTATGCCGTATGAAACGTATAATACCATACAGTTAGTTACTTGCATACATACATATTTATTATACACAT-ACAAACATACATACATACATATTTAATCTCGTACTTAGCTACAGCAAATACAAAATATAACATAACAACAACATAACAAATATACATATACATATAAGCCACAAATACGAATACATATTATGTGTATATATAATGTTAAAAGTATGTGTATCGAACAAATTGAACGCTCAAAGCGAT---TAGGCATATACAGTATA
>esc 11827180 11827459|12883 chr2L 11826816 11827226 scaffold_18 980457 980875 - 4635|415 475
TGTAAATAAAGTGAG--TACATTGTA------ATTTCACATGTATATAAGCAA------CA
CGAACATAACGTAAATCTCCATTACACGTGACCTTTCCCTTGTAAGTAGTCAGGCAGGTAA
>esc 11827180 11827459|12884 chr2L 11827278 11828394 scaffold_18 980917 982076 - 59618|0 227
TGG-------CGCAGCTGGGCGCAACCACAAACCAAATCTCACGTGGCCAAAACT-----TACAACATTTCCCTCAAT---TAGTTCCTAGT------TGGTTAGCA---TTAAGATATAGAATTACGCTCCTGTGCTG----TTCCAAA-----------TTATTTCAAG----TAAATCCAATTAAT---AGTTGGATGAGATTTAAATATGTTAAGCCGGTTGCT
GAACCGCATTCATAGCTGCAGACACACCACAACCAAATCTCACGTGGCCAAAATCCAAGGCACAACATTAATATTTGTGCCTAGTTCCTAGTATTTACTTGTTAGTCCTTTCCACAAATAAACCAATTATCTTATGCTAGGTTTTCTAAATTCAAGATTATTTATTTTAAGCTCTTATACAAAATTACTCCACGTCCGAAGACACCT-ACCACATTCGACTCGTTCCT
>CG31758 11841505 11841957|12892 chr2L 11841383 11842376 scaffold_18 992587 993655 - 5274|145 693
GCCAACAATCCTTTCGACACACAAGCCAA---AGAAGAATCCAGAAA----TCAAATCGT------ATAAGAGTGCCTTGT--------------------ATTAATCATCAATGTGAAAAATATAGAAATAAAT-----------CAGCTTATCAACAAGAGTATTTGGCATTGCATTTGATAGCGCTTGAACA--CCTTATC--GCCA--ATACGAATCG-TATAAAAC--GCGACACTG-GCAAAAACT--AGTACCCACTTCCGAAA-------------CTTGCAGTGATTTATGAACTCA----ATACTTTCGTTCAAGTGGCTTTCGCCACC----AAAGATTACGAAGAGTGCATTTCGCGAA----------------TAATTTAACATTAATCTTCGATGAGTCACTTTAAAAACACCTATCTTTCACACTATGAA---CCAGATTGTAAAAAAGTAATTACTTGTTAGTTTATAAATAAAGTGACAGTTATTTGAAACCATATCAATAAAGTTCTTTCAATGCTTAAGTATTTGGCAC
GCCG--AATTCTTT---CACAATTGTCAATATAAAATCATTTAAAAATATTTAAAATTTCTTCAAAATAAAATCACTTTGTTCAATTGTGAATCAACTGAGCTGAATCATCAATG-GGGTAATATAAATGTATATGTGTAATATTGCCGCTTATCAGTAAGCCCATTTGGAGTGCCGATTGATAGC-----AACAGTCTTTATCTGGCCAACATATGAACAGCTATAAATCAGATGACAATGCGCTCAGACTTAAGGGTTGGCTTCCGTGAACCATTGATTCCGCTTAAAATGAACTGTGAACAACAAATATACTAGGATCTAAATAG-TTAAGCAAACATATAGAAATTTAAAAGCATACA---CGAGAAAAAAAAATAAGATGTGCAATTTGATCAAGCTCCGCAGCCAGTTGCTTGAA------------TATACTTTATGAATTTTTCGATTCTAAAAGCCTAATCTTCTAATATTCCCAAAAAAGTTTTTCATACTTTCATACCAATATTAATAATATGT------TGCATATATGTAAGGTAA
>CG6686 11984319 11984506|13036 chr2L 11982399 11984356 scaffold_18 1141367 1143357 - 58387|1964 2015
AAATACACTTTGGATT--------------TATCTTAAAAAGCTAATCTCAA
AAATGTATCCTGTATTATTTTCTTGTTCCTCAGTTCAACACGTTAATGTACA
>CG6686 11984319 11984506|13037 chr2L 11984358 11987422 scaffold_18 1143834 1146923 - 119907|0 171
AGAAGGGCGCAGGAAAGACTAGCAATTTAATTAACAAGATATACACAACCAAATGCAATAGACACTTCCTAATCCGCGTACTAAATACTTA----AGTTTA-ATACCACAACATATGCATCCGGCTCA-----------------AATATGTAATTT-TCTTCATATTTATT
AGAGTTGGGC---------------TACACCCCAGAAAATATTTACAACCAAATGCAATAGTAACTTCCAAAATCACAATTTAAAAGCTTATTGTAGTTCATATGC----ACATAAGTTTAGAGTTCAGAACCATACAAAACGCTAATATGCAACTCAACTTCATATTTATT
>CG12314 11988735 11989062|13039 chr2L 11988309 11988736 scaffold_18 1661382 1661790 + 8399|440 441
AC
AT
>CG12314 11988735 11989062|13040 chr2L 11988737 11989066 scaffold_26 1469951 1470236 + -1110|0 333
AAATCAATTGATTTAATGTATGACTACCAAACAGTTCCTCAGTATGCCAAATAATTATAGTTCTTATTTTCTAAGTGCCTTCAATTAAACTAAAACTTTTTAAGGCAGCTTGATCTTCACACACAAAGGAGTGCCAAATTAATTAAGCA-----AAACAAAAGTAATCAAAATGTATACCTAACAGTATAATCCGTATGAAATCTTTATCACTTCGATTGAGTTGACTAATTTTCAACGTGCATTTAGTTATGATCAGCTTTGACTATATATATAACTTTCTACTTTATTCATCATGTTATTGAAAGCTTTTAAGTAAATAAAAGTT---AATT
GCAGCGATTAACCAAGCGAATGTGCTCCAAACG--TGCTC------CCAAGCTATTATATGAAGTATCTGC------CCTTTGAT-------GAGCTTTT-------GCTTGTGCT----GGCCGAAAATTCGATGAATTTGTTGTGTATATATTAGTAATAGTATT--AAGTGCTTAATTAATAGAATTA----TGTTCAATTCTCATGCCAAGAATCGGCCGAACTAAAT---AAAATACATT--GTTATCATC--TTTTGGGTTCATCT-TAAGCTTTTAAATAATTTGT----TTATCTAAA--TTCTAAATCATTCTAAATTGAAAATC
>CG18787 11997895 11998192|13049 chr2L 11996387 11999531 scaffold_18 1151693 1154819 - 65658|1565 1879
CAACAAATGCAGCAGCAACAACAATTTCAAATGCAACAGCAACAGCAAAT-GATGCA--GCAGCAGCAGCAGCAGCAAGCTCAAC--CGACCAACGAAATCCAG-------TCCTCAGTTTACAGTCGCATGGAGGATCTCAACGAGCAGGAAATCGAAGCATTCAAGGCGGATCAATTTCTACCAGGTGCCTTGCCATTCAAACCGCCTCCACGGAATCTTTGCTGAACCAAACACTTAATGGTACACTAGCGTATAATGTATATATTTTTACAGAAGCTGATATAATAAAATAATTAGAACTT-----ATAAG
CAGCAACCGCAGCAACAACAACAAATGCAATCGGAAGCACCACAACAGCTCAATGCATTACAGCAGCAGCAGCAGCAGGTGCTACAACAACCTTCGCAACCCGACAATAGCTCATCTATATATAGTCGCATGGAGGACCTTACACCGGAAGAGATAGCGGCCTTTAAAGCAGATCAATTTGCGCCTGGACAGGTGCCCTTTAAGCCACCGCCAAGGGAGCTTTGTTAAATTTAA------ATGG-------ACTTGCAACCGTTTTTTTTTTTCA-AATTTGTTATTAAAGAATAAAAAAAAGGTTTGTAATATT
>CG6746 12001234 12001413|13051 chr2L 11999725 12002287 scaffold_18 2346512 2349076 + 115612|1547 1744
ACCTTGACCAGC----GGCGAATGCAAATTATTGCA---------TCATTTGCATATCATTGGCCGTCGCACTTTGAGCCGTTTTCGCTTTTTGGGGTCTCTCTTGCCTCACCTCTTACACAAGCACATTCGTTCGGACTAAGCTTAGTTATAAGTGGTTTT-GTGTACAAA-TAAACCTAGATACTC---TTCCAAC
ACTTTGACCCGCCGTTGGATATTGGAAGTAGCCGCAGTACTTTGTCCATTCGTACAGCCATGTAAATTGCTATTT-AGCA--TTTTGCACTTTGAGTTCAC-----CTTCACCTGACACGTA---------GTTGAGCTTAAGCTTATTT-TAAGTGGTTTTTGTGTACAAAATAAAATTAAACACACACTTTTCAAT
>CG6734 12014304 12014692|13070 chr2L 12014594 12020747 scaffold_18 2360476 2366763 + 265939|0 168
AATTTT----TGGTATCACACC--------------------ATTTGTA-----------------------------CAATACTATGATATTATAGTCTAGTTTATTTTTA--------------TTTTCAACGGCACCAAATAT---TATTTTAATGCAACTAACGA
AGTGTTACGATGATATTACTACACAAAAAGACAACTATACTAATTTATATACATATATATACATATATATTTAATTACCAGTCCGGTTATAGTATATAGCAATAGAGTTCTACCCGTACGAGTTCTTATTTAATGGCACCAAATATATATATATTAATTCAACTAAGGA
>Tom70 12035995 12036270|13085 chr2L 12035166 12036190 scaffold_18 2382800 2383824 + 18376|851 1101
CTAATTAAGTTAAT--ATCGACCATACC--TGTTATTTATATATATATATAT-----AAAGCTTGTTTACGT--TTATGCTCCTAGCTTTAGCATAGAAA-----------------------------------TTGTCATGTATTATG---GTACATATGTAAACTAGAATCTGTTGCCTAAGGAATCCACTAAGACAAAT-----CCAGTAGCTTATGTTTAAGCGTAAGATTAA-ACTTAAAACAAG
CTAATCAAACAAATCAATCGATAAGCCCGATGTTATATATACATATAAAAATGTGGAAAATCCCGTTTTAGTTATTGTGCACCTAGTTTTAACAATGAAAGTCGACGATAATGAAACTAACATCGTTTAAGTATCCTTTCGTGTATTACGATCATCTATATATAAATAATAG--TATTGCCTAAGT--CCCAACTATGCAAATAGTTAAGATTAGCCTAGATTTAAA-GCAATATAAACATTTGTAATTAA
>Tom70 12035995 12036270|13086 chr2L 12036269 12038501 scaffold_18 2383939 2386144 + 94437|0 1
AG
AG
>CG6766 12038613 12038826|13087 chr2L 12038676 12043315 scaffold_30 189319 193949 + 113016|0 156
GCTGTCCGTGTATTCTA-GTGAATTCCTATAAATACATTGATTGTAATATTACAATGCATTTGTATTTCAATTTGTAA-AGTGGATGAAACCGATTTTAAAATTTAAGAACTCTGTTTCGGTCTGATAGAA----TGTAATATAGAGATCTAAAATA
A------GTTTGTTGTACAAGCATACTTGAAAATATATTTAATGCGGGCTTTTATGTAAATTACTTTTTACTCAACAAGAATGTATGAAG-----TTTAAAATTAATAGTCTGCGTTTCGTGTGAATTGAAAATTTGCAGCATAGACATACACCATA
>CG6785 12041049 12041108|13087 chr2L 12038676 12043315 scaffold_30 189319 193949 + 113016|2482 2541
GGAACTGACTACCATATGCGATATTTGTTAAGGAAAATATAATTATGTTGAAGATAAACT
GAAA---ACTACTTT------TACATATTTATGAAAATAAAAT-ACGTTCAAAA------
>CG6770 12045346 12045765|13089 chr2L 12044876 12045624 scaffold_18 2386306 2387058 + 6190|552 832
GGAAGGAAAGAAAGAAAAACAAAAGCCAGCTGGAAATACACATTGCATTTGTATTGTGCATTGGCTTTTCATGCGGCGCTAAACTTTGTGAACAT-TATAATAATTTTATTTCGCTTATAATTTCACAAACACAAAAAAAGAAAGGCACATACTACTCTTAGCTTCTAATATATTCCTAAACTAATTCAGACTTGCAAGTTTTAGTTGCTAAGCCTTAGAGCGTTTCAAATAATGAAGTTTGACTTAGGTAATACATAT-AAAATAAAGAGAAAACCAAAA
GGAAGAAGAAGAAGGAGAGCAAAAGCT-GCTTCGGCGGCAGCTGGCATTGTTGTTG----TCGGCTGTCGCTGGAAAAGCACACTGGAATTACGTATTGAATAGTTCTAGTTTAA--ACAATTTCCTAAATTTAATA---------CATATACT-------------------------------TACAGACTTATAA-TTTTAG-TGTTAAG-CTTAGTGCGTTTCAAATTATGAAGTTTGCTTTAGCTATAACTTATGAAAATAAAAACAAAAGAAAAA
>CG6770 12045346 12045765|13090 chr2L 12045625 12046070 scaffold_30 195781 196197 + 11697|0 142
TGCAGGGCATCGACGGAGGCGGTGGAACAGGAGAGAAAGAAGTAACGGG--GCCGCGCTGAAAGGAGAAAAGAAATCTTCGAATTTAAAAGGAAAGCAAAAGCAAAGGAGAGAAGAAAAAGAAGAACAAGCAGCAGTTTTGCT
T-------------------TGTTTGCCTTACGATAAACAAGTAAAAGGAAACCGTATCGAA---------------TTTTGATTGCAACATAAAATAATCATGAAAGTGAAAGGCAAAAGAGGGAGAA-----AGTTATGCT
>CG6792 12046854 12047395|13092 chr2L 12046389 12046962 scaffold_18 2388116 2388765 + 3797|586 696
ACCTTATCAACGCCAGAAGGCTATGTATATATGTATGTACGTAACATTTGTTTATATAAAATCCATTAAACCAAAA--CAAACTGAAAGCTTTTCGCTATTCAGAAATAAA
ATCTTATCACCGGCA-AATTCGATTTGTA-------------AACAATTGTATTTATATAAACAAATGGGCAAACAATTAAACTAAAAGCTTTTTTCTA----AATTTAAA
>JhI-21 12051748 12052229|13094 chr2L 12049935 12052509 scaffold_30 203004 205625 + 66267|1903 2432
-CCTACATATATGTGTGTACCACAACCGTAGAATTTATGCATTTAGTTAAAAAAAA-ACACTCGTAATTGATATTCGAAAAACGTGAAACTGAAAACTTGTTAAATTTGAAACCGTTTTAAGTGCCGTTTGTATGATATTTT------------AGCATTGCTCATCACCAAAATTGGCGTCGATTA-----------GAATTTAGTTTTTATCGTATGTACGTATTTATTTTTTTTTTAGCGATCCCCTCAGTTAACAGGTTT---TTGCAAAACCCCCGCCTTTTTGGCCCACTTCCCACAAAAGTTTAC---------TTTTTATGTCTATGGTTAGGTGCAACAATCCGAATTCCTTTGTTAAAACAATCAGGAAATAAGTGAATGCGCTTATATGGGAACAA----ACTACGAATATGTAACATGTTTAGGGAAGCTACACAGCTAGCA-GTACAATAAGGAGCATATTGATGTTTAAACATAACCGCTTAGCA-------AATAAATGTATTATTGCAAATTCG
CCCCAACTACACCACTTTCCCACATCCATG----CTATGCATTTTACCACACAAAGCAGATATTTTATGCATAACTCCAGCCAAGGCACTTCAAAACACGCCAAACAT-------------------TTTGTATGATATTTTCGCATAGACGTTAGCATTCCTCA-AATCCAAATAGGAAAAGCTTATGCTAGCTATAGTTTTTAGTTTTTGTATTATTTTTGTACTAATTCAAGTGTTGGCA------TTAGCTAAAGCTCTTGATTTGCTAAGCATCCACAGTTATTGGGAATTTCTCACACA-GTTTATATATACAGATTTATATATATTTATATATATATATATATACGTATGTACTTGCCTCAGTTGTGACACTTTTAGGGAAAACTAATCTATAAGCAAAACTTTAGTTCTTAAGTATAAAATATTTATC-AAGTTGAACTCCAAACATATACAAAAT------------TTGTAAAACATGGCTTATTCGAATGGAAGTAATAAATGTTAT-TCGTGTATGTA
>prd 12082997 12083313|13120 chr2L 12082822 12083703 scaffold_30 236074 236985 + 17723|213 548
AATCAAAGGGACACGGATCCACCACCTA--------CTCCTCCAGGAGCAGGAGCAGGTGT-----CACCAGATCCA------TGGTACAAGTCGCCAAAGATGTACATACCCATAGAGCAGGGGACGAAAATATAAATAACATTTTATTTGTGGTGGAGCAGTACAGACATTTTCCGTTTGGGAAAACCGCTGACAGACTCGCTCCTAAACAATAAACATATGTATTAGTTCCAATTCGTAGATGTAAGCCTAGAAAATAGTACCGACTTAGGATTAGAGTTTAAGATGATTAGCCTAAGTAGCAAGTGCTCTTAAATAAAAAAATATATCTATG
GAGGAGTGGGAGGGGGAGCGCAAACTGAAGCTGGAGCTGGAGCGGAAGCGGGAGCAGGTGTTGAGCCACCATCTCTAACATTTTCACTGATGTCGCCAAAGATTCATGTAC--------------ACTAGCATATACA--------TATTCATCGTGGAGTCGCCGCCACAATTC-----------AATCTCTAA-GCATTTACCAATTACCTATTTCTCTAGGCATAAGTTGCGAGTTCT-----TAAGTTTCGAAAAGTAAATATATGGTATATTAATTTATAAAATAATT------------GAGCGTCTTTTAAT---------------TG
>CG6712 12095169 12095235|13133 chr2L 12094764 12099992 scaffold_6 1614966 1620327 + 221670|441 515
GTGTATTTCGAGGCATTGTATTTAGGTATAGAACTACTTAATA--------AACCAACAGTTAATACGAAAATAA
------TTTAAGACTTTTGCTTTCGATTTGAAATATGTTAATATTTTGTGTTACGTAGAGAACATAAATAAACGA
>Patsas 12100762 12101395|13134 chr2L 12100039 12104623 scaffold_6 1620362 1624869 + 167267|755 1432
CTACAAGCGTTATCCTTACTTGCGGGACAAACGCGGACGATATCAGAATCCCTTCTCGCGTGGTCCCATCCTGAATTTACTCGAATTCTTTGTCTGCCTGCCGGACCGGGGCGATGACAACGATCTCCTGCTGGAGGATAACATTTGATTAAGGATCTAGGATCGAGCCCCTGCTCGCCGGCGCAAGCTGCCCGTGCGTGGATAATGTTGCGAGGAGGCAGCCAGAGACCCACTCGGGTAGGCTGCCAG--TTTGGTTTTGCTCCGCAGGCTTACTGCTT--ACTCGAATGCTTTAAAGTTCGAACCAAAGG----TCGTCAA---GTGCGTGTTTTATCATTTACAATTGCAATCAACATATCCTTGCGGAAGGACAAATCGATAG---CAAATTCCAAG-------TGCAATTCAGAG-------CATCAATAAATTACA--TTGCTAAGATTCCATTATTGTTAACGGCTCCAAATCAATTCC-TTCCGCAATGGTGTTCAAAGCATCGGCCAGCCGTGCTTTTTGCTTTTTTTAACTAACTAATTACCTTTTAGGCTTGGATAAGAATACGCTTCTCTTGTTAG------TTTTTGTACAAAATTGTTATGTATAAAATGTGTTATTTAATG-ATCTCTA--TATATTATATACCTATTATAATCA----TAAA
CTACAAGCGTTATCCATATTTGCGGGATAAGCGCGGACGCTATCAGAATCCATTCTCGCGCGGTCCGATTTTGAATCTGCTGGAGTTCTTTGTTTGCCTGCCGGACCGAAGCGATGACAACGATCTGCTCTTAGAGGATAACATTTGATTAAGAAGCTAGGAGCGCGCTCATGCTCGCCGGCGCAAGGTGCCCGTGCGTGGATAATA--GCGA---------CAGTCACCGCTTCAAGGAGGCGGCTGTGCTTTGATTTTGCTC--CAGGCTTTGTGCTTTAACTCGG----CTTAGGCTCCATGGCGAAGGGTTTTTATCAATCGGTAAGCGGAATAGAAGTTGTCCTTGCAA--AAGAATTTGTTTTGGAATGGTTAAT-GATAGGCTTAAGCTTCAAGAAATTATTGTAATTAAAAAACTTTACCGTGCAGGAATTAGAACTTGATAAAGTTCCAGTAAATTATAGATCTCTCGATAAATTATGCTCTGCAAGGCTATT-AAAGCTTCGGTGCGCTTATTTTTATCCTATTATAAGACA----------------GCATAAATAATAATACGCTACTCTTGTTAATTTTACTTTTTGTACAAAATGGTTATGTATAAAACGTTGTATTTAATGAATCTCTAATAATATTATATACTTAATATAATTAACTTTTAA
>Rab6 12107280 12108172|13135 chr2L 12104624 12107790 scaffold_6 1625053 1628249 + 148040|2759 3336
CGATACCCCCTAAACCCTCTA-----AACGAAAAAAAACCCAAGACCATGTACTTATGTCAGGCCAGGCGGTCCCA----------GGATCCTCCGACATTCCAGCTCTCGGCATCTCCAGCAGTCGTAGATACCACGCAGCCAGTCTGTGTTCAA------------TGATTC---------------------CACCAGCCAGGCATTTTGTTTCCAATTTTA-GCCCCCGTTCTGTTCTGTTTGCGGCTTTTGTTTCGCCAGTTTTGGTTAGGATTTCGGTTTTTTTTTTAGCACAGCGAACGCGACTGCTAACTGGAACTGTGGATGGCATAGGACTTGGCCACGTGCATCTTATGAATAAATATACACAAAT------ATAAA-----ATATGTATTTTTATGACTAAAACTGAAACAGATAAGCAGAGCACGAGCAGAGCAAACACTTAACAATAT------TATTAACGATTTTT-GCTTCGATTAGCGAGAGAACTTTGTGCATTTTTTACGCGAAAAGCAAAAGCTTACAAAATTGATAATTGAATAAAAACATAAACTATTGATGCAA
CGAACTCTCCCAAATCTTGTACTTACAACAAAAGAAAA---GAGACCAAACCTTGAGCACACGCAAGAACATTCCACATTGTGTACTGGTTGCCCCATTTTCCCCCCCCCGACAAC------------AGATACCACTGAGCCAGCATGTGTTCAAGCCCCCAGAGCATAACCCAGAAAATGAGATCATATTAGGCACTGGCAGACCGATGTGGTTCCATTTATATGACTAAGCCCCGTTTTGTTTGCGGCTTTTGTTT-GTTATTTT-------ATTTTTGGTTGTATTCT-------GTGGAAGGCACGGC-AGCTGCAGTTG--GTTGGCGCAGAACTTGGC-------ATCTTATGAGTAAATATATATATATGAATTTATAAATATATATATGTATTTTTATG-------------------------------GCAGTGTAAACAATTAACAATTTAAACAACATTAACAATTTTTTGCTTCGACTAGCGAGAGAACTTTGTGCATTTTTTACGCAACAAGCAAAAGCTTACAAAATTGAAATACGAA------------------ACGCAA
>Rab6 12107280 12108172|13136 chr2L 12107912 12110467 scaffold_6 1628671 1631305 + 84982|0 354
AACCGG------------------TTGAGC-------------------------CGACGATCCAACCATCCTCTCCCCCTTTTTCAACAGCAGGAGCAGATGCAGATGCAGGAGATCGGCCAGCAGCACTGGTGTACACAGGTGTCAGGTGTATGT-----ACTGGC------CGGATCTGCGGCGGA-----------TTCCTCAACAT-CTATACACACATACACAC---TTTACGTTTAAGTTTATTTAT--AAAGTAAC---------------------AAATGATAGCAAAG-GCAAATAGACTAAACAACAA-TTAACGAAATCGGCTAACTAATTACTGTTAATTG
AACTGGGCACTTACCCAATTACCCCTCAGCTCCCTCCCAACCACTACCACTACCACCACTAGCCTACTATCCGCACAACCTTCGCTGCAACCTCGAAAAGATTCACACATTGACACACACGCTGGCGCGACGGGGTTTATAA----CAGGTGTATGTGGGCAACAGGCTAAAGATGAACATGCAACAGAAAACAGAAACCAGGCTAAACATGAGATGCAGACATACACACAATTTTATGTTTAAGTTTATTTATAAAAAATAACTAAAAACAAGAGTATAAAACAAAATCATAGCAAAACATAAATAGACTAAAAACTAATTTAACGCAATCGGCTAACTATGTAC-GTTAAATG
>CG6583 12171181 12171697|13204 chr2L 12170568 12171265 scaffold_2 5309402 5310153 - 8665|691 777
TATCGAAAAACCAGTAAATTGTACACACAGAATATGAAAATATATACTATATTAAGAGTATTAAACAATTCAATTTTCATT--TCGA
TCTCGCAAAAC--ATATTTTGTGCATTTCACAACTCGAAATATATAATA-GTTCATATCGTAGGACAA----ATTTACACTAATCGA
>CG6583 12171181 12171697|13205 chr2L 12171266 12171472 scaffold_42 607490 607674 - 609|0 207
ACTAGCTAAAATATTTAAATGAAAAGTAACGTTAAACAATTGTAAATTTCCTATGTCGCTTGTACTTTTTATATAGTTAACTTA-ATGAACATGTTTTCAAAATGATTTTACTACATTTGATTTTTAAAAAATGACCATTCCGAAAATGCTTACGTTTGACATATTTATTACTAGTATTTACCTGCCATATCCGAATAACCACTACCA
ACTGGCATAGATTTTCTAACAATATCTGACATTTGGCAGTGATGCATTTCC-----------TACTGTAGAAATAACTAACTCACATGTACAAGTTTTTTACATTTATTT------TTGTAATTCTACAAATACATCAACATGAAATCGACTTCACATTAAATGGCAAGTACGGATACAAATCTATTTTATTTGA------GATACTT
>CG6583 12171181 12171697|13206 chr2L 12171473 12171937 scaffold_2 5310154 5310615 - 10909|0 241
TAGGAAAACCAGGCTTATCCTCACCACAAACGAAACACGCAATAAGTGCCTTTTCGCCACTCCACATG-ATATCTAAGCTAGGATTGACTT---------TTGATATCAAAA-------ACACATTCCGTCCACCTTTTTCCTGCCTATAATTAAGTCGAAAAGTTGAAAACATTTTAATCGTATAGGTACATTAGTTATCTACAATATCCAAACAAGAGGCAGGTAAATTTACAGACCAAA
TAGAAAACTTGGGGGAATCGCATGCCCA---GCAGCATTAAAGAAGTGCCTTT---CCAAGTCGGATGTACAGCTCAG--AGGAAACACTTAGTTTCTAGTTGAATTTAAAACTGTTGTCCACATTCCGTCCACACTT--------TGTATTTAATTTTAAGAGCCACAATAGCTGTACACAT-TCCGTCCACATTTTGTATTTAATTTTAAGA------GCGACAAAAGTTGTACACTGAA
>CG6579 12175448 12175564|13210 chr2L 12174993 12175776 scaffold_6 2949703 2950506 + 9628|518 644
TGCCGCACCAAATCCGGTCCAGAAATGCAT--TAAATAAGTGTGAAAAACATACCTGTACAAAGGAGAAATGT-AAATGTTAACTATAATA----TTGATCAAAATAAA---GTAAATCAAACTAAA
-GCCGC----------TTCGACAAATTCATAATTCATACTTATAATCGA-ATTCATGTACAAAT----AATGTGAAATGTTATGCATATTGGTTTTTAATAAAAATAAACTTGTAGAATTTTGGAAA
>CG31764 12403262 12403580|13510 chr2L 12402756 12403347 scaffold_41 113070 113665 + -46|557 644
GTCT-TCGATAATTGGCTTAATTTATAATGAAGTGCAATAAAATATATGCGATGTCTTTGATAAAACTGACTAT-TATAGAAATGAAC
GTTTGCCTGTAATTGGCCAATTGTGTCGTG----GCAATTCGACATGGAAAATGTTTTC-------CTGACTGCATATAAAATTAGTC
>CG31764 12403262 12403580|13511 chr2L 12403348 12404786 scaffold_6 3255310 3257202 + 8496|0 295
GGTTTCTAAGTCTCTC--CCAC------------TAGTCTAGGCATTT----------TCTTTTAGTCTT---------AACTCAATAGCTTGTAAACAT---------AAAACGAGGATATCTCTGAGAGATCCAAAGAAAT-------------------CGGCGCTCATTTCATCCGTAATTTATCCTATTTATTTTCACAGACAACGAGTATT--ATGTATGCAAGGTGACATTGAAAATTATTTATTGTTAAAATAAAAGAAATCAAAAATAAGTGTATTAATATAAATAA
AG----TGAGCCCCGCGGCCACAACATACGTATATAGTCTAGGGTCTTTAATCTTAAGTCTTTTAGTACTTTAAGCAGCATTTTCATAGCTTGAATATGCAACTCTTTAAAAATCGACATGCCTTAAGAAAACATCAAGAAATACCTTAAGAGAGTTGCCAGAGTCGCGCAT----CCATTAAATTATTCTCACTGAGCTCAGCAAGTACGAGTATTAAATGCATTCGATGTG-CATGCTAACATATTTATTGATCAAAAAAATATATATATATACACATATATAAATACCAAAAA
>CG31764 12406989 12407178|13515 chr2L 12406581 12407742 scaffold_6 3260508 3261898 + 25915|541 873
AC-TTATTTAC--------------------GACAAAGAAAAAACATATATCCTTTGAAAG-ACATTTAACCTGGAAATGCTTGGCAAGCGCTCTACTAACCAATAAAAAAAAAAA---------------------------------------------------------AACGAATTGTATATTGAGATCTTTCTATA--ACTTGTAATATACCTATATACAT-------------------------------------------------------ATTTCTATTCT--TTTTTTAAATAAAGTTTTCCATAAAACTAAGCA-----
AAGCTTTTTACAGCATTTCAAAGCAAACTTTGAAAAAAAAAAAACAAAAAAAAGATAAAAGCGCATCTAACCAGGAAATGATTGCAAAATGCCTTGCCAATAAAAACAAAAAAAAATAAATAAATAAAATAAAAAATAATAATAAAATAAACGATGCTGCGTAGAGCTCTACTAACCGACTATATACTACACTATATACATACTATATATACTATATATATATATATAAAGAACATGTATATTGAGCCGACTATGTAAACTTGTAATATATATTAAAAAACAATTTCTAATATAATTTTTCAAATAAAGTTTTGCATTAAACTAAAAATAATT
>CG5446 12426942 12427225|13542 chr2L 12424845 12427840 scaffold_6 3288050 3291332 + 70130|2395 2738
GATCCGTAGCGCTGGCACGGCCACGCCCATTCGGAAAGTGCAT--CCCAATACCATTAGATACATACATCGAACAC---------------CTGGCACCCAGTCACCCGTATCAA---------------------GTTT---ACAATTCCAGGTTCTCACATTCATTTAATCTCCTCCGCACCCAGCTGCTCCCCAA----GAAATGAAGAAAAGAACACA---TTTGCTCAT--CCATTTATTGCTTAGTTTTAAGTTTCGCCCGGTCGGGGCACATCATAATTTAAGTAAAGT------AATTCTTTTGT----GAGCAATGGCCAATAATTTTGAATTAT
TA-----AGTGCCAGT---GCCACGCCCATAATCAAGGCACATATCGCATTCACATAAAGCATATACATCGAACATACATACGCACGCACACGCACACACACTCACTCACATTCATGCACACACACACACAGATACATTTGTAACAATTCCAGCAT-TCACATCCCGTG-----CACCCACATTTAATTGCTCTCAAACTGTAAAACACAAAAATCAAACCAAATTTTGCTCATTTCGTTTTTTTGCATAGTTTTAAGTT-------GTCAAAAT------TAAGTTAAGTACATTTTTGAAAGTTTTGTTGTTTTCGAGGCAAGGCAAACAATTTCGCAACAT
>CG5435 12429827 12430071|13543 chr2L 12428155 12430272 scaffold_23 1128938 1131093 + 82403|1708 1987
TTCCACAAATCTGTGTTTGCTTTCCCAG-AAAGAA-------TACCATTTTGCGTTTTGG------GTTTTACAAACATTATTGGAAATA---------AATTTGGGACACAGAAGCAGTC---------GTCACGCAGTCGCCTCCAGCTTGGGCTGCTTGGGCAGGTGCTCCACATCTCCATCATACTCATCCACTGCTTGTGGAGTGTCCTGTTGGTCATCCTCCGCCTGTT---GCTCCGACGCTTTGTGACGCTGTTTCTTGTTCTGGTTACGAT
TTTCACA------TGCCTCCTTTTTCAGTAGAGAAGTGTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTGGTGGTTTGTTTTACAGA-ATTGTTGGAAAGACGCAATAAAAATT---GACAGAGCAACAGAACGAAAGCGGATCACGCAAGCGGCGACAGCTTGGGCTGCTTGGCCGGGAGCAGCTGCTGCTGCTGCTGCTCCTCCGTCTCCTG---------CTCCGGCTCCTCCTGCGCCTGCTCCTGCTGTGCCGTTTTCTGACGTTGCTTTTTGTTCTGGTTACGAT
>SC35 12431856 12432204|13546 chr2L 12432117 12432802 scaffold_23 1134187 1134881 + 19486|0 91
ATATGACTCGCTGACTAGGG---CCAATGCTGTATCCTGTTCCGGATCTATGGCTCCATCTGT-GTCATGCTGTACCCGAACAGCAGGTATA
ATTTGACTCGTGGACAAGGGTTTCCGGGCAGGTGCCCAACTGGGGCTACCTGAAAACACTTCTCATGGTGGTGTACAGAACCGGCAGGAATA
>SC35 12432309 12432344|13546 chr2L 12432117 12432802 scaffold_23 1134187 1134881 + 19486|196 244
ATATCGACGTC---------ACGTTCCAT-TTAGTGGGAGTGCG---AG
AGA-CGCCGGCTCGCTTCAGACGTTCCATACTCGTGGGGGTGCGATAAG
>Oatp33Ea 12441400 12441788|13554 chr2L 12441392 12442711 scaffold_23 1144884 1146187 + 30050|8 438
AATCAACAAAAAAAAGAAAGTGCAACCCATCCGTGATACTCAATTATAAGGAGTAGATTCATATGAAACACGCCAGTTCCGAGTATTTCATAACAATAATTCAAAGCACATTCCTAGAGTTAGTTTTTGAAATCAAAATAGAGAAAGATTGGGC--AAAGCCTGTACTCCAACGCCATATGTACAAATCTTCCGCTTTTCGATAGGAATT-----TAGCTATTGAACTCGC-GCTGTCAAATGTCTTCTTTCAGTGTACAATTGTTAA-------TTACTTTTACTTTG-TGCTAAGATCAA-TTAAATA-TACCATGCTTA----GTTTAACAACAAAAATGAAAAGAATTTATGTGTACGTATGTATAAAAAA----AAATG--TTTCAAATAAAAATGTATGTTT----------ATTAAAA----TA
TGCTAACCG------------GCTTCCGATGCAATATACTCAAAAATCTGGTGCCAAT---CATGAA-------------GAGTGT----------------------------------------------TCAGGATATGGTGGACTTCAGCTGTGGGCCCG-ATTCCAAAGCCATTTGTACAAACATTTCGCT---------GAATTACGGCTAACTATGGATGCGACAATTGTCATGTGCGTCGTTTAAGTT-----TTGTTAATACATTTTTATCTGTAATTTGTTAATAAGATGAATTTATATGTTATAATGTTTAAATCGTATGCCAATAAAA---AAATAAGCCAATAAATAAATAACTAAAAAGAATTCGAAACGATTTTCGAGTTACCTGACTTGTTTTAAGGGCTGCATTAAAGAACCTG
>bun 12456577 12457755|13567 chr2L 12455487 12457508 scaffold_23 1166212 1168467 + 21465|1218 2419
TAGGTAGACTAGCCTGCTGTTAA------------GAATTGTTA-----TGTTGTTGCTGGCTGTTAAT-CTGCTGCAGCCGCCGTTTTGTTAATTTCTCGATTGTGATATTTGTTTAACACACATACAGACCACCACACACACACACACTCATACGCATTTACACACACATCCATACGAAATACACACACAAACACACAGATAGACTGCACGCTAACAGC--GGCTGCGGCTGGC-----GCTGTTAACGTCCGCTGTTAACTCGAAGCGAGTATAGGAGTTCTT-TTAAATATCGCGCTGCTGCGCC------------------------------------------------------TCCACATTTTTGTTTAATACCT------TTTATTTTTGTTTACCCGTTTGT----------------TTCCACGTTG-TTAACGCTACG------------AAAATAAAAACATAAGAATCAT---AAACAAACACCCAGAACACCACACCACAAAACCAACTCACCAAAAGCTGGCTGCAAAATAATACTTGA------CGAAAGTAAAATTTTTGGCCAACGGGGAAAAAGAGCAGCAGAAAATGCAAAAATACAAATCGATAAAGTGTACTAGAGTGCCAGGGAAAACACACAGAAAATGAATAGGGACAGAAGGGAAAATAAATGAAAT--AATATGTGATAATTTGCATTGTGCAGTCAGAGACATAAGATGTAAATTGTAA-------------------------------AAAAAAAAAACA-----AAAGCAAACCCG----------AGAAGCAAAGGACAGGAAAGTAGGATTCAAATT--TCCAAACATTCAACATTGATCGATAA--------ATTAAATACAAATACAATTTAATGAAACAA--------------GAAAAGGCCAGCTGCTATTTTTATAATTTACCTTTAATCCTAACTTTTATTGTAAAAATACAAGGGGAAATATTAACT----------ACATCATAAATATGAATATGTTTCAAATT-------------AAACAATGGATAAC------------------------------------AAAAAAAAAAAGTA-------------GTAAATTATAGTAATTCTAGCATATTCTCAAGCTATATTTCAAAG--ATTGTATAGCTATTC
GAAGTGAGTTCTGCTGCTGTTAACGTTGCTGTTGCGCGCTGTTAGCTGCGGCTGTTGCTGTCTGGTAGCACTGCTGCAGCCGCCATTTTGTTAATTTTTCGATTGTGATATTTGTTTAACACACATAC------CTTCACACATACACACTCACACACACACTCACACTCAATCGCAC-----ACAGGCATAGTTAGATGGATAGACTGCGCGTTAACAGCCTGGCTGCGGCTGGCCAACAGCTGTTAGCGAACGCTTT-------AACAGAGTGTTTTTATTATTATTTAACAGTGCGCTGCTGCGCCAATTAACATTCAGGTTCAATATACACAGTGAGAAAAAAAGAAGGCGAAAGAAAATTCATGTTTTTGTTTAATTTCTAAACGATCCTTTTTTTTTTTCCTTTTTGTTGTTCATTGAATTTCGTTTCATGTTATTTAACGCTCGAAAGAAGTTGTGCAAAACAAAATCATAAATATAATTGAAAACAAAAAC-----AAAACGCAAAGCAAAAGAAAATT----AAAGTTGGCTTCAAAA-AATACTTAAATATTGTAAAAGTAGAATTTGAGCCGCGCAATGTGAATGGGTAGAGAAAAGCAGAGAAAGATAGCGAGATAGAG-------------------------ATAGAGAAAGAG-AGAGAGGGAGAGGAAAATTAAGAAAACAAAATATGTGATAATTTGCATTGTGCATTGTAAATTGTAAAAAGCAAGCAAGAAAATATCCGAAGCAAGCGCTAAACAAACAAACAAAAAAAAAATACACTTAAAGAAAGTCCGCAGCAGCAGCAGCAGCAGAGATCAACAAAATTGTATTCACTTTAAACTAAACAT---ATATAAATTGATAACAACACGGATTATAGATCTATATATATATATATAAAAATATTATGTCTATGTAAAACAGCAAGCTGCTATTTTTATAATT----TTTAA---------TTATTTAACTAAATCAAAGCAAATTATTAACTTACAAACAAAAAATCGTAAATGTG--CATGTTTCAAATTTATTATAAACAAAAAAAAAAAAATAACACAAAAACAAAAATACACAAGAATATTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACACAACACACGTAAGGAAAATTGTTGTAGTTATA------TATTAGAACATTTTTCAAATTCATTTCAAAGTAATTC
>bun 12456577 12457755|13568 chr2L 12457535 12458260 scaffold_23 1168509 1169288 + 17158|0 259
ACAG-TTGCTGCTGTGGCCCGAACACACAGTGTTTGTTTTTTTTAAGGCGCCCACGCACCGTGGTGTGTGTGGGGGGAAATGAACGTTTTTAAGAATGAAAACCGTAATGTTAACTCAGCCGCAG------------------------TCTCTTTCTTAGTCGGAGGAGGCGGGGCCGAGGAG----AGCAGCG----AAAGT--ATTAGGCCAATAACAACAAGAACAGCAATAGCAGCGCAGCGG----CAGGCAGA
GCTGTTTGTTAGTTTGTTTTAATCGTA--------ATTTTATTAATGTGGCCCATTGTCCAGGG-----GCACTGGAATGTCGAAATAATTGAAAATGTCAACTCTAA----AACTTTGTCGCCGCGACAGAGTAAAGCGTTAGCAGCCCCCCGTTCCCCCTTCCAGTAAACATGCCCCAGCAACAGCAGCAGCGCAGCAACGTTAACAAAGCAGACAACAGCAACAACAACAAAAGTATTACAGAAAAGCTCAAGCAGA
>CG5525 12690325 12690537|13870 chr2L 12690257 12692234 scaffold_23 1556347 1558302 + 100968|78 341
GCAG----------TGTAATCCGCATTCTTCGGTCGTCTGCCTC----TGATCAAGATCAA-------------------TCTT-----CACGCAAATTCATCTAAAGTCTCACATCTTATGTCCATTATGCGGTTG--------CGCATTAAATTTTGAATAAAATTCACATATACACTACGCCTCACCAGCTTAACATGTATTTAA-----AAAATAAAACTATATGATTAAATACTTCGCTAACACAACCTACATGAAAAC
ACATGTTCGCCTACTGTGCTGCAAGATCTTTACTTATTTGCATTTTCATAAGCCACATCAAAAAAAAAAAAAAAAAGAACTCCTTAACACACACAAACACACACACACTCGCACACACTCATAACGTATTGCGGCTGCTTTGTGCCGCGTCCAA--TTGAATTAAATTCACCT-TATAATACAACACACAAG-GTAATAACTATTTAACGTTTAATAAAAAACTATGTATTT---CGCTTTGTATTAACAAGCAAC-TGAATAT
>CG5780 12693872 12693986|13873 chr2L 12693958 12695338 scaffold_23 1558938 1560378 + 23909|0 28
TATGATTTAGCCCACAATATCTGTGCAAT
TATGATTAGGCAGACAAT-----TGTAAT
>CG5781 12696426 12696470|13876 chr2L 12696447 12699191 scaffold_23 1561977 1564645 + 84581|0 23
AAATGAGATTGTAAATTAAATTTG
CGATACATTTTGAAATATTGTTTG
>CG17036 12699061 12699151|13876 chr2L 12696447 12699191 scaffold_23 1561977 1564645 + 84581|2688 2778
GATAATATAGGATTTTACACAAATCAAAACAGGACGAAATGTGCAAGTTTGTAAATACAGGACTTCTTATTTACTATCTTATTTATTCAAA
AAGTATCGATACTTTAAGATAATTTGTAATCTCATGTCAAGTTTAATTATCTAA-------------TAAGTATTGATTTAATTGTAAGTA
>CG5776 12701426 12701889|13879 chr2L 12701388 12701765 scaffold_4 299937 300338 - -3430|38 425
TGTTATTAGCTCTCCA---AAATCTGTTCACTCGATCAGCCTTCAAATCGGAGTTATGTATGTA--------GTTATGTAAGTTATGTAAAGTAGAACCGATTAGAGGGTCGACTT--TGGTGTTTAGACA-------------------GTTCTGAAATTCATATTTAGTGCCTGCAGATTAGACTACAAAGATAAGATGGCTATAGCAGAACTATCGGTGATAACTTGAATGCTCTATTTTTAACCTCTAAATTCAAAGAGTATCATTCTCTCGATTGTGAATATCA-AGAGCAAACGTTGAGCTTTCAACAAATTTCCAATTAATGCGTCACTTAATTGTC---------------AATAAATTGATGGGGAACAATCCAAGAAT
TCTTGCTAGCTTTTCATCTGTCTTTGTTCATGTGTATAATGCTGCATTTTGTTTTGTATATGTGCAGCCAACATGGAGCAGACGTTGGACGACAGTGCGGCCTTGCTGGATGATATGCTGGTGGATAGGCATGCGCCAATTGTGCGTCCCATTCCGGGTCCCTCGCTGCGTGCC-ATTGACTGGTCT----GGCTCGGATTGCGACA-------TGTCCTGGATA---TGCCTGCTA-ATATTTATACTCGCACTCT-----GTGTTGTTATACCGCTCGTCTATGTCATTTATCTGGCGGAGCATCCGCATCACAATCACACCTCATAGCTCAAGTGATCATCATTCCAAGTGTGCTAATTGAGATGATAGGCGAAAAAACACAACT
>CG5776 12701426 12701889|13880 chr2L 12701886 12704584 scaffold_23 648173 650930 - 96308|0 3
ATTA
AGTA
>CG5787 12708785 12709252|13886 chr2L 12708715 12708788 scaffold_55 5746 5809 - 85|70 73
GAAA
GGAG
>CG5792 12713275 12713339|13888 chr2L 12712610 12714475 scaffold_23 1578345 1580146 + 28741|712 780
-AAGGCACATAAATGAATAATGCCCGCTGTGATAATGTTAATAAAGGCGCAAAT----TTTACAATTTA
TAAAAAAAAAAAATAAAGA------GCAATGATAA--TCAAATGAAGTATAAATCATATTTTAAATTGT
>kek1 12818930 12818961|14009 chr2L 12818046 12821697 scaffold_2 3556510 3560560 - 130121|1176 1218
ACTTAACACAACTAAACA-AGAGATATAA----------AAAT
CACACACACACACACACACAGACACACAATACCCAGCAGAACT
>CG12404 12993748 12994074|14222 chr2L 12993738 12994322 scaffold_2 3740752 3741429 - 20579|10 433
-GCTACGAG--ATCCCTGC---TGCTAT---------TCCACCACCAC--------------------------------------------CACCACTACGCCC---TCTGTTGTTGTGT--------------------------TTGCCTGGTTTTAATTGTCCTGCAAACA--CACACTCTAGCAGCACAATAAATACACACACAGATGTCAGGAGGAGAAGCAACAAGAGGAGCCAAACCCGAACCACATATGGATATGTATAT-------TTTTAAGAAAATAAGCGCCGATTGCGAATTTGTTTTACACATTCTACTTTTTTTTCGCTGGCCAAGCTGCGCGTTTACTCAATACTTTTGTTGTCA-GCCAATGTAATAAATTTGATTGCGAATAAAAAAATGGTTAACAAATTGAAA
CGCCCCGAGGCATACCCACGTTTGCTATAACCGTGTGTCTACGGCTGTCTGTGTGTGCGTGTGTGTGTGTGTTCGTGTTTCTCTATATGTGACTCGACTGCGTCTATGTCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATGTTGCAATATTGTGGCATGGTTTTAATTGTCCTGCCCACAGCCACACACTCACTTACAAACACACACATGCACA------------------------------CAAAACATACGTACACATGGCTATAGACATGATAATATTTTAAGAAAATAAGCGCCGATTGCAGATTTGTTTTTCATGTGC----TTTTCATCTCTCTTCATGC---------ACTCGTTTTTTTTTTTATCATGGCCTCGTAATAAATTTGATTG-----AGAAAAAATGTTAACAAATTGTAA
>Vha68-1 13000765 13001411|14229 chr2L 13000127 13003345 scaffold_2 3749166 3752521 - 151879|716 1498
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ACGCCCATAACTTCAGCTTGAACATAAACAAGGCAAACCAATACCAAAAAGGAAAAATACCAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAAATTTACCAAACGAAATAAGCAACCAATGTTAGGTTATTATTCGAATTCCCCCATCAAGCTAGTCATATATACATAATGCGTAATAAGATATTTGAAATCAATTTAATTTTTAAGTT----AAACAGTTTAGAAC------GGTTGCGTCAGGTAGGACTAGAAAGCGTTTCACTCGAGGAACACGAAAGAAACAATGAACAATGTACACGACGAAGATGACAAAGATTTAGGAAAGACGAACAATAATTAGCCGATAGCGCAAAATAAAAACAAAAAAGAACGGATGTTGTCCACTTAGAACCAGCCATATAAATA------ACACATACAT---ATATATATA-AATTATCTATGTTGATATATGTATACCTACATAATTATAATTCACAGCTATTTATTGTTAGTAAAAAAAAAAAAACAAATTCGTAAAGTTATCTAACTGTGTTCTCTACGTAACTGTAACTACAAACTACTAAAAATTTACTTAATGTTTTTTGCCATTGCGTGT-TGCAAGAAGTTTAATATAATACGAAATTAT--AATACTATATC----TATATTATAGACCTTTACA-AACGCAATAATTACTTAGCCCCA------------------ATTGAGGAATAACT----------TGTGTGCGTGTTACAAGTGGAGCTATGCAAATAAAAATGTATTATGAATGTTAC--C
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GTCGCG--CACCCTTTAACCCATACTGCTATACTTAGGACTAGTTTAATGTGCAGTTTTAGTGTCTACCTATCTTCTACATATAAATATAAATATTCTT----------------TGTGC-------------AGGATTTAGTTTATTTGTGGTGCCCCCGATTTTTGGGTGGCCTGCA-----AGTAGCAGTTACCA--TTAATCAC------------CGCTCCCGTTAGGAGTCCTAATAATTTAGATGTTTGAAAAATATTGAAAATTTTCG------------CAAATCTTTCGTTGTTTTTCTACTTGGTTGCG-------------AAAAAAACGACACAAT----------ACCGAGTTGTGCGGGTAATTTGGTGATTTAAAAAATTAAATTTACTTGCAATTGGATTTCCAAATAAAAAATAATGAATTAT
GGTGCCGCCAGATCCAGAACCATAAT-CTACAAACTAACGTAGCTTAATGTGCAGTTTTAGTGTCTACCTATAT-CTCTATACAAATATTATTATAATTAATATATATATGTATATGCGCTTAAACAGCTGCTAGAATTTAGTTCATTTTTTTTATGTTTTTCACTTGGGGTAGTCGCACTCGCAGTCGCAATTCTCAAGTTCATCACATTACAAAAATATTCTTGTTTTCAGATTTCTCAAAACTTATGTATATGTTAAAAATGCAATAATTTTAATTATTAAAGTACATATTGTATATTGCTTAATTGATTGTTTTTGTATAATTTCTTTAAAAAAAAAAACGCGGTTTCTGTATAAATTCACGTTCACAAATACTTCGGTTATTATAATAAATATATAT-TTTGTAATT-----TCAATTTAAAGTGTGGTGATTTTT
>A16 13019570 13019675|14236 chr2L 13019579 13019953 scaffold_2 3769023 3769408 - 15648|0 111
TAGC------------GGTTACTTAGGTATTAGGTTCATAATTAGGTTCCAC---ATAATTGTAACATTTTTGTAAAATGAAGTAAATGATTTTCTTTTGTTGAACAAAAAT
TAACATAAATATATCTATATATATAGCTTTTAGGATTTTAATTAGGTTCCGCGAAGTAATTGTAACATTTTTGTAATATGGAGTAAATGATTTTCTTTTGTTGAACGAAACT
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GCCACATCCAAGGGTCGAACCTTTTATTTAATTTAATCCATAATTT------ATCCAACTAAGCTTATGGTTATT-------------TTTCGATTTAAGTGAGTTTTGGTTTTGTTAATATTTTGTTGTTGCTTATGCTTTTCCATATTTTTTTTTGGGTATGC-GTTAGTGGAGTTGGGGATTCGTTTTAGGCACCTGTTTTGGGATTTCTATTGTCACTAACACACACCCACTTATACACACCTA-------------GTTGGAACATGTTCCTGCACTTTTACGTTTTTTCTAGAACCTAAGGTAATTAAGTAACGA-------TAATTTATAAACAAAAAAGGAATGAAATACCATTATTCGAATACTTTGCAAATGGGATAAGCCGGAATTCTTAATGTAATTACTTGCTAGAACGGTGCAAAATGTAATTTAAACTAATCGTATTGTAACTTATCAAAGAGATAACTATAGAAGGCATTTTAATATAGAACCTATATATATATATTTACCATCGGCTTAATATATTAAATTGGAAAACCAACCCAATCCGAGCAAGATCCAAAAGCGTTTCAAGGAAAT-CAACTTTGTACAGGA--------------------------GAAAAAGAGATAAATTCAAAATTATGTCTTGCTACAAATAATTCGTTTAATTTTTCGAATGGGAACTGTGATTATTGATAATTGTAAAT--GC
GCCACAGCTGCAACGCAAACCTTTCTTTCACTATTGTATTTTACATAGGAGCATATAATTAACTTTATTATTATTATTATCATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTTTGGGGTTGTTAATGTTTTGT--TGTTTTCAATTGGGTATCTAGTTAGTCGAGT------TTTGTTTTAAGCACCAATTATTA---TTTAATTGTTACTAACAAAAAAACAGACACACACACAGACAGAGTTGACACCGTTGGAACATGTTCCTGCACCTTGA-ATCATATTTATAA------GTTGTTTATTAACAAAACTTATTTGTTTATATAGAAAACAAAAAAAAAAAAC----ATATTAGCAATGCGTAAATATGTTAATTATATTTTGTTATGCCTAAAACCT--TAGCGCGGTGCAAAATATAAATATAACTAA--------AAACGAATCAA-------------------------------AACTTAAATAT-------------------------TTAAATCGTACGATCAA--------AAGCATAA-ACAAAAGCGTTTCAAAGAAATCCAAACTTGTGCATGACAAAATCAAAAAAAAAAAAAAAAAACTAAAAACAAGCAAATTCAAAATTA-ATCTTGCTGCAAACAATTTG------TTTTTGAATGGGAACTGTGATTATTGAATATTGTAAATTAAC
>CG9928 13142481 13142544|14386 chr2L 13141889 13142571 scaffold_7 3932357 3933047 - 373|654 722
ATGTTACGATGTTAAAATACTCAATTTAAATAAAAGAATTTTTAAAAGATT-----AAGAAATAAGCAT
ACAT---------AAAAATTGAAATTTATGTAAAAATATTATTAAAAAGTTTCAAGAATAAATCAAAAT
>DnaJ-H 13163291 13163549|14411 chr2L 13163151 13165544 scaffold_2 3937782 3940148 - 54545|170 432
-GCAT----GTGGTTGTGGCTCCTGCAGGCGCGGTATCTCTGCCTCGATTTGTGGCTCATCCTGGGCACTTTCAGCGTAGATGAAGTCTGCTTCCTGGTGCCGCTGTTCGTCCTGATATGCATAGTATTATTTTTCATACAGGAATGTTTGCTGTGAAAAGCGCGTGATCTAAATTCGTAGTGTTATTATTCGAGACTAAAGCTTAGCTGATCTGTCACTAATACATTAGCCACGCTAAATTAACTATTAACTACTTATTTAT
GGCATGGGCGTATCCGTGGCTGTTACAGGCTCGTTATCTCGCCATCGATCTTTGGAACCTTCTGTCAACGCTTGGCGTTGACGAGTTGTGCTTCTTAGTGCCGCTAGTCGTATTACTATGCATAGTATTATTTTTCATACAGGAATGTTTGCTGTGATCAGCGCGTGATCAAACT--ATTGGCTCATTTTT--AGGCTAGTGAATCTCAAATCAAACAGT--TAATTTAGCTTAGCTAAATCAA--AATATAAATGTCCTTAC
>CG16975 13169643 13170451|14415 chr2L 13169603 13170995 scaffold_2 3945371 3946964 - 40497|45 1092
TGCG---------CGGATTTTAGTTTTTTCAAAGC----------------------------------------------------------AAAACGAAAGTTATCACCGATAGAACACACACACACACTTTTATACGTGTACA--------------------------------CTACTGCGTATGCATATATAATATATATATATATATATATAGATATATAGATATTGAAGTATTTTGTTAGCACTGGAAATCGAAACACAAACGTTGCCTAGAATGGA-TCAACCATCCATGATACAA-TTGTATAACTAACTCAAGTCTCACAGCGCGTTATTTTATACCGATTAAAT-------------------TGTAAA---------CCGTAG--ACCTTAGGCGTACGCTCATGTTATATCAGTCAGAGTTCTATATCAACAATTGTATAAAGATGATTGAATTGATGACAGTGACTTTTTTTAAA---TCACGCATATTTTTATA-----------------AAAATAAGAGTAATAACA-----------------ATGCATGCA-------------------------ACACATGTATTCACATGAATATATGGGGAGATTGCATAGCATGGGCTTG-TACAGTGTACATAAAA----TAAGCCGTCGCCG-ATTATATAGGACCCAAGAATATCATATTTTATATAGAAGCAAGCGCA-----------AGCAAATAACCCAGGCAGCATGCCCTCA------ACTTTCAGTCGTAAACGGAGCGATTGGAAGTCGCTCCTAGTCTGTAAG-----ATCCACGAT-TAACTAGCCGCTCTCTCCTTCG------GTTAACTTCGTTCCGGTGTCAC-ACATCTCTGCAAG--GAGGGCATTATTGGTGTAAGGCAA------ACTTTTGAAGAAGGCAACCTTAA--TGATAAAATATGTATTTAGATATCCCTAAGGTACCAGCTAATGTCAAGATACTTTAATAAAACCGAATTCAAAATTGCAAGTATTGAAATAT
TGCGGCATCATGAAGGACATTA-TTATTTCAATGCCAGAAACTAAACTTAAACATAGTTTAACAAAGCCAAGCGTAGTTGTATTTAATTTTTTGAAACAAATGTTATCACCGATGAAACGCACGC------TTCTACACGTGCATATTATGATACATATATAGCATGTATATTATATCCTATTATAGATATATATATACAATATATATATATATATATATATATATATAAATTGAAGTATTTTGTTAGCACTTGAAATCGAAACACATACGTTGCCTATAATGGATTTAAGTATCCAT-ATACAGTTTGTATAACTAACTCAAGTCTCACAGCGCGTTATTTTATATCTACTCTATATATATATACACAAACATATATAAACACGTATCGCCGTAGTAGTCTTTAATGTATGCTCATGT--TATCAGTCAGAGT-------------TTCTATATAGCAAAGTGAATTGGGGTAATTCATTTTTATCATAACTTCACGCATATTTTTATAATTGTAGCAACAAACCGAAAGCATAAGATACAGCATATAAATACATATGTACATACATACACACACACAAAACCTTAAATATATATATACATATATATATTTGGGTATATAATCATATTGTACCGGTTAGGTTTACTAAGGTGTACATAGGACTTGTGTTTCGTTCTCGCATTGCA---GCCCCAAGAA--------TCGATAGCAAAACAATTGTACACTAGACAGTATCCAGAAAATTAGGCAGCATCTCGTGAGCACATGCATCCAGTTTAGAGCAGAGCT------AGTTGCTCTTAGTCCGTAAGCAAACAGGCCCAATACAAATTGCAGCGCTCGTCGTCGTGCTGATTTAATTTTTTTTTTATGTTGTGGAATCCCAGCATATTGCATGAATTAAGTATGTACCATAAATGAGTACTTCTTAAGAAGGTAAACTTAAATTAGAATACTATGTATCTAGATATGCTTAAGATATCAACTAATGTC---------TAATAAAACCGAATTCAAAATTGCAAAAGGTGAA----
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------------------GACTAACATCTATTGTCCTATTCGGCTAGTTATAATCGTAT--ATATTTATATGTATATGTGCCTGCTTT-----CCCAATCA---TCAAACGAACTTACATGTTTTTACTTTAAGCTAAACATATCGTCATCT--TTAATCTAATCGTATAAC--ACACTCTG-ATTTCTCATTAAATCAATTCAAAATTTAGTATCTCAGCAGGCAGAGAGCGCCGACAGACCCGCCATCTGTGATAAGAAA--------CTAAACTA---------GAAAGGAATT-------------TAAAATGATTCTCAAATTTCATGGAATTTGATGTTGTGAATTTAGTTAAAGTACGTAAATTA--AGTATGCGAGTTCTCGACATGAACAGATTCG-TTTGTTTTATAAGTATATATATTGATAAATGTTACCAGGCAAGCTAATTTCAGTATTTATTAAATAAACAAATTTGATCCAAGGCCTAACTCGTTCTTCTAGGAAACTGTGATTTTAAGGGATAGGACGTAAAATACCAACAATTTATCTTGTCGATATTGCCGCAAGTTGTAATTAATCAATTGATCAGAATTTGT-AACTAACTAGATAAG--CGTTCTTTGATGAAGTAGGAA--AGTAGGTTTTTAGGTTTATGAAACTGCACTTA
>CG16974 13184942 13185416|14421 chr2L 13184717 13186975 scaffold_2 3961081 3963423 - 66776|379 917
AGATTTTTTTAAATTAAACATTAGTAACGAAGATATAAACTGTATAGAAGTACGTAAATCAAACACGCATCT---------GCAAATGAAGTTAATGTTAATGGTTACGC----TACAATGGTAGGGCGGACAACAATAATTAAACTTAGAGTTAATTAGCAAAACGCAG-AAATTCAAGTGCTGAACATTAGA------AAATATATATGTATATCGGAACAAGTCATACGATTACACCGACCGATGAGCTGATCAAAAACCAAGCTTAATGAATTTAAAATTGAGATCTATTCACAGCTGGATTCTATCGCTGAGGTATCATC----ACGTCAATAAAACTTGAAAAGAGAGCCCCCCATTTGTGATTTCA--------------------TTACTTAACGAGTTTAAAGCATCAAAACTGTAAAGTGCAAGGCGTATTTTA---AAATGAAACTGACAAATTTTAATTGAACTGT----------ATGAAAATAAAAGCGTATATA-------ACAAATAAACCATAACTTATATC
AGATTTTATTAATTTTTAAATATGTTATTAAAGTA-AAAAAGCACACAAATACAAAAACCCAACAAAAATTGACGCTAAAAACACATTAAACAAATGTTAATGTTTAAAATGTGTAAAATGAAAATGCATCAAACAATAATTACGTATAGAGTTAATTAGTGAAACTTAATGAATTCAAAAACTAAACATTGGATGGATTAAACATAAATGAAAA---AAACAAGTCATACGATT--------------------------------TAAATAATAGTAAAATTTAAA---ACTTAGAATGTGCTCGTGTGGAGAAGGTATCATCAATAATGTCAATAATACTTGAAAAG-----CCCCCATTTGTGATTTCATCAATAACATATGAAGCGATTTATTTATAGAG---AGCGCATTAAATCTACATAGAGTCAGGCGTATTTTAAAGAAATGATAAAAACAAATTTTATTCAAATTCTGAAAAGGCAAATAAAGCAAAAAATATATATATATATATACACACAAATA--AATTTGTGTC
>CG16972 13197092 13197555|14432 chr2L 13197023 13198683 scaffold_7 2213577 2215181 - 36353|74 558
ACCTGTGTCGCGGAACTAGAAATG-TGGAGAGTCTCGGCCTTGAACAAAGTTTTTGTTTTTTTTT----TTCACACAAACCCATGTTTGAATATCACCCAGAATACCCGATCTATAAATGTGCTTTTGGCTGTCTGCCCAAGTATAGTTCAAATATAGGAAACTATAATAAGT-------TGCGTGTTAAGCCCTGT-----AGTCCTAACAATCATTTTAGTCGTAAGTA-AGTCGGAGAGTAGTAGCCTTTATTATGCGCTATTTTGAAATAAGTGTTTTTGTTTCTTTCGTTCTTTTTATTTTTTCTAAAAGAAAAACAAAACTAGCTTAAGCTATCGTAGTTTTAGGCATATGAATTCAACTGTTTGATTTGCTACTATCGACTGAAGTAGTAAATTTGTCATATTTTTAAGATTAATGGAAACACCAAA---ATGGAAAGAAATTAATGTCATTAAAACGGAAATCTATTAAAAATACAA
ATGATGTTAGCGGCTATGGAGGTGATGGCGACATCTGGCTC---ACAAA-TGCCCGTTTCCGTGTAGAGTACATAAAAAATCCAACACCAACAAACAAAAAAATACAAAATTT-TAAATGTAACATTTGC-----AAGTGAATATAGTTT-----TAAGTTATTTTAATGAATCCTTTAATGCTTACCAAAATTTGTTCGTAACTCCTTACCATC----TAATTCTAAATATAACTGTAAATTCACAG--------ATGC----TTTTGAAGT-AGTGTCGATACTAACCTCGTTTAGTTATAGCCTTATAGCCATAAATCTATATGAACGCATACAA----ATTTATATGTATGTAAATACA--------TTTAGCTCCTAACGAAGGGAATTCAATATCAATCGTTGTC----------TGGAAGCCTAGAACATATGAAGCCCAGTTGAT-TTATTA------TATTTTTTTTTTAATTTAG
>CG15482 13210773 13210851|14437 chr2L 13208080 13211121 scaffold_7 2224920 2227910 - 85274|2863 2969
AACTTCCG---------------GTTTTTTTTTTTTTTGGAATTCGCAATATTTTTGGCCATGTATTTAAGTCTA-----------AGATTAAACAAGGAAACA--T
AAGTCGCATTTAGGCTATAAATAATTTTTATTGTTTTT----------ATTTTTTTGGCAATAGTATTAATTATATTTTCTTTAACAAACTAAACATGACAATGATT
>kek4 13212335 13212656|14442 chr2L 13212181 13212445 scaffold_14 1610056 1610325 + 541|172 286
AAACGTTACTAA-TATATAAAAATATTTA-TTTACACAGTTCTAAGTGTTTTAACCCACG--CACTTTAAGTGAAAGGAATGTAATAATAAAGTTTTAAGTGATGCCTTTAAATG
AAATGTCACCAGGCACACGAAAAAATTCAATTTAGACTCATTAGAGTGCTCCTCTCCACGGAAATCTTTAGTAAAAGGCG---------AAAGATTTATTCGACAACTGAAGAGA
>CG9426 13216290 13217158|14448 chr2L 13215722 13216382 scaffold_7 2235059 2235772 - 18272|639 735
AACTGTACCAAAGCAAATTAATACAAACAATCAAA--GATGCGAACTGTATTCATAATAGGTGTATTATCGAAA--TAAATATACGAATTATAAACT
AAATGTACCAAA--AACTAAAAGCAAACATTCAAAAAGAAACAAACTGTATTAATAATAGGTGTATTTACGAAAAATAAACGTACGACTAA--AATC
>CG9426 13216290 13217158|14449 chr2L 13216383 13216620 scaffold_9 4995669 4995903 + -264|0 245
GTCATTAGGGACGTTTCCTTATCTGTATGTTAATTCGACTAATTCCATTCCGACAGTATTCTACTTCT-AATGCTCGAATATTTATACGAATGCAATCTTTTAAAAC----GTATGTATGTATCAGTGATTATTTTTTTA---GAATGTCTGTTATAATTAATTCTGGTTTTTATCCAAATCTAAAGTATCGTAACAAGTTTTTCATTACTTTTAATAAATAGCATACTGATAAGAAAAAGTCCCT
GTTGTTGCACACATTTTTTTACATCAAACTTCTTGCTTTTGACTTACTTTCTTCTTCCTTGTTTTTCTCGACCCTCAAATACTTTCACG--------CTTTTCACGCCCCTTTCTGTTTGTGTCAGGCATTAATTGCATACTCGTACTTTTCTTTTTTTAAGTTATTGTGTACTTCAAAGTAAGACTAAT--TAATTAGTTATAAATT-TTATTATTAAAAAAAAAAAAAAAACGAAAGAAAACCT
>CG9426 13216290 13217158|14450 chr2L 13216645 13217650 scaffold_7 2235796 2236759 - 29661|0 546
GACCTCGGACTGGTTCGGAAGGGTCAAACACAAAATCTGTCG---TCGTTTTAAGAAAACC----ACACACGAAAAACACTCTCTAAC---TGTAGCTCTTTGACATTGTATAC--GTTACACACATCACAAGTCTCTTCCCTTTTTTCGATTCAATTGAACGTAGTGGTCACTCGCCAAAGATATGTAAGCGCGTTGTTATGGGTATGGTTGATGTTGTATGTGGGAGCATAGCGCAGCTATTC---ACCAGTTAGTACACATGCTAATAGTTAGCC---------ACGATGGAAGCAGCCAGCCTCAGATTGTTCCGTAGTTCGAGTTGTCCTTTATAAAAGCGAAACCAAACACCGAAAAATATAAGAAACCAAAGCATTCACTTTGAAAACGACAAATTTAACGTATCGTAATTGCTGAACATTAT-----TTGAATCAATTATT--TGTTTGTTTTCA--AATGTATTCTCTAATTTTATTGTTGAATTCTGACCAGAGTGTTAGGAACAATGTTTGAGGCGCCCTTGAAAAGAGCGAAATC
AA----------GTCCAACAA---CACTCTCACGATCTTACGATCTTGTTTTAAGCACATCTAATATGCCCGACATAAACTCTCACACACATTTGCTTGTGTGGTACAACACTCTAGTTACAACCATTACAACTATTTTCCATTT------GAAAGTTGAACGTAGCGCTCTCTAACCA---------AGCCTCGACGCTCT--GTGCGATTAATGTTTTC----GAAACGTAGCTCAGCTATTCCTACCCAGTTTAGTATTAT-CTAGAACTTAGTCTGGAATGTAACAGTAACAATAGCCAGCATCTGTTTGCTCCGTAGTAAAAGTTGTCCTTTATAAAAGCGA-----------------------AAACCAAA--ATTGACATGGAAAAAGTATA--TCGATCTATCGTAATTGCTGAAAATCGTTCATCTTAGACCTATTGTTGATGTTTATGTTAATCGATCAATCATTCAAATACA---------TCAAGTCAGAGAGATTGCCAGCATTGTAGGTGCGTTCTTAAAAAGCGCGTGACC
>Ski6 13221394 13221480|14455 chr2L 13221431 13224564 scaffold_7 2242852 2246162 - 75934|0 49
AATAAAGTAATCTTTTCTATTCCAATCTTGTCGTTTTTTACAATTGAAGG
AATAAAGCA----TTTTTATT--AACTTTACTTATTATTAGACTAAAAGG
>Rep4 13283887 13284651|14505 chr2L 13281945 13289097 scaffold_7 2309469 2316962 - 194419|2223 3135
ATGGTATGTGAGAAATATATAAAAGTTACCTAGCCAAGCAATATTGTACACAATAACTTTACAAAATGTATCTACGAGTTTTGTTGCTATTTTTAAACAAAT---ATTGTATATTCAGTTGTTAA----------GCATATTATAT-TGCTGATCTCATATGGGAT-----------AAGTTGTACAAAT----GGAAATTATCTCGATGCCAACTATAAAAACTTACTGTTGAAGGTTTTTCATAGTAAATACGTAAACTATTAACATACTTAACATATGCATTTAAT-----GTTCATATAGCTTTTCAAACTATTCAAATTAAGTGACTATGCAATATCGGTATATAATCTAGAGTTAAAAGTTAGTTGATTGTAACGCTAGTAGCTAACAATTTAAAGTTGGCGTTACACA-------TCGATCAGCAAGTCCAAACTATGA-----AATATGAAAATAT----TGTAT----------GTTATGAAGTATGTA--TACTCATGTAACGAATTT------------AAACAAAAACGTA-----------------ACAGTATGA-----------AAAGGTTTTGCTACACTTGGCTTCTCTGCACCTCT------ACAAGTGTTTTATTTT--TGTATGGGCCATGTATTCAAGAGCCAAATCGTCGGTTTTATTTCCATCGATATTGT-ATACAA---------ACAAGTACAAGTTTT-------TTGATTTG----ACTTCTTTATTTACTAAAAATGTTTACTGCATATAAAATTGTACAACACAAAATATAGTTTATTTATGTATCAAATAATAATA---TTCAAATAAA-TGTGCAGAACGTTCGTATGCATACGAAC----TAAGTA-AAATA--------ATAAATATTGATGACAAAC
-------GGAAAAAAACTGTTAAAGTAACCTACTAAAGCAATATTATACACAATAACT-------ATGTACTTATAACTTATATACTTGTATGCGAGCTGCTTTAATTGTATGCCAAGTTAAGAACTGTGTATATACATATGATTTAAACAGGTCTCAAACAAGTTAACTTAAAGCCAAATTGTACAAATCTAAACAAAGTATCTTAAAGTTAACTATCAAAGTTTAGTGTTGAAAGTATTT-ATAATG------------ATTGACATATT-----TATGCATTTAATACATGGTAAAAGTTGATCTGCATACCATT-------------TATACAATATACATATATAGACTAGCTTTAAATGTT-GTTAACTGTAGTGCGCGTAGATG--AGTTTTGAGCAGGTATTTTGCCCGTTGCTTTGTTCAACATGTCTATTTTAAGATACTGTATACTCAAATATATACTACATACTTACACCCGTTACATAATATACAAGAATACGGGTAATTGATTCTACCTAAATCTAAAATCAAAATGTATATGCCATTATTGTAGTGCAATATGAATATTACTAACAACGATTTTGCTACGCTCGGCTTCTCTGTACCTCTAAAGAAACAATTAAAAGATTTTAATGTATTTGACATATGTT---GTTGCAA---------TTTCTTTTTGCTGACTTTGTGATATAATTACTATTTTCAAATCAAAGATTTAAAAACATTGTTTTAAGATATTTCTTTATTTACTAAAAAATTTCACTGCATAAAAAATTATACAACACAAAATATA-------TGAGTATGAAATAATAATAGTCGTCATATAGATTTTATAACAAATTCGTATGCATACGAATACCATATGTATGTATATGTTTTGTATAAATAACTATGACAAAC
>CG9377 13359901 13359941|14589 chr2L 13359873 13360843 scaffold_7 2417409 2418376 - 31663|29 76
AACAATTATTGAGAAAC-TAATAAAACATTGAATCC------ATTATC
ACGAGC-----AGAAATGGAGTAAAATGCTATATGCCGTTAAATTACC
>Nnp-1 13363300 13364012|14594 chr2L 13363785 13366341 scaffold_7 2423009 2425648 - 82452|0 277
CAAAGCGTCTAGTGGCAGCGACTGGGATTGGGACAGGATG--AGGAAGATTAATTTGGACTTAGTGCTCTGAGGGACGATGAAGAAG-------------------------------GGGGAGCGCTTCGCATCATACTACTTCCTTATAAGGCAGTATAAGATAACACATCC---------ACAATAGGCATGTCTTATGCTGGTTTTATAATACGTCTATACACACGAAAGTTTCCATGCTATATTTTT--------CTATTTTACAATGTTAAA
CGTTGCGTAAATTGGCTGGGGCT-------GGACTGGATGGAAGAATGAATGGAATGGATTGAGCGATTGGGAGCCAGACCCAGAAGTGCCGCACTAGCCTTGCACTGAGAACTTCGAGGGGTTCTGTTCTCGTTAGCCCAGTCCGATGGATGAAAATAAGGCATATAACTTGCATAGTTAATACAATAAATGTGCATCG-GATATTTTTACATTAATAGTATGCTTATT-TTGTTTTCATATAATATTTTGCTTGTAGACTATTTTTAAATGTTCAA
>CG9306 13370219 13370367|14597 chr2L 13370281 13371142 scaffold_7 2430180 2431044 - 28632|0 101
TCTTAGAGTACCGTAATCAAATCACATCCAATCTTTGTCTTT------AAAAGTAAATCTATTG---------GAACTCACATTATGTGCTATTATAAATGT
AC-TAGCTTTAAATAATGTAGTCAAACCCAATATTTGTTTCTGAAGTAAAAAAAAAAACCATTGGGCAAACACGAGCATACATTGGCTGTTAATAGAAATCT
>CG9305 13371427 13371503|14598 chr2L 13371465 13375850 scaffold_7 2431045 2435590 - 128480|0 40
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TGTTAATTCGCTAGTTTTTAATTTCTTGGTATTTGTTGATA
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CCCTACTGCTGGACGGCTGTGATCACGGACGGGAGACTCGATCGCTGCTCCTCAATCGCCTGCTGGCGCCTTATCAATGCGCGATTACAGGCATACAAAA-GACTGAGCACAGCTCACAGGATCTTCGCGACTTGTGTGCCCATCTGGTGGATGTGTTACAGCGTGCAAGTTTGCG----CGTGCAGGGATCTGGCTATGTGCTGGCCGGGAATAGGCATCAGCTAACAGAGCAGCTAGAGCTATATGACTGCCTGGGCATACCCTATGATTTGCTCCTGGATGAGCAGCAAACGCTGAGCAATGGACTGCTGCAGTTGCGCAGCCGCGACACGCAGCTGGCGGAGACCGTGCACATAAGCGATTTACCCGACTATTTGTTAAATATTTTTAGAAACTA
>CG33649 13831938 13832624|15071 chr2L 13832302 13833077 scaffold_7 761403 762224 + 25786|0 341
GTCGCATACAACGATGCTTTAAGTCCCTGGCTTCCGCTGGCTTCTTTCGCACCGTGGAAGA------------CAATAAACTGGAGCTACTGAGTCATGGAAGGGAATACGCCAAACTGTTGCAACAGCATTGGACACGACTACGTCCCTTGGCTGCGCACCTGGGCG------CCACGAAAGAACCCATAAATCCAGTCAACATCCAGCGTTTTTCCTTTCCACAAAGCCAGCAATTCCGTAACAATTTCCAAAAACTCGTCAAAGATCATCCTCGAAAGGCCAAATGTCCCACTCTTCTGAAACATCAAAGCACTTGTTC-TGGTCCCACTAGCAATTCC
ATCGCCTGGGCCGCTGCCTCAAATCACTGGAAACCACTGGCTTCCTGCGCTGCTCAAATGATGCAGCCACTCCCCATA---TAGAGCTGTTGACTCATGGTTCTGCTTATGCCCAGCAGCTGCTGCAACATTGGCTCAATATGCGCCAATTGGCTGTCAATTTGGGCAGCGTTTCCTCTAACGAATCACTTAGT-CAGTC--------GCGTTTCGCCTTTGTGCATGGCCAGCAATTTCGCCAGCAGCTGCAACAGTTGCGCCAGACACATTCCAGCAAAGCCAAATGCCCCACGCTGCTGAAGCAACAACTTAGGTGCACATCGTACAACCCGCCATACC
>mRpS23 13834247 13834296|15072 chr2L 13833102 13835087 scaffold_7 762244 764306 + 74014|1235 1294
GCGGAACATCTTTTATAAACTTAAAATAAACTTGTTATATGTAAA----------TCAAA
GC------TCCGTTTTATGTT----ATAAACTAAATATACAAAAAAGGATTGTTTTTAGA
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TAAATCTCAATAAACTATAAATGTATCGAACGAACG
GAGGCGTCAATAAAGTTTACAAGTTT---AAGTTCG
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TTAGGCCAAATAAACTCTACATA-TTATCC------AAAACAA
TAGAGCT---TCGACTTTAGACAGGTGTGCAACAAAAAAACCA
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AAAACCAAACCAGCAATCGCTGCTGCAGCTTCGGTTGTGGCCGTGTTTTCCCCAAAAAAAAACTGAAACTGAAACTGTTACCATCAGCCGGAGCAAGATTCCGCCAGCCTAGCCTGTGCAGCAGCAGCATTGCGAATTTGCTTGTTGTGTTT-------------------AGACCAAACTAAAACAAAATACCAATCAAAATCGTTCACTTTCAACTCGATGGCTACAATGATGACGACCTCCCAGCAAATGT-------TAAGTGGACAATGGCAAAC-----------------GCACAATCATCAACAAAAATTCTTAAGAGAAAAAAATCGTA----------AAAAAAAAATATCAA
AAATCCAACCCAGCAGCAGCATCTAGAGCAGCAGCAGCAGC-------------AACAACAACCG---CTGCAACAACTATTGTACAATGGGGT--------------CCGGCTCATGCGGCAGCATTGCGTGGAGTTTGCTTGTTGTGTTAGACAGAAAAAAAACCCAGAAAACTAAAAAAGAAAAAAATCTAAAATCAAATCGTTTACTTTCAACTCA--------AACGACGACGA-CTCTCAGCTAACTTATACGGATAAATGGCCAAGGATAAACAAAGAAAAAAAAATGAAAAAAAATCAAGCAAAAAAATATCTAATTGAAAAATTTCATGATCCAAGCTTAAAAAAAAAAAACA-
>Smg5 13899353 13899821|15128 chr2L 13899680 13900332 scaffold_7 841658 842293 + 34062|0 155
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GTGAGCC-----------------GTAGCGGACGCT-AGGTGGCAAATGC-ATGGCAAACAGCAGATGCAAATTTATAAATGCAAGAGGATGTGCAAAGCGTGTGTTCACTGTACAACCCACAACAAAAACGGACATGGAGTTCCAAAGTTAACGA
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ATTGGTGAAATGAACTTTTTCTCTCTCTCTCTCTCTTTCTTTCACTTTTTCTTTGCAGCATTGAAAAATCGGTTATGAACGGCAACGGTTATGAATGGATATATAGCTAAACTGAAAAAAAAAAAACAAAACAAAAACAAAGTATAACTACCTTTTTAAC---ATCACAAAAACCCATAGAAAACTTTTAAAAACC----------------TTCCATATTTTCCATATCATACCCAAATGCCCAACA------TTCCAATTACACTTTGCTATATAGAACGTGATAA-CGATAGAGATTCTGATAACAATTTTATAATGTGACCAAAATGTGACACGAACGAACTTACTTAGTTTTTACGACGAACTCTCTTTTAG-CTTAAGCCATACAAAAAAAAAAAAAATCAATACAAAAAAAAAAAGCAACAAAACAAGAAAAGAAACGTTGACGAAAATATCCCGTGAGAATTGT---TATGAGAAATTTTGAAGACGATTAGATCTAGACTTTAAGAACAAAATACTAACACATTTGGGCCGCACAGCCCAC------AGAACAACAAGATCAAGAACAAGACCCATAACAACAA----------------CAAAGACAAGAAC-----AACACACACAACATATGACACCTCAG-CAGGATCAAA------------------TTTGGATGTGTTGTTG-GACTTGGCTCGCTAAACA------------------------CTGGGTACATTTGACGTGTGGTTGCTGCTGCTGTATTGTCCTCCAGCTGCGGCTTCTCCTCCTTCTGCTCTGGTCCA-CCGATTTGTGCACCCGGTTCGGTTC-------GGTTCGATATGATTTGAGATCTG---------------------------ATTTGTGT----------------------GTGTGATAAGACTTCTGTTTTAGTGTTTAAGTGTTTACTCTACATATATATATATTAATATAAATACATATAGATAAGGGAGGCAGCCGTGCAGTCGCCTATTTAAGTCAGTTTGTAAACGAACGTATTGTATTA---TTTGTAATATTTTTTGCTAT--CTAGTTTTTAATACAACCAACTATCTATAGTTTTGCTTAATGTAAAAAGCTGTTGAAACGGATTTATGAAAAGTACTTAGTTTACCAAATATTTTTTTGTCTCTGTAACATCAACAACAACAACAAAACACTCTGAT----AATGAAGCTGATGAATG--TAAACAATAAAAACGAGTAGAACGAAGTGATCAAAACTAAAA----------
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ACCAATT--TATCGCTAACGAGGGCCAAATCAGCTTATGAATTCGGGTAAAGGCGTACGCATCAACATCAATGTCG-AATTTTCCAATATCCACATGAAAAACAAA--ACCCAACTGGAATTACCCCCAACCCGCAACCCTCAGAGTACGACTTAC--ATTTAGTTTTAGTTTGTGATACCAACCGAAATTCTAGGAGGA---------AGCAACAATCGTTCAACGG--GAAGATCATCAAATGTGACATTTCGATGAGTGGTTCCCAGGACGGAACACTCTGGAAACTTGCCAGCAACTGCACCCTTAAGAAAAACAAAAGTAACAAATCAAAGCCACATTCGTTTGTCCCGCTTGTCAATTGTGTCACCCGCCTCC-TCTTATGTACAGTTCTTTCTAGACAGGAAAAACAAACAAACAACAACAACAAGAGAAAACACCTGAAACCAGTTGCATCTTCGACTTTTTCCCGTTAATTTCTATTCTATGAAATTTTTGTACATATTTAAATAATGTAAATAAAAAGAA---TTAAAAACAAAAG
>CG16884 13944756 13945228|15174 chr2L 13943479 13946050 scaffold_7 903142 905875 + 54738|1597 2110
GCGGACGGAATGGACCGGAAGCAGGCGAATCTATTGGAGCGAGC-----GGACTTAATGGAA-ATGAGCCGAAGGATATCTAGCAACATTTTCAATTATCTTCCC-----------------------CACTCTCTCCACCTGTCGGCCTTCCTTTCCAAAACCGAGCGCAGAAGCAAACTCTTAAAATACCCCCTGGAAGTCAAACTTCCGCCCTGCCACACT-----CTCTGTAGCTGATAAGAAC--CCCCAAGATGAAACAAGCAATGCCTTTTGTAAATTATTTCCAATCCAGCCATCCAATGGAAGCCATTGTGCTGGGCCAAGAACTCCAGGTTTAGGATAAATACCAGCTAACTGTTTGTAAA-----TTTCGCCATTTATGAACAGTTTAGCTGGCCAAGTTTATCAGTGAAAGGTTTCGGCGCACAATGAATTGAATGGATAATAAGAACAGAAATATCTATGTGAAAATCTATTAAGGACAAATAAAATAAAATGTATAAAAT
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>CG31839 13965006 13965086|15194 chr2L 13964790 13965422 scaffold_7 945731 946381 + 23634|216 303
CTT---AGACTTTCGCACTTTATTGTTTCGTCTTGGATC----AGAAATTAAATAGACGCCCTATCAGGGCATTAAACTCATAAGCAA
TTTTCGATTGTTTTGCACTTTTCAAATGTCACTTAAATCTACGACCAATTAAACAAACGTCCAATCAGCGCATTAAACTCGTAATTCA
>CG33115 13968278 13968342|15197 chr2L 13967410 13968882 scaffold_7 951108 952594 + 26808|952 1016
GTTCGGAGCTCTCACTTTTCCAGCATCACTGAGCAGTCTCTAATAAATATTCATGCATTTCCCAA
GCT-GGCGATAATAATATTCTA-CATCCC-------------ATATATATTC-------TCAAAA
>He 13972094 13972239|15201 chr2L 13972039 13973017 scaffold_4 44126 45109 + -3637|55 207
AATCATATTTAAATAATATTATCTAAAAACAAGGATTTAAATAATAACTTTCTTAAAAACAAA---TTTGCATCCACTAAGTATTAAAATAATTTTTGGCACGAATCTTAAAATATTTGA----AATAAACATGACTCATTTATTTCCGACAA
AATAATATAAGACTTTTATTAGTTATAC-----GAATTAAATAA-AACT------AAAATAAATATTTTGC-----TTAAATTTTGTATCAGCTTCTTGT----ATCATCAAGTATTTTATTATGACAGGGATAACTGTTTGGCTTAAATAAG
>CG8942 13974117 13974229|15205 chr2L 13973754 13974145 scaffold_4 45873 46298 + -1534|410 438
AAATAAATTTATAATAATAATTATAATAA
AAACACCTATACGATTACACTTATAAAAC
>rk 13982726 13983421|15214 chr2L 13982643 13983749 scaffold_7 980824 981790 + 12244|83 791
TGGTGGGACTGGCGCTGGCGAAGATTGGGTGGGGCCAACCAGGAGACCTTTCTATAAAAGTAATGGGGAACAGGACAAAAGCTGACTGTGTTCATAGATTGTATTGTGGGGTGGGCTGGGGAGTTGATGAGGGCTGTTCGATTGGGTTGGCACTTAGGCTAAGTAAGACACAAATTAATAAAATTCACATTAGGCATATACAAAATATAATGTATTTGTAGCATTAAGTAGCCAATTTG-TTAAGTAAGAACAAC-CGAAGATCCGGATCCCATTAAATCAACAAAACAAACCAAAGGGATAACAACGTTGAAAGGATCAGTCACAACTCCAGTTTCTCAAATGATTGTTACATTTCT-CAGATGTTGTGCATCAACATAACATTGTATTGATCATTGTTTAGATAAATACTTTAAGTGAACTAGATCTGGTATATGAACAACATTTTGAGAAACTGAAGCCGACAATGAATATTAAGTATTACCTAATTTATTACGGTAG----ATTATGTTTTTAACTTTAAACCATAAATGTTTAGCTTAACTATATATATATATATATATATATTTATATACGTGTGTATTATTTTCGATGCCAAGCATCCTTCAGTGTAAAACTTAATCGAACGAGAAGATTGTAAAGGAAACCAAGCCATAAAA--ATTGAAATTAAAATATTTCCACAGACAAACATTTTCCTGCC----TT
CCAGGATTTTGGGGCAGCTGGA-----GGCGCCGGCAA-GAGGAGACCTACCTGTA-----ATTGGGGAACAG----AAAGCTCACTGTGTTCATAGATTGTATAACGCGG-GAATTGGGACAGAAATCGGGGC-ATAGTGTAATATTGGAACAT-GGCCATGTGATGCA------------------GCCAGGCGTCATCTATATAAA---------TAATCTTAAGTAGTCAATTTGTTTGAGTTTGAGTCACACACACACACACACACAACCAATTCATCAAATGGAAAAAAAAGGA-AACAA---------GAACAGTTA-AACACGAGT------ATTATGTGCTACATATATGTATATGTAATTTATTAA--------TAGGTTAATCGT------------CCCTCTTGATAGGCTAG--------TATAACCAGCATATTTAG-TGCTTAGACTAGCA---TAGTTTAAATGTC------TATATTTCGATATGCGCATAAAATATTTAAAT---AATGCTAAGCATTTGTCCACATTACTTGAAGATATTTAACAAGTTCTATACACACAGATA-------CACTCACACGCAC-------------ACTCAGACACACACGCATA--GAAAACGAAACAAAGCCATAAAAATATTAAAGTTTATCTATTTACAGTAATCTATCTATTTCTGTTGGGATA
>l(2)34Fa 14018734 14019488|15261 chr2L 14017938 14019469 scaffold_7 1049150 1050798 + 51819|814 1691
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ATCTGCTGACTATACTCAAACTTTCGTTATGGTTA---------TTAATTATTTGGACAAAAGCTTTACAAAGGAAAGGGAAAACTTTC-----CAAGCACAAGGGAAACTTTAACAAATTGTATATCATCTTAAAATCTATATG--------------TAAAAATTTATTGTAGTAATTCAAACAATAAGAGTATATAATTTTC-TTTGCGTTTCAATAAGTAAAACAAATTA--ACATAAAATTTAAAACTTATGCGCTAAAGATCTATATAGTTTTGATGGAAAAAATTAGTCGTTCATCATATAATTAACATCAAGCTCAATAATAACATCAACCTCATCATCATATCGCACTCATACCAATTGAGTGGATGTTGTTTTATCTAAAATTTCTCTATATATCGTACAAGTAGTTTAGGTATATATATATATATATATATATATACAGGCGTATATATTAGTTAAAAGCTGGCACTCAAT-GGCTTGTAAGTCCGTTAAATTCATTTCATGTTTAAAGCTCAAGTTGCATAGCTCTCTGCCGATTGGTAACAAAACAAATTTTCTTTTTTGGTTTTACAGTGTTTGTTTTTGTGTTTGTTCTAGGCGTAAAGGGTCTCAATGAGATCCGCATACATTTTGTTAACCACATTGCGCTTGACCTTCAGTGTGGGTCCCAGTTCGCCGGTGGCAATCGAGAAATCATGCGGCAAAATTGCAAATTTCTGCACCTTTTGGGCATTCGAGATGGACTGTTTGTTGGCGCGCTTGATGCCATCCTCGATGGATTTCCAGACCTTTGGACAGGGTCCAGCATTTAATATTTCGCTGAGTGTCTTGTACTCCACGCCCAGAGATTTCATCCAGACGCTCGATTC
>CG31840 14023666 14023749|15265 chr2L 14022408 14023909 scaffold_7 1059681 1060820 + -2035|1295 1378
TGAGAAGTCTTGCCAAAGATCGATGTCCAGGCGACGAAATTGTCGCATGTCTAGAAAACCGCAAGAGTACATACATCGGCTACT
CGCAAA-------CAAAG-CAAACGAGCAACCATCAAAAATGTCAAA-----AGCATAATGCATGAG-AAATAAAATAAAAACC
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GCCCGATGCCCGTGCAGCATTGCCAGCGAGGCGTCGCTGGAAGTCCTTTAGCTGCAGAAGCAGAGTCCTTTGCTGTAGCCGAGAACCAGCACGAAAGCGACGAGCCCGAGCCTCGGCATCCCACGA---CACATCCTTGTGCAGGAATTCGA----AATCCGAGCGCTGCTTGGGGATGCGCTGCCGATTTGAAGGCTGGAACATGTACCTAGGCGCACATATATAT------GCCACGAGTCCTTGCCAGCCGTCAGGACTC-----GTGACTCCACGGAGCCTGGAAAGTGTTCGCTATG--TGCGAGTGTGTGTGTGTCCTGCAGCTTTCAAGCTCTTCCCGGCGAGCTTTCGTCGGAGGCTGTAA
ATGCGCTGCCAGGCCGCAATTGCCAGCCAGGCGACGCTGGAAGTGACT--ACTGCAGCAGCAG---------CAGCAGCAGCAGGCGAATCGGAGAGCTTCG----TTAAGCTCGCTCGCACACGAGCGAACATCTCT-TGCAGCAGACCGATTGGATGCCCCAAACAGCGTGGGGATGCTAAAACG---TGACTG--GGAATGCGCTCGTACACGCTCGTGCCTGGAAGCCAGCTGCGAGCGACTG---GCTGGAAGTGCCCAAAGAGAGACCCAACTTAACCTAATCCGACTCCGACTCGACGACTAGTTCGCATGTTGGCTTAGGC-----AGGACCTCAAAAAAAGAACTTGCAAGAGGCTGCGA
>CG15293 14108088 14108195|15359 chr2L 14107056 14108194 scaffold_7 1214946 1216104 + 11742|1129 1245
TAGCTCATTATAAATATTAATATATGGAAATCATC-GCAATATTTTGTAAACAATGCTTAGCGCAGTTTAATAAATAAGCTTATCAGCCTGGGCTAAACCCAGAAA---------TT
TGACGCCTTTTAAATTTT----TTGCAAAACCTTCAGTAGTATTTGGGAATATATCACGTTAATAGATTAATAAA-------ATCCACTTTGATTATAATCAAAAAGAGCTTAATTT
>CG15293 14108088 14108195|15360 chr2L 14108195 14108369 scaffold_7 1217376 1217562 + 4340|0 0
A
A
>CG31769 14109591 14109692|15363 chr2L 14109545 14109631 scaffold_7 1217246 1217325 + 295|46 91
AGTATAAATA-----ATATAAATAAATCTATGTTTACCGCATTGAA
TGTATGCACGTACATCTATCTATACATCTATGTGT----------A
>CG31769 14109591 14109692|15364 chr2L 14109672 14109871 scaffold_7 1217367 1217564 + 4553|0 22
TATACATAAATAAA--GAGATAT
TCCAACCAAATAAAATGCGTAAT
>CG32972 14163506 14163941|15432 chr2L 14163467 14164563 scaffold_7 1288720 1289884 + 37005|39 568
AGAGATTAAAGCTGC-----------CGGGGTCGGAGAATCCCTTTATTAAGCAGTTTTTGGT--TTAAGCCTTAAGATTAGTTTAAGCGA-----------GGAGGAGTTTC-----ATCAACCACATCCA----AAATTGATAGTGAAATCTTGCCAACGTCCTTAAAAGGACTTAAGAAATTACAATCTTTTATAGAACTGGTGCAAATCCATCA----------------TGTATAAGAGATATACGCAACGA---TTTGGTGCTTCCATATA---CTTTTCTGTATTTTTCTTTTTCGCCTTCATAAAACAGTCATTAC-----AAATAGTTCAATTTAAG-AAAGAAGCAGAGAA---------TATGTAAAAAGAA-------------GCCAAGACAGTTG-----GAATCTGATTGGTATCTAAGCTAAGTTCACATAT---ATTTAT--TTTTGGCATTAAAT-CATGTGCAAATTAATTTGCAAAATTCTGTAAAATAAATAAAAAATATAGTTAAGAA
AGGACTTGAGTCTGCGATCGGCCACGCTTTGACAGTGGGCCTTGTTATT--GCAGTGGTTAGTGCTTAAG-TTTATTTTTGGTTGAGTCGACCAAACTTTGGGGGGGATTTTTTCATAATTAATCACATGCGCAGCAAATTGTTTGTGAAATCTTGCCA------------------CAGAAATCGCGATCTTATAGAGAATTGGTGCAAAAATAACAACAACGAAATAAGCAGAAAATGGGAAATGAGTGTAAAAAATGTTTGGTGCTTCCATTAATGTTTTTTCTGTATTTTT-TCTTTCGCTTTCAT-AAACAGTCATTAAAATAGAAATAGTTTAATTTAAGTGAAAGAGAAAACAATTTTAAACTTGTGTAAAAAGGAATGTTTTTAGAATGAAAAAAGAGCAGCGAAAAAATTGGGTTAATAT-TAAG---AATTTTTATATCTAATTTATTGTTTGGTCGTGAAATCCAATCGAAAATTTATT---AAAATTAAGTTTCGTAATTAA-----GTCGATGCAAA
>smi35A 14184470 14186137|15453 chr2L 14184014 14185934 scaffold_7 1324754 1326943 + 1240|522 2348
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ATTGTGT----ATGTGAGC----------------CCGCAACACCCCCAAAAGCACTCTCACACACACACACACACACACATAACAAACA-----CACACACTTGCAACACTCTTGCAGTATTCTCAGTTTATTTCTCTGATTTATTTTTTTTTTTGCTACTGCCATAGCTAAATATACATATATATCTCATT---ATATATGAATGTATTCCCTAAATGTATTTGTTTCCC-------------------------------------------------------------AAAAGTATTCGGAAAACCACAACTTTTGCC--CTCCATTGTGCAAGCATAAATTCATACGTTTTTTAACACTGTTTCATCTGCATGCATGCAAAACCTGTATTCAACACGAACAAATTATAAATAATAACAATAATAATAATGATAATATAATATAATAAACCTCCC-AGCTCAAACGGAACAACATAACCTAGTTATATAAGAAGTTTAACGATATATTATATCGACGCAAACACAAATCTGTAACAATTTCATACAGCTTCCATGTCTTTAGCAACAGTATCAAGGCTGTTAATAGTTACAAAT-----------ATATAAATATATTGTAACTATGATTTATAAGTTCCCAAACAAGGTTGGAATGTTTCACAATCTATTTAAAGCTCA------AATATAGAACTTTTTCACTACTAAAACTTCACTGCTAGGGAACCTCATAGACCCACCAAATTA--TCAAATCGAAACTACCCTAGTTAACTATATAAATATATAGGTATAGCCTCTGATAAACTGAAACATTCTAGCCCGGAACACACTTGATTAGGTTCTATAAATTGAGCGTAAAGTTTGACAACAAGTTAAATGTAAGTTTGTATTTTGCATGAGAGTATAAATAAACGGAGCTGTTCAAGATTTCGATATCTCGACTTCACCCATTTGTAAGGGATATTAAAATCCAGAACAGAGCCGTTTGATTGAATATGCCCAAACATTCATTCATAACATGTCATAATATAACGATTATA------CACATATTTAATAAACTATATATTACGTAATTATTGAATAGAAAGGAGAACACAACAACAATTTACGGCCAATACCACACAAAGCATGTGTAAGAATTATAACTTTAAATTCTATGTAAATCGTATTAATGGAAGAAACAAAAAACAAGAAAATATGAACAAAAATGAATACAATTTAAATATAATCACACAGTTGACAGTTGAATAATAAATGTTAGCAGTAA--AGAGCGGAGCGCGTACCCCAATGTCCCCTCTCTATGTCTATCTAACTTCCCCTCTCTCTAGACTGT-CACGTGAACAAAGTTTGTAACGTACTTTTAGATATCACTGTAAACAAAATGCAATTTTT--GCTCATGACTTTGATAATGTCGTACGTTTATATATATCAAGAATTAGTATAATAATTTTTGCCTATTTTATGTATTATTTATGTTATTTACATTTTTCTGCCGCTCCTAATTACAACTATATAATTTTTTTCTTTGACGTACTATGCCTTTTTATTCAATTTAAAACAAAGTTAAGAAAAACAAAAAAAACTGCAAAACTTTATTTACAAAGTGAGTTTCGAATTTAAAGTTTAGTAATAAATTATAAAAAAAAAAAAAACAACTACCTTTAATTATAAAAAAA---------ATATATCAATTTTAAATTAATGAATCATATTTAATGGCCTAGAAACCAGAAATAAATGAACATGTAATCAA-TACAATTACAATAATT--GAAAAATAAATTAAAAATTATGTACTCAAAATGTT
>smi35A 14184470 14186137|15454 chr2L 14185935 14187196 scaffold_7 1327086 1328359 + 67064|0 208
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CTTCGGGCGCGGCCCACCAAGCTGGAGCTCAAGAAGTGCAAGCTGGTTAATATGATGGACTTCTGGAGCTAGAAGTGGCGTCCACAGCACTGCGCTGCCCT------GCGGGAGGAATAGCTGCTACTGCTGCTGCTGCCGGCTGCTCCAACCTAAATCTAGCTATAACTGT--TATATAGGCTATACA-------TATATGTGTGTAG
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AGCTTAAAAAGTTGTTGTAAAGTTAAGATACTTTT-------TTCAAAAGTTTTGCCACGAAATTGAACACGATTAAAAGCCAATATTCAAAAAA
AATTTAAGCCATAATTGTAATGCTATTGTCTTTTTAAGCAAATACGAATGTTTT---ATAAAAT--------AATAAGAACTACTACT--GAAAA
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TGCTTGTGATAGAT-GTTTTCATGATTTGTTCAAAATCCTACAAGTCTTTGT
-------AATCAATGGTTTTCAATATTTGTCAGATTGCTTTTAACACTTTTT
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ACGAACAATTGCAATTAGTTC-TGTACATAAATT-----CATATGTTAAATTAATCTACATATTTA----------------------------------------------------------------------------TTTTAACAATG
AAT----TTCGTGGACAGTGCTTGTACATAAAGTTTTAATTTATGTAAAAAAAAAAAACATCTTTAGAAAACTATTAACTGTAACTAGCCCAAAAGAAAAAAAAAACGGATTTGTTCATTCTTCATTCAAATCGGCAACACGTATTATAAACT
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TGTGATTAGCACACGGTCAAAGCAA--TTGATTTGCTCTAATTAATTGATTGCAACG---------CTCTGGCAAAA---CACTGAAACTAATTAAATATCCTATTTAAAGGCGTAACCATAAACACATAAAACATTTAA-----TGTGCTCCCAATGGAATTCA--TGTGTGGTTTTTTATTCTACCCCTTTTAGCCATAGATGTCATAGATTTCGAGACCCCGAAAAGGTATATATTTAAACATAATCTGTTCGCACCAAATGTCAGATCTAATGGATTTTGTCACTGGCCACAAATCATGCAAGAGTATTAAAAACTTCAGCATTTTCAACATTATTAATAAGGCACGACAATAAAAAATGTGTTCGC
TGTGATTGGAAGGCGGAATATATAACCTCCATTGGATCGTAGAAATCACCTTCGACATGTTAATGCCTCCTACAAAAGTATACTGAAGATTTTTGAA----CTTTCGAAAGTTATTAAGGCACGCAAATAAAGTTTGTATGATTTTGTTTTCCCAAGAAGATCAAATCTTGTGGTACTT----------------GAAATAAAAGTCGTGTATTTTT--------------TAAACGTTTTATTATAAGCTGTTAGCAC-AAATGTCAAAATTAATTACTTATGTCACTAGCAACAAATCATAAAACA----TAACA----------TTTCAACATTATTTATAGCGCAAGACAATCAAAA---TGGCCCC
>elB 14390625 14391178|15680 chr2L 14389847 14391069 scaffold_7 3014470 3015675 - 21328|855 1379
TGACTCACTCGTGAAACGAAAAGCTAGTGATCTAATGTACTGTAGTTACATACAAATGTGTTTACAATTTAGCTTAAGGAGTCTAGCGTCTAGATATACATACATACATATATGTATCTAATATCGATGATATATTACATTAGTGCAGCACATCAAATATCGCTCGTCCTTGTGTGTCTGTGTGTGTTTTGTGGTTGCTACTAAACGCAAACGGTAATTTTAATTTAATTTATTCTATTCAAGCGATTACGAT-----------------------------------------------------------------------TACGGAATTAA---CGAAATGAAAAGATTGTCCAAAAACTAAAAGTTGTAAAATTCTTGTAAAATATATGAGTAACTGCTTATAATTAAT------TCTATACATATGCCTAAACATAAATGTGTAATTATGAACAATATTTTAATGTTCAATTAAGTCACTACAAAGAAATCAATAAATCAAAGAAAATTAAATACCAAA
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>elB 14390625 14391178|15681 chr2L 14391089 14391944 scaffold_7 3015695 3016521 - 47086|0 90
-AGGCGGCTGATTGAATCGCAGCACAATGCGAAAGTTCGGCCTTCAGTCAAACCCATCATTTCTCTTGAG-TCGTCGTCGTATCTCTATGT
GGGGCAGCAGTTGGAGCCGTTGGTCAA-------------CATTCAGTCAA----ATCATTTTGCTTGAGTTCGTCCCAGCAGGGCCAGGT
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GCCTTTTCAATAGCCAACCACACA--------CAAA---AAACCACAAGTGAAGATCCAAACTAAGCCAAACCAATCCCCCCAAAATCCCACT-----------------AAAAATAATCCAATAAAACCGATCCCATTGAAAAGACGC
AGCAGTTAACGAGGCAACAGCAAATTCTCTGCCAAATAGAATTGATAATATAATATTTAAAT--AGCATAATTGTTATCCGAACATTCCAACCTGTGATTTAGCAAATCAAAAAATAGTTGATTAAATCGAACTCCACGCCAA---CGC
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AACCGAGCTCAACGTTTGGAAAGAATTTACGAAAATCCACTGCAAAACCAACATCACCAGCATCATCATCAGCATCAGCATTAGCATCAGCATCGGCATCAGCATCAGCATCAGCATCAGGTATTAGAAGCCTGCCCAATTCAAAGGGACCCAGTCACAAACGAATATATAAAACAGCTGCCGTCATTAACATACAGCAACAGCACAACCCCGACAATGCAATACAAAAGGAAAAAGCACAATGAACAACAATGAAATAATGAAAAACAAAACGAAAAACAAAACAGTTGAAAATGAAAAACCATAACCAAGAAC----GAACAAC-AACAAAACCAGTGGAATAACCAAAGAATAATTAGTGCTAATAATAAATAAATTATTATAATAAATATTTAACATATAAAAAT--AACTTA--AACCAAATG-----CAAAATCGAACGGAA-----------ATACATAAATATAAA-------------------------------------------CATGGCTA-----ATAAAGATGATGTTGGTGATGTTGCTGCAGCTTCTCGTAACTAAGAGCGAGAACGAGAAA---AAGATT-------GAGTTATACTAACAACAACAACAAATGTTCGCCCCCTTCCGCCGTAAGC--TGGAAAGGACGTTGAGCAATGGAAAAACTAATCATAATATCCACAGCACCAATAACACTTACAACAACAAAATCATCGTAAACTAGCCACTATTTAAAATATCAATTATTGGCAAGAATTCAATTTTCTATTTGACGAAATGGATTTATCAGTTATTCTATAATCGTAT-TGTAT---------CTGTTACATTTACCCAAAAGTTTCTATGTCCATTAAATGTGTCATTTA------CTTATGTAGTATTTAGGACAATCGAAAAAAAAAACAGACCATAAATGTT-ATGCTCAACTATTTATACACATATGGCATTGTCAGTATGAATTTACGTGCATATAAGTAACTTGTTAGGTTTTTGTCTTTAATATCAAAATTGTTTTGCGAGATATATACCTAAATATATAAATCACATATAAAAAATGTAAGTGCATTATAAATATTAATAAATTAAACTCTATTTGTTCTGTTAACCATTGGTATTACTCAA-ATTTCTTACT---ACTGATGCAATTTTAATTAAGTCACGTTCGTGG---CAAATAAAATATGTTTATTGTATTTACAATTAAGTCGTTATTTGTGAAAAAAAAAAAAATTAAACATGCAAAATTGTTT
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CTTGATAAGTACGT
CCTGACAAGATCTT
>CG15279 14840925 14841045|16197 chr2L 14840939 14842519 scaffold_2 1709383 1710971 - 67197|0 112
TCCATCATCAGTGAGAACAA-----ACTAACCACAATCGCT-CATGTAAATAATCTTATTTTAAGAGAAAAGAATTTAAAAGATCTTGTATAAATCTTAAGTCTGCCAATAAA
ACT-------GTGAGATCTCTGGTTTTTTTTCGTAAGAGTTGTGTGTAAATAATTGT---------GAAAAGTATTTTG-----CGATAATAACTTTTAAGTGTGCCAATAAA
>CG15278 14871041 14871341|16245 chr2L 14870521 14871680 scaffold_2 5155801 5156970 + 13385|571 918
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AGCATGAAATT---------GACAGTGCCAAGCGAACGAAG-----ACGCTATCCATTAGGTGCGGAAGCGGCACAA--GAAGT--AAAAGGCGTGTGGGATGTATAAGCAATGCACAAGTTTGGCATCAAATCAAAGCAATAAACCAACAAAACTGAGCAACTTCAGGCACTTGCACAAACCAGAAACACTTTCGCTGCATAACACAACTGCCAAACTGCAGGCATTTATGACAGTGTGCACTTTCTGCCCCTCGCATTCATATCGAAAGGCAGGCAGGGCAAATCGCATAACGAAATTGTTGCTGAAAAGTTGAGCAAATATTGAGGTCAGCTAAATTTTACGAGG
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T
T
>mol 14971682 14972244|16364 chr2L 14971411 14973606 scaffold_2 5286851 5288891 + 67227|311 929
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AGTCCAGTGGGAGCTCCTTGTA---CGAGTTCTTGACAATTCAACCAACTT--TTATTGACAAAAACAAAAAAA---CAGAAGAAAAAAAAAAATGCTACAAAACAATTTGTGATAATTTCTTAATTTAAAAGCAAAGAAAATGAA--------------------ACTTAAAAATTGACAAGATCGCATAATTTACC-----TGACGTACTTATAAAAACAAA-------------TTAAATGCACTTAACTTTAATTAAATTATTTTAAATATATAAGTTAAACAAAATTTAATTTGTAA-ACCTATCGATACATTCATCTGAGAC----------------GTGATGTTCACTTGTGATAAGATAAGATAAATCTGCCACACGACGGACACAGA-----ATGCGTGCA--ATTTATTTCTATTATTGTAAATCAATA--CGATTCGGATAAATTCAATTATGTCTTAAATGAATTCCATGCCAGTCTATGTAACGATTAGCTTAAAAACAAAAGCAAAAAAAAAAAACTAT-TATAAAATGCGTGTAAGCTAAGTTTTTTTAAGTTATGACAATGTTTTAAAAAATATATATATGTATGGCAGCAAATGCAACGAA
>CG4140 15002512 15002573|16397 chr2L 15001837 15003338 scaffold_2 5317890 5319377 + 70775|696 762
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TCGTTTATTTTATTAA--------------ATATAATACTTAATATTAGTTGGGTTCTATGAGTGAA
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-
T
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ATATAGTCTAATATAAGCTATAGTTTTAATTTATATCTTAGCACTATCAGTTAAAACTTTGACGGCA----ACTATAGCTTAAATAATTATGCTGTATTATCAACAAAATATACTTTTTTTACGTATCTT
ATTCAATCTATAAAAATCTGGA-TTTGAATATCTTTATATGCAATA-CTTTCAAAATTCAGGAGAAATATGATTGTATCT--AATAATTAGTATTTATTATCAAAAAAAAATCATTTTGCTGCTTAT-TG
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CTTAGGCTCACCATGGTATACCCAATCAATCACATTTCAAATAGTTTATTAAGCTGACTTACTAACAAACAATAATGTCATAATGTAAATACAAAAATGCACCGCGTCATAAACACAGCATGTAGATTTAA--ATATCCAAGTGATCACATTTCGCATGGTGTACCCTTGATGAGATCGCGGTTCTGGCCCATCAAAATACGATAGTTGACGGCCGAGGGATCGAGTTCCTTGTACAAATATGTCGGCATCTTGTCGGACAGCACCCAAATAGTGCCTTCATTGTCGATTTTCATGTCATTTGGAAAGACCAGAGTGTGCGAATCGGAATCGATTAGCCCCTGGGTGTCCGGAGTGTATGGACGCTTGATGTTCCAACAAGCAATGGCGTCTTTGTTCACCTGCGTATAGAAGATGACGCCGGTCTCGGGGTCAAAGACCTCGGCGGTGGACTGGCCATTCATGCCACGGTCACCAACGTATTTAAAATCGTAATACGAATCGCCAGCGGTCACGTGTGATTCGTTTTGCAGCACGCGGTTCGAAACCTTGAACTCCTTGGTACTGGCCAGGGCATGGAAATAAATGTCCTTGGAGTGATCTGGATTCATTGGGCCCACGGCCAGCCCAAAAACGCCATCCGTCCACTGGAAGTTCACGCCGCCCACATTGAAATCACCATGCAGAGGATCGAAGTGGAAGAAGTTGTGCTTGACGCGGTAGGATTTGTCGTTCCTCAGGGAGTACACAATCACACCGTAGGCACCCAAATCCGGAATGTAAGCAAAGGCATCTTGGCACTCCGAGCGGTCCGCATCCACAACCTA---AATATTGAT--TAATTCGATCAGTTTGGAATTTAAATA-ATACGCCTATGCATACTCACAATATTCGCAAAGAACGAGTCCTCTTTGGTCTGATCAGCGGGAATGGTGAAACGGCGCAGTAAAGTATCTGTTTTCAAGTCGAAAACCAGGATTGAATTGGGCGTAATCTGCTTGGGACTGCCCAGGATGTCGGCCAAGCCAGTATCGAGCACCCACAGGCGATCGCATACGTCGACTTGAATTCGGAAGGTGGAAATGACAGTGGAGTTGTCCTTCAGCTGGATGCCGGCATCTTGAGCCTTGTCCGCGTCCAGACGTCCACCGGATGGTGTCTTTTGGTCCTGTGGCTGCACATCGATGGGCAGCTTGTTGGCCTCCCAACTGGGATACGGATGCAGCTTTGGCGACTTCTCCGTCGAATTAATGTCGATGTAGTTGAGTGTGGCAGCAACACCAGCCTTCCATCTAAAGG
GCTAGG-------------ACGCAATACAGCACATATAGACTTGGACACT--------TTATTAAGTGAATATAATTTCATAAT-TAAATATAAAATTA------ATTAAAGAGAAAACAAATCAATTTGCGCACAATCAAAGGCTCACTGTTCGCATGGTGTACCCTTGATAAGATCACGATTCTTGCCGGTCAATATGCGATAATTGACGGCCGTCTGATCCAGCTCCTTGTACATGAAGGTGGGCATTCTGTCGGATAGCACCCAGAGTGAGCCAGTGCTGTCGACTTTTAGATCGTTGGGAAAGACCAAAGTATGCGAATCGGAATCAATGAGTCCCTGTGTATCCGCTGTATATGGACGATTGATATTCCAGCAGGCGATGGCATCTTTGTTCACTTGCGTGTAAAACAATACGCCTGTCTCCTTGTCGTACGCCTCGGCCGTCGACTGTCCGTTCATGCCGCGGTCGCCGACAAGTTTAAAATCATGATAGGATTCGCCGCCATTGACATGACTCTCGTTTTGGAGCACACGATTGGAGACCTTGAACTCCTTGGTGCTGGCCAGCGCATGGAAGTATACGTCCTTGGTGTGATCGGGTTTCAGTGGACCAACGGCCAAGGCGAAGACGCCATCGGTCCATTGGAAATTCACGCCTCCCACATTGAAATCACCCTGCAGCGGATCAAAGTGGAAGTAATTGTGCTTGACACGATAGGATTTGTTGTCCCGATAGGAGTAGACAATGACGCCATATGCGCCCAAATCTGGTACATAAGCAAACGCATCATCGCACTGTTCGCGCTCCACATCGACCATCTATACAATATGGATAGAAAACTTTTTAAGTAAAAATCTAAATAGACTTGGCCAAGTGTACTCACAATATTAGCAAAGAACGTCTCATCCTTGGTCTGTTCGGCGGGTATGGCAAAGCGGCGCAGCAGCTGATCCGTTTTCAGATCAAACACCAAAATCGAATTGGGTGTAATCTGCTTGGGATTGCCCAAAATATCGGCGAGACCCGTGTCCAGCACCCACAGACGGTCGCAGGCATCCACCTGAATGCGGAAGGTGGAAATTATGGTGGCATTGTCCAGTAATTGTATGCCCGCATCCTGCGCCTTTTCCGCATCCAAGCGGCCACCGGCGGGCGTCTTCTGCTCTTGTGGCTGCACATCAATTGGCAGCTTGTTGGCCTCCCAGCTGGGATAGGGATGCAGTTTCGGTGATTTCTCACTGGTCGACAGATCAATGTAGTTCAGTGTAGCCGCCACGCCTGCCTTCCATCTGAGGG
>ck 15040890 15041342|16439 chr2L 15040728 15047430 scaffold_2 5358411 5365081 + 377592|166 703
TAAAA---------------CCTACACATA---------------ACGCAAA--------------------ATATTTATAATAATTATAAATTACAATTGCAATAACTTATAAAAGCCTAGTACTTTATAGATTTAAATCATACTTAATACCCACCTCCCTTTATTCCAATTGCATTCCCTTCCCAGAGAATTCATTCCAATTTTGGTCTTGTTCA---GCTATCGATTATACCAAACCAACTTGCAACTTT------TGTTTTTAGTATTTGTATTTGTATAAATTTTTGCAATTACACGTTTAGGTATTCTTATGGCACATTCCGG----TTAAATTATTAAATACAATGTTTTTGTATGAAG-AAAAGGTCTTACATAT-----TTTTAGATAAGCATTTGTATCTACACATATTGCA-TCTATA----TCTTTGTATATCCTAACTGCATATCTGTACTGATGACGTTTTGTATCAAATACATAGAAATGTTCAATTATTTAATAAATTATATACAAA-----------TTAT
TAAAGCTATCTAAAAAGACTCCCACACACACACACACACACACACACATAAATAATATATATATATATATATATATATATAATAATTATAAATTATAAATGCAATAATTTATATAA--CTAGGACCT---------------------ATAGTCAATTACCTATTGTGCA-------TTCCTACTTTGATAACACATTC--GTTTTTGGCTTATTTAGCTGCTATAATTTATACCAAACCCTGTTTCATATTTATATAATGCTTTTCTTTTGTAAAAATATGCAAACTTTTGT---------TTTTAGTA-TCTTATCTCACATTCCGTTTACTTAAATTATTGATTAAA-------CATATCAAGTTGAAGGTCTTACATATTATCCTTATAGATAAGCAATATTATCTATGCATTTTGCACTCTATATAACTTTATGTATATCTCAACTGCATATCTGTACTGATGACGTTTTGTATCAAATACATAGAAATGTTCAATTATTTAATAAATTATATATACACACAATCTGTGTTAG
>TfIIS 15054848 15055419|16454 chr2L 15054721 15054859 scaffold_7 4287773 4287920 + -67|142 153
TCGTTGTGTTAG
TTGTTTTATTA-
>TfIIS 15054848 15055419|16455 chr2L 15054860 15054912 scaffold_7 2831727 2831779 + 1953|0 52
TCATATAGCGGGCATAGGAATAATTAAAACATTAACGCAAAATAAATATGTGT
TCATATTGCCAGCATATTGAAAACTGCAAACGTTATGTGAAATAAATATGTGT
>TfIIS 15054848 15055419|16456 chr2L 15054913 15055096 scaffold_7 3365134 3365370 - 2205|0 239
GAATACATTATAAATATAACTCAGAATGATCTA-GCAGAGAAGTAAA----TAAGACGCCATATTGTGTATGTATTCTCGAAGAGTATTAACAACC-----------------------------GATGTAA------TTAGTCAGTTTTAAAGCAATTTGCATTAACGAACTTTGTA----------------TTGCATTAAGTATAGAAGTCGGAACGGGCCAGATCGGACAACTATA
GAGGGTATTATAATTTTATCGTGAAATGTGTTACGCATAGAAGGAGACGTCTCCGATCCCATAAAGTATATATATACTTGATCAGCTTCAACAGCCCAGTCGAGCCGAGTCCGTCTGTCTGTTTCTATGCAAAACTTGTCTCTCAGTTTTAAGGCGATCTTAATGAA---ACTTTGCAGAAGTCCCTTTTCCTGTTGCACACAGCACATATGTCAAAACCAGTTGAATCGGCCCATTATA
>TfIIS 15054848 15055419|16457 chr2L 15055185 15056799 scaffold_2 5371839 5373583 + 58333|0 274
CTCC-----CAAAATTG----TTCCAA--AATATAAATCAA--TCCCAAATGAGCACACACCACACATCCTTCATATTCTT-------------AAATGAAACATTGTAAAGACACGACACGCGAGAAAACATTTTGTATCTGCTGCCCAACTGCGGAGGCGTTTACTCTGACCACCTAAA-----------CCTTAAACGAGAGAAAAGAAATTTCAATAAACATTAACTATTGATA-AAACGGAGACGTCTTGTTG--CCGCAATCAGTTTTT
GTCCGCGTTCGAGTTCGAGTCCTTCAATTCATTTACACCAAATTCTTACATGCGAACCCCCCCCCCCCCCCTCCTCCTCCTCCACCCCTGCTCCACACTAGATATTGCATGTGCAC-ACGAAAAGGAATACACTTTGTATTTG---------------AACGCATTCACTGACCACCTAAATTACAAAATTTCAATAAAAAAGAAAAAAAAAATATACAAATATATAATATATAAATATGTATGTGTGTGTGTTCTTGTTTTTTAATCAGTTTTT
>vig 15060127 15060362|16463 chr2L 15058815 15061005 scaffold_2 5374748 5377116 + 24512|1562 1839
ATCGATCGTTTT------------GGGCAGGAGTAGG----------TTCCTCAAATTGCAGTTTTGGTTACTGACGATGGTGAATGAAAGCAGCAAGTT---------------ACCAAAATGAAAACTTATAAATTAC--GTATATCACAGACA---ACAAACTTTTTAAAAACTAAAAGAAAAATGGGGAAATTACGAAAACAATTGTAGCCGCCATTATAAGCCAAAAGCAACAAAAATACCAACCAACAAGCTAAGTAAAAAAAAACGGATAA
GAAGCGCGATTGCAGATTAGGATAGAAGAGGAGGAGGAAGGGCGCTTCTGCTTCTGCTGCTGCTGTGGCAGGCGCCGGGAGTGCATTCAATTTTAGAGTTGGTGTCTGTATTAGGAGCAGGAGGAGGA-GAACAGGTTACCAATATATCAAATACACACACACAC-----ACACACCAATACACACACATACGAATTGTAAGCGAGAGTTAAATTTTCATTATAAGGCGGCCGCAGCGCAGCCA--AAGCCAAAAGCAAACAAAAAAAAAATAAATAA
>CG4168 15158036 15159510|16582 chr2L 15157780 15159133 scaffold_2 5509461 5511181 + 20657|278 1793
GACTTTTT------TTAAAAAGAATTGTGCTAGACTCGTCACCAAA----------ACTTATTTCTTCCGCTCGTAAACT-------------------TCCAGCAGAATGATAAACT------------------ATTAGTTATCTCAAGTCGAACTTATTCATCTAAATATGGCTTTTT------TACTCCCCTGATTTCCACTTTT------------------------------GACGCCCAATACATGACCT-----------------------------------TGTGTCTTGGCCAACATTTAAAGTAATTAATGCAATTGATTACTT----------------------ACACAGAACCATACACACACCAGCGAACATATGATGATTCCTA------------------------------------------------ACACACTCACACAC------------------------TTAGAGCATAGTTAATAAACAGTTTTTCATCTCCATAGAGCAACATAGAAACATAAGTTGTTAATAATAGT--------------TATATAACTATTTTTAAAACGAATTTGCAAAACCAAACTAATAATACGAAATCTAGTTTTATTTGCCTATAATTTACAATTTAG--ACAAGGCCAATAAGTACATTTAATATAAATACAAATACACACTTAGATAAATCGAGATATATAAAACGATATATACTAATA-------ATATGAAAATT--------ATTGGATAGCAATTATTAATTGTTTTTTAA-------GCAAGAGTAGCG-GACATTGCACATCTAAC------------------------------------------------AGCAGAACTAGAAAACGGTTTGCAAACTTTACGGGCAGTCAAATTTTAACAACACACACGCAGACATATATAAGTACATATCAG-TTTGGCAAAAAAAATAATAATAATGGTAAAATAATGAAAAGCATAATCATGT------------------------------------CATACACAGACATACACAACTCCAA---GCAATTTAACTGAGAGGAATAAATTACGAAATAAAAACGT---ATCCTTGTTTTTTGCGTTCATTACTCACTATTTCAATGAATTGAATTTTTTC----------TACCTTTTTATATTATTTCG--GTTACAACAATGACAATCGTGATACTAATTGTAGTTGTTTACACGACGATGATGCAAAGTGCACAAGTAAAATAATAATAAT-----GATATTGGTAAATAAACTATTGAATGAGACA--AAGTGGACAAATGAATTATGGCAAAACAAAC--------------------------AAACGAAAAA-------GCTGCTGGT----ATGCCAATTTTTTTGTTAC-CTAACCA------------TTCAGTTTTT-CAGTTTTCTACCCAACAACTGATGTCCCCAAATGAAAAAAAAAAAACAA
GATTTTCTTATCAATAAATATAAATAATGTTGGAATTGTTATTCAAATTATGATTCATTTACTCATTCCTTTTTTGGACTTAATATATTGGCTAATTACTTCATGCGAATGATTCAGTTAACTATTTTCGACACTAATTAGTGGTCACAGCTGTTCCGTATTATTATTTATATTGTTTATTATGCGATACTCTTTTTTTTTTCTTATTTTTCATATAATCATTTATTTAGTTACCATCAAAAGACCATTACGTAATTTAAGTGCAGACGCTACACACCCTGTCCGCTTAGCGCTGAGTCTTGGCCAAC-TTAATGGTAATTAATACAATCGATTACATAAAATCACAAACACATTAACACACACACACACACACACAAACAAGCGGATATATGTTGATTCCTAATAGGTGACAAGGACACAAACATCATACTTATTTATAGACACACCCACACACACTCACACACATACATACACACACACACTCACAATTAGAGCGTAGTTAATAAACACTTTTGCATAT--ATAGATTTA-ATAGACAATTAAGTTGTTAATAATAGTATACATGAGGTATATATATGA-TATATATATGAGTAATTTTAAAAGCTGAACCGAT---------TCTAG----ATACAAGTATGGAATACAACTTAGCAACAAGGCCAATAAGTAAATTATGAATAAATAAATCTATA---TTAAATAATTTAAAA-ATATATAACTAATTATATGAATATTTAAAGATACGAATATGAACGATCAATTGGATAGCAATTA-CAATGGTTTTTTAATGAACGTAGAAAAAAAGCGCCACATTGCACACTTATCACTTAAAAATATAAATTAAAAAAAAAACAAAAAAAAATAAAAAATACGAGGATTACTAGGGATGGGTTTACGAACTTTGGCGGCAGTCAATTTTTAAC-------------ACACATATAAGTACATATCAGTTTTGGCAAAAGAAAT-TTAATAA----AACCTAATGAAAAGCGTAAACATTTACAAAGTGCACACACACACACACACACACACACACACACACACACACATACGCGACAACAATATGAATACCAATTAAATGGCATAAATTATCAAACACAATTTTCCAACCACTTTTTTTTTGTTTTGCTACTC---TTTTTTGTAAATTG---TTTTTCAAAATAAAATCACCTTTTTGTTGTGTTTTTTCGTTACAACAATGACAATCGTGATACTAATTGTAGTTGTTTACACGACGATGATGCAAA-TGCACAAGTATAATAATAATATTAAACAAAAAGAACTAAATAAACTATTCACTGAGAGAACAAATGAATAAATTAATTAAAATAACCGAAACGCAGACCCACGCGATTTTGTGGTGCGGAATGAAGGGTTCGACTGCTGCTGGTCATGAAATAACTGTTTTTATTCCTTTAAGCAAGCGTATTCTTTTTGGGTTTTTGCAATTTTTGTGAAAACATTTTTATTATTAAAATATCATATTGTAAATAC
>CG4168 15158036 15159510|16583 chr2L 15159170 15163491 scaffold_2 5511230 5515515 + 200586|0 363
TGTTGGCTTTAGTTGCCGGCG-AAGTAGGTTACTCAGAGATCGGATCGGATTCCGAACTGACTCCGATGC-TGTGGCTGAAATGCTGAAGATACTCAACTGATCATTGCCTGTATGATATGTACATATATAAATATATATAAAATGAAGAACTTAAACTAATCGGTAGGTACGAATTTTTG--------GGATATAGCTAATTGTGAGAGCCAGCCCCCGCAACAATAAAGATACAATTAAATGAAAGACA---AGCAAATCGGTTTATGTCCACTCGTAAATAATAAGTTTTATATGC---------ATACAAACAAA-GTATATTTATAAGTAGTGGAACAAGTCATGTGCTGGGCACTTTA
TGTTGGCTCTAGTAGTTGATGCAACTGGCCAACTGAGATGCCTG-TTGGATAACGA--------TAATATATATGTATGATAT-TTGTATATA--AAGTTGAACATAATAT-----ATATATATATATATAAATATATATGTA----------TGTACTAATC-GTAGCCA-GAGTTTTGGCAGCACTTGGAATTAGCTAATG---------AACCCAAACAATAACGAAAAAAAAGGTAGAGAAAAAATAAACAGCAAATCGGTTTATGTCCACTCGTAATGTGTAAGTTTTATATATGCATATTTAATATGTACAAGTATATATTTACGGAAAGTACACACATATATAAAGTAGG-ACTTTA
>CG3994 15224658 15224857|16664 chr2L 15224840 15224937 scaffold_2 5609604 5609707 + 3509|0 17
AGTTCTGATACCGCTTAC
ATTATTGAAAGCGCTCAC
>CG3975 15248317 15250896|16695 chr2L 15248153 15248737 scaffold_43 635993 636543 - -2323|167 601
TTCCGAGCACTTACCGCGGTGCACCATGAGGCACTGCTCCAGAAGCAGCCTGGCCAGAGCCACCTTGCACTCGTGCAGATCCATCAGTTGGTTCTCGGCGCGCTCGATGGCCGCGTACAGTTTGCACCTCTCCTCGATGAGTTCGCAATCGATGAGCGACGTGGTGAAGGCCCAGAACCACTCCAGTTTCTGGTACTCGCCGCAATGT--GGACACATGATCAGGTCGGCGCCATTGAACTCCGGCTGGGTGTACTCCTCGGATAGCCACCAACGCAGACTTGGAGCATGGGGCAGGGCGTTGGGTGTGAAGATCTCCATACAGTTTGGGTTATCACAACGGTAGCGATGAAACTTATGCTGCGGGAGGATAATTATTTAAAGCATTATTACATAATAAATGAA---------TGGTGTCTCAACTTACGAA---
TTCCACTCACCTGCTTTGG----CTGTTAGGCAGGCCAGGATTAGCTTTTTGGCCAAGCATTGCCTGAGACTATGATAGTCGAGCAGCCAATTTCTGA-------GATAATCGAGCACTTTGTACGCCTCGTGACG-------CGCATTCGGTTTATCACA----GCATGCGCATAACACTAGAAATTCCTCATGCCAGCTGAAATCTTGGGGCGCCTGACATACTGTGCAGCA--AATTTGTGGCGGTTCGGGCTCCT------GCCACCAGCTGAGCTCCGCCAGCTGGG---------CAGGCACAAAGATCTGCTCGCAGTGTTGG------CAGCGATAGCGATGAAAAGCAAACTTCGAGAGTAGGGAAAACAAATGAGATGAGATGCCAAAAATAGAGCGTAGCTGTGATAGGTTAACCCACGTAATC
>CG3975 15248317 15250896|16696 chr2L 15249180 15249421 scaffold_43 636661 636902 - 4073|0 241
GGCGCAATATAATCCTCGTAGTAGTTGATGAATATATCCTTGAACTCGTCGGCTATGAACTCCAAAGCATTTAGCATTTGCATCAGCTCCCGATCGTTGCACTTGTAGTTGCTCAGCGCCATCACATCCCAGAAGTAGGAGAAGTACTTCACGTACTCGATTGACTGTCCGCCATACTGGGCCATCACGCTGGGCAGCACGGATCTGAGGATGGAGCCCAGTTTGTTGAACTCCCAATCGTC
GGCTCAATAAAATCGTTGTAATAGTTGACAAATATCCGTCGCGTTTCGCCGGCCAGATAATCGAGCTTGGCCCGCATCTTGGCCAGCCTCTGCTTGCTGCACTTGTATTTGCCCCAGGCAATCAGATCGAACAGGCAGCCCATTATGGGTATGTACTCAACCGCGTTGCTGCCAATCTGCGCCTCAGTTCCCGCCAGCACGTATTCCATAATGCGCCCCAAATGGCCAAATTCTGTGTCCTC
>CG3975 15248317 15250896|16697 chr2L 15250775 15252255 scaffold_7 4345825 4347274 + 30997|0 139
ATG------AAAGCAAAGCATGGAGATGTTGCTAAAGTAAGGGTTAATTGTTAAGCATG-----------GAAACAGTTAATGTTTTTAATAAATTTATTTATG-ATTATTGAAAATAATATATATTTTATGATGGGTTT
CGGCGCTCCCAACTAGTTTAGTTATATGTTACAATAACTGAGATTAACAAATTAAAATGCTAGCATTCCCGAAATACACACGATTTACTACAAA-TCATTTATGTATAATTTATAATAAATTAAACATTTTTCTTAGTTT
>yuri 15253266 15253341|16699 chr2L 15252655 15253521 scaffold_18 353533 354511 + 19207|692 792
GAGTCGCCAGGATTTGCATGCAACTCCTCCTTCCATTTAAAAATCGTTCTCACCCA---AAATC----------------------TCTATGCCATCAACA
AGCTTGCTGTAGGATATATTTATTCATTCCTTCTACTTGCGGTTCAATTTTACTCATTCAAATCGGTTCATTTCACGTAATCGTTTTTTTTCCTTTTATCA
>yuri 15257135 15257389|16702 chr2L 15256044 15257216 scaffold_18 357726 358731 + 2224|1138 1219
CTAGAATCACAGATTGCTGAAATGAATAGTTTTAATGAAATGAACTAGTTTTAAATAAAGTTTCTTTCATATCCCAACCAAA
CCCGTGCCGAAGATAGCGTAGTTCCCCATTTCTCGCAAAATGACCCCATCTAAACAATGAATCGTTTAATTTATTAAAGGAC
>yuri 15257135 15257389|16703 chr2L 15257217 15258795 scaffold_18 359146 360832 + 2541|0 234
CTATGTCACTTGTTGGGCCTCCTAAAC--------AGTTAGTCTAATCTAAGCCACGTT---------AAGAAGTT-------TGTATAGTTTAGCTTAAAGTTTGTCGTTCTTAAGT-------TATTTATCATC------------GCGATTGTTCGCCACGAAAACTC-------------------AACTCCACTCAAATCTATATCTATCTATATATGGTTAAACAGAAA
CC--------------GCCGCTTAAGCATAGTTTAAATTAGTTTAATTTATCATAAGTTTCTAAACAAAAAACGTTACCTAAAAGTAAACTTTAGCCATAAGTT--TTGTTCTATAATGTACGACTATTTATTAGCTTTAATAATGCAGCAAGTTCCCGCCAAAAAATTTCAAAGGCAATAGTTACAACAAACTACACTTACATCTAT---TGTATATAAATTGTTATATATAAA
>gft 15261956 15262302|16706 chr2L 15260554 15262153 scaffold_18 363903 365633 + 3293|1583 1817
ACTGACCACGATTATAGATGACCGCCAGC-CAATAACCCGAATACATAAATATATCAATTAGTGCGCCCCGAATCGTAAAATTTCGTTTCGCAACCC---------------ATTTTGTAAGCCTGACATTCAAAATTCAACAGTTAAAAATGCTAT-----TGGATAAGGCACCACCATAATTATTATCCCTC----------------TAATATATTTCTTGATATTCTCTAA
ACCATCCAAAACTTTAATTAAGCGCCAATGCAGTTACGAGCATCCAAACTGGAATCATATATTTTGACCAAGAT-GTTAAATAGAATTATATAACTCAATAGACAAGTGCGAAATTTGTAAGCCTGACATTCAAAATTGAACAGTTATTGCTAATCTTTAGATGGTTATGCAGCTCTCCTTCTTTCTCTCTCTCATGCCATTGCTATCCATAATATAATTTCGACTATTCTCTAA
>gft 15261956 15262302|16707 chr2L 15262229 15264704 scaffold_18 365708 368208 + 119442|0 90
-CGGCCCACAAAAAGTAGCAGGAGCGTCTTAAGCAGGATCCGGAACACACTCAT-----------------CTTCAAATCGCCAGGGCTTG
TCCGCGCGCAAAAGGCATCCAACTCAT-TCAATCCG---TTGGCACATACTCATCATTTTGCAATCGAAAGCTACTAATCACGAGCAACTG
>CG15261 15270155 15270197|16717 chr2L 15270019 15270806 scaffold_18 373152 373946 + 18277|247 296
CAACTAATGTCTAATAAATTGTGAGA-------AAAGTAGAAAAGTAGAA
CCATTAAAGCCTTCAAAACTGTAGGGCAGAACCAAATTAAATACGCATTA
>CG31828 15364112 15364732|16853 chr2L 15364094 15364461 scaffold_18 2330314 2330746 - 11694|20 442
ATGAGCTCGAAAGGATGC---------GGCTTTGTGGGGATTGCGGTGCAGGAAAA-----------CGAAACGAAAATTGTAAATCACGAATTTT-GCTGGAAGATATGCAAAAAGCGGCGCACATTTTGTAGCAAATTGAATTTTCAGCAGAAAATCCCCAAGAAGG---CGGTCGAGAAGTTTTGTAGCGAG---------------------------GCCTTGTTAAAGGCGAAAAAATAAGAATCAGCCGCGCGCGCTTGCGCATAAATTTC-CAAGCCCCAATCGGAGCAGAGTACCAGAGGGAAAAATATAAATAAAAATAAGAGCCGCAACAGGTTGCAA-----------CAGCAGCAAGAGCATG----------CCCCAATCTGCATATACAAGCCATAAAGCAATTTCCA
ATGAGCCCGAGCGGTGGCCGGAGTTGGAGCCTGGCAAGGAT-GAGGCACGGCAAAAACGAAACGAAACGAAACGAAAATTGTAAATCACGAATTTTTGCTGCCAGATATGCAAAA-GCGGCGCACATTTTGTAGCAAATTGAATTTTCAGCAGAAAACCCAAAAACGGGCAACGAGCGGGGGGTTGTATGACTGGAAGTTGTTCTTGTTGTTGTTGTTGTACGCCTTGTTAAAGGCGAAAAAATAAGAATCA-----GCGCGCTTGCGCATAAATTTCACAAAGAGCATTTGCAACTGCG--ACAGGTTGCAGGTTGCAGGCAGCAGCTAGCAGC-CAACAGTTCCCAGTTCTCAGTTCTCAGTTGCCAATGCTCAGTTCTCTGACTCCCAATCTGCATATACAAGCCATAAAGCAATTTCCA
>CG31828 15364112 15364732|16854 chr2L 15364690 15365390 scaffold_18 2330747 2331504 - 18583|0 46
ATCAGGCACAGGAAGGTCTC--AGCATAGCAGC--CGGGTATGGCAA
ATCAGAGACGAAAAGACCGCAAAACGTTTCAGCTACGAGTATGCCAA
>wor 15419222 15419650|16927 chr2L 15419222 15422139 scaffold_18 548622 551974 + 86602|0 561
TC----------------------------------------------------TTAGTCAGTTTAGCCAAAGTCAGAAGTCAGATTCAGGGAAAAGTCAGTGCCAAAAATTAGTCAGGGCAATTTTATTGCCTCTTAGGGTC---TCTAGTTTATCAGAA-ATAT----------------------------TTATTTAGAGTTATCGCTAAATTATTCCAAAACTCATATCG-CAGTTGAGAGCTTAGCATTAGA-----------TTGT------------TTTCGTTGACAATTCCTTGTATTATAGTTCGTTGTTAAAACTCATTCGTGTACAAATCAAAAAGGTGCCAGA-TAATTAAGCCCCAATTCATACGACATACCT--------------ACCAACTTATAATTTAATCTTATAATTTATTT-TACCTTAAACATTATGATTTAAGCCTTGTAAATA------TGGTGAAGGTAGCCATTTACTTGCATGTATTTAATTTTAATTTTTTTAAATAAATAAAACAC---AAGAAAACAGAAACCACCAACA
TCTATATACAATCAACTGTAGGATAGTTTGGGGCTACCTCCAAGTATTAGTCAGTTATACAGTTTAGCCAAAGCAGGGAAATA-AGTCAGT---AATTCAGTGCCAAAAATTAGTCAAGGCAATTTTATTGCCTATTAGGATCATTTCTAGTGTGGGAAAATATATTGTATCCAAAAGTTAGAATTTATATATATTATTTATATTAACTATTTAATT-TTGTAAGATTCGTAGGGCCAAGTCAAGGATTTGCATCAGATGAGCAGCCATTTGTTGTTAACTCATGTTTTGTTAAAATCTTTTTACGTGTATATTTATTGTTGAAACTCATT-GTGTACAAATCGAAATGGTGCGAGATTGTTTATAGCTCGAT--AGAAAATATAGCTATGATTATTTTTGCATTAAAATATTATTTAATTTATTTCCTCATTTCTACTTGTGTAAATATGAGCAAAAATATAGAAATACTATATTTATTCATTTAGCCAAGTTCTTGTATGT-TTAGAATTTAATGAATTAAAATAAATATAAAACTGAGAAAAAACGAAATGGAGCAACA
>sna 15472522 15472863|16992 chr2L 15472423 15474890 scaffold_18 600777 603549 + 76772|119 520
GATTCTCGACATATGAATCCCTTAGCAGGAC--ACAATTACCTAAGCAAAC----TCACATTCCGCTGGCGAAGACCAAA-----------CAAACAGACAATA--------CCTATTATAAGTTTGTACTAAGTCGATTCGGTTTTGGTGCTAC------------TAT----TACTATATTTATTTCAGCTATAGTATTCTAAGTT--TAAGTTCATGTATATTGCCTCATTGTCACACGCAGCATTTTACCAAATCTATTCATTTAATTATAATATACCCTTATT-------TATGTATTCTCAGTACTGTTAAGCCAACTGT--TGTTAAGAT-TATTCCTAGCTTAAAGAGAAGAATTAAATATTTTTAT-AAAATAAAACTCACGA------AAAG
---TCTAGACTGGCGCTGCTCATCACAGGACCAAGACGAACCAAAGCAGACACAAACACATTCCGCTGGCGAGGATTAAACCCAACCAAACCAAACAGACAATAATCTAGCCCCAACTCATAGTTAACATAAGGTCTTATCGGTTTTGGTGCTATACATTTAGACAGTATAATATATCATATTTATTTCAGTTTTAACACTTGTAGCTCCTAAGTTTTTGTACATTTGC-CATTTTATCAGACAGCATTTGACCAAATTTAAGCATTTAGCTATTA---ACTTTTATTGAACTTGTATAATTTATGAATTATGTTTAGCAAATGTTTATGTTAAGATCTTTTGCTAGTTT----TTAAGCCATATATATTTTTATAAAAATAAAACTTAAAACATGACAAAA
>CG11864 15608419 15608446|17138 chr2L 15608318 15609028 scaffold_18 771702 772413 + 10398|108 136
GCAAAATATAT-TTGAATTAGTCATAAAA
TTATTACATATGCTGAACTGACAAAAAGA
>CG15254 15609857 15609899|17141 chr2L 15609545 15610891 scaffold_18 770204 771678 + 26841|387 461
TAAATAGAAAGA---------GATCATAAC---GCAAATATAGATG------------CTTTA--------ACCG
AATGTTAGAATATGCATTGTGGCTGATAACCCATCAAAGGTAAATGAAAAAAAGGTTCCCTTAAATAGGAGACGG
>CG31825 15651573 15654016|17185 chr2L 15651540 15651986 scaffold_7 4387481 4388060 + 902|33 594
TTTCGCCACACAGACGC-----CTATTTTTTTTTTTTTTTTCAGCCCCCTTCC--TGGGCATT---------------TCTTTGGTGTCGCATCGCCTCGACCTTT-------------------CCATAAGTGCATAATATTGTTGGAGAAAAAATGTACAACAAATATTTTATAATACACGGTCATGTTTTGTCTGCTGAACTTTTCCATCCAT----GTTCCATCCCG---------------AGTTGTATTAGACAAA--GCGACTACGCATGTT-GGCAATTATTTACATGGGTATGACATTGTTTGTCGGA----GCAAATAACTGAGGGGTTCAGATGAATGACATCTTAGAGAGTGCCATTCATGATGCAATGATTTCTTT-----------GTACACAGGTTTTAGATTTC-----------------GAAAATGG--------------------------GGTGGGCTTTTTAT--------TATTAACCATTTTC---AGAATTTATAATCATAT-AGTATTAATACATT---------------TAGAA
TTAAGCAACAAGAACCCAAGATTAATATTCTCTCTTTTGTTTTACCAATTTTCAATGGGTATAGGGCGCAAAAATCAACCCTTGGTTAACAACAGCCTCGACCTTTGTAAAATGTCCAACTTGTGCCGTAAGTGCATAATATTGTATGAGAAAAAA----------ATATGTTATGATACACAGGCATGTTTTGTCTGGTTATATTCTAAGTTCATAGCTGTTCTATTTTGTTGTACTCTGCTCTTAGACATGTCAGACGAATTGCAAATACACATGTTCTGCCGTT--TTAGACAGTTATGTTTTTGTGACTCGAAAGTTGCTAA-AACTTTTAGTTTTTAATGTAAAAAATTGCAT-GAGT-CCACACACACAGCGGTCGTTTATTTTAAATATAAATGCTCGCCAAATTTTTATTGCTGAATACAATCAAAACTGAAAACGGCGATTATATATGGTAACATATCTGCCAGTAAAACATTTATGAATGGGGCATAAGTCGCTTTTGAGAGAATTTATTTTAAAATGAATATTGGTGCAGGAAAATATGTGCATAATAAAA
>CG31825 15651573 15654016|17186 chr2L 15651987 15652339 scaffold_7 4388281 4388525 + 8026|0 355
TCTGGCGAACAAATTGCGTGCAAGTGGCTGCATTTTGCTAATTCCGGCACCACCCAGACACTGCACCGCTGACATTTGAGCAGGTCTCCTCGGTCTCGGTCTTCTAGACCCCGTTCCAGACCCAGACCCAGACCAAGACCCATTCCCATACCCATACCCATACTCATTCGCAGCCATCTTTGGCGTTGTCATTGTTGGCTTTTGAATGTTAAGATGTCGACAGCTGCACAGACGAGCGACAGGGAAGCCAGCTGGTGTCAACTAAGAATCGTGCGCGAGAGGGCATTGCTCAGGGTCGGGTCTCCAAGCCAAAGTCTCA---CCCATTCCATCCATCCATATATGTATGCAACCCT
TCTAGCAAACAATTTGCGTGCAAGTAGCTGCATTTTGCTTATTCCGGCAGCGCC--------------CTGACATTTGAGCAGCTCTC---------------------------------------------------------------------------------AGAGTCGCCTTCGCCGTTGTCATTGTTGGCTTTTGAATGTTAAGATGTCGACAGCTGC-CGGCGCCGGGACAGACAA-CCAGCTGGTGTCAAATGAG---TGTGTGTGTGAGGGCATTGTACAG-----------CAAGCCCCAGCCTCAACGCCAATCCCTACCAACACCGACTAGAAGATACCCT
>CG31825 15651573 15654016|17187 chr2L 15652340 15652497 scaffold_7 4388642 4388801 + 3904|0 168
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AAATATTTAACTAATCTCTTACAAAAAGCTAATATAAATTTCTTAT--------ACAAGTTATTGCCTCAGCATTTGGCACGTGCACTCGAACGGAAAATATATTCCTAAGAAA
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GTTTTTTTTTTTTGTGCCATTTCTCACTCTTTCTCTCAGCCGCTTG------TTGGCTGTCATTCCG---TGTCTTTGCCCCTCTCTTCTCTGCCTA---TCTCTGG------CGCTCTGCTGCTTG-----------GCTGCTCGTCATCATCCTTGTTGTTGTTGTTGTTGT-TGTTGTTGCCTGCTTTGCTATAATGCCACTTGCACTTTGACGTTGACATTGTGCGAGGTTTGTGTTCGGTACA-------------AAAAGGATTCC------ATGTGTGCGTGTGTGTGTCTCTCTCTCTCTCGCTCTTTCTGTATTGAGCTTGTAGTGCAAAGCTCTTCTAGCTGGTCGCCTGCATTTCTTAAATAGAAGCATGTGAAAAGGGCAGCGTCTGCCGCCTAGCAAATGTCTTCACACTAAAAGCATTCGC
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GGTATAATTCCAGCATATTTTTAATAGATTATTATTT-----AATAAAAATTTAAA--ATCTTATGATTTAACCAA---AAGTATACTGTTATTATGTAAAATATAAAATGAATAATTACACATATTCCATATTCCATTGCAAATATTTTGATTTGAATAAAAAGTG
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TGTGTATGCGA----TTAAGCAACAAGAACCCAAGATTAATATTCTCTCTTTTGTTTTACCAATTTTCAATGGGTATAGGGCGCAAAAATCAACCCTTGGTTAACAACAGCCTCGACCTTTGTAAAATGTCCAACTTGTGCCGTAAGTGCATAATATTGTATGAGAAAAAA----------ATATGTTATGATACACAGGCATGTTTTGTCTGGTTATATTCTAAGTTCATAGCTGTTCTATTTTGTTGTACTCTGCTCTTAGACATGTCAGACGAATTGCAAATACACATGTTCTGCCGTT--TTAGACAGTTATGTTTTTGTGACTCGAAAGTTGCTAA-AACTTTTAGTTTTTAATGTAAAAAATTGCAT-GAGT-CCACACACACAGCGGTCGTTTATTTTAAATATAAATGCTCGCCAAATTTTTATTGCTGAATACAATCAAAACTGAAAACGGCGATTATATATGGTAACATATCTGCCAGTAAAACATTTATGAATGGGGCATAAGTCGCTTTTGAGAGAATTTATTTTAAAATGAATATTGGTGCAGGAAAATATGTGCATAATAAAA
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AGAGTCGCCTTCGCCGTTGTCATTGTTGGCTTTTGAATGTTAAGATGTCGACAGCTGC-CGGCGCCGGGACAGACAA-CCAGCTGGTGTCAAATGAG---TGTGTGTGTGAGGGCATTGTACAG-----------CAAGCCCCAGCCTCAACGCCAATCCCTACCAACACCG
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TAGAACAAAAAATCACTCATACGCCACCGGCTGCCAGTTGACTTGGCAAATGGTCAATGCGAATT-GTCGTTGTCGAATTCTGTTCTTCTTTTATTCTGTGCTCCCTCTTCAGCTTATGCTGCATACTTTCAGGCTGTTGCTC-AGCCAACGCCCA-------TGCACTTGTCACGCACTTTTCGCCTTTCTTTTCTCGCATTTTGCAGCTTTCTTTTGCCATTTGCACTGCGTTTCTCCCCCCTCTGGTCTGGTCTC-TCGCTTCTATTCTTTTTTATATGACTC
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AAATATTTAGGTGAACTAATATTAAAACGTAATATAAATTTCTTTTTCGGCTGCACAACTTATTGCTCCAACATTTGGCACGTCCATTCAGATGGCAAATATATTGGAGAAAAA
AAATATTTAACTAATCTCTTACAAAAAGCTAATATAAATTTCTTAT--------ACAAGTTATTGCCTCAGCATTTGGCACGTGCACTCGAACGGAAAATATATTCCTAAGAAA
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AAATGCGTTAATAATCCTTAAAGTAAACCACATCAACTGTGAATGTGTCACGGCCGGAGTCGTCGAGCAGCTCCAGAGAGGCTCTCTAGACATGTGCTCCACAGTCCGCAGCCGTCGTCGTGCTAGTAGCTGGTTAAATGCCCAACGGA------CATGGCAGACAGCACTG--GCGGGGCAGGT----------GGTGTCAGGTGTGGAGTTGAGGTCCGCTCACTTGATGTCAGTCTATTT
>CG33311 15685170 15687613|17235 chr2L 15686928 15687429 scaffold_7 4390475 4391001 + 3847|0 575
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CATTAAAGCATTTAAAAGGTCAATATCGGCATCGCTTTAGCTTTCGTTTAATATTTTTCAATTGACAACAGAGTATTGTCCAGTCGTTACATAACTGCTGGCAATATTCTAAGTTAGTTTTTTCACAAATGAACGAAATTTGTTTTTTTTTTTTGTGCCATTTCTCACTCTTTCTCTCAGCCGCTTG------TTGGCTGTCATTCCG---TGTCTTTGCCCCTCTCTTCTCTGCCTA---TCTCTGG------CGCTCTGCTGCTTG-----------GCTGCTCGTCATCATCCTTGTTGTTGTTGTTGTTGT-TGTTGTTGCCTGCTTTGCTATAATGCCACTTGCACTTTGACGTTGACATTGTGCGAGGTTTGTGTTCGGTACA-------------AAAAGGATTCC------ATGTGTGCGTGTGTGTGTCTCTCTCTCTCTCGCTCTTTCTGTATTGAGCTTGTAGTGCAAAGCTCTTCTAGCTGGTCGCCTGCATTTCTTAAATAGAAGCATGTGAAAAGGGCAGCGTCTGCCGCCTAGCAAATGTCTTCACACTAAAAGCATTCGC
>CG33311 15685170 15687613|17236 chr2L 15687434 15687470 scaffold_7 4391199 4391235 + 213|0 36
GATGAAGTCCTTGGGTGTCCTTGGCTGACCATTTGGT
GGTATAATTCCAGCATATTTTTAATAGATTATTATTT
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CAGCATTTATTTGCATTCGTTTGCAAGCTAAAATTGACTTTAAAATTGCATTTAATGGCGGAAAAAAGGCTGTGCCACGCCCCCTGCA
CAGGCTTTATTTGCGTTAAGTTCGAAGTTTAAATTGACTTTAAAATTGCATTTAATGGC----AAACAGTTTTACAGTTTTTTTTGCA
>CycE 15723691 15724809|17276 chr2L 15723372 15726926 scaffold_7 4435885 4439756 + 95205|345 1682
GAGATTCGCCTCACTGCTCTTGGCCATCATCCTCTCACACTCAC-CACACCCGCCCAAACAGTCT---ACGTTAAGTGTTTCTTATA-------------------------------------TTTAAATTATTTTTGTTAAGTGAAAAGTTATTAGTTGCCTAATTCC-TATGCTACAAACATATTTAATTTGAAATTATCTACGCGC------TCTTGATTCTCAACTCGCGATATAATCATTTTCCTCGCTCAGCTTAATATTTAACTTTGTGTATTTATAGAAAAAACAGAAATATAAT-----TTTAAATGTACACTATCTATAAAGCGCTCAAGCTTATATA---TATATATATACACATACACTTATAGTATAGC----AGACCAGACAAAACTGAATTAACCATTAGACTA-------------------ATACCTGCTGAAAAGGAGCACAACACTATCCA---------------GAATTCAGTGGTGTGACGCTCT------CACAAACCAAGTTGGG------------TGCCTCAAAAATGAAACAACAAAATATGTTCGCAATCATACATGTTTAGCTTTCAACCAGTCAGTCAATCATTTGATATCACCAAT-----------CACCAAGCAGCAACTAACAAAACTAAAACTGACAAACAGAAGAGGGGGCAGTAGCGGCCCAGAGCACAGTACTTGACTAATCAACTAAAATTAGCATATAAGTCGAGGGAATCTAT-----------------CTAACTCTACTAATGCAT-TTCATTC---------GACCATTAATCCTACTAACA--------ATGAATCAACAAACAAGAC-------------------------------------AAGTCCACAGCTGACATGGAG-TGACA-----AAAAGAAAATGGCAATTGAAGAAGTAAAGAATTA----AATATTCATGAATTGAAACCCCAGAACAGACTATATGTATTCATATATACATCATTGTAAAATTTTTTTAATTAGACTAATTTGCCATAATTTGCTAAGCAAATAAATTCTGTACATAAA-------ACAAAACAATACA-AAACGCACAAAAACAAGAATTAAC---CGTAACTGAAACGCATATAATATATTATTATATAAGTGTACAATTCTTTATATGGCTTAAAATATTTTATGTACATTCAAAAG-GCAACCACGCAAGGTAGAAAAATATTAT-TATTCGTTAGCTTAGGCATAAATAACATGTAAGTGTTCATACGATTAAGGCTGGATTGAAAAC-AAAAACAAACAAAAAACAACTAAAAGAAAAGC
TAGGCGCTCTAAAGGCCTGTCCACTGTCTCTCTCTCAAGCACACACACGCCCGCCCTAACAGATTTAAATATTAAGTGTTTCTAATACATATATATATATATAAATATCTAAAAAAAAAAATATTATAAATTATTTATGTTAAGTGAAAAGTTATTAGTTGCCTAATTCCAAATGTTTAAAAAATATTTAA-TTGAAATTTCATAAGCGCGCGCTTTTTTGTTTTTTCTCTTTTAATTTG--CACTTTGCTCGC--------------AAATCGCTGCCCAAACAAAAACAAAACAAAAACAATGCCTATTTAAATTATGTGTATCTATATAATATAAAACAATATATAATTTTAATGTTTACAATATAGTTTATAGTCATGCTTAAATCCAAGGCAAAATTGAATTCAACTTAAGTTTATAAATAATTATTATTTCTTGTTTTTGCCAACTTAAAGTTGAGCAGTATGTATTTATTATAGACTTCAGACTCAGCGTTGGCATATTTTATAAAGAACAATACACTTTAGGAAAAAGTCTAGTTACATTTAAATTGTACAGAGAGAACACGTCAGAAAACACACAC-----ACACTCAGACACTCATTCCCTCAGTTAA-ATCACAAACTCAAATCATGGCGCGAGGTATTAACAAACTAATCTTTAATC--CAGCCAAAAGTCTATGCACTAT--------------ATACTTGACTAATATACTAAAATTAACCGATAAGTTGAGGGCACATGCACCAAAATTAACAACGACTAATGCTAATGCGGCATATTCATTCATTCATACAAACAATTAACACTACTAACCCCATAAATATATATATATATACAATACATACATATATATATATATATATAAATATATGTATAGAAATACCTAAGCTGACATGAAGATAATATTTGTAATGAGAATTGGCAAATGAAAAAAAAAAAAACAAAAACAATTAACATGAATTAAATTACAAACACAATC---AAGCATAAATGTATATGTATTTGCAACATTTTTATTG-TAGAATAATTTGCCATAATTTGCTAAGCAAATCAA-TCTGTATATAACTATATATATATATCTATATACACACACACACACACACAGACCCGCACACACTGCTAAAACACATATAATATATTATTATATACGTGTACAA-TATCTCTATGGC-------AACGAATGTATATTCAAAAACAAAAACAACAACAACAAAAAAATATAGTAAAATTATTCACTTAGGTTAAATTAAACATTTAGTGTTCATATTTTTAAGCCTGGAATGAAAAAGAAAAACGCACAAA-------------AAAAGC
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AGAGATGATCGTCCCCGAGCTGGCTTAGTGATTTTGCTTAAGTTTGAAA---CGTAAAATTAATAATATCAAAA---CAAAAATCGCAATAAATATGGAA---AC
------GAACGAGCTCCAGCTGCCC----------------GTTAGAAACCTCTTTGAATTAATGTTAGCAACAATCAACAATTCGCAATAAACATGGAACACAC
>l(2)35Di 15746337 15746418|17303 chr2L 15746021 15746341 scaffold_7 3554685 3555004 + 833|335 339
CAGGC
CAGGT
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ATAAATAA------ATATTTT--TACATTA
AGCAGCAACGAATCATATTGTGCTACATTT
>Gli 15751930 15752866|17309 chr2L 15751952 15754034 scaffold_7 2958288 2960365 + 64934|0 1039
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GCACACCTGGAGGATTAATCGTAGCTTAGATTGTAGCTTTTGTTTAATTCCTAGTTTTATATTATTTATACTTTATGAC-------TACACAGATCTAAAAGATCTCTTGAGCCCGTAAGTGCAGCTATAATTATTTGTATTTGTAATTTAAAATTTGACAATTGTGTTTTTCTATTA--TTATTT----TCCCATATTTTCTAAGTTCGATAACCCAACGAATACGAATCCATATCAATGACATTCCATAGATTAGTTTTGGCCTTTTTGCCAGAGACCTCCTGTGAGGCGGGGCCTTGAAATGTACATACATATATATATATATATATAAACGACAACATTTAGACTAAGTTCATAATTTTAAGCACTACATTTTCCTAATGCTGTCACCTGAGTAAGAGTCAAG---GTATGTAAAAAATATTGG--TGAACCAATTGAAATGAATTAGCATTAGTCTAGGGGCAGCTTTAGTAGACGCCATC------AAAATACAATTATTAAATACAAATTGTACAATACTTACGCATAATAAAACTGAACCGCCCAAAACGAAGT--------TTCTGCAAGTTGTTGGGGTATTAGTTTACATG-TTATTGTGTTGTCAATGTCCATATTATCAAAA----ATTGAAAGAACA----------------------------------------------AGTGCC-----------------TTGCTCTAAATGGATCTAGC-------TTAGTGAT-----AAGTTTGTGTACTCATATTTCGTATTAGTGCTATAAGTTTTAACTGGCAGTTATA---TATATTTTATATATATGTTTTATGTGTCGCATATATAGAAATCAACGACCATAC-AAATCAGTGTGAACCGTCCAATATTTTTTATGTTTTCATGTGAAGCGTGTTTATATTAAGTATGTACTATAATTAATTAGGAGCTATTGATTACATGTGCGAAAACATAAGAAATACATTTACATATATAATCAT-TGTAGTGTATAATATTTGTGTGTATTTTTCC
>Gli 15752933 15753024|17309 chr2L 15751952 15754034 scaffold_7 2958288 2960365 + 64934|1116 1211
GTAACAGCTCTCTAAGCGCAGGATGCGCTTAGGGAGTCAGCCGAATCGTCCAATTACAGAGCCAATCAACAATCCAGGAGGAAGTATGCCA----G
GTAACCGCTCTCTAAGCGCGGGATGCGCTTAGAGAG-AATCCACATAGCCCTTTCAATGAA-CAATCAACCAAATCTGACAAATTTCGACATTAGG
>wek 15762404 15762563|17319 chr2L 15762040 15762486 scaffold_27 987429 987809 + -1272|369 451
AATTAAACACACAACTGCCCTTTTTGCATTTAAATTGGTTTTTAATAAGTTTCAAAATAAATTCACTTTTTAAACGCACACTT
AATAGCACACACTCCCAAAAGCAACATATTTAAATAAAGTCTAATTG---TTTAAAATACTTGTACATTTC-CATATATGTAT
>wek 15762404 15762563|17320 chr2L 15762487 15763285 scaffold_27 990114 990839 + 18051|0 79
ACCATGTTGGTTGACAAAAATGTATAAATAGCAGTGCGCAGTAAAATTTTAT---CCCAGAGACATTTACATTTACACTT
TCCA-----------ACTAATGTTCGTACTGCAATT----GAACAATTCTATGAAATTAAAAACTTATACATATACACTT
>Ku80 15764441 15764667|17325 chr2L 15764142 15764603 scaffold_27 989700 990110 + -3087|325 491
TTCTTATATGTAAGTCGAAAATAAATTATTATATTGTTTATATATATATACCAGAGTAAAAACTCGGTCGCATGTT----TTAAAAACAACATTATATCCCTGGGAAACCACATCCAAATGATGATGATAATACATCTCTATGTTAATAAACATCGACACGCAGGAA
TTCCCA---GTGCTTATTAAATAAGACATAATAT------------------AGCAAAAAAATTTAATTATAAGTTACTGTTTAAAGCAAATATGTTTATTTGA-----TCCGCCCAATTGCGACTGAAATTAAAATT--ATCATTATAAATTT-------------
>Ku80 15764441 15764667|17326 chr2L 15764604 15767236 scaffold_7 2971586 2974308 + 62814|0 82
TTTATCATTCCAT-TTTGTT-----ATATTAAGCAAATGT---GCTAAAATTA----------GTTTTTGTTATACACAGTTT
TAAAGAATTCCATATTTGTTTTTAGATTTAAAGATAATTTATCGCTAAAAATAAAGATTTCATGTCTTTGGCCTAATCAGCTT
>CG31826 15767188 15767272|17326 chr2L 15764604 15767236 scaffold_7 2971586 2974308 + 62814|2706 2759
TATTTTGAGCAC---GAACCAAATATATTG--ACTATTTATAATTAAAACAAAA
TATGTAGAGCGCACTGATTCAAACATGTAGAAACAAATTGCGGTTTACATTAAA
>CG31826 15767188 15767272|17327 chr2L 15767237 15767684 scaffold_7 2974497 2974952 + 17386|0 35
GGAGATATGGGGAACTATTGCTTACTATTTTATTAG
GAAGAGATTTAAAA--ATTCCTAGAAGTTTCAAAAG
>TepI 15884568 15884630|17482 chr2L 15884317 15884592 scaffold_7 3703359 3703673 - 421|308 332
AATTAATAAAATTTATGTTTTAATA
AACTAACAATATTTATAAGTTTATA
>TepI 15884568 15884630|17483 chr2L 15884593 15885680 scaffold_7 2871514 2872703 - 10966|0 37
AGTCAATTCAAAGTATGCGTTATTTCTATGCCTACAAA
ACCCAATCCTTTA-ATTAATTGGATCTAAA--TGCATA
>CG31820 16001697 16001834|17636 chr2L 16000410 16002440 scaffold_7 3874683 3876902 - 12779|1559 1698
GAAACCCAAGGTACGACAATTCCTGAAGAAAACGACGTGAAATTTTTTTGTGCTTTTGGTTTGAACCACATTTTCACTTACACAATGGTTCGAGC--TTTTCAATAAATTAATGTACTTAAACAAGTAACTTCTTATTTA
AAGACTGTCCACAAGACAATTCCAGTCAATAACCATTTTA-----TTCTGTATGCTTGCGTAGGAACACG-----GCGGACATTTTTTTTCGGTTTATTTTCTGTAAAT--------CTGCAAAAGTTATTTGTT-TTGG
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TAAAAATGTATTCAATAAGCAACAAAAACGAAATATATATATATAAACAACAACAAAAAAAAATAACGGTACATGCTATATAGAAATACATATGTGTATGTATAATATATATATATATATATATATATAAATATGATGAGCATGTTGAACTCTATAAAAACCATCGCATTAATTTTTACA--TTTTTAAATTATTTTCTATTATTTAATTAATTTTAAAATTTACACACACACA-CACATACAGAGAAAT---ACCCACTTAATTGTATTTTTTCCTTTTGCCCAAAACA------------------------------------------------------------------------AAAAAAAAAAAAAAAAGAAAAGAAAAAACGAAAATGCGACAATTTTTTGGAATGGAACTTATCGAGTTTTTGTTGTTTGTATAATCTAATTATAAGAGAGCGCGTGGTAAGAAGAGAGAGGATCGTTTATTATATAAAC---TACACACATACATATACATATATATATATATATACTTTATA------------------------------------AATACATGCAAAGTACATACATACGACATAAGCTAACGCAACATTACATAATATTACTACTAAATACGAGTACATTTAACATATA---TACATATATATATA
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---TTAAATAGGTT--TCCTTTTTGTTTTATTGT-----------------------ATACACTGCTCCAAATGCAA
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AATTCTCCCCCGAC---------GAAGT--CAAATCTCAGCCATAACCTGTAAAGATCCTCAACATTTACTTAGCGGACGCCAAAAAGC-----------TTCATAT
AATTCAACCACAACACCACAAATAAAGTTATAGATCCTACCCCGAAACAAAATAGGAACGGAAAACTGTGTCAATACTTGTCAAAATTCGGGGCTTTTTATTAATAT
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GC---GACAGGGAAAAAGAGAATGTACCTCAA------------CAGATTGATAAAGACAAAACTAAGCAGCAAGCCTCGGATGATGA---CAAGGAACGCCTCAACAGTGGAAAAGCCGCAACGGACAACAATTTGAAGCTGGCAACCTTGTTTCGGGAAAAACTTTTGTTAGACGAATC-------------------AAAAGAGCCGTCC------AATTCCAG--CAACTGTGCACGTCGCAGTCGCAGCAAAAC------AAGGAATGGACCATCCA-----------GAATC-GAGGCTTGT-----CCCAACCAGGACACACGGATCCCAC----GTCAGTCTAAATTGCGT---------------AAATCTCGACCGCGC-AGTAATAGCCGTCTTTCAGCACAGGGTATGATACTCGAATTAGAACCTGTGTTTTTTTGATTTTGATTTTTC----TAAAGTTTGCAATCAGGCTAAGCACAAGCGAAGCGATCCTGTGGCCTTGTACCAGTACTATCAGAACGAATGGAGCCATTTCCGTGACCAAATTCCAGGCGAAAACTCCCATACAGACCTACGC
>chif 16339521 16340294|18006 chr2L 16339526 16340164 scaffold_18 1198118 1198668 - 421|0 687
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TCCCTCCATGAGCATAAAAACAGTAGCATAGCTGTCATTACGACATCTGATTCCTGATTCCTCGTCCTCTGTCCCG----------------------------CTAATGTACAT-TATTATACATTCAT-----------ATTCATTGTCTTGATTGTTCGAAA-----------------CTTTTTATAATTCCACATACGCAGCTACTCCCCTGACAT-------ACTTAGGTATCCAAAACCACACACATAAT--------------TAGCATAAT-----TTCAAATGCAATGTCAGC--AACATACGTAAGATAAGATAAGTTTAATTTTAGCTTAGAACAAATTCCGTACTCTTTGATGCGCCCCCTAGCCGACTTCCCAATAAAGAAAATGAAGAAACGATGCGAAAATA--------CAGACATAAATTAGAATTAGCAAAAGT---ATAGAACGAT-----------------------------------TAGATTAATACAAAAAAAAGAG---AAAAAAAAATAAGAATGAAAAAAACATACAGTACATTTCGTTTTTAAACAATATCAACTTGATGCTCAAATTATGTATAACACGAATATAAAACCAAAAGCAACTGTAAAAAACAAATAATCAAAGAGTACATTAA---AAATATACAATTAAAAATATACA
>chif 16339521 16340294|18007 chr2L 16340248 16345735 scaffold_18 1198740 1204693 - 122956|0 46
GCACCCTGTGTCATCTAATCATCATCCAGATCAAGAAACGCATCATT
TCATCTT------TATTGTCGTCATCATTGTCATTAAAATCGTCATT
>CaBP1 16350868 16351110|18012 chr2L 16350699 16350971 scaffold_2 1122467 1122750 - -1659|191 297
GCGTTTTTCTACAATCCTCACATAGATCTAAACGAATCGAAACCAACGATCATATAAACTATGTACCACAAAATGAATAAACTGTGCAACAAAACGTG---TAAATT
TCATTTGACTAAA-----CGAAGGGATACAACCAAAACCAAAACAA------TTCAAGGGTTGCAGTCCAA---TAATTGACAGAGCATTCAGAGCTGAGCTGACAG
>CaBP1 16350868 16351110|18013 chr2L 16350972 16351104 scaffold_18 1208677 1208809 - 1494|0 142
GAGGATCGGAA----------ATCAAGACTGTGCGGCCCAAGCTCAAATTTCCACTTATTAAACTAACAAACACTTGCATTCTGAATGATATTCATTAGTCAGCCATCGTATCTAAATATAAATAACTCTTAATTATCTTTTA
ATTAAACCGAATTAACACTTCACCAAGAC--TGCAGTTCATGCTCAATTTTCCAGCTAGCCAACCGATTAACTTAATCTTCTCTAATACTA------AGTCACACAGCGTAACTAA--ATAAATAAACACTAATCTTTTTATA
>CaBP1 16350868 16351110|18014 chr2L 16351105 16352446 scaffold_2 4586341 4587692 - 43461|0 5
GGCTGT
AGCTAT
>CG5888 16396098 16396429|18077 chr2L 16395281 16396986 scaffold_18 1263940 1265582 - 5226|913 1292
GCT-------------------------CCAAACGGTTCGTT-------GGGATTTTACGCATCAGTACTAACTA---GTATATGGATATCTGAGTAGCTTATTTCTGAGACTATAATGAGATTAAAATAGGCTGAAGCTATTTGTTTCCC--GAATAACTTA---------AAATTAATACTCCCATATATGTTCACCTGCTAAGTATCTTTTGAAATAT-AACACGATTTGTATCTTTAGTGTAAAAGTTTTGAAATAGTTGCTATCATTAAAGACTATAATTTTATGTTTGCTGATTGTAAGACTATAAAATCGAAAAGTTGGAAATATTACTGTAT-CAATAAACTTATGAAATAAAGATATTGAAGAATACGAAC
GCTTAGATGGTCAAAATCTTTATGATAATCAAACGGTTCTATTAATAAAGATCTTCTTCTGATTTGTATTCAACAAACGCATTTTCACTTATTACATATTTATTTTTAATATTG-AAGAAAGCAGATCTAAGCGTAAAATATAAGCTTTCCTTTAAAGACCTATATACAGCGAGCTTGGTATTTGGTATCTCGTCTACCTCCTGCGATTCCACAAATATATAAATACGAATAATTTGAATAAATTACAAGCGGTGTGCT--TTGGTAAACGTGTCGACTATAATGT-----------GTTATATAAGCATACACTTTACAAGTAGAATGTTTCACAATAGACAGTAA---TGTGAATC---GGTACTATCGCAAACTGAA
>dac 16462439 16463549|18149 chr2L 16462317 16463723 scaffold_18 1337831 1339248 - 24212|139 1385
ACACC----TGGTCAGGTG-------AGGTGGCGAGGATTTATTTGATCTCAGAGTGCAATCCCAAACGGCG--------------GCGGCTCTTGAGTGGGTGATGAAGTGAAGTGAAA-------------------------------------------------ACGTGTACATACCTAAGATGAAAAGTTGA----------AGTTTTGAGAA---------------CGTTGCAAACGTTGGAGCGGCCATTTTGTACATAGAGAAAGGACGTAGTGAAAAGATGCAGAACTTCCGATATCCCTTATTGAGTGCTTAGATGCGATAGCGAGCAGTTGTAAGCTTATAGTGACGTTGTATATAGCAGCCGATAC------GAAAGACTTTTTAATGAATTGAAAAAACGATAAGCTGAATACCCGTGTAGGC-----AGAGTTGGCATACCTAGCATTTAACTTCCCCGAAAAGAAACCATTTTTAGCATTGCTTATAAACATTACGATTTAGCTTCAATTCGAGTATATTAATGTAACAGAAATATATAATAAATAA--AGTAATACGTAGTTATTTAGGGAGTAAAGAAAATAAATCTTACGGGCCGCTTTTTAGTGTTTTAAAGATGATGGAAGAAACTTTGATTTATTT---TACGATGTAGTTTTTCTAATGCTAAGGTTTTAATTTATTAACTAGCCTAGCAGGAGTGCAGTAAGTTCGTAATACTAAAAATTAGCATATAAAAATTAATAACTTCAAGTATTTCACTTGCCTAGGCGATAAACAATAATTCATATTATATATATATATATCAAATAAAGAATATTAATAATAAATGCTAAACAAAACAAACTTGTATGCCCGTTGCAAAAGCAAAACAAAAAACGTAATGAAGGAAAAATGATCAAAAATTGACATTAAAAAACTATTTAAACGCTTCATATGCTAT----TATATATACACCCTATATATATACAC---ACATTAACTTTAGTCATAACAATAGTCAAAGAACAAATAATTCCGCGAATCAGC-----AAACAACAATAACGGTTCAAATATTGTGCAACATTTCGCCGCTCGCAGTGAAAACACAGAAATTATTATAATAAATACGATTAAAATAATACAGCA-----GCCGACAACCGA----CAGACAAAACCAACACCAGCAACCAAGCGAAAAAGTTTAAAAATAATATATAATAATAAATTATTATTGCAAAAATAA
GCTTCCATGCGGTCAGCTGTTGCCAAAGGTGACAAGGA--TATTTGATCTCAAAGTGCAAT-CCAGGTGGCGGCATTGAGAGGTACGCGTCTTGTGAGCGCG-GCCGGACCAAAATGCAGAACTCCAACATATTAGAGCAATCTTATGTATATACAAATATATATATGTATATATATATATATATTTCAACAATTTAAACCAGCTATGAATATTGAGAATGTTCGTGCAAAAAGCGTTGCAAATGTTGGAACGGCTATTTTGTAGATACTTTTAA---ATAGCGAAA--ATAAATTACTTCCGATA-CCAACATATAAAGCATAGATATAACC-----CAGTTGAATGCTT----TAGATTTATGGATAGCTACTAGCATTTTGTATATAGGCATGTAAAGGCTTTTAAAAAAGTAGTGCAGGGCTGCCTTTATTGGCTTCTACTAGTTGGCATACTTAGCATTGAGAATT------AAGCCACACATTTTATCAT-----------------ACTTAGCTTC-----------------GTACTACAAAAGCTTAATATATAGTTTGTTATACGTACTTATGTATGTAT--------AAATATTTTATAAAGCGCTTTCTAGTGTTTTAAATAGGTATTAAAATATTGGTATTGGCGCGAGTAAGCTGGGGTTAATTT---------GTTTTAATTTATTTATTAGCTT---AGAAGCGCATTAAGCT----ATATTTAGCTATATTTTATAAAG--TAAACACTTCAAGTATTTCACATGCTTACCCATTAAAC----------------------CATATACAATTTAAAGTAATAATAATATAT--------AAATAAATATAGATAATT-------AGACATAAATACACTCTTAATTGA-AAAATGTGTTATAAACTCGACATTAAATATATATTTTAACGCTTCATATGCTATTATATATATATATATACTAAAAATATAAACAATACATTAAATTTAGTC---ACAATAGTCACTAAACATAATATCTAAAGGATAATACATTGAAACAATAGT----GTTAACTAATTGTGCAACATTT-GTCGCTCGCTGCAAAAATATACAAATTATTACAATAAATACCATTAAAATAATGCAGAAAAAATACAGAAAATCAGCAACCAGAGAAAATCAACCCTAACAA-AAAGTG---AAGTTTAAAAGTAATAC---ATAATAAATTATTATTGCAAATGC-A
>CG5953 16505049 16506064|18197 chr2L 16504444 16505119 scaffold_18 1376206 1376969 - 8800|725 804
TTGCTGGGTTCGAGCCCCTCGAGCCACAAACAAACCA---------GACCTCGCCCCCTAGAGCAGAAATACAGAAATTC
TTGCCATGTT-GGGCCTCTC-AGCAACGATCCGACCATGTCCAGTGGGCTTTTTATTCTTATACGGTAGGCCCAGTAGGC
>CG5953 16505049 16506064|18198 chr2L 16505149 16505240 scaffold_18 1376993 1377103 - 1842|0 110
ACGTCTAACTAGCAGAATCTCAGTATTAACTATAAAATACAC----------TTTACATAGGGATCCA-AGCATTTGC--------CATAGATCGTTTCCTTTGGGGCCCG
ACAACTAACCGACAGAATCTCAGTATTACTTATAAAATACATCAACTTGGATTTAGTATGTGTATATACAGCACCTACGACGATATCAGAGAAAGGCTTTCCCGGCGTCGG
>CG5953 16505049 16506064|18199 chr2L 16505752 16507417 scaffold_18 1377189 1378852 - 44902|0 385
CAGTGGCGCCCCAAGAAGTGGACGGCTGCGATGGGTAACGGAAGTAGTGGGGCCGTTGGTCTGGGCATCGGTGT--------GGGTTTGAGCAGGATCAGGCTGGGCAGGAGCCTTCTCGCCCCGCAGCATGGCAAGT----------GAATTCCATTTGATGAAATAGTCGACAGAG---------AGTAGTAGGCA----------------------------------------AATACAGAGAACACAGTACAACTTATTTTTAGTTTGGCCAGG----ATCGGGGTCACCACTTGTACAAAGCTTGGCTTGAACGGGGGCAGTGTTACTTAG--CCGGAAAGAAAGTGGGAGAGAAGTGGGAGAGTGGGAATGAAAGCAG
CAGCGACGTCCAAGGAAGTGGACGAGTG----------TGGGACGAGTAGG--TTTAGGTACGGGCAAGGGTATTACATCAGAGAATGGAATGGCAACGGGTTTGGAAATGGCTT---------GGAACATGGCAAATAGACAAAATGAAATTTCACT--GTGAAATAGCCAAGAAAACTAACCACCAACACAAAGCAAAACAAAACAAAACAAAACAACAACAACAACAACAACAACAAAACAAAACAAACAGTACAATTTACTTTTAGTTGAACGGGGCCTAACCAAGGGGCTCATCTGTACAAAGC--------ACATGGGGCAGCGTTACTTAGAACCGGATAGC---TGTAAGGACAGCGTACGAACATGAACATGAACAG
>trpgamma 16660696 16660814|18398 chr2L 16660814 16661548 scaffold_18 1470389 1471132 - 28218|0 0
A
A
>CG31782 16695306 16695960|18434 chr2L 16694333 16695916 scaffold_18 1490765 1492295 - 55327|1010 1653
AACGCTTTGTGATTTA---ATATATATATAATGTATATTA-----TAATAAATAATAAAATAAACTTTTCTACTCAAAATCG--------------CATAA--------GATTTATTGTTCGATAACATTTA---AACTAGTTTTCAATACTCGACTTTTGCTTTAAAATTCAACAAAATTAAAATCGAATGAGAGCCCGCTTAGCAATACACAACGTACTCGTAAACAATGCAATGAATTAAAAATAAGTTAGCACATTGAGAATTTTAGATGATTCTGATCGAAGGTGATGCATGAGTTGCTCTTACAGGCTAGACAAATGTAAATATAACCGAATACAAGACAAGACAGGATTTTAAGTTCGAATGAAACTAAAAGCTAAGGCACCGAATTTGTAGCAATCGCAATCGGCCAGGTGGTGGGTCCTTTAAGCACGATATCCTCCAGGGCGTTTTTGATCTTGATAAATCGTCGTTTAAACTCCAAGCCGCAACCCTTTGACAGCCGGCAGTCAACAAGAATCTTGCCATCCATCTCTATAATGTGTGCCTTGAAAACCAATCGCAGCTTATTCCGATCGACTGTGGATACGGTGACCACTCCGTCGTCACCAAATTTGCACGTATAACCACCCAGTCTTTCG
ACCGGATTGTGATTTATAACTTTCTTTATAATTTACATTGGCCTTCAACATATTTTCATATAGAATTTACAGTTCTGAATTTTGTTTAAATGTCGTCATAATCAGTGTCAATTTATTGTTTCATAACGTTTAGCTAACTACAGTAAAATACTTA--------TTCAACATTTAACAAAACTAAAA----------ACTCTTTTTGAAATACCTATTCTGTGCATAAA--------------GTAAAAAAGTTAAAA---------------------------------GACACATGAATTGTGATTACAA-----ACAAATG-----ATAGGCTAATTTAA--------AGAACTCGATGTCTTATGAGTACTTAAATCTAGGGCACCGAATTAGTTGCAATCGCAATAGGCCAAGTTGTTGGTCCCTTCAGTAAAATATCCTCCAGGGCAAGCTTAACTTTAATGAAACGCCGCTTGAACTCAAGGCCGCAGCCCTTTGACAGCCGGAAGTCGACGAGTATCTTTCCATCCATCTCAATGATATGTGCCTTAAATACTAAGCGAAGCTTACGTCTATCAATGGTGGACACTGTGACAACGCCATCGTCGCTAACTTTGCACGTGTATCCACCCAACCGTTCG
>CG31782 16695306 16695960|18435 chr2L 16695917 16696183 scaffold_6 2474391 2474663 - 1799|0 49
TCGGTGACTGGAAAATGGAAA------TCAAATATGCCCTCCTAGAACAC
CCGGC--TTTACAAATGTCCACACTGTTCAAAAATCTGTTCTGATCAGAC
>VhaSFD 16719067 16719921|18466 chr2L 16718997 16719522 scaffold_2 3422712 3423236 - 3583|70 579
CGCCCTCAGTTCTTAGAAAGTATTGAGAGAAAAATTCGATTTTTTGTTGGCATTCC----------------AAAAAGCAATTCACTGTAATGGCAGAACAAATACAAGCAACTATCCTCTACAAATTGTTCCATTCAATTCGATTGTTTATATATTTTGTTGTTATTATTATTT--GTGTTCTTAATTTTATGAGTGCGCCGCTGTACAGAGTTTTTCTAA---------ACCAGATGATATGCGCTTCTTACGTTTATATAGTCGCATCTGCGCA------------------------TCCACATCTAAGCAAAAAACGAAACTAAAGAAAACAAAAAATATATTGTATAAACCTATCAAGTATTTCTTTCATTAAAAAAAAAATAAATCAAATAAGCATAATTAA--AACGAAAAATATGTATTGCATAATAAAGTTGTTATTAAAATGTATGATACAATTTTGGGAGTGTAAAAGAAA-ATATACATAAATTAGCCAAAAAATAT
CAGCGTTTGTTGTCGAAAACTAATT------AATTGTTGCTCTTTGTTGGCATTCCGCACCAGTAGAGAGATGAAGAAGAGTGAAAGTTAATTAGAAAAC-AGTGCAAAAA---ATACACAGAAAATTAT--------ATATTATTGTCTTCTTGTTTTGTTGTTATTATTGTTTTAATATTTCTACTT-------TGCGCTGCTGTACAGAGTTTGTCTCACGATTTCTTGCAAGTTCATAGTAAAATTGTAT-TATATATTATCGCATCGGCGCACATGTACAACCTATCAAGTATTTCTTTTCTTTAAAGCAAATTATAAAAAAAAAAAAACGAAAAAATTATAAATGCAATATTATTAAATGTTACTAAGCGTGTGAAATATCTG---CTAATAACTGCAAGTCGTTTACCAAAACCAC----------ATTAAATTGTTATTAAAGTGTATGATAAATTTTT--GAATGTAAATCAAACATATACATAAAT----------AAAT
>VhaSFD 16719067 16719921|18467 chr2L 16719548 16721852 scaffold_2 3423272 3425916 - 69314|0 390
TCCTCATATCATTTGTTTTCAATTCATGACCAGGATT---ATCATCAAAATTCTCTGTGTACTC---AAAATGCGTTTGTTTCTCTCTTTGTTTTTATCAGGGAATACCTGGGCAAGCAGCTGGAGAAGGAAAACGAGAACCAGAAACAAGGTGCCGCCCCCATCGCTGGCAAGGCCTAGGTGGTCTA-ATCAACAAG-TCATCCATGCACAGGCACACAACAAATATTTTAGCCA---GGCCGCCAG----CCTGAAACCTTAACTAACAATAAGAGTCGTAGGGGGATCTATATCTCCAGCCTGATCCTCCGCTTCTCCATCACACTTGCAATGATG-TTTGTTCTTGCTATC-TTTAAGCGCATGTTTGTTCCCCGTTTAAACTAAGT
TACCAATA-CGGGTGTTATTGCATAATTTCAAGCATTCCCATCACCAAGTTTCGACATCAAATCTCAAAATTGCGTGTGTTTCTTATCGTCTCTCTACTAGGGAATACCTTGGCAAACAGCTGGAGAAGGACAACGAGAACCAAAAACCAGGCGCAGCTCCCATTGCCGGCAAGGCCTAAGGCATCAATATCGCTCAGCTAAACCATGTACAACCG-------------TTAGCCAAGGGATCGCCAGATGCTTTAACAACTTAACTAACAATAAGAGCTGGGGGCGTGGCGTTACATATAGTCGCCACCTCCATCTCCCACGCCCATTAACAATATCGTTTTATTCTTGCTATCATTTAAGCGCATATTTCTTTTTC--CTAATCTAAGT
>CG17996 16726384 16726479|18472 chr2L 16725705 16727030 scaffold_2 3429369 3430730 - 38861|719 830
AGTCCCTGAGTAGTTCCTTATTGTTGTTTGCTTTGTACAAAAGTTAAGTAATTAAAACGCCGCACAATAGTCTCTGTTACTGT-----------GGCTT-----CCTGCAAA
----TTTAGGCTTGTTATTGTTTTTGTTTACTTTGCACAAAAGATGTGTAGTTAAAGCGCCGTATCACAGTCTCCTCAATGGTCAGGGATTGCAGGCTTGCCGGCGTGCACA
>CG17331 16727142 16727217|18473 chr2L 16727031 16727412 scaffold_30 1436101 1436479 - 8038|114 201
TTAGG----------TTTTGATTTAAGCATTTAAAATGCAGTTT--TGTAATAAAATGCGTCTGGATTCTTGGCTAATTTAATACACG
TCAAGTGGCCGATAATCTTATTTTAAGCATTTTAAATGCACATTAAAGCAAAATAAAAGATTTGGATT--------------------
>glu 16729546 16729725|18478 chr2L 16728288 16729569 scaffold_30 104096 105371 + 50054|1285 1308
ATAATAAATGTTACATAAAATTGT
ATAATTAATATTA-ATAATATC-T
>glu 16729546 16729725|18479 chr2L 16729716 16738153 scaffold_30 105380 113798 + 281627|0 9
CTCCAACCTA
GAGCCATCTA
>CG13277 16738255 16738597|18480 chr2L 16738485 16739075 scaffold_30 115685 116257 + 22094|0 117
TCCAAGGTTTTG-TGGCTGGGATGCGTTCCAGAATGTAGACTAAGTACAAAGCTCTTTTGGAAATCGGTTT----AAATATATTTAGCGGAGACATACATACGTATAAATTAGTTCTT
---AAGGATATGCTGGCTGGGCT-------------TAGGCTAAGGA-AAAGTTCGCGTACAAA--GGTTTATAAAAATACGTTTTGCAAGCATTTAAATTAATGAAAAATATTTATT
>Cyt-b5-r 16784786 16784859|18505 chr2L 16784794 16785832 scaffold_30 170416 171442 + 52655|0 70
GACTT-----AATTTGTATGGGGCTTAAGTAAAAGTAAATAAATATATCCACAACATCTTATTAGTTTACA
AATATCTTCAACATTGTATGTG---TGTGTGTTTGTAAATGAAGGGATCGCCGTATGCATTTGGGTTTATA
>Cas 16817079 16817252|18544 chr2L 16817089 16820441 scaffold_18 2407766 2411079 + 146680|0 169
AGGAATCGACCGACTTTAAGCTCATTCATCGCAATCAAACCTCGCCATACATTCGAAAATTTATGCATACACGCACTCGATCACTCATTGCATGCCCAGTTTATTGTCATTTAAAAATTGT------ATCTAATATATGTAAGTTTTGTAAACAATTAAAAATTATGTTT
----------------TAAGTTTACACATGACACACA---TCGGCTGCACACACCATACTTTACTCATACACACA----------CAAAGCACGAATTATTAATTGTCATACAAGATTTGTTTATAAGTGTAACAATTGTAA-TATTGTAATCAATATATAGTTATGTTT
>CG31810 16844947 16845073|18559 chr2L 16843985 16845068 scaffold_4 6312735 6313762 - -926|1071 1193
TAGCAGCCATGTAAATATTTGGCAAAATAAATACCTTAGAGTTTACGGCAGTTTTTAACAGTGGAAATAATATTTTAAATT-TTTGAGAATATGTTATGCTGAAAATAAAATATATTACACTT
TAGCTAAAGTAAAAATATTTGATAAGG---ATATATTGA----TAAGATATATATTATAATTAAAATCATTATGATAATTTATTTGAATATAGAATATAATAATGATAAACATTATTTTATAT
>CG6115 16883051 16883390|18604 chr2L 16882950 16883961 scaffold_18 1954760 1955759 - 17699|127 505
GTGGGCGGAACGTAAATCGGCGGGCGGGAGGCGTGGCAGCGATGCGGAAATCGCTGCAAAAACTCAAGGACTGATGCTGTGGATCGGGGGGAGCACGAAGAAGGAGGTGTAGAAAGAATCATGAGAATATGATACG--------TTTCGCCTTGCTTGTCGCACACAAAAACTAAAAAAAT-----------------ATATACATACTGAAATGCATATTGTTCGGCCAAAAGAAACGTAACCCAAAACACACAATAATAATTTCGAATGTCTTGTCAATGTCCAACTTAAAGTTTGTTATTGAGGCACCCAAAAAAAAGCGAAAAACGGACGTAGCGAATAAACGAA-----------GCAGTCATTG---AATAAA
--------AATGCAAA-------------------GCGGAAATGCG--------------AATTGAAGGACT---------------------------------------GAAACAGAAACGAGAATATGATACATAAACACCTTTTGTTTTTATTGTAATTGAGAAAACGAAACCAAATGTACACCCCCCCCCCACACACACACACACACACACACACACAGCTACCAGCACACATGC------AAACACTAATTGTTATTTTCGAATGTCTTGTCAATGTTTAACTTTAAG-TTATTGTTGA-------ATAAAAGAGCAACAGTC------ATTGGATAAGCAAAAAGAAACACGCGCAAACATTGACAAATTAT
>CG12288 16896464 16896650|18615 chr2L 16895564 16896885 scaffold_23 1571903 1573172 - 1297|950 1136
TATACATTTAGACTAGGCATAAGGTTTGAAATAAGTTGAAACTCAATTCAATGAGATTCGTTTGACTTTCTGTTACGAAGTTAACCACCGGATCAGTTTCCGTAGCGGACACTAGATTGATTATGTTGACCAAGTAATCGTTGAAAGATTACTCAGAGAACAACTTAAAAATAAAATGCAAAATTTT
C---------GAGGAGAATAAAAGAT---AATAAATGAAAGTCCACATGGTTG---------TCGCTATCTCTTA-----TTGACCGTCAGATTCCTTCCCGACTTAAAAGCAA-----ATTATATT-ACCTACCGATA-------------TTATAAAACCCCACCACATTGACATTCAGTTTCAT
>ApepP 16904148 16904244|18621 chr2L 16904066 16906101 scaffold_0 1371018 1373101 + 74420|91 222
-TGCATTTTTAACCCGTTATTT---------------------CGGTCATCTTTAACTAATATTCTTTCCCATGCA-----TACACTTACTCTTTTCTCAAGACTAAAA---------TATTAAAAAAAAAA
ATGTGATTTTATAATGTCAGTTGAGGATTTTTAAATCAAGCAACGATAATTTTTGA--AATTTTCCTTTAAATAAACGTTTTTTATTAACTTGTTTTGCTGCATTTAAAAGTTTTTGTTTTTAATTAAAACA
>beat-IIIc 17185739 17185878|18981 chr2L 17184747 17186409 scaffold_23 1880785 1882521 - 20205|1168 1313
CTGCATTAAGCCACAAGGCGGCTATTTCCCTCCACAACACACACTTTTCACCGATTTTTCCGTCTTCGCTTTGCATA----GAAAATAAAGAAACT--CACTGAGAATCAAAAACAGGAAATGAACAAAAAAAAAAAAAAAAAAAG
CTGCATTAAGCT----GGCCGCCCATGCACTCAGCCCCGCCCAATTTTCCAATGAATTTCCGTCTTCGCTTCGCAGAAAATAAAAATCAAAAAAATAAAAATGAAAACCAAAAA-AAAAAATGAAAGGGAAAAGAAAAGAAAAGAG
>CG6860 17363438 17364125|19224 chr2L 17363442 17364349 scaffold_23 2107225 2108182 - 17133|0 796
AATCGGTGGAAACAGGACATGGATGTTGAATCGGAACTCTAGGATATTCCGCTCATA---------TCTGG----ATGAGTTGGCAAA-----ATGGGTTTCCTAA--------------TGGCCGCCATATACACACTTACATAAAATACATGCCAAATGTATGATTTGTTAATACTTATATCTCACTCATTTTTCTAGGTTCGTAGTTCATTTATGTAAATACACAACAACACTCACAAGGAACACTTAAAGAAACCAAA----------ATACATAGATCACAAAACAATCGAACATATATCGAATCAAATCACACAAGTCAC-----AAGTTATTTATGCGAGTTTTTGTTT------------TGTGCAATTGTTTAGATTTAATTATGTATGTGCTACAATCGTCAGCTAGTTTTTTGTTAAACTTTTCCCATCACACCCATACGAGCGAAATATC----------GGGCCAAAATTACGACTAGCGATTAGTTGCATATTGAATACTGTTTTAAGTATGAATC----------------------------ACATATGAACATCCAAATATTTAGATATTTATCGAATTAT----------------TATTATGGCATATTTATTATGTAGCTTAGATGTAGATCTACGATTAACTGTGGTAAACATTTTCTACCGGCGCTGCATCATTTCTACGATACGAATCGAATTGTACTAGACCCCTAAGTCTTGGAATATACAAATACTATATAAACATATATCAAATAAAGCGGAGGAAAATTGTCATACGTA
TGGTAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGTTTCTTTTGATGCTGAGACACGTGCAGCAAATGGATAATACTTTTGGAGCAACTATTTGATGAACACACGCGGGTTTCCTGACAGAATTTGAAAGTTGGCCGCCTTTTTGTTGTATTTGTAGCCAAGTTAGTTTAGATATGATGCGTGCACAT---TATGTCAAATGCTTTGTTAGTTT----ATTTATTTATGTAAATACAC-ACAACATAAACAA--AACACGCAATGAAACCAAAAAGCACACTCATACATACACACACACACACACACACACATACC-AACGAATTTGAGTTAGTCACAAAGAAAAGTATTTATTAAATTTGTCATTTGAATTCTGCATACACACAGTTGTATATTATTAGTTTGTAAACTGGCAAAAGGTTTACCCATATGTATTCCAAACTGTTTGC----CATTTGTTTCTGTTATATATCTATTGCTGTTTGGCCAAAATT-TGAATAGCG------TACTAAATGAATACTGTTTTAAGTATGAATCAATCAGTCTATATATACATACATAAATTACATGCATACATATAAATAATTTGTCATATATCTAAATATATGCATATATGACTTATTTTATAATATTATGATTATGTAGCTTAGTTCTA-----ACGA-TAGCTGTGCTCACTTTTCTACAC-------------TTTATACGAAGCGAATTA---TGCACTAAA-CTGTAAGTCTTCGA---------------------ATATATCAAATAAAATGG----AAATTGTCATACGTA
>Rpb11 17405625 17405686|19285 chr2L 17404975 17406133 scaffold_23 2149566 2150689 - 32483|707 768
TCATATAATTACCAATTAATTCCTTAGTCTTATGAAAACCCAATAAAAGCTTCTTCTTCCAC
T--TGTAATTACA--------CTTTATTTTTACAAAAAATTTACGAAA--------------
>CG31803 17407578 17407614|19286 chr2L 17406174 17410553 scaffold_23 2150718 2154919 - 105868|1501 1542
GGTTGCTTTTGCATAAATATGTTTTTTTTTTG-----AGCAT
AAT---------ACCAATATATATTTTTTCAGTTGCTGGCAT
>Dif 17408873 17409443|19286 chr2L 17406174 17410553 scaffold_23 2150718 2154919 - 105868|2810 3391
ACAACAAACTTTGCTAAATACTAGTGTACATATATTTCATAAA---ATATATCGGAAATTAACCAATTAGAGCTACATGTAAAAAGGTCTCAATCCAAAATGAACTTCAACACAAAACCTGTCTTATATAATTCTATTTTACCGCAATGTACATAAATTTAATGAGGGAAATGCGAATCTCATTGCCCGATGCCT------TGTTACGACTTTTCGTTATTGACAAAAGTGAATTGAAAATGATTATTGTTTAAATAAAATAT--AACTTTAGAATTTACATGATGTATGTATGTATGTTTCGCTTTCATGGGGGAATGTGGGTAATACTAGAGTAATATAGAGTGCTAACTGTTTAGCGACAGAAATAGGGCTGACCCAGGTTGGCATTGTTCTCATTGCGCATGCCGGCAAAGAACCGATTGATATCCTCCTCGGTCACTACCTTCTTGCTGGCGGCGAATGCCTGCAGGTATTCCTTTAGCTTGTCCTTCATGCGATTGTATTCGGTAATCGCATCGATTTGCTGTGTCCGGTCAATGGAGGCCAGTGCCCGGATTCCTTGCTCATAACTGGAATTCTC
ACAATCAGAATAG--AAATGATAATACATATGTATAGTATATATGTATATAT-------------------GTTACGTGTA-------------------------TATTCGCAGAGCCAGTTGTACATAGATATTTG-----GCTATTTAGATATAGTT---GCCACAAGCTTGAATCTCATTTCGT-ATGCTCCGAAAATGTTGCGAATTGTTGTTGTGAAATATA------TGAAGACCATAAAT-TTTAGATTGTACATTAAATTCCATAATTTGGGGAATGTTTATACGTAAATATAACTACCA----GGAATACT-----CAATAGGTAAATAT-GTGTAC-----GTTTAACGACAGAAATAGGGCTGGCCGAGGTTCGTATTGTTCTCGCTGCGCATGCCGGCAAAGAAACGTTTGATGTCCTCCTCGGTGACAACTGTTTTGTTGGCGGCAAATGATTGCAGGAACTCCTTTAGCTTGTCGCCCATGCGATTGTATTCGGTGATCACGTCGATTTGCTTGGTGCGATCAATGGAGGCAAGGGCGCGTATTCCCTGCTCATAGCTGGAGTTCTC
>dl 17432762 17432976|19314 chr2L 17432705 17436487 scaffold_23 2177419 2180969 - 90250|68 282
TACCTTTTTCACAACGAACCAGAGCAGAGCAAGAACGGAGGAGTCAGTAGGATGATGATATGATAATGTTGTATAATTAAATCTAACCGACCTGGTCGTCGTCTAAATGATTGTTTAGTGCTGTAATAACTAGTCTTAAGGCGAAATGTAATGTGTTTTTGTAGGAAGTAAGGTTTTTTAAATATGAATAAATTAATCGTTTTAGCAGAAAGTAC
TACCTTGCT---------------------AAGCTCTGTTGTGTTAGT--------------------------------CCCTAA--------GTCGTCTTTTATACAAATGT-----------------------------AAAATCTGTGTGTTTTT------AGCATAATATTTTCAATACGAATAAATTAATCGTTTTAGCAGTTAATAA
>dl 17434527 17435717|19314 chr2L 17432705 17436487 scaffold_23 2177419 2180969 - 90250|1917 3220
ATTTGTTGATTTGATTGTTTATATTCTTTATAGGCAAACGAACCGAGGAAAATCCTCGAACGAAACCCAATAACGAAGCAAGTTGGCTTCAAGCCAGTGGAAATTGCATTGTATTTCTCGGAATCTGTTTCCATTAACTCTGGCGCCACAAATTGTCCACTTGTTGTAAGGCCGGCTGGAGCGCAATGTCTTCAGTACCTTAATGAATTTGTATTTGTTTTATAATTAATAATTGTGCTAAAAGTATCCCCAAAATAATTTGTAAGTGATACCAGG----CAAAAGACCCCAAAGAAATGGGTCAAACCCAATGATTTGTTTGTTGTCCAGGTGGCCC--ATTTGAAGGGGCCAACCTAACTATTGTATTTAAGCGAAATCACT-----CAATTTTCAGAGTA--GCGTAAGATTT----CCCAATGGAATCGAATATATTGTTTAAATTGAAACCGAAAAC----CCGATCATATGTACCTACAACACGGTGTGTATATTTTGTCTTATAGATCCAGCGCACTTGAGGCGGAAACGTCAGAAGACTGGCGGTGATCCCATGCACCTGCTGCTCCAGCAGCAGCAGAAACAGCAATTGCAGAATGACCACCAGGATGGCAGTAAGTTGACTGTTGAGATTTTTCCCAAACTGGTGTCGGTCTT-----------------------------CTCTATCCTCTATTGTGTCTGTCGCGACTTTGA--GTCGATTTTTTCCCATGTGTTT------GAATCCAC----------------TTGGGTACA-----------CATACTTTGTTTTGAGATGGATGCTAGACATCTAACTGAATCCTACCTAGTCAAATAGCATCATATATATTTGATGTTTTCTTCGGTATACCAAAGACTACTTAACAAATCATCGCCCCCGATGACGTATTACTCGAATAGACTCTTTTAGAAACTATTAGAAAGCACTCAATCAATGCACAAATCCACTCACCCAGAACACCATGAAATCTACGTAAAGGGGGGTAATGTCCCCACTATATTTATATATTGATTTACATGATTAGTCGAAAT-TATAGTCAAGAAAATGAGAGATTGATTC-----------GAAATCAATATGAAATTTTTGTCGCTTTTCTACTCGTTTACATGCGAAGAAT-ATTTGATATTTTTATATACGAA--AAATTA---------AGAGTTTGGTAAAAATATTTTGTATAAAATATTGTAGCTTAATAAAACAAAAAAAAAAAATCAAGAAAAATTCAAAAAA--AAAAAGTAAAGTTT--ATT
TTTTTGTTATTGAAAT-TGAATATTGAATAT---------------TGTAATTTTTTGA--TAGACCAGAAAACAATTTGTGTCTGGTC--AGCTGCGGAGGATTGCA-------TCCAGGCAGCAATTTACACT-----TGGCAGCGGAAA----------GCCGTAAAGC--------------TTTCCCCGAAAAATT--TGTAATTGTATTTGTTTTAGATTT----ATTGAACCGAAACCCCCCC------ATTTTGTAAGCGGTAGTCGTAGTCTCAACTACCCGAACGAAATT------------TGATTTGTGCAGCAGCGCGTTTTCCCCAAAGGGAAAGGGAAAATC-----------GTTGCGCGAATTTGTTTTGAGCGGGCGCCGGAAAAGTGCGCCCGATTTTGTATTTAATAGATTCGTCTAAGTAATCTAAGCCGAGTC--AAGACTTGTCCAACAATTTGTCCCC---------TTTGTAAACTCTTTTTTATAGATCCAGCACACCTGAGGCGGAAACGTCAAAAGACTGGCGGCGATCCCATGCACCTGCTGCTCCAGCAGCAGCAAAAACAGCAGCATCAGCTTGAACCCCAGGATGGGAGTAAGTT--TTATAGAATTTTTCACTTACCTGGTTGCGGGCTTTGTCTTTTGTGGTGCTGGTTTACTTGTCCCGTTCTCACCTGTCCAGTTTGTCTCGTTTGTCCCTGTGGTTTTTTTATCAGGTGTGTTTTGGCGGATGCAACTATTTGTTGCGTGTGTTGGATAAATCCAATCCGAGCGCAGTTTTGTTTGAGTGTGACATCGATTAGTCAATTGA---TAAGAAAATCAAAACAGATCCTACCTATTTAAGTATGCTCGACCCAAACCAAAG---ACTTGGCAAG--------CTCTATGATGTATTAATCGTATAGACTA--TTAGAAAATATTCAAGTTATCTGAAACGAAAAATAAAACCA---ACGCACAATAT--TTAAAACTATGCAAAAATAAATA-----CAAATTATATTT--------AATTAAATACGTAGTAGAAATATATAGT-AGCAATATTGTTGTTGGAATTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATGTTTGTCGCTTTGC------ATAAAACACAAAGAACAATTTGATATTTTTATACAAAAACCAAATTATTGAATATTAAAAGTAATCAAAACTATTTTATAAAACG---TGTAGATTAAT--------AAAAAAAAATATATATAAATCGAAAAAATCGAATGTTAAAGTTTTAATA
>CG6639 17450183 17450266|19331 chr2L 17450108 17451060 scaffold_7 2099423 2100346 + 6864|75 159
TATGTCAAAAGGAACGACATGATGCAATAAAT-GATAAAAGCGCTTAAAAGTGTACATTAAAGTGCACAGTAATGCAAAGAAATT
-ACATCGATAAGAAATACTATACACCCTAGACAGACAAACG-----AAACATATATAT--------ATATAAACTTATAAATATT
>CG18563 17452684 17452690|19334 chr2L 17452375 17453419 scaffold_7 2099135 2100293 + 4682|401 407
CGCTTAA
CAAACGA
>BicD 17456763 17457654|19337 chr2L 17456709 17460512 scaffold_2 296463 300489 + 162031|64 1194
CATAAGATCAGCGTGCAGCGTAAACTTCTAGCTTTGGTTTATACTTTGCTTAAGTTGTAAAGTCGTTGGAGTTCCTGCGGAA----ATGAGAGATTCCCA----------AAAC-------CACATG-----ATATACTGCGAACGTATTTGAGAACGAAGCTATATCCCAGCTGTATCC---AACTACTATAACTATGTTTGTTTGTA-----TTGTACTTGTATTTATTGAAAGTTTAGTTAGATGAAAG---TTTTGTGTTAGGCAAGGGA-GCAACAAACGGTTATTAACGGTTAGTTACTTAAACGTCCATTTAATTTAATTAA--------AAACAAAAAAGAAAAACTTTAAGGAAGATTAAACAATAACGTAAAGCATCGTATTTTTCTATACAC--------CAATGGCGTACTTGTCTTAAA-GACGCCTGA--TTGGTTTGATCTGAATTTTG--------TCGCGATGATTTTTTGATTTTTGTTAACAACGCTGTGCGCAAGCGAA--TAAATTGACAAACTAAAAAGATACACAAATTGATGTTGAACAGATGGTATTGAT-------------------------------ATTGGCAACTGAAA----CATGCATTAATTGGCCAACCCGATAAT--TAAAAGTATTTTTCCAAG--------GTCCAGTTTAAGCTAATTGGCCAACAAA-----TATGTACGTAAAAATCAAGT----------------------------------------------------------------------------------------------CATCAGATTTTTGCTCGAAATGTATATTACCC--------GCATGGCTTGCAGCCATTGAACCTAAAGTAGC-ACCAGGCTACGTCTCAAAGACGATTCAGATAGATGATGAAGATTTTTGTATTTATTGAGCGGCATTTGGTCGCCATGAAATGAAGAAATTGTAGGTAATTAATTATAATTTGCAATTG------AGAAAAACTAAGTTTTTGCGTCTTATTTAGCATTAATTGCAAACATAACTTATGATTTGTGCATTATTATTTAATACAATTAATA-----AATTGCAAC--------G
CATAAGATCAGCGTGCAGCGTAAGCTTTTGGCTTTGGTTTATACTTTGCTTAAGTTGTAAATTCGTTGGGAGCATCGTTGGACAACATGATGAACCACCACCCACTCCGCAAACGGACAGACACACACACACACATACTGCAAATGTATTTGTGAACGATGCTATAGCTACGGTCTATCCTATATTAACGATAACTA--TCTATTTGTATCTGTTTCTATTTGTATTTATTGAGAGTTTAGTTAGACGAAAGAATTTTTGTGTTAGGCGAATCACGCAACAAACAGTTATTAACGGTTAGTTACTTAAACGTCCAATTAATTTAATTAACAATTTTGAAAATGCAAAGAAAAACAGAAAACAAATCGAAAC--TAACGTAAACAATTGTATTTTTCTATATATACAAAACACATACACATATATGTATTCAATAACGTTTTAGTTCGATTTAAGTTGAGTTTTGTTAAATTTTCGCGTTGATTGTTTGATTTTTGTTATCAACGCTGTGCGCAAGCGAAACTCAAAAGAATGAGGAAAAAGAAAAAAAAA---AACTAAAACAAAATTTTTTGATATGATAATGTTTGAAGATCTAGCAAGATCTAATTGGCAAATGAAAAACCCATGTATTAATTGG----CCTGATAACAATATAAGTATTTTTTTCAAAACGGACCGCCCA---CAAATTTGGCGTCCAAAAAAAAAACTCTGTACGTAAAGAACAAACAGAAACTCTTGTCAAGGGGGAGGGTAGCTACAAAAACCCAAGATAATGGGTGCAAAAGCCACATGCCCAAAAAAAAAAAAAAATAATAAGAAAATATAAAATGTAAATTCTACATACATACTATATTTATATAAATATGGAAAGCAACTATTGAACGATGTGTAGCAATTGGGCTGCGTCTAAAAGACG------------------GATTTTT------------CATCTTGTATTTACCTTCAATT---GAAATTGTAGTAAATTAATTTTTGTTTGCAATCAAAATATAAAAAAACCAAGTTTTTTTGT-TTATTTAGC------TGCTGAAATAGTCTATAATTTGTGCATTATTATTTAATTTAATTAATAAAAATAATTAAAACAAAAAAAAA
>Aac11 17471420 17471516|19351 chr2L 17469482 17473938 scaffold_6 2071747 2076561 + 136170|2310 2421
GTAAAGAATCAATCGTGAGGCAGAAGAGCAGCAAAGAACACTTCACTTGAATGGTTTGTCCCTAGTCCGTAGACA-----------TACAAAAAAAAAAAAAACAAAA----
----------------GATGCAGCCCAGCAACAACAACT--TTCACAT------------CCTAGTCGTTAAACAACATGAAACAACACAAAAGAAAAAAAAAAGAAAGATA
>CG6453 17477917 17478375|19355 chr2L 17478137 17478821 scaffold_6 2080128 2080813 + 20840|0 263
AATGTTCAACAATCGACGATGAGGATGAGCCGCAGAGAAATGTGAATGCTTGGCATGCGTAGACCAGAGATTTGGGGATTGTATTTTAGTTTTAAA---------------------GGAGAATATCAATTTTGTCGA-GATCATTCCCAAACTGCAGCAGGAAAACCATCAAG-AATTGTAGCTAATTA--ACTCAGTATATGCATTTAAGCAAAAAGTACATCAAGTTTCATTCTGAATAAAGTGTAAACACCTAGTATTTT
AAC-TACAATAGCTAAAGAT--TGATTGGGTGTAAACAGA---GAGTTTTT---------------GCAATTTTCGGAATGTATTCTAGTTTTAAAAGTGATTGAGAGAGGAAGATGGAAAAATGTAACGTGATTTGCTGATCATTCCCCATAGGTGGCGCTCATTTTGCGAATCAGTCGTAGACAAATATTATTCAGCATTTGCATTTAAGC--CAAGTAAA--AAGTTTCATTTTT--TTAAATATACATATATACTACATT
>qua 17482735 17482889|19357 chr2L 17480416 17484351 scaffold_6 2082672 2086584 + 126933|2437 2615
ATTATAAACATGTTGAAATGCGTGTAACGAGTGCGCACTGTACATAT----CCTCAATTGCAACACAATGAATACTATGAAGAGGTAGTAA--CTGTTGAAGCAAT------------------TTATGTTAAACATACACATTTTACGTAGATATAATAAAGCAAAAACATGAAATAT
GCGA--AACATTGTGAAATCGTAGTAGCA--CACACCCTGTATATAGTACACGTTAATTGGCTTTTTTTTACTCATCTGGAATAGTAATAAAGCAGTTTAAGGTATATTATTACCCTTCGTAGATTATATTTAAGCACCGTCTTTTATGAATTAATACCAATTATATTATATGAAATAT
>CG6412 17495193 17495327|19368 chr2L 17494864 17495890 scaffold_6 2099701 2100672 + 26387|353 487
CTAGCCATTAAGCAGAGTCTAGAACACTAAATTGTTATTAGCACAACAGCTGAAGATTGTTAAAACCGAAATTCTGGACAATGTTCTGGTCAAAATTTGCATGTAAAACAAGTAAAACAACCATTACGATCAGAT
AC-----CTGATCTGGACGTAATATACAAATTTGTT----GTACATCTTTT-----CTGTTAATTCCCATATACTGGCCAAAACT---AACGAAATTCGGAAGAACGAAAAAAAAAAAAAACATTAAAATAAACC
>CG7094 17550282 17550367|19418 chr2L 17550255 17550300 scaffold_6 2168790 2168834 + 1296|27 45
AAATCTTTTAAAAACCCCA
AAATTATTTAAGAGATCGA
>CG6870 17587376 17587626|19474 chr2L 17587209 17588432 scaffold_6 2218641 2219966 + 17072|173 437
-ATAA-------TGCCAGCCGATTTTGCACCGATCGCCTTCGCCGCCGTCCTCCATGTCGTATAT----GTCTATATATATATATATTTTTAGAGT---ATTCATCGACTAGTTTTCTAGTTGTAATCCGCTTATTTCGAATTCCGCTAAACGGCTTTTGCTTAATCATCAAAAACCATACAGACAACTATGTATGTATATTTATATGTTAAATATTTTTGCCAAGACTTGAAACGGATCTAAGATTATATTATTTTAAATTTGA
AATAGAGCTCGCTACCAAGCCGTCCCGCTCCGCTTGTCTTACATACATTTATTTATTTCGCATATTCGAGTATTCCCATATTCTTAGCTTTTAAGTGAAATGTGTTAATCAGCGTTTTTGTTTTCATCAACACTTTACAC------CTATACATATTTTGCACATACAT--ACACACACACATGCATATATATATACATATATATATATAGACGATTTGTGC----ATTT-------------GATTATATTGCTGTTCTAGCGA
>CG15147 17621676 17621706|19520 chr2L 17621516 17621734 scaffold_4 4996384 4996599 + 1213|160 195
TAAATAT--TACAATAAT---AAACCAACACACTTG
GAAATACAGTACAAAAACTAAAAACAAACAAATTAA
>CadN 17645795 17646312|19545 chr2L 17644841 17646605 scaffold_6 2301791 2303770 + 37539|1247 1774
GCTGGTGGAGCGAGCAGTGATGAGGAATAGAGTGGGGAGAAG-GGAGAGACCGAATCCAAATCCGATGCGGATACCTAGATGAACAAA------CTAAAAACTGTTAGTAGATACAAAGTTGCATTTAAAACGAAATGAAGCCCCACTCCCGAGGGAAACTCACACACACACAAAGAAAGCGCAACCAAAGAAGCATCTCAATG-CTGAAGTTGGCAGAACTCTCTA-CGTAAATGGAAACTAAGAACTAGAAAACTAAAATAGGGGAAGGGAAGTGGAAGTGAAATCAAACACATATTATGACACGTAAAATGACATTTGT-AAAAATATTTCATCAGCATTTAAATTTAAACAATTACGATAATGAGATTTAGTTGTTAGGGCAACCGGTAAACCGAAAACGGTTACGGTCGCACTTTTTCCAGCATTTTTTGCGGGGCAAGTTATGAACGAAATAAAACTAAAAATTGAGGATAGAGATTTGTATGATGTAGGAGAGAGCATACCAAAGTTTAGTTTAGGAGCGC
GTTT---------CCAGCCAAAAAGAAAACAAAGAGAAGAAACGAAAAGCCCGAAACTGTA---AACGCAGTTAAGTAGCCACAAAAGTTGCATTTAAAAATTCTACACGACCGTGGAGGTTAGGCAAAAATCATCGTAAACGATTTTCCCG-------CTAACTCAAACACAAAG-AAGCGCAACCAAAGAAGCATGGCAAAACCCTAAGTTAGTGGAAAAATAGAGAAAAAACAAAAACAAAAAGCGAAAAAACATGAAAAAGGAAAAAAAAACCTA--TAAAACTAAACACA---TTTGACACGTAAAATGACATTTGTAAAAAATACTTCATCAGCATTTAAATTT-AATAATTATTCTAATTA-ATTTAG-TGTGAAGAGAACGCAAAAAAAAATAAAAACGAAATTCA-AATTTGCGTGACAATTTTTTCGCAACA--TTTTTAAGAAAGGAATACGAAAACC------TAGAGTATTGAGCAAGG--AGCGAGAGCATACCAAAGTTTAGATTAGGCGCGT
>elfless 18005839 18006425|20007 chr2L 18005730 18006194 scaffold_6 2799711 2800206 + 7970|134 534
AACTTTGGCCATAAAACATGGCGCAAGGACACACTCGCATACTTGCAGGAAACC-----CCGGAAAAATGGAAGGCA-----AGCAATGAAAATTCCGACCTACCGCAATAAATTCCGCGGAAAAACAAAGCAAGTGATGCCAAAATAAGAGTGAAATGGCCAGCTCACACACACACATGAATGTA-------AATGAAGTGGAATCACCACCTCAGAAAA----ACTCAGGGA----CACCTCAGACACG--------------------GCCCTGTAAATCGCGCTTATCCAAAACACAACATGGCATCAGGAGGCATTGGAGATTCAGTTTCATTTTCATTCAAAGATTGAATAATAGAAGGGGGTGTTCCATCCCTACCCCAACAACCTTTGACCTG
AATTTTAAATAAAAAATATAAGGATAGCAAAAAGTAAGACATTGTAAGGAAGCCTGTGGCTGCCGACACGTGAAGCACGCAAAGCAATGAAAATTCCGACCTGCCGCAATAAATTCCGCG-----------CGCGT-CTGCCAAAATAAGAGTGAAATATCCTGTGCGCACACACACAAACACACACACACACAAGCACACAGCAGGACTAACTTGAAGAGCGACACACAGGAATAACCGCCGTGTGCGTGTCTGTGTGTGTGTTTTGTGCGCGCCATAAATCGCGCTAAGCCAAAACAAAACATAGC-TGGCCAAGTCCCAGAGAA-CAGCATCATGC----------ATCAGGCATCAGGCAGGTGGATGCCA------------CAGCCTTTGACCTG
>elfless 18005839 18006425|20008 chr2L 18006212 18006771 scaffold_0 1745090 1745644 + 1157|0 230
GACGTGATATGGCAGAAAGCATACTAAACTAAAAATACCACGGTTTTAAATACCACAAAT----------AGACTTGTGGCATATACTTTCGAAAGACCGTAACACAATATTCACACCTAAAGAAACTGTTGC-------TCCATTATAACAACGCAAACAAAATCTTATCCCAGGCAACATACTCAAGAAACACAATGCAATCGAAAACTTTCAGCTGAGAAACTAAAAC
ACCATGTTTGAGTAATAACTTT-------TAAAAATTCA------TTAAATTCTTTAGATGTGCGCCCGAAGATATGCAATGTTTTTTTTTCTTTGACC--AAAACCATGTGCTTGTTTATA-----TATTGCACATACGCCCTGTGTACACACATAAAAAGCAACAAATTACGAGCAAAAATCTCAAGGACAAC--TGCAGTTGCAGCCTGCCACAATAACAACAACAAC
>kel 18125259 18127449|20123 chr2L 18125222 18125575 scaffold_6 2937605 2937950 + 8106|39 379
TTTAGCCGATATGTTTTCCTATGCTCCCTCATATGGATAGACTCAAAAAAGCATAAACACT-GATGAGCGCTAATGTGCATA---GTA-TACGTATATTTTTATA----TTTTTTGAAATTTTGCTTCTAAATCCAATATTACGGGAATGCTTTATTCTTACTCGTTTACT----CTTTAAATATTTGTAGTAATTTGTT-------GGCTGCAATTTCTCGCTATGT----CTACAAGCTTTGTCTAAATCGCTGATAAGTTCTTTAGGATTAGATTTTATATATTTGCTGTTGTCGCTGCTGCTGCTGCTCTTGATGTTGACTTTGTAGTATACTTCGT
TTTAGCCGATATGTTGTCTC---------------------TTAAAAAAAGCATTCACACCCAAAGAGCGTCTAATTGCATATATGTAGTACATATTTTAATATACGTATATATTGAATTTTTGTTT-GAATGTTAATTTTA----ATTTTTTTGTTTAAATTCCGTTTCTAAGTTTTTGTATATTGGTTTTTTTTTGTTTTCGTGTAATTGCAATTTGTCGCTACGTAGATCTACAAGCTTCATTGGAATTGCTGATAAGTTCTTTAGGATTACGTT---TATATTTGTTGCCATTCATTAATTCACTTCTTCT----TTTCTTCTGTAGTATACTTCGT
>kel 18125259 18127449|20124 chr2L 18125582 18126430 scaffold_6 2938050 2938998 + 8474|0 1008
ATTACAACGCTGCTCTACAAAATTGGATCTCAAAACAA----TACAAGCATAACGAATCGACCAAATGAACTTCGAGCAAAATTATAAATTCATTTTAAAAAT------CAAAAAGATATACACTTAA--ACATTGTAGAATTTGATATTACTCTAGAATCGGGCGACTTTGTGTGACCAGCCAACGCTCAAGATCGTATATTATTATGTTGCATACTGTAGTTGTAGTTGAAACAAGAATTTTTGTGTGTCATGTCGAGTTATAGGTAACCTAAGAGCCACATCATATCACTCTCCGTAACCACTTTAAGCAATATGCATTTGATATGATAG--TTCCATTATTTTTCCACTGCCTACTCAAA-------TTTCCATTACCCCA----------TGGCATTTGGCACATGGAC-CGCTTCGTTT-CAGTATGTTAAGTTATGGCTTTAAA----CCGGAACAATAATATTTAGCCAACTATTGTACAAGCTCTCCACTAGAATCCTATTGTTTAAGTCAATTAGAGTTACAGGTATTATTTACATGCATAT--------------------ACATATATACAAG-------------------------------CGCATATACAATACTCCAGATCGGTACATAAATA-TAATCATACTTACAAATGTATTGAGTTTAACTAATTCATAATAAAATAGTTCAACGAAATGC---------TATGCGA--------------------CTGGAATTATTTTTCTGGA------------------------AGATTTTTGTTTTTATTTTAACAAACTATTATAAAATTGGA--TGCTCCGTTCTCATTGCTT--------------TGTTGTTCATATACACAGATACA--TTAAATATCAATACCGTAAATTAAAAAATACAATATCTGTTCGTAATATACTCGTTCTATAGATATATCATGCCAGGGATTTTTGCGTTTGAATTTTGGTCGCTCTAGGCTCGATT
ATTTGAACGCGGCCATTTAAGAGTAGTTCTCATAACTACATCTAGAAAAACAAAGAAATGCCGAGACGCAA--CATGCAATACAAAAGCGCCATATCATGCACATTATATATACATATACATACTTAGGTACATAAAACATATAGACATT-TTATAGA------------TATATAAGCAATACGCATTTGATATTTAATTTTGAAATGTTCCA-------------------ATATAAATTGTTGTGTT--------ATTTTTTGATGGCACGGCAAACAAGTC----CACTGCCCCAATCCACCCTCA--AATATGAATTATATATGCTTACCTATCATTATTTATTAATGTTATTTTGGAGAGGGGCGTGTCAGTCGCGCCCCCTTTGATATTGGCGTTTGTTATGTGCACGCGCTTTATTCACATTGTGTGCGTTTAGTTTTTCGGAGCTTCCCAAGCAAAAAAA---AAAAAAAAATTGAAAGGAAAAACCATTATGA-ACTATCATTTAGGTCAATTAGCATAACAGGTATTATTTACATGCATACTACTTATATACATACTATACACATATATACAAAAAATATACACACGAAAAAAAACCATAAAAAATGCATATACAATACTCCAAAT----ATATAGATCCTAAGCATACTTACA--TGTATTGCGTTTAACTAATTCATAATAAAATAGAAAAAAAAAAAATAAATATATATATGTAAAACTTGGTATATTCAAAAATTTGGAACGATTTTGTTGTGTTTTTGTTTTGCTTTTGTGTTTTTATCGTTTTATTTTTATTTTAACAAACTATTATAAAATTGCAAGTTTTTCATTCTCATTACTTCTTCTTGTTGTTGTTGTTGTTCATATACACAGATACAGATATAATATAATTATTATAAACTAAAAAATACA-TATCTGT-CATAATATACTCGTATTCAATATAGATATACATATATGTATATGTATATATATATATATATATATATGCCCGATT
>kel 18125259 18127449|20125 chr2L 18126688 18127484 scaffold_6 2939419 2940206 + 22082|0 806
GTAATTGACTTCAACTTCATGTTTTCCCGTGACTGCGTGAGTTGCGATACAGCTTCAGTGGCATCTCAGATGTCAAATCCGTATGGCACACCCCGTTTGAGTGGT------CTTCCCCAGGATATGGTACGCTTCCAGAGTTCCTGCGCTGGAGCTTGTGCGGCAGCCGGAGCAGCTTCTACAATACGAAGAGACGCAAAT---GCATCAGCTCGCCCACTGCACAGCACTTTGAGTCGCCTGAGGAACGGTGAAAAGAGAAACCCCAATAGGGTGGCTGGTAA------------------CTATCAGTACGAGGATCCTTCCTACGAAAATGTGCACGTTCAGTGGCAGAATGGTTTTGAATTCGGAAGATCCCGCGACTACGATCCCAATTCCACCTATCATCAGCAGCGCCCTCTGCTGCAACGGGCTAGATCGGAGAGTCCCACCTTCAGCAATCAGCAGAGGCGACTTCAGCGGCAAGGAGCTCAAGCTCAACAGCAATCGCAGCAGCCTA-AGCCTCCTGGGTCGCCAGATCCCTACAAGAACTACAAACTTAATGCTGATAACAACACCTTCAAGCCTAAGCCTATCGCTGC------------CGATGAACTCGAGGGAGCTGTTGGTGGAGCTGTAGCTGAAATAGCGCTTCCTGAAGTGGATATCGAAGTTGTAGATCCTGTCAGCTTAAGTGATAACGAGACTGAGACAAC-----CAGCAGTCAAAACAACCTTCCAAGCACTACCAACAGCAATAATCTGAACGAGCACAATGATTAAATGTGGATAAAATAA
GTTATTGACTTCAACTTTATGTTCTCGCGCGACTGCGTCAATTGTGACACCGCCTCGGTAGCCTCACAAATGTCCAATCCGTATGGCACGCCACGCTTGGGCCTCGGCACACTGCCGCAGGACATGATGCGCTACCAG-----------------------GGCAGC-------ACTGCCAGCATGCGACGGGATGCCAATGGAGCTGCTGCTCGACCGCTGCACAGCAATTTGAGCCGCTTGCGTTGCGGCGCCGACAAGCGTCAGAACCTGACGGCAGGCAACAGCTGCAGCAGCAGCAGCTATCGCCATGAGGATCCCTCCTATGAGAACGTGCACGTACAGTGGCAGAATGGCTTTGAGTTTGGACGCTCGCGCGAGTATGATGCCAGCTATA---ATCAACAGCAGAGGCCGCTGCTACAACGCGCACGCTCTGAGAGTCCCACGTTCAGCAATCAGCAGCGACGCATGCAGAGCGCCGCGGCACAAGTGCAGGCACAA----AACTGCCAACAATCCGCCAAGCTGGCCGATCCTTTTAAGAACTACGAACTGAATGTGGACAACAATAGTTTTAAGCCCAAGCAGCCGGCGGCAATGGAGCTGTGCGATGAGCTGGAGGGCGCTGTCGGTGGTGCAGCTGCCGAATCGG-----------ATGCAGAGCAAACGTTTGAACCCC-CAAATCCGAGTGATAACGAGACTGAAACAACGACTTCAACAACAACAACAACAACCGCTGCAACAACAACAGCAACAACAACAGCAACAACAACAAACAGCCAACAGCAAAACAA
>kel 18127511 18128538|20126 chr2L 18127507 18131920 scaffold_6 2940231 2944676 + 161623|4 1141
GAAATCGATGTGGAAGCGGTCTTCGTTGTACTCCACTTTATACGAACAGTCGATCCAATTGTCAACGCCAGCGCAGTTTTGACGACACTGAGTCCACGGACGGCTACAATTTGCCTTACGCCGGAGCGGGAACAATGCGATACGAGAACATCTATGAGCAGATTCGAGATGAGCCACTTTACCGCACATCCGCTG---------CGAATCGAGTTCCGCTCTATACACGTCTCGATGTTTTGGGTCATGGAATCGGAAGAATTGAAAGGCACCTTAGCTCGTCATGCGGCAACATCGATCACTATAACTTGGGCGGACATTACGCGGTATTGGGACACTCGCACTTCGGAACCGTGGGACACATTCGATTGAACGCCAATGGATCGGGAGTAGCAGCTCCTGGCGTAGCTGGGACCGGCACTTGCAATGTTCCAAATTGTCAAGGT-TATATG------------------------------------------------------ACAGCAGCTGGATCCACAGTTCCGG------TGGAGTATGCAAATGTTAAGGTTCCTGTGAAAAACAGTGCCTCCAGTTTCTTCAGCTGCCTGCACGGTGAGAACTCGCAGAGTATGACCAATATTTACAAAACGTCTGGAACGGCAGCTGCCATGGCTGCCCATAATTCCCCATTGACGCCAAATGTGTCCATGGAGCGAGCATCCCGATCGGCGTCCGCGGG---------GGCAGCTGGATCAGCAGCA------GCAGCTGTTGAAGAGCATT-------CTGCGGCA--GATAGTATTCCAAGCTCATCCAACATTAATGCCAATCGGACAACAGGAGCCATTCCGAAAGTGAAAACAGCTAACAAACCCGCTAAGGAGTCGGGAGGATCCTCCACGGCCGCATCGCCAATTTTGGATAAAACTACATCCACTGGATCGGGA---AAGAGCGTAACCTTGGCGAAGAAAACTTCTACAGCA----------GCAGCACGCTCGAG---CTCATCTGGAGATACCAATGGCAATGGGACTTTGAATCGTATCTCCAAGTCCAGTTTGCAATGGCTACTAGTAAACAAATGGCTGCCGCTGTGGATTGGCCAGGGACCCGATTGCAAG
GCAATCGCTATGGCAGCGGCCTGCGCTGTGCTCCGCTCTATGCCAGCAATAGATCCAATTGTCAGCGACAGCGCAGCTTTGATGACACCGAATCGACAGATGGCTATAATCTGCCCTATGCGGCGGCGGGCACCATGCGCTATGAGAACATCTACGAGCAGATACGCGATGAGCCGTTGTATCGCACCACAGCTGCAGCGGCAACAAGTCGCGTGCCGCTCTATACGCGCCTGGATGTGCTGGGCCATGGCATCGGACGCATCGAACGGCATCTAAGCTCCTCCTGCGGCAACATAGATCATTACAATCTGGGCGGACACTATGCGGTGCTGGGACATTCGCATTTCGGCACCGTGGGTCACATACGTCTGAATGCGAATGGTGCTGCAGCAGC---------CAGCAATAATGCTAGCACCTGCACTGTGCCCAACTGCCAGGGGATATCTGGCTGGCGGTGGTGTTGCTAGCGCTGGTGTTGGTGGTGCAAGTGCTGCTGCCGCTGCTGCTGCTGCAGCCGCCGCAACGGCGGGCATGGACTATGGCCATGTCAAGGTGCCCGTCAAGAATAGCGCCTCTTCCTTCTTCAGTTGCCTGCATGGCGAGAACTCGCAGAGCATGACAAACATATATAAAACCACGGCTGCTGCAGTTGCTGCGGCACACCACTGTTCACCACTGACGCCCAATGTCTCCATGGAGCGTGCGGCACGCTCTGCATCCGCCGGACCTGCCACAGCAGTTATAGCAGCAGCAGCTGCTGCAGCTGCCGATGAGCAGCAGCTAAGCGGCGGCGGCGACAGCGTGTGCAGCTCGACC-ACAGCAATG-----CGACCCACGGGCGCTATACCCAAAATAAAAACCACCAGCAAAGCGGCCAAGGAGTCCAGCACAGCAGCAACTGCTGCCAGTTCGAGTGGAACCGAGAAGTCAGCAACTGGAGCAGCGCCCAAGAGCGCTGCGCTGGCCAAGAAAACAACAACGGCAAACAACAGCTGCAACGCGCTCGAACTCCTCCTCCTCGGATGCC---GGCAATGGCACCTTGAATCGCATCTCCAAGTCCAGTTTGCAGTGGCTGCTGGTCAACAAGTGGCTGCCGCTGTGGATTGGCCAGGGACCCGAGTGCAAG
>kel 18128892 18129454|20126 chr2L 18127507 18131920 scaffold_6 2940231 2944676 + 161623|1514 2099
CCAAGCTGCTTCGTTGGCCATCGCACTGCTGGATGATGAGAATAGCCAGGCGGAGGGCACGATGGAGGGCGCCATTGGTGGTGCCATCTACGGTAATCTGGCGCCGGCTGGTGGGGCTGCAGCGGCTGCAGCTCCAGCTGCGCCGGCTCAAGCTCCCCAGCCAAATCATCCGCACTACGAGAACATCTACGCGCCAATTGGACAGCCCAGCAACAACAACAATAACAGCGGCAGCAACAGCAACCAA--GCTGCAGCCATCGCCAATGCCAATGCCCCTGCAAATGCCGAGGAAAT------------------TCAGCAACAACAACAACCAGCTCCCACTGAACCTAATGCCAACAATAATCCGCAACCGCCAACAGCAGCAGCTCCAGCACCATCACAACAACAACAACAACAGCAAGCACAGCCACAACAACCTCAA---CGCATACTGCCCATGAATAACTATAGGAATGATTTGTATGATCGATCTGCCGCCGGCGGAGTCTGCTCCGCCTATGATGTTCCGAGAGCCGTGAGATCTGGCCTTGGTTACAGACGCAACTTTAGGATTGATATGCAGAATG
CCAAGCGGCCTCGCTGGCCATAGCGCTGTTGGATGATGAGAATAGCCAGGCTGAGGGCACCATGGAGGGCGCCGTCGGTGGTGCTGTTTATGGCAATATAATA---------------GCAGCAGCCGCAGCACCGCCAACGCCTGCACAGCCCGTT------AATCATCCTCACTATGAAAACATTTATGCGCCAATTGGACAGCCCAACAACAACAACAACAATAATAATAATAAC--CAACAAGTTGTTGTGGCCAATGCCAATGCCAATGCCCCTGCAAATGTTGAGGAAGTAGCTCAACAACCACAGCAACAGCAGCAACAACAACCAGCAGCAACTGAAGCCAATGCCAGCAACAA----CAAT--CCGGCACAAGCCCAGCAAGCAGCACCCCAACAACAACAACAACAACAACAACAGCAGCAGCAGCAGCAAGCGCGCATGCTGCCCATGAATAATTATCGCAATGATTTATATGATCGCTCCGCATCCACAGCGG------CTGCCTACGATGTACCAAGAGCGGTGCGCTCCGGTTTGGGCTATCGTCGAAATTTTCGCATTGATATGCAAAACG
>kel 18129517 18129542|20126 chr2L 18127507 18131920 scaffold_6 2940231 2944676 + 161623|2190 2215
ATGGAAGAGCAGGGTGCATTGGCCCG
ATGGAAGAGCAGGGCGCATTGGCACG
>Socs36E 18134597 18135773|20131 chr2L 18134480 18137175 scaffold_2 5311466 5314343 - 43804|124 1523
CGGGAGGAGCAGCA-----------------------------GGTGGGCTTCACCTACTACGAGGACGTGGAGAGCGGCAGC------GAGGTGGACGAGGACGACGACGAGGGGGTCAACATACGGGTCTCCTACGTTCAGCACGCCGAGGTGGTGGCCCAGCTGCAGCAGGTCACCACGGCGTCGG--GCC--CATCGGCTCCGTCCTCATCCAGATCGTCCA-ATCTTCAGGAGCACCTCAGCAGGCTGCCCAACCGCATGGCAGCCGCCTTTGGTCGGATGTCGGCCAATCTGAATTGCTACCAGAAGACTGTCGCCACGCCGGAGCGTCACTCCAACTCCTCCTGAGGATCAGGACGTGGACGGAGGGGCAAACAGA---ACCCAGAAACCAAAACTCA----AACT--GAGACAATCCCAGTG---CAGCGTGTGCCGCCACCATAAGTTAAAAGATCAAACGCGAAGCCACATAACAAAATCGCTAGCTCGCTACTACAAGACTGTCATGGATCAAAAACCAAATGTTCACCAT---ATATATCTCACCTAT------TGGAATGCAGCTCGGA----CGGATTTTTGAGTTGTGG----CACTCTTGAAAGCGA-GCTGGTAGAATGTAGAATCGAAATCGCAGTTAGCTAATTGTACTATAAACTAAGTATTATTATCTAAAGCAACCCTCTC----------TCCTACACACATAAGTATTGCAAAAAGAAGGGCCAATCGAGCT-------------------TTTCGTAATCGCTGGTATTCTTGT------AATATTTCATTGTATTTATTTGAAGTATGGAATCTAAATGATGTGTTACTGTT-------------------------------------------------ACGTGTAAATACG-AGATAC--GAATGCAGCTTAGTTAGTGTAAAACTCTCTCATTAGCCAAATTTCCAAATGTAATTTTCGCCTATTTATGAATATACTTTATTTATTTATTCG-------AAGTGATTTCGTTC-GCAAGCGAGTGCTTTGTTTAAAAAGAAAA-----AACCCGTCAGTTGTACACGTGTAGAGCATTTGTAAATACTACCGATTTTCGCATTAAGCTGTAGCTATAT-TAATATAATGAATTATAAATCATGTATTCCTACCTAGGTGGTTGCTGTTATTCGTAAACAT--------TCAATAA----------------------------------GCAGTTGTTTCCAATACCTATTTAATGTATTTTACATATCTCACATGT------TGATGAGCATGCGTATC----AATATTCAAAAACAAAATCGAAAAAAGAGTCAAACAAATAAAGTTGATCAAGATATTAGAAAAAAT
CGGCGGCGGCGGCGGCTACTCTGCAGTTGGAGCCAATGCCTGCGGCGGGCTT---CTACTACGAGGATGTGGACAGTGGCAGCGATTGTGATGCGGACGATGACGATGATGAGGCGGTCAACATACGTGTTTCGTATGTGCAGCATGCTGAGGTTGTGGCACAGCTGCG--CGATTGCGCCAACGTCAGCAGCCGGCGGCAGCCACAGCCACAACAAAGGCAACAACAGCTGCAGCAGCAATTGTTGAGGCTGCCCAATCGCCTGGTCGCCGCACTTGGTCGCCTCTCCGCCAATCTCAACTGCTATCAGCCCGTGGCAAGAACGCTG----------CCAACGC------GCAATCAAGTTGCCGGCAAACGTGCCGCCTGATGTGTGCTAGAACCAAAATCAAATACAACTTAGAGACAATCCCAGTGCGTCGTCGTGTGCCG-------AAGCCAAAACTCCAAAAGCAAA-----AAAACAA------------------ACAAAACTAAAATACATAAAAATCAAAATATTCTATAGTTAATGCAAGTAGCCTTTAAAGCGTAAAGTGTAACCCTAAGTATTACATATTCAAACTGAAAGATCCTCTCCTATATACGATATTTGCTACATATATAGCCTAATATATATATATATA-------TATATGTATAGATTTATTATCCATACCAACTCGCTCCGCATTTGTTTCCCAAAGTATTTAATTTTGC------AATTTTCAATTGAATTTGTTAAAGTATTTTACAAATTGTATATTTGCTGGCGTCCTATTTATTCAAACATCTTTTAGAATT--TTTGA-----GAAAATTAAATTATTTGTACATATTCAAACCAACCACACCCCCCCACGCCCCCTTTTCGCCACACACAACTTAGGCGTTAACATACGTAGATATTATATTACAAATTAA-TAGCGTACAA--CTCTCATTAGCCAAATTGCAAGTAAACGTGTTTGTTTTTTTGTAAATTTAATTTATATACATATATATATACATATATGTATATGTACAGGAAAATAGTATTTTATTTATTTATTCTAATTGTAATTCGT-GGCTGCGCTAAAGAAATATATTTTTAAATTTTCCAG--TTGTACATAAATCAATTATAACATACACTTTAGTTTATTATTAA----ATACTCCTA-CTAGGTGGTTGCTGTTAATCGTAAATATTACAAATATCAATAACAATATATATATATATAAATACCCTGTAAATTATGCAGTTGTTTCAAA-GCTTATACAAACAG--TTACATATCGGA-ATGTTCTACGTGTTGAGTATGAGAAACAAATAAAAACAATAAACAAAACCAAATAAA-----AAATAAATTTAAATAACTAGAATTTTCGAAGAGCG
>CG7200 18153039 18153137|20152 chr2L 18152736 18154469 scaffold_6 3732387 3734219 + 56538|311 468
-ATAAGCACAGCTCAAATGCCTCGGCATATTTTTATACCAATACTTGTATTCATATACAACCGAAAGTCGTAATATTTTAATACA------------------------GACATTTAAACAC-----------------------------------C
CGTATGAGCAG-------GCCCCGGCATATTTTTATACCAA-AGTTGTATTCATATACAAT----AGTCGTAGTGTTTTATTATATCGTATATTATATTTATAATGAATGTAATTTATGTATTATACATAAAGCTAGGGCCCGGGCATGGACAGGGGC
>CG7180 18176921 18177997|20183 chr2L 18176823 18177843 scaffold_6 3764738 3765791 + 10656|98 1188
GGCACCGCCTTAAAGCAATAATACTGAGTATTTTTGTTGTCCACAAAAGCCAGAGAAGGAATGAATTTTGTTGTTACGAGCGTCGAAATGTAATTTCACGCCACTGAAAAGATACTTTTTACTTGTTTTTC----------------GAGCATAAA---ACAATGATACTACTACATAATGTATAAG---------CTTTTTGATC-------TGAAATGTATGTGCCATTTGTAA--CCCTAGTTGTTGTTGTTA----TAAACAGGACGATACG-ATATGTGTG-ATGAGGATTATGAGTATAGA-----TTGAAGTAATGAAATGAATTGATAGGAACAGAGAACTATTACCATTAAAATTTATATTTATATCTGTAGTTATTATTACGTTTACTCTTAAACCTTGCTACCT--GGGCAATTGTTGATATATATCTAACTACATATACCTATTATGAATCTATTTATACATAAATACATATGCATATATATATATATATATATATATATGAATGTTATATACTGTTGTAAATGGGAACTCGCTACGTTTTCC----ACTACTGTTGACA--------GAACTTTATTTTTTATTCATGTTAAAGAA-------------CAAATATTTATTGA---------------GCCACATAAAGGGGAAACTTCAACGTGCTGAAGTGAACAAACTTTGTACTTATTTATATATGCTTATTTATAAAACTCACAAAACACTCAAACAGAAATACATACCCATGTATGTATATGATTTCGCATCATGATTTTCCTCTATTTTCGCATTTATGCATTCGAA------------------------------------------ACACAAACCTACCTACA-----------------------------TTTATTGTTGTAACTCTAATTAATTTTTTTTTTACATTGTGTATAAATGTGCGTCTGTCCATTTTATTCTTTGTATAAACCAATCTACATGTGTA----GAAATTAAGCTG-ACAAATTGTATTGGATTAGGCTA--ATGAAACGAAACTGAAGCCGAGAAATATGAAACGAAACAAAATTCAAAT
GGCACAGCCCTTAAGCAATAATACTGAGTATTTTTGTTGTGCACAAAAAC---ACATTTTGTTAGTTCTTTTGTTGTCTCCG--GAAATTAAATTTCCC---------------CATTTTATTTGTAGGTCCACAAGTTCCTAACTGGACTATAAATATATAAAGATAATTTAATCAAATGCAAAAGCCATAAGTACTATATGATCTGATGTTTGAACTGTATGTGCCATGTCTAATGCCCTAATTGTTGTTGTTATTAGTATATAGAAATATATATATATATATATATATGTATGCCGTATGAAGAAACTCTTGAACTATTACAATTA--TATTTACGACTAAATATGATTATGTTTACGATTCATATATATA--------TATAATTACGTTAACTCTTAAAACTTGCTACCTTATGCAAATTGTTGATATATATCTAAACTTTACTGCATACTATAAATGGAT-----------------------------AATATATATATATATATAAATGTTTTGTTCTTGTATAAA-AAAAAGTCGCATAGTTTTTAGGGGGCTGGTCTTGAAAAATGTTTGAAATTGTATTTTTTATTCATGTTAAACAAAAACTGCAAAAACAAAATATTTATTTAGGTGTAAAACGAAACGCAACATCAAAAACAAAACCCCAAACACTATCGTGAACAAATTGT----TGATTTATATGG-------------------AATGTACCCAGACATACATCCATACACATACAT-------ATGTCGCGTC--TATACTTGTATATTTTCGCATTTATGCATTCGAAATAAGATATATTTGTCTAACAATTCAAATGCATATAACAAATACACACACACACACACACACACACACACACACACACGCACAACACTTATATTTATATACATATATATACATATATTCTTATATTCT-TGTAAATG------TATTGAATTTATTTTTT---TAAATGTGAATAAATGTGTATTTTGGAACGATTCCGTACGAA--ACTTTAGAGTAGGTTACGAAAAAACCAAAACAAATACCACAAAAAAAAAACAAGAGAAAA-------
>CG7180 18176921 18177997|20184 chr2L 18177994 18182356 scaffold_6 3766162 3770620 + 148677|0 3
AGTG
GCTG
>CG31802 18204343 18204516|20215 chr2L 18204126 18205071 scaffold_6 3804858 3805936 + 23301|246 508
TTGCATTACGTTTAAATTT-----ATTCCGCAATTC---------------ATTTGTGTAAACGGGAAACGACGTTGTA------TATAACCCATATAG-----ATTTACTCATTTTTCAGACAG------ACACATCAATCTGACTCGAAACCC----------------------ATTACAG---------TGAAGAAGTTTGGATATGCTTCGGTTCAATAAAGC---TTCGCATTGAA------------------TTA
CCGCAACCCAGGCAGGTCTAAGACACGCCCCGACTCTGGCTTATATTCGAAACACGCACACAGAGGAAACGACGTTCTAGTGCTCGACACTCGTTATAATAGCTAGCTAATCAGATTTCAGGCAGCCCACAACATTTCATCCCCCCACTTAATCCCCCCAACTATATATATTGACATATCACAAAATATTTCTTGAAGAAGTTTGGATATGCTTCGGTTTAATAAAGCACGTGTGCAGAAGAAAACAGCAAGGTGCCTTCCTA
>RpS26 18438427 18438646|20526 chr2L 18438499 18438642 scaffold_25 323067 323202 - 449|0 148
CTCGTCCAGCCGGAGGAGAGGAGCACTGGGTGCACCA-----CCTGACATCTCCATATGGAGTCTACCAATCTAGCCGGACTCGCGCCCCAGTGCGTTCCGCTCTGGCGTCGAGGAATCGCCAAGATAAGCAGACGAAATATATGCATC
CTCAGCTACTCGGAGCAGGCCGGCGCTGGAGCTATTGGTGGCTCTGGCGGCGTCAAGCTGAAGCCGCCTGTGCCGCCCAAGACGCACCTGAGCAAGC----------CGTCG-GGCATTGCCA--GCAAGTACATTAAGCAGCTGCAGC
>RpS26 18438427 18438646|20527 chr2L 18438646 18439152 scaffold_6 4151733 4152233 + 30614|0 0
A
A
>CG12750 18440436 18440570|20528 chr2L 18439408 18440768 scaffold_0 4168831 4170183 + -3535|1152 1297
ATCTGGAGACTGGACAACGTGACGTGACCAACA--AAGGCAGATGAATA-------TTTGTGTTAAATATTTTACTTTTACACATGTACAAAGCAAAACCCACTAAACCGATAAAACAAAAATAAATGTA-CAAATG-CAAATTTC
ATAGATAGGCACTAAAGTGTTCCGTGGTTGACTGTACGGCCTGTGCATAATTGGATTTTGTGTTAAACATTTTACTTTTAATCG----------AAAACAAACCAAAACGGCAAAAGGCAAATTATTTGATCAAATGTTGAATTTC
>bsf 18445443 18445562|20533 chr2L 18444792 18445446 scaffold_10 3892526 3893149 + -3323|701 704
GAAA
GAAA
>bsf 18445443 18445562|20534 chr2L 18445447 18445629 scaffold_6 4162279 4162460 + 3129|0 128
AGG--TTTCTGCAAAAG--------GTCCTTGTTTAGTGTAGGCCGTCGTGATTAAAGCTTAT--TTTTAAAGTATTTACT-ATGGATAAACAATTTGTAAACTAAAATAAATTTAGTTGTTTTGTTGC
AGGGCGTTTAATAAAAGAGACGTTCACACTTGCTTAGCTTAAACCT---------AATCTTATGACTATATAGTATGTATTGATTGTTAAACAAAATATATATTTAATGAATATT--TTTTTTTGTTGC
>CG10283 18468879 18469147|20572 chr2L 18468818 18469446 scaffold_803 6945 7592 + 14807|62 362
ACCATAATCACCTATTCATTACAATGCCTATATACATACATAAGTTTTGTACTCTCTTGACAATGAAATTGTTCAGATCAAAATCATAACTTTTATCGATTTATTCAAAT-CTCTCTCACATTGTATCTCTAG----------AACTTAG-----------AAGTAGCTTGTAGTTTAA--ATACATTTAAATCATGTATAGTTTAATATGTGGTTTCAGTGA--------TAGTTTTGATATACAAAATCATTGGCCTAACAATAAATGTTTTTTTAAAAGGAAATAATTAAAATAATTA
A--GGAAGCAGCTGCCCAACCTTTTCTTCATTTACTATAATTAATTATTTTCTCCAAAAACAATGCAATTGTTCAGCTCACA---TCAACTTTCATAGATACACACAACTACAATTTTTAATTATAAACTTAGCTTTTGCATAAGCTTAGATAACAGATAAAGATAACAGATAACTCAGTTATGGGTTTAAAATAAATGTTTGTTAATAAGTCAATTGAATGAGTTGTGTTTCGTGTTGGCAAGCAGCAT--------TAGCTGTAA--------TTAGAATATAAGAATGAATATTATTG
>CG10275 18483675 18484002|20591 chr2L 18483427 18485713 scaffold_6 4230972 4233270 + 88654|266 631
GGTTTAGAAGGATGTTCTGCAATAAAGGGATCAATACAAGCGTTTCCAATTCGATCGGAATTAGTCCTAGGTTATTTATTTAAATATAAGCT-----TACGTTTAAGGCTGATTTATGAGATTCGT------------TAGGAAAAGTGAAGCATTTTATATACGAAAACATTAATTATAGTTTGGAAAC----------AAGCACACATACATATCTGGCGTGTCATATACAAACG-ATTAGCATTAAGGACGAGAACAAGAGTT----ATACTCAAAAAGCCAACTTAACTTAGCCTTAGAATTGTGTTTGCCAACG---TGGAATAC---TTTTTACAATAAATGACAATACTTTTAAGCGTA
GGAGCAGAA-----------------------------------CACAATTACGACACAATTAGTCTTAGCTTATTTATTTAGCAATAGATTTTAGATATGTTTAAGGCTGATTTATGAGATTCGCACGTTCTAGTTGTAAGCAAA-CGGACTTTGTTAGTTTCTAAAGAGCATTTGATAGCACGTAAATTTGCTACCGAAAAACCATACACATATTTGCCATAT-ATATACATATATATATGTATGATTTATAGTCGTAAGAGTTTGCCAACTTTCAATATTATACAATGTTGAGTCTT----TTGTGTTAGAAAACGATTTGAATTACGAATTTTTAAAATAAATGACAATACTTTTAAGCTAA
>Pde11 18528657 18529263|20630 chr2L 18527951 18532291 scaffold_6 4307108 4311592 + 103940|827 1489
ATACATCCCAATCTGGTGTGTTCCTAGAAACTCGGAAACAGATTAAAGGGGATCATATTTAACATGATAACTCTTAAACCACATATGTGATGCCTAAAAGTATGCAAGAAATCAAAAAAAAAAAACTTGTATTGGTCATAACTCTTCAAAAGGTTTTCTAGACAAGTCCGTTGTGGCGAGATTTCTGGATCACATTAGCATATCTTCAATATGTACATAGTTCTGAACACCTCATCTAAATCGCAAAACACATTACCGCCCACTCTCATCCTGTATATAACATCCATTTTGAGCAACAGTATCGGAGAGCAGTAGGAAAGAATATTGAGAAAAACACATACCATAAGCAAATTGTGG--CACAGCAATTTGATAGCCTACAAC-TAAAGCTAAATAGAAAGATTCCTATAAACGTATGTA-AGTCGTTATA--TACCTATGTATGTGTATATTCTGATCTGTGTGTGTTTGTAACTTAAATTTTTAGTTCGTATCGTCAGCGTTAGTTA-------------------------ATGAT------------------AATGCAAAGAAGTCAAATTTTCTAGATGTTTAAGCACCA-----ACCAACAAAAGAAACAAACAAAACAAAACAAATGAAAAGAAAAATCTTACCAAA--AATGGC
GCGC-----------------------AAACTTTGACTGTCATTCAAAGAATTATTATTT------GTACATAGGAGACGACATTTCTCACGCCCA---------------------------------TTTTCTGTATATATCAACAAATTGTAATCGCAACA-------------------TTTGAGCAACAGTATC-TATCGTAAACCTAACAATAATAAT--ACAATTAATAGAAAGATTAAAACATATAA------AACCACATACCATACGCA----------TAAGCAA----ATTGTGGCACAG-------GCAATTTGAACATAAAACGTAAATTAGCCAGATTCCGATTCCTATAAACTATATAAACAACTATATATATATACATAAAGATATACAAATATACGAGTGTGTAAACGTTATGCTTACGTATA-ATTTTGACACTCTACGCTGTGTG----TTTAACTTCAATTTTAGTTTAGT---GCAAACATATGCTATATGCTATACTATATATATATAAATATGATAAATATGAAAAGAAACTAAAAGCAAAGAAGTCAAATTCTCTAGAAACTTAAGCACAATGTTTACCAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTACAA-----------AAAGATTTAACAAAGGCAAAGGC
>amos 18591976 18592238|20701 chr2L 18591946 18592187 scaffold_6 4410582 4410775 + 2284|30 242
CGGGCTGTGTTGCAGCAACACCTTCATATCCTAGTGGAAATCTTATAAAGGCTGTTAGTTTTACGTTTATTATCATAGTTG-TACACAATTCAAGCAATAGTTTTATAATAAAAATGAAAATACAAATCAATTATATTGTTTTAAATTCATATCGTATGAAATGGTGGAGTTGGAATGAAAATAATGTTGTGCGAACTTGGAAATTTATATTT
CGGGACGTGTTGGAGCAACACTCGAA---CCTAGTGTCAACTTTA-AAAGGCTGTTAGTTCTTAGGCT-------TAGCTGCTAAACTATTTAATTAAGA-TTTAATTTAAAGAGTGTTAATAAAAGTTAATTA---------AGATTCAAA---------------------AAACAAAACTAA---GATATAAATTTTTATATTTGTAATT
>CG10413 18595678 18596538|20706 chr2L 18595619 18598893 scaffold_6 4419179 4422641 + 104449|59 995
ACTTCGAATTGGAGATATTCGCGTTTCCATGAGTGATAAAATCCGGAGTGCAACCGGATTTAACCAATTGTGAGGGTGTATTTCCAACATTGTGTGCGTTTTTGTGTGCTCGTAGCTTTATCGAGTAATATTATACATTAGGGTGAGCCGATTAAGTTGCAATCACAAAAACATAAGATCTACATGTTGCCGATGCCGAAAGGGCAAACATATG---GCTCGATTATATTATTGCAACTACTTAAAAATGACAAACTTTTTAGACAAACCT---TTTGTGTCTTTGTTTTATAATATTATACCAACTGCATCGCCTCACCCTATAAAAGTAGTATGCCTTTAGTTTGTTAATTTCATGTTGTAGCT-AATTTAATATTTATTCGCACAGACCCACAAAACAGTGTCGTAAATTCCGA------------ATCAAAATTTT---------TAATCATATCAG-AGTACTATTGCAAACAATTTAATCGAACACACGTGGACCATCCAGCAATTGATAAATA-----ATATCATATTCAAAACTCATCCCCAACGGAACTCACACCGATATTAACCTCTTTGTGATTGATTATGAATATCTACTATTACTAATTCACGATTAAACAGACCACAGGACAAAAAGTATTAGATAACCGCGTTCCATTGTGGTTGTAAAATTGATGATTTCATATT----GCACTTAGTTTGTAATCCATTTTTGG-------------AAGACCTTCACAGCTCGGACGGACATTGATC----------GATTGTCGTAGACAAGTGT-TTTGTGTGTGTAAACT------------TTATGGAACTGTGACCTAGCTAATAATATAATAATTGATCACAGCATT--CATTGTAATCGGTTCTTTCCAATATTTTAAATAAAGACTTAGCGATATGTATTTATGTAAATGA
GCT------------------------------AAATAAATCCC--AGTCCCAGCCGCTTTCTC------------TGTTTCTCTGTTGTTG-----GAGATTGTAGGCGCACAGTGATATCAAAT-GCATTGCATATGCGG---------------------CACATAATC--AAGTTTT-----------------AAAAAGCAAATTTATGCACGTTCGGTC-TTTCCTTTCAATTGT------AAGCCCATCTCTATCAATTAACATATATGTATGTATTTGTTTTTGTGTTGTGTGTAGGCTGTA-AGCTGTAGCAAATTATAGC-GTATAA---TAATATATTCATGTTCAGTTATAACTCGATTTTAAATTGTTTAGCACACACAACGACAGCAACAACAACAACAACCACTCTCTAATATCATCGAAACCCTTTGTACTAATTATCATATCAGCAATTCACAAATTAACAACTATATTT--TATATGTATATTAAACAATATTTAACACATATGTGCGGACCATTTAAAGGAAACAACAACAAAAAAAAACATAACTATATCAA----TTTGTGCTCTGTTCGATATTAAAACGTTTTGTGATTTGAGAACCTGCTCTCTATGTAGCAAAAAGTATTAT-TAAAAACGGTTTGTT----TCGCAAAAATA--GATTTCATTTGTTTAGCATTTAGTTTTCAACATATTTACGGGCAATTCACAGTCAAGCGATTAACTGCTGCAACAATTTTTAAGCTAAACATATAAATTATAAATGATACATATATTTTTCTGATTAGGCTGAGTTAATTGTGCTTTGTGCCTGTGAATAGTCCAATTATATGATTATTTATATTTTTACTAGCAATGTATTCGGTTCTTTCCAATA-ACAAAATAAAGA--TAGCTATATTTCTTAATTTAAG---
>CG10414 18605501 18605535|20715 chr2L 18605522 18608441 scaffold_6 4427949 4430844 + 79268|0 13
GACTTTTTTCAAAT
GGAATACCTCTAAT
>CG15161 18610268 18610372|20718 chr2L 18610370 18614167 scaffold_6 4433261 4436891 + 36172|0 2
TAG
GAG
>Cyp310a1 18646986 18647099|20760 chr2L 18646934 18647631 scaffold_6 4474679 4475431 + 16866|52 207
ACTAAGTTAAGC------TAAGTTAAGTTCTT-------------------TAATTTGAGCATTTTTT-CCAACACTTTGTCGTGTGTGCGC----------------GACACCTGAAATTATGCTATAAATAAAATTCAGTATATTATGGTCACA
TTTAATTTATGCAACACGTGACGTATTTTCTTCTCTCTCTCTCTCTTTATATATTTTTTGTATGCTTTACCAACACTTTATT-TGGGTATTCTGTTTTGCTAGCTATGAGCACCTAAAAATATGCCATAAATAAAA-TCAGTAAATAATGGCCTGA
>CG31790 18662821 18662893|20779 chr2L 18662782 18666846 scaffold_6 4497715 4501891 + 125130|39 118
AGTACTAAACTTTTTC-----TTTGCATTTGTATTTTTTCAAAATAACTCAGAATAATATATGGTTTCTA--CATTTCGG
AGTACTGGATGTGCTCGGTATTCCATATTCGGATATGTTCCAATCAACTT---------TTTGGTTTTCAATCAATCTTG
>CG31791 18666813 18667278|20779 chr2L 18662782 18666846 scaffold_6 4497715 4501891 + 125130|4381 4415
TTTTGTTCGCT-ATTTTTTATGTTTCAAATGTATG
TTCTGTTCGTTTGTTGTTTTGGTGTGAAATTTATG
>CG31791 18666813 18667278|20780 chr2L 18666868 18667291 scaffold_6 4502470 4502948 + 2095|0 501
TTATTTTATGCGCCGTGGCAACCTGAAAGTTGCCGCATAACTTT----GCCTCTTCTTGTTGCCTGGTCGGGTCGGGTGTATTATTTACGCTTAGAAAACATAGAGTAGAATTTTTCCAACGCC-------AGTCGGAGGC----GGATCGAGTTCATCCGGATAAAATCCATTGG----------------AATGCCACTTAATCCGCGACCCACGACCAATGGCAACACACCCGAGGACTGGCAGGTGTTCGAG--------------------------GTCTTGTTCGGTGCTGAT-------CAGGACCCGAAAACGATTCCCGCACGGATGACCACAATGTCACCTTTGCCACAACCAGCCATTCCATTTTGCCAGGTGAGTAGTTTTTGTCGCTTAAC--------------------------TATTTTGCCAAAATCGTGCGCCAAATTGCCATAAAAGCGTG-TAGACATCATATCAAGATAGATTTATGTG
TTATTT-ATGCGCC-TGGCAACTGGTAGG----CGCATAGCCTTTCGAGCATTAGACTGTTGCCAGG---------------------CAAATAGAGAGAATAG--TAGAAATTCTACACGGTCGAAAAGCAGCTAGAAACTCGGGCGTCGTTTTGAACATAAAATATTTCTTTAGCTTTTTTTGTAGTCGTAATGCCGGCGAATCTGCGGCCCGACACGGATGGCAATACACCCGAGGATTGGCATGTCTTTGAGCTTCTTTGTGAAAAGTCATCGTCTGAGTCTGGCTCATTGCCAATGTCGCCACCAGCTCCAGCTCCAGCTCCAGCTC---CAACTCCATTGACAACCGTTGTACACTCCTGCGCTC----TGGTAAGTTGTGGCGATATCTTTGCCTGACTTTAATGTGACGCTATTTGGCCATGTTATTTGCCTAAAATCATGTGACAAATTGCCATTATTCCACGAAAAACATAACTGAGTAATAAAACCATCTG
>tos 18675559 18675633|20794 chr2L 18675530 18675895 scaffold_6 1877666 1878032 + 3137|29 112
ATGGCTCTTCTAGATTGTAAGCTTTTTGTTCTCTAGATTTATCTAATT-----TATTAAAGTGAAGA----GCTGAACTGACTA
--AGCTGCCATAGACC-TAAGTTTTTTCCTTTTTTTTTTACGTTAATTGTTGGCATTATGTTTAAAATATTTATTAATTAACTA
>msl-1 18679649 18681174|20796 chr2L 18679460 18679705 scaffold_6 1881340 1881613 + 985|225 285
TTGTAGAGCCCTAAACAAACTCACCTAC-TGTAAGAATAAATGTACTACATACA---ATGT
TCTTAAGAACCTAAATTAACTAGCCTAAGTAGACGCGTGACTATATAGCATATATCTATAT
>msl-1 18679649 18681174|20797 chr2L 18679864 18680347 scaffold_6 1881760 1882174 + -2728|0 496
TGTGTTGCAAAGAGTTACTCAGGTATATCTCTGATAATTTGTCTTTTTTTTTAGGATTTGATTGTGTAAAAATTGAGTGCGAGTGGTTGTCTGCTTCGAGTAATCAAATTATACATTGGATCTATTGTTT-----TATTTTATTAACTTCATTAAACTTGTT----TTATGTTGTATCGAACAAGAAAGGCCGTTAAGATGAAAACTAGATTTGAAGAATAAATATAAAACTGATTCCCGAACTGCACACCCGTTTGGCCTTATGGGCACCATGTATTTTTGGCTAAATATTGTTTCGTTTAACACTT-CTTCTGTTTGACTTTCTGTCGCAATGATATGGAGCCTGCCAACGTCCGGAGAAATCAAATCACCAGCTCGCTTTCGAGTGGCGTCTTATTTTTGTACATTTCGATAGGTGTAAAGTCGGTTACTTGTAATATAGCGTTAAGTAGGCACTGTACCCAAACGCATAGAGAT---AATTATAATGTAACAA
TTTGTTATAAAGATCC------GTGGTTCTTCGACAAATG--CAGGCTGGTTAGGGTGTGCGTGTGTGTGTGTGTAGTTTGAGAAATTCGTTACTC--AGGTATATATTTGTGTGTGAAGCTTGTAGTGTGTGTGTACTGGATAAATTTCATAGATTTTATTATGTGTGTGTTGT-TTGAACACAAATCGAAGTCT-GATCGTCATTTGACTGGGATAAAACATTT-------------GGTCTGCAT-----------TTTGTGAAAGCCATGGTTCTACGTATGCAAACAAATACATATTATACATATTTTTGTTTAATT----------ATAATTTGGAA-------------AAAAAAACAACAACAACAATACA----------GACTCTTGTTT-----CATTTTGAGAGAAGAGAACCCACAAAAACTTGATTTA--------CAAGCAATAAAATGAGAAAGAAAAAAACTCAAGTTAAAATGTCTCAA
>msl-1 18679649 18681174|20798 chr2L 18680381 18680691 scaffold_6 1882197 1882501 + 2394|0 342
AATGATTAGTTTTTAG-----TTAACGTCTTG--CAATTGAAAAGAGTTTCACCCTTGCTTGTTTCCAATGTACGTAAATTA--CTTAGTCCCACACAGCATGTA---ATTCAAACCAGTCGCTTAGTTAGATTGGTTAACTCATCTCAGCTTTATCACCTTTAAAATCGCCCGCACTAAAGTGATAAGAACACGAAAGATATTCACATAAGTTATATTGGGCATTTTTTTGGAGAAAAACAATGAAATTCGTAGACTTATATTTTTAAATATTTTTTTTCTTTAGCCCTTAT--------------------AACCATTTTTTTTGTCTTTGTTTATACTGT
AGTCGTTAGTTTCTAGAGACTTTAAAGTGTAGAACAAGCTCGGAACGTTCAGTCTGAGCTTGTTTCAAAGG-ACGTAAACAAAACTTATGTTAAATATTTATATATACAGTCAAAAAAACAAC--AACAACAACAAACAAAACATCTCAGCTTAATT-------------------CTGAATTGATAAGAGCAAAAAAAAACCGCAGAAAAGTTTGGTTTGGCTTT----------AACAAAATGAAAATTGTAGACTT------CAAAAGCTTTCTTTGCTGCAAATCCTATGTATATGATTTATTTAAGAAAACCATTTTTTTTTCTTCTATTTTTACTGT
>CG10383 18686831 18687045|20801 chr2L 18685417 18689506 scaffold_6 1886788 1890792 + 142655|1467 1682
-ATGGGCCAAGTCCCACTAA-ACACCAGTACCCTAATAGTATCCCGACTAGTCTTTAAAGACTTGTAAAGTATTTTCTACACGAACCCTCACCATCATGACCATTCATCTTTGTAAATACTCCAGCACTCCATATAGTTTTTTACACCCGAATCCTAACTTATTATTCTCGGTCTCCGACTAAAACGTTTGAATAAAGATACATGTGTAACACTAA
TGCCGAACAGCTTACACAAACACGCTTGTACCTTGATA-------------TAGCTATGCATCCAGCAGGCAATTT---------------------TAGTTTGTAGTTTTTGGAATTAAT--AGTATTTC--------TCTTAAGCGCGACT-----CGCACTGTTCGTGTTCAC-----AATATGTATACATATATATATATATATA-------
>CG10376 18696534 18697555|20808 chr2L 18694750 18696883 scaffold_6 1896135 1898291 + 46475|1883 2252
CAATAGTATATAGAAAAAGTGCACAATTACGCACATAAATATGTTTACATATATTTTAGATTAGCCAGCAAGCATATTTATACA--CATTGAAGTTGTTTTCGGCCGCTTAGTGCTTCCTGCTGTACGATAATAAGCCAAGCCATGTAGCCAGGTACACATATATCGTAGTTAAACGCGTATATATTTACA-----------CCCGTAACCGTATT-TAATGATCCCACACAGATTAAGTACCTTTTTATACAAATCCAACGAACCTTTCATGCATTTTATCGAACAACCCAGGACACATTTTTAACAACACACACGCAAATTGATAAAGA------TTTTTTATTGGAATAATAAAAGTAATTCACTGA
CAATTGTATTTTTAAGCAAAGAAAATATAGCTACAAACAAAT---CATGGATCTATAACCTTAGCTAAAAATCTACTCAATAAGATTATCAAATTTGTTCTTTATAGTTAATTGCCTTTTAT------ATAAAATGTTTGTCAAT-TGGGCATAGACAC-----CCATAGATATACCTAGGCATATTTACAAGGCGCATAAACACACAAACATATTGTTGAGATCCCACACAGATTAAGTACCTTTTTATACAAATC----------TTCAAGCATTTTAACGAATA--CCTTTTTAAATACAAAAAAAGAAAAATACAAATTGTTTACAAATATTTTTTTTTATTGGAATAAAGTAAATAA-------A
>CG10376 18696534 18697555|20809 chr2L 18697226 18697410 scaffold_6 1898654 1898845 + 1925|0 194
AGTCATATCAAATTTTACGTATTCGAAAGAGAAAAATGTGCCAAATATTTTTAAACAATTCAAGAACG---CAATATACACTTGATATTGGCATGCATATTGTGGGAATATAAGTAATATAATCCATTTTCTAAAAGATTATTGAA-------CGTACGCAATCGTTTAATGTGATACAACGAAAATAAGGTATT
AATTTTATGAAGTTTTGTAAATCCGAAAAAGAGACGCTTACTGATTTCTATAAAACAATTTTAATTTGTTTTAAAATATTTCTAGTTTTTGAA-AAGTTCTACATGAAAATAATTTCTGTAGCCCAATTTCAAGACGGCTTTTGAAAATTCTTTATACAAAAATGTTTAGAAAAATATAA--AAAACAATTTGTT
>CG10373 18700499 18700682|20812 chr2L 18700502 18703795 scaffold_2 1484266 1487573 + 112787|0 204
ACTGAC-----CAGTT---TGACACAGTTGGAATGATCGTTTTTATCGCTAGTTATCCTTGTCAATGTTGATCCTTGCAAAG---CAAATCCCGGTATTGTA---------ATCGATTTTGATTTTTACTTTTGTATTAAAC----TATGATTTTATGCAGCCATCATGTAACGCAAATATTACAAATGTCAATAAAGTTTTCCC
AAAGACAGCAGCAGCTACAAGTTGCAGCTGGA--GCTAATGCTGATTGTTGGCCATGTTGACGAACGTCTACCCTTTGATAGTTACGCATGCTGATGCTTTAAATCACTGTATCCATATGTATTGATTCTTTTTTATAAAATTATATATGATTTCTTATTATCAATGTATTTCTT-GCTACAATAAATGTCAATAAATTGTCCCC
>Faf 18702190 18702461|20812 chr2L 18700502 18703795 scaffold_2 1484266 1487573 + 112787|1756 2069
-CAAGCACCACCTACCAAATGAAAGC------------------ATCATCGTGTTACCAGC-AGCAACGCATTACC--AAAACTTGAACCAAGTTTTAAGTAGTCGTAGTC--AACGTCC-----AAGTCGGAGGATAAATAGAG----AAAC----------TATTCCTAATTTAATCATGAACATTAATATTAATAATTGTTTAACAATGTTTAGGTTGATTCTCTGATCTGCCCAACACCATCAACCAACCCGTTTCTCAAACATTCACACATCAGTAAAAATCGTTTCCAGAATAATTTCCGTGAACCAC
ACAAATAACAACAACAAAAAGCAAGCAAAAGAACGATAACTAAAATCATTGTGTTACCAGCTAAAAACGCATTACCAAAAAACTTGAACCAAGTTTGAAGTAGTCGTAGTCCTCACGTCCCAGAAAAATTGGGCGGGATATAGGAGGTTAAACACTTTACACATATTCCTAATTTAATCACGAATATAAAC----ATAATTGTTTAACAATGTTTATGTT-------------------CACCTTCGTCTAA-CGGTGCCCCGAACACCGATTCACCCCCAAAATTC-TTTTCGAAACAATTTC---------C
>CG10570 18805965 18806189|20942 chr2L 18805871 18807295 scaffold_6 2433325 2434765 - 17488|99 347
ATGCTTTAGTAGATCCCATT-----GAAATGTTCCTCTAGGAATGTGGTGATCCTTGAGAAACGGGGAAGC---TGGGGGCTGATAACGTTGTTATTTCTATTTGGTTCAGCAGG-GCCGCTTTAGGTTAGTTTTGTAAGCC--------ATTTTATAGACTTATTCATTGCTATGTGATAAAAGAAAAGAAATCATTAATCAATCAATTGGCTAAAAAATTAAATCAGAAGAAG-------ATGCGCC
TTCCC-------AACCTGTTTACGGGCAATGATCTTTTATT--TTTGGGGCTAGTTAATTGCCTGCAACGCGCATCGAGACTTAT----CTGTTATATCTG---GGCTCTATGGGTGTAATTGTAGCTTAG--TTGTAAGCCTGTTATTGATTACAAATATTAAATTATCTTGATAGAATCAAAAAACAAAAAAAAACAA--AAAAAATTTGCGCAAAA---CAATCAAACAAAGTCTTTTCAAGTCCC
>CG17597 18824935 18825001|20967 chr2L 18824842 18826526 scaffold_6 2470437 2472123 - 84168|93 165
GGGATGGGATCTTGATTTTGTAAATATTTTTATTAAACGGGAACTGCTTTATATAAAACTTAAAC------TG
ATAATTTG--TTTGATTTTGTAAATATATGT--------TGCATTGTATTTTATATTCTTTAAGCGCATTGTG
>CG33120 18837328 18837406|20976 chr2L 18837335 18839445 scaffold_30 1338643 1340761 - 86439|0 71
CTTCCTTTCCTCTCTTTTAAGACTGGAGGGCAATCTCTATATACATAATGTATGCGAAATAAAAACTATTTA
GACCCATCACTGTATACCAGATCCCATTAAAAGTGCATGTAAAAATAACGT-----TGATATAATCTATATA
>CG10602 18851053 18851181|20991 chr2L 18850229 18854422 scaffold_2 6403168 6407336 - 138898|987 1122
ATCTAAGCCTGTTGCATGCATTTCCGAAGCACTAGAAT--AATCTTG-TTGCATTATAATGATTTGATTGTCACATTTGAACACATTT----AAACAGAAGAGAAATAGATTTGATTTCTAAAAAGAACAAGTGAA
AG----------------------CACAGCATTGAAATTGAATTTTGATTGCATTTTGTGAAGTTTG-------GCTTGAAGTCGTTTTGGAAAAAAGACTAAAAATTAA----------ACAAAAAATCATCAGT
>mRpL13 18853952 18854002|20991 chr2L 18850229 18854422 scaffold_2 6403168 6407336 - 138898|4040 4090
TATGCTGATAGGAAATCATTGTAATTAAGATAAATACAAAATATGGAAAAA
G--GCAGGCCGCAGAC--TTACTGTTAAGCAAAATATAA------------
>tup 18855429 18856885|20994 chr2L 18855451 18856307 scaffold_2 6408414 6409220 - 24735|0 939
TTCTGTACATTTAATTTTATTCTGTTTGATTCGGTGCCAAAAAATAGTCTGTAGGCCGTTGGCATTTTGTGGATAATCTGGCTCTGGTTCGTTATGTAACATACACTTTTGTTGTTGAGTTCGAA-------------GAAAAAAAGATCATGAAAAAATTAATGTAAGCTAAACAAAAATGCTCACACACTTGAAAAGTTATTACAATAATTTCAGACACGAAAACAAAAATTATGATAACAAAAGGAAAACAGTTACTTCGCATCAAGTAGGGAATTTCATTAAACATA-AATTTGTAAATACCTTTTATATATTAATAATAAACAAATATATTTTCATTCAAAATGCAA-------------------AAGAACCGATCGAAAGAAAGCAT---------TCAAAAAC------------GAAAAGAGAATCTGA---------------CTCGTGTGTATTATATGG---TATTTGGGATGTCAAATCCGAGGCGTAGCTATAAACTATAAAGGCGCACTTGGCAAACTTGTAAATCGAATTAGCAACAACAAAAGCATCTACGTTAAGTTCA-TAAATTGTATGGCAAAAGAAACACAAAATTATTATAAATAAATAAATGCAGAAAAGCGGACGGGAATTTTATGTAAGCGAGAAACAAAAACTGTAACTAAATCTAGACTTATTTGTTAGTTTTTAAA---------CATTTCCGAAATGCATTAGAAGACGAGGGAGACAACAAATCCGGCAGCGGAAAGGCAGAAAGAAATGACGAAGTGTACCAAGGATGTTT-ATGAACTGTTTCGTAAAACAACTAATGTATTTTCAATAATATTTAACTAATATTAATAATAAACAGTGCATAAGTAATTTTAGTAACTATAGAAAATGTTTAAATGAAATTACAAACGAAAATAAAACCACAAAAA
TTCGGTACACAGAACT----------------GGAGACAGGCAGTTGTCAGTTTCAAGTT-TCATTTTGCCG-----TTTTCTTTGTTATGTAATATACCA---ATTTTTGTTGTTTTTTTCGAATTAAATTAATTACGCAAAAAACAAAAAAAAAAACAAAAAAAAAAAAAAACAAAAATGCTCACACACTTGAAAAGTTTTAACAATAATTTC--GCATTAAAATCAAG------------------------------CTCGTCAAGTAGGGAATTTCATTAAACACAGAAATTGTACATAATTTTTATATAT---ATACATACATATATATTTTCATTCAAAATGCAAGAAACAAAACAAAAGGGAGAAAAATTGAATCACAAAAATCATATGCGTACATAAAAAACCAAATGGAAAGGAAAACGAGAAATTGACTATAAAAAGAGAACCTCGTGTGTATTATATGGGTATATATAAACTGCAAAGT---AAACTAAACTATAA---ATAAAATCGCACTTGGCCAG-TTGTAAATCGAATTAACA-----AAAATCAGCTACGTTAAGTTCATTAAATTGTATTGAAAGAAGAA---AAAAT---------------------------------GGAAACGTATGTAAGTGAG-----AAAACTGTAACTAAATCTAGACTTATTTGTTAGTTTTTTAAATATATTTCCATTAACACAAAGAGTAAATAGAATAAAACGAAAGCAAA--------CTGTAAGGCAG----------CGAA-CGTACCAAGGATGTTTAATAAATTGTTTCGTGAAACAACTAATGTATTTTCAATAATATTTAAATAATATTAATTATAAACAGTGCATAAGTAATTTTAGTAACTATAGAAAATGTTTAAATGAAATTACAAACGAAAAT-AAATAACAAAAA
>tup 18855429 18856885|20995 chr2L 18856441 18857164 scaffold_2 6409347 6410106 - 22281|0 555
AC-AATCGAACCGAATCTAATC-CAGCTTCTTTTGTTGCTCCCAGAATCCAAGCTGGCGCTGACCCCGTCGTCCTCTTCCTCGGCCTCGGCGGGCACATCGATCTCCTCGCCGCCATCG---------GGCGTCGGAGCAGGGGGTGGCGGTG------------CCGTGGGCGGTGGTTCAGGTGT---CCTGGGCTTGGGCGT----GGTG-----------GCCAATCAGTCGGCCACCGAGCAGCTCATGCAAATGCTCCAGAAGGTAACGGGCTCGGCTTCCCCGGCCTCACATGCGGTTCTCTAAA---------AACAAAG---------------------------------GGCGCGCAGAGGGCGTGGCAGGAAGCTCGAACGTGAGG----------------AGCTGCAGTCGATCTTCATAAACTCGAAAAGTT----GTCTTGCAAAATATTGACACCCGTGCTGAAATTCTGGTG---TACAATTGAATACTTCTTTAAAT-----ACCCAAATCATTTGTACTTTATTCAATAATTTTA
ACAAAACGTACCGAATCTAATCTCAGCTTCTTTTGTTGCT-CCAGAATCCAAGCTGGCGCTGACGCCATCGTCCTCGTCATCGGCATCGGCGGCCACATCGATCTCATCGCCGCCGTCATCAACAGCTGCCGGCGGTGTGGTGGGTGGTGGTGTTGGTCTTGGTCTTGTGGGCGTAGGCGTGGGCGTGGGCGTTGGCTTAGGCGTTGGCGGTGGTTCCATTGCCGCCAATCAGTCGGCCACGGAGCAGCTGATGCAAATGCTACAAAAAGTTACCGGCTCG------CCGGCATCA------GTCCTCTGAGCGCAAGCCCAACTAAGTCTGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGCATCGTCGGCG-GCTGGGGGCGTGGCGGCAG---CGATGGCGAGGATGCGGATGCAAATGCAGCTGCAGCTGCTGTAAAACAGCGCAAACAGCTCGCGGGCTTGTGCAAT----------GTGTCGAAGCTCTTGCGCGATATATTCGTCTCGGTTTTTGATTCGGTGCCAAAAATAGTCTGTAGGCCATTGGCTGGCATTA
>CG18397 18912454 18912906|21075 chr2L 18912169 18913734 scaffold_2 6475004 6476598 - 17918|336 818
ATACAAGATACGCGCGAGGGCGGCAACTTAATATAT-----TCAATAAAGACATGTATCACATACAATGATCCTTCAACCTGAAGACCCAGCTTTCT------------------------AAGTGATATTATTTTCGAAGAAAATGAAAAATCTGAAGGACAAAACTACTTGAAACATTCGCAAGGAGATCAACAGCAGGATAACTGAACTTTGAATGCAGAAGCGGCACTCAAAACAAACACTTGTAATATTATCTTAAACTAGTTTACTAAACAATCACTTCATCTCACGCACTCTCACACATTCGCTAAACACATTCAGATTATTAGATTTTATATTAATATATACACCTAGGACATATACTTAT-TGTAACTTATGTTTAATGCAAAGTATTAACATTATTTAAGCGATCCTATCAAACTCCTACCCACAAGCACATAACAAATTCTCGAATACCATCAACAGCTTTCACCAATACAC
-----------GCCTGATTGTAGAGAGTCTATGTGTGTCTCTCTCTATCTCTATATATCCCTCTCACT-CTCACCCGCTCTAGCTATCTCGCTCTCTGCCAGTGCGCGTGTGTCTGCCGCAAAGTGATATTATTTTCAAAGAAAATCAAACA----AAAACGAAGAAAACTTCAAACATTCGCAAGT-GAAAAATGCTTTGATAAATGA-----GAAAGCATATG----------------AATTTGCAAT-TATTTTTACAATAATTT-----ATAATCAATT------------------------GATATATATATATATATATATATA---TATATTTATATATATATAT-GTATATATGTGTGTGTGTATTGTATGCTAGTTATAACACACATATATTACTTAAT-----------AACTCATAAC----------TTACACATTCACAATCAACACAAACAAC---------CACAA
>CG10621 18948135 18948267|21128 chr2L 18948103 18949044 scaffold_6 4137522 4138503 - 35071|37 180
GG--ATGAACTTCTAAGCTGGGGATCTCAGTACCTTCGAAAAGAACAAAGTAGTTATCCATTTAGTACT-GTAAATAAATGTATTTAGTTATTAAG--------GCATACAACTTATTTTAATAAAACAGAAAAGACAAAAGAC
GATCCCGGAAAACGGATCGGTGGATCTCGCTGTTT------AGAACAAAATGCATTTGATTTAGGTATTCATGAATATAGGTATTTAGATTGTAAGTAAAAAGTGTAGAAAAACTTTTGTACAAAATGTCACACAACAATAAAT
>Nak 18953848 18954228|21133 chr2L 18953673 18954104 scaffold_6 4142532 4143026 - 8218|186 538
GTATTTTTTGAATATAGTATTTATTCGCGTGTAGCAATGTT---------------------------AAAAAGTGGCTAGTACC--------CATACATATTATACACACAACAAGAACAATACCTATAACTGTTATTTAGTGCAAAAAT-----TTAAACTAGTTTTAG--------------------AAGCGAAACATGTTTTAGAATTTATAC-AGTGCGTAAGTTTACCAAAGTTACATTTATT--TTTGTGGCATTTTTCAGCTTGAAGTATTTCATGAATT------------------------------ATATATTTATACAAAACT---ATGTGATTATACA
GTATTTTTTGAGCAAAGTATTTCTCTG------GCAATTTTTAAAACCAGAGCTCAAAACTCCGATAAAAAAAAAAGCAAATAAAGCAGCTAACCTAAAAATTGCAAAAAATATATAACTAATAT-TATAGCTGTTATTTAGTGCAAAAATAAACTGTAAATTAGTTGTAGCGCATTTGATCAGATGTTGCAAATGAATTATAT---AGAATTTATACGATTGCGTAAGTTTACCAAAGTTACATTTATTTGTTTATTGCATTTTCCAA-TTGATTTGCTTTATCAAATGCACACTATTATTTATTTATACTTGTATGCATACATATATACAAAACTTCAATGTGATTATA--
>Nak 18953848 18954228|21134 chr2L 18954105 18956825 scaffold_6 4143255 4146052 - 81014|0 177
TGTGGACAGTGGGGCGAGACCATCAAGGAGACCTG---AGACTGAGTGTTTCAAATTAT-----GTTGACATTT-CGTTTAAGCTTTTCTCCGTTCCGTTTTTAATGTGGG---------------------------------------------GTTCCAAAAATAACCAATATCT
---GTGAAAGCGAGCTAGAGTGACAGAGAGAGAGGGAGAGAGCGGGCGGGCCCACCCGCCACCCGCTTACAGTCGTGGCTGTGCTTATCGGCACGCTGTTATCAGTGCGCGTGGAAAATTCCTATAAAAATATAACAGAGTGTAGACTGAGATAATGTTTTAAAAATTGGCATTGGCT
>Nak 18957040 18958802|21135 chr2L 18957242 18957901 scaffold_6 4147436 4148082 - 8477|0 729
TCTGTGTGTAATTGTAAATTAAGCTA--TCTAAGAGAAGAACTAGAACTATTTATTCATGTTGTTGGCGTAGAGTGTGAAGCAATTTAATTCTTTGGCAATAATTT---GCATATCAGAGTTATTACATACTA-----TACATACATGTGTTAAACGTGCAATTCTAAAAATTA-ATGCTAAA------AAGATTATTATTATTATGGATCTGTAGATCTGATTAAAGCTAAACACGACAGCAAACTATTAAAATTTTGTACCCTCTGATCGTTTTTCAATTCTGCTTTCGAT--GAAGTTCGCATAAAACTCCAATCTCTTCGGATTTGGCAGCAGACAAACAAACAAAAGT-AATCCA-AACAATTGTTAATTATCACTACGAGAGAGTCCAATCAACGCAAGACAATATACATATGTACGATCAAGCTCGAGATAGTCCAATAATGTTTTCCGAATTGTCCAAATTGATCACTTTTGTTCTCTACACACAGAC----ACACCAATTGA----AATGTTCAATTAGCTTTAATTACTACTCTTGTTAATAC-TGTAAATAATTAAGCCAATGGGAGAAAACCCCTTT----------AAGCGTTAAACCAAAGAGCTAACACTTAG-----------------------------TAACTAGATTTACTCAAAATGAGCAACCGATAAGCGCAATGAAAGCAACAAAAGTCAGGTAACCA-AGACACA
TCTGTGTGTT-TTGTAAATTAAATTAAGGCTAA-AGAAAATCTTAAAATATC---------------------ATCAAAAATCAAATGTTTTTTAAGAAATAATTTCTAGCATATCAAATTCATAAATTAATTGAACTTATTTAAATACTCAAGTCGTGCAATTCTAAAGATTTTAAGCTAAATTACTAAAGATTATTAATAATTAGGGCCTGC--------TCAAAATTCGACATGATTTTAATTTAATAAATTTCTTTAAC-------------TCATTTCTAATGCTTATCCGAAGTTCGCGTAAAGCTGCGTTCGCTGCGGATGTGGCAGAAGTTAAACAAATGAAATTGAATGCAGAACTATTGTTA---ATCAATTAATCAATGTCCAATCAATGCTAGACAATACATA--------------------AAAGTCCA----------------TAGGCAATGCGAGAGTTTTCGTTCCTTAAAAGGCGACCACAGCAACAATTAAAACGAATGTTCAATTAGCTATTTAAAGAAACCCTGTTAATACTTGTACATATACTTACAAAAAAAAAAAGATCAATTTAATCAATTTGAAGTATTATTCCAAAGAGCAAAATTTTAGTTTTAAAATCAAGGAAATATACATATATATATATATGTATATTTAGAAGAAAACAAAATGAAGCGCAATGAAAGCAACAAAAGTCAGGTTACGATAGACACA
>Nak 18957040 18958802|21136 chr2L 18957924 18958411 scaffold_6 4148451 4148889 - 1246|0 518
ATATCTCGACGAACCTTCTTATCTTTTGTCATATGAGTTTATTCGGTGATTAATATGTTTTCTTCAAAGTGAGCTGTA---------AATCCTTAAACCTATTTGGTGAAAAATACCACCAATCTTATGTTTTCCAAAAATTATACCCCCATAAAATTATATTTCGTCATGAAAAGTTTTATTTTTTTTTGGTA---AATATTCAAATTCCGTTATTAACTTTTGTTTATTTCGAAAA---------GAAATAACTTTTTTCCCGTCCCTCCATTTCCGTAAC--CATCATCAATCTGCGCGCTTCTAAAAAAGTAATACTTGGTGCTGGTACTGTGCTTGATACAAATTATCAGAAAACCAACCCAAAACTAATAAATCATATATTTGAATATATTA--TATCTAGGTATTAAGTTAATTTAGTTC---TTAATGGTAATAAATTAGCGGTTGTGGTTCAA--AAACTAACCAATCAAAAGAACAAATTTCAAT-TATTTGTATTGTACAATTCATTG
ATGTTGCGACAAACCTCC--------TGTCA-----------------------AAGCTTACTTAAAAGTGTTCTATATATATAATTTATCCATATATTTTTTTTGTAAATATTCAATTGCACTTAATACTAACTAACAAATGTTC-----TGGATCTACATTT-GTTGTATACATATATACATATTTCTAGTGTGTAACATCAATATTTGACAAACAAC--------AGACAAAAAAGGGTTGACCGAACTAATTTGTCTTACACTTTACTTTAACCTAAACTTCAACTCCAATCTAAGCGCTTCTAACAAACAAAT-TTTGGTGCTGGTTCTATGCTAG-------------------------AGAAACAATTAGTAATATATATATATATATTAACAGTAAAAGTAATTAGTGGTTGTGGTTTAAATTAACCAAAACAAATTAAACATCAT--TTCAATTAAATTAAACTGT-------ACAATTTGCAATATATATGTAGTATATGTCTAATGG
>Nak 18957040 18958802|21137 chr2L 18958510 18959092 scaffold_6 4148996 4149625 - 15496|0 315
AATTCT----ACCTTAACTGTTTGCAATGCCAG-AATACGTTTAGTTTTCCGATTGTCGCTTTTGTTCGCTCTCAA----TCTCAATCCAGAAAGTGAAAGTGATTTGAACGTAGACGTAGACGTAGTCTAAAAACTTCCT---------AGTAACGCTATGCTCAACTCAGCAAAGTGCCGCCAAGGCGATCTCCTCGATATCCTCCATCCAAGGAGCCGCTTCCAGACC-ACATCGGCAGCCGCCGTAA----GATTCGATCAGCTCCAGCAATAAATTAACCGTATACTAGCCGATCGCTGCTCGATCGAAAA
AATTTGTAAAATTCTTAATG-TTGCAAAGCCAGAAATACGTTTAGTTTCTCGATTGTTGCTTTTGTT-GCTCTCAATCTCTCTCGATCTAGAAAGTGAAAGTGAATTGA------ACGTAGACGTAGTCTAAAATACCCATCCACAGTAGAGTAACAGCAACAGCAACAACAACAACAACAGCAACAACATCAGCAGCAACAACACCAACAAGAACAACAGCAACAACATCGACAACAACAGCAGCAACAACATCGACTACAACAGCAACAGGGAGAGAATTTCCTCTTACTAGACAAACTGAAAGCGAGAGAAAA
>CG10639 18967920 18968088|21143 chr2L 18964796 18973046 scaffold_6 4155764 4164052 - 190309|3234 3430
TGCCTCTATCCCAAATAATGTAACCAAAGTCCAAAACTAAGTCCTATTTTCTGTTCTGCCTTTATGTCAGTAATGTCTGTACTGAT--TCGCCACTATCGCA------TTTCTTTTC-----------------GAAACTGTAATATTGATCTATTGTGTATAAAACAAAA---TTAAAACTTGTGTAGGTTTCTAA
----------CCAAATAGTAGTTGCCAGATCCCAAGCGAAATCCGTTCTTTTGTTGTGCATTTCTTTTATTCTTTTAAGCATAAATCGTTTCCACTTTTCGATAAAGTTTCCTTTTCTCCCTTCACTCGCAGGAAAATCCGTGAAGCTCATC------------AGCAAGAGTTCTTATACATATATGGGTATCTTA
>CG10641 18973677 18974283|21144 chr2L 18973450 18974761 scaffold_6 4165200 4166412 - 29684|235 935
AGGACTTAGGTTCGCCCT-----------------------------------------TAGTCTAGCGAGTAATTATC-TGGCGTAGGTTAATCGAATG-----TGGAACTAATCCCGGGAGAAGAGGATACGCTTCGTACAAGCATTTTTCAAGCATCACATACTCTAATTATATTCATACTTATCGCCCCATACATATAAAAACTCGATTTGCTGGCAAAAACATCTTGGGAATTGAATGTTATCTTTGACTAATGTTTGTTTTGGATCTTTGAAGTACCCATCACAACTTATCAAGTAACAAAATATAACGTTCAATTTCTAATATATATTTTTTTAAAACCAACCAAACTGAGCCACTCTAGCCAGGGACATATGCATACATACGTACATTAATAACGATCATACCAAAAGCGTATTTATAGTTAACCTTTAGTTAAGTTTAAAATGTTTTAGATTAAGAACTACTTTATTG-TTTGGTGTTGCGCAAAATTTCATTGTTGAATTACGTTTATCCTTGAGGGTTCTCCAAAATGTATGCTTTTTACTTTATGATTTTGTACTTTTAGTGCCATTTTTATGTTCTTCGTTTTAGTTTTGTTAAAAATAAAATTGATAGTTATAT------TAAGCAAATAAACTTGTGAA----------------------------------------ATTCAAC
AG--CCAAATATCGGGCTATATATATATATATATATAAACAAGATATTTTCATAATTTGTAGTCTAGCGCGTAATCCTTGTGGCGTAGGTTAAACAAATGCAACATAGCACACATTTAGGGGCAAA---------TGCGGAGCAGGACTTT---GATATCACAT--------------------------CACATACACAGCATAAC---------------------------AATTCA--TTCAACTATAACTAA---TTATATAACATATATAACATAC--------------------ATAATACATAACATACA----TAAATACATTTAGTTATTGAGCATACCAAAAGCATAAATTTTAGT----------TGCCTATTTAAGT------------------CAAGAATCAAATATATATATATTTTCTATTTAGTTTTAAGGCTTTTCCGTTTTCCAATTTCTTTTTTGTTTTAATATTCCGCGAGTTTTGTTGATTTTTTAATATTTGTCTT----------------TATTTGC-TTTTATTTTTGAATTGTG-----TTAGTGCCATTTT-------TTTTTTTAAATTTCAATTAAATTTAAATCACATGTTTTATGTTGCATAAGTTAAAAAATTTGTTAAAAACTAAAAAAAAAAAAACAGATATTCTATTTTACTTTACACTCAA-
>CG10650 18989541 18989714|21161 chr2L 18989520 18990024 scaffold_6 4183600 4184131 - 2281|26 215
TCCAACCACCTCCACGTAGTTGGATGATCCAATCAAATTACCGGGTGCCTGGGTCTATGAGTAATG--------TTAACTATTACAAAGCAACAGACAAAAAGACATA-ACCTAATTATAGGAGCTGAAGCATTT----TAAGAACACTTCCATAATCCCAAATAAATCATTTTA---ATAAAACAATTA
AAAAAAAA----AAAAAAGAAAAAAAATTAAAGAAAACAATATCATAACTAATTCTACGTACACCAAAAGCTATCTAACTATGACAAACAAATAAAAAAAATTATATATACATA--TATATATACATAAGCACATGTAATCAGTACACGGCCAGTTTT----GTGAGTCATTTTAGTTATTAATTATAGA
>RpL30 19004200 19004303|21179 chr2L 19003970 19004236 scaffold_35 1008132 1008404 - 274|246 291
AAAAACACTATTGTTTTGGTA-AATTCAGTGAAAGC--------AA
AAGAGCGCTATACATTTGGAACAGCCTGGTCAAAGCCAGGCATAAA
>RpL30 19004200 19004303|21180 chr2L 19004237 19005193 scaffold_48 226491 227588 - 30245|0 73
ACATTTATTTTTAATCGAACAAGACGACACAATAAAG-------TTTTGTATGAGCAGAGATAAAGTTTAAAAT
TTTTTTAAATGTTATCTTAAAAAAAAAC-CATTGAAATGGTACTTTTCGTACATTCGAAGGTTTTCTTTGGTCC
>hk 19026767 19026931|21205 chr2L 19026618 19026865 scaffold_2 1994352 1994601 - 1479|171 269
AATACAAGTATTTATTGGACCTCCGCAAGGATCTATATCGTATTTATAGTACATACCTTAATAAAATTGCTAAAATGATTCAATAGAATTACCAAAAAC
AATGCAAGGATATTTTGA---CCCGCGCAGATCTATAGAAAGGCT---TCACACAATCTATGAAAGAAACTGAACTAGGCTTACAGTTT-------ACC
>CG31800 19029586 19029667|21206 chr2L 19026932 19030510 scaffold_2 1994980 1998559 - 124655|2821 2902
CAGAATATATTAAAAATTATTTTTATTAACATGAGGTTGTACCCAAACTTCGATGTTACTGATATTAAAATTATAAAAGCTC
AGCAATA--------ATAAATTTCAATGACAGATGCTTATCATCACAC----ATGTCAATAGTA------------------
>CG15173 19039464 19039548|21211 chr2L 19039452 19048162 scaffold_2 4855529 4864275 + 202047|12 98
GGATTCTTTTTACAGTGTAAT--TTTGACTATTTATAAAAATTTCATTTCGAAGTGAAGCACAAATTTGGAAGGCTTAAAAAATCTT
AATTTTATTTTGTATCATTACAGCTTGACTTTTTGAAAAAG--------------AAAACAAATGTTATGCATGAT--ATAGACGCT
>l(2)37Bb 19045772 19045817|21211 chr2L 19039452 19048162 scaffold_2 4855529 4864275 + 202047|6830 6889
AA-TTGTTGATGGTG----CATTAAAACT---------AAATGCAACAATTTAATTAATG
AATTTATTACTTCTGAAACCAATGAAATTTTCGCTACAAAAAAAAAAAAGCCAAC--GCA
>CG10702 19061201 19061230|21219 chr2L 19059302 19063634 scaffold_7 2167681 2172052 - 121537|1983 2015
ACGATA---ATATACATTTGTATGTGAAAACTT
ACTATATATGTATTTAATTATAAATGCCAACTT
>Lim3 19075163 19076129|21236 chr2L 19075170 19075665 scaffold_7 3013837 3014412 + 14842|0 598
GCTTGAAGATACACCTGACACGGCTTGAATGTTACTAGGCGTTATGATTATCTGTTTCGAACGATTACTTC-----GCTCTATCATTTAGATTCGTAGCCCTGATATTTTAT-----TGTAAATATTGTATATTTGTGTATAGTGAATGGAAACTAA-----AACTGAATTTTAAATT-AATTAAGTCTGTATAGCGTCAAACAAA--TGCGGGGCATGGC------GAGCACAACATTGGTTAGGCCCTGCCCAGAAAAACCAAAACCAACAAAAACATCAACAAGTTATTTATTGCTTTATATAGGAATACAAGAAAATTGCATAGGAGAAATATCAATTACGAAAACGTGATGTCGT----------ATTTATATCTAACG---------AATAAAAGAATTACAAAAACCAAAAATATTTCAA-CCAAATAGAAA-TGTCAGTAAAA------------AAAAACAGCAACTACGTAAATGATA----------------------------------------------AAACGAATGCGATGAAATAAATTACTATTTGACACATAAGAATAAAAGACAACAAAAATTGTTAA
GCTTTAAAACAAAC------TGGCTTAAATAATA--ATGTTTAATGATTTTTCACTACGATTTATCACTTCCTAAACCACATTTGTTTGTACTTTTAACTTTGATATTTTAGTATAATGTAAATATTGTATATTTGTGTATAGTAAAAAAAAAAAAAGAAAGAACTACATTTTAAATTAAATTAAGTCTGTATAGGAACATAAAAACGTGCGGGGGGGGGCAGGACAGAGCACAACATTTATTA-----TGCCGAAAAAGTCC----CTCCCCCCTTCCCAAAGAAGTTATTTATTGCTTTATATAGGAATACATG--AATTGCATAGGAGAAATATCAATTACGAAAAAGTGATGTCGTATATACATACATATATATCTAAAGTAATACCAAAAAAAAAAAAAGAAAAGAAAAATAAAGATTTCAAGCAAAATAGAAATTTTCAGCAAAATGCAAACTACGTAAAAACAAAAAAAAAACAAATGATAACGAATTTTTAAATTTATTGTGTATTACAATAAGTTTAATTAATTCAAATAAATGCGATACAATTAATTACTATTTGACATGTAAGAATAAAAGAT----ACAATTGTTAA
>Lim3 19075163 19076129|21237 chr2L 19075713 19075785 scaffold_7 3014469 3014554 + 204|0 85
CATATTGTTTATGCCCTA-AGCCTTCTTAA---------TTTTTGGGAAGCCTACACCGAAAACAAAAATCCA---AAACACAATT
TATTTGGTTTATACTCGATAGAATGATTAAAATACGAGTTACTTGACATGTACATAACGAGTACACACATACATACACACACAAGC
>Lim3 19075163 19076129|21238 chr2L 19075887 19076722 scaffold_7 3014637 3015512 + 35826|0 243
TACTCGAATCTGCTCTTGCGCTACTTTGAGATGCAGTCGCGCAGTCTGCTGCTGGCCGCTGCCCAGCAGCAGCAGCAGCATCAGCCACATTCGTCGCAGCTATAGCAGCGGCATCACACTGAACGCTCGCAACCGCAGCAGCAGCAGCAACAGAAACAGAAAAAGCAGCAGAAACAGAAAAG-GCAACAGCAACAACATTAGAGGCAGCAACATGTGACTTGGCGAGCTGCAACATCGACTTCA
TACTCAAAAATACTTTTGCGTTATTTTGAGATGCAGTCGCGCAATTTGCTGCTCGCAGCTGCCCAACAGCAACAGAAGCAGCGACAGCACT---------------AGCGACGCCATTTTGAAAGCTTTCGAGCGTCTTAACAGC----GCTGAGCCAGCGAACT-------AACAGAAAAGCTTAACAGTTA-----------ACAGCGCCGT-TGCCGTCGCGAGAGCTTTCGTCGACTGCA
>Ddc 19112409 19112709|21278 chr2L 19110625 19112513 scaffold_7 3051025 3052943 + 59301|1867 1976
ATCATTGTATCATTGATGTTGTT----CATGATTTTTATTGTTAACGTTATGCGCCTAATTAAAACAAATGTATTCTGCTTAA-AAATACAAACGAATTGTAACTATAAA
ATCAAAAAATCGTTATTGTTGTTTTTACATGCTACTCGTATTTAATA-AATGTGCTTAATTAA---------TTACTATTTAACCAATAC-----TTTTGTAACTATGAA
>Ddc 19112409 19112709|21279 chr2L 19112554 19114233 scaffold_7 3052979 3054650 + 82163|0 160
AGTGGTTGTGCAGGTCTGTTCCGTGTTTAGTATATAAATTAATATAGTAAACTTA---AATTGGACCAGTATGATATATAATGCATTGTGACTTGGAACCCGGAACAGACCATACACTTTCCACTTGCGACATGTTTAGGGAATTTA--CATCGCAACAAA
TGTGGTGCATCAGA--AGTGACATGTTTAGGGAAT--CTTAGCATTGAATACTCACCTCCTTCTCCCAGTTCCAATCATAAAG--------------ACCCGTACTCG---------TTTACACTTTCGATCAGTTATCTTAATATATGCAATGGACCAAA
>l(2)37Cc 19117969 19118347|21283 chr2L 19117918 19118768 scaffold_7 3059434 3060235 + 31381|56 439
CTGGGTGCATCTAGTTCCGTTAAGTTGTAACTACCTATAGCATTTACTAAGTACTTTTCGATTTTGTTTCTGCTGAAATATGCACTACTCTAAAGCGTTCGCGCCCGACTGACTGGAGAATACTAAGCGAAACAACCAAAATTTGTCTCATGTAATCGGTTTTTCCATTATCTTCCCGATCGGGTTCGAAATCCGGTCGCAGTGTGCGCTCCGAATGCGGCTCAACTTTTGTTGTTTCCGTTTGAGTCGTTCGTGTGCGCGTCCTGCTGAATTGGTCCTTAAGATCGGCACCGGGCTTAAAACAACTCCAGTAATTGAAAGAAACA-----CAGACCGTAAGAAAATTTCATTATGTGAACAAACAATAAATGATAATCCCTAC
C---ACGTGCCTAG-TCGAATAAGTTGTAACTACCTGTAGCATTTATTAAGTAC-TTTCGATTTTGTTTCTAAACCAAGCTGTGCACCTTGTAACGGGTCGCCTTCTGCAGACTTCTGCTTAAT--------TGTCCAACATTTTTATCACTT--------------------------TTGGGTTTAATATT--------GTGCGCGCGCTG---GTTGTTCAAC-TTTATTGTTGCCAAATG-GACTCCATTGCGCGCAT----CTGAGATAATCGCTGAAATT---------TTTAACTCAGACGGAAGAGCGTAAAGTTACATGTTGCAGGACTCTATAAAATTT-GTTACGTGAACAAAAGAATCAATACAATAAATAC
>CG10689 19119920 19119979|21284 chr2L 19119007 19124935 scaffold_7 3060236 3066196 + 270954|964 1023
TTTTGAGGGGGTTTTTAGTTTTCAATTAATAATAAACTTTTATTGTAAATTTCACCATTT
AT----GTTTATTTTAACATTTCAAACACAATT--GTTTTAATTGCAAGTGTTAATATTT
>Aats-asn 19125793 19125971|21285 chr2L 19125971 19127762 scaffold_7 3068070 3069903 + 101827|0 0
G
G
>gammaTub37C 19179886 19179971|21345 chr2L 19179902 19182590 scaffold_7 3113893 3116465 + 104828|0 69
TCGATAATTATTTATAATTCAACCGTCAATACTTTTTATTTTTTTTATCAACAATAATATATGTATTTAA
CTCATAATTCTCTGAAGTCTAGCTAATTAGAC--------TGTGTTATCCTGAACCAAATATAAATTAAA
>dnt 19334605 19335093|21488 chr2L 19332768 19336891 scaffold_7 3260180 3264375 + 102615|2060 2701
GACA----AAGGTCATCAATG-----TCATCCGCATGGGAATCGGCTCTTTTGAAGAGT-TAAGGAGT---TTAGGCTTAGTTGAAT-------------AAAGTCCTCTAGCT-----TACTC-CACTTTGTTATGACAAGAT--------------------------TTGCCAAATCGAATGTTTAGCCCTTCCT--------TGGTCCAGCATCTGTACATATAGTTTACACATTC-----AGCTCTTTAAGTAACTATCTTTAAGCTTACTCTACGATAAACTCAACTCTTACCACTT------AGATGAAATACATAGTTCAGCTTGCACAGTTCTCCTTGTAA--TCCATCA--------------------ACACTAGCTAAAACAAA------------------GGCCGAAATCAAATATAGTGATATTTA----------TAAATAGAGATAGCGATGTCTATAAG---------------------ATTACACATACATATTTAT---GATGCAT-ATAATACATGTTGT-ATGTTTAGCATTTTTGACAATTTACCGTTTATACGAGAGATCAAACATGATATACAAATATATACACACATATATACACTCATATATATGCCAAAACAA
GAAAGCTCATGGTGTCCACTGGCAGCTTATCGTTATGGGCGC--GCACTTGTAAAGGGCGTGGCTAGTCCATTAAACCCATCTGCATCCGCAACGCAGCAACGGTCCTCGAATTCCTCATACTCTTACTATAGTTAGCCGAAGTCCCATTAGTCTATGTACGTTGTTTTATTGCCAAATCTTATGTTTAGAGTCTCATTTAGCAGCTGGGCGCCTGGTTGTATATATAGTATATATAGTAGCCCGAGATATGTTATAAGTTCTCGTTTAGATCAA-CAACGATAGACTCGAATACACACATATTCAGAGATATGCGACTTATAG---AGATTACGCAGGCTTTTCTGCAATCTCCAGCATTTAAATATAATTGAATAACAAATTAATTAAGATAAATTTAGCGAAAGAACCTTGAACCGAAATCAAATATAGTGATATTTATCTCTACAATTATGTAGATA-AGTAAGTTTTAAAAGTATACAAATATGAAAATGATAATAATACACACATATTTATAGAAATGCACAATAAAATCTATAATAATATGGAGATTTTTTGAAATTTTAACA-TTATACGAAAGTCAAAAGAATATATATAAATAAAAAGAT---------------------TAACACGGTAA
>CG15825 19379143 19379538|21524 chr2L 19379534 19381823 scaffold_7 3298046 3300158 + 35577|0 4
AGCGT
GATGT
>CG17549 19382979 19383098|21526 chr2L 19382608 19384229 scaffold_7 3302928 3304293 + 33332|383 509
AAAGATCG-GCGGAGACCCTCCACTGGTGGCTAGGCTAACATTTACTCCGGTCTGACAAAGCAAACCGCTTCCATTGAATATGTATAAAATATAAAAATA---ATAT---ACGTGTATTTTATTGTC
AGATGCCTCGCTCAGCTCAAATTTTGGTGTTTAGCATATTGTAAAC------CTTGCGAAATTAACGATTCTCTATTTATATGTTTCAAACACAAATATATACATATTTCATATATATTTTAATCCC
>CG17544 19386295 19386597|21528 chr2L 19385838 19386455 scaffold_7 3306294 3307036 + 1135|575 756
ATCCCAGTGAAAGGTTTTTTTTAATCATGTA-----CCAACTATAACACA---CATTCGAGT-ACTTTAAGATGAAAT-------CTGTTACTAGATTACGATTAAACGAGTTGATATGAAAGTATATATGTATATATAAGCGAGTTAAAT-----AAATATTGAATCATTTTGCGTTACAA
ATTCCATAGAGCGTCTTTTTCCAGTTTCATAAAAGGCGAAGTATTCCACATCCCATCCTAATTATTTTGACAGTGAATACCCCTGCTTTCACTATCAAACTGTTAAATGGTGTGCCTAGCAATATTTTGTCAGCTTAACTACAATTGAAATCTAGAATGTTTTAGAATGTTTTGTTTAATAA
>CG17544 19386295 19386597|21529 chr2L 19386468 19387163 scaffold_7 3307330 3308019 + 27243|0 138
GGAGGATTACCACCGAGGATTAGAACCTAGTTACCAAGTGCCTGACTTCGATACTGAAGCGTTCGCTTGGCGCGTAGAAAACCAAGTTAA-----ATTGGAATTGGTGTTGCCTCTCGATA----ATCAGGTATAATGG
AGCAG-----CAGC-AGGACGACAAC-------GCAAGTGCCTGG----GCAGGTCGAACGGTCGATCG----GTCGATCACCCAATTCATCCTTATCGTAATTATTGTTATATGATCATATCGCATCAGGTATTACGG
>Pax 19396704 19397034|21535 chr2L 19396747 19398087 scaffold_7 3315491 3316627 + 24577|0 294
AGATATTCGCAGCTG----CCAAACTCTAGTTATGCATATAATACTGTTTTTTATACGATTTACGACCCAATCCCACACGCACCAGCCCCACTCAACCACCCCCCCCCCCCACACACCTGTACACCTACTTACCGTG---CATCTGTGCTTTGTATAACCGAGTCAATTTAGTAATTTAATTAACGCCATCCGAGCAGGATACGATAATAGAATGCGATCGTAATCAATTAGCAGACACTAATCCTAATCAATAATGTTGGTCACTTTGATATTGCTACTCGTTCGACATGAAAA
AGCCAGTGCCAACTGGGCCCCAAACTATAGTTACG-ATTTAATACTG-TTTTTGTACGATTTACGATTTATGTCTTC-------------------------------------------TACCAATACTTACAATACTTCATCTGCGCTTTCTATAACCGAGTCAAATTAGTAATATAATTAACACAGAC---ACACGATTTGATCAGA----------GTAATCAATTAGACGACACTAATACCCAGCCAACATAATGGTAAA-ATGATATTTCTGCTCTTTTGAAAATAAAA
>CG10237 19431773 19432074|21579 chr2L 19431558 19433076 scaffold_7 3346680 3348086 + 43741|231 566
TCTGTGG---CCACCGGCCTG-------GTGCTGCTCGTGATAATCAACTCCACTCGTTTCCACACGTCTTCACATTAAGCCCACGTGGAGCGTTATA---GTTAAGCACTCGATCTACCATACGCTTGTCCTGTTAGT-------GAGTAGCGCCTAG-AGTTTGCCTTAGTCTTAACCAGGATCGGAGTGTCGATCGCAGCCAGAAG-AAGTGTTATACCTAC------ATGCATATTAT---TTTAATCCGGGGTAAGCGTATTTATATCATTTTACTATTGTAC---ATTAAACCAATTGTTAAAATATAAACATACTTTGTAAACAAACAC
TGAGTGGGACCCAGCGACCCGGCAATATGTACAGCAAGTGATA------TTCCCTCGTATACCCGAAACT---CAATTAGTTTGCATTAAGCATAATATCTGTTATACGCTTGTCCAGCCA-ACGCTTGCGATAGTAGTTTCGTAGTGCTAGAGCCAAGAAGTTTGCCTTAGTCTTAAGC--GATC---GTTTCGATCAAATCTGGCAGTAAGTGTTATGCTAACAGAATAATCCACTTTATATATTTAAATGGGGGTAAGCGTAGTTATAGTCTGTTATTACGTTACACTATTACTTACATTGTTAAAATACATATATA-----TATATAAATAC
>Hs2st 19438759 19439232|21585 chr2L 19438230 19440874 scaffold_7 3352852 3355704 + 58692|594 1197
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TCGTATTGGAAATTCAAGGGTTACAAGGGCAAACACAAAACCCGATATGGTAGATTAAAG----CTCAAGGGTAGCCTTTAATATATCAGGTTATACATTTTTTATTTTATTTTATGTTTTTTTTTTGTTTTTTTCAATATTGTATATAGTTTATCTAGCTCTGATATGTACTTAAAATCAAGCAAACA--ACTCGTGAAAGACACTAAAGACTTTAGCATTGAATATCATTGACATATTAGTGATTTTTCGTAAGTAACGCTTATTTAGTTAGTTTAAGTCATGATATT----AACACTTAAAACCGCTTTCTTAGAGTTATGTAAGCAATATTTAGTAACAATTGTAACGACTATTCAAAGCACAACGTATTTACATATGCGTCTAGTTAATTATACTCTGTATAAGTATTGACAATACCA------GAAATTATGAATTCTTAAGCGATACGAAATATGTGCTGGCTCTGCGCATACAATTACCAACTAGTTTAGATACTTAGAATTTATATATAATGTTTAAGTGTAATTACATTATTGG--ACTCTCAAATGTATATCAGCTTTTAGCACTTGTAGCAGACGCAGACAAACTCATCAAG
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TCACTTTTGCCGAATGGCTAATAC----ATTAAA
TCTTTTTTCTCCATTGATAAACATTGTGATTATA
>Top2 19443291 19443666|21587 chr2L 19443321 19446263 scaffold_7 603953 607011 + 112014|0 492
GGAACACA------------------TTTCCA---------------------------------CACAGGATATTGATAGAA-------------------GATGGACTCTTAGAATCAGCATTATCCGCA---TCGAGAATCTCG-------------AGGAGGCACTTTTTTTTGCGGACTTGCTCGCCACG--------ATCGTTCGTTATTTTATAATCTTTCAA------TGTTCTCCTCGATGTTAACGTCAATGTTTTATAATTCGTGTTTTTATTAACTATA---GATAAACACTTCGCTACATTCGTTCA--CTGTAGCT---------------GATTCTGTTCCAGAGCAGCAAGAAAGCCACCAAGAGG----AATTTAC---------AAACGTAA----------TATCGATGTATTAACATGTTCCATAAAGATAGTTTGTAGTCTCATACGA----GTTTTCTTCATGTAAATAAA
GCTATATAGGCATTACGAGTCAATACTTTCCAGCAGCTGTTATGTTTATTGCTCCTGGATCTACTCCTGGTATATTATTACAAATATTTTACCAAAAAAGTTACCGAATGCATAGAATACAAATTGTGTTTAAGGTCATAAACTTGGTTAAAATAAGTAAAGGAAAAAGTATTTCTAATATACGAATGCGAAACGTTCATAGAAACATACAAAATTAAGGAATTTTTAAAACAGTTTGTCCGCTTCATTTT-----TCAAAATTTCATCATATTTGATTATTTTATTTTTATTGTGTAACAACTTCGCAACATTCTTTCAATTTATAGTTTTTAATAAGGAGAACGATAAACTACAAAAACAAAAAAAAAAAGAAAAACAAGCGATAATCCACCATTATATAAAATACAAAGCACTCTTTAATCTATCAATTATCATGTTTTGTAAACATAGTTTGTAGTCACATACAATACCATTTTTTTCATGTAAATAAA
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GTGACC---GCTGCTTAGCATAGATAAGGACTGTGAATGTGACCCTTAAGCGGGATCCGCTACAAATTGTTATTTTGTTATGATTTTAAGCGGATTTCGTGGGTCGCGCTGTACTTGTCAAATTGCTAACT----------TTAATTAGAATTTTATAGGCAAGGTTTTTAATTAAAGAAATTGTAGTTAAG---------GAGCAACATAAGTTAGCTTAAGATAAATAT---TCTGTGCGAAGGATGTGCCAGGTTCGTTTTAGCTAGACAGGGCGCACATCAAAA
>CG10195 19478797 19479088|21627 chr2L 19479085 19480679 scaffold_7 646833 648497 + 33541|0 3
TCAC
GCGC
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AGGTAGAGCCGGT----TTCCTCTATGTCAGGTGCATTTATCTAGTTTT------ATAAGTTTTCCAACAATTGATATATAAA---------GTTGGACATAACACTTTTTAGCAATATACAAC-------TTATAAAGTTCGATTTCCTCC
CGTGGAAAGCATTTAAATTCGTTGATG-AAAACACAGGTCTTTATTATTCAACAAATAACTTTATTAACAATTTATAAATGGGTAATTGATTGTTGCAGGTGTCATTCCACCATAA-ATACAACAGAGGCTTTATCAGGTGCAATTTTTGTT
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CGCAAGAGGAAATATATATATTTTCTATTAAAA
CAAAACAGTTTATATACATATTT-------AAA
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TTATTTATTACCATTATTTATATATTTTTTAAACCAATTTTACTTCGGACAAAAGATTAATTACAGTAAGTGTGAGTGTTTTCGA--ATTTTACTTCTTCCAATAAATAAACCTATTC----AATATTTATT-GTATACCCAAAACGAAAATGCAATGTAAAAGCGTTTATCCAAAATAGGATTAGGAGAGTATATGTTTATATATAAATATAT---ATAACCACAAGGAATGACATTTCA-----TCGAGATTGCCCAACTTTATTATCTCTAAGCCCGTTTACGAGCATCTTTGATTTTTGATGTGCTCCCTACTGACG-TTATGAACTTTGTATATAAGTTTAAATAACTCTAACCATTTACCATTCCAATCCTCGCTATAAGTGTTTA--------TGTGTTGAGAGGGGACTCAGAACTGGTCCTAAT-CCCTCTAATCTGCGCAATAAATGAAGCTCGCTCCAATAAATGTT---TAATATTTATAAAAT
TTATTTTTAATGCTCAACTTTGTAGTTAAATAACAAATTTTTT---------GATATTAAATACAGAGAACGTTCGCTTACTGAACAATTTTAGAACTTTCAAAATCTCAA--TATTCGGAAAATATTTATGAGTATACACAAAA-AAAAATTAAATACAA---------TCTAAAAAGGGAAATGAACTTTTAAACTTTTAATATGAATATATTTCATATAATAAAGAAAAAACCTTTAAAACGTTCGAGATTA---AAAATTGGAATTTCT---------TTTTAGAATATTCAATTAGTAATTGTTTATCAAATGCCAATTCTAAGCAGT---TATAGTTTTC--TAGCATTCACTGTGTAG-ATTTAATTTTTTTCCAGAGATATTTACATTCATTTGTGTCAAATTTAATATCATGATTTGAAATATTGCCATTTTATTTACAAATTAAATAGGGCATGTTC-AACGAGTGTTAAGCAGTATATGGCTAAT
>CG10188 19498266 19499057|21638 chr2L 19499027 19502480 scaffold_7 673048 676581 + 157068|0 30
CGCCAGTTCACGCCTGAAGTCGAAATCTAAA
CGCAAATTCACGCCAGAGGTCGAAATATAAA
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AAACTATACCGAGGGCTGGGTAACGGAGGCGGATGAGGGACGAGATTCAACGCTGGAATATCGTCTGAGCATATTCGATGCGGTGGCCGAGGACTCCGGCACCTACTCCTGCATGACACCCGCCCGACATGAGCATGCCGTTGAGGTGGTCGTTAAGGAAATCAATTGCCCAGAGATACCCATAAGGCGTGGCTTGATAGTCAATACGAACGATACGAAACTGAGCACACGCGTGCTGTTGTCCTGTTCGAATGGCAACTCGTTGATTGGCGCATCGGAGCTGTTTTGTTTACCCAGTGGCAATTGGAGCGCGCTGTTGCCGGTTTGCGAGAGCGTGGAGTGCGGCGATATACCGCTG---ATGCCGAATAATGTTAGCTCGCCGCGCGTTTCCGTGCTGTCGCGTGAGGTGGGCGGACGAGCGGCATTCTCCTGCTCCACGGGTTACGGATTGCGCGGCCCATCTGAGGCCATCTGTTTGCCTACGGGCGAATGGGCGACACCGTTTCCAACATGTGTCGAAGTGCAATGCGATAATCCTGGTGCGCCGCAAAACGGTTACGCCCAGGGCTCGGCACCATATCGTGCCGGCGACGTGGTCCAATTCAATTGCAACCCGGAGTATATGATGCAAGGTCAGCCAATAATTGCCTGTCAGGATAACGGACGCTGGTCGGGCGGTTTGCCCAAATGTGTGCAGGCCTGTTCGTATCCAGGCACCGCGATCAGCGGACGCATGTCCTCGGTCAAGTTCTACTATGCCATCGGCGAGAGCATTACCTTCACCTGCGACGCCGGTCTCGAACTGCGCGGCTCGAAGGTACTCAAGTGCATGAAGAATGGCAAATGGTCTAGCGCTATACCGACTTGTGTGGCAAATGATGCGCCCGCCGGCG------------------------------------------CCGTCGGTACCAATAAACATTTGG---CAACCATGGGTTA-AGCGATATTTGAATTGAGTTTAAAATCAAAGTGATACTAATACATATG------TACTTACTAATGCACATTCAAG--AAACAGACACGAGTATACTAATT----GTGACATACTTGCAATTTAACATGCAATATA---TAATTGTCTTAC----------------GTCGTCATTTTACTATCAATAAATGTTCAGTCAAATATAAA
>CG10186 19504878 19506480|21641 chr2L 19506442 19508884 scaffold_7 2882615 2884897 + 87538|0 38
GCACGCTAAAATAACTTTAAAGTTGCTAATTAATTTCAG
GCGC---CAAGAGTCGTTTAATTTAACACGCTATTTCAG
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GTGATACTGGGGAGGATGAGGCTGA----GGCCATCGAGGCT-----------------AACCAAAATTTGTCAGGTCCTAGCATGAAAATAA-----------AGAGCTTGGCGTTTGGCCAAATTTAAA---TCT
GAAATGGTGGAGGTTATAAGGCTAAAATGGGTTGTTTCGGCGTATGAGTAAAATAAATAAAACAAACTTTGTAAAGCTC---AATGAAAGCAATTCGAACAGTCAAGTCGGTGCGCTTGGCCGGCTGCCAAAATTCT
>CG10337 19541305 19541733|21655 chr2L 19536410 19541650 scaffold_7 2912816 2918180 + 29637|5458 5809
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AATTTTAACGATTATCTCGGAAAAACTCGGCTATTAATTTGGGCATTTTGGTCATCGAATAC-ATTTTCATTGTTTAGCACACATAGTATATATTTATAAT---------------TTTTATTATTTGTTTAATATACGATACCATTGAATAACATA---------------------------GTTTTGATTAGTTGCCACAT-ACACATATACACATACATACATATACTATA----------GATTAT------------ATATATCCGCGT-AACTTTCGTTTGGTATAATAAATGAAAACAATTCACCAGAAA---TAAACCA---AAAAAACTGACAAATTCAGCC
>spi 19563828 19564221|21689 chr2L 19563772 19565500 scaffold_7 2941419 2943213 + 46308|56 469
GCGGAGCGAACTATGGAAAC------TATGAAAAGATATAGAAAGTCGAATTTCGAATATGCCTTGCCCAACACACAATTCTTAACT---GGGCTTTAGTCGATAGCTGATAACTCCTATTTACCTACCGCATGCTAAAGATCTGTTCACCCGATTCTATATAGAGATCTTGACTTTCTCTTACCAAAAGTTACCCAGAAAGGGGGTTTTAAAGCCAGACAGCCTTGTATTACCCAATT-GACTATGAATTTTAATACCTAACGCTAGCTATTTATTATTACTGCTAACTGATATACGTATCACACACACAACGC-------GACACACGCGCCAAGTATTATTTATTGCGAGAGATTTAAGAAGAAATGATATGGA---TTTTCTAAATAAACATACGAAACTGCACCATGCA
GCAAACCGAAA-ATGAATATCTTCTATATAGACAAGTATCTGTAA-CAAGCTATTGATTTGCCTTGCCCATGTTATGCATGTTATGTCAAAGTCTAAAATTGCGTATTACGAATTTCTATGTGCTTTAGTCGTAGTCATTAATCGTCCTATTAACTAAATGTTAAG-TGTAACCTTTGTATTCCGAGTCGCAGCCCCCAAGGTTGCTGCTTATATC-GAGATTTTGAGATTCTTCACTTCGAATATGTATTTTTTTACCTTACACTAGA-GTTTATATTTATTTTATACTTATGCACGAAACACATCCACAACGATCGAAAGAACAAACACGCCAAGTATTATTTATCGC-ACCTAGTTACGTACGAACTATATTGAGAGTTTTTACAATAAAAAC---GAGCTGCACTTTGC-
>CG10268 19575022 19575386|21698 chr2L 19575245 19578355 scaffold_7 2951090 2953866 + 68745|0 148
AGCTTGGACCTCTCGGCTCACCATGCTTTGAACAAATGTATTTTTGATATAT-CACGTATTCCGGTCACAAATAGCGTAGTTAAT------GCAATACACTAGACAAGAATGAAGTTACGTACCTAATAGTAAATACTCTTGGTAACGA
GGCCTTAACATTGCAA--GAATATTTTTTATAGCAATCCTTTTATAATATATATTTGTATGCACTT----AAAACTGTAATTGATTGGTGGGCTGTG---TAAATGATAATGAAGGCAATTAATT--TACTAAAGATGATTAGTAAAGA
>CG10263 19576537 19577260|21698 chr2L 19575245 19578355 scaffold_7 2951090 2953866 + 68745|1318 2087
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ACTATGCT-CCCTGTCT-----------AATGCTTG-CCCTTGCAGCTATCCGAACCCTCTGCCACCTCCTCCGCTGCTGCTGTCCTTA---------------TGCAGCAACGCTCAACGGCGCGCGGT-TCGG-----TCGGCAGCATTGGCTCAATACCTCCACCAGGAT------CGTCTGACCGAACCGCCGTCCA---CACGCACTCGACACTGACGCAGGCCAATTTAGCGCGCATCAACAATGCGAACGCCCAGGACTGTCATCAGGGCAAAGCCTCGCTGCATCAGACCCTTAAGAAGGGCACA---CATCAGTCCGAGTCTGTGGCAGATGCTTCCTACTACAGCAGCGTGTTAGCCACATTTGGTAGTGCTGGAGGCACACCGGGCGCTA---CTCCCGGCAGCACGGTAGTTGGCTCAAATTGTGCAGCGAGC-------GGTGGCAGTGCATCTGGTGTCGGAACAGCTGCAGGAACAGGCAGCAACATGAATATAGGCAATTCCGCCCAGCTGACAAGCGGCTACGAGATCGGCAATACGGCGAGCAGCACAAGCAGCAACTGGCAGCAAGCGCAGTACTATAGATA--------AAAATAA------AATGGACAGAATCTACACTTTTGC-------------------ATGAAATGAATATTTTGTTATTGTAC--AAATAAACAGTTGTATATGT------------------AACCCAAATTGCATAGCTTGTGTTTTGCCGATTATGGAT
>scw 19695553 19695648|21817 chr2L 19695167 19698795 scaffold_14 1539582 1543587 + 103530|500 630
ATTTAATTGCCTATTTCGTTTGTGATGTACATAGTCATG---------------GTGTAGTTATAAGTTTAAATAAGATGAATACAACTAAAAGT-------ACTTCTAAAACTGAC-------------A
ATGGGAGTGAA----TCGTGGGTAATCCATCTAAGCCTGGCTAACGAAAATGATGCTTACTTCTAGGGTTAAACCAATCAAAGCCGATTTTAAATGGGTTTAGTTTTTAAGATTAGCAATGAATAAGACAA
>CG10462 19728097 19728579|21833 chr2L 19720013 19729296 scaffold_14 1561769 1571338 + 329693|8825 9371
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TGATGTACCCTAGATGAGGGTATTAAAATTTTATCACATTATAAAATGTGAAGCAAACTTTTCCAAAACAATGTATTCATATTCTACGCCATGCAACTGGACATAGCCATGTTCGTCCGCTTGTCTATCTTTCCATCTGTCTGCTTCTAA--GTAAATGCTT--------CATCTTTATTACAATATTGATG--------AAACTTGCTGCAAATAGGACATATTTCTGAGTAGGTTGGATTAACCATCTAAACCTCCTACATATCATAGTTAGCATTATAAATTCCTGTATGAACAAACTTATCAAAATGGCATATGGAT----GCCTTATGAATGTTGGAGGATTCAAATCTTGTATGATGATGGACATCCCATAGAAATAATTGATTGAAAATTGGTTTTTCTATCCAGCACTTTGTTTTTTAACAAGATATACGGAGCAGAACAACAATTACGGCTTTTTGCCGTTGGTCGAAAGTCTATGTATTAAAAACATATTTTTTTTTTATATTAGTTTGTTAAAGTGTAACAAATTATGCGCCATAA
>CG10631 19738743 19739148|21841 chr2L 19738805 19744128 scaffold_14 1576410 1581952 + 104724|0 344
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T----CAAAGCGAAAGTATACCGTGTCATTTGATAATGTGTTAGTTTGGAGTACTATCC------CCATGTTTATAAGCCACATCA----TTTTAGCCTAG--AGTTAGTC---ACAAATAATTTATAATAT----TTAATACGTAAGTATCTCTTATA--------ATTGTATTTATGAAACTAAGCA-----------TCACGTCTACGCTATTGTTAGGTAGAACCCTCCCCTCCACATAC----TAAACATAACTGAGTAGC-----TAATATAATATATACA-TATACATAATATATACATA-------------------AATGTATATGTATATGTAG
>CG10628 19753172 19753233|21846 chr2L 19753147 19754508 scaffold_14 1591306 1592647 + 56772|25 86
TTGTTATTGCAAATAGTTTTGTGAGCGGCTTAAGAAATTAAATTAAATTTGTAGCAGCGGAA
-TAAAATAACAAATTATGTT---------TGAATGAA-------AAGCCTTTATCTTAGAAA
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TTGTTGTGACTACAGTAACGTATCAATAAAGATCAATTATATTTTTTACTAAGAAATGCAA
TGTGTGTG--TTTTATACTATTTGGATAATAAACAATCGTCTTTTTTAATATACATTGCGA
>bsh 19762049 19762288|21855 chr2L 19761844 19762116 scaffold_42 857135 857423 + 538|235 306
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AGTGGAGATTGATTTGGTAAATTTTCGAATTTATGGATT-TTATATTTCCGCA-GAACTTTTGAATGATTTC
>bsh 19762049 19762288|21856 chr2L 19762117 19762703 scaffold_14 1601382 1601956 + 15481|0 183
ACAGTTCGATCGGGATGTGGACCTGGATCCTAAAGTAGTAAAGTTTTCGGTGTTTCAGTTGGGGGAAATACAACTAAAAGAGATTTTCAAATCAAAAAATATCAGTTTCTTT--TACTAAATGACTTTTCTATTAGAC----------AAGCACAGAAGTTACAAAACAACACATATATTATCA
GCCGT---------AAGTGGGTGAACATTGTCAATAAATAGACCAAT---TATAACAGTTAGTGTGCAAAAAATACCAAACAATATACAAAATACCACATTCTCGTCAGTTTAAGATTAAAGGATTTTTTTATTTTATCTCATATTTAAAGCATAGCTGATAT-ACACAATCAATAGATTAACA
>CdGAPr 19771021 19772870|21866 chr2L 19770750 19772334 scaffold_14 1610407 1611892 + 3826|304 1714
GACTAAACTTTGACGCATGTATCGGAGATGATACTTTT--------------CTTAGTTTCTAATGAAAGCATTT-GCCACAACTTTGAGCAAGGTGTCCTAAGT---TAATTATTATACGATTAATTTATATGTACTTTTAAA---------------ACAATAAACTCAATTGCATTGTCACTCACATACTCTTTCTACAACCAATCCAATCCTTGTATATACTCTTCGTTTTTACCTTCAACTGTTGCTAATGGAAACTATGTGCATAACTGGAGATTTGAAAAGCCTGTGTACCCGACTTAAGCGAGTTTTCGATTAGAATCCAGACTTCCGTGAGGCGTTAAGTAAACATTTATGTTTACATA----AAACATACTA--AAACACAAATATATTTTCCTTACTAATGAAAATGTTTGAATTGAGGAAAGTAAAACTAAATAAACAATATGGTTGTCTATAAGT-ATATACAAATACCTTTACACTAACTGGTAACGTTCGCTATAAAAG--------AAAAACTGATTACTTAATACATAGAGGGATTTACTGGAAACAAAAACAGAGCGCTTATATACTAACAAAGCTCTAGTTCGAATGTAACTAAAGTTTACGTTTAATTAAA-AGTAATATAATAGGTGTTTTTGTTGATTTACTTTGTGTACTTCAGAAAGCTTAAGCTTACTAT--AATTAGCTTCGAAATCGTT-------------ACTTTTCTGAAGTTAAGCGCATGGCTGGAAATC---TGCTGAATGAAATTTGCCAAAGGCTGTAAACATATTGAAGGCAAACACGGCTTTGGTTTAGCTAAAATAT-TTATGACTTTTTTCCCCTTTGGTAAATTAGCTTAGCTTTGTTATGCTTAAGAGCCGATTTATTTTATAAATCCTTAAACGTATAAAATACTTACTGGAAAGTCATAAAACGCGTACACAGCAACCATATATAATACTTGTATAACTTACTACCAATATGACCAATGAAAGGAACTTCTGATGCATAACTAAGTGAAGAATTTGTGTGGCTAGTGCTTAGATTTGAAAACTAGATAAATTTGA-----------TACTCTAAAAGGAAACTGTGCGTTTGACAGTTTTTTCAAACCATTATTTACTCCAGAGCAGCTGCCAAAAGTTTTATTTCAAACGTATCCAAATTTTAAAGGAAAACAAAGCCACAAGACGGAAGAAAAACGGAGA----TTAACAGAATTGTAAT----ACAATAACTAAATAGAAAGCTTTAAA--AAATAAGTTAGCATTTGATATATTTTGATA----AATATAAAAG----AAAACCACAGCATAGTTATAAACAATCGTATTTCATAACGACTGAACCACAAAACGGAACCGGAGAATAAAAACAGAAAAAAAACG
AAATTAAATTAAATGTGTAAGTGGAAAGCGCTGAGTTTTTCTTCAAATTAAACTTAATTTA-AATTTATGCATTTCGACGCGACTTTGAGTGAGTTGCTTTAAGTATATTATTATTATGCGATTAATTTATATATTTTAACAAAAATCACAAAGTTTATAAAATAAATACAAATTCGAT-TTACT-ATGAACTATTTTTATTTAAACTTAAATACTTGTAAATACTCTATGCTTGCTTGTT-------------------CTAAATGCGCTAC--GCGGCTTGCAAA----ATATGCCAAAATGAAAAGAA-----GAGCAAA--------------------TTAACTAAAGATTTTTTATTGTACAATAGAAAAGTGCCACGAAACGCGGGC------------CTAACAAATCTGTCGGAAAT--CTAAAATAAATTTAAAAAAAATACA-AATTATTTCCAATCAATAAGTTATCATTCTTTCTTTCGTTTGTG--TTTAGATAGAATAGATCTGTGTAGAACCTGGTAGCTTAACACTT------------TGAAAACAA----TGGTTGTTCATAGGCTAAT----------------TATGGTTACAGTTCGCTATGAGGAGAACAATAGTATAAGAAATATCCGAATAATTTTA--TAGTGTATTTGACAAAGTTTTCAACTAGAATCAAACAAGTTTCCGGAGCTTTATAAAGCAGCTTGATTATGCCTAATTTATGGGCACTGTCGACAATCTCGTTCAGAATTAAATTGG------------AATTTTTTAACGACAGA------TTTTTTTAGACCCGCATACAGCACGCACCTTTTTATTTATTGTATAATAA---AGCTTT--------------CCTATTCATTT-----AACTATAAAGACCAACAATAACTAAATGAAATCAACAGAA---------ATGAACTAAACGCTA-ACTTATTGAAATTA-----GATACGATCTATAAC---CATTTAGAATACTTAACCA------------GTGTGGTTTATAATAAATTTTTACTACTAGTTAAATTTCAGCTAATCAAATTTTTATAAAAATAAACT---TGCATAACAAATTTT---AAT--TTAATCGTCCTGACCCAGCTGCCAAATTTTT-------------------------------ACTGAGCATTGAAAAAATCGAAAAACTGTTCATCTTAAACAGATTTATAATACAAACAATAACTAAATAGAAAGCTTTAAAACAGATAAGTTAGCATTTGATATATTTTGATAAAAGAACATAATAATTATAAATCCGGAACTTAGTTATAAATAATTGTATTGTATAATGACTGACAGCTGAAGCGGAGC----AAATGAAAGC----GAAAAGCA
>CdGAPr 19771021 19772870|21867 chr2L 19772353 19772961 scaffold_14 1611920 1612541 + 6362|0 641
GCTAAGGCAACTTTAGCAACTAATTACATCGAAAAAATGAGACCGCTACCTACATATAATCACAGTTCTGGAGCAGCGTGTATATATGCCAATGAACGCATATATATTTTATTTAGTT------------------------------------------------------------TTTAATCATTCACCTAAGCGATTTGAAATTCTCAAGTGTTATTGACATATACGGCGCAAGCGGATCCAAAGACATACTGATTTATAACGCCGTGTTTATTGCAAACACATTTATAATGATATA-----------ACGATG--------------------ATAATCATAATGACGACGCTTTGCGCCTTAAATCATATGCAAAATTCAATTTTGTTTTGAA---GCAGCATGA-AGAGAGTTTAACTAAAAGACCATCCTTACCATACCCCTCGATCCTGAACAATGCATATTGTTATTGCATTTTGGGAGTTTCTTTAAATAGGTGTTAAGTTT-----------------CATTCGTTTAACCA--TACAAAAAAACGGAATTCAACCCTCTTG------AATTCCATTTCGATT---TCGATTTCGATTTGTTTT-TGCCTGATTTGTGTCTCGAGTGTTT
GCTTAGGCAACATCGAATACAGA----------------------------------------------------------------------------ATATACAGATTATATAGATAACAGAAGACACAAAAAAGGAAGAGAAGACGAGATATGAGAAGAAAAAGGAGCGGCCGCGTTATATAGCTTATTTA---GTTTGTAAAATTCTATATGTTAAGAGCATATTT--CGAGAGCACATGCAAATATGTGTATATTTCTA-------------TATATATACATATATAGATATGTATTGGATTCTGGACCATGCGGCACCAAAGACATAAAACACAAACAAAAT--CGCCGCTGGATGATATAGAGCAGA-GCAAAATTCAATTTTGTTTTCAAAATGGAGCTCGAGAAAGAGTTTCGAGTGAATAACTAACTAAAAAGACCCAGCGCC------AAATGCAAATTGTTATTGCATTGGGCGATC--------GTAGGTGTTAAGTTTATATTTATATATATATGCATATATATATACATCTACATATATATGGATTCTCGTTTATTTGTATAATTATTGCATTTCACTTGACTTGATTTCGGTTTGTTTTATGTGTGATTTGTTTCATAAATGTTG
>fs(2)ltoPP43 19789415 19790453|21880 chr2L 19788844 19789704 scaffold_14 1632893 1633880 + 16918|642 1009
AATTAATTAGCTATTAGATTAGAAT------------AATTTACCCCCACACACGAACACACACACAC-CGCATTTT--TTTGAAAAACAGCTCA--CCGAGCATTTTTCG-------TTTAGTTTCCGCCA---GTTGTCAGTTGCCTTTTTGGTTCTTTTTCCATTCCGACAATAAACAAAAAAAAACGGATAACACTAGTGCTGAAGTCTAATTAAGTGCATAGTCTTAGTTTG------------------TTTTGCTTTATAT----------------------CTGTTGGGGCCTAGCGTTGCCC---GAAATCGAATATAAACTAAATAAAGAAACTCTCAA--------AATACGTGAC
ACTTAATTAGCTATTAGTTTTATATTTTCGCTTTTTGCACCTTGCCACATACACACACACACACACACACATATTTTAGTTTTATATGCATTGTATTCGAATTGTTTTTTACCCCTTCTTTTGCCTCTCCCATTTGTTGCCAGTTGCCAGTTT-------TTTAAGTTTCTGCCTTCGATTTAAGTCATTCCACAAATCATGTGCTAAAGTCTAATTAAGTGCTTAGTTTTAGTTTAGCGCCCAATTCAAATAAATATTGATGTATATAACTAGTAGGTGTTACCCGGCTTTGCACAGGCCTAGTGTTTTTCTTGAAAATTCCGCTTTCGGGAAATTAACGTGCAATCAGGGAAGGGGAATTCATTTC
>fs(2)ltoPP43 19789415 19790453|21881 chr2L 19790008 19790980 scaffold_14 1633881 1634803 + 18213|0 464
TCGATCACCACTACA--CTTATGTACTATATGGAATATATATATCTAAGCGGTGTGTCTGTGTGTCGGTGCTATGGGCGTATCTGTGTGGGTGTGGGTGTGCGTGTGTCTGTGTTCGTTGTCCTCGGGCGCAGTCTCATACTTGCATATTATCCTTAT---CATCTAGACAC--GATTGCAATCACTACAGCTCAATAATACGATTCGTTCG---TTCTCCATAAGGTTGTATTATCCGTTTAATTACTACAACAACTGCTACTGGTAAACAAGAAATAAACTAAATGGAGAGAGACAGACAAAGTCGCAGGCACTTAGGAAGTGTGAGGACA-GGAGACACCCAATGCCCCACCCACGACAATAAAAAAAAGGACTGCAACTGGCAACTCACATCACTTACAGTTCA--------TTGCAGTCAGCACATTTGACAAATGCCCAAAACTAACGATAAAACATTG
AAAAAAAACATCACATTCTTTGGGGCTA-GTCGAAT---TGTAATTGAATTATGTGTGTGTGTGT-------------GTGCTTAAGTAAATGT---TGCTCATTTGTTTG--------GTCCCCTTATAAAACATCAT--CTAGATATAATTTCTATAAGCATAAAGAAACTTGACTATAA-----ATAATTTGTTATTGTAATTCGTCTGATTCTCTATATAAGGTTGTATTATCCGTTTAATTACTACAACAACTGCTACTGGTAACACAGCAAC-AACAACAACAACTACTACTACTACGGCAACAACCAC-GACGATGTGATAAGACGCTGCCACGCCCAAC-CCCCAC--------ATAAACACAA------------CCCACCCGCACGCATCACAGTTCAAGCACGGGTCGCAGTCAGCTCCTCAAAAAGAAG--CAAAGCAAAGAAAACCAAATCA
>Os9 19962656 19962875|22090 chr2L 19960741 19962880 scaffold_14 1852168 1854227 + -5419|2089 2322
GATTAATAGCTAAATATTTAAACAATATCATAGAATTAGAAAGTGTTTGTAATAAAATGAGAAATGTACTTCAAAGAACAATATTCGGAATCTATTTATACGA----------GGACTTTATTCCTGAAAAATGC--CGTTTAACTTCCGGAAAATTTCCGACTGTCTGATCAACATGTG--TAGATATCGAGAACTGATACTTTAAAGCAATAAAGATATTATCGTGACTTGG
AGTCAGCGGTAAGCTAAGTGGATAATGTTCTAAAAT-AAAAAGCGTTGGGAACACATTCTATTGGGCAATTAGAATATGATTATTTAAAGT-----TGTGCGACTGGGTAATTTGATTATATTTTGAAAAAATATAATATTAAAATACCAAACAAGTGTCTAATGAGCTATTACTTTCCTGCTAAAAATCAGATAACAAAACAATAAATGAATATACATGCAAT--TGGCATTG
>barr 20054093 20054313|22185 chr2L 20053972 20054199 scaffold_26 1345516 1345736 + -607|134 240
CAGTATTCTGAAACAGATATCCTCACCCCAGTCGAATTTTATACACAAACGAAGCATTGTTCTGATTTAAACACTAGTTAGTAAACAATAAATTAGGAAATATCTAA
CAGCATCAAAAAAAAAAGAAAACAAGCCGCTTTGAACGTTACGCACGTACGCAGCACGCTGCGTGTTTCAACCCAAAAGCAAAAACAATATCTGAAAATACGTCTAA
>CG10730 20066006 20066067|22196 chr2L 20065772 20066032 scaffold_22 1394706 1394992 + -435|264 291
AAAGATACCATTGTGTACC-CACTATAT
AAAGATGCATCTGCATTCCTTAGTATGT
>pr 20069643 20069844|22199 chr2L 20069433 20071603 scaffold_7 4598401 4600677 + 28893|264 488
ACATTCGAAGATTGTGACATCGCCTAACGAATTTTTTG--ATTGGACCAATGATCAGCGAAGACTCAGCCAACCTCTTAAGCACGC-------GCGTAGAAAAGGACACTTACCATGTAAGGGAATGAAAAGTTATACGAATTACACAGTATGTA---GGAGTAAAATATGTT--AATGCAA--------CATAATATTGAATAAA-ACAAAGGCAACTGAAATA
ATGTGGCAAAAT------ATATACTTACGAATTTTTTGTTTTTGGACCAATGCTCAGTGAAGCACAACTAAAATACTTACACCTACTGTGAAATTGCACATAATAACACATATTTAGTTATTATCAAGCGAGTTATACGATTTACAAAGTATATGTTTAGAATTAAATGTATTCAAATGAAAATCATGAGAATTATATGGAATAAATACTGTAACAACAGCAAAG
>fok 20078217 20078711|22205 chr2L 20077421 20078289 scaffold_7 4609632 4610708 + 4873|1047 1128
AAAAATCAAGTAACGAAAACCTGCCCCGCTTGACCAACGCATTTTTTGACCTTAGGCA---------AAAAAAAAAAAAAAA
AATAATCCAATAGCAGCCGCCCGCTTGGTTAATCCCAAA-------TGACCTTAGACATATATATATATATTAAAAAATTAA
>fok 20078217 20078711|22206 chr2L 20078326 20079040 scaffold_7 4610731 4611513 + 14841|0 473
GTGGGAGCGAGACGAATCTACTGCG---------------------------GACGGTGCCCGCAGCATTCGCGAAATGCCATATATGTATACAGATGTGTAACCTAACCCAGAAGAAAGGAAACCTGAAAGAGTAAGAACAAAAACAAAAACAAAGAAAACCCGAGGAGAAAAGAGAAAAAGCTGTCGAAGAC---------GAAGATTGCGCGA--------GAGAGCGAGACAGCAGCCTGCAGCTACAATAATCTAAGGCAACTGTACCCCTATTTTTTTTAAAATGGTTGCCCAGCATTTCCGCGTTGCG---AATACACTACCATTTACAAA--AGCCAGAAC------------------------------------CACTTGATACCAATTTACAACTACCTTTTTC-ATTATCTAGCCCTTCGTTTTTACACCAACTTCGCA--GTTATGTACAACTACAAACG
GTAGAGGAGAGACAGACAGGTGGCAAAATTTAAGCCAAAAAACAACAACAACAACAACAACAGCAGCAATT-CACAATGCCATATA-----------------------------------AAGTTAGATAAAGACAAAAAAAAAAAAAAAACAAAACAAACGAGAAAAACAACGTTGTAAAGATGCTAAACGCGCCTGCTGGGCAGGCAGCGCAAGCGCAAGCGAGAGCGAGACAACACGAGACAACTACAATAATCTAATGCAACTGTACCTACA--------ATAACAATTGCGT-GCATTTCCGCCTCTGACGTAACACACTACCATTTACAAAGCAGCAAGTACGAAGAAGAAATGAAAATGATTTTTTCTGTTGCTGTTAACTTGATACCAATTTATACAAGCCGTTTACTATTTCTTTACACCCCCCTTTTACAAATACCTTGCATGTTTTTTTTTTAATACACATG
>CG10747 20085558 20085957|22211 chr2L 20083200 20085600 scaffold_7 4616306 4618725 + 95001|2461 2514
TAAAAATCAATATACAAAAA---ATATATATTTAAAAACA--------TAAAAA
TGCATATATATATTCAAACATACATATATATTTAAAAAAAAAAACGAATAAAAA
>CG10747 20085558 20085957|22212 chr2L 20085601 20087002 scaffold_7 4619347 4620699 + 42356|0 373
AGATTTCCACAAGAAAGGCAGAGGGAACACATGGTTATTAGCCTGCGGTACTTTT-----AATATTTTTATAAACCAATATTTGG------ATGTTGACACAAAGTTGTTCGAAAACCGTGATAAACTTTCGAAGAGGTGATAATGAAGTAAATAATTATTTTAATGCCAGAGCAAACTATTATGTCACTTACGTACAAGCATGATTTGGATATTAAGTTATGTAAGACCAGAAAATCATTACAAAAA----CAAACTAAAGCTAGTGATTTATTTGATAAACTAATTGAAAAGTCTTTTTTTGTACCGCCACTTTAAAATATTTCCCAAAAGCCAGTTTCACTTGAAGGT--GCTATCAATACATTTTATTGT
TCCTTT-------ATAGACCGCACGATCCGATGGTTATTGTTGTATATTATTATCGTACAAATATTGTTAAATAATTTTATATGGTGCTTATTATTTTTACGATGCT-CTCTAAAATCG-AATAAGGCTTC----AATTTGTATCTATTTAAATTATTA--TTAATTATGCACCCACTTTTTATGGTGCT---------------ATTTTCTATTCGTTTACGGATCATCTG------CTTGCAATGAATTCCAGCCTAATATTTGTTATTAAATGCCTGTCTTGTTTTAAATG--TTTCTTTGTTTTGTTATGTTGAATCACTTC---AAAACTTGCTTTTCTGCAATGTTCGCAATAAATGAACTTAAATGT
>Taf13 20089014 20089152|22213 chr2L 20087576 20089701 scaffold_7 1177774 1179861 - 86757|1479 1619
CAGCGGTCAAAAAAAGCCACACCAAATCCAGGTATAAGCCAAACCTAGCAGTTAGCTCCAAGATGCGAATTATTTTTAATGTCTTTAATACTCTAA--GCTAGCGCATAATAAACTAATCAAAATAGTCTTCAATGTCAAT
CA-CAAGAAGAAAAAGC-----------------GGAGCACAACCTAGAATTAAAC------------ATAACTTTAAGCATAACTAATACTTTATTTGTAAACATGTTGTACATTAATCAAAGTAGTCTTCAATGTCAAT
>mRpS18B 20092360 20092401|22215 chr2L 20092118 20093132 scaffold_7 4625474 4626462 + 29730|250 300
CCAACTAA--------TGATTAACATGTTT-TTATTAAAAGAAATTACTGT
ACATTTAAAGTTCAACTGATTAAAATTTTTATGATTAAAA-----TGCTAA
>CG17571 20243745 20243746|22306 chr2L 20243667 20244856 scaffold_7 102842 104011 - 34711|81 82
-T
TT
>La 20335984 20336273|22398 chr2L 20335475 20337967 scaffold_18 2525233 2527888 - 56451|693 1004
CTCATCCACCTATATTCCGCCACCCGAGTCTTTTGATCGCAGTAGACCAAGCTTAATTGTTACTCGGTAGATCTAGTTGACCTAGCTTTAAGGCCTTAC------ATATATAATACTTGCTTTCTCTTAGTTTTCAA-AATAATCGTTGCAGGTA----------CAGAATATTCTTCAAATATGCATGTATAGTCTGTTACCTAAATAACGAGGTGGGCTCTAATTTATTTTACATAGAAGACTATGAATCCAATTGTTTCCCTCAGCAGAAAGCTAC--AAATAAAGACCAGTGTGTAA---AACCTGAA
CG-ACACACTCAAGT---GCTGTGCTAGACTCCAGAT----GCAGATGAAAAT------------GTTAGTTCTAGTTG--TTAGCTTTAAGCAACCATTTTGTGACATCCAATTGCTACTATTACTAGTTTTCCAATAACATTAGGCATATGTAAGTCTGAGATCCGAATATCTGAGAAAT----ATGTACAGT---TTACATAA--TATGAGAGGAACTCTAATTTATTTT-TATTACTGAACATG-TTTTGTTTTTTTCTTTGCTCAAAAAAACATTAAAATAAATATCAGTTTGTAATCTATCTTGTA
>CG16798 20364576 20364975|22430 chr2L 20363755 20365872 scaffold_6 2604306 2606587 - 18958|1030 1573
GTGC--CCCTGCCCCAGCTCCACCGACTGTCCCGCCGCGTC-CTCCGCCTTCCTCCGCC----AGCTACTCAGCTATGCCCACTTGTCTTGCTGA---ATGTCAAAGTTTTGAGAGGAAGAAAACTTCAGCATTTAGCTGAAGATGACTGCGCATAGCCACGCCC----------------CCATCCCCATC---------------------------------CGGACCCTGGTTGAACGGA---------TTCCAACTCAAGCCCCATCGGTAC-CAGTGGGTTAAGCATCCTCC---------------------------------------------------GATTTACATAATTATAAGCTCGACTTCGGCTCTGGCCAAGCTTTAACTGCG---ATCGCGAGGAGGACGAGCGGGCATGGCACTTCTCATAGAGCGAGATTAGTCTGTAGACTCCTAG----------ATATAAGATTTTGTATA----AATTATTTATGCC-CCGAGAATACATACATAT-TATAGCTA-----
AAGCCACCTTAACCCTGCTCCAACTA-------GCCGCAACTCTCCGCCCCTCTCCGACTCATCCCCTCTTAGCTATGCCCACTTGTCTTGCTGAAGCAGCACCAGGCTGCCGCCGGCAACTGTCTAACCCATTTAGCTGAAGACGACTGCGCATAGCCTGGGCCAGTGCCTCCTCCCGCTCCACCTACATCTCCTACATCTCAGCAAGCTCTTCGACTTGGCAGCTGGCAACGGGTAAACTGAACAAAACGGTACTTACGGGATCAGCAGTGGAACATGGCGGATGCAGCATCCCACACGAAGCAACAGCTCCTCTTGTACTGCGTTTGGTGAACCGTAATTTATGGAAATTAACTAAAACGTAATCTTAGCTCTACTCTTAACTATTCCTAAGCTGTGCAAATCTATATGATTACTAG-GAATACTTACTTTGATATACAGCG-GATTAGTGCTTAGTATTTTAGCCTTAAACTAAGCTAAGTTTTTGTATAAACTAATTATTTATGATGTCAAATATACGTACATATATATATTTATAAAG
>CG10947 20373649 20373909|22435 chr2L 20373091 20375872 scaffold_6 2616338 2619405 - 66911|597 943
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AGAAGCGCGCGAGGGACGCGGGTTGCGG-----------------TTTGCCGGAGTAGGTTCAATTAAAATTTAGTCAATGTTTTAGTTAATAGCAAGCAAATTCCAGTTTACACC-TAAAGAATTTTTAAATAAATGTTAAAAAAACACAACACCAAAAAGGCCCAGACGTGCCCCAGGAAATTGTTCCTCTCACAATGCAAAAAAAAAAATTGAATAATTCTATGTAACATATTGTTAATTAGGTTGGTTCTAAAAAAAAACTAGGCGTATTTCAAGACTTTTTTAGAATTTTTAACACAATTTTAGCTGAACTTTAAAAAAAAAATAAAAATTATTTGCTTTTC
>CG10949 20402764 20402860|22465 chr2L 20402156 20403603 scaffold_6 2650095 2651506 - 17451|684 780
AATTAGAATGTTGTAGATTAGCTGCAAAAGTATTACGAAGAAGGGTTATTACATAAGTGTAAGCATGAAAATATCTGTAAATAAATAAACTTACTAA
AAAACAAGTGTTCCAAATT----------GTATTCTAAATAA------------ATGCATTATTATTAGAGTATT------------------CTAA
>CG31683 20435327 20435655|22521 chr2L 20434873 20435516 scaffold_6 2685250 2685971 - 18269|565 764
TTTCTTTAATTT-CTCTTTATTGTTATCTTATTGATTTATGCTTATAAGATGAGATATCGAATCACGTGTGTCAATGTCAATGT-CAATGCTTTTATTAATTACTCAATAGTGTTT-------CATTTTCCTCTTGGGTTTTA-TTCGCTTTTATTGTTTTCCATTTTCCGTTTTCCATTTAATAAATTGTTTATATGTA
TTTCTTTAATTTATTCTTTATTGTTATCTTATTGATTTATGCTTATAAGATGAGATATCGAATCACGTGTGTCAATGTCAATGCATAACGCTT---TTTATTACTCAATAGTGTTTCATTATCCATTTTCTTTTTTTGTTTTATTTTTTTTTTATTGTTTTTCATTCTGTATT-----TTTAATAAATTGTTTATATGTA
>CG31683 20435327 20435655|22522 chr2L 20435655 20439006 scaffold_6 2687315 2690835 - 120550|0 0
T
T
>CG18858 20444650 20444772|22533 chr2L 20444772 20449405 scaffold_6 2687315 2692175 - 168367|0 0
T
T
>CG2493 20449178 20449535|22533 chr2L 20444772 20449405 scaffold_6 2687315 2692175 - 168367|4708 4969
TTAAGATCACAAAAATTA---TAAGCCATACTAAAGTTTTTTGAATTGAAGATCCTGTTTGCACATTCGATTAATATGGAGTATTT------AGTAGTTTTGTGAAATACTATATTTTCATTAACTATGATGGAGAAGGA---TGACGTTTTGGACC-----------TGGCAATGGTGAATAGGACTAGTTCATTATT-----------TACTTGGATTGCCAATATAATTCATAAAAACAAATAGAAATTTATACAATTG
TTAACTTAATAAAAATTAATGTAAATGCTGCAACATTTTTTTTTCTTTAGAAAACAATTTCCGCA----ATTAATGCTGCGGCTGTTGGGTAAATGGTTCGGTTCAAGATT----TCTCTAAAAGTACAATAAAAATGGGAATTCCCGGTTCGAACCGTTTTTGTTCATAGCCTTGATTTAAAGCACATCATCATTGCTCAACGCATTAATAAAATAATTTTCAATATAATTCACAA---CTAACATAAATGTGT----CAG
>CG2493 20449178 20449535|22534 chr2L 20449406 20449487 scaffold_2 3541947 3542042 + -866|0 95
TATTATATAACAGCCGAGCAAGGCCAGATTAATC---AAATATTT------GGTATTCTTAAACCAAGGAACAAAT-----TATGAAACACTCAGT
TATTGTAAAAATAACCAACAGTTGTAACTTAATTTTATAATATTTCTTTAATATATATATGCATAAAGGTACAGTTGTTCACAAGAAAGGAAATCT
>CG2493 20449178 20449535|22535 chr2L 20449533 20449966 scaffold_2 3542101 3542543 + 20098|0 2
AGC
AGT
>CG17470 20629896 20630049|22745 chr2L 20629929 20630817 scaffold_18 1803558 1804415 - 12409|0 123
AAAAACTGGTTCCAAAATTCTTAAGGATTTTTTTGGACGACTTCCG---CTTGCGACTATTCCAATTTTTTAGCGTATTCAATAGGTTTTCGGTAAAAGGAAGCACTAGCATTGATGTAATAAA
TAATACTGTCTAC------------GCTTTTTCCATACGGTCTGTGTAATTTGCGAGTTTCATTATAGTTGATCGTGTTCTA----------GCATAATAAAAAATTTACTTTGGGATATTAAA
>phr6-4 20630941 20631237|22746 chr2L 20631191 20633025 scaffold_18 1805128 1806954 - 73616|0 46
-ACCTAAAATTTGTTCGCTACCTTATGTAAAAGGTAGTTAGATCTAC
TATCCACAATATGATAACGATCTC------CAGTTAGCAAATTCTAC
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AATGTTACCTGTCGCTAGTTTAATTTCGTTACA---------ATGTTTGTGTATGTATTGTGTATAC-----ACCCCATACTAATCCCCTACTCTTGTTAAA----GTATTTGATTCCCACGCGCCCTGTT-ATATCCGTAAACAC-------------------------GAAAAGCAATTGTTTGTAAAGAATTCTTACCTACATAGATACAACATGTAACGCATAACACTGTATATAATTAAGCTGAAACACAAAGTTATACTGTGCCCCAAGCTTGATAGAGAAAATGGCCATAACA----TAAATCATATAACCTATAGTTCATGCCTGTAAAACATATACATATTTAAGCAAGCGATGCGCTATTTAAATAGATAGCCAATGTTCCGCGCACTAGAAGC----------CACGCCAAGCATTATACATTTTGATAACGAAGCTCGTGTTTAAAAAATATTTTTATACAATTACCGGGGCAATACACATGTATCATAATGAACTACATATTAAGATTGTTGCTAAAGAAATTATGCCAATGAAATGTGTGAATAACTGTAGTGTAAAAGCAATAAACTCTATTTGACG
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ATTTTATCGGCAGCATGCTAAACCAGATATCGGAATCGATTA-----A
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ACATATATTTTGGGTT--ATTGTTCTTTTGTAATTTTATAAATGCATACATATTTATTGTACTACGTGAATGTCAAGTGTGG
ACATGAACTTTGTGTTAAAATGTTCTTTTGTATATTTATATGTATGTACAT----------CTAAATGAATGTCAAGTATAA
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AGTTATTC---------------------AAATATC------------TCCAAAAATAAAATGAGA-----------AAAAAA
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AATGTACTTTTTTATATCAA
GAAGGAGTTCATCATGTCCA
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CCACCCATCAAGTCTTATAAACCGAATACGTACACCATTCTGAAAAAGTATAAATAATACGCAAATTCTCTAAGAAAATATAAGTTGAAAATACATAC---ACATATAAAAGGA--CAAGCGAAAAAGCGATGT-AATAGTTACAAAAAAAATAATGCGAAAAAGCAAAAACTCTAAGAATAATATTAATTTGAAAATCAAGAAAACATTTCAATTTATTTTGGCCTTGGATG---GAAACACACTTTTGAAAGCTACCAATTCCCAATGCTAAATAAATATGA--------AATATATAATACATT-AATGAAT
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AGTCGGCGATGTGGAAGTGGTGACCTATGAGTAGGAACATTTTATGCCCCCAGTCATCTACATACCTAGGAGCTATGAGTACAGCAAAC
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ATCTGTCAACGACAAGATGTTTGGAGGCAACAGCAATGGGTCTCTCAAGTACATCAACCCGATTAAGCGAGTTGCGGGAAATCCTGACGA
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>CG9337 20851008 20851065|22955 chr2L 20850581 20851454 scaffold_4 5080018 5080843 - 27240|463 520
ATGAAATGGATCCCGAGTCGGCCAAGAACATTAACGGACTCTATCTGGAGGCCGACAG
TGGAAATGGATCCAGAGTCTGCCAAAAACATTCACGGGCCCAATCTGGAGGCATACAG
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GGGGGGGTGTGCACACATGTCACATATTGA---TCTCATTTATGATCCGTATCCAAAGTTTACAACAAATTCAATGTTCA-GTTAAGACT-CATTCCATTTGTGCATTGCTCAAGCTACACTCTTT-TTTATTTTTAT---AAACTTACTCACAGACAACAATTTTGAAATATTTTGTTTCTATACAAAAACTTATTTGTCTTTTAAATTTTCTAGTCAAGAGAAAACAAGAAAATTTTCAAACATGT---TGTGCAC-AACATTCATTTTTTTTCTTTGGTAGGCGCTTGCGCACGCCCACTTTAGCGACTGCTCTTTGCACTACTCAAGCGAATTGTTACAATCACAACGAATACAAAACTTATATAGAAAATATTACAACAATTAACAATACATTAATGAAAATTATGCCAAAAAGAATGCGATTTGCTGTTGCTGCTACGCCGACTCAATGTTCTGTGCGCCACTCAATTTTAGTTTAGATCAAGCGCATAGATCAATACTCTATGAACAAATGAATCAACACATTTCGGAGCTGG-ACTCCAAAATAAAAAAAAATCACACACACACACCTCACTCATTTGCAACACTCGCACACCCACATGTGGCAAGGCA--TGACAGCAAATTTGTAAAATGTTTGTGGCTGGTTAAAAGAAAATATATATATATAATGAATTATGTGTAAATTATATTTTTAGTTATTAATTAATTAAACTCTCTGTGTTGTTGAAAGAAT-TGTGTATGTAAACAGCATTAAATATGGCATATGCTATAGTTCATACCCA--TAATAGCCTAGCTGAAAAGTTTGATTAACTCAAAGAAAA-------------------AAAATATGAA----GTTAAAAAAATATGTATAAATATATTTG--TTACT--TGTTTCTGCGCTGTTGATAAAAGTTTTTAATTTACTTGGTTGACTATTGATACAAATTCTCAGATAATTATTGGTCTGAGGCTGAG----GGGAGCGGTTGCGGGTGCGCTCATATTAATC-------------------TGAACAGTATTTGGCAAAGGGCAACAAAGAGTCAACTAATTCATTATCTTCTGTATATATACAATTGTTTACACTGTTTTTCTATATAATTATATGAATTGTTCTCTATGTGTAGTCGTTGT--TAGGTTTCGATCATTTAATTTGTACA---ATAACCGACCATTATAGA-GAGACATCTAAGTGTGTTATACATAT--------------------------ATATACATACATATATATATATATATATATATAAACAATGATAAGCTGC-AACTGAAGTTATATATTATACAAACTGAAATATTACAATGAATAATATAGATATATACGTACATATTTAAACTATGCGTTGTTCGCTATTTGAATTATAGAGCGTGTTGTTTATTTATTTTCTATTATTATTTTAT--TTTATG-----AATTACAA---ATACCCACACATTCCAGTAATAACCAATTACCAGTGAAAGAAATACCCCGATTAATTATTATTTATT--TTCAAACAAAATTATTGCCTTATTATTTTAAAAAAATTAATAGTTATTGTTAAAATCTTTTT
>CG9339 20858922 20861341|22970 chr2L 20860414 20861515 scaffold_30 735189 736438 - 28128|0 1133
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AGCCATATAGGCCCGATTGGCCCATAGACACTCAAAACGAAACCAAATTGCCCGCCGATGTTCAAGTGCTCAGCTGAAACC------CGCACCTATGCTCCTCTCAGACCTACTCATAAACACCTACACACAGTCTATGCCCACACACACATATATACAGACACACACAATGTGAACGCTTGCGTTTCCGGCTCTAGCGGAAACACTAGGCAGAAGCGAAAGCTGATGATGATAAAGAAGAAGAAGATTAAAATTTGTGTAAACATTTATAAAAACTTATTTATAAATATGTATCTAAAAAGTAAAAACAAAAAAGGCAGCAGTCGTTGTCATCATAGCCGTTGTAATGTTAAATGTT------TAAACCCCAAGCAAAAACAAATTATATATTGTATAATGGAAATACTCTGTGAGTTAATGTTTCAAAATGCAAAAGCTTTGAAATTATATACATACAATAGTTGTTAT-----TCATAAAAAAAAAAAAACAAAACAAAACTATTTATATATAAATATATATAAAAT-----------ATGTGTACATCTAAATGTAAATCGTAAAACGTAAACCTATTTCTATATAACGACTTTAAACGGCAGACAACAAACAAAATATATTCCTTAAATGAAAAGAAATGCAAGCAAAA----ATATCAAAAAATCAATTGTCATGTTAAATTTGTCTGCACATTTTGATAATAACTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATGATTATGCCTAAAGTAATTTGTATGTTTACTTTTATTATTATTTTTCTGCTTTCTGTAAACCAAATTTACTGACTTGACTGAATTCGTTATAAATGTTATTAATATTATTATTACATATGTGTATAAATTATATACTTTGTAAATTGCATTGGAAACTTCTTA--TTTTCTTACTATT------TCTAGTTTCTTTATATATATATAAACT--------ACCTATATTTACATATATATAT---------ATATATATATATATATATAATCCATATAAAATTGAAATTTGCAGC---------ATGAATTCAAAGCTAAAACAC---AACA-CAAAACTTGCAGTGCAGTGTAATAGTTATATAAACGTATGCTATAGCTACGATTAGA
>CG9342 20906684 20906831|23022 chr2L 20906705 20907821 scaffold_30 794942 796051 - 44394|0 129
ATTCTACTCAAGAGATTATTGGAGATTCCTTGCATAAAAACTATATTTCTATGTGAA-AACTCAGAGATTAAGACTCGATATAGTTGTAAACTTAAACGAACAAAGA--CCATTTAATTTTCAAATGCAA
GATCAAAATTTGCATTTATC---TATACTTTAAATAATTA--ATTTGGCTATGTAAACCGCACAGAGAATAAGACTCAAAGTAATTGTAAATT------GGCAAAGAATTTGTTAAATTTGGTAGTGCAA
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ATCAAATCGTGTAACCACTATTTAATTTAAAA-----ATGCGTATTGA-------ATATATGTATTAAGTTTTTGAAAAACGGGAACATTTTCCATATATTAGTTGTACATTAAATATTTCTTATATAATCAG
TTAATTTTATATACTCTATATATAATACGAAATAATTAAGTATCTTGAAGAAGTTATATACCTATTCATTTTGTCAACTAC--------TTTGAAAAGATTCGAT-TCCATTCAATATT--------------
>CG9270 20917045 20917176|23030 chr2L 20916961 20917188 scaffold_35 215320 215537 + 280|87 224
TTAGAGCGTATATAATTCAAATATATTCCATTTTCCATTTTT-----TTTGTTTCTTAAAAGCCG-ATTGCGATTAATGAGAAATACAATTTTTTGATTACAATGTTGTTATTACAGTATTGTGGTATACAAACAAGA
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>CG9266 20953112 20954078|23080 chr2L 20953706 20954307 scaffold_30 837157 837749 - 8249|0 416
TTAATCCATTGATTTCCAATTTTTTTTCAGCTTA---AATAATTCACACAAATCATTTCAGCAATAAATATGAATTCTTTCGCAGCATTTAACAATGAATATTTCAGCAA------ACAAATGTTTTT--------TTCAGCCAAGGTTAC--CTTATTTGTTTTAAATAAC-------------ATGGGATCCAATTACAAATTGATGTGCAGGTAATGAACGTAGAAAGAAAAAATTGAATCATTTTAATTTGGAAACGC--------CACTGTT---GCAAACTTTGATTTGCATGTAAAGTCATAAATAATTCATTTTAACACATCCAACATTTATGAATAATTTTTTCTGTGCTCTTTATATTCTAGCTGTCGCTATTAATCAAATTATAC-GTTTACTACATGCATTTTTA
TTAATCTATTGATTTTAA-----TTTGCAGCTTACTGAATAATTCACACAAAT----------ATTACAATTAATTTTTTC-CAGCATTTAACATGGCATATTTAAATAACTATGAACGAAATTTTTTGATGAAAATTCCGTTTATTTAATTTCTTTTTTGTTTTTGTTATTCCCCAGCTCAGCAAATGGAGCTCATTACGAATTGATGAGCTCGTAATCAGCAGCTACAGCTACTTTTAATAAAATTTAATTTCAACAGGCATTTTTATTACAGTTTTCACATTTTCTGATTTGCATTTAA--TCATAAATAATAAATATTTACACATTTCACA-----GGATTTCTTTTT--------------------------CTATTAATCTAATTATACAATTTCATAGACTAGTTTTTA
>CG9265 21045295 21045833|23176 chr2L 21043379 21045511 scaffold_30 925905 927965 - 44976|1974 2238
ATTTTTGTACTTATATGAATACAATC---------------GCTGAAAGGAGCTGTCCAATACGAAAACTGAAAGCTAACTTTGTTATACGTTTACTCGTTTTTTAGCTGTAATAAATTTTAGCTCATTTAGCGTAGATATACACGAGTTTTTGAACTAATTCATATAATT-------TCTATGTATAAAAAACAAATTTATGTTCTAAATATATTATATAA----------AATTATTGATCTTA----------------ATA
ATTATTTTACTAATAATAACTCAATTAAAACTTAGTTAGCAGGCAAAACCATTTGTCAAATATACAAA-TACAAGTTGA-------AAAAGTTTTCATATTTCTTAGCTAATACCATTTTGTGTGCATCGAATGTTTAGTTAATGCTACTATACAAATAATTTATCGAAAAAAACGAATCTATTTGAAAAATATAAAATAATATACAAAAAATATGATGTATGAAAATAATTAAATATTGTTCTGAGTTTTATTTTACAGAAATA
>CG9265 21045295 21045833|23177 chr2L 21045609 21047897 scaffold_30 928207 930685 - 44079|0 309
GCGCCCAACACCAAGGGCGCATC----ATCCACTGCTGTTGTTGTATTTACATTATTCTTTTTCCAACGTG-GAGGTACGAGCATGTGTAATTGAATTTCGTGTTTTTGGCGTT---------------------------------------------------------------------TTGGCCGCGAGGAACCAA--TACTTAGTCTAAGCTACGAATCTAGTGATATTATATTTAGTTAAAGTAGA--TTGAAGGG-----GAAAGCGTTTAG--CCTTAATTAATCGAATTGTATTTTTGTA
G----------GAGTGCCGCTTCACGTATTTGTTGGTTTATTTTTATTTGTATTTTTTTTTTTGCATTTTACGAGTTATG----TGTGTAATTGAATTT-GTGCTTTTGGCATTATTTTTATTTTTTTTTTCTTTTCGTTCTTCTCCATTTTTTCGGGCAAGCGGACCATCCGCGTTGAGAGATTTGTGGTCAGCAGCCCATTTAGTAATTTTAAGCTACGAGTCTAGTGATATTACATTTAGTTATGATGGGCCTCGACGGGCCCTCAAATACGATTAGTTCTTTAAAATGCTGATTCGTATTTTTGTA
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ACGTAAA
ATGTAGA
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ATCTCCACGAGAAACGACAACAAAATCCACAACCATGACGATGCTTTACACATAGTTTCATCCCCAACTCGCGCTCTCTCGCACACATTCCAGTTTATATTTTGTTTTTGCTCAACTTATATAATTTCTCCTGGATATCGAATAAGTAAAGCCAATTTGTTCTCGCCACGCCTAACGTCTTGAAAGCTAGTTTATCTTATGATGTTTAGTTCTAATTTGTTGCAATAT------GATGTAATTATCTGTATGTGTATATTGTTAATTGTTATTATTTAGTTGTTTAGCAATTATTTAATTTTAAGTTAAAAGTCCCGCAGCCCAAACACCTATGTATCCTTG-TTAGCCAATCTTAAGCTTTAATTTGATATTGATTTGCATTTACATGCATATATACACACACATTATATATATATATTTATACATTTACCTTACGTACATCTTGTGTATTTAGTAGTCCATTGATTTTGTATTTATTTTGTGTAATTTTTTGTACTTTTACCTGCTATTATTTATACATTTATACACCCACATATGTTTATGCTGTATATAAAATCGAAAAACGAAAATCTAA
>CG9252 21132727 21132891|23250 chr2L 21130703 21132801 scaffold_23 506306 508540 - 84829|2213 2287
TTATCAAATTATTGTTCCTATTTGATTATTACAAATATCAATAAAGTAAAATTTGCGTTATACTTTCTATTTAAA
TTAACAAAATATCGTACAAATCACGTATTCTGGCATTTTACACAATTGAACTGTGTATATCAATTATTTTTT---
>CG9252 21132727 21132891|23251 chr2L 21132845 21132956 scaffold_23 509040 509156 - 600|0 46
GCAAATGAAAATGAATGAAAAGTATCTAACATATACTTGACATATAT
GCTATAAACAAAAGCTTAAAATCCTTAAACATATAGCT-ATATATAT
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CTGTGGAAGGGGATGTACACCTTAGGACTATAGCTACACTGCAACTGGCCGCGTGCATTGTGCAAATATTTATGATTAGTACAATTTTGACTTTGGATTTCTCTATATCGTCTAGAAATTTTTAATTAGTGTAA-TACCTTGTAATTTCG------CAAATAACAGCAAAACCAATAAATTCGTAAATGCACACATT
-------AGGCAATTCGCG------------------ATTGTAATTGGCCGAGTGCGTTGTGCAAATATTTAAGATTAGTAAAATTTTGACCTTTAATATTGTTTTATAATGTAGACATTTTAAATTAGATTAATTGTAATGTACTTTTGGGCCAATAAAATACGTCGATGCGTATACAT--GTACATATACACATT
>CG9249 21145023 21145109|23262 chr2L 21144295 21146227 scaffold_23 516263 518185 - 53603|742 854
ATTCGTATATTT----ATTTAACTAAAAGCTAAGTCACGA------GTGTAACAACTAA-GTAGTAAACTAT---------------TCGTCACCCGAGCGTGGTTTCTTAAA
TCAAATTTATTGTACAATATATCTAAAAGCTAAACTCCTATGTCATATGTTATAAAGAATATGATAGTCTATGAATCATCATCGTCGTCGTCGTCCTGGCGCGGCTTTTTGAA
>CG9247 21148228 21148604|23264 chr2L 21146917 21148326 scaffold_23 518746 520219 - 39900|1402 1508
ATACTTTAAATACTTGCATTATTCCAATTCGTAAATTCGCGTA-----TTATTTGAATTCACGCATGAT---CAAAACTGAATAAAAGCAATGAATAGGATTGAACA
ACAGTTTATATATTTAGATAAC----------AAAATAGCGCAGTACTTTGTTTAAAACTGTGCATGATGTGCAAATATAAAGCATAAGAAATACTGTTATCAAAAT
>CG9247 21148228 21148604|23265 chr2L 21148468 21150680 scaffold_23 520581 523013 - 73814|0 136
TTGAGGAGCTGGCCTCTGTTATACCCATGCTCCTTTTGATGGATAGCGATTATCACGAAGACGACAAAGGCGTTCGCCCAACATTTATTAAGTGCAAATGTTATATGTAGTTGCAAAGAGTATTTAACATATATTTA
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>CG9243 21153642 21154271|23267 chr2L 21151241 21154166 scaffold_6 5409287 5412196 + 130908|2443 2980
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CAAAATAAACATAAAATAATGGCAAACAAAAAGCCTACGCGTGATCTGATCGGCATTATTTGGACCAATTTTTGGCGTTCGTTCTTGCCGCGTAAGTATCGTGGCGATTACAAAGGCGACGATTACTTCGGAAACAAATACTTCGAGATACCAGCCAATCCGGCTGTTGGCCAACGCAAA---GAACGCTGGTTCGAGCCGGCCGATAAGGAGGCCTTTGACCAGGAGCTGACCGCCGAATGGGAGGCCTGGCTGCGTGGTCGTCGCGAGGAACCGCCCTCACGCGATGAATTGATCAAGAATCTTCAAGTCATTGAGATGAAGAAGCGCAATGCAGCTGAGCTGGATGCGCAGTATGCCAAGGAGAAGGACGCGGGCGCACTGCCCAAGCAGGTGGAGGGCGAGACAATTGGCACGTATCCCAAGTACAAGGATTACGAAATAAATCCCGGCAAGAAGCCAATGGATGAAAAAAAATAAACATTGTTTGTGTATTTTGAATTTGTTTGTTAATATATGTACGTATTACTAGTTTAAC
>CG9243 21153642 21154271|23268 chr2L 21154169 21157000 scaffold_6 5412392 5415336 + 52889|0 144
ATT------------------------------ACGCTTTTAAACCTGCCGGCATTTTGCAACACCGCCAC---CAGCTG-TTCATGTCATAACAAAC-GCAAGACCTAACCT-------CAAATTCTAAAATAAATTTAAGTTC
GTTTTTAACATTCAATATTTAAATATTGCGCGCGCTCGTTTCGCCGCGCTGTTGTTTTACAACACTGCCACATAAAGCTGCTTCATGTCATAACAAATAGTCACATCCAACCTGAATTAGAAAATTACAAAATAAATCCAATATC
>bur 21161976 21162466|23273 chr2L 21160651 21162247 scaffold_6 5419513 5421251 + 6567|1511 1919
ATGAGGCGCAAATACAGA-ACTGCAACTGCCGCTTCGAAATT--TAAAAACAATTCAGGTTCTTTATATCGATGATGCACGTATGTGTATCAAGATCTAA----AACAGATGGTAAACTATTTGCCAA----TAACAC--------------TTATGTACATTTT---------------------CATGT-----------------TTTGTTCCTTTTGATAAAAGGAATGTGCCCACAAACCACGTAACAAACA--------AAAAAAAATTAATTTACGCA-TTTTTAGTTATATACATA------------------------------------------------------TAATATATATA-----------ATATACATAATAAATAATTGCAAAATCAC
ACAAAACAAAAAAACAAACACCACAACCAACAACAAAATATTAACAAAAACAATTCAGGTTTATAATATCGATTAT-----TGTGTGTAATTAAAAGTAACGCGAAACGATGTTAAACAACAAACAAGAAATTAACACCAGATGGCAACAAATAATATATATTATTGCTGTATATTGAAATATTAACATGTTTAACCAGCATGTGCGATTTGTTCCTTTTATGAAAAGGA----GATTACAAAACACATAAGATACATAAGTAACAAAAACAATTTATTTACGCATTTTTTAGTTATATACATAATTATACATATATATACATATATATATATGCATATATATACACACACATAAATGTTATATATATATACATGTATATATACAGATATTAAATTAATGCAAAACCAT
>bur 21161976 21162466|23274 chr2L 21162334 21163545 scaffold_6 5421341 5422602 + 56060|0 165
TGCGTTC-AAACCAAAATTTTTAACAGCCATTTC-ATAAAAATAGATGAGAGAAAAAATAATCAAC-------------CAACCAATAAGCGGCGGGCTCTCGATAATAGGACAATGGCC------------------AATCAATGGACGGTCAGGAAGGATAAAG
TGCGTTCAAAACCAAAACCTTTAACAGCCATTTCAATAGCAATAGAGATATGTAGAAACAATAAACTACTACTGCATGGTAATTAACAAA-GAGACGCATGAGACAATAGCAGAGATGCCGCCTGCTGCTCATCCAAAAATCCTGGGACAGCTAACAGCTATTAAG
>Ret 21169987 21170765|23278 chr2L 21166297 21170643 scaffold_6 5425209 5429747 + 94508|4027 4789
TAACCGATTTCGATTTCAAATACTCCCAAGCATTTATACACTATTTTAACT---AGCCAAAGACAGCCTTAGTTTTTTTTATTATTACTTCTTA-----TTACTTTTG----CTTCAAAAAGCCATATTCTTAAAAGATAATTAACTTTATTTGTAAATTGC---CAAGTTCGTCCTATTATATGCCAGAAGAATGAATGGTTATCCCAAAGAATTTTTACACTCAATAAATAAAGTTTTTAAAGGAATATTTGTGCTTCAAAAGGGGTTTTCTGTATTTG-GATATTT----ATTTCAATTTAAGATTGTAAAACTCTGCTAAAGTAAGCTAGGTTGATTTATAATGT-------------------CCATTTA-ATGTAATAGCAGTCAT----AATATAAGTTTCAATTTA----TTTACGCCATAAGCTAAACAATCATAAGTAACCTTCATTATTA-ATCA----TTGAGTACATCTGGTACATCTTAAACA-------------ATCTCACAGGCACTCTAGATATTTAGGTATTCGAAC-------------CAATGTACTTATTTATCGATGACTTT---TATGACTTTAATGAATGTAAATACTTGCATCTACTGCATATGTTTAAA-------TTAACTTTTAAA----------------AATTATTTGAAATAATATAAAATAAAATAAACCAAATATAACAGATAGCGGCCAATTGGGGCATC-ACTCTTCATCGGGTACCAGCAAGTTG
TATACGCTTCTTGTCGCAAATACACAAAAAGAT-----CATGATTTTAGCTTTAAGCAAGGGAAATCAAAACGTTTGCGTTGTGCAATTTCTAAAATACTTATTTTTGAAATTTTTTGAAAGTCACTATCATACCAAATATTAATATTTATTCAAAAGATCCTTTCAAATTTG-CTTAAGATTTGCGCACAATACAAAATTTTAACGCCAAGTATTTTTA----------GCACCGTGCTTCAAGTTATGCACTTGCTTTTATATATACTATATATATATAAGAAATTTGACCATTTGTACTTATTGATGTA----TATGCCAAA---AACTAGACTG-TATATAATATATTAATATAAATTTGTATGCCATTTATATATAATAATATTCAATATAAATATATATATAAAATTAAAAATTTGTTCTAACTGTTAGAGATACGAAGCTGAAGGTCCGGATTATATCAAGAGTTAAGATTACCACGAGAATTTTAAATATTTAAACTTTATCGTCGGACAAACAATCGGGACATCGGCGGTTCTAATCTAGTAGCAATTGTCAATTTGTATATTCATTTATTATATTGGTTAATAGTTAAATGTGGGCGAATGCATAGACGTATGATGGGTATTCGAAAAATGGCGCAGTTTTTAACCCGGACGATGCCGGGTAATTTTTTTTTAGTATATATAT----ATATATTTAAAATACAAGAAAGTAGACGAACCCCATGTCTATTCCTCCTCGGGCACTAGCAAATTC
>Ret 21169987 21170765|23279 chr2L 21170644 21171830 scaffold_6 5430312 5431576 + 48847|0 184
AAATAG-----------------------TGTTTCCCAGAGTTC--------TAATCTC-----ACGCCTG-TTTTTCAGTTCAAACTGTTTGTTGATTAGTCTTAGTTTTACATATAAT-CAATTAGCTTTACGTTGACGCCAAA-------------------------TATGGATTTTAAGA
AGGTTGTCCTCCATTCACTTTAGTCACGTTTTTCCCCAAAATTCATACAAAATATTTTCCAATAGCGCCTGATTTTTTAGTTCAAATTGTTTGTTAATTAGTTTTAATCCTATGTCTATCATAATTAGCTTTATAATGTTGCCAAAATTAACTCGAATACTCTGTTTACAGTGTGAAGCTTATGA
>CG8678 21200282 21200658|23305 chr2L 21199957 21201338 scaffold_2 6448933 6450521 + 31432|411 935
CTACGTAACCGTAACATCAAGGA---TATGGTTCGAGATAATAGACAG----------------------CAGAATTTTTAAGCA----------------ACATTAGTTAATTCACCTTAGCCAAGACGCCCCAAACAATCGT-------TATTTA----TATCTACCGAAACT-------TTCTATATTAAGCG------------AAAATACTCGTTTG----------------AAAAGTATTTTATTT-TATATGAAGCATCCCTTAAAATGTACATCTATGGATGTATGTATGTATATAGAAATGTACCTAAAA--------------------GAATTTCACAT----AAAAATCTAGATATTCTTGTGTTAGTTTATTTTTGCCCTAAACCTTA---GGCACTAAATCAAACTCTGTATCCTTTAGAAAC------GTAGGTA------------------TAAGTGTATAAAATTACATAATAAAATTGTGCGGTAGAAGCTC---------AAAA
CCACGTCGGCACAGCCATAGGGACATTGTGTTTCTGGACAAATCACAGTGTGATTAAAAGCGCGCGCTCTCTGCATTTCTGAATATCCCAAAAAAAAAAATATATTGAAAAATTTACGAAAAAAAACGTACCCAAAAAAAATTTAGCAAAATATTTAAAGCAATTTAACTAAGTTAAAATAATTTTAAACAAAAAAAAAAAAAAACACAAAATACTCGAAAGAGAAAAATTAAAAAAAAAAAGTATTTTAGTTATATGTAATTAATTTTTTGCTCTGTA---ATTTGTTTTCAACAATTTGTATATAATTGTAACTAAAGTTTCTATTAAGAACTCCTCCGAATATCTCATTCCGTAAGCTCTGCTCTGTCTCTCTCTCCCTTTCTCTCTCTCTTTCTCTCACTTCGCAATTATGAAAACTTTGTATAATATAAATATTTATTAGTAGGCAAGGAGCAACGTTTTTCTTTAAGTGTATAAGTTCAAGT------ATAGTTCAAAAGAAGCTCAAAAATCCAAAAA
>CG31626 21220077 21220237|23324 chr2L 21220079 21221359 scaffold_2 6471193 6472488 + 36152|0 174
ATGGA--CATCAGGTGGATTCCAAAGAGTTCCGCAGC----CATTTGAGTGGTGACAGCTTGTTAAATTAACAAGTGCCGTC--GCCCATTGTTGTTGAATATTTGTTG------TTACGCAAAGTTCCCGTTGAGATTTT-AGCTAATAAA-AAAATTACAAAACAAAAAATAT
GCGCATCCACCA----------------TTCAGCATCTCCTCATCTAAGGAGCGCCA-TTTGTTAAATTAACAAGTGGCCTCCGTCTCCTTGTTGTTGATCATTTGTTGTTATTATTATGCAAAGTTTCTGTTGAGATTTTAAGCTAATAAATAAAATTAAATAATATATAAAAT
>Mio 21273670 21273884|23376 chr2L 21273616 21274284 scaffold_7 204275 205003 - 20141|81 345
CCGTTGATGCTGATGTCCTTGATATGAATTT--------------ATTTAATTCAATCTTTATTTTAACAAATAATT---TTTGCTAACTGCTCAGCACTAATTGTACAAAATGCCTGATGAGCATATTTTTATACAAGAAATGGGCAACCGGCAACCAATAAATAC------------------------------GCAAAGCAGCAATTAGTGCCTA-GATTCT-TGACTTAAGCGTATAATAAAC-TAACGATTTTACAAGA
CCGTTGTTGCTGCT---CGTGATATGAATTTAAACCAATTGCTACACTAAATCCAATGTCAAT----GCAAACCGTTCGCCCTGCTGGCAGCT----ACACATTGTACAAATTGCCCCGCGCG--------GGGGCAGAAAATGCCACAACAGCCACCAGCAGACGCCGCTGCAACTGCAACTGCAGCTGGCGCAAAGCTAAGCAGCATATAGTGCCTATAATTCTATGACTTAAGTGTAAAATAAACGTAACGATTTTACAATT
>His2B:CG33910 21405852 21405881|23511 chr2L 21405811 21406547 scaffold_1633 17 782 - 34313|45 81
TTTTCTCCTGCGAATG-------CGGACAATAATCCA
AATTCAGCTAGATGTGCATTGTACGGGAAGCAAACAA
>His4:CG33909 21407123 21407168|23515 chr2L 21407071 21410542 scaffold_18 1180517 1183711 - 82678|52 97
AAAGTGTACATCCTGTGTACCCCTATTAAGCAATCGGTCCTTTTCA
AAAAAGGAAAGATAGAATTTATGTTGACACCAATCGGTCCTTTTCA
>His2B:CG17949 21410718 21410783|23517 chr2L 21410713 21411845 scaffold_1633 17 1183 - 56552|5 81
TTTTCTCCTGCGAATG-------CGGACAATAATCCAAAAC----GGCCCTTTTCAAGGCCACAATGTGTTATACCA
AATTCAGCTAGATGTGCATTGTACGGGAAGCAAACAAAAGCAAAAGGCCCTTTTCAGGGCCACAAATCTCTTTTTCA
>His4:CG31611 21412185 21412230|23520 chr2L 21412130 21415284 scaffold_18 1184881 1187795 - 76757|57 103
AAAGTGTACATCCTGTGTACCCCTATTAA-GCAATCGGTCCTTTTCA
TAAGAAAATAT----TGAATTTATGTTGACACAGTCGGTCCTTTTCA
>CG2201 21602356 21602570|23668 chr2L 21602277 21602366 scaffold_14 24501 24578 - 2223|79 89
CATAATTGAAA
CAAAAGAAAAT
>CG2201 21602356 21602570|23669 chr2L 21602554 21602693 scaffold_14 24908 25052 - 3606|0 16
GACAAATATCTGAACCT
AATGAATTTCGGCACTT
>Df31 21614183 21615326|23677 chr2L 21614181 21614279 scaffold_7 4599412 4599508 + 2225|2 98
GGCAGGAAAGGTAATGGCCAGTAAATCCAGCATTCAGCAAAATCAAGATTCGAGATTATTAAAAAATAAAATGAAACGTAAAAATTAAAATCAAACT
GGCCGACAAGCT--CGCCTATCAAGTTCATCATTCATTAAATATAAAAGGCAAGGTTGTTCAAAAAAAAAAAAAAACATAATTGATAATGCAAAAAT
>Df31 21614183 21615326|23678 chr2L 21614299 21615405 scaffold_14 37017 38140 - 22739|0 1120
AGCGGAAGGTGGATGAGGCTGCAGCCAAGGCAGATGAGGCCGTCGCCACGCCGGAGAAAAAGGCTAAGCTTGATGAGGCCAGCACAAAGGATGAGGTTCAGAATGGGGCCGAGGCTAGCGAAGTGGCCGCCTAAGG-------------------GAATCGCCCGCGGAGCAGCAAACTCAGTAATCTACTTATTAAATACTTACTAACACAAAAAAAGCA-----------AATCACAGAAATTACGGTTCTACCGCCAGGAACCCGGAC---TGTATCCATTTTCCGCTCTTG----------------TGAGCGGGTGATACGTGGGTGGCTGCTTGGGTG-GCGGGCGCAATTCTCCAATAACAATCCGGCAATGGGAGCGTAGTTTTATAGCGTACCGGTTCTCTCTCTCTCTACTAACAAACAACCTACCAACCAACAATACCGGCAACAAACGAAAACAAAAAATCCATTATTATTTAAAAACTTACTTA--------AAATCTTAACTTTAAAG--CAAAGTATATATATATATAAAGC--------GAAGGATTAAGAGAACAATATTAAGC--GAAATTAAGATGCGAGACCCTCTATGTTTTAAGAATAAAAGTTGTAAAC---AAAAGCGTCAAATTTAATAATTGTA---AAAAAAAATACGAAGCGAATGAAACAAATTGCAAACAAAATCTTTAAGTAAGAAAAACATCAAAACAATTACGGCAAAATAACATATGTAATCCTTTACAA----------TTTTTAATTT----TACAACCGTATCTTATTTTTGAGTATGAATATTTATATCGAACAAAG--TAAAACTAAAAATTCAGTAAAATGTAACAAAAAGCTGCCAGCAACAACCCCAGAAAAATGT-ATGCCAACCGGCTAAAAAAATACTACCACATAGAAACAATAAAAAGTACGAAAAACAACTTTTACAGCAATACTCTGAAATGTTTATTTTTAAAATGCTTTCGAAATCGTACCTTTTTTATTTGTAATCAAGGTACCACCTATTTCACATTCCCAATTACATTTTATTTACTTGTCTAAGCCTACGAAATAGTCTGCGACGAAACTCTCATTAATGTTCAAT
AGCGAAAGGTCGACGAGGCCGCCGCCAAAGCCGATGAGGTCGTTGCCACGCCGGAGAAGAAGGCGAAGCTGGACGAGGCCAGCACAAAGGATGAAGTTCAAAACGGTGCCGAAGCCAGCGAGGTGGCTGCCTAAAGTAGCAAACCGCATCGCATCGCATCGCCCGCTCAGCAGC-AGCACAGTA--CTACATAT---AAATTTACTAACACAAAAAAATCACACACACACACAAACACACAAAATGCGTTCACACACATATACGCGCGCACACACACACACACTGGCAGCACATGAGAGTACACTAGTGACCGAGCGTGTGA-GTGTGTATGTGTGCGTGTGTGTGCTGGCGC--TTCTCTAACAACAATCCTGTAAAGGGAGCGTAGTCTTAAAATGTACCGATTCTCTCTGACTTTACTAACAAA---------AAGCAACAA----------ACACAAGAAAAAAAAATCCATTATCATTT-AAAATTTACTTAAACAAAACAAAACTTAACTTTAAAGAAAAAAGTATATATATATATAAAAACAAAAAAGAAACAATTAAGATGCGTTTTTTAAGCAGAAAACAAACAAGCAAAA--------AAAAAAAGAACACGAGTTGTAAACAAGAAAAGCATCAAATTTAATAATTATATGTAATAAAAACTCAAAATGAACGATACAAAC----AACAACTTGTCTTGTAAAAGTAAACG--AAAACAAAT---TTAAAATTACGCATTT-GTCATTTTTAAGATAATTTCTTTTTTAATTTTATGTATGATCCTATATTATATATGAATATTTATATTAAAAGCAAAAAAAGCTCTATGTTTAAAACTCGAAAGCAAATCCTAGAACAACAGCAACAACAACACGTAAAAAACACGAAAGCTGCCCACTTCCAGCCCCCTCCCCCTTTG----AGTAATAATTGAGAA----ACCATATAAAGAAATGCGATTATATATATA-----AACATAACTTGTATATCAAATTTTTTTATATAGCAATCAAATCAACAACAGCGCCAACTCGCCAA-----------------ACTTAAGGAAATGTAATAATGTATTTGAAAAATTTAAATAATGTACAAT
>CG2225 21651385 21651429|23722 chr2L 21650091 21651420 scaffold_14 58899 60335 - 15686|1519 1561
AGAAATAAAAATGACTAAAAACAAATATAATCCACG-------
ACAAATAATAATGACAAATTACAATAACAATATGCATACACTC
>CG2225 21651385 21651429|23723 chr2L 21651421 21653191 scaffold_14 60543 62607 - 4602|0 8
TAGCACAAA
AAACAAAAA
>CG2225 21652802 21653054|23723 chr2L 21651421 21653191 scaffold_14 60543 62607 - 4602|1601 2058
AAATCCCCTC---TTGGA--------------TATACCCCTTGTTT--------------------------TATATACACATACATATGTGTATAGTAGCATCGAAAATT-ATAATAACCGTGC------------------------------------------------------------------------ATTAACTTCTATCGGGTCGAAACCTGCCAGTTCATCTTTGCACTCACCTAGTCACTCACCTGCTCATTCGATCAGCAAAGCGCTTGTG-----------------TTCGTTCGCCTTGAAAA----------------------------------------------------------------------AATACATAAAATTTCGTATTGGTCATACAGTAA-GAAGACAATTGGAAAATTCAAATGCACA-AAAGCC
AAGTCAACTTGTTTCAGACGAAGCCAAAACACTGCCCCCCGTGTTTCCCCTCACTCCAAAAAATACTATGGATATATATACATATTTATATATATGTTTTTAAAGAACGTTGATAATAACCGCACCTACGTATACACTATGTAAAATGTAACGCTTAGGTATATGAAGTGGGCGTTGTTAAACGCTGGGTATACACTATTCCCTGCCCACGACCCCAGAGTCACCTGCTCATCCAT-CACACACACACACACCCACACACACACGCACACACACAAGTACGTTTGACTTACTCTCACGCTCGTTCGCTCACCTTGAAAATGTCACTCAATATGCAAGCAATTTATACACACACACACACACCTACATATATATATGAAGCTATCGTACATATATGTACAACT--ATATCGGTCATATAAAAATGCGAAAAACTGAATAATTCAAATATGCACAAAGCC
>Ef2b 21665690 21665903|23732 chr2L 21665663 21667868 scaffold_14 73176 75357 - 135176|27 254
AGCACCACCACCCGATCCCCCACAACATCCAAGTGCAGCTGGCTGA----------GCGGAAAAGCATAGAAAAATATGGAGTGACCGAATTTAACATCTTTATTCGGCAAGGCACTTGAAACATCGCCTTTGGTCAATGTTTTAAAACAAATAAAAACAATAA--AAATTTTGATGATTATGAATTGTATAACATTAAAT--CAAGAATAAATCAAGTAAATGATTT
GCGACTCCAACTTGGGGCTCAACG------GGCTGCAGCTGGCTAATAACAGGCATGTGGTGGAACGATCAAAAATGCAACAACAACAACAATAACA-------TCGCAAAGGTCGCTG-----TGGCCGCTGG-CAGCGTTTAAGAAACACACACAACATTAAAGAAATTTTGATGATTATTAATTGTATAACAGTAAACAACAAAAATAAATCAACTAAATGATT-
>Grp1 21728844 21729175|23777 chr2L 21728157 21729638 scaffold_2 4311614 4313224 + 29552|775 1235
TACTAACAAGCAGCTCGGCGAAT-------------------CTTTTGTCTTGGATCTCAGTGAAACTCTGCTACTCGCT----------TGTGTTGCTCTCTACCCCTTTTTACACAAGTGCAAA----TGCATATACCAATTATATACGTTGTTATGTGAGAGTATTTCCATGT---------TGAACCAATGC-------CTGTAATTGTTTTACCTTCCGCA----TTGGCACA-----ATCCCAAATA---------------------------ATGTCTTTGTATTTTGTTTGATT--GACTCGAAACAAGCCATCACACGCCGA---CGCA-------------------------------CTTTGTCTCTATTGTTGTGATATAACTTATAAAAAATTAGCATAACCAAAATTAAAA-------TAATTTAAAATGGCGTAAAGTA-GAAA
TATTAGATCGGCGCTAGACGGGCCTGCCCCCGATGGGCGTCACTCTTGTATTGGATCTCAGTGGAATATTGCTGCGTGCGTTCGCGTCTATGTGTTTGTGTGTGGCTTTGCCTACAATAATCTCGCTCTTTGCGTATAGTACGTGTGCGTCTTAGTGTGTGTGTGTGTGTGCTTGTGTATGTATATGTATGTGTGCTATTAAACTCCAAATGTTGTACTATGCCCAACGTTTTGTATATAAGTATCGTATATATATATTTAATTCAATTTGTAGTCCGATACGTTTGCCTTTGTTATTTGATCTAGACTCGAAAGAGACACACACAAGCCCAACTCGCACAAACACACACACTCTCATTCACACACCCATCTTTGTCTCTATTGTTGTGATATAACTTATTTACATTAAGCAAAATTTAAAAAAAAAAGGAAGCAAATATAAAATGTTTAATCGAATGAAA
>CG31612 21749882 21750167|23797 chr2L 21750054 21751725 scaffold_2 4365969 4367762 + 30501|0 125
GAAAATATTTTAGGGAACGCTGTTTAAA---TTTAAATAATAATAGATTTTATCAACATCCTAATATCCTTTCATTAAACTAAAACATG-----AATTGATATTAAT----TCTAAAATATTCGTT
--AAATCAATTCCATAAGGCACTTGGAACTCTTCAGAGCATGGTAAGCATTTACGAAGACTTATAAATAGTTTAATTTACAAAAAAATGATACTACTTTGCATTAATAAGATATAAAATAATTGTT
>CycK 22115851 22116113|24164 chr2L 22116060 22117317 scaffold_14 479506 480837 + 54838|0 55
TAGATGCAATGACTAATAA-ACAAGTAAAAAAAATTTGT-ATATTAAAACTAGCGA
TAAATGTCACGCCTAAAACTTTTTGTAGAAATCACTTGTCGCGTTAAAGTTAGGGA
>CG1832 22153557 22154144|24213 chr2L 22153554 22155673 scaffold_14 543712 546029 + 74164|3 758
AT----------AGTTTAAATGCAGAGGTGAC--------------------------AGGCAGCTTA--------------------------------ATGAAGTCACAGACAC---TGGAGTCCA-CCCTGCTTAGCTTCAGTTTATCGAGCGTTACTATGATC-----ATCTGCCTC-------CACCTATGCTAGCCCCAGAACCATCTCTAAG---GGCGCATATAT---CACCACAATGATATTAAAGAATAG-----AAAACGATGTTC-------CATCGTTAACACTTCA------GCTGCATATGTCCTTTCTCCACT-------TTCATGTGGGATCTTCAAAAATGGGC----GAAAC--------------CCAAAAACGC-TTTTTACGATAAGCATACAAA------TGAACCTAATTTATTTGATAGCTTGTATAATATACTTAAACATCTTTAAACATTAAACGCATATATGTATAGGCATCGTATTTATAAGTGTTATAGGCTATTCTCTTATACAAATTGTAGGTGTAA--AATATGGATTTATTA-----------GGTGACGATACGAGCAAATCCGATACGTATGAATATGCACAGGTAATAAACACACAC---ATATAAGTTGAAAGTTGTAAGCTTAAATATAT-TTTAATTAAATCTATCTAATATAAGTATGTAT-TAAATAATGC----------ATAAAATCAAATAAATATTTGAATAAAATACAA
ATAAGAGCAACCAATGCCAATGCCAAGACGACCAACACAGCGACGACTACGGCAGCGGCGGTAGCCTATCAATCGGGATCGGGCGCAAGCCAGGAAACGGGCGGAAGCACAGGCACATTTCCAGCCCAGCCCTATTCAGGCTACTACTATCAGGAGCAACAACGACAGGAAGAGCAGCCCCAGCAGAGCGCCGCCTTTAGTGCTAGATCAGACTATTAAGCTGGCGCCTGTACATACATCATCGAGACAGAGGAGCATCGTCATCATCACCATTATCAGCTAGGCACCATTAATGTTTCATATTATGATCATTATTTTTTTTTTTTAATATCGTAGTTCATGTAGGGCTCTATTAATTGGGCTTGGGGCACTCAAAGGGGTGCCGCCAAAAACGCTTTTTTACGTTAAACTAACAAAACGAATCGAACCTAATTTATTC-ATAGATTGTAACATAG------------------ATACGGCGCA-ATATGTG--------GTACATTTAAGTGTTATAGTCTACTTCCGTATACAAATTGTAGTTGTAATTTACACGGATTTATAAGCGAGGGGCGCGTTAACCGCATGAACAG--CAAATACGTAAGAATCTGCGCAGGCATGTATCATATACATAATATACATCGGCATCGATCCGC--AAATGTATATGTATATATATGGGTAGTACATTAATTCGTTTATAAACAATACTAGCGATAAGAAGATACAAAACAAACATTTT----AAATACAA
>CG3107 602442 602478|274 chr2R 599305 602508 scaffold_11 1975739 1978952 + 122198|3154 3198
CT--------AGTTGTAAATGTAATAAATTTATAAAATTCAATTT
ATTCTACTTAAATTCTGACTGT-ATATACCTAT--AGCCACATTT
>CG3136 661419 662149|310 chr2R 661502 661973 scaffold_59 174418 174902 + 8530|0 518
TTCTTATACCCGTTACTAGTAAA------GTAAAAGGGTATACTAGACTTGT-------TGAAAAGTATGTGACAGGCAGAAGGAAGCGTTTCCGACTATATAAAGTATATATATTCTTGATCAGGATCAATAGCCGTGTCGATCTAGCTATGTCCGTCTGTCCGT--------------------ATGAACGTCGAGGTCTCAGGAACTATAAAAGCTAGAAGGCTGAGATTAAGCATTTAGATTCTAGAGACAATGACTCAGCGCAAGTTTGTT-------------GACCCATGTTGCCGCCAAACCGGTCACAACCACACTTTGCTTCGATTTTTACATTTTTTATTTTCATTTTATTTCCCAATATCTATCGATATCCCATATAAATGATGATGTTTCGCGTTCGCATTCACACTAGCTGAGTGTAAGGGGTATCTGATAGTCGGGTAATTC-GACTATAGCATTCTCTTTTGTCTTTGTTTCTGTAACACTTAGAAACATTTTTGTGTTGTAA
TTTTTATACCCAGAACCCATGAAAAATGGGTATAAGGGTATATTATATTTGTGCAATATCCAAATGTATGTAACAGGCAGAAAGAAGCATCTCCGACCTCATAAAGTATATATATTCTTGATCAGCACCAATAGACGAGTCGATCTAGCCATGTCCGTCTGTCTGTCTGGCTGTCTGTCCGTATGTATGAACGCAAGGATCTCAGAGCCTAAAGGAGCTAAAGACTTGAAATTTTAGATGTAGATGCT-----CATAGTGCTCGCGCAGATTTGTTTCAGATAATCGATAACTTACTCCGTTTCCAAGCAAT---CGATAAAAATCTGTATCGATATTCTGCTTTTTGGGC--AATTTTGGTAAATAATAAGAAATAAAAAATAGAATATATATATGCATTTGATGTTGGAA---------GAAGAGGGTTCAGGGTATCCCCTAGTCGGGAGCTCCCGACTAGAAC-TCCTTTCTTGTTTATTTTAATTTA--------------TTTGGGGCTGGAA
>CG3136 661419 662149|311 chr2R 662018 662543 scaffold_59 174946 175393 + -2441|0 135
AAATGTTGACCTATTATAAGTTTTATTAATTAAAACAGCC----TATGTGAGAGATGTAGTTTTGTAAAATACGTGAGCAATAAAGTACAAAATTAAAAAGCTGAATAAATAAATAATTGTAACGAAAATGATATT
AACCGCTTACTTGTTCTAAATTAAATTGTGCAAAATGTCCGCGCTTTTTGATGGAAATACT------AAAGAAGCTAA-AATGTAGTTCGAAATTAATAG--TGACTTTGCAAAAGCATG--------ATAAAGTT
>d4 803283 803353|377 chr2R 802886 803586 scaffold_11 1968466 1969161 + 21527|397 467
GCTAATAAGCTACATTAATAATTCACCAATTATAAGTTAATCTTCTCATAAATATAAAAAACGTACATTTT
------AAATTAAATTTCTAATTTA------AGGCGTCGGTACAGATGTAAATTTAATTTGTGT---TTCC
>Ogt 836657 836869|403 chr2R 836220 836957 scaffold_11 2275238 2275997 + 12693|439 704
AAAACGTTTATAATGTCAATTGCGATTTGGACATGGGAATCAAGAGATATTCAT-ATAATTTTAATATAAAAAGCAACATTTTAAGTAGCTC---------------------GTATGTAACACATAT---GACTAATACTTCTATGTA---------TAAAGCAAAACTGCATACCCTATTTCGTTTAAAAATTATTAATAAGATGTT---------------ACTTTTTATGAATAAAGTTATACGATAT----ATAATAAGAA
A----GTTTTTCAAATCAAAAAAGACT-----ATGAGA---GAGAGTTATCGTTAACTATCTTGACAGGCGATAATGTGTGCTATTTAGTTCGATTTTGTTTGACATATATATGCATGTTACACATTTACAAGCAAATATTTCTGTATAAGATAATAGTAGAGAGTAACTACTTATACAGTTAC--TTACTTTTTATTTATGGAATGCTTTGATAACCAATTTGACCTTTTA-AACTAAGACGTTACCTTGTTTAAGTAATTAAAA
>CG10395 859101 859291|411 chr2R 858451 859516 scaffold_11 1860020 1861109 - 36214|671 861
ATTTAATTTTAATATTGATTGACAAAAAAATTGTTTATTATTTCATGTTGCTCCGTTTCAATTCGCTGTAAAAACTGCAATTCGCCTTTTAAGCGTTCAAGTTCTACTGTTTGCTCAAATATCTCATATTGATAGACTTGCTGCTTGTTCTGGCGCTGAATAAATGCCGTTTTTAATTGATTTTGAGTACC
ATGTTATTTTA---TTGGTTCATTAGGAAATTGTTGATAATCTCTTGCTGTTCGGACTCAATGCGCTGCAAATATTGATACTCGCTTTTCACACGCTCGAGTTCCACTGTCTGCTCTAGAATCTGGCTCTGATAAACTTGCTGCTCCGTCTGACGCTGTTTGGCCATTGTCTTGAGCTGGTTCTGTGTGCC
>CG30437 954365 955365|467 chr2R 953917 955728 scaffold_11 1854540 1856241 - 19805|453 1527
TATTCTACCCGACGCACAAGT-----------AAATAAACCCATATGGCGACAAATTTGAAAAAAGCAAACAGGACATACCTACTGATTAAACAGTTTGT------------AAACATCACTATATATGAAGCCAGTTTGTATATATATATATATATATATTTA-----------------AAACGCACAATGCACTGTTTTTATTTAATAATTTTAAACACTGCCAATGTCCAATTATATATAAATAACAATATACCTTTCCTTCTATTTTCACCCAGTAGCTTACTATCAAATGTATATATTTTATTATTTGTGTGTATTTGTAGGAACCAAAAATAACAATACATTAATTTATTTTATGAAAAAGCCATTATGTAACCTTTTTATTGTTGAAAATGACTGCAAGCAACAACCCACTTCTGTTTTATTTTATACAAATTTCCTGGTAACATTTTCATATTTACTTGATCTTCATATGCAACTATTTTCAAATACAGTTGCGTTCAAAGAAATAGTGTAAAATGGTTTGTATTTAACTAAGA-AATAATGAAACAAAGTTTTTTCACGACTATGCTATCGATATAATTTCTTGTAAATGTAACATTTCTGTAC---AAAATAAAGCTATTTTTACTA-AATTTTAGGAATAATTGTAATAATTAACAATGAATATATTTAAATATTGTATTTTTTTAATTGGTAATATTTTTCTAA-AATTATATCT--------TTTTATTTTACGTCATCAATTGCTACTTAAACATTTTTCTAAAACTTTGTTTAT---TATTAAAATGTAAATACCAAA-------ATGTCCTTTTGATTATTGTGACAGCAAAGTTGATTTGCATACAAG---TATACCTGTCATTATGGTGCCTTATCGTTCAATCCTGGGTACACTTAATTGGTTTTTGTGTTTGTATC----TTACGCCCAAAATTGTAATATCACAATATATATTAAAAATATGCTCACAATGAAAAAACCCCTTAATT--ATAAATGTAC-ACTCAATTGTTAAATTGTTTAATATGTATACAATAAAAATATATAAATGTATT
GCTAGGCTCTAATGCAACGGCTCTAACTCATAGAAGAAACCCGCACAAAAACAAA--TACTGAAAGCGATGAGGACCTGCCTACAGAACGACCAGTTTGTACAAAGTTTTAGAGACAGCACAATAAGT-ATGTATGTATGTATGTATGTGTATATATGTATTTGTTGTAAATTATCCCGATTAGCACAGAATCCCCCG------ATAAATACGTT--ATCACTGCC---GCCTACCTGTAT---GATACTATTATTACCTGCCTTC--------CGCAAAAGCTTGCCTCTGGGTGCACATTGCTTGCGCCCT----------------ACCAAAAGTTGCATCAAGC--AATTATTCCCT-----ACCCCTCCTGCACTCTACTTAATAATAATAATAATAATAATAAAA-------------------TAATAAAAAATCACGCATAGTGCACACAGATGCACTAGAGC--------------------AGACGAGGTGCAATGAATGATATTCTGTATAAAAGT-----GTTAACAATCATATTAGTATGATTTGGATGTTTGGAGCAGCCGCCATAAATA----CTCCCAGAAATTCAA----TTTGAACTTTGGACTTAGTCTATTATTATTATTTTTTTTTGTTTGTTTGTTTTTATTATCAATTAAAAC------ACATTGGTTTTCCT---GTGGCGATCCGTTTCTGATAATTGTAACCGAAACATGGACTAGCTCCAATCCTCGAGTGTTTTGTAA-----TATGTGTATGTATGTGGATGCATACGTATATGTATGTACAGAATTGATGTATGTATATTTAACTAATGTA---------------TGTATATAGGACCAATAATTCACACGCTGGTGCC---TAGTTTTATGCAAAG----CTTAACT--TTTCCTGGTTTGAATTTGGATTAAGTTTGACTTTGT---------GTAAATTTTAAATACATGT---------AAAAATCAATTAAATGAATAAAGCTATAAAATAATTATTAATGTACATAAAATGTTTGTAAAAATCAAATATATATTATGC
>CG30438 1056385 1056942|525 chr2R 1056417 1056479 scaffold_0 2542661 2542720 - 389|0 63
TTAAATCTTAAGAAGAATACGTTGCGATTCAAAGC-GTCAAGCAAATGGATCGATTAGAAACGT
TTATGTCTTAGGAA----ACGCTAGAATTACGGGCTGACAAATAATATTGTTAAAAAAAAAAGT
>CG30438 1056385 1056942|526 chr2R 1056522 1056946 scaffold_0 2542761 2543203 - -573|0 465
TTAAAGAATATAAAAACACGCACACAATAA-----------CAAACAAAAAATAAACAAA-AGAAATCCCTC-----GGAAATGGAAAAGTGTATAAAGCCGTATTTATCTACTTGA--TACTGAATTTAATACAAACCTCTGAT--------ATAATTAATTAATGACTTCTTAAAAATGG--TAACTACTCTTCTGTCCAGAATTTAATGTAAATCCCTATATTAAATATTAATAAGGACCCAAACAAGTGATTCAAATCATAATTAAAAGGATACATTAAAAATTTTTGACTGTTCCAAAGATGGTATAAAACAATTATGTTT---TACGACCTACATTAATATATAAAG---GCATTAAATTATGATTTTAATACAAGCTTGCTTTCCCTAAAACATCTTTAATAAGAATGTCTAAATAAATTACAA--TAAAGCGCATTTTCAA--------AAATGGAAA
CTAGGGTATACAAATAGATTAAATCAATAACGGCAACTCTCCGAACCAATCTTAGAAAGATAGAAAACCTTCCATTAGACAATTGGCAAGT-----------TAGTTTTTAAATTGATCTATTGTACAAAATTCAAGATTCTGATTCTTTCTAATTGGTAGGCAATTATTATTTGTCATCCGTTTAAGTTCTTTTCGCTCT---ATTGGAAGAAGTGCCTTGTACATATTGTTTATATTTAT---AATATTAAATTTAAGTAGTTGCTTAA-----ACAAACAAAATTTTCGAATATCCTAAAATTGTTGTGTAAAATTTATAAGTGCGGAAAATTTAAACCAAAGTCTACAAATCGTTTAAAATAATCATTTCCTTTCAATTTTAATTGTTAAAGCACACCGC-----GGAAAGTTGGAGTAAAATAAAGTTTAATCTATATTGTTAATTTGTGTGAAAGCGAAA
>CG17508 1118794 1118977|563 chr2R 1118541 1118799 scaffold_7 2870235 2870489 + 9300|254 259
AGTTGA
TGCCAA
>CG1344 1163199 1163336|589 chr2R 1163248 1163493 scaffold_11 468470 468707 - 833|0 94
ATGTAATTAAATTGTATCAGG---AAACTTTGGAGATGT---TTTTAAAAATACCTAACATACTCTGTGTATATGCAAAAAAAAAAAAAAAAAAA
ATCTCATTAAATTATTTTTGTTATAAACTTTAATTGTACGCCTATTATGTAGACTTAAC-TATTTTG---AAAAGCAAAACAAAAAAAAAAAAAA
>CG1298 1180018 1180185|607 chr2R 1179202 1180228 scaffold_11 1895421 1896450 - 34107|823 1013
----ATCAAAAATGAATTCGAAGGAATTATCCGTCCATTTACACAATATTTAATAATAATT--------------AACAAATATACAAATATATACGATGTAAGGTAGAATAGTCATTCCACTAAATCCACTACAAATGTTTTTAAAATGTATCGAATTCGAAGGTAATAAATA--TTTGTCA---AATAA
GCTGATCCGCGAGAAATGAGAGTG---TGGTCATCTACGTACACATCCATAAATGAGGCCTTCGCCGTGCCTTCGAGCGAATATTATAACATATCCGTCCAATTG-----TCGTCTTTAGATTAAGTCC--------------------GAATTAGACTCGAATATAAAACACCCTTTTATCATTCCACAT
>CG17337 1207476 1207608|649 chr2R 1205544 1207548 scaffold_43 192721 194793 - 72860|2029 2129
AATCGGAAGGCGTTGA------------------AACGATA---------AACATCACAATGGTGCACATATAAATATATC-TATATATCCATTATATTTT
AGACGAACGATTTTAACTGGGATCGAATCCAATTCACGACATCACGATGCAACATCACAAATGTGCGCTTATACGAATATTATAAATGAAAATTAAATTCT
>CG17337 1207476 1207608|650 chr2R 1207549 1207627 scaffold_43 717635 717738 + 1779|0 84
GAGAGACTCCTGTACATTGTTTAGTAAACATTT-------------------------GTTGATGATATACATATTCAAATTTTT
GAAAAATTCCTATTAATTTTTGAATTAAAATCTTAATTTAAAAAAAACGCCTGAAAAAGCTTTTAATACATAAATTTATATTTAT
>vlc 1212308 1212830|654 chr2R 1211260 1212498 scaffold_43 722413 723731 + 28008|1187 1396
ATAATGCTCACTGCGAATAGCAAC-TCATGCTTTCTATT--TATACATATATTTTTAACTA------------ACACACGTGTACCCCACAAAGGCATACTT----AAATTTATAGATATTTCTAGTTGAATTAATCATTTACTAGTCCCAACTAAAATTATTGTGTTGGAGCTCCTCACTGAAATCTGTCACAAGGCGTCAAATATCTA
ACAAC----------AACAACAACAACATGCTCTCTAGTTATATACATATATATTAAATTAACTCACACACACACACACACGTAGCACACTCATGCACACTCGACAAAATACTTAGAAATTCCTAGTTGAATTAATCCTTAACTAGTCCCAACTAAAAATGATATCTATATGCGCGCGGTGTGAAGCTTTTAAAACATATTGCATAATTA
>vlc 1212308 1212830|655 chr2R 1212499 1212820 scaffold_43 723885 724214 + 1853|0 345
GGAGATAACGAAGTATTGTCACCAATTGCGACTTACCTAAAGTTGTTCATAAATATTGCCTTATCCGCGAAAGATTTCGCTAATTAATCAATTTGCTGTGCACATTATGTAATTGAAAATTAAAATTACTTGATTACATATAAAAAAGACATTTATTCACGTTTTACATTATTTAA----GTATTTTA----AAAACCAACAAAATTTTTGTATAACATAATTTGATGTTTTATAATTATTTTTGAGA----------------AATTTAACTTATACAACTCTTGGAATATCATTTCTATTAATAGGCAAAATATTTTTATACAACTGCAAATAAAAATAACTCA
GAATATTATAAAGAGTTATCAACGTTAACGGCTCGTCGTAA-TTGTTTATAAAGTTTGCCTTATCTACGTGTTTTTTGCTCGTTAAATCATTTTGCTGTGCACCCAAAAACAACAAAAA--AAAACAAC--AAACAAAACGAAACAAACCAGAAACGAGAGTTTGTAGTTTTTTAACCGTGCGTTTTATTACAAAACTCATGCAACATTTAAAAAAGAC-ATTTATTTTTGTGTAATTGTATTAGCGACCTAAGTGCAACAAACAAACAAACAAACAAAAACCCACAAATATAAATCAAATT---------AATATTTTAACGCGAC-GTAAATGAATCTAAATTT
>l(2)09851 1263375 1263441|698 chr2R 1262000 1263395 scaffold_4 5976384 5977803 - 76195|1399 1419
CCTCGCTATTATTCTGTTTCT
GCATGATAAAACTTCGGATCT
>l(2)09851 1263375 1263441|699 chr2R 1263396 1263750 scaffold_205 10252 10635 - -1641|0 49
TA----ACGTTAAAAAAATTAAACCGATCTTGTGTCTTTGGGTTTTAAGA
CATAATATGACAAAATAATGTAACGGGTTCTATG-CAACGGTAAATCAGA
>gp210 1279589 1279960|715 chr2R 1279165 1279880 scaffold_51 20130 20841 - -422|443 792
TTGGATACGTAAATTAAAGACTGT--CAGCAAACTGA---CTCGGGTTTTTTGTAAAATAATAT--------------AAGATAAACTCAGG-CATTTGTAATACTTA--------------TATGCAGCTTCTGTCCTTTAAAGTAAATTCTTCTCATCCTGACGCCAGAAAAATAGTTTGTTAGGATAAGTCAATATTTGTTATGGAATAGAAGAATTAAAAAAA---GAGTGAGATTGCAACGTCACAAGTTTGTCAGATAAGCTTACGTTT---------------------GTTCTACGTTTCCGCAAAACACAACTAGTTTTTAAATAAACATCAATTAAAATG
GTTATTAGTTGCATTTTTGGCTGTGCTGCCGAACTGATTTCCTAGACTAGCTGCTAAGTTAAATTACGACAAAAGAAAGAGATAAACTCAGGTTAATTATATCATCTAGTGTACTGCCAAAGTGTGTAGGTTGGGGGTGTGTTGATAATTTCTT-------TGACTCTTAAAAACT---------GGACACTTAAACTTTTGTTTTTGACAATCTAAATTGAAATCATTTAAATTAGTTTTTTGAGT--TGAATTTGATAAATTTACTTGCGCTTAATTACATATTTCAATTTTGAGTTCGGCTTTTCCTTAATCCTTAA--AGAATGCAGTTAAAAATAAACTAATATG
>CG14470 1438176 1438751|896 chr2R 1435356 1438871 scaffold_51 257494 261194 - 108712|3062 3776
AGCTAAAAGACTCAC-----------------------AAGCAAGTGTGGGTCGTTTTCTTGTTAA-------ACCTTGGAATGTGAC-------------------------TTAGTGAATTTATACCGTACGCATAATGATAATTTTATCTGTAATGAACCCTGCTTGCTGTGCCTTAATCCCGCGTCCCGAATTTGATGGATTGGTCCGATACGAGATTGATGTGCAGCAAACGA---------------------------------------------------TTGCATTTGCCAAAATGAAAGCAA-----------ATATTTTAAATACT--------------TAAGTGCAGTTTGC-GTAAATATATCTTCAATTTTTCTGGATTGCATTTAATGTGCGGCACACAACGCAGATGCGGCGTGGTATATGAACAGCACTTTTATTTCCCTTTTTGTTCACTGAAAAAATTGCCGGATTGGCAAACAAATGTTGAACAAAT---ACGTAGGCGGCGATTGCCAACGCAATCGAAAATTAAATGCAAATGCAATCATGAAATGCGTCAATGTTTTGGCAACTGAAC---AAATGTAATTTAGTAAAATAAACTTTACAAATGCGC-AAACTAAAAGTTATGTATGCTATTATGTAAGCTTAAATAAAAACTCTTAATAAAAAATATAAACACATATTACCTAAAAGCA
AGCTAAAATACCGACAGATACATACAAAAATAATATATAAAAAAAAATTGTTAATGCCCACTTTGACACGCCCACCCGAAAAAGGGACACGCCCATGCGGTCAAAGCAATTAAATAGTGAATTGAAATGCCTGCAATTAAGTTAATTTTATGATTAATG----CCAATTGCTGTGCCTTAATCCCGCGTCCCGCA---------------CGATACGAGATTGATGTGCAGCAAAAAAATAAGGAAAATACTACAAAAAATACCACAAAAAATACTATACAGAAATAACATGCATTTTTTTCTATGCACGCAGCATATTCAAATATAATATAAACATTTTTTTCCCAGCAAATGTTTGCAGTTTGCTGTAAAATTATTTTCAATTGTTTTCCATTTTTTCTTGTTTG-------------------GGCTTG---------CATTTATTTCATTTGCATTATTATT---TTTATACATGCCTTAAACAGCAAAATAAAGTTAAGCGAATTGGCTGCAAAATGCGAATGCAAATGCAATCATGTTTTGGCAACAACAACAAC----AACAGCAACAACAC----GAAAACGAACACAAAATGTAATTTAGTAAAATAAACTTAAACAATACGCAAAACTAAAAGTTATGTATGCTATTATGTAAGCTTAAAAATCA------AAATAAATACATAAATGAATAT----ATAAAACA
>Src42A 1519000 1519922|972 chr2R 1517945 1520021 scaffold_51 350583 352937 - 53856|1084 2351
TAAATGCTTT------------------------------------------------------TCGAAGTCA------CGGACGTGGCCAGCAGTCGTGACGAAAATTAAGACAGCTGCAAAAAAT------------CGCCA------GGCATCCCAGAACGGACAATTCTTACTAAGTTACTTTT----GTTTTGCATAGATTTTCTACTGCTGCACAACG--------------------TGT----CCATGGGCCCCC----GTTTGGTGCCCGT-TGGCTGT----------------------GGTTGTCTAGGTACCGATACGA----------------------TTCATGTTATTAGCATTTAAGGTAAATAGTTGCTG-----------AGGTGGAATGCAATTT----CAAATGACGTTCCAT-----------TGGA---ACATTCGTTTTCTTGTTTAT---TATGACAAAC-----------------ATATTGG-----------------CACTTGGTCGGATTTAT---ACGCTTTGACATCCTTGT--------------CGTATAT------------TTCGATTAA----------------------TATATCAAATGTATTATTATTTATATAACGCATATAGCATATATTTACGCGTATACACACACATATATATATATGATCACTTATATACAAATATAAATACAACCG-------TATAGTCAC-------------ACCTTCATATGCCGAGACCCTC------ATTATTGAAGTATGCTAAA--------ACATACTTCCCTATTTTT--CTTTAGTTGATAGGCCAACCTGAGAACGATATTTGCAGCACACACATATACAAAAATTTTTCACTTTTAGTTAATTAATTACGTACGTGTCTTACTTCTATTCTCACTGAACATTATCAACGACATTATATGCTTTATC--------ACAAATAGAAAAAGCAACACAAACGCCAATCAT------------TAAATATATGCTAGCTACTGGATACT----TTGCAGTGCCCAATAGCTAAATCCATATAATTACTTATTTAGAATTTAAATGTAATTTGTAACCTTAACATAATATGCATAAACAAACATACATATACGAAAACATGTACATTTA--GAACCAA-----------GAAAATATTTCTTTATAATTTATAAATATAAAATTCTTTAAAATTAAACTCAACTTTGTTCACTCATTCTTTT
TAAATGCTTTATGCGCCCGCTGCCAAACATTGGCAAACTGGCTGCAACAGAGTGGCGCCCGGCGCTGCAGCCAGCCAAGCGGAGCAGACCAACAACAGCAACAACAACAAGAAGAAGAACGAAACATAAAGCAAACGTGCGCCGTAAAACAGCAACCCAAAACGGACAATTCTTATTTAATTACTTATTTCAGTTTTGCACACATTTTCTATGGCATCATAAAGAAACAAAGGAAAGGCAAATATGTAATCCCACGCTCCACCAAGAGCTGAGTGTACGTCTAGATATCAATATATATATATATATATTGAGATATCTATATATATATACAAACATATATAAATATATAGGAATTACATGTTATTAGCGTTTAAGGCAGGAGGATTTTAGTGTTTAGGGCAGGCGGATTGCAGTGTGCTAAGAATGAAAGTATATATATATATAAATAGATATATATACATATTTATATATATATATATAAAAAATTATATGTATGTGTATTAATATTTGTATTTTTGATTTCAAAACACTTCTTTTGTTTCATAAAACGCATGTACATTTATATAGCTGTGTATGTAACATATATCGTCATGATTTATTCAATCGAGCGCTATTCTAGAACGCTGATTTATATAAAGTGCAT--ATATCTATATAACAGATGTATTACTAATCATATGGCGCACGCATACATATACATATA-GTTCACATATATATATATATATATATATACGAAACGCATAAAGTCACAGTTTTTTATAGGATCTTTATATGCATATTTGTTCTTTTTAGTTATTTAGCCATTATAAACGATATTTAAATACTTATATATTTATGCTTTTAGTTAAAAA--CATTACGTGTCTTACCTTACAAACACACACATATACACACAT-----ACACACACATACACACACACACACACA-CACACACGCACACACACTCAACATAATCAACGACA-TATATGCTTTATCTTTATCGTATAATCGTAAAAAGCAAAACAAAAAACAAAAATGAAAAAAGAAAGTAAATGTAAAACGATTAAAAGTAATTAATAATGCAATGCAATAAAGTAAACTCCATATTATTAATGTTATACATTTTAATTGTAATTTTTAACCATTAAATTAAACG----------CATTCAAACACGAATTCATGTACATTTAGTGAACAAAAACATCAAAATAAAAATTTATTATCTTAATTTATATAAACAAGA------AAAAACAACCAAAATAGTCATTGCTAAGGTTTCA
>PNGase 1527404 1527537|977 chr2R 1525190 1527664 scaffold_51 362183 364758 - 78399|2357 2510
AGTCCTCAAAAAATATTTTGGAGAAATTAAAATGTAATTGTAAATAATATA----AACGATTCCCAGTCTGGATGAAAATA-------------TAATAATCAAAAATGTATATTA-AAAATTAAATAAAGGC--ACATAGTGTCGCTATATGT
----CGCGAACAAT------TACCAATTAATTTGTAAATATACCCGACCTACCTCAAGCTTTCCCATTGTAGATGATGTTATTAAAAGGATTTTTAAAAGACAAATGTGGAAGTTATTAGAATAAATTAAGTCCGACTTAAGAATGTTATG---
>CG7861 1552118 1552358|993 chr2R 1549764 1552487 scaffold_1 4149532 4152246 + 75927|2398 2694
CGGC-CAGTATAATAGCACGGACTTTGCACCATTCTCC---------------------GTATTTAGAT---GTATTACAGTTTTAG-------ACAAATGAAAATCAAAA-------------ATTCTTGTTCGATTTTACTTCTGTCTCCCTCTGTTTTAAAGTGCA--------AATGTTATGTTAAGGTACTAATAAGTTGAACATTTCACTAAGCAATTCCACTCAGATATTTA-TACTGTTTTGCTTTTCAAAA--AAGAAAACACGTTATTTAACCAGATAATTAAAAAA
CGGCGCTATAGAATGCAATGTTTTTCGTACCTCCCTTTACTTCAGTAACCCCTAATTTGGTATTCAATTGTGGTATTTTAGCTGTAAAGCAAGCACAAAACAAATTCAAAAGACGTGTATGTTGATTTATATT--ATATTAACTGTGACTTTGTAACCTATGCAATGCAAAATTAATAATGTTAATGTTAGGTACT--TAAGTTTAA-ATTCCGCTTTTCGATTATATTT--ATATTCATTTTTGTTTTGTTTTTGCAAAGTAAAAAGGAACGTTTATTAACCAAAGCTACAAAATT
>CG14589 1645717 1645839|1097 chr2R 1645370 1645733 scaffold_1 4324692 4325047 + 8907|360 376
TTAGTTTTAAGTTATAT
TCGTTATTATGTTATAT
>Cyp6w1 1682769 1682830|1178 chr2R 1682463 1683273 scaffold_1 4378588 4379407 + 5453|340 401
TATATAAAATAGAATTCATAACACAGCAGCCGCCCAAATAAAAAATCAAAGAAGAGAGAACG
AATATTGCTTAGAATTTGCAAAAC--CCTCCACCAAATATGAGCATAAACTTAACAATAAAA
>CG8343 1687675 1687758|1189 chr2R 1687542 1687773 scaffold_885 5407 5633 + 1237|133 223
CCTAATTTGACGAAGTGAGTCGAAAAAGAGTCCGGTTGTTAAATAAAATATCAG-CCGAATATGTGCAATTAAAAA------TGCGAATGA
CACTTTTATCATAAGTGTGTTGGAATA--------TTTTCATATATATTAAAAGTTCAAAT---TGCAATCAGAAATCGTTTTTTGAGTTT
>tomboy40 1734136 1734272|1243 chr2R 1734002 1734175 scaffold_46 923800 923970 - 6002|134 173
ATCAAATTTACTTAATAGTAATCCAGCGGAAGCACAAAAA
GCC---TCAACACAACAACAACACAACACAACAACCACAA
>tomboy40 1734136 1734272|1244 chr2R 1734268 1734953 scaffold_11 79797 80576 - 140|0 4
TCTAT
TTTGC
>bin3 1747151 1747204|1266 chr2R 1746345 1747452 scaffold_1172 324 1508 + 47284|810 892
AATAG------------------GGATCTTTTAGGCAGGAAAAA-----------TGTGTCAAAAAGAAAAAGAACAAAAAAA
AGTGGACGGACGGACGGACGGACGGAC------GGTGGGCAAAATTGAAACCAATTGTGTCAAAATGCAAAAATTCAAACAAA
>Pld 1762335 1762654|1278 chr2R 1762060 1762636 scaffold_1 4516453 4517103 + 9422|275 707
TCTGTCAAAAGTGTCTAAGAT--------------TTTAGAAAGCTTAAAAA----------------------------------------------CCACTTACCATTTA-------------------CCACCCACCAAAAGCAC-TATCTTTAACGA---------TGCCAATGTCAAGTCAAAC-----ATTTTGTAAATA--------------GTGTATAATAGCCGTAGATAACTCTAGATACTTTCAAGTACATGTAGCTATTCCTTACCAATAGTTAATTTATTTTACAATGTTTGTCTATGTCCTCA-AGTAGTTTTAAGATTTTTGTTATTATTTTGTATGATGTT--AAACAGTATTTTAGACCGA--------------------TTTACACAAGTTTATTAAAGTGATATGAAGTGCA
TCTGCCAAAAGTCTTCAAGACGTAACTAGTTTAAGCTTAGCCAGCAAAAGAAAATAAATAATAAAAATACTGGTGTAGGTACAGTCGCGACAAAAGCTTTGTTGACTGTTTAGTTTAGTTTTCTAATTATGCAACCCACCAAATGCGCTTAAACTTATCAAGTTGCTGTTTGCCAA-GTCAAGTAAAACTATAAAGTTTGTACATATATAGAAATATATTTTGTGTAGTAG--GTAAAGAAATCTATAAACTATTATCTGTTTG--------CCTTACAGCTAGTTAATTTATTTTACG--GTATATCGACGTCCCCCTATTACGATTAAGA-TTTTATTGTTAATGTTTGTAATTTTAAAAACAGTATTCTAGACAAACTAAAGCGCAATTATATTTTTTAATAAAATTCCATAAAAGTGATGTAAAGTACG
>1.28 2039829 2040334|1381 chr2R 2039738 2040122 scaffold_1 4570739 4571202 + 6414|113 482
ATAG-----------------------ATACTTCTGCCTGGCCGCGTTAATTCGGTCTAATTTGCAAGGC-------ATGCAGT--------------GCGGCTGTCCCTGCAT--------------CTTGGCTACTGTTTAATGGCCTTCGGTGGGGCAGTGGTAGCTGGACGCACCCATTG----------TCAATATCAACAGGTAACGCCACGAAAAACCACTGAGGTATTTGCATTTCCCATTATTATTACTGCTGCTGCAGCTGTTGCACCTCG-----GTCCAACTCCTCGCCCTGGAGTGCTAATGGCCATCAGTCTGAGCTGGTCA-GAATATGCACC--CTGGGAGCGTGTGAAATTTT
GTTGCAGTCATGTCCAAACAATGGGGCATATTTCAGCCTGAATGCGTTAATGTGCTCTAATTTGCCAAGCCAAGAAGATGCAGTTGCCTTTTGCCGTCGCCATTGCCATTGCAGTAGATGCAGGCTAACTAGGCTACTGTTCA---GCTCTGGGTACAG--GTTTTCCCTGG--GCATTCATTGGTCCCCTGTCTCAATATCAACAGGTAACACACCGAAATGCAACCACACTATTTGCATTTCACATTGAAGGCGA-GCATTTGTGAATAATGCACTATGCCAGCGTCCGGGACCTCGCCTTTT-GTGC----------CAGCCTGAGCTGTTAATGACCAAGGGCCAGCGGTAAGCGTGTGAATTGTT
>jing 2131067 2131209|1495 chr2R 2130332 2131187 scaffold_1 4701760 4702722 + 33084|830 981
GGGCATATCAGATTTATAGTATTTTCTAAGTAATTAAA-----CCGAAAAACAAAC-------GACAAACGAGTAAACAGTGACAAGTAGTCTA-----GTTAGTGTAAGACCA---AAGTAAATT----ACT-------ACATGCATCCAT
---------------AAAGTATTTACAAAGCCCACACACACGCCCCACACACACACCCGCAAGGACAAACGAGTAAACAGTGACAAGTAGTTTATAGATTTTTTTATAAGGCCACTCAAACAAACCCAAAACTATCATAAACATGCACACAT
>Bap170 2154100 2154174|1511 chr2R 2148178 2154101 scaffold_1 4721213 4727447 + 181966|6517 6518
GC
TC
>Bap170 2154100 2154174|1512 chr2R 2154125 2154290 scaffold_1 4732498 4732653 + 1661|0 49
ATTATTTAACTGACTTGTAAGAACGACACTAAAAAAATGTGAAAAGCAAA
ATTATTTTCGCAGTCTTCATGAATCATATTAAGCGCAAGCAAGAACTATA
>debcl 2164460 2164644|1523 chr2R 2163650 2164672 scaffold_16 583219 584300 + 39337|874 1082
ATTCGCTTGGGATCGCGTCGTTAAGAAATACAATCGTACCATTTAGTCAATGAG---AGCTTCAAATCATTCCTGCTTCCATGGGCACCAGTCGTTTAGTAGTATGTAACGGACCCTGTTTTACG-----TATAATATTGTTATT----CCCTTTCTCCTCTTTTTGTACATA---------CAAGGCTATTC---TAGGCGCAATAAA
TT----------TCGGGTCGTTTTTAGTTATAATTGTACCCCGTAGTCAGTGAGATAAACTTGCAATCATTCCTGCTT---------AAAGTCGTTTAATAGCTTGTAAAGAGATCTGTTTAATGTTTGATATGATATCGATATTGATACTTGTTATATTGTTTTTGTACATATGCCTAACTTAGTGCCAATCACATAGAGCAAATAAA
>sced 2171794 2172437|1531 chr2R 2169206 2172162 scaffold_11 3195143 3198344 + 85707|2859 3307
AATGGATTCTCCGTTTTCCGTAACCATGTTTAACACTTCGCT---------GTGGACACAAACTGCTTTTTAACCATTTCGCTATTTATGTTGTAGTTTCTTGTGAATGTGATCTG----------ATTAGTTCGACAAGTTGATTATTATGTTATCCGAGTATAT--AATACGCTTTCC---CACGATGCACTTAGTATTAAGCCTTATATG---TATGGTCATCCTGCTTTGT-------------CAAATGTATTTTAACGAACCATATC-----CGGA----------TCCACTTGGGGGGTCCCCTAGTATTACTACTG-----TTGTGAACCAACGATGA---------ATGTCTAA-----------GAATATGCTCAATTATGAAAATTTACAAAAACGCTTTTATACGTATTAAACCAAAAACCACATTGTTGACTCATT
CATCG---CCTCAGTAGCAATAAGCATGTTTGTTGTTGTTCTTGTTAGTAGGTAGCATTAAGCTAAATGTAAACGCT---AGTATTTATGTTCT---------CGCATGTGATTTGCCGCCTCTAAATGTATTTTAAGTTTTAGCTTTTACCTTGTACGAATGTATCAAATACGCGCTCCATGCAGCATTAGTCTAGCATT-AGTCTGATTTGCCACAAAATATTATTGCTTAGCTTACAAATAAGTACATCTATATATAAGCAAATCATATCATTCATGAAACTAGCATATTCCATATCTGATATCCGATGTTGTGTCTCTTGGTTGTTTGTCTACAAATGCGAACGCGTTTCTATGTCCAAATATCAGATCTAAGTGTGCTCAATTGTAGAGTTATATTGAAACGCTTTTATTCATATATACACAAA----CTATTGTTGACTTATT
>sced 2171794 2172437|1532 chr2R 2172337 2173744 scaffold_11 3198972 3200373 + 67692|0 101
AAAATGCTTCAAGATAGCATAACCAATGCTGAACTGTACCGTGACTAAACCATAAGCTTACAAATAAAATATGCCACAAAAATGAA-GTAAACTTTACAAGC
AAAAAGCTTCTTTATAGCGCAATTAAGGCTCAATTGTACCGTGACT------------TATATATAATAAACTTTATACAAATGAAAGTTAA--TAACAATA
>Adf1 2179191 2179900|1537 chr2R 2178353 2180673 scaffold_4 1147630 1150229 - 70740|850 1840
CTGTCGGGCGGCT---------------GTCATCGGCAGCTGCTGCAGCTGCTCCAACTGGAGAGCGTTCTG---CCCTGAGATCAAACGAGAACAGACCCACGGCTACCCACATCCACATCTACACGGGT---------------------------TTGGGGGTCCTGTGCGGTCATTTTCTACAGTTCATAGGTCTT-AAAGTCAAACTACAGAATAACATTAG-------------ACGTAACATCCCACAGCGTAAAC---------CATAACGCGTAATGATACTTCCCCACGCCCATGTAGACA-AACATATATATTTATATGCTTAGTTGACCCCATGATCGGTGAT--TTAATTCGCGCCCAGTTCT------CAGCTC-----TGTACAAAAAATGCGATTGAAAATAGCGATTCTAGAATTATGAGTAGCTTGTTAAAAGACCGTGGAAACACTTTAT-----------------------ATGCAGCGTATTGTA-AATTTTGACTACGATTTAGTTGT-AATTTGCCATCGGGTCTTAGCTCT------------------------------------AAAACTAAGTATACACGTAAAA---------GTTATTTTAATTTTATAAGTTCTGTTGTAATATGCCGAAAACGCTTGAAAGACACTTTGAAATGC-TTAATTAAGTGTGAC--------AAAGGGAAACATA-------------AAACACCTTTTTCATAGTGA-------------TCGCATATT-----ACACACTTTACATGGATACGAGTAAAATCGAA--------------------------------------------------------ATAGTTGCCGGCAA-------------CGCCAGTT-------GCTAAACATTTTTAATG-----------ATTAATTGTGCAATTATTTGGTATTAAATGAAACATTTGAA--AGTAA
CTGTCGGGCCGTTTGTAGCATTACCAGCACCACCGTCAATTGCTGCAACTGCTGCAATTGGAGAATGTGCTGGACGCTCGATGGTTAATGTAAGCAG--CTACATATAACAACAACAACAACAACAACAGCAGCAAAACAAGATCCCAAAAAAAAAAAACAGGAGCCGCCTGTTTTTTTTTTCCTTAGCAACTAAGTCTTAAAAGTCAAACTAAAGTTTAAAATTAGTTTTAGAAAGAGAAAAAAAAACCACACACACTTCACTTACATCTACATAATATACATAAAACCGAACATACAATTACGTAAGCACAAACCGTATATATATATTCTTACGTG---CTTTGATCTGTTGTAGTTGCCCCCCGTTCAATTCTCTTACCCAGTTTGGAAGTGTACAAAA----TGATAGGAAAC--TGGTTCTAGAAGTATATATATATTGTACGTAGTTTTTTGAAACAATTTACAAATGTTTTCCAATTACTTTGTAATACAGCGTATTGTATATTTTTGACTACCATTTAGTTTTAAACATGCCATCGGGT-TTAGTTTTGTAATTTGTAATTAAGTCAAATTGTAATCACAAACAAAAACAAAACAACAACATAAAAAAAAAACACGTTATTTTAATTTTTTAAGTTCTGTTGTAATATGCTAAAAACGCTTGAAAATTACATTGAAAGGCTTTAATTAAGTACGACCCTTTTAAGAAAACAAACATATATATGTATACACTAAAGCATATTACACAATTACATGAATATATTTCCGCATATTTACAAACATATTTTTCTGTAAAACAAAAAAAAACAACAACAAAACGGTTTTAAATTAACGCTGAATATTTCAAGAAGTTTACCATAGACGTGTATATTTGCCAGCAATTTAATATTGTTTTACCAATTCAATTTACCTAAATGTTTTTCATGTACATGGAATCACTAATTGTGCAATTATTTGCAATAAAAATAAACATAAGAAACAAAAA
>CG3271 2186602 2186878|1540 chr2R 2185414 2187605 scaffold_4 1155823 1157890 - 77065|1228 1504
TAGAGGACTGTCGAACCCTGCGAAAGGAGAAGGCTGCGGCGGGCGGCTATTCATTCTACAATTAGTATTATCTAAGTTATTCTTAGCCCTTAAAGCACGCAAAGCTATCTGGCAATTTTTCTGACATATTTCATGTAATTTGTAACAGAGCGAAAACATGTAATGTATTTTATTGAATGTCAAAGCGAAAACATCCTTTGACAGTAACCAGAACGGCAGGAAAACTAATAGCTTCGTTTAAAAAGACATAATAGAGACTTTATTACAACATTTAGAA
TCGAGGATTGTCAGACACTGCTGAAGGAGAAGGAAATGACAGGCTCTTATTCCTACTTTAACAAGGAT-ATTTAGATCATT-------------AGACACACATCTTATCGATAAGTGTTC-------------GTTAT----------------ACTCGTATTGTACTGTATTG-----------------------------------------------------TAAATTTATTATACATGACATAAT-------------------------
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AGT------------CAAGGTTGAGATAAGCGGACCATGCGAAGATTTTCTTATTTGCCCTTTGTAAGGATGTA----------CAAATAAAGCCCAATTTATCACAAAA
ACTGCGGCCAGCGAGCATACTTAATTTAAGTTTACTTACCTAAGCATTTTTAGATTTGTTTTGGAATTTATGTAGCTTATGATTAGATCAAAATCATATGTTTAACTGGT
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----------ACGGGCA------ACCTGTTTTAATTGGTTTGCTGTTTCAA-----TTTATTATAAATGTT----TTTATATAGT--TTATGATGAATAAACTTTACTTATTAGTT
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GAATAAAAATCTATTTTGCCGATGCCTGCACG------TGGGATAGCCGTAGCCCGTAGCCGATAGTCGCTTCTGTAAAAGCTAC--TAGTGACTAACTCCTAGAAGGTAGTGGAAGCAGATTAATTGTTTTCATTTTTTTTATTTCAAGCAAAATATTAACCGTAATAAATTTAGCTGCAAAAATAGTAAACCGCAAATTAGTGAACCATTTTCAACACTAAGCGTAATGTT-------TTAAAAGAAGAAACCCAAAATAAACTAACCGC----TAAAAAGAAAAATAATAATAATAAAACAATAGCAAAAATAAGAAGGCATTAAATTCAATTTTAAATAAACTAAA--GATCAACAATTGTATATGTAAAATGTGTCGTGCGTGATTTCTAAATTTTGTAAACTTTA
>Rab2 2210358 2211749|1566 chr2R 2210738 2212181 scaffold_4 1186977 1188378 - 12248|0 1081
TTTTGTGTATATTGAAGTTAGTTTGCTAGTTACTTCGTGTAAAATCGATAGTTATACATTGGGATTTTGACAAAATGATGTGTAATATATGAACAAA-------AATCAAACTGTGTGAATTT---TCATTGTGATTCGATTT-CAGTGA-----GGTCCAGCTTCGCAACGCTGCGCCACGCCCCCTTTTGCAATGGGTATCTGCTCCGCTTCT-CTATACACACATACATAATTAAATATATTAATATGTTTACGTTTCCTTCTCAACGCATTTGCTTTGTCTATTTTGTTGTGCAATCCGCTTAGTCTTT----ATACATACACTAGAAAAAAAGTACTTTAACAAA-----ATATACAAAACGTGAGGGCCGAAATGGGGTTATATAATT----TACACAATCAACATGCATTAACCAGTGGTAACACGAAATGCTGCGATTCAATG----ATCAATTTAGTATT-----------TTACGAAGTTTATATATTTA-ATTAACGGCGATTGCTAAGACAAAACGAAAGAT---ACAACTGTAAACGTAAATCAAATTATTTAT-AATATTTGTATTTGCCCAACACAATGCGGAATAATA--AATATACATACTTACTATTAATATAATTATATAAATTAAATCGGTACTTACCTTGGGTTCATTAGCGTTTAATCAAGTGATAGTTAACGACTAATTAGTTTTTTGGTGTCTAGATGAGAAGTAAAACACTAAGGCAAATTTAATGAGGCATTTAAAGTTGTAAACAACTCAACTTTTAAATGAAAAGAGGTCAGACAAATAATTACGCATT--AGTGTAGTTTTAACCCTTTTTATTTAGTAAGAGGCTTTCGGTAGATAATTGTTGAATTAATGTCTTGTAAATATTATTAAATGGTGAATCCTTTTTTGTTTATGTACATATTTCCTAAAGTGTTCGGAATTAACAATTTCCACTT--TCTAT-GTCGGCTATAGGGATATAGTGTCG----CATTTACTTAATTTT--------TTTAAATGTGC-TTACATGTTAAAACATTTTTTTACTACTGAAATATACTATTTAGAAA
TTTTGTGTACATTT-AGTTAGTTTGCTAGTTACATTTTGGCTGAGCAGTAATT---------GAT-------AAATGGCGTGTAATATATATATAAAATTATGTAAACATATTATGTGAACTTGTCTCATTGTGATTCGTTTTACGATGAATACGAATCCTAATAACCCCCGAATCCCGTCTCTCCCGTTCGTGGTGG----CTGCTTTTCTTCTACTACATG-ATATAAATAAT------TATTTATTTGTTTATATTTTTTGTTGAACGCATTTGCTTTGTTT------TTGTGTAATTTGCATAACATTTACCGATATATATACAAACACAGACATGCATAAAAAAATAACTATATATATA------------------TATTATATAAGTTTAATACATAATTATTATACAAAAACA------AAAACAAATCGGGGTGAT--AATGCTAAATCAATTTGATTATGTCGCCGACAATTACGAAGTTTATATATATATATTAAA-------ATAAAGACAGAAATAAAAATTAAACAAACATGAAATCAAATCAAATTATTTATAAACATTTGTATTTGCCAGACCCAAAGCAGTATAATATGAATATACACAATAAATAT---TACAAAAATACAAATTCAAATTGTGTCATATTTTTGTTCGGTAG----TAGGAAGATTAAAGAAAACGTCCGGTTTTTTTCTAA------AAATTATGTTTTAATTATTGAATAATGTTTAAT-----ATTTAGA--TATACACTATTTG--TGTTCAGTTAATTGATGTTTG-TAAACAGTTTAGAATTGCAGTTTAATTTAATATTGTTTTATTTGCTTAATG---------------TTGTTCTGCTTATGGCTAACA---------AAACGGT-----TTTTGATTTTTATTTATTTATCTTTTTAATTTTTTATGGGAAACAACAGCTACATAGTCTACAGTTGTATATAGAGGTTATATCTAGGCATTATTTAGTTGGTTTTGAACTAAATTGAAGTGTGCTTTATATGT----ATATTTATATATTTCT---AGTTGCTTTTTAGGCA
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GCCAAAAAAAAAAAAAATAATAGTAATCCACTAAAAATATCACACACGGAAGTACAGAATAGAGCGGATGCGACGGCCCGGGCGTATGTTATATTTTTGTAGTACAATTTTTTGGAAAAAAATCTACA-ATATCTAAATTAACTACA-TATAGATAATATATACACACATACATTATATTTAAAAGAAAACATTTTCGGTAGCTAATAAATTAAGTAAGCGAATGTTTATGTTTTGTCATGTGATTGTTTAGCAACGTTAACTACTTAACTTATTATTATATTACAACTATTAGTGGTGTTTTAACAGATATCCTATTTATATATATATATGTTTACATGAACGTATCTGATAGACATTAGAGAGCCGTGCACAATCACGTTTAACATGTTCGCAGAACCTTTTAGCATAGCAACTTATC---------TATACCTATATATATACCATAAATTAATGAATGTTTGTCTATTTCCTTATTGTTGTATGAGAAAAATGCGTTATCACAAGTTCAATTCAAAAATTAATAACTAAAATAGTGCGTTGCAGCTAATAAAATTTACCAAAGTCTACG
>CG3267 2260468 2260767|1598 chr2R 2259021 2260790 scaffold_4 1261370 1263171 - 83343|1460 1805
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AAAAAACATGATATCAAGCTATGAAGGGAGAATTT-------GTGCATTTGTGGGCATTTAATGTTCAAAATTGTTGTAACTGTTGCATTTATTAGTGTTAAGTGAAATGTTTTCCTTGTGAATTTGTCATATTTTATAAAAAAAAAAAAACAAGGGCATGGCCCAAGTTTTTCAAATTTAAATAAACCCGAGACCAAAACTGAACATTCAAAATGTTGACGTATCGATTAATCGATATTGATGCCGCTCAAATAACAGAGA----GACGCAAAAGCTTAACAGCGACTTA---------------ACATGAGCATTACATTCGCATGCATTGTCAACACTAAACA
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AGTATATAGTCAAC---AGCCCACGATTAATTGTTTGCTGCATACATATATCAAAACCGAACGGATTACTTTTAAGTCAA--------ATTGCTGCGCTAAACTCTTAAACTGAAACTAAATTCAA---------AAACAACAACAACTATAACAACAGATGGA
>Eb1 2267049 2267852|1604 chr2R 2267488 2267855 scaffold_4 1271432 1271843 - 3433|0 438
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AAACACGAAATTGTTAAAAAAAAAAATATTTAAATT--AAATTTATAACAATTTGTTTTTTACTAGCTTTTCAGAACA----------ATGTGCGAATT---TCTTTTTGAGAATATGAATTTATAAGTTTTAAC------AATCTTGTCATT----GACTTTCGTTGTTTTTTGAGCAGTGTGTGTAGGAAACCAAGTCGAAGTTGTAAAATGTGAGCTAGTTTATGCAGTTGAGATTGGCAATTTGAGTTTTTCAAAATTTTCTTAAACAATAACAATCATGTGTGCGCATGATATTATGAATATAGTAGTTATTAAGCCAATTTTTGCTATCAACTCTTTTTTATTTCTATATTTATGTGTAAAA--ATCCGAAC--GTTAAAAA-TTTAAATAAAAAAAAAACAAAACAAGCAACTCTAATTTCTAAAAACACAA
>SdhB 2320790 2320986|1667 chr2R 2319826 2321616 scaffold_4 1361648 1363469 - 79102|993 1243
G--------GCCCAAGTCCTCTACTCCCAGTTCGTCCCCTGCTGTCCTTAACCAGT----------------------------------GAGCTAAGCCTCCGAAAATGTGTATTGGAGACTCCTCCAG--CCAAC-----ATGCTTACTATG-TTATAATTTATTTAAGCCTAAAGTATCCGACACTTGTTATTACAGTTTGTAAAGGGAAC----AAGACGCGAAAATAAATAATTGTGTATCCACCA
AAAAAAAATGTTCAAGTCCTAAACTCTTTGTGAATCCGCT----CCCTTAATCAGTTGGCTTCTGGCTGTAGGCTGCAGCGGCAACGGCAGAGTTACCATTATGATAACCAGTGT-----GCTCGCCCAGCTCCAACTATTTTTGCTTATTATGTTTATAATTTATTTAAGCTTAAAGTAAACGAAATATGTTATTACAGTTTGTAAAGGGAACTTTGTAATCGCGACATTAATCAACTA-----------
>CG3287 2326128 2326635|1675 chr2R 2325837 2327618 scaffold_4 1368415 1370474 - 34512|300 1009
GGAACATCTGCAATGGGCAGGCTACAGCTACCAGATTTAGTGATCTGGTTGGGTGCAACGCCCCTTGCACTTAGACAAATATGAGAAACTTTCTTTAT-----------------GAACAATATGAGTACAAAATAAAGCATTTGATCCGTTTTTTGTCCGTCTGCTTGACCCGCAGTT----TTGCGCACTT--------------ACTTTATAGTTTTTCGTCCCGTCATTTA--------CCCACTTCATAGGCAAACCCAC-CTCTCATAC--------------------CCCACCATACTAACCGACACAATTCCCAACAAAATGCAACATCAC--AGGCTGATGG-GAGAAGGATAGAGCTCGC--CGCTGTTCAAATTGT---------------------------------AAAACTTTCGTA--------ATCGTTAACTTCATTCTTG-----------------TCCAA------CAATTAGGGCCGTTATCCGTCT--GGGTTAGT----GCCCTAACTAAATCTTA---------------------------------------------------CTTGTTGTTAAACAACGTTTAA-TTGTAATTTGTGCACTGTTTGCTTTGTAATAGTCTATACA---AAAATAAATCGCAAACAATTTCATA--------TGAAACATCAAGTACAAAG
AGAATACTTTCAGCAATTTTGCTATCGTTTC---------GGCCATGAGCTGCTGCAGCAGCTGTT-------------TATCTAAAGTTTTGTTTATCTTTAATCTAAAACCAAGATCAATTCAAGTACAAATTCAAGCATTTGTTTGGCATTTCCTCGTTAAACATTTCGTTCAGTTCACGTTACATTTTCTTTTTTCATGCCAAACTTTATATATTTTTGTCATTTTGTTTAAATTTAAACGCCCCACCTGAACACACACACACACTCATACACTCACATGATACTCCCACTCCCACTCCCCAAACCCCCTCA---CCCAACTAAATGACGCAATATGGAGAAGGATAGAGAGAAAGAGAGAACTCGCTACGCTGTTCAAATTGTGCATAAAGTTAATAATTAAAAAACAAAAAAACAAAAAATGTCATTCATTGTTTGTTGTCGACTTTGCTTTTGGGTCTCGTATTGACAATTGCAAAAAGTTCAGCTTGTGTAATTATTAATTTTTGAGTTAATAATTGCACAATTCAAGTCTTAGCTGTTTCTATTAGCCCAAATTGTAATTTTGTGCAACGTTTTAAGCCTATTTTTGTTGTCAAACAACGTTTAAATTGTAATCCTTTCATTGTTTG-TCTATAAAAG-CTATAAATTTATAATAAAT-GCAAACAATTTCATAAACATTTATGAAATAC--AGTACAAAA
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GGTTACGGGTATGTGCTGTAAGTTGCAAAATCTGC------CAAGAGACAG
>CG15236 2348507 2350173|1703 chr2R 2348603 2349180 scaffold_4 1398902 1399610 - 4883|0 750
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AAAAAACCAAATTATAATC---------------AAATACACGCATGCATATATTGAACAAATTGGAGAAACAAAAACAAGGTAAAAGCAAATTAATGCACATTAATTGAATTTTAATTGGATTGGAATTAAGCGTGGGCAATTATTAAAATTTCAACTGCAGCAGCCATAAACTCACACGAAACTAATTAAACAGTTACACACACTTTCTATCAAACACACACACAGTCGCATACTCAACTTTAACTCAGTCTTTGGACTAACTCAGCAGTAGCTATATACAATTTATGGATTTCA-TGTAAAGCCCTCCCTATCATGAGTGCATTGCACACTCACTAAAACAAATACAAAACCTATCAACAGCAACTAGAAGAACAACAACGACAACTACAACACACACACATGCATATAAAGTTACTCATTTACCTATAGCTGATATGTATGTATAT------GTGTGTTAAGTGGAACAGATTAAATTGC--TGAGAGCAAAGTCTAGTTTATAAGCTGAATGTTTATGCATTTTACATACAACAACAAAACGTAGTTGAGAAGCCAACAAATCTACCCACCCCCGCCCCGCCATTCAACCCTCTGCCCAGTCTCTTAATCAAATGGAAATAAATGTATACACCATTAGAAATTTTAAAGAATTTATAGATGTACT-----------TAAAGCCCACACAGACACACAC------TCACACTGTG-CAACATTAAATACCTACACATACATACATAC
>CG15236 2348507 2350173|1704 chr2R 2349247 2351201 scaffold_4 1400093 1402265 - 8331|0 1154
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AATTTACGATATATTTATATACGAAAATATATACCAAATGAAGCG--TATTTTAAGCAACTAC------TTATATCCATAACGTAAAAACTGAGCAATGACAAATAATGAATTATGTATCTGTATAATCAGTTGCAGCTAGTTTAAGATAATATTGATTCATGTTATTTTATTTCAAC----TTTTTATCGTTCAATTAGAACTTATTTATAATTTTATCGCTACTTGAAGATATTATGATAAATACGTAACAATTAAAAAGGAAACAACAAATATTTTAGAGTATTATATATGGATGATATATATATATCGTTTTTAGAAGC-CACAGT-GGCTAAGAAAGACACCATATCTTGTAGTAATAAACACTTTTATGAT--ATCAAATTAACGTTTAGTCATCAACTAACAACT------ATTTAGTCCATTAGTTCAA---CATTCACTTTTATATAAAGCATAAAACCCGTTGTTCATTTTAATGAGAAATTGAAACTTTATTTTAGGCGTGATAA---TTAATTCACTTTAAAAATGAAATGTAATTTAAGCATAAAATATA---CTTGAAAAGTAGGCACAATTATGGATATTAGATAAAAAGAAAAAAACGTGAAGTGAATAGGAACTTAAATTTTATATATATACTGCATACTAAACGAACGTGACAAAAGAAACTTTGAACTTATTTCAAAACTAAATTGATG-GAATATATAAATCAAAACAACGGCAAAATGTATATTTATAAAAATCAATATAAATGTACTGAAAAACACAAATACAAAAATCT----------TTAAAAAAAAAAACCAA--GTAAAAACAAATAGAGAGAAGGAACTACAAATTGAAATCGTGTACTCGTAATCCGTATTTAAAATGTATACAAAATAAATATTTGCGAATATATCAAATATTGTATGTGTAAAATAAATGTAACTGCAAAATCTCTTAACTAATCTATTTACAAACATATATATGTATGCATATTTACAGGACTTACACACACACGAACACACACACACACACACATATAGACCATTACACGCAAGTTGCGTATTATATATGTATGTGTAAAACGGATTTTGTGTTCCGAG--AAAC--AAATCAAATTGACATGAATAAACCAAA--------------TTAT
>Spn1 2396661 2396686|1749 chr2R 2396639 2397126 scaffold_71 162545 163029 + -1853|22 56
---------ATAAATAAAAACAATATTTAAATTT-
TTACCACAGACAGTGAATGGCTTTATATAAAATTA
>CG9460 2400005 2400079|1755 chr2R 2400002 2400134 scaffold_34 730878 731018 + 80|3 94
GTCGGC------GCTGGAATTCCCCAATATGATGTTTTGTCC-----------GCATCCAATAAATGCCAGTTCACGATGTCAAGTGCACAA
GTCGCCCCAAAAGAAGGAGTTC------ATCATGTCCAGCCCAGCGCCCGCGTGCAGCGATTCCATGCGAATGC---ATGTCGAAGAAATGA
>CG30158 2432157 2434426|1802 chr2R 2432067 2432830 scaffold_34 779509 780149 + 6254|90 773
A---CCATTATTTTGGCCGCCAGCGTCGAGCTTAATTATGTTATTTA-GTTATTACGAGTATGTTGCCACAATGTGAATTAATAATGGACGCCAGTTAATTAGCGTGCATAAACAAGTGGCGCCGTATTTATGTTCGGTGCACTGAGCTGATTATTCTGATAAAGCTACCCAGTTCACAAAAACCTCTTGCTCAAGGGCACAAAAATTTCGATGAATTTGCTACGCGGCAAAACATTTTATAGTTTGTAACCACCAGAGCTTCGAAACGATGCCGTCATGACACTGGCCTCAGATTAT--ATGATATTTCGTAAGCAACTCTGATTAGGTAAATTTATATTTCATTATGAATAGATATCCTAGCTTATAAGCCGTGAATCAAATCAAATTTCTTTAACAACACTATAA--GTAAGTACGCTATAAGTACAGCAAAAGCAAACACAAATACTTATTCTGCGACATTTTAATCCAGTGTCATAGCGGCATAAAAGATAAGGTATTATTCCGACACTGAGCTGACTTGCGAGGCATTGTGCACACAAATCGATTTGAGTTGCGGTCATTAA--GGTTGGAAGGGACCAGGTTTATTTAAATTTAAAATTAACTTTTATACGACAAACAATTTCGATTTTCGCAAACTTCAGTACAGCTCTGGGTGCCCGATTTGAATTTAATTTAGA
ATTGCCAAAACTGTGGTGGGTCATTTTTAATTTAATAATAATACAAATAATATTATTAATA---------ATTATGA--TAATAATGAATGTCTGCTA---------CATGAAA--------------TCGTGTACACTCAACAGAGCTAATTATTTTGATTAAATTGAATAATTTACAAAAG----TTGCTCAATTGC-----AATTAAGATG--TATGATGTAAGGGTAAACGTCTAGATATTCTCGATA---------TCAAGACGCAGCT-TGATTAC-TTATCGATAAATCATCGATGATATATCG----------ATATTCTATAAATCCCAGCTTGATTACTTATCGATTACTCATC----------GATACCACATCGA--TGACTTAACGATAACTCAATGATGAGTTAGCGATAACT--------------CATCGATGGTTTATCGACAACTTATCGAT--AACTATATTGTTGTTTA------CAGCTATAAGTACGA-ACTTTGCTCAACTGTCCGGCATTCT--------ATTTAGTTGAGATTCAATATTTGAATGGTTTAAGGGGACCAGTTTTATTTGAAATC-------ATTTTTATACG-----------------CCGATAACTTAACGATAACTATATATCCTTGCTTTGAATATGAACTAAA
>CG30158 2432157 2434426|1803 chr2R 2433354 2433714 scaffold_34 780928 781284 + 2514|0 418
TCAAGGATAATACAGGGTGAACTTCTTATGCCAAAAC-----GCCAAAATGCCAAATCAAATAGCCCA--------------------------------CAATGCACATCCTGTTCGCAGGAGGCTTGCGGCAGCGAATAATCGATAAATCTGTTTTTAATACGCAACTTGTATCCATTCGCACAAGTTACACTTGCATCTGGGTGGGTGGTGCGTGGGTGTGCTCGCCAGTGTGTGATAAGAGAATCCTTTGTGTTTGTTCACCGGAATGTGCTTAGCA---ATAAGATTTATTTAAAAGACTACATTTAGGCGGTACC-GAGTACGGCGGAGATATCTAAATGATCTGTAAATGGAT-----GAAATACGGCATATGCAAAGTGAATTGTGA------------TTAAACCAAATA
TCAAGGATAATACAGGGTGCATGCTAATTGCCAAAATTAGGAGCCAATCAAATAAATAAAGAAGAAAAACTAATATGAATTTTTGCATTAAATATTAGAGCATTAGATGTTATATATTTACTAGGCTAACGTCAG-----AATCAATAAATGTTTTTTAAACA--------GTTTGAAATTATAAAAAATATATATATACATATATATGTA---------------------TATTTGAT----------TCAGAGTTTTTC-------ATGTGCTTAACACGAATAAGAATTATTTG-----------TTAAACGTTGCAAGAGTTTGGTAAATGCTTTTAAGGGATTTGTAAATGAACCAACATAAATACGGCAGATGCAAAGTGAATTGTGATGAAAATAATATTTAAAGCTAATG
>CG30158 2432157 2434426|1804 chr2R 2433761 2435484 scaffold_34 781333 783189 + 9955|0 789
CAGCAAACA--ATGCACCCAGTGATTGCAGTAATGGAT----TCCAGCTACTGTAAACACCTGGGAAATGTCAGAGGCGTCTGAATGGCCCCAAAATAGTATTGAGTATTGTATTCGTCCATGGAGGATTGTAGTTA--TACATGCATACTTATGTGC-----------GGCATT-------ATAAACCG------CTTACAGTACAGTTACATACGGATACATATA-GTACACATA-GTCAGTACCTAAACAAGTTTGTGTGTACAGTTTGGATGTTTGTTTTACAAGTAATACGTTGTT--------TATACATTGTTACTAGGTGTAGTTA----TTAACAACAAATCTGCTGACTA-------GTCGTCGCCACTCG--CGTATATCATGAACCAATGGGAACACAAGGGTGCGGAGGATTCCACCCTATCCGCCCCATCGACGAGGGACCGCGAGATGCTCGATATCTTATCCGACCTACCCGATTTTAAATAAACATATTCG--------------TCTACGTAGTTCGA-----TTGATTGAGCGCACTTACACTTACCTACTCTACTGAATCGAAGGATCGTGGCCCATGGACTACACGTAGTCTAGGGAAACCCAAATTAACTCTCTAAGTGTGCGTATGTGTGT-CATGTACTTGTAACTA--------------ATTGAATT---------TCAATT------------------------CAAATTGAATTAT--TGACAATTGTATTAGCCAGTTAAAATAAACCACAATGCGTCCC
TGGCAAATGTTATATGCCCTTTGGCTGGAGTTGAGGCTGACGTCCAGTTAA-ATGTATCCTTAGCATAAGCACGATTTATTTAAT--------AAGTACTACTAAATTGTTTATACATT-GTTATTAAATGTAGTTAATTGCA---ACAAATCTGTGCAAGAGAGAGAAGGCATCTGGTTAAATAAGCTAGGAAATATCACGGGCAAGTTATATACATATATATATATATATATATATATCTGCATAGTAATATAACTGTCAGATATATGTATATCTATATATATCTAGAAAT-TGTTGTTGCGCAAAGTTTACTTAGCTA-TAGGTTTTGTTAAACATTCAAATCAAAATTTTGAAATATATATTTGTGTACGTAATTCGATTGTTCATATTAAAACAAACAAAAAATAAATAAATTAATAAATTGAAAATA------------ACTAGAAAGCCCAACAAAATCAATGCCGAGTTACAGTTACTCAAAAATATCTACACATATGCAAAATGCAAAGAAATTGTACTTAATTTTAAAATATCAACAGAAAGCAAATAAATTTACTAAAT------------------GTGTCCATTAAACTACA-----------GAAATTCAACTCTTTTATTTATTTATATATATTTATATGCATATATCAGAAACTATTCTTAACAAATGTATTGCTTTCAGTTTGACTCAATTATAAATGACGCACGGTAAAAGAGTCTAATTAAATTTTAATGTCAATCGCTTTAATTAGTTACAGAAGCTGGCAACAAGGTCT
>CG3358 2436481 2436494|1806 chr2R 2436358 2438714 scaffold_34 784550 787300 + 46000|126 139
AACAACATGCATTT
AACT-------TGT
>CheB42a 2462025 2462100|1838 chr2R 2461588 2462025 scaffold_3 4711336 4711766 + 881|452 452
T
A
>CheB42a 2462025 2462100|1839 chr2R 2462026 2462086 scaffold_34 812961 813030 + 1325|0 69
CACGACAATTGTATATGCATGCTGAACATA---------CAGCGAAACACCATTAAAGTCTATAATTGGA
CAGGCTAATGGAAAATGCATGTCGAAAGAATGAAAGCAACAGGAGAATACCATTAAGGATGATTATTAAA
>CG17002 2500582 2500737|1871 chr2R 2500393 2500730 scaffold_57 122331 122637 - 9789|189 341
CCTCTAACCCCTAACCCCTTTTGTCGCTACGGAACTCGCTAACTGATATACTTACGATTTTAAATAGACATTACAACA----CTGACTACGCTTCCCACGTGAAGTCGGATAAACGAAATAAAGCACACAACTATGGCGTCCCTATTTTCCAA
TATTAA------------TATTATATTTGCTAAGCTC----ACTCATAATTTAACGATTTTAACTGGAAATAATTTCGATTTTTGACTACGCTGCTT---TGCAGCCGCA-GCACAGAATAAAGCACACAACTATGGCGTCCCTATTTTCCAA
>CG30159 2505661 2506121|1875 chr2R 2504939 2507635 scaffold_57 124788 127402 - 34298|723 1220
TTGCGATCTCCCCGTTCCTGCCTCGATGCTATTTACAGGGCTACCTAGCTCGCCACCATTAACTTAGTTCCATGGCCAGCTACTCTCTATATTTTTATTATGCCTGTTTACTAGCTTGTGCATTTGTGTCTTAGTGTTGCTTGCTATCTATTGTTATACGATTGGCAAATATCATATACGATATAAGACAGCATTTGTTTACAAACCCTCGAGCACAAGTACACAAGTCAGTCTCAAAAGCTTATTAGTAAGGGGAATAGCTAGCGCGACTTGCCCAACGCGACTTTCGATGCCCAGGCGGTACGTGATCGTGTGCTAATT--TCCACACCCAGTAGAGCCAAGAACGTCAGCATTTTTTAAATATTCAAATAAGCGAAATGTTTTTACCACGGATGACATCA-------------GTGCGTGTGCCTGTGTGTGTACGTGTGCGTGT----------------------TTCCCAAATAAAATGCCGAAATACCTAA
TTGCTGCAGCCCCGCCCCCTACTCAACGC-----------------------CCCCCCTCTATTCATATTCATAG-----TTCTCTCT----------------TGTTTAA------GCGCGCTGCAAACGAAACGTTGAACGTTTTAATTTGTTATTTTAATTCTAAGT----TGCACGAAAAAAAAAA----------ACAAATCC-----------------------------------------AACGGAAATCCCAAAC----TATGCAAAAAGCAA------------AAGCAGAACGTGTTTTGCTGCTAATGAAATGAAACTGAAACGAACGAAGGAATTTGG----TTTTAGTTAT--AAACAAATGATATTGTTGTTATTCAGTTCGCATCATATATATGTTCGTGTGTGTGTGTGTATGTATGAACGTATGTATGTGCGTGCATTTGGCTTTATATGCTTCTGAATAAAAATGATATAATAATATA
>Tsp42Ea 2509502 2509788|1878 chr2R 2509424 2509751 scaffold_57 129150 129526 - 8776|78 383
T-----------------------CGACAAAGGAC--TAAGGCCTTGCACTAATTTTAATTGAAACCGAAAGTACGAATTATGTTGCCCAATTTTACGAATA-------------------TTTACCTGATACAGATGGCCATTCAAATTTGCATAATCTCAAG-CGTAAGCAGCAAATGCAGCAAATCCAATGACGAATGCGTAACGATCACTTTTGTAAGATCGTTTGTTCAAAGTTACAC-----------TGAATGTGCTAATATGTTTAACTGTACAAAATAACTTATACTCCTGGAGATT
TGGGCTCCACCTGGGATAACTGGCCAGCATAGGGCTTTGAGGCCTT--ACTAATTTTAATGCAAACCGAAAGTACGAATTATGTTGCCCAATTTTATACAAATCATGCACCTACTTATTAGTTGATATGATTCAGTTGGCCATTTCAGTAAGGATA---TCGAGTCTCACATATTTTTTGTTGTTCTTTTAATTACGCAC-CTTGACAATATCTATTGAAAATTATATTCATAATCTTTGCACTGTTTTCCATATGCTTGTGCTAACTTTTTTTACTGTACAAACTAAA-TGTATTTGTAACGATT
>Tsp42Ea 2509502 2509788|1879 chr2R 2509752 2510053 scaffold_57 129803 130123 - 330|0 36
GCAATAAACGGAGAAATTTATTTACAATTTACGAAAA
AAATTGAAAGCGTAAATATTTCCACATTTTGTATACA
>Tsp42Eb 2511548 2511664|1881 chr2R 2510802 2511690 scaffold_57 131040 131883 - 23570|755 871
AGCCGAAGTCAGATACAATCCTTAGACGTAGCCCAGTTCATAGCATAAATCCAACACACGAATTCCTCACTCACTCACTCACCGTAAATAAACCAGAATAGGTTAAGCCCAATGAAA
-----AAATTAACT-----------------CCTAGTCTATATTTTACATCCTACATTCG--TTCATCA--CAGTCATAAA---TAAACAAATTAGCTTTAGATACTTACAACGTGA
>Tsp42Ea 2515790 2516074|1886 chr2R 2515707 2515980 scaffold_57 136782 137035 - 1873|83 283
TCGACAAAGGACTAAGGCCTTGCACTAATTTTAATTGAAACC-GAAAGTACGAATTATGTTGCCCAATT-TTACGAATATTTACCTGATACAGATGGCCATTCAAATT-----TGCATAATCTCAAGCGTAAGCAGCAAATGCAGCAAATCCAATGACGAATGCGTA---ACGATCACTTTTGTAAGATCGTTTGTTCAAA
TC--------------------TTTTAACTTGAGGCTAACCCTGCGATTACGAAATTTATCTCCATATTATTACG---------CTCTTGTAGACGGTATTATAATTTTCTCATGAATTATGTAATGCAT-AGAAGGATACATATCCAACCCTATAGAGTATATGTATAGCGGATCAGCTCTATAGGCACATTATTTCGAA
>Tsp42Ea 2515790 2516074|1887 chr2R 2515981 2516150 scaffold_57 129458 129639 - 491|0 111
GTTACAC-----------TGAATGTGCTAATATGTTTAACTGTACAAAATAACTTATACTCCTGGAGATTGCAA-----TAAACGGA--GAAATTTATTTACAATTTACGAA
TTTGCACTGTTTTCCATATGCTTGTGCTAACTTTTTTTACTGTACAAACTAAA-TGTATTTGTAACGATTTTTATTATTTATACGAAATGCAATAAATTTATAAAT-----A
>Tsp42Ec 2520241 2520435|1892 chr2R 2519454 2520243 scaffold_57 134012 134821 - 18706|828 830
ACT
GTT
>Tsp42Ec 2520241 2520435|1893 chr2R 2520277 2520560 scaffold_14 956650 957011 - 2196|0 191
ATATGTCTACTTATGTTACCATATAACAAACTGTTTTTCGAGCCGTGCCAATATTAATATATACGTCTACATTTCGCCTATTTATCAGTTACT-----------ACTTATGTTATTCTT----------TATAC-TCTTTTTGGAGCAATGCCAATA---------TTAATATATACCGCTACAACA--TTT
ATGTATATACTTATGTATCTATATAACTAATTGTGTAATGAAAAATTGAAATAGTATTGCATGTCTTTTCAGCTCTTATGTGTATTACATAGTTTGATTAGTTGGCTTGCAGTATTTTGATTTTGGTGATATACATCTAATTTTTCTAATACCAATAAAATTGACTATGAGAAATACATCTAAAGCAATTTG
>Tsp42Ee 2529575 2530177|1905 chr2R 2528801 2530236 scaffold_57 145770 147387 - 30023|790 1588
GCAATAGGTGTATCCATCA-ACTACATCTAGAGGCACACCCACATC-----CAGTAGCACACACACCTCACATTCTCATTAACTTT--------TACAGTCGTTGAACGCACAT------ACACAAC-----GGGATACACAATAACACCTTGAAATAAGCCATTTAAGTG-------------GATATTTGT------CACGGAA------------------AAACAAGAAGAA-----------------GCTTAGTTTAAGGCGATATGAAATGCTTACATTTTTGATATCCTATGTA-----TTTCTGGTAAAATTCATGTTATACCTATCGAACGAACGAGCAAACAAAGATATTTCCAAAGCCTTTGTACAAACGTTTTAC------TTGTTAAACCGAATCCCCACACATTAACAA-----AATAAACACGTTAAT-----AATGATATAT-----------TTGTTCAAAATTAAGG-----ATATAATCTATAAACTGTTGAGA---------------GTCCCAAT--GCGAAAAGAAATATAAATTTGTAATAAACATATGTATATACTGGTATATATGTTTGTAAGTACAT--------------TGTTCATTCGA--------TTCATATT---TGTA-AGGAGAATCTCCGGGA--------AAGATTTAAATT-----------------------TGGAAGAAGCGTCAATAATC-----GAGAGCTCGAATTGCATAAGAAATTTATGAA-TAAAGCATTTACTATGTATTTATATACCAA
A--------GCGAACAGCACACTACATAAATACACACACGCACACCATACACACCAACGCACACACA-AACATTCGCATTAACTCTTTAATATGTATTGTCGTAGAACGCACACGAACTAAAACAACTTTGGAAAATGTTCGGTATATATTTGAAGTAAACCATTTGGTTGCACAAATATTTAAGTTATTTGTTTAAAATACGGAACAGAAGAAAATACTTTTCAAAAACGAAGAAAGCGAATAAAAATGTATACCTAGTGTAAGACGCTTAAATGTTGTTTAATCATCGCTTTCGTATTTAATTGCTCTTTGAAAAAAAAAA----AAAACAAGAAAACAAAACAAAACAAACAAACGAATCCAAAGTCGTTGTACAAATAATAAACAAAAAGCTGCTAAACAGCAAATTCACACAAATACAACGAAGAGCAAATCTCTCAATGTTACAATTACAAATTATTGTTTTCATTTTTATAAATTTATACGTACATATATACTTTGTAGTGTTAAAGCCTTATGCTATACTTGTACCAGTTGGCTAAAACAAGTGTCCA-----AATGAATATATATATATATCTAAATATATATATATATATATATAATATAAATATATGTATACATTCAAAGCTGTTCATCATATTACATGTACATTTGAATCTCTTGAAGTTTTAATAACATTTGAATTAAATACGCTAAACCACAACAAAGAAAACAAAACAAAAAAAAACTGCAGAAAAACTCGAATTGCAAACAACGTGAATGAATTAAAGCATTTAAAACGTATTTATATACATA
>Tsp42Ef 2539587 2539895|1918 chr2R 2539223 2539665 scaffold_57 158427 158900 - 13784|383 478
ACAG-------------TGAAACCTGAAAATACTCAACTGGGATTGGC---AGTCGACTTGTTAAATTTC-TGAAGAATATTACACTATTAATTAA
AAGGTGTTGTCCGCTGATGGAACTTGCATTTGTTGAAATTGAATGGCTTCAAATAATATTATTATATGGCGTTTAAATTATTATACTATTATGTAA
>Tsp42Ef 2539587 2539895|1919 chr2R 2539666 2539887 scaffold_0 2726972 2727156 + 983|0 233
TTGGCTTGGCAGGT---CTTGAGCG-TTATTCAAG-----ACTGGGGTATTGCTGTTATATTTTCGAAATTGAAACTCAT-TTAATCAGCACAGTGCACTGAAATGATCCCTTTTCACACGTTGATTTCAGTGAAATACAGAGGGCAACTCACAACTAAGA--TTAAGAAAAGTAAAATAGATTTAGTTTTATTTATTTCAACATACTTTTAAATAAATTTATCGAACCAAAGT
TCTACACTGTAGTTATACTCAAATGCTTACTTAAGGGATTACTGCCATGTTTTAAGTGTATTGAAAAAACTGAAATTCGTATCGATAAACA----------------------TGTACGCTTCGAGTATAATAAAAGATG-------------AGCTAAGAATTTAACAAAAATATAATTGATATA--------------CACATATCGTTAAATAAATAAATCTAACCAAAAT
>Tsp42Ef 2539587 2539895|1920 chr2R 2539888 2539909 scaffold_33 742976 742997 - -82|0 7
CAAGCACC
TGAAAATT
>Tsp42Eg 2544704 2545049|1928 chr2R 2544110 2544882 scaffold_57 165639 166393 - 22597|612 807
GTTCACATACCATTTTGAAATACATTGAA-ATGCATTTCGAAAATTCAAGTTTAAGCTGCGCATACTTAAGGCCAAAGAACTCTCCATA-----CAAATACTTAAGCCGAAACTCGATAGAGATTCCAAAACAAATTTACTTAAGCCAAGCAAACCGA----------AAGCAGTGCGTTGTTTG-TATTCTATTT
-----------------------ATTGAACATGTATTCAGCACAC-----TTCAAAATGCGCATACTCAAGGCCAAAGAATTCTCAATACTGTGCAAATACTTACACTGTA-----CTACACAGCACTAAAC---TACACATACACTAAGCAATCGAATTTCCAGTCTAAATATTGCGGCGTTTGCTAGTCTACCT
>Tsp42Eh 2546517 2546732|1931 chr2R 2546386 2546836 scaffold_57 169894 170387 - 5426|138 424
GA--TAGTATTTAGGGATTTGCAC----GAACCGTATTATCGTTATTTGTTGTGAGTAATTTCCTAGCCATACGGCCCTGGCGAATTGTGATT---------------------------GTAGTTTACGATGATTAACCAAGTTAGGCTACAGATACCAA-GTATTCATTCATAAAA----------------CTGTAAACTGGCACCCACGCC-------------CACGAAATAATTCGAAACGAAAATAAAT--------AAACCCGTTGCCATTGACTAAAC
GCTTTAATTGTTGATTATTGTCGCTCTGTAACTGTATTATTATTATGCTTAGTTAGTTTTGT------------GCCATTGTGATTTGTAATTTAGTACAGCAAAAAAAAAAAAAAACACATATTTTACTATATTCATTGA--TAAAAATATCAATGCCAGCGCATCGAATCAATAAATACAATGTTTGCTGCGTTGTGAACCAACTCCCACGTCAGAAGAAAAAAATAATAAAATACTACAAAAACAATAAAAACCCATAATAAAACCTGTTGCTATTGACTAA--
>Tsp42Ei 2548360 2548771|1934 chr2R 2547807 2548754 scaffold_57 172045 172988 - 19357|554 993
GGGGTTTTCTAAGTCATCTTAGTATTAATTAACAATATATTTGAATCTGTTTTCTAATCAAATGTTTCCTACTTAAATATTTAATAACCG-ATTACTAAAGGCAAACCCAATCTGTACAAAGGGCTTAAGATTTTAGGTACGATTTTCGAGAAATTTGTAATGGGAATAATGTTCATATATT-GATAACGTCTTTTTGATA-------ACGATAGTCACATAAAG-----TTATTACTCTTTAACCAAAATCTATTTATTAAGCTTTTT-----TCTCCATTATCATTACCAAACCAATAGA-----------CATTTTTCAAA-----------TATTCTAATTTCAGTTCGTAA--GAACCATAGAACACACCATTTCGATCTTGTTTC--TCATCATTTTTTCAGTTGTATACAATTAAAAAACACATCAAGGGCTT
-------TCAAAGTC--------------TAACCTTAAGCCTTAAGTATTATTTTAATTCAAAA----CTACACTAATATTTAATTGTTTCAATATTAAAGCCA----CAATTTTTACTATATATGTATATACATATAATCAACTGCCTAATCATTTGTAACCTCAATA-----TAGATATTCGACAACGTGCGTGTCACATTCATCCATGACCATCTGGTGAAAAGCGCGTAATGCCCTTTGCTCAGGGGCAGAGCCGGCAGCCTCTTCGATATATCTGTATTCATGACCTTATCAATATAAATGTAGTTCTCATTCTGCAAAGTATTGAATGTGAATTTAATTTGAATTTGTAAGCGAACTAT---GCACTCTAGTCTCACATAGGGGCAGCTGTGATTCATGTTTGTGCGCCCATCCAAAAATCCCAACAGGAGCTT
>Tsp42Ei 2548360 2548771|1935 chr2R 2548755 2549509 scaffold_57 173973 174726 - 10970|0 16
ATAACTTCAAAGTAAAA
AAGACCTCCAAGTAAAT
>Tsp42Ej 2554486 2554575|1940 chr2R 2554356 2554911 scaffold_57 176617 177156 - 4401|137 253
TGG-CCGAGGATACCCC--------TGCATGATTATTGATAATAA-------------AAATTAACCAA----ATTAGCTAAAATGCCATTAGAAAATAAATACT-TTCCATAGCCT
TAGACCTAGCGCAGCATATTTGTAGTGCAATTTAGTTAGTTGTAACGCGCTTCGAGCCAAATTAAACAATTAAATTAGTTTAATTGCCGTTTTCCAATAAAAAAAACTACATAAAC-
>Tsp42El 2560129 2560358|1945 chr2R 2559783 2560546 scaffold_57 181650 182443 - 8834|350 613
-TGAATATTTA----------------CTGAATAAGAAACCAAACTCCTCAAATCTAAGTGTCATCAGTGTATGGTTT------GTTTTTGATACGAAAA-----CCCAGCGTT-ACTTGCCAAGCAACTGAGTTAATCTTTTTATTAAAGCAATGTTTAACACATTCGAAT-----ATTAAAATAATATGTACATAACTACAAGTACCAAACACATGTCGTTTAAAATACCAAATATATTTAGAAAAATTACTTTCAACAATA
TTTTATATTTAGCCAGAACTAAGTCAGTCGAATTGTACTCCTAGTACCTCATCTATAAGTGTCACCAATGTACCTACTAATGCAATCTTTGAACCGCACAGAGCGCCATGTGTTCACTTGCCAAGCAATCAAATGA--------ATTAAATATAAACTTAGC----TCGAATAAACAATTGCAATCGCTTTCATTTTTCGACATCTAGCCATCGCATTTTGTTCCACAGTGCAAGC-TCTTCAAATCAATTA-----GGCAAGC
>lbm 2563561 2563778|1950 chr2R 2562705 2563561 scaffold_57 185625 186530 - 30502|917 917
T
T
>Tsp42En 2565733 2565856|1953 chr2R 2565633 2565737 scaffold_57 191348 191454 - 5122|102 106
CAGGT
AAGGT
>Tsp42Eo 2568321 2568395|1955 chr2R 2567219 2571457 scaffold_57 192664 196756 - 141993|1148 1222
CCACGAATGACATTTATAGATAAGCACTTGCCACTTGGATAAATAATAAACCAAAGTTTTCATAAGATCTTAATG
----AACTAAGATTTATACGCT-GCATTTGCTA-----AACTACAATAAACGACTTAACTGCTATGATCCATAGA
>esn 2638641 2639683|2032 chr2R 2636226 2639673 scaffold_57 276852 280592 - 113995|2605 3841
CCACCCCCCGTGCTGCCACCCCCGCCCTTCAACCTGAGCAGCTACTACATCCTGGACACGATCCTGGAGGAGCAGAGTCTGA---TGCTGCCGGAGAAGAAGCCTGGCTGCCTGAGGAGGGTGTGGAACTTCTTTGGGCTCGGCAAGCCCCGCCACTCCAACTCCCAGCACAGCAGCAACGGAAGGCTATACAGCGTGTAGCTGTGGAATGAGGTTTAAGAAAGGTGTTTTTAGCACGGTTGCCAACAAAGGTTGTTCCATTAACTACAAAAGATTAGTTCTTCAGAACACTTTTTAAAAATGTACATATATACAGATGGG--GTAAGCCGTGTTTTTTAAAA-----------ATATATCTTTTTAATGGCA--ACCGTGGCTGTAAATAACATATCGTCAT-------GTATAATACACTTA----------------------------------------------ATAAGAAGGCACATATGAGAT------CAGAGATGA-GAGAAAT------------------------------------------CGTTGTACAAAGCTGAGAC-TATATCA--TATTTGCATAT---TCATATACACATGCCCAGTCGGGGGCAT-TACCATAG-GTATAAGTTATTCTAGAGCTAGATTAGGCGAACAAAACAAACGAAAAGTAGAGACCACAAACAACAAACAACGCAATCAACGAACAATAAACTCCAACGAAATCCTATCGAAGGCCAACAAAAGAATCTCCGAAAGAGTGAAAGTATTATTTGTTTCAGA-----------------------------------------TCTTAGC----CAAATGTGCAAT-----AATTTAAAATGGCAACGCAGAACGCGAAATTAACTCTTCCACCAGCAAAGCGAAACGCAGAGATGTAAAACCATTAGCATTTGC-CACATTTGCGGCTTCTTGTCTTCGAATATTTTGTTAATCAATTCGAATTGAAGATTCTTTTGTTTGAGAGTCAAATGTTTTATGTAATTTGCGTGCTTTCTCCGCGGCGTGAAAGGGAAATTGTTATATAAAAGCA---------TGTGTCCAGAATACGTTTGTAACCAACCAGTGAGAGTTAAACGAAATCTTATTTCTAAGC-------TATGCTATATCAACAAGTGTGTATGGAAACATAATCAAAAGTAAAAT---------ATATGTCTGTGTATTTTA
CCACCTCCGATGCTGCCGCCGCCGCCGCTGAATCTCAGCAGCTATTACATACTGGACACCATACTCGAGGAGCAGAGCCTCAGTCTGTTGCCCGAAAAGAAACCCGGCTGCTTGAGGCGTGTCTGGAACTTCTTTGGCCTGGGCAAGCCACGTCCGGGCAATGCACAGC---------------GTCTATATAGCGTTTAAAACTGGA--------TATCGGGGCTTTTGTAAATGGACATATCGATAAA---TACTATATTATATGCAAA--ACTAATACAACAT-ATATTAACTAAGGATTGGTGGACATTTAGATTAGCTGTAAATTGAGCTGGTAAGAAAAAACACACACATATTTTCTTTTCTTTTCATTTTCCTTCTTGTATATTACATTTATCCATGCTGTCCGCATACAACACGTATTATTTCACATACTTTAGCTCACAAAGTATTCCAAACTACATACATATAGATATATACATATAGGGTATACAATGGAGATGATGAGAGACTCCCTTCCCCTCTCTCTCGGTCACTCTGTTTTTTATCTACAACTTTGTACAAAGCTAAAAAGTATATCAAGCATTTACACACATATTATAGGTATATACGCA--------CATATATTATAGCATATAGTATATAGTA----TAGATAAGTCGATGCTAAGAATCTGCCAGAAACAAAGGATAGTAAAATAAAACGCAATCAACGAACAATAAACTGTTAAATAA----AGCAACTGCCAACAAAAGAATTTTTTAA----TAAAATAATTAATTATGAAAGAAAAAAAAAAATAAAAACAAAACAACGAAAGAAGAGCGAAAGTTTTCGCCTAGCAAATGTGCAATAGCTAAAGTTATAAAGAAAACTCACCCCGCTCCA--AATCTCTATATACACAATTCTTTACATGCATATATATGTATATATACATAAACATATATCTAGATATATATGTATGCAAATTGGTTTTCATTCAGTT-AAAGCGAAAATTCTTTTGTTTATCTGCGCGGT-TTTTATGCAATGTTTCAGCTTTCGCCGCCGCGCGAAAGTGAAAGAGTTTTATAAAAGAAAGGAATTTTTGTGTCCAGAATTAGTT------------GCGAAAGTTTTGTGTAATAATAATAAAAAGCAGCGAAATTTATTGCGCCAATCAA-ACGAATGAGGGTAAAGTTAAAAGTTATATACGAAACGCATACATATGAGTATTTTA
>esn 2638641 2639683|2033 chr2R 2639674 2639743 scaffold_57 280595 280648 - -208|0 9
TTCTTATCAA
TATTTGTTAA
>Spn43Aa 2661018 2661065|2057 chr2R 2659367 2661319 scaffold_57 304875 306746 - 68164|1683 1739
TCGTCACACATTTCCCT---CAGA-----TTAAGCACTTTAAATTGTAATCAT-TAC
TATTCCCGCAGCTCTCTATGCAGAGCTCTTAAAGTACCATATCATTTTATCATATAC
>CG11060 2690023 2690101|2088 chr2R 2687992 2692475 scaffold_57 338819 343026 - 65063|2076 2157
CATTCACAACACCCTTTCCCAGTTTTGGT---CATATTTTTTTTAAGTGGCAACACCCAAATAAAATAAAAAAGCATTTATT
CATTTGC------TTGTCCCGGATTTAGTGAACATCTAGTTTCCGTTTGTCC---TTCAATTCGAAT-------------TC
>CG30385 2694784 2694850|2090 chr2R 2693556 2694876 scaffold_57 343832 345198 - 13319|1333 1399
GTGTCGCCGAGCAGACAATATACAACAAAGCACCCAAACATATGACACTTAAATACAAAAAAAAAAA
------------AGACATAAATTAACATTCGACCCAAATACTGAATTACTGAATAAAAAAATAACAA
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AAACTCCCCAGGGATG----GT
ACACTCCCCGTGGAATAGACGT
>pk 2734633 2735193|2117 chr2R 2732256 2734730 scaffold_57 375138 377647 - 121815|2540 2638
TGCCGTCCGCCGGAGGGGTTCCAATCAGAGCCGAGGTTCGAGCACAGGTCCAGATGCTGATGCAGATCCAGATCCAGATCTTATTAATGTGG-AGCCAC
TCCAAGCCGGCGGC--CATTTTAATTAGCGCTGA---TTGCGCGCCTGCCTGATAATAAATGAGGCGCCCCAAGCGCCCTTTACTAACGAAGCAGCCAC
>pk 2734633 2735193|2118 chr2R 2734807 2734990 scaffold_57 377746 377944 - 4801|0 212
CTGCCTCTCCACAAAGCAAAATAAAGTTCAACTTGACATT---AAGGCGCCTAGTTAAGGTACACTCACAAACATACAT---ATGCAACTCCGGAGGAGGAGACCCTACAATAAGAGCCAACACTGTTCCAAATA-------CACATCCCTAGTTAAGCTAATTGAAC----------------TATATACATATATTTTTATTATTACCGAT
CCGCACTTTTACAAAGC--AATAAAGTTCAACTTGAGATTTAAGACGCCCCTAGTTAAG---CATTGGAAACTACAAATGAGATACAATACGAGAGGAAG-GACTCTCC--------TCAATACTGTTCCAAAAATATATAGCACATCCCTAATTAAGCGAATCAAACTAAGATAAGTTCTATATATATATATATATATATATGCATACCTAT
>CG11086 2761726 2761816|2142 chr2R 2760868 2762493 scaffold_45 29591 31377 + 42610|922 1023
GCGCGTGTGAGCGGGACAGCCAGATGTCACAGAATTGAATGGCCCCGCACAGT-GGGCGCAAGCAAACTCTAATGGA---------AACCAGTTGCTG-GGG
GTCCTGTTGA--AGGAGAGACAGAAGTTGAA------CACAGCCCGTCACAGTGGGGCAAAAGATGGTTTTAAAGGAAACAAACACAACCAGTTAAGACAAG
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CCA-------------------------------------------------------AGTAGTCCTGCTCTCTTCTCCCGTAA-----------------ATGCACATGTTTATGATCG--AATAAATAAAGTTAATTGTGAAAATT
GCATACTTAAGTTTATTTTTTAATATTGCAATCATATATAGCTCTTGTTTATACCGGCAGTTGCCGCATGTTTTTCTTACATTGCTTCAGTTTGTTTCGCTACACAAATTTTTGTACTCAATACTAAATAAATT---ATGAGAAAATA
>CG12164 2824833 2825163|2187 chr2R 2823739 2825078 scaffold_45 104111 105484 + 69851|1128 1420
GTCC--GCGGCAGGAGTCTCCGCTTGGC-----CACCAGCCAAGCGACAGCACTGATAT--CTGATAACTGCTCCCGCTGATCC----TGCTAA--------TCCCTTGGGGTTTGCCCCATCCTCCGCAGATCACGATCCCCACTCAAATTGTTACATAGACTTAATGTTGTA-AGGCATCCCACTTCCTCCTGCATTTTGTACAA----------------AACACCTTTCATACCTTTCGTTATCTGTTGGA----TTTACCCATACCCCGCCTCCTT-----CATCGCC
GACTAAGCAGCAGGCGCTAACTTCCAACAATCTCGCAAACTATGCGACAGCACTGATATAACTGATAACTGCCCCCCTGGCTTCCAGTTGCCAAAAGCGATCGCTCTTTGTTTTTGGCTGA-------CAAATTGTTATTAC----AAAATTGTTA---ATACTTAAGTTTGCATTGGCAT---ACATCATCCTCAATCCTCAACAAACACACACACACACACAGCAACACACATACCGTTTGCATTTTGTTGACAAATTTTGCTCACTTTCCATTTCTTTTCCTGTCTCGCT
>CG12164 2824833 2825163|2188 chr2R 2825079 2825349 scaffold_11 252274 252557 - 573|0 84
GTCTCCCACAAGTGTACAAATTAGTCATGCGCGCGTTTGTCTTTAAGTTATACGAAATTCAATAAAACAACAAAAACAATAATGA
GTCTCGAACGAGTTCACGAGTTTCAGCTCAGTGCTTGATTTTGTAAGTTTTGAGGAATTAAGTAACAGGGAAAAAACATTAAGTG
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CAGTACACGAAACTGATACCATGTCCAGCTCATTGATGCTTTCATCGCCAAAGTCAAAGGGCACTATCTGAGGCAAGACTGATTGGGTTTTGGG----AAGAACAAAATCAAAGCAAAT---GAAACGCTAAAGTTGCTAAACGTGAACAAGCGAACTAATAAAACTCTTAACCATTGACGGCCAGGATGGCCCAATGTCTGCTCTCGCCCGCATTGTTGGTGGCCACGCAGGAGTAGTTGCCCGCGTGGCGAGCTCGTACGGATTCAATGCTTAGTACGCTCATGCGTGTGCTGGTTTTGGTGACCACAATGCCATCGTTGGTATAGACACGACC
>CG11107 2902621 2902837|2247 chr2R 2902057 2904402 scaffold_11 336414 338972 - 75968|565 868
GTCCCCCCAGAGTATGG-------------CTAGTT---GTAATATGATGGAG--------------------AATGGATCATGGATAAGAGTGTG---------TGAATTTTAGCAAGTTCTAA------GAAAAATAACCCGTTTGCTTTTTATTGTTTGCTAACTTGATTCAAGCACATAGACACTTTAACAGATCAATAATATCCAAGAACTCCGTTTAGTTAATAGTGTTAATAAAAAACAAGCCACTTTTTGTAT------------------------------------AACTTTA
G------CAGAGTATCGACTTTTTAATAAACTAGTTTAAACAATATTATGAAATCTAATTATAATGTGCGTTTAAGTAGGCATGAAGATTAATTTGCTTAATTGTTCAATTCAATTGGGTTTGGAATAATCACAAAAAAACACGTTTTC-TTTTATTGTTTGCTAACGTTAT---------TACAAACTTAAAC---------ACAGCTAAGAATTCCGTT-------TAGTGTTAATAA-----AAGCAACCTTTTGTATACCTAATAATACACGCTCCATCGAATAATCTCGGCAAGCTTCA
>so 2945946 2946685|2293 chr2R 2945516 2946107 scaffold_11 388681 389323 - 24272|498 680
TTCTAGTTGGAGGCGGCCGCTGCCGCCGGTGGCACTGGCGGGGTCAGCGGCGGGGTCAGTGGCGGCAGCAGCAGCAGCTTGAGCGGCAGCAACATCGCCTTGCA------GCAGCGACAACGCCA---------------CCAGCAGCAGCAGCAGTGCGAGAGCTTCTACTTCTGAGGTGGT
TTCTAGTTGGAGGCTGCTGCTGCTGCCAGCAGCAGCAACAACAGCAGCAGCAGCAACAACAACGGCAACGGCAACAGCAACAGCAACATGCACTGCGAATGGCCAGCTATGCTGCGTCAACGCCAGCAGCGCAGCCAGCTGCAGCAGCATCAGCATCCGGAAAGCTTTTACTTCTGAAGCAGC
>so 2945946 2946685|2294 chr2R 2946213 2946807 scaffold_11 389324 389965 - 749|0 575
AATGCTTGGCAAGGGGATTCTGGCTGGCGATCCGATGGAGAACTACATGGCCCGGGAAACCATATCAAACCGCAGTGGCAATTGGGTC-AGCCAACCCAGAAATTCAAGTATCGGC-CATGACAGTATTTTAGCCAATTGCCGATATGCCATTATAGCCCCACACTTTCCGGATAACATGGCATTTCCGCAACCAGAGATAGAGATATATAGAATTGGAGCTGCAGCACAATCTCCTGGAAGGATTCCAGGGG-GAAACTATGAACTTTCAACTATGACTTCTGCATCGATCTGTGTAAATAGCTAGGCTTTAGTTTTTAGTGCGGTTGGG-----------------------------------------------------AGGCCGACCG----------------------------AAATGCAAATCAAATCGAAACGTGCAAAAATTAAATGTAAACCTACGTACATGCATAAATTATACACTTTTAATTGTAGCCCCTAGTAATTCTATTTT--TGTTAAAAATAAATTCTATTAA------------ATTATTTTCAAAT-----GC
AATAATTGA-GATCACATCCTCGAAGATGATTCG---------TGTATAGATCAAG------TTCAAGATAGCAGCAGCAACAAGTTTTAATTAATCATGAAATAGTAGCACTTGCGCATAATAT-------GGCATTTTTCAATAT--CACCAAGACACCAGAC-----AGATAA------------ACAGACAGAGAGGGGGATAGAGGGGAGTGGA-----AGCATAAGCTGTTGCCCTTCCTCGATTAGCAAAAGAATGGATT----ACTTAAACTTC---ATTGATCTGTGTAAATAGCTAGGCTTCAG-TTTTAGAGCGGGCGGGCTGGGGAACGGAACAGAGTATCTGTTGTCCTGGTATGGCCCCGGATGGATGTAAGGATGAACGATTGATTGGCCGTTCTCTGCCCAACTGCAAATGCAAATCAAATTGAAATGTGCAAAAATTATACATAAATTCTATTAAAT-TATTTTCAATGTATTTATAATTATTATTATTTTTAAATATATATGAAAAATATAAATAATTACCTTTAATGCTCATTAAATATTATCTGTAAATATCGGAT
>CG11123 2954648 2954698|2297 chr2R 2953709 2955501 scaffold_11 398671 400465 - 71082|941 992
TATAT-AGATTGTTTAAACTAATAAACCTTATCTAAACTATTGTTAGAGGTC
CGTGTCAGAT--CTACAACAAAACAACTATATATATACTACT-TAGTATGTA
>sPLA2 2955193 2955195|2297 chr2R 2953709 2955501 scaffold_11 398671 400465 - 71082|1507 1509
GCG
GTG
>sPLA2 2955256 2955656|2297 chr2R 2953709 2955501 scaffold_11 398671 400465 - 71082|1574 1819
CCTCAAGTGCACCTGCGAGCAGCAGTTTATCAATTGCCTGCAGGCAGTGAACAGCATCACGGCCAAAACTCTGGGTCGTATCTACTATGGCAGCAGGAGCAGGTGCTTTGCCAACGGACATCCCACCACCGGATGCAAGCAGTACCAGGAGGGCACCTTCCGCAAGCGCTGTATCCGCTACCAGGTGGACAAGTCCAAGGCCAAGGTCTGGCAGTTCTACGACATGCCGTTCTTCACAATCCCAGC
ACTAAAGTGCAGCTGTGAACAGCAGTTCATTAACTGCCTGCAGGCCGTAAACAGCATGACATCGAACACCTTGGGTCGCATCTACTATACTACGCGGAGCAGGTGTTTCGCCCAAGGCTACCCCACCACCGGATGCAAGGAGTACCAGCTGGGCACAATACGCAGGCGATGCATTCGGTATACTGTGAACAAGAGAGCGGCCAAGCTGTGGCAATTCTACGACATGCCATTCTATTCGATTGCGGC
>sPLA2 2955256 2955656|2298 chr2R 2955502 2955635 scaffold_11 3460971 3461107 + -751|0 149
GTCGGCGGGCTGAC-----------ATGATATCAACG----ATTTGTAGACAAGATGATTACATTACCTGATGCGCACATCACATTAATTATTACTTATAAG-GTAATCCCACTTTAATCTGGATGAAATATAAAATACTCCGAATATTT
GAGGAGGAGGAGAAGTAGCAGCTCGATTGTATCAAGGCGTAATTGCGCGATAAGCTTATATATTTACGTATGGCAGACA-------------GACATACGAGCAGAATCACATTTATACGCTAATATAAAATAAAATATTATTAATGATT
>CG11125 2960980 2961228|2300 chr2R 2959331 2961122 scaffold_11 403675 405465 - 28335|1784 1981
GA-------------ACTCATGCTACATAG------------------CTCCCAAAAACATTAAAGC--ATTCCATCGACTGACTGACCGAGCGAGCTACTGGAATCTTGGATTTGCAAA-ACACGCGTGTT----CCTTTCAACCATGCCTTA-------------CGTTAATAATAT----ATTTTTTAGCTGAGA
TGCACACAAAATTTCGTTAATGTTAAATGAAACAAAAAGAATCTCCCACTCGTAAAAATAGAAAATCGAACGCTTTCAACCAACAG---GAAATATCGCCTGGAACAAT--ATTCCCAACTATATGACTATTGGAGCACTTGGACCAAACCTAATCTTTTATGTGTTCGTTCAAAGTATTTATATTTTTTAAGTGAGC
>CG11125 2960980 2961228|2301 chr2R 2961197 2961681 scaffold_11 405546 406050 - 13598|0 45
GAGTTACAGATTAA----AAACCGCTCATCCA----------ACTT
GAGTGAAGGAGAAATGTGAAAATGCTTAACTATCTTTCGCAGACTC
>CG11127 2976753 2976800|2309 chr2R 2975400 2980128 scaffold_34 852824 857783 + 125835|1471 1540
TTTTGAGAGATT-GCTTGACTGCCATAAAGAGAA----------------TACAAGT-----AAGCACAC
GCTTGAGATTTTAAATTGACTGCCATAAAGCGAAATAACGCATTTGCCACGACAATTCTCCAATGGACAC
>didum 3017686 3017832|2332 chr2R 3015381 3022004 scaffold_4 3266599 3273201 - 269425|2356 2511
GCGGCGCGAGGAGTGCATCCAATTAAAGGCAGTCCTGCTGCAGCAGAGCCAGTCCATGAGATCGCTCGAGCCGGAAAGTCTACAGATGCGTGGCAACGATGTCA---------ACGAACTGATGGAAGCCTTCCATTCCCAGAAGCTAATTAATCG
ACGACGTGAGGAGTGCATCCAATTGAAGGCCGTCTTACTGCAGCAGAGCCAAACGCTACGCTCCATTGAACCGGAGAGTCTACAGCTGCGAGGCAGCGATGCCAGCAATGTGCACGAGCTAATGGAAGCATTTCAGTCACAGAAGCTGGTCAA---
>didum 3017890 3018402|2332 chr2R 3015381 3022004 scaffold_4 3266599 3273201 - 269425|2569 3090
TCAATTGGAGTCTGAGCTCAAGGCCATCACCGAGGAGCACAACAGTAAGCTCGTGGAGATGACACAGGAGATCGAGAGATTGAACAATGAGAAGGATGAGCTGCAAAAGGTAATGTTCGAGAGCATCGACGAGTTCGAAGATTCCAATGTGGATACGCTGAGACAGAACGATCGCTATCTGCGACGAGAACTGCAGAAGGCTGTAGCCCAGTTCCTGCTCGTTCAGGAGGAGCTCAAACTGGCAAATGCCAAGCTTAAAGCTTATCGGCAGGATGGAGGCCAGCTGGAGCACAAGATAGAGGAGGAGATGATTCGCAACAAGTC---------CAACGGAACGTCCGCCGATGTAGGCGCGAATGTGACGAAGCAAAAGTCTCAGAATCCGCAAGGGCTGATGAAGTTCCACAGCAGCGATCTGGACAAGATCTTGCAACGCCTGCTTAGCGCCTTGACTCCACGCACAGTGGTCGGGCTCCTTCCTGGTTTTCCAGCATATCTCATCTTTATGTGTATTCG
GCAGTTGGAATCGGAGCTGAAGGCCATTACAGAAGAGCACAATAGCAAGCTGATGGAAATGACGCAGGCCATCGAGCGGCTCAATAATGAAAAGGACGAACTACAGGAGGTTCTTTTCAAGAGCATCGATGAGTTCGATCAGGCCAATATTGATACGCTGAAGCAGAACGATCGTTATTTGCGCCTGGAACTGAAAAAGGCCATAACCCAGTACTTGCTGGTGCAGGATGAGCTAAAGCTGGCCAATGCCAAACTGAAGGCCTACAGGCAGGACGGCGGCAAGCTAGAGAATCAGCTGGAGGAGGAAATGATACGCAATAAGGCAGCCAACAGCAGCAGTAGCGACAACGATCTGGGCGCCAATGTAACCAAACAAAAGTCTCAAAATCCACTCGGACTGATGAAGTTCCACAACAGCGATCTGGACAAGATCTTGCAGCGTCTGCTGAGTAGTCTCACACCACGCACTGTGGTCGGTCTGCTGCCCGGCTTCCCCGCCTATCTTATCTTTATGTGCATTCG
>didum 3018468 3018599|2332 chr2R 3015381 3022004 scaffold_4 3266599 3273201 - 269425|3157 3288
ATACACCGATCTGACAAATGCCGACGATGATGTGCGCGAGTTGCTAAGCAAGTTCGTTATTCAGATTAAGAAAATGCATCGTACGCCGCATCCGATCGAGAATCGTGTTATTTGGCTCGTCAATTCCATTAC
CTATACCGATCTGACCAATGCCGATGAGGATGTGCGCGAGCTGCTCAGTAAATTCGTAATGCAAATCAAGAAAATGCATAGAACGCCCCATCCGATAGAGAATCGCGTCATTTGGCTAGTCAACTCCATAAC
>didum 3018662 3019190|2332 chr2R 3015381 3022004 scaffold_4 3266599 3273201 - 269425|3351 3879
GCTGCTAAATCTTATGAAGCAATACGGCGACGTGGATGAGTACGTCAAGTTCAATACTGAGAAGCAGAATCAGCAGCAGCTGAAGAACTTCAATCTCTTTGAATACCGTCGCGTAATTCTTGATTTAATTGTGAACCTGTACCAGGCGCTGATCATGCAGATCCAGGGTCTGTTGGACCCAAAAATAGTGCCAGCGATTCTCAACAATGATGAGATTCAGCGTGGGCGGCAGGCGCACGGAATGCGTAGTCGGGCCACGTCGATTGGAGCATCCTCGTCACCGGAGCACGGTGGCGGTCCGGCCTGGAAGCAACTGATCGGGCAGCTGGAGCATTTCTACAAACAGTTTCAGCACTTCGGCTTGGACAACTGCTATGCGGAGCAGATATTCCATCAACTGCTTTACTTCATTTGCGCTGTGGCCCTTAATTGTCTGATGCTTAGGGGCGATATTTGCATGTGGGAGACTGGCATGATAATCCGCTACAATATCGGCTGCATTGAGGATTGGGTGCGCAGTAAAAAGATG
GCTGCTAAATTTATTAAAGCAATACGGCGATGTTGAGGAATACGTTAAATTCAATACGGAGAAGCAGAATCAGCAGCAATTGAAGAATTTCAATCTCTACGAATATCGACGCGTTATACTCGATCTAATTGTGAATCTATATCAGGCGCTCGTTATGCAGATACAGAGCCTGCTGGATCCCAAGATTGTGCCGGCCATATTAAACAATGATGAGATTCAACGCACTCGCCATGCGCATGGGATGCGTAATCGAAACACA--GATT----CGTCATCATCACCCGAGCACGGAAATGTGCCTGCCTGGAAGCAGCTAATTGGCCAACTGGAGCACTTCTACAAGCAGTTCCAGCACTTTGGCTTGGATAGTATCTATGCTGAGCAGATATTTAGCCAGCTCTTGTACTTTGTCTGCGCAGTCGCGCTCAACTGTTTGATGCTGCGTGGCGACATCTGCATGTGGGAAACGGGCATGATAATTCGCTATAATCTGGGCTGCATTGAGGATTGGGTGCGCGACAAGAAGATG
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TCTAACGATGTGCTGACAGCTTTGGCGCCTCTGAATCAGGTCTCCCAATTGCTGCAGTCTCGGAAGAGCGAGCAGGATGTTCAGACCATTTGTGATCTGTGTACTTCTCTGAGCACGGCGCAGGTCCTCAAGGTGATGAAGTCCTACAAACTGGACGATTATGAGAGCGAAATAACGAACGTTTTTCTGGAGAAACTAACCGAGAAACTGAACGCCCGACAAATG
TCAAATGAGGTGCTGTTGCCATTGGCACCATTGAATCAAGTCTCCCAGTTGCTGCAGTCCCGCAAGAGTGAGGAGGATGTGCAAACCATTTGTGATCTGTGCACGTCTCTTAATACTGCCCAGGTGTTAAAGGTTATGAAATCCTACAAGCTCGATGATTATGAGAGCGAAATAACCAATGTATTTCTGGATAAGCTGACGCAGAAATTGAATGCTAGGGAAATG
>didum 3019528 3020438|2332 chr2R 3015381 3022004 scaffold_4 3266599 3273201 - 269425|4234 5303
CAAAAGAGCAATAGTGACGAATTCACCATAGACCAGAAGTTCATTCAGCCATTTAAGGTTGTCTTCAGGTATAGTGACATCAAGCTGGAGGATATTGAACTACCGTCGCATCTTAATCTGGACGAGTTCCTTACAAAGATTTAAACGTCGCGTGCCTGCGTCTTGC------CGGTCGAGAACTTTGCCATTTTGGATGACATTACACTGCTTAGTTT-TTGTGTATTATACGAGTAT------AACGATTCTAGAAATTTAATTT-----GTTCTTATATTTAGAAAATCGATTAGATAATGAAACATTGAGTAGAGCCGTTTTGCCGAAATGTTTGTGTAGTTCCTGTTTAGCTTAAATACCCGTTGTTTATCCACTCCAATAGTATCCATTCCGAGTATCCAATGGCGTACCCGTCCCGAGATGCCAAGTGTTTTT----TTTTGTTGTACGAACTATTTGTAGCAAAAGTAATGGAAGGTTAAGAACCAACCTTAATATGTGAAACGCA---------ATAAATGCTTGGAGTTAGACTCTGACCATAAGAAATCATTTCT------------TGCCTAAACCTTGTACCTTAAATCATAACTAA--------------ATATTTATATACAATGATTGTACTTAACCA----------------------------------GGCTGATTTGTTGCCTTAAAGAACGTGTAAAGCCTACAGA-----TGATAGAGTAAG-----------------------------------------------ACTCATAGAGCTCACCGATGATGCATTGCTGTTGCATTCCATCTATTTATGTATTCTCATTTTCTGCGTAGCTTGTAACTCGTTAGTTGGGTTTCTTAGATATGTCGTTAGACTATGCAAGCCTAAACTA----------------CGTTGGCATTTGTTTGAAACATTCTAAGCAGATTACCTAAACACATACAAATATTATATATTAGAAAGAAAGTACTCGTGTGTAATGAACAGCAATTTATGAATTTTTACAAATACAATCTCGAGTCGTTAAC
TCCAAGAGC------GATGAGTTTACAATGGATCAAAATTTCATACATCCTTTCAAGGTGATGTTCAAGTACAGTGACATCAAGCTGGAGGAGATCGAGTTGCCGCCGCATTTAAATCTCGACGAATTCCTCACAAAAATATAAATTTAGTATGCGAGTGCGTTTCAACCAATTATTTTGAATGTTGCCATTTGACGTGA----------CTTATTTTCTTTTGTATTATACGAGTCTTAGCTAATTGTTGTGAGAAGTCTAAGTTCAGTAGTTCCTGTTT-----AGTTTAATGAGAAAGGAAAGCCCCAACTATCGACAATT----------------CAGTTCCCTTT---------------TTCTTGACCCGTACTGCTAG---CCATTTT-----------------------------TGCCAATTTTTTTTTTAGTTTTGTTGT---AGCTAATTAAAGCGTGTTTA--GAACGGGTTTGAACCAA-TGCAATATATGAAACTTATTTGTAATTATAAATGA-GGGAGTAAAACTCCAGC----AGAAAGCATTCCTAAGTTGCAATAATAAATTAACCTTGTACCTTAACTTATACATAAAATGAAAAGTAAACATATTCATATATATGAAATGTACTTAATGAACATTGAAATGTTACAGAAATATATGTATACAATGGCCGATTTGTTGCCTTA---AACGTTTGGAATGTAGAGACTTGTTAAGATAATAAGTACATATATATTTATATATATCTATATATATATATATAAGTATATATACATATAAAGAGCGCTATATTTGTAAAGATTCTGTAT----TCGATTTATGTATTCTCATATTTTTTGTAAGTTATATGT-ATTAGCGTGTTTTGAAGAACGAGCCCCCAAACGTAACTGGGCTGTATTAAACAATAAAAAGTAAGCCTTGGCATTTGTTTGAAATAT----GACAAATT----------------------TATATT-------AAATACTCGTGTACGATAAAATTTAAAGGAAGAATTTGTAC-AATACAA----GAGCTATTAGC
>CG2144 3034324 3034359|2341 chr2R 3031155 3037528 scaffold_4 3279875 3286173 - 244666|3243 3278
AAAGAAATAATTTAAAAACGCTTAAGCTATTACAAT
-----------------ACGCTTAAT----------
>Cyt-b5 3047430 3047756|2346 chr2R 3047114 3049996 scaffold_4 1545325 1548258 + 95451|316 764
GAGGA-------------GCCACAATGCCCAGCAGAGACTTTC-------------CAGCCCGCTC-------------CGGAGTCGCTTAGTTAATCA-ACAAACGGAGAGCCCGAGAGTCACAT----------------------------------------------------------GAGGAGCGGGACAGTGGAGCGGGAAAGCTTTTTATAGTAAATTTGTGCTAAGTTTT----------------AACGATAAT-TTTTGGCATTTGGCGTTTTTGTACAACCCTCTACACGTGTAATTCCTTCAGACGGCGGTTCTAGACTCTAAAAGTAATTTATCCCATTGATATTCCAACATTTGAGGCACGGAACGAAAACGATAAGTTTTTATTCGCATGTATGTACATTAAACATA----TTTCCAAAAGCA---AGCAAA
TAGAAACAAAGATGTGTTGCCTCAACGCTGGACCGCTACTGCCTCCGATTCTGACACAGATCACACACACACATACACACGGTCACACACAGACACACACACACACACGGTCACACACAGTCGCATTCCCATGCCATGCCTTTAATATTGTTGTAGTGTGTTCTACGCTTGCGGGAGGCTTCTAGCCGGGCTAGTCGTTGCAGCTAGCGGGTTTTGTAGAGAGAATTTGTGCTAAGTTTTTTTTTAAAACATAAAAAATGTGAATGTTTTGGCATTTTGC--TTTTGTAC---------------TAATTTGCTTAAGTGG-GCTTGAGTTTTCTTATAGATAATTGT----TTAACTTTTCAACACATGCAACACGAAATAAACACA-------TATATTTAAATATATAC-TATTAAATATGAACGTATTCAAAATCGCATAGCGTT
>CG2093 3092285 3092488|2378 chr2R 3091838 3094251 scaffold_4 224410 226926 - 77959|463 712
CAATA--------GAACTGAATTTATTTCCCAA--CTATATTATAATCC----------AATCACATCCCCACGACAGCAGCAACGACATGG--AAATCTACCTCGAT-CATCAAGATTTTTT-CTGTCCAAGCAC-------------------CGTGCGCCCAATTGGA---AAACTCAAACTTACATGTCGCACTTTTACGTATGTTAACAACCATGGTTTTGATATTAAAATTTTATGTCAAAGTT
CGACACGTGCGACTACGTAAATCTAATAACTAGATCTATTTTATAATCTCGCTTTGATAAAACCCAGTGTAAAGCTAGC-TCAACAGCATGACAGAAACTACCTCTACATTTCAAGCTGTTGTGCGGCTAAAACACACACACTCACTCACACACACGCGCGCCCAACTTCCCCCACACTCATA--TACATTTTGCA---GTATGTATATTAACAATTTATGTTTTGATATTAAAATTTTATGTCAATGTT
>scra 3104399 3104486|2389 chr2R 3102063 3107225 scaffold_4 235677 241025 - 187229|2556 2659
--CATTCCA--------AGACTGA---TAGGCCTAAGAGACATAGCTTTAAACCCCATCCCCTAGACAAGACCAACAA---TAAAATCGCTTTCTTAACTAACC
ATCCCTCCACCCGCTAGAGACTGACTTTAGACCTTAGACGCATAGCTTTAAAAC--------TAGACAAGGCCAATAAATGTGTGAATAGCTGCTTAAAT--CT
>scra 3106790 3107067|2389 chr2R 3102063 3107225 scaffold_4 235677 241025 - 187229|5045 5414
CCCGCTGACCCATTGCAATTTTGTCAGCAGCACGGACAATGACCACAAACGGGCGG-------------GTTGTTAACAGTTTTCTCTTTTTA--AGTTACTCAATTTGCTATTTTAATCGTG------TTCGCATTGGTATTAATT---TTGTTTTATGTTTCCAATTCAAAT------------------TTTTCGTTTCCATCTTGGAGTGGGACACGTTCGTGTT---CGTCTA-----TATCGACATAACTTTTTACTTATGTACATT------TAATTT--AGGATGACTCGCTAAATATATA----------------------------------TGTGTAAACCCCCGTAAAAAGAACTAA
TAAACGGACTGGGAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAACA-----CAGCTGGGGGCGGGGATTTCCTGTACGTTTTTTAT-GTTTTATGTTTTTAATATTTAGTTGATTT-TTATTTTTCTTATATATTTTTTTTTTTTGGCTTCGATTGCGTTGCTAGCTGTTTTCCATTTAAACGATAATCGCGTAAATGTATTTTAAATTCAAGCAAATAAT-GTATATGTTCATGTTCAGCGTCAAAGTATTGTTGAGATACCCGGTTTAATATATATATTATGTACTAACTTTAAGCGCGTCTCGCAAAAATTATAATGTACAACGAAAAGTTCAAGTGAAAATCGTTTTTGTTTTTGCCCCCCAAAAAAGAATTGT
>CG30494 3159514 3159937|2435 chr2R 3158997 3159546 scaffold_4 294966 295524 - 12075|549 581
CTGTCATCTCTCGGTGTTTGTTGTCCTCCCCCT
CAGTCATCACTCGGTGTTTGTTGTCTCCCACTT
>CG30492 3161165 3161717|2436 chr2R 3160090 3161972 scaffold_4 295647 297602 - 43383|1136 1855
GAG---------------------------------------------------------------CTCTGGGGATCATTTTGGTCTTAGGCCCCAC----------GATATTTGCCAAATTACGCATAGCTTAGTCAAACAAACAGATGTTAAACACTAGTCAGTATAGCAAACCCA-ATTTCTCTGTACATAGCAAATAGGATGGGCATCGGCGGGAATAGAAAT---TACGAAATTACAACAATATTGAAACACGG-GAAATTATGAGGCAGGCACAGAATCTCCCGCACTGGAGGGGCAAACGATTCCGACC-----TTTCC---ACTGCACCAGCACCT---GTTGCACCAACCACGCCACGCGAAT--------------GAGAGGATCGAGCTAGTGTT-----------CTGATCGT-------------------------AGCT-----TTAGTT--AATACCACTTACGT-------AATGCTAAT--GCCCTAGAGTATGCAACG------TTTGT---TTTTAATCATTATAC--TTGCTGTTAATTTTATGAAATAATATGATAAATCCTGTACCGTATCTGTATGCACACC-GCTAACGCTCTTTCCAACGAAACACCATACACATATGCCTAGCGATATCTAGAAATCTAGAAATCTATAATGCAGTAATTCCAAATAAAGCCAAACAATAAACCAACCAACAA
GGAAAGTGTGTGCGCGTCAAGAAAATGGGAGGAGGGTCGATTTATTTGGGGCGGGTAATTGGGCTTATTTCGGGATCCTCTGTGTAGTAGCTGTAGCATTTAGGTGTAGTCTCTGCCAAAATA--------TTAGTCAGCCAAGT-----TAAAAAACTAGTCAGTAAAGGCAACACGCACACGCCCACACACA-CACACA-------CATCCACACCCACACATATCCACACCCACTCACATAGAATCTCCAGCATGGTTAGGCTTTAAGGCAGG--CAGTGCCATCTGCTCAAAGAAATTATAAATTTCCAAACAAAAATATCCCAAAATATAAGCGCACCTCAAGTTGCACCACCAACAATTTGCATATTCATACTTTCTCCCGAGAATGTTGAGCTCCAGTTTTTTTTTTCACCTAATTGTAAAAAACAACAAATATATAAATGCAAGCTAAATAATAATTTAAATGCTAATTGCCTAATTATTAATGCTAATGCGCCGTAAAATATGCAGCATTCTCTTTTGTATGTTTTAATTATGATTTTGTTGCTGTTAATTTTTAAACATAA-------------------CTCTTGTATGCACTTTAGTTAAT------------------TCATACATAATTAATTGCTAACTTCT------------TTTTATAA-ACAACCAATATAAATAAAGCCAAAAGTTAAA-----CAACAA
>CG30492 3163203 3163600|2437 chr2R 3161973 3163841 scaffold_4 297949 299951 - 37274|1308 1758
ATAT----GCGAATACAGTCTTGTTGG--GTGCGACCCTTAGTTGATCTTCC-CGGAGGGGAAAATTTACGACAATGG--CAAAGCACCAATCCGGCCATAATCCAAACCAAATCTTCGCCAAATA-CCATGTGCCATGGCCTCCATTT----------CCCAGTCGAAACATCACGGAAAA--------AAAGTACTTAAGTTCAG-TTGGCCGTTAGCATGCGC-CATTGTTAATTGTAGTTCGTATTTAGTATTACATAATTCTTATATCCATGGATACTATTTATTTA---------------------GCTCTAAGATATGTATTACGTACTTTTTTGGCGTAAGAGAAACTATCCCAACTTCAGCTGAATAATGTTACACCTTACCCGTACTATTGTAGTT-TAAATGT-TACATAATTGTACTCAATAAAACATATAGAAAAGC
ATATAAATGCAACTAAGTTACAGTTGGCTGTGCGGCCATTGGCTGATATTCCACAATGGGGAATATGCACAATAATGGTGCACAGCAGCATCCTGG---------ATACCAAATCAAGACCAAATAATCATGTGCCATGGCCTCCATCTAAACGACAGACATAGTACACATTCAATCAAAAGTATTCTTCAAAGTACTTAACCCAAAAGTTACGCCCAGTGTGCGCGAATAATTGTTTTTAGTTTATATTTATTATAATTAAATAATTATATCCATGGATACTATTTATTTAATCTCTTAAATATTTTATTTAGCGCTAAGATATGTATT---TAGCTTTAAGCCCCGCGAAAAACCCTTTTAACTATC-----ATAATG---------ACCCGTACATCGATCGATATACATATATATATATATATATATATATATATGTATCGATAAAT
>CG30491 3168514 3168583|2441 chr2R 3168487 3168606 scaffold_4 306145 306278 - 649|34 115
TTCGTATTGTG-AAATATGTTTCTGACAATCC-----------CTCTGTTACTTCGCATAAATTTTCAGTTTCTTACAGTCT
TCATTGGTGTATATATATGTATGCGATAATATGCCTAATCTAAATTTGTTATCGCGGA-----TTTTATTATTTATCAGTCG
>CG2070 3175001 3175072|2446 chr2R 3173974 3175023 scaffold_4 305062 306165 - 28581|1117 1139
GCAACTTTATGACTCTTTTAACT
TTAAGACAATGAAATTTTTAAAT
>CG2065 3176938 3177088|2449 chr2R 3176921 3177273 scaffold_4 307559 307914 - -1594|17 181
GCAACCATTAG----TTTATCCCTCGCCATTTCATAATTTATTATTTTAATAGCTTATCATAATGAAGACTAACGCAAA---------ATGTAATAATTTATGTTTGAATTGTAGAATTCTTACGGATTCTACAAGCTGAAAATAAAGAAATGCT-CCCAAAAAA
TCCAGAGCAAAGGCTTTTATTATACATGATCAGATA---CAGTGCTTGCCTGGATTAACATAATTAAGGGTAATACTAACCGCCCCACAAGCAATTCGTTATATT--AGTTACATAAATAT-----ATTTCACATAGAGTGATTAAAGCATGATTAATTAGTATC
>CG2064 3179049 3179160|2452 chr2R 3177634 3180834 scaffold_4 306263 309360 - 114952|1439 1571
AGAAGAACGAATAGTGTTAGAACAAGCCTTTTATTATACTTGAATACTAGCTGCTGTTTCACGAAC--------------GGATTAATAA-------ATAAATACATATTTCTCTAGCTTTCATAAAGCATAT
AGAGCAA-----------------AGGCTTTTATTATACATGATCAGATACAGTGCTTGCCTGGATTAACATAATTAAGGGTAATACTAACCGCCCCACAAGCAATTCGTTATATTAGTTACATAAA------
>CG12107 3186904 3187175|2460 chr2R 3186228 3192003 scaffold_4 314049 319896 - 160474|702 1068
TAACACTC---CCCAGCAA------TACCGGATTCCAG-------------GAGCCAG--------GTCCACACCACA--------------CCACTCCACTCTCCACATA-----------------------AGCCA--GCAGCTCCTCTCGTTTTGTGTCCCCTTTGTACTCGCTGTAGATTGTTAAACTTT-TAGCCAATTACGGTCATGTAA-ATGCATTT--------------CTGTTGTGACCGATTGTCCCGAATCTT---------TCCGTGAAAGATCCTTCGGCCAGCGGTCTTAGTTGAAAACAGAAGAT-TCTATATGTTTTTGAGTGTCCGAAATGCAGAATGCGATGAATC
TACTAGCCATATCCAGCGAGTAAGATACGTGAAAACAGAGAGAGAGAGGGAGAGCGAGAGAGAGGAGCGCGCACTGCAAGACAAGCAATAACCAATTCCACAGTCCAAATGCTAAACCGCAAATCCGTTTGCAGAGCCAAAGCATATTTACTAATTGCCCGATTGATTTTTTGTCCGTGTAGATTGTTAAAATTTGTAGCCAATTACGTTAATTTCATGTGCATTTGATTTAAATATTTACAATAATCGCCGGTTGTATAGAGTTTTGAGATTTTTTCTGTGAAAAATACA-AATACAGCAACCT--GTTGAGAACTATAGATATCTATA----------------AGATGCAGA----GATAAATT
>CG30496 3213363 3213703|2478 chr2R 3210424 3213630 scaffold_4 344528 347938 - 58839|3186 3542
CTTGTA----------GTTTGTCCACAATGAAAGCGAAAT-------GATAACGTAAACTGTGTGTAAACAGAACCGAAAACGAAATCGAAAC----TTAAACTGATCTAT---------------------------GTGGTCTGTGGGTTCTTGGCTGG--GGCGATAATTAACCGACTAATT-GAGCCAGTTGTGGT---------------------GTGCTAACTAACTGGCCAGC-GATGCGGGCTTTGCATT--GCGATCTGCG----CACTGAAATCTAGTTGCACACAAA-------TAGGTACACATAGGT---GTGCGTACTTAACACCTAAGCTGGCAGCGTTTT
CTGGAACTGGAGCAGCGCTAGGCAAAAAGAAAACCCGAATTCCAGAAGGCAGCATATATT-TTTATGTTTATATCTGAAAGCGTAATGAAAACGAAATTTGTCTGACCAATTGTTTGGCCTTGGATTTAGTTTTGTTGGGGCTCTGGGGCTTTTCGGCCAGCAGGTGTTAATTGCCCAACAAGCTGGGGCCAGATGAGCTGACGCTTTTGTGCTCCAAATGGTGTTAATTAACTACGCAGCAGACGCTTTGCTTGCTTTTCGCGACCTCCAATGTCATTTGTACCTAATTGCAATTAGAAACTAGGTGGATGAGCAGAGGGCAAGCGCGTGTTTGTCACATAAATTTGAACTGGTTT
>CG30493 3214793 3215316|2479 chr2R 3213811 3214903 scaffold_4 348539 349648 - 41487|1011 1135
CACGGAAGTGAAACCATGTCGGGATCCGATGCCT---TGAGTGCCACACGCA-----------GTCCAAAGATTAATAATTTTAGTGAGAACGGTTCTGCTAGCCCTTAAAGATCTACACCTATA
CGAACGCCCAAAAACCAGCGAAAGTCCAAAGAACAGGAGAGTGTTGTATAAAAAGAAATATATATATAAAGATTTATACCTATA-----AACCGTCATAATATACCTGATATATGTATACTTTTA
>CG1941 3223714 3223802|2485 chr2R 3222210 3224103 scaffold_45 35957 37870 - 43593|1558 1656
TCG--AGAAGTTATTGTCTA--------AACAATGTGATCAAATGAGTGCTTTATAAGCATTTAATATAAAAATTACGAATTTTATCAGGCAAATAAAA
ACGCACGGAATAACTGTTTCGCGGAGCTGCCAACTTGCCCACAAAATTGCCACATTGGCATTTACTATGCAG---CCAAATTCGGTCA--CACTTAAAA
>CanB2 3299575 3299953|2574 chr2R 3299038 3299796 scaffold_45 140533 141367 - 33876|545 846
AA--------------------TAGGTTTAACGCAGAT------------------CCTTTTCTACGCGATGT-TATTTATTTATTTTATACACGTCGGCA----------------------------TCCTTCGATTGTCACTATCACCACTATTCATATGGTTATTATTTTTG-------------ATCGGCGATTCTCTATAGTTAAATATTGTTATGAGCCTTTGGCGAGCCAGTTCAGTTAGTCAGTCAGTCAGTCAGCCAGCCAGCCAGTCAGTCAGTACAGCGATCGAAGGCTT
AAAACAAATTGAAATCGAAACGAAAGTTTGCCTAAAGTTGCAACTGCATAGGTTTACCTTTTTTAT---ATATATATATAAATATTGTATATGCATAATCAAAGCAAATCATTTTCACTAGTTACTATTTATTATTATTATTATTATTATTACTATTATTATTATTATTATTATTATTTTGTAATGCATATTGTTTGTTTTGAAAAGCTAATTGTTTATATATTTCTCTTTTGTATT-GTTAAGT---TCGGAACGTAAAACAAATATTGAGCAAATTTTTGAAAA-----ATCAAACGCTT
>mus205 3312572 3312857|2583 chr2R 3312571 3313349 scaffold_45 151409 152359 - 4146|1 316
TGCCAATCAATACTCGTATGCAGGTTGGATTTCTCATTCATAAGAGATGTATATGTATTTTAACTTGCAGCTCGCTTATAAAAGTTAAAAT--TACATGCATTGATTCAGCCAGTGCT-----------------TCTAAACATGTACGTAGCTTATACTCTACTTATGCAT---------TGGGTGATTTTGT-TGTGTGTAATACTAGAGGAATTGTTAACTATTGATATTGTTTAGGTTTATCGTGTTATGATTGTTATATGAGCTGAGCATG-GAGCCAATAAACAAGCGTTTTAATGTTTACTTAAAACTT
TGCATAGACATATGTGTATATATATTGTTTTTTTTTTT---------TGTATAT-----TTAACTTGCGACT-GTTTAAAAAAGTTAAAATACTACACGTACAA---CAATCAGTGTCGGCATCCCGTATATATATATATATATATATATAGCTTAAACACTATGAATGCAGGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTAGCA-TATATGCAATGTTAACTATTGATATTGTTTAGTTGCCGCTTGTAAT--TTGCATTAGCATTTGTTCAAATGAATTTCTTGACAGATTTCCTTTTGCTTTAATTAAATAT
>sax 3321233 3321883|2588 chr2R 3319046 3321826 scaffold_45 158410 160966 - 89637|2212 2856
TGG-----TAGTAGTCGAGCCTTAGCT-------------------GTAAGCGG---TAATTTAGTT-------GTACCACATAGGTAGTCTAAGATTCATTCATTGACA---TACCCTGCATTTCACACTATTAGTTCGTAGGTATATTATTCAAAGCTAAGCCAAGATCCTGCGTGTTGAAGCAAACTAATCCAAGTACAAGACCCTTGGGAGCTTATAGTTATATAGAAGACTTTAACATATTTACTTTATGTTTGGATTGACTTTATCGTTTCCGTTCCACCGTGAGCCTAGCCTGAAAAGGGTGCCTTTGAAATTGCCTTAAGTTAAAGTTAGCATCGACTCTAATGTATGTTCTTGGGATATCATCCTGTAAAGTTGTCATTTCACTATTTACCATTATTCATTGTTCATCAAGTGCCATTTGCAATTGAGAATTGTAA-------ACGCCTTAACTTTAAGCTCACTCTTTGAACTTTACACTAAATTCATAACTCTAGAACTTGTCCATGCTATGATAAAACCATAAGCCACACCACCAACTGACTTGCTATCTTAGTTAGTTA------AGCCTTTAGGACTTAGATACCCACGCATAGAAGCATACACACCTACT-TGTATATTGTACAAATGGC
TAGCTTTTTAAGTGTAGAGTGTAAGTTAAGTTAATTATTAATTTTAGTAAGCGACATTAGTTAAGTTCATTTTGCTAGCAGCTAAGTTTTCATATATATATATATTGAAGTTTTATTTTATTTTCCCTTTCATTAGTCTGTAGATGCATTAATCGAGATTTAG------TTTTGTGCCTT---TCAAATTGCCTTAAATGTAAAATTCC------------------------ACTTGACTAGAGATATCATCTATTTAAGTTTTATCAATCGCCTACATC----------------------AAGCTGCCTTCG-----------TGTAGTAGGCAGCATT--------TTTATAATCTTTAATCATTTTCATTTCAAG-TGCCA---------TTACAATTAAGAATTGGTAAACAAA----------AAAAAAAAAACACAACATTTTTATACATTACATTTAAGCTCACTTTTTACAC-CTACACCTATTCACAAACAC----------CCATG--AACAGCCAGCTATCAGCTATATAGCTATATAGTTTCTTTTCTTATCAAGCTATGATAGAGTTATTGAGA-----ATGTAAACAAATGGCGCCACACACACTCACGAAACATATTGTGCACCTAGC
>CG1882 3326324 3326558|2590 chr2R 3325073 3326460 scaffold_45 164843 166268 - 69515|1311 1449
GCAGAAGCAGCGGCATTCGCTGAGAACCAAACAAAAATCACAGCTCGCCTGCCAGCCTGTATCTATTAGCTTAGTGTCTTTGCCTAGTATTAAATGGTCATCTTATCCAATTAGCCGCTA--TTTTTACTCTACAGTCA
G-------AGCAACGTTCTTGCCGGCTTAAATTATAAATTTAGCTCTACTAAC--TTTGTGTCTATTTTATTTGCGTTTTTGCCTAGTATTAAAT-GTTGTCTTATC---TTAGTCTTTAGCTTGTTATTCCATTGTCA
>phr 3339101 3339133|2594 chr2R 3337431 3339724 scaffold_34 1205063 1207295 + 101008|1682 1719
AACGTTTTCGGATT----TGCCTTTGTT-TTGAATGCA
AATTAAAGCTAATTACAATGCGTCAGTTGGTAAATGAG
>CG12822 3345505 3345662|2600 chr2R 3344063 3346473 scaffold_34 1208024 1210503 + 75778|1499 1709
C-------------------------TTATGGATTATTGCAATTGATATTCGTTAATTG-------ACGATTTGTG------------------TTAAGCTTAAGTGTATTGTGTTGAGGAGCTTTAACCTTTGG--CGTTTCAATTTTGCTCTAGAATACAGGACATTCT-TAAATATATGTATGAGGCTTGTTTCCCACGCAAAAGAAA
TGGAGAGAATGCCTCTCCTCATCTTATCATAGGTTTTAAAAACTGCATTCTGTTGGTTGCGCTTAACTGCTTTGTAGTGAAGTTAATTATGTGTTTAACCTTAAGTGTTCCACGTTGAGGAGCTTTAAAATGTGAACAGTTTCGATTTGTC----GATTACTTATTATAATATATATATATGTATG-----TGCTTATTATGTAAAGATAA
>CG30377 3426374 3426823|2693 chr2R 3426438 3427535 scaffold_34 1305592 1306821 + 11163|0 413
GTTAGCTCCTAGATCCGACTCTGGTAGGTCGGGAGAATGGAAAATGGCTCGGCGGAATATTACAAACTACAGTGCCAACTACAAATGTAAAACGTTAGCGAAGCTCAAGTT----------TAGTGTTAGCGGTAGTCGTAAG-------CTCCTGTGGTATTTCTTGGCAGGGCAGGGCCGCCACAGCCACAGCCGCAGTCGCAGTATTGTTAATAAATTATTTATGTGATCCTAGTTAATAAGTACAAGTTAG-----TGCATTTGTTT-----CCGTGCGTACGCGTATACTGCCTGTATCCAGCCTATGTATATCCTTTGTCACAGCTATCCATAAGCCCATTAACCTGTATTAA-GTCTACGTTTGTAACCAATTATAGCTAGATTCGTCCTGTGAAAGTGTGAAGAAT
AGTAATTCTTAGATCCAACAGTAACAGCTACATAATAACTGCAACGAATCGTAGGGGCATTAAGA----------TAATAACTAATTTCTAGTATT-----AGATCTAGTTTATTCGTCACTAGTATACACTATAATCGGAGGGGCAACATGCTTGTTGTGCCTGTTTTCGG-------------------CAGCCGCAGCCGCAGTATTGTTAATAAATTATTTTTGTGATCTTAGCTGTTAAGTGAAAAGTGAAGTTTTGTGTTTGTCTAAAAATCATGATAAATCATGTCCATCATAAATGCTGATTGTATTAGTCGTAAGAGAGTACTGTACAATGACCTTATAGTGTGTAAAAGTGTTTGTGTGCGTCGATAAATAAAGCAATAT-----CAATGAAAATATGCATACT
>lin19 3432219 3432790|2699 chr2R 3430653 3432739 scaffold_34 1310025 1312097 + 83881|1591 2132
GTTTTTGT---TAAATGAACAACTTTCGCT-----GTTTCAT-CTATGCCAGCCATTAAAAATAT-CATCAA--TAAACTTAGATTCGTGTCGACCCTCCGCTACCCTTCCTCCTAGCCCGAAATAAACTGCCGCCGAAACATTCGAACTAGAAGCGAGCTAAAAATACTCC----ATGCTTCGCATAAAATGTGCAATTCTCGCCAACGCGTCACTAACTCCATCTTCCGACACCCAGCACCTCATTCAAAGAAAAGGCCAGTCGCAGGGATCAAGTGAACCTATTGACCAGATCACAGCCGATGAATCCGGCCTCTGT-AGGAACATATTCCAATTGCCGAGG--ACAAGGTTCCAGGTTCCCAGCCTACAAATAGACTTCTGCAGGGGCTGTACGGTATACATATGTAGCGATTTTCTTTACTTCCC-ATTGTTCGATCAATATTTGTTTTAACTAGATTA-TGTTTATTCATAATTCGCTGTATGCATATACAATTATTATAATTCTACGAAGCAAAAAAGTGTTAAGTTCATAAAAC
GTTCATGTTTATATATATATAAATATCGTTCCAAAATTATATATTTTGCCAGCCACTAGAAGAAGATATCAAGTCAGATATCAATTAGAGCCTGCCAATTTCCACACCTCCACCCACCC------ACATCCCTGTATAAGTAATCAAC----AATTAAGATCTGTACCCCCCGCCTATACCCCTCATCTAATG----ATTGTCG--AATTAGCTACATGCTTAACGCATTTAGAATGCGCGCATATTTCACAACCAA---CAATCAAAGCAAC--ATTTAATTCATTTTGCAAGTCCCCCCCCAT------------TGTCATGATCATCGTCCTCTCTCAAAGGCAACAGGAGTAAAGGATTAAAATTCCAACATGGAATTGTGCAAGCACAG------ATAAAAAAAAAATAATTCATGTAGCTTCTTGAATCATTTATAATAATGAGTTTTACTTAGTTTATTGCTGTTTTATAATT-----------TTTTCATATATTACATTACGGAAAAGACAAAAAATGTTAAGTTCAAAAAAC
>CG8791 3441424 3441740|2707 chr2R 3440687 3441506 scaffold_34 1317793 1318605 + 38967|737 819
GCCCTCGATCTGCACCTGGACGCCATGTACATACATTTTCGTTAATTGTAGTAATTATAAGTTATTCTTATTTAAGCTTGCCG
GTTGTAG--CCATAGAAAGTTGTAAT-TAAATAAGTTTAAGTTAAGTTTAG----CATAAATTCATTTTGTGATAGGTCGCCG
>CG8791 3441424 3441740|2708 chr2R 3441507 3441685 scaffold_11 3567369 3567553 - -679|0 198
CTGTGACAGCGTT---ATTTGGATATGCCTAGCTATAACTAAAGATAATGGTTTATGTTTACGCTTATGCTTA-------GGGAAGCTTAATATGACTTAGTTGTGTGATAAGCCCAAAATATGACTTTACTATGTGTGGCACGTTTCGAAGCTG----------CTGAAGTCGCTTTAACTATATCAATAAGTGAGTT
CTTTAATAAATATCCAATTTAGATAT-CGGGAATTTATTTAAAT----TCGTCTATCTTTTCTATCACGTCTATCTTACTTAAAAGTGTACAATTATTTTGTTTCAAGACAAGCGAGGAA-GTGGTTTTTCCA--------AAGTTTCGATAATGTCCATCCAATTTAAAGAAACTTTGCCAGTGCCAGTCAGTGCTGG
>CG8791 3441424 3441740|2709 chr2R 3441686 3442426 scaffold_34 1319275 1319998 + 12474|0 54
TTCTATGCAAACAGCATATTAATACATATTTACAATCCTGTGTCATCGCTAAAAT
TTATATACAAATATGGCATAAACTCTAGTCTGGCGAGGTGT-TTATCGCTGGAAT
>drosha 3448435 3448668|2712 chr2R 3444353 3449217 scaffold_57 56096 60839 - 205246|4174 4411
ACAGCTTTGCGTATGCTATAGCTATAGGAGGCCCAAATTG--AGTAAGACAATCGTGGGAGCGGTGTAAAAATGTAATGGGTTATCTTAATGAATCGCTCATTTAGTAGATGCAATTCTCCCCTTTGCTATCAGGACATCTTACTTTCTAAGTAAGATGTTAGAGGACAA--AAATTTGCCTGTCTCTAATTGTCGCCTAATTAAAAATACCATTAAAGCAACAAATAAAATAACCGA
-CATCTT---------TATAATTGTAAATTTGTTAGCTTGTAACTAGTCCATTTATG--------ATAAATATAGCAAAAGCGATCTTAGCACAGTGTCCTTCGAGTTGTGGTAAG-------TTTGATTGCA--------------CTAAGTTCAATTTTATTGAACGATTGCATTTGCAAATCACGCGCGATAACTAAATCGAAAATAACA--AAAGTAAAAAA------AAATGA
>CG11165 3462149 3462296|2723 chr2R 3462182 3462922 scaffold_57 71835 72660 - 7445|0 138
TGATTTCTATCCAACAAAAAGTCGGCGTTCTGTCTGTGTTCAGTTTAAAT----TCTTTATGTTCACACTGACAAAAGCACATGAAACAT--------------------TAGTCCACTACAAAAAAAAAAAAAAAAAA
TGAATTTTATCCGACTACAAAGTAGC-CCAAATTTGTTTTCAAGATGAATCTAGTTTACTTATTCAAAACGAAACAAAAACTCCAAATATATAGCACACAAAATTATATTTAGCTGATTTCAAAAAAAAAAAAATTCCA
>CG30378 3462763 3462906|2723 chr2R 3462182 3462922 scaffold_57 71835 72660 - 7445|625 816
GAATTCCAAATTGAAG-----GCACAAATTAACCACGAACCCCTTTCGAAAGAGCCCAACCCA-------------GTCGCGTTTTCCCTACGCCTA-GGCGGCACCACTTGAAATTCCCAACCAAATTCCTTTG----GCTTACTC-------------------------AACGCAGCGCCAGAAAGTCG
CAG---CAAACATATGCAATTGCTCAGCCTATTAATCAGTTCTCAGCAATATAGTTAAATACACAACTGAACCCTTAACACACTTTAATTGCACACATGGCGAGCCCACTTAACATTTCTAAAGCATTTCATTTGTGTAGCTGCCCCCCAACAAAGCCAGGCCAGGCCGTGACACGCAGCTCCTGCAGGTCG
>nito 3477096 3478504|2734 chr2R 3474067 3478621 scaffold_4 3745185 3750235 + 134993|3225 5050
GCTGGAGCGGCTGGCGACGGTG------GGGATGGGAGGACAAACTGTAGGTAATAACTAGCCACAGTGCTCAAGGAAAATCTCCGCCACATCTAATTATAGCATAGCAGCCGTAGTCGTATCTTAGCTCGTCCTCTCCCAAGTGGAGGACACCCGGGGGCCACATACATGCA-----AGGGACGTGTAT------------------------------------------------GCGGCTCCTCC------------------AAGCACCGCACACACGCACATACACACACATGATGC---------ACACATACAGAGACAGAAGCAGAACCGAGGAGA------CTTCACCCACACCTCAT----------------GACCCAAAAACCCCGCATTAATTAACC-ATTAATTAACCTTCTTTTGCAGACAGGATCTCTCTTTTGGTTTTAGTTCAAGTTC----TCGATGTGTTAGTGACAGTG---AAGTTTATAC-------------------------ATCCTTTTCATT---ATTGTGCTAAAAAGTTTGAA----AAATCGTTCATGATTGT-------ATCTAAAGCTACCCATACAAATTATCC---AATTTTATTATGTTAAAGTGTACA---ACAGTATGAAAACAACACGAGTAAAAACAAAAATCAAATATTTTCCATAAAAAAAAC-------------TCCATTCGAGTGTCCGCATAT----------GATCAACAACTAGTGCGAAATAATGTCGATGAAAAGTTT------------------------------------------TTGTGTTCCTTAAAATTGATTT-------------TCCATTTTGAT---------TTGTGTTACGCTGATGATTTTGCCTTTGCCCTTTCGTTTGTGTT------CGATGGCGAGAAGGCAGTGC---------GACCAAAAGTGCG--CCCAGTAGTGGTCTGATTGTCCAGTTGGGTCCAAAATAAGATTGCAAAGTGGCTCCAGAAGTTGTTTGCAG--TGCAATTTCCCAATCAGTGCGAA-GTGCTTAACTCCAG---CTGAGTTTCAGT---TCCCCTCGATCTCCAAGAGGTTC-----TTTGGTGTTTCTGGCCGCTGGGTGCGTGAAAGT------------GGCTGGCGATTCC------------------ATATCGTGTTCCGATCCCCGATCAATA-------TCCGTCTTCCATC---CGAAGAGAGAACGTCGTGTAGCATTTGCTCCAAAATGTCTATGCTGTTTGATTTGGTTTGGCAATTGTTACATTGGTTTTCTTGTGGCTGCGCTCAACAGAAGAATAAG--------AATAAGAATAGTGT---------TTTGTTTATAATTTATG-----------------CAAGCGT--TCATGCTACATT-----TGTTTCAGTGAGTTCAAGTGTCATTCCACGGACCGAGATCAGTTTATACACAATGATAATCCAATCCGAGCAGTTCACCCAGTGCATGTGC--------------TGTGTATGCGTGTGTTCGCAAATCTATTATTTATAT-ATATATATATATATC------------------AATCGTAATATGTACAC--TCAAAGGTAGTAATAAC---GATCAA---ACGCAGTTGTCTTGCATCATTAGACGGATGT--TCGA---AAGTAATTTATGCTTCAACAAAATATTATATCAAACTATTGTAC-----------TGATATCCAAATAAACGACAACTATCGCATCCTACGTGTTAAAAA
GCTGCTCCTGCTGCTCACAGTGATCGGTGAAGTAGAACAACAAA-TGCAGG--------ACCCCCA--ACCCAGACGAGTTCTGTG-GACACGTAATT------TAGATGTCGTAGACTTACACAAG---ACCCTCTCCAGAATAACAAATAC---AAATACACATATACATATGCGCATGTATGTGTATTGGTAGAAGCATAGTTCAATCAATAGACAATTGGAGTTACCTGTGACAACAGCTCCTGCTCCCAGAAGAAGAAGCAGAAGAAGAAGACACACGCACACACACACATATGATACTCTATATATATACATATATATATATATGCTGAGTTTTGCAGAATCTGTATTAATCCAATTATTATTGTTCTTTTTGCAGACAACTCAATCAATCTG--TTAATCAATCAATCAATCGACCTTATTT-------ATGGTTTATTTTTTTTTTTTCATACACATTCTGTTTTCCTGTG-TAGTGAGAGTGTAAAAGTTTCTACAGTTCAAAAACAAAAATGAAAAACAATTTTTTTAATTACAATTGTGCCAAAAGTTTTCAATATTTAATAACTATTAATTGTATATTTGATTTTCAATTATTTTTACAAACAGTGTAAAAATTTCCTCATCCCACACTAAAAAAAGAAAGAAAAAAAACAACAACAACAAAAACCTAAACCAAAAACCAAACAAAACAAAAGCTTTGTATACAATATCTTTTCGAATGTGCAACTAGTGCAAAAAAAAAAAAAAAATCAACAAAAAACAACAACAACAAAAAGTTTAAACAAAATGGAAAAAATATGTACATCAGTTTTTGTGTTAACTTATTTTACTGCATATTGTGTTATAATAGTTCGAATCAGTTTTGAGAGTTTGTCATTTTTTGGTTCTGAGAGTTTTATCCAAAATGTTTTGATTGTCGTGAACAAAAATAGTGCAAAAGAAGTGCTTGAATGTTAACTAGGGGTGGGGCCCCACTAGTAATATCCATTTAAATTTATATACACGATATATTTATATAT----------ATTTGTTTGTGGGCCGAAAGTGATCTAAAAATGAAAATACGCATATATTCAAAATCTGAGTTCCGTTCTGTTCCGTTGCCCGCCCAAGGATTCAGGATTCAGGTACTTTGTGC------GTTTGTTAAAGTGTCTCTGATCTGGGCCACCGACTCCCGAGATATCAATGTGTGTGCATTGTGAGCTGTTCCCGAGTTTTTGGTATTGTTTTCTGTTCCAGCTAGCAAAAAGAGAACGTCGTGTAGCATTTGTTTCAAAATGTTTTGATTGTTGAAATGGGTTTTGCAAATGTTACATTGGTTTTCTTATGGTTGCGCTCTCC--AACAACAAGTTCTGTGTCCTATATATGGTGTATATCGATATCTATATATGATCTATAATGCTATATAATAAATCCAGGCATACCCATGTTGTATGCCCAATGTTTGTGTCAGTTGAAGTGTC---CAACAGATAAAATTATATATATATATA--TATATATCTATGCATATAGTTTTACGAAT-TATGATCTGGAGCGACAAAAGTGTGCGTGTATATGTGTGCATGTGTGTGGCCTATATAATACATAAATATATTATGAGACTTCCTTAACCGATTTATCATATGTCCACAATCTATTGGAATTACTACATAAATTAAATTATACAATTAATTGG--TTTTTGTGCAGACGTCGTCCAGTTAATTAAATTATGCTTCACC---ATATTATAT--ATCTATTATATATACATTTAAACGATATTCAAATAAATATGAACAAACGGAAACTCGACTTTTAATC
>nito 3481064 3481321|2739 chr2R 3480136 3483797 scaffold_4 3753313 3757113 + 112773|1126 1393
TTCCGCAGCTAGTCGTTGGATCGCACTTTGCGCAGCGATCCGCGGTTAAACTTGCAGATGGACTCCAGAAGAGCGGAGCGTGTTGGCTCGTCGCCATCACCGCCCTCCGCATCCTCAGACAGCATGTTCGGTGTGGAGGACTGCCGTTCCACCGGTGCGCCAGTCGTCGACGGCAATTCCTGCTGATATATGCTGCCCAAGTGTGGCCCCGGAGTGA--GCGGCGGTGCTGAAAGGAAGACGA--------GATCGGAAGTGAGTCAT
CGTCGC--CTAATCATTTGAGCGCACCTTGCGCAGCGAGCCTCGATTGAATTTGCAAATTGACTCAAGCAATGCTGAGCGCGTGGGCTCATCCTCGCCAGCG---TCAACGTCCTCTGTTGCAATGTTCGGAGTCGATGTCTGCCTCTCCACGGGAGCGCTGCTCGCTGGCAGCA---CCTGGTGCGAC-TGCTGCGCAG--------CTGGCATGATTGCTGTGAACATTAACATACAACAAATTGTTAGGATCAGGTGTGACACGG
>nito 3481403 3481628|2739 chr2R 3480136 3483797 scaffold_4 3753313 3757113 + 112773|1476 1701
TGTGGTGGGCTCCTCGGGTGTGCTGTCGGAGCGGTTGAAGGAGTCGGTCCCACATAACTCGCCAACCACCGTGGTGCTTGAGGAAGCTGCTGCTGCAGTCGCAGCCACAAGCGACAAGCGTCCATTGTTTGTTTGGATTGAACTTTGCTGCTTTAGCTTCGACTGTTTGTGCTCTAGTTTCTATACGTAAGCATTGAAATAAACGAAAAAGAAACCAAAATGAGCT
---ATGGGGCTCTTCTGGGGTGCTGTCGGAGCGGTTGAAAGAGTCTGCCGTACTTAGCCCGCCGCCGGC---GGTAACTGTGCTGGTCGATGCAGCTGTCACGGCCGCCAGCGACAAGCGTCCATTGCTTGCTTGGAGCGAACCCTGTTGCTTAAGCTTCGATTGTTTGTGCTCTAACTTCTAAATATTACCA--AAAGTAAAAGAGAAATAAAATAAA--TAACC
>CSN4 3485712 3485914|2740 chr2R 3484100 3486189 scaffold_4 458664 460922 - 79322|1641 1873
A------------GCAGGCTCTCGCCATCCCATCTCCCCCCA-----CTCATCTTAATTAAAAAACGGCATATAGGAACGCAGTGAATCGGAGGATATAACCCCCGACTGCGA----------TAGATTTCATTTTAAAATTATAAAAATAAATG---AAATTATGTACATTATCGATCCTGTGGAACCAAAAGAAAAGAAAAACAGAACAAGACGAAAAACCCCTTTTGCAA
GCATGCGAGGCGGGCAGACT-GCGTCATACAAAACTTTACTGAAATTCTCATCCTGATCTGGGAAAGTTC------AATGTTTTACATTTAATTTTACACTTGCCGCCGCCGAGTTCCATGTGTAAATTTCATTTTGAATTTA-AGAAATAAATGGCAAAAATGCATACAAAAT-GATTCCATGAATC------AGTGCAAATACGAAACAATAGTAAAA-------TATAAA
>Nup44A 3503048 3503097|2748 chr2R 3500286 3503088 scaffold_4 475226 478089 - 67913|3016 3056
TCTTGTTCTTAATTGTAAGAGTTCCGAATAAATTCCTAAGT
---GATATCTATATATAAGAAGTATGTGTACATGTTTATGT
>Odc1 3518445 3518486|2767 chr2R 3517564 3518555 scaffold_4 496388 497314 - 31874|896 948
CTAAATCACTTA----CTCAATCCAATAAAACCAACAT-------TTTGTGGA
CTAAAAGTTGTGGCATTTCAAATAAATACACTCGACATGTGTGTGTTAGTAAC
>Odc2 3520808 3520877|2773 chr2R 3520462 3520809 scaffold_4 496874 497203 - 7502|363 364
CT
CT
>Optix 3553814 3554349|2811 chr2R 3552883 3554951 scaffold_4 533747 536094 - 54394|979 1692
TATCAGCGGGTCTGAGGTGTCCACCT----------GTAACCCCACCCAGACTAAATCAACAACCCCAAACCGAAATCCCAAATCCCAATCCTCACAAGCTCCGAA-----------GCACTAAGGCCCAGCTATTCAGATTGTTTCAATTGTATTTCTAAGTTAGCC-CGTAGTTAAGCGCATCCCAGCGGCGGAGTTCGAGCA----------------------------------------ATATTCGAACCGGAA------------CTGTTTCCTATATCATGGCCCATAATTAC---CATACCTTTACCTATACCTATACCTATACCGTTATCCAGCAGC--AGCAAATCGC----------------------------------AAGCGTCGCACACTCACTCTTCAAAGATAGCCATTTAAGCCGGATGGAAACTGAGATACAGATTTAGAGCTAATACAGATGGCGGTCCCAGTGGCCCCAAAACTGA--------AATTG--AATTCGA--GACGTTTTCATTCTAATTTTGTGTGTGTGTACGTATTTGTAAATAGAGTTTAAGTATGCAAATCATAGAGCTTACGTATACAATTAGATTGCAATAAAACC----------------------------------------------GAATG-AACAGTTAAGAATTTGAATCATTATACAA------AAA
TATCAGAGGGTTTGAGGCGTTGGCCTTGCCCCGAGGGTTTCTCTGCACAGTCCCTGTCCCTGGCC-----CAGCAGCTCCTGCTCCTGCTCCT-----GCTCCGAACGCTCCCACTTGCACTAAGGCCCAGCTAATCGAATTGTTTCAATTTTTAGTTTAAGTCAAATGCGTCGTTTAAGCCACATCTTCGG-GCAGCTCGAGCGCCCGATAGCAATAACAGCCGCAACAATCGCAGCCAACTTCATGTCAGATCCTGCATCCTGTCACGGCCTGTTTCCTAACACATGCACAGTACATACATACATACATACATATATATATATATATATATATATATGCTGCAGCTAAGGAGATATCGACATATACTATATATATACTATATATATATATTAAACATCGT-CGCACACTTTTCAAAGATAGTTATTTAAGATTTACGCATAC---GATAAAAATCAAATTGGGAAACTGAAAAGAAAAACAGCAACAACAAAATTAAGCAAAATCAACTGAAAATTTGAACAAGTTTTTCATTCTAATTTC-TGTGTGTGTACGTACTTGTAAATAGAGTTTAAGTATGCAAATCATAGTGCTTACGTATACATTTAGAATGCAATAAAAACAACAACTAAAAAATAAAAAATACAAAAAAAAGAAATAAAACAAACGAAATGAAACAGTTAAGAATTTAAATCATTACCGAAAATATGAAA
>lig 3588490 3588859|2854 chr2R 3588086 3588495 scaffold_4 569647 570020 - 12146|413 418
TGAAAT
AGCAAT
>lig 3588490 3588859|2855 chr2R 3588573 3589409 scaffold_4 570667 571613 - 4098|0 314
CATTGTACACTTGTTGACTGTGATTACATATAGGTTTATGTCCTTA-----AATAAGCTTATACCTACACTAATCCTGGATAATCACACTTAC-CAGTTTTTTTTTTGCCCTGTAGCTATGGAGTTGATTTGTTGAACCGCATGTATTTGTAAATTGTTTCCATTATCAACACTAACCGCCAAGCATATATTTGTAAGTCCTCTATT-ACCTATCTACGCACATCATCTGTAAAACAAACA--------------------CCCAAAGTATTTTATGTGTGACAATCA-TTAAACCTTTTCTTTTTCACCTGGGA
CAGTTTCCAATAGAGAACTGTGAT-----ATGAGTTTAAATTCTCGCGAATAATAAAC----AATTGATCAAATCTTACTTAAGCACAATAATTCAGCTTTCGGTT---CCTGGTGTTTTGTAGCC--TTAATTAACCCGTTTCAATTTGTA----GCATTTGTTTTTAAACGTAGCTAACAAAAATACATTTTCATGCATTTTGTTCACAGAGCTAGGCTCATTTTGCTTATCGCGGGAATATTTTTGCGCTCTCTTGCTCCCTAGTTAGTTAAAGTTACTTAGTTAGTTAAAACCTTACACACTCGCACACTT
>lig 3589643 3590638|2856 chr2R 3589507 3593336 scaffold_4 571736 575528 - 97617|136 1272
CTTCCGGAGAACACGATCTGGCGGCCCCTGCAGAT------------------CGCCCGCGCGAACGACTTTTATAGCCTTCGCAGCAATAGCAGCAGCACCACAACAATAACAACAACAACCACCACCACCACGCCCATTCACCACATCTACAGCAAGAGCAGCGCCAGCAATGCCCGGACGCTGCCCATCACACTCGGAACCAACTCAAAAGTGACCACAATAGCAGCCAGCAACTCCACAACGAGCGTGGATGCCAGCAACACACCAACAGCAGCAATAGTTAAGACGACAACATCGGCGATGCCGGGCATTCCCGGCCAGTTGCTGATGCTCGTCAAGGAGCAACAGCAGCCACAACCACAGCCGCCACCACAACAACAACAACATCAA-----------------GCACTCGCCGACAAG----GTGGGGAGCGAGAAATCCTCGCCAGCGTCGGAGAATGATTATCTAATATACGATGATAAGCGATCATACTTTACTTAATAAGAAACGTTTTTACTACGAACGCACTGTAAAGGCGCCGCTCAGCAGCGTCCTGACCACCACGCCTCCCTCCT-------------------------------------------------------------CCCCTCAGCCTC----------AAGACACACCACAC----CCCACACTTGCGGAGGCGACTCCTAAAGCCAACCACACACACA-ACACACTTCCTCACACAACAAAGAGTAGAACGAAACATACAGC----AACATCCGCATA-----AATATACCAAGTACCATTTT-CACATTGCATACAAATAAATTTACAAAGATAAAGAGTAACAATTATTAATTATTAAAGGCGTAAAACGATTTAACAGATTTAAGAGTGTAAGAGAGAAACCGGAAATGCAGAACAGTAAATTAAAAATACAAGTATATATATTAAATAAACCACAAAACCACAAACATAACGTGAATGAGA-AAAAACAAA--ACAAACAAAAATTAATTATTGTAATCGGTTTAAACTTATATGTAT-----AATTATAACCTTAATATTTAAACTAAATACAAAAAAG--------AAGATACGATTAAATCCAAACAAAATGCAAAAAATGAA
CTTCCGGAGAAGACCATTTGGCGGCCGCTGCAAATAACGCTGCAGTCGAGCGCCGGCCGAGCAGGCGAATTTTATAGCCTACGCACCAA------------CACAGCAGCAACAGCAGCAACAACAACAACAACATCCATTCACATTAATAACAATAATATCAGTCAGAG---------AGCGTTGCCTGTAACA---------------------------------------------------------GATGCGAGTTCAATAACAACAGCAACTAAAGC---GACAACAGCAACTGCAA------------CAAATCAGTTACTAATGCTTGTCAAGGAGAAGCAACAACAACAACAACAGCAACAACAACAACAACAACATCAGCAACAGCATAAAAAATCTGAGGAATATCCAATAAGCGAAACGTTGAGCGAGGAGCATTCATCAGAGGATAACGATGATTATCATATATATGAAGATGAGAGATCATATTTTACTTAATAAGAAATGTTTTTACTACGAACGCGTTGAGCTCGCCTCCTCCCTCGCCCTCTC--CCTCCATCAATCCCTTCTTCGCTATGGAACGATGTCGAAGTGCAGATCTATGCATCTTTATAAAGTATACCAAGTTCAGCCCCTCAGCCACGCCCCCTCACATAACATACCATATAAAACACACACACACACACTCGCATACAGAATGCAACAACCAAAATACACACACAAACAAACGCATAAACGCATA-CATAACACGTACAGCCAACAACATCTGCATATATAAACTATACCAAGTACCATTTTTCACATTGCATACAAATAA-TTTACAAAGATAAAAGATAACAATTATTAAATATTAAAGGCGTAAAACGATTTAACAGATTTATAAGCGTAAGAT-GAAAC------------------AAATACAAATACAAAAACAAAAAC-AAACAAAACGTAAAA-------------GTGAATGAAAGAAAAACAAACAACAAACAAAAATTAATTATTGTAATCGGTTTAAACTTATGTGTATTGTATAATTATAACCTTAATATTTAAATTAAATACAAGAAAAGAAGATAAAAGATACGATTAAATCCAAACAAA-TGCAAAAAAAAAC
>sut1 3598394 3598962|2861 chr2R 3598128 3598756 scaffold_4 580478 581063 - 15270|273 650
GACATAGCCCAGTGGGCTCAACTTCCAATTAGC--CATAAGTAGCCGGTGGTTTGTGGTAATACGGTTTAACTTCA--TGTGTGCAGTGGGTCGC----TTAATGA--TTCGTCCATGTCGTGTGCCTTTTGTATGTGTCGACAATAAGCCGAAATCCACGTTGTTCAGGGATAAATTACTCTTACTAAATGTAATTTCCCGCCTAGCCTGTAAGTTCTTTTGTACAAACCAATAAATGCGAAAATTGATCTAACTTTAAGAGT-CACCCTGTAAGAAAGCTTTGAGCGCTGCGTC---CTCTTATCACTGCACAAGTTCAATTAAAACGCCTTGGGACGGACCGCCAAGTAATAC-TCTGTTAATTAGATTTATTGT
GGTGTGGCACACTGGAAAGTAGTTATAATTAAATGCTTTGCTACGCGGCGTATTATATTAAGTTAGTTTTAAGTTAATTGTTAGCTGTAATTTTCATAGTTAATGAGGTTTATGCAGGACACATGCCTCAC-------CGGACAATAAGAGTACAT----------------TAAATTGTAAATTTGTAATATGAATGTACAACTAATTGATAAGACACCCTGTATAA-----------------------------TAATGGTACCCATTGCCAACATATGTAGAAGGCTGTGTTTGGCTCTTATCGCTGCACAAGTTCAAGTTAATTGGCTGTG-------------TTGTTACTTTTGCTAATTGAATTTACTGT
>sut2 3601023 3601110|2863 chr2R 3600730 3601023 scaffold_4 583815 584099 - 16295|293 293
A
A
>sut2 3601023 3601110|2864 chr2R 3601024 3601263 scaffold_4 5980650 5980856 - -1189|0 86
GTGGCATTCACCTTTACATTGAAAATGAAACAAGCTGGTCTTTCTTGAAAAATGAATTTTGCTTGAAAGATATTTAATTTATATGTT
CAGTGATAAGAATTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAACAATTATCTACGGCTTGCCGAA----GTTTAAATACTCTTGCAGGTTTATGGC
>sut3 3603003 3603110|2866 chr2R 3601598 3603321 scaffold_4 5979233 5981002 - 12713|1471 1580
ATCCATCTGTGAACGATGAGGAACCACTTTTTGACTGGTGATTATTTGCCCATGCTTTTGGTAACATT--TCTACAAATTTCAAATATATATGTATGTTTGTAGGATCTC
AAAAAAAAAAAAACAATTATCTACGGCTTGCCGAAGTTTAAATACTCTTGCAGGTTTATGGCAAATGTGCCCTATTAATATAATATATGC-TATATG---ATAGAGTCT-
>CG8713 3608577 3608758|2872 chr2R 3607635 3609429 scaffold_4 588833 590829 - 43185|1037 1292
GAGCTAATTAGTCCAAATACAAAGATGTCGTCGTACAAAGTCATATTTT-TACTCGCTGTTAGTGTAGGCTCTCCTAGGCTAGCTTAAG-----ATAGAACTGTACATATAACTAGACAAATGTGTTCCTTTTTG----------------GTAAATGTATAA----TACTTGTAATCATAAATGGAGATCAAAGAAAT-ATTA-----------------------------------------------TACCC
CCAAAAACTTGTTGACGTACAAAGAACCAAAAATCATCAATTATGCTATATATTAGTTAACAGTTAAGCCGATCTT----TAGTTTAAGTATCTATGTACATGTATATATGGTAGCAAGAATGTGTTCCTTTTTGTTTTTTGTTTTTGTAAATCAATCTATTAACTCTATTTTTAAATACTAGTGTAGAATGATTAAATGATTAATTTCTAGTAGTATATAACAATATAAAAGTAGAATGCTAGATACTGCTGCCC
>CG2158 3636762 3636871|2884 chr2R 3634889 3637437 scaffold_4 612173 614842 - 47485|2138 2248
AGGATAGACAACTAACATGAATTCGTACATATAGATGTTGTTTAATCGTTTGTATTTTAAAAGCTATAAATGTACGAAAC-CCTGGAAATAGAACTCAAGAATGTACACAC
ATGAGGGAATTCAAACTCA----CGTACACATTTATGTTATTTGATCGTTTACA-TAAACAAACTATGAAAATATTAAACGCATGGAAATGTAAGGAAAAACAATAAACTC
>Socs44A 3640609 3641289|2887 chr2R 3639604 3643045 scaffold_4 616914 620670 - 80951|1113 1914
GCAACCGCCGCCCGCCGTCGAGAAGCCGCTGGTCAAAGCTTTA--ACACTGAAGTAAACGCAAGCGCGTACACCAAAGA--------GGTCCGGGCGAATGGAATCCCAGCCT-----GCAGTTGTTCGTAATGATATTTGTTGGTC---GGATTGGCAATATGT-TGTTGATGCATTTCTACGCCCCAGTAACTAAGCGCACAGTCTCTCTT---CACGTGCACGCCGGAATCCCA-------------------------GTGCA--------------CAGAATTTTACTGTATTGTACTGCTAAGTACGGTTAGTACTAGTATCTTGTCTAGGATAATGTAT---TATGTTATTTGCCATATTTAGTCTATTGGTTTGTTTTATATGGGTCCTGGTCAA-GTCTATAC----------------------TCTGCACCACA----------GTGTGCAAATCCTTAAGCAAATTTTTAAACATTGAACTACTGCATATATGTATTAACGTAAGTTCTAAGCCAGATGTATCGTACTATTTACGTTGTTTGCATTTTTGTATTCCTAACTTGGACACTAACTTTT--TGCTAATCTAGAT-TGCATGGAATTTAGGCAGCTTTACGGCAATCGAATACGTTCAATGCCAATTACTCTTGTTGCAACGTGTATGTATTTTATTTA--------------------AATCTATCTATGAATATTTTACAA-GAACAAAATATCAATCAACTCCTTGAGCGATCTTGCAGTCAAAGGAGCTCGCAAATAAAGAAAAAATCAC
GAGGCAGCTACACAGTT----AACGGCACTGCCAGAAGTTATATTATATATATATAAATATATATCTATATACTATAGATTGAATTGGAATTGCTCGATCCGGATCTTAATCTTGAGAGCAAACACACACACACACACTTACAGGCCATAGCAAAAGCGACGAGTGTTTCAATGCATTTGTACACACACACACACACACTCACACACAGAATTGAACACGCACAAACGAAAAATTGATACTATATAGTATATACATATATATGTGCATATTTATATATATGCATGTTTTTAATCTATAACTGTAATAAGTATATTT-GTATTCATATATACTTAAATATAGAATACACATATGTTATTGGCCAAAATTAGTCTATTATCTCGTTTTCCATTGGTCTTGGTCAAAGTCTGTACACCTAATTGATATTAATACTAATTTGTATTACATATACAATATGTATGTGAAGCTCCCAAAAAAAAAAAAAAAACTAAGTATTCGTATACATAAACTCAAGATATTTGTGTTGTATATATGTATATATATATACATGAT--GCATTTG---ATTCCTAATGTCAA-ACTAACTTTTGCTATTATACTAAATATACGT---ATATAGATCACTTAAACTGGGCAGCAAATGTTTAA---------CTATTGTTACAACGTGTATTGACTTTTTTTTTTAACACAAACAGTATGTATAATTTATGTTTGAATATATTTTAACGAAATAAAATTAAATTAAATA--TGCGTGTGCCTATAATTAACTGAGCTCATCCAAATCCAAGCTATCCT
>Pabp2 3644994 3645293|2888 chr2R 3643245 3647040 scaffold_4 620677 624676 - 91717|1854 2202
TTATTGTTTTATTAAAATCCCTAGTAAGGTAAGTTGACAATTTCGAACTGAAAATAATTGATAGT-TGAAATTTTATA-TGTGTGGGTTGCGTCCGATTTATGTCGGTTACATAAAGTAATCCGAT--------ATCTATCTCT-TATATTTTGATACATTTTTTTTCTTAAAAT---TTATAAAACCAA-------------TGAGGACGTCTTTTTATG-TTAAATTTAAGTTGTTAGAAAATGC---------CGTTTGTT--------TTTATGGAGCTAA--ATAGATTTAGTTTGCATAGCT--GGTAGATCATTACGGGAAATAAAAACAATCAAATTTATG
TTATTGTGTTCTT-AATTTTATAGTAAGGTAAGTTGAC----TGAAAC--AAAACCATAAATAGTCTGCGGGCATATGCCTTGTGAGATACATTTGATATTTA------ACATAGCGTATGCCCATTGTGCAAAGCCCATTTGTATATAATCCG-TCCGCTTCCATTGCCAAAGTGCAGTAAAAAACCCAATTTGTATCGGTTTAAAACCGTTCGCCTGTGATTTAGTTTAAACTCACGTCTAATGCACACGGACGCCTTTGCTATAAAAGCTTCATGGGGTATACGAGAGAGCCGGTGCACATAGAGAAAGTCCACTAATACTTTTAACTAATACACT--------TT
>Pabp2 3645428 3646187|2888 chr2R 3643245 3647040 scaffold_4 620677 624676 - 91717|2352 3327
ATTTTTTTACAATATAATTTCAAAAAACATTATTTTATTGCC-AAACTTCTTTGC---TAAATAAAAAAGAGAAAACAATCGCAACAGAAAACGCCAGAAA----------------AAATATCGTTTCAATAAA----AAATGCATCAGCAGCAAG--------AAAACAGGCGAAAAGAAGAGACCTCGAAAATAATAA----AAAATCAACAAGGAA-------AACGAATATCTTGACTTGGCTATAATGTTTTTTGAAGCACCCAACAC--CAAACACCCCCTTTTCACACATTTTAATTTTCAATAAAACATCAAAAAAAAAAAAAAGATTATGAAAAACAAGAAGTTGATTT-----------------------AAAAAACAAAAAAGTATATAC--------AACAATAAGTATATATAAAAG---------AAGCGCAAAAGAAACCACAAACCCCAAATAAAAGAAGTTA-AAAGATGGCAAAAGCAAATAAAGAAGGAAGAAAATATAAAAAAAAAATCAAAAGAACACAAGACTCTTGGGAAAGAAGTAAAT-CAACAAAATATATAAAAA---------GTGCGTGTGTA------------------------------------------ATTTATATATTTAAAAAAA-AAATATATAGAGTAAAGAGAAGATAAGAAAAGAAGTTGAATTTACTAAAGCGAAAAAGATGAAGACAAATATAATCGAATTAAATAAGCTATCAATGCCTTTCCTTTGGGCGGGACAAGGTTTTTTGGGATTGAGGATGCGAGTAA----------------CAGCTTGATTCCTGCCACCACCAGCAGCCCTACCTCTC---------------TTCCAGCCCTCAGAAATAT------------------------------TGTGAATAATAAAAAGAACATTC----------------TTCATTC
ATTTTTTTAATATATAATTTCAAAAAAC---ATTTTATTGCCAAAACTTCTTTGCTAATAAATACAAAAATAAAAAAGAATGCA--AGAGTACGCCAACAAAAAAATATATGCATAGAAATAATATTTAAAAAAAAATCAACTGCACCAACGAAAAAAATTTCTTAAAAAAGGCGCAAAAAAGA-----TGAAACCAATAAAATGAAAATCAACAAGGAAAAGATTTAAAAAAAAAACGTACTTGGCTATAATGTTTTTTGAAGCACCCAACACCACAAACACCCCCTTATCACACTTTTTAATTTT----------TCAAAATAAAAAAAAAAATAATAATAATAATTATATATATTTATATATATAAACTGCAAAACGTAAAAAAACAAAAGATGAGAAACAGTTGGTAAAAAATATATGTATAAAAAAGATGACAAACAAAAGCAGCATAAAAAATAAA--ACAAAGAAAAGAAGTTCTAAAGATGGCAAAAATAAAAGAGGATAAAAAGATATATAAAAAAAATTTTGAAAAAAGAACAGACAA--GGAAAAGATGAAAACACCACAAAATAAAAAAAAATAAATATATATACATATATATAATAAAAAAGAAAAGAAATCCCAAGATAATTTTAAAATCTTGTTCATGTATTCGAAAAAATTAACATATATACATAATAGTATACAAGAAAA----------TTGATAATATCGAAAAGATGAAG--AAATATAAACGAATTAAACAACTTTTCTATGCCTTTCCTTTGGGTGGGACAAGGTTGGGAGAGAGAGAGAGAGCGCGCGAGAGAAAGAGAGAGAGGGAGCTGGCGGCGAGGCAACAATTGAATTCCGAGTTCCCGGCATTATTTATGGTTTGCATAACTAAGCATTATATAATATATATATAAAACAACTATATAGCATGTGTTTCCCAAACAGAAAATTCAAAATAAAATAAACTTGGCATTA
>Rs1 3679481 3679582|2915 chr2R 3675826 3679644 scaffold_16 1586751 1590424 + 167351|3733 3844
AGCTGCAAACTACGCTATGT-TAAATCGTATACTTGTAAAATAAAACTTTTTCTTCTTTAAGGCATTTAATTTTTTTAATTTGCTT-----TAAAC----ATATGACACCTC
TAC-------------ATATATAAATAAAACAATGAAAAAGTTAAA---------------------TAACCAGCTTAATTTACATGTAAATAAACATGAATATAATATATC
>CG2183 3681476 3681904|2916 chr2R 3679746 3681678 scaffold_16 1590510 1592479 + 49993|1804 2013
TATCCGCTCAAGAACATTCCTCATATTATTTCCAACGTTTACGAAGAACGTGGTTTTCCTTACCGCTCTGAACTGG------CGGAATTTTTTTGCAAATCCAAATAGTTTTAGGTTAAAGAAAAGTTTAACTCATATTTCGAATCGAAGTTTATCAATTGTTATTTCTAACTGTTAGGAAACGCGTAATCTCTCAAT-ACATTTAACAA
CACACGAATAATAGAATTTCTAGAATTTCCGTTAATGTTTAAACACAACGCAGTACAAATAACCG---TAAACTAATCATTTCGAAATTCT----CGAATCAAAATAGGTTAAGTTAAAACGCTTTATGAACTGTTATCTGAAGTTTATGTTTAACAAAAA--------AAGTGTTAAAAAAAACGTTAATTGTTAATAAAAATTAACAA
>CG2183 3681476 3681904|2917 chr2R 3681804 3681947 scaffold_14 217606 217728 - 820|0 100
TGACGGAAAACACCATATATATATATATTAATACAACATCGAATGTAAAAATTGAAAAGAGTTATTTTTGTTAACCCATTAATAAAGGAGTTGTTAACTAA
TGACAAAAAAGTATATATACATATATATTTGAATAGTATATGCTTCAGCAAGTGAACAACTTCACTGTTATCACGC----GCTAGAGG-------AACTGA
>Mlh1 3684158 3684215|2918 chr2R 3681948 3684215 scaffold_16 1592483 1594740 + 88813|2230 2288
TTTAGGTTGTTCACTTCCA-GAACTTTAAATATTGATTATATTTGGTATTCTAAACATA
CT---ATTGTTCTTAGGCATAAATTCCAAATATGATTTTAAATTCCCAATTTAATCATA
>CG33087 3737229 3737551|2972 chr2R 3733904 3737402 scaffold_16 1654367 1657790 + 172690|3335 3541
TGATTGACCCGCTGCA------ACCGAGAGCTGTGCTAGGAGCAGTCGTACATGG---------------------------AGACATCCACATCCCAACACTCAATAATGATTTGAACTCGAACACAATGGACTGATAGTTTAGCCATATAACGAACTTTTGTAAACGTTTGTGTATATTTTGTTTCCTTCTATTGTTTTTGATAT
TGATTGAGCCGTTTCAGTCATGATCGGGAGCTGTGCTAAGCACAGCCACAGATTGTTGTACACTTAAAACACATACTTTAGCACACATTTAAATCCAAATGC---AAACTGACTTGAATACGA--ACAATGGACTGATAGCGTAGCCATATTACGAA-TTTTGTAAAC----------ATTTTGTTTCCTTTTTTTTTGTGTGGGGT
>CG33087 3737229 3737551|2973 chr2R 3737425 3738158 scaffold_16 1657824 1658657 + 12930|0 168
GAGCCCTCATCCAAAGAGCTATAACTCGGGCA--GCCTTGCTCCCTTTGTTATGTCCCT---AACGATGTCCTTATACTATTATTTGCTTACACGTTTTA--------------CAAGCGCCTTTTGATAAATG----AATTTTTA-------------------ACAT
GAGCGCTAAACCTAATA--TGCAACTGTGGCGTCTCCTTGCTCCTTGTCTAATGTCCTTAAGAATGATGTCCTTATACTATAACTTA-TAACACTTCTTGTCATTCTTTTTGTTTAAGCGCCTTTT-CTAATTGTCGCAATGTTTACAACAAATTTGCCTTCCCTACAT
>pnut 3751490 3752143|2985 chr2R 3747369 3751567 scaffold_16 1668747 1673270 + 109122|4632 4746
GTCAACACGCTCAAAACCCCCATTCCCCA-AACCCCCTTCCGCTCCTCG--------------------------------TATAC-TTAAGCGCT---AATCTCGAGAACAAAG
GTCAAGCGGCGCTAGTTCGTGGTCCAGCGCAATATCCTCCTACTTAACAGCAACAACAAAAACAAAATTAAAAAAAAAAACTACACTTTAAGGGCTACAAATCTCGAGAACAAAA
>pnut 3751490 3752143|2986 chr2R 3751568 3752195 scaffold_16 1673396 1674060 + 8947|0 688
CAAA-----------------------TGAAAACCCTAGCGTATCC------TACTCTTATTCCTACCACA-TAAAGTAATTCGAAAAGTGCATA-----AATATATCTATTGTT--GGGCCCAGCCGC-------------CCCACAAGGCTTCTATTCGCACAGCAATCGTCCAGCGACGGCGT--TGCATTTGTTTTCTACATAC-TATACAAGTACATATAACACATAGCA--GTTGCAGTATTTTACCAATATATA-------------------------------------TCCACGCATTACTTGACGAAACACATTTGCTAGCCT-AATGAATTGAACACGCAAACGAATTAAATCGAGACAGTAACAAACGGTATTTGCAAAATACTTAAGTATC---TTAAAGCCTAATCATAATAA--AAACTAAGCAGAATGTACGAGTGCGAGGCGAAATTGATCCTAAAATTAATTATAACG-AATAACGAAT-CCATGTATAACGTATGCTATTGATATTGTA-ATTGTATTTTACCTATTATGCAT-AAAGTCATTGAACACCCGAACACACACCAGCAAGGCAAAAGCCGCAAGCGCAGCAGAAAACATCAAGA-----------AACAAAATATACTCTTGCATTTTATAAAATAAAGTCTTCTCCTTAGTTTAACTACA
CAAACGATTTTGTAGCCTTTCGCTCTGTGAAAAGCATCGCGAAACCGCAAGACAATGTAGAACCTAGAACCTTAGAGAGGCCCTATATATGCATATGTATTGTATATGTATTGTTTAGGTTCCAGTCGCGTTTACTTGGACATACACTCGGCT----TTCGCACAGCA--CGGCACGGCACGGCACAGCGCATTTGTTTTTTAGATGCATACATACATGTATTTAACAGTTATTATTATTGCAGTATTTTACCAAAACAAAAAGAGAAGCGCATCAAAATACCGTAAAACTTATTAATTAAAGGGATAACTTGACGTAACATTTTGACTAGCCTAAATGAATTGAA-----AAGTAACCTAAATT----------------GTATTT-CAAAATACTTAAATATCGCTTAAATAACAAATAATAATAATTATAAAAAAAAAAGCGAAAAACAGTTAAACGATAT--ATCCTAA----GAAAATAACGAAACAATTAATATCATCTATAACATACGTATTGTATAATGTGTATTGTA-TTTACTTATTATACATCAAAGTCATAACACAAA---------------------------------GCAACAAAAAACAACAACAACAACAACAACAACAAAACATACTCTTGCATTTTACAAAATAAAGTCTTCTTTTTAGTTTAACTATA
>CG8701 3883806 3883964|3133 chr2R 3883724 3883940 scaffold_16 1147039 1147260 - -95|104 238
TTCCATAGTGCTGTTTGAATCCTAATCCCAGCGCTCAGTATCTTGTTCCGTTGACCTAAATATTCCAAACCGATCCAGTTAAAGTAACTTTTCTACCGTGCGTAAAATTCAGACTAGAAATAAACCGAACTATGA
TTGCAAGATGCCCGATGAA----AGTCCCGACGAGCA----CGAGTTCTAGTA--TGAAATACTCGCAACGGATTGTGCAAAAAATACTT-----ACATTTATACAATTT--ATTGCCAATTAACTGAAATTTAA
>CG11641 3907373 3908111|3157 chr2R 3904903 3908282 scaffold_16 1867737 1871431 + 81531|2839 3712
GGCCAGGGGCCCTTGTAAATAGATGGGCCGTGTACATAGCTAGGTGTCTAAGTGTGAGTGCAAACGAGTGTGTGCGTGAGAGATTGTGTATTACAGTGTGATAGTTGTACAACACCCTAGAGTTTAGCAGTTAGGCCATGTAAAGTAATACTGTGTGTCATAGCATTTACAAAGGACATCGGCTTACGCAAGCAAACCGCAACCCGAAACCAAATC-CAATCCCCAATCCAATTGAATATTTAGCCAACTAAGTAACTACT-------------------TAACACTTATCATATCCCAAATAGCCTAAAAGTAGTATAAAGTCC--------CAAGAGCAGACTTGTGCAG-TTTTAGGCCAAATTTTATCACATTGATGTGCCATTCCAAAAAG--------AAAACAAAGCAAACCAG---------------------TTCATACACCTAACAAATTACATACTAAATGTTTAAA---AACATTT----------------AAACCAAAACTGC------------------ATAAAATCTATGTGTGA----------CCCACAGTCTAAGAAATTCTGTAGAGCTCGTAAGTGATGAGTT----AAAATATTTGCATTTAATGCGTTGGCTA---------AACTTGTATACTGAAACGAATCTGATTTCAACCATTTATAAAACAAATTAT-AACCCTAGTATTTAGCCAGTTCAGACTCGAAAACTAAGATAACTCTATATGGTAG----------CACTCAAAAAGAACAAAAGCAAGCTAAAAGACAGCAAGTGTTTAGAATAAGTAACATTATGTAGCAACTTACAAAA------ATTATGATGGAAAAGAAACGAAAAAAAA
-----------------------TAGGGCGTGTACATA--TAGAGGCC----------TGCTATATACTGTAT-----ATAGTTTGTGTG-TATTTTGTGATAGTTTTA-AACA-CTTAGCGTTTAGTTTTTAGGCCATGTAAAGTAAAAGC-TGTGTCATAGCATTTACAATAAATGTCAGCATATGTCAACCGCCCCCTTCCCCACACTTCGCCACAGTCAACAA---AATTAAATA------CAACCATGT-ACTATTTATGACTAACATTATGGACTAACATTTATCATATCCCAAATAGCCTCGAAGTAGGCTAAAGTCTAAAGTCTACAGGCGCAGACCTCTGCGGATTTTAGGGCCTATTTTATGATATTGATGTGCCATTCCAAAAATTAAAATACAAAACAAAAAAAAAAAGAATTATATATATAAATGGGATAGTATATGTATAACAAATTCACAACTAGAGATTTACATTTATCAATTTGTATGGCTAAGCGCAAAACCAAAATGACAAAAAAAAAAAACAAAAAAGAAAAACAAAATGCAAGAAGCAAAATGACACAAGTAAACAAATTCTTTATAAAACGTAAGCTCTTTGATTTAAAAAATAATTGCATTTAATGCGTTGGCTATATTAATATAACGTGTATACTAAAGTGTATTTTATTTAAACAATTTAT-AAACAAATTATAAACTCTAGCAATTAACGA-TTCTCATTTGGCCATCAA-ACCCCTCTAGCCCATAAACAAACGACCCACT-AAAATGTATGGCAGCGCACTAAAA----------ATCTAGAATAAGCAAATTTATGTAGCAATTGTCGAAAGCCCAGAACAAAAAATAAAATACAAGAACAAACG
>CSN7 3940120 3940397|3184 chr2R 3939804 3940630 scaffold_16 1913084 1913781 + 10149|322 614
GATGAGGACGGTCGAGCGGACGAGGAGTCCGAAGCTGGTTCCAACGGAGCCAGCCGACGCCCAAGGTCGCAGGCAACTCCACGCGGCACCTGAGGGGCGGAAACCGCTCGGC---TTTCGGA--------GAAACTCGCCTCCCAGCTAATCCCATCAAAACTCAGTTCGATT--CACCAG-ATAAAGGCTGTCCTCGTGAAGGATTCCATAATTAG-CATCAAATTGATCGCCAATAAATAACAAATACAAAACCTGTAATAATAGAAACCATACGTCAAAATTCACATTAA
GTGCAGGCCGGCCGAGTG-----------------------CCAAGAAGCCTGCTCAGGCCCA-------ATTCGGCGCCGCGGGGCAGCTGAGAATTGGCA--CATTCGGCATGTACTGGAACCAAAATGCAACTCATTTAAAGACTTAATACAGCAATA-GCAGCCGCATTCGCACCAGCATAAACGC-ACCCTCTGGTA----TCCATAATTAGTCATTAAACTTATTGCTAAATAATAACAATTAAAA---------------ATACAGTTCAGCAAATTTCAAATAAA
>Lcp3 3947697 3947831|3193 chr2R 3947224 3948127 scaffold_16 1059382 1060270 - 5523|510 649
GTGAACCCGCCGACTAGGAACATGAAAGATTGGAGACAGCTAGGTTGAGTTTGGATAATTTCTTACCAG-----TTGTTTTAAATTTAAGGAAAATGTTATCGAATTCGAAAATAAATTAAACCTTGCAATATAAACCAA
---AGCCCGAGCATTAAG--CTTTAAAAAGTGGCACCTGAGCGCACCTGTTGAATGGATCTTCTAACGGACTTCTCTCTATAATTTTACTATATACAATATCGCAGCAT------GATTGATTTTTGAAATTCAAAATAA
>Lcp4 3949905 3950216|3197 chr2R 3949914 3950111 scaffold_16 1034992 1035174 - -1029|0 201
ACGACCAGGACCCACATTCGAATCGGAGGTGCAACTCCAAAGACCTTGCC----CTCTAACCCTTAGAATTTAAACAGCATGCAGACATTATAAATGATTATCGAGTTAGGAAATAAATTCGATACTCTTTGGCAACAAATCTATTTAGATATGGTCTTAATTTCCCTGACGGCAGCAGGAGTTACCTTGTTTATGGCTGAT
CC--CCACAACCCCCAATAGCGTT----------CCCCATAGCGCTCCCCATGGCTCTCACCATTAAGGCAAATTCAGCTCCTAAGC-TGATTGTTTATAGTGGACTTGGAACGTACAACGGA------CTAGTCTCAGATATTTCTCGATAGCCTTTAAGTTCTTCACACCTAAACAATGTTTTTCTTAAATAAGTTTAAT
>Lcp4 3949905 3950216|3198 chr2R 3950113 3950287 scaffold_38 1014721 1014868 - 499|0 103
TATTTTGGCCGAGGGAACAAACGCTGCTTCAGATTATCACGAACTGTCTGGATGTTACGTGATTGATCTTAGCCAATAGTAACCTGTTTAATTAGCGATACATA
AATTTTAAC----------AATGCTATTGTTAGTTGTCTC-----ATCCGAATG--ACGAGTCAAATCGT----AAAAGTA----GTTTAATTAGC---ATGCA
>Cyp4e2 3958836 3958984|3212 chr2R 3957151 3958860 scaffold_16 1938531 1940272 + 55912|1740 1770
A------ATGTCAATTTATTGATCTCTGTTA
GTGTTTTATATCACCTAATTGTATTTTTTTA
>Cyp4e1 3961435 3961558|3213 chr2R 3959630 3962061 scaffold_16 1943333 1945723 + 70167|1862 1986
ATAAACACTTGCATGCTTATGGGCTACGACTTTGCAAACTTTGATAAGTACATGTATAATTCACATTTTAT-TTATCAGCGCTACTTTATTGTCACTTATTTGAATAAAATTAGCTTAGACAGCC
AAATAGACTCGCAGGGTT-TGTTTTATGTTATCTCATAATACGAT-----------TTATTATCATTTAATGTTAAGAAAGTTA-------GAAGCTGACTATGCTGGAACTTTAGTTAATGGCT
>LvpD 3967286 3967599|3218 chr2R 3965325 3969952 scaffold_16 1951437 1956204 + 182678|2013 2336
CTTCTTGTACTTATTTTGTTGTATCAAGAATTACTTCTTTAGTTCGTGTTA--ATCAG---TACGAATGCCACTGGGGTC-----CCTAATAAAGATAGGCCCTGTTTCGACATATGTTTTCCCAGAAATATATTAAACCGAACTTTGAATGCCAATTACCACATCTAGATTTTATAGACACCCACTTAAGATATAGGCATTTGGCCTGAGCTGTCGCTTGGTTATCGCTATGGATTAATCTGCGAATAAACGTGATCGATAGTAATCGTACGAATTTAGTTATTGCCTAAATGGCCAATAAATTAAATGGCTATTATTCAAAA
-TTCACGGATTTCTTTT-TAGCCTAATCAGTGCATTTTATGATCCATGTAAAGATTAAATTTAAAAATGGGCCTACAGCCATGTGCCTGAC-TATACAAACAGTCTTTCGCCACATG-----CCAGTGG------AAACTGGGTAGTAAATACAAAGT-CCAATTCGACTTTGAGTGGGCAATTACTCGAA----AGAATTGTAACTTCAACACTTGATGTGTTTTT------CAATAAACTATTTACAAACGCTTCTTAATATGGACTTAAGATGTAAATTATAG------------ATGAACAGAATTGCTGTC-TTCTGAG
>CG30359 3976846 3976907|3223 chr2R 3976641 3978139 scaffold_16 1962648 1964181 + 73164|205 295
GTTCCCAC---------CATATGCTAGTTAATAATAA-------AATACTCACAATAAAGT-------------CATTCAAAGCACTCGAA
GTTCTTGCACTCAATCGCAGGTGGTAGTCATTTATAATAATGTGAATACTCATAACCAAATAAATGTTTACAAACATTCGATGCACTTGA-
>Cyp6a13 4083826 4083958|3339 chr2R 4083816 4084284 scaffold_16 2160189 2160666 + -2067|10 151
TAGTTGTTATCTGAAAATGTGTATAATCCTGACAGCGCGAAATATGTATAGGAAAACTCTTATCTACAAAAGACTGCG--TTCCAAGATTGCATTAATC--CCTACATTA-TACAAATAAACA----CAAAGAAACTGTCTA
TAG------------AGTGTATATAAT-------ATACAAACTAAAT-TATAATAACTTCTGTGCCGATGGAATTGGGAATTCAAAAAATTTATTAAGTAATCTAAATGATTAGAAATAATAAATTCCATGGAAGCTTTGGG
>rgr 4122702 4124163|3379 chr2R 4121253 4123083 scaffold_11 876034 877854 - 70806|1482 1878
AACCTTCAGCCACTCGAAGTTTTTGCTCTGCACTTTATAATATTTACAAAGCAATCGTAGGGCGTTAGATGTGTGTCCGTGTACTTAAAGTTATTTTGCCGTCTAGCATATACCAATCATATCGTTAATCTAGCACTAATGTAAGTAATGTATTTATAT-----GCTATTTAAGAATGTCTGATAAATGGCTACAAGTGTTGCCTTTT---GCGTTCTGTAAGTCTTATCGTCGTAATCAGAGACGATTAGCCAGCCATTCGTGCAATGCTTGTAACTGGTTTATAATTCGAATCCCAA-----AGTCATCGA--AAGTGAAACCAAAAATATGCGTGTGTTTTAAATAAACATATAGTCAATGTATTTATTTGTAATGTTTTCATCTGGCTTATCG
AAGC-----CGACGCGCAGCTGTAGATCC---CTTT---GTGCTTACCAAATCATT-TAAGAAGTTAGTTTAATAACCAAATACTTAGAGATA-CTCACTGTAACAACTGTACTTATCATATC--TGCTCTATCTTTAAC----------TATTTATGTCAAGGGTTTCTTAACAGCAATAGATGATTAAGCGTAATTTTTAAATTTTCAAATATAATCTATTTCCAATTGGCATATTTGTGAAT-------------TTCGTGTATGCCTTTTGATCTCAACATAGTTTGAAGCTTAAGTAATAATCAGCTATGAAGTGAATTAGAATATACTATTGTATT-------------------ATTTATTTATTTTTATTTTCTTTATTTCCTATATTG
>rgr 4122702 4124163|3380 chr2R 4123359 4123904 scaffold_11 886388 886809 - 4431|0 556
TATTTCATTTTTATCGGCCCAATGCACACACTCAATTAGATTTCATTAAATTGTTGCAACAGAGCAAATTACGACAAAGGCGGAAAATGGAAATGAAAATGAAAATGAAAATTAATTGCACCCAATGACTTGTGTGCGAAACAAACAAAATGTCTAGGGCGATATGCAGTCAACTGTAACGTGGTAATTACCCAAAGACGGGGGCCGCAAACAAATCGAAACCTAATCAACTGTCGCAGGGGCGTCCAAAGGGGCAAA---CGAAGATTAATAGGATCGG--------CATCGAAGTGAGATTTATGCTCGCATAGGTTCGACAATTTTCTGCTCGGACACTCGTCAAATAATTTCCGATTATCCTGGCGGTCGCATCGGCCGAGGCAGATCCTTCAGCTCCAGCTGACTCTTGGGGCGGATGAGCATTTGGACGGACTTCAGGGAGCGGAAGCTGTACCACGGCTCCCAGTAGATGCTCTGCGGGTTGTCCACCTCTCCCTTGAAGTAACGTCCATTTAAATTGCTGTTAAATAAAAAAAAAATTACCCTTTACAT
TGTCTATTTTACATCTGAATAATGCACACGCCAAATATGATTTGTCTAAATTGTTGAAATA-----------------------------------------------AAATTAATTGCATC-ATTGACTTGTGTGT-CAATGAGCACAAGCACCAGGGCAAT--GCAATGAAACGAAATGAGATA----CAAAAAAAATGGGCGTGGAAATGACTTGAGGCTTATCTGTATCTGTCGGCGCGATATAGAGATTCAGATATCTTAATTCAGCAATATCGGATATATTGTATAAAAGTAAATTAAAAGC---CTTAGGTTATTAATTGTTGTGCGCG------------------------------------------------------------------------TTCTTTGGCCTGATGAGCATTTGTACCGACTTTAGGGACTTGAAGCTATACCAGCGATCCCAGAAAATACCTTGTTCATTGTCCATTTGCTTTTTGAAGTATTTACCATTCAGATTGCT-----AGAGAAAATAACATATCTTTTAAAT
>rgr 4122702 4124163|3381 chr2R 4123939 4124145 scaffold_7 509688 509928 - -1581|0 243
GAAAATTATTCAACACAAGAAAAGTAGCTCGCTTTCCCAAGCCGACGCTTAAATACC-CTTG----CACTACATATTAAATACAAACTATTATTGATACAATC------ACTTTTCGATCAAAAACAACAAATATACGATGTGTTTTTTCCCATCTTCAATTAAA-----TTTTTGTCATTTATATAATTGTGA--------ACAAACTGGTGGGTACTGAAT-------------TAATAAAC
GAAAACAGATCTACATAGCCTAAATAAATATGTTTTAAATTGGTATATTTGATTTTTGCTTGGTAATAGTAAAAAAAAAATTCAAACGGATTTTTATTCGATTTTAAAAACATTAAGAAAATGAATAACCTGTA---GATATATTATTGTTCCTCTGAAGCAGAAGCTCGTCTCTGTTGCTAACAAAATTATGATTTTATGTATATATTTAGGAATTTTAGAAATATTCTCTTATATATTAAAG
>rgr 4122702 4124163|3382 chr2R 4124146 4124295 scaffold_5 3802032 3802170 + 1574|0 17
TCTATGTTAAAAAACCAT
TCAACTTTTAAATGTAGT
>Cirl 4135321 4137016|3389 chr2R 4130313 4136685 scaffold_11 893605 900439 - 212338|5535 7132
TCAGTTAACGCAAC--------------TCCCCCGGAACA------------------------GTCTTAGGCAAAAATTGTAGCTTAGGATCTCTAGCTATAC--CTAGTATTAGTCGTTAGTCGAAATATGGAGCATTGTGTGAAACAACATGC-----TGTCATGCTATACGTGCAGTGATTCGAAAATCCCAAAACTTTATAAATGTATATGAAATAACTAAAACCTAGACCATAGGGCACATCCATACCCCTGCGGTGCCGTGCAAGCTTAACCAAAACTCGAGCGATGGGGGGTTGGAATTGGAATTGGAATCGGGCCCTTCGACTTGCATGCATTTTATACCAACTTGGAAATCGATATTAAATATAAATGTATGTACCATATATGTATG-----------ATGTATTGTA-----------------ATACATGTCA-CCACATGCCATTTTTAAATACTTAAAAACTAATTTAAACAACCAGAAAATCAAGTATATATATATGGATGTAGGTATATGTATAAGATCTAGGAACTGTATGTACATGATATATAGAATTCAGGCGAATTATG--TTTTATGTATTTTGTAAG----AAATCAATTGTTTTTGATTTACGCTGATTATGCTCGTAAGATATATATATATATACACACAGGCTTAAGATTTGTTTTGTGTTTCATAAACCAAA-AAGATATCCTACGTTTTGAAA--GATTGTCATTTCTTGCTATCCAGCTGCCGTTTTCCACCTATACA-ACTAAAATTCCTTCCAACTGCGAATC--AAGAGGAATATAAG----AAGTAAAGGGAAATAATACATTGCCA----------------TTTTGTTGCTGCATTTCAGCTA----CGTTGTAAGCAAACCAGAGCGAAGCATTTGAAGTGTACATTTTCATCAATCTAGATGCTTTAAGCACACACATAGGGGCATTTACTTTATA------------------TTTTTGAGATACAGAGAGAG-AGAGAGCT-----------------CGCGAAATG------------------CTTTATTATT----TTACAAA--------------ACCGATACAGCATACGGAAA--TGAAA--------------TACCTATATAGCAAAGAAAGATTTCAACCAAACCTCACTTGTTAACTAGGAACTAACTG-AAAACTCTTTAAACACTAGCCAGCTGAAATCCAATCCTAACACTAAACTGTACTCTATTCCTACTCCCCGAATGGCATTCTCCCTAGAATTT-CACGCATGTGTACAAAAACCAAAT-------AAAATATAGTGCAAACAAGATGATTACCATATATGTCGT-ACATACCAAGC-CAAGGAAGCTCCGTGGGGGCAGCAGGCCCAGCTC------------------------GATCCCATTTGATCTGATCCGATTCGATCCGATCCGATCAGCAAGTTAAACTTGAACGAAACATTAGCACACAATCGATAAAGTTAGTAACTAAGCACCCGCAGCATGCCACACATAAAGTGTCTAAATTGGTTCGGAAATCGCGTGTTTGAAAGAGGAATACAG
ACAGCAAGAGTATCAGTAGCCGACAGCAGCCCTCCACACATTGCATGGCAGGCAGCTGATCGTTGTCTTAGGCAAAAATTGTAGCTTAGG---TTTAGCTATACCTCTAGTATTAGTCATTAGTCGAAATATGGAGCATTGTGTGAAACAACATGCTGTCATGTCATGCTATACGTGCAGTGATTCGAGAATCCCAAAACTTTAT--ATGTATATG---TAACTCAA--TTAGACCATAGGCTAAACAACCAACCAACCA--ACCAACCAATGCGGAGCAAAACAAATTCAATATGAAAATTAAATGGATATTGTTGTC--------------GCTCACAATTTATAC--------AACTCGAT-----ATATAAATGTATGTACTGTATGTATATGTATAATGTAATATGTAATGTATAATGTATGTGAAGCGCATACATGTCACCCACATGCCATTTTTAAGTAGGTTACCAATTACTATACCA--------------TATGTGTATATG------------TGTATAAGATCTGAGAACTATATGTAAATGATATTTAGGG--CGAGCATATTATGTATTTTATGTAATTTATAGGGCGTATATTGTTTATTTCTTTTTTTCGCTAATTAATAACTTAGGAAAACAATAATTTT-------TGCTTAAGATTTGTTTCAAATTT-ATAAACCAACTGAGAAAATCGAAAAACGAAAATGGGAAATCGTTTTTTCGCAACGTGCTGTAA-ATTAAGCTTAGATGCACTAACGTTCATTTCCCACGCTGACCCTAAATGTGAAACAAATCTTATGCGCATGGTTTTTATTTATTTCTAATTCGATTTGTATGCCATTTGTTATTGCATTTCTTTTAAACTTATTTTAAGAGATCC--AGCAAAGCATTTCAAGTGTACATTTTCATCAAT----ATGCTTTAAGCACAAATATA-GGGCATTTATTTTGTACCATTCTTTTCTTTTTTTTTTTTAATAAAAAGAATTAGTAGAGCGCTTTACTATATGTACGAGACAAGAAATGTTATTGATATTTAAATGTCTTTAGAATTAGCATTACAAGCATGCTAAGTACATAACTCCACAGTCGGAGGAAACCCGAAACAGTAAAATATACCTACTTATATAGTAAAGAAAGATTTCAACCAAACCTCACTTGTTAACTAGGAACTAACTGTAAAACTCTTTAA--ACTAGCTAACACAAACTGAACTATAAAGAGACAC----CTTTGTT-----TCCCTAAACGG----CTCTAGAGAATTTCCGCGCATGTGTACAAAAACCAAATAAAGACAAAAGCAAAGTGCAAAATATAATATTACCAAATATTTCGTAACACGCGAAATACGCGTTAACTAAATATATACTGCCTGCACAGCTCTCCTTCACCCAAGCATGAAACACAAATTACCATTAATATAA---AAATCAAGCCTACTTCAAATGCCAGTTAGAATGCAAC-AAATAAGAGATCACAACTTATTA---TGATGAGCACAAATAGACAACAAATTACTTCTAAAGCACAAAGAT--GCTTCTAAATTTTATATACAAAAAAAAAAAACAA
>Cirl 4135321 4137016|3390 chr2R 4136686 4137919 scaffold_11 900578 901643 - 29740|0 354
AATAGCAG-----ATATTGAATGTATAGTGTTGCGCCTCCTAGAACTTTACTTATAAATAATAAAGCAGATTTATCAGATACGAGTATATATGTGCGTGTATATTGACGAT------GCAAGCCA-----------TTGCAATCCCCCTCTTTTGTCGCCACATTCTCGCGAAATTGATTCTAGACCTAGGCATTGAATTGATAAATCAGAGATTTTGAATAAAGCAGAAACCGAAACTGAAAACCAGACGCCCAAATCAAAGTTCATAAAAAGCCCGATGAAAATGTTAATGTACACAATTTTTTCTATTTAAGACAAA--ATACAAGAAATGGATTGCATTTTACTGTAAATG
AATAAAAACAGAAATATTGAATGTATAGTGTTGCGCCTCCTAGTACTTTAAATATAT-TGATCAAGAATATATATCTGATATGAGTATATATGTAAATGGATATTTATGATTATAATGCAAAGCAAATGCCGATATCTACAAACTTCTT--TTTGTCTCTACATGTTTAC--------TTTTGGATGGAAATGTAACAATTACAA----GAAATAGCAAAGACGACATAAACTTAAACTGT--------------------------------GTGGAATAAAAATGTTAATGTACACAATTTTT-CTAATTAAGACAAATAAAGAAGAAAATCGAATGCATTTCAATTT-----
>l(2)44Db 4137916 4137997|3390 chr2R 4136686 4137919 scaffold_11 900578 901643 - 29740|1262 1265
GTGT
ATGT
>l(2)44Db 4137916 4137997|3391 chr2R 4137920 4138168 scaffold_14 662884 663152 + 3392|0 83
CCATTCTAATTGTTTACCTTGTCTTGTGGCGCATCCCGAATTATGTCATAATGGAGTAA------AGTATTGTAAAATGTACAT
CC--TCCAGCAATTTGCCGGGCTTTGTCGTGGACCCAGGTGCGCGTACTTATGATGCTGCTTGCCATTACTGTTAA-----CAT
>CG14749 4141889 4141999|3393 chr2R 4139846 4141944 scaffold_11 902112 904213 - 60263|2100 2170
GCATGCGAT-----GATTTAGTTAGTTT---------TGTTAAGT-GTGTGTATTTTTATAAACAAAAGTG
CTGTACAGTAAATAGATTTACTTGAATTGAATTGCAACGTTAATTAATAGATATTTTTCTTAAGACGAGTG
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TTAATAGCGACAAAGTCAAAGCCGCTTCTGAGTTTGAAG---------------TTTGCGGAAATGAC---AACACGGCGACGACGACAATGACTGCATAGCTAGGCAGCAGGAAGTGTGGCACTCTCTCCGTGCCACATGCCACACACCTCCAACTGGTGGCGCACCCACCACAAATGCCATGCATAACTTCAAGCAGAGACATTTAGCGCAGGTAACCTTTTGGCATGGCTTATTTATGGCCGACTCCCGCGTCGCTGTTCGCGTCTCTGTGCTAACGGTAGTCATAAACTGACTGCCCAACAATAAAGCCGTCTTCCCTGCAGTCAATGCCACTTAAGTCATTTTTTTTTCTGGCTCTGCGCCTTTTACCAACAATAAAAACCCACAATCGACAACAAC
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CCCTGGCACTAGTTCCTGTAGCCATTA-ACTGTATCTG-------TATCTTAATCTGTA----TATGTGTATGCATGTTAGTTAATT----------TCCACATAGGACATATATCTCTAGGGTTAACCTATATATATATATAT------------------------ATATATATATATATATGTGTGTAGTATATATAGCAGCTGCTATGCTCCATTCGCA
>ptc 4176150 4177036|3431 chr2R 4176578 4177039 scaffold_11 944749 945313 - 8928|0 606
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TGCCTAGCAGCCTTGTATGTATGTATT----TAGCATCTAAGGCATTCTTAAACATAGAGTTATTTATTGTAACACACAC-ACACACACACACCCGACACACACACACACACACACCATACAGAGCTATGTACTTATGTTCGGGGTCATCTACAGGACCCAATCTAAACGCGAGATTCAAATATCAAACCAATCCATACA-----------------CTAGTAATTTATAGCATTTAATTTAGTTTAAATATGTACATAGAACACAAGGACTTGAACCAAAATAGTATCGCTAAAAACAACACACACACACACACACACACACATACTGAATTTAAGAATTAACAACGAGAAACAAAAAAAACAAAAAACCCAAAAAACGAACAACAAAAATTGACTAATCTAACGAAATTACAAATATTAAGAAGAATC---CCTCCCGTAG--GTATTTACAGCCAAAATTTATAAATAAAAAAAAAAACCATATAAATTTAATA---------AAACAATGTTAAGGACTGTACGTATCCAAATAACACACACACACACACACACACACAC---------GCACACACACACATTATGCAGTTCTTAAAAAGCG
>CG30354 4189409 4189455|3450 chr2R 4189138 4189439 scaffold_33 1129748 1130119 - 12601|349 379
TTTCAAATTCTAGCAATGCTAAAAAAATAAA
TT--------AAGCAATATCATGAACATAAA
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AAGTCAATGTACTAA---------------------------AATAACAGG----------AGCAGCAGC-TTGAAGCCAATTGTGTACTAAATATAACAATTGTTTTAGTATAGCTCAAAAGAGGAAA------CATGCGTTAT-TGAAACCAAACTAGCTTAAGTACGAAAATATCTAAAAACCAAATAG-ACACACATCAACGG----------CTATGCCTGTAAAG------AGAAAATTTGTGTTTAGAAATTGATTGATTTTTGAGCTCTTTTGCTAA--------------------TCTATTATAATAAAACCTGTATTGAGTTTTTAG--AGTTATGTAGCTTAGTTTGGTTACTTTTGTTTTGTACCATGCTGTTGATGTTGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGTTGAATATGATTTTGATAATGATTAC-GAATGACAATGATAATGAAAGAGACGATAACGGTTACGATTGATGTACAGTTTTCGGTTTTTAGTACATTTTTGAGGCAAATGAAAAATTGCGTAAAATAATAATTATTTTTATAAAACACACAATAAACTAAGCTTAAGTGGTTGCCTAATAATTATGTACATACTTTACATATACACAATCGCGTATATATCAAAATCTAATCCTAGATTTG-AATATAAATATATAAATATAGCGTACTTCTTAAAATATAGTTTAATATATGGCAAATATTGAAGTAATGAATTGTAGCAAATATAAAAACATAAAGCAACATG-TTCTGAATTAAAATGC-TAAATGCAAATACAAA--TTAATAAATTTCTT------TACTTCTGCTGGGGCTAACATATAAAACAAAGAGAATAAAGAGAGAGTGCACTAACTATAAACCCTCCATATACACACAACTCATATGAAGGGCAGCAAAG-AATTGTAAAATGTACAATTTTTTAGGCAAATTTAATAAATGCAACAATG-CGAATAAACTTTA--------------AAGATCAATTGCAATTACAACTCAACATC-ATAATCAGCATAAGAAAGACTTAGAGCTAAAGGAAAATAGTAATGCCTAAACTATTAAGATTCGATTA-------------------------------------TTTTTTATGTGTGCAAATA-GTTTTGATTAAATTGTAGTCATATTTTTAGTC--------------------ACGTATAAC------TTGTAGAAATGATACGGTGCGTTTT----------------TAA
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ATGTAAATCGCGCAAATAAAATAAATTGAAGGCACAAACAATTTTTCGGGGGATTCTATTTGAA
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GCTGTGTATAAGTTTTAATAATTTCGGTGAGGGCATTAAACATCATTTTTTCAAGATGGCGATGAC
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CCTGAAATGGATTCCAATTTAATAAATTTACAAATGCTGCAAAATGAAAA
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GCGCGTTGCACACCGTCCCCTTCCAAGTCCTCCCCACATTAGGCACAACCACC-TCGTTCTGTTCAAGGACTCGCCACA--CGAGCCTCGTTTTATATA-GTTGTACATTCGTTTCT-------ACGACTAGCTACGACT-AGCGTGCTATACATACACATATATAT---GTATATGTATATATATATATTATACTATATATACATATAGTTAAACAGTCTACTAACGGTACGCCATATAATTGTATATTATCCTTTAGTGTGCTTTATGCGCCCTTCTATATTTTTGTATAATCGTTTACATTATCCTAGAAACTATTGTAAAATTATTTTCTAACAGATCCGGTTATGTTTTTTTTGCACAC-TTTTTGTGCGCTCGGCACATTGCTGTTAAATATATATATATATTTT---TTATTTATCTATGTAAAGCTCAGATTCTAAGCGCTAAAGTTAAGCAACTATCGAAGTCGAAGAAAA----------------CGTATTCGAATCACAACTGCTTACATCATTAAATTTATTAACGTCTCAC-TTAAAACTCATT--------GCATTTTAATTA--ACCTCACTAAATTATTAAATGTCTTAAA---TATACTCAACGGGAT
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AGCGAGTGGACGACCCTCGACGCCTCCACCCGGTGCTCCACAGTGGAGGTCCCGAGCCCAAACGCACCTAGTTGCTAGTTGTAATCATTAATGCGAACTCGAAACGTAATTCTAATCAATTCAACTGACGGAGAAGGAGGATGTCATCGCGATGAGAGGCGATGCCCTCGC----------TTAGATGCGTAGGATTCTTTAACCTTTGTTGCAATTCTCGTCATATTTTAAATGTGAAACTTATTTGTACTCCAATAATAATAATAATTATAAATTAATAAAATATCAGACTTTAACTT
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>CG8746 4305553 4305590|3584 chr2R 4305270 4306708 scaffold_1 1232122 1233396 + 8610|306 343
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CCCGC
TCCGC
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CTATAGGCAGAGACTGGGGCCAGCACTGAAACCCGGTACTG-AGCAGC-----CAGCCCCCAGATGGGGAGACAGAAGACGTCAGCCGTCAGCACCTGAGTGTTTGTCGGCCTGTTAGTCTGTCTGTCTTTCTGTCCATTGAACGAGGTAACTTCTTGCTTCATCTTCACATATACATATATATAACTAAATGTACTCCACTCG---ACTCGTAGCTAGTTTAGAAGCTTTCCCT
>sns 4364416 4367450|3659 chr2R 4364673 4365008 scaffold_1 1296840 1297249 + 6850|0 426
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TGGCAGGCTCTCAACATGTGGC-ACCTCCAACTCTGCCAGCATTTCCATCTCCATTTCCGTCTTCATTCGCGTGTGTCGCTCACTTTTTGTCTCAGCTCCCCGCAAATTGGCCACGT-AAAAAGCACAAACAAAAAGAAAATCCCTTTTGCAGTGCATGGCCAAATGAAAATAGAATAAGTTGGTTTAGTTGACCCAAACAGGCTCGACTATGAAATACCCTTTAATTGGTTTAACTTATTAACAATTTTTTGACTAAATTAGTATGTAGTTCAAATTTAAGCATACAAGAAGAGATGAGAATATATTAAATGAAAATTTGATTAA-TATATTAAATGAAAAAT
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CATTTGCCACTCGTCGCAGCTCAGCGAGCGTGACATACCAATCCTGGCCT--GCGTTGCCATTAGCTCTT
CATTTGCTGCTCGTCGCAGCTCAGCGAGCGTGACATGC---TCCTCATCTTGGGGACGCCATTAACTTCT
>sns 4364416 4367450|3662 chr2R 4365885 4366367 scaffold_1 1303298 1303847 + 4109|0 601
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GTGTGTTAATTAATATTCATCGAGCTGTAATTACCAAA--------------GCAAGACCCTGCTTCTATTCTCCCCACCCGCCCCCTGCCACTCTCTAATGCA--GTCGCAGATAATCTCAACTGCATGCCTCTATCT-GAGCATCAAT------------AAAAAATG----AGCATTTGTCGCTGCTGC-----------CAGAATG----TTTCTCTGACTGAAAGT----AATTAAGAATTAAATTAAATATATATATTCGAAATTAACGAACGTACAGACAAAGCCAAAGCCTGGAACAAAGGCAATGCAGGGAACGAAGCGATGCTTTGGCAAACAGAAAGTAAAATTAAGGATAAGCCACATATCCTTGCACACAATACAGATATATATATATATGTATATATGTATATATATGTGTTTATCAATTTTAAAGGCCTTGCAGCTTCTTGCAAGCCTCCCCTCACGCCCGCACATTGTTGCGCCAGGCCCTGCTTTGTGTGAGGTCTTCGCTGGGATTTCCGCTATTGAATAATTGTGATTGCTGTTCGGAGATAAAAGTTAAATGAGCAGGAAAATAAGGAAAATTATAATGGAG
>sns 4364416 4367450|3663 chr2R 4366467 4366798 scaffold_1 1304403 1304794 + 2754|0 426
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TATTCACACCAATTAACATATATGTAAAGCTTATAACTCAC-------ATAGGGCTGCCAAAATTGCATTAAAGGCATTTAAAATTAAATTC------TTGACGTAAGTAGCTAAGC-GAACTAATTAAACCTCTAGTGAGAGAAAAAGTACTACCAATAAATCAATAAACTGGGATAAAGAAAAGAAGCGTATTTCGACCTACTCAATCAATATGCCAAA---TTTAATTTGTACAATA-----------------AAAGGTTAACAGGAAAAACTAAGAACGATATTAATTATGTAAAAGGACAAATGCAGGTATATATAAAAAAAGAGACAGTCATACAAGAAATAACATAAAATGAAAATATTAATTAAATTGGAAACATGCATAAATAGCTATTAAAAGTAGAATA-AATTTCGCATCTCGT
>sns 4364416 4367450|3664 chr2R 4367150 4368388 scaffold_1 1305425 1306668 + 16717|0 306
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AATGTGTAGTTAAAGCATGGCCAAAGAGAT--TTGTTAACAAAGAATATGATTATTTACAGC------ATTCAAATGTTTGTT---CTCAATTGCCTTTTATGATT-------TCATCTCGAATCACAACACA-ATTCTTAA----GAAAATCTCTTG------TTAATACGCATAT--------------GTAAT---------ATGTTAA-------TAATAGGCAAAGGAGCGAAAAG-GCCGGCAGACAAGACTTGAATACTGAACTTAG------TTTAAATGT------------------
>Rya-r44F 4399629 4399910|3690 chr2R 4394862 4399911 scaffold_1 1331208 1336235 + 282606|4882 5164
ATGACTGCGGATTCGCCGCGTCTGATTTCTGGGCACAATCACACTGGCACTAGACGGTCCAAGGACTCTCGGGATCCAATTTTGTATCGGTAGTTTGACAACATCTGGAATTTTTACCTAGTCAACTTTAGCAATGTATTTTAAGCAATATCCTACACAATCGTTTT-TATGTACGTAGAGGAGTACGACCTGTTTCCAAACTGAAATATTGATGACGATTCTAGCACGTATAACAACAAATGTTCTTAACTCATTTTGAAATAAATCTATTCATTTTGAACG
CTGCCCATAGTCTAGATTC-TCTCATTTTTAATTGAAAACA-ATTTATAATGGTTGATATCGATATGATAATGATGCTTGTTTGAATTCTTTTTTTG-CTATGTCTATAATTTT------------------AATATAATCTAAGTACTTATATGTATGAATATTTTGCATATATTTGGACGGATG----------------------GATGTTGATGATTCTAGCATGTACAGTTA-GAATGCTCCTAACTCAAAT--AAATAAATCGATTCATTTATACCG
>Dmn 4405060 4405152|3692 chr2R 4401657 4412569 scaffold_1 1337858 1348497 + 310078|3477 3571
GT--GGATGCATACCATGCGTATTAAATAAACATAGCTTATATTTATGAAAGATACCTATAATAAAGAGATCTACATTCGAGTCCAGTTCCAGTC
ATTGGGCAGGATATTTAAAATGTCTAGCACACATGACTAGAATT--------ATACCAATTATGAATGAAAATA--------TTTATTTGTATCA
>sec31 4410391 4410597|3692 chr2R 4401657 4412569 scaffold_1 1337858 1348497 + 310078|9024 9230
AGCCCCGTCGCCGGATCGCAGCCAAGTTCACTAAACGTATATTCTTATTGTGTCTTCAGATATCGATGTCAAACACAAAATGTTTTGTATACAAAGAGTGGTTCTCTACGTTAGTTTAGGCTGGGATCACCAGAAGATTGTCAACGTTATTCCGTGTATTGAAATATATTTCCACTTAAATCGCAAATAGACATATGCATAAATAAC
-------------------------------TTTACGATTATTTGTGGTTTGT------------GTGTCTAAATCAAAAGCGCGTTTAT----------GTTTGTTCCATTTGATT---TTGTGTACTCCTGCTTTTTGTTAG----ATGCAGT-TATTATAAAGGATTTC---------------TAAAATTATACATACATAAA
>CG13751 4412389 4412438|3692 chr2R 4401657 4412569 scaffold_1 1337858 1348497 + 310078|11213 11302
ATCCTT---------------TTATTAGAGTACAGT----AAAACTAATGAGCTAAAACGGATCAA---------------------CAA
AACATTTATATATACACTTAATTTTTAAATCAAAGTTTTGGTCACAATTTAACTAAAACTAATAAAAATAACTATTTGATCTTAAAGCAT
>Ggamma1 4414374 4416604|3694 chr2R 4413651 4414374 scaffold_1 1349499 1350192 + 14343|771 771
G
G
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ACCCAATCCCAATTAAAGATGATGAATAAAAACCTGAA-------------------CAATAACACCACCAGCTAAATATTGTGCAAAAAATATATACATATATCTATATATATATAAACGCAAATTATAAAAAGCAATATTATTACAAAA-----------CAA----------AAACAAAACGAATAGAAATCCGTAAAAGGGCC-------TAATGTGTACCAAGT-CGTAAATACTTAGAACGAAAAGACATAACAATATAGAAACAGACA---AATGCAAATTTTAAATTCTTCAAAAACTCTTAACCTTTGGCATTTATTCGGGTAATATCAGCAT--------------ATAGTAGAGCAACCAGTGTACACGAATATCCCAACTTAAAGGACAATTAATGTGCGGAC--TAGCAACAACTACCTAA---AACTATGAAATCTATATCTACATTAATAT---ATCAATCCAATATATTTATTAAAGCATAGTAAACACACAAATAAATACAACATACACAAACAACACCTATTTTGCCTACTTATTTCAAGAATAATCTGTTCACGTTGTTAAACAT--ACTCAATTATGAAGTATGCATATTCAAGAA--------TATATT---ATTATATACATTT------------------------------------ATAAATCCCAGCTATGCGGATTCAAACTATATGATTACTTTAAAAGCTTTAAATGCAGGCAGAAATACGGCC----ATAACAAGCTAGTTCAAC-----------TTTAGTGTGTTTAATATCAAGTTTTTTCTTAGAAAAATAT-TAAAGCTCGTTGCAGTAACGCGACAAAAATATATA-AATGCAAATATATATTTAGTATATA---TATATGTATCTCTAAAGTAGTTTTCGTCTTTTTGATTATCAACTGGCAGTTCATGCTAATATATTATC------TCGCTAAAAT--------GAACGATAATTTATTTTATAAATCTCTAGATCTCAATGAAACTCGACACGAAACTGAAAATTGTGTCTCTCAATTTCTGGCTAAAGCAAATTGTAACAATGTGTGATTCTGTGCTAAGTAAACGAAATATTAAGAAAGGAAATGAAAAAAAAAATAAGTCACTCATAATACTTGCATATTATTAAAGCTAATGTTGACATTGTAAATCGGGTGTTATCACGACAGCACATGATGTCATATCTATCAAATGATTTGTGCACGGTTGAGCCTATATTTTTGTAAAGGATAAACAAACCAAATTGTATTTGGCATGAGTGGCAAAGTATATATTAAAGCTGAGTTATTTTTCTACACTCTAACATGGTATTGGGCAAAAATTGTATGGTATTGGAATG--AAACAAAACGGTTCTTCCATCGAGAGA----------------AACATTCA------AATTTCCATATTCACATCTAAAACAAATCCACAACCCACAATTTACCT---------------TGTCGACACAGCTAGTT--------------------AACATTTAA--TATTGAATCGGTTCTTCCATTCTTGCATTTAAGTAAATTATTTGA-------------------------------------------------------ACAAGGAATCACACATATTTACTGAAAGCATTTGTTTTCC---AACACATTCAGATAGATTTTGAACTCTGTTCTGCTGTCGTGAGCATTCAGCAGAAAATTGTTCAAAATTGAAAATTTCCTACCTTAAGAGTAGACTCTTCTGGTCGCTTCCAAAAAAAAACAAAAACAACCAAAACTGCAGTTGGTTACGAGGCAACTATTTTCGGTGGACTAACAATATTTGGCACAATTTTCAATTTCCTGCAAGTTTCATGTAGATATCCCGTTTTGATTTATAGTTTTTGTTCTTCAATTGATTGGATCTATAAAGATTGAAGTGTGCTGAAAACAATCGAACTATCCACTGGAGCACGGATAGTTTCGATT-GCTTTCAGAGACAAACATCAATTCAATGATATACGTATTTACAACTATACTAACTAAAGCATGCACGAAATAATGGATATATAAAGCACCGAATACCAAGAATGA-----GAAAACACTTTAAGAACTTTATTAAACTTCAATTTGAAAACGACAACGATATCGTATTTTATTCGAAC-----------------------CAAA-----------------------TATTGAATTGTATCTGCGCATACGCATTTGAAATAATGTAATGTACTCCAAAATGAACAAATAATTGTTTGCTTGAATTCCAAAAATAAAAAG----------CTTAGATGAGTTATCTAGCGGACGCAAAAAGCCTTTTCTTCTTCTGCGTTTAATTTACAGGCATGGACA
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CTCATCTCTTCCGTCTCAGTTTAATGTTGAACAAAAGAATTTTCCTTCTCGC----CTGCCCAAAAATAGATGCAACTTTAATCAATTTTGTTCC
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AGATAATGTTTAATCACACACAAACACACAAAAAAACACACACACACACAAGCCTTATGCAATTAAAATACGTAATTTATTTTTGTATTTAAAGGAATAGAAGAAAACTAGCACAAAATTCAA-------GAACGTTTTGTAGATTTGTCACATACTTAATGTACTGAT--ACTCTTTGTACTCTGAGAACATGCATAGACTCTTTTTTAATTCATCTCAACCTAAAATCTAAGCAATACACATAAAGAGAACACTTGACAACTTATTCAAATCATATGCATATTGAACTGTAAATCAACTCTTTTTT--------------------------------TCCATGGATACTCGATATTCCAT-----TCTAAAACAAAACAATACAATAATTTAGCTTAAGATTGTTTTAAATCTTGCCGTTAAGTAGATTATTAGCATATAG---------ACGTTTTGGTAATACGGCTCATCTGTGCAATTTATTAAATGTGTGTATATTGTATATCTTAATAATTGCATGGGCGTAGTTATAATATATTTTGTGTTTAAAATGCCTTAATAATACTACACTTATTAATTAAAAGCAAAAAACAAAAACATTAAGATCATAT
>CG8243 4436517 4437159|3705 chr2R 4435042 4439933 scaffold_1 1371648 1376705 + 112564|1546 2304
ATACG-----CGGTGTATTTATGTAGTTGTATTCCTTTAATTAATTGTAAGACACGAGTGTTCGGTTCGTCTCGGTGTTGCAACATGTGTGTGTGAGACGGCGATGCTTGTTTATATACATTCGATTTATACAACAACTTGCCAATTTAGTTAGTTGTCC--------------------TATTCGTGTTCGTAGAAGAATTCATTGTCGAGCAAGCCACTGT-----ATTAAACGATGTTCATGTCCATGTCCATCTCCATGTC----CACCAGGAATCGCGTCTGCTCGTCT-------AAATCTATTC---------CAATTAAATCATAAA-AGGTACATACATACGCGTGTA-----ACACCCAACTACTTA-------------AAATTGAAAATTGAACCACAGAACGTAA--------------TGCACTTTCCAAT--CAAATGTACATGTTAT-----------------TTTTCAACATTAGCTAGGTATTTGATACG--CATGCATTCAAA---ATCGTCCA---CGCCAGGGTACGAATGTAAGGTGT-AGACTTCTGGCGCA-GTACTTTTTAAATGCTTGATATCCTTAAGAACTTATTCACGCCTGTTTGTCAATGTGAATCTAAAATATCATG-GCGGGTTGTCA-ACGGATTTATTGTATTCGATTCTTAAGTTGCTAT--GTCTAAGGAAGAAATCAAACCACTTCGAACTGTGTAATAATAAAATATTCAGACAATTGT
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TTATTGGTACCATCCACTG----GTTAACGATAGATAGAA-----------GCCAGTACAAATGCTAGACCGGCCACCTAGATTGCAAATTTTTAAATGTTATTTTGTATTTGAAAGAG--------------GAATTCCATTTAGTTTTAAGTTCAATATCGTCTGGAGAGACATGCCCACAATAAAATCAAATC
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A-----AATAGTGGACATGATCATTTTGCTGTCGTATGCCCCGCATT-----TTGGTTCTGGTTGGGTTTCTGGGA-----ACGGGTGCAGTACCTG------CAGCTATTGCAAATAAATATCTGTTACAAAACAAATCGAAA
ATATTTCATAATGGAAAAAGCAACGGCAGCGTCCTCATCGTTAAATTAACAAAATGTTCTTGTTGACTGCTTGGCATTTTCACATACCTAGTACCTGTAAGAACAGCTGGCGGAAATAAATTTCTGTTAT--AACAATTTAAAA
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--CTTTAAAACT-------AAGATAATTTGTAGACT-----------TACACAACTAGAATTTGTTAAAG-TACTTAGATAATTG
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TGTTTAAATATACTTTTATAAAATAACAAAATAACTTTTGAGCTT
GCTTTAAATAC-----------------AAATAACTTTCGAGCTT
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TATTGTCCAACAAAATAAACTTACTTTAAAATTTAAA
TA--GCCCGA-AAACTAA-------TTAAAAATTAAG
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>Vang 4617202 4618609|3888 chr2R 4617656 4618624 scaffold_34 488872 489760 - 7348|0 1032
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ACCATGCTCAA--GCCCAGTGAAATACATAAAAATATCCTAAGCTAACGCACACATATCACACGTCCCTTGAAAATGACAAAATACAAAACTGACTTACAAGTTCCCAAAGTATTAATCTTAGGTA-----------ATCGAAAGAACGTAAAACTCAAAA--CAACTTTCGAATGCAGCTT---------CAATTTGTGTACTGCCCTTTTCGTTTATTTTATAGAG------AATATCAGCTAAGTTAATATAAAATCGATTCCCATTTTGGCCAGCTGTAAG----GTTGTGGGTCT----AAGGACT----TGCGCCAAGAG-------------------TGTGTCCCAGAATTG----------GTATGCAACACTCTGGGCGCGATTCGGCCAAGATTTTTCTAAGGTTTTTGCAACTCAAACCCAAACTACTGCGACTCGACATATCTATAGAGATATAGCAGATATATATATAGAGAGAGAGAGAGAGCTCTCCTGTAACTCGAATGTAACTTGTGACAAATACATAACTTAAGCAAGAGACTGCATTAATGCATTTTATATACACTCAAATCTCCGACTTATATATATATATATATTTGTACTAACTACCTAATCGGTGCATAGCAACAGACTAGAGCACACACTAGGCACGAAAATTGATAAGCTAAAGTAAACATTTTATTATAAATGATAATGATAAGTACT----------------------TACATACC------CCCTACATACATCTATATATATATATATATATATATTTATTGTAGCGACAACTTTGCCTAGTTTTGCCCACTTTTTATTTCA------TTTTCTAGCCAAATGCTTTTTACCAGCACCCTTTTTTTT----ACTCGCTCG-ATCCATGTGAAGCTATT------------------TATGGCCTATTTATAGATTAACGCACACTCCAGCTGTA---------------------TTAATAAACG------GGAAATAAATC---------TCTGCGACGGC
>tsu 4623296 4623395|3891 chr2R 4622660 4627835 scaffold_34 493606 498963 - 211211|639 738
ACGACTCCCAGCCCCAAGAATAATTTTTTAAAATAGTTTAATGAATAGGCAACCGTACAAAGTCTATATGAATTGAAATAAATCAGATAACTCTACCAAC
G-------------------------------AAATTTGAATATATATCTAACTCT------------TAAACTAGCATAAA------------ACCAAC
>Phax 4627747 4627850|3891 chr2R 4622660 4627835 scaffold_34 493606 498963 - 211211|5391 5549
GC-----------------CCACGCCAAGCGGCGGGCCCCTTTTATA-----------------------------------------------------CTATTCTTGCATAGATAGACCCATATTTGTACAATTAAATAAATGCCTAGCGAATTAGG
ACGAGAAAGGAACGCATAGCGTTATCAAGCAGTCGGCCATTTGTATGTATATATTGAATAATATATATATATATATATATATGTGAGTGGCGCGTAAATTTTACATCTATATAGTTAGAAACATATTTGTACATCTAAATAAATGCATAGCTATTACGG
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G--------------CCAGTAACGAGAATTATAT--------CTCTGTATAGCCAAGAAATCTTT-------ATGTTTACAAATTGCTA----ATTGTAGAC-CCTAGGGTAAAGTAGTTATAAGAATCCATACACATCCCATTTACATA-------CATCCACACTGACTCA-ACCACGCTTCGGCACCA
GATGAAGCAAAGCAACAGGCAACAATCGATTTGTTGAACACACTTTGTATAGCAAAAACAGATTTCAAACAAATATTTATAAAACGTTAGGGTAACATATACACATAAGGCAATATTCGTACACACACACACACACACCACATACACACACCATCATCATACGCACACACGCACACCATACACCAGCCCCA
>Su(var)2-10 4632352 4632629|3894 chr2R 4631954 4632496 scaffold_7797 507 1101 + 8094|446 614
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ACACACACACACAGACACACACTCGCACATATATGTAACAATTGTAAACAGTTTCAC-ACACACACACACACAAGATTGTGCTTTTTACA-TGTTATGCTTTGGTTTTGTTTTCGTTGGCTTTGCTTTCGTTTTGTTGCCCACTTTCGCTCGTTTCCTTTGCTGGCATT
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ATACAGAGCCACATAATTTAATTGG
ATATATATGTATATTTTTTAAATAG
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ATGAGTTCGAGCAAAAACCGGGC-GTCAACCTATACCTACTAGACAGACCCCATATGCCCAAATATATTTATATACATATATATAGAAAGAAAAAAAAGTACAGCGTGTGTA----GACCAATTGCCAGTAACGGACGCCGGCTGAAGACTTGTGATATAAAA--TTGAACAAAATCCAAAGTGTTATTA-----------ACTAAACAATTAATTAAAATATTTGGTCAAACAATACGACGACAGCTGTTAGAAACTATACAAATTAATTGTAGAACACG-TTTTAGTCACATATCAAATTGGAACAGTGAA-AAGCTTTACAAAATAATTCATAATTTAGTGAGTACAAAATGCAAATTCGCAATTGAAAAACAAAAGAAACAAATACTATATACAAAACTAAAGAACTATTTGACACAGAACAATAATCTTATTCAAACTATATATATATATATATTTTTTAATTCCGTATATATTTAAACTAATAAAAAAAGGAATACAACGCTTAACA-AGAA
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GGGAATCCCAATAGCAAAGGA-------GCCATAAGGATTAGGATTTA-----GTCTAAAGTGACCTACATCTAATTAAA-------------------GAGACATCGGCGCTGTG---------ACAGACGTGTTTTGCCCTGTTGCACAATCTCGA-------AGCGCGGTGTTTAGTGATATTAGTTATTTATTTGTAATTGATTTGTAAACTCACATTGT---------CTGATCGAGACTGGCTCACCTTTTCCGGTGTTTATGGACGCGTTAACAGCTTTTGGCTTGATTTATTGGCTGATCTGCATGTTTCTCTTTGGACCCATGATGTTCTTCGTCTGCGTTTATCTGCCCGAAGTGCCAGTGCGATATGTGAAGAGCCTGAGACAGCAAACATAGATCTTTTACACCCTACTTAATTGTTTATAAATACTTATATACACACCCAATACATAGCACATAGAATATACAATTTATACTGTAATTGATGTACTCGTATAAACAATATAACAACGCATTCTTTACGATAAAAACCTCC-----GATGTGTTA
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AATTATAAATAAATTGAATTAATTA---ACCAGT
AATTTGCGCCTAGTTTAATTATTTGCACACCTTT
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CCATCTCGTCTCTGC-TTGGCTTAGTTCAATTAAAATACCTTAAATATCCGA--CTTGCTATTTGTGATGCCTAGACAGTTTTTTGTACAGTATATAGAATCAGTTTTTATATCAGTGTGTAAAGTATTATCATGATATTTATCTTTTTTGTTCGAAACCTAATTGTAATTGTTATTGTACATTGTTTTTCAGTCTATTTGTAACTGCCCATCAGAACTGACAATGTAAA--------TACATATAGAGTTTTTATAAACTGAACATATACACATTTAATT-TATAGAGAATGACACCAA----TAATTATACGGAGCAACTAA
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CAACGAAGGGGGTTCGACCCAAAAAAGCACAGATGCACAAGAGGACTGCAGCTTCTTGGGTGACTATTGGTGCTCGGTCTGCACGCTGACTTTGGTCCTGGAGCTGCCGGATGAG------TCCCACTGCGACGGCGACGGGCTGCGGCTGCTCAAGGTGCTTAATAATAACTTCGGCATTAGCGACGGCAGCTGCTTGTTGCGCATCACAGACGCCGGCGTCATTTGA
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AGGAGTACGACCCAAAGTTGCACCAAAAACATTTTTGTTAACGTTTTTTGCTGAGTTATCTTTGTACATACGAATTGTCCCCCCCCTTTAATTTGACTTAAGTGTAGAGACCAAGATTTGTAAATAA
>CG8029 4720919 4721477|3969 chr2R 4719234 4721471 scaffold_4 66402 68769 - 55665|1779 2479
ACCGCC------------TACATCATCGGTTCACACCTTATTTG---------ATTGTTCAATGCGC------------------ACTCAATATTCATTCCTTTATTCCTTCAGTCTATCCACATGTATATGTTAACGAATCAAT--ACTTAA-----TACCGTACACGCATTACACATAACACATAA-----CCGGGAAATTAGTCCTCACAATTTGT--ATCGTATCC---GTAATTTTCGCCGCCAA--------------GGATCAGTTTACGTTCAGCATCACAG----------------------CGTTGCTGATTCTTGTCGCCGACAAATTGCCTGAG------------GTTTTGCTTGCACCGAC----------GCAGCATC---------------CAGTATTTCATTTAGAATAGCCCCTAAATGTCGTTTATCGAAGGAACTTTAAAAGACGCACATG------TGTGTGTGTGTTTAAGAGCGCGCGCGTGTGTG--TGTGTGCACATGGGCAGTAAATCTAATCCGAAGTATATCTAAGTGTTTTATAGTTTCTTGTTTGGCGCAAATATGCGAGACTAATTTATGCCTCTGTATGATAGTTTGTCATTTGTGCA---ACCCTCCTGTTGTTCGCAGGCCCAACG--------AAAATAAAGTTTTTTTCAATTGTGTTACAAA
GCAGCCAGCTGTCTGCATTAATTCATTGTTTTTTCTTCTGATTGTTTTTCTGCATCGTTTAATGTGCATAGATATATATCCGTATATTCAATATTCATTCC----TACCTTCAG-CTACGCATA---ATATGTAATCAATTCAATCAACTTAAACAATTACATTATACAAA-AAAAAAAAACACAAAAAAATGTCAGGAAATTAGCAGCCACAATTTATCAGTCATACTCTGTACAATTTACGCCCACAAAGGTGCGCTGCGGCGGATGCGGCCATGTTCAGCATCAGAAAACCACACGTGCGCCCAGCCCCCGCTACACACCTTTGCAGCCG-TAAATTATTAAGGAATTATGTTATTATTTTGCTTGCAACGACTGCTGCTGCTGCTGCATTTGATAAACTTTAATGCAGTATTTTGTTTAAGTTTGTAAAGAAATGCA------CAAAACTACTTATAAACACGCACATTATGCTCTGTGTGTGTGTCTGTGTGTGCATGTGTATGCGACTGTGTGTGTGTGTGTCCTTACACGATTGTTTAAT---TCTAAGCGTCCTTT-----------------------------TTATGTTATGCCCTTGTATGATAATATATCATTTATGTACCTACCCCTGTGCGATATGTATGCGAAACACAAGCTCCCAAATAAAG--TTTTTCAATTGTTTTACAAA
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AGTAGATCAACTTAAGTAAAAAAAACTATTCGGCTTAAATTTTCTTTAAATAATAGTTGCTGAAGCTGATTAAG------ATTTAAGTTTGATTTCT--TTAACTCTGCCT
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CTCCAGTGCTAATCGTCGTAGCTTGGAGCCATACATTGGACGAATATTGTTAACAATAA----AACCGGTTATCCCACATTCAA
GTGGAACTGGAATCGTATTACCTT-----------------AATTATTTTTAAATATTATTTGATATGCTTTTTGCAAACTTTT
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CTTATTTAATCATTTGTTAAAGTTCGGTCTAACTAGAT--GTTACTCATGAAGATCTGAATCACTTAATTAC
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ACCCATATCAATAAACAGCTAACTT
GCTTATATTCAAA-----------T
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TAGCGATAGATACATTTATTCAAAATCATATCATAGTTCTGCATAAATAACAATTATGTGTATAGCC----CCAGGCTTTGGGATGCCCCCCCAAGTCCAATGACA-GGAATCGAAACTATCCCAAGATAAATACCTTGAGGCTGTGCACATAAT------AAAAATGACAATAGAT-----------------CTCGCTGCATTCCG----GCGCGTGTATAATCATAATTGTAATCAATAATCGTAATATAATTATCTTGACATTATTGTAACTTAA------TTTCAATTATCGAATGCTACAACTTAGATACAAATTAAAAATAACATTAATTATATGCATAGATATCTTAAGTTTAACAACAATCTGATTGCATGCAATTGAGAACATTTTGCTTGGGAATTACTCAAACATTTCTCTGCGG-----TATTTTTTT----------ATATTTTGTTTAAAGCGTGCACCCGCATACAAA-CAAATCATTTTTATAAAAAATTAAATCAAGTTTTTAAAAAATTGTTAAAAAATGCTCAAAGCAATACAGTTTTTATGTTTGTTGTTTGTTTTCCTTTTTTTTAAATACAATAATAAATAACAAATGTATAAGCATGTATGTATATAATTTAAAAAATA-
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ATATTTCGGAGCAAATGCAAAAGGCGCTCAGCTACATAGCCGACGGAGTCTGTCATCCGCTTAAGGTGCGCGTGGAGACCATCTTGAGCTCGGAGCAGGACACCATCATATTGTTTACCATCTCGAATCTGTTGCGTTTCTATCAGCAAATCATGAAGCAGGTGGTGCAGGGCGGCAGCCTGGAGCAGTGCCTCATCGAGCTGCAGCAGAGCAGCGAGCAAATCTATTTGAATGCCCTGGCCGCCCAGGTGCGCAGCGTGCTCCAACGGCCAGCGGGCAGC---AGTCTGGCGCTGGAGCCACCGCAACGCGATCTGGTGCCGCCGGCAAGCGTCTCGCGCCTGCTTAATATACTGAAAGAGATCCTCTCCGTGGCGACCATGGTGGACGGTCGCCAGGCGGATATAACCAAAATTGTGACCTGTGTAATCGATCCGCTGTTGCAGTCGGTGCAGGAGAGCGCCGCCCATTTGCCGACCGTGGACATGGCCGTCTATTTGCTCAACTGTTTGTATCACATGCAGAGCACCTTGGCGGTGTTCGAGTACATGGATGAGCGCGTGGAGCGGCTGCAGGCACAGTCCGATGCACAGCTGGACACGCTCACCTCCGAGCAGGCCTCCTCGCTGGTGGCCAATCTCAATCTGGGCCCCATTTACAGCATATTGCAGAGCAATCAGACCAAGATCGAGACCAATTTACTAAAGATTTTCATGTCCAAAATGGATGCATTCCTGGAACTGCCCGATGTGCTGCTATTGCCGCAGGTGCAGCTAATCATGTCCAGCAGCCATCGCAGCACCGTCCAGCGACGCGCCTTCAATGTCATTGTCGCCATCTACAAACAGATCTATGAGCGTGTACACGATCCGGCCAATGGCTTCGAGCAGCCCGACCTGCTGCTGCACAAAACGCCCGATCAAGTGGCACGCATATTGGCCACCTAATAACCTTTTGGACTCCCAGCCCATGTCTATTCATATATACATATATATTATAATATATGTTTACT
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------AATGAAAAACAAAC---TAAACAAACATTAATTAACAAATTTCCAAATGGGAGAATCGATCATAAAAAAGGTATCAAT-AATTAGCGCATTTTTAGACAGGAAACGCGCAGCGGCAACGCGGCCACGCCCCAAA-------ACGCCCTCAGC---------AAACACACACACACACACACACAAGCAAACACACACATATAAAAGAAAACCTATTAAGAATTATAAAAGAATTAAGAAAAAAACAAAAAAAACAAAACGGCAACCGCACATTGTACAATAGTGAAGTAAGGAAAACAAAGTGGATAACAGAAACACACACGAAAAGTAACAGAAAATTAACATAATGGATAACAAGGAGGATATGCG---AGGATAACAAATTCAGAAGCCAATAGGAACGA------AACGTTTTTCGTAGCATTTAGCGAATTTGTCATTTGGCCGGGA
>Rep2 4811246 4814025|4068 chr2R 4812197 4812369 scaffold_45 453455 453663 - 3760|0 212
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>Rep2 4811246 4814025|4069 chr2R 4813093 4814545 scaffold_45 454466 455973 - 18614|0 1118
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GTGGGACAGAACAGATTAATG--CTAAACAACAAATTTTTGAGCGCAAGCGTTTGTCCAAGGCACAAA--------------------------TAAATGGAAATC----------------------AAATCGATAATTGATTACAAATGATAATAAATACAAAGAGTTATAGCAGAGAAATAAATAAATAAATGGAAAAAACAAAAAACAAAAGCAACTCACAATTAGTAAAAAAAAACCAATGAAAAAACGAATTCATTAGCGTTGTTTTAATTTATTAGTAAGTCAAAGTAAGTCAAGCAACAGCAAAAAAGAATGAAATAAATAAAAAGCAAAACGTGCAACAAGAATGATATATGATATAAGAGAGTCATGATTAAATAGAAAGGGAGAGAATGAAGAAGTCAAGTGCTGCAGTGCACAATTATAAATACATATATAAACAAATTACAAGTAAAACAAAACAAAACAAAAACAAAAAATACCTATACATACTCAAAATACAATGCATTACATTATAATAAGA--GCAAGTCGCAGT-TTATAACATACAAAACTCAAAACTTTCCATACTGAAAACTGACTTCTTCAACTGACTTCCATAATCATAATCATTGTTAACATTTAACTATAAAGAATTGCGCTTAACAACACAAAAACAGAAACCCAAAGA----AAACAGGTTTGTAGT-------------ACATTTATTTTTTGTTTGTGTTCCCGACTTTTAACTAGGTTCGAGACGGTTCT---------CATTTCACTTTTAGCCAATCCGTGGCAGAAGCCCGACTTAACTTTAACACGTAACACTCTGTATAAATGCAATCAGTTAGATTTATAAGATAAAACCAACAAAAAAGGAAAAACAAATGTAAGCAGCCCCTCCCAAAAGTAGGGAAAACAAAATCATTTGCATTAGTTAAGCTAAAAAAAAATGCTGTTGGGCTAATGGAAAAGTCAACAAGCTGTGGAAAATAGTTGAAAAGTTGTGGAAACGTGGCCAAGGCACACACAAGAGCAGGATTATACGTTACATTGTTTTAATATTACAAATTACGAATAAATTGATCAATTAAAATATATACA-AAAAAATAATAAAAAA
>CG8806 4937456 4937924|4195 chr2R 4937050 4937500 scaffold_1 2197804 2198224 + 17039|410 454
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---------AGTCTGTACT-----GGAAAAATGCTTGGTGATATC
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ATATATATATATATATGTATTCCAAA--------AACACAACAATTTGCTGCATTTCATTCCGTGTGTGT-TGAGTCGAACGGAGTA-------AGAGCATCATCGTGCTCAACACAACAATGCATCATATAATCATGTCATTTCTATGATCTTTAAAAGAGCGTTAGGGGTTTGCATTA----ATACTGTAACTTTC-GCTAGG--------------CACATTCTCGTGTAAAAATTTGGTTTTTTATTATGTCAACTACTGTAAATATATTTTGTAGAAAATACATATTTAGCATAAATCATAAACATACTCGAAACGTTGATTTGTATAATTTATAATACCGATTTA-TATAAAAAAAAC
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AC
AC
>Pdk 4945087 4945207|4206 chr2R 4945190 4945853 scaffold_43 81766 82486 + 1926|0 17
GAGTTTGCGCCACCCTGC
GCGTTCACCAAACCCAGA
>Camta 4989432 4989905|4266 chr2R 4989103 4990800 scaffold_43 142356 144128 + 30382|369 935
GGG------TCAACTGAGTGAATTTTAAAC-------ATAGGAACAAGCTGCACG----------------GTTCCATAAGAATTTATGAATAGCTTTAACAACCGAGTGAAACTTTCTACTTTCGTATTTGCTCCGATTAGGAAAAACAATCCCAAGCACCTC-TGTAGTGAAACTTT-GTTTCAAACTCTCT----------------TTTACACTGACAACAAACGTTCTAAAT--TAGTAGCAAATACCTGCACTTTAATTAATTTGCCTAACGAATTTTAAGAATCACAC---------------------------------------ATTGTTTTCGAA-----GTGATTGTAGCTTAGGCTAGAAGTCTTTTAAGGTATTACTTAAACCTAAACTTAACTGAAGATCGGACTCCAGGGAGAAGATGATAACGCAATTTTTCCATTTGTCAACTCGAAAGAACTTATTACTGAAGCCTTTAAAAACTTTTTAACTCCAATTGTAGTAAAAAAAAAGTAGCCTGCTATATATACATATTATATACATACAATTTAAACCAA
GCGCAGCTTCCAACTAAGTGAATTTTAAGCTTGGAAGAGAGAAACGATCGATAAGCGATATATAAAACTATGTTCAATAAGAATTTATTAATAGCTTTAACAACTGAGTGAAACTTTCTACTTTCATAATTGTTT--ATTAAGACACGC-------AGCACCTCTTGTAGTGGAACTTTCGTTTCTTACTTTATATGATATATCTATATCTATATATATATATATATCTATATAAATTGTAGTAGC-AATATCTGCACTTTTATTCATTTGCATAACGAATTTTAATACATGTACGGTACTTTAATATATATATATATATGATTGTACTAAACGATTAATTTTGAAACTTTGTAAACGTAGCATATGTTAGG---TTTTGAATTTTATATGTATACATATACATATATATAAAGAAAATTCTTCACAAGA---GAGAGCTCTACTTTTCCATTTGTCAACTCAAAAGAACTTATTAACGAAGCCTTCGAAAACTTTTTAACTCCAAGTGTAGCAAAGAAAATTAAGTCTATGATAAATACTTA------------AACCTAAACCAA
>Wnt2 5014853 5015003|4298 chr2R 5014508 5015294 scaffold_43 162915 163772 + 17193|348 562
ACGGGTA----------GCGGGAGCATATCGCTAGAACTAGGGCTAT-GTCATAGG---------AAATGCG-----------------TTGATTA----------------AGTATTAT------GAGAAATGTATTACAACCGCAGATACGCAC-----CGCGCCACCATACAGACACATTCCAGAATAAACGTAACAAGTTAACATCCCCAA
AATAGCATACGTTAGCTGTGGGCTAATCGAGCCGCAGCCAGAGCCAGAGCCGGAGGCAGAGCTAAAGATGCGAATGTTGCTAGTATTACTTAGTTAGCTCATAACGACTCTTAGTATTATATACGAAAATAATGTATTACACACACACACACATACACACTCAAACTAAAAGACACACACACTCAAACACAAAAAC-ACAGGT---ATTCTCGAA
>CG30337 5048988 5049289|4335 chr2R 5048590 5049422 scaffold_43 207409 208167 + 30576|412 714
ACAGTGCCCTCGCAAAGCCACAGATACACACATCTTGGGATGCAGATGAGGCAAAAGGATTTTACACGTACTACTTACCCAAAGCGATAATGGAAAACCAACCAACAGCAAGATGTTACCAAAAGCACTGTCTACTATTTTGTATACTACCGA-TGCCGATACCAATACCAACTATGCAGTATTTCTACGACTCTCACACACACTATGTACACTCTTTACACACACAGATAAACACAGGGACACACACACACATTTGTAAATGACACCATGTAAATGCAATGCGAAATGCATATTATTTGATA
A----------------------------------TCGAAAGCGTATAAG------------TACTTGT----CTCGCCGCAAGTATAAGTACAAGCCTAAC--ACAACAAA-------TAACAGCACTGTCTACTATTTTGTATACTACCGATTACCGAT----ATACCGACTATGCAGTATTTCTTCTACT---------ACTATGTACCACACACACACACACACACATACACACACATACACACACACATTTGTAAATGACA-TATGTAAATGCAA--------GCAAATTATTTGATA
>CG1809 5075608 5075686|4362 chr2R 5074049 5075608 scaffold_43 247182 248746 + 59535|1578 1578
G
G
>CG1809 5075608 5075686|4363 chr2R 5075664 5076080 scaffold_4 2285715 2286117 + -983|0 22
AAAATGCATCATTGCTAAACGAA
AAAAAAAATCATTAATTTTGAGC
>CG1814 5093504 5093664|4378 chr2R 5092869 5096038 scaffold_43 272573 275872 + 75315|654 856
AGAATTTGTGGGGA--CGAAT-------GCCCGTTAGGAAG----CTCAG-ATTAGTTGTAGGTAACAA-GAAGTGCCAGTGTTTA------ATGCTTGTAGCTCGAAACTAGCGAATTT--------------------AATGCGTGTA-TATCGTTATTTACATTATTGCTCAATAAAATCGTTGTAATAGTTCAAGAAAA
--AATCAAGGGGCATTCGATTTAAATCAGCTCTCTCGAACGTAGTCTTAGTCTTAGTTGATGCCAGAAACAAAGTGCCAGTGTTTATTGTTGTTGTTTTTAGCTTGAATCTAGAGAATTTATAATTATAAATTGTTAGCAAGTGAATTTATTATTGTCACTTGCAATGCGGCTCAATAAAATCGTTGTAATAGTTGACAAATA
>Updo 5097856 5097931|4379 chr2R 5096409 5097937 scaffold_1 5325572 5327197 + 60173|1562 1641
GGTGTGCCTTTCACTAACCTTTAATTTT----ATGATGCTTTTATCGAATGCAATAAAGACAATTGGCCTTGGGTTTAGG
ATTGCAATTATAATTGA--TTGAGTTTTTTCAATGTTGTATTTACATAAT--AATAAAAACAATTTGGCCTTGGGTTAGG
>RpL31 5099741 5099813|4381 chr2R 5098962 5099815 scaffold_1 5328056 5328956 + 28516|829 926
GC--------AACGTAA------------TTGACGGC-----CAAGAAAACACGGTTAATAAAAAGTAATTTTTATTTAGAAAAAACAAACAAAACAA
ACTAATGAGAAACACAAATACCTAAAGAGTTTACGCCGCTAACAAAAAAAAAACGTTAATAAAAAGTAATTTTTATTTAGAAATAATTAAACCTTTGA
>CG1827 5102198 5102415|4382 chr2R 5099816 5104227 scaffold_1 5329676 5334253 + 104662|2618 2849
GG------------TGGCGAAAACTGTAACG--TATTTCAATAAAATTTAAATTTCGTGGAGTTCTCATCTGCAATATAAATTGCGTTATTTGTTTGTCCCTATCGGCAGCAAGATAGACGGGTAGTTTTACCGTAAATTAGCGGTATTAAGAATTATCGATATGTAAGGATCCTTACATAAAATAAATAAATAAAGTATGAGAATAGAATAGAAAAAGACAAAACAAAAAC
GATTTGGTTTATATTTGCGTAAATATAAACAATAAATGTAATTAGAAGCAAATTTTATTCATTTCCT--------TTTGAACTG---TTTTTATTAGTTCAGTAGTGCTGTAAAAC-GATGCAAAGTTTT----TGCATTTGC-----------TTTTGAATATGTTGTGAT---------AAGCAAACACGTTCAGTCTG-------------------CATGACATG---
>Map60 5104229 5104564|4383 chr2R 5104531 5108017 scaffold_1 5334902 5338366 + 63190|0 41
TTATATG-CAAATAAA-------TCTACATAACTTACTTGAA
TTATATGATAAATAAAGACGCATTATAGCTCACTTACTTGCA
>CG1902 5116756 5117447|4389 chr2R 5113755 5118837 scaffold_1 5346641 5352002 + 117197|3297 4066
GTCAATGATCG-------GGCAGTTAGTTGTATATTCTGATGCACATCCTATAGAACACC--------CATTTA-----ACACACAGCCCGATATATACACACTGGAATGTATAGACACTACA-----------GCGCTAAAGCGATCTTTGGTCATAGCAGAACCTGATATTTTATAAATGAAACCATAAGGGAGGAACATCGAAACTAAAAGCAAATTGAACAATATTATAGACGACA-AGTGCACACTAA------------------AACGAAATAAGAAGCAA-ATGGATCGCCATCAAATGGCACAAAAACCTCACAAGTTTGTCGATTTTAATTTATTGCTGTCCTTATCCACGCACATACTTATACACATTCTAACGTCCGGTCGAACGATTCATTCTACCATGATCCCATAATGCATTTTCATGATGAAATCTTCAACGTCTTCTACTTG-----CGTGCTAAGTTGTTGTTGGCTTTGATTTTATCGCATACTTTTATAAATACGGTACATGAGCATACATATATATTTTGGATAATTTTTCAGTTGGTTAAGTGTCGTTTTTACTAATTTTTGATACTAGTTTACACATACATATACATGCATCT--------CTATATTTATGGATA-ATACATACATAGTTA------AATGACTATATTTAAATGTGACAATGTACTGTAG-ACCCCATGTTGAGTGCGTTAATAAATTAAAGCGAATTTGTTTAAATGTC------GGTATAACTAAAACATAAA
GGCTGTGACAGCGGCGGTGGCAGTTAGTTGTATATTCAGATGCACATACTATA-CACACCTCTCTCTATATTTACATACATATACATATATATATATATATATAAATATATATGTACATAACCCATCCATATATGTACTACAGCGAACTTTGGACATAGCTGAACCTGATATTTTATAA---CAATTGATAGAAAGCAACATCGAAACCTAAAGCAAATTGAACAATGTTACAACTAAAACAAAGTGCACTAAAAACAAAAGAAAATAGTGAAAGAAAGAAAAAACAACAAAAAACGCCATCAAATGG--CAAAAACCTCATGAA--TGTCGATTATAATTTATTGTCGGTCTTATCAACGCACATACCCCCATGTCTACGATTAGTCGCCCCCAAAAATCGTTCTCGC------------CACATTTTGCTTACAA-----TGGACGTCTTCTACTTATATACTATGCTAAGTTCTTGTTGGCTTTTATTTTA----ATACATATACA-------TACATATATAAATATCTAATTTTTCGATCATTTT----TGCGTTAAGTGTCGTTTCTACTAATTTTTGATACTAGTTTACACATATGTATACATATACCTAAACATACCTACATATATAAATATATAAATATATATTTAGTACATACACACTACATATATAATTGACGGTGTATTGTAGCGACCCATGTTGAGTACGTTAATAAATTAAAGCGAATTTGTTTAAATGTCAAACAAAATACATTTGAAACGCAAA
>CG30000 5118787 5118991|4389 chr2R 5113755 5118837 scaffold_1 5346641 5352002 + 117197|5526 5600
T------------------------TTCTTTTCGATTTTGACTGATTTCTTTGTTCATTGCATTTATTAGGATTT
TCCAGACAGCTCTGCTTGGCCTTTGCCCCTTACGACTGCGTATGCATTATATATACTGCCCAGTTAATATTATTT
>CG30000 5118787 5118991|4390 chr2R 5118962 5119176 scaffold_1 5350817 5351022 + -3|0 29
TTCGCTTTATATAATATAACTATCTTTGAA
TTTGCTCTGCATTTCA-AATTTTCATTGAG
>CG1773 5219250 5219401|4524 chr2R 5218893 5219253 scaffold_522 5612 5995 + 1835|383 386
ACGT
ATAT
>dap 5226897 5228076|4531 chr2R 5225841 5228094 scaffold_1 5493546 5496187 + 27934|1238 2800
----------------TGCTCCAGATTC---------------------GCTGGCCAACCCACCGAA------------------------------------TTGCAATTTGTAATTTT--------------ATTTTTTACAAGCCACTGC-----GATTGTGTAGTATTTCCTA-----------------------------------------ATTTTTTATTACGAA---------CCTTTTTATGCAGTGCAAGGGCGACAGTTGCGAATATTAATCGTTAGTC-------TTCAACTACTCGT------AACCAGTAATTAGTTGTAAGTCAA-----CCAGTAAGC---------TCGAGCTAAATGAAACTTTTTAGATTTCTCTAGTGAGAAATGCCATAAACTAAGTGATTAGTTCTTAACAACAA------ACAACTATTGAACAAGAAGA-------GAGAGACCGCAAGCTAAATGG--------------------AATTAGTCTTAACTATCTTGAAGCCAACCGAAATTTAACCTTTATAACGATGGAATACTAACTTTACATAACTTTGTGAAATC----CTTGCAAATTTCGCCGGCAACTT-----TTGCATTTGAAATTTGCCGGGTGAACAAAACTCATCCTTTCTCTGCCCTGCCAC-------------------------TTCATCCAAGTACTGA-----AACTGAGGGGAGAGTAGAATTGAGTTTTGTCTTGCATATTAAGGGCGCCAAAACGATGCCCCAATAAGCC---------GCATTTCGGCTCATTGCTG-CTTTGTTTTTGCGACCTACTAACATTGTAACCAATTCGACCAGTGGAAAACAAAAAAAAAAAAGAGGAATGCCTTTGAATTAACTTCGTCAATTTCTGCACGTTTGGA---------TGCCTTATTTATATGAATGCCGCCGAATGGACACAAATTGTCGCGCTCTCATTTCTTAACCAGTGCTAAAAATGTCTTTTATGATTTGCTATGATCTCTGGGCAAATTATGAAAACAATTTTGCCTGAAACTATCATGTACAAAAACTA-GATTATTATACA---------------TACTATACACATAGGCAGAGCCTATTCTTC---ATAACACTTATACAAAGCAT--TAATTTGTAAGGCCTAACTAAGAAC-AAATCCAAAGTATTCTCCTAATATTTATATGT-ATAGACACTCTATGTATAATTAAACC----------------------------------ATATTCAACTCAT----ACATCAATAAACAAAACAAAAACA----------------ACGCGATTGTCCTGTTTCA----AAAT--------TACCAACACATCCGCATTACTTTGG--------------------TTGTAGAC--GTAGCAG-TAAAATGTAGTTTACTAAAACAATTTTGTACATTTTATAAGTTAATATTTGTTTTTCTGCAATAAA---TTGTTTTTGATTTT--------CTAGTTGGTAGTACATAAATCGC
ACTCAGACGGCTGATGTGCGCCGCATCCCAGCGAAAGTAGTTGCAACCTACTCGCCACCAAAAAGAAAAAAAAAAAAAAAAAACGAAAGCGAGAAAACTCAATTTGCAATTTGTATTTGTAATATTAATTTTTAATTTTTTATAA--CACTGCAAACAAAATACGTAATTTTTTGTACACACTTCGATGGCTAACATTTTAAGTAGCTTTCACATTACATTTTTTA-TACAAATTAAGTACTCATTTTTGTGCAGTGCAAGGGCGTAAGTTGCGAATATTAACAAATAGTTTAACTAGTTTAAATGCCAGTTACTACAACCAGT-ACTAGTACTAGAACAAAATAGCGACTAAGCATTTAAGTATCGAGCTATATGAAACTTTTTAGATTTCTCTAGTGAGAAATGCCATAAACTAAGTGATTAGTTCTTAACAACAACAAAACAGAAACAACAAACAACAACAACCACACGAAACAACGTAAAATTAATTGTTAAAAGAATAACAACAACAAATTATCTAGAGACACCTTCAATGAAATCCATCTTTAACCATGAAATTTAAAAGCTACTAACGAAATA----TTTGTAAATTCTAAATTGATAAATTTTACCAGCAACTTTGTGGTTGCTTGTAAAATTTACCATG----CAAAACTTAATGTCGCTCTGCTTTACAAAAATTTTACATGTACACATTTATTTGTTTATACACATATTTATTTTTGTCGAAAAGCAGAGTCATATTGACTTTTTTTTCTCAAA--ACAGACCCTAAAACAA-ACAATTATAGGCCTACAATTTTACAGTCAGGCTTATGCTTGTTTTTGTTTTTGCGG-CTGTAACTAAAGTCCTTAATTCGACCAGTGTTATAACCCATAAATTAAG---------CTTAAATC--CGTTGCCAATTTGTGCGCTTTTGCAAATATATATTACCATATGTTGATGTAT--TTGTAAAACCACATAAATTGCCAATTTGTAAACTCTCAACTG--TATAAAATTAATTTCCATCCGTTGCCA-AATTGTTTGGCAAATGATGAAAGAGATTTTGCTT--AACTATCATGTACAAATGCTATTATTGATAAACATTTATATATATAAACTATTATATATTTAGGCAGAGCCTATATTATTAAATAACATTTTCACAGATCATCCTAATTCATAA-GCCTAGCATAGAACAAAATCCAAAGTATTCACTTAATATTTATATTTAATTCATATTGTGTGTATAATCAAACTCATACTTCAATAAAAAGCAAAAAACTAGCAAACAAAATGCAAAACATAAAAACATAAAAACAAAAAACAAAAAAACAAATCATAACAAACTACTCGTTAATGCTGTACCATCTCAAATGGGTACTCTATCGACACGAGTAGATCCATTCAGTTATATGTTGTTGTTTTCATTTGTAGACTTGTATTTGTTTATACCTAGCATAACATTATAGTTTTGTAAGTCTATTAAGTTGACTTTTGTTTT----CAATAAAATTTTGTTTTTCTTTTTGTAGTAGCCTAATTTCTAATATATATATATT
>trpl 5277211 5277333|4582 chr2R 5276568 5277353 scaffold_1 5550784 5551585 + 15601|700 846
ATGTGATTGTGGCATGGACACGGGTGATAAATCTACATAGGTCCACTAGATGCCTTC--------------CGTATATTCTAGTTAC----------ACACTTGTATTTATCCGTAAAGAAGGAATAAAGTTATTTAGGCAAATTAA
ATGCGTCGCTCGCGTGGCCTCTTGTGATAAACCCTCAAAAGCACGCT--TTGGCTTTAATAGCACTTAAAGCGTATACTCTCCATGCCATCCAAAAAATAATACTATATAGCAATAA------AATAAAATTATATGCATAAACAAA
>CG1698 5309788 5309820|4620 chr2R 5308815 5310364 scaffold_1 5594408 5596033 + 52174|978 1010
CATTGAATTAGCAATAAAACTATATACCATTTA
-------CTAGCAATAAAAATCTGTAGCCTGTA
>lectin-46Cb 5328349 5328413|4644 chr2R 5327515 5328362 scaffold_1 5618922 5619754 + 23008|858 871
TCTCCACAACTTGC
GCAGTACCACCTGC
>lectin-46Cb 5328349 5328413|4645 chr2R 5328363 5328594 scaffold_12 1540768 1541028 - 291|0 79
CCAGCTGAAGC-----------------CCACAACTATTATCGAT--------TAAAAATAAATGACAGCAATA----AT
TGAGCTGAAACGCTAGAGCTGAGTTGAGCCAGAAATACTGTAAATAGTTGGCCTGTATATAGAT-ATAGCCATAGACTGT
>lectin-46Ca 5330251 5330348|4646 chr2R 5328934 5330259 scaffold_1 5620853 5622159 + 25513|1409 1417
ACGCACGGA
AGGCGCAGA
>lectin-46Ca 5330251 5330348|4647 chr2R 5330260 5330661 scaffold_1 5622438 5622954 + -2770|0 135
CCCACCACCAAACGGGC---GGACCAATGGACATTTAGGGA----------------------------------ACCGAGGAATATTTGAGCTTTCACCAAATAAATTTGAGTTTTAA----------CAACATG
CTCACGGCAAAACTGATTTGGCAACAAAGAACCTAGATGGAGAGCTCGTTTCGCCAGTGCCAGTGCCAGTGCATGACGAGACAACATCGGAACATTGATGGAATATCGGTGACACCTGAAATCGGCGCTCAACAAG
>CG1665 5352863 5352975|4669 chr2R 5351599 5353867 scaffold_11 1280044 1282393 - 75022|1377 1490
ATATTCCATTATCTCTTCTAACACTTTATCCGGTATACATTGAAGTTTATTACATAGAACATAGATGAGAGTACTGT-AGAGTTTTATATGCAAATATACATGTGTTATGAGCC
ACAAAGCGGAAATTTTTTGAAA----TATACTTTATACATTCATTTTTATTAAATATAACAGAGATTATGATAGTACGAAAGTTAAATATGTAAATAAACAT-CGCTATGAA-C
>CG1667 5357141 5357333|4671 chr2R 5357268 5358211 scaffold_11 1284362 1285315 - 28034|0 73
TTTACTTAAAACTAATAAGAATGTTCAGTTTAATAA-ATAAGTTA-------TATAATAAGTAATTAATTCAAA
TTTACTTAGAAT-------AATGTTAAATGTAAGGGCATATGTTACGTGAAGTATAAAATATATCTAAGCCAAA
>CG1671 5362361 5362631|4672 chr2R 5358409 5362448 scaffold_11 1285746 1289720 - 132787|4069 4162
GCTTTAGCTTCGGAGCCGTTTCATT------CATGATTGTTAACTTAATTCAGTTTAATTAATTTTAGGAAAAAAATAAAGTAGATAACCATAC
AATTACATTT-----ATCTTTTATTGATTTATATGATTGTT---TTTAATCATTTTATTTAATT---------AACTAATTTAAAGAACCCAAC
>CG30010 5376331 5376389|4685 chr2R 5375824 5377345 scaffold_11 1316808 1318376 - 48124|524 601
TT-------------------GAATAACTTTAATCGTTTTAAAATTGAGACAACGATAGAATATAACTTACAGAATAT
TTTCCGCACTTGTCAAACTGAGAATAAATTTAATGATTTTGTTATTGAGAGAAC-ATACTATGTACATTAC---GCAT
>CG12744 5387866 5388058|4695 chr2R 5387859 5388017 scaffold_4 3236044 3236191 - 454|7 172
AGGAACATAGAACCAGGATATGTCTTGCGAAGGGCTGACCGATTTATTGAGTCTTATGCGCCATCATCTATCCATTGTAAATGATTGTTAAT-TTAATTAAGGTCTTTCCCA-------------AAACTAAATTGGGATATATTGGGAACAACAGATGTGCCTGT
AGAGAGAGAGAGAGAGGAATTGCGCTCATAAGG--------------------CTATATAATATTATCTATAGATTA-----GATTCTTAATCCTAAGTTAGTTTTTTAATATTTAAATCAGTTCAGTTTAAGTTGAAGCTTATCGCAAGCGAGAGCTTTTCCTAC
>CG12923 5400535 5400723|4706 chr2R 5398972 5401053 scaffold_4 3254368 3256599 - 35121|1805 2015
CCTCTG---------------------CTTACTTACATTTGCGTTGTCCTGGAGTGCCTTGCACTTAGACTGCTCCGCCGGATCGGTCAGCTCCGCGATGCGTTTGTCCAGTAACTGGGCAGGACAGAGAACAAGAAAAAATGACAA-TAAATTGCATAATGCCTGCATTACGTGGCACAATACTCACGTTCGTTTGCTCAATCATCAGCT
CCTTTGGCTGCTTAATAAATGTTGCGTCTAACTCACACTTGCATTGTCCTGCAGCGCCTTGCACTTGGCCTGCTCCGCGGCGTCGCTTAGCTCGGCGATGCGTTTGTCCAGCGCCTGTTTTGGGAGTAGAACTCAATTACACAACAGTTTGGCTGCATA-----TAAAAGAC-TGGCAC---ACTTACATTGGTTTGGTCTATCATTAGCT
>CG30008 5402893 5402933|4708 chr2R 5402098 5403693 scaffold_4 3258202 3259917 - 24400|831 875
TCTCCTGTCAACAAAT-CACGCA---ATAAAGGGGTACCAACAAG
CGTTAAATAAATAAATGTATATATGTATAAATGTGTTCACACAAA
>CG30007 5410083 5410161|4714 chr2R 5409580 5410447 scaffold_11 2843770 2844617 - 3563|503 581
TATTCACCGAATTATTATATGGTATTATTTATTATACAAATTTTTTACTTGAATAAATATATTTTAACGTTGCCTAAAA
TAAACACTA---------GCAGTTCTTTTTTTAAAATAAATTATATTCTTTA------------TACCCTTGGCTTAAA
>CG30007 5410212 5410333|4714 chr2R 5409580 5410447 scaffold_11 2843770 2844617 - 3563|632 775
ATGTGTATTTATTCT----TGACAATTTGTTTC-------TAGATT--TTTCGTTAAATATTCTTAATTGTAGCCAATTAAGTAGTTT---TTTAATGTTTTAATTATATTAATA------GAAGTAAAATTCCGTTAAAAAAA
TTGTGAAGTTAATATAAGCTGCAATTGTGAATCAATACAATAGATTCCTTTCGGTCAGGATTCC--ATTTGAAACTATTTGTTCGTCTCAACCCAACATCTCTATTTTAGCAACAGTCGGGGCAGTATATATCTCTT---CAGA
>Fmrf 5421996 5422277|4724 chr2R 5420386 5422158 scaffold_4 6217023 6218918 - 39283|1874 2079
GGTAGTCCTGCGGGACGCCTCCTTGTAAATAGATATGGAC------AAATGTACGCAAGGAT--------CTAAATTGATATACGTATATAACCCACTCCTCACACGAACTCCTGACTT-----------------------------ATGCCTGAACTATGAATTTTTAATGAATGGGCTGGATTAAAAATTCACCGTGCTTTGA
GATTCTACCGC-GCACAGCACACTGTAAATATAAATTGGCCAAAAAAACCGAACACTATGATAATTGTACTTAACACTATGTATGTATGTA--------CTTAAACGCATTATAGACATTGCAGAAGAAATTTAAAAAGGAAAAAAAAAAAAACGTAATTTGAATTTTTAATG---GGGCTGGATTAAAAATTCACCACGCTTTGA
>Fmrf 5421996 5422277|4725 chr2R 5422224 5422489 scaffold_6 5811559 5811838 - 2353|0 53
TGTGGCAACATTTTAAATAAAGATTGCTTTACTGTAAATTATAGCGCACTCGAA
TGTGTCAACA----AAATGTAAACAATTATAAAGTCAAATGTAATGCAACCGCA
>CG12140 5425179 5425301|4727 chr2R 5423176 5425630 scaffold_4 6220296 6222857 - 125886|2047 2227
AAGGATAACTATCGCAG--CCAATCCGTGTACCGCAATTGCATTTCATTAGTTTTTA------------------------------------AAGTTGAGAATTT----GAACTTAT-------GATTCGGAATTAAGC-CTAAAGTT-----GCAATAA---AATTGTAAGAAAAAGTC
AGAGAGAAACATAGCAATTTTATAAGTTGTACCACAATTGCATTTGATTAGTTTGTAATTCATATAAAAAAAAAAACAAAAACAAATTATACTAAATTCAAAATTGTTCAGAAATTATTTCTTAAAATATGTAATTAATTGCTTAAGTTCAAAGACAATAAAGGAAGTGTTA-AAAAAGTT
>CG12130 5475181 5475876|4787 chr2R 5473373 5475310 scaffold_4 5579410 5581226 + 55903|1855 2033
GCGAA-----------------------------------GGACCAAGA-----------CTTACGCAGCTAACAAAGCATTCCTAGTTCTAACTACCTGTACCTCATTGAAATACCGACTTAGTTTTACGCGAGCTATGTATATGTGTGTACTTT---AGGTAACTTTATTTACCTTC
GCGACAGTAAACACATACACATACACACACACACACACCTGGACCAAGAGACTTATCTATTTTGTAAAGCTAACGAAGCATTCCTAGTTCTAGTTCTGAATACCTCAGTGA-------ATTTCTTTTTATACATGTTTTATTTAT---TCCACTTTACCATGTGATTGTGTATACTTTC
>CG12130 5475181 5475876|4788 chr2R 5475590 5477949 scaffold_4 5581331 5583696 + 11510|0 287
AAATCGAAGTTCTCAGCGAATGCGCCTCATATATTGCGATTAATTTGCCAAAAAGAATATAGTCGTATGAATCTGTCATAGTGTGTATTTCGATTATTTAAAGTCTGCGGCTTAACTAGATTTCGTTATAAATAGGTGTACAACATATTGTGTCGACTTGCAAGGCCCCATAGTGGCGAATATGTTTAGCCCCTTTCCTCGTCCCTGGTTGCCACGATCCCAGAAGACCTAGGGTTTAGCTTCTGGCT-GGCGGTCAGACAACCTGGGCGAGGAAACCCTCATTCTCC
AAAACATGTTTGTTGGTGTATACGGTTATTTTTTTTTTTTTAATACGTCTAAAGCAACATTGTCGC------------------------TGATTGATAAAACTTAATTAC--AAGTCGGTTTCGATATAAATATATATATATTGCAACTTATTGTCTAATAAGGCCCCTGTGCGGCAATTA--------------ACTTGCTACAGATT--TAAGATTCTACATG--CTCAGTTTCGGTAGGAGGCTCGTCAATTAGACGACCTGCGCTAAGAATAGCTCGTTCTCC
>Adam 5482350 5482718|4791 chr2R 5481458 5482717 scaffold_45 554976 556335 - 41188|930 1434
ATAGGATCTATAAATGTAGCCCGCATATATCTAATTATTGAATGC----------------ATAGTTGCTTGTTGA--------AGAGTTCTTCTTGTTAGAG-ATGCTGCGCAGGAATAAGAGTCCTTTGTTA-----------------------------------AATATA---------------AAATGGCAGAACCTATATAAATATGTA-----------------------------------------------------AATATATATTTATATAACCATACATA-ACACAAAACGAGTTA--CATAGTCAAGT----CAGGCAATCAAGAAACCTCAACGAACACGCAAATCCAACTCCAAACCGAAAGAATATTTAGGCAACTGACTTATGGCGACAGCACATGTATGTAGGTCGTATTCGGAACGGCTTCTTGTGAAATTCATTTTTGTATAAAGAATAAAACTACAGATCGATATTAAAC--GAAAACAA
ATAGGATCAATAGATAAA---CGCATATAACTAATTATTGAATACACATATATATATATATATAGTTGCTTGTTGATGTCGAAGAGAGTTCTTCTTGTTAAAGAAAATTGCGCTGGAATTTAAATCCTTTTTTGTTGATTTTGAGAATGCTGTTCGAAGGCGCCATATTAATATACATATATGTACATTTAAGTGTAAGCATATATATATATTTGTATGACAGCACAGACACACACCATTATACATACAGACATAAATGCATGTAAAAATTATATATATATATATATATATACATATATATTTAATAGATTAACTAAAGTCAAGTCAAGCAAGCAATCAAGAAACCTCAACGAACATTT--------TTCAGATTTAAAAAAATAC-------AATAAATTA-------GGTACAT------------------GAATGGCTTCTTGT-AAATTCACTTTTGT-------ATCATATTAAAAAGCGATATTAAATTGTAAAACAA
>CG12134 5484555 5484603|4793 chr2R 5483238 5486351 scaffold_45 556635 559674 - 60163|1347 1398
ATGTGTATTTATGTTTTAAATAAAGGTTTTCTAAATACGAAATT---TCAAA
AGACAAGATTTTAT----AATAAAATTGCGCTAATTTCTAATTTACGTTAAA
>eve 5492430 5492592|4801 chr2R 5491816 5493733 scaffold_45 566896 568530 - 23517|654 859
GC----CCGCGATCCACACACACTCTCTCC---CCCCCCCCCATGCTCCCCCAAAAGATTGTACAAACTAGTCTTAG--------------TCAGCCTCATCTA-----TTTATTCCCGAAGATTGTACAGATTGTAGAGT-------------AGCTAATTGT-AGTCATAATTAAGGCGCAAAATCAAATTAAG---AAATAAA
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ATTTCTAGTTTTACACAAGACAACAACAACA-AAAACACAATTTTTTAAATGAATTTTTCCTCCTAAAAAAAAGAAAAAGAAAAGAAAAACGT
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CACTTATCATTCGTGCTTTATCGGCAGTAGCTGTGCGACCGATATTGGAGTTCTATATACATTATAATGATAATAAAAAAAAATACACATACACATACATATAATGATAAATACATACATATATTAAACATCGTAAAATTATAAGTGTATTTGGAGCTACGTTTTTAAGTGAATAAAAATTATAAAGTC
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AACAAAATCAT
AATA----CAT
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GCAGTGGTTATATGGCG
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GCAAAATGTGTGTGCCGCTCATTCGTCAAATGTCCGGTCATCCCGGTGGTATTCCGGGCTTGGTAAGTGCTTGAAGTGTTTGAATCATTAAGCCTCTACATCTATCCATAAAACG--------CCGCCACAGAACTTGCCCTTTCGCAAGGGATTGGATAGCCCCATGCGCTTTACTGTCTTCTGGCTTGTGCTTGGAACTCTTGGGTTCGGTGCTCCATGGCTGGTTGTGCGTCATCAAATGCTACGCAATGTCACAGATGATGAACC
>CG2249 5562619 5562687|4873 chr2R 5562312 5563254 scaffold_4 161499 162508 + 21565|339 477
CA---AGGATGAGTAA-------------------TCCCAAAATGACATAGAACACTCG--------------TTAATAAAT------------------------------TAATAAAAA----TACATTGCACATGG
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TGATCTGATTCATTATGCGGCTGATGCAGATTAGTTG-----ATTTCAACA--------TTATTAAATTATTTTTTAAACAATTAAATTTTAATCGTGTTATTTTAATAAATTTTCATTTGACGTGTGATTTAATATTAATAATTCACAAC----------------GAACTGCACTCAAT
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TAAAAAATTGTCTTGTTTTCAAATAAGTAT-----------TTGTCTTCCTTATAAGTTCAGATTTGGATGTCCATGAAATCGATC
TAAATATTTGTTTGACAATTATAAAAATATACATGCATATATGGACCTCCCTGGAAGTTT---TTTGTAAGTTGCTTAAATATATT
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CACCCTGACCCTCACCTACACGCAGACACATTCCTAGCAT-TAGATTCTATAATTTACATGTGTATGTTACTAATTCTTAATTAGTGTTGTAAATATTATCGAACATAAATGTTTAAGCTTA
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CATTTATTCTA
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AAGAGTCCTAGGGCCGTGTATTTATTTATTTATTTAATTATTTATTTTAGCTATAAGAGTGATGAATGAAACTAAACATGCACATAATAAACTTGCCTCAG-CTATT------AAACAAAACATTTATA
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AT----GCGCTACACGGGAATCTGAAGAG--------AATTTAAGCTTTAGTAGTTGCGACTACTCAATAATACAAATACAAATACAAATACGAATACGCATACGCATACGCATACAGCAAAGTAGACGACTAATTTAGGG---CTAGCTTTAGTAACATTCTATTTACACAAACTTATATTCATAAACACGACTCTAACATGAACATGCTTATAATACCATATTTATTTTGTATATATACGATTAATTC-------------AAATTCTGTATGAGAATTGCC-------ATAA-------TAAAAGAAGTCAA
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ATTTATTACTGTGCGCGAGCATTTCTACGAATAAACATATACTTAAATGTGTTTCAGTGTAAAAACAATAAATGAAAATAACTAAGACAAATATT-----CTTTAA-AAATCTATAGATGTGATTATATAATAAAACTAAGGCAAAAGGCAAAAGGCAAAAGGCAAATACAAAACACAGTAAAGACAAAACTAAACAAAAACAAAAACAAAATAAAAACAAAACAAACAAAAAACATTGTATTG---AATCAAAATATTATTATAAATGTATTTACATA----TATATATATATATATT---GCTGGATGTATAATATGCTACAGTTTGACAAAGAATTTAATGAAAACTCTTATATGACAAATATATATCTATATATACGTATTGCTATACAGTT---ATAAATGTAAAATATA
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>Jra 5609950 5610418|4926 chr2R 5610383 5611398 scaffold_4 4792234 4793246 - 42772|0 36
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ATTTCTA----TTTGAAATATTAGCTAATTATTCCTC
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CCAAACAACTA---AAAAGTTTCCTTTTTGACTATGCAAATATTATTCAGTAATACAAACAAACAAAACAAAACAAAACAACAAACAAAACAAAAGAAATATAAAAACAAATCTTTGGGAGTCGAAAGCAGCAGAGC--AGTAATGTAATAATAAAAGCAACATCAAATCAACATCAGCATCGACACAAACACAAA-CACAAACACTAACTAAACAAAACAACATCAAACATTAAACATTAAACAATACAGCAGGATACTGATGCAGCTTATTGTGGCTGTGTGATGATAGTTTTGAGGCTGAGAGATGTGTAGAAGAGGAGGGACT----ATTGTCATACAACCAACGGAATCTGGCTTAGGCGGTATGTTTAACTTGTATACAAATTGCAATTTATTGCAATAGGAAAATGTATTCGAGCCAGTATTG-TTAAATGAGAACAACCTAAAAG-GAAAGCTGATTAAAGTCTATAAAAA-------------TGATAATGTTAATAAAACCCAAACGTCTTAATTTGCTTCACATGCCGTTCAAGTTGTCTTTGTTATAAAGTAATATGCTCTTGCAAAT-ATTCATAA------ACAAATTTCAAAATCGAAACTATCCGAGTCAAATCTTATATAATTATATAAATAAAATGATCAGCTTACAAGAACAAGAGGAATTACAGTGCGTGCGTGTATGGCAATGATGTGTGAATTTCGTTTT
>14-3-3zeta 5619436 5621500|4940 chr2R 5620078 5620340 scaffold_4 4805161 4805406 - 4100|0 280
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---AAAAATTTTTTTCATTTATTTTCTACTTCTTGGGCCAAAATTACGCAATAATTATTCCATTTTTTATAAT-TATCCAAAGTTTCTTATATAGTTTTTCTGTGCATTAATAAATTAGCATTTACTTTTTTATACAAATTTGAGC
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ACATGTACAACTCGGATACGAGCGAGGACTCAATGATGATCGCCAACGGTTCGCCGCACGATCAGAATGAGCCGCATTATACGAATTTGGATCAGCAGCACGGCGGCCTGGGTGGCAGCGTTTGCGGCCCCGGCGCCGGTGGTGTTGGTGGTGGTGGTGGTGGCGGCATTGGTGGTGGTGGTAGTGCTGGCGAGAAAGGTCAGTTTAATGGTCCCAAAGCTTGGACACAAGATGATATGAATTCAGCTTTAGATGCATTAAAGAATCAAAACATGAGCCTGACGAAAGCATCTGCCATTTATGGCATACCATCAACGACCTTATGGCAGCGTGCTCATCGTTTGGGCATCGAAACGCCTAAGAAGGAGGGCGGTACCAAATCGTGGAACGAGGATGCCTTACAGAATGCCTTGGAGGCGTTGCGTTCGGGTCAAATATCGGCTAATAAAGCATCCAAAGCGTTTGGTATACCCTCATCGACGCTCTACAAGATTGCGCGTCGCGAGGGCATACGGCTGGCGGCGCCATTCAATGCCGCACCAACCACGTGGACACCCGAGGATTTGGAGCGTGCATTGGAGGCGATACGCGCCGGCAATACGTCTGTACAAAAAGCAAGTGCCGAATTCGGCATACCGACAG
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AATACAACTCGGGTTCATTCATTAAACAGTCAACAAGTCAATTATTTGTTGTTGTTG
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GAGAATGAGCTTATGGTATTCCAACTGCAG
CAGCATGTGCAATTGATGCTTTAAGCGCTG
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TATAAAAGCTTCTATATATATATATAATTAC
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TTAACGTTGCAATTTATGACTACTGCCTGC---TGCTTGCGTTGCGCCCACACAAAACTCACGAACTCAACACATCACAAACAAAAACAAACAAAAACAAACAAAGAAAGCAA
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GACATTACCTGATCTTAAAATATTCGTAACTTGCAAAGTCCCAAGCGAGCGCAACTCATCC----CTGCTGTCTTAAGACCAACAATATTGTTAAGTTAAATTGAG--GAAAGCCGGGTTATCTAT-CGACACTCATTTCATTAAAGCCAAGATAAAAATTTCCAATAGATTGCAAAAGTAATAA----TGTTAATAGGTTTATATTAGGC-------------------------------------------------------TACATTAAAAGCGAATAAATTATTGGCTATTGTAACTTGTAATT------TGACTATTGAGAATTAAGATATTATTAAGTGGCCGATAGGTATAAGTGAGTAGAAGGCAGCAG-CAGCAGCAAACAGTACACTTTCTGCGACATCATTTATAGAATTTTGAATTTAATATTAA-ACATCGAGAAAAACCATTTCTAAGAAAATGCTAAAAT-GTATTAACAA----ACAAGCATATTATATGTAGTTATTGATATCAAAGT-------------------------TGTCATCAATAG----TTAATTTAT-------------AAACAT-----------------------TTTTTTTTTAAATTCATTTTTACAATG---------TCGAAAGCCGCATGTCTATCAAAACACCAAAACGATCTGTTATCAATAAATAT--GTACTTGA
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AAT------------AATACCTTATATTAACAATTGCACA-GCAACAAATTATGAAGATACAAAAACATTAAAAATGCTAAA---TGAATAAAAATGTGTG------TTTGGTTTGGCT------------------------TAATAGTTTATTTGTTCTTAATTTTTGCCAAGCTGGGACAGATCTTCCT---TCGG
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A---ATGTACAGTTCATAGTGTTGTTGTTATATAGACCCTACGGATACACATATTATTAAATATATATTATTAAATGTAATTTTTATTTTGAACTATTGTGTTTATTATTATCAGCCTGTAAAGCTCAGTTAATGGATTTGATTAGAATCAATTTGGTTTATTTATTTATTTTTACATGCATATTTGAATACTTCTTTTATTGTTTTTCGATATGTTCAAAGCTTTGAGGATAAAATGATTAGAGCATAAGAAACATTTTCCATTCCTCGTATGAAAAAAGAAAGCTCGTGAAATACAAAACTTAACCGATGGAAATTTATGTACACACATTGTAGCTACAA---TAAATAAGTTTTCCTTTGTGTTTGTTATATAATTTGAATATTTGAATTGTTCTAT
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AATGTCTACTCTGTATGTTAAACCCGAACGAAAATAAATAGTTATGTACATTTACAAAGAATGTATACAAAAATATCTAACTATTCTATATTAAAATATCTTAAAAATAGCACATATATCAAAATCCAATATATTTTTTATTATACGTTATGGAATTTGGGCAACAGTAAATGGATAATTGATAGTTTG---ACAAAAGAAGCTTA-ATGATAATGTTGAAAATCAACTACTTTAACTACTTTATCTTAAAATCAAACGAATTGGTCACAAATCGAAAGTTTTCCAGCAATAAATTCTTAGACCTCTGAAAGGGTG-----ACTGCTTTGCTTAAAGTATCCAATATTATTGGAAATACAGCGTCTAGCTCTTGAACAGACCGACGCACATCAAGAGATTGCGGCGCGTGAAGTGGAGGGTCACAAACGGCGAGTTCTTGCTGGGGAAAGTGCGCAACAGGTAAACGTCCTCGTCATTTTCGT
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ATATAAATCAATTATATT--GCTGTAAAAACATAAGTAAATT
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GCATGAATAGCCACTCCAATGCATACATTTACCTGCATAGAATTTAAGTATCATGATG--------AATAGCTAACGAGAGCTTGAAGACTGTTCGCACTTATCAATCAATTACTCCATGTATCGAATCAACCAACAGCAATTATCACACAGAGTTTTTCACATTTTGAGTTGATTTTAAATTGTTTT------TCGTTTCTGGACACACATCAAACAAAACCACCAAGTCTATATGCCCATGCATGTAGAGTATATATACAATAGTTCGATTGTATATATAATACAATACTGGATACATTTTTTGAAGT---AAACCCAATAAACAGCCGAAAAAAAGCGCTTTGAAAGCGCGC
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CAGTACATGTACATGCTGCAGCCCACCTGAGTGTGGCCCCATCACTACCAGGCCTACCAATTATGGCCAACAAATCCAAATCCAAATCCAAATCCAAACCGGACCCAAGCCCAGCCACAGCAACAAGCTACGAACAGCAGCCGTGGATGCGGCAATGACCAAAACA---TCAACGAGCGCATATCAAATGTCTAAGCATATCGCATTTGGGCACACAACAAAGTAAACTCTA
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>shn 6732122 6733320|6052 chr2R 6732576 6734059 scaffold_34 1199399 1201028 + 46574|0 935
GCACACTTATAAATCTATCTATAT---TGTATACACTTAACCATAATTT-GTTTTCGAAATGC---------------------ATAAATGCAAAAACTCCTGAAGTGCTGTGAGTC-TATCTACAAATGTAAAGATCCGAGAGCGAGAGAAGTGTGTTATTTTTAAGGCCTAGCCCCGAAAATGAACCTCCAAACCGAACCAGAACACACCCGCACACTAAGTATATTGGTTTTCTATGTCCAAATCCAAGT--------TTTGCCCTTTGAAAATCACGTAGTTCTTCCTTATTTCAAA--TTGTTATCACACCAAGTTTTG---AAGCGCAACTATTAACGGTGAATGAGAAATGACTTGCGCCCCTAGTTTTGTTTTAATTCTTT----------------------------AAACAACGAGACCACGAGACTCATTT-AATTGTTTCTTTTAATT------TTGTAT----------------------------------------TTGACAGAAGAGAAACGAAA------------TGATGAAAAAAAACGCTAACTGTAAATAATCAATATGTTGTCATATATGCATTAAGCG--GTAGGTTAGATAAACAAAC---------------------------TACACAAAGTTGATAGATATAAATGAAA--TATTGTACAAACTGCTATGGCAAGCGCTGCAGCAAAATCTATATATACACATAGAT--------------ATATATCTATATATTTGAATGTGTGTATGTGGTTAAACAACAAGAAAATGAAGTGATCTATTACATTATTGTAAAATATATCAAAAAACTGAGAAAAAAAAAA--------------------AACAAAACACAAACAAACATAAAATCTTATACAAAAAAATGACAAAAAATAAAGAAATCAAT
GTATATATATATATATATATATATGCGTATATATGAAGATCTATAATTTCTTTTTCGAAATGCTTAAAACAGAAACAAACAAAAACAAATACAAAA-CTCCTGAAGTGCTGTGAGTCGTATCTATAAAC---AACAACAAAAAAAAAAAGATGATTTTTTTTTTGTGTGTAAATATTAGTTAATAATTTATAAGGCTTAGCC----CACGCCCACCAGACCAAACTCCTCCTCCCCTCCGACCGAACCCAAGCCGAACCCGTTTTCCCATT--AAATCACGTAGTTCTTCCTAATTTTGAAGTTTGTTCTCTGCATTGGATTTGCGTACACCCTATTATTA--GGT--------------------------TTATGTTTTAATTTTTTTAGATTAACAACAAAGAAAAAAAGAAAAAAAAAACGAGACCACGAGACTCTTTTCAATTGTTTGTTTTAATTAATTAATTATATATATATATATATATATGTGTGTGTGTATATGTATATTTAATTAGCGAAAGCAAATTGAAAATCAAATAAAATTACAAAAAAAGAAAACTAACTATAGATAAAGATTATGTTGTCATATAAACATTAAGTTTTGTAGGCTAGCTAAACACACACACCAACACACCAACACACACACATGCACATAAAGTTTATAGAAATTAATGAAAATTATTGTACAAA-----ATGGCTACAAGTATAGCAAAGTATATATATTTATATATATTATATGGTATATATATATATATATATGTGTGAATGTATATGTATGTTTAACAAACACAAAAATGAAGTGATTTATTACATTATTGTAAAATATATCAACAAACAAACAAAAAAAAAACTGAGCATGAAAACTTTACAAACAAACCACAAAAAAA--GAAAATGACACAAAAAATAATAAAAACAAAAAAAAAGATCAAT
>Syx6 6737768 6738389|6056 chr2R 6736806 6738263 scaffold_34 1203565 1204815 + 44574|978 1483
TTGCTTTCGTTGTTCCCAAATCGTTTATATTTAGTGTAAATTAGATTTATTTATGACTTAGCTTGCTTTTGAATTCGGGCTCTTAATTAC-AATTCCATGTAAACTCCCTTGCTGTATATACACGGAAACATTTTAACCTGATTTATTACCAGCCGCCTCTCTCTATATATATATAATGTAATTCCAAAGCTACGGACAAATGATCATGTAAAGTC-AATGTAGGCGGGTAATAAAAGATAACTAACTACTTACATATAAACCAAGTGCTCCAGAGTTCTGTCATTCCCAATTTGGCCAAAGGATACTGCAACTGTAAGCTGTATATACATCGAAGGATATATCTGCATATATATACATACAAACAAAATGGACCTACCAATATCAAACGAGTTATTTAACGAAGAGTCTTAGGAAATTTCACTAACCAAATCTAGCAAAAACTTGTATGCAATTGAGTAAATATATATA---CTTATAAA-----TTAAATTCCTAATTTAAAGC
TTTATTT-GTTGCGCTTCGTTTGATTGTGTGTAGTGTAAAT------------TGATTAGGTTTATCTTTGAAATAAG--TATAAATTTCAAATTTTAAGTGAAATTCCATATTTTATATATAT-----TTTATTAGCCAGACAACAAACAATTTTCTTAGCTGTATATACACGTTTAAACATTTATTAACTAAAATC--ATCATCAAATCGAGTCTAATGTAAACGTATTTCCAAAGACAA--ACCGAATCATGCGTAA-------TTTCCGGCATAGGCTAGATGTAACACTTGCTAAATGGTAC---------AATTTATATGTATGGGAAAGAATATATCTGT---------------------------------ATATCAAGAGAGTTATTTAAACAAATG-------------------------------AATACCTGTATGCAGTTGAGTAAATATATATAAATCATTCAAAGACAGTTATATTTGTTATTTATAAC
>Syx6 6737768 6738389|6057 chr2R 6738267 6738413 scaffold_10 3474622 3474752 - -12|0 122
ATGAGGTACTTCTTACGGGTCACCTAGAAATACTGTATGAGTGCACAGAGAGAAATTGTATACATATACAAAAATTTGTTCGCTATTTTGAAAGCCTAAATTAAACAAAAATTGGAAATACAA
ATTTGATTTTTGTTTTAA--TACGTATAAATAA---------AAACTTAAACAAATTTACTGCACACAC----ATTTTTATATCTTGCTGACTACTCAAAAAAAAAAATTATTTTAAATAT-A
>CG7737 6742024 6742653|6061 chr2R 6740511 6742030 scaffold_43 281300 282813 + 68630|1521 1527
CTGTAGG
CATCAGG
>CG7737 6742024 6742653|6062 chr2R 6742586 6742843 scaffold_43 289918 290220 + 9049|0 71
AACGTGTAATACATACATTTATAATTA---AGTCATTCTTTGAACACAAATAAATTTTGTACAACA-AGTTT
AATCTTTAATATATGGATTTGGTTTTGGACAATCGTTATTTGAGT-TATATAATTGTTGTACAACAGAGTTT
>CG7738 6764501 6764519|6087 chr2R 6764413 6764567 scaffold_43 322763 322895 + 762|91 109
AGTACTTTGGAGCAATTAA
ACTGCGTCAAGACACC---
>Or47a 6767630 6767822|6089 chr2R 6766436 6768484 scaffold_43 323935 325962 + 23424|1309 1517
ATGTGGTT--TGACCACAAGGCTTTGGATTGAT-----TTTTGTGCAATTTTTGTTTTATTGCTGAGCATGCGTTGCCGTACGACATTTAACAATCGATCTTACGTAATTTACATATGATAATCTCACATATTGTTCGTTAAGCACTAAGTAGAATGTAGAATTTGAA----TTGGC-----TGTAGAAATGCACAGATGAAGCACGAA
AGATAGATAACGACAACAAACCAAGAAAATTAAAAACATTTCGAGCAATATTCGTTTTATTGCGTAGCTTGCGATGTCGTACGACATTTAACAATCAAACTTAAATAATGTACAAAACATATTTTAA---ACGATTCGTTAGGCGCTAGGTAGA-TGTGGAAATCGGGAATGTTGGAGAACGTGTGGAAATGCATAAATACACACGGAA
>CG13224 6771797 6771893|6094 chr2R 6770799 6771836 scaffold_43 330327 331228 + 22195|1013 1056
GCTCTCCTAGAACCTAG----ACTACTCAAGTATTGTTTAATTT
TTGAGACTTATACCCAGCTGTAGCGCTT-AGTATTATTAAATTT
>CG13222 6782678 6782768|6106 chr2R 6781986 6782778 scaffold_43 347239 348057 + 35096|719 834
CGA--------CAAATTAATGTCATTTAAATG--------------ATTGATTAGTTTGAAGATGTAGTCGCAACTCAAAGGCATGAAATACATGCATCTGAAAAGTC---AAGCA
GCAGCACAATCCAATTCTATTTCAGCTATATATAATATATATATATATTTGCGAATTAGTCGATTTAGTCGC-ATTCAAACGCGTGAAATACATGCGCCCATAAAATCCAAAAACA
>Vhl 6796322 6796940|6126 chr2R 6794833 6799516 scaffold_43 369928 374704 + 171300|1557 2299
GAGCACACTC----------------------------CTAGTTGTTAGTTAAGA-----GGGCGGGTAATC-ATCTTAGGGACTGAGAGACAGGCTTGATTTCCAAATAATTTAATA--ACTTTAATTGATTTCCATCCTGGTTTTCGATTTTCGCTTATT---ACTTATGTACAAATTGGCTTGCATA-GAGCTCTTTACAAGTTGGGCTACTACCATTGCATTGATTTTTCTGTATATT------TAACAGATTTCTTATACCTATGTATGTTCTATGTAAATAATTATGTATAAACCTAATGTGAAACAAGTGTGAATAT---TACATACATACATATATGCGCAATACTCTAGGTCTAGTTGCTTCA-----------------------------GATGCAAATACGATTT---------AATGGTATGTCT-------GCAGTTACTCCTTTG--CAATGCTTATCTACGTGTGTCGCAAGCC----TAATTGTTATAAGTCTGAATCTGAAGTACATA--------TTTATTCCTAACGAGAAGTGAACAAACAAAAGTACTCCGGTGCACTTTTAAATTTAAAGTTAACGCTCGTACAGATTCTCCTTGAATGTGTTTGTGTTTGTCCACGAGTCGAGTCGAGAAGAGATGAGACGAATCGCAGGTT---AACTCAAATATATTG---CAAAATCAACTTAT----------AAAAATATAAATTGTTAATCGA
AGAGAGGCGCGATATCGTCACGAATATAGAATTATATATTAAGTGTTAGTCATAATTTGTGCTCGTTTACTCTATGAAAGGAAAGGAAAGCCAAGCTTGATTTCCAAATAATTTAATATGATTTTGATTGATTTTTGTA--AGTTTT---TTTTCTCTTATTTTCACTTATTTACAAATTGGCTTGCATATGAGAT---TATATGTT----TTCTACAATTGCATTGTTTCCTTTTTCTTTTACCATATAACAGATTACTTAGAATTAT--ATGTATTATGTATTTAATAAGTAAACAAACGTACATACAACATATATATATACATCTATATATATATATATATATGCA----TCGATCTCTAGCTGCTTTATGAAACTGTTTATAGACGGGCGTTTGCTTGTTGTATTTATGTTCGTTTATGCCAAATGGTATGTATAAAAGGTGTGAATACGGTTTTATCCAATTGTTATGAACG---GCTGCAGGCTCCGATATTTGATCTATATATATATATAGTTTATGTAAAACTCACTTTATTCCTAATAACAA------AAACATAACCCATTTGCGGTGCATTTAGTGTAAGTGTT-----TTGGACAAATCC-------AAATATGAATGTTGTTAAATGAATTGAT---AGAATAAAAAAGTCGAAAAGTACATACAAAAAACAAATGTGTTTGATCAATTTTAGCCCATTAAATAACAAAGAAACATAAAATATTGA----
>CG13220 6800867 6801007|6128 chr2R 6799900 6804507 scaffold_43 375124 379823 + 138867|1004 1183
ATGATCTGATCGATACGATATAGGACTGAGGTATTCGAACCCAAAAGTGGGTTCGTACTGT----------------AATTGCTGTCTTGGC-------------CGTACATAGCTC-GTAATGC----AATATTATCTCCCGCATATTTGAATAAAATTATACT-----ATAAACCCGA
AAAAGTTGATGGCTAC----CGAGACGGAAATGGT--------AAAGGCGATTTATGTTGTATACTAGTTTTTGTAAAGTTGCAGACATGCCCACGATTATAATACGCTCATAGTTTAATAATGTGCAAAATATTTACGTACGCA-ACTTAAATAAAAATTTAATTAGTGACAAAAGTAA
>CG30033 6808697 6809500|6130 chr2R 6804850 6808921 scaffold_43 379824 384039 + 134358|4104 4337
AGATTGTT------CTGCTTACCGCACCAGTCCGAAGGGAACCGGCAGCTTCTCGACCACATCCACCACGCAATTGTCCAGCTGCTTGAGGATCAATTGGGCGGCATAGAAGCCGGCGGGTCCGGCGCCTACGATGCATATCCGCTTGGTGGGCGTGGTGCTCTGGATCAC---CTGCAATCGGGCGGAACTCGTGTGGAGGCCACGTCTGAAGATGTTAAGGCAATTGATGCC
AATTAGTTTATATGCAGCTTACCGCACCAATCCGAACGGCACCGGCAGCTTCTCCACGATGTCCACGGTGCAGTCGCTCAGCTGCTTGAGCAAATATTGTGCCGCATAGAAACCCGCTGGGCCGGCGCCCACAATGCAAATTCGTTTGACTGCTGCTGTTGACTGTTGCACATTTTGGTATTTAATTGCACTTGTACTCAAATTACAGCTGTATATATTTA-ACAATTTATGTC
>CG30033 6808697 6809500|6131 chr2R 6809220 6809660 scaffold_19 972692 973176 + -714|0 307
AGCACCGACAGT-ACATTAGTAATAGAAAGCTAGGAAAGTAAGGATGTTTTA---------ATATTGTTATACAGACAGTTGCAGCGGAGCAAGAATTTAAATTGCGCGCCTTTTTGATACTTGATACTCTCATAAGGCGTTTAAATATACATATCACTCCTTTCATTTCTAAAAATATTGAAAATTAACAAG----AAGTATTTAT--------TATTATAAAAAA-ATATTGAAGCATTTA---CAGAAATGTTGTAATAAATGTACTAAAAGTCAAATAATAAATGAAATAAATACTT-TTTGAG
AGCTTCGATAATGAAATTATTAAAAAAAAGTTTTTAAA--AATGAATTTTCATAAAGAAAAATATTCTTATA------GTTTT-------------TTAAAATAGTGAATTAATTTTGTATCTGATAATCTGAACAAAAACTTAATACTTTATTCTCAATCTTGCACTTTAAATAGACTTCCAACTTAACGAGCCCAAAATAATTAGAAAAAAAATGGCATAAAAAATATACTTATGTATGTATGTCACGTATACAATTATACATGCATACATACATACATCTTTACATACATGTGCACATACTTGGA
>CG7741 6821400 6821514|6137 chr2R 6818056 6822896 scaffold_43 899741 904653 - 170592|3509 3647
GCAAAGAACA----TTGTATGTATAGTAAAAAGTTCATATCGGTTGTAATTGCTGAG------------CCCTTGCTAACAGTTCATCCATGTAAATGCTAAAACTACAAT------TTAATTAAAA--ACGTATCCGT
GTGAAGAACAACCGTGAGTTGCACAGTAAAAA----ATCTCTGTTGTACTTATTGAATATATCAAATTACACATACATGCACACAAGCCAGTCAAATACTATA-CTACAATATTATGTTAGTCACACCCACTTATGTAT
>CG7745 6825433 6825740|6140 chr2R 6823851 6825776 scaffold_43 905814 907763 - 68014|1667 2008
AGGGCTAGCTACTA--------GGTATTTGTAAATAATGTAATCTATTATCCTTAACT------------TATGTTATTCGTTAGACGGTTGTCAGATAATAGTAATTGCATCGCTTTGGTCAAATTTCCCACCAATGAGTCATTTGCAAAGCTCTACGTTCTACCGAACACTTTTCAAATGTGCTAGTCAAGACCAGCAATTGGGATTCCATATCTGCATTAATTTATGTTT-----TTTTATATATGTTTAAGAATATAATGATCGGTTTTAATTTATTTAAATTCTTATTAAAGTGTACTCAATGGAAAAGTGTCTTTCCAATGT---------GAAAA
GCGGGCGTTCAGTATTAATAGGGTCGCTTGTAAATAGTGT-ATAGATTAGATTTGAATTTAAGTTGATTATAGATTAATCATTAAGTTAATGCAAAACAGTTTTTAAGTTGTCCGTTTGGTCGTG-AACCCACCA---TGGCATTTGAAAAGT----CGTTTAAGC-CACACTTTCCATCTGTGCTAGTCATGAACTTTAATTGA---CCAACATTCAGTTTGATTTTAAGTTAAAAGTTTAATGTAATTTATGAAGTATATATATTTTTTTTTATTTAAAGGGATAGATGTCCGGGTATATCTAGT------ATACTTTTCCAAGTTCAATTAAAACAAAA
>lambdaTry 6853586 6853703|6179 chr2R 6853694 6853696 scaffold_1 5304907 5304909 + 282|0 2
GTA
GTA
>lambdaTry 6853586 6853703|6180 chr2R 6853697 6853827 scaffold_1 1702533 1702646 - 22|0 6
GTATATT
GTGTGTG
>betaTry 6863011 6863043|6198 chr2R 6862245 6863083 scaffold_1 5313252 5314098 + 51123|775 807
TTATTTTTCGAAATAAATCATATATGAACAGTT
GAACATTGCAAAATAAA------ATCATGAGTT
>deltaTry 6872002 6872035|6216 chr2R 6871240 6872021 scaffold_1 1713662 1714440 - 43622|762 781
AAAGTGTGCGAAATAAAACG
AACTCGATCTAAATAGATCG
>deltaTry 6872002 6872035|6217 chr2R 6872022 6872432 scaffold_1 1718825 1719224 - -1272|0 13
TATATTCTGACTAT
TGCACGTTGGCCGT
>iotaTry 6873409 6873443|6219 chr2R 6872800 6873479 scaffold_1 1721076 1721769 - 5422|649 683
ACAGATTTTGGAAAATAAAGACCATGCTTAAAAAA
ATATAGTCTG-------ATAGCCGCTATCAAAAGT
>san 6877645 6877786|6228 chr2R 6877603 6877802 scaffold_1 5331099 5331270 + -654|42 185
AGATGAATTTCA--ATATGTATAACAAACAGACATGTAGAGGCGGCCAAAACGATGTATTCAATTAGTCCGATCATATCTATGTGTAATCAATAATAATTACCCCTGCGCGGGAATAAATAGCTCTATACGGCTTGGCCAGTCG
AGCCGTCTTTCACCACAGTTGCCACGACCAAACAAATGAGGTCTGCCGTCACGACA----CAATCGAGCGGATCGGGT-TCCCTGTTACCAATGGTGATCA---ATACATGGAACTTCAGAGACGCAAATGCGCTGGCCTGGCG
>CG13204 6886144 6886191|6235 chr2R 6883333 6887067 scaffold_11 1038212 1041864 + 90877|2989 3056
GCGTA----TTCGTACAAGTTATCTCTAAAT----------------TAAAATTAAATTAATCTCAAC
GCGCAAATCTCTGGCTACCTTGCTTATAAATACTTACATATGTATTGTTAAACTTAAGTAAACTTAAT
>CG13203 6892729 6893016|6241 chr2R 6892116 6892981 scaffold_11 1049561 1050438 + 26616|634 907
GGAACTGACGGATGGGAAACCAAGTTC--CAGTTCCATGGAATCCGA--CCATTTAATTGCATTTGCCCCCAGAGGATGT-----AGTAGCAGTAGTGGAGCACTCGTTAAAACGCAATCGCACCTCGCTGAGACACCATATCCGG---CGTCCACGCGTAGTTCTAGATGG--TACCGTAGACCCATTGAACCCGTATTTACTGTATGG--CAAGCTTATGTGGAC---GCTGAGCCTGGCCAATAATTGTAGACCC--AACGTAGATCCTTA
AGCGCACACGGCCGAGGA-CCAAGTTATGCATTTGCCCCAAACAAAAACCCATTCAAGCCCCTTT--CCCGGGCAGATCTTCATACGTAGAAGTAGCGT-GCACTCGTTAAACAGCTA-CGCACCCAGCTGAGTCACAATCCGAGGATGCATCCTGTTGTAGTTGTAGTTGAACTAGAGTCGCCAGTTCATGCTTGAAGACGCTGTGCAGGCCAATCGCAACTGAAATTAGCTGAG---AACAATAAATTGTAGACACCAAACACAATTTCTTG
>CG7759 6923885 6923992|6280 chr2R 6923884 6924157 scaffold_12 3387074 3387334 + -352|1 110
CTAGGATTCTTTAATAATTGATTAAAACATTGTTTG--GCTAATGAGTTTAATTTGCAAAAATATATAAAATAAAAATGCTGTAAAAAAACAGATTCCCATCTGAGGACA
AAGTAATTTTTGTATTGCTT-TTTATTTACTGTTTGAAATCTATAAGTTTAATTTGCGAGTATTTAGATAAATTTATTATTTTCACAA-----------ATTTGCAGCAA
>CG7763 6931223 6931369|6289 chr2R 6930674 6931320 scaffold_2 2446602 2447256 - 6325|583 687
TACAAAAATATTT------ATCTCTTTGAAGTTAATATTAGTTTTTGATATCTGA-CATTTACCACATGGTTTATGGAGGAAATAAGTATAATGTTTATTTCAAA
GCAAGGGCTTCTTTCGTACATATGTTCGATATTATAAATAAATATGCATGTCTGAGTGTTTG----AGTGTTTATTTA--AACAAAGTCAAAAATTAAGTTCAAA
>CG7777 6957446 6957527|6316 chr2R 6956973 6957628 scaffold_11 1136992 1137618 + 26805|473 563
TCCGTGATTCCGCC--------CACCCATTACACACACACACACACACACACACCCAT-CACACACACAAACACTCACTCACACTTGCATT
AACAGCAACGCGACACCTGAAACATCCA-CAAACACACATCCACACACACACACACGTACACACACACACACATCCACAAACACTCAC---
>CG7777 6957842 6958130|6317 chr2R 6957818 6958132 scaffold_11 1137619 1137994 + 4237|24 387
ATGCGCAAACTGGAGGGAGCCCGTGACTACGCCTAGA-------------TATAAAG--------AAATCTTTGCGACTCGAATCTAGGGATACAGATG------------------------------------AAATCTGTGTGTTTAATCCA-TTCATTTCAGTGTCTAA--------CATAAACATGTCGTGTTCTTCTACGTTCGTGTGTATTTATGTATTTATTCATGCAAAATTCATTTTTAACTAACTAATATTTAATGTGTAAGCTGCCCTAAAATGCAATCTACAACAAAATTACTTGTACTCT-----CATGCGCTCACAATAAAGTGGAAAACATT----AACTGAAACAAA
CTGCGCAAACTGGAAGGATCACGCGACTATGCCTAAGGCGTTAGCCTGCTTCTGTAGCCTGCATCACATCGGGTCCACTCGAATCCTGCGAGTCGAATGGCAAATGCTCACAAGAATTGGAAGAAAGCATGATTCAAGTCTTTGTCTTGATTCCGTTTCGTTGTAATCTTGAATAATTTTTCATATACGTGTTA-ATTTTTGTATGTAC--GAGTATTTATGTAATTATTTATGC-AAACCCATTTTAA---AACTAATACCTAA--TTTAAGCTGTGCTTAACGCCAATT--CAACAAACTT-CTTATACTATATATACGAGCGTTCATAATAAA--GATAATTATCACGAAATTAAAACAAG
>CG33472 6963509 6967521|6322 chr2R 6963046 6965220 scaffold_11 1144560 1146910 + 23497|463 2582
TGGAAAGTTCAGGCAATGGACATATGTGCTTTTGTGAGGAAGATATGTGCAATTCTAGTAAAAATTTACA------CACTAATGGTTGCCAGCTGCATCTCATACCCATCGCAGTGGCAGTATCTTGGCTAAT----------------------GGGTCAATTGCTCAGCAGATAGAAAGTGTTAGGCTC-------ACCCACAG----------AAATCCACAT------------ACTCAGAACATACAGAACATACAACACAGCCAGAGAATAC---CCTACACACTCACTATCTCTC-----------TTCCTCTCTATCTAAGCATATGATT------------------------TGTAGATTGATTTGATTTCA---TTACGATAACAGTTACGATTGATTTGT-----TTTGGAGCACAGTCTGCAAAGGTCGGACTTCGAGTAGCTTCGATCA-GCAC---------TAAGCGAAGACTCGAAAA-----CCCAATCTACGGAATGTGAATGCATACCAAAGCTTCCAAAGACAGAAGGCTTTCTCTATTTCTCTATCACACACAGTAAACACACCCTAAGCGAGCTTGGGATGCACAGAGTTCTTGAGATGCGAGTTTAATCGAATCGCATTGAAGTCGAATCCGAATCGAA-----------------------------------------TCACAGTACTCG---TATTCGGT------------------------------ATTTGAATTGCATGTTGTTGATGCTAAAGCTGAAGCATGTAGCGCTTAAGTAGG-AATCGTAGTGGTTATTACATTTTGATTTCG----TTGTTACTTACATTTGTAAATGCCC-------------------CGACCAGAGGGATAAACCAAAAACCAACGTCAGTAATCG-ATTCAAACTTTAATTCGTTTATAGACTTACTTTGAACATTTGTCTAAATCATATGTAAACTTGGAAT----AACTCGACCCCAGACACATTGTGTATATAGCCAGACCCAAAAACA----------------------TCAAAGATCATCCCAAAAGTAT-------------TGCAGTTAC-CAAGTGGAACATTTGCTCATCTTGTTTATTCCAAAGTCGGAGGAAAACTCCATAATGCATAAACGTTACTTTGTTGTTAATACTCTGTATCCTAGATCTTAGCCATTAAGCTGTACTCTCGGTTCTCGCTTGGACCCCAAAACTAACTAAAATCCCACGCATCATATCAC-----GTACCGAAGCAACAATGAGACCGAACTTTGGTGACCTATCGATCTTAGAGTAGAACCTGCCACCAGCACCTAACTGTATAAAG--TACCAATCACCCTGGTCCCTTTGGTTTAT--GTTAACAAGTGATAATTAGATTGTAAGTA--------GAAGACCCAGTTCCCAATTCCGATCCCGAGCCCT--AGATCCGTAAAGAACCCGTATCCCTCATTATGAAATTGAAA--TTGAA----------------------------------------TCAATTC-------------------TCATTCATGCTAGTGATAGTTTTAAAACGA---ATCGAATCGGAATTATA-GCTTATATAGTTTATTATTTAAATTTTTGGAATTTGACTTAATATTATGAATGAATAGTTATGATTATCATCTCGACTAGAGTATTCGACTTAAAGTTTTGTATTCTAAGCGTAA-------------------------ACCTTTTCATTTGTATAATTGAAGATTGGCTAAT---AAACAACCATTTTTACCATACGTACATTTCTAGCAAAATTTACTCTCAACCGTTGC---TGT-TACTTTTTAGCTTAAATTTGCTTTATCTA-CTTGCTACTCACTTAA----CCAACTTT----------------------TCAACAATCGTGCACTTTTGCCCACGCATTTGTACAAAACTTAACCTAGACTTGGCTTTAGTTTAAAAATGCTTACAAAAAC--------TAACTAAAGAAATCAATAGAAAATCCGTATCCGTCCAACAGGGAAGCATGAGAACTAATTTCGTTGCT
TGGAAAGTTCAGGCAATGGACATATGTGCTTTTGTGAGGAAGATATGTGCAATTCTAGTAAAAGTTTATACTCATTCGCAAACGGTTATCA---ACATCTCATGCTCATCACAATGCCA------TGGCTAATACTGCTAGCAAAGTTTGTGCCCAGATAGATTGACAACTAAACTCAGATTGCAGGGCATTCGTTAAACCCAGAGAAGCGTTATAAAGTACATATTGTTACATCTAGACACGAGACATACTCTATAGATATCATGCCCAACACACACACACACACACACTCACATTTACACATTAGTTGAAATTGATTTGTAGCCAAGT-TCTGATTAGTTAACTTTCGCATTTCAAACAATGTAAATGATGTTGATTTTCGTTCTGCAAGCACAGTTATTATCGACTTATTAATATTCAACGAGTAGATCG-AAAGTTTTGACTGCACACACACACACACACACACACACACGTTTAAAAGACGCCCCCAAAAGGGGCCCCAAT----GAATTGCCGATGCATA-AAAGACTTCTACATGAAGAAG---TGATGCATACGACTCTCTTACTTAATACATATACTATTTACTATATTACCACAGTCCAATGAATCAAAATGCGAGCTTGTTGCACTTGCCCGAAAGCATAATTACATTAATAACTGGTACTTGGTACTTGGTACTTGGTACTTGGTACCTGTTTCTTGGTACTTGGAATGTTTGGTACTCGAGATCCATCAATGATATGAACTACTATTTGAAATGCATGTTGTTAATGCTA------AAGCATGTAGCGCTTAAGTAGGTACTCGTATCTGTAGTTACATTT---CTTCAAATTTTGTTACTTACATTTATAGAGTCCCAATGAAATGAGTCACACATTTATCATACATATGTACCATAAGTAAGC-TTAGTAATAGAACTCATACTGAGCTACATACCTAAGCAAATGTAAAAATTTCGTTTTGTATATATCAGAGTGCCCAATTTTGAATCGGAACTAATGGAAATTGAAATTGAAATCGAAATCGAAAAGAAAAAGGAAAGATAAAGTATTGTGCAATGGTCAAGTCTGAAGTATGCTTGTCAATTGCCGCATTAACTCAAATGAA--ATTTGCTCATCATGTTTATTCCAAAGTC----AAGAACTCCAT-ATGCAT-AACGTTACTTTACTCT---AACTCTAT---CTAATCTCTAATCACTAAGCTAAGATCTATGTCC--------------------AATCATATCACAAATACTCTTTCTCCAGGAGTACCTAGACAACACACA---CCAATTTAAGTTGAATATCCAGGTCC-AGTAGTCGCT-----TAGCTC----CTGTATAAAGACTCCTATTGATTTCAATCTCTTTGGTTTGTTATTCAAAAAGTGATAATTAGCCAGTAAGTAGCCCCAAGGAACGCCCTGTATACAAC----AGCTCGAACTATTCGAAGTCTAAAACAAGTTGTTGCTAAAATTTC--AATTGGAACTTTGAAGACAGGGCTGTGTGTACAGGGTGTCGCGCAGTCGGGCAGCCCGACTCTGCTGCCCTGCTCTTTTTGTTATTCATGCTAGTGATAGTTTTAAAAGAATATCTCAAATC--ATTTATGTACTTATACA------TAGTTAAA--TGTAGCTTATGATTTATTTTTCTTTACACATAATTATATTTATGA----------------CAACTTGAA--TTTGTATTCTAGGCATAACAAAAACAAAAAATAAAATAATTTCAAATTTTCATTTATGTAATTGAAAATTGGCTTATCAGAAATAAACATTTTTACCTTACATACATACCTATGTATATACCTATGTACATGCTGCATATGTATGTGTATGTGTATGTATTTGCTATACTCATTTTGAAATTTACTTCAACTCTCAACTTTGCCTTATTTCACATCACCTAGATCAACTTTC--TCAACTGCACCCA-ACATTTGTAATATACTT---TTAGAGCTGGCTTTAGTTACTAAACTGCTATACTAATTATTCTTGTAACAAAAAAAA--AAAAAACAAACAACATCAGGACATGCTTGAAAGCTTAAACATCATCTCATCTCC
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AAATTCATCAGACACTTG--GAAAGCCTTTGGTTTTTGTATAGTTCAGTTTTTCTTCG-TTTATCTAT-TTATT------TTTTCTGGTATGTTGGTTTCTTTGACTATAATATACATATAATATATACATATAAAACAGCATATATATTTTAACAAAATTTCGGTTTGTGAATGTGAACAATATTCTTATAACCAGTAT--------TTGATTGAAAGTTAATGCGTTTCAAAGTTTTTAACAAATTAACGAACTAAATTTATTTGCAACAA--TTACAAGAAATGCGATCATCATACACAAA-TTTGTAGTGCAAAATGAAAAATATAATATCATTTTAGTTTAGTACTTTTTGTAGTT-AAACATCTCTCTGAATCTATTCCTCTCTCGTTCTCA-CACACACACACTCTCTCTCTCTCGCTCTCTGT-----CTATATATATATATTTATCTTTATCTATATACATACTCTGATTAGCTCAATTCTCGAAACTTTCTTT--TCTTAAACAATCTTTTTACTAATCT-------AAACTTCACAAACATAGAACTC--TAATTAGA--CACCTGCGTAGTTTAGTTAAAGCAACAACACAACAAATCACG
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CAAGTGCATATCGAATCAGTTAATAATTGAGAAAAAT-TACAGTCGACTACATTCTGACAACAAACTGATCTA----------GAAGCACAATGCAGTCTAGTGTTAGCCAAAATCCAAGCAGTTCTCATAAAGCTATCGTAAATTTGTACTA-TGCTAGGCGCGTTTTTAATT--CAATCTTAATTATTATCGTGCCATATTAAAGGCCGCAAATAGTCCCGTTTTTTTTTTTTATTTTTTTTTTGGCATTTATGATCCATAAATTCCTCACAATACAAAAAGCACTAAATTAATATCAAAGACTCTACCAATATGGCAG-TTGCCATTTTAA--GAATATTGGTATTGGTTGTTGAATATTGTAA------AAGAAAAACCAA--------CAAAAACGAACTTGAGAAAAACCAACATTTCCTTAAAGGTAT---------ACTTTTTGTTTCCTAAGTTCAGTT
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AGCAGATAATTCAGATTTTAA---ATTGACT-------TTACACCTCAGCTCACCACGCACACATCTAAATAGTGCTTCCCGCCACTCACCTCAATTCGCCATTTCACCCACTCACCCCAACTCAC-CACACCAAGTGGCGCAC-GCGCCACAAATTCCAC--------------------CAGTGGCGTACGCAGGATTCTCTCAAAGGGGCTTGAAAATATTTTCTTATTTTCATTTAATTCTGTAATATGCTGAAGAAGAAG-----AGCCCTCTCCCTGCGCACGCCACTCTCTTCAACCACCAAC-----ACGGTTGCGCAGCCGCGACAGAG-------------------------AGATA-----------------------------------------------TGCCTTCGCTCTCTCGCAGCTGCGCCACGCCCACCACCCACAGCCACCCACGAAA---ATGGTGCTTTTTCACATACGACACCACTGTCTGACT--ATATTTTTCATCATGTACGCCATCGCAATCCATGCCACAGTGGTCGCAATGCCGCGACAGCCGCTCCACAAGTGCCAC-------CAAAT------ACTATTTTATTTGTGTATTTATTTTCACCGAAAATGAATTCCTGCACTTTGTGGGCGGCAGGCGCGCGTGCATTGCCGAGCATCTG
ATCGGTTTTTCCATATATTTATTTATTTACTTTTTTTGTTTCGTTTTCGATAAGCACATTCATATGTACATATG---------TATGAACATGCATACATTCATACATCCATTCGTACAAACATACATACACATGTCGGCAGACTGCAGTACAAACTTAATGATGTGTCTGCATATATATACATATGCTCATGCATGTACTGGTCGAA--GGCCTGCGCTCAGTTCTCCATTTT-GCTCAATTCATAAGCACTCAGTCGCTTGTGTCTCTCGCTCCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCCCTTTAGCTGGCAGTGTGTAACAGCTGCACAGGCGTGACAGTGTGCGGGATTGTTTTTTTGTCGGCTTGGATAGGCGAAAAAGCTTTCTCACGCAGCTGCTGCTTGTCGTCCTCTAATCGTGCTTTCGCTCTCCCACTTGGGAGACGCGCTTCTCCATTACAACTACCGTTAAACGCTATGGTGCTTTTTCACATACGCCACCACTGTCTGACTTAAATTTTTTCATCATGTACGCCATCGCAAACCATG--ACAGTAGCCGCAATGGCGCGACAGCTGCTCCACAATCGCCACACTTGCGCACATGCCTGCACACATACATACGTGCGTTTAAATACA-TGCATATGTATGTTGCGA--TTGTGGACAATCTGCGCGCGCACATCTGCAAGCAACTG
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CTAGCGAGTAAATTTTAATCGTATTCTCGAATATAAATTGAGCAAACTTTAAGTCAACGAGCACATTTGAAAC
CCAGCAAGGAAAATTCAGTCGTATTTGCGTAAATAAATTAA---------AAAGCAACTTGCGCATTGGCAAC
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AAACTAATAATAATAAAAAAAAAAAAGAAGAAACTATAAACAACTCATTTGTTAAATAGCAAACTGTACATATTTGATAATAATTTTGAATGATAATGCTAATAAATATATTTTAAGTGATACAAAATAATGTTAGTTGGCATCTCAACACACACAAAGACACACACATACACACATGTATAGATATATATATATTTAGTTTATATATATATATATATATATGTATATATAAACACAAACAAACACACACACACATGGACATTTGGCATGTTAGCTTTCAGCTCATGCCGTTTCAGAACCACGCGCTTTAGCAATGCTGCCACGCCCACTCGATTGGCGTTGGCAGCGTGCGTTAACAAAATAAAAGAAGAAGTTAAAATA
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GGGCAATATTTATTGTATAATTAACCATAATATTAATATTTAA--ATTTATTGTGTAGCGTGTAAGCTTAGTGCTTAAAGTTGCTAAACAATTAAGTTGTAAAATATTCTAGTCCCCCCTCGGCGCACGCGACGTGATTTGCCCGCTCGGATGCGGATGTGGATGCGGA----CGCGGTGGAGATGG-----AGTCGTAGCTGCCCCGCGCTGCGC------TGCGTGT---TTTTGTATAATAAACTTAGAAACAGAAAAAGAAAAAATAATGCAAAAAGAAAAGAAAAAAATAAACAATACAAATAATATAAATAATTTAACAAACATTTAAATTATACA
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GTTATTATTATGATTATTATTATTATTTATATTGCTAAGTCGCGTAGTTTTATGATTCGTGTAAATTATGAGTT-TAGCACTAATTTTGTTGCCTAGATGATGATGATCAGCATTATTATCATCATCATCATGAAGTAATCTCTGTAGAAAAA-TGACATAACT---ATTTAGTTAAGAATGCAAGTGCCAAATGCAAAACTATCCAGAACTATCCCGCTCCCCCACCTCAAAGGAGTTCAATCCAATTGGCTAT---TCGAATATAGAAAGCTTGTAAAAAGAATATATGAATCTTTTTTTAGTAGTATAAATAACTCTCGCAGCAACTGCGTCTATGTAAATTATTATGTATGTAAAATAACTTTATGAATATATATATATATATATACAAATATATATATACAAAAAATGAAATAC
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ATGGC
ACTGA
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TTAAGTGAA--AAGTCGAG--TTCCGTTTCCAATTGATGAATTTGTTAGAATTTA
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ACATTTTGTTTATTAAGCGTAAAAATCCTATTGATTTGATCTATAATCTTTTTTTGTACACAGTTTTCACATTTTCACACTTTTTAAAAAAGT--TCGCAATTGGCGAGAAAGCTTTTTGATGCTTTTAGCTACAATTTGTTTTGGCTTGATC------AGCTTTCTAG----TATAACTAATTTAATTAATAAAGCTCTCATAAA
-----CTGATTTAAGAACGCAAAAGTGAGAAAGATTTTAACTTACTTCTGATTTTTGATA---TTTTGAAGTTGTC-CGCCGTTGAGCAGTGTGACCTTCATAAATAAAGAAAATGAATACTGCGCGTGGT----ATTTATTTAGGTTCTATTGCACAGAGTTGTCTAGTAAATATCGATAATTTTGTGAATGCAGCGTTTTCAAA
>CG13197 7211217 7211360|6617 chr2R 7210847 7211529 scaffold_1 2095792 2096687 - 47|420 687
C--------------CGCTTCGTTCGAT-TTAATATT-------------ATAGTTTTAA---------------------------------------------------AAAATCCTTGAGTGTAAAAAATTTCCAACGGTGTGTTGATCAAT---TTGTAAATTATTGCTAATTAG--------------------CTGCAACTACAGGTACGGCAATTAAAATTCATTT----------------------GAGACCACATAAT
CAGGATAGTAGACCGCACTCCAATCGCTATCAATATTTGACTGACCAGGAATAGCTTTGATTGTTGGCTATTTAGGATTTGGCGTTCAGTAATTGGTCCTGCCTGATTCTGTACATTTTCGTTTCGTAATAAATTCCAGTCCTCTGTTGGCCAATTTGTTGTAAATTATTGTCCATTAGGCATCCCCCTCGTCACGGCCGTGTTTCCGTGGCAACAACAATTAAAATTCATTTTCAACATGGCCAAAAGCCGCGGGTGCCGGCTCAAT
>CG8271 7367636 7368231|6832 chr2R 7367224 7368420 scaffold_1 4974555 4975991 + 19693|424 1296
AAAT-GATTCGGATTCG--TTGGTTGCC-------------------------CCATATGTTAATAGT------GTTTTAGTAGCGATCAAATACTAGTTGAGTTCCTGAGTTTCA------------------------------------GAGTTCGAATGCCTCACCGATATTGCTGATTCTACCAGTTACTATTAC-----------------------------------------TACTATCCGT-----ACGTTCTCATCCGTATCTTTGTATCTTAATCAATCCCCATGCCCACCCGCACCCAATCGCTTGTTATCCTTCCGTTGAGCAACAGCAAAAGGATGTGTAAGATGATGATATTCAAACGAAGAAACCA----------AACAA------CCTAAACAACCAACAACTGAGCACCAAATGTTGCGCAAAAAGAACTGAGTTTAAAAGACATGAACTACA---------------------AATACCCGTATA---------TAACTTTATAATAT-----GATAACTACGATC-----AATGCCCGACTAGATGGTT---------------------------------ATATAGGCCGAC-TATAGTTGTAGGTTCGCA----------CATCCATATCGGAAAGGACT---------AAACTTTGTGCAG---GAAAA----ATTAAGTGGCTTTAGACAGAAGGGAGGCTTGAATGGAGAACATC---------------------------------------------ACATTACATTACCCTAGAATTAAAATAGTTGTTGTGAGACATTTACCCATAAAGACAATTACCAAATAAACACGAAATCAAAAGG
AGCTAGACTCGGGTTCAGTTTTGTTGCTTAGCAGTTATACAAAAAAAAAAATACTAAATATTTGTTGTTCCGTGTTTTTAGTAGCGTTTACA-GTTAGACCGAAACATGTTTTCCATAGCAGTACAAAAAAAAAAGAAAAAATATACAACCTGAGTTCGAATGCCTCACCGATAAAGTTGATACTC----TTACTGATACTCGACACACACACACACACACACACAAACCGAAGCAACATTTACTTTACGCAACCAACATTCAC-TTCATCCTTTTAAATCCTGAGTTGTTCTCGT-CTTACACATAT---ATCTGTAATTATATTTATATCTATATATATGTATATCATCTGCCTGCTTATCCTATGCAATATTTGCAACTATTGTGTATTTAACAATGTTATCCCAAACATGAAA------AGCACCGAAAGTTGCGC--AAAGAACTGAGTTAAAAAGACATGAACACCAAAACAAAAGAGAAAAACAAATAATATCCATAAAAGGAAAAAGAATCTTTAGAATACATATAAATAATTGTATTCGATATAATATACGAATATGTGTATGTGTATCTGTATTTTTTTGCCCAAAAATACAAAATATGTAACGATATTTAGCTGTAGGTTTACACGATGAACATCATCAGCATCAAGAAACACTCTCCAGTTGGTATTTTATTCAAATTGAGAAGCGCATAGAGAGGCTATCAGTAAAACTACTTATTAAATGTTTAACAACTGTACCAAACAATTCAAAAATCATATTCTTTGGGTGCATCCAACAGCATTACATTAATCTAGTTGTATAATAGTTGTTGTGAGACATTTACCCGAAACAAGA------AAATTAACACAAAATAAACAAC
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GCGGCGGAGGTAGTTACCCCTGATCGAGCGAAGAGTCTGGCACAGGCTGACTTTAA----------TCCACACTGCTAGTTTATAAGGCTCTAGGCATTTAAATATAATTATATATACATTATTATGAATAAGCCGCGTACTAAAAATACATATTACACATATTAAATGCTCAAG
>Ef1alpha48D 7410874 7411518|6849 chr2R 7407868 7411680 scaffold_51 418330 422362 - 143607|3375 4087
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CAAGTTT-----CCATCGAGAACAACAATAACAT-------------CAACTACAATAACAACAGTAACGTGATGAAGCAGCCACAACTCAGCAGCAACAA-CAATAACAACAGCAACAGCAACAATGATAAGCACAACAGTAGTAGAACACATACACCTGTCCTGGGCAAGATGAATGATAAGATGATGTTCCAGCAAAAGCAAAAGTTTAATTTTTTCCATCGCAAAGAGTTTCGTCGGATACGAATGTTAAACGCCATC---GCCGCCT--------AGACGATTGAGAGGAGGAGCAACAGCCGCAGAATACGAAAAC-------TTTA----------------------CACCCTCGATCTTAAGTTTACCTACATATATATATGATATTGTACTAAATTGATTT--TATAATGATATCATATTTCATAGTTCGTATAATTTGTGTAGCAGTAGCGCAGGCGTATAGCATTTAT-ATATTGTGTATTCGTTAAAATTAAAGTTTTGAT---TTTCCTATATCTTATCCTTTTTTTTTTGCGCA-ACTACTTTGTACACTAATTTTGAAACAAGAAGCAGAACACAATACTAGAAGCAAAAAGATAACTCTATTTACAACAAAAATAAACACA----TTTTGTATTTATTCTGTTT------------CCATATGA--------TTTTGGGTTGCGAATTTTTCGTTT
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TCTGGCCACGCAACAACGAAGCAAACAACGCACTTGTTCCTAGCAGAATTCCACCAGGGCACAGACAGCAAAGGACTCGCAAAT----CATTTTAGTG-TAAATTTAAATTATCGCACGTACTTA--TTAATGCGCATTTGTCTTGAATGTAAATAGTTTAATGGAACCGGGCTTTAT
>CG13189 7416895 7417306|6855 chr2R 7417192 7418800 scaffold_51 428029 429635 - 14954|0 122
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GGTAAACAGACGTATGCATGTGCAATAGGTTTTAAGTTGTCAGCGTCTTTC--------------TTCTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACAACAAAAACAAAACTGTCGTAATAT
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GCGTAG
GAGAAA
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CAATCGCACTATCTAAAACCAAGCGCCAAGACACAAAACATGATTTG
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GTGCAGCAATAATTTAAGTCAGAAAATCACGAACTGTTTCCCAAATTCATTAAGTAAT--TAATTTAGCAAAATATAATAAAAAAAATAATAATCTTAGGCTAGACTTAAATGTATTCCACACAAAATCCATTATGCATATATGTAAAAATAATATATTCTACTTTTAATAGCTGCGCATAATTGATTTTGTTCT-----AATATTGAGATTACGACAGCGCACTGG---TAACTTTATATATACGCATATATATATACATATTAAAATATATATATATATATATATACAAAAATTGACTTTTTTGCGCAATAACACGCCATTACATTGTATAGTTATTAGTTACGTTTGTTTTGTGTAAATTTAAATGCGTTTCAGTTGTTGCATCGATTCGCAGCCA--AAATTCACAAGCCTA-----GTATATATTTTTGTATTGTCACATACATTGTATTACGTTAAAATCAATACATTTTGAAAATAAATGT------ATAGGCTGATTTGTCTGTTCTTATCGTAATATGTAATAT------GTATTCTGTATTGTATATGAGCAACAATAAAAATTATATTCTAGTTAAAGTAA
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TCTTGACATTCCAGTCTCGTTTTAGGCTAAGTATTTGTACTTTGAGATT----ATAGTTTAAGCGTAACTAATCTGTATTTGCCAACTTTTCTAGGAGCTTATATTAAAATATAAATGCATTTTTAATCTGTCGA
TTTCAAAATTACAAACTAGCAGTAAGTTAAAT-----TATGCCAAACTTCCGCACATTCTAAGATTAAATAAACT-TATTTA-AAACTTTTCAA------------CAGATGTAGAGACTATATTTATC-----A
>CG8290 7492984 7493638|6940 chr2R 7493063 7494365 scaffold_51 514788 516135 - 20501|0 664
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AAAATTCAGAACACGCCCATAAACAAACATCATCATACTTAGTCATAAAAGTAATGCATAGAGTATATTGATA--TTAAATAATATCGTTTATTTTATTTTTTTTTAATTGTAAAAAATAAATACTTGGCGCAATGAGATTGTTAATAAATAATTCACATTTAATACGGATAAACAAAAGTCACGAACCCAGTTGCAATCATATAAAGTGGAGTATTGGGGAGTTGAAATTATGCAACTAGTGCATATTTTCGGTCTTTTTGTGCGTTTGCTTAAACAGATTGTAGTAGATATAACTATGTGA---AAATTGAACAAG----------------TCTGTGCGTTTGTTAAATAATATTTCAA--ATAGTATTA-------ATAGCACCCAAAAAAGGTGTGCAAGAATATCGGCC------CTTATACATTATTTTGAATTTTTTTCTTTTAAACTAAAATATGAAAATTCACTTAAATACCACAAATAATCTCAGGAACAAAAAAGTTTTATATAGCTACGCGTTATATAAGGTGTGTGCAAAACTGTTTGTCGGAGTATTCAATGCAAGAAATCATATTAGAAATGTAATGTAAACTCTAGATATGGAAGGAGGCCAACATTTTCGAGGCATATTCACAGCTCTTGTGCTTTAACAATT----
>CG8298 7507190 7507348|6950 chr2R 7504876 7507380 scaffold_16 1804360 1807136 - 88120|2540 2777
TGGCTGATGTAGGGAAGAACGGCTGCTCT---------------------------------------ATCTAGTCA-ACCAAACAC--------GTTCAAATGTGTGCAT-TAAAATTTATTGTTTAGTTTAGC-----------ATATAATCTTAAATAGTTCATTTTATAT-GTATATAT------------------AATCAAAGTTGTAGATCAAAATGTTTGTGATTCACGT
-----GATGTAGCGTAATAAGCATGCTTTTAGGCGCTGTCGCCAGAATTCTGCGCCCAATTTTCTGAAATCTAGTCACAACAAATATGTATGTAGGTTCAA--GTGCGCATCCAAAATTTATTGTTGAATTTAGCCAGTAATTTGTAATTAATTTTTCATATTTCCTTCCTTATAGTATATTTTCTACTATTTTTTTTTTGAAT--AATTTGTAGATCAAAAGTTTTGTGATTGGTAT
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A-------------------------GAAGAATGCGGCTACTTGTTAGTTTAAT----GTTAGTCTAGGC-CCTAAGTTAACTAAATATTTAAGAAGTAGATGGGTACTACGA------TTAGAAC------------ACACACACAAAACAA
>CG17509 7548889 7549603|6997 chr2R 7549260 7549721 scaffold_16 1862439 1862854 - 8440|0 397
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ATTATTTTTAGATACATAATACAAATTTATCGAATAAAAACTAAATAAAAGAAGTTAGAATGCGAATTAGTTAAAAAGTATGCCCCGACGTAAAGTAA------------CAAAGCCTTATTAAGAAATTAATATTAACTTTTCTATGAACGCAGTTAAAATTTAGTTAATATAAAATGCGTGATTAATCATAATATACTTTATTAAACATAAAAACATACATATTCATAAAATACAGAAA--ATGCATTCAAAATGTATTGAAACAATTGAAGAACATTGTTGTAAGCGTA-----TTGAAATAACATT---AATATTTGGAGAAAATGAAAAAA------AAAAAACAAAAATTGTACATTTAACTATTATTACTGTTTTTCAAATACAAATA---
>CG8321 7551786 7552167|6999 chr2R 7551392 7554523 scaffold_16 1864427 1867630 - 90520|402 925
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GTTGCAGTTACACAGAGAATTTCCTT------GAGTCAACTATGGCAGCAGTATTAGCATATA-ACTCACCCTTCCCACAAATTAGGGATTTATTTATTTTTTTTTTATATATATATTTATATATTTGTAACTGTGCAATGCTCCTAAAGCAAAATCGAACAGCGTTGTATTTAAATACGAATTTTGTAGAAGCTAAAGAAGCTAAACGGGCAACTTAAAGGCGCGTTTGAATCTGTCAACTTAACAGCTAAGTAAATAAATTAAATTAAATGAATTATATTATGCTAATAATATTTATATGCGCAACAGTGTAAAACCCATGTGAGAGTACAAAATGAAAAATGTGTAAAAGCAAATTCTGTTTATAGATACTAAGCAGATTAAATAGTT---ACTAGTA---------CTAACTAAAACTTAATTTGAATTGTTTTGCCATTCAAAAACTCTAATGTAAGACTTAAAATGTGTATTATAAGAACTAACTAAGAACTACTAGTAGAATGTTGCATTAATATAT
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ACTCTGT----GCAACGATA-ACACTTTGATTACT-----TGATGGCATTTTTTATTCGAAAATAAAAAACGAATGTGCTTTAT
GGCCTGTTAATACATAGATATATTCTTTGGATTTTAATTGTGTTTGCATTTTTT----TGAAATAAAACGCGAAT---------
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CGA
TAA
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CTGCCCATTCTGGGCAGCCTTAGATGAAGCCTGGCCGCCAATGAGTAGCCAAACTAAG-GCACAATTT--TATCAAACGTTGTTTCACGTAAACGAACCGAAA--ATCAGTCCTGCAACATTGGGTTAACATACA-CGTATTTGTAGCATATAATTAGGAGCTGCGAAATGCCACAATATAAAAACGAAACGTAATGTAACGTAACAAAATCTTCAGAAATGCTTCATAGAATTTAAGAGCAAATGAAAGTTAACGAAATATTACACGTATTAGCATAAAATCATCG---CAAAATCGTCATAAAAAAAAGGGTCC
>Rep1 7565073 7566080|7011 chr2R 7565557 7566197 scaffold_16 1880564 1881173 - 6807|0 582
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CAAACCACAAACAGGGTTGCCATCTATCTATTTATTTGATATTCGATTATAGTAGAAAATATCTGTATATATATATATATTTAAAATAAAAACGTTTGTAAATTTATCACACAT--------AGTTTTGGTTAATAGGGAGCAACTCGTCTTTTA-AACAATGCATGTAATTTAAATCAATTTGAATTAAGAACAAATCAATATAAATTACCCAAATACAAAATATTTATTTATTAAATTTAAACGAAAATCCAAATATATGTTTTATAAATGTGCTACATCATTGTGTGTGTATGTATGTGTGTATATCTGTGCACTTTGTTTAGCAATTAACTATGAAAAGAATACAAAATGAAAAGTCATTCAAAAACAAATTGAAATGCAATTTACGATTACAATGCG-------AACTCTTTCTC----CACATTTTACAACACGAAATTACCACAAAAATCGATCGATTCGAAATTGGTAAAACTGGCAAATAA---GATAAATGTACGAAAACTTTTTGCATTGTCAGTGAGTTTACGAATAAA
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TTTTGTGTGTGTAATATTGCTGG----TATTGTTGACTGAC-------GTACTGACATCACACTTTGACAGCTCCTTTCAAAAGTTAAATGCTTAAATCGACCAGAATAATTAACCCAATACAATGCTGCCACATTAGCAGCCACACGAT
TTTAATTTATATTTCATTGTTGGCCATTGTTATTACCTGACAGGTGCCGTCCTGTCGTCGCCGTTTGACAGCT-----------TAAAACGCTAAATTCAAGCCAGATAATTAACACA--------------------------CCCAAT
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TCGGATC-----------------CTGCCGCTGAACCAACCCACACAACCAACACGGACGAACTTTTCCTTTGCTAACTTTAACTGGAGACAGCGTATTACAAGCGAGACACAAATCAAGGAGAGTA---ATTGATTATAC-------------------ATACATGTTGTTGCCATAAGTCT-----------GTAGCGCAGGCAGC-----------AGCGCGATGGGGAGGGA----GCATGCCCTTAACTTTTATAT--TTGTAATTGTACATTTTCGACCTTT-----------GATTATGTTTTACCCCGCACCAAGCCCGCACACCACACCCACACAACG
TGTGTCTGGGACACAATGCACTGACTGCCTCGCAACCCGCCATCCCACCCACC----ACCATCACCACCACCACCAGCTCCCA--AGACACAGCGACGAACTACAAATATGTATATCTGGACGAACAAGCAGTAATTATCCCCCCTCCCCCTCCCCTTAACTATAATTTGTTGCCATAAGTTTCCAGCATTTTGGCAGCTAAGGCAGTTGTTGATTTTAATTGGCATGCAAACAGACAACACAATTCTTTAATATTTATATACTTGTGAATTTCTATTTCCAATTTGTCTTTTTTGAAATATTTTGTTCTATTGTTTTACAA----CAACACTTCGCACACGAAATG
>CG8378 7658748 7659236|7115 chr2R 7659058 7660548 scaffold_16 2020757 2022241 - 39737|0 220
CCAGCACACCCACCACACATTTCACAACAATTCGAAA------GTTCAAAATTCTAAAGTTTATT--TATTTTTTGATCACAACAATGTCTTCGA---TGAAAACAAACAAACAA------AGGATTATTATGCAACC---TACGTCGTTTTTATAATTATT--TTACA---------------AAAACCAACTGAAGCAGAA-----ATAAAATATTTTC
CCAGCGGCTCGGCCGCAATTACAAAGAAAATTTAGAAAACTAGGTCTCAAGCTCAAAATTTTTGTAATGTTGTTGGATCAC--CAATGTCTTCGAAACTGCAAAAAGAAAAACACTTTTTTGTAATTATTTTACAAACAAATACAATATTTTT-TAATTATGCATTACATGCTTGCGCTCATTTCACGCTAAATGGCGCTCAATCAGTATGCCACATTCTT
>CG12367 7668313 7668661|7121 chr2R 7668311 7668612 scaffold_5 561517 561839 - 3203|2 336
GATACGATACTTAAGACTAGTTTATTTTTAACCAAATTTCTAACACACTATATTTTGACCAAGGAATA----------GATTCCTATGTACTCTGTGTGCATTATAAATTTCCAAATAATTTTATTAACAA--------TAATGAATTCCAGACAAACCGAAGATCGATATATAAACTGTAGTCATTATATCTAGGATATAGATTAACTGACAT--CAACTAAGCTTAAATTAAACG-GTTGTATTTCGATTAAAATCCATATTTAAATG--------------TGCCAAGTGTAAGAACTGCAAGCTAATATTGTAATAATCTTGTTAGAATCT
AATACAATA---------AAATTAGTTTTTACTGAGGTGGAAATGTGCAACTCTTTGTCTAAATCATATTGATTGACCAGTCATAATGTATTCCATATATATTGCAGATCTAGATTCTGATTTATCTACAAATTGAAACTAATATATTTTAAA-AATCCATAATTTAAAATGTAAAATATAA--ATGAGTACTTGCACCTAGTTCCATTGACATTGCATTTAAATATAAATAAAACACGCAGCATTT--ATCAAAAGCTGTAGTTGAACGCGAAACGCGGCGTATGCGTAATGTAAGAACTGCACGCTGTTATCGCAACAATTTAGCGATAAGCT
>CG8407 7669978 7670133|7124 chr2R 7669734 7680157 scaffold_4 777149 787696 + 521478|313 481
ATGCGGGTCAGCAGTGACACTA-------ACGTACCTAGAAACCGGAACTGGAACCAAAACCGAACCAAACAAAAATTTAGCATTAATTTTA-GTCATACACACAGAACACTCACCGTAGT---TAACGAATGTTATGAATATTAAGCCGCGC--GGAGGCGGCGGAAA
AGCGGCGCCAACGAACAAACAGCTAACAGACGTACCTAGAAACCGAAAACGAAACTAAAA--GAATATATAAAAATTTTTGTATTACCTATACAACATATATATATATATATCTATATAGCATGTAGTTAATGTTATG--TATTAAGTTGCGCCATGTAAAAAGAGAAA
>SmD3 7685769 7685916|7129 chr2R 7685620 7686436 scaffold_4 792202 792944 + 23442|152 304
GAACTGCCTACTGAACAACGCATTTCTATTCTCTAAGTTGCGGGCATCATATTATTAGCGGGCGGGTCGAACTTCTCCAGATGTT-----TTTTGTAAAGTATTTATCGGGCAGAGCAGCCGAGAATACACTTGAAACTTGAATTTGAAAGAG
GAGGCAACAACGGGAGGAGCACATTCTACTATATAATTTAAGGGAATT-TAATCTTAGCGGGCGGGTCGCAAAACT-AACATGTTGAAAATCTTAT----TATTTGTCAAGAAAACCAGACG-GAGTATA--TGAAAATTGAATTTCAAA-AT
>Cct5 7693224 7693441|7136 chr2R 7691596 7693459 scaffold_4 798184 800051 + 110200|1632 1881
CGACCG-----CCCAGCAGCAGCATCATACATCAGATCTAGTTTCAGATTCACATCCCCAC-----------------------GCTTCGCTATC---TCTTCACGAACAACACCCGCGTCAAGCCTCATCTCTATGTACATCTGTATTAATTGTTTAATTTTATTAATCCACA-AGTTCTTTGGAAAAGAAGAAAATTACATTAAACAAGGGGCTATCCCTGTTCAAATACACTAAAACGAAACTAAGA
AGGATGTCATCCCAAACACACACATCAGAACTCACACGCATATATACACACACACACACACACACACACACACCACTTAGCTTTGCTTTGCTCTCGCTGCTTCATAAACATAATATAAAT--ATATATATATTTGTATAACTCTGTATTAATTGTTTACTTTTATTAATCAACACACTTCTTTGGAAAAGAAACAAA-------AATCAAGAA-------CAACTAAAATACAAT------TAACTAAAG
>CG13176 7698108 7698286|7141 chr2R 7696604 7698164 scaffold_1 625047 626675 - 50082|1606 1667
TGAATATTTAGCTTTAG-----TACCGGTTTAAGTGCCTTGGCTGGCTTAAAGCACTAGCAA
T-AATAAATCGAATTAGAATTAAATTAGTTCCAGCTATGTGCCTTGCTTTAAGCATTAGTAA
>CG13176 7698108 7698286|7142 chr2R 7698253 7698486 scaffold_18 2137724 2137986 + 1349|0 35
AACCAGTTGAATAAAACTACATATTAG--CAGAAAT
AACATTTTAATTTGAAATATTTATTTATCCAAAAAA
>CG13175 7699129 7699484|7143 chr2R 7698700 7699514 scaffold_1 626832 627672 - 21452|430 825
CCTTATAGCACCATGTCCAAGGTGGGAGTTGTGCAGTTGCAGAGGCGTCTGGATGGCTTACTGGCCTTCCTCAATCCGCACTGGGATTTTGTCAATTGCCACATGGTGAACTACTTGACGGACCAGCACTGGGACGGCTTTTTATCCGAAACGCTGAAAAGTGAGATCGCCGGCAAGGAAGATGTGGCTCTGGCCATAGAAGACCTATTTTGGAAAACTGATGAATCAGAAAGGTTTCCGGCATGGCGAGAATTCCTAGGCAAGAGCAAACAAGAACGCCTGTC-----------------------GCTTCAGAGGGTCAGGGGAACTCC-----------------ACGCAGCTAAGCATTCGGGAGTTTATGAGCGCCAAAAAGTGCCATGAG
AA--GCAACAACATGAGTTATCTGGGCG------ATTTACACCAGCGCCTCGATGAGGTCTTGTCATTTTTAGAACCGTACTGGAATTTTGCAAATTGCCACATGGTCAACTACATAGTTGACAATCATTGGCTGCACATGATGCCCCAGTCGCTAAGAGCTGAGCTAAAATCTGTTGATCATGTCAAACAAGCCATACACACATTTCTTTCGCAAACAAAT---TCGCCGCAGTTTCCAGCACTGGCTCAATTTTCAGAAACATGCAAGCATCAGCGATTGGCCAGTTGCCCGCAACTATTAACCAGTGTGGAACAACTGGGGCAACTGCTGCCCGCCACAATGGAGAAACATTTGATCATTAAAGAATTTATGAGCGCTAAAAAGTGCCATGAG
>CG13175 7699546 7699737|7144 chr2R 7699530 7701190 scaffold_1 627846 629615 - 62086|16 219
GTGGATCTAACAGCCGTTCTCGTGGACCAGCTTGTGAAGAACTCCGGTCAAGAT------------TGCTTCATTGTAGACGCGGGCGATGGCAAAGGGTATTTATCCTCGCGCTTGGCGCTCCAGTATGGTCACCGCGTGCTCGGCATCGATGCGAACGCGGCAAACACCGAGAACGCATTGAATAGGAATCGCAAATTGCAG
GTGGATCAGACGGCGGCATTGGTGAATCAACTGGTGCGAAGCACAACTCCAGAGGCAAGCGCCACATGCTACATTGTGGATGCTGGCGATGGAAAAGGATATCTCTCATCGAGATTGGCGCTACAGTACGGACATTACGTGCTTGGTGTTGATGCCAAAAAGTCAAATACTGAAAGTGCCCTTGCACGCAATCGCAAGCTGGAG
>CG13175 7700300 7701413|7144 chr2R 7699530 7701190 scaffold_1 627846 629615 - 62086|882 1773
CGCGCTTGGAATGGCCTTACGGAACGAGCGGAGCTGCAAGTCCAGGGAATCACGCCCAAGAGACGTGGTAAAAAGTCGCCAGCCAGGGAGAGCACCAAGAGTGCGCCTGCCTTGGAAAACTACAAGACAACGGCAAAGTTTATAACCACCGAACTTAACTTTGGTGCCCTGCTGGCGGAGAATTTCACTCAGT-TTAGACCGGAAGACAGTCCAAACATTTGCCTTACTGGATTGCATACCTGTGGCAACCTGGCCGCCACCTGTCTTCAGGTTTTCCACGCCCAAACGGACTGCCGGTTGCTTTGTAATGTTGGCTGCTGCTATCATTTGCTGCGGGAGCGCTATTCGCAGCAGGAGTTCTTTGGCAATAAGTCCCTGATGGAGCTGCAAACAGACTATGGATTCCCATTGAGTCAGTACCTGCGGGAGCGACAAGTGCGAATGGGTCGCAATGCGCGGATGCTGGCGGCCCAGTCAATTGAACGCACCTTGGACACCAAGGAGCTGCCTAATGTAACGCTCTACTATCGAGCTCTCTTGGAGATTCTGGTTTGCCGCCATGCGCCGGAGCTGAAAAACGAACTGCAGGTGGGCAAGGTACGGAAATTCGAGAGTTTCGAGGAGTACATTCAAAAGTGTGCCACCAAATTGGATGCTCCCTGGTTGGCAGCTGTTGAGAAAGAAGAACTTCAATCCCTGCTCCAGGAATATGCCGTGCATAAATACTTCTTGGATCTGTTCTATCTGCTGCGCATGTCCTTTGCTCCGGTGCTGGAGAGTCTAATTCTCCTGGATCGCCTGCTCTACCTCAAGGAACTTGGCTATGAACGCAGCTATCTGATAGATTTATTTGATCCCGTCATTTCGCCCAGGCATTTTGCAATTGTTTCT
CGCGCCTGGAATGGCCTAACGGAACGCGCCGAGCTACAAAGCCAAGGCATAAGACCATCAAGACGCGGCAAAAAATCGGCCACAAAGGAAACACCAGTAAACAGACCAGTTCAGAACAAATACAAAACCACGTCAAGATTCATTACCACAGAATTGAATCTGTGTGATTTAGTAAAAGAGCATTTTGAGCAGGAGCCGAATGTAACTAAGCCCAGA-ATATGCCTAACGGGTCTACACACCTGTGGCAATCTGGCTGCGACCTGTTTACAGGTCTTTCATGCCCAGGACAACTGTCGCGTGCTGTGTAATGTTGGCTGCTGCTATCATTTATTGCGCGAACGCTATTCGCAGCAGGAATCCTATGAAAACAAGGCATTGATGGAGGAGTCAACTGATTATGGATTTCCCTTGAGTCGTTATTTACAGCAGCGTAGTGTATGCTTGGGACGCAATGCGCGTATGCTGGCTGCTCAGTCCATTGAACGCACCTTATCGTCCAAGGAGCTACCGAACATAACGCTCTACTATCGCGCACTGCTCGAGATTTTGATATGCCGCCGTGCACCGCACTTGAAGAATAAATTAAAGGTGGGCAAAGTGCACAAATTCAATAATTTCTTTGAATATGTGAAAATATGCGCGAAGAAGCTAAATGAGCCCTGGCTGGCAGCTGTAGGCGAAGCAGAACTAGAGGCATTGCTGCAGCAGCACGATGTAGATTGGCATTATCTGTCCCTATTCTATCTGCTGCGCATGTCCTTTGCGCCGGTGCTGGAAAGCGTGATACTTCTAGATCGCTTGCTGTACCTCAAAGAGCTGGGCTATGAGCACAGTTTTTTGATTGATCTATTCGATGCGGTTATATCACCAAGACACTATGCAATAGTTGCT
>CG13175 7700300 7701413|7145 chr2R 7701191 7703677 scaffold_1 640577 643182 - 43468|0 242
ATAAAGCAGCAAACGCAACAATAATGAAATTCACAAATGCATCAAAAGCTTGACGAGAAAGCCGGTTGTGTTTAATTATTTATAGATTATAGCGTGCAATA----------CTTTTCATATCGTATATGTAT-TGCGTTAACGCTTTTAAAAATCTA---ACTAAACCATAGCACACAAAAAGTAAATAAGGTT-----GTTAAAACTAAGAATCATTATA-ATAAATGTAATCATGACTTGT
AGAAGGCGATAAAGACAACATTGGAGATACCTCCAAGTTGCTAGGAAAA--GACAAGAAAGTCGTAGGAGTCTGAACAGACGTAGAGGGCAAT-TGCAAAAGTTGAGGCTTCTTTCCCACCTGTGTATGTATACATATTCTCGAGTTGAATAAACTATATGTTTCATAATATCATTCCTTAATTAATTTAATTTTCTCCGTTAAGTCTAAGAAAAAACATCCACACCTGTAGTCGAAATTAAA
>CG8447 7701215 7701413|7145 chr2R 7701191 7703677 scaffold_1 640577 643182 - 43468|24 242
TGAAATTCACAAATGCATCAAAAGCTTGACGAGAAAGCCGGTTGTGTTTAATTATTTATAGATTATAGCGTGCAATA----------CTTTTCATATCGTATATGTAT-TGCGTTAACGCTTTTAAAAATCTA---ACTAAACCATAGCACACAAAAAGTAAATAAGGTT-----GTTAAAACTAAGAATCATTATA-ATAAATGTAATCATGACTTGT
AGATACCTCCAAGTTGCTAGGAAAA--GACAAGAAAGTCGTAGGAGTCTGAACAGACGTAGAGGGCAAT-TGCAAAAGTTGAGGCTTCTTTCCCACCTGTGTATGTATACATATTCTCGAGTTGAATAAACTATATGTTTCATAATATCATTCCTTAATTAATTTAATTTTCTCCGTTAAGTCTAAGAAAAAACATCCACACCTGTAGTCGAAATTAAA
>Cyp6g1 7704045 7704336|7147 chr2R 7704068 7704460 scaffold_16 810768 811172 - -2920|0 297
ATCTGTATGGATACACA-----TATGG--------ATACATATATGTACATATATGGAATAAGTGATTAGTTGATGGGGCAATCGCCTTC-TGACAGCTG--------------GCATTTGCCTGACTTATGATGCAGATTATATAATGATAATCCGTGTGTTAGAAGCGGCGCCTAGAGTCTACTAAATAAAAACAAAATCATTATCAAATTACATTTAATCTGCGTGCTGAGCAGCTAGCAGCTACTCAATTGCGCCACCAATAAATAAATGCAATAAAT-GCTATCTTTACGATT
TTC-GGATGGTTACATATCATTTATGAGATTTTTTAGAAATGGTTGAATTTAAAGGGAACAAATTGTTA-TTAAAATAAAAATTGTATCCGTAACAATTATTCGAGCTTACGTCGTATTTTCATAAA-CATAATTTTTATTGTATATACACAATTTATTTGTTATTA-CAGAGCC---AGTGGGCTTGGCATATCTAAAGT--TCACTCA--TGCACTGAATGTGAATGGTGGGATGC--GTAAATATTTAATTGTTAAGCTTTCAAAGCTGTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTCCCCT
>DebA 7715300 7715382|7154 chr2R 7714913 7716716 scaffold_1 657193 658991 - 59296|419 516
AGTTAC--------TTTTTTTTGTTTTATTCAAAAAGAATAATTGCTACAAATATTATCG------CCCGAATGGTAGTTGTCCGCTCT-AGTACTTC
ATTTACAGTTTGTTTTTTTTTTGTTTTATTCAAAAAGAATAATAGCTACAAATATTGTTTTTTTTTCCATAGTGG--GTTGTCCTCACTTAAAACTTC
>CG13168 7771515 7771599|7228 chr2R 7771160 7771543 scaffold_1 727984 728369 - 9986|362 390
TGTCCCAAACCGGATCTCTGTATATTTCT
CA-CATAAATGACATATGTACATGTTTCT
>CG13167 7774459 7774609|7231 chr2R 7774474 7774880 scaffold_11 1810345 1810804 - 688|0 147
AATCCAAAATC---TAAAGTTGTCCAAAAATTCTTAATTATTTTTA-----ATATGGTGTGCA----AATAGAAGATTTATTTTAGGTGATCACTTCGAAAAAGTATAGCAATTTCAGTCGAAAATCGAAAAATATATGGAAAAATTT
AATTCATAATCAACCAATGGAATACAACAGGTTGTAACCATTGTTATAGACATCTGTTTTGCATAAGAATATAAGATTTACTTTAAACGATCGCTTAGAAACA----AGAAATGTGAA-CGATTATCAGAAACTAGAAAGTAATCGTT
>Cam 7789702 7790532|7252 chr2R 7789233 7790888 scaffold_1 749025 750572 - 43615|494 1401
AGCGTTAAATTATTTCTTTTTAAGCCTTTCTATTTTTTTAAGATGTTGACGAAGACTGTAGCTGTGCGCAATAACATCGCGCCACGCTGTTGCTATGGACCCCAGTAAAAGATCTTAAAAAAAAAACAACAAAAAAAAACAACAACAAACAACAAAGAGTTAAGCAAAAAACA----ACCAACATAAAGGAGA---ATAAGAAGCAAAAAACCATTTAAGAAACTTTAAAACAAA----TAAAAAACTTACAC--------------ATCTAAA----AAAATGCAAAAGCAA-----ATGAAAATTTAAACAAGCGAAAA---TGAAACAACCGAATTGAATTCAAAGGTAAAGAATTTCATTAAACTGAGCGAGATGTTGAACGAGAGGGAAAACAACA----TAATTTTAATGCAACAA--------------CAAACAACAACCAAGCAGC-ATACTTAATGAAGTCACCGTTTAAAACCACAAACCAACTACAACTACAACAAGAACAACCAGCAGCAACAAACAAGAGTCGCATGTTATCGTTTCGAGCAACAAGAACAACAAGTCTATCACTACACTTA----------------AACAAAATGAGGAGCGAGAAGAAGACGAGCAAGCAGAGGGAGAAGCAAGAAGCAGCAGC-----AGCATCCACCAGTATTGCCGAAAGATGGCGCCCATGGCGCACTAAGGTCAGCGCGCCACCTGGCGACGGCGGCTCGCACCGGCTGCATTTTGTTTGACAGTTTTCCACTAAGAAGTAAAAAAAAAGAAAATAATGAAAACCCCCCACTCTGTAAGCTAGCAAATTGTGTTTAAAGTATAATGAAAAAATTGTCGATTTCGTTGCGAGAAAGAATAAAAATAAAAGCTAAACAAACAACAAAT
AGCGTTAAATTATTTCTTTTTAAGCCTTTCTATTTTTTTAAGATGTTGACGAAGACTGTAGCTGTGCGCAATAACATCGCGCCGCGCTGTTGCTATGGACCCCAGTAAAAGATCTTAAAA--------------------------AAACAACAAAGAGTTAAGCAAAAAACAAAACAACAACAAGAAGAAGAAACATAAAAAACAAACCAACATTTAAGAAACTTATAAAAAAAAATGAAAAGAACTTACACTTAAACGAAGCATAAACTAAAAAAGAAAAGAGAAAAGCAAAAAGCAAGAAAATTTAAACAAGCAAAAAATGAGAAAAAACCCAGAAAAATT---ACATGAAAAATTATATAAA----------ATACAAAACAAAACAAAACAAAACACACTTAATTTTAATGCAAAAAGCGAAAAAGAAAAGAAACCAACAACAAAACAGCAAAACTTAAAGAAGTCACCGTTTAAA-------------------------------------CAACAACAAAAA------GCATGTTATAAGT-----AAACAACAACAAAAATTAAACTACTACACTTAACTACAGGCATACCACACTAAAACGAACAACACGACAACAAC-AACAAACAAACAACAAACAAACAAACAACAATCAGAGAACTTTGAGCA--AATGCCAAGGCAAAGCGCGCAGCGCCCTCTAGCGGGAGAGCAGCGCCAGCTGGCGGCG------AACATTTGAACTGTGT----------------------------AAAACTAAAT-----------------------------------TGTTTCAAGTATAA-ACACAATTTGTCGAATTTGTTGC----AAAAATAAAAA-AAATGTTTAACAAA-AACAAAT
>CG17739 7826147 7826319|7287 chr2R 7823244 7826176 scaffold_1 793600 796535 - 135822|2948 3006
--------------------------ACATACCATTAACT---GCTACAAGTATTAGTT
GGAGGCGAGAATATCCCTCTGATAATACTTATCAATTACTCTAGCTTCAAGTATTAGCT
>garz 7848284 7848377|7297 chr2R 7842998 7850054 scaffold_1 989368 996764 + 262808|5606 5704
ATAGTTTTATATTTCCTTTTATCTTTCCACTCCCCCGTTTATGTCTTTATATTTTTA--TACAAACTAAACAATAAATGT---GCTCCATATTGATTGC
ATGAAATGTTATTTAGTTTGTGCCTTTAAATTGATGTTATTGTTCCTAATCTATTTAGTTATCAATTAATT--TAAATCTCTAACTGCTCGTT--TTGC
>garz 7849404 7849729|7297 chr2R 7842998 7850054 scaffold_1 989368 996764 + 262808|6762 7179
AGAGGAGCATTGAAAGTTCATTTCAA--------TTTCAATC---AAACCACCTGACCGTCTTAATTTGTACCCCGTATAAAATTGTGTCAATTTG-------------TTTTTGTTATTTATGCCTCCCCCCAACTAAAGTAGAACT------------------ACATTCCGC-------CATGG------------CGTGTGTTTAT------------TAAGCTATCCAGAAAAACAAACCTAAATC-----ACAGATGCGAAGTTCGGCTGAACCCCCTATAA--GCTTTAGTAATGC-AAATAGTTTAATTAAT---------ATTAATTAAATAATTATATCTTCTGTATGTTATGCAAAGAGGCAAACTGTAAATAATCAAAATTAAAAGTCTATAA--AACAAATCAAA
GCAGCCAAAGTGAAGATAGCTTTTAAAGCTCTTGTTTCAGATGGAAAATCCCATATTTGTTTTCAGTCATTTTAGGCGTTTTATTTTGTGTATTTTTTGAAAAGAAAACTTGCAGTTATATAAAACTTCTTGTAATACAATTATTATTATTATTTTTTTTTTTTACACATTCCGCGGGTGTACATGGTTGATTTCTAAATGTGAGTTCATCGTAAGAGTATCTAACAGTTTCACTAATTCGAACGCAATTCGACGTACATATGCAAAAT--GATAAAGCTTTATGCCACTGTTTTAATTACGAGGAATAGTTTTTATAATAATTAGAGAAATATTTATATGAATATATCGTATTTATGTTATGCAAAACGGC-AATTGTAAAT-ATCAAAACCCTAAATATACAACTATTAATGCATA
>CG8490 7852029 7852112|7300 chr2R 7851742 7852464 scaffold_1 823507 824198 - 14177|348 431
AATTATTATGTTTTAGGAGTAAATAAACATTAAATAAAATAAAAGATTTCGGAGCTGCTTTGGTAGCCCGACACACTCAGGTTC
ACAAATTTTATTGTAAGCGTAAAGGAAAATTAGTTGAGCGTAAAAA--------------------------------------
>CG8493 7855161 7855452|7304 chr2R 7854035 7855517 scaffold_1 826271 827970 - 32121|1273 1687
AGGCTAGCGAGGATTGCCCTGCCGAACCGCCCACAG--CCGAGTAGTTTTT------AAGTGACCAA-----------ATTACGAATGTAACTCG-------TTGCCGAAGA------ATGAGAG-----GAGCATCGGAATTACAT-----------------------------------------------------------ATGTGAATACGATATCCATGATATCGCTAGTTGTAGTGGGTTTAGTTTT--CCTTGCCGAATGAAAATGTTTAAAAAA-----CAAAAGCAAACTAAAAGCAATTG-AGGCGGTGAGTCGGCATATTTTTAAGGTTGGTCTTTCAAAATAAAGATTTGTTTAGCCA---CAAAACGCGT----------TGGCTTCGA------ATTCA
A--CTATTAAA---TACTTTGTTATAATGTTTGTAGCTCTAAGTGATCTTTCATAAAACGTTACTAATTGTAAAATGCACTGTGAATACGATTCAACCGTATACGCTTAAAACAACTTGTGAGAGTGAAAGAGCGGGTGAGTGACGTTCCGTGCGACCCAAGCCTTATGTGGTGGATGGCAAACGTTGAACGCAAGCTGATCCTCCATGCGAATGCGATATTTATTATAATAATAATTTGTATAATTTAATGTTTACTCTGGCCCAGTGCTTGGCACTAGAAAAAGAGCCAAAACCGATCCCAGCACATTTGAAAGAAGTGCGAC-TCATGTATTTTTAGTTGGATTTC--GAATAAATATTTGTTTATCCAAGCCAAAGCACTCATATTTATCATCGCTCCAAGGGGACAAACG
>CG30043 7878692 7879072|7317 chr2R 7875535 7878723 scaffold_4 2417405 2420462 + 28899|3323 3360
GCATTAAAT------AGCAGTAGGTATCCATTTACAAT
TTATTGAAGTTGCGAAAGAGAAACCTTCAATTTACAAT
>CG30043 7878692 7879072|7318 chr2R 7878724 7878927 scaffold_4 2415084 2415289 + -1174|0 213
CGTACAAGATACTCCATCCATCACCTCCGAAA-AGAGAACAATTGGATGAAAATTGTTAAATATTTCGGATAAGAGAATGTTATGTTATATTAATGAGTTTGAGAATCCCATGAACGCAGAGAA----TCCCATAATCGCAG-----AGAATCCCACAAACGCAGAGAATCCCACTAACGCAGAGAATCCCATAAACTTAAAAAAATGTATTTA
A--AAGAAATACTTCACGAAGAAACAAGAAAATATATATAAGCCAGAAGGACAGACATGTATATTACTGGGCAGAAAGC-TTGCCTTGCGTGA---AATTTGGTGTTATTTGCAGCGCAGGGAAATCTTCCCATGTTTTTGGTATACAAAAACGTACAGGCATATATAGACACACAAACACATGCA--TACGTACAATCAAACAAAATAATTTA
>CG30043 7878692 7879072|7319 chr2R 7878928 7879126 scaffold_4 2401740 2401915 + -821|0 144
TCTTTAAGCGGTTGGAAGTTTTTCCTACCGAAGCCTTAAAACTTTCATGACCCTATTACATTGCGGAAAAAGAGTAAGCTTTAAATTTTGTAGACCACATGTATTAAAATGCCATTGACCGTATGATAATAAACCCTTATCCATT
TATAAAAA----TCCAATTTTTTT------AAATCTCAAGAAAAACAGAACACCG----ATCTTCGAAGTGCTGTATTATTTAAGAAGTGTTTTACACTTATCGCAGAATCCAAGCTTCC-TATTGTGAAAAATTCATGT---TT
>CG13160 7890949 7890999|7325 chr2R 7885781 7891893 scaffold_4 2431195 2437494 + 98369|5511 5576
GATAGTTAGCTAATAAGAATA--------CCAAGTCATTGACACT-------CCCAACCCGAAAAA
AATAGTTGAAAGAAAAGTATAAATAAAATTTAAACATTTTATATTGTCTAAGCCCAACCCATCCAA
>CG13159 7891507 7891598|7325 chr2R 7885781 7891893 scaffold_4 2431195 2437494 + 98369|6240 6340
AGCCGCCCATCCGATCCACGATGCTGCC--ACTTGATACGATCCTC-ATCACCTGAATAGCCAAA-----TAAAAACACCAAAT-ACCAAAAAACAAACAA
AAGTGAGACTCTGCTCAACGCTGCCGCCCAACCCGCCACATCCAGCAATAATTTGTTTCGTTAAAATGTGAAAATATACTACTTAATTAAAAACCAAATAA
>CG8501 7900276 7900427|7330 chr2R 7898299 7901146 scaffold_4 2444883 2447490 + 2905|2125 2293
TCGGCGACACTTTTTGGGGTGTG--TTCTACCAGTTCCCGGAACTATGGAACTCTCTAAGGCCACAAATATAGTTTTAAGCAGATTAATGATTTATGTGCGACAGTTTTCAAAG---------------GTGAAACCTTGTCAATAAAGTCACTGATACCAAATAAACC
---------CTGAGTGGGATTTGAATGCTCTCAGT--CAGATTATATAGAATTA---------ACCAGTCGACTATGTAGCAGATTATTAGTATAACAGGAAAGTCTCTTTAATTAACAATAAGTATCCATAAGAACTTG--AATAAATATATAGATAATAAA------
>CG8502 7905603 7905966|7333 chr2R 7903238 7906754 scaffold_4 2450158 2453729 + 46593|2701 3094
GTGTCGAGCCTGAGCTGCCCTCATTCACAGCCATA----------TGTTCCCGCTA----CCCAAGCCCCCAAAAACAGTCCTAGTCCCAACTCCAACATCCAA------CTCCATTCCCCATGCATTTGCCGAGTGATCAACGGGCAAAACCTATAACAAGCCATCGCAATACCGAAAAAAATCCACAAAAAAAGCAAAAGGAAGGTGAAGATGTCAACATATCGAGTGGCAACCGGAGAATATTCGCAC----ATAAGTCCGATCCCATGTT---ATTTCGTATTTATTTATCTGTCGAACTGTCGAATTTGACGATGTTGCTATGCAT---AAGATAATTAATTTGTTATTATCGTATATCGAAATAAAACCTACTAAATATTTGTTATAA
----CCACATTGCTGTGTTCTCATCTAAAGCCATAGGGATTGTGTTGTGCACAACACATTCTTAAGTCCCC-----CGCCCTTAACCCC--CTGCACCATTAAAATGTCCCTCCATT-CCCATGCATTTGCC--GCCAGCAGCTGGCAAAAACTATAACAAGCCATCGAAAAACTGCAAAA-------AAAAAAAGAACAACAAACGAAAATCCATAAAAA-ATAGAATTGTACACAAAAGGATTTGGTACTCGTATAGCCACGCCCGCATATGTTAATTTTGTATTTATTTA----TCGATATATTTAAATTG-------TGTTATGAATTTAAAAACAATTATTTTTATA-TATTTTTAATAAACATAAAACAT------TATTTGTTACAA
>CG8505 7920341 7921022|7349 chr2R 7919986 7920506 scaffold_4 2465745 2466221 + 14165|369 536
GAGTGGATTACCCGCCAGATGTTGACCAACGATTCTGACCAACTTCGATTCTGATGTGTAGATGCTGCTCTGTTGCTGCAAGTTGATTGCTGCCCAACACCCCAATTCCGATCCCCAGACAATC-ACTCATAAGACACAAGCCAAGGGCTG-TAACCTTCGCCTCCTC
TAGGTAGATACCTTTTAAAGG-------------------------GATATGGAGGTGGAAATG-----------------------------ACAATATGCGAA---CGATACTCTGATACTCTACACACAATA---AAGCAATTTGCTGCTAGCCCGTATATCATC
>CG8511 7924257 7924440|7353 chr2R 7923576 7924598 scaffold_4 2470000 2471200 + 27358|793 1096
T----TTAA-----CATATGTCCA------TAGATGTCCATAGATGTCCATAGATGTCCCCTGTAATATTTCGCTTGAAAGTATTATGCACTG----------------CCTGAATGCCATACGAAAT---TGAAATGTCTACATTCCGTAGTTAGTCTTAA-----------GCAAACACACACACACACACCGAAATA------------AATATTGGAAACGATAATGAA---------------------------------------------------------------AACGACAA
TAGCGTCAACCGGGCGTATGTGTAATTAAGTAATTAGCATTAAGTATGTATGTATATCCTATATCGTAT--------AAAGTATTACGTACTGGAGATAGCACCCCACTGCCCTATGCCATACGAAACATACGATGGGTTTCCA---AGAATTCAGTCCTGACACTGACATTCACACACACACACACACACACAGCCATACACAGACACCTGAATACCCAAAAAAATAATGAAATGAAGAAGTAATAAATAAACGAATAAATATTGAACAATTAAGTTTGTGTCTCATTGCCACTTAACGAATA
>CG8520 7941159 7941371|7367 chr2R 7940070 7941224 scaffold_4 4052245 4053424 - 45414|1119 1201
---------AAACCCCTT-----GTCA---CAAAGCAGTAGTTCAATTAGCGCTATAAAAATTACATGTTTTCTACCTCGCTG
TTTACCAACATATCCCCTCCAAAGTCAATGCAAATTTTTAGTGTAATTAGT------AGAATTAAACGTTATCTTATTTTCTG
>CG8520 7941159 7941371|7368 chr2R 7941225 7941447 scaffold_23 600006 600265 + 296|0 182
ACGCGGTATTTTAAAATTCACAATATCTTGTACTTACAAATTTCATATCGAA---AATGCAA--TATTAAAATT------AGGTGTATTTCGCAAGTAT------------------TAAGACAATAAA---AAATAGACAAAGTTACCTAAGC--GATTGGCTTTATTAAAC--AGCAAGCT
GCTCCGCA-----AAAGCCGCACAAAATTATAATTTTCTTTTTCATAATGCACATAATGCGAATTGTGCAAATTGTCTGAAAATGTTTTTAGAAAGCGCAGCCAATTTTATTGTGTGTAAGCCCAAAAATGCAAACGTCAATTGCTATTTCGGCCAAATCAGCGCAATTTAACGAACCGAGCT
>CG8525 7942777 7942888|7370 chr2R 7941599 7943621 scaffold_4 2492594 2494668 + 70878|1220 1354
GAGGAGGCCAACT---GGTCGAATCCGTATTC---TGGACTTTACTC---------ACTCTAAGTGCATTTATTGTAGCTTTTTTA--------TACAACTGACTAAAACCTATAGCAAAAAAAACCGCATCTAT
AAGGTGTACATATTAGGATATAAATCGTAATCCAACAGAATTTATCCCTGTGTATAAACTTATGTAAATATATTTTTGCATTTTTGTAACCGCCTACAATTAAATAACAGTTGTCCTGGAAGCA-----ATTTAG
>Dyb 7967896 7968830|7389 chr2R 7967446 7968892 scaffold_43 877980 879685 - 22645|559 1769
CCAATGGCAGGAGCAGTTTGCACAATGGAGTCTTAATTCGCAGAAGAACTAAGAAC------TGGCTACCAGTGGAAACCGCAGG----------------------ACTGGGAATCTCCAGAGGCAGC-----TGGATGGATGAAGA-------------CGAATTCTCGCTTAGCTTTCTACCTTACCTTAACTCATACGTTGACTTAGAGCAATTTATTTATTGATTATTTTACTGAGCCGTAGCCTACACTACCTTA---ATCATTATAATTTATACTTTGAAGATTGC---TATCTACACAGAAA-ACACAGATATGTAAACGGATATATGCATCTATATG-------------ATTATTTTACTGAAGCAAAAGATATG-AATATAGCTGATAAAA------AAGACTTGCAGTTGCACTGCTCTTCGAAGTCGCAAAACCATTGAATCTCGTTGAAACTTTTACGATCGTACTGCTAAAGGGCAATAAGAGGTATGGTGTTTTAATTTTAGGTTTCCGCGATTCGTAATTGGCTTTTAGATTGTGTAAGCGCCCCCGTCAGCGGATATTTATTACCAAGAAACTTAACAA-ATGGAAAATCAAATCACGTAATGCGTA-----ATACAAATACGATATAGACATTGACATATTATGTACTTAATAACTAGCAACTTGTTGAGAAC------------CTAAAATCAAATTCTAAATGCT-----------------------------CTACATTATATATATATATACATTATACACTTTGAGATACGATAAA---------------------------GCCAACAACTATTTGAA--------------TCACATGAAAGAGA--------AGCCCA------ATGTTGAACACTAAAAC---------------------------GAAAAACTA-----------------------------AACACGATTTATAT-------ATTATCCATTTATAATATGCATTCATACAAAAAAGTTATACCATATAATCGTAACG----------GCATAGA--------GCACGA------TATAGAGAAAATCCGACATTTATAGAACTTATACATAA----CTACTGAATAAA----------ATAACAAGAAAGAGAAAATTAAATAAAAAGGCATTTTAAACAATCACAAAGAATGAAC
CCAATGGCAGGAGCAGTTTGCACAATGGAGTCTCAATTCACAAAATAACTAAAGAAAAAATATATATATAAATGGAAAATACAAACAAAAAAAAAACAAAAAAACACGCTGTGGATCCAACGTTGGAACATATATATATATATAAATATATACACTTAGTGCGGATCGGCGCTTAGCTTTTTAAA--AACTTAACACTTATGTTGATCTAGAGCAATTTATTTATTGACTACTTTA----------GTCTGTACTATCTTATAAAGCATTATAATTTATTTTGGCGGGCATACACATATATATATATATATATATATATTTATCCATAAATATATACTTCTATACGTAGATACGTACACATTGATTTGTGAACAGGAAATCTATGTAACAAAAATTGAAAAATTTTATAAGACTTGCA------------TTTGAAGTCGCAATTCTCTTGAATCTCT--------------ATCGTTATGTTTAGCTG--------GATTTCTTTTTTGAAT-----------GCGCTT--TATTGCACGTTGGAGTTGTGCAA----------------CTATTTATTAC----ATATTTAACAAGAATGAAAATCAAA-CACATAATACAAATACAAATACAAATACTATATACACATT-------TATGTACTTAGCAACTAGCGACTTGTTGAAAAAAAGAACGTAAAACTAAAATCAAATTCTAAATGCTGATTCCTTATACTTCCCCAAAGAGGACAGCAGTACAATAAATATTTAAACAA---ACACTTTGATATACGATATAATAATAACATGAAGTACGAAATCTTTAGCCAGGAACTACGTGAAATTATGAACATATATAATATGACGCGGACTTTCCAAAGTTTATACAATATTTTGGATATTGCATTTTATGTTTGAGTTTTATTTCGAGTTTTGAAAAGTTATTCGACATTAAGGTATCCAATGTTATGTCGATGCTATTTAAATTACTATTAATATCAATTTATAATATGCATTCATACAAAAATGTTATAAAATATAATCGCAATGCATACAACCAGCACAGAAAGATGAAGAACAAAGAGATGATAAACAAAATCAGACATTTATAGACATTATACATAAATAACCACTGAATAATGAAGAATATTACAAAAAAAAGGAGAAAAGTAAATAAAAATACATTTTAAACAAT--------------
>Lac 7980789 7981556|7408 chr2R 7979490 7984065 scaffold_43 894959 899681 - 125202|1408 2281
GCCAATGGGCCCACGGCC--GTCGACTCCAAGCGCTTCAGGTCCAATCCATCAACCAGCCCT-CGAATGCATA-AAACATATAT-------AAAATAGATATATCGAAAACAAACATCGTGTAACCGCGCAATAGATGTCTCAAACGATTTCGGACACACCAACCCACATCCAGTTCTCAGTTCGTTTTGTAGCTTCTGCTT-------------CCGTTTCCGTATA--GTCCAGCCCAATTTTTGTACGTCCAATATTATGTCTTAAGTTAAGTATGATAAGTGAAGGGCCAACGATAACTAGACTATAATTTATTAGCACCCTAGAGCCGAACTCAAACCGAAATTAGACTCCAGCCCAGCCGTAAACGATGCATTTCACCTTG--ATCCCGTCCGTTTTGCTTTCTGATCTGGCACTGTATATGTTTTAAATATTTT---AATCTAAGCAA-----------------------------------GATACATCACAA-----------------GCATTCCGATTTTGC----TTCGACAATTGAGAGGATATTTTATTTTTATTTAAT-AATAATAAAGTATTTTCGTTACGCAAACCTATCAGCTCGACACACTATTCCCTAAATAATATCTCAACCCCCATAATCGAGGCAAAATCCATATTCGAATAAAA--GGCAACAAA------AGTTGTGTAC---ATTATTAGCTCA--TAAGCACAATGAGAAATTCTTTTGAATAACAAGACA-----TTTTTACCCAAATTTTTGTGTGGGTGTGAGTAAAATCAATTTCGACTTTGTAACAAAAAAAAAAAAAGACAAACGAAAAACTAAAATTAACAAAAAAAAATGAATAAAAA
GCCAATCCAGCCAAATCCAGACCCACCTCGA-CGCTCCATATCTAATCCATCAATCACATTTACGAATATATATATACATATATATATCTGAAAGTATATATAGCTA----------CACATGATTAGACAACAGCTGT---AGTTGACTTTG-----ATCTGTCGCAAAGCTCTCTTTAATTTGTGTTCTTGCTTCTATGTTAAAAGTTCAAACCTGCCTGCGAATACCATTTTTCCAAGCTATTAAACGTCCAACCTTATG--TTAAGTTAAATAT--------AAGTTTCACTCAGAAATGAATCATCTTTAATT---------GGGCCTAGAACAAACCCAGA--------------------AATCGACACAATTTTTCTTGAAAACCCGTCCGTTCATTTTTTCTCTCTA----TGTATAT-TTTTAAATAATTTTAGAAGTTAATTAACTAATATACATATATATATATATTCTCAATATATGCATACATCACAACAGCGAAAAGCAATTCTCCATTCCGTTTACACACAATCACATATTTATGAGAATATTTTATTTTTATTAAATAAATAATAAAGTATTTTCGTGCTG--------------CTATATAATATG---TAATTAGCATCGTAAAAGTC-TGCTCAATTCGAGATACAAATGCGAAAAAAAGCGACAACAAACGAAATCGTTGTGCATTCAATTTTAAGCGCAATTCGACACAAAAAAAAATTAAAAAAAAAAAAAAAACAAAACTTTTGTAGCC-CATTTTCGAGCGGGTGTAAATAAAAACCATGCGACTTTTGTAATAAAAAAAAAAAAAA--AAATGAAAACGTAAAATAAAGCAAAAAA-------AAAAA
>CG8545 7987459 7987629|7409 chr2R 7984542 7988133 scaffold_51 656675 660115 - 92644|2967 3163
ACACCTTAGATCCAGTTTTGTTAAGTAGACTATAAGCGTGTGACATATAGTTGGG----------------GTAGTCCCGACGCGATTA-CCAATTTTATATTGCGAACTGTCTTAGCGAACGATTGAAGATTGAACTACA---------ACAGCGGTGTAATTAAGATTCAATAAACGTTAAGATCGGTTTAATGT
GCA---TAAATC--ATTCTAATTTCTATAGTTTAA--TTGAAATATTTTGTTGGGTGTCAAAGCTTTTTAAGCTGTACATATCCAATTATTTGTTTTTATAATAAGAACAAAATAGTTG---GATTTTAAATATATTTACAACCATCATTACAGCTGTATGTAT----TTTATTAAAGCTTAACATTAAACTGTTTT
>CG30044 8016960 8017374|7436 chr2R 8015409 8017578 scaffold_51 681397 683284 - 30457|1628 2066
GCCTAACAAG-----CAGTTCACATTAGTTGTATGGCTGCAAACCGAAACCTAAACCACAATCGTGCTTTAACTATGATTAAGATAGGTTGAGATTGGTGAATTCA----------TGTGTTATTACTGCAGAATAAGAAACTAGT-TTAGTTTTCAGTTATTTCATTGAATCTCAACCACCTAAAAAGATGGCTAGAATCTTTCTTTGATATGCTATGAAAAGCACACTTACTTTAGGTGTTTTTGAGTTAAAAAGGTTGACAAAAATATCACGCTCTCAGTACAGAGAAAATAACATT-TTAAGCAAAACGGATAACAATAATTTTAACGTTTAAATGTTTTAGAGCTAAGCCAGTGCATATCCC---TGTAAATGTTCGTGTCAAGTA--CTCGTATCAATAAAATCA--AAAATTGTAATTGAACGCAACAAGCG
AACTCAAATGTTTCTTGGCATGCATAAGTTCAAAATTTACAATACGATA--TATATCACATATGTGCTTTATTT---TTTAAGACA-GTTAAGAGCAGAGAAATCAGTCTGCGATGTGTGTTGTTCTGGCCGATGCCTTGAGTATTCTTAGTATTAGGTAATTTCCCCG-ATTTCTACCAACTA------------------TTCTTT--------------AGCAATCTTGATCTCGGGTTGCGTGATTT---------------------TTGCATTTGCCCCCAAACCATTAAGGTTCCTCTGTAACACACACAAATGTATTGTTAATGTT---AGCTGTTAGTTCTAAGC--ATGCATATCCCAGATGAAAAGGTTTGCTGCTAGCAAGTTATAAACAAAAATATCAATAAAAATGTACTTGAGCAAATTTAACT
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AGATGGATATTAA
AGATACCCTTTGA
>CG13151 8033166 8033191|7448 chr2R 8033179 8034078 scaffold_51 691684 692601 - 32818|0 12
ATAACATTTATTG
ATAACGTTTATTA
>CG8569 8037092 8037533|7453 chr2R 8037119 8037419 scaffold_1 547087 547420 - -537|0 343
TATGTCCAAAGTGATAACATCTCGTTTGTTACCATCCTTTTGTATCAAATGTATCCGTTCTTAAGATATGCATCAATATTTTCAGAAGATAAAG-AATGTTAAACTTGTATTAATGAAAAATA--TTATCAATGAGATATTTGAAAATGGCGCCTTTTCCGTTCTTATGATGGGCAGCACTGTTTCCGCTAGGTGTCGCCACCTGATCATATTAATCCATATTCATATTACGTTTATAAAAAATCAGAA------------AAAACGTACAATACTTTAA--AAGTGTGGGC-----------------------GTGGAACTT---ACTTGTACTTGTTACTA
ATTTTCTAAAGTTTTATAAAACATTTTAGCAC-ATCTTCCTG-ATGGTATGTACAGATGCCTAAGATCCACGAAAATGC------AAGTTGACGTAATCTTAACTTAATATAATTTGAATGTCACTTACCAGGGAGAATATTTTTAACAAATATATTAATATTGAAAGGGAATGCTGTGCACTTTCTTTTAGGTATTGGTATCTGAAAGGAGGAAGGCAAATGCTTATTAGTCTTATAAGAAATCAGAATTAAGACCTTCCAAAAGGTAATTGGCATTAGCCAAGTGCAAACAAAATAAATTGGATTGAAAAGAAAAAGAACTTCACACTTTTATT--TTACTA
>CG8569 8037092 8037533|7454 chr2R 8037420 8037473 scaffold_57 131282 131335 + 1860|0 53
ACAATATAAAAACTTGTTTCCTACCAAAAAATATATACATATTTTATAAGAATG
ACAAGGAAACATCTTGGATCCTAACCAAGTATATATATATATGCTATAGCCATG
>CG8569 8037092 8037533|7455 chr2R 8037474 8037676 scaffold_1 547480 547699 - 589|0 59
GGTATTATTTCGTGCCAGCTGTATTCATAATAATAAACACAAATTATTGTTCATCCACAA
TAAATAA--TAAATATAAATAAATATATAATAATATATATAAATAATAATAAAAGGTTAA
>CG30056 8078501 8078568|7505 chr2R 8078066 8080508 scaffold_4 2817680 2820097 - 54025|448 528
GACAGTCTTGGTT------TTTGTTTAGTAGCATACAAAAGTTTTGAATAAACATAAATTCTTCCATTAAAA-------TG
--CCATTTTGTTTGCTTGACTTGTCACTTTCCACATGAAAAATACAACAACTTATTGATTGATCCCTCATACCTAATCTTC
>fra 8079027 8080093|7505 chr2R 8078066 8080508 scaffold_4 2817680 2820097 - 54025|1028 2185
CACTGAAGCCGCCTTAA--TAATGTCCGGCTGGCTGAAAGTATTAGTCGTCAAACAGTGG-ATGTTACTTGTTTTTTAGTTTCTGTTTTATTTTATTGATTTAACTCGAATTTGTGAAATGCAGTGAACCGACTT--GAATTGTGTTTCCCTCCAGCGAGGTTCGTTTAGC-TTAAGTTAAACAAATGTGCGATATATTAATGACCGAAAAGAATTGTAAATACGAACGACGCCGC---CATATAAATTTTTAAGTCTAGATACACACATTCATAACAATAAATATAAATTAGGCATAGTTAATTATCCGATAAGAAGAGTGTAAAAACGGGGACAGAAAACAGAGAAATAAGAAATTAGGCGAACAGTAGCGTCTATTGTGCAGGATCGGTTCTGTCTCTAAAC---TGTCACACGACATTTCATATTTATCAATCTGCATCATCTTAATTTA---ATCCGCA---ACCGAGTGCGGATAGTCTAAGTCTACATACATATGCCATTCTATATTCATATGCAAGCAGCATCTTAGCTAAGTTTCATACTAGTAAAGACCCTAAGAACGTACTTTTAATCTATTGTAACCCAATCAAA--CAATCAAAAT----------------CATTCTATCTAGACTTGTCCCCTAAA----GTGTTCTTCTAGTTTGTTTATCCATTCATACGTATGAGTTTGATACGTGCCATTCAATGATTTGTCGCCAATCCAACAAAACTACTTAAGCTATAAAGTCAAGGTCTTGACTAAGCCAGCAAAGCATTTACGATTTAAACTAAACTATTATAAAATGGTGGCATTGCAT-TGCCTGTTTTACCGCATA-AGGTGTAATTAAA------------------CTTTTTTAAAAGATTTTGATTTGTTCAAAGTTTTTATTGCCAAGAAA-----GTTTACTGTTTTTTATGCGTT------------GTTCACCAAAA-------ACACTGTATTCAACATTGCTTTGCACAACAATCTC--ATTAAAATCAGCAAAACATTTCAAACGACGCAAATGCACACTA-AAGGCATTTACGAATTGTGAAATTTTTATTGTATTGAACG-TAAACTTTGT---AATCAAAAGAAAATTGCTAAATATATAAAGAATATGTGAAAAGAA
CACCGAAGCAGGCCAAAAGTATTTTTTAGCCGGGTCAAACAA-----CAACAAATATCGGAATGTTAATTGTTTTTTTGTCTTTAGTTGAT-------GTTTAGTTTGCATTT------CGCATT---TTGATTTCATAATTTAGTTTC-------------TAGTTAAGCTTTAAGTTACAC-------------------GAGCGATTAGAACTGTAAATACCAACGACGCCATATACATATAATTATATATACGTATATTCATATATATATACATATATATATATGCTA-GCCTAGTTAATTTT------------------------------------------------------------AAAGCGATTTGTGTGAAAGAAC-TCTCTGTCTCACAGCCAGTGGCATATTTATTCACATATTCA-CATACTATATAACCTAAACATAAAGATACATACATACAATGAACGCGTAGTTTAAGCCATCATCCA---------------------------AGCATCTAAGCCAAGTCTCAT-CTCGTATA---TCTTACAACACA---TTATTCTA--GTAACTAAATCAAAACAAAACAAAACTAAAAATACCACAAAACATTCGA-CTTGTGTAGCTTACGAAACTTTGTATCGTGCCATTTCATTTTCTGTAATTTTCCTTTTAATTTGTTATGCCTAACTTAA------GTCCCGTACATAATATGACGAATGATTCTAGACTGTAATCGAATTAGTAAAGCCAGCAAAGCATTTACATATTTAACTAAACTATACGAGTATGCATACATACTATATATATATATATATATATATATATGTAATGATATCTTTGAGAATTCCGACTCTTTTGTATCGCGTTTTGATGTGTTCAAAATTCT--ATGCCTAAAAGTGTTTGTTTTCTCTTTTTCATCTATTTATTGTCAGGCAGTTGAACGAAATTTTTCGGAAATTTTTATCATATTGCTAAGCACAATAATCTCAAATTGAATTCA--AATTTAAAGAAAAAAAACTAAATGCACAGAATAATATATTTCCAAAAATTTGTGTATGCATTTTATTTGATACCAAATTTTGTAAAAATCAAAACTAAAATATGGAACACAT------TGTATAAAA----
>Cyp301a1 8084864 8084968|7510 chr2R 8082955 8084935 scaffold_4 2825822 2827940 - 85373|2088 2159
TTTGTAGACTTTAGTATTTCGATTTTATACACTCTGTTGTAAATAATAGTCACTTTACACACAAATGTTTAA
-CTGTAGTTATTAGCTCTAAGTGTTTGTACATTAAGC-----ATATTATACCTTTTAAATATATATATTAAA
>stil 8087668 8087873|7514 chr2R 8087267 8087669 scaffold_4 2830672 2831047 - 3678|407 408
GA
AA
>stil 8087668 8087873|7515 chr2R 8087823 8088334 scaffold_4 2831067 2831552 - 654|0 50
ACTAAAGAATGGTTATATTTTGCTTTTTTCAATAAAGTATCTTTAAAGATT
ACTAAAATAACGTAATTTTTGGTATTTTCTCAAAGAGCAA---TAAATACT
>CG8594 8091072 8091215|7516 chr2R 8088415 8091087 scaffold_4 2831659 2834336 - 109453|2740 2758
CTT---TGCATTAAATGCA
TATTCATACAATATTTACA
>CG8594 8091072 8091215|7517 chr2R 8091088 8091660 scaffold_4 2835998 2836644 - 6577|0 139
CTTTTACGAAAA----TTTATCGAATGCCAA---AAGTGGGTCTAATCAATTAAATATTTTCCATTCACTTTTGATA-----AACTTTTGTTTTAATATCTGCGCAATACATTTTTACAATTTAACTTAATAACCTTAAA
TTTTTGTGAATAACTTTTCATCCAATTGCCACCCAGTTGAGCACAATTTTGTAAATGTAATGT-TTCATTTTCGATATATTTAGTTTTTGTTTTTTAATTAGCTCATATGATTTTTACAACTTAAATTAA---------G
>CG30055 8106144 8106246|7527 chr2R 8105935 8106238 scaffold_4 2853606 2853931 - 1875|256 356
CTAGCTACTGGGTGCAGCGCATGTCCGAGGTGCACCAAAGTCCCTGGAC-CAAACAAAAAAATGGCACAAACCAAACTCTCCGACTTC-----CAGGCGCC
TGCGTTAGTTAATGCAAATC-------GAGTGGAC---AGTTTTTAGACACACACACACTTATGACATGCGGCCAAAGTTCAAAGTTCACGAGCAGGCGCC
>CG30055 8106346 8106618|7528 chr2R 8106531 8107050 scaffold_25 221168 221663 + 1179|0 87
GTGATAAAAACTTTTTGTTATTTATTGTTTGTTTGTCCTAAAAAATTGACAACACAGTAAATGGAAAACTTTACTATAAAATATTTAA
GTAAAAAGAAACTTTCTTCTTTTTTTGTTT------CCAAGATATCTTGAACCAAGCTGAACTACGAGCCTTACTTAAAAATATTAAA
>Amph 8126997 8127980|7556 chr2R 8126827 8127019 scaffold_4 3841876 3842081 - 9543|173 206
A-----------GCGACAAACTGGGGAACAACTG
AAAGCTGACGCCGCGAC-GATGACGGGATAAATG
>Amph 8126997 8127980|7557 chr2R 8127024 8128133 scaffold_4 3842185 3843473 - 20657|0 1182
AGCAACGAACCATCAGCAACTTCAGATCAACCATAAAAATCTTTACGAACGGAGGTCCAAATCCAAATACAAACTTTTGGCCAAATTT-------TCTTTGTGAGCGCTGCTTTTGCTTTTGTCCAATTAATAAA-----------TTCTTGTTTTGTGAAATGTA----TTCGGTAACTGGCAATCCATTTATA---------GCGAT--------------TGTTCGTTAGGGCAGTGCTTCCAACCATAAA-----ATTGTTATTGTTAACACAAAGAAGAACGAACACACAGATGAGGAATGAG-------AGAGAGAATATTTTGAAAATGTTTC--AAACATTATTTT-TTAGTTCTAAGTTTCAAGAAAACCTAAAGCATAAAC----------------------------------------------------------------------------------CTACGTATACATATATTATTTGTTAATCCTATTATTGTGCTCATAATTAATGCGAACAAAACGTATCTAATTTGTAATTTGTTAATGGCAA-----------ACCACAAATGTAAAACATATCACTCGAGAGCTAGAGTAATTGTTAAACA-AATCAAAAGTCGGAGGAGATAGCCAGCCTGAACCTTTTGTATTTTGTGAATTTTGCAA---ATATGTAGTACGAGTTTTTTATAGTCAATTGAATGT------ATTTTTGGGGCGATGCAAAAAGGCCAGATGTAATTCCTCTGTGGTCCCCGAAGTT--TTGGAAATTGTTT--CAAGTAACAACATTAACGTTTAGCGATTACGTGTATCTTTAATTTGTACTTTGGTTTTTAATTTTT-------------------------CGTTTGAGAGACTCGAACTAGCTACAGCTTTATAACG-CGAACACAATCCAATAGTCACTAACCGATCGATTCGATGTTTTTAT--------TTTATTTAACTCGA------------------------TTGTAAATCACACGAAACCCGAAATAATTGTTTAAATTGTGCAC-ACACTGTAAAGTTATTATTTTAATTTTATTTAATTAATTTAAACACTTATTTATCGCATGAACATATTGAACAAATGATAATAATTTACAGAAAGCCAATAAAACATAGATTAAATA
AAAAAAAAACAAAAATACATTTTACACACATTTTACAAATTTCGATGAACAAACTT---------------AACTTTCGGCCAAATTTATACACAGCGCTGCGA-CGCCTCTTTTTTTTTTGTCATGTCCATAAGAACCTGTGGTTTTTTCTTTTTGTCAAATTTATTGTTTGGATTATTTTAAATTCGTGTTTGAATTCGTATGCAATAAACAGGAGTCTTGTATTTGTTAAAGCAGTGCTTCCAAACATTAACTATTATTACTATTATTATTATTATTATTGCTATTATTATTGTTGAGAAATGATTGCACACAAAATATATATTTTGAGAATGTTTCAGAAATATTATTTTCCTAGCTGTAAGCCTAAACAAAAACAAAAACAAAAACAAAACATAAACAAATCTAAAATCATAAACATCATACACATACGTATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATTATTTGTTAAATCTATTATTGTGCTCATAATTAACACGAACAAAATGTATCTAATTTGTAATCTGTTAAAATCAAAAAAGTTAAAGACGAACAATTTAACGCATATCACTCGATAA--GAAACATGTTTCAAGCATGTTTGCCAGCCGAGAGAAAGA--------TATCCTTTTGTATATTATGTATTTTGCAAAACATATGTAGTACGAGTTTTTTATAGTCAATCGAGTGTTTTGGAATGCAAGAAGCAAAGCGAAATGGGACAACAGAAGTTACCTATTTTCTTTTTTTTTTGTTGGCATTTCATTGGTAAATCGGAATA-CGGCATTAAATTGTTTTTTATTCATTTAAATTAAATACTAATTTGTAGCTGTTATTTAGTTAAAGCAACCGAGTAAAACTCTCGAAATACACAACTTAGCGCCAGCTTTATAACATTGAGAACAAGCCAATAGTCACTAACAGATCCATTCTTTTTTTTTATTATTTTTGTTTATACAAATCGAATAGATTGATATCCAGTTTGAAGCTTGTTTGCCAGCCGAAATTGCAAAAGTTTGTTTTCTTTGAAATCTGTACTGTAAAGTTATTATTTTAATATTATTTAATTAATTTAAACATTTATTTATCGCATGAACACATTGAACAAATGATAATAATTTACAGAAATCAAATAAAACATAGATTAAACA
>Galpha49B 8134771 8134887|7567 chr2R 8134264 8134938 scaffold_4 3850473 3851134 - 9300|556 672
GGCGGGCAGTGCGGATATCAGGAAAAGTGGCAATGCAAATGAATTATTTATTTATAATGTATATGATTTGTTTTTCAAAGTCCCTCAATAAAAACTAAATATAGTCTGTGAAATATC
GAAGCCAACCTC---TATATACATATATGAAAACCTATATAAATTAATTTCATGCCTTACATTTTGTATGCTTTTATTTGATTCTTAATGACA---AAATATAG--AGTAAAATGTA
>Galpha49B 8135054 8136208|7568 chr2R 8134939 8135089 scaffold_4 3851269 3851419 - 10613|115 150
ACTGGATTTGGATCGAAAAACTATTTTTGTGATTTT
ACTGGATTTGGATCAGAAAACTATTTTTGTGATTTT
>Galpha49B 8135054 8136208|7569 chr2R 8135090 8135342 scaffold_4 3851536 3851792 - 6556|0 262
TATACAAACACACATACACATTCATATAATTCCTTTTTCGCATATTTAC-TAAATATAAAAGAA--GAATTGAGAAGCGAGCGAATG-TGGCCGAAAATTAGGCATAAATTAGACCCGA--GAAAGTTTCTTACGTTTGTTACATCAGGAACCGAAAATTGTAGCATAAATAGAATACTAAACTGAGATGCTAAAACCGCATCAGCAGAATGATGA---AAAAGATGTATACATTTTAATTTGAG-AGAAAAATAACACAAAA
TATATAAAAATATGTAAACATTC--ATAATTCCTTTTTCGCATATTAATATAAAAACAAAACAAAGAAAGAAAGAATAAAACTAATGTTTGCCGAAGATTAAGCGTAAATTAGGCCCAAACACAAGTTTCTTAAATTT-TAACATCAG---CAGAAAATTGTAGAACCATACTAAAACTGATGGAAAAAGAAAAACAAGTATAATAATGATGATAATGCGATTGCTATATACATTTTAATTTGTGTGGAATTATAAAATAAAA
>Galpha49B 8135054 8136208|7570 chr2R 8135343 8135591 scaffold_14 1435378 1435586 - 407|0 248
TCTGATACAGTGTGACAACAAATAATCAGGGCAGAGTTTCTCTTACGAATGTGACGATTCGTAAAACATTTATTTATATTGCAGTACTTCTATTCTTTCTAGCGGCAAAGTTTTCAGAAAACGTTGTGTGAATTTTTTTTTTTTGTTTCGACTAGGAAAACTCTTGAAAGTCAAAAAGACAGTGGCCAGAAATGATTGGTACCCAATCGATAGAGTTTTTGGTTAGATTTGAATAAATCTGATGGTAGT
TTCGACTGTTTTTCATGATAAA--------GTAAAGTATTATT---------GAAGGTTTGCTAGGCCTTTCGTCTGATTGCCAAA-----ACTTGTTAAAGCTAGAAAGCTGTCGGACTACATTTTGTAAAATTTCTTTCTTTACTTTGGCGAAGCAAAGTC----------AATTAATATTTGCCAGCACTAAAT--------ATAAAAGAAACTCAAATATAAATTAGAATAAATAAAAAGTAAAT
>Galpha49B 8135054 8136208|7571 chr2R 8135601 8136494 scaffold_4 3851793 3852731 - 9917|0 757
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CAAAACAAAAAAAA-----------AAAACATCTGATACCAAGTA-----CGAGTAAAGTAAAA-------ATAATATTTA---AAATTCATTATTATAG-AACTTTTGTAATAAAATTGATAGAAAAAAATGAGAAAAAAAAACCAAGATAAGAAAACAAAAAACTATAATTTAATCAAAAGCTTGA-AAGGAACAACAAATGGAAACAATTTTTGCCGTACTGAAGCATA------------AACATTTTAC------------AGAAACCAACAACAAAATGTAACTTATAAACAAATAGTAATTTTTGCATA-------AACAATAAATGTTAGAACTTTCTCATAATCACTTAAAAATCACAACAAATCCTGTAAACTTAAGA-----AAGATGA---------AAAACAACAACAACAACAACAATTGAATCGCAGATATAATATTGTATTTTTTATTAAGCTA------AAAGCGTAAATATTGCAACTATTGTTTACTGAAATATTTATATATTACATACGAGCGCATAATATGTGTATATACATACATTGCATACATACAGACAAACATACATGCATACATACACAGATAACTATGTAATGTTTAATGAATTAATTAATTTGTAACGCGAGAAAGAATCATTCTAATGTAAATTACAAATCCTAATACTAATACACGCAAATACACACACACACAAAATGGGAAACGATTATCAACGCGATGATTAAGTACTATATAACGTAATAATGA
>CG17760 8144429 8144526|7588 chr2R 8144098 8151420 scaffold_4 3859005 3866415 - 221835|349 447
CCTCGATTTCTACA-AAATGTCTATTTAAATCATATTGATGAGTAACAACCTTTGTGTATCATATTTTAAAAATAGGGAAATAAATGTATGTAAAACAG
ACTGCATTCCGACGTGGAATTCCTTAGAAAATAAAATGATCGTTAGCAAC-------------------AGAGTGCCTTCCTAAACATATG--------
>spt4 8150062 8151948|7588 chr2R 8144098 8151420 scaffold_4 3859005 3866415 - 221835|6419 7803
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GTGTGGTGTATGTTAGCATACAAA---TATGTAG-----TTTATT--TAAAGTAATAACAAAGTACCAAAAGTACATACATCTAGAATAAAATACAGTTTTAAGAGCAGCTGCCATCAATCATCCAAGGAGCTCACACGCAGTCCAACGCCGCCTGCTGTGGTGACATGCACACCAAAGCCAGCCGCCTCCAGCTCCTCCTTCAGCTTCCAGTAGACCTCGTTGCACTCGTAGTTATCGGGCAGCAAAACAATGGCATATCCACCAGCACCGGCGCCGGTCAATTTGGAAAAGAAGCCACGCTTGAAGGCAATCGTAAATATTTGCTCCAGTTTCGGATGTGAGACGCCAATCGCCTTCAACAGATCGTTGTTGATTTGAAAAAGGCGCTCGAGTTTCTCGAACTTTTGGCTATCATCCTGCGCATTGCCAAAACTCTCGTACAGCGGCACTGCGGAGTTGACCAGCTCCTCGCACGCCTGCCAAATGGCCTCAATGAGCTGCGGAAACTCCTCAGCCAAGTGACGCACTTTAGCAACAATGTCAGCGGTGCTGCGGCTCACCCGGCTGTCCACAAGCAAAATGTTGAGCGGCTTTTGTATTCGCAGCGACTGAAAGCCCTGACCCTTGACGAAACGCAGAATACCGCCGTAGGTGCAAACTGTGTTATCCACGCCGGAGGGTGTCCCGTGATTCACGCGTTCCGATTCATAGGCCCAATGCGAAATCAAAGCCAAGTTTTCATCTTGCAAATAGCTCGTTTTATCGAAATGGCCTGCCAAAATGAGAAAAGCGGCAGCCAAGGCAGCGCCATAGGAGGCCGAGCTGCCCAGGCCAGCGCCCACATTCAACTCAGTGTCTACGTGAACCTGGAAACCAGATTGCAGTGTCAATGTGGGTTGATTGGGTGCCGTGAGCACAGCGCCTGCCAGCAGATAATAAATGGATATAAAAGCGCGCTGTGTGTGTTGCTTGGGTGTGCTGCCCACGCTACGTTCCAGCTGCTTGGCCACTTCAGCGCGCACCTCCTCCATTAGCTTCGCAGTGCTCTCCAGCTTGTCGCCGGGATATTTGCTGCGGAAGTTAACCAAAAATGCATTGAACTCGCTGAGTTCTATTTCCAGGGTGCAGTTGAGCGCCTCCAGCTGAAAGCTGGCCACCTGGCTGCCCGTTTGGGTGCGCAGCTGAAGCTTGGTGCCCAGGCCCACGACGGCGGCCAGTGCGGGCTTCTGATAAACAACGGCATGCTCACCATGTAGTATCACCTTGCCAGGAGCGTGCACCTGGAACTTAAGCATTGTTGTTGC----------------TATGTGCGGTGTTTTTGTTAACCGCAATTTTATCTTTTGATCGGGATATTTGAATTTCTAATG
>spt4 8150062 8151948|7589 chr2R 8151442 8152037 scaffold_4 3866438 3867113 - 11282|0 627
ACCTGCGACAAGTA-GTTAAACTT---------TTATGGCTGTATT--TCTTTATGTAACTTATGC--------------ATTTAGTGGATCATTTGCGTTGTTTATTCGGTAACTCCTATTTCTGGCTGCCGATTCCTGTGCTTTCCCTTTCACTTTCTTTGTGCGACTGGCGTTTTTCGGCTTGTTCGTCTCTTCGATCGGAAAGCGCAACCATCAGCAAAACGAACAACAGGTTTTTGCGGCTAGTGTTTGCTGTTGTTGTATCG------------CTCGTGTATATGTATGTGTGT-----TGTTGGTTTTT----------------TTTTATTCGGTACTACTATTGGGCTTTCACTTTCTCCCACTCTTCGGGTGTGTAGGATTTCTGGGAGAATGCATGGATTTCTTTCAGTTCTTCGGCAAGCGTTGAGTTAACT--------------------------------------------------------------AATCTATGCTTCTGGAGAAGGGTCTTGCCGCTGAAGGCTGGCGATACGATTACGGCGCTGAACTTGCCGCCACAGCCGTCTGATTCGTCCGTAACACTCACGTACTCCGTCTGCAGTTCCC
AATGGCGTCAAGCACGGTTCACTCGAGATCAGATTCTCGCTTTATTTGTATTTATGTATGTTTGGCTGAGTTTTTATGTAATGTTACGAGTAATTTGCGTT-TTTATT--GTAGCTCCGTTCATCGGCTG-------------TTTCCCTTTCACTTTCTTTGTTCAACT---GTTTTTGGG-----------TTTCGACTGGCAAGCG------------------------------TTTGTCTGACGTTGGCTG--GTTGGTTCGGTCACACACACACGCACACACATGCAGGTATGTACAGGTTTTGGGCTCCACAGTTTAGCAACAGGTTACGGTTATTGCTTCTCTTGCTGTTGCACTTTCTCCCACTCTGCGGGCGTGTATGATTTTTGCGAGAAAGCGTGTATTTCCTTTAGTTCCTCGGCGAGCGTTGTGTTAACTCTTAAATTAAATGCATAATATTTATTGTAAATATTTTGTTATTTTAATATAGGGCGAATTACAGTCTGTGCTTTTGCAGGAGTGCTTTTCCCTCAAATGCTTTAGAGACGATGACAGCGCTGAATTTGCCCCCACATCCATCGGAGTCGTCTGAAACATGCACGTACGTTGCCTCGAGTTTAT
>Iswi 8156245 8156535|7594 chr2R 8154959 8156539 scaffold_1 2204408 2206020 + 77617|1301 1665
A-------------GCGACA-------------------------------------------------AAGCAAACAGATATTTTTC---TGAGATTCGGCTCTACACTCAGCACTAGGCAGTTAAATAGTTAAGACAAGCGATTACTTAAACATATTTTACTCTATATAGTTAATAGTTCATATCTCACGCCGGAAGCAATATCACACCAACCCCACCCCCAAAATCTGAAGTTTTTTTAAACACCCGCCTACACATCCGACTACATTACTAT-TGCGTGCCGCTGTATTCTATTCCAAATAATTGTATTGTGTTCTAAGACTATAATCA--------TTATATTTATATAAATCAACACAGC
ATGCATCTTATATGACGTCACGGTTGAAGACTCAGTTGATAATATAATAATTATAATAATGATAACAATAATTAAACAAAAACGATTCAAATGAGATTCAGCTCCGCA--CAGCATTAGTTTG-----TAGTGAACA----CGCCCACATAAATGCACTCACGTTTGTA-GCTTCTTAGTTCAT--------CCAG-----TTTTCACACAAA-------CACAAATTGATTAATTTTATTACATACTTAATAA------TTACTATACTTATATATGCGCGCCGCTGTATTCTATTCCACTTAATTGTATTTCGTTATAAGTTTCCAATTATTTGTACTTTATGTTAATGGAAAATATTGCTAC
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AGTCTCTCCTGTTGGCT--GCTACTG-TAATAATATGTAGGCTTGGACGTGCTGGAATGTATTTCCCCTAAAAGCTCTCAATCAAAATTGCCTGTGTAATTTTTCTAATTATTT-TGGTTGTGCACATTTGTGTGCAAA
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AATAAAGATATGATATAATACGATATGAT
AAAAAATGT-TAATTAAAAGCTATATGTT
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GATGAATCTGTTCCCT-------CCCAGTA-AATTTCGATAACTTTAGGCTTCGATTCGTCTGTATCTAGT----------TGGGTGTGTAAATACAATTTCGGC
CAGGCAGCTAGATTCTAACTAAACTCAGTATTATTTAAGTTCCATGCATATCCGATGTATTCTGATCTCGTAATCCGCGTCTCTCTGTGTAAATACAATTTGGGC
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AGAAGTGACAAATCTGCTTACAGAACACTGTATACTGTACTGTTGATGACTTTGATGGTATCAAATAAAGGGTCGTCAACGAAA
GCGAGGGGCAGCTTT--------AACAT-----------------------------ATATCAAATAAATGGCCATCAATGAAA
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AAAAAGGAGATGCCACGCCCCCACACAAACA-----AAATCTCATACGAGCGACAAAACATGAGCAGAAAATGCTCCGCAGTAGATTTAAACATTTAAAAAGACTAAATTGTGATATAT--ATTCAAACTAAAACGGGA--GAGAGTTA----------GAGAGAGAAAGGGAAGCAGGAGCAAACATTAATTGTGCATTCACGAATCAGTGTTGCCAATATAGCTATATTCCAGCTAAATGTAGCTATTTCTGGCACATCATATATTATATTATATAC
>CG12488 8266506 8267456|7713 chr2R 8266772 8268416 scaffold_43 512535 514325 - 27636|0 853
AAACCGAACAGCTCGCCCTGCTCTATACCACATATATTTTGTAGAGCAGCGGTTGCAGCAT-------------------CCAAATC---------AGCG-----------------GGTTATAC-----TAACTACATATGTATAATGGGACAT-------------------TTTGAATGACTTC----------------------------------AAACTGAATTCAAACC-----------------ACTATTAGCTATGGT-----------CACGTA-------GTAGGTGAACCAAGACTGTAGTCTTCCGCAC-AAGTCGAGTGTATTCGTAGGACTTGGTTAGAGTTAACCACATAAGCTAATCCGGATTAGTGCTCCTCAGACACAACAGCAGTTGAACATTTGCATTTAA-GGGTGAAATATTTCAAAGTGTTTACGATGCAGTATATGATGCATATATATATATATATATATAAAGATACGATACATATATATATATGTATACGGTTTCTAAGCGAACATTAGACGACAACCATAACAATAAACTGTACATAGCAGTCGTTCTTAAAGCTAATGATAATGATAATGACAAGCTCTTCTTTAA--CCGTAGTTAGCTCCTCCGGGCTGCTGCC----------ACCGACTACTTCATTGCAGCAGCCCGTTTCCTAAGCATATATACATACATACTTACACTATATA-GAAC-----AGAACGCATTATGATCG--TGAGGAGGGAATCTAGACGTAAGCTCGTAT-GAACATTATAAATGTATTTTCTTAGCGTAGCGAGTACAA--------AATAAACAAAAAGAAGTTACAGAAAA
ATTCTCACTCGCTCGACGTGCTCTATAC------GCTTTTGTAGAGCAGCGCTCGCAGCGTGCCCGAGACGTATGTGTTCCCAAATTGCATTTCCAAACGATAAAAAACTTCAGAAAATTTATATATATATATATATATATATATAAAAAAAACTATATAATCTGTATACAATATTTGCATTATTTCTATGGAATAGCCAAAACTTTGCAAAGTGTAAAGAAAACTAAAACTAAAGCCCAAAAAAACTACTTAAACTATTAGCTATCGTACAGAAAAGAATACTTATATATATATATATATTAAAAAAATGTAGTCTTCCGCACAAAATCAAGTGTATTTAGAGCATGT-------ACTAATTATATAGATTTGTAGAGTGTGTT------------TATCAGTTGGTAGACTTTTGTATGAAATGGGTGAAATGCAGCAA-------------CAAAATATAAAGCTACAATAGATATACAG-----------------ATATATATATATATATATGGTTTCGAAGCGAACGTAAAACAA-GGCGATAACAATAAACTGTAAATAG-AGATATATATATATGTATATGTAATA--------CAGCTCTTCTTCTACTCTCTAGTTAGTCTCTTTAAGTAGCAACCGATGTGAATTACTGGCTCGGTTTTTGCAA----TCACATCCTAAGTACGAGT-TATATATATATACAGTATATACGAACTATAGCGAACGCACTACGCTCGACAAATGAGAAATTATAAATTTAAGCTCGTATAAAACATTATAAATGTATTTTCTTAGCGTAGCAAGTACAAAAGTAAACAATAAACAAAAAG-AGTTACGACAAA
>mRpL18 8273022 8273080|7717 chr2R 8271991 8273410 scaffold_43 520155 521634 - 41779|1089 1149
CCAAAAGAAACCACACTTAGTTATCGTTTCGTTTAGAAT-AAACGTTGATTATTAT-TGCT
AAACAACAAAATAGCTTTGGGTTTCGTATCGTTTAGAATAAAACGTTGATTTTTGTATGCT
>Dgkepsilon 8275426 8275628|7718 chr2R 8273411 8276438 scaffold_51 44476 47679 + 118843|2113 2395
--ACATTAATA-----GCTAATACAGAATAGAATCCCTTATGTGCCA-GTCCCTAATCTCAAA--GTACTTAAC----------CTGGAACCTC--------------------AATGTA--TACTTAATCGAATTCGGTTAGCAAGGCAAGTAAAGACACCCACACCACCTAGTGGAAAAC----CGAAACTAGTCGA-----------AAAATACACGCAATCGT---------------ATTTGATTTGAAATAAATCCATT--------TTTATTAAGA
TTGCAGTAGCAACTATGCTAAACCATAAAATAACCC----TGTGCCACATGGATGATGTAAACTTGTACTTAACTTTCGCTTTACTAGAATCTCTTTCCCAACTAAGCTTACCTAAGGTACTCGCTTAA--GATTGTAGTTAGCCAG--AATTTAAAATTTCTA----ATTAATTAGAAAACGAAGCGAAACTAAGCCACCCAACTCTACACAATATACCAAAACATAAGATTAACATCCAGATACTATCTGGGATTAAAAAATTAAGTAAAATGTTTTAGAT
>CG12374 8279578 8279732|7720 chr2R 8277990 8279621 scaffold_4 1432270 1433892 - 52257|1667 1710
AGCTTGGTATGTACCAACTTGGGCGCAGATGCTGTGAAAAATAA
AGTGGGACACTTTTAAAATT---CTCAAATGCCG---ATAACAA
>CG12374 8279578 8279732|7721 chr2R 8279622 8279771 scaffold_43 523602 523749 - 1743|0 117
ATAAATCATTTTATAATTATAATGTGAACATTCAATTTTGATGTAAAATGATTTTATTTATAAACAGTGCAGATTAGCTGAGTGTACGTTTA-------ATAAAGAAAGAAGTTGCCG
ATAAATCAATTTAAATC------GTGAAT-TTTATTTGCGTTGCCAAAGTTTTTCATTTTTTAATGCGCCTAAT--GATTAATATAAGCTTATAAAAAAGGAAAAAAAGAAGCTGCTG
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GCCAACAGCTGCCG------AAACCAGCT-----AAACAGCTACAGTGAACCACCAGAGCCATGCCTACTATAGTTTGGAG-----TGCGTGCGTGTGAAACGCGCAAAAAAAATAAAAATAATACTTAAATATATATGTGTAAAAAATTACCGTAAAGAGATTTGGCGAGCAGGGCAGAGGGGTAGGGTAGTTGTGGTGCGTGTTTCTTTTGTAAATAGCTAAATTCTTGTCTAAGTTGTAG--TTAATACTATATCAATGGAGCTTA--TTAGCCTCGTCAAAAAAAATGTGGAAGTAAAACAAACATAAAGGAGAAAGTGCTTAAGAATAGAGTACACTAGGCGTATGCGTAATCTAGTTAATCTAGCTATAGAGAGTATCATCATGCAACTTGTCCATGGAAATATGCAACCCGTACATATTTGTTTTGTCTTTCAGC-AGATCTCATAGAGGCATAAGTTCGCGCAGCTCAAATTTGATACAAAAATCTCGACGACTACAAGCCCAACATTCAAACACATTAAAAAAAAAAAACTAAAAACAAAATAATGAAGTAAAGAAAACCCTCCTCTATTTGGGCATATATCATGAGCAAAACAAATATAAGTGCGTGTATGTCTTGCAGTTATTTCCATAATAA------CATTAGCTCTAA---GTCAAAAGCC-AGTCTTTAGTGTAGGCATCTCAGACAAATAATAATATATACTTAAATGTCAAAACAGTCGCACACACAAAGCGAAAATTCTTCAAAATATTCTTATTTCTCTTGAATGCATTTTTGTGAGAAACTTTGTGTGCTGTCTGTATGCTCTAGTGTTTACAATTTAAGCGTCCATATCAAGTACATTGTGTAGACTTGAAACAGTCATTAAGTATAGTCCTAATGGTAATTTAACAGTTGGTATTTGTAATTGTTGTATTATAAATGTTATCAGCTAT-CAGATCC-TATTCATGCTTGCTTAGCTCC-----CAATACAAAAGATTCAGCTTAACTCTCTCATTTTCACTCATGCAACAACCAACGTATATGCCAAAGATAACGAGAGCAAAAATAAAACCCCTCACAAAACAAAAAAACAAAAAAAAAAATAAATAAAAAATAATAATAACAAAA-------ACAACTATTTTCTGCAGTTTTGCATATACCAAAAAATACAAATAAATACAAAAATATATT--ATTAATAACAATAATAATAAAAGTTGCAGCTAGCTTAAGTCCTGGTCAAGCAACAACTAAATATATATATATATACACATATAAATATATATGCCTGTAAGTATATATATATATATCTATGTATACGTATACCTGTATACATTAATTTTATGTACGTTACATATTAAGCGACTCAAAAGAAGAAGAATAATACTGG-----------CTATAGCCAGCGTATTTTACAATAAATGAATTGATGTGAAA
>CG17580 8322827 8322941|7763 chr2R 8322056 8322835 scaffold_4 1479760 1480748 - 3591|1005 1013
GTGCTCCTG
AGGCTTTTG
>CG17580 8323194 8323718|7764 chr2R 8323501 8323796 scaffold_7 568298 568573 - 2054|0 219
GTTCTGGTTGACTCTTCAATGGCGAAACACTTTTTAGTTGAATGAAGCTAGTGAATGCACATATTTTGGGTTGCATATAAAAAATCCTACGATTATTCACTGGCCCTATTTATTTTGGTGTTAATTAACGAAGTGGAGAATGGCATTCATTGATAAAAGTGTACAACGATTTTTATTTCACATATTTATGCT-ATTGCTGTAATTAAAATAA-CAATTTG
GTTAAGTTTGATATGCCGAATTCTAAACACGCTTGGG--AAATATACGTTGT-AATATTCATATTTTGGATTTCATATAAAACATTCTG-GACTGTTTATT--CCTGAATGTATTTGAAATTAAAT---------TCGTATCTTATTATCAAATGAGAATGTGGTCCGATTTTGGTTTTGAGCAGTTAAGCTGAAAACTTTGGTCAAAATACTTAAATTG
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GCTGGTCCAACCCCGCCCACCCGGGCAAATCACACCACCACACACCGAACACAAAAACATACATACAAAACATACGGGGCCAGGGAGCAAGACGAAGTGGCTGGCATACAGGGCAGAACCCACACACCAGACACGCCGGAAACACATCTACCACTTACCCATTCCGGTTCCAAATCGGAAACGGATCCACTCCGGACTGCAACCAGCGCTTCTGCCCTGAATGGGCCATTCTTCGTGCTCCCTC-CAGCCACTTTTTTGGGGGTCATGCTACACACTATACTAAAATACAAAAATAAAGGCAT-CCGAGTGAGCGCT--GAACAGAACACAT---AAGCATAATAACTATACTTAACATACTAAGGGAACCCTTCAATCTTAATC---------TAATTGTACTAGT-----TTGGA-----------------------------------------------ACAGTCAAATGTATTTTCCAAAGCGATTAAAGAACGTTTCCTTAACCAAAAAAAACCACAGTCTAAACAACACACACAT-------------TCTAATTTTTGCCGCCCTC----------CCAAGAACAACACACACAGATGTATCTATAGATATATGCGCTGTCATAAAACACTATATAC-TATATATATACGA-----------TACGGTTTTCGGAA-----------GAATTGTGA-----------CGAGGTGATTAGGGGAACAACG----CAGACACTCCAGATGAATTCATTGCCAGGT-----CGCGAGGACAGAG------------------------AAATATATTTTTAGCACTACTAGCTCTTACCGATTTTCCCC-----------------------------------------------------AATTTCCGAC---------------------------TTTTCGATGTAACCCCGCCCTCAAG----------GAATCCTCA-------------------ATTGA--AAACGAAAACAAGCTGAGGCCACA-------ATTTCGATTCGAGAACAATGTGCCCAAATTGTTGAAAGCATAGCTTATAATTTGTAAACTATTGTTTTAGACCATCATTACCATGCATAACATTAAATGAGCTGTAAAAACC-----ATACGACCCATTCATATTTCCAGCATTTTTTTTTTAGTTTA--------ATGCC---------------TATTTTTTTCTTTGCTTGCATAATCGACATGTG---------TGTGAGTGTGGGCCTGTGTGTG----------TATGCATAGCAAC-GCTCTTGTGTGAGGTTTTCGAGGTGATGGGAAAGGGGTAGT------GGGAGGTGTGGCGCAAAGCACGCGGCAGTC------------GAAAACTTGTTGACATT
ACCA---CAACCAAACCCA--------------------AAACACATAACACACACACACACATACA-------------------------------------CATTAAAAAGAAAACACACATAC------------AAACGAA-----------------------CAGAAGTAGAAGCAAGTGGACGAAAACATACAACTA---CTTCTTTCAAATGGGGGTCATGCTACACACACACACACACACAC----------------ACACACAACTAATTACTATAC-AAAATAAAGGCATCCCAAGTGAGCGCTGAGAACAGAACACACATAAAATATAATAATTATA-TTAATATATTAAGGGTATTTTCAAAACTTAAACACAAACAAATAA-TATTTTAGTTATTGTTGGAAGCGCGCCTGAGCGACATTGCGAAAGCAACATCAAAATATGTAAAACACAATAATATGTATTTG-CAAAGCGATTAAAGCACGTTTCCACCACACAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACAAGCCCGTTTCCACTGACATCAAATTAACGCAGTCCCTTGTTTAGCCACCCGCAACAACAACTACATACAAAACATTACATATAT---------------ACTACATATATATATATATACAAATCCATAGTTTTACAGTTTTCCCAAATAGTATGTGTATATTGTGAATGAATATATTCAAAGTGAT--GGACGACGACGACGACAAACACTCCAGAAAAAGTCATTGCCAGTTGTGTGCGCGGGAGCAGCAGCAACCATTTGATGAGAGCGTGTTAAATATATTTTTAGCATTAGCATTACT------TTTTCCCCTCCCGAACTGTGAGCATTACATAGTAGGTCTATGTGTTTAGGAGAAGGCAGATGATGCTCGACACCCCAAGAACAATGTTCAAAACTTGATTTTTGTCGCCCGCCCGCCCCAAAGTCCCAAACTTGGATCCACATACATATATATATATATATATTCATGAAACGTCTTTTGGATGAAATCACACACGAATGATGCAACACGATAA-ATTGTACCAAAATTGTTGAAAACACTTTTTATAATTTGTAAACTATTTTTTTAGACTATCAT--ACATACATTAA---AAAAGAACTGTAAAAAACAAAAAATAAAACTCATTCATATCGTAAGGGATTTATTTCTGGCTTGCATAACTCATGCTACCCCGGCACGCACACACTCATATCTATATTTACAT-CTCGGTGTGCGGTTATTGAATGCGAGTGTGTGTGTGTGCGTATGTCCAACCTTATGCCTAGCAACGGCTTTTGTACTGGAG----GGGGGGAGGGGAGCGGGCTGGTCTGCAAGCAAGAAGAAGCGT-TAGCACGCGGCAGACAGAAAAAAAAAAAAAAACTTGTTGACATT
>Aats-asp 8398813 8399077|7847 chr2R 8398641 8399089 scaffold_11 976214 976678 + 16320|172 465
GCACGATAGACTCAAACAACGTACTCTTTAGAT--TTGAATACAATTCGATGAAA-CAATTGTTTTACTTTCCCTGTGACTTTCCAAGCATTCAGT------------------TCTTTTTATTTT----TACGCCAAACCCAATCGTGAGTGTTTTATCCTTCTTCTCAAGACTAACATGCTGCAAAGTTGTTAAACAACGAGAAAAATGTACGGGAAGACTGCCTAGAGTCAAATTTATTTGGAAACTCGTAAGAAATAAATACTTGCGCGTATGTTTTGTA----CTTTAA
ACGTGATCGATTCAAAAGGAAAAACTTCTATTTTATTGAATTAAATTCGCTACAATTTCTTAATTAATTTTCCCTCTAACTTTCCAATCTGTGAGCCTTCGCCAACTCTCAACATTTTTTTATTTTAGTAGACGCCTG--CTACTCCCTAAGTCTATATCC-TCTTTTAAGGACTTGCATACTGCAAAGTTGTCTGACAACAAAA------TTTGTAAAGACTGCTTAG-GTCAAAGTGTTT---AAAACCATACGAAATAAATCTTTGCAAGTGTGTTTGGTAATGTCTCTGT
>vg 8414648 8415302|7867 chr2R 8414158 8414691 scaffold_11 997023 997649 + 174|595 647
ACGCCACCTGGCGATG---------GAGATCGCCGATGTCCTTCGGCGAGTGT
-CCCCTCCGCGCAATGCAACCAGTTTAGATTG--AATATCCTCTGTTGAACGT
>vg 8414648 8415302|7868 chr2R 8414903 8415314 scaffold_11 997729 998187 + 9366|0 501
TTGTAAACAAACGATTTTTCGCGCATTCGA---GACCATTTTTTTCGGCGTAATTTG-ATTTTGTAAGTTTAGCATCCCATATCAGCAATTTAGACACACATACAATAATGAC------------TATATACAC-----------------------------TATATATATATAAATATACACATAAATATATAATGGTATTCGTA------------ATCAGCGTTGGTAACGTT-------------------------------------TAATAATCAATATTTCTTGTATAGTTAACGCGAACTTTGACATAAACTTAAAGCAACAACAAAGTTAGAATTTATTTTGTTTA--AACTTCGATTTTTGCAAACTTCAACAAACTAGGATAACGAAAATCAAATTGAGAAAAAAGCAAAGCAGAAAACCCAATAAAAA-AAAAGATAAATAAAATAAAAAAAAAACACAATTTGAATACAATCAA-----TAAACTGA
TTGTAAACAA-------TTCGCGTATTAAAATTGTGTAATTTTTGTATTGTATTGTACGCCCCATAATTTTAGCATCCCATATCAGCAAGTTAGACACGCATA-AATATTAATTAAAAATATACATATATACACACACACAAGTACATATAAACTTAAATATATATATATATATAGATATATAAATATATATATATATATATATGTATTCTTATGCATTATCTGCGTTAGAGTTTTTTGGTAACAATTTACTACGGCGATAATAAAACTAACGATAATAATCAACATTTCTTGTATAGTTAACG---ACTTGGACATAAAATTTG---------AAAGCTAGAATTTATTTTGTTTAATATCTTCAATTTT----GAATTTCACAAATTAGGTTATA------CAAATTG------------------AAATGCAACAAAAACAAAACATGACTAAAATAAAA-------ACAATTTGAATACAATCAAAATGCCAATCTGT
>l(2)01424 8438965 8439147|7901 chr2R 8436426 8439792 scaffold_50 542235 545816 + 126807|2698 2984
AAAGCA----------------------ACGCAGTCCCGCA-----------TAATAACAGCGCTATATGTTTATCACTTCCAATATTTATTCACAAATCGAT--------------------------------------AATGATT--------ACATGATGAAAAACAACAAAACTAACAAAA---CACGAAAAATAAGA--AACAAAATACC--------------------ATCAGGGTGGAAGTTTGAAATCGCGGTTGCAAAACTTAGTCAAATTATAGT
AATGCATAATAACCAACCACACACACACACACACACCCACATACTATATATGTAATAACACTTCTCTATATATATATAT----ATATTTATTCGCAACCAGCTAAAACGAAAAAAAACAACAAAAAGCAACAAAAAAAAGAAAAAATTAACCTTCAACAAAGAAAAAAAAAAAAAAACAAACAAAAGGGCAAAAAGAACAAGAAGAAAAAAATATCAACATTAATACATTATCTAAAACAAGATGAAAG-TTGAAATCGCGGTTGCAAATGTTAGTCAAATTATAGT
>CG13319 8440255 8440258|7903 chr2R 8439842 8440624 scaffold_50 545863 546700 + 7827|488 521
------------------------------GTGG
GGCAGCCGCCGTCATCATGTATTTATAGTTGTGA
>CG13319 8440329 8440571|7903 chr2R 8439842 8440624 scaffold_50 545863 546700 + 7827|595 847
GGCCCGCCTGCGCTACCGATGACACGGCGCCGCGTGGG-----GGTCAACGTCTATTTCGG-GGACCGGCG--GCTACCCCACGGACGCAGCTTCACGTACTCTACGCACTCCATCAGCTAACTATCTGGGATCTCCGATTCCCGATCTCCGCTCAGACGTCATGCGGCGGCCGAGTGAGCACGAACTTTAAACGTGTATCGGTGA--TACGAATTTTGTACAATAAATTTATTGCCCTAAGTAAGTTTACAG
-----GCGTGTGC-------------ACGCCGTGTGGGTCAATGCTGGGCGTTTATTTTGGTTTGCCGGCGCCGAGACCCCACGGACAACGTGGGATGTGCTCCCAGC------TCAGGACAACATTGACAA----CAGTTCCAAATC-------------CATTACAAGTTCAAACGTGCGCAAAATTCGTACGCTACGCGCTCAATCACAACAATTTCAAAATAAA-------ACCGGAGTACTTTT-CGG
>sug 8446436 8446553|7911 chr2R 8445644 8447073 scaffold_50 551396 552882 + 35310|877 997
ACTGGCCAATCGGTTCGCCTCTCGTCTCTCTTCCCCTTCTAGTCATTGCGCTGTTTC-CCAGCTCTTGTCACCACACCTAG-ATTACTATTTAACGTG-ATTAAAGACTGTTGTAATTGAA
ATGCCGTATTGTGAATGCCATTCA------------CTCTAGTCATCAGGCTAATACACTAGCTCTTGTCATTAATGTTAGAATTATCGTTTAGTTTTCAATAAAGACTGTTGTATGTAAT
>CG13320 8456225 8456319|7919 chr2R 8454893 8457797 scaffold_50 562420 565388 + 127030|1441 1549
TAGTTGGCCTAATCATTCTATTTTTTTTGTAATACTTCAACATGTTCAATTAGCCTAGTGTACATACTAAA--------------TTAAAGCCTAACAATTATCACTCC
T--------TAATCGTAATGCTT-------AGAGCTTTAATCCATGTACTAATACAAATATAGAAACTACAAATGAGTACTAAGTTTAAAAAAGAGTTGGTTCTGCTGC
>CG13321 8470983 8471082|7938 chr2R 8470681 8471157 scaffold_50 581802 582285 + 15796|302 412
GCTGCTACAGCGACTAG------ACTTTTGTGTTGTCCCCCCGTCGTCTGCCTACTAATTTATAAATCATTTTGTT-----TCATTAAAAACGTCCTCTGATAAACCAAAT
ACTGAATCAATGCGAAACGGTTCGCTTCGATGCCGGCCCCAAAAAATC-----ATTAAATTCTTAAACATTTCCTTGATAATCAATTAAATTATTTGTATATCATCAGACA
>Su(z)2 8520284 8520290|7988 chr2R 8516781 8520297 scaffold_50 634434 638146 + 71728|4057 4063
TCACAAG
TCACAAG
>Su(z)2 8521672 8523721|7990 chr2R 8521499 8522205 scaffold_50 640289 641229 + 4578|247 972
CGTTTCTTTGGCTGTGCGGAACGCAAATGTATCTTGTGGCGCCGCTGGAGAATCTGCGAAATACCGACAGCAACTGAGGTGATG-----------ATCAACC---------GTATAAACAACTCCTA-------------TAGCGCAAGTTTTCCAAACCTCGCTCC------------------CGAAGATGAAGTGCAATT------------TAATCAACCATTAGAATGGATCGTAAGCCTTAGAA-CTAACCCGAACAACACTGA---GCAATATCTAC-----------------------------------------AACACAGCGGAATGT-ATCTGTTGGATGCGAA------AACCGCAT-CATTTGCATACATATATGCAA-------------ACATTTGCAA-----------TCGAATTAGTACGCGACTAAATAAATAATCCAAGCAAATTTCAAAAA---------------------------------TGCCAGCAACAATATTCATTAATAAATAACCCAACTGTGAGAGAAAGAGAGAAGAAGCGAGGAGGAGAATAATAA--TACTAATCAAAA---GCGCTGGCGT--------------TCGCTGGCATTTTCGAAAGCAGGCAAAAAAGCAACAACAAAATTAATTATAAAATATCAACAGCAAAATATGTGTTAAACCGCGATAAGGTCAGACGAACACA
CGTTTCTTTGGATGTGCGGCACGCAAATGTATCTCGTGGCGCCACTCGAGAGTCTACAAACCAGCAGCAGCAGCAGCAGCGGCAGCGCCAGCGGCAACAATCAGAATCCAAATGCAAACTGATTCCAGTTCCAGTTGGACTAACGCAGCCAGTTCCAGTTCTGCTGCAATCACAATTGTTGAGAACCACGGAGAAAGGCAGCTGGGGGGCTGGCACACACGCCCCTTGCTGCAGCGAGTAAGCCTTACAATTTAAGCATAAGCACACTCATTGGCAATACACACCCAAGACAAAACTCGCATCAATCCAATACCAAAAAAAAAAAAAAACAAAAAGATACAAGCTATAAGATTCAAGATACTTAAACACACACATCTGTAGATACGAATGCGACACAAATTCGCGCACATATGCAAATATTTGCGATTGGAATTAGTACGCGTCGAAATAAATTAT--AAGCGTAATGGAAACATATATAACGTATACTATATATAAACGTATTTGTTGCTAACTACAACA-GCAACAACAAAAGCAGCAACAGCACAAAAAAAAAAGCTGACACAAAAATGCGAAATATAAATAAATAACCACAACGCGAGCTGCTGTTGTTGTTGTTGCTGTTGCTGTTGTTGTTGGCA--AAGCAAAAATGCGA-ACGAAAATTAATTATAAAATATCAGCAAAATAACA------AAAACAAGATAAACAGAAACGTAGATA
>Su(z)2 8521672 8523721|7991 chr2R 8522390 8522454 scaffold_50 641992 642057 + 1223|0 70
CGAAAACGGAAATCGCATCAGGAATATTTGATTACAACAACACACACTCAG------TGCCGAAAGTGTTT
CAAAAAC--AAATCGCAT---AAATTATTTAATATGATGAGAAACGTGCAGCAAGTTTATCGGAAGTGTTT
>Su(z)2 8521672 8523721|7992 chr2R 8522476 8523192 scaffold_50 642085 642715 + 9430|0 771
CTGCCACGAAGTGTGAAAATTCGGTGGTAGCGTTGGTGGTGGTTGGGCTAGCTGC--------------TAGATTTTTCGAAAGGAACACACTCGCGTATAGCGAAAGATACAGCCCGATACCCG-ATACCCG---------ATACACACTCACGTTC-CTCATCGGGGCGATAAAATTTTAACGATTTTGCGCCGCTTTGAGCGAGCGTGTCAGGCATAAAGATACAAAACAATACTTGGGCATATATAAACAAAAGCAAACAAAGCGGAATGAAAATAATGAAAATAACAAGCTCGCACTGGCACAATGCGTATATTTCTATACATATACCCAAATAAATATAAACACATATTTATATATACGAATATATATATATAT----ATATCTTGTAGATACCTTGTCGCATTAGTTGTTTAAGCGAGTTACGTTTAATTGCAGCACGAATTTTGTACATAAATTTAAAAATCGAAGCCAGGCGAAAACAAAATGCCAACCCAGCACACAGCACCCAGCAACTTGGAAATGAATTTTAATTTTTTAGAGCTTCGACCAA--------ATGAAATACTATACACATAAA------CACGAACACACACGCATTAT------GCAAA--TATTGATAAACTTCTTCTTATATTTACG---ATATTCGTACACTCGAAAAAGGCTTTAGATTTTCGTACATTTATTCTCAACTTGCTCTTAGCTGATATTTTTTGTTTTGTTATCTTGTATATGGTCTGTACATATT-TTAAGCAAAG
CCGCGGCCAAGTGTGAAA-CGCGCACTTGACGCAGGTTGTTGACGAGC--GCTGCGAATTTTGGGTTTTTAGATTTTTCGGTGGTGGTGTGTGAACA-GTAGCCACACACACAGACACACACACGCACACACGTACACACACACAAACACTCACGCACGTTCGCTGAGGCGATAAAATTTTAACGATTTTGCGCCGCTTGAGCTGAGCGTGTCAAGCATAAAGATACAAAAC----------------TCAACAG-------------------------------------------------------------------ATACATATA-CGAAATAACTATATATAAATATATATAGACACCTATATATAAATATATTCAAATAACGTGTAGATACTTTATCGCATTAGT-----------GTTACGTTTAATTACAGCACGAACTTTGTACATAAATTTAAATATCGAAGC--------GACAAAAATCTGG--------ACAAAAATCGACAGAAAGAAAAAAAA------------AAAGCTTCGACCAAAAAACAACATAATAAACTGTATTTATAAAAAGAGTAAAAAAAGGAGGTGCTTTGTTGTTTAGTAAATTTATCGATAACTTTCTATCGCTTAACACGCGCCTATCGATAAATTTAAAAAACAACCTGGCCCTTAGTTTAGCTACTTTTAGT-------------ATATCGTGTATCGTATATCGTTGTCTAT-ATCGATAAATATCGTCATGCAAAG
>Su(z)2 8521672 8523721|7993 chr2R 8523219 8523701 scaffold_50 642970 643509 + -1679|0 592
GCAAAAAGAAAAACCCTAAGTTATATGAGTTTCTTAGAGGAA------TAGCTGGAATTTA---GAATTGGTACATGGTGGCAGATCCACCCCATTGTTTATTCGTATCTGTATCT--------------TATTTTTGCAACCCCTGT--CTGCTGGCAGCATCCCCCTCATGATCG--GCGAAAAATTAACATAATTTCCAGGCAATCAAACAAATTGAAGGC----------------------------------------------------------------CTCGG---------ATCGACCTCCAGCTATTCCAATAATAACTTTGGCTCCGACTCCTGATTGTTGTATATTTATTTATTCCTATTATTGAAATATATACATTATCTATATACATATATCTAGTTGTATATGCGAGAAAAGGCTCGACTTATTTAAGCTGATATTGTACTGTTCGGATACCTTAACTAATTAAACCTATAAATACTTA-AATATAACGCATATATA----TATATGTTTAGAAATCTGATTGTATGCACAT-CTGTATGTAAT----ACTGTTAGAAAACCCTCGAAATGTAATC
GAAAGAAAAACAACCCCTTGGCTGATGAGAATCTAACAACCACCTTTTTGGTAAAAATTTGTTCAAATTTACATAAATCAAAAACCCCACCCCCTTGCCCATTCAACCCTCAACCCCCGCGATATCGATATGTTTGCGTAACCCTGGAAACTGCGCACGAAAAGCACTTAACAATTGCAGCTCGAAATTGTTGTAAATTCCTAAAAGAGAAATGAATTGAGAACAATTATAGAATTGTATATTTATTTAATATGTAACAACATTAACTAACAATTAATTAATGATTAACTCTGGCTATTGGCATCGTGCAAAAACTATAATTATAATTATATTATTTTTAAGCTCTGAT------ATTAATGTTTGTTCCCAGT---GAAATGTTTAAACTTT---GATGCTGAAAATTAACTAAATATACAACAACAA-----------------------------------------CAACAACAAAAAATGGAAAAAAATTATGATATAAACTTAATAAACAATTATATATTTAGAAATCTGAATGTGTGCACATACAACATATAATTATAATTATTAGAAACATATTATATTATTGTT
>CG13325 8641624 8641687|8121 chr2R 8639903 8641637 scaffold_29 525803 527576 - 35570|1800 1813
TTCAATAATAACTA
TACAACAACAGATA
>CG13325 8641624 8641687|8122 chr2R 8641638 8642052 scaffold_29 522098 522530 - -2070|0 51
AGGTAGTTCATGTA--AAAAAATGTATTATTAAAGAAAATATTTTTAATCGT
ACTTAGTTTAAGGATTGTCACATCTATAATTTAATAATATAAT----ATTGT
>Cap-G 8674625 8674753|8138 chr2R 8671973 8677225 scaffold_45 19052 24305 - 139564|2985 3115
A-TATCATAACAATCT-ATTTCCATTGACAATATGTGGTTCGAAATCCTACCTGGTGCGGTGATCATCACCACGCTCCTCTCGGTGCCCATATACGCCATGTACGGCCTGGACAAGCTGATGATCGGCAAT
AATATCATAATAATTTTGGTGTCTCAGTCAAAATGTGGTTTGAAATCATACCTAGCGCGGCTATCATCACCGTGGCTCTCTCTGTGCCCATATACGCAATGTACGGCCTGCAGAAGCTGACTCTGGGCAAT
>Cap-G 8674924 8675010|8138 chr2R 8671973 8677225 scaffold_45 19052 24305 - 139564|3307 3393
GCTTTCCGGCGCAACATGGACGAGCGTTTCAGCCGAGTTATGTACCAGCGCGATTTCCGACTGACCGACAATCCCTACAAGATGAAC
GCCTATCGCCGCAATATGGATGAACGATTCGACCGTGTTATGTACCAGCGCGATTTCCGACTGACCAACAATCCCTACATTATGAAC
>Cap-G 8675441 8675561|8138 chr2R 8671973 8677225 scaffold_45 19052 24305 - 139564|3826 3947
GGTCTGGATGCCATACCGGATGAGAAAACGAACTAATTTTAATTAAGTAAAGTTTTCCGTTTAAGCTTAAGTGCAAAA-GTGAATAAACGAAACGTGCAGTTCGGAAGTGATAGTTGAAAT-
GGTCTCCATGCTATACCAGATGAGTCTAAAAAATAAATGTAACGTAGTTGAAATT--CTGTTAAGCTTAAGTGCAAAAAGTGAATAAATT-----TACAGTACGAAATTGAAAAGTTATATC
>Cap-G 8675638 8676098|8138 chr2R 8671973 8677225 scaffold_45 19052 24305 - 139564|4044 4559
GGTCTTGAACAAATTCCCGATGAAGAGGTGAAGAAGGAGGAGAAGGACCCCAATGAGGACAGCGATGATCCCGCAATCGTGAAGAAGCGGGAGAAAGAGCGGAAGCTAAGGGAGAAACAGCTGAAGAAGGAGGAAAAGCTCAGGGAGAAACAGCTGAAGGAGGAGGAGAAGCAGAAGAAAAATTAATATCAATAAAAACAAACATTTCGCCAGTGGAGCTCTCAAGCCGAGCACAGGACTTTCGGCCGCCTTTGCCGCGCATTTAGCAACCCTGTGCTCGTG-----ACAGGAAACCACCCCTAAGGGAGAAGTACGGGTGGCGAAACATCCC--------GTCGTCAGCTTTGTGTGGTATTCGGTGAAAAGGCGTCGTC--------GAGCTGTGTGCGCGGAA----------------ATAAACAAATATTCTGCCGACTTACTTCGAGCTTACTTCTTAAAATCTATTTTAAAATTCGGGTAGATTGAATA------------------TT
GGCCTGGAAGAGATTGAGGACGAAGAAGAAGAGAAGAAAAAGGAAGA---------------------------------GAAGAAGGAGGAAAAGGAGGAGAAGAAAGACGAGAA------GAAGAAAGAAACCAAAC------------------------------AGTAGTTAAAAAAAAAATGTTGACTATTCCAAATGATTTGTGACTTAAGGTAGATTGTAAACAACTAGAATAAACTCGAGGTTTGCCGCGCAACAAACAACCCTGTTCTTGTGCTCGTATGGAAAACCACCCCTATGGG---------------GACGCTTCCCCCAATTGGGTTGTCAACTTT-TGTGGTATTCTG-AAAAAGGCGTCGACAGAGGCGAGTGCCGAGCGCACAGTACGGCGTATAGAGTTCGATGAGCTTATATTTTTACTATAAAGTGCCGCCAGCATCTCAAAAAAGTGCTTTAGTAATTCTCTAAATAGAAAACATAAAAAATGCGTGAAATC
>Nrk 8678558 8678736|8141 chr2R 8678498 8678558 scaffold_45 25565 25625 - 5220|60 60
G
G
>Spt-I 8686389 8686445|8150 chr2R 8685788 8686396 scaffold_11 700510 701116 - 24989|606 613
GCCTTGTT
GCTTTATT
>CG33138 8690559 8690707|8156 chr2R 8688684 8690759 scaffold_1 1986959 1989043 - 122069|1876 2032
-----CTAGTCAGACGCAATTAACCGGATCTGACCGGATCTATAAAAATGTTAATGCCTAAACGAATTTC-ACATTTAGTTATAGTGATTGTTAATGTTACGAATCGGGATGCCATCATTAAAATATATG--CTCACTGAGGTATAGTTTTCTAAAA
GCGCACTTGTTTAACCAAATTGTTGATATATAATTATATATAT-----TATACATG-CTATGTGAATTTCAAAATTTAGCTATACTTTTTGTTAATGTTACAA------GAACCATCATTGAAATATATGTATACACACAGAGATAGGTTTACAGAA
>Aats-val 8718502 8718619|8185 chr2R 8715186 8718632 scaffold_1 2017784 2021099 - 167996|3341 3465
ACAGGGAA---CGTGGTAACCGCTAGTCGGGAAGACTGGTAA----TTGATATTTAGTACGCTTGCCTTGCCAGCTGCTGGGCTTTACTTAAAAAATACAAGAACGCGCTTCACTCGCAAACAAA
AGTAATCAATCCTAGATGAATCCTGGACAGAATGAGCTGCAATATGTTGATATTCTCTA-------------AGACGCTTGACTATACTCGCTTAAAATCAGA-----------TAGCAAAATAA
>CG17059 8736811 8736925|8200 chr2R 8736671 8736873 scaffold_1 872083 872286 - 5723|149 211
AGGCCACCACGCAATAAATGGATTGAAAGATTTGTATTCGCGACTCGTTCTTCTGTCTGTAAT
AAAATGCCAAACAGTAGATTATAAAAAAAAAATATATATTTGTCTAATTGCTAAGTCTTTACT
>Dp 8743078 8744116|8211 chr2R 8742282 8746127 scaffold_11 3436429 3440257 + 95440|823 2020
GCTGATGGTGCCGCCGTCATTGTGCCAGCCATGGCCGATGCGGAC----ACGGATGCGGATGGAG-GAGCAGATGCTGATGCGGAGGACACGTTTAGTTTTACGTTTATCAACGCTTTGTTAGGTTTGCCACGGCCCCCTGGTTAGTCAGGAGCCGCACTCCACTCCAAT---CCACTCCACACCCAATCCGACCCACCCACACAA---TTGGTTTTGTTTACTTCTCAATGAGACTC--TTAAATTATATATATACAATCTCGCAGCGACGAGAAAGATTCGGTAGTTCATGTATGTAAGTGTAGTTTGCATACACAGTTTGTAATTGTATCATTGAAGATTTATGTTTAAGCTGAAACGTTTTTAAAATAATTTGTCTAGTTAAGGAGAACGCGTTTTTAGTTCAAACCACAATTCACATAAG-GCAATACCGCGAAACCACATGCCCAGACTAATGTTCACTCTCTAATTAGTTGTTATCAGTCTCCCTTTTCCCCCCAATGGCCTTTTCATGTTTGGGTAGGC-------TTAAGCAA-AAGCGA------------------------TAATGTTATGGGTAATTGTCTCTTAATAATATAATATACCAAAACTGTACACAACCGCAGTGAAATGCAAT-----TATTTTTAGAATGCCACGA---GCAGTTTGAACTGCAGACAAGAGCGAACATATGAAATATGTTTAATTTGCTAACACC----CTTTGACAAAGCGATT------CTTTTAGA--TTCTCAAAACCCAAATTTTAAGTTGACAAGGGAGTGCAGATAGTTGCG---------------------------------------------------------------AAATAATCAACCTACCTAATTAG---TAATAACAATTAAAACA-CGATATACATTTTCAGAATTTGTATTTATATTATTGAACCCTCTTCAAGTGAATACAACAGCATGCAAATACAAATTAGTAGTCAAGTATAAGGCGTTAACAATTAAGTGTCGAGCATGTAGTTGTGTAATGAAACGAAATAATTGCA--TGGATGGAAAGGAAATTGCAAACAAGTGAGACGAAAT-------CGAACCGAGTGACAAGTTAATAAAG-------AAGTAAT-------TTGCATATTGTAAAATATGAT---AAACAGAGAATTTAA
GCTGACGATGACGCGGACGT-------GTCCTGGGCGATGGGGTCCACTGCGGATGCTGGCGATGTTAGCAGCGGCT-ATGCAGAGGATACATTTAGTTTTACGTTTATTAACGCTTTGTTGGGATTGCCACGCCCGTTCGTTTAG------GCTGCCCATTTCTCACATTTGTCTTTCTTTACATATACAGAAGCA-TTAAACAGCTTTTGATTTCGTTAATTTCTCAATGAGACTTGATTAAACTATAAATAAGTTA------AAAAGAAAGAAACATTTAATAAT-------TATAAATATTACTTG-GCGTTCAGTTTGTATTTGTATTTTTGAAG-TTTATTTTTAAGC-GCAAAACTTTTAAATTAAT---------------------GTTCTTAAGCAAAAACACACAAAACAAAAATGTATTTTAGTGAAA----ATATACAAAACAAATTTCTGTCTTCTTTTAGTTGTTA--------------------AATG--------ATGCTTGGAAAAGAGAAATTGTTAAGCAGCAAGCGAAAAGGGTTTTTAAAAGTTCATCTTCAATGTTGTAG---AGCAACTTTTAAAACTATTGTACACCAAAACTTGAAATGACAGCAATTAAATATAATGAAAATATTTTTAGA--GCTACAAATTGCAGTGCAAACTGTAGACAAAAG----CATATGAAATATGTTTATTTGCCTCACACTAACATTTTAAGACAGCTGTTACCATATTTTCAAAATTTCTCAAGAACCG----TTCAGCTAAAAATAAAAAATATAGAAATATGGTTATAAATACAAACACATATATATATAAAGCTATATAATACATATACATTAAAAGTAAATGCAAATAATCAATCTACCTAATTAGTTATAACAACAATTAATGCATCGATATAAATTTCTAGAATTTATATTTA-------------ACTTCAAATGAATACAAATGC------ATACAAATTAGTAG-AAAGTGAAATATGT--ACATTTAAGAGTCGAGC-CGTAGTTGTGTAATAAATTTAAAATATTTCATTTTGAAAATGAGAAATTGACAAAGAGCAAATACAAAATGCATAAACAAACAAAAGAAAGAAAAAAAAAAGCAAACATAGATAATAAACTCAATACATATTGTAATATATGATTAAAAACAGAGCTTTTTA
>CG12765 8747557 8747572|8215 chr2R 8746658 8748552 scaffold_50 389448 391530 - 56758|965 1065
AACT-------------------------------------------------------------------------------------CACGCAACGCAA
AATTGATATGCGTCCAACAAAAAAAAACCAGATATATCAGTAGGTCACGAAATATATAAGGAATGGAATTAAAGGTCAGCTATACTTTCTAAGCAACCCAG
>CG4688 8756671 8756925|8224 chr2R 8755625 8757661 scaffold_50 398338 400131 - 24895|1073 1329
CACTAGAGGGTTATCAAAAGGCTTGTTTAACTAAGCATTGAATCGGATTTAATTTTATGGTTGGTTTGGGTTTTCTTAACCTCTTACATTTGAATAAATTCTAAAACAATGTGTAAATTATATTTAGCAAATTCTTATATAAGATCTAATGCAACATACAATGTGCATATGTAAAAGTCTTAACTCAAAGATAAAT--AAACCGATTCATGGCAGACAATAATAATGACTCGCCAATAGAAATTCATGACAGAAATC
AACTTTA--TTTACAAAACGGTTGGATCAA-----AACTGAATC--ATCAAATATTGCTCCAGGAAATGG--------AGCTCATAGACTTAAGCCAAATTAACGAAACTATTTAGG--AGAGTTTGCTGCTGGTTGGATACAAAAGAGAGTAGCAT---TTGAATCTTCGCCTAAAACCTAACTTAATCTGGGTTTGAAACAGCTTCATG--------------TGACTTACTGGCTCGAA-GCGTAAAATGAATC
>Mp20 8763416 8763680|8232 chr2R 8761915 8764616 scaffold_50 406579 409788 - 49199|1892 2263
GCGCCAAAGGATGGCC-----AGGATGTCCACACCCTTTTCTACACT-------TATGCTAAGTGAAC-ACACCCATATATATTTTGTATGATGA------AAAACATGAAGAACACAATGA---TATTCCTCACCAAAGCAAAACTCAACACCAATGAAC------------------ACACACTCACACAA----AACAACACATAAAAGCA---ACGCAAAGGCTTGT-------CGCCTTATATTAAGTATACGCCTAAGTTAATCTATTTATGAGTA-----CAATAAA-----------------------------------------------GTAATTCAAAGAACCCAGTTTTCCACT-TTC
ATGCTTGGCTCTGGCCCTCAGCAGTTGTCTTCAACTTTCTGTCTGTCTTTCTAATTTGTTATTTAAACTACATCTATGTTTAATTGTTAAGTTTACAAACCAAAACATTAAACCAACAACAAAACTATTCCTCACACAAAACACACAAAAAACCAAAAAAAAAAACCCACAAAAAAATGAAACACTCACACAAATGCAAGTACGCACACACACACACACACAAGGGCTTGTCGCGATGCGCCTTATATTAAGTATACGCCTAAGTTAATTTATACATGAAAAGCAATTAATAAAAAAATGATGATGATATTGTGGAGAAAACGAAACCGAGAACGTGCAGCATAATTGAACGAACGAAATTGATGGCCAATT
>CG4716 8773039 8773206|8240 chr2R 8773003 8773293 scaffold_50 417223 417502 - 3267|38 221
GCAAAGGGAGTCTAGACGAAGACGCCAGGCTGCCGATCAGAAATCCAGCGATGCGCCGGACCTGGATGCCCAGGCTGAGAAGGAACTGGA---------------CGAGCAGATGGCGCAGGCTGTGGCGGAGCTTTTGAAGGACAAGGACAACAC-CAGCATCGAAGACTACGCCCAGGGATG
GAGCAGACAGCTCAGACGA------CGCGTCGCCGGCGTGAGGCC-------ATGCCGGACAATGCCAGCCAGCAGCTGGAGCAACTGGAACCAATCCACAGTATTGAGCAGCTGGAGCAGT---TGGCCGAA----------GCAAGCGATTCACTCAACATGGAGGACTATGCACAGGGCTG
>CG4716 8773262 8773353|8240 chr2R 8773003 8773293 scaffold_50 417223 417502 - 3267|280 311
TTTTGAATAAACATAAATAACATTATAGCTTA
----GAGCCAAATTCAATAATCGTATTCTTTA
>CG10799 8774359 8774399|8241 chr2R 8774355 8774611 scaffold_5 1470853 1471153 - 486|4 44
ATTAAATAAAAGCAAAGAAGAATTCTAAAAATTTAAAAATT
ATGAATCAGGAATTGAAATGCTGACTGAAACTATAACTATT
>CG17041 8779839 8780246|8248 chr2R 8779370 8779894 scaffold_50 422447 422925 - 21790|469 524
GGAGCCGTTCACCCAGCTAACCGGCTTATCCCTGGCAGCAGAAGCTGTCGCATCCC
TGGCC-----------ACAACCCGCAGCCCCCAAGCCGTAATCCCTCTCACACCCC
>CG17041 8779839 8780246|8249 chr2R 8780135 8781094 scaffold_50 422954 423925 - 19195|0 131
GCTTTTCCCCTGTGTAGAGTTCCCTAACTCTT---TCATACTTGTACATAATTTTGAATATTTC---GTGTCTGTTTTTGTCGCTTT--------AATAAA------AAGAAACCCCCCGAAAACCCCAAAA
GTTTTTGCTTTGAATTCGTGTACATAAATCTTAAGCTGTATTTGCATATGTATTTGTCTTTGTCTCTGTGTGTGTGTGTGTCCGTGTGTATTTGCAATAAATCATAAAAGCCATTTGCCATAAAGCC-----
>AttC 8910457 8910586|8422 chr2R 8909556 8911412 scaffold_50 595389 597397 - 54989|927 1166
AACTATA--------------------TTCTTAA------------AAATATT----------------TTACAATAACTAAGTGTTATT---------CAAAAT---------ATTTATTGACA-----------------TAAATTCAAACGAATTTTGTTGCTTATTTCAAATGTGTTAAAAATATATGA--------CTTAACTCAAACAAAG-------------------GGAA
AACTATATCCGAGCCAGGAGCTGACTTTTCCTAATTCGACAAGGTGGAATATAGGTGGATCAAATTTGATCACGAAAACCCAGAGCTGTTGTTGCAGTTAAAAATCTCAGCTCCATTTGCGGAAAACGGGCGAAAGAATAATTTAAGTCGATCGAAAATTAAAATTTGTCTTAAACTTTCAATAAATCAATGAAAAACAAACCTAATTTAAGAAAAGCTCACTCGGAAAATACGTGGAAA
>IM10 8923889 8924010|8436 chr2R 8923687 8923909 scaffold_1 1385542 1385776 + 8193|212 234
CTTATTT--ATGTTTTCAGTACT
ATAATTTTATTCTTTGCAGTATT
>CG33470 8928616 8928737|8442 chr2R 8927774 8928636 scaffold_1 1384733 1385776 + 14469|1050 1072
CTTATTT--ATGTTTTCAGTACT
ATAATTTTATTCTTTGCAGTATT
>CG4840 8969119 8969300|8487 chr2R 8966070 8969304 scaffold_1 5632592 5635948 - 86871|3288 3482
GT---AGCCACAGCAATACAT-CACATTTGTACTCTAATCTATAGTCAATTCATAACGTTCGTGTA---ATATGTACATA-----CCAATTGCATACGCAGCACTGTGTTATTTTGTTTACCAACAACATTCCAT-TTTGTTGAATAGTATTTATTTCTACCGTTGTGATTTTTATAATAAACTAACATTTATGT
ACTCGATCGATGACAAGTGATAAATGCATGCATTTTCATGTGCAAT-AATTAGGTACATTCATATGTACATATACACATACATTCCTACATTCATATATAATTTAGTTTTTCATTGTGAACCATTTGTACTATGTACATATTACATTGAATTACATTGTGATTTTAAAATTTCTGTATACATCTAACATCTTACC
>mars 9021766 9022008|8524 chr2R 9021679 9021964 scaffold_4 2840314 2840636 + 1466|98 325
TTTTGTCTATTGACAGTAATTGTCCGTTGTGGAATTGTTTATACTTTTATCTTCTTA----------------GTTTAATATTTTTTTGCGGATGCCATTAAGTGTTA---ATTTATTAAGAT-GTTGAAAATTACAT---------TTGGCGTTTTAAATGTTCGACGAGTATGTTCTGTGAAAATGAAAGCTTATTTTATTTTTAATTATCTATCTTACCTTGATT
TTTTTTTTATTAACTGCAATTCTCCGTTTTCTTTTCACTTCTAATTGTTGCTTCTTATATTGTGTATTATGTTATTCATTTTTTTTTTATTATTACATTTAGTTATTACGTATGTATGTATATAGCTGAGGTATACATAAGTGTAAATTGTTGTATACATTTAACAACAAATACAGT-TGTTAAAATAAAAAC--ATTACACATATTATTTTGTGTGTATTCTTGATT
>EfTuM 9025121 9025240|8526 chr2R 9022708 9027145 scaffold_1 6083554 6087931 - 94328|2486 2632
ATCCCCGGAACGC-------------------CGTCAGTCATTAACTAA-AATCATATTCTTAAGCGA-----TTTTTATGCATATTGTATAAGTTG--TTGGCGCTCCAATCACAATCGAGTAAAATATAAACAAACACCTATGGA
TAACCTTGTATTCATCAGAAGCTTATTCTAAAAGTCAGTCGTAAATAAATAAACATATTTTTAATTTAATTACATTTTATACATGTTGAGTTAGTTGTTTTGATGCGTTTATTATTAT-AAATCATAGGTCAACAAATAATTAAA--
>mip120 9028737 9029019|8527 chr2R 9027146 9029034 scaffold_1 6088113 6090129 - 41160|1724 2075
GCATGCAAA-----TATAGT----------------------------------CACACATTA-ATTAGTTTATAAGTTCAAAGAGTTCTTGACCTTTTCTCAATCATATTCTAATTTT----------GGCTTTCTAAAAGTTGACCTTAAAGTAAAGTGTTTACCCTATTTAAATAATTTAAAC-ACAAAATGTATATATCATACATAGCA--AATTTCAGATATAAG-GCTATTTTAATTTTTGGCCGAGCATTGTAATTGTGT-TGTAAACTTTTCCC---TTGGATTGAATGTAAATAATTTAGATACCTAATAAAG-------TTTAATGACCATT----GAACAC
GCTTGAAAGCTATTTATATTACATTTTAAAGCTTCTCAATTTTCAGTCTTGATGCACATACTATATTATTTTTTAAGTTCAAAGCGATCTGACCTGTTTATTTTTTCCATTTTTATTGTCTCTTAAATAAGCTTTCCAAAAGTTGACCTTAAAGTGTAAAGTGCAAATAAATTATTAACTTTATGCAATTGCATGTAAATAGCATTTACAATAGCAGTAGCAAATATAAGAACAACTCTATCTTATGGTATCGTTTTTAAATGCTTTATGCAAATAACACCCAATCTATCGTGTATGTAAATAAATTTAA-ATTCAATAAAGCAATAATTTCAATAACCGCTATTGAAACAT
>CG13330 9033144 9033353|8529 chr2R 9032793 9036292 scaffold_1 949540 953165 + 86726|415 662
-TAATATAAGGGAAAAGTGGGGGATTATATGTGTGATTTTTGGAACAGAT------CATCTCTAGAATATAGAGCTAAGCTGTTCCAGAAGACGCTCATATACT-------CCCCTAACTTTTCTATA------TTAGAATAGCGCCAAAATTAGTTGTATCATTGCTGTTTT-TTTGACTTTTAAATGTTC---------TTAACTAAGCTAAATCCGAAA--------ATTATATTCCAAACTATA
ATTGGAAAACCAAATATTTGCGGCTGATAT-----AACGTCAGGATAACTGTCATGCATGGCTA-CATATATAGCTACATTTTTC----AGTTATTTGTACGCTGTACCAGCCACAAATATTTTAATACATTTTTTGGATTCGTGCTCAAT---ATTGCGTC--TGCCGTCTTATGTCAATTTCAAACATTTCGCGTCCTTTTCGCTAGTATTATTTTAATATAACATGCATT-TACTTTAAATACAA
>Roe1 9071195 9071516|8563 chr2R 9070932 9073213 scaffold_1 984028 986334 + 32499|263 626
TAGCCATGCGGCTGCCCAGAGGCATGTAAAATTCCCAGTACTCCCCCCCCCCCCCTAAACCAATTTACATGGCGTGTGTCTCTCAATTGTTTGCAATTTGTTTTCCGCTGCAAAATTCATGTACGTAAACCCTGTGTAAATACAACCTATCCCACAAACGCAT-----CCTTCGGGCAAAGCTTGCGAATTTAGAATTC----------------------CTCCTAGTTTCTAAGAGATCTGTGACTGGATTTGATG-GCCACA-ATTTGTACCATACGCGTGGCCATCGAGTGTTCCACTTTAAGGTTTAATTACGATAATAAAACATGTTTTAGTT-------------TGTTGAAATATA
TAGCTGTTTTGCCAGCGGAAATCCTATGTACTTGCAGAAAAACACACC--------------ATTTACATAGTATA---CCTTACATTATTTGCAAATTTGTCTTAGGTGCAAAATTCATGTACGTTA---CTTGGTAAATACATATAAGTTCCCCTATGTACAGGGAATTTTCTTAAGAGTTGGCAAAATTAGAATTCACTATTAATTTTAGCCAGCGATTCCCTAGTTTCTAAGTGCTATTAGGCC--CTTCAGTGTACAACACATTTTTACCACAGACGTTGTCGCTGCATTGGTAATTTAAGAGCTTTAAAGTTATTAAACTATTTGGTTTGTTTTCAAATTGTTATGTGTTTGAAT-TA
>CG13333 9073065 9073254|8563 chr2R 9070932 9073213 scaffold_1 984028 986334 + 32499|2303 2453
GCGGAATGTGTGACTAGTCTTAAGACCATTTCAAATGAAATACATTTTCCATAAACCAACTAGCTTAGTGATCTCATTTT--GTAATTGATTCCATATATAACACTAAAAATCAAATGAGTTTTAAAGTAATAATGGGGGTTTATTTCGAA
GC---------------CCCTAGCTACCATAATAATAAACCATAATCTAAAGTATAAATATAGTCT-GTAGTCTTACTCTAAATAAAAAATACAAGCTATAACCCTA-------------TTTTAAAAC----ATGTGGCGACACCTCAAA
>CG13333 9073065 9073254|8564 chr2R 9073214 9073517 scaffold_6 679597 679867 + -516|0 40
TGTGTATGATCTTACAATAAATCTATTGCAGATTGTATTTA
TATATATAAAC--------AATTTGACTCATATCACATTTC
>CG6197 9112406 9112470|8603 chr2R 9109549 9112466 scaffold_16 588155 591154 + 164475|2953 3022
ATGTTTATACATATATAT---------GACTTTTTTCGGGGTAAATACATGTATGTCGAAAGTTTTACAA
AAGTATAGATAAAAATGTTGTAAGAGAAATGTTTTTCCCATTTGATACGAATATGTTAATAGTTTTTCAA
>CG18369 9114379 9114657|8604 chr2R 9112705 9114776 scaffold_16 591703 593749 + 84619|1698 1985
TCTCCGGATCTGGATCGTCCGCACCTGTGGCGCTAGTTACCACCATTGCTCGTTCTATTTTACATTTGTTACGTGTCCCGTTTTTGGTGTTTGTTCTTTTCACAATATTGTCTCCATGTCCAAATTTTTGGTTTAGTGTTCCG-TGAGCAGCTGGGTA-----ACGACACATTGAAGACAGTTTTACGGACAAATGGACCAGCTCAGTTATTAATGGTGGAAGCAGTTCGACTGGCTTCTATGGATCGTCTCCCAGC--TGCAC-AAAATTAAATGATTTTAAAGTGC
ACACTAAACATCTACTTTAAGT-----TAGAGATTTTTACT-TTATTATTTTTAACAACTTG-ATTTGTTA---GTCACGTTTCTA--TTTCAACATTTTCAAAATTATTCGTTATATTATGAGTTGTTGAAATGGTGGGGGGAAGAACACCCAGGAACACCCAATGTATATTAAGCAAAATCGTACTGTAAACCACAATAGA------ATTAGTAGTATAACGATTTTAACTG------------TATTTGCCAGCAATGTATGAAAAATAAAAAAGATATATGTGC
>fas 9262619 9265284|8792 chr2R 9261997 9263372 scaffold_16 812395 813919 + 32300|635 1584
ATTTAGT------TGGGACCCTGT--------------GAGAGTGAAAG---------------------TTGAATGAATGATTTCTTAGGGAGTGACTGACGCGTTTACAACACCGAATGTT--------------------CTATGTAATCTA----ACCCCCTATGGCTAA--GCATATGTATGGATTTACCCAGT-TACTCGACAT------TACCACGTGAACTATGCTACACAACTACTACT-------------------------CTATATAGCAATACATATGTGTATCTGTAACCGATTTAGCCAAGCATCCAAAT-------TGC----------CCTAGTCTAAGACCCCAAGCCCATCAGTTACCCGAAAAAAAAACACACACACACTTTTCTAGATCCCCCAAAAAGGAAGC---GACTCTTTAACCCTAAGCTATTCGAATATTTTTACTGTAACCCCCCTAGCTGTAACTGTAACTGTAACTGTAACTGTAATGTTAACTGTAACTGTAACCCTATCGCTGTATGTCAATGTGTATGAGTGT---------GCGCTTAACTTAAATGCCAAAGCCAG------------------AAAACGTAAGGGAAAAAAGTTTA-------CAATTCTTTGGATAAAAACATTGTTATAAAGTTGATTATTACGAA-------TACTTTAAGTTCCTTTTCGACGAAGAAGAGAT---CTCGAGAAAGCGACTGATTTTGTTAAATATTTTGAAGATGTTTAGAACTA----AAAGCACGATGAG-------GAGAACCTATAGTTTAAAAATGTACATGAAGAAGTCAGAGACGACGAAGTAATACTTACCAGGCACGAACAAATTCCTTCCATTTGAAAAGTTTGCCC---CGA-------------------GCAAAGAAACTGTAAGATATTTTGG
CTTTAAGAGTGCATGTGAACAAGTCAAAAGGCGCTACAGAGAGCGAGAGAGTCCGATTGTGTGTGAGTGTGTGAATGAAAGA-----GAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAATGCTGACTATTAACTCTTGCAATTTATTATGCTATGTACTACATACTACCCACTATATCTAAGCGCATATATACATATATATCCACTATATATAACATATGTACTACTATATG--CTATTGCCTACAACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTCTAAAGCTATGTGTATGTGTACTTGTAACCAATTAGCAAAAGCATCAAAACGAAATTATGCCACTTTAAAACCTAAGCTAAAACCCC---CACGACCCTCCCCCTAAGGACATACA---------TTTAGTAGG-CATCTAAGTTGGCAACTTGAACTTTTTAGCTAAGCATTAGCCACATCCCCCACTAAAAAAACTCATACTCAATATTTTTACTGTAGTCGTAAGTATG----TACTTGTAACTGTAA--------CTGTGTGTGTATGTGTGT-AGTACTTAGTAGCAGCGCTTACCTTGAATGCCAAATAGAAGAAAAACTAAATTAAAGTAAAATATTAAAGAGAAAAGTAAAAAGAAAGTACATTTTTGCGTTTACCTATTGTTA-AAAGTTGAGACATACATAATTATTGTACTTTAAGTTCCTTTTCGAAAAATAAGCGAGTAACTTGC-AAAGTGACTGATTTTGTTAAATATTTTG-AGGCAATTAGTGTTAGAGTGAAGCAGAAAGAGAGTGCTTAAAAAAACAAAGTTAAATACTATACTTTAAT--GTAAATGAAAAGCAAGTA--ACTTACCAAGCACGAACAAATTCCTTCCATTTG-AATTTTTGCGCATTCGAATAGGCAAAAAATAAGTATATAAACAAGCTGTAAAATATTTTGA
>fas 9262619 9265284|8793 chr2R 9263373 9263975 scaffold_16 814076 814719 + 8929|0 688
GAAATCAAATTAAGCGAATGATCAAAAGAGTTTTAACCTAAACGAATTGGGTTTTATTAGGCATTAAATCGCACCCTATCATTTCACTATG--------------AGTTTTCAATCGTTTGAAAGGACCAAAAACGAATCGTTTTCATTTACTACGAATATTTTTGTAACACAAACATAAGCATATTTATAGCCCCAAAAACAAATGAGA------GACCCTCCACATAAGCGATATT----TGTAAATAAGTGTTCAAGTAGAGAATTGCTCAAAC--------------CAAAACGTAAA------------AGCAAATAAAATACAA----------TGATATGATATAAAAAGTGTTAAATGTTGTTCGAACGCCTAACTAAAGCGACTAAAA------TATCATATGTAGCGGTTCAATGAGTA------AACTATAAACAATAATGTATGTAAAATAACAACACACAAACAGCC-----ACTGAAAAGTTCGTTTACCA---------GCTATTGTAAAATATTTCAGTTTAAGGATCAGCAATGTGCCAGCGAAATCGAAATCGAAATCGAAATAGAGATCGTTTGCTTGCCACAGAATTTTTTGTACAAAGCCCAAGCTTTTGTAATTTATTTCTTAGTCGATCTAAGCTTCAGATTATTCTATATCCTATGCGCAATACA
GAAATTAAATAATAAAAATACACAAA------TTTATTTGAAATAATTGATTTTTGTATTGAACTAAATCAATTTTTAATTACTTACTTTATTTATCGGGACTTTAAGTTACAATAATTTACAAGGACCAAAAAC---TCTTGCATATTTTTGAAATAAATTTAAGAATTCCAAACAAATACAAATATTTGTTCGAAAAAAAAAATAAAATAATAAAACCCTCCACACAAAATATACAAAAATGTACATAAATGTTCAAGTAGCGAATTGCTCAAAAAATAATATACAAAATAAAAAGTAAATAACTAAAATTAAGCACAGAAAATACAAAAATACAGAACAATATTATATAGCAGGTGTTAAATGTTGTTTGAAA--TTAA--GAAGCCACCAAAAATAGTATGGCACATGTAGCAGCAATTTGAATAGTGCGAAACTA-----AATAATATAAAAATATTATAAACACAAAAAAAACCCAAATATTTAAATGT-AATATAGCAAAGCTTTGCGCTATTGTAAAATAAGTATTTTCAACAACC-------------CAAAGTAGAGCTAAAAACATTATTAGCG-------------CGCTGTTTTTTGTGTATAAAGCCAAAGCTTTTGTAATTTATTTCATATAACATCTTAGCTATATAGACATATGTATTGTATGCGCCATATA
>fas 9262619 9265284|8794 chr2R 9264019 9264781 scaffold_16 814728 815543 + 12938|0 903
CGGTAGGCTAAGCGATCAGTGTAAAAACC----AGAAATACTTAGAAGAACCTAACGCCAATTTGAGCCACAGCAAAATT----------ACATTT--GCAGAGTTCCAAGAATTCTG-----ACAAA-------------------------------GAGCGGAGAGCATTGTAAG----ATGATAAGTTTAAATTGAGGTTTAATTA----------ATTATTAATATGAGAATATGAAGGGAAGTGGGAGTA-------TGTGCGTACCCTATGTATAGTTCAGTTTAGTGATTTAGAAAGAGAGTAATTTTTTTCGCTCCTTGGGTTCATTGTCAGCTGAAAATTGCGAAACTGTAAGAACAAAGC--AAGCAAACACGTCGTCATGTTAACTAAC-TAATAAATTACTAAACAAGTGA--------------------------------------------ATTACTAA------------GCAAAATGTATT-----TATGATTCATTCTGTTGGTAATATTTACAAAATATAATTTACAAACAAAGCCAACAAACAAACGAACAAACATATATGTATGACTAAAGAAAATACTAGCTCCTAAGTGCAACACAA-ACCGAATGTGGCAAATTAATTTTAAACCAAT---GAGTAATTACGATAATTGCGATATGAGAGACAGAATGTTCATCTGTAGTGCAAAATGTTTGGATAGTGCGGTCTAGTGGGGACACTATTAACCCATACAATTACGATTACAAATACAAATACAAATACAAATACGAGATACAACAATACGTGTTACAATAAGCAGAATCGGTTTACATATATAAGACATAGGCCCAAGAGAAATGTAAGCAAACACCACCAACAAAACACTTTTAGCCGTAAACGCA
CTACATTTTAAGAGATCAATGTAAAAATCAACAAGAATTACTTAGAAGAACCTAACGCCAATTTAAGCAAAATTCAGATTGCAAACGCAAACATTTACGCAGAGTTCCAAGAATTCAGCGAACACAAACAACAACAAAAACAACAGCAACAACAATTACAAGTTAAAAGCGTTTCAAGCATTGTAAAAAATATAATTTGAAATTTAATTAGAAATATGCCAACATGCATAGATGGATATGTACTTATGTATGGATAGCCTAACTGTATGTGTGCCATGTAAAATTGAGTT------------AAGAGAGGGTTTTTTT----------GGTT--TTTATAAACGAAAATTGC-AAATTGTATTAACAAAGCAAAAACAAACACGTCGTCATGTTAACTAACAAAATTAATTATTAACAAATGGAAATTATGGTATTATATACATACATATAAATATATATGAATATATATTACAAAGAGTGGTCAAATGCATATTGTATTTATTATATGATTAATTATTATAATAATATTTACAAAATATTATTTATAAAT-------ACAAAAAAA-----AAATACATAT-----AATACCGTAACACTTAGTTCTTAAGCGAAACAAAATACATTATGTGGCAAATTAATTTTTAAATATTACAGAATATATAATAGAAACTTCAAACAAAAGTCA----GTTCATTTGTAGTGCAAA-------GAAAATGT------GTTGAAAAACAAAAAAAAAAAACGATAAACATGAAATATGCATACGAAAATACAAG-------------AATACGAAATACAATAAGCAAA---GGTT--------TAAGTCATAGGCCCAAGATAA----AAGTAACAACCACCAA-AACAAATTTTTAGCAGTACGAATA
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GATAAATTGGAGGATGATAAGCCCCCCTACAACAGAATCAAAAACTAACTATTAAGCGACTCCGTTCACTGCCCAGCAACGCAATAACTCCGCATTCTTGGCAACAGGCGGACTGTTACGTTTAAGCCAACTTCGCAGGCCAATTGGCCAGGTTGAGGGGGCGGAAAGGTCAGAATGGTCCGGAGGTCAGAAGGTCGGAAGGTCGGGGCAGGGCAGCCTGCCGAGGAAATTTACAAGTTTAAGTGACAAAGCAACAAAAGAAAATAGCCAATTTAGCATAAAGTAAAACACAAGCCGAGCAGAATGCAAATAAAAATGCAGATAAAAACGAATGGCGAGGGGAGCGGCAAACAGAAAGCAAACTGACAAACAAACACCACATACACACACATGACACACCACACAGAAATGAAAATGAACATGGAATAAAATTTAAAAGCAGAGAAATGCAACAAAACGTAAA
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AAGCTTAACTGATCATAAGGGTCATTAGATCATAAGGAAATATTGTTGATGTTCGGGATATTTGTT-ATATGAACAACATTAAATATCTAATATTAGGGCTGTTGTACAAATATGTAAATAAAATAAAATAAGTGTTAATCCAAAAA
A---TTTATTTTTCAT-------------TGATGTGGCAATACTGGTTGCATTTATGGCGCGCATCGATACGAAGTTCATAAAAT-TCAAATAACAAAACGAGT-------TACTTTAAGGTTACAGCTTAAGTGTTGTTAATTATA
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ATATCCATTTATTTTCCAAATTTATCAATAACAATTTATGTTTGAATAGGCGTTTGGTCTAATTTCAAATTGAGTTTTTAATGAAAAAAAAAATGGAGTTTTTAATATGGCAAGCCAGCTCGATGGCCA--GTTAATTAAGTTGCATCATTTAATTTAATTATAC------ATGTGTTCGTAAGCGTAAAAAATTAATAAAAAAAAAAAACTATAAGAAAAAAAACATATATAAACTAAACTCTGTACTTAATTTGTTGGGCTCATACAAAATGCAAGAGTACCTTTAATGTAAATGTAAAATGAAACAAAATAAAATGCATCAACTCTATTTGGGCGGTCGAATCGATTGAATTGTTTTATTCACTAAGCTGATTTTAATTTGATATTAATTTATATTAACAAAAATGTACTTGTATCCAAACAAAAAAGAGAAATAAACAAAAAACTGCCAGTAAATGTCTCCGCCTAAAACACAGAAAATAAATGCATGCCCAACTTTAAAACCAAAAAAAAAAACAAAAACACAAAAAGC----------TTAACTAAATAAATTGTAGTTTCTCAAGTGTATTGCAAATGTCTGTTCGGTATTTTGAAAACTTCGAAATCTCTTCAAATCATCA------------TTTCCTTAGCACGAAAAGCTAAGTATTAGAAAGTTCAAAGTTCATTTCAACTATTTACATGCAGCAAAGTACCCTAAAAGGTAAAT-TTTAAAAACAAACTCTTCATATGATATCGAAAAAAAAAAACAAAAAACAAACA--------------ATAAAT---------TAAATAATAATA----ACAATTCAATG----AGTACATTTATAGAGTTTA----------GTATGGAAAGTAACTAGGACACCAAATCATTTGACAAACAAATTATGAGTCATTGCAGAGTAAAAGAAATAGAATAAAAATTTCAA---------TTTCAACTAAATGCAGATAATATAG------------CAAAACAAACTATTTACAAAAACCAACAAGAACA---TTCAAGAATAAATAAAAAACTAT---GCAAA-----TGTCATATTTTG-----------TCCATTTTAAGC----------TTCATACAAAAAAAAAATGAGAAAGAAATTATATAAAAATAGACA-AATAAATAAATCAAATATATAATAAAAATCTTC-----CTAAAAACAAAAAACAAAGTAAAGAAAAATATCAAATGCAAATTTTGTCGTGTAGTTAATT-TATTATTTTCTATTTTTTCAACAAGTATAAATTCTTAATAAACAATTTTCAAGTGCTTTATTTGACA---------------------------AATTGATAGGCACAAATTTAAAAAAAAATAAATAAAATATATATATAAA------------------------GACACGGCTAATAGGCAAAGTACAGTCAACACAAAACA-------------------ACATACACTAGCCAACACACAACACAAAACCAAATACATTTCAATACCTGATTTGGCTTAGGCCTC-----------ACCGACATACATACACACAT---ACATATTATAATATATATTTAATGATATTTATTTAGTTAAATATTATTAAGAATTATATGGACAGCTAA------------AAACAACATTGTGAGCATATGTAGATAAATTTAACTAATTTTAATTTACATGCAACAAAACAAATAATATATATAAAAATGTGCATTAAAACAACAACAACAACAACAACAACATAACACTAGCCGTTGTT-TCGTAATAAATAAATATAAATGAGAAACACATT---TTGTGCATATTTAAGAAATTATTAATATATATTTAATTGCAGCAAATTCAGTTGAAAGGGCATACACTTTTTAAAGAAATTTAAAGGCAAAGAAAGTCACAAAAGTATAAAACCCTTTTTTTATTTTAT-----ACAAT------AGAAAGTG-------------AGAGTAAGCCCATGC------------------CATACACATACTTCACACAGCACA----CGCAAAATAATAATAAATAAAAATAAAATTATAATAATAATAA----TAAATGG-----CAGCGTGAATCATATCATTGTATTTTGCTTTACGA------GTGACGATATTCT
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GCTCACAACTGCGCCATGCAATTAGTTAGATAGTATAGTCAATTA------AAAACC------ACGAATTTATAACTTTGTTACTGTAGT
GCAC------GTGCCA-GCCGTGGGTTAGTCAGTATCTTTAAGTATTTGTTAATACCATGTATACGAATTTAT---TTTGTTACCATAGT
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CACTGGCGCAGCACCAGGCTGCTGCGGCTTACGATTCCAATTAAAAAAGACGCAGCCCTGACGCTAACAATGCCAATGCCAATGCCCAAGCTGTTGCACCCGCTGCTGTCCTGCTGCTAATATACAACAACAACAACGACACACCCACACACACACACACATACTCACACACACACACACACTCCGCCCCCTTTAAAACTCGCTCCT-TTAGTTTGTTTATTTTAATTTGTTTGTGCAACACTCAATTTCTGTGAATTTCTGAACCAACTAGTTGGTTCAGATGACGATTGATGATTGATTGATTGACTTATGTTTAGTTTAGCTGTATGGCGAGCGTGGTTTAGCGAATTTCAATTGATCTATATTGTATATGTATATTTATAACTATGTATTTAGTTTTATGTTTATTATATAACGATACATCTATTTGTATTTGTAAAGGCTTACAAAAGACTTGCGGCATTGTGCCCA--CGATATTATTGGTTAGGAGAACATTAAGGGCGTTCCGAAATATATGTATATTTAGCAGCACCAACTGGCAGCGCTGGCGTTGACG----TACACACACATGCATGCACACACACACACACACACACAAGCACACACTGATATTTACTAAACGCATAAACTGCAATTCGCACTT-GAACTTTAGCATAAATGTTTAACTCGTAACTATTTCCCCCCTCAAACGTTCCTTTCTGTGACAGCTTAGCACAAGATACATGACAAAAATAAAATAAAGAGAAAACTTATTGTAAAGTCATCCGTTAGGCACAAAAATGATGGGCACGCCCCAATTATCTGCGCCATTCTAGTCAGTTTCATATGACAGAACCGATATTACAAGTACATAATGCTAGCAACTATAATATACAGACTTACACACACACACATTGTCTGCATT------------CATATATTTAAATGTC-TAACTAATAAAATGTTTGTGTAGAACAGAAATATAGCAATCCAAATGGA--GGCAAGGCAAATACTACAAATACCAAATTTCAATGTGTCAAAAAAAAAAAAAAAACTGAAAATTAACATAAATAAATTCAATTCCATTAC--ATA
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CTAGATACCACACGATAAGCGCGCGACTCGCACTTGCTGCCCGTCATCATGGTGCGGAAACACAGGGGCACTCTGGCCGTCATTGAACAGATCTATCAGGACATACCCGCTTTCACCGATATCTTTACGGAGGAGAGCTTCTACACGTTCGCCTTCTGTTTTGTCTGTGCCACCGTTCTGGTGGCATTTATACTATCGCGCTTTATCACCATCAAGCCCGTTGATTTCTGAACCAG-------------------------------CATTAAAAACTTAAGCTTTAACATGTA--AAACA
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GCCAATTGTATTGTTCAATTCCGCACACGTACTTTTCAAAATATATATACGCTCTAACATGTAACAAACA
ACCAG-------------------------------CATTAAAAACTTAAGCTTTAACATGTA--AAACA
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AACAATATATATGCACCACCGCTCAACCTCATTTATTTAAT----CACAGAGAAGCACCT--CTATATTCCGAAGCGAGCATCTCAAAAGTAAACTTATA-------------------ATTTAATGAGCATATGTTACGATCTGTAAAACTCATCATCGCATTTTTTATATGATTTGCCATTAAAAGTGAATACAAATTAGGCATATTACAA---TGTTGATGTTTTGTACAAAATAATAAAAAAA---ATATTTTTAAAAATAACTCAA
>Aats-phe 9485747 9485809|9007 chr2R 9484050 9485788 scaffold_1 1241759 1243489 - 80571|1734 1779
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TCTTAATTAAAAAAAAATTGTTTTAATCCGAAAATAGTCAAATAAA
>Aats-phe 9485747 9485809|9008 chr2R 9485789 9487202 scaffold_1 5660991 5662522 + 43265|0 20
ACACCAGTAAAGATAGCCAAC
GTATCGAAGTCGATCGATAAC
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C--------TTAGCTTCAGTTGACAGTTTTATTTGGAGACGTTGTT---GAACATAATTTAAATT--------------------AAAATATACATAATTCCTTTTGCTGA---GAAACTT----------------AAA
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TAAAGAATTTAGACTTGTAGTCTACTACCGAAAATTGG---AA
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A----CGATTGTC-------GATAACCACTCAAACACCACCTCCAGCCAGCACCAAACACAACCACCATCACCACCATAACCACCACGA--TGTTGCCTCAGTTTTGTTTAGATTTTTTTTAATTTTGTTGCCTCTTGTTGTTATTGGCCTGGACAGCCGAACCCAACCGACCCGACCTGACGCCCAACCGCCCCACACGGCC--CCGCCCCCCTTGTTCCTGCCAACGAAGTTATTTTGTTTGTTATATGTGTGTGAATTTATTCCTAAGCTAAGTTCGTTCGTCTATGTTCTCTAATTTCGTGAGCTCCACTGTATTGTATTGTATTGTATTGTATTGTATTTGATCGTATTTGTATGTATTATTAGAGCTGTTCCCAAGGTCCAAGGCGAGCGGCCAAT-GGGCGTGGCAGAGGC----GAGAGTTCGCAAA---------------AGACAT---TCCATATGCAGCGGTCGA-----ACGAAGGAATTAGGGAAATTCGAGAAAGTATTTGCAAGTA-------------CTTTGAAAACAATCGAACAGATTT---CAGATTCTCATACACCGATACAGATACAGATACTACAGACTCGTTGTGCAACTTAAGCACTTGTACTTAATGCAAATTTGTAGTGCCACGCCCAGCGGA----TTGCACGCCC--CATTTCGTTTGATTACTTAAGCAAAAACC----------AGATGAAATGATGGTAGCAAACACAAAAA----GAACCAACAACAAAACAAAATC-----------------GAAAAACAAAACACAA----------AATAGTTGTACATTTTATATTGTATTTAATTTAATTTAATTTTT--ATAAAAACAAAATCGACAAACT-----AAGAGAAACAAACAAAAAAGCGAAAGAAAACAAAAACAAAAAAATGGGAAAACAGATCGAGAAACTTTCAGAATAAAGAGCAAAAATATTGGTGATATTTTAAATGCTTAAACACAAATTGAGAAATAAGCGAATCAAATGAGAAAACAACAAAAAGCGAAGACCACAAAGCATAGTGAAAG---GGAAGAACTTTTAAAAAAAAAAAAGCGACATAAATTTGAGAATGAGAAGCAGTTATTATTATTATATTATAATTATTATTGTACATTAATT--TTTTAGACGAGTTCATTTTTAAATGGAATTTTAAACGCGGAGCAACAGTGCGAGAAATGCGCAAACA--AAACATATTTAAAAAATATACACTATATAT----------------------------------------------------------------------TATGCGTAG-TTTTTGGTAGTGAAACGTA-----------------ATTAGTAGTTTGTTAAATAAATTGATATACACCCAGAAATACATA-ATATACAAATCATATGTATGCGATCCGATATATTTGATTACTGTAAAAGCA-----------GCGCTA-ACAATTTACGAG-TATATAATTAG-TCCATAAGTCGCCACA-------AAATGTTTGAGGAGCTAAGCGGAGATCGAA-------ATTTATATTTA-CTACATGCG---CCTGGCCGCATTACCAAGTGATGCCATGCCAAGCCTAGCCACGCCCACACAAATGAGGAGGAGAAGGACGAACAATATTAGAGCAAACAAAAAGA-AATCGCGAAAAGAAGAGCAAACGAAAATGCCAGAGATTCCAGCAATGAAATTATTGTA-CGACAACTAATTAGAGCAATTCCATAAGTCCGTAAGTTAGACA----CGATCAGTT-------------GAGGCCATAGAAATTTTTGAATCAATCGGGCACATTGGTTGCCACTTCCACAATTATATAGTAACAGACAGCT----CACAGCCATTTT----------TGCAGAGTTTACATACATACATTAATTAGGATCAGCAGCAACAAATCCATAGCACACACGCCTAGCAAAAAAAATATATAATAAATTTAATGAAAAGTATTTAAGCCGCAGACAAACAAACGATTAAAACCTAAAAAAATTTACTATT--ACAATTATAAATGAAATAAAATACGCGAATTGTAGTTTGTAATTAA--------------------TGCTAAAGATACGAAGTAAAAATTTGTTTATAACT---ATTATATACCGCAAATTATATATA---------CACTATTATTACTATATACAATATGGCATATTATTATTACATTTAT------------ATATATATATATATATACATATATATATTTCACCATT
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>mam 9573822 9576263|9125 chr2R 9575889 9576348 scaffold_1 5477040 5477666 - 5653|0 557
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ACACATATTTACACTCACATATACACACACAGCCAGACACAACTCGATATCAATTA-----AAAGCAAACAGCTGCCAGCGGCAAACCAAAACTTTAACAATTTACAAAAAGCAAACTTCAAAAGCAAAAAAAAAAAAAACAAAAACAAAAAAAGCAAATGCAAATGCAAATTAATTTTAGCTCATAATTTATATAAAAAAAAACAACAGAAAACACAAACAAAAAAAAAAAATACAACAAATCGAATTGGATTTGAATTCGATTTGAGGGCCTTTTGCAGCATTTTGTTATGTTTTTTCTCTTTTTGTCATTTAGCCAAAAGATGT-TTGGTGCACAAGTCTTCGGTTTGTCGTTTTGTTGTCCTACAGGATGTGCAACAGAACTTATGTGTCAATAAATCGAACACGTACGAATTGTTGGCCGCAAAAAAAAAACAAACATACAACAAACAAAACAAATACAAACATTTGTAGATTTTCTTTTAATATTAAAGAAACCAGATAAAACAAAAACAAAAAGCAACAAAATAAAATAGTAAAATATTACTTTTGTAAAT
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TGGACTAAGCCCG
G----TTGGACAG
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TTTATGACAATTTCAATTGTTTGTATTTTAAATTCTATACAAATTTACTTGAGTCTAAAA
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C-------------------------TC
TTTCCAGAGACACGATGTGGCCGTTGTT
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GC---------------------GCACTCTTCCTAGTGC-----TGTTCTAGTCTTTTTTGTCTAACGCTAA-GTACAAA----TTTGTATAATTGTTGCTAGTTTTGTTCAAACAAAACCGATATG
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AAGGCGAATGTACCGTAGCTCCGACCGCTTCTCGCTTATCCATGCATTTGGTTTTG--------------GGCCTGGTCACCAACCTCACCTCGTATTGGTTACGTTTTGCAATAAATTTTAATTCT
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ATTTATTGCTGCCCACTACACTTTTGGTCTATTGTCTACCCAGGCAGCGGGCCAGGTTGTCTGCTGTCTGTTGTCCGTTGTCGTCTGCTCCTTTGCCTACCAACTTTG
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>CG8468 9744431 9745489|9297 chr2R 9745350 9745426 scaffold_5 1976287 1976371 - 1126|0 85
TAACGTTTATCAACTACAATTACATTAAAACAGAATGAATGATTTATATTA------CAT-TTAAATTAAT--GAGTTTACATTGC
TAACTGTAATCA-CAACAATAATAATAGAACAGAAAGAATTATTAATAATAGCAAGGCGTGTTAAATAAGTAAGAAAAAACAAGGC
>CG8468 9744431 9745489|9298 chr2R 9745427 9745773 scaffold_4 3048230 3048622 + 7916|0 65
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ATTATGCTTGGAATTTGGTTGC-CTTGATCCATAATGAAACGCATTTGTTTTTAAATACAAACTAA
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GCAACC
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>%26bgr%3B4GalNAcTA 9775493 9776017|9321 chr2R 9771366 9776022 scaffold_4 4836949 4841535 - 151476|4371 4963
C------------------------------------------CTGCATAAAAGACAGCGTTACAATACGTGACCTT--------TCCAACTCTCAAATATGCGTATGTACAAAGGACAACATTACTTTCACAAACGGTAGTCTCTTTTAATAGAATGACAGATCATGGCGGCATGGTTAGAATATTAGGCACATATTG-TGTGTATGGTAGTAAGTCCAGTAACTATACTCATATTACGATGTAGTATACTTTTAATCCATCATTTAGCTTCAATTCGTAATCCAAGAACAACAATAAGAACTCGTCTCTGTAGCAATAATCCTCCCGTTTCACTACTCAAAGTGCTCAATGATACTTATCTAAATAATATAC---CTCTGTTGATTTTTGTATTGTTTTATGTTGTTTTTAGTTTTTTGTTGTTTCACTATAGTGTTTTTTAATAACTTCTCAAAAGAAAG-----------CTACACCTATTCCTACAAGGTGAAATGTAGATATTACTTTTGTGATATGCAAATTGTTATTCGATCAGAACG---ATTTATACCAAAATAAACTTATAAAAACTTTTACTATACCAAAA
CCAAACACACAGACAGACACAGACCGAGCAGTTTGTTCTCGAACTTCTCAAAAGACAAAATTGC-ATATGCGAATCTCAATTTCGTGCAATATTTACTTATGTGTATGTACAAATGACAACATTACTTTTTCAAA--GTAGCCT-----------------AATTAT----------CTCGAATAATAGACACACATTATTGTGTAC-GTAGCGTGTCCAGTCAATATA-------------GAAATACATATGTACTTTA--------------------------------------------------GTAGTACTGCTAGCCCCATTTAA------AATATATTCTATG----TATTCTAGCGAATATATAGATTTTGTTGATTTTTGTTTC------------------TTCCTTCTAATTTTATTATAAATCTCTCTAAAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACAAAAATTCTACACCAATTCCTACAAGGTGAAATGTAGATATTACTTTTGTGATATACAAATTGTTATTCGATCAAAACGATAATTAAAAGAAAAATGAAAATATATTAACTTCGGC-ATGCCGAAA
>Ih 9813374 9813771|9351 chr2R 9812756 9817136 scaffold_4 4882023 4886347 - 90999|618 1059
CACTGAGGAGCAGTGACAAGCGGTGCCCTCGGGCACCGGGCAACCATCTGAAGCAGCAGTTCGCTGGACACTCACTCACCAAGTCCCACATCCATACTCCACACA--------GGACTACCACTCACACACACACACACACAC-----------------TGCGTATATAATAATT--TAGTAAAAGGAACCCCAAGACGCGATAAGAGTACACTAAAA--AAGAATCAATTTATGGTAGACACTCTATATATGCAATTGCGATTTAGTAGAAAACG----------TATTAAAAACTAAAAACCCAAAAAAAGAAGATA----AAAACAATTACACAAAAAATGTCCTCAATAATTATTCATAATTTCAGCTCCGCTAACTGTGATG-ACTTTAATATAAGAATCGAAAAAAAAATTAACAAACAAACAAAAAAAAAAAAA
CACTGAGGCATCACAACCAGCCCAATCGGCGTGCATCGAGCCACCATCTG-AGTAGCGGTTCGC-AGTCCCCGAAAAACAAAAGCAAATAGCAATACACAATACACATACATGGGACACACACAGACACATATACACACACACCCACACCCACACACACATGCGTATATAATAATTAGTAAAAAAAGAAAACCCTAAAA-----AAAAGTACAGCAAAATGATGAATCAATTTACGGTAGTCTACATATATATGCAATTGCGATTTAGTAGAAAATGACAACAGCAACAACAACAACAAAAACAACAACAACAAAAGAGATAGTAAACGTATTACAC-AACAATGTCCTCAATAATTATTCATAATTTCAGCTCCGCTAACTGTGATGAACTTTAATATAAGAATCGAAAAAAAAAAAAATGAAAAACTAAAAAAA------
>CG8603 9866364 9866670|9408 chr2R 9862808 9866662 scaffold_11 3104803 3109069 - 99421|4168 4487
CCTGGCCAACAGCTAATGGGCAACTGGGCCGATTCGATTCTCCCTGCTGTCAACTCAAAGTTGAGAGCCGATCGAGAGAGCCCGCAGGATCGGCCAGTTTAGTCCGCA-----------ATGTGTATTAGTTTAAAACGATGTGCTT-------AATTAC-CACACCCACACTATAATGTATAAATATTGTATGTTCATTTGTGATTTTCAACTAGCTAGTAGGTTAATTATTCTATATATCGGCCGCATAGGTGTAAGC-ATTTTCTACATAATTATC-AAAGCAAAGATATACCGTATGCATTAATAAAAGTATGAAA
TGCGTCTAGC-----------------TCTCACTCAATTTTCCGTGCTGTCAACTCAAAGTTGAGAGTGGTTTGCGAGAAT---TGAGCGCTGCCTCTTTAGTCGCCGGTCGGGGTATTGTGTGTATTAACTTAAAC--ATGTGCTTAAAATTCAACCACACACACACACACTATAATGTATAAATATTTTATGTTCATTTGTGATTTTCAATTAGCTTGTAGGTTAA----ACTATATATCAACCGCATATGTGTAAGCAATTTTTTACATAATTATCAAAAGCAAAGATAAACTGTATGCATTAATAAATATTTTAAA
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ATCCGGAAAT-------TTACTCGAAATGTATTTTAAGAACTTCTAGATGTTAGTTA-ATTGTTATTGATTTGCTTCAAAAGCAAACAAAAAGGAGTTCTCGGAACT
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AGTT--AGTTAAGTTAGTGGTATAAAATTCTAGGCCAATAAACACA--GATTGCACTAAATAAATCTCTTAAGCGCCTT-----------------TATTGGGCAGATTTTAAA------TAACTTAATAACTACATGTATAAAC--CATTTATTTTTTCATTTATAAGCTTTAAGATATGATTCATTCAATGATAAGTATCAGCATATACAAATAAATAAATATACGAT----GAT
AATCTAGACTAAGTTAGTGGAAT--ATTTTTAGATAGACAAAAGTATTTATTAAAAAACATAAATACAGTAAAAATTTTAGATATAGACAGGAACAAACCGAACTAAGCTCAAAGAATTCCAAATTGAGAATTTCAAAAACAAAATGCATTTACTT--------------CTAAAAACAAGATTCATTGAATGAAACAACAAAGCATTTGCCTCT---CGAAGATTCGATACCCGAT
>Tfb1 9880216 9880336|9418 chr2R 9877939 9880359 scaffold_11 3122583 3124998 - 99377|2330 2477
CAAACGC-------------TCAACGGAGGCGAGCTCGA--------GCATCTGCCACACACCTCAAGAACCATTATTATAGACTAGGCTTAACTATAAGAGTATGCGGAACGCATTGGAATAAAA-----CATTATTTGCA-ACTTG
CAAATGCAGCATCAGCAGCACCAGCAACAGCAACAGCAACAGCAGCCGCAGCAGCCAACCATCCTAAACAACATTATTATCGACTAG------------CAGTACTC--AACGCATTGAAATAAAAATATGAATTACGTATATAATTA
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TAAACTAAATTAGTTTGCTCAACGAAAAACCTGGACACTTGAAGCGCCTTCATCAAACACACCCGCACACATACTATATAT-CTTTATAAAATACAC-ACACACATACATACATACACGCATGCATATGCATATGCACCCTAACATTTAGTTAAGCAACAAAAAGTTTAAGTAATTTCATGTAATTTCCCTACACCCTTTATTTCTTGCTTTATTTTTTTAAGTGCAAAATTCGTGCTCCTCCGTTTGGATTTGCGAATTGTGAAATGTGTATTTTCTTTCTTTTTTTTCTCCTTCTTCTACGTACGAAAAGTGTTCGGC-ATTGTCAGCCGTCACATTTGGAATTAATTAATTA--------ACTGATGATGTTGTTAGTTTACACAATGAATTA---ATTATATATCTCGATGCATACAATACAAATACAAAACATACAAATACAAAATGCACACGACCAAC--CAACGTGTAAAACTGCAAACATAAAATACCACCAAAGT-TTTATTTT
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>Asx 10026215 10027309|9572 chr2R 10026493 10027460 scaffold_1 598883 599895 - 11824|0 935
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AAACTTAGTATGCAAGCAAGTGTTGTGGATTTTGTTCTTGTTGCGTAGCCC-TAAGAAACTCG---GTTCAGGTGTTTGTTTATAGGGCTATCGCATGGCCACATACAAAATGATGACATGAACAGATTATAAACACTCAATGTAATTTAAACAAAACAAATACAACAAAAAGGCAGCGGCAAAAGCAGCAAAAACCAATATAAAAAAAAAAGAAAAAAATAAGAAAGCTATGTACATATTTATGTTTAATATTAATTGTAATTTATAAATGAAAAAAGTATATAAATATATATATATATATATATATATGAATATATATTTACGATTAAGCTAGAATTGAGAAACTTCAAACTTAGGTTGACATATGCCTGAAGACTATATTTTTTATAATTTGTCGTTGCAGCATATGCGTGATGATAATTCAGTTGGTTCGTTTTAAAAATACATAAGCAACTACATAATAAACATACATGCAACTACAATACATACATTATATATTTTACTGTGTAATTTTTAAAACCTAAGCTTTTTATTTC--------------------CCTAATCTA-AGTTTATCATTCTTCACAACCAACA-CACCCACACACACATACCACAAC----CACAACCACATCTCTAGCATACACATAATATAGCGCATAAAAGTAATTGTAATTCACATATAAAACAAATTGATTTAAAAGCATAAAACTGTTGATAAAACAAAATAACAAC-ACACACACACACAAATATACACTGAAAG----AAAAAACATAAAT-GTAC-ATTGAGAAACTAAA-ATGCAATTAAAAACAAAAACAAATTATTATAACAAGATGAGGAACAAAATTCAAAAGAGA-------------GAAAAACAAAAAAAGGA---AAACGAAAAATCATTTTGCTCCTAGATGCACT-----CAAAATT
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CGATATGTGCAAATTGGCAATAGCTACAAGCGTTAAGAGTACTGAGATTCCCTACCCGCACACACACACACACACACATACGCACACAGACATCCACAC--ACATCTATGCCACGCGCAGACAGCAGT--CCATACACTCACACACACAGACACAGACACACACACATACGACGGACTTTATAAACTGCTGTTCATTGACGCT-GCGAAGCGCCGCA--AACTATGTTAATTATTATTAGTAGCAAAAA--------TTAGTTAGGATTTATGAAGCG--TATATATGTATGTATATGT------ATGTAACTAAATAGCATTCAGCGTTGCAATTATATATAAATTTAGTTATATATTTACAATGCATATTGTACACACACACACACACACCGACACACACGCAGACGCACGGACACACATCGGATTTGTGTATGTATATAGATGAACTCTGATTAGGCCTAGTTAAGTTAAACTCCCTCACGTGGGAGAACTGAGCAAGCGG-AATGCCA--TTTTTTGCTAATTTCAAATTA-----GCACTGCAAGTTTTTTATATATATACGATAAATATATGTATATATATATATAAATATACATATTTGCATATACATACCATATAACATATATATATATATATATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCATAAGTAGCCGA-TTTTGTACTGTGTAAAAGCGACGCGTTTGATTTTTGTATGTGTAAATGTTTTGTATGTATGTCTGCCGTATTGTAACTGTAATTGTTGTAACTCAATGATATGATATTGAATCGATATGATATATAAGCGTATATGTATATGTATATGTATTTGTATAGTTAGTTAGTGTTATTATCGATGTGTGTCTGT-------AGCCATACTTACGTTGATATAAATAATGGCAGATGTTTAGGCTTAAGCTTGCAAAGATATTCCTTAACGATAATTATAAAAAAAAAAAAAAACAAA--------------AACTGTGGCCATTATATCGCAATAACAATAATAATCAAAGAACAAGATGAAAAAGGTGAAGAAGCTACAAATGAACGAACTCAAC---AGCCATGGTACAAT--GTGCACAAACAAACCAGAGAGAA--CATTCATGTATTTTCGGTATACCGAATATTTAATACCCTTGCAGATATATCAGCTCAATTCGGACTGCGTCA---TAGATATTTATATATCAGTCTGTTAAAGCCCAATTAAACCCACAATAATAAAACTTCCAACCAAATAAATGATTTAGTGAGCCAAGTCAAGGCCTGATCGAAGACTCTGCAAGGCTATCAAAGTAATTTAATTATATAATAAATGTCTTCGTTTCATTCGTATTTTGTGTATTCCTAAT--------TATTTCTTAGCTAAACTATTTCTAGACTATTATATTGAATGTGCAATTTCCATTTTACAGTTCAAGAAGAATGTGTTTCATG
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CAAAAGTGGTTTCGCTGGACGACCATCTTTGGA---CGCAACGCCAAGTTTGAGGCCGACACAAGCGTGGCCAATGTCGAGTCCTGGCGCAAAGGTGGTCGAACAGCGAAACGAGAACAGGAC----------------------------------------------------------------CCAGCACCAAGCAGTCGCACGCGACGTCCAAGACAACTGCAGCCGTACGATGAGCAGCCAAAGGGCAACAAGGCTGCAAACACTGCCCGAGGAACCGGAGTTAGAGCTGGA---------------GCAAGAGATGGCTGCGGTGACGGAGCAA------------------CCGCAGTTGGAGATGAG---GCAACTGTTGCGGAACTCCTGGACACTGTCCGCAACCAATACGAGCAAAATATGGCTTTTAAGAACTGGCAATACCAGTTGACGTGTGATAAGTTCT-AAGCAAAACCAAAGAATCCATTTGAAGTTGTACAT------TTCGTATATACGTATTTACCCTTCTCTTCTTTTTATTAA---AAACTTCAAAATGTTTAAT
>Sec61beta 10134185 10134547|9684 chr2R 10131903 10136366 scaffold_11 3008202 3012754 + 70466|2542 2986
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TACCAGCGGCAATTTTAA
TACATGTATCTATTTTAA
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AAT--ATTAGTTTTTAGT---ATTGACTATAGTTTGAATAAAACATGAACTGTAC---AATTATGATTAATTAAATATGCAACATTTTTGCT
CACGGATTATTTTCCAATTCGATATGAAATAATTTTAATAAATCTCACAATCAGCCTTAAGTACAAAGAATTATTTGATCGACG-GTTTAAT
>Dro 10261048 10261577|9859 chr2R 10261503 10261510 scaffold_11 3768494 3768501 + 401|0 7
ATGTAAAT
ATTTAAGT
>Dro 10261048 10261577|9860 chr2R 10261511 10261841 scaffold_11 3766370 3766717 + 1975|0 66
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ATTGTATATAGAATA--TTATTATCATAATTAAATAC-----TTCAAATTATACAAAGTAAGTATAA
>AttA 10262984 10263084|9862 chr2R 10261964 10263057 scaffold_11 3766832 3768020 + 28051|1131 1206
GCCTGCGTATTTGATA-TTATTAAT-TCTAATTTATTGACAATTATATTAAAATCAAAATATTGAAACCTAATAAA
TTATGTCAATTTGCCATTTACGAATATTTAAATTATTTAT--TTATAATACAAAATAAAGGAGAAAACCATTTAAA
>AttA 10262984 10263084|9863 chr2R 10263058 10263380 scaffold_11 3770174 3770493 + -163|0 31
CCTA-----ATAATAAATTTTAATTTAAAAAA
CCAAAAACCAAAATAAATTTTATGTTTAAAAA
>AttB 10264839 10264938|9865 chr2R 10263976 10267209 scaffold_11 3769189 3772483 + 108839|946 1070
AT----------ATTACCCTGGTATAGATGTAGAAACTAATTTATTTAAAACAAAATAAAA-AATAATCAAAAAAGCT-------------ATGAAGCTATCTGCTAA-ATTATTACCCTTCTTA
ATGTCAATTTAAATTGGCCATTTACGAATATTTAAATTATTTATTTCTTTACAAAATAAACCAAAAACCAAAATAAATTTTATGTTTAAAAATCAGCCTATTACCTAAGAATTCTATTCGGCTGA
>CG30476 10267977 10268142|9866 chr2R 10267256 10270451 scaffold_11 3772531 3776006 + 74354|836 1001
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GACAA--------------------CTGGAATAGAAGCCAA---------CATATGGTAAGCATTTACCCTGAACAT----AACGCCACGT--------------GATCACAATGTGAGC----------ATA-AGCAGAGGGCAACGTTGGACAATATCCGCGAG
>CG12859 10271870 10271936|9868 chr2R 10271197 10272660 scaffold_11 3777062 3778535 + 55146|700 790
GCCATACATTCAGCCAA--------------TTGATCTTCGATTCGTATAGTGGA----------ATTAAAACAAAACCGTAATGAAGCTA
AT-GCCCATTTAGTGAAATTATACAACAATGTTAACATTCGAATGTAATTGTGTATTTTTCGTTTGTTATATTAGTTAATTTAGGTATATA
>BEAF-32 10287271 10287501|9884 chr2R 10285316 10287523 scaffold_11 1586458 1588643 + 48538|2081 2364
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TAGAACAAGCTAAAAACTACGGATATACATAAATCATTTTAAACTTACCCAAGCTGAAGAAGAAGCAGAAATCACTACAAAAAAAAAAAACAAAACAAAAGAAAGAAAGAGAAAAAAA---------AAACAAACACAAAAATTGTAACATTTATCTTATCAACAACTATTCATATAGGCTAAAATGTTT------------ATATGTACGTTTGTTAACGTACCATTTGCAAT----TCTTAGTTGGAACATATAATTAATAAGCAC-ATATGTTGAGACGAA
>CG10200 10324747 10324796|9923 chr2R 10324099 10325014 scaffold_11 1634405 1635213 + 7325|670 721
AACATAGGTTTTTTTTCGAGTGTAAACTTTAA--TAAATTACAGTAAATTAA
-----------------GAGCCCCAGCTCCCAGCCCACCTATATTTAGAAAT
>CG10205 10348436 10348818|9951 chr2R 10347316 10348808 scaffold_11 1660998 1662338 + 19509|1164 1598
GGGGGCTGGAGAGTTGTCCGCGGGGCGGCAGGTGGAGCAGTTGAAGCAGGTGGAGGTCGGAGGTCAAGTATTACCCGTCCAGATGACGCCGGGCCCCTATCCCATCTACTATGTGGTGTCCAAGACCAACGGACGCTTCGGCAAGTTCCCCATCAAGTCGTTCCAGTCGCCCGCGGAGTTCGCCAAATATCTGGTGAAGAGCAAAGCGGAGCCCATTGGCCGGGATCAGCGATTCGAGG------------------------------------------------------------TGATCTTGTGATCT--ACCCGCTCCATCTTCTCTAAGTCAAAGTTAAAGTCTAAATTATTAGCCCCTAAACGTAGTCGTAACTATAATATTATAAATGCTTATTGCCGCAATAAACCCATGTCTAAAATTAGCTAA
----GCAGCTGCACTTCCCGC-------------------TCGAGTCTAGCGCGAGTCCCATGG-AAGCGCTGCCCGTCCAGATGACGCCCGGTCCCTATCCCATCTACTATGTGGTGTCCAAGACGAACGGTCGCTTCGGCAAGTTTCCCATCAAGTCCTTCCGCTCGCCCGCCGAGTTCGCCAAGTACTTGATCAAAAGCAAGGCGGAGCCCATTCCCCGGACCCAGCGTTTCGAGGGCAGGCCTCAACCGACGACCGAGGAGGGGTCGGTCGCCAGACGGTAGTCGGTAGCTTTACTGCTTTTGTGATTTGCACGCGCGCTTTGTATGCTAAGTTAAA--------TTAAATTATTCAC-------------CGTAATTATAAT--------TGCTAATTACCACAATAA--------CTACAATTACCCAA
>Ercc1 10368666 10368811|9964 chr2R 10367811 10370274 scaffold_1 604411 606842 - 96072|870 1018
---CAATCCATATTAGGTGTAATGCATCCCATAATCGTGTATGACACACTTCATCCATCATTTGAATACTTTAATTTTTTATTACGCAGACACTGTACAAAAATTAAGTTCCAGAATTACCCACTTAAATATATCAAACAATAATCCTT
GGCCAGTTTATTGTAACAGCTATTTATTACAAAAGGCAATAGGA--------------------AATACTTAAATTATATA---CACAAAACCGGGACAGAAA------------------------GATATG----------------
>CG12855 10372166 10372363|9965 chr2R 10370275 10372315 scaffold_1 606991 609088 - 88226|1983 2136
GT-GCATTGGCCATTGGTCATTCCAGATTTATAACATGATTTCTAGTCAATTTTCGAGACTCCTAGGCGAGATAATCCACTCGAAATTTTGTTAGGTTTAGGACAACTATCATCCACTGTT--ATAGGCTACACAACAAGGATATT-TGTAAAG
ATGGCATTGTAAGTT--TTATTT---AGTTATATATTTATTT--------TTTTTGACATTCCCTTAAAAGATG--CCACACGA-----TGCTAGT-------CAACTTTCGTTTGTCTCTTGACATGATATATCACACGAATATTCTATAAAA
>CG12855 10372166 10372363|9966 chr2R 10372316 10373482 scaffold_1 609513 610659 - 46033|0 47
TTATTGGAAACATATATATTTTCTTCAACCGGCAATAAAAATGTAACA
TTCTTATAACAATAGATTTTTTCAACAAACGTTTATTAACTATTTACA
>Cyp6a22 10388233 10388334|9978 chr2R 10387785 10390615 scaffold_16 2166280 2169259 + 81761|448 604
TGCTGCTTATTAAATCG-------------CTATCTGGATTGTATTCTAAC------------------------------ATTTA--GTATCTACAT-TTTACAATGCTGTTATACAAATACACAATCAAA---TGTTTTTATCAAT------CAA
TCACATTTATCAAATTGACATTATGTAGTCTTATATGAATAATGATTTAGTCGATAATAATAAGAAATATATTAATAAATAATTTATCGTACTTACATATCTACAATTATATTG-ACCACTGCCCGATTTAAGACTATTTTTGTAACTAGGGTTCAT
>Cyp6a17 10390409 10390422|9978 chr2R 10387785 10390615 scaffold_16 2166280 2169259 + 81761|2781 2794
GTTTTTAACAAATA
AT-----ACACAAT
>Cyp6a23 10392298 10392517|9980 chr2R 10391239 10392527 scaffold_1 642378 643781 - 557|1259 1504
GACTATAAACAAAATTATTA-------------TGGGCTTTAATGGTTAAATATTACAAT--TTTATTTGGTCATTTATTCACGGCTATATATGATT--TTTTTGAATTAAATCCCTCTTAAAGCTCATATTCAGTAT------ATGAGAGTATAGCATTCAAATTAAGCCTTGTTAGTTTGTTGTTGTAAATTTATTGTAAATATTTGTGGTAATACCCTCAATAAATTTTT---GTTCAGCTTT
TGTTACCTTTAAGATTTTCATATATACTTTGGTTGATCCTTATTGAAGAAATTTCATTATAATTTACTTTGTTATAACTTTA----TATATTTGATTAATTGTTTAAT-------ATCTTACAATAAATATGCTCTACTTAATAAAGAGGTCTTAGCTTAAAAAAGAAAATCGTATACCTAGGTCTTGT---TTTATATTA------TATTATAATATTTTCAAAACATTGATTAAATGCAGTGTT
>Cyp6a19 10394229 10394618|9983 chr2R 10394365 10394577 scaffold_16 2174616 2174814 + -513|0 223
AAAGTATTTTTTCTGCAAAAGAGTCTTG-TAATAATT---ATGCAATAATAAGAAGCCTTTAAAAGGCAATATATCACCCAGAAAATAAAAAA-ACAATTTTTTAAAACCATAAAATGAAAGCCAACTTACAGTAGTTAGTTATCCACAAGCATGCTACTGCGATTAGACACTAATAAGCTTAACATTCTTATAGATATAGAGCAACATTG------TTTCTGG
ACAATAATATTGAAGTAATAGAAGCTGGATAGTAGCTGCGATGTAGTCGTAAAAAATATTTA--------TATATTGGCAAGACAAAAATAAGTATGATTTATGTAAAT----------AAGCC---CCGCAGTTTCAAGTTAAAATCAAGCAGTGTATTTT-ATTAAA-ATTCCTGAGC--AACATATTAATAATTCTAAACTCATATCGGGTCATTTGCATA
>Cyp6a19 10394229 10394618|9984 chr2R 10394578 10396198 scaffold_16 2172350 2173999 + 69501|0 45
AATTCCATATAAAATAG---GGACTAATA--GATTAAATATTGAAA
AACACAAAACAAAACAACTAGTATTAATATTGAGTCCATATTAAAA
>Cyp6a20 10398628 10398911|9989 chr2R 10398501 10398716 scaffold_4 5062660 5062885 + 520|132 228
AAGTTATAAAGATAATTCATGAATTATT------CGGTTAAAGCTTTGTTCTTG-CGACGTAAAT-ACCAATACTAATACTGGATTGAATTGAATAA
AATATGTAAACGAGCTCTGTGCTGTGTTTTCAAATGCTTGAATTGTTGTCGATGTCGTCATGTGTGGCTAATACGCAGTCTGAATTTTATATAATAA
>Cyp6a20 10398628 10398911|9990 chr2R 10398717 10399325 scaffold_16 2181304 2181944 + -2479|0 240
TTTTAAATTAAAGCTTTATGATAGTTTTTCACATGCAG----TTAATTATACCTTTTACATCACCTACAGT--GTATAATGTGTATACGTTTTTTAATATGTGAA--------------------------------CTAGTTTGTA--TATTTGATGT----AGCTTAGTTTAAGGTTTCAAAAG--AAATGTTTTGAATCGTAACAATGACATATTTATTAAATAAATTTACAACTGAA
GTTTTAATTGGAGCTAAATAATAACTTTGCAAATATGGAAACTCAGAAATTCCTTGAAAGCAATGAAAAGTTAAAATAATATTCACACAAAAATAATAATGAAAAAAAAGAACAAGAGGAAAAATGAAAAAAAAAATTAAGCTTGTAAGTACTTAAGAGTGAAAACTCAAATTAATAAATAAAAAGATAAATACTTGGAATAATATTTAAGAAA----TCATAAACACAATGAAAACT-AA
>CG12853 10448696 10448789|10036 chr2R 10447711 10448802 scaffold_16 2222311 2223431 + 5878|1097 1193
GTTCCCCAACTAGTTTGGTGGAACTAACTTAAAAAGAGGAATTCAATGTTTCCGTAGAACAATAAAC---CAATGGTTTAAAGCAATGTAAAATATT
AATCCAAAAGCA----AGAAGGATTAAAACAAACCAAAGAATTGACTG-----GACAAATGATAAACACAAAAAATATTTGAGGACTTTAAAA-ATT
>Lap1 10453945 10455165|10038 chr2R 10451890 10454529 scaffold_16 2226579 2229318 + 92785|2231 2868
TGGACCATCTATTTACCGA-----CCTAAGCCGATTCCCATCCCGAGACCGAAGACTTTTTGTGCATTTTTCTAACGCATTTTTCCAATAAGCAGCATCGCCGAAATCGGATAACAAATTACTTGGACCGATCATAGTGTTAGTTCATAATACCCTTCCGTACTGGCG-GTCAAACCATCAGTCATAGAGCACAATCGC--------CAGCTAGAG--GATCCCATGCTTTTTGTATATTAGATAGACGAATCCAAACTGCCATTTTCTTTGCACCTCCATACTCG--ATAGAAGAATATTACCAGAAGACGGCCAAATTTAGTAGTTATA-GCCCACAACAAGTATTCTCAAAATTTAAGTTGAATG--AAGATGAATTGAATTTATGA------TTTGACTTTAAAGCTGTTTATAATTCGAATTGAGCCACT-TATAAGTTGGATTTATTTAATCAGTATCTAATCGATATCTTATGTAAATAGTTAAGTTATGCACTTAAGGAAGCAATAA-TATGTTTGGCCAATTATTAGTT-------------CCAGTACTTTATTATTACAATGCGTAGATTACATTGAAGTGGCATT--------TGTATTGGAAGTT---TGTGCTACCATTATTCT
TGGCCCCTTCCGTGTCCCACTCCCCCCATGCCTAT--ATATACCGAGACCGAAGAC---TTGCGCATTTTTCTAAAGTAACTTG-AAATACGC----TAATATAAATCAGCAAAC-CATAAATATTAGCAACTGCATTTTCAAGCCATAAACAACCTTTTCACTGGCGCCTTAAACTTGTAATAATA----ACAGTTGCATTTCATTTAGTTAGAATCTATTTCAACTGCCATTTACGATACTTAGCAGAAGCAAAAGTGGTGAGTTCATTATATCATCATTATTGTATTCTATTTACTTTGATTGAAAAC-----ACATTCTTCATTATATGCGAAAAGAAAGTATTTTAAGTATTCGAACTGTAAGCTAAGGCAAGCGTCTTTTACGGAAAACTTCTGAGCTAAGAATTGTTCTAAACACCTTTGAAACTATTCTATAGATTG---TTACTTGAACA---------CACGACTGTATTAAAATATGTTTCTTATGTATTTGATT-AGCAATAACTAGGTTT--TCAGTTTGAAGTTGTTAAAACGTGAGCCAGTATTTGATTGGTAT----------TCAAAATGAAGCAATATTATTTTTTCTGTATTAAAAGTTCTACATATAATTATAATTCT
>Lap1 10453945 10455165|10039 chr2R 10454530 10454965 scaffold_16 2229494 2229960 + 14424|0 504
GACCGCCAGTGGAATGTATCAGCATAATACATA--------TAAATAGTGCAATTAGCGTCGATTATAGGT---------------------------------------------ATATATATACGCACTCAT-------TATATATACTCGCGATAATCAGACAAATTACCTTCAACTAGCGCCTATTTTACGCCCAGCGTTGTTCAAATTTGTTCCCAA-------AATTATATGTATAGATCAATTACTTGATTACA-AAAGATATTTGCTGTTTATGTTAGTTGTTATGGTGCAGCAATACAAATTCTATATATATATATATTTACATATACGTACGCAATCTATATTTATTGTCC-AATCGATCGAAGTGTCAAACATTATTTTCAATGGTGAACTGTTAGCACAAACTGAATTCTCACGCTATTGGCATTGTGATCAGTATTATTATTTATCTGGTTAAACACGTGAAATCTAATCGAAAGATAAGCACTTCTATATT
GGCCGCCAGTGTTATTCATAGCAAACATACAGAAAATATAATAAATAGTGCAATTAGCGTTGATTATACGTGCATACAATTACGAGTACCATATAGACAGCATTTACAAAACAAACACATATATACACATTTATATGTGCCTAGATATACAT---ATAAGTATATACAATATTTACAAATAGCGCCTATTTTACGCCCAGCGTTGTTCAAATTTGTTCCAAATTGAAATGATTATGTGCTTAGATTAA------GGTTAAACAAAGATATTAGCTGTTTATGTTAGTTGTTATGGTGCAGCAATATAAATTCTATATGAACATAAATATATCTATTC--------TATATATTTATTGTCTAAATCAATCAA----------TTTTCTATTAAAAAAAAATTGTTA----------AATTCTCATACCATTGGCGTTGTGAACAGTATTATTTTTTAGCTGATT-AATATTTGAATATTATGCTAAAGTTTGACATTTCTATATC
>Lap1 10453945 10455165|10040 chr2R 10455018 10455186 scaffold_16 2229962 2230137 + 2030|0 160
AACACACGCCCACACACACACACAAACATACTGCATAAATACGAATCTAGC-TAACTTAAGCAAGCGCACACATTTTGCCAATTCAATTTGATTTAAGAGCGTTACCACAAATCACTGAAATA------CAACATTCACTTTGTCATT------TCGCCAT
AATAGATCCAAACATTAAAACACAACCACA---AATACACACAAATACAGCATAGCATAAG--ATCGCACATTATATGAAAATT-AATTTTGTTTATTCGCGCTACAACAAATCACCCAAACAAGATGCAAACAAAAAATCAGTAATTAAATAAACACAAC
>CG10257 10459197 10459329|10045 chr2R 10458554 10459306 scaffold_16 2239435 2240189 + 24073|674 788
GGGGCAATGGAAGGCTCCTCCATACGATACGATAGGATAACGTTTTGCATTTGTTGAATTTGTGCCCAGTTGT-----TAATAAACGTTTTTCGAAAGTTCTTTTCAATTTGATT
GCTAAGACAAAGGGCACC----------ACATTTGCATCTTGTCATTGATTCCTTGTGTTTTCGTCAACTTAGATACATACTAAATCGGTTTCAGTAGTAAAT---AATTGGATT
>CG10257 10459197 10459329|10046 chr2R 10459313 10462018 scaffold_16 2240678 2244045 + 52680|0 16
TAAACTTTGTCTTATAC
TAAAGTTTTACTTACAC
>CG12424 10494549 10495447|10082 chr2R 10493073 10494549 scaffold_16 2285502 2286951 + 71639|1529 1529
A
A
>CG12424 10494549 10495447|10083 chr2R 10494633 10494698 scaffold_16 2287019 2287079 + 957|0 65
TTAAGTTCAATTTGTTTTTGTATTTCTTATTCCAATTGCGTGTGGAGAAGCATTTATATTGGATCG
TTAAGGTGAA----CTCCCGCAACTCGTGCCCCAATTGTGAAC-GAGAAACATTCACGTAGTGTAG
>CG12424 10494549 10495447|10084 chr2R 10494699 10494793 scaffold_16 2287526 2287631 + 2870|0 110
TATTCTGTATCATTTCGATATGCACACT--------GTGTAGTAAA--------AAGCAACTACAACTGAAAAGCTTTGGACAAACCATGTATACTTTTGTACTTTTCCTA
CATTGTTTATGATTT--GTAAGCACAATATTTAGGTGTGTATTAAATGTAACTCGATGAACTAAAAAAGAAAAGCTTT---CGAAACACGTATACTTTTGTACTTTCCCTA
>CG12424 10494549 10495447|10085 chr2R 10494810 10496923 scaffold_16 2287655 2289718 + 13853|0 718
CCGAAACTATGA-----GTGTTAACAA-----TACAAAATGAAAATAACCAAGTAAAAGAATGGTAAATGAAGCGCAACATGCATATATGCAGAACTTGCATAGTTATTATATAGCATAAAATATATATAATTCGATATATAAATAAATATTTAAACGAA---ATCATTTATATGGACAAGTATTTAGTGGTTTGATACTATACGACAGAGGAGGAATCAACAAATAAACCACACGGCACACTCTTAAACAAACACAATGAAAGTCAGGCAAGAACTACTATTTAAAGATCCCATTCAGACAATTTCAAATTGTATTATTCTA----------------GAATTTTGT---------------------------ACCTTAGTTCTTTGTTCATTTTTTTCAAATCACGCTGCACAGAAATGTTTCTTTTTGTTATGATTACAACTAAAATCAAA----------------CTATATGAAA-TGAATGTATAATTAAGTGTTATTCCATACAAAGTAAAAAGATGCATTATATAAAATATAAATCTTATAT-------TAGCGTTAAATTAAGAAATCAAAAATAAAAGAAGGAAACGAATCCATCTTTATAAATTATGTTTAATCGGGCATTGATGCTGAATAACGTAT-GAAATTCCGTGGTATACAACTGAATTGCCTTCTTCTTTATAATTTACATAAATAAAAATCTTTTAGTG
CAGAAATAATTAAAAGTGTATTAACAAAATGATAGCAAACAATAATGAATATCTGAAGATAATGAAAAGTAAGCGCAAATTGCATATATGCAACAATTGCATAGTTAATATATAGCGTAAAATATATATATATGTATACATTAATAAATATATAAACAAATAAATCATTTATATGG-CAACTATTTAGAGGTTTGATACTG---AACAAGAAATGCAACAGCAGGAAAATAGAAAGACACAC-----AACAAAAGCAACAAAACTATTTAGTAAACGTCTAAGCAA------CATTTAGTTAACCAATATTTGTATTTTGTTAAAAAAAAAAAAAAACAGAGTTTTGTTACAACTAGAAATCAAATCAAACTACAAATTCAGTTGTTTAAGCATCATTTAAAGTGAACACTTGAGTTTTATATATATTTAAAATATGTATACAAAACAAAAGAAGGCGAAACAAGCAAAATCTATATGAAAATCAATGTATAATTAAGTGTTATTCCATATAAACTATAAA-ATGCATTATATTAAATATACAAATTATATATATATATATATTTAAATATATATATTAGCGTTACATTAAGCAAGCAAATAC-----------------------GGGCATTAATGCTAAATAACGTATAGAAATTCCGTGGTATACACTTCTATTGCCTT--TCTTTATAATTTACTTAAATAAAAGTTTTTTAGTG
>pcs 10505937 10506204|10099 chr2R 10504774 10509784 scaffold_16 2300698 2305901 + 77932|1224 1505
TGAGCAACTAGGGGGCCAGAGGAG-ACTTCTTCAGCCAGCCC---CATATCAGATTT-------GTTTATATTAAATGAATAATGAAAAGTAATTGTAAAACGTTGAACGCCGCATTTAAATGTGCACCACTATCGATAAGTCTCTACACCCACAGGATATAAACACCAACTATTTTCGTATAAATGTTGATTACAT-TCTA-ATCTATTGTCTCCGTATATGTTTCTCACTGTTAATACTTTAACTATGTAAATGTTTTGTGATT-CGAGAGAGCTAAAAA
C-AGCAGCGGCAGCTCCTCTCTAGAAACTCTGCGGTCGTTTCGCGTATATCAAATTTAAAGTTAGTTTATATTAAATGAATCGT-AAACGTGAACGCAAGTGAATGAA--ACGCATTTAGTTCACACTGAATATTGAATATTGCCTACAAACA------------------TATATATATATATATATTGCATATATATCTACATCTATT---TTCGTATCTATTAAGTATCATAAATGTTGAGTAAAGTTGAGTGTCCTGCATTTGTGTGCAAACTTCAAA
>hbs 10555623 10556259|10138 chr2R 10552203 10557613 scaffold_16 2351395 2356772 + 196397|3505 4196
GCCGTGCTGAGCATCAATGACAGCCAGAAACTACCCAACCCAGCCAAATCCAGCTAGACTGATTGACATACATCATT------CATAATCACCATCGGAAACACGA--AACACGAAGAACTTGACTGTCATTTCGTTAGGATTG---------------------GTTGTCGTTGGCCATTGCTGTTGCTGTTTGGTT----TTATTGAATGTTTTTATTTTTATTTTATGCTTGTAATTATTACTATATGACGTTGATTATTACGGAGCGCAAATGGAGAAACCATGTTGAGTGTGTTTTGAGAAAAGACATTTGCATGCGGCGCTCGAAGGCTGTGATAAGTACCTGTGCCCAAAGCTCTGGAGACGTTGGCACCAGCACCACCGCAACTCGCAGATGGAAACACG--CAGGCCAAACGTTTGCCACAAGACC---------------AATTCGTTCGCAGACCCCTC-ACCACAGAAAAACCGAAAGATACACCCATTCAATTG--GGTGTAGAAGAGG--GGCACGGAATATGGAATATTGGTCTGGCCACGGGGCAGGTGCGCAACCCGTTCTACAGAAATGCCTGCCCTCCACCCACTTTTAGTCCACCACAACACCTGAATCCGAACAACGGCAGAAGCAGCAGCATTTTAGTAGACACCACAAAATAAAAAAAAAAAAAAAAAA
ACCATGCAGCACGTCAAAGACG---AAAGACAACAAATACCAGCCAAACCCAGCTGGACTGATTGACATAACACATCACAAAACAAAGCCAACACCAAAATTAGAAACAACACCAACAACGGATATATAATGAAATTGAGATCGAGTCGATTTCAGTCAATAGGAGTTTTTGTTGATGCTTTTTGCTAGGGTTTGGTTGTTGCTGTTGCAAGT-----TTTTTGTTTTCTGTTTATAATTATTACTAAATGACGTTGATTATTATGGAGCGCAAATGGAGGAAACATGTTGAATGTATTTTGAGAAAAGACATTTGCATGCGGCGCTCGAAGGCTGTGATAAGTACCTGTATCCAAGGCTCT--------------CCACTCCACTCCAACCGACTCGACACGACACGACTCGGCCAACCGCAT--CATGATACCCAGCACGCACATCAAAACTTGGATCCACATCAATCAATCGAAGCGATGCCGATGCCGATGCCGATGCTGATGGCGATGCCGATGCCGATGCCAATGGCAATGGATTA-------GCCTTTGGGGCAGGTGCGCAACCCACTCTAC--AAATGCTTGCC-----CCCTCTCATCATCAACCAT--CAACCGA---CAAACAACAACAAATACAACAAC-----AACAACGACAAGAGAAGAAATAGAAGAAGAAGAAG
>chn 10658315 10659646|10229 chr2R 10658384 10658660 scaffold_16 2459222 2459539 + 7380|0 330
ATGCATTAGGCATTTGACATTGAAAATTATTTAAAAAATTGCATTTAATTTTTTAAATTTTAAGTTGTGATGTACCTGAAATATGATTTCTCTT---------------AAACAAACAAAAAATA--------------CTTAAAACAAAAAACAAACAAACACAATTCATGCA---------------------AACGGTCTCGAAAGCGCTTTTGCAGCCGACTGCAAATGAATTTC--ATTATCTTAGTTGTACGATTGAG-CTATCTCACAAACACACCCCACTCACA-ATGAACATTTACACACGGATATTTAACTATTTAGTAAC
ATGCATTAGGCGTT-AACATTGAAAATTCATTAAAAATTTGCATTTA-TTTGTTAAATTTTAAGTTGTGATGTACCTGAAATATGATTTCTCTTTACAAAAAAAAAAAAAAACAAAAAAAAAAAAACATGAAAAGAAAACAAAAAAGAAAAAATAAGAAAACACAAAG-ATACATAACGAAAATCATTATTAAATAATAATGTAGAAAGCA-----ACGCCCTCATTTCGATAAATTTCCCATTATATTAATTGTATAATTGAGGTTATGTAAACGACACAC---ACACACATATGCACAGGCACACTC--ACGTTGCAGTGTTAAAAAAC
>chn 10658315 10659646|10230 chr2R 10658723 10659729 scaffold_16 2459582 2460813 + 22364|0 1167
ACATCCATTTGTATTTG--------TATTCGATTGAATGAAA-------TGTGAAGTAAAA--GCTTTAATTTGCCATTTACAAAGC----------TTCAGTTAAGT--TACGAGTA--ATGATTGCCATC--TTTTTACACCTAGCATTTAGTCGTCTAGTTACCCTAGTTTATGGATTAATTTATGAACTGCAAACGCGAACCTCATCGAACCCTTTGCCTTACTTA---TCATTTAAGCTTTAA----CGTGA------------ATGTACATTTACTTTAAGTTGATTTAGTTACTCCTCGGAGCAGCAGTCACGCCCACAATGCCCAC---------------------------------------------------AAAAAAACAAAACAAAACAAAAAGCATTATCACGCAAAACGTTTTAAATATGAAGGAAGAAACGTCTATAAATATTAACAAAACAAAATGAACAAAAACTATATTACTGTACGTGTAGATGTATTCATGATTTTATCTGAAAAACGCGGAATAGAAAGTCGGCGAGAACAAGATGGAAACACAAGAACAACTTACAAAATACTCAAAGAA---------------------------------CATGGATAGAATAC-----AACTTTTTACCACAC--TGAACAAGAAA-TATTTGACTGAAAAGTGTCGGGGGAAGAT------ATGATATA--TGAATAAA----------GGTATAAACAATTT-TAGTGTAAAATGTGTGTTTTTGCTAAATGTGGTAAACTAAAAGAAAACTTAAATTTATTACACAAAAC--TAAACTAAAG-CGTAAACGAAGAGAA----------------------------------------AATTCTTAAGTAAAGTAAATTTTTGGATGACAA--GCCATTTAGACAAAATTTTTGAGACGAAAAAAGACATTTATAAG-----AAAGGAAACAAAAAGAACAA-----------ACCGAATTACTTTAAATTTTATTTAAGCAATGAACTTGCAAAAAATAAAAGGTA----------TAATTACAATAACTG------TAATGTGAGTGTTTTTAGTTTAAAATTATATATTTCC--AAAACATTCAAAATAAAATATAATTAGTTT--AAAATAT
ACACTTAATAGAATCTAGGAAGAGATATTCGTTGAGTTGCAAAAACATTTGTGAAGCAAAATAGCTTTAATTTGCCATTAAAAAAAAAACATCAGCATTTAGTTACTTAATACGAGTATAATTTTTGCCATTAAGTTGTATTCTCTACACACACACACATACATATATACATATATAT-TTAATTTATACAACATGAATGCAAACCTCAAATACCCTTTTGCCTTATTTTATTTAAATTAAGCTTTAAACAACATGATTATTGCATATTGTGTACATTTATTTA-----GTTCTAGTTTTAGTTTTGAGCAACAGCCACGCCCACAATGCCCACTCACAAGCGTTCTGCATATGGCAAATAGTTTATAAAAATAATGCAACTGATAAAAAACAAAAACAAAA-------------------------------------------------------------------------AAAAACAACCATATTAACGTACGTGTAGTTGTATTTATGATTTTATC-------------AATGAAAACAAACAAAAACAAAA---AAACACAAGAACAA--TACAAAATACTCAAAGAAAATACGATATATATAAATAAATATATATATATATATATACGGAATATGTATTAACTTTTTACCACACACTGAACAAGAAAATATTTGACTGAAAAGTGTCGGGGAAATATTAAGAAAAGATACAAATGAATAAAACAAATAAATGCTATAAACAATTTCTAGTGTAAAATGTGTGTTTTTGCTAAATGTGGTAAACTTAAA-----CGTAAATTAATTACACCAAACGATAAACTAAAAACAAAAACAAAAACAACAACAAAAACAAAATAAATACAAATATAGAAACCAACAAGAATTCTTAAGTAAAGTAAATTTTTGGATGACAAAAGCCATTTAGACAAAATTTTTGAGACGAAAAAAGACATTTATGAGTAAAAACAAAAAACAAAAAAAAAAACAAAACTAAAGAACAAATTACTTTACATTTTATTTAAGCACC--AGTTGCAAAAAAAAAAAAATAATTAAAAAAGTAATAAAAAAAATTAAAAAACAAATATAAGTGTTTTTAGTTTAAAAAT-TATATTTCCAAAAAACATTCAAATAAAAGTA-AATTAGTTTAAAAAATAG
>CG7544 10663919 10663940|10234 chr2R 10662738 10664259 scaffold_16 2461881 2463457 + 40433|1221 1253
AAT-----------TAAGTTACCATTAGCTCTG
ATCTATATCGTACATAAGTAAACA-TAGCTTGT
>CG7544 10664034 10664574|10234 chr2R 10662738 10664259 scaffold_16 2461881 2463457 + 40433|1358 1621
TTTTAATGT----ATAAGTTCTTGGAGAATTGCTGCA--ACTTTCGAATGTACTGTGACCTTCACCTGTGCTCATCCCAAAAAGCAACTCCAAGGCACCTAGAAAGCTTTCGCCTTAAATGGAAATTTGCATGTCAACGGTCACTTTGCCACC------------------------CAGCTCC---ACGAACGGAAATTATCGTTTCGCTTTTATCATTGAC-----CACAGCTGACCACACACTTCGACGGAAAAAGGCAAA
CACAAATGTGAGGGTATCTTTTTACCCATCTGCAGCAGCACTTTCAACTGTTGCCCGCCCATATCATATTCGCGGCGCA---------TTTCGTGCGACCAAAAAGCTTTTCCACTAAATGGAAATTTGCATGTCAGTGGGCACTTTGCTGCCGCAGCCAAACGAAAGCGAGGAAAGCGGCACCAAAACGAACGGAAATTATCGTTTCGTTTATATCATTGACCAGCGCACAGTTGCCCATCCAATGCGCCACAAATAGCAAAA
>igl 10703846 10705157|10272 chr2R 10703529 10704164 scaffold_16 2527037 2527753 + 17796|317 735
G--GAGC--TCACCACTTGAATTT-----TCATTGCCCTCGGTGGGCTAGTCACAGATGATGAAGCTAACTTAATGC-TTACGCAAGTGAATAAAATTATTGGTAAATTGTAAATGTGTAAAAGGCCAATCGAGATGAGGGCACACAATTGTAAACTTTTTAGTGAATATGCT--TTAGCCGGCA-------TGGCGAACCCAAATGATT--CTCATAATTATTAAATAAA---TTAAGTCG------AGGGCA------------------AAGTTACATTTAGTTTGCAAAGCTTTAA-------------------------TAAATGAATAG--TAAAACCACATTA-------------------------TGCGAATGATGATTCGGAGTTACGCGACATTTACAGATACATT
GCTGAGCAGTCCGCGTTTGAATTTGTTGGTATCGGCTGTCAGCAGAGCAGTCA------ACTAAAATAAAAAAATGTATTAAATAAACAAACAAAAAAATTGGTAAAATGTAACTGTGTAGA--GCTTACGAAAAAGCCTGCACTC--TTGTAAACTTTTTAGTAAATATGTTAATTAATTGAAAATGATATTTATGTAACCATATTATTAATTCATTATTTTATAAGCAATATTTAAATTGTCAAAAAGGACACTATTATGCCGGACCCTTAAGTTGTCCTACGTTCGTGTACTTTTAAAATCATCTTGGGATTCGTTAAAGAGTAAATAAATTGCTTAAAACGCTGTCAACTTTGGCGCTACCGTTGGATTTGCTGTATGGAATGATTTGCAAGTTATATATATATATAAATCCACT
>igl 10703846 10705157|10273 chr2R 10704184 10705173 scaffold_16 2527780 2528885 + 15406|0 1167
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TATTAGCTAAAATCGGTAGTCTTAAATGCATCCTACTTACTCTGTTTCATAATTTTTATTCAATATCAAATAATAATATTAACAAAAAATAAACAATTTCGCTTCTTTGCCCTTATTTGCATAAATTAAGATTCAATTAGCTTATAGTTGCAGAAATTGTCTTTTATTTAAAATTGAAAAAAGTAAATCATAACTTAATAACTAAAACCAAAACCTAAAGGCGAATCAGTGTTTAAAATCAATTTGCAAAGCATGTTAAAAAGGCACGATGTTCC---AAATTTATTGTAGGGCAA--------AAAAATGAAGACAAACCCAAGGAAAATGCTGAA-ACATTTTTTTAAACTTAGT--CGGTTTGTCTGGCCAAAGCCAAAACCAAATGCAGTGTATT-GTTGTACCTACACACGGAAACATAAAAAAAAAATAAAAATAAAGAGCATAATTTGTAACTGACTCAATGTTTATAAATTAAATAAGCCCGCAAGGCGCATTAGGGGTACTCAAGCGACA----ACAGCTACTAAACGTCAAC----AAATTTTTCAG----CGAGC----TACTTAAACTGATAAACAA--GAACTCTA----AACTAATCTGGTGGCACAATTTTTTGTTTTTCTACCAAGTGTACTACAA-GTTTGTCAACTTGAAAATATATTATCAAAAAAATATTTATATACATACGTACGAGTATTATAGAAAATTGAAAAAAAAAAAAAAACAAAAAACGTAAATA-AAATATAAAAATACAATTTAAACAAAACTAAAACCTAATTTAAATGCTGGCAAATTT------------GCAGCAAAGAAAAATTGTTAC---------ACAAGCAACTACAAATAAATGTTT-AAATTCAAATTAATTACGACTA-----AATAAATAAAGAGC-----------ATTATAATTATATTAGAGATCAAAGTAAAATTCTACTAAAC--TGCATACCA--ACTACATTAAACCAAAAGTAAATAGGCATAAGAGAAACATATTAATGAAAATATTTGAGAAAACACAGAAAGCATATACATACATTCAAAAAACTGCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACATCAACAAATGTCCCAACTAAATTTTAATTGAGTAATAAAACTAAATAAAACTTCTGAAAATGCAA
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AAACGCAGTTTGATTTAAGTTTTGAAACACATTTAATTAACAATTACTCATAAAATATGTGTACTCATAGGTATACAATATATATATAAGATATATCTATATATAAAGTATACAAGGGTGTGCATATCATATTCTGTAATTCGAAAATCTTGCTATATAAGGTTAAGCTATCAGTCAATTAATTAATTTAGCTTCGCTCAAACACACAATAGTTACAAAAAAAAAAAAACGTGGAAAAAATATGTTTAAAAACTAAAATAAATAAAATACATTTTGTTTAGATTGTGGTAAAAGCTAAACTATAAACGTAAACGAAATGCGTGTGCCAACCAATT
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AAGTCACAAAAACAG--TTACAAGTGAGAGTCAAATACTTTTT----GTTTTCAATCAAAAAAAAAAAAAAAAACAC--------------ACTCGTATCAAAAAGTTTTGATATTTGATGCAAGAAAGAAAAAAAACGGAAACGTAAAAAACATGATACTAAACAAATTTGATG----
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GGCACGT
GTCGGGT
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AAACAAAACATGTTCATGAGTTGCCTTTTATTTGAAAAATGTTTAAAAAAAATGAAATAGAGAGTGCGAACGAAATGGGAAACGAAGCGAAACGAAACGAAAAGAAACGAATCGAAAATATGAAACATGCTAAAATTGTAATCAAAGTCTAGGCATATAAGGCATAGACATAGTCACATAGTCTGTACTAGTTACGTAGTCTAAGCTAAAGATATATATATATATATATATATTATATATAATATATGTGTAGTGTGTTGTGTTCGAGTCTTTTTCGGAACTCTGAACATTTGCTCAACGAACTCTGTTCCCCATGGGTGCCATGCATTTTTGATACTAAACTAAAATACATTAAATATACATATATATTATATAGAATTAAATGTAAGTTTACGATTATGTTGAAAGTTATTTGTGGCTTAGCAAACTTATAGTTTTAAACAATAGTTTGTAGTTTT
>unc-5 10882019 10883165|10454 chr2R 10882779 10883190 scaffold_43 118905 119246 - 8955|0 393
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>SRPK 10900255 10902720|10466 chr2R 10901427 10902750 scaffold_4 5997454 5999017 - 6412|0 1611
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AATGGACACA-GAGACACACACATATGTATACAATCAACGTGCTTTTAATTCGCTTAGAATCGCTATAGAAATCGCGT--TGCAGTTCGATTAACCACTAATCAACAGATT----------------CACTAATTTT-CGAGCAACTTTTAAGCAATCAAGAGCGTATTCAATAGAAAAAAGAGTAGATATA---------------AGACGGAA--------------GAGTTAAGTATTAAGCTGTTCATATCGCGCGTTTCATATT----TCAGTAT---------GCGCATATTGTATACCCT--AACTCTCTGTAGAAAACTAAACGGATTTTATTAGTACTGAAGATTTGGGAGAATACATACATACATACCTAGACTCGTGAGTGTCAGCGAGACTTATTTTGGCCTCAATATATTGCGATAATTTTGAGATGCAAATGAAAACTAAGGCGAACCGTTTTTATTGTCATCAAATTTTTTCTATTTTTTATACCAAATAACTTTGAAT--------------------------------------CAACTAAACGGGAGGAGTTATTGAAA--TTGCTATGCTCGATAAGGCTA----------------------------------GGAGCTTTT------------CCCATAAGTTGCGGCTACTAGGAGCGATTATACGAAAGCATGCCTATGCTATTTATA-TATATGATTAGGTGCGGTACGGATAGGTGT--GCGTTGAGAACT-CGATAGAAGCGC-----TTTTTATAAACTAACTA----GATTTGTATCGAAATGTGA--AACATT-----GAATATGATAAACATGA--ATTGTACTTTTATGATGTATGCGTATCCACTGGCCTTATTTATTG----AGAAGTAACCAAAC---------------------AATGAGCTGAACCCC--------------AACACACACAAGTGA-------------------ACACACACATACACGAGAACACAGCGAGCGACAAAGAGATCCCAGAAAAACA---------------------------------------ACTTGAGAATTACAATTGAATTTTCACTAAGATTCAGGCTTAGGGCTTTGCGTCACTTTTGTTAATTGTTTTTTGGCGTCCAATTTTACATG-------ATAACTATT---------GTAGGACTCTAGACA----AGCAAATCGAAACTATCGAGAGTAGATTAACTATCGAGTAT----TTTGTAGTGCG------TAAGCTAACTAAAACATAAACCAAACCAAATGGAGATAACTTTTTAGCGCGAGACTCCTTGTGCAGGAAGATTTTGAATTTGAATTTATTTTTAACGACTTTTGAATACAAGACGAAACAATGAAGA------------TGACATTTTATCAGAGATCGTTTTTTAC----------CTATTTAACATTTCCTCGAACCACATACAAAACAAC----TATT-TGCTAAGTGTA-CCCTATGGCCTATGAGTTAGTTATAAGAAAGTG--TTTTCCAAGCCCCGCTTAGACCACAACACT
AATACACACACAATACACACTTACACATATA-AAGAAATGTGCTTTTTAATCGCTTG----------AGAAATCGCCGCATGTAGTTAATATAGATACATACAGGCATACATGGTATATGTATGCAACACTAATTTTTCGAGCAACTTTTAAGCAATCAGCAGCGTATTCTATATATACATATATATACATATATACACTTATGTATATATGGTACTTATACTTATATATGATAGAAGATTAAGTCATTCATATC-CGTGTTTCACATTGTATTTAGTGTTGAAAGCGAACGCATATTGTATACCCTGTAATACCCTTGTAGCAGCTAAGCAGAATTTATTACTAC-AACTATTTGAGA--------------ATATCTTGA-------------------------------TAAACATTTGATGATGATTT-------------------GAGACAAAACGTTTTTATTGCCACGAAATTTTTTCTATTTTTTATACCAA-CAACTTTGAAAGCAAACTAAGCATAACCGATGTTAAGAACAAAAAAATATAACTAAAGATAAAAAAAAACTAAAACCTACTTACAAGCGACAAGAAAAAAAAAACAAAATTTGAGAAGAGAAATTCGATAGTGGAACATTTATAAGGCTTGACTCTATAAGTTGCGGCTTCTAGGC---ATTGACAGAACTTAGTCTTATACAAAATACAACACATGCATACGGCAGGTGTTTGTATGTGTCCGCTTTTACAACAACAACAACAACACAAGAATAAGAACAAACCAACCACTAGAGATCGTATGTATATAAGATGAACACTACTTAGTATATGAATATTATTATGATTGTACTTTTATGATGTATGCGTATCCACTGGCCTTATTTATTGTCGAAGAAACAAAGAAACAAACCGAATACTACATTAACAAATGTGCTGAATTCTCACAGACACACACACACACACACAGCAGACAAATACACATAGCCACACACACACACACACACAGAGACACACGGACAGGCAGAAAACTCACACATTTGCACTTAATATATGAATTTATTTGCGTACAACTTTTGAGCGCACTTGAGAATT--AATTACATTTATTCAAAATATTTG---TAAGGCTTTGCGTTAATTTTGTTAATTG--TTTTGGCGTCCAATTTTACATGCGAATAAATAAGTATTAACTAAATCGTAGG-CGCTAGAGAAAGTAACGAGTAGCGAGTAAGCAGTAACGAGTAACGA--GAGCATCGTATTTGTAGTGCATAATTTTAAGCGATTGCAAACA-AAAAAAAAGGAAATGCAAACACCTTT----AGCACGTTCAATTGTGCAATAA-CTTTTGAATTTGAATTTATTTTTAATGACTTTTGAA-AAAGGATAAATCGAACGAGAAACAAATACTAGAAACATTTTATTAGACATCGTTTTCTAAACACATATTGCTGTTGAAC---TACTCTAAGCACTAACTGTACGACCGAGTATTATTCTAAGTGTACCCCTATGGCCTATTAGTCA---ATAAGTCTGCGGTTTTTCTATGCC-------AACAGCAACAAC
>GalNAc-T1 11029882 11030460|10623 chr2R 11028354 11034770 scaffold_4 6166093 6173247 - 156845|1593 2336
GGAGATAGGG--------------------TGTAGCGGGGGAATGGGATGGGGACCAAA------GCAACTGAGAGATACTGACTAACGCCGACTGAACGG-----AACT-CGAATTCAAATTAGAACAAC--CCTTTGTAAATACC-------------TAAATCGAATCCTAGAATTA------TATATTTTGTGTA------------CACAAATCGTGTATATTAAGAAGAAACGGGGTAGCTAGTG-----CAAATCAAATCGAAAGGAATCAAATCAAAATAAGAAACCAGCAAATCAAACGCAAACGAGTCATTTGGAAAGCTAATAACA--ATTAACTGTGTGTTGTGTACTTTGTGTGTATAAATATAAA-------------------------TAGAGCAAGTTGTAAGAATAGA-------------------------GTCGAACCATCCTATGTAAATGA---------------TATAGTCGCCATGTGATCGTGTAAGGATGTAAGGCAGGGTGTGGAACGATTGCATTCCATGGCCAGGGATTCAACAAGGAGCTCTCCTGCGTGAGAGCATCCAGCAATAACCAACTATGTAAACTG---TAAACTAAAAGTGTTGTAAGCATTTATCTAC--ATAACCA----TTTTGCCATTTGTTTTCAT-------------------GAATAAAAAAAAACTTCCGACTGGAGGATGTACATCTTCAAACG
TAAGTTAAGACACACACACACACACACGCCTGTGGCCAGGCCCAGCGA-GCGGACCAAGCCAATTGCAACTGAGAGAAACTGACTAA-GCGAAGCGAAGCGCTTTTAACTACAGACTCAAATAAACGCAACAACATGTGTAAATAACAATTTAGAAAAAAAAAATACAATGCTAGAAATACATATGTATATTTTCTATATAATATATACACCATACACTATATAGATTGTGTAA----GTTGTAGTTAGAGAATATCAAACAAAATCAACACAAATCAAAAACAAGTCAAAAAATATTATACCATAAAAAAAAAA--------GAACACAAAACACAAGATACAATATGTGTTGTGCATTTGTTGTGTAAAGAAAGAAAAAAAAGAAGAAAGATAATTGGAAACTAGAACAAGTTGTATAGATATACATAATATATTATATCGGTTTATGTGCATAATATTCCTATGTAAATGCTTGAATAATAATAATTATAATTGCTATGTGATCAT-CAAAAATGATAAATTCATCAT--AACACTCGCATTCCAAAAT--GCAGTTCAGCCAATTGC-----------AGAGTCTCGAATAATTA--AACTATGTCATGAGAACCACATCAAAGGCGTTGTAAGCATTTATTAACTAATGACAACTTTTTTTGCCATCTGTTTTCTTTTTTTTTGTTTTGAAATTCAAATATAAAACAACTTCCAAACGGAAGAT-TAAAACAACACATG
>CG30467 11054801 11054878|10635 chr2R 11053227 11056128 scaffold_4 5619339 5622263 + 83649|1613 1695
ACAACATGCCTCCATGATGGATAAAGCAAAAATGACTGA-GATTGTAGCTTGCA-GCACAATATATTCTTAACT---TAGTTA
ATAATAATACTCAG-------------AAACAGGACTGATAATTGTTGCACATATGCACAATTCATACATAAATACATACTTA
>Vha36 11057141 11057361|10636 chr2R 11056129 11057183 scaffold_4 5622375 5623516 + 55542|1097 1155
GTATTA---CCTTGG-----------ATGTGTTTATTCCAGCAATA--TTATTGTTAAA
GTATTAATCCCATAGCATGCGTATACGTGTGTGTATTCCAGCAATATGTTATTGTTACA
>Vha36 11057141 11057361|10637 chr2R 11057184 11057969 scaffold_4 5623929 5624735 + 23152|0 197
CTATTTTCTGTTCTGTATCCGTTTCCATATTGTAATTCGC-AAAGGGCAAGCCACAAACTTAAT---TGTACCTATGTAGCAA-------------AAGTGTGTAGACTA-TTCCAATAAGCAGAAAAGTATGTATTCCATTTTTGTAGTGTAGTGTAAGCTGCGCAAATCATGCATTAAAGTCTT--GTTGTATCAT
TAATTATTTGTTCCGTTTCCATTT--------TAATTCGCGAAAAAACAAAAAAAAAACTTATTGTATGTAGCTACGTGCAAACTTTGTAAGCTTAAAGTATATAGTGTAATTCCAATAAG-AAAAATGTATGTATTCCATTTT-GTAGT----TATGTAGCGCTCAAATCATGCATTAAAGTCTTTTGTTGTTTCAT
>eIF2B-gamma 11059186 11059280|10638 chr2R 11057970 11061186 scaffold_4 5624946 5628220 + 135257|1226 1323
GCGGCT--AACTTAATGTGGCTTCCTTTATTAACGAATTGAGTTAGAAGGCGGATTCTTCTAGCAGGACATTAAATATTACAAAT-AGGTACACAAAA
TGATCTTAAACTTAATGATGCTT-CTTTATTAACGAAATGAGTTAGAAGGCGGATTCTTCTAGAAGGACATTAAATATTACAAATAAGGTACATAAAA
>CG12963 11077088 11077309|10655 chr2R 11076716 11077415 scaffold_4 5647939 5648687 + 15053|420 644
TCCGTCGGAGGCATGGATAAATTGGAACTGAAGCATTCGCCGTGCCACTCTGGGCCACACAGAT-GCCACTTTGTGTGCGCTTTCA-GTACAGAAATGAACTTGTGTGATCTTATTGAGTACATACCTATTTAAGTTCTAGACATTAGGAGTCGCAT-ATTGTAAATATATATTTTTAGGACATAGGATGAAAATTAAAGTGAATTATTTAATTGAAAATAATGA
ATCTTTGGATG-------AAGCTGTCGCCACAGCATTC-CAGTGCCACTCTGGGCCACACAAATCTCCAGTTTGTGTGCGCTTCTATATTGAGAAATAAAA--GTGTGATTTTATAAAGTA------TACCTAAGTATTAGACCGTAGGGTTTCGATAATTGTACATATATATATATA--------AATTTAAGGTGCAATAAATTAATTAAGGAAAATTTATTT
>CG30465 11121617 11121751|10725 chr2R 11121612 11121747 scaffold_1 926772 926919 - 3231|5 149
CATTTTCCGT-----TTGGTCTTGTTTCCTTTCGGGCGGAAGAAATTTAATTTCCATATGTTTCGTGTGCTG-----TGGCAGCTGCTGCA-GGTTTCTGCTGATGTGCAA---GTTTTAAAGTAACCCAATCGTCCGAACGAGC
CAGCTGCTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGCTGTGTAAATGTAATTTCCATATGTTTTGCATGCTGCCAGCTGGCGGCAACTAAACATTTTCTGCTGATCTGCAGCGTTTTTTGAAGCAA--CAACGGGCCAAGCGAGC
>Ranbp11 11202198 11202283|10837 chr2R 11201085 11203977 scaffold_1 1054177 1057239 - 110616|1219 1320
TTCCGG--ACTGCTGTGCTTTAAAAGCTTTCTA------CGCTAAGTTATTAATG-----TATTTTGTATTGAAATTATATATTTTTAATTGTTAA---AAA
CGCCGTTCATAGCTGTGCTTCAAAAGCTTTCAAAACAGTCTTTAAGTTATTAATGTATTTTATTTTGTATTGAAATTATATATTTTTAATTGTTAATCCAAG
>CG30089 11276118 11277426|10953 chr2R 11274326 11276118 scaffold_34 1002307 1003978 + 28413|1900 1900
C
C
>CG30089 11276118 11277426|10954 chr2R 11276153 11277198 scaffold_34 1004142 1005276 + 16221|0 1271
ACACTCGTTAACCCAAAGGTATTTATTTGTACGGAACTCAAG----------CTGCTCCTAAATGAATGTAATG------------------TAACCCCTATCTGTA------------------------ACCTGTATCTGTAAGCGGCGTT-AGCTGGTAAGAT------GTTTGTTGTACTTGAATGTGTTGAATTTATTTTTGTAAGCATTAAGCAGATGCGCAGCGTAGTTATTACGAATTCTAGATACTTGCAATTATACATATACGCCTACCCATTGAAGTATTAAAGTATCCAAAACGAAAGAAAATGTT---AAAATTAGAACATGAGAAACTCTGAGCTCAGCCAACGACTAATTGAACTGTAAATACGACGAAATTTCGAACGCATTTCTAGCA---ACTAAACTATAAACCAGGCCAGAAACGAAGAGCAAATACTAAGTATATAGTGTATGTAGGTATGAGTATCCTCGGGATATGCATAACTCGCAACGGAACGCTACGGTGACAAATTTGGCGCGCACTTTCGGAAACCACGAATATCCAACTGAATACTGAACTTCGATGTCGATTTCGATTTCTGAATGCGTTTCGCACAAAAACAAAATAGGTAGACC---------------------------TACCCCTAATGATATGTAAGTTACGACT-AATTGTA-------------CGCGT----------------------------GTCCTGCACGAGTACAACACACACAG----------ATACACACACACACAACA---ACAACCAAACACACAC-TCGAAAACTAACTTAAAGTCCTTTACCGTAATGTGCAAGGC-AACGTAAACTAAACATGAGAAATAAAACCCAACAAAT----CGTTGAAAAATGCCACAAAA-CCCCAAATTGTTTTTCTTTCTCGCACG-----------------AAGGGCGTG--------------GCACATGCCTCCACGTCCT--------------GATCCTGCTTAATCTACCGTGAATTT-TGCTGCCATCGCCAGGCCTCTAAAGTTTTGTATTCAGAGCGGGGTAAACATCCGAGTTTCTCTGAGTGGGGTATTCGGAGTCCCAGCGATTAACACCCAGCA--CAGCACAGCCCATCACCCACTCACTCACACCTTAGGACGAGAGCCGAAAAAAT------AAAATACCAGGC------------------TCAAATGAAACCAACAAAAATTGGTTGAGCATGAAATTG
ACACTCGTTAACCCAAAGGTATTTATTTGTACGATACGAAAAACTAAAAACTCTGCTCCTAAATGAATATATTGATATAAATATATATTAACTAAACCCTAAATATAGTTCATGCATCTTTGATATATACCATATATACCGATATGCGGCATTTAGACAGTAAGATATATATGTTTGTTGTACTTGAATGTGTTGAATTTATTTTTGTAAGCATCTG--AAATGCGCTGCGTATCTATTACGAACTAT-----CGTAAAAGTATTAAAATATTCC---------AAAAACGAAACTATCC---CCAAAAAAAAGTTTTAAAAAAATTAACAC------AATTTTG----TAAATAACAAC--------------------------TTCGAGTGCATTTCAAGCATGCATTAAA-TGTAGATTCTCTCCCAACCCAAT-----ATACTATATATATGG---ATGTA--TGTGAAAAACTCTGATGTA-----AATTCGCAACGGAACGCTACGGTGACAAATTTTGCGCGCATTTTCG--AATAACGAAT---CAAACGGAAACTGAAACT-------------GATTTCTGAATGCGTTTCAAACAAATAAAAATAAAATATATTATAATATAAAATTAAATAAAGAGAAGAAAACCCTAAAGATAAACTACTTACAAATAAATTGTAGCGCAGTTGCAGTTGCGTATGTTATCAATATTAAATACTGATACAGATCGTGCATAAGTACAATACAGTTAGCAAATAAATACTATATATATATGCTATATATATAAATATATAGAAATATTTAAATCCAACTTTAAGGTCCTCTGTTTTATGTGCAAGGCTAAAATAAACTAAA---AAGCAAAACATCTGCAAAAATGTAATGTTGAAAAATGCCACAAAAGCCGCAAACTGTTTTTCCTTTCCGCCTGCCAGCGCTCAGCAACAAAAAGGCGTGTCCCCCACCCTCGCTCACACACACACACGCGCGCACACATAACCATATATCCTGCTTAATCTAGCGTAAACTTGTATTGGCCCTGC--GGCCCTTATAG-------------GCACGGTAA------------------------------GTGGTCCAGCGATTAACACCCAGCACGCAAAAATGCGGAGCGAACAAAAATTGACACCTTATTCCATTGGCCAGCGATATGCGAGGAAAATGCCATGAAAATCGCCTCGGAAAATGCCAAATGAAAACAACTAAGCTTGGTTGAGCATGAAATTG
>CG30089 11276118 11277426|10955 chr2R 11277401 11282213 scaffold_34 1021976 1026882 + 161205|0 26
TCACAAGAGAAAAGAACTCATTTT-TT
TCCGAAGGTTAAAAAACTCAGCGAATT
>CG8253 11368059 11368450|11055 chr2R 11367240 11369925 scaffold_71 190273 192644 - 36924|829 1236
ATGGAGGGCCAGGGGATCTAGAATGCCGAATCGTGCATCCGAAGCATCCAACAGCCCACAGATGCAGAACGCATCCAGCAACTCAACCACATCCAAATGCAAATACAAATCCGTATCGAAATCGTTTTGTCGTTGTCGTTACCAGACAGTTAATTACCAATTGCATAC-------ATATACATACATACATATACACGCGAACATATAAATATATTTATG--ATAATGTATTTTTGTATTCAGGTTAACAGAGATCAAGTGCAGAAGACGGTTA------AAACGCTGGCGCCACGCAGCTCTT-GGCGTTCATATGCATTAAACTTCAATTCTAAAGAAATTATAAATCTAATTATACATTTTTTATTGTACGTATTGTATTGTATTTTATAAAGCAACCACCACAC
AT------------TATCAATAACCACGTAT-ACATATACTGA-----CATCAGCCTAAA-----AAAAAGCAT--AACTATGTTAGAAAGTTTGTGTTAATGTCAAACTCGATGTCACAAACGATATGCATTCA--ATCACAAAACAGTTAATTATAAATTGCATACATATTATATATACTTATATACATATATA-ACAAACATATATATATAAATATAATATAATGTATTTTTATAGTCAGGTTAATATTAAATAAG---AAAAATCTGTAAGTAAATAAACAATTACTCTTCCGACTCCTTCAACACCCATCTGTAACCAAATTAAATTTCACACTGATTA-AATTATGCTTATACGTATTTTATTCTATGTA-TGTA------TTCAAAGGGCGA---------
>CG8297 11450704 11451308|11170 chr2R 11449662 11451059 scaffold_1 5293915 5295327 + 34461|1084 1474
--TTAGTTAATACGT-------------TTAATTCTCTATAAGTCGCATAAGTAGAACACTGGATTTACTATTATAATGTA-ATTACCATTTAATTAAATTCACGTTAACATTTACTTAGGCCTTACGAATTACATGTATTTGGGGAATTGGTAATTGTTGTTTTCTATCGTTC-GGAGCCTTCAAATCAATTGTGTTCATTTGCACGCT----AACTGGCATCC------ATAATTTAAAGCTTAGTGGCTAACAAAATCTAAAAACTTGAGAATTAATCAAATAATTCAAACTTATAATTACGATTTCATATATATTCCATTACTTTCATTGAATTTTTCGA--------TTAGGTCTGAGAGTGTGTGTTGTAATGATTTCGGCGTTG
ACCAACTTTAGGCATAGGAGAGGATGAATTAAGTAGTTACATATTGTTTACG-----CTTTAAATTTACTATGTGTGTATGTATTTTCGTTTAATTAAATTCACATAAACATTTAGTTATGCCTTAAGAAT----------------ATTGG-----------TTTTATAGTTTAGGAGGCGGC---TTAATCCT-TGCAGCTGCAAGATCTTAAGCTGGCACTCCTCTGTATAGAATTCAGCTTACGCTCTATAAATAACTAAAATCTTGAGAATATTTTAAACGATTC-AACTTAAAATTAGAGCTTTTTTTTTTTAACTTTAATACAACTAAAAATTTTCATTAACATTTTAGATGTGGGTGTGGGGATTGTAAGTGTTTGTATATTG
>CG8297 11450704 11451308|11171 chr2R 11451268 11451748 scaffold_1 5295731 5296379 + 4920|0 40
GTGTTTTTGAGTGTGCGATGCGGAAGATGTTGGCATACAGA
GTGTGCTTGTGTGTGCTGTTAGGTATGCGTGTGTGTATCCT
>CG30093 11459262 11459356|11187 chr2R 11459263 11459509 scaffold_10 89468 89721 + 752|0 99
AGCGCCTATTATTTTACTCTTTAACTTAGCTTACTACGAACTGATGGTAAGAAGTTCCCACTAAATGG-----AATGCCACCTAGATT-TTTGGATAAA-
AGTTCTTATCAGTTGCGCCAGAAACACACCTGACTGCGACACGGTGATAAGAAGTTCGCAGTTAGTTGTCGAAGTTGTCTTCTGTTTTGTTTGTATACAT
>CG8366 11471474 11471501|11196 chr2R 11468281 11472221 scaffold_4 3000823 3005011 - 154471|3370 3419
ATACATACA----------------------CATTCACTGTGCTGCTTAC
ACACACACAGCTACAACTAGTCAATAGATATAAAGCATAATGCGACTCAC
>CG8320 11508276 11509038|11217 chr2R 11507567 11508309 scaffold_4 3043798 3044532 - 26917|727 760
AAGCCACTTTCCGAGTTGACCTGGTGGTTAAGGG
AAACAA------GCGATTCCTTTGCGTTCGATGG
>CG8320 11508276 11509038|11218 chr2R 11508310 11511701 scaffold_4 3044760 3048399 - 129157|0 971
GTTCCTGGTTTTAATGAGATTCTACGC----TTAGTT---GTGTGTGCGTTTCCAATTTGTTAATTGTTCAGCAAATTAAACTGCTCGAGACAAAGACAATTCATTGTTTTAGTTAGTCAAAGCATTT--GTGCGATTTAATTGCGGTGAATTTTTAAAGACGCAAACT------------------TTGCGAGGGAAATTGCATTTCC-------TCAAGGC---------TGCCTCCCATTTTTTGTGCATTGTAAATA------------TTCGTGTA-----ATTGTTTATAAATAAATGTGCTT---------------CAGTGCAGCAGGAACTAGTGCAGTGTCCGTTTCTCTTCGAGATGCTGGCAA-AGGAAGCGTGGGATTTAAAGAA---CAAATAGTAAAGGAAGGGTGACAAAAATA----------AAATTAAGC-TTTTGCAACAATTTATTCTCTTGTTGTCTAGACAATTGTGAGCATCCAAACTAA--AGTATAAAAGTATCAAATAATGTTATGCCGGGTACTGGTGTGTTGTGCGGCTCGGAGCACTAGATTTAACTAGGTCT-----------------------AGATTCCAAAACCCCTAAGGGCTCCGGGGACACGCAGCGCTTACAAAAACAACGAGGGTA-ATGATGGTAACTTAAGAACTTTA-----------------------AATGCAG------------------------------------------------GATAAGT-GAGAGGGAAAGGGAT---------------CTGGGGAGAGT-----CACATGCGCGGATAGACCTCAATGGATCCTTC------CAGCCAGCGGAGCG-------------------GGTGACCTCTTTGCCTAACATCAT----------ACATCTGTGCTTAACTACAACAACTTCCGAATAATATATATGCTT
GTTTTTAGTTTTG-TGAAATTTTGTGCGCTTTTAATTAACGTGCCCGAGTGAACAATTTTTATGTCATATAGCAAAA-ACTCTGCACAAGACGTCCAATATTGGATATAT-ACTCTGTTAACTCCTCTCAATCCGATCATACTTTGGTTAACTG--GAAAGCGAAAGCTGCGCTAATGTTTAAGCCCTTGTGAAGGAAATCACAATTTCGTTTTAACCGAAACATTTCTAAATGTTCACTAGACCCTGTGCTTTGTAAATAAATATTTATATATGTGTGTATATTCGTTAGTTATAAATAAATGTGCATTTGAGTGCAGGAACACAGTGCAGTTCTAATTAGTGCACTTTCCACTTCT-----------TGGTAACAGCGAGCATGGTACTTTAATAAAATTAAACTAAATAAAAATGTTGAGAAATAAATAAAATCAACAAATTAAGCATTTTGCAACAGTTTATTC-ATTGTTGACTAAACAATTT---GCATCCAAACTAAGAAGTATAAAAACAT---ATCAAATTATAATGATAAATGTCGT----------TTGGAGCTCAAGATTTCACTAATTCTTTGTTATATATATTTTTTTTTTCAGTTTCCAAAAACCC----GGCT------------ATAGCCTAGAGGAGCGTCAACAATATACGATCGTAACTTAATAACTTTATGCTGGTAAATAGTATGAATGTAAATGCGGCTTAGTTATGAAACTGTAAACATATGTAATGTATTTAACTAAGAGATAGATAGATAGAGAGAGAAAGAGAGAGAGGGGGGAGCAAACTGGGGTAAGCTGGACCATATCGGTATATATAGTAGAATTGAAACTCAACTACACAGCTAATGGAGTGTTCTGTGTTTGTGAACCATGCGGCCATCCATGCTCGCCACTAGCAGTTGGTTAACATCTGTGCTTAACTACAACAACATCC-AACAATTTGTA-----
>CG8370 11521610 11521771|11225 chr2R 11516457 11521762 scaffold_4 3053785 3059402 - 142791|5685 5838
GGGAATGACGAGGAGCAAGCTCACTGATCAAACCGAATCAACCAAATGAAATTCTTACCACTTAGACACCTAGGATACGCGACGATGGAGGAACGCTGAATGATCTTTTCCAATTTGACTTTTGACT-AATAAACGCAAAGATAATTGACTTTC
AGGTGCATCAA-----AAGCTCACTGATCAAATTTAAGCAACCAAATGAAATTCTTATTCTATAGACATTTAGGCTACGCTAAGATTGATGAA----ACATGATCTTTTCCAATTTGACATTTGACTAAATAAACGCAAAGATTTATGACTTTT
>CG8370 11521610 11521771|11226 chr2R 11521763 11522479 scaffold_4 3059756 3060437 - 32390|0 8
GTATCAAAC
ATACAAAAT
>CG8389 11528400 11528687|11228 chr2R 11523391 11528692 scaffold_4 3060740 3066024 - 124764|5258 5562
ATCTCTGGTCACTACCTGACTGGATAAGAGTTTAAGCGAAGGATA-TCGGTATTGACTG-TCATGTGATAGGCGATGAAATGACTTCCCCGTAGGGAACATTCCACTCTCGCCGCAGTAGTTATCTGAGTTGTGAGGAAGGACCAGTGTCAGGAACAGCACTATCTGTATGACTATGCATC-------------TTAGGTTTAGGTTTTCGATTATTTATTACCATTTTAGCCCCTA--GACCTAACTTTTGTACTGCCATAAGAGCCAAAATACAAATTAAAGTATGCATATTACAAAAACCAG
--CGTTGCGCAC-----------ATAAG----TACGCCAAAGATAGTCTATGGAGACTACTCATATGC----CACCGAAA--------CTGGCGGAACCATTGAATTTGTGCT-CATAAGCACGAAAATTTGT--------ATTAGTGGCCATAATTATAATAATGTGATAATTATGCGTTGTGACCAAATGCGCTAGATTTTAG-TTTAACTTATTTATTATCA-TATAGTTTGTAAGAACATAACTTTTGTACTGCCGTAAAAACGTAATGATATACAAAA----AACTACTGTAAAAACTGA
>Rrp42 11530894 11530917|11229 chr2R 11528729 11531936 scaffold_4 3066250 3069370 - 117552|2265 2288
AGCGGCAAAGTCTTGTAATGAAAA
AAGTGAA-----TTATTATGAAAG
>CG8399 11539256 11539497|11234 chr2R 11536585 11539515 scaffold_4 3075933 3078966 - 109751|2853 3111
GCCCCCTAA--TTCGGATGTCCTGTAAC---CTGTCCCCTTCCAATACTCGTGTCAGTTTTGTGTGCTCATTGTTTAACCCCTTCCGCCCACGGCTCTGCCCTGCCCACCACCCAAATTCCCATCCTTT-------TTCCATTCAGCTTTGTGTTGTTAAGTGT-AATTAGGCGC----ATGTGTAACCTGGGGCGGAGCGTTCAGTACATGTTATATAATTTATTATTAATAAAATAAAACAAGCCAACATAAATGCA
GCTAGCTAAGCTTAGGACAACCTTTAACAATCTCTACACGGCTGCAACTTTTAACAATTTTGTGCTC-AATTGTT----------------------TTCGATGCTTATTATTTTTTTTTTAATTTTTTAATGTAACTCGTTTCCGTTTTATGTTGTTATGTGTGAATTAAGCGCAAAAAAGTGTAACGT-----------TTCAGTACATGTTATATAATTTATTATTGATAATGTAAAACAAGCCAACTTAAATGCG
>CG8401 11544851 11544954|11239 chr2R 11544331 11545490 scaffold_4 3084703 3085862 - 18416|527 715
TCCATCGAACA---------------------------------------------------------------------------TTCCCCCAATACCAAGCCCATCCATAATTTCTGCTT--------CTGCTTGATAAGTTAATAAAGTGGCGC-TTATTGCTTTATGGTT-GTGTCGATTTCAGC
ATTAATGCTAACTCTTGCCGGTGCTCCTGCTGCTGCTCTACTTCCGCCTGCTGCTGCTCCTGCTTCTCCTCCTCCTGCTGCTCCTTCTCCTCCTGCAGCTGCTTTGCCTGTTGTTTCCGCTTTCTAATAACTGCTTTATAACTGAATAAAGTGCGGCTTTATTGCCTGATGATGAGTGGCAA----GAC
>SP2353 11560469 11560800|11258 chr2R 11559916 11562202 scaffold_4 3101036 3103201 - 68194|562 931
AACGCTGCACGCAC-------GCCTCAAGACTTTTGATAT--CGACTAGTTTAAAT-TTATATGTT-----------AAACCACACAAATGTCCTTCGTCGATTTGTGTTTGTACAAATACGCTTTTAAAACCAAAAAAAAACCAGAGAGAAATCGAAA--TTGCAGAGTTAGGATGAGGAACATTTTTTTACACCACGATACG----GAGGAGAGAC-GAACTAAATCTAAATGGGAAACATACTACATATTATATA--------CACGCATATTGAGTATATACAAATGGG--CATATATATATACATATATATTTAAAGCAGAGGAAAACAATTCGAAAAACCAAGGCACGCTTCTTGTAGAGCCTG
AACGCTGCGCTTACATAAGAAGCCTCAAGACTTTTGATATATCAAATAGTTTAAATGTTATTTTTTTCAATTAACGAAATGTTTACAAATTGTATATTTCG-TTTGTGTTTGTACAAAGACGCTTTTAAAATCAACTGAGAAT-GGAGACGAGCAGAAGAGCAGCAAGTTCTAGCTGGGGGA-ATTTTTTTACGCCAAGAGACGAGCTGAGAAGTAACTAAAGTAAATATA---GTAAACCATACTACATACGATATAGTGCATACAAAACATATTGATTATATACAAATGCATTCATAGATATATATATATATATATGTAACGAAAGAAACCCAAAAAAAAAAACAAGGCATGCTTC--ACATAGCCTG
>CG8405 11574190 11574330|11270 chr2R 11573181 11574446 scaffold_4 3118604 3119783 - 22573|1141 1284
GC--AAGGCATTAGT-GGCGAGCCTCCAGAAACGTACACAACACAAACCCAATTCCGAAATCGAATCCGAACACAAGCCCAAACCAATCGAAATTAGCTACCCACATAACAAGATGTTATACATAAAAGAGCTAGTAAATTTTA
GCCTGGGGTGTTAGTGGGCGGGCCGGAAAAAAGAAACAAAAAAAAA-----------AAACTAAACATGAAGA----------------------------CCATTATGCAAG------CATATAAAACAGCTAGTAAATTTTA
>Rho1 11620915 11622092|11324 chr2R 11620574 11622042 scaffold_4 3184766 3186202 - 36691|359 1648
AAGAGCAAATCAACAACATGAAAATCTTTACCACACACACACACAGCAAAAACAACAGCATAAACACACACAAACACACATACACACCTTTTACAACAATAACG--------AGCTGAACAACA-----------ACCACT-CAACA-ACAACATCAAGAACAACCAGAACATCGGATACACGAAGCTGC--ACCACCACCCAACCAGCAACAAACATGAGCAGAAAACAGAGAGCTTGAGCTAGAAGATCAGCGGAGGAGGGATGCAGCGAGATATAAGGGAAGGCAGCACCAAGTAGAATGTCAAATGCGGATTTGATTTTATATACAGTCTAGTGTAGTTATAAACCGAAGTAAACAACAGTAATAACTCTGGC------------ATTATTATTTGTAAAAACTAGGGCAGAGCAGATCAATCAGTCAGCCACTGCAAGCAAAAAATATATA--------TCGATATATGTAAACATATTCAAGTTGTGTCCGTTTCTGTCCACCCCCTCCTCCTAGATGTATGT---TATTATTTCGTTAACTG----------------------------TGTTGTCAAGTGTAGAGTCGGCTGTGGCTGGACGAGATTGTGT-CGTATGCGAGGGTGAGTGAGTCA------GGTGAATCAG-----------------------TGGAATTAGGAACAGAATCGGAAACGGAATCGGATGTTGGATCCCGGGGTCCAAGGAGGTCGTAGGCGTCAAGATGAGAGTTATGTTCCCATTAAATCTATCAAATACAGAGAGACC-----------------------AGGCCGCCAATAGGAGTTGGAAGCGAAACTACAT-----------TACAAGAGCCGAACTAAACACAAAACAAAACAAAACAAAAACGATAAATGTTTATTTAACTAAACGTAAGCCACAAATGAGATGCATTCAGTTTTCGCGTGGGAGATGCTAAGAGGGAAAATTTTTGATGAAGTGAAAAACTATTTCGAGCGCATTAAGCGAGTTTTTAATATTTGTACTTTGCATTAAAACGAGTGGAAAACATAAAAAAAAAAAGATACTACAAAACAACCAAACAACTATATGAAGAGTATTTTATGATTTTATAAAATACGATTATACATATAATTATAC-----------------------TATACAGTACATATGTGTATGTCTCTTTTTTTGTATTTTGTACCGTC-AATCGTGTAATTCTCACACAGAAGTTGAAAAACTCGAAGATGCATCAGATACAACCA
AAGAGCAAATAACAAA-----------TTTCTATACATACAC-------------------AAGCACACACACACACACACACACACATTTTACAAGATTAACAACTACTGTAACCAGATAGCATGCGGAATCCGGCTACTACAACAGGCAGCAGCAACAACAACATCAACAACAACTACCGAAAGCTACAAACTACAA--CAACAAGCAACACACACAACAACAACAACAACAACATGA--------------------------------------------------AACGGGCAAAATGTCAAATGCGGATTTGATTTTATATACAGTCTAGAGTAGTTATTAACCGAAGTAAACAACAATAATAAATATCGCATTAATATTATTATTATTATTTGTAAA---TGTGACGGCGTCGA--AATCAGTCAA-CACT-CAAACTACCAATACATACTTACTCGTATATATACATATATATATATACACCCTTTATGTATGCATACACTACAATGTCCTATATATATATATATATCATTGCATCCGTTGATTTTGAGATTAAAAGCCAACAACAAAATGTCTACAAATACATTACTGATCATGTGTGTGCGTGCGTGCGTACGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTGATTAGTGATGATGCAGTTATTCATTTTTTTTTCAAACTCTTATATTCTGATAAAAACGGACTACAAAAAAAAATACTGAA----AGAGCCTAAAATGCAAGCATTCATAAACATACCAATTACAACTTTTTTGACTCATATATATACACACACATATATATATATATATATTCAAACAGAGACCGCCAATA--AACTAAAACGAGAAATATATATATATATATATATATGAATAGTACTTTGCAAACAAATACACAAAATGAGAA----ATATGTT--------TAAACATAAGCCACAAGTGAGATGCATTAAATTTGTTCATG--------TGCAAGTGCAAGTT------------------------------------CGAGTTTTTAATATTTGTATTTTGCATTAAAACAA-------------------------------------------------AATAAGCGTATTTTATGATTTTATAAAATACCAATATACACACACATATATATATATATATATGTATATATATATACATAGTACATATATGTGTATGTCTCTTTTTGTATTTTGTACCGTCAAATCGTGTAATTCTCGCACACACTCAAAAAAA----AATATGCGCCGTTTTCTACAA
>Rho1 11620915 11622092|11325 chr2R 11622043 11623181 scaffold_4 3186771 3187996 - 5706|0 57
AACTATATTATACTTATGAATAAACAGTACATTTGATCTACTCTT--------GGTTT
ATATATATCCTGCGTCCAAATATTCTATATACTATATAAACTCTTAAGATCCGGGATA
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ATGTACAATTTACACCAAACAAATCAAATCAAATCAAATCAAATCGAAATCAAAATCAGTCTACAAGCAATCTACAAGTCCATCTGCATATCTGACATAT-ATAAACACGTATTATAATTTATTCTAAAGTTCATGGCATAA--------GCTATACGTAAAATAATCATA
>Asph 11629635 11629729|11334 chr2R 11628439 11629923 scaffold_4 3195222 3196838 - 29860|1385 1479
AAATAAAGCCGAAAGAAGCTGCACCTGCTCCCGCAGAGAAAGAGGATCCTTTCGAGCAAGAGTTGCGCAAGGCAAACGAGGAGATGATTAGGGAG
AAATAAAACCCAAGCAGCCAACTGGCGCCCAGTCCGCGGAGGATGATCTGTTCGAGCAGCAGCTGCGTCAGGCCAATGCCGAAATGATCAATGAG
>Asph 11629803 11630457|11334 chr2R 11628439 11629923 scaffold_4 3195222 3196838 - 29860|1567 1694
CTCAACAATCACTAAAGAACATCACAACAAA--AAAACAAAAAACACAATCTCATTTCAAAGCTTTAGTTTATGTTTGC--TTGTCAAGTTCATTAGATCA---TATAACAGCTTAGTCATGTAAGAA
CTCAACAATCACTAAACCAAA-CACAATACATTAAAACAAAACATCTAG--------CATAGCTTTAATTAATGTTCGCTTTTGTTAAGTTCTTGTGCTTAGCTTTTAAGACATTTGCAACAGAAGAA
>Asph 11629803 11630457|11335 chr2R 11630201 11630464 scaffold_4 3197727 3198002 - 8219|0 268
AATATCCACCCCAAAGAACTATGCCCAAGCCCTGCGTTCCTTTAACACGCTCACCACCAACTTTGCCCACGAGCCATCGGCCCATTTGGGAAGAGCTCGACTTCTGGAACTACTGGCCAAAAAGGAGCGCAGCAATCAGCGCCTGTGGGAAGCCATCGATGCTTACAAAAGATATTTGGCCTTTGGCGAGCTTGTAGCCAGCAAT-----------CAG-GAATTTCAAACCGCCGGCGAAAGCTGCATCGAGAATTTGAGATTTTTGG
AAAACCTAACACCCAGAACTATGCGAAAGCTCTGCGCGATTTTAACACGCTCACACACACACACGCACACAAGCCGGCGGCTCATCTGCATCGGGCGCGGGCGCTGGAGCGCCTCGCCAAGCTGCGCCAGAGCAATCAGCTGCTCCTCGATGCCATCGAATCCTACAAGCGTTATCTGGCCTTCGAGGAGCTAATCGCCAGCGACGGCGTCGGCGACAGCGACTATCGTGCCGCTGGCGTGCGTTGCATTCAGCATCTGCGATTTCTGG
>Asph 11630516 11630621|11336 chr2R 11630501 11631404 scaffold_4 3198051 3198968 - 30303|19 124
GTCACCACCGACAGGCAACTACCATCCATGAGCTGCTCATCAATCGTTTGCCTGAGGATCCACGGCTTCGTAACCAACTATCACTCACCTATCTTATGGTAAACAA
GTCGCACACAGCAGGCGGTTGGCATACACGAGCAGCTGCTGGCGCGTTATCCGGATGAGGCGCAGCTGCGCAATGAGCTCTCGCTCAGCCATCTGATGTCCAATAA
>Asph 11630674 11631399|11336 chr2R 11630501 11631404 scaffold_4 3198051 3198968 - 30303|177 912
TCTTCAGCAGGTTG----------AAAAGGTGGCTGTGGAGACCCTGAAACTTTGGCCCAACAATGCAGTGGCTCAACTTCATTATGGACTAGCACTCAGACAGTTCCATGCTGATTACGCCAAGGCGCTGCCTTATCTAAAATATGCCGTGGAGTCTGGAGAGGAGGGCACGCAAGAGGCTTTCTTCTATTTGTCGCTGGGCGAGACCATGCAGCGCCTGTCCATGAAATCAGAAGCTCTTGAGGTGTACGGTAAAGGTGTTGCCAAAGGATTCTTTGCCAGCCTCTATCAGAGATCGCTGTACAATGAGCCCAGGTTGAGAGCACAGCCATTTTGGCAGCCCAAGGAAACGGGCTATGAAAGGCAGCTGGAGAAGCTGACGCTCAATTGGCGTGCCATTCGCGATGAAGGACTAGCACTGCTGGGAAGAAGTGGATTCTTCGAGGATGAAGCGGAACTGCTGCGCGACAAAGGAGTGTGGCAACAGTATGAGCTATATGCCCAGGGTCGTCGGGTGAAGGACAACTGCCGCAGGGCCCCAATCACCTGTAGCCTGCTGGAGGAATTTCCCGAGTCCGCCGGCTGTCGACGTGGCCAAGTGAAGTTTAGTGTTATGCAGGCCAAGACGCATGTGTGGCCGCATTGTGGACCCACCAATTGCCGACTGAGGGCCCACCTCACGCTAGCTGCTCCGGAGCCGGAAAAAGCATCACTCCGCGTGGCGGAGCAGGAAAG
TTTCTTGCAGCTTGGTCAAGCTGCAGCAGGTGGCAGCTGAGACACTCGAACGCTGGCCGCATGATCCCCAGGCGCAGCTGCACTTTGGCCTGGCGCTCAAGCAGCTCGGGGGCGACTATGCCGGCGCCTTGCCCTATTTGCAGCGGGCCATTGACTCTGGTGCGGCGGGCACACAGGAGCCATATTTCTATTTGGCGCTGGGCGAGACACTGCAGCGTCTGGGCAGGCAGACGCAGGCGCTCCAGCTGTATCGGCGCGGCGCGGACAGGGGCTTCTTTGCCAGCGTCTATCAACGCTCGCTGTACAATGTGCCTGGGCTGCGTGCGCAGCCCTTCTGGCAGCCCGCAGAGACTGGCCAGGCCGCCCAGCTGGAGCAACTGCAGCGCAACTGGCGTGCCATACGCGCCGAGGCGCTGGCGCTGCTTGGCGGCCAGGGCAACTTTCAGCTGGAGGCGGAACAGTTGCGCGACACGGGCAACTGGCAGCAGTTCGAGCTCTATGCCCGGGGCAAGCGCCTGGAGAGCAACTGTCAGCGGGCGCCCGTCACCTGCGCGCTGCTCGACAGATTTCCGGCCGCCAGCAGCTGTCGCCGTGGCCAGATCAAGTTCAGCGCCATGCAGGCACAGACTCACGTCTGGCCACACTGCGGACCCACAAACTGCAGACTGCGCGCCCATCTCACGCTGGTCGCGCCGGAGCCACAGTTGACTAGTTTGCGTGTGGCCGAGCATCAGCG
>Asph 11631456 11631863|11337 chr2R 11631426 11631812 scaffold_4 3199286 3199635 - 8352|37 403
AACCTGGCGTGAGGGAGAACTGTTCATATTTGATGATAGCTTCGAACACGAGGTGTGGCACAACGGAAGCCAGTCACGCCTTGTGCTCATCCTAGATATGTGGCATCCGCAACTGAGTGCCGCCCAGCGCCGCAGTTTATCACCCATTTGACCGGTAGTCACTTAGTTGTTCTATTCATAGTTCCGGTTCCTAGGCCTGCAATTTAGTTTAATTTCTACATTGTTAGTTAAATCGCCATGTTGTATAGACATTGTAATTATACCTCTTAGTCG-TAAGTTCGGTT----TGAATGCGTGTTTAGGCTATGTAGACGTCAATTCATCTGTGTATCATATACGATTAGCG-----TTGGCTGGCAGCTT
CACCTGGCAAGAGGGCGACTTGTTCATCTTTGACGATAGCTTCGAGCACGAGGTCTGGCACAATGGAACCCAGCTACGTTTGGTGCTAATTGTCGACCTTTGGCATCCCGACTTGAGTGCAGCGCAGCGACGCAGCCTGACGGCCATTTAACTCCCAGTAG-----------TAGACATAAT----ATACATATGCTT----------------------TTGTTAGTTCATTCAC--------ATAGA---TCTATTTGTAACTCGTAGCTGATAAGTTTATTTTGTATGAATGCGTGTTTAG---CTGTAATCGCAAACTTTTTATTAAGTC---TATAATTAGTGGCTGCTTGGTTGGCGGCGT
>Asph 11631456 11631863|11338 chr2R 11631837 11632579 scaffold_4 3200397 3201176 - 13737|0 26
AATAAAACCTTTTAGGATTTGATAATT
AATAAGCGTTTTTAGT------TAATC
>Jhe 11637506 11637638|11341 chr2R 11637608 11638602 scaffold_4 3217870 3218826 - 5198|0 30
AAAATAAACTACTATCAATACTTAAGAACAA
AAATTTAACTACAATTAAGCTTTAATTGAAA
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AACACCTGCACAAGAACCCCAGCGACTCTGGACTGACCACCGAGCTGCGAAGCATGTCCCAAGTGGCAGGTTCCGCGATCAGTAATGCCACCCAGGTGATCGCGGAAGCCACCACCAGTTTGATGGAAACAGCACGCTCGTCAGCCTCTCAGGAA
AGCATCTGAGCTCGGCGACGACAAAGTTTATAAGTTCGAACAGCATGCAGAGCTTGTCGCAAGTGTTGG------------AAAATGCCACGGAGACCGTAACGGAAACCATCAAGGATATG-TCGTATCTACGCGC--------------AGAG
>spin 11651288 11651429|11351 chr2R 11650782 11651435 scaffold_4 3231420 3232035 - 12801|516 660
TACTCTGATGTGG---AGCAATTCGAGGGACTGCAATATGCGCTCTTCTCCACCAGTTTTGTGGAGGTGCTGGGCGGCATTTTCTTCATATTCACCGCCTGCTTTATCATCAAAGACAAGTACAATGCCACACGAGGACTGCAAG
GCCACGGATGAAGTCTTGTCCTTCGAGTCACTGCAGTATTCGCTGTTCTCGACGACCTTTGTGGAGGTGCTGGGCGGCATATTCTTTCTGATCACCGCCTGCTTCATAATCAGAGACAAGGCCAAGGCGACCAGCGACAGCCTGG
>spin 11651697 11651892|11352 chr2R 11651765 11652204 scaffold_4 3232165 3232574 - 6754|0 133
TTCAACTCGGACTGCCTGGTCCTTTGCACTGACATCGCGCTGCGCGAACGCACGTGATAGCTAAA-----AATATGAAATATGCATTCTGGTGCGCGGCACCAAATGATTACTTTATTTTGGCCC-AGTTCCCG
TTCGATTCGGATTGCCTGGTCATGTGCACAGATATTGCGATGCGAGAGCGCGCGTG--AGCCAAATATCTAATTTCAATTAGCCAAAATTGTATTTGGCCC----------TTTGTTTTTGGCCCTAACACTCG
>spin 11652068 11653101|11352 chr2R 11651765 11652204 scaffold_4 3232165 3232574 - 6754|312 458
ATGCCACGGCTCAGCAACAGCAGCGGGATGAGCGCGGTCAGATTGCCTAATACCAGC----------CGATTCTGGAGGTTATGCTGCGCACTCAGAGCTCCGATGGCATGCCGGGTGAACTGATACTGACTGAAAACCATCTTTAA
GTGCCTTG---CAGCAAC-GAATCAAGAGCAGCGCCATCGTAATGCCTAATGCCAGCCGTTGCCAGGCGATCCAAGGAGTTATTCGACGCACTCAGCGC------------------GAACTGATACCGACTGAGAATCATCTATAA
>Got1 11656457 11656797|11357 chr2R 11655966 11657213 scaffold_11 1314436 1315697 - 17394|501 880
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ACATACAATTGCAATAATTTGAAGCAGAACGTGATGGCAATTACAAATGTCTCCCAAAGTAAAGATATTG-----ACGAGTTA----------------ATTATGCATGCATTAAAAAATAGCATTTTATAGAATTAAACA--AATTG----TATTAAATAGCTCAACTTAGCATTTATAGAAAATTTGTTACCACACATCCAATAAATAC---AAACATAT-----ATACTCACATATAAATTTATGTGTAAGAACGTCCTTCCGCTTCGTCGGTCCAAGATAAACCCATCCAGTGATGCATTAACATGGTAAGGATGGACATCCTTATCGG---ATGTCAAATGGCTATGCCGGACCATTATTTTTATTATTATTACA
>Aats-cys 11660632 11660773|11359 chr2R 11658099 11660791 scaffold_11 1320121 1322791 - 110880|2578 2722
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----------------CTACGTGTAACTGATATT---ATATATACAACTCG-----CCAGAAAAATTCAGTCTAGGTATT----TATATTTTCATAACATGCTCGTTTAACATTTGCATACAATAAAATCCAAACTCTACCCGAA
>lbk 11683719 11684383|11383 chr2R 11683190 11684457 scaffold_1 3980277 3981693 + 19487|589 1402
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GTTTGAGCCAAAGCCAAGACATATGCAAATAAAACCAAAATGCACACACCAAAAAAAAAAAAAAAAACTACAACTGGGGAGATGGGCTGCCCTTGCCACGCCCCCTACCTTAAAACCAAAACCACCCGCCACCCAAAAACTAAGAAGAAGAAAACCTAACAAACGAACAAAGACTGTT--ACTCGTAATAAAATTAAATATAA-TAATATATGACGACGCTTGCCATCAGGCGGCCTTAAAGAGTATATATGCAACTGTCGCAGCACAGATATATATATATTATATATATATGCATGCTGTATATATATTATATACATACCAGTGTCTTCGTAATTTATGAAATTTAATGGATTTATTATTACTTTACTTTAAATTAAAACATAATTAAATATTACTCTAGTATCTAAGCATACATATAAATTTATAATTTGTAATTGTTTATTTCGCTTGTGATATTATTTATTATTATATTTTGATCGCTTAA--------------ACATTTGCAGCTGTATATATATGGCACCTGTTACCAATTAGTATCTAGTTTTAGTTG-TAGCTCCTAAGTCCCAATTGCCACGAAATCGGCTATGAA----TTGCTAAAATATGGTATATTGC----CTGAATGCGTTTATATATACAAACACATACACAACTATTTAAGTCTGTTTTATGTTGCTACTATTTCAAATTTGATATATGTTTATGTGAATTGATTTGCCTTATGCTTATGGCCTTG-ACTATATATATATATATATAGTATTTGAAAAATCTAGAATCGT-----AAGTGATACATT---------
>Lis-1 11698540 11699970|11395 chr2R 11696833 11700883 scaffold_1 3998291 4002943 + 128158|1870 3766
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-------GGAACTCGGCAAAAGATTTGCTTATTTCTCAATTTAAACATAATTAATAAAGCTACAATATTTATATATATAGATATATATATATGTATGCATATATATATATTTGAGTATGCAAAACAGCACACAGTCTCAGCCACCTTTACCAGATGCATCAATGCAAACTTCAATTGTATATTTCAAAATATATCTATATATATATGTATGTGTATGTGTATGTATACATATGATGTATGTCTAAAGTTAAAACCGAGCAAGCAGCAATTAGATGAAAAAAAAAAACTAAACAGCGAAAGAAACGAAATATTTATTTAA-TGTACGGCCTCCTAACCAACTAACCTACCTACCTACCAACTATACAAAGTACATGCATATTTATATATATATACCTTTAA---ATATACATACGATTACTG-TTAATTTAAATGCTGTGTAGACCCACGCCTCAAAAAATATAAAAAAGAACACATAAGAAAAAAAAAAACAAACAAACAAATCGATAAGAAAACAAACGCCCACAAAGCACGCTCGCTAGCCGACAAAAACTTAAGATCTGTAGTTGAATTTTCGTAGTTTTCTTGTGAGTGTGGAA---AACCAATTTGAAAAACGATATATTATAAAAATACGCATACACAAAAAACAATTGTACGACG------AAAAATGTCTTTGTCAAAATCCAAATGTTGCAATGTCACTCAACGCAGTCTTTATAGACCACATAGCGAAAATACGATATTATATGATGTTGTCGTCTCTGAATTTTGTTGCATATAAGCGCATAAGAATATAGATAAATATATGCCACACCCTCGCGCAATATAAGAACAGATAAATCAACGACAACAACAAAAGCAGCAACAAACAAAAGTATTTTTTCCTTCTACTAAATATACTATTATTAAACGCAGAGCGAACGATTTCTAATGGAAGGCAAATTTGTTATTAATTACTTGAAATTTTACTTACATGA-AATTGAGGTAATTTTTGTCTAAATGAATAACAAATCAAGAACGCTTTTTACAAACATTTATGAATACAGCTTGGAC-------GTTTTGAGTTCTTTTTTGCTAAAGGATC-TAAACAAAACCACAAACAACAAACAATACAAATAAAACTATATAAAATGTGTACAAGTTTAAGTTTGCTTTAAGTTCAAAAATATAATTTACTTTAGTG--------------AAAATGCTGCAAATTTAATTTTAATTTAATTGTTCA--TAAGTGCAAAGGCAAAATATAGTAGTATATATGTATACATTAT---TAAATATTTGTGGAACATTGCAAATTTCGTATAGAC----------------------AACACACAAATATGCAGAAATTAAGAAGCAGAACCGGATTAT-GGATTTAAACAAGCAAAAGAAAACAAAAAACATTTGTAAACAAT-AAAATTTGCTTCTTCAAGAAACAGAAAAACAACAAAATCAACAGTTGATGACATTTTAAATGCTCTGTACCCAGAGCATGGATATGCAAATGCTAAATAATATTGATATTTCGTCA--GATCCAACC-ATGAATTGAGTGTTACGTTTGTTTGCGAGAACTGGGTACAGGGTATTGCATAGTCGAACTCAGTCGATTATAGACTACTCTCGTATTTGAAGCACCTATTTTTTAGCATAAGTT-------------ATGGGAATTACAAT-----TAAACAAAAACACAAAAAACGAAACGCTTCTCTTATCACCAAAGCTGCTTTAAAATGTTGGCCTATTATCACGATAAACCACACATGCAATCGATAATTAGCCAATTATTACATTAATGGCAGTTTTATCGCTGGTTAATATACATTGATATATATATACATATATATACATAACATGAATAAAT
>CG8443 11707931 11709112|11397 chr2R 11701319 11708449 scaffold_1 4002944 4010506 + 240712|7268 7948
ACGCTCC--------CAATGGG-------------------CGATGTTT-------AACAAAAAGATAT----------------------------------------------CGAAAATCCCAACA--------------AGTCACAAAATTTGCCGCCTGTTCATTGCATTGCCGTATCGTTAATCGT---ATTTT------GGGACTGAGCAAAAT-----------GAATGCATTCAGGTTTTAAACTACTACAGCAATGACCTACCACCAACAGCA------------ACATCAAAAAGTACCAACATCGT-AATAAAACATAATTGTATATGTTTTTCTTAAAGGCTGCTCTTGTACTGCTCACACACATCGCATCGCGTCGTATTTAAGAATACGCATAGAACGT-----CCTATAACCATTTATGGCATAGGTCAATAAAGTACTTTTAGATTTAGT--------CAAGCAAACTATCAGCAAC--------ACTATTAAGCATCCTATCCAAAACCTACAGACAGATATCACAGAAAAATCAGCTCT-------AACAGAAAGTTGACTTGTTTTTGAACGCAAAAAGTCGCC--TAGCTCTAACACACATGTATGTTTTGCCAAACCATTTGCAA--ACCCGTCAAATGCC---TTTTATAGTTTGTAA
ATGCAGCAACAACAGTAACAGGAATGCAGACAGCAAGCATTCACTATTTCATAGGCAACAAAGAGACACAACACACACAGCACAGACACACACACACACACACACATACACACCAAAAAAATCACACCAACCATCTACATGAGAGTCACAAAATTTTCAACTGTTGTCCAGCATTATTGTGTTTGTCAACGTTTCATTTTATTTCGGGGACTGAGCAAAATTCGCAACAACAAAGTGTTTTTA-CTTTCAAACAAGAACCGAAATGAATAACCAAAAACTAAAAGAGAAAAGTATACAACTAAAAATAACAACTAAATAAATAAAGCATAATTATTTATGTTTTTTCTAAAGGCTGCTCTTCTACTGCTCACA-----TGTGTAACGTTAAATATTACTATATACAAATACCGTGTACGGCCATATCCTTAGATGATAAACGGCTTGAAA--AATTTTAGCTTTAGTGTCTATCAAAAACAAAACATAAACAACTACAAAAAACTATGAAACACACTACCAATCATCCTCCTA-----ATCATCAA-----CAGCTTTAGAGAAGAACAAAAAA-------------AAACTTAAACAATTATCATTGTCTGTAGCAAACCATTTTTTTTTGTTAAACATTTGATAGGCGCCAGTCAAATGCCTTGTTTTATAGTTTATAA
>CG8443 11707931 11709112|11398 chr2R 11708825 11710772 scaffold_1 4010531 4012423 + 80776|0 329
TATGCATTGTTTTTGTTGAATCAACTTTACAACGAGTGCGACTAAATATTTTACAATAACGTTAGGATTCACCCGATTGGAAAAAAA----------------AACCAGAGGAATTA---TTGAAGGATTACGTTTTTGTTATACAACTATCATATAGATATATATCAGAAAATATATATAT-TATTCATAT-GTAATGCATAC-------------------ACATTTGGGTCCTTC-GTCTATCAAGGACCACATGAAAAACG-ATTCATACGAACAAAATGGTTTTTTATTATTAAAAAGATCGAATTGCGATCAAATAAAAATGAA
TATGCATTGTTTTTGTTTTGTTGA----ACAA-----------AAAAATATTTACATAATTTAAGTTTGCGCTTAACTGAAAGAAAAGCGACAGATAATACGAAGTACGAGAAATCAAATGAAAATGGTTCTTTTTCTGTTATACAATTACCATATAGATATATA----GAAATATATATATACAAACATATTGTAATGCATACTACATACACACACACAAACACATTTGGGTCCTTTTAAATGCCAATAAGGACTTGAAACATTTAATCACATGAACAAAATG-TTTTTTATTATTAAAAA----------TGATTAAATAAAAAAAAA
>CG8446 11714041 11714242|11401 chr2R 11713304 11714092 scaffold_1 4015530 4016330 + 38460|745 807
TTACTGTTGTGCTAGCTCGAAAAAATTAACAAAAAAA-----------TATATAATCCATTTC
TTTTTGTTTCGCTAGC-----AGGATCAACAGCGATAATAGTTGACTCTGTTTAAGCCATTTC
>CG8446 11714041 11714242|11402 chr2R 11714118 11714247 scaffold_1 4016356 4016507 + 1153|0 146
TTATAATCTTTCCAAGAAACCATATT------ACTAACCTAGTATTTAAGCGGTTTACCA----------ACAAACTATTTACTTTTGTTACCACGTTTTATATAAAAGAACTGCATTAAATGT----TTAAACATT--GATTATTA
TTATGATCTATACAACTGGTCTAAATACCTGAACTAACGTAGCATGTAAGAACATTAATATTTTCCATATATATTTTATATACTTTATATACGATTTGCAATAAAAATGCGTTACATGAAATGTACTGTAAAATGTTTAAATTGTTT
>Tsf3 11744643 11744737|11440 chr2R 11741969 11749101 scaffold_16 1739288 1746312 - 193815|2738 2858
ACCCGA--GCTCAACACTAATCTTATTTATTGTGATATT----------------------ACGCTAAACTTAAGTTAAGAACAACAATGGCTTCAAAAC--GAGCTTTATCACCCAAACG
ACTCAAGTGCACAAAAGGAACCTTAGTTATTGTGATATTAATTTGTATATGCGCACATATAAAGCTAAA-TTATTTTAGGAA--------ACCTAAATACAAGAAATTTTAAAAACAAACA
>CG15701 11748850 11748949|11440 chr2R 11741969 11749101 scaffold_16 1739288 1746312 - 193815|7174 7274
CTTGTTAAATATTTTCTAATTATTTGTATGCGTTTGTTGAAATCATTTTTTAA-AATGAAATAAACTCGAACTAGTCCTACTCACTTTTAATCAATTTTAA
TTTGTTAGGAAC------ATGAATTTGTTCAATTTGTTTACATGATTTAGCAGCAGTGAAATAAAGTTG-------TTTTCTTATCCTTACTCTATAACTT
>CG3687 11752208 11752344|11443 chr2R 11751328 11752479 scaffold_16 1751329 1752620 - 24415|973 1150
ATG----ATTTCACTTTTTGT---TGTGTTAACC-ATTTCGTTTATTGAGTTCAT-TTCCTTGCAGATCAGCAGAGTAACGCGCCACACACA----------CTCT----CCACACTTCTTCCAAATTGT-----------------AATCGTCTAGTAAA-ATTCCTACAAATCCAA
ATGCAGCAGGCCAAGTTTTGTTTGTTTGTTATTCAATTTCGTTTATACGTTGTGTGTTCCCCGCAA--CGCCCGAACTACTCTAGAAACTCAAATAGTTGCGTTCTTGTGTCTCAGTCCATCAAAATTATTGTTCAAGCCAAAAAAAAAAAATCAAATAAATATACCAAAAATTGTAA
>csul 11781738 11781822|11478 chr2R 11777079 11785432 scaffold_11 589297 597635 + 373259|4835 4946
C---AGCAGACGATGTAATA-ACAACCAATAGCCAAATAATC--------GGCATAATTTTTTTG------AACTGCAATAAGAATCAAA---------CTAAAGAGACCT-
ACTAAACTAACG--GCAATATACAACAAATGGGGGATTATTAACAACGGGGGAACAATATCTTTATTGGACAACTGTAACAGAAAACAAAACCAAACAACAAAAAAGAACAA
>CG15704 11795212 11795336|11487 chr2R 11794758 11795497 scaffold_11 608180 608955 + 8314|480 683
CCAGGACACCAGGAGTGCTGCTAAA-------------------------------------------------------------AGGATGCGCGCGTTTGTGTGTTTGAGTGTGTTTCGACTAAAATTTAATAAAGGCAACTTTTC---------------TAGTGGCGAATAAATTACAACTCATATGT---GCTTGTAAA
CCCAGA----GCAAGTGCCGCTGGACTCGGACTTGGACTCGGAATCGGACTCGGACAAGATGTTAGCTGCAATGGCAGATGCACTGAGGGGGAGCGCAGATGGGGGGTGGGCAATGTGTA----ACATTCTAATTTAAGTGACTTTTTGTATGTAATTTGGCATAGACATAAATAAATTGCTACAAATATACAAAGTATGTGTG
>JhI-26 11806074 11806193|11497 chr2R 11805775 11806193 scaffold_11 616723 617119 + 7778|299 420
TCAATTGATAGCCTAATGTAAAAGTATTCAGGCATTTCAGGTATAGCGTAACTGTAGATAATAAAATAGATGTTAA-AGTGACATGCATTACCTATTTAGAGTTTAATA-CACTGTTTAACC
TAGCGTGGAATTCGAATAGATAACAATTCATGAATTC-----------------TAGATAGAAAGATTGCCATTGGCAATGACTTTTAATATCTATCTGTATATCAATAGCTGTGCTTCGCC
>Atg9 11811922 11812098|11499 chr2R 11809300 11812223 scaffold_34 1222797 1225939 - 115664|2921 3123
CAGCGGCCAGAGTGGATCTAACCACCTGTAGAGCT----------------------AAGGACCACCCATTCTGCTATTAGTGATTAACCTAAATTTTAAAGTGT---AAACGAACGAACGACGTCGTCTAGTGCGTAGCTAAA-CTAATCTGAAACTAAGCTAAACTAAACGAGAAGCAATAAACATAAATGCATTATCAAA
CAGCGACCCGTCTGGATCTAATTATCC-TAGAGCTTAAGGAAAACATTAACTAAAACAAATAACACGAACCCTGCTATTAG-----AATTTAAGTTGTAAAGTGTGTGAATCGGACGA-------TGTCTAGTACATAGCTAAATCTAAT--------------------ACGAAAAGCAATAAAT-TAACTGCGTCAACGAA
>CG4282 11839377 11839672|11532 chr2R 11837268 11842487 scaffold_43 512171 517710 + 151370|2237 2553
CACCGAAAGAGAATTGCTTAAAAT---ATTCGAACGCCTTTCTTCACTTTCACAGAATTAGTTCGAGTCAAATTCAAATTGCCCAATATTATAAATTATGACACATTCGCACAACAGTTTTTAATTATTTGTCTATAAAACGTAAAGTTAAACGTATTGTATAAA---CAATCTCTTTCGAATGAAATCT-GTGAAAGTTGA-------TATTCAAAGGGCGTTTTGTACCTTAGTCCTAAGCTGAAAGTAT-------TTAATAATAAATGCGAACTGGACTCTGCTCCGATCCAAATAATTGATAACAAAACAAA
---CAAACGTGGCCAGCATAGAATCGGACTTGAA-GCATTTCTAGATCAATATAAGTTATGTGCACTTAGAATTAAGTCTAC---ATGTT-TAGTTTTTGTC---TTAGC-------TTATCTCTTAGTTGTCTAT----CCTTAAGCTAAAGAAAAAGAGTAAAGATTAGTCGATGTCGACGCAATTTTGGTACACGTTAAACTGTTTTATATATGGGAGGAATTGTGCTTTTCAGCTGATGTTAAGATATCACTTTACCATTAATATATTTTCGAGGCACGCGACTCTG---TGGGCAATTGAAAAC-AAACAAG
>Hmgs 11855741 11856118|11544 chr2R 11854005 11856424 scaffold_43 531461 533965 + 83313|1843 2280
CCCCGGGCTATGGTTCCTTCGGTTTGGTTTCGGTTTCGCCTACAACTTGACAATAACTCTAACTCTCTCGACCAAACC--CATGTAAGCAG----------TAGCTGTAGA-------TGGTATCTATTTATAACTGG---TATGATCCCGAGGGGTCGCTATCCTTTTTGCTCTTATTCGGGTCCTTGTCGCGTATATAGT----ACTACAC-TTCTTATTTATACAAGCTTGCGAATTAACTCTTTCATCCAGTCAGACCTTATTTATATCAT--------------GGAACAAGTCTTAACTAGCGTCGGTACTGCAATCTATGCCTATAATTGTACAAT-------ACTTATACC---TGTGTGTAATGCACACAATC---------AATTGTTTAATAAACAATAAAAATCAACAAAGTCAAACTCTTCAGTG
CCAAGAGCTAAACCGGCATTAACTAAGCTACT----------TAACTTGACAATAAA-CTAACACTCACTGTTAAACTAGCTGCTAAACTGGCTGCTAAACTAGCTGCTAAACTAACCTGTTGTAAAGCTTTGGCTGGGAACAAAATCCC------TTGACTTCTTTTTTAAACTTAGCTACGT-----TGGTGGATTTGGTTGTCTCTATGCAATATTAATTTTATGGCCTGGCTTATTATCATTTTCATAAAGTCCGCTTTTATTTATATCATGCCCGAACGCAAACGGAATCAGTGTAAAAAATTCCTAATATTTTAA--AAACTCTGAAACTGTACAATAAAATACATTTAAACCGTATTTATACAATATGCATAGTCGAAGCATATAAACGTTTGTAAAGTGCAAATAAACAAGAAATTCAAATACAATTGTT
>Nup62 11860629 11860691|11549 chr2R 11860320 11860651 scaffold_43 537399 537737 + 19644|309 338
A-------GATAAGTCCCCTTAATTTGTTA
ATCTGAATAAAAAATTATTTGTATTTGTTA
>Nup62 11860629 11860691|11550 chr2R 11860669 11862428 scaffold_43 537916 539716 + 59667|0 39
TCCATTGTAACC----ACAG-------------AAAGAGT
TTCATTATTATCGTACACAGGAGTATGTAGAATAAAAAGG
>CG15925 11962215 11962377|11677 chr2R 11959412 11962250 scaffold_4 4589000 4591751 - 19586|3051 3086
ATGTAAAAAGTGATAATCGTTATCTTTTACTATCCA
ATTT---AAGCGTTCTTCTTTCCCCCTGACTGACTA
>CG4439 12007864 12008099|11732 chr2R 12005919 12007958 scaffold_4 4635901 4637817 - 63429|1959 2053
TGCATCTTTAATTTATACTTGACGAGGGATCCGCGACATCCCGATAATACGTGTCTGTGTGAAAATTCAGTGTCCTTTATGTGCTCGGTCACTTG
---ATTTTGGACTAAAATATCACGTCAGATATG-AACCTTTCGCTGATATGTGTTTCC----AAATT--GTTTCCAGTATGACCTTGACAGCATG
>Sema-2a 12047264 12048292|11789 chr2R 12047080 12047624 scaffold_4 4690524 4691110 - 4805|201 613
TATCACGAAGAGAGTATCGCCCTCAAAATGCCGTCATC---GTCGTCCAATCAATTTTAGTTAATC----GAAAGCGAAGAGGATAATAACA---ATGCGGAATAAAA--AGCCCAGGACGAG-AAGAACTCATTATAATCA-TTATTATCAGCGAC--ATCATCATAGACATACTTTCTTCAGCAATGAACAGAAAACTCTTCCTAAAGGATTATGCATTTACCGAAGCATTTACAATGCATCCATTGACTTAGACTTAGACATTAGGGTATTATCGCATGACACAGCTCCTCCCA-TACGGTGCAATT----CACCCACTTAAAT------------CGATTCA---CATAAAATAC---------------GATAACAAAAGCCACAACCCATAGTTAGTTAC-GACAAT
TATCATGACAAAAGCGGCACAGTTACCATGCCAACATCCATGTCTATCAAACGTTTCTACTAATTCCTCAAACAGTTCCCAGGATTGAAACGCGCAAATGAAATGAAATCAAATCAAATCGAATCAGAGCTAAAACAGACCGCCTAGTTACAGCGATCAATCATCTATCATCAATCATCATTGGCGCTAAACTGATAAAT------------TTAAGCATT---CAACTCGTAGATACTGCATTTATACGAATATCAACGTACATATGTGTAT---------AGAGAGCCACTTCCAGTACAGTGCATTTATTCTACATACTCAAATAATCAAGAGAGCTGATAAAAGTTATTAAATACAGACACTTGTCTATGGGTTATACAGACCATAAAC--TAGCTAGCTACAAACAAT
>Sema-2a 12047264 12048292|11790 chr2R 12047625 12048399 scaffold_4 4691297 4692298 - 5007|0 903
TGAACAATGAAGATACTTAAACAACTGCCGCAGAATCGCACATTCATATCGTTAT--------------------------TTGAATC--------TAGACTTTGATCAGTTTCAGCATAACAACGTACGAGTATAT-TATATATATACAGATATCCAAACTTTGAACTTTCAAGGCTTACTTATAAA----------TATGGCAAACTA-ATGTAATCG-AGAAGCAATGTGATGTTAAGTTTTGATAAATTTATGAACAGCCTAACTAAC--ATAATCGC-CATGAACTCGGTTTG-AATGTACTATAGCGAA-----------ACAATTATAAAAATTGTACACACATGC--------------------ATGCACA---TCATACGGATATATGAATCAGCCCCAAATCGAATCTAATTCTA--------AAACTTAAAGGAACGATCCTTAG-----ATAAAC--------------CTCAATCACAAGCAATACTCGCCTAACGTGCATC-------------TAAATACATAAATAAC-------------------TCGAATCGGTCCATAGCTTATATACTTCACGATATATGTA-----------------------------------------ACAGTGT----------------------TCAGTTGATATCT---------AATACGTATGTGTACTT--------CAAATGCCAGTTTATATTGTAAAATCC------------ATTCCCATCTTGCCCACAAAAAACGATTTGGAAGATTATGATTTTTAGTGACTTGCACTCTCTTCACACTAAATGTACTTAAGGTAATTTGCAAAAATCTTTAGTTCTTAAGCGTTTAGTTATAATAAAATGAGACAAAAACCA
TGAAAATGAAAAATGAACAAACAAGTATTACAAGTACACACACACCTATATATATATATACGCATGAAAACATAAGCAAAATCGAATCACATTTCATACATTTTAAT-----TCATCATAAAAACA-ATCAATATATATATATATATATATATATATATAATACCGAATTGCATCAAATAACTATAAACTCTAAAGCATATATAAATCTACATGTAATTGGAAAAGCAATGTGATGTTAAGTTTTGATAAATCTATTAATTGCCTATTTAAACGATATTCACACAAACAATTGATTCATAAAAGGCTATAAAAAATAAAAAAACATACAAGCATAAGCAATTTACATACATGCTAAGCAGCTGCCGCATCGATACGCACACATTCAAATATAAATATGAATATAAATTGCATCAGATCTGCTTTCGAACTAAATAAATTTAAAAAAATTTCACATAAGCAATATAAACGCATTTTAAGCAAGCAGAATTAAACATGATATACATTAAAGCTGAATTATAAAAGAAATAATTGACACATAAATAATATATAGCAAACAATTTACATCAAATCGGTCCATAGATTATATACAATATAATATATATATATATATATAAAAAGACAAACACTTAAAGCTCGCCACTTCTACAATTTCAATTTTGAAATTTTGTTTAAATCATTTGATATCCTAAGATGAACATTCTTGTGTATACTCTATTGTTGTATGTGTTTTTCTGAATTTTTAATTACGTACAATTTCTGACTTCTGACTTGCCAAGACATGCGGATTAAACAAAACATGAATTTT------TAGCATACTTTT----GTGTCTGTACTTAAGTTAAATCGATGACAT-TTTAGTTTCTAAGCGTTTAGTTGTAAAATAA------AAATTAAA
>CG4750 12051641 12051949|11794 chr2R 12051739 12052117 scaffold_32 1211059 1211442 + -1342|0 223
ACATTCTGGTCTGGAGAAGCCATCCTCGTAAAGGTTCACTTTAATATCGTTGGCAATAAATTGTATAAATTATGAGAATTTCAAGTTGGAACCAAATTGTATTGATGTTTTTG--CAAAAATTA--------GCTATTAGACATATTATATAAATGCATAGTACCAAATTTAAGCAAAATTGTAAATCTATTCGCCGATTAAAAGTATTCA---ATCAAGCAAA
AAATTTGTGTGTGG----GACAATGTAGCTAAGCGT-AATCCAATACAGT--ACAATTAGACGCAAAATGCAAGGAAGTGTC--GTTTAAACCGATATGTTTATAAATTTCTGGTGAAAAAGTATTGTGACGAAGTTTCAAAATATTATGTTATTTAAAGGTCACTAGAATAAACAAAGCTTTTTCTCTAC-----------AAGAATTCATAGTTCAGTTCAA
>Syn2 12071593 12073346|11814 chr2R 12071196 12073098 scaffold_4 4731723 4733626 - 14757|478 2113
ATCAAAA-----ATATTATGAGGGACAAGAATTCGCAT-----GGACTCACACTCA--------------AAATGATATATAATGA-------ATATTCGTAAAGTGCAT-----AGCAAATAATTCGAATATGAATGTTGGACTATAGGTA----TCGCATACATGATTGTCCGCTTGGAGTTATTATAAACGAGTACGCGCATATACATATGTATGTTGATATCTGAATGATTGTAATTGTAATTGGATACTGATATGGGTATAT---TTATAGCGCTGATAAAAC-------------------TGAAAGTGAAATCTCTTGGTGCATTATAGTAAATTTTAAGCATACATAAGGCAATTACTTTAGGCATTTTTCCTATTACGTAGACTTGGTACTTACAAATTGACAACAAATTTATAT---TGTTTATAATCGATCGTTTCCGAATGTAGCCTTTAAAGTTAAATTAACCCTTAACCCTACCTACCTAACTTACGGATTGTTAAAACCACATAGGTCTGCCGATTCTGAATGTCAGAGAAATCTAATCGCTTTTTGCTATTAGCCGAAAAGATTATAATGAGTGGCCTTAAAGGCTTTAACCCGTGCTGTATCCTCTAGACATATATTTCTTCGGCGGTTTAACGAAAATTGATTGAAATATAAAAACCGTGTTTTGTGTGCGCTCTAATGAAAATTTAATTTTCGA--AAAACGAATGCTTTAAGATCG-GATTAATTGTTATTTTCTACTGAAGTAATAGCTGATGT-CATAATAGATATATATAAAAATACCTTATAAAATAATATATATATATATAACATCCAC---CGAACAAATCTCAATGCACAGACGTAACATGAACTAGATTTTATAACTGTTATACATT--TACTCAGAGCCAGTTAAGTGATTTCAT---CAGACACTCACTTAGGT---CATTTGTCAATTCAGAATGTGTCTTTCGGTGGCAAGATCGTATTTGTTGCTAGCATATTGCATTGTACGTATTGATTTTAGGCGTTATTGCACAACATACAACTACATAT-TATCGAATTAGTTAGCGAATCATCGACGAGCACAAA-AGATCATATATCTACACAAAAATA----TCAAGTTGGTGCATACGCAAATTGCAAAATCCCAAACAGCA--TAAGCAGAATATCACT------------------AAAAATATGAAAGTATCTATAAACCATATACCACAGCTGAAAACAGAATCAAAAAT-----ATTTACTGTACATATGCTTAGCTCTATTGGGTTAGAATCCGCT--CCTAGCTCCACAAAGT---ATATATGTATATGTATATGCATACCATAGCCGCAGAAATAATATTTGCATACAGTCCACACGACAAACCGATCCTAGTTGCACCCAAATCGCAATCCTAAGACCCCAAAAACCCGACCAACATACGTAATCTGCAAACACCGCAACATGTTATACGAGTATCCAATTACCAGGGGGAGTTAGAGCTCCCTCATCAGAACTAACCTACATAC---CATACATACATACATATATTTTTAATGCGAAGC------TTACATAGTGCTGTATG-----AAGTACACGACATACAGATATATACATACATCCATA
ATCAAAACATTTATAAGCTGAGCAACAACAAGTTGTATTTCAAAAATACACATCAATTATATAAGTATGTAAGCTATTTATCGTAAACAGGCTATAATTATGCAGTGTGTAAGTAAACAAATGTTTTG--TATGTATTATGGAAT-TAGTTAAAATTGACTAGCCTAAATATTCAGTTAGATTTGATATAC---------CGAATATACTAATTAATGTAAACATTTGCATACATACACACACACACACACTCGCATACATGCATATAAATCATAATAATTATAAAACAAATTATAGAATGATAAAATTAATGTGAAATCTCTTGGTGCAACACATGTAAACTTAAGCG-------------TGCTCTAGGCTTCTTTCCTATAAT----------CAGTTA-AAGTTGTCGATACGTTTATATACATATATATACATATATATATCTGAAC----------AATTAGAAATTACACTTAG--ATACGTATTTGATTTATCTAC-----------CTTAGGCTT------------TATCCAAGTACTCTAATCAC---------GAAACGAAAGCGACTTTGTCATCTGAAATCGAGAGATCGAAATCGAATTGAGTAA---AGCTCATTATTTTGTCAACTACAACATTATAAATGAATGAAAACGA--------------TGTGCATTATAGTGAAAATATAATTTTCAATTTTAATGAAAATTCTAATGTTACAACTAGTTGTTTATT----------CAATAATTGTTGCGCTTCTTAAATAT-TAAATCATTAATCTATTATTTTATAAGCATGCATCTCATTTGGGCGCATGAACA------AAAGTTCAAATTTGATTTTAATCTAGATGCATAATATTTAAATATGCATACTCACACACACATACACACATACACACACAGACAGCCACCGAAATTCGCATTCGT--ATTCATACTAGATTTT---------AAATCAAGCCTCAATTTAAGTAATTCCATTGTAAATATATACTATATGT-----------ACACACATATATATATATATAGATATAT---GCGAGTAATTATGGCTCATAAACATGTCGTGCGTCAATTCAAATGTGTCTTTCAATTGAGCGAATACAC----------ATCCATAACATCAAGTAAACAAAACAATGCTACAAAAACATACAACTAGAGAAACATAACAATATTTGTTGCTCATACTCATTAAGCATTTCCAGTGGAACAAATGGTTGATTTATTGTACACA-AATCAGTTTTACTCAAACTAAGACAGTCGAAACAGCTTAATAATATTTAATATATGCTCATATATTTATATA-TATATTCGCAATCGT-GTGTTTGCTTGGATTCCA---AGTAAACACATGCCAG--------AAACTGTAAACGCAACTCATCAA-----------------------CGCAATCATATCAAAATATCAATTAA-----CAATTATCAAG-------------CCCACGT----ACTCACTTGTAGATGTGCACACATAGATACAGGTGCACCCAAGACAAAGCTAAATGTGACAGGATATTGCAAGTTTCCACGGAAACAAC-TCCATATATATACACTGAACCATA
>Syn2 12071593 12073346|11815 chr2R 12073099 12073102 scaffold_5 1349917 1349920 + 150|0 3
TATA
TAAA
>Syn2 12071593 12073346|11816 chr2R 12073166 12073455 scaffold_5 1349979 1350218 + 79|0 187
CGATTCTGTAATAAAGTTCA----ATATTTATCCGGAACTGCGCTACTTGACAAAAATTCAACGATATGAAAACCATTTGTGTTGCTTTAGTTATGGTTCCCTATTTACTTTTATGCGTTTGCTAATTGAAATTATTGTACAAG---AAAACCAAAACATTCGAATTGGAATAAAATCTAAATATCTA
TGAATTTGTAAAAAGGCATAGAATATATTTTTCTGAA----CGCTAAATGACAATA--TTAACTATATATATA-------------TATATATATATATATCTATCTATGTGTATATGT------------------ATACAAGGCAAAAACCAACGCGACGATAT---AATTAAATGTATGTATGTA
>CG4945 12084667 12084985|11823 chr2R 12082646 12085267 scaffold_4 4747828 4750616 - 93970|2163 2624
CA--------------------------------AGACCGCCGACTCTAATTGTC---ACTAATAGTCATC------CTTGCCGCACTTTCAGAGCTTC-----------------GCGATGCCC----------GGCACTCGAGCTACGCTAAT--CTCCCA-TATGCTTCTCAAGTTAAAGACAGTGCCTACGGATCGGTCGATGTCAGCGAGATGGCGGTGGCGGCCAG----------------------------CAGAAGTCCCTCGCTG-----------------------ATGAAGGACACCGCCTACGATCGCACCACCAGCTCCAGCAGCCACAACATCGCCCGGCGACAGCGCAGATAGCTT---CCCAGGGG-----GACAGACGAGCGGCCA-------------CTGATTTAAAAGTTCCAATAAATAGATAACGTACATTTCTTAA
TAACAACAATATTCCTAACAAAACTAATCCGATCAAAACGGTGACTTTCACGGGCTTGACTAAT-GCCTTCCAATCGCTTGCCCAACTCCCAGTGCTGTCTAATCCCGTAGTGCCGGCGATGCCTCCCGCAGCAATGCAATTGAATTATTTTAATCGCTCCCACCATGATTCTCAAGTCAAAGACAGCGCCTACGGATCGGCCGATGTGAACGACATGACGCACACAACAAGTCATCCACAGGCCCATAACACTCAGCGCCAGAGGGTTTACAATGGCGCACGTGAATCCAATTTGAACATGAAGGACACGGCCTACGACCGTGTGGGGGTCACCAATAGCAACAGCGC------GCGAAAGCGAAGATAGCTTGTGCCCGGTTGCATCAAACACACATAAATCCAACAAAATATATACACAATTTGCAAGTTCCAATAAACATAAAACGTAAATTTGTTAA
>Cdk4 12099899 12100311|11840 chr2R 12098466 12100553 scaffold_4 3817135 3819043 - 31250|1504 1959
TCTCGATGCCCAGAAGGATAATGGATAATGGATTATGGATTATGGATTATGGATTATGGATGTGGAAGTGAAAGTGGCAGTGGACTGATCATTGCGGCCGCGCTTCGTTCTTGTTACC--AATGTTCCTTTAAGTGTAGTGAAGCATTTTGTTTATTTTTTCGCGACAGTCCAGTTATTGTGTCCGGGGATACGGATCCGGAATAAAGAATACCTTAATTTGTTTGTAGTCGTAAGTTAAGTGTGAATACTACTGCCGATCAACTATCTGATGACCATTACATGTGAAACGATTCTCGAGGGCGTTTGAAGGCCCTCCAAATCGAAATGTGATACACAAAGTTCAGGA----------------------------------ATGCATTATACAATTTCAAAATTTTGTACA------ACAATCATTTATATATGCAATTATATATACA-GCATAC
---------------------------------------------------------------------GAATGCGGCTGAGTTCCCAGCTAAGCGA-AGCATTTAATTGCTTCTGCCAAAATGTTCCTTT--------------ATTTTATATATATATATGTATTTTTTTTAATATTGTTT------------ATCAAGCTTAAA-----------------TGTAATTGTTAATCA------------ACTGCCGTTAAAC--------------------------GAAACTCGAG-------GATTGCGATCCTGTCTAAAATGTGATACACAAAGTTCAGGACTAGACTCATGGTCGGGCATATACCATATACCCTATAGAGTATACCCTATATAAATGCTATATGCCACATGCAACTAATTATATTCAAAATTATACACATGTATATAT
>RpLP2 12101428 12101595|11844 chr2R 12101078 12101469 scaffold_10 4587965 4588377 - 23621|356 412
GCG---------------GTTGAATGTGGCGAATATACTGTGCAACACACTTGCGAG
ACAAACCTCTACCATCTTGTCCAACCACTCGTATATACTGTGTAAACCAACAGCAGG
>RpLP2 12101428 12101595|11845 chr2R 12101472 12101549 scaffold_52 664075 664148 + 565|0 78
GAGAAAGCAGCGTTCTGGAGCAGCCATTCATACATG-GCCGGCCAGTCTACACACTTGTGTAGCACCCATCCGTTCACC
ACAAAAGCAGTTCTTGAGGACAGCCAGCAGTATTCACACCGTCTGCTTTGCACA-----GTGGCACACATTGCTTTAAA
>RpLP2 12101428 12101595|11846 chr2R 12101550 12101897 scaffold_10 4588739 4589094 - 1163|0 45
ATTTCTACGTAATAAAAATCAGCAGTGTTTGCACTTTATATAAACC
ATTTCTATGAAATAAAAGTCTGCAGTGTTTACGCTTTATATACGTA
>CG5089 12115142 12115278|11863 chr2R 12114921 12115164 scaffold_1 4572319 4572552 - 1836|221 243
ATGGAGCTCATTTTACTATAGCG
CCTAAAGCCAATTTACTGAAGAG
>Chit 12208502 12208618|11968 chr2R 12206390 12208651 scaffold_1 4689570 4692045 - 81529|2363 2486
AGTG---GGAGTC----CAATTTGATTTATGTATAGCTGACCATGTGAAGAAAATGCTTGATCAAGAAATATATTTGTCCCATTTATATTTGTAATGTCATAAAGTGCCTCAGAACACATAATG
ACTATATGAAATCATAACAACATGTTT----TGTAATTGAATATAGAAAATAAATGTTTAATGTATCTAAAAATTT---TCAAATGAATGAAGAAGAGCTTACAGAGCTATCGAAGA------G
>CG15920 12297740 12298038|12072 chr2R 12297182 12298476 scaffold_1 4797255 4798652 - 19647|610 1011
G----------AACGACTCAC-------AGACACATTTAGCTAGATTCCCCGA--------------ACATATAGCAATACCTAG--TGTTA-AGTCCTTCTAGAACTATGTCCC--CTACCTATGCCC-------------------CTCATCCTTCCGCA-TCTATTC-GTGCCCATTCTATCCCACTTCTTGCTGTCT------------------TTCGCCCA---------TCCATTCAGCCT--GCTCAATTCCTCGTAGTCGT----------------AAGTCCCTGTTGATCTAAATGCAAGTGCGAAAAATAACCCAAAAAAAGGAATGAAATGATAAAGCTACTTCCGATGTAAGTAAAGAAAT-TAAATACATATATATTTTTTATAAAA
ATACTAGGACCAACGACCACCGAATATGAGACACA-CTAGCTAGCATTTCAGACGAGTTATGGAAAGACGTAGAACAATATCTAGAACGTAAGAGACACCTTAGAACTATGAACTAGTTACCGTTACCCGCTTAACGGATTCACCAGATCTATCGCCCCACACTCTACTCTATACACATCTCACGCTATCTCATACTATCTCTTCCAACACAATATTTCTTCATCCAAACTTTGATTTCACTTAGGCTAAGCTCAACTTGTTGTAGTTGCATATGAGAAAAAAAAAAAAAACATTCTGCTCGAAA-------GCGGCAAATAACCCAAAAAAAAAAA-AATATAATAATG-------GAATGAAGGAGAAGATATACAAAGCAAGATTTGTTAAATATAAGA
>CG5522 12306215 12307339|12080 chr2R 12305587 12306535 scaffold_45 767881 768868 - 40437|630 999
GC------CGGGCGCCCAAGAACACACAGAAACTCGAAT------ATATATTGTACTC----ATTGTAGC---CTAGTTTATCTAGTTTAGTTAGCTTTAAACCTTGAAACG----TGCACAGC-CAAAAAAAAAAACACCCACCCACCACATCGCTCACT-----------CACTCCCTGAAACGAGGCAACCAC-AGAACATTCCCGCAACCACAACGAACGAACAAATTGCAGCTTGCATCAGATGAATCGATTTCAAAATGGTATTTCAAAAGACTGAC--ACCGAATGAGAAC---------ACGAAGAT--ATAGTAAAGGAGGAGCAGTACTACGAAAGTAGCCACACAATCACAACAACAAC
GTCATTGGCAGGACTGCAGGACTGGACACCAACGAAAATGATGCAAAAAACTGTACTCAACAATTGAAACTAATTAGCTGTTC--ATTTACTCACGATTTCACTTTGCAACGCAACTGAAAATCACGCAAAACAGAACATTCCCGCGGCTCTCTGCTTGTTCAAGCAACCCACACTCCGAAAATCACAACAACAACAAGAACAACAACAAAAAC-TAACTAACGAACAAATTGTAATTTG---CAAATGTAACGATTTC-AAATGGTATTTCAAAAGACTGACAGACTAGCAGAGAACAAGATAAAGATGAAGATGGATTACAGAGAAAAGGAAACACTCAGAAACACACGACACAGTCTAAAAAACAAC
>CG5522 12306215 12307339|12081 chr2R 12306714 12308923 scaffold_45 769040 771319 - 47568|0 766
GTAGTAAAATCTGTAAATGGGATCCAATACTACTAGCTAAAAACCAGTTTATTTCCGAATTCGCTTAGCT-------TGGCAACAGGGCTGT-----CTTTTTGTTAATGTGCTGTCTTTGCTGTACTTTGTATTTGTAAAATGTTATATTAAGTAAATTACTTGGACGTTTAC--------TCAACTTAATTTTGCGCAGA----CTGTGCCATATTAGTTTA-------------TAAATTTATGTGTCTACACAAACACTGTTGGCCA--GCAAACGAATCCAAATTCGATTTGCCCAGCTCCTAACTTTGTAACGAAAAATCAAAA--------------------ATCCAACGAACTTTCTACGC-GTAACTAAGGGCTTT--------AATATTGTGTATCGCTACCACTATCATGATCAACATCCGTTAATCTCTATATCTGCCTTAAGTTGATGCACTAGACATAAA----TAGAGCTATAAAGTACATATGTACGTATCAACAACAAATGCATGCGTAAATTATAGGAAA---CGAAAGTAATGTTAGT-----------GTTTCTT----TTTTTCGGTTGAGAAATTGAATTGTA---------------------ACAC----------CTAAGCTTTGTCACACATACAGATTATCATTTGCAGTGTTTTACATTACATTTAAGAAAGAAATGCAACAAAAACA--------AAATAAAC--TACAAAATGAAAGAAAAGAA----------AT
GCATTAAAAGCATTA------ATCATATACGACGATTTAATTAACTATGTATGTTCATATATACATATATATATATGCGCTGATTGTGCCATATTAATTTTTAATTAAAACATAGTTTTAAACACGATTTACACATACACATTTATATACATATATATATATATATATATATATAGAACAAATCAACTGCACTTTATGCAAAACATTTGTACCGCCTTTTCTTAGGCCAAGTCTAACTATAATTAATTAATTGCTTAATTCCAAGTGTCTAAGGTAAACG--------TTCGTTCTGCTTAACT----ATTTTGCAACAAGGAATCAAAAACAAAAGAAATAAGAAAACTATTTAACGCATACTCGAAACGGTAAACATAGGCTTTAAATAAGAAATATTAAGAATTGCTAACACGATT-TATGCTATTTTGTTGCATGTTAGGGTCAAGTTTTAGTTTATTTTTTTAGCTTAAGTATCTAGTTTTATATGTTGCATGTTTTC-TCTAGACAATACA-----GCTTGAATTCTACAAAAAATCGAAAACTATGTTAACTATGGGCAACAGTTTCTTCAGATACATCAGTT-AGATATATAAACATATATATATATATATATATAGATATACATTTACTTTGTTAAGCTTTGGCACTCACACA---TTTGATTTGCAGAGTCTTAGCTTAAGCAT-ATAAAGAAATGCAGCGAACAAAAGTCGATTAAAGAAACAATACGAAAACTATCAAAACTAATGCCCTTTTAT
>CG5550 12332281 12332444|12113 chr2R 12331555 12332497 scaffold_11 3662288 3663223 + 14446|743 907
GTCCTTGATACTTTAGAAGTACTTGTTTAACTGACTAGATAACTGCCTAAAACTATGAGCTGATTAGTTATTTGCTAACAGTAAAAAACTTACCAATAGTTATACATTCAATTT-ATTTATTTACCTATTTTAATTATGTAAATATATCTAAATAGATTGCACAG
AATCAATCAGCCTTAAGGCTGCTAGCT------------------CTCGAAACTCC-AATTAACTTTTTTTTTACTAAGAATCTAACATTTTGCTATTAAAAATGATTCGGTTCAAATTAAATATATATTTTAGGGGAGACACAGCATTAAAATA---TAAACAA
>CG5859 12368792 12368964|12149 chr2R 12365378 12370353 scaffold_11 3668156 3673135 + 216583|3503 3703
TCGCAGCCCCCACAGTCCAAACTCTAATTCAAAATCCAATATCCATAATCCAACATCCCAACCTCACCCGCACCCACAAGCAGACCAACTAGCATTAAGCTCAAAGATGT---------------------------AGTTTATATTGTATGCATAGGCTTTAC-GGTTAAGTTAAGATTAAAGAATTGTACGTTTTTCCA
TCACAGGCGGGGTAACCCCCATCCTAGCTACAAACTACAT---------------TCACGACCAAGCCCACA-----AGGAAGACCAATTAAAGATAAGCTTCAAAAGGTTTTGTAATGTTACGCAATTAGTATGTAAGTTTAAAGTGTAGCAAAAAGTTTTGCTGGTTAAATTAA----AGAAACTTGTATTTTGTTTAG
>Dek 12374728 12375219|12154 chr2R 12373921 12374961 scaffold_11 3676259 3677334 + 32759|838 1106
AACGACGCGTTGACAAGTCCACTTTAAAGTCGAAGAAGGGTCCAG-----------------GCTCTGTACACATACAACACAA-AACAGGCGATAGCAAAGTCAGGACGTTGTACGCCGATGCAGAAAGAAGTTGGGCATGGTTCGCGAAATGTAACTCCAAGTAGTTGTCTCCTATAAGTATATGATTTGTACTCCTATCCTAAAAGCTATCTGCAGTTCACCTTAA----------------TCCTAACGT-CAGCGGCAGTCGAC
AACTACACAAAAACGGAGGCAA--TGGAGCCTGGGGATGGGCCAGCAAGCAGTAAAACTTGTAACTTGCACACTAACAACAAAACAACAAGCGACCGCAAAGCAAATATATTTTGCCACT-TTTTGAGAGCTGCTGCG--------ACAACAAAGAATTAAATCTAGT--TTTCCTATAAGCGTATAATTTGTACTCTT----TAAAACCAACTAAAACTCAACCTTGAACGGATTATGTCCTTTTTCTATTGTGTACTAGGAGGCGAT
>Dek 12374728 12375219|12155 chr2R 12374962 12375789 scaffold_4 4858152 4859008 - -309|0 288
TATCCATTCTTATATATATTCATCTGTATATATAACTTTTTATTTGTCCAACCGTGCGCACGCATGCACATCATTTTCTATTTTCCTGAAAGTATGTGCAAACGACAG------------CTCTGCG-AAGTGTGTAAA------------------TTAAGCAAAGAGAAACTTGTAAAAATCCGATAAAAAAGAAACACCTAAACTGTAGTGCATTTTGATTTGACGTTTAACAAGAAAAGATGTATTTAACCTTAAGGCACAAGAAATAATAAACAAAAAGCAAAA
TATTTACTTATACATATGTACATATGTGCGTACA------TATTTGTACAGACATTTGTATGTGTGCA--------TGTGTGTGTGTGCCACTATGTGCGAATTGCGGATGACGAATTACCTCCGCTTACGCATGTAAAAAAGTCTTTTCGCCTAATTTAACCACGCCGCAGCAGCTGAAA----GAAAAAAGAAAAAAACATGGCATGTAACGCAGTTCAAT-----ATCCAATAAGAGA--------------CCAAGTCATAATTAC--ATAATCAAATAGAACAA
>Ef1beta 12383943 12384039|12160 chr2R 12383028 12383986 scaffold_1 4829990 4830983 - 50311|952 1004
ACATCTGAGATTCTTA-------TATTAACAATAAA--CTTGAGCAAAGCGAA
GCGTT--ATACTCTTAAATGCAGCATTCAAAATAAAACACTAAGCAAAGCAAT
>Ef1beta 12383943 12384039|12161 chr2R 12383987 12384654 scaffold_1 4834192 4834856 - 8594|0 53
CTAAGCAAATATAGTTGTCTTCATATTTAAATAAAATATT-TCACATGAAAGCT
CTAATCCACCGCAGTTCTTTTAATATGAATACCAAATGTTATTCCTTCATAACT
>CG6426 12386607 12386717|12162 chr2R 12385560 12386731 scaffold_1 4836101 4837125 - 23242|1068 1183
AC-ACATTAACTTGCTAAATTTATATTGTAATTAAATTTAAATAATGTAATAATT----AATTATTTATGGCAATGCATTTGAATTCGATTCAGAATAAATGACAATACAAGCAAA
GCTATATTATCT--ACGAGTATATACTTTAATT--ATTTATATGCAGCTACAAGTTGGAATTTGTATACTTTAAT-CGTGTGAATT--GTGCAAAA------ACCGTATAA--AAA
>CG6421 12387712 12387771|12165 chr2R 12387022 12387784 scaffold_1 4837939 4838742 - 23685|741 823
-----ATAAA-AAATAAACATTATATATATATGTTAATAAACTTAAT--------ATTTTTATTTACC---------CGGGAA
CGGCCATAGACAAATACCCACAATA-----ATATTAA-ACACATAATTGGTATTGCTTTCAATTTAACGGTTGGTATCGGTTA
>CG6429 12388488 12388624|12167 chr2R 12388541 12390375 scaffold_1 4841705 4843521 - 18728|0 84
TTTAATTTATGTGCAAATAACTCAT-AGCTAATATAGGCGTTAATTTCGATTAATAAACTAGTGGCTTGGAGTCAACTGAGATCA
TTAAATAAATATCTAAATTTATTATTAGATAATTAAGATG--AGCTTCCAATATTAAGTTGTCTATTTT-------TTGTGAATA
>inaC 12416301 12416441|12201 chr2R 12415693 12416461 scaffold_1 4877625 4878391 - 28121|616 765
AATGGTCTAAAAAAAAGCTTTGAGAAAAGTTTATAGGCTT---CTTCGAAAAACTAGGCTTTTGCAAGTTAATTTACCGAAATTTATTTATTGTATCCTTC--GCT-AAAAGCCATCTAAATGTTCATTAAAGCTTTAA---CGCTTAAA
GCT--------AAAAAGCTATTGTAAATTGTTAAAAGCTTTGGCCTGAATACACAATAAAGCTACAGGCATAACTGTACAGGCTTAACGCTAGCAAGCTTTCAGCTAAAAAATCAACCCTGAGTTCAAAGACTTTTTACGCTCGCGCAAA
>Pkc53E 12457690 12458026|12258 chr2R 12455740 12457853 scaffold_1 4936256 4938350 - 101102|1995 2182
ATCCGATCTGATC--CGATCTAATTTCCAT----TCTTCGCGTTGTGTCCCCTAAGTCTATTTTGATATTGATTACTAAAAAGACATCTTGTTAATCTTTGTTAAGTTTTCTGTTT---GATTTTCA-ACCATTATATGTATCTATATTTATTGAA--------------TTGTTAAGTTTTTAGTTA
AGCAGCTGTAAGCAACAATCAAACGGAAACGGAACCAGCGAGTTGTGTCGTC--AGTTGATATTA--ATTGTTTATTAAAAAAAGACATCATAAATACTTTTTTGTTTATTTGTTTTCGGTTAGTCATATCATAATTGTTATTTATGCTAAACGAAAGCAATAATTTGTTGTCTTAAGCTTTTATTTA
>veg 12471966 12472184|12268 chr2R 12470050 12472390 scaffold_1 5708707 5710921 + 49390|1950 2178
GC---AAAATG--ATTGAAGTAAAAGGAGCA-----ATATAACTCGCTGGTTGCCAAAGAGACTGTTCATCCGCATGGATTTCTTTTTTAGTGTGTAAATAATCGTCCAAGTTCTCAAAATTCAATTGTTGAGGCGCTCAAAAGTATTGGTTTCCCATTTCTATTTCCATATATCATATACAAAAAAGTAAAAAATAAAATTGTTGACCATTTTAGAAAATAATTGTAA
ACTCGAAACTGGAATTCGAACGCCATGAACATATGTATAGAAGCTATTGGTTGCCAAAGAGACTG--CATTAGGATTGGATTAGTTTGTAGT-TATTGTTTATAGCCGATGTTGACCA-----------CCAGAAAATCAAAAGCA----------ATTGTCATTTGCTTGC--------------------AAATTAAATTA-----------AATAAATGTTTGAAA
>CG6665 12473069 12473069|12269 chr2R 12472497 12473642 scaffold_1 5710922 5712040 + 44970|572 572
A
C
>CG6665 12473134 12473794|12269 chr2R 12472497 12473642 scaffold_1 5710922 5712040 + 44970|637 1163
CTAAAGAACTACAATTCTCGTAAGGCATCGCCTGCACGAACGCCCAGAAAACAGACCAAAATGCATTCCCTACTAGATCCTGCGCGCCTGCGTCCGCC-CACGACATTGGAAAATGTGCAGCCCAGCAGTGAACTTAAGACTGGACAGCACGCCAAGGTTAATCTGACTCTGGGTCTGCAGGGAGGCGGTGGTGGCGGTGGCGATGGTCCCGCCGAGCTAGCCACAAATCCTCTTCATCTTCAAGCACCCTCCGACAGAGATCTCATCATACGCAATAGAATTAAGACACCCACACTGGATGACATCATCGTAGA---GGCGGACCACCATCAGAGCAGTGATGGAGGT----GTCATGGAGGACAATGAGATTAAGAGTATATCATCAATGCAGTTTCAGCGGAACTCCAGCAATGTCTAAGACAATTTCCAAAGAATTCAGTC----ACTTTTTCTTATTGGCTTTTATGTCTGCCAGGAAAATATGGGTATACATTTT------TTTGTTCTTTATTTATTTGT
CTAAAAAACTACAACTCGAGAAAGGCCTCGCCAGCGCGCACGCCACGCAAACAA---AAAATGCACTCGCTGCTGGATCCGGCACGCCTTCGTCCGCCACCCGTCGTTGA-------GCCGCCTAGCAGCGAGCTGACAGCCGGCCAGCATGCCAAAGTCAATATGACGCTGGGCCTGCAA------------GGCGATGAAATGGTTGCCGCCGAATTGGCAACCAATCCGCTGCACTTACAGCCACCCGCCGAACGTGATCTCATCATACGCAATCGCATTAAGGCGCCCACGCTGGACGACATTGTGGTCGAGGCGGCGGAGCAGCAACAGCCAAGTGAGGCGGCCAACAATAATGGGGAAC-ATGAGATAATGAGCATATCATCGGTTCAGTTTCAACGCAACTCGAGCGTAGTCTAAGGTAAATACGTAAAACTTTATTTGGAGATTTTACATTAATTGAAACTA-GTCTGTGAGG-------GGGTTTCCTACTTGTCGCACTTGTCTTTTTTTTGTTTTT
>Cbp53E 12509421 12510924|12320 chr2R 12509020 12510010 scaffold_1 5774213 5775442 + 21361|407 1263
GCCGGATGTTCGAGAACATACCAAAAAGAGATTTTAGCCAACTCTATTTTTGTCACCCGAACGCGGGAAATCCAG---AAATGAGGC------------------CAAAATGGGCTTCAAGGCAATTGTTTACTTT------AGAGCTGCATTAAAAGGGGC--------AGCAAATAAACAAAAAAATAAAAGGATATTGGAATCG---GGGATGAATCCTGAGAGATTCAAACCGAAACG---AAGCTATTGGTATAAAATAAATCTAATATAAA---------------TGTTCAAATC------------TTAAATAAATGTTTATCGTACGTTAAGATATTGAGAGTATATATTT----CCCCCAAAATCAAACCAAAACGG-------AAATTTAT------------------------------------------------------------------------CCAGTCAAA--CAATTTGCAACACA-------GAATCGAGCCACTTA---AAGTAAAAAATTAAGAAATGATAACAACAAGATCAGTACATCGATTTT----ATATTATACT--------------ATATATGTA---TTTATATTTTCTATGT---GTATTTGCATAACGTACTT-----TATTT--------AATTACCAATTAAAATCGAAAT----------------AAATGTAGCTATTTTTAA----GGATACC---ACATTTATTTGAGACTACCTAAGTAAAAAC-----------------------------------ATATGTGTGGCTAC---------AATCTGTAGATAATTGTTGTTAATCATTGTG
-----ATGTTTAAAAACACACACACACA----------CACATCTATTTTTGTTACC--AATTTGGGTAAACTAATGCATATGGGGCGTTTTTGGCCGCAAGCCAAAAAAAAAAAACCAAAAAAATTGATTACTTTAAAAAAAAAACTGCCCGCAACGAGGCGCAGCTCGAGGAAATAACCTCACAAATGCTAAGAAA----AACCGTTAAGAATAATACTACAACAATTTGGACAAAAGCGCTAAAATTCTTAACA-AAATTAAATCTAAAATAACAACAACAAAAAAGCTTATTCAAACTAAATGTTTCAAATTAATTAAATGTTTAT-GCATGTTAAGCTTTCGAAAGTCTATTTCCAAGAACTACAAAAGAAAAACCAAACGTAAACAACAAATTTATTATATATGTGTATTCGTAAAGAGAAAAAAAACTTGAGAAAATGCAAAAAAAAATTATCTACCAATATGAATACCAGTAAAAATTACTTTTTGACAAAGCAACTCGAAACCAGCCATAAAAATAAATGAAAAACAAAAAATAAGCAACCAAATTGTCAGTACATCGATTTTAAAAAAATAATATTTTTGGTCAGCCAGAATACTCGTAACGTTTATATTTTCTATTTCCAATATATATATTGCATATTTATTTATATTTAAAAGAAAAATAAAAAATTAAAACTAATTTAATTTTGACTTAATTAAAACGTAGCTAAGCGTAAGAGCGGACACTCAACAATTTATTGCAAAACAAACAAGCAAAAATTTGAAATAACAAAAAGTGAAATTTAAATTATTATATTATATATAATTATGTAGTGTGAATTTTTTAGATAATTGTTGTTAATAATTGTG
>CG6796 12518402 12518465|12324 chr2R 12516917 12519831 scaffold_1 1366014 1369159 - 107520|1556 1619
TCAGATAAAGATATTAAATGTTTTGTTTTACGTTAAAAGTCTAATAAACAAATATTACTCCAG-
CCGCAAAACTCTATTTTCT-TTTTGTTTTGTATAAGTTGT-TATTGAATTTACAAAACTCGAGC
>CG6805 12521979 12522467|12328 chr2R 12521650 12522641 scaffold_1 4132921 4133842 - 13365|335 857
---------TTTCGCTTCTTTTGTAGTTATTTATCGCTGAACTAGAG------CAATGGT------AGCGCCGTCATGACGTCACTTAGTTGTGAACTTTTAAATCTCTTTGCATGCTTTTAGATTATATGCGTAGACGAGTTGTAGAGTAATTAAAAGACTTCCTTTCAGAAGGAACAAGAGAAACGAAAATAATATCAAGTACAAT-GTGATGAAATCTCTGCTAATTTAGCAATCATTTA-AGCAATTCTCAAGTGATCCATGGAAATAATGCAGCTTCCGAGTATATATACATACATATGTTATCACTCAATTAAGACGATATTAATTTAACGATTGATTGCATTAAACAAATGTATTTTTGTACACTAAACTGTTGATCGAATAAAAAAAACTATTACCTCTCGACGTGACTAAT-----CTTTTTTGTTACTGAGTCAATTAAAATGATACTCTGTTAAGTAT------TTGTATTGAGAAACCTGTTAATACAAAAAAATAAATAAATCGATATGA
TTTGGTTCTTTTCGCTTCTTTTGTAGCCATTTAATGCCGAACTAGAAAGTTTCCAGTGATAAATGAAACCAAGTGTTGCCGTCAAAAGCAAGCAAAC-----AATCTCATTTCATACATATCTGACTCAGACTT---CAAATTGAAAACTTATGTAAGCAAATACTC------GAAATATAACACAGGAATATGAGTACAATTAAATTAATAATTAAACATATTGTATTTAAAGAGTCTCAGATAGCAAGTGTTAAGCTAACCACTCAATGAAT--AACTCCATAGTGCAATTATACACATACA-------TCAATTTATACAATCATAGTATATCAAAACAT----GTAAACATACATATTATAGC------GACTGCTTAACCTGTCACA-----TATCACATTTAAGTTCAATCAATAGAGACTTCCTT----TTAAGCTAAGCAAAGACATCGAGCGTGAAGGATAAATTGTTAAAGTTCAAAAGTTGTTTAT---------TAAATAAAGCAATAT--
>Ark 12538201 12538235|12346 chr2R 12536031 12538840 scaffold_1 6145606 6148285 - 43537|2267 2302
ATTTCTGAATCATTTGAA-ACAAAAAAAAAATGTAA
A------AATCAAGTATATACATACGTGATCTAAAG
>Ark 12541292 12541567|12348 chr2R 12541289 12541413 scaffold_1 6150779 6150903 - 2563|3 124
CGCCAGAAGTGCGTCCCTAGGCGGCGCACGAAACAGGAAAGTCCAAACTACAACATGGCATTTATAGGATTACTGCTCTACTACCTGATGGTTTTGCTCTTCTACCTCCTGGGTCCGGATTT
CGCCGATTGTGTGCCTTATTTTGGCACACACAAAACGGTTATCGACTTTACCAAATCGCACTAATAGGATTATTACTTTATTATCTAGTGATATTAGTGTTTTATTGCGTCAATTTGCTTTT
>RhoGEF2 12559184 12559523|12363 chr2R 12559240 12559498 scaffold_1 6174463 6174723 - 2707|0 271
ACGCATTTGACCAATTGAATTGGCGGCGTCTATGTTTTACGAGTA-GCCTTTCTTAGAGCATGCCTTTTACTACTGTTAATGTAGCTTCATTTGTTTTCTTAAAATATTA--TGTA-TTCCACAAGAGCCGA-----TAACACTTTAAATTAAGTCTAACATTGTCCCCTCGTAA----AACTAATTAAATACATATATATATGCATATTATCGACTTAAAAAATATCAGATAAACACACAATGTTTGATACATTTATAAAGAACAATAAAC
ACGCCATTGTCCAATTGAATTGGCAGCGTCTGTGTT-----AATATGGCCTTATTAAAACA----TTCAACTAC--TTATTATAGCTACTTTTGCTTTACTAAGTTGTAACTTGTAGTGGCATAAGGGTGAAATAAGTTTTGCTTTAAAATACCTATGTAAATTCCATTTAGTGACATTAAATAATTTAATACAAATTAATATTAGTCATTTTGCGATAAAAAGCAATTATTGTATATGAAATATTACGAATAAACTTGATGTAAAAGAAAC
>RhoGEF2 12559184 12559523|12364 chr2R 12559499 12561412 scaffold_1 1345451 1347497 - 63294|0 30
AACATAGT------TATTGAGAAGAATAGCA
AAGTCAGTGGTCCTCATCGATTGCGATAACT
>CG9640 12561416 12561631|12365 chr2R 12561603 12562145 scaffold_1 1348139 1348709 - 9806|0 35
AGAAATAAATAAAGAAT-------TGTCGTTCAATT
ATAAATAAATCTAAAATGAACTCGTATCGTTCGAGA
>CG9646 12568389 12568718|12369 chr2R 12566385 12568511 scaffold_1 1353432 1355621 - 61743|2168 2308
TATTAACTTTATCTGGCAATTGTGATTTA---------TATGCTTTATAGTTCTCACATGTATTCCCTATTTATCGAT--CGAATGTGTGACCAGTCTGTGTGATCAGTCCCAGTTTGATT-------TATCAGTATATAT
TATTAGACTCGCTCGATGCTTGTGATTTGCTGCTAATCTATGCTTTAAAGTAT-------TATCTCCAATTTATTAGTTCTCAACGTCTGGCAAATC-ATGTGATCTGTTTTACGTAAATTAAACAAATATTTATATATAT
>CG9646 12568389 12568718|12370 chr2R 12568575 12568738 scaffold_1 1355830 1356041 - 2695|0 197
AGCGGAAAGCAAACCTACAAATTTATGAACTAC----------------------------AAACTACGATAGTG----------------------AGCTCTGTTACCGATGATATGGAAATATATAATTGTAATATT---ATTTGTAAATTGTACGGCA-AAATTTATACCATGAAATATATACGGAATAGAAAAG
AGCGCTGAGCCAACCTACAAATTTATAAACTACTTATATAGATATTATAAATATATACAAACACCTACTAAAACGCTGCATTTTGAGGTTATATTAAAGAATTGTTACCAAAAATA-AAAACGATATGTATGTAATAATGCGATTTGTAAATTATATGGCATATATTTATAT------GTATATATTTATTAGAAAAG
>fat-spondin 12574077 12574168|12372 chr2R 12570269 12574226 scaffold_1 1359525 1363659 - 106863|4055 4169
G-GTGCTGTTACAATTGTTCATCACAATCCTTAC--TCCTTACTACAATCTTACTCCTCTTTCTTAATAAAGT--------------------TCGTTTGAGAAACTGTAATCAT
GCATTCTG------CTGGGCACCATTAACTTTGCCTTTTCTATTAC-ATTTTATAACTATTTC-GAATAAAGTGAACAGCGCTTTTAATAGACTCGTTATAGACTCTTTTATGGT
>CG6967 12580583 12581407|12377 chr2R 12580505 12580936 scaffold_1 5705331 5705722 + -2730|78 457
--AACATGGAAACGTATCTTAAAATCTGTGCCTGCGTTTTGTAACTGAAACTGCAGAAATTGTAAGACTTATGTATAAGCTGTAGACTAAGTGGAAAATTACAGAC--TCCCAAAAGTTTAATGTTAAAGTTCAAGGCA------------TTAGTGTGTCCATAAAATGATCCTCTAGAAG------AGATGTAATGAAACCAAATCAAATGTATTCGATGCTCAGGCAGCACCAAAATATTCTAAGCTATGCCACCCACATCTGT-TAACTTAAAGTTTATGTTTTGTTTTAATGTAAGTTTCTGATAACAATAATCAGCTTAATATTACGTTATGAAGAAGAATATCCAAGATATTCCATTTGGCGTCCTG---CAA
TCACCAAAGAAAC----CAAAGAAATCGTGACAGCG-------ATCATAAATGCCTATATACAAATGCTTATGCTGGATCTTTAG-----------CATTTCGAATGATCCCATAATATGGATAAGAGAGATTGGAACAAACTATATCGATTTAGATTGTCCATAGCAT-ACGTTTTAGAAGTTTTCAAGAT-CGACGTACACATTTCAAATACGTC-------------------ATATATTCACATCCTTTATATATATATATATATATATTTATGTATATAT---------ATATATGTATATATATACATATATATATGTATACATACATCAT--------ATATGCATTACATGACATGAGGCGCCCCGGCTTTA
>CG6967 12580583 12581407|12378 chr2R 12580937 12589187 scaffold_16 140328 149250 + 133783|0 526
ATTGAAAAAGAAAAACATTTG------ATTGAAGCTTTGTGTAAGAAATTGACCAATGGAATTCAAACGGATGTG-TTCATATGAATGTTAAGTCAAATTCGACATTTTAATCAAGTTTTTTTTTATATTCAACCAAATCGGTGATTCGAATCCGTATTTATCATATATATTTATATATATTTAAGCTGTGTCTATAT--AATTAGTAAAACGATTACAAAATACAAATACAATGGAGTTGCTGCGTTAGGTATTGAAAAAATGTTTAAAAATAGTTT---TGCTCTTGTCGCGTTGGATATTCAAGTGTTTTTTTTTTATCGCTATTT-TTTAAATTCGTTCAGTCTTTGTTAATCAACAACTTTGTTAAA-GTGTTCAGTTGCGTTTTTTGCTTGCTTTTTTGTATTTTAA-----------------------GCAATTGAAGATGAGAGAAATGTGTAAGATAGAAATGCCAAGTTTAGTTCGATTAATTA-------------------AAGTTTGCTCGAC
ATCAAATACCGAACGCATTTGGAAAATACTAAAACTCTTAGAGAACAGCTTCAAAATAAATTTAAACCAATTATAATGAATATGAGAAGCAAATCCATTT----ATTTTGAT---------TTTTATA---------------AAGTCGAGT---TAAATATGGTGTATCTAGAT-TATATTTAAGCAGTGACTATATTAAATTAGTAAACAGTTTACAAAATACAAATATAATTAAAGTGTT----TAAGATTTCGAAAATTGTTTGAATTTTATTTGAATAGTTTCGTATAATTTTGTTTTCGAGTGGCTTTC----AACGCTTTTCGTTTAAATTCGTTCAGTCTTTGTTAATTAACAACTTGGTTAAAAGTGTTTAAATG------------------TTATACTTTAATAAAAGAAAAGAAAACTACATTCGTAATTACAATTAAGAAATATTTGAAAAATA-AAATGCCAAGTTTCTTGTTATTTATGATTATTATTATATTGCATATGTTTTTGTTCGAT
>CG6984 12607791 12607933|12396 chr2R 12606948 12608082 scaffold_16 172645 173753 + 26925|853 1009
CCGCAACATACAATAT---GAAATAATGAATCA--------AAACTGACCAATTGTGCATTTATACTTTTAAGCTTGAATTGTCCAAAGTGACTTAAAAGAATGTTA---ATTTGAAATGTTATTTTTTTAAACGTTTATAAAACAATGTTGAACAC
ATGAGATCTGTCACCTGCCGAGATAAACTATCAGTTGTATGGACCCGAACAAATGTGCATTTA---GCTTATGTATGGA-----CAAATATAGTTAAGAACTTATTATGCATTTTAAACGCACTCGTCT---ACGTTCTT---GCCATCCTGATCA-
>CG30456 12622000 12622410|12410 chr2R 12619204 12622000 scaffold_16 189286 192028 + 76999|2946 2946
G
G
>CG30456 12622000 12622410|12411 chr2R 12622368 12624746 scaffold_16 192914 195456 + 4567|0 42
GGATTAAAAAATAAAAGGTTAAATAATATGGAAAGTTCAAAAA
GGATTGAAATAGAAATTACTCCATGAATATGAATTTTCAATAG
>CG15611 12629141 12629224|12418 chr2R 12628166 12629565 scaffold_16 201819 203303 + 50401|1001 1094
ATAGTTCCCACCTCAATGCAACAACCATGTCCACATGCCCATCTAGATCGTAGATATCTA-AGAATAAAGCTAAGTTATTT---------CGTA
-----CGCTAATTATATGCTATA---------------CTACTTAGTTGCTAGG---CTATAGAATAAAGCTAAGTTATTTGTACACGTACGTA
>Amy-d 12641148 12641245|12432 chr2R 12639346 12641148 scaffold_1 2384743 2386556 + 42930|1891 1891
A
A
>Amy-d 12641148 12641245|12433 chr2R 12641149 12641233 scaffold_51 56307 56383 - -477|0 88
CAACTGGGGCAAAGACCAAGGCCGAAAAGCCGAGCAATTACTTGAGATTATTCATTTTTAAAATATATATTAT----GCGATTATAACA
CCAATATCTCCTTTACCA-----------CTTTTCAACACAATGAGATTATATACGTAT-ACATATATTTTATTTCGGCGAACATAAAA
>CG11400 12649668 12649708|12441 chr2R 12649675 12650524 scaffold_33 758838 759710 - -127|0 33
CCATAAAACTGGGAACAACTGAGAATTAATTAAC
CAATAAAATTAGGATAATACAAAAATGAATAAAT
>CG11395 12653603 12653695|12444 chr2R 12653607 12653977 scaffold_85 113262 113677 + 473|0 88
TTCGGATTCAAATGAAATTCTGATTAATACTGTTTCATGTTCACAATACATATTTCATTGTGTCATTAAATCTGTCATTATGTGTAATA
TTTGTGGTTGATTTAATTTGTGATACATACTTTTTCATCTAAATA-------------TGTGTCTCTAAATATGTCAATAATTATCTGA
>CG17290 12669999 12670173|12458 chr2R 12667996 12670184 scaffold_16 240673 242934 + 32592|2277 2487
GATGAAAGCCATTTGTTATTG----------------TTAATTTGTT----------GACTCGAGTGCAATTGCTGAATACCATC-TTTAGAAATTCACTTGGAGAGTAAATATC-TATCTGTGAAAAATTATTCGTTGTCTTGT-CCTTCTTTGGTTGCTATCAAAGTTGAGTTCG--CAGGAAAATATACTACAAAATTTAA-----AA
AATGTGATCCGCTCTGAATTGAAGAAGAGTCTTGCCTGTATTTTGTTGTTATCGCTGGACTCGAGTG----TGTTGGAAGCTGGCACCAAGCAAATCTAGAGCAAAGAAGTTATTGTAACTGTAAAA------TTGTTGTCTTGTATTTTCTTTGATATACATCAAAG--GATCTCGAACAGGATAATGTA--ACTAAAGTTAATTATTAG
>mbl 12810764 12813423|12633 chr2R 12810441 12811953 scaffold_16 416764 418702 + 11487|339 2015
ACA-------TTGTAATATGCGTGCTGACAACAT------AAAAAGGGGTTATAAAA-----GTAGAAGTAGACGTG--TCAAATACTTTCAAAGATGCTTCATTAAAATAATCAGCTACAAAGCA--CAGAAGAAGTGTAGCAAACTAAGCAGCAAAAAT-ATGCGGGAG-AAACCAATGAGGGAAAGCGAAGAAAAGCGCCGAGGGGAAAAAACTGAAGGATGCGGTGAATGCCAGTGTGTGGCTGTGTTTGAGTGTGAGTCCTTTTTATGCCTTTGCCCCGAATGTAAACAGGCTGGCAGTGCAAGACTTT-CAACACTTTTCCCTTTTCGCCATCCTGACACTCATCAAATGCTTGTGTCTGTCGGCTTCTGCAACTTTGCCGTCGTCTTTCACTTTTATTCTCCGTGTTGTCTGCTATTTTTCACTAATTAATTATGCAGTAACAGCAAACAACTTGAAATGTAAGGAGATTAAAGCGACTTAAAAGGCATTTATGCACTGCCAG--GCGATGGCA-----------------AACAAGCTGAAAAGAGCAGGACA----------------------TCAAGAAGGGACT----------------------------------GACAACAAAATTGCAT-TACATGT-----------TGGCAAAAATGTC--AATGCAGGCGAGTTTGCATGTGTGTTTGTGTCTTGTA-------------AAGTCATGTTTAC---------------------------------------------AGTACTCAAAACGGCCAAAAGG--------------------------------------------AGAAAAGAGTGACATACCAAAGACTAAG-------------------AGCTCTATTTTAAATAACTGGC---TGTCACACAAATTCAAGTTAAAACC--------TTAGTTATTAACTCAAGTCAATTA------------------AAACTTACAGATAGAAAAAATGGA----------ATTTATTAAATCTTTCAAATTGGCTGTCTCACAATTTTAAGTATTATTAGAAAATTTTCATG-----------------ATTTATCATTTT--------------------------------GTTTCTTTTTTGTGGCCTTACAA----------------TCACACT--TCCTATTAATTTATACCTAATTAAGGGCAAGAACAACAAAAGCCGCAGCACCAAAAA--AAAAAAGTTGATACTT----CTTTTTGACAGCCGTTCAAGCGG----------------------GAAAAGTTATGTAA----------------GTATGTATGAAAATGCTAATTGAGTTACAAAATGCT-CTG--CAAAATATAAATTATATACAGAAATTTGTGTG-----------------------------------------------------TATTCTGGT---------ACATGCGTAAGTGTGCGACTTAAGTGGGCTTGAAACGACAT-----------CAGCGAAAAAAGCAACAAC-------------------------TCTTTTCCCGACAATTTCCACAGCCTCTAC-TTTTTTATTTTTCGGTACACGTGTGTGACAGGTGCCAAGACAAAA
CCACCTTTGATAATAAAATACGTATTCGCGGCATTGGTTACAGAGGGGAGCACGGGAAACGCGCTGGGGTAGACAACACTTGACAGCTGGCAAAGAGGCTTCATTAAAATAATCAGCTAAAAAGAAGTTGAAACGAGTGCGAAAGTGTGAACAACAAAACTGATGATAGAGCAGGCCAAAAGGGCAAAGCAAAATAAAT------GTGGCAA-----GTCGTGTGCGATGCCTCTGTGTGTGTTGGTGTGTTTGTGTGTGTGTG-GGTGTGTGTGTGCTCTCTGACTGT-------------GTGCAACACTTTGCAGCACT----------------CGCAACACTCATCAAAAGCTGTCAAGTTTTGGTTTCTTTAGCTTTTCTCGCATCTTTG--CTTTACTTTTATTTTTGCCTTGCTATTTTCACTAATTAATTATGCAGTAACAGCAAACAACTTGAAATGTAAGGAGATTAAAGCGACTTAAAAGGCATTTATGCAATGCCAGCAGCAGCAGCAATAATAACAACAAAAACAACAAAATAGAACAAACAGGACAGACAGAGTAGAACAGACAAGTGTCAGGCAGTCGCTCTCCAAGGATGCTTCTCTCAGGGTGTCTGCATAAGACAACAAAATCTTATATATGTGTGTGTTCGTGTGTGTCATCAGTGTCTGTGTGTGGGCGTGTGTGTTTGTGTATTTGTATCTTGTGCGTGTATCTTGTCAAGTCATGTTAACAAGCTTCAAATTGCGTAGCAAGCAGCTTAAATTTTTGTTAAAATTAATAAACAAAATTTCCCAAAGAATCTTAATGAAATTTTCACAGAATATTTTCTTAATTTACGGCTTATAACCAAGTGGCAAATTAAATAACAAAATATTGTGAAAGTATATTCAACTAATTCTGAAATAGCCTGCAGATATTTTATTGTTTCATGAAAATACCGCACGGATTTAGTTAACATTTAAAGCCAATTCTTGTTACAGACATAATATATATTTATAAATACAAAACACAAATTGCATAAATGTATATAAAATCCTTTAAATTTAA-GAATCGCATATTCAAATGCATTTATGAAAGTCTTCTGCCTAATTTATGCGCAAAGCTTATCCTTTGTCGCATCATCAACGCCACTCGCATGTGAAAAAGCTTCTTTTATTGTGATTTACAAGTTGCGGCCCTTATTGTCATGCTGCTCATATTAATTTACACTTAATTAAAAGCGCCGAAAACAACAACGACAACAACAACAACCAGCAGATATGATAGCTGACACTTTTTGACAGAGGCGGCAGCAGACGCTTAAAAAAATTGCCACACAAAAAGCCAAATGGCCGGGGAGAAAAAATTGTATTTATGAAAATGCTAATTAAGTTACAAAATGCCGCTGACCAAAATGAAAATTATAGACAAAGGATTGCGCGCACAAACAGCACGAACAACGCAACCCCCCCACCCACACACACACACGCTAACACATACATGTAAGCGCACAACATGCGTGTGTATATGGCGTAAGTGCGCTTCAAACGATACAACGACAACCACGACAACAAATACAACAACAGCAGGAATAAGAGTTGGCACGTTTGCTTTTCTC-----TTCGCACTGCTACTGTGTTTTCTCTACTTTGCCACACGT-TGTGGCAGGTGGCAAAGCAGAA
>mbl 12810764 12813423|12634 chr2R 12812032 12812333 scaffold_16 419128 419524 + 3251|0 407
CCATCACGTGTGGGTACAAA--------------------GTGTGTGTGTGG-----TTAAGTGT-CACACAAAAAACCCCGCACACCTGCATTTACGTGTACGTG--------------TGTGTCTATGCCAACGACTTTGTGCT--------CTCCATTTTCCTTTTTTTTTACG--------------GAGTTTTAAATATAAT--AATGACAAGGCAGCGGAAAAATAA-----------TGTCGCGGGTGGCAGAGTGGAT--------------------TTTTTAACCCTTTGT--AGGCACCAA---------GTAAATGTTTTTCCATCGTGACATAAAGTTGCAACAATTGAGCGACATTTGCTGTTGCATGTTTTTTGTAGCGCGCATGTCGGGTGT
CTGTCACGTTTGTGCGCAAAAGTTGCTGAGTCTACGCTGTGCATGTGAGTGGGGTACTTAACCATATACACCTAACGACACACTCGCTCACACACACATATACATACCTATAGTCAGCCTTATGTCTATGTCAACGGTTTTGCGCTGCGAGCGGCGCCATTTTGAGAGTTTTTAATGTAAAAGCCAAAGCAGAGTTTTACTTTTTACCAAAAGAAAAAGCC-CGTAAAAATAAAACTCGCCAACTTTTCTATCTTGTATAATGGATATATATATATATACATATTTTTTTTGTTGCCTTGTCGAGGCAACAACAGCGACTCGCAAATGTTCTGCAGGC-TGACAGACAGTTGCATCAATTAAGCGACATTTGTTGCTACATTTT---------GCGCATATTGTGTTT
>mbl 12810764 12813423|12635 chr2R 12812531 12812820 scaffold_16 419575 419806 + 418|0 291
TGTTATGGACAACTATAAATCCATTAATCATACATTTTATATCCGTACACATTTTTTATTGCTTCGCAACAGAATATGCCTGACGTCCATTAAATGTGATGTTTTTGTTTTTTAAATCCATGAAA--CCTTTATTGATGCATTGCATAAAGTATAACACGCTTAACCAGCAGTTGATGTCTGCTCTCAATTAAATTGCAAGCTGCACATATGAATATTTAAATAATTTAAATACAATCTCCGCTTTGCCGTCGTGTCCTGTCAATGTTTTAAAGCGTACGCAATATCCTTTC
TGTTATAAGAATCTATAAAGCATTCCACAATATGTTTAATTTGCATAAATATATATTA------------AGCGTATA------------TGAATATTTTAATTTTCTTTTTT----CCTTGACATTCATTTACTCCCAGGCTGTCTGTATTCTCATTTACTTATGCCG----TGCTATATTTTCTCTATTTATTAGCATTTTGCA------ACACTTAAAATGACTTATTTACAAGCTCC----------------------ATTGTTTAACAAATACACCAAGTATTTTA
>mbl 12810764 12813423|12636 chr2R 12812886 12813185 scaffold_16 419849 420303 + 7312|0 459
CTGCAACACCCGCATGTTTACCCCCGGAAAGTATGCAACACTTTAAAGCTCT--TTTGCGGTTGCTGCTTTGGC-------------------CACCAAAAGCAAAAGCAACAACAGCATTTTC---------------------------------------CGACTACTGTGCGTTTTTATTGCGTTTTTCATGCGTCCCATGTGGTTTATTACAAATTGATTTTATTATTGT-----------------TTTCA---------------------------------CCCGTACCCTCCTTTTGAC-------------------------------------CTGTAGGCCCTGCT------TTGTTTGCTGCTGGTTTTTCCGGCTGCTGGCGATT-------TGAAAACTGATTGCAAACACATGATTATCCAACCACCCCCCAGCACCTACTC
CGGCGATACCCGCGAGCCGCGCTCT--AAAGTATGCAATAATTTTAAGCTCTCTTTTGCGGTTGCCCCAAAAGCGCCCACAAAACAGCAGCAGCAGCAACAGCAGCAGCAACAGCAGCAGCAACAGCAGCGGCGGCAACAACGGCAATTGGAGAAAATTGAGGCGACTGCTGTGCGTTTTTATTGGGTTTTTCATGTGTCTCATGTGGTTTACTACAAATTGATTCTATTATTGTATTTTTTTTTTTTTTGCTTTCATTTTTTGATATTTTTTTTTTATATATGCCACGCCTCGCATTCTGCTCATGCCGCACACGCATTACGCATTTGCTTTGTTGTTGCTGTTGTTGTTGTTCCTGCTGTTGCCTCGTTTGTTGTTAGGTTTT---GCTGCTGGCGATTTGAAAACTGAAAACTGATTGCAAACACACAGGCACACACATACACACGCATACTTACCC
>mbl 12810764 12813423|12637 chr2R 12813218 12813889 scaffold_16 420499 421319 + 576|0 361
CCCGTCGATTGTTTAATTAATTTTATAATGAGTTAATTTTACGCTGGCCAAACGGGAATTTAACATTT--------------TCCATTCGGCTTTTGGTCAACGTTTTTGC-----ATTTCATTCG---------------------------------------------------------------AAATTGAAGTCGAATGGC-----------------GAATTCAATTATAAATATGCTTA-----CATTTGCAT----------CTGTCAATTTAGT-----------------------TGCAAATGTTG-------------------TGTTGCCGATGGGATAGGCAAAAAA
CCAATCAATTGTTTAATTAATTTTATAATGAGTTAATTTCGCAAAGCGCAATC----ATTTAAATTTTGCGCGGAAAACCCATTTATTTAATTGTTGTGCAA--TTTTTGCCACTGATTTTGTGCGTACTAAATTATAAGTACAAAGCCCCCACAACACACACTCGCGCACACACACACACACAAGTACACACTCAAACCAAAAGACCAAAGCGTCCGCCTATGAAATTTAATTATAAA-ATGCTTACATTGCATTTACATATTTGCGGGACTGTCCGTTTAGTTTATAAACATTTGCCACGCTCAGTTAAATTGTTGCCTCATTTCGTTTTGAGGCCGTTGCAAATTCGAAAAACTCAAAT
>mbl 12867244 12868426|12706 chr2R 12864379 12868205 scaffold_16 491473 495822 + 37229|3395 4691
CGCGATTTTATTTACGCTTACTTTG-----------TGTTTATTGATTTAACA----AAAGTTTTTTACGTTC-------------CAATGT-------------TTCCTTTCGTGGCATGTCTTTAT--------------------------------GTATTTAT--------ATTTCTAATTAGTATTAATATTA-AACTATGTATACGAA-TATTGCGAACTAAAAACGAAAACATTGTACAGAGTTTTGAGTTCTTTTGAGTTTGCCAAAAGATCAAGCTGAAA-----------------TTGCGACCAAAATCCACTGTA-TAATTCGCCAATAACCAGAAATTGATTCGA-CGTTTTGACACACATTCGTATTTGT----------------------CTAACACCGCCAAATTG-------AAACCAAATATAAAGACACCCAATCTTGATGTT---CTCTTCTTTTCATTTCC--TTACAACTTTAT---------------------------------------TATCTACATATATA----------------ATATTAAAGAAT-TAGTACGG----ATCGATTCAT----GAGTCGATC----GCACAATATT-----GCA------GTTTGGCCAAGCAGCTGCTTTTCAG--AAGCTTATTTAGGAAGCTTACGA---------GCCC--------TGTAAATAGACCAAGA---AACTAAATTGCA----------GAATTCTTTGCACATCAATTTCTAATTTCACCCTTATTTTCCTGTT----TTTCTATAGTTAT----TTTCATTTT--CCGGATAAAGCGGAAGGGAGGCTCGTTTTTCATTCCATACTCAAGATCCCCATAT--------AGAGTTTTAGAAAATCTCCCTGGGCCTTGAATAAAATCATCGTAGATGTGAAGTTCAAGATTAGCAGCGTTT-TTCGTACTCCCTAGAGGATCTTTTTAGTACCATAGAGTTGGTAG------ACGTTTAGCCCATTG-ATTTCAAGATTTTTCT--TTACATTTTCAAGCT-----ATTTATTTACTTTGAAT-------------CAGCAGACACCGAAATACTCTCTACA------------------------AACAGTCCACCCCGAGCTCCCCGTAACGTCTACGTGTATTTGTTTACTCCTGATTTTGAAT--AATCCTTGCATTCTCGTTG----------------TTCCTTTTTGTTATGTTTGTGCTACGTGTTCCTCTTGTGTTTTCTC
TATGCTTTAATTTATGCTTACGTTTATTTCGTTAATCGTTTATCGTGTTATCGTTTTATCGTTTATTTCGTACACAATGAAACAAACAATATGCAAAGAGAAACGCTTCTCTTTTGACATGTTTCCATATTGTTTTTTTTTTCGCATGCTAAAAAATTGAGTTTTTATTATGTATTACTTCATATAAGACCTAATATTTTAACTATGTATAAAAAATATTGC--------AACTAAAACCATGTACAGTGTTTTAAGTTCTCTTTAGTTCTGCCAAAAATAAAAATAAAAAAGAAATATATGAAAAATTATAACGGAAAGTAATATTAACAATTCGCTGATAAT-AAAAATTGATTTGATCACGTTGACACACATTCGTATTCGTATTTGAAAACTTGAACTTTTATCTAACATCGCAAAATTGTCTTTGTAAAATCGTTCTACTTATTCTTATGTCTGATATAATACTTTACTTTTAATTTTTATTTATATATGTATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATGTATTTTTGGTTGGTATGTGATACAATCTTGTACAGTTGTATCAAATCATCCAAGTGTCGAACTCCGGCACAATTTTTGTTTACAAAATGCGCTTACCGAAGCGGCTGCTACCCTGCAAAGCTTACGACAAGCGCTTTCAGTATATGCTTGCCCAGAGCATTTGTAAATAGAACAAAATAAAACCAGACTACATACAAATTGAAAATTCTGTGCAC-------------TTATCCGTTTATTATATGTTAAGACTTCTTAAGTTATATACCTTCATTTTAGCCAGATGCTCCCAGAATAAA-----CTTTTCAACAGGTTGTACACTTTCACATGTCATGAGTAAAAGATTAAAAAAATCTTGGTATATTTTCTTTGCATTCATTTTAAAATT----TTAAAGAATGTTTTTGTCTGTTAGGAGTCT---GCGAATTGATTTCTAAACTAAGAAATGTTATCTTGCTATGTTAACTACAATGTAAGCTAACACTTTTTTAGTTAAATT---AGGCTGTTACATTTATTTTTTTTTAATTTGGTTTATTCTGCGATGGATTATAAAATACCCTTTCTATAGTAAAGGGCATTCTTGTTTTTCCACAGTACCAGTCTAGTTTCTT-TCAGGTCCTCAGCCAATTGAAAGCTTTTAAATTTTTATTAAACCCTTGCATTTGTGTTTAGCTAACTCAAATTTTTGCCTTGTTTTGTTTTTTGTG-TATGTGTTCTTTTGTTGTTCTCAA
>mbl 12867244 12868426|12707 chr2R 12868206 12868671 scaffold_4 4883351 4883800 - 2142|0 240
GTACTCAAAAGTGCACCAACTTAAAAAATGCAAATTGAAAACTAATCGGCATG-------AAGCA----AAAATAAAAACCACACCCAAAAATAAACCAATGCAATACCAATTCCAAGGGGCAAGTACAATAGCAAGAAAAAAAAAGCATAATCAAAAAAATCCTAACACAAATAAAACCAAAATTTGAAATGCATCTG---------TATCGGCTCTAACCACTAAACAAAAAAAAAATA
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>mbl 12874526 12876349|12714 chr2R 12873062 12876675 scaffold_16 502052 506319 + 32233|1821 4122
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TTGAGTTAAGTTCATTATTTCTTATTTTTAGCTC------CCTCTTTTAGTGCATGCTTTCAAGCTGCGAATGTGCTATGAAAAAAGAACTGCTAAATCAGCTTAAAAGTAATGTAGGGCAAAAACTG---AATTTCGCTAAATATCTGTTTAACCTTATGATGCATACTTTGCGTTGACTAAAAGCATTTTACAAATTCAAATTTAAGACAATTGATGA-ATACTTCATTTTCTTTCTATTTTCTTGAAACATCATTTTCAAAAATTCTAAAAACAGTTTAGAAATCCGAACGTTTTTTTAATTTTCATCGAAGTTGTTAAACATTGAGTTGAATAAAAAAAAAGGATATATATATTTGTCCTGATTCAGAAAGTCAAGTCATATCAGACAAATGTATGCATCAAGTTTAAAGTTGAAATAGATTTTAGTATGTATAATAAAACTTCCAGTTCCTTGGCGCTGACAACCAAACAAAAGCAAATCACCACCCCATAATTACCCACTCAC-----TCGCTTACTCAGTCAGCCATGCATTCACCCACTCATTCACTCATTCACTCACGCATTCACTAACACTGAAGCACTCATTTACCCATTTACTCGCTAATTTCACATGCACTGTGAAGTGCCATCAATTAACGTTTATAATCAGCGCAGCCCTCAAGTCAGACAGACAAGTCTTCCAGCCATTCAGTCAGTTAGTCAGCGAGCATTTAATTTGCAAAATGAAGTAATTATCTGGCATATCAAAAGCGCAAACACGCACTACACAACACTGCGAACACACAAATGCATATTACTAATCAATTTCCCAATACTACATGTTACCCTGTTGGACTCTGGCATCGACAGCT-TGCACTTGCAATCATCGTTTGTTGCCGTGTTGCGTGCCGTATGTAGCAACAATTAGGGGTAGCATATGATAAATCACAATCACGTACACTCACGCACTCTCTCACTCACTCACCTGGGCAAGTGTTAATTAAAATGATTTAACAGTTAATTGGCCAGGCCCCAAAATGAATACACTCACTCGCATTTGACTGCATGACGAACTGTTTCGACGGTTCCGACTGCTCTGACAGCTCTTCCTGC-----------TTGGCTACGCTTTATTATTTTTACGGCAACTGCAGCTGCT-AGTGCATTCACTAGTGTGCCAGCCCTGCTTAATTGCTTAAGTGCTTTTCCAGGTTAATTAGCTG--CGGGCTGTATCCGAAATTTGCTTGGCTTTTGTGCATTTTGTTTAAACTTAAGTCTTGGCAGACTGCCTGCTCCTAACTTATGTATTGTATTCATCGTATGTATCAGATATTGTATGTATTATAATTACATAGAGCTTAGGTTAACTTATCACACATTCACATCACGCTAGTCTAAGTCTATATATATATATATATTCTCTAACTTACTGCTAATATGAAAACAAATTTGAATTTTGTATATTTATGCTGAATATATTCACTAATTTCATTTGTGTTCT-CTCTCTTCTTCGTTTG---TTTTTCGATTCCGACTTTCATTTGTTTTCTGTGTCTCTATGTTACTTGTTGCCAACAATTCAAAACCAAAATTCGAAAAACAATCAATTATCGTATATATTGAATATATATGTACCAACAACAACAACATCAACTACAACAACTACAACAATAAATGTCTGCTAACCCAATTATGCCAAAAAAATGAAAAATTACCAAAAAAAAACATCAACTGCAACAAATTCATCAATCAACAATGCGTATCATTCAAATTAATCATGAAATGAAACAATTACTAATATCGAATTACGATCA-TTACGGAATATACAATCATGAAAATAATAAAAATAATGACAATAACAATAATAACCATAAATGTGCACAATTACCAAAAAGATGGATGTTAAAACGGTTGGTTCATTTTACTATGAAAACTTCGTAAGTACTCCAAA-TAAATAAAAAACGTATCATACAG-----------ATAAATGAAC----AACTATCCATCCAGTAT-TATAATACTACATATATAGAAGAACACATAATATAAACCTATAATTACTAAACAAATAATTTAAGCTGTGTTTCTTAAAACTGCGCAAGCAAAGTTGTGTTGTAAAACGATCGAAAATAAGTAGCAAATCGATTCGATTTATTTTTAAATTACTCTTTGTATATAAAACATTTACTTTTCACTTA-----------AGTTACATGAATA------CACTATTCCAGATGTTTGAATAT--ACAAAGTT----CAGCTAATTTTTGTAGAAAGAACTTCTATTTGAAT
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TAGATCTATGTGCAGTCGGTTAAATTGTAGATTCGTTCATTTAACTGAAG
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ATGACAAGGTCGAGGTGATTGATCAACGTGTTGCTGTCTGTCGGGATCATGCCAATAGCCAGTGCCGTCGTAAACAGTGTAAATACTATCATATACCGATTGTCTTGCCACCGGCCAATATAATGGCCGCCATGATCACCAATCCCAGTGAGCAGCAGGCGGCTG------------------CTGGCAGTGTGGTGGCAACAACCACGGCAGCAGCAG------TTGCTGCCGGCTATAACAACAGCAACAACAATTTGATCATCATTGAGCCGCATCAGCAGCAACAGCAACTGCAGCAGCAGCAACAACAA--CAGCCGCAGCAGCAATACAGTTATCACACCAACAACACTAACTACTATCACAGCAACACAAATAAAGCAGCAGCAGCAGCCACACACCACGCCAGCAACATGTAT------------CAGCAACATCATCATCAGCAGCAACAGCAGCAACAACAACAGCAT---------------------------ATTACTTACCACTGCAGCTCACCGTACTCCCCCTCGTCGGCCTCCTCATCATCCTCCTGTTCCATAGCCACATCTCCCACACTATCGTCGGCCACCACGCTGTCTACCACATCGACGGCAACAATGCCTACACCGCAGCAACAATATGCTGCTGCTGCTGCTGCGGCACCGACAGCGGCATTTCTCAAGGCGCCCGCCTACTATACCGATGCCACGCCTACTCTGGTGCTAAGCAGCGATTACAATTCTAACTGCATACCCATTCAGGCAGCGCCCTTCATCTCGCTG---------CCGCAGCAACATGTCCTAAAGTACACGACGCCGCAGCAGCAGCAACAGCAGCAACATCACGGCCTGATACACCATCAGCAACACGCGTATGTGGGTCATCATTATCCGGTGGTGGCCACCACAGTGGCTGCTCTGCCGGCCACCACAATCACCGTTACGCCGGCCACAATAGCCGCGCCCTCATCCTGCA
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>mbl 12888681 12890732|12724 chr2R 12890338 12894261 scaffold_16 520138 524768 + 74479|0 447
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GA
GA
>Sip1 12919651 12920036|12767 chr2R 12919709 12919828 scaffold_16 563235 563360 + 3486|0 128
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>Sip1 12919651 12920036|12768 chr2R 12919973 12920037 scaffold_16 563694 563758 + 2066|0 64
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TCTGTATTTAGTTT-ACTTATGTGCTTTTTACCGTAAATAAAGCAAAACAATGGAAAACAAAAGA
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--------GGGCCAACTTATTGCGA---------ACCAAGTTTCTTAAGTACTATACCTAGGATTAAATGAAATCGTTACTTAAATTATCAATTCAAGAACTGCC
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CGATTTATAAAACTTTGCCACGAAATAACAGAAGAGACGCTGATTCGCCGCAAGATTTATGTGCCACCGCTCTATCAACAGTTCCACAAAAAGCGAGGACCCAGAGTTCACTCCATATCCATTACGTACGAATTAGATCCGAAAGACAAAAGGCAGCCGGTGAAAACTCCATTGAAATGTGAAACTGTAACGT---CCGCGTCAGCGTCGCAGTAAATATATACATATGTGTGTAACTAAAAACATTTCCGTAATCAAATGC
CGCCTTTTAAAGCTCTGCACCGAAATAACCCGAGATACCATCAGGCGCAAAAAGCCCCTCATGATGCCGGGTTATTACAAGAACTCGAAGAAGCGCGAGCCGAAACTTCACTCCATTTCCATTGCCTATGAACTAGAACCG---GGCAGAGGACGAC--GAGAATTCACCATC-AAACCAGAAAATCAAGCTCATACTCCGTCAGCTCAGTCCTAAACATAAACATTTCCGCACAACGAATA--ATTTGAATAATCTAAAGC
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GTTAGTCTTATATCAAATGCACAATAAGTTTATTTAAAAAATACATTACTATAAATTACAA
>CG18467 12957147 12957352|12793 chr2R 12956399 12957364 scaffold_11 1466588 1467416 + 14039|751 959
GTCCATAAGCATACAATAATTGTCCAACGATTGTCGGTCGGCGTCTACTGCGAAACTTTTTAAATGTACGTTGATTTTTTTTTTTTAGCAAATCTACATATATAAATGTATTTTTTTTTGTGGTGAACCAACATAAATAAGTGTAATTTTTTTTGATGGATG---TTGAATATTAAATATTTCCATGTCTTGATGTAAATTGGAGCAAA
----AATATCGTGCAGCA--TGCCCAAAGGGCG-AATCCGGTGTCTACTGCT--ACTATACAGATCTA--------------------TAAATCTATATTTATATATGTGT-------------------------ACAAATACAATTTTTTTTTTTAGATGTGCTTAAATAC--AATGTTCTAATATCTTGATGTGCAACAGC-TACA
>CG10764 12970488 12970594|12814 chr2R 12970437 12973729 scaffold_11 1471644 1474885 + 45711|51 166
AATAT-------TTAAATGCCTTAAAAATGTAAAAGCACGTGTAAATACCAATTACTGAC--ATACGAGTGATTGGTACATGTTTTAATAATAAAGTAACATACGCTAACGAATAA
ACTCTATGCAAATTGAATATTTCAAAATTGCATATGCACTGTTCCCTCAGAATAATATACCAATAAGAATATTTATTAAATTTGTTATCAG--AATTAACTTAGTTTAAGAAACAA
>robl 12971859 12971999|12814 chr2R 12970437 12973729 scaffold_11 1471644 1474885 + 45711|1495 1651
ATG-GCATGG-------TGCATCGCGACTATTGCTGAATTATCTGCACATTTA-TATCTGTATTCTAATCATCAGCGTATAAATGGAAAGTTAAATTATAATGTAATGAAATTGTACTCCATACAATAAATATATTTATGCATAA-------AATGA
ATGCTCATAGGCGAAATTAAATTGCGAACCTTG-----TGATATGTGGTTTTATTTTCTGTCTTCAAA-----GGGGTGTAACGAAAAAATGTAAATACAATAT----------TCCTTTATA-AATCAATACCTTCATGTAAAACTAAGTTATTCG
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>CG14478 12979097 12980443|12819 chr2R 12979426 12980681 scaffold_11 1480549 1481815 + 13781|0 1182
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TTTGAACAA-AATGAATGCGAGATTCCCGCACGCCACGTGTGGCAACACTGGCCAAACACATGCTAACCTCACCACCACAGCCAGTGTTGCCATGTCGCTTTGTAATTAGTGTTTTATGC---------------------------------AAAAACTCCCGATCTTAAGAA------------TGTAAGACCTACTTTTAGTTATCGT-----TTTTAATTAACACCTCTCCCC----------------CACGCAAATTAGTTACAAGAGGATTATTTTATTTGCACTTA--ACTCATTTTGTTGATTGTTTTTAGTTATGCAAACAAAGGAGGAAGAAGAAGAAGATGGAAGAGAAAGGCGAACAAAATTAATGCAAAGCGAGAAAAATAAAAATAAAAAAAATGTAACTAAAGTATTATTTTAAGGCATAGTTTTTTGTTGTAGCAAAATACACACACAAAACGAAACAAAAGAA----AACAAGAAGAAAAACAAAAACA----AAACTAAAATCCTATCATGTAAAGTTTGTTTACAAGCA-----------GATATAAATAATTATCAATGTAATTAATACTTATTAAATTTAACGAAACAAAAAAAAAAGAGAGTAAAAGGAGAAAGCTAGAGCAA----AAATTAGCGTTAATCTAAGATCAAAATCAACTACTAATTGGTAAAACTGAAGAGAAATAAAAAACAAAACAAAAAGAACACATCTGAACATAGAAATCATGCTGAA---CAAACCATATTAAATAATTCAAAA---CTCAACTCATTT--AACTTAATCCAT----AGACAAAGCAGACGTGATCCTTCAGA------TCCTGCCGG--------TCGCTGCTGATGACGATCCTTCGTTGTTTTTTGTTTTTTTTTTTTTTGTGCCGGCCGTGTTGCGGTTC--ATCAAAGCAACGACAAAATACCCACTAATATGGATGATGTTGACGGATACCCTATAAATATGTAGAGAGAGTACACACAGACATATAGATACACACTATTGCACACACTTGGCAGACACGACGAACTGAACAGATGCAAATGCAGG---TGCATTTGCAGGCAACCAATCGCAACTATTCGAAAGTATCCTGGGAGCAA--GCAACTC--CCGAGTTCTGTAATTCAG--------------------
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AATTTGCTGGACCCTAGTAGTGCCAGCGGAGGTCGAGGT------------------------ACAAACCCGGCGGCAACCACCCAAAATTTGACCATGAAATCCCAACC---------------------------------CAATAGCAGCAACAACTTTTTGCCAAATCACGGAGCAAGTGAGTGCCAAAATGGCAAGAACATAAATCCCAACTACTACTACAATTCCAACGGCAGTTCCAAG
AATTTGCTGGGATCTAGCAACGCCAGCCGCGATGGAGATGGTGTGAGAGGCACAACCAGTGCGACAAGTCCTATACCGAAAACCCACAATCTGATCAGGAAAGCCCAATTTGGTAACATCAGCAAAAGCAAAAACAACAAAAACAACAGCAGCAACACGTTCGTGCCAAGCTATGATAAACATGA-----AAACAAGCAAAACAACAA----CAACAATAACAACAACAGTGGCGGCTGCTTACAG
>qkr54B 12987356 12987672|12828 chr2R 12986881 12989953 scaffold_11 1495100 1498623 + 28285|567 987
GTAAAT------------------------CAGCAACAACTCCAACAGTCGCAACCAAATCTCCCACCGCAGCTATCAG----GCCACAACAACAACAGCAGCAATGGCAGCCGGGC--------CAGCAATATGATTAACACCAGTAGCCACAATAATTGCAATAG--CAACTTTCACCCAGTCGGTGAGAAAAACTCCAACGACGTTTCATTTATATCCTCCTATCGACTTGGTCCAATGG---------ATGGCCAAAAGAGTGC------------------------------------------CAACAGCAACAATATCAACAATCACACATTAGGCAGTAAAAACCACAGCAAC---------------AACACCACCACAACCGCTTCAGTGCCCAATATGCTCTTAGTAAG
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>qkr54B 12987950 12989516|12828 chr2R 12986881 12989953 scaffold_11 1495100 1498623 + 28285|1369 3291
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CCCTACTTATCCTACGCTTCATTTTCGCGAGATTCCGTTCTTGCCAGTGCAGTTTTTCTAAGCCACATTCAAATCTAACAGATACAATAACAGCAAATACAGCAACAAAATACAGATAAACAATAACAACAAATCAAGAGACAACATCACAAATACTTTGTACACTAAGAGGGAAGAATATTTACAAACGAAAAACTTAAGATATACATGCTTATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAAATATATAAATATAAACTAAATACAAACATATACAATATATACATTAAAATATATATATATATTCATGTATATATATATATATATATATATATATATATATATCTATTTTTGAGTGCAAGGA-AATCGTT---GGATGACACAGCTGGATCTACAAATTGATATTTTACCTTGTGTTGGCTGGTGGACGATGGACAATTTATGCCAAGGATATATTGTCCGGTTTTTTAATCTATATTTACACAAAGAGCAAAACATCTTTAAGATACTCGTATTAAAAGTGCGTGCATAAATAACAAATTATCAAGAGATATAACCGTTAAATACT------TAGATAAGCA-------CAGCTTAAAGCTG-GCTCTGATACTTTGACATATATAACAAGCGTAATACTAATAAATATATATATACATATATTTATTACAAATCTGCTAAATGAACAAAATCTCTCAATACATGCACACACACTACTCGATCTCCAGAATAGAACGCACATGTCTTTAAAAGGAAGCCCAAGTTAATGAATTTTCTGAATAGTAAGAGTTCGGTTACAAAT-TAGAGAATCGAGTCAAGTAACTACAGATTCCTAATTATTATTTAAATACTATAGCTTCAAAGGATTTAGTTTATATTTAGACAATTCTATCCTGGAGATGGAGGCTTGTGTGCATAACGTGCAGTAGGTCTGCAAATCTATGAGATTCATTACGTGAAACTAAATAATTGGGCACACTTAAATTAAATATTTAATATATATATATATAAATAAATATATACAAATATAGAATTGAATATTTACATTCGAGCAACAAATAAATGAATGATTGATCAAATAAAAGTGAAATGCTATTTATATAATATTAA-----TATGAATAAAATACTCATAACATAATATACATACATATTTATATTAATCAATGATTGTGGGATGAAGCCCATATGTGGATAATGCTGCAAATGATTACTTTATTGAAACA-AACAAAAGAACACTAAAATATTGTAACAAATAATACTCATTGAATTTACTCAACTAAGCTCAGAATATTAATCCCAATTGTATTTTCTACTT---------TAGTAAGTTCCCTTTTTTGATTATGATTTGTACTTCATTTGTTAATTGACTAAAAAATTTTGTGATTCAATG--------AAATTTCGAATACGACACCTGGT-----------------------TTGCGTGTGCCC-------TAAAAGTGAAT------------------------ATGAA--ATACATTGAAAGAGCAAGAGAATGTTAGAGTTTGTGCCAAATGTAATAAACAATTGATGGAGCAGTCAAGTTTTCAGAAACACAATCTTCCAGTTC----------------------------------GATGATCCGTGACATTGTTTATACGAGTCGAAATAAGTATTCTGACTAT----------------------------TGACTACTTGTGAATTTCCTTCTGCATTGCAAC--ACAGTCGAAATG-----TTTTAAAAATTATTATTTTGTTGAACTTATAAGCTGAGCGAAGCGATATGAGCATAAAGAACATAAAGTCTAACCTATTGTTAGTAAAGTGCAAACATAATGAAATCAGATAAAAATAAATA
>CG4827 12996801 12996991|12836 chr2R 12996710 12996939 scaffold_11 1514190 1514415 + -620|92 253
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TGTCATAGTTAACTTATCAAAT--GTAATTATTTTTATAAATAAAGCCTTATAATTTGGAGGCACATAAGTTCTAGACGCAAAAGGACTTGAATGGCATTCAAATGGAACTATGGTTAAAATTGTACTGGTCTTCAATAATATTGCTAGTGCTTGTTAGACA
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AATAAACAAATAATCGCGAGTGTATGCTTAAAATGAGCTTCAAAGTTGATGCGTCGATAATGCGATAATTTTGAATCTAGAAAAAGAACTTCTTCATCAA-TTGTGTTTGCCATTGCATAGTTTTAGGCTGACTTAAGTAG-ACACAAAACTACAATAATAAAAATCGTATGTAAATAG
ACTATTCAACTGCCTAGGTTTGAATTTATCAGATTAAATGTACAATAAATATCTTAATGCCCCTATAGATC----TCTAGCACAACCAACCATGCCTTAGCTTGCGATCAGAAGAACATAAGTTTCGAATTTCTCAAATTTCACATCTATTTGTAGCATCA-----CGTGCGCAAGTAT
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GGACAACTAGAGAGCATGGGCAC------CAACTAAACGA---TATATAAACAAGCATAAATCATATAACCTAAATTAAAA---------------------AAAAATAATAATAATAACTGAAT-TACAAACGCCTAAGCAATAATAACTATTCCCCCTCTAAGTATAATAAATCGCTA----AGTTGCAC----------TTTAAGCGAATGTCCTTAATTAAGAAATGCGAAACACCGACAAACAAAAAAACAAAAAATAAACATATTTA-TAAACACATAATGCACTGAGCAATCGATCA-------AATACGTGATTAATAA-AAGTTAATTTAGTTGACCACAAAACAAAAGAAAAACA-----------AAACAAAAGTAAAGAAACTTATATGGAACGTTGCCAAGCGTTCAGTT--CAAAAATTAATACAATACAAAAACGAAATCAAATAG
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>CG4844 13023202 13023510|12856 chr2R 13019600 13023535 scaffold_11 2327465 2331441 - 78194|4083 4420
GCATCTCCTTTCCCACGAATGCCACTAGCCTAAGTTGTGTGTGTGTTTGGGTCGAGGTGTTATCCAGCCGGGCATCCGGGTTCCACTGAGGAATGGCCATTTTCGAGAGCCGGCCGGACATGTCCGAAAATGACGCTTCTCTCTGAGGAC-----------------CTCGATGCCAATGGATGACCGCGCTGAAATGCAGC---GAGAGATTAAAGGAGCTAAGACATT-AATCTATATATAAATATATATGTATTGTATGCTTTAATTGTATGACAACCACCACAAAAAAAAGGAAACTCTT-GATTAATAAACGTAAT-------AAGTAAATAA
GCTTTTAGTTTTACACATAATCCA------TAAGTTTGTCGAGCGTAAGGAGCTAGGTTTTGGGGCTCTGG---CGTGGGTTCCACTGAGGAATGTTCATTTCAATAACCATGC------------AAAATGACGCTTCTCTCTGCGGACCCACGACAGTTTATACTCTCTGTAGAAGTTAATGAACACCTTTCCATGCCGCCTAGACAGTTTGAAAGTGT--GGATATTAAATTTATATACTACTTACTA--TAATATATGCTTTAATTGTATGACA------------------AAACTCTTCGATTAATAAAACGAATTTGGTAAATGTAAAAAA
>CG4847 13028619 13028722|12864 chr2R 13027278 13032278 scaffold_11 1552121 1557163 + 133006|1365 1468
GCGGGGAATCCGAAATTTATGGCAAAATTTACTGTGCAGTTTGTGATGTGGACTTGGCGTTGGTTGCGTCCATTTCTTAAATAAAAGTCTTTTCTTAATTATAA
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>CG4853 13031968 13032305|12864 chr2R 13027278 13032278 scaffold_11 1552121 1557163 + 133006|4923 5256
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ATTTGAATATATACAATAAGACGATAATTTTTGGCGATAATCGAATCTAGCCTCGCACAAACTTCCATTGAGTTTGTACACGATTTTTTGTTGATACTTCCATGTTTACA-TTTGCATTTGCATCG--------CAATGACGATAATAACT-TTACACTAAAATCGCAATCGTATTTGTTAATTTGTACTTAAGTCTGTA-----GCGTACATACATACATATTCAACTGAT-CATAAGCAATTGGTTGGCATGTAATTTGCAGCTCCAATAAATTTACATACAGT--CTA----ACCATTTTTTATCCCATTTTTCGGGACTTGAAATATCCC
>CG4853 13031968 13032305|12865 chr2R 13032282 13033851 scaffold_11 1557410 1559072 + 63877|0 30
AAATACATAAAAATA-------AAAGACTTC
AATTACATACAAAAACTACTGTAAAGATTAT
>CG4866 13033813 13033883|12865 chr2R 13032282 13033851 scaffold_11 1557410 1559072 + 63877|1651 1689
AGAGACTACCTCCCTTAAGATAACCAGTAGAGTAACTAA
A-CGACGATTCTGTTTCAAGTATTTTTTAAGCAAACTAA
>CG4866 13033813 13033883|12866 chr2R 13033852 13035951 scaffold_11 1559402 1561695 + 50855|0 36
AGCTAACTTGCAATAAAACCAACTAAGAC-----TTT
AGTCAAGTAAAAAGAAAAACATTTTTGGCCGTAATTT
>eIF3-S9 13053646 13053966|12884 chr2R 13051267 13054049 scaffold_11 3792559 3795442 + 144972|2449 2828
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ACGACCCC--CAAAACTGCGCCCACGTCCTCCCCCTGTTTTCACATT-AATTAAAGCTGGTGGCTCAGACTT-GCG-ACGCAACGTGACAACGTCCCGGCAACATCCACTTGTCGGGATTCATTTGCAAACAC-GTATCGCGTCATTAATATTGCAACTAAGCTTAACCATATTAAATAGCTTGCGTTACATACATATGCACACATATACATACACTTATATCTATATAAATTTGATCCTTAAGCACAAAAGT-AACGTCACATCATTTTATATTAACTAAAGTCAAGCTCACGAACAACTTTATAACTGGATAGAATCGAGCACAACCAACAAACAACATGTCCGAGACCACATTGTCAGCCATTAGAAGTAAATTTGC
>CG18631 13058973 13059221|12888 chr2R 13057977 13060586 scaffold_11 3803109 3805683 + 49533|1003 1266
GTCACAATCAAGCCCAAAAGTCGGCACACTCAGAA--ATGCCAGAGGCAATC---------CCCCTGCCATTAGGGATTCGCTATCTCGGTT--CAGTTTACAAGTGCAAGCG-TAGCCGCATGGACTGATT-TTTATCGCAACGCCCAACTGACGGCCGAAAGAGGCCCGAAATGAAATCTATTTAATTTGGTTTACAGCCCGAAAAATGTATAAAAACATATATATATATACATAAATATATGTGTGGTTAGAGAATAAAAA
-------TTGTGATTATGAATCAATGCATCCAAAATAACGTCAAGGGTTACATGACGTTGGCTTCGACTGATAAGCACT-GCTGTCTTCATAGATAATGCCCAAATGCCAACGCTAATCAATAAAACAAATTCTTTATCTCTCTGTACGGAAAACGG-------------GAAAGTAAGT--ATTTAACTCTATTTACA-----AAATTTTTATGATAACGTATACTT-----------TGTG-GCGTGGTT------------
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TCACAACTA
TCATAATAT
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GGGCAACAGTTTTATTTGATTCTTAATTATAATGTTTAACGTTTGCT-GCAGCGAATTATACAACGTAGAGTTTAACA-----ATGCTACGTATCCTTTTTCTTGTTGCGATTGCGATTCTTCACGTTCGTTGTCTCATAGAAATTGCTGCCAATTTTTTTGCGCTTCTGGCTGCGTTCCAGAGCGCGCTTCTGTTTGGCATTGAGCCGTGGTGCCTTGGCACTACTGCTGGGTCCGTCGTCGTCATCGCTATCGTCCAACTCATCGGAATCGCCTGGCTGCACCTTGGCTATGCGGAATTTACCCGACGATGTGATGGCCAGCTGTTGTGCCTTCTTGGTCTTGGCTTTTTTGTGCACCACACGCTGCAGATCTTCATTATATTCGTCCTCAGAGTAGAAATCGCTGGCACCATCACTGGAATCTTC---CTCTTGCTCCGGATTGACCAGTCGCGCCTTTTTGCGTGCGGCACGCTCTGCTTTCTGTTGCTCCAGCAGCTCCAGATCAATGT
>POSH 13086866 13087185|12909 chr2R 13084261 13087648 scaffold_1 4134836 4138397 + 100997|2783 3247
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CTCAGTGCACATTCCTTGAAGCATTTGT--GTTGAAATTTCAAATTCCATACACAAACACACACACACACACACACACACACATTTGTCAAAATCCATTTTTGTGAATCGCCGGTCGATTTGTGCTTCCTTCCACAAATGTTTATAACAATCTCTTCCTCTTTACGAAAAAGA-----------ACTATTCGAATACAAAT-----GCTCGATTATGTA-GTTTTTATACGATTTTTAATCAAATTAGGCTAGCCAATATATTAAGCAAAAAGTAACATTGTACTTAAGACAAAAAACAAAATGTTTAATTAGATAGTGAAATCGAAATACGAAAATTCGAATCAACGAACCAACCTTTATTTCAAACGCAGATTCCTTTATAAAATCTACATTGAAATTCGTAACTAACCACTGTTATGCATAGTACTTGTACTTACACGTAAACATATACGCAAATTATTAAT
>Rab4 13089406 13089842|12912 chr2R 13088769 13090132 scaffold_1 4139793 4141497 + 32309|645 1305
GT----------------------------------------------------CGCATAAGTT-----GTGCTGATTTATTTCCATTTAATCTCAAACCGG--AATGCGCATTCGGATTACCCCTTAGTTGTAT-------------TGTGTACTTGTGTGTGTCCACTTTTTTAGTATGT----------ATTTTGTCTTGCTAGATTAA--------TCATTCCAATTGTAAGCATAATGCTAATC--GATTTGTTTTTTAACATAACCAATTACCACTTTGAAAACCTA---TGATTTCGGGTTAAC------------------------------------------CCCAAATGTTACTTAC----TATAATTTGTAAT-----------TCGTGAAGCACTAG--AGCCCTCGAGCAACAAATGA-----------------TGTATGGCTATAA--GCACATGGATC-TGATCTAGAGGATGAACAG--------AATACACTCGGCATTTTTAATGTAAATAAGTAGCGATACGCC-GTTGACGACGTCGCCGATTGTAAATCCCATTGAAGC--------ATGCACGCGGTAAA--------------------TAAAAACGC-------------CCATTGATAAATT-
ATGTTTTGGGAGTATTTCAACCAGGTCGTTTAGCATGCACGCGAACAATATCTGTGTATTAGTTTAGGCGAGCAAAAATAATCTCATTTAATCTCTAACTAATTGATACGAAACCGCATTAGCC-TTAGTTATATGTACGCCTGTTTGTGTGCGTTTGTGTGTGTGTCTTTCAACGGCATTTGTGCGGTCAAATATTGTTTTGGCCCACTGTGCAACGTTTCGCCCCAATTTTGTTAAAATTGTTTAACCGAATCTGCTGTGCAATTTGTGGCATTCCAAGTTAGTTCGCTTAATTTGTTTTTGATTTAATGACTCTACTTCAATTGCTGAATTAATTGTACAAGTTTTTCCTTCAAAACGTTACTTATATATTGTAAATTGTAAGCTTTTCAATTATTGTAAACCAGTGGCGGGCCCAATAGCAACGATTAACAACTGGAACCGACCAGTTGGTGGCTGGCACAGCGCCTGAATCACCATCGGACGGATTGATAATTAACATAAATGCGCCCAGCATTTT----GTAAATAAGCGGCGTCAAGTTTGTT--TGACAAAGCAAATTGTAAAGAATTTTAAAATGAATAATAATGCACGCGGTAAATAAAAGCGCAAACTAAATAATAAAAATGCAATTAAGATCTCTCGAGCGTTAAACTT
>icln 13106630 13106748|12926 chr2R 13103914 13108021 scaffold_11 746265 750399 - 98989|2861 3033
AG---------------------------------CATAACCTATTTAAACATCAATACC---------ACGTTTTATACCAG--------ATAAAATGTACGA--TATATATGTATTGGATTAGATTTTGGAGTAATAAATA--GAACGCGGTAAGCGCGATTAAAACAAAA
GGCTGCTAAAAAGTGAACTAACTACTCCACATAACCATAACATCCATAAACATACGTATTTATATTTGAATCTTTTATACAAATTGTAAGTCTAAAGTGTATGAATTGTGAAAATATCTGATTAGCTTTTGGAATACTATATACTAAACGCTGTAAGCGCACCAACTACA---
>lack 13118050 13118847|12933 chr2R 13114204 13119323 scaffold_11 757148 762452 - 170068|4095 5083
GATCCAGAAGAGACACTGTGACCCTCACCTGATCCACGCATATGCATATACATAGACACCTTTAAATATATTTAGTGCACATTATAAAGAAACATATATCAAGGCGATTTGAAATCAAAATTGTACTGACCCTGGTCAAGATGATAAGTTTATATTTTTATTTGTTTGTTGATGAACTGCTCCCGTAGCACTGTTTAATCTTGTGTG-----CTGCGTATTTTGCAGTTAAAA---------------ATTTAATTTAGCGAG--TATTTACTGACTCA-----------TCGTATACATAGTTACCAAGTGCATACATATATATATATAAATATATATATGAGTATATACATTTTCACACCCCCAAACAAACATATACATATACATATATAACCTGGCCTTTGTTTGTTTACGTCGTGGCGCGTGTTATAAATTGTAGTTTAAAATATTACGAAACCAATTATACATACAATTATACAAGATTATACATATATCATAGTTGATAATTAGGCATAAAAACAACT---------------------TTTAATTGTAGGCATTGGACGGGCAAATTTTTGTGCTTTTGTTTAATTT--AGTACATTTTTGATGTTTATTGATTAGAGTTTGTACATTTATAAAAACCAATCGGACCCATTGCTAAGTTTTTGATTATTCTTTAAATAGTCCTTTGACACACTTA---------------------------------------------------------------------------------------TCGACTTACCCGCTCGCATATTT-----------------TATAACTATGCGAGCAAAATGATTGCCTACC------------CAAAAATAAGATA------GGGAAACAAAACACTTGAAAAATTACTCAATCA-TAAAATTAGTTATTTTTTACATTTTTAAATAAATGCAAATTATTTAA------------TTAAA
---TTACAACGTACGC----ACACACAGCCG---CACGCACACCCGCATTCTTACACTCCCATATATGCATT--------ATATCCGATACAAATATATGAAAGCGATTTGAAATCAAAATTGTACTGGCCTGGGCCC--CCTGCAAAACTGCATTGGAATTTGTCTGTTGA-AAAATGCTC------CACAATATGATGTTTAGTGTTTGACTGCGCCTTTTGCAGTTAAAAAAAATGAAATGACAGACTTATTACAACATATTTATGTGTTGCCTGAAGGGCAATAGTTCTTAAACATAGTTACCAAGTGCATATACACTCACGTATATCTTTATATTTG------------------------------------TATTTTGCTGTCTACCCTGGCCTTTGTTTGTTTACGT-------CATGTTATAAATTGTAGTTTTAATTATT--GAACCCATATACATAAATACATATACATTATACATTATATATCATAGTTGATAATTAGGCGTAACAACAACCAACAACCACAACAACAAATTATATAATTGTAGGCATTGGACCAGCAA--TTTAGTGCTTTTGTTTAGTTTTAAATGCATTTTT-ATGTTTACTAATTATATTTTGTACATTTATAAAGA--AATCGAACTCAATGCTAGGTTTTTTATTATTGTTAAAATTTTCCTTAAATACACACACTATTATTTTCACGCATTCACACGGGAAACATTCAGATTGAAACACCCTAAGCCCCCACTCATTTAATATTCTTAAGAAATGTAATTTCAATTGACCTATATACATATATATATATATACATATACATATATGTATATGTATGTACCCATCACCTCCCTATCCCCAACACCAAAAAAAAAAAAAAACATGAAAAAGCAAACACTTGAAAAATTACTCAATTATTATAACTAGTTATTTTTTAAATTTTTAAATAAATGAAAATTATTTAAATTACATTTGGTTAAAT
>eIF3-S8 13183725 13184107|13011 chr2R 13180489 13184153 scaffold_11 842490 846266 - 176199|3329 3822
ACGTTGCTGCAACCTCAGCCCATCCTCTCTAGCGAGCGTTAGCTTAAACATCAGCAAAACTTAAACAGATCAAATTTGTA--GCACTTCGACTATTAAAATGGA---ATGGCCATGGACAACACGTTGG-GTCACATGCTTTCAGGCCTCCGATTCGGTTTCAGGCTGGGTCGGAGGTCTGTTTTTATCATGTCCATTGCATATTGTTGTAGCCAAGTCACAC-------------------GAACATTTGTTTCAGCGCTCATTACGTTAAATGATAA------------TACTAATAACTACATTTTGTATGAACCCAA------------------------------------------AACCGAAAAAGAAACCTTAAAAACAAGAGACACA---------------AAATCAGTGACTTTTTTT-----------TGCAAATTTTTACCAACAACTAATATTAAATTTATATGTACT------AACAA
AC---ACAGTCATCTAAG---------------------------------TAGAAGCCTTTAAACAAATTTCATGAACAATACACTGCGTATAAGGAAATGGATCTGTGGAAGAGGAACAGCTGCTGATGCCGACTGTGGCCAGACCTCCGATTCAGTCAAGCCCTGAATCGGAGGTCTACATTCATTATTCA----GCCTTTCATTGTAACCATTTTATCCTTATTTATTACGCTGTACTGTGAATTTGTTTCAACGCTCATTATGCTTAAAAAAAAAGAAAAAAAACTAATTGATAAATGCATTTTGTATGAACTAAAATCTAAAGTGCGCAAGTCTTTGATTAAAATAAACAGTAAAGGAAACTAAAAAGAAACCGAAGAAAAAACACACACACAAAACAAGAAAAACAAATAAGTCGTGTCATTTCTAGTGCGATGTAAAAACTGTTAACATGTGCTAAGAATTGTGTCGTATATTTCAAATTAAATAA
>CG30108 13184505 13184680|13013 chr2R 13184244 13184760 scaffold_11 846350 846841 - 9333|287 468
TCGGCTCCCTAACCACGTATGGTTTGACCAACCTGTAATCCCCAGCGCGCTATTAAGGAGAAGAAGATCGATTTGCAAGAGATAGATCCGATCTTCGAAACCGGGCTTGAGGAGAATAATGCGAATA----GATCTGATGCAAAA-CAGCAGCAGGC-GGGCGAAAGCTGACCCCGTAAGCT
TAGACACTTGTATTACTCATTGCTACAGCATGATAAACCCAACAGCGTGCCATGCGTGAGCAGAAAATAGAATTACGTGAAATTGAAACGGATTACAGCACAGGCACCGAATACGACAACAACAATACGGCGAGTGGGAGCAAAAGCCAAAGCGGCCAAAGCAAAAGTTGACC---------
>CG4966 13204906 13205693|13030 chr2R 13202109 13205882 scaffold_11 3827092 3830983 + 128332|2863 3788
GCTGTGCAATG-------GATCGTATATTATA---------AACATATTTAAATACTCGCATGCTTAGCCAAAA----ACAGATAATGTAATCGGGGACACCAGATA--GTCTGGGTCCCCGAA-------------GAATAGCCAACTTAATGCCATCC------ACTGTTATTTCATTTGCGATCTCTGGCTGATTCCTTCGTGAGTCTTTTCTTTTGT--ATAGTGGTTAGATAATGATTCCATAT-CATATACAATGCAAACCAAGGGAACTC-AATTTTAAACGATCTAAATTTTACTTCGACTTTTATACAACAAATTTATAAGAAACATTGC-----CGACCTTTTTTACCGCCATTCAATGGACTCACGAAGGAAACCAAAAGAATTT----------TAGATATGCCGCTTACAGCCAGCGAAATATTAAGCCTTGTTTGAAT---TTTCACTTGATTGATGTAAAGTACAA-----------AAATGTTTTAAGCTTTGTTTACAATGTCCAGCACTGTTGTTTAATT---------TATAAGCTTGTATCCTATACAATT--------ATTTTAATCATTTTGCATTTG--CTTTGACCGAAAAGATGCGA---------CATTTTGCACTGATTTCGAGAGCCAAAGAATTTAAATCAAGGTTTTTAA--TTGTAAATATACAT----------TATACAAAATTAGATTCATTTAAATGGAATAA-----TGTGTAACTAACCTAAAATTCACACAGATTCCGTTCTGTCCAGTTGCAAACATAAACCTATCT--TAGCTGTTTCTCATTATCAAAGATTAAGCGCTTTGTGCCAATTTAAA-----------TGCAGGATAAATGCTTAAAATAAACCGTCAAATATGTAGGA------ACGTGAGAACGAA
ATAACGGAATAACCATATGCACACATAGCAAAAAAAAAAACAAAAAACAAAAATACTCGCATGCTTAGCCAAAAACTCACAGATAATGT-----------CCAGATCTTATATGGGTGCTGTAACTGCAACGCAGCCATAAAGCCAATTTAATGCCATCCGTTCTAATTGTAACTTACTTTGCCATCTCAGCCTG-TGTTTACACGAGGTGGAGAATTTATTAATTGAGTTTCCATGTTGATCGCTTTTACGTGTACTGGAACGACAAACTATATTCAAATTTTAATCGATCTATATGTGCTTGTTACTCTCCTAGAATCTAATAATTGGAGCTCGTGTTAGCACAGCATATTTTA------------------------------AAAAATATTTTTGTGTAAACTAGATGCGCAGCTTTTAGCC----AAATCTTA--TCTTATGTACATTTGTTTTTCTGCATTCTTGTAAAGTACAATATCCTAAAGTAGTTGTTTTTAATTTTTTTATTAGTACACCCAATTGTTGTTTAATTATAATTCGATAAAATATTTGATTTTATGTAATTAGAAAAAGAGCCAAATAGTGAAACGTTTGAACTGGGATAGTTAAGTTGTGATTAGGAATTCAATTTTCAATAATTT-----ATTTATTATTTTTAATTATAATTTGTAAACTAGTTAATACATATAAATGTCTTATATACAAATATGAATTTTTGGCCAGGGCATCAAAGGCTCTGGAACCATCT----ACTCATAAAG--------CTATACCCATGTCAACGTGGACTTATTTACAAATTGTTT---------GAAAACTTAGCGCATAGTGCCAATTTAAAAGCCGTCAATGTGTATGAAAATTGC-TAAAGTATACTTATATACTTATACTATATACTATATATGTGTGTA
>CG4975 13243173 13243345|13063 chr2R 13241764 13243605 scaffold_51 522406 524303 - 57129|1442 1614
TAGTTTCGATGACCTAGCATACAGCATACGTCTACCCATGAGAAATTGGCAAACGAGCCATGACCACTGGCTGGCCAACAAGTGGTTAGATGTTATTCACACCACGTCATGCTCCTCGCAGTCGTTGCCCCCCTTTTCGGGCTTTACGATGCGCTAATGGCATGCCAACAGAT
TAGACACA--------------AAAATACACAAATCCATTTG-----------------CTGTCCATTTGCC-ACTAACAAGTGGTTAGCT-CTACAAACAGCACGACGTCATCCGCGGA-------------------------ATGATGCGCTAATGATATGCCAAAAAAT
>CG4984 13247655 13247852|13068 chr2R 13245955 13247656 scaffold_51 528070 529782 - 83423|1745 1746
CT
GT
>CG4984 13247655 13247852|13069 chr2R 13247662 13248123 scaffold_4 77300 77691 + -58|0 214
CCGGATATCTTTTTGA--TGGTATTACCTAATGCC---CATACTGCGACCAAAGACCAAAGCAATTGGCTAACTATCCGCCATTGCTTATCATTTCACTT----------TTGTTAT-TTGTTGTTTTCATAATGGCTGT--------ATTTAAAATGTTCGCTTTATAACTTTAAGAATCTCAATGCAATAAAGGAATTGTTTTCAGTCAGTAA
CCGGGCATCTGGTCGAGATAATGGTACGCAATGCCGGTCATATGGCGCCGCACGATCAGCCCAAATGGCTC----TACGAGATGATCGATCATCTCACTCACTACAAGCATTAAAATGTTGATGGTTTCTTGAGTGCAGCTAAAAAGCACCTAAAAAAAACAGCTT-TAAATTTAAAAAT-TCAATTTAAAAATGTAA--ATCTGAGATCGTTTA
>CG4989 13248899 13249351|13070 chr2R 13248338 13249371 scaffold_51 530276 531293 - 41039|573 1026
TCTTTGTGCTCTCCGCCATACATCCACAGAAGTTCAAAGATGTGGTGCAGAACCTGGGAAAGCTACTAAAGCCAGGAGGACTGCTTCTGTTTAGGGATTACGGTCTCTACGACATGGCACAGTTGCGCTTTAAGCCGGGCAACAAGATAGCAGAGAACCTCTATGTAAGACAGGATGGCACCCGTAGCTACTTCTTTTCAGAGGAGGAAGTATCCAAGCTGTTTCAGGAGAACGGCTTTGAGGTCATTACCAATGCCTATGTCCATCGTCGAACTCTAAATCTTAAGGAAGGCGTGGATGTGCCGCGCATTTTTCTGCAAGGCAAGTTTAGGAGGAAAAACCTGTGACCAGAGGTTAATAATCATGACCATTGTTACGTATTTAGTTTTTGTATTTATTTTAAATCAATAACATGGTTCAAGTCAACGTTCAATAAATATTTGTATG-TATATA
TCTTTGTGCTATCCGCCATACATCCCGATAAATTCGCCGATGTGGTACGGAATTTATGGCATCTGCTAAAGCCTGGTGGCTTGGTACTGTTCCGAGATTATGGGCTCTATGACATGGCGCAGCTGCGCTTCAAGCCTGGCCACAAAATTGCCGAGAATCTATATATGCGACAGGATGGCACACGCAGCTATTACTTTTCCGAGCTGCAGCTGGCACAGCTGTTCATCCAAAATGGTTTCGAGGTGCTGGACAACAGCTATGTGCATCGGCGCACACTCAATCTGAAGGAGGGCATCGATGTGCCGCGCATCTTTCTGCAGGGCAAATTTCG-----AAAGGCTGCAGCCAGCTGATGGC-ATTTCAAGTATGTATATATATATATTTTTTCTTTTAAGTTTAAGTCAATTACA------ATAACATTGTTCAATAAATATTTGTATACTTTATG
>CG4996 13258309 13258838|13073 chr2R 13254806 13258834 scaffold_16 2852937 2857059 - 168990|3621 4249
GCT----CCCCCGAACGATTATTTAA----TTGTATTTATTTTGTTATAACCCCAA------ACTAA--------------CTTTGTTAGTAGATCAATCTCAT-GACATTC----TTTACGTGTAATTA------ACATTCCGTTTAGTTCAAA----TTAACATTGTGTTTAAGGCTAATGATTCTACCTTAGTTATACAGGCGATCTCCATGAAGTACTTCGTTTCAAATTT---AGAATCTCCCAAACCCTCCTTAAGTGCAATCTATCCTATAATCTT---------TCTAATTGATAATTGGCAATT----------GGTTTACCATTCACCATGACTTAAGTACCTAGAGAAAACAGACATATATATATATATATGTACACACAAA--------ACACGTATAATTAAGATACCTATTT--------ATTTGTAATATTTATTTGCAGCAGGAAACAGACAAATAATTGTAA--AACAACT----TAAATGTA---AGGGGCAGCGTATCGATTTGATTTGCGCGCCTCCCACGATCAC----ACACC-----ATTAACTATTTAGCAACTGTAACAAAATAAC----AAAGAATACATATTTTGAGATATGCATATTACAA
ATTGATATTTTCTTTCTCTCATTTTATATTTCATATTTATTTTGTTATGGTCGTAACCATTTGCTAACTAGTTGGTCGAACCTTTGTTAGTAGCTGAATTTTGTCGGTGTTCTATATCTAATTGTATTTAGATTATACATTCCGTTTAGTGCAAATTGGTTAACATTAAGCTGTAAGT---TGATTGTA-TTTAGTAACATAAGCGATCTCCATGATGTACTTCGTTTCGAATCTGTGAATAACGTGAAAACTCTATTTAAATGCTACACGCTCTCTACTTGTAGACATGGCACAAATTTATTATTCTTATTTTTTGTAATTGGGTTTATCATTCA-CATGACTTAAGTACCTAGAGAAAGCATATACACATATACATATATCTAAAAATAGAGATAAGACATAAACAAAACTAATATATTTATTTTAATACCCAATTGTAATATTTATTTTC-----GAAACGGACAAATAATTGTAATTAACCGCGATTATACATGTACTTAAAAACCGCA-ATTCACCCAATTTGTGGGTTACTAACAGACACTTTAACACCTAGTGGTATACGGATCTGAAACTACTTAAAAATAACTAATAAAGAATACATATTTTGAGATATGCATATTAAAA
>CG5002 13268010 13268077|13080 chr2R 13266631 13268072 scaffold_4 2635966 2637399 - 55859|1395 1457
AGAACCTAGTTTATTATAAGCTGAAAGTATTGCATCAATATCACAATTATATGAAATTTCATT
CAAAGCCAAGTCAATGC-GGCCTAGAGCGTAGC----TTAGCCCAACTATTTAAGCTTACAGT
>HLH54F 13275202 13275380|13086 chr2R 13274635 13275539 scaffold_4 2642587 2643534 - 14247|650 853
---------------GCGGATATTATAAATAATGTTCTGACCTAAGCCAAATGAATTTACCACCTAGTAAGTGTATTAAATCGTGATTTAATTTTACGTGTTTCCGTATGTGCAAGCCTGAACCTATGCTATAAGGCCAAAGATTGGTGTTACCT----------CATGATCATTTAGCTAGCAAATATATCTATGTTTTTAAT
TGAGGTGCATATCTTGCATTTACTTTAACTTACGCTCTAACTGAAATCGTATTA-----------AAAACGTGATTTTAATCGTCATTCGTCATTGTATTGCATTGTATGTT---------ATGTAATTTACTAAGCCAAAGACTAGTATTATGTTTAACTTTAACAATATTACCTAGCCAATAAACATAAGCAAGAGAAACGT
>CG5009 13279235 13279423|13088 chr2R 13276011 13284970 scaffold_4 2643751 2653001 - 299959|3438 3673
ATTCATATCCTATTGCTCTGGAAGATTTTCAC-AAGTGTTATTA-------------------TTGTAAATATACATT----TGTTTCCATTGTTTTTGTATTATAC-------AACTGTCTGCTTA----GCAAATGGTCTTTAAGACAATTATGATGTCAGGGCTTGTGCAGTTGAAACTAGGCTGTAAAATTATACACAAA------------TAAAATATTCAACTATATTT
AATAGCGTGCACTTTTTTAAGGGGTATTTCGTTAACTGTTGTAGGCCTGTTATGTCGCCGTATTTGTATATAT-CATTAAAGCTTTTTCGTTAATTTTATATTATTTTGTGTGGAATTGTTTGCTGAAGTTGTGTTTGGTACTCGAAGCACTTTTGTTTTTATTAAT-ATCTGGATTGATCTATGTCG----ATTGTTCTCAAAGTTCCTTAATCCTTAGATATTCATCGAGACTT
>aft 13303277 13303430|13099 chr2R 13301190 13303328 scaffold_4 2669862 2672099 - 72515|2206 2258
CATAACGAACATGTATTTCTCACTTGC-ATCAAATTACAGTGCTACTTTTACA
-ATTATGTATACTTATTTTTAGGTTTCTAACAGATGAGATTTTTGTTTACATA
>CG5033 13307221 13307320|13101 chr2R 13304565 13307298 scaffold_4 2673513 2676240 - 144283|2696 2775
TTTAGGTGTACAAACCCCAAGAAAGTTTCTTTTAGTTTCCGAAAGT-TTTGTGAAATTTCA-ATAGTAAATAAAAAATAT
---AAGCGTGCAGCTTGTTGCACATCTAGTTTTAAGCGCTCAATTTATATGTGAAAGTTGAGATAGTGAACAATATATCT
>CG5036 13312633 13313008|13112 chr2R 13312174 13313263 scaffold_607 3933 5123 + 22443|464 961
AGAGGATG-------GCTTGATGTCCCGGATCGGATTTGGATTTGGATTTGGATCGAATTCAGTTGCGCTGTGTTGACTTCCGCTGTTGCTCTCCACTGGTATATCTCTGATTTTCCGCCCCAATCGCTGC-TGCAATCGACT------------AAGCAATATGT-----------------ATCCATTAGTAGAACCATTTAACCATTTTGCGAGCAG-------------------CCACGAAATCAGGATCCTGGTTGGGGCCGGTGAATCAGACGT-CGTGCGT-------------------------------TCAATGTGAATCGGATT------------------------------CCTTTCTCTTCCT----ACGTTCTAGTCGTTAGCTAACCAAAGAGTTAGGTATTACAAAATATGTTTTCACTAAGAAGCAGGTTCGACCACAGAAAGCATTTTCCAAAACAACCAAAAAAAAACAAAAAAA
ATGTTATGTTATCACAATTGACGTTCTG--TTGATTTTGTTGTTGTCTTAACATTAGACT--ATATAATTTTTTTTATTTATTTGATTTTTATTTGCCGGTTAACCCCGCAGCTTGTCCACAAACTGTTGCGCACAGCTGTCCCAAACAAAAAAAAAGCAATATGTCATAAAAACTAAATTGAATCAATTCCAAAGAGAATTTATATATAAAGAGAGCGGGACGGCTGGCAAAAGGGCAACAACAGTTCAGGATAC-GCTCGCGG--AGCTAACCACATATACATATATATATATATATATATATATATATGTATATATATCTATATGGATATACTTAGATGATATATGATGATGCATTATGTGAAACCGATTCCTTCTTTACAATGTTCTAGTCGTTAACAAACCAAAA-----------ACAAAATA-----CCAAAACTAGGCAATTTATA-TACAAAATTAGTTGTT-------AACAAAAAAAAAAAAGAAAA
>grh 13355629 13356476|13170 chr2R 13355792 13356967 scaffold_4 2733123 2734543 - 15081|0 863
ACACACAAATTACGGACACAAC-----------AAGTTGTTTCAATAAGCCATTTTCC----ATAGAGCCTAAGTCTAAATATCGTAGTTATAATAATGGGATCCGCAACAAATCGAGTTGCAACGAATGT-----------TAAGAACGCTAACACAATACGCATGTAAAATGATAC-----------TTTAAAATTGATTTAGTT--------ATTTTAGCAACAA-TGAGATTA---TCTAAAATTGTTTGATCAAATTTTACATTCTCGCTATGTCTATAGAT---AATTCTAAGCCCGTAAGCCCATAAGCGTAATCGTAA-------TCGTAATCG--------TACCGTGTATTTATGCTCATATATAAACAACTATATATATATATATATATATAT----------------ATATGTGCGGAGTGCAACAGTGTCTGTCCAGTAGGAGATAAGTCTCGTTTCCGCTCCCCTGCTTATGCTATGACCTTAGGTCCAGGGCAAGTATG---AGTTACCGAATCTATCTATTAGGTGCATCTAACGAAAGGAATCATTAGCTCTGCACGAACTCTAGCCGTAGCCTATTGTAATCCATTTGTATGTTTGGCTTAAGCGTTT-TACTTGTTGAAT---------ATAAAGTGTAAAATTATTTTTGAAAAAAAAAAACCCACACAAAACACAAATCGTTTGTTCTATATTTCTGTTTCAAAACTAACTCGTTACCCAC-------AATCCCCTCTGTTATGT----------------------------------------------------------------------------ATAATTAGGATCTCTGTACAC
ACACACAAAATGTGGACACAATTTTGCTAACAAAAGTTGTTTCAATAAGCCATTTATTCAAAATAAATCATAAAGCTAGACTAAGCGCTCAATATGAATACATAAAATATGAATATACTTATAATGCATCTATATATGTGTGTGTAAAACTGAACAATATACGGA-ATCGAACAATACAATATTTGTAGTTGTAAATTGTTTTTGGTGTTAGCTAATTTTAGTAACAAATGAGATTACACTTCAAATTCTTTTAACCAAATTTCCACTTCTCGCTATGTTAATATATCTAAAAGAAAAACGAATACAAACAAAAAAAAAATTATAAAAAAATGCTGTAATTAAGTGAAAATATCATCTTTATGTATTTATAAATATATAAACACACATATATATATCTATATATTACTTATGTTAAGACAACACGAATAGAGTGCAA-AATGTCTGTCCAGTAGAACGCCAG------------------------------ACCCTAGGTCCATTCCAGATAAACAAAACTCCAAAATTTCGCTTC------------------GAAATTTTATTTTCAGAATTAACCCTATTT-----CAATTGTGCTCTATATGAA-GCTTGTCTTAAACATTTCTTATTGTTGAAATCGAAATAAATTAATTGTAAAATCAATTCGTAAATAAA----------TAAAAAACAAATCGTTTGTTCTATGCCCCTG-----GAACTATCTGCCTGCCTAATTAACTAAAACCCCTTTGTTACTTGTGGCTATATAATTATATGATATATATATATATAAATATATATTTTTTGTATGAAAGTTGAATTATATGCTTAAAAATAATTAGGATCTCTGCTAAA
>olf186-M 13363060 13363307|13178 chr2R 13362240 13363344 scaffold_4 2741749 2742991 - 36096|914 1216
AGCCC------------TTTGAATTCTTAGCCATACAACATAAG--------ATAGTCAGCC-AAATAGAGGACTTTCGCTTACGTTAA-TTGTTG---------CCAAGCGGG---------GTTATGGGTGACCTTTGACCTGTGAC-CCATGTGATCATCTTGTCTTGTCCATTAGTCATTACAAGTGCCGCGTACTTAGCTGT-TTAACTGT-----------ACTATTGTATTATTATCAACTATTGTGAACT-TGTTTTAAGCA-TGTATTAAAGATGATATTTTATGAGACATTTT
AGTTTGAAGCCGGAGTATTCCCATTCCCATCTACCTAGTATATGTATATCTATTGATTAACTGAAATTGTTAGCCCTAACTTAAGTTAATTTGTTAGACAGCCCCGCGAGCGGGTATTTACCCGTTTGGAGGGGCTTTTTATTTTTATTGTCATGTGAT--GTTTATCTTGTCCATTAGCCTTTAGTTATGCCGCGTACTTAGCTTTGTCTATTGTTGTACCTACCGATTGTGGTTTTATTTTCTAGCATTTTAAGCTCTCGATTAAGCATTAAAACAAAAACAAAATT-------GCATTTC
>olf186-F 13374658 13375433|13192 chr2R 13374080 13374781 scaffold_4 2758355 2759125 - 34606|583 780
CATCACTTGGCGTATCCGCAC--------------------------------AAGTGGATCGAACGAAAAAGACAGC----------------------------------------GGCTCAGGGT--AAGCTTCAGATTATTTTTAGTGAAACACACATATTGTAAATTTGTAGTTGATTAAAATTGTGATACGC
CAGCA---GGCCAAACCCAACAACAAATGCTTCCCCTCAACAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACGGATAACAAAAACAACTTTTGTAAAAGCTAAAAGACATATTAGCCCCCCCGCCGGGGGCCCAGAGGAAAAACTTTAGACTACATCAATTG---TTCAGA-ATTGTGAATTTGTAGCTAATGCAAATTGTGATACGC
>olf186-F 13374658 13375433|13193 chr2R 13374782 13375071 scaffold_26 1374999 1375303 - 1441|0 312
GGAATTCAGTAGATTTCTACTATATATATATATATATGTGCGAGTGCTGCTGTAGTCCTTTATTTTACT--------TATGGCAATTGCGGATTAGCACGGATATTGACAATGATAAAAGACCCCAATTAAAGCAATACTTCGGATGAATATTCCTCAAAAAATTAGC------TGATATTTGTTACATATTTATATT-------GCGTGTATTTTAAATTGTATGCCATGCCGGA--TTTTCTTTTTTTGCAACCATCCTTAGGCAGTCTTCCCTTTTTACGTTTAAGACACAACTTGATTGTCAAATTTAA
GGAATACAATAGATCTTGCCTATATATGTATATGTATGTACTACTGGAGCCGAGTTCGTTAGCCTCTCCGTCAATGATATAGC-ACCGAGAAATGGGACTTGTAATGAAACTGATATAAA--TATATTTATATGTATATTTTATTTTTTTATTGTTATCAACACTGGCAAAAAGTGCTCTTAGCACAGGATCTGCGTTCCTGCTGGCAAACAATTTACATGGAGTTTCGTTTTGGGGTTTTTTTTTTTTTGGCAATAACATTATTTAATTATA-----TTAGTTGTAATATAAAGGTTGATACCCACACTTAA
>olf186-F 13374658 13375433|13194 chr2R 13375210 13376076 scaffold_4 2759126 2760056 - 12350|0 247
AGAATGCAAAATTTTAGAGACAATTTGATAT---ATTTTATATGCAACATAAAACAATTGTAAAATAAAGTATTTGAAAATGTACTGCAATATTTATATACGAATTATATT-----CATAGGTATTCCAATAGTTTTGGAAAATATAACAGTCTATTTTC-GATCTTTACCGATGTAAGCTAAATAGCGCTGTAATTTATATACGAC-------TGATTAAACG----ATTTTT----ACTACATACA
ATAAGGCAATATTATATATTTTATTTTATTTTTTATTTTTTTTTCTACTTTACATA--CGTTACATACA-TACATGTAGATATAT----ATATATATATAGTATTTGTACGATCCGCGCATGGGATCCA---GTCTACATATATATGAGCCTCCATTGGCAGGCCTATGTCTAAGC--GCTAGCTCGC-TTCTAATTTATACATAACATATACTTAATTAAAGGTCTTATTTTTCTAGACAACAGAAA
>elk 13440284 13440455|13268 chr2R 13438437 13440287 scaffold_4 5298974 5300970 + 75263|2032 2035
GCAG
GCGG
>elk 13440284 13440455|13269 chr2R 13440294 13440392 scaffold_4 5301126 5301223 + 5911|0 98
GGAGTCATTCGCATGCAAACCGCCGTTTCGTGATTTATGTCCTAATTAATACTGAAACACAAAGACGCTTGTACATTTATTATCTTTAAGATACCCACA
GGATTCATTTACATGCATGCCGACGTG-CGTGATTTATTTGCTAATTAATACTGAAATACGAAGACGCTTGTACTTTTAATATCTATAAGATATCAACA
>CG10910 13537175 13537269|13398 chr2R 13536412 13538033 scaffold_4 5445095 5446719 + 12843|787 881
ACTTAAAATGTCGCGAAAAGCAAACCTCAAATATTAGGGGATATGGTCAGTGGACTAAGCTTTAGGCCAGCAAATAAATAAACTTATCAGCATTG
------AATGGTGCCATAAG-ATGCCGTTGATGTGACGGCA-ACACTTTTAAACTTAAATGTTTAACAAGCTAAATAATAAATTTATCAGCATTG
>CG5098 13615072 13615976|13505 chr2R 13610452 13615119 scaffold_4 5546392 5551377 + 115051|5177 5224
GTACGCGTGCGCGTCCAGAAATGCCGCCTGGTCGCCAAGCGTTGAGCG
GTACGCGTGCGCGTGCAGAAATGTCGCCTAGATGTCAAGCGTTGAGCG
>CG5098 13615072 13615976|13506 chr2R 13615314 13616518 scaffold_4 5551802 5553000 + 21758|0 753
TATCAAAGCGTTTGCCACGTTATAGTTAGGTTCCCTTCCCCAAACCTTTAGTTG------TTTATGTTTAAGATACGTCCTAAATTATTTTTTCGCATAGTCCAGAACTTTACA------TTAGTACCTTTTAGTTCTAACTAATTTTAAAACCACCAGCCCATGTCCTATGCCCACCCATCTGCATCACACATACGCCTCTTGATAATTCGGTTTAGTTGAATTCAGTCTGTTTGTATCAA-CAAATACTCCATGCCATACCGAT--ATTCAACTGAGTAATCAAGGTAACTGAAGTAGCTATGGGCGATTCCAATTGATATGTATATGCGATGTGAAGTTGCAGTAAAACAACTTATA--------AATAGAAAATGTTTGACACCAAGTAAGCG-----------------------------------------------AGAACATTCGAAGCCCAATTAAAAATGGAATATTGTAAAACAATATAAT---ATGCATATAAGAATATTAGTAATGTTTATTTAAGTGAACAGTTAAAGCCAGCAAAATGAAACCTTGTATTGTATTCGTAATTCGGTAAGGTCTGTACGTATTGCTGATAATTTTAAAACTCTAAAACGTATAAACAATAAAAACTTAATCTCAC-ATGCAACAGGAGGGCGAACTT----------------GTTCGGGTTTTTGTAAATTTTTTCGTTTTATTTATCAA-TAAATATGCAAAAATATACACACACAT
TATTAAATAGGTAATTTAGTTGTAGTTATGTTAACAATGCAAATACTTTACATAGCCTGTTTTACGTTT----TACTGCGCA---TATCCTTTTGC-TGATCGAGCACCTCACAGATTGTTTATTTTATTCTTGTTCATGCTAATCTT--------------------------------TTTACTTTATGCATATGCCAATTGATAATTTAGTTCAATT--------TTTGTATGTATAAAACGAATACTCCATGCCATAACGTTTAATTCTATTTA-TAATGATAATAATTATAAT-------GATGATGATGATGAATATATATGCATTGTGCACAGCATTAATTAGGCTAAGCATATAACCACAAATAGAAAATGTTTGACACCAATTAAAAGCAAAGGCAATATCGAAAGGCTAAAAAATAAAAAATGCAAAGAAACAAACAACATTCGAAAACTA-TTCAAAATGGAATATTGTAAAACAATATAAATCAATAATAATAATAATATTAGATACATGTA------------------------AAAGTAAAACATTGTATTGTATT-----------------TGTATTCATTAATAATAAGAA-ACAATTCTAAACACTTTAAACAATAAAA-CTTAATCTCACCATGAAACTGCATAAAAAAATCAACAACAACAACCAAAGAATCGTTTTCAACAAATTTCGTCGTTTTATTTATTAAATAAATATAGCAAATTCAATAGAATATT
>Spn6 13642995 13643082|13527 chr2R 13642658 13643088 scaffold_4 6291756 6292192 - 16398|352 439
AAGCCCATTTCTCACTTCTTTCGTATTGTTTGTATTGTTGTTGGAAAAGTATTTTTAAATAAATAAGCGCTCCATGATTAAATTACCC
AA--TCATGCGGAAGCCCTTTA--ATTTATTATTTTGATATTG----ATTTTGTTTAAATAAA-AAGCAATGGCACACAAAATTACTC
>Dip3 13644869 13645111|13528 chr2R 13643308 13645260 scaffold_16 1183883 1186033 + 39980|1826 2081
GGCGTCATAGTCATCATTCTATACGTACAATTCTCGATTAGTATCCTTAGTGGTAGACAACGCACTCGAACACTTCCCACACTCCCCCTTCATTTA-TGTATTTACA-TACTTGCAAACAACTTGTAACTCTACGTTTCGAGTCCTAGGCTAAGGTTCTAGGTTAATTTGAGGCGATATGTGTCCATA-----------GTCCATATCTCTTTAGTTGTATCAACATTGAGTCGAATAAAATTATGCACAAAACAA
----TCTTACTTA-AATCCTGTCTCT----TTCTC--TGGGTATTT-------------ACGCATACGAACAATTCT--AAGTCACATTAAATGTATTATTTTTACATTATATGCAAAATATGTAGCATTTTCTAAGACGCTATTTAGATTAAGCTTTCTACATAATTTAGTTTTTTTTATTACAGTACTGTTGTATGTGTCCATATCTATTCAGTTGTATCAACA---AGATAAAATAAATTATACACACATTCA
>Pcl 13654100 13654323|13534 chr2R 13652515 13654848 scaffold_16 1194021 1196686 + 79515|1825 2063
ACCCTTTGGCATACCGACTCATTATGAATT--TTATATTCTTCATTTCCATTATCATTTCTTTTCG-TTATTATGTA---TTAATGAACGCTGCCAA--CTACGGGCC----TCTTTATTTGTTAATGTTTAAAAGTTTATTACCAACCCACTGCCAAAATAGAAAAAGATT---GTTCAAAATATTGGTTCAGCATTAAAGCGATAAAATGTTAAATTGTAAAAAAAAAAAACGAAAA
G-ACTTTGGCACATGATGCGTTTACTGATTACTTATTACTTTCATT----TTATGGTATTTTCTCATTTATTGTTTAAGCCGAAAGTTTTCTGCCAGGTTTTTGGGCCCAATTTTTGTTTTGTTAATCTTTAAAA----------ACGCCACTGCCAAAATAGGAAAAATGTTTAGTACGAAATGTT--TTTGGCATTAAA----------------------------------AAAA
>pAbp 13660084 13660137|13538 chr2R 13658243 13662033 scaffold_16 1200673 1204706 + 140412|1948 2002
GCTCGAACAGCTCAAGCGTATGAACATTTTACA-AGAACACTTTACACCCAAAAA
GCTCGAACAAC-AAAGCGGATTAAAATTTTTTATAAATCACTCGACACCCAAAAA
>pAbp 13660205 13661101|13538 chr2R 13658243 13662033 scaffold_16 1200673 1204706 + 140412|2084 3211
TTTTCCACTAAT-----CTTTCAAT-----ACATGAACAACAAA-----------------------AATTCGCATTCACTGATGCTT------------TGCGCAGGGGAGGAT----------TGCCA-----AGGACACACAATTAAC---------ACAGAAAAACAAAGCGAAAAATCTA-------CGGCTTTTTCTTTTCTAATCCCAGAAACATCA-ACAAAAGCAATTTCAATCATTTAATTTCGAACGCATTTACGCAAGTACACGAAGCAAAAGAAGAAAGTCAC---------------GCAATCAAATTCTGCAG------------TCCACTTATAAATTCTT--TTTTTTTACATAAACATGTT--AATTAAAAAAAAAAACGGAAAAATGTGAAATGAAAAAAAT----------------------------------------------------------------------------------------TTCGTTATTGCTTTAACTGGATCGATATTATTTTGTATGCGTATAATGAAAACACCAAAAAACCATTGCAAAATAAACAGATTAAAGCAAAGCATACATGTAAACCGCTTCTTGCAAGT-ATTGAAATTGTGTTTTAAAAATTTTAAAGAAGTTTCTAGTGTTACAT----------------ACATATTGA---GTTTTTCGTACACTTTTTCCATCCACA-CTTTCAAACAA-----CAACAAACACGAAAGCGATATGTAATTTTTTTCAATTCTTTTTTCTCAAATTCAAACTTTAAGAAAGCTTTGTTTAGAAAAAGAAACGCGACAACCATACACTTTTAAAAAAG----CAAAGAAAAAACAAAAAAATTGCAAAAGAGTTA----AAATAAAAACGAAAAAATG-GAAAGCAAACTGTGCAGAGAACAGAAGAATAGAAAGAAAGAAAGAAAAAGAAAACCGCAAGAATATGAGAGTCAAGTTTTTGCTACTTTGAAAAAAGAGAGAAAATACAGAATACCAACAGCTGAAAAAATATGTTGACAAATGAAAACAAAACATAAATCGAAAAAACTACAAAAAAATGGCAAAACCTATGTAAAAACAGCAAA
TTTTTTTCCCACATTCACTTTCAATTTTAAAAATTAAAAAAAAAAAAAACACTTAAAGGAACACATGAATTCGCAT----TGATGCTCAAGCAAAGAAAAAACGCAGCGAATGACACAAGAAATATAACAAGAATAGGATGAACAATAAACTTGATGGCTAAAAGAAGATGAGAGGAAAACTCCAAAATAGCCGACTATTTACTCTTTTCCGTTAGGGCAACGACATAAAAACAATTTCAATCATTTAATTTCGAACGCATTTACGCATGACCACAACGCAGAGGAAATTAGCTACCTGCTTACAACAAAGGAAACAAAATGCATCAGGCGCAGATGTTTTTTATATATATATTTTTCATTCTTTTGGATTTTCAAACTAAAATGAAAAGAAAAAAAAAAACAAAACAAAATACGAAAAATATGTACGTTTAGAAACATTTTATATACATATTTTTCTCTGTGTATGTATATATATATATATATATAATATATATATATATTTTATTTATTTTTTTTTGCTTGAACTGAGATG--TTTATTTTGTATGCGTA----------AACAAAA------TGCAGAATAAAT-----------AATTATAAATGCAAA-------TGGCAAATAATTGAAATTGTT-----AAGCCTGTCGGCAAGTTTCT--TGTTACATCAACACAACAACAAAAACAAATTTAAATACTTTTCGTACGCTATTATACTACACATCTTTCAAATGAACATCCAACAAACATGAAA-CATGATGTAATATTTT----TTCTGTCATTTCAAA-------------------------AGAAAA---------------ACCTACTTTTAAAAAAGATGAAAAAAAGAATACAAAAAAATTGCAAAAATGTTAAAATAAATAAAAACGAAAAAATGTAAAAGTAAACAG----GAGAGATATAGAGCAG-AAGAAATATACCAACAACCAACCGCAAGAATATGAGAGTCAAGTTTTTGCTACTTTGAAAACCAACAAAAA--TCAATATGTTGAGAAAAAAAAAATACAATTTTAAAAAAAGAAAAATATAAAAACTAAAAATCTTACAAAAAAATTGAAAAATCGATGTAAAAAATACAAA
>CG10914 13675034 13675173|13546 chr2R 13673025 13675085 scaffold_16 1216433 1218616 + 65735|2166 2219
AA--AACAAATTGTTTATAAATTGTAAATAAATACAATTGTTTAAATTACTTAA
CGCTGTTACATTTTAACTGCATTGTAAAGAGAAAAAAAAACCAAAATTAATTAA
>CG10915 13678389 13679077|13549 chr2R 13677586 13681910 scaffold_16 1221029 1225230 + 109773|819 1559
ACACCTACACTCAGACTTACATTAATAACCGATATTGGGCGTAGCGATAAGCGAAATACTCAAGCGGC-GTAGTCCCTCGGTGACCGCGCTGGGCAACAGGATC---CTCCATCCCGAAC---TGACAACTTTCATGTTCTCTTGTCTT-----------------TAAAATGTTAAAAT-TTTATGGTCGTACATGTCTTCATTTTTTTTTTGTTTATTGTGATTATTCAGTTTAGATTGTA-GCTTACAAAAGATTTCAATTTAAAAGTCTCTTTTATATATACTTTGATATTTACTCATTTATACAATCGACTTCATTGTCAGTTCGAGATTGGAATCCTAAAAAGTAATCTAAAATCTTCT-TAAAAGTGAAAAGGATGCGATT-----ATTTGAGTATTTTCTGTTGCCTAGC---------GTGATTTGGCATACAAAACGTTTAGGAGAGAAGTTTGTTAAGAATT-----AGAATGATAGTATACAGTGCGACTCCCCCCCCAGGCGGCCTATCGTCTAAGTTTGGTTTAGTTTAGTTATTGTTTTTTACCAAGCGAACGATACATTTTACAATGCCGTTGGCGGTCCGCGGGCCAAGCCAAGAGACAAGCGACTTTAAATGTAATTCCGTACGTAGTAACCG------AACATTTGTACAAGGCCGTGCGATTCTCATAACAAGTAACAGCCACAATATATGATAATTATATACATACCCCACAGATATATA
-----TGCTGTGGCGGCTACGGCAACCAC-AACAACTGCCTCCTCGACAAGCGCAGCA-----GCAGCAGTGGTA--TCGGCGACTACG--GCAAAACATAATTAGACACCTTCCTAGACATCTTTCGACATACATATATACGCGCATTATACCATATAGCATATAGAAAAAGCGAAAATACTCAAAACCGAATATAGCTCCACACAATAATTGGCCGTTAATACTACTTA----AGAGGATACACTCCTTCTGGAGCGTAAGTAAAAAGT-------ATAAATTCTTTGACCATGCCAAACTCAGACAGTCAAGTAC-------------GATTTCTACCCAATTTACTCATATAAATATTTCTATGAAAAAGTTAAGGATTTATCTTTGAAAGTTGAGTCCTGTGCTTTGATTAATTCTGTTATTATATTTTGTTTTACTATTAGCTTTGCAAAGC--CCTGCAAAGAATTTAAGCATAAGAAAATAACAAAGTGCT-------------GTAGTTTTTCTTTTAA------------------ATTGCTTT----CAAGTGT------CACTTAAAAGTGTTTTCATTGTTTCCCGTTTCCCCGCGCTAGAT------TTGTGTATGTAATTCCGTGTGTAGTCGTTAGTAAATAACATTTGTACAAGGCCGTACGATTCTCATTATCATTAAAAAGGAAAATATATGA----------------------ACATATA
>MED9 13682801 13683001|13552 chr2R 13682611 13683819 scaffold_4 4798862 4800090 + 21693|191 391
GCGGCAGCAAAATAAAAAAAAGGGCAAGATGGTGCTGCGACTGCTAATGCGCTACCTGGCCAACAACGAGCAGCTCATCCAGCGCATGGCGGAGAGCTATCCCATGAGACGCGCTGCCCAGTTGGTCGTTTCCCTGATGTACCGCACAAAAGACTTGGCCCGGGAGCAGGGACTGCACGAGATGACGCCAGAGCGTTTCAA
GATACACACTCACACACACACTGACAGGATGGTGCTGCGACTGCTGATGCGCTATTTGGCCAACAATGAGCAGCTAATACAGCGCATGGCCGACAGCTATCCGATGCGACGCGCCGCCCAGTTGGTTGTCTCGCTGATGTATCGCTCCAAGAGCCTGGCCAGGGAGCAGGGCCTGCACGAGATGACGCCAGAGCGCTTTAA
>MED9 13683071 13683243|13552 chr2R 13682611 13683819 scaffold_4 4798862 4800090 + 21693|461 633
ATCCTTCGTTAACATGTTTAAGAACAACGTGCGCCAAGAGCTGGAGGGAGTGAAGAAGGAGCTTAATAGCAAGAAAAAGAACTAGGGTTCAGTAATTAACTTGTTTAACTACAATTGTATATACGCGGCAAGATAAATTTTAGTAAACACAGATGAATAAACATTGAAGCCAG
GTCCTTTGTGAAGATGTTTAAAAACAATGTACAGCAGGAGCTGGAGGGCGTCAAACGGCAGCTGAAGAATAAGAAAAATAACTAAATTATTGTAAATTAC-------ATTATAGATATATTTATAGG------------CTAGCAACTTCAGGCACATAAACAAAATTTCAAG
>CG10916 13689465 13689553|13555 chr2R 13688686 13690322 scaffold_50 368894 370502 + 16130|797 895
TGCTGCTGATATCTTAAATCTCTTATGCCTTATTGTATGAATCTGTGTTA--------TAAATACATATGTACGTCTTATTCTATT--TTTGAAAAAAA
ACCACCTG-----TCAAATCTCTTATAGTTTAT------GCTCTGTGTTAGTTCCGCCCGGGTGCG-GTGCATGTCTTAATATACCAATCTATATTGTA
>CG5140 13697243 13697844|13560 chr2R 13695491 13698969 scaffold_4 1210445 1214037 + 125380|1833 2497
---------------GTCCACAGCCATGTGATCATAAG---AGACTGCCCCAGTTGGGTATTAGCACGCGATTGGTATTGAGGATTGCCGATTTTGT----------------------------TAGTTAGCCAATGCATGAATTAAGCA-----------------ATAGTAATAATTTAGCAGTAAATATATAAAAATACAAAAGGCATATGTGTGTGCGATTAGGCGGCAATTTTTTTCTCCGCCGTGCCCGTCCATTCCTCGCGCAAGTGGACACTACAGCCGAGGTCGCGCAACGCCGCCTTGATGTCCTGCTCCACACTGGGGTGCTCCTTCATTGCCATATTTAGTAGATCCTCAACGCCGAAGGAGATCCAGGTTTCACACTGGTTCCGCGACCGTGACACCATATTGCGGATGGCCCACGCTCCGTTTCGCTGGACTATCTTGTGTTTGGGATGGGCGCGAAGAGCCTCCACGATTACTTCGGCGATGCCGGTATCGAAAAAGGCGGCACTGTGTTCCTGCACTCGGAGTGTCAGAGTAGTCACGCAGGCCAAAGCGGCGGCAACGATGTTTTCATTGGACTGGTGCGTCTCTAGCAATTGCTTTATTATAGGAGCCACGCCCTGCTGTACTATATGTGACTTCACGGAGTCTTG
CCAGTGCGAATTGTTGTTATAAGCCAAAAGTGTATAAGCCAAGACTGCCTCAGTTTCGAATTATAGTTTG-TTAGCATAATATATAGATGAATTTATAGATGAGAACCTTGTGTGAGCTTCCGAATATTGTGCTGTTGCATTAGTTTCGAGTTTGTGTGTGTGTGTGTATGGAAATAAGTTAGCAGTGAATATAAAAGTAGAAATATGTGGTCCATGTCGCTATCTATGCGGCAATTTTCTTTTCCGCCGTGCCGGTCCACTCCTCACGCAACTGCACATTGCAGCCAAGATCGCGCAGCGCCGCCTTAATGTCCTGCGCCACTGACGGATGCTCCACCATGGCCGCATTGAGCAAATCCTCAACGCCATAGGATAGCCATGTTTCGCATTGATTGCGCGAACGTGAAACCATATTACGTATGGCCCAGGCGCCGTTGCGTTGAAGTATTTTGTGCTTGGGATGCATGCGCAGCGCCTCGACCATCACCTCGGCAATGCCCGTGTCAAAGAAGGCGGCGCTGTTCTCCTTGACGCGCAGCGTGAGCGTTGTTATGCAGGCAAACGCGGCAGTCACAACGTTCTCATTGGATTGATGCGTATCCAGCAGCTCCTTAATAATGGGTGCTACGCCCTGCTGCACTATGTGCGCCTTGACCGCATCATG
>CG14500 13704426 13704517|13564 chr2R 13702447 13704599 scaffold_11 3436538 3438611 - 6008|2101 2203
GTAAATTCAGGGGGCCATAATTGTTCGTTTTTCAATAATTATAA----ATTGTCATA-ACTAAAAACTACGTT---TTAAATAAACT---TGAGCAACTTTTG
GTAAATTAAAAAA---AAATTTGTTCATTG---AAAAATTAAAAATGCATTTTCCTAGACCCTAACATATGTTAGGGTAAATAAAATATATGATGAAGCTCAA
>CG30114 13723118 13723161|13591 chr2R 13722733 13723636 scaffold_4 418738 419754 + 23741|446 489
CATACAATGGTATACGGGTGTACAATGGCGATGTGGGGATCGCG
--CAAAATCGGCCTCGGTCTCAGACCCACCGTGCAGCCCGCGTA
>fj 13750725 13751177|13625 chr2R 13748349 13750735 scaffold_4 450898 453582 + 84898|2788 2798
TGAATCGATAG
TGAAACGAACG
>fj 13750725 13751177|13626 chr2R 13750840 13751384 scaffold_4 453725 454400 + 4570|0 417
GCTTTGTCGAGGTTATATATTTTATAAAGGGGTTCTAGAAAATTGTTATTTTATAAATTG---AAAACTTAAAAATG-----------ATAATCATTGGGAGTCTTTAAAAGCATA-----TTC--GATAAGCCACTGACCCAAGGAGATCCGAGTATTAAGGGGTGATCCACTAGAATACCTATCTTGTAAATGCCAGACTCTATCCATGAGTATTAAGCTTACCTATCAGTAAATGTATCTGTATAAACTAAG---CCTAGCTAGCGTTA---ACAATGTGTGTGATA-TTTGTCTAAGGAACCAG-------------------ACTAAGTAGATTTCATTTTACCTTTACAACCAATAAACC----------------ACAAATATACCGAACGA-----------------AA
GCCTTGTTAAACACACATGCTTATTAA------TCTAAGTGATT-TAACTTAATCAAATGCCAAATGTTCACAACTGGCCCGGCTCAAATAGTCAATAGAAGAAGAGAACAGCTTAACAATTTCCATATAAATCGGTGGGCCAAG----TACGAGTATTAGCAGGACATCAGATC-AATATCTAAA--GCGAGTATTAAGCATTAACTTTCGCAATTAAGTTCTAGCGTTAATAATTGTTTTATTTTTAATTCCATTTCGTATTTAGTTTGAGATACATTTGTTGTGATATTTTGTTTAAGCATTTAGTGAAAACTAATTTCTAATCTGTAAGTAGATATCATTTT--TTGTATAATTTATGGGCCATTTTCCTTAAGCGAAACAAATAAAAAGAAAAACCACAAAAAAAAAAGCCAA
>pen-2 13792933 13793016|13687 chr2R 13792092 13794719 scaffold_4 506638 509532 + 44769|855 991
ACATAACTAGATTAATTCGTTAGCAACTAATGATATTAAAAAAG----------------------ACTTCATTCCTA----AACAAAATTAACGTTT-------------ATTATT--------------AATCCA
TTGTATATAAATATATATGT-ACTATATATTAATATTAAAAGGATATAATTTAACGATTGATATTAATTTAATACACATACTAATAAAATTATCATTTGTATAACATTTAAATTATTGGCGCTTACCTTAGAATCCT
>CG14502 13809461 13809576|13697 chr2R 13808497 13809462 scaffold_4 524065 525040 + 10216|998 999
TT
TT
>CG14502 13809461 13809576|13698 chr2R 13809463 13809658 scaffold_4 526386 526628 + -1887|0 168
T-----------------CCACGTGGGCGATCACTTAAATA-------------------------------GGTATTATCAAAAGTACCTATGTATATTCCTATTATAAAG----CACGTAGAGAGTAGTTG-ACATAAAAAGCAATAA--ATGAAGCATCAAAGACA
TGGTTAAGCCCAGAGACAACCCAAGGGCCATGGCATAAAAAAAATAATATGCACAGTTATCGAAAGAATTAGGTTAGTTTCAACAGTATCTATCCGTAT--CTAGCCGAGTGGTTCCAAGAAAACACAAGTTATATTTAATATACAACAGCTCTGCAATTTGAAAGTTC
>IM1 13899093 13899251|13823 chr2R 13898883 13899267 scaffold_4 5737486 5737851 - 3142|216 374
GAAGTTTCAACCCAAGGATTCGAAAAAGGACATAGTCTACAAACTAGAACACAAAAGCTGTTACCATTTTTTACTGGAATAATACATAGAATTAAAAATGCAAATCAAAGAAATACATACAAATAGAGGATTCTATTTCCTTTCTAACTAAACAAAAGA
A-----TTATTGAGAGAACTTACATAAATACATAACCAGCTA--TTGTTTAATATATCTGTTTTTATTTTT------AATAAAAAATA-AATTAATGTTTTTATAAATATTTATATATATATATATATATTTGCAAATTACTTAGGCATTAACATAGTA
>CG18107 13899702 13899781|13825 chr2R 13899397 13899902 scaffold_4 624427 624895 + 2819|307 386
AAATTTTTAATCAAAACTTATATTTAGCATCATAATAAAAATGTAATAAAATGAAAGCTATATTGTAAATTGTATTTAAA
A-------TACCAATCCCTGGAGCAGCCACAGCCACAAAAATGCAAT-AGCCAAATACTCTAGTTTAAAATGTTTTCCAT
>IM2 13901736 13901898|13828 chr2R 13901025 13902409 scaffold_4 621778 623174 + 6004|770 943
GAAAGTAGGAAAGTAGGAAAGTACTCGCCTTAATTTCGAAGATGGGCCAAAACTTACCTCAAATCCAAAGCACCATATTTATACTCTCACTCTTGTACTAAAATGAAAACTAGTAGT---------AAAAAATACATCGCCAATTACAAATAAAATGGTGA--AAAAACAAAAC
ACGAATCGAACCGAACGAA-----TCCCGTTCAGCTT---------CCTAGCCTTACCTCAATCCGTTGGCACCATATTTATGTACACACTGCGTT--TCAAATTAAACTTAGCATTTAAATAATGATAAAATAAATCAAC--TTACAAAAAAAAACGAAATTTAAAAGAAAAT
>IM3 13903239 13903370|13829 chr2R 13902739 13903898 scaffold_4 624205 625520 + 4285|540 714
GGGCAGCGGAGAATGAAGGATGCCAGT---TGAAGTTCACACAGCCACA-------------CATATTTTTAAGTCGAAAATG---------TAATAGAAATTCCT---------AGAATCAAGTGC-----CCATATTAAATATATTCCAAACAAAA----CAACATATTATT-
AACCA-------------GATACCAATCCCTGGAGCAGCCACAGCCACAAAAATGCAATAGCCAAATACTCTAGTTTAAAATGTTTTCCATTTAATATGCATTTATTATAAGTACAACAACAAGAACCACAACAAAATCACAAAAAATCAAAACAAAATGTTTAATAAATTCTTA
>CG16836 13904260 13904321|13830 chr2R 13903899 13904299 scaffold_4 625782 626169 + 3789|370 410
ATTACTATGTAATCAATAAGT-TAATAAAATAATATCTTTT
TTTTCTGCATAAATACAACATATAATTAAATAAAATCGCTT
>CG16836 13904260 13904321|13831 chr2R 13904300 13904662 scaffold_4 5740709 5741141 - 1183|0 28
ATTTCTCAA-------AAAAAAACCTTAA
ATTATTGAAAGTTTATAAAAACAATTTGA
>CG15065 13905041 13905110|13832 chr2R 13904791 13905523 scaffold_4 627795 628532 + 6767|274 351
A-----TTGGA--GTTATAAAACTTTGATGTTTAG-TAACTACAATAAAACTTATGAAAAATACAGATTGTGCATAAA
GGGCTGTTGAAACGCAATTCAACTAGGATTTAAATCTCGCCACAAACAAACAACTGAATACTAT-GTTAATGCCTAA-
>Idgf5 13910028 13910145|13840 chr2R 13910028 13910200 scaffold_18 1316766 1316975 - -846|0 156
AAAGAATAGC----------------TATT--TGCTTTGAATTTAAAATTTACTAGCTTTCACAATTATCCTTCTACTTTTTTAGTGTATTTTTGTGA---------------------AATATGCATGGATTGCAATAAATTTCATTTAAAATAGT
ATTGAATTGTGTTCATATAAAGCTCATATTAATAAACAGAAGATGAAATTTCTCGGCTT--ATCAGTTTACTTCCAGTTTGAAAATGGGTATGTATAAATGTGATAGACTAAGCAACCTAATATTTGTGGATTTTAAAGCGCTTAATAAAATATAGC
>GstE1 13913970 13914087|13849 chr2R 13913906 13915055 scaffold_20 1553303 1554409 - 2198|64 191
AACTAAACTTATATTTAAATATG---ACATTTCACAAGTTTGAATTCCATCAATTAACAACATACACATCCATTTCTAAAACGT---AAACTTCTTCAATAAAATATAACATATATATAA----AATA
AAAACTATTTTTATGTAAACATATGTGCATTGTATTATCAAGAACTTAACAAATTAAAAAT-----CATCAATGCGAAAAGTTTCTACAAATTTCCAAACTAGATATGAGCTACATAAAATAATAATC
>CG17523 13915053 13915242|13849 chr2R 13913906 13915055 scaffold_20 1553303 1554409 - 2198|1206 1208
TAA
TTA
>CG17523 13915053 13915242|13850 chr2R 13915056 13915273 scaffold_4 640393 640635 + -1123|0 219
TTTGTATTAAAAAAAA---AATACCATCAAATGCCATAAATACCATAAAAACAAATCAAATCGAATAGTACTACAACTGAT--------------TTGTAACAAAAACCTATCATTTTTAGAATCATAATAAAACTATCATTACGTACTGAATCCTAAAGAGAGAAATAATAAA---AGAGAAATAT-------------ATAGATGGAAAAACTTAAAT
TGTGTGTTGACAAACAGCTAATTACACAAAAT------AATATTTAAAGAGCGCCCGACACTTGAGTTCTCTTCAGTTTATGATGAAATATTTGTTTGGAACAGAAACCGCTGCGTCATGG---CGTGACAGCGCTTTTGGTAGTTGAAAAA----AGAGCGAGCGATCACAGAGAGAGCGAAGTATTTTTTGGAGTGCGACAAGCAGAAGAGCGCAATC
>CG17524 13916283 13916332|13855 chr2R 13916126 13916422 scaffold_4 641481 641773 + 2562|163 228
GGCA----TTTTAGTATAGA--CAAAAATAAATAAG----------AACAACAATTATCATAACGA
GCGAGCGGTTATCGCGTCGAACTAGCAATCGAGAAGTTGCCGGTTCAACAGCATTTGTT----CGT
>GstE7 13922490 13922551|13870 chr2R 13922477 13922639 scaffold_20 1561538 1561701 - 302|13 76
ATCATCTATACATGCTGCTAATATATATTAAACACTTTATA-AATAAAATAATCGTAC-AGTAC
TGGATCCTAATTAGCTACAAATATACATAATATATCAAATACCATAATATACTCATGTGAATGT
>GstE8 13923392 13923429|13875 chr2R 13923390 13923515 scaffold_4 642736 642846 + 941|2 41
TAATTTATTCTTAGTATATAATT--GTAATAATAATGTT-
TAGTTGA--CTGAGTGAGTGAGTCGACATTATTAGTTTTC
>GstE9 13924620 13924698|13877 chr2R 13923954 13925221 scaffold_4 644714 646073 + 37441|666 790
TTG----TTTGCACTAGCTTAAAGGTTACAAACGCAACGTGT---------------------------TCTGATTACGTAACAA--------------TAAAGCTTCTAT-TTGTATAAACTTT
GTGAGATTTGCCACGAATTTACA---TACATACATATTATATATATATATATACATATATATATATCAACTTGATTACATAATAAAAGGCGCACAGATGTACGGCTTGTTTATTGTCTGTAGATT
>Dp1 13934289 13935987|13883 chr2R 13930044 13935208 scaffold_4 651172 656459 + 261498|4289 5418
GTGCATCGGGCCGAGTGTCCCGATCGCCAGCAGTAGCAGCAATACTACAAGTCGGGGTGCGCCGGGGATCGGAGCTGGAGATGGACCAGGAGCTGGAGCAGAAGCTGGAACTGGAACTTGAATTGGATTATCGGGCAATGAGCGGCAGAGCAGCGGCAGTCGTG--CGGAC-ATCTCTTTAGTCGAAAACTAGTGTCAAAAATAATGGTATAGGTTGT-----------------------------------------------------------------CTCCCAGGAGCTTTTCTACAACGCAATTT----GTGCAGGTTAATAGAAAACGACTATTTTTGTATGATTTGATACAGGATCAATCAAACACACAAAAACCCACACTCACACACAACGGCACATAC-ACATGCTCACACATATGAAATTGCATTTATACAACATATAGAATACGAGAATCGAAACAGACA----ATTGACCACGCCTTCAGTTCC-----------GTTCC--CCGATGTGTTGGCCAAACCCCGGCCACTTTATATATAAAAAACACTTAATTGCCAATTTCTTTTTATATAACCATTCTTCATTGCAACACATAATATTCTAATTAGTTGAAGCTCCCTAAAAGTAAGCAGAAAGTTCAGCAAAATGGTTTG------------------------TTAATTGAATTAAAAC-TGAC-------------------------TAGCGAAGCACGTTCAAGAACGA-ATGTAATTTTAAGCATAAAATGTTAATTATTTAC--------------ATTTACCTTCTAT--CTACCCCCCGTTTTGATTACACCATACTCAATTTTCGTATTCGGAATTTCCATTTAAA------------CCCTTCCCAATTAAGTGATGA--TTATTATGAT-------TTATGCGAAAGTAAATGTT-------------AAATGAACGTTGATTGTATTGTACAAACGT---------TTCTTACGTTGCGG-GGCGAGAGTGGAAGTGGAGATGGCGATTTAT----TTGAACAGCAAATATAAACCTTACCTAAATTTAATAACTATAT-----TACCCGCACGCCTGCTCCTACTCCTAC
GC-----------AGTAGTCCAATCAGCGGCAGCCGCA----------------GAGTGCGACGGGGATT---------------TTGGGTAACGGAACAGAA--CGGAACGGAACGGGCGGGCGTACTGTCGGGCGTTGAGC-----AGCAACAGCAGGCGTGCTCGAACGAGGTCCTTAGTCGAAAACTAGTGTCAAA---AATGGTACAGGTTGTCTCTCTCTCTCTCACTCTCAATCTCTTTCCCCTCTCAATCACTCTCTGTCTCTCTTGTTCACTCACTCCCAGGAGCTTTTCTACAATGCAATTCAAAAACAAACGAAAAATGATAAAAACTATTTTTGTATAATTTGATACAGAGAAACTCTGACCC-------CACACACATGAACACACCAACACACACAACATGCTCAGACACTTGAAATTGCATTTATAC-ATAGAAAGAAAAAGAAAACAAAAAGAAACATTATATTAGCGCCAGATTTTGCTCCCATTTGTCCTTGTTCCTGCCCATTTGTTGCCTTACCCTCCTGTCCCCTTCCTCAAAATATGACTTAAATGCCAATTTCTTTT--TATAACCAT-----ATTTCAATGCATAATATTCTAATTAGTTCAAGCTACTTAACATTAAGCAGAAAGTTCAAC-AAATGTTTTGTTAAAAGTGGTTGCAACAACATATTTAATTGATTGAAAACATGATATTTTATGGAAAAAAAAAAAAACAATAACAAATTACGGTCAAGAACGATTTATAATTGTAAGCATAAAATGTTAAATATTTACTATTGCGATTGCTGCTCTATTTTTTATTACAAATCTATTGTTTGTTTAT-TAATTTTTTTTTTTAGTGCCGTGTGTTTCTTTCTTGAAGTGACACGCCGCCAATCCGAACCGAGTTATAAGTTTACTATATTTCGCCTCTTTTGGGAAAGTGCATGGTAAAAAAAAAAAAAAAAGAAACGTTTGTAATTGTATAAAGAAGTGAGAACGAACACTCAAATTGAAATGATGAGAAATTGAATTGGAACAGCGATTAACTGAATTGAATTACACAAAAGCATGTACTTTGAAATTATAATATATATTCATATATATATATATCTACACATATATTTAC
>Dp1 13934289 13935987|13884 chr2R 13935227 13935386 scaffold_4 656494 656657 + 7227|0 163
TCTACCATACACACAGCCATGATACAGAACCCGAAAAACACACACAC----ACACACACCGACTCTGTTCACATTTCAAAATGAGTATCGACATTTTAATTTTGTGCAATCCCCTTGATTTATATTAAATTGTTTTCGACTTATATTTTCCACTTAAATAATTT
TTTAACGCACGCCTGCTTCTGCTCCAACAACCAACAACAACCAGCTTTATATCCCACACAAACCCCATTCACATTTCAAAATGAATACAAACATTTTAATTTTGTGCAATCTTCTTGATTTATATTAAATTGTTTTCGACTTATATTTGCCACTTAACAACTTT
>Dp1 13934289 13935987|13885 chr2R 13935491 13936046 scaffold_4 656727 657368 + 13652|0 600
ACACCGCGCAATATCTGACAGTTGAAACACAAAGTATAA----------------GAAAAATTATT--AATTTTTTACTATTACTATTCAAT------------------------------AAAAACAAAAAACCATATAAAACCAATAAAAATCGTAAACGA---------------ATTTTTTGCTT----TTTTTTTGCAACATTTTTATTTTGTTTCACGTTTGTTTAGTATTTCGATTGCTTCTGTTAAAAAA--------AAATATGATAACACCAAG-----AATAACAGACCTGATATTGTAAATTTTTAAAAATATACATACATATTTACAA-CAACTGCATTAGTAATTCTAAG-AACGTA------AAAATACAAACTATATCAAATGTATATATTTTCCTATATTAACGGACA-AAATCAAATGTAAGAGTCGACGGCCAAATGGCAATTGCTGTCTGCAAAACAAAATATTTTCATTAACAATTCGATTTCTAACTATAATTTTC--AACCCAGATATAGCAGATAC---AACCGTATGTCTTATTTCTTTTGAAATACAAA---------AGTTTTAAACC-GAAA
ACCCTGTTTATGATTTGA-AGTTGAAACACAAAGTATGAAAAATTCAAACAAAATAAAAAAATATTACAATTTTTTAC--TTACCATTCAATATAAAACAAATACAAAAAATATATAAAAAAAAAAAATAAAAACAAAATAAAACCAATAAAAAACGTAAACAATTTATATATAGTTTGATTTCTTGAGTTCAATTTTATTTTAGTTTTTCTGTTGCCTTTTGCTTTTATGCGGAAATTTCTTTCGACATGTGAAAAAACGAATAAGCAAAAAGAAAACACCAAGAAAAAAAGAACAGACCTGATATTGTAAATTTTTTAAAAT----ATACATATTTACAACCAACTGCATTAGTAACTTTAAGAAACGTAGTAAATACAAAACAAAGTATAT-AAATGTATATATTTTCCTATATTAACGGACGTAAATCAAATGTAAACGTTAACGAAGCGACGACGAAAGCTG-----AAAAGCAAACCTTTTTTTCACTTATTGCATT----------ATTTTCCAAAAACAGGCTATTCAGATACGAAAATAATGTATTTTATTTCTTTTGAAATACAAACAACAAATTATTTTGAAATTAAAAA
>CG5174 13939354 13939746|13889 chr2R 13938671 13940701 scaffold_4 659450 661618 + 54128|740 1174
GTC-------TATGAACCGTTCGCAGTTCTG--------------------CTGGGCAATTAACCCGACTAGACAGTTTTAATTT---CTAACCATGCTTTTT-----GTTTCAAACTCCTGTTGAAACGCTATAACGTGTATTTATTTAGTTACCAATCGGTGGAGCAGAGCGTGGGCACGTTTACTAAAACGGTGTACGAGGCACCACTGTAAGTAATTGGGTTCAGGCTGATTTTTAATTGGGTACTTTTGGAGTTACCGGACTAACGCCGTGTTTCACGCCACTTCCTTTAACACAATAACCAACTCTCGCCTGTTTGTAACTAAAGCGCACCTATGTTTGCCCACTTTGTGT-------ATGGAGGAAAACTATCGAGATGAGTAACTAATGTTGGATTTATTTGTACTCTCCCCTAGATACCAACGCAC
GTTGCCACTGCAGGAGCTGTACTCCGGTCCAGCTGGTCGTCAGACCATTAACTGTTCAATCAATCGAATCAATCTGGCTTTATTTGTTTTTGTTATGCGTTTTTTTAAATTTAAAAAATTTGTTCA--------------TATTTATTTAGTTACCAATCGATGGAACAAAGCGTGGGCAGCATATCTAAAGCCGTGCACGAGGCACCACTGTAAGTAATCGTGTCCAGGATTGTGTTCCGCTGG-------CAAACTAACCCAATCAGCAGC-TGTTCCATGT---TTCTCTTAACACAAACTTTTGCTTCTGTGTGTCAATAACCAAA-TGCATTGTTGTCTATATTCTATGCGTCTCGCTCGTGACATATATCTGTCGTAAAATTGTGCTAATTTATTTTCGATCTGCTGTTTTTTTCAGTTTCCAACGCAC
>CG5174 13940311 13941096|13889 chr2R 13938671 13940701 scaffold_4 659450 661618 + 54128|1809 2225
ATTTCGGGG---------CAACTGCAAGGCCAAGCGCGTCGATAATGTGGAGCAACCTATAC-TACATACAAACAGACCCACGCACCCACTCTATTAACTTAT--TTAACTAAAGCGAATTGTCGTG--TCTGCGCACTAACAACAGGATCAGAATTAATTTAACCAGAAATCATATGTACACCTGTGTCGATACGGTTTATATAATACTTAATATAACTAAAATCTGCGCGTCAAAAATTTGCCAA-------TGGGAGCACATATTATATGCATCTATTTGTATTTGCCT-----TGGAGACACCATCAAATTGCATGACTTGTTTAAATTTAAAGCCACGGAGGATCGAAGATCCAAGGGCTTGCTGCATTCGTTTATATAACTATCAATCTAAGTGTACGTTTAAAGACTAAA
ATGCACGCGTAAAATAATCAAAATCAAAACAAAAACAAAAAACAACATAATTACACCTTTACACACACACACACACACACACACACATACATAAATAACACACAATTAACAATTGCGTTTAAATATGAACATAAACACTAACACCAAGTATGGAATTTATTT----ATAAAATATATGTGTGTTATTATTATTATAACTATTATACTATTTAATGTA---------TGTGTATCTTAACTTTAACAAATTTTGTTGGTAGCATACG-TACATATATTTACATGTGTGTGTGTATGTGTGTACGTGTTGCGCTATTTCAATAATTGTTTTGGTTTAAAAATCAAAGAAAACAAAAACATGTTAATTTACCAGAGTTCTTTATGCAA----AAATCTAAGTGTATGTTTAATGTTTAAA
>CG5174 13940311 13941096|13890 chr2R 13940723 13945161 scaffold_4 661809 666102 + 176184|0 402
ATGTCATTCCCAAATGTTTCTAATACTTAGTAAAAACATTAGAAAAT---CATGCATTGCGGTTAAAGTGAATATACATTTGTTTTACGCTTTTATTT---CTTCTCTAGGCGTTGAGTTCCGTGGTTAGATGGCGTTCCCTAATCCGTTGAAAAGCCAATTCCAAATTTATTTAGTACTA-----AATATTTGTGTTACGATCAGAGCTTGCGTGCAAATAACGAAAATCCATTGGTAAACTTAAGTGGATGTAGTCCGTACTGCTGAAGATTGAGAAAGAGACGAAATCGCACCCA------------ATTTGTTGCTAATGC---TGATC--AAATTTGCTATATGTGTATGAAATCTTTGAATAAATGCAAAAATT-TTTGCCCCATAAAAATAGCGAT
ATTTCATTCCTAACT-TCTCTGCCGCTTAGCTTCACTATAAAAAAAAATATATGTAT-------------AATATATATTT--TTTATATTTTCATTTATTTTTCTGTAGGCTTTGGGTCGTGTAGCTAAATGGCGTAAC---------TGACAAATATATTCCAAATTAATTTAAAACTATTTAAACAATGAAAGAAACAAATTGAGCTTGCAAGCTAAATAAATAAATACATTCGTTATATTAAGACGAA--AAGCAGCACCAA-GAATATTGTAAAAAAT-TGAAAGCACACACACACACATTATTGATTCGTTGCAACTACACTTGATTTAAGATTTGCTATATGTGTATGGGATCTTTGAATAAATACGAAAACTATGTGCCCCA-------------
>CG12263 13945145 13945196|13890 chr2R 13940723 13945161 scaffold_4 661809 666102 + 176184|4549 4565
TCTCAGCCAATTAATTA
CCGATATTAATTAGCTG
>CG12263 13945145 13945196|13891 chr2R 13945162 13945488 scaffold_4 666255 666539 + 578|0 34
TTTATTTCGGCCTTAATACACAAACACGTAATAAG
TTTATTTTCGCCTTACTACAAAAA-----------
>slim 13959648 13960395|13906 chr2R 13958480 13960837 scaffold_4 680300 682627 + 55248|1177 2125
GCCTGTTACTGT---------TCCCA---------CAAAAATAAA-TCGAAATCAAGGAGGGTAGCGGACCCATACTCGAAACTCTTTCAGTTGCAGAACTTTATGTTATCATTCTTTTAAA-------------------------------------GTTTTGTTTCACATTGAGCGCGCGCTGTGATCGAACATGAAGATAATATATATCGAATATATAGTTGTACACATGTGTATTTTTATACTTGTGTTTCCT---------ATGCGGACATGTTTAGCATGTAAATAAGAGTGTAATTAAGTTTAGCTAGCACAACA--ACAGCCAGATA-CAAGCCATGCGTATGT--ATTCTAAACTTCAGCTTACAGATCAGCCAGCGCA----CCGCGA------AAACGGAGCATCGGAAAAA----TTCGCTATAAATCTATAAATCTTTTACCTGGTCCTCAAATCTTACTTGCTATATCGAAACACGGCCCTGATATAATGTTTCACCCTCATTAAATCCAACACACATCCCACTTTGCACCCAAACAAAACAAAACAAAA--CAAACAAACCCATAATGAAAGGCTACACCAAACAATGTCATATAGAGGGGGGACATCCCCGATGTA-------------------------------------------------------------------------------------------TTTTTGTCAAAGTGTACATAATACTTAGCGGTAGTAATATTTAATTAACAA--TAAGACTC-CATCAATATTGCGATATCATGTACCATGCAGTACGTAGGCTACTGCTCGCCCCCGTGGCGAACGTTGGTTTGCTCGGTTTACATTACCCAAGACT--AAATTTGGTTGAATCTAAGTTAATAAATAAATTTCTAATGCAACA-------------------CA
GCTAGGTTCAGCAGCTTTACATCCCAATCCCTGCCCAAAAATAAAGTTGTGAATTGAGAATGTGGCG------TGAGTGATTGCCCCTGTGTTGTTGGA-GCTATGTTCGTTTTCGTTTAAATTGAAAAACAAACCAAAAGGAACAAAAACAGGACATTATTTAGTTT--TTTTGAGCGCGCGCTGTGATCGATTACGAAGGACATTTATAT-----------TTATACATGTGTGTATTTTAATATTT-CGTAGACTCGAATTGAAAGGCGAACATGTTTAGCATGTAAATAAGA-CGTAATTTAGTTTAGATAGCGGAACAAGACAGAATGACAGGAGGCAATTAGTATGGAAACTCTAAACAATAAC-AAAAGAACAGTCAGCGCACAACCCACGAGTCCACAAACCTACACTCAAGTAAGACCCCTAGCTATAGCCATACGAATACTAT------------AATACCAGTATATCCTTCCAAGTATTGCTGTATTAC----TCACATCCACGCACCCCCCACCCCCCGCCCCCTGCTGCATTTGCAGAATTTCAAGCACAGCCCCGACTAACCCCC----GAAGGCTACACCAAACAATGTCATATAGAGGAAGTATGTGCCAGAGGCAGGCAGTTAGCGAGAACATTTCGTTTCGCTGGGGTTCTCGCCAATTGGCCAATATATAGAGATAAACGTACATACATACTTCCAATGTATTTTTTTTGTCAAAGTGTACATAATATATAGATATAGTAATATTTAATTATTAAACTAAGTTTTGCGTCTTTATTGCGGCATCTTCAGCCCAACATTAACACAAAGTTTGCTCGATATTATAATATAT-------------ATATATAATAGCCCAGGCTACAAATTTGGTTCATTCTAAGTTAATAAAC--GTTTTTAATGTAACAATAATTTCTTGTATATTGGCA
>CG5189 13962004 13962219|13908 chr2R 13961867 13965908 scaffold_4 684014 688041 + 160040|137 357
GGATAAAACAATGATGTACCAAGTTCCGAAATGAATAAGTTAATAAGTGTA-----TGCATCAAAAGTGAATCAAATGAATATGAATAGTCTGCGGAAAAGTTTAAACGATAATATATTAGTACTTGAAATTATGAATCTTTAAGGATTTTGTTAGTATTTAAGGAAAAACTTGTCTGCTGGTTTCCAAAAGTAACCCAAAGATATTTCGTATTCTGAATT
CGAGCGAAAGA--GTATTCGTAGGCTCGATTTCGATTAGTCT-TAAGTGTAATTCCTGTTTTGTAGTTGA------TAAACATATAAAGTACGTTGATAGCTTTT---------------GGATCGGAAATAAAGAA-------AAGTCTGGTT--TATTTACGCGGAAATTGGTTTACG----CACAAGAGCGGTTAAA------TATGTATAC--ATGT
>CG5190 13967580 13967601|13909 chr2R 13966082 13967624 scaffold_4 688047 689607 + 55851|1549 1575
AGTTACTCGTT-----GTATTCATTAA
ATATATGAATTATTTAATATTTAATAA
>CG5224 14019689 14019707|13962 chr2R 14019682 14019845 scaffold_45 283757 283907 + 9|7 27
TA--TAAACGGTTTTTATTCG
CATTTATGCAATATATATGTG
>CG5226 14038063 14038570|13985 chr2R 14036178 14040271 scaffold_1 5919113 5923598 + 65421|2195 2793
-----AACGAACCGAACCTGAACTCAAAACCGAAGCCATGGATACGAACCTAAGTGCAGCGCCATGTCTTAGAGAA--CCCCAAAGAAATCAGCAACCAGTTAAAACTAGGATA-----GCTCTAAAAA-ATAGTTCACTAACGCCCTTCGCATGGCC--CAGAAACACAAAACA----------CCGAACACTGAACACCCAGAAAAACCGA-----AAAAAAAACTAAG-GACATGGCTCGACTCAAGTAGAAACCAATTGCTCATCCTCGGTTACCAAGCAATTACCCGTACTCAATACCACAAAGAACTAATCAA---CGCACAGCAATTAATCGT-------------AGCTAG-----------------------CAAACAATAGCAAACAGCTCTTTTAAACGAAAACCGGATAAGGCCAGA------------------ACAATTATTTA-CAAAACCTAAGTTTAGGGAAAAGACTAGCAAAATCGCTTGAAGGCTCAACAGGAGTAGGGAAATGAGTGTACATAGATTTAGGCAGTTCATGGACATATATAAACCCAA--TTGGCGGCTGATCGTGGCTAATATGCAG
ACATAAAAGAACTAAACATGTTTAAAAAAAAGAATAC-------CTAACCTAACCCTTTAACTAACTCAAAAAGTAGTCTCCCGAAAAATAA--AATCCGTTCAACGCCTGTCACCCACGCTGTAAGGATAAATTTCAC--GCGCCGTCTGCCTGACTAGAAAAAACCCTAAACAAAAATCTCACCCATACGTTACGTATCGATTCGAACCGATCCGCATAAGCCAATAAGTAAAATATTAATAATTTAAAAAAAACGCACAGCAAATACTCAACTATAGCAAAAAAAAACAATCGCAATGCCATTTAAATGTAATAGAGTTCGATAAACGATAAAGCGTTAAGCTTCGATAAAACTAGATAACTCGTCAGCGCCTTCTTTACAAAGAACAAGAAAAA-----CTTAAACGTAAAACAGAAAAAAAAAGAAATAAACAAAAAACGTTTACAATTATTTACCAGCAACTTAGTTTAGTGCAATGTTTATAAA------CGAAATGATAACCAAAAGTTTAGACAAGTA---ACATTCACCTAGACAGCTCA-------ATATTAGGCTAAGGTCGGCAAC---------------TGCAG
>CG5226 14039096 14040297|13985 chr2R 14036178 14040271 scaffold_1 5919113 5923598 + 65421|3386 4817
GACGACGAG---GATGACGAGAACGATTTTAGCGGTCCGGCGCTGGGTGGTCATGTCAAGACCCAGAGCGATTTCTCCGACGACGACGAGGAGGACAAGCCCATGACCATGCGGATGATGATGATGCGTCCGACAA-------------------CAACAACCAAGACATCGAACGTGCTAAATGTGCCAACAAGCAGAAAGAACAACTATAAGAAGGAGGCGTACGATGTCTAGAAAAGCCACAGCCCCACTCCCAGGCG------CAGCTATGGAAACGAAAGCATAAGATATGGATAAAGATACAGATACAGGTAGAGATAGAAGGCCAGGTACAAGTCCAGATACAGGTCCAGGTGTGAACCGATACAAAATGGCAAGTGAAAAACAAAAACCAATTTAACTAAGACGAGCGGTAAGATGGGTGCGTGCCGAGCTGAGCGCAAACATTTATAAATATTTACTATAAGTATTTTAACTTAATTTAAATCTAAA----------CTAAGTAATTACCAGAATAAAC-------AGCCGAAGAATTGCA-------------------TTCGAGTGCGT-AACTAAAATTGTT-AAATCGTATTTTAACACAAACTGAACTAAGCCCAAACTAAAACTAAATTTAACAAACTGTGTACGAGTACAATGTGCCGCAGGAGGAT----AGGTATTATCTAAAACGGGTTG-----CAAATGGTT-TAAATTCGATTA-TGTAGCATTTAGTTGGAA-----TGCTTAAAGCTTTACCCTTAGACACTCGAACACACAAAACTAAAAGTATTTCCGACTCCCACAGCCGCACTCCTTTTCTCCCATCCCCAATATCCCCAACAATTCCCCCACAATTCCCCCCTCCCCCG--GAGAAAGCTCTTCGACGGCAAACGCTTATAGTCGACTTAGCC-----------------AGCGCATTTCCAAAGAGTTAAACTCAACATTTAGTTTTA-GTAGAGATCTGCCGTTTTGTTTTGACCT---------CAAGTAGA-ACTCA--TCAGACCTAC----AATTAATCTATGTATGT-------------------AATCTAAGAGGA--GTTACACGATTTACAATTACTTT---------------AAACTGATTAAGAACGTTGAGACA----CAATATTAACACTTCGAGTTCTAGTTGAGTT--------------------------------------------------AAACAAATACCTATACTTAC---TATACTGATTAGAGAATGATA-------------CATGGAATGTGTGATATTCTAAATAATATCCTCA-----------------------------ATGTTTAGATGTTAAGAC---TCTTCATCCACAGCCCCAAAGTCGTCCACTCAATCTTA
GATGACGATGACGATGATGAGAATGACTTTAGTGGGCCCGCGTTGGGAGGTCATGTGAAGACTCAGAGCGATTTCTCAGAAGATGATGAGGAGGACAAGCCCATGACAATGCGTATGATGATGATGCGTCCAACAACAAATGCAAACACGCCCCTCAAAAACCTGGGCACCAATCAT-CTAAATGTGCCAACAAGCAGAAAGAAGAACTACAGAAAGAACACCTACGATGTGTAGACAAGCAAGTGTGGCAAGGGTAAGCGACCTCTTAATTCTAGAGGTTAGGTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATATATATATAGAGA-ACAACATGCTATATATAAATCT-------GGTC---------------------TTGCGATTAAAGCGCAAAAACCA------------------------------------------------------TTTATATATTTACACTAAGTATTTTAACATAATTTATATTTAAAAAACCTTAAGTTAAGCAAAAAACAAATTCAACAAATATTAAACAAAGAAATTTAAGAAGATTAAAAAAGAAGCTATAAATATGTAAAACAAAATTGTTAAAATAACATTTTAGTGCACACCTACACACACTCACAC-ACAACTAAACT---------------ATGTACAATGAGCTACAATTGAACTAAAAACGGGTCTCTGAAGAGAGTTGAAAAAAAAATGTTTATAATTTCTGTTGCCGTAGCATTTAGTTAAAAACTGTTTTTTAGAATTTAACTGTTGAGCAC-----------AATACAATTGTATTTGTGTCCTTATAAACCCTAATACATATATATTAT-----ATATATACTATATATAACCCAGTTGTATACCCTGCCTAGCCATGAGAACTTTTAATTGCAAAACGCTTTTTGTAGTGTAACCCAAAGAAACTTTTAACCAAACGCATTTCC-AAGAGTTTAACTCATTATTTTTATTTACTTAGTAGCATTCAGTTTCAAGTTGAACTTATCGCGCCCAAATATATATTCAGTTTAGCTCTATACAAAGTTAATTTAAATATATACATATATGTATATGTATAAATGCAAAAGTATTGTAATAATAATAAGAATAAATTCATAAATTTAATATGAAAAGAGATCGAAAAGGTTAGGCAAGTTTAAATATTAACTAAAGAATTACTAGTTCAGTTGTTAACTGCAAATAAAATAAGAAAATACAAAAAATACCAAAAAAAAAACGACAAAAATACTAAAATTTACACGCAGACAAAATAGAAAAAAGTAAAAAACAAAACAGCATGGCATGTGTGATATTCTAAATAATATCCTCGAATTGTAGTCTAAGGAAATATCATCATTTATGTTTATGTTATACAACTTATTTTCACATACAGCCACTTG--CTTCAACCTAATCTCA
>CG10924 14049417 14050621|13994 chr2R 14047098 14049901 scaffold_1 5935733 5938433 + 106727|2330 2906
TGTG--------------TGTGTTCCATAGGTTACT-----TCCTAATCTAAGACCCCTTATTGCCTAAAATAAAACGAAACGAACGAGATTTT----TATAGTGAAATTTGACTTGTGCCCATTCGAGAATGGAATTGGGATCGAAATTGGGTTTGGGGCGTGGCCTAGACGGGGCTTATCAGTGGTCGCCTCGGCGGAGGCCCGTCCGC-AATTGGCGTAAACAAGCGTATAAATCCATAATGCCGTTTAACCTAACTT-----------ATCAACAGATCCACGCG-ATGAAAAACAAGCAAAT-AAATGCCAGAAAAA-----GCCAAA--------AAGAAAGTAAAGTTTATGG---GTGAACCTT--TGCAATTTTCGGTGGGTTTC---------CAAGGACTGATTACTAAATTCAAAGCGTGTGGTGTGATGTA---CACTATGGGGTGAACAG-----------------CGATAAAAAGCCAATAAGCCAAGAAACCAAAAGGCAAAATAGCTAAGAAATCGAATCCCTT-----AAAATAGTTCATGG---GCAATGTAAAGAT
TGTGTTGTTGCTCCATGTTGGGTTCCATAGGTTATTGGTAATCTTAGTTTAA-------TAAAGTCTAACAAAAAAACCAGC-AACAAGATTTTTTTGTACCATGGCATTCCATGGCTGCCCCATT---------------------ATATGGCACGGGGCGTGGC------------TATCG--------------GGAGGCCCGTCCACAAATTGGCGTAAACAAGCATATAAATTCATAATCGCG-TTAACCTCTCTGCACCGCTGCGAATTATCAAGATCGCGCGAAAAAAAAACAAGTAAATAAAATGGTAAAAAAAAGTACACCAAAATTTGGACACCAAAAAAAGTTTTATAGAACGTTGATCTTGGTGGAAAAGCAAACGGGCCTCCGCAGTTGTCAAGGTCTGATTAACGCCTT----GCTCGTGAGGTGGTGTGATTCTACATGTAGCAAATCGCCAAAGAAAAGAGGCCTCAACAAAAAACTGATAAGCCAACAAGTGTGCCCACGAAAGGGGTCTAAGATCCGGTTAGCTATTCAAAAACAATTCAAAGCAAGTAATGGTAAGAT
>CG10924 14049417 14050621|13995 chr2R 14049947 14050380 scaffold_1 5938940 5939449 + 2404|0 527
ACAAATCCGGGTCTGATCTATATTTAGA-----------------------CGAACTCAGAGGCTCGTCCAC-----TGATAACCCGCCCGGCTCCCTCC--------TCCCCATTGCCTTCTTCTCAACCAATCGCATTATTGATTATGCATATATTTAGCGAATCGATCGTCTATTGACGTAAATTCCAAA-TAAGCCCGAATCATCGAAATGCGCCAAGTGGCGGTTAGGTGA-----------------GAACAGGAGCGAAGCAGTTAGAGTCTGAGTCCAAGTCCAAGTCTGGGT-----------------------------CCAGCAATTAAT-GCCGATGATGAAGATTATCAGGCCCAACTAGAAAAACAAGTCCATAGT-TATAAATAAACCAATCGAAAATCACGGCAACGCGTGTAGACGAATTCGATTTAATTCGCAACT-----GGACTTTTCGTAAAGGGAGTC----AAAAATGGGGACGGGGACTGTAAGAGGGGGGAGCCAAGGACCA
AAAAACAGAGCTCAACTCTATATTTAGAATAGAATATTTTCCACTGCTTTCCGAGTCTAGGGGCTCGTTTACCAGATTGATAAGCCGCGAGCTGTATTACAATTTGTATGTCTATAGCGTTATGTATATTGATTTTCATTATTTATT---TATTGATCCGTCGAATC--------ATTGACGTAAATTCAAAAATAAAGTCAAGTCATC-AAGCACGCTTTGCTATAGCAAGGCGATCTTTGCACGTCGCGGGGCTTAGGCATGAGGCA--TGGGATTTGAGGGGAATCGCAAGATCAGGCAGGGTAGAGGTGTGTGAACACTGGCAGCACAAGCAGACAGTTGATGGTGATGCTGCTTATCAAGCTGAACTAGAAAAACAAGTCCATGGTATAAAAATAAACACA-CGAAAAAAAATTCCGCGAATTTTTAAACATTTTTTTTTTTTTGCAATTTCAAGAGAC---GCGTGGAGGTAGGCTGATAAAAACTTTAACTGGTATATAAACAGACGTCATACAAGGATCA
>Pepck 14054009 14054282|13997 chr2R 14052058 14054381 scaffold_1 5941625 5944090 + 129213|2003 2380
GAAGGATCAATGAGGAGAGTCCCATCTACAGCATCTTTACCTGCCCACACACCTGC--------TCACCCACTGTGCTATCCCGTACTGACCCCATCA-------CCAACCCAATTTGTTAACCTGT--CCTAAATACCTGTCCCCAATACC--------------------------------------------------TTATTTAGTCGTTTCTCTAGTTCTTAAGCCGAAGACTTCC-AAACTATTTATTATATAAGCAGCCA----------------TAAGATTAGCA-AGTAGGCCATACAAACAGAGAAAATTAAAAAAAA-------------------AATAAAACAACACGATTTTATAACCTACA
ATGCAGTTGCCCAGCAGAGAATTTATCACAAATCTTTCACCCGCACGCACACAAACACGCATCTTTACCCGCCTTGC-ACCACCTATAAACCTAAGCAAAACTATCCCACAAAACCTGCAAACATATAACCTAAAACCCCGCCCACAAAAACCAACATATATACTCTATATAACCCGAAGACTATGCTAACAATTTATTTTTTCACTTAGTCGTTTCTCTAGAGTTTAAGCCGCAGACTTCCAAAACTATTTATTATATAAGTGTTTAGCCTTAAGTCTTAAGTTAAGATCTGTATAAAAGAAAAAACAAATAATGAAGAAAACAAAAAAGTAAAAAACATATAATTCTAATAAAACCAAAAGATTTTATCAT---AA
>CG10927 14129073 14129117|14072 chr2R 14127868 14129292 scaffold_50 519482 521037 + 39121|1324 1377
CGTTTAACAAACCTTGGT---TTTAATAAAGGATTT------ATAGGATATCTT
CTTTTGACAATTGTTTATGCACTGAATAATAGATTTAATTTGATAGCAATGTTT
>CG5323 14130622 14130862|14073 chr2R 14129340 14131250 scaffold_50 521277 523259 + 54460|1393 1667
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CTCATTGTGTATATGCATGTGTGTTGCATTTAATCTTAATTAACTTTAATA------GTTGAGCTCCTTTTCTAATGTCTGGCCATGGAATATTGTTAACTAAATCCACTTTTATAGCCGCAAATTAAATGCTG--TTATTTTTTTTTCAGAATTTTTGGCGCCA---------TAATTTGAAAACAAAGTTTGTTTAATTGAGATCAAGTTTGCTTTCCTATTAATAACAGCACAGTCTACATATATATATATATATATATATGAGAACCAAAA
>CG5327 14131502 14132017|14075 chr2R 14131531 14131613 scaffold_50 524156 524231 + 1892|0 83
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TCAAATGGGAACATGTAAGTTGT--------GTACGCGATTTTGGCACGTATTTTTGGTATAGCTAAGACTTAAATATAAACTA
>CG5327 14131502 14132017|14076 chr2R 14131805 14132799 scaffold_50 524277 525343 + 43171|0 214
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ATCTATTGCTCCGTTGGCTTGGTTCGCACGCCGTATTTACTCCAGAATGTCACCTTGGCCGTGGCCTTTTTGCCATTGTCCTGGAAAATGCTGCACGTATCGAAGGGCGGACAGTATAGATGCAGCGAGACGGCCGTATCCGCATGACTGGGATTCTCCACGCGATGCAGGCCGAGGTTATCTGTGTGCGTATCAAAATGATGCATGAAATAA-G
>CG5327 14132074 14133181|14076 chr2R 14131805 14132799 scaffold_50 524277 525343 + 43171|271 1082
GCCACATCATTGACGGCGATTGGTGTCTCCCCAATCTCCACCAGCTCTCGGCTATCGATCTCGCCAT---CGGGATGATG-----------GGACCGGCCGTTGTCCCTGGC-------AGATCTATTGGGATACTCGTAGCGCTTCTCGCGCAGATCACCCTTCAGCATCTTCATGAAGCAATGGGAATCGGCATGGTCGTGCACCGAGGAGCCGTGTCCTTCGCCCCAGCACAGAATCAGCAGATTGAACTTTCCATTGCCAGCATCCACGAGATTCCGCGTGTAGGTGTAACGATCGAACTTGGCATATTTGCGCCACTCCCGCGGATTGGACTTGTAGCTGAGCATAAGGTGATTCACCATCTCGATGTTAACATAGTTCGACTCGAATTCCCGGTGAAGGGCGGCCACCAAGTCCGATAGGGAATTCACCTCCGGTCCGTATTTCAGGGGTTTCTCCAGCGGCTGATAGTAGCTAGTGGCCTGACGCAGGTACTTCTCCTGGTCAACCTGCTCGATCTC---------GGTGTCGATCTTGGACAGGGCCATTTTGGGCTTGCTCTGATTGACCTAG-GTTGCGAAAAGGGAAGCGGAAGTTAGAGTGGTGGT-GCATCAGTTGAG---------GCTGAAGGGC-----------------------GTGGAAAA--------CTACCTATAAAGTCTATA--------AAGATCACTGCTCAATTGATTTAGATGAATT--ACGTTGTAAAGTCGATGATCGCT----GATAATAGCTATTGGTATATATATATATGAATATTCC
GCCACATCATTAACGGGTATGGGCGTGTCCCCGATCTCCTGTAGCTCGTGGTCATTGATCTCGCCATGCTCGTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGGTGCTGCTGTTGATCCTCGCTGCTCGTGGCTCGATTGGGATAACGGTAGCGTTTCTCGCGCAGCTCACCCTTGAGCATTTTCATAAAGCAATGCGAATCGGCATGATCGTGCACCGACGAGCTGTGCCCCTCGCCCCAGCAGAGTATCAACAGATTGAACCTCCCGTTGCCGGCATCGACCAGATTGCGCGTATACGTGTAACGATCGAACTTGGCATACTTGCGCCATTCCTTGGGATTCGATTTGTAGCTGAGCATCAAATGGTTGACCATCTCGATGTTCACGTAGTTCGACTCGAATTCCCGATGCAGCGCCGATATCAGATCCGGCAGGGTCTCCACAACGGGTCCATATTTCAGCGGCTTTTCGAGTGCGCAATAATATTGCGTGGCCTGGCGCAGATATTTCTCCTGGTCGATGTGCTCGATGTCCGTATCGATGGCATCGATTTTGGACAGGGCCATTTTGCACGTGCTCTGATTGACCTGTCGTTGGGCAAATTGATGGATTGATTAGACTATTTATAGCATGGCATGGGGAAGGGCTTGCTGAAGGCTCAATCTGTTGCCTGATCGATTCAGTGGAAAAATACAGATCTAACTATAGATTC-ATAATCGCTGTAAACTTACTTCTTGATTGATTTAAATGAATTGCGCGCTGTGTTGTTGTTAATCTCCTCTGGCTGATAGCT-CTGATTTGCTTTTAGATGAATCTCCC
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-----------------------TAA-----------CCATGTTAACCCAACTA------ATGAAGTCTGAAAA------TACAAA
CTTTAGGTTTGCATTTGTTTGTATAACTAGATGCATTCCGTATTCTACTAACTATGTGCTATAAAGTCTGAGAGTTTTGTTAAAAG
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ACC
AAC
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TTAGTTTGAATAGCAATCA-----CAAACTGTTCCCTGTGGCCTTTTTAAGTGAA---TTAAATATTTGTATATTCAT
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>CG18604 14219659 14220675|14178 chr2R 14219808 14226654 scaffold_11 136877 143902 + 202214|0 973
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TTAGTCCTGTTCAAATTCCTCAAATTAGTAACTTTAATCAAAATTTTATTAATATTTACTATATATGGAACTAAATAGCTATAGTTGTGTATTTAACCGGCGAGCATTTTCAAATTTATATAG----CTGCGATTTTAGCTATGATAAAGCACATCAGGCTTAAAGCAACGATCTAGATATATATGCACACACACACACACACACAGCCAAACTGACAGAT-ATGTTTTATCTAA-----AATGTATCCAGAAAACTTAA--ACTCCCTTTTTTTTTTTCTGTGGAACAA-------CTTAAACGAAAACAAGTTAAATGCATTCCAGTAGCTAAAATTTTTCATACATT---------TTCG----------GATATACATATATATAAAGATATATCTAATATGTAG---TATCTAGTTAAGCCTAAT-ATCTTTTTAAATTCTGTGCAATCCG-ATACGA----CAAATGTGTATAGCGCTCACGATTTGGCACGATT---------TCGATTTC--------------AAACACTTTATTCTATATATATGCTAATAGTATGACGATTAAAGTAATTTCTGTAGTTAGTT---AGTTACAGTTTTT-GCTCCGATATTATGTGTAAGCTCTTGATTCCGTTAAATTTAAAAAAAAAGAAGGTTTTTCTATTTA------GTAAAACTTTGTTCGTTTGTTAATGGTTAGTAATGGCGCCTTCGATATGCGTTCAAATT-----------GATTAAACACAA-ATTGAGAAATCTATTATT----AAAAGACTGCTGTGATTTTAAATATAATTAAATATTTAGTTCAGAAACAAGAAAAACAAACAAAACATTAAAAAAAAAATAAACAAGAAAACAAACAAATAAACAACAAGAACTTAGTTATACATATGATTATATAA-TAATTAATTCAACTTTATCTTAAATAAATTACCAATTCTCCAAACAAT
>CG15073 14222886 14223086|14178 chr2R 14219808 14226654 scaffold_11 136877 143902 + 202214|3392 3598
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ACAATCTGTTTACTATTTATATATATGGTATA---------------------------------TAATATTTAGTGTATTTGTATA------------TTAAGTAAAATCCTTAGGC--TAGCAGCAAGTAACAAAATTAAATAGACACAGATTAAGGCCAGG-CTTCGGACCAGGAATGTTGCACAGA-------GATATTCTGT
>CG33147 14267040 14269389|14241 chr2R 14266426 14267192 scaffold_11 200387 201097 + 29970|619 781
-GCTCGTCGTGGCGAAATTCACTGGCAAATGGAGAGCTCTTCGCTGTC--CTGGCTGGCCATAAATCTGCTGTTGGTCAAACGT---TTGGGTCACAGTGCAGCCAATTTAATTACA----AGCAGGAGCGGCTGATGGAAAAAAACGAGCAAAGTTATCCAG
TAGTTGCAATGGAGAAA--CATGGAC---TGAAAGGCTAACGACCTCCAACTACGACACCATACAACAACCCCTTCCCAACCTTATGCTGGGCTGCACTTTGGCGCATTTAATTACAGCGCAACAAAAACAATCGATGCGAAAAACTGCGTGCAGGCTGCGAG
>CG33147 14267040 14269389|14242 chr2R 14267221 14267927 scaffold_11 201141 201772 + 8699|0 760
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ATTACAGTGCACAGCAGGGCGCCATATTTCTCTCTGGCTGTCTGCCAGCCG-GCTGACAGTTCAATTATGCGAACTTTGGCGCCCACGAATATCCTT--TATACGCCCAAACCTACAAAACG--CAGATTTCCACTGCAGCGAGCGAAAACGCAAAAGAAGCGTGAAGAGAAAACAAACAAGAAAATGTGAAAATAAATACCAAATGAAAACAGAAAGA----AAAAAAAACGAGAAAAATTGAAGGATAAACAGCGCGTGTTTTTTGCAGTGCAGCCGGCCATGAAAATGTACGG-------------AAAAATATCGAGTATCCGCAAAAGAAAATAT-----------------------AAATTAAAAGCAATATCTACATGATGTACGAAGTTTGCAC--------TGTCTGTGTGCGAGAGAGAGAAACA-----------GAGAGAAAGAGAATGAAAGAGAGCGCGAATGGGTGTGTGAGTGAGCGAGAGAATGCATAAAATTTAATTAAGCAACTAAATGTGATTTTATAGCAAATAAGCGATAAACAAATGGAAATTAATTGCAATTGCAATTTTCGG----------------------------------------------------------GGCAATT--AATTGTATTTAGACAAGGACAAAAACCGTCGGCTGAATTAAAAGTGTGCATAAAAAA----AAAAAAAACAACAAATA-CATATACATACTGTAATAGTATGATTT
>CG33147 14267040 14269389|14243 chr2R 14267928 14274609 scaffold_11 215749 222581 + 138906|0 1798
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TGGTGGGGGGGATTC
--ATGGAGGAGCTAC
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TCCATAACCAGCGCTGATTCGGTGCTGGTGGC------ACCGCTGCACCACAGCGCAACTGGTCCA-CAGCA-------------------TCTGATGCAGCAGATGACCACA-------------CGCTTCCGCGCCAATACCAGCCAGCTGAAGCACAAGTTTGGCCAGGCCAAGAGCCTTAGTCTAAGCCAAGGCGA-----------------------TTAGTCCACTTAGTATACAAATTAACGG--------CACTTAAGCAACATCGCAGACGCAA----CTTTAACTAAAT------GCACCAAAGT-TTTTGCTTAAATTAAGAG
>CG33146 14288607 14289532|14261 chr2R 14288941 14289270 scaffold_11 248276 248595 + 5061|0 347
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AACTATTTACACTTGATGGATATACACTGAGCAAAACTATTTGGTTCAGTTATGTAAATACACCAACAGCACATTGTACTT-TATAAAGC----ATGTACTTACATTTTACT------TATATATA---CTATATAGAACCA------GTACCTAAAATTATTTTT---GAACATCTATTTG--TATTTACCAAGAAGATTACCAAAACGCTACCCGCGCAATTCCTTTGCAATCGTATGAATATG-AATTAATTATTTATTGTATATTTCAATTTGTGATATTTTTCAAAGAATTC--AAACTAGAAGTACTATGTGGCTTATCCAAAATATATGAGAATACTTACC
>CG33146 14288607 14289532|14262 chr2R 14289323 14290163 scaffold_11 248629 249581 + 6260|0 233
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AAATATTTGAATACCTTTACTTCTGAAGTTACCCTACGATATGAATGTATTTATGTATTTT--TAGTCTAATTGATTGCCCTCAATTTAATTT--AAGGCTTTTTATATGCATACCTAACTATACTTACTCATATATGATAGATCTATTTAAATAATTATTGTAATTTGATTGATCAACAATTA------------CCTAGTACATAGGTTGCCAT--ATGAATTGCAATCCAA
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GCACACTCCTCCGGCAGCGGAAATTGAAAAGATTCATCATG----TACATAGGGGCA--------GAGGGGATACGGATGGGGTTCACGGGGTCCAGGACGATGGAGGATAGCTCCTCCAGCTGCATTGGCCCAAAATACAAAACCGTATCCGC-TGTAATTACTTAGCTTTAATTAAAAATATGTT---AAAAATAAGCACTTTAAAAGAATAATG-----------------AAATATCGAAGAGTGAAGATA--ATTCCATACATTTTTTTAAAACGAATTTTGAATAAGATAACAATAACCACAAATGAAAT-----TTCTATTAAGAAACTTTACCTGCATTGAGCGCTCTTTTGAAAACCCTTGATA-----TTTCCAGTTAGAACCAT-TAGTATGTAGACCTTAGAGAT--AGCATTA----CGTCAGGATACCACATAGCCAGCATATAAGTCTACCATATGTACATCATTGTGTACAAACA
GTGC-------------CGCCACATCAGGGCACTCCCCATGTAAATACATAAGGACAAGTGAGACGAGCGTAGACGGAGGCTGTTCA--GAGCACCGATC--CGGAAAATAAGTTCTCCGACCGCAACGCGC-----------GCCGTATTCGCTTGTAATTAGCT---TTAAACTACGAATATGTTTTAGGGATTAAGCGCATAGAGAGTTTTATATACTTGCATATATATATACATATTTATATATGCATATCGTATTCTATCTATATATTCGAAGAATTGTTCGAAAAACGTAGTGAATATCATAGTTAAAATAGTTAGTTGATTAAAATAC------------GAGTACTTATTACATAATACCAGATAGGCAGCCTAAGTTTTGTACAATATAATAATGAGAACTAACAAATAAAGAATCGAAATCGTTATAAAACCCCCCAGCCAGTATATAAAATAGTATTATGCATATAATTGAGAAGGGGAA
>CG15080 14308987 14309463|14287 chr2R 14309426 14309690 scaffold_11 273304 273573 + 617|0 37
ATGCAAATACAAATACCAATAAAAACGAAACGAAAAAT
ATACACATACA--TATCTACGATAAGAATTGGTAACAT
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AGCAGAATCCAGCCTACCTGAAGCTGCGTAAGCTGCGTGCTGCCCAGAGCATTGCCCGCACA
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ATTGCCAGCTCACAGAACAAGGTCTATTTGTCGGCGGATAGCTTGATGCTTAACATCCAGGACTCTGGCTTCGATGACATGACCGAGAAGGTTTACAAAAGTAAATAGCTCTCGTTTTGATTAACAAAAAGAGTTTACTTTTAAGTTGAAAAC---------------ACTTG-TACTTTTGGTTTCAATCACATTGGCCAAAAC-TTAGACA----TAGCCTTCATAATTGAGTAATTTCTAACGCGTTTTCCGTACTCCATC-TCTCTTCCTATTTGCCGCACAAAATTTCGTTCTGTTAACGTTTCACCC----------------------GATCGCGCAACCCAGTAGCCGATGACCTGGACTAGG-AGGCGATCCACATTC--------GTTGTTAATTAAT----------------TTTTATT-------------GAAATTCCTTCGAG------CTAGAGCCTAAGTACCGTTTAGTTTTAACCACTCCCAA-GCGGCG----CATTGGCTT------CATTTTTTCACGAATTATCTGCCAA
ATTGCCAGCTCACAGAACAAGGTTTATCTGTCCGCCGACAGCTTGATGTTGAACATTCAGGACTCCGGCTTCGATGACATGACTGAGAAGGTTTACAAAAGTAAATAACTCGTTTCGTCATT--------GAGTTAACGTTTAAGTTGAAAATTGAAACAAACTGAAAATTTGTTGTTTTTGGTTTCGA--GCATTGGCCAAAACTTTAGACATATGTAGACCGTGTATTTGAGTAA---------CGTTTTCTTAAATCTCTCTTTTTTTTCTCTTTGCCAACACACAATTCACTTCGTTTACGCTTCTTTCCTTTTCTTTTTACTTATTTTTGAAACGCGCAACGCAGTTCTAAACGATTTGGATTAAGTAAGCGGGCTA-ATTCATTATCTAATTGTTGATTAATTAATTCTATGCGATTGTTTTCTTCTCTTAATAACGCGAAATTGCATACATATAAGCCTAGTGCCTAAGTATCGTTTAGTTATATAACCTCTGAACGCGACGTCGCCATTTGCCGTACACACACACACACACACACTGTCTGCGCC
>l(2)03709 14336561 14336704|14314 chr2R 14334362 14337348 scaffold_11 815112 818039 + 80381|2348 2505
GATTGAAACACGGCCAG---------GCATTTTGTGGACCAATGATACCA-----ATGCGGGCAAATGGCCGCATCAGCATTTAACTTTCCATGTCCCATCATCGAGAGTCACGTGAAACGGAAACTGAAAATAAATGCGTACTGAGAACTGTCTGAA
GCACAACACGCGATCAACTGAGGCACACACAGTGTGTGGCAATGGGGTGACGAGTACGCGGCCAAATCGCCG---CAGCATTTAGCGTTT--TATCCCAT--TCAAGA---ACTCACCACGAAAACTT--AATAAATGCGCATTGAGAA---------
>CG15083 14351619 14351705|14326 chr2R 14351247 14360446 scaffold_11 842146 851402 + 406874|399 525
TCCTTATCATTCTACACTACATAAATTGTCGGGGA------------AGAGCCCACCGTTCG--TTCATCTCA------------------------GTGTTTGCAATAAAATGCT--TTGTTTTTT
CTCTCCTCATTTTG-GTTGCATT--TTGTCGGCAACTGTTTAATTTAAGAGTTTACCGTGTGCCTTCGTTTTATACATATTTATATATACAAAATAAATATTTGTAATTAAATACTACTAGAGCTCT
>CG15084 14366750 14366827|14332 chr2R 14366670 14367856 scaffold_4 846096 847351 + 27923|95 187
TTTTATAATGCTTTCTTTATA-AATAATT--AAATGATT------GTATAAAACAAAATAAGT------ACAAATAAAAAGAATTCTAATATA
GA--ATAATGCTCTATGCACACAATAAATGGAATCGATTTAATCCGTATAATACAACAGTTGTTCCTAAAAAAAAAAAAAACACATTAATACA
>Dpt 14380993 14381627|14345 chr2R 14380371 14381841 scaffold_4 860676 862432 + 8128|706 1569
GCTTCAT-AAATATTTTATTGT----------------AAAAAACTTCACCAAATATTATCTCGATTGGTATCCGAGTCTAGCT------ATTATAAAAACCATACCCACTTTG-------------TATATTCAGATAATTGCAAAATATATAACCGAATACAACGATATG----------------------------CATACCTGACC-----ATAATTTCACTATCTCAAAT---------------GCCATCAATGTCCTTGGCGTTGTTTGTTTAACCCGGAACATTGAGGCAGACTTCTAGAGACAGAGGCTGGTGGGTCAC--AGATGATCTTGCAGTTTGGCTAATTGTTGATACATCT---------------------------------------------TGTTTGGCCAACTCCGTTGGGTAATAACAAATTACGATGACAGGCGGTC-------------TTAATGAAACCTGCCA------------AGACAAAATGTTTTTTGCTAATTGGATTTATTGCGTAAACTGTCGAGAGAACCTTCGATGGAAATTTATCATGCGCAACATCCGCAGCCTAACCCGAAGATTA-----AAATATTACGCCAT-----------------------------CCCCAACGAAAGCGAATAAGATTCGCTTCGAGTATTTGAAAAATGATTCGTGCAGAGGCTGTATTCTAAACTCTTTTACAACCAAATTTGGGGATTACCAAAGCTTT-------------------TCACATCATTAATTCCAGCTAAGAA--------------------TGGCCAAATTGAGTTGACCTTGTAAAATGATGAATCGAT
GTTTCATCAAGTATTTGTTTATGCTTGGCAATATAAGAAAAAAAATTAACTGAACTTTAATAAAATATTTATTTGAATAAAATTTATCAAAATATATCAATTACGCCCTTTTTAGTGTATACACAATTGTATTGAGGTATATACAATTTGAGTACCTGCATTATAAGCTATATTATATATTGTTCATCCAGCTCGCTTCTCTTGTCTAATCTATGAAAAACTTAAAGATGCCAAGCTTAGGCTGGGCCTGGGCTATCCTTGAGCACGGCGACGTTCGTCTACCCCGGAACATACAGTCAAATTTAC---------TGCTGACAATCCATCGAGATGAGCTTGCAGCTTGGCTAATTGTACATGTGTTTATATTGTTTTTTTGTTTTCTATTTGTTTTTTTTTTTTTCTCCTGTTTTCTGGCTAATTCTTGTTGGTAATAACAAATTAAGCGCACACGACGTCAACGACTATTTGCTTAATGAAACCTGCCGCAATGTTTAGACGGATAAAATGTTTTTTCTTAATTGGATTTATTGCGTTAACTGTCAAAAGAGGCTACAATGAAAATCTATCATGC--------CACAGTCTAAGCCAAAGTCTATAAATAAATGTTGCTTAACAAATTGTTGTATTAATTATGTGTAGAACGCACCAGCGAAAGCGAAAAGG--------CCATTGGCTGAAGGGTGG--------GCGTTCCTATATCAAATTACTTCA-AATTAAAATGAATCATTTTCGAAGCTCTAGAACTCCCGAAACGGGAATTACAAAATGATTTTTAGGCAGAAAAAATTTGCATACATTTTTCGTTGCCAATTTAAACTGACCTTGGTAAGTTGAGGAAGGGT
>DptB 14382704 14382760|14346 chr2R 14381918 14383373 scaffold_4 862544 864280 + 7185|930 1011
G-----------GCACTTCAGAAGCTACATAATTTTTATTAAATAAAATAAATTTATTACAATT--------------ACAA
ACGGGGAAATGTTCATTTTAAATCATAAATGCTTAACAATAAATAAAAAAATTTAAATATTATTTACACGAGCTGTACACAA
>sano 14473067 14473298|14479 chr2R 14472580 14473378 scaffold_4 983001 983814 + 27035|488 756
GATGATTGCATGGATGT--ATCT-------------CCAGGATGACGATGACGATGAGGAAGTAGCA---------------------GCACGATGATGATGATGATGATGATTCGTTGCCAACTCGTTTCTAGCTGCCATCGACCCCCACAATACAGA-AACAAAAACAGTAACAGAAACAGAAACAGAAACAGAAAAACACTGAGAAATAAAACACAATAAAAGAAGAGCAACTACAACTTTTGGCACGCTGTGTGTGTTCCTGCAG
GATGTCAAAAGGGTTGCCGAGCTATGCGGAGTCGAGCTGGAATGGAGGGGAGTGTAGTGGAGTGGAGTGGAGTGGAGTGGACCAGAGTGGACTGGAATGAAGTGGAGGA-GATTCGTTGCCAAATCGTTTC--GCTGCCATCAACGACAAACCCACAGACAACAACAACAACAACATCTACAACAACAACTACAACA--------------AAAACAACAACAACAACAAGCATCAGCAATATTTAG--CGCTGTGTGTGTTCCTGCAG
>sano 14473456 14473773|14480 chr2R 14473398 14473935 scaffold_4 983863 984450 + 12542|58 433
CTTTCACCA-TTTAGCCTGCAGCAGCAATTTTAATTAAT-ATTGAATTGTGCCTTTCCCTGCTACGCCCAGAATTATGCTTTAAAACCAGATTCCAATGGAGTATTTGATGAGAATATTTCGACCGGATGGAACCACGACAA----------------------------AATGAAAGGCTGCCAGCACACACACACACTACTCACACCACAAAACG-----ACCACAAACACATACACAAA---GCCAACATACACACACACCACAC-ACACATGCATACACACATCAAGTCTATAAAATTGTGATTTTAATTTTATGTTTAATTTAATA---------ATTATTGCGAACCATCTTCAAA----------TTGG
CTTTCACCATTTTAGCTTGCAGCAGCAATTTTAATTAACAATTGAATTGTGCCTTCCCCTG---CGCCCAGAACTATGCTTTATACAAAAATTCCACTGAAATATTTTTGAAGAATATTTTGCCTGGATGGACGAAAGAGAACGAATAATAAGAGAGACGGAGATACAGTGAAGAAAAAATGACGGAAGAACCAAACAAAACCAATCACATGAAGCGCTGACAGCACACACACACACACACACGTACATACACACACGCACACAACACAACACACACCTACACACATCAAGTCTATAAAATTGTGATTTTAATTTTATGTTTTATTTAATATTATGCGACACTTTTAGTTAATATTTTTAAACGATGCGATGTGGC
>Topors 14491601 14492125|14504 chr2R 14487906 14491621 scaffold_4 1001692 1005299 + 75760|3888 3908
GCATAAGCCACTGATTTAGAT
ACTGAGGCCAGCGACTCGGAT
>CG15105 14523637 14523807|14539 chr2R 14522948 14524449 scaffold_4 1044479 1046012 + 44905|700 925
------TCAGAATCCGCGAAAATACCGATACAAGGAAAATCCATTGCATTATCTC--------------ATCATTAAT-----CGACCATTTTTATTTCGTCTTTAATTAATATTGGTTAC----------GAAGTGCCAAAGCAA-----------TTAATGTCCCTCTTTCTACGCCTAGAAATTGT--GTCAATTAGCAA-------TGGAGGAAAAGCAGCT
GCCACGCCCAAGCTCGCGCTCAGGCCGCCAAAGCGCAAA-CCAGTGCATTACTTTTTATGATGATTCAATTTATTAATTAATGCGTTCTTTTTTATTT-GAATATTTTGAATTTTGTTTGCCTTGAGACTTGCTGTACAAAATTGAGTGCCCATATTTGAATGTCCACATTTCTAGGCCTAGAAATTGCAAATCATTTAAGAAATCAACTCAAACAGAAATATGAA
>CG15109 14575307 14575933|14620 chr2R 14573736 14575740 scaffold_4 1126131 1128397 + 30001|1911 2365
TGCAGCACCACTGAAGCACCATCGCAAGCATAAATCCTCGCCGGCTGTGCCACCGATGCTCTACATGCTGCAACAGCTGTTGCAGCCCAATTTCGAGGGAAATCTCTTGCTGGAACC---ACCAAAGGAGCCACAGCGTCACGTTAGTTCACCCCTCTATCAATTCCTTGATGGCGCCATGGATCTGGCTTTGCGCAACAATCCCGATGTCATCGATCACCTGCTGGGCGATCACCTAGAATTGGAGCTG-GAGATGGAAAAAAAGAAGGGCAT-----CAAGGATAAGGCACTAACGAAGAAGGCCAAG---AAGGAGGCACAGAAGATGGAACCCA---------AGGAGGAGCTCATCGTCAGCTGTCCCATTCACCATGAGCACCATGCCAATCGTAATGGCGACGTGGTCGAAGATGATGTCGTTTTGGTGAACGAGTGCCATCTAGTGT
CATGACCAAGCCGAAGCATCATCACAAGCACAAATCC---CTGGCATTGCCGCCCTTTCTGTTCCTGCTGCAGCAGATGTTGCAGCCGAACAT------GAATCTCGATCTGGAGACGATGCCACAGACGCAACGCAATCGCTTGGAGGCGCCTCTTTATCAGTTCCTCGATAGCGCCGTGGACAATGCGTTGCGCAACAATCACGAGGTCTTCGAGCATCTTGTTTCCGATCAT---GAACTCGACCTGAGCGATAATAATAAAGAGAAGGATAAAGACAGGGACAACCTTGAATTGAAATCGGACAAGCCCAAGGAAGCTATTGAGTTGGCAGCAAATCGCAAGGAAGATGAACTAGTCGTTAGCTGCCCCATACACCATGAACACCATGCCAGCAATAATGGCGAAATGGTTGACGACGACGTTGTCCTGGTCAATGAGTGTCATATCGTTT
>5-HT1A 14634324 14634346|14706 chr2R 14633968 14635329 scaffold_4 1206632 1208133 + 6390|381 403
ATAGTGCATGCGAAGAGGCGAAG
ATAGTGCATGCGAAGAGGCGAAG
>5-HT1A 14635387 14636821|14707 chr2R 14635341 14636817 scaffold_4 1208526 1210247 + 10875|48 1790
ACGCTTCTGCTAAACCGACCAGCGGATGTTGATCTAACCTCTTCGGCTATAACCAGGATAACGAGGATTAACGCATCTTGTATACCAAAGACGA------TGAAATCAAGGACGACGCAGG--------------------ATCAAGGATG------CAGTCGAGCAGTCGCATAACCAATAGTTGTTAAGTGTGTAAATAGCAGATTGAATTGATGTTAACCTATGCA----------------AAATATATTGTGTTAGATATAGCTAAATTTATAGAGCCAAGTGGAGACTGTTTTTAGAAGC------AAACAAAAAAAGTTGAATTGTGAGGAGA-----------------------------------TGCCACCAAGGAAATACAAAAGT----------ATCTAATCAAAATA-------ACTAGAGATAAGCCACCACTACC--GCATAGTTGACATAACGAGCAATCTACTACCAATTTCTATGTGTTTTCCAACTTAAC-GTGAATTGTATAACTCATAACCGTGTTAGGCGCTAGACTCTATCTCTCTTCTCTGCTTCAGAAAAATTGGAAAATGGAAAATGGAAAAAGGGAAGTGGGAAATAGGAAATGGGAAATGGGAATCAAGGCATTGGAATCGTTATAACTGAA-GCGAGTACTCGATTATGTATAGCCCAGCTAGAGACATTTAATAAGCATAT------TGCATCGTAGTGTTA---------AGAACATTTGTTGAGCATCGTACTA--AACTGTAATATTGCATATAGGATC-----TATAAAATATCGAACCG---GTGGAAGCCAGTTTAAATTTAATTTAAACGTATTGTTAAAAGCCACAACTAGGTAAATTACATTTAAAA-----------------------------------CTGTTGTACTATTACTATTATGTGTTAGATTGGTAATTATGTGTCGAGGATTTCTTTGAATAAGCTGGCATATTACGTAAC----------------------------------------------------ATATAAGCAAACAGTTCG-------AATGACATGTAATATTTGAAGAGCAAACTACTTTCGGGAAAAATGGGTAAAACGTAATTAGCTAAAACAAACAA---AAACGTTAGAACATACACTGCATAATGAC-----ATACATAACATATATGT--ATTTATATGTTAGTTTAGACTAGACG---------GGTATCAC-----------GATGTTTTACCTAAATAAAACTACCAAGCGAACTATTCGAAAACCAAAATCAAAACTTTACGAAAACTTTAAGCCGACATCATTAACTAGCG-ACTAAGTGTTTGCAGATC--TGTCTATCT----------TTAAAAACCAATAGAAAATAAGGCAAATCGCCAATG-----GCAGCATAC---------------TTC--------GCAATAATTCGAAAGGACACCCACACATATTTCTAGCTTAAAATTGCCAAAGGCGGTTTCTTTTATTTATTGTCACTTAATTTTTTTTGTAC-ATTTGGTT--CAAACAAATTGGCGCGCATTTTTTAAAGAATTATTGCTGGGTATGCGT-GCCGATTTTCCGGGAATTTCGCT-------AAACAAACAGCATAAGTTAAACTAATGAGATTACTATAAAATTCATTGGCTGC-AATTTAAATAAAAATTCAACTTTCATGCAAAAAA
GCGTTTCTGCTAAGAAGGCGAGAAAATTT-------GCCTCTTCGTTCAACAAAAGAAGAAAGCGCATACAAGCAGAA-GCATATGAAAAAAGAAACGAATAAGAAGAAGTAGAACACCAGCACTCACAAGAAGATTGTATACCAAGAATGATATAGTAGCTGAAAGCCAGCGAACCAGATTATTTTTAAATAAATAAATA-TAAATACAATATATATAAATAAATATACATACAATAGAAGTGTAAATAAGTTGAGCTAAATGTGTTTAAAATT-CATAGTTAAATTATGCAAATAATTAAGACCTTTAAGGAACAAAAGAATTATGATTGTAATTAGGCCAATAAACTGTTGGAAACTGATTTTTTTTTGGCTTGTGTTCAAGAAAAAAGGAAAGTTGAACAAACTGTGTAATCAAAATACGATATTGTTATTAATTAGTTATGATTATCTAGAATTATTTAGCAAATAAGCAAAAAACTTCCAAAAAAAAAAAACTATGCAAATAACTTACGATTCGTGTACAATTTAAATATGCTAAAAA-------------------TATGGTTAATAAAGCTTGGCATAGGGCATTTTGGAATCGTTATAACTGAACCCGAGCATACTGAATCTATATCTCTATACATATATATATATATCTACATATATATATACGATATAGGAAAGCCCA-CTAGAGAGTTATGTTAAGTGTGTATAAAATCAATTAGAATTTAAGTAAAAACTAAAACATTTGTTAACTATTTTATGGCTATTAGCATAATTGCCTATTGTATAATGCATATAAATAATTTAATTGTAAATGTAAAT--GTTTAAATGCAATTTAAACCTATTGTTAAA-GCAAATTCTAGTTAAATTATATGTAAAAAAAAAAAAAAAAACAGAAAACAAACAAGAGAAAAACTGTTGTATTTTTAATGCCAAGC---AAGTTGGTAGCAA-ATGTCATGGATTTCTTTGAATA---TGACATATTAAATAAATTAAATGAATAATTAACAATTAATTGCTTAAGGGTGCAACAAATTGTGGTAAATGTGTGTAAAAAGTCAGCAACAAAAGCCACGTGTATTATT-GAAAAGCAAACTACTTTCGGGAAAAATGGGTAAAACGTAATTAGAAAAAGAAAGAAAATTAAAATAAATAACAAACTTCAAGTAACAACTCAAAATACTTAAAACATATGCTAGTTAAAAAGCTCGAGTTAAGTGAACAAAAAAAAACAATATCACAATTGAAATCAAATGTTTTA--TTACCCTAACTAATAAACGAACTATTTAAAAAACAAAAACATAAAT-------AAAATCAAAAGGAAATCTTTAAATAGCATTTTAAGAATTTACCGATCTATGTCTAACTAAACTAGATATCAAAAACAAAATAAACCCAAGAAAAACTATCAATAGTTATGCAGTATAAAGGTGGCCATAATTGTTCTATATCAAGCAATAATTCGTA---ACACCTACACTTATTAC------AGAATTGCATAGAGTGAAATCTATTATTT------TCCTTATTTTGTTTATATAATTTGGTTAATAAACAAATTGGCGCGCATTTAGT-AGGAATTATTGCCTGGTATACATAACAAATATGTCTAACATTAAACTGCAACAAAAATAAGCAACAAATACTATACTA---AAATTACTGTAAATTACATTGGCTGCAAATTAAAATAAAAATTGAACTTTCATGCAACAAA
>botv 14647982 14648581|14720 chr2R 14645140 14648123 scaffold_1 1013128 1016118 + 136690|2873 3019
TCGTACAACTGATCCCAGAATCCCTATTCCGACAAAGGCGGCCACTTC-ACTTATTATAACGAGGTGATCACCAGCTGAATGACTTCTAGTTGTAAGTAAAACTTATCG---GGCCTGTT-GCGGTTTTCACATATTTGTTTTTTAG
----ACTCCAGACTCCACAAATCATTTAGCAGCGGGCGTACTTATGCCTAATCCTTTTTACTACATTTT----AGCTGATAAGCATCTAGTTAACAAAACAACTGATCAACCGATCAGTTAGTGGCTATAACATGCGTAATTGTGAG
>botv 14647982 14648581|14721 chr2R 14648124 14648354 scaffold_16 382699 382934 - 430|0 246
GAATCTATATCAAAAAGCTAACCAATTTGAATATCTTAAAAATATT----ATTTAAGAACTCTAA--CCAAAGGTGTGCAATACGGAATATAACAAAAATTTTAAACAAACTATTAGTTACTCACTCATTGTAAATCGAACAAATCGTATAATCTGTGAAAACCAAAA---CAAGCCCATATGTATATACTCTAAATG-GACACA--AGTTA----GCCACTGATAAGCCAATCGAGATAGCACAGC
GCAGCTGCTACAAAATGGTAATTAAAGTGAATGTGCTTAAACTATTGCAAAGTTAAAGTTGTTAACGCTTAAG----GCAAAACGAGGAGAAACATAAA---TAAGCAGTCCAT--ACTATCAAAACACAGAAACATAAACACA--ATGTAAATTACATAAATGAAAACTCCAATCTAGTAAGCATAACATATAAATATAACATAATAGTTATTATATTATTGAACAGCAGCTCGCGCCGAAACAGC
>CG15111 14655770 14655901|14725 chr2R 14654522 14655886 scaffold_1 1022281 1023680 + 53375|1281 1414
G-----------TGCGATCAACTGGATATTAATTTATGTATTAGA-----CGAATATTCTAATTTAGTTTTTTACCGCAATCAAACTGACACGTTCCAA-ATTTTCCGCCCTGTACAAGCAAATTAAAGCAGTC
ACAAGGATTCCTTGCTGGAATGTAGGTCGTAATTTATTTATAAAAGCAACGGAGTATTTAAATTTAATTTTATACAGCA---------ACATGTAACAATATTAATCGCACGGTGCATACAAATTAAAATAGTC
>ena 14676552 14677482|14741 chr2R 14676484 14678878 scaffold_419 1330 3923 + 17848|68 1335
ATCAAAATG-----------------------CTGTCACGATA--------------------------AACGCGAATGTGTACCAG----------GCTCTATCCAA--------CTCAATGGGA--------------------------------CTAATGGGACGAAGATCAGGATCAGAAT-------CATGAGACTGGAGAG---GACAAGGAGCCGGGCGTGTAATTTAAGGCATTCGCGACATATTC------GATGATCGAA--GCTCGCAACATTGCCAGAATGTTGACGATCGATCGACGAGGTGATGGCATGTGCATAGGCATAAATACGCAT----ATTTATGATGCATTTGCTCTAGGTTAACACAAACATCTAGGCTAACAAA---------------AAAAAAACAAACACACACACACACACACACAAAGAT-----------GCAGACGATGAGGAGAAATTTAGTCAAAGTAATT------------ATATTTTAATGGGAAGAAC-----TGCTTACCGACATCTATAAGTTATGTAACT-----------AACTCTGTTGTACATTATTTTGC-------------------ATAAGTCTATAAGCCAATTTTAGTGTGAGAACAAGAGAATTGCTTGCAATCTTCGGTATATCGTAATCATCCCCCCCTTTTTTCGTTTGTTCTCCATACTACCCCACCTCTACCTTTTAGTTTGTTATGCTCGCCGGGATTTATCTATTGTTTCGTACC----AAAAAACAACAAAATCAAAATGAACAA--CGTTTGTAATTATACATAGAACGTATCTC---------TCTATAC--------ACAGCCACAAA--------AACATGCATATATATATATATATATATATGTGGTTTA-----------------------ATATATATGGAC---------TACTCATTAAACTAACC------TAAAGGGAACTAGTATTACGACTCAAAAACGAAATGAAA----------ACAATTCCACAAA--CGTCAT----CCATCAAAGCTCCTGAAAAAATGGAAAAAC-TCCACGCATTT------CCTACAACA------------------------AAACCACAACATTTTCCTAAGCACACGATCTCATACGACTCAATTTAAGAACCAGCAAGTCTTCAGCAAATCAGAAACATAAACAAACA--------------------AACAAAAAAAA-------AAAAC
ATCAAAATAAATATTTAGCCTCAAAGCAGCCTCTATCACTGTCTACTGTTTACTGCCTACACCAAGTATAACAAGAATAAGAACCAGAAACACCAACACTTTACACAAACACTGTCCTAAAAGTGAGTCCGGCTATGGCCGGGTTGTCGTGTCTTCAGCAACCGGCGCACGTGTCACGAACTGAGTTATATTGCATGTTAACAGAAATCGCGTCAAATATTTAAATGTGTAATTTTAAATATTTTAATTGTATTTCATTCATATATTCAAATGGCGCCCAACATAATGGGCATAT--ACAAGCAGCATATACATATATAAAATTTATATATATCTACATACGTATATAGATTTACCACAAAATATATATATATATATATATATATATATGAATATATATTTATATGTATATTTATATATATATATATATATATATATATATAGAAATATAAATCTTATACATATACGAAAGTACGCAATTATGTATCAGCTTTTTACGAGAACAAGAAACTTTAGTCAAAATAATTTTAATTCTAATCGA--TTTCTAAGTTACGCAAATTTCGTGCGAGGAAAATTTTAGTATGTAATTTTACAACTGTACATTATTTTTACATAAG--TATAAAACAATTTAAATGT--GAACAAGA-AATGCATTGTATACTTT--TGTTCTGTGTTTACCCAGCGTATTTTGTCGCCCTCTAACCTCCTAGCCGATGAGGAGCACTTA-TTTCAAATGCATTTCAT--TTTCGCTTTTCTTAAATACCAAAAAAAAAAAAACAAAAAAAAAATCAAAAACTCGTAAATAATTACATATA-AACATAAGCCAAAAATAAACCTATACAAGAAAAGAAAGAAACAAAACATTTTTAACAAGCATCTATCTAT-TCTACATATAAGTATATCACACACTTTCTCACACACACACACACATACACAAACACTAATGCATACAAGTTTAGATAAACGCGTTGTAAGGCAGTATAGTATTACGA---AAAGACGATTGCAAATTTAAGAGTCGCAATCCCATAGATGCGTCATGGGATTATC-AATTTAATCAAAACACAGAATAACGTCAATGCATTTGATAACTCTTCAACAATTCCCCAGTTGACAACTGACATGAAAACAAAACACTTTCCTAAGT-CACGATCTCA-----------TTAAAACACAAGAAATATTGATAAAACCCGAAATATACCTTAACAACAACAACAACAACAACAACAACAAGTAAAAAGTCTTCAAAAC
>CG10737 14691853 14691947|14752 chr2R 14687522 14693050 scaffold_1 1050046 1055761 + 123384|4734 4838
ATCCTTATTTT-----GTGACCAATCCA---ACTATCTGAATACTTATTC--TTTTGTAAACAACTTGAATCCGCCAAATGCAGTTTGATATTTACCAAGAGCA-
ATCAAAATACTCACACTTAAATATCCCATACACTATTTGTATTAATAATTAATATTGTAA--------TGTCTGCTAAATGCTGTTGAATATTTACTGTAAGCAA
>CG10737 14692731 14693091|14752 chr2R 14687522 14693050 scaffold_1 1050046 1055761 + 123384|5841 6209
ATATGGGGAATACCCTG----GAATCCAA--------------------GCCAGACAGCCCCAAGCCGAGAAACCTTAATCGAAATAAT---ACCCTAGTTACATAGAAGTGAAGGAAGGAGCTGTGCTAAC-CATCTTCTTCTGCTATGGAAC--ATCTCGATACATTTTACGTTATTTAT-TTATACACTCACGCGAACACACACATGTGCAATAAGTTCTTTGGATTCG------------------TTTTTAACCCATTTCTCCGTGTCAACGTGCTCGAGCCCTTTGATATTTTGTATTTTCTACAAACACGAATAATAATTGTACAAAATAAAAGTGAATTAGGGTTTTTTTTTTAAATTAAA
AAATTTACAATGCACCGATTTGAATCGAAATAGTAATTTTAAATAGTTTGCAATTTATACACTAAACGAAAAGAAGTCATCTAGATTATTTAAATCTTGAACTCTAAAAACAAA--AAGAAAATACACTTGCATACATACTTCTG-TATGTATTTGATCCTTATCTCTTTTACTATAATTATGTTATATATTT-------TTTACACGAGTGCAATA----CTTTGGTTTCATTTAAAGAATATCTTTTTTTTTTACTGAATTTCTTAGCATTAACAAAAAGAGAGCCTATGAACATGTTTATAAT-TACCATCACGAATAATAATTGTACAAAATTGAAAACA------------TTTTTAAATAAAA
>CG7097 14741003 14742063|14801 chr2R 14740893 14743345 scaffold_1 1096397 1098849 + 66273|111 1324
GCTAATGGGCGCCCGCCCAATCCACTGTTATATTTTAAATATAA--------------TCCGGTTCAC-CACACACA-----TTTTAAAGG----------GCTGTCGCCGCCGTCGTCGTCAACTATTAACTGTAATTTAATTACTCGTAGGC--TAAGC---AGTGAGTTCA--CTGATCATAGATGACTAGAGAGAGCCAGTTGCATGCCGAGCGTTCGATAGCTTAGATTAGCGCAATTTAACAGCACCTAGAAGCGGCGGTCTTCGAAGAAGGGTTCCACACTACCATGCACACTGACGGGTATACTCGACCCGAATCGCTA------TCTTTAGATCTGCCGATCACTCGATATATATTGAACGTCTGCGTCTACCCGATTCCGTTGTAGCTATATTTTTGTATTACAAAGA------------AATGCTTTAATTTATACAACTAACCTTAATGAACTACAGTAATCGCTACGTCTAGTTATGTTAGAGA--------------TTTGTGTAAACGCTTCACAAAGCCAATAGAT-------ACGTTTTCAAATAGTC---------------AGCCAGCAGGAGAATCCAAGTATACA---TACACTTAAACACGCAATTATCCACACGATTCGAGACCGACTAAGGCAATTAGAACTAAACAATTATATTTAGTCTATAGCAATTGTAAATCGCAA-TGTTTT-TAGCTGGT----------TAAACTGCTTTCGA---TTGGCTCAAAACCGCAACGGAAAATCAAGAACGAGAAATTGAAGAATGCGATATAGGATG---ATACGGTTTGTTGGGAAACAAAACTAGTTAGTAAGACTTTTCTAACCTAGTAACACGAATTCAAAACAAAATAAATGCA-----------------AATTAATGGT-------------------CTGTATC---TGTATGTTAAAAAAGTAAACTGATTGTCATAGTTACGGTTCTAGGCTATAAGATAAGCGATGAAAACAGACAACTTTCCGAACAGCACATTTGTCGATTGAGTTGTATAAATATTCTACTAGATGCT--AAGTTATTTAGTTCATACGACAACAACAAAGCAAAAACCGAAAATTACAAACTAATACGGAGAAAAACAAACAGATAAACTCACAAAATTGTTGAACTCTAGCTTAGTGCAAAAATAAAAAAAAAATACGTGAAAGAAA
GC-----GGCGCTA---------CTTGTTATTTTATAAATATAAATACACATATGATACAAGATTCACACACACACAATAAATTTGAGATGCAAGCGAGCAGCTGTCGTCG--GGCGGCGTCAACTACTAATTGTAATTGAATTACTCGTAGGCCGTAAGCTAAATTAAATACAAATCAAGCATAGGAAACTACA-------------ATTTTGAGGGCT-----ACTTAGA---GCGCA-TTTAATTCTA-----AAACGAGATTCTT----GAGTCTCCCCCCACCCCCATTTTTTCC-------ATTCTTTGCCAAAATCTCTAGGAATGTAGTTAAATGT----ATTAAACGAGTTAAGCCGCACAGTCA-GTCTACCCTGTTCCGTTGTAATTATATTTTTGTATTACAAAGAGATAAAAACAGAAATGCTTTAAATTGTATGCCTAACTTTATTG-------GTATTTTGCATAACAATTCATTTTAGAGAGAGAGTAAACAAAATTTGTGTAACGAA--CACAAAGCAAAAAAATTTAGTTTATAGTTTCGAGAGATCCGGAAAAGAAGATTGAAGCAGCTAAAGAGTCAAAGTTGGCAAGTTGAGGTAAGGCGCGTAATTATTGTCGTAAT---------ATTACTGAAAATTTAAC--AGAAATTGCAT--AGGTTTTAGCCATTGTAAATCGCAAGTGTTTTGTAGTTGGTAATGTAAAGCGAAACTGCATTAAAAAGTCGTCTAACAACCGACAAGAAAAGTCTA-----ATAAATGTGAAAATTGAATGGATGGAGCGCATAAGGTTTGTTGGGAAACAAAATAGATTA---AGCATTTTCT-------TAATAAAAAATAAAAACAAAA-AAACACATTTGAACAACAGTTTACAATAAATTGTTAAGACCTTCAAATGGCGCCTGTATTAGTTGTACGTTGAAAA------CTGATTGTCATAATTACGATTTTAGCCTA-------------AGAAGAAATCAATTTTCCGAGCA-CACACTTTTTTCATCAGTTAAAAAAATAT--------ATGCTTTAAGTTAATTAGTT-GTACGTGAATAGCGAG----AAACCGAAAATTATAAATTAATAC------------------------AAAAACTTGTTGAACTTTAGTTTAGTGCAAAAATAAAAATTA------TTTAAAAAG
>cora 14758184 14758621|14809 chr2R 14757899 14759167 scaffold_1 1114662 1115908 + 28344|289 877
ATTTTATAATTATTTTTAAACCATTCGGATG------------ATTTTCTA------------AGTAAACCCGCACACACACTCACACACATGAACACCAGCCCACGCA-------------------------------TACGCAGCACTTGCAGTACACCTTTTATACAACCTATATCTAAATATAATTTAAACAAATATATATATATATACACACGAGTGTATATTTGAGCTCGAGCTGATGAC--CCACATGACATAACACTAAGAAACATAAAAAGATAAATTCCCAATTATCCGTTACCGCAACCGTCTACGAGAAAATGCAT----CTACATGTT-----TATTATTTTTATT----------ACAACTGTTGTTTATAATTACTTT------TTATTACGTATATT--------------------------------ATATATTGAATGTGCAAG-GCAACGT------------TGAAATGAAAACTCTATATA------------------------TTGTAAACCACGATTGCATTCAAATACAAGAATAAAACCTAAATGTACACACACAAAAAAA
ATTTTATAATTATATTTAAACAATTACGAAGTAAAAGCCACACAGCTTCAGACCACAGTTAACAGTTCACCCACACACACACACACACACACACAC-TCAGACCACGCACCACCAACATACAATCAACAACAAATCAAAGTACACAGCACATCCAGTACACCTTTTATACTACCTACCT-----------------------------------ACTTAAGTTTATAGAGACGGACATACTGAAGAAGGCCACATGACTAAATATGAAGA---ATACAATATTTTCTACAGAGCTATCCAT-------AACGTTTTTGAAGAAATACATATGCCCATATGTTTACAATATTTTTTTTATTTTTTAAATACAAAACTGTTGTTTATAACTACCTTTTATTATTATTATGTATGTCTAACAGAATGCATTACAAAGCTAATGCCTAAAGTATATTGAATGTGCAAACGCAAAGTTAAAAGAGAAAATGAGATAAAAATTATATAAATATATAAATGTATTCATTACATATTTGTAAACCACAATTGCATTCAAAT--AAAAAGAAAACTTCAATGTACACA----------
>wbl 14765666 14765777|14821 chr2R 14765171 14765667 scaffold_1 1121762 1122264 + 22199|501 502
AC
GC
>wbl 14765666 14765777|14822 chr2R 14765773 14766948 scaffold_45 835031 836291 - 6723|0 4
ATCCA
ATTTA
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TTAACGCTCACCATGGCCTGGCAGTATGCCACGGACAGCCTAGACTCCTTGGAGTAGGCCAGGCTTAGATAGCAACT-------------------CCTATTATTCAAACCCAAT--------TAGATCCATCCTTGTGTTACT--------------------------------TTCCTTACTTACCATCGGC--GACTCAGGCGCCGACCAGCGTTGGTGAAGCTTTAAACGAAGAAACCTCATCCCAGTCGTTGTGGGAATCATCCGCACCAGCACCTGGCACCCATC------------------------------GAAAATCAAACCCACACACTAAACTAAA--TTGTTGTCAGCATCACTTTGTGCCTAAAAAAAACAGAAATGTTAGGATATAGATAGTAGGATAGGACAGCATAGAATACAGATAGG------TACCCTTAGGCTAG--------GCACTCGTA
TTGATGCTAACAATGGCCTGGCAGTATGCGGCCGATAGCCACGATTCCATATTCTAGGCCAATCTTCGAC-GCAACCAAACCAACCCACCAACCCACCCATTTTACCTACCACACTCTGTGTATAACCCCATCCATTCGTTTCTCTGGTTCGGCGTACAACGTGCAAACTTATTTGTTGTGTTCTCATCATCGACATGCCTCGGCAACGATTTAGCGGTAGTGAAGCTTTAA------------TGACCCATTTTATCCCGGAAT-ACCCACCCCGGCACCGACCCGCAAGCAGGGCAAGAGACAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATCAAACATAAATATAAAACAAAAACTTGTTGTCAGCATCACTTTGTGCCTAAAAGAAATAGAATTATTCACATAAAAATAAATAGATTTAGATATATAG-ATGTATATCGGCTAGTTTAGGCTTAGGCTAGACTTACGAGCACCCACA
>rib 14794978 14796259|14858 chr2R 14795381 14796119 scaffold_1 1150748 1151518 + 6279|0 843
AAACAGTGTTACTCCAC--CATCCCAGATGCCGGCCA--ACTGACAAAACTAAGATATGT---------------------------GTGCATATGTAAACCCACTTACATAAGACTGAAGGCGGAATCGGGAGGCGGTGGAGGAGCTATCTAAGGACAGAGCAGTAGAGGCTCCCATCAGAATGGGTTAG--------CGGGTTAGCTACACCTTGTACAACTTTGTT-AAATGCCAGTGATTTGTTTTAAAAATTA-TTAGCACTAGATTATTTATAACGACCATGCA-TGTACGTGGCCTTACTTTTATGATTTT--CGAATCGAAGAGAAACCAGAAGATCC----CACTTGAACAGAACTACCTCAAATAGC--------------GTATCTTT-----GTTAGCCTC----------------------ATGTTATCCTGTTAGCGAGATATTTA-----------AATCGTCCTGGGTTGAA-TTTATAAGACTGACACCGACTCAAACGTAC-CACGAGCAAGAGCACACGCATTAAAATAAAATAAAATAAAATTATAAACTAAACTTAAATACGAATCGAGATCCTTAGTTGAAAATCTGTAAGTTTCCCGCAAATTGATTAGTTCTAAGGCCATCAACTAAACGTAAGCACTAAAACTAAACTATTTATAAGACAAAACAAAACAAAACAAAAAACAACACACATGAAAACATGCGCTGGGGGCAATGCAATAGGCTCTTTAATTATAAACACCTACACTTATGC---AACTTATATAGTCGTACGGTCGATAATGTTAAATTGTTATACGAGTAACTCTGTACATAGCATCA
AGGCAGTGTTAGGCCATGGTAATGCTTATGTCGCATAAGACTGATGAAAAGTGGGTGTGGCAGAGCAAAAGAGGCTCATTATATAGAGTATATATATATATATATATATATA----TATATATAGAATCG-----------------TTTCGTTAGGCATAGCATTTGAGA-----ATGGATCTTGGTTAGATCAACAACAAGTTAGCAATACTTTGTACAACTATCTTAAAATGCCAGTGATTTGTTTTAAAACTTCTTTAACGCTAGATAAAAGCAAACAGCTGTTTAGTTTACGT----TTTGTTTAATTACTATACTGAATACGATATGTATTTTGAGCTCCATTTACCTAGAACCGAACTACCTCAAAAGGCTCAAAAATCAATTGGTATATTTTACTAGTTAACTCCTATACATACATATATATATATATTGCTTTTTTTTTTGTTACATTTTAAACTAATCAAATAATTGTCCTGGGTTGAATTTTATAAGACTGACACCGACTCACACACACACACAAACACTTACGCACACACACACACGCAAGCAGGCACAACATTTAAACCCAATCGAATGCGTACAAAA----TTAACTAA-----------------GCGAATTAATTAATTGTAAG--CTTAATTGAATTGTA---ATTAGAATTTTA--GTTTATAGTGCA----AAAATAATGCAAAAATCAA-------ACAAACATGCGCTGGGGGCAATGCAATAGGCTCTATA--TAAGTACACATAAGTATATGCAAAAACTTATTC--TTACACATACGATAAAGATATATATATATATACATATATATAGCTATAGCGTTA
>FK506-bp2 14805600 14805827|14870 chr2R 14804983 14805845 scaffold_1 1155336 1156233 + 22052|651 936
GCG----------------CACAGGATGCCCAATGTGTATA-----------------CCCCAAACCAAATCGCAGGGGGTTGCGGACCGGCGCACCGGCGACGAGCCG---------AAGAACATCATAATCGGAACCAGAACAATCCAGCAGCATTT---GCCAACCCAAAATAATAATGATAACTTCATACACAGCTCTAAACTAGAACTAATT-----------TAACCGCAAAGGG--AACGCATCTTCTACCAATACAAATAAACATTTATTCAAGTCAA
GTGGTCGGATGCAGCAAACAGCCGAAGACCGTGTGTGTGTATGTGTGGTGAACACCTGCTACACACATGCACACACGCGCGCACGCATATACACACCTATAACCTGGTGCGCTCCGGCAGTGGCAACAGAACC-AAACAAGAACAATCCAACAGCATTTTAATTCTATTCAAAAT-ATAAAGGTGGCCGC-TGTGGTCCATGAAATTAGACTTAATTACCAACACAGATAAATGAAAATGGCAAACGC-----------ATACAAATAAAGATTTATTCAAGTGAA
>CG7417 14818497 14818887|14884 chr2R 14816501 14819614 scaffold_1 2476975 2480402 + 47433|2286 2896
CCCAAAAAGCTGCACCAAACGATAACAAAG-----------------------------------TTCTCTTATCGTGCATGAG------------CTAGCTCCTGACTGTTGTTCT----------------------------------------------------------------TGCATGCT--CGACTTTGAAACTGTGATAGC--ATTTAAACTAGTAGGC-----GGCAGGTTCATT-----ATCCACTGCATGGCTCCACC-----------------------TGAAAGACATGTGCGAAACGA----AAACAACAG--------------------------------------CGAACGGAAAC-------GAATTGCTTAAGCGCGGCCTTTTTAAATTATTTTAACATATTCGATTTATGTATGTACAT---------------------TAAATGCAATCGCCTCAGCCTCAGGCCGTTTAATTTAACAATATCCTCTAACCGTTAAACTAGCATTAAGCCAACGAGAAACAGAGTTTATTAT--TTTTAGCCCGCTCAAAAGTAAATAAAGAACGTTATTTAAATATTTACAC
TC------GATTGATCGACTGATAATATAGAACGCACGATCGATTGATCGATCGCTGGCTTGCCTGTTTGTTATCATTGATAAGTGTACTAATTGTCAAGGACCCAAGCTATGTTCTATATATATACATATATATACAACCAAAAGTTTCTCTAACATGCATTGGCTTGCGCACTTTTGTCTGCATGTTGGCAACTTTGAAACTGTGATAGCATATTTAAATTAGTTTCCAGTTAAGCAAATTAATTGAAAAAGTCAAGGCACGCATGCAGCCTCTATAAGTATATACAAATAAATGCACTAAATGTGTGTTACGAACCGAAATAATAGCTCGTTTCAAAAGCACGACAAATCTTAAAAAAAATATACAAACAAAAACATATACGAAACAGATAAATGGAAATAATTACAAATTACATTAACCTATTTAACCTATCTATTCACATATAGCTTATGTTTAATTAATATTTATGTCAATGCATATGCCTCA--TTATCTGTTTTATTGATAGCACCTG----------TATTACTAAGC-------AAACAAAGTTTATTATTATTTTAAGCAGCTTGCA--TAAATAAAGAA-GTTATTTAAATATTTACAC
>CG7461 14821971 14822047|14886 chr2R 14820161 14821971 scaffold_12 3176610 3178421 - 82159|1811 1811
A
A
>CG9975 14859190 14860425|14928 chr2R 14857422 14860397 scaffold_4 2355374 2357961 + 55997|1810 3149
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------CTTGC-------------CATCGTCTTA--------------------------------------------------------------AACACAACCGCACACTCACGAAAG-ACACACATATACATAAACAGAC---AACATCTAGACAGT--------------------------------------------TTTGGGGACTGTTGCGCTGCCGTAGCGTGGAGAGAG--------------------------TAATAACCAAAAATAATATTAACAGAAAAA--GCTTGAAACTTGAAAAAGGCTCGCAATAGGCGCGAGCAACGCTAACGACATTCTGACCATATGTATAACATAAAAGACCTAAGGCCCAATCTCTGCGTGGTTGGGTAGCTTCTGGATGTCTTTCGTTACTCGACGTAAGCGCAACGAAACTAAAAAGGAATTCGTTTT---TAGTTATCTTTTCA--TACTCTAACT-------------TTTTGATATATCAGTGAGAATTTAGTAAAAACAAAAAAAGGAAAAAAATACCAACTTTGGGACACGTGTCCACTGCCCTGCCTACTACTTGAAAACGCTGACC----------------------------CTTTTGGC---------AGATTGAATGATGCCAGCGTTTTAGTTTTTAAGGCTCATTTTGGCATAAGAAAAGACTTCTCTCTAACCAAATTTCTACAAAAAAAAGACGTAAAATTAAAAAAAAAAAATGAAGAAATGATTTACATACATAAAGAAAAGCCTTAAAAAATTTTCACATGCTAACAAAATTTAAAAAAAA--AATTAATTCGC----AGCATGGCGCGAATATGTGTGTGCAACAATTAGTAGGCAGTGGTCTTAAGAGGTGGCTGTCCCTCTGATCGAACGCTGGACTGATTTAGGTGACAGTGCCAGTGATATTT---TTATTTACATGTTA-CAGTTAAGATTAGTTTGTGGTTTCTGCAATCCAAACATGTTCATCCACACAGA--------------TACAAAGTGAATATTGT-TACATTCTGAATTG----------------AAAATTCAAAGT-------GAACAATCCCACAATTTTAACACACTTACGATGCACCATAGAAAAGTGAGAAATTAGCAAAGTGTTTAGCACA-----ATACAAGCTTATATTACGTAGC----CGACAATACTTGACTTAATGTTAAATACAATTAAT--------------------------GCAAGTCCAATCGTCTTACATGCGAACACTACACAACCACTTTTAAACTTTAGACAATT
>CG11961 14877155 14877236|14945 chr2R 14874052 14877172 scaffold_4 2378357 2381439 + 113231|3148 3165
AGAAGCTATCTAATGTAT
AAAATATATGAAATTTAT
>CG10051 14882077 14882157|14947 chr2R 14879166 14886956 scaffold_4 2385343 2393177 + 232159|2923 3003
GCGGCGATGAGAATATAGACTCCAAAGTTGGCGTATCTTAATAAATAATTTATAGTATATTTTAATAAAATTACAAAGTAG
A-AGCTACAAACGAATAGTTTACAAA-TTTCTGTAACTTAATAAATTATTTTAAATATATTTTAACACAATTATAAGCTAA
>CG10062 14894910 14895040|14952 chr2R 14894736 14895222 scaffold_4 2401347 2401805 + 7060|174 309
GCCAATACGATATTGATATTGCTTCTGATTTACTAATTGTAGTCATTAAGCGTTAACCATT--AACTGT-ATAGAATCTGATA-CCAAATACCAAATTTTATTACATTACGAATACTATAATTACAATCG-AGAAC
---AAGAGGCCATCGAT-------------------------------AGCAATAACAAATAAAACTATAATAGATCTTGGTATTTAAATACTAAACTAATTCAAAAT---TAAATTATAATCACATTGATAGAAT
>CG10073 14899756 14899836|14954 chr2R 14896213 14900169 scaffold_4 2407639 2411461 + 62458|3644 3726
GGACTTCGATCTCGATCGCGAAAATAATTATTTTAAACACAAGTCGAACAATAAAATGAACTGCT--AAACATTGAATAATAA
AT-------------TAACAAAAATAATATT---------------ATCAAGGATGTAAGCTGGTTCGAATCTGGAGCTCTAA
>CG10081 14904117 14904187|14958 chr2R 14903383 14904188 scaffold_4 2424041 2424864 + 14373|755 836
TTATATTCAA--TAATTAAATGAAACTCATGAAATCGTTTCTT----GTATATATTAATA-----AAAATGTGTTGAAAAAA
TTATATGCAAATTGCGAAAATAGCAAGCACGAACAATTTTCTCTAAAATAAATATTAATATGAACAAAACGAACTAAACAAG
>CalpA 14943448 14943913|14990 chr2R 14942011 14943532 scaffold_11 2468415 2469936 + 65436|1475 1590
AAATAATGAGG-----------GGTTTCTAT-----------AACTAAAAGCTTCTTACGTGCAATATGT---------GGTATGTTGTGACTATAGTATTCTTTAATCTCTAGTG
ATGTAATTCAGCAGCAGATTTAAATTTCTATTCAGTCCTTTAAACGAAATGCAATTTGCAAGGGGTGGGTATATGACAAAATATTTCGTCACTATATGCATGTATGATCCTTGATG
>CalpA 14943448 14943913|14991 chr2R 14943533 14945162 scaffold_11 2470211 2471869 + 38349|0 408
CTAGTAAATGTTTGACTAGATTTGTTTC-------TTTACCCTCTACAC--ATTCCTGACAGATAAGTTGGTTATGCCATT----------TTTTAATCACTCCTCTTATATATATTTTTACCTGAGATTAACGCCTGCAGTATTCCAGAAACTCGAAATATATTTCTTCTAGATAAATTCAAATGTAATGTCGGTCTGTCTGTTACATGTTAAGAATAATTCTGATCAATATGAAGTTCAATTTTCT-TAATTTATCAGTTATAAA--------AAGGGTGGCGGCAGCAACATAGTGAAATCTATTAACAAAGTTAAATTTTTCGGTTTATTTTTAACCCTTGTTTAAATTGTATTTTTGTCATGTAACGAGATATTTATTAAAGTAATAATAAAGGAAACTTCCAC
CTAATACGTCTATTATTAAATGCAGTTTGCAATATCTTTCCGTCCAAACGTATTTTTTATAGAT-------TTATGCTCCTAGAAAGAAAATGTTAAACATTTTTCGTAGGCAAGGTTTTTTTT-----------------TATTTCAAATTTTAAAAATCAATTT--TCTATATAAACTAGTATGAAAAAGC----------TTGAGAAATAATACTTTTTCTATTC--------GCTCAATTTTCAATAATATATTATGTATAACGTAATTCCAAATGTAAGATTTTTAAAATAAATATTTTGTACAAAATAATTAGATGTTT----TTTTTTTTATTTCATTTTTATACATTTGTTCTTTTTTGCATCGCCAAACTAAT---AATTTTAACTTAGAATATTT----
>Spt5 14956655 14956762|14994 chr2R 14952572 14956665 scaffold_11 2480120 2484409 + 188403|4330 4340
GCTCTACATAC
ATTGCATGAAC
>RpL11 14958304 14958382|14995 chr2R 14957262 14958353 scaffold_11 1366055 1367257 - 41135|1166 1224
AGGAGCTCTATCAGTAACCATGTTTTTT---------AAGAAGAATTCTACAATAAACC
ACGCGCCTCGC--GTAGCTGTTTACAATCTAAAAAAAAAAAAAAATTCTGTAATAAACC
>mei-W68 14973969 14974387|15013 chr2R 14972706 14974092 scaffold_11 2497593 2499067 + 25878|1363 1497
-----------AGTTCAGTGGTAAACCCCATAAGCCAAATATTATTACTCTTGAAATATTATTAGTTAGTTTAAAATATGTTGTAGGTATAGTAATATAGTAATTAGTTTGTAAAAAACGTATCTCTATAAAGAT
TTTTTTCAAATGGTTTTCTGATCAAATCAGAAAACCAAAAGTTG-----CCTTGAACATTTTCACGCACCCAAAGCTA--------ATATACT--TAAATTTATTTCTTTAAAAGAAATGTGTTTGTATTAATAT
>mei-W68 14973969 14974387|15014 chr2R 14974115 14974273 scaffold_1 138324 138490 - 1224|0 174
TACTGTAAAAGTTAGTTCGCGTAATCAGCTTTCCATTAATATTTGAATTAATTAAGATAGTAATTTAATAATTAAATTCCC----------CATTCATTGGGATTCCGATTTTGTTGCTTATGTTATAAAATGT----AATGTTTAATTTCAATGCAGCTTTAA--TAACGTCAA
TACTGTATATGTTAGTAAGAGTAATCAACTTTC---TTCTATATAAAATATTATTTACACTTTTTTGAAAACTCAATTTTTTTTCGTACAATTTTCTTTG----TTCAAGTTTGTT-CGTGCCCTGAAGAATGTTTCCGATGTGCAGTCTAAATATATCAAAAAATTAAAGTTAA
>mei-W68 14973969 14974387|15015 chr2R 14974274 14975527 scaffold_11 2500132 2501329 + 21535|0 113
TATAATATTACGACTAATTAATATTAAAGTACCTTAAGATCCTTGCCTTTAGAAAACATAATTTTAATATTTGGATAACGGATAATAGTAATTTACACTCGTAATGTCTGAGTA
TGTAATATTGCGATAAGTTTGCAACACAACA------GAATTTGAGCCTGAAAAGATATCAATGAAATCTTTGACCCAC-----------ATTTCCAACAGGAACGTGTGAGT-
>par-1 14996027 14997425|15038 chr2R 14995406 14996486 scaffold_11 2524111 2525306 + 26481|730 1294
TTAACAAAACAAGC-ATTAACTACTTCTTGTTAATA----GTTCTAAAACTGAAACTG------AAACAAACGATT-CCCCTAGAGTAAACGCGCGTGACG------GAGAGGTTCAGATATGAACAGACAGACACAGATATGGTCGAATCCAATCGGATCGCTCGGATCGGAT-CAGATCGGGAAAC-GATACTG-TTCACGTTGCCGTTGCCGATCCGAAATCGCTTTCGAATTCCATTTCGAGTTCAGATCCGTTTCCGGTTTCGATTCG--AACCCCTTCAAATGAACACCGACAACGTTGAGTTCCGTTGCGTTA--------------------------------------------ATTGAAATTTCACAAATA---CGCCTATGTTTTATTACAATTATTAACTAATTATACATATAAATTTATATAAATTAAAG-----------------------------ATACATATACATATATTTAAAAGTAA-----AGCAACCACAAACAGAAATTACGAAACCCTTTGTTTTCATTGTTTGTAAAA-CGATGCGAG
TTAACAAAACAAGCAATTAACTACTTCTTGTTAATAGTTCGTTCTAAAACTGAAACAAACAAACAAACAAACGATTCCCCCTAAAGTAAACGCTCGTGACGAACAGAGAGAGAGTGAGAGAAAGAGAGAGAAAGAGAGAGAGAGAGAAAGAGAGAGAGATA---CAGATATGTTACAGATATGAAATCAAACACAGATACAAGATACAATATCAGATCGGA----------GCGTTTCACTTCGGTTTTGATTCC--------TTCCGATTCGTAATCCCCTTCAAAAGAACGTCGACAACGTTGAGTTCCGTTCCGTTACGTTACGTTGCGTTGCGTTACGTCACGTCACGTTACATTACGTTAATAGAAATTCACAAAGAAAGCATCTATGTTTTACTACAATTATTAACTAATTATACTTACACATTTATATAAATTAAAATACACACACACACACACACACACAAACACACATATATATATATATTTAAAAGTAAAAATCAACAACAACAAACAGATACCA-ACAATTCTTTGTTTTCTTTGTTTGTAAACTCGATTCGAT
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TGAGTTCTCGACTTCAAATCACAAATGAAATT--------------------------CGAAAATATAATACGCATAG---------------------GCTGTTGCTATGTCATTGTCACTATTTTCCATATTGTT------------TTACTGCTAAAACTGAAACTGAAACTGAAACTAAAACTA----AAAC--------------------TACAAACTAAAAACTAGTAATGCT-------ATCTAAAATAT-------TAACGTTATATTGCGATGCG-CTATCTTAGTAATTAC-ATATAATATGTATACATATACCACGTATATTTATCCGAATCGTT---------------TAAGTTCACACCAAAAGCAGCTGCGAGTTGTTAACAAACAAAAAATATGAATTCAAATTTACCAATACCACAATGCAAATGTATCTATATCTATGTACG--TATGTATGCAGGTTGAAATATG-----TATTTAAACTGT-TCCGAAAATCATATA--CAATCACGATTAA
>par-1 14996027 14997425|15040 chr2R 14997104 14997613 scaffold_11 2525807 2526307 + 10075|0 333
ATTCATAATCACCCA-----------GAAGCCAGATGTGCAGCGTATCTAGTAATTAAGCATACCACGTAGTCACTAAAAAACAATACAAAGCGATACATGAAAACCAATTTAACTTAAATTCAAGGAATAACAATGTATTACCACTA-GTGCATGTGACCATTTTATTTGTACAGCTGATTATCTATAGATCGTGTTATCATCGGGCGCCTTCAGTGGCTCGATCAGTAGTTATCTATACATATTAAGTTTCAAAGAAATAACGCATAATTAAAACAATTGATAATTTAATAAATCCATAATAAACGATGTGAAACATTTGCGAGCAAAAGAA
ATTGATAAAAACACACTGATTATTATGAAGTTGAAGTCGAAGCGCATC----AAACGAGCGTATT---TAGTAATTTAAGAACAATGATTAGTTAC-CATAAAGA--AAACTATCTTTAA-TCAAGGATTAAATATGTATTAAAACAACGTGCATGTGACCATTTTATTTGTACAGATGATTATCTATAAATCGTGTT---ATCGGGCACCTTCAGTGGTCTGATTAGT-------TATATATATTAAGTTTCAAAGAAA-ATAACATAATTAAATAAATGAATAATTTAATTA----GAAATAAATTATGTGGAAAATTTGTTAAACAATGCA
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CTTAATAAAACGACTAACGAGAGCTGCACAGCCGCCACCACC-AGCAGCACCATCACCACCGATAGCGACACAACAAAACCAACCACCTCCACTGCCAGATACCAGATGGCCAGCGGCAGTAGCA------AGCTGTCTGGGCAATCGATGCTGCGTCGCTCGGTCAGCAGTCACCAGAGATCGAATCGGTTCAAGCTAAATCGATTGCCCGGCAACAGGCATGATGGACACAAGAAGACGGGCGTGCTGTCCTCGGCATTTCAGATTTACTTGCCCTTCAGATCGAAGGATACTTTGAAATCCCAAGTCAAATTTGATGCGTCTCGCTCAATCGGTTATGAAAAGCAGACTGAAGAGCGTCCACAGATGGAACCAATAAATGTTATGTTGCCGGACAACGCCGATTGTATAATGCCCAGTAACTCAATTGAATCTCAAGTGCTAAGCCAAAACAAGGATGCAGCAGCTGGCGGTGGTGGTGAGAGCGATCGGAATATTGATTTGCAAAAACTGGCTGGTGGCAGTGAGCTGAAAGCAAGAGGAAGCAGCAGCAACAGCAGCGGCAGTCGCAGAGGAAACCGATTTAAGAGGAACATCAAGAATACCGGAAGTCTAATTGTACGCAAATTAACAGCCTCCCGTTACGGGGGGGACACAGGCAAGGCAGGCGGCGGGACAACATCAAAGCACTCGGACGAGCAGAATGT------TATAAATAACGATAAGCCAAACAACA---CCAAACAGAAAGTAGCAATGTTACGCACCACAACTCTCTAAGTACATGAATATATAGAATACATCAAGATGAAATTGGATCCGGGCTCTTGTGGCAGCGCATGTATTTGTCTCCAATCATAGTATGACACTAGCATAGAATCTCAAGTAAAAGTTAATGTTTTACATTTATTCATTGATCTATCGCGTATTGA-ATATCTTATACTTATAATAACAGCCGAGCAGACAAA-------AATTACCCACAACTTAAGTACATAAGCACCAACACATGCATACATACATATATGTCATATGTACACTTATATATTGATATCGTTAATTGCTAGACAGCGTAGGTGAGAGCCACACCGTTTTAATTCAATAAAATGAAGAAAAACAAAAAAAAAAA----AACAAACA--------AATAATA-TATATATATATATATATAACATAAAA--A
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TCATAC------------------------------------TAAAATAAAA---------AGGAGGTTTCCTT----GGTCTACATATATCA-TTACTTAT------TACAAAATTTTCTT---------------AAGTATCTTTCGAATAAGTTATATATTG------------------TATGCAATTTTTTGATTCATATATTCC------TATATATTTATTATGTAAATTATT--TATAATTGCTAAAAGTACTAGGTATATATAAATGTTTA------------------AATGTGAGTGTTTCTGTGCATTTTGCTTTG-ATAAATATATGTTCGAAAAATATGCATTCCAATGCG-
CCAGGCATAAAAGTTCTTAAACTTGATCATCACTTTATTGATTGAAACAAAAAACTGGAACAGGAAAATTCTATATACATGCTAAATTTATCAGTTATATGTACCATATATATGTTTTTCTTTTCTTTTTTGTGGACAATTGAATTTCAAAAAACTAAATTTTTGCTTAGCACAGTTGATAATCAAATAATTCTTTG---CATATAATTCTTTATATATAAATTTATTGTGTAAATTATTTATATAAACGCTAGAGTTACTATATATATATCTATATATATATATACGTTTATATATGTATGTGAGTGTGTGTGTGTATGTTTCAATATATATATATATCTTCGAAAAATATGCATTCCAATGCGT
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A---------------------------------------------------------------------------------CTACGCCTCATGGTCTTGTCCCTTTACATACA----------------ATATCATAAGTATTTATTGAATTTTACAAAACATTACAGCATTAAATAGATATTTGTTACC
AGCTGTAGCTGTGGATTAAGCTGTTTCAATTAGCCATGGCTTATATATTTATGGCCAGTCTCAAAGAAAGCGCTTACACATTTTATGCTTCATATATGTATGCATATATATATATAGATATATATATAACATATCACGAGTATTTATTGAATTTTACATAGATGCGAATGATTAA------ATTTGTTATT
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GCTGTCCT--GTCCACCACTGGTGCCATCTCATTTCTG----CGTGCACGTGCTAATAACTGTTATTCGTTTAGTTCATAGTT-TATTTTAACTTATTGAGGAGCTGC----------CACCGCCAAAGACACGTACAATTGCACTAATATTTGCATTCTAAACTCAGACGTGCTCTCGTCGCGATGCCATTGTAGAAAATATTTGTATGATCTTGCAT-TTGCATAAATTGTAGCTAATCACCAGGTACCAAATATATTTA--AAAATGTGAAATGAGTCAACG
GCTGCTTGAAATTAACCA--AATGTCATCTCATTGCGAATGTTTTGTACGTGCTAACATCTGTTAATTGTGTAGTTTGTAATTGTTTTTTAATTTATTTTGTCGTTTTGCACAAAATGTACAGCTCGAGGCACGTACAG------AAATAACTATGCAAAAGACACAAACGT-------------TGCCATTGCCTAATTTAT--------TACTGCATATTAATTAATTTGTAGCTAAATTCAAGTCATAAATTGTAACTAATAAAATTTGTAAGCTGTTAAAG
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ACACAACACAAAATTCTAACAAAGTAACAAGATGCAGTGTTATACTTAGTTATTAACTGGAATACACAATGTTGATTGTAATATTATAAATAACTAGACAAAAATCACTCAATATAAATGTGTTTACTTTTATGTTAACTTTAATATATTTATAAATCTCACATTTATCTTTATTTATCTATATTTAGAAATATCTATATCTATATATA
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AAGATGCCGCT---AAGTGGCTTTACTA-TGAGATTAACCAAATTATATTTATACATATACATACACAATCACACACCCGAA---------------------------------------------------GTGCATGGCTGTA---------------------GCTTGGTCCATTTTGGGGCTCTAATTATACATT--GTGTATGTGCCCGTATGTAAAG-AGTATTTTTGTAGCCAAAAACC---ATGAA---------------------------------AGTAAACTGCACAAAGCCAAAAGATGCAATCGCTTCGCCAAGAGCACGC---GGCTGCACTCTACAAACGCTTACCGATCAGTACGAATTGCATTTTATACATACATATACATATATATACATACATACACATATATATACATACATACATATATATATATATATATATATATATATAAATATAAA-ATGTATCTATATCTAGTCAGGCCTTCATCCTACAATTGTATTAGGTTAAACAATAATTACTCT-ATTCATCTAGTTTGCTAGCTCATC-TTCAGCCGAA----TCTCGCACTACATTTAGAAAATGTCACATACTGCATCCCACAGAAACAACCCATCAGTTTATAAGCGCTCGTACGTGTGGTGATTTAAGTGCGTTGTAATCCCAGGTTGTTTAAACCATCAACTTGAACTCAAAGTATTATTTTGTAAACCAAATATTCAAATTTGCATAGTTTTAACAAAATGCAAATAAATCAATTAGTTTTTGATACAAAAC
AGGCGAACCCTTTAAAGTGGCCTAAATATTGAGATTAACCAAATTCTATTTATACATGCATATATACATTCACAAGCCTACATACATATACATTTACATATGGACACATATATATATATATATATATATATATATATATAGATATATATACACCTACATACATACATGCATAGGCACTTGACGTGCATCAGTTATCAGTTAAGCGCATTTGAGCCTCATTAAAGTATTGTATGTATAAATAAAAAACAAAATGAAAAAAAAAAAAAAACCAAAATAAAAAATAAGACCAGTAAATTGCACCAAGCCAAATATGCAAAACGCTTCGCTTACAGAGCACATTGGCTGCAATCGACAAACGCTTACCGATCAGTACGAAATGCACTAAATATA---------------GTCTATACTAGCTACTATA-----ATTCTAACAACTAGTTCTAGTCATGT---TTCGTAAGCTTTTAAACATTTATC-AAACCTATCAAAGAACTCGCACAAAATCTG---------ACACAAAAACTATTTTCACACAACTGAAACGCAAACACGTTGTTGATGCGAAAGTTTTGTGCGTTGTATTTACAAAAGTT----------GTTGGAAATGAACAAAAAATAAATAAACAAAC--------------------AAGAGTGAAAGAATTAAAGAAAATGTAAGGCCGCAACT-------AAAGTATTATTTTGTAAAACAAATTGT------------ATTTTGATAA---GTAATAAAAATAATTAGTTTTTTATATAAAAC
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AGAAGTTAGGGATTTAATGCTTGGCAAATTGTGATTCG-------------GGAAAAAATGTAACAAAATTTAAATAAATTCTTTGTCCAATGAAA
AGCAGCGACCAGCAC-ATGC-TGACAAATTGTAATTAATTTATGCGTGCATTGAAAAACAATAATAATAACTATATATCATAATAGACAAAACAAA
>Obp56e 15227715 15227824|15299 chr2R 15227116 15227734 scaffold_1 3413017 3413666 - 7791|635 654
GAAAACCTTTTTTGATTTTC
AAGCCCATTCTGTAACATTT
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ATCAGCATGT--------CACTAGGGGAGTCTTATTAAACCACGTTCTC-------------AGCAACACGTTTTTAATTAATTTTCGA---TTTAACAAGTTTC
ATTAATATATTTATTGTGTATATGAAGAGAAAAGTAAAAGCAGGTTGTTTTCCAAATATCGAATAAACACGTTTTTAATTAATTTTCACCATTTTAACGAGCTGC
>CG8654 15498945 15499620|15576 chr2R 15497964 15499863 scaffold_1 3722290 3724215 - 37115|981 1811
GGCTTTTCTCCCAGTGTTGCATCGGTGTAGCAAGGCGAGAATTTAAAATTTTCGAGCCCAGCAAAACTCCTAATGCCTGGGCTCTAAAATTATTAAATTTCGACTTAAGTTGAGATTTATACGATGCGATATGTCAGTCACCGAAAAGC-----TAAACTGCCGTTCGTGCCGCAAACAAAAGGCGAAAAGCAAAAAAAAATTGAAAAATCTAGCGAATGCAAAAGGTAATTACCGCGGAGTAACTTCCACTTCGTGATTATTAAAACTGGGTTAGCAGTCTGAATCCAGTCTCAATCGTAGCTGTTCTCCAACTGCCTTA--ATGTCGAGGTGCAA-AGCAGCCA-AATAGCTAACTGGAAAA-------CCAGCCAAGTGACTGTGAATGCAAACTTCGCATGTGAACC-------CAATCGATAG----------------------------CAGCTAAG-ACCAATGAAATTATATAGTAGA------ATTCAAG---TAGAAGTGGAAACTGTTTCTCCGGATCG-AAGTGCATCTCATAA----------------------AGTTTCTGTGGGCAAACACGAGGCTTTCAATCTGAGATATTTGTATCAGCTGTCGCTATAAGTCCCGAGAAATCTGTACCATCAAGGTCGTATGAAACATTTATTCGGTTG-----TTACGTTAATAGTTTAAGAGCC-------------------ATGCAATGTAATTTTGAATCGA----------------ATAAATTGCATTTTAGCATTTCAT-------------------------------TTAATAAAACAA
------------------------------------GAGTAACTGGAAATTTTGTGTGGTGCAAAAACCCCAAAGTAT-----------------------------ATCAGACATATGCACAAGCCAAGCTCACAGCTTCAGCAAAGTCTGTATAATATACCCATTTGGCT-----TAAAATGCCAGCAACAAAAAAGGGT---------TAACAAATGCAAAATGTAATCGCTGCAAAATTAATACAG--TTGTTATTGTTAAAACCGGGTTGATCCCTTG----------CAATCTTTTATTTTTCCCGATTTTATTGCTATGCCTAGGCGCAATAACAGTTACAATAACAGTTTTGGAAAGTTAAGTTCGGTTATCAAGTTGGGAAGAGAAATTTTTTAAATAATTCGCGTAGACAATTTATAGACACCACCCTTTATAAATAAGTTTGATTTAGTTAAGCAACAACGATACTTTATAGCAACAAACATATTCAATAGCTAGAGATACTTACTTCCTATTTGGACCATAAATAAAGAGTATAATGAAACTAAATAGTAATTGCCGAGTTTGTTCAAATATATAAGAATAGTTAGGTCCAATCAGGCCGTTTACGACATACTTGTAGGTAC------ATATGTACTTCCTGCGGCG---GAAAAATTGACCTCTTCAAAGATTTAAGACGATAGCTTAAAAACTGAGACTAGTTCGCATAGAAATAGACTGAAATGGAAAATATATATACTTTATGGGGTTAGAAATCTCTTCTTTGCATTTCATGGCAAAATTGCAGAGGATTGCACTGAGATGATTCGTTTAAGCA
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G--------------------CTGTCCCTCTCACACTCGCACGCACATACGCTCAATAGGGTTC--CTGCGCAGGGGCGGCCATCTTGAAGCTGCTCGCTCGCTTGCGCGTCAGG-CATACAAAAAAAAAGCACACACACTCACACATAGAATATATATAC--ATACATATATATATAAATTAAAAGACTTTTTCGTAGGCATTTC-------------TATTCGCATGCGCCTTCGGTG---------TTCACGTGTTGATGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTTTGTAGTTGTCTCGCACAACCAA--CACAAACACGCACACACACACACACACACACACACGCATACACATACCTACACACACACACACATTTAACTCTAAGCTTATTATTAAAATTTAACTACTAAAGCAAAAAAAAAAACAAACATATTTACTAGAAATGTTGCAAAAACACTTTCAAATTCAATGTGATATATTAATTAA
>18w 15630906 15631795|15736 chr2R 15631367 15632555 scaffold_1 3925710 3926949 - 11690|0 457
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ACTGTAATTTGTAGCCATTAGT-----TTCTAGCCTGGCCTAAAACACACATTAGTATATATATGAATATATATAGAAGAGGAAGCAAAACATTCATAACAAGA--TTTCAGTAATCTTAATAA-------------------------CTAAATAATTATTATTATTATTATAATTA-----------------CTATTATTATATATATATATA-------TATGTGTATATAGAAAGAGATCCAAGCATAGAAATTATTTAGCGCACTTAATGTATTTATGTATTATGATA-ATAAAAAAACAACAACTAAATTAATTAAATTAACT--------AAAAGAAATGTATTATTAAATTAATTATTACAATTACAAAATCGCAAG--AAAAACTATATATGAGAAAAATAAACAAAAACACATATAAAAAAACTATTATAAAATATATACAAAAATT
>CG18416 15719172 15719573|15822 chr2R 15717722 15721032 scaffold_1 4041906 4045299 - 24700|1710 2227
TTAGAAGCCTT-----------------------AGCAACATTCTGCTGAGCTGCAGCTCATG-----TGAAAAGC----------------------GAGGGAGAGCGGAGGAAATCGGG---GAAAGGTAACCGACCGGATGGCCAAG------------------------ACATCCTCAAGGATATGCGGGAATCAAGGGGAGATAGGGTAGGGATC-TGTGCTGGATCCCGTCAGGACAACAAAACTCGACATGTTGCATGTTGCGGACAG-CTCTGGCTCAAGTT-GCAAGGATATTCCAGTACTGTTTTGTCGATGGGCAGGTTTTCTCTGT---------------TTGTCACTGCCACTGCTTTGTTGTTGAATATCGAGGGAGCCAGGGCGGACCTCGGGGAATGAAACTGGGTCAA-------------TTCTCTT-----AGCCCGAGCTGCGAACACAGC---CAGGACACGTAGTGGCAACTATCTGAAAATGACGCCAAATTA
-TAGGGTTCTTCAGTGGGTCCATTTTTGGTGGTAAGCTGCAGTCAGCT-ATTGGCAGCTGACAGTAGCCGGAAGGCTAGCTTTACAACAACGACGTAAGAGGGGGAGACGAAAAGAACGAGCAAGAGATGTGAAGATGTCGATGGGTAAGTCGAGTCGAATCGAGTACATGTTGATGCTCTCAAGGATATGCGGGAACGATGGCT-------GTCGGCATCATGTCCTGTATGCTCTGTGCTGTGTAAA-------------CGTGTTGCGGACAGGCTCTGGCTTAAGTTTGCAAGGATATTTCTGT-TTGTATGGCAAGTTTTCTGGTTCTGTGTGCGTGTGTGTTTGTGTGTTGTTTGTACCGCAGCTTTGTTGCTCAATATAGACTCAGC--GCACACAGCACACATGCCCAAACTGGGTCAACTATAGTTTTGTTTTTTCTTTAAACAGTCCCCACTCCTGCGGCAGGTAGCAGCACACGTAGTGCCAACTATCTGAGAATGACGCCAAATTA
>CG11044 15749702 15749796|15862 chr2R 15749421 15750202 scaffold_1 4082950 4083818 - 16579|281 406
ATGCCAAGGATTCAACGAATTTTTGTATGCCTATTAA-------------------GACTTGTGATAAACGTTGTAGAGCTTT------------AATAAATAAACCAAATATTGAGACCAATTAA
-----AAAAACACGCCCACTTTATATTTAAAAAAAAAAAACGTAAGAAAAAACTGCGACTTGTGATAAAAGGTGTAGAGCTTTATTAGTTGATGAAAAAAATAAACCAAATATTTA----------
>CG11099 15753285 15754064|15866 chr2R 15753281 15753798 scaffold_1 4087631 4088229 - 12164|4 601
AGCTGCAG---TAATTGAGATAAACT------CGCTGTATATAATTATTT--------AGTTATTATATTTAATTATTATTAATTAGTTTTGTACATGTCATGTAAATGTTATCG-------------------------------AACTACTGACAGCCAGCGCC-----ACGTGTC----CAAAGAGAAATCGAATTTTTC--------------GGCTAAAGAAAACTCTGTTTCGGTCCTCGCTCATGGAGGTGTAGGTAGTCATCCAAAATGCAATGATGGGCCTCTGGAAAGGCATTTCGGCAGTCAACGCCATGGCGACCCATCCTGTAGGCATCCAAATATCTCACGTCCAGCGTTTGATGAGGTCTAAAGGTTACATAGAGTTATCTATGGCTTA-------------AGCTTACGCGAAAGTCAACTTACCTTAACAACCTGTGGAGCAGTTGGGCGTAGAGTCCACTATGCTCATCCACCTGACCATTCTCGCAGATCAGACGATCCAGACAGGCACTACCATTTTGACCCAACTGGTTCATATAGGCCTCGGCGAACTTGAATAGCAGAAGTTGAGGCTCGTCCAC
GGATGTAGAGTTAACTAACGTTAACTGTGCCGCGATCTTTGTAAATGTTTGTACAAAAAATTAGCATTGTTTA--ATTAGACGTTAGTTTTATAATTGTTATTTAAATGCTTAAGCTTGTTAAAGCGGTCATTAAAGTGTCCCAATAACCAACGGCAGCCGGCGCCTTGATATATGTTAGGGTATACAAGAATATAATTATTATATCCACAGGCTCAGCTTAGACAAAGCTCTGCGTCAGGCCACGTTCGTGGACATGCACATAATCATCCAGCAGACAGTAAGCAGCTGTGGGATATGCTTGGCGGCAATCAACGCCATGTTTGCCCATTCTATAAGCATCCAGATAGGGCGTAGCCAGAGATCTATGGGGTCTAAGCCGGATATAGTGT-ATCAATTAGTTACTAGTCGTAGTGTAACCCTCGTGTTCAATGTCTCACCGGAGCAGTCTGTGCAGCAGCTGCGCATAGAGTCCATTGTGCTCATGCACCTGACCATTCTCGCATATCGCACGCTTCAGGCAAGCTTTGCCATCTTGGCCACGTTGATTCATGTACTCCTCCGCAAACTCATACAGCAACTGCTGCGGCTCATCCAC
>CG11099 15753285 15754064|15867 chr2R 15753820 15754245 scaffold_1 4088269 4088710 - 9617|0 253
TGGAGGAGCAGGTTGGGTCAATGGTCCCTTGAGATTTCGGGAGCCATCCCAAAGTTTCCACCAGTAGATTGGAGTTTGCGGCTCATTGAACTGATAGTGAAAGTTCATCAGCCAAACCAACTGGCGCCATGCCTTTTTCTCCATAAACGGAGCCGGAAATGCACATCCCGAAACGAACTGTAGTGACACATATGTATTATTGTATATCGATCAA---------TACTCAATAAATATTTGATGTCCAACCTTGA
TTGATCTTTGGTTAGTTTCAGTGGTCCTTTAAGATCACG---TCCATTCCACAGATTCCACCAATATATGGGCTTAGTTGGCTCCGAGAATTGATAGTGATAGTTCATTAGCCAGACCAGCTGGCGCCAGGCATTCTTCTCCTGGAAGTCCACTGGAAATGCGGTGCCAGTTACCATCTGTAAGG-----------TTTTCGGGTCGAGGTCAAAAAGTGTTTTTTTTTTTTTGTGATTGCAGCCTTACCTTAA
>CG11048 15757634 15757745|15870 chr2R 15755703 15757634 scaffold_1 4090748 4092616 - 80739|1940 1940
T
T
>CG11048 15757634 15757745|15871 chr2R 15757659 15759567 scaffold_1 4093116 4095092 - 108158|0 106
TATCAAAAATTGCATGT-------ATATACAGAAAAATTCGTGGCAATATAACTTTCGGAAT-------------GGTGAACATCGTGCTTAAGACCTAAACCTTAA
TATAAAAATTTCCATGTTGTGTATATACAAAGAAAATATCGTGACAAATGCATTTTGAAAATCTTTTAGGAATGCGCGAAACTGTGTGCTTATAAACTAAGTTGTAA
>CG11055 15775823 15776599|15882 chr2R 15771288 15778553 scaffold_1 4108416 4115566 - 211517|4851 5687
GATGAATTTCCATCGGTCTATATGCCTATTGGACTGGAGAACTGAGACCCCGACAATGAACAATATTAACCAATGGCAGATTGTAAGTGGCAATGGGATTTCACAATCACTGTAAAATTTTGTCACCTGCATTTATACCCCCATTGGCCATTTCTCCACTCACATAGGCGTGTAAATCGAATTTTGTTATGCGCAGGAACAATTTGAATTGTTCATTGTTATACGCACTTTCTTGCTTTTTATTACTACGTATATGTAATCTCAAAGGTTTTTTTTATACAATTTTATAT----------GACACA---------GCTTTCTATGTTTTATA--------TACTCACAAACTAAGTATAGGATACGTATGTATGTAGCTTCTAGCATAAGCAAGCCAAGTATGCAAGTATTGGAAGCGTGTAAACACGCATTATTTATTACATGTATTTACATACGATTAATGCTCTTGAATGCAGGCACACACTCGCTTAAAGCTCTTTGTTGCAAAACTCCCGACTATGTGCCTCATACGGAACGAGTACTTATACACAGTGAATAGAATAATCGCCCATTATTACCCTTG-ATTTAGAACTCCCCAATGGTATGTCCAGATTTTCTGCAGCTGCGGAGGCTAACAAACTTCAATGTCGGAGATATGCCAAGGTTTTTTGTCTATCCCACGCCA---------------------AGGTGTTTGATAAACCACTACTCTTAATATGTATATGTTT---------GCAATCTCTCTCTCCTTA--AACGATACCCAGTGTTATATATGGAATGCGAATAAATGGTTATTACGCCCTAAAATCAATT
GCAGCGCCTTAATAACAATATATACTTAT-------------------CCTTATA----------------------------------------------TACATATACTATATATTTATATTCCATATATTAATA-------------TTTATACAC---------------------GGTTTGTTATATGCAACA-----TAGACATGTTGTTTGTGTGGCACAATT-CTTGCTTTTT---------------TGTTCTCAA---CTGTTTTTATACACTTTTATATTATGAATACGGACACATTTAGATTAGCTTTATATGTTTTGTAATGGCAGCTATACAAAAAGAATATATAGGATAA----------AGCTTCTACATTAACTCAGCCAATTGTTCAAGTATTGAGAGCGTGTAAGCACGCTCTAAAATATATATAAAGTAAGATACATCACA-------AAATGTA----------CTCCCAAAACTCAT----GCAAAG-TCTCGAATATGTGCCTGTTATG-AACGAGTACTTATATGTAATTTATAATGATAT---------TTATCTATGTATTTAG------------------CTTGACCTTTCGATATTATGGAGGCTTAAAAAGTTC--TATTGAAACTAGTTTAA-----TTTGCTTGTGACAAACCAGATTAAAACGTGCAAACTTTGATTTATATGACCGAACACAGCAGCTCGATTGCTTTAGTTTTAACCATAGGCCAACTCTCTCTTTATATTAACTGTACCCAGTGTTAT---------GTTATTAAATGGTTTTT--GCCATTAAACGAG--
>RpS18 15779626 15779757|15883 chr2R 15778910 15779715 scaffold_1 4115798 4116605 - 36489|760 867
GCTTAGCAGCGTTCCCTGCCGGAACGGATTTCC--GATTC--------GACTTTAATTTTCACA--------TCAACCACAAAATAAAAGAAAACACGGAAGCCGGAA
TC-TAGCGG------CTGCTGCAACGCATTTCCTGTATTCAGGCTGAAGCTGTTATTGTTTACGATACTTCTTTAACAACCCAAAAAAGAAAAACAAAAGAAATAGAA
>CkIIbeta2 15805296 15805414|15901 chr2R 15803608 15805635 scaffold_11 3216773 3218774 + 69602|1749 1889
TCCTAAAGCTAAAATTTCTCATAAGCAACTGTCGCGTAC-TTCTCGAATAAGTGGGCACTGTTCGC-----CCGGCTGGCTGCC----------------AGCTCATTAAACTCTCATAACAATAACTGCTCAGGCTGTGA
TCCCATGAACAAA-----TTATATATATATATAGCATATATACCTGAACTACAGTTTATTGTCTACTGTTTCCATTTGTTTTTCTCGCCCTTTTCTAAGAATCTCATTAAAATATCATAATCATAATTAGCTATGCACTAC
>CG8920 15840677 15840840|15933 chr2R 15836848 15841907 scaffold_11 3255555 3260942 + 110062|4225 4456
GAAGTCTGAGTCGGAGGAG-----------ACGATCCATTTAAATTTGTTCATGTTTATGTTT-----------------------------GCGTAATCCTAGTTTTAGAATTAGG-------------------AATATACATATA-------ACTTATTACGACGAAACATTCCGCCAGATGGAACCGATAATAGCTAATAAACT--GATGTTTTTTATCGAGAGAACG
ACGATCTTCCTTGATGGGAGTATTAAATTTACGACTCATTTGT-TTTGTTTACGTTTATTTGTTTAAATTATGTGGCCGACAGTTATTACAAGCATATACACATATTTATGAGCAGACATTCCGCGTCTAACCTAAGATATACATCTATATATATATATATTACCATGTTTTACTCTGTTGTATTCAAGCAAAGCGCAACAATAAATTATGATTTTTGCTATCGAGAGAACG
>CG8929 15845226 15845587|15940 chr2R 15844075 15845415 scaffold_16 1409287 1410656 - 57547|1200 1408
GTGCCCCTA-TCATTTGAATCATTTCATTAATTCTTTTAATTCCCAACTTCCAATTCAGCTCATTTACTTGACCTACTATTTCCTTCCTTCTCGT-----TGTATCTTAATCATTTCCTCATCCCAACT-----------TCCCCCGTTTGTACATTTAAAATGTATGAAACTGCACTT-GTCAACTTATAT-TTTGATAATCAATATA
ATGCAATTAGTTATTTCCCAAAAGCCCGTAAGCTGTTCCCTTCTACTTTTCCTTTTTGGCCCATTCA-TCATTCTGTTAGTTC--TCCTTCTCCCCTTTATGTTTTTTGATCATTTCACTAACATGATTTTTGAATTTTCTTTTTTCTTTGTACATTTATAATGTATGAAAATGCATTTCGTCTGCTTTTGTATTTGATATCTAATTTA
>CG16739 15857539 15857637|15955 chr2R 15856821 15857662 scaffold_16 1426657 1427399 - 17091|725 828
TGATTACACATTATATTCAAATCCCGGTGTATTAAAGTGAATTTCGATAATT--TTTAAACGTTTTGAAGGCGTAT---AAAAAATATAAACTTAGTCCTTTTT
TAATCA-------------------GGAATATCAAAGTAATCTGCTAAAATTCGTTTAAATTATATATAATAGTATTGCAAAAGTTACATACTGTGTTCTTGTC
>CG33041 15985480 15985827|16082 chr2R 15984061 15987385 scaffold_16 1599745 1603119 - 82179|1648 2083
CTATGCTTTTTATTG-----------------TTTAA-------CTTGTAGTACTGCCTTGTTTGCTTATT--ATTATTTGCTTTAATATTA------ATTCAATG----TTATTATTTAAATATGAA-TTTTAATTTGATTTATGAT-----------------TTGTTGTTGTACG--------AGTATGTAGCTTTAGTTGTTATTCATGTGTTTAATATTAAATATTTA------TTTGTGTTTGTTTCCCTTAGCCGTTTTGTAATAATATGTTAGTTTTATATTTGCTGTAATTAATTTCCACTTAAACATTTTTTGGTTTATAGCACCATTAATTCACTTTA---ACAACTTCA-------CCCCACCAAGTCTGCAAAAAAAAAGCTGCACAAATAAATCCGGATGC----------CAAATGGTTTT
TTAAGCATTTACTTGATTTTATTTTCTCTTCTTTTGAATTTATTTTTGTGTTTATACTTTGTTTGTTAATTGTATAATTTTAGTTAATTGTATAGCAAATTCTATAACGATTATTTTCAAAATATCAACTTTTAACTTTACCGACAATATATTTTTCTTATTATCTTATCGTTATACTTTGCCTTTAGTATTTTCCTTTGACT--TATTT-TGTATTTTTATTTAAATATTTAGTTTACTTTAAATTGATTTTTATTTGTGGCTTCTCATTTTTATTTCAATA----AATTTCTATATATTTTTTCCATTTAA-CATTTATTGAATTTTTCAATTTTTCACTTATTTTGCATACGATTTGAATAATTTTCTCTTTAAATTTGCCTAACGAAGTCCGCATAA-TAAATCCGGATGAATTTCTCGAACAACTGTTTTA
>Obp57c 16019042 16019069|16122 chr2R 16018642 16019332 scaffold_16 1662979 1663615 - 2495|409 440
TCGGTCTAAAACTG----GTCAAGCAACTTAA
TTAATATATTATTATATTGTATATTTATTATA
>CG13422 16041655 16041689|16152 chr2R 16040984 16041978 scaffold_16 1694827 1695858 - 15115|750 784
ACTATGCTTGAATAAATGTGTTTATTATTTTATTA
TC-ACGC---------------------------A
>CG30154 16048519 16048799|16166 chr2R 16048603 16049085 scaffold_11 1024785 1025268 - 1505|0 208
GCTTCGCAAT--TGATTTTCGTCGAACAGTACTCGATTTGTATGCTAATACTTCATTCATGGTCACACTCACTTATATATAGTCACTTTAAT-TGTGCACCTTTTTATCTATGACATTTAAATATAACCCTTTAC---TATAC-TGTATGTAATAGAGCCAAAATATT-TAAACGAGATTAAAAGCCTAAT----ATTGCAAATATGAA
GCCTCACAATGTTGGCTCTCAT-ATTTAGTACTTGATCAGAGTGCTACCGATTAACTTGGCGCGGAACTCATGTACATGCACTCGTATAAACATGTGTATCTCTT-ACTTATGTATATTAAATATAACTTTGTATGTATGTGCATGTATGTACACAAGTTAAATAACCATAAACAACATT-TGGGTTTAATTGGAAGTGCCAAAATCGA
>CG18067 16050188 16050218|16167 chr2R 16049123 16050326 scaffold_16 1279051 1280349 + 4404|1233 1263
AAGCCAAGTAATCAATCGTACACGAGTCGCT
TA------TATTGAATAAAATGTGAGCAGTT
>CG13423 16053044 16053125|16168 chr2R 16051458 16054541 scaffold_16 1712155 1715251 - 36963|1655 1761
AAAATTGTTTAGAACCAAAA----------------AAAAAATCTTTCATAAGAAATACATTT---------ACTACATTTTATTTGCCTTCTTGAATAGATAAAAA
GTAGTTGTTCAGGGCTGGCATACCGTCCAATACACCAAATCAGCTGTCATCAATTTTAAATTCTGGCAAGGAGCTGCTTCCGCCTGGCCT--------------AAA
>CG13424 16074005 16074816|16189 chr2R 16072837 16076644 scaffold_11 3205683 3209341 - 107616|1220 2105
AAAG-------GCGATTGGTTGTCTTTAGAATTTATGTTCCGTACGTCTCTCATACACACAAAAATATGCTCATACAAA---GTGTAGTCATAGGGGGTAGTAGAGTAGGTGTCCTGTCTGGGTTGATTCCATTACAACTAGCTGAGAGTGGCACACTTTCAGATCTGGCCGGGATTACTGGCGTACCCCTGGTGGCTCAGCACTGGTCTAGTTTACGTTGTGGTTCTAGTACTAGTA----CTAGCGCTAGTTATTGCTATTCTATGTTACATTGTGTGGGTCGGGTACTGTTTACTGACTGGCTCTCAA------CAATTAATAAATGTAAATTAAATAATCAAAAATCACAAA------TATTACACGTCCGTTGCCG---TTAGAACTCTAGTTGGATCAACTTAAATGCTACAAATTACACGCTGCATACTATAACTTAACCATTGCTATAACTATTTGCAATTTAACACGATAAATTGAGAGAGATAGACAGATAGAGAGAGCTGTAACAAAAGCGAACGACACTGACTTATTTACAATTCATTGCGTTGCTTGTGTGGCTGGTGTGC-TAGAATGGAACACTTTTGGCTC----TTGCCACACACAGTTCGGTTCGGTTGACTACTATACATAGTGGAGACTCATTTGATTTGATTTTGTTACGCCAACAGTAGGTCCGTAGGCTAGGGATCTGG----AGCAGACGAATTGCGTTTTCTATCAGAAATCAGGGCTAGTACTCCAAGTACTCC--------TGCCTACGCGATGGCTGCGAACAGCGTCT-------------------ACTGTTCGAGGAG---------ATTCCATAGTTACAACTTAGCTAATTGGTCAAATAAAAATTAAAACTC
AAAGTCAGCTTGTAGTTAGTTATCTTTACAATCTATGTTT-ATACGCC------ACACACAAAAATATGCTCATATAAATACAAATAGTCATACAGATGTGATGAGTATGTTGTCTGT--AGGTTAGTAGC--TATCACTATTTGACAGTGGCAGGCACACAGAGTAG--TAGGATGTGTGTAGTA----GGGGGGTATTTCACTGGGGGAATTTAACGTGTGTGCCTGTCTCCCGAAATGCTTAGAGTTAACTATGGCTATTCTATGTTACATGTTGTGGGTCGG-------TTGTTGGCTCTCTTTCAAGTTACATATTACACGAATTATAATTAGATAAATCAAAATCACAAAGACTTATGTTTAACGGCCATTACAGACTTTCGAGCTCGATCTGGA-----------GTTGGAGTTCATTC------------AACTTAAC---------AACTAAATGCTCATTTGTACAGTAAAT-------------CAGATCGAATCAGCATTAACAGAA----ATAACATTGCAATATTCGTCAGCGACTGCTGTGACTATATA--TAGTATACATATTATCTAATACTGTCAACTTGTCGTTGCTA--------TTGCTTCGGTT--------------------ACAAATTTCAATTGGCTGTGT---GCTTCGAGATGGGGCGGAGGGTACGGATCTGACTATAACATA-GAATTGGATC---------------GGTCTCGTTGCACAAGTTTTACAAATTAAATATATACGTAGTTGTAGTAACTGGAGTCTCATCTTAGATCGGTTTAGCACTGGTTGCGAAACATACATTAATTTTACAATTTTAACTAAACTACTTAATGAACAAAATAT--AAACTT
>CG30153 16112175 16112704|16240 chr2R 16111036 16112499 scaffold_34 123666 125212 + 2183|1342 1677
AAATGAAAACGGCGAAACAATCAACCGATATACGATTACTTATACCAAATCGCCCGTCCATC-----GACCAACCGCCCGCCTATCTGATTGCCCGCCCGCCCGTCCATCGACCGAAACCGAAACCGAAACCGATACTGAACGTTCGAACGCCCGCCCG------CCCATCAATCGCCCGCCCGCCTGCCTGACCGTACGCCCGCCCGCCCGTGTCTCCAAATATGTGTGAATAATGTGGGGCGCAGTATAAAGCCACTGTGTCTGTCGACGATTCCCAAGGCCCCGAACGGTAAACCACAAAAAAACTTTAACCTTTTACCAATTACTAGATTAT
ACAATAATAATGCATAATAATACACATACATATATATATATATATATATGTATGTATATATATTTAAAACCGAAAAAAAATATACACAAATTTTATACGGCCAACCAATCAACCGAA-CGTTAATCGAAATATCGCCCGACCGACCGCACGCCCGCCCGATCCGCCCGCTCAATCGCCCGCCCGCCCG-----------ATCCGCCCGTCTGT-TGTCCAACCAT------CAAATGTAACGCACAGTATAAAGCCACTGTGTCTGTGGACGATTCCCAAGGCCCCGAACGGTAAACCACAACAAAATCTAAAAACTTTACCAAATATTTCATCAT
>bl 16121338 16121717|16251 chr2R 16121221 16121607 scaffold_34 135703 136077 + 3237|118 422
GTGGGCAAGGACTTGAACAGCTACAACAGCAATAGCAACACCATTCGACAAAACAACAAATTCAACAACTACAATAACCATCGAGAATTGCTGCGTTTCACGTTTAAATTTAAA-TGTACT-----AAAAGGAAGAACTGGCGAACGCCCAGGGCAAGA---------------------------GAGCATCCTCCAAATACGAAAGAAATTTATGTATTTCTTCACTAAATTTAAGTGAATATT--ATACGCCCCAAATGGATAAGAAACTGGAACCGAGTTGCCCCAACCATCAGCGCCTGC
GT------GGACTTCAACAACAACAACAACAA-------------------------------AACAGCCCAGATGAAGAGGAGGAGCTGC----ATCCACGTTTAACTTTAAAGTTTACTAAAACAAAAAAAAAAAAAAACAAAAACAAAAGAAAGAAAAAAGAAAACATAAGCAACTGATTATTGAGTGTCCTCCCCAATATCTAGAGAGTAATATAATTCTTTTCTAAGTTTAAGTATCTTCTACATACTCCCTACCCCGTCCCCCAAACCAACCCAACCCAACCCAACCCAACCCCCCTGC
>bl 16121338 16121717|16252 chr2R 16121631 16121714 scaffold_34 136108 136195 + 1995|0 91
CACCAGTTTGCAATTT--------GGGGGAAAGTCAACATTAAAACTCTGTATGATAAGAAGAATGAACAAATAAAGTAAACATAAACTTGA
AACCAACCTACAATTCTCTATACGAGCATACAATATATATATATATTATACATGATAAGGAGCATGAACAAATAAAGT----ATAAAATTAA
>CG9945 16135612 16135944|16264 chr2R 16135291 16135664 scaffold_34 156248 156618 + 10241|325 380
TT---GTAAGGTTTAGAGTATAAGCTAGTAAGGTCCCCTTTGATATTACATTTCGT
ATTAAGCAATTATTTGTTTTTTAGC------GTTGCCTTTTGATATTGCATGTTGT
>CG9945 16135612 16135944|16265 chr2R 16135773 16136872 scaffold_34 156932 157940 + 5742|0 195
ACTTGAAATGTATAGTTCAGTTTAATTAGTTAGCGTG-----------------TTATACAAAACAGTACATTAAAATGTAAACCATGAAGCTTACCAACTACCTACTTAAGTTGTTTATGTACAAAAACAATCATAATAAGAATCACG--TTGAAATATATTTCGTTTGCT-----CGATCTAAATTCCTTGAAA
ACATAAAACTCAGACATCATTTTAATGTATGAGCGTACGTTTTCCTGGTATTTATTATAAAGTATTTTATTGTTACATATTAAACATGAA--------ACTATGTACAAAATCTAATTAT--AAAAACTTAATGTT--TAAGAATTCAGATGTGAATAACATTTTGTTTATTGCCTGAGCTCTAGATGCCTGAGAA
>CG16742 16143056 16143173|16271 chr2R 16142584 16143111 scaffold_34 163684 164200 + 6537|512 576
GAAAACAGTTACGCCTTTTATTACAAGTATG------TACACTTTT---TGATCTGTGGATGGTT
-AACACATTTTGTTATAATACTACAAGTATGTTTATTTACACTTATCGATGATTTGTTAATGTTT
>CG16742 16143056 16143173|16272 chr2R 16143112 16145458 scaffold_34 164353 166879 + 76162|0 66
AGACTGTCGATCAGAGTATTGTTATTCGTATTCCTATTAACTATAATAAACAA-----TGAATGTCA
AATCTATTCATTAG-GTTTTATTTCGCGAGTGATCACTG--TACAAAAGTCAAGTTTGCAAATTATA
>CG13436 16153181 16153286|16283 chr2R 16152384 16155493 scaffold_34 176702 179906 + 94611|806 920
AGAACGGCTAAGAACATAT---------ACTCACCGATTTTCGATTTTCTTAAATCAAAGAAACCTAGAACACGATTCACAATAAAGTATATAAAGTGGTCCTGCCACACAAGCG
AAAACGTCCTCTTCCGTCTCGTGTCATCACTCACCTTTCTTGGGCTGCGAGACGTCGTAGATGCCCAGCAGACGATTCACTATAAAGTAGATATAGTTCTCCTTCCACAATATCG
>maf-S 16156410 16156537|16284 chr2R 16155605 16158609 scaffold_34 179907 183095 + 103237|836 986
ACGATTGCCCAGT----------CACATTCCTGTTTCTGTCAAAATTACAATAAACCCAAAACGGAAAAAAACACCTGTAACTAAAGTACAATAGCTGGCA----------AATATCCTTC---CTCAATAAACGTAATCTGCTCAAGAAC
CTG--CAACCAGTTAAATCTTATCACATTCCAGTTTC------AGTTTCGAAAATC---AAATCAAAAAAAACACCTGTAACCATAGTACAATAGCTGGAATTTGATTTGTAATGTCACACAAACTCAATTTACATATAATAATAAACATT
>CG11132 16160582 16160734|16285 chr2R 16158977 16161020 scaffold_34 183247 185275 + 89034|1622 1821
TTAAG-TTAACGCGGCCCGTTTCCAC-TCAGATTCCCCAGACGCCGAAGTGTGTGCGGCGTGCTAATCATTGTAAC----------------------------------------CCGTTTTCCACTGTCCATATTTGTGCATTTGCGCTACTCCCAGTCCGCATGG----GGAAATAAATGGATAAAC-AAGAAAATT
GGCAGCTTATAGCTGGACGCAGACGCGTCCGTTTCCATGGAAGACAATACGCACGGCGTGTACTAATCAGTGCAACCAACATCAACAACAGTTGCTATCGGCGCGTAACCCGTTTGCCGTTTGCCACTCGCTTTATTTGTACATGTGCGCTACTCCCAGTCTAGTTAGTTGTTAGAATAAACGGAAAAACGAAGAAAATT
>CG30152 16187301 16187417|16317 chr2R 16186979 16187419 scaffold_34 220754 221204 + 17509|332 475
CTCTCT-------TTGCCATATC--------TTTTGTACATAGGGAATACTTTGAGGAATGTCTAGGATTAAGTGTACCA------------TTAAGTTGCATCAGGGAGTGTGTGCTTAGCATTAAAGCCCTTAAAATCTGTT
TAAGCTAACACAGCTGCCCGGCCCGGCGCTGTAGTGTACATATATAAGGATTTAAGTCA-GTTTAGTTTTAAGCGTACCAAGTGCTTGTCGCCTATGCTCTATGA-------TGTGTCTAACATTAAA-CTTTTAAGATTTGTT
>CG9235 16418337 16418390|16660 chr2R 16417271 16418562 scaffold_34 565213 566522 + 26359|1101 1164
AACAGATTGGCTA----TAGTGTATGTGGAAAATATAATTCGATAAAACAGAATAG------AA
AGTAGAGTGCCAAATGCCGATTCATATTTTTATTATATTTTCATAAAAAAAAGCAATTGGGTAA
>Rx 16444356 16444614|16692 chr2R 16442308 16444401 scaffold_34 597324 599456 + 59285|2302 2347
CGCCAGTCGGTTCCTAGCTAAGTGCACCTCCAATTGAAAACAGTTC
-GCCTGTCAGT-----GGCAATGGTTCCTGCATTCCTAGACAGTTC
>Rx 16444356 16444614|16693 chr2R 16444404 16444783 scaffold_34 599617 600126 + 1097|0 292
AGTCCCTTGTATCGCGTCATTTAGGTGTGTTCTAAGTTTAGTGAATTTCGTGTTGTAAGTACATATTTCTG-------------------AGGCAGTTTCTTAGAT-------------------------------------GGTAAACTCAACG--------TGTGCAAAGTG---TATTTGTAAAATTTTAATTACTTCAATGAAAAACGGCTG-------------ACGAAGAAGTCTATTCCTAA--TGCATATTAGCACAAAATAAATATGACAAGTTTTAGCTCAA
GTTCTCTAATATCGTGC---------GTGTTTTA-GTTTAGTGAATTTGTCGTTGTAAACATA-ATTTGTATAGCCAAGAACCAGTGAACAGAAAGTTACTCAACTCGAACTTGCAACATCCGAACGGTAAAGCAAATAAATCGGCAATTTCAATAGATTTGAATGTGCATAGAGATCGACTTGTAACCTTTCAATAATTCCTAAAGAAAGCTGATTTAAATATTCATATAAAAAACATCCTAATCCCAAAATGCATATTAGCACAAAATAAATAT-ACAAGTTTTAGCTCAC
>Act57B 16453517 16454022|16697 chr2R 16448314 16454289 scaffold_34 614658 621086 + 144793|5929 6465
GCAGTTGCAGTTGCCTAGCACCAACACTAGCACCACCCGGTCTACTCACCTGTCTCCTGCTCATCTGGTCCTGCTATTTGTGGTGGTTCTGGGTGTGTGGGCGGCTGGTGC--TCCACCGGCAAAAACAACAAACACCACCAC------------------CATCCAACCATTTG-TTTTTGAATGTCATTATTTACCAACGTG---TCATCCTTGGTTCGAGAATACTCTTTTGTACTGACTGAACACAACACCATCAATCAAAATGAATTGTCAATCTAATGCCACGGACCGCGATCCCCATCCACTTGTTAATCGCTCGCGGTTTCCTTAAATGTTGATCGCCATTTGATTGTTTTACGAATGAACCGACACCCTCATGTATTTTGTACAGAACCTAACAACTTCCCCGATAGAGCGGATGGGGTCTATTGACTACGAAATGTAAAATAATCTCATGATTGTAATATTAATTAAAAC------AATTTATAATTATTTATAAATAAAAACGATTTTTTAGATTTAATT-TTTTC
GCATCTAC--TTGCTAATCATCTCCAGC-----------GTCTGCCTAGTGGCCCATGCCTTGTCTTATGCC-----------TGGCTCTGGGTCTACTTTGCACATACGCAATCCAACAACAAGAAGAACAACATCAAACACATCTCCGAACATCCGAGATGCCCAGCCATCTGTTTTTTGAATGTCAT--TTAACCAATGTGTCATCATCCTTGGTTCCAGATTA-TTTTTTGTACTGACTGAACAC----TTTGTAATGAAAACGAA----------------------------CCCCATTTAATTGTTTATTTTGTGTGTTTTCATCAA----TGTTAACCATCTGATTATTTTATTAA-GAAACGCCAGCCTCTTG--TTTTGTATAGAAC-------ATCCTTCAATAGTCTAAATGGGGTCTATTG-CTACGAAATATAAAATGATCGCATGAATGTAATTTTAATTAAAAACAAATGAATTTATAATTATTTATAAATAAAAACGATTTTTTAGATTTAATTCTTTTC
>CG33704 16458263 16458665|16701 chr2R 16457063 16458300 scaffold_34 624962 626187 + 11785|1357 1394
GAATCAACGAAATTTTCACGTCACAAACGTAACGAGTG
GGTTCATCGGGGC-------GCAAAAAGGGAGCGAAGG
>CG33704 16458263 16458665|16702 chr2R 16458355 16458607 scaffold_34 626249 626524 + 5922|0 303
ATCAAGGTGTTGGCCCGGCAATTAATGACTCGGCTCGACTTTTCACATTCACATTCACATGCTCGAGCTGGGCAAACAATGCTGAGGGCGACAACAGGAG-CACGCAAGCCAAAAGGACTCGGGCTGAAAGGCACACAA------------ATAAATTGTGAC-AAAGTTGCGGAAATTTAATTAAAATCAAAT-------------------------------------AGAGGCGGCTAAGCGAAAAAGGGGTAGCGAATTGGCAGTCAGGTGTGACCCGATATAGTTGGTAACACGCTTC
GTCGAGCTGCTCACCTGGCAATTAATAAAACGCAACGAGT-------------------AACTTGGTTAAAACAAACAAACCGAAAGGCGATAACAACTGACACGCCAGCCGAGAGGCAGCAG------AGGCAGGCAACAGAAACAGTTTACAAATTGCGACAAAAGTTACGGAAATTTAATTAAAATCAAATACATTCATTTGCCAGCGCGCTTTTTGGTAGGACCAAAAAAGGGGGCCAAA-ATGAAGGGGGTAGCGAATTCTCAGTCAGGTGTGACTTG--ATAGTTTATAGCACGCTTC
>CG9344 16485048 16485179|16742 chr2R 16484897 16485218 scaffold_1 6398355 6398624 + 2544|151 283
ATAC-AGGAGGGTCTCAACTGGCATGGCACCATGAAGTTCGTAGTTAGAGAACTCTGATTCCTCTGTTTCCTTCAGAGGGAACCTGCGACAACACAAGTGTTTCATACTTCAATATTAAAGCTGAACCAACTT
CGACGAGGAGGG--------------------TGAAATGCGTGATTAAACAAATGCGA----------CACTAAAGTGGGCGCCATTCTCAGTACAAG--------ACGTCA-----TAAGCAAAAGCAACTT
>CG9313 16491382 16491625|16747 chr2R 16488708 16491441 scaffold_11 2904302 2906925 - 113886|2701 2760
ATCCCAACTTTTAACCAATTCCAGAAACACACTGTTTTCAGAGTTGATGTATTATATTTT
ACGCCAGCTATCA-------------------------CAATGATAATGTATTATATTTT
>Pros29 16503614 16503700|16758 chr2R 16502649 16504868 scaffold_11 2918671 2920867 - 76782|965 1074
TCCCAAGGATGCATTATT-------ATTGATTAAGGGTCTATCCTGATTTT--TGTAACCGATGTACGGAGTGTGTGAAATAAAATTTCAAA--------------AAAC
TCCTAAGCAGTCTGTGTTGCTTGAGATGGTACATGAATAACTTCTAATTATAATGGAAAAAGTTAATTTTGTATATGAAATAAAATTTCAAAATTATGGGTTTAGGAAAT
>CG10543 16513828 16514225|16768 chr2R 16511182 16515363 scaffold_11 2931199 2935629 - 128922|2860 3404
CAGTCGAAGCA------------------------ACATCAACAGGCCCAGCA------GCCGAATCACCTTCACCACCAT---------CGCTGGTGGACGGAGCCA---------------GCCAAGAGAGGCGATGTTTTTCATTGAAGAAACAACCGGAAACAGGAAAACAGGAAACGGAATACGGAACAAGTTCGCTTAGATTGTAAGTTTAGGGGGGACGGTGGATGTGTGGAACGCG------AGGAGTTGTGTAGATAGGGCAGTCCACACATTATTT-------------------------------------------TTTTGAAATTAAGAGCAATAACATAAAGATTAGAGCGGAATGAGCTCAGAATATCTAATCCGACCGGCGCTATGATACGTGTATA--------------------------AAAAAAAGTAATCATTTACAAAG-------TACATCAGATAAAG---------AGAAGCATGTATACATAAATAAATTCAGACA--TATACATAGTAGCACCTAA
CAACCAAAGTAGCCGGCGCTGGGTGGTGTTCCAGGGCACCACCAGCACCACCACTACGCGCATAATCATAATCATAATCATAATCTAACGCGCTGGTGGCCAGCACCAGCAGCAACTTTAGGCGCCAAGAGAGGCGATGTTTTTCATTGAA--------------------------AAACATTAACCATAAACATTTGTTTAAGTCTGTACGTTAAAGTGTG-CAAGATCCGGATCGGAAGCGATTCGTAGCACTTGTGTAGATAA-------CAAAGATGATTCTAACTAGATAAGGTTAACAATAACAAACATTAACACTGGCATGTTATGGAATATAGAGCAATAATTTGAAGATTGGAGCTGCG-ATGCTCAGTATATCTAATCCGACCGACCCTATGAGGCACGTGTATTGTATACAATAAACTGAATTATAATAATAATAATAATAATACAGACAGACAGACAGACAACAAATCAAATGCAATGTCAAAATGATGAACATGAACATGACTACAGACATCTATACATAGTAGCGAGTAA
>CG9346 16523163 16523210|16772 chr2R 16519711 16523201 scaffold_11 2940612 2944094 - 126925|3653 3695
AGTGTCT----GCTCTTCGGACGATTTGTATTTAATTAAACAT
TGTGTTCAGAAGTTTCTTGTAATACGTTTATATATTCAGAAAT
>CG30296 16531900 16532492|16781 chr2R 16531012 16534136 scaffold_11 2961871 2965097 - 64349|963 1681
ATCG----------ATTTTTATATATAT-------ATAATTT---GGCAAT--------GAACA---------------------------------------CGACTTGATTCAGAC---GAAACTAACTAATTGCAAGGGCCGAGTGAAATTTCGTTGCTAATTTCGTTGAACGACGAACATTATGACTGATTGCCACGAAACAGATT-TGCCAATAATTTGATATCTGATTTGTATATA--------TATACATAT-TGTATGTTTTGATATCTTCGTTTTGATTTTAAAACGCCAACGTTGTGTCTACTCC---CTCTAAAGTAAACCTTAAAACTTTATGCTCTTGAAAACCTTAATCATTTTCGGTCAA---AACTTAAAGCCAAACTTGCATGTCTAGAAAACTCTTTAGCTCGTT---TAGAAAACCGCGTCTTTGTG----AACTGCATGATTTTGTGTGAATACTCTTAGTTGAAAGTCAATGCAAAACTAGTCTACCATTA-----------AGCTAAGCGCATATGTATTTCAAGCC----GCATCGTCT--AATCAAAATCCGTAGCTACTTGGCAATGAAATTACCTTAAAAAAAAATCCAAT-----------CGATCGCACGTAAATCGTATGATTAAACA---AATAAAGTTAGTGCCACGGCGTTTGTGAACCTAGTATAAT--GAATAAATTGAAAACCG
AATGCAAACTATATATTCGTATGTATGTTTGTCGCATAACGTTACGGCAATCATAATGCAAACATCGAACCCTATCGCATTGTTTTGCCTAACTTGCTATTTTCAAGTTGATTTGAAAACAGGCATCACATAATTGGAAGATTTGAGTGAATTT--------AACCAGATTCAGC-ACGAATTTTACGACTGATTAAAAAAACATAGATCCTGTTCGTAATTTGTCATTTGATTTGTATATAATTATGCCCATATATGTATGTATGTATTTCTATATATGTATGTATTGTG---------TGTTTTATCGATTTTGTTCTCGAAATCATAT------AGTTTTTGCTTTGTA----TCTGCACCTGTTCGGTCAACTGAACTT----CTAAA--TGTATGCCAAAAAAA------AATTCATTAAATGGATATCCATGCCTCCTTATTAAAAGTGCAAAATTTTACGTGCATATTGTTAGTTGAAAGGCAA---AAAACTAGTCTACCATCATCGATTTAAGAACCTTAACGTATTCACATTTGAAATCAAAAGAATCATTTTTAATTTTAAACGATA---ATTTTTCAAATAAATTACATCCTACATAGAACCCATACAATAATGTTCGATTGCAC------CTCATGATCAAACATTAATTAATGTTAGTGCCACAGTGTTTGTGAATTTAGAATAAAAAGAATACGTGTAAAAAAT
>CG9350 16533559 16533672|16781 chr2R 16531012 16534136 scaffold_11 2961871 2965097 - 64349|2866 2999
AGA---AGGCGTAAAGTCTAG----------TTTCCTATGTTTAGTTTAATGGTGATTCGATGAGAGAAAGATTCGGCACT--AACCGCTTGC-----CTTGCAACCGAATAAAAGCCAAGTCAGAAGTGATAA
AGAGCCAATCGCTGAACATGGCTATAAGCTCTTTCGTGTTTTTAG-TTATTAATGTACCGAAGGGA-----AGCCGGCAATTGTGTAGCTTACAAATGAATGTAAACGAATAAATGCCTAGTGAGAAGTGATAC
>CG10540 16566644 16567465|16820 chr2R 16565963 16568099 scaffold_4 5525902 5528173 - 57962|692 1665
GACCAGGAGGTGCAAGCGGAA---------------------------------GAGGAGCGGACACAGTC---GACAAAGCGGCCCAATAGTCTTCCACTTGCCATGGCCAAGCGAGCATAG-GAACCGATCACCAGCATTAACACCACAGCATCCGAAACGAAGTAGCAGGAATACGAGA------AACGAGGGCGGCCAGGTGCAGGTGCCTGCCGAAAAAGCAAATGTCTGTAATTGG------CTATATACATACGAACATATACCTACTTATATATATATATACGGCCTGTATTTATAC-TGTGTTATACAACGACGAAAGTGCGTAAACATAACT------------------------ACACATATATCGAGTACGATCGGAGACGATTTGATTGCAA-----------GGATTTGGATGACTTTAGCCT-GACGGTGAACGATGCACTGCCGCCTCGTCTACGTCACGATCGCCACCAATTGTCGCCTTTATCGTTTAAGAAGAGCATTAAACGCGGATTTT--------------------ATCATGTCCTCTGACCTATGTATTAT---TCTAAT----------TTTAAACGAATCAAGCTCGAGATCTGCGCTCTCGATGAGCCAGTCAATTCTTCGTGTCTTTGAAGACCAACCAGCCGACTCTCGACTATTTTAAGTGGTATCATTAGGAGCACTCATTCAAGTTTTTCGCTTTCCCGATTGTTCACAAACCAACCACCTAGTATGAGCATGAATAATAACT--ATG--CTAAACCACTGATCATTTTTGCCAGCTCTCCATTGAC--AAACAATAACTAAAGA------CTTTGATTTTATAAAAACAAT--------------------AAATTTGTA-ATTAAAATAACATAACTATAAAACATTTAAGATTGCTTGAATTAGTCAAATTTAAAGAGAATAAACTAATTGAATCGG
GACAAGGAGCAGCAAGCGGAAGCCGTAGGCACGCCAGCCAACCCGTTGCCCATGGCAGTGCTGGCGCAGTCACAGATAAAAAGACCCAACAGTCTTCCACTTGCAATGGCAAAGCGTGAAAAGTGAGCCG---------------------------GAAAAGTCGCAGCAAGAACCATACACTATCTATTTACGATCGTTAAATGTTGGCGCTTATTTAA----TAATTGTCTTTAATTTGCCTATCCTTTACACATACATACATCTATATAAATATATATATATATACAACATGAATACATCTATCTGTTATAATACGATGAAAGTGGATATATGTATCTATAAACACACACACACACACACACACACACACATTACATCAACTCTGTACATATGTATGTGCTACATAATGAATTAAACTTGGATGATTGTTGCCGAGACCGAAACCGAAACA--GGAACCGCATTATAGTCACAATCGCCACCAAGAGTCGCCTTTATCGTTTAATTAAAGCATTAAGCGCGTGTTTTTAATAATATTAATAATAGTATGCATGCACTTTCAATAATGTATTATAGATTTAGTAGAGCATTGGTCCATACATATATAACCCGTGA------CTCTCACTGAAGCTGGCAAC---------------AGATTA-------GATCCTAAGTGACGGCAACTTGCAACATTAACAGTATAAAGTAACGATAATAA------CAATTTATAACAA----------TTTTATTAAAATGAACAATAATTTAATGAATTCAACAACAGCTTATACAAATAAGCGCTTCTTAAACAAAAACAAAAACCAAAAACCTTTTCTTTTTTTTTACAAAAAAGACTTGGGTTTTTTCTTTTTTTAATATTTGTATACTAAAATTGTATTATTACAA---GTTTAAGAATGCTTGAA-TAGACAAATTTAAATAAATGCCAAGCGTTGTTTATC
>mRpL54 16569011 16569173|16823 chr2R 16569072 16572605 scaffold_4 5529034 5532537 - 70189|0 122
ATGTTGTTTGCGATGCTCTCCTGAGCA---------ACAAGTGTGCAAACACCATGTTATTTTGCTAAAAGCG---AATTGCAAATACATTTATTG-----CACCGTCTTAT----CATAAAA
ATTTTTATTGCTACGTTGTTGT-AGCATATGCACACATATGTATGTATACAAACCTTTACTTTGACAACACCTTGCACTTATCGATTAACTTGTTGATTGACACCATCTCAGAGTGTATAAAA
>CG9357 16570780 16570794|16823 chr2R 16569072 16572605 scaffold_4 5529034 5532537 - 70189|1738 1752
ATTTTATTTGTCCAG
ATTTTATGTACACAA
>Treh 16594537 16594994|16846 chr2R 16592768 16594851 scaffold_11 1883277 1885500 + 67627|1852 2275
AAAG--AATCTGTAGCCAGGCCAGAACGCAATCCATCAGACATCATTGTC--------------AGCATCATCACAG---------------------------------------------------------GCTCGAAGCCAAAGCT--------TATTCAA-------AAAATTGTATTTAGATATTTGTATATTATTAAGGCTCCAATCAGAAGCGCTCATCAACTGCTCATCCTTAGGCTAAG----AAAATGCTGTCTCTCTCGCTCTGCGCAATCTTTATACCTTTAAAAGCCGCTGTCTATAACCAATATCTGTACCGCGAACCATCGACATCTCGAGCCAAGCAC--------CACGAACCACAGCACCACAGTTACAGCA---------CCGCCAGGAATCAAGATCTGAAGT
AACAGCAATGCCAAGCAACTCGACAAAGCAATTTGAACGACATCATTATTGAATTCATTATCCAAGCATCGGCATTGTCTTCCCCCACAGTTGTTACACTTGCTGCTCTGGCCACAGAGCAGTCTACATAATTAGTTTTAAGTCGAAGCTCGCAGAGATGCTCAAATAGATGATAAATGTATTTATTTATAAGAGTATCAGAA------CCATCTGAAGCGCGTATCCATTGCCCATCAATAGATTAAGTTCTTAATCGCTTTCACTGTCGCTCT-------------------------TTCCGTCTATAACT-TCCTCTGTATCGGAAACAATCAGCGTCTACAA-TAAGCACACGCTCAGCACGATTTAAGTCAGCTTTATCATAGAGTCCAACCTTTCAACAAGAACCAGGACTTGAACT
>Treh 16594537 16594994|16847 chr2R 16594953 16595048 scaffold_11 3301930 3302026 + 1650|0 41
AAGAACGCAAAGAACGCTATCTATCAAGTTGAGGATTCACGA
AAAGAAACGAGTTGCGTCTTCGATCGATCTTCAAAATGATTA
>Treh 16595363 16595440|16848 chr2R 16595049 16598796 scaffold_11 1885690 1889614 + 95731|348 425
GTAATCGTATGATGGGCATCGTGGGCGTGGCAGCTGTCACTATAGTTGCTCTGATAGCAGGTCGTGTTCTATGGTGAG
GCAGTCGGATCATCAGCCTTTTGGGCGTGACAGCTGTAGCGTTAGTGGGCGCCTTGGCCGGCCGATTTATCTGGTGAG
>Treh 16595520 16595811|16848 chr2R 16595049 16598796 scaffold_11 1885690 1889614 + 95731|521 920
ACAA-TGTGTGCCAAAACAAGACGTAATTGCTACTCAAG-TAGTGTGATTCCCCCCTCCGTGTTTGTGCGTGTG---TTGTGAAGTCTG---------------TAGTTGC----TAACGTTT-----------TTCGTTGAGTGCGGAGATTGCAGTATTAGTTTATCATTATTTGGTAGTTG----------AAGTGA---GAGTTGTATATACTGAATTTATATGGGCATGCCCGAAATTGTTATTACGTTTTAATATTTAGCAAATACCTATACCAATCCTAGC------------------------TCCTCGCAACCAAATGAAGACACAAAT-----------ACAA-------------------------TTGTTAACAATAATTTACAAA
ATGACTGTGTGCCAA------CTGTAATTGCCCTATATGAAAATGTGATTCCCCTTTACCTATGTGTGTGCGTGATTTTGTTTTGTTTTTTTGGTTTTTCCTCCTAGTTACATAAAAGCCTTTTCAGTTATTGCTTTGTTGAATGCGAAGATTGCAGTATTAG-TTATAAACAATTTACAGTTGACTTATTGTTAGATGAACTGAGTTATACATACAGAGTTTA-ACGGGCATGCCC-ATATTGTTATTATTAAAATATATGAAGTTAACATGTACACGAATTTATGTGAGTGCATGCAGACATTTTGAATATCCTCGCCACCCCATGAATACACAAGTGTTATGAAATCACAATTTGATATATTTTTGATGTTGTTACTTGTTAACGAAAATTGCCAAA
>CG9394 16628231 16628291|16863 chr2R 16625398 16628274 scaffold_11 3340776 3343771 + 100005|3022 3065
TGAATTCTGTAGAGCCACCAGAGATATATACATCATGCAATAAA
CTTCTACTTTGTACTT------GATATTAACGCCAAGCAATAAA
>CG9394 16628231 16628291|16864 chr2R 16628275 16628761 scaffold_11 3344048 3344568 + 2157|0 16
ATAACTAAAAAGGATAT
ATGACAAAATAGAAGGT
>king-tubby 16630822 16631286|16865 chr2R 16629174 16631020 scaffold_11 3346272 3348078 + 83175|1703 1905
GCTG-GCTGGGATCCTCGGGTTGGC--CCGTTGCCTTATGTACA-GCTGATTATCTGGAGTGCGGATCAAGTCGCTCCGGGCGGATCATTGTTGAAATTATTATCGGAAATCTAGTCACTCGAAGTCGGGTTTTGGTAGACCATCGTTGAAATGAGTAATGTAGTTAGTAGCTACTCGTATCGCGTATCATTGTATAACGTAT
ACCATGTCCTTATCCTTGTTACAGTTACGGATGCCTTATTTATACGACAAACAGCTCGACTTTGCAT-------ACCCTAACTAGTATAGATTGTAAGAATTATCATGAACGCAGAGGCTCGTA-------TCAGGCAAAATATT-TTTAAATAACGAATCTAATTGCTCTCAAAGAACATCAAGAACTATGGTATTATTTGT
>mago 16636778 16637322|16869 chr2R 16636173 16637296 scaffold_11 3368517 3369826 + 24210|672 1350
GCCGTAGCCACCACCT----------CAAGCAT-AGCCTATTTATCGGACGGACACATCGTATTTTATAATGGAACTTCTACG----------ATACTTGTAATTGTATAAGCTA-------------------------------------------------------TACCTTTGTACTTTTTGGTACAGTTTGCAGTGAATAAA---AAAGGATT---GGAAGATACTTTGTTTTCAAAGT------------------CTTGTGTACAGTCTAG---ATTGTGCTATAGAAG----------------TAAATAGCAAAT--CTTCGATGTAGTAGCAGAC-------AACAAGTTTAACAAT-------AATAGCAAAC--ACAATAGTAAACC--ATTTAACTTTTGATGTTATAATGTGTAGGTATATTTGAAAAATACAATT---------------TAATATCTATTGTGTTTGAATAATATACATACTCGAGATAAAAAT-TTAAAGTCCTTTACATTTGTACAATTCGTATATGTCTAAAACAGCTTAAGCTAAGTGATTAATATCTCACAAACTGGCAAATTGTCTTAACGTTTAAGTACAAGCAGTAACTTAGCCTAAGAT-----AATGATCGGTATCTTAAGAAACTGGAATAAAATACGCAC
GCTGTATTCAACTCATTTATATATACTAAACATAAGCTTAATTA----GCAGACACACTTAATTTTGTAAC-GATTTACTACAAAAGAACAACATATATATAATTTTGTACGATGGTAAATAAAACAAAAGTGTTAAGATTGCGCTGCGGTGATCTGCATGTCGGCCGTTTACCTGAGAATCGTTTGAAGCCATTTCAAAAATAAAAATCTAAAACATTGAAGGAAGGCATTTTAATCCTATATTAACCAAGATCATAAGTTGCCTCTCTTCTGTCTGGAATACTATATTATATAGGCCGAACTTGTACCCTATTAAGATTAAACTATTCCAAAGCTCTAGTAGACTATTGAGAAGCTGATTAACTATTCGCTTAGATCACTAACTAGGAATTGTCGGCCAAACTGAACTTGATTCGTTCTAAAG----GATGCATTCAAATGATGCTGTTATTAAAAACTAGTCGTAATATCATTTA---TTGAACAACATAT-TGTGTAAATTAGAAGTATTTAGTTGCTATACATTTGTACA-----TATATGTCTAGA----------CTAAATAATTGGTATTT-----ATAGACAAACTTTATGCATCTTAAA----AGGTATGGGTTTATGCTAATATGTTAAAATGAT-GCCATATTTGATAATCAGAATTGTTTATAAAT
>mago 16636778 16637322|16870 chr2R 16637297 16640529 scaffold_11 3369941 3373235 + 152030|0 25
TCACATACGGTTTTGAGACTTGCAAA
TCACAAAGCGGTTAGAGATTCGTAAA
>Xbp1 16652447 16653335|16879 chr2R 16649287 16653360 scaffold_11 3385127 3389707 + 94195|3598 4706
ATGTTGA--------------------------GCA-------------GGAACAGGAAACCGAGCACAAGGTCAGCCTAAATGTGCAGATGTTGAAGATAAATGGAAACCCACAGCATACCACAGCAGCGCCAGCCTCGAGAACAGCCACAATCACAGCGA---CAGCGGCCGCCTCGCAACTACAGGCCACTCCGGACACAGTGTACGGCACGTATGATGCCAAGACGAACTCGATCACCATCGTGATGGACGGGGATGCGGTGCCGGTGAACGAGGCCGTCGAGGAGATCTACTGTGACGGCGTCAGCGCTGGCGACGACTCAACGGACGTGATCATGAAGTGTCCGCCGCCAGCGACGTCTCCGTCACAGGTCTATCTCAACGTGATGAACGCCGTCGACAATTCGGACGACGAGGA------------AAGCTTCGATCCGATCGACCGATTCCTACGTCCGCGCGTTAAGGCGATCTCCCCGTTGGCCAAATCCCCCGCATTGTCTCTACACTCGGCCACCTCGGACCATGGATACGAGTCCATACTGGGCTCTCCCACATCCGTGGCTC---------------------TCACTCTGCCCGCAGATGAGGACGATTTCCCCTGGGAGAGCAACTTTGACGAGCTGTTTCCCAGTTTGATCTGAG---------------------------------------TTTTTCAAGCTGAAA-----------------ACTTCGTTCTGTCTCTCTTTTA---TTGTT------------AAGTTTGGCCGGCCGCCGTTTGTTTAAGTTTTTTAGTTGATAG--------------------------------------------------GCTGTACATAAATTCATAATCGAAGGCTTTATATATGATACTGTAGTTAGAG--------CGCTAAGTTTAGCTGTAGGTTTCCATTTATATTTAACAATCTCTAACCACATAGGCT--TATGATTACTCTTATATGTATGTATTGTGCTCAAAGAATTTGAAAAAAA---------AACATTTGACTA---AAAAATATTCAAAATATAAACCAA-ACCA-AACAACAAG
GCAATGACACCAAAACGCATCCCTTTATAATATGCACACCCACACCTACTAAAAACAACACCGACATCAACAACAGCCCGTGTATGCAGGTGTCACAAATAAATGGAAACCGACAA------ACAAAAGCTACAGCCACAACGATACCAACAACGACAACAATTTCAGCAGCTGCGTTCCTGCAAAGCGCCACACCCGACACGGTGTACGGCACCTACGATGCTAAAACCAACTCCATCACAATTGTCATGGACGGCGATGCGGTGCCTGTGAACGAGGCAGTCGAGGAAATCTACGGCGAGGGCGTCAGTGCTGGCGAGGACTCTACAGATGTTATCATGAAGTGCCCGCCGCCAGCAACGTCGCCTTCGCAGGTTTACCTCAACGTGATAAACGCCACCGACGACTCGGACGATGAAGCGACCAGCCATCTAAATTTCGAGCCCATTGAGAAGTTCCTTAGCCCGCGCATTAAGGCCATCTCACCGCTGGGCAAATCGCCCGCCCGCTCAATGCATTCGGTCACTTCGGATCATGGCTACGAGTCGGTTATGGGCTCACCAGCATCCACGACTCTGTCCCACTTGGACAACGATATTGCCCTGCCCACAGAAGATGACGATTTCCCCTGGGAGAGCAATTTCGATGAGCTGTTCCCCAGTTTAATATGAGAGGTTCACATGAACTTCAGAGAGGCTTCGTAAATGTTAATTTTTCAAATTGAAAAACCTGTTGGATCATCCAATTCTCTCTCACTCTCTCTTAACTTTGTTAGTTTATGTTTAAATTCTGGCCGGCCGCCCTCATTTTAAGTGCTTTAGCTCGTAGTAAACGCAGTTGTAATTGTTGAAAAGTGGGAAAACCAAAGTTTTTCCATCTCTGTACA-GAATTTGTCATCGAAGGCTT--TATATGATATTCAACTAAAAAATAGTAGTTGCTAAGCTAATTTGTAAGTTTCTATTTATATTTAACACCTGTCATTCACATAGGCTAATATTTTTGTAATTGTAATACTTCAATGTGCTCAAAGAATTATCCAAAAACATGCAGACCACATTCACATGTATATGAATATTCAAAATATATATAAAGACCACAACGGAAAG
>CG9418 16655073 16655211|16881 chr2R 16655178 16655732 scaffold_11 3391869 3392397 + 5159|0 33
AACAATAAAATATCCGCAGCATTTGTATGTAGCC
GAGAGTAGTAAATCC------TGCGAATCAAACC
>CG9437 16677527 16677595|16902 chr2R 16676260 16678089 scaffold_11 3413872 3415766 + 47720|1378 1450
GCAGGTTGCAT---GCAATATGTACATA-GGTTTTAACATAGTTTTTTAATGCAGTACAAATATACAAAGAGA
GCAGGTTACATAGCGACATATGTACATATAGTTTTTAAATAGATTTTTA-TGGAGTACAAATATACAACT-GA
>Xpd 16681661 16682086|16904 chr2R 16681095 16681917 scaffold_11 3418615 3419550 + 42894|566 948
--GATGTGGAAGGTGCT-----CTGCCAACCGGCTCTT-----------TGTCGACTGCCTTC------------------------------------------CGGGAATAAC-----TCAACACAGCACAAGCCGTCAGCTAATGACATTGAATGCCATTAAATGCGGATCA-CAACGGCGATGCTGGAAAATTTAAAAGTAAAATTTTTTGTTT-----------------------TTCGGCT--GCCATGCAAATCGAACGTAAATGTCCAATTAATGGCTAATTAATATTATTTATAATTTCGCGG------------------GCATGACTAA------------CTTAACTG-----GCCGCTCAAGGCGGCGA
TCGAAATAAACGTCGCGTGGTATTGCAAACCGGCTCATCAATTGACTGGCGCCGGCTTCCTTCCGCAATGTATTTGATTTTCGACTGGGCATGCTTGTGTCTGTACGAGAATAATTATAATAAATGTTGAATTTGTTGCCAGCTAATGGCATTGAATGCCATTAAA--CGGAGCAGCAAAAAC--------AAAATTGAAAAGTCAAAGTTTTGGTTGGCTGGGGCGGGTTTTTTTCATCATTCGACTTGGCCAGGCTAAACTGACGTAAATGCCTTATTAACTGATAATTAATATTAT---TAATTTAGCGGTTGCTCATTCCCCCAGATGAATGACTCAATGCCCAAATGCCCAAACTGCGGCTGTCTCTCAAGGCGGCGA
>Pu 16689548 16690198|16915 chr2R 16689381 16690331 scaffold_11 3428561 3429531 + 14997|168 910
AGTGGGCACTAGAGGACGCTACTGAAATCCGAGACCAACTAAACCCCTACAATATTTTTGGAGGCGCTTATATACAAACAAACAAAAATGAAACGAAACACAGGGTCCATTAGTTTATGTTTTTAGGATTGATTTCATTTAGTTA---GTGCAATGATTGCGCAGCCATTTTCCTTGTTGATTTGTGTAAAAATTGTTGAAAAATTTTGTTAGCAAAATACGTTTTTTAGATAGATGAATGTAATGAGAAGCGAGATTCGAAGAGGACGAGATTTGAATACCGGTGTTGGGTAGTTTTATGTTCAATTTTATATGCAGTTTTATGGCACTTGAACGATAATTTTTACAACGTATACATACGATTAATGCATTGTGCAATAAGGGAACAACTGATAATAAATCACGGCAAATTGTTTAGGGAATTTACAATT-------------TATAAACAGTTCACAT---CAAATTAAT-------CAGATCTATAGTTATGTATGTATGTTAACCTATATAAA--------------------------------------GAGTTGC-----ATTCATA---------ATGTTCCTCGACAGGGACCAAAGTATATTGGAAGATTTTAAATGTTAAAATTA-------------TATGCTCATTATGTAAATGACGTTGCTTGTAGTGAGTCAAAG-CTGCTTATTAATTATACAATAAATTATGTATTTAAATAACGTTAAAATGAA
------------------------------------AAATATACATTT----TTTTTTTG-----ACTTGTGTACAAAT------------------------------TTGGTTGAAATTTTTAG------TTTCGGTTAGCTAAATATGCAAAAAATACGTA--CGAAAGCATCGCGAATTTTGGTGTCGGTAGTTTTACAAT---------ACAATACGTTTGTTCATT-------TTTAATGCAAATT--------------ATGGCACATAAATAA--------------TTCATATT---TTTTATAT----------------------------------ACACATACATACATT-------GTATGCAATAAGGGAACAACTAATGAGACATCATTGCAAACCGTTTAGGGAATTTACAATTAAGCTAAAATTCGTAAAAATAATCTACACATATAAATTGATAAATATATATACATATATATACATATATACATTTACATATACGAACAAAACACATACAAATTTGTAAACAAATGGAATCGTTCGAATTGCTTGTTATTTATATGAATACATATGTATTTTTTAAAACAAATATGTATATTAATCGAATTCAACTTATAAATTTAAAATAGAGAAATGAATGCTCATTTTGCAATTGTTGTT-CTTGCACCAAAACAAAATCTGCTTA--AAGTATTTAATAAAATATATATTTGAACATTGTTAAAATTAT
>tud 16699709 16699980|16918 chr2R 16690895 16699722 scaffold_11 3806042 3815331 - 272048|9542 9555
TCACCCCGTTGTAC
TCCTCACGTGGAAC
>tud 16699709 16699980|16919 chr2R 16699749 16700504 scaffold_11 3815506 3816430 - 12523|0 269
ATGCAGGAGATTGTGATTGGGTTGGCTAAAAACATGCGATGTATTATCCA--TTAAGTTGAACGAGTTAAACTTATTCAAAGGGAAGAG----GAGGAC-------------ACCACACGATTA-GCCAAGATGCTTCATTGACTTTTCATGGAAAACCAAAATGAAAGC-AATTTTTAAT----------ATTAATTAAAGAATCAATACGGAATGCAAAACATTATCACCAAAAACACAACAAAACG-------AAAAAAAATCGAAC
ATGCAAAAGATTGTGATTAGTTTTGGCTAAAATATCCGTTGTATTACCTAATTTAGTTGGAACAAGTTAAACTTATTCAAACAACAGAATTTTGAAAGCTCTTGATTTTGTGGCTATATGCTTATAGCCTGAAGCTTCATTGATTTTTCATGGAAAACCAAACTGGAAGCTCATTTATAATTTTCTTATTAATTAATTATGAAAAGAAAAGAAAAAGCAAAAAA----AAAAACGAACACATTTATACATATATGTAAAAGAAAACGAAC
>CG15658 16706715 16707018|16925 chr2R 16706022 16706846 scaffold_11 3824723 3825571 - 25141|727 867
CACTTTAGTTAGTTAATTAGTTGCTTAGTTAGTTAG---TTAGTCTTAGGTGCCAGTTATTTATTA-CCTACCATTTATGCGTTAG--TTTAGCCTTAGGACA---ACCGTCTACCTAGCAAACTGCCTTGAATCCTTTAC
CCATAAACACAATTAAATTATATATTAGATGTATAGCGCCTAGTTCTAAG-ACTAGTTATTTATTAGCCTAGCTCCTA-GCTCTAGTATGTACGCTTAGAAAATCTACAGACTATCTATCGAATTGCCATATACCAACTAC
>CG15658 16706715 16707018|16926 chr2R 16706924 16707456 scaffold_1 3413269 3413748 + 150|0 94
TTTATTTGGTTTAATACGTAACATAGATTTAAGCCAGCAATGGAGTGGATTTTTTATAACGAATGACAATAAAACGTTGATTTAAAGAAGAAGTC
TTCATTTTATTTCTCATATGGCATTTATTTATATCACC--CTGCTTGCATCTATTATCTAAGTTCACCTTTA-----TCATTTGTCAGAAACAGC
>Glycogenin 16716265 16717475|16935 chr2R 16716042 16716399 scaffold_24071 390 778 + 15041|235 389
ATACAAAACCGAAACTAAAC----AGAACAAACAAAT--GCAAATCGTTCGTTATTC--GTCGTTTTGTTGCCATTTTTTTCTTGTACACGCGCACACACGTACACACTTAACACCCACCCCTTC------------TCCACCCTAAAATGAAAA
ATACAAAATAATATATATATGTAGAGAACAAAAACATAAACAAATCGTTTGTCGTTTTGTTCAGCCCACTGACAACTCTATATCCCAGCCCAACACACGCACACACACTT-GCACACAACTGTGCCAAGTTTTTGAGTCTGATCAAAAATGAAAA
>Glycogenin 16716265 16717475|16936 chr2R 16716645 16716779 scaffold_11 3847904 3848052 - 5348|0 153
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AGAGGTATATATATGAGAGCAGACAAATTTTAATTAAGTTTTCAAATTAAACTTTTTACACT-----CGTTGCCGTCGCTGCTGCTCTCGACGTTACACTTGCAATGCATGTGTGTGTGTGTGTGTATGTGTGTGCATAAACGACGCACTTGGC
>Glycogenin 16716265 16717475|16937 chr2R 16716850 16718196 scaffold_11 3848123 3849490 - 8628|0 642
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GGCTCAGCCACAAAACTTTTACACTTCATTGTATTTTAATTGAAATTTGTTGTACTTTTGCCCTCTTGAGTCTTAACCGATTTGTGGCATCCACTTTTCAGCTCATCTGCAT-AAAACTCCT-----CATCAATTTTATTTAATTTT-------------------------------TTTTTCTTTCTG---------------------------TTTTT-----------AATGCAAA--ACGTGTGTATAAAATG--TAAAATAATAATAAAACAAAAATCTCTTAAATATATATATATTTCGAAACTAACTTGAAA-----ATGTTGCG-----TGTGTGTGT-TACCTGTGTGTGTGTGTTTT--------------------------AGCTTCCCCTC--------------------------AAAGCGAGCTGAACGCCAACTATTTGTTTTAGTTGCTTTCTCACAGCAATAAAATCTTTCT-------------TATACC-TCTATGTTGTAATTTACATTG---AAATATTGTCTATAAAATATTTATTCAAGAACACAAAACACAA----AACAAAACCCTTCGTTTCGTCGCGAATCGTTTAAACTGTGCATTTTTATTTTAGTTTAA
>Glycogenin 16720196 16720552|16938 chr2R 16718199 16720448 scaffold_11 3849493 3851547 - 82705|2047 2311
AGATCGCCGCTTGCCCACACCGAAACACACTCAAACACACACGACACTCACACAACACACA-AGGCACAAGAATACACACGAAAAAAAAAACAAGCTTATGAAATGGCCGGAAAATAGAGAAGAA-----AGGCCCTGCGAAGATCCCGATCCCAAGCTAATTCTCCTGACCTATTTCAGCATCCAGTTCAGTTAGTTGCTGGCGGTCTT-TGCACGCTACTCGTTAGCTTTGTTATCAATTAC-----CAGCTGTCTAGTGCCC
A-----------GCGCGCACGGCACAACCACAAAACAAACACGCACCCATCGAAACACACACACGCACACCTATTCACACG---------CTAGGCTTTTGTATTCGTTAGAAATTTAAAAAGTATATTTTGATTCTGTAAGATTGGAAATTATGAG-TACCCCTAAATATGTATTTCAGCGCCCAGTTCAGATAGCTGTCGCTGGTCTTCTGTACTCTTCTCGTAAGCTTTCTTATAAATTATTTGGGCAGCAATTTGTTGCCC
>Glycogenin 16720196 16720552|16939 chr2R 16720449 16720487 scaffold_11 3852331 3852369 - 1076|0 38
TAGAAATGTATTACGAAATTATCCAAAATTTATTACAAG
TAGAAACATTTTGAGAATGTATTCAAAATAATTAACACA
>Glycogenin 16720196 16720552|16940 chr2R 16720488 16722724 scaffold_11 3856203 3858410 - 57094|0 76
AAACTATCTAACATAATTGTAGC---------CTCTTTTGTTAA---CAACAAAATAAAACTCAAGTTTTGGTTCTA
AAACTAATTAACATAATTACAGCACAATTTTGCTTTTCAGTTGAAGTTAGCAACATATAAA--AAGACTTTGTT--A
>CG10069 16792809 16793251|17032 chr2R 16790647 16793217 scaffold_4 60643 63330 - 83970|2243 2798
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CAGCGGGCGAATTAATTTTATTCAATCGGAATTTAATATAAGCATATGTATATATAGCATTGTATTACATGCGTGCACACACACACATTCGCCCGCATGCATGTGTGCAGACTTATGTGTGCGTGCATGTGCAGCTCGCATTAACTATTTTAATATTACACTATTTCTATATATGTGTGCATGTTTAAGTACTGTGTGCTTGTTTATTCGAGAGCATATCACTTGTTTTTCTGAACCTACATAATTAGTTTTATCTGCGTTCATTTTTTATAGCTATTAATACTGAATGTGTAACGCACTAGACGCCCAAATCTTTACCA-----------TATTTATTATGTGCATGTAAACAATGGCGGACGAGCTATACGAGTTAACAGTTTTATCTATATATATATAAATATATTTTATA--CCGCTGTGTGTGTATGTATATCAGAGTCTCCTCGTTTTAAGTGCCGAAGAAATATACATATATATATATAATATAATAGTTAAGGCATATTTACACTGATATGTAAATACAGTTT-TCGTACACTTTTCGTACCAATAAA
>CG10069 16792809 16793251|17033 chr2R 16793218 16793331 scaffold_21 1702588 1702673 - 7|0 33
ACCGAATTTGACTGTTCTCCGCGGCAGTACAATT
AACGC-TCAGCCTGCCCTCCG-------------
>RpL29 16801942 16801992|17040 chr2R 16801447 16802021 scaffold_4 1579404 1580010 + 15890|528 605
A-------------------------TGATTGCCCCGCGTGTGGATAATTAAAGGACAATTCAGTTTAACAAA--GAA
ATTCCCAACCGCATTCGATCTTGTTTTGAATGCAAATCGTGTGTTAGAATAAAGGAAAGAAACATTTAACGAAATGAG
>CG30387 16817726 16817987|17056 chr2R 16817250 16817800 scaffold_398 6049 6655 - 16427|526 615
CACAATCTTCTCTACTA-----GGTGAAACCAGCCAATGA----------GATGGCCATTTAGTGCCAGCTACGCTTAGTTACAAATTAG
TAGGACTGCAGCGACTGCGACCAGCAGCAACAACAAATGATTCAATATGTGCTTTTTACTTAGTGCCAGTTAAATTAAGTTACTAACTAG
>CG9485 16826985 16827151|17064 chr2R 16825378 16827316 scaffold_4 1608079 1610082 + 81510|1611 1833
ACCACCGTAAA------TACTCATATTCAAACCTGTTAGTTGCTACCAA-------AAACTGTTATTAGTGTTACGTTTGAT------------AATTGTACGGATACAA-GATGGAATGAG-------ATTCGATGCCTGAGGT---------------CCCTTGAAATTTTGCTATTCCTAT---TCTATTAAAGTTGCAATTGTTTTTAAGC-----GTT
ATCAAAGTCAACGAATCTCTCCGTCTGCAGAGATACCATATAATTCTAAATTATACAAAATTTATCCAAATATACACTTAATTGGTTAGCCGCCACTGATGTGCATAAAACCATTAAGTTAGTTATTCAATTTGTTACCCAAGTTGTGGATCATACCATACTCTCCCCCTCTCTCTGTCTCTCTATACATATTAAAGTT---ATTTTATCTATGCCAGCACTT
>dom 16843648 16844530|17081 chr2R 16841883 16849070 scaffold_4 2573766 2581727 + 189107|2093 3222
TGATG-----------------------------TTCACTATCAT----------ACCT-CAGTCAGTATTATC-----------AGCTGTGTGTGTTGTGTGCGTTTTAGTGGGCGACTAATTAT--------------------------------CTGTGGGGAGACGGGTCCTTCCCCGGCTGTTACTGC---------------TGCCAGGCGACTGATGCATAATG----AGTATTTA-TAGACTGTAACAAGTTTCCTTCTATCGTATGAGATAAGTTAGTTAGGCGCCGGAACCCACG-------------------------------------------CTAGAATCTAGAATAACAAATTAAACTTCATTTGGTCAAACATCT--------------TGACCTATAACATCTTGACAAAATGCGTTATTTGCCATTCGTCTGTGCAACCAATGGCTTCCTTTGTAGCCTC-----TTATGTTTTGAAAAACAAAGGGATCAGATGTCCTAATTTTTCATAGAATTAAAATAACCCAGAAAAGTGGTAGGAAAGAAATCCATTCCTAAGGCGTATCCATTCCTGTCGCTTCGGGAAAGATTAGGATGAACTCAACATTCAGGGAACAAAAACGGACGACTTGTCATAAGT-----TAAAAAGTGAAATGAAGCGGGAAGGTAAACGGGAAGTCAAATAATATTGCACGATTGTATAATGCG----------TATAGCAAATTTTACTCTAAATTACCACATCCTCGATTGTTGTTGTTAAATAATGTTTGTCAAAAAACCAATCGAGACCACAG------ATCAAACTCCTTTCCCAAAAACTGCATTAGATCTTAAGAAT--------AGGTA---------TACTATGATAATTGTTAAACATTTTTGCATTCTATAATTTATTTTGTACTCTAA----------------------CCTAAATGGAACATTAACAATCTAAAGACTATGAGCATA--GATTGACTAACCAATAAGACACAGAACTCATTTCG-TATGCTTTAAAAAGTATCAAAATCCA-------------------TTTATTGTGTAACATAACAAGATAAAACGAAACGTATAA
TAATAAAATAGAGACAGGAGGCGACAGGACAGTATTAACTATAACTAAAAATGAAACCTGCTGCAAATCCTTGCTAAAGCCGCGGAGCTGTGTGCGCTGTGTGGTTTTTAGTGAGCGTTTAAAAATGGCCACGCAACTGTTGACAACAGATAGAAGCACCTTGAATAGATGTGCATCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAAGCTGCTTTAGAACTATGTACGAGTATTTAATAGACTTTAACAAGTTTCCTTCTA------------AGCTAGTTAGGCGGCAAAATCAATAAAACAAAAAAGGCAGTGAGAAACAGGAAAAAGAGAGAGTAAAACGAAAGTTTAGGATAACAAATTCTGTTTAGCATAGGTAGATACGTAAGTAGGGGGCAGCCAATTGATAAACTTCTAAAAATATGTGTTTAATACAGCTCAGAT-TGAAGCTTGCAAAGCTCTATGCCACCACAATACTGATATTTTGATAACACAAAAAAGCAGATTATTTTATTTAAGTTACACTTCGATGAACAGCGAG-------------------------TTAGATAGATTGATTTCTGCTGCCCCC------------ATCCAAAAACCATTTAAGAAACACGAACCCA-GATTGTATATAAATACACCCTATAAGAAAAGTATATCAGAAAAAATATAGTTTATAGACTTTATATTC----ATTAAGCAATGTGCGGTTAACTTTTTAAAAGAAGTAACTAAAACAAATCAACTCCACTTGTATTATTATTAGTT--TCGTTGTTAAATTTCTGTTCTTGATCTAAGTCTTCAAAGAAACTCTCCTCAGCTAATGCGCCTTAGTTTATAAGTCTCACTCCTTAGGTAACTTTTTAACTCTATGGTAAATGTTAA-TAATTTTGCATTCAATAATTTATTTTGTATTCTAAAAAAAACAAAACCTTAAACTAGTTTAGATTTAACAACAACAATCTAAAGACTATAAGCATATAGATTGACTAACAAATAAAACACAAGAATCGATTCGATATGCTTTCAAAAAAAGTTAAAGAAACTTTAAGACGTTGTGGTTTTTTTTTATTTAAACGGACAAATTTCGTGCGTGTGTTTAA
>dom 16848710 16849423|17081 chr2R 16841883 16849070 scaffold_4 2573766 2581727 + 189107|7920 8395
CGCTCG------------ACTAAAGCCGTCA---GACCACGTCAGCGGCGGAGCATCACGAGCATCACCTCCACCGCCACCGCCAC-----------------CTACAACACACCAACTCAGATTCA--AATCCCACAAGCACCTCAAAATCAAACACCTTCAACTCAGTCAAAA--------------GTCAATCAATCTGATCCTTTCGAATATCAAGATCGA-----ACAAATT-TCAATAGCTCATCTCAC-------------------------------------GCCGATCC----------TCATGCATTCAATCAGTCAGTCAGTCAGTCAATCAGCCCGTCATTGC-TAAATTGATCTCAA------TTTCTGTCGATTGGTTTTGCAGCCATGAGCGATCTAACTG-------TTCTGGAGGATTGTGAGCTCAAGGTGAAACGCTGAAGATTACAACGATGAT
CATTTAGCGAATCATCGTACGAGAGCCGGCGTACGGCCACGCAATCGGCGCAGCATCATTACCAATACCCACAAAACCACCTCGACAACAACAAGCACAAGCACCACAACAAGCACACTTACAATTACCAGCACCACAACGACCACAACCACAACCAAATGCATTGTCGCCACAATTATTACGGATCATGTTTAGAGACGCCAACAATTTCGATATCAACTGTGACACAGCCAAATTATTGACAGCCTATCTCGCTCATTGCTCATTGTTCAATATGTCCGTCAATCAATCAGTCAATTCAACCAACCAACCAACCAATCAATCAGTCAGTCAGTCAGTCAGCCAATCAATCATTGCTTAAATTGTACTTAAAACCCTTTTGTTTCGATTGGTTTTACAGCCATGAGCCGACGCGCCGCCTTGCCTGCTGCTGGATCCTGAGC----------------GGGATTTAAGTGATGAT
>dom 16848710 16849423|17082 chr2R 16849090 16849465 scaffold_4 2581752 2582074 + 93|0 342
CATGGAAGCCGTATTACTAATTTTACTGATCCTTAGATATA-GCACCTTAGCTTAA-GTGAAATTTCATTGTATCTATTCATATTACGAGAATAGTTTTAAGGAAGTGTAGGTGGAGTGCCTAGTGTGTAGGCTAACTGCTTTAAATTCAA--TATGTAAATCGTAGTTAACTAAGTATCAGCCCCCCTATTCCCGTAGAGCAGTATGTACATTGGTAAATCTAATTCAGATCTATCAGATACTACATAAAC----ACACCTAATATGTAGCTATAACTAAATGTCCTTTCTAGTTGTATGATCGAAAGCAAATAAAGAAAATTGTAAAAAAAAAGT-TTAAA
CATGCACACCGCACACACA----TACACACACTCACACACACACAC---AGCTTAAGGCTGTAGTTAATTGTAATTATATAAAT--------AAGTTTTAATTATTAATTAAT-----------TATTTAGCCAAACAATTTAACACGCAAATTCTGTAAATCGTA-TTCCTTAAG----------CTTATCC--------TAGCTTATAGATCTA-GAATATAATTATAATATA-CATATAGAACATTAACTTAAACTTTTAATATAATATCATAAATA-----TCTATATAATC-TATGAT--ATAGTATACTATAAAAAAGAAAGAAAAAAAGTATTATA
>CG15666 16852623 16853193|17085 chr2R 16852279 16853229 scaffold_4 2585708 2586680 + 29215|360 969
TATGCTGCATCATTTTGGGCCGCTGACCCGCTCGAAATCCTCATCCACACATGGATTGCTGGACGCCAACGCTGGAAACAGGGATAGTTTTGATTACAGCCGCTTTAGACGACACTTTGCTACACTTTTCGACAGGATTGTGAGATTAGCCTCCTCTCCAGTG-----GCAGTTAACCCCGAAAAGGGCAAGGAGGAGCCTTCCACGGAGGAGAAGCTACCGCCGACACAGCAGGTGGATGAAATCGGCAATATGCAGCGTATGCTGGGCGAGAAGGGCTTGCCACTGGCTCCGCCGAAGCGAAGAGCCAACATGAGCAGCTCCCTGGAGGCAGTGGAAGAC---GATGAGGAGTACGACGAGGAGGATCTTCGCGAGGATGTGGGCTATCGCAAGGAGTACGG------------AGCAACCGATCAGAAGAACCCAAACCACAAGAAGCGATCCGAGTGGGTGAACGAGGACTTTGAGCTGCCCACCACCGAGGAGCTATTCAGCGACCTGGGCATCTGGTGGTAGGCTTGGACGACTTGGAACTTGGGTTATTCTCGTCGCA-------------------ATAAACGTGCAAACTGTCAAAACAAA
TATGCTGCACCATTTCGGACCCTTGATGCGATCCAAGTCGACATCAACCCACGGCCTGCTGGATGGCAGCACC---AACAAGGACAGCTTCGACTACAGTCGTTTCAGACGTCATTTCGCAACGCTCTTCGACCGCATAGTGCGCTTGGCCACATCCTCGACGGATGAGCAGGCGACCAAGCGGACCGCAAACACGGATCAACAA--GTCGAACAGGTGCCGTCTGCACAACCGCTAAACGAGATTGGCAACATGCAGCGCATGTTGGGCGACAGCATGGCGCCAGTGGCAC--GCGCAGGCAAGA-CCCATTTGGGCACCTCACTGGAGGCTGTGGAGGACGAGGAGGAGGAGTACGATGAGGACGACTTGCGC---GACATGGGCTACCGCAAGGACTATGGACCCGCAGACGCAGCCGGCGGCGAGCAGCAGCAAAGGCAGGGCAAACGCTCCGAGTGGGTCAACGAGGACTTCGAGCTGCCCACCACCGAGGAACTGTTCAGCGATTTGGGTATTTGGTGGTAGCCTCTACGCAC---ACATCTAATTCATTCTTATTCAAGTAGATAAATCTTAAATATATATATGTTTGAACTATCAAAGAATA
>Acox57D-p 16896714 16896865|17141 chr2R 16894475 16896718 scaffold_4 2652929 2655200 + 69847|2314 2318
TGCCT
TATTT
>Acox57D-p 16896714 16896865|17142 chr2R 16896736 16897006 scaffold_884 466 725 - 717|0 134
AACCACCTATCTAGAGTTAGGC--TCAATGTAAT---GTATTGTAAATACCCCATATGTATTGGTGTTTTGTATTATTTTTGTAAATAATACTCTTTAATAATATAGACCCAACATATACCGCTCTTTAAATGAA
AAACGCTCTTCTCTTATTGGTCAGTTAATGCTATCTCTTCTTGTACATATTAAACTCTTAAT--TGCTTTGTAACAGTTTCTTAAAAGATAACATTTTATATTGGCG-------CTTTTTTACTCTCTAGTTGCG
>Acox57D-d 16899898 16900022|17144 chr2R 16898560 16899898 scaffold_884 2279 3618 - 62850|1356 1356
A
A
>Acox57D-d 16899898 16900022|17145 chr2R 16899952 16900921 scaffold_884 4289 5281 - 24877|0 70
AACTACATGTTTTGTTTAAATTAGTTTTATACCAGTTTTATTTAGCAAATCAAAACCAATTTCTCAGTACA
AACTGTTCGGTTTGTTTAAATTAGTTTTATACCGTTTTTATTTAGCAAATCAAAACCAATTTCTCAGTACA
>Sara 16994288 16994695|17270 chr2R 16993872 16995893 scaffold_4 2803316 2805746 + 46246|430 1048
CTTT--AGTCCCTCG---------TAGTGCAATT-----------------------------------------CTCCCGCTGGATCCGAAGACCAAACGGAAAC--ATTCTTAACTCTA-AGCTCGACGCGATCA---------AAGCCAATGGACAACTACACGAGTCCATGGGGCAA----------------------------------GAAATGA------------GGACATGTTGGTATTGTTGGATGGCTCAGTTAAC-TGTGTATATATTTAAGTAGCTCAT---------------------CGTTTGGTTTTTGTCTATACATTTCTACAACCCCCC--CATTTCTAACCTTTCACTTC----------------------AACTGTTATATTATTTC---------------TGATTTTTATTAGTTTTGAG-----TTTTCA---TTGAAAGTA-----------------AAACGTATCTAAGAAACCTAAATATATATATATTTGTATGTGATGTTCTTTAATATGCTT-TACACATTTACCACTCGAGTATATATGAATAACAACTATATTAAAACTGTTGA--------------TCAAA
TATGCAATTCTCTCGCTGGAGCCTTAGTGCAATTGCTGGTACTAGTACTTTATGGAAACACACCGCCTCCCCCCCCTCCCTTACTACCCGAGTATGGAACAGATAATAATGCTATACAATACAGCTGAATACTTTCACACATTTCTAAACAAGCCTCTAGCTACGTAAGCCTATAAAGTGATCATGTGTTGCTCCCCGCCCTCCCCCAGCTTATCGCAATACCTATTCTTCGCCGGCTGCAATGGGATCGTTTGATGGCGCAGTTACTGTGTATATATATATAATTAGTACATGATAAATATATATATCATGGGTGTTTTTTTTTTTTTTTTTGGTTTTTATTCCCCTCCGCCCGCTCTCGCCTAGCGCCCCCTCTCCTTGACGAGCCGACGCAAACATTTTTGTAATTTTACAATGTTTGTATAATAATCTGTGACAGCGTTTGGCAGCCTTTTCACGTTCAAAAGTGTTTTTTTTATTTTTCTCAATCTTGTATTGTAAAATCAAA-----ACATATTTGTATATGATGTGCTTTATTATATTCCTGTATATTTTCGATTTGAATATA----AATAACGACTATAT-ATAACTGTTAAAATCGGTTTGTGTTTCAAA
>MESK2 17020031 17020302|17302 chr2R 17018960 17021312 scaffold_4 2837344 2839708 + 60677|1113 1454
AAGTCCATTCCGTTTGGAGCAAGATATCCCCTCCATAGATTCAGTTCAGTTCAGTTCAGCTCAGTTTTCCCACAGGAGATGCTCC-----------TCCTAGCTTAGCCCCCG---------------ATTTTCTCCGTGGAGACACACGCA----------CACACAAAGTACACAAACGTCCCTGACCCAA--CCTGATTTTAGTCTAAACGAAAATCTT----TGAGAATCAAAAGCTTTTTGAGATGCATTGAAACGAAACCAAAAATCT-----------------------ATTGTGCAAAATTTTATAT-----TTACAAATTGGTTAGATATAC
AATTCCATGCAGTAT---TCAAGACGCTCTCTC----------GTTCAGACAATCGCAAAGTTGTTCTCCAATAGAAAA-ACTCCACTCATCACAATCAAAGTGCAGCTCCAGAGCCTACACTAGAGCATATTTCCCATAGAGTTACACAAAGTCGCCTTCTCTTCCCAAATACTTTAACTAACCTAGTCTAAAGCCTCATGTTTGCGT-ATTGAAGATCTCATTAGTAAAAACAAAAGCTTTTCAA----CTACTAAAAAAAAAAACAAATTTGAGAAAACAAGCAAATTATAAAAATTGTTCAAAATTTTATATAAGTATTATGAATTGGCAAAATA---
>MESK2 17021119 17021180|17302 chr2R 17018960 17021312 scaffold_4 2837344 2839708 + 60677|2362 2429
GAAGATCTGCCGGAGCAACCAAGCAGTAATATACC----CAACAAATTGC--AAACAAAAAAAAAAAA
AAAAAACTCCCATGGCAAATAGTCTCCGAGAAACCTCAGTAGAAAATGGCTACAACAAAAAAAAAAAA
>MESK2 17021877 17024824|17303 chr2R 17021453 17022895 scaffold_4 2839835 2841323 + 9583|438 1648
ACGACGGCGGCAGAGCAGAACTATGTGAGCGAATGGAGAGAGCAACAGCAGTGGCAGCGGCATCGGCAGAAGCGGCAGCATCGGCCCCAATTCGGTGGGGCAGAGTGAGTGAGAGAGAGAGAGAGAGCAATTGGATAATCACCCGACGCCGATACACCC-------AAAACAAAAAATTAGA-ACA-ATAACCACACTGAGAAAAATGGT------TTACAGCTTTGCTTTTAAGGGCA-----AAATA---ATCTTGCTTCGGTTTCTCCACTTCTGTGATTTGCGTTGAAATTT-ATCGTTGCTCTTT------TGTTTTATGTTAAATACTTTTTTTGTAATTAATGCGATTTTTAGTTGGTAAGCTATTAAGTGGAAAGCGGCAAGTG---ATTAGTTTCCATTTCGTTTGTTGTCTACAT----AAATAAATGCA-TTGC--ATATATGTACTTTACATATTGCCTTTCGT-TGTGTCACCCCTTTTCTCCCACATGCCTTAAAAGTCGGGCTG-----------------------CTTTCAC---------------CATCCACA-ACACA--------------GCTTAAATGTACGAGAGCAATAAGTTTAAACACAC--------TATACAAATATACATACATGACAACGCTAT---------TATATACAAATTACATT-------------------ACACTAACCATACTCAAGTCGAGAAAAACGATAAACGAAA--------------------------CGAAAATT--GAAAAGTGTAAGCTTTTGTTGTATATTTGAGAATTCTAAATAAACGAACGAA--CAACGTGAATTTCGAACTGTAACGGTGCGGCCAGAGTGATATA--CTCCTCCGAGATATGAATATATCTGGTGTTGATGGTCCTCTGGCCACTGGGA--------------GTCGCGTCTCTTTCCCACAGCAGCAGCATCGTCGTCACAGCA-GCCACATCCAATTCAATCC---CAGCAAAGGGAGCTCATCGCATCGCATCGCATCGCATCGATCCGCTCATCGAC-CATCGCGAAATCTCAGC-CCAGCTTCCTTCCC------TTCCCCTCCATCTCGTCCATCAACTAGAACAACAACAACAACAAACAACAATAA----TAATAAAATTTATTAATTATAACGATAATAGAACAACAGCAGCAG
GAGCAGTCCGCCGCCTAAATTGGAGT-------TGGAAAGGGC-------GTGGCCGCGG-GCAAACACGAGTGAGAGAA-------------ATTGGAAGACACTGAAACAAAGATGAAAGCACAGCACGCTGA-GACCAACACACACATATACATACATCTATGAAAACAAGGAAACACACACACACACCCACACTGATAGAAACAGCAACAAGTTGAAGCTTTAGCTTTTTTGGCGCTTTTATGTATGTATTTTTTTTTATTAACTGCAATTCTCCGTTTTCTTTTCACTTCTAATTGTTGCTTCTTATATTGTGTATTATGTTATTCATTTTTTTT----TTATTATTACATTTAGTTATTACGTATGTATGTATATAGCTG-AGGTATACATAAGTGTAAA------TTGTTGTATACATTTAACAACAAATACAGTTGTTAAAATAAAAACATTACACATATTATTTTGTGTGTATT-CTTGATTTGTTTCATATGCCTCAAGAGTTGAGCTGTACTTGGGCGCTCGTTGCTTAGACTTACACACACACACAAACACACATTCACACACACACAGACATATGCAATGCGTAAATATATTAAAGCAATAAGTTTATATTTATACCTAACATATACAAATATACATACAAGACAATGCTATATACAAAACTAAACAAAAACAACAACAACAAAAAAAAATGAACAAAAAATACCAATATATAAAGATATATATACTATATACAATATATATATTATCTTAAATGGAGCTATGCAAAAATTTCACAAATTGTAAGCTTTTGTTGTGTATTT--GAATTCTAAATAAAAGAACAAAGTCAACG---ATTTCCAAAT------------CCAAAATCATTTAAGCTGAGCAAATGCACAAATTCGCTCGCTCTTTCTTCTCTCTCTCCCTCTGTTATTGTTTCTGGTTTTTTCGAGTCTCTGTCTCTTCACAGCAGC-------TGACAGCAGGTGGCGCCCTACTCTCACCAATCAGTTAAGTGCATGCAGCGCG------CTCTCTGTCTCGCTCTCATCATCAACATCTCTCATAAACGCCTCGCCAACATCATCATCAAAAAGCTCATCAGCAGCTAGTACAACAAGAACAACAACAACAACAAC-AACAGCAACAAATCGCAGCAACATCCAGTGAT--AAACAATGGCCAAGCAACATCATCAA
>MESK2 17021877 17024824|17304 chr2R 17022959 17023264 scaffold_64 244063 244377 - -180|0 338
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ACAGATGTGTGTGCGCTGTTTGCTTGTGGCTAAAATAAGTGTTAACGGAAAAAAAGTAACGTGAGTGCACTCAGATACTTTAAACAATTTAACTGCATGTGTTATATTCGCACATATCTAACTATATATATAG------TTATTTTTATTAAATAATAAAAA---CCAGCCAAATAACGGTAA--GTACACATTATTAGTCCTAATTTCGAATTTACAAATAGTACAGA--TATTTCGA--------ATATAGTCCGCGCTTGCATACATAC---AAATGTACGTACATACAAGTACATATAAGTACGTGTGAGTGTGTTTGTGTTGGCGCTTGGTTTA
>MESK2 17021877 17024824|17305 chr2R 17023265 17023922 scaffold_4 2841338 2842002 + 25894|0 735
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TACACACACACACACACGCGCACACGCACACATATTACACGCTACAAACGAAAACATGAAAACAGCAGCAAATCCTT--AGAACGTGTAAAAAGAACACCCATAAAAAAAACAACAACAACAATAACTACAACTACAATTAACATGCCCAAAAGTAACGTAACGTAAATAACAAAAGCCAAACTACTACTACCTTCCCCCCCTCCACAAAAAATATATATACAACAACAACTACAACTACAACTACAACTACAACACTGCAACTACAACAGCAACGCCGCTGTCAACGCCGGCTAGTTCTCCCTGCGGCACCAAATATCACACCTATTCATCGATATTCTTTGCCAACTTCCGTGAGCAACAATTGCAGGC------------------CGCCCAGGAAAGAGAGCGAGAGCGCCAGCTGCAGCTAAGCTTGCGCGTCGGCAATCGACTGCGAGAGACGGCCATCAACTGCAGTGGCAGCAGCATGAGCAGCAGCAGCAGCAGCAACAACAATGCAAATGACCCGAATAGCGAAGAGGATCTGGATGTGGAGAATGGCAA---------------------------------------------------CGGGAATGGCAATCGGGCATATGTGACCACTGATACATCCGGTACGCTCTACTTTGGCACACAAAGCAACAAGATACGCATCACTGAGAATCCACTGCCCGAGCCGATTAGCTCTTAGATTGTTA
>MESK2 17021877 17024824|17306 chr2R 17023923 17026552 scaffold_4 2842113 2844966 + 46001|0 1172
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TTATAAACTACGTATAAATATACCAAAACAAACACACACCTAAACGCAGTATCAACAGTATCAGCAGCAGCAATCGCGCAGCAGCCGCGCAGCAGCCTCAGACGCCAACTCAAGCAAAGCTTTAGCCGCCAGCAACTGTGACAGTGTGACCAGAGCAGCCAAGTGCCGCCTGAATGTAGATTTAAGCCGAGCCGCGCTCCAAGAGAT-----------TAAATTGAAAAATCACAAAATAAAAACAAAAAAAAACAATTGAGATAAAACGAAGACACCGCTACCTATACAAGATATTTATCTACTTATGTTACTCAAACAACATACAAATGAATTAAATG-----CCGTTCGAATTTGTCTAGTTTCTGTTTTAATTAAAATCACAAAAAAAAAAACAAAACCAAAACGAAACAAAAAAAAAGAAAAACAAAAGGGAAAATAACAATATATTGCCGAGTAATATTGAAATATTTGTAATTTACACTTTGTGCCTGAGCGTTAAATA-TGCAAATACACATAGATACATTATATTAAATTATATGTTGTCGGTTTTTAGTTAAACAATTGAATTAACAACAACAACAACAACAGCAACAAAATATATGCATAAAT-ATTACGCGAGATTTGATTTCTATTCTAGACATTATGCAATAAAAAAAAAGTACGTGTATTTTTTATGAAGAGCTTGCTTAGTTGTTGTGAGAATAATTAAAAACAAAACACAAATAATTATAAATA----------------AATTATAATTACAA----------------GCTTAATGTTAAAAGGACACTGAAACAAATTAAATACAACATTAACTTAATCCCAGGAGCAAAAAATAAATAAATAAAAAACAAAAAAACAATGTAGCATATCAAA-----AACGAAG---CTCTCAAAATTACATAAACTTAAATAGTTATTAAAAAAACTAAATAA-TTGAAATTCATACTGAATTGCA-------TTAAACAAA----------ACAA--------AAACAAAC----AACAAAGGCAACTTAGGTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACAACA-ACTAAATACACAAGAGATCCACACAG-----ATAAATAATGA--ACTTTTTGCAAATAACTTCAAATTCAATTTAATAAAAGTTTTAGAAGCTTAA
>Egfr 17066665 17067009|17359 chr2R 17062742 17067582 scaffold_4 2886697 2891873 + 217270|4043 4511
GCTCCAGTCGAGTAGGAGCAATTG---CCAATGAAGAAGGAG----------------------------------------AATCTTG-----------CCAAGTGCCTT-TGGAAGCCA----------------------TGCGGA----------------TATGCCTT-TGCTGGCTGTTATCTTAGATA-------GGAGCCCGTGCGCCTGTACAGAGCCTAGAACGACCC-------ATAGATTTGTAAATTACTCTCTAGTGTACTTAGCCAGTCCCCCT----GCATCTTTGTGTATACTTCTCTATCCTAGCCCGTAAACCAGTAGTCAGCAGGGATCGTCGTCGCGGTCCTGCGCTTGTAGAATCCATGTAATTACGAGAACAAAACACCGATAGTGCATTTCTTAGACGCCTC-------CGCCATG--CCAAATTCGAA---GAGATCCCGGATC
TTGC--ACAGAGAAAGAGGAAGTGAGATAAAGTGAGAAAGAGAGAACACACTGCCAGAAGAAATGAGTTAATTTTGGATATCAATCTTGCCACGTAGTACCCAAGTGCCTTGTGGGAGGCATCGCCAGTTGTCGGTTGCCAGTTGCGGACGCAGTTGCTCTGATGTGTGCCTTCTGAATGCTGTTATCATAGATACAAAAACAAAACCCATTCGTCTGTA-GTTGTAAAAAACAACCCCCTTCCAATAATTGTATAG-------TCTAGCGTACTTAGTTCCCCCCACTCACACCCCCTTTAAGAACAACTCTAGATACTTATTTA-ACTCTAGTTGT------GTACTTTTTTC---ATATAGCGCTTGTAGATTCAATGTAATTACGAGAACAAAACACCGATAGTGCATTTCTTAGAAGCCCTGCGAAGAAGCCAAGAATGAAACTTGAACCCAAGTTCATCCATT
>CG10080 17138460 17138843|17444 chr2R 17135830 17138849 scaffold_1 2849986 2853031 + 97871|2780 3193
GCCCACTCCTCATCCAAACCAAC-------AACACACACAACT-GTTCCTTCACCGATCCACTGCTCCGCTCC--ACTGTTCACCCACTGTTTCGTCTCGTCTCGTTTGAACCTCTTAGTTGTCCGCAGCGCGCATGGA-AGGATGAGCAAGCAACAGTCGTCGTAG----CATAAGCACTCTAGATATTAAGCTGTTACATTAAAATCTAAATTGTTATTTTTGAATTTTGTACAAATCAAATAC---------GAATGCCGCAGGATTGCATTAAAGCCAGCTAAAGATTATTAAAGAGATCGCATAATGAGTACCAACTGT-----AAAAATCAAATCTATAAATTGTTTAACAATTT-TCATTGTACAAGCCTGAATAAAATTTGTGTACTTTTGCTATAAAACAAAAAT
A---ACGCCTCGTACAGAACAGTCCAGATAAGCTCAGTCGACTAGAACCAACTATTTTTCGCTGCCTTGGCTCGAATTCTTAGCGTGTTTCTTCATATTCTCACGAATGAACTAC-----TATTTTCAGCATGTCGAGATCGGATTTGTCCCCCTTATTCAACATAGGCTATATAATCGCTTAGTTTTGTTAGCTGTTATATTAAATTTTATTTTA----TGTTAAAGTTTGTACAAAT-AATTACAATGTAAAAAAACGCCCCAAAA---CACAAAAAAAA---AAATACTGTTGAAGAG------CAATAAG---CAAATGTAAGGAAAAAATTAAACAAGAAAATTGTTCAACAATTTCTAAGTGTACAGAGTTTATTAAAA-TTATATACTTTT-CTAAAAATAAAGAAT
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CCAGCGGAGTTTGCCGCAGCGGGCGCTCCTGGAAACGGCGAGTGCCTGCTCGGCATTTAGAT-------GACCACTTAGATGTAATA-----------------TATATACATATATATATATATATTTTTGTACTACCCC--------------CGTCTAGATAA--------CAATTTAGGAATAAGCACAACTACACAAAT------------------------ATTGCAATCCTAGATTTCTGTCGTAG-AACTTGTTTAGTAGGACCTAAGCGATTCACTCG------AATTTTGTAAGCAGATACGAAACT----------------------TTAG------------GTAGGCAGATCGAGGCG--------GATCCT----------------CACATCCAAACGCTTGGGGCATAAATCCTGCGT-GGACTGTGCCAGTTTTTGTTTTTAATTTTATTACCC-TACTATTATTATTTTGT----TTTCCCGGGGAATA-CAGACTGGCAT---TTTAGGCTAAACGTATTTTGGCGTTGGGTTTTCATTGTTGGGCTTTG---------------------AAATAAGTGAAT---------------TTGTTTTAACTGAACAACAAAATAAATTAACAAACCTTCTATGAAACCATAA
CCAGCGCAGTTTGCC------GACATAACCGGCAATTCCGAGTGCCTGCTCGGCATGTAAATCCTAAACAGGCATATAGATTTACTGAACTAAACAAACATCTTGATATATAAATATATATATATATTTTTATACTACACCATAGCATATGTATACGTATATATAAATTATACTTAGCATACAACCAAACACACACACACACATACACCTACAGATACACACACACCCATTGCAATCCTAGTTGTCTGTCATCGTAGCTTTGTTCGTAGTACTCGAATTTCGTACACGGCGTTCAATTGTATAATAATAAATAAAAATGGCCGGTTTTATGCATAAGTTCTTAGGTTTAGGCAACAGTAAACAAACCGAACAGACAGCCGCGATGCTTTAAATAATTATATTACATAAATGAATGGCTATGGCA-AACCCGTACATCTGTCTGCATGTATGTGTGTCTCTGATGTATTCATTCGGACTAATATAAACCAGTGGCGTTTC-----GAATATCAAACTGGAATTTATTTAGATTACA---ATTTTCG-GCTTGGTTTTCATTGTTGGGCATTGATTATTACTAAACAAACGAAAAAAAAAGAAAATTAAAAATTAAAATAATTGTTTTAATTGCA-AATAAAATTAAATAA-----CTACATTGTAGCCATTG
>CG10082 17164656 17165021|17465 chr2R 17162542 17167549 scaffold_1 2882355 2887712 + 191948|2292 2718
GCTCGCTATAGAAACCACATCGGGAGAAAAGA-------ATATGAATATATATATGGGGCAACT--------------GGGCGGGAACA---CACAAGTTAAAAGTACAATTTGATTTCAGAA--TACCTAAATTGTTGTAGCAACATGAGTTAAATTATGAAACAAAATCAACTTATCTTTAGAAATTCAAAATGTGATTCAAGCAAACCTATTTAACAACCGGATATAGACCTTAACTTTTAACTT--TTAACCGACGCGTAACGTTAAGTAAAAGGGCGGAGCGTGTTTCCCCCGATTAATCGCAGCATTTGTGGAGA----ACCAGGAGCG-----------------------------GAGAATTTAAAATTAATTTGTAAACAAGTCGCTTCCAAAAGTAGATGAAAGTAAAAAAAAAAA
GCTAGCTGCTGTGGCTGCAACTACTGCAGCCGTTGCCCCATTTAAATCTACCAGCGAAGAAGCTCACGCACAGTGCGCGGTCGGGAACGGAGAATAAGTTAAAAGTACAATTTGATTTCAAAAAATACCTAAATTGTTGTAGCAACATGTGTTAAATTATGAAACTAA---------TATTTAGAAATTCGAAATGTGATTCAGCTTAACAAAAAGAAAAAT--AATACAAAAGTAAAAAACTAACAAAATTAACCAG---ATAACAAAAAAAAAAATAACACAAAATATTATGGATATATAATGCCAACTTTTTTAAACACCATACGATAAGTGCTGTTTAGAGCCTTCTCAATGTGAAAATCGAAATTGTGAAATGTGTTTGAAAAT--GTTTCTTCCAAACGTAGTTACAAGTTTAATGATTAA
>CG10320 17166327 17166658|17465 chr2R 17162542 17167549 scaffold_1 2882355 2887712 + 191948|4251 4622
ATATACTG---------AATAAAC---------CCATTGTGCTAT--------------CGCTCCAATTCACT--------TTATTCGCAATACATGTACGCGTAGGGGTTTTCACTAAAGCTAAAGTAGTCCTCCGATCAGTTAATGCGCGGCTTGAGCTCGTCGTAGCACGAGCGCAGAAAGATTTGGGGCTTCTTGGCCGGGTTGAAGTACTCGTGGCCCTTCGACCAGTCGTAGCCGACGGCGTACGCAAATATCTGGCCGTTGGCGTTAAATCCGCATTTGGTAATGGACTGATCCATGGTCTCGCTGGACTTGAGCTTGGTCCGGGCATCCTTGTCCCAGAAACTGAAGGTGCCATCTGAGCCAAC
ATTAAGTGTTTTAGTTCAATAAAAATGCAAATGCCAATGCGCTTCGATATTTAATGATACGATACAAATTAATGATTGATATTACTCGCAGAACATGT------------CGTGACTAAAACTAAAGCACGTTTCCGATCAGTTGACGCGCGGCTTTAGCTCGTCATAGCAGGAGCGCAGGAAAATCTGTGGTTTTTTGGCCGGATTAAAGTATTCATGTCCCTTGGACCAGTCGTATCCGACAGCGTATGCGAATATTTGGCCATTGGCATTGAAGCCGCATTTCGTAATAGATTGATCCATGGCTTCACTGGATTTGAGCTTGGTTCGTGCATCTTTGTCCCAGAAACTGAATGTGCCATCCGATCCCAC
>CG15675 17175081 17175176|17469 chr2R 17175057 17179175 scaffold_1 895558 899695 + 93953|24 128
------CTAACTACATTCGATT--TTAAGTGCCAGTA-CGAATTGTGATATCTTGTGTTTATTTTTTATATTAAATCTCTGCTTTGCGGATTGTTTGATTACAGT
GCCTTTCGGACTACAAACGCTTCTTTTCGCATCATTATCGGAAAAATGTATCTTGGTTTCATCAATCATTATTTATATTCTTTTT------TATTTTTTTATAAA
>NC2alpha 17179062 17179175|17469 chr2R 17175057 17179175 scaffold_1 895558 899695 + 93953|4253 4366
TTAGGATCTATGTGAATGCGCTTTTAAATTATTGATACATTAATATGTACTCTAGGTCTAAGAAATCACAATAACATTTTTTGCAAAATAAAGACCATGCTGGATTTTAAGCTG
GTAGTA----------------------------------TAATATGTACATTAGGTTTACGTAAGCAAGTTAATAATTTTGGC-GAATAAAGACCATGTTGGATTTTTAACTG
>CG30263 17192211 17192218|17479 chr2R 17191784 17192589 scaffold_1 5592129 5592923 - 24680|448 455
ATGTGCAA
GTGTGCAA
>CG30263 17192283 17192582|17479 chr2R 17191784 17192589 scaffold_1 5592129 5592923 - 24680|523 839
AGAAATTGAGCAAAATCAAAAAGGTGGAGCGTTTGGAGCTGGAGGAGGAGCAACGCCAGGCGCAACTGGCGGAGGCTGGGAAAAACGGCGTCGCCGAGGCGGACAAGACATAGTCCTCCGATCCCGGTTACAACTAAGTTGCTTTT-TATACCATTGTGTACATACT----TTTG----TACAAAACATGTAGATTACACA------AGACATGCACTTCCACATGAACTTCC-AGGTTAAGCAAAACGGA-ACGGAACTTCCCTTAAACATGAGATACATACGTGTATATGTATTAAAATCATTAAACTTCCACTT
GAAAACTGAGCAAAATCAAAAAGGTGGAGCGTCTCGAACTGGAGGAGGAACAGCGCCAGGCTGAACTGGCGGCCGCTGCGAC------CGTTGCGGTACGTGGCGAGACGGAG----------CCGGCAAAGACTTAAAGGCCTTGAAATACCAAAACCCAAATGCTGCCATTTGGGTATAAATAAAAAGTAGCTTCCACATACTACGTACACACACTTCCAATTAAACTTCCTAGACAAAGTGAGATGGATGTGGATAATCCTTT------------------TGGGAATTAACAAAAATCGTCAAACTTCCAGTG
>CG10306 17193693 17193786|17480 chr2R 17192892 17195051 scaffold_1 5593598 5595770 - 93735|808 917
GAACCTCATTCGCGTTCATAGTCCTTGTCTAAATTTT-TACGAATAGTAATTAACGGAAAAAAAATAATAATAAAAGCCTGT----CCGTACAGC-----------TAAA
G---------------CTTAAATAAGGTTTAAATTTTATACG---GTTAAGTGACGCTCTATATATGCCAATAAAATCCAGGCACACCTTACAACATATATATATACAAA
>CG10307 17197770 17197835|17482 chr2R 17196524 17198905 scaffold_1 1388167 1390466 + 58582|1300 1366
-ATGCATTAATCTGTGTCAACGAGGTCTGATATTATGTAGCACACATAAATCTGTGGTTTATTCTCT
GATAATTCAAATAGAGTTGTTGCGTACTATGTTTATTT-GTGTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCCT
>CG30290 17200275 17200354|17484 chr2R 17200271 17203788 scaffold_16 2689625 2693240 + 153412|4 83
TTATGCACACAAAGTTTATATCGCAGAATATTTTGTTACAATAGTTAGACAAATAATATGGAATTGGCTATGAAATCTTA
ACATACACATAA---CTATATCGCAGAAT------------TAGTATAACACGTAAAATATATTCGAGGACTAAACAT--
>HmgD 17223463 17224307|17509 chr2R 17222946 17223956 scaffold_16 2717940 2718996 + 26230|611 1168
ACTGG----------------------------CTCATCCCCCACCCTAATCCATCACCAAGTCACACACAACCAGCCAGAACCACCCGCAAGCAAACAAGAACACTGGTGGCAACACCACATCCAAACATCAGCAACCACAGTCCCCCTTAATAGAA-TACAAAG-CCGCCAAGCCCGATCATATCTCATCGACAACTTGAACAACGAGATCTGTTGAACATTGTATCCACA---ATCACATACGCGAGAGAACAAAAATACGCGATAATAAGGAAAATTGTATTTATACACACGAGTTTTTAAGTTTATAGTAGTCGTTTATTTTATAATGCCCATATACAAAGAAGAGGACAACCGGCAGGAAAGGAGAAGAAATAAGATTAGCAGGATGTGCGTTGAGGTGTTTTTTTTTTCGATCCTGCGGCG------------TTTCGCCTGGAAAGGCGAGTCGTTCGGAAAATG------AAAGAGAAAAGTAGTCCCCTTGCATATTATT--------TGTGTAAAGTAAACGA-----TAATTCCATTATAAATAAA
ACCTGTCAGTCAGTCAATCGCATTTCGTTTAAACTCCACCCACACCCAACACCACCACCCACCCCCCTACACTCCACTTGCACCAACCATACACAAAACATAAAAT-------AAACAAACAAACAAACA-----AACCATAGC--------ATAGAAATACAAAGACCGTTGAACAGGAAAGT-TGCCGTCGAAAA-------AACGCGA-CTGTTGAATAATGTAACAACACGAAGAACATATGC----------------------------AAAATTGTATTTATACATAAGAATTT--AAGTTTATAGTAGGCGTTTCTTTTAGTATACACATATTTACGAGAGAGGACAA----------------------------AACAG-----------------TTTTTAAGTCGAGCTCGAGGCGCGGAATACTTCCTCTCGCCTTCAAAGAAAACAATTTAAGAAGACGGCAAAAAAATAAAACATTGATCAATTTGTATATCTTGCATAAAAATTTGTAAATTAAACGATAACGTAATTCCATTATAAATAAA
>HmgD 17223463 17224307|17510 chr2R 17223957 17225367 scaffold_16 2719113 2720747 + 18937|0 399
AAGATACAAACAATTGCATCTTGTTCTCTAAGTAGTTGGATGATAGCGATTGATCGAAG-----------------ATCGGGTGGCAAAAGGGAAAGAA---ACAATCCACTTCACAGACAAAATACA----------------CGAAAAACAATACACACACCGC---AAATGAATCGAACGAAATTTCGCTCAGGTCTTTTCGTCATTTTGCATTAAACTTAATGTTTAACGTCTT-GTTAG---CTAAAGATGTATAGCAGAAGAGGAAGTCGGAAGTTAGATGAGACAAGCAGATGTAATTGCATTTAATCGGTAGTTTTAATTGATTACTATACGTACTATTTAAAGAGAAAACCAACAAATTAAAATAAATACA------TTTTTTAAATGCGT
AAGAAACGGCTTGTCACCGTCTATTATATAGATCGATATAATATACCAATAGCTCTAATGCATAATGTTAAAAGTTATCGAGAAACAAATGAAAAAGAGTGTACAAACAAACAAACAAACAAATGAAAACAATTGAATGGGCCTTGAGAGAGCTTTTTCACAACGTTCGAAAAGGAACGAA--ATATTTCGCTCAGGT-TTTTCGTAATT----ATTGAACTCTA-GAGAAACATCTTTGTTAAATCCTGAAGATGTT---------------------GCTGCATAAAACACG-AGATGTA-TTGCATTTAATTTGTAGTCTTAATTAATACCTATATAATTTAATTCCA-ATATGAGAAACAAATAAAAACAAATAAAATACATTTTTTTGAATGCGT
>CG17952 17231240 17231641|17516 chr2R 17229408 17231796 scaffold_16 2725854 2728378 + 80966|1867 2386
GCCGGGAGTTGACCCTTCTATTTTC-------TGTGGCCATTCTTA-------------------------TTTTTATTTT----GATTTCAGTTTGTTTTTATTTTATGTTTCGAATTTGTATATATA---ATACGTATTCATA-------------------------ATTCATATTGTTCTAGACCACCAATACAGCCCCCCCCCCCCCTTCAGCCCATTACTTTTAGTAACAAAATTTGATTTTACACTCGCCGACACACGCACATTAAACAAAATGAATTTTCACACACATAATTATAGT----TAAAAAACCCATCTAGCTGTACGAACT-TATGCG--------------------CTTAAGATCTAGAC-ATCTTATATAATCAATACTTGTAATCTATGTGG--TATGCATATAGATAGTACTTTTTACATTTAAATA---------------TGAAATAAAAAAAA-AACATAGTTTCT----------ATGCTATGAAGAAACGCACAA
TCTCGT-GTCGCTCAATCGATTTTCATTTTTATTTGGCTCTGCCCACCGTTGACGAGTAAAATTTGCAAACTTTTTATTTTATTAGCTTTTAGTTACATTCGAATTTGCTTCTC---TTTGTATATATATACATATATATATATATATATATATATATATCGTGTATTCCATTCACATT-TGCTTGCTGCGCGTCGCAGTTCCATTTGCCCTTTCAA-----TGATTTTAGT-ACAAACTTTTATTT--AACTTCGTGACAAAAAGAAATCGTGAAAATT--ATATATACATATATTGCTAAGGCCTTATAATAAATCGCTATAGCCATAATAATTATATGCAACTTATATAATTAGACATTTTCTAAGACTTAGACTATATTATTTAACTCCTTTTTATGATACTTGTAGCTTATGCAAAT-TTTAAATCATTTACCATGTAAATATCGCAATTACTTTATTATAATAAACAAAATAATTTCGTTTCTTAAGAAAACGAAACGAAAAAAATATGATCTA
>Grx-1 17265424 17265560|17556 chr2R 17264820 17265479 scaffold_16 2762146 2762816 + 17596|630 710
----AAAGTGGGCCGACCTA---------------------TGATCTTACATTTGCTTTTCTTGCTCTGCAGTAATAAAGA
CATGAACTGGGGACGATTTACTTTGGGGTTGAAGCTGCAGTTAACTTTATGTTTGATTTGCGTTTGATTGGGTAATAAAAA
>Grx-1 17265424 17265560|17557 chr2R 17265538 17266090 scaffold_16 218904 219669 - 1922|0 22
TTGAGCCATTTAAAAAATTGCTT
TTGCGCTATAATAAAAATT--TG
>CG9284 17311430 17311923|17611 chr2R 17311547 17311760 scaffold_34 399828 400044 + 2773|0 218
ATACCCAACACTG----GGATATCCTACAC-TGGGTAACCTATACTTTGGTACCCTATACCTTGGTACCCTATAATTTGGTACCCTATAGTTGGATACCCTTCACTTGGATGCCCTACACTTGGATACCATACACTTGGATACCCTACCCTTGGATACCCTACCCTTGGATACCCCAAAGCTTGGATACCCCAAAGCTTGGATACCCCAAATATGGATA
ATCCCGGACACGGACATGAACATCCTGGTCATGGACATCCCGGACATGGACATCCCGGACATGGACATCCCGGACATGGACATCCCGGTCATGGATATCCCGGACACGAACACCCCGGACATGAACACCCTGGACATGGACATCCCGGACATGGACATCACGGACATGGGCATCCC-GGTTATGAATATCCC-GGTCATGGATATCCTGGACATGGACA
>CG9284 17311430 17311923|17612 chr2R 17311862 17312226 scaffold_16 2813289 2813649 + 3535|0 61
TGAATAGATTATTTAAAACGTCAATCTACGTTGATTAATTAAAGACTTTAATAAGCGTCAAA
TGGCTATATTATTTGTATTATCAAAACATGCTTGCATATTTAAATTTTTAAAAACTGAAAAA
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TTGATCAGGCTTGGAGAATAATCAACGACAGCAACGGGTTAATTACTAAGCTTTGTAGTCAAATGTGCTAAATGAAGAAACGCAAGAATGTTAATCATACTACAC-----CCATACCTATATATATATATATATGAATATATATATATAA----------------------------------ATATTATATATTT
>CG9304 17483107 17483787|17813 chr2R 17483436 17483802 scaffold_11 27888 28301 - 7901|0 418
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ACTTACATATATAAATAGCTGTAATCCATATAGTTTTTAGCCGCCTACAACGAAGTTAGTGAGAGTGCAA-AGTGCAGCAAAGATTGTTGTGTGA-TTTATCTAATATGCTTAAATTTATATTTAGTTTCGTTCACAAGATAAGCAGACATAGAATACGCAT---AGATTGAC---AAAGAAAACGCTTGAG---AATTATTTCATTGTGGTA------CAATAAGTTTACATTTTTAATTACAAATTATATAAGCTCTATATGCATGACCGACACCATCATTTGAAGCAAAACAAGAAAGTATTTTGATAAGAACAA---AAATGCAGAAGCATTAGAAAAGTTAACGTTAAGAAAACAAAAAACTCCGAAAAAATGTCAAATGAAATCGAAATAAATCAATCATTTTTCGATACACT
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ACTGCAAATTGATGAGCA--TTTCATCTGATAAAACAGTCGCGAAGTTTGTAAGATTTTCTTAATATTGTTTCAAAGGATTACAGGATT
ATTGTGCGTGAATAAATAAGTGTCCTTTGACTCAG-----ACAAAGCACATAA------CTCGAT-TTATTCCAATTGATAACAAGACT
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CTTCCCCTCTGTGTTAATCTTTGAGCCACAATTTGTTGCACATTTCATGCTTCACAGGCCATAAAACTTTCAAGCGACACCACACACACACACACACATATTTCACACAGGCTTGGAGACATTCATGCATATGAGGAACAGGATAAAGTATCTACAACTTGGCGCTCAAGTATCCATTCGCTTCACCTATA--AACTGTG-CCCACATTGGATTAGCAC---AAATTTATGGC-----CCCTCCCCAGGACAATAACAACACGAGTAGCAGCAACAAACTTATCATATTCATACACAAGTTTCTTTCGTTTTTTTTTTTGGTATTGTGGTGGTATTGTCTCTAAGACCAGAGAATAAACAGGGATATAGACAGCGAGTGGGAGGGAAATGCAGGAAAATAGATGGAAACAAAAGTTTTTG
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G--CCAGCGACCGAGAGAACTCCCTCCAAGATATCTAACGAG----AAAAAATGCACTTAGTTACTGACTTTTAATAAATAATTAATATTACGTAGCTGGCGATGATAGATCGACAGTTCTTAATGTGAGAACAGCCTGAAAATAATGTGTGGGAAA--TTTGATTAGTTCTTCACTTCTTTTT--------------------CTGTAACGGCAATTGATAAGACTTGA--AATTCGACGAATTGTTTCAATACTGCTGCAAGTCCCCCCGAGGAATGCAGTATGGATATACACGTACATATATATATATAAGATATGGCCTTAGAG----CATATTTTTCTACTATTCATATTTAATAATGCATAGTTATAGTCTATACTGCGTATATGGAATGTCATACTTATGTTTACGACTTACACGGCCTACCATTTAGCTTTAAGGTCGTAACTAATAAAACGACAATAGATTT
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ATATTAATACTAAATATTTGTTTGCCTTTTTAG
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GCTGCAGGCTACGCACACGGG
GTAGGATGC------CAAGGG
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CATACAGTCTAGCACTTAATATTGATTGCAGTCCACTCTATTACATTCCGAGCTGTTGTATTTATCTATGGAAGTCGCATAACTTATAAAAATATATT------------------ATTTTTGCCAAT---TGTATTGTAGATATCATTTATAT----ACGTGTTAAAGTGTTCCCAGGCAATAATAATAACCGAATTGGCATCATA-TGCATTCAATAGGCATAAAGAAGTGATTGTAAATCAAACAAAGCTTGGTTCGTTGCTTTCAAATCGAATCTTTCTGTTTCTGTTATATTAACACGCTTTATTACTTAACCAACACTGGGCGGACGTACTCA---CTAATGCACCAAATAAATAAGTATTTACGTATTTATGTTATTGATAGCGAGCAATCTGAACAAAACAAAAAAAAAAAACATAATAAAGTATTAAATTAAATTTACACATGTCTGTACATGTTTAAACAA-TTGTAGCCGTACTAGTCAAATTAACAACATAAAAAAGGTTTAGCTGAAAGTATAAACAAAGAACAAAAAACAAATAATGAAACTTTTATGAGTTGTTGTTACAGCTTCAACGATGAGAGCTCGCAATATTATAACTTATATCATTTGTTATCAGAGTTTGCTTCAAAAAAGGCAACAAAAACAGAAATAATAATATAACTAGTTAAAACTATGGACAAACCTTTCACATAAAAAGATACTAGCTAAAGT-------GTTGAAACTACAATGAGTTGAACTGTACAACTATTTATTGCATTAGACTTTAATCGGACGAAGCTAATGCACATACATATACGAAAACAATATCAA----------AGAAAATGCAAATTATGTTAAA-----ATAATGTTG-ATGTTACAGAAATATGAAGTTGTATAAATGT--TTAATCATCCAA------AATCGATAAAT-------AAATCAATAAATATGATGCATATAATACAAAAT----AGAATGTT
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ATTCCACACCGAAAAC
ATCATGCATCGAAAGA
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ACTTTATTTCTTGATAAACACTATCAACATTTTGGGACTTTTATTTACAATTTGATAATAACCG--TTTCCCGCTGATTTGT---TTGTTGTA
ACTTTATTTGTT--TCATCGTTATCAACA----ACACTTTTTATTTACGTTTTGATTATATTTGGCTCTCTTGTTGTCTCTCACGTTGTTGCC
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ATAAAGTCTGTTTTTATTGTAGGTCATTCAAGAATGTTACATTCACTCTAAAAGTATGTCATAATCTGATTTTGATTGTTATC--CGCGAAGAGTATGCTTAAATTGTTAACGTCTACATATTCTACTCAAATTATCCCTTTGCTTGTAAGCTATTACGTCTACTATGTTTTCGTTTAAGACGACGAAGTGAGTCTTCAGTACATACCGGATCGCTATAGG
>mei-S332 17631847 17632150|17983 chr2R 17632060 17632632 scaffold_11 1212083 1212715 - 8595|0 90
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TAATTCTGATTTTACATAGATAAAAAAAAAAAACTGAAATTA--GCTGATAT---AAAGCTTGTAAGCAAATATCACAA-ATTGCCATTAA
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AAAACAGAATTTTTCTTTATTGTGCATTTGAGAGAATATTAATGGTTCTTAAATAAATAAGAAGTAAACAGAGAA
AAAATGTAATTTTTCTTTATT-TGCA-----------GTGATTGAGCCTTAAATAAATACAGAATATAC---GAA
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-GCGAATCATTGGATCACATATACATAAAGCTATACACTCTACATACATATCGACTATAAATGTTAGCACTATTGTTAATACCTGAACA-GCAGCACATAATTCTTTTAAGCAAGTTAAAT-GTACATAGAACACTTAAATTTAGTACTAGTTATGTTCT-----GGCCCCCAGCATATATGTACCTTTGCTAGCATACATAATATATATGTATCACTTAATATAACTCATACAAAACTAGGCTATTTGCATGCTATATTGAAGTAATTTAATGAATCAACCTTTTTAAATTAGTTA-----GATAATCTAAGCCAATCTTCTAAACGTTGTACAATTTTTTGAAAATTAAAATGCCTACCGTAAAATGAGTACCTATACACAGACTTGAA
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GC
GC
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TATTCAAATAAGAATTAAAGAGCTCTAGGATTTA-TATTAATAAAAAATTAAATAAGGGTTAAATAGATTTTTCTAAGTAGATGTACATAAACACTGAAAACTCAGACACCTAACCCCGCGGTGCTTT--------TGCCCGTTAATGGGAACTCTTAAGCAAATGGAAATAAATTAT--TATTCCCCTATATAACTATTGTAATTAAACTAATAAA----------TAAATCT
>CG5625 17696256 17696390|18045 chr2R 17694062 17698119 scaffold_4 4056495 4060818 - 174659|2223 2357
ACAAATGTCCTGCTTTGGCGAGGAGAACGCTGAGCCGCTTAGGACGAATTGTGCGCTGGCTGCTTCAAAATTGCTGAAAAAACCGGATCAATGTCGCGGTGTTGTGGCCTGTGCGGCGCTTTTCTGGAGTGGAAA
GCAAATGTCTTGTTTTGGCGAGGAGAACGCCGAACCGCTGCGCACCAACTGTGCGCTGGCTGCGTCCAAGCTGCTGAAGAAGCCAGATCAGTGTCGCGGCGTTGTGGCCTGTGCGGCGCTCTTCTGGAGCGGCAA
>CG5625 17696450 17696633|18045 chr2R 17694062 17698119 scaffold_4 4056495 4060818 - 174659|2417 2600
GCAAAACGGCGAGGAGATGCGTGACGAGAAGCGAACTTTGGACTGCTTAAAGAAGGGTGCTCGCATCGCTTCGCAGTGCTTGGATACCGGAGTGCAAGTTCAATTGTATGTGGAGCTGCTGAATCACTATCTGTTTTACTTCGAACGCGGCAACTCGCTTATCACTGTGGCTATGCTCAACCAG
GCAAAATGGTGAGGAAATGCGCGATGAGAAGCGTACGCTGGATTGTCTGAAAAAGGGCGCACGCATCGCCTCACAGTGTCTGGATACGGGCGTGCAAGTGCAACTGTACGTGGAACTATTGAATCATTATCTGTTCTACTTTGAGCGCGGCAACTCACTCATCACTGTCGCCATGCTGAATCAG
>CG5625 17696696 17697469|18045 chr2R 17694062 17698119 scaffold_4 4056495 4060818 - 174659|2663 3612
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GCA
ACA
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TGACAGTATGAAAGACGCCTATT----TTAAAACATCCAAACA--TAAATGTA-------------GAACTTAACAACTTGTAGCTAATTTTTAAAT-----GAATATTCAAGTGCATATGTAGT-TATAATCTAGTTTTGACATACATAAACTACGTCTAATTATTATTATAATAATATAGTTGTGAAATTCGATATCACGCAAAA--ATCGAACCCAACTGCAATACAACGCCTTGCGCCAAACA--------ATAGGGCATCCA-AGCCGA----------GTGCTGCTCCCCATAGTTTTCCAAAAACATCTCGTATAATATTTAAAAC--ACGGCAAACTCGACAAC-AACAAATTAACAAAGAACA---------------------TTCAACGGTTTTAAATCCATTATTGTGAGA--------GAATTGCAGGAATAAAACATGTTTTA----------GTCTTAAGTCA--TATTTACGTATTCTAG-CTGCAAAAGCTAAACAG--CAACAACAACAACATCAATATTGA---TAATAT-------------------TCAAGTATTTGT-ATCTGTA------------------------ATTGTAAAGAAAAAGTCTTAAATTCTAAACAAATAATGCAAGGAAATCGACCCGATCATCAAAACTAAGTTCCCCTTTTTCTACAT---ATTGTGGATTGGCATATTAAGCTGAATTATACATTTTAGTTATTAGGTTAACGC----TAAGTATGCTTATGCGACTGAATTTAAATTAATTAAA----------------
>dve 17792943 17794059|18168 chr2R 17792736 17795053 scaffold_43 662389 664619 + 27585|208 1435
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----------------------GAGGCCTCTCTTGAA--TTGAAATGAGAGGAAATCGGAGGCGTGTC-----------------ACGAGCTATATGTAAATACACA---------CTATTTAA--GACTT---AAGCCCTATGCAGCTATGACAACATAATTAAGAGAGAGAAGATAAGCCCCTAATG------CACCTAGTTAAGCGCCGTCTCTCCAAGTATTATAGTAAGAGTTGAACCAGTTTTCTAACCCAGTATCAGACCCACTTTCGGTCCCAGTTAGCTAGGCGAACGAACGCCGCAGAATATTTAGCGAAAAATAAAAACTAAATAAAAAAGAAGAATTAGTTAAAAAT-TAAAATTAGATGAACTAATAGGACTTTAATTTAT-----------------CACAGCTTCTAGCATGACCTTAACAAATAAAACTCTATATCTAAATAAGTTTAA---ACATCCATCAGTTCGCAAA--------------GTTAGGAGTGTGT-AACCAAAGAGAGCCAATTTC------------------------------ATGTGTAAAT-ATGTATGTTATACCAA--AACTATTCTATTACTATAAAATATTTG-------AATAGTTATACTAGCATTGG----------------GAATTTCCTGTTTTTCAAATACTTTAAAGTTT-------TTGCCTTATTTTAGTTCGTTTTCC-AGCTTAGCACATATCTATGGAGCATTTTATATGTTTGAAAGAAAAAGAAGAAATGCAAAAACTAAAAATATCAAATAAATCTAGCCCAAAAAAAGGGGGTTACGTTAAATGTCCTGGTATTTAATACCTGCTAAATGGCATTACATTTTCAGCCGAAAACTCAGCTGCTGT----CTTAGGTATTCCGTTGTGTATTTGAATTATTCAATTTCAAGCGTTTGATAACAATTACGAGTAGTATTCACATTTATAAAGCTACACTTAAACGTGTTTAATGAATAATTGTTCCACTAGATCCATAAGCATACAAATCGTAAACAAAAACCAACTAAATTTAATTGTAATTTATTGAAAG-----CATAAATAAACACAAA---CACACGGACACATACACATTAAACAAACGTACACA----CATACATTATATTA----CAATATGTATTCCCAGCAATTATTAAATAATTAAATAAATACAATTTTAAATGTCAAACTTGA
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GCC---------ACATAGCACATAC-CATATTGTTATACATTCCCAACATGTTAGACTTCGCATAATATTATTTAAAAGCACCTTGAAATACACAATAACATTTTCTTCAAAGTAA
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GTCCCAACCGCACAGCAGTTAGTTAGCAGTTAGCTCCGGGGACTTCGTTTAAGTGCGGAGCGCGGTAGTCGAGTGTGTTGCGCTGTTTTTTTAATTTATAAGTTAATTCATAGTTAAACACGTGGAAATTCCAAGCAAAAGGTCATGAAATACAAAATACAAGAACAACAAACAGTAATAATAATAATTCATAAAATAAACGGTACGACTCGACTTTCAAATCCAACTCAAGTCGAGTTTAACCGTTTGTCAACACTGACAGAAACACAGAGCGCCCACGTAAGGCGTGAGAAAGTATTAGCAAAAACTGAAAGAAAATACTGAGAAATAACCCCCCCCACATACATATATATATATATACATACTATCTATCTATCGATCTATCGATCTAGCTAATAGTTGTTGTTGTACTTAATTCGGTTGCAGCCACCGATGGCAAAGGGCA-----AAGGGCAAAGGG-------CAGAGAACGCGAGCGAACAATTAGCAACCGTTTCGGGAGCAACGGACTTTAAACTGATTGGACTCCTCGTATTATTCTTCATATCCTTTTGGCATACACATGCACGTATCGGATGTCGGATGATTTTTTGTATACTTTTGGAACAGTTTGAAGATTTAGTGCCATTTTGCCGAAATTCATATTATAATAAAGAGAGAGTGAGAGAGAGAGAGAGAGGTTCATATTTTTGAAACAGACACTCAGTCAT----------------------AATGGAA--TGGTTGGAGATGTATCTGTAGATCTG------AACCTGCCAG---ACTCCTTAAAATAAACCTTTGATATCAAATCTGGACAAGAAAAGAAACGAAAAGAAAAGACGCAAAGCATATTAATTACTACGTTAAGTCTTTTATTATTATTTTATCAATCAAAT-CAAGTA---------CATTTTCGACTCTGAAACATATTCTGAATTCAATAAATTATTTTAACCAAAATGAACTTAATCTTTAAATTG---------TAGAAACACATACTAATATAC--------AATAA-AATATAATTATTTATGAATTGGATTTGATTAATTTAACATCAAA
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AGCAAATAAAATAAACTAAACGGATTCAAT
AAAAATTACACTAAATTAAATGTAT-CATT
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AGCAGTTTGAGTTCAAGACCGCTCCATAAATCTGCACCACCGGCATTACGTGATT-------------ACGTTTGGAGATGTGCACCGCAACAGATGAGCTTGA
A-TATCCGTAATCTAAAACCACATTTAACCCATGCACCACCGGCACTTGAACATTTTATGGCAGAAGGACTTACAGAACTGCGCACACTCAAAGACGAGCTTGA
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TATAGAAG---CAATGCGCCGCTGCCTGCCGCTCGCTGTTTGTTCACCATTTTGTCATCATCTCATCCAAATGCATGCCCCGCCTAGCAATGTGCATGTGCATGTG-CATGCGCCGCCA
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ATTTTG--AGAGTTGAAAACAAGAGGAAAACCTAACCAAAACGAAATGAAATGAGT-AATGTACGTTTAAG-AAATTAGCTTAAGTAGACGAATGCTCCAAATGAACACACACACA-------CACACAACGACACCTACATATATATATATATACACACACACACACACACACACACAC---ACTGACGAACGTTGATTGGGCTTTCGATTGATGACGGGAAACTCGTTAGATGCCATTTTTTAAGCTTTCCGTATTTTCCTTTTTTCTTTTCTTTTTTTTAACTGTGTGTTCTGCTCTGCGAGCGTTT-----------------------------------TGTGAAGAACTTTTCGTTG-TGGATCGTAGCTGTTATCCAAACGGACCC---CAAGAT--------GTCTTGATTTTTATTTTTGTTTTGTTTCCTCTT-TGTTTTTTTTTTTTTAATAATCCTTATTGACGC--------ATTTGCTCGTTTATCATTTCAT---AATGCATACGTACAACTT------------------------------------------ATTTAATTATTTCTTCAATGC-------------------------------AAACATTTTTTAACAAGTT--CGTTAACGACGAGGAGGC------TTTTTATTTGTTACGTTGCGCAGACAAGTCAAACTTTAATTGGAACCCGCGTCGGACATAACAGAAACATATTTTACTT---TGCGTGTAGCATAATATTATATGACTTATCGCGTACACA----CATACATTAATACATATACCAACTACATATAATCAAGCATACAATAAATATAAAAAAAAATATAAACCAAAAACACAAAAGCAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAAATCAATAATTAATAACTGCAAACACGAATCTATATGACTACGATAATACGACAACATTAAAAAGCTTAGCATTATCACATCATACAAAGAATACAAGAAA------ACAACAAGAAAAAGTATAAAAATACATTTCATGAAAATGAAGAGAACGCAAACCCACACATAATTGTTATTGTTGTTAAACGCAACTAAAATTGTAATAG-AATTATGCAAATATACATACAAATATGGTGACAATGTTAAA
>rad50 17933040 17933064|18295 chr2R 17932581 17933052 scaffold_43 355645 356113 - 21272|460 472
AAAATATTATTTT
TTAAGATAATATT
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CCCAGTGAGCTGCTCCACCTGCGGCTGCCCAGATAGACCAATCTGACCGAATACCACCTGCCCCGCCTCACGCTTGGGAGGATCAGCGAGAGTCTCGAGGAGATTAGCGAATAT--TTCTAGG-----CGATGTTTGCGTAGTTGATGCGTACTTGT--ACTTGTACTCTCCCCGTAGTAA-GGCTATACCGATCTTTAGGGACTAACTGTGAACTTATCCGA--GCGAATCT--------------------CGAGCTCGTGC----------------------------TACACGATTTTATTT------TTTACAGAGAATAAACGGAGCGTCTATTTGC
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GCAA--------------------------------------ATTTTTGATT---------TCGCTTTTATATGTGCCATATTAATAAATGTCCCTTGACTTTTG
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>CG4554 17999509 17999615|18353 chr2R 17993522 17999514 scaffold_11 2028118 2034163 - 240399|6085 6090
ATAGTT
ATATTT
>CG4554 17999509 17999615|18354 chr2R 17999515 18001805 scaffold_11 2037399 2039728 - 92510|0 110
AGTCGGTCTGCTTTAGTATAAGTTTTTTTCTAAGTAGAATGGAAATAAAACAAACATTGTTACATAAGCAAAATGAAATAAATATA-----TGACGA-----TTTTGCAAT
AGTGGATTTATTATAATATA----TTTATATAAATAATCATAAATTTAATTAAGAAACGTTGTCTAAAATAATTTAAA-ACGTATACTGGCTGACGAACAACGTTTAGAGC
>CG4610 18001808 18001877|18355 chr2R 18001816 18002022 scaffold_11 2041567 2041779 - 4396|0 70
TATGTAAAAATAT----ATGTAATATTTGATCGCAGAGTCCCAAACC-----AAAAAAGAACTTGCAAAGT
TATATAAAAATAATTGAATATATTATTTAATTACCTGACGCTTTAGCTTTGAACAAAAAGACATG-ATTAT
>CG11362 18070372 18070435|18440 chr2R 18070136 18070632 scaffold_5 503279 503743 + -1017|238 313
GCGTAG----------TATGTTCTTTTTTGATATATTTTCCAGCTGTGAG--AAGAATTCCAACGCGCTCATAAAT
GTGCAGGAGGCTGCCATATTTTCATCTGTGAT-TTTTTTTTTTTTGCAAGGCAACAAATTCATTG-GCCAACAACA
>CG3927 18103517 18103534|18473 chr2R 18103060 18104201 scaffold_4 1285485 1286555 + 5788|490 507
GCTATGAGTATAGCAAAC
GCTATGAATACACCAAAC
>CG3927 18103760 18103935|18473 chr2R 18103060 18104201 scaffold_4 1285485 1286555 + 5788|760 945
CACCTACATCAATGACAGCGACAAACGCTACGCCATTTAAACGTGGATATCCGTATCCAAGT----------ATAAGCCCAATCCTGCTATGTGGACTGACTGAGTTTATACAATCCAAGGAAGCACATTAAAGAAAGCAGCATTTAAAATGATTCTTTTAATTAATAAACAAACATTTATAAAAA
CACGCCCATCAATAATACCAACAAACGCAGCTGCATATAAACGGCCTCAGCCATACCAAACTGACATGAAACGTATGCGCGAACC----------ACCCATCAAGTCT-TATAAACCGAATACGTACACCA--------------------------------TTCTGAAAAAGTATAAATAATAC
>CG4269 18107790 18107938|18475 chr2R 18107083 18107792 scaffold_11 2165692 2166442 - 10508|789 791
AGC
GGC
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ACTACTCTGTCTGGTTTTCAATTTGGATTAGAGCTATTTTTTACAATTTGAAAATGGTTTGCACGC-------------------ACGTGCGAATAAAACGGAATAATTAACTG-------TACAAA
GCT-TTCTG-CTGATTTTCAATTTGGATTAGA--TATTTTGTACAACTTGAAAAT-ATTTGCGCGTTTTCTCTTCAATTCGAGGAGCATGTGAAT-AAACGGAATAATTAACTTAATGTGCCACAAA
>CG4071 18116892 18117013|18485 chr2R 18116806 18120414 scaffold_45 484207 487933 + 182670|131 315
AACCTATA---------------GTAAAACGAAACCAATGCCATTTTGTATGTATATATGTCGTTCAACTAAATTTCTCGATAAGTCCAATGTGAAATACATATTTTAATAGAT-------------------------------TATGC--------------TTGACTAAAGAACACA---TA
AACCAATGCCATTTACTTTATTCATCGAACTAAGCATAACC---TTTGTATGTATGTA--------AATCCCATGTATGTATGAGTCCTTTGTGAAACACATATATTTTTATATAAGATTATTTCCAATCAGACTCGTCAGCTGCTGTGCACTTCGCATTTCCATTGACTCCAGCATTTACATTA
>CG33143 18140093 18141667|18500 chr2R 18138717 18146787 scaffold_45 515474 524060 + 259257|1526 3388
CAAATGGCAGCCGAAACATTTATCTAAGCTCGC--ACTGAAGGCAACTGGACCCTGGAACCCGGATAGCCCCTAAGAGTTCCCAAAGCCGCAGACAAAGTACCCAATCCAAATCCTATTTCAATAATCTAAGAATCTAAGAA-GATATGTAGTTAAGACGGAGA---------AAGTATGCCAGCTGCTCAAATAAGTGTTTCGGT------GAGAGGCTTTAACAAGAAAGTGCAAGGACGAGAAGTAGTAATAGGATAGAAAAGAAG-------------------------GATATTGTACCAGTGGTCATCACCAGGCA------------AGGAAAGCTTTGTATATTCAACAACGACTGACGTATACACATATGTGTAGTACATTATAAACGAAACCAATGGTAACCTGTAGAACTTTATAAGTCGATTATTGTGTACGAGTATGTGTGTATGCATACCTATTAACTGATAAATCAGCTTTAACAACAAACAAGTAAACTATCAGGCTTTAATATTATGAAGATGATGAATTTCTGGTTTAACCT---AGTTATGTAGACTCACCTAGCTGTTGAAACTAATAAATCGATTCTTTTTAATTCTTCTCCTATAC----ATATAGCCAAAACGAACACAGA---ACACTCGGGCACCATCACTGTTATACACGCGATCTAGATCTATATAGATTTACCAAAAATATACATCTATATACATATTTATACACCCAGTAAAATTAGTTGTGTGCGTCTAAGAGCCT---CGCATGGATCAACAGGGTTTCCGTTCAAGATCCTCCAAGAATCCTG-GGAAACAGTTTTCATTCATGCCAGTCTCTTCTTCGTACCGCCAGAGGTTTTCGGACACCTGCTATACACTTAGCTCCTAGTTTTAAGAGAATGAAATCACATAGTCCAAATGTTACATGCTAACATATCGAATTCTCTACTGTACCCACGACCAAAG-CGAAACGTTTGAAACTGTAA-CTAGTACATAATTAGCTTTAAGCAACCTATTACATGACTATTAACTAGACGTAGAGATTTTTGCAAAGTAAG----TGCCCTGGACGACTTCTGAGTGTTTTTGAAACCAGACTCTTACGTGTA---TTCCGTGTAGATGT-------------------TTCTGTAGCGCGATCGTACCCTATACAAAAAAA---AAGTATAT-------CTCATGTTAGGCGAACTTATTG-------ATGGATTTTTAGA-AGTTT---------------------ATATAGGAACGATACGATACTATAGGAATCTATGGCA---CCAAGCCCATTTGCTCCCGCTCACTTGTTTAGGTAGTCTCTTTACATTTTAGTTATGATACTCCAAATTT----------------TATCTATCCACCTACGCGTTAGACACCTGAAATCTATCCTATACAGTTCGTTTCAAGAATGAAATACAACAATTGTAAATACACATGCACT--------------TGTACCTAC-------------------------------ATCAACTGAAA-ATTTCT-------------TCAGTGGAACAC-AAACGTTGTTATTAAGGAATTGTCAATTTATGGTCCAAAGCTACAATAAATAG---------AACATCATTTGGATGGGTCAGCAGTAAGCTTAACTAAGTTCTAGTT----TACGTTCAATTCGCTAACACAAAACAAAAGTAAAATTGTGTGAATGTGTATTTTT-GAAATCAAA------------------------------------TAAACGAA----------------------TTACATAAATGTAATCTT-TTCATAAAGA
CAGATGGCAGCCGAAACATTTATCTAAGCGCGCTCATTCAAGGCAACTGGATACCCAGTCCCAGTCA---CAGAAGAAGCACCAGA--CACAG-CAAAACACTCACTCGCACACACACACACACACACACACAAACGACGCCCAATCCTTGACTCAGATGGAAAGGTAATAAGAAGTATGCCAGCTGCTCAAATAAGTGTTTCGGTAAAGCTGGGGAGGATTAACACGCCTCTTCAGGCAGTAGAAGTAGATGTAG-ATGTAAGAGTAGACATAGGGCATAGGGCGTAGGTGTAGTTATTGTACCAAAACAAAATAGAGGGCATCGAAATATTGCAAGAAAGCTTTGTATATTCAACAATGACTGAAGTATACATATATGA-----ACATTAAAAAAAAAATATATAGAC-------GATGTTTATACGGCG------------------TTATATACACACAC-----AACTGATAAATCAGCTTTAACGACAAACAAGTAAACTATCAGGCTTTAATATTATGA------TGAATTTCTGGTTTAACCCTAGACATAGGCAGACTAACA-ACCTGTTGATA-----AAGTTATATACTCCTAATTGTTCTCCTATACCGATATATACCTATAATATATACATATGTATACACACACATATTAATAGTTATA-------GCCAAACCTAGGGCACTCTAC-------ACATGTTTATATACATATATACACCTC---TATGAGTATATATTTTCA-CTAACAGCCTATACACGTATACCCTAAAGGTAGTTG--AAATACCCACTAAATAGCTTGTAGGCACAAAT---ATTGAACCTAGTC----------------------------AAAAATGTTACTTACTTATCTTAC----------------------------------CTACTAGCTAACATATCAAAT----------ACCCACGACCAAAAACGAAACGTT-GAAACTGTAAACTAGTCTATAAAT----------------TTAAATTCCTATAAT---GATATTGTAATTTTTGTCAAGTAAGAAAGTGCCCAGGATGAGTTCTAAGTGTTTTTAAAACTA--CTTGTACTTGTACGTTTATGTATAGATGTCATTTTAAACGAAATATACTTCTTTATAGCTATAGATATAGATATAGAGAAATATAGGTGTGTGTACGAACTCATAATGTATCCTCTTAGTGTCTAAGCGTGCATTTTCAAACAGTTTCACTTGATGTACCTATCATGCATATATGTTAGTTATATCGATTATAGAACTGATGGCAGCGCAGAAACCATTTGCTC----TCTCTTCTCTAGTTAGT-TCTTTAAACTTTACTTATGTTACTTAAATTCTCTGAGCAATACTTGCTTGAATAATCCCCTACTAATAATAC-CATTTAACTTAAACTATGCACACTGTTTCAACAATT--------CTTATGTATATACACACGCACTCTACTAAGCTCGTTTAAACCCACTATGAATACAACACGAACTCCATACGCAACTAACAACTGAAACATTTCTAAACTGGATTATCCGAATGGAACACGAAATGTTGTTATTAAGGAATTGTCAAATTATGGTCCAAAGCTACAATAAAAAACATGAAACAAATACCATTTGAATGGGTAAGAATTAAGCTTAACTAAGTTATAGTTGGTCTACGTTCAATTCGC--------GATTAAATAAAAAATATATGGATGTGTATTTTTTGAAATCAAATAAACGAATTACTTAATTAACATGTGATTTACGTATTGAACTAACACATTTAATTTGCAAACATTTTTTTATATATTTATTTTTATTTATAAAGC
>bonsai 18146396 18146450|18500 chr2R 18138717 18146787 scaffold_45 515474 524060 + 259257|8472 8526
GCCCGATTCTTTAATGTTACGGTGTCTTACAATAAATGTAAATGCTGGTTTTCTT
----GATCATTTAATG----GCTGCCAAGCAATAAAATCGCCCAATGACATTCTT
>CG3875 18159759 18159911|18516 chr2R 18157954 18159995 scaffold_4 1284501 1286539 + 41360|1969 2139
AAACAAAGGACAATGCTTACGTTGTAAAATCCATGCCGGGGAACTCATGGAAAAGAAGAAAGCAGCATTCAAAATGATGCTATCAATGAATAAATTTTAAAAAAAGCACTTGCGCTGACAATCCTACAAGCAATATTAATTTGA------------------ATTTTTTAT
AAATA------------TAAGTTG-AAAATACAT--------ACACATATAAAAGGACAAGCGAAAAAGCGATGTAATAGTTACAAAAAAAATAATGCGAAAAAG----------CAAAAACTCTAAGAATAATATTAATTTGAAAATCAAGAAAACATTTCAATTTATTT
>CG13510 18166608 18166795|18527 chr2R 18166386 18166608 scaffold_11 3313162 3313369 - 7263|223 223
C
C
>CG13512 18168748 18168969|18530 chr2R 18167946 18168849 scaffold_11 3316090 3316892 - 4782|850 956
AGACGCAGCGAAAACACTCGCCGATTTCATATCATTTCATTTTA--TATATATGTATATATATATACATAACCAACTATACATACATATATGT---ATGTATGTTCA
AACGACAGGAAACTGCGGAGCCAATAAGCAGATATACAACTCTAACCACAAAAGCACATATATATATATTA-----TATACATTCAGATATATTCCATATATGCGCA
>CG13512 18168748 18168969|18531 chr2R 18168850 18169168 scaffold_11 740982 741324 + 331|0 140
TATCTCCTTAT----GTATCGACG---GCGTCAATGTGGTGTCTTCATCACTTA-----------ACATACATAAAAATATGTTTGCTTA---GTGAGCAAAATAAGCTGACAGCGAAAAAATAAACAAATAGATTTTGAA
TAACTATTATTAAAAGTATTGTCGCGCTTATCAATATTTT-TACCAATCACTTAGCGAAATACATACATACATAGATATTCATATCCATACATGTTAAAAACTTCGCATGGCACCATACCAACACATATGTACATATGTAT
>CG4250 18171860 18172086|18535 chr2R 18171574 18171971 scaffold_11 3331365 3331792 - 9430|295 441
AAGTGC-------------------------TATCTCAACACCAAATATTACAGGGATAGATCCCACTTTGTA---TCTCCACACCTATTGATGGGATCAGATTTGGCACGAATATTCA-------CGAAATACAACTCTGGTTCAA
CAGTTCGGGCTGGCTTTAAATACAAACGAAATCTCTAAATACTTAACATTACGG-----------AATTTGTAATGTCTTCAAGATATTCCACACGATT---TTCGGTATTAATCATCAATCAAATTGAAATAAAATATTGAATTAA
>CG4250 18171860 18172086|18536 chr2R 18171972 18172082 scaffold_11 3333769 3333872 - 1473|0 119
ATCAATTGAATATATGTATGTAATTTTCGCATTG---------GTTTACTTTTCAAAATAAATTTCTAATCACACAAATTGTTGGCGATATATGAATGTTAACACTTTCGTATATAATAT
ATCAA--GAAAATAAGTTTTAACCTTCCTCATCGAGATCGATAATTTATTTTT--AACCAAAATTTGTTTCACGTAGATT------------TAAATACTATTATTTTTGTTTATAATAT
>CG4250 18171860 18172086|18537 chr2R 18172083 18172610 scaffold_38 1040547 1041069 - -1746|0 4
TA-AT
TATGC
>CG30273 18175278 18175522|18538 chr2R 18174678 18175908 scaffold_11 3334317 3335574 - 25728|631 939
TAATACGGAG-TAAACAAAACCAAACGAACCCAACCAAATCGAACCGATCAACGCTCACAACCTCAACACACCCACACACAAAATCATCCACGAATGCGAACATTTTTGGTCAGGTGTCCACAGACCGACAGCTGTAC-------GATGAAA---------TTTCCCCAATGGGGTAAACAATCGGGC----------CGCCAAGCTTTTGGC-------------------------------------TTTACTTGATAAGAATACGCGATACGCGAGACACATTTTTTTTTCCAACGGCGCTCCCT
TAGCTTTATGCTAAACAA---------------------------CAATAAACGTAAACAATTTCTCCACACATGCACACGAAC----------------ATTTTTTTTTTTAGGTGTTAAGCGACACGCACGCACACATACTCTGATGGAAAGCTACTCATTTTACCTATAAGGTAAACAAATAAGCGCACAATCGGCGTGAAGCTTTCGACAAATTGGGCGCAAGAAGCAGAGACAGCAGAAACCTACCACATTTGATAAGAACCGATTGGGTGCGTCGCAGGTTCTTGTTTTTTTTTTGTTTTTCA
>CG30275 18219951 18220333|18576 chr2R 18220066 18220193 scaffold_11 3390391 3390522 - 2732|0 131
TCGAGCTCAAGCTACTGACTTTCCTAAGGGAGCATCGAAGAGACTTTCGTCACAAGTTCGCCCTGCCCGAAGACTTTCTCAAATTGGA----CCTGGCTGATTACGAGCGATACATGGATACGGAGGAAAAT
TGGAACACAATCTATTGGACTTTATACGAAAACGTCGAGGGGAATTCCATCACGATTTCGTACTGCCTGAGGACTACATACAGGCGGATAACTTTGGGGACCTTCGCTCGGGTCATGGAAATTAATCAAAAT
>CG13526 18263372 18263478|18624 chr2R 18262452 18263380 scaffold_11 3446082 3447054 - 9996|1042 1050
GCTGAGACA
ATGGCGACA
>CG30267 18265452 18266579|18629 chr2R 18265421 18267036 scaffold_11 3449232 3450788 - 94977|38 1175
AACTCCTTGCGCGCTGCACTCACTGACGTCACAATGTTGGCCACGTGCCCCAGTACCGTGGCGAAGAGCATCAGGCCAAAGAGCAGCTGCAGGATAACAAAGACGTACTCGCCCTTGGAGCGCGGCTTGGGAAGATCCCCGATGGTGGTCAGGGCCAGGGTGCACCAGTAGTAGCTCTGCAGATACTGCTTGACCACGTCCGCCGACTCCGAGTCGTGGTAGACCCAGTTGCGTGATCCGAACCCATTGTTCTTGTGTATGATGTGGTAGAGACAACCGTTCCAATGGAATATCACAAGCAGGTAGTGGATGAGGGCCGTGCTCCGGAACAGGTTCGGGTAGTTGGTGTGCCGCTCGGTGCGATCCATGAAGGCCCAGAACCGGTAGATCTTCACCAGCCGGAAGCTGCGCAGGATCGAGTTAAAGCCGATGGACAAATAGAGAAAGTCCAGCGGCAGCAGGCACAGGCAGTCGATGTAGAAGATCGTCGAGTTCATGTAGTGGGTGCGCAGCTTCAAAGCGTCCGTCTGCAGCACCCCGTCCTCCAGGTATCCGGTGCGAAAGTGGAACAGTATATCGATCAGATACAGGAAGTCGGACAGGTAGTCCAGACAGAACCAAATGGCGATCGTTCGCCGATTGATCTCCTGGAAGGCGAAGCGGTAGATTATCACCCAGAAGTTGTACAGGAAGGCCATGGACACCACCATGGACCAGTAGTAGCACAGTCGCCCCGCCGGATCAAAGACGAAGTGCAGTTTCCTGGCCGCCGTTGCTGCTCGAATCCGCTGCGAGGCCGTTCGTCGTGGTTTCTGGTGGTGCGGCTGGCCACCATGAGAGCCTGGTCCACTGCCTCCCCCACTGCCGG------CGCCACCGTGGTGCGGGTGATGCGGATGGCCGCCGTGGGGGGGTCCCGGCCCACCAGGGCCACCCTGCGAGGGTGGACCGTGTGCGTGCGGGTGGTGCGACACCGTGGATGCCGAGTGCTGCAGCTGGTAGGGGTGGTGCGCCTGCTGGGCGGCATTGTGGTGCCCCTGCTGCTGCGATCGGGAGCGCGGGTAGCTATAG----AATCGGAAAAATAAATAAGAATAATGTCAGATATACTTGTATTCGACTCTCATATTAGAA
AACTCCTTGCGCGCCGCACTCACCGACGTCACAATGTTCGCCACATGTCCGAGCACCGTGGCAAAGAGCATCAGGCCGAATAGCAATTGCAATATCACAAATACGTACTCGCCCTTGGAGCGGGGCTTGGGCAGGTCCCCGATGGTGGTTAATGCCAAAGTGCACCAGTAATAGCTCTGCAGATACTGTTTAACTACGTCCGCCGACTCGGAGTCATGATAGACCCAATTCCGTGAGCCGAAGCCATTGTTCTTGTGAATTATGTGGTAGAGGCAGCCGTTCCAATGGAATATCACAAGCAGATAATGTATAAGGGCCGTGGAGCGAAACAGATTCGGATAGTTGGTGTGTCGCTCGGTTCGGTCCATGAAGGCCCAAAATCGATAGATCTTGACCAGCCGAAAGCTGCGCAGTATCGAATTGAAGCCAATCGACAAATAGAGAAAGTCCAGCGGCAGCAGGCAAAGGCAGTCGATGTAGAAGATCGTCGAGTTCATGTAGTGTGTGCGCAGTTTGATTGCGTCCGTTTGCAGCACCCCATCCTCCAGATATCCAGTGCGAAAGTGAAAGAATATGTCAATCAGATATAGAAAATCGGACAGATAGTCCAAGCAGAACCACACGGCGATCGTGCGCCGATTGATCTCCTGGAAGGCGAAGCGGTAGATTATCACCCAGAAATTATACAAAAAGGCCATGGAAACCACCATGGACCAATAGTAGCAGAGCCGCCCCGCCGGATCGAACACAAAATGCAGCTTGCGGGCAGCCGTGGCGGCGCGTATACGCTGCGAGGCAGTGCGATGCGGTTTCTGATGCTGTGTTGAAT---------------GTCCGCTGACACCCCCACTGCCAGGACCGCCGCCACCATGCAGTTGATGGTGCGGATGGCCGCCATGAGGCGG---------ACCAGGGCCGCCATGTGCGGACTGACCATGCGCATGCGGGTGGTGCGACACCGTGGAGGCAGAGTGCTGCAACTGGTATGGGTGGTGCGTGGCTTGTCCGGCATTGTGGTGCGACTGCTGCTGCGAGCGCGAACGCGGGTAGCTGTCGTTGAAATCG--AAGTTGAATTAGATTA--------------------------------TAGAA
>CG30270 18292425 18292516|18666 chr2R 18292130 18292630 scaffold_11 3487192 3487658 - 3014|298 391
TGCAATGTGCTTAAAGTGCAGCGATCAAATTCTAACT--ATTTCGACGGACTACCAAGACATTTCCTTTATAATATAAATATTATTTGTAGCAT
AGT-ACGTGTTTTAA-TAATGCTAACAGATTCTTTTCAGATTTCAA------ACAAAAGAAACACATCTAAAAGATAGGTGGGATAGG------
>blw 18309275 18309768|18690 chr2R 18306578 18309765 scaffold_11 3506883 3510169 - 136433|2877 3473
GCATCAGCAGCAAACGAAGAATAGGAGTAGCGGTGCGTGCAATTA--ACATCATAGAT----GGC--------------------------------------------------------------TCGAATAATGCTGCCATCCCTGCG----CGCCATCAACAACAAC-------------------AAATAACAACCTACAACTTAAG-----ATAAAC-----AGAAATTATAAAACAAAAACAAGAGAAAACTCCTTTGCACATTCATGTTTTCCTGCGCATCCTGACTGGATCGATCGCCTTCAATCCGTGGTTCGGTGCCATTATGCCGCAAAATCTTGGGAGAGAGAGAGCCGGCCCTGGCTACGGAGTGGACG----GCGAGCCCCAGCCGGATGCAC-TTTCGAGTTTCAGCGAAAAATCCTTGCGGTTCCTCCAACCTCCAAAACGATAGATAATCCCCCGTTGTTCTTCTACCTAAAATATGTAATCAATATTTGAAATATTGTAATCGAGAATAGTCGAAATAATGTCTGAGGATGATTGTGAAACGATGATGAATTAAAACGATACTAAATTATACTCTAAA
GCAGCAACAGCAACAGCA----------ACCGCCGCGTGCAGTTATCATATCGTAGATATGCGGCAAACCAAACATCTTGCAAGCAAATAAATGAATTAATGTCTGAGCCGAAAGTCACGTTAATAATTGAATAAAGCTGCCAACTGCGCGTAGATGATAACAACAACAACATCATCCGAAGAAAAGATAAAACAACAACCTACACCATAAGAAAATATAAACAAACAAAAAATTATAAAACTAAAGAAAAA-------CCTTTGCGCATTCATGTTTTCCTTTG--------CTGCACAATTCACGTCCCGTCC--------CTGCCACACACACACACACACCTGGGGGAGAGAGAGAGAGAGCGCG---CGGGACGGACGTGAAGAGAGCAGCGGAAGTAACCCCACTTCGAATTTCAGCATTAGCC-----------------CCACTCAAATAATAAA-----CTCTGTTGTTCTAGCTTAAAAAAACTATAATCAATATTTGAAATATTGTAATCGAGAATAGTCGAAATACCGTTTGTGGATGATTGTGAAACGATGA-AAATAAAAACGATACTAAATTATACACTTAA
>CG30271 18329250 18329606|18706 chr2R 18328695 18331186 scaffold_11 3531904 3534213 - 25349|565 956
GT---------------GTCCGCAAA-CGTTTTGTAGTTTATTCA----------CGTTTGTTG-TGTGTGCCGTTTGCTCAACCCATTTACCCCTCTTCAATGTGAACCTCTAAAATGAAACGCAAAAAACTCAAAAAAAAA----AAAACTGAATTTGAAAAGTA-ATATACCAATCTGCTGCAGCCAGGCACTCAAATTCCATTCATTCCAATTTGTTTTACCACTGCAAGAGCCACAGCAACAGCAACA-ACTTCAGCCGCAACCCAATCAGCAGCAAAATGCGAAACT--TTAGCAATCAACTTCAACATAAGCCCGCTTAGATAATGAAATAACCGTAACCGAAGCAAAATTTCTTGATATATCTCTATACATATACATATATATA
ATGCCAACTCTTGTGCAGTCAGCAAATTGTTTAGTAGATTGATTGATTGATTGATCGATTGATGTTTTGTGGCGTTTGCTCAACTGTTT--------TTTGATATG-----------TGAACTGTATAAAACTAAAAAGCAGCTGCTGGCACTCAGTTTAAACCATATATATATATATAT-------------ACTTAAATACCTT-------AATTCTGTACAACAACGTAGTCCCAACAACAACAACAACACAACACAGCTATACTATATATAAATATACAATATACAACTGCTTAGTA------TTTGCTATAAAACC---TAAACAATATTAAAATC-------AAACCGATTTCGTGGATGCCGTACAAAACTTAT-CAT---TGTA
>CG30265 18342074 18342188|18717 chr2R 18342015 18342203 scaffold_20 2306177 2306365 + 530|60 181
ATCGATAGCACTTAAGTCTCCAGTGTACAT---AGAAACTATTTAAA----ACAATCAAATAAAAAAAAAATCACCTGACGTGGTATTAGATAAGGCAAATTCGGCTTATCAGCTAATTCAA
AACAGAATTACTTAAA-CTATGTTATACATACGAAAGACTATCGCAGGATCGTATTCAAATAGCCAAAATTTAAGCTAATG-----TCAACTAGGTCCAATACGCTTAAGCATGTAAAGTGA
>CG9825 18346882 18346897|18725 chr2R 18346862 18347204 scaffold_11 3549698 3550069 - -1452|37 55
TT---CTTAACCCATTTAA
CTGAGCTGCGGCGGAAACA
>RpL23 18363243 18363296|18735 chr2R 18363014 18365895 scaffold_4 4887618 4890541 - 119481|234 300
GGAG----TTTCCTTTTCAA-------TAAACCCA-CAACGGAAAAC-AGATTGTTTTGAATTCGAA
GCAACAGTTCCCCAATTCAACAAGAAATAAACCCAATAACGGAACACCAGATGTTATTAAATTAGAA
>fd59A 18377793 18378306|18747 chr2R 18376675 18377882 scaffold_4 4904158 4905398 - 39913|1242 1343
GCGGGATTCCCACTCGCTTGAAC------CAATTGGCTTGTGTACAGTCCATTGAACGGTGATTTCAG------TTTCGATCTAAGCACGTTTTAACAGCCC
TTAG--TTCAGCCGGGACGGAACGGTGCGCCATCTGCTTGTGTATATT-------AAAGTGATTTCAGTTACGATTACGATCTAAGCATATTTTAACACCTC
>fd59A 18377793 18378306|18748 chr2R 18377940 18378517 scaffold_4 4905656 4906221 - 3507|0 404
GTAGGTG--TATCCGTAGGATGTAGGAGCCAGCACACGAGTTTTTAAATGCGACCAAATCGAAGTCAACGCTATAGTTGCCAGTCCACTTACGTACTAAACA------TATATCTGCGCGTAATATCTATGTAAATCTGAAGCATCGCACGTCTATAGTATACTTTTA-ACACGAATTCTTGGGGTCTGGAGTCGGGATTTCAGGTTCTAGACCTATATCTACCATGCAAGTACTAATCATGTGTATGTG-------TGTGCGTGTGCGTCTGCGTGTAACTGTAACACATCCAA--------------GCAAGAGGAACACTATTAACTATAAATTAGA--CTAAGATTTTTGCTGATGTTATTGAAAATTGAATAAACAACAACATAATAA------TAGTTT
GTAGATGCATATTCGAGATACTTTTATGCCAGCACGAAATTTT---AATGCGACCAAAAAAAAAACAAAAC-------GCGAGTCCACTTGAATTGTAAAAAATATAGTACATACATATGCATTATGCTCGGGATCCGACAGGAACG---------AGCATACATACACACACATAT--------------------ATATATATGTATAAATATATATATAT-AGAAAAGTACATATTTCTAGTATGTAGAGCACATGTGTGTGCGCGTGTGTGTGTAACTATATTGTATTTAATGCCAAGGCGCTCAGCACATAAAACACTATTAACTATAGAGTAGATTCTAAGAAATTTGCTGATGTTATTGAAAATTTAATAAAATGTATAATTAGAAAACGTCTATTTT
>CG13532 18381508 18382033|18751 chr2R 18380488 18381964 scaffold_4 4908886 4910343 - 43425|1068 1614
TTTGGTAGTGTCCTTT-----TTATGTAGGCTACATTCGTTTTTATGTTTGGACTAGGAACTTTGATACTCCTTAATTTTTAA-TAGACTTTTAACGGATAAACGTAATTTTTTGCGGTATTTTTAAAAAAAAGCGCTTATTTTGTACATGCATGTATTTGTAAGGATAACGAAAC----------------------------------------------------------------------ACAAAACAAAAACAAACACCACAATGCGTAAGCAAACGAACCCATAAAGACAAAAAGGACAACAGTAAAGCATAACAAGAAATTCTTGTATTCATATATTTACCACATAAATAAAATATATATG-------ATAGTTATATACGATGTATAGGTCTAATTGAGTACAGAAACGCTAATAAAAAAAATACGAAAAGAAACATTAAAAGTGCATTAAACCAACC----GCCTTCGTCGTCGTTTTTCTTTGCTAAAAAACTAAACAAATTTTAA-AATTGT--ATTTTTATTGTAAAATTACG
TTTGATAGTGTTTTTTGTAGGCTATGTACGTACGATTTGTTTTTATGTTCGT-TTAGAATGTTTACAACTTTTTCATTTTTAAATAGAATTTTAAACGATAAACGTAATTTTTTGCGGTATTTTTAAAAAA--GCGCTTATTTTGTAAATGCATGTAAATGTAAGAGAAATGAAATGACTCACACACACACACACACACACACTAACTCACACATACACACACACTAACACACACAGACAGTAAAAAGAAAATAAAAGGAAAAGTGA-AACATACAACAACACTCAACAAAACAGCAGAAACAAACAACAACAAAACT--AAAACAAATTATTGTATTCATATATTTACCACATAAATAAAAAAAATATATATATAAATAGTTATGTATGATGTATAGGTCTAATTGAGTACAGAAACGCTAATAAAAA----ACGA----AAACATTAAAAGTGCATTAAATAAATTGTTAGCAATTGTTTTTATGTTATTCTATTCGAATATTAAGTATACGCTAACAGTTGTCAAATTTAATTGCTAGTTTAAG
>PIP5K59B 18388092 18389039|18754 chr2R 18388060 18389529 scaffold_4 4917081 4918688 - 45987|32 1180
CATGTGGTGACGGAACACAAGACACA--------CCAACCCAGATATATCACGATGTGGACTGA----------------------------------GAAAGAGTCCGAGCG-----------AAATATGCCTCATACTCT---------TACATACTGATTATGCTTGCGTGTTCA---------------GGCGCTCTTGTATAGCTAGGATATAATCAAAAGGCGCCC------------------------CACGTAGAACAGATTCCCCCATGTCATGCCCA--CGACCACGACCACAGCCACACCCACACCTGCCCATCCCTTCCAGCGGACACTGGGTGAAAAATA-------------ACCAACAAGAGACATAACTCAAT--------CAAGCAAAAGATATT-----ATATACAAGCCCAAAGCA-TACTCCTTATACACAGAACTACAGAAGCATATAGCATATAACTGGCAAATCAAATACGAGTAAGGTGCT--CAGGATGGCATCCCGTTGGTGATCAGAGATCCGTGATCAGTGATTCGTAGTCCCGGTCCCCTATACGTTTAGTGTACGGTGTAAAGAGTTCGTTATGCGTTCGATCA------------------------GATAATATGAAAATATACAATACACTGAAATTA--------------------TATAAATAAACGTTTTTGCGATACTTTCGATCTCCGATATATCCACATAAGTACGTATTATGTATACCTATGTATAATCAGCAATCGCGATATTACAATATTATTGTAAAATATTTCAATTTACA----AGCCAGACAAACCAAAAGCAAAATTATATACATATTATTCATCTGTATTTATTAACGATAATTGTAA-CGCGCTTAGGTTTACTCAACACAATAAACAGAACAGAACCGGACCGGACCGGACTTAAAAAGGATATTACAATAGGTGCACCAACAGACGGACTCGGACTGCAGACAACATTTGACTCAAAACATG----------------ATGAAAGAATTGATTATTTATTAATTAGTTGAATGTTATTTAACTTATATGCATTATTCTAAAGATTACTGAAATCCAAATGTAATTACA----ATAAATTAAATTGCAAGGTTGAAA
CATGTGATGATGGA-CACAGAACAAAAGCAGCAACTAATTCTCGTATA-CATGAGGCAAACAGAATTCGAATAAAAGTACAGACAAACATATTGCAAGGATAATGCTCGAGTGTTTAGGTACAGAGGTGTGCA-CATACTTTGATATATAATAGATACTGGGTATGTATATGTATGTACATATTTGTGTATGGAGTGCACGTGTATAGCTAGGATATAATCAAAAGGCGACCTTGTAGAGCTCCATGAATGAAGTACCCGGAAATCAGATTCAACACTTCCCCACACATCCAGCAATTTCTACATGCATTCGTATATTTACAGGATACCAGCAACAGATATCGTTCAAGAAATATATATATATATATACAAACAAAATACATATATACATATAATATACGAATACAATAAATTTATCTATTTGCATACCCAAGGCAACAATAATTATAATTGATATTATATATATATACAAATTACAA--AACAAATCAAATATGATGCAAACGTTGACAAAATGCAATTCCA-------------GTTCCCGTTCCTTGACCCGCGTTCCATATAATAATTATATTAATAATGTGTACTAAAAAAATCGTTCGGC--TCGATGATATTTGCTAGAAGAAGGGTGAATGAATAATATCGAATTATACAATACCGCAAAATTAAAGCAAATATATGATCAAATTAAAAGGAAACATTTTTGCTATACTTTCGATCTCCGATATATCCACATA----CGTATTATGTACACCTATGTATAATCAGCAATCGCGATATTACAATATTGTTGTAAAATATTGAAATTTATAGGACAGTCAACCAACCAAAAATCAAATTTCTATGCATATTATTCATTTGTATTTATTAATGGTAATTGTAAACATGCTTAGGTTTAGAGGACGC----------------------------GCACTCAAAAAACAAACTAACATGACGGGAACGACAGACGGACTCAA----CGGATCAGATAGGGCCTAGGTCTTGTACTCGAGAAGCAAATACGAAAGAATTGATTATTTATTAATTAGTTGAATGTTATTTAACTTATATGCATTATTCTAAAGATTACTGAAATCCAATTGTAATTACATACAATAAATTAAATTGCAAGGTTGAAA
>asrij 18395134 18395182|18758 chr2R 18395127 18401751 scaffold_4 2553345 2559970 - 285050|7 55
GGTATTGTTATTTTGTTGGACATTAAACGCGCATAAAGTTCTGTGAAAA
AGAGAAATTATTTAGATATATCGTAAATGCGCGCA--TTTATATTTCCT
>CG3700 18403276 18403346|18760 chr2R 18403279 18403719 scaffold_13 3051657 3052034 - -431|0 67
TTAGGAGTCGTAATATAACAAAAAAAGGATAGTTTAAAAAATAAAAATATTTCAAATAAATCAAATTA
TTA-----CTTAATGTAACATGCAAAAAGTAGCATACG------------TTTGCGCGATTTAAATTC
>nahoda 18423690 18424324|18783 chr2R 18421439 18424312 scaffold_4 2588427 2591349 - 59152|2504 3171
AGCTCAAAACACATCCGATTATTTAATGTTCGTTTTAAGTTCTACTCTCACTCTGTTTCGTCCCTCACAAAACAAAATATTAAGTATGTAAGTATTGAATCGTTGGTCCATTAAAGATAGATTGCGTAAACTTTCAATAGATTTTAAAATAATCACAAAAATTGTTTGGGTTTTCCATACAACGTTAGGCTTAAATGAATTATTTCAAGCTGACCCTTGTTTAAAAAAACAGACAATTGACCTCGATTCGACTCTTATCTGTGCACTCTTGTTTCCATTGTGAGCCCTCTTTAG-------TTTCGATTTTGCCATAACGCAGTTGCGCTGCAGCGGCGTTTCCAGGTGCGGAAGCTTTACCACA------AAACGCACAACGCATGATTCCA---------------------------CACAACTTAGTGAATTGTAAATATTTTGAATAGGCGTTAATGCTCTTGCAACGAAAACAAGAAACAAATCCAAGCCACACAAATCACACAAAAATAAAAACTATAAAGCAAGCTTTGCAGTTAGGTACGTGCATACATAATGTTTTCGCATTGTCTTATCGTAAATGTGCAAAGAAACATAGTCACTGTATTTAATCAAATTAAATATACGCAT-TAAGTACATATAA----ATAAAGTTAAGTACAT
AA---AAAACAAAAACCA------------------------------------------------ACAAGAACAAACAAAACGTCTTCGGG-----------CGGACAAACAAATTGAAAGTGCATACACACAAAACACGTTGCAGCTTATTTAAAATCTTGTTTTAAGTACTTCGCTCTATGTATTCCGT-----CCTTTTATCTGGCTGACTGCTGCTT-------------------CTCGTTTCGATTGCCATA-AAGCA------GTTTCACTGCATGCGTTTTACGGGGAAAACTTCCCACATTTTCACCATTAATTTTTTTTA---------TTTTGGCTGCGTAAGCTTTATAACAACGCACAAATGCACCGAGTTTAATTTAATGCAGTTCAGGAAATGTTTTTTAAATCCACAATTTAGTAAATTGTAAATATTTTGCATAGAATATAATTGTCTGG--------ACAAGTATTGATTCAGGAC--------------------------------------------------------------------TTTTGCAATGTTTTCTATTTAATGTGCAAAGAAATATAGTCACTGTATTTAATCAAATTAAATATATGTATGTTAATATATAAAGTTTTAAAATGTTGAGCGCAT
>CG30193 18437138 18437331|18791 chr2R 18436414 18437301 scaffold_1 6560346 6561357 + 10794|861 1066
AGATGGCTACCATCAAGCATACA---GATACTCAGCGAACAATCGGATTTTACACACTCAGCGAAACACTTACACTTCATCACAT--------TAACACTGTCGCC--------CACTAGCAGTTATAT------------------TTTTGTTTCAATAATGTATTTT--AACTACGTTTACACCTAAGTTT---CCGATTAGTT
TTAGGGAATCCAAAAAGCAATCGCATGATACTCAGCAAATGCAAGCACAAACAAAATTAAGCGAATTTCTATTATTTTG-CACACGCGACACCTAACCATGTCGTCGTCATCATCACCAGCCACTATATACACCTAGTTAACATAGTTATTATTTGAATACATCATTCTCTATATATATTTATGCATATTTTTAGTCTGTTTAGTT
>CG9849 18446385 18446634|18802 chr2R 18446060 18446453 scaffold_1 6568312 6568702 + 15446|328 396
CGTGATCGGATTACATGCAGCTCAAAGGACTCGTGTGAAAGAGACACACACGATCTGAAACCAAAGTGC
---GTCCAGAATGAAGACAGCGCACAGGTTCAGGATGCGCCTAACA---AAAATACGAAACCAAAGTGC
>CG9849 18446385 18446634|18803 chr2R 18446454 18447666 scaffold_1 6569251 6570537 + 57832|0 239
ATACTCG--TAGGCTGAGACGTCGAGACCGCAACTGAGACTATACTTTAGAGTACCAATAAGTAGCTAATTCGTAGACGGCAGC--------------------------CATAAACTGTAAATAAA-TAGCTTAGCAGCCAAAGAGTCAGGTCGCCAAG--TTGTAATCTAGAC--AATACTAT----AATTCTTAATT-------TTTATAGACAAATG---------------ACAA
ATACTTGACTAAGCAAAAAAACAAAAAGAAAAACTGAAACTGAACT---GAATT----TAAGTAGCTAAATTGTAAACAAAAGCAATCCCCTAACAAAAATAGATCCAAGCGTAATTTGTAAATAAAATTGCTAAGCA-----AAAGACAGTTGGTAAAGAATTGTAAGTTAAACCAAATACTATGCATAAATCTTTATTAAAGCTATAAGTAACCATATGTAAGTCAACTGCTGCATGT
>twi 18555677 18555926|18939 chr2R 18555394 18556598 scaffold_1 6708714 6710031 + 22279|309 664
CGGCGGATCAGGACACTATAGTCCGAGA-------------------------------------GGGGCTTCCAGCAGC--AACTATCGTGTG------------AATTCCAGAGCCCTGGCGCTCTCACTCTTCAATTCTCTGTCACGCTTTCCATATATACGTGTCGACTAG--------ATGATTCTAAG------------------------------ATGTCTAAGCCTAAAAAC-------------CTACTGTTAATGCCT-ATTTAATGTCATAGTCTAAACTAAATT-AATTGTAAAAAGCCAACAA--GCCAAGAAACAAAGAAACGCCATGAACAAAACCAGA
AGGAGAGTGGCGACGGCGGAGGCGGAGGTGGAGGTGGAGGAGGGGGAGGAGTGTCGATTGCCATTGGGGCTTCCAGTTACTGAACAATAATGCACACAGCGTGAATAATTCCAATGCGAGTGCTCGCGAGCACT---------TGCAGCTCTTTCCATATCTTATAGATGACTAAGCTAAAACATTATTTAAAGAAACAAATCAACAACAACAACAGCAACAACAAATGAAAAACTAAAAATATAAGAAAAACAAATATTGTTTAGGTATAATTTTATGTC-TAGCGCTAACTAAATTAAATTGTATAAATTAAACAAATACAAAGAAAACAAGAAA----ACACACAAAAGC-GT
>CG30194 18568858 18569154|18955 chr2R 18566705 18568873 scaffold_1 6724664 6726947 + 98014|2277 2292
GAGCGCCGGACTTTGT
GAGCGGTTAAATTAGT
>l(2)k09913 18579156 18579481|18960 chr2R 18578204 18579501 scaffold_16 1402247 1403550 - 58696|960 1329
GTGTCTCTAACGAGGAGCGGCTGATCAGTTC-AGTGATATACATTTATTCAAGAATCAATGCGATT--ATGATTTTACCCTAGTTGCTAAGACCTAAAGATTAACGAGCAATGTAAAACCAATGTCCTCTTTGAATGATTATGATCTGTGTGTCTCTCGCGAGGCAGAATCTTCAAAA---------------GCCCGCACGGGAAATTCCTAGG---CTAAGCTTAAAGTCGTATTTCATCAACCGAGAGAAGAATGCACTACGCC----------TCTATATTGTTACA--------TATATTTTGAGATCG----CTGCAAAACAGCTAAATAAAGTAATTTAAAT-GATACGAACACATTAAATGA
AAG-CTCT------------CCGCTCAATTTGGGTGATACAAA-------AAAAATTGCGACGATTTCACGATTTT-TGATAGTTGATAAGAATTAAAGTTTAAC---CATTTT-------GTTCCCTATTTG------TATTATGTGTGTGT-------GTGCCAGAATCATCAAAAATTTTACCAAAATCTGCATGCAAGCAATATTTTAAGAATTTTAAGCGATAAAATGTTTCGTCTCGTCCCTGAAGCAAATGCTCGACAACAGTAAAGCAAACGATATTTTTCTGTACTTTGTTATATTTTGAAACCAGCACCAGCATCAATCCTAAATAAATTAATTTAATTAAATGTAATCAAGATCAATTG
>CG3085 18584275 18584458|18969 chr2R 18582689 18586612 scaffold_1 2501184 2505105 + 155900|1631 1825
ACTTGGGACTATGCCGCTTGCTCACTTATTCAATTCTATTTGCCCTGACGTTCGTTGCACGTTGTAATTTGTCCAAATTATTGTGAATAAA-----------TAAATGGTATAACGTTAAAGCTTCTTCTGGCCAAAGCTGAAGGTCAGTTCACCCAGCAGGGGCTTGAAAACCGTGCTCCATTCTAGATGCGTA
AACTGATAATGTT--------------------TTCAATGTATTCCCATGTCC----------------TGTCTAAATTCTTGTGCTGAAATCTGTTTTTTTTATTTGGTTTCTTCATGACTCGCTTGCAGCGAAAAGTTAAAAGTCAGCTCGCCTAGCAGCGGTCTGAGCGTTGTACTCCACTTTAGGTGAGTT
>CG30192 18646612 18646689|19041 chr2R 18646206 18647015 scaffold_1 2578252 2578987 + 5952|418 505
---TCTAATCCGTATAC-----TTGTAACTGTTGCAGAGCAGTCAATGGTTCCATAGCAAAACTAATAAAATCTTTAGT--TAGAAAA
AAATCTAAGATGTGTACCATAATTAAAATTTTGGCAAATAAATATAC-----------------AACAATTTCTTCAGTATTGGAATA
>Klp59D 18651956 18652099|19049 chr2R 18650913 18652029 scaffold_2 4887428 4888634 + 25755|1139 1214
ATATTCGCCCACCACCTACTAATAATCCTAGCATATGAATTTATTTTCTACC--ACTCTGTATCTTTTCAATAGCG
AAAGACGCCAGCGAAACATCAACAAACA------ATTTATTTATTTTCTATCGTACGTCATATTGTATTATTTTTG
>Klp59D 18651956 18652099|19050 chr2R 18652030 18652443 scaffold_1 2583996 2584403 + 6626|0 84
TTTGGAAGACCCCCGAATGGCTTAGATTTCGATTCGATAAAC---------------AAGCAGTTAATGAAAATTCAAGCGTGAA
TTTGATACTCTTCCACACAACTTAAATTTATATTAAGCAAAATTGAAATTTGATGCAACTCAGTTGATGATAAAAAAGTGGAAAA
>CG3092 18741437 18741528|19153 chr2R 18740224 18742215 scaffold_1 2685964 2687680 + 36113|1226 1317
TGTTAGTGATCAGTTAAAACTCTTTGGTTATGCAATGATTGGGAAAATGTATGATAAATTCCAGCTGGCAATAAATTAAACTATGCAACTTA
-------------TTGACAATTTCTGCTT----------------TAGGCGTAACACACGCC-----------------------CAATTTA
>CG9861 18834314 18834348|19273 chr2R 18833075 18835237 scaffold_1 2802000 2804221 + 32833|1358 1416
ATTACAA------------------------TAAATTAAAACTCTTTTTCAATCTGAAA
CATATAACTAGCGAATATACGACGTTTTGCTTTAATTAAATATATTTAT-AGTATAAAT
>CG9863 18855072 18855377|19292 chr2R 18854394 18855081 scaffold_1 2831061 2831728 + 12871|688 697
CCCACAAATT
GCCAAAAATT
>CG30409 18862524 18862569|19304 chr2R 18862171 18862536 scaffold_1 2842608 2842979 + 6851|367 379
TCTTTGTGGGGAC
ATCCTACGGAAAC
>CG30409 18862626 18862832|19305 chr2R 18862807 18863693 scaffold_1 2844313 2845159 + 34971|0 25
GTTGCGATTGAAAGCAAGCCTGTTAA
GCCGAGGTTTACTGCAACCGCATTTA
>CG30410 18863680 18863798|19305 chr2R 18862807 18863693 scaffold_1 2844313 2845159 + 34971|873 886
TTCTTGGGCGGAGT
AACTTATTTGGAAT
>CG9875 18865948 18866145|19307 chr2R 18865350 18866376 scaffold_45 418464 419464 - 6138|650 851
TT----AGTTGTTTATGTTTAAATGCCATACACCGATTTCTTCAGGCGCATCATCATCATAATCACCCAACTTATCCACATGACACGGCTCAATAAAATTGTTAGTTGCAATCTTTGTAGAAAGTTTTTATGGAATTAAGGAAGTAATTAAAAATCCATTGGGTCATCCCAGTTGATTAAAACTAAAGTTCTTTAGCCCCTA
TTTATAAATCGTATAGATACAACCGATGTGGACTGTTTAT-------------TAATTTTTGTTATTTAAATTTCGTTTTCTGCGCAAACCAAAACAAACG---------------GCAAATATTCAATATTGCATTCAAAAACCATTTTCTATTCTATAA----ATTCAATTCAATTAAATTCGGACCGTTATAGTCATTC
>CG11079 18867823 18867873|19309 chr2R 18866909 18874159 scaffold_4 2208091 2215332 + 308721|934 987
CTTTTGGC---TTACATACAAAGTGGGAAGTAAAGCGAACTAATACGAAAGCAA
ATTTAATCACGTTACGAACAAATTGTA---TAAATCGAATATACACAAAAATA-
>CG13550 18878949 18879061|19311 chr2R 18877616 18879645 scaffold_4 2079771 2081836 + 44711|1394 1509
GATTCCCTTTTATGAATTGTAACTATTTATTTATGTATGTTATTGTATA---GATTTTGAATTAAACTAAATGCCAACTGCGCTGCGGATCTTTACAAATTTAAACTTACAACTAA
---TAAATTGTATGAATTGTAACTATTTATTTATGAATATTTTTATATATATTATTTTGAATTAAACTAAATGCTAACTGCAATTGATATCTTTACAATTTTTCACTTACAGCTAA
>yellow-d 18887880 18888038|19315 chr2R 18885557 18887915 scaffold_4 4144205 4146795 - 61712|2616 2651
TGACTTAGCAAATCCACTTAATTAATATATGTAAAT
TCTGTATATAAGTCGACT--ATGAATAAGGGCCAAT
>yellow-d 18887880 18888038|19316 chr2R 18887963 18888210 scaffold_1 931334 931589 + 1938|0 75
TAAGTGCTAATAACAGCCTATCTGAAATTGTAAAGATTCCGCAAAGCCTAAGAAATATATATGACGTGTAAATATT
TATATGCTGACAG--GCATCTATAAAACTGTAGA---CCTGTAAGCTGTTACAAAGATGTACGAAATGTAAATGTT
>yellow-d2 18890152 18890193|19318 chr2R 18888591 18890174 scaffold_4 4147818 4149532 - 68313|1713 1735
GTCGCTTCCCGCTGCTGCTCAAT
GCCCAATCTCAAT-CTGGTCAGT
>yellow-d2 18890152 18890193|19319 chr2R 18890192 18890744 scaffold_4 4149704 4150254 - 15952|0 1
AA
AA
>eIF2B-delta 18896573 18896656|19329 chr2R 18895215 18896681 scaffold_4 4291980 4293504 - 64214|1410 1560
----TCAGACTTCATCGATCGCT---------------CAGTAGAACT--------------------------------------------CGCAGTTGTTGAATAAATAA---GTTTTATTACAC-TTTGATCAAATCGACAAACAAGA
AGCTTCATATCCTGTTGCTTTCTTTTTCATGGAGTCGACAAAAGAATTGTATAATTTATTGAGAAATTAAAATCCGTGTCTCGAGTCAGTGCGGCATTTGTTGAATAAATAATCCTTTTTATTATACTTTTGATCAAAC-----------A
>CG30411 18924157 18924838|19347 chr2R 18923655 18924158 scaffold_4 4322121 4322614 - 6266|537 538
GC
AC
>CG30411 18924157 18924838|19348 chr2R 18924159 18924582 scaffold_53 565960 566333 + 1786|0 432
TGTCTGACCCATTGTTGTAAATATCAATTAGTGTACGGAGCTTTCAGCTGTGCAAGCCAAGGAAAGCACATAGGAAAATGGGTTGTATCTTTGAGATACAAAAAGCACA----TATATAAGCTTAAATTAGTATATATTTTAAGTAAACAAATTTCAAATATTTCACGCATAGAATAAATTCCTTTATGTTTATAGATAGCACTATTTGAAGTACAAACGAAACATCTGTAGCCCTGAACTTCCCACGCCCACCTCTATATTTATATTCAATGCTATCTGGAGTGAAATCGACATCTTCAGATTGTGTTTATTACCCAAGACACACGGTCGCTATAGTAATGATAGGTTTTTATCTGCCCCGTGGACTGAAAACTTTGTAACTGTGCACTGAACAACGTA-----ATAACATTTAAAGTTAAAAGTTGCCAGG
TGTATAATCATTTTTTGT---TTTCAACAATATAACGAAATATCTAGCT-TCCAATTGAAAACTAGCCCACATCAAACTGGGTTGTCTTTTTGATAAAAAAAAAACACACACTTATATAACC---AAACAGCATCCATTTTTGGTACACAAA------------CATACATAGAAGACTGTGCTACGTGTAGAGCAGCTAAACTATCGAATGGACTATCGATAAATCGGT-----TAAA-----------------TATCTTTCTATACACTCCTGATTGGAG------AGATGTCTTGAGAG------------CAAAGACATGAATCTTCCAGATTTCAGATATATCATATAAATCCTTTTTTTCCTAAATATTTTTGGATGTGGATTAAATAAAGTGTATTCCTACTTTTTCGACTTAAAAGCTGCGATG
>CG30411 18924157 18924838|19349 chr2R 18924834 18925492 scaffold_4 4324818 4325530 - 3494|0 4
AAAAC
AAAAC
>CG5357 18965470 18966210|19395 chr2R 18964825 18965650 scaffold_4 4380990 4381965 - 23536|772 995
GTGGATGTCACGGACAAAGTTTTCCGAGTTACTCAGCCCACAT---------CATATTCACA---------TGCCAAACTTTTCCAATCGAAAGTTTTCGGCCAG-----ACGGTTGGCG-AATG------CAAGTGAAAATGGAAATGGAAATGGAATCCGTACTGAACAATTGCG---GTCAAGAAAGTAGT----------GTGCTTTCCCTGAAGGTCAT
------GTCAAAGTCAAAGTTCATCTCCCCACGCCACACACACACACACACACATATCCATATTATACGCTTGGCAAACTTTTCCAATCGAAACTT---GGCCAGCGGCAACAGTCGGCGCAATGTGTAGCCAAGTG-AAATGGCCACGCAAATGACCGGAACACCGCACATGTGCGTCCGGCTAGCGAATAGTTCCAGACAGAGTTCAATTCGTGAAAGCCAT
>CG5357 18965470 18966210|19396 chr2R 18965792 18966286 scaffold_5 4698471 4698965 - 16144|0 424
TATCGCCTCGTCCTCCTGCGGGACTTCCGACTCCATCGTCATCAAATCCTCCTCGGAGGGCGAGAAATCGTTGGTTATGTGAAAGGTCTGGCGAATCTCCTCCGTCGTGCGGCCTTTAATCATGTTGGCCACCGTCATGCAGGCGGCGTTCAGCAGATTGGGAATGTCCAGGTAGTTGGCCGCCAAGATGAGTTCGAAGAGCGTGCCCTGATCCATGGACAGGAACTCGGCGTCCCAGGGGGTGATCTGCACAGCGACGGACTTGGCCGCTTCCTCTTCGTTCTCC------TCTGCAATGTCCTCGCGATGATGCTTGGCCCAAATGAGGACCTTCTTCAGGATCGTCGAGTTCACATTGGGCAGCGGGATAAGAGTGTCGTTCTCCGCTTCCACTGGACAATCCTCCAATAGGGTCTTAATGG
TGCCGCTTACTTCTCCTCACACCATTCGTTCTCCTTGCGCACCTGCTCCTCCTCGGCCGGTGTAAAATCTTTTTTGATGTTGAACGTCTTTCGGATGTCCTCGGGTGTTTTGCCCTTGATCATATTGGCAACGGTTTTGCATGTTAGCTCCAGTAAGCCCTTAATATCCAAGTAATTGGCAGCCAAGATCAGTTCAAAAAGCGTGCCTTGGTCAACTTTCAGAAAATCGGCATCCCATGATGTGATGT---CATCGGTGCGCTTCTCCTTGCTCTCATCATCCTCCGTTGGCTGTGGATCATCCTTG---TGATAGTTGGCCCAGGTCAACACTTTTCTCAAAATTGTCGAATTCACATTCGGCAATGGCACAATGGCATTCTCATCATCCTCCATGCCGCAATCCTCCAACATGGTGCGAATCG
>CG5360 19035239 19035865|19477 chr2R 19033665 19035240 scaffold_4 4466879 4468470 - 60233|1652 1653
AA
AA
>CG5360 19035239 19035865|19478 chr2R 19035473 19035688 scaffold_19 319277 319495 + 1676|0 240
TCAAACCATTTATATATAATGACAGACAATCGTATAATAATAGGTATAAGTAAAATAATCTGATATAGATCTTATAGATCGCCTCTTCTTCGACTCGCAAGACTCCCGACTTTTCCTTGAGCTCAAATGTAGTTCAAATGCAAGTT--AAATTTCTTTTAGTAACGGC----------ATACATACATGATCTATATGGGATTTA-----TTTTATGCGACTCAAA--------TTTGATG
TCAGGCAATTCAAAAATAGTTAATAAAAAT---------ATATGCATATATAAAATAATTCGGAATGTATATCATAAGAAAATTGTTTTTCAACTTGAATAAATCCC------------AGCTAAAAAAAGGTTTAATGATAATTTACAAATATTTTACAAAAACAGCTTTTAATACAATACATTTATGAGCCCT-CGGAATTTAATGGGTTCTATTAATATTAAAATTGATTTTTTAATA
>CG5360 19035239 19035865|19479 chr2R 19035689 19036043 scaffold_4 4468610 4468979 - 11959|0 207
AATGCAATATTTTCCACTGAAGT-------------------------TTAGATGTATTAAGAACATTT---TGTGCTTAAAAATTACAAATTTTACTTAACTACCGCACGAGTACTCAATGCAACTGAAAT-TAAGCTGAAGCAAGTTCTGTAACAGTGTAAACTGAAATTAGTATAA--TAAAAGCGCCCCAATCAATAGTAACCA
AAGGCAATATTTTTCGCGGAAGTAAATGAGCTTAAATGAGAAATGTAACTAAACGAGATAGCTACGTATAAATATGTATAAGAAT--AAGCTTTTATTCGGCTAACGCCTGGTTACGAA---TAAATGAAATATGAATTGTA-----------AACAATGTAAACTCGGAATAGTATAAAATAAAAAGGATCAACTTAATAGTAGCCG
>CG30185 19052378 19052499|19488 chr2R 19050279 19053931 scaffold_43 543787 547343 + 103658|2136 2257
GCCCCGGGCGGGCACCCTTGCATCCATTCACATCCAGTCACGAATGCGACACTTAAGTTATTTATTTCTATTGCATTTCACAATGTAGTTTTGTGTGTTGTGATTATCATTTAATGCCAATG
-------------------------------------TTAGCAAAACGATTCCCA---TATTTATTTCTA---CACTTTTACATACATTTATCTGCGA-----------------GCCAATG
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CTAGCTAGCTGTCTT--------GTTTAATAACATACATATTATTTATGCTAGCCGCATTC--------TGGATTCCATTTGACTTTAAGTTTA
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ATGCCAGTAAATGTAATATAACTTTTTAG--------GTAAGTGTATTTTAATCTAAACG-------TAGTAGGTAAAGCGCATACCTACATTCAGGTGTATTATATATATATATATATAAATATATTATT--------------GTGTCGTGTGTATATATTA-----AGCAGACCCTTTGCTACTGGTACG---------------------CACA--------------------
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----------AGCAACGCATCGAACACTGTTAACTGCTTGATTA-----TCATCGT--TTTCATCGTTGTTATAGTTGTATAGCTGTAACTTTGTAGCACGTAGCACACTTTAGCA--CGTAGGGCGTAGCTAAAGTTAAATTTTAGAATAAGCAACAAATTTTGTAACCAG-AGACAGACCGGCACACACACACACACACACACGCGCACATGGAAAACACACACGGAAACACAACACATGCATTGAGCTGCGATTCACAACATTCCTGGCATTGTTTTGACCAGTATTTAAAAGCTAGAAGCACAAACACACACACACACACACACAAAGATAGACGGCAGCTCATTGCGCTTGCAGCTGCAGCGGCGCACAAAAGTATGCCATATTATTTTATATAGTTAAAGGACTCTCGCCCTCAATACAACAGCAGCCCATGCATACAGCCTACCTCAC-AGTATACA-ACACACAAACACA-AATACACAGGGACACAACAGAATCCTGGGCAGAGGCAGGTGAGTTAAGGCGCGTGTTTTGTGGC----TCTGCACTTGACCAAGTCAAGTGATTTGTGAATACGCCCGAACGCATTCAAGTTT--TTAGTTCTACTTAGTTCTAGTTCTAGTTGTAGTACCCGTAACA-GCTCTCCAAGTTGCTCAAACCTACACACACACGCACACACAAACACCGAAACGCACACACACAAACTCTACTTACCACAAATGTATTTTAAACATGTACTTA
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GAAATGCACAACAAACCTTTTTTTAT----CTTATTTTAGAAC------TAAGTTATTTCACCTTGCATATTACGCGCATATATTATCTATATGATCGAAATTCTTAATGCAGATTTCTATTTAT-------TTTGTATAGTTCGTATGTGGACATGT-------------TTTTCGTTTTTAAATGCCATATTAATTTGCAAGTATATCCA---CACATTTATTGTTTCAAATGTTGTTAAGCGACCTATCTACATATATATATATATATATAAATATACATATATATTTATGTA---TTTATATAGACAAACATATAACATAGATTATATACAAAAGCTTTTACGTTGAAGCAGAATTTCATTTTCATTTTATTGGCGCCTGTTATGTAACGCTTC-TTGTAAAGCATTTGTAAATGAGAAATACAAACTATTTTAAATAAAATGAAGAGATATTATAATCATAGGACCAGCAC
>apt 19106128 19107300|19556 chr2R 19107130 19108254 scaffold_4 4138575 4139631 - -465|0 175
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TTTTTTAGGAACACAATTTCAATTATCTGCTTG------CTGTGTTCTCGCAGCTCGTGATTCTTTCACCTCCAGATTG-GCGTCCACATCC-CCTTCATATTCCGT--------TTTTTTCAGCTCCTTGATCATTTTGTTGCGCAGCCTTTGCAGCTGCTCCCTTTGCTAAAGT
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GCTGTGACAATAAACATAAGCTCGACGTTTTT
ATTGTATCTCAGCCCATAAGAATGATGCTTGT
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>retn 19161419 19162420|19625 chr2R 19161718 19163092 scaffold_4 2158997 2160586 + 12149|0 900
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ATATATATATATAGCTATATATACGCATATATAGGATATATCGATTAGTTCTATTCATTTTCCACACTTTGCATAAAAGACAAGCCTGCGAGCATTGTATTTATTTATAGGCCCTAGTTA--TAAGCAGCTGCAACAATTATAAACAAAAACAACCACAAAATATTACAATTATTATAATAATAATAATAATAGATTTGATTAGTTGTTAGGGTGCCCAAGGTAACGACACGCCCACCTACACACACACACACATACACACACACACCATCCTTCCACGCCCACGCCCATACGCCGCCCTGTTTAAGCGAGCAATTTCTTTAGATTTGCTGTTTGTTAAAAAACTCTCTTTTTGCTCAGCTAAATTTTTTTTTTAATTGTCTTAGGCTGCAAAGCTTGT-GTACATATCAATAATTGCT---------------ATGTTGTAGTAAATATCACCCCATATATATATACATATACGTATATG-------TACTCTACCTTTATGTAATTCTAAGTGAACATTCACACACACACA-CACACTTGCATTTTGACCACATGCATAGCCCATTAACCTTAAAGCATAG---CATATAGACATAAATACAATTATGAGCCGAAAGCATAAAG--------CATATATATACATA-CACAATACACACACACACACACACACACACACATACATGCATATACATAAAGTAATAATTATGACATAAAACTGTTTACGCATTGGCTTTCTATACAAGAAGCACTTGTCCCCCCTTCCTCTTCCCCTTTCCCTTCCACGACACAACAACC-------------CAATCCAAAGCCAATTAAAATCTAGCTACAAATATTGTAAGCGTAAGCGTTCAATTTATTGAATAATAAATCTATTTAATTTTAGCTC
>Pde8 19186290 19187628|19651 chr2R 19185593 19190584 scaffold_4 2200263 2205540 + 132795|715 2199
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CATACGGCTTTTCGGAGAATATTCTCGGGTCTACTTAAGCCGCTGCCGGCCCAGGCGCCTGCCACATCCACAATTGGCGAGAACGAAATGGAGGATATGCTCTAGTGCAGGCGAATCCGA--GCCCAGAGACGT--GGCTTTCG--TCGCACTCTCTCGGCATAGGTTTC--------GTTCTTGCT-GTTGTCGCTTGTTGCACACATATCTCGACTAAATAACGCTTCCCAAACAGCTCTGTGTGTGTGTGTGTGTG------TGTATAGGTGGATTCTTAATCCTTATTGCGAGCTGGC---CACAAGAAATGGTGCCAAAACAAACAAAGATTTCTCCAGCACAGACACACAAGAAAAAAAAACAACAAAACAAACAAATACAAAACTGTGGCAAATGTTTGAAGAGCAAAACAAAACAAAACAAAAAGAAAGCAAAGATAAACAAAACAAAAAAAATTATTGGGCTGGACTCAAAATTTAATATTTAAGTAACATCACAAAAAAGAAAGCAAAATTTGTGTGTATATGTATATCTGTGTGCCCTATTCAA---TGTGTGTGCGTGTGTGTTAAA------------ACATTTATATATATATATAAGTATATAAATAAATACAAATCTACATGCAAA-------------------TACAAGAAAAATAGCAAACATAGACG-----------CATATTGTCCAACGAACAATATGGCGCGCGCTCTAGGGTACCTAA-AACGGTATAACAGCACGGTATAAC--CAACAAAATGGCGTCGCGGCCATTGCACAAACACACACATACTAGTAGATAGGTCGTGCGTGTTGCCCTCTCCCACCTTCGGTCACCAGCAGCCCCTCACACACGAAGACAATCTCTGTTTAATAC-AAGTGTCCAACTACTTTTAAATTAAGATAAATTGCAAGGCCATAGCTAGATGACTCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTGTATGTGTGTTAGGTCTTTGCATGGATTAGCTGGGACAGCAAATG-----ATGTGCATA-GCAAACGAACTATTGCTGGAATTAC-ATCAATATCTATTTCTAC-TAATGTACAACAACTA------AATTGATTAGC--AAAAATACAAAAAA----GCAACAA--CAATTCGAATCCACATATGTAACGTGCGAAATTCTATGGGGCCCCTT------------------ACTATCTACCTTC--------------------------------TATCTAATATCTAATATTTACTATGTTTA-CTTTTGATGCATA------AAAGCAACAAACAAAATGCAAACAATTTATGATTAAGTGAA-TCCTTTTTGAAATCTTTTTTATCTAATTGACTGAACAAATTACATAT---TATATATAACAAGTAAATTAATACGAATCGATTTAATGTTCTTGTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAACAAA
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TTCTCTCTA-ATTGTCTTCGCTAAAGTGTTTCTTGGGTAATCTTCGTTAATAGTCTTTAAGCTGTGATGATATATGTACATA--------TATGTTTA----------ATAAATAATTGCTTCCCGT
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CATTCTAAATGTCCAGCTTTCCATTTTTAATTTATATTTAATACAAGATTTACGCTAATTCTAATTCTCATTTTCGTTTAAGAA
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AGCGCTG-AGCGCGTGACGTCACACATATCGCAGCAGCAGCTATAACAGCAACAACAGTAATAATAACATGAAAACCAACACCAACAGCAGCTACACTGACTGCTGACAGTATGCAACCATTTCCCAAGTGGCCTACAAAATAATATTCTAAAATGGCAGCTA
>Pal 19197574 19198194|19660 chr2R 19196508 19197574 scaffold_45 429071 430131 - 49901|1082 1082
G
G
>Pal 19197574 19198194|19661 chr2R 19197621 19198467 scaffold_45 430169 430919 - 8014|0 635
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CATTTAACTGTCTTC-------------CCCATCAATAAAGGCCACCAAATTAAC-TG
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TAGGGATTAGG------------------------ACTTTTTGGTAATTGTTGCTTTTATTTTTAT----AGTCAACATAGTTTTGTTGG-TAAACAAATAAATA------TTTAAAATC
-AGTTGTTAGGCAAATAATGTAAGTCATTAGTTGAGTTTTATAATTATCATTGCTGTTGCTTTTATTGGGAGTCAACATAAATTTGTTTTCTAAACAAATAAATACATGTTTTAAAAATC
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C---------GCGGAGCCTCGAGCCACAGCACCATTATTGCACTTGTAGTTTTAAGCGGACATTGTTTAAGTTATTTTATGTAGATAGTAGGTTGCA--------TCTATCGCGGGACGAGTTGGTAACCAACTCCCCGCCCTCTGTACAGAGCCAA---AAGATACGAAAGACTAACGTACC
CACCCAGAAGACGGATCTGGGATCCAC-------CCATCCCATATATAGTGTTAACTGGACATACCTTAAGCTATTTC-----TATGGTAGGTTAAACAGTTCTTTTTATCTC----CAAGTTAATAAGCACTTTTCACACTTTTGTACAGTACTAACACAAGAGACTAAATATAATTACACA
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CGAATAAAAGTAACTCCATTTT
CGAGTGAGGCTGACTCAACTTA
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AACCAAAACTGACGCCCAGCCAGCAGGTAGAACAGCGGACAGCGGTAGTCAAGGAACGAGTAGAGCAGGAGC---------AGAAACAGAATCAGCGAAAGGC-----CAACCACAAGCGAAAAGTC-----GGAAAC--ACGCAGAAAAGATCAGCAAACCGG----------AGGCGAAAGTGGAAGCAGCGGAGGCTTCTTGAACAAAATCAAATCCATGTTCAACTAA
>CG11299 19240249 19240786|19693 chr2R 19238449 19241897 scaffold_51 569193 572865 - 66697|2040 2628
TCTCATTAAGTGAATAAACATACATACGTACGAGTATATATATATACATACACGCCCAAAAACCACTCACCACACACATACCCACA-CATGCATAAAACATTTTGT-TATTTTGAGAGAG-CGCATCGGAAATT--CGGCGAATCGGAAACGGAAACGGTATCTGAAGGATCGATCCCAGAGGCAGGA-----AGAGCCGCGAAAATACTGTT----TTGAACACAACGAAAAGATGGAGTAAATGG-------AGCGTGTG-CTAAGCTACATGGATAGCAATTAATAGCC--ATTCGATATCGGTGTCCA--TTAAATGAATGTGAATCG---TTTACTAC-TCAATTACCAATAGTCTGTGT----CTATGGTTAGCCAACACGCCAATTAATCACGTATGCA----------GCCACAATGCAAGAATGGAAAATAATTCCCAAATTGAGCTGAACT---CAAAAGCCAAACCTTCTGTCTG----TTTCCCTTTCGTGAATGTGCAAGCAATAATCACTGTACATATGTATTATGTTTTGTTTAATTATTTTAGCGCAATAAATACAACTTTATTTTAATTAAA
TCTCATTAAGTGATTAAAGATATA----------TATACAAATACATACACATAACTAAAAACAATCAAAAACACGCATGCATACATCATATAGTTACCACTATATATATATTAAAGGCTCCACATAGAGAGTTGATGACGAGTTTTTAATTTTACAAGAGCATTAAAGAACAGAATTAAATGAAAAAAAAACAGACCCGATAAAAAGTAGTTGCAATAGATCCCACTGAAA--TTTGTGTCAATGTGTCAATCAATGTATGTCTCATCTATATATATAGTATAGTCTAATCAAATTCG---TCAATGTCTACTTTTTGTGAATGAAATTAGAAATATACTACAGCTGTTTATAATATTACCTGTTGCACTAACAAAAGCAGAAGTAAGAGATAAACAAGTGTGTAGTAGTATATGGCCATTGGGCCTCATTTGAACTCAATGTTTAA--------GAATTTGGCAATGATTGAATCTACGGATTGTGGTTTTCTGTTTCCTTAAAATGCTTGCAGCAATCACTGTACATATGTATTATGTTTTG-TTAAACATTTTAGTAAAAAAAATACATTTTTATTTTAATTACA
>CG5532 19260828 19261011|19715 chr2R 19260417 19260908 scaffold_11 3686414 3686907 + 18741|420 505
GCTAAT-----TTCCGGCCACATGCTGGACTTGCCAGGAGATTGCCCTACCTTCATTCTTCATTCGTATTGAATAGGTTTTCTACT
ACTAAGAACAAGTCTGGATTGCTGCTGAGCTTGCCGAGAGAATTTTTTGTAT--AATTTTAATT----TTAATGTGGTTTTTTGCT
>CG5543 19318927 19318984|19764 chr2R 19313573 19318976 scaffold_11 3752790 3758473 + 234774|5740 5793
-GAAGTCAATCTATTT---ATAAGAGCTTAGATATGTTAATAAACTCGTTACGA
TTTAATTAATATTTTTTAAGTACAAACTTAAATAAATCAAGAATGTAGCTACTA
>CG5543 19318927 19318984|19765 chr2R 19318977 19319853 scaffold_26 1359247 1360099 + 14003|0 13
CGTA------AGAA
TTTGCTTGATATTA
>CG5554 19354190 19354624|19805 chr2R 19353104 19354756 scaffold_1 1976539 1978422 - 41201|1233 1845
GTGCAGCGGGGTCCCTGCGGATCTTCAGCCTTAGCGATCATCAGAAGCGGCAAC-AAAAAGACTA----------ACACACTGAATCGAGAGGAACACAACCTCTTACCCAAGC-ATCATTCGAGCGGACATAATCC--------------------------GTCTGC---------TCTGCCTTCGCGCACAAAAC---------------------CGATTGTTTTCC-----------------CTCCTTCTAATCCTAGCCAGA-------------------------------------AAACGGC--------------GCCCCATGTATTTCATAATTATGTAAAGCAAAATTGCAATCCATTAAGCGATAGCAAGCGTAACAATAACTAAATGTAACTTTAGTCGTATATTTTTACCTTTTGCCAAGCAT---TTT-----------TGTATTTTGTGTTCAACTTGGTTTCCACACAATTCATTTCTCT-TAAGC---ATTTCATTTGTAATTGTACTTCAATCGCAAATTGTATTAAATTTTCGTATTACAA--------------------AATAATAAAAAAAAACATACA----ATTT
G-------------CTGTGGAGC----GGTTCAGCGACGAGAAG-GGTGGCAACAAAAAAGACTAACCTAACATTACACAATAAACAAACACGAGCAAACAAACGAAAAGAAACTGTAACAAGAGAGGAGAGGATACTGCAAATTGTTGCTATTGTATTACGAGTCTGTTTTTAATTGTTTAATTTCGCGCACAATATAAGCAAATTTGTCGCATTTGAAAATTGTTTTCCAATTAAAGCTGTAGCAGTTTTTTTTATGCCTACACACATATATATATATCGATTTGATTCTTAGCGGCAATTGCGAGATGGCAATCGCGTCCTAGCACCTCATGTATTTCATAATTAT-------------------------------ACAAACGTAACAATAACTAAATA----TTTAGTCGTAT-TCTTTAGCGTTTGCTCAGCATACATTTCATTGCTAACATATTTTTCGTGTTCACATTTGTTT----ACGAAACATTTCTCTATATGCTTAATTTAATTT----CTTCAATAAAATTGCAAACTGTATTCAATTTGCGTATTACAAATGAAATTAATGTGTCTTTCATCAATAAACAAATGCAAATATTGCATTG
>gbb 19360723 19360849|19811 chr2R 19358932 19364567 scaffold_11 1398397 1403899 - 134840|1820 1957
ATTCAATTTACCACTTAGGCTAAGCACTATAGCACTATATATA-TAAAGCATTTCTGTGTAG----------ATGTCCATCTCTGTACTAATCTCGAATATTTTTATACAAAAATATACAGCGCTGTACCTAACTGAA
--TAAAATTAAAAC----------------AGTTGTAAATTTGCTTTACCATTTCCGTGTAATCGAATATACATTGTAATTTCAGTAATAATCTCGAATATTTTTTTAGAAATAAACCAAATGTATTATAAAAAAGAA
>CG5569 19374181 19374255|19818 chr2R 19373723 19374201 scaffold_11 1416428 1416916 - 17285|469 490
GATTAG-TTAGACACATCTAAT
-ATTAACTTAATTAAATCAAAT
>CG5569 19374181 19374255|19819 chr2R 19374237 19375596 scaffold_11 1417221 1418774 - 57392|0 18
AACTGTTTTGTAAAATTCA
AACTGTTTCGTAG---TCA
>ken 19384378 19385042|19833 chr2R 19382501 19385090 scaffold_11 1426322 1428760 - 89751|1888 2621
TGTCCCGGGCATCGGCAACCGCATAATCCGAGAGTATCCCATCTGTCCGATCCGATCCAAGTCGATCCGAGGTGATTCGCCGGACGGACAATTGCAAAGAGACCTGAATTTTA------------------AATAGTAGCAGTAGCAGATTTAA-------------------TTGCCTATTGTATA--AATATGTAAAATCTAAATTTAAA--TCCTAAGTTTACGCAACGCAACACATTCACGCGACTCCGCTCGTTCATATTTCACGCAACGGCCTGGAGCTCCACATCTGAATCCGCATGATCCTC-GATCCACGATCCCCGATCGGAGGCCACTCACGTTGATTTCTCATTTAAGTTGTATTCGAC----------ATCCAATCCCTATTCCAATTCCCCGCAAATGCACCACTACCTACTTACACCCCCCTTGCTCTAGAAGCCCAATCCAA-------TACTTTTTAAG----CGGCTGGTCCATTCA-GTGGAGCACTTA-TTTGTAAGCATATGTCTATACGAGAGGTATTTTAATTGCTATTGTATTTCCAACTCGTCTAGCATGAACTTCATGGCCCAAACTTGTACCTATATCTACATTTTTGATAGTTTTGATACACTTTTTGTGTTAAGATTTTACGTATTCCCTCCTAAAATCGCCAAT--TAAAGTGTGTAAATTGTACAGTATA--ATTCGCAAGCTCGTAATAAAATCAGAAAAGC
----------------------ATAATCTGAAAAAGG---ATCTGTTCGATTGGCTGGCTGCCCGTTAACGCTAAT----CGAATAAGTAATTGCAAAGAGACCTGAATTTTATAATTATAAACTTACGGTTACAGTAACAACAAGAGCTTAAAAATAAAAATAAAAAAAAGCTTAGCTCTTGTATAATAATATGTAAAATGTACATTTAAAACACATAACTTTATTC------ACACATTCAATTGTTTTTACTCAATCATTTCATCGGCGATAG-------------------AACCGTGTGACAGTCAGAAGTGCGAGCACTG-------------CCTATTGGCTTTTAATTTAAGTCGGATTTGACTATGTACTAGATGCAATTTACATCCGAA------------------------ACTGAAACTGAAACTGAAATCGAAACCGAAACCGAACGGTCGCCTTCTTTTAGCCGCCGGCTGGTCCATTTGTGTGGAACATTTAGGTTCTAAGCATATTTTTATTCAGAAGGTATTGTAATTTGTATTGTATTTTCTACTTGATTCACATTTTACTTTTGATTAACATTTTTTTATACA---ACACTCCTGCATACTTTTATATGT------AGTTACAATTTT------------TTAAAATCATAAATAAGAAAATATGTAAATTGTACAGAACAACATTTACAAGTTTGTAATAAAAC---AAAAGC
>TM4SF 19388250 19388460|19837 chr2R 19387221 19389976 scaffold_11 1431737 1434424 - 79360|1129 1339
CAGACGATTAGCTTTTAAGGATGCAAAAATTTATGGAAACTCCAAAGAAAAAGTATAAAAAAAATGTTGTAAACTGAGATGGAATGAATATAACTGTGACCCTCAATGTTACGTTATGGTAATTTTAAACAATTTAACGTTCGAGAAAAGAAACAACATTTGAATTTGGATTAACTCTCCAGTAGTTTAATTAAAGCTTAAAAACAATTGG
CAGACGATTAGTTTTTAATA--TCTAAAATTTATGAAAACTC-----AAAAAG--TTATAAAAATGTTGTAACCTGAGATGGAATGAATATAACTGTGACCCTCAATGTTACGTTATGGTAA-TTTAAAAAATTTACCGTTCGA-AAAAGAGCAAACATTTAAGCTTTGTTTATTTCGCCAGCATTTAAATTATATCTATAAAAC------
>CG5597 19396346 19396377|19846 chr2R 19395440 19396383 scaffold_11 1438412 1439344 - 18380|925 957
ATAAAA-GCGTTGTTATTTATTGTTACTAAATT
ATAAAATTTGTTGTTA--TATTGTTG--AAACT
>CG5602 19400720 19400777|19850 chr2R 19400079 19401022 scaffold_11 2412954 2413996 + 35443|710 770
CCGGTCTGCTCCAGCCATGTGTACACGATT-TATTTAACAATAAAAGTCTGTTATC--GCT
---------TAAAACAGTAAGCGCATAACTAGAAATAACATTTAAAGCATTTAATTAAGTT
>CG17658 19404300 19404603|19858 chr2R 19404573 19405824 scaffold_11 2406003 2407300 + 36730|0 30
TTAAGAATAAATTGTTTAACTAGTTGATAGC
TTATCAATAAGATTTCAAAACAGCTGTTCAC
>CG5591 19411212 19411264|19862 chr2R 19410537 19411251 scaffold_11 1461973 1462687 - 18045|697 736
GAGAAGCGGAATCGTTTAAATTGAAATAAAGAAAATGCAA
AATATACAATTTTTTCTTATTTAAAATTGTGTAACTATAA
>CG5594 19432510 19432696|19882 chr2R 19431870 19432665 scaffold_11 1505460 1506257 - 33628|675 834
GAGCATTAATCGCTCAGTTTTATAAGAGTTCGCAACACTAGACAAGTTTAAGAATCAATCAAATTTTTAAA-GAAGG---TTATTAATTTGTTATATTCAATCATATGTCCAAATATTTTATTTTTACGTAAATAAAATATCAAAAAATTGTAACAATAA
GGGCATTAATCGCTCGGTTTT-TAAGAGTTCGCAACATTAGACAAGTTTAAGAATCAATCAAATTTTTAAATGAAGGTGATTATTAATTTGTTATATTAAATCATATGTCCAAATATTTTATTTTTACGTAAATAAAATATC-AAAAATTGTAACAATAA
>CG2812 19434387 19434510|19885 chr2R 19434136 19434388 scaffold_11 2376313 2376570 + 10593|256 257
CT
CT
>Tal 19449615 19449714|19896 chr2R 19448833 19449623 scaffold_11 1479761 1480551 - 35583|782 790
ATGTTCCTC
TTTTTTTTC
>Tal 19449615 19449714|19897 chr2R 19449624 19450104 scaffold_17 1083972 1084448 + -1761|0 107
TGGGTCCGCTAGCAGGTGGAGGATGAATACATT--------CGTTTTTGAAAAAGACA---------ATGATTTTATACTTTAATAAACACTACAATTAAAAGAGATG
TTAATCTGCCATACTTTTGTCAATGAGCTCAATGTTCGCCACATTGTTGAAGCAGCGACCTGTGCTTACAAATTTTCAATTTAATA-----TTGAATTTGTGGCATCA
>G-salpha60A 19454348 19454539|19904 chr2R 19454016 19454804 scaffold_11 1522919 1523698 - 34415|336 537
GTTATCCCCATCGCCGTAATGCAAGTAAATAAAA--------ATATTAATGACTTACTGTTTTAAATATA--ATTATCAAATGTAATTTGTATTTAAATAGTCCCTTGATTAAAACAAAAAATTCGCTGCATTTAGATCTGGTATGACCTTTCACAAAACTCAACATTAAAGAATAATAAATAAACATGTTAATAACAGACA
GTTATCCCTATCACCGTAATTCAAAAAAATAAAGTGAAAAATATATTATTGAATTACTGTTTTAAATATAATATTATCAAATGTAATTTGTATTTAAATAGTCCCTTGA--AAAATAAAAG---CGCTGCATTTAGATCTGGTATGACCTTTCACAAAACTCAACATTAAAGAAGAATAAATAAACATGTTATTAACAATTG
>fzr2 19459642 19459699|19911 chr2R 19458945 19459658 scaffold_26 541341 542053 + 20944|698 714
GGACAAAATTGCGACGT
AGATTTGATGGCGACAT
>fzr2 19459642 19459699|19912 chr2R 19459670 19460042 scaffold_11 1549199 1549566 - 10052|0 29
TACGATAAATTATATTTGTTACCATCTAAA
TACAACGCATTAAGTCTATGGCTGGCCGAA
>CG2970 19460035 19460061|19912 chr2R 19459670 19460042 scaffold_11 1549199 1549566 - 10052|390 397
GAATGAAT
AATAAAAT
>thoc5 19463896 19464007|19916 chr2R 19462742 19464564 scaffold_11 1543619 1545497 - 56035|1235 1352
CAGTTGAATAACGAATGTTGTACAACACAATGCGCCAATGCGGTTACTAAACGTTCTCACAGTTGCGTTTATTACGATTAG-TAATACAAT-----AAATAAGTAACATTTAAAGCTA
-------ATAGAGTTCATCTTGTAATGCA---------------TATGTAACTTTTTTTAAATTTATTTGTGCGCTATCAGCTAATATAATTTAGAAAATGGATACAATGAACATCTG
>alpha-catenin-related 19468937 19469225|19921 chr2R 19468814 19469005 scaffold_11 2328627 2328827 + 8376|132 200
CATTACGGGATGGCTCGCCGAGCCAAGGGGGATGCGCGAAGGACGAGGGTGTCCTTCCTGCTGTTCTGA
CATTATGGAATGGCTCGAAGAGCCAAAGGTGATGCCCGACGGACAAGAGTATCATTTTTATTGTTTTGA
>Fmo-1 19472143 19472252|19927 chr2R 19472141 19473763 scaffold_1 311208 312826 + 44246|2 114
ATCCTGAATCAATCAATAGGAGCATTAGATTCCAAAACATCGTTTTTGGACTTCCCTTCGAAATAAAAT---AAATTTCCAATTCTTGTATTCCAAAACAACAGTTTAAAAAA
ATCCGATACAACTCAACATAA-----------TAAACGCTCTATTCAAAGCTTATATTGAAAATTGAATTGAAAATATTCA---TATGTACTGCAATATACTGTACTTCAATG
>Alas 19474249 19474348|19928 chr2R 19473764 19474346 scaffold_1 318405 318945 + 18692|487 584
TTGCCTCTTGGAAACACGACTATAAATGAAGCATTCGAATCATAAAGCTATGCCTAAATTATCTGTGCGGTTTTGGACAAATAAACAATGGTTTTGGT
TATATATTT---------------AATGAATCTGTGTAATC---------TTCTTACTGGCTTTTTGTGCATTATGACAAATAAATAATGGGTTTGGT
>or 19476378 19476544|19932 chr2R 19475856 19476544 scaffold_1 6734246 6734882 - 21912|522 706
CA-----AATGTGCGTCTGATA-TAACTCTCTCGTCTAATTGTAATCTGTTGAATCTAGTGCTTTTTCGCAGTCCTTCATGAATTTC-----------CAACAGCTGTCGACTGTTCCGTAATATTAGGTCCCACGTACTCTATATAACTCCCCTACCATA-ATAAAAATGCAAATGAATTACCA
TATGATTAATGTAAGTTACTTAGCATTTCTGTGATTTAAGTACAAATTCTCG----------TTTTTAACAGAAACACATATGGTCCGATCTCCGCTACAACTGTTGTTATCAAATAGGTAATTTTAAGTACTAAAGCTAGTATCTAAATTTAATATTGTACATGTAAAATTGAGTAAAACACTA
>CG3065 19479498 19479833|19936 chr2R 19478283 19479635 scaffold_1 6786959 6788240 - 40688|1238 1375
TTTCATAGTTACTCCTTACTCCTTAAGTCGCTAGCCATTGGCATCCGCATCCAATCGATATTGGCTACCACACGGGCGTGTGTCGGGTGACGCACACAGTACAATAAAATTAAATAAATTCGCAATCTAACTATATTC
CTTCTTAGATAACAATTTATTTTAAAGG-------CAGTAGCATCCGAAGAAAAT-----TTAGTTGAATCAGGCCAGTGTTTGGGA--------GCAAAAAAATATAATAAAATGAATTCACAAACTAACTATAATC
>mr 19482941 19483012|19938 chr2R 19481117 19483083 scaffold_11 1575764 1577833 - 75343|1938 2028
GTTTCGGAGATCCAAAACCAAGTTGCAAACGACTGAA--------------GGAATCATGAAATAAATAATGAAT-----TAACGCGATAA
AAT-----------AAGCTTATTTGCTGAATACTAAATAATATAACTCAATTGAACTTTTACAAAAGCAAAGAATCTTGCTTTTGTAATAG
>Sox14 19492620 19492777|19949 chr2R 19492048 19492785 scaffold_11 1663364 1664136 - 26520|607 781
GAGATATTTAAG-TTTGTGTAATTTATAACTAATCTAATTGTACGTTTATAATTTTACACCAAATTATATAT---TAAATATGTATA---TGTATGCAGATAATAC-----CATATATTC---CATAAAT-TCTATATACATACA-AAAAACGCGAGAATAAATGCTTTGCATTG
GAAATATTTAAGATTTGTGTAATTT-TAAAAAATATGTTTTTACGTTTATAATTATACACCAAAATATATACACATATATATATATATATTATATATAGATATTATATACACAAATATATAAGCATAAGTATATATATACATACATGTAAACGAACAATAAAATGCTTTGCATTA
>CG3121 19527433 19527495|19988 chr2R 19526713 19527568 scaffold_11 2246202 2247016 + 26262|721 784
GTTAAATGAAATTGCTTGTTTTTATGTTCTCATTCAAGTTCT-GCAATAAAATGTATTGGCTTT
-----ATGACAATGATG--------------ATTAAAATTATAAAAATAAAAGTTA-----TTT
>CG11388 19531551 19531584|19991 chr2R 19531463 19532235 scaffold_11 2287567 2288360 + 2409|88 124
ATAAAATTGTTATAGGA---ATATTAAATTAATTAAA
ATTCTATATATATGTGGTACAAATTGCATTACTTAAA
>Adk2 19533248 19533477|19992 chr2R 19532428 19533330 scaffold_11 2289171 2290057 + 31231|846 928
TTTGTTCCTGCGCAATGATCAACTACTGATAACTGCCTCCTGACAATTTATTTCGAGACACACACAACGTTTAAGCCTAAAGT
------CGGACTTAATGCCAA---AATGAAAACTGCCT------GTTTGATTTTGAAAATGAAACAATAGTTTAATTTCAATT
>PebIII 19534996 19535117|19995 chr2R 19534607 19535044 scaffold_11 2303538 2303974 + 17085|392 443
GGCG---GATCCCGGTTCCGGAAACTCTTGGTTATATGCACTGTTAATTAGG
GGCTATCGATACGGAGTCTGTAATATATTTA----AGGCAATCTTAACTAAG
>CG3163 19538085 19538155|19999 chr2R 19536956 19538085 scaffold_11 2254082 2255180 + 35261|1149 1149
T
T
>CG3167 19544251 19544308|20007 chr2R 19543623 19544297 scaffold_1 6807704 6808371 - 21500|632 678
AACACACAACTCTACATTAGATACTTAAGTTATTAAATGCGAATTTG
GTTGTAAAACTTT--ATTAGAAGCTAAGGGAAATAAATAAAATTTCG
>CG3173 19551939 19552038|20012 chr2R 19546996 19552242 scaffold_1 473902 479204 + 198076|5003 5113
GCGTTCGGTCTAT---AAGTTAGAACCGTCATCATATGTAC-AATGTAATCTTTGCTCCTTATAATAAAGTGTAT------TCTGCGGTACGAGAT-TTTTACCACAGCGG
CTTTTTTGGTTCTTCAAAATATAAACCCTGGGCTAATGCACTAAAAATATGTTTG----------TAAAGGTTATAGTCTGTATGTAGTACATTTTATTTCATAAGGACGT
>RpL12 19568956 19569116|20039 chr2R 19568737 19569026 scaffold_11 2292896 2293195 + 13945|219 299
ACAGTT-----TTTTAAACAGAATTAATAAATTGTACGCGATACAGTCTGTAATA-----ATTGACCCAATCGGACAGAAT
ATTTGTATTCCTTTGCAAAATAGCTAATAAAACTAACGTTTTGCAATCAGCAGTATAAATTTTAAACCGATTTTACAAGAT
>RpL12 19568956 19569116|20040 chr2R 19569027 19569239 scaffold_53 551267 551467 + -707|0 94
TTTACTTTCGA--GCTCAATGCGGCC---GTGAATGCGATTTCAGATAGGCTAGCTAAATGTTAAACAAGAGGAAAACTAGAAGTGCATAATATT
CATATTTATGATGATACAGTCTGGCCTTTTTAAACATATTGCCTGATGGATTAATGTCAAGTTTCATTAGGATACCTCTAAAAATGCG-------
>Rap2l 19572941 19573005|20048 chr2R 19572752 19573275 scaffold_11 2297751 2298246 + 13599|189 253
AAATTTTGTAAAATTGTAAGATTATTATAGTTAAAAATAAAATTACTAATATTTAATAGATAACG
AAA-TTTGTAAATACATAAGATTAATATAGTTAAAAATAAAACCATTAATATGTATGTAATAAAT
>CG3209 19580932 19581074|20058 chr2R 19580626 19580977 scaffold_11 2223091 2223454 + 17933|306 363
ATTACCATATTACCAT------------ACAGTGACTGTAAATGATATACATACATGA
GTTAATACTTAATAATTTGTAATTTTCAACATGATTTACAAAATGTATAAATATATGA
>Mlp60A 19583213 19583293|20062 chr2R 19583050 19583224 scaffold_550 2114 2287 + 8654|163 174
GGACTAAATAAG
CGATGTGGTAAG
>CG16786 19593603 19593760|20068 chr2R 19592529 19593696 scaffold_1 6488162 6489334 - 31901|1109 1204
TTTTTAGGAGCAT--CTACGCAAGCGAGAGTGTCTAACCCCATTACTTCTTTGTAATTAGGAATCCTGTATTATATTTAAGAACACGTGCAAATAT
TGTATAGATATATTCCTTTCCAA---------TTAATCACAATCACTTACCTATTATAAATAAACCGAAATTATG---ACGAGTCCTTGCACTTAT
>CG3231 19599493 19599619|20077 chr2R 19597695 19599725 scaffold_11 2112483 2114523 + 16547|1969 2121
GT--------------TACGGTAGGCTACGAGATAAGA-------ATGATATAA-ATATTGAAGAT----TAATGTGTACAAATCAAAGATTTTTAATGTATGTATTTATCATGCAACTATAAGTATACAAATAAAACAGAACTACTCAAGGA
ATTTTTGAACATAAAATCCAATGAGACACAAAAAAAAATATACATATAATAAAAGATACTTAAAATGACACAATATTTTATAATAAAAAACCTT--ATGTACATACAAATAATGTAAATGGAACTGTTTAAATAAATGGGTAATAC-----GA
>enok 19614540 19614634|20090 chr2R 19613348 19614623 scaffold_11 1676864 1678167 - 47527|1237 1333
TAGATG--------CGCACA-----TTTTATATGTTACTTTATTAAGTATGCCTGTACATAAATGTGTGCTGTAAATAAATATATATTACGTCAATT
AAAACAAAGTTCATCATACACAAGGTATTATATAAAATAATATAAATTCTACCTACTTGTA---TTGTGTTGTGAATAAATATAAATTCTGTGTATT
>CG3257 19629603 19630870|20106 chr2R 19629473 19629606 scaffold_4 5662205 5662331 + 6900|130 133
GGGA
AGGA
>CG3257 19629603 19630870|20107 chr2R 19630580 19631129 scaffold_4 5663788 5664260 + 3626|0 296
AAATCGAAAGATAGTGAAGCAAAACCGACTAAGTCTGTTAGCTGTTAGATGGAAGTAGGAAATTACAAGTAAAACGCGTAGGAA--AAGCGAAT----CGATACCAAGTACTTTTTCCAAGTAGCTAAGTAGCTGAGTAAGAGAGGAGCCCGAACTCGCATCAGCATAGAAATAATTCGAAAGGGATCGTAGGAAGTGTAAGGATTGTATTTCGGGCTCTGGGAGGTTTTCAAAGTCGGACTCCTGTGCTTGAAAAACATATATAAATGTACGAATATACTAAACACCTCACAACCG
AAAACGAAAAAAAAAAAAGAAAGAATGACTAAGTCTGTTAGCCGTTAGTTGATATTAATTAGT---AAATATTTTGCTTATGTATCAATCGAACTAGACGAAATTAAAGA---TTCAAAAATATATTA-----TAAAAAACAATTTAAACATGATTACAATCATTTTACACATTCCTCCAACTTGGTCAGGGGGA-TGCCAGAAT-----------ATCTGAAAATATTTCGATTTTGAATAAT--------AAAATAGAAAATAAACAAGAAAATATACTAAACAATATATAAATA
>Zfrp8 19642771 19643005|20123 chr2R 19641616 19644941 scaffold_4 5673452 5676915 + 142288|1200 1527
CATTAAA-------------------------------ATGCGTACATTTAAATTTTATTCTTGTCAATTACGAAACA---------------------------------------------------CGTGAACAT-----------TTACTTCAGCTTGATGATGGGGAAGTAGCTGTGTTTGGAGAAGTCGAACTCTGGCTGCCGCTTGACTTCCTTCTGGTGACCGCGAGCCAGCACATTCATCACCACAAAGTTAGTCCGTGCGATTTGCAGGAGGTCCAGCATCTGAAATTAAACGAAACGCATTTTAATCCAGGAAAACC
C-TTAAGCACAAGCTGTTCGGCTTACAGTCTCCGCTGTATGAATACAAACCAATTTTATTTGT-TAAGGGACGAAACAAAATGTAAAAGAAAGATCTAAGACAATTAATGATTAGAGAGAGAGGAGCGATATGAACACGAACTTGGGAGCTACTTCAGTTTGATAATGGGAAAATAGCTGTGCCTGCTAAAATCAAATTCCGGCTGACGCTTCACCTCCTTCTGGTGGCCACGGGCGAGCACATTCATCACCACAAAATTGGTACGCGCTATTTGCAGCAGGTCCAGAATCTAGAA---GACAAAACCCAATTAATTAAATTGAA--T
>Dat 19665149 19665362|20133 chr2R 19664446 19665345 scaffold_4 5694052 5695060 + 27127|769 1017
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TTGTAATGAGGCAATTATGCATTTCATA-GAAAATATGTGATT-TTTAGTTTGTAGATCGGTGGCGGGATTTTTAAGTATATATTCAATCGAGAATCGTTCGCTCATTTTCATTCTATCTTTGTGCTTTCAACTTCTAATTAGTAGAAAAATATACAAGTACAAGCTATACAAATATTTATGTAATTAAATGCGCCCATCGCGATGTTAAA-TTAAGTATTCAATTTGCTCAAAGATTGCTAAATTAAA
>spag 19668971 19669098|20136 chr2R 19666938 19669649 scaffold_4 5696993 5699955 + 48876|2146 2336
A--CACCCAATGTTTTATGTTA-AAATGTACTTATGTTGCTTCAAATTGTTAGCTCCAAAATCAACTAAAACA----------ACAAAAATGT--------TTAAAATATAAAGAG----GATTTGTAGATAGGATC--------------------------------------CCAAAACGTTACACAG
AGTTAAAAATTGTTATAAACAATAAACGTGCTTGATTTGCTTCAGATTGTTAGCCCAAAAAGGTTTTTAAAAATGTTATTTTCAAATAGATGTGAGTAACCTTAAAATTAAAAGTGGTGTGGTTTATACATACAAACATTTAATTTATCATCATATGAGGAGGGAACTAGTCACACGTACAGCTCACACAG
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TTAACAATTTAATTTATGGCACGGATCGAATCGAA-------------------------------TCGGAAACGGAAACGTAAACAAACACC--ACAAAGAAAAGTT----------------TTCGCACGTTT-----TCCAACACTTCATTCCAGCGCTC---AGCTGCAACCGCTTGCAGCTGAATGTTGGCAACAAATATGGCAAGAACAAAAATACAAAAGCAAACAAAAA
>Nop60B 19684706 19684891|20146 chr2R 19683002 19684883 scaffold_1 6730646 6732553 + 82698|1761 1948
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CA-----TATTTTCTATAAAACTAGGCATTAGGCTCTATGTCCTCCACTATTTTG-AGAGCATTTTCTTAGCTGTTAAGTTTAAAATTTTAGACGGCATCTTGTATATGTGAGCTGTAAAAATGCAAGTTTTCTATGCATTTATAAGTGACATTCGCAATGCAATAAATTGTATAATTTTATTGTAAA
>Nop60B 19692606 19692651|20147 chr2R 19692397 19693112 scaffold_1 6732648 6733434 + 12617|233 293
CTTGGA-ATACTGCTCAGAGGACA------AAGCGGGAG--------TGACGGAAGATACG
CTCGCACAGATTGCTCAGTGGTCGTGAGTCAGACAGAAAGATCTCTATGGCAAACTGCAAG
>Nop60B 19692839 19692889|20147 chr2R 19692397 19693112 scaffold_1 6732648 6733434 + 12617|504 567
ATCGGCGGAACGAAAACTAAAAACGTGCTT----CGAATAAACAT---------AGGAATTAAG
AGTTTTGCCAGAACAGTTCAGACTGTGCCCGAGCCAGCTGATCATCTTAGCAGCAATAATAATG
>Nop60B 19693078 19693120|20147 chr2R 19692397 19693112 scaffold_1 6732648 6733434 + 12617|771 805
ATTTGTTGATTAGGTTATGCAATATATGGACTATA
CTTTGTT--TTTGGCGAGGACATCTATTTTCAATA
>Nop60B 19693078 19693120|20148 chr2R 19693113 19694201 scaffold_1 6733684 6734747 + 7588|0 7
ACTTTAAT
TCTTTA--
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GCTGATT----TTTCATCTCATTTCTTGGATACGGTTACATATTAAATATGTA--------ATCTGTTTAGTTATATCTAGAAATAGACTTGTCTGTTATTATGATTTTCAGCCATGCGAAATGGCATTCTATTAAGTTGTGTATCATAAAAAATTACTATCTTTAATGAT
CCAAAGTCCGATGAAATTCGGTATCCAAAAATAACACACAAAAAAAATATATACAAAAAACACCCGCGCAG---CAGCTA-AAATAGACACAACTCATATT-TGATATGTAG----ACGATTCAGTTGTTAATTTAATTATTTACCAT--TTATTTAGTTTCTTTTATTAT
>CG3362 19704432 19704629|20152 chr2R 19703520 19704632 scaffold_1 6745246 6746333 + 50260|915 1122
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CTCCAGC--------TAAGGCTGCACTTTAAAAT----------------TGTTTATTGGTTATCCAGCAAAGTGTTAATTGATTATAATCAACAAAAACAGAAGCTACTAATTTGATGCTTTAGTTGTAAAGCCTCCCTCATGTTTCACATATTTATGTACA---TACGTTTGTATATCATAATAAAATGATATTTGT---TTAGAA
>CG3356 19709478 19709787|20153 chr2R 19705408 19709738 scaffold_1 6747346 6751702 + 177511|4216 4501
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GCTGTGTCCCGGCAT---------ACCAATTACTACACACATATCGAATGCAATGAACCCACATAGAGACCGATTCGAGCGCCCATCCCAGCTGCAGGAATCGA----------------TGGCTGGCCAAGCAACTATTCCAGTTCACGTA---------GAAATTTAATTATGGAAAACATAATTAATTCTCTAATGTAAAGTATGAAGCTTATGAGGTCTGTTT-TCCAAGTTTTCTTTTTAGTTAATTTGTGTTTTTTTCGTATTACACAATATAAATGTAA
>CG3356 19709478 19709787|20154 chr2R 19709739 19709860 scaffold_30 1139759 1139881 - 1373|0 48
ATCAATGCGATCTAAGAATATTTAAATAAAGGGCAAGCGTTGTCAGTCC
CTCGACCCGGCC----AATATAATGGCAAATGGAAGGCGTCATTT----
>nord 19762028 19762693|20224 chr2R 19760660 19762696 scaffold_1 6815261 6817500 + 43159|1530 2303
GCGCTACCAGTGGTGGTCGTAATCCCCCAATCCAAACCCATACCCAAAGCTTCGCTGCATTTTCGAATACAAACACT--GAACTATCCGTCGTTGTAAAGCTACCTTATCCACTACGAT---------------------TACTACACTATCCTACAAAAAACTATGCTGGT--------------TAAAAGACTATACACC--TAGCTCCATATACTATATATATATATACAATATCGAG-GCATGTGT---TGTGTGGGCG-------AGTGAGTGTGTGCGTGTGACTTCTGATTGAGTTGCCATTTGATTCCAAGTATTTTCGAGTGCTTAGTTTTGTAATTTGTAG-CTAGCCGTTAATGTTTGTATAAACTGTTTCATTGGTTTCCCACTCCGCTTTATTCGATAAGCTCGTTTTCTAGATTTTAGCTTTAGCACTCT-TAGTTTAATGTTTA---AAGTTAGTTTCGCTGTTAAGTTTACACCGTAGTCGAGGCGTCTTGAGTAGTTCTTTTGTACATTAAGCTTACACTTAGCT---CTACATTAGATATACCATGTCGAACCTACGAGTCTACGAACATACGAACATATATATGT---------------------------------------GCGTTGAAAGCGTTGTATTTTTTGAAGCCGAACTTATGCAAC---------CGAAAGGAGACAATAAACAAATGTGCTATAAAGGACGAAAGTGTCGCAAATAAATGTG--AGCCACTGCTAAAGAAGACC
GTACTACTAGGCGTATACGCAATGCAGTTGTCGTAGCAGAAGAGAAAAAA-----------CTCAAAAACAAATAATAAAAACTATCCGTCGTTGTAAAGCTACCTAATCCACTAAACTAAACTAAATTAAACTATGCAATACCATACTATACTAT----ATCTATGCGGGTTTTTGCGCTAAGCATAAAAGACTATATATCTTTAGATCTATATATGGCAAACATAGCTATGTTCACGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCGTGTGTATTGTGTGTGTGTGGGTGTGAATTTTTTTTG-TTTGCCAACAAATTCCAAGTATTTT-GAGTTCGTATATTTCTTGATCGTAACCTAGCTTTAAATGTTTTTGTATAATTGTTTACGATTTTGTGTGTGTTCATTGTTTAA-AATCTCGAAT--CGGTTTATAGTTTAGTTAATATATATCTAAATATTTATGTAAGTTTATTTTAGCGCTAGGCTTTCGCTGT----TAAGTTTACCAATAATTTTTTATACACAAAAATCTTA-GTTTAGCTAAGCTTAACTATGTATAC-------------AGAATATATATACATACATACATATATATATTTACATATATTTAATAGCTATAAATGTGCGCTAGTGTGGGCGTTCCAAGCGTTGTATTTTTTGAGGC--GACTTAAGCAAAAAAACACTGCAAAAATCGATTGAAATCAAACTTAA-ATAAATAAATAATGTGG-ACAATAAAATGTACTAAGCATTAATAAAGTTGGCC
>CG3376 19771950 19772823|20233 chr2R 19771483 19772034 scaffold_1 6831668 6832234 + 22930|483 578
GCACTGTTTATGTCAAGTTCGTGTTTCTATGGTGTA-----------GGTGGCTCACACAAACTAATGCAACTCGAGTTGTAATTGTAATCAATCA
GTATCGTAGTTGTCGCTGTTTGTTCTATTTGTTGTACAATTGTTGGTGCTGGTTTGCGAACACT--------TTGTGCT-CATTTGTGTCCAATTG
>CG3376 19771950 19772823|20234 chr2R 19772090 19773210 scaffold_1 6832292 6833681 + 2976|0 994
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ACACATACTGTCTC-ATATAATTGCAAATAATTTCACACACTTTTATTCTCTCTGGTTTGGGC---------------------ACACATGCATACAAACAGCGGGGATGAGAACAACGTGGAGCCGGAGAGCACAAATCACACAAATGACTGGGAATTTTTGGATGTGGTTTATGGTACATATGGTTGAGGTCAAAACGACAAATTGTAAATATTATCGACGAATAAATATAAGTATTTATGTTTAAGCACTGACTAAAGGGGCTGCTGGTGATTTTTTGTAAACCTTTAATTAATGTAAATTAATATATTTGACAACATTAATATTATTAACATTTGACAATAAACATTACAAGATTTTAACCTTAACCCGCACACATGCTTCCGGTTTGTTTGTGCCTATGTTTCTATCACAGCTATAGCCTGATTTCGTCCATCACCTACCTGCCCAAGTATCTGCTGAGCTATGGCTGAGCTGCCTTTCGGCCATG-----TCAACG--AGTCAACTGCAAGTCAAAGTGCATCGAATCAGTGCAAATTTAAACGCCTACGTAATAAGTTTACTATGTGATAATTAGTGCATAGACTAAATTAGATACGTATATGTTTACTCTAAGGTTTACTCCACGCACGTCACAATGCACCTGCCCCTGCCCCTGCTCCTGACCGTGCCACAGCCATGCAGCTAGCAGCTGCTACCCGGACAGAGCCGCATCCGCATAGCTAACTTTTCTCACATCTAAACTGAGTCAATGAACAATAGTCATTAAAT--TAGTCGAATCATCGTCATTGTCGTCGTTGTTGTCGCCGTTAAGTGGGCGTGGCAGTTGCCACAGCGGCCAGCCCAGTGGGCTGATAGCGTCACTCGCCCGTTGTAGGCAACACAATATAACCCGTTGAACAAATAACTTAAT-AGTCCTTTAGACTTAA--TTAACGTAAGCTTCTAGTACGTAAATAAAGTGCAATTATTTTAATGAGATTATAAA
>nvy 19797886 19798688|20264 chr2R 19795273 19799532 scaffold_1 6863669 6868195 + 125676|2913 3859
CGCATTCGCATGATGAAACCCAAGAAGAAGTACTTGTGCTAGTCAAATT----AAAGGGGGTGAACCACAAAACCATATAC--ACCATTAAAAAGAAAATATGCAGCTAATATAGAGATATCCAAAAACAAAAATCGAGTGAAGAATTCACGGTCGCATCGTC---------------------------GGTAGACGTGAAGTGAAGTAGA-------------TGATGCTTAACATCCAGAAACGCATAAATAGATACAGATTGACGTGCATTTTCACTAAAGTTTATACATTACAATGTTTCAAGATGTCCATG-GTATTGAGCGGGTTGAATTAAATGGGTTGAAAATCCATAGAAGAAACCAATATTAATTACTCTCACTCACAAAACATTTTACG----GAATTTATCCAGC---AATTCTCAACCTGTGA----CTTAATGTATGAAATCGCATTTTTACC----ATCAGCACTTTCACACTCGAAATACATAAATAATAATTAATAACAATATGTGCACACTAATAA-------TGAATTACATAAGCAAGCTAAATCA------------TTTAAATCAGAACTTGA---------GAAGCAGTCAAATTCTGTGAGTA------AGCAACC-----------CAAAGCGAGTAAAAACAAAAACTGAACATAGTAGATTTTATTAATACA-ATACAGTATATTAC--------------TACGGATATGATTACGATTATGGCTAATTTATTGA------------GCGAGTTTAATTTATTGATTAGTATTTATTGTACTCCCTAAACTAA--------ACCTAAATGTACTTTTATCATAAACAAATACC--AAGTAAATGTTAAACCCACAAACGCGGGCTGCTGCAAGGCTCCGGCAAAAGAAACCCAAGAAATAAAGTGTTTTAAACCAAAC
CGCATTCGCATGATGAAACCCAAGAAGAAATACTTGTGCTAGTCAAATTAATGAAAAGCGTTCCGGCTCGAATACGAATACTAAAAACCCACATATAATTATGGAGCTCAACTAAAGTAAACCTTAACCAAAAACAAAATGAAGAGAAATTGTCAGCATTATCCAAATAGTTTTCTAAATGCACACATAAAATATACTTCAAGTAAACGAGATAGAAATGTAATTTAAAACTTAACTTTTTGCATTTCATTAAAAATCAGAAATTAAAATAAA-AATAACAAAAAAATAAAAATAATAATAATAAAGCAGTTTAATGAGTTTTGTGCGTGACAAATTGATTTAATAGATTTTCTTT----------TCTAGTGCTTAAACGTTTTCGTAAAATGTTTCAGGACAAGAAAGGTTCCAATAAAAATTTCCACGCTCCAAACTCATTAATTTATAAATT----TTTTAAACTTGTGTGAGCACTTTAAAAA-AAAAATAAAAAAAAAACAATACACATAAATATTTGCACCACATTAAAGTTTATCGAATTAAACGTAAAAGCTATATTAAAGGCAACTCTTAATAAATATAAATTTAAAAAAAAAAGAAAGAAAATAAAAGCTGTAAGTAGTACTTAGGACCCAATCCAAAAAGCAAAGAAAGCGAATACATAAACTGAACATAGTAGTTTTTATTATTATACATATAATATATTATATTTATTATTATTATATGATTATTGCTATCATTATGGCTAATTTATTGATTATATATATGTATGTATTTAATTTATTAATTAGTATTTATTGTATTTCTAAAAAAAACAAAACATATTTAACTGTACTGCAAATGAAAACCAAAAGCATAAGTAAATGTTACAACCACAAAAAAAGGCTA---------------AAAAGAAACCCAAGAAATAAAGTGTTTTAAACCAAA-
>CG3394 19805592 19805723|20272 chr2R 19805250 19806196 scaffold_1 6877299 6878374 + 31385|342 494
GGA----TAGAGGTCCCTTTTGCGCCCACAATTGTATTCCAGCCAATCCTCTGTGTATATTGCAAAACGCTTGTCTGTCCCAATGTATTTTTA-----ACGCTTAAACA-----------ACGACTGATTCCGAAAG-ACCAAAATACCTAAA
GAGAATCTAAGAGGAATGTCGGTTCGCTCACTTAGACTTAAGTTA-----------------------GCTTGTATATACACACATATACATACACACACTCCCAAACACACACAGACGTACAGTTAGTTCCAAATGTATTTTAACACTTAAA
>betaTub60D 19819748 19820703|20292 chr2R 19818744 19821805 scaffold_1 6897687 6901021 + 82945|1007 2179
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TGGTGTGGCCAGAGGAATGAGGTGCGTGCGTGA--GCGTCTCCTATTTGGTGGTCAGCCCTTGTTCTTGCGCGGCATGCGACAGCAGCTGCGCGCCAAGCACTGCCAGATACTCTGA-----------GGACGCAGCAACACACAGACACA-CACACACACA-CACACACAGATACA-----TACACACAGAC-------ACATTTATACA---GGAAATGTCAAGCGTAGTTTGACAGCAATCGAAACATCATCAGCCGGAAATGGTCCAAAGCTCTCATTTCATTTCACACACCATTCGCTCAGCTCAT------TCACTAATCACTCGCTCATTCACTTTGCACTCACTCACTATTCACTTTTCAC--------------------TATTCACTT----CACTCGATTCACCTTCTACTCACT-CATTCTTCATTCTACGCT------------------ACACTTTACACGGAGGCACGTTTATCGCATTTCTCGCAGCCATTTTCTCTTCTCATTTTCACTCTCTCTCTCTCTCTTTCTCTCTCTGTCTGCCCCGTTTGTGTCCCCTTCACTGCATCTGCTTTGTGCCCGCACTCCCCTCTCACTTAATTAA-GTCGCGATTTTATAACATTTTTTATATACATAATTATTTATATACAACAACGTTTAGTAACGTATTTTAATTCAAATATAAAATTTAAAAATATATATCAAAAAAACAAAAAAAACAAAAAAACAAAATATTGCACAATTCTCAAAAAGCAAAT-----ACATTTTAAACCATTTCAATTTGCACCGAAGACTGACGGACAGGCATAAGTTTTGGACTCCAGGGCAATATTACGAGTACTT---GAAACATCCGAACCCAAA----GATCGAACCTTCTGAAAACAAAAA----TGAAAATCATCTAAAAAT-CATTTAT-TATTCATA-GGCGCAACAGATCTTGTTGCTGTTTTTGTATTCCTGTGCA-TAATTCTCTCGTAGTGTTTAAAGTACCCAAGTAATTAACTAATGCTTAACTTGATTAATAATAATAATAATAATAATAATATGCTGCAAAAACGTTTTCAATAAAAATGCAATATGCTCAAAAATAAATTTTATTTCAATTCTATTTTTAAGGGAATGTAATTGGGCAATTATATAGAAAACAT
>bs 19883591 19884075|20362 chr2R 19883419 19883823 scaffold_1 6975906 6976365 + 5325|174 472
CC---CCCAGCTACGCCTA--CTGCTTATCATGAGAT----------------AACTGAGAACTGCGTTTATCCACACTTGCCCACACCATCT--GGAAAAAT-------------CATCAGCAGGAGATTACCATTACTCACCCAC-TACTCTCTTA-------AAGTCTATCCAAAGTTTTCACGTCATCACCGGGGATGACGATCGCC---TGCTAAGTCTA-----------AGTCATACTA-TATCTAC---TATACCG----TATATATACTATTTTTTATACCTATACAAGG
CCGTTCTTCAATGCGCTGAAGCGGCATAAATGGAGATTGCTTTTATGACAACAAATTGAAAATATTATAAATCCATATCTAATCATGCAATCCAAGACAAAATACACACACATCTACACAAGCCCAAACACACGCACACTCACTCACACACTCACATATGCACACAAGTCTAACCATAGTATACACG-CGTCTCTTATAATAATGTTGGTCAAAAGCTGATCATACATATACACCCAGTCATATAACTATATACGTATATATCAAATTTATATAGACTA-TTTTTATACCTATATAAAA
>bs 19883591 19884075|20363 chr2R 19883854 19884090 scaffold_1 6976402 6976629 + 6760|0 228
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CTCAAGCTGTCGGAGGCAGA--TAATTGCATAAGTTATAAAA--TTTACAAGTTCTATGAGATTGAATC----GCTGAGATGAAGTTAATGAGATGAGGAAATGATTATGCCGATGATGATGATAATGTTCCTAAGCCGCAGATGAAAAGTTGCTTTGTTAATAGTTTATATTGTTTTTATTATAT--------TATACACATAAACCACTTTTTTTGCAAAACAACAA
>Mov34 19911874 19912127|20387 chr2R 19910621 19912124 scaffold_1 7006069 7007630 + 70463|1284 1596
GAGCGGAAGAAAAAGCGCAAACCCCGTCGCAAACGAAAGAAGCAGCGGGC----------GCAGGACTAGCTGCTGCTTCTTCTGT----TCTCCAGGAAGTGGAACTCATCT--GCAGACCATACGGCG-------AGGGTGTGCAGTGGCCTCAGAAATCA-AGCAT---TGCTACCATTCATCGTTCAT----------------------TTTCCACACGAAATTAAGCTCCCTCTTATTATTTCGCGTAACTAACT-------------AATGGCAAGTTTATGTAATTAAAAATTAAATAATTTAAA
GAGCGAAAGAAAAAACGGAAATCACGTCGCAAACGCAAGAAGCAGCCGCCAGAGCCGTAAACAATACAAACAACAACAACAGCAGCGACACCAACAACAATAGGAACATATTTTGGCCAGCTTAGCGGAGTCTGTTAAACATGTCAACAAACGTCGAAAATAATAGCATACATATTCCTCTTCATAACACATAAATATCGTACCTAGTTATATATAAATACACGCAGCGAAATCCTCTTTAAATATTTTGTGTAGCTAAGTACGCTTAACAGTAACCAGCAAGTTGATGTAATTAAAACTTAATTAATTTAAA
>CG3419 19921712 19922011|20398 chr2R 19918901 19921815 scaffold_1 7019162 7022202 + 102391|2968 3098
TC--------------------TTCACTTCTTGGCCAGTCCAA---GTGCCTTATACCAAAGTTCTAGGTTAAGATTAACTATTTATTGTAACTTAAGTCTCGTGAA----TCACAACTTTCGCGATACAA
TAGTAGCAGGCGGCTGGCGTGGTTCTGTTGCTG--CTGTCCAAAGTGTGTCTTATACCAA------AGATTAAGCTAAACATTTTATTAATCTGTTGTTGGCATGAAATATTTGCAGCTCTAGTCATATAA
>CG3419 19922095 19922383|20399 chr2R 19922083 19922830 scaffold_1 7023063 7023851 + 21483|12 407
TTGTCG---AACGCTGG------------AAAAAAGTAATCCATTTGACACGCCGTTGGCACTTAATTCC---CAACAAACATCTGAGGC-----------GTGGGGCGCGGCATCCGCGTTCATTGAACGTTACCCGGCAGAGA--------------------------------------------------------TCTCGTTGCGGACGCAATTGTGTTCTGATTTAGATTTT-----------GTGTTTGGGCCGCCTAAGCCGTAAACCCGTTT-------TGGCAA---TGAGGCGACAATTGGCCTATAAAATGCTGGACCATTTTGGCCAACAGCATCAGTCACCGACGAACCAA-CCAAACCAATCTACAAAATCAACATGAAG
TTGTCGCCAAAAGCTGGTAACATGAAATGGAAAATATAATCCATTTGACACGCCGC--------AATGTCGAGCGACAAACATTTGACACTGAGGTTCTCTACAAGGCGCGGCATCCGCGTTCATTGAACGTAACCAAGCAAAAAAAAAATAAATAAATAAATCAACAACAGCAAAAAGTTAAATAGAGTACAACAAAATTTCTTACTGCGTCCGCA-TTGTGTTCTAATTCAGCTTTTTATTTGGCTCTGGGTCTGGGTC--TTAAGCCGTAAACTTGTTTGAGGGCGTCGCAAGCCTCAAGCCGCATTTTGGCTATAAAAGAGTCCAGGTAATTGGCCAACAGCATCAGTCGCTGACCATTCATTCCAAACCAA----------CAACATGAAA
>CG3419 19922448 19922897|20399 chr2R 19922083 19922830 scaffold_1 7023063 7023851 + 21483|476 859
TTCCTTATCTGCTTGG-CCCTCTGCATCGCCGCCGCCCAGGCTGGCTTCATCGCCTCTCCGGTGACCACTTATGCCGCTGCTCCAGCATATGCCGCCTCCTACGCTGCTCCCGTGGCTTACAGCGCCCCAGTGGCCACCTATGCCGCTGCTGCACCAGCCTACTCCACCTACGCCGCCGCCGCTCCTGCCTACTCGACCTACGCCGCCGCCGCCCCTGCCTACTCCACATACGCTGCCGCCGCTCCCGCTTACACCGCCTCGGTGTACAGTGCTCCGGCCTACACCGCTCCTGTGACTACCTATGCTGCTGGTGCCGCATACGCCGCTCCCGTCACCACCTACTCTGCTCCGGCCATCGTCAGCCCCATCCTGAAGAAGAAGTA
TTCCTCATCTGCTTGGGCTCTCTGCTTCGCCGTCGCCCAGGCTGGCTTCCTGGCCTCACCGGTGGCCACTTACGCCGCGGCACCTGCCTATGCAGCCACTTATGCTGCC---------------------GCACCCACCTATGCAGCT------------------ACCTATGCAGCTCCAGTGACCACCTACTCGGC---CGCCGGCCTGCCCGCCGCCTACTCCACTTACCACGCTGCCGCGCCCGCATACGCAGCCTCCGTGTACAGCGCGCCGGCGTACACAGCGCCCGTGGCCACCTATGCTGCACCTGCC---TATGCTTCCCCAGTTGCCACCTATGCTGCTCCAGCTGTCATCAGCTCCTTCCTTAAGAAGAAGTA
>CG3419 19922448 19922897|20400 chr2R 19922889 19923597 scaffold_1 7024215 7024966 + 15534|0 8
CTAAGCGAA
CTAGGCGAA
>CG3483 19954329 19954439|20435 chr2R 19952648 19954329 scaffold_16 2981493 2983044 - 28229|1732 1732
G
G
>CG16837 19983535 19983621|20462 chr2R 19982038 19984017 scaffold_16 55661 57907 + 24694|1616 1727
AACATTTCCG-----GTCGCTGTGCGTGTGTGTGT-----------GCGGATG-------TTAATTGTACTGTA-TCCATATTCCACCCAAATTAAA-TTGCATGCAATTG-
AGTATATGTGTGGGTGTGGGTGTGGGTGTGTGTGTCATATATCATAGCATATGCTTTATATTAGGCCTATTGGATTCCATATTAAAACTTGGCGAAATTTAAAAGCAATTGA
>Crtp 20004496 20004630|20489 chr2R 20004027 20005294 scaffold_16 83585 85007 + 9275|536 709
CCAG---GAATCA-----TCGCATCCACTTTAACAAAATTTACGTT--TCTCGGTCTTATTGTATTAATGTTT--TCCGTTGGCAAAGATAAATATAGAAAA-----------AAGGATGCTCGGCCAT----------------CATCGAATGGAGCCAGACAGCTGAGGAAA
TTCGATTGAATAACTCAGTTGTGGCCATTT---CTAAATTTATGTTCATCTAGTGCATCTTGTATTCCTGCTTGTCCCAATGGGAGAGTGCAAAGTAAAAAAGAAATCTACCTAAACGCGCCAGGACATTCTTTTTCTGTATACTCTTCGCACAGA-CAGGAGGGCACAGGAAA
>CG30169 20036936 20037146|20515 chr2R 20035839 20036936 scaffold_4 5909240 5910386 + 2286|1223 1223
T
T
>CG30169 20036936 20037146|20516 chr2R 20036937 20037128 scaffold_8 5098453 5098652 + -1118|0 212
ACACATTAAGTAAGCGTTGCTTTAT-------ACCCAAAATATTTAAACCGCTGGCCGATTTGAAATGGGTAGAGATTTAGTTGAATTAATTA--AGGTATGCCATTAGTGGTCTCATCATGACAGATTGAATAATTGTATAAGTTATCATAATAAGC------------GTTTTTTGTTAAGTGCACCTTATAAGGAAATAAACGATCCGAT
GAAATTGAGGTAAACAGTGTTCTATGTTGTCTATTAACACAATTTCCTCAGCTTGGCCAGT----AAGATTTAAAATATAGTAAAATAAAATGCGAGGAAAGACATT--TTATTCTATTATTTTAAAATGATTCACTAAGAAAACTCCTTTCACGGGTTACAGATTTTCAGATTTTCTATAAACACAACT-------ATCTGAACGCCCTAAT
>CG13585 20040712 20040989|20521 chr2R 20040474 20040713 scaffold_4 5912172 5912403 + 8367|239 240
GC
GC
>CG11413 20044228 20044396|20524 chr2R 20043286 20044333 scaffold_1394 2360 3290 + 7923|1017 1123
CTTTAGATTTCTTTATAGAGTAACAGTAAGAGAAAGAGAAAGGTGAAATATAATTTAAGTAAATGTATACAT-CTGTGACAAGTTCATCACTCGGCTTTAAAAACAA
GGCAAATTTTAGTTGCAGC-TAATAAGTTTAACTAGAATAAGACGATCTATAATGCGC-TAAACGTATTTATGTTATCATAGGAACATTAATAA---TTAAAAATAA
>itp 20064026 20065299|20549 chr2R 20063431 20066120 scaffold_4 5942597 5945520 + 45662|654 2253
CTCTAAGTCCC---------------------CGCCC---CACACACCCACAGCCCCA---------------------ACACACCATACACCATACAGCACACAACAAACA---ACACACACC--------ACACACAGCT--------------------GAGAATC-GGTGCGAATATCGT-----------------------------------------------GGGTTGGAACGAGCATC-CGCATCCAGATATAGATCCAG-ATCCAGATCGAGAAACAGTCCCACTACGACCACACATGCAGAGCCAGAACACAGAAATCTAAAATATTAAA------ACGCCCAAATTTAATTCGTACTTATTTATTACTGTATGCCTTACAGTTTTTACTATATGTGTTTTTTTAAAAACGAATTATTTTTATTAATTTATTGAGAACGTTATGCGTTTGTTGTAAGT------------AACATAATTGGGGAGTGGGAGATGGGCGATGATG-----ATGATCAGATGATGATGATGATGA-------------------TGTGCAGGAGGAGGATCGCAG---------------------------------ATCTCGCACTCCCCACATA---TACATAGAAGCCGAAG---TATTTATTTTTAAGTATTCTTAGCTTGTTTTATTATTATTGCGTTATGCGGTTTGTATATAAAATAAACAAAACGAAATCCATTGTTTTTAAT----CTATGTAATGTAAAATGATAACTTTTATTTTTGTATCTGTATTCTA--------------------------------------CTGTAAAATCAGCATTTAGAGTTTACATTTTACACGATTTTCCGCAAGGGCAAAACTACAA--TGATAAAGATAAACCCATACGAACACACA----------CATACACACATACACACATACACACACACTCACACACACACATATATACAC-CGCAATCGAGACCGAAAGTATTTTGCAAATGTATTACACTTACAATTTTGTGCTATTTTGTAAAGATGAAACCCTGAATTAGTGTAAA-TCTGTTGGCGCAAAACGGAGATATGTATTTACCTATATAGTATATAGTATATGCATACCTATCTAAAGCTAAAGCCTTACATATATCCGAATACGAGTACCCTACACACATGCTAAATATTAGAGAGAAACGCAAGATCGCAATTTGTGCAAGACACAAACAAAA-------ACCT--GGTAAAAACACGCGAA---GAACGGAACGA------CTGCATTACAAATGTGGC----AATAAATAATACATAATTAATAAAACCCTGTAAAT-----TAATAAAGGAT-AATCAATCATTCGCTGGCTATTTGAGAGCATC-AAAATTGTGATAAATGAGAATTAGAATGCGAATGCGC-GACGCAGGACACCGCCAGAGAAAGAGACCGCCATACAGAAGGCGACAGAGACAGACAG-----------------------------ACTGCAGCTGGCG-ATTTGC---GCGCGTTTCTGGCGCGACTAAAAACGCCTGCTTACCGTTTTTGTTTTG
CCAGAAGCCACTCACACGCACGCACACGCACACGCACACGCACACGCACACAGACACAGACATCCACCTATCCGCAGTTACACACGCAGCCACACGCAGCGACACGCACACAGGCACACACACTCACGCGATACACACAACGAAATGGAAGAACAAGTTCAAGAGATTCCAGTTCGCATATGGTTCGTTTCGGTTCGTTTCGTTTCGTTTCGGTTCGGTTCGGCTCGGCTCGGCTCGGAACTTGAACCACACAATCAACAACAGAAACAGCAGCAAGAACAACTATAACAATAACAACAACAACAACGACAACAACAACAAGCAGAA---CAACAAATTAAATGTTTAACGCCCAAATTTAATTCGTACTTATTTATTACTGTATGCCTTACAGTTTTTACTATATGTGTTTTTTAAAAAACGAATTATTTTAATTAATTTATTGA-AACGTTATGCGTTTGTTGTAAGTGAGGGACACGGGAACATATGTGGGGGGGCCGCGGGGGGCAGGGGTATATGTATGTATGTACGGGAACGAGTGCGAGTGAGCAAGCACACACACGCACGCAAGGGGGGAAAAACGGGCGAAAGTACGGTATCAGGGAGGGTGGGGGTCTACCTCTCAGTACCATGACAGCGTACCCCGTAGCCGAAGAAGTATTTATTTCTAAGTATTCTTAGCTTGTTT----ATTATTGCGTTATG-------TATGTAAAATAAA-------AGATCCATTGTTTTTAATATACTTATTTAATGTATAATTATTATTTTTTATATTGTATTTAAAAAACAAAAACAAAAAGAAGAAGAAAACAAAACATAAAAAAAAACTATAAAACAAAAATATATCGCGTATTCCAAGCAGCATTTACATCAAAGGGCAGACAAAAAAAGGATAAAAATACTGAAAAAAGAGAAAACAAAACAAAAGCTATTCACAGACACAAACACACACACACACACACACACACACACAAACACACGCACACACAAGACCGAAAGTATTTTGCAAATGTATTAGATTT------TTGTGCTATTTTGTAAAGTTTTAAAACATAATTAGCGTAAAATTTGTTGGCAAAAAGAAAAGAAA---------------------------------ACAAAAAAAAAAAAGAAAAATTATATATCCACGAATACATAAA----------------AATATTTAAGC------CTATAACGCAATTTGTGCAAAACACAAACAAAACAAAAAAACCTTTGGTAAAAACACGCAAAAGCGAACAGAAAAAACAAAACTGCATTCGAAATGTAGTTGAAAAAAAAAAAAAAAAGAAGAAAAAAAAATTATTAATATTTATGTTAAATAATGAACAAAACAATCGCTGGCTATTTGAGGGCATCCAAAATTGTGATAAATGA-AATTAGAATGCGA---CACTGACCAGGGAGAGCGC---AAAAAGAGAGCGCACAACGTGAGAGCGAAAAGGCAAAGAGCGCGAGAGCAGAGAGCGTTCGCAACAAGTGCAGCAGCTGACGTAGATGCTTGGCGCGTTTCCGGCGCGACTAAAAACGCGCGCTTACCGTTTTTATTTTG
>itp 20065630 20065969|20549 chr2R 20063431 20066120 scaffold_4 5942597 5945520 + 45662|2606 2955
GCAAGAATGCTTCGGATCGCCCTTCTTCAACGCCTGCATAGAGGCTCTTCAGCTGCACGAGGAGATGGACAAGTATAACGAATGGCGCGATACCCTGGGTCGCAAGTAAAGTGCGATTCTCTGGGATTTTCTGGCACCGTCACTGGCAC-GAGCAGCTACTTAATTC----TATGAACTATTAACTAAAACTATTATTATTGATAACTGTGGCAGA-ACACG-GCACGAAACTATGGCAA---CCAGGAAACGATCGACCCGAGGAATGTGTACCACTTGAAGAAACAACTAAGCTAACATCTAGCTACAAGAGAAAGCAGAGCAAAAATGTTGAAAAAAAAATTATGAA
GCAAGACTGCTTCGGATCGCCGTTCTTCAATGCCTGCGTCGAGGCGCTGCAGCTGCACGAGGAAATGGACAAGTACAACGAATGGCGCGATACCCTGGGACGCAAGTAAA---CGGACGGACGGGCTTGACTTGAA-----GGCGGCATAGAGCCATAGCTAAACGCATAATACGAGTTATCC-CTACATATATTATA--TACTCTCTTTCACACACACACACACACGTACTACCGACAAATACAAGAGAACAAGC-ACACGAGTTAAATTAATCACC----GAAAATACGCGAATTACTCTTAAGTGAAAATGAACATAATGAATATATAATGCATAATAATACATAAA
>CG11414 20072377 20072666|20552 chr2R 20071883 20075046 scaffold_4 5951228 5954420 + 51213|557 969
GGTGGT-----------------CGGATTGTAGGACAAC--------------AAAAGCTTTATCCCTGTATATTTTCTATGTACAT-----ATATACCGTGTCAACCATCTAGGAACCATGTCCCCAGATCATGTTGTGAGTGGAAACCCGAAAAAGAAC-----------TAGCCGAACCCATCAGT--CCATGTAGCGCGACCCACGAAGCCATCTGTTCAATGTGACTTAGTCCG-------------------------GACAGAAGCTTATCTTGGATGCG------------------------------------------------TTTCTAATATTT-ACGAGTGAGCTTGTGTCTAGCAAATGCCCGCAACCTAATAAAGTTCAAATCAATCACAATTATTA
TGTGGTTTCAGCAATCGCAACAACAAAACAAAAAACAACGATTAATTGCAATGAAAAGCTTTACCTATGTATATTTTGTATGTATGTAATTAATTTATCGTTTGAAGCAC-------GCGCGTCCCCACACCA-ATAATGAAGAAAAGCGAAAGCAATGACAATGTACACGAGAAACGAACTTGTATGTGAACATATAGCTTAACT-------ATATGTATTCAACATGATTAGGCCCTGTAAAATTACGCTGTTGCATGTTACGTTAAAAACGTGTCATGATTTTGCAGAATCGTCAACTAAAGCCACCTGCACATTGTGAAATCCGTTTTTTTTTTTTAATTTTTAATGAGTGAGCTTGTATTAAATATGTA---ACAACTGAATAAAGTGCAAAACAATCA--------A
>CG11416 20075560 20075661|20553 chr2R 20075278 20075793 scaffold_4 5954797 5955343 + 19124|291 427
CGAAGAGTAAAACTTCAGCTGGATATTACTAGTATATTTGTTCAAGT--------------------------------TTAATGTG---AATTTGTATTACAAACACAACGCAAACAATAAACAACTACTGGTGTG
TG----GTACACATAATGATGGGTGAGATATGTACATTTATTTACTTTGTGGAAAAACGGAATTATGAGCCTATGTACATCAATTTGTTTAACCTGTATTGTACAC---ACGCACACAACAATAAATAATTAGAGTT
>CG3511 20082031 20082104|20559 chr2R 20081235 20082053 scaffold_4 5960322 5961155 + 34612|830 857
GCAG-----AGGGCTAAAATAAAACTTT
GCAGTAATTAGCGATAAATAAAAGGTTT
>Start1 20084862 20084899|20561 chr2R 20082587 20087202 scaffold_4 5962001 5966962 + 121325|2466 2503
ACCTAAAAGGCTATATTCCTCGCTATGTCCTGGATGCA
ATCTGAAGGGCTATATACCACGCTATGTGCTAGATGCA
>Start1 20084966 20085279|20561 chr2R 20082587 20087202 scaffold_4 5962001 5966962 + 121325|2576 2953
GCCCTCACCTCGTCCATGACCGACTACATTAGCAATCTGCGCAAGCATGTCAACGAACTGAGGCAGAAGGGGCGTGGTCGAGCCCCCA----------------------------------------GGACCCACTAGGAAATCAGTAATCCGTATTT-------------------TAATTTAAATCCCATTGTATCTCAAGCGAGTGCTGTTCGCAGCAAGGTATCTAATAGAATATTTCAATAATTTGAAGCAGGAGAGCGAGTTCAGTGCT-GTAAGTTTATTGAGTATTTTATGTATATGTATGGCATAAGTTCTATG----TACCTATATGCACGGCTTACATTATAAATTTTATACATGACTTTTTTAAC
GCACTCACCTCATCCATGGTGGACTATATGAAATATCTGCGCAAGCATATAAATGAGCTACGACAGCGTCGACGGCGTTGATACTGCACTTCTCTTGTACATAGACTAATACGATAGGTCGCTAACATAAAGCTTCTGCAACATATTTAAATTGTATTTCATAAACAAATAATTCGCGTAATTATATTCTAATTGTATCTCAAGCGCGTGCT----------AGTTAACTT-TAGAGGACAAGAAAAAAAAAAAACAACAG-TCAAGTGCATTGCTCGTAAGTTTATTGAGTATGTATTGTATATGC--TATATAGGTATTGTAAGTTTATGTATATGGACGACTTAACTAATACATTTTATACATGCTTTTTTT---
>CG3541 20100046 20100359|20576 chr2R 20099400 20100109 scaffold_4 5991785 5992560 + 18529|729 794
GGCAGGCAGACCCGACTCATTGGTTACAAGGTAA--AGTCCATATGCCAAGATGATGAGTCCATTG
GGCATCCAG-TTGGCGAGATTGGTTACAAGGTAACCCATCCATATGCCAAGATGATTAGCCATTTG
>CG3541 20104566 20105473|20583 chr2R 20103452 20105058 scaffold_4 5999256 6001047 + 70561|1180 1815
GCGCGGGAAGATGAGGAGGATGGATAGTCCCCAGGAGGAGATTCTAAATTCAACGTTTCCAAAATCCAA------AACACTCAAAGTGTT---------------AAAAAATCAGATGGTTC----------CCAGGA------------GGAGATTCGGTCGCGCAGGTGCGCTGCGGTAGTCAACGATTGGTAGAGTTGGAGCCACTTAGTTTTAGGATGCCGGAGCA----GTCAGACCAGTCTGGTCCAGCGGCTGTTTCTTAGATTAAGCCTAGCCTAAGTTGCAAATGATGTGCAGAGATTACCGGGCAATGGCCGGGGTCCATC----CCCATTGCCCGCTAATGTCGCAGAGATCT----TGGTCCACATCCACATTCGGAAATGGACAC--------------CCATCGAGCTCTGTTCCGCAC-----AGTCGGT----GTTGGACTCGC--------------------------------CCCCCCTCCT----------------------AAGCGTGTTTCTACATCCCTGACTAACCCCATTCCCAGAACAATCTG-----------TCGAACTAACAACGAATGCAGCAGCCGACGCTCAGGTGATATTTGTACTCGTAT
GCCGCAGCAGCAGTGAAATGT-GACAGCTTCAATTAAAAATTTCGCA----AATTTTTCCAAAACAAAACAATGGAACACTCAAAGTGTTTAAAAAAAAACAATAAAAAAGTAAAACGAATCGGTTTTAAGGCCAGGATAAACAAGAGATGAAGAGATGCACACGCAGCCGC-CTGCGGTAGTCAATTGTCAAATGTCTCGTGACAAGTTGGATAGCAGTTTTTAGTCCATAAGGTCACAACTTTTTAAGCTAAT--CAAATTATTATTTTAAGTTTTGCAAAAAGTA-AATCCCTGTGCAGAGATTACCGGGCAAT-----TTGCCCATTATTGTTAATTGCCCGCTAATGTCGCAGAGTTGTGCAGTGCTGC-CATTTGCAATACAAAACATAAGCATTGGCAGCACTGTCTTTGGCACTCTGTTAGGCACTTTCGTGTCGGTGGTGGTTGGACTCCCTTCCTCCCAGATTCTTATCAGAAAACTCACCACCCCCCTCCCGGCCTATGTAGTGCAGTCATTAAACTTTATTTATAAATATTGTATTTATCCTACTATTTAAACTGTTTAATTTTAAACACTCGAACTAACAACGAATGCAGCAGCCGACGCTCAGGTGATATTTGTATTTGTAC
>CG3541 20104566 20105473|20584 chr2R 20105117 20105413 scaffold_4 6001102 6001375 + 2702|0 319
AACTGCCCTTCTAGTAGAATTTCCTAAACA----CTTTCTTGTCATCGATTTACGTACTTA-ATTCCCATGCGGCAGGAGTTCTAGCCCTTATTATAATTCAGCCGTCCGGATCAGCCACCTATTATACATGGTATATATATAACATATATGAAGGCAGAAGTGAACAGTTCTCAAACTAAGCTCAGCATTTGCACCGCTTCAATCGAGCATT---CCGACGTCCACTGCCAGGATGCAACCAGAATGCTCCTCTGGAGCCGTACAAGCCA---CGCGATTCAAT---------TCATACTG---AAGCTCAATTTAGTG
AACTTTGTTCTTAGTTAAATGTTCTGTACAATTTTTTTCTTGTCATTGTTTAAACTATTTGCACTACAATATTTAAATACTACTATTTACTTTAAGCATGCAGCCG--------------CTCTTATTAATAATATATAAAAACTGTAT---------TAATTAAATATT--------TAACCCAAGCTTTTGCACAGCTTCATTTGAGCATTGGACCTATTTTC---------------TTAGAATGCTCGCCTGGAGCCGTGCAATGCGAATTTCGAATAAATACACAAACATCGTACAGTGAAAGCTCCACTTAATG
>CG3541 20104566 20105473|20585 chr2R 20105414 20106672 scaffold_4 6001582 6002757 + 25274|0 66
TAGCTCTAAGTTAATATTAATC-------AATGAACAATAAACTCAAACTGACCCTAATATCTGAAA
TAGGCCTAAGCTAAAAATAAAACTATGAAAATGAACAATAAAATTAAATTGACCATAAAA-------
>CG3548 20109213 20109969|20586 chr2R 20106699 20109815 scaffold_4 6003032 6006359 + 87607|2698 3550
GGGCGTGGCTGTTGG----CCCATATGCATATACA----------------------------ATACGAAGAGA------GCCAGCAATTAGGGTGTAAGGCATTTAGAGGAAACATCAACAGTACTTTAAAATTTAGCTTGAAATATGTTTAGCGAAATGTAG----CTCT---------TCCGGTCAGCCAGAGTAACCGGAAACGGAAACGTAAACGCCGGACGCGCATACAATA----CTCATCGACACACTCAAGTTGCCACT----------------CGGA-------CGAATGGACTGTTGTTTATT----------------------GTGCAATTCGCACGAGACGAACTCACAGGCA---------------------------------------------------TTGCATTTTCAAGAAATTAGTATTA----CATAATTGTATCC--GTATCTGTTAAGTACTCCGG------------GCGAAGA--GATCAATTCAAAATGCGGTTGTGTCGT---------CGAAAAAAAAACAAACTCGAAAATACTC------------ATGCACAGACTCTGAA---------------------------------TAAGTTCCCCTTTGCAGAACGC--AATTTACTCATCAGTCAGTATTCTCTATGGCCACTGTATTA-----------TTTTTATACCTTCATT------TGTTAGCTTTAAGTTTTTTTTACACAA--CTACTACTTATACTTGTGCTGCCAC--CAGTTGGGCTGC--CGTAGTTGCAGATCAATGTATCCATTGTCCATACATTGCGAGAATCTTTTATAATT
----GTTGTTGTAGGCACACCCATACACACACACACACACACACACACCCAGTCACCGAGAACACATGATAATACGCATTGCCAGAATTTAGTGGATACTGTATACAAAAGAGGAAACAACAA------AAAACTTAGCTTGAAATGCGTTTAGCAAAATGTAGAAGACTCTCAAATTGTCTCAAAAGACACAGACTATTCATGATTGAATATGGACA---TTAAATCATATACAATATACTCACGTTGCCACACGCAGGCGACGTCTTTTTTCGCGCCCTGCACGGACACAAATCGAATGGACTGTTTTTTTCTTTTTCTTTTTTCGTTGGTTTTGGTGCA--TGCCACAACACAGACTAACAGACAACCAACCACCCACCCAGACAGACAAACAAACACACACTACGCAAACATTATTTGCATTTTTTCAATATTAGTATTATTATTATATTTGTATCCTGGTATCTGTTAAGTGAACTTGCTCTACAAAGTTATGAATATTTATGAATTTCACAAGCGGTTGTGTCGCAAGAACAAACAAACAAAACAAAAATCAAATAATACTCAAAGAACCCTCGAAACACACATGCAGAAAGGAAACAAAAGAAATCCTCGCATGAGTTTTTCCAATTTCCAATTTGAAGAAAACCTATCCTAACAGTCAGTCAGTATTCTATTTTGTCACTGTATTAGAACTCTATTTTTTTTTTATTATCATGCAGCTATGTTAAGTTTTTATTTTGATTATAATATTTTTTTAATTATATAAATACTTATACGATAATTGTACATCTATGTAGTTGTAT-TCTGTATGATCTTTGTTCATACAC----ATTAACTTTTATAGCT
>CG3548 20109213 20109969|20587 chr2R 20109834 20109951 scaffold_4 6006518 6006625 + 4734|0 118
TGTACGTCGTGTTGTATAGCGCTGTAATATCCTGTCAC-CTGCTTCTGCTTAATTAATACCCTATATCGGGCGAGAGCAAGGTACGATTAAACCATTAGATAATGAAATACAAATACAT
TACACTTTGTGTTGTTTAGCGCAGTAATATCCTGTAACTTTGCTTTTGCTTACTAAATGACATAATTC------GAGCAAAGGACAATTAAACAATTAGATAAAGA-----AAATACAT
>CG3565 20110975 20111088|20589 chr2R 20111016 20114586 scaffold_45 855611 859165 + 124764|0 72
CTTAAATTGTGACACGTCTAGAAATTGAAAAGTGCAAATAATTTAGTGCATCATAAAGGTTTACACTTTTATT
CTAAAAGTGCGGCAC---TAAAAATGCCAAAG-----ATAATCTGCAGC--------TGGTCATACTTTTGTT
>CG3570 20112159 20112271|20589 chr2R 20111016 20114586 scaffold_45 855611 859165 + 124764|1156 1269
ATAAGATTCAGCCCCCATAAATCGATGTAA-ATATGTCCACGTCTACTTATTTATGGCTTAACTTATCTGTGTTAAGTGCGAGTTAATAATAATGGTTGACGATTTATCTACTA
TTGAAAT------------AATAGATGTCTTATATGCAAACTGTTATCTATGGATG--------TACTTGTATGAAGT--------ATATTTATGAGT-----TCCTTCTTTTA
>CG3608 20121456 20121507|20593 chr2R 20119544 20122211 scaffold_45 176488 179274 - 95001|2053 2114
ACTA----AACGGTGTCCCCCAAT------TAAAAGTACAAAACTCTTCACGAGGAAAGGGA
TCGGCTGCAGTTGTTCGTCCCGGTATTGAATTAAAGTACAAA-----TTAAAGGGCAATCAC
>Cyp9c1 20140473 20140532|20616 chr2R 20138456 20140481 scaffold_45 209267 211257 - 61043|2078 2086
TTAAAAACA
TTAATCACA
>Cyp9c1 20140473 20140532|20617 chr2R 20140499 20140549 scaffold_45 211947 212007 - 1550|0 34
AAATATTAATAAAG-CGAGAGAAACGAAACAAAAA
AAATATGAAAAAAGTCGAAAGAGGCAAAAAAATAA
>CG3663 20169949 20170017|20649 chr2R 20169107 20170268 scaffold_45 242908 244012 - 34029|856 931
GATAGCCCCTCCTGTCTAAATATCTGTTTGTTATAAAGCCAATTGCATTTA---TAAAACCAT----CATGCAGAA
CCAAGCTTTTGTTATTTACATGTTTG-----------GCACTTTGCATTTAAAGTAAAAGGATATGATAAGCAAGG
>CG3683 20172969 20173040|20651 chr2R 20171412 20173088 scaffold_45 245898 247668 - 40299|1758 1851
ACAGCTGCCAGCGCCTAGTGAAATTTGAAAGCGTTCATC-----------TTAAT-----------ATAAACTCTTGTTTCCATTAGTACTCGA
AC----GCTGAGGCTAAGTGAAATTTTAGGGCAGCCGTCGGGCCCAACTTGTAATTTACAACATGCATAAAATCTTGTTTCCATTAGTAATCAG
>Pof 20178832 20179118|20654 chr2R 20177290 20179940 scaffold_45 251577 254382 - 40660|1727 2074
TCTGTCATGCTACAGTGTACCAAATTACTCGTCGTAGACGAAT--------------------------TAGAATAATAGTTTAGTTTATTTTTTATTGGACTTCTGTTTCT-----------------------TTATTTGTTGTATC-TTCGTTTTCGTTTTTGTTCAGTTTCTCT-------TATTTCAGCGTACATTTATGGTATATAATATTAATAATAATACATAATAATACGTAAGTTAAATAATATTTCGGTTTTAAATATTAAACCCGAAAAAATATCGTTTAATGGACTGTCTTAAATAT----CACTTATATAATAATCATATGTACTCGATGATGA
TCTACCAAATTGTAGCACCTCAAAATTATTTGCGTATAAGACTTTTTAATCAGCGGCATATATGTACCATATAGATATATATATATATATATATATATATACATGTGTGTGTAGGATAGCTTAGTAGTGGATAGAGTAGTAGTTTTAACATTCATATTTATTTTTATTTAATGTTTTTCGATCACTTTTGCAACGTACA---ATTTTATAAAATTGTCATCATA----ATAATAGTACGTAAATTAAATAATATTTCGGTTTTAAATATTAAACCCGAACAAATATCGCTTAA--GACTTTTCTTACAATCATACACTTACAAATTAAGTATACATATATAATGATCA
>CG30421 20263689 20264578|20741 chr2R 20259917 20265329 scaffold_45 593510 599012 - 153187|4015 5064
ATGCGATATTA-TAATCCATATGGATGTATACTTTGGTAAAGAAACCCGAAAATGAAAGCGAAGCCGAAACAAGAATATACA-AAACGCACTATAGCCATAAGCCTAAGGTTTACTTTATATGATATTTCTTAACCGGAG-----------------CTCCCGAGCGATAAGCTCGGGATGAAGATGTTATACAACTTTGTTTAATTTAA--------GATACGTACTCATATATACGATACTTGCAATACTGCATAACGTTTGAAAGTTTGATAAAACTTAAATATATTGTATAAGCA-----TTAGACTATTTA--TTCAAAGCCAATGACGAG----GATTAGTTTTCTTT----ATATTTCACCGAATTGACGAAGATTTTTATAACCTAACGACTACC----------------GATATTTATTTAGCCAAACAATGAAGTACAATTTTATTTGATTGAGTTTTTCGTTCAAACTATAAATCTTCTTGTATAATTCCCT----------AACGATTTTTATG-ATGAAGTGCTTGGCATGCCTAAG------------TTAAGCTTTTTTTACATGAAACCAAGTTTCGGACTAA--AATCTATGAGCATAGTTATAAATGTAAGGACACGTATTCTCTTTAATTACGATTACTTTGAATTGTACATTAATCTATCTGATTGTAACTTTTCCACAACCA-----AAAAATTCTGGCACAACTGCATATGATTCTTTCGATTCGTTGTCGGGCTACGTTTTGTGAATCGTTTATAATGCGGATCTATATACAAACATATATATTTCTTTAAAAATAATGTATTCTATATGTAGACGAAAGCATTACACCAAAACATTATATTGATAAAAAATGTTTGAGGACTCTACCACATTGTTTTCTGG----------------------------------------AGAGAAAGAACTTTATTACGGTGT------AAAATGTT--------------------------CATTGTATTCATAAATAAACGTGAAGTTGTTGAATATGAA
TGACGATATTGTTAATTGATTTGGATACGGACT-------------------------------CACACACACACACACACACAAACGCACTATAGCCATTAGCCTAAAGTTTACTTTATACTAAATATTTCGATCGATGAAGTTATATATATATACATATATATACATAAGCTA-----AAAGATGTTATAC-ACAACGTTTACTTTAACAATTTGCGATTTACAAACATATATAC-ATACTCGTA----TATATAA---TTATATATATACATATACATATACAT-TTATATAAACAGTTAGTTAAGCTAGTTAAGTGCAAAAGTTGTACCGATTTTCGTTTAATTTCATTTTAAGTTAACTTATTGAAGAATCGAGAATTTTCTTGA---AACGATTGACATTGCATTATTTATATAATATTTATTTAGTATAATATGAAAGTACAAGATGATTTGATTTTGATTTCTCTTCATGCAATAA------TTTTATAATTTCTTTGATATATAAAACTAATTTAACGCAGAAAGTGCATGGCATATATAAGAAGAGGAAATACTTTAGTTTTTGTAAC--GAAACCGAGTTTCAAGCTGAGTATTCCATATGCATA-CTGCTAGTGTGTATATGTGTGTATATTTTCATTTCAATTACTACGTCTAGTATTCGCATTTTAATATTTACAAATGGTATATAAACATGAAGAAAAAATCAGGCACAGCTGCATATTTTGCTTT-------TTTTCTTGATATATAT--TAGATCGT--------------------AAGAGTTATACATTT--------GTAATGTATATTGTATGTGTAGGAAAGCATTAAACCAAAACAATATATTGATAACAAATGTTTAAAGACTTTGAAACATTGTTTTTTTGCATCATTTGTACACTTTATTATGTACATCATATATAATATATATGAACGATTCAACTATTGTGTGTTAAGAACATGTTTATTAATTGATGAATTGTGTATTGTACATTGTATTCATGAATAAACGTGAAATTGTTGGATATAAA
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ACACTTCCTGGACAGGATTTTCGAAGGAAATCCTTAGAATAAGACTAAGTTCTAGCCTTTAGAGGAACACAACTTTGAGG--TGAAAGGCTCATTCTAGTAATCCACCCGGGTGCCCCACAGCCCTATACGGATCACGCAGAGTTTGCAGTTCGTGC--------------------ATCTAC-CAGATACAATCTTAACCTAGGCGGTTAGCTCCCTCTTTCGACTGATTAAGCCAAGAGCAGTGCATTTCTACTAATAAATACGTTTCTACCT
GC---TCCTAG---------TTAAACGTAACTCTTAGCATA---------TATAG-----AGCGAGGCACGAGCGTGTGGCATGAAATGCTCATTCTAGTGATCCGAGCG-------------------TGGACTGCGCAGAGTTTGCATTTCTTGCAAGACAAATACATGAATAATATGTATACATATATATATATAAAGTAAGCAATTAGCTATC---CTTGACTGAGTA--CCAAGCGCATTGAATTTCTACTAATAAAT--GTTTCTGC--
>CG3894 20273866 20274350|20746 chr2R 20273183 20274035 scaffold_45 604882 605722 - 28629|698 867
GGCTCTGGACCATGAGCTCTATGAAATAGGGCCCAGTGAGTGTGAATGAGAAATGCGTGTTTGGGGAAGTGTGCATGAGCTTGGGTCGTGATAGTCTGTTTACCCATATATATATTGTATACGCCTGCAGCGCTAGTGAAGGGCCCTTTCATTGACGCCCGACTCCGGAC
GAA-CTGAGAGACAAGGCACACAGTCACAGACACACTTTATGTAATAGAG---TGC-TGTT--------TGTGCATGAGCGTGCGTCGTGATAGCCTGTTTACCCATTTATATATTTTATACGCATCGTAGGCAGCTGAAGTG-CCGTTCATTGACTTTTCATTCCTCAC
>CG3894 20273866 20274350|20747 chr2R 20274181 20274358 scaffold_4 5720320 5720484 - -388|0 171
GTTTGTGTATGTGTGGATCACCAACACCAGCGGAGGTCTCCTGGGCGCCCCGACTTTTAGCGTTTCGGTCCCCAAGGCGATGCCCGTTTCCATTACCGCCTAAGCGTATTGTTGCTATATGTAAGTTAAGTCCACTTAATAAAGGATCGATCAA--AGTCGCTGTAACTGCT
GTATATGTATATGTAAACTTCGAATAAGTGCCTAACTAGTTTGTCCTCAAGCAACTTTA----TTTGTTTCCAAATGTGATA----TTTCGAGTGC-----AAGTTCGTTGT-GCAATATGCATTTTTCACCCAAGTAATCTACAGACAATAAACAAGCCG-TACATCTGTG
>Eap 20289311 20289384|20756 chr2R 20288555 20293649 scaffold_45 622273 627527 - 181349|798 881
ATAGCATAAGTTCTTAC---AATGTAAGCCATTCTATGA-------TTATTTAACAACAATTAAAAGTTAACATTACCGGATAA
GTAATACTTATTAATACGCTAATGTAA-CAACTTAGTAAAAGACTATTATTTAAATATAACTTAAA--------TATTAGAAAA
>CG3589 20293001 20293150|20756 chr2R 20288555 20293649 scaffold_45 622273 627527 - 181349|4690 4859
GGAGACTCGTGCATTGTTCATTGTTAACGAAACTGTAATTAGTGTTTTTATATA-----------ATATGGCCGGTTAGCCAGGCTTTTAAGATTAAACAAGATATTGTAAAAAAAGAAAATATATATATATATATAAATTTATTAATA-------TGGTA--AGAAATT
------------ATTGTTTTT--------AACTTGTAAAATGTGCATATATACATGTGCAAAAAGATATTATTTGTTACAATGTTATTTTTG-----------TATACTTATATTAAGAAAAATATATATATGTATAATTTTTTAAATAAAACTTTTTGTATTTGATATT
>CG3611 20307076 20307162|20772 chr2R 20306660 20307080 scaffold_45 643591 644010 - 4293|428 432
GACAC
AACAC
>CG3611 20307076 20307162|20773 chr2R 20307152 20307395 scaffold_45 646125 646431 - 4630|0 10
GCTGACAATGC
GCTGACAATGC
>Dll 20341618 20342763|20813 chr2R 20341390 20341688 scaffold_45 691755 692032 - 16561|228 298
GTTTCGAGCCCGATATACCGTACCCAGTTGGCTGTAAACGATGAATCAGCCCGTTTACCACCAGCTCCAGC
GTACGCAGCCCAA----------------GGCCGAAACCAACTA--CAGCCAAAATATTGTCGCCGCCTGC
>Dll 20341618 20342763|20814 chr2R 20341738 20342249 scaffold_45 692074 692612 - 3470|0 598
TCCGTTTAACACACAGTGTTTGGCCGGCGGTCTAACAGCATCCGAACCAGCTGCCCTCG------------GCTGCCTGGACGCAGCACCAGCTGAGCCTGGA--------GCAGCAGCACCAACACTCCTGCCAGGAGCTGGGGCACCAACTGCAGCTGGAGCAGCTCGAGCAGCAGCACCAGGCCCAGGCGGAGGCCCAGCACCTCCTCCAGCGGCA---------------------------GGACCTCGCTGGCAGGACCTTCGGG-----GGCGGGGCAGTG-----------CAGCACACGATATCTTAGCCAATAAACAATAAACAACCATGA------------------------TAGCAACCTGTAAAATATCTATGAAATGTCGAGAAAGAAGCGAGCGAGAGCACTGGCAAGTTAGGCGTCAAGTTTTGTACATTTGAAACGTAATATAAATATGTTTACCAACGTAAATAAAGTCGTTCTAAAATGTAGTCTAGCTAAGAAGAAATCGAAAACACACACACACACACACAAACAACACAAAAAGAAAACAAAAAAAAATACTTAAAGCAGAGAACATTCCTCAAT
TTCATTTTCCTTGCAGCGTGTGGCCGGCGGTTTAACAGCACCCGAATCAGCTGCACCCGCCGCCAACCCCCGCCGCC--GCCGCCGCCGCTGCT--GCCTGGCCACAGACTGCGGCAGCGCAG-------TGCTACGAGGCAAGGC----CCTGCGCCG-----AACTGAATCTGCACCACAATGCCCATTCCCATCCCCATCTTCATCATCATCAGCATCAGCATCATCATACACACAATGATGCGGTTTTTGTGGGCGAGGGCGACGGGATTGCGACGGGCCAGTGAATGTGACCCAAAACAAAACAAAACAAAACAAAAAAACACAAAACAAAAACAAAAATATATATACATAAACAAATCTTAGCCAATAATTGATTATTGATTGAGCATTGATTGATGAGTATATAAGAACATTGTAAAATATTAAAT--AATTTTGTATATTTAAATTTTAA----------------AATGTGAAT-GAGTCGTTTTAAAGTA-AGTCTCTCT---AAGAAATAAGAATAACAATTAAAGCTAT---AACAACAAATTAAAATAATAAAAAAAAA--------------AACATTCCTCAAT
>Dll 20341618 20342763|20815 chr2R 20342267 20342633 scaffold_45 692626 693039 - 3611|0 436
AGTATGAAACGTGTCCTTTAATTTTGTTTAATTTAGCAAATTAACTATGTATAAACCTATCTATATGAACGTAACTATA-TGTAGTGAGCAACAACAAAGTATAAATCGTAAAAAGTACATCGTAAATAAATGAAATCAAACAAATGA---------AAATCAGCTGTTGATCTTAGAGTTTCTTTC----------------------GAGTGATTTGTTCTTAAGTAG-------AAGAGTCGAAA--AAAGGCAAAAGAACGAGCAACAGAAATCAGT-AAAATCAGATCTCAAATGCAAAAGGAAAAGTCCTCCTAATTCATAAATGCCCTTTAATTTTTTTGTATTTTATTTTACCTGCACCCAA------------------------AAGAGGAGACCGGTTTCGTTCTTTAT----TGTGCAATATAAT
AGTATAAAACGTGTCCTTCACATTGTTTCTATATATATATATACATATATATATATATACTTTTTTTATGTAAACTATAGCAAATTGCATATTGTATAAATATGAACAATAAAAAAAACAAACAAAAAAAAAAACACAAAAAAAACAATTAAAAAAGAAATCAGCTGTTGATCTTAAGCCCTTTTTTGTAGAGCCCAGCAAACGCAAAGGTATAATTTGTTTTTGTTTAGTTTTTTTAACCGCTAAAAACAAAAACAAACACAAAAAAAAAAAGAATCAGTAAAAATCAGATCTC-------AACGGAATATTTTGCATA----------------TAATTTTTTATAATGAACTCTCAAATGCACTCGAAAACAACAACAACAACAATAAAGCAAAAGCAGAACAAATATTTTTTTCATGTTATGTGCAATATAAT
>Dll 20341618 20342763|20816 chr2R 20342665 20343131 scaffold_45 693280 693694 - 4700|0 113
TTGCTTGAAGTGTACATTTTGTATAGACCGCATGCAGAATCAAATGT-------------GTGCATCAAATGTCAAGGGATCCCATTT--TAACAATCGAATCAAGGCGAATTC
CTGCATAAAATGTAAATTAAATATAAA-----TATATAATTAAAGGCAAACCAACAATAAGTATATAAAGCAGCAACAAAATATATATATTAATACATATATATACATATATAT
>CG30420 20387317 20387894|20868 chr2R 20386753 20387570 scaffold_45 756018 756965 - 28478|618 968
------GGCGACTGGACATTGTTTTCCCTC------------------------------------------------------------TTGGGGCAATTGGTAAAGTTTGACTGATCCA--TTGTCAGCCAACAGA--CACATCCTCTTACAC------------AGATTCAAAAACAGACCAGACTAGGTGCTGGGAGCCATCTACG-CATATTACAGAT---ACTTCAGGGAATTTAATTCCG-GGAGCCAAGCAAACCACACACACGACACTACACACATC------TGTCACTATTCT----TCCTTCCCTATATATGCATAAGTCCGGTAATGTAATGTAATTG
ATTGTTGGAGGTGAAACGTTTTTCTCTCCCCCCCTCCCTTTCTCTCTCTCTCTCTCACACACACACAATCTCACTTGGCTTGCCCAGGTGCTGAGGCAATTGGTAAAGTTGAACTGATCCATTTTGTCAGCCAGCAGATGCACACACACATACACACACACAGACGGAGATACACACGCACACCAACACAGACAGCGACATGTATAGACGATGTATTCCTAATGAAAGTCCATGGAATTAAATTCCGTGGCTGCAGGCACTCGAGTGCAACAAAACGAGTCAACTTGCTTGATGGCACAATTCTCTTATCTTCCCCTTGTTAACTGTAAGTCCTATCATATTATGTAATCG
>CG30420 20387317 20387894|20869 chr2R 20387698 20387915 scaffold_45 757458 757673 - 3001|0 206
CGGCAAGCGTAATCCTGTGTTGCATGGCAGCGTGGGTTATTGTATATCAACTTTTTTTGTCACTGCGAATCGTTGGATTTACGGTCTGGAGAAGCTGAGGAGCTTAGGAGGAGGGACAACCAACCGAAGCAAACTA--ACATATTATA--------TTATTATAAATATATGTATACATACACACATATTTATATATAGATATATA-
CAACAACAACAACTTTTTGGTGTCTG-CAACAAGAATCAATTTATGAAAACTATTTTAAAGTCTGCGCATTG----------AAACAAAAAAAACCCAAAAAC------------AAAACAAATTAAAGCATAATATGACATATTATAATTATTATGTATTATAAACGTGCATACATATATGTATGTATGCATATATATATATATAC
>CG9047 20393571 20394050|20875 chr2R 20392089 20393678 scaffold_34 1260695 1262175 - 37949|1533 1652
ACTTAAGTACGTCCCGCTGCACTTGCTCCTCTCCTCTCTCTTACTCACGCTTTCTGCCTAGGCAGGAT-GGCTGTTACTAACTCTACCAG-----------GATCACTCGATCCCTAAAC
-CCTAGCTGGTACCAATTCCAACAGATCCTCAATGCTGCATTCCACTTGATTAGTGACCAAATCTTATAGACTTTTAGAGATTCT-CCAGCGGCGGCTGCTGCTCACGCGATCCGCAAAC
>CG9047 20393571 20394050|20876 chr2R 20393890 20394541 scaffold_34 1263325 1263922 - 3677|0 162
AGAAGGCGTGGAAAGTCGTGACAGAATGCAAGCCTAACAATTTTATGTTGATCTGTGATAACTGAAAACAAATATGAACGA-CAAACGATAATTTGAAAAACGAAAATGTCACAAAATCATTATCAAGAAAAGGATATGACA-ATTTGTTGAGAATACGAGCG
AGGAGAAGCGGAAAGTCC------AATGC---CTTCATAATTTTATGTTAAACTGTGATA-CTCTACATAACGATAAAAAAATCAAAAACAATTT---AAACACAAATGTCACAAAAACA----AAAAAAAAGAACAAAAAACATTTATCGAAAAAAATCGAA
>CG9083 20406964 20407105|20887 chr2R 20405546 20407055 scaffold_34 1282798 1284528 - 27927|1712 1807
ACGGCAATGTCCGTCGTTGGCCATCTGGTCGTCTAGTCTACTGTTCACGTTTAACTTATATTTGACATG----TTCGCTCATCCATATTCCACACA
GCAGCA--GCCAG--GGTGGCCAT-TGGTCGTCTAGTCTA-TGTTCATGTTCATGGCCCATTCGATATAAGTTATGATTCGCGCACAATCCATGCA
>NaCP60E 20422650 20422717|20893 chr2R 20421227 20424835 scaffold_34 1320402 1323966 - 130126|1433 1500
CATTCTCCGGCGAACTTTCTATCTGATATTTGGGAGTTACTAATCCTATTGTGTCTCTTCACAGGCGC
---------------TATGTATTATAAATATAAAATTCA-TGATCTCAC--TGTTCTTTCACAGTCGC
>CG18506 20425745 20427880|20894 chr2R 20424836 20426768 scaffold_34 1324571 1326706 - 45228|975 2259
CCTCCGGTCAACA------------CTCCTCTGCGGGATTCGGAGAAACGCTC---------------CAGCCGTGGCAGCCGCAGTAGTAGCAGCAGCACCAGCAGCATCAGGAGCTGCTCGTCCTCATCATCGTCGTCGGCGGCATCGGCAGCCGCACCCTCGGCGCGGCGTACAAGCTGACAACCTTCGGTCTGAGTGCGTATTCCTTGCCGATTCCTGAGTGCATTTGTGTCAGAACTCGTAGTTTCTTAGGCTTAGGCATGGGGC------CCGCCTCTTTGTTATCATAGTCG----ATAACCTATATAGTTATATATTAATCGCTTTATACGATATACATATATACACAT--------------ATACAGATACGAAGCTATTCAA----------ATTTATACATGCA-----ATATCAGTTTAAG--------------------------------------------------------------------GACGAAATCAATATTAA--CTATGTTAACAAGAACGTGCATTAAAC---------------CGTTGTAGTACTCGAATCTAATCAAAAATCCGAATGAGTCGGAATCGCCATCATCATGGTTAATGTCACAATCAGAATTGAGGAAGAGCAAATTTGTCGGTAGTTTACTGCCCGATTTAGT--TGTAGTCAGAATGCCTGACCCACAAGTGAG------GCAATGAAGGCAAGGCA-------CGGCCTTCTATTCTCCTGCCGTGGGCCAACTTTCTGCCACATTTTCGAAGGTTGTTTTTGAACT-------------------ATACAATACGTAGAGGTTTGCATCACATGCATACAT-----TACATG-----TGTAACTAACTATCGCGGT-TAGATCTAGGC------TCATAACTGTAGTGTTTGTTTC-----------GTAATTATCGACTTGCATATACGGAAGGTATATGTGAATAGTATCTAAATACATTTTGTACATATGCCAAAGGAAGTATTTTAAATTAATGAGCTAATACTATAGTTACA-GACTAT----------------------------------------------GACGTTAGTTAGATACAATTTATTGAAGTAATTATAAAGGTTTTTCGTTACGATAGCGCAAAGATTGCCGATTACAAATGCGATTACGATA-GCGAATATTATCCATTACCGATTGTTCGAAGTACAAAAGCGAAGTATTAGTAGATTTGATTATTATTATATTGTATTGT
CCTTCAGTTAACATGGAAGCGCAGCTGCCACAGCCGGAACAGAAGCAGCACACAGGTAGGATAAGCAGCAGCAGTAGCAGCAGCGAGACGAGCAGCTGCACCAGCAGCGCCAGCAGCAGCACCTCAACAGCTAGCCAGTCAACTG-----------GTGCCGTCGG-GCAGCGTCCAAGTTGACAATCTCCAGTCTGAGAGCACATTCAAT------------GTGCGTATGGGCGAGTATTTTTAATTGCTTAGAGCTAGGCACGGGGCGAACGTTTGCCCCTTTGTTATTCTAGTCGATTAATAATTTATATATATATATATATATATATATATAT-ATATATATATATATACATAGTCGCTTTATACGATACTTAAACAGAACTATCCAATGTTTATATCATTCATATATATATATATATATATGTATAAGTCTTGGCAACAGTGCGCTGTGCGTCCAGCCAAGTGTAGCCTAGTCCTAGTCCTAGTCCTAGATTAGTTTACGAAATCAATATAAACTCTGTGTTAACAA-AACGTGCATTAACCCGTACAGTGCGTACACGTTGTAATACTCAAATCAAATCAAAA--CCAAACAAATTAAAA-------CACTAACATTAATGGTAAAAT---------GTAACATTAACATTAACATTAACTTGATATATGATATAGTTATGTATAAATAGGTACTAACTAATTGGTTGGTTTTTCGTTATGTCAGTCTGTCAGTCAGTCAGTCAATCAATCAGTCAGCCAAGTGACCGATTTCGAAGATATTTT-AAAGGTTGTTTTTTAATTGATTATACAATACAATACAATACAATACAATACAATACGATACATACGTAGATATATACCTACATACATATTGTAACTAACAATCGCGTCGTAGACTTAGGCCTTTATTCGTAAAGATAGATTTTGTTTTTCTTCAATGCAATAAATACATATATATATATATAT-ATATATATATTAATA-TATATATGTAC---TTGTACATATGCCAAAGGAAGTATTTTAA-------AGCTAATTATATACATACATAACTATTCATAGCAAACATGCGAATTAAAAGAACAAGCATACGTTATTTATAAATATTAGTTAGCGACAATTGAATGAAATATTTACGACAGGTTTTCCCTATTTTCCAAACTCTCTTTCCG--------TTCGATTAGATTATATATATAATAGCCA-TACCGAGTGTAT-AAGTACAAAAAAAA--------------TGAGAAGTATTATACGGTAGTTT
>CG18506 20425745 20427880|20895 chr2R 20426942 20428921 scaffold_34 1326849 1329050 - 11300|0 1172
AATAACTAAGCCAAAAACAATGTCAAGTGATTTTGTACTCAACGCACTTACATATTTATATCAATCCTAATCCCAGTCGGGATTAACACA----CTACACTGCACT-CTTATCGA-GACCCAAATTAATCCGTAA-TCAATCAGCAGTCC-ACATAA--------------GTACCAGTCAGAA---GAAGTTTACGAAGATGAA--GTTTTTAAGTTTATTTTCGATAAG-------TACAGTCGA---AAATAGCAAATCAAAAGCAGGACGTAACAATTTTGGTCTCCTATACAATGAACAACCAACAAGCTTCCACATGAAC--------------TCTATTTTAGCAAAATAATTTACAATTTACACTCACTTTATTGTACGACTAAGAATGGTTAGGACG-GGCCAAGTTTCCAAGAAACTCGCCTTGTTTTGTTACTTTTTAAGTGTTGTTCTCTCTTTTAAGTCTCCATTGTGATCGCATTAAGTTAAAACATCGAACAGGAAAAAAGTTAAGAAGTGAATAACGTACACTCCGAGTGGGAAAATATTAACAAATCCCGAATAACTTATGCACCCCCGCGCCATTCAGGGCACTTTGCTACTCTAACTCTACTTTCATAACTTAACAACAGACAATCAGACAGCGATTGATAGTAAGTTGAAATTCTATGGTACCAACTAAAACGTTTTTTCCAGAAACAAA---------CAACCAAATGA---------ACACACAACAACTT----AATTGTGATTTTAACTGCAATTTTTACACAGA-AAATACAAAAAATAAGGTCAT---AATTTTAATTAGAATTGTTAACAA-------------GGAAACAAAACCA--------------------------AAAACAGACAGAAACCAAACACTCGTCAATTAAGTGATATTTAATATTGGTACGTACTCGT-------ATTCG--------ATTGTACATA----------------------------------------------------------------------------AACGAAAAACGATTATGATAATGGTA-------------------ACGAAATAGCA---ATAGAACCTGATTCCAACCACAAAA----AAACTAAAAGCTCAAAAAAAAAGAGAAA
AATAGCTACGGCCCA------GTCGGGTATTT-------------GCTTAAACATTTAT-TCACTCATTAACCCACACTACCATAACATAATCTTTATTCCGTAATACCTATAAACGTACCAAACTTACAGGCAATTTGAGCCGCAGTCCTACCTAAGCCATGTGCATTGTGTACCAGTGAGAACTTTTATTGTACGGAAACTAAACGCTATATCGTGTACTTACCAAATGTTTTTTATTTAGTCTAACTAATTGTGAAATCAAAA--------TTGCATAAATGCTCTTCTATACAAGCTTCCACAAAACATTGATGATATATACATACAATATATACATTAATTATTACTAACTATATTTAAATATATACTTATATTTGTATTCTATT-----TTATTGGGCCTCGGCCAAGTTTCGAAGAAACT-------TTCTGTGAGATCAAATGGATTGTGTTTACTTAGCTGCATGCAATCATAT---ATTAAGTTTTAACATCGAACAGTA---------------------------------------------TAACTATCCCCTCTTAACACA--------------------GACACTTCTATACTCTAA-------TCTCTAACTTAACAACAGACAATCAGACGGCGATTGATGAAAAATTGAAAT--TATGGTACCAACTAAATCGTTTTCTCCAAGAACAAAAACAAAGACAAACAAAATAATTAACAAATACAAACAAAGACGTACACACTTGTGATTTTAACTGCAATTTTTACACAAACAAATGAAAAACCTAAGATCATATAACTTTTAATTAGAATTGTTAACAAATTTGCTAAAAATGAATATGAAATGAATAATAATTGTAATATTTAATTGAATACAACAGACAGAAACCAAACACTCGTCAATTAAGTGATATTTATAATTGGTACATAGGCATAAAAACCATTTGCAAGAATTATTATACATGCATACCCATATATATATATATATATATATATATATATATACATAAATATATATATATATATATATGTGTGTATTGTACCATAAAGTAGTTTTTACAATAGAACTCATATTTCGATTTGTACATAAAACAGAAATTATAGCAATAGAAACCAGCAACAACAGTTGAAACCGAAAA---AAAAAAACAAAAAAA
>CG3760 20447129 20447372|20912 chr2R 20446628 20448417 scaffold_4 3400478 3402540 + 43090|560 950
GTCA-GCCCA----------CGCCAACGGTGCTGTTGCTGGCCACTTGAACCG---------------------------CTATCTACCACAGTGTCC-GCTGCC---------------------------------------------------------------GAGCTCAAGCCATCCAAAGGT--------------TCTATGCCAGCACATGCAGAT----------------TTTCTAGGCTTTTTGATTCATATAAACCACCACTGCTACTCTTACCCTAAACCACAAACTACTATTGTTCATTTCGTTTTGCATTTTGAAAAATGGA-TTAATGTAATA--------------CAATACGAATAATACCCATGCGTTGAAA
GCCACGCCCATTGTTGTTGCCGCCACCGATGCCGATGCCGACGCCACAAACAAACAAAAGAACAATTTACCGTATTCATCTTATGTGCTACACTATACAGTTGCCACACACTGCAGCAAGGCGCCAGTTCGGGTCGCCAGCTAAAATGCGCGTGCGGGACCTGGATGTGAGATTCAGCTATACCAATTTATAACGAGTTCTTTTCTCTGTATGCATATATACATAATTATTGTAAACACTTTTCTAGGCTTTTCGATTTTTA------------------CCCATACTACCCCGGAAACAAATATTGTTCATTTCGTTTGCATTTTTGAATTATGGAATCAATGTAATAGAGAGAGAGAGAGAAAGTATGAATAATAGCCATGCGTTGAAA
>CG3770 20454126 20454236|20918 chr2R 20453354 20457056 scaffold_4 3407955 3412063 + 99331|820 939
CTGCCTTTGAATACAATAAGAACACTATCTGACTTGGAGCGAGCATACTTAACTTCATTCTCGAATTAAATTTAT---CATTAGCATAAATAAACTTTTAACATT-CTACAG-----TAT
GAATCTCTATAGCTAACAAAA-------------TTGGGCGTTTTCAACTTAATTTAATTTCGAATTTAATTTGTTAACATTAGCATAAATAAACAACTAAAATTTCTACAAACAGCTGC
>l(2)k03704 20478347 20478460|20937 chr2R 20476032 20478908 scaffold_4 3435271 3438171 + 99181|2463 2631
CATCGGCCC------------------------------------ATGGCTACCATCATCCGCGCTGTTCGCCGA--CTCATAGCATATA--------TTGGCGTAAGCCACCGCCTTCG--------TTGGAATAAAAGTTTCGTTTTCCGCA-TTTAGGTATAAAAA
CAACAAGTCCAAACTTGCGCTTCACATATATAACCAGAAAAACAAATGGCCCCCCCCCTCAACTATTTAGACCCAATTTCATATGATAAACGCAGCAGTTTGCCTAGA----CATTTTTGGATACATTTTGGAATAAAATTTGCATTGCAAGTGTTTTAGGTATGAAAA
>CG3829 20497896 20498086|20954 chr2R 20496273 20498085 scaffold_4 3472005 3473900 + 65061|1657 1920
AAGTGCCACTAGTTGTTTA-----------GTTAAGGGCGG---------------------GTATGGGG----------------------------------AAAATTCAAACTTAAATGAGATTTTCGAATTTGTCTGCATTAATTATAGAATAGTTTGTAAAC-----ATATAGTCGCCAGTTACCTTTAGTCTTTAGTCATCTGATGTATGTAAATATATGTAGAATCGTTTAATAAACTGTTCAT---TACCTATAAC
TAGTGCCATTAGCAATTAATTGGGTTGGGTTTTGTGGGCGGGCCAGCACAAAAGGGGTTTTTGTGCGGGGAAATAGCCTTGCACTTGCTTGTGTGCCTTAAAAAAAAAAGCAAACATTAA-GAGATTTTCGAATTTGTCACGACTTAGGATACGATA--TTATTAGCCTAGAACAAAGCTGTAGTTAACAAATTGTATATATGTATCATATGTATAAAGAGAT-CAAACAAATGTTCAATAAATAGTTAGTGTATAACAATAAC
>uzip 20536954 20537686|21006 chr2R 20535354 20537819 scaffold_1 4991971 4994720 - 68185|1662 2658
ATGAAATT----------GAGCTGTGG---------------ACTCAGTATAGAGTTTAATTGTTGTTGTTGTACCTGTTGTACCCGTCTTTGAGAGCGT----------CAGAGAAACGTA-------------ATAAGCAGATAGACATTGTATGAATA-------------------TATAAACTCCAAGAACCGG--------------GAGCG------AAAAGCGAAAAGCGAAAAGCAAAAGTCGATATTTTTTATACTTGTCCCAAG------GCTTCTTCTTTAA----CACGCATGCA---------------------------------AGCGAAAGCGAATTTAAATGATCATTAAAATAAACGTAATACATTCCTAAACAGAACCTCTTACAATCGGAAATAAATCAAAAGTAT-------------AATTAAAAATAAATTTATTCATATTTTTATGT---------------AGAAATATTTTACAAGTTTT---TTTTATTTGCAAGGATTTAAAT-----------GGCTTTTCATTTTTG-TAGTTAGTAAGC---AGCATTAACAGCAAGTAGAAAAAATATTAA-------ACTTGAATTGACATTTGCT-TAGGGATGGTATTATAGATCACGCTCTCTAAAATGATGTATGTATAGTATACCTGTATGTCAAATATGT-AAACCTATGTATAACATAAGTACGAGTATGTATGCTATTTTTTAGGCCAAACACTCAAAATATGTAAAATAG---------ATATTTTTATTTGAGCCCTTT------------------------GATTTAAAGTATGATTTGCGTTTATTTAAGGCTAATCTCTATCATAAT-----------TAATTTGATTTTAA-------TTAAAACTTCATTAAAGAAACAAT---------------------------GAATATATATAAATAA-AAGGCTTGTAAATGAAAATCG
ATGGGTTGGCCAGGGCCAGGTCTGTGGCAGAAGGGTCTACCCAATTAGCATAGCGTTTAATTGTTGTTGTTGTACCTGTTGTACCCGTCTTTGAGAGCGTGTCGCGAGCGTAGAGAGACAGACACACAAAAGTGGAAAGATAGACAGACATAATATTTATAGAACGCCCAAAAAAATATTTAAAAAAATCAAAAACCGGTTAGCTTTCTGTGTGGGTGTTCATTGGATGTTAGAGGCGAA---CAAAAGTTGATATTTTTTATACTTGTCCCCCAATGCCTGCTTCTTCTTCTATCTCTACATATATATATATATATGTATATATATATATATACCGTAGTAGCAAAAA-GAAATTGAATTTTAA--GAGACAAACATAAAACATTCCTAAAC-TAGCCCCTCACAAAAGGAAATGAATCAAAAGTACATATATATACACAAATACAATATATATATATATATATGTATATGTTTATATAGTCCGATAAACAATATTGAGCATATTTTAAAGCTGCTTTGCATAGTTTCTTATCCTCATTTTCCGGCTTTTTATATTAGTTTGTTAAGGCGCTAAAGCATTCACAATAAGCTGTAGGAAAAGTAAATGAATTATTTGATCGGTCGTTTGATAGAGGGTTGATATAATA---TACGCTCTATGATATGATGTA---------------TATGTCTAAAATGTAAAATCTATGTAAAACATAAGTATATGTATATGTA----TGTTTAAGTGAAACACTCCAAATATGTAAATTAGTTACTAATTATTTTCTTTTATGTGCCCGCGTCCCCCCCTCCTCTACCCAACCAAAACTTCGGCTATATTTTGCTCGTATACACTTCTTAG-TTTAACATACTCATATGTCTTGTATTTTGTTTTCGAAACTGTGTTGAAATTCCAAAAAGCAAAGAATCTCGTAAAGCTCTAATTTCGTTTAAAGTAAAGCAAACAAAAAATAAAGCTTGTACATTGAAATTG
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GCAGTGTTTCATACCTAACCAACCGATGATCAATTGGAGTGGTGCTGGCGTACGCGGTCGTCTGTCCAATTACTATGTGGATCCC---------------------GAGTCCTCATTAGCGCGCTTGCCGAGCCTGTCAAGTAACTCGCTGCCATCAGGACGCCCTCCGCGCCCGCTCCTGCGCTCAGGGGCTCCAGTCTATCCGCCCTTCCACACCTGGGGCACTCCGCCGCGTATCACAGCACTGCATCGACGAGAATTTCGACGCAACT---------CGCAAAATTACGAATACTAA---------------------ATATC--GACAATATACTCT------------------------TTATGCAAATAACGCGATACAGATTTCCT--TAGTACAGAAGTCGGAAAATATACCTATACAGTGT-----ATGTATTTAGTGTAAATCCCCCAAATGTAATGTCACACACTACACCTGCGAACCTTGCGACTACTAAG
ACGTTGTTTCCTACCCAATCGACCGATGATGAACTGGAGCGGAGCTGGCATACGCGGTAGTCTGTCCAAAATCTATGCGGATCCCATCGAGGCGGCCAGGTCATCGGCGGCAACAGCGGCGCGCATGCGCAGCATTTCCACCAATTCGCTGCCGAGCGGA-------CCAGCCAAATCCAATAACCGA-----CCCATCTATCCCCCCTTTCACTCCTGGGGCACTCCGCCGCGTATTACAGCACTGCATCGAGGCGTCTATCGACGCAACGGTGAGTCCATGGACAATTACGAATACTAAAATATACAAATATAAATATATATATCGTGACAATATAATCTAAAATACAGTAACTAAAACAGTAACAATAACAATATCGT-ATACAGACTTTATGATAATTGAGAAGATATTTAATACAGTTATACAGTATTTTCGATGTAGTAGTTCTTAACACC-----------GTCACACAC-ACACCTGCAGCACACGAAGCTACGCAG
>Nplp1 20546707 20547597|21017 chr2R 20547154 20547990 scaffold_1 5018028 5019090 - 5407|0 607
GGATCTGTATGGCTATTGCTATAACTAT-----------------------------CAAATATATTTATG--AAACTGAAGTAACTGATATCAGTGCAAAGCATAAACACGATATATATCAAAGC-AAATCATATC----CTCTGTATAATTTA--------AATTCTTAAAAGAAGTTTTAAAA--------------TAGTGCTAGTGTGGTACCTT-GCAAGAA--CTTGAACTTCA-----------------TAAAATA-------TCTTTATCCTTTATTGCTAACTTACTGATAACAGTTTAGATTGTTTTCCCTGGCGTCTTTTATGTG--------------TAAATGACAATAACTGTTTCCACTAGGTAAAAGCTAAAAGTTGCCATCAACGAT-----CACTGATATATGAAAGCGTT-----------------------------------------------AACAA-----ACTGCGTCAAAGACAATAAAACTAAAGAAAATCTCGATTTATATATATACTTATAAATATATTATACTTTAAT--------GTATTCAAGACAATAAAAAAATATTGACAATAAAATATT
GTATCTGTATATCAATATATACATATGTATGTACGTATGTAAACAATATCGAATAAACAAATCTATCTATGTATAAATGAGGTAACTGATGCCAGTGCAAAGCAAAGGAACGTTTAATATCAAAACTAAACCATATCGAATTCTCGTTTAACTCAACACAAACAAAAATAAAAGGAAGTGAAAAAAAAACAATAACAAATTAGTGCCAATGCCGTACCTTAGCAGGAAGTATTGAATTTCAAGGCCAGGACTCTGATCCCAACTAATCCTAGTTTTTGCCAGTTACTTCGAACTCCCT----ACAGATTGTATTAACTTCTTCTAATACCTCTATGTGTATAACTAGTAATATAAATATAATTAATCAAAGCCCCCAGTTCTAGCCTAAGTTATGGCATCAATCATATATATACATATATATATATCCATTTATGTATATGTATATATATATCATGATTTAAGTATTCGTATACACCGAAGAATGTTTACTGCGTCAAAGACAATAA---TTAAGAAACT-----TTGGTAAGAATACTGCAAAACAGACAATAAATGAATTGACAATAAAACTCGAAATCAAAAAAAAATATATATATTGAAATATT
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TTTTG
ATCCG
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GTCCATTA--CCG
GTCCATTAAATAA
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CACCATTAAAGGAGCAAACTCGCTCTCTGTGGGAAATGGATGAATTTGTATATATGGTTCAGAGTGCCGGCGATCATCAGATGAGGCTGGCTAAGAGTT-----TACGGTACAGGAATTTATGTCAAGTACAAGTAGCTTGCAAAACAAAACAAACAACAAAAAAAAGAAAAAAACAAAAAACAACCAAACTATGAAAAATTAAATTAATTTTTAGTCATTTAGCAAATAACAAATGCAGATTGCACATAAATCAAAAAGCTCCAAAAAATTGTACAAAAAACACGTTAAGCTAAGACAAATTTTAGGCGATAAGAAAACACTCTCACCCAAAAACAAAACGTAACCCAGCTAATGTTGTGCCATTCTCAAAGCCTAGTTTTAGTTATATTTAGTTTAAATATTATCCTCGGTTGTTGTCCAGTAATTGTATATAGCCAGCGTTTGCAGCTGCCAATTGTAAATTATACAGCGCTCT---------CTCTCCCAAAAACAAAAAAAAAAAAACCTTTTAAAAAACCAAACAAAAACAAATCAAAAAACACATTTTAGTTATTGTTTAGTCTAATTTGTACGCATCTTTTGATT--ATTCTCAAAGAAAAC---GCCAATCAACACAAAAATCAAAACTAACTTTAAGTTATTAACAAGAAGAAAGAGTATATAAGAATAATAATAAATTCTTTATATGTAATGCCAATTGTTTTGTTTGCCATAAATTATAAATTTAATTATTTTATTTAAACTAGCCAGTACGTTTTATTGCATGAATCTCGTTTTATTGAAAGCATTTATTATCATATATGTCAACATGATTCTTACTTTTAGTCATTT-TTTTTAGTCTGCTATTTAAATTGTATTTAATGAAGCCCCGCCAACTGCTGCCGCGTGCTGTGGGGGGCATGTTGCGAAAATAAAA
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A
A
>CG30428 20762078 20762448|21279 chr2R 20762079 20762806 scaffold_18 307245 308096 - -1917|0 428
GCCAATATAAAAACTCCACATTATGGATTACA-----ATTAATCATAAATATCCTATATT-----TCAATCCTGTATTTCCTTATCAGCTTTAA--CAATATAAGTAATAACCAAA-------ACGAGAGTTCCCCAACGATCAAATACCTGTTACTCAGCTAGTG-------------------CGAATGGGAACGC-----------------GAAATTTCGTAACTTTTCTGCGATATCGTAGATGTTGGGGAATAAAATTAAAAAATTAACAATTGTTCAAAAGTGTGGGCGTGACCGGTTTGATCGTTGTGTAGGT---AAGAGGAGGGGCGTGGCCACAGAGTTTTTGGAATACAGATAC-AAATTGGCAACAGAAGTTGTTTTAGAAATTTCTTTAAAAAAAAATACGGGAATATTTTGTTT
AACAATAT---ATCTGCAATACATGAATCACGCAGACATGTTTTAGTAAGTTGTTGTACTTGGCCTCAAATGAGAGTGTTTGTATCTGTGTTAATGCATCATAAGCTAAAGTAAAGCCAAGTTATGGGGACTGCCCAAATATTATATGCCCTGAACTCAGTTGGCGTTCTAGCTTCTACCACAAATAAACAGGAACGCATGCCGCAAACTGCCAAGTAAATTCCTGACTCTTT-------TTGTAAACATTAGGACTTAATATGGTGAAAATAATGTCTGTGCA------------------TTTCGAATCTTTTGCGAATCCAAAATAAAATGAAAAGGACGCAAAATCTTTGACTTTAAAATACTTTATCAAAACCTGAAGATGTTTCGAA-------TTCGAAGAAACGATCCAAGTGCTCAGATT
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AGGATAATGTTTAAAGACACAATTTAAAAATATCAGACTTTCACTTACATTTAATTAATGATTAAGCAATTTCACCAAAATATATATGTACAGCACGTAAGCATCGTTATAAGCTTGCAATACTTTTACACCGAAAAGAACAGAGAACCGAACGCACACACT--TTCAATTCAAATAATTCCTAAAAGAACCGCAAGCAAAGAACAGCAAAAA--AAGATCAACGAAATAACAGGCATTAATCGC
ATGAAATTATATAATAGCGATATTTTAAATGTCAAGCATTCCACTGCCAAACAACATTTGTTCAATCA-TTTTATCCTGATAAAAGTGTGCAATACTTAAATGAAATTTTAAAATAGAATTTATTGTAGAA-GAAACAAGGAAATAAATAAATAATCAAACTGCTTAAATTAAAATAATAAATAAGAAACCATTTCGGTATGAGTTAAAATAATAAAAATAAAAAATTTATTCGGCTTCAATCAC
>CG30428 20764019 20764924|21282 chr2R 20764459 20765032 scaffold_6 345641 346315 - -564|0 575
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TCTACGGCAACTGAACTCAATAAAATATCAACTTATTTCTT-TAAATTAAATTCAGCTACACTCAAAAACAAAAGATTTGTATTTTTTTTTCATTTGAGTGTAGCGCAATTAATATACAAATATATACAAATGCAGCTGATGGA-ATTATGCAAAGCCAAAAAA-CAAACAACCAAATTTTAAACATGAATAAAATTATTTTTTTTTCAGTAAAAGAAAACAAAGCAAGAAAAACAAGCTGAAATATAACTATGCAATAATTCCAAAAAATATTGTCAAAACAATTTATTTTTAATACTTTCGAAAATCTTGAAAATTCCAATAAATTTCTAAACTCATTGCAGCTGC-TGCTCGTTAAGCTGAGATAAATATAG-------TATTTATTTAAATGTATATGTACTTAAAGTAGTTCGTAGTTTTAGCCGTGTAACAGTATTAGTTAATTTAATTAGGCTTA--GATTAGTGCAAAAATGTCGCTTGTGTTTCAAAATTTAA---------CTCAAATTTTTTTGTTTGTTTGTCTAAATGT--TCCTAA------CTGCAAAAAAATATATT---
>TpnC41C 573679 573816|264 chr2R 573609 574422 scaffold_11 2042558 2043447 + 28825|74 247
-ACAATATCAAAAGAGTACATCGAAATAAGT-------------------ATTTTAA--------TTTAAACAATGCAATCAAAA------TTGAATGACATGAGAAAAAATTATATTATATT---ATTTTGTCTAAAGTAAATAAGTAAATTGATCGTATGAAAACGTAAAAT
TATAATATTATATTGGTAAACTAAAAGAAATAGAAAGAATAGTAGACGGAATTTCAAAAATATTCTTGGAGTAATACACTTGAACGCCATTTCGAATTATCTGTTAATGTATT-TAATATATTTTGATTTTGGTGACCGTGATGCATCAAGTT--TAATACTCAATCATTAAAA
>CG2944 624598 625050|281 chr2R 624283 625404 scaffold_18 2732751 2733887 + 9611|359 848
TAGTTTT--GTTAAGTAGATGGAGG--AGCAATTTCAATTTTTGCTGCATGTGATGAAAGCAGCAAATACTAATTGTGTTAGATTATAATAGTA-TTAGATCAATGTT--TGTCTGTCCTCCAACAGGAAAATCATAGGTATACAA-TTCGTAATAATACTTTACTTAAGCTATAAAGATTG-ATTGTATATTAAGAAGC-------ATTCAAATAATAGTATGTACACGGAATGACATCTCATCTTGCAA---TAAATT---GGAGAATCGAGTTTCTTCATGTAACATTATTTAAAAACTATACTCACTTCGTGTTATATA-AAAAGCATATTTGTATAAATATTAAAACTTAAAAAG----------CGCAGTTTTAATTAAATGTATGTATGTATAAATAATTCTAACAATATTTAACATGAAAAGCTCTGAAAGTA----ATTGGTTTACTTTTTATAAATATATTTCGGGAGAAAAACTTGAAA
TATTTTTAAATCGGGATTATGTAAGTTATCATTTTGCATCTCTGCTGCATGTGATGGGGGAAGTTAAGGTAAATAGTTTTAGTTCGTAATAGTCTTTAAATCAATGTTAGTTTTTGTCGTCAAGGAATAATATAA-AAGTATATAATTTTTTAACTATACTTGATATTCGTTTTCCTATTTGTGTTGTAAATTAAGTCGTCGGTATGATTAACACAATATTTAATATAATCACAAACAAATCATTTGCTAAATCTAAATCATGGAAGAAATGTATTTCT--------CTTTAATTGA---------------CATATTATATATAAATATAAATAAATATAAAAATTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACGTCGCAAACCTCGTGGTATATTCAAAAACATAAAACTGTACCATAATATTAGCTATAACATCCATTTTAAATATGTTCTTAGTTTAGCATTT-----CATTTTTAATGACACCGTGTTCAGA
>Nipped-A 685389 685437|313 chr2R 685302 686059 scaffold_11 1621588 1622343 - 28306|88 143
TATTGCAA----ATGTTACTCTAAAAACCAAATAAAA--TGATATTTTG-TATTGC
CATTTCAAAAAGATTGTATTTATAAATTTAATTTAAGTTTAAAATATTGATATTG-
>CG10465 847090 847175|405 chr2R 846778 847169 scaffold_39 232184 232613 - -1115|374 455
AAACT--CTATTACATATGATTGACATTGTTTTTTATAAACGATTAAAAAAAATATATATATGTTTTCTTTTCTTAATAAAA
AAAGTAACCAATACGCAATATTGCATCTGTTAGAGATATATCATTCATTAGG----------GATGTCTTTATTTAATAAAT
>CG10465 847090 847175|406 chr2R 847170 848132 scaffold_11 1861629 1862606 - 49296|0 5
TTTACA
CTTATA
>CG10417 867714 867975|422 chr2R 867472 868008 scaffold_11 1863542 1864010 - 777|251 519
TTTACTTGACATTCGGAAGTGCACTCATCTTAATTCACATTTAATCGTAACATGCATTTTAATTGTAGACATTTAAGCTTGTAGATCGAAGTGCGAAAAACTGTGCCACTTTTCAAAATGATATTGATGACAGGTTTATGCA-AACAAATATTCTTTAATAAGAACATATATTAACTATATTTTAAGAAATATTTATATTTCTTTCTCGTAAATTGCTAAA----TAAAGTCGCAATGAAATAAA--TCTTTTATTTATAGAGCAAAAA
ATTCTATTA---TTGGGCCTACACCACT----------ATTTAA--------------------------ATGCGGGCTCTTAGAGCAAAGAAAAAGAAA-----ACAATTTCCAAA---TTATTTAATGCAAGTGTATACATAACGAATATTCATTTGTACACATATATTTTACCTA----TTCATAAATATAT-TCTTTTTATTTTGTTCTTTTCTAAAAACGTAAAATC---ATTAGCTCACGTTCAATTATCAATTCAATCAAAT
>CG30440 975702 975720|475 chr2R 975461 975733 scaffold_55 12782 13018 + 1473|246 267
AACTT---TAAAGTATCAACTT
ATCCTGGTTAAAATTGTGGCTT
>TpnC4 1010824 1011031|508 chr2R 1010440 1010979 scaffold_61 157607 158136 - 1650|433 588
ATGCAAAATCAAAAATACATAAAACAATAATAGCCATTAGTTTTGTGTCAAATATTATAAATAAAATTTGATTGAAATGTATTAGCATCATTTTTCTCTTATCTAATTTAAATATAAACAAATATCGGGCCAAAAGCAGATAAGGCCGATGTACGA
ATGCAAAGCAACAATAATAATAAATAAT--TTGACCTTAGTTATGCACAAATCATCTTAAGCTGAAATGGTTTAACATGTATCGGCATCATTTT---------TAATTTAAATACAG-------------TAAAAAAAACTAAATGCGATTAATAA
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TCAAGATG----------TTATGAAGTTTAAT--ACTTGAAATATGTTAATTTACTACATCAACATTCTA---------------------------------------ATTAATCTTTATGTACGGTTAAATCAATA-AATTATCCAATTGTTGCTTGT
TAAATGTGATAATAATCTTTACGGAATCCGATTCCCTCCCAATATGT-------ATACATCAATATACTATCACTGTGAGGACATGGGTTAAGCACATAGCGCCAATTAATTAATCTATA-ATATATTTCAATTATTACAATTTCTTCATTAGTCTTTAT
>CG17510 1110974 1111127|545 chr2R 1111122 1111290 scaffold_7 2864883 2865062 + 1429|0 5
TAACGT
AAATAT
>CG17510 1111201 1111283|545 chr2R 1111122 1111290 scaffold_7 2864883 2865062 + 1429|79 177
TATTTTATACCAA-----CACGTTTTTAACCGACAATGTTCTTTTAAAAACAAG-----CAGTTGAAAAT-----TAAATATTTA-TGATTTAAATTAA
GAGCTTAAACTAAGCATGAACTTTTCTCCTAGAGAAAAGTCAGCGAACGACAAATGTACCAATTAAAAAAATATATAAATATTTAATAAATGAGAAAAC
>CG11665 1149043 1149398|578 chr2R 1148995 1151466 scaffold_7 2871406 2873902 + 94152|48 491
ATGGTCAAACAACTCTCGTACCAAACCACGTACAATAACAATTAGATTTAAGGCTTAAAACGGCGTACAAACAGTGATGAAGA---------TAGCAGCCAGGAC-TAAAAGAC--------------------------------------------------------------------------CATTAACATTTTTTGTAACCTTTGATTCGTTTCTTCCAGCTGATTTATTGTATTACTGCTTAGTCGTAATTAGTACGTTGT-TAATTACTACAATTATTGTTTGTTTAATACCAGTACTATAATATTCTAGACCGTATAAAAAATTAAAATGAAT--GCAGTGAAAAGTCGTAAAAAATAACGTTTTATAAATATTTTTTCAATAAATACG-TAAAAACAATAAAAAATATGAGATACAATAAAAAATACAGGAAA
GCCGGC------------TTTCACACCACGTACAATTACAATTAGTTGTTAGGCTTTAAAT-GCGTACAAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGTAGTAGCAAATAGAAAGTAAAAGAATTGCAGTAGGATGGGGGAATCTATCAGAGGAGTTGATGGAGTGAACGGATTATATGTTGGAGGACGTCAAATGGCATTGGAAATTTTGGAAATTGTTAATTTGTTTCTTCCATTAGCTTTTTTGTCTAACTGTTAAGTCTTAATTATTACATTGTATAATTATTACAATTATTGTTTACTTAAAATCAAT----TCATAGCCTA-AGCAAATAACAAATGAAAATTGTCTAGCAATGAAAA--CTTAAGAAATGA--------AAATATTTTTTCTATAAATATGCTAAAGAAAAAAAAAACTCAAAAAAATCAGTAAAACCAACTGAAA
>l(2)NC136 1164306 1164598|590 chr2R 1163494 1164736 scaffold_14 2471122 2472546 - 5457|883 1369
AAA------TGTTGCGATGTTTGT-----TGCTTCGTCTGTCTAAAAGAAAACCAATCCATTAAAATAATAAAATAAATCAAT-----CCAATTTTCATAAAAAAT---------------------------------------------CACACAATCATAACACAAAT----------------CAAAATCG---------------------------AAAAGCGCGAGAAAGATC----AACTAATGGAA-----ATTTAAAAGAAAAAGCAAAAC----AGCCGTAACCATAAGTTAAAAGTAA------AATGAAGT---------ATATTTATTAGG--AATGCATG-------------TTTTTTA-------GCTTTA-----------CTCCTTTCGTTAATTTTACATTCTTGCAGAATT---------------------AATAAGGATGCTTACT--------TTTATACACA
AGGATGCGTTGTTGTGATGCGGATGCGGATGCGTCGGCTGTTTATGAGAAAACCAATCCATTACTACAAT--AATGAATCAATAGCCCACAATATTCACGCATAACAGAAGAACACTCACACACACACACACACATACATACACACGCACACACACACACACAACACACACACACACACACATCCAACAGAATCGCACACATTCAATCATCACTTTCGCACACACACTGCAACATAAATCCATAAACTAATGAAAAGATCATGTGTAAGAAGCGATAAAGCAGCAAGCCGTAAGCATAAGTGAAAAGGAGAAAAACAATGAAGTATGATACTGATACTTGTTCGGAAAATCCATGTAAAAACATATGCTTTTTTATATAAATGTTTTATTGTTTATTATTTTTTTTTTTTAAGATTTACTTCCAACACAATGAGAAAAAAACAAAAACAAAAAAAAAAAGAAACAAACTATAAAAAAGTTATGCAAA
>scarface 1184137 1185104|615 chr2R 1184118 1184261 scaffold_4 3812549 3812733 + 4319|19 184
GCACCAATA----AATTTATTGATATTTAAAG-TTTTCCCTATATCATAAATTGAATTATAT------------TATGTTTA--------------------ATGTGTCTAAAAATAGCTTATAATTTAATTATTAAATAAAGAAA----ACTAAGATGTACGACA
GCACCAATACCGAGATTTACCGTTATTTAAAGCTTTTTCCTATATCGTAAATCGTATAATATGTATGTATGTAATATGTTAAACATGTTGTATAAAGTGTCTATGCATCTAAATTTAGCTTCTTATTTAATTTTTAAATAAAGAGAAATTATTTAGATATATCGTA
>scarface 1184137 1185104|616 chr2R 1184426 1184638 scaffold_35 18924 19126 + 788|0 213
CAATTTTTCTCATACAAGTTCGTTCGAATATTATCATATGTTGTATGTATAT-ATACATATACGTAAATCTTAATGTCAAAAATAACATTTTCTTCAGTGAGTGAGGCCAACGATGTAGAGTCATAGCTGCATCATGAGTTTGAATCAGTTTGTATCCAGTACGTGCTCTCGAAGTACGTATGTATGTACATACATGGGGTTTTATGTAAACGA
CGAGCTTTCTGTAGCATTTTCACTTGAACATTG--AAGCTTTTTACGCAAACGATGCATCTGATTTAGTTTTGTTTTGGCTGATCTCAATTTTAATTGTTATTGA-----ATATCGTAGG----TAGTTGTATTTTGACAGTGATACAATTTTAATGATTTGATTCCGTCTGATATATATATGTATGTATATGTATGATGCAATAAGTATTCGA
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TATACAATAAAGTCCATATGTACAT-----GTAGTATTACGGTAAAGTAATAGCTTCGCTCAAGCATACGACCAGGTTCGTAAGCTA--TTAATACGAA-------ACTGTAATTATAATCAAATCAGTAAACACTGGAAGATTTGTACTTACAAATAGTTAACTCATAAGTCTTACCATAGAAGCTTAAATAAAACGTATTCAAGCAAAAAAATAA
TATATATATAAATATATATATATATCTGTCGTAGTATTACGGATATTTACTTGCTTCGTGAAAA---AGGAACTTGATAATTATTCAAGTCAAGATGAGCAATGGCAATGCAATTGAAGCAAAGTGAATAA-CAC----AAATTTGTACTTACAAATAGTTTAAACATAAGTCGTACCATAGAAGCC-AAATAAAAATGATTAAAAAACAAAAATTA
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AGTTCAGATCTAACACATTAACAG------GCCCAAAATGTTGTTTC----TATTTCTAACGTTCATTTGTAAATATTGTACTAGAACCTTAGTTATATTGCGCTTACCAGAATATTGTTAATAC-TTATTATATATATATACACATATAT--ATTATATACAGATATGGATATGCATCCGGCATATGGATATATATCTA---GCATACGCATTAAATAAACAAATCTAATATATAAATTTAATATTTATTGCCCGAATTACATAGTTAGAGATGAATTTAGTTTA
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TAAAAGGTTTTTGCTTATATATGAGGAGTAAAGTAAAACTAATAATTGCCGAGTTTGGTCACG-ATATCTTGATAAACAAAATGTTTTTTCATACAA----AAACTTAATATTC-----------GACCGATCGTTCCTATGGCAGCTATATGATTTAGTGGTCCGATCTTAATAGGATTTTATATATATTAGGAGTAGAGTTATAAATGCCTCGTTTGGTCAAGATATCTTGAAAAACAAAATGTTTTTTTCATACAAAAACTTA-----ATTTTCGACCGATCGATCTTATGGCAGCTATAT
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CAGCTGCTCAGGGACAGGGAGCAACACAATGCCGCCAGCA----ATACGGCTGCTGCCGCCGCTGC----------CGCTGCTGCTGCAGCTGCTGCTGCTGCTGCGGCCTACGCAAT------TGAGCTTCAGCTGCTGCAGTCGAG-------CGGCAATGGACGCTGCTCGCCGGCGCTGCTGTCGTTGGCGGACCTGTTGAATGGCAGCGA---CGATTAGCTTGTACTTGTACTCAAATACTCAAAA
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TACAA-----------------CAAACAAATAACAGCTCTCTTCTAATATTATACTAA
CAGAAACCTTGTCCAGAATACGCTTGTAAATAATTTTTGTTTTTAATTATAA------
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TTCAATTATGAAATTAGCAAATAGCTTAAT-TAAGTTCTATTATTACCTCTAGACATAAGCGACTACAAAAACAACACCAATATATGTACTGAGCGACCAAAGTCTGTGTGCTGCAGCATTATCAAATGGCACCATTTTATGTGATTATATTTGTATTTGTTATAAGAGCCACGCCCGCGTCTTACCCTAAAATATTTCAAATTGATTTTATGATATTTAGATAAAACGTAATTTTTATGATTTTAAGTTTAA
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GCCCGAGTCTTAATACTTTTTCATAATACTCTGTCGCTTTGCTAGCATAAGCA
GCTTAGTTTTTTATA-TGTTTCATAATTCTTTAATGTTTTGCTTGCACAAGCA
>CG30436 1374661 1374952|828 chr2R 1374716 1375016 scaffold_51 187158 187370 - 6871|0 246
AACATAAAAGCAAAGTTCGCTCTGTCAATTAATGCAAGCCCGACGTGGAGGCGGGCAAAGTCCAGGAGCACTTAATACTGCAGCGTTCGGGACGGACCTGCTGAACTGGACATGGG------AGCAGGGCATAAATGGAGATGAAGTTGATTACGTGGTGAAATATTTTATGCGATTGCGAAAATGAAACACAAACGGCCAGCGGGCTATTAATTTATATGC----ACGTGCGAAAGCGAAAGAAAA
AACATAAAAGCAAAGTTCACATTTGTAATTAAGG----------------------------------------------------------------TGCTGGGTGGGGCGTGGGTCGTGAGGCGTGGCA-------------------------AGTGCAGTATTTTA------TGCGCAAATGAAACACAAATGCCCAGCGGCCTATTAATTTAAATGCAAAAACGCAAAAATGCGCAAAAAAA
>CG7881 1468386 1468873|928 chr2R 1468607 1469094 scaffold_51 286920 287599 - 9852|0 409
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GTTAAGAATTAAGCAACAAATTAATATGCCGCGTGGCACGCGGCGTATGCGCAATACATACATTACGTATACGTAGATATATATAGAAGAAATATATATATATATATATTTGGCATGGACCAAAACTTGTCTTGGCCGCAAAATGTGGTTAAGCGTTGATTAAACCGAATTGTAGTCACTTTTGCGGACAACAGCGTTGATTTTTAATTAAAAATTCTTTAAACGTTTT------TGCCAGCATTTTAATTTCTTGTTTGCGCGCATTTTTCTAGCGTCTTCCAATTCTGCTGCTACTGCTGCTGCCGTTTGGACTACCGCAAAATGTAATAGAAAATTCTTACTACTATTTCTGCTTTGAATGAATTCATTTTCTATTTTTGGTATTTTGAGCCACACGCATTTGCATG
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AG---TAATATAAACATATTCACATTGCATACCTTAACACGTTCTTGTTAACTGGTTAAT-----------GGTTGCTATAAGT----AATACGCAACTATTCTGTTTTAAAATTTAAAATAA-AAAGAAAAGGTTTTTTAAAA
AAAACTAAAATAAATTTATCCATTTTGCTTACCTTAAAATATTATCCTGAAGTGGGTAATACATAAAAGAAGATATCTTCAAGCCCAGAAGATATATATATTCTAGATCAGCTTTAAGCAGGATATCGATATTGATTTTTAA--
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TTATTTTGATGTCCGCTACGATTGATACAACTCTCTTTTCAAAATACTTTGGGGACTGTCCCGTGCTGGAGGTGCCTGGACGCGCCTTCCCGGTGCAGCAATTCTTTTTGGAGGACATCATACAAATGACTGGCTTTGTGCCCTCGGCGGAGTCGCGTCGCAAGCGCAAAGAGGCCGATGATGAGGAGCAACTGTTGCTCAGCGACAATCTGGAGGAGGGCGAGCAGAATCTAAATAAAGTGTGCGAGGATAAGTACTCGCTGCAGACACGCAATGCGATGGCCATGCTGTCCGAATCGGATGTCAGCTTTGAGCTGCTTGAATCGCTATTGCTGCATATCAAATCGAAAAACATTCCCGGCGCCATTCTGGTTTTTCTGCCCGGCTGGAATCTGATCTTTGCTTTGATGAAGTTCCTGCAAAGCTCAAACAATTTTGGTGACCCACAACAATATCGCATCTTACCTTGCCACTCGCAGATACCCCGCGATGATCAACGCAGGGTCTTCGAGCCGGTGCCGGATGGCATCACCAAGATCATATTGTCCACAAACATTGCCGAGACTTCGATAACTATTGATGATATTGTCTTTGTTGTGGACATATGCAAGGCGCGTATGAAACTCTTCACGTCCCACAACAATTTGACCAGCTATGCGACTGTCTGGGCCAGCAAAACCAATTTGGAGCAGCGCAAGGGTCGAGCCGGCCGTGTACGTCCCGGTTTTTGCTTTACGCTCTGCTCCCGCGCACGTTTCGCCCAGCTGGAGGAGAACTTGACGCCGGAAATGTTCCGCACACCGTTGCATGAGATTGCGCTAACCGTGAAGCTATTGCGCCTCGGCGCCATACATCATTTTCTGTCCAAGGCATTGGAGCCGCCGCCAGTGGATGCTGTCATCGAGGCGGAGGTGCTGTTGCGCGATATGCGCTGCCTGGATGCCAATGATGAGTTGACGCCATTGGGCCGCCTGCTGGCACGTTTGCCCGTCGAGCCGCGTCTGGGCAAGATGTTGGTGCTGGGCGCGGTGTTTGGTTGCGCTGATCTGGTGGCCAGCATGGCCTCCTATTCAAGCACCTTCTCGGAGGTGTTCGCCTTGGACATTGGACAGCGCCGTTTGGCCAATCATCAGAAGGCTCTGAGCGGTCGCAAATGCTCCGATCATGTGGCCATGATTGTCGCCTCACAGATGTGGCAGAGTGCCAAGAAGCGCGGCGAGCACGAGGAGGCACGTGTCTGCGACTGGAAGGGTCTGCAGATGTCCACAATGAATGTAATGTTTGATGCCAAGCTCCAGCTGCTCGATCTGCTGCAGCAGGCCGGCTTTCCGGAGGAGTGCATGTTGCCACACCACGTGAATG------CCAATGCGGATGATCCCGAGCTGGATATATCCCTCGCTCTGCTCTGTTTGGGTCTCTATCCCAACATTTGCGTGCACAAGGAGAAGCGCAAGGTCCTGACTACCGAATCGAAGGCTGCCCTGCTGCACAAGACCTCGGTAAACTGCAGCAATCTGGCCGTGACCTTCCCCTATCCGTTCTTTGTCTTTGGCGAGAAGATACGCACACGCGCCGTCTCCTGCAAGCAATTGTCCATGGTGGCGCCGCTGCAGGTGATGATCTTTGGTTCGCGCAAAATCGATCTGGCGGCCAATGGCCTGGTGCGCGTGGATAACTGGCTCAACTTCGAAATGGATCCGGAGCATGCGGCCAAAATTGGTGCACTTAAACCGGCCCTGGAGGATCTGATTACCATTGCCTGTGACAATCCCAGCAATGTACTCCAGCTAGATGAACCCTACGCCAGGCTGGTGCGTGTGATCAGGGAACTTTGCGTCCAGAATGCCGGCGACTATGAGCTTCAGCGTGAATGCGGCGTGTTGCCCCACATGTCGCGCAACGTTGCCAGCGGCAGCAGCACCGGCGGCGGACCAGCTAAGCGTGGGCGCTACG------------------ACAGTGGTCCTGGTTACGGTGGCAGAAGCGGAGGCTATGGCGGTGGCGGTGGTGGTCGCCGTTATGGTGGCGGCGGAGGCTATGGCAACCGTGGAGGAGGCTTCAATAATGGTGGCGAAGGCGGTTTTAATAGTGGAGGAGGCGGCGTCGGTGGCTTTAATGATGGAAACGGTGGTGGCTTCAATAGAGGAGGAGGCGGCGGCGGCGGCGATGGCTACAATAATGGAGGAGGTGACGGCGGCTACAATGAAGGAGGCGATGGCTACACTAATGGAGGAGGCTTCGGCGGCTT------TAACAATGG------AGGCGGCGGCTTTAACAATGG------AGGCGGCGGCT
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CCGTATAGATTCCTCGCAACAGGATGGCGAA----AAACGTCAGGAAAGC---TCCGTGATTCCGTGGGCTCCTCCTCAGGCAAACTGGAATACGTGGCATGCCTGCAACATCGACGAAGGCGAACTGGCAACCACCTCTATTGATGACCTTTCGATGGACTACGAACGCTCGCTGCGTGATCGCCGCCAAAACGACAACGAGTACCGACAATTCCTCGAGTTCCGCGAAAAGCTGCCCATTGCAGCGATGCGGTCGGAAATTTTAACCGCAATTAATGACAATCCAGTGGTAATCATTCGTGGAAACACAGGGTGCGGAAAGACTACCCAGATTGCCCAATACATTCTTGATGACTACATCTGCTCCGGCCAGGGCGGGTACGCTAATATTTATGTGACCCAGCCTCGTCGCATTTCAGCCATTTCTGTGGCCGAGCGCGTAGCTCGCGAGCGGTGCGAGCAATTGGGCGACACTGTAGGCTACTCGGTGCGATTTGAGTCTGTGTTTCCACGACCCTACGGCGCAATCCTCTTTTGCACCGTGGGTGTGTTG-CTGCG-CAAGCTGGAGGCTGGCTTACGAGGAGTGTCGCATATTATTGTGGACGAAATCCACGAGAGAGACGTGAACAGCGACTTTTTGCTGGTCATCCTTCGCGACATGGTCGACACATATCCGGACCTGCATG
TCGCTTGGACACC-AGCCAGGAGATCGAGACGCGCACACGCCAGGAGAATATTGCCGTGATACCCTGGACACCGCCGCAACCCAACTGGAATGCCTGGCATGCTTGCAACATCGATGAGGGCGAACTGGCCACCGCCGCAGTGGATGATCTGTCCATTGAATATGAGCGTCAGTTGTGTGAGCGTCGCCAGAATAATCCCGAGTACCGTCAGTTTCTGGAGTTTCGCGATAAGTTGCCCATTGCAGCCATGCGCTCGGAAATCATGACCGCCATCAACGAGAATCCGGTAGTCATTATACGCGGCAACACCGGCTGCGGCAAGACCACACAGATCGCCCAGTATATACTCGATGATTATATTACCTCGGGCCAGGGCGGCTATGCCAATATTTATGTGACCCAACCGCGTCGCATATCGGCCATTTCTGTCGCTGAGCGTGTCGCACGCGAACGTTGCGAGCAACTGGGCGATACTGTTGGCTATTCGGTGCGCTTTGAATCCGTCTTTCCACGTCCATATGGCGCCATACTCTTCTGCACGGTCGGCGTCTTGTTTGCGAAAAACTGGAGGCGGGTTTACGCGGCATATCGCACATTATTGTCGACGAGATACACGAGCGCGATGTGAACAGTGACTTTTTGTTGGTCATTCTACGCGACATGGTCGCCACCTATCCGGACTTGCACA
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GAGCTTCATGGCGGAGCTGTCCATATTTGTGCCGGCCCTGAAACGCAAGGTGACCGCACGTGAGACCGGCTCCAACAAGAAATCGGCCAGCAAGTCGTGCGCCCTGTCGCTGGTGCGTCAGCTATTCCATCTAAAGGTAATCGAAGCCTTTAGTGGCACACTCAAAAAGAAGAAGGACGAGCAACTGAAGCCGTATCCGGTTAAGCTAGATCCACAGCTCATTGATAGCGTGGACGAGGTAATCAAGGAGCTGGAGTTGCCCGTGGTTAATCCGCGCAACATCAAAGTGGAGCCCGATGCCGCGCCCATGTCGCTGATT
>mle 1487315 1487342|943 chr2R 1487319 1488085 scaffold_51 304594 305445 - 27022|0 30
TCATG-----TCGG--GCTGTGACCAATTTG
TTATGAGTTATCGACTGCTGTGCGCAATTCG
>Act42A 1521298 1521657|974 chr2R 1520762 1522897 scaffold_51 359266 361686 - 81626|599 1247
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GCAGCATAAAGAACAACAACAACAGCAACATCAAAAACAAACACACTGTGGCTGACGTTGGGCGTGGTCCTGTCTGTGTACGCTGCGCCTCATACACACACAAAAAACATTGCATTTGATTTCCTCTTTCATATAAGGGATAGGTTAGAGAACAAAGGAGAGAATTGCCGGGCGGCAGACAGACGCACACAGACAGGACATATGCACCAGCACCAGAAACAGGAACAGCAAAAACAAAGAGAAACTACATTTTTTTATAACAATTTTATACGAACTCATACCATATAACCGCACACATACACACGTCCACCCACACCCACACACATACACACATAGTCACACACACATATTACACATAAGAAATTAGCATATTTTTGTGTTCTA-TCGAAATTCACGAGTTCATACGCACATTGGTATTATTATAAAAATATATATATGCATATATGTATGTATTATTCATATTCGGCATTAAACATTAAACATTCTCAAGCATCCCTACATATATTATTATGTATTACACATACTCAAAAATACCCAAAAAAAAAATAAATAAATAAAAATAAAAACAAACAAAAAGAAAATTAAACTAAAAAGCATTTGTAACCGCTGCGAAAATAAGAAACATCAATAAAAAGCGTTGAAGAACTG
>dream 1528255 1528732|978 chr2R 1527665 1528399 scaffold_638 2864 3681 + -3180|708 859
TTTATTTTGGTCGATTTTTTAAGAACGGTCATCGCATGTAAAATGTTAAACCGTGTGCCCTTGAAAT---TTTTTAACTTTTATTGTACTAAAAATTAACGTTTTA---ATGTTATTATAAA-ATAAAAACAGTTATTTTTTCTCAATACCA
TTTATTTATATCT-TTTATTAAGTATCAATATCACGTTGATGATCTTTTGTTGT-TGTTGTTGTATTGGGCTTTCGGTTTTCATAGCAATAAATGTG---GTTTTACGTAAGTCGTTATACATATATATATATTTATAGTTCT--AGGCGCA
>dream 1528255 1528732|979 chr2R 1528704 1529279 scaffold_1 4982698 4983349 + 12461|0 29
CCATAGATCTTAAATCTAAGACAC-GCCAT
CCTTGTGATTAACATCTAAGATATAGCCAT
>SCAP 1533661 1534057|983 chr2R 1533615 1537295 scaffold_1 6155552 6159353 + 164116|57 502
AGCGCAAAATTTTAATTTAGCGTGGTTCGCTAGCACCTAGG----AATAAGTTGACTTAAGGCTTTAA---AACGCCTGGAAGTCATTGACGCATTCACTATTTTATATAAATATATACACTATTAGGGTCCGCAGCAACTTACGGTTTTAACACAAGCTGTACGTATCT------------CATCTCTAGAATTTTGTG-TTAGTTTGTGGACACTAAGT-----------GTAACAGCTACGCT-CCGGTAGGTTAAGGAACTAAAC---TAAATGAATCAGATATATAC-ACATATATTTTCGCGTAATTATATAAACTACATAGTGTCTTAAAGCGCCTCAGCCTAATATAAAATGACTAAATGTTAAAATAAATACAT-----------TATTTATTAGA-ATCACCTACGCTTAATATTCAGAAAGAATAAAAAATTT-T
AGACAAGAATTTAAATTT---GTAGATC-CTAAAGTTTAGGTTACAATTTGCTCTCTGTTTGATTTAATCTAACAATGTAATCTTACTGACGCATTCATTAATTTA-------ATTTATAACTTTAGGGATTAGATCTTTATCTCTATTCACCAGTGGCGTTGTGTTTATTCCTTTATGCTACATAACTATAGTTATATATTTTATAATTGTACAATACATCTGTATGTCTGATAATTACTACGATATCGCTAAATGGAGTATATATATATGTATATGGAT-ATATGTATACTATATATATTTTTGCATA---ACATAAA--ACATAGTGTCTTAAAGCGCCTCAGCCTAACATTAAATGACTAAATATTAAATTATCTATATTTTATATACTATATTTATTAGACCTCACGTACGCTTAAATTTCTATGTGAAAAGTAAATCTGC
>CG14591 1543946 1544417|988 chr2R 1543717 1544956 scaffold_1 6166409 6167536 + 6163|236 744
TAC------------------------TTACTGCGTCTAATATGCATGTCAATTCACGAGCCCCTACGGCTACGGT--CCACGTTT---TGCAGATAGCCGCATTGCCCGATCATACTAAAATATGAAGGATTTGTGTGAGATCTAAGAGAGGTGAATGTATTTAACAAAGACGTGTAGATAATAAC--AAATAAGGCT----AATTTTCATGCTCATCGAGGTTATACTTCTAAACAAAACCAACACCACTCAAGAGTTATCGAGTTATTTCTTACTTCGAAAAAAATCAAAAGTTACACCACTTCAATGGTTAATAATAGAGTACGTGTCTTAAATTGTAAGCCTGTAGCGATC-AACAGATAAATTCAAAATTCAAATCGAGCGC-CAAGGGACGGGCAACTCTAAAGGTCTATGTTCGGTCTGGCAGCACTGTCCGAGTGAACTGTGACCCGTTTATCTGCAGCTGTTGGTGAATCTTGAAATAAATAATAAATAGTCGAAACGG
TATAGCGCGAATATGGAGAACAGGCTATGTCTATGTCTATTATAACCGTCAATTTATTACACAATTTGGTTGAGATAGCCAAACTTAGGTTTGGTTTCTTGTAGAGCCCG------TCAAATTTTGTAGCTAGTTCCATAGACCT----GTTGCGAAT-TATATA--------GTGTACATAATATTCAAAATAAGGCTAAAAAAGATTTATGCTCATTGAGGTAATACTTC-AAACTAATGAAACAGTTCGAAAAGGTTCTTGTTCAATTATATGACTATTTTACATTTAATTTTGGTGTAAAATCAAAAGCATACAATAATGTGTACATTTTTAAACATAAGCGCTCAAAAACCAAATAAATAAATAAATAATCCAACTTAAACGTACAAAACA----AAACTTTTGAAAT-TACAACCGCTTTAACAGCAATATGGCAGT-----------CTTCAAATAGCTGCTGTT----AATATCAAAATATATA-----------------
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AGCGACATGTATTTACGTATAAGAATATTAAAGAAAAAATAGTAT
TCCCACATATAGTTAAGTTT---TATATTAAATGATATATGCTAT
>CG7843 1588216 1588803|1033 chr2R 1588286 1588875 scaffold_1 4240919 4241591 + 19509|0 621
AGAATTGCCTTTGGAACACCAGCGCCGGCTTATCGGTTACCATGATTTGGATGCGCCTGCCAATTCTGATATGTTTGAC----TAATTGATTAGCACAATACAAATAAAAACAGGCCATAT-TGATGCAGCTTATAT-CGGTTGGCGAGCTCAAGTTTTAAATGCAATTCAAGCAATGCTAGGAAAA---GTATCTACTGCATA-TAAAGATGGTTT--------ATATACGACTAATGATATCTGTTTT----CCTGTACAATGCTAGAACCTACCTTTATTGCCCAAAATAAATGAA-AATCCATAGCCTAAAAGAAAACATTGTAATATTTT----------GTATCTCTGCC----CTATCCATAGT-----------CTTGCGT---------------------------------------------GAATAATTCCAATATCT-----ATATTCATTCTCGTTGCTTGCAGACCCGGTGGTTTTGATTATCGACCCAGATCACACTACCGGGACTTGGACGCGCCGCAAGAACCATACTAGAACTAGCTGTGCGGAGAACACAAGCTAG---ATAAATTGTATCAAATTAACTGATAAACA---CTCAAACACT
AGAAATGCCCTTGGAACACCAACGCCGGCTTATCGGTTACCATGATTTGGATGCGCCCGTTAATTCCGATATGTTTGACTAATTAATTGATTAGCACA--AAAAGCAGAAACCACACACAGATAATAAACGCTAAATACAATTTTCAAGCTC-AGTTCTAAAAGCAATTTAAGCAATGCCTAGCTAATGGGGACCTACAAAAAACTAAACGCAAATTATTACATAATTTATGTCTAAAGATATTTATTTTGATCTTTGTACAA----------TATGCCGATTGTAAAAAAAAAATGAATACCCCAAAGGACCTAATTAAAGATTTTAATTTTTCAATTAATAAAATATCGATTCTGATGCTTTCAATAATGCAACCGCAAACTTGCGTCGAATTACAATAAATGTTTGGTTTTACTATATAAGATTTGTGTACAAATAATTCCTCACTCTAAACAACATTCATTCTCGTTGCTTGCAGACCCGGTGGTTTTGATTATCGCGCCAGATCACACTACCGGGACTTGGACGCGCCCCAAGAGCCGTACTAAGATAA--TGCCC------CACACAATAGACTATAAATTATATTAGTTTA--TAATAAACAAAGCTCACGCACT
>CG7843 1589124 1589228|1034 chr2R 1589118 1591445 scaffold_1 4242267 4244734 + 87599|6 113
ATACCGACCGCCCATGTATCCACCTTTTTCGGCAATGCCCTATGGTTTTGGTCCACCCATGATG---GGTGGTGGCCGTGGAGGACGCAACTTCCCTCCCGCGCGCAG
CTATCGGCCACCCATGTATCCGCCATTCTCAGCTATGCCCTACGGATTTGCACCGCCCATGATGGGCGGCGGTGGACGCGGCGGACGCAATTTTCCTCCAGTGCGCAG
>EcR 1598168 1599975|1040 chr2R 1597308 1599813 scaffold_1 4249874 4252714 + 27848|951 3021
CGTAAAATGCAGTTATTTAGTCTTAAGCCTGCAAATATT--ACCT-----ATTATTCATACAAATTAACATATAATACAGCCTATTAACAATTACG---------CTAAAGCT---TAATTGAAAAAGCTTCAACAACAATTGGACA-------------------AACGCGTTGAGGAACCGGGAGAAAATTTAAGAAAAAAAAAACCATTGAAAATTATGAAATTTAGTA------------------TACATTTTTTTTGGGTGGATGTATGT-------CGCATCAGACTCACGATCAATTCTCGAATTTTGTTAACTAAATTGATCCTCCAAACTGCATGCGAAA-CAGATCAGA---------AAAGAGAA-------CAGACA-GTAGGGCGTGAACAGAGGGAAGAGAGAAGAGAATAAAGATTGTTTATATTTAAAAAATATATAAAATAATAATTACTAACTCTAAACGTAAT-------------------GAAAGCAACTGTATAATATCTAACTATAACTATAAATTCGTACTGTAGGGAAGTGAGAAAATCTG--TTAAATG-----------AAACAAAA-----------------ATAATGATAATAAC-----------------ATTATCATCC--------ACCATAATTAAAATCATTTA---------AAGTAATTAAAAACAAAACACTTTTAAAACACGCAAAACTTGGACTGATTTTATAAATA-TTTTTTAATCATA-------AAGAAAGGCAACCTGAAAAAAATATTACAAAA-------------------ACAAATAACAACATATTTT---ATTATGACACCCTTATATGTTTTC---------------------AAAACGAGAATTTAAATTCTTAGATTCTTATAATTTCATCCAAAAATATTAGCCAGCAAAAACCTTTATTATTGGCATTGTTTTTAGACATGTTTTCAAAAAAAACTT--TGATATTG---AAACTAAACAAAGGATAATGAAATGAAAGTGATTGGAGTCTTACTCAAAAACCAAAAGGCATCAAAAGGTATTAAATTAAAAATATAATCTAATTTCGAGTTCAAGAAA--CACTTTTTGGTGGAAAATA----------------GTTTTCAATCACTTTGATAAAAACCACACAAATTAATAAATACATGCATACACCAAAAGACTTCAATATATATTTTTAAAATTTACATTGATAATTCGAAATTTGA------------------ATAAGAATCACATCC------------ATCTAATTTGGCTAAATCAAAATTTTTATGAAAGCCACACAAAAAA----------CGTGCAAATTTGATTACTTTGGCAATTTTTATG---TTATACAAAATTTATGCAATTGATTTTCAAAATAATTTTTATTAGATTGTATTA--GTTTCATTTTGCTTTGGGATGTACATTTT-------AAATAAATTTTACTTTAAATTGTTGGCCTTATTTTAACTTAAATCAAATTTATTCTAATTTTAGTA-------------------AAAAAAAATGTGTTTAAAATTGAAAATAAGAACACTGTAAAATATTAATAAAAAAT---TAAAGTTTAAAGTGA--TTCTTTTATTATGTAAAAAGAAGACAAAAAATATCTTACGTAGCTTTCTACTTGAATTGTGCAATTTTTTACTTTTAC----TACTAATCCTA--------------------------ATTTAAATATAATT-----------TACACACACGCCTACACATCCAGCCACATATTTTTAATTTTAAGTCAACCTAATTTATAAATATGAATTTGTATAATGACGAACTAAAATTAGCATGACATCATGGACATACTTGGAAATAACTCTATCAAACGAGCTAAATGCAT-------------------------------------------TGAAGAAGAA---------------AATTCTTGTTAAATATAGTCTGCACTTCG-----------ACAAACGAAAAT-CAGTGAATT
CGTAAAATGCAGTTATTTAGTGTTAAGCCTGCAAATATTAGACCTAAGGCATTATAAATATAAACAAAATTATTATAAAACACACACACACACATACAGACACATCTAAAATTATATAACAAACAAATTCTTAACAAAAACAGAGAATGCTTAAAACATAAAATATAACAATTTGAAAATTGAAAAAGAAAGTCAAGCTAAACAAGGGCATAG-AATTTATGCAGTTAAATACAACAACAAAAAATACCTTAAAATATATATAAATATATATATATGCTATAATTAATAAAAATTGTATTAAATTTTC---TTTTGTTAATT---TCCAGCCCCGAAAAATCGGACTAAAGCAAATGATAATTTCTGCTAAATTCAATGCCTGTCAAACATGTCATGCAAAAGAAAATTAAAAACAAAAGAGAATAAAGATTGTTTATATTTTAAAAATATATAAAAACAAAAACCTAAACTTTATATATAATATTAAAAAAATAAAAATAAAAAAAAATGTGTATAATATGTAAAACTAACTGTACATCTA-ATTCAAAAGCAGCGAGTAAATCTGATTTAAACACCTTGAACTATAAACAAAATACTTATTAATTAAATGCTAATGACAGCAACTAAGTTTAAGTTACACAATTCGCAACCCAACTCTAAACAAAACTAAAACAAAACAAAAAACAACAAAGAAAAAAAAACAAAAAAA----AAAACACGCAAAACTTGGACTGATTTTATAAATATTTTTTTAATCATATTAACTGAGTAAAAAACAACTGTATAAAATGCTAACAAATGTTTAACACAATGAAATGGCTAAAAACGACATTTTTTTTAATTATGCCCTCCTTATATAATTTTTTTTTTTTTTAATTAACACAAAAAATGAGAATTTACATTTATTAAGCGCCGTCGTTT--TTTAACACAATT------CACACAGTTACATT-------TTCTTTTTG---ATTTTCCCATAAAACAATTGGCGAAATTGTAAAAACTTTGTAAACAACAAGAAAGAAAAAGTGATTGGAGTTTTACTC-AAAATTAAAAGGCATT-AAAGGTATTAAATTACAATTTTTTTTAAATT--AAATTCATTAAATGCACTTTTTGGCTGACAAAAAAAAACAACAACAAACATTTTCAATCACTTGG----CACACACACATCCACGCACACACACACACACACCAAAAGACTTCAATATTAATTTATAAACTAAAAATTT-TAATTCGAAAATTTATAAATACTTGTAAATTATATAGCACTTAAATTTTATTGAAAAAAAATACCATTTGGCATAATCAAAATTTTGTTTTTAAACAAAAAAAAAAAAAAAACAATCGTGCAAAATATACATTTTTGGCAATTTTTTTAAACTTATTTGGAATTTGTTTAATGCAATTT--AATTAGTTTTTTGTATGCTTTTTTATCGTTTTTTGCTGCTTTTGCTTTTGAATTGTAAAAACGAAAAAAAGTAAAC----AATTGTTGGCCTTATTTTAACTTAAATCAAATTTATTCTAATTTTAGTAGCGATTTGTAAAATACGACAAAAAAAAAACACATAATAATAAACACAAACATAAAAAAAGAAAAAAACAAAAACTATGTAAAATTTAAACAAACCTTTTTTAATTGTGTATAAAAGTGGCAGAGAA----------------ATTTTTGAAATGTGCAATTTTTTAATTTTACTAAGTACTATACCTATTATAATTATTATGCTAATTAAATATATATACATATAATTTTCGCATACAGTACACACACACATACACATACACTGACACATACACA--TTTAAGTAAATTTAATTTATAAACATTGAATTTTTTATACAACAATTGAAAATAGCAAAGCAACATATATATATATATATATATATATATATATATATACATATATATATATATATATATATATATATATATATATATACATATATATATATAAACAATTAGAACTTACATGGTTTAATTTCAATTATTTGTTATCTGCACAGTAAAAATGAAAGCAAAAACAAAAACACAGTGAATA
>EcR 1598168 1599975|1041 chr2R 1599814 1600316 scaffold_1 4252856 4253470 + 6218|0 233
CAGGCGCAGAGT--CAGCT-----CCACCAACAT-------------------CACCACCACA-----ACATCGACGTCCTGCTGGAGTAGAAAGCGCAGCTG--------------------AACCCACACAGACATA---GGGGAAATGGGGAAGTTCT-----CTCCAGAGAGTTCGA------GCCGAACTAAATAGTAAAAA-------GTGAATAATTAATGGACAAG
CGGGCGGGGCGTGGCAGCTGTATACAACAAACACACACACACACACACACACACACAAACACAAACACACACAGACAGACAGACAGACAAGCCTGTACCGTTAGGCGCTTTTATAATGGATTCAACCGATTTGTATATAGCCGGAGAAACTGTAAAATTTTGCATATTCAAAATAGTTTGCTTTTCTACCCAGCTACATAAAAAAAAAAACGGCGTGTGGATTTAATAAACAAG
>CG11211 1688307 1688368|1191 chr2R 1688301 1689514 scaffold_622 696 1943 + 7150|6 67
AATTGTTATTTCAATCTGAAAATATATAAAACAATATCCAAAGCAAAATGAATAGAACACAA
A---------TCAAAAAGCAGCTCCTTATATTA-----TAAATCAAATCGACTGCAACGTAG
>Ptr 1689363 1689897|1191 chr2R 1688301 1689514 scaffold_622 696 1943 + 7150|1178 1348
GCCTTTTGAAC-------AAATCACAGCTATTTCAGTCACTTTTTTATACT-TGCCCGCAATTTAATGACACAACACAAGCATTTCATCGATAAGAGCTCAGAGAACTTA----AAATACCAACAACACATTAACATACCTCTAGTTACATGTATGCT-------ATTTGA
GCATTTTGCATTCTATTTATATTAAAACGATTTCGACAAGTCTTATAAACTATGTATATACTAT-------CTATACAAGCATTTCATAAAAAGCAACGCAAGTCACATAGCTTAAGTTCCCACATTATATATATATATTTTACATTTAGTTTTTATTGCAACACATTTCA
>Ptr 1689363 1689897|1192 chr2R 1689515 1692506 scaffold_622 2278 5280 + 111648|0 407
GTGAAATATGCGAAAGTCCTCGTTGAAATGTGACAGGAAAATTCCTTATATTTATAGAGTGTTCTGTGGGACAGCCTTTAAACAAATTACTAG--CAAAGTAAAGAGCATTACAAACCCTTTAAATGAATGATCAA--AATCGGTATGGATTCTCAAGCTAAAAGTATTTCAAT-------TACCCCGCTTATCAGTCGATTTTATTATACGAACCAACAAGGTTGAAGTTTAAATGTCTTATTTTGACAACTCAAAAATGTGTTAATATCGCCTGTAGAACATATAAAAAAGTTTTG---ATTGTTT---AGTTTTTTGTACCTAT---TGCAATTAAAATCGAGTTAGAGA-----GGGACTTGACGAAACAGAGCAAACATTCTTGTCAACCATATTTAAGTTAG
------------AAATTTTTGGT--AAATGCAGCGGGAAGTCACTTGAGATTT----AGCTTCCT--------AACTTTAAACAAACAAAAAAATTAAAAGAAAAAAAAAAACAAACGTAATTAAGCATAGTTTAAACAATTTGCCTGG-----CGATCCATAAATAATTGCATATATTTATATGAAGCTCATTCGCT--TTTTATTTT------CAACGAGTTTTCAGAACAATTACTGCGTTCATGT--------AATGTGTTA--------TCTAGAATTTCAGGAAATTCTTTGAGCACTGTATCAGAATTTCTTGAAATTCTTCATGCACTTGCAACCTATTTAATAAATGCCGGGATCTGGCAACAC----TAAATATGTTTGTGGGGTCCA-TTAAGTTGG
>CG30432 1704987 1705205|1207 chr2R 1704690 1705012 scaffold_1 4420418 4420793 + 6210|359 384
TCCTCGCCCGAGTTGAACGTGCTCGG
TCCTCGGCCGAGTTGAACGTGCTTAT
>CG17994 1714606 1714693|1217 chr2R 1714597 1715711 scaffold_1 4434589 4435678 + 43677|9 96
CTTGTTTGGATGATGCATTTTTGATGGTTATGTACATATATACAAATTGTTGCTGGTTTTATGTTATTAAAGTCATTTAATACTTGTA
C-----TAACCAACGTGTTTT-------------CAAATATGCAA----TTGTTGTTATTATGTAAATAAAATAATAGTGTAATATTA
>l(2)k14710 1717165 1717481|1219 chr2R 1716985 1717420 scaffold_1 4436720 4437160 + -637|184 469
TATACTTCCTAATTCCTTCAGTGTAAAAATTGTTGT--ATCGCAGTT----------TTGGAGCAACAAATGTTTAAATATT-GTTTGTGTGTAAATTATTACCAAGAATTGTTCGAGCTTGGCTGTATT---ATGTGAATGAA--------CCATTCTGCTATCTTCCTTAATCACCCACTTTTAAGGAGATGGTTCGGTTAAATTTATTACTCTATT-----AGGTGTTGTTAATTACATACAAAATTGGTTATTATATAAATATA-CAGTATTTCGTGAAATT
TATGATTTAAAATACCAATCGTATCGAAATTGTTCTCAATCGCCTTTGCTGCAGAATTTGAACCAGCGACTGCTCGCTTATTAGTTTGACGCTCAGCCACACTGGCTTATAACCCAAGTTAGGCTCACTTTCGATTCAAAAGAAAGGTTCAGTAATTATGTAAGCTTCCTAAA------AGGTCAGAGCAAATATTTGAAATGTATATCTCATTTTTTTTAGACATATAGTAGGAATTATTTATAAGATTTGTTATCTTTAAAGTGTAGAAAAACTGCGTTGACTT
>l(2)k14710 1717165 1717481|1220 chr2R 1717468 1718966 scaffold_1 4437846 4439522 + 31581|0 13
GAACACTTTCGTGT
G--CATTTTCATGT
>CG15234 2118803 2119094|1485 chr2R 2118963 2119675 scaffold_1082 3807 4388 - 8318|0 133
GCCGAATAATTGATACCCTGTCGGTTGGCCTACCCCGGAGGGATACTTTTCAAATCGTCCGCGAGAGCTCTGAACAATACGCAGCAAA--ATAAATGACTACTGTGTCCGCTCGTAAATTAAAAGTTGTTGGCT
-----------GATATC--AACAGTTGCGCCA------------ATTTGTAATATTCGGCGCTTGAGCTCTGAAACAAAGGAAGAGAGGTATAAGGAACTTAAAGCTCTGCCTGTGCAT----AGTTGTTGTCT
>Vha16 2138726 2139282|1503 chr2R 2137036 2139009 scaffold_1 4707509 4709513 + 50798|1924 2241
CGCCGATTTGCA----CCTGTTGTTCA--------GTTTACCTCG------------ATTCGCTGGCGCGTGGTTTAGCTTAGT----TATTTTCCGTTCAAAATCAGTCTTAAACACGAGGAAAACAATTTGCAAT---TAAGTTCATAAAGATGTAAT-AATTATGATTTTTGCTATATCAAGAAATCCTGCTCTTTTACTT--TTTATTTTGCGCTCCACAATTTTGTGTGCTCTTTGTTATTTGTTTTTTCCATTATTATTATTAAATAATGTTTAGTGTATATGTAAAGTTCGTTAAACAAAAAGAAAAAATT
CAACAATTTATAATTTCTTGTTATTCAATTTGAATGTTTACTTTGCACATTCGCCTAAATTGCTGGCCCACTGTTTAGTTTAGTTTTATATTTTCCGTTCAAAACAAT---------------------TTTGCAGTTCATAAGTTCATAAAGTTGTAATCAAATATCAAATTTG---TCTCTTACTTTTCTATATCTTTATTTTATTTTTTTTGCGCTCCACAA-AACGTGTGCTCTTTGTTATTTGTTTTTTCCATTATTATTATTAAATAATGTTTAGTGTATATGTAAAATTCGTTAA--------CAAACTCT
>Vha16 2138726 2139282|1504 chr2R 2139042 2140143 scaffold_1 4709579 4710779 + 31212|0 303
ATCAATCAATGCAA---ACACACAACAACAACAGATAGACAAACGGCGCCCAGCGGTCAACAGCAGCCACATCAACATCAGCAGCAGCTTCAAGAGGAGCAGGTAAAATTGTGTCAAGCCAATGAGCAACGTGCAACATGCAACTTCCAACA--AGCAAAAACCACAACAGTGCGTGTGCGGTGCAAGCCCGGCGTGGACCGTTTGTACATAGGGAGAACAACCAAAA----------------------------------------------------------CCAGTCCTGCCGGACTGC
ATCAATCAATTCAACACACACACACACACAACAAGTAGACAAACA--GCCCAGCAATCAACAACATCAACTACAACAACAACAACAACAACAACTGCA--AGTAAAAAGTGTATCAAATTGAAAACCA-----------------TCCAACAATAACAACAAATTCAA-AACGCGTTTTGGTGGCAACTCTGGT---GGCCGTTTGTATATAGCAACAAAAAACAAAAAAAAAAAAAGAAAACAAAACAAAACAATAACAAATAACTGCAATTGATGAGTTGGGCGCCAGTGTTGCCATATTGT
>Trap1 2145460 2145586|1509 chr2R 2145178 2145483 scaffold_1 2081774 2082051 - 813|300 323
AAACGTTTTAAATATTTTAATTCC
ACACATTTTAAACACTTTAAGATA
>Fmo-2 2154230 2154516|1512 chr2R 2154125 2154290 scaffold_1 4732498 4732653 + 1661|109 169
ATAGCTCTTTAATTCTAAGCCTCGTAGAATTGTAGAAGTCAAATTAAAATCTTACTCCCGA
ATAGCTTTTTTGCTTCAAGCGAAGCTGCATTGTTGCAGTCAAATCAAAAT-----------
>geminin 2167267 2167463|1527 chr2R 2167259 2168217 scaffold_16 587098 588048 + 31904|8 234
GCTACACACCAAT-CACACGTTTTTTTTAGTCTAAGGT-----TTTACATTTAGTT------GTAGTTAAATA-------------TCGCGTTTATATCCCTGTTCGT-CGTCAGCCAACACAACGG-CTGGTCTAATTGTACGCCAGCAAT--ATATTTACTTGTT-ACACGCCAGTTATAATCCTAATAAAGTTTTACATTTGCACAATTGCACACAATATTTAA
GCTAATAACCAATAAACACATTTTGTATGTTTTTAAGTCATTATTTAGATTATATTTTGCAAGTAGTTAAATGATTTCAATTCTCTTAACTTATACATTACACTCTATGCAACATCCAACCCAATGGACTGGTCACAATGTACGCCAGCAATAAATATTTACTAGTTAATGTGACAGTTATGTTCCAATAAAAGTTT---GTTTCCTAATTTGCGTGT--TGTCCAA
>Dpit47 2172463 2172493|1532 chr2R 2172337 2173744 scaffold_11 3198972 3200373 + 67692|129 159
GACAGTGAGCAAATAAAGTGATTCCTTCTTG
GTGGAGAAAGAATCTTAGTTTTTATTGCTTG
>CG30445 2188809 2189118|1543 chr2R 2188214 2188814 scaffold_0 533485 534199 + -1963|723 728
GAAAAT
GATATT
>CG30445 2188809 2189118|1544 chr2R 2188815 2191161 scaffold_4 1158460 1160836 - 112452|0 349
GCG-TCGACCCGAAAAGGGATTTGCGGATTTACCTCTACCTAGTATTAGTTGT-------------------CGAGCTGAAATGAGGCATGAATC---AATCGACTACCGACTAACATTGCTCAGTTTGAATTTAAGAACATCCATTTATGTACTAGTAGGACCTTAGTTG--TTGCTGAATATCATGTAATTTAAAGATAGACTCATTTGCATCTGCTTATACCGTTTAGCTACCTTAAGTTA---CTGTCATGAAC-----AAAAGCACTTATTT------ATAAACATTATCTCGGCATTTTTTATGCAAGTTTTTA----AAAAATACA---AACACAATCCAACG
GCGATAGAAATGCAAA--AATTTGTAGA------------TAGTATTAGCTGTTTTTTTTGACGTTTAAAAACGTGCTGAAATGAGGCCTGTACCTAAAATCG--TACGATTTGAATTTGCTCAA-TTGAATTTAATTAAGTACATATTTATA----TAGTTTTTAAGTTGCACTGCTGAATTTCGTTTAATTTATTATTGGGTTCCTATTACCACACGTAATACATGTTAATATCGTATGTTAAAGCTCTTATGAGCAACAAAAAACCACTTATTTATAAACATAAACATTTACTTAGCATTTGATATGCGCATTTTTGTATTATAAATATATTTAACTAAAACCGACG
>CG3403 2206927 2207406|1561 chr2R 2205773 2207283 scaffold_4 1181577 1183033 - 51623|1154 1531
GACTCTAATGCAGATCTT---GTATGTAGTTTAG-ATGTCAGATACACATA----GAGCTACATAACGATAACTAAGTAACAAGGGCAGACCCCCTCAAACCCGCTCGCCCCATCTGATCCTAAGTCAGCAATTATTTCGCAAGTTATATTACGATTATGTTTAACTCCTTATTTTAA-TAAATTATATGTAGGCAC----ACGACCTTCTCGTGG------CTGATTCCACGTCAAATCCCCGTAAACTAAACTAAATTCCCTTGACTACTGGCAGCCAAAACACCAACACAGCTGTAC--GTGACTAAAACGTGAACTTTACTATACAAAATTACTATATACACAACAGAAATTGCAATAAAAGAAGTACATACAT
GAACTCATTGCAAATTTTTGTGTATGTAGTTCAATGCGACAAATATATATATAAAAAGCTATATAAT--------ATTAACAAGAGCAAAAG---TTAAAACAGACAAC-------AAACCCGATTCGCCACTTAATTC--------CGTAATGAATATGTTAAAATTCTTATTTTAAATAAATTATATGTAGACACGAACACGAACACACAGTAGACACAACAGATTTTCCTTT---TGCCCAAAAAAGATAAGAATTTTTCCTTAA----------CGAAATGGAAACGCAGTTGTAACAAAAACTAATAAGTAAAGTTTATTCATCATAA--ACTATATAAA----AACATTTATAATAAA-----TTGAAACAG
>CG3403 2206927 2207406|1562 chr2R 2207406 2208854 scaffold_4 1183342 1184877 - 53177|0 0
G
G
>CG3409 2211933 2212485|1566 chr2R 2210738 2212181 scaffold_4 1186977 1188378 - 12248|1279 1569
TCAATATCAATGCAGTGCATCACTGCCAGGTGCAAAC--GGGTCCCTCAATTGTCTTCTTTACAAAATTTAGAAAAATAGTTT--TAATTGCCTTACATTT-CGTACGAATATTAAT-----------TAAAGGGAATACAA-------------------TAAACAACAATCTATGTAACGTATGCAATAA--CAAGTGACCATTTT-CAATCAATCTAAAACTCACAATAAAATCTTTGGAGCATTTGTTTGTACATCAAACGTCACGGATCCGAATAGTT----TCCA
TCAATATTA-----GTGCATCACTGCCATGCGCAAAACGGGTTCCCCTAATTGTCTTCTATGTAAAC----AAATAATAGTTTACTAATTGTTGTAAAATCATATTCAAAGATTCGCCTCGATTGTCATAGAAGAACAACAAATTACACATCTAATCAATATCAATACCAATCTATGTAACATATGCAATAAATTTAAAGACAAGTTTGCAATCAATTTAA--CTAACAGT-----CTTCAAAGCG-------GCAAATTAACGGCTAGCAATTAAAATACTTAGCACCTA
>CG3409 2211933 2212485|1567 chr2R 2212221 2212979 scaffold_4 1189915 1190774 - 29042|0 366
GTTACTTACATTGCACT-GTTGAACGCCGCAAGTAG-----------AAGGCAACTGGAGGTACTACAAAT------------------------------------CCGAACTGTAGCAT------------AATAATGGACTAGCATTAAATGTTAACGAGTTTCTTATGTCAAATGGTGTTGCAGCCATAAAA-----------------------------------------TCAGAGCAGAATTGTAACTGAA-ACTAAGCCTATTCCTAAGCTCTAGCCTGTAAGACTATACTTGACTTGACTAATCGTAGCTAAGTATCAATATACACCTAACATATACTTACCGCACTAGGGCAATTA
TTTACTAAAGTGTCAGTAGAAGAACCAAGCAAAAAGAAATTTATATAAAAATAATTATATATAATTCAAATCAAGGACTACAATTGATAAACTTCAGTGCAATTATGCAGCACTGCGGCCTAATTAAAACACAAATAATGGACTAGCATTAAATGTTATCAAGTTTCTTATGTCAAATGCTGTTGCAGCTGAAAAACAAAAACAACAAAAAAAAAAACATTACCTAAAATATAAAACTCAGAGCGAATTAGTAGATAAATAATTAATTAATGACTAGTTCTTCGCATGTAAGCAAAACATTGACTTGA--AAACAAATATATTTAACAAC-----TATATTAGTTAGTTAACGCACTAGGACATCTA
>ZIP1 2228158 2228354|1579 chr2R 2227342 2230212 scaffold_4 1211757 1214730 - 35878|957 1154
CCAGTG-TGACGCCACTTCAGTATTATCAAGTTATAGAGGAAGCAACAAAATAGTATACAAAACGATTCCCTGGGGATCTGTAAAAGTTATTATATAAAATACGAATAGAATTTCAAAAGAGGTTTCTCAGAAATCTTATCCAACGCAAATAATTAAAAATGTAATAACCATATGGATTAAAAGAGACAATATTTTAC
CGTGTGCTTGAGCTAATGCATAA--ATCAA--TATATGTGA-----------ATTATAATTAACGTATCTATAGTTAGCCTTAACAAGCGT-------------AATAAATTGTTAAATAATCGGCATCAG-TATATTGCC---------GGATCATAAACATGCTGAGTAT----ATCAAACAAGCGAATATT----
>l(2)01289 2232912 2233403|1582 chr2R 2233306 2234080 scaffold_4 1217521 1218339 - 34275|0 109
ATGGTATGGGT----TGGGGA----ATCGGGAAGAATGTACTGAATCACGTTGAACGGCTGT----CAACTACGATGGAGGGTTTTCGACAAGACACACAAAAGCGAGCG
ATTCCGTGGGTCAACTGTGGATGCTGTTGGCAAAATTTTATTGAAGAACAT---ACGATATTGCAACTACTACAAGGGCGTGCCTGCGTGTAGAGA-ACGAGAGGGAGAG
>l(2)01289 2238642 2240095|1585 chr2R 2236099 2246727 scaffold_4 1228141 1239556 - 363754|2846 4721
ATGTGGA--------TAACCACAGACAGTTAGATAGTGATTGATTGTATGATTGAATGATATACCAT-ACTAAAGTAGCACGTATACGCACTGTTGCCA-ACTGATAGAA--------CAATTA--TCAAACCAAAAC---------CAATACCAAACCCAAAACCAAAACCAAAACAAAATACAAAACCAACTCAAACCTGTATAGCCAGCA----AAAGAACCTTCAATGACAGGTT----TCTATAATTAATGTACATCATCTACAT-----------------------ATGTGTGACTG----------------------------------------------CAAAAGACAACAACTATGACAAGAACCA----------------ACTGAAAACTGAATTCGCAGGCTGTGTGTCC--ATAAAATTGAGGT------------------TTCCTCGCACTAATCCTAAACAGTCTGGCACAAAAACATTGACTTAAATACCAATAC---------ATCTTCTGTGTCAGATCAGAACT--TACTCCACACTTTT-----AAGCAGCGAGCC-TTGGGCGTTGTTCCACGTTAAGAAGATCCACGAGT---AGCAGAATCACACGATACCCGA-----------AATAATGAATAATGATCAAGAAAAC-----------------------CTACTAACTAAAAC----------TTTGTTGATATTTTCGC---TTTAACTTTCTTCAAGAGGGGCCGACCTGTGT------AGGTCGTCCCCAGGTCTATAACT---AACTAAACCA-----CACATTTGTTGCATTTTGCCAACGGATTTCAA----------AAAACTTTGTTCAAACTAAAAGCAATTACTTCGACAAACAA-----------------------------------------------CTATAA--AACTTCTGAGAACTTTCGCTCGTATATTTAGTCAGCAA-----------GCTTTGTTATTAACAAATT----AATGGGACATTGTCTTTTGTCAATAACGAACGCCTAAACTTTTTTGATACTACTTCT--------TTTTGTCGCAATATACAATTTACATTTATGTAGTTAGTCTAATTTAAACAAGGGCCAAAGCA-----TAGTAAACGAACGAACAA--------ACGCATAAAATATTTTTTG---AAACAATTTACAC--CTGACAGTGCACAACTGTTAGCTAATTTAACTGAAACGTGTAACTATGAGAGCCTTCAACTTTCATAAGTTTTCATAATAACAACATGAGGAACCA-TAATTTGTAACCACAACTTTTTAGAAATGTTGC---------AGCAGCATACAGGCCGTATACTTAATTTTGTTATGGAATCGAAAATCCAATATTTCTCGCTG-------AACA-TGGCCTCGCATATTGTAGCTCGCCATTTTGTTTCATTTGTTT-----------------TCTTCTGAGAGCGATTTCTGTACCGCTCG----------CTGTTGTT--TTTGTTATCGGTATTTGAAAAATATCGAATTAGAAATCT-TTATCATTATGTTTTCTTAAGCTAAAGCCTACC---------AATCTAAACGCAATTGTAACTAAATCCAACATATATGTAAACAAATTTTGTTGAACAGCAGCTGATAAGTCAAGATTTTCGAAATG-GAAATTGTCAGATCGTAAAAATCAAACGCAAATCGACATAAAGCACTTTTGTAA----------------------------------------ACATAGCTCCCGAATGAAAT-TGTAAGAATATTTAATAAAAGCCATCCAACTCAATAAACTTAG
ATGTTAAATATATAGAAAACAAAAGCAATT------CGAATGATTGTATGATTCAGTGATATGCAATAATTAAAGTAGCACGTATACGCACTGTTGTCATGTTGCCAAAAACCAAATGCAAATAAGTTAAACAAAAACTAAGAACAACAACAACAACAACAAAAACAGCAACAAAGCAAAGCACGCATAAATCTAAGATCTAAGAACTCTCTGCTGTAAAAAACCTTGAACAACGGGTTACTATCTATAATTAATTATCATTAATTATATACTTATATGAACTATAAAGTGTAATGTGTGATTTTGTTTGTGATTGTCATTATCATAATTTGTAAGTGCAACATGCATCCCAAAAGACAACAACAACTTAACTCAGCAGGTTGTGTAAATGAATACTAAAAACAAAAGCCTTAGGCTACACTGCCCAACAGAAATGAGTTTATTTTTTGGCGGCCAAATGCGTTACTTTAATATTAAATA--TTACTTAAACGACACCCGATCAAATGAAAATGTTTAAAGCGAATTTCTTGGAAAAACCCAAAACTAAAACGCAAAACTGTTTGAAAGAAAAACGAACTGTTACTCTTTGTTCCAC---ACGTAACTGCAGCGGTTAGAGCAG-GTTATATGCCAACTGGCCAGCCTTATTGTCAATTAACAATAACAACAATAACGTTGGCCACGCAACTCAAAACTACAATTAACTAATTCACTTAACGTATCTTTTGGTACTTTTGCACTTTTGACTTTTTTCCTGTCGAGGCTGCCTGTCTGTTAAAAAACTGAAACTAAAACTACAACTAAAAACTAAACTAAAAACTAAATTTGTTGCATTTTGTCAATGGATTTCAATTGCGCCAACAAAACTTTGTTCAAATTTAAAGCAATTACTGCAACAACAAAACTTACTATTAACACACACACACACACACACACGCACACACTCGAATATATAACCAACTTTTCAGAA-TTTCAGGTATATATTTAGCTAAAAGTAAATAAAAACAATTCGTAATTAACAATACATAAAAACCAACATGAAAAATTGTCAATAACTGA-GCATAAAC-TTTTTGATACTACTTACTACTTTTATTTTGTTACAATATACAATTTACATTTATGTATGTAG-CTAGTATAAACACAAAACAAATAAATATTTTTTAAACAATTTTACAATGAGAGAGAAGCGCAAACTACAATACAACTAAACTATTTACATAGCTAACTGTAAAGAGCCA--AGCATATTTCATATAAAT-CATAACT-----AAACTTATATTCTTTGTTGTTGTGGCAATTAAAACACAAGCAAGCGCTGATTTGAAAGCTTTAAAAACTAAAAAAAATACTCGCTTATATTCATCATACAGTTCGTATACTTAATATTACGAATGGCTGTCAAATC-------TTTCGCTAGATTTGCAACACTGGCCTCGCAAAAT---GCTCGCCATACTGTTTTTTCTCTTTCTTTTCTCTTCTCTCTCTTTTCTGAGTGCCAGTTCGGCTCGGCTCGGCTCGGCTAACTGTTAGCGATTTGTTATCGATATTTGCAAAATATCGAATTCTAATTTTATTTTCCTTAGCTTATCTTA----TAAGCCTTTTGTCACTGAGAGTCACATTTCTTTTGTAAGAATTTTTAAAATATTTG----------TTGTTGAACAGCAGCTGTAAAGATAAAACAAAAAAAAAGAAAAAATGAAGGAAAATAAAAGAAAAACTCAA----GCAAAATGTATTTTGTTAAAGTTTTTATTAACTCTTTTTAAATGAACTATTTATACATTATGTAATTAATTAATGGAATAAACAAGAACATTTTTTGTAAAAC-TGTAAAGCGAAAAGCAAAA
>CG3420 2268103 2268170|1605 chr2R 2267909 2268801 scaffold_4 1271896 1272872 - 22510|227 303
ATTTAGGATTGGTTGTAGGGCCCTGCCCGTGTGCGAAAAGAGAAATGCATTA------ATTTTGAATC---AAGCAA
GTTTAAAATGGAATGCATTTTGTAGCATATATCACAAATGAGAAATACGATGAGCATCATTTCGAATCAAGAAGCAA
>CG9436 2269414 2269648|1606 chr2R 2269648 2270772 scaffold_4 1273622 1274734 - 52030|0 0
A
A
>Epac 2273725 2274459|1608 chr2R 2273566 2274616 scaffold_4 1277222 1278484 - 18094|192 1130
GCCC----TTGTGGAGCTGTCATCCAATTAGCCTGT---AGCGCGTATTAAGTGTCTAACCCTAGTGTGTGTT------------------------------AATCAACCGCAATTAGCTGCACAGTTATGAGCTTAGCCGGGTTGTTGTTGCTTTCCGAAAGCCAATTGGGCCACGGCCACCACAGCCCGGACCAACTTTC---GTCCGCAT--------------------------CCGCATCCGCATTAGCC-TAAGCTACAGTGTACTATATCTACGACCCG----ACTAGGAACTATCTCAATCTTCTA-ATGAACTGAAACCC-----AAACGCATTTTAATGCAAACGAGAAACTTTTTGCTTTAGTAC-AAAACGATGGAAAA-------------------GATGGAAAACAATTTGAAATTCGGCAATTCCCCGCGGAAACCGAAACGAATAAAAACTAAAC------TTGGACGTGTGTGATACTAAACATTTATAGGAGGCAACATCAA-------------AACAAACACAACTATACAGCATAATTTCCCACAAACCATTACTCTATAAATCCCGCGCGAGCTGGTAGAATAATTTGT------AAAGTTGTACAACGTTTTCGAGAGCA---------------TGGAATCTATATTTTTA-----TAAACCCTAAAC-----------------TAAAACCAA-CTATTAAAC----------------------------------AGTCTAGTTACAGCTAGTTATT-AACAAGTAAGCTACGTAGCGGATAAGTTACTTTATTTATAGTTTTCAATCTTATTTTCATTTGGTATTC-----CGTCACCCCATCTCCTTTTACGGCAACTTGGAAATAAAATACGA----AACCATTTATTAATATTTATTTACACACA
ATCCAGCGTTAACAAGTCGTCGTATAGTCCCCTAGTATAAGCGCGTAATTAGTGTCTATTATGAGTATTAATTGGTTTAAAACAGGCTCCATTAATTAAACTAATTCAACTGTAATCAACTGCACAGTTATGAGCTTAGCTGAGTTGTTTTTAGCTGCTGCCCCGCCGCTAGCGACCAACCAGTGCATTCTAAACTAAGCGGCAAAACCCAAATATAAAAGTAATCAACTAATAAGCTAACTTTATTCATATTAGTCAGAAACTAAGTTATATT-TATGTAAGCTTCGCAAAAAAAACAACTATATCAATTTCCAACATGAACTGAAACATAACAAAAACACA---AAACGAAAAAAAAAAACGTTTCGCTTTAGTACAAAAATGATAAAACATTTGGCTTTCGGGTAGGGGGGCGGGGTCTGAATCGAAATTC--CCAAACCCAATGGA---CGCAACAAAAAAAAAACAAACAAACAAATGGGCGTGTGTGATACTAAACATTTAGAGAAAGCAACAACAGCAACTGCAACTGCAACCAAAACAAATGTACTAAACCTATTTCC-TAAAACTTTACTAAAAAAAATATAAAACAAATAATCAAATAATATATCCAGTCAAGGCTATGCACCA-CTCCAAAAGTAAAGGGTATACACAAGTGGAATCTATTTTTGTAATAAGAAAAACAAAAACGAATAATTGGCATGTCATAAAACTAAGCGACTAAACCTTATATATATATACATATATATAAACATAATCAAATCTAGTTGAAGCTAGTTATTAAAAAAATAAGTTATGTAGC-GCTAAGTCA-TTTATTTAAATTTTCC-------TTTTCCTTTTATATACACACATATAAACATAATTCATTTATGCAAAATCCATGAATAAAATACAAACACACACATATATTTATAGTCAGTTATTTTCA
>Cyp6a2 2291528 2291655|1634 chr2R 2291530 2291656 scaffold_16 813944 814080 - 269|0 138
CCTCCATATTCGTTGCTCCCATGTATATAGCTTAGGATCCAAAGCTAAAGTGATGTACATTTTAGACTGTTCAATTA---TTAAATAACCT--------TAACCTAAACAGCCA--TATTAACTTATTGGCCTGTGATA
AATACACAATTGTTATTCATGTATGAATTAATCAGTTAGCCAGATAAGAATTATACACA---AGAACTCTTTAACTATACTTATCTAATCTAACATTGATAAGTTAAGCAGCTAATCAATTGCTTATACACCCATCACA
>l(2)k03203 2321888 2321904|1668 chr2R 2321904 2322362 scaffold_4 5002056 5002507 + 14686|0 0
A
A
>CG9445 2349887 2350402|1704 chr2R 2349247 2351201 scaffold_4 1400093 1402265 - 8331|766 1392
CAGGATGGAAAGAGTAAAGTGATACTTTAGTAAATAGCACCCATGTATGAGCCATCATAAGAGGAATATAT-GTATCTAATGTTGCACCAACCTTGGGCTACATGATTTATGTATGCCGGTGGACCAATTCGCCCGCATTATGGACAATGATGCACGGCATTAATTAACTCGCAGTCTTACCTT--TTGCAAATAGGATTACAAACACTGAAATGAA------ATAGAGCCATGTTTCGAAATGCCTTAGTTGGGTTTCGGTTTATTCATGTCGATTTGATTTCAATTTGATTTCAAACACAAATTCCATTT---------------------AAACACAGGGATGCCGGTGCATCTGTATCTGTGTGCGAGT----------------------------TGC----------------------AGATTAGTAGAGAG---TTGTAGTTACATTTATTTTACACATAC--------ATAAATACGCATA-------TTTGTATACATTTTTAATATG-------------CTCGTTCAAGATGAATTTTTCTATTTTTCTTCGAATTTACCATACGCTCTCTTGTGCAACATCAATAATAAATATTTACGTTTGTCTGCATCGGT
-------------------------------------------TGTTGTAGCCCAGCTATGGGGAATATGTGGTAGCCAGT------CCA-------GTTGCATGCATAATAAATTCTATGAAACCG---TGCCAGC-------------------------------------GCCTTACCTTAATTCCAAA----ATGACGAGAGCTTAACTAAAATGATTATAGACCCATTTATCATAA--------------TTTGGTTTATTCATGTCAATTTGATTT--GTTT--CTCGGAACACAAAATCCGTTTTACACATACATATATAATACGCAACTTGCGTGTAATGGTCTATATGTGTGTGTGTGTGTGTGTTCGTGTGTGTGTAAGTCCTGTAAATATGCATACATATATATGTTTGTAAATAGATTAGTTAAGAGATTTTGCAGTTACATTTATTTTACACATACAATATTTGATATATTCGCAAATATTTATTTTGTATACATTTTAAATACGGATTACGAGTACACGATTTCAATTTGTAGTTCCTTCTCTCTATTTGTTTTTAC--TTGGTTTTTTTTTTTAA----------AGATTTTTGTATTTGTGTTTTTCAGT
>coro 2373814 2374874|1727 chr2R 2373633 2373974 scaffold_9 4297869 4298233 - 553|194 380
GCGAGAGCAGCGTCATTAAACACCTACCGATT--TTGTAATTCACAACCATTGTAAAATGAAGACTATATACATATACATACATAAATACTCTATATACAAATAATTTACAATTTGATACGGAATAAAACAAAATACAATGCCAGAAGAAGT------------------------TGGGTGCTAAT
GATAAAACAAAATAAATAAA-ATGTATTTATTTATTTTAATTTATATA---TATACACTAGAGAGTTATTACAAATATATATATACATAATGTATAAGGCAAAA----ACAAAACAAAACAAAAAAAAAAAAACAACAAAACTTAAGAGAGTTTAATTAGCTGAAAGTTGGGACAATGGATAAGGAT
>coro 2373814 2374874|1728 chr2R 2374059 2374074 scaffold_9 4298340 4298355 - 650|0 15
AGAAAGTAAGAAACCA
AAAAAACAAAAGAACA
>coro 2373814 2374874|1729 chr2R 2374075 2377216 scaffold_34 707345 710581 + 90000|0 914
GT-----CTAGCAATG-----AAACGAGGACTGAACTGATAA----AAATGGGCGGAATGGATTGGAGGAGAGACAGAGA---------ACTGCTTGTAGAAGCTCGTAGCTACGCTT--AATTTCTCT---ATTGCAACAAAGCGCGCTGAGGACGAATTGAAAAAGAACTTATTGTCTATTACCATTATGGTTTCGATTATTTATTTTTTATAATTTAATATT-------------AGCGAAATCAGTTGAGTGCGGGTGTGGCACAGAT-AGGGTTAGAGAATGCCGAGCTAAATCATCTAATCGAACTTAAGCGAGCATAACCGAGCAGACCTGGACGCTTAACGTATAAAACATAACATAAAACTACATCCTGCCAA------------------------------AAATATATAAAAAACCTAACGAACTACCTACATTTTGCGCCCAAAA--------TCAAGCAGAGCGAAGGGCAGGTACTCGGCCCTTTGAT--------CGGCTTGTTGTTACGC--------AAGTATGAAATTGTTGTAAATTT---------------AACAAAGGCAAATCATAGACTAAACCTCAATCACTTAAGAGTTAACACCTACCTACCAAATTTGTACGAGCTCCTTTCTGTA-ACGTCTGTATATTTGTACGTCCCGGAAGTTTTCATGACAATAGCTGATAGAATCGATACTGTTCATCCTAGCTGAGGCCCCCTTAATCAGTC-ACATTTCCCTGCAAATTGTCGTGTCAAACATAGCGAATTTAGTAAGAAAGTGATGGGGGTCATCGGACTTAATTCGTTTTCGTAATCAAAATTTTATTGTTCAAACTAATGATAAGCTGTATTTTGAAATAATAAGAGTAA--CAATAAATGCAACAAAATCAGAA
TTACCAGCGGGCGACAGACATAAACAGGGAGAGAGCAGGCGAGGTTAACCTAGAGAGAGAGAGAGAAGGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGGGGGAGCAGCAGCTCGTCGTTATCGTTTGAATTTCTCTTGAATGGAAAATGTTTATATTTTGTACACGCTAAATGAGAG-TTGTCGTCGTCTATGATTATGATTTCGATTATTTATTTTATATAATTTAATATTAGGTCTTTTTACGAGCAAAATGAGTTG---------------CAGATCAACGTCAGAAAACAGCAGAGCAGTTCATACAAACACACACACACACACACACACACACACAC-----------ACATA--------AACACACAAAAGAATCCTGCCAAAAAGAAGAATGCAAATAAATAAAAAAATTTAAATATATAGTTAACCTAACGAACTACCTAAAAGTCGCGCCCAAAAGATCGTATCGAAGCAATAAGTCGGAGAAGGAGTCTGTCTGTCCATGCGAGCTGTGTTTTTTTTTTGTGTATCGCAGGAAATGTGAAATTGTTGTAAATGTAACAAGAAAAACAAAAACAAAATCAAAGTATAGACTAAATTGCAATCATCTAAAAGTAATGATATATCCTACCAATTTACATACTTTTCTATACATATACATATACATATTTATATAT-------ATATATATACACATAACTGAT---------------------------TACCCCCCTATTGAGGCAATATATTCATGACAATAGCTTTTATAACGATTAGGCA--TACGCATACCGCCGCCGCTTTCATTAAACAACAAACAAACAAAAAACAACATTTTTCTCGTTCTAACTAATAATAAGTTGTATTTTGTAATAATAAATGAAAGGAAACCAACGAACCAATTTTAAAA
>Spn4 2387717 2387809|1740 chr2R 2387763 2388346 scaffold_34 724233 724722 + 7654|0 51
GCAATAGGAAGC-----TTCCTATGAAAAAAAAAATTGAAGTTCAATAAAAT
AAGACAGATGACAACTATTTTTAAGTCATAAAACATTTAAATGAAATAAACT
>Spn4 2387962 2388339|1740 chr2R 2387763 2388346 scaffold_34 724233 724722 + 7654|210 588
GTATGTTTATGAGCCTTACTTCGCTGCCCATGCCGAAGCCGGATCCGATACGTTTCAATGTCGACCATCCATTTACATTTTACATCCTTAACAAGGACTCAACCGCTCTCTTCGCTGGCAGCATAAAGAAACTCTAAATAGGCAAACATACTAACCAATCCACAATGTTACTCGAGGGTCTCGTATTCATTTAACGTGCAAGCGGGTCAGTCCTATATTGCTGGCTTGACGAGCATATTCAGCTTTTACATTGTCTATAAGGATT-CACAAAATTATAGTCTGTGCGCAATTGATGATCTTATATATACACTTAATATTTTTATACTAACCAAGCATGTAGCCGTAGCCTCAATAAAGTCTAAAAGCAAATGTCTAAAA
CTATGGTCATGTGCTTTGCTTCGATGCCCATGTTCCAGCCGGAGCCCATACGTTTCCATGCCGAGCATCCATTTATTTATTACATTGTCAATAGGCAGGGCGCGGTGCTCTTTGCCGGC---------AAGCTCTTAAGAG------------------------------TTTGAAGCCCCGAACTA------------------------------TGCGGGCCACACAAATAGAAACAACAT-----TCTTCTTTAAAGACTGCACGCGATGA-----------CAATTTATTGTACTAAACATCT--------TTTTTCTACTAATCCAGCATGTTG-------------AGTGTAAAAAAATATATATATAAAG
>Spn4 2388340 2388409|1740 chr2R 2387763 2388346 scaffold_34 724233 724722 + 7654|589 595
TTCACAG
TTTATAG
>Spn4 2388340 2388409|1741 chr2R 2388347 2388413 scaffold_34 725048 725109 + -221|0 62
AGTTAGCACTCCATCAAAATCCACCAATCACAACCATTGAACTGAAATGCAATGTAATCCCAA
AGTAATTATTCAGTCCCTGTTC-----CTGCCACATTTCTAATAATTTGCATTGTCTCCCAAT
>Spn4 2388701 2388759|1742 chr2R 2388414 2391020 scaffold_34 725914 728680 + 42415|309 372
TGGTACCTGATTCTTTGGCAAAACAATAAAGA-----CAGCTATTTATTTACAATGGAAATTAA
TAGTAACAAAATTTGTAGCACATCTAAAAAGGGTATTCCTCTTCTTTTTTTTTCTGAATAAGTA
>CG33558 2438294 2438354|1806 chr2R 2436358 2438714 scaffold_34 784550 787300 + 46000|2456 2516
ACCACCCACCTATCCCAACACCAGCACAACCACCAATGCCACTTGCGAAGATCAGTGCTAA
ACCACCCGACTATCCCAACACCAA------CCCCAACCGCTCTTGTGATGAAC-------A
>Cyp6u1 2483925 2484117|1858 chr2R 2483919 2485898 scaffold_34 831638 833681 + 57463|6 234
AGGAGGCTCTGCTGGAGCATCGC---------ATATTTTGTATTGTTTGC-TTTACAAAGCGTTTAAGTTGTTTTTATA----TTTGTATATGCACCTTTTTCGTTGATTTTCCTAAGCTGTGGACTTGTGTGATAATGCTGACGATGACTTT-----------TATAATCTT-----------TTGCACCAAGCTCAACAACGTGAACAAATAAATAATTTAGTTGTT
GGCAGACGGGGTTTCGGCTTCGCTTTATAATTATAGTTTGTTGCTTTTGTGTGTACAAAACGCTTTGTTTTTTTTTATATATTTTTGTATTTGCGC-------------------------TAGACTTGTGTGATAATGCTGACGTATACCTTAAATGATTAGATGTAAGCCTGTGGGGTTGACCTGCAACAGTAACAAAAGAATGAACAAATAAATACCTTAATTGTT
>vimar 2487095 2488365|1860 chr2R 2487039 2488028 scaffold_57 103685 104731 - 23176|57 1134
TCAGCCCACCCTTAGCCACACAGACACACTCAG--AACCGGAGAAAATAGTAGTTTTCACCCCAAAGCAACGATTCAGAT-GTAGACTTGACTGTAGTTTGGTAAGAAGAAAGTGCAGATTCACAAGTTAAGCAGTTAATCAGTTAAGCACACTGGAACACGCGAACACGAGAGGAGCAGAAAGTATTTTTTAGACGCAAGCGTATTTTGACTGCATTTATGA-AGAGAATCCGATGTAGTAAGGA-GTCACAAATCGTATGAATATTTATA-------GCATACATACATAACATATACGTATAAATATAATAATATTAATAATTTAGCATATTAAT-CTTTTCTGTTACATGATTTTTAAGAGCACAATAACAACAAATCGTGGTGATATCGCTAAATATATTTAATAAATGTATTTTATG-ATTGTACTTATAATTTTCAATCGACCTCTTT----------------TAAACCGTTGCTGGCACAAACCAAAAACGAGAAGATAACAAAACATTTAGACGCA----------CGACGTAATTAAGGTATTTTAATTGGTGCACAGACACATATTGCAAACGGCATCCCATATATT--TATTGTAAAACTCGGCGAAGTTATC---------------------------------CAAAAT--GCATTTTTAAGCTAACTT------TAAAACATTAACAAAACTGCAACTCAGTAACAATCAGCAATCCGAAAATAGTTGAAAACCAATAATGCAAATATTTCAATTTTACAAATCGTAGTTTATGGAGTGC---------TACAAATTTTACCAATTATTAA----AAACGATGTACT-AATGTTTGGTCACCAAAAACTAAAAA------------------TTAAAC--------------------GAACACAATTCAAGGGGAATGGTGTTAATATATAAAGCGTTGAGACACCCACACACATAAATGCGAAAACATATTTATGAACTCTAAACACAATAATGTACATTT-AATAATTCAAATAAAATTTGAAATGCATGAGAAA--------TAAGAGAAAACCAAA
TCAGCCCACACTCAG----ACAGACACACTCCACAAGTTGGCCCCAATTGTAGTTTCCACCTTAGAGCAACGATTCAGATCTTAGACTTGATTATA-----------------TATAGTTTCA----TTAACC--TGAAACAG---AACAGACGTGAACA---GAACAGATGATACG-GGAATGTATTTTTTAGACGCAAGCGTATTTTTACTGCATTTACCACATAAAACATAATTAATTAAATATACTACATACTATATATATATATATACACACATATATATACACGTAAAATATATATATATACGTAT--GTATTAA--ATAAGGCATATAAAAACATTTCTGTTACATGATTTTTAAGAGCACAATAACAACAAAACGAGGTGATATCGCTAAATATATTAAATAAATGTATTTTACGTATTGTACTTATAATTTGTATTTGAACGATTTACAAAAAAAAAAAAAAAAAACATTTGTTGGCACACATCAAAAACCAAAAAGAAAAAACAATTTCAAGCACAATTTTGCATGCGATTTGTATTAAGCATTTTAATTGTTGCAC--------TTTTCAAAATTTATAATTAATATTAGTACCGTAAAACTCACCGAAATTCTCTCTCTCTCTCACACACACACACATACACACAGTTGAAATTAACATTTTTTAAACAATTTATAGCAGAACACAAAAGAAAAATTGTAACCTTATAACAATCAG-----CGAAAATAGCTTAAACTCG--AATG-AAATATGCAAATTTTACAAAGCGTAGTGC-TAGAGTATATATATATATATATATATTAAACATT-TTAACATTAAGTATTGTACTCAATTTGTGGTCACCAAACAACAACAACAACAAACAGAAAATTTCTTAAACCTAACACGTAAGGCAAGTTTAAGCACAATTTAAGAAAA----TATT--TATATAACGCGTTGAAACACAC------------------AAATATTTATAAATTCGAAACACAATAATGTACATTTAAATAGTTCAAATACAATTTGAAATGCATGAGAAAATAAAATGAGAGACAAAACCAAA
>vimar 2487095 2488365|1861 chr2R 2488319 2490500 scaffold_57 104735 106950 - 122595|0 82
GAA--------AACGGGGA-CTGTCA---TTGCATTTA------------------------TCCCAGCACCGCAGGATGCCT
GGATTATAGGCAGCGGAAATCAGGCACATTTGCATTTATACGAGAGAAATCTACCCTCGCTGTCCAAGCACCGCCAGTTGCCT
>Tsp42Ed 2521673 2521786|1895 chr2R 2521249 2521737 scaffold_57 233444 233997 + -1464|486 564
CTCTTTAA-------CGTCATAAAGTCAATATGAATAAATAAAAC-----AAAGTGCTTCG--CATGCTTACTGTATAT
CTCTTTAATATGTATTGTCGTAGAACGCACACGAACTAAAACAACTTTGGAAAATGTTCGGTATATATTTGAAGTAAAC
>Tsp42Ed 2521673 2521786|1896 chr2R 2521786 2521793 scaffold_57 234070 234077 + 746|0 0
A
A
>Tsp42Ep 2568210 2568400|1955 chr2R 2567219 2571457 scaffold_57 192664 196756 - 141993|1037 1227
GCTACCATTAAGATCTTATGAAAACTTTGGTTTATTATTTATCCAAGTGGCAAGTGCTTATCTATAAATGTCATTCGTGGTTAGTAGGTGTAGCGACGAGTCTTGTTGGTCAGCTGGCAGCACAAGGTGATACCCAAGATGATGCCTACGACCTGTAATAAAAGAAACAAAGTGTTGCATTAAACATTTAA
GCATCTCTATGGATCATAGCAGTTAAGTCGTTTATTGTAGTT-----TAGCAAATGC-AGCGTATAAATCTTAGTT----CTAGTACGCGTAACGGCGTGTTTTTGTGGTCAGCTGACAACACAGCGTTATGCCCAAAATAATGCCCACAATCTG--AAAAGATAAACAAA--------------------
>pgant3 2569464 2569970|1955 chr2R 2567219 2571457 scaffold_57 192664 196756 - 141993|2328 2866
-GAGTAGGATGTCATGCCGGTGCCAGGAC-ATTTAATCCAATAA--------CCCTGCCAGCAACTTTTTAACGCAATGTGATATTTATTGAAATTGTTTTAACGAAATTCACTCGTTAATTTGTTTATGTGAACAGTAACCAACCCACAAGCACACGAACTTCAGACACCTGCAGTCCTGTTGTCTAACAAAGCCTGATTTCACTGTCGCAATTTAATATTTAACTGCGCGTAAACATGAGCAGCAGCAACATATGTGTGACAGTGGAACCAGTCTTTACCAAACAATCGTACACCGATACAGACCCACTTGAATTGTTTTTAAAACACACTAACCGAATGCGTGGGAGAGCTTTTCTCCCCCCACGCATTGCGACTCTATCAATCTAGATAGCATAGTGGTATGCTATATCTACGTCATATTTATTAAGAAGA-GTTAGAAAATT---TTTAGCTG---TACTTACTAACCTCGACCTTAATTTTTA----------TATCACTTGAATAAAGCAATCG------AATGTAGAGAAA
CAACTTCGAAAACATGATAACGACAAAACGAGATAACACAAAAAAAAAACCCCCCTGCCAGCGA---TCTAATACAATGTGATATTTATTGAAATTG-TTTAACGACCCGCCCCC----------------------TCACACACACACACACACGCACACT---GACACATACACCTTGACACGCCCACAAGAATTGTTTTGAGTG-------------TTTGCCTGGGAGCTTTTCTCCCCTGCA-CAAAAAACGTG----AATGGTACT--------CTATGCAATTCTACGTC-ATATTTATTAAGTCAAAT--TTTTTAGGCAATTTTAA--------GTCGCAAAGTAACAAGTACTTTACTTAATAC--TTTTAACATTTTA----------TGACACTTTAATTTTCTAACAAATTAAATAAACAAATATTAAAAAATTAAGCTCAGCTGCGACATTTAA-AACAGCGACCTGCCGCTTTAAATAGAGGCTCATAAATTACATAAAAAGAATGAGAAATAATGTAGAAAGT
>Tsp42Eq 2573920 2574266|1959 chr2R 2573660 2574599 scaffold_57 198376 199309 - 7340|315 678
AAGCTGGCCTTAAGTTTCTACCAAAAGTA-TTAGAACTGTACGAATGTGAAA-----GTGTTCCTAATTATATGAGGGAGTAGTTGCCAAAACATGAATACATTAAATTGGTAACGTTAATATATTTCAACCGTATTTAAATTGCTCAATACAAAAT-----------TTCAGAATGTATGCAAGCACTTTTATAAAATTAGTCACACTTAAACCGATTCGTGGTACATTTGGAATGTTGTGTCGCTTTCGACGTCTGGGTCTAAGCTGTTTTTATGTGCAATACTATGTATAAGAAAAGTATGATTATATATTTAACAAGTCTATGAAGCTTATTAAGAAAATAAACAATTTAATGCTTAGTA
ACTTTGGCTTTAATTTG----TAACAGTATTTCAAATTGTACAAATATTAAATGTTTGTTTTGTTAATCAT--------GCAATTTAAAATGTGCGCGTAAGCTAA--------------------------------AAGTTGCTCAGTTAAAAACAGCGCCATCTGTTGTGTATGAAGACAACTATTCATTTAAAATTAG---CAGTTGAAGCAATT-----TAAATGCAAGGCATGTTGTAGCT------------------GATGCTGTGATTGGCAATCTCATCTAATGCATAAATGAATCTAACTATTACCTAATTACGAACACCTTATTCAGTAAA----------ATTGTTATGCA
>Cyp9b1 2639650 2639853|2032 chr2R 2636226 2639673 scaffold_57 276852 280592 - 113995|3809 3841
TAAAATACACAGACATAT---------ATTTTA
TAAAATACTCATATGTATGCGTTTCGTATATAA
>Cyp9b1 2639650 2639853|2033 chr2R 2639674 2639743 scaffold_57 280595 280648 - -208|0 69
TCGTTTTGAATAGGAATTGACAGGAATTGGAGGATTCCGGTTAATAAAAAGACGGATTAGTTGATAAGAA
TTATTTTGATTATGTTTCCATATACACTG-------------ACTTAAATGATA---TACTTAACAAATA
>Cyp9b1 2639650 2639853|2034 chr2R 2639822 2639848 scaffold_57 280716 280739 - 291|0 26
TGTAAAATCGAATTCCGCTCATATTGT
TTGAA---CAAAACTCACACACATTGT
>Cyp9b1 2639650 2639853|2035 chr2R 2639849 2641396 scaffold_4 1529046 1530586 - 15487|0 4
GATGA
GATAA
>Cyp9b2 2642082 2642188|2038 chr2R 2641798 2644085 scaffold_4 1531934 1534177 - 13594|317 427
GCTGATTTAGCGGTTATAAG----CTCACAAAAATATAGATGTTTTACTTATTGTTATGATTTATACACACTAATTGATATTATAAAATAAAATATGAAACATAATTGAAA
GCTGCCTGAATGCATATGCAACCTTTCGCCTGAACCTACAAACTATA-TTATC-------TATAAATAAACTAGATAAGATTGCAAAAAAAAA---------------AAA
>Spn43Ab 2663478 2663543|2059 chr2R 2663408 2664979 scaffold_57 310301 311771 - 57775|75 149
GCTAGATCGCA-GATACGGAGTAGATCATTTTGTTAA---AACTTACAAATAAAAAACACACGTAAATTG-----
TGCGGCCTGCCTTCCCCCAACCACAACCTTCGGTTAATTTGAGGTGCAAATTAAATATGCGATTTGTTTGTTTTT
>Spn43Ad 2665550 2665692|2061 chr2R 2665547 2665891 scaffold_57 312945 313253 - 7358|3 147
GTCTTTCTAGGCATACCTAATTCTCGATTCCAATGCTAGTTCAAGCCGGGC--GGGCTATCGCCTTATCAGCCCCACTCAAATCTCCGCGAAATAAACAGAATCACCCGTGGCCAGCCAAAGGTGACAAATGATTTGTAAACACA
AGCCGGGGAG---------------GAGTCTAATGCCTGC----ATCGGGCAAAGGTTGTCGGCTTATCAGCGCC---------------------------TCGCC------------AAGGTGATAAACGATCGGTAAACAAA
>nec 2668289 2668397|2064 chr2R 2668384 2669838 scaffold_57 315878 317334 - 35764|0 13
AATGAACCAAATTC
GAGGCAGTGAATCC
>Or43a 2744652 2745031|2132 chr2R 2744787 2746133 scaffold_45 19026 20242 + 31810|0 269
GCTGAAAGACCGAAAAAACCGGAGTATCCCCTTCCATATTCCCCCTGCTCCTTTATTTTCCTTTTCCTTTTCCCTTTCCCTTTTC------------CCATTCGCTTTTCCAGCAATCCGGGTAATGCAAAAAGTTGTTGCTGGCTGTGGTCCTGGCTGCTTGTTTGGCATTTGCATATGCTTGTCG-------------TTTGAAAGGATTTAATCGGACTGCTGGCACGGAGTCGGCATCCTGGCTCCTGGATCCTGGCATGCAAATA
GCTGGAAGCCAAAAA---------------------------------------------------CTTTTCGGGCTCCCAATTTGGAGAAGGAGTGGCAGTCGCT-----GGCAATCTGAGTAATGCAAAAAGTTGTTGTAGCCAGC--------------------CATTTGCATATGCTACTCGTTGGCGTAGTTATTTTGAAAGGATTTAATCTGGCTGTT----TGTAGTCTGGACTGTAG--------TGTTGGCATGTAGATA
>Ady43A 2754873 2755463|2138 chr2R 2755105 2756333 scaffold_45 24139 25413 + 40515|0 435
ACCGACGCCGTGCATCGCC-------------------------------------ACCTCAGATAGCGCACAACAAAGCACCAAAGTAGACTCTTAGCTTGTAATTATTCCG----GTAATCTCCCCA-AACCTTAGGCTTAGTCAAACATTTGTCCACCATTTCACCCAAG-CAATGAACTTAG------------------TCATAATGTGACTAAATAA----AAATGATTTATACATCGTCCTATGAAAGATAATAATATTTCTGAGTGACTATATGTGA-----CTACATTTTATAATATATATAGCGAGATTCCTATTGTATGCAATTTTTTAACATTTAAATATCTTTTGATA-----GTTCTATGTAAAC--AGATGTTGCTTTCTCAAAAGACAAAACAGATTTATCTAAAACCAGTACATATGTA
CCTGGCGCCACACCTAGCCTTTGTCTTTGGTATGCGGATCACACAAAGATTTCGTTGACTCAGCGAGCGCGCACACTGACACCAAAGTAGACCTTTATAACACGAATCTTACACTATATAATATATATATAAACATATATATATATATATATATGTACTTAGTTCCTTATGAGACAATGCACTTAGTGAGTAATCTATTTGCGCTCTGACTGTGGTTAAACAATGAGAAAATATTTACAAA------TATATTCAATAATAATTGTTTTCA-TATCGAAAAGTGAGCTGTCGAATTTTTATA--------AACGAAAATCC-----AACGCAATGCTCCA-----CAAATA-CTTTCTATATTTGTGGTATATGTAGATTAAGCTCATGCTTTATATATATATATACTACATAT-----AAATCAGTGTATCTATA
>CG1845 2784345 2785084|2157 chr2R 2783928 2786708 scaffold_45 65570 68371 + 79010|431 1275
AAGCTGATGGCCCGATTGCA--------------ACTGTAGGCGCCGC-----TCGAAAGAATTCAGCCATTTAGTTAGCTCCCCCACAAGGGATCGCCGTATTTTTATATCTCGTTGTTGTTACTTGATACTCGAA----------------------------GATGACGCAGTTG----------AAGAAGGCCCTCCATTAGAGTATTTCGTTGGC------------------GAATTTCCAA-TTTGCACTGCAAGTGTCTTTAATTTTCGTTTGTTGCCAAGCCAAGTCAC-CAAGGATCGTTTACCCCAATACCATTATGTACAGTACAGTTTTTGTAATAGGCGCAGTTGGCGAAATCGTTGGAGGATCCTTACCCTTGTACATTATTTGGCTTTTGAGACTTCGATTGTGAAATGTTAAGTAGATCCAGGAATCGCTCGAACTACAGCAACATGGAATTTATAACCTCAAGACGATTCACGC-GAAATCAAATCAATGTTTAAGTTAAATAGTTTTAAGCTCTCCTACTGTTAAGCCCGGAATCAACATTATAAGCACAAAACCAACCGCTAAAACCAAGCAAGCAGTCGCCTCAAGTTAAAGTCGTGTAAAAACTAGCCGCTATATAGGGGACTAGAGATGATTATAAACATTTACAAATAGCATTACAAATTGTATAGATGTGAGTGTGTGTGTGCGCGTGAGTCTCCATAAATCGATTTATCTCTATATGCA----AATAGTGTAC--GTCTTGATTTCCACATGAACAAATA---AACCATTTG---ATTATTGCGATGTATTAAAGAGATGCGG---------------A
AAGCTGTTTGCCCAATTGCATTTAAATGTTAAATGTTAAATGCGCCCCCGCCTTGTAAACAACCCGTGTAT---GCTCTATTTTCTATTATGTATAGCTCTATATAAATATATA--TATATATATTTAGTTCTCGAAATAGACCAGCCTGGGAGCTGGATGGCTGGCTGATGCTACTGTATTGTTACTGAGAAGGCCCTCCATAAGTGTATTTCGTTGACTTTTTCTTAACGTTTCGGAACTTTCCAATTTTACACTGCAAGTGTTGTTG--TTTCATTTGTTT---ATTTAAACAACGAAAAAAGCAAGCAAACAAACAAAATTA--TACAATA----TTTCG----ATGCCTAGTT----AAATTTTTGTAAAATATAT-------TTCAAAATTTTATTTT----------ATAATAAAATCCTTTGCAACAACAACAACAGC---AACAACAACAAAATGAAATTTATAACCTCAAGACGTTTCAAATAAAAATCAAATCAATGTTTAAGTTAAATAGTTTTAAGC------------------------------AGCAAAACGAAACAAA---ATAAAATTAGTTAAGCTACAAATTTTGAAAAAAAACGTGTAAAAAGAAAAAAACAAACAG------AAAAAAAAAACAAAACATTTACAAATAGCATT--AAATTGTATATGTGTGTGTGTGTGTGTGTATGTGTATCTGTGTGTCTGTGTTTGTGCGTATGTGTGTGTTTATTGTGTTCCGTTTTTAATTTCCATATGAACAAATATGCAAAAGTTTGATTATTATTACGATGTATTACGATGATGATGATTATTATTATTATTA
>Dscam 2831367 2832495|2193 chr2R 2829485 2832580 scaffold_11 255951 259391 - 39158|2241 3607
TTTGTAAGCGCCCTCTGCGGCGGTGGGCGTGGCATTTTAGCTTAGTGTTTTAGGTGCATGAAGTGCGTGGGAGTTGAATGACACTTAGAGACACAGGACACAGATACACACAGACAGAT---------------CATCAGGACACAAGGAAAGAG---------------------ATAGAGAAAGAGAGGGAGTTATATACCG----AATATACACGTAAAATATTCAACTACTTCGAGTAATTATAGCGAAGGAATGCAAGTTTCAAGAAACATATTTATAT---TGTCTATGCAAGCAGCAAAC---CAAACTTACATAAAGTATATAAGTACATTCAATGGATAACT-ACTATAAGAGAGTGCTGGAGACACTGAAG--GAAATTACTCAAGTTATTCGAGAGGAACAGAAAACGAAATCTCAAGAT---------CAAGATCATACTTACGTATTCGA--------------------------ACTAATTTTCAATAATGTACT--TTAGTTTTAAGCGGTGT----CTACCGAAATATC---AGAGCAACAGCAACTGAGATGGATTCTTGTGTGTAAGAGGAGATGATTCG-------AAATCTGTTTGTGTAAACT--TTTGCCATCTATGCCAGGAGCAGAAAACTCATCCTTTGCCTAGCCTAAGTCAAAGTCATAATATTAACTCGT--CTAATTGATA-TATTTAGTCGT-------------AACATATGCGTA-------ATATGTATGATTTCTTCCTATGCATTTTATAATTCGTATGG-----------ACAGCGCACAT---TTGGAGTTTTG-TTTGCGTT---TTGCGTTGACTTGTGATGATTGTTAATTTACAGAGCTTTGTGAGTGAGTACTTACGATTGTGCTCATTACTCGCTTTG-------TTCTTTAT-TTACAGAC---AAGTGATTGTCCTATCTTAGTTCGC---------CCTTAT-TTTTAATTCAAAAATGCGCTTCCAACAGAACA-----------AATCGAAACTGTTCAATGCACAAATCGCAGCCACAACAATTGAATGTATTATACAAGATCCCCAGGACACCGAAAAA------------CCAAAACCCCTAACCCGAAACACAGATACACTC----AAGCACGATTTATTAAACCAATTCTGATATAGACCG-TTCTGAACATGAG--TTATACGCATTTGAAGCTTTAAGAGAACCTGAAATTGTTTATTT-----CACTTCA---TTTGAT-CTATC----------------CTAAGTTATTAGTTCATAAG-------------------TTGCTAAATATATGATTTTGATTTTATTTT
TTTGTAAGCGGCTT-----GCAGTGGGCGTGGCATTTTAGCTTAGTGTTTCAAGTCAATGAAGTGCGTGGGAGTTGAATGACACACACACACA---AACACACATACATTAATATATATTTATATATATATATATATAAGTATATATGCAGTCAGTCTTATTTGAAAAGCATTTGCATCACAGAAGTAAGCAACGCATAAAGCGCATACATATATATATACAATTATTAACTATTTCAAATATTAATAAAAAAAAG---------TCGAAAAGCATACTTATATGCATACACACACAAACA-CACACATACACACATACAGAAAATACCAAACAATGTTTGTCTAAAAACCAAATGCAAATCAATTTTTG---CATTTAAATTAAAACTCTTAAAA-----CGAAACGAAAAGAAAAGAAAAACAAAAGATATATACAAATAATACATTAATTATAAATTCAATTGTGTGTGTGCTTGCATAAAATAACGTAAATTTTTAATATTGTATTTCTTAGTTGTAAGTCAAGCAGAACTACCAAAATATCAAGAAGGCGAGAGAAACAGAAGAAGTTCTCGGCCCAAAAACATAAATGTCTAGCTTGTAAGATTCTTTCGGTTTGATTTTCTTTGCCATCTATGCCAAAAGC-----ATGCACTAATTGCGTAGCCTAAGTCAAAGTCATAATATTATATTGTAACTGATAGATATTGTTTAATTTTTGATGGTCTGCCAATCCTATAACTACGATCATATATGTATGCCACATGTGTATGACATTTATATTTTGTTCGACGGCAAGTAACCCAGCGCACATTCATTGGAGTTTTGCTTTTTGTTGACTTGCGAAGTTTTGTGATCA----TAATTTTTAGCAGTGTATGAGTCAATATTT--TATTG------GTACTCGATTTGATAACTATTTTTTATCTCACATACGTTAAGTCTTTTCTTTTGTATAATTTACACCGCAAATCCTTGTGTTTTTCTTTTAAAATGCGCTTCCATATAAGCATAACTCAAGCGAATAAGATTTGTTCAATGCA--------ATGCACA--AATAGCATTTATTTTACAG---CAGAAAAAAAGCGAAAAAAAAGCCACTTAGTCACAAGCTCTAAATTGTATTATACAAAAGCTCCACAAAGCGCACTCTTTT------ATTTATTTACGAATCGTTTCTGCACTTCAGTTTTTTACGCATTTCAAGCTTTAAGACAAACTGATATTGATAATGTGCACACACCTCAATTTCTGATACTGTCAAATATGTATTTAAGATTTAATTATTATTATTTAAGTTTTTTGCGACACATTTGTTTGCTAAATACACA---TCAAATTTGAATT
>cos 2893977 2895009|2242 chr2R 2893273 2894709 scaffold_11 327614 329084 - 7967|830 1668
ACAAGTTTCGTCCACAGTCATGACACAAATAGACTACAACACATGGTTCTCATTCCGGCTCTTTAGCTGGGGAGCATTTATTTTAGAAACCCCCACACGTACATACACCTAGCATATGAAAGTAACTATCCTCATGAGATTCAACCGTAAAGACTTGA--CCTGCTACTTAAGATACTCGCAAGACAAACCGTACACAAA------------------ACTCGCTCAAAGTGTTGACCTAA----GTCTCCGCA--------------TTGTTTAACTTGTACATA-ACAATA-------------ATTATTAGGTAACCACTTAATTTTAATT----GATTTTGTT------AGTTTTAGCTTAGTTGTAAACACTATTGTGTCTTCCCTCGAATTTTAATTGACCTTCGATACC---AATTACAACATACGTAC----TCCATACCCAA-GTGTTAACCTTTAATATTCTATCAAAAGCATTTACTCTGTACAACTTATAAATGCTTCAAATCGCAGTATTTGCGCTAATCCAATACTCAT----------------------------TTTGCATTAACTTAAAATTAAAATTCAATACTGTTTGGTTGTGTACAACGTATTTTTTATTGTCCATTGATATAGATGCAGTTTGCACTGTACTCCGAGTAACTTAAATTGATATTAATGTATGTATGTTCCCTCAATATCAGCGTGTGAAAAATTATAAACACATTTGTAAGCATACATATTCCGCCAAATCGCTCGGCATGGCTTTGTGTGGATATTG--------TTGGTTAAGCAAATAAATATATACAAACTAAACTAATCAA
ACAAATCGTACACAAAGACATG-TATCAATAGACT-TAAC-CATGGTTTTC-TTCTGACTCCT-------GGCGCATTTA-------AATGTCCACA---------------------AAAGT-------CCCGCGACTGGCAAATGTAAAGACTTGAGAATTGTTACTTAAAATACTCACAACTCAGACTTCCCAATAAGATGGAAAATCGCAATTAACTCGCTCAAATTGTTAACTTAATATTGTTAACGTAATATTTCGAATCTCTTGTTTTATGTACATATATACAATATGTATCAATTTTAGTTATAGGTTCTACATTTAGGTTTCTTTCTAAGACTCTGTCCCAGCAATTGCTTTTTTAGTTTTAC-TATAATTGTGTCTTCCCCC-AGCCTGACTCGAGCTCAAATATCCTTAGATATATCAAACTAACCGATTTCCTACCCGATGCATTTATTCTCAGTGTATAATTAA--GTAGTTA-TCTTTATG--TTATATATATTTAAATTCG-------TGTTTCTATCAATTACTCATACCATATAAATAAGTATAAGCTTACATGTATGTATTGAATTTAAGACTATGTTAAAAACTTTTAGGTTGTGT----------------------TTGATTTTGTTTGAATTTACAGAG-----CGAGAATCATAAA-----AATATTGCATATGCTTTTTATCAAATTCAT--------ATATTCCGAATAAAAGTATTTTAACAAAAA-------AAATCTATGTGTTTGAGTATATAAAAATGTAGCCTCCCCTTTCGCAAAGCGTATGAG-GTATAGAAG------------G
>cos 2893977 2895009|2243 chr2R 2894999 2899145 scaffold_11 329240 333384 - 135963|0 10
-TACGAATTTA
CTACGAATTTA
>CG1707 2905359 2905481|2248 chr2R 2904623 2905626 scaffold_11 341043 342126 - 16962|823 998
TCTGGCTGGCAGATAGAATTAACTTGA---TTAATTGCGCATCTGC------------------CACTGTTCCTTAATAGCGATCCCCACT-----------AGGCTGGACCGCCGAGTGGAGTCGCAA-------CAATAAA--------------TGAGAAATTGTGTAACAAT
ACTAGAGCAGGGCCATATTCAGTTTTAAATTCTTTTGCACATTTGTTTTTTTAACCAATTTTTACACACTTGTTTATGCTCGTTTTTTTCTATTTTTCGTAAAGGCATTGCAGTTGAATTTCGCAGTAAATGTTTGTAATAAAATCACAAGCCGTATTTGCGAATGGCGTGACAAT
>CG11166 2910037 2910208|2252 chr2R 2908586 2910691 scaffold_11 344482 346910 - 43356|1820 2063
-TGTTTAA-------------AGTTTGATCTTATTTGCCTTCTTTTGACT------------------AAACCAAC-------------------------------GACAACAAGAGCAACAAC------AATTATTGATATTTTGTCTATATGCGTGTAATTAATTTGTAATTATTGAGAGGTGATTTTACTTGCTAGTGAAATTTTTTAAAATAAATTCTTATTTCTAC-ACCACG---AT
TTTTTTAATTGTAAACCATTTAGTTGTAATCTATATGCCTTCATTTGAGTACTTTCAAACAAATCAAGAAACTAACATACAATAGCAATAGCATACAACAAAAGGAAGAAAACTATAGCAAAAACACTATTAATTATTGATATTCATTCTCTCTGCGTTT--TTAAGTTGAAATTATTGAATGGTGAATTTAATTGCTAGTGAAATTTTTATAAATAAATTCTTAGTTCTATGATTACGCATAC
>CG30503 2955633 2955824|2298 chr2R 2955502 2955635 scaffold_11 3460971 3461107 + -751|147 149
AAA
AAT
>CG30503 2955633 2955824|2299 chr2R 2955701 2959041 scaffold_11 400489 403610 - 65995|0 126
ACTTCGACG---TCCGGCGATAAGCCCTCAATTGTTTACAAAACAGATTGTGCGGGGAGCGAAACCTAATGTGATTAGGATTTTGACGGTAGGTTATTTGTGTAATAAATTTTCGAAGCTTAAGGCT
ATCAAGGCGTAATTGCGCGATAAGCTTATATATTTACGTATGGCAGACAGACATACGAGCAGAATC-----------ACATTTATACGCTAATATA---AAATAAAATATTATTAATGATTAAAGCT
>kappaB-Ras 2956836 2956838|2299 chr2R 2955701 2959041 scaffold_11 400489 403610 - 65995|1191 1193
CTG
C--
>CG30502 2957985 2958196|2299 chr2R 2955701 2959041 scaffold_11 400489 403610 - 65995|2398 2616
TACAGTGCTACTATAGAACAAATTACATTCAGTTTTCAACGCAACAGAGTTGCTGCCGCAGCAAATAGTTCAATCAAATCGGAAATTTGGTTTTTAGCCTATTTGTGTAGGCTGAATACTGAGCATTAGGCTTAAGAATTATTTGTAAGACTTTTACCAATTTCTATTAAACAGGAATACAC-TTCCAATGATACCAAAGAACA------AATGGAAAA
-ACGATGGTCGTAGTAACCAAGTCACATT--------------------TTGCTAC----GTAAATAA---GAACAAATTTGTAATGTAGGTT---------------------AAGACAAAGTAAGA----TGACAATT--TTGTAAAACTTT--------------AAGAAAAAATATATATTTAAATGAAACCATTATATTGTGTATAATAAAAAA
>Inos 2966727 2966885|2304 chr2R 2966632 2968667 scaffold_11 411418 413416 - 86914|99 272
TGGAT----GGCCGCATCCCTGATTTTCGATCGGAAT------ATATAATTGGAATATATATGGTTTTAGTTGGATAAACTACGAAATAGACTTAAGCTACTATTACTAACTGAATCGTTTAAATATAAAA--AGGCGTAATAGACTGTTGTCTGTATACCACAAAAC---AAA
CGGACTTTAAGCTGCAGGCAT--CTGTCTGCCGGATGCTGCTAATATAACACATATATATCAGCATATGAATGTATATATTAATATATATACG--------CGTAAACATGTGTACTTTCTAAATTACAAACTAGTTGTAA------GCTATCAGTATCAAATAAACTTCAAAA
>CG11141 2972240 2972472|2308 chr2R 2971946 2974817 scaffold_11 418008 420964 - 82141|366 631
TTCAGTATTAGAATTAAG-TGCATACTCATTCGATTCCATTTGC-----------ATTTTTGCACTTTATTCTCTTTCTATGTTTCTATGTTTGCAAAAGTGTTGTGTTTATCAGATTGTGATCACCGTGATTTAGTTACTCTTTTTAGTGGAATTTACATACATAAGTGTACATAATATTAGACGTATA----CTGACCCC-------ACCAGTATCTACACAAATAC-ATATATTTCAAATATTAGCC---------TTTATTT
CCCAGTATTAATGATATGTTTCAAATTAGTTGAGTTTGATTTGTTGTAGCGTAAATTTCGTGCACCTTTTTGTCTTCTTTTTTTTTTGCCTAAGCAA----TTTGTGTGC-TTAAATTGTGATTATCG----GTTGTTAATGTTATT--TAAAAATTTCTTA---AACTGTACATAATGTTCAGCGTAAATAAGTTAAGCACGTTATTTAATAATAGTTTTAAAAGTGCAAAACATTTGTAAAATGCACCAACAACAGATTTTTGT
>p47 2976828 2976949|2309 chr2R 2975400 2980128 scaffold_34 852824 857783 + 125835|1576 1744
CTAACTATAAGTCAAGTACGCGTATATGTGCTCTCAGCGATGGGGGGCAAAAACCTATGAAATAAAACTGGATTTGGTGAAGTCGGG--------AAACCTATTCG--------------------------------------GGCCGATCCGATGCCT-ATAATTAT
CTGTTCACTGTTGAGATA-----AAAGATACAACAAGAAATGAATAATAATAAT------AATACAAATGGATATGGTGCATTCAAATTGCAATACAACCCATTAACAAAATTACAACTACAACATTCACAAAATACTTTGTATTGCCAATACGATGTTTTATAATTGT
>Aldh-III 2978687 2979108|2309 chr2R 2975400 2980128 scaffold_34 852824 857783 + 125835|3574 4130
AAACTACATATGATGCGAGCCGGAGCTGGGTG-------AGCCTGCGCCAGAGGATTCCCAATCAACCAACCACTTAATATTGTAATT---GTTTGCAATAAATGTTTAGGCGT--AGGCATAACTAACTT-----------CATTGCACATTCAGACAACTCACATAATAGAAACTACTGGGCCATCTGGTGTTGTATT------------------------------------------------TTACACTGCAA-TATGAAATTATATATATTTGAAATCGTCGACAA-----------ACGCCTGCAATTT------------------------------------------TGTACTTTCAGAAA----AGCTCAACTGATTAATGGGCCGAGAACTTTTTTCTTTTTATACGCATATCGGTGGGTGATGTGAAGCT-TTGGATACTTCGATATACATATAGTTATTGTTATTTAGTTGCTATTTAA-----TACAAATGTGAATGCTGTAATGTAATGTACGACAAATAAACAGTCAAAAATGAACAA
AACCCATTAAATCTATGGGTCGGACTTGAGCCGTAACACACCATGAGCCAGTGGACT-----TTTGTCATTTATACTATATTTGGATTCGCATTCGCAGTAAATGCACAAGCATTTAGTATTAATTAATTTGTTTTAACGGGCTTTGTGCTTTGTACTAACTAGTATATTAAGTATTAAGTATCAATTTTGCATTTAATTACAAAACAAAAAACTTGATATACATAAAACATGCATCCTTTAACCCCTTTACAATGTAAATAACCAATTCAATATGATTGAACACTTGTAAAACATAACATAACACGTATATATTTTCTCTTATTTAATTGTTTTTATTTACAATTCAATGAATCGATTTATATTTTCAGAAATCAGAATCAAACTAAATA-TGAGCATGTACTTTTGTACTTTTAATACGCGAAACGGTGGGTGATGTAATGCTATTGGATACTCCGCTTTATAC-TAGTTATTGTTATTTAGTTGCTATTTAAATAAACACAAAAATAAATGTTAAAAAA-AATATAT-----ATATATATCTTTAAGTCACTCG
>dpld 2993683 2995206|2319 chr2R 2991265 2998378 scaffold_34 869950 877318 + 209504|2850 4678
ATAAGGCCACGAGTGCCGATCTTTTTTTTTAGACCATTTACAAGAGCGAAACCTTAGCGTAGA-------------GTTTCAAATAACATGACGA-----------------TTATGAG----GAGGTGCCGAAACCGATTTAATAAGAAAAAATCTGAAATCATGAAAGTTAGCGAAAATTTTTAGCTTAAGTGCTACAACGATTACCTCGATATTGCTTAAGAGTTAT-------GGTTACGATTTGGTAATTTACAATACAATACGAATTACACATATGTATCTATGGATATCTATATCTATACGCATATGCATATATCTAGCGAATATACAAG-CCCAACCAACTAGAACTA-----TAACTAAAACAAAAACAAAA----AACAAAAACTAAAGC----------GAAAGGCAGGCGGTTGAGTAGGATTTAGGAGA--------------------TATATATAAACGTAGGGTCCGTGAGC---ATTCAGTAGAGTTACCG-AACCTAGTAAAAGATAATGCAAAGAGGGAACTCAACC---------------------------------------------------------------ATTTACTAGATGAAAATATT---ATTACCTGTTAGTTAGACTGA-----AAGGCAGTTTG--CTAGCT---------GATAGAAGGAGGTACGAACCAGGT-CAGGTGGCGATTGTGTTTTTTTTTACGGGTTTGCTTAGCGGAATGAGGAA------ACTACATTCGACAAGAGTTACTAAACATGATTTGCAGAAACACTGTATGGTATGGTATTAATGTTTGTATTATATTTATAGTTCGTTTG-TTCAGTTCTGTTTTTCGTTTATT-TTAAAATTACTTTTTTTTTGGGACATACATATGTATTTTAATGATTTCCTTATAATTGAGACTGAGCATTTGACAACACGAACTTTGCGTGTACGGAAGCA-AAGCGAAACAAAACAAAGAAAC---AAACAAAAAAC-AAGAAAATATTGATGG-------------------------AACCCGCTGACTTTTCGTTGAACTTTATACAAAGACTGATTAACT--AAACCGCAATTTCGGAGCCAACTAAAGAACCATATATGGTGAGGCCAAAATAAGTGAAAGAGCAACACACTCAAATTGCAATGACATTGATAACGTAAAGTAACTT--AACATAGCTTAAC----------------------------------ATACATACTTTCGCGCATATAGAGCGATACAGATATCATATAGATCCGATCAT----CCAGTCACGAATCA--TCAT-------GGGCATAGCTGAAACCGAGTTTAACTGACATTCATCGACATATTTACCCATCCATCCATCCATCCATCCACTCAC-TCATACCGATCA-TGCATCAC-------AGGGCTTTGTTTTTCGT--TTGTCGTTAC-TTTGTAATTATTGTGAAAGGATTTAGCCACAGGATACAGATTCACGGCAGGTTGAAAGGAGGAGGAGGAGGAGGGAGGGGTTAGCTAAAATTAGTGGGACATTTTGGGAAGTAAACGAAACAGACCTGAAACAAAATAACGAAGAA----GTTATAATTTTT-GACTC-AATGTGTTCATTAGCATTTAGTAGA---CTTAG---CGGGCGTGGCATAGTGAA--------------AACGTATGGAAA--------ATCCAGAGCAATATAAGGGCGTATTGAATACACATTTAGGTGACATGTTCCTCGCAAAAGAAACAAATAAAACAAAACAAAAGAAA--ACA
ATTAGCTTATAAA-------------CTTAAAACAAAAAACGAAAACAAAAACAAAAGAAAGAAAAAACGGACAACAGATCAAAGAGACAGACGACGTTTTTTTTAGACCATTTACAAGCAAAGCAAATCCAAAACAAAAACACAAAAAAAACAAAAAACGGCATTAAAATTAGTAAAAATTTTTAGCATAAGTGCTACAACGATTACCTCGATAATGCTTAAGAGTTATTAAACACGGTTACGATTTGGTAATTTAC-ACACAAC---AAACAAACAAACACATACACACACACACAAACACAATCTTATATATATATATTTAGCGAATATACAAGAAACAAGCAACAACAAGCAAGATTTAACT-AAACTAAAGCAAAATACCAACAAAAAAAAAAGCGCGTTCTGTAGAATTTTAGGCTCGAGAACCTAACCTAGAAAAAACACAAAGTGAACCTAACCTAGAAAAAAACGAAGTGAACCTAACCTAGAAAAAGCAAAGTGAACATAACCTAGAAAAAAGTGAAAAAAAAAACCAACTCAAACTGAAAGAAAAGAAAACTCGTCTTTTATACACAGCAGAGTAGGTCCGGAAGAGCAGCACACAATAAGTACTAGATGAAAATATTGAAAATACCTGTTAGTTAGACTGAGCGGGGGGGCAGTTAAATCTAGCTAGGCGTTGGGTTCGAGCGAGATACATATGTGGTATGGGATTTGTTTATGTTAAATTCGATATGTGCTATCATTTTACTGACGAGTTACTCAATAATTTCGCCAAGTGCT----------TTTTACATATACACATGCCAATAT--TTTTCACTTTCGTTCCGTTTTGGTTGCTTTTCAATTTTAATTGTGTAAAGGATTTATTATTATTATTATTATTTTTTTTTTAAATAT-TGTTTATTATAATTAATTTCTTATAATTGAGACTGAGCAAGTGAGTATG-AAACTTTGTAAAAGGTAAAGAATACGAAAAACAAAAAAAAAAAACTTAAAACTAAAAACTAAACACATATAAATGGTAATTATAAATATTAAACAAATGAAAACCCGCTGACTTTTGGTTGAACTCTTAACGAAGACTGATTAAACAAAAACGGCAATTTCGGAGCCAATTGAA-CACCATATATGGTGAGGCCAAAA----------AACAA-------AAATTGCAATGACATTGATAACGTAACGTAACTTAAAACATAGCTTAACGATACATATACTAAATACGATATATATACTATATATATATATGTATATGTATATATATATATATGTGCAGCATAGAACTCAGCAAATAAAAACAGTCACACATCAATTCATAATATGGGGGCAAAGCTTAAACCGAGTTTAACTGAAACACAC--ACACACACACACTCCAACACACACACCAACACACGCACATCTAACCGCACACTGCATCACCTAGAGAAACATTTTATTTATAATTATTCTCATTACTTTTATTACTATTATTA-----------------------------------------------------------------TAACTATATTATGTACAAGATTTAGCAAA-------AAAAAAACCAGAGAGAGA-----GGAGAATCTTATCATAATTTTTCGACTTGAATGTGTTCATTAGCATTTAGTAGAGATCTTAAAATCTAGCGTGGCATAGTTAAAACTAAAATTGAGCAACATATGGAAAAAAAAAAGAACCCGAGCAATAT--GCGCGTATTGAATACATATTTAGGTGACATGTTCCTCGCAAGAAATATTAAAAAAAAAAAAAAAAATACACTACA
>CG1621 3002642 3002861|2323 chr2R 3002354 3002694 scaffold_34 880776 881186 + 4821|379 434
TGCATTACAATACATATTTACACTTCAAATA--GACGATCACGC-CAGCATGATTA
TGTATGAACATATGTATGTAGCTGTTGAACACGAAAAACCACGCATAGTGTAATTA
>CG1621 3002642 3002861|2324 chr2R 3002744 3003751 scaffold_34 881586 882576 + 37827|0 137
GGACGCG---------TATATCCGGGGGAATGTGGGGAGATT----TACTTTATAAGCCTAGCTTACAGTATT-------ATAAGAACGCGACTGACTAACTCTGTGAATCTGCCTACATACGTAGCATGTAATCAGT
TGGATCGCCGCACCGATATATGCCTAGTTATACGATATAAATATAGTACATTATAAGCCTAGCTTACAGTATTAAAATACATAAGTATGCGACTGAAATCACACACAAACACACAT---TACATAGAATGTAATCAGT
>CG1620 3005618 3006181|2327 chr2R 3005606 3005833 scaffold_2 6266392 6266626 - -469|12 244
TATATCTGTAAAGTCAATTCTATTGTTTT-----GTCGA--TATTTGACCAAATGTTTTAAAA----CCTCCAATAATTTAATGAATTTCAATTCTCAATTTACGAAAGTAATGTATGATCAGAAAAG--ATAAATAT---ATATGTACATCGAAAGCTTTGTAGACTCACAGGTAAGATTCGCTACAAATCAGATACTAATATTACATAAAAGTACATCTTAGATATCT-TA
TATATTTTTATATGCTACTCAAGTATTTTAAAAAGTTGAATTTTTCAGCAAAAAGCCTTGAAAAAGCTTTAAAACACACTAATTAATAAAA-----CAAATGCGAAAAGAATTGCATGAAAATGAAAATAATGAATCTTAAAAATGTAAAGTTTAAATATTGCAAATTAACAGATTTTAGTCAGAAACTGTAAATAATTGTAATTATAAGAAGGTCAATTTT-----TCTAGA
>CG1620 3005618 3006181|2328 chr2R 3005924 3006138 scaffold_34 885330 885566 + 2671|0 238
GCGCAGGCGCTTTCGATTCG--GTTGGGCCAGGCGATGTATTTGCAGGGCGCTTCATTACCATTACCACTCACTA--TAAATATGCATACTGTACGTGTA-GTATATACCATATGTCTAAACATATATATTCCAGATTCTTAAATCGACATCTCTCATAACC---CGTAAAGAATT---------------TCTCTATTGTTAAGTGTGCGATTCGTCTATTTGT-TACATGTGCGTGT
GCGCAGGCGCTTCCGACTCAACGATGGCTGCTGCAAAAAATAGGGCGTGGCATTCAACAAAATCAACATTCATTATGTAAACATACCTACAATATATATATATATATA-TGTATACATATGTATATATATATTATGTGTGTACAGTGAAAGCTCTCTTGAGCGTACGCAGACGGTTCCAGTTAAATTGTCCTCCTTAGTGTTAAATATAC-ATGCATGTATATATATATATGTACGTGT
>dpa 3008514 3008613|2331 chr2R 3008505 3015015 scaffold_4 3259810 3266595 - 285946|9 108
TTTTATTACATTTATCTCATTCAAAACCAACCGCAAATTCATTCATTCCTATTTTTAAGCGCAACTACAAAAATGTTTTCAATAAAAAAATTTCAAATTA
TTTCATTGCA--------GCATAAAAACATTC----ATTCATTCATTCCTAGTTGTAAG---------AAAACAGTTTTTAA-ATAAAGTTCACAATTTC
>CG12736 3020340 3020433|2332 chr2R 3015381 3022004 scaffold_4 3266599 3273201 - 269425|5205 5298
CGACTCGAGATTGTATTTGTAAAAATTCATAAATTGCTGTTCATTACACACGAGTACTTTCTTTCTAATATATAATATTTGTATGTGTTTAGGT
TAGCTC----TTGTATT-GTACAAATTCTTCCTTTAAATTTTATCGTACACGAGTATTT-------AATATA----------------------
>az2 3022424 3022604|2334 chr2R 3022265 3022596 scaffold_4 3277535 3277838 - -1227|159 338
CAAACCATGACAAGTATTTACATTTGTTAATAACCAGAAAATATGGCTA---TAGTGCCAAAAAACATGAATTTTTTAATGTTCTTAATGTATTATTACTCCTAAATATTTTTTAGTATTGAAACAAGAGATTTTACAATATATTTGTCCAAGCTTGCAAAAATGAAAACAAAAA----T
TTTATTAAAAAAAGTAATGAAAACAATATATTGCCTTTTAAATTTCCTAGTCTAGCGCTATAAGACG--------CTAATGTTATCGATATCTGTATAC----ATAAATCGATTAATGTT----------------CGCTATGTTTCTCAACACTAGCCGAGAAGCAGATGAGCAGCTGC
>az2 3022424 3022604|2335 chr2R 3022597 3024151 scaffold_4 3273324 3274922 - 59261|0 7
GACATTTC
GATGTTTC
>CG1603 3025883 3026139|2337 chr2R 3025633 3026160 scaffold_15 1282328 1282857 + -2263|257 569
ACTCTCGCCTTGAGGGACATTTTTAGA------------------------------AACTGCTTTATT-------------------TTTTGATAACGAGAATCAGTAAGCTTCATT----TGATGTAAATCAAGAATAAACTTACGTTAGAGTAGTGATAATAACAAGCGTGTTGTTAAGCACTTACGGCTTTTGTGTATTTGATAAGAACATGTGTATGATAATCATATGCACAAGCTTTTCCTTTTTCATACTTTCCTTTTCAAAATTTGGTTTAAGGAATGT---ATTATTCATAAAAAAAAGAAGAA
ACAAGCGTACTTTGGAAAAGTATCAGATGAAGCAGCAAATGCAGCACGACCCCGCCCTACAGCTCAAATTGGAAATGGATGAGGAGAGTTTGCATATTCAGGATTAATAATAATCATCACCGTTAAATAAGATTACAAAAAACCTATTCTATATTAGATAAAATAA-ACGAATGTAATTAA-TGCCTACA--TTTTATATACCT--TAGGAATCTTTGCTT-------------ACAACCCATTCTTTTCGAA-----TCCATAGCAATAACTTATGTAAATTATATTGAATTATCTATAAATAAAGCAA---
>CG1602 3028793 3028826|2340 chr2R 3028793 3030681 scaffold_4 3277808 3279689 - 52338|0 33
-TTTGATTAAATTTGCAATAAAATGACAGTTTAT
CTTTATTAAAAAAAGTAATGAAA--ACAATATAT
>Orc1 3034248 3034496|2341 chr2R 3031155 3037528 scaffold_4 3279875 3286173 - 244666|3167 3415
GGCCATAATGCAAGAACAAACGAATAAGAAGTTAATTAAGCACATTAAATTCTCATCTCCATTTTTAAGACTCCAAATCCAGGTTACTTGACCTATCACATTTCCACCATTTTTAAATCATTCATTATTCATACAACATTGTAATAGCTTAAGCGTTTTTAAATTATTTCTTTTTAAGCGTCATGTTTAAACAATTTAAAGTACAAACTCGTTACTAAAAATACCAAATAGAACACCAGCACAGTGTAA
---------------------CAATTAGAAGTAA--------------------------GGTTTTAAAGTTTTAAAGC-------------------------------TTTTAAATTATTTAATA--------------------ATTAAGCGT-------------------------CATGTTTAAACAATTTAAAGTACAAACTCGTTGATAGGAATACCAAATAGAATACCAATACAGTATAA
>CG1600 3037931 3038467|2342 chr2R 3037839 3041466 scaffold_4 3287161 3290915 - 83293|95 771
GCGTGGAGGAGGATATGGTTCCCCATCAAGGCATTAACTCATTTAATATGGATA--TCTGTTAGCTGTATT---------------CGGAAGACAACCGACAAAACCGACAAAACAA-----------------------CCTGCAACCTGCGACACTCTCGAAGCGGATTCAGAAATGTGCTTA--TTTTGTAGCCGGTCATTGTT---------------TTGTAACCTTAAT-------------TTTGGACTGCAGAC---GAACTCCTCGTTTTAATTGATTTAGCG--TTTTAGGCA-TTTTTAGTAT------------TATGTACATATAGATTGTGATTTATTTTATTTGTAAGCCACCACCATGATTCTACTTTTGCAAAGTCACCCAT-CACATCGCCATATTAGCCGGAGTCAAAATTCGGCGGCTTCTTCAATGATTTTCGATTAAG-------CAAAA----AGCCCAGC-----AGAAGCGGATTA---------CAAAATAAATGTTATAC--ATACTATACACGAAATTGTTACGCATGCGATGC-AAATGTTTGATTC-AATTGCTTGATGTTTGTACTCATTACGTACCCAACA----TTATACTCTACTC--------TTATTCACAAATAAAA----------ACCATTAACTATC
ATCTGCAA--------------CTATAAAAGCATTAACTCATCTTATATGAATATCTCTGTTAGTTTTACTCACCCACACCGCACACACAAAACACTTGGCGCACCTTTCAAGCGAATTAGCGGATCAGGCTCCTCTGATCCCGCATCCAACCCAACCCAAACCAAACACTAAAATATGTGCTTAATATTCGTAGCAAGCATTCGTTAACGTACTGTTTGAGTTAGTCCTTCAATAAGTTTTCAATTCTCTTGAAAGCAACCAGTGATTTCATTAATTTCATTAACTTCATAATTTTTAAGCATTTTTTAGTATTATTATATTTTGTATGTATATATGGATTGTGATTGATTTTAATT-TAAGCAGCCCAAAAAA---AACTTTTACGACTTGATTTGCGTACACTTTTATGT-------AGTTCACGTGTCGTTTATGCTTCAATGTTGATTTATTTAATTGGACTCAAAATCACAGGCCATCAAAATAGAAGCGAGATAAAAAACGTTCAGAATAAATGTTATATAAATAAAAAACAAAAAATTGTTATGCATGCAATGCAAAATGTTTGATTCAAATTGCTTGATACTTGTACTCAATACGTACCCAAAAAAGCTTACAATTTATTCAATTATCAGTAATCATAAATAAAAGCATACGCATACCAATATATACC
>CG1598 3050043 3050186|2347 chr2R 3050129 3051428 scaffold_45 442416 443645 - 65571|0 57
GATAGCCCGTCCAACCCTTTACCCATCCGTTTGTAAGTTTCTTCCTTAGTTTGTGTGA
G----------CGCCTATGTAGGCATTTGTTTGTATGCATCGTTC-TAGTTTGTAAGA
>CG30499 3076245 3076373|2371 chr2R 3072754 3076700 scaffold_4 203392 208059 - 58152|4487 4618
AGATTCATTTACCAGCTAGCTTAAGAAAGAATTTTTTAGATAGGCGAAATGTTTTGAC---CAAATTGCATTGCAAGTAATGGGGAAAATTCCTCGGGAAATGGTACCATTAAAAGAAACTTACAACCGTAT
AAATGCATATTC------------AATAGAGTTTATTACTTAAGTTCAAAGTGTTTGCAGACAAACAAAATTTCCCGTTCAAGATCCAATTTTTATACAATTTATATAAAGACAGGACTTTTGCA---TTTT
>boca 3077683 3077770|2373 chr2R 3077479 3077698 scaffold_16 179882 180093 - 159|221 236
AAATTTATTAAACAAA
AAATCATTTAAAACAA
>boca 3077683 3077770|2374 chr2R 3077699 3078168 scaffold_4 208752 209225 - 22790|0 82
GCCGGTTCCACGGCATACCAGCACATCAAA--ACATTCTC---------ACTATTTAAGATCAAAGTTCAATTAAAATAAAAC
TA----TTCATTGTATCTAAGCACTCCAAACGACATTCTCATGTAAAGTATTTTGTAAGCGCAAAAATGAACAAATAGAAAAC
>blow 3092298 3092602|2378 chr2R 3091838 3094251 scaffold_4 224410 226926 - 77959|484 852
ACTGCCGCACAT--CCGTCATCTGCTATTCACATCCGACGTCC---TGGAGAGCTCGTTCGTCTCTGTAT-------TGTAGATTTAATCCTTAGGCTAGTGAAAA--------------CCACTCTCCGGATGTCACATAACTTTGACATAAAATTTTAATATCAAAACCATGGTTGTTAACATACGTAAAAGTGCGACATGTAAGTTTGAGTTT---TCCAATTGGGCGCACG-------------------GTGCTTGGACAG-AAAAAATCTTGATG-ATCGAGGTAGATTT--CCATGTCGTTGCTGCTGTCGTGGGGATGTGATT----------GGATTATAATATAG--TTGGGAAATAAA
-CTGCGGGGTGTGACTGGTGTCCCGCAGCTGGATCATACATGCATATATAGCACTTATACACATCTATCCATATACATATATATTTAAT--TAAGGCTAGCGACAAAAACACGCGCACGCACATTTTCATGTTTATCTTCAACATTGACATAAAATTTTAATATCAAAACATAAATTGTTAATATACATAC---TGCAAAATGTA--TATGAGTGTGGGGGAAGTTGGGCGCGCGTGTGTGTGAGTGAGTGTGTGTGTTTTAGCCGCACAACAGCTTGAAATGTAGAGGTAGTTTCTGTCATGCTGTTGA-GCTAGCTTTACACTGGGTTTTATCAAAGCGAGATTATAAAATAGATCTAGTTATTAGA
>CG1360 3099585 3100316|2386 chr2R 3099768 3100799 scaffold_4 233408 234562 - 14595|0 696
CGGCCAGAAGACAGCTCCGGCCATGCATTAAAGTACAA--AGAATGAAAATACTTG--TTGTGGCACATAATTAAGCGTTAGCACAATAC-------TAGAATCAG-------------------------------------------------------------------------ACTCTTTGTGCCGCTTGATAAAGCCAGCCGAGGTGGGAACCTGTTATCCACTCGCCCGGTCTTCTGGGTCGAAT-CACGCA-----ACGGCTATGCACTTATCACTGCTGCCGGAGACAAGTCCAGGCGGGGGGACCCAAGGTTGTCCAGATATTGCGCAGCCAACCTGGTCAGCATGCTTAATTTATTTC--TCGGAGCGCAACGTTTAATTAAAATTGAGTTGTTTGCCTCAGCATCCCATGAACGCGTCCTTCAAAACTGCTGCCCAAAAAGG--GCAGCCGATC------------GGCTCTGGACGGGCCGCT------------------------------------TTATCTGCCGCCGATTGTGAAGAGCACACGCACAGGAGAAGGCTCCAGACTCGGCTTCGACCCATGGCCC-----TCTGCTTACCCCTTTCTGTGCCGAAGACTCGGATTTCTCGGCAGCTGCGGCAACAACATCTGCCTGC-CACATTAGAAGATTTCTGGTT
AAGTTCGCACAAAACCAAAGCAA---ATTGTTGTTCTGTTTGAATGAAAAGACCTGTATTATGGCGCATAATTAAGCGTTAGCAAAATACGTTTAAATAAGAGCAGCCATTGTGGCATGAATCAGCAGCATTGATTGTTGCAACCTGCTGCTGCTGCTGCTGTTGCCGGGAAATCAGAGACTTGTCTGTTGGCCCGATAAACGCA----AGCTGGGAACCTGTTGT----TGGCCCTGCTTTTTGAGCCCAGTGCACGCACAGACATAGTCACGCACTGGCCG--GCTCCC---CACACGCCCAAGATA------CCAAGGTTATCCAGGT--------------TCCGGCAGAATTCTTAATTTATATCAAGCAGAGTGCAATATTTAATTAAAATTGAGTTG-TTGCCTCTGC--------AGCACGTCCTTCAGGCC--ATTCCCTAAAAGGCAACAGACTGTCGCAACTTCATCTGGCTATGTATTTGTATCTCAAGCTGTATCTGTAGCTGTGTGTTGTTTTGTGTGCTTATCTGCCGCCAAAAAGACAGAACAAACACGCACGCACATCCT-GAGATTGGCTTTTTAAACAAGGCTCCGATTTCTAACTTGCTCCAGCAGCAGCAACATCTGCCACCTTTTGGCAGCCACTTTCTTG----CTGACTGCGCACATTAGAAGTTTTCTGGTT
>CG1358 3107078 3108352|2389 chr2R 3102063 3107225 scaffold_4 235677 241025 - 187229|5430 5609
GTCAGAGATAAAAAGATAGT------TAACACGCGGAAGCCACGTAGCGATTTCTT-----------------CTTAGCCACGAGTTCTTGCA---------AAACGATATACATATGTGAATGTAAATGTGTACTACGTGTATAAAAGTATTCAATAAACTATATTAAATAATCAGTGT
GTTGAAGACAAAGAGAACATATGGTGTGCCTAACGGTATCCACACA-CTCTCTCTCACACACACACACACACACATAGTCAAAAGTTATTTCATTCAAAATGAAAATATATATAAATATATATGTATATGTGTATAGTGGA---AAAAGTATTCAATAAA-------ACTTAACCCGTGT
>CG1358 3107078 3108352|2390 chr2R 3107336 3107733 scaffold_4 241131 241552 - 2426|0 467
GCAACAGAGAGTGTACATAATTTATATACATATATAATTGCATTCCAAACCCGATCCACCGAGGGCGCTGCTACTGTTGTACAAAGCACAAGTATATCCTG-CATATCTGGCAAACTGTAATATTTTGGATGTTGA----TTTACAACTAACAGCAGATTCAAGTC-AAAATATATACATACATATATACCTATACGAGAAATATATATCTATACATTTGA---------TAGTGTTGTGAACTAGAGGAACCCAC----------------------------ACTGAACACTCCGCCG-GCGGCAATGCGTAA------TCCACTTTTGTAGATAGCCTTTAGGCCGACCTTTAGGCCAAGTGACAAACGCAAGGAAGTTACAATCT-----TCCACCCAGAGTCAATTGAG--------------ATGGCCAAGGAGCAGACAC-ACTGACTACCTGACATGAAC
GCCAAAGAAACTGT---TACATTATGTACATATATAA-------ACACACCTTAACAAATGCATGCACACCTACACACACACACA-CACACACACTTGCAATCATATCTGAGATGTTTTAACGTT---GATTTTGAAGTATTTACAATTGAAAG-----TCAAATCTAAAATATATACAC-CATATATAT----------GATATATATGTATACGTTTGTAATACGTATCATTGTTGTGACATAGTTGAATTAACTAACATCAAATGCAGGTAAATGCAAATAAATTAGCACACTTTTAAGCTGCGGTACACAAATTGTATTCAATTTTGTAGATAGCTTTATGGCCAATTG------CCAGTATTATAC----------TATAATATATATATACATATATAGCCAATCGTGTAGCTCACTGAACTAGAGTCAATTCTCAGACACCAGAGACTACCTGACATAAAA
>CG1358 3107078 3108352|2391 chr2R 3107909 3108876 scaffold_4 242351 243328 - 28206|0 520
GAAACT---CAGGCCGGCACGGCGACC---------------------------GTCTTTTATGTATAG-----TATTCCACGCATATCGTT------TTACTATTTAATTTATTTA--------GTTGTTTA---CTGTACATTCCGTTGTAGCCTTAAGTG--TTGAATTTTAAACTGTTCATTAAAGGTGCATAGCAACATACACACGAACACGACACGCACACAACATGCGAATACAAACACGAACACGAATATGAATATGAGTAAGCTTAGGCAATTATTTTTTCAATTT--TATATTGGCCACCGA-------TTACGGTTTAGTGCTTAGGTTAGATGAATCCAAATTCAGCAGCCCC--GAGACTTGC--ATCGAAATTCAGCTTTATCTTTGCGTTGCCACTGCACTGCAACACCAACTAACACAGGCAAGCCACACAGTACAGACAAGACAAGACA----------AGTCCTGACAAGACTAGTCAAGACAAGACATGTTACGTATATGGA
GAAAATACACACACACGCACACCCACACACACACACACACACACGCACACCTGGGTCGCGTTTGTATAGTTGTATTTTTAATGCATATCGTTTTTAGATTGTTTTTTTATTTATTTATTGCATTTGTTATTTATACTTATGTTTTCTGTTGTAGCTTTAAGTGAATCATGTGTTGGATTTCTTATTAAAAAT-----------TACACACACCCAC-ACACACACAC-ACATATGTATACATATACACACGCG-------------TTTAGCTTAGGCAATTATTTTTTCAATTTTATATATTGGCCAAATAAATTGTTTTTAGATTTTTAGCATAAGTAAGTTGTAC---ATTTGAATAATTGCAAAAGACTTGTCGACTTAAATTTAGCTTTATCCTTGTTCT-----TTTGCGACAACAACAACAACAACA-------------------ACAAGACGAAATATTTATATCCTATTCCGAAAATATATAGTAAAACACACACTTGTTACAAATATGTA
>CG17985 3163432 3163924|2437 chr2R 3161973 3163841 scaffold_4 297949 299951 - 37274|1567 2088
TGGCGCATTTCAAATGCAACCCCAGGCGACGGAATTTATTTTT----------ATACCTATGCGC---------GTAACTTTGTAT----------------------TGACT---------------------CTTGATAAAAAAAATAAGGTCTTTGTCGACAGAACTTTTAAATTACCACGATTTGGGTGCTTCCCAGATGCATAGGCTTGTCTATGCGCCACATAACTTCTGGCAG----------CACCAATTGCAGGATTCTAAGATCCGATTGTGCTGTGAATATAAATCGTAACCCCGCCGTTT-----------------TGCTTTTCTATATGTTTTATTGAGTACAATTATGTA-ACATTTA-AACTACAATAGTACGGGTAAGGTGTAACATTATTCAGCTGAAGTTGGGATAGTTTCTCTTACGCCAAAAAAGTACGTAATACATATCTTAGAGC---------------------TAAATAAATAGTATCCATGGATATAAGAATTAT
GAACGCATTTAAAATGCAGCTGCGAGACGTAGAATTTATAATTTTTTTAAAAAATGATTATATACAATTAAATAATAATTATTTATCATAGAAACAAAGAACCAATTGTGACTTGTACAATATATATTAATAGACTTGACAAAAATAATGAATGTGTTAATGTAAAAGTCTCAATTTTATGAAAAATTAAATTAAACAAATCTTAATTGGCGAATACAGGCATCTAACAAATACTTTAAGTGTGGTAAAACAACAATAATTAGTATAACTGATCATAAGTTTTTATTCATATAAATTAAAA-----CTATTTATAACAGTGAAAGAACATATTTATCGATACATATATATATATATATATATATATATATGTATATCGATCGATGTACGGGT---------CATTAT-----GATAGTTAAAAGGGTTTTTCGCGGGGCTTAAAGCTA---AATACATATCTTAGCGCTAAATAAAATATTTAAGAGATTAAATAAATAGTATCCATGGATATAATTATTTA
>CG17985 3163432 3163924|2438 chr2R 3163887 3165744 scaffold_4 300009 301892 - 106960|0 37
TTGGGTAATGTCTGCACCCGAAGTGGTCATCATTCCAA
-----------------CTCAAGTGATCATCATTCCAA
>Rpt1 3164249 3164348|2438 chr2R 3163887 3165744 scaffold_4 300009 301892 - 106960|369 493
GTTACATTTATTGGCACTATTCTGTATCCT-------------------CTGCAAACTGTAAC-ACTGCAGCTGGCAATTTATTAAATAAAG----CGAAATCTATA-CCTCCACCAACTGAAAA
GTTACGTTTTATACAGCATTTCTTTATTTTGCTGCGCTGTGAGCCTTCAATTCAAACTGTAACTGCTACAGCTGGGCTTTAAGTAAATAAAATATCCAAAATATATAGTATTCGCCACTTTTGGA
>CG12042 3179054 3179213|2452 chr2R 3177634 3180834 scaffold_4 306263 309360 - 114952|1444 1624
ACTGGAAACTTATTAGCCAACAGGCGTACTAATCGACTTATGCGAAATATGAAATATGCTTTATGAAAGCTAGAGAAATATGTATTTAT-------TTATTAATCC--------------GTTCGTGAAACAGCAGCTAGTATTCAAGTATAATAAAAGGCTTGTTCTAACACTATTCGTT
AATCGATACTAATTAATCA-----TGCTTTAATCACTCTATGTGAAATATA--------TTTATGTAACTAATATAACGAATTGCTTGTGGGGCGGTTAGTATTACCCTTAATTATGTTAATCCAGGCAAGCACTGTATCTGATCATGTATAATAAAAGCCT-----------------TT
>mRpL52 3185528 3185613|2459 chr2R 3185363 3186196 scaffold_4 313131 314014 - 16904|181 304
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>CG1399 3188880 3189804|2460 chr2R 3186228 3192003 scaffold_4 314049 319896 - 160474|2885 3963
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GCGCGCACCAGGATCGATCATCATCATCATCATCATACCCAAAAGCTTCCACTCTCATGCTGTCTCTGTGCTGTGGCCATCAACCGGCGTCTAGGCATATACCTTGC-AATTCTGTGTAGCTTTAATGTTGTCCATTTTAATGTTGCTTTCATTCATGAATTTGTGTGTTAATTTGTTGACAAAATTGTTTGTTTCTAATTCGTTACGCATTAAGCCTGACACTCGCCCTAGCTATACACGATATATGTATATATATATATATATATATTCTAAACCGGAT-TCGAATCCAATC----------TAACCCACAGGAGACATTAGTTGAAGGCCTGCAAC---GCACCTCGACAAGACGCACCTTTAGAGATTCGCCCTATACCAAGGAGGATGTCGTCGATTTATAAATCCTGTCTATTATATGTGCTCAAC---------------TCGACATTCCTTCTCCCCCCAAGCACCAGACTTCAAGTTAT-GATAATGTTTATGATAATAACGACTA-TAATGATAATGATAATGATTATGATAATGAGA----ATGCTGCTAAT-------------GAGCAAAGGTTGCAACTAATTCGTACTGAACAATTTTTAATTTATGTGCAATGGCGCGAGCGTATATTGTGTGTGTGTGTGTGTATTGTTTTTAAATCTTTGGCAATTTTTTAAATGAACGTGATTTATTTATTTATAC-----------TTTTTAACCCAAATAACTTTTGCATATTTATAAAAAAAAAAAAAAAATAGTGGAATATAGAACCAACGTTTT------TATGTACTATATTTTTATGTATTTAAAATGAGTTAAGTGCCAATTATATACAACAAAACAAATCTATTTTTCAATTTATCTATTGAAAACTAAAAAAAGAAACTAAACATAAATAAATACGAAGAAACTAACGAAGGGAACGCAATGAATAT--TATGATATATTTAT-ATGTAAATCATTTGCGTGCATT-TAACTAATTTAAAGGCCTAAACAAATTAAATAAACAAACTTTAATGAAATGTAATATTTTT-ATAAATGCTTCCAAAAATAAC
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AACATTAAAGCTAGCCTAAGAAAAATTTAA
AATAATAGAACAAAGCTTAGGAAACTGTTG
>tor 3216986 3217115|2481 chr2R 3217068 3217435 scaffold_4 351618 352004 - 4586|0 55
-AGTCATTGCTTCAAGATTATAATGAACG--------AGTGCAATACATTCTAAAT
GCGCAAATGAGGGATATTTGTTATAAATGTTTTCCTTAGTGCAATACCTTTTAAGT
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TAGCTAA---ATTAAAATGCAATCCAACAAAAAGGAAAA--------AAACATTCTTATAAAGTGCATGAAATTCAAAAAAAAAAAAAGC-------TACCAAACTTAGTTAATTTGCCAAAAAAAAAATTAAAAACCTAGCAAATGTTTCTGGGAAGCTAGCCGAACAAATTGAGAATTCGATTAGAGAAACTGTCGTTAATCAAAAAACAAAAATTAAAACAA----GAATTAAACGCAATTGTATTACGGGCCGTGTACTTGTGCAGTTAGTACA------TATACTAACTCTTAAATGGA----------------------CACTAAGAAAACAAATACGTACAT-----------------------------------ACTATAAATTCAATTGTAATTATA------------------CAAAGGAAATCTAATTACCAGATTATATATATATATATATATACATATATTAAATATACACACTAAAAACCCAAAAAAATATATATATAA-TATATA-TAAATATTTGTTGC-GATAAATAAAACCGAAAAAATAATTCCC
>CG18812 3230259 3231074|2495 chr2R 3230872 3232052 scaffold_45 40348 41694 - 37815|0 311
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ATGGCGGCCATTGTGGCTGTCTA-GACAGCTCTAACCACCAGAAATATATAGTTATACAGGACATATATACACTAATACACACACAGACACCCACACACCTAACCATATATATATCTATATATATATATATACATATATATACAGAGAAAGGTATATTGAAATTTTTTATAAATTTTATAGAATTGTACTCTTGTTTTTTCCCTTTTTAATTGTAAGTCTCAATTTGTGTTTTATTGTTGAAATATAGATTTTGTGTAGGTTTAAAGTTAAAACTAACCAAAAATGGAACGCGAGCTGATCATGTGTAGAAC
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AAACGGAAAAAAACGCAAATCAAAATCTCTAAAAAACAAAAAAAAAACAAACAATT-------------------------TTTTTACTTAAAAATTTTATA-----AATGCAACAGAAGAG----------------------TGGAAA--------AAGAAACGAATGGGAGAGTGCA----TGAAAGAAGGCAACTTTGCTAAAATATTTGCAGTGTTTTTTTTTATACAATAA----------------ATATACACACATATATATATATATAT---------ACATAAAATT-----ATGCGTGTAAAACCGTAAAACTGTAAAATCGTGTAGAACTATAGTTTATATAAAAAATAATA-ATATAACTTAATGTAAAACT-----AATGGTATCTAGTGAAGTTTAACAGCAGCAACATGATTGATTGATTGATTGATTGATTGATGTCAAGCATTGTGATTGAGTGACTGTTTTGGCTTGTTCGTTCGTTTGTTTGATTGTTTGTTTGTTTGTTTGTGTAACAAAACTGCTGGGTGATAATTTATGAATGATTCAAC--TGATATACATA------------CATATATATATA-----------AACATATATGTGCATCTAATAT----ATAACATATTCAATTTATAAATAATACT----TTTAATAATT---AAACTACAGCGCATGCAATGTAAGCATATATATATATAT--------ATGTATATGTAAACATTGAATATTGTTTTAAAGCAATATTCCGTAAAAAAAAACAAAAAAAAGATGTTAAGTCCAAAATAAAATTGCATATGCTATGCTATGTTTCCTCTGTAAATGTGTTAACTGTTAACTGTAAATGGTTAACAGTGTTGCTGTTAAATCTCACACTGTTAACTTTACATAATTTGCGTTCATATTCATTTTCAATTTGTTTTATTTTGTCTAACTCTTTTTTTTTTGTTTTGCATAGCGTTGA--GTGAATTTTGTTTTTGAATTTGTACTGTATTAATTTTAGTTTAAAATATTATGTAAAACTGATTGATGTTTGTATATAATGTGTGTGTGT----------GTATATATATATACATATATAGAACATGTAT-----------------TCCAAACCAAAAAAAG---AAATTATAATTTAGGGAAAAATAAAACTTGTACA---CTTGACAAGTTTTTGGTTAACATTGGAAATTGTAACTTTGCTCACAAACTGGCTGCATGACTTTTTATATATATATAAACATTTATTATATATACACACAC
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TTGGAGCAGCAACAGC------AACAGCCACAGCCAACGCAGCAGCAGCAACAACAACATCAACAACAACAA----------------------------------------------------------CAGCAACAGCAGCAGCAGCA--ACAACTACAA------CAACAACCA----------CAACAGCAACACT-----------------------------------TTAACAATATAAACAGCAAGAAGAAGATTAGCAGAGCGCAGGATGAGAAT--GTGGCAGCCACGGGCAGCTTGGTGGTGCTGCAGCAGCAGATCAACAATTTGCCAGTCTACAAACTGAACCAGCAGCAGCAGCAGCAAGAACAGTCAC--------------GGGCGAAGC-AACAGCAGCAGCAGCAACAACAGCAGCAGCATCAGCAACAACAGCAACAG-----------------------------------CAGCA------------------------------------------ACAGTTGCTGTTGGGCACCTACAGCGGGCAATTTGCATATTTCTATCCGCACGATGGTTCGGCGCCCAGTTTGCTGCTGCTCGGCGAGGATTCATACTTAAATGTGAC------ATTGGCGCAACAACAACAACTACAACAAATACAACAACAACAATATATCTAAAAGAAAAACTTACAGAAAGAAAAACAAAAAAAAAAGCCCGGGCTAACTGCAAGACACGAGCCTTTAGTTGTACAAACCTGTCATT-TATATATATATCTATATATATATATATATATATACACACACATATATACATATATATATATATATATCCTGTTGTTCCTTTTTCTATACATTT--TTGTACGC--------ACGCTAAAGACTCGACAGAACA----GAACTCACCGTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCCCCCTCTCTCACCTGAA----AAACAAAACCACAATTGTTGCTGCAAAATGTTGAGCATGATGTTAATGATGTAGCTAAACACACACACACACACACA
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ACTAGCCAAAA
ATTATATAAAA
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GAT-----------------------------GTTATTTAAACCATAAATATATTCATATTTTTTGAGTGA----TTTAGTGGCATGTTTTCAAGGTTTTTAAATGCTAC-------TACATAAATGTT------------AACTAACGC------------------AACGTTTTTTTTTT----------------TTTAATATTTAT-----ACTGTAATTCCTTT------------------------------TATATCGAGGCGAATT--GCTCAATTGGAAATACACAAAATTGTATTTAGGCAAC-----ACGAATCAGGGCTAAATCAGAAATCAAAATGTTCAT-------------------------------TACATCAAATACTAAGTGTTATGTAATTCGGTTAAACATTGAAATTGTTAAAACGCAAGATGAAATCCTACGCTGAACTGAAAAAGAAACCTATTATTATAGATCGATAATTTCATATT----------CATTCTCATTGAAGAACACACAACAATGATGTCTTACAAGTTAGCAAACTACAAGTTTTAAGTAAACATTAAAACGCTTGTTTATTGGCTC-CATGCTCAGCTCATATAACAATCATAACACGATAAACCTAAACAATATCAATAGTTAACAATTCCTCTAGTATTACACACA-ACAAAATCACCCA---------ATGCATAAGTAGAGTATAAGCTACGTACATGTTTAGA-----------------AGCACTGGCTGAATCAATGCATGTA--ATTTTAACTTTTATAAGCGAGCTGCAAGTTAAAATACATATACATCTCTTATGAATGAGAAATCCAACC
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CATTAACC
CAATGATC
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>Dgk 3348055 3348635|2602 chr2R 3347315 3348410 scaffold_34 1211541 1212770 + -521|899 1287
TGTAGATCTGCTATATGTGTATGTATTC--TTGTATGCATGTAT------GTCGAGTGAGTT---ACAGAGCTT-TATATTTAGTGTTAGACTAGCCAAATATACAACCGAGTCAAGTCCATTCCAATGGCATCCGAGTGCGGTGGCTGTATATAC-ATACATAGCAATACTGCGACGGCTTTAGGCCACCGGATATTTTAAGAACACAC-------TTTAAAAGCGATAGCATAGCGAAAATTGTCCAAAGATGCAACTGAAATGAGACCAACCAA-GCAACCAGAACAACAAACCAAACACAAAAACCAAACAGCTAATAGTAGTGCGAATTT-----TATGCCCTAGGCTAAGTACGAGTATGTA-------ATTTATTCCGTCAT
TGTTCAGTTGCTATATATACATGTATATATTTGTATATATGTATACATATGCGCAGCTAGTTTGTATATAGCGTATATATATAGTTATATTTAAGTATAAAAAATCTCAGAGTTATG--CAT--CAGTGTTAACCATGTGAAAGCTTTAGATGTACTATATAGGGTGGTAC----ATGTATTTA-----TTAGACACTGTAAGGACACACACACACATTTAGACACACCCACACA-CACAACTTGTCCAATAATGCAACTAAAATGAGACCAAACATTGTAGTGCGAATTTTAAAAATAGTGCACAATTCTACACACGAATAAATATATATATATATATATATATATATATATATATATGGATATATATATAAACATTTACATATACAT
>Dgk 3348055 3348635|2603 chr2R 3348518 3348730 scaffold_34 1213183 1213398 + 13436|0 120
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TTCAGGCGCAGCGCATCGAGCGACTTCATTGGCCGGCGACAGGTCTTGGAGTCAGCCGATGAGCTGGAAGATGATTATCGTATTGTAACCAGAAGCACCACCGTCCATAATTTACCTTAGC
>CG12159 3426842 3426980|2693 chr2R 3426438 3427535 scaffold_34 1305592 1306821 + 11163|460 700
CGAATCAAAAAGGAAAACAAAAC--CACTTGTGATAACGATTACGATGATATGTA---TGCAAGGCATTAAAAATCTCATAAATAC---CAATGCTTTCAA--------------------------------------------------------------------------ATCGCCTCTG-----------CGTCGATGTTCCATATAAATAAATGTTATAT---------TACAT
CGAAAAAATAAAAAAACAAAAATAACATTTGTGATACCAA-----AAGATATGTACTATGTAAGAAGTTGCAA--TTAATGCATACGATAAATGCTTTGAACTTATTTTCTACACATTCATACCTAAAACATGCAAGCACTAACACATGTTGTGTGCGTGTGTGTGTGTGTGTGTATTGTCTATGATATATGTATATGTATATGTATAACGTGAATAACGGTTAAACAAATAAATGTGTGT
>CG12159 3427146 3427177|2693 chr2R 3426438 3427535 scaffold_34 1305592 1306821 + 11163|910 941
AATAGCAGACACATGCACACGCCAAAGATCCG
AATCCAA---ACAAGATCAGGCCAAAGGTCCA
>CG15835 3434582 3435049|2701 chr2R 3433575 3434687 scaffold_12 2971321 2972508 - -3263|1118 1266
TATCGTTTAATAATTTGATA------------------------TGTTATGACATGTGTAAAATTCTTTGCAACCAA-------------AAGAGAAACGCCC------ACTAAATTGGCAACCATTTTTAAGGAACTATCAGAAAAAA
TA--GTACAATAAATGGATAATAAGTGTGTATTTATTTACTGCTTGATATAACATCTGGAACATGTGCTGTAATCGACCAGCATTTGATGGTAGGGAACGCCCTATTTTGTTAAGTTA-CGCCCATCTGTCA------ATCTGAAAAAA
>CG15835 3434582 3435049|2702 chr2R 3434688 3436769 scaffold_34 1312479 1314465 + 75714|0 388
GGATTCCAGATGTGGCACTGCTTGCT-GGCAGTTTTTGATCTCCTTGTTAGATTTTCGCGCCGCAGCAATCAAAGATCTAGTAGTGATATTCTTTGGTAAATTTTTATACATTTTAAGAGGACATGACGACATAACTAAGAAGATATGTGTGTATA-ATTTAGAAGACAAGCAAATTCGTGCAAACAAATATGTAAATCTTTAAGCTGTAGCT----GTAGGGCAGA-CTGAATTTGTCCGTTCACATT--TTAATTTAACAAGTGTCTGTTCCCACCGAAAGAAGTATTGCAACACAATTTAAATCTG-----AAAAT---------GCCAAAAT-CATTTTTTAAAGAACACCCT---AAAGGCCAATGTCTATAATCACACAGATA
------CAGCTG-----CTGCTGACCGGGCAGCAACTCTTCTCCGTAAACGATTT---------GACGATC-----TCTGTTGTTGGTAGTTTT---------------------------ATAAGACCGCGCAATCAAAGAAATACATATACATATATATATATATTAATAATATTCACATAGATATAC-TATATATTATAAATAAGTACCTAACAAAGGGGCACAGCTAAATGTGCTCAGCTGCACTAGTTAAATTAACGTTTATATAT---------AAGTAGCTTTGCAAAAACGACGAAAGCTGCCATCAAAATAGAGGCAAAGACAAAATGTACTTTCCGAATAATATGTTTACGAAGAGCAAAGTCTGCAAAAGCCCATGTA
>rnh1 3442838 3442941|2711 chr2R 3442898 3444352 scaffold_34 1321101 1322511 + 26897|0 43
AAAGCTATTTTAAATTTACCGTATTTTTAGTATGTAATTGATAT
AAGACTATAAAGAATTGAAT-TAGATTTAAAATTAAGTTAATCT
>CG8728 3448670 3448783|2712 chr2R 3444353 3449217 scaffold_57 56096 60839 - 205246|4413 4529
CGCTGGGTGTGAGACCGCCTCCATTGGATATCATTTCGCTTTGTTTACAATATTGTGCGAAGGGCAACCGTGTTAAGTTTAAATTGGCTAAAAACCAAAATT---CCCAAAATTCGA
AGCTAAG-------CTACCCGAATTAATACGTTGTTGAATTCGTATTGCATTTTGTACCATAGCCATTCAAATCTA-TTTGATTTTGTTAAAATTTACAATCTTCCCCAACAATTAC
>CG14764 3453853 3454447|2717 chr2R 3453926 3454721 scaffold_57 66460 67272 - 13573|0 624
GCTGGGAAACCTAAAAATCGAACTGGACGAGAGCGTGGCCAAAGCATTTGATATA---ACTTTTTCTACCGACAACCACACAAGCGGATACACTCAGGCGGTG--------------------------ACGGAGCCAACTGAGATTAC----------------------------------------------------TAGGAATATCGAAGGAAATGAGAGTTATTGAT-GTGAATTAGATAAAGGGTAACCGATTCCCACTTGAACAGA---TATAGACAGATG------ACTTGGCGTCCAAGA------AAAGATCAGAAATGAACAGACACAGCACAGTAATTAAGCGTAGCGTAATTATGTGCAGCTTATCAATACTTATTACAATTTAGTGCAGCCCTAATTACTTATTTAATGAAATATACATACATGAAAATCTGTGT--TAATG----TCCCCGTGTTTTTGCTGCGAGAGTCGATATGTGTAAAAGCCCCTGTTTAGTTAACTATCCCAAATGTAAATACATAAAAACATCAAATGGCATACATTTTGTGATTGTATTTTATAGTTACTCACGCGTAGACAAACATATACAGTATATAAATATAAATATAA
AC------------AATTTGCAGCGGCAGTTGTCTTTGATATA-CATCTAACATATTCCTTATTTGTATATACACACTCAGGAGCCGCTGGA-TCAAACTGCGTATAATTAATAGCCTTTATTATTTAAACGAAGACAACAAACATTACATTTACACACCTGCATACTTACGGTCATCTGCGCCATATTATGTGAAACGTTTGAGAATATCAAGAGAAGTTCGTTGTATTTACAGTGATTTCAGCATAGAGTAGTTACATCATACATAGATCAAATTTATACATAAATGTGTACTAATGAACGTTCTATACTCTGTATAGGCGATTCATGAGCAGA------ACAGCAGCT----GGAACAGCAGCCGGAGCAGCTTCTGTCCAGTAAATAC-----------GCCTTAGTTACTTATTT------GTGTTTATAC-TGAATATTTGTTTTATAATGATACTCTCCCTATCTTAAATACGA--------------------------TTATTT-----------ATGTAAATAATTAAAAG----GAATTACATACGTTTTGTGATTGTATTTGATAGTTA--CACACAGATTCATACATAATCAATACAAATAACTAAATATAA
>CG2915 3470011 3470102|2731 chr2R 3469932 3471535 scaffold_4 3742987 3744599 + 70275|80 185
-CACAATGATATTATGAGCAAGCATTTTGTACGTTCAACGATAT---------ATTACTTTATCTTTTTAAAA-----ATAAACACACGTAAACGCGAAAGGCAAT
TTAAACTGATGATATTCTTAAAGAACTTG-ACGTATAACGATGTAGATTACTAAGTACATTTTGTTTTGACAAGCGATATAATCTTAAATAAACTC-AAATGTTTT
>Sep5 3471937 3472193|2732 chr2R 3472064 3473304 scaffold_22 387258 388490 - 51192|0 129
TTAAGTTTAGAATGTTTTCGATTTTACTAAAACTGCCTATGCGATTAAATTTCTACAAACCTTACCTATGACTCCACTCCTATACCAAGAAGTATACTAATTTTGATATTTTATTTCTTTTTATTTTAAC
ACAGACATAACATATAAGCAATTGTCTTCAAGTATTTTGTACGATTTGCGTATCCCAAA--GTAATTAT-----TGCTTTTTCATCTCGTTGTATTC-ATTTATGCTATTAAGTTTCTTCAAATATTAAC
>CG14763 3478587 3478651|2734 chr2R 3474067 3478621 scaffold_4 3745185 3750235 + 134993|5153 5187
ACTTGGTAATAAAATTGATGTTGATGCTAGCAATG
ATTTGGTAAAAAGATCTATG--GATTATATTTCCT
>CG14763 3478587 3478651|2735 chr2R 3478651 3479244 scaffold_4 3750410 3751015 + 20085|0 0
G
G
>CG8726 3479944 3481071|2738 chr2R 3479884 3479994 scaffold_476 4890 5001 - 1245|65 122
CATATTCCCACACATATAGCAAACCAAATAAAGTGTAAACTAA--TTGTTGTT-----
CATATTCT-----ATATTAAAAACCAAATAA---GAAAAGTCAGTTTGTCGTTCACCG
>CG8726 3479944 3481071|2739 chr2R 3480136 3483797 scaffold_4 3753313 3757113 + 112773|0 1133
CTGCGGAACTGTGGGACGAATAAATATTACAATTTTTGGACCAAATGTGGCGTTATGAAATAACGATACCATCAAA---------------------------------AATAACTTGAACTAATCGAATTCCAAAAGCTACA-TTTTAGAGGCATATTAAGAAACAGAATACTAGCAGATCGAAGACACCGCTGAGCATA---GAATAGTCCCAAAACAATCCAGCAATTA-----------------------------------------------CTATATGTATTAACGAAACCCACTGATTATAATTATTGCATCTTATACGTGTCCACCATACATTGCAT----ACGATTTATCGGCTAAAA---------------------AGCATGTGTCTATTTATGTAAGCAA---CAAGTTACATGTCACTCACTT-------------GCGATCAGATTCC---CGATCGCAACTAAAGCTTTACCTAT--------GTGTCCACTACACGACTGATACTAACTTTGGTACGAATATCTTAAATGAAAAATGGAAACAAAGTATCTAAATCTAAAAACAAAAATCTAGAACACGAATGAAACGACATACAGAGAAATTTAAACTTTCCAATATTTA-----CATAAGTCTGCACCAAAATTTGCACGA-GACGAGACGAGATGCTATTCTTTTATATGGCCCACTGGCCAACATATAGTACATGGATGTTAGATGTATTAAGAAGTCGTTCCTCGGTGTTGTGCTATCTCCACCAGCGCGGTTTTATCGCCAAT---TTTTAGTA----------------------------------GTTGTACTGCAGGTTTTGTA-------------------ACTGAATTTGAGTTTTTATATATTTCGAAGAGCCACGAATGTTTCAAAAACACTCAACTGTTCGTTAACGTCTAGACATACTCGGAGTCCTGGACTCAAACAAGTGGAAGCAACAGGACAAAGACAAGGAAATGTGGCCAAGAATTCGCACTGTTATTGTTTTACTTTTTATAGATAATTTATTAGGTGTGTATTTAACCGAATCCGAGCGTATCGAGTATATTTATATTTAAATATGTGTATATAGATGTA
--GCGACGCGCAAAGAATTTTACATATT-TACATTTTGGACCAAATGTGGCGTTATGAAATAACGGTTCCATCAAATTAAAAGGCAAAACAAAGAACAAATCAATGGAGAATAACCAAAAACAA--GAAAACAAATAGATACATTTTTAGATACATATAACAATACATATTGGTAAACTAATGCATCTATTTATTGGCATACTTAAAGA-----AAAACAATCCAGCAAATAACTATAAGTAACTATATATATATATATATATATATATATATAAACATATATATTTACTAACGAAACCCACTGA------------------ATCTGTGTCCACAAAATAACGTATAGAAATGTTTTATGAACTCAAATGATATGTTCGTCTATTTAGTAGCATATATATATATATATCTATGAATCTAAGTTACAAATCACACACGTCTGCGATACGGAGGCGACTAAAGGTCAAGCGTACGCAACTAAAGCTTTACATATACATATACATGACCACTACACGACTGAGACTAACTTTGGTACGAGTATCTTAAATGAAATCACGA-----------TTAATAACAAGACAAAAAAAAAAAAC----------------------AATTTAAAAATTTCCAAAAATTGTTAACTATAAGTCTGCACCAAAATTCGCACGACGATGACGCTCTAAACAAATAATCTACTTA--TAACTATCATGCATAT-GTATATGTATTTAATCCATAT----AATCTGTTCCTTGATGTTGTGCCCCCTCT---------TTTTTATTGCCGTTACGGTCTAGTATTGAGGACATACAAATGTATTAACTTGGCCAAATGTTGTACTGCTTTGTTTTTATTGGTATACTTTCTCTTGTATTGATATTGATATATTAGATGTTTGAAAGCGTAACAGGCGCATTATTGA-ATTCAAA---------------AGATATATTTATATATGTATACTCAAACA-----AAATAAT-GAACAAACTCATGAAACAGTTGTAATTTGATATTGATGTGTATGTTTGTATTCCTGTCTATGTGTTTTTATGTA-----------------------ACTGACTGTGTATATGTTCAAATATGTGTGTATATATGTA
>CG11198 3485924 3486299|2740 chr2R 3484100 3486189 scaffold_4 458664 460922 - 79322|1883 2324
TGCATGATGTGCATTTTGTTTAGTTAAATTTGTT-TAAAAGTAATTAGCGTA---------AATCTAGTTATGTA---------------------------------------------TTGGAGTTGTAGGCATGGGTTAAT----------------------------TTGTTGCCTAAGTGGCCCGATAAA-------------------------------------CTAGTTGTAT-----------------CGTGTACATATTTGATTATGTATA--------------------TCCCCTGAATACA------AATCATTCCATTAGTTGTATAAGAACTAAAGTCCTT--TGTACACAGAGCCTTT---TGAATAATACGAGT--------TACTGAAAAAATAAATGTATGGTACACTACATTAACAAAA
TGTACCATTTGCATTTTGTTTAGTTGAATTTTTTGTAAATTTAATTAGCCTATTATACTAGATACTAATTAGTTAACTTCAATGGCATTGGCAGACCTTCTGCTGTTGTCTGTTCTTTTTTTGGAATTGTAGGCAGTGGGTAGTACGAGGAACCCTCTTCATTTAAATTTGGTAGTTACTCAGATATCAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAAAGGAAGACATATATATACACTACTCTATATATATTAATATATATATATATGTATATATATATATATTTATATATAATATACATTGTTTTTGTATTTGTATTGTATACAAAAGCAAAACTTTCCGCTAGTTGTCTAAGACTTAAAATTGTTTATATACACAGAGACTTTTTGTGAATTATACGAATAGAAATACTATTGTGAATATGTGTGTATG------TACATGTTTCATA
>CG11198 3485924 3486299|2741 chr2R 3486277 3494915 scaffold_4 461042 469712 - 438360|0 22
TTCTACGCTATGTTCTAAGTTCT
CTCTACGTTAACTATTAAGTTAT
>CG11196 3505603 3505706|2751 chr2R 3505682 3506525 scaffold_11 647785 648640 - -616|0 24
GGATGCCCCAAAATTCGTATCCATT
GTGGTGCCCAAGCCACGTGCGGATT
>Hey 3507249 3507473|2755 chr2R 3507099 3508856 scaffold_879 1410 3084 - 29922|151 396
TTGTGGGCATAAGCCTCAGAAGGGATATTTCAACC---TCTAGTCAG-----AGCAGACCAAGTGTGATAGTCTTAAGTTTCGCATCCTACACAGAGAGAAAAAAATGGAGAAACAA-----------CGCAGTG-AGATTAGCTAGTCCCGTAAGCCTTTAAGCTTAAGTTATACCCTATGATA-ACTATAACTTTGAACACTTTGTGAATCTATTGTAAATAAACGCATGAGTGTATAAGTGAA
GTGACAG----AGTATCTGTCCGGCTAATGCAACCCGTTCTAGTCAGATCAAAGCCGAACATGTGTGATAGTCTTAAGTTGTG----------AAGGATCAAACGATCTCTAACCCGAGTTCCATGTCCACAGTGTATATTGTCTAAATGCTTAGGA---TAAGTTAAACTTTTTCCACATTTTCTACGAAGCATCCGCACAAATTTTGAAAGCATTTT----------ATAAGCCTGTAAATAAT
>CG11191 3512462 3512693|2761 chr2R 3512510 3513935 scaffold_4 491128 492478 - 18883|0 267
GACCGGAAACGGACACTCG--------------GCGGCTTTGTAAC-------CTCCACTTTGCGT-----------CCAGCGATAGAGCACGAAAA-------------CCAGTCTTGTGAGAATTACCTAC--------------ATACGAGTATATTATACATATATGTAATCGAGTATTTGAGTCGGTAGACC----------GCAATTTTCATTAT-----------AGAAAGTTGTTTTCGA----GAATATCCATTAACAA
GCCCAATGCCTGATGCCCGATGGATGTGAGGGTGCAGCTTAATAATAATCCAACTGGATTTTGCCTAACGGATTTACCCTGCACTTGTGCTCTAGAGTTCTAAGAGAGTTTCCATTTTTTGAGAATTATACGCTCTATTTTGAATCGATATAACAATAGTGGCCAGTTTTTTAATT---CATTTATGTCGCTCGATTATAATCGCTGGCAATTTTCATTATTTTTCATTATATGAAAATTGGTTACAATTTCGAAAATCCATTAAAAA
>CG14762 3520924 3522340|2774 chr2R 3520969 3521535 scaffold_4 497335 497925 - 1251|0 617
CACGAAGGTCGAGAATGCATATCGTTATATTGTTATATTATATCGTGACATATCAAGAGCTCCCAGTAGTAAG---ACACTCGGATGGCTCG----ACACAGCTAATATAGTGACATTTTATAGAA------TTTACTTACATTTTTGAGGCATCTGACAAGTTTGATATATTTATGCAGAAGTGAATTAAGCAAATGCAG----------CGTGTATGCAGAGTGGAATTTTTGAAATTTTTTATACA------------TATACTT--------TTATACACACATACATACGTACCTTTTCGATTATGTCT---ACGCAAACTAAGTTGTAATC-CGATTAGCTATACTGACACTGACACTCCAAGTCCGCCCGATCCCCTACCCGCCTCCACACCAACCACGCGGTGGCTTAGGTCAGTAGCCACCCACTGGTGGGCGGTGGTGCAGCGGGAGCGGGCTCG---GGTCCGGAAATATTTTCAAGAGAATGCGCCGCACCACCGATTCGGGTCAGTTTCCTTTGGCTAGAGCTGTTCTTTTCAAAATATTGC-AAAACACTGAACCCCATCGAAAGCTGGGCTTACATAATGCTCTCCATGTGAGCAATCTGAAA
CATAATCGTTATATATATATATTATACATATACAATACTATATATTGTAATATCACAACATATCGGGAGTGCGCCAATAATTGGTTGACTCGCAAAATGCAACAAACAAAAAAAAAAATACAAAAAACATTTTTTACAACTACTTTTGAG--------CATGTGCAACAATTTAGAACACAAAAAAAAAATGCAATTTTTGAAATTGTTTTCTTGTTTTGTTTACGATGTTTGTGTATGTTTCTATGTACCTCTATTGAATTGTATTTGAACTAAGTTATACACATATACATATACCTGTTTCGTGCTAAGTATTGTGCATAAGCTATTTTGTATTTACATTTTATTGTCCAAAAAAAAAAAAAAAAACCCCGTTTTGT------------TGGGCACAGTTCGCCAGTTCGGTTGGGTCAGT---TAGCCGTTAGCTGGCGTCCATGCC-CGAAAGCAATTTCAATAGTATTCAAAATATTTTCAAAAGAATGCGCTGCAAC-CCAACTCGGGTCAGTTGCGGCTG--TTCAGCTGTTCTTTTCAAAATATTGCCAAAATACGTAAACAAAAGCAAAACCGAATCCATGAAGCAGTTCCGTTGTCTTCGTTGCGGAG
>CG14762 3520924 3522340|2775 chr2R 3521561 3522081 scaffold_4 497951 498606 - 6231|0 656
AACCAAAACCAAAACAGAAAGCTAA--------------ACAGAAACCTAAACCCAAACCAAAATCGAAACCCAAACATATCAGAAT------ATTGTTACG-TTTAAGCGAGA-----------GATTTTGTTGTTACTCGCGTTAATCT--------------GTACGAGTTTA----------------------------TCTGTGCAGCCTAGGGCTCCGTTTGCCCATCTATTATGTGTAGT-----------CTATCGTCGTCTTGTCGTCGGTGTTGTGAGATACAATCATTACTAACGCGTTTCGTAGTCCCTCCGCCCGTTTCCAGACCTACCTTCAGCACCCAACCGATACCCAGTCGAAATTC--GCAAGCTCCTCGAGTCCATGTGTCGTGTTAACCAATTCTCAGC------------AACCATGGCCAAATGTGGCTCCACTTTGGGTGCCAGAGGCGGGCGAAACAAAGCGAAGGCACAAGAGAAA------------------------GTAAGAAAATTTCATTTGCATCAATCACCAAGAACTGATTATGGAATAAGTAGTTTGTACTCTTTATTTGCCACAAACACGGGCAAACTCC---CAAGAAAT----------CCCAATTCCATAACCCATA
AGCTTAGACTTAAGTGAAAAGTTAAGAGATTCAATTTTGAAAGCAACAAAAACAAAAAACAAACAAAAAACCGAAACATATCAGAAACCGTGAATTGTTACAAGTTAAGCGATATTATTATCATTATTATTATTATTACTACCATAATTATAAAGAATTTAAAGAGCAAGAGTTTAAATACTTACACATACTACTACCAAATTCTGTGTGTATTGTGTATATCTATGTACCTATTTATTGTGTGTAGTACTATGTGTCGTCGTCGTCGTCTTGTCGTCGCTGTTGTGAGATACAATCATTATAAACAATTTCTTTGTGGTTTTTTCTATTTTACATTTTTCTATTCAAGTTTTTCCAAGCAGCATATCAAAAGGCATGCAACCTAGTCGAAATT-TTTGCAATATTTATCGATTATTTACCAAAGAAATACTAATGCTATTTATATATGTATCTACCTAAAACAAAAACAAAAAGCACAAAAAAAAAAAGTAACAAATGAAAAACGAAATTGTACGCGTTCGAATGGAAGAAGAATAACATTTGCATCAATCACCAAGAACTGATTATGAAATAAGTAGTTTGTACTCTTTATATGCAAGCAGAAGAGAGAAGCATGAAGCAAGAAGCGTTTAGGCGGATCAGTTGCAGCATCCGCA
>CG14762 3520924 3522340|2776 chr2R 3522227 3522516 scaffold_4 498924 499198 - 8260|0 114
ATTATGCAACTCTGCCAGTAATTAGACTCAGAAAGCACGCTTTTCGAACCAGCAGCAG-GCCTCCCCCCAGCAAAGTTGCTGAGATGACGCCCCTGGAGAGGCACCACCACCACT
ATTATGCAACTCTGGCAATTGTTAGACTCAATATGCACGC------AACCAACAGCAACAACAGCCCCCAAAAAACAAGCTGCAATATCACCC--GCAAGTGCCCCATCGAAACT
>CG12769 3565639 3566175|2830 chr2R 3564905 3566658 scaffold_4 546610 548373 - 32797|891 1491
CAGCCACAGTTGGCCGGCAAGTAGGCAGCGGATTGAGGAGCTTGCCGGCTCGGGATCTGGACGGTCCCAGTTATCGGAACCGGAATAGGAATCGGAGCGGAGCGGAGCGGAGTCGATTCAGAATATTTACTTAGCTCAATTTTGAGAGATTTTCCACAACCAGGCACACAGTTAAGCTCAGAGCAAATTATACACTTACCATCTAGTTCTACGTTTACACTTACGTCTACGTTACATATATAGTTAGTTAGTTAGAGATAACTCATCATATTTTTATGATCTGCATGCAGAGAGTATGAAAATCAAATGAGAGCTACGTAGTTACCTAATCCCTTAAAGAGTCGAAGACGAATTAGAAGTTGAACAGTCGAACAGT-CGAGATGGCAGAATCAAAAACGGAGTGCGATGGATATACACACACATATATACCTTCCCGAAAAACCAACCCTGTTATGTAGTCTTA--TTATGCATTAGGTTTTGTAGTT--TAGTCCTT-------------------AAGTACTT--------------------------------------GGCAATAATTTC--CAGCCGGTTCAACTGGCCAGCAAA
CAGCCACAGTTTGGCGGCAA------------------------------------CTGACAGTTGCCAGCCACATAAA--AAAAAAAAAAACAAAACAAAACAAAACAAAATGAA---AAAACATTTATCTAAA-------TGCAATATATAGCTCAAACTGAGTCGGAAGAAGG---AGAACAAATATAACAC------ACTAGTT------------------------------TAAAGTTGATTAACAAAA-------------ATTTTTACAAAATGAATTAAAAGAAAAGATAAGAACAATGAGAGCTACGTAGTTACCTAATCCCACACAACG----AGAAGAATT--CAGTTACAAATTCTTCCAATGAGAAATCTTAAATTTAAAA-------------------------------------CCCCATACCCAAATCCTGTTATGTAGTCTTAATTAATGC---AAATTTTTTAGTCTATAGTCTTTGGTGTATATATATAGGAGAATATACATAAATAGAAAGGTAAAACGAAGCTGAGTAAAGGAAAAAAGGCAATAAATTTAACAGCCAGTTTAACTGG-CAGCTAA
>CG17977 3578422 3578562|2846 chr2R 3578375 3578479 scaffold_18 2413715 2413801 + 1801|47 104
TTCTGATTGGGATTAGCCGATAAGCTGGTATCAATGCTGCATTTCGTTTATTTGCAAC
TGCAGAGTTGGAGTAGTCGG--GGCTGCTGACAACGCCA----------------AAC
>Vps28 3591031 3591130|2856 chr2R 3589507 3593336 scaffold_4 571736 575528 - 97617|1677 1786
CTATCAGTTTCTCAT---------TGTTTACGTGTATCCCTAAATTTATATAGCATGTTCCGATATTAAACAAGTTTG-ATATATCACCTTACTTTTAGCGCAGACTAAA
TTGTTAATGCTTTGTACACTTTCGTATTTACTCGTATATATATATATATAT-----------ATATTCAATTAGTCTGTAAACGTCGC---------AATAAAGATTAAA
>slv 3592370 3592652|2856 chr2R 3589507 3593336 scaffold_4 571736 575528 - 97617|3116 3473
GC-------------AGCTAATCGGACCAAGCCA-------------------------CGCATTTCGCTT-TGGCCTCCGAGCGTGCCGCACACAGGGTTTATACATACATGCTGCTTGCT---------TAGGCGCCAG--------GCTTATTTACTATAGACATACGTAAAAGTAAGCCTATATTTATTGTAAAGTATTTAT----------TTAATCCCGAGGAT---TTGCCTCGAATATGCCGCTACTTACGTTGCCTTGCTGTTCGGTGGCGCCCATTTAATTGTACCCTTTAGAGCCCGTATTCCTAATAAA------CGAACACACGGGAAACGATTGAGTAACCGAA
GTTTAGTTATGTACAACCTTACAATATTAAGTCAAGTATTTGTATGTACTTATATATTGCGCATTTTGCATATGATATCTAAGCATGTTTCATACAGG-TATATATATATATATATTTTGATATAATGTAATTGGCGAAAATGTCGCTTGCTTAGTTTCCATAGAGTTACGTTTTTCTTAGCATATAAT----GTAAAATATTTATAAAACTGATCTTAACTTATGGGATAGTTTGTTCCTTTCTTGTATGTACTTACAATCTGTTGATTTTCGGTG---CCCATCGGAATGT--TATTATGATATTGTATATATAATGAAGTAGACAAAACACACGCG----GACTCTGTAGC--AC
>CG8712 3608750 3608879|2872 chr2R 3607635 3609429 scaffold_4 588833 590829 - 43185|1236 1464
AGGGCC------------AAAGACATATT---------TTTTTTTTGG----AAGATCTCGATGTATT-TGTTCTGGCATCCAGTCAGTAATCCAAATGCATGTATGCTCTTGT-----CATTTAGATTAAACATAG--AAT------------------AAAACGATTAACGGGTA-----------------------------------------------TAAT-
CAGCTCTAGATTGCACTAAATGCCGTATTGTTAAACAATTTTCTTCGATTATAAAAGGGGAAAATATTATATTCTAAAAATCATAAATTATTTCTCATTTATATACTTATATATATATATATATATATAAAACATAGTCAATTGTCAAGTACAAATTCGAGGAATGGCCAACGGGCAGCAGTATCTAGCATTCTACTTTTATATTGTTATATACTACTAGAAATTAATC
>cul-4 3614071 3614357|2875 chr2R 3614017 3616988 scaffold_4 597466 600552 - 127066|54 394
GTCATCGCCCTCG-------------GAACGTCGA----------TGCCTCCAGCAATTTAAA-------AAAGTTTTCGAACCGAAAGCAAACTAGGTGTTCAATAAAC--TTATTTATTGGACTTATTCTAATTTGTTTACTTTTAAT-----TGATAATTCTCCTTCAATTAACAATAGAAGTGACATTTGCAGGCTAATTTTCTAAAGGAAACATTAAAATAATTAT-AACTCGTACTAGTAGCTCTG----TATGCAAAAAAGAGATACGCATAACTTAATAGTTTTTTATTTA--------CCATAAATAAAAAATTACTTGAAAATATAA----
TGTTTCGTCTTGGAGATATACATGAAGATCGTCGAGCGCGAAAATTGACAGCAACATTTCAAAAGAAAACAAATTGTAACTACCGCCAACAGAGTTTGTTTTCTTTTTACTTTTGTTTATAGGGGTTTTAATTATTTTTTATATGATGATGATGGTAGAAATTCTCCTTCGAAAAACAATAGAAGAAACATTTGCAGGCTAATAT--TAATAGAATACTTAAATAAATGATAAACTAGTACACGTAATTCTGCATCTGTATGTAAAACGGATATGCATAATCTAAATCGTTTTTATTTATGATTTTTCGATAAAC-AAAAATTACTTGTATACATAATTAC
>cul-4 3614421 3614623|2875 chr2R 3614017 3616988 scaffold_4 597466 600552 - 127066|480 749
ATGGCCACAGATTCTGT-----------------------GAAATCCGAACACCGATTCGATTGTAATTCGC---------------------TCTATACCATACACATACATACTAG--CAGTCTAATGAAGTTTTTGGAGTGCCCTCGTCCGATCGGCGATGTTCAG-------------AGTTTTTCAGCTGTAATTTCGTTTCTATA----ACTAAATCGTTGAACAATCCGCCAGCTAATAGTGTAGCGACA----GTTCTTTTT
GTGCGCGGAAATTCAGTCTTGTTTTTTTTTTTTGGCCTACCAACACAAAAAACCGA-ACGATTGTAGTTTTTCCCCCTTTTTTATTTCTTTTATCCATAACATACCATCAAATACTAAACAACTCCAACGAAATTCATTTGGTATCTGCATGCGGCAAGCG-TATTGAGCAAATATCAATTACATATTGCAGTTGTAGTT--GTTTACACACGATCCCACGAGGTTGAAAG---TGGTGGCTAGTGTAGTTGCTGCAATTCGTTTTCTTT
>CG30372 3626576 3627078|2880 chr2R 3626098 3631070 scaffold_4 602072 607534 - 202075|616 1294
TCAATC-CCCTGTTTGTGCTGAGTGATAGTGTGTGGCTGCGCGTGATTGTATATAGATATATATAGATGTGTGTATGCGT-------------CTTTTAAACTCTAATGATATATAAAACAAGTTTTTATTTATTACGACTATTTTATCACAAAGCG------------------------TTTGACTATTAATTTGCCTAAGACTAAACA------------------------------TGTAAACGT--CTCAAGTAAGTTAC----TCTTAGCTTAGAAGCCAA--CTACTCA------TTTACACTTGTATTTCAATCAAAGCCTTTAAGTAGCGATCTTGCTGTGCAT------TTCCCGTTGGCTTCCTTCATAAGGT------------------TAGCGCTTTAA-----------TAACTGAATATGTCCTGCAAATGCTGT--------AATT---------CGTACCATAACTAGATCTAACTTTAACTTAGCCTAA------------------AACGCTGTGCGCAAAAGTT--ACTCAAT-----GTCAGAAGAATTGTCGGGA---GATAAGCTTATGTATTG-TATGCTTGTACTTTATGCTGCCATAAACAGATACTAACGATATCCACACGGGCC-------------CCGACCTGGTCG
ATGGCAGTCCTGTTTGT-CTGAGTATTCGTGTGTG--TGTTTGTTTTTGTGCGTGAGGCTGAAAGTTTGTTTGTGTGCGCGAGCGAGTGTACGAGTGTGAGTGTGTATTATACAAAAACCCCGATATTATTTATTAC-ACTTTTTTTTAACAACACAACAACAACAACTACAATTGTATGTATTTATTTTTTGTTTACTTTGTTGTAAACACACACACACACACAACTTTGTGTCTCAAGCTATAAACGTAAATCAAATAATTTACGAATCATTATTTTTAAACGCAAACCTATTAAAAGTATATTACACTTATAT----GTAAACACTTGCAACTTATG----TACTGTGTATATTTAATTGATATTGATACCCTTTTTAAAGCATATACTATAAGTAGGCGACGCGCTTTGAATTGCTTTTACAAACCGAATATGTCCTGCAAATGTGTTATAGGCTAAATTTTCAGCTAACCTATCATCATCATATACATATATAACTTACCCTAATTGCTAGCCAAAAAACATCACGCTCTCCTCAAAAGTTGAACTCCATTCGCGTTTAAAATGGAAATCGAAAATTGATGAAATTATGTATTGATATGCTTA-ACAATACGCTGCCATATACATATAC-----ATATACATATGTACTAAAAATAAAACAGCCGACCTGGTCT
>CG8710 3636793 3636882|2884 chr2R 3634889 3637437 scaffold_4 612173 614842 - 47485|2169 2259
TTATCATTTTTGTGTGTACATTCTTGAGTTCTATTTCCAGG-GTTTCGTACATTTATAGCTTTTAAAATACAAACGATTAAACAACATCTA
CAA--------GAGTTTATTGTTTTTCCTTACATTTCCATGCGTTTAATATTTTCATAGTTTGTTTA-TGTAAACGATCAAATAACATAAA
>CG11508 3641162 3641307|2887 chr2R 3639604 3643045 scaffold_4 616914 620670 - 80951|1766 1932
ATATACATATACATTTGTGTGATTTTTTCTTTATTTGCGAGCTCCTTTGACTGCAAGATCGCTCAAGGAGTTGATTGATATTTTGTTC-TTGTAAAATATTCATAGATAGATT--------------------TAAATAAAATACATACACGTTGCAACAAGAGTAA
ACGTAAATAGTAGCAGCGAGGATAGCTTGGATTTGGATGAGCTCAGTTAATTATAGGCACACGCA--TATTTAATTTAATTTTATTTCGTTAAAATATATTCAAACATAAATTATACATACTGTTTGTGTTAAAAAAAAAAGTCAATACACGTTGTAACAATAG---
>Obp44a 3646178 3646322|2888 chr2R 3643245 3647040 scaffold_4 620677 624676 - 91717|3302 3476
GAGTTCAGCGCAGTTCC----ACATCAATTCTAGAAGCGAAAGATCAATCAACACGCAAGCAACGCGGCATTTTCGAGTTGAAATCCGCTCAGGCTCTGCAATCCTACG---------ATTGAAATAAAACC-ATATAATAGTGCTTTTGAATGAA----------------GAA
GAACTAAGCGTTGTCCATCTGGCATCCCGTCGAGCAATCGAGTATCA--------------------GCATTTGAGTGTTG-----CATTAATTTTTTGGATTCCTGCACTTTGTTTAATTGAAATAAAACCCGTATAATAGCGTGCGTTAATGCCAAGTTTATTTTATTTTGAA
>CG8709 3649801 3650047|2892 chr2R 3648778 3650656 scaffold_4 626456 628380 - 17804|1172 1476
ACTAGCTCCAGTCCTAGCCCCAGTCGAAGGTTGTGCAGCTTGCAAATTGTGATGTTTTTTTTAAG-AGAGTTAGGATTGTGCTATACCTGTATGTCTGTGCCTGATGTGCCAGGTCAGCGAGCTCCAAGTTCGTCGGCCAGTTAAGTTTCGAAAGTATTCTG--------CTCCCAGCAGGTCTTTATGTTTAGTTCTAAG-------------------GATGACCATTATACATATAAATTAC------------------------------CCAATGAAATATACCTTCACTTTCGCCGTG
GCAAAGCCCATAGTTGTATTTTAATGAAGTGGGGAAAGTCCTCAATTTGTGATATGATATATGTGTAGCGCTAAGTTT----CATATTAGTCTATAGTTTTGTGATATGGGAGCAC-GCTCCCTCCTATTATATTAGC--ATTAAGTAAACCGACTTTTCAGAGCCAAAACTCCCACGA----TATATGCCTAGTTCTAAGCTATATTCAATTTATTCATTATAGCTATCATAAGCCTAAAGTTTAATTTGTTTTTTTCTATAATAATTTATACACAAATAAAATGTGTGCATACTTTCGTTGTT
>l(2)02045 3658730 3659085|2898 chr2R 3658186 3660461 scaffold_4 635335 637741 - 59358|587 1069
-TGGGTAACCATACCAGACGC----------------------------------------TTTTCCAATAAATGAGGAGTGCTATTATCTACT---------ATTTGAGAACGTTT-------------------------------TGTTTTAGAGCCTA----------GTTTTATTTA-CCACATATCATGCTACA---ATCCCATATACAAACATATGTC-----GTCTGCCTTTGCCAATTGTTTAGTTATTTGTATTCTTCACGGTAACCTATTTATTATATATATATTTTTTG---------CGT----------TCAGATGAACGGGGGGATGTGCCGAGGCATCCCTACTATG---CATATATTTTTGGTACAATTTGTTTGATGTACATACATACATACGTATAACTATACTTCTTTAGTT-TTATCCTTTAAACGA-----TACAAATATATTTAAATTATTTAAATCGGA
ATCGACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAATGATTGCATTTTCGTTAGAATTCTTAAACAAGTAATAAAAACGCTTAACTAATGCAAAAAAAATTAAAAAATATTTAAAAAAAAAAAAACAAAAAAAAAGTAAATCATATTTCATCAGCTATTTTATTATTATTTTATTTAGTTATTTATATTTATATATATATTACATACACATGTATTTATCTGTATGCCTGCATTTGCCAATTAT-------CTTGTATTTGTTATATTTATCTATTATTTATGCGCATACAAATTGACAACAAAACGTAGCCAAGTAGACAAACAAACAAAAAAATATTACAAAGAAACTATATATTATATTATATTATTTTGGTACAATTTGTTCAATGTACATAATTATGCATTT----------TGATTTAGTTATTATTTACTATATAAAGATTTATAAATAAACTTAAATTATTTGAAAT---
>CG8708 3671270 3671852|2911 chr2R 3671179 3672734 scaffold_14 202773 204409 - 47349|141 767
TAAGGGATAGGTATTCTTAACATCTTGTGTTCCGACAGGGTCTCGACTGCTGCTCGGACTTGGCCATCTCCTTTCACTACGTAGCTCCGAATTCCTTCTATGTCCTGGACTATCTCATCTACCACTTGAAACCCTACGGCCTACTGCGATCCCTGGAGCCTCTGCCCGCCAAACTCAAAGTGGGTCAGTTTCTGCCGCCTCCCGTGGAGGCCAGGGGGCGCCTGGC--CAGTAACGAGGATTCCGCCGATGATTACGACAGGATCTATACGACCACGACCGAAAAGCCAAAGGAGCCCGATGCTCGGGAAATGGACTCCAAGGAGGTGGA--------AAAAGAGGATGC------------CAAATACAGGGAAAAGCTTTCAAAGGAGGACGAGGAACGCGAAGACTCGCGAA-----AAACTGACAATGATTCGGAGTATACTGAGGAGGAAACGGAAAAGCGTTCCAAGTCC--AAGGAAACATCGAAAG-AAAATTAAAA----TTTATTGAGTTTAC-----TTGGCAGGCTTTGGAACTGAGCTGTTTCTGAGTCTACGCCGCTCATCCGGTTTATACATTTTAATAA-----AAATTTTCTTAGATTATTATTTTAGAA
TAAATGATTGGGATCA--ATTATTTTGTTT-----AAGGGTCTCGATTGCTGTTCGGATAATGCCATTTCATTTCACTATGTGGGCCCAAATCTGATGTATGCTCTAGATTATTTGATCTACCACCTGAAACCCTATGGAGTGGTAAGAACGCAGCAACAGTTGCCAGCTAAGCTGAAAGTGGGCGAGTTCCTTCCGCCGCCAA--------AGGAGGAGCCCGCCAACAGCAACGAGGATTCCATCAATGATGAGGACAGGTTGGCGAATACAACAACTGTAGCTCCGACAGAACCTGATGCAAGAGAAGTCAATTCGAACGAAGCCGATTTAGAAGAGAAAAAGACGCCGAAGGAGAACTCAAAAATGGAAACAGAACTTAAAAAACTGACAAGTGAAATAAAAAAACTTGAATATTCAAATGATCTATATTCAGAAGAACAC-----AGAACACAGAAGAGCACATAAAAACCTTATTTAATCATAAAAAATAAAAATAAAAAACTCTTATTTAGTTGTCTGATTTTAGCGGAATTAAGAGTTATGGGGTTTCGGGAAATTCCACCCGCGTGTGTGAAAAAAACGCGAAAAACGTTTGAAACTTTTTTGCTTACCATCCGATCG
>CG8707 3673492 3673715|2912 chr2R 3673208 3675059 scaffold_4 648401 650317 - 66865|299 595
GCG----CACTGCATCCCCAAGCGGAGAGCCCCT---------TTTATTGCCCCCCTA----------------------------------------CGCTAGCTTCTCTGTGG----ACTCTTTGATTCCA--ATTTGTACGTTCTCTTCCGT---TAAATCTGATGTTACCT----TTGTCTATTGATACGTTAGGACGCC------ACTCTCACAGAGCAGCGTAAAAAATTGCCCAGCGGTTGAAATTATTGATAA-TACTACCAATAAACATGTCTATTTTTAAATACGAG
ACATAATTACGGTGACCTTAAGTTCTGTGTGTTTAACTATTGGTTAACTTCCCCCTTATAATTACACGTGAACACACAGACAACAATGCTGATAAAATCACTAATTTGTCTTTAATAATTCTTTTTTTATCCATTTTTTTTATGTTTACTTTCTTTTATATATCTATCTTTGTTCTATATTGTTAATTCATATGTGTAGCCGCTTTGCTGCTCCTTACAACGCCA-GAAACAAAATGCCCAGCG-------TTATAAATAACTACAACTGAT-AATATGTATATTTTTAAATAAAAT
>CG30373 3675761 3675877|2915 chr2R 3675826 3679644 scaffold_16 1586751 1590424 + 167351|0 54
TCGTAGGGTTGGTTTGTTGTACGTTTTTGTTTCGTTAAGTGAAA---TTAAACAT
TTTGCATCGCAATTAGTTTTATGTGTTGTTTTTATTAAGCAAAAAAGTTAAATAT
>CG14756 3716701 3716785|2961 chr2R 3716726 3716911 scaffold_26 623103 623285 + 1079|0 59
CGCGCTGGACACTCCCACCTACAAATGCAGCTTTAAAACTCATTAAAACAGCAGCGAAAA
CGAGTGAGAAGCCCAAGC---CAAAAGCAGCTGAAAA---TGCGAAGAAACCAGCGAAAA
>dpn 3740784 3741229|2978 chr2R 3740651 3742444 scaffold_16 1662129 1664065 + 55495|145 711
ATCAACCGCACAGGCCAC-------------------------------TTCTATGTTACGTTTATA------------------CATTGTTAATTTA-TTTCATTGCAATTTTTTCAAAGATCACTTCAATGCTTTAGAACCCCATTAAGTTTCAACGATTTCTATATGTTTTTATGTATCCCCGTTTCGCTTTCTTC-ATTTTAAGTTCAGCTGTGATTTT-------GTATATTTTTTGTGTAGTT-------------------CTCGTTTAAGCGC----------------------TTTATACGACTATTATGTAGTTCATTAAATAATTATGTTCTTTAATGTTTCATTAACTGCTC-------AAGTATTTAAA---CAATTAAACGTGTTTCTATTTAAGTTATGTAGTTTTCATTGTATAGCGTTTATCATTAGGTCATTCACGTTTCTA------TATTAGTGTTTTAATTTAAC---GATTGTAATTTTAACTTTTAGGTAATGCAAAATT---CGATGGAGTGAAAATAATGATAATAAAAAAAAAATGCTGC
CGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAACATCCTCTCAAATATTGTCTATGTTTTATGTTAAGTTTATGCTCCCCCTCTCTCTCTGTCTCTGTTAATTTATTTTCATTGCAATTTT-------------------ATTCAGATTTCCATTAAGTTTTTCCATTTTCCAT------------------GTTTCGCTTTCTTCAATTTTAAGTTCAGCTGTGATTTTTTAAAGCGTGTATATTTTGTGTAATTTTTGTATAATTTGTATTAATTTGTTTAAGCATTTATCTATTATTATTATTATTATTACTATTATTATTATGTATTTTAGCAACATGGCATATTCTTGATTCAT--ATTAAATGTTCTTTATTACATTATTTAAGTTTCAACTGCAAGAATTTTTAACTAAGTTATGTAGATCTTAGCGTCAAGTTTTTCACGTT--TCCAGCTTCGATTCTAAGAGGTTATTAATATTTTATTTTAGTATAGTTTATGGACTTG--TTCCAGCTGAATTTCAACTGAGCAACTGAGTGAAACAAATA--AAATAAACAAAATTGCTTC
>CG2291 3772459 3772677|3004 chr2R 3772651 3772860 scaffold_16 1697075 1697278 + 5476|0 26
ACGGTTTCTCTTGAAGCTCTCTGCAAT
AGGATATTGCATGAAATTAACCAGAAT
>CG30365 3870761 3871325|3120 chr2R 3870602 3871363 scaffold_16 1825342 1826163 + -1458|177 843
TACA----AGAGCACCAATGACCAAAGAAATAAACATAACCTTTAAAACTTATTTTTTATTTTTATCCTTGTTCTTATCTTTCTTCTTATCCGTGCCCTTATCCTTCTTATCCTTTTTCATC-TTCTTGAGCATGTCTTT--------TCTCGCCTTCTTGGCCT---------------------------------------TTTTTATGGCACTGGGACAGACGTGGTTCTCACCATGAATTTTGACC---CACTGACGACCCCGCTCCGCTTCGCAGAGGCTCAGGGGGAATCGGCACTCGCACTCGCGAGGTCGATATGGTCGCTTGGCCAGCTTAGGCTGCTTACAATCCGACCAGCAGGGCATCGG----------TGCACACAACCTGCGGCAGCAGGAG------GGCGTCTTGGCCGCGTGGCATCTGGGCGGACGACGTCCTGGCACGCATCGTGCCAACGGAGCGAAATGGGGACATGGTCCTGTGGCTGTGGCA--CTGAGCGTTGTCCGCTCGCGCCGCTCGGC---CACCCGACGGGCGGGGCTCAGAGCCTCCAGCT---------TGTCGTAGGCG-----------------CAGATTATCTTCTTGCGGATCATGAACTTGGGGCACTCCACCCAGTGGCGCTGGTAA
CACATTTAAGAGAATAACTGCATAATAAAATAAAGATAATGTTTGTA------TTAGTACATTTATA-TTGTTATTATTTTT--TCTGAATTGCACACTTGAGCATTTCGCCCCATTCCTTTACTATAGAGAAAATCCTTCTAAACTATATTGCATATTTAGCATCGGAGGGGAAAAAATACAGTACAGTTTAAATGGACTTAATTTATTCGCAAGTGGGGCAAGAGCAGTCTTTTTGGGATATCCTTTCCTTTCTGTTCTGAAAGCGGTAGGCTTCACAGATTGATATCAAGCTTAAGCAACGGCACTCCCGAGGACGTTCGGCTACTACAGCAGGGTCCATGCGATCGCACTCAGAGTAACTAGGGAAGGGACATTTTGTCTTCACACAGTCGGTCGGTACACGAGTTAAATGGCAGTTAGGCGGTATA----CGGGACGCGCGACAGCACGGCATGGTTTGC----------CGAGGGCAGCCCTTGGCCTTCTGGTTGACACAGTCCAGACGTTTTTTGT---CATGGCTTGGCTTGCAACTGGTACGCGGA---CAGAGAGGCAAGCAACGCCGTGATGTCTCGGGCGGAATGGAATCGCACCAGCAGCAGACGCGCTTGGGCACCATGCGAGGACAGCATTCCCACCACGTACGCTGAAAC
>CG30364 3873036 3873036|3121 chr2R 3872878 3873128 scaffold_16 1839910 1840145 + -732|158 158
A
T
>CG30366 3875203 3875303|3124 chr2R 3875177 3875373 scaffold_16 1157055 1157262 - -1593|26 132
TAATCCTAC---CGAAACACGTAAA---AGTGCAAGTTGAGGGTCTGGCTTTTAAAACGAAGTAATAGATACAAAGTGATGTTTCTATTAATTTGCTTTAGCAGTCA
TTGCCCCACTTGCGAATAAATTAAGTCCATTTAAACTGTACTGTATTTTTTCCCCTCCGATGCTAAATATGCAATATA--GTTTAGAAGGATTTTCTCTA-TAGTAA
>CG30363 3876205 3876322|3125 chr2R 3875374 3877171 scaffold_16 1828320 1830136 + 15670|895 1014
GAGATTCCTAAGTGTGCAGTCGTCTGATTTATTTAGAGGTTCTTCAACAAAGAGTATGCGGAAGTAACCTAACCAGTGAC-CTAGTTTTCCCGG-CCTAGTAACTCACAAGTTCGACAGC
-AGATACCAACAAGAAGGCTCGC------------GATAATTCTGGGCGAAACGCTTGCTGA-GTGGGTTAACCGGTTATGCTGGTTTCCACAGATCTAGTCA--------TTTGAT-TC
>CG2127 3880152 3880815|3128 chr2R 3880815 3881363 scaffold_16 1835966 1836496 + 7640|0 0
G
G
>CG2121 3908206 3908386|3157 chr2R 3904903 3908282 scaffold_16 1867737 1871431 + 81531|3823 3902
ATCTTATGTGATATTGCCAAATATTGTTAGGAAATTCGTTGATTTCGTTAC-TCAATAAAAC--CAAGTTTGTTTTAATT
ATCTAAAGGGATATT----AATATACACAAGGA--TTATTAGTTTTGTTTTATAAATAAAACGCAAAGGGGATTCATATT
>CG2121 3908206 3908386|3158 chr2R 3908350 3909262 scaffold_16 1872072 1873041 + 39746|0 36
TTAGCTCTTCAAGGCTAATTCCATATCTTGCCATTTT
TCCACTCTGCCATGTTAATCTTAATTGATGTGATATT
>Lcp1 3942447 3942557|3186 chr2R 3942249 3942448 scaffold_16 1054566 1054767 - -352|219 220
AA
CA
>Lcp1 3942447 3942557|3187 chr2R 3942449 3943089 scaffold_16 1918937 1919555 + 11438|0 124
AACCTCTATGAAAGCGGATCGCACT--ACGGACTGTTCCCCG-AAGACCTTTCGAAC---TATTAGCTT----AAGTAATCGTACTGT--TTGTAAAATACACGC----AATTGTTAACGGCAGA
AGGCTCTGAACATGTTGACTCGATCAAATGGACCACTCCCAGAAAAATAATTCGTACATTTATTGTTTTTGCCGCATACTCGTTTTTTAATTGAAAAATATATGCAGCGAATTGTTGAAAGCATA
>Lcp2 3945780 3945903|3191 chr2R 3945543 3946591 scaffold_16 1925315 1926340 + 9826|273 399
GACTCGTCACC-CGGATCCCGGACCACTCCACGGACTGTTCTCCCGAAACAAATCGCCCAAGTTGTTTAGCTGTACTTCTTGACTTTCAAAAAAATACATGCACTTGCTTATAGCAG--TAAAAATG
GGCTATTGGCAGTGTATATTGGATCG-TATATGGACTTGACCCTCGAA--------CTTCCCTTGTTTA----TAATTTTTAAGTT--------ATCCGCGCA-TTGTTTATGACAAATTAAAAAGA
>Cyp4ad1 3951206 3951300|3201 chr2R 3951249 3951265 scaffold_16 1037930 1037944 - 391|0 16
ATACTTCATTTACTAGC
ATACG--ATTTATTATC
>Cyp4ad1 3951206 3951300|3202 chr2R 3951266 3952757 scaffold_16 1931825 1933251 + 44364|0 35
ATTA-ACATTAAAGGACCCTTTTACTTGATTGTATT
GCTATGCAATAAAATCCTCTATTGCGCGGTTGGATT
>LvpH 3961474 3961548|3213 chr2R 3959630 3962061 scaffold_16 1943333 1945723 + 70167|1901 1976
GCTAATTTTATTCAAATAAGTGACAATAAAGTAGCGCTGATAA-ATAAAATGTGAATTATACATGTACTTATCAAA
TAAAGTTCCAGCATAGTCAGCTTC-------TAACTTTCTTAACATTAAATGATAATAA-----------ATCGTA
>LvpL 3967722 3967755|3218 chr2R 3965325 3969952 scaffold_16 1951437 1956204 + 182678|2474 2572
ACTAATATATT---------------------------------------------------AGATCCTT--------------AATAAAGAATAACAC
TTTCCTATTTTCCAAAACTCATTTCGCTTATATTATATTTCGTGACAATCTCTAACACAAAAAGATGTTTGAAATACAAATTACAATAAAAAAAATCAT
>mXr 3986241 3987227|3229 chr2R 3983686 3986661 scaffold_16 1989638 1992724 + 93785|2701 3172
AAGAGTCGGCTGATCAAAAACCTTCGCAACTCTTCCCAAAAACAAATGTGTTTCTCCATTTTACACTTCAGCAC-----AAGAGTTAAAAAATAT--------ATATTTAAA---ATAAATTGTCAACCTTAATCTATTAATAAGTGTTTAGTACTTAAGCTTATCTAG-----AATTCTAAGCGTTGTTTCAAAGCGTTCCGAAAGAAAC--AAAAAAATGAAAATGTGATATAATTTCAAAAATGTGT---TTTCTACAACCGAAGC---AACTTACAAGCTATCTGAATAGTACACGAAACTTATAGGCTAAGT-GAGGCAAACGTTGTACAGTGAGCACTGGATAAAGAGGACTTTT-CGAGGGCGCAATTATGTTCCAAAAGGGCTG------GGACA-------------CAGCCCCTTTGCAATGTAGCAGCTA-GTTAGAACAATTACAATTGCATTTATTGTG
AAAAATCTGTTGCGCAAAAA-----------------AAAAAAAAACAAGTTGCAACAATTTTAGCAATAACCCCAACGAAGAGTCAAAAATAATTGTCAGCCACATTTAAATGTATAATTGCGAAACGTTT---------TAAATGTTTTATCTTTAAGCTTAACTAGTTATAGAGCATGGGGTTTGTTTGCAATCGCAGCAAAGATTACCAAAAAGAAAAAAAATGTGATATAATTTCAAAAATGTGTGTGTTTCTGAACCCAAAACTAAAACTTATCTTGTATTTGTACT--------AACTGTTAGGCTAAGTCGTAACCTAAGTAACAACTTGCGCACTCGA----GTGAATTTTTATTTTGGTGTGATTATGTTACAAAGGGGTTGCATGCAGCACATGCAACACACCCGCAACCCCCTTGTAACGTAGCGGCAATGACGGCGCCTTAACAATTGCGTTTACTATG
>mXr 3986241 3987227|3230 chr2R 3987058 3987763 scaffold_16 1993260 1993992 + 17862|0 238
CTAAACGCGCAACAATTGCAGCAACAGCTGCTGAAGGAGCAGCAGCGACAACAAGCCGAGCTGCAAACGCAAC------------ATCCGCAGCAGCAACATGGAACACAA------------------------------AGCTCTTCCAGCGACACCGCCAGCACGGGCAGCGGCAGTG----------------CGGCG-----------AAGAAGCGGGCCGCAATTCCCGTTTA
CTAAACGCACAGCAACTGCAACAGCAGCTGCTAAGGGAGCAGCAACGCCAGCAA------CAGCAACAGCAACTTGAGTGCTTCAATCCAGTTCAAGCGGATCAAGCACAACTGGCAGCGAGTGAAGTTGCCGCCAGCAACAACATTGGCAGCGATGTTGCAAGCACTGGCAGTAGCAACGGAAGTGCCACAACGATCGGCAACGGAAGCGGCAAGAAGCGCTCCGCAATTCCAGTTTA
>Cyp6a14 4076157 4077522|3332 chr2R 4076024 4077755 scaffold_16 822790 824502 - 59949|133 1505
GCGAACCGCCTTGATCACCGATCTAGATTTCATCAAGCAGGTGATGATCAAGGACTTCAGCTACTTCCAGGATCGTGGCGCTTTCACCAATCCCCGAGACGATCCCCTCACGGGCCACCTGTTCGCCCTCGAGGGCGAGGAGTGGCGAGCGATGCGGCACAAGCTGACGCCCGTTTTCACCTCCGGAAAGATTAAGCAGATGTCGAAGGTGATCGTGGACGTGGGTCTTCGCCTGGGCGATGCCATGGACAAGGCGGTGAAGGAGGCCAAAGTGGAGGAGGGTAATGTGGAGATTAAGGATCTCTGTGCCCGGTTTACCACGGATGTCATCGGATCGTGCGCCTTCGGGTTGGAGTGCAACAGTCTCCAGGATCCAAGCGCCGAGTTCCGACAGAAGGGTCGCGAAATATTCACAAGACGTCGTCATTCCACGCTAGTGCAATCCTTTATCTTTACCAACGCCAGGCTGGCTAGGAAGTTGCGAATAAAAGTGCTCCCCGATGATTTGACCCAGTTCTTCATGTCGACGGTTAAGAACACCGTTGACTACCGCCTCAAGAACGGCATTAAGCGCAATGACTTCATCGAACAAATGATAGAGCTTCGAGCGGAGGACCAAGAAGCTGCCAAAAAGGGTCAGGGTATCGATCTCTCCCACGGCCTGACCCTGGAGCAAATGGCTGCCCAGGCCTTCGTGTTCTTTGTGGCCGGCTTCGAGACATCCTCCAGCACCATGTCCTTGTGCCTGTATGAGCTGGCCTTGCAACCGGATATTCAGCAGCGGTTGAGGGAGGAGATTGAAAGTGTGCTAGCCAATGTGGACGGCGGGGAGCTTAATTACGACGTTCTCGCTCAAATGACGTATTTGGATCAAGTGCTGTCGGGTAAGTACCGATCCGCCTTAGCTAAACAAA-CTGATT---TTAAGCCAAAACCTCTTT---CAGAAACTCTTCGAAAGCACCCACTGCTTCCCCATCTCATTCGAGAGACTACTAAAGACTACCAAATTCCCAACTCAGATATTGTGCTAGACAAGGGCATTCTTGCCCTGATTCCGGTGCATAATATCCACCACGATCCGGAGATATATCCCGAGCCGGAGAAGTTCGATCCCAGTCGCTTCGACCCGGAGGAAGTCAAGAACCGCCATCCGATGGCCTATTTGCCCTTTGGCGATGGACCAAGGAACTGCATTGGTCTGCGGTTCGGTAAGATTCAGGCTAAGATTGGGCTTGTGTCGCTGCTTCGACGATTCAAATTTTCTGTATCAAATCGCACTGACGTTCCTTTGATTTTTTCGAAAAAATCTTTTCTGTTGACTACCAATGACGGCATTTACCTAAAAGTCGAACGCGTTTAAATGTGTAAA
GAGAGTCGCTATGATTGTCGACCTGGATCTGATCAAGCAGATGCTGATCAAGGACTTCAACACCTTTCAGGATCGCGGCGTTTTCAGCAATGTGCGCGATGAGCCGCTTACGGGACACCTATTCACGCTCGAGGGCGATGAATGGCGTTCCATGAGACACAAATTGACGCCCGTCTTTACCTCCGGCAAAATGAAGCACATGTTCGGCGTAGTCGTCGAGGTGGGTCATCATCTGGCCGACACCATGGATAAAGCTGTAACCGCTGCTCGCGCCGACGGTGGCGATGTGGAGATCAAAGAGTTCTGTGCTCGCTTCACCACAGACGTCATTGGCACTTGCGCCTTTGGCCTCGAGTGCAACAGCCTGGCCGATCCGCATGCCGAGTTTCGTGCCAAGGGTCGCATGCTGTTCGAAAAGCCGCGTCACCACCAGCTGGTGCAGGCCTTCATCTTCACCAACTCGAAACTATCAAAGAAACTGCACATGAAGGTGTTTCCCGATGATCTATCCAATTTCTTCATGGAGGCTGTGCGGACGACAGTCGATCATCGACTAAAACACGGCATAAAACGCAATGATTTCCTCGATCAGCTGATTGAGCTACGCGCTGAGAACGAGGAGGCGGCACGTCGTGGGAATGGCATCGATCTCTCTCAAGGCCTCACCATTGAGCAAATGGCCGCCCAGGCTTTTGTCTTCTTCATAGCTGGATTTGAGACCTCCTCCAGCACAATGGCTTTTTGTCTATACGAACTGGCACTGCAGCCGGATGTGCAGCACCGCCTCAGGGAGGAGATCGAAACGGTGATCAAGGCGACAGCGGATGGAGAGCTCACCTACGATGCCATTGGGCAGATGAGCTATTTGGAGCAAGTGCTGGCAGGTAGGAA---ATGCATATTCTCAATACAACTCTTACTCTATTAACCTCTCAACTCTCCCAACAGAGACTCTGCGTAAGCATCCGATTCTGCCCCATTTAATGCGACAAACGAACCAGGATTACAAAGTGCCTGGCACAGACTTGGTCATTGAGCAGGAAACATCTATTATAATTCCTGTACATAGCATACACCACGACCCAGATATTTATCCGGACCCCGAGCGTTTCGATCCATCGCGCTTCGAGCCTGATGCCATTAAGGCGCGACACCAATTTGCATATCTTCCATTTGGAGATGGACCTCGCAACTGCATTGGTGAGCGCTTTGGCAAAATGCAGGCCAAGATTGGCCTCATTTGCCTTCTGCGCCGCTTCAAATTTGGTGTATCTAATCGCACGGAGATTCCGCTGATTCTTAATAACCGGAACTTTCCATTAGCCACTAAATATGGCATTCATCTAAAGGTGGAACGTGTTTAAG-----AAA
>CG14748 4085181 4085487|3342 chr2R 4084932 4087632 scaffold_4 5124683 5127286 - 97252|274 617
TG----------GGGAGCGCTGATT---TAGATTACGATTAG-CAGATT----AAGACATGCTTGTGTACTATAGATACCCCAATCCCCCATTCC-TCCAATCCCGAACCCTAATCCCAGCCAGATGTACTTGGACCG----------CGCGGACGT--------TGTCGTTGTGATCATCATTGAGATTGGATACCATTGTCGTCAGAATCAAATGAAAGCAATTAACTTATTAACTTAACTCCCCTGAATGTTGAATGCAACCCAAATGACAGCTTGCGTGCAGGCATTCTTAGTACCACTAAGCTGAATTGTATGTATTATTAATAAAATTAGTTTTTACG
CGGCGGCAGCACGCGACAGCTTATTAAGTAGTTTCCCATTAATCAGATTTTCCAATAGGTTC-TAAGTCCCGTTCTTGCCCCCGCCCCTGCTTCCAACTTAGTTCTAACAATGACGAAAAAAAGAAGCATTCTCACCGGTTTGTCTGCTGCACACGTTGCAAATGTGTCGTTGTGATTTTCAATGAGATTGGATACAATTTTC-----CGTCGTAAAAAACCAATTAACTTATTAATTTTTCT--------TTTTACATATAACGTTAATCACAGTTT-CGTGCTGGCG-----------ATAAATCTTGTACTTATGTATT-----TAAGTTGAATTTAAACG
>CG8736 4105841 4105977|3358 chr2R 4105464 4107175 scaffold_4 5145733 5147217 - 35732|381 565
GGCGGCCTAGGGCTCACTTGCGGCCAG------------------------------------CCGCAGCTTCCTTTAACGC---TTCGCCTTTCCCCAGTTCTCAATTAGTGGACATTAAT---------CTGAAATTCTTTGTTGTTGGCGCCGAAATAAATGCAAAATGTTGGTCAAAGAAA
AGCAGCCACACACACACACACACACAGCGCCTGCCCACACTGTCCACACTCTACGCGATCTGTCCACACGCTCATCACACGCATTTTTCCTTTTTTCTAGCTTCCTCCTAACGCTACCTAGTTCTCGACTATTGAAATTC--TGTTGTTGGCGTCAATAAAAAAGC---ATGTTGGTCATATAAA
>CG8735 4109341 4109499|3362 chr2R 4108873 4109370 scaffold_4 5148648 5149131 - 11241|511 540
AAAAAAAAACGAATACATTGAATGGAATAC
AAAAACAAAAAAATAACTTGAAT---ATGC
>CG8635 4142007 4142118|3394 chr2R 4142025 4143581 scaffold_11 905325 906892 - 74825|0 102
TCCTCCGCGTAGTTTG--TTTGAAATGAGT-----TTGAAAT--TGATTTCTGCCTTTTAGCTACCCTTCAATCAATAAAGTTGTGGCTCTTAATTGTTGCAT
TCTTTGTTATAGTTTGATATTGAATTGCATACACGTTCATATAATGATTTCTGCC-TTTAGC-AACTTTTGATCAATAAAATTGTGGCTATCACATGTTGCAT
>CG30355 4190952 4191023|3452 chr2R 4190693 4190965 scaffold_11 965208 965487 - 11340|267 280
GACCCTTTCAAAAC
AGCCGCATTTAAAC
>CG30355 4190952 4191023|3453 chr2R 4190968 4191040 scaffold_10 2026148 2026216 - 404|0 55
AACACGATGCATTTTAGCAAATTTATCGTGTAATTGACATAAATAAATCATCTTTT
ACTATTAAGCGTTACAGCTAATCTAT-ATGTGATCCGCACAGTT---TGATATTTG
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GC---------------------TTAAACCTTAATCCACGATGCAAATGAAAAATGAGAAGCAAAGGTCGTTTTTTAATTTCAAAAATTAACCAAATAAAATATAACGTTTAGATAG
GCCAGCATTATCAATAAAATACATCTAATCTGAATTGA--ATGCTTATGAAGAATGAA----------TGTTTATGCACTGGAAAGAT--GTCCAATAGGAT-TAGGATGCAGAAAG
>CG14767 4229825 4230506|3508 chr2R 4229621 4230148 scaffold_11 1006618 1007165 - 6866|218 583
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CTTGGCCGCGTCAATTT-------CGTTTGGCATTTGGTTTTCATTTCGTTATCCTGTGAATTTTACCTAGT-TAAGCGCAAGTAGTTGTTACCAAAAAGAGAGTCGAACGGATGTTATAAGAATCTAAAGGGAAGTATATTTATGCGAAAGCATGTTCTTCTTATGTTTTAAGCTAACTTGTAAGACTTTATGCATATTTACTGGCATGTCAGTTTTTTAATTTAAATGTGTGCATGAATTTCGTGTACCACACT----TCACAGACATCCGAAAAATATTATTTATGTATGTACAACATCTATATGTATACTATATACTAAATATGCAAAGATATTCGAATAAATATTAGTTTAAAAAAA----
>CG14767 4229825 4230506|3509 chr2R 4230246 4231855 scaffold_11 1007253 1008865 - 58275|0 328
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GTTGTGATTTCATTAAAGTT--TTTACAGAATTATCGTGTTGTGAGCAAAACATTCGCCCACACGCTTCCTCTCTTGCCCCCATATTAGCACAACTTTTCTCGTTTGGTTGCCACATATATTCCATATATATTCCACATACGATTACATTATTTCTGTCAATGCAGTTTAGTTTGCACAAAAATGTGTACTTCGTCGTATATTAATATTGTATGTATTATCGTATTGAAAAATGTTTGT---GAAACAGAATGAAAAGAATTCTGTCATATTTATTCCGCTAGCAGTCGC---GTATTGTTATTAATCGTAAAAGGCATCAAACCTAAC
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AT---AGAAAAATCCCGTTGAGTATA---TTTAAGACATTTAATAATTTAGTGAGGT--TA
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AACATATATTATTTGCAGTAACCTGGTCACGGAAACCGTACGTAGTATCAATAGTATATAATAGCGAAATTGTTTGTATATTACGGGCAGGGTATAGATATTT----------TTGACCTGGTCAATTTAAAATTAAATTTTTGTTATTACATGCTAATACT----TGTTTAAGAGA-----AATATAAACGTTATGCTTATATCTGAATATATATGCTTATATCTAC
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GCATTTTTAACGCGCCAGTTGTGTTAAAATGATTTCGTTAGCCGCCAAATGAC-
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TATTTTGCGGCAATTTTCGTTGTATTTATCCTATATTATTTTCAATTGTACAATTTTCGCTAGTCA--------AAGAAACAAAAAAATACCTAGAATATATTTATATGACAGCCTATGAG------GCAACTAAGA-ATTATTTTATAACCAATTGTTAAATTTATTCATAT-----CATGACTGCAAATTCCAATAAAATTGGAAACTGGCTCGAATCAAT-------------GCCCGGTTGACCAGCATATCTTGCAATTCCGGATTCGAATCGAATCGAATTTGCAGCCATGATATATATATATATATATATATATATATATATAGGCTAT----------CTATGTGAACAC--TTGTATATATAGCGCACAAATATGAATGTGAAAA--ATATGCTCGATAAATGTCCACCAAGAAATTAACATAATTTT-TAAGTTAGCCAAATTATAGAAATTAGAATAAATTAGTAGCTGTGATTTATGGAAAATTTAAAAAAAAAAGAAAAGAAAAACAATTTATGTGTA-------------------TTGCGTGTTATGTGATTTGTGGTTTTACACTATAAGT----ATATATTTATAAATGTTATCAATGTGTCCTTAATAAAAG----AAAATAACA
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TATTATAGCCAATGCT-GTATATTTATGTATGTATAATTTTA---------------GAAATCCTTTATAATA-ACTGCAT---
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AATGCATT-GTTGGAAACACATCAATGCTTTAAGATCAAATAGTTATTTTTATTAGTTTTAGTTAAATTGTGACCAAAACTTTGATTTAAAAATTAAGTGTATATATAAATGTTTCAATCTTCGAAG
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GCTTATCTAATATTAAAC-TAAACGATTCGATAAAATGTAAAGCTTAATTATTTTAGTTTC---AAAGAATCCTTTACATGTATTTTCACATATTCTTTGTCACACATGGAAATTATAAATTTCATTAACACACACACACACACAACTCACATACACAGCT--------------TTGTATTAATAAACTAAAACCTTAAAAAAAAAA
>CG8252 4421243 4421283|3696 chr2R 4419386 4424102 scaffold_1 1354901 1359763 + 146161|1997 2053
ACTTGAT--TTCCCTATTAAAACC--------------TTTGTTTTGTGTCTTTCAA
ACGAGGTGGGGCTCTAACAAAAACTCATACGGGAAAAGTTTGGTTGGGG--CTTCAA
>Pgi 4422715 4422992|3696 chr2R 4419386 4424102 scaffold_1 1354901 1359763 + 146161|3575 3910
TCATGTCTGGCTATTTGTTGCGAATTAAAAAGAAATGTTTACACAAATGCTCTAATTGTTAGTAGTTTCTGAGCCGTTATTCAGTAGCCGCCGCTTATGTATACTCGAGCTACAAGCCCCCTGTTATTGGCACATTATTCAACTGTATTTATGAACTGGATATGTT-------TGTTTGCTTGCGTATCGATGAAATCTCGTGT-CGGAATTAGACCAACAATTGGC-----TCTCACTATTCGTTGTTGCAC------------------------------GTAGT----------TTAAAACCGTAAATAAAAATTTATG-----AATTCGAT
AC----------------CGTGCAGCCCAACAACATTGACAATTAGGTCTTTTACTTATT-------------------------------------TATATACTCGCGCTACCAA--TCCTATTCTTGGTACAAAATTAATATATATGT---AACCATATATACTTACACTATATTTGCATGCATAT---TGAAATTATACGTAAAGCATTTGTTTGCAAATTGGCAAAAATCTCACTATCGGTAGTTACACTATTACACAGATATATGTTGTTGTTTGGCAGTAGTTAATTACATGTAAAAAACAAAAAAAAAAACTAATGCATGAAATTTGAG
>CG8248 4430751 4431162|3701 chr2R 4430149 4431125 scaffold_1 1365697 1366602 + 4192|662 1084
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TCAAATAGGGAACAAATCAAAACTTTAAGATAAAAAGTAGTTTTTATTGTCATATATGTGTTGTGAGCTAAAACTTGATTTTCTACTATATCGTTGTAAGACATATCCTATCTACTACTACTATTTTTACCCTCAAACTCCACTTT---------------GAAGCTATTTCTGTAT---GTGAATGTA--------CTTTGATTCCTATAAATATATATAACTTTA---------------------------------------------------------AGTGTT--------ATTGACTTGTATGTT-------------------TATGTGCCTATATATAT---AACCTATATGAATCTGTGAAATGTATGTTA----AAAATAAA---ACTCTTCTCTGCACTCCTGTGATGAT
>CG8247 4432079 4432319|3703 chr2R 4432281 4433736 scaffold_1 1368145 1369567 + 27722|0 38
AGCATTTCAACCATTTGTACATAACTTTTTATTTAGTTT
CCAATTTTTGCAGTTATAAGCTAACACTTTACTTTGCTT
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GGCAATAAATG-------CGTTATGTTTCTGCAAGTTATTTATCATTCTTTGTTTATTTTGACATCTTG
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TATTAGATCCTAGCCACGACTGCGCCATTTCCTCGCTTTGATATGCTTTGCTCGCCGCTGGAGCACAATATTTTTCTATTATTCTATTATTTTCACTCTA--------TATCCAGTCT-----CTTTGTCCCAATCCCAGCTGTGTACACAAAAGTGGAAGGTCTATTTGCC-CAACAAATTCGAATCCAAGCCAAACAAAT------------------------TATAGCAAACGTTGACGTTAAAGTGA---AAAGCTAACAAAAACCCATGAACTAATGTTAAAATTTAGAGCTAGACTGCAAAGCGAAAAAGCGTAATATGAA--ATAACAAACAA---AATACGAAGATCTTA--------AGAATGTA---------AAACAT----ATTTTTTGCTACCGCTAAGTAAAGAATCATAGTTGAGAAAAAAGTTAAGCTCCGGACGCCTATCAAACGATTCTACTAATCCACAAAAACAAACTAATATATATATATATATATATATATATTAAAAAAAAATTGATTATATCTATATATATATATATACATATTTACATTGCGTATGTTAGT-TATAATAATTATATA--ATATTGTGTTTAGCAATTGGTAGCTAAAGCTAAATTAAACACTAACTAAAGTTG-
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GCAGCTGCTGGCCAAGAAGCACAACAAACACAATGCGCTGCGCAAGCTCTA------AGCCAAAGTACGGAAGCACGGATAGA-----------------------GAGATCAGTTGCAAGGCGGCCATGTCCTGAGCGTCCGAGGCGTTACACATACCCAACTCAGTTCCCATGCTCATATTTAGTGTATATTTCTTTAAGTTAAGTCATCAGCCATACACAAAACACACACGCAGAGTGAAGAGAGAGAGGGGGGGGAGAGAAGGCAGCGACATGGCCAAATAGAGCAAAAACATTATGCATTGGAAGTCAGTCACACATTATATATTATATATTTTTTGAGTTGCACCGATTAGTATATGTATGTATATATATATATATATATATATATTTTCTTGTTCGCACACACACACACACACA-CACACAGAGAGAGAGAGAAGCTTGCAACGGTTGCGCAATGCTAACAAAAATTTGAATAAAACTTGT-GATAGTTAATT---ATCTACTAATGATGATGATGATGAT--GATGATCGTGATGATGTTCTAAGTGTCAGCTGTGCGGCCTCCTATGCAATCCTCATTTGCCTCCTTTAGTTCTTATTTATATAGTCTGTATATATGTATGTGTTAACAAGTCGCAATATATACATATATATATATATATATATAATTATATTCCTAGTTATGCAAATTCTAAATTTTAAATGAGAAACGACTAAGTGA--------AAAACAAT--TGAATACGTGGGAATAGTCCAATTGCCAAGTTTATTATATATGGTCTGCGTTTGTGCGGCACAGTATAAATTTTTAGTTTTAGTTCAAATTAATATTCTTTAAATAAATGCATTATTATCAAAATCAAATGTA
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AGGCGGCAAATCGAAGA-AGCATAAAGAAAATGAATATGAAAATCTTTCACTGAAGACAACTTAAAGGCCACGGCAAACGTTTAA--AGGAATTATATTATAAATGAAACATATCAAA-TGTTCAACAAATGCATATCATTCTTGTTGTTAACATAAACAAATATATACAAAAATATCTAAAATTAACTCAATTAAATTATATTCAACACAATTATAATAATCAAACGGGATTTTCAGTGTTTTTCGTAGAATTAATTATATTAATCAGACAACAAAATAAATATGAAATTTAAAGAAAATATATATATATATTAAATACTGACTGAGGCATTCAATGTT-ATAACAGCAAGTATTAAACACAACAATTTTATTCGCAAAAGTCTTAATGTTATTATCCAAAAATATACTCAATTACAAATTAATTAAAAATGAATATTGAAATTAATAAATTAATTAACTAACATATGT
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AC-GCCACGCCCACTG----------------CATCAGAGCG------------------------------------CAACTGTAAATAGAAAAGTAGGTTTAGAGGACATTTAAGCGTGGCAAAGCGAGAAAAGACAAAAAACTTAAAAGAC-----AAACGTCACATTCACAAAACTCATCCT----CCCCCT--------------TGGCATTAGTTTAAT-----------TGGAGTATTGCGCTGACAGTTTGACAAGCACTGTGGC-TTTCAAACTAGCAACACTTC----------CATTGCCTACTTTGAGGCGTTTTCTGCGT-------TTTAAAATTAAACTAATTTCAGAGCGAGCGACGCCCCTCCCCCCTGCACTCACCAACATGCGCAATAATAATTTTAAGACATATTTATTTTAATTGCTAAGCTTATTTATT----TATTTATTTATTTATTTAATAT----TGAGCTGCCGTGTTTTTTTTGCTATTTAT---TTTGATTCAACTAAAAACTGTAGCATGCGTTTTTTTATTTTTTTACATAAAAAAAAAATAAAAAAAAAAAAGAGAAAATAATAATTTTAATATAATCAATTGTTAATTTTCATAGGCAAATTGTTGTTATGTTAAAATGCAAATATGCGCAAGCGAGAGAGCATATGTTTTTAGTTCAATTGAATTTATTAATTAATTAATTTATGCTTACGATATACGATATATTTACCTTATATCTATGTATTTCTACATACAATTTGTTAGCAACTTAAGCGTACAAAACGAACAAAGCGAAAAACACAAACACAAGAAAAATATCGACGAAATAAATGAGAGTAAATTAGTAAAAAAAAAAACAATTGA
>CG8170 4530838 4531245|3795 chr2R 4530446 4531316 scaffold_50 712036 712842 - 10564|402 863
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GCTAT-------GCAACTTGTGTCTTATT-TATTCTTAAGCCCAGCTTCAACTCCAGCTTGC--AGCAAGCCCGCAAACATTTTGTACATAATTCACTTCTACAGCTACGGCTTCTATCGAGACTTTCG---CATTCTTTTTATCTTATTTATGCATATTTTTAATAATTTTCA-------ACAAATTTCGCGCAGCGCCCCACAAACAAAAATTCTATTATAATAAAAGAAGAAGAGGATACTGCGTATATTAGAACTTAGTAGCTACAAGATATCGGTTGGAATATCTATGGGGATATCATTTGGGATATCTGTTAAGCGATTTTCAAACTAAACTTTAAATTAATTATTAAT-------------TAATTTACTTAGTCATATGCGCTGTTACGTAATTTTAAA-CTATTTATGAACTAA---TTGTGTGTAAATAAATTATGTAAATGTTGAAAAAAA
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GGACTTCCAATGAAGAGATTTATAAGATTTAAATACAAATAAAATACATACCA
GTGC-GCTGTTTATGTTATTTGCTTG--TTAAACTCAATAAAAATGTTTACTA
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TATATATGTTTATATATATGTATATCATAAAATTGTGCATGTAATTA------AATTATTTGATGGGCGTAGCATT-----------TGTTGCATATTCTATATAAACAAACACACACACATAAATATATAAATATAAATATATATATATATATATATATCTA----------TATATATACAGACAAAATATAATTTATA-------TACATACAAAGAATAA-----TCAAATTTCACTCAAATTAGTATATACTATATATGTGTAAACATAATTATAGCAAAGAAAACAAATAATGTATTTTAGAAATATGCAATTATAAAAA---ATAAAAAATAAATGAAAAAAT
>CG13743 4556663 4558318|3823 chr2R 4557002 4557822 scaffold_50 742598 743633 - 7416|0 1095
TAGATGTTATC---------CGTAGCTTTAGCGTAGTCTGAA-ACTATTTGGGCACCAATATACACATGCAATCCTTAGAGACAACCGACTCCCCAAGTTGAGAAGTGAATCAAAATCGAAAACGAAATCGAACAAGTATTATATGTATGTACCGAGAAC-TATTTGTAACTATGTATGCCCC------------------GACGTTACCGGATCGTATT------CCCCAGTTTTATATG---TATGTATATGTATACAAGGGTAGATA--------------AAAATG-----------------CGCTTGAACCGAACTAAAATCAAAC---------------------------TACA----------------------------------ATATATCCCCATCAAC-ACATCG------ATTT--------GAACAACAGTTTTGAGTTGTTAACG--------GCACTGAATTCTGTTTTGAATTGCATATGTACACCGAACACGATCGAATATTTATATATACAGAAACATAGATATATTTTTGTACA----ACTCTTGGTTT---ATACTGCACG-------------------ATATTATGTAAATACATGTGTA-----TGCATTTTTGGATGTGATTAAA---GTCTTTACACTCACACAAAAGCCAT------------------CACCTCTTACTTTCTCTTCGGGCTGAGAGATCGGAACCAAG------------------------------CTGAAGA-----CCCCACAACTCTATATTCTAAGAGCTTA-----AACACTACATATC---------------------ATGGCCAA------GGAACACG--GGACATGCCC-AGGGCTTTTCTGAGATACATTTTACAAGATCTAAACAACTAACCAACTGAACCTATCGCTTTTACACAACGAATACGAGAACGGAAACGGAAACAGCAGCATACAATTTCCACAGACTTCCTGTATATACACGCTATATATATGTAGATCCGCTTGTCGTACGATATTGCTCATCTCTTCACTCGCCAAATATCTCGTTGTATCTCTCTTTT
TAGTTGTTATTGTAATTACAAGTAGCATTAGCGTAGTCTGAATAATATTTGGGCACCAATATACACA--CAAGACATGCATACAAAGAA---GCCAGATCAAGTTGCAAAT---AATCAAAAAGTAA---GAGAAATTAATATATAAAAACAAATAAAACGTATTTGTAACTATCTATTATATACTATATGGCATATAGAGAAACTTATCGAATCGAATCAAATCAAATCATATTTAAACGTTTTATATATATGTATACAACTCTAGAGAATTGCTTCAGCTCCAAAATGTGACTAAGCTTTAACAACATTTGAAATACACAAACAACAAACACAAGAGACATGAAACATGAAACATGATACATGAAACATTTAATATTTTATATTTTGTATTTGACATAGACCTAGATCAACTATTTCGTCTAATATTTTAAATGTGAAACAACAGTTTTAAGTTGTTTTCGAATAGAATGCACTGA--TATTTTTCGTATTGTG---GTAT----------------TATTATTATGTATGTACACACTGGTATATTTTTGTACGTATTCCTTTTGAGTTGACAAAATGCACGATATATAGAGTATATATATATATTATGTAAATACATATTTGTATGTTGTAATTTTTGATGTGATTAAATAGATCTTTTTTACCACATATTAAACATGGGAATATTTACACACTACAATGCTCACTCT-TCTTCTTACTGGTCTATGGGAACCAAGTGTCTAGTCCGTTTGCGTTTGATCTAAGAACCAAAGACACATCCCCAAACAACTCTATCCTAAGAGCTTAAATACAATACAACATATCATGCAAGGCGAATACAAAACAATGGCCAAAACAATGGAACACACTGGACATATTCAAGGGCTTTTCTAAGATACTTTTTACAAGAACTTACA--------------------CGCTTTTACACAACAACAACAACTACAACAACAACAGGAACAACACGAGAAAACTGAACAACACTTGTATATACACTTTATAGAGCTGTCTATTCAGTTATTAAAAAAGATATATTATATAT-------ATAAATATATTAAAGATTCACTTTTTT
>CG13743 4556663 4558318|3824 chr2R 4557857 4558217 scaffold_50 743679 744088 - 1247|0 430
TTAATACAGCTGCACCACGTCGCATCGAAAG---------AAACTTGTACCTGAGTCCCAGACGTTCAAAGTATCTGCGTAAGTAAGTAGTAGGCACAGTGT-TGAAT---------TGGATTAGTG----------GATAGCGGATAGCG-GATGTGTGATACGGG----------------------------CGAACCTCAGTACAAA--GGCCAGGCATTCTCTCCGATCGAGTAACCCATGTATATTTGCACCGGATAGTCGT--TTAAA----GTGTACATTTCGTTGGATCCCCGTTGTTGATGTCGATATTGTTGAAAGTAGTGAAAGTTCCTCGATATATAAGTGTGTGTGTACTCCGTACTCTGTACTTTGA-AGCCATCAAGT---TGAGCAAGCGATTTGAATTGAATTGAATCGAAAG
TTGTTGTAGCTGCACCATTTTTGGTTAAGGGGCAAAACGAATACTTGTACCTGAGTCTCTGATGTTCAAAGTATCT-CGAAACTGTGTTGTAGTATCTGCGTGTGTATACGTGTGTGTGTGTTTGTGTGTGTGTCTTGTTAGCTAACTGTGAGGCAAGTGATACGAAGGATTTGAGAAGAAAAATAACAGAAACCTGAATCTCAGTACAAAACAGCAAGTTGTTATAGC--ATATATTTCCCCAAATGTATGTGCACCCAAAAAAAGTAATCAAACTCTATTTACATATAATATGATTTCGTTTACCA--------------GAGATTTTTGCCAGTTTTTTCATATGTGTGCAGTTGTTTCTTATGTATTTT----TTTGATGGGCAGTAAATATATAAACAAACAAAAAATAACAAATTGTAGTGCAAG
>CG13743 4556663 4558318|3825 chr2R 4558226 4558569 scaffold_50 744702 745086 - 16071|0 127
-TTAACGGAACGGAAGTCAGC---------------------------------CCACGATGTGGGGCGCGCGGGTTGGGATCGCATTTTTA-TGGTTTGGGTTTT-TGGGTTGAAACTTCTGATTTG
CTCAACTGAAGAGCCAGCAGCAAAAAGAGGCGGCGGCAGCAGCCAAGCCAAAAGTCATTAGTTAAGTCATAAGCATTGGCAATACATTTGCATTGATGTGGGTTTTACGGGTTGTGGATTCTAGATTG
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TTACCTGC
TCACCTGC
>CG8080 4601587 4601730|3875 chr2R 4599657 4603698 scaffold_50 379590 383606 - 158338|1964 2149
ATCC--------AGTGATGCGCCCCTAGTGCCTGGTC------------------------ATCTCGCTCTAGCATGTCT-GAATTTTTGAAATTATTTAAGTAA---------GCATTTTGCAACTACTTAGCAGTGTAAGCTCAAAAGTTATTTTGTTATTTTATAAAAGTATATTTAAACATC
AACACTGAAGAAACTGATATAGCAAAAGTGCCTGCTCCGTTAACTGAAGGCTGCTACGACTACATTTTTGAAGCATGTCTTGAATTATTGAAATTACATAAATATTTATATGATGCGTTTCGCAACTGCTTATTAGTGTAAGCTCGAAAGTTATTT-----------------GTATTTAAAGCTC
>CG13741 4604316 4605020|3877 chr2R 4604240 4604914 scaffold_50 383980 384693 - 7650|83 765
TGTGCGAATTGCGAGTCGACGCAGGCAAGAAGAAGACGATTTCGACGATGCCCAGTGAATGGCA------------GGGGTGAATAGTCGCTT-------TCTGCCTCTTTTTTTTATATATATAACACATATTTCGGCTGATAAGAACAGGCTGGGCCTCTTATCAGTAATGCACAACAAGAAGTACACACGGAC-----GAACGAGATGTGAGAAGCGAAAGCG---------------------GACGAAAATAGAAAC-AAACGGCGATAAATTTACAGCGA---AGGCGATTTTATATACATACATAACTGATGTGC-CGGAGACGAACAGAGTAATAATCAGTTAATCTGCCAAGCACCCAGAGAGCGGACGTGAAAA----------------------TGATCATCGGGATCGGATAGCGGGATAGTTAGTAGTGATCGTAACTTAGGATAGTGT--GCTAAAC-ACTAACCTCAACCTATGTTTTGTGCTTTGTCGAGTGTAGAACGAACACGCAGTTATTTTGTTGTTTGTGCAAAAGC--ATTCGAAAGTGGCCAACTGAAGAAAGAGCCAT------CGATTCTTTGCATTTGGTTACTTTTATAGCGTAGTCTTTTTCCCAAA-CGATTTTCTTAACGAATACGAAATAAACTGAACACAGTACCCTAAA
TGCGCGCATTGTGAATGGTGTATGATAAGAAGAAGAAG----CGCGGTTGGGCTGTGAATGGCATTACGCCGACACGAGAGACGCAATTGACTGAAAGTGTTTGTATTTTTGTTTTAT---TAT----TATTTTTGGGCTGATAAGAAAAGGCCGTGCCGCTTATCAGCAATGCACAACAAGAACT--AAGCGGACAACTTGAGAGAGAGGGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGATGTTAAAGCGAAAGTAGAAACAAAACAGCGATAAA-TGACGGAAAACGAGGCAA----ATATTCATACACGAGAGTTGTGTATGGAATCGCA------ATCAATCAGTAAATCTTCTAAAGACAAGGAACGTGGACGTAAAGAAAAAGAAGAAGAGAAAAAAAACTGGTCAATGGCTGCGGCTAACGTG-TATTTAGT-GTGATAACAATTGATGTCAGTTTTAGTTCAACAACTAACCTCCAATTACGGAATGTAAATT-----GTGCAAAAGAAACATAC--------------TTAAGCAAAACCCTATTCAAAAAAAAAAAAAAAAACAAAGAAGAAGAACGCAAGATTATTGAAGAACCTTTAAGTTTGGTACACACACATTCATTTAAATCAATTGATGTAGCACACACGAGTTAAAT---AAAGAATTTCATAAA
>CG13741 4604316 4605020|3878 chr2R 4604960 4605081 scaffold_50 384738 384872 - 1124|0 65
AAAACCGAC--ATCAAGTTGCATTTAAGGGATCTATCTGACTTCTGTTATT---TCTAAGTACTCA
ACAAATGGGCGAGCAAG--------AAAAGTTTTATTTGTTTTTTTTTTTTAAGTTTAAATATTAA
>CG8078 4608744 4609123|3884 chr2R 4608545 4610270 scaffold_50 387285 389024 - 71839|218 630
GAACACATATGAATTTTATTTATTCGTGATTCCACAAG-------ATACAAATTGT-GTTCATCCAAGGTTGCCA---ACCTGAAAAGATAACAACAGGAACGATAAGTTTG--GTTTCGCAGGCTAATTTCATTAATACTAGAATGCATTA----TGAAGCTCAGTGCCAAGTTTTTAACCAGGGCCCATAACCAGTCAAACAAGACGCTCTATCTCCAAAAGAATATTGAAGAAGATTGCCAGCGCTTGACCTTTATATGGTGTCTGTGAATGGTTTAAGTGATCATCATTGAAATCTTCATTTCCGCTAAACAGAATCTCTTTT-----CGTACTAACCTTTTTAGATATTGGAATTTATAAATG-----AACCA--TTGACGGAT--TCATT--TTGCTACGCATGTTT
AAATGCATGTTTA-TTTATTTATTACATATTTTGAAAGTACAACAATGTCAGCTGTAGCTGATCCAATTGTTCGGAGCACCTGCAATAGAAAACGTGGCATAAGTAAATTTGCTATTTGACAACATAATT-------------GGTGCATTAAGTGTAAGACTCAGTGCCAATTTATTAACCAGGGTCCATAACCGGCTAAGCAAGACTCGCTTACTTCAAAAAAATATTGAAGAAGTTTGCCAGAGCTTAACTTTTATATGGTGTCTGTGAATGGTTTAAGTGATCATCATTGCAAATGCAAT----AGGATATAAAACACGTGTTAAACGAATACTAACCCAATTCAGGATTATTATCCAGCGAAGAGTGCAGCCAACTTCACGTACAGCCATTAAATGCCCAGCAGCATG
>Pmm45A 4618955 4619210|3889 chr2R 4619122 4619207 scaffold_1 2808106 2808178 + 374|0 85
GAATGCACCTTTAAGCGGATACGCTAGGCGACTGGGACGAAAGATCTAACACGTAGACCTGTCTAAAATTGAAAGTTCTATACCAA
GACTAGATTTGCAAGCGGA-----------GTATAGATGGGTTTTCGTATATGTAGA--TGCCCCAAATTTTCAGTTTTCTGCTAA
>Mys45A 4623314 4623483|3891 chr2R 4622660 4627835 scaffold_34 493606 498963 - 211211|657 826
TACCTTCTTGCGTTTCAAACCTCGTAGTGCTTTAAATGAATACCAATATAAGATATATAATTCTAACCAATTGATTGTATAAAGGGTAGTTGGTAGAGTTATCTGATTTATTTCAATTCATATAGACTTTGTACGGTTGCCTATTCATTAAACTATTTTAAAAAATTATT
-------CCGCGGGCAAACCCGCCT-----TTCGCATTGCCACTGCAATAAAATTTATTTTCC---------ATTTGTAT------TCGTTGGT------------TTTATGCTAGTTTA------------AGAGTTAGATATATATTCAAATTT--------------
>CG18659 4635110 4635514|3896 chr2R 4635098 4635967 scaffold_57 286423 287316 + 23105|12 454
AGGGA------CACAGCTGGTCAGATAACCTGCATCAAATATGATACCAAAATAAGTGTGATTG-----ATAGATTGTGTTGTAAATAGCTAGGAGAGATAGGCAAAATCAAGGATGGGAGAGCGATGACAGTAAAATAACCCCTAAATACCCAAAATTGTGTGTCTGCAGTAGTGAGTTAGTGAGTTATACTTAAGCAGAGGATCCAATTAAAACGCTTGTTTGTGTAAATAACTGTTTAGT--------------------------GAAAAGTTTTAACAATTGCATGAATCGGAACTCTCGCTAACTACGCATACTTACATACATATTGTACGCTGGACTTCCAAATC-AAAAGACACAAGAATCTAGAGTAGCATGAATTTAAGCCAATTAGCCTAACAAATTACCAATAAATATAAAATAAATTCCAATTAAATTAT
AGTGAGGCGCCAACAGCTAGCTGGAAAAT--------------ATACCAAAATAAGTGTGATTAGGTTTAGGATTCGTATTGTATATAGCTAGACG---TAGGCACGAT----------------ATGTTACCAGACAAAACCTTAAATATT---ATTATTATGCTAGTTATAGTGCGAGAACAA---------------------CAACAAAACAGCTTGTGTTAACTATTAGCGGCTTGGCTTATCAAAAAAACAAAAAACACAAAAGAAATGTATAAGCAACAAATTTACGAGCAACTATT-TAAAGAAGATATAAGCAAATACAAA---TACGTTTGACTTCCAAATCAAAAAGACACAAAGCATTAGCATAGTGAGAATTTAATCCAATTAGCTTAACAAATCA-----------ATTATAAATTCTATTTAAAAAAT
>CG8057 4647183 4647371|3903 chr2R 4645824 4647814 scaffold_57 297780 300036 + 83440|1577 1831
GCAACTCGCAATTGGTA------TTTTAGCTGTAGGAACA----------------TGGTTTTTATGAGGGATACCACGTCC-------CGCTTGTCAAATTTACCTTATTATGAGTAAAAGTGTTTTAGTTTTCTCTCTATTAAGCGTTGTATT------TTTATTAGTTATAA-ATATACGGAACTTGTAAAAATATA-------------------AGATTATTGCATTGTGTCATAA-----------TTT
GCCAATC-CAAATAATACAAAACTCTTAACAATAATCATAAATTAAAAGTAAGCGTTTTTTTTTAAGCTGTAAACTGTTTTCAATTGCTCGCTTTATACAATTTGTGGGTGAAGAGCCCAAGTACATGCGCATATTCT-TGTTAAGCGTTGTATTCCTTTTTTTATTAGTTTAAATATATACGGAATTAAAAAATATATATATATATATAGTTTGAATAAGATTATTGTTCTGTGTCAAATAGTTCTTTAGTTTT
>CG8055 4653957 4654427|3908 chr2R 4652993 4654182 scaffold_11 2900435 2901695 - 9338|1102 1375
TATTTGATT------TGTTTATTTTGAATAACGCTGA-----------------TTGGCCATCAGGTGTATGCAGATCTAATATTCCAACA------AAGAAATG--TAGCTTTTT------GATAAA-AACCCAAATATGTTTTGTGGCACTCATCTTTCCGC----------AGTCTTAGCTTTGTATCGAGCGATTCAAACGAAAATAAAAACATGAAGCCTCTCGACTGCAGGTAACTCAGTAGCCGCGAGAGGCGCAAAAAAACATCAA
AGTTGGATTGGCACATATCCATCTCGAAGAAAGCTCAAGCCACGTTCATCTAACTTACCCTGGAGGTATTTATAATTATTATAGTCTAGCACGATCAAAAATATGGTTAATTTTTTCAATATGGTAAGCAGCTTACCTGTAGTTAGAGACATTCTGCATGCCATTTGTTGAGCTCTTCTTGGCTTGCTATAAAATGTTTTAATTTAAATTCAATCTATAAAT-------AAGAAAACTAGATGACAAGCCTGGACTTACTAGAAAGGAAGTCAA
>CG8055 4653957 4654427|3909 chr2R 4654183 4656396 scaffold_34 660555 662877 + 76105|0 299
ATCAGAGAGCTATTGAAATCTCCTTACTGTTCTGAAGATACACCC-------TATCGTTT--------------------------TTGTTTAATTTAATAATCAATACTGCTGTTAATT------AAGCAAAATTTTAGTTCGAAGCGAGGGAGAGAATACAAGGCATTAATT-CCTTTGGCAATTCAACAAATGGTACATAAAC----------TAGGAATGTGATTTTAAAATAAACGAAATAAGCATAGTCAGGCCTCACATGAGCAAAAGTA-GGTATCA----ACGTAGTTTCA
A--AACACGCTA-TGAAATCTCCCC-CTCCTCCCCACACACACCCACACACACATTGTTTTAATTGCCCGATTAACCCAAGTCAGCTCTTTTGTTGTAATTTTGAATATTCTTTATGATTAACTGAAAACAAAAATTTAAGTTGAA--AAGCGCGAAATTTCAATTTGCAAATTATCACGAGCAATAATACGCATTATATATATATTTATAAATAATAGGAATGTGATTTTATAAATAATAAA------ATAGTCAGGCAACAAGCACACAACAATACGCTACCATTACACGTAAATTCA
>CG8008 4669720 4670424|3919 chr2R 4670422 4671291 scaffold_895 4386 5196 - 29668|0 2
GGC
GAC
>CG8046 4673848 4674539|3927 chr2R 4674003 4674410 scaffold_34 673003 673514 + 3611|0 530
CACTCATCCGTATATCAACTCGAACC-----------------TATTTACATACTCGATTGTCGCGTAATAACCTATACAA------ATCCAAGCGTAGAGTTTGGGGAATTGTGCTTTGCCAATATCTCGAGATCTCACTCTGCCTTCCCTGGGGAAAAATCGTTTAATTACAGAAGCAAAATATTTTCTCATT--AACAAAAATATGGGTTATTATTGCAG--------------------------------CCAAGCTGTGGCGTGTGCGCAGTCACTTGAC-AATTCTTACGGAA----------------TATCTATAAAAATGTCAGGATGTGCAC-----------------ACTTTTGTACACC-----------------------AACGATTGGTGCTAACTACGGATCTGAGCGAGCGCTAATTCCACTTGCTAATTTTAAATTAGTCGCCAGAT---------TTTTTACACCCTTGATCGAAATGGGTCTTGTGGCCGCAATCTACTCGAAACCCGA
CACCAACCAATGTGTGAAGTCTAGCTGTGCACTTCAAGGGGGGTTTTTA-----TTGATCAGCATTTGGTACCATAAAAAAGCGAACACACCGGCAAATAACGTGTGTAATTGCGC-TTGCCA--TTTGCCATATTTTACAATAATTT--------AAAAAAATTCGAAATAT---AACTAAACAATTTTCGATTCGACCTCAGCTATGGGTTAATATAACAGCACGCTTCGACGGGCTGCTCCTCTGTTAATTTCCAGGCAACGGCGTGTGCGCAGTCACTTGACAAACTCTTCCAATACACATACATATATATGTATATATATATATGGATGGATGGGCATGAAAACAAATAAATATAAATATAATAAACACAAATAAATAAACTTCCCAGCAGAATGAGTGGTGTTAACTTCATGTTAAATTGAGCGCTAATTTCATTTGCTAATTTTAAATTAGATGTCACATTTTTTTTTATTTTTGCACCCTTGATTTAAAAGAATAATGCGAGCATGTTCGGTTCGACATTTGA
>CG8046 4673848 4674539|3928 chr2R 4674448 4674854 scaffold_34 673571 674007 + 8741|0 106
TTTATGGG----GGAATCAAAGTTTCATGGAGAATGGAAGAAAG---------CGCCAGTCAT--GTCAAGTTTTGGCTATCACTTACACAGGTGGACTGGACTGGC
TATCTCAGCCATAAAACTGATATTAAGCAAAAAAGAAAAGAAAGAGCTTAATTCGCCAGTCATTCGGCAAA-TTCGCACATCAATTATACAAATTGGCTAATATGCC
>rad201 4678374 4678675|3930 chr2R 4677106 4680094 scaffold_34 676388 679420 + 38760|1389 1734
ACCACGCCTGCATCCGTGATGCGCAGCAGACAGTGCTCACCATCAGGGCCATATGTGTTCGAGATGACGTAAATGAAACGCAGGCCATCGTCCTGGAGGGTGAAGTCCTCTTCCTCTGGAAGCTCCACCGACAATCTGAGCGTGGCAACCGAGCTCCAGTAGGATCCCAACA-------------------------------TGGGCTCCAACTGCTGTCG-TGTC-ACTTCCTCATCGTCGCC-----ATTTTGCTCTCCATCATCAC------CACAACTATCTATTAAGATAAAGTTGTAAATAGTTTTAATTCCGTAATTTACAAGTGAAACTAGCACATA
ATGACGCCGGCGTCTGTGATGCGCAACAAGCAGCTGCCGTCGCTAATGCCGAAGTTATTATTAAGCACCTTGAGCAGCCGCAGCCCGTCGCCGTCGCAGTGGGA------CTCATCCGGCAGCTCCAGGACCAAAGTCAGCGTGCAGACCGAGCACCAATAGTCACCCAAGAAGCTGCAGTCCTCTTGTGCATCTGTGCTTTTTTGGGTCGAACCCCCTTCGTTGTCTACATCCTCATCCTCGCCCATGTCGTTGGCTGCGAACAATCACGTAATAGATGTACATATATAAATTTAAACGTTGAAATAGTCTTGCCTAAGGAAAT----------------ACTTA
>Rme-8 4679569 4679946|3930 chr2R 4677106 4680094 scaffold_34 676388 679420 + 38760|2658 3113
CGACGTGTTATCCGCCGGACCAAGGCTAAAGCTTAG-----------------TCTGGTATTCAAGGTAACGCTAGCATGAAGCCTTCGATTGCCACGGAATCAGAAAACGGAAACGGAATTGCACGGGTTGCCCCCAATTATTGTATTAAAC--TTTATTTTATTTTGTACACTCGCAGCCAATTGTACGTATCGTGAAAAAGGCTGGTACGGTAATCGTTAGCCAGCATATTATTAA-TATGTAACAAAGT------------TTCATTTTTTATATTTATAAGAAAACCAACTGTATAAAAAATTAGTTGTTAGTTTATACAC------------------------------------------CGCGCATAAACAACCTAACTAGAGCATGCATAAAGTGATTAAACATAT----TATGGAATAAAGCCGATTCATTACAAATGAAAAACC
CGTCTGCTCATCTACCACAGCCAGACTAAAGTTAAGCACAACTTATGAGTGGTTCCGGCTTTCAA---------AGCGTACATCTTTTG-TTGTTAC-----------------ATGGAGGTGTACTGATTTCCT----TTATTGTATTAAATGTTTTGAATATTTTTATACACATCCTGC--ATTGTGTGT-----GAAGAGCGGAGGCGTGGCTATC---AGCAAACATATTAACAAATTTGTAACAAAGTCTATGGAAACGTTTAATTTTTTATATTTATA------TAAATTGTATAAATAGTAATTAGCGAATATACATACACACACACACACACACATATATATATATATATACATACCATACATGCATATACACCTTAACTAAAGCATGCATAAAGTGATTAAACGTATGTATTATGAATTAAAACGGACTCATTAAAAATGAAA--CG
>Rab-RP1 4689677 4690246|3937 chr2R 4689210 4691062 scaffold_34 688850 690731 + 45981|482 1210
CCTGGGA---CCGAGGTCCGGCGACTC-CTATTCCCATTCCCAGTTTAAGAGCGAGTTTCAACACAGAAACGC-------CATGTGCCTACGTCCAC------------------------TCCATGTTCATG-TTGT-----TAGAAGATAGCGATAACTATGCTTAGGGTTTTAACGTAACATTTGTCTAAGACTTAG---------TGTCATCCGTATCATC--CCGTCCGTC--TTTATCTTTAACACCC----------------------CGTCTGTGGGTCCAC-------------AATGTTGCGCCGGCATCGGGATCCGTGT---------CACTTTGAGAATTTATATGGTGACACATAACATACCTACGCATACGAAACATTATTAC-TATCACCATCATTGCCCTAGTTGCGAGGATTAGCCGGAGGTAGTGCAGCATCCGTATCATAGCATACTACATTTGTGTAAAATGCGAATCGTCTT---ATTGTTTTGTTTGTTTTATTTGCCTCTGCTGGCGAGATTGTTTTATCTTGGAATTAT-----------------------TATTCTCGTATGCAAACAC----ACTCTGCCATCATTATTTGTATTTAGATAACAATACGT----------------------------ACGCTTAATGCAATGCGAAATCAGAAATAAAGTTTTTAATGGTAGTTAAGTTCAGAC--GAC
CCTGCTGCTCCTCCGATCTGGCCAAGCATTATAGCCAT---CAATTTGGGC-----TTTACACACACACACACACACCCACACACACACACACTCACACCAAAGTCTGAGCGCGAACCAGTTCCATGTGCCTGCTTGTGGATATAAAAGATAACGTTAACTATGC-TAAGGTTCTTTTGTAAAGTGTGTCTAAGACTTAGACCCCATCATCTTATCATTGTCATCATTTTTCCATCATTTAATCATTTACGCACCTGGCTATACAGTCAAACCATGCGTTAGTGTTCCAACTGGAACAATATATGACGTTCCAGTTGGAACGGGAGCAGTGCGTGCTCATACAAATTATTTACATATATTTTATCACACTATGCACACACACACAC---ACACACCCACATATATCTATATATATACTAG------AGCTCAGTTTGAGATAATGCAGCAT------------------CATTTGTGTAAAATACGAATCGTCGTCCAATTGTTTTAATTGTTTGTTTTG-CTTTGTTACTGTGAGATTTTTATCTTGAATTTTTATACATACATAGACACACACACATACTTGCATACATAAATACATAAACTCTGCCATCTTTATTTGCATTTAGATAAAAGTACGTTTTATGCAACACAGATTACAGCAGAAACACATTTATATCTGCACGCAATC--AAATAAACTTTTTAAATCTAGTTAAGTCAAATCCAAAT
>CG8026 4698474 4699826|3943 chr2R 4697022 4698694 scaffold_34 697725 699637 + 8423|1746 2031
TCGTGCTGAGCATGCGCAGCTGCTTT---TAGTTTAA--GTTTAGTTAGTTGTTGCGAAGACTTATTTGGTCT-----------------------------------TTTCGTAGTAAGTAAAGTGATTGTTGTTCCTAAGTGTGG-----ATCAGAATGGATTT---GTGATTGAATTCAGACGAAAGTGTTACA--------ATATACCTGTGAAATATAAGTCCATAGCCTCACTCTTGCAAATAAACCAAA---TCTTTGTGAGCC------AAAGAATGC
TTCTGTTTTATATTTATAGCTTGTTTATATTATTTAAGTGTCTTGTTAATTACTATAAAACCCTAACTAGTATTTAGATTCTGTAAGCCTTCTGCTATAATGTACAACTTACGTTTTTGGAAACGATATTCCTACGCAAAAGCATTGTTATATTTAGAAAGTAGCTTAAGTAGACGACGGCAGCAATAGGAATTACATTTAATTTATATATCTGCCAAGTGAGAGTTAGAAGCATCGACTT------TAATCCAAAATGCCAGTGAGAACCTCGCATTAAAAATGT
>CG8026 4698474 4699826|3944 chr2R 4698822 4699066 scaffold_34 699803 700060 + 9261|0 262
CCCCCTTAATTGTGCAGAATCTCTTTGCTAATCTGAAACA---------GCCAATGCGCCCTTACTGTAAGTAGAT-GTAGCTTTCAGTTCTCAGTCTCTAA--------CCGCATTGTGTTTGGTTCTCTTTGCAGGTTTGAGGGCTACAGAGGCTTCTACAAGGGGCTGAAGGCGAGTTTAACCCGAGTAGTGCCTGCCTGCATGGTCACCTTTCTGGTGTACGAGAACGTCTCGCATTTCCTGCTCGCCAGGCGGAAGCG
TCTCTCTAATTATGCAGAATCTCTTTGCTAAACTGAAACACAGGTATTTGTCAAT----TGCAATTGTAAGTAGGTAAGAGATCCTGGTCAACATTTACTTATATATATCCCACACT-TGCTTCGTTCTCATTGCAGATTCGAGGGCGCGGTCGGCTTCTACAAGGGTCTCAAGGCGAACCTGATACGCGTGGTGCCCGCCTGCATGATCACGTTCCTGGTTTATGAGAATGTCTCGCATTTCATGTTGGCACAAAAGAAACG
>CG8026 4698474 4699826|3945 chr2R 4699096 4699565 scaffold_34 700100 700523 + 4828|0 513
AAAATAGCCCCTGCCCA-----TGAAATGTAATTTCAAAAACGCATTTCTTGCACTCTTCATCAAAACAAACACATATTTAGTTCTTAGTTTAGTTAAATTATTTATTCTATAACGGCTTGGAATTGTGTAAGCACAAAGAAAAACCAGTTACTGTTTAGTTGATAC-AAAATTTCGTTTTGGCAAAAAGATTCTTCATAGTTTTTGAAAATGGTTTATAATTTTAAGGATAAACCTTGACATTT--------ATGTAAATAA----GCATAAACGCATTGT------GAAACCAACTTAGTCCTACAGTGGAACAATCTTATTGAAATCAAAGA---AAAGATAAGAAATGCGAAATTACT-----TACCCATATTAAAAGGCCACGATGGCAGACCTAAATGAAAACCAAGAAACAAACTAAAGCAAACACTGTCAGCGCGTCCAGCCTGCGTC-TTTTCATTTGTCCAAGGGCTCATGGCA-----------GCTTGAGTAAGTAGTCCTT
AAAGTAGCTTGTGCTAAAATATTGAAATTTAATTTCAATAA-------TTTGCAC--------------AACAC-----TAGTTTATAGTTTAGTTAAATTATTTAT-----------TTGAATTAATTGCAATGTAAATATGTTCTAGTTA--GTTAGGCATATACTTAATTTTCGTTTTGGCAAAAAGATTCTTCATAATTTTTG----TTTTTTAAAAT----------AACCTTGACATTTAGAGTTACATTTAAAAAATGTGAAACAAACGCATTGTCAACAGAAAAACAGAAAAAT--TTCAAGAAAACAACCAT----AAACCAAAAACACAAAAAGAAGTAGTAAAAAATAACTAGAAATCTACACATTAAAATGCCAAGA------------------------AACCAAACAAGCG-------TTTCCATGTCCTCAACACGAGTCTTTTTTATTTCGCCTTCAGCCTGAACCAACCGCCCTGAGGCTATAGTAAGTAGTATAT
>CG8026 4698474 4699826|3946 chr2R 4699625 4700209 scaffold_34 700592 701245 + 21518|0 265
ATGGAGTATTAGTACTAGATCATCGAATCTGGAATCT------GACAGAGAATTTAAGCTA---AGCACCTAGA---ATACACGAATCTTTCTCGTTTCCTCCGATGTGCAGCTAACAGCAGAAAATGACAAA------CTTATTCTGTATTATTGTTGTAACT-------CGATTTCGGTTTAGCCCTA---GCACCTTA------------------------------------CTTTAGCCTTAAGTGTATTCCATATCTAG
GCGTTAGAGTATTACATAGTTA--AAAACTAGAAAGTAGCCACAACATTGAATATAAATTACATATTACCTATATATCAACATGAATCTG---------AACGGAGCAGCAGC-AGCAGCAGCAAATGACAAAGCGGATCATAATTTGTATTATTCTTGTAATTATGATTATGATTTTGTTTTAGTTTTACTTATACTTTAACTGCTACTTTCATTTATCATTTAAGTGTTAGTTGTATTTAGCTTTAAGCTAATTCCATAGTTAG
>CG8027 4716221 4716718|3966 chr2R 4715583 4716252 scaffold_51 57014 57734 + 9043|764 804
AAACAAAATA---------AACCATTTCTATTGATTTCCAA
AAACAAAATTTTACTAAATATCAATTCCGAATAAT--ACAT
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TTTTTTAGAATATTTTGTGGTCCAGCTTTTGCAGTCGACCTGTTTTGTGTTCAGTTTCATAATATCTAAGTT---TCTATATTACTATTTCTAAGTTTGGCTTTACAATGATATTTGCTCACCTTAAAAGTACTGAACTGAAATATTCTAAATACC-TAGTTTA---ATTTTGTTTACAAAATACGTAACTCG--------AACATACACAATGTACACATATTGATATAATGGAGTACGCCTTAAATGATATTTATACATTTTGCTAGTGAATGTTCTTCATTCT
TTTTTCTGAAT-----GTAAGCCGAAATTCAAAGGCGATATTGCTT---TTCCATATCATTATCTTACAATTCTTTCTAAATATATATATGTTACCTTGGCTTA-----TATCTTAACTTACCTTAAAGGTAAACAACTGAAATATAGTAAAAACTGTTGCTGAAAGATTCCATTTATGGGGAAATTCCTTCGTTTTTCAAAGCTTTTACAAGCTGCTGAGGCAGATAATAAAGCGATAGCTATAAATAATTTAC-----TTTTTTTAAATATTTTTTAATATTTT
>CG8027 4716221 4716718|3968 chr2R 4716547 4719095 scaffold_4 63730 66241 - 94772|0 175
-ATCGATTTCGTGAAGTTCTCTCCCTTCTGCAATGTTGTGATATGTTGTGAACATTTATGTAAATTGGCCATTTCTGCAAGCGATCATA-GTCAAATCTAGTTGTAGGCCATGTGTA---AGGCTATTTTTCTAGTTCTTTAGGTGCATGCTAGAGGCTACGTTTAGAAATAGTCA
TATTAAGGTTGTATGATTTGTTTTTCATTTCAATGTTGTGATAAGTTATAAGCTTTGAGATCG--TCGCCATTTTAGCGC-CATTTATAGGTGGAATCTAGTTTTAGTTAAGGTCTACCTAGACTATATC-----TTATTTAAGCGCAATCAAGAGGCTAATTTTAAGTGTAGTAA
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ATATCAACGTTAAATGTTAAATCGTAAAAAAAAGAACATAATATCTTATACATTTTTTTTCTTCATTTGCTAAAAACTCTTTATAAATAA--TATTCCAATTAATTGCTTAAAGAAGTATTATCTATTAATCAACAGTTAAATACAGGTATTCAAAA--TTTAACAACCGAATACAAAGTTAAACTTCTTAAAAACAC----ATTTACTATATGCATATAGAGCAGAT--ATGTATGTATAAACCGATGTAAAGCT----CAATGATATATCAATGTTGATTGATTGATTAATTGATTGATTGATTGATTGATTGGTTAGTTAGTTAGGCGCAAGCACTTGCTGCATGGAAACG------AAAGTCATATC-----------CCTCTAAAAGGAAACGAGT---------TAGGCAAGCCATAA----------------GTAATACTTCTTATATAGTTA--ACTATACTATATAATGTACGAGTCTGTAAGCAAATGCAAAG
>hig 4739594 4740898|3989 chr2R 4740083 4740926 scaffold_4 100353 101341 - 18654|0 1032
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AC--------------------AACTGATAAATGCACAT---TAAATGCACATACGCTGCGAATCCTTG-------------------------------------CGTAATCTTCCAAAGTGGGCCCACTCACAAATCAAATGAATTAATATTACTTGTGTTGTATTTCCGCTGTATATCGTACAATCGATACCGATCACGAAACCGAAACCGATACCGATACCGATCACGATACCGTTACCGATACCGATCACGATACC-GATACCGATACCATCACGATTCATTCCATGTACGCTCATCTACATCCACGACCTGACCACCTTGCATGCCAAAATGACCATGATCCATGCATCCAATGCTCCAATCTCGCAATCAGGCAAATCGCAGTGCCCCTATCCAGGCGACCCGCCCAACGGTTTGATCGCCCCGCTCAAATTCAACTATGATGCGGGCGACTATCTGAGCGTCCAGTGCCGGCCGGGCTTCATACAGATCCAGACGAACGAGGATCACAGCACGGGTCCGCCCGAGCGGCCAAAATGTCAGCCAGATGGCAGGTGGTCAGGCCCGTTGCCCAAATGCCGCAGCTACGAGGAAGTGTAGCTCCACTGAACTCCAGCTCTGGATCCCAAGGGGAAATGAAGTTCTAGGCCAAAGCCCAAGCTGGCAGGCCCAAGAATTTAGTACAGTAGCGAA--CCAAAATTCCAAATTCAAGCCGAAAATAAAAGAACGAAAAAAAATACATAAATAAACCCGAGTGATATTTAGATTAAACTTAGTGCGAGGTATCAAAATTAATTAACATAACTACAACATAATTTTATTGGCTATAATTGAATTTGACTTTTAATCACTCGCTATCTTTATATTCCACTTATAACAACAAATACTT---GAACGTTTCTTTGAAATGCATCTATAGCTCTTCT------AGGCCCACTTGAACAAATTCTCAAATATTCCATTAGAGACAGAGATAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAAATGTTCTTATGTGCTAAAGTGAATGA
>Pkn 4765313 4765876|4021 chr2R 4763738 4765859 scaffold_4 128875 131166 - 13249|1793 2520
AAGGATTTACTAACGGGCCTAGCCCGATCCTTAT-----AGCCTATGGCCTGCTTTTGCTTTTACTTGTGTACGAAATTGGTTTCGAGTAATTTTACTTGGCTTAGTAGTCG-ATGTGAGTTCAATATTTATACATGAAGACAGCATGATAATACAGATACAGGACATATATATTTATAAACTATATCTATATAGAAAATACATCTACTAACGAGAGAACTTTTGATTGTTGCTCACTGGCCGAGAGACCAACACAAACCAAAATACCTAG--TTGTCCATGTTGTGGAAAA-------------------GCAAGCATTTGTCAATCATCCATGCA------ACCGGTTTAGC--------------------ATACAGTGTACCCAGAAATCATCC--CACATTGTCGT------------------TGCATTGTACAGCATATAGAGTTGTTTCCTTTTCCAAACACGAGAACGCATTGAATAGTCTGACAAACCCTAGGAAAGCCTTATACGCCAAGTTGTAG---TTTTGGAAACCGTTTTTTAAGACCGGATACAA--------------ATAGATTTTATAGAT-----------------GAGAAGTGTATGTCTACAC-----------------------------CCCAGAGCAGT---------------------------------------------CATTGCAACCTATTTT
AATGCTGCTCTAATGCCCCTGTCTTAGTCTTAATGCAACGGCCCTGGGCCTAGCTCAG---TTAAATAAGTTGAATAATGCTTTTAAACATGTGCAGCGAGTTGTTTAGCCACATGAGAATTCGAGAAT---------------------------GAAACCCGATATATAGATATATA---TCTGTGTCTGTAGTGAATATATTGTATAA------ACCTTGTGCATGTTGCTC------------AGAAGCATTGACCAAATTGCCTAGAATATTCTACATAAATGTAAACCTGCATCATCAATCATATACATACATATATCAATCATATATACATTATATATCAAGTCAACGGCAGCTGCTAAATTAATATATATACTATATATACAATACATCTAACACATTGTCACGGAGGGGTTAACAAATTGTGAATTGTATTTCGTTTCG-GTTGATAATTTTCCTAATCA----AATATATTGAACAGTCTGACGAACCTTTGGAAAGCCTTAAATGCAATGTTGTAGAATTTTTGGACAGATTTTTGTTAACATAAAGAAAAGAGAGCCAGGTTCTATATTTTGTATAGATGTTAATTGAGAAAGAAAGAGAACGATATGTATACACAGCTATTTTACAAGCGCCAGTAGATGAGTTTTAGGGCAGGAAACAAACAAACACACATAAACACACACACACACACACCCACAAACATGCATACCTATTTT
>Pkn 4765313 4765876|4022 chr2R 4765869 4766965 scaffold_1 2088551 2089677 + 9823|0 7
AAGCTCAT
CAGCCCAT
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ATTTTAAT------------TTTTAAATAAACATTTAGTTTTAAACATTCTCATCC----------CAAG--GCTTTCAA--TAGAAGCCT-------TTTTTGGGTTTGTTTTTCCTTTTTTACACG
--TTTAATCAATACAACCTATGATAAATAAAAATACTTATTTAAATATCCTCTGCTTTTAAATTAACAAGTCGCAGTCAAACTAGCAGCTGCAGTAGATTTTCGAACCGATCTCTAAAATTTGCCATC
>TXBP181-like 4800760 4800907|4055 chr2R 4796219 4800776 scaffold_4 170108 175007 - 148355|5130 5146
AATACATATAAATTATA
AGTAAACATATATTATA
>Myd88 4815491 4815706|4070 chr2R 4815285 4816165 scaffold_45 457354 458337 - 15404|264 538
GATCATAGTGTTAGGATAGCCATT------CATTCGATTTCTCGATTCTTTGA--------TTCCTTGTCGTGTGCCCAGTCTAGTTG-----------------TGGCCGCCCAGTCACCAATGTCG-------------TCACCCTCCATGC-CTAGTGA-----------TAATCTTTAGCCTAATCCT--TATCAAGTCAACTAACTT-AATATACTTAGACGCACTTGTTAACTTATATAAGACAACAACGAATAAAGACAATACCACAT
GAGTAAAGTAGCAGG-CAGCTAGCTGGCAACACGTGGCATGCTGCCTGTGTGAATGTGAATTTCCTTAAATTGCGCCCAGTTAAGTGGCATGCGAATCCATTAACCAGTCACCCGGTAACCGACACCGACAACGGCACCAACCACCCTCCATTTAATAGTGATTTTTCGTTTGTAATCGTTAGCCTAAACCTAAAACAAAGCCAACTAACTTAAATGTATTTAGACGCACTTGTTAATCTATGTAAGTCAACAACGAATAAAGACAATA-TATAT
>CG12158 4874384 4874462|4129 chr2R 4873519 4874526 scaffold_45 513440 514477 - 3950|937 1015
AACTGGGATATTTCTGGAGGGGGACACACACCTCCTCGCCACTTTCCCAGTTACTTAAATAAACACTTTCCCCAGCAAA
TTTTTAAACATTTTCCGAGAAAGTTGCCAACCGATATACAATTTGATTGGCAACTTAACCGAATAAAATAATCAATGCT
>CG8801 4908078 4908291|4171 chr2R 4907894 4908169 scaffold_7 1971791 1972108 + -3488|220 319
CAAATTGTTTATTT------TTCGGGGACCACACATCACACACTCAGTAAACTTTGGTGGAATTTTTGTATCATAAAAAGCAA--AGAGCCTTGACTTCT
TCGGTTTCATATTTGAATTTTTTAAGAAGCACAACACTTTTGTTAATTAAAGTAGGTAAATAATTTTGTTAAATAGAAACAAATAAAAATATAGAAATAG
>CG8801 4908078 4908291|4172 chr2R 4908170 4910549 scaffold_45 549724 552114 - 139958|0 135
GCGCCGCAGCCTTG--GCTGGTTA----AGTGATTCTACCTGGTGGGCTCGCCTGCTCCTCTGTATAAACTAAGCGTCTATC--------TTTATCCCTGAAAAACATTTTCAATACAATATTGTATTTTTACAAA
GTGCCTTAGCTTTATCTCTAGTTATCTTTATAATTCGCTGTACAAATGTAACTTGATCCTATGCAACATCT--GCGCAAATCAAATGCAAGTTGTATTTAATAAATA-TTTAAATATCTTGTGGGATATTTACAGA
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TGTAGGATGTTTCCGCTAACAGACTAATATAGTTCTACCAGGATAATGATAATGCTGCTTCATTCGCAAAATAAATATGTAGTTGTACAAATCT-AATCCAGGAT
T-CATCACGTTTCCGCAAGTTAATTAATACAAGTATCTTA---TAAAGCAAAC---------TTCGTGTAATAAA---ATGGCAACATAAAGCTTAGTCCA---T
>wun 4912360 4912847|4173 chr2R 4910708 4912996 scaffold_51 64099 66296 + 26329|1716 2290
CACGCAGA--AGTGCAAAA-------TAGCAATT---------ACAAGTTGCACGAGCTGTA-GTTAAACTAAGGACTCGATGTTCTTACGGCTTTCT-TCATGGGGACAGTGAAGCCTAGCTT---------------------------TGCGAGCCTTCCCAATTAATTTATTCCTGTACTGGCATTTTAAGAGCTGAGCGTGAATGTATGTGTTAGC----TGCAAGTGCACTCGA---------GTGCCTTCTTTAATAT--TTAAACTAGAGCAATTGAGAGATCTG--TGTATGACGATAGCTATA-------CTAAATATTTTTAACTGACGCAACAATTTCCACAAAACAAGTGACCTTTAAAACAGAGCTGCGCAAAAAATATATGAAAGCAATAAGTATTATGTAAACTAGTTTTAAGCTTTGGATACGGAAAGATAATTAAAATATTTCTAAGATGGCCGTTAAATA------TGTTAA----TTTATAATTTTTGGCGAGAATTTACAATT------GTTCGCTGAATATTTTTATGAAAATAAAATAGAATTAAGAATATG
CCCACAATTTATTGCAATAATCGTTTTAGTAATCGTTTAGGACACAAATTCCATAATTTATAAGCCAAACAGGGATCTGCAAAATTGTATCACTTGATGTAACGGTTAAAACAAAGCCAAGCTTATGTTTGTTTTTAGTTACATACATATATGCAA---TTTTAAATTAATTTA-------------ATTTAACTAGATGAATAGCATTTTATGTGTGTGTATCGTGGAAATCCACTTAATTTTACCTCGTGACTGCATAACTGTGGTCAGAC-ATGGTAATTTAATGGACTGATCGCAGGCAAACATATATATGTACAACTTAATGTATTAGTCTGAGATATTCGTTT-----AGGTATGC-ACCGTTTATTCAGGCCTTCG---ATTGTTGTTGATGACTATAACCACTA----AAGTGACCTTAAGATT-----ATAGAAATCTCGATTTGCTATTCT---GGCAATCGTTAATTAGTATTATATTAAATTCTGTCTAGTTTTTGA--AAATTTCACAATATGTATAGGTCGTTCAATAA----ATCAAAATATTTTATAAATAACAA----
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AGCGGTGCTACCAAGGCCATTT---TCACACTTC------AACATGATTGA-----------------AACTTTAT-------GACATCCCAAAAGTTTGTCTC---ATCGTTTATCCTTCTATGTTTCTCCGATTCGCATGCATTCCAATCC-AATTGCAATTCGATTTATTTAATGTGTATTATTGTTTATATATTGTATTGTATTTATTATCATTGATTTTTTGTCGATTTTATATTGCATATTATGAATTCTACTATTATTATAATTATAAATATGATA-ATAATCTGAGGTCAAGATCAAAAGAACACAAGAAACAACCGCAATGCACCTTGTTTAAACGTATCAATTTGTTGCTGTAGTTGAATAGATTAATTGATGGTCGAGT------------------------------------AAAGCGAATGAAAAAATGTTAACAAGTG------ATAAATGTGAAAATTGCTAAACAATGCTAA----CTGAATGTGAGAATTTTGTATAAAATAATTATAAAGACATAACCAGAAGCAAATGAATCGATTACT----GTATAGAGCCGAAATACGAGGAGAATTAAAGCAAAATGAACA-ATATTTAATGT-TATTGATGCA-ATATAGAGAAATATT---------------------ATTATT-------------------ACTATTATTATTGTGTACGTAAAGAATAAAATGTAGTGCCTAAAAG
AGCGGTGCTAATTACGCCATTTGCCGCACGTTTCTTTCTAAATACGGTTGATCGCGAAAAAGTCGTGTTACTATATATATTGAGAGAGTATACAGTTTTGTAGCTATATAGCCTATTTTCCGATATTTGCCTGCTTCGTTAAATTTTGAATTTGAATTATAAATCTTGTATGTGTATGTGTATTATTGTTTATATA----------------------------------ATTTTATATTGCATATTATG-----------TATGATTATTATATATATTATATATTATCTTATATT------------ATATTATATCGAATCG-AATGCACTTTGTTTAAACGAATCAA-TTGTTGCTCTAGTTAAATAGTTTAAATGAATGTCAAATGTCGAGCAAAATGTCAAAGTTAACAACAAAATAAACAAAATGAAAAAAAAAGCAAAAACAAGTTAACGTCAGAAACGTCGTGATAATGTGCAAACGCTAAAAACCTAAATGTGAGAATTTTGTATAAAATAATTATAAA--------------CAAACTAAACGAATATTATAAATATATATCTGACATGCTTTATG---TACATATATATGTGCATATATATATTATATATATATATATATATATATATATATCTCTGTCAAGCACACGCAATTAATTATTGTATAGCTCTGCGAAATGAACAATATTTATTATG-ATGTAAAAAATAAATTGTAGCGCCTAAAAT
>CG1888 5056985 5057168|4348 chr2R 5057054 5058112 scaffold_43 217186 218167 + 22522|0 126
-CTGGCTTGTTATGCAGTTG-----------GCAGCTCAATCCAAAGCCTAAATGCAATGCTTAACTTAAGTTCAACTAGCTACTCGATGTGTAATTTCTTGACTTT-ATATCTATGAATCGACCAT
CCTAGTTTCTAAGATAGTTTCCACACATAACTCATCCCAATCCACATCATA---TCGATTCCTAGATCATGTCCCATG---CACACGATACGT--TTATTTGACTTGAATATCGATATATCGGATAT
>CG1884 5078750 5079790|4370 chr2R 5079178 5080236 scaffold_43 257286 258639 + 13961|0 894
GAAAACGCCACCGTCCGACGCTTCTGCCTGG-----AGGTCTGCGCGAGACCCAGACGCAGGCAGTAGCTGCC-----------------------------------TGGGCAGCA-CACCACCACCACCACCCACAA--------------------------------------------CACCACACAGTACAGCGTTCATTGAATTCTACTAACCATTACTGTGTTTAGTTCTTAGCAAATCGTTTTAAG--------GAGACAGTGAAATC------------AGCAACAGCA--CACACAAACATTAACAAAACAACCGCAACAATAAGCATAGGG---------------------------------------------AAGGGAAACAGCAGGCC------AAGCCAATTGGTGTGCTG---------TGCCGGAAACCG-----------------------------------------AAATTCGACATGTATTTAA------------------------ACGAACGGAAGCGATATTTTAAATGCCTCCCCCTT-----CGTCGGGGAATGTTA---CAAATTTTTAATTGAGTTGTATTATAAATGGTAGATGAAGGCGTTAAAGTGTTGATGACAGATACTGTGTAAAGAAATCAATCAAACAGATAAAA------------------------------------------ACAGAAAAGCGAAAAACAAAAGAAAAAAAAAAACGAAAATCGAAAAAGGGAAAAATATTTTCTACAAAAAAAATGGCAAAATGTACAATGAAAATGCGAAAAAACTAACAAATGCGAACGGTCACATATGAAATTTGTGTAAACATATTGAAAAGCGAAGGAACCA
GTAAACGCAACGGTCCGACGCTTCAGCCTGGACATAAATTTTGTGCCCCAATGAAACGTAGACAGCAGCAGCAGTAAGAGGAAGAAGCAGCAGTAGGAGGAAGAGAAGGGAGCAGCAGCAGCAGCAACAGCAGCAGCAGTAAGAGGAAATAGCAGCAGCAGCCGTAGCCGTAGCCACCGCGGCCACCATAAAATCAATTATATATATATATATACTAACGA--GATGTGTTTAGTTTTTAGTAAATCGTTTTAAGCAAAATATGAAACAATGAAATTACAAAAACGCAGAGCAACAAAAACTAAAAAAAAAAAAACAAAAAAACTAAAAAAAAAAACAAAAAGAAAATCGAAAAAAAAAATGATAAAAAACGAAAAGAAAAAAAACAAAAAAAAAAAAACAAATCAAACAAAAGCCAGTCGTCGCCCAGCCAGGCAACTGGCCCGAACCGAGAAAGAGGAAGAGGAGCTGTTACAATACGATATATATGATAAATTCGAGCTGTATTTAAGTAGTAATTATTGTGTTGAGATATATATATATATATGATAATCGAAATGAGCAACATTTTAAAATGCCCGCAAATGTTAAACAAAAATTTTAATTCAGTTGTATTAT-AATTATAAATGGAAAAATTCATGTATTTACCTGTGGTTTTATGCCCTGGGCTCAGGT--TCAAATAAAACCCCACGCCCCCCTCCCCCCACTCCCTCCTCCTGTTCCCCTGCCAGGAGAAAGTGAATCGAATGAAAAAAAA-----------GGAAAGAAGAAAAACAAAATGAGAAAAAAAAATTGCAAAATGTAC-TCGAAAATACACAAAAACTAACAAATGCGA---TGTAAATATGTAGTTGTTGTTG--CTATTGACAAGGAACAGCAACA
>CG1874 5087321 5087334|4373 chr2R 5086845 5088425 scaffold_43 266578 268263 + 57351|497 510
TATTATGGACACAT
TATTATGGACACAT
>CG1868 5093569 5093626|4378 chr2R 5092869 5096038 scaffold_43 272573 275872 + 75315|734 818
TGTAAATAACGATA-TACACGCATT--------------------AAATTCGCTAGTTTCGAGCTACAAGCAT------TAAACA
TGCAAGTGACAATAATAAATTCACTTGCTAACAATTTATAATTATAAATTCTCTAGATTCAAGCTAAAAACAACAACAATAAACA
>CG1863 5106706 5106743|4383 chr2R 5104531 5108017 scaffold_1 5334902 5338366 + 63190|2328 2365
TGGTGGAGCTTACATCTCTGCTCCCGTTAGCGTAGATG
GGCGGCGGCATGC-TGCAAGCGCCGCTCAAGATCAATG
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AG----TCGGAACGTGTTTTAATTAGTATTCAATAAAAGGCAAAAACAATCCTCAAA
ATTAGCTCACACCATGAACTGA---------AATTGAATGGGAAAAAAATCCCGAAA
>CG12926 5119940 5120161|4393 chr2R 5119860 5120026 scaffold_1 5351742 5351910 + 3865|82 168
CGCCGTCGATTGCTTAGATTTTCGGTCAATAAAAGTCAGTCCCTCGTCATGGTAGGGATTTGCGGATACCCTTACGCGTTCCAACCA
CCGGACTGGCTGCTTGGACTTTTTCTGAACAAATTCATAGGCCACATCATGATAAGGCTGGGCCGCATCGCGCACACGCTGCAACCA
>CG12926 5119940 5120161|4394 chr2R 5120080 5121453 scaffold_1 5352003 5353436 + 49167|0 133
TC--------------TAGTGCGTAACAT-ATAAAACGTAGTGATTTTT-------------------AATCTTTGTACGAACACAAACA-----------AATCAAAACTAA-------ACAACATAAAACTA
TTTATACATTTGATAGTAGTACATATTTTAACAATAAATAATTATTTTTTTAATGTCGTAGCAAAAGAAAAATCGATTAAAGCACAAACAACAAGTAGGTTAATTTAAAATAAGACAGACAAAAAAAAAAACCA
>Mmp2 5123504 5123904|4396 chr2R 5122936 5123604 scaffold_1 5355603 5356330 + 1408|684 789
AGCGCAGCTGTGTGACAGTCTGGCGCTTCAA--TGCCCCCAAAG---ACGACACCGAGCGGCCTTTCCTTAGATTTAAGGAAAATAAATCAACACACCAGTGAAAG
AGCTCTACTGTCAGACAGTAGATCGCTTCAATCTGCACCCAGAAGATAGAACACGCAGCGGCCTTAC---AAATCTTCTACAAAAAACTCA--TCACTTATAAAAT
>Mmp2 5123504 5123904|4397 chr2R 5123858 5124667 scaffold_1 5356575 5357404 + 32452|0 61
GATTGAATGTGGAGCGTAGCCTAAGAAATGT---------------CTAAAACTAAGAGAGA
GATTGGAAATGGAGTTGATCTATAAAAGTTTAGGCATAGGTTTAAGCTTAGTTTAAGGCAGA
>Uba1 5200100 5200580|4502 chr2R 5199662 5201772 scaffold_1 5462715 5465008 + 78642|550 1214
GC-------CCGTCTATAT--------------TCCTAATT-TAACCATTAAATTATTTT-------------ACGATCCCGTTTTGTTGTCGGCGACGCGTTTTGGAATCGCGCAGCTCCAACGAAGGAGT-TACTGTCTAGC-TGTTTGCATTTT-------------------------------------------------------------------------AATTTTCACA------------ACAC---------CATTA----------CGAGAGCAGCCCAGATCTAGAAATTATATAAAATGTGTGTGAAT-------CCTCTAAGGAATGGCAAAAT----AATACGCATCATACG-AAATACAAAGACTCGACT----------------------------AAAAGCAACACTTAAAATGCATCTGATGAAACTCTCTGCTCAGCATAGTTGTAAAGGTAACGAATTACGAAAAACCGAAGGCGGATTTTAATCGCATTGATTAATTGGAAATTGA---AAACTGAATGAGCCAGGCGGAAAATTTCTCTTCACTCATATATTTTTTTTATATGGAAGCATAAACTAATTACGTCATTGTATTAAAAGGAGTAAAGCAAATGAATAAAGCTGTATATTTCATATGGTAA
GTTTCGGTGCAGCCGATATGCCACGCCCCCTAATCTTAATTGTAACAGTTAAATTATTATTTAAACAAAAGAGAAAATAACATTTTTTTTTGATCGTCGCG-TTTGGAGCTGTGCGCCT-----GAAAGTTTACAGTGTGAAGCAGGTTTGCATTTTAAACAAAAACAAAAAACAAAACAAATCAAAACAAACACAAAATAGGAAAAACCAGAAAATGGCTACAACCACAAACTCTCACACACATCTCCCGCACACACACACACACATTAAACACACACACGAACACAACTAATCGATATAGAAATTATATATTATATATGTATGTGTAATCCTATAAGGAAATGGCAAATATTGAATTCGCGTTACACGAAAATACAAAGACTCGACTTAAAAACTAAACAAAAACAAAGGAGAAAAAACGAAACAATTAAAA---ATCAAATTTTTGTGTCTGCTCATCATAGGTTAAAAATCGTTTAAATATGGA---------GCGCATTTCGTTTTTATT--TTATTTGAAATTTGATATAAACTAAA--AACAAAACAAAAAA--------------------------------------AAATTAA-------ATTGTATTAAA---GGCGAAGCAACTGAATAAAGCTGTATATTTCATATGGTAA
>CG30004 5228251 5228331|4532 chr2R 5228155 5229161 scaffold_1 5498460 5499426 + 29221|96 238
GTGCCCATATCCACAGCCCT-------CTGTATAT-------------------ATGCGATATATATATTTGTA--------------------TGTAGAGTACAGATCAA-----------CTAATTG-----GCACATAGG
GTGTCC--ATCCAGTACCATACGAATACTGTATATAATTTTTCATTACTTATTCATGTACTATACATACTACAAGCAGGAAAGAACTAAAAAACTAAAAAAAAAAAATCAAATCAAACTTAGTTAATCGCAGTTACAATTTAG
>CG1776 5230452 5230809|4535 chr2R 5229995 5231101 scaffold_1 5500675 5502003 + 19038|557 1101
GGCATCCGCATCGCATCGCACCTCCAACTGCATCCTGCAATCGGATCGACTTTGTATATTACACGATTAACTT-------------------------------------GTCAAACTAATTGTTGT----TCTTAACTTGAATGTGGACCAAGCTGGCTAGCTGA----------------------------------------------------------CTCTCTGTCCGTATCTTCTATCTTTCTTTGTCTCTT---------TGTTAACCCCACCTCT-------TTGCTAGAATCAATCCTTGTCTTCGGACGAGGGAGGAC----------------------------CAGCTTGCCAG-----ACAGAACTGTTGTTTAT-----GTTTAAGTAACCCTAGCATTAAGCTATATGCCTGGCATCCTTGTAGCGGATGACCAGCCCTATTAACCACTTT----------------------------------ACACTGTGATAAAGACAGCCATTGAAAAAAAAAAGAAAACAA
G----CGGGGGCGAA-CGCA------------------AATCACAACCAATTTGTAAATTACATAATTAACTTGAAAACCAACAAACAAACAAACAAACAAACAGAAAACGACCAACTAATTGTTGTTCTCTCTTAACTTGAATGTAAACCAAGTTAGCTCAATGAGAAGCGCGAAGAAGGGCACGCTTCAGTGCCCGCTTTAACTCTCACGCGCTCTCTCATTCTTTCTCTTCATATATATTATATTTTTCAATCTATTAATGTTTTGTGTTAACATAAGCTTTAAATGAGCTATTGTAATTA--TGTTGTGTGTGGAAGAAAGAAGGCATGTCACCAACAACAACAACAACAACAACAAATTTTGAGTATTTACATAAACGTTGTTGGTTTATATTTTAAGTAACCGTAGCTTTAAGC----------GCATCCTTATAGCGGATG-CCACCTCTATTAACCAAATTGCCTAGTTATACTTATAAGTTGCTTAACGTTTCGACACTGTGATAAAGACAGCCAATGACAAGAGTA---------
>CG1690 5268736 5269215|4573 chr2R 5269166 5269947 scaffold_1 5539581 5540294 + 16162|0 49
ATGTTCCCAAAACGTCCCAAATAGCCGTCATAGACGTCATAGCCGTCACA
ATGT----AAAAAATC----ACAGCCACAACAACAGCTACAACTACAACA
>CG1688 5278175 5278377|4584 chr2R 5278169 5279248 scaffold_1 5554338 5555567 + 32949|6 228
TGTGCTCATCCTAATCCTCCTCTCCCAACCATCTGCAATCTTCAAT-----CTGCAATCCGAATGCTTGAATCATAGGCTAAGTGAACTGTGTAATTAACCCAAACTAGCCCATCTCTGTGTACATTTGTCTGCCTATCGAAATAGTGAGAACTCGTATGTTGTCTG---------------GAATTCAAATGAATTTGTGTAAATAAACGGAATTTTTGGAA
TGTG-TGACCAGGACACGCTCCTATTAGACATAT--AGTTGTTAGTGCTAAATGTAATCGTAATATTGTAAT-GCATGCTTAATCAAGTGTATAATATATATGGTC-------TCTAAACAGACATCCACATGTACATGCAACTCGTAA------GTCTGTTGTCTGCTCTACTCTTAAACAAAACAACAACAAAAATGTGTAAATAAAATGAATTTTTGCAA
>CG1648 5323198 5323290|4638 chr2R 5322283 5323784 scaffold_1 5612709 5614380 + 35566|1074 1229
AGGC-GTCTCCCTTCGCGGTGCC-----------------------------------ACCTAAAATATCTTGAT----------------GTGAAAATGCTTT-------AGATACAAAAACAAAA----AAAATAGAAAGGAATTTGCTTCAAT
ATGCTAGCTCCGATCCATATACCCAACATCCCCCCCCCTTCAAAAAAAAAAAAAACAAACCGTAAATAATTCTATCTGTGTGTAATAAACCATGAAAATGCTTTAAAAAAAAAATACAAAAAACAAAAACGAAAATGCAAGAAAATTTGCTTCAAC
>CG1625 5334890 5334977|4652 chr2R 5334880 5336276 scaffold_1 5626409 5627826 + 65307|10 97
ACAATTACTCGAAATAGGTGTATGGGACCTCCAAGCTAAATATTATTAGGAAGGTTTTTTAATAAATGAGTGACGAATGGCTTAAAAA
GGAATAACT--GAATAAACATATGAA---CCAAAGCTA---------AGGAA-----------AAATAAGTCAC------CTAACAAA
>CG1623 5339914 5340239|4657 chr2R 5340089 5341815 scaffold_1 5633218 5635086 + 56773|0 205
AAGATCG--------------------------------------------GCGGATCAAGATGAGAAG-----TAGTGCAATTTGTTTGTTAAACAAGAAACCA------TCAACTATATTGTGTTGTATTTTGTGTTAGCTGCTAAGTTGATTACGAGAAATGTTGCCAAATTTAATTTTATGCTTCGCGCATCAGTCAGTATC
GCGCCAGCAGCTGTCCCCTCTCCCCCACCAGTGCCACCAATTCCCCGTGGTGCGAGTGAAGGGTCGTCGTCTTTTAGTGCAATTTG-TTATTAATCAAAAAAAAAATATATTGAACTATCTATTG-TGTATTTTGTGTTAGCCAATAAGTTCATTATGAGAAATGTTGCCAAATTTAATTTTATGCTTTGCGCATCAGTCAGTATC
>CG12924 5350246 5350455|4668 chr2R 5350446 5351196 scaffold_11 1278641 1279377 - 18193|0 9
TGTATAGCTT
AGTAAAAGTT
>CG1599 5352887 5353006|4669 chr2R 5351599 5353867 scaffold_11 1280044 1282393 - 75022|1401 1522
GACAA-GCTTTAAAGTTGTTTATATTGTTATAGGCTCATAACACATGTATATTTGCATATAAAACTCT-ACAGTACTCTCATCTATGTTCTATGTAATAAACTTCAATGTATACCGGATAAA
GGCGACGCGATGCGAAAGTTCGAATTGTTATAG-TTCATAGCG-ATGTTTATTTACATATTTAACTTTCGTACTATCATAATCTCTGTTATATTTAATAAAAATGAATGTATAAAGTATA--
>Orc6 5357253 5357377|4671 chr2R 5357268 5358211 scaffold_11 1284362 1285315 - 28034|0 121
GCATTTATATTTTACATCTTTA-AACATTTCCTAGTGAAATC---CAGTTTGAATTAATTACTTATTATA-------TAACTTAT-TTATTAAACTGAACATTCTTATTAGTTTTAAGTAAA
TGATATGAAATATCAATCTTAGCGATAATTACCACTTGGCTTTGGCACTTTGGCTTAGATATATTTTATACTTCACGTAACATATGCCCTTACATTTAACATT-------ATTCTAAGTAAA
>Prosalpha7 5358440 5358543|4672 chr2R 5358409 5362448 scaffold_11 1285746 1289720 - 132787|31 135
TTCGTTTGTGTGCCAGTGAATCTAATTCTGGGCCTCATACATAATGTTAATTTTATATTTCCCTAAAG-CGCAAAATGAATAAACAAAATCGGGTGAAATTTAAG
TTGAAATATGTTCATCTGATTCTAAATC--GGCTT--TATATAAT----ATTTTATAATTCGCAAATGTCATAAAATACAGAAAC--GATTTTGCACAATTTAAA
>CG1516 5362521 5362949|4673 chr2R 5362941 5364320 scaffold_11 1289820 1291192 - 64399|0 8
ACAGTGCCA
TAAATACAA
>cbx 5376321 5376402|4685 chr2R 5375824 5377345 scaffold_11 1316808 1318376 - 48124|514 614
-ACCAATATACATATATTCTGTAAGTTATATTCTATCGTTGTCTCAATTTTAAAACGATTAAAGTTATTC-------------------AATTATTTACAA
TAACAATATATATATGC---GTAATGTACATAGTAT-GTTCTCTCAATAACAAAATCATTAAATTTATTCTCAGTTTGACAAGTGCGGAAATTTTATGCGC
>CG1472 5388712 5388938|4697 chr2R 5388201 5388729 scaffold_529 1020 1630 + 6392|624 641
GTGCATGTATTTATTTAT
GTGCATATATTTATTTAT
>CG1472 5388712 5388938|4698 chr2R 5388730 5391816 scaffold_529 1798 4869 + 145553|0 263
TATATAAGCAGGATATCCTACCACTATTGTATGCAGCATAAATACGAGTTTCTAAGAACCTAAA----------------------------AACTCAGACTCTGGTGACTAGAAG-------CACGAAGCGA---ATGCAGGTGACACTGGTGC-----GAAACAATGGAGACCAG-TTCGGGACAGACATACACTTGATACACCTTAACCACC-----------CATCCCCTACCCACTCTCTCGGCTTAGGTAATTTTAAA
TACATAAGTCGAAAATCCTACTACTATTGTATGCAACATAATTACGAGTTTATCCGAACTTAAAAAGAAAAACTAAACAAAAAAGTAAATTTAACAAAAACTCTGCTGACTAAAAGGTAGACAGACAAGCCGGGCCAGGCAGGAGGAGTTGCTGCAGCCAGCTCTGATTCACATTAGATACGCATCATATGTTCATAAAATCCCCCACCACCACCACCACAACCAGCACCCCCTCCCCACTCCACGAAACAAAGATATGTAAAA
>CG1441 5410807 5411007|4715 chr2R 5410453 5410843 scaffold_11 2359331 2359760 - -3353|409 448
AATTGGTTTATGTATGGCGACGA---ATTTTAAAGGGTAT
AAT---GTTGCAAATGGAAGTGGTTCTTTTCCTCGAGCGT
>CG1441 5410807 5411007|4716 chr2R 5410844 5412765 scaffold_4 6205446 6207359 - 85328|0 189
AACCCGTCCGGATGGAACGCCTATTTAAGTGCTGGAAACCAAAAGATGTGCCCTGCC-----CCAAGCCGTAGCTGTTATGTTTGCTCTAGGATCTAAGT-TTTCTAGTTTTAGGAGGTGCTG-TTGGATGATAAGTACTTTACTTG-------------------TTATGAAAAGCAGCTAATAAAAAA
ACACCGTTC-CCTGTTAAGTTTAGTTAAGTGCTCGAGACCAAAACTGCTCCCCAGCCGTTCGTTATGCCGTATTTGTTACGTTTTGTTATGTCTTTAAGTCTTTTTTATTTTAGTTGGTGCTGATTAGCTGTCAA--AATCTATTTGTAAATGTTTAGCAATAAGTTTTCAAAATGCAGCAAATAAAACA
>Mef2 5425308 5428558|4727 chr2R 5423176 5425630 scaffold_4 6220296 6222857 - 125886|2236 2623
CACCTACATAAGTGTAT-----CCATCGATGTGT--CTGTTCTAATAACCATATACAACTAAATCGTAACTCTAA---------GCTAATGACAT-----------GCAACCGTTTTGGTGAAAAACAA--------------------GATAGTACATT------------------ATACATAAATGCATATATATGTGAAACTATATAATGAGAAACATGTTTTATCCGTGCACTGAATATGAAAGGTTTTCGAAATTGACAAATTGATTGTGGATTCAATATTTACCTATTAAGTTGGTGTTTTAAACAGAAAAACAAAAAAACGAGAACAAAACCGAACAAATGACAGTAGAACATTTTAAATAAAACCTTTTTGGCAACTGA
CACATATATATATATATAATAACCATCGATGTATTTCTGTTCAAATAACT---TACAACTGAATCGTAAGTGTAATTACGTTTAGGCAAAAACAGCAAAAAGTTTAGTTACCATTTTGGTGAAAAACAATTGATGTTTTTCAACTAACTAATGATAAATTCAATGAATAATAATAATAATATATATATATATATATATATTATACTATTTAA------ACAAGTTTTATCCGTGCACTGAATATGAAAGGTTTT-------GAAAAATTGATTGTGGAATAAACATTTACCTATTAAGTTGATGTTTTAAACA--AAAGTAGAAACTTTTAAATAAAACAAAAAAAA-----------------------AACCTTTTTGGCAACTGA
>Mef2 5425308 5428558|4728 chr2R 5425811 5426490 scaffold_4 6223481 6224250 - 8920|0 803
TTTCATATGATTTGCAA--AACCTTTCGGATTCTCCCATATCTATCATTTTCATTAGGACCTCGTTCTGTTTATGTACATAGAT-CCTGCTAAAC--AACTTCACTGTGTAGTGT--TGCCTTAAAAACAGTGCCTCTTTTTGATGAACAAACAG-----------ATACATGAAGATATAACTGAATGTTGTACCAATGTTGATTGCAAATGATAATG---------------ATAACGAACAACTTGATGGTGAAAAAT--TTCAATACAGGTGTTAATTGTGCTATTTAAG-----------------------TAAGCGTAGATAAATCTGGTAACTGATATTAACCT---AAATCAATCCTAGTGAAATCC------------CGAGAGAGATAACCTCCAC---TGAGCAGCACGTAATGTACAAAGGGGCGTTTCGATTGGCATTGCATGAGGAAGGCTTACCCAGAAAGAAACCCATATATGTAGTCT--AGTTAAATAAAAGATGGAGTATATATATTGCTAGGAGTTTATATTTGAATATA------------------------------TTCGATCGACGCACTGTACAGTTGACTGTCTAAAGGACG-TCCTACGGTCACAGGGACCAC----------TCACAGCACGGAAGTAATCCAAAGGTCGGGATCTGCACACAGATCGTCCAGAGTGTAAATTCGTATTCGCTGTACCTTTAGGATATA-----ACCTAGAAAAAATTATGTTACACCTACGCACTGTTGTAATGAATGAAATTTATGTGGCAC
TTTTATATAATTTGCAATGAACTTTTCCAAATTTCACCTAGATTTGGTTCT--TTAACAATTT-TCATTTAAATGTAAATAAAAACCTGGTAACTGAAACTTCACTCTGTAGTGTGTTGCCTTAAAAACAGTGCCTCTTA--AATGAACAAAAAATATATATATATATATATAAACGTAAACGTAAATGTTGAACAGCGATCACTTGC---TGAAAATGTAACCAAGAAAATATAAAACAGAAAACTTGATGGTGAAAAATATTTCAATACAGGTGTTAATTGTGCTATTTAAAAAAAAAAAGAATGTAGTTAATGCAAAACGTAAACAAATT---GAATTAAAACTAAGCTTTAAAATTAA----AATGAAATTTATGTAACTTGAACAAAATGGATGACTCAAGCAGGCGAGCAGCACATCATGTACAAAAAACCA--ACAGATAAAATT-CATAA-------TTGGCTAAAATTTAATTGGCATATAAAATTTTGAATACTTTAAGAGATCAAACATATATACACACAAATATATATATATATATATATATATATACGATAATTATACTACGATGAGGTCGGAGCCGTGCACTATATAGCTGGCCGTCTAGCAGGCGATTTTATGGTCACAGGGACCACAACATAACAAAAAGAATAAGTAAATAAAAAAAAAAGGGGGGAATGGAATGATATATGTATATGTGTAAACTGGTTCTCGAGATAGAT---GAATATGTTTGTATTTAGTATAAA--ATGTTAAAAGTATGCACTGTTGT----GTGGAGATCTATGTGGCAC
>Mef2 5425308 5428558|4729 chr2R 5426841 5427752 scaffold_4 6226520 6227637 - 13700|0 1157
ATGTACTCAG------------------TGTTCTATCATAATTTGTAATTCTGTGC---AATTTATTGTCAATTTTTAGTTGTCTTTTATCTA----TCTATGCACACGCTCTAC---TGAGATTCTGGAGTTCATCATGGAACCA----AAAACGTTTTTTGATGG------TTGGCCTAATT----------------------GATTTGAGCCGAGATCACAGCCTTG-------------TGCAAGCAAGGCATACACACTTATGGTTTAA-------------------------TTTAGTTCCGATTTAAGCGA-------------TTATTTAATAGACACTTT----TCTCTTCATCTCTTAAGCGAAACGAAGTCATAATTTGTAATTTAAATTTAAAGTGGA--TTTCTATTCAATTTGAAGTGT----TTCAAATTCTTGTGCCTAAG------TTTTGTATTTT------------TTACA--TTTAAATGCAGTTTGTAAAACAACAACAATCGCAACAGCAACAACAAC-TCA------------------------ACAAAATATAATTTAAATAAAATTATTCGAAGCAA---------TTTTTCGTTGTCGTTGACAGTTTTATTTGATTAGTCCATATCTTTATTTGCTCTCTGTACATTTCACATTTCACTCGGCCATATATTTAAACAGGCCATATTAAACAG-TGGGCGTGTCTGCGCCTGTGTCAATGTCAATTGCCCATTTCGAAATTGCCAATATTTGG----------------------CTAAGGGGTAAACGCGC-CCGCCAATATTTGCACTG--GCCACATGACCTGTTGCACTTTATACAGC---------AGCGCGAAAAGGCGCAAACAAAA-------------------ACAAAAAAGAGTAAAATATTTTATGTA-------TATTTGTATTTGTATTTGTATTCGATATAGGGCTGCATCAGCTGTGCATATTTGAATAGAGAACGTGAAAATGCAGGTGCATGCAGGTGCAGCCGGCGGCAAGCATTAACAATAAGCAAACACACACTCTACAGGTTTCCCC---------ATTGAACAAGCTTTACAACACCTACA-TATTTAAGCAGATTGTACAGATT
ATGTACTCAAAAACATGTTGCACAGAAATCTATTTTTTTTATCTATAATTTCGTTTCCTAATTGAAGTGCAATTTATGATTATGATTAAACCAGTTTTTCACACACACACGCAACGCTTGGCAAAATGCAATTGATTAAATAAATATATAAATATTTTATTTAATGCAACGACTCAGTTTAATTTTAGTTTTAAAATATAATTTATAATTTAAATGTATGTCTAAGTCTTGGTGGGAGCGTGTGCGTGAGTAAAAAAAAAAGAAAATTGATTTAAATATTAATTCATTGTAATTGTAATTTTTTTTTTTGGTTTAAGCAACGCGTCTCCTCCCTTATTTGATAGACTTTATATATTCTCTTTCATTTCTAAGCAAAACGAAGTCATAATTTGTAA-TTAACTTAAACGTGAATTTTTCTGTTCGATTTGAAGCGTTCGATTCAAATTGTTGAGCCTTAAGTTACTTTTTGTATTTTTACATTTACGAATTACAATTTCAAATGCAGTTTGTGAAACATCAATAACAACAACAACAACAACAACATCAACAACTACAACAAAAACTCAAAACACAAAATATAATTTAAATAAAATGATTATAAACAATTTCAGTTGCTGTTTATTGGTTTTTCCTCTTTTGTTTTATTTTT---TGTTTTTGTTTTCTTTCTTATTGTTTAAA----CAGCTAGCAGTAAATGTGTAC--------CTAACTAGGTGGGCGTGGCTG------TGTAAATGTCAATTGCCCATTTT----TTGTTTTTATTTAAATAAATGCATAAATATACGCACTTAAAAGGTAAACGCGCTCTGTAAATATTTGCGCTAATACAATATGACCTGTTGCACTTTATACATCCAATTGTAAAAATCGAAAACAAACAAAAAAAAAAAAAACAAGAAAAATGTGAAAAAAAAAAATTAAAAACCATATGCAAATACTTTAACAGTACTTCTATTTGTATGCTGTGTA---CTGTAACAGCTGTGCATACTT---TATATAGCGCGAAATTAACGATCC--GAATGCACAACAAATG---AACACAAACAATAAAC--ATTTACACTTTACAGGTTTCCCAAAGATGAAGAACAAACAAGCTTTAC-ATATATACAGTATGTCAATAAAGTGTTTTGACT
>Mef2 5425308 5428558|4730 chr2R 5427753 5428046 scaffold_4 6227739 6227999 - 1482|0 327
TGTTAGAGTGT--TGAGCTGATTTAGTTTAGTTACAATTACAAATACAGTTACGAGTACGGTTAAAGTTAATGTTAAATCTAATCTTAGGAATGAAATCATGCAGACAAACAAAAAGCAAAAAACAAAAAACAAAACGGACGCGATTGATGGAAGAGCTCTTTATG-CTGTACATATTTG---ATTTTAGTGTCATAAGTTTT---------------------AAACTTAGTTCGTAGGT-------AACTACGAGATACGTAAACCATGCAAGTCATACGATGAAACGATTGAGAAACTCTAAGCAAAACACAGACCCTCATGCAG
TGTTAGCGTGTGTTGAGCTGATTTAGTTTAATT-----------------------------------------------CAATTT----AATGTTAACTTTAAGTCAACAACAACAACAAAAACAACACACACACAACATGCG----------------TTTATGTTTGTACATATACACACATTTTGGTTCAATAAGTTCTGAAGCTGCAAAAAAAAAAGAAGAAATTGAATTATAAATTAATTAAAATTAAAAGATACGTAATGCATGCAAGTCATATGATATGATATATAAGATATATATATATATATATATATAACTATGAGG
>Mef2 5425308 5428558|4731 chr2R 5428089 5428328 scaffold_4 6228171 6228499 - 6359|0 328
CGGCTACGACTGCTATGGCCAGCAACTGGCGGTGGCCTACG---------------------------GAGCGCAGCAGCATCCGTAGCCCCCGCGTC------------CTCCGTTTCCGGACCAGTGCAATAGTTGAGAG-AGGAAACAGGAGGC----AGTTTTGTT-TTGTTTTCGGA--TTAAGCGAA-----CAGTGACAGTGTCATATCTATAGTTATTG--TAACTTAAAT-----------------------------------GAATTACGATTACAGACCTACGGTAATAGTTATAATTTTAAATTATATACGCAGA
CGGCTACGACTGCTTTAACCAGCAGCTGGCCGTGGGCTATGCTCCAGAGCAACATCAGGCGCAGTAGCGAAAACAGCAGCAACAGCAACAGCAGCAGCAGGAGAGCACATTAACGTTTCCAGAGCCGTGCAATAGTTTTGAGTAGTCAGCTGGAAGCGACAAGTTTTGTTATTGGTTTTAAGTTTTAAGCGAAAAAACAAGTGACAGTGTCATATCTACAATTATTGTCTAACTTATAGTTACATATATATATACACACACACACATATATATATAAAAACGTATATGTATGTGTGGTAATAGTTATAATTTTAAATTAACTATACAGA
>Mef2 5425308 5428558|4732 chr2R 5428362 5429156 scaffold_4 6228539 6229312 - 15538|0 223
CCGGCACGAGCTGCTGGTAGCAGCCACTACAAGCCACATCACAACAACAACACCGGCTGCAGCAGCATCAACGGCAGCAACACCAGCTGCAGCACCAACAACACCATCACCAGCAGCAGCAACAGTAGCAGCAGCAGCAACAAGAAGCCGGC--------------------------GGAGTGCG-ACGACCTGGTCATGATGCCGCCACCGCCTCGTAAGGA
CCGGCACGTGGCGCTGCTTTAAGCAACTATAAGCTACA--GCCACAACAACATCAACAACAACAACAACAACAACAGCAACATCA----------------------------------------------CAACAGCAACAAGAAGCCAGTTAGCAATAGCAACAACAACAACAACAGCAGCGAGAATGATCTGGTCATGATGCCGCCGCCGCCGCGCAAAGA
>Mef2 5430947 5431236|4736 chr2R 5430759 5432028 scaffold_4 6231922 6233440 - 28630|257 633
TACAGTGTCTCGCGCCGGCTGCACACACATTTCTATCTA--TCTATCGTTGGTTCTGTTTTATGTTTT----------TTTCTGG--ATTTGTTGC-CTTAGTTTCTTTCTCTCTGATTTGATTTGAACTGAACTGACCTGATTGCATGCTTGCTCGAAACTCTAACTAACTCTAACTCTTTAACCGTGCTTTTGTTTTTTTTTCTGATATTTAATTTCTGATTTCCCTAACCCACTCACC---------------------GCCATCTAACCAA------------------GTTGCGTGCG---------------------AAGTTCTGTATACCATATACA------------CGGAGATATATATATATATA
TACAGTGTCT-----CGGGTGCACA---ATTTTCATTTATTTCTATTTCTGTTGCTGTTTCACGTTTTGAGTTAAACGTTACTCGCTACTCGCTACTCGTTATTCGTTACTCGTTAAT---ATTTAATCGTTACTCG-TTAATCGC-----TACTCGCTACTC--GCTAATACGTATTATAT-----TGTTTCTGTTTTGTGACTTG-TATTTTGTTTTTCTTACACCAGACCCCCCTTCCCTCGTTTTGAGGAGCAGTTTAACTATTTAATTAACCTTTCAACTCGTTACTTATTGCATGCACAACTCGTCGTTTAGGCAGCTAATTTCGATTTAACA-ATACAGTCTCGACTATTTGGGAATTTCTAACTTTATC
>CG1418 5475657 5475842|4788 chr2R 5475590 5477949 scaffold_4 5581331 5583696 + 11510|67 253
CCGCC-AGCCAGAAGCTAAACCCTAGGTCTTCTGGGATCGTGGCAACCAGGGACGAGGAAAGGGGCTAAACATATTCGCCACTATGGGGCCTTGCAAGTCGACACAATATGTTGTACACCTATTTATAACGAAATCTAGTTAAGCCGCAGACTTTAAATAATCGAAATACACACTATGACAGATTCA
TTGACGAGCCTCCTACCGAAACTGAG--CATGTAGAATCTTA--AATCTGTAGCAAGT--------------TAATTGCCGCACAGGGGCCTTATTAGACAATAAGTTGCAATATATATATATTTATATCGAAACCGACTT--GTAATTAAGTTTTATCAATCA-----------------------
>Pka-R2 5507617 5508303|4821 chr2R 5507625 5509055 scaffold_50 388307 390068 + 12502|0 806
AAAGTCTGAACAATCAACCA-ACCAACAA-----------------------AACAACCAACCAAGCAACCAAGC-----------------------AACCAACAACAACCACCACCATCAACAGCTAG-----------------AACACACGGCAACTGAAAGTGAAAGGTCACTTGCAGGCTTCTTAGGATTTTAATTTG---TAACCATGTTTCTTTCTAA------TTGAGCAACTCTACGGACAGCAGATAAGAGCAGATCACAAGCCACAGCAATGCACA--------------AATACCAAACAAAACA---CAAGGACACAAAATCATTTAAACTTAATC-ATGAATA-ATTGATAATTGAAATTAATCTATAATACTACGATAATAATGATTATGATGATGATGAGATAGTGTTGATCATGTTGGGAAGAAGCTTCGCCATGTTTCTTATCCAAAACAGAAAAGCAAGCAAGCTGGCGAGT----TAAGCAAGAATTGTATTGTATGTATTTAGCAATTGTAATTTGT---AATGTATTTAATTCGGCAAAACTGAATTCAAATGCAATCAGCAAAGAGAAGCAACAACAAACGATTGGCTCAACGGAAAT----GTTAAAAATACTAATTTAAGT-TTTGTTTAT------TCATAACTTTTTGTTATCCAT----------TGATTTATTCATAATTTAGAAAATAAC-----GCAATCACTTGTTTCATTGGCTGCTAGTTACTGATAAGCG---AAAAGTAAGCAAAATATATCAAATAAGAGCAAATAGAA
AAAGTCTGAACAACAAACCACAACAACAACAGCAACAAGCAGCAGCTATAACAACAAACACAACAACAACCAGGCTAATGGGTTTTGAATGGACTCTGCAACAACAACAACAACAAATAACAACAACAAGCGCAAACCAAACACACACACACACACAAACAGACAGACACATATACCCTATATATAAATAAAAGTAAAAACTTGTTTTAATTATGTTTTAAGCTGAGGCTGGTTAATGAAATACACAAACAAT-GATAA----AGATAATACGCTAATGCTAATGATAATGATAATGATGATAATGATAATCATAATGAGTTGAGCACACAAAAACA--CAAATATATTCTATGTATGTATTAGCAATTGTATTT------TTAAACTATTATTATTATTATTATTATGATACTAATTTGTTATCGCTTGATTTACGCATAA-------------TTTAGCACAATATATAGCAGCAAAGAAGAAGAAGAATACCATAAAAAAAACTCGTTTTTTG---ACTTTGCGAGTCGCATATATATAAATAAAAATATTTATATATATATATATATAGACATATATATCAAATAAGCGCAAATGGAAACACATCAAGCAAAAGAGTTTATATCTAAAAATACAAATCTAAATACTTATATATATAAAGTGAAAACCCACACATATGCATAAAACAAATCTAATTTATTTATAAAATAAAGTAAAACAAAAAAAAACCAATCATTGTACTAGTCTATATATATATATATATGTAAAAAATTGCTTTAAAAACAAAAAAGAAAAGCAAACGTAA
>CG1407 5540249 5540731|4860 chr2R 5538645 5544456 scaffold_50 312268 318617 - 104148|1645 2250
CTAATCATGACCAGCGACAATGTAGCTACATATTACATTTAGAGATTCAGTTGTGAAGCCTCCTT------ACGACATACATATACTTT------------CAGTGTGTAAATA-ACAGAGGTACAGACAGTCCATCCTATAGGGACAACTAGGTT-----------ATTATGTTTAAGTTACGAATGAGTCGATAG----ACAATTGTAATGTA-------------TATGTATGTAAGTGATAATG--CGAAAAATGTTAGGAGATCAAAATCTTAATTCTTGCTTGG--------------------ACATTCGA-----------------GTTTGAAATTTAAAATCGTA------------TTAATTTAGTGTGTAAGGATAAAGTTATTAGAACATTTCGAACAAAA-------GTATATGTC--------TATATAGGAATATAGCTCGTTATAGCTCGCGTCAACAAAAAACAAAATAGTATACACGCTTAG--TGGAATA--ACAAGAAAATCAAAAGCGAAACTTTAAGCAACACATACGGATCTGTATAT-TTACAAAAA-----TAAAATTCCAACTATTCCCATTAATCGAA
CTAATAATGACTGGCGATAATGTGGCCACGTATTACATATAGAGTTTTAAAT---AAGCCAGCCTTTGGCCACGGCACGCGTCTAGTCTATAGGGGGTATACAATATATAAATCTATACATATATATATATTTTGTACTAGTTTGTATATTAAGTTTAATGAGAAACATTATTGTTAAATTGTA-------CGATAGGCGCACCATTGTTATCAAATTCTTTGTGTCTTATGCTTGACAGTGCAAGTGACTGAATAATGCCTATAAAATGCCTATGTAGTTGCTTCTCGGCATAAATCAAACGCTGCCACACATTCCGACACAGATTCGCGTATTGTATAAAACCCAATATCGGAAAACAATATTTCGTAAATTTGTTTGTCTAGATTATTAAGTGAAAATGTTACGAACAAAATATGCGGGTAGATATCGCAACTAATATACCAATATACAGAGCATTGCCA-TGTCATCTACATATAGTACATATATATATATATTAAGCGTGGAGCAGTACAATATAGTTAATATAGTAA----AAATCAAACAGAAAAA---GTATATACTATAAGAACTAACTAAAATCGAGAGCATCTC----AATCGAA
>CG1407 5541074 5541617|4860 chr2R 5538645 5544456 scaffold_50 312268 318617 - 104148|2726 3379
ATAATAACGTAGAATGTATTATGTGTATGTTTTTGTACCATAGAGCCAAGTAA-----ACTGCCAGATTTGTCAGCGTTGCGGTT-----------------CTTAGTAAGCAAATAAGTTACCTCTATGCAATTCATCAGCTGTTTAGTGTAGGCTATTTAAATGTTTAAATGGCTGGGACCAT----AATATAAATCACCACATATGTATAATCGACTA---------------AGTTAACATTAGGCAATATGTCATTGGTTTCACACACGCATTTATCGAATTTTTTAATGGAAATTAGAAGAATCGAATG-TGGAATTTCCTAGTAGATGAGATGGTGTTATCCTCCGAAGATTTGTACCTTGCTAATGCATTCATGAAACCAA---------CTATCCTTGTAGATATCGAAAGATCTTCAAGACTTAAACCTAATGATAAGCA------------ATGAGATTTCAGTACACACTATTA----ACACACACG---GAATTCAG---------------TAATTTCCATATGGTTTTAATTTATGTAGTTAGTAACTGTTTGCAAGTTTTT---ATACTTTTTCTTACTTTGTACACCTTAATGCCCAAATACATA------------------TATTAT----TGAA
TTAATATACTCGTAAGTTTTATGAATGGAT---------ATAGTGTGAGATAATTGTAAATGTAAAATGTATAACAGTTGTTTTTACCTGTAGCTCGGCTTGCCCAGTTTCCCACTGACT---CTGTATGCAAGAATGCAAATGT-----GTTATCTATACATATATCAATTTGAATGAGACTATCATAAATATATATATATATATACATATATTTCATTAGGAGTATGGATAAAAAGCAAATACTAAATGTAAGCTACTTGTTTTTATACAGTCAATTTGTAAGC-----AATGGCCAGTTTATACATCTATCGATGGCAATATCAAGCAATATCATTAGCAATAACTGTTGAACTCTTAAATATTGGTCAATTAGCATTTAAACACAGCTCGTGTCCCATTGTTTTAACGGTCATGAGA-CTTTAATACCAAAACA-AACGAAAATCATTTTTAGTTAGGATCATATCCGAACACAGCCCATAATAATACACAAACGAATGAATTTGAAATTGTAACGCATTTTGATGCTTTTATAATTCTAAATAACGTAGTTAGT--TTGGTTTCAAGTTTATTGCAAGTTTCTTTCTATTTTGCGCTTCTTCATTTTTTTTTAGATAGTTCGCTAGTTTTTAATTTTTTATACGACAAA
>CG18445 5547576 5548756|4863 chr2R 5547230 5548128 scaffold_34 430243 431248 - 2560|370 1071
TCGAAAACTAATCCATATATATGTAAAAGCCTGCATATGTTAAAATGTTTACCATATAGTCTATGTGCGAACTAAAAA--AAATTTTTCAGTATCATTACTATTGTAGTTCAAATCCCGCCCGAAGGAACAACAACGTGACAAGTAGAACCAATGTTATCATCTTCAATTTAAAAACAAAAGCC--------TAAACA-------AAAGTCAACCAAATCCTAACTTTAGACTG-AAGCTATT--GACATTTACTAAGC---AAACAAA-----------------AAGCAGAACGTGCGTAGATAAAGTTAGTTAGTAAG---------CCGTCAAGTTGATTTTGATATTATATTTAAACCAATTCTTGTACAAGTGCGTA-----------------AGA-----------------GTGTCTGGACAGGAG---------------TACCGGCATGCTCCACATTTGTATATCCTTTCCAAACCGGC-CTATTAGCTGGCTCTTTTTGTACATGTTCGTGTCCT----------CCACTTGTGGCTTCCTACTCCGTAGCTCTTAAGCA-----TGCTCTTTATATAACCTT--TTTGTTTTACCCATTAA---TTTGTTAAACCCAATAAATG-----------------------------ATTTTTCCCGAAATCCTTACACGTA-ATCGATATA
TTAAGAATTCTTCCA---ATATGTACAA-------TTTGTTTACATGTTTACCATATAGTCTATGTATG---TAAAAGTCCAATTATGCAGGCCGGCTAACTTTGAAA--CATATT-------AACGAACGCAAAC--TGCAAATGGCACCAAGA--AATATCCTCAA--CAAAAACAAAAGTAAATGCTGGTAAATATCACGTTAAACTCAACCAAAACTCAACTTTAGACTGAAAGCTATTTGAAAATTGAATACACTAAAAACAAAATATGAAACGAGAAAACAAACGAAACACGCGTAGTTCAACTTATTTAATAAGAATAATTTTATATCGGTTCGATATTATTGTCATATATATATATATATATATATATATATATATATATATTTCTCTCTCCAGAATTGTGTATGTATGCATGTGTGTGTACGAAAGACGAGGCTGAGCATTTAGCCACATTTATGATCTTTGTACTCCTCTACTTCCCCGGCAATGTTGGCTGGAATTTTGT----ATGTTTATATTTCAATTTGAAAACCAACTCCAGCTCCTT--TTTGTAG--CTTAAGCACAATTTACTCCTACTATAAATGTAGTTTGTTTAAACCATTTATTGTTTATTAAAAAAAAAGAAAGAAAAGAACATATAACCATCACACGCGTATATATATATGTAAGTATATATACATATATATGTATA
>CG18445 5547576 5548756|4864 chr2R 5548574 5549615 scaffold_34 431919 433071 - 30151|0 227
TA---------------GCATTGGCCAGC--AAGTGTGAGGAGATCGAACAA--------AACAACGA--GGACGAGGGTGGAACGGCAGGGATTGGAGGCAGTCAGGGGCC-------AAAATG----GGTGCTCCATATCTGATTGATTGA-----TTAATATATACACTGCGAGAATTATCCAATGCGCACACGAT-ATTCGCACACTC-CAAACAATTGCAACA
AAAGTCGGAGCGGGAGCGGAGTGGCCGGTAGAAACCAAAAGAGAATGAAAAGGCAGCTGCAACAACAACTGGACAATTGAGACACGGCTGGGATTGATGTGGATGAGAGGTTTGGCAGGGAAATGACACGGAGAACCAGGTGCTGTGGGCTAACAGCTTAAACACACACAC-ACACTCACACTCACACGCACACACACTCAAACGCACACGCACACAAAACTGCAAAA
>CG12918 5562675 5562835|4873 chr2R 5562312 5563254 scaffold_4 161499 162508 + 21565|465 662
TTTGTCCCAGTGAAA-GCTTAGTTAATTAACGAA-TTTCCTTGAT-----------------CGCCGCCAGTGGAGGTCTTTGTACTGATATTTCGAACGAAAATTATGTTTAGCTAATGTAAAGAAAACCATGCCAAGTGTTACAAATTATGTACGACAATAAAT------------------TCCATGTGCAATGT
T---TCCTAGTCAAATGAGATGTAAGCAAACGAATTTTCCATGATCATCATTGTTATTAAAGCGCCTGCAGCAGGCGGCTC----CTTGTGTACTGAACGAAAATTTTA-------ATTTTAAACGCACCAACGACAAACAGTTTAAA------ACGACAATAAATACGAGATGTGCAATTCCCTCCACATGAAAACT
>CG2292 5575192 5575556|4888 chr2R 5575072 5575246 scaffold_14 382302 382453 - 642|126 180
ATTTAAAACACTTTTGATAGTTAAAAATAAATTGTAAACTAATCATATTAAAGAA
ATTGAGTGCAGTTC----------------GTTGTGAATTATTAATATTAAATCA
>CG2292 5575192 5575556|4889 chr2R 5575331 5575405 scaffold_11 2034155 2034237 - 494|0 85
GATCGATTTCATGGACATCCAAATCTGAACTTATAAGGAAGACAA-----------ATACTTATTTGAAAACAAGACAATTTTTTA
AATATATTTAAGCAACTTACAAA---AAACTTCCAGGGAGGTCCATATATGCATGTATATTTTTATAATTGTCAAACAAATATTTA
>CG2292 5575192 5575556|4890 chr2R 5575406 5575730 scaffold_4 173828 174170 + 5299|0 158
TCCTAT-------AACCGATTTGACAAACATTCGAGCTAAGCTTAAACATTTATGTTCGATAATATTTACAACACTAATTAAGAATTAGTAACATACACATGTAAATTATAGAATCTA-ATGCTAGGAATGTGTCTGCGTGTAGGTGAGGGTCAGGGTG
ATCAGTCTGAATAAACATATTCAGTATACATTACAATTAAGCT-AGACATTTATATTTAGTAATATTTACAACACTAATT-----------ACATAAACATGTAAATCGTAGAATCTATACGCTAGGAATGTGAGTGTGTGTGTGTGTGGGTGAGAGTG
>cdc2rk 5579030 5579048|4893 chr2R 5579046 5585189 scaffold_4 747000 753213 - 205836|0 2
ATG
ATG
>CG1371 5582784 5583023|4893 chr2R 5579046 5585189 scaffold_4 747000 753213 - 205836|4107 4402
TTCCGACTGATAGTCGCATTAGTTGTTCAATTTAGTCACATTTCGAGGTATTCGCGGTAGGTATT-------CATTTGGTTTTTGTTTCTGT-------------------GAGATT------TTGTTTAACCCTTTTTAATTTG---AATTGCATTT--------AAGAAAACGTTGTAATTTTTCACTTTCCATACATAGATTGAGGCAAGTTTATT-TGTG----------TTCGTTATCCACTCTTATAGCTAAAATAAATAA--ATACAATTAAATAGATTAATTAGACAA
TCCAGTCCAG-----GCCTAAG------ACTTTAGTCACCATC---GGTATT--CGGTAATTGTTTTCTTTCTATTTAGTTTTTCTTTTTACTCTTTCCTTGCTGAAGTAGGAGATTTGCGCCTTGAGTGAAAATTAAGCATTTGTTTAATTGCATTTTCCGGAACAAATAATCGTATAAATGTTTTGTTT------AATAG-CTGAGGCAAGTTTATTATGTGCATGTTTAGTTTCATTCATCACTCTTATAGCTAAAATAAATAATTAAATAAATAAATAAATACACGGCCCTA
>sut4 5597253 5597441|4907 chr2R 5597183 5597587 scaffold_1 6174504 6174849 + 598|70 270
TACTTGCAATCTTTTGATATCATCAGGGATTCAAGTCTATGGATCTCTGACCAAAC--TTTTGATAAATTTTCGTGGAATTGGAACTGAATATTTGTACCGTCAAATGCAATCAAATGCATTTAAATTTATGTCTTAACATTTTT--CTACATGATGTTATTATGAATAAAATGCCACCTCTTGAC--------ATTTTAA
-------GGTATCTGAATATTAT----------AATCTTTATATATTCGACTGATCCGCTTCAACAATTGATCATG---------CTAATCAATTGGTCGGTCAGCTATGTGAGAGTATACAGATATTTA----TTAATATATTCGATTTTAAGAAAGTAATACCATTAAA----CACCTCCTATCGCAGAGCAATTTTAC
>CG1381 5610329 5610403|4925 chr2R 5608949 5610382 scaffold_4 4786921 4788549 - 31819|1642 1695
AATTTTTTTATGTATATATCAAGTGCAGAAAATATACGTATATTTTAAAAGTAC
AATTTTGTTCTTTAGATATT-------GTAAATATATATATAT-----------
>CG1381 5610329 5610403|4926 chr2R 5610383 5611398 scaffold_4 4792234 4793246 - 42772|0 20
ATAAGTTTAAGGCGTAGAAAT
ATATTTCAAA----TAGAAAT
>CCS 5633299 5633430|4954 chr2R 5632202 5633640 scaffold_1 1343965 1345654 - 29651|1374 1526
AC---TTGTTTCCATCTTTAATCTTGTAAATAAAATTATCTTATCTCT---AGGTGTCACTTTCCACATTTTGTTCTAGAAGTTTCTGTCGCG-ACAAAGTCCACAGA-ACATCAA-----TTCTCGTTCCGCAATTAAAAT--------TAG
ACCACTGACTTGTATATCGGCTTTTATTAT--AACCGCTTTTAACTCTGTTAGGTGGCAACGCTGTCATTTTTTTC---AAGTTTGTGTTCCGCACAACATTTACAAACGCACCGAAATATTGTTTGTTTTTCAATAGGAATAATTTTTATCG
>KCNQ 5657706 5657887|4982 chr2R 5657164 5657865 scaffold_4 1597052 1597878 - 12491|613 838
AAAGTAGCCATTACAT-TATCACTAGAATTATATATTATATACTATGGAATGCATATTAATGTCATTTTGGGACATCATTTGTGTTCAAT-TAATTGGTAGCAAACA--------AATGAAAATCAAACTAAATAAATCTGTTTTAGC--------------------------------------------------------AGCAAATCTTACATTACCGAAA
AAAATAGCAGCTAGTTATATCTATAATGTTATATAACATACATTACATTATGTATGTCAAT----TTTAACGACATATTTTGTGTTCAAAATTATGGGTAGCAACTACTTAAATCAATTGAAATCAAAAGTTTTAAAACTGCTTTAGCGAATACAAATAAAAGCAAAAACAATCAAATAATGCGCATTCCACTTGGTTCTAATCAACAATGTTAACATTGCCTATG
>KCNQ 5657706 5657887|4983 chr2R 5657866 5658639 scaffold_4 1598594 1599335 - 29138|0 21
TTAATTGCAATTGAAATTAGCT
TTAAATGCAATTGAAATTAGTC
>CG12214 5668183 5668482|4994 chr2R 5668154 5669902 scaffold_4 1612564 1614545 - 77779|29 453
GGCGCGACGTATGGGCTACATG----CTTCCGTATCTGGAGAGG-----ATTACCATTAACCCGAAC------CGCCCTTCGTCCCCCGCCT---------GGTGCTACAAC---------------------------TTGTGATCTTGTACACGAATCATTTACATTTACTTTACTCTACTGTTAGTGCCGTTCTGTTCTCCGCAGCGAACC--CCTGTGTACATACGTTCTGAAAATGGCCAA-----GCGAGCATTACTGCGCACCCACATCG-------------------------------------------------------------------TATATTTTAATTATTACTGCCTAACCTAAGCCACACACAAAATACAAATACAAACCACCACAAAAAAAAACAAAACAAAAA
GGCCCACCTGGTTGGCTACCTGGGCACCTGGACACCTGAAGCGGTCGGTGCTAACAGCAACAAAAACAACTTGTGATTTTTGTATCGTGCTTATACAGACGGATACAACAACCCAACCATATATATGTATATACATATATCTCGATATAATACATAAATCTATCGTACATATTATAC-ATATTTTTACTATTATTTACCGCCTTCCAACAAAGCAACTAATGTATATACA---TATAAACGGCCAAAACGTGCACACACAGAGACACACACACACAGACACACACACAGACACACAGAGAGAAACACACACACACACACAGACACAACACACACGTACATAATATATATTTTAACTGT---CGTCTAACCTAAGCC-----------TCAGCTACAGACTAAAACAAACAAATACAACA-AGCAT
>Hr46 5717249 5719820|5036 chr2R 5715692 5718613 scaffold_4 1669965 1673282 - 29544|1817 3501
TTTTATTGTTT--------CTAAGACTTAAACTTAATTA------------------------------------------AAATGGAAACCAAAACAGACTGACGGACCG---------ACCCCGACAGCATGCCACGCCCTCCCCCGCCCC---ACCCTCCACAGATCCTGGCAGAAATTTCAAAGGAGTTTGATACACAAATCGAGAAAAGAAATTTTCAAAAAAATAATATAAAGAC-AAGCAAACGGCGACTTTTTTGGTTGATACATTTGAAAAGAA--------------TATACAATTAAATATCTGACTGACTATACAAAGACGTTACACACACGCATACACATACACACACATACACGCATACACACACAGCTTACGATACATAAATTAGTTAAACTTAGAGTAAACAAACAACAACAA--------ACACATTGGATAGTAGGTGATAATTGGTGTGTCTTAAATAAACCTTAACCCCTCCCCGACCCCCGCCCAC------TTGCTTAATACCCA-----ACGCCCCAAAAA----------------------------GCCCCACATTTCTACTAAATGAAAAGCTTAATCAAAACTTTTTTGAAATTATTCAAGTGAAAA--------TTT-------CAGCAGGCAGGCATA-AATATTAATTAACATTAATTATAGCAAGGAAACTTATAAATAAAATGTATACAAC-------------AAAACTACAAA------AATTAAATAAAT-TACATTTTGCAAATTCCACAAAAAATAAAACATGATT--TTGCAAATTCAC--TTAAAATCCTTTCCCTGAATCCAAGCAAAAATATTTACACTAGCTTACATAGAACTGGGACGAGGACATGAATATTTCAATTGAGAAAAAAATCTATGTTAATGTAATCGATCGATTTG----GACATATTTAAGTTCGACATTTTTGGCCTTACA--------------AAACAAAAAACAAAAAGAAGAAACCTAAAGTACTTTATATATATACAAACCATATATACA-------------------------------ATATAGAGAATACAAAACTAGTTTTAATTTATACAAAGCAAGGGAGCAGCTTTCAAACTCAAAAC----AAAAATATCCCCGAAA--------------------------AAAACAACAACTTTGTTAAAAACTGCGCATAATAAAGAAAATAATAAACA----AAGTTAATCTATAATATAAATTGAAGTTAAGTTGATTTGAGCGGTCGACAACAAGAACA--TAAATGTATCTTT-------------------AAATGATATATGTATTGTTAAATTTGTATGCTAAGTTTTTAG---------------AAAGGTTACATTTTTA------------------AAGAATAATAACAAAAGATCGCGAACTCGACAAGGTGTAAAATGAGTACATTTAAATTAAAATTTAGCATATATAATGCATAAATATTATGTTACGATATTTACATTTATATAAAACAAAACAAAAACACTAAAGAAAACCGAAAAAACAGAAGTCCCATATTAAAA-------------------ATGAAATAAAATGAGCAGAACCTATAAACTGATAAGGGAATTCTGAATATTAAAAAAAAAAAGAAAACA
GTTTATTGTTTTAAGCAAACAAAAATTTAAAAATAAATATATATATTAAAAAAAAAAAAAACAAAACAAAACAAAAATACGAAAAAAAATACCAAACAGACTGATGGACCGCACGCCACAACCCGGACAGCTTCCCGCGCCACTCCTCACACCTGAACCGCCCACA-----------------------------ACACGCCCA-CAAAAAAGGAAA-----AAAGAAAACATTTAAAGACAAAGCAAATTG----GTTTTAGATTAATTCATTTTATTTTAAATTCTTTTTCGTTCTATCTGGCAATTTAAACGACTGACTACACAAAGACGTTGCACACA--CATTCACACACACACACACACACGCACGCACACACACTTTAC---------ATTAGTTAAAC-TAGCATTAAAAAAGAACAACAAGAACAACCACACTTTGGATAGTAGGTGATAATTGGTGTGTCTT-AATTGGCCTTCCCCCCGCTCCG--CTCCGCACACCTCATGCTGCTTCCTACCAATCCGCAAGAATCAAAAACAAAAGCAACATATATACACTTATATATATACAACTTTTTTACTAAATTGCAATTAGCATATGAAATTTTTGGTAGACAGGCAAAAGAAAAGCGCATCCTTTTACCCCACAACAGGCAGGCAAATATTATTAAATAA-ACTAATTATAT------AAACTAT-AATTAAATGTATGCAACAGCAACAGCAATGAGAAATGCAAAAGCGACAATTAAACACACATATATATATATATATATAAAAAAAATAATAAATTACCAATCGCAATTCCACAATTAATTCACTTTCTTTACGGC------------TTTCGACTGTCATGC-----------CCGGCGTCTAGAATAATTTGTTTGGCTGCTTTCGTTTTGTTTAAACAATTGAAATAAGTGAATTAACCAAATTACGTTTGACATTTTTGGCCTTAAAATGAATATAAAAATAAACAAAACACAACAAAAATTAAGT--AAATACTTTATATATATACACCACATATATACATACATATATATGTATATAAATATATATATATATATAGCGAATA-AAATTTAGTTATAATTTATACAAAGCAAGGGAGCAGCTTTCAAATGGCAAACTTTAGGCGATAGCCCGGCAAGAGAATATGAAATAAATAATTTAAATGAAACAAAAACATTGTTAAGAAA-AAGAAAACTCAACTAAAGAAGAAGCAGCAGAAGAAGAACAACAACAAAAGTTAAAA--ATGTTGAGTTGAGCAAAAGAAAAAGAAAAAAACAAAAAGTATCTATATAAAATATATATACAAGAAATAAATATATATATTGTTAAATTTTTATGCTAAGTTTTTAGTGCAAAGAAAATAAAAATGGTTAAATTTTTAATAAACATAAAAAAAGAGAAGAAGAAAAACAAAAGA--------AAAAAAAAACACAACACGAGTAAATCTAAATTTAAATTTAGC--ATATAATGGCATATTATTATGTTACAATATTTACA---ATAT-AAACAAACGAGAAGCAGAAGAAGAAAAGAATAAAAAAAAAGTAACACAACAAAAAACTCCCCCTATAAACACGAGAAAATAAAATGAG---------TAAACCGA------------AAATATATACAAAAAAAAAAAAAAA
>Hr46 5717249 5719820|5037 chr2R 5718614 5720698 scaffold_4 1673392 1675703 - 59796|0 1585
CAAGAGCAGCAGCCGTTCCTGGAGACGACCGCGGACGATGTTGCCGAGGATGCGGCTG-----CCGCCGGATGTGTCCTGCCGCCGGTGGCGCCCCCTGC--CGG-----GCAGCA----------ACCAGC-GCTGCTCGAGGACTGAGGGCCGCAGGATGTGGCAACAATAATTATTTGAGTAAACACTGCACT--------------------------GCGCATGCAGCAGATACAAG----AACTTTATCATGATTTAAGCTAGCATACAACCAAGGATGTGATCCTCGCCAAGGACTCACTTAAAA----AGAACTCTATCTATATACA--------------------------------TATATATATTATATAT-------------------------GACAGAGC--------------------------GGATGACGCAAAGGGAAGGGAAAATAT-------TTCAAAAATATTGTTAACTCAGTTAAGACTTTTGCTTCGTAGAGAACCGAAACCGAAA--------CCGATTGCATTTCGAGCAAGGGGCATCAAACTGATTTTCGAGGTTATACTATACATATATACACACAAACACACACACACACATATA-----------------TATATATGT-------AACTTCCAAACTTTCATATCC--TGGCC-------------------CGAGCAGATCAGATCGTCTAAGTACTTAAAACCAAGCGAAATTCTCTACACCGCACAACCCAGGACCCGTAGACCCCAAT----AATTCAGTTCGGTTAGTGTT----------------AACCCCAG--------AAAGCCCGATTCCGATCCCGC-----------------------------CTAGGTTGTCTTTGCCTTACGTTGTAACTAAAGTATGTGTATTATATATACAGCAAAT------------GTATGTATAACTATGTCGTATCGGTTA----------------------TATGCCTAA--CAACATTATTTTTTGTAAACAA---------------CAAAATCGAATATCTCGG-AAAATGTGTTCTTATAATTATATTGATTAATGCAATTACAATATATTTACAATTTACCGTTACGTTTTTACATTATACATAAGACGCAAGAGAAGGAAACGGAAGTTTAAGGATTAGAAAGCTGAATAAGAAAAGGCTTAAGGACGAGCTGAGTAGCAGTTAAAGTGAGCGAGAAATCGAATGAATACCAGAAAATTTCAAGCAAGCACA---------------------------TAAAAGTATGCAATATTTTGTTTAAAAACAACTTTTTATTAGTTTCTTAAATATAACATAATTACGTACATACACACA-CGTATATATAGGGCTATATATATCTATATATATATATATATACATGATAGACAAATCCCAA--TCCGGTTCCAAGGTTTAGTAAAAATAAAGAGAAATAAAAC----------------------------------------GAAAAACAAAAACTTTTGATATGAAATCCTACGCATAATTAACAAC
CCAG---AGCCGCTTTTTACGGATACGTCAACCGGTTCTGTCGCAGATGTTGCTGCCGGCTGTCCGCTCGAAATAT--TGGCAACGGCAACGGCAGCGGCAACGGCAACTGCAACATCACCTGTGCATCAGCTGCAGCTGGAGGACTGA-AGCGGCAACA-ACAGCAACAAACACAATAACAGCAACAACAGCAACAACAACAACAGCAACAACAACAACAAGCAACAACAGAAAATAAAAAAACCAACTTTATCATCATTTAAGCTAGCATACAACCAAGGATGTGATCCTGGCCGAGGACTCACTTAAAATTACATAAAGCAAGCTACAAACAAAACAAAAAAAAAAAAAACAGAAAAAATATTTCAAAAATATTATATATACTTTTTTCTAGGCAAGAGCAAAAAAACAGAGTTAAAACCAGGCTAAATAAATGAGTAAAAAAGAAAAAAAGAGTAAATAAAATATGAAAAAATTCAAATA-AAAGGTAACTCAGTTAAT-CTTTCGCTTCATAGACAAAATATACAAAAAGTTAAAGTCAAAATGCATTTT-AGCAGAAGTTTTCAAGATAA------AAGCAAAAGGATACATAAAAAAAAACAAAACTAAACAAAATAATGAAACACAACAGTTTTCAGTTAGATACGTTTTACAACACTGCTAAATAGCCACGCCCCTTAGCCAAGTACTTAAACAAAAAAGAGAAAAGAAGAAAACAAAAAAAGAAATCAAACTAGAAAAATGTTTTTCTTGTTTCTATACCAAAATTTGCGTATCTATATTTTAAACTGAGCTCAGCTTGATTTTATTGTATTTTACCTAGACCCCAGCGCGACCTACGACCCGCCCCCGACCCCTCCCCCGAAGAGGAAACACACCGCTAACCCTCTAGGTTGTCTCTGCCTTTTGTTGTAAACTAAACATGTGTATTATATATACAAAACATATATATATCTAAATATATATATATGTGTCTTAAATATTATCATTTTTTATATGATTCTACGTATACATAATGCAACA----TTTTTGTAAACAAAAAGAAAACAAAAACAAAAATCGAATATCTCGGAAAAATGTGTTCTTAT-ATAATTATGATTAATGCAATTACAA-ATATTTACAATT---------ATATTTACGTTAAACTTTAAAC-------------------------------------------------------------------------------------------------AAACAC--GAAAACTTACAGCACATACAACAACAACAACAACAACAACAGAATTATGAAAAAGAGAAATATTCTGTTTAAAAGTAAAAGAAAAC-AGCTTTTGAAATAAACT----TTTCGTTTAATCATAAATCATATTTTTAG-------------------------------CATGGTAG-CAAATCCCAAATTCCGGTTCCAAGGTTTAGTAGATTTAATTAAAAACAAAACATAAGCATTAACAGACTTTAATAGTTTAGCTAACACAAAAAAAAAACAACAACTTTTGATATACAATACAATACATATAAAGCGAA
>CG12209 5757886 5758147|5095 chr2R 5756678 5757972 scaffold_4 1730805 1731914 - 11984|1260 1352
ATGCTGTGACTTATACAA--CAAAGAATCCA----AAAATGGGCTTAGAATAGCATATTTTGTCCATAATAAAACAGATATATTACTTGTGTT
ATGCCTTGACTTATGCAAGCCTACAGATACATTGTAAAATGAATTAAGTACAAATTCTT------------AAGTAGATCGATTGCTTTCCAT
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CTTTTTATAGCTAAGCCGATGTAT--ATGCCGAAGAGATTAAACCAATTTAGACC----------------GACGTCAAATTGCGAGACAGCCGATTTGACGATAACCCACGATTTTATACCGAGTGACAATAAACGCC
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TA-AACAAAAAACAGAAAAAAACAAAAACAAAATGTATCCACATGCGGCAAGGCAACTTGTTGCGCTTAACTCTAAGGCAACATATACAAA---A
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TATACCA----ACACAGTATATACCCTAAGAAAGATAATGTTGCAATATATGTATTTGCAATAAGAAGTGTATATTGCTTATAATGAGCTTAAATGTTTGTCTATTATATAATTTAATTACCTTTAAAATGTACATTACTTTTTA----ATAAAGTAACTAGTTGGTT------CAGATTTTATTTCTTAGACCCATTTCCCCCCATG----GAGAATCAATTTTTACTTATAAGCTATACTACTACTTAAGCTTAATATCTAA
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AACAGGAATAACAGAGGGGCATGT
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AAATTT-----TTTTCATTTA-TTTTCTACTTCTTGGGCCAAA-----------ATTACGCAATAATTATTCCATTTTTTATAATTA
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AT-----------TAGTAT-TATATAATAATATAAA-CTGTATATTAGATAA--------------TCCAAGTGCTTG---------
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T---GCATAGTCCTAATTGTAGTGAAACTCTTGCGAGATTCTTGTTAGCATTTGTTTTTACTTCTCTAGTTATTCGTTTTAACAATCATCAAACATAT-TGTCTATTGTAAGTTTTCAATATAAGTGCAAAAGTGTTCGGAAAAAACGTTTCAAATCAAAATCCACGCGAAATGAGCAATGCAATCGTATGTATACATATAACTAAAAGAAAAAAAATCGTGACAACTTGGCTGATTTTTAAGATCTAGT-TTTAGCAGCTTTTGCACA--ATTTGCTGTTTCTCAATTAATTAGTTTGTAAATGAAAGATAAAATATCATTTTAACTTAAG-GCTAAAAAAATATATAAATATATATGT
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ATAAT-AACAATA--TCTAATCGCTGCTCCC
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TGTAATATGTGCATAGACTAAG-------TTAAAATCAAAAAAGACACTTCAATTGTAAGTAAGAGGCCAACTTTTATT---TAGCTTGTGCTT
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ATTTGTCACATACGATTCATATACCAAATACACACAGACTACTGCATACTCTACGTGGGCGGGGCACTGAGGGGAAACGATTGTAACTTCCATTTAA-ATTTATTATGTTTTTGCACCGTATGAAACAAGGATTGTCTCCGTTTGTTTTTTTTTTAATTTGTCTTTGAAAAACAAAGTTATGAATTATTTCTTGTCTATTTGTGTGTCATCCCCAAGAAAAAAAACAAAACAAAAAGATAAGCAACAAATATTTTATGTTTAATTGTAATAATATTAAAATAATTTATGTTTTATAAG-GAGTGCAAACAATTCTAATCAAGCATATAATCAAAATCGCGAAAGAAACCAATTAGTATTAAGACATCAATATTTTCAAATGCAACGTATTATTTACAACAATTTTATAGATATTTTATGTATATGTATTTCCAGAAAAACGCACACGAAATGCGAATCGACGTTGATATTTTGCAAATTGATATTTTAATTGACC--TAAGCAAATAT---TTTTGTATGGACTTTTA--TGAGATAAGCGATTCCCGACCACATTCAGATACATGTTA--GACTATATTATGCGAGGCCCCCCACATCAAATTTTCGCC--GAACATATCCATTAACAATAAAAGGCCAAAATAATTAGCGTTTTTTTTGCCTAAGATCCTTGAAGCCAATTTGGCGACAAATTTT--ACATCTTGCCC---AATTTTCCACCCTACTCAACATTGTCCATGCCCAAAGATCTCTTTTTATATATATTGATTTACTTGCGCTTTATGCCTTGAGCCTGACCCCAACCTTGACTGCCGAAGCGATCTCCTCGATTTATGCCATATTAGGTATTTATTTTATTTAAAATTTTGACTGATTATGAGCTAATCATTCGTACATTATAGTTATAGAATCGCAAATCGATTATGGATTGA--ACAAATTTATTATTTTAAAAGCCAAAATCTTACATTTTATACATAACATTGACTTTTTGAGACTGAAAGCAAT-TATATTTAGGGTTTTTATTTTACAATAACC
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ACGTGTGAACTTCAACTTAATTATCTCTGAGCGCATTCCGTTAATTTTCTTTAATTTTTTGTTTTATAATTTCTTTAATATTTTTAAGTTTTGTTGACCGTGTGCCTATCCTTTAGTTTAAGCAGCAAATTGGTCCAAGACCACATTTATTTATATCCCAAAAAAACAAAAACAAAAAAAAAAAATGAAAAGAAATCACTTGATTTGTTAATGTCATTTCTGTGGTGGGTTGGTGTTCTGAAAAACTTCCAAACTCTCTTTAACTGTTTCTCAAATATTCTTGCCAGCAGCAGTTCCAAAAAAAAAAAAATAAAAAAAAAGTAAATACAATTAATTAAATAATATTGTAAAGCAAACAAAGACTTAAAGCGCCATTA-TTTGCCAC------------------------------TACATATATTCCTCAGTTACACACATTTAAGTACAGTATGT-------ATTTTCGGGTGTTATAAACAATAATTTTTAAACTTAAAAAGAAAGCAAAACAAACGTTGTGTAC-ATTTTTTATATATACCATATGCATAATTATATATCTATATTATATATATTTGTAAATGCAAGCAATTAAGAATAAAGCATACTTATAATAATAATCATACCATCTATGATCAGTTGAGTAGAGCTGTTTCACACGATTACCATGAACATTTATTTATTCTATTTTTATTTATTTTAAAAGC
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AATTATTGGTCTAAATGGAATGGAAAAAAAATACAAAGTATATGATAAAAAAAAAACTACCATTATTAACTTACGAATTAAATCCAATTTTTGACAATGCGATTTTTGC---------TTTTTGGAAATCGTGCTT
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TACAATCAA-----CAACAA-TTGCAAGGACGCCAG------CAACTGGCAACTGCTG
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AAACTAGACGTAGTTTGCAATACATTGAACAAAAAGACATGCAAAACAAATTATATTGTATTGCTTTAGCAAATTCTCACAACAAATTTAAACCTAATCTTTATAAATATGTGTAAATTTTTTTCCCAGAAAAAAAGAAAGAAAAAAAAAAAAACGAAA--------------------CCAAACCAAACAGAAAATAT-ATAAAACTAGTCATCAGCTAAATTTGTTTTAGGTGTGCTACAAACACTACAAGAAACAAAAATAATAAAAAAAAGATGGG
AAATTAGTTTTAGTTGGCAATACA------------------AACGTTAATTTTG--GTATTGTTTTAGGGAATTTTCAAAAGAAAAACTAACAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTC-------AAAAAAAAGAAAGAAAGCAAGAAATGTGTAAATTTTTTTCCGAGAAAAATCTCACACAAAACGCAAGAAATTATATAACTAGTCA-CTGCAAAAATTATTT-AAGTGTGCTATA-----TAACATAAACAAAACTTA-AAACAAAAGAT---
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CTAA---AACCATTCCC------AATTTCTATTT-------------------------------------------------CATGACTAAC------CAAACAAAC
CTAACCTAACATTTCCCTAATACAATTTCTATTTTCATGCGCCAAAAAAAAAAAAAAATCAAAATTATAACAAATCCAAAAACCATTGCTAACACTTTCCAAAAAAAA
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AGAAATTTGGCAAATGGAAAACGCATTGGGAAATGGATTTGTGTATAAAGCGTTGAAGTTGGATAGAGACACACAGTTATTA--AATGGAAAAACTAAATATCAGGGATTACAGAAACAAAACAAGCAAGAAATAATGAAATTACATAAAAAAGAAAAAAAAAAGCACACACATTGGTGTGTGTATTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGACGGTAGTCAAACAATAACAACAACAACAAGAACATAACAACACACCTAGCTCGGGGTTTCTTTTATGGAATACGGAATCAGTGTGCCAAATTAATATTAAAAACAAAAACTAAAAAAACAAC
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TTCTTTAAAAGAAATATAAAATACATATCAACGAATATTGTTAATAAAAACTGCCTTTTGTAAC-
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TA
TA
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GATAATGTATTCTTTAAAATCAAATAGAATAAGCGTTATCCGCATAGGCA-AAGTGCAACATTTTGTTGAGCAAAACCAAAAACAAAAACGTAAATTCAAAAATAATTAATATGAAAACAAATATGAAAATTGTAACTACCAAAAAAAAAAAAGAAATAAACCCAATAACAACAACACACTCACACACTCAAGAACAACAACAAAGAGAACAAACATAACAAAACAGTTAGTTGAAGAAAGCAATTGAATATATATATATATATATATATATATATATATATATATGAATATATAAATATATACATATACCATATATAGAGAGAACAAGTAGCT-AAACCAAGAACAATTACAAATAAC-AACAACAAAACGAATTTATTGGATGCCACATCATTTATAAAGAGAAACAAAACAAAAACAAAAACAAAAAAAAAAACTTAAAACAAAAAACAAGCCCATATACATGCATATATACATACGATATATATATCTAGTATATACAATACATATTATGATAATATGAACAAGAACAAGTTGAGAATTATTGTTGACAACTGAGCATTAA------AACCAGAATTAGCTAAAATTAACAAACTGAAGAAAACAGCGTAGCTATTATAAAATATTTAACAAGCTAG----ACAAGATATATACATATATACATATGTATAGCTGCAGTCAGTGCAACATTTTATAGAATTTTAGTAAAATTATAAAACATAAAAAAAACGTAAAAAATTACGAAC
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CCCC
CCCC
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AATCCATAGAATTGTTGATCATATTGTTGTGTGTTGTTTAAGAATCCCTCCAATTCAGTCCCGCCCCCCCCGAACTCTCCCAGTTGCTGCGAAACAGTCAAATTGTGTATATAACAAAAACGAAACAATTCCATTTAA----TGTTGTTAAACTTCGCTA-----------------GCTAAGCTAAAATCATAAAAAAAAAATTAAGAAGAAAGTTAAATATATGTGTACAACTATTTATTGAAAAGAAACTTTGGTTTTTTGTTGTTAACTTTTTTTTTTTTCACAAAATATTTATTGTATTCTTAATCTTAAAAACTGCAGAATTTACAGCGCG-----------------------CGCAATTGCAGCTACTTTGTGGATAAACGAAAAAAAAAAGAAATG
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TAAATATGCCATAACTGTTTGTTACTTAAGCATA
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AAACGCACAAAGCTAGCGAATCGGTGAAATTAAACATAAATATACACATGCATACATTTATATAAACTATCTATTATTATCTAAACTAGCTACACCACACACCACCCACACACACACACACAC------------------ACACACACAGACACACACA-----CACTCATACACACACACATGC----------------------ACAACCTTACGCGTTGTA-------------CATGCATAAAAAGGCTCTAGTCAAAGGTCATTATTATAA-------TTATAATTATTATTATGTATGTATGTATTTATGTAGTGAAATGAACAATTTTAATGTGTTGCATATTATAAATGGAAATTATACATATATAAATATACATCTATACCATATATATATATATATATATATAGACAATTAACAAAAGAAAACCCTCAAGCGAACGGCATCAAATCATTTGATTTATTTTATAGAAAAGTCGATTGATTTCTTTTTTA-----AAAGAGAAAATAACTTTTTTTCAAGCAGATCTGAAGAGCTATTAGCTAGTTGGTTAGTTGAGCATATGCCCTTTGTGGCCAAGTCTGACAATAAACGATTGCAAAAAATATGCTTGACTAGTGGAAAGTGTGGAAAACTGCAAACATTTTCTCAACGCACAACGTTATGATTTTCTTCCGCTTAGATCTCTTTTTGAATTTTCAGCTACTTAACAAATTGACAATTAAGAATTGAACCCACCGTGCGAGACTGCACAGTGCAACAAAACA-CAGAGAAATCGGTGCATTTAATTT---------TAATTAACTACA-----------CTTAACTAAACTTCTATTTTGCTGTGCACACAAAATAAAGTTATGT-----TTTTTTGAATAAT---------CTTTGAAGGGAAAGGCCGTGTTATAATTTAAAAGAAAAAAAAAAAAACACAAATTGGAAATTGAGAAATTCTTGCGCTGCCTTCTCAACAATTAAATAAATTAATTGAATGCCAG---------CTGACTTTGAG-----ATATTATTATATATTATTATATATTATGCATGTATAAAAGAACAAAACAATTTTGTATAGCTAAAAGAAAACAAAGAACGAACAAACGCTGAAATATATTTGAGGAAATTGCTCGTAATTGCAGAGTTTCACTTGA------AATTAATTAAAGGCATATCGCTGTATTATAAATACCC
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CAAGAAAGTATTTAAAATGTTTGTGCAACACCTTCGAGAAATT-TTCAAATAACAAGAACAACAAGATTAAGAGAAACGAGCTAAACATTAAGC----------------------TAGACACT-TTTAAAAACATATTTAAAATGTTAATTA----CAATTAATGAGC----------------TGTCAAG---------GGCCGATCAATATAGATATACT--ACTAATCAGTACATATATATATATATATATT--------TACACATTTCCAAACTTTCTGCA
>Rab3 6237235 6239716|5583 chr2R 6239716 6240278 scaffold_4 2340484 2341078 - 31121|0 0
A
A
>CG12338 6245482 6245545|5588 chr2R 6244626 6247710 scaffold_4 2347307 2350547 - 51592|1032 1127
GTGGT---AAAATCGTTGTT---------AATTGTTGGTCATTAAACTCTTTA----------------TACTCAGAATCTTTGAAC----CCAGA
GTGATTTCAATTGCATTGTTGATTTGTTAAATTGTTGATTATTAAAATGTTTATATGTGCAATCTGTTTTATGCAGAAACTTTGACCCATGCAAAC
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CTCTCTA-------AAAAAATATCCTTTAATGGTCGCACAACCAGAGCACTGAACGCTTAA----TTTTGTTGAACAAATGTG--TCCTATACGAATCCATTCAGTTAACTCGTAACTTAATATATGTTAAATAAATAAATGCTATA
CAGGACAATGGAACAAATATTACAGTTTAAAACTAGC---AGCAGAGCACAGAACGCTTAAAACCCATTGTTAAACAAATGTTTCTCCTATAGAAATGCATC--ATTTCCATGTACTCTAATCCTATTTATACAACAAACCATTATA
>CG33144 6256303 6256835|5597 chr2R 6254531 6257372 scaffold_4 2363059 2366035 - 109787|1809 2498
GTGGCTGGATCTCCACGCATCCCCATCCAT--------------ACGCGAC--------ATAGGCTGCAG---CCTGTAAATGCAGCTGCTGTAATTA------CTGGTAGTTTCTATTGTTAATGACGA-CAGCTTACGTACATTTATTTTAGTTATTACAATTATAATTGTATATGTGTTAACTAAATTGTGATATTTACAGTGATTCGATTTCTAATTGAATCGACAAATTTGTTGAGAACCTATACAAAGACAAGA----CGCCTTCGATTCTTTT--------------TAGGTTCTGT--------CTCTACATATATTCTTTCCTCCCCC-----------TAACCACACCTTTGAATATATAT---------------TCGACTAAATCAATCTGTATAAATCGAGTAGGTTCT-----CTTCCTAGCGCATAAGTTAGTCTAAATATATTAG----------------GAGTACGCCTC----GTATTGCAACAGTGCT---TTTATA------ACGCACCCACCCAAACAAAATCGCCCG---------ACTCACCCACTCAATCCTTCTCTCAAGTATTACG--------CATGCAACTAACA---------------CCCAAAAT--TGATGGGTCAC-----TTTGATCAACTGCTTGGCAATGCTTTTATCTACGC
GCAGCTGCTTCCTCTCACCCCTTCACCCCTCGCCCCTCCCCCTCACGCTCCCATTTTGAACAACCTGACGAGTTCTTTATTTTTAACT-TTGCGACTAGTTAGATTGGTGGCAAATATTGTTATTGACGAACCGTTTAAATTTATT-ATTTTAATTGTATGCATTGTA-TAGTATATGTGTTAACTAAATTGTGATATTTACAGTGATTCGATTTTTAATTGAATCGA-AAATTTGTTGA--ACCTATACACAGAGAACAAGCGCGCCTTTGATTCTTTTCTTGTTTCTTGTTTTAGGTTTCGTGTCGATTTCTTTACATACACAAATGTATGTCCCATGTCTATGTATATATATATATTTATATATATATATTGTTTTATGTTTGTCCATTCAACAAGATTGTATACATTGTGTAGGCCCAAGCAACAGTTTAGCGCGTAAGTTAGCCTAAATTTACTAGCCCACTCTAGGATTTTAAGTATAACTCTCATATATTTCAAATGTGCTGCTTTTATATAAAGAACACACACACACACACATACACACACAGATCCTAACACACGCCCATACGACCTTTTTCTCAAGTATTACGGGATACCACATGCAAATATCGAAACCGAGTAATCAGCCCAAAATGTTAATTGATTTCAAATGTTTGTGCAACTGCTTGGAAATGCTTTTAAATGCTT
>CG12340 6316326 6316629|5666 chr2R 6316549 6317110 scaffold_4 2450332 2450895 - 21428|0 82
ACGGATTGGTCTGTTCTCTTCCTTA--GATTCTAGTTTTAGTAGAAGATATGTAATTTACTTTTGTCCTTGGTAATCCGTTCT
GTTGAGTGCCCCGCCCCGTTTGGGAGTGTGTTTTGTTTTTGTGTAATTTTTTTGATT---TTAAATTCTTTGAAATTAGTTTT
>CG7637 6326459 6326523|5673 chr2R 6325554 6326866 scaffold_4 2460832 2462161 - 55995|921 991
GCC-GCATTTTAGTTTTAATTAGTGTACATCTT--TATTTACAAATAATAAGCTACA---AAACAACAAAA
GCCAGCGTTTATGTTTAAATTAGCTTACATGTGTATATTTACAAATAATAAGTAAACCGTAAAAAACAAAA
>CG12341 6328023 6328269|5674 chr2R 6326976 6328183 scaffold_4 2462291 2463499 - 39200|1063 1243
CCAAGCGGACATAT-TATCAAT----TCTTCAGGTGTGCAAACCACAATTAATTGAA---------------TTCATAGTTATGTGTATAGGAACATTGTGATTTTTAAAATTATACCTTATACGATGAGAAAATAATGTAAAATACTTAGATCTTAACTTAAAACCTAATTATAATTGTA
CCAAATCGAAATATCTATCAACAAAATATTCAGGTGTA-GAACTTAAACAAATTAAACAATTATGTACATTTTTAAGAGACACGCGTATAAAAATATTGTGATTTTTAATAT-ATACTATCTAACGAAATAGAAAACTGTAAA-TATATAAAT--------AAAAATAAATAATA--TTTA
>CG12341 6328023 6328269|5675 chr2R 6328200 6329544 scaffold_4 2463639 2465175 - 19307|0 75
AGC------ACGGACTGAAGTTTTTCATCGGCCATGGCCAACACTCCATTCTCCACATCGCGCCCAATCCAATGTT
AAAGATGCGACGAACTGAC-TTTCACATTGGC----ACCCACACCCATCTCTTTATTTATGTCAAAATCCTTTGTC
>CG12342 6331933 6332102|5678 chr2R 6330778 6335043 scaffold_11 1944047 1948322 - 114831|1214 1419
GTTCGG----------------TAATCCCACAGCTGTT--------CCCATTGTACATAGCTAATCCCTACATATTTATCTTAATTGTAATCAAGTTTTAAACTACAAAGAAAAGTTAACTTATTTTCAACTGATGCATCTAATCTGGAGGGTCTAAAAT------------ATATAAATATAATACAAAGATATATGTACAATAA
GTTAAATTTAAGAAACGACAATTAACTGTGCAGATTTTGTAGCGACCATTTTGTAAATAGTT-GTCACAATGTATTTATCATAATTATTTATATGTATT----------TATATGTTATCCTGTTT----ATGTTGCACTATACCAGTTATTTGTCAAATCATATTCTGGACGTTTGGCCGCAAAGTAGCAACATTAGCAGTAAAA
>CG12344 6343336 6344562|5682 chr2R 6338480 6343886 scaffold_11 1951070 1956706 - 179631|5123 5854
TTAGGCTTAAGCAAATCAGCCAAGATATGGAATTGGTGCTTTACGAAGATAATAATAATACAATGGCCTCAAAGGAT------------------ATTTGGATTGTAAATAACGAAACGAACAGTGAATGCT-TTTAGAGATTTTTACATATT--TAGAATTATTTATCCATTATAGCGCATTTT----------------------AATGCAAACATTA-GAGCTGTGGCTTT-TACATCTAATACTAAAATCGACCTGTAGTTCAAACAGCGCACATCAGGCAGAATTTTTGAAACTATAAACATATATATATAC-ATATATATATGTTAAGCTAAA----TCGAGTTTATATTTGATATGGAAATACAAACACAATGTAAATACATTACATCACTACTATA-----TATATTACATGCATATA------TTTATCTAGGATTGTAACTGC--------TATAAAAA---------GTTAAGTTT---ATATAAATATCTGTATTCTTTC------------------------CATTTTTAAGTTATGTTGTTCACTCAGCTA-------ATCGTAGTTCAGT----GAACCCTCTAACAATGT---------TATCGAAAAGCTTTAAATTTATTCT---------------------------------TAATAAAAGACAAGGCGCGT-----------------------ACATCTATCAAATCA
TTAAGCTTAAGTAAATATGCCA-GAAAAATAATTGGTGCTTTAAAGAGATAATAAAATTTACAAACCCTCTAAGGATCAAGACATATTCATACACACTTGGAATGTAAATAAGTAGTAAAA-----AATGCTATTTAGGACTTTTTACACACCAATAAGACAAATAATCAATT-TAGCGCATTTTTTGAAGCAAACGGCATTAAGAAAATGCAAAGATTTTGAGCTGTGGCTTTATATATTTTATAT----ATTTACCTGTAGTAAAAACAGAGCAC-----TCAAAA-----AAAGCTAGGAATACGTACGTATGTTAAAGATAATTCATAAGGTATAAAGGTAAAGATTATATTTTGTATAGCAA----AACATTGTGTAAATATAGAACAATTCAAATATTCAAATTATATAACAAACACAAAGGAAAACTTATTTA---TTGTAGCTACAATGTGTGTACATAAATTTCCATCGGTTAAGTTTTGTATTTCACGAGCTTTCTTTTTTCATACGAGGAATGGAAAATGTTTCTTATGCTCTAATCATTTTATCCTCAAAGCTTTGAACATATCGAAAAACAATAAAAGAAGTATTCAAATATGCATGTAAAAATAAATAAATAAACCAAATTGATTCTAATCAAATCCATTAACTGAGCTTTACAGGCTGATAATAATAAACACAATAGTTCAAAATAAAAATTACATTTAATAATATATATTTAATAA
>CG12344 6343336 6344562|5683 chr2R 6344325 6346013 scaffold_11 1957267 1959003 - 68350|0 261
GATTTGGGGAGCTCCAGACTGCATATGTCTGGACTCCGTTAAAAAGTCGAACAAACGCGAATATGTTGATGAAACTGCAATTGGACTGGATTTGGATATGCAAACTTCAAGTGCAATGCCAGTGACGCTAGGTCTTT----GGATGGGAATATCTGGAAACCGAGAGCTCTATGC--TGCACGTCATCAGAGTACAAGAAACCACAAGG--------------AAAGTCTACAGTTACCTA----AATACATCCATCGGGTA
GATTTGGGGAGTTCCAGAATACACTTTTCTGGACTCCGTTAAAAATTCAAATGA-------------TATTAACTCACAACCATATTGGAGTTATATATGAACACAACGCG-GCCCTACACTACAACCTATACCTTTACCCATCTTTAACAATACAATAACCAACTGCTATGAGCATAACACTCCACTCAAGTACAACACACTATATGGTACCTACAATGGGCAAATCCTGCTAATATCTGAAGTAATACTCTCGTCGGGTA
>CG7686 6352913 6353015|5691 chr2R 6352936 6353130 scaffold_11 1970163 1970354 - 7386|0 82
CTTAAGTTTCCGGCTCTGTTCTCTAGGCTTAAATGTGAAATGTATACACAGCGGCGTATATGTTAAGT---GATATCTATAAA
-----GCCTTTCGATGCCTACATTAAGTTTAAGTGCCAAG-ACATGCACACTCTTGGAAATGCTAGTTTTAAATCTCTATCAA
>CG30015 6355001 6355809|5694 chr2R 6354872 6360856 scaffold_11 559077 565197 - 120335|133 1028
TGGATTAGTTATTTGGGAT--------AACCTAAATACTCCGC-------------CGACCAGACTGTACCTAGCCTAG--------CTGCAATCCAAGTGCTTTTGTCTAGTGATGCGCTCTCCTTCAAGCAAATAAAGCCAACTGGGAGGCAACAAATAATCAAATTATCATTATAATCGTTAGCTTAAAACCTGTAAAGAATCGCAAATGAAATCAAAGTTGAGGGCGCCGGACTG-----GCGAGGTCATCCAAAGACAA----------TAGCGACCTGCTCGATTCCGGTGCCCG---AAAAACTCGATAGGCAATAACTATATACCGATCTTCAAAAAGTGACTAGATTATATTTATTTTTAGTCTGTTCAGAGTATCGCTTACTATTGAAAGCTTCTCAG--TTAGGCTTCGATTCGAATTTGT-TCTGTGCATGTCGAAAAATGTTTTGAAATAAACTAAATTACGTCTATTAATTGAGAGTCAAGAAAACTGTAAGGACTGTGAGT-ATAATTACGCGTAGCAAGGA-----GCCTGATATTCGAAACATTTGATTTACTTT-AAGTTGATAATTTGCAAGCTTTTAATTGG-------TAGAAGAGATTGATTTTACTATTTAGACTAACTATTATTACTTA---------TTAGTATCATGTACATGTTTCGAAGACCTTGTTTATGTATAATCTATAGAGTCTGTCGAGATTGCAGACCCATATGAATGTAAACGTGTAGAAATTTAATCATATTCACACCCAAGTGT-ATGTAAAACATTGCGAGTGTATAATTGTTTTCGAAGTG------TCAAGTTTG-------TAAATGTACATACAACAAATAAAAACGATTTAATAAATATCCAAATACAAATTT
-GACTCTGTTCTTCGAACCTGTTAACGAACTAACATATTTGACACAGTGCTGTTAACTAACAGAATTGACATAGTACTGTACCTGCTCTGTTCTCGTAGTGCTTTAGTCTAGTGATGCTCTCTAGTGTAATTGATTC---CGAACCCGAAGTAAACAA-----CAAATCCCTAACATAATTGCTAAAAAAA-------AAAAAAAAAAAAAAAAAAACAAAATACAAAAAAATAGAATGTATTAACGAGTAAATATATAACTAACTTGTGGGCGTATCTATCGGCT---GTTTGAGGCCCATCCAAAGAAACGAGTTGCGTCTTCGAT----CGATCTTCAAAA--TGATTAGTTTAT----------------------------------------GGCTTATCAGTATCATAGTTTGAGTTTAATTTGTGTTTGTGCAAGTC--AAAATCTTATAAAATAATAAAAACTACAACGCTAAA---------ATAAAACTTGTAAGGACTGTGAGTAACATTTACAAATAATAATAATTGTTTTATGATATTCGACACATTTGATTTGTTGTAAAATTGATATTCT------TTCTAATCTAAGCGACCCAATATATATATATATATATATATAGACAAACCTATGCTAGACAACTCTGAGCTTTCAAACAGGAACAGTTTTCATAAAGAAATCTTATATAT-ATCTATAGCA------------------------GCATTTAA------------TCAATTATTTTCATAGCAACATTTAATGTA----ATTGCGAAT-TGTTGTTGGGATTCATGTAAGCTGTTCAAGTTTGTGCAAATTACATATATTTATGACATATTCATCGCATATAACACATAT----ATATATAACT
>CG30017 6386471 6387169|5717 chr2R 6386068 6386539 scaffold_11 586366 586740 - 5395|418 486
TTGCAGCAGGTGGCGTGACTAAGACATTCCGCCATGGCAAAGTGAGTTTAAAAAAAAAAAAAATCAAAA
TTGCGGCAGTTAGCGTGACTGAGGCATTC-GCCATGCTGAAGTGAGTTTTCAAAT--------TTGATA
>Taf5 6393210 6393397|5723 chr2R 6391601 6399091 scaffold_11 591279 598821 - 312280|1664 1894
GAGC------ACAGATAAGCTTATTTGGTATACGTAATGTAGTGTTAAGGAATGCTCGGAATGTTTAGGATTAATGTTTTGTA---TTTCG-TTTGTGACCCATCC-----CCCCTGAAATG-------TCGATTAGTTG--TTTAAGCATAAAAGTGTAAAGTGCATATATGCGCAAGTTATCAAT-------------------AAATTTTAATTAATATAAAAGTCAA
ACGCTGTATTTCCAATAATATTGGATACTTTAAGCAAAGCAGT-----CACCCTTTCAGAGGTCTAAGAATTTATTGCTGGAAAACTTTCGATTTGTGACCAATTCGTTTGATTTTAAGATAAAGTAGTTAAAGTAGTTGATTTTCAACATTATCAT-TAAGCTTCTTTTGT---CAAACTATCAATTATCCATTTACTGTTGCCCAAATTCCATAACGTATAATAAAAAA
>CG7712 6413043 6413195|5734 chr2R 6411853 6413934 scaffold_1 1379241 1381573 - 69937|1309 1543
TTATT--------------------------------CAAATTGAAATAGTTTAAATACAAACTCCGA------------------CAGAGTGTAAAACGAAACAAAG--GGAGTTTT---GTGCGCTTCAGAAACGCGTGTGTCC--TTGTTTATTGAGATTGTGACTTCAAAAA------------------------TATCATGGTTTCACTGTGAATACATACTA-ATGAA
CTTTAAACAGATTTTCGAGCACTTTGCAAATGCTTAACAAATTTGAATAGTTTAAATACAGAAAACAAAATGTTTGGCACGAATACCAAAATGATAAACTATATACACTCACAACTTTCGGGCGCGCTTTCAAAGCGCTTTTTTTCGGCTGTTTATTGGGTTT---ACTTCAAAAAATGTATCCAGTATTGTATTATATATACAATCGAACTATTGTATATATACTCTACATGCA
>Rpb5 6414149 6414238|5735 chr2R 6414008 6414878 scaffold_51 693374 694220 - 41946|150 240
TCCTGGACTTATGAATTATTTTAAGAAACCTATGATTTAAGGAAAAGGCAGCG-AGTTGTACACTTTAATAAATCGCAATCTTTTCAGTAA
GC---GACTTGCAGACCGGCTGACAGCTCTTGTAAAATCAAACAAGCGCAATGAAAATATATATTT-------------TCTTTTAAG---
>CG7722 6456092 6456220|5783 chr2R 6456217 6458805 scaffold_71 42448 44764 - 33035|0 3
TTGC
TTAC
>luna 6498683 6499204|5816 chr2R 6496199 6499693 scaffold_71 65134 68463 - 26040|2876 3414
GGCGAGATTTAAGCAGGGCCATCCGGAAGAGCCGGAAAATCCAGAGGCAGAGGGGAGGAGGAGGAATCCAGCGGAAACTGTGTGCCATCAAGGAACGATGAAAAACTTGCGTAACGCTAATCAAAACCACTTTATTCGTGGAGCATAGAGGGGTGGGAAAGTAATCAAGGAAAAAACCAACTAGGGAAAACATCACAACACAAGCACAAAGATGGAAACTCAAGTTCTCTGATTCCGATTGACATTTGT------GTTGCCATTATTGT----CGCCGTTATCGTTTTCGTTATCGTATGGTTATCGTCGTTATCGTTTCAATTGCAAATTCGATTTGTT-TCAATGCCTTGTTAAGAATAAGTT---TAAGC-TTTAGCAGCCTGAT--CACATTTCCCCATTCACACCTATCATTTAGCCGCAAGTTCTGAACAAACAGCAAAAATTGTGTACAATTTACCAAAGCTAAGCTGATTTCTTTAATTAGTAAAGCAGCGACAAAAATCCAGCATTTGCTAGAAAAAAAAACAAAAAAAA
GGTGGAATCTAAA----------TGGAAGTGC-------------------------------------------AACTGTGTGCCATC-----------ACAAGCTGCTATAGTGCTAAT----------------------------------------TAATCAA----------AACT------CACATAACAGCACAAGCA-ACTGAAAAATATTTAAGAACTTCAAATTCGATATAAAATTGTGTGTTCGTTGCTGTTAGTGTTTAACGTCTTATTCCATTTCATTATCGTTTCGCT----TCCATATCTTTTTGGTT-TAATTTCATTTTATTGTTTAAGCATTTAACAAAATAACTTCCATATGCATTTAAACTCTTGACAAAATATTTACCAAAGCAAATTAATTTTTTTTCAGTAAAACATCAA-----GGAAAAAATACTGAACAAAATAGCAGTCATAAA---------TGAACTTATAAAGCA-CAATGAACATATGAAAAGTGTATGAAATATATATATATATAT
>Cyp12d1-d 6639561 6639777|5955 chr2R 6639711 6639774 scaffold_494 8454 8524 + -186|0 71
GCTTCTCATTTGT---GGCCTTTACTTGTGTTCCTTATAGTTGCGATTTTTGA-----TTACAGTAAATGTT
GA-ACACACTTACCTAAGATTGTACATATATTATTTAGTCAAGCGATTCCTAAAGTACTTAAAGTATATACT
>Cyp12d1-d 6639561 6639777|5956 chr2R 6639775 6640809 scaffold_1 5130545 5131653 + 10956|0 2
TTT
GTT
>CG13229 6655776 6655936|5973 chr2R 6654963 6656287 scaffold_34 1093220 1094707 + 20317|991 1203
TTGGGCACATCTAAAGATGT-GATCATGGGCAGGAGCAAACACTAGTGAGG--------------------GATGAAGTAGGTGAGGGACATCCAA----------GATGTTCCGGCCCGGCATTGAA------TTTGAATTTTCTAAAGCA------TAAACTTTATAAAAGTTTCGTTGACTAAACAAAGCCT---------AAATATGAG
--AAGCGAATGCCAAGGCGTCGAACACGTCCGACGACAACTCCGACGGAGGCCGAGACGTGCTTCGGGGCTGACTAGGAAGATGGGTGAAAGAAAAAGTTTAAAGTGGTGTGTGGGCAGCTCAAAGAGATGCCTCTTGAATTTCTAAAAAAAAAATAGTAAACTTTCAAAAAGTTGAACTGATGAAACTGTGTGTGCCGGATAAGGGTATACC
>CG12391 6663504 6663831|5983 chr2R 6663789 6666130 scaffold_34 1106003 1108218 + 42499|0 44
AAAAACCAAGGTGCGGCGGCTTGCGGATTTCAA--TTCAATAATT
-------AAGCTTCGGCTCCGTTCTGAATCAAATTTTCAATAAGT
>CG9084 6733320 6733357|6052 chr2R 6732576 6734059 scaffold_34 1199399 1201028 + 46574|935 979
CGTGATTAATCAATAAAAAAA-------AACATTGTATATTCACA
CTGGGCGTACAAATTAAAGAACAACTACGAAATTTAATTTTCACA
>skf 6742364 6742929|6062 chr2R 6742586 6742843 scaffold_43 289918 290220 + 9049|0 306
AGAGAAACGGAGAAGAGACACTATTTACCCGTAGGCGGTCCTGCTGGGCACTCCCGTCCGGCCTTAGTCCTTTTCACGACATGTACC-TTTTTGCGTAACAGTGAAAACAATGTAATGAATACAATAATTATT--------GACAGAAAGTGAAGGAAATTTG--------AACTCAACCAGCATCTAAC----TTACAATTAAATTA------------------------TATAAACT-TGTTGTACAAAATTTATTTGTGTTCAAAGAATGACT---TAATTATAAATGTATGTATTACACGTT
AGAGAGATAGAGAA---ATACTATTTACCCCTAGGCGGTCCTGCCGGACGCTCCTGTCCAGCGTTAGTCCTTTTCACGACATGTACCTTTTTTGCGTAAAAGTGAAAACAATGAAAAGAATACAATAAAAATCAAATACGAAAAGCAAAGCAAGGAAAAATTATAAAAACTAATTAAACAAACATTTAACCAAATTTAAGCAAAATTATTGCAAAACACACAAAAACAAAATTAAAAACTCTGTTGTACAACAATTATATA-ACTCAAATAACGATTGTCCAAAACCAAATCCATATATTAAAGATT
>skf 6742364 6742929|6063 chr2R 6742847 6743949 scaffold_43 290376 291443 + 54725|0 91
ATCGGTTG--------CCAAATGTGGACAAGCATTTCATGCAGTTTGTTG-ATGAACACCAAAGTATTTTTGCCATACGAATTTAGCAATCT
ATTTTTAGCACCAACCCCCCGCCATGCCACGC-CCCCTCGCAATTTGTTGAACCAACACCAAAGTA--TTTGCCATACGAATTTAGCCAACT
>CG13217 6752106 6752173|6074 chr2R 6751660 6752749 scaffold_43 302046 303145 + 13271|496 571
AGCAACAGCACTCACCCAAAATATA-GTCTAAGAGTTTCGTAATAAAGC-------TTAGTTAAGTAACATTAAAA
TGC-------CTAGGCTTAAATTTATATTTTTATTTCTCGCAAACAAATTCTAGTATTAATTGAAAAAC-TCAAAA
>CG13216 6754014 6754093|6076 chr2R 6754022 6755161 scaffold_43 306495 307608 + 15536|0 77
TTGAGCCTTAAAAATCCATATATAATAAGCTAATTTATTTTATTTATTT---TCGATAAATA---CAAGAACATTTAT
TTTATTTCCAACAATTTGCATAAA------TTATTTATTTTATTTATTTAGCTAAATATATATTGCACGAACATTAAT
>CG9080 6757647 6757707|6079 chr2R 6757267 6758285 scaffold_43 310256 311331 + 8337|414 474
AAATAGTTAATCACTGTAATTGAGGCGAAAATAGAAAAAAGTCAAAAAATGAAAACAAAAA
TTATGGCAAATAGGCGAATTTGATGTAAAAACAAAACAAATCACAATAA--AAAACAAAAA
>CG30027 6788257 6788373|6119 chr2R 6788342 6789206 scaffold_43 356464 357312 + 8912|0 36
GCAGTGGATAAAT-----TGTGGGTGCGCCAAGGATT
TGCGTGCGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCGAGCGAGT
>TpnC47D 6789943 6790020|6120 chr2R 6789606 6789948 scaffold_43 358837 359250 + 3116|423 428
TTATTT
TTGTGC
>TpnC47D 6789943 6790020|6121 chr2R 6790018 6790169 scaffold_32 10433 10614 + 3267|0 2
GCA
ATA
>CG9070 6793858 6793891|6123 chr2R 6793722 6793881 scaffold_12 1617784 1617943 + -365|146 173
AT----AAATGTGTTGAACTTTACTTTC
ATCATAAAATAGAGTGAAATAAA-----
>CG9070 6793858 6793891|6124 chr2R 6793882 6794464 scaffold_43 364297 364835 + 15140|0 9
ATAATGTTAA
ATAAAACTAA
>CG9067 6794800 6794842|6126 chr2R 6794833 6799516 scaffold_43 369928 374704 + 171300|0 10
CTGT-AGATTA
CGTTAAGATTA
>CG9062 6796384 6797172|6126 chr2R 6794833 6799516 scaffold_43 369928 374704 + 171300|1653 2547
GAGAGCCCACGC--ATTGAACAACACAAGA-----ACACCTAT-CACAAACACAACGCATACTTGATTTCTGCAATTG--CTATTGCCTAACCGAGAGTTGTGCTTATATATATCCGCCCCATAGGTTCGATCGGGGATAGCTTGGAGCGCGTGACGCGCAAGTATTGAACGCTGGCAAGTGATC------TCCCGCCTAACCGAAGCAGTACCGATGCATTATTGAATGAGAACGAGATTGAGCAGATCGATTAACAATTTATATTTTT----------ATAAGTTGATTTTG---CAATATATTTGAGTT---AACCTGCGATTCGTCTCATCTCTTCTCGACTCGACTCGTGGACAAACACAAACACATTCAAGGAGAATCTGTACGAGCGTTAACTTTAAATTTAAAAGTGCACCGGAGTACTTTTGTTTGTTCACTTCTCGTTAGGAATAAA--------TATGTACTTCAGATTCAGACTTATAACAATTA----GGCTTGCGACACACGTAGATAAGCATTG--CAAAGGAGTAACTGC-------AGACATACCATT---------AAATCGTATTTGCATC-----------------------------TGAAGCAACTAGACCTAGAGTATTGCGCATATATGTATGTATGTA---ATATTCACACTTGTTTCACATTAGGTTTATACATAATTATTTACATAGAACATACATAGGTATAAGAAATCTGTTA------AATATACAGAAAAATCAATGCAATGGTAGTAGCCCAACTTGTAAAGAGCTC-TATGCAAGCCAATTTGTACATAAGT---AATAAGCGAAAATCGAAAACCAGGATGGAAATCAATTAAAGT--TATTAAATTATTTGGAAATCAA
TACAACATTTGCAAACACAACAACACAAAATTCATACACACACACACAAACACACAGTGAGATTTATGATGATAATTATTTTATAGTCTAATAGTTAGTTGTGTT------TATCCACCCAATAGGTTCAATCGGTGATAGCTTGGAGCGCGTGACTCGCAAGTATTGAGTGCGGTTCAGCTACCAGAGTATTGTGCTTTACCTAAGGCGTTGCTTTCCACAGACGCATGTGATT-----------------TCAATATTTTATGTTTCTTTGTTATTTAATGGGCTAAAATTGATCAAACACATTTGTTTTTTGTATGTACTTTTCGACTTTTTTATTCT---ATCAATTCATTTAACAACATTCATATTT-------GGATTTGTCCAA-----AACACTTACACTAAATGCACCGCAAATGGGTTATGTTT------TTGTTATTAGGAATAAAGTGAGTTTTACATAAACTATATATATATATAGATCAAATATCGGAGCCTGCAGC---CGTTCATAACAATTGGATAAAACCGTATTCACACCTTTTATACATACCATTTGGCATAAACGAACATAAATACAACAAGCAAACGCCCGTCTATAAACAGTTTCATAAAGCAGCTAGAGATCGA----TGCATATATATATATATATATAGATGTATATATATATGTTGTATGTACGTTTGTTTACTTATTAAATACATAATACAT--ATAATTCTAAGTAATCTGTTATATGGTAAAAGAAAAAGGAAACAATGCAATTGTAGAA----AACATATA---ATCTCATATGCAAGCCAATTTGTAAATAAGTGAAAATAAGAGAAAA---AAAACT--TACAAAAATCAATCAAAATCATATTAAATTATTTGGAAATCAA
>CG13213 6801055 6801870|6128 chr2R 6799900 6804507 scaffold_43 375124 379823 + 138867|1247 2141
TCCA-------------GTCAGTGG--------GCAAGTCCACAC---ATCGGTTTTATTGTTGATCAGGCGGGCCAAGTTTAAATGTAATTTAAATTGTTGCATCCCTC----TTCGCGCGAAAGGCGTTAAGCGCTTTGTTGATTTTGTAATGTAGTCCGCAAACATATTGCAATATTTGCATATTTGCAATCGCTT-GCATCTTCCAATAATGCTTATTTTGTTTATAGGCCCTAGAGCGTAACTACTGTACTAGCATAGTATTCTCTGCACAGCGGCAGCAGCGAGTTCCTCCCTTTTCTGGAGGTGCCCGCATTAGATGCTGTGCGAATAAGCAACCTTTTGTAAATGCAATATGTAT-TCATAACTAAGTTGATTCGAATTTTTTGCAGCGCGAAAATCATTTCCTTTTGAAGACAACCGT-------TGCAACGATTTTCA-ATGATTTTTTTTAGTAT---ATATAATGGTATATATATATATATACATACTGATTTATTGATAGTTAAGTCCGACCATTGAGCGTTTGTAAAGTATGTATACAAGAATTAAAAATAAGTTTAAA------GTGTATAATTC-GCAATACAAAAAGAATATA-----------TTTACCATAAA-----GTAGTCGTCAATTCAAAGTCGCCAAGGCAATTTGTAGAATGTTTTAATCCGA--CAAGAATGTACATA-----TTGGCGTTTCCGATTAGATGTTTTTATATAAACGAA-------GTAACCATTTATAAAGGTAACGCATATACCACACATACATA-ACATAAATTAAAACAATTCAATTGTTAAGCATTACTAGCAGTTAAGAGACGGCAATTAAAGGTACATTTAATTTAAAATAAACGCAAACATTTTCAATCT
TATATATTGAAAGCTGTGTCGGCGGCGGCAACAACAACTTGAAACGAAATGAATGTAATTGCTGCT--AGCTGGC--AGCTTGAATGTAATTAAAATTGTTGCATTCTTAAAGATTAG---GCAAAGCGTTCAGTG----------TTTGTGGGACTGTCCACAATAATGT-----------AATAGTCGAAATCGCTTCGCATCTTCCAATCATGCTTATATTGTTTCTAGGCCGCA---------------------------------------------------------CCCTTGTGT---------------------------------------TTTGTAAATGCAATATGTATCTTATAATTTATTTGTTTCGAATTT----CAACGGGATAATTAAGCACGTT-GAAACAAATCGTAAATATATACAGTGATGTTTAGATGATTTTTTTTTGTATTGCATATATTGATTAGAGCGTAGATAAGCA-ACTAAT------------------GACCACTGTATGTTTGTAAAGTATGTATGCA-TATTTAAGATTAAGTTTAAACGTAATTTGTATGCTTTTGCAATACAAAAACAAAACAAAACAACATGATTAACAATAAATAGTAGTAGTCGTCAATTCAATGCCGCTAAGGCAATTTGTAGAACGTTTTAACCCAGATCAAGTTTGTAAATAAGTATTTGGCGCTTA-----AGAAACTTTATTGAAATCGAAAATAGTAGTTAGCATACATATTG--AACG-ATTTCACACACACACACACACATATAT-AAAACAATTCAATTGTTAAGCATTATTAGCAGTTAAGAGAAGGCAATTAAAGGTATATTTAATTTTAAATAAAAA-AAACTTTAATATTCT
>CG18335 6805592 6805804|6130 chr2R 6804850 6808921 scaffold_43 379824 384039 + 134358|788 1066
AGTGATCCACCTGCGGGTATTTTTCCTCCGGGCATGTTCGAAT--TGTAACGC---------------------------------------TTTTG---TCAAGGC----CTTGCC--ACCCCACGTCGCAAGTGCAGCATTTATTGTCCTTGTATCACCTGGTCCCACT--------------GGCGATTGTTGTGATGTATCGATACAACAACAACATCCCCAGCTTTCTATCTACGTCGTTCGTTGCAGCAAAT--AAATAAGTTTTAATTGATT
AGCAGTTCAAATA-ATTTGTTTATTTTCGGAATCGGCTTCAATAATATAAAGCAATTTAAAAATCCAAAAACTGATAAACATAAAGTTGTATTTTTGGACTTAAGGCGGTTCTTGCCTGACTTTACAT-------------TTTAT--TCTTTATCGAATCTGGTCTCACTCACTGTAGAAACTAATCTATCGATGTCGCGTATCGATACGACAACAACATTGCTGCTCTCGTTTCTACG----TCGTTGCAGTTGATTAAAATAAGTTTTCATTGAAT
>dare 6806892 6807023|6130 chr2R 6804850 6808921 scaffold_43 379824 384039 + 134358|2210 2373
TG--CCAGGATTCCATGGGTTGCGGTTGACAATAGTTTCCTTTTATA------------------------------ACCAATCTAGTGTTCTTTATTTATCTGTCGTTTGAGGCCTTTGTTATTCGTTGTAAATACACAAGTCATTTATAAAACAATTGTAAA
TAAACTAGGTT-----GAGGGACTATTGGCATTAGTTAAATTTTACATTCATTAACCCAACATGGATGCCAAAGCGAAACAGTATAGCATCTTTTA---AGTTGTCACTGTATATAATTGT-ATATATTTTAAA----CAGCACATCAATGTTGTAGTTAAATT
>CG18336 6809555 6809826|6131 chr2R 6809220 6809660 scaffold_19 972692 973176 + -714|381 507
TGATGGCTTTTTCGA--------------GCAATAAAATTAATTAAACTTTAGGTCACAAGATAAGA-------ATATATTCGTTATGGTACACAAGGTGCCAAAAACACTTTTCTCCTAACAAATA
TTTTTTTTTTTTCGGTGTATTTTCTTTTTGTATTAAAACTAAAT-AACATTAGG-CACAACCCAAGATGGTTAGATAAATTAAATAAATTTAAAAAAATAAAAGAAACACAAAGTTGATTAGAAGCA
>CG18336 6809555 6809826|6132 chr2R 6809661 6810556 scaffold_43 384203 385190 + 10614|0 165
GGACCGAGTTATCGGAACACTCACTCACCATTAGCCAATCAAATTCGCTGTGTTACGCTTACAGAAGCACCCGAAATAAATCGTATCCAGTAGAAGCCTGTAGAAAATGGCAAATAGAAATAAAATCATACAAATTCAAATGTCCAAGAAAAGCACATTTAATTTA
AAAAAAAAC--TCGAAGCAATATC-------TAGGAACAAAAATTCCAAG--------CTGCATAAG--CTCGTTATAAATTATATTAAGTA-----TTTTAAAAATTG---------AATAAA---ATACAAGTTACCATAT--ATGTTAGCTGCAGTTAATTTA
>CG13211 6810451 6810588|6132 chr2R 6809661 6810556 scaffold_43 384203 385190 + 10614|855 1047
TGCACTTTCCGGCCCTG-------------------------------------------------------------AGACCTTCCATCTT----------GTTAATCAATACAATCGCCCTGTAAATGACTAAA---TCATAAACCAGTAAACGTA-------------ATAAAATAAAACGTACCCCATA
TGATACTTCCGGCTCCGGCTGCAAACTCCGAGCGCAGACGCTGTGCAATAGATTCTTAAAATTTATATTAAATTGAATATATATTGCGTTTTTCTTTTAAATGATAATCAAAATAAATTCCCTGTAAATGAATAAACAATTGTATATCCATGTACGTGTAGCATTGTGCGCATTAATCAATATACAAGTTATA
>CG13211 6810451 6810588|6133 chr2R 6810587 6811840 scaffold_43 385226 386518 + 33429|0 1
AG
AT
>Fpps 6821409 6821536|6137 chr2R 6818056 6822896 scaffold_43 899741 904653 - 170592|3518 3671
ATT--ACTCAAGCGCAACGACTTTACGGATACGT--TTTTAATTAA------ATTGTAGTTTTAGCATTTACATGGATGAACTGTTAGCAAGGG------------CTCAGCAATTACAACCGATATGAACTTTTTACTATACATACAA----T
ACTTAACACAATAACATCTAATACATACATAAGTGGGTGTGACTAACATAATATTGTAG-TATAGTATTTGACTGGCTTGTGTGCATGTATGTGTAATTTGATATATTCAATAAGTACAACAGAGAT----TTTTTACTGTGCAACTCACGGTT
>nompA 6826354 6826557|6141 chr2R 6826233 6826411 scaffold_492 3554 3789 + 753|179 239
TGGGACCCT---CGAATATTCGGTGGTCCATTAAGTAGCCTAAGAATTGCACCACTGACCA
TAGGGTCCTGCACGTGCATTCGGT--TACCTCAGGTTACCTGAGGCTCA-ATATCTATCTG
>nompA 6826354 6826557|6142 chr2R 6826458 6827604 scaffold_492 3846 5104 + 34904|0 121
CCATGGTGGCCGAGTCCGAGGACAATCAGGAGGTCTGAGATTGCAACTCCAAG-------------CCTCCTGTGATTAGTTGTAAAT----AAGCTAAAGGTTTTTAAC-----TTCAGTT
CCATGGTCGCCGAGTCGGAAGATAATCAAGAGGTCTAAAACCCACGCACAAGGATATTTTGCTCGTCTTCTTGTGATTAGTTGTAAATAACCAAGCGAAAGCTGTTCGACAACATTTCAGTT
>zetaTry 6855090 6855163|6182 chr2R 6854769 6855188 scaffold_1 1709740 1710085 - -2842|323 396
ATTAATTATATCACCCATTCCACGTTTTGTAAATAAATTGGCTTCTGAAGCCACGTGCCTTAGGGTTTTCCGAA
CTCAATCTAAGAACATATTGAA--------ATAAAAACTGATTTTAATAGCTACTTAT----GTATTTTCCTAA
>%26thgr%3BTry 6857609 6857860|6189 chr2R 6857473 6857778 scaffold_1 1709771 1709997 - -1869|136 305
CTTCCCATCTGCCCATCTAATTGTTAATAAGTTTCATATGGATGATACAATTATGATTTATGGCAAATTTCGATGTTGCTTTCTCAAGTCTTTTAGCCAATCTATGGTGTCTCAGAAAAATTAGTATTGACTAAATTGTAAATATATATTAAACAGCCAAAAAGAGGAAA
CATTTCAACTGCAAAGCTGATG--------------------------AACTATCAACTACGCTACACATCA-----------TCAAGTTTTTTAA--AACTTA---------AGCAAAATCTTTA-----GAAACTGTCTATATCGTTCCGACTGCTGAATCCAGTAAA
>%26thgr%3BTry 6857609 6857860|6190 chr2R 6857848 6857894 scaffold_1 5309731 5309776 + 958|0 12
ATATAAATAATAA
AT-CAAATCACAA
>alphaTry 6860158 6860228|6193 chr2R 6860046 6860180 scaffold_1 1712483 1712634 - -82|120 157
GCCA---------------TTCAGAACATAGATGATTT
GTAATGGTTTCTTTGTTTCTCGTGGATACAACTGACTG
>alphaTry 6860158 6860228|6194 chr2R 6860227 6861003 scaffold_1 1706616 1707392 - 49855|0 1
GC
AC
>epsilonTry 6861136 6861183|6195 chr2R 6861077 6861194 scaffold_1 1709964 1710071 - 385|59 106
AGCCAGACAAACACTTGAAATAAATCGCAATTGAATCAGCATTGATAT
GAACATA-------TTGAAATAAAAACTGATTTTAATAGC-TACTTAT
>gammaTry 6864967 6865000|6204 chr2R 6864945 6866731 scaffold_1 1710004 1711950 - 44502|22 56
GAAGTATGCGAAATAAATTTCAGTTTGGATA-TTA
GAACATATTGAAATAAAAACTGATTTTAATAGCTA
>CG13202 6872021 6872072|6216 chr2R 6871240 6872021 scaffold_1 1713662 1714440 - 43622|781 781
C
C
>CG13202 6872021 6872072|6217 chr2R 6872022 6872432 scaffold_1 1718825 1719224 - -1272|0 56
TTTGTTAATTGCGCAATA------AAAATAAAAGACCAAGTTTATAGTCAGAATATA
CTGGATACATATAACATAGGCGATAAAGTTAAATACTACTTTTACGGCCAACGTGCA
>CG12384 6873807 6874022|6221 chr2R 6873827 6873930 scaffold_1 5324505 5324636 + -113|0 131
CTTTGAATG-CGATATTTACTCTTTAATTTTATATATGCATTTGCCACTGCATTCCATAAATTAAAA-------ATGCTGATTTTCTG-AGTTAATATTTT-------------------GTAATAAACTTT
GTTTGAATAATTTTGCTTAACATTAATCATTCCAAATGAATTTTTGCGCGAAGATCGTAAATTAAATGAAATATATTATGGTTTTTTGTAGATAAAATATTTGAAAGTGGTTAAAGATAAGAGATGAATTTT
>CG12384 6873807 6874022|6222 chr2R 6873931 6874004 scaffold_1 1725513 1725584 - 2236|0 73
AACTATTATCATTATCTAATCTCTTTGATCTTTTGTTGAAATTCTATGAGTCCTCTCAATGGTATTGAAATCGC
AATTTTAATTCTTGTCT--CTTTTTTTCTTTTTTGTTGTAACTTCACGAGTTTTCTCGAAGGCAATGTGACCGC
>CG12384 6873807 6874022|6223 chr2R 6874005 6874342 scaffold_1 5324722 5325080 + 12660|0 17
TGCGTACTCGGGCGGAAT
TATGTCATACGATAGTAA
>Tapdelta 6886193 6886359|6235 chr2R 6883333 6887067 scaffold_11 1038212 1041864 + 90877|3058 3322
GT---AGAGGATGCCTTCG---------TCATCGAGATTTTGAATGAAATTCATTCGC-------------ACTAAAGTCATG-------------------TACCATCAAATTGCCGGG-------------------------TCCCGGAGATTTTTCCACATTTTGTACACCTAAGCATCGGATCACCCGCCGCTCCAAAATAAACTGATTGAAA-----------------------GACCAACCG------AAGGAACCT
GGCCAAGCATGTGCCTGGAATGGGACGCGCGTCGACTTCCTGAATGAAATTCATTCACCATACCAAGTAGAAACAAATTCACGACATTATTAGCGATTCGCATGCCTGAAAGACGCCGGATGGGCTGCCCATCTAGTGTAACATTTTCTAGAGA-TTTTCCACATTTTTTATCATTAAGTCTTAAAGTTCGAGAATCGTGTAAATAAAAAAAGTCAAATGTCCATCAACCCGAATTAAGACGACAAACTGCATTTTAATGCATCT
>CG13200 6896447 6896588|6246 chr2R 6896360 6896919 scaffold_11 1057030 1057542 + 6049|95 236
TCCGAAACATGCACCCGGATCGGATCGAATGCACGCATGTGGCATGGGATTGTTGGCCATCGTAGTGATCTGCATACCTACTTACACACTAACCACACAACCATGAGTCGCACACCACTACCAACAGTAATTATAATACTCC
-----------------------GTGAAGGGGCGGCATGTGACGAAGCAATACTA-----CATAATG------ATAACTAATC-CGCACTCAT------ATCGTATTCCATACAGTACT--TAAATGTTTTTCAAATACTCC
>CG9027 6897224 6897475|6247 chr2R 6897074 6898235 scaffold_11 1057823 1058905 + 28211|150 439
ATATCCCTTCCAACGTGTCAGCCAAATCAAT--ATGCTGCTC---------GAATACTTTATGTGTAGTTGTGTAA-----------------CTCCAGGCGTAGTAACTAATGAAATGTT--TTCCCAATTTTCCCAATTCCCCCACCCACAATCACACTCACCCTT--ACATGTTTGGCTTACACATTTCCCTCAATTAATTGTCTCAGTTCA-CTGACTCACTCGATTT-----GCCGTGTGTGTGTTTGTGTGTAATAAAATCAACAAAAATTAACCGAAATCTAA
ATAT-CCGAGCAATTCGTAAATGAACTCAATTGATGTCTCTTTATAAAAAAAAATAACTTCTCTA-ATTTGTGTCAGCTAATAAACTATTGTGTTCTTACCACTGTACTCTCTGTAATGCTAACTGTAAAATTAACTAAAACTGTTATACACACGCTCTCTCATCATTCGCCACATTTGTTATACATACATTCACATATTGAATGACTGGCTATATCCGGCTTACTCCCTCTCAGTAGCTGTATCTGTGCATGTGTGT--------------GTATGCATGTGTGTCTGT
>sprt 6900640 6900967|6251 chr2R 6900300 6903091 scaffold_11 1062661 1065435 + 93029|378 739
AAACCCGATCCCAAT-------CCAACCAAAACTA-ATTGTTAATCGAAGTAGCTTAATCCTCGACCGATCCTAACCGGCGGTTAAACCCAAAAAACAGGCGGACATGTGCAAAATTACAGTAGGCAATATAATTTTAACCAGCTCCCAAGT--GGAAAGTTTCTTATTATGTAGTAGCAGT-------------AGTATGTACTTACATTCTATATCTTGTATAAGTAGGGCTTGGCTATCAAC---------ATTTAGTATTGAGAGAATCAAT-AATTAAGAGTTTTTGTATGTACGATGATTTTATTAGCACAATTTACAAATGTGAATACACGA-ATATTTTCACCTACTTAAATGC
GGCTCGGACCTTAATTGGAATCCCATCTGGATTTAGGTTACAAACTGGAGAA------------AGAGCTGCTTCGCAGCGGACTTCCC-----AGCAGGCGGACATGTGCAAAACTAAACCC--TAATTAAAATTACGAAATTTGTCGAATACGTAGAATTCCACATTTACCTGCAGCTATTAAAATAAATATAACTATGTACCTACCAGATAT------CATTATTAAGGCCTGGCTTCCATTTCGCGTTTGCTTTATTATCGCCAACTTGGATGAATCGGAAGATTGTTTGCGAAC------TCGATTAGCACAATTTTCA---------ACCCGATAGATATTTATTTATTT--ACGA
>Drip 6927849 6928292|6286 chr2R 6926537 6928982 scaffold_11 1095288 1097779 + 24773|1472 1999
ACAGT-------------------------------------GGCCGAATACCATATATGTATTTTTGTAAATGTCCGCACC---------TGCTT-------TCCATTCCCATCACACATTCGCTT---TCCCATCGAATTCGTTTGCCGAAATTTCTCGTAGTTTAGGTTTGCTCCACCATCACAACCAAGCTGAATTTTCAACGCAATTTGTACCA-TTTTATTTTTTAAACAATAAGAAAGCAAATGTCTCGTTTAGTTGTACCGCGATGCCCCAGCACTTTAAAATATGCAATATTGTATTTGAGTAATTTTAAGCTAAATTATATGCACATCATCATTACGCGAATCGAAGGAAAACTGTATTGAAGCTTAACTAAATTGTACTGGGAAAT-CACTTTCCAAAGCAGCGAA---CAGGTGGATTACCTACGCTGTTGATCGCC-------ACTTGCTGAGCACCTGCGAATTGTATT------ATGAC-----TATGTGTAATAAAAAAA-----TATAAAG
GATATTTTATCCGCGTATTCCGCCCTCACACCTTCTCGCTTGGGGAAAAACCCACATCCTTGTTGTTGTACGTGTGTGTATTGTGTGTAGATGCTTATTCGTATTCGTCTCATTCAGAAATGTGCTGACATTCTATCGGA-ACGATCGCACAATTCACAAGCCACTTAGATTAGCCGGGCAA--------AAGCCGCA----CAATACAAATTATACAATTTTTATTTGTTGAAAAATAAAAA----------TCGCTTCGTTTTA----GTCGTACTAACAC-CTAAAATATTGAGTATTCTATGTTTGTAG-CTTAAGATACATTTAATTCGCATGTTTATC--------------GAAACCAATTAGATGCAGCACAAATTCGTGCCTCGAAACGCAGTTTGCTAAAC--CGAATTCCACATTATTTGTTAAAATTGTTATTGTCCAATTCATAATTATCGAGCACAAATAAA-CGTATTTGATAAATGACAATTGTATGTGTAATAAAAAAAAAAACTATAAAA
>en 7039911 7040505|6413 chr2R 7039899 7041465 scaffold_11 1241089 1242856 + 30971|12 757
GCGCTGACCAATGGTTACCCATAAGGGGTTACTCCTT-----------CTGACGGG-----GGCGTGCAATATTCGAGGGCGT----------------ACAAATGGTTTTCATGTGATATAATTGT--AGCGTACA----TATGTTTTTGT-ATATATCTCTAAAAATATATATATATATACGTATAATCCTAACCTAGAGTAAGACCCATCCGTAGCGAATTCGAGCTGTAAG----------TTGTTGGCGTATTTATTTAACCACCCCTGGATAGCCGAAAGTATTATCGTAATCACCCGACACAAAGCCTATC------GCTATCGCCGCACTTCAAAAGCTTCGACCTTCAGACGTTTATTCCTACACAAAAC-ACTATCTATAGTTATTACTCCCTATA-AATTACGCGCTTGCAACCGCTCTGTAAAT-------------------------TAAGTAACTTAACAGTTCCCTAGCTTAATTCCTAGTTT--------ACACACTTAAGGATTGCTATGAAAGAGTATTT-TAGTTTCTAAGC---------GAAATGTT-------------------------AACGAGCAACTAATAGCTG-----GCAAATGCACCTAAGAAAATAACAACGAAATGTTTGTGCTAAAGCAAGTTCATGAAAAGAAAATTAAAAACAAAATA-------------------AAAGAATTATGGAAAAAAATTAA--AATGCAA
ATGGCTACCGCTCCCTGCTCTCCGCGTCCTGCTTCCTGCTCCCTACACCCGGCTGGTCCTCAGTGTGCAATATTAATAGGCGCCATCCCCTCGCTCCTGGCTGATGGCTGGTGGATTGTGAATTTGTGCGGCGTACAAAACTGTGTTTATGTGATATAATTGT---AATATACATCTATTGTCTCGTAA---------AGTATCGTATCGTATCGTATCGTATGCTATCTATAAGCTTCAAATTCTCTTCTCCGTTGTTATTTAAGCTAC--------ACAGAAAGTATTAT-----TCGCCTTTTCTGCAGGCCTTCTTAGGGGTAGCCCCCACCCTTCATAAATATTGCTTTGCAGTCTTGTATTCTAACCAAAAGCTAACAAACACGTTAATTCCTAGCTAAACAAACACTTTCTTATTTTGTATCTATAATTCAATATATGTATGCTTAACGTGTTATAAGTAATTTAAAAGTTCATTAGATTAATTTATAGCTTAGAGAAAAACACATTTAAACGCTTCGGCAAAGAAGTATTTCTAGTTTTTAAGTCGCAAAACGAAAATGTTGTGGATGAAAAATGCTTAAAAAAAAAACAAACAGATTATAAATACAAATTCAAATGCACCCAAAATAAAACACAAAAGCAATTTATCCGAAATCCATGTGCTAAAAACAAAAACAAGAGTAATACAAAGAAAAATTTATTTAAATAAACAACTATTTAAAAAAATTAAACAATGGAA
>tou 7094789 7095733|6474 chr2R 7094670 7096787 scaffold_11 1321204 1323335 + 40498|139 1246
TCCTGCACCACTAGCCAGCCACAGATCCAGATGGCTACCAGCACCAGCAGCACGATCACCATTGGCACCACCGTCACACCGAACAACATGGCCGTCACAGCAACGCATCCCATTGAAATGGTCACCCTGGTCGCGGCAACGCAGGAGGATGAGGAGGCAGCCGTGGAGACGACAACAGCATTAACTGAAGCAGCACAATTTTGGTCAAGAGATTAGTTTAGATTAAGCAGAGATTGTACATAAATG--------------------GGAGGAATGAGGAGAGGGTCGAGAAGCA--------------CAGCATACACATTAATATATATATATA---TATATTTATATATAGTAGATATATAAACACACACGCGAGAGTATTCAACGTCCTACGTCGGTAAAGACCTTGGAAAGGGGTAGCTTTGATTAAATTAAATCACCAGCCAAGGCGAACAACAGCGCAAGTATGCAAGT------GAAAAAGTGTATTCAGATTTTAAGTATCCAAGGCGGCAGCGGCAGCAGCAGTATATAAACAATAACTATTAGCCGACATAAACTAGCAGTTAGAAATCGTATCGCATAAGAAGCCATCTACAGTAGACGCCCGGACTGGATGAACGCTGACAAATGACAAATGAACACGTACAAAAACTGTCTACCAATTTCCGATCCGATCGATCGATCCATCGTTTGAACAGTATTTTGTGCACAAAGCCGCGTCGCTTTATTTT-------------------------------------------CTACACTTACAATTCGAACCCTAATTTTAAC---------------AACTATTTTTTAAGCACCA-------------------------ACGAAGCGCTCATTTAAGTTTTAAAGTGTATTTTGTACTTATA------------------------GCAACTCCGAA----------ATCTGTATTTAAACGTATTATA-ACAAGTGCTAACAGTTGCCCAGGCAAAAATGCGAACAAT--TATACTCAAAAAGGCGGTGCGAGGAGGACTTGTAAATGTAAATGAAAGCAAATTAAAATTAAATGTATTAAATTATTTATTCTGT
TATC------CTCCCCTGCCGCAGCTAAATCCAGCAACAGGCA-CAGCAGCACCAACAGCAGCAGCAGCAGCAGC------AACAACA--GCTGTTGCA------------------------ACTGTAGCAACTGGAA-GTACAACGACGACAATGCCGCCAC--AGACAAGCGCAAC---------AGCAGCACAATTCTGGT--AGAGATCAG----GAGAATATAGAATTTGTATATATATGAAGATGCACAGCTAAAGACAGGCAGGCTGGCAGGCAGGCAGGCAAGCAGGCAGAATTATTAGAAGGCTAAGCATAAGAAGGTAGCTGTAGTTTGTATTATTACGCATTATATTAAAACATATATATACACCAATATAGACAGTCCCAGTTC-----------CAGGAGGAGGT--CTTCAACTTGTGAATATCTATAGCCACGAACAAACCCAATG-AAATGTGTATTTTTTGCCAAGAAAGAGTTAACGGTTTTTAGTT-----AAATTGCA--AGCAGCAGCAACATTTA---ACTAACTATT--------TAGACTA-CAACTA-AAATGGTA------ACGAAACTAATTAGAAGAGCC-------------AGAAGCAGACAAAC------TGAACAGTTAC---------------------------GTGTGTCTATGCAACATTTGAACAGTA-TTTGCGCACAAAGCTGCTTTGCTTTGTTATTTTATTTGATTTAATTTAGATATTTGGATAGTAGTCGACTTAACTATAACTGTAACCGTAACTGTAATTCTAACTATATCTACTTATAAATCTATGCTTTATGAATTACATTGTACTTGATTTGATAGAAATCACGAAGCGCTCATTTAAGTTTTAATTTGTA-TCTGTACTTATACTTAGTGACCGTTCGCATCTGTTTGCAACCGCAAGCATTCATTGTATTTATATATATATGGACTAAATCCAAATCCAAAACCTAAATCTAAAACTAATCTTACCTATAATATACTCAAAAGGTAG--ACGGCAACGTTTTGTAAATTAATTCAAAATTAAATTAAATTTATATAAATTATAATACCGA----GT
>l(2)k14708 7132776 7132836|6515 chr2R 7132836 7134970 scaffold_11 1362974 1365158 + 75523|0 0
G
G
>CG9005 7136095 7136751|6517 chr2R 7136108 7136293 scaffold_11 1366881 1367076 + 1558|0 206
GCAGTTGTATCTCTCTAT-----CTGTATCTTTTGGGGTCCACAATACGCGGGTCAAGCGGCGCAAC------TAGCAATACAAAA----------AAAAAAAACTATGCAATGTGTGAGTGTGAAAACGCAAGGGAGGTAACTACGTATATAGGGCATACATGCAGATACCACATACAATATATATATATATATATTTGAATATAT
ACAAGCAAATATCTCAATTTACACTGAATCCCTGAGGATACACATTATTTTGGAAAGGAGCAGCAGCTCCGCATAGCAATACTAAGATGTAGTTACAACCAATCATATGCAATACGAGTATATAGAAACGAGTGCGAGTGAATAAC---TAGCGTGTCTGAGTGAGAATGTGA--------ATATATATATGTGAATGTGAATGTAT
>CG9005 7136095 7136751|6518 chr2R 7136341 7137015 scaffold_11 1367142 1367785 + 11572|0 444
TAGCTACTGCAA-GCCCTGGGCGGCACCTTCG-----AGCTGCTGCGCCGCCTGTGCAAGCAGTTGCAGAACAAGTGGCAGCAGCGGGAGGCAA---GGGAGCTCTGGCAG---TTGCCCAGATACCAATTGTAGAATGGGAAGGAGAAGGAGAGGAAGCAGGATGAGAAACAGGATGATACGGAGGGCAGG--TGGCGAAAGAAACTCCTGTGTGTGCGTGTGTGTGTGACAA----CCAACCAATTGCTTTACTAG----GATATCGTTTAATTTATCCCTAAGCTTAGTTTCCTTTAATATTTTTTGGTATTTGACCTCGTGCGAGGTTTTGTTCGTTTAGTTTGAATTTGAACTACTGGAAAATGTGT------------GCGAAAACATTGCGAAAGTAAAAAATGTTGAATATGAAAGCCAAGCCATCGAATTGGTCGG
TAGTTGCTGAAGCGCCCTGGGCGTGGCATGTGTCAACGGCAACTGCGGCG-----GCAACCTTGTGCGGCGCCTGTGGAAGCAGCTGCAGGCGCGCTGGCAACTCTGGCAGCAATGCCCCAAGTATCAACTGTAG-------------------------AGCATCGAAAATTGGGCAGTTCTCTGGACAAGCTTAACAACGGGGAATC------------------GAGACAAATTTCCGACCAGACGCTGTTTTATTCTCTGTCTCTCTCTCTCTGTCCCCACGCCCAACACCCCACCACAACTC----TGTTTAAGTCAGTTTAAGG-------CCTCTAGTTTGAATTT------TTGAAAATTGTGTTAATGCTAAGCAGAAAGAACATTGCGATGTGCAACAACAAC-AACCTAAAGATTAATGCCTCTACTCTCTCTG
>Roc2 7168733 7168808|6557 chr2R 7167444 7169020 scaffold_11 1401206 1402733 + 39845|1359 1445
ATATCTCCACCTGAT-ATTACTTTATGCTGTGTCTAAAAAA----------ACAACTATAAATAAAAAATTAAAAGTATAAACATAT
G-----CCACGAGATAATTAAATACTCCTTAAGCTAAAGCATGTAAGCGTTTCTGATATAAGCAATAACTTAGAATCAT---TTCAA
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CCATTAACCACACCCAACCACAGACAGCTG-CAGCAGCAA-CTCAGCTGCCACAATCTGTGGCGCCAATCTGAGCCGAGAGCGGCTCCTTGGTTGAAATGTGCATGTGGCAAGCGAACAAATTTGAACTTATCTGCCGAGCGAAATCGACAGCGGGCAAATGTTTGGCCTGTTTGGAGCTACTAAAACAGAAATTAGCACTTAATAAAATGTTATTTATGTTCATGTCGCATGTAATTGGACGGGCCTGAGAATAAAGCT---ACAAACAAATCTCAA
>CG13196 7200056 7200416|6603 chr2R 7200415 7200994 scaffold_16 574152 574745 + 18841|0 1
TT
CT
>wal 7204834 7204985|6611 chr2R 7204829 7205844 scaffold_1 2090853 2091908 - 54225|5 199
GGCGAGATTGTCACTTGCTGTAGTATAAA--GATTGTGTACCGATGAATTGATAACTGTTGCATTTATTTGAA--------TTTTGACATAAGTCCG-------------------------------TGGAAGATTTTCCCTTAAATTTTGTAATAAAA--CAAGCCGAAGACCTATTCTATGTGAAAATTGTA
----AGAATGTTTAGTTCTATAAAGCTAATTGATTCTATCAAATTTAAGATTTAAATTGTGCATTTATTTGAAAATAGTCTTTGCGGCAACTGTCCGCCCGTCGCTTCCCGTCTGCGCGCTGTCATAATGTTTGCTTTTCCTT----TTTTGTAATAAAAACTAAGCCGAACGTCTG-ACTAT-TTAATGTTGTT
>CG8991 7343070 7343266|6804 chr2R 7341773 7343074 scaffold_1 2297198 2298570 - 44342|1385 1389
AAAAT
AAAAG
>CG8991 7343070 7343266|6805 chr2R 7343075 7344161 scaffold_1 4939837 4941132 + 23526|0 213
ACATAGACCTTAGGATTTACCCCT--TAAAAGTAGTAG----------AATGTATTTATCTATGTATGTGTGAGTGTGTCAGTGTGTTTGTGTAAGCGGAAACGGAAATGGAGTCCAGAGGAGGAGAGGAATGCAGCAAAAGGCACAAAGTGCATGCGGTACTCAGTT---TTGATTCTTAATAAACT-------AAAATATAACTTATTGGAT
GAATAGGTATTAACATAAAAGTGTAGTAGAAATAGTAGTAGCCCTTATAAAATATTAGCTCATAT-TATGGAAGTATGCGTGCTGACTTAAATAAACATAATTACAATTATAATT-------ATAAAAAACTGTAGTA----GCACATAGTGCGGGCAAAATCAGAATGAATAAATTATTACAATACTGTACATAAAGCAACAGCAATATATGT
>S2P 7358008 7358215|6822 chr2R 7357157 7359862 scaffold_1 4959691 4962296 + 71207|905 1113
GAACTGAAATGGAAAACTGAAATGGATCCTGGGAGTTCAACTCCCTGCAAAGACGCTAGACTGCTATTTCACCTTCACGAAACACACAAAAACACAGCGAATTGTAGCACCTCAAAGATTCGATAGCTTTTTGTCATAGTCCTTAGTCTTAACTCGTATTTATTTTCGT-ACGGTTGTCGAGCTCAAAAATAAAATCAAATTAAGCTAA
G------------------------------------------CTTGCGTA----------TCCTCTTCTATCCTC------------------------------------------TACTCTAGGTTTTTGTTTTAAGCTTTATTATTTA--TGTATGTATTTATGTGGCATTAGCCAAGTTTGTG---AAGCTCAAATAAAATTTA
>CG8986 7378440 7378525|6839 chr2R 7378266 7379602 scaffold_1 4977830 4979317 + 34080|224 323
TTTGTAGTGTCGT-------CTAGGTC---TACAGCCCATGAATGTAAATATTATTTA----TGATCGCTGCCATTAAAGAGAGTTTAGAGAAAGCAAAA
GATAGGGCTCCGTCGCCATACTAAGACTCATACAAACCATG--TGTAAATATTATTTATATGTAATCGCAACGTTCAAGTTGAGTTCCTTGATATTAAA-
>Damm 7381102 7381249|6840 chr2R 7380075 7381994 scaffold_1 4981430 4983525 + 1377|1111 1363
TGAGT----------TGAGTTATA----------------------TATTAAAGAATTTCTTTAAAATATATTTA-----AGATACTTTC-------TGGTCAGAGTAAAGTTAAATGACAGATTCAACTGATCCATATATT----TACTT--TCACTTT---------GTCAAACTGTAATTTA-------------------------------CTGTGTTGATATCTTATCT---------------TTA
CTTGTGATTAACATCTAAGATATAGCCATACGCTAGAGCCAATACGTGATAGAGACTGTATTCCAATTATGTTTACATACACATATATTCATTCATACAATTCGGATATGCACAAAAAACGGAAATAGTTAAGATATTTAATATGCTGCTTAATCATGTTCCTGTCAAAGTTAAAATGTACTTTAACCTGGGATTACCTCTATTGCTTTTATCTTTCCGTTTAGTTATCTAATCTGACTGCAAAAGCTAATTG
>CG13185 7383783 7384050|6841 chr2R 7383856 7385668 scaffold_51 396180 397974 - 74120|0 211
TCATTGCATTTACTCTTG--AGATAAAAAGAAGTGAC------------TTTTACTTATTAATATTAA---TACAGGCTTGAATATTTAGCCCACTTAGTTATATTTCACATGTAAATATTAACTTGTACAAACTGAAAATGTGACCGAGTGTACGATTGTTCACTAATGCTTTTATAATTTACTTGAAATTGTTACTTTTTTTATTTTTTA
TTGTTTAATTTGTATATAGTAGATGTATCGGACGAACCTATATGCTATTTTTGACCTACT--TGTTAAGTGCACAGGAGTGAACATTT-----------TTTTATTATTTTTGTAAACCTT-------------TGAAAAT-------AATGAACCTTTAT---------ATTATTTAGTTTAACTGAATTAAATTTTTTCTTTAATCGTTA
>ERp60 7403470 7403651|6845 chr2R 7402601 7405690 scaffold_51 414491 417581 - 94494|888 1095
GCTGCA---CGCCGGGTA---------GAACTGGC-----CGCCAACTAGCATTTCCATATTTTTGTAAAATCGAATGCATTCTCCA-CAATACTTGA--GCAAAAAA------TGTATTAAATTATTTGATAGTGATGAAACGCGTACGAACACAATTTGATGATTATGTCGCAATAAACTTAAATCTTCATTTAATTAGTTAACCA
ACGCCATCTCGCCGTCTGCGTACATCTAAATTAGCGTGTAACTCAAGTAGCATTTCCATATTTTTGTAAAATCGAATGCATTCTCAGCCAACAGCCAACCGCAAAAAACACATGTGTATTAAATTATTTAATAGTG-----------------------TGATGATTTCTTGAAATTCAATTAATACTGTCAATAAACGTAATAACTA
>CG30038 7411898 7412031|6851 chr2R 7411923 7412730 scaffold_51 422363 423200 - 28451|0 134
AGATCAGTGGGT--GCATCCACTTCA-----CTTTACT-AAATATTTAAG---------CTAGGAC-----ACACAGAGTACCATTTTCCCACACTGT---TTCACCTTTTTGTGCAAAT-TACTCCAATGTAAA
GTGCCAGCAGCCTAGCAGCAATTTAAAATGGCTTTGCTCAACCATTTAATGGATTATTCCAAAGGCTTTTGACGAGGTGAACATTGTTGCCAAATTTTCCATTCATGTCATCGTCGAGATATACTCAATTAAAAA
>CG13183 7420230 7420746|6858 chr2R 7419481 7423446 scaffold_51 429738 433794 - 95140|875 1492
TC----ACTTTGGCTGGCCCTAATTTATTCATCGTCTAGCGTTAATTCTAAAATTATTTAGTCAAAGCCTACG---ATTAAGTTTGGTCAGTGAAGGATCATCGATTCACTGGATCACTGTGGAGTGCATTTCGCTCAGTTTTG---TGATAAATGCAGCGAAATGCAGCCATTT------------------AGCGTACGTCACTTAATACGCACTAACTCT-------AATTAACCGCAGTTAACTTTAAGTCA--AGCAGAGAGATTTAATGATTATGCAATTTGTAATGAGTAATTAAAATTTTGCCATAGTTTCTTAAATCGTTTAAGACTGAGAGAATGTCCTAGAGCCCACG-------------------------------------------ATAAGCGCA-------CGGAGAGTTTGGCTG-AGATTCAGGATGGGGGCAGATAATGTCATATGCAAATTAATTGCTACTTTAGGCAAGTTCAATTTATTATTTTCTTATTATTTTTCTGTACATACA-CTTCATATGTAAATAAGATCAA--ATTAAAAACATGTAATCGATATTAGTACGCAT-----TAAAAAAGAGTTATGAAA-----GTC
GCTGAAATTGGAGCTGGCCCTAATTTATTCATCGCCTAGCATT-ATATTATAATTATTTAGTCAAAGCAAATGTTTATTCAATTTGGTCA-----------------------------GTGGAGTGCATTTCGCTCAGTTTTGTGATGATAAATTACGCGAAATGCAGCCATCTTTGTCGAGCATAATTTTGGACGTATTGCCAATAATAGGCATTAACACTTATACTAATTAAAACGCAGTTATGGATTAGACACCAGAGATGAGATTTAATAATTATGCAATTTGTAATAATTGATTAAAATTTTGCCATAGTTT-TTAAATCGTTTAAGACT--GAGAACGTCCTAGAGTCGAGGTGTGTGCACAAAAATAAAAGAATAAGCAAGAAATATGAAATATATAAACGCAATAAATGCGCACATTTTGATAGCAAAGAAAGTATAAGG--ATTTGTTGTCATAGGCAAATTGCTTGCTACTTTAGGCGATTAACTTTTATTGTTTTA-------TTTCCTGTAAATACATTTTCATATGTAAATAAGTTCGAATATAACACACATGTGAACACTATATAAACGTTTATGCATAAAAAAAAGTTTTCAGAACTGTGTT
>CG8979 7483243 7483436|6935 chr2R 7482860 7484329 scaffold_51 505037 506711 - 30935|482 729
TTAC-------CAGGAATGCCATGTATAGTGAGCAATTCAAATCTTTAGTTTAAAGCAATGAAAAAAGTTTTCATTT------TAGAAGACCA-----------AAATTAAACGGA----------------------TTGTTTTAA----AAGATTATTTTTATTACGTTGCATACACAATACAGAATATTACAGAATTTTACAGAT----ATAAAATAAAAAACAGCAGCCTGTTAGACAACGCTT
ATACGCATAGACCCGACTTATGGATATGGTCTGCTTATAAAATCAATAGTTTAAATGCATTACAAAGTTTTTCAATTAGAGTCTGAAAACCCAAATACAATTATAAATTAGACAGAAGAAATGCTCTTTACATGGTTTTTACTTTAACTAGAATATAATTTTTATTGTTGCTCATATACAATACAGAATAC------ATATTACATATTACGATAAGAACAGACAAATCAGCCTAT------ACATTT
>CG33145 7496488 7497636|6944 chr2R 7496415 7497078 scaffold_51 514659 515316 - -2433|74 731
TTTAAAGCTTCGGCATAGATTTTTGACATTCAGTTCCTATAATTTCTTGCGGACCACA------------TTGGGATAAAATGTAATCAACTTGAATTGAACAGTGATAATTAATCCTAAAAAGGTCATACATACAATGATTTTGATTTCATATTAGTTTATGACGATAACTTCGC------TTGTCAAGGCATGTATATACAATTTTAGATG--GCCTAGCACTC------------TCAATACTC-------CATATCAA--------TGTTAAAAGTAATGCACGAGCTAAATATCTCATAAATCCA-TATTCTTATAATCTTAAGAAATTATTTAACGACATAGTGTTTATAATAGAAGAGAAAGTATTTATTTTTGGACATGACTCGCCACATATATGTATCCTTATTTACCATATGCTGTAAATTAGTTTTTAGTTGGCACACATCATCAC-TATCTTTTCTCTTC-------------TAAACTAAA----ACTATCAACTATCTATTGAATTGACGCACAGCAGTGTTCTTTAATAAGAAACCATTTTCTTAATTTAT-GATACGTTATAGAACTATATTAATTTAATATGAAAGATTGCCAAATAAACAAATTGTTTCTGTTCAAAAGAGCGAATAAATTTTAAAACCA
TTGAATACTCCGACAAACAGTTTTG-CACACACCTTATATAACGCGTAGCTATATAAAACTTTTTTGTTCCTGAGATTATTTGTGGT---ATTTAAGTGAATTTTCATATTTTAGTTTAAAAGAAAAAAATTCAAAATAAT---------GTATAAG----GGCCGATATTCTTGCACACCTTTTTTGGGTGCTATTAATACTATTTGAAATATTATTTAACAAACGCACAGACTTGTTCAATTTTCACATAGTTATATCTACTACAATCTGTTTAAGCAAACGCACAA---AAAGACCGAAAATATGCACTAGTTGCATAATTTC----AACTCCCCAATACTCCACTTTATATGATTGCA--------------------ACTGGGTTCGTGACTTTTGTTTATCCGTATTAA-------ATGTGAATTATTTATTAACAATCTCATTGCGCCAAGTATTTATTTTTTACAATTAAAAAAAAATAAAATAAACGATATTATTTAATATCAATATACTCTATGCATTAC----TTTTATGACTAAGTATGATGATGTTTGTTTATGGGCGTGTTCTGA----ATTTTCATGTGCCATGGTATATTATTGATTTG--GGCTAGTTGCTTTTCGAAAACGAAAACAAA---------AA
>CG33145 7496488 7497636|6945 chr2R 7497113 7500286 scaffold_51 515353 518552 - 91822|0 523
TCACTGCACCGCAAACCCGATTGAAAGCCAGCAGCGATGTGTTGTACGGCCATCAGTTTTGCAACGTGGTGCCGGTTAGCGAAGTAAGCAGCAAGTGGTACATGCCCTCATACATGTATAAGCCGGAGTCGTATCCAAAGTATCTTTCCGGAGCCGGCTATCTCATGTCCATCGATGTAGTGCAGCGCTTGTTCGAGGCTTCGCTTAATACGACGCTGGTCTATCTGGAGGACGTGTACATCACTGGGTTGTGTGCACAAAAAGCTAAGATCAATCGACACCACCACCCGCTCTTCAGCTTCGCCCACTCGAAACAGATGTGCGCTTTCAAGGGCACCATCACACAGCATCAGTTAAAAGACGATAGCATGGTATCCGCCTGGAACTACGTGTCCAACTACTCCATCAAATGTCCGCCTCCTGGGCGGTACTTTAGCCAGGTGCGACTGCGCAAGCGGCCTATCTGTTAGATGTCCTAACCTAGAACTTCACGGTAAATTTATCCACTACCCCTTCCCATTTCT
TCATGTCGCCGCAGAATCGACTAAATGCCACCAGCGGGATCATGCGTGGACATCAGTTCTGCAATGTGGTGCCTGTCAGCGATGTGACAAGCAAATGGTATATGCCCTACTATATGTACAAAGGTGAATCATATCCCAAGTATCTGTCCGGTGCCGGTTATCTAATGTCCATTGATGTTGTCGAGCGTTTGTTTGAGGCCGCGTTGAACACATCGCTAGTTTATCTAGAAGATATTTTCATAACTGGTCTCTGCGCGAATCGTGCCAATGTTAAGCGGCAGCATCATGCACTCTTCAGCTTCGCCCACTCCCCGCATTTGTGCGCCTTTAAGGGCAGCATAACCCAGCATCAGGTGAAGGCGGAGAGCATGGCGGACGCGTGGCGTTTTGTTTCAAATTACAGCATACAATGCCCGCCACCGGGACGTTACTTAAATCATATGCGATTAAGGAATCGAAATAATTGTTAAAGCACAAGAGCTGTGAATATGCCTCGAAAATGT---TGGCCTCCTTCCATATCT
>RnrS 7499048 7499335|6945 chr2R 7497113 7500286 scaffold_51 515353 518552 - 91822|2046 2335
GGCTGGCCCCGGACATCATTGTTGCAATTTAAACCTCTCAAGGGCTGGCTTCTCATCCTTTATATTTTAATCTGACGGCAATTATATGTAGTCCGTTTTAATTTTAACATAGGCTAAGAACAATCACAGACCTTCAACACATTCACCTAATCATTTACTTGGACCTCCAATTACGTTTATAATACTATCTACACACTTGACTTTTACGAGGAGCGTACCTTTTCCGAAT--TCATTGTACATACAACATTTTAAATAAATTTATACATAGACAATTATTAAGCACTACAA
AGTCG------------------CCAACGCTATCCACACAGCTGCTGGTACCGGGTGT----TACTTTTAGC-GATTGCAATTACAT-TAAACCTTAACTATTTCTGTATATTTTAAGCTCATTTTCTGAC-----GCATAGGCAAATCATCATTGTC-----------ATTCCTTTTACAAAATTATAAGCTCATTCAATCATTTTGTCAACTGTAC----TTCAAATTATCATTGTAGAT--AACATTTTAAATAAATTTAC-TAAATATAATTACATA----TATAA
>rho-7 7502621 7502778|6947 chr2R 7501835 7502687 scaffold_51 519386 520189 - 14118|814 880
GACATCGTTCTGCCTTAGAAGTTCATTGAAATCAGTTAAGTTGAATAAATCGTTGACATCCTGTACT
GAGATCGTTCAGCCTTAGAGGCTCGTGTTATCTTATTAGGTTCAATAAAATGACAGAATTATA-AAT
>rho-7 7502621 7502778|6948 chr2R 7502766 7503464 scaffold_51 520249 520951 - 28575|0 12
TACAGGAGGCTTG
TGCAAATGGCTTT
>otk 7517385 7518031|6967 chr2R 7517325 7518264 scaffold_16 1821233 1822256 - 12731|64 872
-GCCAGACTGATGGCT----------------------------------------CGATCATGCCAAAAAGTAATTCGTAGTATTGTCTTAGTGTCTGCACGCCCGAGTTTTGCTATGCGCTCAGAAACCTAGTCTTAAGGATCGAAGGATAACTGCGCCTGTTTAACATGCGCATTGCGC--ACTTGGTGGCACA---CAGAATGAAGTTAAGCA-GCTACTGTACAAACAC----------------------AATGTATGG-----AAATGGGGATATCTTCGTGAATAGTAT---------TGCGTGGTGCTGCATATTTTTAGGTATGCAGCTAAAATGTACATAATAACTGCCACAAATA--TGCATTTAAACCAGTTGAAGCATTTCTAG-----GATTAGATCATTTCAACCTTCGTCAG---CATTTAATAATCGAC------------------TTCTAAGCT--------------------AAATTAGTAAATAAAATAAAATATAAATACACAAGCATATGC----ATCACACAAAACAACGAGCGATTTCAT---------TGTTTTCAA---ACATTGAGAAACTAAGCCAAATTTTAAGTTTAGCATTAAATATAAATAACACACACCACCCACATATTTTATC-------ACAAGCCTA----GTTATACACTTTTTAATGCGTAAGAAACAAAC-AGCCGAAACAATTTTATGACTAGCCATTTAAGCTTTGATGCATGTTTACAAAACATTTAAATAAACTCGAATA---AAATAAATTTAATCAG-AA
TGCCAGACCGATGACTGACTTAGTGTTGGTAAACGTTGAAGCAAGAAACAGTTTGCTAACTACGCCAAATA-TAATTTGTAGTATTCTCTTAGTACATACATGC------------ATACATACATAAAAATCGGCTTAAGTTAAGTTTGATACATTTTCGAGGTTACGTCTTGCATTGAACTGAGTTATTTTCAAATGCCAGACGCATGTTCAACATGCATATTTATAATCCCAACTTAAGATTAATGTATTTTAAATGTATAGACCATAAGCATTGATATCTTCTCTAA-AGTATTTACATACATACGTGGTGCTGCATA-----GAATATGCAGCTAAAATGTAAATAAAAACTGCCACAAACATTTGCATTTAAACCAGTTGAAGCATTTATAGCCGTAGTCTTGGCAATTTGAAGTATTCCAAGAAATATTTTAAAACTAACCCAATGAATATAGGATTATGCTAGGCTTAAGTTGATTTTATTACCTAACAATTGTAAGCAATACGCAAAATATATATA-AAATATTTGTGAAAGTTACAGAAAATACACAAAAATTTAATCACAGCGTGTATTTTCAATTTGAAATTAACAATTAAGCCAAACTTCAA-TTTAACGTGAAAACTTTTAAACATATATCATATACATCATTTTTCTATACAAACATGCATATTACATCAAATACTTTAAACTTAGGCATAAGCATGTAAGCCGTAAAAAATTTATAACTAGCATTTTAAGCTTTGATGCATGTTTACAAAACATTTAAATGAAATAATAAACACAAATAAATAAAATAAGCAA
>CG8964 7539053 7539334|6994 chr2R 7538879 7543791 scaffold_16 1852263 1856808 - 130077|200 503
GGAGTAGTGCTCCTGCGCCTGTGGAG----TAACCTTTCA---GCCACTTTCCATGATC------------TCGCTAAACATGCCCCTCGAAAGTTACTCCGTTCTG-TTGTTGAGAATCAAAAAGGAACTTGTGAAATCCCC-CAGAAATCTATTTGTATTTATATATTTATCTAGTTTATATATATATAAATATTTTATGTATTTATGCATGTGTGTGTCTCTGTGTATATATCCCATGTACAGTTATTTTTTAGTAGAATAAATATTTTATGGCTCTCATAGAG-CCCCATTTTATAGCGC
GACATGG-----------CAGTGGAATGTTTGGCTCTCCAGTTGCCACTTTCAATGATCTCTTATGGCTGGTCGCTGGCCA--CTCCACATATGTTAATCCCATTTGTTTGTT-------------GAACGTGTGAAGCCCTTACCTAAAACTTTTTGTATT--TATATTTATCTA-TATATATATATATATATATC---TATATTTATATTTGTGTATATCTATGTATATAT---TCATGTACAGTTATTTTTTAGTAGAATAAATATTTTATAGCTCTCATAGAGCCCCCATTTTATAGTGC
>CG8889 7541488 7541750|6994 chr2R 7538879 7543791 scaffold_16 1852263 1856808 - 130077|2754 3020
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ACTG---TTTATAGTCGT-GTAGCAAATATACCT---------------------------CAATTCTAGACTGTAT---AATCCTATAAATAAGCAA------TAGATTCTTTTGAACTTATATAGCATGTTATAATCAAAATATATCTAA--------------TATTAAAGAACTGATTAAGTAGAAGGATTGCTAGGCTTATATCTTAGCTTAATAGCTTAGCTTAAT----------------ATTATAACTGAGTATTATA
>jeb 7606529 7608515|7056 chr2R 7604586 7607708 scaffold_16 1938702 1942235 - 16188|2490 3821
TTAAATATATATTAATAGTATACATATACCAATAACAAACAAATATACAATTGAAGAAAATATTGCATTAGGTTTTATTGCTGATAACTGAACAAGCTAACGAGTGCAATATA-ATATACTTATATACAATGCAATAACAGCAAGATTAGCGACAAAAACAAACATTTACAACTTATGAGAATGAAG--CAAACATTTACATAAAGAAAAAGACTTGACTTCATTGAAAACCCAATTAAGTTTCTATAGTACTCAGATACTTTTGGTTTTGAACTTCAACTCTCGTTGTTAGTAATACGTTTGCCATTATAGATGATT-TGCTCCGATTCTTTGTC--CTTCATG----TTTGTAAATAATACTTTCAATT---------------ATCCTTTTCGTTTGCCTGTAAGGATCTCTCCCCCTCCAT------------------------------------------------------ACCACAGTTTTTGATTTCGTTCATGAGTGACAACAGTTCTCACGGAAATGGCAGCTATCTGTAGTTAAGTAAATTTATTTACATAATTGAACTATGTTTAAATAACAATGGACTTATAAATATATATATCTATATAT------ATATATATATATATAAAACGATAAGCTTATAAGCGAAA---------------CGAAAAGCTTGTACAAATGCTAACTAACACTAATCCATTCTCGACCTTTTTTCGAAGCCACAAGTGTTTATTCCTAATCGATTTTTGCATTAGTTTTTTATTCGCGCTGTTTTT---------CTCGATTGGAAAAGCTGAAACTCAACCTT------------AAAACT--------------------CAACCAACAATGTTATCTGGTCCATGAAAATTATTCGCTATT--ATTATGCCTGTTAAGTG-GCGAGTTTCCAACACAATCAATCAATTATGAAATACAATCAAGCAAATTTTTAAGCC-----GAAATTTACAAATTAAAATTTTTAAACGGTTGTGTACGCAAACAAATGACAGCGGCAAAAGCAAAAAGCGCAAGATAATACCAATGGCGAATTAACAATAATAATGAATAACCTCTAGAGCGATTTTCACATACTGCATTTCCCGCGTTTTCCCCCGAATTTCCGCATTAATTTCCGCATTTCATTCAATTGAAATATTGAAACACGGCAAGCAAGCGTTTTAATCGCGATTGAC---TTTGTGGACTTAATCAATCGATAATTGGTGTCATTTATTTTTTTGCACGTATGTATTTGCATGTTACTAAATCGATTCGTGTGAATTGCTAAATCCTAAAAAAAA
TTAACGATTTATCAATTGGAT---TGGATAAATGTCGGATAACTAAACAATGGCCGTAGGGTCTACGC-ATGTCTGA--AATGATATATAAAAAAAAAAAAAAA-ACAATATATATATATATATATATATATATATGAAAGAAAGAGCAG--------GAAAACATTTACAAACTAATACAATGAAGGTATAACATTTACATAAC-AAAAAGACTTGACTTGATTTTA---CTTATTATGTTT------------GATAGTTGAGGTTTTTTAATTTATTACGTATTATGCGTATTATGCATTTAATTTACAATTATTATGCTAAAGAGCTTTTCCACCTTCAAGATATTTTGTATTTAATTCTTACCATTTATGTGCTGTGGCTAAACTTTTTCATCGGTATGTAGAAATCATTTTTGACTCATTTTGTACATTAGTTGCTTGCTGTTTCGTATATTTCGTCTAAGTAAGTAAATTTTATCTCACCTTATGATTTC-TTCATATATGA-AACAGTTCTCATGGAAATGGCAGCTATTCGTAGTTAAGAAAATTTATTTAAATCA----AGTATATTTAACTAACAATGGACTTATAAATAAATAACGAAACAAAACCCTTAAAATGTATACAAAAAAAACAAAAAAAAAAAAAAACAAAACTTATATTATTTAGTTAAAGCCCTGTAAAAACGCTAAC-AACAAAAAACAAAT-TCGACATAA---AAAATCAAAATATATTCATTTCGTACTGACTTCGCCATT------TTACTC-CGCTGATTTTTGTTCCCCCCGCTATGAGATGAGCGCAAATACAACCGTTGACTGTGCTAAAAAACTATAAAATATAAATATACAAATGACAAACAAA--CAAATGACAAAAGTAAAATTTTTAATATTGCAATATTGTTATTATGCATACGGAGTTACAACAAA--CAATCAATTAAGAAA-ACAATCAAGCAAATTTTTAAACATAAAAAAAAAATCGAAAAAAAAATGTTGAGACGGTTGTGTATGC--------GGCA-CGGTAA------------CAAATTAATAACAAT------TAAACAATAATAAAAAAAAA------AAACAAAT-----------------------------------------AATAATTTAT----------------AAAAATTCGAATGCTTAAAATAAAAGTCT--------ATTAACGTGTTTTGGGAGCTATTCAAACGT--ATTCTCGTC-TTTATTTTATAAAACCTTCAATGCCAACTTTTATGTAATAAATAAAAGAAAAAAAACAAAAAAAAAAAAAAC
>jeb 7606529 7608515|7057 chr2R 7607718 7608073 scaffold_16 1942474 1942839 - 5819|0 383
TACATACTAAAGCTAAATTACAATTCAGCAAAAGGACAAAAAAAAAACGATGTTTTTTT-----CATTTTCAAACTTGT---TTCGCAGGAACAGAAAACATAATGAGGAAAAACAAAATTGGGCCTAACTATTTTTAGTATATATTAAATAAATATAT-TATAAATATATCTTACTATATGAA---ATATAT-TTCGTGTACATTATTTAATTATACGTGTATTAAAGTTAAATAATGTTAATGTTAAATAAACAAATGAAATGAAATGAAATCAAAACGAAGCAAGCAAAAAGAAAAAAAGCGATAAAAATAACGATGA---------------GGCAGCAAGCAGAAGACGAATGAATTATATATACATATACACAGAAAA
TATATATTAAAAAGTATTCAAAATATATTAAAAAAATAAATATATATATATATATATATATATATATATATATACATATACGTATGTGAATACATACAATACAGT--------------TTGTATTTAAATATATATA-TATATAT-ACATATATATATATATATATATATATATATATATAAATATATATATGTTCGTGTACATTATTTAAACATACGTGTATTAAAGTTTA--AATGTTCATGCAACAAAAACAAAAGTAAATCAATAAAAGCGAAAGAGATGAAAATATTGAAAATAAATCAAAAAATGCGTACATGAGCGAGCTGAAGTGCTGACAGTAGGGGAAGAGCAAAAGGGTTATATATACATATACAAATGAAA
>jeb 7606529 7608515|7058 chr2R 7608119 7608500 scaffold_16 1942875 1943229 - 480|0 403
CAACCACACACACACATACACACACACACACCGTCTAATACACA-GCACACAC-----AGAGAAAATACACCTAGCGAACTCACATTGACAAACAATTAGTTTTAACATGTCGCCCCAAGCAAACAAGAACCCTGTTAAGTTAAACATTA-TCCTGGAACCAGACACACAGACAAGCCACAAACCACCCGCCTATCCTTTGATGTCCT-TCATGAGAAAGATTTTCCCGAGCAAATACCGTAAAAAAATCCCCAGCCACACAAAAATTCAGCTCGCAATGGGCTAAATGGACAATTGCCAA----GTATGAAAAG--CGAAAGCTATGATTAAAAACAAAGTGAGGCAGAAAATGTGCTTGACGAAAGGT--------ATGATTATTATTACACTATTATTATT
CACACACACACACACATACTCACACACATACTAACCACTCCGCCTGCCCACACCCTCAAAAAGTAAAAAAAGTATTGAAC--AAATTGCAAA-------GTTGTGGTATGT--------------AAAAATCCAAGTAAAACAAGTACTAATAATGGCAACAAATATTTAAAAAAAAAACATATGATTTG---ATCTATTATTACACTATTATGAATTAAAAC------AGAAAATAAAACAAACAAAAAAACTACCAATCAAGAACT--ATTCAAAA---GATAAACAAAAGATTTCTAAAATGGCGTTAAATTTTCGAAAAGTA-----AAAAAAAAACACAAGTGGAAAATTTTGTCGCAAAAAACTTGCCCCAGATGGTTTT-------CTTTTATTGTT
>skpB 7655291 7655345|7112 chr2R 7655230 7656038 scaffold_16 965385 966218 + 25900|62 116
ATACCATCAACTTACCATGACGAAATTAAAGCTTAAATTTTTTGTTTAATCAACA
GTGAGCGCAGTCTTTAATAGGGGAGT-----------TCCTTTATTGTATCTATT
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T------ACGATAGTTAGTTAT----CCCAATATCCTGCCCTCCCCACCCCTCCCCTACCTTACACAACAAAACAAAACAAATAATTAATAG--CTGCTGCTAAATGGCAACAAATTAGTGAAGCCTGGCAAAACTACATGAATTAACAGTAAATACAAATAACAGTTCTGCTGCGTTTTCAAGTATTTTTTAGAAGTAAACTATAGCCTAAGTGAAAGAGAGACACCAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGCGCGAGGTGAATTTAGAAAGGTTACGCCTTCATTGGATCAATGTCTGTTCATAAAGTTGTTGCA-GCACACTTAAAAAAAGTGAAAAAGCACAGAATTTTGTGTCATTTCTATCGTTCTT--TCATTTTAT----------ACAACA----TTTTTAAGGACATATTCAGC----------AGAAATTGTTACAGTACGTACATGCAGACATATAT-----ATACATATATATAGGAGAGATGAATGTGT-------AGGCACTGAGACAGGTGCACCGTTAGGTTATAAATTGGCCTTGATAGCAAATT----ATTGTTTA-ATTTTAATTTTATTTGAAAGTTTT---TAAGTTACGCTCGCTTTAAGTCGCACCCGAATCGATTATATTACATAAATGATAATATCCCCTCAAA--------AGAAAAAAAAAAAAAAGGAAAAAAAAGTATT-----TAACTAGATGAAGGTTATTATTGCATAAAACATAATTATTAAGTTTAAGCTAGGCTATAAACTGCGTATAT------------AAATAAAATAACTAGAAACTGTATGTCATTAACGATTACCTATATAAG
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GCGGTGCGCATATGGAGTCTTAGGGTTCTCGT------TTTAGTGCATACAAACAAA---TTTATAAGCCTGT-TTTCAATATGCTAGCATGTAGGTACATTTTGTAATAAA----------AAAAAACCATTCTTTTCCC---------------------------AACAA
AAAAAAAACCTGTAAAATTTCTGCATCAAGGCGAGATGTTAAGTGCGTACAAAACAATTTTTTATAAATCTGTATGTGAGTGTGTCCTACTAAAAGAAAAGCCTTCAATTAATTTCCACATTAACCAAGTTTCCTTTTTCCTTTTTTTTTTGTTTTTGTTTTTGTGTGGACTA
>Oda 7682479 7683304|7127 chr2R 7682455 7683179 scaffold_4 789463 790260 + 8191|24 854
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GACATATTGACCCCAAAAAGTGTTCAATGAAAATTCAAACTTCAA----ATTCGAAAC----------------------AAATCGGTTTAAACTTTGTCAACGCCAACATTTTTTTCCTTTTGTAGTTTTTCTATTAAGACCCAATTGAAATAACAACATTGCGTTAGCCACGTTAAGAGCAAGCTATCAACTTGTCGTAAATTATAACACACAATATAATCCAATTA-AACAAAGAAGAAAAAACAGTAAAAAAAAAAATGTAAAA--AAAAAACACTAAAACTACGAAAAAGTAAAAAAAAAAAAATATTGTATTAATTTTAAGTTTATTTTTGTGTGAAATATTGCATTATATATTTATGTTTTTATTTTCTATTGTTTTCTGCATATTAACTTCGATTTTGTTTTCTAAAACCAATTTTGTTCTACTCTAAATTATATATTTCTCCTTATAACCAACACTTTGCGTAAATCCCACTTATATATATATTC-TATGTAAGCAAATATTTTATATATATATACATATATTCAACCTTTTGTATACTTA--------TGTACGTTGAATATGAAGCAAAGAAGCATTCGATAGCAAAACACATACATACATATTTATATAATTAACTAACTACGTTTAGCAAGCGAACACACGTAAACATATACAAATATATATTCAAATCAATAAATAAACTTTCAATTCAATAGATTAAAAGTTAACACAAACACACACAAAACAGCAGCAAGAAATCGTGAATTAGTATTTTATTTACACTTATTTTGTA-------------TAATTCTAATTTTCAAGTATATG---CAATAAAA
>Oda 7682479 7683304|7128 chr2R 7683206 7685158 scaffold_4 790290 792191 + 73638|0 133
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GAAATTGATAACGTTGGCAACAGTTTAGGGTCAAACGATTTGTAGAATCAAATAACCAATAACCGATTACTTATATTCAAATTTATCTACCACTATTATCAATATCTGTAGTGTTTGCCGTTATAAGAAATAAC
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TCGATGTCTTAGTTTCGTTTTAGTGTATTTGAACAGGGATAGCCCCTTGTTTAATGTAATTTTCTTCTTTTCCAAAGAACT-TGTGGATTAATAAAA
TTGAATCTTTAGTTA------ATTGTATTTTAGTTG-------TTCTTGATT-------TTTGTTTCTTTTCCAAAGAAGTGTGTTGATTAATAAAA
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TTACATGTAGTTCACGATTCCACGCGCATCTTTAGCGAAATAAATGCCCCTTCTTCGGATTTTATACACACAATACAAT
TTCAATAAAAGTCAACAATCAACGC-------------AACACACAACTACAATTCGGAATATATGTATATACTAGAGT
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AAAGCGGCAGGTGGCCCCCGGACCGGA-AAGAGA
ATCTTGGCGATTGGCAATTGGTCAGGAGGAGAGA
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CCAATGGATTCAC------------------------------CTACATACACCCACACCTTACTTCTAAGTCTACAAACGTAATGAAATAAAGCTAACTTTATTTT
ACAAATGCGACACTAAAGTGGGCGCCATTCTCAGTACAAGACGTCATAAGCAAAAGCAACTTAGCATTAAGAATCCAAAAGAAATGAAATAAAACTTGTGTAATTAT
>CG8858 7708274 7708479|7151 chr2R 7708253 7708280 scaffold_1 649363 649390 - 1226|21 27
ACTTTCA
GCATTCA
>CG8858 7708274 7708479|7152 chr2R 7708281 7711918 scaffold_1 649893 653635 - 163303|0 198
GTCATATTAATATAAGCATTTCAAGGATGTGTGTGTGGCCAAAAAATCTGCCTTGGGTAGATTTTATAAAAGGGGGTAAGCGTTAAAAGAAAACATCTAACTTTGGCAAAAATGAATAAGTAACTTGCATGAAGATAATTTTCTATTGTGATTCATTGATCCAGGAGTGTAAGGAAACCTTAAATATACTATCATAAAT
GCCAGAACATAAATAACATCGCCCAAAATTAAATA----CACAAAACCCA---------------ATGAAAGTACGCTAG-ATTAAGAATCAATATCTA--------AAATCCGAATAAGCAGGGCGCAAG-GGATAGTTTGGGGAAGCATCAAATTGAATTATTTATGTAATGAAA----AAAAATAATAACTTATAT
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AAACTAA-AGATGACCGCAAGAATATGGACACGAATTGCATTGAATGTACAT-TATTAATATGATTTTCTTAAATAAAAG---------TTGATTGATTACAAA
TTTTTGATTGCTGCCCTTGAATATTTGGA----AATTAC----AATATAAATGTATTCAGATTAATTTC---AATAAAAGCAACATTAACCAACTAATTATAAA
>RpS11 7715220 7715372|7154 chr2R 7714913 7716716 scaffold_1 657193 658991 - 59296|329 505
AGCGGACAACTACCATTCGGG------CGATAATATTTGTAGCAATTATTCTTTTTGAATAAAACAAAAAAAA--------GTAACTTTAACCATGGGTTTTCTCCAGTTCT-------TCTCTCAGTTTCCACAGC--ATTTCAGCAGTCGTGCAGCCAGCTATTCCAT-TAAAAG
TGAGGACAAC--CCACTATGGAAAAAAAAACAATATTTGTAGCTATTATTCTTTTTGAATAAAACAAAAAAAAAACAAACTGTAAATGTAATCAT--ATTCTGTCTAATTTTGTAGATCTTTTTCAGTATTTTCAGCAGATGCCGAGAGATCT-CGGCGTTCTATTCTCTCTAAAAG
>Sr-CII 7724761 7724942|7162 chr2R 7724847 7725260 scaffold_2 6013319 6013727 - 3239|0 103
GGGGTGATTCCATTTACTACCTACAGCCTTACTCAAATTTGAAATCATATCAAAT-TGAATGGCATATA-TTGTGACAATAA------ATATTTTTAAGAAGTT
CTCGAGAATGGAACGAATGTGTACA----TACGCGTATCTATAGATACCTCATTTATGAATACAATTTACTTGTTATAAGCAAAAATTATATTTTTATAATGTT
>CG8854 7740366 7740612|7182 chr2R 7739917 7741187 scaffold_1 684205 685471 - 21222|473 737
-ATCCATGGGGCCGCATCCACGTGGATCTGGGATTTGGGTGCTTGGGTTAGG---CTAACTACCAACACGTTTGCACCAATCGCGAACAGAAACCTTAT---TGTTATTTAAGTCATTTTGCAT-TACAGATACAAACACAAACACATACACACACACACACTGAA-------GACCAAATAACTGAAACATGTTTGTCGTAGATATATAGTGTTTTCATATT-CATATTTACCG---AATAAACATTTTGAAGTCAAGCATTAA
TATCCACTGTACTGCA-----------CTAGGTCTTGGGTGTTAGGGTTTAGTCTCTAGTTA--AACTATTCTTAGTTAAGAGCGACTCAAAGTCGTCTATACATGAGTTAACGAATTTCATTTGTACTTAACTCATCACACACACACACGCACACACACACAAAACAACACGTACCAAATAATTTAATTTGTTTTAGTATCGATTTAGTCGCTCTCCAAGTCACGCATTAATCGTGCAATAAGTCTTCGAGATTTATCGAATAA
>CG8850 7814685 7814838|7278 chr2R 7813328 7814792 scaffold_1 780031 781561 - 18265|1590 1703
ATTGGTAATTAATATATTCTTAGGCTT------TAGGCTTAGCATAAGCATTGAGAGTTATCTGTTTTTAGGTAATCTAATTAATTGGATTTGTTTTCAAAAAAAAAAAAAACA
ATAAGTAATTTAAATAATATTAATATTAAAAACTGAACTGAACTTAACAA--AAGAATTCTTAGTGTTTAACTAAAGTAACAAAT------------------AATAAAAGTCA
>CG8850 7814685 7814838|7279 chr2R 7814797 7815794 scaffold_1 782353 783337 - 47956|0 41
AGGACTACTCTAGTGTATTTTAGTGTTACGCTTTATTATTAA
------ATTGTAGAGTTCGACAGTATTTCAATTTATTTTTAA
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AAGCGGTGGCCACCCTGTGCGTGTGGACTCTT------CCTGCAAGTTTCTGCAAGAGCCCAATCTGCAAGAGCCCAATCTGCAGGAACCCAATCTGCAGGAGCCCAATCTGCAAGACGACACTCTGCAGGAACCCAATCTGCAAGAACCCAATCTGCAAGAGCCCAATCTGCAGGAACCCAATCTGCAAGACGCCATTCTGCAGGAGCCCAATCTGCAGGAACCTAATCTGCAAGACGCCACTCTGCAGGAGCCCAATCTGCAAGACGCCACTCTGCAGGAGCTCAATCTG
AGGAGGGCGCCAATTTGCGTGGCTGCAATTTTGAGGATCCAACAGGTGTGCGCA--------------------CCAATTTGGAGGGTGTGAATCTGAAGGGTGCCTGCCTAGAGAGCAGTAATATGGCCGGTGTCAATTTGCGCGTAGCAAATCTGAAAAATGCAAATATGAAAAATTGTAATTTACGCGCCGCTGTACTGGCCGGTGCCGACCTGGAACGTTGCAATCTATCAGGCAGCGATTTGCAGGAGGCCAATTTGCGAGGTGCTAACCTTAAGGATGCTGAACTG
>SIP2 7818444 7819243|7284 chr2R 7819171 7819272 scaffold_1 787717 787831 - 1897|0 72
CCGTAATTATGCCAAACTAATAGTTGGCAATATGGGTGAACATTTTTTTGAAGTTCTGCCGGCTGGCGAAATG
TCACATATATGTCAAAATTCTAATTGGCAACAATGGGCAAAACATATTTGAGCCAGTGCCAGCTCATGAGGTG
>SIP2 7819310 7819401|7285 chr2R 7819389 7821303 scaffold_1 788174 789991 - 5666|0 12
ATATTCAATAACA
ATATTCAATCAAA
>SIP2 7819469 7819667|7285 chr2R 7819389 7821303 scaffold_1 788174 789991 - 5666|80 279
ACAACAAGCTGAGTTCGAAGGAGGAGGAGTTCTATAATCTCTACGGGACCCTCACGCACAAACAAAGGGAAGTGAGGAGGCAGGAGCATATCATCAAGTTGTTAAAGGAGCAGAATTCGCG-GGTATCATTGTTGCGAGCCAATCAGGACGAGCGGAATGCCACGATGGAGGAGGAAATCAAACATCTCAAAAACGCCCT
CCAACGAGCTGGCATCCACGAATGAGCAGTTCCAGAATCTATGCTCGACGCTCAGTACAAAGCAAACCAAACTGCATAGCCAGGAGCACGTCATCAAGCTGTTGGAGGAGAGCAATGCGCGCAGCGTCA-AGCTACACACAAAACTGGGCGAAAAGAATGCGCTGCTCAAGGACGAACTCGACCATTTACGTCGTACCGT
>CG8841 7838414 7839223|7294 chr2R 7837418 7838920 scaffold_1 817885 819482 - 19291|1055 1674
TTTTATTTTAGTTAATGACTAAATTATTAAACAACTCATGTTTTTGTAATCTGTGACAGAAAATGTTCCTTGTGCCGTATATTTTA-----------------TTGCATGGTTTTATTTATTTTATATTTTAATAATTTAAAAATTTCCTGTTTTT------------------------------------ACTTATGTATGTATTTAAGGTGCAAATACCAAGA------------ATAAATTACTTTCACTCAGCCACTCTACAAACGATTCGCTTTAT-------------CCAAACAAATTTGTAACTGCACCTATTGACA-----CCATAAAAAGCTTTACGTTCTCTTGTAATGATTAGGAAACTTTAGTTGAGTCCAATGAACTGCTT------TGTAAACTTAATTAAATATAGAC--------ATTAATGATAGAATTGAGAAAGTGTATTAATTTACTGTC-----TACGTGTGCTTATAAACTATATACA---CAAACTAAACTTATGACACCTATACAAGTCAGTTTATATAAATCATTTA--------CGAAATATAGAGCAGAACCCAAGATAAGTAATAAATAATAAATAAATTTCATAAAACG
CTTTAAACAATTCAATTATTCGATTATTGTATTCCTAAAATAGTTTT-ATTTTTAATAGACAATGTTCCTTGTGCCGTATTTGTAAAACTTTGCGTAGGTAATTTATTTGCTTCAACTTAGTTTCTATTTATATATATTATAGTTTTGCTTTATTTCAACACAAACTCAATAGCTATTTGAAATAGTCTACAAAATATGTTTAGATTTAG---TTAAATCCTAAGATTTAGCTGTCTGATAATTTGCGTACGCCCTGCAATTCTTTTAAACATTGTATTTCCAAATTATATTCCACTATACAAAATCCCGAATTAATTTATTTTTAATAACCAACATCAAGCTTTA--TTTATATATATTGTGTAATTAGCTTATATTGTGCAATGTCAAAGGTTCAATATATATAAATATATTTAAATCTGTACTTATTTATTTTAATAATTGAATATAGTTTAAAAATTAATTTGTTTTCAAAATTAGGTGTGCTTTAAATTCAAATACATTTTAAATATATCTTCAAACATCAAAAGTAAAACATTCAAATAAATATTTCATGTATATTCAAAAGATGTTGCACTATATTAAGTGCGTATAAATAAATAAACGATATTTA-AAAATC
>CG8841 7838414 7839223|7295 chr2R 7838956 7842117 scaffold_1 819510 822802 - 148241|0 377
GTC---AGTAAGTGGA------------------------------------------------CTCCCAGCTACACCAGCAGCGCAATCGTAGCTTACA--------------------------CGCTTTGGCATTTACTGTAGTTAATTTATTTAGTACATATTTCATTCCAAATGTTTTTGTGAAGAATCAGTGTGTAATGAACTACCTTTCCCACAATTTTGCTTATTGGCAACAAAAAAAATGAGGC----TTATCAGTTACGATGTGGCATTG------AGATCCATTCAACA-GATTTG-----TTATCGGCTTT----TAGCATTGATATTTAATT-------------GCTTTCCTAATTTGTTTTGA
AACTCTAGTAAGTGGAACACACCAAACAGCAACATTAAAAAACAAACAACAACTACAATAATAGCAGCAAACAACATCAGCAAAAGGAACATAGCTTATCCAAAAAAAAAAAAAAAAATACAAAATCGCTTTTGCATTTACTGTAGTTAATTTATTTAATTTATAGTCCATTCCAAAAATGTATG--------ATGTATGCAAT-ATCAATGTTTTAAAGGGTTTT--CAGTTAGAAAAGAAAAGCATAATGCTGATTCATCAGTTAGGCGGCGGCGTCGTCAGAACAATCCATTAAACACCATTTGAGGCTTTATCAGTTCTGACATAGCGTGAGTTTTTTATTTTGTTTGTTATCAGCATTTTTAATTTGTTTTTA
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T
A
>CG8839 7855517 7855799|7305 chr2R 7855518 7857746 scaffold_1 831456 833751 - 87038|0 416
GAGCAGTCT-----------CAAACGTGCAAGTATGCAGCTTAGC---TAGCTTTTAGATAGTAGTGGTCAGGTTAACGTCCTGGTCTCC-------CCCCACCCATTACTAACTAC------------------------CCCTACCCACCCGAGCATTCGC-------------------CTGGCGATGAAA---------GGTATTCCTTGTGTACTC--------------------------------------------CAGTGCCTCATTGTAATATCAAT-TTTCGATGTGGATT------------TATCTATTTTGT-----ATGTGTTTTTAAATGTAATCTAATCATAGATCCGCGCGGATCCGTTCCCGTTTTGCATTTATAATAAATAATTGCAACCAACTGA
AGCCGTTCTGTCTTAACCCAAAAACACAAACATACACAGCCGAGTGTATAGCTTTTAG-TAGTAG-----GAAATTGTATCCTGGGCCCCGCAAATAACCCACCCACCACAAACCACTTACCATCGGCTCGTTAATTAACTTTATATACAGCCCGGTATACACAATGTTTGTAATTGTTGCACGAATTGTAAAACGAACCATCAGCATGTCCTGTGTCCGCATATTAATATATATATATGTATATATATATATGTATGTGAATGTTAGTGCCTC---GTAATATCAATATTTCGATGTGGTTTTAATTGCTATTATATTAACTTTGTATACAATATGTTTTTAATCGTAAATTTAGCAGTAATCTAAGC---TCACATTTGATTTTGCATTTAAAATAAAATTTGTTAAACAAGTGA
>CG13154 7942789 7942884|7370 chr2R 7941599 7943621 scaffold_4 2492594 2494668 + 70878|1232 1350
ATGCGGTTTTTTTTGCTATAGGTTTTAGTCAGTTGTA--------TAAAAAAGCTACAATAAATGCACTTAGAGT---------GAGTAAAGTCCA---GAATACGGATTCGACC---A
AT-----TGCTTCCAGGACAACTGTTATTTAATTGTAGGCGGTTACAAAAATGCAAAAATATATTTACATAAGTTTATACACAGGGATAAATTCTGTTGGATTACGATTTATATCCTAA
>CG8831 7944354 7944407|7372 chr2R 7944185 7946274 scaffold_4 2495574 2497680 + 81444|221 276
TAGGAATGGAAATGAGCTGATACGTTGAATAAAACCCACATATG--TGTAACACAA
T---------------------------------CCTCCATATGACTGTTACCGAA
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CCCCAAAAATCATTATACTCATCCACTCATACGAACGC--------------------AAACTATTATTGTATTTCCATTTACAAAATTGTTATAATTTTT-----TTGTTTTTGTTAACACAAACCTAGTTGTAGA---------------------------------------------------------ACGTGCATATATGCGA-ACACAAACATATTTAATTATAAAAATTAA-AAAAAAAAAAAAACAATAGAAT------T
CCTTAAAAACCAGCTTACACACACACACACACACACACTCACACACAGAGAACAGCAGAAACTACAATTGTATTTCCATTTACAGATTTGTTATAATTTTTACGCATTGTTTTTGTTAACACAAATTTAGTTATAGCCTTTAAAATATACATATATATATATATATATTTATATCCATATATATATATATATATATATGCATATATATTATACACATACATATTAAAGCATATAAATTAGCCAGCAAGAGAGAATGTTACGATACTCCCT
>CG8830 7947809 7948249|7375 chr2R 7948018 7951403 scaffold_43 837932 841385 - 90202|0 269
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GAGTGTGCCGCCC--GTTTTCACATACACTGTACGC------AATATATATATATATATTTTACAATATATATATATCTTATATATATACACACACACCCAAA---CACACACACACACACACA-CACCTCCATGCGCAGCGTTATATCTAGAGTTATATAAGTATATATATATATATAGAAAATTATGCGATTCATTGTCATATGTATGTAAGTGCAGTTTGGCTACAGTCTGCACTTGCTAAAGCCAACGTTAGCTGGGCAGTCTATC
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GCATGTACGTCTCGTGGACTCTGGACTTCACTGTTTGCGGTTAATTGGTTTCTTGAGTTATTTCTTTCTT
CCCTGAAT-TTGCTTGGATTTGGGGCTTTACTGTATGTGAAAAA----------AAAGAATACTTTCCAT
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TCATATAAAAGTTCAAAAGCAACCAGTGCACTTTTCCAAAAGCCATTATAAAATTAAGCAATTGATATATAATAACAATAACAAAAGA
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TATTATCTATAAGA---------------CAAGAGGCGCAACTCC-----CGCTCCCACTCTGTGCGTTAATTAGTTTATAGTGTAATTGTTATTTTTAATTATCGCAATACATATTAAGCGTTAAGCGTCCACTAAAACAATGCAAAAGAAAGCAAAATAAGCTAACGAGGCGACTTTTTCAAAGACATTTTGCGACCAAGTGGTTTCCGGCAGATCAGCCATGCGTAATCACGAATTTCATTAT-------------TTAATTTTAATTTAATTTTTATTTAAT-TATCTCAAACATACGCACACACATAAATCACATACGTAAATACCCAAACAATAA-CATAACTAGCATTTTGGCGATTGAGGATGTATTTAGTAAG--AGTGACAGTGATAGTTTTAGGTAATATAGGAAATTTATAGATTTCATATACTCACATGCACACA---ACAGGTAAATACTTTGTAAGGCATACTTA---GTTTAGAGAATTAATAAAATGGACAAGATAAACATGAGCATATAGGATGTACTTTTGATAATTTT-AAAGCTTTATTCAAACAA-AAACATGATATTGTTTAGTAT-ACATACAAGAATAGATT-GTATGACAGCAAATCGTTTTGTGTTTCGTTTTGTATTA--------------------GGATTATTTTAAATTACATTATCAGTGATACAAACAATGTGACCTTATAAAAAAATAAATAAATAGGAAGCAAACAAAAAACAAATGAAAATTTAAAAAATACAAA-AAACTAGGGTTAATATACACATATGTAATC
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CAAAGAATATATATATATATATATATATATATATATATATATTTCACAAAGAATATATATATATATATATATATATATATTCTTGGTGAAATATATATATATAATATCTGTA------TGATATTGTATATTGATAATATAATTCCTATATGATAAAGGTAAGCTGAAGCTTTTAGCAGCTTATGTTGCGCACGTTATTTTGAAAAGAGGTATTTGAAAAAACTCAATTTTCCACTTTATTCAATATATAAATAATGTTTCTATCTAAAAGACTCCAATATATACTGCCCGCAAGAAAGTCGATTCTACGCCAAGTTTTAACAATTTATCTTTAAAATAGAGATTTGTATAAAACAAA--CAGACATGTCTACTACCAATCAATTACAATT
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TACACTGATTTTATTAAATAATTAAACATTGTGCAAAAAGAGAG
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ACCTCTTAATCAAAGATTTACTGTACATAT
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TCAAAGGGTATCTCATG
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TCCC---CAGTTTC---CATCGTTAAGCCGTTGTCATCGTAGTTACAGCACAAGTGTTTGCACCATTGAGCAATATTGCAAGCATCCCCATATTGCAAGCCCCCACAAGGAATGTAGTGTCT------CTTCAATAAATGTTAT
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TTTAATATATATATTTAAA
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AAA
AAA
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AACAGCAACAACAAGCTCTTTTTCACTTTGTAC-AAAAGTCATTTAAATTGTAGGCGTAGTATTGCTCCTAATAATAATAATAATAACAATAATTATAAATATTGTAAGCATACTACAACATCTTGAGTAGCGTTTAGTGTTTAGTTTAATGATAATGGCAGCGTTTCTAGTTGTTAA-GCGATTTACACTCTCACACACACACACACACACACACACACTGACACTGACACACACACATATACCCTACAAGTTGTTGCAGTCGCTCCTCTAAAAAAAAAAAAAAACCAAAATATAAACAATTTCTGGAAACTGAAAACTTTTGTCGGACAGTGTAGTTCGTTCGTGCTAATTAAGTTGATATC------------AACGTCTGTTTAGCTTTTAAGGAATTTTATGAACACACAGAACTTTTAATTTTACATCAAATTTCACGTATTTTTATACATAAACAAAAAAAAAAAAAACAT--AAACCTTGTACAATTCCTTGTGAATACTATTGATTACACGCCTATTTTATAAGC---------TTAATTTAAGTTGTAAAAATCATATGAGCTAATTAAAAAACAAAAACTAAATATATCGAAAATGAA
>Sin3A 8091145 8092406|7518 chr2R 8091720 8092875 scaffold_4 2836691 2837924 - 35101|0 819
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AGTCATTGCCGCGTTACACAGGCCAAGTACACGCGCTTCCAGAGCTACGTCAACAGATGGCTGCAGCAACACGTCAGCGAGCAGCTGCAGCAGCACTGCAGCGACTGGCTGCTGGGCAAGACGCCCGAGCAGATCAATGCCAGCGGCTGGGGCGCCACCAGCAGAACGAAGTCGCTGCAGCAGAAGGACACGTCCAAGACGCCGTATCGCGTCTACACGCGCTACAAGGTGCTGCAGTCGGGCGCCGCAGCAACTGTTGCAGGTGCAACAGCAACAGCAGGTGCAGCGCCAGCAGCAGCAGCAGCAGCTGCCACTACAACAGCAAATGCCAATGCAGCAACAGTTGCCGCTGCCGTTGCAGCAGCCGCTGCAGCAAGCACGCACATAATTGTCAACAGCAGCAACAGCAACATCAACAGCAGCAGCAGCAGCAGCAACAACAGCAACAACAGCAACAACATGATAAATGCCGACACGACAGCAACAACAACAACAGCAGCAACAGCTGCGACTGC-AACTGCAACAGC--TGCTGCTGCTGCTGCAACGCCGCAGCAACATTGCAACAGCGCCGCAGCAGCAGCTGCTGCTGCCACGGCGGGCAGCGCGGAGGCTGCGCTGCAGCAGGTGCGACCCATGGAAAGCTAACCGGCAG---------------CCGTTGCAATAGCCAGCTGGTCGAGCGCTGCGTTCCTGTGAAGCAGCTGCCACGCCACATGAGCTTCACTGTATACAAAACAAAAACAAAAAATGAATTCAAATTTGTGATAGCAGTTCCTGGACACAGTTGCAGACCTGGCCTGGCTAT
>Sin3A 8092475 8092900|7518 chr2R 8091720 8092875 scaffold_4 2836691 2837924 - 35101|891 1300
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GCGGCGCTCGCAAAGCGCGTTTTCTGCTGCGCAACAAGCGACGCTCGCAGCTGCACGAGGAGCAGGTGCGTCAGCTGTTCGAACAGAAGCGCAGCTGCAGCGGCATCGAAGGGCACGCTGCTGCGGCC-------------------------------------GAGACGACGCCAAATGC--CGGCAACAACAATATAAATAACAACAATAACAATAACAACAACAACAATAGTTGGAGC---AAACGTGCACCTGAACGCTTGGGCGCCTCACAGGTGGGCCTGGCGGAGCAGTATGCGTTCAATGACCGCGACGAGATAAGCACAAATGCCAGCAACGGGCGCTGCTTTGTGACCAGCAAGAATCTCAATCTACTCAAATACGATGCAGTGCGTCGTGCCAAGAAG
>Sin3A 8093361 8093467|7519 chr2R 8093247 8093917 scaffold_4 2838286 2839077 - -1377|151 313
AAC--AGTGGGAATGGGATGGTCTTGAGGGGGTTTG--------GGGGTTTTCCTTTTTCCGGGCTAGAGCCACAATCGAACTCAGTAATTGC---CACACAGAC-----------------------------------------TTAAGTTTAA--GCAAG
AATTGGGTTTCTCTCGTTTGTTTTTGCATTTGTTTGTTGTTTTTTGGGTTTTCCTTTTT-GGGCTTAGTGCAGCTGCCGTGTGGCATACATACACACACACATACGCACATGATGTGAGTGTGTGTGTGTGTGTTAGTATACGCTTTTAAGTTTTACGCAAAG
>Sin3A 8094364 8094440|7520 chr2R 8094000 8094816 scaffold_4 2839161 2839970 - 9138|377 478
AATAAC---ATAGTTTTGATAATTTCAT----------------------TGAATAAGAAGAAGAAAAAGTCATATTGCAAAATGAAATAGTAATAAATGAA
AATAACAAAATAGTTTTGATAATTTCATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATA--------------------TGCCCGAGGACAT-------------
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CATTAGAAATTCAAATATCCCGATCAAAAGATAAAATTGCGGTTAACAAAAACACCGCACATA----------------GCAACAACAATGCTTAAGTTCCAGGTGCACGCTCCTGGCAAGGTGATACTACATGGTGAGCATGCCGTTGTTTATCAGAAGCCCGCACTGGCCGCCGTCGTGGGCCTGGGCACCAAGCTTCAGCTGCGCACCCAAACGGGCAGCCAGGTGGCCAGCTTTCAGCTGGAGGCGCTCAACTGCACCCTGGAAATAGAACTCAGCGAGTTCAATGCATTTTTGGTTAACTTCCGCAGCAAATATCCCGGCGACAAGCTGGAGAGCACTGCGAAGCTAATGGAGGAGGTGCGCGCTGAAGTGGCCAAGCAGCTGGAACGTAGCGTGGGCAGCACACCCAAGCAACACACACAGCGCGCTTTTATATCCATTTATTATCTGCTGGCAGGCGCTGTGCTCACGGCACCCAATCAACCCACATTGACACTGCAATCTGGTTTCCAGGTTCACGTAGACACTGAGTTGAATGTGGGCGCTGGCCTGGGCAGCTCGGCCTCCTATGGCGCTGCCTTGGCTGCCGCTTTTCTCATTTTGGCAGGCCATTTCGATAAAACGAGCTATTTGCAAGATGAAAACTTGGCTTTGATTTCGCATTGGGCCTATGAATCGGAACGCGTGAATCACGGGACACCCTCCGGCGTGGATAACACAGTTTGCACCTACGGCGGTATTCTGCGTTTCGTCAAGGGTCAGGGCTTTCAGTCGCTGCGAATACAAAAGCCGCTCAACATTTTGCTTGTGGACAGCCGGGTGAGCCGCAGCACCGCTGACATTGTTGCTAAAGTGCGTCACTTGGCTGAGGAGTTTCCGCAGCTCATTGAGGCCATTTGGCAGGCGTGCGAGGAGCTGGTCAACTCCGCAGTGCCGCTGTACGAGAGTTTTGGCAATGCGCAGGATGATAGCCAAAAGTTCGAGAAACTCGAGCGCCTTTTTCAAATCAACAACGATCTGTTGAAGGCGATTGGCGTCTCACATCCGAAACTGGAGCAAATATTTACGATTGCCTTCAAGCGTGGCTTCTTTTCCAAATTGACCGGCGCCGGTGCTGGTGGATATGCCATTGTTTTGCTGCCCGATAACTACGAGTGCAACGAGGTCTACTGGAAGCTGAAGGAGGAGCTGGAGGCGGCTGGCTTTGGTGTGCATGTCACCACAGCAGGCGGCGTTGGACTGCGTGTGAGCTCCTTGGATGATTGATGGCAGCTGCTCTTAAAACTGTATTTTATTCTAGATGTATGTACTTTTGGTACTTTGTTATTACTTTA--AATAAA-----CTACATA---TTTGTATGCTAAC
>CG33672 8150070 8151730|7589 chr2R 8151442 8152037 scaffold_4 3866438 3867113 - 11282|0 347
TAGTACCGAATAAAA----------------AAAAACCAACA-----ACACACATACATATACACGAG------------CGATACAACAACAGCAAACACTAGCCGCAAAAACCTGTTGTTCGTTTTGCTGATGGTTGCGCTTTCCGATCGAAGAGACGAACAAGCCGAAAAACGCCAGTCGCACAAAGAAAGTGAAAGGGAAAGCACAGGAATCGGCAGCCAGAAATAGGAGTTACCGAATAAACAACGCAAATGATCCACTAAAT--------------GCATAAGTTACATAAAGA--AATACAGCCATAA---------AAGTTTAAC-TACTTGTCGCAGGT
AAGCAATAACCGTAACCTGTTGCTAAACTGTGGAGCCCAAAACCTGTACATACCTGCATGTGTGTGCGTGTGTGTGTGACCGAACCAAC--CAGCCAACGTCAGACAAA------------------------------CGCTTGCCAGTCGAAA-----------CCCAAAAAC---AGTTGAACAAAGAAAGTGAAAGGGAAA-------------CAGCCGATGAACGGAGCTAC--AATAAA-AACGCAAATTACTCGTAACATTACATAAAAACTCAGCCAAACATACATAAATACAAATAAAGCGAGAATCTGATCTCGAGTGAACCGTGCTTGACGCCATT
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CAATTGTCCATATTTGATATGCCAC-----AACACTTAACTAGTATTAAATGAGATGCAGGT-GCTC---CAATTGGAGAGCGAGTGA--GTAGTTCTAAGTGCAGCAGCCCCACACACAAACACACAAACACACACACACACATCCACACAGATCCAGATCCACACCCAGACACAACTCCCAAAAAGAAAGACATGTTGAACATGACTGAGCAGC-------------TGCCGCTG-----GACTGCATTGAAAAGATGATATTAATTCTTAA-GCCCT-------------AGCACCGATTCTGCACATATATGTTTGTCTTATGTGTGCCTAGTTAGTACCTGTATCTATACATATA-CACACA-TATATATACGCAC
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ATAGATATCGTGCCACTCCCCTAACGTTAAGCTGAAA-ATTGCATTTATTA-----------------TTTAACCTGTTACTGTTGTAGAAACACTTAAGCGGCAAAGTCCAGTTCAATTGTTTTTATTAAAAGCATTCGATCCTATCGAGCTGCC
ACAGAGTTTG-------------GCTCTAGGCCAAAGCAGTGCATTTATTAGATTGTTATTCAACTGTTTTTATCTGTTATTTTTTGAAATCAATTTAAATAATAA---CTAATGCAAACGT--------AGAGCTTTATACTAGAGCTAGTTGAA
>CG8776 8175489 8176150|7612 chr2R 8175521 8175989 scaffold_43 399738 400299 - 3802|0 582
AGAGACCACGCTTCTGCA-ACTC--------TATCCGAACCCTTTGTAACCTTTTATATGCCAAATTAAATCCACATCATACACTTAGACTACTCCATATGGCTATAATCAAAACCTT------------TGCCCACTTTCAATCTCTCAGTAGGTGTGTAGGATTAGGAATCTCAG-----------------------------CAGATGAGCAGAAGACCAAGCAAGCAAATCTA-----ATCAAAATTTTGACG--TGTTCAGCC--------------GAACTTACTGATGCATCCAGGCACTTGCAAGCTAGA---TTAGCCAGTT-------TTTTGGTACTATAGTAGAATTTTGATATACTCGTAAGCCCATGTAAC-------TAGTGTATGTATGAT-CGTACCACGTAACGCATTGAATGTACGCACTCGGACTCAAA------ACTGTCGCATTTGATG----TTTTTTTGTAATCGTGCAA--GTATTTGTATTTTCATAATGCGCTAAGCA--ACCTAAGCTGTAAACC---AATTTTACAAACA--------AATAAATACTTTTGC
ACAAAACACGCTTTAGCATACTCTTCATAATTATATACACACACTATACTAAACTATATGCCAAATCAAAAAAAGAAAATCTTTATCAACTAC-----ATAAATCAAATCTAAACCTTTCGCTATCAAAATGCCAACTTTTGCT-GCTAAGTAG--TAGTAGGTATAGGAATCTCAGACTTAGCCAGACCTAGTTGGGAATATACACAGATTCACAAAAGTATATATATATATATATATATATAATAGAAACTAGAGGACCGCCCAGCCCAGACCAAGCATTAGCAATTACAAATACAT--AAACCTTATACAGCTGAATTCTTAGCCAGTTTTAGACATTTTTACACT----TAACAACCGAAAATACTATTCAATATATATATTACTTATATAGTGTATGTACTATACGAAAC---TAATGCATAAACTTTACACA---AAACTAAACGTAGTTATTGTCGCATTTGATGTTCTTTTTTTTGTAATTGTGCAAACATATTTGTA-TTTCATAAAAAGCTAAGCAATACATAAGTTGTAAACCCAACATTTTACAATTACTATATATAATAAATGATCTTTC
>CG8776 8175489 8176150|7613 chr2R 8176098 8177340 scaffold_43 400396 401613 - 45447|0 52
ACGGTCCGTCCGGCTCGTCAGAGTCTCCGCCGCCGGAATTGGTCCACGGCCAG
ATGGGC--TACAGCCC------------------------AGGCCATGCCCGG
>nemy 8186512 8187082|7623 chr2R 8185310 8186676 scaffold_43 413009 414298 - -4759|1276 1452
ATATGTAAGTTCAGATATACATATTTGCT--TGATGGCAATTGAATA--TATACATGT-TTAGCTGAAAACGCACACAATATA--TGGCATATCGTTACTTAATGGGTCTTTTGAGGTTGGAAGATTATACATGATATATAAG-----AATAATAAATAAAAGATGTTTACTTACTA
ATAAGTAACTGGTAACATATAATACTGCTAATTATAGCTAATGAATTATTATAAATGTATTATCCCAAACCTAATTGAATATTATTTGCAAGGTATTA------GGGTCT----AGTCTAGAAAGACATCAAAAATCAATCTGGCTCTAATAATTACGATAATGTTAATAATTATTA
>nemy 8186512 8187082|7624 chr2R 8186677 8187276 scaffold_43 414523 415156 - 3606|0 456
GCGTACAGAGATCCA---GGATCCCAGCCGAATCTCTCTGACTAAATTATTCGCACAA-CAT-TTTAGTTTATATATGATGT--ATTAG--ATTAAAGT-----------TAAGAGTACCCAAAATACCATCAGTTCACGCTGCTTGGTTAGTCCTATATAATTTGT-AGTAGTCATCCCACGTGCAAGTCGTGATCCTTCGAGGCGGATCCACTGCA--CGAGCGGCATTTGTACTTGTACTTGGTAGCGCTTAGTTAGCCACAAAAATTCCATGTTATCCTACGAAACAATGACAATAAT-------CTTAACGGA---------------TATCTAACTT----TCCCACATAACTGGGGT--CTGTGACCTGCCTAAATGTATTGCATTCGTACTTGTCAATTGATATTTGTATGCGTTTGAATGTGTATTAAGAATCCCGTTTAAAAAGATC
ATATATATATATATAAATAGATAACTGTAGAATCTCGCT---TAAATTATTTGCTTAATCATCTCTAGTTAATATACAATTCTAGTTAGCTATCCGAGTTCTACAACTTGTGACATTAACCATAATGAACCCAGCATACATACC---ATAAATTATATACGATATATAAATATATGTTATATATATACAGAAATATCTATTTATGCTTCTCCGATCAAAGCGAATGAAGGCAGCATTTGTACTTCGTAGGATT---TTAG--ACAAGCATTCTAAGATACCATTGAAAGCAATGACAATAACAAATGTATTTAAAAAAAATATCCCACAGAGTTATCTAATATAAAAACTTACATAATCTATCTACCTGTGACTTGTGAATATGTACTTATTACACAATTGTCAATTGA-------AAGTGTTTCGATGTAAGCTCAGAGCTGCGTGTTTTTTGTTC
>Obp49a 8205966 8206071|7632 chr2R 8204700 8206014 scaffold_43 436746 438050 - 29994|1305 1353
GCCGAACTTTTAATATCATTCAATTTAAGCCAATAAACATTTAAAGCTC
GCTTAATTTTTA----TATTCAATTCAAAGCAATTTCCATGTAA-----
>CG8768 8207214 8207444|7635 chr2R 8207250 8209722 scaffold_43 439858 442389 - 39154|0 247
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GTGGAAACAAGCAGAGATTTGTATTAGCAAATGACATTGGCACAATATAGTCTGT-TATTTAGTTGATCTTCCTTTTTTTTATTATACAAATTAAACTAGAGCAAACACGCCCCGCAATTTGTTTTGTGCAATCGCGAAGAGCTGTGATTAAAATTGTGAAATTTTTAGTGCGGTAATTTAGCAAAAATTGTTGAAATTTAATGTGTTTATCCATTAGCCATGGCCA--ATTATCGCTTTATTTTTTT
>tafazzin 8268932 8269215|7714 chr2R 8268417 8270159 scaffold_43 514452 516275 - 42346|561 888
AACGT-----------GATCATGGATGAGCATAGACATTTGTAATAATATTTATTTGTATAGTATTAAGCCTAAAATGAACCCTCGAAGCCCTTTTG-ATCCATTTATTATAATTATAATTATTTCCGTGTATTGCGA--CTAGTTCTTCAAGATGTATTTGCTGGATAGGAACATTAAGTAAATCAGTGTGCATTATTAGTATAAATATACAATTGAAACTAATTTGATCCAAAGGCAATAAATTGCATAATATAAAAAAGAGTATA--------------TCTTCAAATAAA----------------TGTGATTAACAAACTTGA
AAACTTTAGCTCGGCAATTCAAGCAGATGACGAAACATA---AAGCTTATTTATTTTTATAGTATTAAGCCCAAAATGAAGCCTCCATCAAGTGTTATATATATTTATTGTATTTACCATT-TTTACTTGTAGTATGAGGCTTATGCTGCCAG-----TGTGCTAAACGAGCAAAAGAATTCGA--AGCATCCTTAAAAAACAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAAGAAAAAACTATTGTGAACGGTTACTTTAAGTAAAAGAGTGTGTACTATCATTAATTAGTCTCTAAATATAACGAAACTAAGCCTGCTATAGTTTTAAAACCTTG
>ox 8273038 8273102|7717 chr2R 8271991 8273410 scaffold_43 520155 521634 - 41779|1105 1213
ATTAAC-------ATGATT--------------------------TGTTG---------TAATTAGCA-ATAATAATCAACGTTT-ATTCTAAACGAAACGATAACTAA
ACCAGCGGTTCCAATGACTGCAGCTAGTTTTAAATAAAACAATGATGTTGCTTCATTGTTAATTAGCATACAAAAATCAACGTTTTATTCTAAACGATACGAAACCCAA
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AGCGGGCTTCAGCGTTAGCTGCACTCCTGATTTTGTTGTTTACCCGCCTTTCGATAATACTGA-----------------CCCAAATGTT--GTGCATGCCCCTCAAGGGGCAGCATGTTA--CACCAGTCGAACATTTAAT--------------------------TATATTTCAAAAGATTGCGTCTTAATAAA--------AATGGATTTATTTCAAATC
---GGGCCACGG----AGGAACATCGCTGCTTTCGTTGATTACCCGCCTTTCGATAAAATACAAATAAACAAACCCAAATCCCAAATGTTATGTGCATGCGTCTCT-------GCATGTTAAACACCAGTCGAACATTTAACAAATTAACAGGAGAAGAATAAAGTGACATGCTTTAAAAAGTCAATATCTAAAACATTTTACTTAATTTTTTAATCCCAGATA
>CG17575 8361451 8361510|7817 chr2R 8360925 8362825 scaffold_4 1538312 1540321 - 43647|627 723
ACTGGCGGACTC-------------------TGCAATTCCAAGGCCAATCACTAACTTTAATAAAAATGAA--------------AGGACTT----T
ACTAAGTGTCTTTAATATGGTTAAAATCAAATACAATTCAAATGC--GTCACGAA---TAATAAACCTTGATTTACTGCATGCTGAGGACCTAAACT
>CG17574 8365265 8365643|7823 chr2R 8365073 8366174 scaffold_4 1542921 1543991 - 11774|199 615
AATCGCACTGTGAACTGAGGATCCCCTTTCCGTCTCGTTATAGCTTTTTTACTCA-----GCTGAACACTTTACTTTCCATGTTTT------CTTGCATAAAAAACTCCAAACTCCTGGTAAAAAACCAAGTGAAAGCGATCGCACAACG--AGCCATTTTTATATTCCA---------------------TGTGATGTATGTAAAGTGTAC-ATATAACTTAAGCGCAACCTTCTATTTATACATCTATATTAAGCAAATCCAAAACGAAAACCAAACTGAACTACATGAAGTGTTAATTGTAATAAACCAGTGAAGTGCACATCAAATGCAACTGAAGCACATTTGTTTCGATGTGC---ACTTTCACAAAATCACAAAAACAAGAAATGCAAACATGTTTTCAATTACTTCTGC
----GCACAATAAGCAGAGTCTGTCAGTTTTGTCTGGACAGTTGTTATTTGTTTATGATTTCTTGTCGCGTGCATTTCCGAGCTGTTTACAGCTCACACATAAAATACACAATTCGATATATGCATACGCTTTAGAATTGCTTTAAAATATTAGCTATATCTGTATTAGATCATTATACACCATTTGCCGTTGGGGCGTAATTGGGGTGTCCGAAGCTACCAAAGTGAAG------AGCCATCTATTTGTATTCATTGTATTCAAAACACAACAACAATT-------------TCTTAA--GTCATTCACAACTGAA-TGTGATGTAAATGCAATAAGTGCAACTTAATTTTAATTTATATAACTTTATATATATAACATAAGAGAGAAAAAAAAACTT------------------
>CG3790 8388691 8388743|7840 chr2R 8388689 8390392 scaffold_11 964758 966504 + 67303|2 63
TCAGTTACTAGTTGTTCAAA---------TAGAGTTGGTTAAAATAAAGTTTGAAATTGAAA
TAAATAAACAATTGTTTAAAATCTTCAGTAACAATTGGATCATATAA---TTATAATTGATA
>CG3814 8391065 8391179|7841 chr2R 8390393 8392910 scaffold_11 966896 969454 + 50495|717 835
ACTGGTCATTATG--ATCCATAGCT-TCTATTCCAGTTTTAGAAATGTAACTTA-ATTTTATGTGCCCAGTGCCACCTTAGCCGGAAAGAAATACAAGACGACTAACTAATCCAACATT
ATCGGGCTGTGCGCTATCTAGAACTATTTATTACTTTATT----ACCTAACTGAGATTATGTGTCGGAATTGTT-----------CAAGAAATACAGTTACAATAAC-AATTTATATTT
>Nmda1 8392998 8393561|7842 chr2R 8393003 8394767 scaffold_11 969572 971380 + 49250|0 655
GTTC---CGCTCTATTTCCAAATATTGTTTGCAGCTTAATCGG--GTTATTCAGTAACCTGGAATAC-----------------ACGAATATTGTTGT---------CGCGTAATCTCATCGGTGTGCTCCCCCAGTGGAGGTAATCTTCAACTAACGAATTACTCAAA------TACTTACAAATCTATC-TACTTCGTGTTGTGTTTGCCCATTTTCCCCGTTTCCTTCTAGTTCTAAATGTCAACTAAGGCTATATGAACTACTTACTTTTTGTTATGTATG------------TTTTATTGTTGCTTAAGTTGAGGCGCAAACCAAGTGGATATTTCCAAATTTAAAAATAAAAAAATTATATATATG------------TATGTATACCAAA---TGATATGCCATTCAGATAA-------------ACGAAACAACA-ATAAATAGTCACGTATAAACATATTT--------------ATGTAAAAATATACATATAAGCAAGTTGGCTTGCAGTTGTTAACACATAAAACTTAACCGTGTGTAATAACCAAGGAATCCCGATTTTCAACTATGAATCAAGTACCGAACATTGTAATCCCTGCAGCGACACTGAGT--TTAA--AGTCAACAATAAAGCGCATCTATTTA
AACCATGCGCCCAATTAACTTGTATTCGGCAAACTTTGATTTAATGTTAACAGGCAATGTGAAAAACTTAATTGTATTGCCCTTACTAATGTTATATTTCTAATAACCGCATAATCTCATTTACCAGT---CACAGAAACGAAAGCGTTCGAATATT--ATTATTTTGAGCTGTTTGGTTGCGGAAATATCACACGCTTTGTTAAGTT-GTCAATTTCC----TTTATATATTGTATTAATCTTAAGCTGAAA-TGTATGGAAAATTCTTATGTTGTTATGCATAGAAATGCACTGATGTTGATGTCGTTTACTTT----------CTTGATATGTATTTCAAAATT---ACCTAAAGACTCTGCATACCTGATATTGATTGTTTATCCAAACCAAAAAATAATATCGCATAAATACAATAAATAGTCGTATATGTAATCACATACAAATAGCTATGTACATACCTATATTCAAATATGTATACACGTATGTATGTACATATATGCAGCGTCGCTTGCAGTTGTTAAT---CAAAACCTAA-----------AACC---TAATACAGGC-----------------GCCCCAAATATTCTATTCTGTGCAACGACACACAGCGGTCAACAAATCAACAATAAAGTGAATCTATTTA
>CG17019 8446817 8447273|7911 chr2R 8445644 8447073 scaffold_50 551396 552882 + 35310|1292 1572
AGTATGTT-GCCAGTATATATATATGCCTATATATAGTGTAAAACCTGATATCGCTTTTAAAGTGTATTCATC-TATTTCAAATGTGAAATACTTTT---GCTATTTATTT---TGTTTGTTCTTGTTGTTTGTATA-----------AAAACGAGAGGTTATCT-AGATCAACTAACATTCCTATAAACCGCAAAAAAAAACATTAAATCTGTTATTAACAGTTGTG----TGAAAAACTCGTCTAGATGCGCATTTAAACAATAAATATTTTCCAATAT
AGTATGTTTGCAAATTGAAAAATACAACT---TACAAAGTATGTATTTACATATATATATATATATATAGAGCATATTTAATTTGTGAACTCGTTTTTTGACTATTTATTTCACTATTTTTTCTCGTTGTTAATATGCGTGTGTGTATGGATCGAGTTGTAGTCTTAGCTAAGATAACATTCCTATATATTGTAAATGATGGAAT---ATATGATAAACACAGTTGTAAAACTAAAAATCTCGTCTAGATGCGCATTTACATTAATAAAAT----CGACAC
>CG17019 8446817 8447273|7912 chr2R 8447095 8449881 scaffold_50 552902 555878 + 76506|0 295
TGATA-----CGGCTAAT--------CTTACGGTAACTGG-ACATAGTGTAATG----ATGGAAGCCGAT-----AGCCGCCA----------------CAAGC--------------------TACATAC-----------------AGATACAGATCCAGC-------------CCAGCTGTACAAGTTGTACAGCAGATCCTGAT-----GATGC-------------------GACTACAACGTATATGTTTCCTTAAATGACGCGAGTGC----AACAATAATATTAATTT
TTCTAAATGGCAGCCCATAGCTCTGCTTAATGGTAAAAAGTATATAATATAATGTATTATGAAAACTGGTTGATTGGCGGCCAGCGTTGAGAAGCTGGCCAAGTGATTTGCTGTTCTGTGCGTGTACATATTGAAAGTATGTATTATTATACACAAAAATAACAAAAATACAAGCACAATCTGTGCTATTTATACCGTTGTTACTGGGTCTTAAATGCTCAATAACTTCAGTTGAATAATAACAACTTGTTTGTTTCCTTA--TAACTCTAATGCTGGCAATAAAACAATTGCTTT
>CG13322 8450134 8450658|7913 chr2R 8449904 8451613 scaffold_50 555905 557925 + 62739|283 1070
-AGCCAGTCTCCAGTC------------TCTTCAGGGCCAAGCAACATTCAACTCGCCAATAGAAATTAAAGAATGTACATTTTCATCTATACTGACCACT----CGCTCTCT----------CTAGCTGCT-GCTTAAGAT------------------------------------CCCCTGTGAAAGTAGAAAACTTT---AAACACCCGTGGCCACTGA----AAACGAACGATGCGGTGCTGGCGCTGCTTG--------------AGGACGGACT--------------------------------------------------------CTCCAACTGCCATCA------------------TTAGCCAGCTCT----TATTATGGCTGGCCAACATTCTGGCCGGAGCAA-------CAACGGACGCATTTGTTTATGTAATTAAAGACTTATCGACAAGAATTTTGGAAAAGCTCAATCATCGGAAACCACATGTGTATATA--------------------------------ACTAATTGACTTGAAG------------------------------GCGGAGCAGAAGGTAGACCGTATAATATTTAGCAATTAATTGATGTATTATTTTAAACAAAA-----------------------------TTGCAACATTTTATGGCACTTAACTATTTAAATGCATACAATTACATACTTAACTGTAAGTAGTGGATGTGAATTAAATAAA-ACCAACTAAAAGATT--AAACTGC
AGCCCAGTAGCCAAACACACATAATCGTTTTTTAGGGCCAAGCAACGTTCAACTCGCTAATAGAAATTTAAAGCAGTACAATTTCAAC-ACGTTATTCATTTGCGCGCTCTCTTATCTATTATCTTGCTGTTAGCGTATGCTGTTTTTTTATTTTTTTTTTTATGTGTTTTGTTTTTGTTTTTGTTTACTTGGAAAACCTTTGTAGTCGGTTCTGGCCAACGGTCATAGATCTACGATGCGGTGCTGGCGCTGCTTGGATGATTCACAACCACCACGAACAACAACAACAAGAACAACAATAATAATAATATAAAAAAAAATGTAAAGAAAAAAAAACTGCAACAACAACAAATGCACAGACAGAGCCAGTCAGCCAGCTAGATGATAATTTACCTTGCAAACATTTAACGCGCAGCTAAAAAGGGCAACGGACGCATTTGTTTATA-AATTAAAGACTTATCAACAAGAATTTCG-AAAAGCTCAATCATACGAAACCGCATGTGTATATATATATATATATATATAAATATATGTATATTGTACTAAATGACTTGATGCAACTAGAAGAGCAAACATGTTTTCAATGTGTGCAACAAATCGTATAAATTATACATTATAGCTATTAACTGATGTATTATTTAAAAAAAAAAAAAACAAAAAAAAACAAAAATGCAAAGATTGCAACATTTTATGGCACTTAACTATTTAATTGCATACAATTACATACTTAGTTCTAAGTAGTGGATGTGAATTAAATAAACATAAACTAAACTAATGCAAGTTTG
>Mdr49 8456237 8456330|7919 chr2R 8454893 8457797 scaffold_50 562420 565388 + 127030|1453 1560
CACAGCGAACTGGAGTGATAATTGTTAGGCTTTAA--------------TTTAGTATGTACACTAGGCTAATTGAACATGTTGAAGTATTACAAAAAAAATAGAATGA
CACAACAAACAGCAGCAGAACCAACTCTTTTTTAAACTTAGTACTCATTTGTAGTTTCTATATTTGTATTAGTACATGGATTAAAGCTCT-------AAGCATTACGA
>CG3884 8466305 8466399|7930 chr2R 8463912 8467312 scaffold_50 573093 576511 + 94108|2597 2691
GCTAAAGGAACGGAACACTACAGATACCATATGCATTTAGTCTAGATCAAACTGTTATCGCAGCCAAATAAACTGATTGTTAATACCGGAAGAAA
GC-----------GGCACTCACATAAACATATATTTATATTCTTGAACAATTT-----------CCAATAAA--GGTTGCGACTGCT-TATCAAA
>Psc 8482217 8482424|7948 chr2R 8482350 8486118 scaffold_50 594986 598780 + 107911|0 89
AGGAGTCGTCC--CAGCAGCCCCTC------------GTAGATCGTAGCTCTAATTAATTTTTAAAGACCTTG-TTTTAGTTATTCATTT
CTCTTGCGCCCCGCAACAGCTCGTCTAACCCTCTGGGGTAAAGGTGTGCACTAATTAATATTTAAAGAGTTTACTTTTTGTTTTTAGTTT
>CG13324 8565049 8565186|8047 chr2R 8565168 8565524 scaffold_50 689162 689595 + 11135|0 18
GTGATCTTTGGGAGCATGT
GTAATGCTTGGCGGGATTT
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CCAGCTTAAGACGTCCCTGCTGCTTGTGTACGCCTT----TTAGTTGAATTAGCCAGAAATTGTTTCTGTTTCTGTTTCTATCTCTGTATCCATTTCCTCAGAGTTGTGTATTAATTTGCCTTTCCGTTAGCCAACTCAGGCGGCAACTTAAAGTTGTCAAGCCCCCCCACAAAAAAAAAA---AACA
CTAGATTAAGATATTATTGTTG-TTGTTTCTGCTTTAGTTTTAGTTTGAATTGCGCTACATTGTGTCTGTTTCTGTTTCTATTTATGT---TATTT-------------------TTTGCATTTCTGTTAGCAAA-------GACAACTGAAAGTTGTTCAAAAACCATGCAAACAAAAAATTTAAAA
>Drl-2 8572469 8574016|8055 chr2R 8572972 8573474 scaffold_50 700014 700576 + 6240|0 620
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AATTATAAAACAGCTGAATTTCAATTAAGAGGAGTAAA-----TGTTACATACTCTGTTGTAA------CTGAGCCGAATGCGTATTCTGGAATGCATT--------ACAGTAAGTACAGTTGAGCATTTAAGTAGCTAGAAATTAAATA---------CACATGC----------------TTATATAG-TATATGTATACACTTCAGATTGCGAAATGCAAATTGAGTATTGAGAATGCATATTTTATTGAATGTGCATAAGAAAAGAGCAAGAGAACACAAAGATAGAAAGAGAGAGAGGAAGAGAGAGAGAGAGAGAGGGGAAGCGAATAGAAAGTTGAATGTGCGACAACAAAATACGGAATCTTTTGTTCTCAAATGTTGTCCTC--AATTGTTATCAA-ACGATATATTTATTTATTGATTTACCAACGAGCATTTAAATATTATTATATTACATATTATTATCAAATAT-TTGTAAGGAAAATTCTCGACTGATTGCGAGTCAAAGTGAGGCACAGCGGCAGCTGAAGTTCAAATTAGAATCAGAATCAGAATCAGGTGAAACAACAGACACTGTAAAGCAATTGTTAAAC---------GCATAAGTCACAC
>Drl-2 8572469 8574016|8056 chr2R 8573684 8575341 scaffold_50 700717 702247 + 62360|0 376
GCGAGACGAAGGACTGACGACGGATGAGC----------GGTATCCAGGTGGAGTCAAGCGGAGCGAA------------------------GCCCAAAATAAATTAATTGAA-ACTTTTGCATTTTAAATGTGAG-ATTAAATGTGAATTTACCTGTTAGAGTTTGGCGCAAAACCAATTACACTGAAAGCCAGCTAACTTCAGATACGTAAGCACACGCATATACACACACCAGTACACTGGGATGGACCTCAATGAGTTGAAAATAACTATTAAAATTAATA--AAAGCAGTTAAATTAACATGTAGCTTAATATCACGGAAACTGCCTCA-AGAAATATACCACAAGG-----CTATGCTAATAGGGTAAATT
G-GATCCTGATGATGACTGGCTGATAGGCCTGCGAGCTAAGCATTCAGCGCGTGAAAAACTTATTGTATAACTAGATGCATGCACACGAGTTGCGTAAGATAAATTAATTGAATACTTTTGCATTTTAAATGTGAGAATTGAATGTGAA-TTACCTGTT---------------ACCAATTTCTCTGGCGTCT------------GTGTGTAACCAATTGAACGTACGTATATGTGTATA-------------TAGTATATAGCAATTTATTGTCTAAGTAAATATTAAGGCGTTTAAGTGTCACAGAAACCAATTAACTCGACAACAGTTGCAGACAATTGCACTTCAAAGCACAACAATGCAAACAGAGGCAATT
>CG3955 8643819 8644098|8128 chr2R 8643116 8648938 scaffold_723 676 6425 + 128846|851 1157
GCCTTCGGGTCACCTCACAGAATTTACGGACACTCAGCGCTCTCAAAGATGCTCCACACTGAACTCAACTCCACTAAATGCCAAATCCTAGCTAACTTTAGTT----CGATCTCTTCTGCAATGTAGATAG----------------GCCATCATGTTGCCGGGTGATAAG--AAGAGCCACAGCGAGTTCACAC-----CCAACAAAACGGAAAATCCTCAATTGGACCCTTGTTTCTGTAGGCTAGTACTAATATTATATTTTACCATGGATTACTTTTAATTAAAAATAGATTTCCCAGATATG
TCCCTCGCAATGCGGCGCCGAAACAAAAGGCGT---------------GTGTACCTCATTGAATTTAGCCAATTTAAGTAGCCAAACCAAAC--ACTCAAGTTGCCCAAAGCTATTCACTAAACTAGCTAACTGTACCAGTTTGTTTGCCCGCATTTTACCTACTACTAGATTTACATATACAACTATTCTATATACTAGCCTGCATAAGAGAA----------------CTTGTGTGTGTA--CTTGTG-------TATAGTTAGCTAAGGGTCATGGTGTGATAATAAATGATT--CCAAGTGTC
>CG13326 8645418 8645508|8128 chr2R 8643116 8648938 scaffold_723 676 6425 + 128846|2543 2633
TTCCCATGATCTCTAATGCGCTCACCAAATTATCCTGTCCAATTGCTTCTCATATGCTATATGCATGCTTATTAAAATTGTTTTATCGGGT
GGCTCG-------------ATTCAAAAGATTTT--------ATTGTTGTTTTTATGC----------------AAAATT------------
>PR2 8658739 8659032|8132 chr2R 8658826 8661183 scaffold_45 5254 7952 - 68581|0 268
AT---------------------------------------------ACTCCTTTAAGGCCCCCAATTCTGGATCGCCATGATTTGGTTTCAACGACCGCCGTTGCCTTAACCTCATAACTATCGTTTCTAATTTGTAGGCTAA-GCATGGGATAGGCTTAAGTAATTTGGAACTAACGTAATCACTGCTC----------------GCCATTGGCTCCCTTCTTCATTCGGATCGATAGAATCTCAGCATGTACTTATTCACGCATGC
ATGATGCGCATGTAGATAGAGCTATATATGCATACGTATACCTACAAACATCCTTTGGGCCTTATTATTTGTGTCTTAAGCATTTAAAGTTCGCTGCGGATATTACATTATCCT-----------TTATTATTTAATACTATAGTGAATAGGACATCTCTAACT---------CGACCTCAATCACTGCTCAAAATATGTTTCTAATGTAATTCATACTCCTCTCCTATTGTATGAAT-GAATCTCAGCATGTACTTATCTAATAATGC
>CG33007 8662120 8662441|8134 chr2R 8661590 8667224 scaffold_45 8607 14240 - 225998|602 951
CTAAGGAAAATGCTGAAATACGTTCTCAATTTACTGTTTGGCAATGTGATGTCCGATTAAGGCGATGGCGATGAGGAGATGGAGAGATGCGAATTGAATACGGCAAGTCGTGGTCACGAATGGATGCTCCGCAAGGAGCTTGGCGATGTTGTGTTTGTGCTACTGTCTGTGTGTGAGGAAGGGAGCGTAGAGTGTTG------GCGTCGAAGAGTAAATTGTAGAAGTATTTACAGCGAATAGAT----------------------TATATATTTTTTGGATTTGAATTTTTTGAAGCGAGATGAGAGTGTGCCTTATAGGAAAACACCGAAGACCTCTCAGAACAGAT
CTAAGGAAAATGCTGAAATATGTTCTCAATTTACTATTCGGTCATGTGCTCTCGGATTAGGGAAATGCC------------------------------------------------------ACGCCCCGCCC----CCAAGTGGTG-TGCGTGTGTGCGCGCGTGTGTGTGTGATGTAGT--GTGGTGTGTGTCGCCAGGTGTGTCGAAGAGTAAATTGTAGAAATATTTACAGCCAATATTTATTAGTCTATACATATACCATATATATATATTTTGGATTTGAATATT-----------TGGGAGAGTGCCTTATTCGGAAACACGGAAGACCTCTCAGAACGGAT
>TppII 8668795 8668900|8137 chr2R 8668747 8671781 scaffold_45 15942 19002 - 112729|48 172
GCACTTTCCGACAG--AATACGCAAC-----AAATA-----------TTCACGCTTCGAAGCGATCATTGTTTTGTATAACTAATGTAATCCAT-ATGTATATGAATAAATGCTATTAACTGAAA
GTGATCGTTGGCAGTTTTTATGCAATTAGCAAAATAACCTTTACAATTTCACATTTAAATCTAATCACTGTTTTATTT--CTATTGCAAGCCATGAAGTAATCAATTATATATAATGTACATGAA
>GLaz 8679963 8680123|8142 chr2R 8678946 8681169 scaffold_45 25904 28237 - 37958|1191 1365
GAAGCTCCTCCAGCGTCTCATCCCCCATCTATATGTTTAAGTTCAT------TCGGTTAAGGA--ACAAATTACATTTGATGCCTAATCAA------TTAGGCTGCTGTGATATCGAGGAGTGTGAATCGGCGGAGAGAGGCGAAGCAACGCAAATACAGAAACAAAAAACAAGA
---ACTGATTCAATGCCT--TTCCATATATTTATATATAACTATATAACTGATTGTTTAAGTATCATATATTGAGTCTATTGTATAGATTATAGGCCTTAGGTTGCTGTGATATCGCAAAGTAGAGCTCTGTTTTGCTTTGCGAAACAA---ATATAAATATGCGAAATTTAATA
>CG17724 8691999 8693331|8159 chr2R 8691992 8694516 scaffold_1 1989326 1992374 - 51001|7 1830
GGTCTAATGGGTGGCCAAATGGGTCGATTTTTGAACAGTGCCACCATAATGCCGACCACATACTTCTTTTAGAAATCTCAAAAATGTTCCGCGCAGATTCGGTTGCCCATGGCGCAAAGCTG---------GGAACGCA-------------GCTCTGTGCCGTCGGCAACG--------------------------TTTAAATGTTTTT----------------AGGGTTTTAGAATACTT-------------------CAAAAATCGTCACATTTGGCCACCAAAAT-----GCGGGGAGAAATGCAA--CAG--------------GAGCGTTTGCTGTAAAGAAACGAATGAAATGGAAGGAATATTAA-------CTCAAACTTAA--GCCAAGCT--------------------AACTC-ATTGATATTACCACACTGTTGGATGTGCATACGAAATTTATTTTTTTACTCAAAA---------ACCAAATGCCTACA--------------------------------------------AGAATATAAATCAA----------------ATGTTGTTC-----------AACACACAGAAACAAACACACACACGCGAATGGATTTGAGGCGGAATCAAATGCATTCG--------------------------GTTCACGGCA------------AACTTAAGAGCATCGTAAATTA------AAATAATTTTTACGCCTAAGATAAATTTTAAATGTTTAAGTGC------------AAAACACGAGACACACACCCCAAACCAG------ATGTAACAATTTCA------CCTGCCTACAGTG-CGGGCAGAA--TATGTTTAGCGTAATTTAGTTTTGCAAGAACGA--------------TTCCGTTTCGAT---GAAAAGGATAGCTCACT-----------TTTGTAACTACCGGGAGCGTTC------------------TCAAGAAATATACTTATA--------------AATATAATTTGTTCC-TTGCATAATGAGAGATAGACAGCTAGA-----------GCGACTATGCAACGTATTTCATGTAGTATTTATT-----CGATAAGTT-CTCGATCTATTTATTTATTTTTGTTAACTATTTCCATTCGTGTGACCCGCCGCCACCTTTGTCATTACACTTTCTTTTGCCATGTTGTATATTCTTTACGTATATATATATATATATCTATATTTTATATATTTTATTTGCAATCTTGTTATGCCATTC-----------------GTACACAAA-------------------TAGGAATTCAAGCATAGCACCGACCCA--------------------------TACTTTAGACTAAATTATTTTTTTAACCCGTTCTTGTGAAACCAACGGCCCAAGAATACAGAGATACCACACACACATTAGGCTAAGCGAAACCAGG----TTAAGATAC--TTTAAG----ATGAGTTACTTTAACCGATGGAAGACAATGATTTAAA---ATAGCTTGTAGTACGTACTCTAAG--------------ACAAATAA----------------GCAAAACTGAGTTGCAC-TTCTGTAAGATA--------TACTGTAACTAATAACGAAGCGAAAAAGCTACAAATAAAGC--------AACTCGAGTAGCCTACATAATGTATAATACAAATTCTAAAGCTAATA-----TTTACGTACACATATATATATTTATTATAAACAATAAAAATACAATTTTAAAAATTTAAAGC-AATAA
GGTCTAATGGGTGGCCAAATGGGTCGATTTTTGAATAATGCCACAATAATGCCAACAACATATTTCTTTTAAA---CTCAA------TCAGCGAA-----TGTTGCGCATGCCGCAAAGCAGCCACATGGCGGGGCACAGCTTCGTTGTGCTGCTTTGCGCCAGTTGCAACAGAGACTAAATGCAAAACAAAATAGACTTTAATTTTTTTTTTTATATAAATTTGTAAGCCCTTTCGACAATTTGTTTGGGGCATGAAACATACAAAAATCGACACATTTGGCCACCAAAACAGGCAGCAAGAACAAAAGCAAATCAAAACACAATTAAATTAAATCTATATTCAAACAATAAAAACGAAGCCAAGTAAAACTTAAAAGCAGCCACAAACTCAATTGTAAAGCTATGCAAGAAAAAGTATAAGAAACTCAACTGATATTA-CATAATGTTAAA-ATGCATACCAAATCTATTTTTCTACATAAAACAAAATCACATAACATGCATATATATATACGTACATAAAGAATCCTATATATATATATACTTTGTATATAGTATATATTAAACTCATGTTTATGTTCATGTTGTGCGCAAAATGTTAAATGCAAAGAAGTAAAAATTCAAACAAAATGTTGTTCATAACTGACACACACACACACACACACACACATGCACGCACATCACTCATGCACGGCAGTGTTGTGTAACAAATTCTGTAAATTTCAAATCAACACTTAAATTATTTTTTAAC---ACATAAGTAGCGTATATATAAGTGCAAAAACAAAAAAAAAACACCAACGAGACACCCGAGCCCAGTTTTCTAAATAATATTTTGAGCAGGCGCTGTCT-CAGCGCCAGACAAAATTTATTTTTAACTTAATTTACTATTCTTAAAACTAAAAAAAAATACTTTTACCGTATTATTTGAAAAAAAAAAAACTAACTGCTTACCAGACTATGTAATAATTTAAAGCAATTACTTAAATACTATTTATGTATAAATATATATTTATATGAACACATAAACTTATATAATTTGTTCCTTTGCATAA-AATAGATGA--AGCCAGAAATACCTATTGGCAGCTATGCAACGTATTTCACTTAAAGAGTATTGTCCGTAATAATTTATTTTCTATTTTTTTTTATTGTTGTTCA-TATCTTTACCC---TTAACAAACGCTACCCATCCACTCACATTTCTCTTAA--ATGTTGTATATTATTTAAAAACA-AAAAAAAAATACAAG-----TATATATATTATTTGCAATTTTGTTAAGCCATCCTGCATGCGTTAAAAATAATACATTGATTATGATTAAACTTACGCCTAAGAATTGAAGCATAGCACTGACCTAAGTTGTTAATACTAAGCGCGGTACCCTAGTTAAGATCAAAGTATTTTTTCATAATCACAATGCAAAAAGAAAAAAACAAAAACGACAAAAAAAAAAACAAAC--------AAACGAAAACAAAAAACTAAAGTTATTGTTTAAGCCTAAAGAACTACT---ACTAATGGAAGACAATGATACAGATTCAAAGC-----ATATTTATTTTAAGATCACAACCAACAAACAAATAAGAAGAAGAGAAATATTGAAAAAGTGAGCTACACTTTTTGTAAGATAATTATTTTTAGATTAAGTCGTAACGAATTAACGAAACTGCAAGTAAATAATTAAGCGAACATGAGTAGAATACATTATGTATAA---AAAGTCTATGAATAATAATAACTATACATATATAAATATATATTTATTATAAACAAGAAAAATACAATTTTAAAAATTCAAAGCAAATAA
>seq 8695589 8695980|8163 chr2R 8695391 8695764 scaffold_1 1993851 1994310 - 1007|269 478
C--CACCAAACTAACTTAGCGAAGCATTTGTGTACTTACATCCGACACATCACATACTCATAATAGTCGGTTGCTTGAGGAGATCTCGTCTCGTCTCGCCTTAT------------TCATTGATTCATTCACTATTCCATCGT--------------------CACTTGTTGTGTGTGCGTGTGTGCAAGAGCAGCAACGAGCAAATACC
CAACACTAAATGCATATATCAA---ATATGTTTGATCATA----ACGC-TTAAATACTCATAATACTTATTTACATTAACACACATTTTACAACACTAACAAATGAGGATAAACTCGCATGCATTCAACTGCCACAACACAGCTGTACGTGTGTGTGTGTGTGCGCTTG-TGTGAGTGTGTGTGTGTGTGCACACAAACAAACAACAACA
>seq 8695589 8695980|8164 chr2R 8695765 8695853 scaffold_4 2670641 2670736 + 1630|0 95
CCAATCATAATCCCCAAACGAAAGCAACGCAAATGGAAGACATTTTCAATGTT-------TGCCCAGATCAACGGACAAGCATATAAATAAATAAT
CCACACATAATCCTAGCATCAACTAAATGTACATCCAACAAAGTTACAATTTTCAGCTATTTTCCAGATCAACTTTCACATATATATATCAATCAT
>seq 8695589 8695980|8165 chr2R 8695858 8698665 scaffold_1 1994375 1997426 - 95850|0 142
ATAA--------AACGATCCACACAGAA------------AGCTGCAGCCAAAGTACCAAAAATTCTATTTAACGAATACAAGACTCAACACCGAGTTCGCAATGAATACGATAGCTAAACGAATCGAGTTTAAAAGTGAATA
AAAAGCTACGATAGCAAAATATACAAAATATAAAAGCGACAACTGCAGCCAAAGTACCAAAAACTATATATTGTTATAACTAAA-TCA-------------AATGA--ACAAACGATAAAACAATATAATT---AAATGAACA
>lat 8718633 8718762|8186 chr2R 8718633 8722478 scaffold_1 2023879 2027713 - 118089|0 129
CTCGCTCGGGCTATGAATAACCAAAATCCCTTAGGTATTTTTATCTTTTCTATTTATTTATATTGGGGCAAATTTCATGTGTGGGACGTTATGAATAAATAAAACATCAATCGATTTGTCTACTCTGTAC
AC-------GCTATACAAACCCAA-----CTTGAGCGGTCCTCT---------------------AGGCCAATTGCATTTGAGTTTGGGTATTTATTAACAACAAAACGATCAAAATGTTGTATTTGTTC
>AQP 8728239 8728630|8193 chr2R 8728599 8729346 scaffold_1 2032766 2033502 - 41209|0 31
GAACGAAAGTTAGCCTTTGTATATCAAGTATC
AATAGTTCATTTACTTATGCTTTAAAATTATC
>CG4630 8731561 8731676|8196 chr2R 8731547 8732168 scaffold_1 2035888 2036537 - 15704|14 141
TTCATTCTTGTTTGGATG-----------GACATATTTGCCACCGATCAGCAATATACACATATATTTATATAAAGCGATGTAGCTGACCTTAAAAAATACTCGTTATAAAGTATT-GTATACAAAAA
TGCGTCCACTTTCGAATATTACGAACAATTCCACATCCACGAACAGTCAACAACACGAATCCATAATGTGATTAGGCATATTAAGAGCATACATTATCCATTTAGTACAAAGCACTAGTAGTTAATTA
>CG4646 8735397 8735552|8199 chr2R 8735415 8736367 scaffold_1 871083 872023 - 29713|0 149
ATCCTGCTGCACTTTACCTAGGATTTTCTTGATATTAGGCTAACGCCTCAAACTGATAAATGTACACTACACGGCACCCGAAAACAAATA------TCCTTTAAGCATATAAAGGCATTT------CGAATTGTTTTGTTAACTATAAAT
AATCCA----ATTTTA-----GATTTTCTT--TTTCACGTTAAACTCGTCTGCCAATAAA-------------GCATTTGTTAAGAAATAGAAAATTCTTTTTTGACTTGAGAAGCATTTTTCTTGCAGATTTACTTTTCACATAGAAAT
>CG4643 8736846 8737188|8200 chr2R 8736671 8736873 scaffold_1 872083 872286 - 5723|184 211
ATTACAGACAGAAGAACGAGTCGCGAAT
AGTAAAGACTTAGCAATTAGACAAATAT
>CG4643 8736846 8737188|8201 chr2R 8736942 8737052 scaffold_11 3429857 3429967 + 3378|0 112
TTTTTTGTACAAAATTAT--GCATTTTGTTGATTTACGCTAAGCCAAAGTTCATATCCACCTCGGCACTATCTCACATGGCAATTTACCTTAGTTATACGAACCAAATGAATA
TTTTTTGTACAAAAATATATGCATTTGTTGATTTTAGAGTACGCCAAAGTTAAAAT-CACATCTATTCGTTCT-GTATACCAACTAAGTTTAATTGTACAAACCAAATAAATA
>CG4643 8736846 8737188|8202 chr2R 8737063 8738145 scaffold_11 3430149 3431236 + 48228|0 131
CTTTG------CAGAGGGCCTACAACTTGGTTAACAACTTCCACGGATCCATTAGGTTATTGTGTACATTTGTATTTATCTCAATTATGATTGCTTCATTCCACCTGAAACTCAGTTCGATAAATTTAGTTA
CTATGAGATAACAGATGAAGCCTTACTGCCCTAA-AATTTGTAAAAATAAATGCAGCTA--GTATATATGTATATTCGTTTAGAT---------TTCATTCTGCTTATGTCT-AGTTTTATTAATATAAGTA
>CG4663 8744174 8744351|8211 chr2R 8742282 8746127 scaffold_11 3436429 3440257 + 95440|2082 2329
GC--CGACCAAATCCTCGGAGAATTAGCTT-----AAGTTTAAGTTACGTTCCG---TTCAGCTTCTGTATATGTACGTCCACGTCC--CTGTATTTT----AGGTTAGCT----------TCCGCCTTTTGTATATTTCCATTTAGTTGTAAATGTTTAT-------------TAGCCAGCGATCCC-------------------------------AATGAAAGTAAACATAAACCATATGCGAT
AAAATGGCGAAGCCATCAACCTTTTAGCTTTAAGCCAATTAAATTTGTGTTCTGGATTCCAACTGAACAATAACGAGGTCAACTTCGAGCTGTTATTTCGTGGGGTTATTTATATCAAAATTTCTACTCTTACAT-TACCCAGTTATTCAACAGCATTCCTCCACACAGATCCTTAAACAGTGGTATTTTTTTGAAACACAAATAGAAACCTAAGAAATAACGAAAG--AATAAAAAACATAAACTAT
>CG4670 8747663 8747971|8215 chr2R 8746658 8748552 scaffold_50 389448 391530 - 56758|1228 1571
GTTAATCCGCAGGAAAGCTTTCAC-ATATTCTAAACAACAAAGAAAAGACACCGAACACCGAGAAACGGAATTTAACACGCCACCTCATTGCATGATTTGTATTCGTGGCACCTAGAGTTATGATTAAGTTAAAAGTGTGTATATATATATATATATTGTATGAACGAACAGTCCTCTTCCAGTTGTAGTCCCTAACCTAATCGCTTTTTACCACGACGATGCACCTGATTGCTT---TATTCTTAGGCATGCAAATGTGATTTTTCCCTCCA-----------------GAAGTGACAGTTTGAATAAAA---ACGATCAA-----------TGCTAGACGAA
TGCACTC------AGAGCTTTGGCTCTATTATCA---------TAAAGACAC-----------ACACAAATTTTTAACGACCACCTCTAAATGTTTTTTGTACGTATGTAACTCACAATTAGGTTTAAGCTGAACGTGTATATAT------------------------CAATTATCTTCCAGTTTTAATCC---------------TTTATCATAACGA-GAAAACAATCGCTTTTATAAAATTACGTATCAACATGTACTTATTGCTTCTGTTTTCTATCAGTGCATCGATGTGAAGTGATAAAAAAAATGTACGATCAAAGTTGTTTATCTGCAATATGTA
>CG4679 8753162 8753220|8222 chr2R 8752862 8753177 scaffold_1 6558645 6558948 - 889|319 334
AACCATTTAATAAATA
GATTAAATCATAAAT-
>CG4679 8753162 8753220|8223 chr2R 8753178 8755560 scaffold_50 395798 398238 - 99249|0 45
-AGAGTCTTTTGTAAATTATATAATGAACGCTG---TTAAATAAAT
CAGTTCGTTCTGTTAATT-TGCAATAAATGCAATATTTAAATAAAT
>CG4712 8764801 8764849|8233 chr2R 8764617 8764893 scaffold_16 551399 551696 - -433|204 262
TAGGGCT----------ATTACCACTTTTCAACCAAATACATTTTTCCACAAAAATAAT
AAGAGCTGGGCATGATAATCATGTCTTTTTATCTAAAAAACATCTAAAATAAATAAAAC
>CG4714 8767753 8767802|8236 chr2R 8767772 8770798 scaffold_50 410910 413895 - 6530|0 30
AGTTGTAAGAATCCACAAATCAATAAAACAG
ATGCG-AAGTGTCTTCTCAAAAAATAAACAG
>CG32843 8783704 8784955|8252 chr2R 8783632 8783976 scaffold_50 427770 428130 - 5148|79 383
CGAAATAAATTTCAGCCTTTTGCCGGCAACGGACCCACTTGAATGAGAACATATTTATTGTACCTATGAATGT-AAGAATTTATGTGGATATTAAATATCATTGTTGTCTTAAGTGTTAAGTGTATCCTAGGACTAGTGCCCCGAACACCCTCCTCCCCAAAAAATATATATATATCTCTATCTCTCTCTGTGGTAAGCTGAGCTTTCTGGCA--------------------------ATCGCTTTTA-----GTGTGTCTATGAATGTACGCAAATGTAATAAAATTTTAATTATATCTACGT
CGAAATGTAACT-AGCATTTAATTTACAGCGAACCCATATTCATAAAAGTAAACT-ATTATA----TGATTATTAAGAATTTATGTGGATATCAAATATCATTGTTGTCGTAAGTGTTATGTGTCT-CTATAACTAAATTATCATGCATATGTGGC---------TATTTATATATACATATATATTTATGTGGTAAGCTGAGCTTTCTAACATTTTTAAAAATTAGGCGCTTTATGTTTTCGCTATTATAGATGAATGCTTCGAAATCTGTGTATATGAAATAAATATGTGAATATA------T
>CG32843 8783704 8784955|8253 chr2R 8783987 8784195 scaffold_23 478482 478710 + -835|0 252
TT----------TTTCCTAAAT-----------TTGCCATGCATATTTTATAGTCT------ATTTGGTAGACACCCGAGATATTGTTACGAAACTTTCGGAAAACTTCAAAGCACCCAGA------------ATAAGTTCCTTAGCCAGCTAGGCTG----ATGTACAATATATTTTGCAACAATTTGCGCCATGCTAAATGTTAAGTTTTAATAGTATATACAGAAGCAGT-TTTCCTTGGTTTCCTCAGA
TTAGCGCGCGGCTATACAAAATCAAAATTTTTATTTCTATGCAGATTTTCAAGGCTTACGCAATATCTTAAATGT-----ATGTCTTTTCAAAA---TCGAACGTATTTTAAATTAGCAAATTTGTTTTTTTTATGTATTTTTCAGCTAAATCTGCTGCTAAATGGACAACATAT-----AATCAT-----------AAAGTGATCGGTATCAATGGTACCTAGCTGACCAATATATCCTTGGTTACTTTATA
>CG32843 8783704 8784955|8254 chr2R 8784196 8785441 scaffold_50 428686 430123 - 29493|0 915
CTAAAGGACATG------TCGGCCAAGCGACGCGCCTCAGC---------------------------------------AGGACCCCAACACCACCAGCCCCATCACCAAAGCCACCAGTTGTCCACGGATCAGCAGAGAGCTCGCAGCCAGAGCCTGG------------------CGAGTTCGTCGTCCTTCCTGGAAGGCTGGCGCGACCGGATGCCGTTCCTGAAACGGCGACAAACTATCGACCACTCCCGCCAGAGCCAGCCACTCATGGAGGAGG-----------GCGGAGAGACCGTTGGCCAGGCCAAATCCGCGCCAGGTGCCGTTGACAGGCCGACATTGATGACGACCATTGCGGAAGATGTTGCCGAGACAGGAACGGCAGC---------------AACATCGCACGCAGCTTCAACATCCGACGCAGC--AGCAGC-----AGCAGCAGTAGGAGC--AGGAGGTGCAACTGGAGCGGAGGAGGGCCATCCCAATGGCATGGGCACTGTCATCGTTCGCATGGAGAGAGCTGGCCAACAGCATATGGCCGATGAGGCGCTTTAGGTTAAACCC--------------------------------TTCGAGTCACACAAC-----------ATCTCATAGTTTAAGCCACAGTTATACCAAAACCGAAACAGGTCAAGAACCCAAAAATCAAACCCCACCAAAAGCTACAGCCCATTGAACCCAGTTAGTAT-CGCCAGGCATGTTCCTGAAATAGAGTTTCTAAAATAAATAAACGGGTGCCCA------AAAGTGGTCAAT--------GTCATTGTTGTTAAATGTTCAGAGGCACTGCCGATAAAGAAGCCCAGCTAAAATCTTAAAAGTAACATTTTCATTAGCTAAATTTGCA
CTAAAGGACTTGTCGGCATCGGCCAAGCGACGCTCCTCAGCGCCCCATCGCCCACATCAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAGCAGCTGCAGCAGCAGCAGCAACATTTGCTGGCACAGCAGCAGCGGGCGAGGAGCCAGAGCCTGGGCATGACAGGCGCCACAAGCAGCTCGTCCCGCCTTATCGATGGCTGGCGCCATAAACTGCGTTTGCTG---CGGCGCCCGAGCGTGGACAATGCGCATCAGCGGCAGCCGCTTATGGAGGAAACAGCTGGCAATTCGCAGCCGCAAATGGC--AGCCAA---TACGCAAGCGGAGGCGGACAGGCCGACGCTGATGACGACAATAGCAGAAGATGTCGCCGAAGCAGCAACAACAACTGCAACTGCAACAGGAATAACAACAACAACAACAACAAACAACGCAACTGAACAGCGAAATGGCACGGGCATGGGCTTAGGATTAGTATCGAGATCGGGCTTAGGCCTCGCACCTGGCATAGGTGTTGTCATTGTCAGCGTCGATGCGAATGACCAACAGCATATTGCCGATGAGGCGCTTTAAGCAACACACACACACACACACATACACAGAGACACCCACAAATCGAGTCACAAAACTCTGTTACGAATTCTCATAGTCTAAGCCAATTTT------------AAGCATGCTACCCGCCCAAATAGATAACCATACTTGAAACTAGAAACCA---AAACAAATGAAAATGCACCCCACCTAGAAAAAAAAGAAAACAACAAAAATATATAAATAGTCGCCCGCCCTTCAGACCGATAAACAATCGTAAGCTATAGCAAATATCAATGCAAAGTTGCTTTAATAAAAGAAA--TAAATAAAACCTTAAGC-TAAACTTTTGTGCAGCTAAAGTCATA
>CG10814 8891878 8892087|8399 chr2R 8891859 8892092 scaffold_19 1700131 1700368 + -472|19 260
TGCTCCTTAGATAGCAGGAGCAGCAAGCACATG-TTATGTTATGGCTACATTAATTAGCCATCTATCAATGCCAAAATGCTTTGATTGACATCGCAATGTGGTAGCAATAGACAGAGTAGAATCATTAGA-------TTACTTTCGA-----ATTTATTGTGCTCG----------------AGAAATTAAACCATTTATTGACA---TTTTGAATAAATACTATTTTAATGGTTTCTAATC
TGTGCATTGAA-------AGTGGCATATACTTGATTATAAAAAAACTATTACAATTTACTATCTTT--------------TTTTTTT----TTTTAATTTGAAAGCAACCGCCAAAAAATGACCGACAAGCTCGATTTTGTTATCGATATCGATTTATTGTGTTCGTTTTGCTAGCGTGATCAGCATACTAGCCATATATCGGCAGAGGTACGAAATGAAAGTATCGATACGG---CTGATA
>CG4744 8910493 8910649|8422 chr2R 8909556 8911412 scaffold_50 595389 597397 - 54989|1011 1265
-CCGCT----------------TTAATCAACGTTTTAGATTTTT---------------GTTTCAATTCATTAGTTGTT-----TTTTTCAATTAAAAATTCC-------------------CTTTGTTTGAGTTAAG--------TCATATATTTTTAACACATTTGAAATAAGCAACAAAATTCGTTTGAATTTA-----------------TGTCAATAAAT---------ATTTTG---------AATAAC
TCCGTTTTTTCTCTTCATTTGATTATTAAAATTATTCTATTTTTATATATGTTATGGCCGTTTGAGGAAATTAGACGGTTTTAGTTTTTCGAATAACGTTTTCCACGTATTTTCCGAGTGAGCTTTTCTTAAATTAGGTTTGTTTTTCATTGATTTATTGAAAGTTTAAGACAAATTTTAATTTTCGATCGACTTAAATTATTCTTTCGCCCGTTTTCCGCAAATGGAGCTGAGATTTTTAACTGCAACAACAGC
>CG18278 8923949 8924076|8437 chr2R 8924051 8925602 scaffold_63 255954 257524 + 42072|0 25
ATATATGCATATTACTCCTAGCCAAA
AACAGCGCATATTTTTCTAAATAAAA
>CG30059 8928678 8928803|8443 chr2R 8928778 8930329 scaffold_63 255954 257524 + 41830|0 25
ATATATGCATATTACTCCTAGCCAAA
AACAGCGCATATTTTTCTAAATAAAA
>CG17034 8930882 8931424|8444 chr2R 8930802 8931092 scaffold_10 4345823 4346111 - -766|83 315
CCCTTGTCCGCGGCGCAGCTTTGTGATACGGATACAGACTTGCATTCTTTTTTAAAAAAGTCTAT-----CTCTAAGTAAACTGTAAACATTTGTACCTACATAT------GCATTACATT--ATTGTGAATTTCAAA-----AAAACATATTGATGTCAGCAAAGAATCTGTATTTTTCGGTC-ACCGAACCGCTGAT-ATTTAATGGAAATAAATCATA--TTTCTCTAAC
CCCAAAT------------------ATAC---TACAAATTAAAAAACATAACTAAAAATATAAATGGAAAATCAGAGTCAAGGATAAGCAGACACACCCACTTGTTGCTTATCATTAAATTTGATTTTGTACATCGAATCTTGTACAAATACGGATATCAGTACATA--TTTTACTTATGGGTCAATTGAATAATTGTTCGTTCGATATTAATAAATTGTAGCTTTGGTTGGC
>CG17034 8930882 8931424|8445 chr2R 8931093 8931638 scaffold_1 5596108 5596711 - 4804|0 402
-CCGAAAACGATGGGACTCTGGATCTCACGGT-GCACATGTATATAGGAGAACGC---------------------------------------------AAGGAGCTACGATTTCGATTCACATTGGTATATATTTAGAGCACACTTCTGGTAGGCCAAACTAAAAAAA-------CACACAAAAC---------ACATCACATTTATTATCTATGTGTCTTACACCAGCAGTAATTGAAAAACATTTCGTAGACGCCACTAAACATTTGAATATTGCGCTTATA------TGTAAGTTTATCTTTCTATTTGCTGTTATTTATTTTGTAAGATCGCGAGGAAAAAAAACAC---ATTTAAGAGGCTAGAGTTCGGTTTTGTTTTTATTTTTTGTATCTGTC
CTCGAGAGTTAAATAAATCGAGAGATAACGGCAGCTATTGTATTTATGGCTATGCATTAGTTAAAGCAACACCTGAAACCTATGAAAGCTTATGTATGTAAAAGGGCCAAAGAATAAAATCATTTAAACACATATTTTAAGCATACTAAATAAACAAAAAACAAGAAAAAACAATGTTAACTGAAACTTTTGTGAAACCACACACTCTTTTTCTGGTATTATTGCATCAATA-TATATATTCTACATGTGTCTTACATTACTATTTTTTTATATATGCTGCATATGATAACTTAAATGTGTATGTGTATCCTAACTGTTAATTATTTATTAAGTC----------AGAAACACTTAAATAAAGCCGTTAGAAGCA--------TTTCATTCTTTGTACATATC
>cnn 8955218 8955978|8476 chr2R 8955012 8956551 scaffold_1 5620804 5622240 - 19664|224 1030
CGATCGCGCCGACGT--CCAGTATATCAGCATTAA------CCCGAGAGGCCATTCACC-----CAATGTTCAATTGCCATTTCTTGCCATTCTTATATTTTGTATGCATTGTATTTTGTTGTCTCGTTGCTAA--CTTGATATCAATTATTTATGTGTTTTCTTCTATTTTTTTTTTTTGTTTAAAAAGACCGTAAACAACGAAGCTATTAGTACGAAATACCCATGCATTTTCTAAAGACTGTTGAGGGAATCGAACC--CATTGAATGAACTATCACACACACACACACACACACCTGTTTTAAGCACAAAACGAAACTAACTTGAAACTTGAAGTGCTGAAAATATGTATCTAACCCGGCGC---ACTCATTCATATTGAATGACACATGTATATTAGAATGTATATA------TATATATATCCCCTAGTACCATAACTTTAA---CGAAT---ATTCTCTAGCATACTCGACCTGATTCTTGTCTCGCATA------ACCCTCCATTTTCCAATCATTTGCGTGTAGTGACTGCCTGATTAATGTATTCTCCTGCTGCTTAACTGCTCTTAATCCTTGATTTCAGTTAACCATCGAAACGGATATTGAAATAATTGTTTGACTTGCCGGACAAAACAGTTTAGCTACGTTGCCATCCAATAACCCTTTTTGTTCGAAACATCCATTTGTACAATGTGTAAAAAGTAGTGTGCGTTGTCCTGGAGAACAAGATCTAGAACTTAAGTCATTTGTACCCGTCGTTTTATGGAATAA---ACAATTG-----CGTTAGAATTATT
CAATTGATTTGATTTGATTTGATTATCATCATCAGGTGGACTCACAAATACCATTCATTTCTTACAAT-TTCCTCTTTCATTTTTACCAATTTTCTTGTTTCTTTTAAATGTTCTTGTAAATGTCTGTATATAAGGCACGAAAGCAACGAGTTAT--------TAATACTTGCATTTTTT-TAAAAAAAGACTGTGTATAATAAAAATATATATAATGTATATGTAACAAAATGCAAGTTTCCACCAACTGCACCTAACTGGTATTAAGTTAAC-----CAGTCACACATACACACATTCGTTC------------------------ATATTGAATGACCTTAAAATACATAGTTAATTAAGAGCATTACTAACCGATTCTGAACA------GTATCATA-AACACCTATAGCTCGCTAGAAATAACCCTTGG----ATAACCCTGATGCCGAATGCCATTTCTTGCCATA-TCAATCTAAATGTTCTGTAACAAATAAAAGACTAAACAT-----AATATTTTGCTTGAATTAAT------ATTAATCTCTTTTTATCCCAAAT-TTTGCTATGAATTTTCGTTTTCAGTTAACACTTGGAACGGATATTGAAATAATGTTATGA-----------------TTTATTTGTTTTG------AATTAATTTTTCTGCTGTA-----CAATTTGTATAATCTGTA----------------------------AAGATAATAGACCTAAGCGTTTTGTA-CCATTATGCAATAGAATAAAATACATTTGTAGTTCGTTTTAAAAATT
>CG30062 8961624 8961684|8481 chr2R 8958846 8962134 scaffold_1 5624119 5627814 - 37692|3288 3371
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AGTATTAAATCTGAAAT-AATGAAATGCACTTTATCACTTCTTCTTGTCCAAAGACAATAACATAACATTT-------------GGTTGCAATTTCTAATTAATACAAACGTTCTACTTACATCTTATAAAAAGTGTTCTGTTGTCTATGATCTACTCGGGCGA----TTAAGATTCTTCGTGCATTGCAGCATAAGAACAGAGGCAGGCAAGCAGAAC---------AGCACAGATAATGTGAGGGTATACAACTGGTTAAAATA
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AATTGGCCCACGCGCTGCGCCGAAGGACGTCTGACGGCGGCAGCGCAGGCGGCGGTAGCCCTGGCAGCGGCTACCACCCGACATCATTTGCGCCGCAAGGGCAGTCGCAAGTAGCACCTGGCATACCTGTGGCATACTTTCCGG
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AGTGCTAGTAATAATCAAAAAGATGCTCAAATTAAAAAGGAATCAGAGGCTCTAAAAGAAAAATGCGAAGCGGAAGCTTTACAGAAAAAGTGCC
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TGAGAATTGAACGTTACTGTATTCGAGCGACTG--TTACTATCGGCCAAAAAATAAATTCTATAAATTAACCGAAAAATCGAATTGCTATTTTCATTCAAGAAACCAACCCAGCTAATTGCAGTGTAATATTGTTACATTAAGACGATTAAGAATAATTGTGTGGACAACT--TTGACTGCCTTTCCTCT--GGGCCACAACGCATTGGGTGTCCAAGGTGAGACAATTGAATATTT
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GCAGCGGCAATGGACTTTTAAAAGGAGCGTGCTAATATTGCAAATTCTGGTAGCAGATGATTAAATTTAGATGACTTTGTCAGGTCGCTATATCTGCTAATGCCTAATACTAATTCGTTAATTTTTTACGTTTAC-TTTGTGAATTGAGATTC-------AAGCGAGACTTGCGGTTAATCTATATATCTGATTATATATACATAATTATTATTTTTTTTTTCTCCATTTTATACATTTGTACTGTACAATACGTTTGTAGTTCTGTTTTTGCACACGCATGCAACATACTTATATACAACACACTAATTATCCTTAGTAGAAGTCACTGATATACATAAATACATACAAGACATATGTATGCATATATAAATGTAGTATATACAACTATATAATATTTTAACAATTATG-----AACGCTACAAATTATCTGCGTGA-GATAACAAAATTTCATCCACAATTACATAATAGAATTTATACATATTTTAA--ATGGCA---GTTGAAAAGCTAAAAAA-------GATCGAACCCTAAATCGTCGTCTAGCTAAATTAGTTTTTAATTTTAAAATTAAGTCATTTTTTATAATACGAAAAAAGTTGTGTAAAATAATAT-AACCTATGTTAAAATAAATTGTTAAGCGTAACGAAAATTTA
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CAAAAATTTC-ATATG--CTAATTGCAATTTAGTAAAAAAGTTGTATATATATAAGTGTATATATG
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CAAAAGATTTGTATAGTAACTATAAATGCCCCAACAATACCCATTATGCATTGTAAAGAAGCGGTGTGTTGTCCACTTCGATGTACTCAGATATCAATGAATGTAAACATATT-----GATTACATAAAAACGTTCACTTAGTGCAGCA---ACTTGCGATAACCTACAAATGTATTTGTTAAATTAAATACTATATACATATATATTATATATATTTACGGATTGTATGTGTAA-----------------TACGAATAATGCGCCCTGTTAAATGCAACAAGGAGATAGGGATCTCAGCAAATATACAAGTATAAATTAATCATTTAGAGTTCGTGTG-----CGTTATAAAACAAAAAGGTAGTGAAAG-------AAACATAAAACAAAATT-----------------TACTCATTTAAAACTT---AATGATCGATTTAAATAGCGAACCCAGCCATAAAATCGGCTTGAACATTTGCGAAACACTAT-TGTAATAGAT--AAACTCCTCAAGCAAGATTCTCAACTGGACAGCCCCT--------------CAAGAAATAATA----------ATAAAT------ACATATTTTTAAAAATTAACCCAA---------------AATCACTAA
CATAAGAATTGTATAGTATTATGAAAAAAAAAAACTATTCGTACTATACAATCGAAAA----------TTAACCA---------------ATATCAATGAATGTAAACATATTTAAATAATTAAACATAAATGTTTGTTTAGTGCAACATCAAATAATGGTAAACTATGAGAGAATTTGTTAAAAAAAATA-----TATATATATATATTATATATTTATGTATTGTATATGTAAATTGTCTAAGCCAGCTGTATGTATA-TGTACTATGTTGTATGTGCAAAAGG---------CTAAGCAAAAGTA--ATTAAATATTA--CATTTAAAATAAATGAAAAAACCGTTCATCAAAAAACCTCTAATTAAAGCCAAACCAAATAACACACAAATTTGCGGTAAATTTATAAACTATTCGTGTAGAGCTCCTGAATGA--AATAAAAATATTTAA-------ACATAATCGGTACAAATTGATGCTAAATTTTAAATGTACTTGTTTGAAAATCCATGAACAATAATTTAATAAAACCAATCCCAGCTAAAAATAAAAAAAAGAAATAATACAAACAGTCAATAAATTATGACACATATTTTTAAAAACCAATACAACGCCTGCAAATTATTAGTCACAAA
>synaptogyrin 9357657 9359190|8897 chr2R 9358317 9359255 scaffold_16 945096 946061 + 16876|0 995
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GCGTATCACTTAGCAAGTTGTGCCACTCCTCCGTTGTCGACACACACATTTTT----TTGGTAGTGCAAATGGCAAATACAATTTTTACACCAACTG--CAATTATAGTGCACAAGTTGGCTT-AACCTAATACACCGATGTCAAGCATATAAGAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACTA-----CAACCACAACTACAACAACAATGCCATGCATTTGCTTCAGCAAGGAATACAGTAAGCAG-------CAAGCCGATCTGCTCAGTTGAAAACCC---TATCCTTATACAGTATAAT----------ATTAATGATAATAATTTATAAGCTAGCCCCCTAAGTTATGTGTGCAG-TTTTTGTAGTGAAAATTTGTTGCAATATATACGAGTATGATATATACACATTATAAACTAAATACTATATATATGTATATATACAT-ACATATATATACATATATAATTATGCTTTAAACGTTGTTAGTTGTTTAGTAT---------------------ATTGTATTAAATT------TTCTTGTGCAAGGCCCTGG--CCCTCTATGCTCAGCTCAGTTCAGTTTTGCCCTGACAACAGGAAATGATGAAAAGAGAAAAACCAAAACGGACAAACCACTGTTTTTTAGACAAATTTACACACGCCAACAGCAAAAA--TGATTATAGTAATCGATCCACACTAGTTAACTGGCAGACAT-------CACAA---AAACTGCTCAAA--ACATATCCATTTTACAACCAACCAAATGACACACAAGCATTTTACACCTAATAACTCCTACTTCTGCTTGCTCCTAAAACATATTTCTTTCTAATGCCCAACAGCTGCAGCACCTATGGCCAGGGTCGCTTGAATTTAGCGCATATATATATATATA-TATATGGAAACAATAAAACACAACGCCAA--AATGTAAAAAATCTAAA---------ATTGAATTACAGCTAATAATTGTT
>CG6543 9368854 9368956|8902 chr2R 9368832 9370229 scaffold_16 951737 953140 + 57271|22 134
AT----ACTACCCTAATCAATCC------CAGCCAGCTTTGCATTTATATTATCTAAAAGAAAAACTGTTGTTTCTACGCAATTAAAACTTTAATCGTGATAATTTGAAAATG
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GGGATCAGCAGCCATTCCCATCCCCGAATGATTAGATATTATCTTATGCATCGCTGGCGTGCTTACTTAAATCTA---CAAGTATTT--CTATTTTTTTCTTTTGTTTGCACTAGCTGTGTGCTTATAGTTTTCTAGAACTGCTCCTGAAATGTTATTGCAGACTTTGAATACT-GATTATACATACAATTGCATTGATTCAATACTTAACA-------ATTTGTCAACTAAGAAATCTCAACTACATTCGTTCTATTTTGGTAATCAATATTATATTTGTATAATAAAAAAAAAACTGAACAAACTATGAGGTTCAACTGAATTGGCCAGATTACCACAG
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ATGTGATTCATTTTATCTATTTTTAGTTGAAAATCAGCTTTTCAATTGCTTTTATATATGCGAAACGACACTTACCAATAAGTTGCTTGGGTATTTTTTGTAAAAAGAATAATTGTGTTTCAATTCAGTAACGTGCGCTTAGACTTGAATATTGAATATTCTTTA
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G--GCGGACGCAACAGTT---------GCCAATAAACAATTAAAAACAAATAACAAAAAAAAAAACA-ACACAAAAATCTTAAAAC----AACTAACTACGCACTGAAGTTCTTTCAACTAATCAACCACAAATTATGAACTTTCCCCCTGACCCCCGCCAGACTCTACACACGCAACAGAGAGACTACATTGCTGTAGAAAATGTAGCAACAGGAACCAGTTCAAACAATCGCTGAGAATTTATACAAAAAGTATTTTGTAAAAAACAGCGTTAGAAAATTTGCAAATCTTGGTTAAGCGTAAAAGACACAAAAAAAACTCAACAAAATGAGAGTTTAGAGAACTGCAAAAATAAGTTTTTATAGCAACCGTTATAAAGAAAACACACA-----CACGCAAAGTTG--------AGAAAGCTACTTGCAAGTAATACTAACTACTACGA--ACCTTTTGCTACTACTAATATTTAATGCCTACTATAT------ACTAGTTGTACTTTAATATTGATTTCCAAATTTATAATTTGTATATACTTATATAA-------------------AATTCAAAATACACTCCAAGTGCT-TAAGCCAATTCAAAATCTAAAAAAAAAAATGAAACAAAAATTATAAAAATTAACAAAACAGAAAATGAAAAAAAAAAACAAAAGAAAATGAAAAAACATTCGAATTAAATGTC---------GCTGCGCGCTGTCATTAGTCCTTGCAGTCTCTGAATGCGTACACAAAATCGCCAGTTTGTGGGCGTGCT--CAAGCTGTGG-GCGTGCCAGTTGCGTATGCGACCAAAAAAAGTAAACCCAA--TCGTTTAAGAG---AAATTTGATTTTGTTCTGTTG--AAACTAATAGAAAAAGTAAAGCTTGACAGCCGCATAAAAAAAAAAACAAAAAATATTTAATTATATACTAAAAGTCATTACTCTAAGTTTAATTAATATTTAGTTAGTAAGCCTAAAACAAGAAGATACCAACCACACACACAATTTGTAATGCATAATTATTTTTTGTTTTTTATATGCAAGTGGAACATATAACTAATATTATAGAGTGAAAGA-GAAAAAGAAAAAGAAAAGAGAAATAATGCAAAAC--TTTATATAAATATTGTATAATACTAATACTAAATTATTTTGTTATACGAAACAATAGAAATGCATTCAA---CGTTTTTTGTAATTCTATTAAATTAAAACAATTTAAACGAGAAATAAACCTTTACAAAAAAAAAAAAAAAAAT
>CG6646 9458441 9458497|8978 chr2R 9457088 9459211 scaffold_1 1212087 1214360 - 12105|1566 1622
TGGGAATCGAAGGAAAAGCTGATCATAAGTTACATAAAAATAAAAATATGAAACATT
GCATATTCATATAAAATATGAATCTCTTGTT-CTCAATTAGAAAAGTGAGCAATAGT
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AAAGTATAAAAAGCGACACCAAAATGAAAAACAAACAAATTAACAAAAACACATCCACACAGCAGCAGCAGCAACAACAACAACAAAAACACTTAAATTTCGAAAATGAATTCGAATAAGCAG---CCAACT------CAGAAAAAAAAGAAGCAAAGCGTTTACAAAAGCCGAGTCGAAATCATTAGAGAATAAGTTTAAAATGATGTTTATA-------TTTAAGTTACAAAGAAAGCCAGAACA--------------GCTCTTATGGAGCACATTTGCAT---TAGCTTTTAGG-----------CCCAAA------ATACACACACACACCAATACCCACACGCCAAAACCGTAGGGAT---TAGAGAAAAAGGG-----AATCGAATGTTTAAGCACAAGCAGGCGCAA-CAAATGTGAAAGAGAATTCTCAAAAAAAAAAAAAATTTTTAAAATAAAAACAAGCGTAGCGAAACAAACTAAAGGGAACAAA----ACGAAAG-----TCAAATAACAACAACAAAAACAACAACAGCTGAAAACAAACGCAAAAAAAAA-------------------------CAACAACAC-ACATTTACGATGAACTTTTGTAATAGAA---------------TAAATTATATTTTTACACAATACAAAACAAAAACAAAGTTTAAAAAATGTGAAGACAAAAAAAATGCAGACAACCAAAGGTTTTTTAGTATATCAAAACAAGAAAAAAGTTGCTGATTAACACACACACACACACAGACACAGACAACAAAACACATACACAAAAACAACAACAAGAACAACAACTCGGAATTCTCTGTACTGTGAACGAAGACCACCACCAAGCTTAAAGAATTATTAACAAAAACAAAAATGACAACAACAAACAACAACATTACGACAAGCATT-AAAGAGTGTAATAATTAGCCATATATATCTATATATATATATATATATGTATGTATGTATAAAACAAAAAGAATAACTTCAATACTACTACAACTCAAATGTCCAGAATTGTAAAGAAAAGCAAACTTTTTAGTAGACT-TAAGTTGGGAATTACCAAAA---------------------AAAAAAAAAAAAAAAAAACAAAACAAAAACAAAAAAGTAA------CAAC-ATTAACGATAACTCCAATTTCAACAAGGGACAAACTTTTGGTC-AAACAATTGCTAGTTATATTTATATATTATAATATAAATATAAAGATATACATATATGTGTATTTAGGCAACAAGTATATTGTATCTGTATAAACGTGGCT----------AGCCGTGACTTTAACACAAATGGCATAAA-ACAAAAACAATACTTAAAAGTTTGCGCTAAACTTATGTTAAAGTCAACAGTTGCTGTTTAACTAAACAGCGAATTTAAGTTATAAATAAATAGTTTATGTTTTCTATAAACACACTATGCACACACACACACACTCACACACACA-------CAACACAAC----ATACACGGCATATCAAACCCAATGTCCAATTAATTTATGTACCTC--------------------TATTTAGCT-CAACTTAGGT-------TTCATAATTTTAATAACAAACAC
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CTTACG-------TGTGCGGCTTGG----TAGTCATTGATATGG---AATCCGAA--------------------------AGCAAATTTTTTCATGTGCTGAGTGAT-----TTTTGGATGC-TAAATAAATT-------CAAATGGGAGTTAATCGGTAGTTAT-CTAT
CGCGCACATATTTTATATAGCCCAGCATATAATCCCAAATATTAATTAATCCCAATTTAATGAACGCGTTCGAAACAGCCCATCATATTATTACTTTTGCACATTTATCCAAGTTTTCGATTCAAAAATAAATTGGCCATGCAAATGTTGGTATGTATGTATTAATGCTGC
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TCTAA-----AAACTATAGGAAATTCTATATCAAATTGTCTGTGTCGTG----CACGTAAAGTAGTAGTCCTTTTCAATTCAATG
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TGTGCCATGACCAAAGACACAAC------TGCGTTATCTATTTAATGTTTTAATTTAAGCTCAAAAACAACAAAACAAAACAAAACAAAACGAAACGTTTATAATCACAGTCACGACTTGTTCATAACGATTTTCCTTATTGTTTAGTTATTACGCTTATTTTGTGCAGCAATGAGTAATAAA-----GGATTGTTAGTTT
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ATTAGGCAAC---------CATAGTCGTAGTTGTTCCCATATTTCATAATAATCACATTTGGATTTCGATTAAGTTCTATGTTAAAACAAAACGAAAGCACATCATATTCCTGATTCTTCAAAATCATATATATATATATATATATATATATATATATAGTTCCCTGACCCCACTCATAAGCAAAAAGGCATTTACCCAAATTAT--ATTGTACTATGCGAGG-ACCTACGACCCACGAGATGCTGACACC------------GACGATCATCGAAACACAACTCGAAGTCACGA--CAGTTGCATTAAGTTTTTTTTGTTTATAATGCACTCGAACG-TCTGGATCGGAATCTATTGTAAATCTGTGGTGGAAATTGTGTTGTGCTTACTGTAAGATTTTCCTTATTTTTACTTTACGTTTATTTTAAACTAGTTTTAGTTATACAATAACGAGCACAGGCAGCACAAGCCCAAATCTAACAAACAACCACA-----TGAGATAATGGCACGTTGGCAGA-------TCGGAAGTCATAATTTAAGCAAAATTATTATTTGGTTTCCAGTGGATAACCAAAAAGTTGACTGGGTAAAATGCAATCACAGTC-GCTATACATATGTAAACTTTAAATATACATGAGCAAAACTATTATTT
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AAGGCGAAACACACA-CACACACAACCTACGCGGGACGTGACATCATCGGCAGCGACAACAACAACTATTAACATCATGCGCTGGGCGCATATTCGCAGCCTACGTCATGTTCTCACCAATACACCAACACTCACTTTGTCGCGCCGGCCACACATGGACATGAGCGAGAG-------ACGAGAGTGACAACAACGAAGAGAAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCATCAG-CACAAAGCTTTAGCAGCTTTTTGGTTAAGTTCATTTCAAACTCTCC---TTCAGCGCCAAGTGGCGTGCCGGCAAGCAAAGCAGAGAT--CAAACACAACAACATACACGACATTTCGATGTCGAATCTTCACGTCGCGCCTGCGGCTATTTTTGGCTCTGAACGCCACTCCCAC--ACAACTCTATTGTGATATTTTCACAAATTTTGGA--------------ATTTAAACAGCAAACTTTGTTTGCCAAC----ACCGAGCGGCAGGTAAT-----GGAGTGGAGGTTGGCGCAC--ACATTTCGCCCCCAGGTTAAGTCGTTGCTTTTATGCAGAGCAGCAGAGCAGCGGCGTTTGCTTGTGCAA-AGCTTTTGATAAGCTTTGTGCGGCGAGCGTCGCTGCCTCTGCTGCGTATGCGTCGACGCAGCGCCTATGACTGTGATGGGTGTTGCGTGCGCCCTCTTCCTCCCCCTTGCCTACACGCTCAAACT-----CCGCTGCCTTGGCCCAGTGCCGGCGCAGCGCTGCTGCAGTGCGCACAAGGCGATCAGGCG-TAGGCGTAAAGCTCTGCAGGCTTCGGCCAGCAGGGCTCGCGTCCGCTTGTCGCCAAGTTCGAATTGCAGCAGCTGC----GACGCTGGTCCTTAATCAATGCGGCAAAACAAAACACGCTCATGGGAAG-CAGCGCAGTCGCTTTTGTGCGGCGCACGTGCTCGACGCAATTCCACGCTGTGGCCAGTTGGCAGCACTCTGCGGCTCACTTCGGTGCGCTGCAGC-GCCGCTGCCGACTGCGGATATGCCCGGCCTGGTGTTGTGCTTGCGGTGCTTGCGTCTGGCGCGACAGCAGCTGCTGCGGCTTGGTCATGGGCAAACCCGAATCGTCTTTCAAGGCGATTCGAAAACCTACA------TTGAC-ATTATTAATGTCCTTCAATCGTACACATTGCACTACGATGGCTACGCTGTCGCCATTCGTGCAATTGGCACGCTAAATTGACGCCTGTCGGTGGCAGCTCCTTGGGGCTTCACTGTACTCGG--CAAGCA--------------TTAGGCACGCCAGCGCTCACACGCACACACACACACACACACATCGGGGTTTCGGATTCGTCGCTGCTCGGTTGCTCCAGCTTGCGGCGACTGTCACGAAACCCCAAACCATGCAAGTCTAGCCTCTTGTGTAGAATCCTTAGGCGCGTAGTGCCATCCATGCCTAACATCGGTGTCCATACCATGGTGACCGTCGTCGTCCAGCGTGCGCCAGCACCTTGGAGCATTGGCCAGACGAAGCGCTGCAACAACGACGGCCCGCGTTCCCCGATGAAGTGCGATGCCAGCTCCTTGGCATATTCGCATCATCATCCAGC-TGGGGGCCTAACGATGACCACAAGAGGCTACGATAAGCCGATTAAGAAATCAAA----AATTGTAAAGACTGAAACCAGAAAACTGAAAAACCA--GAATACAAAAACCCAAAAACCAATTTT
>phyl 9942199 9942590|9485 chr2R 9942101 9942468 scaffold_32 777265 777667 + 2531|106 418
CAAATACCTTAATTAATTAGCGGACAAAAAAAAACACACACACACAAAACAAACAACAAAAG----------ACCTAAGAATGTTAAGTTAACGGATGTGGAAAGCTATATTTAAAATATACATATT-----AGTCGTAGGCAAATCCCTGACTTACCCAAAAAAAAAAACAAAAAAGAGAATCCCCTCGAGCCAATGTAGTTGAATTTGTTTGT------------TTGCTCCAAAAGACAAAAGTATTTCAAAATAA--CATGCGAAATAAAAATAGCACAAAAGCAA--------------TCAGTATAT
GAAATA----AATATATAAACAAATAAAAGAAAGTTAAAACAAGTGAAACAAACATAAAAAGTAAAAACAAAAATAAAAAATGCTACCTCAGACGGACTTGAAAACAATAATTTAAATAAATGAATTTATATAACAATATGAACAT-------TTATGCTTATAAACAAACAAAAAAAAAAAACCTATAGAGCAGAAGTAAATGAAATTTTTAGTGAATTTACCTCATGATACCAACACAGAAAAGCCATGCACAAGAAACCAAAAAAAAAAAAAGGAGAAGGAAAGCACAACAATTTATATATTTAGCATTT
>phyl 9942199 9942590|9486 chr2R 9942469 9943652 scaffold_8870 7 1192 - 20761|0 151
AAACGATGGGTCCAATTGATGCCCCGCACACAAAATAG---------TCAAATTGCATGCACAATACGCAAATTATGAGCATTAGCAAATGTCTAAGTT---------------------AATAGTACCTCGATTACATTTTAATTGTTAGT
AGGCAAAAG-------------CCTAAAAACAAAAAAGGAGGAAAAATAAAACATAATAAAAGAAACAGAACTAATGAATATTAGTCAAATTATATGCCACCAAAAATTGCGAGCAATGAAATAGT--CTTAATTAAATATTAATTTTTATT
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ACATCCTATAGTGTGAAAGATGTA---AAGTTTTAGTTGATAGTTGTATTTGTAATTTATGTTACGAGTTTCCCAATTGTAAATC---------------------------------TAGTTTTATAGGCACAACAAAGTATTTTGTTAAGTAAA
GCCGCCTACTTTTGTAAAGTTATCACTAAGCTGTAGTCCTAGGTTTTATTTTTAG-TTAAGTTACG------CCAGCTGCATGTCAACTTAGTCCAACTGCCCCAGCCCCCCATACGATAATGTCGTAGTAGCAACAAACTATTTTGTTATGTAAA
>CG10112 10027405 10027554|9572 chr2R 10026493 10027460 scaffold_1 598883 599895 - 11824|1039 1094
TATTTCTTCTTCTCCCAAATAAAATATTGAAAAAACTTTAAACAAATGAAAATGAA
TACTTTTTTTTCTGGTTGTTAACAAATAAAAAGATTTTGGTTTATGTTTGAATAAT
>CG10112 10027405 10027554|9573 chr2R 10027461 10027947 scaffold_16 294053 294547 - 13684|0 94
-GCAAAATGAACTGAGGATTTCTAACATTTAGAAACGGACTGAATACTTTGTAGACCCCCAAAATAGAGTAAAACACAATCTGAAC-AAAAAGTG
AGCATGTCTAAAGGAGGGTTTCTAACATTTAGAAAAGAACTGAATACAGTGTA-------AAATAAAAGTCAGAACAGGTCTTAACTAAACTATG
>LamC 10085667 10086027|9644 chr2R 10085445 10088964 scaffold_16 363427 367001 - 107393|299 708
GCGGGAGCTTCAACTTCGAATCGGACTGGCTTGGCTTGGATCCTGAGGCCCAGCCAAACAAAACCCAACTCACCGCAGA-GACTCACAGACTCCGAGCTGCACATTCAA------ACCACACACAGATCTGTTCTGCATATCAAGCTTATTGTGAAACTATGTACAACA-------ATCAAAACTTGTT-----CAACTCTTAATGTTAAATGTTTAAGTGACCTTA-GTACA-------------TGTCTT---TGACTC--TATGCGTCTCCTATGTTTAAGTAAGTTTTTTCACGCTCTACACCCTACTCTCACTCTCTCTCTCTGTAATTTATGAC--GAGAACATGCATTTTGGTAAAAATACAAAAATAAACAAACAAATAAATGTTACAAGAAA---------
ACAGAACCCACA--------------CAACTCAACAAACACACAAATACACACACAAACA------CACACAGCATAGATGATTCACCCACTCATAGAGACTCACAAAAGGATGGAGGATAAAAAGAT-GGAGCAGCATCTGGAGAGAACTGGAACAC---GTGCAACATTCACACATCAAAACTGATTTTTGATGCATATCAAACTTAAAACTGCAAGTTATTTAATGTACAACAACCACAATATTGTATTGGCTGGCTCTATATATGTTTAATATGCTTAAGAGAGATGTTCAAAA----------------------CGTTTTTTGTAATTTATAAATGGCAAACATGCA-TTTGGTAAAAATA-AACAACGCACACGTTAAAAAGTGTAAGAAAAAAAAAAAATAT
>RpI1 10110470 10110524|9670 chr2R 10108075 10110486 scaffold_16 413517 415861 - 78862|2456 2472
ACATTAAACGTGTAAAA
AAATTAAACATTTTGAA
>RpI1 10110470 10110524|9671 chr2R 10110487 10116014 scaffold_16 2561535 2567074 + 262646|0 37
TTTGTTTAAATATAAATTGAAATTTTTTAAATAAACAT
TTACCACAATTATG-----------TTTAAATAAATAC
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GTCGAACTTCATCGCGCTATTAAAGCGCC---------TGGGGAGGAGGCTACTTCATTAACTCGTGCTCCTAAGTTCGCCCAACTGGATTGTGTCAAACGGGCTGTAAAGGAGCATACGACTGAAATATTGTTTTGGTGAATCCTATCCCATCTAATGCAT-TTGGTTGGCGAACAGTTCGCAACTAGATTAATTAATTATTCACCCAAAACACCCTTTAATCATAATAATTCGGT-------TACTATTATTAATGCTGTATAAAAACATAAATTGTAAATATCAAATCAATTACCAA-----------------CATTACATACAGAGGTCC---------------------GCATGGATTGTGATATGTATTTTAAAGGAACTGCAGCAAACTGATAATGATAACATTAAACTAATTTTAATTATAAATGCAATTGTGCAGCAGGTACAAAATAAAGATTAATTTGTACAGAAGCGACGATTAACTTGT
TTCGGGTTCAATCGCGTTACTAGTGTGCCACAATTATGTGTGGGAGTGCCAACCGCACAA---------------------CAAATG--------CAAAGGCTCAGCACGAGGATATA-GACTGAATTGTTTTGTTATAAAATCCCTGCCCATATCCCATATACTGTTCGGCAGCGCCTGTATAATCATCATTATATAGTTTTCATC----ACGCC---TAACCATAATTACTTGATAGTTTGACAATATCGTTTATGTTGCATCCTCGTACGTTTTGTAAAATGTAAAGTAACCACAAAAAGAGAGCATCCGTGTATATTACGCGTCTCATTCTCTTTCTCCTTCAACACGCGTAACACACTTTGTGATATGTATTTTAAAAGCGACAGCGTAAATTGATAA------CAATAAACTAACTAAACT----AATCCAGTTGTAC----GTTCTAGTATAAAAACAAGTAACATCTTAAATGTTGCTTAACGTGT
>tra2 10117367 10117756|9673 chr2R 10117362 10118454 scaffold_16 422907 424059 - 21859|5 455
TAACTTCTGACATACAGACACAGCGTTCCCGGGGCTTTTGTTTCATTTACTTTGAGAAACTCAGCGATGCCCGCGCGGCTAAGGACAGCTGCTCCGGAATAGAAGTGGATGGTCGCCGTATTCGCGTCGATTTCTCTATAACCCAACGGGCTCATACCCCAACTCCGGGTGTGTATTTGGGTCGTCAGCCGCG----------------TGGAAAAGCTCCACGCTCATTTTCA---------------------CCGCGTAGAGGACGCCGTGTGTATCACGATCGC-----------------TCCGCTTCGCC----CTATGACAACTATCGTGATCGCTATGATTACCGCAACGATCGCTACGACCGTAATCTCCGCAGGAGCCCTAGTCGCAACCGT---TACACTCGCAACAGGAGCTACAGCCGTTCACGCTCTCCGCAACTAC
TAATTCTTG-----CAGACCCATCGCTCTCGGGGCTTTTGCTTCATATACTTTGAGAATCTCGGTGATGCACGGGTAGCTAAGGATGCCTGCACTGGAATGGAGGTGGATGGTCGCCGTATACGTGTCGATTACTCCATAACGCAACGCGCGCACACGCCCACACCTGGTGTGTACATGGGACGTCCATCACGGTTTGTTGTAGATTGCTTGAGAA--TGAATGTTTGTTCTTAAGTTGAATATGTTACAGCCCTTTGGGTAGACGCTCTCGTGAGCGTGACTATAGCACTCGAGACACCTCTCGTTCGCGTCGCCGCCACCGTGACGA--ATCGTCGTCAGTATCA----CCCTACGATTCCAATCGTCGCAAATATCGCAGCCGTCATCGCTACGACCGTAGCCGCAGTCGCACTCGCAGCTATTCCCGTTCGCGCTCACCACGCAAGC
>CG12863 10134658 10134695|9684 chr2R 10131903 10136366 scaffold_11 3008202 3012754 + 70466|3097 3134
GATACATACAAATATATATGTACAAAGATAAATACAAA
-ATAAATGCA---------GTCAAAAGTTAAGAA----
>CG12862 10155240 10155312|9713 chr2R 10155077 10155450 scaffold_1 5287108 5287521 + 1604|194 266
ACCAGATAGCGGTAGACATGGACGACGGAGCGAGGTGGTACCGGGAGATTTATGAGATCTTTGACGTGACATC
CCTACACCATGTTGATCTTCAACGATGGCTCCGAGCTATTTGGACAGCTATACGATATATTTAAGGT---AGA
>Adgf-E 10171661 10171741|9738 chr2R 10170915 10173403 scaffold_1 1774216 1776746 - 48925|900 983
AGCACATACTAGATAGCTGACTAATAAATTGCATGTGTACTATACATT-GTTAGTAT--ATGTTTCTATAAATATTTAAACAAC
GATACTTGCCCAACAGATGCTTAAAA---------TCCAGAATAAATCAGTTCGCATTCGTGATTGCTTAAGTGAGTTCAGAAG
>CG12860 10180484 10180603|9750 chr2R 10180505 10180741 scaffold_16 1839953 1840191 + 154|0 100
AGGAGGCACACT--TTGGATTTGTGGACCCATTCATGGTGCTTCAACAATAGGCAGATAAAAATTAACAGTGTAATAAAAGATACGAAATTTTTGGTTAAA
AGGCTACACATTGATTGGGTGTTTAG-------CTAGTAGCACCAACAGTATAATTATTGGCATTAATAGAAT--CAATTGATCGTAGACTCTTATTTGAA
>mspo 10186798 10187229|9757 chr2R 10186747 10187266 scaffold_1 1794376 1795029 - 4933|51 645
ACGATCCACTTGGCGGAGGCACAGGC--GATATAAATATAATTTTAATTTAAGGCGTAAGAATTGCTTTTTCTGTGT-------GAACAAGAAAGACCAGCCAGGCCGTTAGG---------AGTGTGGTTCATCCCGCAA-----------------GGAGATTTTAATTTAACTTTACATTATCA------------AATGACATTGTTTTT-------------AACGCAGACGGCA---------GAGACTTCAATTA---AAAATGGATTAAATTAGAGGCGACGATGGGGAAGACTACTGACAATATT-------------------------------------------------------------------------------------AAAAAACACAAGAAAGATTTAGACACAGGACACAGAGGATTGGA----GTCATTCGTCCTGCGGAT--GTCGATTCAAACATTCTTATGTTTATGTGTTCACATTGATTTATATTTTTTTTTTCGTTGCTTTAGCTCTAAATAATATGTAAAAAAATCATCATAAAATATAAAAAATGAAGAAAAAAAAAACAAAA
ACGCGCTA--TGCTGCAGCAACCGGCCATATATAAATATAATTTTAATTTAAGGCGTAAGAATTGCTTTTTGTGGACAACAGTAGAGCGAGAAATACGAGAAATCCCGCAGCGCAGAGACCAGAGACGGCACAGACAACAAACCCAAACCAACTGCTGAGCGATTTTAATTTAAATTTAGATTACGATACGAAATTCACAAAGAAATTGATTTTAAAATTGCACGCAAATGCAGACAGTAACATTTTTCGAGATATATATAAAAGAAAATCATGAAAATTGCA---TATGAAACCGAAGACTACTGACAATATTTAAAACAAAAAGGATTTAAAAAACAAATAAGGAAACACACACATTTGGCTAAAACAAAAAAAAAATAACAAAAAAAAACAAAAAGAAAAAACACAAACAAAAACCAACAAAAAAACCCAAAAAAAAAAAAAGTGTCATAAGTTCTTTAATTGAGTTGCTTAAGCTAATTTTAT-------TGTATAAATCAAGCAAAACTTTCAACATATGTGTCATAT---------ATATATATAAAAATC--CAAAAAAAAAAAAAAACGTAAAACCAAAAAAAA---
>CG30480 10190034 10190188|9761 chr2R 10189338 10190122 scaffold_1 1797876 1798699 - 9894|771 866
CTTATCAATAACTGGGTCTTTTTATTATCAGCCTGGGAATGT-AAGCTCCACCTATCGCA----TATCTAATCA--GGTAAAACAGAAGACCCTCC
CTTATCGATGACAAAGC---TGCCTTATCTGCATGTGAGCATTAAGCTTCCTCCTACGCACCCTTATCTAATCGTTGGCCAAACAAAATCACCGTC
>CG12858 10255229 10256042|9853 chr2R 10254160 10256014 scaffold_11 3759100 3760946 + 12184|1275 2125
ATTCAGCCCATCTTCATACTCACAGTACTAAAACGAACAAAGTATAACCGCAAACATATCTTGGACATTGGCCTGCAATATGAATTGCATAACTGCATTGCTTTATTTTGATTTGTTGGGCAGTCAACATACGATCTACACCATA------------GCATAGCATATACATATACACATATATATTTTATATAGGACATGC---CACATA-------------GCCAGCATAAAG------------ATTCCATATGAGTTGGATTGATTCAA---------GTCGATGGAGTGAGGGG-GGAAATCGAAACGAATTTTCACATAGC------AGCTTAGCAATATATACATAGGGCAATATATGTGTGTGTACGTATAGTTATATATATATATATTGTG---CCGATCTATAATATTTATAGGCCTTTT-TATATTAGTTGCATGGCGCCGGGCAATGATCATCCCGGATCATCCCGGATTTAGTTTTCAGTTATGAGCATGCAGAGCTTGTTGCCTACTTTTGGGCGATCACCAAAGCAAATTACTCATACGCATGGGTTACCCGTTCGCTCCGAAATACACATAAAGTACCTATACAATCACGGAACAAATACTAAACAGGAGATTGAAGCTATTCGACACCAGGATATGTGAATACGAGGCGTTTCAAGGCTACAGGACATCGGGAAGCAGTGGGAGCTGCTTC-----GTTTAGCCGCAGTTGATTATGACTTTGATGTTCACTATACTATTTCATAGTATTAATTTAGATTATCCGTTGTCTTATGGCTTTGAAACGCACCGTGTGGATTACCCAATAAGTTAGGACAGTTTCATGTAAAGTGC
ATGCAACCCATTGTCATA------------GAATGAACAATATATAACCGAAAACATATCTTGGACATTGGCCTGCAATATTAATTGC-CAAATACATTGCTTTATTATGGGTTTTGGTGCTTTTA-CATAACAAATATGCCATATAAACGAATAACACAAAACCAAAAGATGTATAAAAATATATTTTATATTGGAGGTTCATATACATAAAGCAATACATTTGCTTTCATAGCGCTAATTAAACTAATCACAAGCGAATACTATTTATTTATTAACTGTTTACCGTTGCCATTAGTTACAGCTATTTGCATAAGTGTTTATATAGCTTATTTAGATCAAAGTTAGATAAATAACAATATTTTGTTCATTTTATTGAAAGCAATTCAAACATAAATTGTTGGCCTCATCTAAAATATACATAAGCATTTCATATATAATTTGCATCGCA----------ATCATATCACATGAAAGCGGAGTTATTTAAAGGATCACAGCACATAG--------------TCCTAGGGGA--ACCAATGGAAATGAATGGCACACATT-------------CCATGAAAAACACAGGAAAAACATA-------ACTAAATGGAAATTACACATAAAGT---ACCTATAATAGAAAAGAAAA---GAGTAGAACGCAAGTGTAGACAAAAAGATTTACCAAATCAATGAAATGTCAATCTAAAAATATTATGGAAGATGATTCAAA--TTAATGTTAATT---TAATTTGATAATA--GATTTGGTTTA-----------ATAGCTTTAA---------TATAATTTATATTATTATTT-------TTTAATATTTATTGA
>CG12858 10255229 10256042|9854 chr2R 10256015 10257543 scaffold_11 3761516 3763041 + 95470|0 27
ACGGGAACGTTGGCTTCCCGGAGTCGGC
ACCCATG---TGACTTCCCCCAGTTAAC
>Rpn6 10265014 10265348|9865 chr2R 10263976 10267209 scaffold_11 3769189 3772483 + 108839|1192 1593
GCG----------------GTGTGCAGGAGACAT-TATTCAAC-TCAAACATGATATCAGCATACTTAGCAGACTTTTCATAGTTTCCT-TTTGTATT--------------------TTCCAACAACTCCCAAGCATTGTTCAAGCCAAACATGTTTTATGTTTCTGCAAAA---------GCAAAATGA------ATTGGTGAAGATAGCAACAGGAGCAGCAACAACCACAAAAAAATGTAAAACAAAATCCATTAAACTAACATAAGCAAAATTATTAATCATTGAGTGGGATCGAATTGTTTACGCAAGTGCGGTATAATAAGCAAAA-TATTCAAATAACTACAAAATAAAATGA--TAAAAGAAAACCG---TAAACTGAT-------ACGAAAA
GTACTCACAGTGAACACGCATGTCCCGCACACATCTACGCATCATCTGAACGAATATCTGCGAAATTAGAAGACAATTTTTGGTTTTTTCCTTGTACTCTGATAAATTCCCTCACTGATCCCCAAAAATCATAAACTTTGTTATAACCACAT-CATTGTATGTTTCGGTACAACTTACAGCTGAAAAATAAACACTTATTGGTGGGAATAGCAGTA---------------ATAATAATGTGTAAACCATAATA----AAATATTTCTAAGCGTAATT-----------------ATCCAATAGAAAAAGAGTGCGCAATATGATAAGTAAAATTATTCAATTAACCA-ATAATAACACGAATTAAAACCTAACCAATCTCAATTATTCTCACCAACAAAGG
>CG10151 10268200 10268334|9866 chr2R 10267256 10270451 scaffold_11 3772531 3776006 + 74354|1062 1197
TTAAGAGGAACTAGTCGTTATAAGTGATTGATATTAGAAACAC-ACTTAAGTGATCTCAAAGAAATGATATTCTGGTCTTTACTTTAGTAGACTCTAAAACCAGTATCCTAATAATAAAAACCAAAGAAATCTCTC
TAAAGCTGAACGATTGGATATTAATCA--AGTACCAAAGATATTATTCGAATAAACT-------ATGCAATTCAAATGTTTATTGC------------------TATTCAAATAATTGCTGC-------ATTGCGC
>CG10153 10271924 10271942|9868 chr2R 10271197 10272660 scaffold_11 3777062 3778535 + 55146|778 796
ATGGCATAGCTTCATTACG
GTAATATATATACCTAAAT
>CG12857 10272915 10272984|9869 chr2R 10272788 10273022 scaffold_46 321269 321533 + -809|139 221
CTATTGA-------------GTTTGAATAGTAACGACTAGAATTCAAATTTGCGGGCTTCAGTTTGTGCTAGTATAACAACTT
CCGATGACGGATGATGCCCTGGTTGAAAGGATTCGCCATATACCCCCATATACGTGCTTCGTCCTTTGAATGGAT-CCAACAT
>CG10155 10276013 10276901|9871 chr2R 10274426 10276352 scaffold_11 3780565 3782556 + 20942|1906 2282
GTTCGATTTTAGTATCATTTCGGTATACTCCATTTGAATTGCCATAATTAATTGTATATACAAAAGAGCAGGAAGGATTATGTATCTAATTTT------------------------------------AATATACTTTTAAAATTGTAACTTATGTTTAGTGCTCTCGCTTAATTATAGTTTTGTAAAAA-CGGGCTATTTGTTTTTATTCGTAACTGAACACACATTTTTTTGAAAAATCAAAATATTATACAATGATTGTTTTAGTTTTAGTTGTTTAGGGTTTTTTGCTATTTTACACTTGCTTGTTTACAATTCGAAATTGGAGAACAGTATTAAAAGGCCAAGGCGAAGGCAAAGGCGAAACGAGAACTAA
GTTTAAGTTTTG-ATCATTTTGTAA--CTCCATTTGATTTGCCATAATTTTTTGTATATATATATGAAGATCAAATAACGCACACACATTTGTGCACACATACATGCATACGCACACACACACGCACCAATTTAACATTTATAATTGTAATTTACGTGTAGAGCTTTCACTTAATTATACTTTTGTAAAAACCGGGCTATTTGTTTATACATATATATATATATATATTAAATTTACGTATCATATGCTTAATGAATAGTAATTCT--TTTTAGTTCTTTAAG--TTTTTGCTACTTAAC----TTTTGTTTACAATTTGAAATTGGAGAACAGTATTAA---GCCAAGGC-AAGGC---------------ACGAA
>CG10155 10276013 10276901|9872 chr2R 10276353 10276529 scaffold_6 1987959 1988124 + 531|0 179
TATCTAAAAGTGGACAAGGAAATGTTTTTCTGATAAATGGCAAGAAA-ACAATGTTTTCACACTGTTGAGATGAAAAAATCGTGTCGATGCAAAAGCACAGCTTTTTCAAATCGGGTGAAAGAAGAATGCGTAAGAAGCAATTCAGCTTGA--AAATCAGTTTGCCAAAATGGGTCTGGG
TACCAAAAATAAAATAAATAAATATAGCTCT-ATAAATGGCAAAAAACACAATAGTTT-----TTTTGATATTGATTTGTTTTTGTGTGCCCCACATATAAATCACCCAAAT--------AGTAAAATCAACTAAAAACAATTGAAATAAATAAAAACAGCATACAATAATTTGTTTATT
>CG10155 10276013 10276901|9873 chr2R 10276622 10278172 scaffold_11 3782604 3784154 + 60705|0 291
CATTTGGAGGCCCGCTTGCAAGGACAGCACGATGATGACC------CCAGGCCCAGAAGCGAATTCCACTACCACCACTCCGAGCAGAGCATAATGAACAGCGCCAAGCGTCCGTGGGGCGCCAAGCAGAAGCAGTCGCAGCAATCACAGCAATCGCAGCGTCATTTTTACAACTGGGAGCTGTCGCACAGCTTGGGTGCTCCCCAGCATCAGACTCCGCCG------TATTTAATGCAATCAACTGGCAGGAAGGCACCGCAGAACGATTACGGACGCTTGCTGTTCTAGG
CATTTGGAGGCTAGATTGCAAGGACAGTACGACGACGACTACAGCACCAGGCCCAGAAACCAGCAGCATTTGCAGCCCGACGAGCAAAACTACAAGAGC---------CAGCTGCTGCGACTAAAACAGCGCCAGTCGCAGTCACTGTCGCAGCCACAGAGGCATTTCTATAACTGGGAGCTATCACACAGTCTCGGCGCGCCTCAGCACCATCCGCCACAGCCGTTATATCTGATGCAGCCGCGCAGCAGCAAGGCCGCCCAAAACGACTATGGACGGCTGATGTTCTAAA
>kn 10287510 10288781|9884 chr2R 10285316 10287523 scaffold_11 1586458 1588643 + 48538|2373 2386
CGTAATACACCATG
CATGCTAAATTATC
>kn 10287510 10288781|9885 chr2R 10287524 10289018 scaffold_11 1589598 1591351 + 19187|0 1587
TATTACTACTAAATGAGGCTATTGG--CAGGCCCCAAATCCAATCCAATACACCCCCTCCATCCCACAGGAGTCGCAGATACCACGCCAATCACAAGAAGCTCGAAAGTGCAATAAACAAAAGAAAATGGTTCCAAAATTCAAAAATCTAT--TAATATAGTTGTACATTTTTTGATTGAATGC----------------CGTTTTTAATTTAATTTGACTAATTTAATTAATTTGATTTGGTAAT--AGATTTATAGACATACGCATAGAATA--------CCATATCAAAGTAATGGAAAACATATGATGAA---GGGAAGGCATATCATGCAAGAAC------------------CCAAAAGTTAAG-------------AACGGGCAGAACTAATTC-----------------------TAAAAT------------AGC---TTACATAGCATACATTT------------------TGTAAATATTTATCCCAAAGTAAATAAA--------------------------------------AAATCGTAATT------AATAATCGGAACTGTGAATAGAGGAAATTATACA-----AAATATATACCCATGATGA--ACAATTCTAATACGAATCAAGATATACCAAAACAGATACAATTTGAAAGAACTTTTGGACATAATTAACTAAATGCTTGTATACGATACTTTCTTGGATTAATATCGAAAA---------------AATAAATAAATAAATA----------------------ATGAA------------------------------------------AGGAAAGTCTTGGAAATACACT----------------CTGCCAGTCGAGA-GAACCGAAATCAAAATGTTATATACCTACA----------TAGATATACAAAAAGCCAGATTTGCAGCATATCTACGCGTAATATTACAACAAAT------TTATACCAAACTTTTGGCAAACATATCGTGCACTTAGTC-CTAATATCCACCCTAAGCGAACATATTTGTATAATGCCCATCATATCCACAATTCAAAATTCATTTTGAGCGAACCACTTACCTATATCAACAACCAAATCATCAAATTAGACATACATACATTTCGCTATTC-AAGTCAGTGTTTGATAAACTACCG---ATTTGTTGACTAGAATCTAAGCCTAGCATAC---TATATATATATATATATAGGC-----------------------TTAAGTTTATTGTTTATTGCTCGATTTGTAGGAGTTTTACTGTAATTTGTATTCGTATTGTATGATA-ATGTACGCTT----GCACTCCTAGATCTACAAAATATTGAAGAGA---AAAACGAAATGGCTGGCTACGCAAT--TGGGGAGCGGCCAATACAAG-CATATCTCTA----TAAGAAACGCATAAACAGCAGAACTTAGCCGCA-AAATCGATTTGTAAATTACAATACAATAATTTATAATAACAATCTAGCAACGCTCTCTGTTTTGTAAATCTTAACAAGTTATTTAAATAAAATTTATTTAAAATAAA
TATTATTATTAAGGGAAGCTGTTGGCCCAGGCTCCGAG-------------ACCCGCTCCA-----------------AAACGAAATAAACAGAAAGACGCTCGACAGTGCAATAAGC-GATGAAAATGTTTCC-AAATTCAACAATATATAAAAATACACTAATATATTTATTGTATAAATATGCAAAAATGAAAACAAGTTGTTTATTTTTGATTGATTACTTTTTATAAATGTCCTTGTAAATTACGAAAAAAAAAAAATCTCATAAAATGTTTTAAGTCCATATCAAA-TAACAGAATACATATGAATAAAACAGCAACTCATATCATACGTGGACTGCGGCCCGCTCTATAAACTAAGATCTAAGATAGTCCGGTGTCAATAAACGGAACCGACCCGTTCTTTACGGATAAATTCTTGTTAAAGTCCTGGCCGGTTCAGCTTGTTGCACACCTAAGATTTGCTTGATTAATCGATATATGTACATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATCAAATATTTATTGGATGTAGTTATCGGAACTGTGAATAGAACAAAATATACCCATTTACATACACACCTATGATAAATACGATGATGATCTGA---AAGTCATGCGAAAATAAA------GTTAAATCAATTTTGGATA----TATCTAAATGCTTGTATACGAAAAT--------TAAATACCAAAAACAAGATACACAAATTAATATATATATAAACATATATTATTTATTTGGAGATCGATGAATCAAATTATATTTCCAGCTCATATCTCTCATATCATTTTCCGAACAAATTTTGATAAACTCACTTAGAAACTGTGTCGAACTGGCAGAGTAGACGAACCATAATCAAAATGATATATACCTACAAATAACAATTTAAAAATGTAATAAACTATAAATAAATAAAATATGATTGGGCTGCT--AACGAATAGCTAATTATACC-------CGAAAAAAAAAAAATAAATTAACTCACAAATACTTATC-------AAAGTTTTGGCATATGGTGCACTTAATC----------GATCCCATCAGAACACACAGCTAG--TAGGTCTAGAGTCCCTACATAAGAATTAACACA-------TCCGCTACTCAAAATCGAAGATTAATCAACTACCGAACATTTGTTGACTAGAGATTAAGATTAATAAACAGATACATATAACAAAATATAGATGATATTGGGGGTGCATATACTTAGTAAGTTTATTGTTTATTACTCGATCTGTAGGGTTT---------ATTGTATTGATATTGTATTATATATGCGTATTTCTAGAGACACGTAAATCTATTGACAGCTAAATAGAAGCAAAATAAAATA------TAAATAATAATAATGCATTATTGATACAAATCATATTTCTAGTTGTAAGCATTGCGTAAGCCACACAAATTAGCTCCAGAAATCGATTTGTAAATTATACT--------------------TCTAGTAATGCTCTCTGTTTTGTAAATCTCAACAAGTTATTTAAATAAAATTTATTTAAAACATA
>CG10202 10332723 10332819|9934 chr2R 10332604 10336117 scaffold_11 1642408 1645975 + 66518|132 253
TCTTGGTTT--------TCAATTCAA-AACGTTCGATAACATTCATTTTTATGAGCTGTAACTAATGGCAA----------------GTTTTTAAAAGCATGTTAATAAAATCATAAGAGAC
TTTTTATTTGGCCTTACGCAATTTAATAAAGTTTCCCTATTTTCTTAATTGATCG-TGAAGTTAGTTACAACAGCGTTGTTTTTTTTGTTTTTAACAAATTATGCACTGTTCCAAATGAAA-
>NaPi-T 10357574 10358230|9958 chr2R 10358024 10359831 scaffold_11 1673811 1675712 + 60524|0 227
CATGTGTGGTCGCACTCTGTTTAATTGTCATAATATCGTGTAGATTATGGC---------------AACGAACAACGTCTGATAAGGCTTATCG----TCATTTTGTGTAAATAACTACCCGTGAATCCACTGA-GTTTAGCATCTTTAACCTCTATATTTAAGTGAGTTGCTAACTATAC-CATAGGATTAGTTCCCTGTTCTCCCCCAAGATTACCTTCTTATACA
CCTGCGTG-------TCACTTTTATTGGCATAAGTCCATTTTAGTTATAGCCCCCATTGTGTGACAAACGGCCAAAGGCAAAGCAAAGTTATCAGAACTCATTTC-------TATTTGCACACATATCTTCTGACGGTTAGTG----------CTAAATTTAAATCAAATATAAATAACATGCATACAGTCTGCTGTCTGCAGCACTCCATAAATTTATTCGCAAACA
>CG10209 10360920 10361280|9960 chr2R 10360891 10362846 scaffold_11 1678029 1679957 + 81866|29 440
GTCCTGAGCCGTCTGTGGGAAGCCACTTGTGGAGCACCACGCCCTGCGACGGTGTCCCCCACGACGGCAGACGCGCACAGCTGTTAGCC--------------------------------------CTCGATTTAGACGGCAATTCGTAGGTCTCATTCTTATGCTAGCCTATACCTAAGTACACATTGCTCACTACACTACTACAGTCAAAAATGGTGCAGTCAATGAGGAAGA----TACTCCTGATGTATGCCATTTTGTAGTAAGTGG--ATGCCGTGATCCTCATGTAAATGTTCCCGTGGCAATAACAGCGTAGCTCAA---CTGTGACTCAAGTTCTCAATAGATCGCGACGCATACATTTTTTCGGTGTAAATACAAATATAATTGAATCTTA----AAAACT
ATGTTGAGCCGTCTGTGGGAAGCCACTTGTGGAG---CGCGCCCTTCGACGGTGTCCCCCACGACGGCAGACGCGCACAACTGTTAGCAACAACAAGCAACTAGCAACTGTTAGCCAACCGGCCCAGCTCGAC---GACAGGGTCTGGTCGGGGTCTCTCTTACGCCCGCC---ACATAAATGC-------------CGGAACTGTGTGCAAAATTGTTTCAAACACTAGGTTTTACTCGTACTTCTAATCCTTACGCTAGCTTACTATGTAGCCATGAAATGATCTTCATGTAAATG--CCATTGG-------------GCTCGATCCCAATGGCTTA--TCATCAATA-ATTGTG-TATATACA-----TAAGAATATATACATACATATTAGAATTACATATTGAAATT
>SMC2 10363452 10363534|9962 chr2R 10363319 10365395 scaffold_11 1681232 1683357 + 79158|158 258
AATGGAACTCGTTTACTTTCTT------ATCACTTA-ATAAAACTTTAAAAATACCATATA---------AAACTGTTCTTATCAT--TTTAATTGTGAAT
CACATAGTTATTAGGCTTTTCGAATAAAATCATTTACACAAATCTTTAAGACTTCAAACTATTTTATTGTAAACCGTTTTTCGCACAAAATAGCATTTCAT
>CG12797 10368724 10368814|9964 chr2R 10367811 10370274 scaffold_1 604411 606842 - 96072|931 1021
CATAAGGATTATTGTTTGATATATTTAAGTGGGTAATTCTGGAACTTAATTTTTGTACAGTGTCTGCGTAATAAAAAATTAAAGTATTCAA
T------------------CATATC------------------------TTTCTGTCCCGGTTTTGTG---TATATAATTTAAGTATT---
>CG33506 10372312 10372375|9965 chr2R 10370275 10372315 scaffold_1 606991 609088 - 88226|2133 2136
CTTT
TTTT
>CG33506 10372312 10372375|9966 chr2R 10372316 10373482 scaffold_1 609513 610659 - 46033|0 59
ACACACATTTATTGTTACATTTTTATTGCCGGTTGAAGAAAATATATATGTTTCCAATAA
ACACAATAAACATGTAAATAGTTAATAAACGTTTGTTGAAAAAATCTATTGTTATAAGAA
>CG33505 10373704 10373823|9967 chr2R 10373620 10373728 scaffold_7 941259 941364 - 1050|84 108
GGTTCTTACTTTCAAACATATAAAA
AATTC---ATTTGAGACGCAGAATC
>CG33505 10373704 10373823|9968 chr2R 10373729 10375745 scaffold_1 610761 612739 - 78762|0 96
GTTAACTTCTAAGC--TTAAGTAAAGTTGTATAGTTTTTGTAACAAGAAACGGCCTGAAAATATATACATAAAGATCATTTGTATCTTCTACCTGAA
GTTAAATG-TAAGCTTTTAAATAAACTTGTTTAT--------AGAAGAAACGCATCGAGTA-ACGTGAATAAAAATAAATGTTAAATCATTTTTGAA
>Cyp6a9 10394218 10394621|9983 chr2R 10394365 10394577 scaffold_16 2174616 2174814 + -513|0 223
CCAGAAA------CAATGTTGCTCTATATCTATAAGAATGTTAAGCTTATTAGTGTCTAATCGCAGTAGCATGCTTGTGGATAACTAACTACTGTAAGTTGGCTTTCATTTTATGGTTTTAAAAAATTGT-TTTTTTATTTTCTGGGTGATATATTGCCTTTTAAAGGCTTCTTATTATTGCAT---AATTATTA-CAAGACTCTTTTGCAGAAAAAATACTTT
TATGCAAATGACCCGATATGAGTTTAGAATTATTAATATGTT--GCTCAGGAAT-TTTAAT-AAAATACACTGCTTGATTTTAACTTGAAACTGCGG---GGCTT----------ATTTACATAAATCATACTTATTTTTGTCTTGCCAATATA--------TAAATATTTTTTACGACTACATCGCAGCTACTATCCAGCTTCTATTACTTCAATATTATTGT
>Cyp6a9 10394218 10394621|9984 chr2R 10394578 10396198 scaffold_16 2172350 2173999 + 69501|0 48
AAATTTCAATATTTAATC--TATTAGTCC---CTATTTTATATGGAATT
ACATTTTAATATGGACTCAATATTAATACTAGTTGTTTTGTTTTGTGTT
>Cyp6a21 10400125 10400160|9992 chr2R 10400076 10401731 scaffold_16 2174777 2176445 + 67559|54 89
TGCCTTTTTAATAAATTGTTTATAACACATATCGAA
GAACTCACATGGCAACATATCATAGTTCTTATCAAC
>Cyp6a8 10402031 10402263|9994 chr2R 10401882 10402250 scaffold_16 815997 816372 - -1278|161 397
AACTCTCAACTAAAAGCCAAAGCTTCTAACAAAATA-ACTGATAAATAGATGGTAATTTATTCAACCTAAATCTTATAGAATCATATTG--GGGTAGGTCCTCATGGCCATTGATCTA----TCTTTTGTTTATTGCC-------AGATAATTTAAGTGCTTTTATTTTATTCCAGTTTGTAAAAGGTGTAGGGTAGAATGTTTGAATTCA---ATAAAAATCTTATTATAAACAAA
CAATCACATTTA----TCAAA----TTGACATTATGTAGTCTTATATGAATAATGATTTAGTCGATAATAATA----AGAAATATATTAATAAATAATTTATCGTACTTACATATCTACAATTATATTGACCACTGCCCGATTTAAGACTATTTTTGTAACTAGGGTTCATTACATTTTGTTCGACATAAAATTAATAAAACTTTAATTAATTGATTAAGAACTTATTATTAGC---
>Cyp6a8 10402031 10402263|9995 chr2R 10402251 10402425 scaffold_16 822894 823068 - 1823|0 12
TAAACAGACTGAA
GAAATCAACTAGA
>CG10249 10416338 10416835|10000 chr2R 10413563 10416452 scaffold_16 2178893 2181768 + 67208|2901 3020
CGAA-CAGTG-AATCAAATCAAAAGGTTCATCTTTAGGATAACCGGGTGTATTTAATAGGA---ATAAAACCAAGCTAATTTAAAAGCAAATGTTTTCTCAAATAAATAAATTCTTAAAT
CGAATCAATGTAAACGTATATATATATTCAAACTTAAGGCGGCACATTGTATTTAATATTACACATATATGTATTC-ATTTTACTATTAACTATTTT---------AGAGCATTTTAAAT
>CG10249 10416338 10416835|10001 chr2R 10416453 10417019 scaffold_16 2181926 2182673 + 11517|0 534
AGCCATTTCGTATTAGCGGCCAAATCGACGAACAAACAGCTAGTGACTAAGATTTAAATTAGCATTTCGTAGAGCTGCTCAGA-----------ATACATTCCATACC------GCCATACTGCGGAAAGGCACAAGGGC---------------AGCTTACACTTTTCATAT---GTATATTGTATAACTAGAATT----CGTTTGTCGTACGTTTTATTTATTTGTAAATCTAATTTAATCGCTAATTGTAG-------------TAGCAGCTAACTCTGTGTAATCATTCTGA-----------------------------------------------GACACATCGATCAACTAAT-----------------------------------GCAATTAAGTAC----------------TACTGCACAGGCCTGAGCTACCGATCTTAAAGTAGCCGACAAACCAACCAACCATATCAAGCAACCGACAATGCAAAAAACGAT-ATATATTGTAC-TAACCAGAAATAA
AGCCATTCTGTATTAGCGGCCAAAATGTCGAACAAACA-TTAGTGG-TAAGATTTGAATTAGCATTTCGTAGCGCTGTCTAGGGAAAACAGCTTAAGCATTCCATATCAGTCCAGCTAAACTATAAAAAAACAAACAAACAATTGTTAATATTTTAGCTAATAGTTAACACAGAAAACAGAAGGCACAAGCAGTTTTTAAATATTATTTTTAAATTGTATTTAATTGAATCTCT-ATTTAATTATAAAGTCTAAACAGCTCACAACTTAACAATTAAC-CTGTGCAAAAATTATAAGTAATGCTTAGTTTCGTAATTATGCTACTAAAATCCAATGGAAAACTGACAAAACTTACATTTAATTAATAGTAACATACATATTTCTTTTAAGCCCGTAAGAAATTATTTACATTATCACTAAACAAATACTGCACTAGCCTGTGCTACA------CGAGTAGCAGCCATAT--AGCAACCATATC-AGCAAACGACAATGCAAAAAACGACAACAAATTAAAAGTAAACAAACATAA
>CG10253 10444944 10445100|10032 chr2R 10444952 10445716 scaffold_16 2218687 2219498 + 24752|0 171
AG------GGTAGCCAACTAGATAGTGCGCTTAGTTCG-TTTACTAGTCTTAGT--------CACTTTACTGATTTTCCTAGTCGCTCTTGGGGGTTCGGGTCTCCAGTTCTTTTGTAGCGGGCTCATGTTTTCTATGG--------GTTTTGATAAATAAATGGAGTATTT
AGCCACTTACTATATATCTATATAATATATATCTATAGAAATACTAGTCTAAATCTAAAATACCTTTAACTGATTT--CTAGCTGCTTT--GAACCTTGG-----CAATTTTAGTG----GGGCTCAT-TTTTGTATGGGTGTTACAGTTTTGATAAATAAATGGAATATTT
>aPKC 10459318 10460090|10046 chr2R 10459313 10462018 scaffold_16 2240678 2244045 + 52680|5 1159
CAAGCAAACACA------ATCCGTCTACTGGCAA---TATAACTTTGTTAAGTATTAAAAAAAAACTT----TTGTTTTTAATGCATTCCACTGTACTTACAACAACAACAAAAACATAT-----------------------ATATATTTATTATTTTTGTT------------------------------------------------------------TATTTGTGATGG----CATATATAGTGCCAGCATCTTTTTGTAATCC-------------------ACATATGAATATTACGAAAAAATTAT---------------------TAAAATTAGTATATATCAAAAAT----------------------------------------------ATCATTGTGTTGC--------GAAGGTAAA--TAAAATATTGTGTTTTTA--------------ATTGAAGCTAA-----------AGATAAATTTCAGCAAAAA----------TGTTACTTGTTAATGTATGAAAAGCAAATAAAAGAGAACAAATTAAGCGCATATTGTTAAATTTCCAAATACAACGCAATCTAAGAAAGTAATATTGATCA---------------AAGTTTTTGATTAAAG---AACATAGCAAGCAATCAATTTAAATGCAAA-------ACAAACAGGACAAACTGAAAAACAAT-------TTCAAATTGCACTT-------------------AAACGT--------TACCGATTTTATTAGTA-------------ACAACCAATATTCTTTAGCCTATC------------CCAATTAT-------------------------TATGTTGTTGTGTTTGATAACCAAGTTCTATGAGTAAGTTTAATTAGTATATAATGATTTTACTGAGCGTATAACATCAATTTGTAT-------CTTCTTCAACTGATGTTTCCGACTAAT----------------------------TTTTTAAACTGGATGCACTTTTGGCATATACTACCAGATGCTAGCA-------AAATGAAATTGAAAACGTAAACGATAGTTGCGTTACAATTATGCATATAAAGAAAAACGAATAAAGTATTGTATAAGACAAA
AAAGAAAAGAAAAGAAACATCCGTCTACTGGCAATTTTTTTGTTTTGTTAAGTATTAGAAACACATTCCACATTGTACTTACTATACGAAATTGTTGTTAAATTTTTGTAAATTACGTATAAGTATGAGATTTTCAGCAAGCAATAAATTTATTATTTTTATTACTGTCCCGTTTTATTGCTCGTTGTAAACGATCTGAATATTGAATCATTTTCGAAACACGAATTTGTTATGTGTTCCCTAGAAAATTGTTTCAATTTTTTGCATTGCGTGAGTTTTTAAAATAAAAGTATATTAATAAAACGTGTAAATTATGTTTTATAATCCATTAACGAGTAGACATATTATAAAACAAAAGTAATTCAACAAACAAAACAGAATTCAATTAGTATTAAAACAAAAAATATCATTGTGTTGCTTTAACTTTAATGAAAATTTACAAAATTGTCTTTTTAATTATCTACAAATTATTGAAATGAATCGTATATGATAAATAAAAGAAAACAAAAAAAAAATAAGTAGTTAATTGTTAATGTATTCAAAGTGACAACACGTAAAGCAATTTA----AAATTATTAAACG--CAAATACAA---ATTCTAAAAACAT-ATTTTGATTAAACGAAAATAATAACAAGCAATCAATTAAAGCCTAACATAGTACATCATTTACATACATACATACATACGTACATACCTACGTAACTGATGAACACTGAACAAATTTAGTATGCACCTTTTAATTGTAAAAAAAAAAAAACGTAGTGACAGCAATGAATTCATGAGAATGATTTTTAATGTAAGAGGAATTTTCCTAAAGTTTTCAAAACAACAAAATCAATTGTAGACGTCAAAACTTTTTTAGGCAAATATATATTTATACCACATATATTTTTTCTTCAAGTA--TTTAACTTAAATATATTTGTTTATTTGAACA------ATGTATTTGTATATTTTTATTTTTTCAAGTGCTGTTTCTAATCAATTTGTGTTTTTAATTTTTTGTATTTTTCATTTTTATACTAAATGCACTTCGAGTACTT-----TGAATGCTAGCAAAATGTCAAATGAAATTGAGAACGTGAACCAT--TTGCGTTACAATTATGCATATAA--ACAAACGAATAAACTATTGTGTAAGTAAAA
>aPKC 10461013 10461280|10046 chr2R 10459313 10462018 scaffold_16 2240678 2244045 + 52680|2212 2479
CTCTATGGCGAGGATTCCAGTGATTACGATTCCGTGGCTGACGATTTGAGTCTCCTGCATTTGAACAGCGCAGCGGGAGCTGGTGGATCAGTTAGCAGCAATAACAATCTCAGCCAGCAGCAACATTATCGCCAGCAGCAGCAGCAGCAATATCAACCCCATTCAGCATACTCACAACAGCAGCAGCAGCAGCAGCAACATCAGCAGCTGCAGCAACTTCAGCAGCATCAACATCAGCAGCAACAGCAGCAACAACTTCATCATAATG
CTTTATGGCGAGGATTCCAGTGATTACGATTCCGTGGCTGACGATTTGAGCCTCTTGCATTTGAACAGC---GCGGGA---GGTGCAGCCAATACCAATAATAATA---TAAGCCAGCAGCAACATTATCGCCAACAGCAAACGCTACAGGCACAGCAATATCATCCATACCCACAGCAACAACAACAACAGCAACAACTGCAACAG------------CAACAGCAGCAACTGCAACAGCATCAGCAGCAGCAACATCATCATAATG
>aPKC 10461340 10461378|10046 chr2R 10459313 10462018 scaffold_16 2240678 2244045 + 52680|2685 2723
CACCACGAAATGTGCGACTTACATCCGTATAACATGCGG
CACCACGAGACGTGTGATTTACATCCATATAATATGCGT
>CG7639 10502515 10502794|10096 chr2R 10502486 10503593 scaffold_16 2297775 2298900 + 41617|38 353
ATGCCCTTTTCCCCGCAACCATCAACTAGATGTAGCACCAGCAAA---AGCCATGAGAGTCACAACAGCCCAGTTAGAAACAAATCCTTATTCACAACATATGGCTGCC------------CTGTTCGTAGTTTCGAGCGTTTACAGATTCTGTTTCGTATT-TTTGTCAATGCATTTTATTTTCCTCTGAAAATGTATTCGTAGTCCAGCG-ATCATTTAAG--TAGTTCCTAAGGCGTGTACATACGTAAAACGAAAGGTTAAAC------AAAATAT-------AAAAAAAATTTTAAACGAATGAG----AG
--------------------ATCTAAGAGTTAAATTGCAAGTGTACTTAGCCATAGAAGCCTGAGAGTCCCCCACGAAAGCAAATA------TGCAATATGTAGCTGCCCAACAATAGTCACTGTTC--AATTTTACTCAATGAT--ATCTTGTTGTATTTTCTTTGTCAATGCAT----TTTTCATCCTAAAATTAATTTGTAAACTAGAACATTTATTAAGTATAGTTTATAAGGAGTGTATATAAA-AACATAAAAGGTTCAACCAATAAAAAATATATTTAAAAAAAAAATTGTTGAACGAAAAAATCGCAT
>CG10265 10507189 10507508|10099 chr2R 10504774 10509784 scaffold_16 2300698 2305901 + 77932|2679 3066
TTGTA--TTCGCCGTAGTGTAAGGATGGTGCCATTAAATGTGCCTCTGGAGGCGAGGATTTAGCAATATAACTTTATT---TAATTTAAATG----------GAGATTAATAAAT-----------------TCCCGGATAGCGTTTATAACTTTAATA---GCAAGCGAGTCTCTTTATTATCAAATCGCTTAATTTTAAATGTTTTATTTTGGTTTTTTTGCTCAAGCAGTGTG-------ACCTTTTGATGCGACAACGTTATCGATTTAATATATCGACTATACACTAGTGGT----------GGC--TATTTAGCTTATAAATGTAT---TGAACTATATT--AAATAATTAAAAC---------TATATATCACTCAAACAA
CAATAAATCTTAAAAATTGTATGCAGCTTCAAAATAAATTTGAAAACGCCCGCCCATTCCCAGTAGTAGAACTTAATTAATTAACTTAATTATTGAATGAACAAAAGCAATGAACAAGCTAAACATTAGTCGTCGCGATTATGTATTATTACTTTTACTTATGCATGTGCATGTTTTTTTTGCAGAATGGCAATGCTACTATATTTTTGTATTTGTTTTGTACTTCAAGCGCTTAGGGGAAAAACAAATTTAAACAGCTGTTATAAACAATTGAAATGCCGA--ACCCGATAGTAGCCCGACTCACGGGCCGTCTCTAGCTGCTGAATTTAGAGATGAGCGATATTTCGAGTCACTATACCGCGACATGTTATCAATGACTCATATTA
>CG8092 10721386 10721812|10293 chr2R 10721733 10722670 scaffold_16 2547712 2548668 + 44176|0 80
TACAAGCCCCACGGAAAGCTCAAATCACGCGACTATACCCTTCACTGGCAGAACTATTAGTTA-AAGTTCATTCATATTCA
TACAAAGCTATGGGAAAGCTAAAACCACGCGATTACACGCTGCCTTGGCAGAACTACTAGAAATAACTTCACCGATTTTCA
>CG8092 10726103 10726434|10297 chr2R 10724643 10730544 scaffold_16 2548682 2555036 + 202425|1565 2003
TACTATCGTACTTTTGTAGCAAGTTTTTATTTAGGCCGTGAATAG----AATAGTGCGTTATGATAAT-----------------------------------------CTGTTAAGTGCCTGCGTTTC-TCACTCCAAACTGA-----------AATGTT--------------TTCGTTT---TGTTTGATTAGTTTTGGTTAATCGAACCCAACAGCTGAGCTCAGGTCCACTTATTGTGT----TATGTGAATTGTGAATTTATATAATCTATATAGGTGAAATGT-----------ATCATTGATATATTCACATATGTACAATTTAAGCATTACTTCCTGACATTTCT----CGTGTCTAATTATTTT-AAAACAACCCCATTAG----------AGAAACCATAAATAAACTTGCAAGAAATTTA---ATAA
TAA---------ATCATCGCTAGTTAGTATGTAGGCCGTGCTTAGTCTTAATAGTCTAATTTAGTCATAGGGCGGCTGTAGCTGCGAAAAATGCCAAACCCGAATTATATTGTAATGCCTTTGCGTTTTGTCACTCCAAAGCGAATGTAATTTTCAATGTCCACTATGCCCTTCATTAATTTAAATGTTTCAAGATTTTCAATCTATTGACATCGAATGTTCATGAAAGCTTCTTTTATTTTTTTTACTATGTGCA-TGTAAAT-----TGAATTATATTCGTGATATTTTTAAATGAGTCAGCATTTAAAATCTGATTTACATATAATT------TTACTT-TTGGCATTCTTAAAATGTGTTAACTTGTTCTAAAAACAACAACAGATGAAATAAAACAAAAAACTAAAAATGAAACTGTATAAAAACTATGTAAAA
>mRpL41 10731886 10731926|10298 chr2R 10730569 10732499 scaffold_16 2555072 2557015 + 42419|1397 1459
ACATA----------------------GGTTTATTGTTTCTTAAATACAGAGTCTAAACTCGA
ACGTGCACACATACATATGCTTATAAGGGTTTATTATTTGTTAAATATGTTGGGTTGTTTC--
>Hex-C 10733698 10733762|10301 chr2R 10733321 10735388 scaffold_57 328984 331080 + 78790|403 467
GAACTCACTACTATTGTAGCAATAATAGAAGGACTCAGTGTAATAAAACAAATTTTAACTCACAA
GCAGCCAAAGTTAGCAAATCGGTCAACAAATATGTTATTGTA-------GAATTTAA---TAGCA
>Fs 10738419 10739004|10302 chr2R 10736211 10738982 scaffold_57 331779 334838 + 89986|2412 3124
CACATCGGCCTA------------------GGGCTT-TATGTAGCGTGTTCTTCCGTAGCTCCAACATCCAAAGATTCTCGTTGTGCGTTTT----CGTGTTGTAA-TCGGTGGATGGGCCTGCGGCTGTTGCCCAAGCCTAC----CGAGCTTA----CACTACATATTATCCGATACACTTA-ACATACAGGCA-------AAGTATTATCAACCTTAC-------------------------------AACATTACGT-------ATTGCAGCAAATCTTATCCAGCATGTATCGCAAGAGAAA-CCACATATCTTAAGAGGCTTTTGTATTTAACATT--------AACATTAGGCTACACGATAATTAATTTAAACG---ATCGGTTTGTATGCCCATTAGGCTCGCAATTA--GTTTAGAC-------CAACGTGTGCGAAGT----CGTATTTATTT---------AACATTACCTTCCCCTATTCTTTTT----------------GTTTATAAGCGAAGCTAAATTAATTAATTGACTGATAGCTTAACCTTATA--GCAAGATTTTTGAATTA---------ATATATACATAC--ATAGAATCTATGTGTATATACAT---ACATATATATT---TACATACACTTATAAATATGTT-TGAGTAATTGTTAATTAAATGTGTTTCCAA-CATCATTCAAAA
CACATTAGCATATATACTAACATATATATAGAGCGTATATATAGCGCATCTCTGTGTAGTTCCAACATCCAAAGATTCTCGTTGTGCGTTTTGTTTAGTGTTGTAAACCGATGCAAGGGCCTTAGGCTGCTGCC--AGCATTCAATACAAGCATAGAGTAACTCCATATACACACACACACACACACACATATGCACTTGGCTAAGTATTAGCGCATTTATCAACACAATCGACAACCAGAACAACAAAAAAAACAACACGTTTAATATATTAAAACAATTCTTATGCAACATCCATGGTAAGAGAAAACCACATATCTTAAGAGGCTTTTGTATTAAACATATAAACATAACCATAAAACTAATTCATAATTAATTTATATACAAATTGGTTGGCACACGCATTTCGTTTACGTTTATAGTTTAGCTTTTACCACAATCTAAACAAAATGTATTTTATTTATTTTAGTTTTTAAACATATTTTTTCCACGTTTTTTTTTTTTTGTAACTATTGTGTGTTTGAGCGAAGCTAAATTAATTAATTGACTGATAGCTTAACCTTATATAGCAAGATTTTCGAATTACAGAATATGATATGCACACCCTTGTATACTTTATATATAGATATATCTTATATATATATTGTATACCTATGAGTACACATATTTTATGAGTAATTGTTAATTAAATGTGTTTCAAAACTTAAATCAAAC
>Fs 10738419 10739004|10303 chr2R 10739004 10739466 scaffold_57 334872 335386 + 13231|0 0
G
A
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GTCACAACCCGGCGCCGCTTTAATCGTTCGCTTACCGAGGTCCGGCCTGATGCCTACATCTTCGACGAGGGCACGCACTTTGAGGTGGTACCTCTGCCGGAGGAACCGGACGAAGTGGTCAAGTCCCGTGAGGCCCTCAACGAGCAGGTGGTCCGCAAGGCGTCGATGCAGTCGGAGGCAGACTCGGACATCTACATTCCCGTGTCGCAGCGTCCATCGACTTGTGAGACGGTGAAGCGGACTCCGTACGTGACGGTGCGCCAGGATACGGGTGCCAGCACGGAG
GTGAACAATCGACGTCGCTTCAATCGTTCGCTGACCGAGGTGCGACCAGATGCGTACATCTTGGATGAGGGCACACACTTTGAGGTGGTGCCGCTGCCCGAGGAGCCCGACGAGGTGGTCAAGTCGCGTGAGGCGCTCAACGAGCAGGTGGTACGCAAGGCCTCGATGCAATCGGAACCCGACTCCGATATTTATTTGCCATTGTCGCAGCGCCCGTCCACCTGTGAGACGGTCAAGCGTACACCGTATGTGACGGTGCGCCAGGATACGGGCGCCAGCACCGAG
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GAACCGA
GAATGAA
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AACATCGAGTTCCGATTGCGAAAGATGGAGGAATCCTCGGAGCAGATACTCTCACATTTGGCCGTCATACATCGTTTCATGTCGACACACACGGCTGGTGCGGATGATTTGCGCGGTTCGACGATAAACATTCCGGGAGAGATGCAGCGCATGCGCACCATCTCGATTTCGGACACCGAG------------------------GGCGGCAGCGGACCAGGCGGAAATGGAGGAGGCGGTGGTGGTGGTGGAGCCATCGTTCCA---CTTGGTCTGGGTGCTGGTCTGAATTTGAATTCGCTCCAGGTGCGTTTGAATT
AACATTGAATTCCGTTTGCGCAAAATGGAGGAATCATCGGAGCAAATACTGTCGCACCTGGGCGTCATACATCGCTTCATGTCCGCACATACTGCTGGCAACGAGGAGCTGCGTGGCTCCGTGATGAACATTCCGGGTGAAATGCATCGCATGCGCACCATCTCCATGTCCGACAATGAGGGGGGCAGTGGCAGCGGAGGAGGCGGCGGCGGAGGTCCAGGCGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGCGGAGGCGGAATCGTTACATCGTTGGGTCTGGGACCCACGCTTACTTTAAATTCGCTGCAGGTGCGTTGCGGTT
>CG30078 10782093 10782639|10361 chr2R 10781902 10782915 scaffold_43 4964 5890 - 28275|213 778
GCC----GAGCAGCAATAATGTACAAATATCTAACTTTTCTCCCTGCGTGCCTGCCCCAACTGTCGACTGTGTGTGCTTCTGTAACTAACTGCATTACGTATACGCCACC----TGCTC---------TTTTGTATTGAAATCAACCTTGCCACTTGGCGACAACAATAACAACACCTCCTAATTGGGTTATGGGGAAACGATTTGCCTCACTTTTGATTCCATTGTGCATTTCTATTGCCCCGGGCGCTGTTGTTATTGTTCATTCTCGGTTTTCGCTTGTATCCT-CTAACTCGCTTGTA-ACATGTGTCCACTTGATCGGCAATCCGCAGGATTGGAGGTGCAGCGGGACAATGGTCTCAAACTGTTCCTGGAGAAGGACGACCTGGAACGGCTGTACGACTTTGAGGAGGAGTGCGTCGAGGGATTCTTCCACGAACAGGAAATCATCCTCAATCAGTCGACGGACGAGCGGGTTAAAAACACCACAGAGCGAGTGGAGACCATGTCTCAGAAAATCGAGGACATCAATCAGAAGGAAAACATACAAACGGCCACCGTTCAG
ACCCCTAGAACGAGAATAATGTAAAAAATCTCTATATCTCTCTATATAT-----------------ATTTTGCCTGCTGCCGCA--TTGCTGCATCTCGTCGTTGTCGTCGTCGTGCTCGTCCACAACTTTTGTGTCCAAAT---------------GTGATTTCAATA-------------------------------TATTTGCGT-------------ATTGTTCACATCTAT----------GCTGCTTCTTCTGCTTAT----AATTCTTGTTGGCATTCGATTAATTCAATTGTTTGCTTGCGCCTCTCTT--------TCCATAGGATTGGAGGTGCAGCGGGACAATGGCCTCAAGCTATTTCTCGAAAAGGACGATCTGGAGCGGCTGTACGACTTCGAGGAGGAGTGCGTCGAGGGCTTCTTTCATGAACAGGAAATCATATTGAATCAGTCGACCGACGAGCGCGTCAAGAACACAACGGAGCGCGTCGAGACCATGTCACAGAAAATCGAGGACATCAATCAAAAGGAGAACATTCAAACAGCCACTGTGCAG
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GACTTAGACTTTCAAATACCTGAAGCATGCATTTTT---------AATATTGACATTGATATTAATTTTGTT------TGCCTGCAGGTATGGATGTTCCAGCGCTTCACTGTCGTCATGGAGTATCAGCAGAAGCCGGTGCTGCCGCCGCCCTTCATCGCCTTCTGCCATTTCTATTCGCTGCTCAAGTATTGCGTACGCAAAGCGAAAG
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TATAAGCAGACTATAG------AAATTCGTATTCATTTATTGATTTTAGGTAAATTGAAATAAATTCTTAATATCTTGG
T-TAATAATGTTATAGCTAATTATATTTGATTTCATTTAACCGCGCGTCGTTTATGCAAATAAAGTGT----------A
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AAATAATAAATTTAATTATTAATAATGGTG
AAATAATGAACCTGGT-ATTAA-AACGAAA
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CACAAATTTAGACTAAGTCGGACGGAATGAGAACTGAGCGGGAGCACAGCTTGA-GATTGTTGGACATATAACGACTGAGACTTCCTTTGGGATTGGTCAGCCCCAAATATATAGATATATATATATATATATATATATATATATATATTTATAGCCTAAGAAAGCC----TAAGAATCAATCTTGTTAAGCGTCTAACTGTTTAAAATTAGTTAAAGCTGAGATTTTCATTGAGAAAGTTGCTCAAAATGCGCACCAAGAATTGACATTTCGTCAGAAACCAAAGCATTCTCTTTAGTTCATTTATTTAT-TAGCTGCCAAATCGAACAGGCCAAAAATTTTAGTTTGTTGATAAAACTTGTTTAAGTTACATTCCA---CACTTAAACTATATGCGCTTACAATTTTAAACTAAACTACGTACTTAATACTTGTGACTAAGCAAAACTTTTGAAAGACCCTTTAATTTGTTGATTGTAGAAACATAATATTTTCTATATTTACAGAA---------------------GCTAAGAATTTGTTTTTTTTTTTTTCGTTTTGACTCCCTCCTAATGTCCTTTGTAAAGTTAACGAGAAATGAAACTTTTAAAAATCGCTAAATAAATGCATTCCAAAACCAA--AAGCAACATATTTCAGGCACGATCCAAGCCTTATAAAGTTGTTCTTGTGTATTCCTCTATAAGATTCATATTCGATCTAAGATGTCTTGAAAAGGAAAATGTTTTTTATGCATAAATTAATTTT------TAAAAATTTTTGCAGATAATTGAAAGTCGAAGCCTTATTATCTCGTTTATCGTTTATATCTTAGGATATTATAAATTGTGAAAATTTATTGAAACATTGAGG
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TACCCCAATTTCT--TAATCG---TCTTAAAATCGTAAACAAA---AAATAAATAGTTTTTTCCAACATATACCTGCTGTTTTCGTGAACCAAATATTAAGGAGACCACGGATCCTGGAGATAACTCGCAAACGAA
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GTCTTTTTTTTAGCAACAGCAATTCTTAAATTATACTACTTTT-----TTCCCAAATCGAAATATATAA
TTTTTTTTT----------CGATTCTTTCTTCAAAGTATTTATAGAGATTGTTCATATAAAACATGTGA
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GACG----TTTTAA----------------TCAATAAAGATAAAGCTTAG--CCTGATAACTCAAACCTAACTTGTCATTTGGTGTGTTTTGTTGTTGTGCATGAATCCACTTGAAATGGGTAACAGGCAGATGGCCGAAGACATCCCATTGATTCCAGGTTAGCAGCAAAAGTCTACTCGATCGAATCATGAAAATCATGAAATGTCTATCAAATACCAAGAAATGCCG-CCAAATGTCAACTTCAATCTACCCAAACATAAACATATGCGCATATGTAAAATGTGAAAGGTCAGAGGAGCCTATCGCTGGCCAAGCCAATCCGTTTTTATGACATGCAATCTGCCATTTTCCTAGAACTCAGGTCGAAATATGCATTACGGAATTCTAATATTG
>Pms2 10882935 10883200|10454 chr2R 10882779 10883190 scaffold_43 118905 119246 - 8955|157 418
TATGTGTAAAAAATCAGTTGTTAAATTATTGTTGCAGTTTTAATTTTATTTAACTTTTCGTTTGAGCCACTAAGTATACGTCATTGTTCTGTAAATGCTTACTTGATTAACGATT----AAACGACAGGAT-CAGACTTAC-ATCTAAAGACAAATACAAAGGTTATCACTTGAGTATGTCTAACAAACTACTCGTTTTGTTGTTTTGTTTTATAACTATTACTAGATGTTACACTAAATATATATATATATATATATATGG
TATGCTTATTCATTGGGCCATTAAATATTCGTT--------ATTATTGTTGAAATATTCATTTGTTCTTCTTATTCT-TGTTGTTGTTCTTGTTAT-CTTGTTTGATTAACGATTTTTGAAACGACAGTTTGTGAACTTATGAACTAGAGACAAATACAAAGGTTATCACTTGAGTATGTCTAACAAGCTACTCGGTTTCTTAATGTTTCTT-------CCTCTACATTCTATATGCTTTCTATATATGTAAATGTGTGAGT
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ACCGGAAACACGGA-AACGCAACCAGGACGCGGGACTCCGTCGAGCAATGACCCTGTGG-CTATATCCAGATATATG----TTTAAGTACTTGTCAAACTCGCTGGCCATTACTTGATTAAACAACCGGATTAGGCTAACCATCTTGACATTTCCACATTCAACAAGCAC---CTTGA-CAACCAGGATTGGATTCATCACATTTACCCAAGCAATCATTATCATTATATGTGTAATTTT---TGGACCAAACG-TTTATACA-TTCATA------TTTATTAG----------TTTTAAGAC-CATTTTCATGTTGTACCACGTTGAATAAATAAATATTTTTCCTGGAAATA
ACTGAAGATTCAGATTAGGCAAT----------ATATCTGCAAATCCCAGACCCTGTGGACTATATCCAGCTATATGTATATTTAAGTA-----AACACTTAC--------GCTCAATTAAACTAGGAAATTATATTGTTATTCATACCATTGACATAATTATTATCTATATATTTGACCCATTATAAACAAACCAAACACTTTTCATCA---ACTCATTGTCATTTACTCAATTATTTTGTGTAACTCAAACGCTTTGTACGCTTCATCAATTATTTTATTAGACAACTTATATATTAAGACTCATTGTCA---TGTATCACGTTGATTAAATAAATGTTTTTCTGGAAAGT-
>CG8180 10987328 10987449|10565 chr2R 10987055 10987913 scaffold_4 6121745 6122732 - 28030|353 496
CCCGTAAGCCTGACAAGAAGG-----------TGTCGCACCTGGAAAACGTAGATC---TTAAGGTCCCAACATCTCTCTGACTGACTCTGATGCAATTAGCTTTTAACCAA-------TTTAGTGATAG-TTTTAAGTGTGAC
CTC-TAAGCCTGACAATTAGGTCGCCACAACATGGCGCATCTGGCAAA-GTAGTTTAGGTTTAGGTTCCAAC--TTCTTTGACTGACTCTGATGCAATTAG--TTTAGCAAAACAATTTTTTAGTTCTAGCTCCTAAGCCTAAC
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TTGTACCCAAAGTGTTCGCATCAGCTGCAGCGTTGGACTAATTGCAGGCAATCGACGGTAGCCACCAG--------------------CAGCCA-------GCCGGCGACCTGCCACAGATTGCGTGCAACCAGCGGCGCTGCAGATGCGAACAGTCATGGCAAGAAGTGCTATGCCAATCGACGCTCGACGGCCTTCTAAAGCCGCCACCCAAGATGACAATGTCGAGAACGAGGTGGACGAAGGAGAAGCGACTCGACAAGCAACGAACAATGCGGAGCATACTCCTCATGCCAACCATATTCAAGCTTACTTAACTAT---TCTCACCCCATGCCGCAAATGAA-----------ATGC-------------------CGTACACTTATCCACACGCTTCTCTAAGTAGTT-TAAGGCGGTGTCTACAGCAGAACTAATTATTA------ATCTAGCTAAA--------------CTAAACTAAATGAAACGAATCGATACTAATCTA--AACTAAGCCGGGTAGGCAATTGCGTAGTTGCAATA------------------------TTTCGAACACTTGAGCGAGAGCGTAAAATTTAGC---GACCCTTCGAAT---TATGTATGTATG------AAACAATCACTTTTGATTCCATTGTTTTGTGTTCGTGTAGTTAATTGTCGTTTTTTGCTTTTCGATTTTGGAATGAAGCGTTTTACTG-----------ATATATTTTCTAATGGTTCTTTGCC-----------------TTTAGTTTAGTTAAATTGTTTTTG-----------------------------------------ATATCAATGTGACTTGTTTAA-----CGATGAGCTTATATTTTTACTTGTTATTGACTATATTCAATATAT--------TTGTATATATTTAT-----AATTAAGATCT--------TGCAATAATTTCGTCTCCATATGACCTTTCCT-------GAGCTCATTTTCTTTTTAGCGCATTTATATACAATTACCAATA--------------CAATACGATGTTAGTA-ATAATGAAAGCAACATATTCTATATAGCTGCGTCT---------------AAGCAATTGAAGCTTCC-TAAGATTTTCGTGTCTTGGAACTTACTCCCCGATTATGTTGCTTCGCACCGTCGCAGTTAATGTGTAAATTGTATTATTTTGATGTGATGTATTTATAATTTCCCTTTATATATGCATATATAAATATAAATAAAATTTATTTTACCGT--------------------------ATACGTAGCTCATTACTTATGATTTC--TTTTGCTTTCTTACCCCG-TCCGAAAAGTGCAATAT-AAGTGTTAGGCTCTTTAAGT----------------------------TGTATTTATCAATGTTGAAGGTTGTGTGACTATGTTTGTGAGGCGTTTTAAGTACCATTAACTTAGCACCGAGCCAGAA------GTTGGTGTAAAGTCCAAAAAC-------------GAAAGAAAG----------------AAAGCAATAATTGCATTAAATATTCGATTTTATGTT-AAGATACTTTAATAATCGTACACAAATATGATTGAGAATGTGCCGAAATAACGTGGGAAAGTTAATGATCAAACAAAGGCACCGGCTAAAGAACGTTTGTACGTAAAACCGTAAACGTATCCATCCATCCATCCAACCAACCAACATCCAAAGCACTCCAAAACTGAGTCTGAGATAAATTGCAATTTA------------------------------------------------AAACACAATAA-------------------GAGCGATTTACACTTAGAAAACCCAAAAACGAAACTGAAACTGAAATC-CAACAGAAAACAGTTGGGGACGTGTCA-----AAGGTCAAG----CCCAACTGGAAGATCTACAACCAT----TCATCCAGT---------GTATACAAGCATAAATATACACCACTTATATTATATATATATTAGGTATATATTTTCGAACTGT-TTTTCTACTTGCGTAAAA-GCGAAAAGCAACTACCAAAATATA--CTTGAAAATACGTCCAAAATTTAAAATCCAAGGTCAAGATACAA-CTATGATATATATACTTA------CAACTGCATGGATATTCATGAATATAAATATA-AATTGCATATTTACCAATGATAAACCTAACTGAGACAGAACTAATTTAAATATT------------------GAATGCTCCCTGGGGGAATCCCGAGTA---------------TTAAATCCCAA---------------------------CCAGGGGCATTTGTTTGAGTATGTA--------TGTGTGTGCATTTTGTAGACGCCGCAATTCAA--ATTCAAATCGGTTG--AGCATTACAATTC----AGAATTAATTTAAT----------------------------------CACATGAATGTACATA---GCGAGTGTGGCAT--TATGACCGGCAAAATCACCATCAAA-------------TTAACGCATTTAACTAGCGCAAAATAACTAGAGGTTCAATTAGAGGTTGA--TTGAGTAACGTAGTTGAGTCCCCGATTGAAAACGAA----------------AGTTAGCCGCA--------GCCCAGTCAGTTTATTTGTAAAATAGAT----------------------------------CGAAAATCCATAGTTGTAGGCA---------GTGTGCAATGCA-------ATTGAAAAATTAAGT-------------------AGCCGTAGAGATCGCGATTGGAA-CGCCGACAAATTGAATCG-TACCTTGACGT-------------------------------TATTAAAGAACTAATCATA----TTTTTGTGCAATC---TAGTGCAGTTCTCATGCAATCAGCCCCGCAAATGAAATAGTTTGC-----------------CATTGCATATAGCATCTCTAGC---------ATCTAGCCTCTAGCGTAACGGAATGTTA-----------------------------GGCACACACATATTAACTATATGGGATATAGGATCAGAAGGCAGCCTTCGGAAAGAGTTTACTTGTAAGTTTGCGCACTCTTAGAGCTTTTAGCACGGTCAACGAA-TAAATGTTATTACACCACAA-----------------TTATAGCT------------CGACTCCATCAGCCGTTAAATAAACTATCCAAG---AGTTCAGT------CACGAGTTAATGAATAAACTAAAC-----------------CATATGCTAGACCTGCTTTATCAT--AGTACACAAACAGACGCACCAAGCAAAAAAACCATTGTTGATGAATTTGGTTCGGTTCGTTCGGTTTGTAAGTACGGATATGTCAGTTTAGTTCACTCCACACTAGTAGTTGCAA-ATGCAGAACATAAAAGAATAGACTAGAGTGCAGAATATAGTTGTCAGCAGCGGAAAGAGTAAAGATAATTCTGGTAATTTACAATTG----TTTTACTCCAATTTAAGTATTTTAATGCCAACACGCCAGAGAAATTAAACAAAAAACACAAGCGTAATCAGCAAATTTGAACAACTTCAACAAAGCAAAACAAAATAAAAGAGAATATGAAATATGTACTTATA--TCTATAAATACAAATATACAAACATGCAATGG
TTGTACCCAAAATGTTCGCATCAGCTGCAGCGTTCGACTAATTGCAGGCAGTCGACGCTGGTTAGCAGTCGAGTTGGTGCAACTGCAGCAGCAACTGCGACTCCAACAACCTGCCACAGATTGCGTGCAACCAGCAACGCTGCGGATGCGAACAGTCATGGCAAGAAGTGTTATGCCAATCGACGCTCGACGGCCTTCTAAGGTCGCCAAC------------------------------------GATGCACATCGTCCAGCAACGAACAATGCGGAGCATTA-------ACCAATTACACGCTAGCTTAACTTACTCTCTATCGCACCGCATGCCGCAATTACACACACACACACACGCAGACACACACACAGCCACACACACACCTAATCCAACGCTTTGATATGTATTTGTAAGGCGGTGTCTACAGCAGAACTAGCAACTAGCAATTAATTAACCAAGTGGGCTCCCCCTCTCTCTGCCAGCTGCACC----CGATCCTAATGGATTAACTAAGCA----AAGCGTTTGCGTAGTTGCATTAACCAAGTGCAATACCACGGAACACTTTGATACCCTTAGTCTATATGGTAGTTTATAATTATGATCGTTTAAATGTGTATGTGTGTATGTTTCCTAATGGTTTTTTTCCGATTAAATTGGTTGAGTTCTTTGTAGTTAATTAATGTTTGCTGCTTTTTGAT----AAAGCACGAACTTTACTATATTAATATATATATATTTATATATATTTTTGTACCGGTTGATTAATTAATTGCCTAGTTTAGTTCAATTGTTTTTTGTACGTACGAAACTTTATTTTATATTTGTATATCTTGAACTATATCAATGTGACTTGGTTAATCCTACTACGAGCTTATTTTTT--ATTGTTATGGACTATGTGAAATATATGAAATCAGTTGTATATAAATATTAATGCAGTAAGTTTTACCAGACATGCAATATTTTT---TCAATATATATTTCCCTTATAATTGAGCTCAGATTTTGTTTAGCGCATTTACATACATATATATATATACCGACAAGAAACCAATACAATATTAGTATATAAT------AACATATTCCATATCGCTGCGCCTGTGCTAAACAAGAAAAAGCGAATCAAGATTAAATATAAACTAATTATCTTGTATCTTGTTTTGAGAACAAGAAGCTTGGCATACGCGCGGTATATATGTTAATTGTATTATTT-GATGTGATGTATTTATAATTTTTCCATTTATAT-----TGTATATTTAAATAAACTTCATTTTGCTATCTTTAAATATATATATATATATATGAATATATATATGAATATATATGTTTTGGGTTATGTCTTATTATTTTGCTATTCGATGTGCAATATCAATTTTTTGTCTGTATGAGTATTATTATTTGTATAATATATATAGACGTATATCGATCAATGTTGAAGGTTGTGCGCCAATGTTTGTGA------------ACCATTAACCGAACACTGATACAGAATGAAAGGCTTGCGTTA-GTCCAAAGATTGTGGACTGCGTGGAAAGGAAGTTATGAAGATGAAAATGAAGCAATAATTGTGTTGAATATTCAATTTTATGTTTAAGATAATCTATGAC----------ATATGA-----AATATATATATATA----TGGAAAGATAAACAGCAAAC--------CGGCTGACGAACGTTTGTACGTAAA--------CGTATCCATCCATCCA-ACAACCAA--GACATCCAAGACACTCCAAA-CTGAGTCTGAGATAAATTGCAATTTACAAACAATAAAAAAAAAAACAAAAAATAAAAAAAAATTATAATATAAAAAGCAAAATAATAACACTACAACCGACAACAAGCGATTTACACTTAGAAA-CCAAAATTCAAAACCGAACAAAAAATAATAAAAAAAAAAAATTCAAAATATATGAGTTGAAAAGTTAAATTAACCCAACTGGAGGAACTACAGCCAGACAGTCAACCAGTATAATACTTGTATGCATACATGAATGTGTATTA--TATATTAGGTATACAT---ATGTATATTTTCGAACTGTGTTTTCTACTTGCATCAACTACCAAAAACAAAAACAAAAATATATACTTGAAAATACGTCCAAAATTGAAAAATTCAAAGCAAGCTAAAAACTACAATATATATATATATATATACAATTACATA-ATAATTATATATATATATACATAACTATTTATTTACCAATAATACATATAATTTAAACTGAACAACTAAATATATCTTCGGTTGGCCGAAGCTAAAATGCTCCTTGAGAAAGTATTGAAAAAACGAAAACATTTTTTTGAGTTTAAAAACAACAATTTTCATAAAAATAATGCTCAAAGAGCATTCAAAATAATACATAATATTTGGTGTGTGTGCAATTAGTAGACGCCGCATTTGAGTTCTTAAAATTTGTTTCTAGCAAAACAAAAAGAAAAAAACTCATTAAATTGTTGCAACCCGCCCAGCACAACAATTAAATGTACAGTTGAGTGTACATAAAGGCGCATAAAACAAAACATTAACTGCAAAACAAAAAATGAAATATTACTGAAATTTAATGCATTTAATAAGCGTAAATTAC------ATTCAAATAGAGCTTGAAATTATGAAAGATATT-------CCGATTTAAATCAAACGAAAACATTTAAATAAATTAAAGGCACGCATAATGCGCTTTCAATGTATT-GTAAAATAGTTGAGAAAGAGTTTAAATGAAAATTACCAACAAAAAAAAAAAGCGCTTGCTAAACGCATCTTCTAGAACTTACAGTACACACATGTATTAAGTTATAGAGTGTAGAACAGCAGAACGCAAAGTAGAAGAAATCAAGATTGAAAATGCATGCAAATTAAAAAGGTACCTTAAAGCAAGAACGCAGCATCTAACCGCTATATACATATATTATATGGCACATTTTAGGAGCTATTGCCCTATCAGACAGTTAAATGTAGATACAATATGATTTGCAAATCATATAATACACAGACACACCCCGGTAAACATTATATATA-CATATACTACTTAATAGTTATATAGGCTC-GGTATGAATAGATGTTATTTTATGCATTGGCTTCGCATAGAAGAGCAGCATATACATTTTATGTGGATAGCACCCAGAAAACCAAAAAA----TTATAAAAATGATATTCGTAAATTTGAGCACT-TTAGAGCTTTTAGCACGATCAACGAAATAATTGTTATTAAAATACAAAATACATCAATTACAAATTGTAGTCTACCCTCGCAAGCAAAACCATCTACCATTGAACAA-CTACACAAATAAAGTTGAATAAACAATAGGAATTAGTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACAACAAATGCTTTTATTGTGCAATCAACAAATACACAAATATCAACACGAGCTCTAAATGCAGTTGTTAAT---TTTTATTGTAAAATTTCACTTTGCTATTGTAGTT--GTAACTTTTGTGTACTC-GTATTAACAATCGCAAGACAGACAACTTAACAAAAAACACAGACATTCAACAA--------CAACAACAACAAAAACAAGAACAATTTCTGTAATTTATACTTACTTATTTTACTCCAGTTTTAGTAACTTAATGA----ACGTCAGCAAAAATACAAAAAAAAAA-ACGCGTATTCAACCAATTCGATTAAATTAAAAAAA--AAAACAACA-ACAAGA-------AATTATGTATTTAAAAATCTATAAATATACA-----AAACGTGCAATGA
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GTAAAGACAGAGACTAACTA---AGTTAAGAATATATTGTGC-TGCAAGCTACAATC-TCAGTCATTTTTGCTTTATCCATCATGGAGGCATGTTGTTTAGGCTTGGCCCGACTCCTTAGCCACTTTATCCTTTAAGCATTCAAGTGCCCTT---GAGAAAATGGCTTCTTCCTTTCCGGCTTTGAGTGCAGACACAAACAGTTGCACCTTTTCATCGCCAATCTCTTGGAGATCC------------GAGTTTTCCGCTTTTATCACCATACATGCCAACAGGCGCAGCAACTTCAAGGCGTTCTCCACATACTGCTCCTTTGGAGCGTCATCCTCCTCCTCTTCGTCCTCTTCGAACTCATTGGCGTCGGGATCACTTCCCCCCGTGTAGTTGTCAATGTGCTGTTTAAGTCTATACCACAATTCCAAAAGATTTAAGAAGGCCTCCTTGTGATAGAAGTACTTCAGGCGCTGCAAAAATAAAT---------ATTTAAATAGAA
GTGTATATA-AGTATAAGTATGTATTTATGTATGAATTGTGCATATGTGCAACAATTATCAGTCCTGTTT-------------CTGAGTATTATTATTT-GGCTTGGCCAGCTACGTCATTTAAAACCGCGCTGAGGCGCTGATGTGCCCTCTGAAGGAGCACATCTTCGACCTGTTCCGCTTGCAAAGCAGCGCGCAGCATTTCCACTTTAATGGCATCAATTTCTTGTATATCCTTCGTTAAGACTGGAACGTCAGCTCTGACGAGCATATGACCCAGCAGGCGGAGCAGTTTGAATGCATTCTCCTCGTACTGC-------GAACG-----CGGCTCATCTTCGTAGGCATCAAAATCATTTTCATCGTATTCG---------GCATAGTCTTCAATGTGCCGTCGCAGAATTGACCAGACGCCGAGTAGATGAGCAAAAGCCGCCTTGTCATAGAAATATTTCAGACACTG--AAAATGAATTCAAGCGGGATTCAGTAAGGA
>CG8192 11059178 11059413|10638 chr2R 11057970 11061186 scaffold_4 5624946 5628220 + 135257|1218 1539
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GCATCATGAGTTGACCGTCTCGTCTGGCCAGCTGGTCGCACTCAATGCAAACAGTCTTGTCGTTCC---------ACGCCTTGTGTTTTGGAGTGTTTCTCTT-----TAGCTTTAAGCTCT-GTCAGCGCCCTTTGTCACTAGACACACACACACACATACACACACACATGTATATGCTATAACAACAATATAGTCCCAAAATT-TAGCGCGAGTTTTATGTACCTTATTTGTAATATTTAATGTCCTTCTAGAAGAATCCGCCTTCTAACTCATTTCGTTAATAAAG-AAGCATCATTAAGTTTAAGATCATCATTGTA
>CG8195 11077557 11078026|10656 chr2R 11077416 11077888 scaffold_45 532476 533023 + -1073|168 580
AA-----------------------------------------------------------------GTCCTGCACAATTTCCCTTCG---GCCCTGATTTGTGTTTCTCATTTGTGCATTTTTCGTTG------GATATTATTGTGTTGCGAACTTACGTACAACT--ATTTATTATAATCTTACAAGTGTATTTATT-----CTCTGTAAATAGCTTTAGATCCCACGAATACCGTTTATCTATGTGATAGTCTACAACGTTTTGCTGAACTCCACCTATAATTTATTTCCTCGGTATTCACACTGCGCTTAGCTGTATAATTGTTGACTTCTCAATACAAGATGAAAAAACATATACACATATTGATAACTAATTACAATAAATAAAACTTGTCTACCGTAAGCTTTAAA
AAATATATATATATATATATATATATTATATACAATAATATATTGTATGTATGTAGTTGTAGTTGATATTACGCACAACTTTCATATGCATACAATAATAATATTTACTGATTTG---GTTTTAAGTTAAGAGCTGAGAATCCTGATTTGCAATTTTACGTACAAGTTAAGTTAATATTATTTTTAATTTATATTATCTTAGCATTCTGTAAATAGCTGTAGTCCTAGTGTTTATC-TCTATATATGTGATAGGTCTTAAAATTTT-CTGAAC----CTTTTTTCTTCTTTCTAATCTAATCAAAT--------GCTTTAT-ATGCTTTAGTGCTCGACCTTATAGACATATATATATATATATATCAATA---------TATATATATACCCTTTATAC--TCAATTGTAGC
>CG8195 11077557 11078026|10657 chr2R 11077889 11078043 scaffold_4 5650961 5651091 + 1408|0 137
ACAATAGCAATAATCACGAATGGAGGCTTTTTGTAAAAGTCGGGCTTCTACAAACTTTGAATGTTGCTCATTGCAATGCAATCTAAAACTTGGCTGTTTACGAGTTCGTTTCGAATCGTTCTTAAATCATATTGGGAC
ACAGTATAGAGAATGAAGAGCAGTTGCAGTTAATATTAATTGAGTTTCTACAAAA--TGAATATAA---GCTGCTGTCTAATCTA-------------------TTCATTTCGGCTCATTATGGTAAGTGATTTGGAC
>Flo 11081130 11081436|10662 chr2R 11081102 11082787 scaffold_50 367390 369134 - 59806|30 372
AAAAGTACCCAAAAGAAAACCAAAAACACACAAAATTATGTACTCTTCAAAACGAAAATAAGAAAACAAAAAAGAAATTACG---CTATATTGAACGATCGAATACTTCAA--AACTGAAAT-CGAACGCATTTAAATTTCTTTATAATTAATATATTATTGAATCTTTGTGCTAACCCGACAAATTTTGC--------------------AACATGTTTTACACACACACTCAGAGAGAGGAGCAAAAATAT-TTTGTATTACATGTATAATGTATTTATATAAGTGTATTGCACAAAGCGTGGAATAAATATTCTTCCTTGGATCAA---------CAAAT
AAGTTT--------GAAATCCA---------------ATATACTCTTCA-----AAAACAACACACCATAAATAATATTTCGAAACAAAATTGAAAGA---AATTCTGCAAACAATTAAAACAAAAACGCATTTACTCGTTCGTTTCGTTCAGCAATTTT----TTTTTGTATGTAACAGTGTAATTTTGCACAAAATGTCAAATGGCAAGAGCATATTTTGTATTCAATATTAATATAAGAAATATAAATGTATATGTATT---TATAT-ATGTCTTTATACAAGCGTTCTACACAACA-GTGAAATAAAGAAATCTCCTTAAATGAAATCCTAACTAAAAT
>Cdk5 11084393 11084994|10664 chr2R 11083608 11084468 scaffold_50 369645 370503 - 7330|891 983
ATTAAGTAAATTAGAATAAAAAAAATTGAGATGTAACCTAG----------ATTTTTAAACCAA-------TAAAGACACTTACCGCAGCACT
ATTAAGTAAATTTAAGAACCAAAAATTGCAACTGTACCTAGTTCACTTAATATTTATAGAATAAATCTTCATAAATATACATACCGAATTATT
>Cdk5 11084393 11084994|10665 chr2R 11084469 11084766 scaffold_18 205031 205338 - -1572|0 327
ATTTGAGCTGCCAAATTAACATTTATCGATAA--AATACTTATTGATTCAGTAAAATAGTT-TTATTCTTAAAAATTTTTATGTTGAGTGTATCGTTAAGATCCGAAAATTGTTCAAATTCCTAGACGATATCTACTGTTTGTGTGAATGTGGAAAAAATATTTGAAATCCTAGTT--------TCTGTTTTCAAAGACTAAAAACTAGGCAATACATC---------TGGTT--TCCAAATTTAATG--AGTGTCGAC------GATTTTCTTATTACATTTATTGTGTATTTTTAAGAATTTCGATCTTTCTGAATGATATGAGTC
ATTTACATTTTCAACTATTTGTTTTATTTTGATTTATTTTTATTGATGTGGTAATTTAATTAATACTCTTTCATACGTTAATTTT-------CCATTAAT------AAGTAGCTCATATCGCTGTA-AATTTATATTAACTAC----ATTTAAAAAACAACTTTACTAACATATTTGCATTTAATCTGTCTGTAAGCACCACCATTTA--TAATACACCACTACGGAGTGGGTAAATCACATTATATGTTGGTATTTACCTAAATATTTGCCTCATCGAAATAAGTATACGATCCTATAAAGTTATTTCCTTATTAATTATATCAACG
>Cdk5 11084393 11084994|10666 chr2R 11084767 11087728 scaffold_50 370504 373274 - 50595|0 239
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TGTGGCAATCAAGTTAACTTGTAGTTCTAACGACTGTTTCAATAATATAATATAATATATATATATATAAATTGTATGTATATTTTAGGAACGTATTTTTAGTTATACACAT-TGTTTTT--------------------------ATCCCCAATTCATTGCAATTCTATTACATAGTTTTTACCAAATTATA---------CCATGAGAATGCCATCAGTTGTAATATTTTAAATATAC
>CG8204 11087999 11088051|10667 chr2R 11088001 11088850 scaffold_1 872362 873244 - 15155|0 60
ATTAAGTTGACACACAGTCTCA---------ATAAAACTAAGCCTTTAT-TTTGTAACTAA
AGTCTGTTGTGCCCACGTCTCGTACATGTATTTAAAATTATGCCATAATATATGTAGTTAA
>fus 11172316 11172829|10798 chr2R 11172315 11174233 scaffold_1 1019128 1021412 - 19120|1 661
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ATACGTTTGCTGCCCCATACACTCTCTCTTTTTCTTTCTTTCTTACTCTTGCTCTGTCTCTCTTACTTTCGCTATTTATTGAGAAAGAATTTGTCTTGCCAATCGAAGAAACTTG--TAGTAGTCTAGTTTAGAACCAACTATAGATAAGTCGCTAGCTCAGACGCAAACCATTAG-----CAAACGCTGCGCGGCGAATTGCGGCAGCCGCACTTAACGACACGAATCTCGCCGCAAACGCCTCTCCCCCCTCCGGAAACACTTCTAACAAAAATGTTAAGAGAG--------AATTTCATGAATTTTTAT-----AGAATCGGTTTTAATTAATGCTTTAGGTAGACACCCAGTGCAAATTGCAAACTCTATTTATTATTGAAATGCTGCATTAAATATATATAACACATACACACATACACACACATATATATTCCAAATATAAATATTAGCAAATTAGCAAAAGAATACA------ACTACAAATTTATCCCTAGTCAATAGTCAAATTATTTATGCAATTATCTAATTTTAACTGCATGTTAAATGTT--------------------ATGTCGAAATACAAAAAAAAAAAAATCAAATATATTGTGCAATTGTCAATGCGGGCAAATGCATTGCCAAAATCAGTCAAAATATGAA
>fus 11174876 11176884|10800 chr2R 11174806 11175161 scaffold_1 1022357 1022836 - 2896|100 493
AAGGCATGGGAAAGATAGTC-------TGCGCCTGGCCTAATCCTTAGCCTAATTTAACCTTTAGTCTTACGTAGAATGGCAATCAAGTGGCTTCCGAGCGGGT------------------------------------------------------TAAACGGCCACTTTAAAGAA--------------------ACAACACATAATCAATTGT-ATCTACTTAACTAGTTTGTA-CGCACAGCAGTTTTAATGT---TTTTTGGAAATTTTACGATTTTTGATATTCCAT-TCTTTTTTACCACTAGATGTTAGTAAAA--AAATCTTTGATTAA------TTTTTTACATCAATAAAATACGACATATCGCC-------------TAAA
AAAGCATGGGAAAGATTTTCATAGCTTAGCATCTAGTTTAATTGTTAG------TTAACTTTTAGT------TCATACGACAATCGAGTGGTTTCCCATGGGTTTTTGCAATACATACATTTACGATCTATGGCTTCCATAAAAAAAAAAAAAACTCATAAGCAGCCACTTAAAAAAACAATTTTATTAATAACAATTATAATACAAAATACATTTTGATTAACTTAATTAGTTTTTAGCGCACAAAAAAAAAAAAACAAAACAAAAAAAAACAAGCAAATTTTGATATTTCATAATTTTTTTAATGCTTAGTCTAAAGACAATCGAAACTTTTATTACAAAAATTTTTATACTTCAAT-AAATAT-ACATATCGCTACATTCTTATCTATAAA
>fus 11174876 11176884|10801 chr2R 11175186 11175780 scaffold_1 1022876 1023438 - 3590|0 625
TAGCTCTTAAGTGTGCGTAACTGGTGTTAGTCGCAAATGGGATAGTTCTCTCTACTATATCACTCTCTACCTCTTGATATCAATACCTCTCACTGTTTGTGTGTTCTCTGTCATCACTAATTTATTCGGGATCAGCTAGATCTATAGTCTAAA-------------------GCTTGTTGTAAGTTGCGGCGCTTTAGTGTCTATATACATATATAGTGTGACTAGTCTACATAATCGGATAACTG------ATAACTGGTTACTGGTGACTCGGGCTTACAATCCTGCAAATTGCTCGTTAGCTTTAAGAC-TGTCTTAACTCTTGAGAAGTAACTATTTTGAAACGATATGATAATGAGAAGTCAACCAAATTATAAT--ATACAATTCGGCGTAGCTCACTAGGTATTTAGAAATCTGCAATATATGATAAGGAACATCTCGTGAGTTAAGATAGGAATTCAGTTAATGAGCATTTTGT--TCAATTC-TTACACAAACAGGAGCTTTTGTCAGCGTCTTTCGGATTCCGAATTCCCCAACCTACCGAATCCCCCAAAACCAAAATCCATATATCCACCTCTGTCTTCTCCTGCTGCGTCTAACACTAAGTTTCGCTCGGCTT
TAGCCGATAAGTGTGCGTAACTGGTGTTAGTCGCAAATTGGAATATTTTATCGA-----------TATACAT----ATATCAACTCTGAATTTACTTTGTGTGTTCTCTGTCATCACTAATTT-------------TAG-TTTATAGTCAAAACTCTGACAACTCTCTCCCCACTTTTTCTTTCTTTCCCCTCTTC--TGTCTTTGGCTCTATATAACTCCACTCGTATATACGCCTATATAACATATATACATAAATATCTCTGGATATCAAGAGGGGATAAGTCCA-AAATTGCTTTTTATCATTTGTACGTTTCTTAGCGCTTTAG-------TGTCTACATTTGATCTGATA-----AAATACATAATATGGTTATGGATATTTTTTGGGTTTATGCTCTAAGTAT----ATATCTACAATATACGAT------TACATAGTATGTCTGTCATTGTCCTTGGTTTGTGTGTATTTTGTGGCCACTTAGTTACACATTCAATGTGTGTAGAACGCGCTATAATAATCCAGAATCGGTCCGAGCAGAGAGTC-------AACAAAAAACTTTTACCGATC-CTAACTCCTCTT-CTGCGTCTAACAAACAGTTTTGCGCTGCTT
>fus 11174876 11176884|10802 chr2R 11175910 11176162 scaffold_1 1023794 1024036 - 2712|0 288
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CTCACTGCCTGAAGGGCGTCAGGTGTTGGCTCATGCGTAACAAAAATTGGAAAAATTTAAAC-AAATTTTAAGCT--AAATCGAAATGTGC---------------AACAACAACAAATCGAAATCCCTGCCCCGAAAC-------TGTTAAAAGCTTAGACTAGATTAAAACCATATAT---------------------ACCATATATATATATATATACCATATAATAATAATAATGGAAAACAATATGCTAGCTTTTAAGACGTACAACTTGTAAAATTGGTTGG
>fus 11174876 11176884|10803 chr2R 11176553 11176881 scaffold_232 7320 7575 + -690|0 335
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CTCTAACCGATTCAGGCTAAA-------------TGCCAAAGTTCTGATCCCATT---CGGGTTTGTTGGGC---------------------ACGGCACA-ACATGA--ATAACA------AATATACACACACGCACACACACACGCACACAAAACTCTCTCT----------------CATTCCGTCTCAAAGTCCAAAGCGC-GAACGTGTCGCATTTACTCTTAG----------------GTCTTAGGTTTACGTGTACGATTCTCCCTAGCCATGTACTGCATATACATAAATGTACATACATATCTTAACTTA-ACTTACATGCATAC
>CG8207 11192079 11192196|10827 chr2R 11191095 11192627 scaffold_1 1047603 1049300 - 25240|1197 1325
GAATGATTTTATTTTTTATCTTCGCTCTGTGTCCCT-----------ATCAGTATGTCATTTTATATGTTTATATTGTGCTATATTCTGAAAAACTCCCTATTAAATGTGTCTTATCCTCTGCAGCCAA
GAGCGA--------------AAAGCCACGTGCCTCTTAATATATATAATCAGTATGCTA---AATATCCTTGTATTGTGCAATCATCCTTCAAACGGTC--GCAAATGCCATTTA-----AATAATTAT
>Vha14 11194286 11194470|10831 chr2R 11194251 11194876 scaffold_27 16098 16668 + 22413|35 219
TTCCTCGAATTCTGCTCGAGGACACTGTTTCGTATTGCTGCAACCGCCAGAGAATTGCTTTACACCCTGTAAACAACTATCCATAGATTCAGTGCTTCGCCTTTGTTCTTATCGTGTATTTAAAGACATTTATTAAATGGTTTTCGTTGTATAAATAGATTAAAATCAAATTGTTCCAAATCAAA
ATTATAAAATGTTGC-----------GCTACATATATTT-----------AAAATTGTTCAATGTTTTCCAA-----TACCTTTAACCACAGTGTTTAATCT---TGTAAATTGTATGTTGAAAG-----TATTAAA-----------GCACAAGTGAATATTATAAAAACT--------TAAAA
>CG8214 11202239 11202297|10837 chr2R 11201085 11203977 scaffold_1 1054177 1057239 - 110616|1268 1334
CGCGTAGAACATAGTTT---TTAACAATTAAAAATATATAATTTCAATACAAAATA-----CATTAA
AGGGTGGTCCACAACTTGGATTAACAATTAAAAATATATAATTTCAATACAAAATAAAATACATTAA
>CG30080 11213582 11214481|10851 chr2R 11213569 11213782 scaffold_11 2333652 2333859 + 2302|13 225
CGACGACATATCGCCATATCAACT-----AACTGCACAAATAATGTTATGTTATATGTTAATAATGTTAATGT-TAAGAAACATGTGTAATTATCTATAGC------TCATCCCATCGTAACTAATCTAACTTATGTGCTATAATGTTAATACTTAGAAATTAGTTTTAGTGTGAAAATATAATATAAAATGCAATGTATATGAACACAACCA
CAACGATATAGCAACAAAGGAATTCGGTAAATTTAATATATAATATAATATAAT-TGTATATAATATTAATATACTAATAATATGTAAAATTCAATAAAGCGTTCGGTCGATTCGGCGGAACTTGATTATACTGAATGTTGCATCATCG-CACATAAAAAAGAGT----------------AAGATAAAATATAATATATATGCATATAACCA
>CG30080 11213582 11214481|10852 chr2R 11213783 11214011 scaffold_50 304500 304694 - 3713|0 230
GCACATTCGA-TTTGTTGACAAAGTCTTTAGAGCCCTGATCGCCGGCACCCTGCTGCTCCTGATGACCGCCATTTACCGGGAGGACAACAACTCCGGATCCCACTACATCCATCCAAGACACGCCATGCAGTAGCTCCATCGTGGTCTACTAAGATCGATTCAACCTAGTCCG-ATGCAATCGAATCTCTCGAAAGTGCGGCACAAAAACCGGTTGTGTATATTGCCGGCT
GCGCATTCGAGTTTGTTGTGCGCGCCTTTG------CGATTGCCAGC---CTGCTTATCGTTATGAGCGCCATCTATCGGCAGGACGATGATCCTGGCTCCAACTATTTACATCCCAGACGAGTCATGCAGTAATGCCG-----------CAAACTTAGTTATACCTCCTTTGTACTTAATCAAA----------------CACACAAATTACCTTAGTATAATGTTTATT
>tun 11277428 11278055|10955 chr2R 11277401 11282213 scaffold_34 1021976 1026882 + 161205|28 862
GCCGCAACTCAGAT------------GATTTTGTTCGACTTCAGGGATCACGCACAGTTGGTTAAACACCAACTAT----------------CTATCAGAATCTTCGGATTACTTGGATACGGGAGCT------TGCTCCCAACTCGTATC-------------TAATGCTTATTATTGCAATTGTCAGAGTGAATAATGCGTAACTATTATTATTTCTATTTGTTTTTGAATTGTGCACACAAATGTTATCCTAATTTTAACTGATGCGATCATCATCGATTCGCTCAAAATCAAAACAGTAGCTGCAAACGAAACGAAATCGAATTAGC--------TAGCAAATTATATGTCC----------------------------------CACACAACTATTAT-------TTATTCAAACATCGTATCATAACCGAACTAC-----CGAACCCCA--------------GATAACTATGTATGTACTGTGGCCAGAGTTAATTTACTTAGTTGAGCCTGAAAACTGTTGATCAACCCGTAACCAAAAGCTAACAAATCGCGCGAGAGGATTTCCCAAAACCGATTGGCGGCCTA--------------GAATCGG--GCTAATCAGAG-------ATGTCAAACGAGGTTGTCAGCAGGCAGTT---------GCTTACTTAAT-------------------------------------------------TTCTAAATTTATGTTGTAA-----------ATTATCCATAATTCGATTGTAAATTGTAAATGATCAGCAAGTGAATAAATTTCGAAATCTTTTTCGCGTTT
GTCGGAA--CAGATCTTTAACAGCTCGACTTTG---GACTTCAGGGATCACGCACACTAACAACTACACCAACAACAAGGACAACAACAACAACAACAGCAAC-TCTATTTACTTGCA-ACAACAGTTCTTAAATAAGCCCCAAGCGTAACAGTGAGCTGTTCGCATAGCTTTTTATTGCAATTATCAAAGTAAATGATGCCCAACCATTATACTT--AATTTCCTTTTAATTTGTTTTTTGAACTGTTAACCTAATTTTAAATG-------------------------AACGGAAATGAAAACTGCAAACGACACGAAATCGAATTAGATATCACAGTAGCAGACTATATATCCCCATATATATATATATATATATATATATCCGACACACACACAAACTATGTTTATATTATTTATTCATCATATCATAATCGAATTATATACGAGAACCACACCTATTATGCTTATTATATATATGTATGTATT-TCACAAAAGTTATTTAATTCCGATG----------CTGTTGACAAACC----------AACTAACAAACCGCGCGAAAGGATTTC---AAATCGATATAAGAAATATATATCCATCAACCGAATCCGCAGCTAATCGGAGCGTAGCCACCTCTACGCAGCTTGACAGCACTTAATTCGCGAAATACCATATCTAATTCGTTGCGACCATAAATTATTAAGCCACAAATTTAATTTAAATTATACCTTTTAAATGTATGTTGTAACCCGATTCGATAGTATCTGCAATT-GTTTGTGATTTGTAGAAAATCAGTTAATTAATAAATTTCGAAATCTTTTTCGCGTTT
>Poxn 11341556 11341892|11029 chr2R 11341182 11342948 scaffold_71 166998 168840 - 34792|411 774
ATCCAC-TGAGTGC----------GTCTCGCCACTGACCCAGTTT----TGATCTGTGTATATATAGCAACCTAGTTTAATCGTAAACGCCCCATTCAAACAGTACTAATTTAATCTAAGTTGGA---ACTCGAATTGATGGAATTTCTGTGGTCACACGATCTTTTCACTTTCTTCTCTCTTAAACTGGATCTCTGATAATGATGTCTTAA---ACTGAATTTGTTCAGTCGATT----AAAATACCCGTGAAATTGTATTCATTCCAAGTTCCATCCACATTGATTGCTATGAATAATGTTGCAAGGGGGTGATAATATAA--TAAAATATTTAAATACAACAATAAAACAATGTTCTGAGT
GACGACATGTTTGCTTTCACTTTAGTTTAGTAAGAGTACCAGTTTAAAACAATTAATGTGTTTATG-----CTAGTTTA-----------CTCATTC--GTGATAACTATTTAATCGAAATAAAATACAATCGAACT-ATGTAAATGTAATTAATACCCA----------CTTGTTTTCTTGTACAATTTCTATTCGATTTTAGTGTAAAAAAATACTATTTGTGTCCACCCGTTTTTTAAAAACAATCATT---TTTTAGGCGTGTAAAATT--------ATTGTCTATTATTATCAATTCTTCCAATACCTGTAAGTATAAGGGAAAGTTATTTCATATAGCCATG---------TCCGCCC
>CG8249 11358953 11359080|11042 chr2R 11358693 11359158 scaffold_71 182042 182425 - 645|262 389
TGCATTTGGGTAGATATGAACTTCGAATGAGATGAAATAACTTAAATAGATCCCGTGAAGTGCTTAGTACTGTGATAGACAATAAGCAACGCAGACAATAATAAAAATAAGTTTTTAACGAAGATTAA
-GCGGTCAAGCAATTATCA-------------------AACTCATATTGAAAACG---AGGGCTTAATGCTGTGATACATACAAAGTAAAATATGCACATATTCATAAAGGAATTCAATTATAATTGA
>l(2)k05713 11372614 11372741|11059 chr2R 11371139 11372912 scaffold_4 3761010 3762922 + 27453|1703 1841
GAGCACCAGCGACTTAACAACGACGACCACATCACCCGGCCATCGGAGGCATGGACTAGACTTAAGATCGAACGTTTAAGATCAA-----------ACTTATTTTCATTTTGCTGTTAATAAAACTCTTTCAACTCACA
G--------CGACTTAA--AGGACGAGGACTTCACGCGTTCATCT---------ACTAGGACTAAGCTGCAACGAATTATACAAACTATATAAACAACTTCTTTACATTTTGCTGTTAATAAAG-TCTTGAAACTCACA
>CG30085 11379167 11379384|11063 chr2R 11379371 11380773 scaffold_4 3769215 3770587 + 56331|0 13
ATTGGACCTGACTT
GTCGAATATTACTT
>CG33464 11386282 11386282|11069 chr2R 11386133 11386582 scaffold_1 4019553 4020042 + 19098|183 183
T
T
>sli 11387534 11388241|11072 chr2R 11387144 11387678 scaffold_1 1991240 1991790 - 1346|445 589
GCTCACAGAAGCACAGGCGGCTCCGGAAACGGCTGTTGCGGTGGCCGTGCCGAGCACTGCGATAGATCTGCGCGAGAGCAGCGGCCACTTTGCCAACGATGACGAGGATGGCGAGGACGGCGATGACGGCGTCGATGACGAGTTC
GCCCACGCCCTCGCCGCCAATTGCAACAGCTGGCGTTGCGCTAGATGCGGCCAGCTATGTGGACAATACAGACGACATCATCGAAGAGCTCAACGAAGATGATCTGGTCGAGGAGGTCATCGATGAGGAGGCCAACTGCGAG---
>sli 11387534 11388241|11073 chr2R 11387679 11388352 scaffold_1 4021241 4022124 + 22851|0 777
CTGAAAGATGCGACTACCCAATTGCTCGAACGGAGCAATAGCAGCTTAGATGTTAGTTTAGGAACAGGTTTAAATCTAACTTATAGTA---------------------------------------------------------------------------GTAGTTATAGTAACGATAGTCTTAGC---------------------------CATAGCACTAGG---GATAGCACGGA--------TGTTAGGGGGACGAAGGATGAAGCGGAGGAGAGTGCTGACGCGGGGGAGACAACGGAGGAGGTGAGGGACGAGAGTGATGATTACCCCACGGACG---------------------GCATGCAGTCCGATCTCTACGACGACACCATCGATGACGACGATGACGATGGTCTCGATGATGATTATGC-----------AGACGAG-------------------GAGGATGGGGAGGAGGATCCAGAGCAGCTTCCCGATCCCAAAGGTCTGGTAAGTGT------------------------------GCCAGATGAAGAGGAAGA---CATGGGTTACGACGAGGATGACGAACGTATCGCCATGGAGCGGCCAAGAACGGTTAGACCCAGGCCCGACGAGGAGCATTTCCTTAACGAAGAGGGCAGTGGTTTCGGCG------------------GCTTTCGATCGCGATTCCGGCCGAGCAATAGCTTCCGCGAGACTCAGCTGGAGAATATCCGCAAGAAGCT
CTGAAAGATGCGACTACCCGATTGCTTACAGAAAGCAATGGCAGCTTAGATGTTAGTTTAGGAACACAATTAAACTTAACGTATAATACAAATAACAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAACAATAATAATAATAATAATAATAATAGTAGTAATAGTAGCAGTAGCAGTAGCAGTAGTATTAACTTTAGTCATAGGCCGCATAGCAGTAGATTAAATAGCACGGGGCAGCAGCTGCTGGGCGT-----GGCTGCTGTCGAAAAGGGGCAGGAGGCGGAGGTTGCGTTGGGCGAGAAGGATGATGAGGACGATGACTATGCCATGGAGGACATAGAATCCGATACAGAACGCATGCAAGCGGATCTCTATGACGATGACGATGACGATGACGATGACGATGATGAAGATGATGATGATGGTTTGGACGAGGAGACGAGCTTATTTGCAGATGATGACGAGGACGATGACGAGGAGCCCGAACAGCTGCCCGATCCCAAGAGTCTGATCTCTGCAGCGGCACAACAACAACAGCAACAACAGCCGCCGAATGAAGAGGAGGAGGACATGGGCTATGATGAGGACGATGAGCGTTTGGCACTGGAACGGCCGCGTACAACGCGTCCGCGCGCCGATGAGGAGCATTTTGTGAATGAGGAGGGCAGCGGCGCCGGCGCCGGCTCCGGCACTGGCGGCTACAAGGCGCGTTTCCGGCCCAACAACAGCTACAGGCAATTGCATCTGGAACACATACGCAAAAAGCT
>CG8291 11437903 11438045|11157 chr2R 11437830 11441554 scaffold_1 4090078 4093963 + 146426|87 291
CTGACTAATATCGTACCGTACATA----------------------------------------------------GCGTAACTCTTATGCGATCCACATATCCGCTTGCTTTCTTAGACTTGATTAGCGCTAGTTATCTAAATACGAATATTACCTTGTAGTTATG-CGAATAATAACGA---------AAACAACTAGTTGGT
-TGACTAATATCAAATCGTACATATAATACACACACACACACACACACATACATATATATATATATACATATATATGAGTAATTCTACTGATGATCACATATCTGCTTGCTTTTTTAGACTTGATTAGCGCTAGTTAT----AAACGAATACTATTTTGTAGCTATATTAAATAATAATTATGTTATAATAAAAAACTAATTAGT
>Iap2 11447027 11447494|11166 chr2R 11447022 11447149 scaffold_4 3804288 3804414 + 1628|5 135
GTTATAGTACTCTTATTAACACATGTATGTATTTTTGTTGATCATGTTTATAGGCCGCTGATAGTATGGTTTACACACAACTATATGCATTCTCCAATAAATGTATATGTAAAT--------GTTAAAAAA
GTTACAGTAGACTTGCAAA---------GCTTTCCAGTCAATAGTAATTGTAAATCCCCACGGACTGGTTTTATGCATATATATATGTATATTACTTTAAACATATATGTACTTTAATCGTGTTTACAAAA
>Iap2 11447027 11447494|11167 chr2R 11447193 11447263 scaffold_11 974188 974260 - 2073|0 72
CTTTTGAACCATACATTATGCACGCTGAAATGACCTTATATAGATGAGCAGCT--CTAATTCGCGCTGAAAAG
CTTCAAAACATTGCAAAACGCAACCCGAAATGTTTTGATATAAATGAGCAATTGCCTTAGATGAGCTGAAAAG
>Iap2 11447027 11447494|11168 chr2R 11447323 11448694 scaffold_1 4102263 4103571 + 46861|0 174
AGTGCATATCGACATCATTTAGAGTTCACCAGCCTAGTTAGCAGTTAAGCAAATCGATTGATTGCACCCACACAAACTACTACAGCGAAGTTCAAATTATCCGGTGATTAGCTAATATAATCGTCTACTAATCGTCTACTAA---GTACTTGGCCAACTGCAGCTATTCGTTTTT
AG----CAATGTCCTTAATTGAAAGACCCTAGCATAATTCATGTCTACT---ATGTACTTGTAACGCCCAAGCAACCGTTCGGGATGGTGGTGGGCGT----GGCTATCAGCT------ATCAGCTGTTTATCGTTTGCTAACTGGTAGTTAACGCACTTGAAATGTTCATTGTT
>Mlf 11450703 11451446|11170 chr2R 11449662 11451059 scaffold_1 5293915 5295327 + 34461|1083 1474
CAACGCCGAAATCATTACAACACACACTCTCAGACCTAA--------TCGAAAAATTCAATGAAAGTAATGGAATATATATGAAATCGTAATTATAAGTTTGAATTATTTGATTAATTCTCAAGTTTTTAGATTTTGTTAGCCACTAAGCTTTAAATTAT------GGATGCCAGTT----AGCGTGCAAATGAACACAATTGATTTGAAGGCTCC-GAACGATAGAAAACAACAATTACCAATTCCCCAAATACATGTAATTCGTAAGGCCTAAGTAAATGTTAACGTGAATTTAATTAAATGGTAAT-TACATTATAATAGTAAATCCAGTGTTCTACTTATGCGACTTATAGAGAATTAA-------------ACGTATTAACTAA--C
CAATATACAAACACTTACAATCCCCACACCCACATCTAAAATGTTAATGAAAATTTTTAGTTGTATTAAAGTTAAAAAAAAAAAGCTCTAATTTTAAGTT-GAATCGTTTAAAATATTCTCAAGATTTTAGTTATTTATAGAGCGTAAGCTGAATTCTATACAGAGGAGTGCCAGCTTAAGATCTTGCAGCTGCA-AGGATTAA---GCCGCCTCCTAAACTATAAAA-----------CCAAT----------------ATTCTTAAGGCATAACTAAATGTTTATGTGAATTTAATTAAACGAAAATACATACACACATAGTAAATTTAAAG-----CGTAAACAATATGTAACTACTTAATTCATCCTCTCCTATGCCTAAAGTTGGTC
>Mlf 11450703 11451446|11171 chr2R 11451268 11451748 scaffold_1 5295731 5296379 + 4920|0 213
CAGCATACATCCACATCCCTATGCCGCCAATCCGA---------GGCGCCAACAACGTGCCGTAAAACATTTTCACA------------------------CGGAGGACGAAGCGGCCAGCTCC--TACAAGGCGGTCAAGCGCGGCAAGAAGAAGTAGTAGAAACGTGATCATCTGTATGCCAACATCTTCCGCATCGCACACTCAAAAACAC
CAGCATACATCCACATCCCTATGCTGCAAATCCCGCTGCCGCCCGTCGCCAGCAACGT---CTAAAGCATCACCACCAACAGTCGAGCGCCACCCGTGGATTGGAGGATG--GGAGCGAGCCCCGTGTCAAATCGTCTAAGCGGAATAAACCTCAATAATAT-GATGTGGGCAAGGATACACACACGCATACCTAACAGCACACACAAGCACAC
>Mlf 11452978 11453117|11173 chr2R 11452534 11453179 scaffold_1 5297530 5298376 + 13590|612 795
ATC---TAAAGTCAATACAGTATATTTTACTAACTATCCGATAAAACAGAAACAGA------------------------------------ATTGCATAC-----TATAAATTTCTGCTAATTACATTCCCAACTGCGTTCAAACGAAACGAATATCGAATCGAAATCATAGAATGCACAGAG
TTCAAGCAAAGTACATACAGTATATTTTACTAATTATATATAAATATGTATACATATATATATATTTATCAGAGTCAAAGAATCCCAATGCAATTGCATATATTAACAAAAATTTCTGCTT-TTACATTCCTA-CTACGTTCAAAT--ACTAAAAGATAAATTAAAA--AGAGAACAATTTGAG
>Strn-Mlck 11461788 11462119|11189 chr2R 11461794 11462500 scaffold_4 2993870 2994582 - 19120|0 367
TTTAAGTCGGTTAAATGCCGACGAGCATAACT-------TTATTACAGATAAAGCAGA---------------TATAGCATTGTTTAAGTAAAAAATATATATATATACCCCAGAGAAA-CTTTACGAAACACTCGA----ATATGAATGCGACTGCGGATCAGCATCCCACCCACCCACACACACACGTCTACCCACTCACAGTAGGATATATGTATGTATGTCTGCATTCAAGCGGAT--GCACTCCCTCCGTT-----CAGAGGGAACTGTACTTAGGCTAGAGGAA-GCTAAGTGTTTAAATTATTGTATCGATTTATATACA-------TATTTACCATACTAATTAAAGTTAATGTAACGAA
TTTATGTCGCTTAAA-GCTGATTTACTTAATTCACTTTATTATTGCAAATATCATTAATTATTTTTTATTTTGTTTTGTGTTGTGTATGTAAAAAA-----AAACAAACCCAAGGAAAATCTGTACGAAACACTCGAATATATATACATACAAATATGTATAAGTAT-----------ATATGGCTGCGAATGCGAACTAATTGTAATCCAAATCCGAATCCAAATGCACCCAACTTTATAGGCACTGGCACTGGCACAGGCACATCGCACTGCACTTAGGCTAGACAAAGGCTAAATAATTAAATTATTGTATCGATTTATATACATAATATCTATTTACCATACTAATTAAAGTTAATATAACGAA
>CG8314 11504537 11504803|11216 chr2R 11504522 11507210 scaffold_4 3040862 3043608 - 80787|15 343
GGGATGTGATTGGAATGCG----------TATTAGCTTAATCGAACAATACTAACCAACTAACAAACGTACAAGGCAACAAGTTGTCGCTACTTGTTGCGCCGCTG-AGTGCAATTT-----------------------TGTATATTGCAATTGCTATTTTTCGATCAATTGTCAACTATATATTTACT----------ACAAATCGTGCATATGTATGTGTG------------TGTTTAGGCCTAA---GCGAAGGAATT--AAATATCCATTTCCGTGGCCGGGTGA-AGATGTGTACTTACCTGACAGCCCTACTAAATGCCTT
GCTGGATCCTTCCAAAACGATGTTACTTACTGTAGCTTAAACGAACAAT------------ATGAATGTACAAGTC------CCGCTGCCACTTGTTG-ACTGTTGCAGTGCAATTTTCAAATTCAATAAGCTATCGATATGCATGCTGTGCTGTGTGTGTGTTTTGTGTGTGTCAGC-GTGAATTTACTTAAGCCTAACATAATTCG-ACATATGTATGTACGTCGCCTTTATCCTGTTCAGGTGCAACATGTAATATACTTACAAATAGTTAATTATTTAACTGAGCAAGAGATTT----TTACTTTGTAAACCTGATGAGAGCATT
>CG8315 11506230 11506356|11216 chr2R 11504522 11507210 scaffold_4 3040862 3043608 - 80787|1916 2097
-ACCTGATATTGGAAACTTTGTAGATAAGGGCCTGTATTTCCTTG------TATCTATTTTAAGTGTTGTATGTATTGTATTTG-----------------------------------------TATTTGTGCTCGGATTA-----AGCTGAATGA---TAAACAAACGATTTTATTAAAC
GACCTAATACTGTA---TTTATATATGAATTTGTGAACGTACTTGTTGCACTGTATATCTGATATTTTGTATATATGTAATTTGTTAAGTTGAAAATTGACGATTTTATGAAACAGTTGATGCTATAAGTGTACCTAAATCATTAGGAGCAGACTGCTATTAAATATTTTATTTTTTAAAAC
>ATPCL 11507289 11509090|11217 chr2R 11507567 11508309 scaffold_4 3043798 3044532 - 26917|0 760
CCCTTAACCACCAGGTCAACTCGGAAAGTGGCTTCTATCTCATGCGACGCATTCTGCGATCCATCTTTTTTTGCTTTTTCTCGTCCACCTGGGGATTATCGTCCTGGGCGTTGCGTTGCGACAGCCACGGCTGGATGACGGAGCCCCAGAGCATCCATCCAGCTCGTATGGGCGCCAAAAGCAGCACCAACCAGAAGTAGTTTGAGATGAGGGCCAGCAGCAGGGTGCCGGAAGTAAGGATGATCAAATCCTTAACGTTTCTAGAG------------GGAGAATCATGTGTAGGCAGAGTACTTCAAAGCTTCTGTGGGTGCACTTACTCCGCGATGCCGCCTTCCATATTTAAGTCGTTGCCGGAGTCCAAAAGAGCACCGCTCTCAGAGTATTTGGCCTGCGACATGAACGCCATAAACTGGTAGGAGCTCCCCAGGATCAGCAACGAAAGAATGTGCATAAACTAATAAAGAACGAGAGGCTGATGATTGAGTTCATTGAGGGGGATTTTCGGCG----GCCTACCACTGAGGTTTTGGTGACTTCGAAGACCAGGAAACTGAGGAGCAGAGCGGGTGCAGCACATCCAATGGCCATGTTCCGGTAGAAAGTCAGTGTAGTCTTGTTTTCCTCCACGATTTGCTTGGCGCCCTTCGTGCCTTGTTTACCCTTTTGCTGGGGCTGAAAGTGGACAAGCGGTTTTATGTAATCCTTGAGAGCGTTATCCCTGTGCTAGT--TACACTTACAGCCATGGT
CCATCGAACGCAAAGGAATCGC------TTGTTTTCATCTCATGCGACGCATTTTGCGATCCAATTTACGCTGCTTCTTTTCGTCCACTTCGGGCTCCTCTGC---GGCGTTGCGCTGCGAGAGCCAAGGCTGTATAACTGTGCCCCACAGCATCCAGGCAGCACGCACTGGGGCCAGTAGCAGCAGCAGCCAAAAGTAGTTGGAAACTAGGGCCAATAATAGCGTGCCAGAGGTAAGTATTATCAGATCCTTGACATTTCTGAAATTTACCACAACAGATTGTTAATTGGTGAACGGAGCAGCTTACAG--------GGTATACCTACTCCGCAATACCGCCCTCCATGTTCAAGTCATTTCCAGAGTCCAAGAGTGCACCGCTGTCAGAGTACTTTGCCCGGGACATGAATACCATAAATTGGTAAGCGGCGCCTAAGATAAGTAGCGATACGGCCAGCATGAACTAAAATAGTTTGGACTGATCAGCAATCATTGCATCTAGCGGAATAATTCGTGTTTGACATACCACAGTTAACTTTGTGATCTCAAAGACCAGAAAACTAAGCAATACGGCGAGTGCAGAGCATCCAATTGACATGTTTCTATAAAACGCCAATGTTGTCTTGTTCTCCTCGACGATTTGTTTTGCGCCCTTTGTGCCCTGCTTGCCCTTCTGTTGTGGCTGCAATT---CGAACAGGATCAAG------TTTATAATATAAAGCCCATCTTAATGGTTTACTTACAGCCATGTT
>ATPCL 11507289 11509090|11218 chr2R 11508310 11511701 scaffold_4 3044760 3048399 - 129157|0 1023
GGCGTGCTGATGAAGCCGCGACGATGTTATATATATATATTTACGTATATACAAGCATATATATTATTCGGAAGTTGTTGTAGTTAAGCACAGATGT----------ATGATGTTAGGCAAAGAGGTCACC-------------------CGCTCCGCTGGCTG------GAAGGATCCATTGAGGTCTATCCGCGCATGTG-----ACTCTCCCCAG---------------ATCCCTTTCCCTCTC-ACTTATC------------------------------------------------CTGCATT-----------------------TAAAGTTCTTAAGTTACCATCAT-TACCCTCGTTGTTTTTGTAAGCGCTGCGTGTCCCCGGAGCCCTTAGGGGTTTTGGAATCT-----------------------AGACCTAGTTAAATCTAGTGCTCCGAGCCGCACAACACACCAGTACCCGGCATAACATTATTTGATACTTTTATACT--TTAGTTTGGATGCTCACAATTGTCTAGACAACAAGAGAATAAATTGTTGCAAAA-GCTTAATTT----------TATTTTTGTCACCCTTCCTTTACTATTTG---TTCTTTAAATCCCACGCTTCCT-TTGCCAGCATCTCGAAGAGAAACGGACACTGCACTAGTTCCTGCTGCACTG---------------AAGCACATTTATTTATAAACAAT-----TACACGAA------------TATTTACAATGCACAAAAAATGGGAGGCA---------GCCTTGA-------GGAAATGCAATTTCCCTCGCAA------------------AGTTTGCGTCTTTAAAAATTCACCGCAATTAAATCGCAC--AAATGCTTTGACTAACTAAAACAATGAATTGTCTTTGTCTCGAGCAGTTTAATTTGCTGAACAATTAACAAATTGGAAACGCACACAC---AACTAA----GCGTAGAATCTCATTAAAACCAGGAAC
GA--------------------GCTTTTGTCCATTAATATAT---------------TACAAATTGTT-GGATGTTGTTGTAGTTAAGCACAGATGTTAACCAACTGCTAGTGGCGAGCATGGATGGCCGCATGGTTCACAAACACAGAACACTCCATTAGCTGTGTAGTTGAGTTTCAATTCTACTATATATACCGATATGGTCCAGCTTACCCCAGTTTGCTCCCCCCTCTCTCTCTTTCTCTCTCTATCTATCTATCTCTTAGTTAAATACATTACATATGTTTACAGTTTCATAACTAAGCCGCATTTACATTCATACTATTTACCAGCATAAAGTTATTAAGTTACGATCGTATATTGTTGACGCTCCTCTAGGCTAT------------AGCC----GGGTTTTTGGAAACTGAAAAAAAAAATATATATAACAAAGAATTAGTGAAATCTTGAGCTCCAA----------ACGACATTTATCATTATAATTTGAT---ATGTTTTTATACTTCTTAGTTTGGATGC---AAATTGTTTAGTCAACAAT-GAATAAACTGTTGCAAAATGCTTAATTTGTTGATTTTATTTATTTCTCAACATTTTTATTTAGTTTAATTTTATTAAAGTACCATGCTCGCTGTTACCA-----------AGAAGTGGAAAGTGCACTAATTAGAACTGCACTGTGTTCCTGCACTCAAATGCACATTTATTTATAACTAACGAATATACACACATATATAAATATTTATTTACAAAGCACAGGGTCTAGTGAACATTTAGAAATGTTTCGGTTAAAACGAAATTGTGATTTCCTTCACAAGGGCTTAAACATTAGCGCAGCTTTCGCTTTC--CAGTTAACCAAAGTATGATCGGATTGAGAGGAGTTAACAGAGT-ATATATCCAATATTGGACGTCTTGTGCAGAGT-TTTTGCTATATGACATAAAAATTGTTCACTCGGGCACGTTAATTAAAAGCGCACAAAATTTCA-CAAAACTAAAAAC
>CG8386 11521754 11521816|11225 chr2R 11516457 11521762 scaffold_4 3053785 3059402 - 142791|5830 5838
GAAAGTCAA
AAAAGTCAT
>CG8386 11521754 11521816|11226 chr2R 11521763 11522479 scaffold_4 3059756 3060437 - 32390|0 57
CTAACTCAACTAGATAAAATT----ACTGGCAACAAAACAATGAACAAAGTTTGATAC
CTTATTTAGCTAATTTTTCTTTTAGTCTGACAATTATAATATGAACAAAATTTTGTAT
>CG8388 11524264 11524309|11228 chr2R 11523391 11528692 scaffold_4 3060740 3066024 - 124764|934 979
CCCTAGGTGACCTTTTGACGCAATAAAAAACCAAATGGGACACCGT
--TTATGTG-CCCTATGACATAATTATGAACTTAATAATTCGGCGT
>l(2)05070 11528667 11528753|11228 chr2R 11523391 11528692 scaffold_4 3060740 3066024 - 124764|5542 5567
TAAACCTGGTTTTTGTAATATGCATA
TAAATTCAGTTTTTACAGTAGTT---
>l(2)05070 11528667 11528753|11229 chr2R 11528729 11531936 scaffold_4 3066250 3069370 - 117552|0 24
ATAGTATACCTACCCAAGTAAGATC
ATGGAATGGATTCTAAATTCTGATT
>CG8397 11530904 11531001|11229 chr2R 11528729 11531936 scaffold_4 3066250 3069370 - 117552|2275 2379
TAGTTGGCCACCAGATAGCTTTT---AGTATTAAGCTTAATCGGAGCGCCGAGCTCCAAGTCAGAGTCAGATCGTT--TAAAT--AGTAAATTTTCATTACAAGA
T-----GCCGTAAATTAATTTGATAAAGCCCTAAGCT-AATAGAGAAAACATTCTCAATGT-ATAGTCAAAT-GTCAGTAAATTAAATAAACTTTCATAATAA--
>CG8400 11539490 11539838|11234 chr2R 11536585 11539515 scaffold_4 3075933 3078966 - 109751|3104 3129
AGAAGAGAAAGAAAGTACTGCATTTA
AGATAAGCATTGAAGAAACGCATTTA
>CG8400 11539490 11539838|11235 chr2R 11539619 11542450 scaffold_4 3079082 3082045 - 86301|0 254
TTCCGCTTGTT-----ACTTTAAGGCCGTTTCGTTCG---ATTGGGTTTAG--TTTTTGCATTAATATCTGAAAATTGTAGATCTACCTATAATTTACGTACTATAATTAAGCAAGCAGCAACA-CTTTAACGAAAGCATACACACCACA--TACATACATATATACCTATATCTAAAGATAATGATAATTTCTAGCTGCAAG-------------GTTTTATACAAA---------TCCATACTAAACATAGAA
TTCTGTTCGTTTTCTCAGTTTTTAAGCGTTTCGTTTACATATTGGGTTTAAGTTCTCTGCATTAATAAGTGAAAAAATTTAGTCT---TGTATTTTTTATGTTAATTTTTATATAGTCGAAACAACAACAACAAAAATATCTACAACAAAATTGAGAAGAAAAAAAACGAACTCTAAGCTTAGAATCATCTAGGAGCTGCAAATTAAGAACAAAAAGTTTTTTACCAACATAATATATCAAAACAAAAAACAAAA
>Dg 11596032 11598134|11301 chr2R 11595823 11596227 scaffold_4 3158243 3158669 - -414|220 445
GTACCCTCCACAAATACACAGGCAAATCAATAAAC---------ACATGCAATAATTATAATAATTATTGAGAA---TAACTAACT--GCGTGAATATAAAGGT---------------ACATACATACATACGTACGTATGTACATACATATGTCCGTATA-GGATATACGTATGCATATATACATGGATTCTAATAAACATTTATATATTTTGATACAAAAGAA
ATATCTTAATTTCATGCGCAGCCAACTTAATAGGCCCCCAAATTGCCTGATAGAGTTGCCAGATTTGCTGAGAAGCTTAAAGAACCTAGCGTTTATTTCAAGGTTCGTTGGTGTGAAAAACAAACACACACACACACACCCACACAGACACGCGCCCAAACACAGACACACA-ACAAGTAAGTACACAAA--CTGATAACTAAATACACAAATTGTTTTTAATTGA
>Dg 11596032 11598134|11302 chr2R 11596344 11598754 scaffold_4 3158777 3161198 - 32724|0 2108
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AT--GTGTCAACGGCAGCA--AAAGCAGCAGCATCAACAACAACAATAAGAGCAGCAACAGCAACAATAATCACTATTAATCAATTCTTAACAAACACAAAAATGAAAAACA-------ATTTACAATCTTAATCAATGATATCTTTCGCACCCTCGATTTCAACATTATCAACGT--------------TAACTCAAAAGTTGTT----------CTGAATTTGAATTGAGGTGCAAGTCGACAGCCCCGCCCACAATTAT--------------GATAATATTTATGAA-AAGGTATTATGTACGGACACAACTGTAAAACAATCA-----------ATTAACGATTTCAA----TACGCGACTTGGCTAACAACTTAAGCTAAAACTAAAAAAAAAAAAAACTAAACATTTAAGTAAAACTAACTATGCTGCATATAATTTATCTAGTATGTACCTTAACTTATATGTACACACACACACACAAACACACACACATACACACTACACACTTTAATAAGCAAGCGAAAGAGCTTGAAAAACACACACA------CACGCGAACCCTTTTATAGGATAGCATTTAAAGCACGT-----TAAAACGCGGTCAGCCGCCGTTTG------ACCCATGCCCTTTGCCCAGGCTCGACCCTTATGTATCTAATTATTTATTATTGTTAATTAATGTGCAGCCAACAGACGTTCGGCTTGAGCTATTCAAGCCGAATTGTTTAGTCCCTCTTTTATGGCCAGTACCATCCGAAGTGTAGCAGCAAAAGCTCACCCTAGAAATTCTCTCCCCCTTCAAAAGCTGGCCGCTGCCCAGGCAATTTCTATTTTTCGTTGAGGGGGCCAACACCTTAGCCACATTCTGTATGCAGCTCGAACTTGTTGGCCGTCTAGTATTATATCATATATATATATATTTATAATTGCAGTCACTTG-----------AGCAGGGGGCATCTC--------GCTT--CTATTTTGCATTTAGTTTTTAAGAAGCAATCGTTTTTATAATGGTTAACTTTTTAAAATTATGCTATACTC-GATACAGCT-GCCATTTGAATAGTGAGTATGTTCACACAATTCATTAACAAACAACTACAAATCAAAATAATAGTACATATTCCGAATTCCTATAGTTGCCCCACAAGTGCTTCCTCCATACCACCAAAATCAAACCCAAAACGTAATGAACTAAAACAACAAAACACAAACGCCCACACGAAACAACACACACACAAA-------GTATATCAAA--TCATTACTGAAAGTAGTCCCCTTAGTTATTAATTGATTTTACAAACCCT--------------------ATATGATTAG---AATTTACACGTA--------TTTATACACATATATTAAACTTAAACTTAAAATTACTTGAGAAGGAACC--------------ATTTGAATTGTACTAAAAACTGCATATTTTAGCTATGTAGTGAGTATGTCCATTGATTTTTATATACGAGACCGTCATCTATG---------TAAGTTAGAGCAATATTTTGTCTGAGAAAAACAAATGAA--TGAAA---------AAAATCATTACGAGAAACAAATTACTTAATGAACAAAAGAAATGAAAAAAAGAAGCAAAGT------TAAAGTAAATGCGACCGCAA-TGCGGCGTAA-AGCCTATTAAATTAAGCATATAGCATATATGTACGATTATGTGTACTAAATTGAGTAAATTGTATAAGCTCATTAAGCCTAACATATTTACAC--TGTATTTTGTAA------------------------CAACAACAACAACAACAACACACACACACACAACAAT-AACGGTATCAATTTATTTTGAAT--AAAAAATGCCAAAGATACATTTTTATTCTTAAGTTTAATGTTAATTTGAGCACATTAATTGCAAATGTGCATTAAATTGGATAGTTAC-TACGTTTATGTAGTATACAATTTG-------------------TGAAATCTTGTGACGTCACTTTAGCAGCAGACGTTATCAACTAAATAATCCCAGAGTGTAATTAATAATTGCT-------CCATGGCTGAGT
>CG8414 11614165 11614232|11318 chr2R 11613844 11617561 scaffold_4 3178411 3182090 - 49072|329 396
AACTGAGCTTACTGTAGCAATCGCAATCGGATAACATTGTAAATAAAGTTAGGTTTATTAACACAAGG
AGC--------CTATGTTAACAACTTTTGTACAA----ATGTATAGAGAAATGTGTATTAACTGGTTG
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AACAACTCTGAATCCT------AGCCAGGAGATTAACCCA---------------------------------AAAGCCAATTGCCAGGTGCGAAGGGCAGAGAATTGGAGGATTTTTAAAC-------------------TTATGTATGTACGTATTTACCCAGAATACACGCA-CATGACATACGTTACACGAGCCACACATTTAACTAATCGAATAAATGTTGAATTTA-----ATGTATACTAATATTATAAATCG-----------ATCGATCGACCTAAGAAGTATGTAAAACGCGGGAACATTGCAAATTATGAAATATGAATGAGAATGTGCGTTCATTTCAGATCCAAGCCCAAATTGA---TAATTTAAGTCCACGACA----------GCCGATGCATTTGTTGTTTAAGTTTGAGAAAAGTCTATTGTTTATATTGTTAAGGACACACGTGTTACGCCTAAGTTTATTTATTATTAGTTTAACGAA-----------------------ATCTGTTGATTACTTTTACCACAAGAAACCACACATCACGTTCTCTAAGCAATCACCATGAGTTCCTCTCATCAATGTTAACTGCATCAC------------------------------------CGGAAA---------CAAAATACTAACACGGCTTTAATTACTCTGTTTGTTACATGATCCCAAAAAACAGTTGAATGGACTACCCATAATTACTAATAATTAATTGTTATTGCGAATCCTGCAACCGTTCGAACCAAACAGATCGACTGACGAAAAAAAGAAAAACAACAGCTCC--------AACACGAAAACGAATCAAATGCGGGTAGAAATATA--------ATAGAATTGCTTTCGCCGCGAAAGTTAAGCGATTAAAAAGTACGTTTTAAGAGAAAAGGCTTGGGAACTAGATGTTCAAAGCAATGTGTCGTGTCC------ATGTTGTTTCGAAAACGACATACCTGTTCGGGAATAATATTGTGAAACCTAATACCTAATCGATGAAAAACCAAAACATTTT
AACGAAACTGAGTCCTAGTTGAAGCCAACAGAGCAAGCTATAGAAACATATATGTATATGTATGTATATAAATATGGACAATGGTCAAGTGTACATCATAGAGAGCTTTAAAACTGTCCAACAAGAGCGAGGAATAATGTATTATGTGCATGTATTATTATTATAATTATAATTATTCTGGCAGGCGCAACGCAGCACGCACATTAAACTAATCGAATAAATGTTGAATTTAAACGTATGTATACTAAAGACATCAAACGATATAAGACGAATCGATTGATTTATATTCCGATTGATTGATTGATTGATTGTAATGCACAGAAAACGCAGCAG-ATGTACAGCCAATGCAT-----TGTTCAATGTGATTTTTGTTTAAATGTACTATATATATTTTATGCGTTTGCATTTGTTGCTTAAGTTTTATAAAA------TGTTTAACTTGTTGA------------CTTGTCTAAGTTTATTTATTATTATTGTACTAAGTTAAGCTGTTCTGTGTTTTTTTTTTTTGTTAATTACTTTT---------TAACATTCATGACATTTGCTAAGC-ATCACCATGAGTTCCTCACGTCAATGTT-ACTGCAACACAGTCTATGCTATTTGTTTTTAAACAAACAAACAAAACAAAAAAGAACAATTCAAAATTGTTAAATGAATTCAACTAGTTTGTGTTTTAAGCATAACCAAACCAAAAT--AACGAGCTATGCAAATTGGTAAACGAAACTTTGTTATT-TGTATGTTTAATTTTTTTTTGTCAGTTA-ATTGAATG-CGGGTAAATGGAAAGCAAGCTTTCCACAAAAAAAAAACGAAAAAAAAACAAAGAAAATGTTAAATATATATCAACTATGATTATGTATTCCCCATGAG----AAACAATAACTAACTAAACTAGAAGTTAGTA-GCCCGAGTATTATAATAGAAGCACAATCTGGTTAATCCAGCTGAAGATTGTTTTGTTTTTGGCAT---TATTCG--------ATTTTGAGCGCT-----TCGAGCGTTTCAAAG--AAAACTATTT
>Ric 11622303 11623619|11326 chr2R 11623223 11624748 scaffold_4 3188066 3189861 - 54153|0 646
ACCAGGAGGCGGATTCCTTG------------AAATGAGTGCAATATTAACCACAA----AAACCAAGTA-----------------ACTTTTGTTT-GCTATAT-TTTGTATATA----GCACATACCCATCAGATACA-ACATACA------------------------------------------------AAAGAGAAATTAACCGATCGAGGAGCAGATAAC--TAATTGTTATGGCCA------------------------CAGTGGTTTA---TTTATTATTTGTTATGG----------AAACTATTTAAA------------------------------GTACTTGTTGT-------------------TGGCCGGAAAGGATAGCGAGGC-----------------AGTAGATCAGCGATAGA-----------------------GTATATCAATACGTTTAAGCACCGATCCAAAAGATACATATTA---ACAATGCACGTACATATGTTTATGTAGTAAATATTACTAATGTTGATTCCTAGACGAGAGCGATTAAGCAAGTGT--------GGCAATTG-------------GCTAAAGCTCAAAA----------GCATTTAAATTC
---AGCCTGCAAATTCCTCGGTTCGCATGCGCAACTAAGTGCAATATTAATTAATGCGTTAAACTACGTATATATATAAATATATATATATTTATTTGGCTATATATATATATATACGGTTTGCACACCGATCGTATATATATATATATGTATCTGTATATGTTATGTGTTGACACACCTAGACGTCTAATCATTTAATGAAAAATGAATTTATCAAATGCGAAACTATTGTAATCGTTCAGGCCAATGGCAACAGCTAAGCGACATTGTCAGAGCTTCAACTTTTGTTGTTTGTTTCCATATATTCCTTAAATTATTTAAAACTGTTTTCATTTGTTAACTATGCCACATTGTATTTGTTGTATCTGTATTGTTAAGGTGCTAGACGCCAGGCAGCGCGACGCACAGTGGTACGAAAGAGAGTATATGAAAGAGATATATATATATAAATATATAGTTATGTATATCAATATGTTTAAGCACGAATCCAAAAGATACATATTATAGCAAATGCACATACGTATA--TATATAGTAAATAATAAGAATGTTGATTCCTA-ACGCAAACCAATTGGCAAAGGCAAAGCAAAGGCAAATGCAAAAGAAAAAACGACAACAATCAAACCGAAAGAAATGCATTTAAAATT
>CG10731 11660769 11661746|11359 chr2R 11658099 11660791 scaffold_11 1320121 1322791 - 110880|2718 2741
ATAAGAATTAA-AATAATCATATC
ATAGGTATTAACAATAAGTTTCGG
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TGCACCAATACGGAAATGCTCTCCGCTGATCTGAATCACATGCGTGAACGTTCGGCTTGCATTGATCGCTTCTCCAAAATCTACGGCCGCATGCCACTTCGCACGGTGGAGTTCAGAGCGGACCCTGTGTTATTCCGGGACAATTTCCCGGACAAGTTGAAGCGTTACAATGATATTGGTAGCTTATAAGGGTCCTTAGCTTTGAGGCCAACATTCCAGAGGAACCTATGCAGATATACCAAAGACTTCT-GAGAATACCGCTCAACTCTAATGGAAATCTAATGTTCGTTTATATCATAGCAATACCTTCTTAACGGATAAAGAGGCCAACTTATCTGG
TGCACAAATACCGAAATGTTGTCAGCCGATTTGAACCATATGCGTGAACGTTCTGCTTGCATTGATCGGTTCTCAAAGATCTACGGACGAATGCCTCTTCGCACGGTTGAGTTCAGAGCTGACCCCGTTCTCTTTAGAGATAACTTCCCAGATAAGCTGAAACGTTACAATGATATTGGAAGCTTGTAAG------CCGCTATCATGCAAACA-------------TATTCATATATGGACATAATTTGTAGACGAAATAGCTAAAGACTTATCCAAAGATGATATACATATAAATATGAAC--TTCTTTCTTAATG--TTACGAGTGCATTTTAAATGG
>CG10731 11660769 11661746|11361 chr2R 11661434 11661925 scaffold_16 2604946 2605448 + 5737|0 385
CTATGAAGTTTGGCGAGAGTTTCCTGATCACATTGTTGGCTTTCCCAGTCGAATTCATGTTTGGGAAAATGTTACGATGCG-----------------------------------------------------------------------CTGGCACTACGAATCGGAGTGGACGAACCAAATATCAATGGTTCTTACCGGCGCTGCTTTCCATCACAAGTACTGGAGTCACATGTACACACATGCCATGCCG--GGTGATATCAAGGATTGGGTGGATGAGCACATGAATTGCGAGGACATTGCCATGAATTTTCTGGTGGCCAACATCACCAACAATCCGCCCATTAAGGTTACTCCTCGAAAGAAGTTTAAGTGCCCGGAG
CTACACGGTCTGGCGAGACTTTCCGGAACGCATTGTGGGCTATCCGGCGCGAGCGCATTTCTGGGATGACTCCAAGGTGAGCGAGGGACAAGAAGGGGCTCACAATATACGAACTGCGGCTGATGAAGTTGTTCTTATTTTTTTTAGAATGCCTGGGGCTATACGTCCAAGTGGACGAACTACTACTCGATCGTACTGACAGGGGCGGCGTTTTATCATCGCTACTACAACTACTTGTACACCAATTGGCTGTCGTTGCTGTTATTAAAGACT--GTACAGCAGTCCTCCAACTGCGAGGATATCCTAATGAACCTGCTGGTCTCGCACGTGACCAGAAAACCGCCGATCAAGGTGACGCAGCGCAAGGGTTACAAGGATCGGGAG
>CG10731 11661805 11661964|11362 chr2R 11661926 11662795 scaffold_11 1324300 1325182 - 31643|0 38
TATCCACCTTTCCATCTATATCGAAACCGCTGAAAATTC
TATCTACGTTCCCAACAATATCCAAGCCGTTGAAGATAA
>CG10731 11662029 11663663|11362 chr2R 11661926 11662795 scaffold_11 1324300 1325182 - 31643|103 887
GCGACAA------------CATGCACATGCGACGGCCCAGAGGAAGTTCCTATTGGTAGTAGCCCAGCTGAACATTCTTCCGCGCTTTGTGAGGACTCTGAGGGAGTTATCTCTGGC------TCACAGCGAGCAATTGCTTCTTTTGGGAGCCTGCGAGAACTTGGATCTCACAATGCGCTGCCCTTTGTCGCAGCACCACAAATCGCTGGAGTATCCTCGGCTGCTGTCTCGCGGTAAATTTTGCCTGCTAGGTCGTAGTCTTCGCATGGGTCAACCCGATCTAGTAGAGATTATGTCTCAGCACTGTATTCCCGTAATTGCCGTGGACAACTATGTGCTACCCTTCGAAGATGTGATTGATTGGTCATTGGCCTCCGTTCGTATACGCGAAAACGAACTGCATTCCGTAATGCAGAAGCTAAAAGCAATATCGAGTGTTAAGATAGTTGAAATGCAGAAGCAAGTGCAGTGGTTGTTCTCCAAGTACTTCAAAGATCTGAAGACTGTGACACTAACTGCTCTTGAGGTGCTGGAGAGTAGGATCTTTCCGCTGCGAGCCCGTAGCAGTCGTCAGTGGAATACCATTGATACCAACGCCCGTTCCACATTCAATCCCCTTTTCCTGCCGTCGCTGGCACCAAAGTCACAGGGCTTCACCGCCGTCATCCTCACCTACGATCGCGTGGAGAGTCTGTTCCTGCTGATTCAGAAGCTCGCTGTAGTGCCATCATTGCAAAGCATTTTAGTGATTTGGAATAATCAGAAAAAATCTCCACCGCACT
GCATCAAACAAACTCAATTCCAATCCATAACGGAGCCCACCGAAAATATTTACTAGTTGCAGCTCAGCTAAATCTTTTGCCGCAGTATGCACGGACTCTTACGGAGCTGATGTCGACGGCGAATAATGCTGAGCAAATGCTTCTGCTTGGACCTTGTGACAACAATCAGCTAAAATCTCGCTGCACATTAACGCAGCATCAGAAACGCTGGGAATACCCACGGGTACTTGGCCGAGGCAGATTCTGCTTTATTGGTCGCAGCCTGCGTGTTGGACAGCCCGATTTAATTGAGATAATGTCACAAGGCTGCATTCCTGTGATAGCGATTGACAACTATGTGCTGCCTTTCGAGGATGTGATCGACTGGTCCTTGGCAGCTGTTCGTGTTCGGGAATCCGAGCTGCATTCTTTTATACGCAAATTGGAGTCAATTTCCAATGTAAAAGTTGTTGAAATGCAAAAGCAAGTTCAATGGCTGTACAGCAATTATTTCAAGGACTTGAAGAGCATTACAATAACTGCGCTGGAAATACTTGAAAGCCGCATATTTCCTCTGCTGGCTCGCAGCAGTCGACAATGGAATTTGGTTAGACAAAATAGCCATTCAACCTTCAATCCGCTATTTCTTACATCGCTTGCCCCAAAGTCTCAAGGGTTTACAGCTGTCATTTTGACCTATGATAGAGTCGAGAGTCTATTCCTCTTAATCCAGAAGCTTGCAGTTGTGCCATCGCTTCAAAGTATTTTGGTTATTTGGAACAATCAAAAAAAGATGCCACCACATT
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TGCCTGAACATCTACAAATGCGAGCACGACCGCCTAAAGGTCTACATCTATCCGCTGCAGGAGTTTGTTGACGAGCAGAGCGACAAAACGGCCACCACCCTGTCCAGCGAG-TACTTCCAAATATTGGAGGCGGTACTAAAGAGTCGCTACTACACGTCCAATCCGAACGAAGCGTGCCTCTTTCTGCCCAGTTTGGATCTCCTGAACCAAAATGTCTTCGACAAGCACTTGGCGGGCGCTGC---------CTTGGCTTCACTGGACTTCTGGGATCGTGGTGCCAACCACATCATCTTTAATATGCTGCCCGGCGGAGCTCCATCCTAT----AACACTGTGCTGGATGTGAATACGGATAATGCCATCATTTTTGGCGGTGGC---TTTGACTCTTGGTCTTAT-CGCCCGGGCTTTGATGTCGCCATTCCAGTCTGGAGTCCACGATTGGT
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>CG10731 11662029 11663663|11364 chr2R 11663233 11663822 scaffold_11 1325617 1326229 - 3621|0 445
ATTTATCGATTCATTGCTGAATTTGCTTATATTAT---------TAACGGTCTATAGCCAACACTGTCATATCAGTATTTTTGGTTGACCGTTATACGGTCATGTTATCTTGGGAATAAGAGAAAAGGACAATATGTGAAAATATCAATAAAATGACAA-----AAATAAAGA-ATCTGCTGAGTTTTGTGACCCAGTCACGGGCCATATCGCACACCAATCCCAGGGAACATATACTTAACTGCCTGACCTATGGGCTACTAGTCATTGTGGCGCTCTGCGCGGGTTTTCTGCTTTGGGATCTCTCCAGCAGCCCACGGGATGGATTCTTCCATGGGAAAAGGGACTCGCACACATTAATCCTCGACCTGGAGCACATCCAGGAGCTTGCCGTAAATCCGGAGGCCGAACAGCGGGCACGGAATGTAAACTGCACCTTCTGGGAC
CATCACTAGTTTGTATGCAAGCTTGCTTCTGAAATCCTTCCATGTAATGGTGTATAAGTGATGTGAGTCCATTAGAAGGCAGGGCAAGATGTTTAACAGT-----TATTATGATGATATATAAAAAGG------TGTTAAGCTA--AGTAAACTGAAAATGCATAGGTACAAATGCTTAATAAGCATTG------AACCGCGAAGTAAAACAATGCATCATCCAAAGGAGCAGATTTTAAACTGCTTGACATACGCACTTTTGGCAATAGTCGCAATCTGTGCAGTTGTGCTGCTGTGCGACATATCCAGC---CATCGAGATCGATTCTTTTACTCCAAAAAAGACCCAGTTGTACTTGATTTAACCATATCGCATGCACCAGAGGTGCTGCTGCGCCCGGACCCGGAATATCGTGGCCGGAATGTAAACTGCACGTTCTGGGAT
>CG10731 11663789 11663865|11364 chr2R 11663233 11663822 scaffold_11 1325617 1326229 - 3621|599 639
TTTTGCAGTGTTGAGAAA-------AGCTAAGGCTTGCACA
TTTTGCAATTTACAAAAAGCATAACAGGCAAAGCACACACA
>CG10731 11663789 11663865|11365 chr2R 11663829 11666398 scaffold_1 3954090 3956629 + 22783|0 42
TCC----CCAGCAGAACACGAAC--TTATTGGTTTGGTCCAAT
TACTATATCAGCAATATGCAAAATGTTACTGTTTTTGTTAAAT
>CG10734 11672274 11672319|11373 chr2R 11672074 11672788 scaffold_9 5036717 5037451 - 7|212 257
ATTTATTGATGATATGTAAATGGGCACTGATATTCGAACGAAACAT
ACTATTCTATTCTATTCTATTCAATATTAATGAT------AATAAT
>CG8435 11684463 11684530|11384 chr2R 11684529 11688126 scaffold_1 3982259 3985742 + 121650|0 1
CC
CC
>CG8441 11699977 11700026|11395 chr2R 11696833 11700883 scaffold_1 3998291 4002943 + 128158|3774 3827
TACCTCCTGTTC-TATTCCTATCAATAAACCGTTTAGAGTA---ATAAAACACA
TGCTTTGTATGCATATTTAAACAAATATAGCTTATGGTTTATAAGTGAAACAAA
>CG8445 11708920 11709297|11398 chr2R 11708825 11710772 scaffold_1 4010531 4012423 + 80776|111 532
GCGACCAGACGACCAGCATGTACATGTTTTTAAGAATACAGTTTGCATTTTTAAGACCATTCATTCCAGTATTGTTTTTCTACAATTTCCCCACCAAGAAGCACC-----ATTAACCCATAAG--ATCGTATAAGTTTAGTTTTAGTAACACTCAAATGCGGTTCTTT---TAAATACGAAATC--------AACTTGGCAGCTTCATTTTTATTTGATCGCAATTCGATCTTTTTAATAATAAAAAACCATTTTGTTCGTATGAAT-CGTTTTTCATGTGGTCCTTGATAGAC-GAAGGACCCAAATGT-------------------GTATGCATTAC-ATATGAATA-ATATATATATTTTCTGATATATATCTATATGATAGTTGTATAACAAAAACGTAATCCTTCAA---TAATTC
-----------------ATGTGCG-----CTGAGAGAA------------------------------------TTATTCTAAATTGGTACTATCAATACACACCTAAATATATATATATAAATTACTATATATACTTAATTTAATTAGTAACTAAGTTTAGTTATTGACATCGATATCGAATTGCATTTTGAATTTTTTGGTTTTTTTTTTATTTAATCA----------TTTTTAATAATAAAAAA-CATTTTGTTCATGTGATTAAATGTTTCAAGTCCTTATTGGCATTTAAAAGGACCCAAATGTGTTTGTGTGTGTGTATGTAGTATGCATTACAATATGTTTGTATATATATATTTC----TATATATCTATATGGTAATTGTATAACAGAAAAAGAACCATTTTCATTTGATTT
>shark 11714286 11714587|11403 chr2R 11714371 11714624 scaffold_1 480436 480725 - 3154|0 262
GCCAGTTTCCATTTTCCATTTTTTCCGTTCTGAGTGCAATTTTCTGTA-------GCTATTTATGCAATGTCTTCTATTTCGTTTTC--------AACGTATTAACGATCTGGAA-------------CCCACAGATCACTATTGTTGTTCCGT-ATCCTAGTATTCATGTTTATA-----GCTTGTA------------ATATATTTTTTAATCATATGTACAACCAATTTGTGTCAAAAGAAAGCGAACAAGTGCCTTAAA
AGCAACTACTCATCCCC-----CTCCCATAAATGTGCAATTTCTTTTACACATACTTCATGTATTCATTGTTGGCTTGGTTGACTCCAGATATCTAATGTATTATTGTTTTTGTAGCTCACATCTTTGCCAGCATATCCAAGCTGGTATCCTGTGAGCCTCCTCTATATATCTGTATATCTACTTGTACCATACATATACATATGTATTTTA--TATCTATGTGAACAATTTGTGTCAA---ATAGCGAACAAGTGCCTTACA
>mrj 11718185 11719159|11408 chr2R 11718186 11719274 scaffold_1 484428 485763 - 10762|0 1288
CTAATTAATTAAAT---------------------------------TCACACATAATATATATATATATAAATATCAACAAAA-------------------------------------------ATCAACAAAGGAAAAGTCATAAATGTAAAGCCGAATGAA--TATTAACAAGCCCAAGAAGAACTCGGA------ATTCGTTACCGCTTCGAAATATGATACTTTTAAAACTTTAAAACTTTGCTCTACACTACAATTTAGTTAC-TTTTAATGGACC---------------GAACAGCACCATAAATGAATCAACAGCCAGCGAAAGGACCA--AGCAAAAATTAATCAACAGCAGAAACACTAACAGCAGCGATATCCACACCAAAAATAT-----------------------------GGAACATGGAACAGGCCATTGAATTAAATCAAAATTCCCCGTAATAGCGAAATATGGAAATTT-------------------------------------------ATTTTTTAAGCATAGTTTTTGAACACAGCTGCC----CTACAACAAAA---TTGCACCGGTG-------GAATAAAGCCAACACCATCGAGCACCACGAGAATTAATGGAAAAACCATACTGAAAATTTAGCCAATAAGTTTTAGGGGCCAGATTTTAAATATGCTGTTCGGAGCGAGTGTGTTTGGGTGTATATCTTTTTGGGGGGGATAATTATGTATTCTTCGTGTATGTATCGTTAGTCACTTAAGTTGCCACAATACTTACTAGGAAATCGAA-----------------AGCGGAGAAATTCAATCTAAGCAATGAATCGGAACTAAAATAGGCTTTGCGTTAATTTTTCTTTACATTGTAAGGGATATGAATATGAAT-ATTCTAAACGATGACATTTA-----------ATTTTTATAA----------------------------ATATTTCATAACCTAGATTTC----TTTATTAATTTCGA-TGCTGTATGCTAGCGTATAGTCGTTTTTTAAATGCTTAAGACTA------TTCTCACATAACCTGCAGAGCGAAAAGAAAATTAATCGTAA----------------------------------------------CATAATCGCCAATAATTTAATACTTTGTTAAGCGAAAAT--TTCATAATGAGAATAAAAAAA-----AAAACACATGAGAATGAAAATATACAATAGATGCGAAACA------ATTAAGACA
CGAATTAATTCAATGGGAAACAACACAAGTGGATAACAAGTTATTTATCAAAAACAAAACAAAACTAAAAAAAAAAAAGTAAAAGCTGGAAAATAATAATAATTCTATACGAACGCGCGGACATAACAATAACAAAGAAAAAGTCATAAATTAAAAAAAAAAAAAAACCAAGAACAAGAAGAAGATAAACGCAGATGAACGCTTTCTTAATGCTTCGTTGATAAATATGTTTAA-----TGAAA--TTGTTCTACATTAGAATTTAGTTATGTTTTAATGAAACCGTTTATTTGGAAGGGAGCAGC--------------AAAGGCGGGCGACGGCAACAGCAGCAGAAGC--AGCAGCAGCAGCAACAGCAACAGCAACAACAGCAACAACAACAACACCATCAGCAGCAGCAGCAGAAACAACAGCAACAACAACGAAATGGCAGTT-----AAAT--AAATTACTTGTAG----GGCTTATGGTTATTTGAGTGCAAATTTGATTCGAAATTCTGAACATGCAGGCAAAACAAATTTGTTGTCAAAAGTTTCGAACAAAAAGGCCTGAATTACATTTAAATATTTGAAGCCGAGGTAGCAAGAGCAAAGCAAACAAAATAAAGCA-----------AACACAACTGAAATGCTGAAAACT---CTTAAGCGATTTAGTTGATAGGTTTTTGAT---TTGGGCGGATCCAGTCTTATGCTGTTTATTGTTTTTT------TATAGTTAT------TTCA-------ACCGTTAGTCAATTAAGTTGCCACAATACTTACTACAAAAGCCAACAAAAACCAGCAATAGCAGCGGCGGCAGC--GGCTACGCACAAAAC--GACCAAGAAAATGCGTTTGCTTTGCTATTTTGTACATTATAAACAATGCAGA---GAATAAATCTAAACAATTATATATACACACATACACATAGTTATAATATTAAATTAATGCAAAAAAAAAAAAACACATTTCTGACATTGAATGTTTATATTTAATAATTTAAACTTTTCTTTCATAGTCTGTAGTCGTTTTTTAAATGCTTAAGCTTAAGAATTTTCTCACATAACCT--AAAATGAGAACAAAACAAATTATACATATATAAACAACGTATTGAACAGAATGAGACACAAAACAACTAATCATAATCGCACACAACTTAATACTGTGTTTTTAGTAGATCATTCTCAGCTAAAACAAAAATAAATTGAAAAAAAAAAGTAAAGAAAACAAACAACAACAAAAAAACACTAAATATAAAAACA
>CG15706 11738077 11738159|11436 chr2R 11737867 11739823 scaffold_16 1733807 1735819 - 72861|251 338
ACATAGTATCAACACATGCCATTTTTATTG-----CATATTTTTGTACTAATTTTTTACGTTAAACAAAAACAAAGAAAGAACGACAA
GTATATTAGTTCTAGTTCCCTTTTGTACTGTTGCACACGTTTTTATATCATTTTCTAACG-----CATATCCAATTAAA-------AA
>CG15707 11752964 11753196|11444 chr2R 11752607 11753042 scaffold_16 1753538 1753997 - 7885|405 483
GGACTCTTTTTGTTTTTGAATTATCACTACTTCGGAGCGATCCCAATAAACTGACTATGTTCGAACATGTTATCCAGAT
GGACTATATCCATGTAGTATCTATCAGTTCATTAGATAAGTCTTAATAAA-------TGCATAGAGCTGTATGTCAAAC
>CG15707 11752964 11753196|11445 chr2R 11753115 11754099 scaffold_16 1754954 1756057 - 17109|0 81
GTCGGGATAAGTCGTCGGAATAATGTTAATCAAATTTAAAGTAGACATAGTTTACATAACAATAGTTCCTAAGCTATTTGTA
TCTGCAGCACAGCGAC--AATAGTGTAGAACAGGCCTGAACGAACACTAACTATAGTAGCATT--TTCTTTACCTATTAGTA
>CG15708 11755798 11755889|11447 chr2R 11755212 11755989 scaffold_16 1757056 1757826 - 2767|603 700
AAGGACTTTGAGTGGGCGTAGTACTTATTAAATTGGTTGTGTA--TACATCTGGCTATGTTTTTTT----TTTTTAATAAAAAACAAGTTGTTCGATA
ATGTGTTGGCAATGTATCGAGTATTTAAAAAGGCCAGTATGCAGATACAACTTGCAACGGTCTTTTCATCTTGCTTATGGAAATCAAAAAGTT----A
>Cng 11758008 11758794|11451 chr2R 11758229 11760025 scaffold_11 565002 566846 + 59364|0 736
GTCG-------CCGGAAAACGCGCTGGAAAAGG------CTCGGAACCAGTTGCCTACCGCCCCCGCCGCCGTCAGTTCATATCTCCAGCCGAGGCCGGAAAATAGTGATAAATGCATTAAACTTGCAGGAGTT------------------------------------------------------GTCTGGGCGGGGA--------GATAATCCTTTTTGGCCCGCAGCCAG----------------------CAGTTTTTTGGGCTACAAA---------AAGCGGGTAAATCAATTTTTAATTTTTACAATTAGTCTATAGA-GCTATATAGGAGCTGGGGAGCTGGAGCTGAAAATTGGGTGTGGA--------------AGTGATGCGCGGGAG---------------TTGTTTGTTGCA-AACTTTATAAATTTATTAGATGATTCCAAAAACTGAATGTGCCTCAAAAAGTGTGTGCGTGTGTAAGAGAAAAATTGGGTT-----------------------AATTGTAATAGCATCAGATTATACCCAACTACGATTCAGTGTTTGTACATAAGTTAAGCATA---GTCCAATTTTACACAC-CTAGGCTAGGATGATTTT---TACACACACCGAATTGATTTAGCGCACCATGATGCAAC----CAACTGACCGATCCGACGAGAAACATTTCACATTAACTGACCAAGAAACGATGGACAT
GGCGACGATGCCCGAACCAGGCGCCCGAGCAGGGACATCCGCATGGCGACATTCCAAATGTCGCCTATTCCATATGCCTGCGTTTCCCGCT-CTGCTGAATGATGGTGATAAATGCATTAAGCTTGACGGAGTTACGAGCATGGAGAATCATGCTGCAGATTAAAAACTTGCAACGGAGTAGCTTGTGGTTGGGACTGGGACTGGGACTGGGACTGTGGCTGGGACTGGGGCTAGGGCCGGGGGGAAGGTTTGCTGCGACTTGGCTGGGCGCCAACTCGACGCGTGCGCGTGTAAATCAATTTTTAATTTTTACAATTAGTTTTAGGACGCGCCAAAGCAGGTGCAGGGAGGGAGGGGGGAA-GGAGTGTAGAATGTTTGTCAGTCGAGTTTTTCGAGTTAGGTTTTGTTTTTTTTTTTTTTTGTAGCGCAACTTTATAAATTTATAAAATGATTC---AAACTGAATGTGCCTCAAAGTGTGTAAAAGTAGATAGGTTAGGAGCCGGCCTGAAACAACGCAGTGGGACAGGGGAACTGCTATGATTCGAGA----ACTCGAACTCGAACTCGAACTTAAACCCAACTAAAGCACAAATATGTGAATTAACTTGCAAGAGACAAGAATCGTTGTACATATGCAAGCTGAGCTGACATTGTG------AATGCGACTCGGCAATAGTCCAATTTTACAAGCTAGATTTTATTTTTCTAAATCTATAACCGTTTGAGAT
>Khc 11781828 11782126|11478 chr2R 11777079 11785432 scaffold_11 589297 597635 + 373259|4961 5273
ATCCAATCACCACCTGTCGCCGCCCAGTTCAGCTCCGCTTTAAACTAAACTAAATGGATTACGTTATACATACTTAA-CATAACTGATAATTGCCTTCGCTTAGATGAGAT-GTGTCGCGATCATGTGCAGCGCTTTAAATATACATACATATAATTTAATTAAATAAATGAAAGGAAACCGGAA-----------ATTAACTAAATTTTACAAACCGAAAATAATAAAACCCACAGATATGTAAGGACATCTATATACG-TTAAGAGTATTTATAAACTTTTCAAACATAAACCTAAATAAAAGTCGCAGAC
A---------------TCGCCGCCCAGTTCAGTACAGTTTCAGTTTA---------GCTCCGCTTTAACCTATTTAACCATAA--AATAATTGCCTTCGCTTAAAGAATGTCGTTTTGCGATCATGTGCAGCGCTTTATATATAAATATAAA-----TAATTAAATAAATGAGAGGAAAGTAAAAAAGAGGAAATTATTAACTAAATTTTACA-----ACAACAAGAAACCCCACAGATATTTAAGGACACATAAATAAGTTTAAGCATATTTATAAACTTTTCAAATATAAACTTAAATAAAAGTCGCAGAC
>CG30324 11802451 11802508|11493 chr2R 11802434 11804139 scaffold_11 611529 613249 + 6139|17 74
TCCTGGGCAGGACTCAATTGGGGAAAAAAGAGTTTAATAAAAGTTCGGAATGTGAGAA
TCCT--GTAACAATCACTAGGGGAATAAAGA-CTCGAGATGAGTTTGTATTAAGCGCA
>CG7747 11807123 11807172|11498 chr2R 11806194 11808979 scaffold_11 620090 622942 + 111496|1026 1076
CCCATTGTTTTCCAA-AAATAAATATTTAAAAGACCGTTTTAGAAGTAAAA
C----TGTGTTCAAATAAACACATATTTTTAA--------TAAGCGTACAC
>CG8060 11831175 11831547|11528 chr2R 11830239 11831347 scaffold_34 1251178 1252210 - 41629|955 1145
GGTAACAAACTTTATTGC------------ATGAGCATATAGATAATACAGATAGATATAGATATTTACAAGCTGGGGGACACACACTCAAC-AATGAGGCAACAAGACAAGTGACGAATAAATAGCCA-----TCTAAGCTTAGCTAAACCGAACCGAACCCGAAATAAACCCGTTGCTTATGCAAATGA
TGTAACAATTTGTTTTTTTTTTTTTTTATTATTATTATTATTATAATGCATATACGTAGAGATATTTACAAGCTTGGG-ACACACGCATAGCGAATGAGGCAACAAAACACATGACGAATAAATATATAGAAAATAGAAAACTATATAAAAAAAACCCAA--------AAACCAGTTGACAATG-ACATGA
>CG8060 11831175 11831547|11529 chr2R 11831348 11835544 scaffold_34 1252969 1257257 - 154659|0 226
ATTGGTA----------CAGGTAGCTTAGTTGTGT-GAAGTGTTTGTCCTATAGTTTTTGTTTTTATTAGAGTGTTCGGAC-----TGTTTGTGTTT------TTAAAGCGATTTACTGCGACCGGGGCATCAAATGTAGAACTCGGATCCGCCTGC-AAAGAAGCTCTTGCTATTT----ATTTATATTCAAAACCAAATGCAATAGGATATTGGACGGCACATTG
GCCGACAATTTCTTTGCCAATACATTTATTCATGTCGATCTGTGCGCGTGTGCGTGTGTGTTGTTGGTTGTGCGTGCGTATGCGTGTGTTCGTGTGTACGGAATAAAGACGCGGCGTCGCG-TTGGCGCTTCAGATGTAGAACTCGGAACCACCTGCAAAAGGTGCATTTAGGAATTCAGCATTCAGATTAAAAGCTAGTTAAAATG-------GGACAGCACATTG
>Vha44 11840126 11840828|11532 chr2R 11837268 11842487 scaffold_43 512171 517710 + 151370|3156 4039
GA--TCGCCCGTCGCCCCCAACATTGCATACATCCAGCCACA-CAAAATACACTTTAATACAAA---------AGAAAAAAAAAACAACC---------------------------------------------------AACTTAAA----------------------AATCAGCTGAACCATTCGCAG-----ACATCTAATGAAACAA------AATTAATAGATTACTTTAAATAATTTTAGTCATTGTTATCTAATTATTGTTGTTATTTATGTTGCGCGTTGCCGATAT-CTGTTTCAAATCTACTTCCG--------------GTTCGAGAAATCGAGGCGCGCCCAAATCAACCGAAATAAGTCCTTAAAAAAG---AAGTAAGAAAACTTTTGCAA------TAATCCCAGATCTTGTGGAA---------------CTTTCCGATTGTTCTTTTGTCCCCCCTTCAGTTTGCAAAGCAGTATTTTATGTTTTTCTTATGCCTTATATATGTTTATCACATGATGGAAGACCAGAGTGTTTAACCCGCAGCCAAATTTACACGCAT-TCTCCTTTTTTG------------TTCGTT--------------TTTTGGTAGCTATACAA-TAAACATTTGAGTTACATTTTGTTTTACAACATTTTCGTCTCGTTTCGTGCTTATGCTCCA--------CCACTTGGTATCTGTATCCGTGACTAACAGCCAACATACAAACAACATGCCCAAAATAAATTTAAGCCCGAAAATGGTGTCGCAAATCGCA------AACTGAAACGTTCACGGAGCTAATTGTGCTAACAAATT----TCCGATGCTATGGTACGTTTCGACTAAAGACAAACT
GAGGCCGTTCTCATGCCTCTGCATCGCACACACACACACACATCCACGCAAATATAAATACAAATATGCCAACAGCAAAAATTAATAATTGAATATGCAAATTATATATTCAGCGGCAGATCCTGAAAAGGGCGCTGACTAAACTTAAATCTATCCTGCTCATTGAATCCAAATCAACTACAACAGCAACAGTTGCCACGCCTATTAAAACACGCAAACAATTAATAGTTTACTATAAATATTTTTAGTCATTGTTATATAATTATTGTTGTTATTTATGTTACGCGTTCATACAATTCCGTTTCAAGTTCAACTTAAAAAACAAAAGAAGAGTTTAAAAAA--AAAATGCGCGTAAGAGAAACTAAGAAAATTTGAGAACAATTTCAAGTCGCAAAACTAATGCAAAGTACATTAAAAAAGAAATTGCATAAAAGTGTATGTTTTTATTTTACGTTCATTGTTCTG------CTTCAGTTAT--AAACAGTATTTT---TTGTTCTTTTGTTTTCTGGCTTTGTTTTAAACGAACTAATAATTGTGCTTTGTTCTTGCAAT-AAATACACACACACATTTAGTTAATTGATATAGAAAACCTTCACTAACTGAGCCAACAATATTATTATTAATACAAATAAATATTTGATATTATATATGTTTT------TTTTTTACCCGTCTTGTTTTTGTGCTGTAACTTAACCCTAAATTGCATACTTCTCC-CGACTAA--ACCAACTGTTAAACTAAATTT-----ATAACTATAAGTAT--AAATGGTGTCGCAAATAGTTTGATTTAACTAAAACAT-----------ATTGAAATGAAAAATGAAAATCTGATGCAATG--AAATTTTCACTGGAAATA---C
>CG7997 11856110 11856252|11544 chr2R 11854005 11856424 scaffold_43 531461 533965 + 83313|2272 2414
GCCCAAGATATGCAAATCAGCCGCTGCCATCAAATCGAATATGCTCTTATATACACACTATTTCCACATTGTCCATTGACGTTGCATCGATGATCTGTGTAATAAGTTAATTCCGACAATAAATACCAGGTAATCACTGAAGA
-----GGAAATTGATGAGAGCTGTTTCTACGTATTTTAATCTA-------------ACTCAAGCCAAGAAGTCCATT-----------------CCACATGTCAAGCTGAAACTGTGTGAAAGAAAAAGGCAAGAACAATTGT
>l(2)k07824 11860691 11860737|11550 chr2R 11860669 11862428 scaffold_43 537916 539716 + 59667|39 91
TTGA--AGGCAGTATGATGTTTACAA----TAAATTCTTAAATAAAATCATTA
TAGGGCGGACGAGCGGATGTCGACGGGTTTTATATGCCT---TAAATTTATAC
>Menl-2 11929669 11929943|11644 chr2R 11929414 11929806 scaffold_4 4555351 4555746 - 9220|287 463
AAATGCCCGACATTTTAACGTTATTATTGTCCTGTCAACGGGAAGCCAGTTGACATGCTCGTGC---------------------------------------GCCTGTGTGTGTGTTTGTGTATCCAGCTGATTTGCATATAAAATAGGACGAAATGTCTGCTCACCAAAAATGTC
AAATGCTGGGAATTTTAACGTCATTATTGTC-TGTCAGTGCGACA----TTGACATATGTATGCACGCCCGTAACACAGATACACACCTACACAGAACCACATGCCCATATGCATGTGTGTGTTCGCTACTGCTTTGCATATAAAATAAGACGAAATGTGTGCTCACCAAAAATGTC
>Menl-1 11929678 11930107|11645 chr2R 11930002 11930176 scaffold_20 941449 941597 + 476|0 105
ATCTTTCAAATGTTTACCCAAAGCCCGATGATATCTGTGAGTTTGTCAAGAGAAGTCTGTATAAGTTCGATTACAGAAATTCCCTGCCAACTACGTGGGACTATCC
GCTTGGCATCCACATACCCAGAGCCGCAGGACACGCGCAAGTGGCTGGAGGATCAACTGTACAACTTTAACTATGAGTGCTCGATGCCAGTCACCTGGACCTGGCC
>Menl-1 11930191 11930485|11646 chr2R 11930177 11930509 scaffold_4 4556430 4556758 - 7928|14 312
GGTCGCGTGCTCTTCGGATCCGGATCGCCCTTTCCACCAGTGGTCATCAATGGCAAAAGATATCGCCCCGCTCAGGCCAACAACTGTCTGACTTTTCCGGGCATCGCATTGGCCGCCATTACGGCCAAGGCCCGGTATCTGCCAAACGAAGTATTTTCCGTTGTGTCGCACGAGCTGGCCAGGAATACACCGCAGGAACT----ACTTGACGAAGGCACTCTGTTTCCGCCCATCAAGGATGCACATAATGTGGCCTTCAATGTGGGCGTTGCCATGACTCAGTATCTAATTGATAATG
GGTCGCGCATTGTTTGCCTCCGGCTCACCCTTTCCGCCGGTTGTTATCAATGGCAAACGGCTGATACCAACGCAGGCCAATAACGCGTTTGCCTTTCCTGGCATTGCCCTGGGTGTAATGTGTACCCATCCTCGTACAATATCGGATGACGTTTTTCTTGTAGCGGCCCACGAAATCGCCAA----ATACTGTAGGGAATTTTACCCAAACGACGCTGCGCTTTATCCACCCATTAAGGAAGCTGCAAATGTGGCCTTTAGCGTAGGCGTTGCTGTGGCAAAATTCTTGATAGACGAGC
>Menl-1 11930544 11931749|11647 chr2R 11930520 11931856 scaffold_4 4556767 4558135 - 26124|24 1242
GGCCTTGCGTTCACCATTAAGGAACGGCAACGTTTGGGCATCATGGGATTGATGCCCTGCTCCGTGCGCTCCATGGATGACCAGATGAATGCGGCCCTGGCGAATTTTGAGGCGAGACCCACAGATATCGCCCGCTTTACATACTTGAGTGCTGTCCACCATCGACACCGGCGACTGTACTACCGGTTCATCAAGGAGAACATCGAGAAATCGCTACCCATTGTTTATACACCAACGGTGGGCG--ATGTGGTGGCCACCTATGGACTGAACTTCCAGCAGGCCATCAGCCTGTTCATCAGCATTCACGACAAGGGCCACATCCGGGATCTTATGCACAACTGGGTGGACGAGGGCGTTAAGGCCATCTGTGTGACGGATGGCGGAAGGGTACTGGGTCTCGGGGACATGGGTGCCAATGCGATGGGCATTAGTTTGGGCAAAATGATCCTATATACGGCTTTGGGTAGCATTCCGCCGAGCACACTAATGCCCGTTTGCCTCGACGTGGGTACCGATAATCAGGCCCTGCTGCAGGATCCCCTTTATGTTGGGGCACGAATACCGCGGGTCAAGGGACCGGAATACGATGAACTGGTGGATGAATTTATGGAGTCGGCGGTTAAATGCTTCGGAAACAACACCTTCATCCACTTCGAGGACTTTGCCACTCCAAATGCCTTGAAGTTCTTGGAAAAATACCAGTACAAGTACTGTTGCTTCAACGATGATATTCAGGGAACGGGAGCCACTGGCCTGGCCGCGTTCATCAATGTGGAACGCATCACTGGCCGTAAATTGGAGGACACCGTATTTCTCTTCGTAGGAGCTGGGAGTGCGGCATTGGGTATCGCCAATATGCTGGCCATGGAACTGGAGGTACGCGGCATTCCTGCCGAGGAGGCAACTAAAAATATCTACTTGATGGATGTCAATGGTATTTTGACACCGG------AGTCACCTAATCCACCGGAGATGGGTAAAATATTTATAAAGTCCATGGAGCCCATGAAGGATATGATGGCCGTGCTGAAGAAGCTTAAGCCATCCGTACTTGTTGGAGCAACTGGTGTGGGTGGAATTTTCAATGAAGAAGTACTGAAAACCATGGCGAAAAATCACGAACGTCCTGCAGTTTTTCCCCTCTCGAATCCAACTGCCAACTCGGAATGCACCGCCGAGCAGGCTTTTACACACACTGAGGTTAG-----ATTG
GGCATGGGATATACGCATGATGAACGCCAAAAACTGAATGTAATTGGACTCTTTCCAAGCGCTTATCGCAGCGAAGCCGAGCAGATAAGCGCTGTTAATGCCAATTTTCATGCGCAGCAGTCGGATCTTGCCCGTTACCTTTATCTGAGAACGTTGCGTTCTCGCCAGGAGCGCCTTTATTATCGCTTTGTCATCGAGAAAATCGAGGAGGTAATGCCCATTATATACACGCCCACGGTAGGCGCGGTATGCCAGGCATTCA--GCCTGATCTACCACAGTACCATGGGCCTGTATGTGAGCAAGTACGATAAGGGCTACATGACGGATGTGCTCAGTAACTGGCCGAACACGGATATACGTGCTGTGTGCGTTACAGATGGTGAGCGAATACTCGGTCTCGGTGATCTGGGCGCCGGTGGCATGGCCATATCTGTGGGCAAGCTGGATTTGTACACGGCGCTGGCAAAAGTACCACCCCAATACCTTATTCCAGTTGTCCTTGATGTTGGCACCAACAACCAGCAGCTGCTCTCCGATCCCCTGTATATTGGCGTGCGCGAAAAGCGTTGTAAAGGCAAGGAGTACGAAGATCTTGTGCAAGAATTCATGGATGCAGTTGTCAAGGTTTGGGGCTACCAGACGCTCATCCATTTCGAGGACTTCTCTACGCCGAATGCCTTTAAGTTTATCAATATGTACCAGGACAAATATTGTAATATCAATGATGATATACAGGGCACAGCGTCCTGCGGCCTGGCTGGCTTTCTTGCCGTCGAACACATCACAAAGAAACCACTAAAAGATCACACTGTCTTATTTGTGGGCGCTGGCAGCGCAGCGCTGGGCATTAGCAAGTTGCTGGTTAAGGAGTTGATCAGCCGGAAGTTAAGCGAAGAAGAAGCTGTCAAGAACATTTACATAACCGATGTAGAAGGTCTCATAACCAAAGATAGACAGAAATTTGATATACCAGATTTG---AAGCTATTTGCCAAAGACAGGCCTCCCGTTAAGGATCTTGAGCAATTGGTTAAGGAAATTAAGCCGTCGATTTTATTAGGCGCCACAGGTCAGGGCGGCATCTTTACCGAAAACATACTGCGTATTATGGGAAGCGAGAACGAACATCCAGCTATTTTTGCTTGTTCGAATCCGACAAACAAAGCAGAATGCACCGCCGAGCAGGCATACAATTTTACAGAGGTAAACAGACACAT
>Menl-1 11931813 11932192|11647 chr2R 11930520 11931856 scaffold_4 4556767 4558135 - 26124|1330 1376
CAAGACCTGACTGGCATGT---TGTTATGAATGGAAAGTACAATAAG
CAAGGCGTTACAGGCATGCGAATGTCATAAAAGCAGAGTATCGCAAG
>Menl-1 11931813 11932192|11648 chr2R 11931976 11932382 scaffold_4 4556200 4556542 - -41|0 223
AACCGGAAGATGTTGAGGAGTATATCGAAAAGAATAGCTATAAACTGACCTATGGAAGCTCGCTGGCTGAGACTTGGGCGTATCCAAAAATGAAACCGCATCCAAGTACAGCCGGCCATGAAAAT---AAACATCAAAAGAAAAAGTAGGCGTTTCGAATAAAAATTTAACATCTCAAAATTCCCAAATGAAAAGGTACCCATA----AAAATTCGGACTTGCA
-------------TCAGTACTACACGGAACG------------------CCATGCAA---CTCTACCTTTGACCTGGGAGTACCCAAATATGTCTGCTCCCTTGCCTAAAGGCGACGATAAAGATTGCAAAAATTAAGTGGGAGAATATATG-TTCACATTTACATTTATAAAATTGTAGTTCCATAGTTCAGACTTTCTGTTATTATTAAATTCAGAGTAGCA
>CG7848 11948711 11948758|11667 chr2R 11948227 11950595 scaffold_4 4575810 4578279 - 45691|618 677
GACCTGTACTTACGTTTAGGCCATT--ATTA--------AATGA--ACTAAACCAGAGGG
CGCACAACTTTCATATTAATCGATTTAATTATAATTCAGAATAATGATTAAAAAAAAAAG
>CG7813 12011752 12011841|11736 chr2R 12011504 12015867 scaffold_4 4642130 4646733 - 24621|304 416
TCAGCACAAACACTATTTCGTAATAATTTTCTACCAATTTGTGTT--AGTTGTTTTTCGTATTAAATTTTATGTTACATT---------------------TGTTTACCGTTC
TCAGCAGCTTGGCGTTGTTATTTAAATGTAGTTCAACTTTATGTTCGAACCGTTTT---CATTAAATTTGCTGTTGAGTTGAAATGCGAGTTGTGGGTGTCTGTTGTGTGGTG
>DAT 12073420 12074250|11816 chr2R 12073166 12073455 scaffold_5 1349979 1350218 + 79|261 296
AATAAATTATTATACTTTGAGTTACTAAAAAGTGAA
TAT-TTTTGTTTTGTTTTGCGCTG--GAAAAATTAC
>DAT 12073420 12074250|11817 chr2R 12073456 12076278 scaffold_4 4735874 4738891 - 97799|0 989
GTTCGACCAGTGGCCCGTTTTCAAATTTACTACGTTTAGATTTG---GAAATTTACCAACAACC--------------------------------------------GATGTTCACGTATGTAGATTGTGGCTTTGCAGGAGAG-TTTGTGT-----TTTTGGTTCGACATTTGGCGCAGATCCGCAGAAGGATCGGCAGC-AATTTCGCAAACAACG----TACTTAGGTTTCGGCACCAAAGAAAAAAAAGAAGAAAACCCACAAGCAAACGCAGCTTCAAACCATAAGTTCTAAGTTAAGATTAGCTTGTAGTTC----GTATGGTTAATGCCCAGT---TATAGCATACTCATATATATAC---------------------------------------------------------------GATGCTGTGTAGATAATA---------TCAAGTCCGAAAGTGCGAAACACTTGTCAGTTAATCTATCGAGAACTCCTTGAAAGAATGTTTG---CATATGCCA-ATGGAATTAACGACACGATCGAGGCTCAAAATT-----ATTGGGCACATAATCTGTACATACACAAGTCGATGATGTAAAAGCTTTAAAACACGTTATAGGATATCTCATGGAACTG--AAGCAAAAGCT---GCCAGAGTTGAACTACAAAATCCGCTCAAACAGCCATGAGGGGATTTTGTCAT--ATGCAAAGGTTTGTTCTAGACTAATTAACCCCGTCCAAAAAAAAAAAACTACGATTGTTTGCTTAAAGCAGCCA------TTTTAAGCAAACAATTGAGAGTTATCGAAATAATACATTCCCTTT-TATAAACTC------ATTTCTGTACATAGATGTATGATA-------------TTTTAGCATTGTTTTAAGAGTTTCTTTCAC----------------GCTGAAGCGGAACTAACAGCCATGAGTTCTGTTTCAATTTGTTGA
GTTCGACCGATTGCACGCTTTCAAGTGTATTACGTATAGATTTGAAAGAGATTTACCAACAACTTTTACACTAACATCTACCATGACATCAACTTTAACATCAACTTGAATGTGTGTGTTTGTAGCCTGACGTCGGCTAGAATTGATTTATGTTTAACTTTCAGCTTGGCTCTTAGGCAACAGGCACCTAGGAATCTAATGCAAATTTCGCATACAACGTACTTACTTAGGTTTCGACACCAAAGAAAAAAAAATAAGAAAAATGT-------TGTAGCTCAAAACCATAAGCCTACAGTTAAGATTAGCCCGTAGTTTCATGTTGCGCTGCATTTACACTAAATACACCCTACTCATATATATACTACATATAAATATATAGTACACAATATTATGCATACATAAAGGTATGTTTGTATATTTACCAAAACGCTGTGTAGATAATACAGAAATATTTAAGTAAACAAAAACGAAATTGTAATTGTTAAATTGATATTGCACTTAGC-CAAGTTTGTGTGCAACATATGCAACAGGGAATTAAAGGTACGATTCACTCTCAAGATCCCCAAATGGATGTCAGAGTTTGTGTATGTACAGACCTA------AATAGCTTTATTATATAGTGC-GTATAGCTCGAATGTCTGTTTAGCCGAAGCTTTAGCCAGAATGTGTTATGTATATAGGTTTAAGCCATCAATAGCTTACCTAGATACCAATTTGTAGTTTTGTCAAGCAAAAAAGAGTACAGAACATCCCTACCAAATACTTTTTATATGCTTAACTCAGGCAAAGTCTTTTTCACACAGCCATAAAAAGATATTGCCATAATTTATAGAATTTACATAAATTCTGATTGTTTTCTGTTAACACCCGTTAGAAAATTTGTATCTAATTTGTAGCTAAATTTTAAGTGTTATCATAAAAACAAAATGTTAAAAGACAAAAGCAAAGTTGGCAGCCATCAACTTTGCTTTGAATTTATGA
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GCGCTGGCACTGTGTCTGGAGCAGAGTCGTCGCCTCCTTATTTGTGGGCCGTGACTTGTTTTTGGATTT-TTACGCGT-AATAAAGGAAACGTAATTTTTTAAGAACGTAATGCTGTC-------------TTTCAATC-----CTCACTGAAGAGTAAA----CACTGGACACTTAACAAATTTA
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TACACTCCAATCGAATCCAGT-----GTCCATCCAGC-----------------------CAATCCGGTTTGGTT-----------TGGCCTTCTACAGGGTC--CTCTAGCACTTAGCCACTTAGCCACTTTCGATGCGTCCTAGTTCTAAGTCA---------AATGCACTGCAG-------CACGAATATAGAGAAAGAGAATGGAGCACTCATC---ATATTAAATATTATATAATATATATATATATATACACATTCGCACCAAACA----CCCACAATCACAACCACAAACACATCCTCGTAGATTAAGGCCCAAATGTTT----GTTATGCCACTTGTTATCGCGACGTTTGATTAAAGCTAACAAAACTGATATCAAAATGCA
TGCGTCTCCATCGAATCCGATCTTAAATCTAATCAACAACCATGCGCAATAATCATGCCACAATGAGCAATGGCTATGGCTGTCACTGGTCTTCTACAGGGTCCTCTCTAGCACTTAGCTTTTT----TTTATTATTGTGTTTTAGCCATAAGTTAGCCCAGCACAACGCACTGCAGACACGAACACGAACACGACACTCGACACTCGACTAACTATCTATCTATTATAATCTATATATTAT-TATAATTATATACACACACATAACACATATATTCACCCACTCACACACACACACACACACACGCCCATGCATACACACATCCCTCCTAACTATGTTAA--GTAATCGTATCCCTAAATTAATATGCATGTATATTATATT----TGTT
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TCAATTATCTTGTACATTTTATTGCCTGCTGCATTCCTGTT---GCCATCTTGTGGTGGGTCTATGTGAAGTTCTAAGGTGGAATCTTAGTCTTATGGATATATAATGACGCTTACAATAAAAACT------AAATTGTTTTTCTTTTTATTTTGTTTGCTCAATAAAAAAAACCAACGCAAAAGTATAATATTATAATTTTGTTCTAATTAGAACCGATTTAATATTCCAAAGTACGAGGAAATTAAGTCCACGTGCTGCATG
>CG8311 12101908 12102156|11848 chr2R 12102135 12103722 scaffold_4 3819208 3820792 - 38286|0 21
ATAGAATGCATATTTATGTAAA
ATAAAAGTGATATGTTTCTGAA
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TCTATTCACACAGCAATGCAAAAGTAGCCCAAAACTTAGT----CACTTTAACTAAACACGTAATGTAAAAGTAATAA--------ACAATTTTAGA---TTGTTTGTAATTATCAACCGGTTTATAGTCAAATAGTCGATGAATACGAGAACTAAACTTTAAATGATTAAATATGTAACTATTATTCAAATAAA------------TATGATTTTTATATTAA--GG
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TGAGTGGATCCTGTTCGC------TCATATTGTGCAATA-TTCAGTCCAAAATAGCCTTTCACGCCTTCAACTCAGTCGTCTTCATCGTTGTAATTGTTCTTCATAGGATATATCATGTATTTTTACTTTAAGTTCTCACACTTGAGTACAAGTCAATTGCAAATGCGAGTATAGTAAAAATCGAATAAACA-----AATCAA
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TTGATATCTATGATTTTCAGCGCATATGCCGCCAACCAAATATCAGTAGTTTTTTGGTACACTTCATTGCTCAACAATAATATG-TCGCAACGAAATTTATGAAAACAAATATACAAAAACAAATACTATAACAGTGCGAATTATTTAAGCGGAAATAA-----AAATAATGATATAAGTATATAA--AAACAATAAATAGTATTTTTTATATACT-TAAAAGTTAAAACAATGA
>Alk 12140948 12143935|11891 chr2R 12141162 12141465 scaffold_72 63591 63899 + -2496|0 336
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AATCTCTAGAACAATCAATATAAAAATTAAAAATATTTAACCCTCTGCTGAAATTGTTATCTCAACGGCAAACGCGGAATTGTGAT----GCGTTGAAATTTCTG----TTTAT--------GGTTTTTTATTAGCACAAATAAATGTTTACATATGTGTGTATA---AACATTTGCATGTCATACTACATAT-ATGAACTTGGGCTAAAATGCACACGAAATGATAATTGTA--TAAAATGAAATAGTTCACATAAAATCGTATTAAAGTCAGATATGTGTATGTATAATGTACATTATAGCAAAATGTTTGGGATTATACTT------AAATCAA
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TGTATCTATTATGGTTGTGCCGAGGCATGTAAGG-------GCGTCTCTGAAAAAACCCCCAATACAAATACATACCTACA
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TGTACAAACATAAATGAAAAGTTAAACAACAAACAAGAACTCAAAAATAAATATGCA---ACACATTAAAACACAAAATGAAACG----------ATATGAAAATATAC---TTCAAATATATCTCAACTTTCACAGCTAACAATTTAG------AACTTAACTTAAAACTTACTTTTTGCT
>Alk 12140948 12143935|11895 chr2R 12141889 12142153 scaffold_0 1516523 1516808 - 651|0 297
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TATTTTAAATTCTGTT-TACATAGAAAGAAAACCAATGTAAAAAACATATTGGGTATGTGAGAGATACTTTTTAAAAGATTTTAAGTAATATATTCTGATCGTTTGATAATATTAAACTCGA-TTATAGTATAAATGAAATACGATTTAATATCATATGCTAATGTTTAACCCTTTACAGACATTTCTAAATGAATCACTGAA------TTATTTGGAAAAATTG---TACCCTTCGAATGGGGGCGGAATGGTATCTTCATCTCTGGATAAAAGTAAACTTGACAAC-GATAAAAAA
>Alk 12140948 12143935|11896 chr2R 12142164 12142689 scaffold_1 4603249 4603918 - 10801|0 682
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TTAGTTCAGACGTAACAAACAAGCTTTAAATTATATAATTTTTATAAAAATATATATACACATGGCATAAAATATACAACAAACAAAAAGAAAACGAAAATGAAAATGAAAAAGCATACATATTTATATTTAACAATAAATGTATGCATTAAAAACCCAAAAAACAAAAACTTGATAAACTATACAATACACACGAAGAAAAAGAATAACATTGAGCAAAAGTGTGCTAATTTGTGCGCCAGGCTTAGTAAAAATATATATTAACGAAAAATTTAATTTATATG-ATGTATATGTACGTATGTATATTAAATGTAAGCATATTCAGTGTGTGTTAAAGCCGGCAAATAGGTATATATGTATATGGATATGACATCTAAGAACACAAACC--CAAATAAACAAAATGATAACGATATGTATGTGTATGTTTTGCTT-ATGTACAAGTCTACAGTTATATGCGCATACATCT-ATATAAATACATATATACTAACATATATAAAAATATGCATATATAAACATAATGTATCTAACTATATATACATACATATATGTATATATATACATATATATGTACGACAA-AACAAA---TAAATTAA--TGCTGAATACGCAAAACAGAATACATAATATTCGAGTATGTAAATTACATTCAAA--TGCATAGATAAAACATCAGCATGCA
>Alk 12140948 12143935|11897 chr2R 12142690 12143357 scaffold_1 4604029 4604757 - 7239|0 796
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AAAGCTTGCCCAAGGCCGAAGTTATCGATCATTCATTGCAGCTTGTGAATACGGATATGTCTTGTTTAGGGC--CCCGGCCC------------------------CAGTCACATTTTGTTTGAGAGCTAA-AACGCATTATGCATATTTATGGCAAAA--ACAAACAGAAAGAAAAAAAA-------AAAACAAATCGAGTGAGAAGT--TCACAAAAATTGTATTGTAATTTATAATTAAAAATTTGTATGCGTCATAGAACACACACAGACACACACACATAATAACATATTTGAAACAAGAAAACAAATAA-------------TAATACTGCAAATTAGTTGAAAATTAGTTTTAGTTTAGTTTAGTTTTTGTAAGCAATTAGTTTGCCAA------------------------------------TTGCAAGAGGTTGTATA
>Alk 12140948 12143935|11899 chr2R 12143855 12145454 scaffold_1 4605198 4606973 - 78980|0 80
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-------------------------AGAGCAGCATAGCACAT----GATGTTAAACACAGGCTGACTGTTTGTGTGAATTT
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GTAAAGGTAACACAG----AAATCTG---------GGCTTTATTTTTG----TCTCAAATTAC----------------------------AATAAAAACGAACGCACATAA-------------T
AAAGAATTTTCACATTTACATATATGTTTTTCTTCGTTTTTGTTTTTGTTTTTTTCAAATAACGACATTGAATCGGGATTTATTTCTCAATAATACAATAAAACGCACATAAACCATAATTTGGCT
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GACTCCAAATGGAAGTAGTATTAGCCGTAGTCGTGCGTCATTAACCATTAATCCGTACACTATACGATATGCG---TAGCTT-AGTCCTTGTTTTAGTCTAATTATTTGATAAGCCAAAAGTTGTTAATATTGATAGTTAGCCTTTGATTTATTCCTA-------CATCTGCATAAATACCGCTAAAAAGACACTAATCTTCC----------AATTGTAAATAAATTGGGAAC----TGAAACCGAAACCACACCAAGTCGAGCACAAAACGTCAACTTTAGTTAGTGAAAT---CGAG--------------GTCTACCATTGCAAATGTGTAGTTTTCTTATTTTATTGTGATAGCGAAAGAGTTTACTTCTC---------TCACTGATTTGTTTTGAAATTAAATGAACCGCTCAAGCGAACATTGTTAAGCAAACAACCAAATGT----------------------------ATGAAAACCAT-----------TAAAAACTACTAGTTTA----AGAAACAAAAAACA
GCCAGCGAGTCTAGGCAGTAATTACCAT---------------------------TACACTTTACTACACACAAGCTAGTTTAAGTTATTGTTTTAGT-TCATTATACTCTAAGCCAAAAGTTGTTATTAGC--------GCATTAGAATTGCCCCCAACCTCAGAATCCAAATACAGAAAGTATAAAAGACAATAATCAGTCAGCCAACAAAAATATAAAAAAAAGCGAGCACAAAATAAAATTAAAGTCACATATTGTT-AACGTAGTTGAACAATTTTTGGCAGTGCAGTGCCTGAGAAGGGTATTCAATTGTCTACCATTTAAAATGCGTAGTT------TCTTATTGTGATAGC-AGAGAGTTTAGTTTTTCTTTTTACATAAATAATGTCAATTCAATTGAAGTGAATTAAGTAA--TAACATTGTTGAACCATGAATAAAATATTATATACTTTACTATACATACATATATATTGATATGCATATATCGTTATGTATAAGCAAACGATTCAACGTACAAGCAAAAAGAC
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>CG30463 12188324 12189564|11942 chr2R 12188816 12189043 scaffold_1 4669610 4669852 - 4881|0 259
AATTATTTATGAATTTTACAAATGTCATTAAATGGCTCTGCGAAAGCCTCATTCCAAATATATGTTTTAGCTGGTAAGCCCTAGACTAAGTCTA-----------AGTTGGAAAGCATTTGGTGATAG--------CCTTTGTTTCG-------------CCCAAGACCCCGAGCATTCCCGAGTTTATATGAATTCTTATAGCTATCTTTCTGTAAATCCCTTGAAATGGCGAACCAAATTTTTGATTTTATTTATTTT
TACTATTAATGAATTCTCCTGACATC--TGAATGGCTTTGCAAAAGTCGCGTTCCAAATAT--GTTTTAGTCCGTAAGTCTTGCTTTAAGTCTATTATTGTTGTAGTTTGGAAAGCATTTGGTGATTATGCCCCGCCCCTCGTCCCGATTTACTTATGTGCCCGCCGCCCCTAGCATTCCCAATTGCCGACAAGTA--TGTACTTATGTG---GGACATCCATTGCGTTAGCTA--------TTTCCTTTTATTTATTTT
>CG30463 12188324 12189564|11943 chr2R 12189044 12189141 scaffold_1 4670037 4670130 - 2951|0 101
GCTGG--CCAACAAAGCGAAGTCGTAGCGCAATTTTTGCATTTA-AATTTGTAAAC-ATTTAGCACAATTTACGGAAAGTGTGAACCTTGACTCTGTGTACG
GCTGGGTTCAACTAG--CAAGTCGTAGCGCAATTTTTGCATTTACAAGTTAAAAACTTTTTAGCACAATTTTT------TTTGAAGGCAAACTTTGTGTGCG
>CG30463 12188324 12189564|11944 chr2R 12189189 12189731 scaffold_1 4670199 4670791 - 10447|0 452
GGCTACTTCTATGCGAGGGGCAACCTCCTGTTGCCCACTTCGCGGCG---------ACACCAACAATCACAAGCATAGC-AGCAGGACGAGAAGTGGAAGCAG----AGGCAGGACATAAAGTGGCGGCAGGAGCTGGAGTAGTTAGAT------TCCCCCGAGGCATGTGCAATAGTGGGAGTGGCAGAGGGACGATC--GGATGGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCATCACTTGC-------------------------------------CATGCTATCTATATATATTATAAAAAATTTATATGTTTCCAAACAACAGAGTAGACGTTACTTAGCCCTA----AGTACCACACATCCACAGACTAGAC--------------AAACCAGACACTGAAAAAGGAACGACTGCTGTACAGTAGCTATAAGTTGATAAGATTTCTAGCCCTAA
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GCAACAACAATTCCAACTGTATGCCATGTTTAATCCAACAACAAATTAAATATATATATATACAAATATATATATTGGGCGTATCACTACTAAAGAATTATAAATTAAAACGGCTTTAAATAAAAACT
>unc-104 12266359 12268303|12048 chr2R 12266487 12268589 scaffold_1 4762507 4764964 - 34261|0 2288
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>Sod2 12287779 12287882|12061 chr2R 12287728 12290545 scaffold_1 4785751 4788552 - 91158|52 158
GCACAGCCGGCGATTG--CGTATGTTTAATCTATAAGCATCTGCGGATCGGAGATCCTAAATTGTAGTC-TAAGTTGCGGCTAATAAATTGGTACCAGCTAGCAACT
GCGCAATACTCAATTGTCTTTATGTTTAATGTAT-CGTATATGCAG-CCGCAGGCTCTGAA-TGTAGTCAAAAATTTCGGCCAATAAATTGGTGAC------CAATT
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TTCATTCGTGTGTTATCTGGAAAAACGTACAATTCTTTAATCTTAACTTAACC-GTAAAGCCTATGCATACAATATAAACT---------------------------ACATCTTTGAGCTTAATGCTAGTTGGTCTGCTTGTGGGTGCGGGTGAGGTTGGGATGTTGGA
TTAG--CGTGAGTGTTCCTAAACAAAATACAAGTTTCT----TTAATTTAACCAGCAAAACTTTTTGCTACACTTTAAACTTACATACTAATTGCGTAACATTACAAAACCTTTTGAAGCTTATCTTTAATTGGTCTTCCT-----TGTGGGCTTGGTCGTGA-------
>Psi 12377828 12378966|12157 chr2R 12376101 12379026 scaffold_11 3678758 3682046 + 17405|2040 3471
TGA------TCTATTGTTCTACTATGTCCCTATGTCTTTTATCCCCCCACAAAACTAGCAAATCAGAAATGAAAAGCAAATGATTTTTAATTGCAATAACAACAGCAA-AAGCAAAAGCAGAAGCATCACCACCACCACATAGACAACACACGGGATGGAGGCGGACATCAGGCGAGGACCCGGATAAATCGGAGAACGTTAAGCTTTTGCAGAATTGTAAATT-------AATACTATTAACACTGTCTATTA------TTTGGATACTGCATATAATTTCACCATAGCTTGTAAGAGATTAT-CCCGAGATCCTAAGTCTACTTTTACCTAATAATTATACATAATTCCGACCGATTGAAACATAATGCTCTTGCTGTTCATGATCA-----CCACTTGCACAGACATACTAAGAGACGCTAATTGAATCCGTT--TTGGGTGTTTTGTTCATTTTTATACACATCTGCATATATATAGTCATATATATATATATATATATATACA-------------------TCGCATATATAGG--TTCTTTCACCGTCAATTCAGGCAGC-------------CAATCTG--CAATGGGCGTTCAGTAATTAAAGACACCCTTTGTTAAAATTCTCAACTTTAATGGTAGCAATAAACAAAT--------------CGAACGTTTTATATACACGAACTCATTTTCACGTAC---TTAGCTTAGCTTAGTTGTACTAGAAGCCATTTGAACTATATATGATCGACATTTACACT-TGATCATATATAC--------ATATGTCTG--CTGATCTGGTAAGATTTAAAAGATTTGA----TCGAACCTTTTTATTAAATTTGATTCAAGTGAGGGCCAGGTACAAAAGG-------TTATCTTCCTT--------------------AATTGATATTTAACATCTT--------GCATAACAATATTTTCATCTTTCAGTTCT------GGAGAATCTATGAAATCATTTTTGTAGCACTAAG--GTGAAACTGAACTGAGTT--------------------------------TAAAATT-------------------------ATTTCCTGCTCTATAATTGT----------------------------------------------------ATATTTTTTTAAATT-ATAAACCTGGTTTGAATACGCTTGCAATATTTACCTT------TAAACGAACGCGCA-GGATAATCATGCTTGTTTTAATATCTATTTCA----CCAAATGCAAACATAAAGTATGT------------------TATTTTCAGAGGACGC---------------TCTTCAGACCAGTTAATAGCAGAAATACGAAATCAAACCCCAAAACTTTTTCACACTATAACAAATAACGAAAAC
TGAATCATTTGAATTGTTCTACTAT---CCTATGTCTTTTAT--CCCCAATAAATTAGCAAAAATTAATTGAAGCGCAAACAGCT-----GAGCGAGAAGAATATCAACGAGCTCCAACAG--TCAAGACAACCATCAATCAATCAATCAAACAAAC--AGTCAATCAATCAATTTGCACACTTGCAGCTTGAAG--CGTCGCGC-TTTGCATAAATGTAAATTTATTATATATATTAATTATA-TGCCAATTACATTGGTTTCTTTTCTACTTATAATTTTACTTTAGACTTTAAGTGACTTTGCCTGAAATATTAATTCT-----------ATGACAACAAAAAAGAGAGATAAACGAAAAAGAAATGCTGTTGCTGTCCAGGTTCAGATACACAACTTCTGGGACATTACACAAATTGCTATTTATATATATGCATACAAAATCATATATACATATATATATATATGTATATATAGATTCATATATATATATATATATATATATATATAGATTTATATATAATTTCGCATGCATAAAATCTCTTTCGTCGTCAATTTAGGCATCTCGAGAGCTGCTGCAAACTAGCCAATGCACATGT-----TTAACTATGTCCACGCTGGAGTGTGTTGATTGAAAGACAACAAATAGACATATATACAAAATATGACCTACCTTTTGATAC-CGCAAAACGTTTCTCTCATACATTTTAACTTAGCTTAGTTCTAATG-----CATTCATATAACATTATACCTTCACATATATTATAATATTAAATACTACGATCAACGTCTCTACTCTGATCTGGTAAGAATTTCAACCTGTAAAATTGCCAATGGTCTTATATAACTCAAAAC-ATTGAACAAAAAATGCGTAGGAATATGTTTTATTTTCTCTTGGATAAAACTGGTTTGTTGAACTGTTGTTAAACCTTTGTTACTCAATTACTACAATTTTTTAATTTAATATTCCCATTGAGGCAAACCCCATATGATTCTTTATATAGCTTTAAGTCATCATTTTGATTTCAGTTCCGCTTTCAAGCAACTTCTTAGGCAGCATCCATAGAATTTATCCTACAAATGGGCCCAACGCAGATTCGATGCTCTCTAATTCTTGTCCTGTCCCTGTCTGAATTCTTAGCCAACCGTTTGTTCTATATCTTTTCTATTTTTTTTTTAATTCACAAACTTGTACTTGGTAAGATCTTAAATGATAAGTTGTGGTATGAAGAAATGCTCATAAACAAGTTCACTTATTTCGTTAATATTTTGAAAACTTGAATGCGTGTGTATATTATGCACATGCACCACATGTATGTACTTTCAGAGGCCGTTTGTTAATCCAGGCATCTTCAAACCAGTTCATAAC---AATTGCAACTTAA--CCGAAAACCTTATGA---------AAACGAATATAAC
>Psi 12379432 12379548|12158 chr2R 12379519 12380963 scaffold_11 3682244 3683869 + 58538|0 39
GG----------ACGTTCGGATGTATCGGAATCGTCGGTA
GGGGACTGAAACAGATGCGGGTGCCTTGAAATGGTGAGTA
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TATTTACTTCTTTTGTGGGCGTTTTTGGCA------------TTTAATGCTTTTAATT-------------CAAAAGAAAAACTATGC---------CAAACATTTGTATTTAAATGATAAACCTTTGGCAAGCACTGATTTTTTCACTAATATTTTGCTTTCATTTCGTTTATAGTCGTAAGCAGAAACTTCCACTTAGTTTTCAT-------TACGTTCACTGCCCACTTTCATAACTCTTCACCGTCTAGAGA-----TATGA----TAAGAATAGGATGATATTGCTGCCTTTCGTTCGACATTGCCTCAGTCTCAGTCTCAACATGAATCAT-----TACCAATTAAAAAGGTTGTTG-AAACAATTTCAATTTGAACAGATTCTGA-----TGAAAATATCCGTAACAGTCCTTTTTACTTTCAAGTTTCCATATACTAGACTACCAAACAGAATACCCCTTAATAGAGAGAACCTCAT----CTCGAGATATAGAACCATGACCA-------------------CTGAATGG--CAAACCAA-TGTTAGAGCCAAGCTTTAGCAAACGTAAGCCAGAATCTGAATAAA-----------TTAATAACTATGT-----------ACTACCAGTAT---------GTTAACATGTT---------TACAAAAAGCGAGAGCATATTAAAGTAGTTTT-CATATACCCCTCTATATATATTA-----------------------------------------TATATATATATCTGTATCTGTAACTAAA-------TCTATAGAATCCATACC---TATATTGGAAA-CTGTTCAAATG-CAAACATAAGCAATGTTTCGATGTATGTACGTGTATATGTGTTACCAGGATTGTTTTAAAAACAGACAAATATATCCCCGAAAAGTGGGAAACGA---TGAAACCCAATAAAGAATCAATTAT---GTTG
TATTTATTTCATTTAACGGTATGTACAGTAAACAAATTCATTTTTTACACAATCAATATAACCAAAAAAAACGAAAGAAAAACAATATTTGAACACACAAAAAATTGTTTTTTAGTGCAACAATTTTAAAGAACA--------------AATTTTTTGTTGTAGTTT---TTTTAGTT------------TTTCTTTTATTTTTCATATATATATATATTTTTTAATAACTTTTGTGACTCTGCCTTAGCCACAGAGCACGTATAAAAGTTAAAAAAAAAGTTTTTTAGAATTCTTTT-TTCCCTTTTGCTGCCAGTCAAGTCTAAGAA--ACTCATCTGTCTCATAAGTTGAAAGGTTGTTCCAAACAATTGT--TTTTAATGAATACTAACAATTTAAACAGATTCTAAAC-------TTAAGGTTCAAGTT-----ATACAAAACTCAAAAATAAAA----ACGAAAGAGATTAAAACTCAATTCACTCAAACTTCAATTCTATGCCTAATAGATTTTAATACTAAACCCGAATGGAACAAACCAACTGCAAAAGCGTAGCTAAAGCAAAAGAAAACGAGAA-CAAATTAAACCGATCTAATGTTAAGAACTCTTTTGAATCCCATAAAGACAAGTATTTAGTGAGCGTTAACAATTTGGAACGTGTTAAATTATTGAAAAGAATTCTAAAGTAGTTTTGCATATAACAAACCAAATATACTACTATCTAACATATATATACTATACTATACTATGTATTGTACTATAACTATAACTACAACTATAACTGAACTATAGTTCTATAGATACTATGCCCCATATATTGGAAAGTTGTTCAAATGGCAAACATAAGCAATGT----------------------GTATTACTAAATGTTTTCGAAAAACAAACAAACAAAC--------------AAACAAACCCAATACCCAATAAAGACAAAGTTATTTAGTTA
>CG8910 12389587 12390718|12168 chr2R 12390529 12390847 scaffold_1 4843522 4843798 - 10244|0 192
GGGAAGGGCACCCAATTAGCCAGCAAAAACGCATATTTCCAGTTGCAATTCTAGCCATGTAAGATCATCACCAAGTACCCGTGTAACCGTACTATATCAAGCCAGATAGGATCGGATGGAATCAGAC---CTCCAACTCACACACCTCAACACCCCCTACCCATATGAATCGAGCTTGATTGTAATTTTATGA
AG---------TTAATTAACGTGCAA--------------AGTTAATGTTCAAATTACAAACGATAACTG------------GCATCTGTATTATATCAGACATTATGCAAAC-------ACGAGACACACACTGACACACACATCCATGCACACATCACACATAGA---CGAGCTTGATTGTATTTATAGGA
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TCTTTGTTGTACTGATTACCTATTTAAGCATACAAAAATTCCCTTCAGAATACTTAGTTTTATTATTAAAAATTTGAATATTTTGAAATCTACTGTACGTTGAAATTGACTATTAATAGATATATTGAAACCATGAATTTAATATTT-----TTGTGTCCGTCTAAGTTTACTTTTCTATATGATAAGAAGGTCGCA---TTGTTTGAATTTGATTATTCTATTCTATAGTTTTGGTTAACGAGCA---------------CATTGTTTTCCATTGTCTTAAAGATTG---TAAATATATAAAAATATAACATTTTTTAAAATCT
TCTTTATTTTAGTTATTCCTTAGCAAAGTTTTAAAGCATTTTTCGCAAATAATTGGATATTTAAATTAGAAACTTAGAAAAAGAAAAACTTGAAACAATTTTATGTTTATTATT--TTGGTTGATT-------CTCGTTTAATCTCTGCTACTTGTCGCGGCTCAAATCAAAGTCACAGT-CACTGAGAAAGTCAAAAACTGGGCAGACTTTGTAAATATAATCATAGTATCAAGATTAACAAATAAGTCTATATAGTCTATATAGTTGCCTTTTGCGTTTGCATGTGATTTAAGTTTAATGAAAAACAAATTTCATAAAAAT--
>CG33456 12463160 12463578|12264 chr2R 12463568 12466649 scaffold_1 4944227 4947403 - 80930|0 10
GGTTTCTCTAA
AATATATTGAA
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TCTCAG-----------------------TAGTCGCCG--------ACCTATACATTCGTTTGA-------TTTTGTACGTTTTTCGAGATATCCTGTAAAA--TTGACCGTGTTACCATGACTCGAAAACAAATT------------GCTACGCCCCGCTGTGAAACTATCTCCAAATTGGTGGTCAGCGTCGGCAGTGG
TTTTAAGTTAATATTTTTTTTTTTTTTTTTAGTAGCCAGTGAGATTAGTTTCGTATTTGTTTTCGTTTTTTTTTTCTTCTCTTTTTGTAATTATTTGTAAAAATTCGCTCGGATTTCAGTTA--CGGAAGCAAATTACTTATTAAGCGGCCATGCCCC---TTGGACGCATCACCAAATTGAATGTTAACATTGACAAGTG
>CG9001 12513473 12513565|12322 chr2R 12513464 12513592 scaffold_1 5781269 5781519 + -2656|9 223
GCGATATATTT-------------------------TTTATCGGT-------------------GTTTCTCAAACA----------------------------------TAGTAGCTTCTGATTGAGTTATCCGTCTTGGG-----TAATATAG---------------------------------------ATATATACAATATTTTACAAT
CAGAAGAAGTTGCAGTAAATGCCAGAGCAAGCTGGCTTTTCAAGTCTCTAGACCAAAGCATTTAGCTTCTCACACACTCTCTCACTCTCGCTCCGTATTGTATCGTATTGTAGTAGCCACTTGTTTAGTTGTATATTGTGTAGATTTCAATAAAGCAAGCGATAGCCAGGACTTTGAAAACGAACACCAAAAATGTATATGAAAAATTCTAAAAT
>CG9000 12515103 12515218|12323 chr2R 12513666 12516916 scaffold_1 5779889 5783259 + 105358|1499 1630
GACAGCTCACTTCACA-----TAAGACCAAAGTTTACACTATTCCCTTTGATTTAACGTACACAAAATAAAGTAAGGGGACTTACCCCAACAAGCTATTTAAGATTTTGCAATGTGGAAAC-----------
GCAAGCTGGCTTTTCAAGTCTCTAGACCAAAG------------CATTTAGCTTCTCACAC------------------ACTCTCTCACTCTCGCTCCGTATTGTATCGTATTGTAGTAGCCACTTGTTTAG
>NiPp1 12518420 12518531|12324 chr2R 12516917 12519831 scaffold_1 1366014 1369159 - 107520|1574 1780
TT------------------GCGTATTA-------------------------------------ACAAAAT-----------------AATTAA--------GATTCCACCTACGATTTTCTCAAGCATATGATTGACAACACACT---------------CTGGAGTAATATTTGTTTATTAGACTTTTAACGTAAAACAAAACA
TTCAAAACGGATACAGAACAGCATATCCCTATGCTGATGTTTATTTAGTTGACCAGTTGACATACACAAAATCTGGGACAGCCTAGTCCAAGTAGCGTGCCCTGCTTCCAAATTGGAATCTCCAACAAGCGCGCTTGCAAATTAATTATTCTTTTTTTGTAGCTCGAGTTTTGTAAATTCAATA-ACAACTTATACAAAACAAAA-A
>CG15609 12522769 12523317|12329 chr2R 12522642 12522852 scaffold_1 6132002 6132248 - 2111|146 247
TTTTACGTTAGTTTTACTTTAGCATTTATCCCACATAACTAGAAACGCTTCATCCAAAAATACACGTACA------------------CTTATATATTTATG
TTGCACATTAATTTTATTTTAGCTTTAATACTACGTATTAAAGAAAGCTTCACCCCTAAGAATATGTATAAACTATTTGTTAAGAAACTTGTTTTATTTAGT
>CG15609 12522769 12523317|12330 chr2R 12522921 12525075 scaffold_1 6132307 6134289 - 34173|0 420
AA-----ATCGAAATTAACCAAACCTGACTGGAGATTATACTTACAC----ACACTCAATCTTATCTATGTAACTAGTTAGATAACAACTATGTTCAGAGACACGCGATAAGGTCGCGTGGTTTTTGTGGTTCGGTGTCGCTTCTTATGCAATCGTTATATCCAACGACAACAAATACTTGGACCACTTGGTATGGTTATTAAAAAAAAAAAGGTATACTGTGAAACAAAACAAATTGCTTTTGTATTTAAGCAAAACAATTCAAGAAATAAGAACAAAACGTCCGTTAGTGAACTAAGTA-----AAAAGACAGGCACACGTTTATACA-CCTATTTACGATAAT---------CAGATCTTGGTATTACTTTAAATTAAATGGTGGTAACTTTGTTTCATGTTTCGTTGTTGTGCCATC
AAAAAACACCTGACGTAATTCAACTTGACTGGAGATTAAACCTACACTAATATCTATAATATTGTGGATATACACAATCATAACTTAACTGT----------ATGTATTAAA--------------------------------------AATCGTAATATAAAAATGAAACAAAGAT-----CCACTAGTCTTCTTT-----AACAGATGTTGCAGACTG-GAAACATA------TGGGTTAATATTGTAAAAAAA------AAAAATTGACATCAAAACGTCCGATAGCGAATTAAGCAGCTTTAAAATTTGAATAAATTCTAAATCATTTTACTTAAAAGAATGTTGTCATGTACATTTTAAAATTACATTTCATTTACC-----TAACTATATATGATAATT-GTTTTAGTGCCATT
>CG8963 12531189 12531828|12338 chr2R 12531000 12532765 scaffold_1 6141294 6142925 - 45425|211 856
-CGACTGTG-GAGAACTGTGTTGCATTGGACGGATTCATGAGGGCGTGGTCGTTGGCAGGATATAGCTTGGGTATAGGAGGGATGGTGGAGAGCGTAGGAGTGGAGCATTTCCAACAAATTCTCGGTTGTAGGATCGATGATTGCAGTTGCTTGGTTCAGAACCAATTGTGATTATCTTTTAAATTATTGATAGCAAATTGTTTGTGATATCTTCGTGTTTCATGCACCTATCATAATATGACATGTGTTAATGACTTTGTTCGAACGCTTTTTGTGTGATACGCCCGT-TTTGTATCTCTGATAACTAACTCTCTGCCATGATAGCCAGTTCATTCATTCAGTTTGTACTTTTTAACTTGAATTAAATAAATTTGAATAGTCGCGAAGCCAGGATTTCGACCGTAAACGGTAAAAGAAATATATATATATATAACTATAGCCACTGCCACGCCGAAGTGAACCGCTGATACAGACACACACGCAGCTGCACTCAAAGACTCGTAC---TCATATGCGCACCCACACACTTGCATGGCACATATGCAGACCCATAAACGGCAGAAAAAAACAAAATCGCAAATTTCACATTCAA-TTAAACGACATTCTCTTGATCATACAAATCGAAAAACGAAAGAAAAAAAAA
TTGTATGTGTGAAAAATGTGTGGTGTT-----AATTT-----GGCGTGGCAGTAG---GGATACATTTTAAGTATA-------------CTCACATATTTAAAGGGGTTACCTGACAAATTATTGGTTGTGTAGTTGCAATTTGAATTTTTTTTGTTT-------TTTTAAATTTTTTTATTTTTAATTGGTTACAAATTATTTGTGAT---------------------------ATATGACATCTATGCTTAGCTTT----------------TGTATTACATACATATTTATGTCCAT------------------------GTGTGTGTGTGTATTCAG-AAGCACTTCTCAATATT--TTAAATACCTTGTTTTTATGGAATAG--------------GTACTCGTTTAAAAAAAAATCTAAACATTTTCTTTAACCTTCTGCCACGCCGATG--------CGTTACA-------ACACAAACACTTTTTGAGACTCGTACAAATAGTATTCGTATGCCTACACATCCAT---ACATATGTAGATTCAT-------------------AACTGCAA----CACATTCAATTTAAATTGCATTCTCTTGATCATATAAATTTAAAA----------------
>CG8950 12574726 12574806|12373 chr2R 12574784 12577481 scaffold_16 131329 134142 + 123642|0 22
TCAGCGGCGTGAATTATTTGTTA
TTAGGGATAGGAAATGATTGATA
>CG30460 12580822 12581644|12377 chr2R 12580505 12580936 scaffold_1 5705331 5705722 + -2730|339 457
TTG---CAGGACGCCAAATGGAATATCTTGGATATTCTTCTTCATAACGTAATATTAAGCTGATTATTGTTATCAGAAACTTACATTAAAACAAAACATAAACTTTAAGTTA-ACAGAT
TAAAGCCGGGGCGCCTCATGTCATGTAATGCATAT--------ATGATGTATGTATACATATATATATGTATATATATACATATAT---------ATATATACATAAATATATATATAT
>CG30460 12580822 12581644|12378 chr2R 12580937 12589187 scaffold_16 140328 149250 + 133783|0 831
ATTAATTCCACGTAGCCATTGTTTTCAGTAGCTGACACCACTCACA---AAACACAGAAA-----ATGAACACTAGCCC----------------------------------GGAATGAAGACGTCCTCCTGGATCGGTTT-------TGGGATCTTAAATA------------TATACCAAATGTAGTTGTTAAACGCAAACAGTTTGCGA-AGAGCGCTAACACCGCT----TCTATACATAATAATACGAATAATATATATTTTAATACGAACCAAATGAAACAAAAC--AAAGGTTTTATGTCGAGCAAACTT-------------------TAATTAATCGAACTAAACTTGGCATTTCTATCTTACACATTTCTCTCATCTTCAATTGC-----------------------TTAAAATACAAAAAAGCAAGCAAAAAACGCAACTGAACAC-TTTAACAAAGTTGTTGATTAACAAAGACTGAACGAATTTAAA-AAATAGCGATAAAAAAAAAACACTTGAATATCCAACGCGACAAGAGCA---AAACTATTTTTAAACATTTTTTCAATACCTAACGCAGCAACTCCATTGTATTTGTATTTTGTAATCGTTTTACTAATT--ATATAGACACAGCTTAAATATATATAAATATATATGATAAATACGGATTCGAATCACCGATTTGGTTGAATATAAAAAAAAACTTGATTAAAATGTCGAATTTGACTTAACATTCATATGAA-CACATCCGTTTGAATTCCATTGGTCAATTTCTTACACAAAGCTTCAAT------CAAATGTTTTTCTTTTTCAAT
GCT-----CAAGGAACTATTATTTGTAGTTGTAGTTGTCGCACACACACACACGCAGAGACACACACGAACACAAGCACACACACACACACACTCACACAGTAATGAGCTGCGGCGGTGGAACTAACCTGTTGGCTGGCTTGGCAGAAACGGGTTGTGAGAAAGAAGGAGGTTCTTATACCAAATGTAGTTATTACATGCAAACAATTTTTGAGAGATCGTTGATATATGTATACCCTAAATGCAAT-ATGCTACTTAAATATATTTTAATAATAATAATAATCAAAAAAACGTAAAGGTTTGAAATCGAACAAAAACATATGCAATATAATAATAATCATAAATAACAAGAAACTTGGCATTT-TATTTTTCAAATATTTCTTAATTGTAATTACGAATGTAGTTTTCTTTTCTTTTATTAAAGTATAA------------------CATTTAAACACTTTTAACCAAGTTGTTAATTAACAAAGACTGAACGAATTTAAACGAAAAGCGTT----GAAAGCCACTCGAAAACAAAATTATACGAAACTATTCAAATAAAATTCAAACAATTTTCGAAATCTTA----AACACTTTAATTATATTTGTATTTTGTAAACTGTTTACTAATTTAATATAGTCACTGCTTAAATATA-ATCTAGATACACCATATTTA---ACTCGACTT---------------TATAAAA---------ATCAAAAT----AAATGGATTTGCTTCTCATATTCATTATAATTGGTTTAAATTTATTTTGAAGCTGTTCTCTAAGAGTTTTAGTATTTTCCAAATGCGTTCGGTATTTGAT
>Sply 12603297 12603582|12392 chr2R 12602600 12605250 scaffold_16 167807 170651 + 91428|865 1248
ACACCTGGAGCAATCCCCGTTCTCTTCGCCCACC--CCACGGAGCTAATGCATTTCCTGTGCTGTATTTAA-ACCACCAAA----ACACCCCGTCGTTAAACCTTCCTCAAGCAATTTATATTAGG-----------ATGCAATTA----GTGCTGTAATCGAGGGTACAA-----------------------------AACGTCGTTCTACGCGAAA-----ATCTATCTAC-----------------CTATGTTCATCCCATTTGTCAACATTCGTCGCTCTAAGAGCC--------------ATGTTATTAA------AGTGTTTTTCTGTGTAAC--TTGCTAGTGAAATAATAATATAATATTA---ATCAATTTTT
GTGCTT--CGCCATGTCAGCTGAATCCAGCTACCTTTCACAGCACTCACATGTTTCTAGTGCAATATTCCATACCACCAAACTTGATA-CTTGTTGTTAATGTTCCCACTCGAAGTATCCATTTAGCATTAATTCCAATGCATCTATATCTTATTGTAAACTAGGGTAAAAAGTGTTTGTTAATGAAATTTATTGAGATCAATGTCTTTGTATGAGAAGCTAACATATGTCAACTGTGCAGTGCTTATTTTTTATACTTATTAAATTTTTTCTATGTAATCGCTTTAAAATCTGTCGTTTACATCAAATAATATCAACTGTATAGCAGATATATTCGCAACAGCTGCTAGACAGCTGTTATTATATTTCTAAATATAAATCTTA
>GstS1 12608116 12608923|12397 chr2R 12608091 12609944 scaffold_16 174014 176098 + 70214|25 1134
GTT--------------------------------------CACCGAACAGG-ACTTGGGAGGATGGGAAAGCATTGCACAACCAC-TCAGACACAACCGCACCGCAGAAATGCACACCACCCACA------------------------------------------------TCTGCACACATTTTGTTCCTTTTTG-----------------CGGAGGATCCGAGAGGACGGCGGATTT--TCGCACGGGGT------------------CATAAACGCGTAGGAGTTTAGCACGTATCACTATGGATAAATCGTATTTGTTCTTAATTTCTTGGTTATAATTCTCTTTGCATGGCGCTATATACATATTTCTATTGGGGTCCGGCAGCGGATCGCCGTTCGTTAGCTTCTT------------------CTGAAATGATGAAAGATAATACTTATTGCACAGTTTATAATATTTTGGCTTACTTTTAGAACATACATTTAGC-GCACCTATGCA-------GACATTTGCTGTA-----CCTATATAT---------------------ATATATATATGCATAAA-ATACA-AAAGCTACGAGTGGTTCATCTTATAGG---CGTATTCTATTGCAATTTATTCAATGCGGAGGGCTCAATAAATATTTA-------------AAACAACACCAGCTAAGGCTGAGAAACAATTACAAA------------------------TTCTTATTTTG-------TTTTTTATACAA------CACGCCATCG--CGGCCCCAGGAATTTTCTTCGTCTCATCCAGTTCCCTTTTAAGTAGCCAT---TAAAAAAAGACTCACATCAA------------------TAGAACCGGTTTCTCCAAAAAAAAAAAAA-------------ACAGACTCTTACTGCCAAATTTCAAATGCACATAATCACATTATTATATACAT----------------------ATTATTTATTCAAAT------TTGTAATTGTATTTTTTGAATATTTTCACA---AAACAC-TTTTTAATAAACATAACACCTAAAAAGGAATGAGC--ACTTTTT
AGTGAAGAGCTAACAACAAATTAAAAAAACAAAAAAACCAGCAGCAAGCCGGCAGAAGTGCGGAGGGAGAATCATTGCACAACAATAACAAGAACAACAACA--ACAACTACTAACAACACCCAACACGACACCATTATTATTATTTTTATTATTTTTTTTTTTTTGGCATTATTTTTCACACATTTTGTACCCTTTTAGTTGGGGCTTCTAATTTTGGTAGACCTGCGAGA--GGGGGATTTAACCGCACGGGGTTACGTTCGGAATTTCAAATATTTATGCGTAGTCTTTTAGCACATGACACTAAA-------------------TAATTCTTTTGGCATAATTCTCTTTGCATTGCCTCGAAAATGGATCTATTT-----TCTAGCTTTAAAATAACACTTTTAAAGTTCGTGACTATAAAAGAAAAAACCTGAGAAAGAAAAAAATATT--TTATTGCACAG-TTATAATA--TTGCTCTACTTTTAGAAAATACTCCTAGTAGTACATATGTATATGCTTAACGCTTACTATATAAACTCTATGTATCGATATGTATGTTAACTATGCATATATATCTGTATACATATATATATATCTATATGTTCCACATCCTATAAGATTAATATTCTACTATCTTTAGTTCAATGCGAAGAGTTT--TAAATATTTAAACATCACAACACAAACAACAACAACAACAACGCGGCAGCAACAACAACAGCAGCGACAACGACGCAAATATTTTATTATTTTAATATTTTTTCTTTTTACGATTTCGGCACACATTCGTCCAGCCTCAAGAATTTTCTACGTCCAA--------CCATTTAAACAGAAATCTATTGAAAAAGACTCAGACAAAACCTCAAAATTTAAATATTGGATATAGTTGAACTGAAAACAAATAAATTCTTAACTCCACACAGACAACAACTGCCAA----CATATAAATATTTTTATTTTATTTTATTTTTTTTTTTTTTGATTATTATTTTCATTAATTATCCACGTCAAACATTGTATTTGTA-TTTTTAAATATTTGCACACACAAACACGTTTTGAATAAACTACACACAAAATAAGAATTGAGCATACTTTTC
>Amy-p 12633569 12633648|12426 chr2R 12633225 12633586 scaffold_51 644262 644666 + 294|403 420
ATATGATGAGATTATAAA
ACACAATGAGATTATATA
>Amy-p 12633569 12633648|12427 chr2R 12633624 12635211 scaffold_51 644684 646328 + 93475|0 24
ACAACTGGGGAACATGGCGAACAGC
---------------GGCCAATATC
>CG30458 12673193 12673307|12462 chr2R 12673272 12674100 scaffold_16 246802 247629 + 29854|0 40
-TCTGTGTCCCCCAA-----TTGTTGACTAATGTGATAGGC
CTCTGTGAACTCCACGAATTTTGTTGACTAATGTGATAAAC
>CG10953 12680324 12680410|12474 chr2R 12680281 12681865 scaffold_16 259821 261224 + 23815|60 152
AC------TTACCAAAGCCCAACGAAAAACTGTTTCCTAACGAATCCCTACGGGGACTCGCAATAAAAAATTTCCGCCTTCAATTTGTTAAAC
ATCCGAAGCTCCCAAATCGCAACGCA--------TCCTAACGAATTTCC-CATAGAATATCAATAAAAGA------------------AAAGA
>CG6568 12920167 12920343|12769 chr2R 12920218 12922212 scaffold_16 565112 566989 + 34324|0 134
ATAAGAAGTGCCA--TCCGCGAAGGTCTGTTTAAAGGCCA----ACCAGATGTTATTGTCCTAGTTATTTTAAGAATTTAATTTAATGTATTGTTAATGCAATGTAGAA---ACTGACTATTAACAAGTACGATT
AAGTTTAGCTTAAATTTAAACAACACCTGTTTTAAGGTCGTTACACTCGCGATTA-TGTACACAATATGTTAGCATTACAATTTAA-ATTTTGATACTA-AATGTTGTATTTAGTCACTTTTAATTACTGTAATT
>CG30101 12923258 12923585|12770 chr2R 12922830 12926946 scaffold_11 1429646 1433865 + 76571|569 934
GGATCGTCCGCTGATATCAAGAGCCAGAC------GCACAGAAAGCGAGCACAAGAAGAAGGAGGACG---------------------AACAGGGAGGAGTACGAGGAGCAGCAGGCGTGACACTGACAGCCAGTCCAT---CTGTGTCTCTCAGATGCATCCACGCAGCAACGTTGAGCTGGACGTTGAACGGGTGACACGAGCGGGAGGAAATGTAGCCGATGAGAGGCCTAAAGAATTCGCTGAGTTCTTTGGCCAGGAGGAGGATGAGGAGAAGATGATGATGATGAAGAAGAAGAGGAGCCAGAGCAGAAGAGGGAGAGCC--------AGCGGGGAGTAGCAGTCAGAGGACAAACTAA
GGATTAGGAGGCGTCAGTGTGGCCCAGTTTGGCCAGCACAGAACGCGAGCACAAGGAGTATACGAACATCAAAAACGAACAACAACAACAACAACAACAACAACGAGAAGAAGGATATATGTGAGAGAGCACAAGGACATGGGCAGAGAGTCTTTGTCGCAACCACGCAGCAACGTTGAGCTGGACGTTGAACGGGTGA----------------------------------TAAA---------------------CACAAGGAGGA------------------------------GAGGAGTCAGAGCAGAAGGAGGAGAAGTTCGAGAAGACCAACAAGCAGCAGTGAGAGGACAAACTAA
>cnk 12928834 12929435|12771 chr2R 12927047 12933888 scaffold_11 1433971 1440829 + 223628|1865 2522
ATGTGTGATGAAAACTATTGTGAATGCTCGCGGGGATTAGCCCCCGTTTACTTATGTATTTATACACACGCATATAGATATATATATATATATTATATATAGCGATATTCTCGTACGATTTAG-GTATACAACTTGTTCATTTTGATCGTCTTCCCTGTCTGTCCACCAGAAACAAACACACGCATACCTGCAATCCCTTCGATTCGAAACCCACT-----------TAGATGTAAATGTTTAA----TCTGCCTTATTTGCATT-GTATTTCGGTTCTAGGCAAAA------TGTTTTACACATGTAGTCACGCAAGCAAAACAATGAAT---TATAGCGAAAATGGAGAATAACTT-TAGAAGTCTGT--GCATCGAACA---AAGACGGTTCTTTATGATTTGCCTTTGTAC-GCGATTAACCAAGTTAATCCGAGCTGTTTGATTTGCTCAACAGTTTGTGTCTAGATTGCGTGTAATATACATATATTATTAT-----------------GCGAAATGAG-ATATTATTGTAATGGCATCCAGCG-----ACGCCAATGGAGCCAGAAATGTTGTAGCGGAATGCAAGAAATATATATATACACAATTACACGAAATATACATGCATACGAATAAAGTCAACTGTACATAATA
--GTGTGATGTAAACTATTGTGAATGCTC-----------TATATATATACATATATATATATATTTACACGCATATATATATATATATCTAT-----------ACATACTCGTATTAATAAGTATATACAATTTTGTTCTTTTGGCATTTGTCCTTTTCGG--AGCGAGTTGCCGGTTCACATACAT-----ATTCCCTTGGTACTCACCCCATTATCCTGATTGATATATATATATATATAGAGATTTAGATTTATGCATATTCGCCTTTTGGTTCCACTTAGAAAGATTTTGTATTACACGCGAGGCAGCGCAAAACATATATCAAGTCTGTGCATCGATGTGGGAAAAAATGTTGTAGAAATACGCTAGAAAAGAATATTAACGAAAATTCTTTATGATTTGCCTTTATATTGAGATTAACCAAGTTAATCGAAGCTGTTTGATTTGCTCAACAGTTCATGTCTAGCATACA-GTAATAAATATATATACGCATCAATTTACATACATACATCAAAAGGCGTGCATTGTAGGGGCCGCCTCCAGGGGTAACACCCTAAGGGACCCCCAAATATTTTAG----------------TTAGTATACACAA------GATAAATCAATACGATTAAATAAAGTCAACTGTATATAAAG
>CG6550 12940526 12940565|12777 chr2R 12939231 12942961 scaffold_11 1447233 1450810 + 154549|1321 1360
CCACATCAATAAAACATCTCGTTCCAAATTCATAATTTAA
TAAAATAAAAGGCAAGGCAGTTCTTGAATTGATAATTTAA
>Bap55 12944212 12944287|12779 chr2R 12944178 12945781 scaffold_11 1452367 1453946 + 83763|34 121
GGACAGC----------GCAATCGAATTCCAATTTTAATTTTAAAGAC--GCAACTCTATGTAATAATATAAATGTGAAATGTGAAAA
GTGCAGCTCTCTGTCAATCAAACGAATTCCAATTTTAATTGTAATGCCTAGTAAC-CCGTACGATGATAT-GATTTTATATGTGA---
>EDTP 12946973 12947435|12780 chr2R 12946109 12947587 scaffold_11 1454897 1456543 + 20237|932 1528
GAAAGGATTAGCA------------------------------------GCTA-------------TGACCGTTTGTTAGATTTCATCAACATTGTTTGTT------TCTTGTTAAGTGCTACGC---------TTTCAACCAACGACTGTA-TTTATAGACCTGTTAAATTGCGTTCTTTAGTATCTGTTGACGATTGTGTAGTGTAACG-GATTACTGA----------------TTACCGATAAGCATCGAAAGAACCAGGCGATCGTAGGCAACGAGCAAACAAAATCCTGTCGTCCTTCTGCCCCGG------CTAAACCGCTCTCCTG--------------------TTCTCTAGGTTC---TCCCGCTCCTTGTTTGTTTAGTTATTAGTT--CTTCGAGAATGCAAAGCAAGTGAAATATAAAATGCTATTTGGATTATACAATAGTTTTAAGTTGTAATTTATAGTAATGTATTTTTT-AATAAACTTA-TGTGCATTTTATACGAAAGAAAGTCATGTTCTCAG----CGTAGGCCGCCTTGAGCGCC--------GTATTCT-------AGCTAAGGGTAAATAA
AGTGTGGTTGGCACTGGAACTGAAATGTGCGTGCACCCGATGAAAGTATGCCACATCCGCATCAACCGACTGACTGCTGGATTGTGGCTTTGTTGTTTGTTAGTTAGTCTTGTT-AGTGCTGCGCGTTTTTTTTTTTCTACCATGGACTGTATTTTGTAGACATGTTGAATTACGTTCTT--GTGACTCTTGTTGATAATAAACACAAATGCGATTACAAAAATGTAGAACAAAATGTAATGTACAAGTAGCCAAGTTCCTCAGCGCCCGAGGCCACATACCATATGGACAACTGTGCTCTCCAGGCGCTGGGACTGCTGCAGTCGCTCCGCCGGGCAGCGGGCAGCCAACAGCTCGGCTAGATGCATGTCGCCGGCCCCATATGTTTCGGAAACTGTTTGTTTAGTGATTGCA-------------ACAAAAT-CAAATCAGTTTAAACAATAGCTCTAAGTTGTAATTTATAGTAATGTATTTTTTAAATAAACTTATTGTGCATTTGATATAAGACTAACTTAACTGAATAGCTCCCGAACGCAGTCAGGAGCTTCTGTTGCGGGTCTTCCTCACATACGACAGCGGCATATAG
>mthl3 12963396 12963688|12803 chr2R 12963529 12964489 scaffold_9 3137501 3138524 - 3943|0 167
ACGTGCCATCAAAGCGAGATCAAAGCAACTACTA----CATGGGGATATGTACGAATCTTATAGGCATGAATACTCGGCATTTATATACCCTGGTCTATTAT---TATGGATGGAGGATAAAAACTCAGGAAAATACTTTTCGCATCAGCACTTATGTA-TGCTCACT
CAGAGCCATCGAA-TGAGCATATATCGTTTATCAAGAGCGGGAGGATCAGCTCGAA---AATATTCGTAAAAGCC--GCATTTATTTACTCTCAACCATTTTCGATTTATATATAGATCAATATGTCAGATCAAGTATTTTTATAACGCAAACTATATACTACTAACT
>mthl3 12963974 12963980|12803 chr2R 12963529 12964489 scaffold_9 3137501 3138524 - 3943|479 485
TATATGG
-------
>CG6522 12980737 12981282|12820 chr2R 12980777 12982915 scaffold_11 1488731 1490889 + 68104|0 536
GGCAG---CCAAGGAACCACAACAGTA-TTCGCTCACACATATATATATATATATATATATGTATACACAAAGGATCAAAGACACAATCATCGGATTT-TTGACGGTGCACTATATACAATATTTAATAACCAGCTAGTGATCAATAGATGCCACAGACTCAAAGTGCCTAGA-ATAGACTTGAATTTGAAAAGAAGCTGAGTTTAAATGTAAAACGCCAATCAAATTACTGCTATTCAAATTATTCCATTAGTC--GCAAATAA--TTTTATAAAATATATTT-----CGTGTCTCAAGATTTTAAAGACACCATACATCAAACAGAAAAAAAGACAAACACGAATTTTAGA-----TATACAACCGAC-TAATTTGATTGGCTTTTTAAA---TGAAAACGACGCCT-AAATATTTACAATTCCAACCGCTTTTGCAGTGCCAATAGACCAAGTAGAGTA----TATACAAATATTTTATATATAATATACAC-AGATCTATTTACT-TATTGAAAAGTATTATGTATACAGGAA
AGCGGAACTGAACCAATCTAAACAGTATTTCGAATACGCACAAAAACA-ATCTGATTAGACGCAGATTAGACACTTCTATGCCTAGATTAGCGTATCCACTAGCCATGCA------ACTGTGCACAATTACGAGGT--TGAACTCCTTTTTCCATGTATTTAAAGTGCCTAGACATATATATATATATATATATA---TATATATATATATATATATATAGTACGATATATACACTCCACACACGTTTGTTAGCCGTGCCAATAGCCTCTTATGGAACATATTTACACACATAACTGAGTAT------------GCACATTATAAAGATTATTAAGCATACTGGTTTTTTATAACATTTTTATAATGCACTTTACACAATAAAACTTTTAAAAACTTAAAACTTTAAATAAAACATAAAACATTGCTTTCATTTTTTAAGTG---------AAAGTTCAATACCTTTATTCAAATTATATATATATATTTTTAACTATGTCTATATAGGATATTTGAGGACACTATTTGCACATGAA
>CG6520 12990061 12990298|12829 chr2R 12990081 12991347 scaffold_11 1502658 1503944 + 26860|0 264
GAGCAAACCGGAGGGCAGGAACTCCTCCT--------CATTCTAGTCACTTTGCTG--CGATCTCATTGCAAGTAAAACGA----------------GAGAGAGAAACCAAGGGTTGCG------AACTTTCCGGGGGTGGAAATTATGCAAC-----ACAGGGATCTGGGTATTCCTAAGCTATTTACTCTAGTCAATTATTGTAAAGCAATATAAAACACA----------TAAGCAACAACGAAATAAATTATGTATATTGA
AA--------GAAGGCACCAACGATCCCTATTCGGGACATTCTAGTCAGTTTAATGTACAATTTTATTGTACCTAAAACGAACATTGTGGATGCCTGAGGACATTGGATAAGGGCTCCGCAACGCAATCCTAAAGACGAGGGAGAGTTTCAACTTTTACTACAAATTTTAGTTTT--TAGGGTATTTACTCTAGTCAGTTATTGTGAAGCAATATAAAAACTAAACTATATTTTATGTAATAAATAAATACAACATATATTTTTA
>CG11419 13031888 13032325|12864 chr2R 13027278 13032278 scaffold_11 1552121 1557163 + 133006|4843 5256
GGGGTATAT-AACTGCTAAAATACAACATTTAAAACATTACTTTAGTAATTTTATGCATATTT-TTGGTGTTTCTAATTAAATGCCCGTCACTTGTATATATATAATTCGAATGCAAATAAATATATACCGTCGTCTAAGCTTAAGTACAAATTAACAAACACAGTGGA------AGTGTAAGAGTTATTATTGTTACTGTTTTATCGCGATACAAATGCAAAATGTGAAAATGGAA-CGCCAACGAAAGAGTGCG---AGAATTATTGCATCGTTTTGTA---TTGTATTGCACTATC-TCGAGGATTGTCGT-------TAATGATTGGTGATTATGTGTTCGATTTCCTTGCAGCTTTCAACGTCTTGTAGTGATCCTTCTCCTCGCCGGTCTCGGGTGGCTCGCTTTCGT
GGGATATTTCAAGTCCCGAAAAATGGGATAAAAAATGGT----TAG--ACTGTATGTAAATTTATTGGAGCTGCAAATTACATGCCAACCAATTGCTTATG-ATCAGTTGAATATGTATGTATGTACGC-----TACAGACTTAAGTACAAATTAACAAATACGATTGCGATTTTAGTGTAA-AGTTATTATCGTCATTG--------CGATGCAAATGCAAA-TGTAAACATGGAAGTATCAACAAAAAATCGTGTACAAACTCAATGGAAGTTTGTGCGAGGCTAGATTCGATTATCGCCAAAAATTATCGTCTTATTGTATATATTCAAATTAATGTGTTCGATTATTTAGCTGCTTTTAGCGCTTTATAGTGATCTTTCTCTCCGGCGCCAGTCGGCGACTCGCATTCAT
>CG11419 13031888 13032325|12865 chr2R 13032282 13033851 scaffold_11 1557410 1559072 + 63877|0 60
GGAAA----------ACTTTGGGATTTATCGAAGTCTTT-------TATTTTTATGTATTT
TAAAAAAAAAACAATACTCAGAGACTTAAAATAATCTTTACAGTAGTTTTTGTATGTAATT
>l(2)k07433 13034543 13035297|12866 chr2R 13033852 13035951 scaffold_11 1559402 1561695 + 50855|910 1796
GCGGTGGGCTGAGTATTCTGAGTGGCATCTCGATTCGGATGCAGAAGGGTGGCGGCAGTGGAGCGGTTTGGCCAACGGGCGCTTGGCGCGGTTTTGGTCGCAACCACACTATTCTACAAGAT-TGCGCATTAAGACATCTATGGAAGCATAACAAAACATA---------------TACCG---------AATGTTTTTCTATAGGTCGCGGGGTTTTGGTGTTCATCGGGGCATA-TACGGCTAAAT-ACTATTTGCACATGTTT---CAAGAACAACAAATCGGAATTTACGAAAAATATTGTAGTGATTAATACAATGCGAT-TGAATATTTATTTTGAATATAAATGCATATATCCAGCCTAAGAATTTATTGTTCACGCAAGCCTGAAGCAGTAGGAGAAGCATTCAATTGTAAACGAAGAACAGATAGAGCAGGTAGATTGCACTCGACAGCCAAA--AGAATGTAATGGAATTTTGAATGAATGTATTTTTTGTTTGCAAACAGTAAGCTCCGCTGTAC-------------------------------------------------GATGATGAGGAACAAA-----TGTAGAAAATCCT--TTTTATTAATTTGTTTTATATTGTTATGAAGTTATTCATGTAAAACTTTTTCTTGGCCTTGGGCAGGCG-GAAATGAAATCGTG-------TATGGGCCGCAGCCAA-------AGTCGAAACTAATTTTAATGCCACTAGCTATTTATTTTAACACTAATTAATATTTACTTT-TTATGCGTATTTAAAAAGGAATAATAATACAACTAATACTTAA--------------ACTTATGTATATCTATAC-------------AAACAGAAAAAGA
-------GCCGAGTGT-----------------------------------------GTGGAGCAACTTGGCCCATGG--------------------------CTAACTATTCGGCAACCTCCTCAACTTAAATCAACTGCGAAAGCA-AACAGAATTCAAAGTTTTTACTACGGCACCGAGCGATTGCAGTGCTTGGGTTTTGGGCTCGGGACTCTGGGGCAGGGTACGGCATATTATGGCTTAATAACTAATTGCACATGTTTGAGCGACAGCAACAAATTGGAATTTACT-AAAATATTGTATTTATTAATACAATGCGATAAAAATATTTCATTTTA----------ATGTATACAGCATAAA---------------------------AGCAAGAAAAAAATTCAATAGGAA---AACTCCCGATA------------------CAAAAGCCAAAATAAAATCCAGCGGA----TAATTTAAAGTTTTTTTTTATCACATACAGAGAACACACAAGCACACAACAAATACACACACACACACACACACACATGAGCAGAAAATTTGAAGATTATGAACAACACAGATATTGTAGAAACTCTTTATTTTATTAATTTGTTTTAAATTGTTATGAAGTTTTTTATGCGAAACTTTTG-TTGCCCTTTGGCAAATGCGGGCTTTTATCTTGCCCCTGTCAAGGGCTCTGAACAATTTCGCCAGTCGACACTAATTTTAACGCCACTAGCTATTTATTTTAAGACTTATTAATATTTACTTTCTTATGCAAATTTAAAAAGG---AATAATACAACTAATATTTAAAGGATACCTACAATACATACATATAGCTATGCAACAAAATGAAAAAAACAAAAAAAGA
>RpL18A 13061253 13061333|12890 chr2R 13061256 13062350 scaffold_1 4104525 4105724 + 47150|0 142
GA------------------------------------------------TTCTCCTGCATCCTATACCTATGA------------CTTAGTGGATTTTTTCAAT--AAATGAGAACGTTGAAGAGTACA---CTAGTTGTGA
GGAGTAACCCGACAACAAAATCAGCTGGCGTTAACGCACTGCGTGCGTTTTGCTCTTGGTTTTCACGTTTTTAAGCAGCAAGTCTTTCTAAGTGATTCTTTCAATAAAAATGAGTACGTTGAAGAGTACAAGGCATATTATGA
>Ngp 13080308 13080721|12906 chr2R 13079254 13082603 scaffold_1 4129922 4133229 + 141968|1090 1539
AATATTACGTTTACACTCTAGGCTATAT--TTTCTTGCAAGGAAAAACTACAC------TTTAAGAATCCAAATAAAAAGTTGATCC----------------------TACTCTGAGCACTGCTTCTTCTTGGGAATTTTGCGGCCACATAAGTCGGTTCGGCTGCACATACTGGGTTCCTCCTC------ATCGGTGCTGGCCTCCGAGTCACTAGACTCCGTGTAGGAGCCGATGCCCGGAAGTATAGCGATGCACTTTAGGGCCCCCTGGTTGTATTTGTTTGTAATTAATGTGGTGTTCGTTGTCTTATCAGCAGGGTCCTTGGTTGCTTCATTTGTCGCTGTCTGTTCGACCTCATTCTCAGTGATTTTGGCTACTTTACTGGTGGTGGGCAGTTCGCCGTTTTTTCTCTTGATGCCCTGGCCGAGCAGCGTCTTCTGAGTGCT
CAT-----TGTTAAACTCTACGTTGTATAATTCGCTGC-AGCAAACGTTAAACATTATAATTAAGAATCAAATAAAACTGTTGCCCCCAAAATACAAAAGAAACCAATTTACTCGGCGCACTGTTTCTTTTTGAGTATCTTGCGACCACACAAATCCACCAGACTGTTCTTATCGTGATCGTGATCATCGGTATCGGTGCTCGCCTCAGAATCGCTCGACTCGGTGTAGGAACCAATGCCTGGGAGTATGGCGATACACTTGAGAGCGCCAACATCGTGTTTGGTTGTG------TTGATACTAATT---------------------GTTGCCTGTGCTGCTGATTTCTCTGCGGGCGTTTCCTGCTCCGTTTTGGACACCTTGCTGGTTGTGGGCAACTCGCCATTTTTGCGCTTAATGCCCTGTCCCAGCAGTGACTTTTGTGTATT
>CG14482 13087195 13087265|12909 chr2R 13084261 13087648 scaffold_1 4134836 4138397 + 100997|3296 3368
CCTTGCCTGCCGTAGTTGAATCCACAGTTAGCCTCGATGTTTTGCT--TGGTGAATAAAATAAGTTAAAACGA
TCT--------GATGTTTAAACTAGATTAACAAAATATGTTTAAATGATGGTGAATAAAATAAGTTGAATCCA
>Dcr-2 13089842 13090257|12912 chr2R 13088769 13090132 scaffold_1 4139793 4141497 + 32309|1305 1727
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TTAAAAGTACATTTTATGTAATCATTTTAGCTATGCAATAAATTTTTTATACAAAATTTACCATTATTTATGTACATGAATATGGTTCAGCTCAGCTTTCAATTGATTGGTTTTAGTTAAAATCAAATAAAAAATATGCCTAATCCGTGAATGACATTTGAGAACTTTCATGCAACAAATGAATTTCCAAAGAAATACATTAATAAATTACTAAGTGCATAAAACTGTCCCCAACAGAGATTGAAGAGAATTGTTAGTGCTATTTGATGGA-TAGTGCTGTGTAAACTGCCAGGACATAGTTATATTAGCTATTTTTGTTCGCCATTCTGTTAACTATAAAAAAGATATGGAAAAGTGGAGTCTACACAAATCTTGGCCCGGACCTAGCCGGGTAATACCAATCAGCACTAAATAAGTGCACA
>Dcr-2 13089842 13090257|12913 chr2R 13090180 13091696 scaffold_1 4141552 4143062 + 56608|0 86
TATGATGATTCCAGCCCAGTCTA---GTTTCTGCTAAACTGCATTGAATTTGCTTTC---TAGCCAAGACGTAAT---CCTTTGGAA
----ATGAGTCCAATTATATTTAAGTGTTTTTG-TAATCTTTTTTTCTATTATTTTCAGTTTGTCAGCATGTGTTTTCCCTAAGGAA
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TTCCGTCAGTGTAGTTCTAATTAGACTCAA--TTAGTATAATTCTAATT---AGTTTGACAAGATTTTAAGTCTTGGA
TTTTGTTAAATTTGTTTAGATTGGATTTAAGCTTGATCTAAGTCTAATTCCAAGTTTTCCGAGTTTTACACCATAGGC
>CG6484 13096775 13096992|12920 chr2R 13096848 13097683 scaffold_11 740593 741420 - 25505|0 146
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CAATTAGAGCTGGGCCTAAGCATATACATATGTATGTACATATGTCT--AGTCTATAGCTTTAGTCTCTATCAATAAGAATTAACAAATATATTTTCAAATACTAAACCAAT-TGTTTGCAACTTACTTGATAGAATATACATATAT
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TTTTGTTTTAATCGCGCTTACCGCGTTC--TATTTATTACTCCAAAATCTAATCCAATACATATATA--TCGTACATTTTAT--------CTG
---TGTAGTTGGTGCGCTTACAGCGTTTAGTATATAGTATTCCAAAAGCTAATCAGATATTTTCACAATTCATACACTTTAGACTTACAATTT
>CG10936 13119814 13120215|12935 chr2R 13119734 13119953 scaffold_11 764190 764385 - 3480|83 225
GCTTA-ATATACGTATGAAGGAAATGTTTCTTAATAGAACGTTAGGGGCGTGCCCCGGAAAATAAATAGTCATGCACTCTTAGTTAATCCTAGGTCATATGTAAAAC--TAGATACACTAAAATATATTCTTTGTATTATTTG
GCTTACATATGTATATGGA------------TATTAGGAGTTCGCATGTGGGCTTCCAGAAATCAATAGTCATGCACTTTTAGTTAATGCTAGTTTGTA-ATAATATTGTAGACACATTAAA---------------TAATTA
>CG10936 13119814 13120215|12936 chr2R 13120116 13121368 scaffold_11 764796 766032 - 56467|0 107
GCGG-------GCTCTCTCGACTGGACTGGAGTGGAGCATCCATCCATCCGTGTACTAGCTTTAGTAACT-TGCAAACGATTTTGAATTGTAACTAAATAGCGTAAAG
TTAGTCCATAAGTTCCCCCAAC-----------------CCCGACTAACCG----CTAGCTTTAGAAAATATGCGATCGATTCTGTGTCGCGACTTAATAGCCTAAAG
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ATAATACATGCTCCACTCCGAAGTTGTTTCACACAATAAATCATTAAAACAAAAGCCAAACAACAAATACAGACACAATTAACTCAATCCGCCTGAAGGTTCAGGGGCAACATCGTTTTTCGTTTTTTTTTTTTTTGAAGTCTTCGTGGTTTTCTTTAGTTAGGAGCTTACCAAAT---TCGAGTCTAAGATTAACTAATTAACTATATGCGCTAACTATTTGAACTAGTTTTAGCTGTAAGGATATTGAAATATTACGTTAAGTATATACATAATCGATATACACACAAATTATATTTGATATTGAAAGAAAATATAAATAAATAATTTGTTATTGCGCCAGCAA
>rhi 13146817 13146832|12960 chr2R 13146484 13147021 scaffold_11 796810 797350 - 8961|357 372
AGATGCCTAGTACCGG
TGATGGTGAGTTTCTA
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ATGTTCGTCCCACTTAATCTTAAAGCATAAAGTTGTGTAGGTTTTTAAGTTTCTATTGTCTGCTG---------------TCGCAGTTTCATC---ACCTAAAACAGTTTTTATTAGTTGTGTTTTTGGTTTAACTGTGACAGTGAAACTTAGTTTTTAAGCCATAAAACATTCATACATGTTTCAGATAAAACTATAGAAACGGTTGCCAATAATTCACCCTTTTCGGCATCAGCT-TCGCTTTGGTTTTTAACAAATACAACGTTAATTCC
ATGTTCGTTGC---TAATTTTAAGGCA-AAAGTTGTGTAGTTTTTTAAGTTTTCACCGGCAACTGCAGATATGGTACCAATCGTTAGTCTATCTTAACTAAAAACGTTTTTGATCCTTTGTGTTTTTAGCCGTATACTTTCGATTGAACCTAGTTTTTAAGTC--CAACCATTTTGGCA--TTTCAACAAAGAGCCTA--------TGCTAGTTGACTATCTAGTGGGGCATATGCTCTGGCTTTGATAAGCTAAATACAACACGTT------
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AGAGGGAAACATGCATCAGTTTTTTTGATGGCCAGTTTACCACAAAATTAGTCGA--------------------ATTTTCGTTGTTTATGTTGCTGTTAGTTGTAGTAAACCCCCCGCCCGACTTG------ACGT-ATCAGCAGTTTTTCTGACGCGTTTGAAACGTGTCTCGGCGCATA-----CGTAACTGTTGTG---CTTATATTTAGTGTTT---------------------------------------TTTTTCTGTCAAGGTTTAGTTAAATTTATCGCTTAAACACAGCGCACTGTGC---------TATGCTAGAGAAA-----GGGCATTACG-ATAACGCTTGTAT-GCCTTTTGCTGCTACGCAGTATACGAGGCGGCACATCTATATGTTTATTTGATAGAATAATTTGTAAGTGCATTAGAGCTTAGACATATGCATATCACATATATAGAAACCAGATTCGGGCTATACAAA---AATTGGCTATGTTTTATTGAACAAAAGTTTTTGGTCGTGCCCAGAACTGTCGAACCCACCCACAAATCAAATATTTTTCTCGAAATTCACGACGATTATTATTCTGTACAAGTATTTTGTTAGACTGAAAGTTTTTCTATACACATTTTAGTTTTCTATGTGCATG--CAACAATATGCTGTTTAA--TTATATATTTTGTGTTTTGTGGCTAAGAAAAGCAATATAAATTGTATCTAACATAAAGCTCAATAAGGAATTGAATATAAGAATATGTATTTTTGTAACTTTATATTGTACGATTTAGGCTTAAGGAAATTACACGATTATTTAACGTTTACTTCTGCGGTCAAACATAAATGAGGCTGTTTCGTAAGAACTGAGATCCCTGGACACACCAGCCCTTAAAAAGTAAATAACGCACAA-------AAAATGATTGCACACGCCTTAAAAAATATATATATAAATTTATATACATATATATAAAAGCCTAT---ATTTAGGCTTTAAAGTAAATGTGAAGATACAAATTTAGGCTAAGCATTATAATAAATACATACTTGCATGTATTTTAAAGCAGAATCAGCATTTT-ATATGTTTATGTTTAATTTTTAAGATGTTGTCCGTCC-------------------------------------------------------GTAACATGCAATTTTTTATAAATAATAATCATAATATATTTTTATATGTAATTGTATCTAATATTTTAATGTCTAAGTACAACTTTAAACACAAACACGAAAAGAAAAAAAAAAAAACAAAATTTTGAAATTCAAAAA----AAAAAAAAACATAAATAACAAAATCTCTAGAATCAGGAAATGGCAGTGCTCGAGTAAATCCGAAAAAAACATCATCAGATCGAGCACATCCTGAAATTCTCATATTGTGATAGATTTTATTAAAATTTTAT-ATGATAAAAACGTATGCCTTTTAGGAAGAAAAACAATGATATAAATTTGGAATAGAGTCGTCTTTGCATGCA-------ATTATTTACGATTTTATTTTTCGATCAGAA----AAAAACAAAAAAAAAACAT--AAAATATGTAAATTTTATAACCCACGTGTA-----TTGTACTTGATATATTGTTGTAAAGGCGTTTAACGAGCTATGGTAAAATTTAATAAAGTCGTCATTTTTT
>swi2 13205137 13205950|13030 chr2R 13202109 13205882 scaffold_11 3827092 3830983 + 128332|3138 4014
TTTATTCTTGAAAATCTACAAAAACAATACCGGTCTTTGTATCATATATGAATATTTATATAT---ATATATATAAATAATGTTGTTTAG--GTATTTATGTATGTATATTTAAGCTAGG-TCAACGCAAAACTCTCAAAATAGTT---GTTTTCCACACTATTGC-----------------------ACTGTTCAAATTGTTTTGT-----ATGGTTAAAAACATTCGTTCTCACGT------TCCTACATATTTGACGGTTTATTTTAAGCATTTATCCTGCA-----------TTTAAATTGGCACAAAGCGCTTAATCTTTGATAATGAGAAACAGCTA--AGATAGGTTTATGTTTGCAACTGGACAGAACGGAATCTGTGTGAATTTTAGGTTAGTTACACA-----TTATTCCATTTAAATGAATCTAATTTTGTATA----------ATGTATATTTACAA--TTAAAAACCTTGATTTAAATTCTTTGGCTCTCGAAATCAGTGCAAAATG---------TCGCATCTTTTCGGTCAAAG--CAAATGCAAAATGATTAAAAT--------AATTGTATAGGATACAAGCTTATA---------AATTAAACAACAGTGCTGGACATTGTAAACAAAGCTTAAAACATTT-----------TTGTACTTTACATCAATCAAGTGAAA---ATTCAAACAAGGCTTAATATTTCGCTGGCTGTAAGCGGCATATCTA----------AAATTCTTTTGGTTTCCTTCGTGAGTCCATTGAATGGCGGTAAAAAAGGTCG-----GCAATGTTTCTTATAAATTTGTTGTATAAAAGTCGAAGTAAAATTTAGATCGTTTAAAATT-GA
TTTATTTTTTAAAAAATTATGCTTAAATACACGTGTATTCATCGCGATCTGATATT-ATATGTTGCATATTTGTAAAGTATGCTTTTTAGTTGTATTCA---ATTCATATTTGGACTAAAATCAACACAAA-CTCGCAAAATATTTTGTATATTGCACACATTTCCTCTTTGCAGTTGCAATTTACACTGCTGCTAAAACTGTCTCGGCGGCAATTCTGATAAATATACACACATATATAGTATATAGTATAAGTATATAAGTATACTTTA-GCAATTTTCATACACATTGACGGCTTTTAAATTGGCACTATGCGCTAAGTTTTC---------AAACAATTTGTAAATAAGTCCACGTTGACATGGGTATAG--------CTTTATGAGT----AGATGGTTCCAGAGCCTTTGATGCCCTGGCCAAAAATTCATATTTGTATATAAGACATTTATATGTATTAACTAGTTTACAAATTATAATTAAAAATAATAAAT-----AAATTATTGAAAATTGAATTCCTAATCACAACTTAACTATCCCAGTTCAAACGTTTCACTATTTGGCTCTTTTTCTAATTACATAAAATCAAATATTTTATCGAATTATAATTAAACAACAATTGGGTGTACTAATAAAAAAATTAAAAACAACTACTTTAGGATATTGTACTTTACAAGAATGCAGAAAAACAAATGTACATAAGA--TAAGATTT----GGCTAAAAGCTGCGCATCTAGTTTACACAAAAATATTTTT------------------------------TAAAATATGCTGTGCTAACACGAGCTCCAATTATTAGATTCTAGGAGAGTAACAAGCACATATAGATCGATTAAAATTTGA
>swi2 13205137 13205950|13031 chr2R 13205883 13207740 scaffold_11 2834162 2836022 + 63084|0 71
TCTCTAGATCTAATGTTAAAGGAAGTTCAACTCGAAAGTATTTCTCAACCACCGAC----GATGGCTTTCGG
TTTTTAAATAGTTGGTTCAAAGTATTACAAAT-GTAAATAGTTGAGGGTGTTCGACTAGAGATACCTTTTAG
>rdgBbeta 13210636 13211090|13034 chr2R 13210127 13211913 scaffold_11 2845353 2847269 + 29591|576 1125
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GAATATTGTTTAAATGACAGCTAGTTGAATTTTTGTGAATGTTATACCAAATTATTGCCAACAGGGCCGGCAGACAGTTTTAACCTATAGCTCAATAAGATAATGTTATGGGACATTGCGAGCTTACAAATTTCTCAAGTCGTAGCCATAGAAAGTACACATATATA---------CTACATATATAAATGGTCCAAATAAGCTCAAGATACTAAATCTGACTTGCAGATAGACATAGAAACAAATATGAGTACT---------ACTCGTAACCAAAAAA--GAAAAACATTATATTTATGATTTGCATACTGATATATTTATGTGG---GCAACTATTTTAG-GTTTGGTTTTTGTTAACTATTCTCTTTAGTTATTTGATATGTATCCTCGTACATAATACGCAGAAGCTGTAGATTTAAATGCGCTGATGACTTAAATGTACAAATACAAA--ATTAAAAATAAACGAACGTAATTTGTGTAAGTAGTAAACCTTTTGTTGCAACTTTATTGCTTAGATAAGATCATACACATGCCTCTATAGGTTT
>CG6424 13218200 13219342|13046 chr2R 13218193 13220669 scaffold_4 45222 47908 + 47989|7 1433
GC---------TACGGCTACAGATATCCTTCTTC-----------CATTCATCCACGCATGCAAAACTATTTATTTCATACCCAACCAAAC------AAATACA-GACCTAGA-TCTATACAAATTACATGTAT-----------------------------------------------TGTAGTTTTTAGACTTATATTTACCATATATTCTATAATGATACATTTTATGAATATTGTTGATTCCTTATTGTTTTTTGAAAACACATCTATTGAGTAATTGTAATAAAAGAAAATTAAATTTGATGAGACAAAACGAAAAAGGAG---------------------TGATTGAGAAAGCAAACGCTAGACATTTG----ATTCAGACCCATTCTCCTCTCCACATTA----TTCGCACGGAATTGATATCTAT------------GTGTAACCCAAGAATCTGCAATGTATATGTTCGCACTCTTCCCATTTGTGTTCTTGTAAATCGTCATTGATGTTAAAAAATGACT---------------------TGGCCTGATTTGTCCCACTTCTGAAACGGGGAGCACACATTATTCGAT-TAGCTATA---GTTTCGAACGATCTATGCGTGGAG-------GAACACGTTGC--------------------------------------AACCGCAAATCAAATAGAT------------------------------AAACTTTATAAATGTTGTCTA-----GTAGAATTGAACATTTTATATCGATATGCAAA---------------CCACTAACTAGCAACCTAT---TAACCGAAATAC-----CCGAATTATAGTTGTGCTTTCTTCCATTAAATGTTTCAGTGTGCAAATGGCACGCAACCACGCA-CGAAAAATCGAAAACATCT--GAATATTTGATAGCGTTGGAAGCGGAAGTTAAGTTTAGACGATCATAAAGTTAGGTTCGTACAC-------TGGCCGAAAAAG--TCGGGCAAATGATTTTTGTGCAACAAGCAATTG-------GGTTTTTTTGAACGTGTATACTCGGCCCTAACCAACGCATACA-ATATATGATTATACATACATATATATATTTACAATGATAAAGAATGTAAGGCGCAAGCCAAGCAAACACATATGTAACGTGTATTTGAACCACGTACTTATATATTTACATGTTTACATATACGAACAT---CCAAAGCAAAGGTATATACACGTA----TAGGACTCAACATTTACAAATTCAATATTCTTATATGTGGAAAG---CAGAGCGTTACGATTATCTCCCAGCTAACTGAAGCGATTGAATGTCTATACATAATTTGTAATGCAAAATAAAATAAAATATATCACGTT----------ATATTAAACA
ACAGTGCCCCATACACACACACACACACACACACATACACAAACAAACACACACACTCATGC-AAACTATTTATTTCATACACGAGAAATTATTTCAAAATATATGACATATAGTATACATTAATTATAAATATAAACAAAACAAAAAACAAAAAAAAAAAAAGAAAGATATACACAGCTATGTAGTTTTTAGATTTACATTTATCATATATTCTATAATGATACATTTTATGAATATTGTTGATTCCTTATTGTTTTATAAAAACAC--CTATACGATTACACTTATAAAACAAAATTGAAAATAAATTCACAAAAACATCTGAGAGAAATGTTGACACATCTTGACTTGGTTTACAAGCTACACTATAAATATATATAGTGTATATTGCACTTCTCATATATCAATCAGACTTCCACACGGAATTGATATCTATATATTCGTATGCGTATAACTCTTTGAGCCGTAATTGAAA----------------ATCCATTTTCT----AATCGTCATTGATGTTAAAAAATGAATATTGGAACCTATTTTTTTTTATTTATTTATTTGTTTAAGTTCCATTTCGCAGAGAATATAATGCTCGATATGACTGAACCGCTTTCAGACATTGCATAAACAGAGTTGAATTGAATTTATTTTTATTTATTGATTAGTTGTAGAGTTCTATATGTTTGTTAAAGCATAAATCAAATATGTATGAATAACTATGAATATTTCACAGAAAGAAAATTTTATAAATGTTGTCTATCCACTTGTAGTCACAAATTTTATAACGCTAAACAAATACAACATATATATGTCTCTCTCTCTCAGTATATATAGAATCTAGATTTGTATACAATATTATTGTCGCGCT---TTCAATCAAATGTTTCAGC------ATAATATTCATGTGCGTAGAGCGGAAACGGAAGCAGCTTCTAACAGTCGATATCG-----------AGATATATCCAAATATATATATATATATATGCATACATAGTGGGGAGGCCCAAATAGCCTCGTTCGAACGGTTTTGATTTGGTTTTCGGTTGTTGTGCAGGGTCTATTGAGGGTATTACGCAGAAGCGCATTAACACTTACACATATATATGTAAATAAATATATATGTATTTAT----------------ATGCGCA-------CATATATATGTATATCATATG----------------ATACGAGTATAAATTTACAAATACCAAAACATATTAAATTCAAAACATTTACAAGCAAAATTATTCTTATATATTTAAAAAGGCAAGA--CCCAAATGCGACAAGATTTGTAGCGTTACAAATAAC-CCAAACAAA--AAAAAAAGTAAATGTCTA---------TGATATGAAATACAAAATAAATTATATCACGTTATTATAAAAAATATCAAGCA
>CG6410 13239890 13240244|13062 chr2R 13239991 13241636 scaffold_4 71469 73093 + 49143|0 265
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-----------TTAGGAACAGGCAACAAGGTTCATC---GTGTGCGTGTGTGTACAATATTATGCTGAGCATAACTCTATGCATACGCACGGCATACATACA-------------TATATCTCCCAAGTGCATATCAGGCGAT---CCACAACAAGGCTCACTATATCTATATATATATATATATACACATCAGAAGTGCTTTAGTATTCAGTTTGATATTAAGTCTAAAAGAACATATAAATATTTTTATAGATATATATATGCG
>CG6406 13249272 13250178|13070 chr2R 13248338 13249371 scaffold_51 530276 531293 - 41039|946 1047
CATATACATGTGTAAACT-AATATATA-CATACAAATATTTATTGAACGTTGACTTGAACCATGTTATTGATTTAAAATAAATACAAAAACTAAATACGTAA
CATATGTATATGTAAGCCCAACATAAAGTATACAAATATTTATTGAACAATGTTAT------TGTAATTGACTTAAACTTAAAAGAAAAAATATATATATAT
>CG6406 13249272 13250178|13071 chr2R 13249895 13252607 scaffold_51 531993 534677 - 86119|0 309
TGCAATCAATCGTCTCGTTCCAAAGGCGATTAGCCAAATCCAAGTATCAAGTATATAAATTTACAACTACAACTGGGGTGAGTGGGTTTTGTATGAATGCAATAATAGATGTAGGCAT-TGTGCAGGCATTTTTTTTTTTGTAATACAAGGATAATTCTAGGGCATTTCGTTTGCAATTTTGATCAAG------------------TTATACCAATATATATAATTTATCATTATT----ACCAGTTTGTCAATATATAAAGTAATGTTTCTGGTTAGATGCAATTATAGCCC---CTGCATTTTGGTCG
CGTGCCCAA-CATC--------AAACCAATTAGCCAAATTCAAGTAT-----------ATTTATTACGATTACTCTAGCTACATATATATATATATATATATATATATATATATACGTATGTATTCGCACGTTACCTCCT------CGGTATTAACTGACGAACAAAACCCGTAAGATTTGGACCCAGGCAACGTTGGGACGTTTTTTGAACTGGAACATAGAACGCAGCAATATTTAAAAACCGTTTTTGAATTTGTTGAATAATGAATATTGTCACATTAAGTTGTTGTTCGTATTGTATTCTAATTG
>sub 13260358 13260835|13074 chr2R 13258960 13260683 scaffold_16 2857714 2859434 - 24854|1429 1762
AAGAAACTTCGAGCAAGAATACCAGAATCGCAATTACCATAAATGTTCCGTACGCCTGCCACATCCACTGAAAATCCACAATCCTTAGCGAGGTAGGGTGCTCTCTTT----CCTTCAACTGCAGGCTGG----GATCCTCCAGACCGGACAATCCAGCTGCTGTCATGTCGTAGTAGTGCATTCCCACCCAGAAGTCATAGAGTCCATTGGCATTTACCTCCAAAATAAGTTGGCTGACGGGCTCTGTGAACAAGGAATTCTGCGGCCATTGGAAAGAGAGCAGCGCCAGGGACCACAGGCAGTCATCCGTGGAGTAGATAAACAGCTCTCGG
AAAGGATTTCCAGCACTAATACTAATGTAGCGAGCATTAAAAGAGCTCCATAGGCAATCCAAATCCACTGAAGATCCTCCAAGCGGAGCG-----------CCTCTTTAAGTCGTTGAGGCTCACGCTGGAGCGGATCAGTGAAGGATAACAAACCCGCCGCGGCCATGTCATAGAAATGCATATCGACCCAATGCTGAAACAGTCCAAAATCCCGTGCATCCAAAATCAGTCTAGTAATAGGCTCCAGGAACCAGGTACTTTTGGGCAGCTGAAATACCATGTGCGTGAGTGTTCGAATGCAGGCATCCATGGAGTACAGAAAAACCTCGTGT
>sub 13260358 13260835|13075 chr2R 13260740 13262938 scaffold_4 2627928 2630145 - 65132|0 95
TTTCTTTAATTCACAATTTTTAATTTGTTAAGTGTTAGTGATTTTAAAATTTAAATTTGAAACTTGATATGTTGCAGAGTTGGCCACGTTTTCCAA
TTTTTAT-----ACGCACTTTAGTTAATGTTGTGTGTGTTATTTTCTACTAAGAGTTCGTGCCCTATTTTTTTTT--GGTTTGCTGCGTTTTAAAA
>CG6385 13268410 13268438|13081 chr2R 13268096 13268440 scaffold_4 2638121 2638412 - 2942|319 347
AGATTAGTCTCTTCCACTTCCAAGAACTC
AGGTAGATCCCTCTCTCTCTC-----CTT
>CG6370 13279435 13279543|13088 chr2R 13276011 13284970 scaffold_4 2643751 2653001 - 299959|3708 3931
GTG-----------------------------CGTTCATC-----ATTGTACGAAGTCAATAAGTG--------------------------------AGCTACTCTCTATCTTGCAACACCATCAGAAAACAAACTTTAATAAAGCGATTTAGTTAAGCCC-----AAACACACA--------------------------------------------CTAA
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>CG14488 13282028 13282129|13088 chr2R 13276011 13284970 scaffold_4 2643751 2653001 - 299959|6533 6648
ATGTGGAAATTGTATGAGAGTAGTGCCCACAGAATATTATTTAATTTTGATCTTTCATTGTAAATGTTACATAAAAATTAA---------ACTTGCAGTT-----TGAGAAATTCT
TCCAAAAAA-------AAAAAAATATCGTTTTTGTTCAGTTGAGTTTTAATGTTCTGTGTGAATTTATATGTATGTATTACGGACGCAACACATACAGCTAAACATGCAAAATCTT
>CG18635 13282671 13282710|13088 chr2R 13276011 13284970 scaffold_4 2643751 2653001 - 299959|7206 7259
CAGTTTCCGGCTA-GTTTG---TTATATCGAAGTAGGTAGAG----------TG
-AGGCTCCGAATATGTTTGGCCTGACACAGCAGTCGGTCAAGCACTTTTCATTG
>CG6355 13288824 13290110|13093 chr2R 13289064 13289384 scaffold_4 2658781 2659038 - 2215|0 321
TTGGCGTGCGAAAACTGGCTAACTTCTTGGTGGCGCGCACTGCCACCATTCAGTTCGGATTTACGATCTGAGCGGTCAAGTTGTAGTGCGGCGAGCTGCGCTTAAATGGC-GCCATTTGCGGTTCGGTGGCAACGGAGGGACTGGACTACTGGACTAGTGGTCAGCCACTGGCCAAGGGTGTGCCGCAACATGAGTGCCAGCTACAAAGTTTTCCCACTGCACGGAGACTCAATAAATGTTTAATTAGAGTGCAAAGCATACAAAAGCAGGAAATCAACTATGGCAATTGCCTACGACTGGAAGACCAACGATGTGTAAGGA
TTGGCGTGTGAGAA---GTTTGTGTTTTGGC------------------TCAGTTTCGATTTACGATCCGTGCGGTCAAGTTGTTGT--------TTGCGCTTGAACGGCTTTCAGTTTCGCATTCGCGTCTTCCTTG---CTGTGCCACTTGGACA-TGGACAGCGGCCATCTGGGCTTAAGCCCGGCCATGTTTAC-------------GCCCAGCCGCTCGCCCCCCCAAGTGCTGTCC------TGTGGCAAGTGTTAAAGAGTGCAACAAAAACGATG------------GACTGGAAAAACAACGATGGGTAAAGA
>CG6355 13288824 13290110|13094 chr2R 13289808 13297045 scaffold_4 2659266 2666461 - 252537|0 320
TCCCCTTCACCCACCCACACACACACACACACACACACACACAAAGTGCAC-ACGT-TAGTTAACTTAACATAGCTATAGACGCAATAAAGTAGACGCCAATCCAACTCAATTCGATTTCAACAACCAACACTCTGTCAGCCAGCATTTCCGACTCCGCAGGCAAATTGATTTGGCCTTGACCCGCATCCGCAGCCCGGAAGCCACC-GCTGCTCATGACAATTGAAAGCCA----------TGTACTTCGGAGTTGC--GTGCCAG--GCGAAAAAGGAAATTATTATCATGA-TGGAGACCGCGTCGCGAAATGAAATC
--------ACGCAACCAAATATA-----ACCAACACTTAGTTAAGCTGTTTAACGTCTAGTTAACGTATAGTTTCGATAAAGCAACTAAA----ACGCAAACGCTGCTGCTTAAAATCACATTCACATAAAC-----CAGCCGACAT------ATCCGCCAGCGAATTGTTTTGCACTTGACCCACTTGTGCG--CCGGAAATGGCCAGCCATTCAGGACAATTGAAAGCTGGCTAGCCAGCTGCCCGCTGTGGGTGCTGTTGTTAGTTGCGTGTGCGGAAATAATTATACTGATTGAAAATTGCGTTGCGAAATGGACTC
>UbcD10 13303270 13303500|13099 chr2R 13301190 13303328 scaffold_4 2669862 2672099 - 72515|2199 2258
TGTAAAAGTAGCACTGTAATTTGAT-GCAAGTGAGAAATACATGTTCGTTATGTTAAAAT
TATGTAAACAAAAATCTCATCTGTTAGAAACCTAAAAATAAGTATACATAAT--TAACAC
>thr 13376356 13376460|13195 chr2R 13376180 13378440 scaffold_4 2760753 2763130 - 30881|186 298
TTAGATAGTAGTCTCCTTAGTTCGTATTTATTCTTATCGAAAATGTC---TTGGTATTTAAATATATATA-----TATATTGTGTGTAAGTGTTACAAAAGAGCTTTTGACAT
TTA---------CGCTTAGATTCATACGCGCTCTCGCCGATATTATTTGATCAGTTTTTTTAGTTTTATAGCACTTGTCTTTTTTATATATTATTCAGCAATAAATGTTACAC
>Mapmodulin 13381882 13382072|13197 chr2R 13380992 13382330 scaffold_4 5220668 5222194 + 17963|1082 1364
-ACCCTGATCTGTCGGTATAGCGTCTTTGTACGTTATAAATTTAAATAT----------------------ACACCCACACACAAAACAAAAACACACACACACATCATATTTTGATA--------------------------------GAAAAAGATGATAAAT------------CCTTTAG-------------------------GAAACCCACAATTTGTTTCTCTAAAATGTAAGCT-AATGAAAGAAGAAATCGACAAAAAGAAAAAACAACAAA
CAGCATGATCTATAACCGTATCGTCTTTGTACGTTATAAATTTAAATATATATACACCAATACACACACACACACATACACAAAATACAGCAACAGGAACACACATCATATTTTGATAAAACAAAAGTGAAAAATAAAACAACAACATAGGAAAGAGGAGATAAATAAGAAGAGGGCCCCATTAGAAAAAGATTTATAAAAACAAAAAAAAAAAAACAACATTTGTTTCGTTACATTTTAAGCTAAATATTCTAAACACCCGACAAAACAAAACAAAATGTAA
>Bc 13402076 13402274|13215 chr2R 13402127 13402268 scaffold_50 739007 739139 - 122|0 141
GCTCCAACTAACAGAGATGATTTTAAGAATCAATGGAAACGGACTTGAAAACGGAAAACTCTTGGAATCATATACACTTTTTGCTATTAACTTATAACTAACCAAACTTGTGCGCGTTTATGTGGTGTTTTATCGTTTCTAA
TTCTCAACT---CTAGCTGATGACAATGAT-GATGACAACGACCTTCGCATAGATATAATCAT--AATCATAT--ACTACTTGGCAATAGCCTATATTGCATCTTGATTGAGC-TGTTAATAAAACGCATCATGGCATTTAA
>Bc 13402076 13402274|13216 chr2R 13402269 13402803 scaffold_4 5252023 5252580 + 23925|0 5
ATGATT
ACAATT
>PpY-55A 13470258 13470406|13311 chr2R 13470046 13470369 scaffold_4 1008976 1009275 - -399|214 332
TTAAATTCGTACAATAACAATTCTTTTTATGTAGCTGATATATCAAATATATATAC-TATATATACGTTCACATTTAAATATTTAACCAGAAAATAAAAG------ACATTAGTTACTA
TTATATATGTTTAATAATGATTCT------------GATACTATATATATATTTTCATTTTTGTAATATTAATTTTATTTCTTTGATTATAATATAAACATTTATTATCTCAATGATTC
>CG5773 13557767 13557975|13428 chr2R 13557576 13557999 scaffold_17 1348907 1349290 + 2110|199 422
GTTTTGGAAAAAAAAGTATTCAAGTTAATAAAGATTTTGAATTTGTAATTATTCAAAAATTTTT---AGTTTATTATAT-ACAACACGATAAGATTTCAAAAAAAAATTGTATGTTCA-------ATTGAAAATTAATTGATG----AACAGCGACTTAACGGTCTATCACCATAATGAAAAATTAAAAATTAAAAAATGTATTTTATTAATAGAAAGAACTTA
TTTTTGAGAAAGTAAATTTTCAAAATACGGAAGTTTTTTAAAGTTTGAGTGCTTATACACTTTTAAAAGTTTGTAATATGATTACATTGTCAAATATTTGGTA-----TTTATGTTTATTTATGTATTTATGTTTATTTTATGACATAGCATCTATTCAATAGTTTTTCTCCCTTTTCAACAACTA-----------------TTTAGCAGTAAAAACAGTTCT
>CG5765 13565089 13565168|13437 chr2R 13564114 13565252 scaffold_4 5483879 5484993 + 3896|1022 1123
GCGTGAGAAACTTTGTA-------------TTATTTATT---------GCATTCAATGAGAAAATTTAGCTACGTATAAAGCGTAGAATACTTTTGGGTTTG
ATTTGCGATGTATTGTAGTTTGAATGAGCTTTATTAATCAAGCGGAAGGCATGCATAAATAAACTTTATCAATTGATAA-------------TTTATTAATA
>CG10911 13567410 13567493|13441 chr2R 13567345 13567538 scaffold_3 5311791 5311970 + 1735|65 155
GC-GATCGTTTT------AATTTTAAATAAAAGCATAAACGAATAAAACCCAAATAAATATAAATATCTACTTTATTTATTCGAAAATAAA
GCCTATTATTTAGAAACAAATTCAAAGCAAATGCATAAACAAATAAAATC-----AAATACAAACAAAGAC--------GACAAAAAAAAA
>CG5757 13608591 13608775|13503 chr2R 13608547 13609396 scaffold_4 5543324 5544122 + 16573|48 234
CACACGTCCTCGCGTCGCCATTCATTAGAGGGGATTTACATTGATTTATGCAATACACGAATGTTTGTTATAAATGTTTTAAATGCCGCTTAACTTTTAATTTACGATAAAGCCGCAGGCAATAAATCCTAGCATCGGGCGATTGG--AAGGATATCGTTAGGTGTTGAGCGAAATGCATTTACAGA
GGCA-------------------ATAGCAATGGATTTCCATTGATTTACGCATTGCA---------------------------GACGCTTCACATTTAATTTACGAT------GTGTATAATAGATTTTAGGTTGGCGC-ATTGATTAATGCATTTGTAAAATGGTGAAAAAATAACAATCCC--A
>CG5756 13615913 13616113|13506 chr2R 13615314 13616518 scaffold_4 5551802 5553000 + 21758|689 916
ACGAGATTTTGAG--------------ACGAACGAGCTAGGACTAGTACCTTAACTTATAGCTAAATTAGTA------------AACTATTTATGCCTAAGCTAAGACTACAATTGTACCATATATAGATCACTTTTTTAAAAATCATACTCTACTCGTATGTATGTGTGTGTATATTTTTGCATATTTA-TTGATAAATAAAACGAAAAAATTTACAAAAACCCGAA
GGATGAGGATGAGCAGCTCCTCCTGCTGCGGACGACGTGAGATTACTACTACAAA----AGCTAAGTTATTATTTATGTGCTACGATAATTTAGGCTTAACTTAA---TGCAATTGTAAATTATATATATATATATATATATATTTATA-------TATATATAATATTCTATTGAATTTGCTATATTTATTTAATAAATAAAACGACGAAATTTGTTGAAAACGATT
>stau 13632759 13634643|13517 chr2R 13632096 13633506 scaffold_4 5566433 5567982 + 2871|771 1685
CGTAACCCCATTACTCCCCCCTCCCCCCCTCCCCAATACACACACAT-----TGCACACACCAAC------TGAAATTTCGAGAACAATAGTTTTAATTACTTTTATCCCG--AACAGCACCAGTTGATTAAGCGTTAAGTTGCGTTATGTAAAA-TGTATTTTGTCTAAGCCATCACGTTGGCCACAATGTGCATGATTGCTTCGCGATTTGCGATCCTAACCTAAG-------------------------------------------------------------------CTTAAGCCCCAGCGAACTGTA-----ACCGTTGAAATGAAGTCAATCCCAGTATTAA---------ATGTATAGATAGGGGGCAGTTGTGCGTAACTCCCATTAAA-----------TTACTAGACTCACAGA---------------TATATATCGTGCACATTGTTTGCG----------------------------------------CCACACAAATTGTTCATTTTGTTAGAAGATTTTGCAGACCCAGCGGATACGATACGATACGATCATAATCGTAGTCAATAAATTTTCATGTGCGAGTGTAGCGGTGTCTGCTTTGCAAAATCTTCACAAAATTGATTGAAATTATTAATCTTAATG-TGAGATGTATTCGCAGGTAGC-AACAATGCGTGAAGATCTGTTCATTAACACCAAATAAAGGCATACGAGTCAAGATGAGAGAACACATTTATTAGTCTTAAGCCTACGCC----CACACACATTCACTAAGTTTTGTCTATCTGTAATGTGACACATAATCGTGTTATGTCATTAAAACTGAAGAAATCCCCGCCCCAAATAAAAATATGTAAAATGTAATTATACGAATAAAAAGTGAAATAAAGTTGG
CTTAACTTTATTACACACAC---------------ACACACACACATATATGTATTTACACTTGCATGTTATGAAATTTGTTGTACAATAGTTTTTAATTGCTTTGCCCAGTAAACAGCACA----GATTAAGCGTTAAGTTGCATTATGTCAAATTGTATTTTGTGTAAACAATGTTCGTCGCAACAATGTGCATGATTGCTTTAACTTAAAAGAACAAAACCTAATTTATAAATATTAAAAAGAAAGAAAACATTAAAAGAAAATTACGTACGAAATTCAACTAAAGAAAAGCCTTACGTATAAGCGAATTATATAAACACTTTTAAAA-----ACACATCCAGTATTAAAACACACACATACATAAATA---AATATCTTTGATATACACACATAAAAAAAATATATATTTAATATAAAAAAAGAATAATTATAAAATACCTTAAATCGTGCACATTGTCTGCATGCGTCGCCCCACTTCCTCAACTCCTCCTAACTAAACTACCCATTCAAAAGGTTCATTTTGTTAGAAGATTTTGCAAAACAAAAGAACAATAAATGTTACG--------------CATCAAAT---------------TAATTGAATACACTTTGCAAAATCTTCACGAAATTAATAAGAAGTAATA--TATAATGTTGCATTATAATCGTTTATAAAGAAGGAAACCAACCAATCTGTTCATTAAGACAAGACAAAGGAACAAAAA-CAAAACGAAAAAAAAAATATAGTTGT-----GACTACAGCTAAATACACACATTTATTAGATTTTA------AGCAACAAAAACAATCACAATAATAAGATGCAGAATCGGAAGAAGAAGCAGC----AACAACAA-----AAAGTGTTAGTATTTAAACAAAA----------------
>stau 13632759 13634643|13518 chr2R 13633563 13637731 scaffold_4 5568035 5572560 + 122639|0 1362
GCATAAAGCGCTGAAAATTTCACAAAACCCTTATTAACTGCAA------------TTTTTGTTGTTGCACATAAGCATGATAAGAGCAAAGCAAAGAAAAAACAATTGAAATACCCGTCCACAAAGCAAACCTTAAACAAAATCCAAAAACCAAGCTGTGTGCAAATTCAAAAAAAAAAAAGAAGAAAAATGAGAAATGTAAGAGAAGCAATGCAAGAAACAG----TTTTGAAATAGCAAATTATTAGTTAATACCTATTTATTTATTTAT------GTGTGCACGTTGTGCA-----------------------AACTGGTGTTATTATTTT-ATTTATTTGTTG--AGAATTGAATAACGAATCGAACTGATAGTAACCGA-----AACTGAACAGAGGCGAACACTTAACCAGAACCGCAACGTTGTTAATCCAAATC----------------GAGAATCGAACAATAACTAGACTTAATGAAAAC--CCAACAAAATC-------------------------------------ATGAATGAACAGATGCATATATACATATGTGCAG---------------------TACCTAAACTTAAGATTAAAGCTCATTAACCACTTGAATTGAATTGATGAACAAA-----------GGACTATTGATACCTCTTAGCTGCATGCGGC----------------AATCGCTTTC-AAAAATAAATAC-AAAATTTCTGAGCACCTCGGTGCAGG------ACAAAATTGAAGGATATCCGCATTTGCGAATAAACCAGGCAGGCTGTCAATGGAGAAACTGGACAAATTTTTGATTTA-TTTTTCAAAGC-----ACGACAACCAT----------GAA---------CCGTTTGTGGTCATATGCTTGATGAAACTCGTCGAATAATGAATCTATTATACGTATACTATATTTA--------AGTGTTAAGCATAAGCATCGGCGAATGTCGGAAAGCCGTATACCGTACCCCATGACCGGTCGATTT----GCCAAAACTTTC-----------------------AGCAAATATTTGCAATGTTTTGC-------------------------------------TGGATTTTGGTTGATTGATAGGAAGTG-GAAGAAAGGGCGTTCA----------CGTCGAACATACAACATAAAATACAATTTACATAATCGTT-ATAATTATATTTATGAATGTTTAATAAGCCATTTTTGTAAATGTTCAGCTTTTGGCGAGTGTACAAGCT------AAAAGCTGAACATCCTTATGAATAATGAATCGTGTTGTTTAA---TCTGTCATGGTTTG
T----AAGC-------------CAAA---CTAATTAACTGCAATTTATATATATTTTTTTGTTGTTGT------GCATTGCAAAAGTAAATGAAAAAGCAAA------AAACACCCGTCCACAAATCAAAC--TAAAGAAAAAAGAAGAAAGAAAGAAAGAAATAATGAAAACTAGAAGCTGTGTGCAAATTGAAAATATTCAAGAAACAATGCAAGAAACAGTAATTTTTGAAATAGCAAATTATTAGTTAATACCTATTTATTTATTTATGTGCAAGTGTGCGCAATGTGCATTGTTGATTTGCATTTTTGTGTTAACTGCTGTTATTATTTTAATTTATTTGTTGTTGAAATTAATTATTGAAATGAATTGAACAGAGCCCAGAGCCAAGTCAACTAAAACAAAAATATAAACATAA--GCAATAGAATAAATTAAAAGCCTTATGGCAGCAAGAGAAAAGTTGAAAAATGTTGCAGTATGTTGCACACATTCTACACAATCACATACTATATTCATATACATATATATATATATCTATATGTATGCATATGTATATATATGTATATATATAGATAAATATAAATATATATGTCTATGTATATTTAGATCGAGCACTCATTAGGCACTTAAATTAAATTGATGAACAAATTATAAACACGTAACTAATAATATTTATTAGCTGCATGCGGCTGCCAAGACGCTTATGCAACGCTTTCAAAAAATAAATACAAAAATTTGTCTGCCACATGTTGCATTTGCCTCACAAATGTGAAA------------TTAGAACACAACAAAATTGAAGCC--TGCACACGCTTGTGAAATTTTTAATTTATTTTTTCAAAGCCATGAAAGCCAATCATCGGAGCATAAGAACTGCTGCTGCTGCTTGTGGTCAAATGTATGATGGAACTCGTCGAATAATGAATCTA-TATAATAATACTATAATTAATATATCTATTAATAAGCAACAATAATTACAACGATC---AAGCAACAAATTGTGTGC---AGCTAAACAAATTTCCAGCCAACATTTCCATTCGCATATTGTGCGGTTGCAAAGTGAATGTTTGAAATTTGTTGTAGCCCCAACGGCTCCAGCTGCCACAATTTGTGGCAAGTGTATTTGCTTTGAATTGTGGCAAGTGCCCAGTTGGGTCGCATATCAATCGGCTTGTGGCTTATAATGAAGAAAATACAATTTACATAATCGTTAATAATTATATTTA--AATGTTTAA-AAACCA-TTTTGTAAATGTTCAGTTTTTTG---GCATACACCCCCAACTAAAAAACTGAGCATCTTTATGAATAA-----CGCGTTGTTTAAATTCCACTCCCAGTTTG
>Hsf 13645157 13645617|13528 chr2R 13643308 13645260 scaffold_16 1183883 1186033 + 39980|2132 2249
GATTTAAGATCGCACGCTTCAGTTTATACATTTTAC--ACACTACTCTTATCATTATTTCAAAATAAATTGTT-----TAATGTCGCGTTGAGCTGCAAATG-------AAATCAAAT
GGATTTTGGTTACACGTCTATATTTA-AGATCTTGCCGATGCCAAGCTCATTTTAAG--CAGAATGAAGCATCGACTCTGAAGCTTTATTAATCTGAAACAGTTTTTGTAGAGCAAAT
>Hsf 13645157 13645617|13529 chr2R 13645261 13648003 scaffold_16 1186348 1189338 + 72785|0 445
CTTATATTAAGTAGCAGCAGCTCAGCCGTTAAATTGGCGAACAAATC---------GTTTTTAGTGTTAAATGCAAATCTTGACACGTTAAT---------------------------------------TTTCAT----CACCTA-------------CTCTGTCTAACCA--TTTAGTTGATTC--------ATACGATAATCACATTAATAACCACTATAATCATATGAATGATCTGTATATGCCTTATGCACTATATATATGATATATAGACTAACCAGTTCTTGTTGTAGAAA-------------GACTCGAAGAATCAGTAAAGATTTAGATTTATTTTG-TATCGCGGGATTTTGCGGGCCCCAGCTCAGCAGGTAGAAGATTTTTAGTTTGCACTAACCGATCGAGAGTACAGTGAAAGCTGATCGCATCGTATAC
CATAAAAGTAATAGCAGCAGCTCAAACACAAAAGGGGCGAACAAAGTTTATAACAATTTTTTAATAACACACATACAGTTATACATATATATGATTTAATGTATAGTTCAGAGACAGTCGTTTAATATTTGTTTCATATAACACCCATCATACTGTTGAGCTTTTTCTAATAGTTTTTAATTGTTTTTCTCTTTGAAAAGAAACTAACACAACTATTTAT--TAATCCTATTGATG-------TATGCCTTACGCACTATATATAAAATATATAGAACATATAATATTTTCTGTATACATTTTTATTTTTATTTTTCGTAAAATTTAAAAAATTATAGCTGTAATACGATATCGAAAGACTATTAGTGCAGT------GTATGTAGA----TTTTATATTGAACAAAATGA---AAAATTGATTTCAATTTTATCGAATTG-ATAC
>CG17680 13662160 13662451|13539 chr2R 13662131 13663700 scaffold_16 1204797 1206365 + 10446|30 352
GCATCCGGACACTTGACAATCTCCATGTGGGAGTGCCTCCTAGTCGGGAT-AAATGTGTTGGCAACGCGGCGTTCTCCCACGCAGAGGAAACCAGCTCACGGCCATATATTTGTTCATCCATTAGCCTCCTTTTTCTAC-----------ATACATATATAAGAATCCGCGCAGCTCTTGCATTT-------TTTGTGTATTGTCGTGTATTCTTCAAGTCCCGCTTTGA-TATTTTC---GCTTTCTGAATGTTAACTAT-----GCTCGTTAAATACTTGAATGTACTAGAATTAAATA---AAGTTTATTCGACTATGCT
A-----GTACACGACGGGAACGCCAAATGG-AGCATGCCCTAGTCACGATTGGATTAGACAACAACTTGGAGT-CTGCTTCGTTTTGTTAACCCAGCAAAAGCCAAGAGTTTACTCATCTTACTTTCTCCATTTTGCAATATTAAATCTAATATAATTTTAAGGATAAAGACTTTTTCTATGTTCGATTTGCTTTTTGAATTCTGTTAACTTCTACAAGAATCGAAGAAAATATCTGCCGAGCTCTCTTTATAAAGACTATTGTTAGCACATTAAATA---AAATGCATAAAAATTAAACGCGTGAGCATGTGCGATTTGTTA
>CG5742 13663309 13664538|13539 chr2R 13662131 13663700 scaffold_16 1204797 1206365 + 10446|1304 1720
TGTTTGTTTTCGAAATCGAAAAAAAAAGAATCCACGTAACCGCTTGAAGAACGTTCATCAAACAATTGCGTTCTTCTTCTACTTAGGCTATGTGTACTAGAGAATCGA------TCGCAAAACCATTTCCATTTCGCCTTTCCT------CGCAATAGTCTCAAGTATTTAGAA---GTGCGCAAAACTGAGACCAGCAGCTTCACAAATCAATTATAAATAAATATTTATACATACGCATGTAACCAAGTATTTATTTAGTTCCATCTTAGCCAAT-TATTTATACTGCAAAGAGCGTCTGTACTTGCTTTGT----ATTTGTTAATCAACAAAACCAGCTAGCACCGATTTAGTTTCGGTTCGCATTGCTTTGCTGTGATTTTGCCCTCTTTAAAACAAAAAA-----AATATGA
TATCTGTTTTACAAAAAAAAAGAAAAGAGTATCACAAAACAAC----ACTACTTAGAAATAACACATAAATTTGCCTATTATTTAAGTTGTTTATATATTAAGATCAACAAACGTCCGCAAACCGTTTCCTATACAATTTTCATAATCAGCAGAAAGTATTTACGTATTTACGACGAGTGCGCAAAACATAAA---ACAGCTTCACAAATTTAT-------AAACTTGTGTACACAC--------------------TTAGTTCCAATTTTTTAAATATATATATAC----------ATATATATATGCTCTATGCATATTTGTTTCATAACGTTTTCAGCTACTAT--ACCTAAGTT------GCATTATTTATAAACATTGTCTTTGTTATTATATCAATAAATTTTTAATCTGC
>CG5742 13663309 13664538|13540 chr2R 13664139 13666176 scaffold_16 1207113 1209067 + 79606|0 461
CCAGGCGACGGAGAA------GCCGCGCCAAAGGCCAA-------AGCAGCAACCGGCGGACCGACTGGAGCAGCGACTG-----GCGTTCATGTCGACTTGAATCGCAAT-GCGTCCTCGCCCTCCATTGCGGAGTTCGATTGATGAGGCGTCTACCGCGACACAC-GCCTCTCA---TTCTGCCTGTCCGCCTGTCCCACACATTTCATGTCGCGTTTAGTGATCACTCCAGCAAAAGTCGGAGGATACAGCTCGAACGCGGGCGGCTTGTTTATGTATGTATGCTTAAGAGGAAAACACCCACACACAAAATTGCAATTTTCACCATGAGT---------------------------------------GAATCCCATACTCTCCCGGTCCAAATCCAAATTGGACGCTCTGAAAATTGCAATTTTACATTTACGTTTTGTTATGTACTGTATTTGTT
CCTAGCGATGAATCATCGTCGTCCTCGTCAGCTGCCAACACGCCCAGCGCCGTCAAGCAGATCGATTTGAATCGCAACAGCAGAAGCAGGTGCAGCAATAGCAACAGCAGCAGCAGCCGTGCGC-CCATTTCCGAATTTGAT---TAAAGCTGCAAACGCTATCCACGGCATCTCCGGTCTCTGCCATAACGTTTGCCACGCCCA------------------GACCAGACCAGC--------------CCAGCCCAGCCCCGCCCATGTTGATCATGTATGT--------------------CACA-AGAAAATTGCAATTTTCACCATAAATTATCAATCAGTTAAATTATCAACGTGTCCCCATTTTAAAGAAGTCATGTTTTTGTTTGTGTCAATTAAATTGTAACGCTCTGAAAATTGCAATTTCG-GTTTAGAAAAATTGATGAATTGAATTTGTT
>lolal 13669184 13670010|13541 chr2R 13666652 13670489 scaffold_16 1209777 1213852 + 125903|2830 3744
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TGGTATT-----------TAAACAAATAAAAACAAATAAACA--------CAACTATAAGAAACTTATATATGCAAGCAAGAAAACAAAATTCCAAC-------AAAAGAAAGAAAATAGTGGAACATAGCAAAACAACATTTGAGATATACA--------------CACAAGGTTCATTTCAAAAACCAATGCACACCCACAAGCACACAAAGTTG-ACAGATATACGATAGTTCAAACAAAAAGTAACGTTTACGATTTTATGAGTCCCCTCCTATCCTCACC---TCCTTGATA---GATCAACAGATTTGCAATATTTATGAACAC------TGTCGAC----CCATTGAATTTGATTTGAATCGTATTT--TTAATTTCATCATAAAATAGTTTGTAATATACTATTCTTAAAAGTAAACAATGAAAAAAAAAAAAAAACACTGTATAAAAGGCAAAATATGGACAAC----CCTA---CAAAACAAAA-------GAATGAGA------AAACTACGCACTTTTGTAAAGTAATTAAAAGAGAATTCATAAAAAAAATATATAGAAACATAATTATACATAATATAATGTGAAAAAAATGTGCAAGTAGAACGTTAAAAATCATACGCATGGCCGCGAATATTTACAACACATTCAGTTAGATTTTAAGCAACTTACTAAAATCC---ACATGTCACGCTCTTCACACAAACACACACACGACACTCTCAAGGACAGAAAGAAAAATATTAATTATGTATAACTAAACACCTTACTTAATGCAAAATTTTAAGTACTTTAAATTGTT---------CTAAAACATTATTCAGCA--TTCATACCATAAAATATTTGTAACAACAACAACAACAACAACGTTTACCGATTGCGATATGAAGATAGAAACT
>CG5733 13679551 13679626|13549 chr2R 13677586 13681910 scaffold_16 1221029 1225230 + 109773|2074 2161
TTTTGAA------TGCATTTTTAATGTAATTTATTTTGTATTTTTCGCTTTTCCAATAC------ATCGTAATTTGTTATAGATCGCG
TTTTTAAGCAAACTTCTTTTGTAGTTTAATTTATTTTATA-TTTTCGCTTTT-AAATACATCGTAATCGTAATTTGTTGTAAACGTTT
>Dgp-1 13683271 13683887|13552 chr2R 13682611 13683819 scaffold_4 4798862 4800090 + 21693|661 1291
AAAGATAATTGGATGAATTTATTTTGCGACCTTCTAATCTAAAGTGGC--ATGTGCCCCAA-----------TAAACTATTTCGTGTCCCGTTCTTGTCC-------------------ACTGTACATTGTGCTATATGCCAAACCAA-----------------ATTCTATATTTTGTTTGTTCACTAGACTTAAGACAACCGACGTCACTGCAGCATGGATTTCATTTGTCTTTTCACTGAATAAACGCAGGTTGAACCAGATGCTACTTGTGTACATGATATTAAATTATCTCTCGATAAACTTAAATAGACACGACTTTATAAATTGGAATCTTAAATTAAA---ATCTTATAGTTTAAGATGAGTTTAATGTCTATGCAAACTGAAAATGAAAACAAATTTGCTGACGCAAATTACGTTGAAAGCGTTGTAAATGCAGACATTAGGTTATTATTTGATTTTTTTGTAAAACGATAGTTTCAGAA--TGACAATCTGAAGTTCTCTTTTGTTT-----TTAAGTGTTAAGATAAA-------------ATGGCAATGAATAAGGATTT-CTTTGTTTCCTAATTACCTTAATA---------AAAGCAATTTCCTATTCTACAAAAA
AAAAACGATAGAAAGAACGTATTTTGT-ATACAAAATTCGATAGTTGTTAAGCTGCTCCAAAGTATTTTGGCGAAAAGGTTGTGCGGCAAGTGCGCGGCCGTGTTGATATTTAAGAGAAACTTAGAATTGTCTGAGAAACAAAACGAAGAGAGAGAGAGAGAGTGAAACTATTTTGCTACAGGTAACACGCGGTAAGACGACTT---TGTATGCTGTGTGTAATT-GTGTGTAAATTTGCT-AATAAATGT--------CTAATTTTTGTTTTCGTCCA--ATGTCAAGATTTAGCGCCAACAATTTAGTTTAACTAAGCGTTAAAAGAAAATTTGCCAAATTCAACTTATTTTATTTTTCAAGCTTTATACACTGCGAAAAAAAATGATTGATTTTATCCACTTTCATTTCGCTAATTACATTTCTTTTGTAGCATAGAATTACGTTGAAACGTATTTGAATTGCATAATAAATTTACAGTTTGAAAAACTACAAAATCGCAGAATTCTTGGAATTAAAACCCAAATTTTAAAGCAAACATAATTTCCTGCAAGGCAGTTGGCAACGCTGTGCAGCGTGCGGTCAGTGTTGTAAAACGCTGCCACATTTCAATTGGATATTCCTCAAA--
>Dgp-1 13683271 13683887|13553 chr2R 13683875 13687833 scaffold_4 4800147 4804085 + 110426|0 12
AGTGCGCCGCCTG
AG-ACGTTGCCAG
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AACAACAAAGCCAAGCCGGAGTGCAGAGAAAAACATGAATTGTAGAGTTATACGAGTAGTCTTATATAGATACTTAAAC-------CTCTTTGTTTAGGTATAATCAATATGTTCGCAACATGCGTAGGTTCAAAACACTAATCAGCATATAAATAGCGTCTAACACATTTTTAATAAAACAAAAAAAT---
AACACACAAATCAAGATAGGCTCAAGTAGCAATTGTAAATCGCATATAAATATAAATA--TATATATATATAGTAAATCGGAAACAATTTATGCTTATCCATAAACAAATTGTAAATAACTATTGTACTCGCGACGGATCGATCAGCATACAA-------CAAACACACACACACACACACACATAGGTACA
>CG5726 13690141 13690942|13556 chr2R 13690341 13690779 scaffold_14 3049424 3049868 + 32|0 457
ATACAAAACA-ATTTAGACCAATCACAAAACAAATCCATCTCAAATCCAGGCTTAAAGA-ATATTAAGCATGCATGCATTACACATTGGAGCCACTAAATTTGTAAATACCAATTATATATATATGAATGTCTTGTGTAGTCCCACACAAC-CACGCCACATAAACACTCCCACACAAAATACAGTCACACACACTCATTTTTATATTTATATATACAAATTGCTTAGAAACTA----AGTACAAAGTCAATGAAAAAACAAAAATAATCCTAT----TTCTATTGAAAAGTAAAACGCCTGTTGGTGAA--------ATGTTAAAAGCATGTTGAACATATAAAAATTTGTATTTTTAGCTAAATATATACTTATATATTAAATGTCATGTTATAGTGCAGGTTCAGCCGATTTATTAAACGAATTATACAAGCTTACGTATTTTTAAAGCAAATTT
ATACAAAATGCGCTTAAACCTAACTATAAATGAATTAACAACAAATACAAACGCAAACATGCATTATGCAAATATGTAGACTAAGTCG--------AGATATTTACATAATAAT-ACATTTAAATTGAGAATCCGTATCCCACCACACAAAATGCAACCCACAAGCAAGTCCAAAAACAGTTAAAATGTATGTACT-ATACTTATGCTAAATAATTATAATCGTATAGTTAATATAGCAATAGTAGGCAACCAAAGAAGGGCAAATGATTTGACGAAATCGGCATGAATATTACAAAAACTGAACATAGACTTCTCTTACGTTAACATAGAAACATAAATACAAACATATGCATATTTATATATAGTTCTACATACACATTAGCTTATCTAGAACGTCGCGTGTTTACTAGAGAACTTCAACGAATTAGTAAAG---ATACAAACTACAAACGAACTT
>CG5726 13690141 13690942|13557 chr2R 13690942 13691932 scaffold_50 370964 372080 + 48514|0 0
G
G
>CG5721 13697290 13697403|13560 chr2R 13695491 13698969 scaffold_4 1210445 1214037 + 125380|1898 2056
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ATAGCGACATGGACCACATATTTCTACTTTTATATTCACTGCTAACTTATTTCCATACACACACACACACAAACTCGAAACTAATGCAACAGCACAATATTCGGAAGCTCACACAAGGTTCTCATCTATAAATTCATCTATATATTATGCTAA-CAAAC
>Ote 13790466 13790667|13686 chr2R 13788903 13792057 scaffold_4 498745 501927 + 53149|1737 2041
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TTGAGATTTCATCTGTGCCATAGCAAACGAAAAAAAAAAATTACTTGAATTTGTCAGCACTTTAAAAAACTTTAGTTCAGTCTCATTGATTTACCATATTTTCTCTGTTAAATAGCCACAAAT--TGTTTCGATTAATGTATGTGTACTCTATATATATATGTAAATGTGTATGTGCCGATCAGATTTGGCTGCAACATGTTTCAACTACAATCAGTTCATGTAATGCTGTCGGGCACTGTGTGTATGTTTTACATGTACCAATAAAAATAAAACCTAAACACGCTGTAACT-TAAATATAAAGA
>sbb 13793843 13794965|13687 chr2R 13792092 13794719 scaffold_4 506638 509532 + 44769|1955 3144
AACCGAGAGGAACAC-------AGAATCGACTATTTATATGCATAAGTATTTTTTG-ATGTTTCGTTCGATGTGGTTAACTATAA----CTAG-------CCTAAGGTATCACTACTATTACCACAT-------------------------ACAACCTATACATATATA----------------------------AATATATATAGCATAACTACATA-TAGCGAC-TTTTTCCTAAGTGTA-TTTGCATCTGCATATAGATATCTATAT----------------------------------------------------------------TTATATTTATATCATACGAGAGAGGCGTAATCCGAACATGAACAAACACAACCAACAAACAGATTACATGAAACATGCAAAAAATGAAAGGGAAAAAAACGAATCAAACTCGATA-CTGTAGTGTGTTGATTTCTTTGTAAAAAAAAATAAAAACTAAACGTACGAGAAATGAAATTAAGAAAAGATCGAAATGTATGAATATTGTTTAACTA-----AATGATTA-----------------------AATTATGCAAGTAGAACGTACAAGATTAGCATTTAGC-GTGTGTATTAAT---TATCCTTATCTGTGTTGCGGATGGAGCT-GCGCGGGATTTGCATCTAAAAGACAAATTGGGCGCGCCGCCCATTCAATTCTTATAAATATAAATATATATTATGTGTATCTAAATCTATATCTGTGTGTGTACTACTCGTATCCGTAGTTTCTACTTTATAAGTT-------------------------------------CTCCGTGAATGACTACGA-----------------------TGAATTTTTCG-GCCAGCAGCCGCACATTAATTTTAATTGTTTCTAAGCATCA-------------------ATTTGTACTTTAAATATTTATACGCATATGC-----------------TGCATATATGATATGATAACGATGGCGAGAT-----ATATATGTAATTAAAG--GATTATCTAT----------------------------GTGAATGTGGGTGTGTAGTAATTCACTAGCCGCTTCAT-AGACTCTACACGCGTGATTT-ATGGCACTTAATGTTCTGTAGCCTAAGCCC------
AACAAACAAAAACATAAATGGAAAAATCGACTATTTATATGCATAAGTATTTTTTGTATGTTTCGTTTAACGT-GTTAACTATAAAAATTTAGTTTAAGCCCTAAGTTATCACTACTATTACCAGATAAAAAACAGAAAAGAAAAAAACAAAACAATATATATATATATATGGATATATTCTAGAGTACATACAATATGATAAATATAGCATAACTACAAATTAGCGATGTTTTTCCTAAGTGTATTTTGCATATTTATATATATATATATATATATATATACGCACACATATATATATATATATACACATATTATAAAAACATAATATAATTATAGTTATATTTATATTATACGAGAGAGGCGTAAATCGAACATGAACAAA------AGAAAAACAAATTA-ACAAAACAAAACAAAAAGAAGCAAAAAGAAGCAGAAGCAAATGCGAAACCTGTAGTGTGTTGATTTC-TTGTAAAAACAAAACAAAACAAAACAAAACAAAAACAAACAAATTATATAATTAATATTAATGCATATTGTTTAACGATTATTATCGATTACCAATTACCGTTTACACTTTAGCAATTACAAATGTAGCACTTACAAT-TTAGCATTTAGCAGTGTGTATTAATTAATATCCTTATCTGTGTTGCGAATGGAGCCAGCGCGACATTTGCATCTAAAAGACAAA--GGGCGCGC--------CCATTCT--------------TATATCTTATGTATGTATGTATGTATGTATGTGTGTACTATTCGTATCCGTAGTTTCT-CTTGAGAGGGCGGAAAAAACATAAAACAACAAACACAAAGAACACGAACAACTTGAAGAAAAACAATTAACATTTTTTTTACTTTTGTGTGAATTTTTGGCCCCAGCAGCCGT-CACCTATTT---ATGTTTCCAAGTATCAGATCAGAATATATATATATATATATATAGTATATATTTATATGCATATATATGTATATGTATAAATGTATGTGTATGATATGATGGAACTAATAATATATATGATATATGTAATTTACATTTATTAACTATATTATGAATGTAAAATGTGAAGAAGAGGGTGAATCTGTGTGTGTCGTAGTTCACTAGCCGCTTCATCATAGACTACACGCGTGATTTAATGGCACTTAATGTTTTATAGCCTAAGCCCCGACAA
>sbb 13793843 13794965|13688 chr2R 13794800 13797500 scaffold_4 509655 512364 + 106893|0 180
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GAACCACTGAATGGCAGCAACGAGAAGAAGGCCTACAATGTGAAAAACAACTAGCGGGGAATGGGAACGGGAACGGGAACGGCCACGGGATCGTGAGTTGGATCAGAATTGGAATTGGCATCGAAAGGGAGGAGATGCGTAACTGGAAGAGGCAGTGGTTGATAAATACCCAATTGCATTT
>sbb 13799985 13800095|13689 chr2R 13797548 13804055 scaffold_4 512373 519331 + 163932|2708 2828
GTTGGTG----------TGGCTTGGGAATTGAGTTGAGGCTTATGTTGACTTGCTTTTCAAACTGTTTCCAAAATTATTGTAGAGACTAGATAAATGAATAAAGATGCCTTTCAATATTAT
GTAGCTGCCCAGCCCCCTGCCCTTATCCACATGCTCGAGCTTCGTTTGCCTT---CTGCATATTGTTAACGAAA------------------------ATAAAGATGCCTTTCTAAAACTT
>CG14505 13817808 13818387|13713 chr2R 13817923 13818420 scaffold_4 534609 535209 + 7987|0 586
CGTTTT------------------------GCAGGTAAATGACTTGATTGCAATAATAAAGCCCGAAGCTGCG--------------------------------AGTTGGATTCGGGGTCTGCCATTTGATTAATTGCTGCCAAGTGAGCA--------CAGACGGTGGGGAGATGCTGGATGCAAGGAGCAGGAACAGGGGCACGGTTGCCAGTTGATTGACTC-AACTTGGC-----------------ACTCTCCGGACCTTTTGTAGCGAAAAAAGTTAACAAGTTTTTGTGCCGTTCCACTTGACTGCCGCCGTCGAAGGAGGCGAATGAAGATGCAGACGGT------------TGGAGCTACAAGCTACAAGCT-TCAAGCCTCGAACACCCAACCAAACCAATCCAAAACCCAGCCCAGCCCAACT----CAGTGCCTCTCCAGCCCCACT--------------------TGTATTCCTCATTTTGGCCGGGCACCAA-GCCAACTAAGGTTTTTATCTAGTTGAGTCCATCTAGTCGC--TTTTCCGTCCGTCCCACGGGTGTCTGCTGTGGACAA
CGATCTCTCATGCATGTGAGTGCATGCCATGCAGGTAAATGACTTGATTGCAATGATTATGCCCGATGCTGCTGCTGCTGCTGCTGTTGCTTGAACTGCAACTGCAACTGCGACCGGAGTCCG-CACTTGATTAATTGACGCCCCGACAGCAAACAGCAGCGGCAGGCGGTAAGCGGCAGGCGGCAGGCGGCAGG--CGGCATAACGACTGACGCTTGATTGACTCGAACGTGGCCCGGAGCCGGGGTCTGGGCCATTCGAACCTTTTGCAGCT--AAAAGTTAACAAGTTTT--TGCCGTTCCACTTGACTGC------AAAATGCAGCGAATGAAGACGCAAACGGCAACGCAATCCAATAGAGAGACCAGAGACCAGAGACCATGGACTGGAGACCAGAGAGCATGACTCTTGGGCACAGCTTCGCTTCTCTTGGCCGGGGCCATGCCAAATGCGGTGCACAGTGTTTTATTTTTGGTGTGTGTGTTTGTGTGTTTGTGTGTTGATGGCTAGCCAGGCCTTTATCTAGTTGAGTCCATCTAGGCGAAGCTGTTCGTCTGT-CCACAGCAGTCCGACATGGACAA
>CG15067 13899774 13899914|13825 chr2R 13899397 13899902 scaffold_4 624427 624895 + 2819|379 509
ATTGAAACACTAAGAAATTATCTTTTTTTTAAAACGAAGATTGTTTAAAC-TTATGTGGTGGAGGAATCATCTGTAAACCAATATTCGAATTTTTTCTTATAGTCTCTATAAATG-ATTGCGATTTAAATA
AATAAAAAATCAGCAGTGTTTTTTCATTTAGCTATAAGAATTTATTAAACATTTTGTTTTG-----ATTTTTTGTGATTTTGTTGTGGTTCTTGTTGTTGTACTTATAATAAATGCATATTAAATGGAAAA
>CG15067 13899774 13899914|13826 chr2R 13899913 13900741 scaffold_4 620628 621529 + 5684|0 1
AG
GG
>CG15068 13905205 13905254|13832 chr2R 13904791 13905523 scaffold_4 627795 628532 + 6767|449 498
AATGTGGAAATCAGAATATGAAATAAACTAAAGTCACTGAAACACCAAAA
-----------TGGATTATTGAGAGAACTTACATAAATACATAACCA---
>imd 13924654 13925034|13877 chr2R 13923954 13925221 scaffold_4 644714 646073 + 37441|704 1205
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CTGATCACGAAAAAAAAAAAGAAACGACAAAACAAACAGGAAGAAGCAAGATGAAAAACAAAATAACAGGGCATTTCGGAGCGGTCTTAGTTAGGCCTCTAATTTAG-----TTGTTAAAACTTATAAGTTTTAGTACATATTTGTCACGCCCTTTTCTGTGCACTTAAGCATTATTTTTCTGTGCAATATTATTTGTTAAAAATTTGACAACCAATTTTGACAAACGGCATATTGTTAAATACCGTTAATATATATATATATATATGTATATGTATATGTAAACT-TCGAATAAGTGCCTA-------ACTAGTTTGTCCTCAAGCAACTTTATTTGTTTCCAAATGTGATATTT----------CGAGTGCAAGTTCGTTGTGCA-------ATATGCATTTTTCACCCAAGTAATCTACAGACAATAAACAAGCCGTACATCTGTGCGCCTTTTATTATGTAATCAAGTTGATATATATATATGTATATATATATATAT
>CG30118 13945579 13945967|13892 chr2R 13945549 13946910 scaffold_4 666618 668035 + 53369|30 485
GGCA-----------TGAGGCCAGGAGTCAACATAATC---------------------CATAGCCAAAGAGAATGGAA-CCAAAAGATTATAGTTTCACTGCTGTACATAATATAAGCTTCTATCTTTCGTTGCTCCAATGCATGCCACCTCATTTCACTTTCATTTTCTATTCTTTTCAAAATTTCAAATTGATTGTAATCGTTTTGGA-TTTGATTTTCGCCTGA---CTATGTTTCTCTTTTGATTTTGTAGTTAAGGGCGCCGCTAATGGAGTCTCGAGCACGCCGCTGCTCCTCAATGGTCAGTAGGCTTCCGAACTGTCCCTGAATCTCTTTTGCACACGCATAT-TACACGGCAAAAGCAAATTATAAGAACACCAA----TGACCTGG-----------CAATGAA--------------ATGTACAAAACAAAAAAAATTTTAAAA
GGCAGCTTCTCCCGTCAACCGCATGCATCAACATCATCATACCCTGGTGCTGGCGCCATCAAAGCCAAAGATTGTGTAGTCCAATAGTTGCTTTCTAAATTGCTGTACATATGCTA---------CCTACATTTTCCAAACGC-TTTTAACGCATGTCGAAT---TTGCGAATTTTCCTCCTATCCCCAAATCCTTCTTCATTAACTTGGCTTTTGATTTTGGCCTGATCTTTGTACTTTTCTTTTAA-TTTGTAGCTAAGGGAGCCACACGCGGAGTAACCCATACCCCATCGGTGCTCAATGGGCATTAGATGTT---AATGTA---GAATCTCTCTCTTACACACACACACACAC-ACACACACACCCGCACACAGCCTCAACATTTGACCTGGCTAACTTAATACAATTAACTCTCGTTTGGCACATGTACAGCATATAAAAA---CTAAAT
>Gbp 13962218 13962329|13908 chr2R 13961867 13965908 scaffold_4 684014 688041 + 160040|356 467
GTCCACACTTAGTAATTAAGTCCAAAATTTTCTTATACAATATTCCCTAATGATTGTGTGTTTTCTTGAACAAATCTTGCAGAATAATAAACCTGACCCTCTATCCAAATAA
AAGCGGCTTGTTTAATTTAAGCAA------------ACGGCGATCCATAGT------------------------------TAGCAATAAGTTCAACATTTTAT--AAATAC
>CG30116 13971825 13972420|13913 chr2R 13971467 13971974 scaffold_4 695330 695858 + 5869|386 540
TAAGCAATTGAATGTATATATA---CTAAGCTAATATGTTCGCTGTAGAATTAGTTTGAATTGCAC--TTTTTCGGGTCACGGGCTTGCACTTCCCTCGAATATAACTTCAATAACTTTCTGACAATCAGAGGTTCTAGCCTGGAACGAAAAACC
GAAGCGTTTGAATATTTGTGTATAACTGTGC-ATTAGTTTAAGCCTAAACTCTGTACTAAGCGCACAATTTATTTTCTATCAGTTCTGCACGCACCCT--AGTTAACTTCAATAACTCTCTGACAATCAGAAGTTCTTGCCTAGAACAAAAAAAT
>CG30116 13971825 13972420|13914 chr2R 13971975 13972464 scaffold_4 695985 696658 + 5283|0 638
GAC--------------CTGATTCAGCAA--TTAAATGGAATACTTA-----------TCCAAAATGCCAAGCAATAATGGGGCAGACGATCATAACAAATAACCCATCTCCC---------------------------------------------------------ATTTCTCTCT--------------------------GTGTACGAGTAGATGTAAAC------------------------------GAATGAAATGAATGTAGT----------TAAATCTGATAAACCACCGTCTCAGACTTTGTAGGAATTCTAGAGT------TAAGTAAGCCCTTTAACATTTACAAATTTTATTGTTGTAGAGTGTTTTATGTACCTACCA--------AGCCAGAGCTA--AATGTTAAT-TGTATTGACCCAATAACGCAATAACTTAGA--------ATCTGATC----AAATGCGATATGCAGATACGAGCTCTCTAAAGGGGTAAAAAGCGTAACTATGCTTAAAAACACAAGTGAAACAACATTACTTAATGAAAT--------CCACACACCCA------CACATGCACACAGATACACTGAGAACATTGATGGTTAACTAGGAAAC
GCTGTAAGGCGCACTGGCTAATTTATAAAAGTTAATTACACTAGCTAATAAGTAAATGTTTTAAATGGTAAGCAATAATTGAGCAACTAGCTGCAACCTAGACTCTCCCTTCCAAGTGATCTGTTAAATGTTTCCTAAAGTTTAATTATTTGTTTACATTTTGGTTTGGTATTTTTTTTTTTTAATTAAGCTTAGGTTTGTTTAGAGCGAGCGAGTAAAACTCAACAATATTTTGATTTGCTTGGTTTTTTCCCCAAAATTACAAAATTGTAGTCTGTAGTTTCTAAAAAGCAAAAACCACCGTCTCAGACTTTATATAGAACCTAGCATACATGATAAGTGAGC-------CATTTTGAAATTTTAATGTTGTAGAGTGTTTTATGTACTCATAAATAATAACAACTTGAGCTATTCATGTTGTTATGCATATATATATACATACTTCTATATAGATTGTAGAGATATGATCGAGAAGAAACCAAATGCAAACCACAAAACT-TGAAGGGGTTAAAAGCGTAACTATGCTTAATAAACAAAAAGATACAAAATGCAGAAATAAAACTGTAATTGTCACACTATTAATATGCCACAAAACTATAAATTTATGGAAAACATTTAC-TCAAACCAAAAAAC
>CG30116 13974538 13974715|13916 chr2R 13974548 13977700 scaffold_4 702905 706123 + 126932|0 184
CTGGCA-AAGACCCAAACAT------CGACCACATCGAACAGCCACACCACCACCAACAC-------TGTGCACC--ACTTCCGATTTCCAGCACCCCTTTTTGCCACTCTTTTTACGTAGTTTTGGCCATGCCTAGTTGTTTCCCAGTAGTCAACTTAAACGTATTTATTTTA-ATAAATTTCC
ACGACCTTACACCCCACTACGACCTGCCACCAGTACGACCTGCCCCTGTACACCCAGCACATACACATGTAGAGCAAACGCACGGACCGCTACACTACTTTTTAAC-CAATTTCTACATTGCACTACAAAACTTCTGTTTATTCTAAGTAGTT--TCTAGCATCTTTTATTTTGTATAAAACTCC
>CG30115 14068975 14069195|14020 chr2R 14068705 14069007 scaffold_4 4049681 4050007 - -468|314 346
ATAAAGTTCGTAATCAATTTGAAAATTTTAACG
ACAAAATGCAAATTGAATTTGAATAGTATAATG
>CG30115 14068975 14069195|14021 chr2R 14069084 14071309 scaffold_557 569 2913 + 76608|0 117
AGGATCC-TAGTGATGCACAGACGAGCCGTTGTACACGACCCATTGCCATAAATG----AAATTCCTTTATTATTTCTACATGTACATAGTTATA-AGTGTCTGATACACACTTTGTA
ACGAGCCGTCGAGGGAGATTGCGATTCCCTTGT-------TCATTGCCATAGAAGTGCATAGTTTCGTAGTTTTTTTTTACTGTATATATTCAAGTACTTTTAAATACAAACTATCTA
>mRpS35 14129071 14129103|14072 chr2R 14127868 14129292 scaffold_50 519482 521037 + 39121|1322 1357
ATCCTTTATTAAA---ACCAAGGTTTGTTAAACGTT
ATCTATTATTCAGTGCATAAACAATTGTCAAAAGAA
>CG5493 14131557 14131806|14075 chr2R 14131531 14131613 scaffold_50 524156 524231 + 1892|26 83
TAGTGTAC-TTTAAGTGTTAGCTGTACCAAAAATATTCAATAAATAAGTGAACCATTG
TAGTTTATATTTAAGTCTTAGCTATACCAAAAATACGTGCCAAAATCGCGTAC-----
>CG5493 14131557 14131806|14076 chr2R 14131805 14132799 scaffold_50 524277 525343 + 43171|0 1
AT
AT
>Atg7 14135319 14135583|14079 chr2R 14135170 14136260 scaffold_50 530581 531712 + 20260|159 474
GTTCCACAAAATTGGTCAAGTTTTATCTTCAAAGCAAAATATCTTAAATATGAAATTC-AGCTTATTGTGGCTTTAATTTTCTGC------AGCATTTATA-------------GTTCAATGTCTATACCAAAAATGTGTGTACTTCAATGCTTTTATTCTATCTAGTCGTTAAGCAAATTGT---------GAATCATTCAAATGAAATTGATGTGAAAATTAGGCATAAGA------------------AAAATGTGAATTTACTATTGAAAATTGTAATAATAAAAGTGTGAATTTACTATTGA----AAATT
---------------------TTTGCTTTTAACGAACATTGCATTTTCTACCAGATTTAAGCTTAAAGAGTCATTCGTCTAACACCAAAAAAATATATATATATGTGTGTGTGTGTTTTCTGCTAATACCAAAC---CATTTCTTTAGATATTTTTCTAGT-TGTAGTAAAAAACCGAACCGTTGACTTGTAAGATCATTTTCTTTCTGTGTGTATGCCCTTGTGGCATTCGACCAGGCAGCATCCAGTCCAAAAGCTGAATTTCTGTTTCAGCCTTAACACAAAAGGATTGCGAAATTAATGTAGATCAGTAACT
>CG5482 14144727 14145061|14086 chr2R 14144656 14144844 scaffold_1 2645270 2645472 - 1177|81 215
AGT---TTAATCAAC-----TACATTCT---GTCAGACAAGT---AACGGGAATTGTTAAAATAAACACAATATTCTCATCATTATGTTTTATACAATTTTCAAACGAAATAAAGCAA---CACAATCGAAATCA
AATAATTCAAGAAATAGTTATACATTTTTGAGTCATACACATTTTAACGGGAATC---------CGCACAATATTCCATTCGTTAGTAAACATACAATTGTAATGCGAGAAAAATCAATGTCACAATTTTAA-CA
>CG5482 14144727 14145061|14087 chr2R 14144845 14146548 scaffold_45 168978 170804 - 58599|0 236
GG-------ACAAGCATTG-CACACGAACTACTGGTTATTTTAAGCAATTGAAATGCATTTTTTAA---GTATATA------TAGAAGGCAAAATTATGAATGTTGGAAAGTCGCAGTTGCTTA-TTATGATGATATGGCTCTCGTTGTACAT--TTAATGCTATGCACACTTCACAATAGTATGTATCTTTCAAATAGTATGGTTTTGGATATCGTACATATAATGTTAAAGCTTA
GAGAGGGGTATAAATGCTGTTATTTCAACCATAGAGTAATTTAAGCAATTGAAATGCATTTTAAAAATGGTATATATTTATTTATAAAGCAAAATTATAAATGTTGGAAACT---ATTTGCTCACTTGTAAAGATATCCCTTTTGTTATACATAAATATTGCAATGCACACTTTCCAATAG------------AAATAATGGGTTTTTGGATAATTTAAGATTAGTTTTAACAATTA
>CG30122 14147192 14147684|14089 chr2R 14147066 14147449 scaffold_11 3162713 3163096 + 3343|134 417
AAACTAAGACTACATATAT----CATT-TGAAAT------TGAACGTGAATGTTTCGCTTTTCATTTTCCACAACGCATTTTCTATATGACAGTGACGAAGCAATTGAATGAAACGCGGT----CTTTACTCTGGC--ACTACGTATCTAGG-CAGTACAACTTGTTTTAACGTTTATTACGATTATTGTTTTATTTTT---TACAATCAACGCAAACAATTGAAATGAACGCATTAGAGAAGAAACA---TTAACGAATAAATC--TATACATTGAAAAAATC
AAACCAAACATACAAATATTGTGCATTATGAAATGGTTTATAATTATAAACAATTTGGTGTTTGCCAATTAGCATTCTTTTGTTCTGTTTCAAAGA--AAGCAAT--AAAGGAACGTTAGTACACCTTCTTTTGGCTCATTACGTATCTAGGACAGTACAATTTGTTT-AACGTTTA--ATTATCATTGTTTTATTTTTTTATACAAT-AACGAAATGCTGGAAGACAAACTAAAAACAAACAAAATAAATTTAACAAATAAATCTATATACAACATACAAAAC
>CG30122 14147192 14147684|14090 chr2R 14147516 14148043 scaffold_11 3163282 3163913 + 12929|0 277
AATGCAGCAACACTATGCAGCCGTGTTCCACCAGGCCCAGACCCCTCTGCGTTGTCCCGAAAGGAGTTAACCACAAATCTGAAC----------------------------------------------------------------------------------------------------TAAACTTTATATAATAGTTTTAAACGATTAACGAACAGTAAAACAAAATTAATTTAGTTTAGCCAGTTT---------GGGCTAGTCGAAACCA
GA-GCAGCAGCAGCA-GCAACAACAG--CAGCAGGATGATGCACATTTTCGGCGTCGCAA----GGCCAACTTTCATTTTGAACAACAAGCACACACACATACACATAAACAAACACATGCACACACACACACACACACACACACATATATATAAATACGCCCACAAGAAGAGGGAAAGCAACTTATAGTTTTTAATATA-TATAAAACAA--AGCAAACAAAAAGCGAGCATAAATTTAGTGTAGCCAGTTTTTAAGCGTCTGGAAAGTCCAAACAA
>SP2637 14155886 14156044|14100 chr2R 14155638 14156188 scaffold_11 55698 56300 + 9112|254 461
GTTCCGACG-------------------------------------------------CTGGAGACGGTTGCTTGGGACGAGCCTTAGAAATGGATCTGAACTGGGAACGTAAAAGCGATATATAACGATAAATAATTATTACAATTCTATGTGCAAATGTGCATGTAAATATTTATGTGAACCCCATTAAAGAACCTATTACTATTT
GTTCGGATATATATTCAAACGTATATATATATATGTATATATATATATATATATATGCCTAGAGAACACCGTTTGGAATGCGCCTTATTAATGGATCTGAAA------------------GTAAAACGATATATTATTGT-GTATGCATATATGTAAAT----ATATATATATGTATGTAATTCTTATTGAAATGA-----ATTATTT
>Gint3 14173278 14173399|14126 chr2R 14172791 14174810 scaffold_11 78755 80852 + 61009|555 723
AAGT----------------------GCTTTAACCCATATATTCAGCGGTAT-TTGTCCCTTATA-----TTATAACAGAGCTGTTGTTATTTATTACTTTCAA-----------------ATCTATTATTCAAAATCAATTATAA--ACGCACTTTACACAAAAGAAA
ATGTTATATGTATTTCCATGTAACAGTCGATAAGGCATAAGGGCAGCAGTATATTGACCAATGTCAATGTTTTGAATAAAAATTTTGTTATTATTTATTCCCAAAAAATAACTGAGCACACATTTTTGACTAGCATAAAATTAAAATGACCCATTTCAGGCTCTGTCAA
>CG33136 14179825 14179889|14132 chr2R 14179312 14180655 scaffold_11 85658 87228 + 11325|644 733
ATCGAATTGT---------------GGCGAATGCGGTGACCAAAACAAAAT---------CAAGTAAATC-GTATAAAGACCGGGAAAAA
ATCAATTTGTTAACTCTCGACTCTAAGCGAATGCGCTTAGCAAAACAAAAGCGGCAAACACAAATAAATAGGTCCAAAGACCGGGAAAAT
>edl 14182384 14182691|14135 chr2R 14182318 14184390 scaffold_11 89717 92054 + 29618|75 391
GGATTACCCATATATCTCACGGATACCCAGT--CCTCTCTATGGTTGTACATATCTCTAGGAT-----TCGATTAGTTAAGTTCTAGTTATGCTAGCTTATA-ATGCCTAGTCCTTAGTTCTGCTCGTCATTTAAGTATTAGCGATAATATTCTGCATTTCAATATGGTCAAAGATTGCTTCAAGTTTTCAATTCATTTTGAAAGAAAAGTGATTGGAGTGAATAGAATAAAAGATTGAAGTTACAATGCTGTCCTATTAGTTAACTAAGTTCGCATATGATGAAAATATAAAATGAAATTTTAT-AACTGAACAAG
GGTGTGCTCGCCGAGAACACCCGTGCGTAATAGCCTAACCA-GGTTGTACATATACATAGTATATACATATAGCACCTATGCTTTATATA-GCTCACTTAGACCTAACTAGTCGCTAGTGCTCCTAGTC--TTAAGTCTTAGACCTAA----ATGCATTTGTTTAT---------TCGCTT-AAGTGGTCGAAGCATGCCCCGCCTGCGCCTGCTCAAGTGCGGCCCACCGCGGGGCACACTTCAAATGCTGTCCTATTAGTCGTATAAGTT-GCATCTAATGAAAATATAAAATGAAATTTTATGAAATGAA----
>CG15086 14193543 14194348|14147 chr2R 14192943 14193941 scaffold_11 103854 104731 + 9956|661 1088
GCACTCTTGGGACTCAGTCCCATTGCCCACTATCGACCCGGAATGCTGCAGTTTCCCGTGAATTACCTACT--GGCG----GGCACCAATTTCCGGCGAAGGCTCGTTCGCACCGCCGCCGGCGTAACGTTGCACCAGAATCCGTACTCGAACGAGGACGATGCCAAGGATCTGCCCAGCTTTCCGTGCCGCCAGAAGACTAGCAGCCCCGACTGTCGAGCACCCGTTAAAAAGTGGCTCTGAGCTCCAGAACGCGTCGTCGAATTATATGCATTGTAGCGTATCGAAGGACGTAGATGGT---------TATCCTTCGATC---CATACAGTGCATACGTTCGCCCAGACGCGTAGTGGCTTATAGTTTTC---------TTTTTCCAAATTCTTAAGTAG--TTCTGATTAATATTTCACAAATGC
GTATTCATGGTCTACAG-CCCGTGGCCCACTATCGACCCGGCATGCTGCAGTTCCCCATCAACTATACGCTCCGGCGCAACGGCGAGTGTGTACGCCGTAGTCTGGTGCGCACAGCGGCGGGGGCCACACTCCACGAGCGGCCACACAGTGAGGAGCACATATCGAATGCCCTGCATGA---TCTATGCGGGTCCAAGCCATGCAGTC---GATGTCGTTCCAATTTACAGTTTTGGCACTGAGTGCACAAAT--------------TACGCATTGT--------GTAGATCGTATATAGTACTAATCCATCTACTTATATCGAACATATAATGCATAATTTTGTTCGGCCGCGTGGTGGTT--TAGTTTTCAAAGCAAAATTTCCGTCGACTTTCAATTAAGCTATAGATCAATATAT-ATATATAT
>CG15086 14193543 14194348|14148 chr2R 14194066 14194781 scaffold_11 105052 105737 + 1863|0 303
CCAAACATTTGGGACACCAATTCAAG----GTGGCAGCGGCACACAACGAATC---------CAGCCACGATGAAGATAGCATGGCATCCCACAACAAGACACCATCATTTTTCCTGCCCAACTGCGAGGAACATCGCTGCAAGCGCAATTGCAATGGGCTTTGTTC-GCGAAAACCGCATG-ATTGTGGTAAAGGTTGCAAGTCGAGATGTCGCGGTCCCTGCTCCAAATCAGGCGG---AGGTGATGGGCGTAGCCGCAGGAAGGG--ATCGAAAAACAAGCAG-CGATCCAATCAGAGGCA
TCAAGCATTCAAGTCCCTGCAGCACAGCCTGTCGCAGTGGC-TGCAACAAATTAACTGGCCGCAACAACGGCTACTCCGGCTCGGCAGGCTATAACGGAA---------GCTGCGTTCCCAACTGTACGGCTCCCTGTGGC--------TCCCAAGGGCTTGAGCGCGGCGGCAAATGTGTGAACTGCTGTGCGGGCTCACGCTCGACAGAGCACAAGTCCAGTTGTGTTCCAGGCTGTCAAGCCACCTGCAGTAGCTCGATGACGAGCAACATAAGTGCACCCAGTCGATCCAATCAGCGGCA
>CG15087 14223010 14223119|14178 chr2R 14219808 14226654 scaffold_11 136877 143902 + 202214|3522 3631
TATTTGTTTCCACAACATAAAGCAACATTCCACTTAAAATCTCCGTCTATTTTGTTAAACGCTGCTAGCTTAAGGATCTAAAAATAAACACCCTGTTTCTAATTTAGATA
T-------------------------ATTCCACACAGAATATC-------TCTGTGCAACATTCCTGGTCCGAAG-CCTGGCCTTAATCTGTGTCTATTTAATTTTGTTA
>CG15088 14243018 14243047|14209 chr2R 14242594 14243070 scaffold_11 162047 162490 + 5523|441 470
CAGTTTTTGGCTGTTTTTTGGCCACCTTGG
CAGTCTTTGGCTATTTCTTAGCTGGATTAG
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GGAATATGGCATAATAAAATTTTAATTCGTTGCGATTGATGGTGGCCCCTCAAACGT-AACCACCACATCCATATAC---------------GTATACATATATACAAGCATCGATGGTTGATT------------TCCCAGAGC-CGAGGGATA-------------------CAACCAATACATTACATTTTAT-----AACCCCAGCTAATTTGCAT--------ATATGCAGGCATACGTACGACCATAGAAATACGAGTATATGTGTCTGC----------------------GTAACATTGATTGGATTTGTTTGACTTTCACACTGCCTGATGGCATCGCATCGAAGATGGCTGGGGTTTTTCGGCCTGGGATGGTGAAAGGTGGTTTTTAGGGCTTTCTGATGGTTTTTAGGCGGTGGTGCGCTGGAAGGCTAAGTGCCTGACATTTACTAAATGGCAAAGGGA--ACGGCT-----TCACAGGCTTTTGCTGGTTATACTTTCCCCATTTGCTCAACCGAAAATTGCACTTGCCTCGTT
GGCATATGGCATAATAAAATTTTAATTCCCAACGATTGATG--GGCTGCACACGCATCAATGGCTGCTTCTAAATCCTAAATGACAGCAACAGCAACAACATGCAAAAGTCGCCATGGAGAATGAGAAAGAGAGAAACACAGAGCGCGAGAGAGAGTGAGAGAAATGTCTGTGGCAGGCAACACATTAAATTTTATATGGCAGCCAGAGCTTATTTGCATATGGATACATACACACACACACACACACACACACACACACACGTACACACACCTACACATTCGATGTGTGCCGAGGCTGTAACATTGATTGGATTTGTTTGA----------GCTTTAGAGCTGCACAT--------GCTGAG------------TGGCGGGCGGGAGATGG------GAGCTC----ATGGGTT-------------------GAGTTTAAGTGCCTGGCATTTGGCAAATGGCAAAGAGCCTCCGCCTGTAGCTTACACACTCT---TGGTAATA-TTTTCTCATTTGTTCAACC-AAAATTGCGGCTGCATCGTT
>CG30121 14253990 14255254|14223 chr2R 14255001 14255953 scaffold_11 178232 179357 + 6063|0 260
TCAAA-TGCGTGTATGCAAATGCCATTTGTGCGATTAACAATGCAGGCTTCAAGACCACTGAGCACACTACGCACAAAAGACACACATTAAAGTTATCTGAAATTATATGGCAAAAGGTAACACATGGATATATATATACAATATATGTATATATATTGCCGTACCTAGG--GGAACTGACCTGGCTGCC----TGGCAACTTTCCCATAATTTACACTTTATCGAACGATAACAAACAACCTGCATAATGTATGGCTCTT
TCAGAGTGAGAGCACATAATTGGAATTAAT----------ATGCCCACATAAATTCCATTTAGAGTTCAACTAGCTAG---CTCA-ATTAGGGTTTTAGCACACCATATA-TGCAAGCAGGCACATAGATACACACATA---TACACGTACGGGTGACCCTTTAGCTCTGCTTGTGCCACACTTGCTACCACGCTGGCAACTGTGCCATAATTTACACTCTATCGAACGATAACAAACAACCTGCATAATGTATGGCGCTT
>CG17821 14258663 14258679|14229 chr2R 14258654 14259258 scaffold_11 184167 184773 + 17019|9 25
TTTATAAATACAATGCA
CCTAAAAATG----GTA
>CG15092 14273161 14273299|14243 chr2R 14267928 14274609 scaffold_11 215749 222581 + 138906|5796 6019
ACA-----------------TTATTA-------------------AGACTCTCGTGCGTAGCCC-----------------------------------CCTAAGTCTAGG-------TTAACTCCAAGTATCGATTATCGAATTAAGCGTTGATGAAAACTGAACTTGAAACGTTGTCATGAAATACAATACAATAC-CGATACAACAATACACT------TA
ATCCTCTATCTAACTGTTGTTTATTAGACACACAAATACACACACAAACACACGCACACACACAAACACACACAGATCCCCTCTGCATATATAGACACACCTAAGTCTAAGCCCTAGTTTAATGGAAAGTATCGATTAACGATTTAAGCGATAA--------GATTTTGAAGTTTT----TGGTGGATGAAACGATAAACGATAAACTGAAATACAGAATAATA
>CG15093 14290531 14290779|14265 chr2R 14290626 14291888 scaffold_11 249585 250864 + 64341|0 153
GGGTCTGGGCAACAAGGACTTCTCCGTGGTGTACGACCTGATGAAGAAGGAGAAGTTCAGCGTTTAGGTTACTCACAGACTACAGGTTGTGGTGGCCACAACCACGTCATGTCCACATCCAAACCAGTCCTGCATTTAAATATAGCACTAAGTT
GGGACTGGGCAACAAGGACTTCTCCGTGGTCTACGACTTCATGAAGAACGACAAATAC------TAAGCAGCTGCCCGAGGATAGCTCTTGACGGGC---------TTCCGCCC--------ACCAGTTTTGCATTT--ATAGCGCACTAAGTT
>CG15094 14309481 14309671|14287 chr2R 14309426 14309690 scaffold_11 273304 273573 + 617|56 264
GAAATAACAAAAAACGTGGCCTAAGGATTGGTTGTAGATGTGAAACATTTGTACCTTGAA-GGCGAAGCATTCCT-TGGAATTGATGAATCGCAATTAGTATCGTATTACTAGTTATACACGCAACACACATTTATGTCTACATATATGCGAAATA-TATATACATATATATACAATTTACGTATAAAGC---------------ATTG
ATAATTCGAATTTATACTTTTCAGGG--TGAGTCTGAGCTTGAAACTGATGTACCTAAAATTATAGGGTATTTAGATGGAATTGATT-GTCGCTATT----TTATGCTAATATATATAGAAATATTAC-----TACGTCTAGTTATACATGTCACATTATATACACTAATATGTTATAAAAATATAAAACGCTTTTTGTGTGCTTATCG
>l(2)08717 14312127 14312341|14292 chr2R 14311658 14312908 scaffold_11 275398 276754 + 26297|528 833
AGCCTGGGAT----------------GGCATGTTCATACC-----------------------------------------GCATCCAGA-------ATCATCCGGGCTGTTGTTTCTTAGATTCGTAGGCGTAGT---------TAGT--TAGTTAGACACCAG-----ACAAGCTGAAAGTTAACTTTAGTGACGATCGCGTGCTTCCATTAGCGATATT---------ATACGGTAATTGCTTAGTCCTAAGGCAGCGTAAATTATTATTGTTTGCAGTA--TTTCCATAATGTACATAATCC
ACCCTAAGACCACCAGCCGGACTAAGGACTTTCTCATGCCTTTCAACTGAACTAAACGATAATTCGTTTATATATGATGATGTAGGAAGAGCATGATACTGTCATAGTTGTTGTTTTCTTAAACTAAGTGCTTAATATAAGACAATAGCTATAATTAGAGGTTAAAGGACAAAAGCTTAAAATT-GCCATAACGACGATCGCGTGCTTCCATTAGCGATATTAATAACAACATATGATAATTGTTTAGTTTGTAGGCAGCATAAATTATTA---TTTCCAGTATTTTTCCATAATGTACAT-----
>CG15096 14323199 14323474|14307 chr2R 14323049 14323435 scaffold_11 297603 298035 + -275|150 442
AACTACTAGTCAGCTAGTTCCGCTCTCC--------------TTCAA--ATC------CAAAACTATCAATCCTATTTGCAGCCAGGTGCAATGCATTCTCGCATTCGCCGTGTATATTTG----TAAATTGTATTTGTTAACTGTG-ACTATTTCGTATTTGCAT------------------TCCACTCGTCT--TAAGTTT------TAGTTTGTTAAT---ACTATGTGATAAGAATACCCATGCAAAAAATAAGAAAACAAAAATTACAAAAAAAAAAAAAACAATAA
AATCGCTAGTCATCTAGTTCACATTTCCAGCCCACTGGCTGGTTCGATCATCGATCGACAGAAGTCGCCAATCTAACTGGAATTCGAGGAGATGTATTCTCACATCGTCCCAGCGAATTCGCATTTGTTTCGTATTTCTATATTGTACACTATGATATATATATATAAACATATATATATTATCTGAATTTGTCGTATAAGTTTAGCGTGTAGTCTGTAGATTAGGCCTTGTTGCATATGTGTATAAAGACCAAATGACGAAAAAATATATATATATAATTATAAAATGTTAA
>CG15096 14323199 14323474|14308 chr2R 14323474 14326872 scaffold_11 298073 301490 + 59683|0 0
A
A
>CG15097 14337041 14337822|14314 chr2R 14334362 14337348 scaffold_11 815112 818039 + 80381|2948 3280
GAATA---TTTATATGACTTGGAGACCCCG-----GGCGGTGGTTCGATTGCTCAACATCAAGGATGAACATCGCAGTGAATGCATGCCCATAACACACACACATGTTTCTAGTCAAGATCTCTCACACACACACAACATGGGAATGCCGCGGGGACACAACTCCTGGAGAAGCAACCTAATCTGCCTACAATTTACATACATAAACC-TCTATACACTTAAATTA-----TATACTGTATACAC--------TCTTATGTACTATTCTTATGTATTTTATACACGCAATTAA---AACGATAAGTAAATGTTTCGTAATCGTATGCGACGAA
GAATAGATTCCATAAGATC---AGACCTCAATTTTGAAGACAAATCGATATATCCGACTTACGCATAAGCATAACAATAAACACACACACACA-CACACACACATTTTTCTAGTCAAGATCTCGCACGAACTTTAAA-----GAACTCCCAAATGTAACAGCTAC--AACAAGGAACCTAATCTGCCTACAATTTTTACATGTGAATCGTCTATACATACATATTAGAAATTATACTATATACACGACATCTCTCTTATGTACTATTCTTATGTATTTTATACATGCAATTATTATAATAATAAGTAAATGTATCGTATTTG-ATGAAATGCC
>CG15097 14337041 14337822|14315 chr2R 14337349 14339784 scaffold_11 818236 820561 + 129411|0 493
CCC---TTGGCCAGCATAACCGAGTCCTTCGCCGCAGCTGCAGCGAGCGGCACTAGCAATGGCAACAGCACCATTAACGGAATCGGTTCCGGTGGAGTCATACCTTCGTCATCGGGCGTGGGAGGCACTCTAACCGTTCCGAGCCGAGCGGAGGCTGCTGCCTTTACGGCCAACATTGCTCTGAGTAGTTCCGCGCCATCGGCTAGCTCCACGCTGCGTCGTCATCGGAGGGACACACCCGGTCTGGCCGAGAGCCGCAGGGCCAACAGCAATGCCAGCAGCAGTGGCAGCGAGAGCGGAAGTACCAGCGGGGCCAGCGGATCCGGAGGAGGAAAGCCACCGGCGACGGCCTGATCCTGGTCCATGTCGCGT------CGCTTCTAAGC--CACCTAACAATTACAAATTAACTCACATACAAAGCTAACCCC-ACGCGCCTAATGCAGGAAT-----TTGATTGTTCGAGTTCG---TTATGGATAGACTTAA
CCCCCGCTGAGCAGCATCAGCGAATCTTTTGCCGCTGCCGCAGCGAACAACGCCAGCAATAACACCAACACCAACAGCAGCAGCAGCAGCAATGGG--------------AACGGGAAC-AGCGGCACCTTGAACGTGCCCAGTCGCGCCGAGGCGGCTGCCTTTACAGCCAACATTGCTTTGAGCTCCTCGGCGCCATCGGCCAGCTCCACGCTGCGTCGCCATCGACGCGATACGCCCGCCCTGGCGGAGAGTCGGCGCGCCAATAGCAATGCCAGCAGCA---GCAGCGACAGTGCCAGCAGCAGC---------------------GGCAAGACACCATCGACTGCCTGATCCTGGTCCATGTCGAGTGGGCGACACTCTTAAGCAACAAAAAACAAAACAAAATACACTAATCTACAAAGCTAACCCCAACGCGCCTACTGCAGGAATTATGATTGATTGTTCGAGTTCGTTATTATGGATAGATCCAA
>CG15098 14348382 14348513|14323 chr2R 14347520 14349846 scaffold_11 836235 838349 + 17028|894 1025
GCTCCAGTGTAGCTTCCCGTTTGGCCAGCTCTTATTTCATCATATCCCTTTTCGAATGTTTCCAATGGGGCTTCCCCGATAAACCCAATATTTTTCTAGCTAGTAGCACCAAAATTATATACTACGTTGTAT
-------------------------CAGCCGCTGATTAATCAGTCCC--------AAGGCGCGAATGTGCCCGCTCAGGGAAACA----GTTATCCCAGCTA----TACCAAAATC-TAAACTCCTTAATA-
>CG15099 14351679 14352209|14326 chr2R 14351247 14360446 scaffold_11 842146 851402 + 406874|497 1053
AAACCGGCTGTTGCCCAACGGCA---GACGCAGTCGCAGATCCAAGCGAGTGG---GTCACACTTCGAGCTCAAGCTGAACCTGAACCTAGGTATGGAGTCTGCCATGGAGTCGGGCAGTACTGGCCAGGCTGTGCGAATACTGGCGGCCGTGCAGGCTAAGCTAACTACCCAAAATGCCGAGACGAGCTTTACGCAGTCGCAAAACATCAATAACAGCAGCAACAATAAGATGACCAACTTTCCATTTTATGTCTA---AGTAAGCAGATTGGAGCAGAAGACGATGCCGAGTATGATAGC-----------TAGCTATATAGATAGAGAACTGTGTCGAGAGTATATAATTGTCCGTAGTGTGATCGATCGTTTTAAATGTTGAATG---TTTAAGAACGCGGTAGCCCAATAGCCAATAGCACCCTGTATGTATATGTATGTAACCAATGTATTT-AACTGTTGATAGTTGATCCCAAGTCGATGTGAGTAAGAGATGTGCGTTAACGACAAACTGCAATCAAATAAAAAACAA--AGCATTTTATTGCAAACA
AAACTGGTCGCGGCCTACAGGCAGACGACGCAGGCGCACATCCAGACAAGAAGCCTGACACAGTTCGAGCTGGAGCTGAATCT------------------------------GGGCGGCAACGGTCAAACGGCGCGCATCTTTGCGGCGGTTCAAGCGAAACTGAGCAGCCAGAACGCGGAGACGAGCTTCATGCAGACA------------------------ACCAAGAAGACCAACTTTCCATTTTATGTTTAGAGAGTGAGCCGAGCG-------ATACGATAGCTAGTTAGATAGTGCAGTATAGTATATATATATATATAGCCGACTAT-------GTGTATTAATG-----AATATTAT-----GTTTTAACTGTTGAGTAAGTCCTATGAAATGTTTAGC-------TTAGTAGCAACCTGTATGTATGTATGTGTA-------TATTTCAACTGTTGATAGCTGCGCCGAAGTA-----------------------AACGACAAATTGCAATTCAATAGAGCTCTAGTAGTATTTAATTACAAATA
>CG15100 14361721 14361945|14329 chr2R 14361722 14365547 scaffold_4 841228 844999 + 167240|0 240
ACATCACACTTCCTAACTAAAAATCACGCTGGACGCTTTTACCTCAGCCCTTTTAATCAGGCATTC---GATGGCAAATCTTTAGTCACGGACTGGCACAGTTCAATTCAT---CTCCCATAAGTT--------TTGCGTTTGCATTTAACAA--CCTTTTGTATTTATTCG-AAGTATGGCTAAATATTCAGTTAGTAATTTATTGAGTTTGTGAAGAAAAATAAAAAACAATTGACTTT
----------------------------------------AGCTTAGTCATATATATACAATATTCAAAGGTTGCAAACTTCTCGT---------GGACAAGTCTATTCATTTATTTTATTAAGTTATTTCGCGTTGCTTTTGCATTTAAAGAATCGTCCTCTATTTATTTACAAGTATTGCAGAAACTTCTTTTAGTAATTTATTCAGTTTGTGAA-AATAGTGAATATATATTGACTTT
>Jheh1 14368285 14368323|14334 chr2R 14368248 14369653 scaffold_4 847477 848887 + 66680|37 78
ATCTTCCAATAAAAGCT---TAATTGTTACAAAAAAAAATTA
AGCTACAAATAAAATTTGAATAACCGATATGTGCATACAGTA
>Jheh2 14370621 14370768|14335 chr2R 14369695 14372303 scaffold_4 848976 851434 + 59014|1037 1187
AACAAAATTGTTTATCATTAGTTATAGAAGTCCATTGTACATTTTCATCGTGATTCT-TGAAAGAAACGGTTATGTTTGTTGCAAAAATTAAATC--AAATCGACTTGGTGATTGTATTTGCCTTATCTGCTTTGAAAACCGAAAGTTGAA
CTTGAATGAGTCCATTTCCATTTTCGGTTGTACTTTAAGAAGCGGCACAAGGAATATATAAAACTTTTGTTTATTTTTTATATAAAAAGACATTTTGAAATTGATAAGATTGTT-TATTTATCA-ATAGGCAT---AAACGGAATGCTAAA
>Jheh3 14375229 14375254|14338 chr2R 14374999 14375237 scaffold_4 847287 847546 + -1371|265 273
TACCAAACG
CTACAAATA
>Jheh3 14375229 14375254|14339 chr2R 14375238 14377392 scaffold_4 853067 855167 + 73649|0 16
ATTGTTTTAAGTATAAT
--TGTTGTAGCTCTCAT
>prod 14484268 14484697|14495 chr2R 14483810 14485862 scaffold_4 998767 1001112 + 52816|599 1204
-GTCCCAAGCGGCAGGGCGA--GATCAGTGGGTCTAAGCAGTCGGCAAAAACTCCAGCAC------------------CAGCAGAAGCCACGGCGAAAGGATCAGCATTAGCAAAAGCAATGGAACGAGTCAAGTCAGCTCGAATTG-TATAGGTCTTTT------------ACGAATGTGCTCT-----TTGGCACTCGAACGTTTTCT-----AGCTCTCCAAGT-------------CCTGCGCTCCGCCGGAACACACACAA------------AACTGTAACTTATAGTAGCCAGATTTAAATTGACTAGTTTAAAATTGACATAG----------------AATTCTATTGTGTAAACAGTTATTTTCAACTTTTCAAGCACTTCATCTACGATATCCATATATATG---AAATAGGCATAAA-------ATTGTAATATCTAAAGTGAAAAAC---------------------------------------------------------------------------------AATTGGACAAGTAATTTT-AACGCGTTGTATGTAAATGTTAAGAATAAAGTTTACCAATGATAAA
CGCCCCAGGCAGAAACGCAAAGGAGCAGCCGCCCACAACAA-CAGCAACAACAACAGCAACGAGAGCGGGAGCGGGAGCAGCAGCAGCGGCAGCGGGAGCAACAGCTGCCGCAGGAGCGGGCAGTCGAGCCGAAGAAGAAGTAATAGTTATAGTTTTTATTGACACACAAACACACAGATGCTCTGCCAGTTCGAATTTGTACAATATTTACGTGAGCTGCAGACGTGAGACAGACGACAATTGAGCACTTCTGGATGGGGCATGATCGATGCCAGCCTATCATAACCTAAAGTAGCCAGTTTT-------TTAGTTTAAAATTTACGTAGTTCATATATTAATGCAAATCATTTTCTATATACAG----TTTCAA--TTACGAGTACCATACACAC-ATACACACACACACACACACACACGCATATATATTTGTATTGTAATGCTTAAAGGTACATACACATGTGAACATAGCCGAATCCTTGCTTGGCATTCGCTTTGTTCGCATTGCTACCTTTACTCTCAAGTGGAATCCATGTCAAATTGGACACATAATTTTAAACAAGTTGTATGTAAATGTAAAGAATAAAGTTTACCAATGATAAA
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TTTATATGAAACCGCTAATAAATATTGTGACAAATC
TTCAAATGACATCGT------ACATTCTTACAAAT-
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CC
TC
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TGAAAGTGCATTATTTATA-TTTACCACACA
TGAAAGTGAATTACTGGAATTTTAGCTTTCG
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---------------------TGTACAGCATGATTCCAGTGATTTATAAAATAATAATTAGAAGGTTTTCATCTTCGACTGTGGAATACTTAAAATGACAACAA---CGTAACA-------GTACAATATTATACACATAAGTCCACGCGGAAGAAAAGTATTGTAGATATTTATACTGTTTTTATAACCAA
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CATCCTACGAACCTACCTACCAACCATTGAACCAATTAGGTAACCAAATGTAACC
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GC---------GGATAGTCTTAAATGCCAGCGCAACCAAAATGAAAAGACAAAACCCATGTTAGAGAAAACCAACTAAATACAACAAATACTCATTAACATTTAGA----------------------GCAAATGCAATTGGACAATTATTACATACTTAGTTCAAACATAATACATATGCAAATTATGCAAGAGAGTACAATAATTTATCAGAATATACATAT---AAAATATACAACCTATATATATATATATATATACACACACACACATATTAAATTAGAAAGAAAGGGCATTGCGTCCTAGCTTAGTCCATGTCGTTTGATCAGTGTGCCTCATGTAATCCACAAAATGCATTCCAATCACCCAGCATTTAGATATACATATAGCTAAATGACCTATCCTTGTTACTTGCTCAGCTTTGAAACAAAATATTTAAATAACTATATATTTATCAATACTAATTCGGATATAAAGAATCTCCACTTAAATATGAAATTAAATGCAATTGTTTTTTCAAATTCCTAAGAATTCAATTATCAAAATCTAAAAAAGAAAAACATTTGCTATTTTTATTCAACTTATATTTATATAGTGCAAAATATTCCAAACATTTATTATTGTTGCAAAACTAAAGAAGTCTTTATTAATTATTAAGCTTCTCAATCTCACATTGAACAAAGTATTATATTTTGTGTTAT-TTTGCTAGTTGTTTATTCGTTAATTAAATTTA-------------AAGTGTTCTTTAAATATA----TATTTACGAGATTGTTAATATTACTATTCAAAAGTATA--TAATTTATCTTAGGTTA------AATATACTTACCTTAACTGTCTTCTTTACCTGCCTTTGTTAAATTTCGGTGCAATTTTTACCCCAAAGTCAATTA----AATGTTGCTATTTAAAGTTTAAGATATGTCCAAAAACAAAAAAC--AAACACCAAGCCAAGCCAGACTTAGCGCTAAATCAAAGTAACAAAAGAGATTTGAAATTAACGTAATTATTAAACGTACAATACCATAAAAAAAAAAAAAACAAGCATAGCAAAGTAAACAACGA----TTTTAGGTTTTCAACATTGAAAC---------GCGTCTAGAGATGGTTTTTAAAAACAAGCAAGCACACCATA-AACTACTATGTGAAACAAATGTATTAAAATTTAAATATATGAATAATAAAGAAT
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TCTTAATTATTATTTATTATATCTCGCCTAAGACTTCACAATTTAATTAAATAGTCAATGAAATCAAATTAATTTAAAAAGCTTGACCAGTTAATAATATATTATATTATATTCGAAATGTAAAAAAAAAAGGTAAACGCAAATCAAAAGCAATAATTTGTT------GTAAATTTTTAAAGAGTTTAATTATAACCCAAAATGAGATGTGAATCAATTGTACTGATTTTTAGCATGTTTGGCAATTGTTCGCCGAATAGAATTT
>Rgk1 14827005 14827459|14891 chr2R 14827217 14827454 scaffold_4 2316407 2316652 + 1195|0 265
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AAAGCTCCCTAAGATACATTTCGCCTAAGTTT----TGAAACGTACAAGCTAC-------------AAATAGACTC-CTAACTCATAGCTGTATTATCTTTGTATATATGTATAATTTATAATAT--GTATACTTTAATGCTAGTCAGTTAAATATTATTTGTATTAAGTCCTTATAATTGTGTATGAAACTTTGTGTATATATTCAACAAATATAAATATACTTTTAATTTATTTTATAACTGTGTTTACTTTCGTTTAATTACG
>Rgk1 14827005 14827459|14892 chr2R 14827455 14828961 scaffold_4 2316832 2318461 + 24494|0 4
GCACA
AGGCA
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GTGTAGACTCAAAGTTCCTTCACGAACTC-----------AACTCAATCCCATTTTTGCCATGACACCTCAGCTACTCTTAATTCTG-----------GTACTGTTGATG-GAGTGTACCAATTTTACCTA-----------ATCCAACGAACAAAGTGTCGATAAGCATGGCACGTCCTAAATTGTATTAGTATTTACGATTAGAACACTGTAGTTACTACTTTGTAATTTTATTAAAATATACTATAAATTATTTATTAAGATACGCCAA
GAGCTG--CTAAAATGTCTTATTTAACATTTGATATTCAAAACTCACTAC--TCATAGTTCGGATATCAGAACTGTTGTTAAGTTTTTGTATTCACCCATACTCTAAACACAAGTTCACACATTATACTCGCACAAGCGGACATCCAACGAACAAAAGTTGTATTTAAATTAAAAATATAGAATTTAATTGAAATTAACTCCTAA-----CGAAACGATTAGCTTATAATTGTGTTAAAATATATTTAAAATAATTTATTAAGTTACAGAAA
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AAATGTAATGAAGATTA------AGTGCGCAACTAAA
AAAAATAAGAAAGCTTGGTTAAGATTCCTCGAGTGAA
>Scs-fp 14906719 14907261|14963 chr2R 14906754 14909706 scaffold_1 839707 842749 - 122013|0 583
ATCAAGACTTGGAGTTGCAGAACACCCGCATATACACCC--------------CATACCATCACTCGTACGGATGTCTACTTAAACGTCTTTGTGGGCGCCAGTAAATAAATTTTGTCAAATCGCCAAAT---GAGCCGCAATATGCTACCAATTGGTAACTGGGAACTCGGCAGCGGTTCCGGGCATTTTGTGATGAAACGT---AAATCCAGATT--------------------TTCTATACACCTATAAATCT----TTCAAATCCTTATTACT-------ACTCCGCTGATTCTACTTAGTTTCACTGTAAGCTGCCCTCCATTTGGTTACTGTTTGGTTGTCGG--TTATTTACATTATTACATAAGCGAAAAATGTGTGTGA-GTAGACAACGAGTTAGGTCTGAGGCGATATTGACTACGCAGCCTGTTTAGAAGCAAATGAAAACAAATCC------AACTACACTTTTCTAGTATTTGTTAAACTTATTAAATTATTAAAACGAAA----ACGTGTAAAAACAATAAAA------AAAGAACAAAAGTCGAAAC-----GTTTGC-TATACATT
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>cer 14911075 14911224|14965 chr2R 14910329 14911618 scaffold_1 843752 845014 - 10829|790 950
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>hts 14912198 14913554|14967 chr2R 14911806 14913305 scaffold_11 3127363 3128984 + 19683|466 1784
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>hts 14912198 14913554|14968 chr2R 14913347 14913737 scaffold_11 3129036 3129459 + 15546|0 241
GCTGACCATCAGCGTGATCCGTAGGAGTAGCAATCTTGACCAACCTCCCACCATCAGCG-----GGAACCGAGAA--AAATAACGACAATGATACCACGAGA------------------AAATGGA--AACTTTAGCCAGATCAGCAAAA--GAAGCATTATATAAAAAA-----AAGAGAGAGGCCTAAACAAGCAACGGATGAGCAGCTAAAATCGATCGAGATGCATCTAAGGGGAAA
GCCAACCACAA-------CAGCAACAACAACAACAACCACCAACGCGCAGGCGGGGACGACAGTGTAACCGAGAAGGAAAGAGAGAGGAAGAGAGAGCGAGAGAGAGAGGAAAGATACGGAAGTGGAATAACGATGATGGAAACGACGAAAACAAAGCAACAAATAAAATAATATTATGAGAGAGGCATTAAAAAGCAACAAATGAGCAGCTAAACTTGAACAAGTTG-----ACGAGGAAA
>hts 14914380 14914722|14969 chr2R 14913883 14916291 scaffold_11 3129995 3132418 + 33585|529 885
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----ATATCAAGGGCGTGGTGCGCAGAACCAGGGCCAAGTAGGCTCCATTCACAAACTTTTAAATCGAACCAACTATTACACAACTCGGCACTCGGAAAATTTGTTTTTTTTTTTTTGTTAATTATGTTAAAAGTTTCTAAATGAATTGTCTTTTCTGTTATTTTTCTTTGCCTACAACATTTTGGCCATGTATTAAAATTAAGCACAA----AATATTCTTAAGTTACTCTGATTCT-------CCAAGCTATA-ATAAATGTCCGCG-----------------------CAAGCTTTAATCATACATACATACATACATACATACATACATATATATATATATAAATCGAATAA
>hts 14921763 14921987|14973 chr2R 14920793 14929089 scaffold_11 3138637 3147487 + 146349|1152 1434
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TTCTTATTTTCGCCAGACACCAAGAAAATATCATAGCAACAACAA---CAACAACAACAAGAAATTACTACTAGTTGCAAGATGTGGAGGTTTTTTTTTAACTCCTCTCCCTTTCCACTACAGCTGCAGTTTTGCTTTGTATAATTGATTTGTTTATTGTGCACATTTTATTTGAACACAATTCTTAATACAATTTGGCTAATTGTAATTCCAAATTTATCCAAATTAATCCCTCT-------AGCCAAGCACAAGCGCAACTAAACTGGCGACT--------
>hts 14923718 14924410|14973 chr2R 14920793 14929089 scaffold_11 3138637 3147487 + 146349|3280 4204
TT-------------------------------------------------------GAAATTGTT-----GGACACCGAATCCTTCAACTCTTTAC--------AGACATTCCACTT-GCTATCCCC----ATATATAATTTCCATTTCG-TTAGCACTCAGTTTTAG--TTTCAACTT--TGCCACTAAGCTGCAACTATATTCACGCATAAAATTTTTAGAGTTTAAGTAAATGAAAGTAATCA---------------ATATACAAATTCTATATATTTATATACTTTGGAA----------------------------ATAGAATTA-----AAACTCGGGCTAAACCAAAATTATTTTACGTGCTTTGCTAGCAAGCAAACAAATATTGTGTAA-TGTGCATTAATCAAATAAATAAAATAAACAAGAAATAAAAATTTGCATAGATGATTTTGTGCCTCATTTAGGGA------------TTTCGCTGCCTCAAAAACAAGACAATAGCGCTAAAACAATGCAAAGAAAGAGAAAGAAATTTGCTA--------TGAATACTAATCACTATGTAATAAATA---------------------------------------------AAACATTTT------TTAATTTACCGAATCA----------ATGATTTCATATTTAACCGCATTATTTTTCATTCATAAAA-------------TTTTTCTTTGCATGTTTTATGGTATCTTTCTTTTATTCTCTTTGTGATTGGTTTTCATT---GTTATTCAAGGCACAAAATCATTTATGCTTGTTATTTTAGTTAATTTATGTTTATTTGATCATTGAAAAGTTTGATATCT--------AGGAACATATTCTTATGTATGTTAAAAATAAACATTTCGAAAAACAC
TTGAGGTTCATCATATTAACTGATTCAAGCCAATATGTATCCTAATACACAAATAGGGAAATTTTTTAAACAAACCCCAAAGCCTTCACAACTCGATTAAAACCAAAACATTCCAATTAGCCATCCATAGAAATATTTAAAGCCCTCAACGACTAGCGCTGCCTCTTAACTTTTCTACTTGCTTTCATTAAATTTCACGCATATTAAGTAATAGAATATATAGGTTGAAAGTGAAACAAAACGGACATACTTTTATTTACATATAAACAAATTATG---ATGCAAATGTTTTGTAACCCAAATGCAGCAAATTCGCCACAAAATATATAATTACGATGAAACTAATGCTAAATCAAAATAATATGAAATGCTTT------------ATAAAT----TGTAATTGTGCATTAATCAAATAAATATACGAAATACAAAACTAAA--TCTCATAGATGATTTTGTGCCTT-TTTAGGAAAAAATACCCATTATTATTTGCCTTAAGAAAAAA-----------AAAACAATGCAAAGAAAGAGAAAGACATTTGTTACTAACTATTAAATGCTAGCAGTTATATTTTAAATATTGCTAAGCCAAAATAATTCCGATTGTGTAAATTTATTACACTATGAAAATTTTCAATTATCCATTGACCG-ATCACGCATGTCTTATAGTTTTCTTCTTCATTTTATTATAGTTTGTTAATGTGAACACACGAATTTCTTTTTCTTTGCATGATTTAAA------TTTATTTGTAAATTGTCCAAATTGTTTTTGTTTACATTTCTTAAGGCACAAAGTCATTTATGCTTGT--ATTTCATTTATTTATA---ATTTG--CATTAAAATAATACATATTTCAACTATGATTAACATTTGCTTGCATTTGTGTGCAATTA----TCCGACGGGGAT
>Fak56D 14945513 14945968|14993 chr2R 14945705 14951501 scaffold_11 2472663 2478786 + 159997|0 287
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GT-------TATTGGTTAACTTAA--TAATGTTAAATAAAATTTTTC-AAAATCAATCAAATTTAATATATTGTTTTTATGTATTTACCTATGTT------TTAAAAGAAGTAGAAAATTTACACCTGTTAAAAATATATTTAT-TTAATGTC
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ATTC--------------------TCT-----AAAGTTGCGTCAAATAAAATGAGAACAACAAC-----AATTAAGTTTTCAACGA-TTGTTCTTTT---AACGTAACCAATAAAGTCGAAACGATTTCTTATAAAAAAAATTTGTTTGCCTTCTGCTAGTTG
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ACATGTATTATTGA----AATCCTTATCAAATGC-----ATGCCTATGCATATTAAATTATTATATTGATTGTGATAATTTATAGTCAAACTTTTCGTGTTTCTATTAACTCAATTCTTTATCTTTTTATAAGTCTCTAGCGGGTATTTTACTTGGAAAATTATCCTTTTTTGACTCGCAAGGATCAGTTCTATCAGTGGGCATTAA----TATTTTATACCTTTTTGAATT
>CG11242 15000354 15000665|15043 chr2R 15000661 15001583 scaffold_11 2534299 2535226 + 31076|0 4
GAATA
TAACA
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TAAATAAATCTGGCGGCGCAGCAGCTGTAAGTGAAGCCATACGAAATCTTTCCCATTCTAGTTTATCTTAGTAATTTATTTATTTGTAGTCTTTTCTTGGAGCTGTTGCGCCCCCT-TGCTGCCACTATCCCATTACGTATGTACTTGGGGCATTGGCTTTTGTGCTTGCCGCACTCTCATGATCTATATAGAGATATACATATACATATATATACCCTCCACATATATACTCAACTATATACAAATTTCAATACACGAAAATTCGAAATAACAAAT------TTAATCATTCGCATCTATGTAAAATTCAATAAATACTCGTGATATGTTATATATATATCTATATATATATATGCATACAT
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CATCGCCATCGCATGACCAGAACCTATTTGTCCAATTATATGGCCCTTGTCGCATAA--ACCGCGAAATGTTAAATATGCCCGATTTGCACTTA
CGCCGCCATCGCATGTCCTGCAACGATTTGTCCAATTATATGGACCTTTCCGCATAAATACGGCTAAATAGCGAATGTGACTGATTTGCACTTG
>CG30130 15028828 15029689|15061 chr2R 15029040 15029946 scaffold_1 3107440 3108371 - 5478|0 710
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AATATATGAATTGAATATATTGCTTAAACATATTTGCAAAAATTATAAAAAATGCAGCAGCAACAACTATGGGAAAGTTTTCAAGTTTCTTGAAGCTGAAAAAGTGTTAGAACTTTGACATTA-----TTGATTAAGTTTAACGAACAAATTGAAAACCAACTATGTTTTAACTCACAATCTTAAGTTTTCTCTCGGTCCAACAATTTTCAGCTACACAAGGCATCCTCGACGAAGGTAAGCGGCGCCCAACGAAGGCA-GCTCAGTGTTTGTCAGTGTTTGTCATTTAATCAAAATGAATATAA-------GCAAAAAGAAATTAAAAATAAAACAAAAAAAAACAATAAGCGCTGCTTTATCTGTATTTGTAATACGTCCTGTCTTAAATGCATTTATGTTTTGTC-TACATCCGGTGCGGAAATGCAATTGCACACACATCTATAAAACTGTCGCTATCATCTACTTATCGGGCACAAGTCGTTAATTGTACTAGCAATAAATTAT---------AAATT-
>sm 15044744 15045426|15071 chr2R 15045196 15045483 scaffold_14773 720 1062 + 5625|0 303
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GATTTGATTACCATTGTGTAAGCAGCCAACAACCAGCTGAACAACACAACAAACAACTACACAACCACAACAAACAGCAGACAACAAACAACAAATATACAGATTATACAGAACTGGAGGAGTTGAATTTATGTGGAGCATATTGGATCGCGATGAGAAGAGAGGCAGACGTACACAACGGCAACATCAAAAACAACAACAA-----CAACAAAGCATATTAAAT------ATTTCAAACACTAATTAAATTCAA------ATATTGATGGAACGAACATACTG-AGTGTAGTCAAGAATAACA
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>hrg 15179410 15179529|15252 chr2R 15178749 15179606 scaffold_1 3336741 3337694 - 21822|793 916
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TGTAAAAAGCTAATACATGTACTATT-AAGGCTTAGTTTTCATAGTTA--ACCTATCCATTGATTTTCCCTGGCATTTTGATGTCACAAAACTGAATGGAAGTCCCTATATTTTATACAAAACG
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CAACCGCCAATGCCACAAGCACAGCATCAGCAGCAGCATCAACAGCCACAACAGCAACAGCAGCCGCCGCCGCCGCTGCCGCCACCGCCACCGTCTCATCATCATCATAAATTTCGCAAGAACAACAATGCGGCCGCGGCGGCTGCCTCCAATAGCATTTTTAACCAGCGTTCAATACTGCATGCGGCTTCTAGTCTAACGGCCGCTCTAAGCATAACGGGACACAAGCGCAAGCAGCCAGCAACAACAACAACAG-------CAGCAGCAGCAACAGCAGCAACAACAGTTGCTGCCAGCA--------ACAGTAATAAAAATGGCAGCGGCAACAACACAAATACTTTATGCTACTACATTGATGACGATGATGACAACAACCAACAGCATCAGCAGCAACTGCAACAGCAACCACCTACCACCCAAAAACCACAACAGAAACAACAACAGCAGCAACAACTACAACATCAACAACAACAACAATCAGAGCATGCTGCTGCTATAAGAGCCATGCCAGCAACAGCAGCAACAACAACAACTGCAGCAGCAGCAGCCGCAACAGCGGCAACGACAATTTCTT
>CG15128 15200469 15200548|15270 chr2R 15200390 15200609 scaffold_1 3368569 3368792 - -862|79 166
TATTATATACTTGACTATTTT---ACATTTGTTTTACTATTT-----TACGGTTACACCAAAGAAATAAATATAAATTTTAAATATTT
TTTCACTTATGTTATTACCTTTACACAATGTGATTCCCATTGCGGAATGCTGCACCACCGAAGTAAGACATATA-----TAAATATAT
>Obp56d 15217993 15218147|15289 chr2R 15218010 15218757 scaffold_1 3398453 3399180 - 16588|0 141
GCGCCAAATCTCCGATATTCTCCTGTGTGATAATCTGTCTGTGACTTGTTACTTAT--ATTGTTTTAATTCAGTATATCAATTCGTAAACAAAATTTTTAGATCT--GTAAATGTTTTGAATAATAAACTCAAGAATATATT
GACCAGGCCCACAAACGGTATTACCAAACTAAAAGCATCTGTGAATTGTCAGCAATTAATTG-------TCGACCTATCAA-----AAAAATAATTGTTATGTGTAAATACATGTATTAAAGAACAAATTTACATAAATATT
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CTTAATGGAGATGC---TAGCATACACGACCCATAACACATTTGTTA----CCCTGTATTCATAAAATAAAAA---TATTTATTATTGTATT
CCAAATGGAAATGCAAAAAGAATGCTCTAGTCGAGAAACGCACGCTAAACGCCGTGCCTACAATACATACAAAGTGTGTTAATTATGTTATG
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ATTAATTGTTGGCTCGCTTTA
ATCAATGATTGTCGCGCACCA
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AATACCA--------------------------------------------------TTAAGGTTTAGGTCTTAAGCACGATGTTCACC-------------ATTCCGAAAGTTATATTGCCACGAATTTTTCTGTATAT-------ACATGCAATTTTTGATA
AACAACAAACACAGTCGTATATATGTGTTGTGTTTGTGTTTTTATAAGCAACAACGTTTACAACTTAGTTTATAAGCACACAGTTTCGCGCATTCCTAAAAGATTTTCAAAATGCATTTGTCACGATATTTTCTTTGTATATACACAACATGGAAATTTTTATA
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TTTGTGCCTTGGCAATTGGCTGTGATGTTGTAGTACTAATGCCATATAATTATGAC-ATATGTACGTTTGTATATATGTTAATGTACCTATATAGAGGGTACATTAATAGCGAGTCCTATTAAAGTTAATGCTGTGTATTTATTGTT
>Ate1 15768655 15769908|15880 chr2R 15768759 15769205 scaffold_1 4104494 4104988 - 7120|0 546
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CGTGTGCTCGTGCTGGTTGATCATTGCCAAG--GATTGGCAA-----------GAATGGAATTATTTTTGAAATATT-------TTTTTTTTTAGCCCGTGATT-GGCACGAATTTGTACATTTTTGTTTGGATTCAAGAATTTCTC---------CTAGTGTAATAATCGCATGCGATTTCTTTTGTGGCGCGCTATCAAAACAAGCGCTAGGGCGAGCAGGAGAGCGAGAGCGAGAGCGAGAGAGAGGGAGAGTAAAGCTGCGAGCGAAGCGTCAATCTCAAAACCGCCAACAGTCAACAACAATTTAAACAATTTTTAACCGTTTGTTTTTGCGCTTC----------------------GCTGTCGCCGGCCGAGGTTTTGCTTAAAAACGTCGTCGCCGCGCGTCTGACGGTACATAACTTAACTAAAGTATATATGCCATTGGCAGCTGGCGATTTAGCTTCATTCGTTCCGCGGCGTTCTCAGCTGTAGCAACAGTGCCCAATCCCGCCAACTTCCACTCCCCCCACATAGCCAGTGGCA
>Ate1 15768655 15769908|15881 chr2R 15769610 15771275 scaffold_1 4106276 4108075 - 45693|0 405
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AATTACAAATAAATTCATAAATGCACCTTTTTTCATTATATACCACGCAATTAAGTTAAACGCCTTAGCTAAGTAGTGCAAAATTATTTCATT-CAAATGTAAACTGTTAAATCTCTGTTAATATGTGCGACTACGTTCTTAAAATTCAATTTTATCATATAACAAATAAAACAAGAAAATGTTGTGCACCAAACTAAAATATATAATTTATTTTAATCAATTATGCGAGCTGAGTAGGTTGACAAAATAATAAAAGAAAAAAACATATGTTTGTTATCCGCA-ACATTTCTGATAACAACGATAGCTCGAATGCTTAGCAAATTAACAACTGTTATCACTTATCATCACAGCTTATC---AACAGCCAGCTAAATGCATCAATAAAAC-TAATTATCTAACAACA
>mus209 15776615 15776741|15882 chr2R 15771288 15778553 scaffold_1 4108416 4115566 - 211517|5703 5841
GTCAGCT-----GTGTTCCT----CATATTTATGTCCC-CGCAT-CGTCACCACTCATCTTCCCACGTTCACTTCATTCCTAACTTTTAAGTAAATCCGCATTT-TTTGATCAATAAAAGCTATACTGTGTAATGTTAA
AATAGTTTCGCGATGTACCTAAAACATATTCATATTTCACATATACCGCATAATTCCCTTACATACGACATACTAATTGTTAAGATTTTA-CAGTGCAGCATTTCTTTGGCCAATAAA-----------GTAATACAAA
>plu 15777821 15777888|15882 chr2R 15771288 15778553 scaffold_1 4108416 4115566 - 211517|6957 7024
TGTATTGTCATTTTGTAATAATTTATTAATTTTAATGTTTGAAATAAATATACTCTGTAAAAAGTGTG
TTAA--ATAAATTTGTGTCAAAATACTCATTT--------GTAAAACAT-TGTACTGGAAAAAATAAA
>CG10444 15786514 15787280|15893 chr2R 15786445 15789111 scaffold_1 4126122 4128742 - 78686|69 911
-TCCGCCCGGCTTAGATT-----------TAGTGTAGAATATA---------------TACATACATATAAAAGAATTTCCAGAAGGCGTCGGCTATTTGGTTAGTCGTGTTACGGATGTCGTACCTAAAA---GTGCATAACTATGTGACCTTTTTGTATACCTGTGTG-AACGAAACTGGCATACAGAGCGACCAAAACAGAGTCTTCCA-TATACACGTAAACAACGATAATTAGTAGTTATTA-----GTCGTGTTGCAAATGTTCACAAGCGCATCATTAAGAGGCC-------TCTTAAGAATAGTCAAATGTTTTTTACAAGAACGTATCAAAAGTAGGAGTCTACCTCAATGAACTTTTACAGAGGGACAATAATCAATTTGGA--GCCTAAAAGCGAGTTGGCCGACTACTTTCCCATGTTGAGCATTGGCAGCCACAATGCCCCACATAAATTA--TTGATTTAGTAGTACATC--TAATTTTAATGGGATAT-TTATATTCAT-ACCTCTTAGTTACTCGATATTTGCATACATAGATAACATAATAACATTACAATAATACACTACAGTGAGCACCGCCTATAAATAGTTACTACATGGCTCTTAAAGCATTACATTGCGCCACAGTGTGAATTCTGTTTACTTATATACCTCTACTATATGTACACAAATATACTATAGACTAATTATATACTCGTGTCGTGTCGCAATCAACCATTGAACAATAACT----------------CGGAGCAGTGAAAGTTATGTGTATT---------TGTAAAAGCCAAACTGCTGATCATTAAAGAAATCTGTTCTACAAAATGTGAT
CTCTTATTTATTTATATTGTTAAATGACATAGTGTAGAATATCATTAACTGTGGGCTTTACTTAC---CAAAAAAAACTTTAAAACATG-CAGCTGTTTTAGCAGT-----------TGTCGTACCTAAAACGTGCATATAACAATGTGACCTATTTGTATACCTGCATATAACTATAACAACTGCTAAAGGCGCCCGAACAACGTCTTCCATTTTGCAAGTGCTTAAAACTATATAATAATTGATAACTAGGATGTGTTAAATATATGTCTATATACCTCGTCGGCATACCTAGCTGATATTCAGTGAAGCTAATCGCTTTACAAA------TGCCATAAATTATAATAGACTC--ATGGATT---------AGACAATAACTGTATGGTATTGCATTAGAGACTGACAGCCAA-GAGTCTCTAATGTGAGGGATAATCA---ACAAT--------TTAGTTAGTCTGCTTTAGTTTTACATAAGTCATATTAGAGCAATGTGTTGTTTTCATCAAATTCAAATTGTAGTATACAACGTTACACATTTAGAATAATATTATAGCAA-AGTTTGCCAAATTGCGCATTGCTGGCAAAATATTGATACACAA-----------------------------------------ACCTATATTC---------ATATGAACATATATACAATTGTCCCGTC-TATGTGCATGCTGAAACGTAGCAAATCAATGAACAATATTTAATTTAAGTAATCAAGAGAAATACTGTATTTTTATTGTATTGTACTTAAATGTAAAGTAACGTTTGCTGACCATTAAATAA---------------------
>CG9143 15790833 15791008|15894 chr2R 15789524 15794016 scaffold_11 3200741 3205204 + 180491|1315 1499
TCTAACTTAAAGCTGTTTTATTGAATAAGAGATACAAAGCTATAGCCTTGGATGTTTCCATCAATGCTTTGAAACAAAGTATCGCACACCTCCATCGGTCAATGAGCGAGCGTGCTTGGCCAATAGTGTGGAAACGGACAAGTTTGGGGTGGTAAAGCACCT---------AGTTATAAAACCGA
ACTAATATAATTTAGTTTACTGTAAAAATAAAT----------------TGATGTAT---TCAATGCTTTGAAACAAAGTATCGTATGCCACCCTCGGTAAGAGAGCGTGCGTGCTTGGCCAGTAATGTGGACACAGATAGTGTGGGCGTGGTAAAGCAGCTGCAGAAAGAAATTGTTAAGCATT
>CG9090 15793919 15794030|15894 chr2R 15789524 15794016 scaffold_11 3200741 3205204 + 180491|4518 4620
AACTGTTTTTA-AATTTAGAGCGAGCAGAATGTTAATCGAATTAAACTTGATTTGTATAGATAAACCAC----ACAGTAAATAAAAACCACACAAAAATTAAA
AAGTGTTATTATAATAAAGATCATAAAAAGCAGTAA---ACTTACACCTAACTTGT-TAAATAAATTTTTTTACCTTTCGACAAAGACAA----------AAA
>CG9090 15793919 15794030|15895 chr2R 15794017 15795068 scaffold_11 647380 648429 - 67031|0 13
-CCAAATATAAGCT
CATATATAGAAGTT
>CG16868 15796492 15797012|15896 chr2R 15795088 15799087 scaffold_11 648444 652167 - 142415|1473 2021
TCCACAATAGCGTTGTTAAGTTTTAGAGC--GTAAGATGTCCGCTTGTTTGCCAATTTAGTTATGTAAGTTTCCAAAAT----GGGCAGTTCAACTGCCGACAGTCCAGAATGCTGGGCCCGCATTCCAAACCCGCAATGTGTTTTGTGAGCTCGCGGTGGCCTCCATTGTTGGCCCATCTGTATCTATTAGAGCCTCCGTGGACGAGACGAACACCAACT-----ATTAAGT-GATGACATTGTT------TCTGCCATTTTTGATCGATGTATTGTATTTGTATTGTATTGTATTTTACTGTAATTTATTGCAAAAAGTATTACTATATTATGTGCAGCTATATACTTCCGATATTTTTAGCATTTATTTGATAAGCACCAA--CAACAGAAATGTACTTACTTGTCTGATTGTAAGATACCATGTCGTA-------TATCGTTTTTTGTAATAGCCCCTAAGACTACAGAGTTACTAACTACTGATTTTAGT-AATACACATCTATAATAGCATTGTACGTTTCAAATAAAATGTTTAAATTTTGC
TCCCAGCTAGT-TTGTTAGGTTGCAATACTATTAAGACGTCCGCTTGTTTGCCAATTTGGTTATTTTG--TACTAAGGTCTGGGGGAAGTTCAACTGCC------CCAG------------------------TGCAGCGCAGTTTGAG----------------CAGCATAGGTCGATGCCTATC-----ACACTCACACATACAAAATGCCAGCCAATTTAATATTTAAGTCGTTTTTATCGTTAATAACTTTGCCATTTTTG-TCCATATA-CACGTTTGCG-----------TGTACTGTAATTTATTGCAAAAAGTATTATTA-------TGCAGC----TACTTCCAATATTTTTAGCATTTA-TTGTTAAGCACTAAATCAAC-TAATTGTACTTA-TTGTC-AACCGTGACAAACGAC-TCGAAGCAAGAGTATGCATTTTTGTAATAGTTTTTAAGTCCATAAAGTTACTAACTATCGATTTTAGTAAATAAACACACACAA----ATTGTATGTTTCCAATAAAATGTTTAAATTTTAT
>CG9036 15803218 15803726|15900 chr2R 15802241 15803589 scaffold_11 3215325 3216760 + 24776|1047 1524
TTCCCATCTCTGTGCATACCCT---------------TAGTGGGACGCCCGCCATTTTGCCATAGACAGGCGCGTTCC--TTTCCGTTTCCGTTTCACTGCTGTTCGTTATCCTGTTTTCCGTCTCTACACCTGGAACTCCTTGCCGT------TTTGTTTTGTTTAAGCGCCTTCATTTTGTGTTAGTC----------------------------TACGCACACACTCCAACACAC---------CATTCACCCACAACATGACCAT--TACGCATTCATACATAC--------ATGCATAAGGATTGTATTTAGTTTTTAAACGA-----------------------------------AAATGGAAATTCGAAAGTGAAACGAACTTATGAGA-TTTTTGTGTATATTTAATAATTATTAAATGAATAAAGAAGCATTTTTGTATAAAACAAAGTCAAAAAGAAAAACCAAA
TTGTCATCTCTACTGTCACCCTACCGCTGTCCCATTTTAGTGGAACG-CCGCCATTTTGCCATAGCCAGGCGCGTTCCATTTTCCA---CTGTTCCACTGT--TTCACTGTTCCG---------CCTATGCCTCGTGTTCCCTGTATTATGCCGTTTGTTTTG-TTAAGCGCCTTCATTTTGTGTTGTTCCACACAGTTGCGGACACACACACACACACACACACACACACAGACACACACACACATACATGCATACATATTGTGACCATCACACGCATTCATACATACATATACATATACATAAGCATTGTATTTAATTTT--AATGAATTCCGATGCAAAATGCATTGGAGCCAAACTCTTTAAATGGAAAATTGTGTACGAA---GACATATGAGATTTTTTGTGTATA-ATGATAATGAT--AATGAATAAAGAAGCATTTTTGTATAAAACAAAGT---AATGAAAAAATAGA
>CG9036 15803218 15803726|15901 chr2R 15803608 15805635 scaffold_11 3216773 3218774 + 69602|0 155
GATGGGGA-----AGTGAGGATACCCGATTTAG---GTCGACCCCG-CAACTATACTCGTCTACTTCATGGGATCGCTG----------------------------GCCGAGTATTAAACGCACATCCAGCCAGTGGGCCAGCGATCGCAGTCAG
TAAGGAGAGTGCCAGTAAGGCGTTACCTTCTAGTGTTTCGACCCCGTTAACTAGACTTGTCTA-----TCGTGTTGTTGTTTATATTGTTTTTCTATCGCCAACCGAGCTGAGTATTAATAGCATCTGCTGCCGGTG---CAGCGATCACAGTTTG
>CG11200 15819378 15819494|15919 chr2R 15819386 15821670 scaffold_11 3237007 3239594 + 54482|0 134
ATGAACTCCACACTCAGTCTAT--CTCACATTCCTCCTACTGGTGCAACGTACTTTTCT-----AGATACCGTCAGCT-------TTTTTGTA------------AATCGATTTCTTTTGTATAAAAACATTTTT
TTGTCAATTAATCAAAGCCTGTTCTTAACATTCCTCA-ACTGGTGCAACGTACTTTTTCTAATAAGATAAGATCTGCTAATAGTCATCTTATATTAAAATAACACAATTGGATTGACTTAGATGAACACATTTTT
>CG13868 15823575 15824435|15922 chr2R 15823765 15826447 scaffold_11 3240999 3243691 + 99952|0 752
CAGTTAAAGGAGCCTAAGGATGTCGCTGCTACGGAAACGGAAACGAAGATGGAGGAACAGGCGATAAAAGACATTGACAACGCAGCTGCAACTTAGAGTTCCGAACCTATTTGAATACTTTGAATACTTTGTCCTTTCCACAGTAATATTCTTTTTAGTAGCATATAGGCACCTCTTACACCAGCACACACGATTCAAGTATATATTCAATTTAGTCTAGTATATATTTCAAA-------ATATTTATTCACCTATAAACACGACAACACGCTCTATATGGTAATCC--------CAACTGAATTATTTAATCGAAAGCGAAACGAAATTTTATTCAAAATATTTAAAAGAA----------------------------------------ATGCGCAAAGTTTAGACTTCAA-----TGTTTCGCTTAGGTTCTTCTAATTTCAAACTATATATATACTTATGCGCAACTATATAATGGCAAAATTAGTTATAACTGGTATCAAGGCAAAACATAAATTGTAATTGTTGTACGAACATATTTCCGTTTAAACACTTAAATGCACTGTACTATTTCGGTTCAATAAAT------AAATCAGCTAGCAAAAGAAAGAAGGTATTTTGTTGGGAGACTTAA---------AACATAATTTTACTTGAACTTTAACTAACATGAAAAGATTAAAGGTGTATTATTG-------CCTTAAATTTGAATTTCGATATTTTTATGGCAGTGATATCGA
CAGTTAAAGCAGCCTAAGAATGCCGCTGCGTTGTCCATGAAGGC---AATCGAGGAGC------------ACAACGACGAAACAGCTGCAACTTAGA----CGAGGAGTTTCAAAATTTTAAAATCCATTTTCCCTTTCAAAACAAATTTATTTT--ATAGTATTTAGGC-------------GCACCTACAA---AAATATAT-TTCAATTTAGTAATATATGTATATCTAATGCATACAAATATATACAATTATATAGAC-ACAAAACACTC-ACATAATAACACTTTTGAATCCCTTGTATTGTTTAA-------CAAATCGAAATTTTA-TCAAAGAATAGAAAAGAAAACAAAAAAAAAAAAAAACAATTATATCAACAATGTAAGTACGAGTAAAACCTATATTTAGATTTTGTGTTGTGCTAAGCTTTTTTCAATTTTCGATT-------------TGTTCTACTTAATAATAATCAATTTA------------AGCTATGCAAAACATTAGTTGACAT-----------AATACTTTCGTTC---------AATGCACTGTACAATTTTTGTTTAATAAATAAATGCAAATCAGCTAGCTAAAAAATAATTGGAGTTT-TCGTCAACATTAACGAAAAAATACAATAATTTTAAATAAAAATCAATGAGAAGAAGAAAATAGCTAGTATTTTGTAGCGTAGTCCCATAAATGGTCTTTTTGGTATTTTTATGATTGAGAACTCAA
>Arc32 15840704 15840826|15933 chr2R 15836848 15841907 scaffold_11 3255555 3260942 + 110062|4263 4442
AAAACATC--AGTTTATTAGCTATTATCGGTTCCATCTGGCGGAATGTTTCGTCGTAATAAGT-------TATATGTATATT-------------------CCTAATTCTAAAACTAGGATTACGC-----------------------------AAACATAAACATGAACAAATTTAAA
CAAAAATCATAATTTATTGTTGCGCTTTGCTTGAATACAACAGAGTAAAACATGGTAATATATATATATATAGATGTATATCTTAGGTTAGACGCGGAATGTCTGCTCATAAATATGTGTATATGCTTGTAATAACTGTCGGCCACATAATTTAAACAAATAAACGTAAACAAA-ACAAA
>CG30151 16043367 16043454|16156 chr2R 16043285 16043406 scaffold_16 1698904 1699030 - 521|89 128
GTCTTTCACTTGTCTGTTATCAATAAAATTTCAATAATGC
GTTTTTCATTTCACGATTAACATCAAGAAT--AATATTTC
>CG30148 16061893 16062091|16179 chr2R 16061617 16062676 scaffold_16 1727027 1728219 - 17999|323 644
GGTCATC---------TTTCAAGCAATTATGGGATCGTAGCCGA-----------GCT----------------------TAAAGCTCGTCTTGAACCATTGTTTATG---------------------GAGCGTA--------CTTTCCATGCTAATCCGCT---------------------------------CTTTTGGCTCACAGCTAATCTTTTTGCTTGCTACA---CAAAGAACAATGCGTT-CACAAATAATAATAATAATTCACC----AAATTAAAGTGTTATCAAAAC-----------ATATTTAATAT
GGAAATCCTAAGACAGCTTGAAATAAGCACGAAATCGAAGTCTATAACGTGAATGGCTAATTTCCATTGTGTGTCAATTAAAAAACCTGTCTTTAATTAACTTATATGAATACATTACGAGTAGACATAGAACGTAGAATTGGTTTATATAGGCTATTCTCTTAAATATACGTTACATAATATATAGAAGAACAGGCTTTTCGCTTGACTGTGCCCTGCTTATTTGGTATATTTTACAGGGTATTTCCTTGTACAAGTACTCGCAACTGCCTTCCTTTAAAACTGACTTGTTCTTGGAACAATTGATATGTATGTCTAGTAA
>CG18066 16064116 16064241|16180 chr2R 16064052 16065357 scaffold_16 1729123 1730547 - 32847|64 191
GTGATGGAGTTCGCTGAATGATGTG-AAAATAAACGGGTAGCTTCCAGAAATATCAACAATTTCCGTTTATTTTGTGATCAGTTA-AAGTGAGTGGGGGAAATAGTTTAGTTAATTATTTTGTATTAT
GTTGCTAAGTTC---TAAAAGTGTGTTCAATAAACAATTGATTT--GAAAAT-------ATTTCCGTTAGTTTTTTATTCGATTGCCACAAAACCTGCAGAACAGT---GTTGGTAATTCCAAAATAT
>CG13430 16065196 16065366|16180 chr2R 16064052 16065357 scaffold_16 1729123 1730547 - 32847|1284 1477
AAACTGTATTACAACATAGAAATA-----------ATGGTCAAAACCACTGCTAAGTTTAAGTTATAACGTAATCCCA---TATATACTAATACGAAATCTAATACTTAAGACTTTTCACCTCTGTAAATGAACCGTATTAAACGCT-----------AATAACTTGCTAATTTCA-------AGTTCAGATGA
AAATTATATTAACTCACTAAAATGTCAATTTGTTTCTGGTTGAAAGCAA----AAGTTTCA-TCATGAACTATTTCCAAGAGAGATTTGAGCACACAACTTCAAGCTTGCGAATTTTAA-------GAATATATGACATTAAGAGATTCTAGTATTAGAGGAACTTGGTGTTTTTCGTAGAACAGCAAAGCTTG
>CG13430 16065196 16065366|16181 chr2R 16065358 16066110 scaffold_16 1731215 1731978 - 26222|0 8
CCTAATTTT
TCTTATTTT
>CG18065 16065196 16066405|16181 chr2R 16065358 16066110 scaffold_16 1731215 1731978 - 26222|0 765
CAGAACTCCACGGA-----TGTCGAACAGGATGGCCGCATTGTCGGCGGCTGGGAGACGCACATCACCTTCTTTCCGCACCAAGTATCCCTGCAGTTGGGCACCCGGCATGCATGCGGTGGAACCATCATTTCGCCCAACATCATCTTGACTGCTGCTCACTGTGTGCTGGAGTACAGTAAACCGCAATATTACGTGATTCGAGCCGGATCTAGCGATTGGACGAAGGGCGGCAGCTATATTCGCGTCAAAAAGATCATTCCGCATCCTGAGTTCCATGACCCCACGAGGATGAACAATGACATTGCCATTGTTCAGCTGCAGCAACCCCTTGTCTATAGTCAGGATATACGACCCATAAGCTTGGCCACCAGTAAGGACATCATTATGCCGACC--GCACAGCTTTTTGTAAGCGGCTGGGGCAGCACGTCGATCTCACAAATGCAGCCGGAAAAGCGTCTTCGCTACACCGTTGTCCATCTGAGAGATCAGAACCAGTGTGCCAGAAACTATTTCGGAGCTGGCACCGTGACCAACACCATGTTCTGCGCGGGAACTCAGGC------GGGAGGAAGAGATAGCTGCCAGGGAGATTCGGGCGGTCCACTTGTCACATCTATAGATGGCCGTCTAAAGCTCTACGGCATTGTGTCCTGGGGATTTGGATGCGCAAACGCCATGTTTCCTGGAATTTACACAAAAGTTTCGGCCTATGACGACTGGATAGCGCAGACAATTGAGGAGCTGGTCTAGCCTAATTTT
CGGTGCCCCATGGCAGCCCTGGTCCACAGGACGGTCGCATTGTGGGTGGCTGGGAGACAAAAATCACACACTTTCCGCATCAGGTCTCAGTACAGATGGGCACCCGTCATATCTGCGGCGGCACCATATTGGCGCCCAGCATTGTGCTCACCGCTGCTCATTGCGTGCTGAAGTCAAATGAGCCGCAACTCTATGCCATACGCGCTGGCTCTACCCTGTGGTCAACTGGTGGCAGCTACGTGCGTGTTCGTCGCATCATTCCCCACGAGCAATTCAACTTACCCACGCACATGAACAACGACATTGCTGTGGTGCAGCTGCAACAACCGCTTAACTATAGTCTCGACATACAGCCTATTCAGTTTGTCGCGCCGACGGACA--ATTTGGCCGCACAGGCGCAGCTCTTTGTCAGCGGCTGGGGCTCAACAGCTGTCGAGCAAATGTCGACTGCATCGCGCCTGCATTACACAGTCATCGTCCAGCTGGATCGCCAAATTTGTACTCGGAACTATTTTGGTGCCGGCACCGTAACCAGCACCATGTTCTGTGCAGGCAGCAAGTCTGGACTTGGAGATCGCGATAGCTGCATGGGCGATTCTGGTGGTCCGTTGATAGTTCGAATTGCTGGTCGCTTCAAACTGCTCGGCATTGTATCCTGGGGCTTGGGCTGCGCAAATGCCCAGTATCCGGGCGTTTATACGTTTGTCCCTGCTTATGGCGACTGGTTGTTGCAGACAGTTAAGACACTGACCTAGTCTTATTTT
>CG18065 16065196 16066405|16182 chr2R 16066190 16067026 scaffold_16 1732074 1732927 - 19829|0 283
TTGGAAGAGCAAAAGCCTAGACACTAGCAGCACCCTTGACCTCCGCCATCTGTTTAATTTGTCCCAAGCC------ATCTATCCATAAATATCTATA---AATCCCG---AAAGATAGTCCGAGAAGGTCAGGGGCCA----------------------CCAAAAGAGTTGGGTCCGCCGATAA------------GATAAGC-----------CGTGTGTCTTGGAGTTCCCTTATAAAAG---------ACCTGAACCACAGTGATTTCCATCA--CAGTC
TTGGAAGAGCAAAAGCCTAGACATTAGTTG-ACATTACACGCCCACTAT-TATTTCGACAGTTACACATCGCTCATATATTTTCATAAATACCTAGCCACAACCTCGTCTAAGGTTAATCGCAGCGCCCTGAGGGCCATGCGAGCAGCCCTTGACGGCGTCTGTGAAATCTGGTGTCGCTGGCAAACACAAAACTGCGATAAGCGCCAAGATATCTGTGCGT-----GGTTAGCCTATAAAAGTTGCCAGCAACGAGAGTCACACGGTTATCCGTAAGTCAGCC
>Mgat1 16074019 16074902|16189 chr2R 16072837 16076644 scaffold_11 3205683 3209341 - 107616|1241 2217
CGACGCTAA----------GGACAGAGTACCGCCAGCTCCACTTCCATTACCACGCAGCTAGCT---CCGCGTG-----------CTTGCAATACC--AAAAATAGCCCTATGAGTTTTAATTTTTATTTGACCAATTAGCTAAGTTGTAACTATGGAAT---------CTCCTCGAACAGT-------------------AGACGCTGTTCGCAGCCATCGCGTAGGCA--------GGAGTACTTGGAGTACTAGCCCTGATTTCTGATAGAAAACGCAATTCGTCTGCT----CCAGATCCCTAGCCTACGGACCTACTGTTGGCGTAACAAAATCAAATCAAATGAGTCTCCACTATGTATAGTAGTCAACCGAACCGAACTGTGTGTGGCAA----GAGCCAAAAGTGTTCCATTCTA-GCACACCAGCCACACAAGCAACGCAATGAATTGTAAATAAGTCAGTGTCGTTCGCTTTTGTTACAGCTCTCTCTATCTGTCTATCTCTCTCAATTTATCGTGTTAAATTGCAAATAGTTATAGCAATGGTTAAGTTATAGTATGCAGCGTGTAATTTGTAGCATTTAAGTTGATCCAACTAGAGTTCTAA---CGGCAACGGACGTGTAATA------TTTGTGATTTTTGATTATTTAATTTACATTTATTAATTG------TTGAGAGCCAGTCAGTAAACAGTACCCGACCCACACAATGTAACATAGAATAGCAATAACTAGCGCTAG----TACTAGTACTAGAACCACAACGTAAACTAGACCAGTGCTGAGCCACCAGGGGTACGCCAGTAATCCCGGCCAGATCTGAAAGTGTGCCACTCTCAGCTAGTTGTAATGGAATCAACCCAGACAGGACACCTACTCTACTACCCCCTATGACTACAC---TTTGTATGAGCATATTTTTGTGTGTATGAGAGACGTACGGAACATAAATTCTAAAGAC
CATCACAAAACTAGTTACTAGATAG---ACCCTAAGCTCAGCTCAATGTAACACGTAACGAATCAAAATGAGTGTTTGAAAACTTTTTGCAATACCAAAAAAATAGGACTACAAGTTT--ATATTTTGTTCATTAAGTAGTTTAGTTAAAATTGTAAAATTAATGTATGTTTCGCAACCAGTGCTAAACCGATCTAAGATGAGACTCCAGTTACTACAACTACGTATATATTTAATTTGTAAAACTTGTGCAACGAGACC---------------GATCCAATTC-TATGTTATAGTCAGATCCGTACCCTCCGCCCCATCTCGAAGC---ACACAGCCAATTGAAATTTGT--------------------AACCGAAGCAA--------TAGCAACGACAAGTTGACAGTATTAGATAATATGTATACTA--TATATAGTCACAGCAGTCGCTGACGAATATTGCAATGTTAT----TTCTGTTAATGCTGATTCGATCTG-------------ATTTACTGTACAAATGAGCATTTAGTT---------GTTAAGTT------------GAATGAACTCCAAC-----------TCCAGATCGAGCTCGAAAGTCTGTAATGGCCGTTAAACATAAGTCTTTGTGATTTTGATTTATCTAATTATAATTCGTGTAATATGTAACTTGAAAGAGAGCCAACAA-------CCGACCCACAACATGTAACATAGAATAGCCATAGTTAACTCTAAGCATTTCGGGAGACAGGCACACACGTTAAATTCCCCCAGTGAAATACCCCCC----TACTACACACATCCTA--CTACTCTGTGTGCCTGCCACTGTCAAATAGTGATA--GCTACTAACCT--ACAGACAACATACTCATCACATCTGTATGACTATTTGTATTTATATGAGCATATTTTTGTGTGT------GGCGTAT-AAACATAGATTGTAAAGAT
>l(2)05510 16077898 16078347|16190 chr2R 16077853 16079448 scaffold_11 3210081 3211636 - 50695|47 507
-AGTTGTAAATCTCTCAAGGCGTGAACGACGTGCGAGTGCGAGGAATGCTAATCAGGGCGGAATTGC----GTGCAGTGGCAATGAACGAAGGAGGGAATATTAATGTACTACCTAACTACTAAAATATACCTATACTTGATGTAACTGCCATTTACGGAACGTAATTA-----ACTTTAAATGTATGCATAGCGTAGGTTTTCAACGACTTATGGCAGCAGACATTGCGACAGAAACAGAAACAGAAACAGACAGACAACAGTGATTCTTATAAAAATACACAAAAAACACTTACATATAAATATATAAATATGCATATATATATATATATATTGGAGAACTTGAAGAACTCGGTCTAACTCATAAGCACCTACTAGTCTCCTAAGTGTAACTGTTAAGCTAATTTAATTAACG-CGTAAACTAAACGAATTAAT-TGATTAAACGAAACTCTGATCTAA
CAATTGTAAATCTCAAA-----CGAAAGGCGGGCTGGT--------TGTTAATCAGGTTGGAGCTGCGTGTGTGCAGTGTGTATG-GCAATTAAAAAAAAATATATATACTACCT-ACTACTAATATA----TATACTT-ATGTAACTGCCATTTATAAATCGTAAATACAATTAATTTTAATGTGTGTA--------GTTCTCAGC----TAAAGCTCCCGACAATGC--CAGCTTAAGTGACAAGAA-AAACCCACAACA---------ACAACAACA-ACAACAAACAATAACAACAGCAACAACAAACACAGTGATTCTTATAAACAT-TTCGATAACATGATAAA-TTGGTCTTATGCATAAGCACCTACTAGTCTTCTAAGTTTAACTGTTAAGCTAATTTAATTAATGACTAAAACTAAATGAATTAATAAAATTAAACAA---TCCAATTGAA
>CG13434 16101082 16101116|16221 chr2R 16101027 16102093 scaffold_11 3237594 3238543 - 5455|66 112
CAAACTTAAATGCAATAAATAAATAAA------------ATACTACG
---AATGATAAGTAGCTAATAAGTTAAGCTTATGTGTATATTCTGCA
>Hil 16121744 16122279|16253 chr2R 16121741 16126338 scaffold_34 140834 145447 + 152876|3 640
GTCGCTAGACCGAACGCTGGCATGGATGGCATGGTTTTCTGGACATGTGGGACAGGAGGCACTCTACGCAAACACAAACGAAATGCAATATTAATT-ATAGTCTACACTTAAGTGGAAACCTAACAAACGTTTACCACAT-----CACAAA-------------ATCCATAATACAGGTGCTAATGGAAAACCCGGC---GATCCAGCAATCTGGCCAATGGCCAATGCCAATCACAACATA-ATCTGATCATGGCGACGAGCACTGATGATGAACTATAATTTTGCTCAATCATTTGATTCA-------AAGGCGGCAG----------------------------CACGCTGAACT------TGTAAATACTCTAGACTCTAATCATTAGACCTAAGAGATGCCTAGTAATACCAACCCTGAAAT-CAGCTCTTAATTAATTTGTACATCTACCGAATAATGCTTAATAATTTATTA------CATAAAC---GCAACGTTGCCCCTT--ATGCATGAACTT-TATCTTATACATATGACTTTGATTTAAAATGTTTAATGTTTTTGTTT-------------------------AAGCGTTTACAATGTGAATAAAACCCTATTATACAAACAT
GT-----------------------------TTGTTATATGAATTTGT------------------TGAAAACGCAAACAGAATGCAATATTAATTAATAGTCTA---GTTAATAAGCAGCTACTAAAAGTCT-CTATATGTGTATACAAATATGTATATCGTGCACCATTGTGCAGGTGCTAAAGATAATCCATGCCTGAGTGCATCCACTTAAATATCTGCCCAT-CTATTTACTATATATATCCAGTT-------CAAACACATTTGTTAATCCACACACAGGCTTCATTATTTTATATATCTTAACGAATTGGCAGCTATATATATATATATATTATATTAAATCGCATCGAATTGAATTATGTAAATACTCTAGACTCTAATCATTAGACTTTAAATG-ACCTAGTAATATGCCTGGAGAAATCCAATCTTTGAATACGTGTTGTACTTAATGATTAATGCCTAATAATTTATTATTGAATTAAAAACGTGGCGATGTTTTCTCTTTAATACACAAGCTTATATTATGTTGATCTAGGTGTCGTTTAAGCATTCCGATTTTTTTTTTTTTGTATGACAATCACCTGTAATTAAACACTCTGATAATGTGAACCAA-------TATATAAACCT
>CG11180 16135777 16135929|16265 chr2R 16135773 16136872 scaffold_34 156932 157940 + 5742|4 180
ATCG-----AGCAAACGAAATATATTTCAA--CGTGATTCTTATTATGATTGTTTTTGTACATAAACAACTTAAGTAGGTAGTTGGTAAGCTTCATGGTTTACATTTTAATGTACTGTTTTGTATAA-----------------CACGCTAACTAATTAAACTGAACTATACATTTC
AGCTCAGGCAATAAACAAAATGTTATTCACATCTGAATTCTTA--AACATTAAGTTTTT--ATAATTAGATTTTGTACATAGT--------TTCATGTTTAATATGTAACAATAAAATACTTTATAATAAATACCAGGAAAACGTACGCTCATACATTAAAATGATGTCTGAGTTTT
>CG11175 16143047 16143658|16271 chr2R 16142584 16143111 scaffold_34 163684 164200 + 6537|503 576
AACCATCCACAGATCA---AAAAGTGTA------CATACTTGTAATAAAAGGCGTAACTGTTTTCTCACTTGAA
AAACATTAACAAATCATCGATAAGTGTAAATAAACATACTTGTAGTATTATAACAAAATGTGTT-TCAGTGAAA
>CG11175 16143047 16143658|16272 chr2R 16143112 16145458 scaffold_34 164353 166879 + 76162|0 698
GTCCGT-------------TTTTTTGGTTCTGGA--------------AACCGGATCCCAA--------TCGATCATCAGTC----------------AGCGTTTAGGTTAAGCTC--------------------------------------------ACTAGTTGTAGGATATGCTCGAT-----CTAGAATGAGATTCCTCGGAATAACGACCAAAGAGCCACAAACTAACTCAGTTTCAGTTCGTAGACTAACGTTACACTGCGAGAA-----TCGTATAGC--GCGTTTATGCGCCAG-TCAATTTGTAGCTTAAATGGGTCTGCATTCAGTTTT--------ATTTGCTTTACTGAATAACACGACCTATTTGCAAATAAAAGTGTACTAAATATGAGACTC-------------CATGGGGATATAATTTTATATGCAAATA----AAAGTAATCGTAATAGTAAATATCACGAAATATCAGACGTACTCAAAAATATAAATAGATATTTCTAAAACAAACAAATATCAAAAAG--CATACCCCCCCAATAAGAG------AGGCACTGTATGAAAATTGCCCAAGTCTAGTTCTAAGAATCGAACACAAATGAAC------ATTGACATTCA-----TTGTTTATTATAGTTAATAGGAATACGAATAACAATACTCTGATCGACAGTCT
GCGAGTCAAGCCTCAAGCATGTTCGAGTTGCAGACAAATAATTGAATCGATCGGATTCGAGCAAGTTTGTTGACCTTCATTCGAACGCTGCCAATGAAAGCATCGATGCTGAGCTCTTTCATCTATATATATTAATAGATATAGATACGTATTCATACTCATTAGCTGTAG--CCCGCTCGACTACCACACAAATGAAATTCCTCGGAATAACGACCAAAGAGCCACAAACTAACTCAGTTTC--------------CGTTACAGTTCGTAAAGTTAGCCGGATAGTCGCCCTTTACTGGTTAGTTCTAGTTCTAGTTTCACTAGGCAACGATTTAGGCCTGTAAAATAATTCATTTCAGTAATTACCTTTAAATTCCCGTAATTAAAATTAATGCAACAATTAAAGTCACACTCCTAGTTACATTACGATATTAAATACCCTGCCAATACCCCATAATTACTGAAGTAATTAACAT--CTAAGAGTTTAAATTACTC--------AAGTAATTGTAACCTGAGCACTCTAATTTCTGAGAGTTTAAATTACTCAAGTAATTGTAACCTGAGCACTCT-----AATTTCTCAAG--TAATTGTAACCTGAGAGCTCTAATTACTCAAGTAATTATAATTTGCAAACTTGACTTTTGTA--CAGTGATCACTCGCGAAATAAAAC-CTAATGAATAGATT
>rig 16148739 16149053|16278 chr2R 16148474 16149069 scaffold_34 172647 173327 + -340|345 699
GCCTTAAATCAACATTTTTGTAAGCGTACTTTTAGCTGAAACTGGCTGT----ACTAGTGTA-----ACTCATTTGAAATCCCCCGATACAATCATAAAGCTATTATCTATT------AGTTAGGCATTTACAAATGTTTTCCATTAATTTGAATAGCCAGAAACTGTGTG-------GAATTGAAACCGATTTGA------GTCGCCTTTGCTATACTTTTATTTTAATTTAATTTACCCTTAAGAAAAGATGAATACAAGATACATATATCAATGGCACAAT------------AGCTAGTAAAACAAACACACACAAATTGAATTTCGAATAAACGAAAAAGCGAGAAAAAG
AGTTTAGCTTAAGA-TTTAGTTAGAACACACACAAATCCAACGAGCTTCTTCGAATAGTTCAAAACTAAACACTTGAAATGGC---ATGGAAAACAAAAACTAGTTTTTATCACTGAAAGTAAAACAACAACATA---TTATAATTTAAGTGTTTAGCC-----CTTTGTTAACCAACGAATTGATTTATGCTCGAACGAATGTTTCATTAATTATGTTTCTCCAATCGTTT--TTGAACCGTTTGGAAAGAAAACTCCAACATGAATTTATACGAATTACAATTCAAAATGTCCAAGGCAACAAAACAAAAATACAAAGAAGAAGTTAAATAAAAACTAAAAAAGAGATTAACA
>CG33785 16157323 16158185|16284 chr2R 16155605 16158609 scaffold_34 179907 183095 + 103237|1943 2872
TGCGCCGCCTTCAAACGAGCCTTTATCGACTGCTCCGTGCTCACCACACA---------TCCAGCAGAAT--------GCAGCACCAAGCGAGCGA----GCTGAG------GACTCCAGTGTGCGCGGTGGGCGACGAGGCTGCTCTCCAGTTGGCCCGCCAGTGCCTGCTTGGTGGCCAAGTGATTGCCCTGCCCACCGATACCGTGTATGGCCTGGCCTGCGATGCCAACAACGAGACAGCCATACAGCAGCTCTACGAGATTAAGGGTCGCGATGAACACAAGCCCGTGGCCATCTGCGTTCACAACATCGATGCGTTGCGACGCTTTGGTCAGGCTGCCCATCTCAGCGACGAGCTGCTAACTCGTTTGCTCCCGGGCCCCCTGACCATCGTGATCGAGCGGACGTCCCAGCTGAGCAACCGTTTCCTTAATCCCAGCACCTCCAAAATCGGCATACGCATTCCGGACTTCAACTTCATGCGCGACCTGTGCGCCGTGTGGCAGGAGAAGCCCCTGGCCCTGACCAGCGCCAATCGCTCCAGTGCGCCCAGCAGTCTGCAGGTGTCCGAGTTCCGTTCCCTATGGCCCCAATTGGGCGCCGTCTTCGATGCCGGTCGAATCGGTCTGACCGAGGAGCGACGACTGGCCTCCACGGTCATTGACCTGGCCACTCCTGGCTACTATGAAATAGTGCGCGCCGGCGTGGCTCTCAAGCCGACACTCAGCCTCATGGAGGAGTTCGG------CATTCGGGAGCTAAAAATGATGTAGTATAAGAGCTAT-------TCCTTTGGCTTTAACTTTAATTTTTAC-------TTTGGAACATCCTACTTTGCTTTGCATGCG------GGAACACAACAAATTGTTTATAAAATATACGGTTCAGTATGTAC--------------ACAA
TGCGCTACCTACAGACACTATTGCTCAGACGCCTCCACGGTACCCGGCCACAGTTGCAGTCCAGCTGCAGCAGCAACAGCATCACCATGCAGACAAAGCAGCAGACCCAACCGACGCCAGTCTGTGCTGTGGCATCGCTGGATGCCTTGAAACTGGCCGAGCAGTGCCTGCATCTTGGCCAGGTGATAGGCTTGCCCACAGATACAGTGTATGGTTTGGCATGCGATGCCAACAACGAGGAGGCCATACAGCGCCTGTACGAGATCAAGGGACGGGACGAACACAAGCCCGTGGCCATTTGTGTCAACAATATTGCTGCACTGCGTCGATATGGTCAGGCTAGCCACTTGAGTGACGAGCTGCTAACTCGCTTGCTTCCGGGGCCTCTGACCATCATCGTTGAGCGGTCACCGCAGCTGAGTAATCGCTTCCTGAATCCCAGCACCACCAAAATTGGTATACGCATACCTGACTACAAGTTTATGCGCGATCTGTGCGCAACGTGGCATGAGCAGCCGCTGGCCTTGACCAGTGCCAATCGCTCTAGTGCGCCCAGCAGCCTCCAGGTCAGCGAGTTTCAATCGTTGTGGCCCCAGCTAGGTGCTGTGTTCGATGCCGGCCGCATTGGACAGACGGAGGAGCGTCGCCTGGCCTCGACAGTGATTGACCTGGCCAAGCCGGGCTCCTATAGTATAGTGCGTGCCGGTGTGGCGCTCAAGCAGACGCTGGCGGTGTTGCACGAATTTGGTTACGTCAAACAGGACCTGGACACAATGTAGTTATAGTTTAATACAACAATACTTCTACTTTATATTC--TTTTTACCGGCATTTTTACAATTTTGAACATGGTTCGGCAGACGTATCTATGAACACA--AAACTGATAATAAAATATATATATATATATATATGTGTATATGTACAAACAG
>CG33786 16157324 16157439|16284 chr2R 16155605 16158609 scaffold_34 179907 183095 + 103237|1944 2093
TATAAGAGCTAT-------TCCTTTGGCTTTAACTTTAATTTTTAC-------TTTGGAACATCCTACTTTGCTTTGCATGCG------GGAACACAACAAATTGTTTATAAAATATACGGTTCAGTATGTAC--------------ACA
TTATAGTTTAATACAACAATACTTCTACTTTATATTC--TTTTTACCGGCATTTTTACAATTTTGAACATGGTTCGGCAGACGTATCTATGAACACA--AAACTGATAATAAAATATATATATATATATATATGTGTATATGTACAAACA
>CG9025 16177337 16177794|16310 chr2R 16177191 16180010 scaffold_34 209785 212693 + 119612|146 794
-TAGTC----AATGGCTTGAGCCG------------------CAACTGAAGTAATTAGAA--CTGTGAATACAATAAGCCACGTTGGAACACATTTATATATCCATATGTAGAAGCTTTGGTGTCTGTATGTGCGATATGTTTCGAATTTAGCGACTTAACTTAGCCAAAAGA-------------------------------------------------------------------------------------ATGCAAAGGGAAT---GTTTTTTTTTAGTTTTTTACACATTTTATTTAGTATACTTCACTCTTA-------ATTTATTTACAATT--------ACAATCTGTAACAACTGCACACGTGGACTGACTGTTTGTTTGTAATCATTAATCATAATCATAACTATTAATCATACCTATGTAAAATCATTTTGTACATTTTTTA----TGTAAAACTACTATTATTCGCAGTGCAAGAGGGCGCAGGCCACCTAAGTTGAATCAATCGAATTGATTATGTTTTT----------------------------------------------TTAGGTGCAAACGAA---ATAAAAAACCAAACCAATATGT-----------AAATCACAGCTGACC
GTAGCCAAAAAAGGAATTGGGCCAAAAACAAAAACAGAAACTCAACTCAAGTCATTAGAACTCTGTGTATATTTTGAGCCAAG-----ACACAATTCTTTATGCATACTAAGTA--------------------AATGTGTATCGAATTTAGTGACTTAATTTAGCCAAATGCCAACAATATCTATCTATCTATATATATATGTATTTTAACACACAGACGCACACACACGCTCACATATATACATGTATATATGTTTATGCATATTTAGTTTAGTTTGTTTTTATGTTTTTTCTCGGTTTATTTTGTACGACACACTTTCATCTTATTATTTATTTACAACTTAACACACACACACAAACACACACACACACTTTGACTGATTGTTTGTTTGTAATCA------------------------------TATGTAAAATCATTTTGTACATTTTCTATATGTGTATAATTAATGTTATTGCTAATGCGAT--------GGCGGCAATTGTAGAATCAATTGAATTGATTTTGTTGTCATGGCCCCTCAACAAATAAATATATGAAATACGCATTGATTTGTAATTGGTAGTAAATGAATGTATTTAGATACAAACATATATATTTAAATATGAGAAATCACAGCTGACA
>exu 16182288 16183145|16313 chr2R 16181107 16182733 scaffold_34 214282 216056 + 8912|1353 1948
AATATGATGTACAATTAAGAACTCGCTGCGTTTAGGCATAGTTTTCCCGGCGAACCGATGCACATCGCCG-CACTCAAATGGGAGATTGGGAAAATATGATCCAAAACGAAACGCCTCGATGAAAATTTTCCATTGGACGGGCCTGTCGAC-GCACACT-----ATCAAAACTC-------TATGAATAAAACCCAAGATCCAGGCCTGGTCCAATGTAGAAAACTTTCACATTGAAGCTAAA--------------GAAAGCACGATATA---------------------------AAAATACAC-----CAATCTAA---TACAGTTAACCTTACGCA------------------CGCACACGCACGCACACAGAAAGCATATTCAAT------TCGCACACTTAATCTAACCCA---ACACTTGTGAACATATCCAGTATTTCAAGCTGTATTTCATATA--TGTTTCAT-----------------------ATTTACAATCAACA-----AACATATGTAATATCTGCAAAGGGCG--------------CGAAT----------------AAACGAACGATAAACTAA
AATTGAATATGCTATCAAATA-TCGTTGCGTTCAGGCATAGTTTTCC-----AAAATATATGAATTACGGACAC----------GATTGGAAAAATATGTACCCCA--GAAACGCCTCGATTAGAACA--ACATTGGGTAAACCTAGGGAAAGAACACTGGAAGATTATAATTTATATATATATGTATATATATAATATTATAGG--TTACCCAATGTTAGAAA-TCTCGTATTGAAGCTTAAACATATACAAACACGAATGCTCAACATATTCTGCAGGAGAGAAGATAGCTAGCTAAAAATACTCAACCACAATTTCAATCTATAATTCACACAACATAAATGCTCAAAACTAATTTCGCATATGAATGCTTAGAGAGAGGAGAAACTATAGCTGATTACACACTCAAAATCATATATATATATATATGTATATATGTATTATTTCAAGCTGTATTTCACACAATTGTTTCATGTTTGCACATAAGTTTGACTTTCATTTTCAATCAAAATAATGAAATTATTAAGCACCACCAAAGCGTAACGTATTTTTATTTCAAATTATTTAACATACACTAAAATTCACATTGGGTTAA
>exu 16182288 16183145|16314 chr2R 16183010 16185801 scaffold_34 216537 219261 + 64749|0 159
TATATCAAAAAATGGATGATCAAA---ACACAAGAAG---ACAAGGG----CAGAGAATGGAGATTTAAACCACA--TACGAACTTTCTTCCTTTTAGAAGATCTAGTGCAGACAAGC----------TTTAAATTCCAGTGGAAGC--AAATTTCCCGT
AAAAATCTAAAATAGATGATAAAATCCACACAAAATTGTCACAAAGGAATCCAAAAAAAGAATGAAAAAAATACAACTGCGAACTGTTTTCCTTTTTGAAGAAC-GGCACAGATTAGAAACAAATTAGTCCAAATTCAAGTGTAAGCGTAAATTTCAAGT
>exu 16183213 16183462|16314 chr2R 16183010 16185801 scaffold_34 216537 219261 + 64749|244 511
AATCCAGTTCTGGTGGATCCGTAAAGTAAATATCTTATATTGAGATACTTCTGCCATTTGCTTTGTA--GATAACG-----TAGTTAACGAGGGGTAAGCCTTCATGTAGATTGTTGATTAATTTTATGAATTGCGTACACTTGCTTGTATTTTTAAT--GAATTTTATGCATCAAATATATTGA--TAAAAATGTAGCCTTTTTTAGCTAAATGTAAAAGGTTTTATTACA-------TATTTTCAATATAAACTCACAACGCTTAA
-----AGGGGGCGCGGCGCAATCAAGTAAA----TTCCATTG----CCATTTGTTATTCGCTTTTTACTCTTAACGCTTTCTAGCTAATG------TAGCCAAAATGTATGTAGACCCATACATATA-----TACATATTTATACATGTAGCTTTGATTAGCGCCTTCTGCAGCCAGGGCGCCCACCTGAAAAAGCCAGTGAATTAACCTGAAAATGTAAGCAGCTAGTGCGGCGCTCTGGCTCTTAATGTTAATTAATTTTA-TTAT
>CG13442 16242687 16242937|16418 chr2R 16242378 16243011 scaffold_34 325582 326246 + 2898|322 653
CAGCAGCATTCAGTTGCAACAGCAACAACGACAACCGGATGGCAGCAACTAAAGTACTGGACTGGGTCTCGAGGGGATCAGGACGGATAGCATGATAGCAAAGGTCTG-GGCAAGTAATTAA-------------------------------------GACTCAAGGGCAAGGATTTTGC---------------------------------------TGGGCTTTCG----TTGTTTGAGTGTCATTTGTTTAATGTAGTTTCAATGACTTAAATTAACTTACTCTCTCTCGCGATGAGAGCTCGAAATAAATGGGTAAAATTGAGCGA
CCCCAATGGTCAATTCCAAGTGCAGCGATGTCGCCGTTCCGCCTGCTGCTGACG--CCAGCCTTGGCGTCGTCGTCGTCGAGTCTGACA----AGGAGCAGCAGTCGGAGGCAAGAAACTAAGTAGTCTGTAATGCCCAATGGACAGTTTGTAATTAAGGGCTCAAGGGCAAGGCTCTCGTGGCTTTATATATATATATATATATATACATATACATGTATATGCTCTCGGAATGTTTTTGCCTGTCATTTATTTAATGTACTTTCAATGCTTTTAATGAA----------CTCGCCAGGAGAACTTGTCTTAAACGAGCTAAACTTTGT--
>insc 16328848 16329789|16530 chr2R 16328898 16329642 scaffold_34 444270 444864 + 6003|0 779
TGACTTCTTTCCGATTAAGCTGCAATGGTTAGCTTAATAGTTTATCAGTCCAATCAAAAGACACCAAATTTTCTCTCTGTGTGGACACGTTCTCCGGCCGGACACAAGCCGGAAGCTCAGACGTGCGTCAAGTGTTATTACTTTGTCTAGAATGTTGCGTGACCCGTTT---------------GGACTCGCTCCCTTA-----------GTCGCTTATCCTTGCTGTATCCTTGCTGCTGGATGTAAA-CGAAGTAATTTTTATATTTCCACTCAGGCAAACAAAACAAACGGAGAGGCGGAGCGAGATGCCAAATAAATAGGAATACAATTTTTGTTTAGTTGTTTTTATTTATTTTTGGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGCTTCTGTTGCCGAGGCAACTTTTGGCATTCTTGTGTGCTTATAACAAAAATGCTCTTAAAGCACTGTTTCACTCGGCAGCCAGATTTATTTTATGTTTCAGTTGATGCAAATGCAAGCT----TGACATTTTGCATTCTTCTTGTAAATATTTTCGCAAAAAATCCTTAAACTAAACCCCATACGGCTGGCAACTTAAAAACCAAAAACTCGGAAAATTCCTTAGCTGTAGCGAAGTCCTTTGTGCCAAATAAAATGAAAAAGAAATTCGAAATATTTATTTCTTCTGAACTTCGAGCAATTATATTGCATAACATTGTATTATATACGTATATGTATTTACGCTTTTCACCAATGTTTGGAGTAATTTCTAAGTTTAGT----ATAAGATTATTGAA
TGGTATTTTTTTTATT---------------------TATTTTTT--------TGCAAAACCACCTGAGTGGCTGCGTCTG-GGGCACGTTC--CGTTCGGTC--------------CGAACGTGCATCAAGTGTTATTGCTT-GTCTGGG-CACTGCGTGACCCATTTTTCCCATAGATACACAAACACACACACACACATCCTGCTACGATACTTATCCTT-----AGCCCAGCTTGTAAATGTAAAACGAAGTAATTTTTATATTTTCGACCAAGCAAA--------------AGGCATA------------------AGAAATACAAATT-------GTTGT-----TCTATTATTATTTTGTTATTTTTTTTTTTTTTTTTTGTGGT-------ACTTTGTACATTTTTGTTT--TGACAACAAAAGTGCTTGAAAAGTGC-ATTGCTCTCTCC-------CTCTCTCCCTGCCTC-TCTGACTCACTTGTAAATTTTTGTAGCATTTTGCAAGCTCATTGTAAATATTTT-------------------------CATACGGCAG------TAAAAACCAAAA-----------TTTATATTTTTAGTCAA---TTATGTGCCAAA-AATAAGTAGCCAAAATTCCAGCAGTT-----------AATTTTGGGCGATTCCATTGT---ACAGTTAGATATATATATATATATATATATGCT----ATATATGTTTAAA------TATAAATTTAGTTTTAAGAAGATTATCAAA
>insc 16328848 16329789|16531 chr2R 16329786 16330561 scaffold_34 444865 445683 + 33147|0 3
TTTT
TTTT
>sktl 16334993 16335573|16539 chr2R 16334966 16338085 scaffold_34 453081 456410 + 107328|29 740
TTTTCAGTGCGGGATTGGTCGGGATATGAAAGGAATCCTGAGCAGCAGCAGGAGCATGTATATATATAGCCCAAATGTGTATGTG-----TGTCTGCAAGGTGAAAGCGTC------ACTTCCACGCCCAAAAAGGGAAATTCTGAAAACGA-------GCTCGTTTATCTTGATTAAACACAAAACCGAAAAGCGAATACGTATTCGATATTGAAATTTATGTGGCGCCCGTGCTAATTGACTGCCAAC---------------TAGACACGCTACCCCCCCCCCCCCCCCCCAACCGC-----------CAAACGCCCCCGGACTCACACATGCACAC------TGCGGGGGGAT------TCCACGTACC--------------------------------------TACTCAAATTTATAATTATTATTTGGCTTCTACTTGGTTGGAATTTGTTA-------------GCGTGTTGCCTTAGCTGAAGATTTTGTTTTAATTTTTGAAATTATTGTGCTCGACAAGCGATGGGCTCAATCGAAATTGGTAAAAGGGTTGAGAAGAGACGATGTGAAAACTCAGTTTTTGTCTACTATATGTGTATGTTGCTGTATTATAAAGTGCGTTTA--CGTATTCTAAGATGCTCA--TGTAAATA--------------------AAGGAACGAGAATAAATACCAATATC
-------------------CGGCGCCCGAATAGCAGCTGCTGCTCCCATATACACAAATCTATATATACTCCATATCCACACATTGGTGCTGGCTTTCATTTGAACCCCTCCCCTCGACCCCCTCGACCAACCTGTGTGCTCCGTGTGGCAGGCGCGACGCTCGTTTATCTTGATTAAACAAATACCAAAAACGAATATGTGTATTCGATATTAAAATTTATGTGGCGCGTTTGTTAATTGACTGCCCCCACACACACGCACACACAGACACACACACACACGCACACACACATAGACACAGACACATATACACACACACACACACACACACACACACACAGGTGTTGCAACAGGATTCGCTCTCAGCGCATCGAAACGAGAAAAGATTTTCGCCCATTTTCTTTTTCGTTTATTAAAATTTACAATTATTTTTTTTTTCCT--TTTATTTGTGTTCTCTACATATATATACATATATATTATTTTTCCAATTTCCCTCGTATTTCTTGATGATATTATTGCGTTTG--TATTATGGGGAAAAATTG---TTTGGAAATTCGTAGAAAATGCTTTTTGTTTAGCCGCAAATTTGACATTGTTTAACTCTGTATT--TGTATTATGAAATGCGTTTAACTGTATTCTAGGATGCTTAACTGTACATATCTATATGTTTATCAATAATAAATAAATAAAACTATTAACAAAATC
>CG17999 16355562 16355578|16571 chr2R 16355561 16355617 scaffold_34 480755 480810 + 817|1 17
AAAATAGTTACCACATC
GAACTGCATACCATATC
>CG9993 16357728 16357820|16574 chr2R 16357316 16357780 scaffold_34 482403 483028 + 7660|562 628
TAATCGTGTTTAATAAATGTAAACACAGTGAATCATCACA--------------AGAACTGTGAAAG
CATCCAGGCTAAGCGCATCAAAAGTGAGAGAAATTTGGCATACTTTGGCATTGACAAATTTCGAGTG
>CG9993 16357728 16357820|16575 chr2R 16357781 16358993 scaffold_4 2488782 2489949 + 3246|0 39
GATAAGATTTATGCTAAATATACAATACATGAGTTGTTTA
--TAAGACCACGAGCAAATATATTTCACTTGAATCGTGTA
>IM4 16376418 16376651|16608 chr2R 16375504 16376539 scaffold_34 510172 511182 + 5854|983 1109
ATTGTAATTTTAAAAT-GTATGAAATTCTAGTGAACAGAGTACAAAAGT--CAAAAGTACAAAAAGTCA--CTTCAAAGTCAGTGCAAATTTCGTCATTAAAAAACATTTATAAAAATATTCATAAA
ATAGAAATTCAACAATTATATTAACTATACATATATATAATAAAAATATAATATAATTAAAAAACGTTGACTTTTATAATCA---------TTGTTATTTAAAAAAA------AAAAACTAAATATT
>IM4 16376418 16376651|16609 chr2R 16376540 16377111 scaffold_34 511898 512487 + 8330|0 122
GATTAGAG----AACCATGTTGACCCAACATTTGACAT-TTGCCTATCCATTTGGACTTTTGAATAAAAATTTTAAAATTACCTAAA------CTCATTTTTATTATTTAATATATGATTAAT
ATTTAAAGATTAAATAATTTTAAAATAAAAACGGAAATGTTAACAAACTAACAAGAC---AAAACTAAAATGTTGTATTTATGTTCAGGATTCTTCATTTCCAGCAATTGCTAGACAATTCAT
>hbn 16462246 16462495|16708 chr2R 16462417 16462493 scaffold_11 2417151 2417213 - 1617|0 76
GCTGTTCCGTGATATTTGGATTCGTTATGTACATATATAGATACACGCATACTTGTAGATATCTAGTTTTATTCATG
GCGCTATCGTAATG------------GCGTACATACACACATACATGCATA--GGTGGATGTATAGATTTGTGCATG
>hbn 16462246 16462495|16709 chr2R 16462494 16463682 scaffold_34 631996 633128 + 31672|0 1
AC
AC
>CG15649 16480801 16480826|16735 chr2R 16480814 16481271 scaffold_34 654585 655037 + 13648|0 12
-CATAAATAATTA
TCATAAATTACCA
>CG15651 16491416 16491949|16747 chr2R 16488708 16491441 scaffold_11 2904302 2906925 - 113886|2735 2760
AAAATATAATACATCAACTCTGAAAA
AAAATATAATACATTATCATTG----
>CG15651 16491416 16491949|16748 chr2R 16491931 16494084 scaffold_11 2907233 2909448 - 87208|0 18
GGCAGCTTTATTTAAAAAT
ATGATCCTTACCAACAACT
>CG3221 16499858 16499910|16756 chr2R 16499860 16502203 scaffold_10 1642695 1645058 + 60903|0 53
AC---TTAGTTGATTTAGAATCTGGTCAGTAAATAAATGTTAAATTATTCAAAA
ATCAACAAGTTGCATTAGTGT-------GAAAGCTAATACAAAAATATTCCACA
>CG30291 16515337 16515383|16768 chr2R 16511182 16515363 scaffold_11 2931199 2935629 - 128922|4786 4812
TTGTTAAAAATAAACTGGTAAATGGAC
TTGCTAGTCTTAGATTTTGTGATCAAT
>CG30291 16515337 16515383|16769 chr2R 16515373 16517553 scaffold_11 2935825 2938137 - 76949|0 10
TGTAACTTTTT
TGTAAATTGTT
>grau 16517348 16517450|16769 chr2R 16515373 16517553 scaffold_11 2935825 2938137 - 76949|2139 2244
GCCCGGAAATGCTTAAGGAAATCGATTTGCGGAAACCATTGCTTAGTTTTTGATTGACCTTTGTTTGAAAACA-AAATATATGTA--TAATAGGAATTATTTGAAA
---CAAATGTATTTTAATGCACCTAGTTACCTT--CCCCTACCTAATGTATATATATATTTTCCCTAAGTGTAGAAATATATGTACGTATGTAAAAATGTTTACAA
>CG3295 16523169 16523483|16772 chr2R 16519711 16523201 scaffold_11 2940612 2944094 - 126925|3659 3695
ATGTTTAATTAAATACAAATCGTCCGAAGAGC----A
ATTTCTGAATATATAAACGTATTACAAGAAACTTCTG
>CG3295 16523169 16523483|16773 chr2R 16523307 16524785 scaffold_11 2945759 2947290 - 72715|0 196
GCCACATCTATGTATTCACCTTATGATAA----TCACCACTGCTTATATGACCAGGCTCAGGCGGTTCGAGGACTGGTGTTGGTTGGCCGGCT------TTCCTTAACAAAACGTAACCATT--TTAA--------GATAGCTTGCTTAGATTCATGTTTTTAGACAAATTCGCAGAGCGGAATCGAACTGCCTGGG
ATCATAATATCGCATATACTATGTAATAAAATGTGAGC-CTGCCTGT-TGGCGCGCTTAAAGCAGTTCGAGCGTGGATCTGGAGCAGAAAGATGACAAATTTCTTGAATTTCGGCAACTTTTCCTTAAATGTTATTGAGCGCGCCACTAGATT--GTTCTTTAGCTAAATTTGCTAGGCCGAAGCGAACTACTTGAG
>shg 16558184 16558387|16817 chr2R 16557215 16562462 scaffold_11 2999363 3004692 - 237126|1165 1381
GAATCT---TCGCCAGCCGCGGTATGATGACGTA--------GAAATTGAAAAGACTTTTTATATACTAAGAGTTGTACGGATGTTGATAGTGTCGGGACAAGGCGCCGGCCTAGCCGGC--GTCCAAAGTCGATTCAGAGATATATACCCATATATATATGGGTAAACTATATATTATATATATACATATATATTTTTATGGAGGAATATTGCAAG
GGCACCAGAACGTGAACTGGAACAGGATGCGTTAGCGCGAACGAAATTGAAAAGACTTT-----TACGATAAGTTGTGTAG--------GGCGCCGGGA-----CGCCGGCATAGCCGGACGGACCCAACACGGCCAATCGACGTG---CCGTGCGCTCTTGA-------AGACATTGCAAATATATATAGATTTTATAAAGGAGGAGCATTGCAAG
>CG30293 16570760 16570828|16823 chr2R 16569072 16572605 scaffold_4 5529034 5532537 - 70189|1714 1799
GTCCATAAAAA------TACACAAACCCCATGA-------CATTTTTCTGGACAAATAAAATCT----AGCACTTTACTGATCCTG
GTGTCTGTAAGATGATTTACACACATTGTACAAATAAATCCATTCGGTTGTGTACATAAAATTTGTTTAGCATTTTACTAAATCTG
>Cht4 16572962 16573015|16824 chr2R 16572856 16574911 scaffold_11 1851578 1853613 + 70377|106 162
AATGTCGATTAAATGAATGGAATAT--GAAAATAAA-CAAACATGGCAATTACACAA
GAAGTATACTGCCCATACTAAACCTTCAAAAATAAAGCAGAAATCGTA---------
>CG10531 16575564 16575613|16826 chr2R 16575369 16575582 scaffold_4 835183 835400 + 498|206 224
TGAAAATTGAAAAAAAAAA
AGGGACCCGCACAACTGTT
>CG10531 16575564 16575613|16827 chr2R 16575583 16577352 scaffold_11 1855532 1857276 + 64259|0 30
AAGGAGAATCCGATTGTTAAGAATAAATGTT
------AATTTTAATCGCAAAAATAATTGTT
>CG10527 16577645 16578163|16828 chr2R 16577353 16577913 scaffold_3 3371694 3372214 - -3071|299 588
GGAAATAAATATAAAATAAGCTGAATAGCTGCTTTAATTTTTCAAAAAAGTGG--TGTGTTAAGATTAG--TTGGATTTTG----GTTTTAGTGAATCTAACAGTTCTATCGCAATCATTAATCACCTTTTAATCCATTTGTACTC-AATGAA-----ATTAGTATCAAACATTCTTTTTTT-------TTAATAAAATCATGACTGAAATGAAATGACTGAAATCTATAGATTAGTTTAAGCAGGCAATTGAAAATAATTTACTCCCACTCAATGAAAATCTATTCCTA
GAAATTTAGTACGATATCAGTT----------CTTAGTTAACAAATAAAACGAATTATATAAGAATTAAGTTTACAACTTGCTAAATTACATTAAGCCTAAACTTTTAATTATAAAGTTCAACTAAATTTTA-------CGAACTCAAATGAAAAACCAATAGGACCAAGCTAAATCTATGTGCAAAGCTTAAGAGAA-AATCAATAGCATTTTATAAATGAGAATTGTTAATAATAATAATCAAAC----GAATACGATTTAC--------------GATTTATAGCTA
>CG10527 16577645 16578163|16829 chr2R 16577914 16578687 scaffold_11 1858182 1859021 + 31062|0 326
GCCACGGATCGAA----------------------------TGTCCA--------------------ACGCACTGAAA--CAAAACGTTTTAAATCAGTTAATCTGAGCGCTTTACAGTTCAACTGG-------TCGCAGAAATTTTATTTTATTTATATGTGCATTTCTACTCAAAACTGTTAAAGAATCTC----TATATTATGTCGAAAAGTTTATTACATTGT---------TCAACGAAATTG----GTTAATAAACAATAAATATGTTTAAGAAAA---TAACATATCTGAAATAGGCACTTATTTGCATTCATTAAGCTT
ATCATCAATTGGAACAGCCCAAATGTATTTAATAGTCAACCTGTGCATCGTAGATGCCTTGAGACGCACGCACTGAAATTTCGAATATGCAACTTCCGCTTTTTTCAACGCTTGGCAGCTTAATATATTTTGTTTTTTATTTATTTTCTGTCAATTATATAAATATTTTTTTT----ATTGTTGATGAATCTCGAATCAAATAGCGGTTAATAATGTTTTCTATTGTAACTTTTGCACAATTAACCTGAAATGTTAATAAACTTAAA----GTTTAAGAATACGTTAGTATTTCAAAAAGTATTATTCCTTT-CAGTCAATCTGCTT
>CG4030 16595965 16596264|16848 chr2R 16595049 16598796 scaffold_11 1885690 1889614 + 95731|1092 1444
GCGTTTGGGCTCCAAGCCCAAGTGATTGTGTATTATGTGTGAAGTACGATTACGATTAGTTGGTATCTCCTTGAACTCTATTGC---TCTATTTCTGTGCTCCGATACTACGATTACGATCCGAGGTCAAACCTTTCCAATGCCCATTTCCATTTGCCAATGTCTATTTCCGATTTTGTTGTTCC------ATTATTTTG-GCCCTATACAT-----AACGTAAGCGATGAGTTGTCT-------------------------------ATGTTAGCTTTCGTCGTAGGTAAGTTTTCGTA-ACTGAATTTA------ACTCAAAGCAAATATACAAATTAAAAACAATTAAA
TCG-----GTTCTTAGCCCTGGCG--------------GTGCGTCACTATTATTAT--GTCGGCAAATATTTATTGTTTTTTGTATGTATGTTTATGTACTGTG-TACTGCAATT-----------------CCTCCTTATGTTTATTTGTTTTTGGGGAGTTTGTGTTTCAATCGTGGTGTCCTTGTCGAATTAAACCGAGTCATATCCAGTCACAAAAGAAAGTCAAGATTTATTTTCAGACTATTTAACTAATCTAACTCCCTAATGTGTTAGCTA-CTTTGTAGATAAGCTCCCAAATATTGAATTTAGAACGCAAGCTAAGCAAAAATATAAAAATAAAAAAACTATG
>CG4038 16603524 16603708|16851 chr2R 16603438 16604290 scaffold_39 441511 442356 + 18802|91 290
TTTTCAGTATCAGATCCTAATCAAAACATTTAAAGAAGTGTACAATCCAATTGTTGTACATGTCCAAATAGTTTCTAAGCAAAACCTC----ATCATTTGG--GTATTGTTCGCTGACCAATCAATCGAATATTGTACCATAAATGAT-ACTAAAATA-----AATTTCCTACAAATTTACAAACATG---ATATAACTG
-CGCCGGTGGCGGAGGCGGGCGCGGCCGTTGGTAGTAAT------TCAGAATGAAGCGCGAAACTGAATAAAATGTAAAACAAATTATAAAAATTAATTGGTTGTTTTGATAAATCGTAAATTGGTTTAATATTTATTTGGAAATACTGACCACGATACATGCAATATTTTACGGATATATATATATGTATGTATAGTTA
>Magi 16637045 16637456|16869 chr2R 16636173 16637296 scaffold_11 3368517 3369826 + 24210|1078 1350
GTGCGTATTTTATTCCAGTTTCTTAAGATACCGATCATT-----ATCTTAGGCTAAGTTACTGCTTGTACTTAAACGTTAAGACAATTTGCCAGTTTGTGAGATATTAATCACTTAGCTTAAGCTGTTTTAGACATATACGAATTGTACAAATGTAAAGGACTTTAA-ATTTTTATCTCGAGTATGTATATTATTCAAACACAATAGATATTA---------------AATTGTATTTTTCAAATATACCTACACATTATAACATCAAAAGTT
ATTTATAAACAATTCTGATTATCAAATATGGC-ATCATTTTAACATATTAGCATAAACCCATACCT----TTTAAGATGCATAAAGTTTGTCTAT-----AAATACCAATTATTTAG----------TCTAGACATATA-----TGTACAAATGTATAGCAACTAAATACTTCTAATTTACACA-ATATGTTGTTCAA---TAAATGATATTACGACTAGTTTTTAATAACAGCATCATTTGAATGCATC----CTTTAGAACGAATCAAGTT
>Magi 16637045 16637456|16870 chr2R 16637297 16640529 scaffold_11 3369941 3373235 + 152030|0 171
CTCTGAGACCTACGCATTCGGCTCTATAAGAGCTTTCTATAGT---------GTTGCATCGCC---TGCAGGCCCTTAGTTTGTACTTTCGTTAGCAAAGTACTCACCCCAAAGACTGAATTTAGTAGCATATGTAAGCCAAACCCTTTGCAAGTCTCAAAACCGTATGTGA
CTCTGAGATTTACGCATTCGGCTCTACAAGAGCTTTCTCTAGCTAGTTTAAATGTGCATTTCACAGTGCAGTTCCGTAGTTT-TATGAATAACTGCTAAGTA---ACCCCAAAGACTGAATTTAGTAACATATG-AAACATTTCAATTTACGAATCTCTAACCGCTTTGTGA
>CG15657 16655058 16655295|16880 chr2R 16653694 16655070 scaffold_11 3390333 3391754 + 34826|1498 1510
ACGGTTTTAGCAA
ATGGTTTTTGCAA
>CG15657 16655058 16655295|16881 chr2R 16655178 16655732 scaffold_11 3391869 3392397 + 5159|0 119
AAATGAGGATATTCTTGGGTACATA--CGAGTAGTCTCCTAACTTACAGACGTTAACAAATACAAAAGTGGGCGCTCCCAAAACTTGGCTACATACAAATGCTGCGGATATTTTATTGTT
AGGTTGCAGTGCTCTTAGCTTTTTAATCGATTCATGTTTTGTTTTAAA----TTAATGAA-----------GTATTTGTGTAACTTGGTTTGATTCGCA------GGATTTACTACTCTC
>CG30389 16656314 16657527|16882 chr2R 16655733 16658700 scaffold_11 3392776 3395814 + 99798|608 1978
ACCATCGTCGCTCCAAGGAGGATGAGGTCATCGATCTCAAGGCAAAGATTGCCCAACTTTTGGCCGTGATGCCAGACAACTTGTGCATGAACACTGGCCCACATGGGCCGTCGAGCAGCATTCTGCGCATGAACGACACGCCGCCGTTGCAGTCGGGT---CCCGGACCGTCCTCGCCCATGCTCAGTCTGAGCGCTGCGCAGGAGTACCAACAGCATCAGCAGCACCAGCAACACCAACAGCACCAACAGCATCAGCAACATCAGCAACATCAGCAGCATCAGCAACAGCAGCACCAACAGCATCAGCAACATCAGCAGCAGCAGCATCAGCAGCAGCACCAACAACATCAGCAGCACCAACAACACCAGCAGCATCAGCAGCAGGGTGGCGGTGGGCCTGGGTCCCAGCAGCAAATGGTGCCGGTCAGTGTGGCAGCTGCCTTCCAGGTGGCTGCAGCAAATGCCGCTGCTGCAGCCAATGCCGCTGCTGCCAACGGAAACGGGGGC---TCAACGCTGGATCCCAATGCTAGCGTTTACACGCCGAAGAATGGCAACATGATGGTGGTGTCGCCGGTGGGCATGAACCCCAACGGTGCGGATGCCTGACGCCAACAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGTCCTTGACGTCATCGTCGTCGTCGTCCTCGCACATGCATCTGCGACGACAAGTTTGAGATTATTATACTTTATATGAATTAGGGAAAAGAAACGCAAACAACCGTC----GCCACAGCAAACGATGAGCAGGCCGTAACCTGGTGCCGGTTCCAAGAAGATGTTTGCATACAATAT-CTGAATGTCCGTAATATAAATAAGCAGTTTCCTTTAAAATTTAATCACCGCCACAGAAGCGCAGGCAGCACTG-----------------ATGAATGCAGCTCAAA--ACTGCTAAACATTTCCCCCC--------------------------------------CTTCCAAAAA-----------------------------TTCAAATTGTTCAATCAAATCCAATTT---------CCTCAATTAATTCGG----------CATTCCA---------------AACAGAAATTTCCTTACATAACTGACCGCCCGTTTCAATATT------CTCAGATCATTTAAAGCACTG----------------TTTTAAATCGGCTG----CCCGCCACCACACCACACACCACATACACATTTAGTAAACTCCCTCTAACACGAAAAGTACATGATTACTTTAACAAGATGATTCGAGAACTCGAGAAACATTTGAGAGCGATAAGAACAGAACACAAATTTCTAAAAATAATAACAAAATGAAAATGGCGA
GTCATCGTCGGTCCAAGGAGGATGAGGTCATTGATCTCAAGGCCAAGATAGCACAGCTGCTGGCTGTTATGCCGGATACACTGTGTCTGAACACGGGAGCACATGGTCCCGGCGGAAGTATGCTGCGCATGAACGACACACCTCCGCTACAATCGGGCGGACCTGGCCCGTCCTCACCCATGCTCAGCCTAAGCGTTGCGCAAGAGTATCAACAGCATCAGCAGCACCAGCAACATCAACAGCACCAGCAACATCAA------CAGCAACATCAACAGCAACAGCATCAACACCAGCAACAGCAGCACCAACACCAACAGCAGCAGCAC---------------CAACACCAACAGCACCAACACCAGCAGCAGCAACAG------------GTTGTGCCCGTCTCTCAACAGCAGATGGTGCCCGTAAGTGTGGCAGCCGCGCTACATGTGGT---------TGCCGGTAATGTGGTTAACGGCGGT---------GGAGGCGGCGGTCTATCGACGCTGGATCCCAACGCTAGTGTCTATACGCCCAAGACAGGCAACATGATGGTGGTGCCGCCCGTTGGCATGAATCCCAATGGTGCGGATGCCTGACGCCAGCAGCACCAACAGCA---------------------ATCATCTGCGTCATCCTCGCATCAGCTAATGAGACGACAAGTTTGAGATTATTATACTTTATATGAAAAGCAACAGAAAACAGCAACCGATTGATTTAGACTACAGTAGTCGAACAGAAGGCGA------------------ATGGATCAGTTTGCATATGATATAATGAATGTCCGTACTAAGCATAAGCAGTTTCCTTTTACACCCCACAACTACAACAGTATCACA--CAGTACTACACGTTTTTCAATTTCCATAACCACCTTTGAAACTATCGCAAAACACTTCAAATCACACAACCGATACCGAGATACCAGTTAGTTGTTTTGTTTTCCCAAAAATGTCTTAAGAATGCGCTCAATATTTTTTCTCCCAAATACGCAATCAATTGAAGTTTTGTAATTGACTCCAACCAATATGGCAAAAAACGTCATTCCACCTGCTGAAAACGTTATCAAAACTTATTTCAAATCAATGGCAATCGTTTTTATCAATTGCCAACTAAGAACGCTAATGACTTGGTATCCGGTTTGTCAACTTTTAATCCAACCAAGATCCGCTCATGGAATCACATACAAAATACACATTTAGCAGACTC--------------GTTGCGCGAGTTTTTGATCGATTTGATTT----------GAAACATTTGA-------AAAAA---------------TAATAAGAATGAAAAAACGCAAATGTGAA
>CG30389 16657591 16657783|16882 chr2R 16655733 16658700 scaffold_11 3392776 3395814 + 99798|2044 2236
TACCGCATGCTGGAGGCGAAGCTGCGCAATCGGGAATCGTCCCAGCCTGATCCCGAGATTCTATTAAATGCGCTGGCTGCCATGCAGGACAAGAACGCAACGCTGGAGAAGAATCTATCCGCAGAGACGAGAGTCAAGCTGGACTTGTTCTCGGCTCTGGGCGCTGCCAAGCGCCAGATTGAAATATCTGACA
TATCGTATGTTGGAAGTTAAGGTACATAATCGCGAGTCCACGCAGGCGGATGCTGAAATGCTAATGAATGCACTGGCTTCCATGCAAGAAAAGAACTCCACGCTGGAAAAGAATCTATCCGCAGAGACGAGAGTTAAGCTGGACTTATTCTCGGCTCTGGGCGCGGCCAAGCGCCAGCTAGAAATATCTGACA
>CG30389 16657847 16658505|16882 chr2R 16655733 16658700 scaffold_11 3392776 3395814 + 99798|2310 3016
GTCGACGTAATCGCGGCAAGAAGGATAATGCAGCAAAGGACAATCACAGCCATCAGCAG-------------------------------CAGCTGGCTCAGCAACAAA----AGGAA-AAGGACAAGGAGAACACAGCCAACAACAACAATAACGACGCTAGCTCGGTATCATCTTCAGCGAGCTCCACCTCCAGCAATGCCATCGC------------GAACCTGGCCAGCAAGGTGGTCTCCAAGATCTGTGAAACGTGTCTCAAACTGGAGGCCGATGTGAAAAAGTATCGAGCTGAAATCAGCCATATGAAGCAAATCGAAAACGAATTGCGGCAAAAGCTGGACGCCAATCTCACCAGCAAATCAACGCTGCAGGCCAAGCAGAAGGAGTGCGACGACCTGGAGAAGCGCATCCAAGAGCTGAACAACGCCCGGCACGCTGATATGCTCAATTTGCAGACTGTGGAGCGAAGACTAAACGAGGAGCGCCGCCAGAAGCAATCCCTGGACTCGCAGCTGTCCAACGAGAAGAAGGCTCGCAAGTTGGCCGAGGAGAAGGCGGCCCGTCCGGAGTGCAGTTCCCAGTGCAAGCAGCGACGCCAGCAGATGGATGAGGAGCAAAAACGGCTGCGCAGCGATCTTAAGCAGGCGGAGGAGGCGAAGCAACTTGCCGTCGAGCATGGCAGAAAAGTGGAACAAGAG
GCCGCCGCAATCGCGGTAAGAAGGACAACTCAGCCAAAGACAATCATAGCCAGCAGCAGTCGCAGCATAAAGAGACTGCAGCTGCTGCCGCACCTGCTGCAGTAACTAATACCAGTAATAACAACAATAACAGCAGCAACAACAACAACAACAATGACGCCAGCTCCGTATCGTCGTCGGCCAGCTCAACATCGAGCAATGCAACCGCTGCCGCCATATCGCACATGGCCAGCAAAGTGGTATCCAAGATATGCGAAACGTGTCTCAAGCTGGAGGCCGACGTTAAGAAATATCGCGCCGAAATAAGCCATATGAAGCAAATCGAAAACGAACTGCGCCAAAAGCTTGACGTGAATCTGACCAGCAAGTCCAGTTTGCAGGCCAAGCAAAAGGAGTGCGATGAGCTTGAGAAGCGCATACAGGAGCTCAACAATGCACGCCATGCCGATATGCTCAGTCTGCAGACTGTGGAGCGGCGTCTCAACGAGGAGCGCCGCCAGAAGCAATCCCTTGACGCTCAGCTAGCTAACGAGAAAAAAGCACGCAAGGCCGCCGAGGAGAAGGCTGCACGTCCTGAGTGCAGCGTCCAATGCAAGCAGCGTCGCCAGCAAATGGACGAGGAGCTGAAGCGAGTGCGCAGCGATCTCAAACAGACCGAGGAAGCTAAGCAGATGGCCGTCGATCACGGCCGGAAGTTCGAGCAAGAG
>CG30389 16658565 16658666|16882 chr2R 16655733 16658700 scaffold_11 3392776 3395814 + 99798|3099 3206
AGAAAAAGGCTGGTAACGCTGTTCCCAACGGGAATGCCAATCACCTGGA---AGATGA---AACGGCCAGTGTGGAGCCAACACCACCTGTTGAAAAGGCGACTAAGG
ACAAAAAGACGCACAATGCTGTCAGCAACGGCAACGTCCTGCAGTTCGAGACAGATGAGGCAGCGGCCGCTGCGGAACCAGTGCCTCAAGTAGAGAAGGCGCCGAAAG
>CG30389 16661467 16661571|16883 chr2R 16661465 16662106 scaffold_11 3395841 3396397 + 10165|2 139
CAGCTACATCAAGTAATAGTAAGGATAAGGATAAGGAGAAGTCAGACTGGGATAGTAGCACAAG---CTATCCACAACAA------------------------------CAGCAGCAGGGGGGAAAGGAGAAGCACG
CAACCACATCAAGTA---------------ATAAGGAGAAGTCAGACTGGGATAGTAGCAATAGCAACTATCAACAACAACAACAACAACAACAGCAACAACAACAGCAGCAGCAACAGGGGGCAAAGGACAAACAGG
>CG4266 16669295 16669837|16898 chr2R 16669259 16670801 scaffold_11 3405450 3407183 + 23484|36 745
GCGACAGACAGATCAA------ATGAGAAACAAACTTATTATTATTGAGCAAATTCAAGATGAGT---------TGTAATTTATGATTTTCCTTATCAAGTAACT----------TTAGTGTAACTC--CATACATGCGAACATTTTACCGTTTTTAAA--------TTGAGATTACGTAGCATTTTTGACGAGGGGGGTGGGGGTTGAACC---------------GGACGCTTT-------------------------------------------TAAAACCAGAGATTCAG--------------------------TTAAATTCGAGTGATTTAAATTGTC---------------------GTACAATAGGAACCACAACTAC----------CAACGAAAACGTGGAGCAACAGATACA--------CACAGT---------TATAGCAAATAATTAGCAAAGGAGACGGATTGTATGGACAGGAAATTGACAGGGGAGCTTGTGGGGGAGTAGAAGCCCAATCATAAACAAATCAGCAATCGCAAAACTTGAAATGTTTATTATTTTGTTATGTATTTAGTTTTAAGAGTATATTTAACACTCAAATTGTTTCTAATGCGCAGATTCTAGGTACACGCATATTAATGTACAATTCAAATATATCTATATTATCGGATACTATAAAATAAAAAATGAAAAAC
AATGCTGACAAAATAGTTCATTAGAAGCAGCAAAACGAACTTTCGACGGTAAATCAAAAGTGTGTCGAAAAATGTGTAATTTATAA-TTTCCTTACAATATGATTTATACATGTATGTGTGTCGCCCAACATGCATGCAAACATTTATATATTATTAAAATTTTAGCTTGAGATTACGCA-----TTTGTTGAGACGCGACGAGTCTGCACCATTCTTGCTAGGCTAAGGCGCTTTATATTATTATTATTAAAGTTTTCACTTCAAGGCTTAGCTGCCGCCAAACCACAAACTAAACAACAATTAGGGGGCGTCGCTGATCCCTAAAGTCGGATGCTAGAAATTTTCATTTTCCATACAGTTATGTATGTAAAAACAAAACTAAAAATATATTTAGAAGAAAAGAAAAACTCCCATTATCAGATACAGTTAAAGGCGCAATGGAACAAACTGTAGCAAATAATTAGAGAATAAAA-----TGTATGGAC--GAAATTGATAG------------------------------ACAGAGAAAACAGCCAC------GCTTGAAATGTTTATTATTTTGTTATGTATATAATTTTAAGCAGGTATTTAACA--CAAATCGTTTCTTATATGCAGATTATAAGTACAGATATAATAATGTACAATCTAAATATGAAAATATTATC-AATACTATTAATAAAAAAAAAAAAACA
>CG4286 16685328 16685397|16909 chr2R 16685385 16686120 scaffold_11 3424362 3425096 + 22782|0 12
GGGAATGGTTGGA
ATGCTAATTTGGA
>CG4302 16720460 16720549|16939 chr2R 16720449 16720487 scaffold_11 3852331 3852369 - 1076|11 38
CTTGTAATAAATTTTGGATAATTTCGTA
TGTGTTAATTATTTTGAATACATTCTCA
>CG4302 16720460 16720549|16940 chr2R 16720488 16722724 scaffold_11 3856203 3858410 - 57094|0 73
AACCAAAACTTGAGTTTTATTTTGTTG---TTAACAAAAGAG---------GCTACAATTATGTTAGATAGTTT
AACAAAGTCTT--TTTATATGTTGCTAACTTCAACTGAAAAGCAAAATTGTGCTGTAATTATGTTAATTAGTTT
>CG18375 16725438 16726531|16944 chr2R 16725455 16729624 scaffold_502 3022 7450 - 147087|0 1261
CAGTTAATACGCTTCACCATACTGAAGCGCAAGGCCGGTCGACTCATCCAGAAGCGCTATATATCCAAGTACATCTAGGGACCGTCCGACGCAGCTAGCCGATTCTGGGCACGTGCCACCAC-------------------------------------------CGCAGGAGTCAACGG------------------------------------------GGAATTATTTATCACGACGCCATG----TTTCTTTATGTTTACTTTTTGTTTGG---GAAAAGCAACACAAAAGGACGAGAGGAGGCGGATGGAGGGAGGAGCAAAACGAGGCTC-ACCATATGCTCATCCATATGGAATGGAACCGACTGCAGCTTCCGCTTGAGT----CATTTATCCCGACGACTGCCCTCAATTAGC-------CAGGCTTTCGCACAAAGTTCAGCACAGCAAAACACACATAT--CAGCCGCATATCAGCCACATAC-CACCACATACTACCCACGAGCATATCGCCGCCCACCACCC-------------------CCTGCATACGTACAACAGCAAATTGAATTTCACTTAAGC---TCCTTAGCT----TTAAGGCCTAGACTAATAACTCATAT-------------------------CAGCCGCCC----GCTCGCCACAAAAACTTCACCTTCAAGTCGCTGCAGAAAAAGTTCTGA-TTGCAATTTGCAGCCAGGAAAATGGAAAATTGAAAATTAGAAATTTAAAATTTAAAATTTCTCAAAGGCCGCACACACACACACACTCTGTGTG-TGTGTGTTTCATCAACGGATAGCTGAAGGAGCTGAAGTTTGTTAATTGCATATATCAAG--TTAGTACTTAAACTTTAATTGAACTCGAACAAAGTTCACGCTAATCGAAAGGCA-ACATTTTAACACTTATAACAAAACTCGCAAACGCACACACACACACACACA-CATACACAAGCAGAATACATAACG---AATCGAATGTGATTTTTGTATAAAGACGAGAATAATTTAAACAATTTGTATCGAATATGA--AAATGTAAATTACATTAGGCGTGGAGATTCGTTGACAAGTAATCGCATTATAGGCTAAATGTTATAATTTAACTTAATCTAATTACATATAATATACCGATTGCTTA------ATACCTAGCATTTAAGGA--CCAAACAACAC----ACACATTGACATGCAAATACGTTTGAAAGATGAAAATAA
CAGTTAATACGCTTTACCATACTCAAGCGCAAGGCTGGCCGACTTGTGCAGAAGCGCTATATATCCAAGTATATCTGAG----------------CAGCAGATTCTGAGCACGTGCCGCCGCGCGTCTCCTGCGCCTAATTCCGCGCTCCCAAACTGGATGCGGATGCGGATGCTGATGGGTTGTGGGAGAGGGAGGGGGAGGCGCGTCTTAGTTATGAGCTGGCATTATTTATGACAGCCTCGTGTTATTTCTTTCCTGTTTACTTTTTTGTTTGTTTGAAAAGCCACAAGAAGG------------------------------AAACCAGACGCAATCACACACACACACACACACACACAAACACAC-ACAAGTCATGTGTGTGTGTTGCAAGTGTGCAAACGTGTGTCCATCATCGGAATATGTGCAGCATTTGCCACAGCGCC---TGCGGCAACAGCTATTTATTATAAAAGGAGAGCAGTCATGAGCGGACCACA-ATTAGGCAACAGCCTAGTCCTGGTCCTGGCCCTGGTCCTGCTTTTGGTCGTCCTGCACACGTACAA---TAAATTGGATTTCAGTTAAGCCTGCCCCCTGCTTAGATTAAGGCCTAGACTAATAACTTAAGTAAAACATGTGCACCACACAAGCCCCCAGCCGCCCAACAACTCGCCACAAA----TTGCTTTCAACTTTCTGTGCATAAAACTAAAATTTGAAATTCAAATTTAAGA----TGCAAATTGAAAAT--GAAAATTGAAATTTTCAAT------------------------AGACTTTGTGCACTTTGTGGTTGGAAAACG------------------AGTTTGTTAATTGCCAGTAACGAGTTTTATTACTAAA----------TATTCGAAAAACATGCA--TTAATTAATTTACACACATTTTAG-ACACATGACAAGAACAACAACAAGAAATCGTGATTTTTGTGTTGTATAAAGCGAAAGTGCAAAAAGTTAAACAAAACATAATTTAAATATCGTTAATATCGTCTATTGTACAGTTCTTACTACCTATGACTAAAACAAAAGCAGCTTCGTTATCAATTTACAATTCCTAATAAATACATTAATAATTAGTTTATAT-ATATATATATATGTATCTATATGTAAT-TGCCTGATGCCTACCACCTATTCCTAGCATTCACAAAATACAAAAAATACAAAAACAAATACACAACAAATTACATTCTAAATGCAATAATAA
>CG30392 16798496 16798867|17035 chr2R 16797813 16798663 scaffold_51 62399 63211 + 1076|747 933
TAAAATTTTCTGTATTGATTGTGTAACTGCAAGTATTCGTTTCCTAAGACGT----AAGTTTTAATTTTGCATTTTGAATTGC--CTGCAATCGCT-------------CATCTATCGCCTTGTCCACAGGCTGTGCAATATTTCCAAAATCCCCCGTATTTTAACGCCATTAAAGCTTTAGTCATG
CAAAGTCAGCTGAAAAACTAGATTGACATCTATTTGTCGTATTGTGGAATGTCTTAAACTATTGTTTTT---TTTTTAACTCCTACTTCAATATTTGTGTTACTGTTTGTATTTATAGCCTCGCCCATTGGCTGTGCA---------------CGTGTATGTC----TTATTAAAACTT--AGCATC
>CG30392 16798496 16798867|17036 chr2R 16798863 16799618 scaffold_51 63212 63954 + 19969|0 4
AATCC
AATTC
>CG9752 16801976 16802016|17040 chr2R 16801447 16802021 scaffold_4 1579404 1580010 + 15890|587 629
CGACGGCAACACAAATAAAGACGGTTC--TTTGTTAAACTGAA
CGA----ATTAAAAACAAAAATGGCTCATTTCGTTAAATGTTT
>CG30394 16827620 16827742|17065 chr2R 16827358 16827687 scaffold_4 1610125 1610496 + 3004|296 376
ATTTAGTTTATAAGAAACTGTAGACTAGAAGT-ATATACAAATTATATACAGTT-CATAT-----------GACTTGGGAA
CTTCAGTTCATGCTTAACATTTGACTTGAGCCGATCGAAAAATTATATACATTTTCATATACTGAATGGCTGTGCTGTACA
>CG30394 16827620 16827742|17066 chr2R 16827688 16828605 scaffold_4 1611070 1612069 + 16928|0 54
TGCGGATAGTTTACAACTATGCAAAGCTTTATGTATATAACCTTTACATGTATTT
TGCAAGCACT----ACCTACACCAAAAATTATG----TAACTGTTACAATTGTTT
>cv-2 16863444 16863587|17098 chr2R 16863443 16864638 scaffold_4 2615578 2616714 + 37844|1 145
-TTAGTTGTCCGTTTAACCTTAGTTACCCATTTAGTTACTACTCGCACACACTTACATTCATGAGCACGCCCATTCCCACACAGACACTCTCGCAGTGGGGGCCGC-AATCCATAGCATACTTTTAGAGGCCCCCAAAAGTGCGG
ACTGAGCATGGATTTAATTATA-------ATTTAGTTGCTACTCATACACACGCACCTATATACACACACACACACACACACACTCTCTCTCATACAGGCTAATGCAAATGCATTGCTTACTTTAAGGA----CCAATGACACGG
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CAAA
----
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AACACAGAAAGCATA--TACATACATTCAAAAAACTGCAAAAAAAAAA-
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AATATTTAACAGACAACAACAAAACAAGCGACTGTTTGCAACACGGCTTGGATGGGGAAAGGGGAAGGGGGAGAGGAGGGGCACAGGGATTGATGGGCGCAAAGGCATTTGTAGAAAACTTTTGTCAGCCCAAAAGTGTCGTCATGCGGGTATCCTGCATCGCCTTGTTAATCATTTGTTGTGCTT------------GTTGCAATAATCTATAACACGCCCCCTTCCGGCG------CCCCTTTGGCTCATTAAAAAATGATCGTCAACTGGGGGGCATACGCCAAAGGCCATAGAGGGTAACGCAAGTTTCAACAACAGACAAAGTCGCAAAGTTTTTCAAATACAAACAACAAAAGACATACTGAAAGTTTCCT--CAGGCA--AGGCCCAAATGACGCATTTTCAATGGCAAGTTCGTATCGCCAGGG
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TTTCTTAATTTGATTTTAAATTTATATAGAAATAAGGTCTTTTTGCCGAGTTCTCTGCAAGCAGCACCGCATGCAAGTTTACACGATGAAGTTCAAGACTTTGTTAAAAACTTTTGTTTCTTCCAAAAGGTGCAATT
>CG10496 17006481 17006598|17289 chr2R 17006588 17009935 scaffold_4 2822915 2826345 + 34358|0 10
CTTAAGTTAGA
CCTAGCCTAGA
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TAACAATCTAAGAGCTAATCGGCTCGGGCAGTGGATTCTCAGTGATGCGTATCTTGTTGCTTTGTGTGCCAAAGTAGAGCGTACCGGATGTATCAGTGGTCACATATGCCCGATTGCCATTCCCG---------------------------------------------------TTGCCATTCTCCACATCCAGATCCTCTTCGCTATTCGGGTCATTTGCATTGTTGTTGCTGCTGCTGCTGCTGCTCATGCTG
>CG10494 17023678 17024838|17306 chr2R 17023923 17026552 scaffold_4 2842113 2844966 + 46001|0 1233
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TT--TCTTCCAACAAGTAACA--ACAACA-GTAAAACTACGATTTGTTTCAGAG---ATAAGATTTATCTATAGCTTTTAAAAGATTTAATTTTTTTGTTAAATTTAGTTTGACAATATTTATTTTAAAAAAATATTGTTAGAGTTATACTAAAAGTACTTTTAGG
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AATCTGGCCGAGAGTTGATC-----------
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AATCCAAATGTTATTTAATGTTTAT--CAATTAAGTTT--GCTGGCA---------------------------------------------------------CGGACAC---TGAACGCAAACACGCTC-----------GTGTGTATTATTAAGCATTTA--CAGAGCCAAGAGCCC--AGCACTGATTTTGTTTTTTAGCCTTG---------ATTTTAAGTCGATATTGTTTTCTCTAAGTGTACCAC--CTAATGCT----------AAAGACCCTAAGTTGTTTCATT-----AAATCAAGTTGGCCAG--GGATATT-------AGCTGGCTTAAATTAT------TGTAACACA-------------------------------------CACGGAAAACTATGGTAGTA---------------------------------TCAACTCACAGCGAAAATAGTTTTGTAGTACTTAATTGATGTAATTGAACCTTTATGAATGTAAACTATGGGATAACTTTTTCA-----------------------------ATATATACGATCCGACG---TCTAAATAGTCTACACCAATTCAAATA----CAATTACATGCAAATATAGATATATTTAACGAAATACAGTTTGCGACCACGCCCTCTATAGAACAACCACTCAATT----------GAATATTTAAATAAAGAAAAA---ACATACGTGT
AATCCAAATGTTATTTAATGTTTATATCAAATACGTTTTTGCTGGCAGTCAACCCATACACACAAACCACCCTCCCCATCCACCCACACACACATACTCACACGCGCACACACACAAACACACACACGCGCACACCATATACGTGTATTTCAATAGTATTTTAGGTAGAGCCCAGAGCCCCCAGCACTGATTTG--TTTATGGCCTAAGTTCGGCATATTTAAAATAGTTTCTGTTTTC-CTTTTTGTAGTACTTCCAATACGGTTATAATTAAAATACTTTCGGTTATTTAATTGCATAAAAAAAAACTAGCCAGACGGACAATTGTTGAGAATTGTCTTAAAGCATAACTTATATAATACGAGGCACACATATGTAGCTATCAAAAGAAAACAAAAATCAAAGAAAACAAAGTAAGTAAAAGAAAAACAAAAACTATGCAACTATATTGATTAAACTAACAGC---AATAGTTTTGTAGTACATAATTGATGTAATTGAACTTTTATGAATGTAAACTATGGATTAACTTTTCAATATACATACATATATGCAAATACATATACATACATACATACCGACAAGTTCTACAATATGTGCAAAATATGAAAAATACTCAATCAAAACAAAACAAATAAATAAATTTTAAAAAACAGTTTGCGACTA---CTTCTAGCAAA-ATCCATTAAATTGTCTAAATGCGTACATTCAAATAAAAGAAAATATAAATAAATAC
>CG10440 17067828 17068739|17361 chr2R 17068728 17069939 scaffold_1670 1560 2741 - 63917|0 11
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TAGGCTCCATGT
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ATGTACTCATCTGTTGTTCTTGTTTTCGTTTACGCTTTTCCCCACATCATCAACTGTGCCCAAAATATCTCTACTAACCACGTTCGTCTATCTTCGCCTATTGCTCCACTGT-TCCGCCCCACCTACCTATCCCCCACGTTAAC-TCACCTGTAACTGCATTCCTTCCCCAACATCACCTGCCTGTTGCAGTGCCGGTTAGACCAGCGCCGTGTGCGCAACACCTGGGCGCCTGCATGGAGTACTGCGGCCAGGCACTGCAGAGACCTGGAACGGACTGCAAGAACGGAGAGTTTTGCTGTGTTTTGATCTAGACTACGTTATGTAATATAATCTATAAATC------AATGAGCATCATTTGTCAACTG---------TAGACTATATTTAACGATACTTTAACTTATA--TATTGTACGAATAATTTTTATATGAAATATTTCTACTGTTCTAATAAAAAAAAAAACAAACACTG----TAAATATTTTGAAAAAAAAAAAAAACGAAATGAATTTGAATTA
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CTCATTATTTCTAAGATAAACTAAATAAAGCAATACTCCCTCGCTTCCAAACA
TGGA-TATTTCTCAAAAAAAAAAAAATAATAAATAAT-----------AAATA
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CGGTGAGTTG-TGCATCCTGCTTGGAGG-CGGAGAAAGCTCAAACC-TTTCTCAAGTTG-----GATCCTTCCCTGGGTCCTTCTGACTAAA-CACCAATTTCTCCAA-TCCCAAGCGGACAGCTCGACC------------GCCGGACGTGG------ACCAAAATACGGACACGAGTTCATTTA------AAACACAAGATAAAAATTCGATAAGTAAAATG-------------------------------GAAACCCATAAAT
TGGTGAGTTGGTAAAAACCGTTCGGAAAACGTGAAAAGCTCAAACCCTTTATCAAGTTGTCTCGGAGCCTGCTCCGTTTCTAACTGACTAAAACACCAATTTTCACGGCTTTCGAACTGCCAGCTCGACCCTTGTTGTTGCTGCTGTGCGTCGTTTAACCCCATAGTTACAGCTAGAGTTCTTTCATGACAAAAACAAAAAACAAAAACAAAAAAAAAAAAACAAAAAGTCTAAACAATTATATTGAAGAAAAACGAAAAACAAAAAC
>PTP-ER 17126966 17127628|17439 chr2R 17127208 17131895 scaffold_45 411946 416766 - 145017|0 581
AAGCGA--------------GCGAAAACCATGATCAACA---------------ACTTTTTGACGACAA-------------------------------AACGATGGAGATGAAGAACAAAACACCAATTTACTATTTGTAATC---ACAATTTTTGTGGCCCTTATTTTAATGAAAGCAACCGCGACGGACAAGCAACAAGTAAAACAAGAAACCATGGCTAAAAGAGTCTCGAAAATGGAATATGATGGCATTCTCCGAA---GGAGGATTGACGGAATGCTTTCAATGTTTTCTAAATATTACTATTACCACATATTCTACATATA---------------------------------TATAAATGTTTATTAAGTGTT----GGATGTATGTGTGTTAAA------------------TGTGTACATAAGTGTAAATGTTTCCGAC---TTTTGGTGTGA------------------ACTATGCTTAAA-----------------CTAAAGTTAA--TTAACAATTATTATACCCTACCTTACCTTACCAAAACCATACCTTACCATAAAGATG
ATTAGATAATTACCATAAAGATGACAATTTTGATCAAGATGATGATTAAGATATAGTTGTAGACGATGATGACGACGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGAGAAAGAAGAACAAAACACCAATTTACTATTTGTAAAAGAAACAAATTTTGTGAAACTTATTTTAA---AAGCAA--------AACAAA-AACAACAAATGCGAATAACCATGGCTAAAAGAGTCTCGAACATATAAACTTAT---ATACAACAAATATGGCATAGAGAAGATATGTTCTCAATGTTTGCTATATAAGCTTATTATC-TATTATCTACACATTATTATGATTACGATTAATTATTATCATTATTATTATAAATGTTTATTAAGTGTTTTTTGGATGTATGTATGTTCAAATGTGGTGTGCATGTATCTATGTACATAAGTGTAAATGTTTTCATTATTTTTCGGTGTGAGCAAACAAACAAAACACAACTATGCTTAAAAACAACAACAACAACAACTAAAACTAAAGTTAATTATCCTTATTAATTACCTTATCTAAC--AAGCTGGCCTTTGGCAACAGGACA
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AAAATAGCTGA
AAAATTGCTGT
>CG30284 17158407 17158443|17460 chr2R 17158432 17158974 scaffold_1 2876980 2877510 + 13454|0 11
GCGGCCAGAGGG
GCGGCCAAGCGG
>Rae1 17166338 17166424|17465 chr2R 17162542 17167549 scaffold_1 2882355 2887712 + 191948|4271 4388
TCGGAGGACTACTTTAGCTTTAGTGAAAACCCCTACGCGTACATGTATTGCGAATAA--------AGTGAATTGGAGCG--------------ATAGCACAATGG---------GTTT
TCGGAAACGTGCTTTAGTTTTAGTCACG------------ACATGTTCTGCGAGTAATATCAATCATTAATTTGTATCGTATCATTAAATATCGAAGCGCATTGGCATTTGCATTTTT
>CG15678 17168549 17168905|17466 chr2R 17168495 17171962 scaffold_1 2889135 2892941 + 11826|54 457
GA----ATCTTGAGCTCTCTAAGTCATCTTTGGCCAAAGATTAAG--GATTAATGT--------AACGAAACTCTTGCCACCGAACGCAAAGGTTCCTATTGAC-----------TGCAAAATAGTCACTTAGTCTTAA-TGTGTCTTTCGACTGCTACCAATATTAACATCACCCTGCACATTCAGCAATGTCAAGTATTAAACGCCACGTCGCTAGTCTAAAAATCCATTACTATTCACAAAACACACCCACTGATTAGGGAAATATAT--GTATTGTATGTATATGTTTAGTCGTAA---CGCAG-AAGCGCAGTGTGAA--CAAAGCCTAAACTTCATTCCGAGAATGAATAATCTG---------ATTAAAAAATACAAC----TATATGTCTAAATAT
GCTCTTTTTCTTAGCTCTTTATCTCA----AGTCCAAAGTTTAAGCTTATTAACTTGCCTGCTAGACTTACATATGGCCA--GTTTTGAATGGTTCCTATTGTTATATATATATATATAAGATAGTCA-TTAGCATTAGCTAAGCTTTCTGACTGCT--CAACATGATTGTCATCCAG--------GCACTGAAAAGTATTAACCATC--------AACTTATAATCACAATA----TCATCATATATATATTATAATTATGTATTTATAGTAGAATTTTATATGTATATATAGTAAGAAATCCGCAATTAACAAAATGTGGATTCGAAAACTGA---TCATTCCGTGAATGAAC--TCTGCATTTGAATATTAAAAAATTTTAAATTGCATAATTTTAAACAT
>CG9865 17175109 17175169|17469 chr2R 17175057 17179175 scaffold_1 895558 899695 + 93953|60 121
TCAAACAATCCGCAAAGCAGAGATTTAATATAAAAAATAAACACAAGATATCACAATTCG-T
AAAAATA------AAAAAGAATATAAATAATGATTGATGAAACCAAGATACATTTTTCCGAT
>Tbp 17193782 17193908|17480 chr2R 17192892 17195051 scaffold_1 5593598 5595770 - 93735|902 1050
ATAGGATAGCGCTTTATTAGTTCTGTACGTGTACGTTTTAAGGTCGGTAGTTCTGGAAGT---CTGATCATA--------TGAGTGGGAGCAGCCTGGCGAGCAGCTCCGATCGAGAATAAACCACAAAGTAATTTA-----------G
---GGCCTACTTCATCATCGCTAAGCACATGTAGTTTTCTAGGGTATTAACTCTTAAAGTTGACTAATTGTAATTTGTATTAAGTTAAGATGTCTCTGTGTG-AGCGCCAA------ATAAAACTGTATTTAGTTTGTATATATATATG
>Tim10 17197790 17197928|17482 chr2R 17196524 17198905 scaffold_1 1388167 1390466 + 58582|1321 1465
CCTGGCACCC------ATTAACCCACATTTCCGCTTAACCAATGTGCATTTTTGAAGCGCTACGATTGTTAGAGGTACATGTACAAAACACCCCGTTGTAGAGAATAAACCACAGATTTATGTGTGCTACATAATATCAGACCTC
ATTTTAAGTTTCTAGGATTTGGTCACATTGAC-CCGAGCCAAAGCGCATTT-----------CAATTGTTA--------CGTTTTACACACACCACGACAGGCACACACACACACACACACAAACAC-AAATAAACATAGTACGC
>CG17922 17200268 17200351|17484 chr2R 17200271 17203788 scaffold_16 2689625 2693240 + 153412|0 80
GATTTCATAGCCAATTCCATATTATTTGTCTAACTATTGTAACAAAATATTCTGCGATATAAACTTTGTGTGCATAACTAT
TGTTTAGTCCTCGAATATATTTTACGTGTTATACTA------------ATTCTGCGATATAG---TTATGTGTATGTCCAT
>HmgZ 17205133 17205703|17487 chr2R 17205014 17206138 scaffold_16 2695473 2696748 + 35426|153 925
ACACG-GTTGCATCCATCGCAATGGGCAACGTTTTTCTGCATAAGTTTTAAAATACATTTTATTAATGTAATTTTTTAAGTGACAAAAAAAACCCACAAAATGAAAACCAAGAAAAAAACCTAATTAAAAACCAAAAAAAAAAATATGAAAAAAAAACAAAGAAAAACCGAATTAAGACCTTAAATCTTTAAATATGCACCAAATCCATAAACATGCAAACACACACGGATACACACACACACATGCCAACACACAGCATAAATCATAAAGA-----CTAAGTTAAAGATGTGAAGGATCACACAAAC----------------------------------------ATTATTTCCAGTCATCTGTTCTTTATATTCTAGGTTTGTACGTATAAATGTAACTATATGTATGACACTACTCCCAAA------------AACACATACAGC-CCACT--GCCCCCGATGGGGGGATTCCCCGCGA----CCCCCTTTAGCAACT-----TTCGATCGCGTCAAGTTATTTGAATTTT--------GAGTCCCTCGATTCGAGAGCAAAAAGTTATATA---------------------------------------------------------------TATATATACATACATT----------------TTAAACCGTATACATAAATATATATTTAAA------------------TATATATATTATGTAATTTAA---------------------------AAAGG
--ATGTGCTAAGGCGAATGCAAT-GGCAACGTT----CGCATCAGTTTTAAAATACATTTTACTAATGTAATTTTTTAAGTGACATAAAA-------CAAATGAAAAAC--------------------AATTAAGAAAAAAAAAACACAAAAAACACAAAAAAAAG-------AAAACCTTAAACCTTTAAATATGCACTTA------AAACAAACAACCACACACACACACACACACACCCAAG--AACCCATAATATAAGTTACCAAGATAATTTTCAGTCAAAAAAAGAAAAAACAAAACAAACAAAAAAAAAAAAAAAACCAAAACAAAACATAAAAAACAAAACAAAAACTAGCAACTGTTTCTTTA-----TAGGTTTGTACGTATGTATGTATCTAC---TCTAACGCGTTTCTCAGATTCCTCAAGTTGGCCAAGTTGAGCACCATTTGGCTCTCCATTTGG---TTGCACATGAGGTTTTTTTTTTATTAGTTTTTTGTTTTGTCGCGGCATCTAATGTAAATGTTTGTGCATAGCGTTCCACAGTTTGTAGGGGAAACGTTGGATAGGATCAGTTGATGATGCGCAGTGTCCAAAGAATTGAGTTCTGAGATGTTTGCGTCCAACGATTCCTTTATTCGTCCTTTTAGCAGACGTTCTCACTTAACTTGCATACA-AATTATAAAGTTTAAACCAACAATCCAACAAGTTATATATACATTTTAATATAATACATAAGTATATATATATATGTAATTAAAAA
>CG30403 17217029 17217690|17503 chr2R 17216938 17217035 scaffold_35 661608 661708 - 3613|94 100
TTGCAAA
TTACAAT
>CG30403 17217029 17217690|17504 chr2R 17217412 17218284 scaffold_16 2712630 2713414 + 5076|0 295
GTTTCTTTTGAAAATGGTGGAGATTAC--ATTCCTT------------TAAATGAATCTGTGAATATGGTT-ATACGTTATCTGCTTGTATAATTTGGCAGAAAATCTTCATTGTACAATTAACCATGCTTATGTGCTGTGTGTTCTTGTTTAAAAACACTCTTGAAGTATCATATTGGATTAAAATCAACGACAAAGCAACCTCATGTTATATATAA-GTTATATAATTTATGATAA-GTGGAAGAAAAATATATTTTTGTTCATACCAAATCGAAAAATTCGAATTTAAATTTA
ATGAATCTTATAAAAGATACAGCTTAATGGTTCCGGTTAACCGGAAGATAACTGAAGCTATAAAAGTACTTGATGCTTTA--------CAGGAAACAACAGAAAA-----ACTATACGAATATCTTTGC-----TGCTGCTTATGTGTGATTTAA---------GAAATATTATTT---------ATGAATTTCCTAATAATTGTTGGTTAAGTGTAATTTTAAATTATTTGAGACAATGTG-----CAAATATCTTTTAAAAAATAAATATCATGCAGGTTCATATTTCAATTCA
>CG30404 17224357 17224999|17510 chr2R 17223957 17225367 scaffold_16 2719113 2720747 + 18937|491 1320
ACGCAATGTAGAGCCCACTATGATGGTTA----------GCGATCTGCGCTGGGTGCCAAGACAACCACCTTGCTA--TGGACACCCTTTTTGGAACAGCTTCTTTCGTTTCTTGAC----------------TTTTGTGTTTCTTTTGTGGAAAGGCTC---TGAGAGAGACTTTGTT--TTTTGTTTGCCATAATTTTGTAGACTAAGCTCCGTAA-TAAATAAGCGCAACATCGTTCTGTTTTGTACACCGTGGAAAACGAAAAAAACAAAGGCCCCCATACTTAATTTGTAAGATCTGGCACTTAAGGAGCGTGTATCTAAATCTAA--GCTTT-------------AATCTCTACGTGT--TTCATCTGAGCAGCCCCCAACACGAA-------------------------------TCCGAATCATCACAGCAGCATTGCATTGAAAAGATATTGTTTAAAAGGGTTGTTTATAT-----TTTAGATCTGT-------------------TAACATTTGATA----ATCCCAAAGTGAAAACAAGAACTTTAATGGTATTTG-----------------------------TATGCGAAATCCCATACGATAAATAGTTA--------AATATATACATAAATATAATATTATACACTAAAT--------CCCACAGAAATCATTGCATTGAT------------------------TTTTGCATAACTAGCGGAAACGAAGGAAATCCATTTAG----AGTGTAGCATGAATTCATAACGATATTTAAAAT----AAAACGTTTAAAGTACCAAAACAAACC
ATGGAGCCCGGGCTGCAGCCTGATGGTGCTTTCCTTCGTTTGTTTTCCCTTTGCTGCATACACACACGCAACGCTAGCCGGGAAAACT-----GAGCAGTTTTCAATGTTTGCTTACAACTTTTAGTAATTTTTTTTTTTTTTTTTGTTTGTAAATGGCCACAAGAGAGAGACTTCGTTAGTTTTTTTTGCCATATTCGTTT----TAAGTTATGTAATTAAATAAGCACAACCTCGATATG-TTTATCCGTCGTGGAACCC--AAAAAACAAAG--------CATCAATTTAAATAATTTTGTCAATACATCAAATCGAATTAAGTCAAAATGCTTCTTCTTATACGCAGAACCTGTACTTGTTGTTTTTGTGAACTGTCGCGACCTTGAACTCTTGTTGGTGTGTGTGTGTGTGTGTACCTTCCGAACCCATCCAA-AGCACGGAACTGAA---ATATTGTTTTATATACATATATATATATATCTATCGATTTGTGAATTAATCTAATGGCGCCTAATTTTTAAAATCACATTTCAAAGTTGATCTGAATTCTCGTGTGCTTTTTGTTAAATGTAGTTTTTAGCCCAAACATTGTTAAACATAATCGCATG-GAGTAATATTTGAGCCCAACAACATGAAACTAACGGTATTTCTATGCAATAGATAAAGATACATAACATAAAACTTAAAACTAATGAATTTTTGATGGTGAAGTTGAAATCTAGCGAAACCAGC-AAAACATATGAAAT-CATTTAGCTTTAGTGTTCGATTATTGGAGGATGATATTTAAAACAATAAATAAGTAAAATGTTTCAACACTTGTC
>lox2 17297198 17297368|17596 chr2R 17297066 17299364 scaffold_16 2796765 2799145 + 77404|156 346
AGGGTGGATGGTTAGGATTAAGTGGGCGGTGGACTGGAACCAAATCAAGAAGTGCCAAATACAACGATTAACCAAAGGG----------GGCTTGTATATTTT--CTACACC---TATGTATGTCTTTAACCCTAACTCGCATGCGATATAATTAAATGTGCACATCTGAAAACTCTTGA-----ACTGAA
--------------AGATCTGCCGAGC------TTGGAGTT---TTGAACAGTGCCAAATATTATGATTAACCAAAGCGTCAAGCGTAAAGCGTAAATGTTTGTATTATACTAAGTACATACTGTTTTTACTGAAATAAAACTGC---ACAATTTAAGGTCGTCTTCTAAGTACATATACCAAATAATGAA
>CG4386 17306909 17307229|17603 chr2R 17305570 17307281 scaffold_16 2808211 2810080 + 47323|1404 1869
CGAACATCTGGCTATTTCTGTATCTATTAATAGTT--------CAATACTCTTGC---TTGGCTGGCAATGTTTAATA---------------------TTATATCAGAATTTG---TATCTTCCATC-----CAATG------------TGAAAGACAAGTTTTCATTACAAAAAGCTTGTTATTT----------------CCAAAATCACTAATCTCATATGCCAAGAAACG---AACTATTTTCGCCGAAAATAACTATGCAATTTCTTGGGATAT------------ATGCTCCAAAACTTTTTG---CCACCCTTGCAAGAGTAAGT------------CAACTTCGGCTTCGTCGAAGATCCC------------ATTTTCAAGCTGTTTTA---TATTTATTGATTAAAAGAAA--------------------------------AGTTTCCATAAA
TACAGACTTCAGCATTCGTAGTAGTAGTAGTAGTGATGCCCAATAATACACTTGCAAATGGGTTAGTTCTTATTAAAAGTAATTCATAGCAGCCTTAAATTAAATCAACACTTAAATTATTTTCAATGATGCGCAATAACTATTATTTGACGAAATCCAAGTTTTTATATCCAAAAACTT-TTATTTTTTCGTGAAACCTCCGCAGAAATATTTAAGACAAAAAGCAATTGAAAGTTTAGTTTTTTAATATTAAAAAAACTAGTTCCTTTCTTTTTATATGTTGCGCTTATTATCCCACAAAATTATCAAAATTCACCTAAATTAAAGAAATTTGTTAGCAAACGCATCTGCAAGTGTATTAAAGACTTCGACTATTCGATAATATTTATATGTCTTTACCTTATTTATAAAATAAAAAAAATAAAAAAAAACACGAATGAAAGACAGCAGTAAAATGTTCATAGA
>CG4363 17341802 17341880|17633 chr2R 17341614 17342707 scaffold_16 2846019 2847108 + 19184|219 297
TATTTATAATGAAATATTTGTATATGGGTCAAGAAATAAATAAAATGCGATTATAAATTATATACAACTAAAAATTGAA
TTTTAAGGCTGGAGT-------------TCACTAAAT------AATGTTCCTCTATATTCCTGACAACAAAACAATAAA
>CG4377 17343028 17343077|17634 chr2R 17342785 17344244 scaffold_16 2847771 2849198 + 11034|282 336
ATTTTAAATAAATATATGTAAATAAAGCG-----AATAATCACTTGCTTACTGAA
TTGTTCAACAATCAAAAATAAACAAAATAAAAGCAAAAGTAAATTATTGATTGCA
>comr 17372449 17372572|17674 chr2R 17372572 17372752 scaffold_16 2881288 2881497 + 1343|0 0
G
G
>PpN58A 17388934 17389055|17692 chr2R 17386919 17389016 scaffold_16 2900490 2902711 + 16780|2369 2465
TTATTTTTTTAAACCA--------TATTGTAAATTCCATATTCCAG------TTAGCGTTATAAGAAGCACAATTAAAATATAAACAGTTGCAATTC
TGATTTTATTAAATCAAAACTACGCATTTTCAATGAAATATTTATGCTTACTTTTGTGCTTTTGAATGCAGAAATTAATTA-AATAATTTGTTTTTT
>PpN58A 17388934 17389055|17693 chr2R 17389017 17390290 scaffold_16 2903407 2904658 + 35403|0 38
AGGTTTAAAGATTCGTCCGTTCGATCATTGTAAAGTAGT
AATTTTTATAACTCAACAAACCCGTAATCATTGACTCGT
>CG13499 17512565 17512689|17845 chr2R 17512472 17512862 scaffold_11 1063356 1063747 - 20408|113 237
CCTGCTGGTACCGCTTCCGGACGCTGAAGGGAGCGCCCCGCGACTTTGTGCTGCGTCTGCGATTCAAGAAGTTCAAAGTGGGTCAGCTGCTGAATGCAACCCACTGCGAGGGCGGCTACTTGCAG
CCTGCTGGTATCGTTTTCGCACCCTAAAAGGCGCTCCGCGCGACTTCGTGCTCCGGCTGCGCTTTAAGAAGTTCAAAGTGGGCCAGCTGCTCAATGCCACCCACTGCGAAGGTGGCTACCTGCAG
>PpD5 17549249 17549394|17898 chr2R 17549133 17549338 scaffold_11 1105916 1106127 - 1132|116 255
TTATTTTGCTTTCAATTGCGGCTTAATCG--------------------AAGGACAATTGAAGGTCGG----GCAGACCCCAAAGAAAAGTG--------------------------TAATAAATCTTCATTTAAATTT
TTTTTTTTTTTTTAACGGCAGCTTAACGGCCCACGCAGGACGCGAACAAAAGGACAAATGAAAGTCAGAGGCGCTGAGCCGAGAAAACAATGAAAATTGAAATCCAATAAGAAACCAGCAATAAATCA-AATTTAAATTT
>CG11475 17577305 17577366|17930 chr2R 17575904 17577308 scaffold_11 1142719 1144150 - 57918|1482 1485
GTAG
AAAT
>CG11475 17577305 17577366|17931 chr2R 17577309 17580350 scaffold_11 1144319 1147501 - 72746|0 65
ACACAAAAAATGATAG-------TCGGTCTCA-TTAGATTTCCCAATTAACAGCCCATATTTATAT
GGTCACAAAAGTATAATTTAAGCTCAGTGTAAGCTAAAAAGGCAAACAAATATTTAGTATTAATAT
>CG11474 17578995 17579137|17931 chr2R 17577309 17580350 scaffold_11 1144319 1147501 - 72746|1841 1983
AGAAAGAAGGAAATCAGGACAAGGAACAGCAAACTAGTTGAATTGTTTTAGTCGTTATAAGCTTAGCTTAATTGTTGAAATTCAGAGTGACCTATGCGAGATCCAAAACGAAATTATACTCAATTTAATCATTAACACTTCAA
AGTGCCCTGAATATTACCATTATATAAAACTA--TAGCTCAAATGTT---GCAATTTTAGGCGTAGCTTAATTGTT----------------------------AAATCAAATTTTCACT--GTTCAAATA-TAGCACCAATA
>CG2921 17581119 17581176|17933 chr2R 17581037 17582836 scaffold_11 1149163 1150944 - 46587|93 150
TCTTGTACAGGCTGGTCAGCTTAAATTATTGGTAATAAATAGTCGTTACATATCTAGA
TATATTAAGCTCTG-------TATTTTATTAGTTTCGA--AGTCAATCCAAATATAAT
>CG13502 17593251 17593473|17941 chr2R 17592553 17595046 scaffold_11 1163725 1166257 - 60792|899 1130
TCCATCCAGCTGCCCAATACTACTGACTTGTTCAGCTCCCGGTGTTAAGTTTCTGTTTGAATTGAGTTGGCTTGATAAGCTGGTATTGAATA-AATAAATCAATTAATTACGAAAACTCTCAGGTAATTTTACTTGACTCTTGTATTGAGT--------TTTATTAACTTCCAATGCATTTTGCGAATATTCACTTGGAGCAGCGACTACGACGGTCCAACTTTTTTATTTT
TCCA------AGCCACATGC-----ACTAGTAGAAGAATAAGTGTTAAGTTTTTGTTTTGCTTGACATCAATAAATAA-----TAATAAACATTATTAAACATTAAATTGTAATTGTTTGCAGCCAACATTCT----ATTTTGTATTATATGCATCATATTTATTGATTT-------ATTTATCGATT------TTGGATGATTAA--ACATTTATACAACTTCATATTTCT
>CG11073 17599066 17599216|17946 chr2R 17599136 17599905 scaffold_11 1173153 1173990 - 13101|0 104
AAGGCAGTCCAGGAGT------------------------TCGCAAATACTTTAAATTATTTATAGCCCATGTACATGTACCTATGCTAGAGCTAAGTAAAGTAA
GAGGCAAT-TGGGCGTGGCCTTTTCAATTGCATGCAACTACTGCAAGTACTTTAAATTATTTATAAA------GCATGTATGTATGTTAAAGTTATGAAAGTTGA
>CG13503 17615163 17616059|17965 chr2R 17613561 17617635 scaffold_11 1188224 1192627 - 30282|1850 3009
TCGA-----------------------GTGTGTGAGCGAGTGTGTTTGT-TTTGTGAGTGTTT-----TATTTAAGTACATAAACATTTAGATGCATTG-------TAACTGCGA----------------------------------------------------------------------------------TTATTGTTATATACACAC-CACACACACACACACACACACGGAATGCTGTTATATAAT--------TAGTTTTCTCTTAAGGCACACGCTCCGGCATTTTAGTTTCGAACTCGAACGATCTATACAACGATTCGTATATCTAAATAATTTTAATTT----------TAAAAGTGTAT----TACTACCAGTATAGATTATTAT-TGTATAGGAAGGGAAAGCCCAGGCTTACAATCCACAGCACACACATATATATGTTAAATCCCGCAGAGTTTA------GTAATCTTTTTAATTATTGTTGTTTATTTTACTGTTAACAAGCAATGAAATGATTGCGTAAAGCGCAG-----------CGGAGGAATGTTATTT---TGTATATTGATTGCATA-ACACTAAAGTTGAATAGCTTTATCCAAACAT-TATATAT-----TTTATAAATTTTAATGTTATATTTTGTTACATTTCAAAAGGGAAGGACTATGGAAGCTTCCCCTCGCGATATTACCACTAAGCACACACA------ATATTATTACGCATAGTTATATTTTTACCCA-----------------ATCTATAC-TATAACTTTATATGTACGTGTATATGTAAACAGAAGCCAACCCATA---------TTGCATTGTATTTCCCTGCGCCCCCATTTACATTTCTCCTACA----TGTAGCGCATGCCTTTACTTT----------------------TGTACCCGGC----TATCATTTTATA-----------TATATTGTACCTACCAACGTCTCTATATATATGCATA-----------TATATTATACCCGATGAATA---ATTTTTAGTATGCAACAGGCACATTACGAGTAATTGTTTGTTTTAGTTTCGAAGTTATCTTTTGAAGAAACAATAAACC------AAAATTCATTTGGATAAAATACATGAACAT
AGGATGTATGCATAAGTATGTGAGTATGTCTGTAAACGTGTGTATGTGTATGTGTCTGTGTTTGCGTATGCGTATGTATGTGTAGGTGTAGGTGTGTGGATCGATTCAACTGTTAAAGCAAACTCACGCGCCGTGTTTACGAATTACATATTATGATTATGTTTATTAAATATTATTAAAGTTATTATTACATAATTTTATTGTTACATGCACACACACACACACACACACAGACACGGAATGCTGTTACATAATGATATGCATAATATTATTATTA-------------TTATTTTTATTATTATTATTAATTATAAGCACACCA---CATATAT-TGTAGCATTTGAGTTCGATGAGAAGATAAAACTATATACAACGATGCAATTTTAAATTGTCCTCTACACACAAAACGAACACACACACACACA---CACA-CACACACAGAGAGAACAACAACAACACATATGCTATCAAATGTAACGTTACAATTTATGATTATGTTTAAAAATGTTAAATATATATAAA-----TATATAAAAAGTTGATAGCTTTATTCCACATAATTTTGTTTAAAAGCATATTTTTTACATACATACT----TTGTACACACATACACACACACATATATATATATATATATATATGTTAAGTATATATATATATATATGCCAAGATTTGTATGTTAGCAAAG---GCAACAGCGATATTATTACTAAGCACACGCATATTATGTATTATTATAGAGACCCATGTTTACACACACACACACACACACACACATATATATATATATATGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTATGTTAAGCCTCATACTAGAATTTGCATTATGT----CCAAGTCCTCA--TGCATTCTTTCTGTATTTCTGTAGCGCATGATTTTACTTTATGTATTGTCGTATGTATTGTCTACAATCGGCTTCATTTTATTTTATATATGATTATCTTATATCTTATCTATAAACACACGTACAAATACGTATGTTGTTGTTTTTTTTTTTAATATTGATGAATATTTAATTTTAGCAC---ACAAGCACATTATTA--------TTGTTTTA--TTTGAAGTTATTAT---GAACAATAAAAAACCAAATGGAAAATTGAACTTGATAAG--CCTTCAACAT
>GM130 17632152 17632341|17983 chr2R 17632060 17632632 scaffold_11 1212083 1212715 - 8595|92 311
AAGAAGTGCAATTATCGCCTACCTACGTATAATCATTACCCTTTTGC-----TACTGTATTTAATTGTAATTGTAATTGTACTTTGTTCTTCA----------------------GAGTCTTTTGTAAATGTTTCCAACAACTTTGTGCGAATAAACGTAGTTTGCATCTAAGAGGAATCTATAAAATGAGTTCCCCTAAAA---GCGTATTAACAAATA
ACAA------------GACAACGAAAATGCAAATGTTAACATATTGTATTTAAAGTGCAATTATTTGTCAGCGTAATCGCGTTTTCGCTTTCACCGCCCTCTGTAGTTTATACACAACTCTTTTGTATATGTTT-CAAGAATATCAAATAATCAAAC-TAATTGGGGCTTACAATAGCTCTAAAAATAAAATATATTTAAAATTTATGTGGTTACAATTG
>CG13504 17637911 17638086|17988 chr2R 17637681 17638556 scaffold_11 1218019 1218987 - 16682|285 478
TCAAGTCCTATGCCGCTCCAGCCATCAGTTACGCCCATGCCGCTCCAGCCATCAGCTACGCTGCTCCCACGGTGGTCAAGTCATATGCGGCTCCAGCCATCAGCTACGCAGCTCCTGCCCTGGTTAAGTCATA---CGCTGCACCTGCCCTGTCCCTGGGTGGATAC---------------GGTTACCACTAA
TTAAGTCCTATGCCGCACCAG---------------------------CTATCAGTTACGCCGCGCCAACTGTTGTTAAGTCCTATGCCGCCCCAGCGATCAGCTAT-CAG--CCAACTCTTCTGAAATCCTATGCTGCTGCGCCAGCTCTGTCATACGGCGGATACGATGATCATGGCTATGGCTATCACTAA
>CG3045 17680387 17680455|18033 chr2R 17676521 17680455 scaffold_11 1270062 1274119 - 148092|4186 4259
TTTATTTTAATA-TAAT--GTCATTGAAACAAAACGT-ATATTGCTTTTCAGGTAAATATATTAAGGT-TGTAT
TTAATTTTAATAATAATAAGGATTGGAAATAGAATTTCAAGTCTGTGTATAGGTACTCATTTTACGGTAGGCAT
>CG3074 17697403 17697941|18045 chr2R 17694062 17698119 scaffold_4 4056495 4060818 - 174659|3536 4220
GGGGAATCAGAGGGCCTACGCCTCGCACCGAGCAATCTCGAGCTATGCAGAAATTAAAACAAATTTATCTCATGCTTTAAAATTTTCCATTTGCTGCTATATGGCACTCAAAGTGAATTAGGCGCTTCTATCTGTAATGTTTATGCTTAGAACCTAGTGACTAAAAAT-ATTAGCTTTAAGTTGCGCATACGCACCAA----GTTAACTGCCCGC-------------AGTACCAG----------------------------------GCCTGTCCCTAACCA-------CTCTCACCCACTAACTGGTCTCGAA--------------GCAACACGAAACTGCCACCCAACA-------------------------------CCGCTCCATCCCCCG-----AATACTGCCACACCAATCAGAGGAACCGGAAGGACACGAACATCCAGCACCCTTGTAGCGCATGTGAT------------------TGATGGAAGGACGAATAAGGACGCGGAGCTAGATTCGA---------TCGGCGAGAGTCTGTAGGATATGTACGAGTGCGAACTCATCGTGTATTGTAAATGGAAGCTAAGTTAACTGATTGATTGATAGACCGATGGAAATTAGTCGGCTT----------ATATATTTTTAATAAACGAATTACTTTACAT
ATGGAGCCGAGTGGCAAACTTCTCGTA-------ATCTCGAGCTATAC-GCCGTGACGAACAATTTATCTCATGTTTCAAAATTTTCCATTTGCTAC-----GACACTGAAAGTGAATTAGGCGCTTCTAATTGTAA-ATTTATGCT-AGAACTTAGGTACTAAAAATGATTAGCTTTAAGTCGCGCTGAGACGACAACATTGTTAACTGCCCCCCGGGTCCAAGTCCAGCTCCAGCACCCAACGAAATAACTCTTCAACTTTTATAGCCACCTCTCCCTGAACGACTAATTTTCTGAGCCCTCGATGGATATGGAACTGCAAATCAATTCGTAACACGAAACTGCCACATATTAACCTTACCGTCCTGCCCCGAACCACACACTTCCTCTCTCTCTCTCACACATAATACTGCCACAGTAAATAGCAAATC-------ATATTCTCGTCGAAGGACTTTGGAAGTCGCTTGATCCACCAATCAGGTTATTTTGAACGAGACATGATATGAGATGCGCAAAGGTATTCAAAGAAATGATTAGGAACGAGTTGGGTCTACGTCTACTTATCCACACTCAT---GTATTGTAAATGAAAGCTAAGTTAACTGATTTAT----AACCGGATTGAACGTGTTCGGCTTTATAATGTATGTATATTTTTAATAAACGAATTGTATTTCAT
>CG3292 17711276 17711313|18059 chr2R 17711022 17713108 scaffold_4 4079943 4082102 - 71190|291 331
AATTTTAATGAATCTATAATA---TAGAGTATTTGGAAAGC
AAGTGCGTCGAGCTCACAAAACGCTAGAAAAGATAAAAAAA
>CG3290 17713587 17713713|18060 chr2R 17713649 17713728 scaffold_4 4080152 4080270 - -182|0 77
AAGATACCATGGA-------------ATATATTCTACTGTAACTATAGGAGATTTGAAGTAATCCAAAAGACAGCGCA
AAAAAATCATTAATTTTGAGCTCGTTACGTAACATACTGTAACAATAATAAA--AGAGATTATCTAAAAAAACTTGCA
>CG3264 17716489 17716583|18063 chr2R 17716397 17716540 scaffold_4 4083781 4083926 - 1374|92 145
TCTGTAATAAAAAT--GTAGCACACATAATGAATGTGTGTATGTTTTGAATTAA
TTTTTAATACAGATCGGTAGCAGAAACTTAACAGATGCATATGCTTTAAATTAA
>CG3264 17716489 17716583|18064 chr2R 17716559 17716610 scaffold_43 358255 358306 - 874|0 24
GAAGGCAGAAAAATCTGTTTTCAAT
TAGAGCGAATGCTTCTCTCTTCCAT
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T
A
>Oatp58Dc 17731263 17731384|18079 chr2R 17730563 17731269 scaffold_43 575863 576529 + 7754|726 732
CAACAGT
CGACAGT
>Oatp58Dc 17731263 17731384|18080 chr2R 17731270 17731929 scaffold_43 576862 577572 + 27692|0 140
-CCTAAGTTATTATTACTCCTAAGTGCTG--TGTGAGTG----AGAGTCTTGGTGCCTTGATT-------------------TGTCAATATCCATGTGTGATTTCCAACG-TAGAGTCCAGTACCATAATAAACGGTATTG
ATTTAAGCTAACGCTATTGTTAAGTTATGATTGTGAGTGATTTATTGGCCTGTCGTTTAGATCGTATGTATATATATATTTATATATATATATATATACGGTTTTTAACGTTGGCGTCGGTTGGTATAATAAACTGAATTG
>wdp 17805795 17806487|18181 chr2R 17805828 17806324 scaffold_43 685476 685959 + 4931|0 572
AAATGCAATCTGATTGTGCAACTGGGAACCGGGGTGTATTCCCTCCTCAGCTTCATCACCAGCAAAATAGGGCAGCAACATGTGCAGCAGCAACACGTGCAACACATGCAACATCTGCTGCAGCAGCATCTAGAATAAAGCAGAAGCCAAGGCGACGAAAACAGTAAACTATTCGAGTTAAGCACCCAACTCCCCTCTTAAGT-----GTGACCGACAAGTAGTGTTTTAGCCATAAGTAAATTAATTACT-CCTAAGCGTAAATCTAGTTTAATACCAAAGTTAAAAAAATATATGCGTTTAAACAATGAATTCAGTCGTCGAGTGCAAAATATCAATGAGCCGGGGA-AAGCGGAAAGGAGTTAAC--TCTTTTGCATGATAAATGCTAT-CAATCTGCATCTGCATGTGATGTTCACACCA-----------------TACTTACTGTA--------------TATGTACTTTTATA-----ACCTACCTATATG------------------------------CTGTAAACTACTTAAGCTGCGTTCTCTTGTGAAATTAAAATATGT
AACTGCGCTCAGAGTGTG----TGGCAATCG--------------------------------ATAATCGATAATCGATATACG-------------------ATAGGCGATAACGG-TGC-------TTTGCAATGAAGAGCAAACAA----------------CAACTATTCGTTTTAAGCTCCCGCATCCCCTCTTAAATATATGGTAACCGTTTTGTA--GTTTTAGCATTAAGTAAATTAATTAATACTTAAGCATAAATCTAGTTTAATACCAAAGTT-TAAAAATAT-----CTTAAATGTAAATTTC--CCAGCAGCTGCGAAATACAAAAAAAAAGATGATAATCAGAAATGGGCTGATGACGCTTTGCAACACTATTTTTCTACTACTGGCATATGCATGAGACACACACACACCCACACAAACACACGATTACTTACTATACAAACCTGTGCATGTATGTGCATATATATATATACACACATATATATATCAATTTATATATGTTCTTTATATATATTTTTATAATATTTAAGCTGCATTCTCTTGTGAAATTATATTGTGT
>wdp 17805795 17806487|18182 chr2R 17806374 17808551 scaffold_43 685987 688193 + 74562|0 113
TTTGAGCTAGCCATCCACTCTCGACACAGCCCGACCTTTCCGACTCGCCCCCACTTAGTTACCCATTGCAATCCGATCGCATTTGACAGAAGAACTGTGTTTTATACGCAAACA
GCTGA-----------CCCCTTGGAAAAACCC-------------CTCCCCCCTTTAGCTGACC--TGCAA-------GTGTCAGGCGTGAGAGACAAGTGCCAAGCGAAAACA
>T3dh 17837308 17837843|18214 chr2R 17837137 17839271 scaffold_4 4941741 4943875 - 58908|173 771
TTTGGAGCCAAAACTTACCCACGCTCAACTTGTTCTCTTGAAGAAAAAAAAATGTTAAACTAACGGATCTTCGTTTAAGATCTGACCATACTTGAGCTTTCAAAATTCTATTTTTTTTAAGCGTATAAAAAGCTTAGAGTGAACCATTTAATTTTGGTTGGACTTGTGTATATACGAAAAATACCATTAAAAACCCTATACAGAATCACAGGAAATTT-----GATGCCCT----GCTTGATTTTTGTTTAC-TTTATG--TTCTTTGT--------------CGCAATGGATCTTATGTACATTCAGCATTATTTTGTGGCCTCTTTTTTGGTCTGCAC-TTCGTTTGAGAATCCTCTACTCAGTTTGCTTTCCTAAGCTGCAGGAAGAAGA-CCGACGCTGGGACCAAAAATACTATGATATA-----------AGATATTAATATTAATATAATATCATACAAATCATACATGATAT---CATATCATTAAAACAAAAAAAAAAGGATTAAATCCTACAAA---------------------TTAGTTGCTCCAAAAAAAGCTTGTAATTTTTGTAATTATAATATATTTTAGACT
TTATAATTAAATAGCACCTACCTCTCAAAATTTTC-------------ACAAGCCAAAACTAACGGATCTTT-----AAAAATGAAGTTGGCTGCATTGACGAAAGCTTTCGCGATATCGATACATAAAAAA--------GAACAGTTCG---TGAACTGAACTAGTTCAT--------CATGCAATTACACAAGTTA--------CAGGGGAAATTTAAACAAATGACCTTGTAACTTAATATTAATTAACATTTATGAATTATCTATAAACCTAAACTAAACATCAAAAGCCACTTGCAAATGAAGCATCATATGAATATATCTTTGTTATTGAGCATAATTGTTATAGTGTACACTCTTCTAATTG-----------GACATAAAAAATATCCAAATCCTAGCGCGCGAACATTTAAATCTAGTTTTCTTAATGGCTTTCAGTTTCGTTAACACAAATTACAA--TATACTCAACATTTACAGACAGCAAAATCAGAAAGAAAATAAAAATATTTTAACAAAGCTCAGCATAGGATTTTTTGTTTACTTTTTCGCATTACGCTCGCAATTTTTGT--TTAC-ATACAGATCGTATT
>CG11206 17841086 17842009|18217 chr2R 17841027 17842932 scaffold_4 4957121 4959168 - 25665|59 1147
GAGTGAAAAGCTAGCTAG------------ATAGGATTACAACTACCACTACCAAAGATACTCAGCTGTACTCCCGCATGAAAATCCCTTTCACC-----CCCCCATAACCCATTTACCCTTTCAGCTGCATTTGAGCTTAGAATCTACAAGCAA---------------------------ACTCAATTATATTCAAGTCAGTGTCAGACCCACCTACAAGATACAA----GCATTCAGC-AGCTACAGATACATATGCGTCAAGTAATACAAGATAAGCGAGTAATCATTTGATCAAATCAGATAGAAATTCGAACTATATGCT---AAACATAAATAACGACATAAT-TATAT-------TGTGTAGACTAAGCCCCAATCGCAGGCAA-GAGAAGTAAGGATCGAATCAACTCGAATCAATTCA----------------------AATCGAATCAAAAACTCCACCCCAACTCCAACAAACTGCAT--TAGTCTAATCAATCACATATATGTAATTCTA-ATTGTAATTGTAACTG---TAAAGATAGCTCTAAACCGATTTAAAAGTGAGAGGCAGATTGCGTGACGGTAATATACTCACTGAATTACAAGCCGATTTGGGCACTGG------------AGATGCGATTGCAATTTAGATAAATTGAA---ATTATTTTGTAACCG-------AAACTATC--GTAGCTAAGCAAATGGAAACGGAAACT---ATTGAATTAAATTTGATAAGCCGCAAGATGCGGCACTTTGTAAATTATGAT-----AAGCCCTAAGCAACGT---TCAAT----------ATCGCATGGTAATGGTAAAATCCGAAACAGAATCAAATATA--TGGTAAAT----ACAAACGCACTCCCCAAAAA----------AAACCCTCGCACAACCAAAGAAAGTCAGTCAGCCTGCTTTATCCGCCAATCAATCA------GTATCGAAGAATCCCCGAGAGCGTCAGGGTATCATTAAGCTGACCAATTTAACTGTAGACCTAT-------GTCGAAGAAAACTATCGAATAAACCCATGATCAAAA--CTCT
ACATCTGATTGCAGCTAACATATTCCCTTTATATGATCGGAACCA--------------GCTAATCGGTA-TATCATATAAAATATTATTTCACCTATTTCCCTTACGCCTCATCTGGCATTCCAAAGTGA--TAAGTTAAGAGTGAACAAACCAAAGTTTAGCGATAGTAATTTGAAAAGGATGCGATTAGATTCAACTCA-----ACACCCACCTCAAAGAAATTACGTTACATTCCACAAGATACAAACACACAACCACTAAGCA--------------------TATTTGATTAAATCAGATTGAGGT--AAACTACAGAACAGAAAACTTGAATATTTATTGAATATATATGTGAAAACATATAGGATAAGTTCTA--TGCACGCAATTAAGAGAAAACATTTAATTAA-TTGAATTAATTAACCACAGAGCATTCGGGCCATTTGCCCGGAAAACAAGCTCCAACTAAAAACAATTTAACTTTATTATAGCCTAATCAAAT---CGTATGTAATTGTACATTTTTTTTTTAAATGAATTTCATTTAATACTCGACCACAATTGCTGTGAG---------GCGAGTGGGCAATATATTT----AAATGTCAGCGGAGATTGGATTTGAAATAATACCCTTAAGCGTAATTGCAATTTAGATAAATTGAAATTATTATTTTGTAAGCGCCCAACCAAACTATCGTGTAGCTAAGCAAATGTGAAACCACCCCCAGAATAAATCAATTTTGCAAAAGTGCAGTATTGTGCAAATTGTAAATGGCTATTAATATAGGTCTAGGTAATATAAATAAATATATGTATTAATCACATGTGTATGT---ACTTTTCAACAGAATTAATTGAGACTAACAAATCACAGCAAACGTAATCCGCAATAGTCATACTGTTAAACTTTTCCAAAATATAACTGAAATATCTTTCCTACCATTACGACAACTGAAACATATATTGTATCAATAA---TATGAGAT-----GTTTACTTTTAAGCAGACCAATTTAATTCTAGATTTACAATTACAAGCCGATAATATAAACGAATAAATTAATGATCAAAAACCTCG
>CG3624 17901644 17901809|18273 chr2R 17901575 17902505 scaffold_4 5057965 5058964 - 11855|77 266
ATTAGTTTAGTATAACGC------TGGTGGAGCACTGCC----------------ACCTCTTCTACACTCTCCACTCTTCTCACAGGAAATGAGCATTTGAAGTCTTTGTTGATTGTAAATTTTTGTA-TTTGTAAAGACACAAAATCAACTTTATTTATTAAATAAAAAAGGA-ACCAAAGTAAACTTA
TTAAGTTTAATATTAAGCAGCGATTTATAAAACGTAGCCTGGATACACTGAAATTGCATCTCTGTCTCCCTTCTGTCTCCAAACGCTAAATAAGAATATTAAGTC-TTGTTAATCGTGAAATTTTCTATTTTGTAAAGACAAA----CGATTTTATTTATTAAAAACCAAAGTATACAGAAGTACATTTA
>qkr58E-3 17917085 17917468|18286 chr2R 17916786 17918657 scaffold_4 5078916 5080807 - 43661|329 773
TAGAGCTCCGGTTGATTTCGTCGCACACCGCTATAAATGAAAACAAA-GGACAATGCTTACGT-TATAAAATCCATGCTGGGAGCACATTGAAAATACTTTAATCAAGA-------AGAAAGCAGCATTCAAAATGATGCTATCAATT---------AATAAACATTAATATTTAT--------------AAAACGCGCACTTG--CGCTATCAATTCCCACAAACAATATTAATCTTAAAT---TTGTATATCCATAAATATG-------------------TTAAACTGTTGGCATGCCTTTTCTGGACCATTTCA--ACAGATAATAAGTCAAATAATTC-CTATTATGTTTAAATTATGATTTCCCGAGTTCG--TAATTTTCTATGAATGTAATAAAATGATACGCATTGAATGAATTTAATAAATTCTCTGCAATCAGA
TA-------------------CGCAAATT-CTCTAAGAAAATATAAGTTGAAAATACATACACATATAAAAGGACAAGCGAAAAAGCGATGTAATAGTTACAAAAAAAATAATGCGAAAAAGCAAAAACTCTAAGAATAATATTAATTTGAAAATCAAGAAAACATTTCAATTTATTTTGGCCTTGGATGGAAACACACTTTTGAAAGCTACCAATTCCCA-ATGCTAAATAAATATGAAATATATAATACATTAATGAATATATATCAAAAGATAAAAAGTTTTTAATTTCTATTATAATGTTCACGCCCTATCACACTCCCTGTAAGTATTCACATAATTCGGCACGTTGATGGATGTGAGCATTCCGAAGGCCAATTAAATTATTCTTACATTCGAAAACTATTTAACTAAGTATGAAGTGAAAGAAATAAACGAAATCAAT
>qkr58E-1 17920490 17920776|18288 chr2R 17919433 17922148 scaffold_4 5081407 5084265 - 50574|1296 1664
CCCATCGATTTTCCAA----AACCCCAAGAAACCAACCT--------------CAACAACAACTACAACAACAACAACAACCACAACTAAACAATGTTAAGCGTAAAGATTAAAATATATTCCAACGAAATATCAAAATGT-TTGAAGT-CAACAATCCAACTATTCACACCTA-------TTAAATATAATATATAAACGAAAATCAAATAAAAAACGTAAATTTTTATTGCAACTGTTGTCC--GATATTCAAATTGTGTT--TAAAATTAAAACAAGAAACC-------------AATAATGCAACAAATTT------------------------TATC--------------CTCAAAAAGATT
TTTATA-----TCCAAATCCAAACCCAATCAACAAAGTTAAGTAGTTTGTATCCATCGACAAGCAAAAAAAAAAAAAAAACAACAAC--AACAACAACCAACAACAACAT------------CAACAAAATATCAAAATATATTAAAGTCCAATAATCCAACCAATAATACATACACTTACTTATAAATGAAAACCAAACAAAATTTAAATGCAAAACCTA---TTTTATAGTAATTGTTGTTCAAAATATTTAATTTGTGTTAATCCAAACAAAAAAACAAACCCACAAATATTAATAATAATGCAACAAACCTAGAAAAAAAAAAAAAAAACAGCTACATCAAACTTGAAAATATTTTGTAAAAATC
>mRpS29 17926519 17926702|18292 chr2R 17926397 17926587 scaffold_4 5088906 5089138 - 3517|159 233
AATTCAAATTGGAAATTTATTTAACGATAATCAGCAATACATAATGATGCACAGTAC------TTTCGTACGTTT
AATTCAAATTGTGAATTTATTTAACGATAATCAGCAATATATAATAATGCACTGTAAAATAAGTATAATGTGTGT
>mRpS29 17926519 17926702|18293 chr2R 17926600 17928595 scaffold_4 5089411 5091439 - 61565|0 116
AGAGCGA---------GTGT---CCTGTATTTGTTAGCCAATAAAGTTAAATGATTTGTTATTTACC--ACAACGATGCGGTTTGCTTGCTGTACGCTCACGACTCAATTTGTAATA
TGCTCAACAGCACTTGGTGTTAGTTTGTAAAAGTTGATTAAATAAAATACATGATTTCCTACAAACTGAACAACCAT---TTCTGCT------------ATGAAACTAATTGCAATA
>CG10344 17933314 17933785|18296 chr2R 17933219 17933584 scaffold_4 5091440 5091841 - 3918|95 415
TAAATA--------TCTGCTGT-GCAGTTCCTACC------TGGGGATCCCGTAAATGACTACTGTGACTTTGGCAACCTCTGG----------------CTGGTTAAATGTTAGTCTTAAGATAGTGAAGTTGTAACCAATACCGCCGGACAGAACGGACGCCTGGCCTTTCCATTCCATTTCACTTTCATCGATGACCAATATCATGTTTATATGAAAGCACATGCTACCCTGTACAAAAATACCTAAGAGATCTTCCACTTTATTTAAAG------------TAATATATTTA-------AAATACCTTTTGTGTGTA
CAATTAGTGGTTCTTCAACTGTGGCGAGTCCTATTGTTCGATAGGAAGGCCATATATGAGGACAGTTACTTTGGC-ACTTCTGGATTCGGCATCCGCAAACTGAGCGCAGCTCAAACGCAATGTTGTGTAATTGAAACCAATACCGCCTTGAACTATCGCTGCTTTTATAGTCGATTCCGGTTGACTTTCATCAAAAACCAATATCAGATTTATTGTAAACTTGATACTGTCCTTTAAAA-------TGAGCAGTCCATCTCTTTATTTAGAAACTAGAATACTTTAAGCTATTTACCCCGCTCAACGCATTGTCTGCATA
>CG10344 17933314 17933785|18297 chr2R 17933585 17934611 scaffold_4 5094857 5095879 - 27935|0 200
GGGGCGGTGTTTCCGCCGATCGCACTAAGGAGAGCAAAGAAAAGTACGACAGAGGAGTGTATCAAAATCTAAGGAGCGTTTTTGGAAACCGCATGCATTTAGCGTGGCTGTCCCCACTGATTCGCAGCGATCTGCCGGAAGACGGATACCACTGGAATGTCCCTACGAACAAACAAGACTAAGACTGATTAGGATCTAGGA
GCGGTGAGGTCTGTGCAGAGAGCGGCAAGCAGCACACA------TATAACAATGGACTCCATTGTAATCTGAGAAGTGTTTTTGGCCAACGTATGCATGTCGCCTGGCTATCACCTTTGGTAAAAAGCCAGTTACCCGATGATGGCTACACCTGG---------ACGATCAACTCGGCTGAAAAGTCAATGGAAACCAAGA
>px 18004080 18004384|18358 chr2R 18004054 18004311 scaffold_11 2044389 2044679 - 4560|30 319
ATCGGATCGGAACTAGTTAACATCTACCTTCAGTAACATTATACTAAGCGATAATTTAGTTGTTAGTCGAGCCTCTTAATT---------TATACAAGAAATTGTAATGTATTGC--------CAGCGCCGCTTAGAT---------------------------------CCAATTCTAAACGTTATAATC-----CTTAGTTATCATTATTATTTC--CCTATTTAA-TGTGAAGCGTATACTTTTAGAAATGGCCTGAATAAATAATTTTTGTTTACAATTATTTGA
GTGAGATCGAAACTAGTTAACATCTACCTTC---------------------AACTTAGCCGTTAATCCAAATGCCTATTTATAAACGAGTATACAATAATTTGTAACGTATTGCATCATCCTCATCATCGCCTAGGTGGAAAACAATTACCGTGTTTTTTTAAATACATGCTTATTATTAACATTATTATTATATACTTATTATCTATTATGATTTCTTTTTATTTAATTGTCAAATGTTTGCTT---AGAGTTGCCCAAATAAATCA-TTTTGTTTATAATTC----A
>px 18004080 18004384|18359 chr2R 18004384 18006434 scaffold_11 2044771 2046837 - 65154|0 0
T
T
>Dnr1 18071089 18071701|18442 chr2R 18070754 18071089 scaffold_11 2130789 2131109 - 5470|387 387
A
G
>Dnr1 18071089 18071701|18443 chr2R 18071090 18071312 scaffold_11 2131259 2131458 - 2940|0 228
TACGAACTTCGAGAAAGTGCTATTTAAACTCGTCTAAGACTTCACTGCATAGCCTATGCCTAGAATCTATAACTGCAGATTGTTTCATATTCATATACACACTGTATACTGTATACACATAGATATATTTACGATCGTTATAGATCAGCGATACCTTATACGATGTAGCCCT----TGAATGTACAACATAG--TTACTTACTAAATGTTAGCAATTTTACCAACTAAA
TGCGA----CGATAAAGTGCTATTTAACCCTAACTAAGACTTAACTACTTAGCC-----------TCCTTAGCT-CGTAATGCCCCATATACATACATACA-TACATAC-ATACATACATATATATACATATAGCC--TATACATAA--------TTATA-GCTGTAAAACTAATGCGAATGTACAACAGGGCCCTGTTCAGTCAAGAAAAACAAAAAAACAAAAAAAA
>Dnr1 18071089 18071701|18444 chr2R 18071429 18071512 scaffold_11 2131459 2131525 - 1518|0 83
TTGAAATCGATTCGAAGCGGCGTAGTCAGTCTTTCAAACAATCTTAGCTCTATCTTTACTCAAGTATTCTAGCGACATAAGCAA
TTGAAAC-------ACACACCTTAGCCCGT----------ATACTCTCTGTATCTTTACTCAAGTATTTTATGGATATGAACCA
>Dnr1 18071089 18071701|18445 chr2R 18071607 18071840 scaffold_11 2131602 2131903 - 7191|0 108
AATTGGTTGTGCTCGCTGCTGTTCCGGCTGATGGAATGGGTGTGCGTGCCGATTGTCTGA---GAACCAACA----TGATTC---ACTAGTGC----TCTATGACCACA
AATTGGCTGTGCTCGCTGCTGTTCCGGCTGATGGAATGGGTCTGCGTGCCGATTGTCTGATCTGACCTTGCAGTCGTGATCCTGATCTCGTGTTGAATCTATGACCATA
>CG4294 18108378 18108584|18476 chr2R 18107994 18110292 scaffold_11 2167117 2169793 - 30416|573 811
CAAAGTCACTAAAACACTAAAAGCATACATAATCCGTAAAATAACGAAAAAGTGTAAAAGCGTGCTTGAATTCTGGTAAGTTGAACTCTTCACGCGACTTAATATTTAAATGTTGCTTTCAGTCAACGTTAAAAAGAAATAA-------ACCCACAAATCACACGCC--------------CAGCAGACGCAGAGAAGCATCCGCCGGCG-----------TAGCGAGTGCTAAACCAT
CATTTTTGTATAAAAACTAA--------ATAACCC----AATAAC---ATTCTAAAATAGCGTGCTTGAATTCTGGTAAGTTGAACTCTTCACGCGACTTTATATTTAAATGTTGCTTTCAGTCAACGAGAGACAACAACAACAACAACAACAACAACTACCACAACAACTACTACAACAACAACAACAAAACAAAAACAACAACTAACAACAACAACAACAAAAAAGTATCAAACAAA
>CG4329 18116915 18117024|18485 chr2R 18116806 18120414 scaffold_45 484207 487933 + 182670|169 326
ACATGCGAGTCTA---TGTGTTCTTTAGTCAA--------------GCATA-------------------------------ATCTATTAAAATATGTATTTCACATTGGACTTATCGAGAAATTTAGTTGAACGACATATATACATACAAAATGGCA
ACTGGAGAGTCTAATGTAAATGCTGGAGTCAATGGAAATGCGAAGTGCACAGCAGCTGACGAGTCTGATTGGAAATAATCTTATATAAAAATATATGTGTTTCACAAAGGACTCATACATACATGGGATT--------TACATACATACAAA---GGT
>CG17807 18141601 18141658|18500 chr2R 18138717 18146787 scaffold_45 515474 524060 + 259257|3262 3378
-AAGATTACATTTATGTAA----------------------TTCGTTTA------------------------------------TTTGATTTC-AAAAATACACATTCACACAATT
TAAAAATAAATATATAAAAAAATGTTTGCAAATTAAATGTGTTAGTTCAATACGTAAATCACATGTTAATTAAGTAATTCGTTTATTTGATTTCAAAAAATACACATCCATATATTT
>Cdk9 18143645 18143768|18500 chr2R 18138717 18146787 scaffold_45 515474 524060 + 259257|5460 5635
ACT-----------------------GCCAGAGGTGTACGCACCCGACTAATAGTTTCT----------CACCTTCAACTAGCGTTAGGTTATTAGGTTAGTGTA---CAATAAAAATATTGGCATTTGCATTA-----GCGCTTG-----------CTCCAAATATACCTACATT
AATTTAAGCACTATTATTATGATTAAGTTAGATGTGAACATATACAATTGTAATTGACTGTATATGCAGCGGTTCAAAGAAGTCTCGGATT------TAAGTGTATATCAACATAAATATTTTTAAATATATTGTTAGTGCGCTGAAAAGCAAACATTTCCATACAAAAC-ACATG
>CG3732 18146387 18146619|18500 chr2R 18138717 18146787 scaffold_45 515474 524060 + 259257|8463 8740
-TGCAACCGTAC---------CCTTTAGGAACT----TCTCTTTA--------------------ATTGCGTCTGTTTTTACACATTTTTCTAAGGCAATCA------TGCTTGCCTTCTTATTTATTTGCCAGTATGCGCTCAGATGATCATGACATAGGGTACGATGTCCAGCCTAACTCTTAAAGTATAATAAAACATATAA------TTTAAGAAAACCAGCATTTACATTTATTGTAAGACACCGTAACATTAAAGAATCGGGCCTAATTGAA
GTTCACCCGTTCGGCGCTAGACTTTCATCAATTATAATCTCCGTATGGAGAAATCATGCTATCATCTTGTTTTTGTTTTTCTTTCTTTATTGCAAAAAAACAAAGAAACGTTTGTTTATTTATTTTTCTA--AGCCTGCGC-CATTTGCCCACGACATG--------TATTGAACTTTACGCC----GCATAAGAAAATCAATAAAATCAATTTAAGAATGTCATTGGGCGATTTTATTGCTTGGCAGC----CATTAAATGATC------AATGGAA
>RpS24 18148103 18148281|18503 chr2R 18147668 18149006 scaffold_45 525071 526404 + 37812|457 660
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AGCAATCCGCTAACCTCGTATGATTGTGTGTGTGTGTTGCTGGTGGCGCGCACCGACAATTCCCAATTTAGCTGCTGGTTATGCGTTAGTCTAACTTTT----AAAAAATTCAACGACAACAACAGTAAAATCAGTTGTTTACTTTTTGGAGCGGCTATTGTTTTATATGCTTAAGAAAATAAAACTCTAAAAGTAAATGCAGC
>Ugt58Fa 18149478 18149531|18505 chr2R 18149499 18150417 scaffold_45 526549 527472 + 28767|0 35
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ATTTTAGTTGCAAATTAATAAAAGCCAATGCGAACA
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TTTGTTTGTTTTGCATTTTGCCAGATTCAAAGCATTATCAAT----CCAATTAGAATTAGAGTACTCTAGAGTAGAGCAGCAATCGATTTTTCTCAACGTTCGAGT------TGGGTTTGCATTTAAAATAATAATTTCTACACTAAGCAAATACTCG-GCTCAAAAACTATTCTCAAATTTGTAACGTCTAGAAATGCATTGTATTTAACTATGTGATAAA
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-----------GGTCAATTAAATTGATATAAATGCCACACA-TAGTTTGTTT--TAATTCTATTACGCATCTAACTCAATTAAAGACCCGC--TCGCTCGA
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TTGGTTTTATTGATC-------ATCTACCAAGATAAT
TTTGTTTTGTATATCTAAACTGTTTGTTTAGAATAAT
>Cyp6d2 18160155 18160262|18518 chr2R 18160187 18160411 scaffold_11 3302050 3302295 - 3466|0 97
AT-CAAAAATAT---------------------GTGGCTATTGTATGTAATTGCAATTTGTATGTATAGATATATATCGATACTCAAATAAATTAATA
ACGCAAAAACATTTTTGAAATCTGACAGCTCAAGTGGTCCGTGTGTGTGCATGCCATAAACATATATAGATATAGATAGATATATATATATATATATA
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>CG30217 18163405 18163934|18521 chr2R 18163088 18163881 scaffold_603 4131 4945 + 13358|361 871
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TACGCTATTGTTATTGTTAATTTTTAAGCACCA---ATTGACCCTGCAATGCGTGG-GAGAGCCATCAGTATTTGTTTTTATTTTTGACGGAGATGAGCGCGAGCAAGCTCTGCCTCTCTCCCTCTCTCTCTC-----TCGCTCATATGCCGTGCCTCTCTGTC--------GCTCTTTTGCTGTGAGTGTTTCTTTGGGCTG----ATGTGGTGTGCCGCCTGCCGCTGCGCCCAGTCGCAATGTCAAGCGCGCCGAACATGTTGGACGAGCTGGAG---------CAGCAGCTGGATAATG-TATCC--------GCTGCCACGGCCACACTGGAACTGGGCGAGGAGCAGCAGCTTCATTCGTCGAAGCCGCGTTTGCGCTTCTATAGCGTTGGGCCCAGCACCTATCGCGTGCTCTGTCCGCTGTGCCAGCATCGCTCCCGCTCGGAAACGGTGCAAATGTCCGGCGCCCTGGGGCAGCTCAGCTGTCTGCTGTCCGCCCTGTCCTG
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ATGTAAAGAATTATTTAAATGGATTTGAGAACTTGAAGCCTTATAAAGGAAAAAGAAATGGAAGTGCTTGGCAATAATTGCTTTATAAAACGAAAAGAATC----CAAGTTCTATTCATTTCAAGTAT--TTTATGTACTCAAGAAAGTGAAAACTTTTCTG-GCCGGAAAAACGCACACACCTCATCTAATTTGCTTACAGGGCATAATTATGAAACTTGGCCC
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ACAAGATACACTGAAAACTCATAGCTTTCGTTTGCCATACCACACGCTGTACTAAA-TTTTTTCGTACGAATCGAGTAGAAAACGAAACAGCAAAAGCAACAGCAGAGACAGAGCGCAGGCGAGCGAGCCAACGACAAAGGAGGGAGAGCGGCAGCGGGAGACAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGGCAGAAAACAACAAACGCCAACAACAAAAAGCAAACAATGA-----ACACAACACACACACATATACATATACATACATACGCAGACA--CAAGCACGGC-AACGGCAACAACAACAGAAACAGCGACTGCGACTGCGACTGCTACGGCTACGGTGTCATGGAGCTG-AAGCTCTGGTCTGGTCTGGTG-TGTTGTTGCTG
>ppa 18193107 18194686|18564 chr2R 18194613 18196396 scaffold_11 3363869 3365709 - 107242|0 84
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TGCGTTCACCATGAACTGCCATGCCTGTGCTGCTGCCGAGGCATAAAATCGGCACCAGCTACGCTTATGATGCACCAACTCAGCT
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AGTTTAGTTCAATTTGTTTTC-TATTTAAATTTGT-GTATTTTTCGTTTCGTGTTTCTCACTTTAATGTGTGTGTGCGTGTGTATAATAATCATTATATGATCCTCATCATGATTACGTTTAATTTCCGCTCGTCTCCACACACACATACACACCCCCACAACTTACCATCTAACAGGAGTCAGTCCATCGCAG-GCTCGACCGCTTC---------GCTTCG----CTTTGGCCACAAGTTCGATTTTGTCCCTGGTCTGTCTGT--GGCCCGCGTCCCCCTGCTGCAGCTATGTATA-------------------CATATCTATTCTATATGT-ACGATT---GTGTGAGAGGATGGCTGGAAACTGAGCAAATTTTATAAAAAAAAAAAAAGAAAGAAAAAACGGAAAAACCGGTGAGCAACGAGCGCATTTGCTGGCTGAAGATATCGGCGTTGCCTCTCAAAGTATTTTAAGTTACTTTCCCAAAAAATAATAAAAACGGGCAACAAATTCGCCATTTTACGCATATACATTATATTATATTTAGCTTA---AGCAATATTTGGATTTGTCAATTGTGCTCTGT-------GTATTAAATCAATTTATAAATAT-----AAATATTTTACGAAAATCCAATAAAA
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CATA-AATACCATTGTGATTTTAAACTGTTTTTATACAACAACATTAGCACTGATTACGTTATTACAAATATACATTT
CACATGATA----TGTGATTTTAACAATATAATATATATAAAC----GTACTGATT--GTAATGCCAAATATGTAGTT
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>CG13535 18371618 18371812|18742 chr2R 18371614 18372589 scaffold_4 4898799 4899715 - 21415|4 203
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AAATCGAGC--CGTGAGCTCGGGC----TCGGGCAGAGCCCAGCACAGCCCTAACCCACCCCGGC------AGGATGTCAATTTCTCAATTCATAAATAAAACCCAAAGCCCTTTGAATGTGTCAGCACAAGTGTGGAAATTAC-AACCATGCCCATCCATGGGCATGGGCTGATTGGAGTGGCCTCTATGCCTGTGTAT
>CG3501 18388929 18389106|18754 chr2R 18388060 18389529 scaffold_4 4917081 4918688 - 45987|1066 1256
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--GTATGTTAAATTGTTAGCAAATGTGCATTTCCGATCAAGTAGAGCA------TAGCCGAGGGCAGA-----GAATTTCAACCTTGCAATTTAATTTATTGTATGTAATTACAATTGGATTTCAGTAATCTTTAGAATAATGCATATAAGTTAAATAACATTCAACTAATTAATAAATAATCAATTCTTT
>CG3499 18390578 18390761|18755 chr2R 18389996 18392502 scaffold_4 4918743 4921317 - 104914|689 874
TTCCCCCATCGGTGTGGTTTGATGGTGTTCAAGGATCCAATTGGAAGGCCGGGTTGGTCTGCCACCGGACATTCAGCTGAACTGCTAAATAT-TTTTAGTTACAATATACATATATAAAAAACCGGAGAAAAAAACCA-AGCAAGAGCGAGACGCAGACGGACAGTTAAGAAATAAAATGTTACAC
T-----------TGTTTTCTGATTGGCTTCA---------------------GTTTAACGTGCACTGCATATAAGTACATATAATTACATATATTTTAGTTACAATATAAACGTA-AACACTCTGAAAAAGAATACCAGAAAAAGATCGGGACGCAGACGAACAGTTAAGAAATAAAATGTTATAA
>Gmer 18395172 18395225|18758 chr2R 18395127 18401751 scaffold_4 2553345 2559970 - 285050|45 100
-TGAATAT-TCCAACCCCAAAAAAAAATGTAAATAGAC-AACGAATTTTCACAGAA
ATATATATATATATATACATAATTGAATGTGATTAAAAGAATGAAAGGAAATATAA
>Nup214 18426536 18426646|18785 chr2R 18426293 18429805 scaffold_1 6547355 6550943 + 48640|257 395
GTTCATAATAAATG-----TGTTGCATAACTCAAT---AGTTTTGCTTGTTCAGTTTT-------CATGAAATAAGAATACC---AGTTAAAATTAAAAATCTTAAAT-------CTTAAATCTTTATTAA---AATTA
--TTATATTTGTTGGTCGTCGTTGATTGAATTAATGTAAATTGAGTTAAATAAATTTTGATTATCTATAAATTAAAATTATTGTAAGTTGTATGCAGGACTCCCAAACAGGTGAACTCGGATCGATCCGAGATCATTTG
>CG3788 18439628 18439717|18794 chr2R 18439653 18439822 scaffold_20 2466656 2466842 - -746|0 69
GAAGTCCTTCGTATCTA-----AGTAAACGGTTCTGAATTGCTAGTTCAAAGATCATTAAAGACATCTCT
AAAGATCATTGCATATACATCGGATATATGATTTCAAGTTACCTTTTGACTCATATGTCAAACCAACTCT
>CG3800 18442173 18443614|18798 chr2R 18441532 18442710 scaffold_1 6564672 6565784 + 12209|811 1355
CTCCATCCAGCTGCTGCCGGCGAGCCTTGGGAATTATCCAGGATCTAAGACTGTAAGACAGGATCTGTAGACAGTAACCAGTATCCCACCCCTATACCATTAACTCCATCCACATCCATACCATACCACACACCCATCAGCCAAGACGCCTGGCAAGATCTCTCAAGCGGGGTAGC-ATGCTATGTAGCTCATAGCTGTGGAGCCAAAGGGGGCAGCAAACAAGAACAGAGAAGCAGACAAATAACAAGAAGAGAACATCAACAATGGTAGACATACACGACGACTTTGAAAACGGAACGCAACGCTGGA-GAGGATGAGCTAAGCGGTTAAAGAAGCAGACAAGCAAGCGGCACTCAGAACACTCAGTGGGCAGATGAAGAAGACAACGGCACACACACACCTTCAGTTCAGTTCAGTTGGACG-GACGGGACACAA---AAGATGCGAGACCGAAACCTACGTACGATGAAGGAAATG-AAAATTCAAATATCACTGTGATTGTTTTTTAATTGTAAATTAAAATGCTGGAGCTGCTGATTTG
CTCCACAAAGCTGCGGCCGGCGAGCTTTTGCACTT-----------------------------------------------------CACCTAT-----------CATCAACA-------------------------------------AGCAAGATCTCT--AGCGGGTTAGCTATGTTAGCTAGCT---------------------GGCAGC-AACAACAACAGCGA-------AAACAAGAACAAAGGCAGTTAGAAGATGACAAAGAGAAA---------TGAAAATGAAGCAAAAAGCTGGATGAGGATGAGC-------------AAACAGACAAAC-------------------------TCAGATGTAAA------------------ACCTTT-------TTCAATTGACCGAGACAGAAAACAAGGCGAACTACGAGGATGATG-------ATGATGATGATGATGAAAAATTCAAATATCACTGTGATTGTTTTTTAATTGTAAATTAAAATGCTGGAGCTGCTGATTTG
>CG3800 18442173 18443614|18799 chr2R 18442737 18444472 scaffold_1 6565806 6567448 + 41312|0 978
GCGCCACCACCCACCCGTGGCACCTCATAAATGTAATCATCGAAGGAGGAATATGAGTAATAATTCAACACACGAAGAACAACCAGAAGAAAAGATGAGAACGAAAAAAAATGAAAAAAAAACGAAAAATCAATTTGCTACAACATTCACAAAGCCAGCCAACAGCAAC---AACATCTAGAAGCGATAGC------------------AGCAGC-------------ACCCAAGTCAAGATCAACCCCTTCAAAATAAA----GAACCCACAACCACATCCACATCCCTCC--------ATTAACACATGCA-GCATATGAATCCATAATCCTGAACATCATCC-AGTAAC-CATCGCTGATTCCAAAA-GCCGAGCCTGCAG-CGCGGTGCCAACGTCCCGAGAACTGAAAGAAGACAAGAAGTATTGGCTTTCCGAGGGAAAGCCGCCAGAAAAGGAATCACGGAGGAGGAAGAGGGCAAAGGCTCCTCGAGCGGGGGTCGGAGGAGCAGAACCAGAAGACGATAGCCAACGGCAGCTGTGCAGCCGAGAGAGCAGATGACACCGACGACGAGGAAGAGGATG------AGGTAGAAGATGAGGAAGAAGACAC-GACGACCCAATTTGTAAGATGAGACTAAACCACAACAGCAACAACAAAAGAAATCACCAAGCAAACCACTCTACTATAATTATACCTATATGATTA-TATGATTATGCTGCAA--GTGTTTGAATTTACTAATTAC-ATTATAACGAATGGAAT------GAAACTATATAAGATTATATAA---------------------------------AGAAAAATACCTTAAAGAATACTATTTAAAGCAAATGATCCTATTAGGAGTTCCACAGCCAGAAACAACCGAAAGAAAAACGTAAATAAAAATTATAAAAACCAATGAAAAAGCGAAGAATCAGGCGGCTAGAAGATCAGGCCACG
GAGAGAGCA---GCGCGAGCGCTCTCTGAGA---AATCAACGAA--------------AATGTTTT---------------GTCAAATAAAAAAATGAAAA-GAAAAAAAAT----ATATAATGAAAAAATCAATTGC-----------------CAGCCAACAACAACAAGAACAGCAAAACGCAAACGCAAAAAAAAAAAAAGAAGAAGAAGCGACCAATCAGTTAAACCAAGTCAAGATCAACAGACACAAAAACAACCCTAAGCACACGACCACACATACACAAACCCACACACAGACTCACACATCCATACACACACACATATATATCTAACCATCATCTAAGCAGCACATCTCTAATTCCAAAGCTCTGAGCCTGCAGTCGTAG------------AAGAAC--AGTGTATACAAGA---------------------------CAACAACAACAACAACTAGGAGGAAGC---------------------------------------------ACGATGAACAGCAATAGT-------CTGGGAGAAGAGAAGACAACGATAGCGCTGGTGGCGCTGTGCAGCTGCTGGAAGCAGTAGTAGAAGAAACAGACGTTGTATTTTAGTAGCT---ACT--ACCACAATAGCAACAACAA--------------------------------------CTATATTATTATTATTATTATGCTGCAAACGTGTTTGAATTTACTAATTACAATTATAACGAATGGAAGAAACAAAAAACTATATAAGAATATATAATTTACCTTAAACAAAAACAAAAAACAAAAACTCGTAAAAATATATAAAAGTATG-TATGTACTACAATGTATCCTATTAGGAGTTCC---------AACACGCAGAAGA------TAAATAACA---ACAAAGTTAAGTAGGAGAGCAATGAGGCGATCATCGATATGGATTGAGAACG
>CG3831 18446585 18446643|18803 chr2R 18446454 18447666 scaffold_1 6569251 6570537 + 57832|160 254
TATA------ACTCGTTGT---------------CATTTGTCTATAAA-------AATTAAGAATT----ATAGTATT--GTCTAGATTACAA--
TACAGTGAACACTCGACATGCAGCAGTTGACTTACATATGGTTACTTATAGCTTTAATAAAGATTTATGCATAGTATTTGGTTTAACTTACAATT
>CG32835 18459588 18459660|18820 chr2R 18459659 18460001 scaffold_1 6589741 6590087 + 2388|0 1
CA
CA
>CG32833 18491866 18492107|18861 chr2R 18491104 18491941 scaffold_1 5305029 5305899 + -638|838 923
TGAAAACGACTTAACTTTT---CCTATAAAA-------AGAGTCGCACATGCAGCTCTAAAAATCAGTTGTTTATAATGATTTGGA
TGCAAACGGCTAAAACTATACGCCTATAAAATATAATTAGTTCGATATGTGCCGATCGCTCGAGCAGATGCCAAATAGGAGGAGAA
>CG9896 18501263 18502283|18874 chr2R 18501262 18502637 scaffold_1 6643936 6645579 + 9803|1 1264
-TGGCAGAGGCACAGCTAAGTGCACAAATCTAGAACCAGTCTTACCAGAAAGGAAATTCGTGCGA----GAAGGTGAAGCGAACAA---GGCAAAGGATAAATAGTTAAGGTTTCCCCCATCACACCGAAAGAA----------GAATTCCACACG----CTGTTGCAT--ACTTCTGGCAGTCAGTTTAGGCCACAGAATCCCCGA---GAGGTCAAAGAAGTAAGCTATACA---GTAAAATACACGTTAAGTATGTTATGTATATTAGTATGCATATATCAAAGATCTATAGGGAATATGAGAGCAGAGTCAAGATCGTATATATATATGTATATATATATGCGGATATGTGTGTTACTATATAGTGGATATAGGCT-AGCTAGTTAGAATCAGTGTTGAGTGTGGCAGGCAGGTTAGTTGT--------TGTTGGCCTTACTTTCCA-------------GTCGTCGTCGAT---CGTGCAATACTAGAGTTTCGTTGA---GTTTGTTGAAGTTGTCCAGGCTTT--AAGTGTAGGCATAT-TTTAGAGAATA-----ACCCTAAGTTTCACAAATCGTTGTTAGCTGAAGTTAGAGCGCTCCCCACCCCCCCA---------CATCTGTTTTCCGT--AATACCAGGCAA------TATCAAAAATCGAATGATCAGATGATCGTTTGGAAACGCCTATGTAC-CTCTTAATAGCAGTATGTTTGCAAAGTCAGTTTTCGTTACTCACACAGCACTAAGCGCACAAGAAAATATCCCGAGCGGATTTGCTCACATATCGGCAATAAATTTAGATTAACAAAAAGTGCATTTCT--ATGAATC-----AGGATTTTTAAA-----------TTATTTATAA--ACCTATTTAGTGTATATTTATTT-CCCACACTGT-------------------------AAATACC----TTTAAATATATTCAAAAT--------------------------------------------------------CGGAAATACATATACGAATAAATATTAGTT--TAACTTAAAAATAC------ACTCACACACAAACACACACACCTACTTA----CAAAAACTGTGAATATATATTATGATTAAAGAGTAACATTTATTTTAAGTAAAA-------------------------------------CACACACATGCATATGC-----AAGGAAAAACAATAAAAAATGAGAAAATAAATTA
CTAGCGGAAAGCCAACAAAATACACACAACCACAGACCCACACACACATAAATATAATTATACAATAGTTAAGGTTTCTAGAACACAATGGTACAGCGTTTAAAGGTGCCAGTCCCCCCTACTTCCTGAAAAAAAAAACAGAAGGAAAACAACATGTTATTTGTTGCATCAACTTGCGG-GCTTTGTTTAGAGTTGCCAATCACAAAACTGAGTGCGAAGCAG--AGTTGTATAAGTGTAGCCTACTTATAAAGTA---AATGTA-ATAGCTAAGCGTATAGTCAGTGTGTACA---CATACTTTATAATAATAAATAT-ATACATATATATATATATATATATATACATATATATGTAACTGTACAGTTGCAGCAGGTTAAGTAAGTTGGAA--AGTCTTCA--TAGGTATATAGGTTAGTGTCTACAAATATGTTGAATGTTTCTTCTAGAGGATAGCAAATGTTGTTGGCAGTTGGCACTCAAAACAATAAGTGCAATAATATGTTAATTGAGCTGTCACAGGTTCTCAAAGGGCAAATATATATATATAGCATATGTATACAATATGTTT----AGTTATAATTGATTTGGCTAAGTGTGTTGCCTTCGTATCTAGTTGGAAATCAGCAATTGTGAGTTCAATTCTAATCAAATATTTTAGCTAAAATT------TCAGCAGCTGGAATACACACACACACACACACACACACACGCACAATATAAACACGCACAATTT-----------------ATATATAAAGAGAAAAAAAACCCACATA--------CACATATCGGCAATGAATT-----------AAAGTGCATTTCTTAATGAATTTTATAATTATTTCTAAAAAGGGAATAGTTAATTTGCAACTACGTACATTATGTATAACTATTTATTCAAACTTTATAATAAAGTTGAGCACTTATTTAAAGACACCAAAATGTAAATATGCTAAAAATGTAACAGTGTTTATAAAAATAAAAAAGGTATAAAAAAAAAAAAAACAAAAGCAAAACGGAAA-AAATATAATAATCAATATATGATAATGGCATACAAATATTACAAGCATTACAAAATAAAATGAACATTAGTTTAACTTAAAAAACTGTGA--ATATATTATGATTAAAGAGCAACATTTATTTTAAGCAAAAACTATACACAAACACACACGCACACACCAAAAAACCCCACACACACACACACGCGCAAAAAGTAAAAACAATAAAA----TGAAAATAAATTA
>l(2)06496 18569018 18569531|18956 chr2R 18569498 18572026 scaffold_1 6727190 6729758 + 86067|0 33
GCGGATATAGATCCAAAGACTGCTGAAAGTATTT
GTG---------CTTAAAATTGCTGAAAGTATTT
>CG9890 18570345 18570408|18956 chr2R 18569498 18572026 scaffold_1 6727190 6729758 + 86067|889 952
CTGAGATTTTTGTATTGTACAGTTTACGTTTAAAAGAAACTAAGTAAATAGCAATGGAATTTAA
ATAAAACCA--AAATTGTAAATTT---ATTTTAAAAACAATCGGAAATTGGCGCTGAAAGCTTA
>Fib 18580491 18580660|18965 chr2R 18580459 18582113 scaffold_16 1404466 1406059 - 66862|33 252
GAAGTCGTTTTCTG----CTGGGTTTAGTTTTAAGGCTA------------TTGTACTAATACAGACGAGTTGTATTAAGTTTC-TTTTAAATATA---------------AAACCGTAGTTATAAAGATAAATCAAAATGCACATTA---TTTTTGTAGCAGACGTACAAAATATAC---------ACAAAAACCAAATGCCAGT------GTAACAAT
GAAGTTCTATTGCGGAGAATGTGGTTAGGTTTTAAGCTATATACATAATACTTCTATTAATACAGTCGTATTGTATTAAGTTTCTTTTTAAATATACAACAAAAATCAAACAAACCATAGTTAAGTTTATAAAC--AAATGCAAACTATTTTTTTTGTAATTGACGTACAAAATATATCACAAAATAACAACAATCAAATGCTTTTAAATTAGAAATAAC
>Art7 18584284 18584379|18969 chr2R 18582689 18586612 scaffold_1 2501184 2505105 + 155900|1640 1746
CGTTATACCATTTA-----------TTTATTCACAATAATTTGGACAAATTACAACGTGCAACGAACGTCAGGGCAAATAGAATTGAATAAGTGAGCAAGCGGCATA
GAAGAAACCAAATAAAAAAAACAGATTTCAGCACAAGAATTTAGACA----------------GGACATGGGAATACATTGAA--------------------AACA
>CG9877 18593479 18593550|18979 chr2R 18593492 18594557 scaffold_1 2513332 2514255 + 8253|0 66
AAAGTCGAGAAGATGATTAACCCTAAGCC----TGTTCAATTCAAA----TAAACCAAATAAATATT
TAG---GAACCATTAGTTAACTCCAATTCGTAGTCATAAATTTAAGTTGCTAAATAAAGTGAATGTT
>CG9876 18597703 18597958|18984 chr2R 18597771 18598143 scaffold_1 2518225 2518589 + 14261|0 201
TGGCGCGGCTAGCTTTAATGGGCCCCATGAGGTTACTTC----ATGCATATGTATTTCAATTAGCCAAATTGCATTA--ATGCTTA--------AAAACGTATTAGGACCGGCATATTCGCCTACCTGACTAATATTTATACTTATACGATGCCGACACAGATGCAGATACATTCACAGATACAGATACAGATACAGACACA
TG--------------AAAGCTCCCTCAGAGATT-CTACACAAATTCAAATGTATTTTAATTAGCTAAATTGCATTATTATTATTATTTTTGATAGAATGTATTTTAACAGATTT------TTACCTGACTAATATTTATATTTATACAACATTAAATCGAATAT-GATGCACTAAACTAAACAAATGTAAATGCAAAAAAA
>CG3215 18636203 18636263|19030 chr2R 18635776 18638844 scaffold_1 2564532 2567702 + 57264|561 643
AGCAGCGGACTCGTC-------GTTTAAGGTGTA---------------ATAAGTTTTAAATAAATACATATAAGCATCAGCA
AAATTAAAGCTTATCCGATGAAAATTCACGTGTATATTTTTTGTTAATGTCAAGCTTCAATAAAACAAAATTTCACTTCAT--
>CG13544 18646676 18646738|19041 chr2R 18646206 18647015 scaffold_1 2578252 2578987 + 5952|490 554
ATGTCATTAAAACCAGTAGTCTCGTACCAAGTAGTGAAAATAAATACAATTTTCTA--ACTAAAG
-TGTCATTGATTCTGGTAAAAT--TACAAGGC------CACAAATAAACTATTCCAATACTGAAG
>CG30188 18672012 18672126|19075 chr2R 18671045 18673275 scaffold_1 2608586 2610898 + 37325|1233 1351
GAGTTAGCCAAAGAGGACATCAAGTGTCAGATCGTGTGCATTGGGGGGAGCAGCACGTGCACCACCAGCACCTTGGGCGCCGAGCGCACCACCATTGTCTAAGGATGAT----CGCGGT
GAGTTAGCCAAAGATGACATTAAATGTCAGATCGTGTGCATTGGAGGGAGCAGTACGTGCAC------CACGTCAGGCGCTGAGCGCACCACCATCGTCTAGAGAGCCTGCCCCAAAAC
>CG3162 18717725 18717748|19128 chr2R 18717744 18723564 scaffold_1 2660970 2666884 + 73209|0 4
AGTCG
TATTG
>yip3 18751633 18751744|19165 chr2R 18751089 18752343 scaffold_1 2702724 2704113 + 8834|740 851
ATCCTCCTACTATCTACATGTACATAGTAGTTAATTGTATCATTTCGATTTATGTTCATATAAATGAATGGTGGCTGCTCCACTGCCCCCCCCCCCCCTGTAATTAGCCACA
AT--TGAAATGACTTGGCTTTACA--ATTCTTAAATGT-TTATTTTGCAGCAT----AAATAAATTAATTGTTGATGCTCC----CCACCTGGCCTCAAATAATTAACCACA
>CG9871 18754192 18754384|19167 chr2R 18754194 18754248 scaffold_28 1403074 1403131 + 2187|0 57
TTTGCTCATTTGCT---TCAACATATTCAACGATGAAATATCAATAAAAAAAAAAAAA
TTTATCCATTTGCTGTTTAAACATAATTAATAATATTAAGCCAAAAAAAAAAAAAAAA
>ord 18778855 18779549|19204 chr2R 18779080 18779540 scaffold_1 2738514 2739011 + 4314|0 544
GAACAAATTGCATTTATCTGCCGTCTGCGGCTTTCACACGCAAATATTTCCATGTTCATTTTCTAATTACGCCACAGCTCACGGTCCAACTTCACTCCGGCTGCAAA-CCCATTCTTCAGCTCCATTTCAATTAGGGTTTTGCCGGCTGTCAGT-TGTTCGAGTGCCACTGGCGGAGCAGCCGAGGGTCCTTGCACCACCATCTGCACCACCATCTACCCCGACCCACAG---ACAGCAACTACAA--------------TGGCTGTCAGACGAGAAGCACGCGTCATTTGCCGGCGAAATGCA-TTTGCGCTAACCAAGACCATTTTTAGCCAAAATC---------------------------------ACCCGGTGACCCAGTT--------GCAAAGCCAAGAGC-----CCGGAGATACATCCTGATGGAATGCTGA----------------CTGACTGGCGGACGGACTTGAGTGATTGGCGGTTACTGGGGCAATTATT--TTGGACGCTGATGGGGTACATCATTCATTTGAAAA
GAGAAACTGGCATTTTTTTAAAGT-----GTTTTAACAG--AATTAATCACTTATCTAATTTCTGCT---GCCACA--------TGCAAATTTTTCTAGCTTGCGAGGCTCATTCTTTAGCTGCATTTCAATTAGACTGC--CTGTCTGTCAGCGTGGCCTACTGCTAGTAGCACAACGG--------------------------ACCGAAATATGCCGGCGACCACAGCTAAGAGCAACTGCAACAGTAAGCTCCATTTGCTTGTCAGTC-AGTGACACGCGTCATTTGCCGGCGAATTGCATTTTGCGCAAAACGAAAGCATTTTTAGTCAGCGTCCTGCATTCCACTTCTGCCCGTGTCCCTGTCCCTGCCCACTGACACAGATTAGAAGAAGCAGAGCGAAAGGATGTAGCTGACAGTATATGTTTTCCGCATCCGTATCCGTAAACCAACACGCTGGCTGACTGACTTGCCTGACTGATTGGTGGTTGTTTGCGCAACTTTTAGTGGTGTGTTTGTTGAGCCCAGAAACCATTTTAAAA
>CG3124 18790343 18790524|19219 chr2R 18790055 18790371 scaffold_1 2753531 2753865 + 11474|315 343
AATAGTTTATATGTTTATGGCCGAAATGG
AAAAGTTTTCACAATTTTCGCTGGCGGGC
>CG3124 18790343 18790524|19220 chr2R 18790445 18790722 scaffold_1 2754424 2754666 + 241|0 79
CGAAACCCTTGAGCCCATCATTAGTTGTTTTTGTACTTTTGCATGATTGGTGTCTCTTTATTTATTTGTTCCAAGACTTC
CCAACTCCTTG---------TCTGGAGATTCTGTTATTGAACCTGGTTGTGGTTCGGAAATTTG---ATTCCAAGCCATC
>CG3502 18851005 18851082|19291 chr2R 18850752 18854023 scaffold_1 2826896 2830175 + 51324|255 332
CCTACTTGATATAGCCTACTTATCCTGATATCTAATAAAATTATTTGTGAATTAAATAGGGCCATGCATTTAGACCTC
--------------------------------------------------------------------TTAAGACTCA
>vir 18867863 18867992|19309 chr2R 18866909 18874159 scaffold_4 2208091 2215332 + 308721|977 1106
GAGGACATTGCAGCCCAACCCGCTTCTCACTGACACTTCCCGTAAACTCGGCAAACGAACCAGAACTAGATCCTAAGATGCCCGCTGGGCAGCTGAATTCCAATACTTAATAGTGTGTGTTGCTTTCGTA
AA----------------------------------------TCAACGCCGCAAA-----------------------------------------------------------------TATTTTTGTG
>CG3493 18878951 18879442|19311 chr2R 18877616 18879645 scaffold_4 2079771 2081836 + 44711|1396 1951
CATGAACTGATGGCTCTCTACGGCGGAGATTGGAACTGGG---AGCCCTGCCCGGTGGCGCTTCTAGACCGCAAA----------------TGATGTCGGAGATCACAAGTACCTTATACTTATACCTCACCCTCGCGCACGGCATGGGTGCTTCCGGCTGACTCTGCAGGCATTTCGAGTAGTAGAAGCCGCTGATG-TATGTGTATGCCGCAT-----------------CCTAGATCCATGT----TATTGTACAGTCCACGAATTAAGTATAGCTACTTCTGTCCAAATCCACGCTAAGCACTTTTGTACATTT--TGATTACGCT----TTCCTTTGTTTCATTCACTTGCTTGCGCTCCATGTCCCATGTCCACGACTTACCTT--AACCCCAGCCTAACCTAA---GTGCAATCGTTT---------TGTGTATTTTAGTTGTAAGTTTAAATTTGTAAAGATCCGCAGCGCAGTTGGCATTTAGTTTAATTCAAAATC---TATACAATAACATACATAAATAAATAGTTACAATTCATAAAAGGGAA
CAAGAATTTTTGGTACTCTACGGAAGCAGCGGCAGCTGGTGGCAGCCTTGCAATGAAACGCTTCTAGACTACTAAAATCAGAGCTGAACCGTTTAGCCCAAGTTCACAAGTACCTTA--------CCTCAACTTAGC-CACAG-GTTGTTGCTCACCGCTG--CATAAAGGCATTTCGACTTGAGGGCGTTGTTAATAATACTTAAATATCATACTGCAATATTTGGACATACTTACATATGTGTAGCCCATTGTACAGT-----------GTCGGGAAACTACAGCAAAAATAACCGCT---CTATTTTGTACATTTGACAACTATGCTAAAATATCTGTGCT------GCTCGTTTAACACCAACTCCATGCTTTTTCCATTTACCGTGCAATCATTTCTACATTTAATGTGTGTATTCCTTGCTAATTCGATGTTCATTTTAGCTGTAAGTGAAAAATTGTAAAGATATCAATTGCAGTTAGCATTTAGTTTAATTCAAAATAATATATATAAAAATATTCATAAATAAATAGTTACAATTCATACAATTTA-
>CG13551 18885460 18885648|19315 chr2R 18885557 18887915 scaffold_4 4144205 4146795 - 61712|0 97
GCGGTGATCCATCCACCGGCAGAAGGCGACCGCACGGACGGATGAACTCGAGACATTT-ACTAAAATGCATTTCAC-----TCTCTTTTGTATGTTCC
GCACTTAAAAACACCCTCGAAG--------CACATAAAACTATAA---CGTGACATTTAACTTAATTGCATTTAACGTTTATATTTTGTGTATGATTC
>CG30415 18893272 18893577|19324 chr2R 18893098 18893338 scaffold_21 1165150 1165373 + 825|185 252
AAATTCATAACTAGCAGCATTTAATTGGATTTATTAAAGAATAGATTAAATTATATTCCACAACT-GA
AAATTCATTTTTAAAGGTCTTTGTTTAAATTTACTTTCGAATTGATGAAAATATTTTTGAAATCTAGG
>CG30415 18893272 18893577|19325 chr2R 18893485 18893568 scaffold_4 2075242 2075334 + 2726|0 93
AACTTAGTC-TTAATTGTCGCATC----AACATTTCAGAGCTGTTTGTGTCGGACCCAACGTGAA-----ATCGGCGAATAAATGATTTGAAAC
GATTTAGTTGTTTAAAGTTGCATCTATATACATTTCAAAGCTGCATCAGTTGG-CTTAACATGAATATTGATTGGTGAATAAATGATTTAAAAC
>CG30415 18893272 18893577|19326 chr2R 18893569 18893616 scaffold_4 4153830 4153877 - 2048|0 8
GCGGCCAGT
GTGGCCAAT
>CG3530 18896606 18897120|19329 chr2R 18895215 18896681 scaffold_4 4291980 4293504 - 64214|1506 1585
CCGTAAATTATGAACTACGCATCAATCTTGTTTGTCGATTTGATCAAA-GTGTAATAAAAC---TTATTTATTCAACAAC
CCGTAAATGGT--ACTATGCAAAGAT-----------GTTTGATCAAAAGTATAATAAAAAGGATTATTTATTCAACAAA
>CG3530 18896606 18897120|19330 chr2R 18896882 18898482 scaffold_4 4293983 4295662 - 76315|0 334
AGGCAAGGCAGGCAGGATC----------------------GAGGAATGGAGCGGAGCTAG--GGTGTGCAATCG--------------------------------------------ATATGGAAACGCTATTAAAT-------------------TTATTGT-GTGTATTTATTGTTGCATTTGTAGACTTAGCTGCTTGTAGAAGCT-----CATTCAAGTTGTTGCAAATGGAAATCAAAAGA---GCAAAACCAAATCAATCCACCAGCGATTGGCTTCCAGGCATCGTCCTAGTCTATAAGCCGGGCACAAAACTGTATTTTGTTATT
GCCCAATTCTAGCATAATCCTAGTTATAAATTGTTGAGCATGTGACGTGGAGTGAATGTGGACAGCGTGCAAGCGAGTGGACGTATTTGTTTCGGGTGCGTTTTTGTGGCATAAATTACATATACACATACTAACACAGATATACATATATATACATATTATTATAATATATTTATTGTTGCATTTGTAGTTGTAGCTACTTAAAAGCACCCTCGACTTTCGAGTTATTGC--GCGCAAATCAAAAAACATTCTAAACTAG--CCGTGCACCAAAAATGTGC----------------------CGAGTCGGGCACAAAACGTTTTTATGTTGTT
>CG3520 18904366 18904539|19336 chr2R 18903881 18908180 scaffold_4 4303702 4308046 - 192441|553 733
ACACGACGACCACTCAC-CGCATTTACACCCTCTCCGCCCACGCCTGAAGTGCAC------TTGAATGGCTAGAACCAACCGCCTACCGTCAATGTTAGTCAATTTTTGATAGCCATCGCGTTCCTTGTTACTTGTATGTGTTTCAACTTTAACGTACATTAAATGCATTTTTGCGCACAA
GTTATTAGTTCATACACTCGAAATGAAACCAACACAACAGA------AAGTGCACTTATTGTTATATAGTTGAAA---------------TAACGTGAATCCATTTTT-ATAGCTTGTGCGATATTTGTTGACTTTAT-TAAATGAACCTCAGCACCATTCAAATTGAAATT----AACGA
>CG9812 18919936 18920394|19342 chr2R 18920293 18920466 scaffold_4 4316597 4316760 - 3356|0 101
ATTCCCATTGGCATCCTGCGCTCCCTGCAGCAATCCTTGGGCGCCCTGGGCGGTGGCGGTCAGCAGCCAGCAGCTGCAGCTGCAGTTGCAGGTGCTCAGGCC
ATACCCATTGGCATTTTGCGCTCCCTGCAGGTGAGCCTGGGCGCCTTGACGGGTGG-------------ACAGCCTTTGCCGCAGTAG--GCCGCTCAGCCC
>CG9812 18920614 18920634|19343 chr2R 18920612 18920748 scaffold_4 4316761 4316909 - 4350|2 22
CCCGTGGGCCTGGCCCTCGAT
GTTGTGGGCAACGCACTTGAG
>CG3906 19018886 19018986|19461 chr2R 19018986 19019958 scaffold_4 4447616 4448595 - 12923|0 0
G
G
>chrw 19027439 19027957|19472 chr2R 19027215 19028905 scaffold_4 4458369 4460112 - 39220|232 840
GATCTATCAGATCCCCAGGATCCACATCTGTGAAAGAACCAATGTGATTTTAACAGAACCAG----ACTGCAGTTCGAATATGGGCTCAAGGGCCAGCCAGCATCGTTTAAGCAATCAAGCAACCCAACTCCGAAAACGCAAAGACCAAAAGCAGCCGCCGCAAACGCAAGATGCAAACTTGGCTTGAAGCTATGTATTAGATCACTGATTAGGCTAGATCCAGGATCC-----------CCTCGATCCACTGACAAGGCGCTGCGACAACCGCTTC-------------ATCATAATCTTAGTTCTTAATGACAGCTGTGTACAGCAATTGCCGCGTGCATATTATGACTTT-------------ATACACTCGTTTCGCTCTAAGCCCATCTGACTTACCAATCATAAGATTAACCCACAACACACAGGGAGCAGCACTCACGAAACACTCACAAAACACTCACGAAACACTCACCCACAAGACATTAACACAAACACCAATTCATGTACAAA---GCATTTTATAC-----------------------TGCATGCCTATA-------ATAAATGTAAATGTA----------------ATAATGT
GCCCGCTCAGCCAGCAAGGAAGCAAAAAT-TGA---AACCATTGTGATGTTAATTAAACAGGTTTTACTTTAGTTT--------ACTCGAATTC------GCAACGGCTAAGCAATCA---AATCCAAAT---------GAAAGACCAC---------CCACTGATAGAATATCCGAGCACAGCGGCCTGCCATGATAAGGACAAATGC-----CTGGACACAGAAACCCTGACAACGGGCCGCATCCAATTGACACACCAATCCAAATGTGGCTGCTAGTTGTAAGCTAGTCATAAGTTTAGTTACTAAG------TGTAACCAGCAAATGCCTAATGTATATTATTTATATCAACAACATCAACATGCAGCGACATCGCTTAAAGCTCACTTGACTTA--AACGATTAAGTTACTCATCCACTCACA--------CAC-----ACACACTCACACA-----CACAGACATCGTCTCGGCTGGGTGTTATCACA------AATTCATGTACAAATTCGCACTTTATACGATAAATACATAAACAAAGTATATATATGCATATATACACACATATATTCACATGTACATATAAAAGGTGTGCATAATGT
>bw 19035405 19035852|19478 chr2R 19035473 19035688 scaffold_19 319277 319495 + 1676|0 240
CATCAAA--------TTTGAGTCGCATAAAA-----TAAATCCCATATAGATCATGTATGTAT----------GCCGTTACTAAAAGAAATTT--AACTTGCATTTGAACTACATTTGAGCTCAAGGAAAAGTCGGGAGTCTTGCGAGTCGAAGAAGAGGCGATCTATAAGATCTATATCAGATTATTTTACTTATACCTATTATTATACGATTGTCTGTCATTATATATAAATGGTTTGA
TATTAAAAAATCAATTTTAATATTAATAGAACCCATTAAATTCCG-AGGGCTCATAAATGTATTGTATTAAAAGCTGTTTTTGTAAAATATTTGTAAATTATCATTAAACCTTTTTTTAGCT------------GGGATTTATTCAAGTTGAAAAACAATTTTCTTATGATATACATTCCGAATTATTTTATATATGCATAT---------ATTTTTATTAACTATTTTTGAATTGCCTGA
>bw 19035405 19035852|19479 chr2R 19035689 19036043 scaffold_4 4468610 4468979 - 11959|0 194
TTGGGGCGCTTTTA--TTATACTAATTTCAGTTTACACTGTTACAGAACTTGCTTCAGCTTA-ATTTCAGTTGCATTGAGTACTCGTGCGGTAGTTAAGTAAAATTTGTAATTTTTAAGCACA---AAATGTTCTTAATACATCTAA-------------------------ACTTCAGTGGAAAATATTGCATT
GTTGATCCTTTTTATTTTATACTATTCCGAGTTTACATTGTT-----------TACAATTCATATTTCATTTA---TTCGTAACCAGGCGTTAGCCGAATAAAAGCTT--ATTCTTATACATATTTATACGTAGCTATCTCGTTTAGTTACATTTCTCATTTAAGCTCATTTACTTCCGCGAAAAATATTGCCTT
>CG3957 19052419 19052663|19488 chr2R 19050279 19053931 scaffold_43 543787 547343 + 103658|2177 2453
TGTTGGCGCAGCAGGAGTCGCTGTTACACAGCCCA--------CGCTG----------CACCGGCGACGCAACGAAAGGGCATGTGATTCGG--------AGCTACGGCTGAGATCCGA------TTATCAGAACAAGAACAACTCGTAGTGCGGGCTACAATAACGATTCTTCATATTCCAACGCTGAACTCTCTCATTGGCATTAAATGATAATCACAACACACAAAACTACATTGTGAAATGCAATAGAAATAAATAACTTAAGTGTCGCATTC
TGTTGGAGAAGCACAAGTCGCTGCTATACAGCGCAACAGCTGCCGCCGCCACCGCCGCCGCCGCCAACGCATCGAAAATGATTGTCATCCAATAAGTATCATCTACATTTGTAATTATATATTTCTTTTCAAAAT-------------------GACTACACTAACGAATATACAAGATTC---------------CATTGGC-----------------TCGCAGATAAATGTATGTAAAAGTG---TAGAAATAAATA---TGGGAATCGTTTTG
>Rrp4 19062618 19062778|19499 chr2R 19062392 19062634 scaffold_30 91235 91489 - 866|254 270
ACACTGAAAACTATCGC
AAACTTGAGAGTATATC
>Rrp4 19062618 19062778|19500 chr2R 19062750 19063739 scaffold_4 4091011 4091996 - 49073|0 28
TATATATGCATATACATATATTTTATACA
GACTGATGCACACGCCAAAATAAAATATA
>CG30182 19107123 19107147|19555 chr2R 19106735 19107128 scaffold_4 4137535 4137973 - 3445|470 475
TTGCTT
GTGCTG
>CG30182 19107123 19107147|19556 chr2R 19107130 19108254 scaffold_4 4138575 4139631 - -465|0 17
TAAAGTGTAGCTGAAACA
AATTGTGTTCCTAAAAAA
>CG4019 19115175 19115432|19565 chr2R 19115339 19116387 scaffold_519 23 1096 + 44021|0 140
GGCCAAAG--------------ACATTGCT--------------------GTAGGAAAAGCCCTAACTAATT-----TAGTTAATATCTAAGAT-------GCCGAATTTTAAAATAATGCATTCG-TTGTACGCTAATGT
GGCCAATGTGACACAAGTGCCAAAACTGCTCTGTGCTGCTCTTTCAGTGCATGGGCAACCACTTAAACAAATCTAACTAGTTATAAGCTAAGATCAATATGGACGAGTTTTATATTAATACAAATGTTTGTGTACTAATAT
>l(2)efl 19192251 19192356|19654 chr2R 19192198 19193268 scaffold_45 420151 421345 - 38979|58 184
GACTCAATCCTTTTGTACCGCCTTCAGTGTTAGTTAGTTTATGTCTACGTGTGCCTTATATATTGGACTCTACATATTTT-----------------ATATCAATTAAAACGAATCT----TTAGAT
ACGCCA-------TGGACTG-TTAAGGTTCTCGTTCGCTTCTCTCTCAAGGAGCGTTGCG----AGCAACTAGATTTTTTCTTAAACGAAAATGAGAATTAGAATTAGCGTAAATCTTGTATTAAAT
>l(2)efl 19192398 19192544|19654 chr2R 19192198 19193268 scaffold_45 420151 421345 - 38979|226 381
TCCTTCCACT---------AGGTGATGTCAACCCCGACACGGTCACATCGTCCCTCTCCTCCGATGGCCTGCTGACCATCAAGGCGCCAATGAAGGCGCTGCCTCCTCCGCAGACTGAACGCCTTGTGCAGATCACACAGACTGGTCCCTCCTCCA
TCTTTTTTTTTTCTATCTCAGGTGATGTCAATCCCGACACAGTCACCTCTTCGCTGTCCTCGGATGGCCTGCTGACCATTACGGCGCCCATGAAGAAACTGCCGCCGCCTGCCACGGAGCGCCTGATCCAGATAACACAAACCGGGCCCTCGTCCA
>CG30183 19198395 19198490|19661 chr2R 19197621 19198467 scaffold_45 430169 430919 - 8014|841 919
TTTTATTTTTATATGT-----GTTAAAGTTTTCTATT-TATATTTGGTTATATTTAAATTGTGCTTAGATCTTTCCACT
TTATATTTTTATATGTTTAGTGTTAGACTTTATAATTGTACTTTTGGTTAT--TTAGTTTGGGTTTGT-----------
>CG30183 19198395 19198490|19662 chr2R 19198484 19201634 scaffold_45 430940 433985 - 67793|0 6
CAGCTCG
CAATTAG
>CG4091 19206546 19207564|19664 chr2R 19205543 19208654 scaffold_45 438054 441187 - 75617|1071 2265
GGAGATTCGCAAAGCGAGCTGAGCTGCAATTGCGTGCTATGAACGAAAGGCTATATATCGAAACCAAAAA--------GCAGCCAGTAGCTAGTTGCGAATGGAAAACGCTTGCTTAAAGCTCACCCACCAACACCACCACCACCACCATCACCACCAAAATACAAAATCTAGGTATAAATATGGGCCAGCAGCGGCAGAGATGAAGCAGAGCTGGGAAAGAATGGAAAAAAGACATGGGTTTAAGGAGAAGTTTAATTTAGTTCAACTAGTGATATAACA-TTGACAACAATATCAAAAGTGTAAAGACGTCCGTATTGATTATTTTGATGACAACGTTAACATTCGTGTACTCAAGGTCTATGTAGTA-ATAATTAGGAAGAACCAAATGCATTTCGCCAAAGGAATTCAC---------------TAAACGGAAATTGTAAACTCGAGCAAAATGCTTTT-ATCGGTGTGTAAGTTGATCGTTGATCGTACGTGTGAAAGT---AACTATATGTACAA-TAGTTTTAAGTGTTAGATGGAAAATACTTCGGCACATAAGCAATTACTTATTCGTGGTCTACTTTTTGATACTCCCAAACTCGCT------------GTGTGCACCCGC------------------------AAGTAACTATATCAACGT---CTTAGTCA-------------GACCTTTGCGTA-------CTTAACCGATCGCCGCCGATCG------------------GAGC---------CACCCATCTCACCTGCAGTC--GTTAGTCGATGCTAAGTTGGTTATGCTAAGTCGTCACCAGAACCTGTTTCTATTTCTATTCGTAT-TTGTATTCGTATTCGTATTCGTATTCCAAGCCTCCAAG-----GGGTCGGTAACCTTAAGCAT--TATTTATGATA------CTCCCACAAT--------------GATATTCCAACTACCCGAAACATATCGAAACTATC---TGAAAGG--CAACATAGCTAAGGGGACAATAAGTTGTTTGCATTTTTCTATGACTTTTGGTTCGATATTC-CAGCGATGGAGGCACAAGTTT--------AGTG-----GTTTAGATTTTAAA------TATTTATTTGTTTA-CCAACAAAACTATGTTGACT----ATAAAAATAAAAGCAACAATTACCAA
GCAGC---------AGAGGCAAGCTGCAAGCTATTGACAAAAAAAAAAGGGGCTATTATCAAACCAAAAACAACATGAGATACTAACAGCTAGTT--------AAAAGGCCTAC--AAAGTCCACC--------------------------------AAATAGAAAGT---------AACGTAG------CGCGGCATAAAAGACACA---------AGAAATTGAAGAAAGAA--GAGCGAAAAGAGGATTATTCCTTAATTGAATTGGTGATAACACAATTAACACTATTATGTAGCAGTCAAAAACGTCCAGATTGATTTAATTTAAGGCAATGTTAACATT-------------TTTTTGTCGTTTAGATTTAAGAAGAA----ATGCATTTTGCCAAAGGAATTCACAAACAAACAAACAAACAAACTCAGATTGTAAACGCAAGCAAAATGCTTTTTATCAATGTAT----TTGTCGTTGATTGTATTCGTGTACGTTATAAGTATATGTAAAAGTCTGTCTAAATATTGTA-GTCTAATATTT-GATACAT-----------------TTGTCTG--TTTTGATACTCCAAAACTCGCTCTTGAAACGCAATTATATACTCGCTTCATATCTAAGAACTTATCAAATATCTATCTATATAATTGTATGCGTATTCACCGCGTATATATTGCCCTGTACTTAATATCCTTTTATCAAATTTCTGCTGATCTCCACAAGAGTTTCCTATCGAGCGAATTGTTGCACCCATATGAACGGAGTTTAAGCCATTGCATATTAAATTGATTAA---AATTGATTAGTTAATACACATTCTAGAGTTGTTTGTAAACCCGATTTACGTATGTATTCCAGCCTCATGGCCACAGGCGTGCGGTTCAATAGCCTTAAGCACACTATTTATGATATTACCCCTCCCCAAATTGTTTATCCAATTAGATATTTAATGTACCCATAACATATCAAAAATATCACTTGAAATGTGCAACA------------CAATA--TCATATATATATATATATAGATAGTTGAACGAGACAAACAGAATCCGTGGCACATATTTTCGATATTAGTGTTGATGTTTAGATTTTTAAAACATGTATTTATTTGTTTAGAAAACAAATTTATGTTGACTCCCAATAAAAGCAACAGCAATGATAATTAT
>l(2)not 19213037 19213130|19667 chr2R 19212982 19213081 scaffold_51 537827 537940 - 929|68 113
TTGATTATGCCAAAA-AAAAAATTGAATAAACAGTACATTAAACGA
TTGTATATGCTAAAATAAATAGAAGAGAAAATAACGCCTTAAACAT
>l(2)not 19213037 19213130|19668 chr2R 19213124 19216150 scaffold_51 537980 541200 - 123089|0 6
AATGGTC
AATGGTC
>egl 19242505 19243542|19695 chr2R 19242506 19244039 scaffold_51 603094 604797 - 47129|0 1247
ATTATAGCTTCTAATTCTATGCAAGAGCAATTAGGTTCGAGCATTGCGACCACCGAGAATCTACAGATTATACGCGAGAAATCCAAAAAGTTAGTGCTGAA-----TATTGGAATATTGGTCTCTATATATAATAACTCATTAAATG-TAATGC--TTTCAGCATTAAGAACTGCAATTGCCAGGGCGAGCGGAGTGTGACGCCCATTATGCGAAC---GACTGACAAGCGCGTGGTGAAGCTCGTGGACGCCGAATCGCAGACACTGAGCACCGGCGACGTGGTCATCACCAAGATATTCTTCCAGGACGAGCACGAGCGAGCCAAGGAGGCGGCCCTGCTGAG---------CAACTCGCCCGCGAAGCGTGTGTCTCCCACATAAACA--TTTCGACCTTCGTACTATGATGATTCCTAAC-----AAACAAAGCGCAGACACAC-TACGTATTATTATTTTGTTTTACAGTTGAGGGG---CTTGGCCT------------TGGGTCCCTCGACGCTTAACGACTTTGCAATAACTTTCATACCAATTGAGAAGCAATATATTTTGTGCCTAGATGTTGAACATTGCAATAACAATTATATATGATCTAGCA-ATTGTTAACTACTCGCCCCGCCCCCGGCCCCCAATCCT---TTTATATA----------------------ACAATCGACAA----ATCGTGGCAATGCAATCTTACCGAATCCCTCTTCTCA---GAAAATGTCTACGGACCTGAG----ATTCTGAGT-----GGAGTTCGATGAGCAGCT-------------------------------------------CCAAACAAA-------------------ACTAAAATTAAATCTGCGTTG-----------------------------------------GACCAATGTGTATTAAATCGTAAA----GAAATTATTAAATGCAGTTTTCTAGAGGTTTCCTAATATCTTTGTCGCCATATCGGAAGAGAACTTATTGTATTTTAACCATAATATTTT-------ATAAACCGAATCGATTATTCAACTCAA-TTTAAGTTTAACCAAAC---------AATCTTCTTAATTAATATCCAATTGTGTAGTCAATCTAAGTAAATGAGGAGAACTAATTGTAATGAAAAGAATACTGAAATGGTACGATTATAAATTAT--ATATCTAATTGAATAAACATGTATATACCAACATT
ATTATTACTTCCAATGCAATGCAGGAACAACTGGGCTCCAGCATTGCGACCACTGAGAATCTGCAAATCATTCGCGAGAAATCAAGAAAGTAAGTCCAAAAACGTTTATTGCAA-----------ACGAAAAGAAAACTATCATATGATATTGCAATTTAAGCATGAAGAACTGTAATTGCCATGGAGAGCGCAGCATAACGCCCATTTTGAGATCAGGGAATGACAAGCGAGTAGTCAAACTGGTGGATGCAGAGTCGCAAACTCTGAGCACCGGCGACGTAGTTATCACCAAAATCTTTTTTCAAGAAGAACACGAGCGTGCCAAGGAGACGGCATTGGCCAATAGCAATGCCAATTCAC---CGAAAAGGGTGGCTTCAACTTAAACAGTTTTTGA----------AAACCGATTCCTAACTAGAAGAGAAATGTGCAGACAGACATATGTATTATT-TTTTATTATCATGATGAGACGTCACTTGAAATGGAAGTAAAAGACGGAGTGCCCAACTC-TATTAAATATGCAATAATTTTTCTATCTATTGAAAAGCAATATAATTTGTGCCTAAATGTTGAACATTGTATTAACAA-TACTTGCTATATAGTATATTATTTACTCCTATTTCAACTGTGTTAACATAAACATATATTGATATATTGATTTTGCTCACTCATTAATGAAATCAACCATTTTACTAAGCCAAAATTGTTACACCGAATCACACTTCTCATCGAGAGATGGTTTAGAATTTGTGTTGCATTCTGATTTTTTAGCAATTTGAGTTAAAGCTTTACTTATACACTTACAATTATATTAAATGAAAACCTAGCGAACCAATCAAATACGTGTATTAAATTTGACATTTAAACAAGATTTGCTTTGTATTTTACATAAAAATTAAGCAAATCTTATAAGAAACGTTGGACCAATCTGTGTAAAATCGAACGCCTTTAAATTTAAAGAAACAGTTTGTTA-AGGTTTCC-AATATCCTTGTCGCCATATCAAAACTAAACT--TTGTATTTTTATCATAATACCTCCAAAAAAAAAAATAAACACGTTTATCCAAGTTAATTTTAAATATACCCAAATATATAATCAAAATTTCTAACCTATAAACAAAGTGCATAGTCAATATAAGTATTTGATATTA---AATTGTAAAGAGAA-CTTATTGAAACTGTACGATTATAAAATATGCATATTTAAATAAAAAAAAAATTGTATATAAACATT
>egl 19243602 19243717|19695 chr2R 19242506 19244039 scaffold_51 603094 604797 - 47129|1312 1427
CTGAATCCATGCAAATGCTGGAAGAGATTCTCCAGAACAAGTCAATGGATCGCATAGCCCGTATTGACAAGCTGGAGGCCATTCTGACGACTGCCACCTCGCTGCCATGTGAACAA
CTGAGTCAATGCAAATGCTAGAGGAAATACTGCAAAATAAATCGATGGATCGGATAGCGCGCATTGATAAGCTCGAGGCCATATTGACGACTGCAACTACATTGCCATGCGATCAA
>CG9850 19261295 19261937|19716 chr2R 19261091 19267443 scaffold_11 3687681 3694586 + 114069|208 996
TGGTTAACTGGAAGCTGTTTCCGTTCTAGTGAAAGTGTGAAAATGCAGCCGCAT-TGGGGGAACGTTTGGAACTGGCACGCAGA-----CGTCACTGCCATCGAAATTGGAAGAAGT------------GTTTGCAGCTTAAAGTGTTTTTAGCTAGAATTTATTACTATT-----ATACTCTGTACGAAACCCTATTGATTTGTTGTTAGTTCTAGCCGCAGCTAATTCTAATTTAAATGATTGCCTGTTTGCTGAGGGCAACGCAGC------AGCCAGCAATGTTGTTATGTT----------CAGTACACG------------------------------------CATATATTATG-------TAATCTAATTTAATGCAAAATGCAAACAATTTTGTAAAATAGTA----------CATATAAT------------------------------------TCTGT---------AAAAACTTCATCTACACATGCACGCACTTTCGGCAGACAACCTAAATTATTTCTTGAGCCACAAATCAATCGAAAGGAAATTTAATAATAATCCC-ACTTTCCAATGTGATAAACATATATAATTTGTACACTCTACTTAACAAATATTTATCGTTTCCTGTTGGGAAAATGCTAGAAAGGTGGAGAATCGATAATA------TACTTACCTTGCCGCACTTTGCCTGC-AGAAAACTCAAATTATTCACTTCATTATTGTAATAAACTTGTTAGAAGCC-TAAATTCTAAAAAAAAAAAAAAATCCA
TGGTTAACTGGAAGCTGTTTCCGTTTTAG------------AGCACTGCCACCTCTGGAAGAACGTTTGGAATTGGCACATGTCGGTTTGGTTATTGCCATTGAAATTTTAACAAATACTTGTTTTGCAGTTTGCAGCAAATCGTGTTTTTAGATAGAATTTTTTATTTTTTATTAATACTTATTAT-AATTACTATTGATTTGTTTTTAGTTTTAGCTGCAACTAAT-----TTAAAATAATT-CTTGTT---AAAAATCAACGCACCCAACTAAGTGAACATTTTTTGTATAATTGCGAACACCCAGTATGTGGCAAAAAAAAAAAAAGAAAAAAAAGCATGAACAAAACATATATTATGTTATGTATAATTTAATTAAATTGAAAA-ACAAACAAAACAAAAAAACAGTATAATGTTTTGTATATAATATTTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATAATATTTGTTTTTTTAAAAAAAATTTCA--TACATACGCATTCATTTTGGT------ATTTAAA--------AGAGAAACAAACGATTTGATAAATTATTCCTAAAGATTTCCAATTTTCCATTGTGATAAA---AGATAATTTGTATACTTAACT--AACAATATTTATCTTTT----TTAGAAAATTGATGAAAACCTGAAAACAAAAAAAAAATTCGTTATTTACTCAGCCGCACTTTGCCTACTAGAAAACTTACA--ATCCCATACATTGTTGTATTAAAATGTAGAAAAGTTGTGCATTGTTAATGCGATCAAACATTCT
>CG9850 19263095 19263370|19716 chr2R 19261091 19267443 scaffold_11 3687681 3694586 + 114069|2309 2594
GGATGTGGCAGACAACTCTGATACCCATTAGCATAAGCTACTCTACCTACTGATAGCCAGAAAGAAACACTGATCCCAGATC----ACAGATCCGATCCACAAAGCTGCTTGAGAAACCGAACCGAACATCCGAAAGAACCGAAGGCTCCCCATCCAACATCAAAAACAAGACCACACTCACAATACAACGCAACACGCATCACACACAATGTCAAACCGATTGATACTGAAACCGAAACTGAAATCGAAACCGTTACCGATTCGTTATCCTTG------CGTGCG
AAAAAGGCCTCAAAAC----AGGAGCATCAAAATTGGC------------------------GGCAACACTG---TCAAATCAACTACTAAACAAATGTCCAACACTGCC------AACGAACCAGTCGT-------AACTGTA-ACGCCTCTGCATACCTCTGATACACGCACACACACACACACAGACACACAACACA-CACACACGATACAAAA---ATTGTCCTCTCGACGGTCTCTCAAA-----------ATCGATTCGTTTGTTTTGCTACTTCGTGCG
>Ssrp 19313961 19314154|19764 chr2R 19313573 19318976 scaffold_11 3752790 3758473 + 234774|434 667
GGCCATAAACACAACAAATCAATTCCATAAACACACACCACGCTC-CTCACACACCCATG-TCCCAAATCTAGTTTACATTCGCCTAGTTTAGTTAAGTGCTGCCTGTTGGATACAGACC--CATACGTTTTTGTTTAA----TTAAAACTCAACAACAATTCGAAAGTTCAAGTAATT-----------------AAACAG--AATTGATAA-------------TTGCCCGT
------------ATAAAAACATTTCCATGAACACAACACACACACACACACACACACATACTCACACAGCTAA---ACATGCGCTTAACT---CTAA--GATAACTGTTATAAACAGACCAGCTAACGGCTTGGTCTAAAATTTGTCTTTTCATTAAACACCCAAATTTCCATATAATTGCTAAATAATTGCGTCGATACAGCCAATTGCTGATCAATTTATTTTTTTATCAGC
>Nxt1 19318921 19319018|19764 chr2R 19313573 19318976 scaffold_11 3752790 3758473 + 234774|5734 5793
TCGTAACGAGTTTATTAACATATCTAAGCTCTTAT---AAATAGATTGACTTC-CTATTT
TAGTAGCTACATTCTTGATTTATTTAAGTTTGTACTTAAAAAATATTAATTAAACTATGT
>Nxt1 19318921 19319018|19765 chr2R 19318977 19319853 scaffold_26 1359247 1360099 + 14003|0 50
GATCCACACACTTGTAT---TTTAAGCTAAGCTAAAGTTCT------TACG
--CCCATAAATTAGTGTCTACTTTAGCTAGTTATAAATAATATCAAGCAAA
>CG4797 19319781 19320025|19765 chr2R 19318977 19319853 scaffold_26 1359247 1360099 + 14003|830 903
ATCGCTATGCTTTAAATTGTGTCTAATTGTTAATTAA-AATTATGATTAGAAATAAACAACTTGAAAAATAAAA
ACTGATATTTAGTAAATTCTCTTGACTTGTTTTTTAGTAACTATTATTAGGAATTAGGAGATT-----ATATAT
>CG4797 19319781 19320025|19766 chr2R 19319908 19321156 scaffold_1 1912146 1913441 - 57329|0 143
GTCGGGG--------GGCTTTAG-TCTTAAAACAGGTCT-------TAGCTTAGCTAGT--TTTAGCCATACTCATAGTTCT-----AGCCGCAGTGCCTCGTAGTCG---CCCTAGACTCGCTCGATTTTCCAGTGACCCCCA
GGTGGGGATTCACATGTATTTAGTTTTTAATACAGGGCTCTTCAAACTGCTTAGTTTGTTATTTAGTATTATGTGTAGCTCCTAATGCGCTGGAGTACCTCGTAGCAGTAATCTTAG-------CGTCTTTCCAGTGTTCCTTA
>shu 19349057 19349294|19804 chr2R 19348694 19352943 scaffold_1 1971616 1975894 - 70989|388 740
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G--GAATGGGAAACTCAGGTATTTCTTTGAACCCATTCAAGCCTTAATTATCCAAAGATTATGTTTATCCACCGAATTTATTAGTTTAGAAAATTCGAACTGACATTATTCCTGCCTTGTTCTTAAATTTGAGGACTTTTTTGTTCATATCTTTTTGGACAGCCGAAACGGACAGCTTATTATCAGATACTTGAATACATTCGATAGAGAGAC-----GGCGGGAAATATTTCGAAGTTTTGTTAAATATAGACTAATCTCATCTGCCTTCTAGCTAAGCCGTGTGCCCCAAAATACTCGAATCTATAACATTATCTTCACTATAACTCGAATATAAAGTTAGCTTTTTGTTT
>usnp 19351081 19351322|19804 chr2R 19348694 19352943 scaffold_1 1971616 1975894 - 70989|2597 2884
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GCATAGAGTCATGGGGTTAGTTGTTTGATCATAAATTGTTTATT--TTACAATAATGATAGGTTCAATAATCCCATATAAACTTATATATATATATATGTATATTAATCATATCGAAGCACG-AATGAAATCTGTGTTTTCCCGCCATCATAAAGCATTCCTTGCTTTCTTTATTTTGTTT--TTGTTATTTTGTATTATGTGCACCAAAAAGAT-ATTTGTATGAGCTGCT----ACTTGCGAGTTATAAGTGTTCAATTTCAAAGAAATTTTTCAATAAAAATTAA
>ytr 19354770 19356056|19806 chr2R 19354757 19355654 scaffold_1 1979296 1980206 - 15865|13 1042
TCTGCTTTCAGCTGCAGTCGACGA---------CGCACGACGATTGCTTTTTGAATATTTCAAAGTAATTAACAATTGTTTTTGTTGACA------------------------------------------TCTCGCCATTTTGT-----------------ACGCATACGAACGAATTAACTGAAGCCAGCCTGAGAAACCCAAATTCACAACAGAAAAATTTCCAAACTCACACACAGACAATTACTTAAAGTATTTGAAAACTTACCACAGCCCGAAACGCACTCTTCACATACCCATACCCTTATCCTTACCCATACCCATACCCATCCTCATCCGCATCCAGATCCCCATCCCGATCCCAACCGCAATCGAAAAGACCTCCCAACAAACTTCCTCCATACGCTGCAATAGTACAAGTTTTACAACC-AAACAATATATATCAAATATATA-TTTAAATATAGAAA----TTATATATACACACACACCACAAGTACCT--TATCCC--------CGCAACCCCCGAAATGAATCCAACAATAGCCATAGCAATTTGTTGAAAGAACTATTATTTGTTGAACAATCAAAATGTTGTAATTAATC------------------------CAGTTAATTCCGATTTCAATCACAAGTGC-----------------CAACAGATCAGGCAAGCAACGC----TGAAGATGAATCACATTTGATACAGATTACAGATATGTATTTGTATAATCATTCTTTTGTACTCTTTTTATAAGATAGTAGGCATGAATTTTTGTACGCCTCAACGAGCTAACTATTTTAAGCAACAGTTTCAGTTACCCATTTCTTTGCGTTTGGAAAACAGCCACATGTATTGGAAAATTTGAACCATTTTGGACCAGCAC-CACTCACACACAT---CTTATAACAATTATTTGTAGTTTTACAC-ACACGAAATTGCAGGGATTTTGTCTTATTTCA---TATTCTCCTACAATAAACTGA--------TAATAAATTTGT
TTTGCTTTCAATTGCATTTGCCAATCTTTAATGCACACGATTAATGCTTTTTAAATATTT-AAAGTAATTA-CAATTGTTTTTGTTGTCAGAAAATCACATACACACGCATAATGCATAATAGTATATGTTGTGTAAGCATTTGGCGTTTGCAAAAACCACAAACACAAACATACGAATTAACTGCA-----------AATCCAAAATTCACCATA----------CACACACACACATACACAATTACTTAAAGTATTTGAAAACATG-CACACACACAAACAAAATATCCCTTAACCC---CAAATATCCTTGCTC------------------------------------------------------------------CCCCCACAAACTTCCTCCATACGCTGCAATAGTACAATTTTTACAACCAAAAAAATATATATCAAATATATATTTTATATATAGAAAATTTATTTATACACACACACACACCAAGTACCTACAAACCCTATTAAATCCCTACCGTTAAATCGAACTCTACAATAGCCATAGCCATTTGTTGAAAA---TGTTATTTGTTTAACAATCAAAATGTTGTAATTTTTTTTTTTTAAATACTCAACAAACCAACAGTTAATTCA----TGAATCACAAGTGCCAAGTGAAAAATAGCAACAACAAAGCAGGCAAATTAAACAAATTAATGTTTAAGTGCA---GACGCAAGTTAAATAAAAATAAGTGTATACAA---CTTTTATACT-TTTTTATA------TATATATCAATTACAATGTGTAAACAATAGTTATCAATTT--GGCAACAGATAATATGAAC------------TTTAAAACGCAAACAAAT---TTGGCAAACTCACACA--CACACACCCACACACACACACACACACACACTTATATAGTGTCTTTGTAGTTTTAAATAAAACGAAATTGCAGGGATTTTTACTTACTTAAAGCTAATTAAATAAAACAAACTAAATACATCTAAATAAATGTAT
>ytr 19354770 19356056|19807 chr2R 19355655 19356681 scaffold_1 1980320 1981298 - 22115|0 453
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GCGAA--------CAGCTTCTACT
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AGCCCGCTTCCTCGCGCATATTGCCTGCTTCCCTACTAATTGAGTCCTAAAATAATTAAGAATGATCCAAAGAAGCGTGCCGAAGTCCAAATAGGACTTGATTGTGCCTTTTATTGCTGTGAAATGACTGTTAATTTTAAATGAGAGC-TAACCAGAATCAAAATACGTACTTTT---AGTACCACATTGCGT-CTATCATCGTTGTTTTG----AAATATTTGAAATTTGTGCATCCCAATCATGAGTAGATGTGA-GACAATAAAGAAGAAGTATCTTTTAATACTAGC
AGTTAAGTTTACAATGTGTTAGTATTAATGGCGTTCTGTGTTAGCCATAGTATAAGTAAGATTAAGACAAGCTACAAGATTCACTTCCCACTTGGAATACATTGCATTTACAAT--------AATTACGTATGTTTTGTAGTGAGTGAGTGATCTGA---AATATATGTAATCTCGTGAATACTTAATTATGTGTTAATATAGTTTTTCTGTTTAAATTAAGTAAAATATGTTTACTTGAAAATGCATTCGATTTCATAATCTTACACAAATATAGAATGTTAAATGCGGT
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A
A
>TBPH 19366666 19367217|19813 chr2R 19367146 19368124 scaffold_11 2449549 2450538 + 41652|0 80
AATGGGAACACC---GGT------TGGTCGAACCAGAGCAGCGGATCTCAAAACGCCGCGGAGAAGTCAAACTTTCTTTAA
AATGGCTGCCCTTCAGGTAACTCATGGTCAAATCAGAGCAGTGGCTCTCAAAACTCTACGGAAAAATCAAATTTTCTCTAA
>TBPH 19367290 19367344|19813 chr2R 19367146 19368124 scaffold_11 2449549 2450538 + 41652|155 210
CCCGAACAACAATCCGGCCGCCAACGGAATAAAGACCGACAACTCGGA-GCCACAG
TCCAAACAATTCTGGTTCTGGCGGCATGAACAAAGGTGATAACTCGGCTGCTAATG
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TTTTAACTATATTACT-GAAAATACAATAATATTTTTGTAGTCGAGATCAACAATGCCTTTTTATACCCTGTACCCATAATTTTAAATTGTGTTTGTGTGCAAAATACATATACATTG
>Thiolase 19374201 19374352|19818 chr2R 19373723 19374201 scaffold_11 1416428 1416916 - 17285|490 490
A
A
>Thiolase 19374201 19374352|19819 chr2R 19374237 19375596 scaffold_11 1417221 1418774 - 57392|0 115
AATCGCCAATTAATCGACAAGGAGGAGAGTGCAGTTTAACTGCGAGATTGCTAGCTTTTATACACCTTACAACTACGTCTATACGAATAAAGAAATCTGAATTTTACAAAACAGTT
ATTTGCTAAGTACTTTTCAA----TAAAATATCTTTTAATAAATATACTTATTGGTGCTACACTGATTATAA--AGATTTTACCCAAAACTGCAAACTGA---CTACGAAACAGTT
>CG4882 19388417 19388509|19837 chr2R 19387221 19389976 scaffold_11 1431737 1434424 - 79360|1296 1388
TGGACAACCCGTGGACCCACGACAACTCCTGGCCACAAACAAGTTAGATCCAATTGTTTTTAAGCTTTAATTAAACTACTGGAGAGTTAATCC
T----------TGCAGCCATTACAGCCCA--------------------------GTTTTATAGATATAATTTAAATGCTGGCGAAATAAACA
>PHDP 19390785 19390886|19839 chr2R 19390643 19390826 scaffold_1 5018849 5019008 - -246|143 184
TTATTTTTACTGACTATTTGGAGCGAATTGCGTTAAATAAAT
TTACTTTGAAGTATTCTTTTAAGTATATAATTCTGTAT----
>PHDP 19390785 19390886|19840 chr2R 19390827 19391084 scaffold_11 1441072 1441331 - 6166|0 69
AATCCACTAATATCTATGTAAATATTAGTATACATTTTGATG----------AATGCAGTTATTTTGATA
AACATAC-AATTTATATTAAAATCTCCA-ACCCATTTGGGTGTAGAAGTGCAATTGCAGCTATTCAAGTA
>CG11183 19396542 19396673|19847 chr2R 19396661 19397961 scaffold_11 2408292 2409603 + 40773|0 12
ACAGAAATATTCA
AAAAAACTAATTA
>CG5339 19404490 19404717|19858 chr2R 19404573 19405824 scaffold_11 2406003 2407300 + 36730|0 152
ATCAAA-------GCTTCCACATCCTAAAAAGAACCCTTCTGAAGTTATTGTAA-CCGTTTTCCTCGTAGAGTTAAGTGGCTGCATTGAGAAACTGAGCATTTATACTTATTACAAATGTAGGCTATCAACTAGTTAAACAATTTATTCTTAA
ATTAAAATATTTGATTTTTATACATTACAATAAATTTTTCATAAATACTTCTAAGCCTAGCTAAGCGCATATTTCATTATATGTTATGAAAA---------TTATAAATG-TACAAATGCCTGTGAACAGCTGTTTTGAAATCTTATTGATAA
>Nap1 19412773 19412913|19866 chr2R 19412832 19413610 scaffold_11 1512676 1513379 - 30457|0 92
GTTGATG------TGGCTGGATTACACA-----TGTGTAATGTATATACATAATTCAAATTTGATTTGAAATATATTTTTGGTGAATAAAAAT
AATATAGCCTTCATGTTTCAACTACAAAAGTTGTGTATAATAAGTATATGTAA------------TAAAAATATATTTTTGGTGAATTAAAAT
>Ca-P60A 19434556 19434752|19886 chr2R 19434548 19439931 scaffold_11 2386000 2391293 + 178758|8 205
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AGGTCTTGGGCAGTGGA------ACAAACATGCAGAAGATCCTCAAGGATGACGAAATTGTAAACCTTTATCAAACTTGTATTCTTTGCTCAG-----------------------AGAATTGTATCCAAAATGAATAAAACTTATTTGATTTAGAGAGTA----ATTAA---ATCTTTCGGTTATTTACAAAGTCTT
>Ca-P60A 19435080 19436830|19886 chr2R 19434548 19439931 scaffold_11 2386000 2391293 + 178758|538 2449
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GAAT---ATTATAATCATTAAGCCCAACATCATTATTCTAATAACTAGCATAAAGTGTTACTAAATATAAACAGAAAGAAATACCTATA----------------GTAATGATTTTAACCAAACAACACATAGACTTATTTCCGAATATTACTAAAAAACAAAA--------CAAAAAAATCACGCGTGATATTTTGATAGA----GATTTACTCGCT-----------AATTTACACAAACACCGTGAAATCGTCAATAGAT--TATGATCAAACGATTTATTGAA---ACGTACACCT---------AATAATTCTGTTTGAATGC----------GTTTTACCCAAGGCATTAATTTTGTACATGCAAT----TAAATAGATGA-----TTGTAGTTTGGAAAATTGGAAATACATACGTGAAGTTTCAGAAGATTTTTTCTTATAGTT-------------TTTGAGAATATTCAAATCT-----AAAATAATTTCTGATTTTAACATAGTTAATTTTTTGAG-------GTTTAGTTTTTTGAAAGAGAAA---AAAAAATCAATCGTAGATTTGTTCGTATTTTTTATGTACAAAAAATTTAAAATAATTTTTCGTCATCTGATCAAAAACCTATTTTTTCTATGAAC--TCTGAGTGCGTAGCTTTATGTAAATATTTCTTTAATGAGATGTCATTACACTAAATAAAACCACGAAATGATTTAATAGATAAATCCTGAATCCCTA-------TTTATGCAATTCATATTTTATTTATTCGCCAACAATTGGCT------TACCAGCCTATTTTCGTGGATGGAATTGCAGATAGATATTTTGTATTGAATTTATG-TATTAAGTAG-TCTTAATTCAGTCAGACTTTGGCCTTAAAGTTAAAAAAAAAACAGTTAGTTCAT-------TCATTCCATAGAATATAAGACGTAATCTTGAAGCAGCATAAAATCAATATTTTG---ACTTATGGCGATCGGCAAGAATCAAT-------------------------------------TTTGGCAAAAGAAAAAAATTGA-----TTGAGTGTATAGAACATTGGAATGTTAGTT--TTTCAGT-TCAAGTATCCGTTCCAATCAACTCGAGTTTTTTTTTTATCATTT----GAGGACTTGCTGAAAGTAAAATAAGGTAATTGGGATCCAGGATTGTGTCCGTGGTATTTATTTTTACTACATACATGTAATGTATACAAGAAAGAACTATCCAATTTGTGTCAAGCTTAGGTTATAAAGAAAAAATAAATAATTCTTTAGTTTCTGTTTAAAACAAAAAAAACTTTTTAGAAATTTCACTTAAAATTTACATGATGTACATCGTTATAAATTAAAGACACTGTGA-----AATAAACAAATTACAAACA---ACATTAGC--ATTACCG----TATGCTAAACTAAAAACTGCGCCTGAAAACCCATTAAATTGTACAGTGGTGGCGTTAGCTCATCTCATAGAACGCTTTTGAATGCTCGCTCGCAATTGCATTTGCTGCTGTTGACGATTAAATGAACGTTCGCATTATTGACTACAATATTCCAATGAAACCTTTTTATAAATAATTTTTTTTTTATACAGTAAATCCCCGATTTCATTAATTGGATGACACCCCATTAATTTTACATAAATTAAGTCCATCCCTGCTATAGAGAA-TATGTGAAGTTGTTAAATGTTGATATACTAGTGTGCCAAGTTATAAGTGAATTC--GACAGATCTTTTGCTGTACATTATGGTCTACTAAAT-----------------------------GAATTCATATTTAAAATTCAGCATGTAAGATATCAATAATT--ACGAAAT-ATAAACACCGAAATCCGAA
>CG13565 19454559 19454690|19904 chr2R 19454016 19454804 scaffold_11 1522919 1523698 - 34415|557 715
TGATACCTTCGACAGCGCGTGAATGTAAATGCCCATGGATATGGATACGGACTCTGATAGCGGAAATACTCTAAAATGCTTCATGTCAAGGGACTAT---------------------------AGAAAATAAAGCAGGTGCATCCTGGTAGAATAGCC
TTATAAAT-------------ATTTTAACTTCT-----ATCTAGACTTACTATCTGAAGTATAACTTACTCATATTTGCTTTGTGTTAGGGGAATATTATAATAAAAATTATGCTCAATACTTAGGAAAATTAATCAAATATGTTTAGATATAA-AGCG
>CG3803 19460117 19460137|19913 chr2R 19460133 19461006 scaffold_11 1538762 1539632 - 37964|0 4
ATAAA
AGCAA
>CG16787 19463935 19464020|19916 chr2R 19462742 19464564 scaffold_11 1543619 1545497 - 56035|1274 1365
AGTCGTAGCTAGCTAGCTTTAAATGTTACTTATTT-----ATTGTATTA-CTAATCGTAATAAACGCAACTGTGAGAACGTTTAGTAACCGC
------ATCCGTTCAGATGTTCATTGTATCCATTTTCTAAATTATATTAGCTGATAGCGCACAAATAAATTTAAAAAAAGTTACATA-----
>CG3825 19483201 19483477|19939 chr2R 19483084 19483349 scaffold_18 1125001 1125299 + -249|137 303
GAAGCCAAAAACTGTTTAACCTGTAAAGTATATCAAAACCACGTACACTTTTCTTCGCCTTTAGTTTTAGAGCCCTAAGAAGTTT------GAATTTGTTGATAACGGGATTAGCATA----TACCTTAATATAAC--------TTGAAATAAATTAAGCAATAGAC
GAAAACATACAACATTTGAAACGTTTATTAAATGAAAACAAAATGCACCTTAAGTCGT-----GCTTGATATATTTAAACAATTTACTTAGAAATTTGTTGGCAACCGTCTTCAGGGAATCTTACAGCCATATAACAGTTCGAATCCGAATGTCTTAACGATTGGAT
>CG3825 19483201 19483477|19940 chr2R 19483350 19484569 scaffold_11 2276502 2277622 + 9229|0 143
CTGGTCCGCATACCT---GAAGTAACTTTTGATGTACAGATTACAGTTTAGAACGATTACAGCAT-TAAAT--TCCAAGTTGTTTGC----GTGTATAAAGTGATCGATTTAGC------CACTGCGTTCGTGATTGATTTTAT
ATAGTCCTAGTATCTTTATTAATAAATTTTTAATTCCTGAAGATTGGTCGGCATTTTGAAAACTTGTAAATAGTCCAGATTGTTGGTTTTGTTTTATAAAGAAAATAGATAACCTGAATGTACCGAATTTTTAATCAATTTTAT
>CG33519 19503143 19503281|19962 chr2R 19503111 19505329 scaffold_1 638860 641033 + 88823|32 175
TCAATTAGCTGCGAAGTAGTGTTAAGAGGAATGTTGTTTTTATTTCTTGTATATATGGAATATATATAAGTGTACAACATGCAAATTCTATATATATAAATATATTATCT-----GGTTAATTAAAGCGAAACTATTCAAATTT
AT-----------AAATGGAGCAAAAAAGAAGATTTTTATTTTGCC----------------CATATGATTATAGGACATTC-------ATATATTTGAGCATATGGAATAAGAAGGTTACCTAAAATGGGA----TCTAAATT
>CG3907 19527498 19527837|19988 chr2R 19526713 19527568 scaffold_11 2246202 2247016 + 26262|787 857
AAGTCCAACATTATTCACTTTAGATACACGATATGTATTTTATTTGCAAGTAATAAATCAAACTAAAGCTC
AAGTCTACAATTTTGTACATTATA---ATTACACGTATTTATTTAACGAACATTGA--CATACTAAGTGCT
>CG30172 19538242 19538300|20000 chr2R 19538282 19538476 scaffold_11 1613114 1613314 - 8798|0 26
AT--------GGCATTTAAATGTTATT
ACTTGTTGCATGAATTTAATTGTTACT
>Chi 19539139 19539403|20002 chr2R 19539315 19541175 scaffold_11 1602144 1604033 - 95823|0 110
AACTTAA----------------TAAAACATAATATTTCG----CTATATTGTCAAATGTATTTTCATACTTGCATGTAAAAATA--TTTAAATAAAGCTTTCAAGTTTTA
AATCAAATGGTATAATCCGAAATTATAATATAATTTTAAGATACATATGTGGTGAAATGTATTTTCATACTTGCATGTAAAAATAATTTTAAATAAAGTTTCTAGCCTTTA
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AGTAAAATAAAATTATGTATTGATTTTAATAAAATAAGCAGCGGACCACGAGCCAGCTAAATAAAGGTGTATTTTCAAAAACATTATTAAAG--GCCACTCAATATAATTCAGCAATATTAAATACATATATTTTTCTGTTTTTCAATATTTTAAAACTAGTTTTTTATTATCTTTCCAA
>gammaSnap 19554745 19554882|20016 chr2R 19554420 19554854 scaffold_83 87368 87827 + 1154|354 474
TCAAAATATATTT---ATCGTTAATAATA-TCGCT--TTTAACATATTATATT-----AACTGTTAAATACAAATTTCATCGCAATCGTTGTACTAATTAATAAATACTAAGATCAATACT
TCAACACAAATTTGGGATAGGTCATGATAAGCGCTAATCTAACAAAATTAATTTCCAGAGCAGTGAATAACAACTCACATATACATCTTTTAAAGTTCTTATACATGTATAAATCACGG--
>RpL39 19569450 19569543|20041 chr2R 19569395 19569678 scaffold_11 2279294 2279558 + 5023|60 154
GCTGTTGATTCCAGGAGTTCCGCAATTTTGTGGAATGCTGAAGATCTTTTCGAGAATATGAAATAATAAATTCGTCTACA-ATTTGCGGATTAAA
ACTTGTG------GAAATGCAGC----TTGTGTTATTTCAA----TTTTCCAAGAAT-TAAATAAATGTATTGAAATACAGACATAAAAATCAGA
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TTCAA-------TGTATACATCTGTATTAGACCTAAAAGTTTTATATTTTGTATTATTCTAAATTAAATATTTTT---CAAATTTTATAGTATTTCT
TAAAAGTTTTTGTGCAAATAATTTTATTAGATTTTAATGTTTAAAATTTTGTATTAATATAAAATAAATATTTTTGCATATATTTAATGATATGTTT
>gek 19599677 19599761|20077 chr2R 19597695 19599725 scaffold_11 2112483 2114523 + 16547|2179 2227
TTTTAAGATAACTGTTTGTAATAAACATATTTAATTTCTCGAATATCAA
TTTTAACTTTATTATTTGTGTCAA---------------CGAACTTGAG
>gek 19599677 19599761|20078 chr2R 19599726 19600162 scaffold_11 2136556 2137088 + 10456|0 35
CTTCAGTCAATCTCTACACGTGTAATTTAATCGATT
---CATGTAATAGGTACAT---TAAATTAAATGATT
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GATCACGGCGATCGAGTCGAGTGAACGTGAAA--GTGAAAGTCCGGTTGTGAGGTGTTTAGTATATTCGTACATTTATATATGTTTTTCAAGCACAGGAGTCCGACTTTGAAAACCTCCCAGAGCCCGAAATACAATCCTTACACTT
GATCATGGTGATAAGGAC-AGCAAGCTCCACAATGTGGAGTAATATTTATATATTGTTTAGTATATTTTCTTGTTTATTTTCTATTTT--------ATTATTCAAAATCGAAATATTTTCAGAT-----------ATTCTGGCA-TC
>CG13569 19630965 19631124|20107 chr2R 19630580 19631129 scaffold_4 5663788 5664260 + 3626|393 555
GTTCTGCCACTTCCTGACCTGCTACTTCGACTTCCACAACATGGCTGGTTCGTATGTGTACAAGGCCGGGGATCCCACCTCCTCCTGCGACGACTGGGGCGTCG---TTAGCTCCGATAAGTATGCGAATCTGTGCAAGAACAGCGGCGAGATTTTCCCCCAT
CTATTGTCACTTTATGACCTGCCATTACGATTTTATCAATATGGAGGGTTCGTATACTTATCAAATTGGCAATGCGGCCAGCAATTGCGGCATCTGGGGCGCCTGGCCTAGCTCC---AGGTATCGCAACCTGTGCACCAATAGTGGCGAAATATTTCCC---
>CG13569 19631184 19631282|20108 chr2R 19631136 19631871 scaffold_4 5664268 5665119 + 7105|60 160
GGACTTCCAGGTGCGACACTTCACCAACATCATAAGCGATCGCGTGTCGCGCGTGGGATGTGGTGTCGCCGTGGGCGCCAACTGCAATCCATCCATCA--A
CCACCATCTTGTGGGCCACTTTACGCTGATGGTGAACGATCGAGTCTCTAGGCTAGGCTGCGCCTTTGCCATAGCCACAAATTGTGATAAGAATAACACTG
>CG13569 19631337 19632034|20108 chr2R 19631136 19631871 scaffold_4 5664268 5665119 + 7105|242 854
TGTGGAGGCTTTTGTT--AGCTGTGG-TGCTCCTGCTACCACTGACTTCCGGCTACAACTACTGCAACAACAAGACGCACAAGTGTGTGCTGGAGAAGAAAAAGCACTTCATGTGCCATCTG---------------------------------------------AAGGACTTCACCGT-------CTACGGGA-----------------ACTCGACCAAGTTCCATGCTTCCGTGCCGAACAACATGAGAATGCAGAAGATAGCACTGGACATACTCAACAATCTGCGGAACAAGTTTGCGGGCGGGGAACTGAGGACGAAGGGCAACAAGACGTTCGCGAAGGCCAGGCGGATGCGCCAGCTGTTCTGGGACAAGGAGCTAGCCTACATGGGCAACAACCATGCGTCCACCTTGTCCCTGAAGTCATCGCAGTGCCGTTCCACCCTGCGCTTCCCCCACGTCGGCGAGGCCATTGCCCTGGTGACGCCCAGGGAGAAGC-----TCAACCTGA-AGGAGATATATTCGAAAGCGTTCACACCGATGTTCGCCGAGTACCAGCATGTATCGGATCCGGACGCTCTCCTCCATGCCTTCGACCCGGACAG
TGAGGCTGCTGTTATTGCAGCTGTTGCTGGCCCTGCTCCAGCTTGCCAGCGGCTACAATTATTGCCGCAATGAGAGCCATTTGTGCAACATGGCCAATAGGCGGCATTTTATATGCAATGCGGCCACTGAGCTGGTAATTATGAACTTTTAATGGTAATATTATTATAAGAAATTAATTGTAACTCTTCTGTGCGCCCAGCATCCACTTTTTTACAGGGCCAAATTTTTGGCTATCGTTCCGGACACGTTGCCATTCCGCAAGCTCATTTTAGACTATCACAATAAGTATCGGAATATGGCGGCTGGTGGCCAGTTGGTTACGGATGGCAATGAAACCTTTCCGGCCGCCTCACGCATGCGTGAGCTTATCTGGGATCTGGAGCTGGCGTATATGGCGCGCGTGCATGCCTCCACGGTGTCCTTCAAGCACACGATGTGCCGCTCCGTTGTGCGTTTTCCGCATGCCGGTGAAAATCTGAGCATGGTTCTTGCCAAAAAGAAACGTTTCTCAGTCAAAGAGTTGCTGGACTTGGCGCTGTTC---CCCATGTTCGACGAATATAGAACTGTTCGTGATCCCGTTGATCTGCTCAAAGATTTCGACTCAAACAG
>CG13569 19632090 19632249|20109 chr2R 19632132 19632254 scaffold_4 5664136 5664260 + 3267|0 119
CTTCTGCCACTTCCTGACCTGCTACTTCGACTACGACAACGTGAACGGATCGTACGTCTATAAGGCAGGCAAGCCGGCCTCTTCCTGTAGCGACTGGGGCACC--ACCAAGTCCAAGGAG
CTATTGTCACTTTATGACCTGCCATTACGATTTTATCAATATGGAGGGTTCGTATACTTATCAAATTGGCAATGCGGCCAGCAATTGCGGCATCTGGGGCGCCTGGCCTAGCTCCAGGTA
>CG13569 19632471 19633164|20111 chr2R 19632525 19633014 scaffold_16749 4 559 + 4753|0 565
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TGAGGCTGCTGTT-ATTGCAG--CTGTTGCTGGCCCTG-----CTCCAGCTTGCCA-GCGGCTACAATTATTGCCGCAATGAGAGCCATTTGTGCAACATGGCCAATAGGCGGCATTTTATATGCAATGCGGCCACTGAGCTGGTAATTATGAACTTTTAATGGTAATATTATTATAAGAAATTAATTGTAACTCTTCTGTGCGCCCAGCATCCACTTTTTTACAGGGCCAAATTTTTGGCTATCGTTCCGGACACGTTGCCATTCCGCAAGCTCATTTTAGACTATCA-CAATAAGTATCGGAATATGGCGGCTGGTGGCCAGTTGGTTACGGATGGCAATGAAACCTTTCCGGCCGCCTCACGCATGCGTGAGCTTATCTGGGATCTGGAGCTGGCGTATATGGCGCGCGTGCATGCCTCCACGGTGTCCTTCAAGCACACGATGTGCCGCTCCGTTGTGCGTTTTCCGCATGCCGGTGAAAATCTGAGCATGGTTCTTGCCAAAAAGAAACGTTTCTCAGTCAAAGAGTTGCTGGACTTGGCGCTGTTCCCCATGTTCGACGA
>CG13569 19632471 19633164|20112 chr2R 19633015 19633132 scaffold_4 5665120 5665240 + 780|0 121
CGTTGAAAATTCGTTTAATTCTTAAATCATTGAAGGACCCTTAATCGATCAAAGGTCCTTTTCCCTTTACATCACAACTCATTCAAGTTTCAAGT-TTCCCACA---CTGTTTAAATTGCTA
CATCAAAAGTTTTAATACTTATTTATGTAATTGAAAAGTCTCAAAAAATGTACAATTTTTTCCCATAGATTTTCCAGTTT-TTCAAGTTTTAAATATTCCCAAAATTCTCTGTCAACTTTTA
>tamo 19634238 19635412|20115 chr2R 19634235 19634394 scaffold_4 5665242 5665411 + 795|3 179
AAGGATTGAAATTAAACCAAGGCCATT-------TCGGCACAACCTTCGCTCAAACC-------------ATTTACATTACATTACATAACTTTGCATACTATTACCGAATGAATTTAGCAGCAGCTCTTCCTAAAATCTCTAACGAAAAAATAACAATAAAATACAATTTTGACAT
AAAAAACAAAATAAAACCAAAATAAATGAATTTATAGGCAAAACTCTTCCTAAAATCCCAGCAATAAATAAAAAAAACAACACTTTGAATTTTTGAAAAATAAAACTGAAAAAA------AAAAATTATACAAAAAATTAAAAAAGAAAAAAAAA----AACATAAAATCTTTGCAT
>tamo 19634238 19635412|20116 chr2R 19634710 19635210 scaffold_4 5665983 5666468 + 2342|0 536
GCAGTCTGTACATACGAAGTATTCTAATT--AGTTACCCCT---ACTCGTAAACACACGCTTTAATTAG-TTTTAGAT-TGTTTCCCATTGTTAAGG-----GCGCTTCTGTTTCAAATTACGTGCC--TCCCTGA-ATAAGTCATCTACATATACATATATACGAGTATATACAGCGTATAGACATTTATATATTTGTACGTGTGCATCCG-GCGCGAGGAGCGAGAGAGTTAAATTCAAAATTCGAAGTTGAAAGTTTGAAGTTTTCTAGGAAATCAACTGATAATATATACCTTATACTAATAGTTGCATTCACAATACGTATTTCCG-----------ACAGTAAATCAGAGTACATAGAGTTA--------TATACCGATCTTGCATAGATAGTACTTGTACACCTATAGCCGTAACATAAGCGATTTCAATTCGAAGAACCGAGCTACGCATAAATAAGGCAACATAATAAATCGAACAGAACTGGTACGGGTTGTAAACTGAAAGT-TTTTGATTCACACTTTACGAGAA
ATATATTATTCATATTATGAATTACAATTTAAGTTTTCGATTAGACTTGTGTACACATGCTTTAATTAGATCGTAGATATGTTTCCATTTGTTGTGGGCGTCGCGTTTTTGTTGCAAATGATGTGCCTATACCTGATATAAGTCGCATGTATGTATGAATAC-TAACTATATAATATAAGTA-ATAACTGTATAGTTGT--GTGTGCCTGCGAGTGTGCGTCTGTAAATAGTTTA--TTAAA---CCGAGTTACAAACAAAAATACAACAAAAAAAAGTATATAT-ACATATATATTGGAAAGCCAAGTATATTTATTATGCGTATATATATATATATATACACACAATATATACATACATATATTTATTGTATGCTAGACTAACTTTTCATA---ATTACCTTTAC-----TACATACAATATAATCAA-TTCAACTTGAA----CGAGCTA-------------------AACAAATGGG-------TAATACAAGTAGT--ACTGAACATGTTTTCACTTATATTTTATTAGCA
>tamo 19634238 19635412|20117 chr2R 19635253 19636255 scaffold_4 5666505 5667578 + 24404|0 213
-ATGCAGTGGATGCAACGGAAC-CCTCGTTAGTGAT--------ACAAACAG--------------------TGTATAGCT-------------TCATATATTTTTTATACGA------CCAATGTA--AGCCTGTGCGCGTGTCTCTAAGATCTAGTCTCGATCGAAGTCGTCGTTCGATGGCAG--GCAGCCCTTTG--TCATCCGCATTCG
TATGAAATATGAGAAACTGTACACCACGCAAGTGATAGAAGAAAACACACAGTATGAAAGGAGTTTTGGATATATACAACTAAACATATAGAACTTATATATTTTTTATACGAAATTCGTCATTACAACAAACTGTGTGCATGTTTATAGAAAGTTCTCTAGTCTTATAGCATC-TACGATTTCAATCACAATCCCTAGCATTATGTACATACG
>CG4065 19642773 19642826|20123 chr2R 19641616 19644941 scaffold_4 5673452 5676915 + 142288|1202 1337
ATGTTCACG---------------------------------------------------TGTTTCGTAATTGACAAGAATAAAATTTAAATGTACGCAT-------------------------------TTTAA
GTGTTCATATCGCTCCTCTCTCTCTAATCATTAATTGTCTTAGATCTTTCTTTTACATTTTGTTTCGTCCCTTA-ACAAATAAAATTGGTTTGTATTCATACAGCGGAGACTGTAAGCCGAACAGCTTGTGCTTAA
>DnaJ-60 19665266 19665380|20133 chr2R 19664446 19665345 scaffold_4 5694052 5695060 + 27127|934 1017
TTTTATTTTGAGCTCGTTCTAAACACAAAACACTTAAGTTTACCGTCGCGACGGGAAGATTAAATTAGATAAATAC----GTAA
TTTAATTTAGCAATCTTTGAGCAAATTGAATACTTAA-TTTAACATCGCGATGGGCGCATTTAATTACATAAATATTTGTATAG
>DnaJ-60 19665915 19665961|20134 chr2R 19665880 19666138 scaffold_4 5695923 5696187 + 7999|37 95
TCCCATTTCCCCATTTCCTT--TGGTCAAATTAAACGT----------GAAAGCATATA
--CCATTTCAACGTTTTAATCATGTTTAGACTAAATTTTTTGTATATAGTATTCAAATA
>mRpS17 19681261 19681435|20144 chr2R 19678745 19682016 scaffold_4 5711837 5714950 + 93088|2725 2899
AGCTCTGCCGGTCGTTTATCTGTTAAGTTTCCCCTTTGTTTAATAGTAAAGTGCATTAATATGACGTACATATGTTTCTCGGTTTTCTTATAAAATGGTTAGGCCGACGAAAGAAGATATTTTTATAGGTTTTTGATTGCTTGAATTGAATTAAAAAGGCAGGTTTAAAAGATTT
AGCCGTGCCGCTTGTTAA---------------------AGAATAGT----TGCCTTAA----------------------GTATGCTCAT-AAGTAGTTAAACAGTTGCGGGTACATTTTACTAAATATTTTTATTT------------------------------AAAATGT
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GTGAGTGCTTGAATGCTTGAGTGCTCGTGTGTGTGTGTGTATGAGTGTGTGAGTGCTCCAGCCGTAAGTGTGTGCGTGTGAGCGAGACTCTGCTAAATCAAAGATACAAATGCTGTGTGGGTAGCTCGTAAGGTTCA----------------------------TTCTCCTCCTGCTCCTCATTGTCCTC-----------TCTGGCCGTAGACGATGGAGCGGT-CGCGCCAAGTTGGTGGGCCGC---------------TGCATCGCTTGGAGACCAAACTCTTCTG---------CCGATCGCTGTGGCATTCCTTGTACATTTACT----CTGTCCCCATTTCTTGTTATCACTGTAAAGCATATTTTTGTACTTAATTC---------TAATTCTTAACGACTGTAACATATATATTTCGCACGT------------------TTTTATACATAATCTT---------------------------------ATACATTATATCTATCATA--------AAGTTAAGCCAAAGA----AAAATGTTAAAA-------------------------------ATATTAATGTAAAAAAGAATAACACGCAGGAACGAAGAACGAAAATACAAACTTCAAAAC--------------------------------------CTATTAACTATTTA--TACATCTAATTCAAATGTGT-----ACAGTTCT-------------------------------CGACGGTGTGCGGCTTCGCTCTATGCTT---GATGCCACGCCCACTCCCACGCCCAGCCCTGCTTGACACACAAC-----------------ATTAGCAAATCTCTAGTTCGTAAGTCGGAGAAT-CAAGC-------ATCGCTTTACCTGCACAATCCCCAGAGGAAAGCCTCCCGAAATCAACCAACTTGTAGCGAATTCCACGGGTTCGCTTCCGAGAGCGTAGAAGATATGAATGCTATTAATTGTAAGGCAAACGCAATGTTCTCATTTTAATTTATATATTCGTAAATTAAATATACACAAACAAAGAAAACTGTAAAGCAAATCTAAACAAATTAAATAAAA
GAGAGAGCCTGTAAATTAGTGTGATTGTGCGTGTGCGTGTGCATGTGTGTGACTGACTCAATAAAAGCTGTGTGTGGGT-AGCG------TATAAGTCTAAGGATGTTAAAGCTGTAAACAAAGCAAACAGAATTAAAAAAAAAAAAACAAAAAAATCAACAACTCGCAGCGCATGACTTGCAATATACCCAAAAACAAAAATCTGTATATAGGCCACAAATCGATGTGCAACTAGTTTGCAGCAAGCAATGCGAGTTGTTTAAGTTTTGCTAAGATCTTTAACGCGACTAGTATAAGTCCCAATTACTCTTCTACTACTTCTACTACTATTACAACAACTACCGCTACTTGTACTTGCTCTTCTACTTCTATTCGAACTTCATCTATTTGTACATTATTTTGGCTGGGCGTTTCTTATACTTTCTGTGTGTTTGTTATCATTGCTTCTATTTTGTACTTAATTTTAATGAAAATTGTAAAATACTTTTGCACATTTTGATACAAATTATATAACATAGTATGCATAAGTTAAGCCAAAGAAAAGAAAATGTTTAAATATTTATCTAATAACTATATACTGTATCTGTATATGTATGTGTATAAATAAAGCAAGCAGGAAAGAAAACATAAAATACAAAACAAAAAACAAAAACAAAAACAAAAGAAAAAAAAACACACACACACACAAAAACCTATTTATGTAAATCT-ATTTAAATATGCTAAGAACAATAATAAAAACAAAACAACAACAACAACAACAACAACACTGGTGTGCAGCTT-GCGCTATGCTTCTGATTGCCCCTGCCACGCCCCCGCTTTAGTTGTCT--ACCAACAACAACAACAAGAACCTTTTATTAGCAAATCTTTAGCTT-TAAGCTTAACAATATAAACAATTTCAACTGCTTTTGTTGCACAGG--AAAAGAGAAAACCCAAAATAATTAATTAATTAATATATA--TATATATATATATATATGTGTGTGTACAATTATTGTTACCTAGCAAATTTAATGAGAATG---------CATACAAATCTACACACT---------AATGTAAGGCAACAACAACTACCGAAAA--AAATCTGAAAAACTCAAAAAAAA
>slbo 19839122 19840020|20314 chr2R 19839999 19841411 scaffold_1 6930030 6931466 + 71325|0 33
CCG----------CTG--CCAGCTAAAGCCAGTG
CTGTGATGATTGACTGAACGAGTGAAAGAGAGAG
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ATATTCACATTCAAGGCATATGAGAGAGTAAAATACATA---CAGTGTAAGCAAACGACATCCAGGTACTACGATATATTCGATGCGATCGGGGAG------------------------CGAACATTTTTAATGAGTGTGTAGGTAACTAATTGAAATATTAACAAATTGTTGGCCCCAGTTAATCCGAGTGACGCGGGGCCTGGTGCGAATCAAGCCGAAATCAAAGCGACATTTGTAGTGTCTGTGACACAGTACGCATATTTATACCTAACGATACGATACGATATATACAAGTACATATATATAAATATGAACGTTAAATATGAAGTAACGATACCGAGCAACAAG--AACAAGAACAAGCGTAAACAACCAACCAAACCAACCAACCCAAAAGACATGATTTACAACCACGCACACACATCCTAATGAAGCATATAGTACTGCAAACAATATATATCCGACCCCAGTCAACGCGAGTCGAGCAAACCAATCCGAAATACCTACATTTAGCCTTTAGACGTACATATTTAACACTCGATTACAAATAGATCACGTTTTGACTACCAAGAGAAAGGTTCGACATATAGGATTGCAACCAAGAACAGATGGACAGCATTTTGACG-------------ATGAGAGCAGATTTAATTGCATACAATCTAATTGTTTGGAAATATACTACGATATAT--------------------------AGTAATACATATATAATTTAAAGCTAACAATAAAAATGTGAATG
ATATGTATTATTGAAGCATATGAGAAA-TAAAATACATAAAATAGCTTAAGCGAAAGACAAGCACAAAGTA-AATATATACGTTACATAATGTGAGAAGCGCAATGAACAAAAGCAAAACCAAATCCTTTTTATCAATTTGTAGTTAACTAAAACAAGATACAACAAACTG---------GATAACCCCAACGGTGAGGTATCCG---------CAGCTGAAATCAAAGCAACATTTGTAGTCTCAATGGCACCACTCAAGTATATACATATACACAAATTATACTATATGTATGCATA---AGATATATATATATATGTTAAA------GTAAATAAACTTAAAGGCAAACCAACCAAA-------TGAAATACCAAATAA--CAACAAATCCAAAAGACATGATTTACAACCACGCACACA--TCCAAATGAAGCATGCAG------AAACGATACATAT------------------AACTACCCAAACAAGCCCCTAATAATTATATCGA----------------------------ATCACAAATTG-------TCGGA--ATCTGTGGAATGGTTCCAAAAACAAAA---AAACCAAAAAAAAATAAAAAGTATTATGCAACCAGCGTATTTATATGAAATGAGATTTAATTGCATACAATCTAATTGTTTGGAAACATACTACGATATATGAAATAACAAATAATTAAATTTAAAAAAAAATACATATATGAATTAAAGCTAACAATAAAAAAAAAAGTG
>mAcR-60C 19886236 19888366|20368 chr2R 19887134 19887975 scaffold_1 6981451 6982264 + 10808|0 901
GCAACCCTCCGCAGCACCTGGTCAAATCAGAATTATCAGGATGACCACAGTCCTCCACCAGGAGGAGGAAGATTCCATTTTGTTAGGCGTTTACGTACTGTTAGGTAGGCACATGCTCGATGCAAGAAGAATTTAATACAAATATAATGGATTACGATTTGCAATTC---------ATACATACACATATATAAGATATATATTTATTAT--------TATACACATGGCAAATGAGTTAGCTTAAGTTGTTGGCGAAAGACGGAGAGGCATAAACCAA----AAAAGCTTTAATACAAGTTCAAAGTAGGAGGATTAAGTTCCGCGGGCAACGAATGGCGGTTGCATCTTGGCCAACCAATGG-AATCGTTTTGTTCTCGTTACGATTTTCGTTGTG-TAGGCGGGGACGACATGATGGGATATGACATGTATTAATCGTACGGGGAATATTGTGATTGTACTGCTCGTTTCCAATAGTTAAA---TCTGTTTTTTTGTAC-----ATGTGTGTAGAAACCAAGATAGAAGGCCAAACAAGCGTCAACCGTGC--AAATCAA-----TTTGTAGACACATACCTGCTAATATATCGGAATATGTATGTATAAAAAAATAACGATTATTTGTATGTATTAAGAACGCAACCCACCATGGTTCGACAACTAAG-ACGAACCTTTTGTAACTG---------ACGTGGCG------AATGTACCCGCAACCGGGAT--GATCTTAGCCTCTTAACCAAAAAGTAACAGAGTAACGAGTAACAGTAACGCAAGCAATA-TGTTTGGGGCACGGGT---GTCGAAGAGATGGCCCAGTTGAGAAGGATCAGGCCACAGACACGGACGTGGGGCGGGAATCAAGGATCAAGGATCATAAGCGTGGGA
GCAGCCCTC-GTAGCTTCTAGTTAAAGCA--------------ACCACA-----TCACAAAGGAAA-------CCCATTTTGTTAGGCGTTTACTT----TTAGGTAGGCAAATGCTCCATGCAACAAGAATTTAATACAAATATAAAGGATTACGATTTGGAATACATTATATGAATAAATATATATACATAACAT-TATGTTAAATATAAAGAGAATATACCTATGGT-------TAAGCTTAAGTTGTTGGCG---------TATCCAAAAACCGAATTGAAAAGCTTTAAAAC-AGTTCAAACAA-------------CCGCGAGCAACGAATCGCAGGTGGCAATTTTCCAGGTGGCGATGACAGCCTGGATAATGCGTATGTCTACATTTTGTTAGCCTGGTATGTGATTATGCTGTTCGTTGTGTTTTTTTTATTTAAG-----TTTTGATAGTTTAGATCATCTTTTGTAAACCAAAGTTATATTTATAAGTACCAGAGGAGCGAGAAGTAGTAAAGGGAGAAG--CTAACAAACATCAACTATGCGTAAACCAAGCAAGTTTGTAG------------TATTAAATTAAAAAACAAAAGCAAAAAAGTGACACAAGTATATGTATCTAATAAGAACGTAACCCACCATAGTTCAACTACTAAGAACAAAACTTTTGTAACTGTTGATTAAAACTTTGTAAAAAACAAAACACAAGTGAACGATATAAAACGTAAAGAACTTAAGATACAATTGCAAGTTTATCGAACA--AATGACAAAAGCAATAGCAATTCAGGCACGCGTCACACCCAAGCGAGGG--CAGTCG---ATGGCCAAGAGAGAGAAAGAGAAAGAGAGAGAGAGGTAGGGAGAAACTATCGCAAATCTGAAA
>mAcR-60C 19886236 19888366|20369 chr2R 19887980 19889700 scaffold_1 6982749 6984520 + 53421|0 466
ATAATTAATACTTAATCACCCATCATCTGGCCGG------TTAACTACTAGTAGTTGCAATAAGTGTTGTGTGC-----------------------TAGAATTTTGGG---AGGCAGTAAAACCAAAACTAGGCTTAGGATTACCCATTGACAAGCAGTACTGATTTTTTGATGTCTAGCCCCCGAC-----------------TATATACACGCATCACCCTTCCCGGAGGGTTGCCATACATAATTACATAAGACAGTTTCAGATGGGATATTTCGCACAAAGATCAGAAATGAGTTCTCTATTG--------ATTGAAGATCT-AGTTAGACAGGAACTTTCACCTACTTACCTCTTC-------------CCAGCCAAGTTAGACCCACGAGGTTCGACCAACTGCTTCCAAGAAA------GCCAAAGATCTCATTAAGGTATCC---TTAGACTAGTTCC
AGATCCGGCAGCCGTT--CCCAAAACCCAAACAAACACATTCAATTCATAATAGTTGCAATAAATGTTGTGCGCAAAATTAAAACCAAAAATGAATGAAAAATTGTTAGCAAAAGCAAAAAAACCAAAACTAGGCTTAGG-TAACACTTTGACAAGCAGTACTGA-TTTTTGATGTCTAGCCCCCAATATATAAATATATAAATATATATATGTGTAATAACAATATCTGTGGGTTGCCCAATA--------------AGTTTCGCAT---ATGCCAAAGATAATACTCGCAAATCAATTTCCATTTGGACTCCATATTGGGAATCTAAATTGAACGTCAA---TCATTTAGAAAACTTTTCAGATATTTAAAAGCCAGATATTTGAGTGCCAGAGCATGTAAACGACATCATTCGAAGAGTTATATGCATAAAATATTATTATTATATTCTCATTAAAATAATTCC
>Plkk1 19899729 19900653|20381 chr2R 19899723 19901686 scaffold_1 6993611 6995630 + 30460|6 1052
GGCCAAGAAATCACAGTGCCCGGGGACGGGAAGCAGCCTGTCGAACCGGCGAACAAAGGAACTGCAGCGGCAGCAGCTATGACAGCTATGCAGAACGTAACAAAACAATTGTCAGCCATCCATTAAGGCTTCCGCCAGAGATTGAGCGCCTCTGCTTTGCT-----------------------TATATATGTATATGTAAGAGAGAGTATATATGT---TTTAGATGGTCATGTATGTATGTAAGTCGGGCCAAGCAGCGCG----TCGGGTCAAGCTTAGTTTTTGTGTCGTAAATGTATTGCATAAG-TTTAATTTTATTATCCTT---CAGTGTACGTTAGC----CTATTGTTCTATTACT----ATTATTATTATTAC--TGTACATGTCTATCGATCTGTCGAAATTCAACGCGATACAATACCATATCTTCGAATATACATGTTACATGTATATACATACATATATGTTATG-------TATGCGAG-----AACCGTCGTGGGCA------AAAT-------TAAATTTACTTAATATTTATCTACGTTTAGCACACCACTC---------ACACTCCCGCAGACAAGAGGACAAACATACATACGTACACCAAACAA------------ATATTTTTTGTTGACCTTATCGCTATTGTAAATATATCTATAGTACTTGTATCTT------------------AGCTATGCAACTTAACACACACACATACACACTAGAGACAGAGACAC-----------ATCCACGGAAAGTTTAGCAAAAGTTAATGTGTAGCAACAGAAGAAATATGTGAGATGTTGGGATTCCA--TGAAACAAATTGTGTGAGCGCTCGAGTTTTGAGCTGCAGACGGACGTAGATATGCAGATCGATAATGA-GGGGCCGTCGGGTAACAGTAAACGATATTTATATTTGTACAAGTTTATGCTTATATATTTTATATAAATATATATATATATATTTAAAATAAACAAAAACAATATTCAACAAAAAAATATTAAAAGAAAGAAAAAGAC
GCCCC-----------------------GGCAGCAGC----------------------AGCCGCGGCAGGAGCAG------CAGCTATGC------------AACAATTGTCAGCCATCCATGAAGGCTAACGCTAAAAG--GCGCATCCCTATCCCACTCCACGTATCTATTAAATACATAATATATATGTATATATGCATAGATATATAAATATATATATATATATATATACATATATATGGTAAATGCCAAGCAGCGCATCGTTCGGGTCAAGC-AAAAATTTGTGTCGTTAAACTTAAGCATAAGACGTAATTTTACTTTTTTTTTGCATTGTATTTTAGCCTAACTATTATTCAATTACTCATACTTACTATAATAACTATGTACATGTCT-----TATCTCTAACTCTCAAGCAACTGGCAACTATATATATATATATCTATCATAAATATATATATATATATATAAATATTGATCGTAATATGCGAGCAGCAAACCAACCAGAGCAGCAAACAAATATTCTACTTAATATGCATAATATATATACATAATTA-TATATTAATTGTTATCCAAACACAAAAATAGACAAAAAACACAAAATCAGAATTAACAAAAAACAAAAACAAACACACAGATCTTTTGTTGACCTTATCGCTTTTGTAAATATACTTACA-TAGTTATGTATTATTCATAATTAATGAGTAAACCATATACTTAAACCTTAATACAGACATACAATACATAGGTATATGATATGAGTTGGTATATGG-GAGTTTAGCAAAAGTTATTGTGGCACATC---TTAAATATGTTAGACGGTGGGATTCCAATTGGAATGAAGCGTGTGA-------------GAGATGAGAAATGATG-AGATATGAGACAAGCGAGAGACAGAGACGCTGGAATATGATAAAGGATATTTATATTTGTAAACGTTTATGCTTATATATTTTATATATACATATATATATATATTTAAATTTAATACAAGAAAAATGCAAACAAACAA----AAAATAAATTAAAATAT
>Plkk1 19903023 19903618|20382 chr2R 19901758 19903149 scaffold_1 6995699 6997156 + 46419|1373 1515
GCTGAACTTAATCCAATTAT-------TTTTTCAACTTTTTCTCTCTCTTTACACCC--ACGCAAATGCATTCACTTTGGTGGCCTACT---GTACCTACT----ACTACCTACAAAACTTAACCAAAAACAAAAAACCGAAA
GCTCAACAAAATCAAATTATATATATTTTGATCAACTTTTTCTCTCTCTTTACACCCCCACGCAAATGCATACACTTTGGTGGCCTACTACTGTACCTACTCAATACTACCTACAAAACTAAAAACAAAACAAAAAAAAAAAA
>Plkk1 19903023 19903618|20383 chr2R 19903150 19903246 scaffold_6 3143898 3144010 - 259|0 112
GAATTGAAAGGCGTGTCTGCCACTGAT--ACGAGAACTG--------------GGACAAAGACAGACGAACCCCAAGCTCATCTTCAAACCGCTGCAACTAGATTGAACCAAG
GAATTGGCAGCAGTAGCCGGCATTGATTAACATGGGCTGCTTGAAAATTGCTTGGAAACTGAATTTAAAACCCAAACATAGCCCTTCAACATCTGGAAGTAAACCATACACGG
>Plkk1 19903023 19903618|20384 chr2R 19903315 19906884 scaffold_1 6998124 7001848 + 154227|0 363
GATCCG------CCCAAGAGCGCTCTCA----------------GCCAAAAGCTCTCCGCCCTATTTCGTTGGTGTTATGTGTTTTT-TAATGTACAAAGTAGATCAACTCGTTTGATA-TAAGTTGGTA-ATGATACT--------TATTGTATATTGATTGGTTTAC---GGTAAACTGTGGTGTCTTGTGCT-CCCTATATCCTTTA-----------AAACTGAAACCCATCCCGACCCGTTCCGTCAAAGTTGT-----------GCGGTTTGTAGATGAGCATTATTCGACGTGAAGATGTGAAACAGGTGGAATAACTATTGGTCGTTTAATTGTCTGCT-TGTCATACAGTTAAAC
AACCCAATTGTCCCCAACAGCCCCTACAAGCCAAGGCTAGTTTTGTCAAAAGCTATTCGCCTCATTTTGTTGGTGTTTTGTGTTTTTGTACAGTTGTGCGTAGTTTATTTGGATTGATCTTAAGTTAGTATTTAATACTGTTGTAAATATTATGCATTTTTTGGTTTACGGTGGTGATTTGTGGTGTCTTGTGCTACCCCATTTGACTCAGCCCCCGCCCCAACCCAAACCCTGCCCCGCCCCGCCCCGCCCGTTCTGTCAAACGCCACAACGTTTTGCATTTGAGTGTT------------------------GAGCAATAATTTTACGGCTTATAATTATGTGCTATATCTTACAACTGAAC
>SerT 19912195 19913051|20388 chr2R 19912187 19912805 scaffold_1 7008004 7008783 + 6086|8 814
CGGATCAGCAGCGATATCATTAGCTCTAGTCTTAGGCAGTCGCACAGCCATAGTTTAAGCCTCTGCTCGGT------GCAGAGCAATCCCATGGCGACCACCAGGATCCCACTTGCTGCCGAGGACAATAACTGCTCGCTGCGACTCAGCAGCTGCCAGCCGCTTAAGTTCCCGCTGGCCAGCGAGTGGCTGGTCTAA--------------------GTGAGCCTCCAGTC----TACACCGGAGTC-CTGCAAATCAGCCATTT---------------------------------------------TGCAGGACTCCCGTGCATAGTGCTACAAT--TCGGAAAGGAGGTGCCAGG------------------AACTCAATGTTTGATCTAG-------------------------------------TTTCTGATTGCTTTGCAAGCACATAGTGAAC------------CTAAGTATTCTAGTTGTTGGGTCATCGATGGTGTTAGCAATGGAACCCTTAGCC-TTAGTTCGTAAGCGTTAACTAGCTCAGCTGTAAGTCAAGTGAAATTTGGT--AAAATGCTTTCTAA---------------GTAATAACTGCTCTAAGATA------GAGAACGCCCTGTACAATGCAT---------------------TACTCAACCGTTTTT------GTGCTCGGGGAAAGGCAATCGTAAGTCAGCCATTTACGTTGCCTCTCCAGCGAGTTTAGTTTGTTTTAAAATATAATTTCGGTTTTACGAAATACAAAAACAC
CGGAATAGCAATGATATTATTACATATAGTGCTAGTGCTAGTCTTAGCCATAGTTTAAGTCTCGGCTCGGTCAACGAGAAAAGCTATCCAA------------------CAACTGCTGCCGAGGACAATAACTGCGCCCTGAGGATCACCAGCTGCAAGCCGCTCAAATTTCCCCTGGCCAGTGAGTGGTTGGTTTAAACAACATGATGTTGAAGAAGGTGACACAATTGTTATAATACAAATAAATCTCTGCAAA-CAGCCATTTGCAGAGGTTTTCTTTTTGGCCAGCTGCTCACGTTACATTTTATACTGCAAGTATTTATCGTATAAAGTTATAATAATTGTAATTGTAATACCGTATACCGATTGTTAGTGCACAACTCATTGTTTAAACTAGCCTAAAATACTCGCCAAATCTACAAGCTATCTAAAACTTACAACTTACTATATATATATATACAATATCAAAAATATTAACTAAGTATTATTGTAGTTCAGTAAAGAAGAGTAATTCAAGCTGTTCCATTTTCTATTAGAATATA---GTTAAATAATAATTGTATAATGTGAAAGTAAATTGGTAAAAAATGCTTTTTAATAGCATTATCGCAAGGTAATAACACATTAGCTACACTCGTTAAGAAGACCCTGTACAATGCATATGCCTAAGTCTAGACTCTCACAGTCAACCTTCTTCTTCTTGGTCCACTGCAAAAAACAATTGTAGAACAGCCATTTACAATTGTTTTTTGATGATATT-----------AAATATAATTTTGGTAGTA--AAAAAAAAAAACAA
>SerT 19912195 19913051|20389 chr2R 19912877 19913562 scaffold_1 7008864 7009566 + 28178|0 200
CATGACCACGCCCAGGTTCACGTCAACATCCGCACCAGC------------------TGCACGAG--------CATCAAGATCTACAACCTCAACTGCAGCAGCAACAGCAACAGCTTGTCACCAACAACCTCAGGGGCCGAGGGAAGGAGCTGCTACTCAACTAATCTCAACTGCAACCATTCCTGCCCGTCGGAAGATC
CATGACAATGCT---GTGCATTTGAATATACACACCAGCAGAAACTATAATTTAAATTGTAAAAGCTTTTCACCAACAACAACAACAACAACAACAACAAAATTAACAGCAACAGCCAATAA--AACAACATCAGATGTTGGCAGTAGCAGTAATAAACTGCTGGATTTCAACAGTTACTACGCTTACCACACAAATAATC
>eyc 19931526 19931554|20412 chr2R 19930750 19932619 scaffold_684 633 2653 + 54339|872 907
AAGGCAGTTGTATACATGTT------TAAAT-ATCT
AAATATGTAATATCCATATTGTATAATAAATCATAT
>CG4563 19958682 19958800|20439 chr2R 19958685 19958785 scaffold_16 12861 12947 + 1253|0 100
TGTACTTTTAAAATTGAGCTACCTGGTTTAATGTGAGGACAAAATTAAGTTCTTGTTGCTTGTTGTTAATTCGTGATAATTAAAACTTACATTTGATAGAT
TCTAGTTTTCCTATTTATTCGTTTAAATTAATTGCAAAACAAAAATAAATTTCTA---------GATAAT-----ATAAACAAAACTTATGCGTAATAAAT
>Pros28.1B 20008459 20008784|20491 chr2R 20008405 20010927 scaffold_16 90605 92891 + 32930|54 479
TTTTGGCCGGCCACCCTGATCCATTCT------------GTTCGCCATGGCCCCTGGCCATTTTCATGACC---------AATCAAAAGTTGATAACCGGTCGTGCTCTCTTTTTCTGGGCAATTCAATTTCGGCCGGGGA---GTTGGAG-----AAAAGTAATCAGCAGGAAAAATGTGTAAAGCGGGCAAATCACTTAATTTGTCTCCAGGGCGTATTTGTTTACTTT-----------ATATCCCTCTCCGGCGTAGACGCGTACGCT---------------------CCTTT---------------------CAGGCCAACCAAGTTAAAAAGTTTTAAGTGAAAATGCGAATTGAATTTGTAGAGGAAAAAT-----------AAGAAAGTGCGCGCACACATGCAGAAAA-------
--TTAGTAGATATATATGATATATTTTCTTCTTTGTTAAATTCACGTTAGCCAGCGGCACATTTGTTAACCTTTCGGCCTAATCAAGACTTGATGAA----------CTTTTTCTTTTGGCAATTTAATTTTAACCTCTGCCCTTTCGGGGCCAGCAAAAGTAATCAGCACGAAAAATCTGTAAAGTGAGCAAATCACTTAATTTGCCTCAAGGGCATTTTTATGTACTTCGAGCATCGAAAACTCCACACTCAATCCTAAACGGGCCAGTCGACCTAGCCAAACTTGGCCAGCCTTTGTGTGCGGACAGCGGATGGCATAAAAAAAGCGAGTTAAGAACTTTTAAGTGAAAATGGAAATTGAATTTGC---GCCAAAATTGCATGCCGGCACAAACCTACACACACACACACACAGAAATACACT
>CG4589 20017362 20017685|20500 chr2R 20016992 20017414 scaffold_16 110469 110898 + 4150|409 481
CATATATCTTGA------------------TTTCCAACGACCTAGTTTTACATAAAACCCATTCGA--AGCAA
CAAATATCTTAAAATATTTACTTTCTTTTTTTTTTACCGCCCTAGTTTTATAT-GTACTCATCCGGTCAATCA
>CG4589 20017362 20017685|20501 chr2R 20017434 20020808 scaffold_16 110930 114405 + 126864|0 292
CCAGTCAGACGGTCCAAGAAGGGAGATGCTGAGACAACTCTTAAGCGTGAACCTAAGCCGA---AGTGATGTGTTGGAGTAGGGGCGGTGGCGGTGTTGCTCGTGTGTC-----CCATATTGTTCCGACTAT------------------GCAATGAATTAACTGT--------TACCATTTAACATAAACGTAGCAGGAT--GAGGAGAGTTTGCTATACTTAACGCGTGGCTGTAGTACGGTATCTTCTTTAAGTAA-GGCACAAATCAGAAAC----TACTAGAAATACA
CCGG------------AAAAGCCACAGGCGAACCCGTTAATTAAGATTGAACCGAAGCTTACCCAGAGCAAGCCTGGGGAAAAATAGGCCG-GCTATCTACCCTACGTCCATAACTATTTGATTGCGATTCTATTTATTATATTATTATCACAAAAAGTTAGCTAGAACAGCAATTCCATAGAAAATGTATTTAGATTGATCCTAGGAGGAGCTCCTAT-----TCGCGAGGCTGTATTA-AGTATGTGTAACAAAAAATTGCACAACTCAGATACTATTTACTATAAATACA
>CG4612 20031284 20031917|20510 chr2R 20029981 20031449 scaffold_4 3738611 3740054 + 16633|1483 1655
CCCTTGGCA--TTAAGTCTAGATCGTGCGATCGCAAC-----TAGAGCTACGCCCAGCTCAGTCCTGGGCAACATATGAATATTTACACTTACCTAATATATATGTATTAAAACCAAACTAAACCAAGAAACAAAGCAAAACGAAAACAAACAAAAAAAGAACAAAAAACAAA
CAATTAGCAAGTGAAATCTAGG-CGAGCGGCGAAAACAAATATATAGCTA--CCATGTCAAGTCATGGGCAAATAATGAATATTTACACATAC----------TATATTAAA----------------CAACAAAAAAAAATTACAAATAATAAAAACA--------------
>CG4612 20031284 20031917|20511 chr2R 20031491 20033641 scaffold_4 3740105 3742637 + 66400|0 582
-GCTTCGGCGGCGGCAGCTGATCCAAGGACATCGCTAG------------------GAGTTGACTTGGAACCC---------------ACACACATACA-------------------------------------------ATACACACCCATATATAAACCTATATAGATATTTACGAGAAATTGTATCGAGCAGCTAGGCGGACATTCAG--GCAGCAGACGGACGGGAGGCAGCTCCTTCG----CATATACACTTAGATGTAGGCAAAAGTCTTGCA------------------------ACACAGTTGAAATTTATAGAAAGAACACAGGGCAGAAACAAAGGGAGGGAGAGGCAGAAAACGAGCTCTCAACCGAAAGGATTTT------CTAGGCATTAGGACAACAATTTCTTA-----GCACTCACTAGCGTTTTTTTGG---------AATTAGATGTTTGTCTTTACTGTTGAATTTAGTGAG--CAGGGGCT----------------------------TTGCTGTCAGCTTCTCGCCTAAAGAACACATTGCGTACACACACGTATTT
TGCACTTTCAACGGAAG--GATCTATCGCCGTTGCGAGCGATGCTGAAGTAATAAAAAGTTTGTTTAGAGCCCCACATAACATACACTACACACACACACACCCACACACACATCTATAACTATATATATATATATATATATATATATATATATATACACATATATATGGATATTTACAGAAAATAATATTGTGCATCAAGCAAAAGATCCAAACACAGCAAGCACAGAAGAGACAACACACACACACCCACACACATTTAGGCGTAGGCAGCTCACACACACACACACCTCCCCCACACACACACACACACTTGAGTTCTGCA----------AAGGCAGAACTATCAGAAAAGAAAAATTTAAA------TCACACTTAAAAAGATTTCTAAATACTAGAGATTAATATGA-AATCTTTTATAAACAAATTCGCTAGTTTTTCTTTAACTTCTTTTCGATTAGATGTTTGTCTCT--TGTTGAATTTACCGAGCACAGAAGCTAAAAAAAAAAAAAATTAAAAAAAAAAAGATAAGAGCAGCTTCTAGCTTCAAGAACAGAGTGCGTACACGCATACTTCT
>CG4622 20040967 20041100|20522 chr2R 20041095 20041969 scaffold_4 5912872 5913737 + 26700|0 5
CGAGAC
TGAGCC
>Nurf-38 20066564 20066700|20550 chr2R 20066172 20068888 scaffold_4 5945606 5948229 + 61791|409 561
GATGTTCTCCTGGGCTGATTCCAT--CACAAGATCCATGATCTATCTGTAGTCCAATCGAATCGAAAATGCTTGCACTTGTGAATTATTAATACTGAAATATTATCGTACGTTGAATAAAGTTTTGCACCGCAATC--------------AAA
ACCGCACGCGCGACTGGAATAGATTGCCCAAGATTTTCAATTGAATTCCAACACACTCGATGTAAAACT-----------TGAAAAAAGAAAAACAACTCACATTTAAAAAATGAATAAAGCTCT--AATGCAAGCCCAAAGTGCGGGCAAAA
>CG12252 20075587 20076059|20553 chr2R 20075278 20075793 scaffold_4 5954797 5955343 + 19124|318 567
TACATTCTTGAATCAAAAAC-----TCTCATTCTGATCTAATGTAAATTGAAGCCTACTGTAAATGTAAATGTTTTAAAAATAAATTCCGTTTCAGCGGACTAGTACCTAGTGTTTAATTTTAAAACGA---ATGTACACCACACCAGTAGTTGTTTATTGTTTGCGTTGTGTTTGTAATACAAATT---CACATTAA--------------------------------ACTTGAACAAATATACTAGT
TAAATTGTAAAATCAAAAACAAATATCTCATTGTAA------GTAAATCG--------CGTAAATGTAAATGTTTTAAAAATAAATTCCGTTGAAACGGACTAGTAAATAGTGTTTAATTTAATAACAACTCGTGTACACAACTCTAATTATTTATTGTTGTGTGCGT---GTGTACAATACAGGTTAAACAAATTGATGTACATAGGCTCATAATTCCGTTTTTCCACAAAGTAAATAAATGTACATAT
>CG12252 20075587 20076059|20554 chr2R 20075849 20075885 scaffold_4 5955500 5955536 + 2541|0 36
GGTTCGTACTGTATGTATTAGCTGTTAATATGTACTT
GATGCGTACTGTATGTATTAGTAGTTAATATGTATCT
>CG12252 20075587 20076059|20555 chr2R 20076052 20077965 scaffold_4 5955840 5957837 + 78018|0 7
AAATTCTG
AAAATTTG
>IFa 20085174 20085174|20561 chr2R 20082587 20087202 scaffold_4 5962001 5966962 + 121325|2843 2843
A
A
>CG4681 20085839 20085947|20561 chr2R 20082587 20087202 scaffold_4 5962001 5966962 + 121325|3542 3690
GCCCTC----CTGCATTATGAAATCCAGCCTAGGTTAAGCAT--------------AACTCAGCTATGTACATAAGTGGAATAT---AATTACATTTTATGGTCTCACTCG-------------AAAAAC-----TCCCCAAG-CAATC
GGTCTCAAAGCTGATCAATTTAATTTATTTTAATTTCGGAACTAGTGCTTATTTGAATCGCTTGTACTTAATTAAATGTAGTATAACAATTAAATTTTATGTTAGGACACGCCAAAGAAAAAAAAAAAACCAATTCCCTCAAGTCATTT
>CG4692 20106685 20106852|20586 chr2R 20106699 20109815 scaffold_4 6003032 6006359 + 87607|0 171
GCGGCGCTGCCCGGT--GGTCCTGCA--------TCTGCAACAG-------ATTCTACACTTTCCACAAGGCGTGCGAGAGGCGGGCAATCACCACTAAACTATATCTATTTGGCTTTTGTGTTTTGAAAACTGCTTAAGTGAATAAA-ACGGCTGCGAATATCCATGCTGC
GCGGTTCATCTCGTTTAAGCTCTTCAGTGTACACTTTGTAATTATAACTTTATTGTTGCCATTCGATAAAGTGGGAGAGTTAAAAAAAACACACAACACACGACAACACAATACATTTCTTGTTTTGAAGACGGCCAATTCTAATAAATATGTCTGCGAATAACTGTGCTGC
>CG4707 20112194 20112298|20589 chr2R 20111016 20114586 scaffold_45 855611 859165 + 124764|1192 1301
CATTTGTC---CATTTACGACAT--CCATAGATAGTAGATAAATCGTCAACCATTATTATTAACTCGCACTTAACACAGATAAGTTAAGCCATAAATAAGTAGACGTGGA
TATTTAATAAGTATTTATGACATAGAAATAGATAAAAGAAGGA-----ACTCATAAATAT--------ACTTCATACAAGTA--------CATCCATAGATAACAGTTTG
>CG13594 20123021 20123799|20594 chr2R 20122972 20123752 scaffold_45 182541 183284 - 1958|64 833
GTCCGCACACTGCAGCTAATTAAAGTTTAACAACGGTCAGGTCGGAGCCCATTAATTGCAACTGACACCTA-GCACAGTGGCTGCCAATTGTACGCGGACACAGCGCGGCTGGTGTTTGCGTTGCATTTATTTTCTTACTTTTCATTTTGTTTT-CAATTAAGTTCGATGCAAATAGAGCATATGGCTAACGGGAAGCCTCCGCTGCCATATATCCTGCATAAATACGCAATATGTGGCCTGTGTGTGTGTGGGTGTGTGTGTCTAGTGGCATTGTGCAAACGTGGATAGTTGGCGAGCGTGACGAAC------------------TGGTCAACAAATCGCAAATAAATTAATTGGGAATTGCAATTTCAATTCAATCCAATTCCGAAGCAGCGGAAGCTCAATTGAAAACCAGA-AGTGTTCCGGCGATGGCGATTATCAGTGAACATAAACCACATATGGAAAAACAATGAAAACCCAAAGCGAAGTGTGCCAACCAATCTCATATTCAAATATGAATGTTATCGAGTTGCAATGAGTGTAAGCCAAATCG--AATTCATTG--GGATTATGCAGCTCGTAATCTGAAAACACAACTACTTGAAAATTCAATGAAATATTTATCC----------CTAATCTGTGTAAAGGGTCTATGTTGTTAGTGCTTAAGTATGTAAGAATTTTAGTG--TGATGCTTTTCGTTCG-TTCATTGATTTCAAATCAAAGAGAAACATTGAAAATATATATTTGTGTTGGAAAAGAA
GTCAACAAGACGCAGCTAATTAAATTTCAA-------CTGAATAAAGCATGTTAATTGCATCTGACACTCACAAACAGTGCGTGCAAATAGTACACACACA-------ACAGATATGTG---TGTGTGTGTGTGTGTGCTTTTCATTTAGTTTTCCAATTAAATT-------------GCAACACGCCAAAGGCAACAGTCAACAGGCAGAAAGT---TAAGAGTGCGGAAATTGAAACAAGTAAAAGCATGAATATG-ATATTAAAGAGAATTGAATACAAATAGAAAATT-ATAATCGCCATATACACAATATATATATATATATAATAACCTATACGCAATTGCACTTTATGATATTTGTTTATTGGATT---TCCACTTCGAAAGAAACAAA----------TAAACCAAATACTGTGCCAAC--------TTATCAACAAAAA-AAAAAAAAAACACAAATAGAATGAAACCCTAAA-CAAAATCTAGAAAT--------------ATTATGAA-GTTAGCGTGTAACATGAAGCTAAATATTAACTGGTAGTTAAATGATGAATGTTGATGTTAGTCATGCATATATACAAACGTATATATATTTATCTATATATATATATAAATAATTAAATAATTAATGTGAGTAATTCGAATTGTT-GTATTGAATCGGAGAAACTTTCTTGTGTCTGGTGCTTTTTATTCGTTTTATTGATTTCAAATCA------------GAATATATATGTTTGAAAACTCAAAGCA
>CG13594 20123021 20123799|20595 chr2R 20123788 20124451 scaffold_45 183341 184044 - -3521|0 11
GTGACGCGCTGG
ATGATTAACCGA
>CG13594 20128302 20128307|20599 chr2R 20128182 20128691 scaffold_45 194056 194618 - 10438|121 126
ATCCAG
ATTAAG
>CG4781 20148283 20148402|20631 chr2R 20148169 20148355 scaffold_4 4826975 4827160 + 277|121 200
TAAAATCGCCAAACAGAAA---ATGTAAA-GCATTTTAATCTAGTGGAAGTTACATTTGAAATA---TATTTAAGAAAGT
TAAAATATCTAAACAAAAATATATTTAATTATATTTTCATTTAAATGTTTTTGAATTCAAAAAGGGCTATTTAA-----T
>CG4781 20148283 20148402|20632 chr2R 20148369 20149830 scaffold_45 224779 226281 - 52992|0 50
-TGTC-----------------GCCCAGTACCTAGTACCGTCTAAGTTCTT
TTGTCTTGTGCGACTAGACAAGGCCCAATACTTAAGTCTGTGTTAATTTTT
>CG30161 20171128 20171173|20650 chr2R 20170570 20171339 scaffold_45 244962 245813 - 3755|651 708
TTTTCA---AATTC-ATTGTTGATGATT--------AAATGTTCTTTTAGTAGCAAAA
TTTCCACGGAGTTCAACTGTTGCTGATTTTCATTTCAGTTTTTTTTTTTTT-------
>Mmp1 20178894 20179742|20654 chr2R 20177290 20179940 scaffold_45 251577 254382 - 40660|1815 2773
AAGAGCTAAGAGATACCAGCGACCTACGGGCAGTGCATTTGT--GAACCTTAGG-----ATCAACGCTA-GCCACTCGAGTAAAGTTTCCAAAATTTTACTGCACGTTG-----------------GACACCGAAGTGCTTGAAATTCAAATGTTACGCACATCATATCGAATACGATGAGAGGAAATCCAAAAAAGAATAATGAAAACATACAAATTGAAATCGAACAGAATATCAATTGTAAATTGAGCGATCAGCATGTGACACAGGTGCCTTATCAAATACTTTTGTTGTTGTGTAAATA----------AAATCAGCCTTAAATATAATG-------------AAATAGTTTATAACATTCC-------------GCATTCAAATCACAAAAC----GATCAAAAGTCATATCAAACCAGAAGTTCTCTACGTAGTTTTGCTGTTTTGGTAATGACAAATTGCGATATTAAATTTAACGAGCCATATGCAAGGAATTGGAGAGAACCAAACAAAAATAAAATACTGAGCAT-TGAACGTAATTT-AGTTTAGATATAATTGTTAATGTCGGCACATGGGAAAGGAGCTCCGCATGCTCCTCCAGCTGTGCTACAATTTCGCAAACTCAAGTGTTTTAAG----TTTACAAAACGATACGTGACTTGACCATATATAAACTAATATGAAAA----TCATCATCGAGTACATATGATTATTATATAAGTG----ATATTTAAGACAGTCCATTAAACGATATTTTTTCGGGTTTAATATTTAAAACCGAAATATTATTTAACTTACGTATTATTATGTATTATTATTAATATTATATACCATAAATGTACGCTGAAATA-------AGAGAAACTGAACAAAAACGAAAACGAA-GATACAACAAATAA-----------------------AGAAACAGAAGTCCAATAAAAAAT
AATAACTGAACGTTGC------------------GCATTTCTTAGAAATTTAGTTATCCATGGATAATATACAATTTTAGTAAAGTTTATACAATTTAAGCGCACGTTGCAAGAGATTCAGTTCAGGCTACCAAAAT-----ATATTTGAATTTTGTAT--------TCGAATATAATACGA------CTTATAAAACAAAGTATATATATATAAAT------------ACATATATGATGTGAA------------------ACACAGGTGCCTTAAAA-------TCGTTGTTGTGTAAATACAAAAGCAGAAAAGCAGCATTAAATGTAATTTAACTTAAATCTTAAATAGTTATTAACATTCCATAAAATTGGAAAGTATGCAAA--ACTAAACAGGAGATCAGAATTCATATCATAGCCGAGACTACGAGTATAATATG--TAACTTAAAGATGACAATTTGCGATATTAACTATAACGAGCCATATGAAAAAAA--------------ACAAAAAAAAATCGATCAACATATGAACATATTTTTAGTTTAGTTCGAATTGTTACC--CGACAAAT-----------------------TCAAGCCGTGTAACAATT-----AACTATAGAAATTAAGGCTCTTTAATCAAAGGACATAGGA-TCGTAAAAAAAAAAAAAAAAACGAACACATTTGATCATTATATATGTATACTTAATTTGTAAGTGTATGATTGTAAGAAAAGTC--TTAAGCGATATTTGTTCGGGTTTAATATTTAAAACCGAAATATTATTTAATTTACGTACTATTAT----TATGATGACAATTTTATAAAAT---TGTACGTTGCAAAAGTGATCGAAAAACATTAAATAAAAATAAATATGAATGTTAAAACTACTACTCTATCCACTACTAAGCTATCCTACACACACATGTATATATATATAT
>Mmp1 20182266 20182537|20656 chr2R 20180601 20184321 scaffold_45 255528 259825 - 111094|2105 2519
GCTCGAATCGATCT-------------ACTGGATCCACGAATATCGAAT--------------CCCGAACTCTGAAAGTCAAAAAGATCTCATAGAAAGAAGTCTTGTATGAGTTGTTACTT------AGCGAGAAGCA---GTTACAAGTAATGAAA----TGATAATATT-----------------------AATAAATCC-TATCTTTATGGTATGTTTAATTAAGTTAATGTCTA-------------------------TGTAGTGAAATTCTAGTACTCAAGTCGAATGTGTTTGTCTTTGTTGCCTA------------------TGGAAGAAAT------------------------------------ACATTTATAATACCTATTGAAAAACTAATTACCAAA
GTCCCAAGCGGATTCGATAGTAGCTGAACTGTAAACA-AAATATTTAATAGAAATTCGAAAGATCGAAACT---AAAGTCAAAAAGATCTCATAAACA-------TGTATGAGTTGTTATTTCTTACCAGCCAAAAAAATGTTTTAAAAATCCTTAAAAATCTGGCAGTCTCTCCACACAGAGACGTATCCATTAAATGAATTTATACAAATATGGTATGTTTAATTAAGTTTATATATGTATCGTATCGTACTCGTACTCGTATTGTAGTTCAATTCTATTATTGAAGTC-AATGTGTTTGTTTTTATTGCCCAGCAAATAACGTTTGAACCTGAAAAAAAGAAAAAACAAAAACAAAAAAGAACATAAAAGAAAAGAAAATACATTATTTTTATTG-AAAACTAATTCTCGAA
>ST6Gal 20199015 20199141|20670 chr2R 20198937 20199227 scaffold_6080 1177 1500 - 6192|82 260
AGAGGAGCGCGATTCCCAGTTGCCAGTTCGCAGTTTGCAGGCGGAAGTGG----CAGTGACAAACCAGGTGCAT-----TTAATCAAGTGGTTTTCATCGAG-------------------------------------------TGCAATAAACAATTCAACTTTGCAATGAATACAA
-------------------TCCCCGATCCGCCACGCTCCCTCGGATCCGGTGTCCAGTGACAATCAACGTGCATTAAACTTAATCAAGCGGTTTCACACAAGTTTCAAGTAGCTAAAAAAAAACAAAAATAACAAAAGGAGAGGCTGCAGTTAGTTATATGTATTTGCGATCAATAAAC
>CG16936 20274316 20274440|20747 chr2R 20274181 20274358 scaffold_4 5720320 5720484 - -388|135 179
AAGATTTTAGCAGTTACAGCGACT--TTGATCGATCCTTTATTAA
AAAAGGCGCACAGATGTA-CGGCTTGTTTATTGTCTGTAGATTAC
>Eps-15 20275914 20276280|20750 chr2R 20275909 20276077 scaffold_45 608502 608669 - 2725|5 182
GGCGAATAGAGAAGTCCAACAAAGCCGCAGCTGGTATTAAATGCTTCATGCTATATACAACTACATATATATAATTTCGCGTAACCACATACTCGTAGA--GCCTAATCATGTTGCGATTTTTAACATGT--ACCAAAACCCTATGAATAAAC----------GTACGAAATAACATC
GGCGAAAGCAAAATCCCCAAAA------TGCTGGTATTATATACATTATATCATATTTAATAGTTAATATATAAT---------CGACATACTCGTTGACGTGCTTCTAATAACGCGTTTACACGCATGTACACCAAAACTCTATGAATAAACCAAGAGAAATATACAAAACGCCTCT
>Eps-15 20275914 20276280|20751 chr2R 20276106 20278996 scaffold_45 608696 612141 - 25519|0 264
ATTAT----------------ATGAAAACCTTGGT----------------------GGGTTGGATGTGATTGACCCATGAGAAGTTGCAGTGGCACATGCAATGGC------------TTCTCTATTCGCACCCAAT----------------------CCGTTCTTTAGTGTTAGTGCTTTCTTTCCGCTTC--GATCAAGACATCCTGGAG----------------GCACACACGTACATATGTAGCTTCCATGGTATTTA
ATAGTTCTCGAATCCAAAACAAAACAAACATTAGTTAAAACAACAGTTACAAATGTGATGTTGCATACGAACAATCTCTAAATAACGACACGAATGTCCGCAATAACCAGATATAGCTGTGCTCCGGTTAAAAGCAACTTTCCAAAATCGTTAAATATTATCGCTTTCAATTGTTATAGTTTATTTTGTGCTCCATAATGAACACTGTTTGGCAATTGTCATTGTGTATTATATCTACATATATATGTATATTCCGTAGTGTGTA
>CG30426 20283136 20283193|20753 chr2R 20282445 20285022 scaffold_45 615738 618230 - 88443|742 814
GTTCTAGCTTAAGTTAGAGA----------TCCA----TACAGGAAATATACTCATTAAAGA-AGAATTAGAA
ATTAAATACCTATTTATATAGTTTGCTGCTTCCAGTTGTTAAGCAATGAAGCACATTAAGAATAAAACTATAA
>CG16912 20289321 20289399|20756 chr2R 20288555 20293649 scaffold_45 622273 627527 - 181349|808 901
TTAACA-----GTAAACCTCTTATCCGGTAATGTTAACTTTTAATTGTTGTTAAATAA-------TCATAGAATGGCTTACATT---GTAAGAA
TAAAAATATATACACATTTGTTTTCTAATA--------TTTAAGTTATATTTAAATAATAGTCTTTTACTAAGTTG-TTACATTAGCGTATTAA
>key 20293112 20293154|20756 chr2R 20288555 20293649 scaffold_45 622273 627527 - 181349|4812 4868
GC-----ACAATTTCT--TACCA-------TATTAATAAATTTATATATATATATAT
TCGGTTCACAATATCAAATACAAAAAGTTTTATTTAAAAAATTATACATATATATAT
>Reg-5 20295603 20295887|20759 chr2R 20295283 20296783 scaffold_45 631453 633149 - 31828|385 734
GATCGCGGTCAGAGGATC-------CGCAGGC-----CTAGACCTAAGTCCTTGTGTGAATGTGATAGAG--------CAGATGAG-------GAGATCCTG---------------CATCATAGAGTGCGAGAGTGAACGTGTGAGTCTTCTA-------GTTGTAGCCGTTTGAGGAGTTTTCTTGAATGCACTTGAGCTTTAATGGAATTTCGTA-TCGTAT-------------TCGTTTAAGTTTTTT--TAATTTTATTTATTCGCGTGCATTAGTCGTAAGATCACATAGAGATTCTTGAGTAATAAACCGCATGATGATTATCATTGTTACGAACGTATTAA
A--CGCAGTCCCAGCCACTGGCCAGCGCCGGCTACTACTACGGCAAGGGGCAGGCGTAAGTGCGGCGCAGGCTGCGTTCAGTTTAATTTGTACTAGATCCTAGTTAGATGTAAGCATTATGATTGAGTGC---ATTGGATGTCTGAGAGAGTTATGAATGTGATATATTTGCATGTGGAATCTTC-----------TGTGCTTTAATTGAATTTCGTATTTGTGTAAATGATGTGACAACGTTTAAGTTTTTCCATAATTTTATTTATTTGTGTGCATTAGCTATAAGCTGAAATAGAGATTCTT-----ATAAACTAAATAAATAACTTC----------ACATTTTTA
>ETH 20302255 20302388|20769 chr2R 20302047 20302284 scaffold_8 1435336 1435560 + 1099|217 246
CCTTGAAAATGGTCCAAGAAAAAATTTAAA
CTTCGGTAATTATGCCAAAAAGGCTTTAAA
>ETH 20302255 20302388|20770 chr2R 20302362 20306206 scaffold_45 639828 643488 - 78897|0 26
GATGTGGAGTATTCGATTTGAATACGG
GAT---GAGCGACAAGTGTGAATACAG
>Orc4 20303340 20303452|20770 chr2R 20302362 20306206 scaffold_45 639828 643488 - 78897|1042 1154
CAGCAGATCAGAAATACTTTGTATATTTATTTATTTAAAAAAAATTGTACCGAATCATTTAGTTGGTAAAGCCCTGTTTTGGGAAAATAAACTAATTTTAATTTATAAAACGT
TGGCAA---------------------CAATTGGCCAACAAATAT---------TCCTTAATTTTATAA---CTTATTT---------------ATTTCTATGTTTA------
>CG16896 20379006 20379089|20866 chr2R 20375821 20379020 scaffold_45 744233 747274 - 41778|3445 3459
AAGGCATATTGGTTA
AAGGCTAATTACTTT
>CG16896 20379006 20379089|20867 chr2R 20379045 20386708 scaffold_45 747868 755735 - 166086|0 44
CTGAGGCTTTTTTGTACGAATAAACTACAAGGCTAGGATTATGTA
ATTAGTTAGTTTAGCTAAGATA----ACAAGTCT--GATTATTTA
>CG30423 20382570 20382764|20867 chr2R 20379045 20386708 scaffold_45 747868 755735 - 166086|3593 3790
AGGGGATTTGTAGTTCACAAGCTCACTAGGCTAGTAACCGGCGCAGGAATATCACCGATGCACTGGGTCCTAGGGTTACGGCCATTTATCCGTAAGCACGCATGCTGTTCGCTTATCCGCAGTCATCAACAAATCTCATATAATCAAATGTATCCAGATAA-ACGCAAACAAAATAA--ACTGACGTAGTAGACATTG
GTGG--------------AAGACCGTT----TAGTTTTAGGCACCCG----TCGGCGATTTGC----------GGATGTAGCAATTT----GGAAGCAT--------TTGGCTCCATCAAAGACGACAGTCAATCTCACATTAATAAATATATTCACAAAACAATTAATTGAAATAACAAAATACATAATAGTTATTA
>Ance-5 20396226 20396344|20877 chr2R 20394552 20396273 scaffold_34 1264370 1266154 - 48594|1845 1895
TGAACATAAACAATCAAGTAT---TAACAATATTTTCTGATATTTAAATAA
TGAAACTCTGCCATAATCTATATATCATAATGCTAATCGATATACATACAA
>Ance-5 20396226 20396344|20878 chr2R 20396274 20397823 scaffold_34 1266470 1267993 - 61219|0 96
GA------------------TACCAAGTACA---GCACGTACTTATCTACAGGTATAAAACTATAAGCC-----AATTACCTAAGAAGAAATATAAA
CACAATCATCTGGGTAAACCTATCAAAAATATTCATATAAACTTTAATACTTGCAAATTATTAGAAACCCAAAAAAAAAATTAGTAGAAAATTTAAA
>CG2857 20406985 20407068|20887 chr2R 20405546 20407055 scaffold_34 1282798 1284528 - 27927|1733 1807
TGTGTGGAATATGGATGAGCGAA----CATGTCAAATATAAGTTAAACGTGAACAGTAGACTAGACGACCAGATG
TGCATGGATTGTGCGCGAATCATAACTTATATCGAATGGGCCATGAACATGAACA-TAGACTAGACGACCA-ATG
>RpL41 20411013 20411189|20890 chr2R 20410058 20418524 scaffold_34 1289245 1297887 - 276186|1114 1312
GAACTCTTGATTGATGCTAACACCGAAACGAAAAACGCCGACTGGGTAGCCCTAAAATGGTGGCCCTAAAGTAATTTTGCAAACCAGTTTTCACAC--AAACGTACATGTGCATTTTAA---ATTCACGTAAAAATTGATTCT---------------AATAAATTACTAGATTTTCGCCAAGGTTCCAC--AACTAAA
GAACTTCTGACGTA---------CAAAAATGAACATGCCGACTGGGCAACTTGA--------GGCCCGAAGTAATTGCA-AAATTAGTTTTCAAACCAGAAAATAAATGTGCTTTACAAAATATTCACTTTGAAATTTCCCTTTGAGAAAACTTGCTAAATAAATTACTGG---TTTACAAAAGTTCCACAAAACGAAA
>RpL41 20411298 20411322|20890 chr2R 20410058 20418524 scaffold_34 1289245 1297887 - 276186|1427 1454
GCGCAGCA--GCATTGCCCA-CTAAATG
ACGCACCACGCCATCGACCATTTTCGTG
>pain 20429105 20429363|20896 chr2R 20428973 20429207 scaffold_34 1329102 1329276 - 4405|132 251
G--TAAGTAAGTAGTATA----TAATGGTTATATA-------GACAGTAAATATTGTATAAACGAATATCATTACTGTACTATTTGTACCCGAGTAAATATTTA----ATTTCAAATGTT
GCATAAGTATTTAGTATAAGTATAATGATTATATAATATTTAGACCGTAAATATTGTATAAACGAATGTC--------------TTTACCCGAGTAAATATATATTTTATTGCGAATGTT
>pain 20429105 20429363|20897 chr2R 20429208 20432342 scaffold_34 1329599 1332688 - 110124|0 167
TGGAGAAT--GTATTTTGGTAGCTTTAGTATTTATGAGACTAATCAACCTTTTAGAACGATTTGCATTTAACATTCAGTTTAAAGAGCCGAGTTAGTCGGAAATTGTTTTTATTAACATACGA----------GTAATGAAATTGAACAAAACCCTTAATAATTGTCA
CCGGATACCGGTGCCTAGATAGATATAGAGATCAT---CCACAGCCACATCCGAGTCCTGCTTGCTTT------------------------GTAGTCAGAAA-TGGTTTTATTAACATACGAATATATAAATATAATGAAATTTAACAAAACCCTTAAGAGCTATTA
>CG30427 20436347 20436499|20903 chr2R 20435598 20436802 scaffold_1 4560069 4561252 - -4505|819 978
CATTCTTCTTCAGTTGCTTTTTTAACATTTTGTACCTTTTATTTCATGTGCCTTTGAAAGGGTTTGTAAGAAAATCTTGTTAAAAA--TATTCAGGTGTT-----TTGTATACGTAAACTTGTTATTGCAAGTCGTTGATAATAAAAATTTTTAAACATT
CCTTGTTTTACTATCTCTTTGGACTGATTTAGGGCCATTT--------TACATCTGCGAATGTATGTTA-AATATATAGTTGAACAGTTTCTCAAATATTATTTATGGTATATGTAATTTGATCAAGGT------TTGGTATTAAAGCTCTTCATTTATT
>CG30427 20437662 20437794|20904 chr2R 20436803 20439641 scaffold_4 3387832 3390841 + 85941|990 1127
TTCTAGTTCTCCGTGGACTTGCATTGGTTTGGTGGTCACAGGCATTTATTTAGTCAATTAGC--TTAGTTGTAGTTACGCATA-TTCGAGGTTTTGAATCCAAATAAATAT--GATTGTAGGTTGTTGAATATACACA
ATCTC--------CGGGATTCTTTAACTTTTGTGGTCACTGGAATTTATATAGTCAAT-AGCATTTAGTTGTAGTGCAATTTAGTTTAAGGGTTT---TCCAAATAAATATACGCATTTAGGTTTTTG----TACTCA
>CG2811 20447301 20447462|20912 chr2R 20446628 20448417 scaffold_4 3400478 3402540 + 43090|864 1055
TTTTGCAGCTACTTGGACAGCTGCCCGGAAGACCTCGCCATGGAAAAG-TGA---------GAAACGGAAACGTATAAAAAAGTAAC---GTTTAT--AAACGGATTTCAACGCATGGGTATTATTCGTATTG--------------TATTACATTAA-TCCATTTTTCAAAATGCAAAACGAAATGAACAA
CTTTGCAGCTACGCGGATAGCACAGCACAAGATCTCTTTACGGACGAGCTGAACTGACCTCGGGATTGGCTTATACAAAGAAATTATACAATTTACTAGAAAGGATTTCAACGCATGGCTATTATTCATACTTTCTCTCTCTCTCTCTATTACATTGATTCCATAATTCAAAAATGCAAACGAAATGAACAA
>Tina-1 20448222 20448485|20912 chr2R 20446628 20448417 scaffold_4 3400478 3402540 + 43090|1888 2094
TACCG-TAGTTGCATTTTAAGACCGTACTTGCAGACGCAGATGTACTGATCGATATATACCCGTAT------ATATGGGCAAACGATATAAACTGATACATATG--TACCATACGCATTATTTAGGTTTTAGCAAACGTAGTCTGTAATTTGATAGTTTTCGACAAACAAAGCAAATAAACTGAAGCAATT--TAAAATAAAATAAA
TACCGGTAGTTGCATTTGTAGCACGTA--TACAGACTTAA---TAACCATATATATGTACACGCATCCAGACGCAGGTGTACATAATATTAACTGATATATACGCATATTATATGCGTATTCTAGTTTATAGCGAACGTAGTTTGTAATTTTATAAGTTTCGAGTGAAAATAAAAGAAATTCGAGTCAACTATTTATATAAAACGTA
>CG15861 20450991 20451262|20915 chr2R 20450964 20451100 scaffold_8 292293 292423 + 1187|33 142
TCTTGTCTTTAGAAACTGTAAGGAATAACATAAAATATAAAAACAGCTTTAATCGCCTCATAAAGTAACCTATAATTTGTCCATATTAAAATACCAACTTCAAAAACGCA
TATTGTATTAAAATACC---------AATAAAAAGTATAAAAACATTTCGAGTCATTAAACAAATCGAACAAAAACGTGTCCGTCT---ATTAGCCTTGTCTATGGCCTG
>CG15861 20450991 20451262|20916 chr2R 20451101 20452353 scaffold_4 3405522 3406775 + 26743|0 172
CCTAGAGAGGAGGTTTGACAGCAATGGGGCTGTTTTAGGTCCCGCTGATGTCGTATGGATTTTAATATATGTATTTATTGTTTAGGTTCATGATTATTTATGAA-----TTAAGCTACAAGACTATGTTACTCTTTTTATTGATTTA------AAATTTTTATGGAAAGGCAA
ACTAGGTTTTAG---CGAATATACTAGGGCAGTTCTAGGCTCTTCT----TAGCACGAATTTGAA----------------TTAAGTTGATG--TAGTTAAGCAGTTTCTCAAATGTAAAGTATCTCTTATTCGTTTTATGCGCATATCAGTTAAAGCTCTGTTAAAACGCAA
>CG2790 20454159 20454269|20918 chr2R 20453354 20457056 scaffold_4 3407955 3412063 + 99331|853 972
GGTCGTATAGATATCCACCCACACCTTGTATCTATA-----CTGTAG-AATGTTAAAAGTTTATTTATGCTAATG---ATAAATTTAATTCGAGAATGAAGTTAAGTATGCTCGCTCCAA
GGCTGT-------TCCAGCTGCAGATGGAGTTGGCAGCTGTTTGTAGAAATTTTAGTTGTTTATTTATGCTAATGTTAACAAATTAAATTCGAAATTAAATTAAGTTGAAAACGCCCAA-
>CG2765 20467439 20468446|20927 chr2R 20467249 20467482 scaffold_4 3426822 3427029 + 2422|192 253
GAGAATTATTTATACATAATAAATAAAT---TTTACTTAG---------------AAAATAT
GAGAATTATTTATACA--ATAAACAAATACATTTATTTAGCAAAAGTGCAAAAAAGAAAAAT
>CG2765 20467439 20468446|20928 chr2R 20468032 20468318 scaffold_4 3428620 3428910 + 2192|0 311
GTGTGAGGTATTTTTT-TAACTTTAACTATAACTGTAT-CAAAATATCTATATCTATGTATGTATATGATTATGTATATGTATCTTGAGGGGGTGCTAAGCAAGACATATGAG--AATCGTATGTGTGCAATAGGATTGTATAAATGTATAACTGAGGATGATAAA----------TAACTGGTAGATATAGTAGTGGATAAAGCAGCGCCTAAGCA---------ACAAATTAACAAAC--GTTCTATTGTAAAAATTGTAACCTCTGCGTTGCATCTCTCTTATGGGTTTAAGGGTAGCCAAAGTCAAAA
GTGTGAGGTCCTTTCTGTTAAGTGAGATTTAATTTCATAAAAAACAAAAACAACTAAAAAACTAAAAAAAAAAACATGTGT--------GGGGTGCT----AAGACATATGAGTACATAATACATATATA-------TATATATATGTATATATGATGATTGTATAGAATCGATCGTAACTGATAATAATGATAATGAAGATAACTACATTTATATATATATATATACAAAATTGCGAATAAGCTTTTTTCAAAAAATCAAAAAACACAATTTGTATTTGTATTTTGGGTTGACGGGTA--CAACAACAAAA
>CG2765 20467439 20468446|20929 chr2R 20468362 20469118 scaffold_4 3428998 3429779 + 33824|0 87
-ACCGCCAACTCAAGGCCT---TCTCGACCCTCTATTTCCTATGCCTCCTACACTATCACTTTCTTTCGAGCTGGTCGGGGTTAACTT
TGCCAACAACTCTCGGAATGTGTGTTTAGCTTCTACT--CTAATTCTTCTTCTTCTTCTTCATCTTAC-ACCTGGGCGGGCTCTAATC
>RpL19 20476045 20476151|20937 chr2R 20476032 20478908 scaffold_4 3435271 3438171 + 99181|13 136
GCAGTC--------CGACCTCGCTAGTCGAGGAACTCCATATTGATAGTACTGTTTATCGTCTGAATAAAACAC-----CTTTAGTTTGGCCGAAATGATTTTGTACAAACGTG----AAACTC
GTCGACTTAAACAACAGCGTTCCCAGACCGTGGGCATTA-ATTAGTA--ATTGTTTTACAAGTGAAATAAAAATTGTCATTTTAGTTTGGCCGAAATGATTTTGTACAAACGAGATATAAGCCC
>Phk-3 20478443 20478538|20937 chr2R 20476032 20478908 scaffold_4 3435271 3438171 + 99181|2613 2729
GCGCTTTGCTTGTCCACCAAATGCACTAATTTCACATG------------------AACCTAATTTAAACCAGAGATCCACAGTAAAGATTTTAGT--TTTTTATACCTAAA-TGCG
GCCATTAAAAT---TAACAAAAATACAAAAAACACGTTGTATCGTACTCGTTATTTAAACTACATAAAACAAAAAATA---AGTAAATTATTTTGTCGTTTTCATACCTAAAACACT
>CG2736 20481021 20481149|20942 chr2R 20480635 20481717 scaffold_4 3441640 3442884 + 14615|527 713
TGATTTACTTTCTGGACTGGACCCGTGTATATA---TGTATGCAAGATTTAGATTTAG-GGTAGAGGTGTCGCTACTGATGAAC--------------TATCAGTAGT-----------------------------------CCGCCGTTACGCAATATACGAT-----TTAGTGGAAAATTGAAT
TCA--------------CAGACACGTGCGTGTATCTTATAGATACGTTTTAGGTTTAGCTACGTAGCTTTAGACACGGATCACCTCATCGGCTGTGCTTATCAGCAATAGCAATAGGAACAATAATACTAATAATAATGATAATGATAATGATACTGTATGTAATTGCGCTTGGTTGCACATCGAAT
>emp 20484204 20484679|20945 chr2R 20483938 20486506 scaffold_4 3447186 3449822 + 92418|274 877
GCGCTCTAGTCGGTGTCTGGTCGCAGTACGAGTGTCTTCGGGTGACTTCGTAATAGTATAAGCCGTAGCTAGTAACTGGGACCTGCCCACTTCCACTTCCACCCCCAATCCCTATAACGATACCCAATCCGACCTCCCTATGTTAATCCCATTCCCCGCGGAGGAATGTGCTTCTATGTAGTTTAAAAGAAATGGAGCTGGGAAGACTTGTATGTATTTGTATGTGTATCTGTATCTATTGTATTGTATGTAGGTTATCTGTGTAA--------GTAAGCGTTATAAAAATTTTGAAGTG----------TAGTCTAACGAAACAGTCGTGA---TCGCTTAAAGGCTCAAAGCTT--------------CGACTTAGAC------------------------AATATTTGTTAT--------------------------ACCAAAACAGCAATCGATCCTGTTCTTGCTTTCTTAAACCCTCTTGAAATGAAATTGTATGTACAATCAAGTCACAAAACTCGAAACGTTTCT------------CAAATAAAACAAAA-------------------------------TTCCGTCCTCGA
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GT
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CTTTGGTTTTATTGTTGTTCACGTACTTTTTCAGTTTTTTGTAGCAGCTTTGCATAGCCAAATGTAAATTAAATTTCATTAACATTCCGTATGT-
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CTGCAACCGATATCCAAAACCACACTGTGTCCTTGTGCTTGTCATTAAAGTTCGGTTTTTAA-AACTAGCAAGACTTTTTA
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AAGGGGCCCAGCATGGAGCATTCGGGC----GTAGT--GTTGCGTAAGGACAACAAAAAACAGCAACA
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ATTTACATACATTTTTTCCGTTTTTCTTGTATTTGCA-----AATGTTTATTAGTTTGGGTT------TTGATTAGTCTGATATTTTAAGTATGTACATACATACATGC--------ATACATATGTAT--------GTAGGTATTACATACATACATACATATGTAGGTATATGAGC---TGATTTCTGCAGAAACGTTCAACAACAGAAGC--ATAAAAATATATGTATGTATGTATGTGCAGCGATAAAGTTGTCTATACCTAAACTTTTTACATTAATGTGCATATATGGATGCATGTA
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CCTAAGCGTGCGACTTTTG-TGACGTTTTAGTACGAACAACGC---AGAATT---GACAATCAATACCAAAATATCTGGCCTGGGCCTTGCTTATAAACACGCG--ACGGGTCGTTTGACGCTCTCAGACGCATTTCGGTTTTACAGTCGATCGGA-----CAAATTCGTGGCTGTCGCACACAAAAATATGGAAACTTCCCATTTATTCGGTTGGTTTTTTGTTTTATTAATTGATATAAAAAGAAATGAAATCTTGAAATCAA-GCAGCTAATCAAATTACCGATTGCAGCTTTGTTTTTGCTGCTCGCAGGGGTAAACGC----CTATCCGCAATTCCCGGACTGGAATGCACGG----AATCCCGATGACCAGCTG----CTGAATACCTTCATCAGTGGGCAGCCGATTAGACCTACCAGCTCGACGACAACGCCTCAGCCAACAACAGCATCGCCTCGCGTCCTGGCCTGCATCCAATCCTGTCCAGCGACCAGCGAATATAATCCCATTTGCGGCAGCGACAATGTTAACTATTATAATGCGGGACGTTTCGACTGCGCCGTTCGCTGTGGTCAAAGTGCGT
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>CG16971 209752 209836|246 chr3L 207147 209874 scaffold_18 1269504 1272164 + 29420|2853 2958
CTGCTGAT----CACCACCCACCCATCCGCACAGAT------------ACACGGTATTTGGTATATCAGCTGCGAAC----AAAATATTGCTTTTT-AAACAAAAT
TTGCTGACGGCGCATCCACCACCAACCCACACAGATATCTCTGCATACACGCGGTATTC-GTATATCAGCTGCGAACGCAAAAACAATTACTTTTTGAAACAGATT
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TAAA
TAAA
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>miple 252652 253872|277 chr3L 253157 254570 scaffold_62 282868 284374 + -4373|0 868
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>RhoGEF3 287416 288826|299 chr3L 288752 294343 scaffold_41 878436 884159 + 177207|0 74
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>Roc1b 341932 342026|329 chr3L 341533 344563 scaffold_9 1969112 1972149 + 169661|416 512
CGAGGAATATGGATCGGGATATTAGGTGGTGATAGCTGTTTG--CTGGCATGTAATTACTGTAATTAAATAAGAACGGACTTGGGTTCCAAAAGAAG
----GCTGATTAATTAACGTATT-TGTATTTATGCATGTTTGGACAAAATTAAAATTCTAGTGATTAA---------GCCTAGGCCTGC--------
>CG1233 348779 349213|332 chr3L 348235 348880 scaffold_9 1976507 1977155 + 15153|576 705
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AATAGGGCTA
GAGGAAGCCA
>CG17090 557734 557900|578 chr3L 557838 559461 scaffold_9 3499151 3501025 - 5126|0 69
ACCACCATCACCACTGTTGTTATGATCTTGAGCT--AGAGCCCGATCGAATGATTCA-----ACGCTCGA
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AAAAAAAATAG
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TGAAGGCGCAAGCGCCGCGCCTCCTCGCAGCAGCCATGAG
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CCCCTACCCTCCCGCCTTTCCCTTACTCCACTAACAGCCTGCCACGCATGTGTTAATCTGCGTGGAGCACAATTAATTTTCTGCAAATGCTTTG--AGACGCATTTTTGGA-CTAACAATGAGACGGCAGCCGGGAGTTGCCCCCGCCGTCCAGAGACTTGCCTCGACGCGACTCGGCTCGGCTCTGCTCCGGGTTTATGTTTTATTAATTGCGCCCAAGTG--CTGCATGGATATATGTACAACAGGGAGGCGCTGCCTGGCGGCTGGCTAATTACTAAAAAATTGGCAGTTGTCGTTGATTTTATGCTAAATTATTTGTCAGAGCGAGA-GGAAGATGG-CAGTGCGTGACGGCCGCGCAGTTGCCGCCTCAGCTGCCACAGCTGCCTCAGCAGCAACTGCTCCATCG
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TGAATGCTTAAAAAATGATTGTGATGCTC
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AAGCTAT----ATCTAAATTTAATTTTGAGC-------------------------ACACACGACCACATAAACATATCCAAACAAAATGGCCAAAAAGAGGGGTAAGAAGGGCAAGAAGGGCAAGAAGAAAGGTGGGGTCAGTTGCCCAATCAATATCAATGACGCAATGCTGAGACCAATGATGCCAAGAGGTTG-------GTATTCCTTAATTCAATTTCTGATA-------GATCCAATCATACATATTAATACCTCTTTCAGTTGTACCCGATTGCGAGGAGTGCTGTCAGTGCCAATGCGATTGCGATTGCAGCCCTGAGATACAGCCATGCTTTATACAGCCGACGCGTCCGGATCCGGGTCCCGAGGCCTATGACGAGTTCGAGGCCTGTCTCAATGGCAGCGGCCTGACAATACGAGTTTTAAAGAATACGCATAAAGTCCAGAGCGTTGACGATGGCGCCGA---TGCG---AACCTTGGTCCGGATGATGATCCCGTTTATAGGTCCAACCTGGAGGACTGCTCATCGAACAAG------TGCCTCAACGATATGCTGCAGCGCAGCGACTTTGCCAGAAAGCACATACAGCGACGCACCTGCGGCCGGATTGTCAATCATCCCAACATACCGAAGGTGCGCGCGAACATCAAGTACTCGGGCAATGATACCTGCGAAACGGACAACTACTACGTGCCCTTCTCGAAGATCAAGGAGGCGTGCGAAAAGGAAGAAGCCAAGGTCGATTGTTATCGATCACAGGTTTGCGATCAGCGGGAGGCCAAGGTCGAATGCTATCGCCGGCGTTTGTGCGGCGGCGGAGTACCCGTGATTCCGGCGATACCGCCCACTCAAAACCGCCGCAGCTGCTGCATGCAGGTGGAGGCCAAAGATATCAAGGAGACCATGAAGGGCGTCGAATTGGACACCCGTAAGAAGGGCATTGAG
>CG9130 1239020 1239520|1362 chr3L 1238734 1239546 scaffold_12 2523855 2524844 + 9790|393 983
GTTTGCTACAAGACCTGCGAGGAGACCGACAGCGACGTGTTCCTAGTAAAACTGGGAAGTAAGGCCAAGTCGCAGCACAAGAAGAATACCATCGAGATCGAGCTGCGGACGCCCAAGCAGCCCGTAACCCTTCCGATCAGCAAGGTGACCACGGAGACCTATGTTTCCGAGG-------AGATGCTAAC--------------CGGTGGCAAGAAGGGGAAGAAGGGCAAGAAGGGCAAGGGCAAGAAGGGCAAGGGCAAGAAGAAGAAGTAG-----ACCAAGAGAT--CCGTAGGCGGATCCCAT-TCCCATCGACCGGACTTG--------------ACGCTTACCCTTTCGGAACACATCC---------------TTTGGCATTTTGGAAGCGACTCTT----TGAAAA-------TTCACAGCAGCAATTATTGAAATTTGGCTCTGGTACTAACCCATTCATATTAACCCGTCCAGTAAGATGCACGAACACTCACTTTTTCGACTAG--------------TTACGTAAATGTATGCTTTTGATTGAATTAAAATTAAGAAAAAAAAAAAC-------AATAA
GTGTGTTATAAAACGTGCGAGGAGACCGACAGCGATGTGTTCCTCGTCAAGCTGGGCAGCAAATCGAAGTCTCAGCACAAGAAGAACACCATTGAGATCGAGCTGCGGACACCAAAGCAGCCGATGACATTGCCCATGAGCAAGGTGACAACGGAGACGTACGTGACCGAGGCATTGCTGGACGCTAACAAGGGCAAGAAGCGCAAGGGCAAGAAGGGTAAGAAGGGTAAGAAGGGCAAGGGC---AAGGGCAAGGGCAAGAAGAAGAAATAGTGGATAGATAGAGATTATCGAAGGCACAAGCAGCAACCCATCGTCAAATCCTGGTAAACATATAAATATATATACCATATATAAATAAGTCCAGGAAGCCTGCCCAGTTATATATCATATAGCCAACCTTTACCCTAAAAAACACTGTTACACAACATCTGGATTCGAAA-TTATTTATAGTTTTAGGTCATTTAG------CCAGCACCCGGAATGAAGGAACA--CAATTGTCTAATGAATAAAAAAAAAATTTTTGGATAAACACAAATCTGTGATCAATTCGCATTTGTATAGTTTAAAAACTCCGGCAAATAT
>CG9133 1239272 1239520|1362 chr3L 1238734 1239546 scaffold_12 2523855 2524844 + 9790|666 983
-----ACCAAGAGAT--CCGTAGGCGGATCCCAT-TCCCATCGACCGGACTTG--------------ACGCTTACCCTTTCGGAACACATCC---------------TTTGGCATTTTGGAAGCGACTCTT----TGAAAA-------TTCACAGCAGCAATTATTGAAATTTGGCTCTGGTACTAACCCATTCATATTAACCCGTCCAGTAAGATGCACGAACACTCACTTTTTCGACTAG--------------TTACGTAAATGTATGCTTTTGATTGAATTAAAATTAAGAAAAAAAAAAAC-------AATAA
TGGATAGATAGAGATTATCGAAGGCACAAGCAGCAACCCATCGTCAAATCCTGGTAAACATATAAATATATATACCATATATAAATAAGTCCAGGAAGCCTGCCCAGTTATATATCATATAGCCAACCTTTACCCTAAAAAACACTGTTACACAACATCTGGATTCGAAA-TTATTTATAGTTTTAGGTCATTTAG------CCAGCACCCGGAATGAAGGAACA--CAATTGTCTAATGAATAAAAAAAAAATTTTTGGATAAACACAAATCTGTGATCAATTCGCATTTGTATAGTTTAAAAACTCCGGCAAATAT
>CG9134 1257737 1258030|1380 chr3L 1257439 1257749 scaffold_12 2544831 2545140 + 18953|298 310
AGGGCACCTCCGT
TCAACATATCTGC
>CG9134 1257737 1258030|1381 chr3L 1257766 1258104 scaffold_12 2545185 2545572 + 733|0 335
ATCCGTACCCATACCCGTACTACATTCACAT---------------CCACATGCGAC---TAAGT--GATTAACTGGTTGGCTCCAACTG----------------------------GTCTTAGCTGGCGATTAC------TCCGGTGAATTTGAATGTTCATTTCGGACACTCA------TTGCTGACAGATCTAAATTCGC----GTATTCTTAGCTTAGATGCGTAAGTGT-ATAAAATTCTTGTTGATAATTAGCTAGTAAACTAATTAAATTATACTAGGATCGCTTGTATTTTCTCATGTAAAATATAAAT-----AAAATGTAT-CTT
ATATATATATATATATATAGGATATATATATAGGATATCAAGCATACGACATGCGGCACACAAGGCAAATTATTTAGCTGGAATAAAATGAAGAAATTTAGTAGTTTTAATGTGTAGTGTATTAGTTGTTAAGTATGTGAAGGCAACTGACTTTTGCTGTGCTGTGTATGTGTTAATCTAACTTCCATACGAATCCAAATTTTCCACAAAATTATTTACATAATTTAATTAATTTGGTTAAGTTCTTGTTGATGCTTAGCTAGTAAACCAATTAAATTATA-------CGCTCGTGTAGGCATTTGTAAAA-ATAAACAAACAAAAATGCATCCCT
>CG32333 1271775 1271864|1402 chr3L 1271311 1271776 scaffold_12 2561168 2561619 + 17781|510 511
GT
GT
>scf 1283366 1283921|1408 chr3L 1282148 1283762 scaffold_12 2573504 2575132 + 47359|1240 1734
AGTGTCTAGATACCCAGAATCCCTGAGATTAAGATTGATCCTATGAATCTCCCACTTCGCATGCCAAATAACTTGTAATCTTGTCTAGCCCT-TAAGACC--TTAAGAAAGTGCATTATAAACCGACTC---------GAATGATGGGCCTTCCTTTTGTATGTGGCACCACGACCAATTGATTTGAGGTGATTTGTTTAATTGAAAGGCGTC----------CACGTCAG-----------------CTCTTGGAG----------------------------CATCA----------------ATGGCCACGTCACTGGAACGAAACC--CCATCCGCACACACATGCGGTCACTTGACCCCCTCCCCCTTGCCCCGAGCCACAGATACGCCGCCTTTGCCT--GTGTAACATATGTATAAACATAAATGATTTT-----------CGCTGTAGCCCGATTTATTTCCAGCTGCGAGAACATTCCAAAGAGA
GATCGC-AGAGAGAGATTAACTACAAGTCTCTAGCTAATAAGTTACAACTCCCAACTCGAATGCCAAATACCATGTAATA-CATTTAGCCATGTAAGCCCGACTCTGCAAGTGCATTAT-AACAGACTTAACGCTATAGAATAACTCCCCACCCGGTTCCAT------TCCTGTTCAATTGGTTTGATTTCAGC--TTTAATTGATATGCATCCCAAAACATACACGTCAGCCAGCCAGCCGCACAGCCTCTCGACGATTGGTCCGGTCCATGGGGTTGCGCGTTCATAATTTCTCTCTTGTTCATATGGACACGTCATGGGTAGACAACCGGCCACAGATACACACACGCACACACAC-ACACACTCGATGT-------ACACACATGTTAGGCGCGTCCGCCTCCATATAACATAAACATA-----AAACGATTTTGTTGTTGCTGCCGCTGT-GCCCGATTAATTTCCAGCTGCGAGAACATTCCAACAAAA
>scf 1283366 1283921|1409 chr3L 1283763 1284016 scaffold_6 205372 205578 + -1173|0 158
GTGTGAGTGCACCGGAAAAAACAATAGGAATCTTGAATGCCTACGATTGCCACTTATCTGGACTTGATACTACATTTTACATCTAACTATTATTAACAAGATCATTTTAGAGTTTAGTTGCAACATGTTCAATAAAATGCTTTTATTCTATTTACTTCT
ATATGTATGCAT-----GTATCATTTATAATTCTATTCACTTGCGATT--TATTCACATGTGCCGTATACTATACTATTTATATATATAATATTCATA----------------TATATGCATGCTAT--------ATGTATCTAGACTCTATACATAC
>CG9149 1288097 1288253|1412 chr3L 1286512 1288269 scaffold_12 2577995 2579745 + 65733|1673 1849
TCTTAATTCATTG--TCATTCAAGCTA----------TTTATTGCCTTTTCCTGTTTCCCACTTAAGTGTAAAGTTTATTTCTCTATTCGCGTAGTATTC----GCACGTACTTAAAGGCACAACCTCCCAAGTCGCAAAATCTACTCAATTAAAATTCAATTGAAAATAC----TT
-ATTAGTCAATAGAATCAATTGAATTGAATTGCTTCCGTTATTACCCTCTGCTGTATAGTCACAATATGTATTGTTTATTATTTTCCTTTGGTATTATGCTTGTTCACAAATCTAAGTGT-----------AGTCTGAAACTTTGTATTGATATCTATAAATTTTAAATACCTAATT
>CG2469 1295241 1295344|1415 chr3L 1294149 1296836 scaffold_12 2585200 2588154 + 88274|1290 1456
CGC--ACCTCTCAACCGTG--------------TTAAATCACTTTTGACTATAT----------------TTAGAGTTGTCT----------TCGAGAGCTGCAAAAAGATACTAATAAAAA---CGA------------------ACTAATTGCCACACAAAGGCA
CCCTTATATGTAACTCGTGCAGAATGCAAAATATGAAATCTGTTGGAACAATATAAGCTGAGGACTTCTTTTATACCAGTTTGTTTATTAAATCAACTAATGTAAATAGATTTTACTAGAGCATTCGATGCTTCATTACCACTATTACCATCTGGCCTAAAATTCCA
>CG9153 1301534 1301860|1417 chr3L 1298107 1302708 scaffold_12 2589324 2593797 + 154360|3460 3805
TCGATCTGATCTGGACCCATTTTTTTACATCGACCTCAAACTACAGGTATTTTCCGAAATCTTCGGATTTCGCGCAT--TTTGGATTGAAGAATGAAAATTGGCTACTTTCAAAGACAACCCCAACGTGGAACACTCATTTATCAGCGATCAAATCAGCAAGTACAATGTCGTG--TTATAGCTTTAAACTCTAGACTAGTTATTAATATCGCATTGTTA--------------TGGAGAGAAAGGAATTCAAGGAGGTAAATAA-GGTTGGTGCATCAGTCTGAGGACAACAACAAATGTCTAAATTTCCGTGTAACTTTTACCAATAAAGTTATATAATATGGC
TC-ATTTCATCTAAGC----GTTGTTGAGTGCAGATATTATTTTCGACAATTTCTAAAA----CACATTTCGCATTTGCCTTGGATTATAAGTTAAAAA----------GAAAATATAAACC---------ACAGTTTTTTTTCAGGGATTAAATCAACTGGAAACTTATTGTGTTTTGTAGCTTTAG----TAAA--AGTTTTTAGCAT---ATTGTTACATATAATTAAATTTGGTGAATAAACAAT----AAAAGTGAATAACAATAGGTGCACATGTTCAAG-----TAACGATTAAATAGTTTAACGGGCACATTTTAA----AATTTCATATGTTAATGG
>Myo61F 1312948 1313155|1423 chr3L 1312919 1313225 scaffold_12 2605206 2605522 + 7202|29 248
GGAATTTACTATGACTTTCTTCAGAAAAGTGGCTTTAAATCAAACGAC-CTTGTTTTGTTA---TATTCGTGTAATTTATAG--TGTAACTATGTATTTTTGTTACTGCAGCACCTGAGAGTTGTGT-ATTCGGATTTTATATGACTAATGTTCCAACTAAATGTAT----ATTGTTTAAAAATA-CATATAAATATATTACAATTTGTATATGAATTGG
GGAATTTAATACAATTAACTAC---CAAATGGCTTTAAATCAAACGACAACTGTTTTGTTATACTATTCCTGTAATTTATATACTGTATTTTTGTA-TTTTGTTACTGCAAT------GAGGCGTGTAATTTTGATTCTATGT-ACTTATGTTCCAATTAATTATATACTAATTGTTTATATACATCATAAATATATATCAGCGCTTTTAATTGAATACG
>mtacp1 1314992 1315165|1425 chr3L 1314349 1318098 scaffold_12 2606547 2610172 + 98639|699 872
ATTGTAATTGTAATGCAAGCCATTGAACGGATTACACTTAAATTTAAATAGAAAACAAGTCAAATACAATTTGATCAACTGAATAAACCAAACGTTAAATTAACTTGTAGTCAGCAATTGTACACGAGGGCTATAATTAACTGCGGAATAGCAGCTAATAAATTAACTATCCAA
AT-------GTAACGCGAATCCATTAAAAGAATACACT-AATTTTAAATGAAAGGCA--TCAAATTTAATTTGAACAA-----------------TATATTAA-------------------------------AATT-------GAATAAAAACCAA----------------
>l(3)02640 1322703 1322939|1432 chr3L 1322138 1323296 scaffold_12 2614452 2615767 + 21483|609 929
GCC--CGTCATCAATATCATC---------GTTTACATTAAGTAGAAAAGTGTAACTAGACAAAATGTTTT--TCATTTCCGCCTCGTTGT---TGAACTCC-CGTGGAGAACTCAT---------------GCTTCCCCTGA-------TTTAACATCGGTAT---------------------------------------TGTATTCAATCCTTCTGCTCTCCCCGGCGAATGC------ATCGTTAATGGTTGGTTTCCGCGTAAACGTTATTTTAGTTTTGTTTTTGTTTCGGGAATATGACAAATAAATGTATAA
ATCTTTATCATCACCATAATCCATTCAAGAGTACGCATTAAGTAGAAAAGTTGAACTAGA-AAATTGTTTTCATTATTTTTGTTTCGTTACGCGCGGGCTCTGCGTACATAATTTGTTGGGTTAGTCTTAAGGCTACTCCTAAATCTTATTTTAATGCATGTACGATATATATATTTATATATTGTATATAAATATATATATATATATATAAAACGTGCTCTCTCTTTAGGAACTGCTCTCAAATTGTCGTTGGT---TTTCTTTGTAA--TTTACATTGTTTATGTTTATAT----GGAAGTCAAACAATATATGCATAT
>312 1335564 1336385|1445 chr3L 1336321 1336558 scaffold_9 3542242 3542521 - 1467|0 64
TGGCTCGAATATATCCTGCGGCGTTTTTTAACGACTGTTTGCTCAAAATATAAATACGCCCACTC
TGGCCTCAATATATCCTGTGGC-TACTGAAACGATCGTCTGCTGAAAATA---------------
>ru 1370518 1370967|1492 chr3L 1369741 1370798 scaffold_9 3586123 3587192 - 30164|777 1095
T------TCCCCAGACGGAAGCCATAGACTGC-ATCCCGTTCACATACACTCACTCCTCTTAAATGTCTCCTCTTAT----GCCCTAGTCTAGTCACTAGATTATAAGACTTTTCCCAGGACAGTGTGCTCAAATAACATATCTATCGTCTATCGGATATC--CTGGCTCC---------CACTTCA-------------AACGGGGATTCGCTCAAAATACTCTTAGCTCGTAAGTCCCAACATTTATCTTATGCCAATGCCAAAGGAGTG---GAGAGGTTCCTGCCGGGAACTGAGCCTGGCTCACATCAAAGACT
TGAGAGCTGCGCTGCCAG-ATCCAAAGACTGAGAACCCAGTCAGG-----------CTCTAAACTATATACTCATATCTGAATAATAGACTAGTCATTAGCTTGTAATGCATT--CCAGGACAATGTGCTCAAAT--CAAAACGAACTTGGTTCGGGCGTCAACTGAACCCTTCCAAGTGCGCTCAAAGAACAAGACAAGAACGAAGACGGAGGAGAAAAAACAGCAGCTACTCATATATAACAATTATCTTATGTAAATGCCAAAAAGGAGTCCAAGCGAACTCAATTGCTAAACGAGCGAGGCTCACTCCAGAGACT
>FucTD 1401394 1401466|1530 chr3L 1400795 1401557 scaffold_9 3620358 3621066 - 15958|613 700
TTCCTTGAGC-----------CCCAATCCC----CAATTATAATTACCAACGATCGCAAATTGCCCTCGTTCGGTGTGGTTCCGTTTA
TTCCTTTAGAACGATATTCGGCCCGATTCCAATACAATTATAATTATCGC--ACGCCAAATTGGAAGCGCTGAATAT-----------
>rho 1450886 1452015|1589 chr3L 1449997 1451565 scaffold_548 2530 4162 + 58397|902 1726
GTTTGAGGTTCGGAGTCGTCAGCATGCTCGCAGGGATTCGGAATCTGCTTGAGCTTCAGGAGAGATCGAGAGAC-----------------AGAGAGTTGGTGGAAAAGA---------AAAGTTCACTCAACGA------TTTAGTTCAAAACT-AATTCG-ATATTCGTTTGGCTTTTGCTTTTCGTT-----------AGCATTATCTCGTTAT----CGTTACCGTTTGCAGTTAA-ACGTTTCAGTTCCGAAACATAGTACACAAACTCAAAAAAAAAAAAAACAAATCAAGAGAAATACACTGGACAAAAAGAAAGTGCGAGGAGTGAGGAGAACATAAACCGAAGCCGAAACGTGTAAACAAATGTTGTGATAGAACCAAAGACTGAATTTATTTCGCGTGTAAAAA--------CCAAGTAAAAATCA----------------------------AGAGGAAAATCAAAGAGGAGAAAC-AGAACTAATCGCCTCTCGCTATGATTT-------AAATG-------ATTTATCCATGTTTTCAATTAATGGT-TTGTCTGTTTT--CTTAAATTATGTATTTATTGGCCGCAA-TTACTA-----------CGAATGAATCGAATCGAAGCATCAGCAAACT-------------------GTATCAAATTGTTT--ATACATCCATAAGCATAATGTGCTCC-------GAATTGTAGGATTTAGTGTTATA-ATTTATATATATTTAGGTATAACTAGCCCTCCTAACAAATTGTTTCAAATTGTAAATACTATTAAGTCGCACACTAGTCAAA
GCAACAAG---------GCAAATATACAAGAAACAACAAAAAACAAATATTCAAAGCAGGAGAGAAACATAGACAAAAAACAAAAAACAAAAAAGAATAGAAAGAAAAAACTAAGAGAGAAAGTTTAATCGAAAAACTGATTTTAGTTACAAACTAAATTCGAAAATTCGTTCGGC-TTAACTTTTCGTTCCGTTCCGTTCCGTTCCATTGCGTTCCGTTGCGTTCCCGTTAATCGTAGACGCGTTTCATTTCC--AACATTTCACGC-----------AGAAAGAACCGAACAACAACAACAACAACAGAAAAAAGAATCACTCAAAGAACG-----------------GGCCGAAACGTGTAAACAAATGTTGTGATAGAACCAAAGACTGAATTTATTTTGCGTGTAAAAAAAAAAAACAAAAACAAAAATAATTACCCCCACCCTTAAAAGCAACCCCTTAAAACAAAATAAAGGGGCATAAACTATAACAAATCGCCTCTCGCTATGATTTCCTATACAAATGTTTATAATTTTACGTTTTTTTTTTTCTACTTCTCTTGTTTGTTTCTGTTTAAATTATGTATTTATTTGTGCTAACTTATTAATAGGATTTTGCGATTAAATGAATTTGATGCG--AACAAATTTTTGTTTATATTATAGACGATTTTAATTTATTTAAATAAATCAAATAGCCC----CGCCCCAAAAAAAAAAATACTAGATATACATATATATATACCTATAAATCTATGCATAACTAGAC--TATAATAAATTGTTTCAATTTGTAAATATTATTAAGTCGCACACTAGTCAAA
>rho 1450886 1452015|1590 chr3L 1451566 1451629 scaffold_36 175883 175946 + 464|0 63
CAACAACAACAGCAACAGCAAAAACAACAAAAAAAATATGGAAAACCACAGCAAAGAACCATTC
TGCGAGCAATAGCGAGAGAAAAAGGGAGAGAGGGAGAGTGAGATGCAGCGACAAGTGGCTGGGC
>rho 1450886 1452015|1591 chr3L 1451691 1451846 scaffold_36 175991 176156 + 2257|0 165
GCGTTACA--AAATCGAGC--ATCGTAATCCCCTACACACACACACACACACACACACTCGAAAGTATTACTAATTATATTTATTTATGGTAGGGCAGCGAGGGTTTATTAATTCGT------CAATTGAGCGAACTATTTATTTATTTATTTATTTAATAATTTA
GCTTTACAATAAATATAGTTAGTCGTGCACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACTCTCACACACTCGCATAGCGCGAGCGGGACAGTTGGTGGGGCGCATTCATGCATTCAATTCATTCATTCATTCATTTAGTCAGTCA
>rho 1450886 1452015|1592 chr3L 1451853 1451866 scaffold_36 178242 178255 + 498|0 13
TTCACACAAACAAG
TTTATAAATATAAG
>rho 1450886 1452015|1593 chr3L 1451867 1452382 scaffold_548 4163 4579 + 3871|0 165
CACGAAAAAACAACAACAACACAAGAGAGAGAAGAAACAAACCAATTCAACTG-----------------TAAAAATATCCAATTGAAAAATACACACGAAAAGCCAAAGAAAATAAAAAATCAAAACATTTCAAGAATACAACAGTAATAACAAAATACAAGCAA
AGGAAAAAAAAAACCGCAGCAAACAGTAATTAAAAATGAAATTAATGCCACTAAATGCGTTCAAAATTCACAAAAATATTTATT---AAAACAAAT-CGTAAAGCCAAAGATAATAAAAAC----AACA----------ACAACAACAACAACAAAATATA-----
>robl62A 1461568 1461901|1605 chr3L 1461097 1461614 scaffold_3 3142851 3143355 + 8501|489 535
TCCCCCAGCCCATCTAGGGGTTAACAGTTTGGACATTGTTGCTTGCT
TAAAAAGGAAAATATCGATGTTTTGCATTTGAAT-TTGTTGCTTGCT
>robl62A 1461568 1461901|1606 chr3L 1461805 1461982 scaffold_9 3703229 3703473 - 5992|0 134
AAACTAAATTATGTTTATTATGTAATTAAGATGTTGGCA-CAGATGCCGATGTCAG------CCATTAAAAC----------AAACGCAGAGC---------------------GGGCAAAAATCCGCAAAAAGC
AAACGAAATAATTTTTATTATGTAATTAAGATGTTCACATCAGATGC--ACGCCGGGCGGACCAATTAAGACGCGCTCATAAAAACTAACAGCAAAAATAACAACAAAAAAACAGCACAAAAATCTGCAAAAGGC
>CG32331 1463549 1464527|1608 chr3L 1463325 1463587 scaffold_9 3705054 3705268 - 6368|225 263
CATTTTTATTCCAAACAGTTGAGCAATATTTATAAACTG
CATTTTTATTCCAAGCAGTTAAGCAATATTTATAAACTG
>CG32331 1463549 1464527|1609 chr3L 1464244 1464345 scaffold_9 3705596 3705677 - 2301|0 101
GAAACACCTTGGAGTCCGGGGTAAAACCGCACGAGCCCAACCAGATGATGATCTAATTGAATGACAATATTATGCCAGGCCTAATTCAATTTGCATTCCTTG
GAGACACCTTGGAGCAGCATCAATGACCGTGGAAGCGCCTC---------ATCTAATTGAATCACAATATTTT-----------TTCAATTTGCATCGCTTG
>CG32331 1463549 1464527|1610 chr3L 1464420 1465173 scaffold_9 3705778 3706562 - 7167|0 107
TGCACTTGTCCGGCCAAATGACTTGGTCCCGTAATTAGCCCGGGGATGAAAGGATGCGGGATGGCTTCCCGTTTTTCGGTCCTTGGTCCTTTGTCGGCCTCCTCGGGG
CGCAATTTACCGGACAAATGATTTT-TGGTGTAATTACC--------GAAAAGGTA----GCGGCAAACGGTTTGTC------------TTTGTCGGCCTCTT--GGC
>CG32331 1464614 1464694|1610 chr3L 1464420 1465173 scaffold_9 3705778 3706562 - 7167|194 315
GTCCTGCGCGGATCCTGC------TGTCTAATTACAGG---------------------------GTAATCAGGCTTTCAGCCGCCCAGACCAGCG--------AATGATGATTGATTGAGG
ATCCATC-----TCCTGCACACTTTGGCTAATTATAGGCCAAAAGGCAACGGCGTCTCCTGCTAGGTAATCAGCCTTTCAGTCGTTTTGGCTACTGTACTGGATGATGATGATTGATT-AGC
>CG32331 1464762 1464867|1610 chr3L 1464420 1465173 scaffold_9 3705778 3706562 - 7167|403 513
GTGACATCTGCCCAA-----GCGCGTGCCATGCCAAGGTGCTTCGAGGAAAGTGCAAACAGCAGATGTAATGGATATGGAAAGGCAAATCGAAAACTGATTTGGAGCGGAA
GCGACAACTGTGCAAATTTAGCGCGTGCCG-GCAAAGAAAAACCTCACAGAGC---AGCTGAAGCTGTAGCTGAAGCTAAACAACAAATCGAAAACTGATTTGGAGCGGAA
>CG32331 1464928 1465284|1610 chr3L 1464420 1465173 scaffold_9 3705778 3706562 - 7167|582 857
CTACAGCCACTTCCATTC-CATACCCACAATCGCAATCAGAATCGCCGAGTG----------TTCCATATAG--------TGCCACGACTTGTCTTGGCCTTT-------GACGCCGTCTTTTGTACTTAG----TTGAGTTGAGTTCAGAAGGCATGGTGATGCAGATGGAGCTGGAGGTGAAGTCACCGCCCGCTGGCTTTTCAATGAGCTGAAAATCAAAAGCTATACGCGATTTCACACACAGTACGACGGATTAAGGATATGCGTGTGCAC
CTAAACACACTGCACTACACAAACAAACAACTGTATATATGCATGTCTATCGTATGTATGAATCGTATATAGCACACGCATGTCAAGACTTCATTTGTGATTTGCTTGCAGACGCGCTGCTTTGACGTTTGGCCTTTGACGCCGCATCTTTTGTCTTGGCGAGGGACGCGGCGC-GGAG--------------CGCTACATT----------TGCAAATCAAAAGCTATATACGCCTGGCTATATA--------GATTAAGATTGTGAGTGTGCCC
>CG32331 1465348 1465512|1611 chr3L 1465331 1465443 scaffold_9 3706582 3706676 - 4085|17 113
CCAAGGACCAAGGATCCCTGGAGCAGCTGCTCCTTCGGAACGCTGTATTTGATTTGCGATTCGA-GGCTGGCGGAAATGGAATGACACGCGAGGCAC
CGCTG----------CCAAGGAGCAGCTGT--CGTCGT-------TGTTTGATTTGCGATTCGGCGGCTGGCGGAAATGGAATGACACGCAAGGCAC
>Psa 1506452 1506912|1639 chr3L 1506022 1506801 scaffold_9 3743037 3743688 - 17645|438 787
ACGTTATTGCGCTCGCCAGCATACCAAAGCATTTAACAACAATCACCAGCAGTGTAACCACAGCAACAGCAACGCCAACGCAGCACCATCATCAGCACCAGTAACCCGTAACCAGGTCATCGTAAGCTACAGCTAATATATCCATAACACCACACGACCAAAGCCGTCACAAATGAAGAAAACAAATGGCAAACGTACTCCTAAAGATGAGAGCCAAATAGGTTAGCTTTAGTCAAGGATCCACCTACAGCCACTGCTCCAACCGGGCGTGCTTACATATATCGATTGACTACTCGCCCCAGCACATGGGACTTGGACTTGGACGCAGACCCCTAGAAGCATTTAAGACC
CCGGCATGACGAC-----GCATACCAAAGCATTTAGCAACAACTAC---------AACTATAACAAGAACACGACCAAAGCTG-----TCA-------CAAAAACCCAAACCCCGCCCGCC---------------CATGTCCCT----CCCCCTGTTCCCGGCC----------------------------------CCTAA----GTGAGCCAAATAGGTTAGCATTATTAAG-----CAGCAACAACAACTGACTC--CTCGGCATCCTCTCA-----------------CGGCCCCGCAACCGG-----------------AGAGCCC-AGCGGCATTTAATACC
>Psa 1506452 1506912|1640 chr3L 1506833 1506904 scaffold_9 3743720 3743789 - 2519|0 75
ACATTTCTATTCCCTGAAAATTATGTACGTGTTGAGTTTATTAC----AATAAATAAATGCAATTCCTAGTAAGAG
GCACTTCTATTATACAAAAGTTA------TGTTGAATTTACGACGATAAATAAATAAATGCAATTCAAATTAAAAA
>Psa 1506452 1506912|1641 chr3L 1506905 1508951 scaffold_9 3744919 3746965 - 75092|0 7
TCAAAACC
TCAGGCTC
>CG7852 1525041 1525365|1653 chr3L 1522726 1528440 scaffold_12 968755 974227 + 215000|2398 2753
TCCG---CTGTCTC----TTTATTCTCGGTCGAAATTCAAACTAAACTCAAACCGATCTTCAAACTCATTCGCGCTAACATCCATCAAACAACCAACCTCAACCAAATACCGTATCCGAATCCGCCTCCGATTCCGCATCCGAATCCCAAACAGAGGCAACAGCCTGCGACGGGTGAAGAACGGCAACAAGTGGCGGGCCCGGGAGATCTCGCTGGACCAGAAGCCTG---------------------GCTCGAAT---GCCATCAACCGACTGTCGGCGAATCTGACCACGGCGGACGTGAGTCCGGCTCTAATCGCCCAGGCCAACTGGACGTTTGTGGAGCGACTGCTGAAG
TCCAAATCTTTATCATATCTTATGTTCTGTTCAAAATTGCACTAAA--------AAACTTCAATCTCATGC-CGCTAACCTTCATAAAATAAAAAACAAAAAACAAAAAAAAAA---AAA--------CGAACCAAAAACCAATCCCCAAACAGAGGCAACAGCTTGCGACGCGTCAAGAATGGCAACAAGTGGCGCGCCCGTGAAATCTCGCTGGATCAGAAGCCGGCAAACAGCAGCGGCAATTGCAACTCCAATGTGGCCATCAATCGTCTGTCGGCCAATCTGACAACGGCAGACGTGAGTCCCGCCTTGATAGCACAGGCCAACTGGACATTTGTGGAGCGTCTGCTGAAG
>CG7852 1525428 1525767|1653 chr3L 1522726 1528440 scaffold_12 968755 974227 + 215000|2817 3159
GATATAAAATCGAAGACCAAGCGGATGCTGCTGGAAAAAATGGGTAACGAGGCGGTGGCGTTGGGCCTCAAAGGCGACGGCATTGAGGAGAACACCTTGATAGCCAGCATGTGCGATTTGCTGGAGAAGATCTGGTCGCACGGCCTGCAGAACAAGCAGGGAAAATCCGCTCTGTGGGCCCATTTGCAGGCCTATCTCGAGATGCAGGAGGCCCGAGGTGCTGGCGACAGCTCAGGAACAGAGCAGACGCCGCCGGTGTCCAGCAGTCCGGGCGG---CAAGATGACCATAGCCACAGCATCGCCCGCTCTGGCCTGGAACGCAATGCGCAAGCGCATGGACT
GACATTAAGTCGAAGACGAAGCGCATGCTGCTTGAGAAGATGGGCAACGAAGCGGTGGCGCTGGGCCTCAAGGGCGACGGCATTGAGGAGAACACGCTCATAGCGAGCATGTGCGATCTGCTGGAGAAGATTTGGTCGCATGGCCTGCAGAATAAGCAAGGCAAGTCGGCGCTCTGGGCGCACTTGCAGGCCTATCTGGAGCAGCAAGACTCACGCGGAACGGGTTGCAGC------GTGGAGCCCGTAACGCCAATTTCCAGCAGTCCCGGCGGCAACAAGATGAACATTGCCAGCGCCTCGCCAGCGTTGGCCTGGAATGCTATGCGCAAGCGCATGGACT
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ATCTCTCCACATTCCAAACGGACTTCGACAGCCCGCCCAGTCCGAATCGCAGTCGCTCGCGAGATCGAAACAAATTCGTGGGCCTGGAGCAGCTGTGCCCACTTCCCGAGTCGCTGGAGTTCGATGTGAA
ACTTGTCCACATTCCAAACGGACTTTGAGAGCCCGCCCAGTCCGAATCGCAGCCGTTCACGGGATCGCAACAAGTTTGTGGGCCTGGAGCAGCTGTGCCCGTTGCCCGAGTCGCTGGAGTTTGATGTCAA
>CG7852 1526018 1526268|1653 chr3L 1522726 1528440 scaffold_12 968755 974227 + 215000|3429 3679
AAATGTGCTGGCCATGGCGGATATCAAGACGCATATTGGCTATACCCGCGCCTGGGTTCGCCTGTCGCTGGAGAAGAAGCTGCTGTCCAGGCACTTTCGTACCCTGCTCTCCGATGAGGCTCTGCTGCGATCTCTGTACAAGCGATCGGCCTTCTTGCGCTGCGAGGAGGAGAAGGAACAGTTTCTCTACCATCTGCTCACTTTGAACACGGTGGACTACTTCAGCTTTACCAACATATACCCCACGACGA
AAACGTGCTGGCCATGGCGGACATCAAAACGCATATTGGTTATACACGCGCCTGGGTGCGTCTGTCGCTGGAGAAGAAGCTGTTGTCGCGTCACTTTCGCACCCTACTCTCGGATGAGAGTCTGCTGCGCACCTTGTACAAGCGCTCCGCTTTTCTGCGCTGCGAGGAGGAGAAGGAGCAGTTCCTCTATCATCTGCTGACACTCAATACCGTGGACTATTTCAGCTTTACCAACATTTATCCCACAACGA
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AGCTGCCCTATCGCGTTGTCATCTTCCCTTCGCGTAAACATGGCTCCTATCACACCTCCAGCAATGTGTGGATCATGGTCTCTGGCACCATGAATGAAACCCAACGTGTGCCCGTGCCCAAGGGCTCATTGGAGTTTATCTTTCAT
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TATAAGAATCTGGGACTGCTGACCACCATGCGCATAGGACACGACAACTCGGGACCTAGTCACAAGTGGCTGGTCGAACAGGTGGTAATGCGCAATGAGGTCACCGGGCACACCTACAA
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ATTCCCTTGTGGGCGCTGGCTGGGCCGTGGCGTGGATGACGATTCCACGGAGCGACTGCTGGTGGGCCAACGTGTTTTGACGAACGCGAAGAATGCAGAGTTAGTTCCTGGATCTGATACGCGCACCCCTCCACGGACGCGGAGCCCCAGTGTGCAGCGCCAGGAGACACTGGCACCATCAGAGATTCAACACCAGCTGGGCAACTGCGTCAACGTGCTGGTCAAATGGCATTATAAGCCCAGCCGGGATCGGGATGTGGGCACCCTGACCAACCTGCTGTGCGGGGACGATGGTTTGGTCAAGTGTCTGGAGCAGGTCTTCCTCTGCGGCTTCCGGTCGGCGCGATTCTTTGGACGAAATCTGTACATCTGGGACTATTTCA
ATTTCCCTGCGGTCGCTGGCTGGGCAAGGGCGTCGATGACGACTCCACGGAACGTTTGCTGGTTGGTCAGCGCGTTTGCACCAGTGTAAAAAATGCCGAGCTCTTGC------CGCCCACGCGGACACCGCCGCGTACACGCAGTCCCAGCGTGCAGCGTCAGGAGTCGGTGCCGCCATCGGAGATACAACATCAGCTGGGCAACTGTGTCAATGTGATTGTCAAGTGGCACTACAAGCCGAGTCGGGATCGGGATGTGGGCACGCTGACGAATCTGCTGTGTGGCGATGATGGGCTGGTTAAATGCCTGGAGCAGGTCTTCCTTTGCGGTTTTCGCTCGTCCCGCTTCTTCGGACGTAATCTATACATCTGGGATTACTTTA
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CCAAAATCAAGGAGCTGTTTGAACACAATCTGCAGATGGAGCTGGAGGACTCATCCTCAAGCCTAGACTCCTCGTTTAGCAATGGAAGCGGCAGCGGAGGAAACAGCCTGCAACGTCGGGAAATCTCCAGCATTTGGCGTCTGTACGTACAGCTTATGGACGAGATCAACGGCACGG------CACTCGGCAAGGACGGCAAGTTCCAGCTGCTTATCTGCTTGAGCTTG-------------------------------------------------------CGGGAGCACCTGCTGACGCGTCTGATAAAGCCAATGGCCTTGACCAAGGTGACGCACGAGATGTACGAGGAGGAGAGCTTCCTTAGGCGTCGCAACCTCCTCACCTTTCTCATCCAAATCCTGGAGCCGCTGGACGACTGCCACATCGTGCTGGAAAACTCAATCACACAGGGCATTCGCATCGCGTCCCAATGCTGAGGATCGGATGCAATACCTAACGCTCCCACTGCAATACTCATGCCACATCTCACCCACGGACATTTGCAACCAGTGACCTAGAGAATACTCACATACATATGCT-------------------CTTGAGGAATCTCGGAACTCTCGAATTCGTTGTTAGCTTTTAATGCGAAGCGGAGGAACTCCTGCCCCTATTACACCTATTTCTAGTTCTAACTATAATCCCAAGCCTAGCCACTAACCACTTGCCATTCGACCCTTCGACAGCTTGCCAAGAAACAGAGTCAAACGCTGAACGTTTTAGGGTAATGGATGCCAGTCCCGGGAACACTGAAGCCAAAGTTGAACAAAATTCCTTGTCATCGACGCAATCGAATTTTAAAGACATTTACTGTGCAATTAAGACGTTTACTATAACAAATTCTAAAA-TGTTGTTCAAAAATCTCCATATATTTGAAACGTATGCGTGTGTGTAGC--TTAGTAGATAAGGTGTCCCA---------ATCCGAAACCAAATCCAGTCAATTATCC--------TGAGTTCCATTATCAACAGTAGCTTTTAGTTTAGTTGAT-TTTACCAAAGAATCTTTGTTTTTTATAACGACCAACTTATGGCGTACATATTTTTTGTATATTATTATATTTTGGTACTTGAGTGAGTGAAATGAGATTAACCCAAAGGTGTTTATGTTATAATCAAGCTTTATTTTTACACTTTAGCCAAACACGTTTGCAGACACTACCTTAAGACCCTGAAAGTCAATAAATACAAATACGCAAA
CTAAAATCAAGGAGCTGTTTGAGCAGAATCTGCAACAGGAGCTGGATGACTCGGCTTCCAGCATGGACTCCTCCTTTAGCAATGGCAGCTCC---------AATAGCCTGCAACGACGTGAGATAGCCAGCATTTGGCGTCTGTATGTGCAGCTCATGGATGAGATTAATGGCACGGCCAGCACACTGGGCAAGGATGGCAAATTTCAACTGCTCATTTGCCTTAGCCTGAGGTAATTAAATGAAGTTTCTTTGCGTTTTTCCCTTAATAAGGTTCTCTGTTTGCAGGGAGCATTTGTTGACGCGTCTTATCAAGCCGATGGCCTTGACGAAGGTCACCCAAGAGCTGTACGAGGAGGAGAGTTTTCTGCGTCGTCGCAATCTTTTGACATTTCTCATACAAATTCTGGAGCCGCTTGATGATTGCCACATCGTGCTGGAGAACTCCATAACCCAGGGCATACGCATTCCATCCCAGTGCTGAA---CCGTGGCTCAACTTAGCCCGCAC---------------CCACA-CTTACCCACAGACATTTGCAACCAGTGACCT--AGAATACTCATATACATATGCCCAAACAGTACATGGAATCACACGGGGAATCTCTGTAA-CTCGAATTCGTTGTTAGTTTTATGT---AAGCTAAAGACTTGTCATCCTTTTTAAACCTAAT--------------------------------CCAAACACTTGCCATCTACTC--------GCTTGCCAAG--------------------TGTTCAAAGTCAATG--------------------TGAAGCCAAAGTTGAACAAAATT-------------------------------------CTGTGCAATTATGAAATTAATCCCAAATAATTCTAAAAGTGTTGTTCAA----------------------TATGCAATTGCGTAGCTATTAGCGTTTAAGCTTTTACATTAACATGTATCATCAAAATATCTTGGTAACTTTTTCTAAGTTAGTGAATTTATTTTTGAACGTTAGTTTTCCATTTAGTTTATATACACCAAAGATTTTTAGTTTTGTGACACGA--AAATTGTCG----------------ATTTTATGATATTTTTAT----------------TGAAATTAAGAACATGGTGTTTTTGTTGATATCAAGCTTTATTTTTATATTTTATTTAGCCAAAAATGAAAATATTTAC-AAAGTTATTGAGTGTCAATAAAT----ATATACAAA
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TTCTATTGCGGGGC------AGCCCGATC-TTTTCTTCTTCTCTTAATGTC---------TTTAATGCTATTGTAAATGGA----------CTTGCTTGCAACTAGTTCGACGGCACACTAT------AGATGCCCCAGGATCGCCAC-GCAGGC------------------------------TCCACGAACACACACTTATAT-TTACTCTAGCCCTAAGTGGTATTGTAATCCCAATGT---TTTAGTTG-----GCACTCGTTCT-----CCTCCTGCCTCAACTC----CACCTGCCCATCTCCATCTGT------------------------GAGAATCG---------------AGGGAATCCTGT-----------AGCTAATTTAGCTGTGTGTGTGTGTG-TGTGGGACAAGCA-----ACCACCAACGCGGAAAAGACTCA-TTTTTGTATTAGGCACTCGACGGACTGTGCACGAAATCAATCGGCAGTGGCGGCAGATTCAGGTGCCGAAAATATCTAGAAATATTTATATTAAATTATTTCGCATAACATTAAACTAAGTTAACAACACCGCAACCAGAACACCAACCAATATAGAGAAATCCAAACAAACAAATTACGAAATACATTCGGAAAATGCAAAAAACAAAAACAAGTAATTAGTAA----CAGTTGGCAATAGCGGAACTATTGCAAATGCTTTGTTAAATA-TTTTTTGAAAAATAAACATTGAATC
ATTAGTTGTAGTGTGTTGCAAGCACAACCATTTTCATATTTGGCTAGTTTCACTTTCTCTCTTAAAGCTATTGTATATTTATTAAATTGTTTTTTCGTGCGATAA--TCGTAGGCATATCATTTGTTGAGAAGCGATGCGAACCTCGTAGTAGTCGTCGTCGTCGTTGTCGTCCTCCTCCTGTTGCCCACGCGTACACAATTTTCTATAAATGTATCTCTAAATGGTATTTTATAAACAGTTTAGATTTAGTTGCAACTGCACTCGCTCCTCCTACCTGTTGCCACCAATCTGCGCTCTTTCTTATTGAAACCTGTAGCCAATTTTAGATTTAAAACAAAAAGAACGGGGCCGCAGCTGCAAAAGCAAATCCTACACGATTTATAAAACTAAGCACGGCATACAAAAATATGCTGTGAAAAAAAAAAGAAGAAAACCAACGC----AAGACTCATTTTTTGTATTAAGCCTT--AAAGATTTTGCGTGAAGATAAACA------------------------------ATATAGAATTATTTATATTAAATTATTTCGCG------TAAGCTAA--------------------------AACCAACATAAACACATCCATATACAAAAACTAT---ACACATTCGCA----GCAAGAAAT---------TTATTTGCAAAACTCAGTTTGCA--AACGATAAAAATGAAAA-GCTTTGTTGAATATTTTTTTGAAAAATAAACATTGGAAT
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A
A
>Cct2 1538701 1538857|1658 chr3L 1538815 1542179 scaffold_12 982740 986381 + 97335|0 42
TGCGCTTAAAATACATTCCGATAAATTTCAGTTAAATTATGAA
CGAAATTTAAAGGAATCTAAACATGTTTTC-TTAAAATATAAA
>CG7864 1543318 1543395|1659 chr3L 1542189 1546653 scaffold_12 2444976 2449752 - 119283|1146 1223
GATTGGATTAAGACTTTTTATATTCATGTTATAGGAAGTATTTTTGTGTCTATGTAATATATTTTATTCATATAAATG
G-----------------TATTTAAATGCTATGGACAATCTT------------AATTGTATCTTCATCATAC-----
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AAACTTAAACTAAGTGTACACTCTTAAAAACAGTCGAAATTATAGTTCTTAGA
ATACGTACATCAA------ACTGTTAAAC----TTACAACTATATTTTTAAGA
>CG12004 1557561 1558268|1669 chr3L 1557069 1559887 scaffold_12 1001041 1004126 + 36624|499 1555
ATC-----------------AATAT----CAAAAGCAAAACTCTAGCGATGCTCGCTACTAAACACTAATTGCAATCACAATTCCACATTTCCGAGCGGGACGCGATCCGAAAGCGAAGCAAA------------------------------CAAGTGTACTTATAGCC--CTAGCGCCTTA------------------GCCCTAGCTTAATGCCCCACAGTATCCCCCGAAACCAAGCTCAGAGAGGAAGATACGTACTAGGCCTAGTTACTTACTTA-----CTCACTC-----CACAAAACGCTGAAAGCTGAAC------AGAAATTAACTTAGCCAGTCCATTGAGTTCAGGGCTTTT---AGAGTTGCCTCTG-----CGTCTG--TGTTTCTGTATTTCCTACGTTTACACTCTACACCTAAACTTAAGCGTTTTTTAAAACAACTTATTTAGACGTTAGCTATGTACGAAACGAACTATA------------------------------------------------ATATTGTACAATATTATGTATTTGTAAACAAAGATTTTATTAT---------------ACTGTATGCAACAATGGCAGT-----------------------------CGCTGAACAGGATTCCCCATTCAAGCG---------------------------------------------------------ATCTTCAAGC------TAGTTTC--------------CCCTCAGCAT-----------------TTATTTACG----------TGTTTCCGTT-----------TCGCTCAAAGATACCAAAAACGAAGTTTTTCCTTC---------------TTTTATTTTGATTTCCCCTTTTG----------------ACCACCCTTTTGTGATAAGCTCTCGT-----CGTCCTTCTATTTACTTCTG------TTTGTAAATGTTTAAACCAATTGTATAAAATATCTAAAA--TACTTA-GCAATAAATGTACGATAAGCTTGACAACT
AACTCTTATTAAAATACAAAAATACAAAACAAAACAAAAACTCTAGCGATGCCCGCTACTAAACACTC----TAATTATAATTCCGAAACAAAAGGAGGGACAAACAAAAAAAAAAAAAAAAAAACAAATTATACAAGCAGATAAAGACAAATCAAGTGTACTTATAGCTAATTATAGGCTTACAATTTGACACCACAGTTGCCTTTTGTTGCCGCTTAAAGATAAAACTAAAAACAAGCGATTAACAATTAAATACGTATTAGGCCTAGTTACTTACAGAAAGCGCGCACTCGAAAACCCAAAACAGAAATTGCCTAGTTACCTTAGAACTTTATGTATCTGAATTATGTACTCTAAAACCGTTTAAAGACATGCCTTGAACAACCCTCTGATGATTTGTGTATTTTTTAAATT--ATGTTTACGTTACGATTTAAGTCTTTTT---ATCAACTTATTTAAATGTTAGCATTCTACTATACATACTATACATATACACATATATATATTTCTATATATATATGTATATATATGGGTAATATTGAATAATATTATGTATGTGTAAACAAAGATTTTATTATTATATATGGTATGTAATTATTTGTAGAAATGGCAATACAAACAGATTCAAATGGAGCTTAGCTTGTACTAAACATGGCCCCCGATTAACACACATTTTGGACAGATATCTATCCATATCCAATTTTAACTTGTCAATTTTTATATCAGAATCTTCAAGCAACGCTCAGTTTCTTGCGGTTTTTGTACACTTAGCTTATGATGCATTTAAATTTTTAATTACGAACTTAAAGATCTTTCGATTCAAATATCCGTTAGCTCAAAGATACCAAAAACAAAACATAATATTTAGAGAAGAACATTGTTTGCTTTTTGATTTCCTTTTTTGTGATAGACTCAAATCGAAAGCTCGAGCATTTTAAGTTCGCGTGCATATGTGTTTTTTTTTTTTTTTGATAACTTTTGTAAATGTTTAAACAAATTGTATAAATTATCTATAAATTATCTATACACAAGATGTATGATATACT-AACAAC-
>CG13917 1583394 1583407|1693 chr3L 1581136 1583503 scaffold_32 1252037 1254423 - 102400|2347 2360
TCAAAAAACAAAAC
AT--------ATAC
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CACTTCATCCTCAGAAACCCAAGAAGGAAGTTGGGCAGCCTCTTCATCCTTTGAACTGAAACTAACCTAACGAATCTCAGCACGTCTTGCCACAAGTGATTCCTACTATGAGCTGATCTCACAACTTTCTCAGCCTTCGAACCCTAAGCACCAAATTCAAAATTTAACAGGTATTTCGGTAGTCCCTTCTAGAACATGAACCAATGTCGTCTGAGGAGCCTGGCGCGGATCAGGAGG---AGCCTGACACTGGGTTTGCGGGGAACTGACCAACACGTCC--------------------TCGCCCGTCAAGCCCTCC--GCACCATTCAAACGACCTCACAGCGGCGAGGTGTCCATGATCTGGACTCCTTCGCCAATGGATGCAGTGCCGCCTACATCGAGGGACTCTACAACAAGTGGAAGCGCAATCCCAGTTCCGTAGATGAG
CATGTTGT------AATTCAGAGAAAGCAA-----------------------AACAAAAAAAAAAAAAAGGAA-----------------ACAAAAAATACGGATTACTTGCCGGCCAAATTAATATTTT-----------CTTAAAATTTAACGTGAAGTTTCAACAATTGTTTTAAT----TCTGCGGGTGCAGCCATGAATCCC--------AACCAGGGCCGCATCGGGCAAGCAATTTTAGCCCAGGGCTTGAGGC------ACGAATACGCCCGCTATAATGCAGGCCGACGGTCGCTGGTAATTGCCTCAAAGCTCTATTCAAA-------AAAGAATCGAACCCCCGATGATTCTGATAGTTTGGCCAACGGCAGCAATGCCATATACATTGACAAATTGTACTCAAAATGGTCCAAGGATCCCGGCTCTGTGGATCAG
>CG18170 1588691 1589054|1697 chr3L 1587161 1590652 scaffold_32 1260276 1263438 - 61839|1597 1968
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TCGTGGGATGCCTACTTCAGTGGCAA-----------GCCTCGGAGCATATCGTCTGCCCGGCAGCGTCAGCCCAAGAAACGTAAATGGCAACC--------------------AGCCTCAGTTT-----CAGAACGTCC--------CGCATCTTCTGCTACAAATCCTGCACCGCAGGCCGATTGGAAATACATAGACGATCATTTGGTCGTACAGGCCATTATCCGAGCCTATCAGACGCGCGGTCATTTGGCCGCTGACCTGGATCCTTTAGGCATTGTGGGACCAACTGGTCATTCTCCCGCCACGGATGACAGGAAGCTGCAGGCCACGCGAGCTGTGCTGCGACAGCATTACTCCTATATATTCA
>CG18170 1589121 1589193|1697 chr3L 1587161 1590652 scaffold_32 1260276 1263438 - 61839|2040 2112
ATGACCTCAATACCGTGTTCAAGTTGCCCTCATCCACAATGATAGGCGGTGATCAGGAATTTCTGTCACTAAA
ATGATTTGAATGCCCTGTTCAAGCTGCCCAAGTCCACGTTGATTGGTGGCGATGAGGAGTTCCTGCCGCTTAG
>CG18170 1589253 1589563|1697 chr3L 1587161 1590652 scaffold_32 1260276 1263438 - 61839|2172 2482
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AGAAATACTGGATCGTTTGGAACGCGTTTATTGTGGTCATATTGGTGTGGAGTACATGATGATAACGTCAATCCACAAGAGCAACTGGATACGCGAGCAATTTGAGAAGCCCGGCGTGATAAACTTCAAGCCTGAAGAGAAAAAACTGATCCTTGAGCGTCTAACACGCTCCACGGGCTTTGAGAACTTTCTGGCGAAAAAGTACAGCTCCGAGAAGCGCTTCGGACTGGAGGGTTGCGATATCATGATACCCGTCATGAAGGAGATCATCGATCAGTCGAACAAATGTGGCGTCGAGTC-----------
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GAATGGCGCATCGAGGGCGCCTCAATGTCCTCGCCAACATCTGTCGCAAGCCCATTTCGGACATCCTGTCTCAGTTCCACGGCTTGCAGGCCACCGATTCCGGATCTGGCGACGTTAAGTACCATCTGGGCGTGTTTCAAGAGCGGCTCAACCGACAGACAAACCGCATGGTGCGCATCACCGTGGTGGCGAATCCCTCTCACTTGGAGCACGTCAACCCGGTGCTCCTGGGTAAGGCCCGAGCGGAGATGTTCCAACGGGGCGACACATGTGGCAGCACGGTGATGCCCATCATTATCCACGGAGATGCCTCCTTTTCCGGTCAGGGCGTGGTCTACGAATCAATGCATCTGTCCGACTTGCCCAACTACACCACCTACGGCACCATTCACATTGTGTCCAACAACCAGGTGGGCTTCACGACAGATCCGCGTTTCTCCCGCTCCTCGCGCTACTGCACGGACGTTGCCAAGGTGGTGAATGCTCCGATACTGCACGTGAATGCGGACGATCCGGAGGCGTGCATCCAGTGCGCTCGCATTGCCATCGACTATCGGACACGATTCAAGAAGGATGTGGTCATCGACATAGTTGGCTACCGACGCAACGGGCACAATGAGGCGGATGAACCCATGTTCACCCAGCCGCTGATGTACCAGCGCATAAAAAAACTGAAGCCATGCCTCCAGCTCTACGCCGATAAGTTGATCAAGGAGGGAGTCGTCACGGATAGCGAGTTCAAGGCAATGGTGTCAAGCTACGAAAAGATCTGCGAGGACGCTTGGGCCAAGTCCAAGACCATCAAGACCATAAAG
GCATGGCGCATCGTGGTCGTCTGAATGTGTTGGCCAATGTCTGTCGCAAGCCCATGAAGGAGATTCTGTCACAATTTCATGGCCTGAGAGCCAGCGACTGGGGCTCTGGTGATGTCAAATACCATTTGGGTTTGTTTACGGAGCGCCTGAATCGGCAGTCCAATAAAAATGTGCGCATCACCGTTGTGGCCAATCCGTCGCATCTGGAGTACGTTAATCCGGTGGTGCTGGGCAAGGCACGCGCCGAGATGTTTCATCGCGGTGACTATCAGGGCAATAAGGTCCTGCCCATGCTGATACATGGAGACGCATCGTTCTGTGGCCAGGGCGTTGTCTACGAGTCCATACATATGTCCGATCTGCCGGCCTACACCACGCACGGAACAATTCATGTGGTCTCCAACAATCAGGTGGGCTTCACCACAGATCCGCGCTTCTCCCGCTCGTCACGCTACTGCACGGATGTTGCCCGCGTTGTCAACGCGCCCATATTCCATGTAAATGCCGATGATCCGGAGGCGTGCGTCCATTGCGCCCGTGTCGCTGCCCTTTGGCGTGCGAAATTCCACAAGGATGTGGTCATCGATATTGTTGGCTATCGCCGCAATGGCCACAACGAGGCCGACGAACCGATGTTCACCCAGCCGCTAATGTACCAGCGCATACGTAAGCTCAAGAACTGCACGGTGAAGTATGCAGAGAAGCTGACCAGGGATGGGGTTATCAAAATGGAGGAATACACGGAAATGGTCAAGAAATATGATAATATCTGCAATGAGGCCTTCGAAGAGTCCAAGAAGATCAAAACCTTTAAG
>CG18170 1590492 1590646|1697 chr3L 1587161 1590652 scaffold_32 1260276 1263438 - 61839|3424 3578
TATTCCTCTTGGATCGACTCTCCCTGGCCAGGATTCTTCGAGGGTCGCGATCGCCTGAAACTGTGCCCCACTGGCATCAGCACGGACACCCTGAAGACGATTGGCAACATGTTCTCGACTCCTCCGCCGCCGGAGCACAAGTTCGAGACACACAA
AATTCACACTGGCTGGATTCGCCCTGGTCCGGCTATTTCCAGGGCCGGGATCGTCTAAGGGTGTGCCCAACGGGAGTTAACCTCAAAACTCTGCAGCATATTGGCGAAATATATTCCTCGCCGCCGCCAGCTGAACATAAGTTCGAAGTGCACAA
>CG18170 1590702 1591820|1698 chr3L 1590662 1592087 scaffold_32 1263647 1265110 - 55189|40 1158
GGGCATCCTTCGCATACTGGCCCAGCGCACGCAGATGGTGCAGGACAAAGTGGCTGACTGGTCGCTGGGCGAGGCCTTCGCCTTCGGCTCGCTCCTTAAGGAGGGCATCCACGTTCGACTATCCGGCCAAGATGTGGAGCGCGGCACCTTTTCGCACCGGCACCACGTCCTGCACCACCAGTCGGAGGACAAGGTGGTGTACAACTCACTGGACCACCTCTATCCCGACCAGGCGCCCTACTCCGTCTCCAACAGCTCCCTGTCGGAGTGTGCGGTCCTTGGCTTCGAGCACGGCTACTCCATGGCCAGTCCCAATGCTCTGGTCATGTGGGAAGGCCAGTTTGGGGACTTCTGCAACACGGCGCAGTGCATCATCGACACGTTCATAGCCAGCGGCGAAACCAAGTGGGTGCGCCAGTCCGGAGTCGTCATGTTGCTGCCACACAGCATGGAGGGCATGGGCCCGGAGCACTCTTCCGGCCGCATTGAGCGCTTCCTGCAGATGAGCGACGACGATCCGGACGTCTATCCGGATACCTGCGACGCTGACTTTGTGGCTCGCCAGCTAATGAATGTCAACTGGATTGTGACGAATCTCTCCACGCCCGCAAATCTGTTCCACTGCCTGCGCCGCCAGGTGAAGATGGGCTTCCGGAAGCCGCTGATTAACTTCTCGCCCAAGTCACTGCTCCGCCATCCGCTGGCGCGAAGTCCCTTCAAGGACTTCAACGAGTGCAGTTGCTTCCAGCGCATCATTCCCGACAAAGGACCCGCCGGCAAGCAGCCCGACTGCGTCCAGAAGCTGGTCTTCTGCTCGGGAAAGGTCTACTACGATCTCGTCAAGGAGCGCGACGATCACGAGCAGGTGGAGACGGTGGCCCTGGTGAGGGTGGAACAGGTGAGACGCCTCCCAACGCGACACCTCTTCTTGTTCATGATAACCATGATTGGGCGCATCCTCCAGCTCTGTCCCTTCCCCTACGACCTGATCAGCCAGCAGCTGGAGCTGTATCCCAAGGCGGAGCTGCTGTGGGCCCAGGAGGAGCACAAGAACATGGGCGCCTGGTCTTACGTGCAGCCGCGTTTCGACACGGCGCTCCTCAAGAACGAAAACGAATC
AGGCATTTTGCGTATTTTGGGCCTGCGCAAGAACATGATCAAGGAGAAAATAGCCGATTGGTCGCTGGGCGAGGCATTTGCCATTGGCACGCTGGTTAAGGATGGCATACATGTGCGCATATCCGGGCAGGATGTGGAGCGCGGCACGTTCTCGCATCGCCATCATGTGCTGCACCATCAGACCAAGGACAACGTGCGCTACAATTCGCTGCAGCATCTATATCCGGATCAGGCGCCCTACGATGTCTGCAACAGCTCGTTGTCGGAGTGCGCCATCTTGGGCTTCGAGACGGGCTATTCGATGGCCAATCCCAACACCCTGGTCATCTGGGAGGCGCAGTTCGGTGACTTCGCCAACACCGCTCAGCCCATTATAGACACCTTCCTTGCCAGTGGTGAGACCAAATGGGTGCGTCAATCCGGCCTGTGTATGTTCCTGCCCCACAGCATGGAGGGCATGGGCCCCGAGCATTCCTCCGGCCGCATTGAACGCTTTCTACAGCTCAGCGACGATGATCCCGACTGTTTTCCGGACATGTGCGATGCGGACCTTGTGGCCCGCCAGCTGATGAACACCAATTGGATTGTGACCAATTTGACGACGCCAGCGAATCTCTTCCATGCACTGCGGCGTCAGGTGGCGCTGGGTTTCCGCAAGCCGCTTATCAATTTCTCGCCAAAATCTGTCCTGCGTCATCCGAAGGCGCGCAGTCCTTTCCGGGACTTTAACGAGTGCAGCTCTTTCCAGCGTCTCATACCCGATACGGGTAAGGCCGGCGAAAATCCGGATTGCGTCAAACATTTGGTTTTCTGCTCTGGCAAGGTATACTACGATCTGCTCAAGGAGCGCGAAGATCACGAGCAGGAATCAACTTGCGCCCTCGTGCGCGTCGAGCAGGTAA-------CTTGGCTTGGAACTTCATCAATAAAATGATAATATTAATTTAAATTATTTTACAGATCTGCCCGTTTCCCTATGATCTGATCCTGGAGCAGATAAAAAAGTATAAAACTGCAGAGCTCATCTGGTTCCAGGAGGAGCACAAGAACCAAGGCGCCTGGAGCTATATCCAGCCACGCTTCGACACAACCATTCTGAAGATGGAGGGTGAAAG
>CG18170 1600050 1600888|1707 chr3L 1599937 1600244 scaffold_32 1274343 1274626 - 4933|116 310
GCGCTGCGTGTCCTATCACGGACGACCGCCCAGCGCCTCGCCAGCGACGGGCAACAAGGTGCAGCACTACAACGAGTACAAGGCCCTGATCACAAGCATCTTCGGAGAGCTGACGCCGGAGAACAAGAAGCGAATCGAGGATCGGATCAAGAAGCAGCAGGCAAAGGCCAAGGCGGATGCGCAATCGAAACCCAG
CCGTGGCATTAATTATCACGGACGACCACCAAACTCGGCCTCATCCACCGGGAACAAGGTGCAGCATTATTCGCAATATGATGCTATCATGACTGGCCTCTTTGGTGAACTGACCGAAGAGAATAAGAAGCGCATCAAGGA---GATCAAGGAGCAGGAGCAAAAAGC---GGCCGTCCAACAGTCCGAAGCTAG
>CG18170 1600050 1600888|1708 chr3L 1600749 1600931 scaffold_32 1275116 1275300 - 748|0 150
ACCTGCTAAA-GATTACG-------GCAGTAGAAATGAAACCCAAAGCACTCCCGGGGAGTCGG---AACTGGACCCAACAAAACCACAGCCCTAGTTTGAATCCTCCTTTGTAAGTCCACCAATAAAGATAGGTAATAGTTACAGAAAGA
ATCTGCTAAGCGATTGAGAAAATCTGAAGATGAAGTGACTCCCAATGATCCCACAAGCAGCCTGTAAAAATCGAATGAGGTGAACTA-------AATTTCAGTTTTGCCGTAT---TTCGCTTAGAAAAAGAGCCAAGTATTGTATTTTAA
>CG33791 1600834 1600894|1708 chr3L 1600749 1600931 scaffold_32 1275116 1275300 - 748|96 156
TTTGAATCCTCCTTTGTAAGTCCACCAATAAAGATAGGTAATAGTTACAGAAAGAATATAA
TTTCAGTTTTGCCGTAT---TTCGCTTAGAAAAAGAGCCAAGTATTGTATTTTAACTAAAA
>CG33230 1603791 1603801|1711 chr3L 1601702 1604092 scaffold_32 1275973 1278287 - 50001|2190 2200
AAGCTGTCTAG
-----------
>CG7955 1606522 1606945|1712 chr3L 1604155 1609248 scaffold_32 1279110 1284343 - 212771|2423 2956
ACGAGGCTCCTAGCCTATTTATGTGTTTGTTATAATGTTATAACCATCCCCTTCGT---TTGGCAATCCCTAGCCACTAAATTCACCGTAGAATCCTCCTGGACCGGAGATTCGCT-ATTCATAGGCTTAAAGTATCATTGTGAC--GTTTGTAAATACAGCTGTAGATATGCG---------------------------ATAAGAGAAATTGAACGGGATGTGGTACAATATGGAAC------ATTTATTATCAGTTTTATCACCCATACATTCGGTTATATCGCTCTGGTTTCCA----------------AGGTTTTGTTTCGAGATTTAATTGA----------------TTTGAGCGTA--TCGTTATGTAAATGCAAAATAATGTGATATT---ATTA-AATGCATTTCATTGATATATAGACAAAACCAA----GAGGATTTGTGT-ATATCCTTCAAATCGGACCTTCATTTCTT----------------------------CAATATAAATTGTTATCCTCTG
TCT-TATTGTTGGCCACGTTGATCACGTTTTCTA--GTTTTAATGATGCGCTTTGTTAATTGACGA-----GGTCACAAAATTTTAAGTG--------------CAGAGATTTGTTAATATTTAGGTTGAAAATAATATTGTGTCCGGTTTGTAAATACAGTTATACATATAAGTATATATTTGCATTATGTAAATATAGCATAACATTGTTTGGATGGATAACAGAACAGTCAAGCACCCAAGGGTCTAGTATACCCTGTGAC-----TAGCTCCCAGTAGACTAATTTGAAGTCCAGATGGAAAGCAGTTTCACGCCTTTTGTGGAAATACGTTTGATAACTGTTCCATGTTTTTCGAGGAAAATCCATTATGTGAA-GCTTGAAAATTTATTACTCCGATTATAATATACTTCACAAACACATAAAACGACCTTAACTTGGGAATTCATATCATAATCTTGGAA--AGATAATCATTTTCTGACTCGGTACGCTCTGAAGAAAGAGTTGGAATCAAAATTGTCATCTTCTG
>Bgb 1624169 1624480|1722 chr3L 1623245 1624484 scaffold_9 2298685 2299828 - 54285|929 1271
TTGGACCTGTGGACGGCTCCTGGGCCGTCCCATCCGCAGCTGCCTCCCCAGCAGCAGCAGACGCATCACCAGCAGTTAGAGACTCAATTCGCGAATACTCAATATTTCATGGACAACTGA--GAATGCTCCGAACCCCTTA------------AGAGGGCTTTCACTTGAGAGATTTCAATACGATTACG-TTAGACACGCTCGAATAATTATGCTCCTAGATTAGTGTTAG-ATGTAAT-GCTTACTTTACGTATGCTTTTATGGTATTATAC-TTACAACTTAGTGTGAAATTAGTGTCGTATCTTTAACTAAA-------------ATACATAATTACTA
TTGGACTTTTGGACGGCAACGACGCCGT------------------CCCAGCACCAGCAGCAGCAACAGCAGCAGCATGAGACTCAATTCGCAAATACTCAATACTTTATGGAAAACTGAAGAAATGCTCCCAAAAACCAAATGCGGACACGGATACGGCTACGGCTATGGA---TTCGATTCGATTACGTTTAGATTCGCTCGAATAATGCTCCTCTAGACTTAGTTTTAGCACTTAGTAAATTACTTAACGTATTCTTGTATGGTATTAAACATAACATTTTAATGTGAATTTA-TATAGTA--CTTAGTTAAATACTTACACATTTACACATAAATATAA
>Bro 1632079 1632145|1724 chr3L 1629047 1632083 scaffold_9 2304547 2307582 - 103379|3172 3176
TGCTA
AACTA
>CG13920 1634666 1635030|1729 chr3L 1634082 1638782 scaffold_9 2311832 2316719 - 110227|597 1160
GTGCCTGC------TACCGGTGCATC----------------------ACGTACTCATAGTCATTCACTGATCCAGCTTTGTTTTAGCACCTTAAGTTGG---------GCTCGAGATGGCGCGC------------------CCTGTCTGCGGGTCT---CAAATTCATTCACATCATTCTAGC-----------------------------------AAATCGAAATTCA------------------------TGTTTTCACTTTGGTGCCAAAT----------------------TATTATCGTATACAGAACTACTATA--------TTGTATGCAATGGCG--AGAGATATTAACTAA----------------------ACTGTAGACGC-GACCAGATCAA-ACCAGAATGTAATCAAATCCTCTTCGTAACG---GGCACT----------TAGTCGGAACCATTTA-AATTACGAC--TTTAGAAACAATTTTAATAAATTT--GAACAACTCATAC---ATATTTAAAATT-----AATAATCCAACGTCA
ATGCTGCCGGAGAGTACGAGAACATATTTAGTCGAATCTAAAAAAAGAATCAACTTATAGTCGCACCTGTAAACAGCTTTGTTTTAGCACAATTAGTTGAATATCGCGAGCTCAAATTGGCGCCCTTAAATACAATATACATACATATATATACATATTAACGAAATAACACACTCATTTCTAGTTATAAATTAAATGAACAATTTTTATAGAGTAAACGAAATTGAAATTGGAGTGTTTTTCTTTTTAAGTTTTTTTTTTTTCACTTTGGTGCCAAATAATAGAATACATACTCGTACAATATATATATATAAAGAAATAATATACACATAAATTAATTGCGAAAGTGTTCAAGTTATAAATTAATAAACGAGTTAGAGTATATAGCAATAAAGACAAAGACCAGAATAATACAAAAACATAAATAAATCC-CTTCAAAAAACACGGCACTCGTGTTGTTGTTGTCGCAGCCAACAATGCCTATGACATTTTAGCAACAATTTTAATAAATTTTTGAATAACTCATATTCAATACATAATGTTTCAACAATTATTCAACATCG
>CG7970 1637395 1637642|1729 chr3L 1634082 1638782 scaffold_9 2311832 2316719 - 110227|3647 3900
GCTATACGACCCTTAAACCCTGTGGTAGTCGTCTTGGCCTAATATTCCAATTACTGCTTAGATTACGGCTGAACTGCTTCAAGTTCTTTATCTTCCCGCGTTCCG-GCGGATTGCAAAAAGTCCGTGTGTATTTGAACACTTTAGATAAGCTAAAACTAACTGGAGGGGCGCCTTATCAACCGACT----GTTGTTATACCTTAAACCCTAAATTTTGTAAACTTTTCTTACCAAAATAAACTAATATACA-AT
-CCACATAGACATAGCATTCCATGGCACCCATCTT---------------TTGCTATCTA----------TAACTATGTATATGCATATATATTAACACGCTCAGTGCAGATTACG----------------CTGGACTCTTTTTTTAA-------------------ACGCTTTATCTGGCGTCTCAAAGGTTTCGAACCGGGAACAATAATTGCTTTAA--CTGTTTAAGTAAATTGAAACTATATATACAT
>CG7974 1649777 1649924|1739 chr3L 1648669 1650408 scaffold_9 2330187 2331909 - 58691|1142 1305
AGATACGAGTGCCAGCAATAAAATGTACAATTGTTTAGGTTCAGGATTCTGTTTTATTTCTATATATATTTCAAT-TAAATGTACTTTAAGAATTAACTCATTAATCCATTAATCGGGCCACTTCTGT---------------AAAAATAAAAGCAAACACTTG
-------------------AAAGAGTACAAATTTTTAGA--CAAGACACT-TTTTAT---TATATTAATTTTAATATAGAAGCGGTTT----TTCCTGTGCTTAATCCAT-------GTCCTTTCCGTTTGCTGAAATATATAAAAATTACATGTAATCA---G
>CG12011 1679833 1679952|1774 chr3L 1678473 1679962 scaffold_9 2368663 2370029 - -1639|1479 1601
GAGGCTAACTAAAGTGATCAATACCGAA---AGAACAACAAAGAAACGAGGTGGAAACTAAGGCATATCCTTGTAGTTATTCATTAGAAATACAAATAAAGTTAAGTGCAAACCCAACTAGAA
ACATCC-TCTCAATCAGCCAATACGAAATCGACAATAACAAGCATCAAAAATCGAACCTA---------TTTCTAGTTCT-------AAGTAGATTTTAAGTTAAGCG----CTTCAGTAAAA
>CG7995 1728545 1728962|1816 chr3L 1726713 1729332 scaffold_62 318491 321036 - 107630|1832 2343
------------------------------------------ATACGACAGT-------------CGCC-----------TGACACTTAGATCGA-TTCTAGGTTGTGATAATAATTATTTGTC-----CGGATTTCGTTTGGATCTTATACACACACT---CTGTACATAGTCCTCGAAGGACAGTGGGTGGTTGAACGTGCTTTAAACCCTGTAAATAGCTGGACTAAGCTCCGTACTACTTTAAGTATCCCGTATCCTGACTATCTTAACGTGTTTTCGTTGCATATTC--TGTACGTCT-TAGCCGTAGTTCCATTGACGTTGGC------TGGACTTCCGCGCGCCACGCAGGCCCATATCAGCGGAAT--------TGTATATAGCC--AAAGTGCAAACGACATTTCTAATTTAAGTAGGTCCCGTACTCGTATGTGTATGTATATGTATGTAGTGATTACGCCCCTTAAACAATAAACAGATATAATACGAATCGAAACTTGGA
TAAATATTTATATCTTTTTTTTGTATATACATGTATATATATATATATAAGTATATATATGGCCCCGCCCCTTCGAGCCATGACTGTTGCATCGGTTTTTCGGTTGTGATAATTTTTATTATTTAATGACAGAACCCGCT--ACCCATATGTATATAGCTAGCTGTTCCTGCTCTGCAAGATCTTTTAATTGGTTGCATTCGCTTTAAAGTGTGTAAATAGTTTA--TGGACCCCTTTCCCCTTTG-----CCCCCTTTCCATCTAGCTTAACACGAAT---GTGTATAATCCATGTACTTATCTAATCATGTTCTGCTCTGCTCTGATAAATCGAAAACTTAATCGATTCACAAAAACACACAATATTTATATATAACTTATGTATATAGCCAGAGAGCGCAAATGACTTTTGTATATTACTTAAGCACCAAA----TATGGGCATG-----GGCTTTAGT--TCATAGCCT-----------ACAAATATACGATTATATGAAACTATTG
>CG13921 1735340 1735927|1824 chr3L 1734993 1736115 scaffold_62 327708 328842 - 18506|366 1066
GACCCCGATGACCAGGAGGTATTCGTCTAGCAGCGGTTTCACCCCCCTCGTATTCTCTAAGGATATTCTCTGTGGATCTGCTCGGGGAGCAGCGGTGGGACTCTCCACATCCGAC--TTCTTCTATATCATACGAACAAGCATCATTCGTACATCCAGGACAGCGCTGGACACCTC-CCATCACTGCCTGTAGAACCACCTT--TGGTTTA-----GAATCGTCGCACTTGTAATGTTTGCCATCCAAGAACGG-------------------AACTCTATTCTA-----------------------------------TTATATGTATGTCCTATCTCCCCAACTA----------------------TCGAAAGTCCTCGGGGCTGCAAACCTTGCTTTAACTACTTTACGCGTATCCTTTGCATAGTTTACCTAGTACATATA-----TTACTTATCA--CATATGGTAGCATTGAATTGAATGTTGACAACTTGTAGCAATGATAATCTATGGATATTATATACAAATTATGTTATATTTACCTGCGTATTTACATAGTTGCGTATACACACACCCATATACACATACAAATATA--------------------TGACTAGTTAGTTAAATGTTAGAGCGCCAGTTAAATTTATTAAAGAGTACACCAAGTATAACCAAAATATTTTAACAAAAA
---TCCGATG-------------------GCAGCGGCTGCG-----------------------GTGCTGTGCGCACCGG--CAGCAAACGTTTGTGAGACG----AAATCGAACTATTCGTCTAGGTTTCATCAACAAA----ACAAAAACAACCAAACACACACACGCTATCTTGCAATCAGTTCTGGTATAGTCTTCCTTATGATTTGTGAACAGATCTTTGCATCTGGAATGTTTGCCATCCAAAAAGTACTAATAGTGTTGCCAAGCTAGCTCTATTGCAGAAATAGTTGGCAACACTAACAACAACGGTACTACTTAAACACTCTCTCTTTCTCTCTTATTAACCGCATTTGCCCGCATTTCACGCTAAGGTCCTTGCGGCCATAAACTTTGCTTTAACTATTTTATG--------TCATCTATTTTACGTAGCATAAATAAGTTCTTATATATAAATAATATTGTAGTATTGTATTGAATGTTG--AAATTGTAG---TGGTAATCTATGAAAATATTAAACCAATTATGTTACACTTACTTGCCTATTAATATAGTTGCAAACATACACA-CCACACACACGAACAAATATAAACGCATATTCATAGACACTTATATAGTTAGTTAAACGTTAGATTGCGAGTTAAATTCATTAAA------ACCGAAAACA--CAATTAATTTTAACCAGCA
>CG8001 1742569 1742741|1830 chr3L 1741942 1755289 scaffold_235 1873 15357 + 713860|690 953
GCACTCCC-------------CGAGGTGCCGTAGACGGGCTT-----------CGAAAGCAGTCCTCGGCG------ATTATATAATTTTCGATATTTTAACTATGTTA--------------------------------------------------GAAAGCGTTTCTGAA-GCTGTGAATTTGTAACCGTAACACATAAGTGCGC--ATATTTTATTTTTAAACAAGGTTTAATAAATGC--------TCATTGAGAATA
GCGTTGTCATTAATCCAAAGTCTACATAACGTATTCGTGTTTGGTTTCCTGGTCTTTAAAAGTCCCGGAAAGCATGCATTATTTGTTTTTCATTATTTTTTATATATTTTTTGTCTGTTGCGAGCACCTGAAAGTTTGCGAGCTCTACGTCTTTTATTTGAAAGCGTTTTCAAATGCTGTGAATAT---------ACAAATAAGCGCGCCCATATTCTAATTTTGAACAATTTCCAATAAATACCACACGCATCGAAGAACATA
>CG12018 1760509 1760556|1833 chr3L 1759209 1761361 scaffold_174 3914 6205 + 86156|1347 1438
GAAACTTCATT------------------------AATACAAATA-----------------ATACA---CCCTGTTAAGTCTTGAGAATCA
GGACCTCAATTGCCGCCAGATTAATTTAAGTGTAGAGTCCAAATAGCTGTGTGTCAATAAATATCCATTTCCATGTTATGTA-TAAAATTTG
>mRpL46 1761825 1761879|1835 chr3L 1761807 1762134 scaffold_32 1290689 1291003 - 981|18 84
TCGTAATTGTTAAAATTGTTTTG------------ATATCTAACAAATAAATAAAAATACTTCAGAG
AATTAATTG--AAAGGCGTTTCGCATAGAATTGAAATATTAAGCAAATATTTGGGAGTCTTT--GTA
>Cdc37 1780707 1780839|1853 chr3L 1779313 1782127 scaffold_9 901314 904076 + 116975|1431 1576
TCGC----CGCCACGTTTCCAT-CTACACCATAGCTCTAATCTTAATG-------TATTTGTCCA-CAAGCATATTTCATCCATAGCCAGATCCTGCGTCAGTTGAGTTATTGTATATAATTTGAATAAATTCTCAGTCACACGTC
TCCTTCAGCGCTGTTATTGCATGTTACACTATAAGTTTAATCTTAATAACCCGCCCATTTGTTCAACAAAATCAGTTGGTGTGTAGTTTGATAGAAAACCAACTAAATT-TTCAGTAAACTGGGCTTGAGCTTTCAATCAAAT-TC
>CG12020 1782062 1782142|1853 chr3L 1779313 1782127 scaffold_9 901314 904076 + 116975|2827 2892
TGGCAGACACCTTATTGTTTTTCCGTATTTGGAACACAGATATTTGTGCGTACAGAGAAATTAAAT
T----------TAATTGTATTT---TATTTG--ATTTAAAT-----TGTGCAAATAGAAATTAACT
>Patj 1785357 1785717|1854 chr3L 1782569 1786871 scaffold_9 904389 908564 + 175872|2836 3205
GGTGTTACGATAACGAAGAATTTCACACATTCCAGGCATTTGAATCTTTAAGCCTGTTTTAAATC-------AAATCAAACGCGGTTGCTAACTAATGGATTAGTTAATCGATATTTTCTACGAATATGAACAACAGGCAGTAGAATCTGAAACGATGTCAGAAACGATGCCAGAAGTACAGGAGCGATTGTTATTACCGAAGCAAAATGTTATGCATATTATTAACGCCGAATTGTGTTTGTCCCCTGAAAACAAGCATTCCACAAGTATGCAATATATTAAA--CCCCCTAGTATTAGCAAATGAATTTTAACATGGTATTTCCAGAGTGTATGTACTTAAACTAAATTAAATAATGTACCTTCCGTA
------ACG------------------------------CTGCATCATTATGCTGTTATTATATTTATATAGGAATTGGGCGCAAGTGC--ACCAATAACCAAGT------ATGTTATGCACCAATTGTGTTGAC------------------------CAGAGCCGCTGCAATGAGCGCGG---------------------------------------------CTCGGCTTGTCCCTGATCCGGGACAGC-TGCATTCCCGATATTCGCAATATATTCCATTCCCCCGAGTATTAG---------TTTAA----GTGTGTGTGAATTTAATGTACTTAAAGCTAAATAAATTATGCAAATCGTTTA
>CG12022 1788365 1788449|1855 chr3L 1786939 1789247 scaffold_9 908815 911198 + 91148|1543 1666
ATCGAGATCAAAGTGCAAAAT---ATAAAACTGTTAAT----------------------GTGTACTTTAACTATTGCTAAG----AAATAGAATACTTTT----------TAAGAGAAAGAAA
GGCCAAGTCCAAGCCCAAACCCCAGTGCAAATGTTAATTGATAATCAGAACGAAGATGACGTGTACTTTAACTAATGCTAAGCGCTAAATACATTATGTTTAAGCAACATATATGAAACACAAA
>CG13923 1790172 1790351|1856 chr3L 1789671 1790357 scaffold_9 911385 912091 + 28822|506 722
ATAGCCGTACATCCGTCGTAGCT-------CTAACATTTCAAATCTTCT------TTGTCCTCTTTTCAAT------------GGTTTCTAT--------CGTGTTAGTCGTGCGTATGTGTGTCGCTGTTTTTTTTCCCTTTGGGGAATGCATTTTTCTTTTAGTTTGTTGTCATTGTTATGCC----TTTTTGAATATTAAACATGTGTTTTCTG
A-AGCCG---GCCGGTCTTAACCGGGCCGGCTGAAACTGAAAGCGCTCTCGCTAATTGCCATTGTTCTAGTTCATAAGAGATGGTTTTCTATACGACATACATTTTA-TTGTTTTCATGT-TAACGCTGTGTATTTTATAGCT-GGAAATGCATTTTTCCTTT--CTTTTTCTTTTTGTTATGCTAATATATATATATATTAATTGAACGGTTTTTA
>GV1 1805673 1805752|1869 chr3L 1805337 1806527 scaffold_9 929236 930607 + 28337|348 446
-ACCGCCGATACCCGATATGCATTTAGAACTACCTATATATAATTGT-------ACAAGAGATTAAAGCCAG-----------ACACCTCAGACACGAA
TAGTGCCTA---CCTATAAGGAGTCGTCTGTCGCTTTGTA-AATTGCGTGTACAACAACAAATTAAAGCCAAAAACAAACAACATACAACAAAAACAAA
>GV1 1806354 1806435|1869 chr3L 1805337 1806527 scaffold_9 929236 930607 + 28337|1230 1324
GCGAACATTACCTTTAAGACTTGC--CCACAATGTTGTAAATAACTATTAATAAA---ATTAAACATCCCATAATAAAAC--------GTAATCG
GCGAACTTTA-CGTTAAGACTTGCCACAACATTTTTGTAAATACGTAAAAATAAATCGAATAAACATTTAAAAAAAATATTAATAATAATAATAG
>CG12024 1841717 1842581|1912 chr3L 1840282 1842317 scaffold_9 1014639 1017018 + 46033|1744 2535
AG--CGGATCGT----------------------------------TTTGTTATCTAATCTCAAC-----------------------GGCCATAA-----CGTGACGATCACGTG------------CGCTAGT---AATCTCCCCAGTTCCCCAGTCCAAA-------------GTAATCTCCGGGCAAGAAC----GAAATCTGAAATCTCCTATCCCAATCTCGACACAAAGATGCGATGGTATTACCCTAGTTTTAA--------------CCTTAAGTGCAATTTTT--ACCCTA------------------------------CCGTGCAATACCCC------------------------CATATACCCATACATATATTCCTTGTTTGTATACGTTT---------------TGTTTA--CCCTTTCGTTGTTGCCAAATTAGCGT-AGTTAAGTTTTATGCATAATTTGTAATCGATACTAAGGCGGCCTCTTTTAAGCCGCGATTGCTAGAGATTGCTAGAAAGCCACACTCACTCACACGTTCGACTGATTATAAAAAGCGTTAATTAACAA-------GCATCACACCAGGAATCGGAGGCGAGTCCCCCAGTATAGCACTTTGCTTAGCCCAAAACCTAGTCATGAAGCGGAACTCGAGCCACTTATTGTACAGTAATAGAAACTACCACGTAACTCTGTCTTAAAATTCACTTTCTACATTTTAACTGCTGGCGAGCGATTCGCCGGCTTCTACGAAAAGCATGCATTATGATTGT
AGGCCAGATCTGGAAACCAGATACTTAGACACTAGATTATCCATTGTTTGTTATCTTATCCTTATTCTTATCGTATATTATCTCATCTGGCCATAAGCGTACGTCAAGGCCATGTGTTTACCTTCAGGCATAAGTCCAAGCCCGACTAAGCCCCTAATCTAAACCCGTTTCACGTAGTAATCTCAAATGGAAATCTATCGAAATCTGAAATCTCGCAACAGA----CGATGCATGTATTAT---GTATATTTCTAGTTTTAAATGTCGTGTAATAACCAAAAGTGCAATTTTCCAATCCCAAGACACAAAACACAACACACAAACAAACCCCAGTGCAATATCTCATGTGTATATTTGTTTTTGACTATTATAAATTTATAC-TATTATACTTGTTTATAGATGTTTATTATTTTAATTTTTTGTTTCATTTTTTTCGTTGTTGCCAAATTAGCGTTAATTAAGTTTTATTGATAATTTGTAA----------AATGGCAGTTCTTA------------TGGAGAACATTTTATAG-----------------TTGGACTGATT-CGAAATGCGTTAATTAGTAATTGAAGAGCATCGCAGAAAATATATAATATGTACATC----TAGAGCACTT-GCTAAACTCAAAAC-TAGTCATAAA------CACAAGC-------------GAAAAAAAAATGAAAACGAAACTC--------AATTTATGTACAGCA-------------------------------------AAAATATGTATTATTGCTAT
>CG12024 1841717 1842581|1913 chr3L 1842431 1844861 scaffold_9 1017120 1019572 + 52944|0 165
TTACGCTGGATTAACATGCGTGCTATAAAC---------TAGCAGAATATTATAATTATAAAGACGAGCTATTTGATTGTAAT-TGTATATGTATAAATATTTGAATAACAACCTTATATAACTATTCCAAGTAT-----CAAATACAGATATTTCAAAACTTCAA
TCATGCTCCATTGAGACAGCAACAAGAAATAAATGTCCATATCAAACTGTTGATATTACAGATAC----------AGCATAATATATATACATACATATATATGGACATATACCATCCATAGTTTTGGTGGCTATGCAAACATATGCAACTATTT--GATTGTAAT
>CG12025 1851025 1851417|1922 chr3L 1850666 1851334 scaffold_9 1026149 1026858 + 25338|359 749
GCGTAAGCGGACATCTGGACA--------------------------------------GTCGAGCTGGTTGATCCA---TGGACGAAGAGAGTGGGAGAAGCCCCAT----CTATAAATATAAATCTGTGTTTGTTTATACCCGACCCGTATAAACAACTTATTTTCTACATTGTAATCGTAATTAACTCGAAACTTGGTTTGTGTAACGTACTTTTTGTGTTTAGCGGCAAAAAATTTCGTTT----------------------------AGACAAATATCCCTTACCCCTGAAATCCGAATTGAAATCTAGC---AATATATAGATTATATATTTTACAAT--ATTTTCTATT---ATGTACTCGGTAAAGTGTTTTTTGTATGCCC
GCACACACACATATATATATATATATATATATATATATTTATATATAATGTAAATGTATGTCGCATTGGTTGATCCAATTTGTATCAGCAAAACGCCCCTGGTCCCCTTACCCTCTGTCTATATACATATATTTATATATAC----------------AATTATTATCTATAT----ATGGTAATTAACTCAGAA---GTCTTGTG---------TTTTATGTGTGTCTTCAACGAATTTCAATGGACAAAACTCAAAAAGGAAAAATGATAAAAAGAAGTAAAACCTAGACAAAAACTCCAATTCGAATCCTAGCCTTAATGTATGTAT----TTTTTTAAAATTAATCTTTTATTATAATATACTCAAAAACG----TTTGGTATACCC
>CG12025 1851025 1851417|1923 chr3L 1851335 1851659 scaffold_9 1027077 1027368 + 9852|0 87
CTTCTCCAAAACCGAACCCAAGAAAGCGAAAAACA-----TTCATACGTACACTCGAAATTGATTTAAAAACAAAAAAAGAGAAGAAA
CTGCTCAAAAATG----CAAAGGATACGTATGACAACACTCTTACACACACATTCGAAATTTATTAAAAAAAAAAAAACAACAACAAA
>CG12026 1874603 1875002|1945 chr3L 1873814 1875299 scaffold_12 1689042 1690787 + 42619|935 1452
GC-----------------ACAC-------CATTCAAA---------------------------------CAGCCAGGACG-------CCAACCAATTA-AGCTTAGCACGTGCAAGAACCAGGGGTGAAACTCAGCTTAAAGTTTTCCATA----AATCGTTCAAACGATTTTTAA---------CCGATTTTCGC-----CGCAACCATA---AGATGAAACTATGAAAATGTGTGTGGTATGTGTATTTGAGTGTGAAAGTCAGCGAGTGAATGATTTGTATATGCCGCTTAGCCCGACTGAATGCCAACT----TGTAGTTGTAAGATTGGAT-TTTAAACTA---------------TAATTTAACATTTCGTGTGAATAGCTTGTGCCTAAGTGTATGCTTCGAATAAGTTAAAAGTTAAAAGAGAGTTCCCGAAGCTCTGCCTGTAAATTATATACCCATAAACA------------ATAAACATGTACAAATATTAAACATAAAACCAA
GAAATGTTGAGTTTTCCGGACGCTGATGCATATTCAAATATTTAACGGACAAACGCATTTGGTTGTTGCGCTAGCTAAGCCGAATTTCACGAATCAATAACCGGTTGGCGAGTACACAAACCTTGG--------CAAGCTAGACTGTACGAAACTCGAACCGTTTCAGTTTATGTTAAGTACACTGCTTGATTTTAGCAAGTACGCAAACCTAGATATGTGAAGTTGTTAAA-----TTTGAATTTGCTCTTTGGCTGTTAAAATTTA-----AAATTATTTTTATGTAATGCTTGAATCGAATGTGTGTGAATCGCTGTGTGAATGATCGACTGAATGCTTAGCCTAAACTTAAGTTTAAATTAATTTAAATGTATTTGTGTATAGCTTGTACCTAAATTCATACGTATAGTACATAGAATAT----------------GATCGCTGCCTGTAAATTATATGCCCGTAAATATACAAACATAATGTAAAAATAAACTTATATTGAACATAATGTTGT
>CG1017 1926268 1926404|1994 chr3L 1924296 1927284 scaffold_12 1746133 1749169 + 93374|2038 2188
TGTTAG----ACGTATGTAATTGATGTATTTGACAGGCATTAGGAAAGTAACAAGTAAATATTGTGCGGCCACAGTTAT----GATGGA------ACCAAAACTTCATATACAAACAATTATATATAATACAAATATCATAAGTTTAAGGT
TTTAAATAACAATTATAAAGTTGA-AAAGTAAATACAAATTA-GAATATAATATCCAAATACTTAATTGGCATAGGTCTTTCAAACGGAAGCAGCATCAAAATATCAGAAAAAATCAAGGCCGTAGAAGTAGGAACTAGGTGATTACTGAC
>CG5690 1933646 1933797|1998 chr3L 1931285 1942889 scaffold_8 4335926 4347629 - 479050|2437 2603
CAACGAGAGATGCTTTCGACAAGTAATATTCTATCTAGTAATACCTGTAGTTTTTTAAGAATGACTGCCTCTTTGAATGGCCGCTACAATGGACATTGTAGTTGTATATTTTTC---------------TATGGAATTCTGAAAGTAAATAGTTTAGTTTTTGCAAA
CA---------------TACAACCGATTGTAACTATATTAAT-----TAGTTTCATA---------GTTTAAATTAATGTATGGTATA-TAGCCATGGTAGCCACATGGTTTTCATACACCCCTTTACTTAGAAAGTTGTAAAAGTAAATTGTTTAATTTTTGCAAA
>CG1140 1950212 1950340|2001 chr3L 1948829 1950313 scaffold_8 4353929 4355430 - 75446|1396 1517
TGAGCCACGTGC----------------TTAGTGCCCAGAGAAGCTGCAATACCTCCGGTTGAGTGATAAACGA---GTGCATTTATTTTTTGTTGACCGTGTGACAA-AAACATTTGTGTT
-GAGTC-CATACAGGAGGCTATTAAGAATTAATGCTCAGGTA---CACAACGCATCTACCTCAGGAAATAAGTATTTGTGCATTTA-TTATTGTTGTACGTGAAGCAATAGTCGTTTTTATT
>CG8960 2181417 2181639|2190 chr3L 2180652 2182363 scaffold_8 4602506 4604236 - 22649|825 1067
TTAGTTGC---CCGCGACCAAAGGGAACCACT------GACATCCCAGCATGTCAATGACAATGTGCCAATTGAGCCCAGCAAAGCAAAATCAAACCCAATCCACAAATATCCCTCTACATCCAAGTCTTCTTCAATAGTCTA-----AATAATATCTAATGCATGGAACAACAAACACTT------ATTTTGTACAGTCATCAAAGCGCATTATTGGCCATAATAAAAAATGAAAAAAAATA
GCAGCAGCATTCAGCGACCAGCAGCAGCAGCTCAAGGAGCCAACCAAATGTGCCAACAACAA-----CAACAACAACCACAAAAACAACAATAATAATAAT-AACAATAATAATAGTATTAACAACAATTTTCCAAT-GTCTACTTGCAAAAATGTTTTA---AAATAATTGTAAACATTCAGCAGAATTTCGTATC-TTATCGAAGCGCATACTTGGCCATTAATAAAAATTATAAAA----
>ACXD 2227155 2227252|2240 chr3L 2226372 2227203 scaffold_8 4651242 4652070 - 38598|799 847
CTGAAATTTACCAGAGATTAGATTTAGGACATGCATGTATGTAAATATA
TCGATTTTTTAAGTATATTACAATT---GCATGTTTGTAT-TATGTATA
>CG2034 2242206 2242454|2253 chr3L 2240132 2242294 scaffold_8 4661344 4663428 - 36676|2215 2303
GCTGCCCGCCAGCAGCGAACGGCAGTACAAATAGCCTTGGCTTTAAGTCTCCTTAAGTCTAACCTACTAAAACCATAAAATACCTGGAA
AATGTGCTCGCACAGCAAACGGCAGTACAAATGGCCTTGGCTTTAAATAT--TTAAGTCTAACATAC-AAATATATAAAATGCATATAA
>CG13806 2251000 2251175|2255 chr3L 2249612 2251071 scaffold_8 579782 581311 + 39773|1495 1571
GG---AAGATGCATTCC--TGCACTTTATTTATTCCTCTTCAATGGATTACATTTAATAAACAACTCATGTTTACCC
ATTCCAAATAGTATTTAAGTGAATTTTGTCAAT--CTTTGTACTGTTGTGACTTTAATGAACCATCAACCATTATCT
>CG32302 2253314 2253369|2258 chr3L 2253062 2253547 scaffold_8 582907 583329 + 1257|258 313
TGAATTGTTTTCATGGTACCAATATTGATTCAAGTAAATGCCTATTTAAAAAATTG
--------TTTGATGAGTCCAAATTTACTTGTGTTGTGGGCCAATGTTGAGCTTTA
>DmsR-2 2283579 2284472|2290 chr3L 2282811 2284975 scaffold_8 615131 617402 + 24476|833 1878
CAGGAGAGCAGC--GGCCGGG----------------CGGCGATGTCAGCCGCAGCCGGCGGAGCAGCTGCATCGGTGGCTCTGGCCCTGGCAGCCACTGATGTTGATGGATGTCCGCCTGCCACCGATGCTGCTGTTTCCACTAACGACATCAGCCTGGTCGAGAAGCT-----------------------------------ACATTTGCAGCC-CAGT-------------------CCAAGGGGGACTGCGATATCCAGTGGCCAGCATCGAAGGCGGCGCAGTGGGAGTGGCACCAAGTGCATCTGGCCCACGACGGACTGGCTGAGAAAGCTGCGTAACCAGAAGGCTAGAGAAACGGAGCAATCCTCCGAACAGGACATAGAGCTG-GGCAAGAGCTCCATCAACAGGCGCAGCAGTGTTCTTCTAATGGTATTACTAAGCAGCTCCGATGAGGTTAAAGCCAAGGCGGTTTTGGTCAGTGAACAGCCGCC----------GAGTC-----------------------CAGCGGACGAGGATGTGGAAGACGCCATTGACGCCCTCTGGCTGTG----AGACGACCCCTCACTTCCATTTTGTACGCC--------CTGTAAATTATCCAAGTACCCACTAATATTTAACTACCGTGTACAGACCAATTATTGAGACAAATTGTTATGCGCTGATTCCATTATTTTCCCGCCAGTGTTGTCTTGGCGAATCGAGAGCCCCTTTCGCTGAGACTTTGCTTTGCTGGAAAATGAGTGGATTTTCCTTGAAAGGACTCCCTGGAAGCAGCCTGCAACATTTTGTGACCACATTTGATAAGTGATATACTTGACTAAGTTTCCCCCCTTAATAGTTGTGTAAGTGCTAAGCGCGTCTCTAGATATAAACGAATTAGTCATAGTCT---------AACTATTAATTAAGATATATTGATGAAAT------AATTCGGAAGC------------TAAG------AGATTAAATTTCTTTTTATATTGAATAAATGTTTTTTCG
CAGGAGTGCAGCAGGGCAGTGTCAACAACAATAACAACAACAACCACAACGGCGGCAACCGGCGTAGCTACA---GCGGCAATGACTGAAACAGCGCCTGATGCTGATGGATG------CGCCAACGAAATTGGCG---CTACTGATGACATCTGCGTGGTTGAAATGCTGCAGCCAAACGACACTGTCACAAACAATAAACTACACAACAGCAGCAGCAGTAGCAGAAGCAGACGGCTAGCAGGGGGGGAACGC-ACAGCAAGGGAGGGACATCGTCGACGTTGCAGCGTAGGCGG---CAAATGCATCTGGCCTGCCAGTGACTGGCTGCGCAAGTTGCGAAACAAGGAGCCGCAGCCGCAGCATCAGCATCAGGAGCAGGA---GCAGCTGCCGCGGGAGTCACA-CAGCAGACGCGGCAGCGTGCTGCTGATGGTGCTGCTCAGCGG---TAGCGAGATGGAGGCAAAGGCGGTAGTTGTCAGCGAACAGCAGGCCGTAATGAGGAAGTCGCAACCGCAGCGACTAGCTCGCTCGGCAACCGATGACATGGAAGAAGCCATCGATGCGCTGTGGCTGTGAATAAGGCAACCACGGTCATGCAACGAAAACAACAACAACAACCGCACTCTTTACACATGTATTTGAATA-TTATCTAGCTGGTA-AGACCAATC------ACAATTTGTTAAACACCCATTGC-CAATTTT--GGCCAGCGTTGCATGCACGAATCGAG----CCCCTCGCGTGTGCAACGCTCCGCCAAATTTCGGCTGTGTGGTCTTTTTAACAGTTTGATGG--------TGCATAAGTTTCT-----------CTAAGTG--ATACTTGACATAGT--------TTATTAGTTAC-TAAGTGCAAAGCGTATGT---AATACAAAC-ATTAAATTATAGCTTGGGCTAAGGAAGAGCCAATCGAAATGCCTTTGAGTTATCCTCAAAATTGGTGAGCCTTGGTTGTCAGTAAGCATCTTATGCTAAGTATCTTTATATAACAAAAAAACTAACGTCTT
>DmsR-1 2327650 2329051|2333 chr3L 2326163 2327699 scaffold_8 662396 663922 + 70650|1522 1571
CACAGGAGGAGTCGTGGTCGCCGAACTTTGCTCAGTCGCCTGCTGAGTGT
--CAGCAGCAGAAGCAGCAGCTTTTCTATCCAAAACCACCAATAGAGCGC
>DmsR-1 2327650 2329051|2334 chr3L 2327766 2328677 scaffold_8 663993 664996 + -1767|0 1084
GGCCGGCAACGATG-CGGTGGAACCAGCGTTCCAGGCCATCGTGGTGGTGGTGGACAAGGTGAGCGGTGCCACGGAGAATCAGCTGTACACCGCC-------GAGCAAGCTC--------------GTATTGTGACGTAGT------------AACCCTGATAGTAGTACATAT-------------TATATGCCTAGTTATCCTTGTAAA----------------------------------AAGTAAACTAGTTGTGT--------AAGAATCGCAGATAACCACAAGTTATGTGCATACTTTGGTGGGAAATCGTAAAACCCGTACAGT-CATAATAATAAAATGCTG--------GTTCATCACTCATACGCACCGTTTGACTTCACTC-------------TATTCCA---------CATTCACAGTCAAGTAGGAGCTGTAAAAA-------TGCTGTGCATAAACGAGCTCGTATACGCTACAGCTGGCGTCACAA----TAATAGTTACCAT-TGGGTTGGCTTCACAACATAGATCAAA------GTCAAAAAATATATAG-----TTTTGTAAAATGTTTCATAAATCTATCTTCATATTTAACTAACACAATTCAGAAACTTTCGCTTGCATGGAAAATGTTTTATTTTCCC----CACTTGACCCAATT--------GTGCGCAACTGTTCAGCTTTTCGGCATGAATCAAATCAAATAT--------AGTAAACTTTTGCATCTTTTCCACTTTGATCCCATGCGTTTTCATGTTGATTTCATTCGCATAAAGTATGCAGCACACGTACTCACTCAAAACTACGAATTTTCGGCAACG--ATTTGAGCAGAATATTTGCCATTTGTTGTACAGATTATATATACACACACA--------CACACTTATGTCCGTATCTTTAATAATGGCAATTAAGTCCTAGAAATTTTGACCTGATATTGATGCAGGCATTGGAAAAATAAGTGGCAGTTGCAGTGCGGTGCGTTGATAAATGAAATACTTTGCGAATTCTATTATTGGAAATCGCAATTTGGGCTGTGAATGAAATTA
AGCTGGCAGCGCTGCCTACGGCACCA---TACCAAGCCATTGTCGTGGTTGTGGACAGCAGCAGCGGTGCCCTAGATCATCACCTGTGCGCGCCCATTGTCAGTGCCAGTTCCACCAAAAGTTCCACTCATGTCGCGTAGTGTTGAGCACACAAAAGCGGATAGCTGCTTATGTAAATTTAAAATTCAATAAGTCTTGTTCCGTGTTTAAACGTGTTTGGTCCAAATCTACAGTTTACGGTTGATAAGTTATTTTGTGGTGCGCACAATAAACTATTGCATATATATTAGGGCATTTTGCATAACGTCAACAATAACCACAACATCAACAAAATATATAACAATAAAAAATTGATAATAACGCGCAGCATTCATACGCACCGTTGGATTCCCCACAGCCATATGTATGTATGACAAGCAGCAGTCCTTTACAGTTCAG-AGAATTCCCAAAAAAAAAATTTGTTGTGTGCACATGCAAGAGTACACGTAACATC--GCCCCACCACCTCCCACAGCCACCCCGTGAAGCTGCTGTCAACTGCAAATCAAACAGGATGACAAAGCGTACATAATGCGCTTATGTAA---GTATTGGATTTTCATTTACATGCCCCAA-AAAATAGCTGTTAGAGTTGTGCGCGAAAAAAAAAGGAATTTTTTTTCCATAGCAACT-ATTCAATGTTGTCGCAGTGTATATATTTACAGCTATTAAATATAAATAGAAAATAATATGAAAAAAAAGAAAATACATAAATATAT--------------ATAGTTCTTCAAATTTATTTTTCTTACTTATATTGGTTTGAATATGCAGTGACT-----GTGCAAATTTTTGTTAAAATCATTTGCGTCAAATTTT---AAATAGTTGTACTTTTTGTACTTACGAAATTAGCTTTTGCTATATTAATCGATGCGCTTTTA--AACAATCACTGCATCCT-----TTTTAAGCCAATAAT--------------AAAAATAAATA-----TATAAT----TGAGTTGATA-------------TCGAGCGATTTTATTTAAAGGCA-----TCGACTGTTAACGAAATTA
>DmsR-1 2327650 2329051|2335 chr3L 2328876 2329060 scaffold_8 665052 665185 + 3664|0 177
AACGCATAAATTATGG--TGATTGAAGTATTTGCACTTGAGCCCCGACAAATATTTTCAATCTCGTTAATAATGAATACATAAATCAAATTACGAATAGGTACATGTGAATACACCAAATATATTGTATGTAACTGTATGTTGCTTGAACAACGATTAAATTAGCTGCTAAATTAAAA
AATATATAAAATATATATTGATGGAAGTGTTTGCTACTGAGCCCCAGCAAATATTTTCAATC-------------------------AATTAT-AATAGGTACACATAAAC----------TTGTGTATGC----------------AACATAAATTGAATT-GTTGATAAATTAAAA
>CG8993 2356305 2356417|2361 chr3L 2355777 2357049 scaffold_8 696564 697850 + 48997|529 657
TAATTGAGAAATCCCAAAAAAAAAGTGGAGGTTGACCTCCTCGCAAATAAAGCTGAGCTTTAGGTTAATTC---------------GGACTTTCGAAATAAATGTTTATTTACCCGTTG-AAACGAAAA
TAG--AAGAGCTCCC------------------TTCGGCATCATAATTGTTTCTAAGCTTTAAACTTGTTTTACTCAGCCAATATGGGTTTTTCAAAATAAATGTTA--TTATTCGTTGCAAACAACTT
>CG9004 2359946 2360020|2363 chr3L 2357242 2361104 scaffold_8 697851 701494 + 129667|2731 2805
TTATAAGTTGTAAATTTGTAAAATATTCATAATGAGGATGCTATAAAACAAATAAAGGACAAGTTTTTGTAAAAT
--ATAACTTGT---TTTTTCTCTTGTTTAT----------------------TAAACCCTAAATATT-----AAC
>CG32306 2447836 2448381|2422 chr3L 2444220 2449359 scaffold_62 113938 119275 + 47889|4150 4858
AAAATTGTCTATTTT-GGCCGAGCATTCAAAATTTCCCAATTTTTCCAAATCCCCGAAATCCCAAACACAAACAC---------AAATATTGCTCTCTTCGTGTGGGTCCGCGCTCAGTGTGATAGATGCGTCCGATCCTGATTCCAAGCTATTAAGCTAACTAGTTGTCTCATAGTAATCCCAATAATGAAAACAAACTGAACGAAACGA---------------------AAATTCCACAGATATGTCAAGCGAAAACGAAGTAA---TAAATGAAATAAACTATGTATGT-------------------------TAGAAATGTATTTAAACCGAGAGACAGTTTTATTCCCAACGGCTCGTAT--ATTAATTATGTC-----------TGGCCAGCA---------AAGCCTTCCAGT---------------------TTACCTTTATCCTATATTATTATTATGCGAAACAGCTT-TGTGCTTATTTATACATAATACACTACTTTTTATTTAC-ATTTAA----AAACGAATTGTACCTTAAACGGAATTA----TATTATGATGAGTATGTATTA--CATTTATTATTATTATTGTAATATTTAATTAATTGGAAGTTGTT--ACACCAAGAAAATAAATA---------CAAGAAATGT--------------------------------------GCT
AAAATTGTAAATTTTTGGCTAACCTATTAAAATTTCACAAATTTTTCGAATTTCGAATCAAACCAACACCACCACCCCCATACCAAATACCATATTCCCCTT-TCGACTAGCATTTTGTA-AATTGTTGTGCTCACTCTCGGCGTCCAG--------------AGCGCTCTTTTTTTACCCAAAAAAAAAAAAAAAAAATGAAAAAGGTGACCCATGTGATTTGTGTGATAGAAGCTCCTCCTACTCCTCAAAACGAATCGAATTAACAATAAATAAAAAAAAAAAAACAAATCCCTAAAGCGAACCGACAAAAATTATATACATGCATCGTAATC-ACAGTATGTTTTAATTTCCACAGTTAATTCCAGTTAATTAGGGCAAATGAAAATGTGACTAACATAAAGTTTAAGAACTTCCAGTAAAGAGTTAATAATTATGAATTAATGTTTATTATAATTTAA-ATAGTGTGCAACTACTTGTGTGGTTAGTTATGC--------CCTTTTTTTATTAATTATTTAATCATAAACGAATTGTACCTTAAATGGCATTAATAATATATTATTAAATTATTATTAAACATTTAAT-TTATTATTGTACTATTTAATAA--TAAGAATCGTTGAACAGTAAATAAATCAATATTTGTGCTTCAAGAAATTTCACTGCACTGCACGCCTTGCTAACGCCAATCTAACTTCGTT
>CG1146 2475603 2476145|2443 chr3L 2474470 2475777 scaffold_62 142780 144048 + 35320|1181 1360
GGAACACGGTGGGATTGAAGGAACGTTTTATAGTGCCATCCCCCAGGG--TCAGATGGAACAACCAGGTGAACTCCCATCCCAA---CCAGGCATTTGTCCAGGAAACAAAGCCACCGGAGACCTTGCCAAGTCCCCCAAGTCCACAGGAAAACGCCCGCATTTTGTTTGTTTAATCGAC
GCAACA--GTTGAGCAGCAGCTGCG--TGATTGT-CAATCTCTCAGAGATCCAAGTGAA-----TGCATGAACTGACATCCAAAAAGCTGTTCAGTTGGTCGGTTAATCGTGCCATGTACGAACTCA-GAAGTCTTCC-AGCCCGAACTCTTCCTCCCCCATTACCTCTCCTCACTCGAC
>CG33232 2482178 2482760|2444 chr3L 2478280 2482744 scaffold_62 152875 157430 + 170212|4023 4671
GAGAGAGGCAGGCAC---AATGCAACTTTATAGACT------TGAACACAATCACAAAACACAAACCAAGCACTTTTATAA--GCACTTTTTGTAGGCGGCGATGCTTTTGCAACGGACACAGACACAGATCTGAACTATCGTATTC-TATAGGCCTATTTA-GTATATCATATACACAC--GTGCGCATATCCCTATGTACTCTC-TATTTTACACA--TATTACATAGCC---TTTATATATGTAACGACTACTATGCAAGTGCACGATGCCAGGCAATAAATTT------CAACTCGCTTCATTCGGTAGCTGTGCGGAGTTTGGAGTTCTTCTATTATATCGTATACCTGTACATAATATT-------------AAGTTGAGTTGTTTTACCATTATTTTATTTAATATTTTAT---------------CGATTTAACGAAATTGCATTTGTTCAATCTCTGCAAACACC----AAAAAGCCA---------ACGAGCTCTCTCGTTATGTCATTGTTTTCA-------ATTCGAAATCATTTTA-----ATGTTAGCTTTATTTCCCTAATTTTATAACTATGTATTTGTGTTTATAATATG-TTAAAAATTATTGCGCA-TATTTAATTTTTATTAAATAACA
-----AAACAAACACTAAAATGTGACCATATAGACTTACACGTGAACGCAATCACAAAA-----------TACTTTTGTAACGAAATATTTTCTA----ACTAT-CTTTGAAAACGTACAT--------------ACTTATGTATTCTTCCAAAACTATTTACAAATACCACACGCACACCTGTGGGCACATCTTTATATACTCTCGTACTTTATACAGTCATCGTATATACATATTTATATACATAACTATAAC-----------------CTAACCTATAACTTTTTACACCGATTTATATCACATGATAGCAGCTTAATGTGT---ATTCAGACAACACAAAGATTATCACGAAATAACACTGGTCTATCAACAAACGTAGAATTTAATTACATATATGTACATAAAAATTTTATGTGCTTTGTTCTTAACAAATTGACAAATTTGCCATTGTTAA---TTTGAATACAGCACAGAAAAAATTAAGGTAAAATACCATTGCTCTCTTTATATCATACTTTTCGTGTGTGTACTCAAGTTCTATTTACGTATATTTAAGTTTTATTTGCTTATTTT--------AGTATTTGTATCC-TATTATGTTTCGGTTTTATTTCGAATTATGTAGTTTTTATTAAAAAATA
>RpL8 2572249 2572529|2517 chr3L 2571050 2573785 scaffold_32 1375790 1378463 - 65446|1262 1544
GCTCTGGCTGCAGCAGGATTCCGGCGTGGCGCAGGTTCCGCCTGAGATCTGGGTAGTGGTCGTGCTCTGCTGTGCGGCGTCGTGGAAGAAATTGCTATTCTACATGGATAATCTGTATGTTCTAGGCATACGCTTGACACGGCAGAATAAAACGTATTTGTAAAACTATACTTCGTTTGCATTTAAAGTTTTTAAGATTTTAGTTATTAGCTTTTGTTTGGATTTATT-ATGCTGATTTATTAGGTAAAT-ACTTATGTTATCTGCAAATTCTTGTTTTCAAA
ACAACAACAACTGGAGCAGCCC------------GTTCCGTCTGAGATCAGCGTAG-----------CGCTGTTTGCTATAATTG-------TGCATATATATATGGGAGAGCTGTATGTGGTCAACATGCAATTTACGCGACGGAATAAAATTTATTTCTAA----ACAACACACTTGC----AAGATTTCTAAAACATCAATCA---------------ATGTACTAATGCTAATGTAATA--TAATCAACAAAAGTTATTTGGAGA----GGATATTAAA
>dos 2578579 2579122|2521 chr3L 2575628 2579185 scaffold_32 1380920 1384558 - 130326|3158 3757
AACTGCTGGTTCAGCTAAATGAAAT---CATATCTCCAGTACATCTAC--------TTGTCAACGTGCAATAGCAAAGGAAGGACCATGTTGCTGATCCGAGATTTTCGTAGTGCCTATTGGTGGTCAGCTGAGGAGAGCTGACCCCATCCAAAAACAGTGCAAATTTCGAGTGGCTTTTACATTCGTTAA-------------------------CATCGTCAAATTCATTATTCATTAAACCA-----CATATCTAGCTTGTAAGAC-GGCACC---AGCATTTCTGTGTGCT--GTTTTGAATC-TGTAATCTGTAACCCGTATCTGAATCTATGTCGTATTCGTATTTAAATCGTGCTTCCAACACTTCCATGTTTATTGTTAAGCTTCGGAATCAAAATGTAACCATGACAAACGATCTTAGTGCTAATTTTACA-ATGCAAACAATTATTTTATATACGCAAGCGAAATATTTATATA---CACGAATTTTATATGGTAACAAATTATTTACAATTTAATAATGTAACTCGTGTGCGACACAAGCTGTAGCTTGATTTTGTGCTTTAAAAAAT----ATATATACAATAATACC
GCCGGCGGCGGCAAC-AAATGAGCTGCACACGCTTCCAA-AAATCCATGACTCACATTTTCAATGTGCAATAGCG------------------TCATGCGAATCAGTTGTAGTGCCTGC---------------AAAAGCTGTCC--------AAACAGTGCAAACTCTAAGTGGCTTTGACATTCATTCATTCATATTGAACACTCACACACATCCATATCCATATTCA-TATTCATATACATATTGATTATATATAGCCGATAAGTTAGGTATTTAAAGCATATTTGTGCCCTCAGCATCGCGTTGTGTGCTTTTTAA---ATGTCTCTATGAAGATGGTTTTTATCTTTCGATTGTGCTTCCAA----------------------TTTCGAAATCAAAGCGTATTT------AACTATTTTATATATAAATATGTATGTACACACACACACT---CACACATAAACTA---ATTTATATACACCACGAATTTTTTATGGTAACAAATTTTATACTAAGTGTAAGTGTAACTCGTGTGCGACACAAGCTGTAGCTTGATATTGTGCTTTAATAAATCAACATTTATAGAATAACATT
>CG16984 2580382 2580533|2522 chr3L 2579186 2582620 scaffold_32 1385090 1388730 - 61093|1238 1488
----------------CAATGACACACACACCTTTTCTGA---------------------------CCATGTGTGTCGGCATCTGGAAG------CCGAGTGA----------GGTGTCTCCATGGATTC----ACTT---------------GCTTTGCTCTTAGAGGCGGA-------CACACAAAACACTTCGTAATTAA-----------GATTGAGAATAAAT---TTAACGTTTATGCATTAAA
CCTATGTACTGGCACGCACACACACACACACACATACTAAGGGGAGCACGCACGCACACACGTACACACACACACATGCACACTTAAAAGGTACGTTCAAATAAAAATTTAACGGGCATCTTC-TAAATTCCGAAACCTTATCAACTCCGCAAAGTTTCGTACTCAAAAAAAAAATAAAGCTGCCCAAAAAACTGCGGAATTGATTCGGCATCGGAATTTGGAATGGCTCGCTTCATGTTTATGCATCCAA
>CG16985 2583644 2583787|2523 chr3L 2582702 2583713 scaffold_32 1389558 1390464 - 9986|990 1063
AACAATTTTTGTAGATCGTCAGAAAAC---GAAATAAAATCTTTCGA-ACCTCTGCTTAAGACGTACTAGTTTA
ATTAAATATATAAGA--GATAGCCAACTCTGAGCTATGCTCTCTGGCTATCTCTGCTAGTGACGTCACAGCTTA
>CG1244 2624549 2625509|2571 chr3L 2620311 2625542 scaffold_32 1451111 1456747 - 176313|4694 5885
AGAGCATGTTGGATCAACCAA----------------------------------------------------AAACCTAATCTCGCAACGTT-----TGCAGCATT------GACAGCGCTTTAACATTAGT-----TTCGTTTTTAAGCCGAACGCGACATTGGCGCCTCACGGTCCCGCTCCTTTACTTCTGTAAGTCGGATGTCGGTATG-CAGAAC--AAGAAAATAATCAGAAATTGGGGCGGATGGTGAGGGAAAAGCAGAGTGGCAAAAGCCGTCGCCGTTGAAGCCGTTGACCACCTGACCTGATAAAACGAGGGACAAGCCAGCGTCACTTGCTGCGGCTACAGGATACGC-----------------------GATACACATA---------ACGCTAACGG-CATAGATTC--ACTAGAGATACTAGTTACGGATTTTAGT-----------TACATACGT--TTTGGAGTGTGCACATAAGTTGAAGTTGTAGCTACTACTAA-----------AATATACCA-------------------------------------------CATACATACATATATATTTAACTATATTTAAAGCATATTAT-GAAGAAGCCGCCAGAGCGCATCGTCAGCATGATGACTATGTAAATTAGTTAAAAACTAA--ACTATTTATACGAGA----ACTACGAGTATCCAAATGTGTGTTGCAGTATGTATATACATTTTGAAAAGGTCCCCGCCCC--------------GCAGATAGA---------TGACGTGCCTCGCTTCGTTCTTCTCTCGAATC------TTCTAGCTTATTTGTACGAACAGTCATGATGATGATGAG-----------GCAGAGAGGAGGAAGTTGCATGAAGCGAAGCGTGGGGGGGAAGGACTCTTCTAAACTGATCTGAGAGACGACGAGACGTTCGAC-ATTTTAATTTTTGTGTACAAGTTTAAACTTATATTTAT----------ATTACACATTATCTATTAATATTAAAATATATATCATCTATTACCACCTAAGATCCCCATGTACTACAGTTATAATGCAAAACCACACACACACAACCAACCAACCAACCAACCAACCAAGCAAGCAAACAACAACAAACAAACTGAAAATGAGAAAATTAAAAACTTAGTTAATAT
ACGGCGCATTGGATGAACCAAAAAAAAACAAAACAAAAAGAAATGAATTAACAGAAAAAAAAAAGAAAAAAACAAACCTAATCTCGCATAGATTTTGCTGCAGCATTTTGGCCGCTGGCGCGTTAAGATTAGTTTTTATTTGATTTTAAGGCTGCGCCGAGGCGATCGTCTAAAAA----------ATATATCTATGATT----TGTTAGTAAGCCAGAACTGTATAAAGCGAGCGGAAA-----GGGAATTTTAGTAAAACCACAAAGCAACCTAAACCTAAATCTAAATATACGTCGATCA------TTAAGAGAAAAAGTTACCGCTTAACAGACACAGACACAGATACA-GATACACACCCACACACTTATGATTAATCAGATACAAACACACACACACACATTAACGGATATAGATACAGATTTCAGATTCTAGTTACGG--TTTAGTTGATATATATATACATATGTACGTTGGAGTGTGCACATAAGTTGAAATTGTAGCTACTACTAATGAACACAATTACCATACCATGCATAATTTACACACACATACACACACATATAAGCACACACCCACACACACATATATATATATATATATATA---TATATTTTAAAAGAAGCCGCTAGAGCGCATCGTCTAC---ATGACTATGTAAATTAGTTAAAAACTAAATATTATTTATATTATATACGAATACAAGTATCTAAATGTGCGTTGCAGTATGTACATAT-TATTACACACACACACACACCAACAAGACGCCATGGCAAATCGAATTTGATATCGATATATGTGGCTATCGCCTATCGACGAGTCGTGCGATTCTTACGTAAAGTTGGCAAGCGCCATGTTTATGGCAAGGTTTTGCGGGTGCGGGAGGGGGACAATCGATATTTGCAATTCGGGGTGGG-------TTCTCTTATATGATCT----------GAGACGTTCAACAATTTTAATTTGCGTGTACAAGTTTAAACTTATATTTATATATATATAAATAACATTATATCTATTAATAT---AAAATATATCATCTACTAGTGCGTAAGA-ACCCATGTACTACAGTTAAAAAAAAAA-------AAAAACAACTAA--AATAACACAAACAAACAAACAAACAAAC--CAACAAA-----TGAAAATGAGAAAAATTAAAAACTAGTTAATAT
>CG1246 2633620 2633739|2579 chr3L 2632178 2638939 scaffold_32 1467262 1474225 - 176314|1526 1653
TCATTATAGTAGTGCACGCTGCTCGGGCGTTGATTTGCGTTTAATCAGTCTGGATGCGCGGT----TGTAAAAAGTTGTGTGTTATTGTTACCTTTATTGCAT----AAAGCTAAAGCTGATGGCCAA
CTGGT----CGGGGCACGGCGCTGATGCG---------GGTTAATCAGCTTGGTTGCAAAACATTCTTCCACTTGTTTTGAGTTATTGTTATCTTTATTACATTTATAAAGCTAATGCACATGGCCAA
>CG32297 2638711 2638987|2579 chr3L 2632178 2638939 scaffold_32 1467262 1474225 - 176314|7077 7322
TTAATGTAGATTAATGTATAATTCTTATGCTTGTTTGTTACCAATAATGAACGGTGATTTTAGGTTGCTGATTAAATGAAATTCCATGTTTATGAGTTTGAAAACAGCAGCAATT----TTACTTTAAACCATAAAAGGCGGCCCAT---AACCTTCATGTCT------ATTTCTGCGCGTAACATTTAATCATGTCCAACGTAGAATTGTATTGAAAGAAA----CTGCAATAGTAATAGACAAC
TCAATACTCG-TAATAAATAACATTTAAG-TAGTTTGCGTTCAAGGGTTTAC-------TTTGGTTGTTG----------------TGCCAACTATTTTCGTCACGCTATCATATCGCGTTAATTGAAACCATCGAAAACAATCCATTGGGGCTTAAATGTTGTATTAAAGTTTTATTTACAAAAAAAAGGCAGCTACAGCTAATAAATGTACAGAATAAAAGTCTCTGCCTATTTTATTGAATAC
>CG32297 2638711 2638987|2580 chr3L 2638940 2640604 scaffold_8 5329522 5331515 - 13780|0 47
TTCAAATAAATATTTGATGTTTATTGAAACTCAATTTGATATACATAT
TTCAAATAAATATTGTATGTTTATTGAAACTCAATTTGATATACATAT
>CG33233 2643755 2644283|2585 chr3L 2643443 2644071 scaffold_8 5334739 5335411 - -1305|329 701
GATTCCTCGGAGAGTTCCACGCAATCAAGTGGCGACCAATAACGGTAGCCATTTGTA---GCCAATC------------------------------TCAGGGTCTAGCTCTCATCTA---CTGTCCACTGGT--------------------GGCCATGGCTATTCTGCCCAACAACTTCAATGTGGACCTCAGCAGCAGCTACAACCTACGCGTGTGGCGATTCCTAATGATGTTCTTCATGATTCCCGGCTGGTTGGCCCTCGTCGGAATTTGTCTGGTGCCGGAGACACCACATTTTCTCATGTCTGTCAATCGGCCGGACAAGGCCCTCCTGGCCCTTAAATGGATATGCCGGATGAACAGGAAGAAG
CGTACATGGGCGAGTTCACCAAGATAAAGCTGCGGCCCAT---GGTGCTCAATTTTATGTGCTATTCCGTTGGCGTCAGCATGATGTATGTGCCAGGTAAGCGCATTGCTCGTATCAAGAGATGCCTACTGTTCCGGCTCCACGCACAGCTTCTGCGATGCTGATATTGCCGTATGAAATAAACTTGAAGATATCCGGCGACTATGCGATTAGCGGCTGGCGTGTGCTCAGCATGACCAATCTGCTGCCGGGCATGATTTCCCTATTCATGCTGTTGCCCATGCCCGAAAGTCCCAAGTACTATTTGTCTGTCCAGAAGACGCAAGAGGCTCTCGACGCCCTGGAGATGTGCTGTCGATACAACAAGGGTAAG
>Acp62F 2730334 2730435|2679 chr3L 2730265 2730350 scaffold_12 10865 10962 + 4037|83 99
GTACGCAGAAAATGCGC
GTACGCAAAAAATGCGC
>CG1240 2751535 2751931|2701 chr3L 2751368 2754038 scaffold_12 36781 39666 + 99588|167 781
ATCAGATCCGCCCT------------CCGATCCTCTCCAGATGC------------------------------------------------------------------------------------------------AAATATATGTGTATGCCTCTCCGCCAGC--CTGGTTTACC-------AATCCCCTGTA-----ACTTTCGGCTCCGCCTGGATTTGTTTGTTCCACAA----------CCTTTGATTAAGATTTAGTTG------------------------------------------------------------ACGCATGTGTTTAGCATTACCCTAATTAGGACGGGTTTGCA----CATTATGCACTTTACGGCATTTTAGGAATAGTTCAGATGAACGGAAAATTACAAAAAAAAAATCGATTATAATACATAATGTGTATGATTTTTTTTATGACAAACTCGTGTAGTTTACATTTTAT--------------------AAAATATCAAAGAAAAACATAACAAGTTTAAGGCA-AGTACCGAGTAATAAAAAGAGAAATAGACGAGTGATGCATCTGA-AAAATACGAAAGCAA
---AGCTGCTCTCTGCAGCCACATGCCCAGTCCCATCCAGATGCAATTGGTCAACAAGCACCAACAACAACAACAACAACAGGCACACGCACACACACATACAACCACGAGCACACACCCACACACACACACACATATATAAGCAAACGCATATACACATCGCTTAACATTTAGTTTAGTCCCTTTGATTCCTTTGAATGCAAATTTTCGGCTCTGC-GACATTTGTTTGTTCCATTTATCGCTGTTTTTTTTTTTTAAGGATTATTTGCACGCGGTGTAGACGACGTCGTCGATGACTTATTTTGGGCTCGGCCAAGGGGTCCACCCCACCAATATGTTAGGATTAAACCTAATTAAGACGAATCTACAATACTTTCATGTAGTCTACGGCATTTTAAGTAACG--------------AAATAACAAAACAAAAATCAAG---AATATATAAT-----------TTTTTGTAACA------TGTAATTTACAAATTATGGTAAAAAAAAAAAAAACAAAAAATATCAAAGAAA--CATAAAATTTTTAAGGCATAATATCAAATAA---------AAATAGACGAGTGATGCATCTGATAAAATA---AACCAA
>pgant6 2769191 2769542|2722 chr3L 2768483 2770988 scaffold_8 3761761 3764433 + 58251|711 1119
CCGCTGCCCTGCAATAG--TATCACTTGCCATGTACTTAGAACAC----------------------TTCGATGTAAATA-------------ACTAGGCTAGA------TAGGTTGTACGGCCGCTTGGC-CACATAACAATTTACCCCGAC------TCAAGCGCACATATGCAACAGAGGATGCAACAGAGAGTATCTTTACCTTAAATATAGTGCATCTCAAACCAATTCCA-AATGCCACAAAAATAATTTG----TAGCGTTACGTATGCTTTGGAGTTTTGTTTGGTTTCAAACAGGATTCCGAATATGCTAGTATTAGCCTCTAAATTGTCATAAGTTTGACAACCGTATGACTTTGTACTCCACAAGAAGTGTTTTCCAATAAAGAA--TATTTTTAAAT
TAGT--CTTAAGAATCGCTCGTCCCTTGCCATGTACTTAAAACGCAATTGTCAAGTCTAATTTTGTATTTTATGTAGCTATATGTACATATGTATTTGTGTAGACCTATCTAGTTAGTAAGCATACTTGGCGCACGTCGCGTTTCGCACATTCCGGTTGTCAGTTATATTTTGACTACAAATTAAATATGAGAACGTG---TTAATTTCTATTTATCGGCTGCTACCCCATTTTGACCAGGCGATTGAAATTATGCGTCCCTATTTTCATTTCTCATTGTAAATGTGGTTCAAATTTTAACAAAGGGCAATGGAAATTTATATT--TTGTTAAATTGAATTAAACCTGAAATTCAAAT---TTGTCATTCC---AAAAGTGCATTCCGTGCATGTACCTAACTTTGTGT
>CG2107 2966837 2967083|2954 chr3L 2964400 2967078 scaffold_8 4004900 4007640 + 95495|2530 2837
GAGAAAAT-------CGTGAGGAGTCC-------------------------------------------GACCCCGAATCCA-------ATGAATATGGCTTTAACGTAACAGGGAGATTTATTTTGATGCTTTTACATTGTATCCCATGTGTCTGAATTGCAATATCTT-------TATCTACAA-TTTATAGATTATA-CACTGAAAACATTCTACCCCATCTAAAGCATCTGTGTCTTTGCTTTTATACCCGCTGCTTTAATGGCTTTTGCGGCTGATGGGATAATAAATTGGCTAACATATTG
GCGAAGATATGTGAACGAGAGAAGTGCGAGTGGAGGCGAGGCACTGTATATTAAGTCGAGGGGTCAACAGGACCTCGAATGTAGTTTGAGATTTAGATGGTCGTTAAG-AACAAAAGGGTTTAATTTGATGCTTTTACAATGTTACCCAGGTGTCTGATTTTCAATACCTTATTCCAAGCTCTACAATTTTATTGGTTATAGCGCTAAAAGCCATTTGCAT--TTGCAAATATTTATTTACATGAATTTAT-----TTATTTGGTTGAATTT----ATTAAGTGAAAAATAAACTTGTTACTGTCCTG
>CG2113 2979392 2979690|2969 chr3L 2978876 2979690 scaffold_8 4021611 4022558 + 12154|593 961
GTGATGTTTTCTGCTTAAAAGTGGGCCAGAAACTGTCATCTACCTTTGACCCGTTTCAAA---ACCACGC---------GCACGTGTTCACCTCTGAGCCCTTT---TGCTAATTGAATTAAAGTCTGGGTT------------CCCGGCCAAAAGGCTTTTAACCAACAGC------------GAAAACCCGCCAATCCCATCACGTATACGACAAGAGG-GCCCTCTCGC---------AAACACCTGTCGCTATGGTTTTTTAATAACACACCGCAGGGGTTTT------------------ACCTCCA---GGAAATAAACAAATTATAGCCGACTTAGTTGAATTCCTGCACTCAGCTGACAAA
GTGATGCCCAGCTCTTGTAGGT-CGCACGTGGCTGTCAGA-GTCGCTGACCCGTGTCAACTGTGGCACGCAACACAGCGGCACGTGCGCTCTCCCTAAGCCTTTAACAGTTAATTCAATTAACATTAAGGCTGCCTAAAGCGCACTCAGCCAAGGGATCCCAAGGCAAGTGCCCCCCCTACCAAGACAACCAGATTGTTTCAATACACAC-CGCCATGCGGCGCCCTGTTGTGCTCTGCAAAAACACCTGCCTCTCAAATTGCCACCTGGAATACAGCCAATGTATCTGTATCACATTTCGGCCGACATTCATATGCAAATAAATAACTTTCAAAAGCCTTAGCCTATTTTCTGTGCCTAGTCGATGAA
>FR 2993928 2994996|2984 chr3L 2992137 2993942 scaffold_8 4040687 4042508 + 82873|1849 1863
GATTGTGTCCGGGCA
GGCCGCACAAGCGCA
>FR 2993928 2994996|2985 chr3L 2994339 2994486 scaffold_8 4042607 4042748 + 3813|0 154
TAAGTACTACTATAGTTTGTACAGAAGGCATAAACTATGCGCTCCAAGCGTTGAGTTACTT-GTGATAAGCGTTAAATGTTTCCTTCCCCAATTTCTCTAC------TACTCCTCCAGAACTTAACTCGTTGATATAGATTTTAAGAAAGTTAGT
TAAACATGTTTTTAGTGTGTA----------AAAATGAGCGCGCCAAGCGTCGCGTTACTTTGTGATAAGCGTTAAGTGTTTC--TCTCCATTTTCTCTACTTCAAGTTCTCTTCGACAGCCCCAGCCGTT-ACATAGCCGATCAAATAGCTAAT
>FR 2993928 2994996|2986 chr3L 2994502 2995766 scaffold_8 4043360 4044605 + 6834|0 670
GCTGAAGAAAATAGTTTCTTAGACTGAGAGTTTTAATATTGTTTTCCTAACGTTTTCCTATCATTTCTCCGGTTCAATGAATTGAATTTGTATCAATTTCGCACTAAATTAGTCATCGAAACTTTTCCGAACCCAA---TATCGTTTCACTTTCTACTG------------------------------------------GCCTTTGTCC-----GAAGTTTTATTTATTAGCGTAAACTTTAGCTGCCTCTAATTAAATATCCTTTACGACGCATTTCTCGGCCGAACTTGATGAATGATTTTCCTTTTCTT--------------------------------------TGGCTGATTTGGGTTTCCC------------GAACTTTTCGATTT---------------CCCTCACACTTTA-------CCGGAAACTGGGGTTCTTCGGGTCCAAATATACAAAGGCCGGGCAATCTGTCAACTTGTCAGAAAGTTTTTAAAATGCCGCTCAAAGTTCAGTCAGCTCAA-------AAGTTTGCCAGCATTATTTAGTCGCCCTAAAAACTC--------------------------------AAGTAGCTCAATTTAACAGC--AAATGCAACAATAATAAACAACAAA-------------AGA
GTTGAACAAAATGCATACACAGACC---AGCTTGTTAATTATTTTCG----GCTTTCA----GTTTCTC----TCAATCAATTGAATTTGTTTCAATTTTGCACAAAATTAAGCCGTAAAACTTTTTCACGCCCAACTCTATAGATTAATGCCCAACGGGGAAGTCCGCAAAACTGAGCTGACCCGAGCCCGCTGGGCTATGGCTTTTTCCACAAGGAACTTTTATTTATTAGCATCAAGTTT--TCGCTTTTAATTAAATA-----TAGACTGCATTTTTCAGCTGAACTTGATAAATGATTTTCCCTTTTTTTTTTCTTCATTTCCTATATTATTTTTCTTTTGCTCTTGTTGCTGATT--GGTTAGCTTTAAATTATAGAAAACTTTTTCATTTTGTTATCGATAGCAGTTCTCATATTTTCTTTTTTTTTGGCGATTGGACT--TTTGGGTTC-----------GACGTTGCAATATGTCAAGTTGTCGGAAAG-TTAAAAAGTTAAGCTCAAAGTTCACTCAACAGCAAGACGGTAAATTCGTTTAAATTGGTTCTTTTTAACACAAATACAAAAAAAAAAAGGAAAAAACGAATCAAATCGAAAGTAGCTCAATTTAACAGTTACATTACAATTACACTTACAAACAAACATACTTTGCTATGGT
>CG2162 3023509 3024003|3018 chr3L 3023103 3024343 scaffold_12 2480358 2481555 - 22372|409 956
ACCGCGGCCCGGAAGAAGGCCAGGTGCATTTTTCTCACCCTTTTCTCATCTGCAATAAATGCGGCAGCAAACACAACACCATGTGGATCGACAACAAGAAACACCACCATTAACGCCCACAAAAACAATTCTCAATCAAAGCTAACACAG---TAAATGAGTAATTCGCATGCTAAGCAATGTACTTTTAATG--TTCGCTTTTTGTGAAATTAACACAGACTTTTGCTCAATTTGTTGTAGTTTTTAGA------------------GGATGCAA------TGCATATTATAT-CATCTAGGCCGTAAGAGAGAAATATCTATATTTATTGGTCGTAGCAATTAAACGTGCAGAGAGACGCGTG-----TACGTGTTGTTTTAACTCCAGCCGT-AAACCTAATTTTTAAGCGCGAGCAATTT------ATATATTGATATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACAC---TGTGAAATAAGTTGAATTTTTGACT---TTAAAGCTAAAAATAAAGGGTTTTTTGCT----TAATTAAACG-CAA
GCCAAGG--CGGCAGTTGCACGCATGCATTTTTGGTGGCATGCTC-----------AACTCATGCCCCAAATCCAACACTCTCCCCCTTT-CTCCTATACTCTCTCTCATCACTG--------------TCTCAATCAAAGCTAGTATATAACTAAATGA-TAATTTGCA---TAAACTGTGTACTTTAAATGTTTTCGCTTTTCATG---------CAAATTGTTGCTCAATTCTTTGTAGATTCTAGAACGCACGCGTAAGCGTTTAAATGAAAAATATCTGCATAATATATATATATATGC--------AAACATACATATATTTATTTGTCTTAG------AACGTAAGCAGACATGCATAATACCAACATGTTGTTTTAACTCCAAGCGTAAAATTTTATTTATAAGCGCAAGCAATTTATATAAATATATTTTAATAAAGTTTAT------AGTGCTTAAGTACAAAAGAGAATTATTATGAGTATTTAATGGAATCGGCGGGATATTCAACTGGTTTAATTCCCTTATATCTGAACGACAG
>Jafrac2 3027488 3027713|3021 chr3L 3027369 3027530 scaffold_9 2715674 2715832 - 4428|119 161
GGACAGATAGAGATGCACATTACCTTAGTAGCCTAGCCCAGTT
GAGCAATCACCTTTTTAAATAACATTCCCAGCCCA-CCCAGTT
>Sk2 3033187 3033693|3025 chr3L 3032175 3033443 scaffold_8 1286870 1288185 - 50063|1029 1338
G----------AGGAGCTTACTGAAGACCA----------------TCAAGCAATAGAAATCTCAATTTTGGAATCTCTGCATTTGTAGCTA-ATACTTAGGGTCCCAGG-----------TGGCCGATATGAGAGAGTTGTGCATTCTACATATTTCGTGTT-TTTGTGGCCTGCTTCTGCCAACCAATCATGTA------TTGTTAACATTT-TAAACACAATAACAGCTATTTCCGAAATATCTA-ACATGTTTGTTTATA------AAACGTGTGCCATATGAAGTGCACGTGAATTTATTTTTAT
GGATTGGCCAAGGGAACGCATAGAATCTCAAGCAACGAGCGTACATTCGAGCAATAATTAATCAATAATGAGAATCTCTGCATTTGTATATGTAGGTGTAGGATATTCTGTTGTTAGGTTTTGGCCCTGTCGGCAGATGCATGCA--------ATATTGTGTTATTTTTATATTAATGCTG-CAACGGATTTTGTAATTTTCCTGTTAACATTTATCATAATTATTGCAGTTATTAACAAAATATATATATATGTCTATATATATATCAGCAACGTTGACAAGATAAGAC---CATTCTTTTTTATTTAT
>Sk2 3033187 3033693|3026 chr3L 3033617 3034262 scaffold_8 1288186 1288869 - 7965|0 97
CAATTCCATATTTTAAAGTAGGA------AGTTAAGAATA----TAACATCTTTGAGCTTGAAATAAAAAATAAAAATGTTAA-----------CTAA
CAAGATAATCCCTTAGAGCGGGAGTCCTTATTGAAGGATAAGGATAATTGTATCCAATTAAAAATGTACAATATATATATTAAACATATATATACTGG
>CG32485 3035047 3035297|3027 chr3L 3034496 3035337 scaffold_8 1288879 1289807 - 33545|555 899
GGCTTCCGCCAC-------GAAATCAGC----ATCCGACGAGGCTTC-TGCTAGGC---GTAGACATATCT---------------CCAAAGAGAACC-----GAAACCAGTACCTAA--------GTTTGCA--------AGGAGGCTTCTGAGAGCTTTTATCCAGTATAGTACTCTA-------------------TCTGTAAATCGATGTGTTTAAC---------AAGTTGATTGTAAAGCGTATTCTATTGGACACCACAACTATTAGTACAATGCTAACTATTTTAGATAAAGGTTTAT---------------CTTGTATGTGTAGTATCTATATAC
GAATTTCGCCGCTCTCCTTAAAGTTAGTTGTAGTCATACATATCTCCATACGAGGCACTATTGACATTATTATACTGCAGCGCGAGACAACGTGTACCTATTAGAAACCAGTACCTAATCAACTGTATTTAAAATCTGTGCAGGAGGCTTACAAAAGCTTTTAAATAG-GTTGTAGTCTACACATACATACTATTATTGTTTACAAATGAATGTCTTTAACTTGTAGCGTGGGTTGATTGTAA--TTGATTGTATTGTGCA-------TATTA--------TGAAATATTTTAGTCAAATATTTATCGATGCGTATTATTGCTTATATATAGAATATATATATAT
>CG1271 3038224 3038439|3029 chr3L 3036717 3038492 scaffold_8 1290734 1292505 - 64101|1529 1753
ACGATCTCAAACGTTTCCGGAAAGTGGCGCGAGTCTTTGAACCGCGTCCCAAGGAGTACGAAACCATTGCCAACCGGATGGACAAATGGAGCCGGACGATTGCCCGGTTTAGTGACTGGTATTAGGTTAAACTT----TTATTCTCTGTCTT--TGTTATTTGTTATTCATTAGTCACTTAGAAGGCTAGGTAGTTGGTAAATAAAATG---CTGAATTTATATA
ATGATCTCAAGCGCTTTCGGCATGTAGAGCGCATTTTCAAACCACAACCAAAGCTTAACGAGATAATCGCCAGCCGCATGCAAAAGTGGAGCAGAGCCATTGAACGCTTTAGTGGCTGGTACTAGGACAGGATTACAGGTATTCTTTATAGTAAGGTTTTCAATTAATGCTT--TCATTTGCA-------GTAG--GGTATACAAATTGGGTGTGTTTTCTTTTC
>CG16753 3039222 3039376|3030 chr3L 3038688 3039249 scaffold_8 1294512 1295082 - 22003|552 579
AAGCCTCAAATCAGCAGATTAATTATTT
AAACTAGAGAT------ATTAAACACTC
>CG11486 3071835 3072206|3054 chr3L 3070790 3073985 scaffold_9 134207 137454 - 70596|1147 1716
GCAACCCGAGGGTAAAAGAAAAACAGAAAACACGCGCAGCTCACTTAGCC----------------ACCATCCGCA---------------------------------CGACCACAAAACGACTACGA-TAAAGGATT--AGATACTA-AGCAAAACATTCATTACGACTAAGACATTTTGA-----GAACCATAAACAAGTAAA------------------------------------------------------------------------------------------ATACGAAGATGTTTATTGTTAAGCCAAACCGAAAAAGGAACTTAAAAGAA--AAAAAAAAAGTGA-------------AAACCGATATCCAATGTT-ATGTTAGCTCTTAACTAAATTTTAGGCATTTAAA-----ACAATACAAAAAGAAACAACCGCAACCACAAAAAATAAACCAACAAC---------------------------TTTTTGAAACCGAAATCTCTCCAAAAGAAAAAAGCAAAAACACAAAAAAATGC--AAACATTAC
GCAAC-----AGCAGGAGCAGGA-ATAGCACATGCGCAGCTCACCTAGCCACGCCCATAGTTCATGACCACCCGCCCCCATAAGAACAACCCTCCACCCTTCCCCTACTCGACCAC-AAGCAACTACGATTAAATGGTTTAAGATATAAGAGAAAAACATTCATTAT-ACTAAGACATTTTGGCGCATGCCCTTTAAATAAGTAAATGAAGAATATAAAACTAAAAAAAGAGAAAACAAAACAAAACAAAAAACAAAAACCAACATAAATAAATAATATAATACAAAATTAACTACATACGCAGATTTATATTGTTAAGCCAAGCAAAAAGATAATGATAAAGAGATGAAGAAAAAAACAACAACAACAACAACAAACTGATATCCAATGTTAATGTTAGATCTTAACTAAATTTTAGGCATTTAAACTTACATAAAACAACAACAA--AACAACAACAACAACAAATAAACCAATAACAACAAACAGAAAAGGAGCAAAACAACTTTTTAAAAAACGAAATCTCTCCAAAAAAGAAAAATACAACAAAAAAAAAATGTCAAAAAAAAGC
>CG1291 3128799 3128820|3111 chr3L 3127420 3128900 scaffold_9 235202 236637 - 71604|1379 1400
AATTCCAATTAAGAAAGCAGAT
AATTCCAA-TAAATGTGCAGAG
>BtbVII 3137066 3138349|3117 chr3L 3135786 3141825 scaffold_38 1023955 1029850 - 137062|1387 2871
AATACGATTTCGAGCCA---------------------------------------------------------------------------------------GGCGGGGACGGCCACTCTGCTCCAGGCAGCCGCCGTAATGGCCGCCAGCGAGCCAGCGGAATCCCTGAGCATATCAGCCATGCCCGTCTCCGTTC---CAATGGGCATGGCGCACAGT---------------TTCCTCATCAACAACTTCGTAACGGTGGCTGCACCGCC------------GGTGGCCA------------CGGTGACCAGCACGGGCCTGCAGTACTTGGACAAGTCGTAGG--TCCGGACACCGAGCCCCCAAAT------TGATCGATACAGGTATTAGAGAAACGGCAGC-AATCTACTGTATATATAGCGGACCGCTTGTACGGCACAGTGGCAATATATGCAGCGATATATGCCGACCCAGGATGGCACAGAAGTGGAATCGGATTCCTGCGCTGAGCTGAGCTGAGCTAAGCGAAGCA-GGAGGATCGCAAGGAAGTGAGGCGGAAGTGAACGGCGAGGAGCGAAGCGAGTTAAGAGAGCAGGCAAGCCGGCCGCACTTGTAATAATACTTTCATAGAACCTAATTCCTTGAGCTAAACGTTTTGAACCCTAC---ATTTTTACGATTGTTAACTAAGAAATCGGTAGTGCAGATCTTCGATATACATACATATATATATATATATATAGCTATATAGCTATATTACGTGTAAAAGAATAATGTAATTGTACATAAA-TTATAAAATTTTATTAGTGTTAATCGCGAACAT---CAAATGATTTGTA-AGCAACTGCAGCTAAAAAG----TGGTGCTGTGTGCCAGCAGCCGACACAAACCTTGCGGAATCCGCTCCATATTCCACTT-----TTTGTAATGCAAGCAAGCAATGGACTAAACCAA--------------AAATTCTATCTGTAATCGTAATGATAAACAT-----------TAAGGACAAAATGAGATTTATTGGCAATTTCTGGCGAAAATTTCCCACATCCTGCGGTTTGCTAGGCTCTGGCGCATCAGAAATAAGTTTTCTTCCTCGTTTCGAAAAGAATTTAATTTCTGCACTTGTGTTACAA----TAGCAAAT-ACCAGTATGTAGGAACTCCCCGTGAGCATTATATTTAGCTTCCT-ATCAATGTGAGACCATTTTCTGTGTACAGTGACGCAAGTCCAC--------------TCTATTCGAAGCATAAGGTAATCGTTGGCGACTCCCGACTCCATGCCGCAGAATGTCAAGAGCAGGGAGATCCGAGGATCGCTGGACCGCGTACAATAGACTAAGATACTAGATCGACGGAGGAGGAGGAGCATGTAAGCGAACCGGATATGTATGATAAATATGTACCAACCAATATATATGTATATATATTTATATTTGTGAATGT
AATACGATTTCAAGTCACATGGGCGTTGTTGCCGCCGCCGCAGCAGGTGTAATGCCTCTGCAGGTGGACCAACTGAGCGGCGGCAGCGGTGAGTCTGCACACGGGCCAGGGCCAGCCACGTTGCTGCAG---GCCGCCGTTATGGCAGCAAGTGAGCCA---GAACCAATGAGCATATCAGCCGTGCCCGTCTCGGTCTCAGCAATGGGCACTGCGCATAGCGCAGCGGCTACCGCGTTTATTTTCAATAATTTTGTAACTGTGGCGGCACCACCACCGCCGCCACTGGTTGCCAGCACGCTAGCACCGCTGGTTAACACCGGCCTGCAATACTTAGATAAATCCTAAGATCCCAGGCGCTGCAGTGCAAGGTGTGTAACTCTCGATACAGGTATTAGAGCAACGGCAGCTACTCTAGTGAAT-----------------TACAG-GCATTAGGCATA-------------------ACCCACGGGGTT-------CGGAATCGGC-----------AAATAAGTTATGCCATGTCATCAATGGAGGAACGGCA-GAACCCACTAGGATGTAGTATCCCTAAAGTTAAGCAGAT-----GTGCCGACAAGC--GACACATATGTAATAA----TTTATAAAACTTTATTCCTTAAGCTACATGTTTCGAGCCGAACATTATTTTTACCGTTGTTAACTAAGAAATCGGTAGTAAAG----------------------TATGTGTATATGTAACCACA-ATTTATAT----------------------TTGTACATAAATTTATACAATTTTATTAGTGTTAATCGTCAAAATACAAAAATGATTTGTGTATCGACT--AGCTAGCATGTACATATAACTTTTTAAATATTAACTACTTAAAATTGGCCTAATTATTTTCATAATTGATGTAATCCCCTTTAGTCCTGGCACTCGTGTTACAAAAGCAACCTTCATTACGTATACATTCTA-----AGTCGTATAATTGAATATGTATTTCTTTCTATAAACAACAT-ATATTTGTGTACAGTTTATGGCCAATCAGTTTTAGTTGAAATGGATGTTTTGTATCTAGTTGATGGGAAATGTGTCT--------GTCTTTAGACGGA--------------TAGTGTTATAATCCGTATAAAATAAACCGTAAGAGAAGTTAACCTTCAAATATTTAATTAAGCCAACTCAATAATGTATGATATATATATATATATATATATATATATGTACCAATATATATATTATATATTTGTAAATGTACGCAATCATTTTGTATTTTCGATTTTGGGCTG--------------------GATTTGTTTTTTTTTGAACCACCAACCATATTACCCAATACCAATGAATATGGAAAGCAAGAATTTGTTCAGAGACTGTTTTTGTGTATTTATCGTGAAACTATCAA---------ATTAATTTCAATATTGGCGAAT--
>CG14956 3141119 3141940|3117 chr3L 3135786 3141825 scaffold_38 1023955 1029850 - 137062|5773 6617
TCTGGAGCTGCCGTG--ACCAAGCCC----------GCATATTTGTATTTGTGACAGGACGGCCGCCGAAAGGTTGACCTCCATCAGACTAGAAGCCACGCATTGCTCGTCCTTCATTCTGGAACATGGTCCACACATGGCCGTCTGTCGAATTTGTTTTTTTGTCAGCAGGAAGCGCG------------AAAAACGCGCGCTCACGA------------ACTGCACCCAAATTTTCATTTGTTGTCCCAGTCCCACTGTGCATCCGGCCCGGAGTCCGGGCACATGGACTGCGAGAGAGGGCGCCAGGTGGCGCCA-GAGAATTGTTTTTTG------------------AGCCGTGCCCAGATGCACGCTGCCA---TTGTAAAGTAACGAAAATCTTTTGGAACACCGTCGGAATGCGGGGTGAAAACTT--------TTTTAAATCGCTAAATGTAATAATATGTTTATGTGTGTGTATCTATGTACTATATGTGTATGTTCTTGTACAAA--AAAAAAACCGAACTA---AAATCTAACAA-----AAATAAAACGTTGACGACG--------------GTGCAGCTCG----AAGCTCGAATT-ACGATAAGGTTTT-----CACCAAGTACAACTATCACTACCAC--------TACCCCAATCCGCTCCGGCCTAAA----------CTTAAGTACGTCCTTGCACCTGTACTTTCGCCGGGCACCGCTGCGCAGGCGCACGAAT---------------TGTCTAGTGGCCCACA-CTTGTTTTACTT-AACGTTTTATATCTATGTATGTATGTACG---TATATGCACATGGC
GCAG----CGCCGTGGAATCGAGTGCTTTTTGCTTAACAAATTTGTATTTGTGACACGACGGGC--------------------------------------------------CATTCCCGCA------------ATGGGCGTCTGTCGAATTTG-TTGTTTGTCGCCAGGAAGTGCGCTGCGGCGCCATCAAATGGCTCGCCCGTGGCGCACTTTTCATCCTGCATCGAAATTTT--TCATTTGTCACAGTCCCACTGT---------CCTGGACCTGGACAC--GAACTGTTCACGCGCATTTTTGAAAGCGCAACAAAAATTGTTTTGTATCTGCGCCACTTGGGCGCAGCGATGTACATGTGCATGCATCCAAACTCGTACATAGATACATATATGTCTG-----TTTGTAAATGCACGAGAAACATTTTAAACTAATCGTAAAGCGAGCTATGTAAATGTAAAGTAATTGCTACGTACATACG---TATGTACATATATTCTTGTACAAATTGGAGAAACGAAAATACATAAATCAAGAAATCAAGTAATAAAACATCGGCGGTGCAGCCAAATGGTGTGTACAGCCCAGATCAAGCTCGAATCAACAGTAATAATATATAAAAATCAAAATCAACTTCTATATGCATATATGGAGTACTACAAAC--TTCCCGCCAAAAAACAACTAGGATTGAGGGCGTAACCACGCCTTTAAG---GCCAGGCACCGCTGCGCAGGCGCACGATTTTGAAATACGATATATACCTGGTAAACTGAATTTTGTGTTAATTAAATGTTTTGTAAGCGTATTAAGATAACCGATAAACATGCATATGGC
>CG14956 3141119 3141940|3118 chr3L 3141910 3142053 scaffold_38 1029934 1030083 - 425|0 30
AATCAATAAATACTTGTGACCCTCTGGTTTG
AGTCAGTCAATATTTCTCTACTGTTCAGTTG
>pfk 3145257 3145556|3119 chr3L 3142054 3145258 scaffold_38 1030427 1033782 - 101094|3424 3425
AA
AA
>rasp 3147234 3147384|3120 chr3L 3145675 3148595 scaffold_38 1034014 1036982 - 78663|1581 1735
CCTCGCCAAAAGTCTGTCTAGATTTACGTGAATCTGACTACTTATGAACGAACTTGTATTATAAGACGGCTTTAGAATTGTTTTGTGTTT--TCACAGAATAATAATTTACTTAATTTTCACTTTAA--CAAATAATAAATATATAATTGTATAT
------CTGAAAACAACCTAAACTAACAACAGATGACATACTTGCACAAAAATAGATGTTA-AAGACTGGAAAACTATTATTTTGTATATGATTAATGTGAAATAAGT--CTGAAAGATAACCATAAACCAGGTAAAGTCTGTTAAGATTCATAT
>CG32280 3151973 3152612|3121 chr3L 3151429 3152605 scaffold_38 1039824 1041114 - 25652|574 1341
G--ATTGAGCGAGCAGGTCCAGCAAGGGGTTCCGTGGTGTAGAT----------------------TGATTACTTTAAGCAAGCGTTTTTTGCCTTTATTTATTTAATTGTAGTAATATCATTTGGATTCCACAGCGAAGGCAGATGGAAAGAGCCAAGGCTTCCCT-TAATCTAACGCTAA--CTCGCTAAATTGCTCCGCTGTTTTACATTTTGGTTCGCCCAATCCTTAATT--GTTATGTGTATGTTTCTGCCA------CGCTAAAGATAGTAAATACGTATACATTA-----------AAATATCCAGCGCTTCGCGGATA----------GGACAGCCACTATAAAAACTCAAATAATGAAT---------CCGCCTTTCTAGGTACCCACATATGTATGTACAAGCCTGATTACGAGCACAAAAGTCGCTTGTGTGTCCATTTTGAA--GAACAGGCCCTTTGATATTGCACAAATTGTAAATCTTTTGAAGTCCGTCTTATGTTTTTCGCACA------TTGTTTAATGAATAAATCGCTTAGAATGTAG----------TCAAA------AGATAAAATACAACATATTTTTGTAACAA--------------------------AGTGTA------AATGTCTTCA-GCGAAAGTGCATATTGTATACTGTGAAAGTTA-------ATCTCCCTAATAATTAATCACGAA-ATCTATATAAT-TGACTTTTAATTTTTAAAT----AAACTTAAAAA
GTTATTGCAACTGCAACTGCTGCCATGCACACAGTGACACAGATATACATACGGAGGGAGAAGAAGTGTTTAATTTAAGCGAGTG--TTTTGCCTT--TTTATTTAATTGTAATAATAACACTTGTATTTCACGGT-------CGTGGGGAATGCAAGGGCTTATCTCTAATCTTATGCTAATCCTTGCTAAACTGCTCAAGCTCCATGCACTTT----------ATTGGTAACTTGATTATGTTTTAAAGTTTACCATTAATTTTCTCAAAATTGTAAGCCAGCATACATGATTTGCTGATTTAAATCCGAATAATGTTGTGAATATTTTAGTTATGTAAATTCACAATCGGAACACATATGTTGGACAGTCTCTAACCGAATATCGA---ATCTTAATATTTATGTAAA--------TATTTGTCCGGAAAATTGTTGTGCTTCGAAGATAAATGAAAGAAATCCTGCAATGTCATCCCAAATTCAAGTTC-----AGTTTGTTTTTTCTTTTTTTGAGAATTGACTGGTATAACAATTAAACATATATAAATGTAGAAATTCATTTTCCAATGCTGCAGATACAATACATATTAATTTTATGAAAAGACAGCAAATGTACAAATATTTTTGTAGTGTACTTGAGAATGTCTTCATGCGAAACTGCACACTTTATACCATTTAAGGCATATGCATATTTGTTTATCAACCGATCAATAATAACCATGTACTATGTCTTCTAATTTTTTAATAATAAAATCTAAAAA
>CG32281 3154408 3154441|3122 chr3L 3153022 3154876 scaffold_12 506641 508535 - 81963|1419 1452
TACAATAGATACAATAAAGCTGTGATTTCCAAAC
TCAAGTGA--ACAATAAAGTT----TTTATATAC
>CG32278 3154870 3155299|3122 chr3L 3153022 3154876 scaffold_12 506641 508535 - 81963|1912 1918
GCAACTC
ACAGCGC
>CG12734 3167804 3168822|3130 chr3L 3167338 3168992 scaffold_12 522572 524315 - 31903|484 1677
CGGGCAGCAGTCTGACTCTCGGAACGGCCGGTTCCAGACGCACCGTTTATCTTATCGATGAGCACCAAAAGCTTCCCGATGGCTCTACTCC--CGGCGCCAC-------ACAGTCACAGTCTGTT---------------GGCGGCAGTGGCTCCGTCAACGCCGCACCTCCTACACCCGCAGAACCTCAGACGCCTCAGAAGAGTACCGAAAACAATGCCCCGGTGGGCCCAGCTACGTTTCTCATGTACAACCGAATAAACACCACGATCGGAGGAGCCTCGAACAGC---------GGGGACCAGAGCCCTCTGCTGCAGGCCA---------GCGGCAGCGTCTCGGGAACGACCATGCAGGATGACAAGTCGGCAAGGAAGCGGACCGAAGACAAGAGCAATAGCATCTGGTATGAGTACGGCTGCGTCTAGATCATTCGAACAGTATACGTCCACAACGTGAACTCGAACATAATGCATTTGCT---GACGAAGTATTATTTCGTTTTAGAAATTAACGAATTTAT-TTTTAAACGCATTAGAACATCGATGTTGCCTTAAGCAAGTTACATATGTAAGTGTGAAGTGCTGCTTAAACCGCTATGATTTGCCTTAAG---------AAATATTTTACAAT---TAGAC-TAGTACATA-----------GTACATACTATAGTTTGTACCTATTTATGCA---ATCTAAAAACT-----------------CCACAAGACTACG----CGACAACTATGCGAACATATAACTATC---CAGTATACACCCCTATATACACAAAACTATAAAAAAATATGT-------------------TAAATATTAGC-------------------TGTACCGGCCTCAATGT-----ACGTCCTAAGCGAAAGGCTTTCTTTTTCGCAG--ATAAGACAAGATATTTAAAAATAGTATTTATATCCGTTCATTTGGTGTTTTGTTAACTCGACTCGACTCTATGTATTCCT-------AGATATGTTGTAAACCACACTCGTACTCTGCTATCAGCTAACGAACGCGCCTTCAATTTGTGAATATATTTTTAT--------------------------AAATTACTTGTAGCCTTGTACTATTTATTGACGCAAAGCCTAACACCGCAATAAAACTAAGCAAACATACAGAAA
CTGGCAGCAGCTTAACGCTTGGCACTGCGGGCTCTCGGCGCACCGTCTATTTAATCGACG------AAAAGCTGCCAGATGGCTCTAGCGCGTCAGCGCAGCAGTCGCAACAGCCGCAGGCTAGTTCAACGCCGACGCCCAGCAACAATGCTGCAGCAGCCGCCGCCGCTGCCACCGGAGCTGAACCACAAACACCACTAAAGA--ACGACAATCAA-------------CCAGCCACGTTTCTTATGTACAATCGCATTAATACAACCATTGGCGGTGCGCCCGCCAACACAACAACTAGCGATCAGAGTCCGCTGCTGCAGGCCAGCGGCAGTGGCGGCAGCGTCGCGGGCAGCGCCAACCAGGACGATAAAGCGATGCGCAAACGCAATGAGGATAAGAGCAATAGCATTTGGTATGAATACGGCTGCGTTTAGATATTTTG---------------------GAACACGACAAAACTGCATTTGCTGACGACGAAGTATTATTTCGTTTTAGAAAGTAACGAATTTATGCCTTTAGCTTAACAGAA---------------GAGAAATTTACA------------AAGTGCTTCTTAAA-TGCTATAATTTGCCTTAAGCTGCAGACAAACAAGTCTGCAATTTATATACGTAGCATTTACATCAATTTTTGTGTATGTTGTGTTTTACAACTAGATATAGATAGATATACAAATTGTAGTTGTATTTATATGTAACAAAACGAAGACTACGGCAACTGTGCGAATTCATAATTACCTAGCAGCATACATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATGTATTTATATATATACATGTTTACTCATATATCCATGTACTTATGTACCGAAATGTATGTCCGTAACGTCCACAAGATTGGGCTGCCCCAAGAGCAGCCACAGGTCAAAAGTTTTATTATAATTAATTATATGCATTTTACATGTAACACTTGAACTCGA---------ATATATTCCTACACGCCACACACATTGTATACTACA----------GCTTACAGCTAACGAATGCGCCTTCAATTTGTGAATATACATATATTTTTCTAAGACTAAGCAATAACAATGAAAGTAGAAGTAACGTTCTTTAATTTATTGACA-AACGCCTAAATACGCAATAAAACCA--CAAACATAAAGTTA
>Hsp83 3180185 3180593|3141 chr3L 3177958 3185754 scaffold_12 532939 540903 - 344257|2231 2719
GCGACCAGTCGAA------------------------ACAAACAACC-----------AAAATTCATTCTATCACTCGCATTCACATA---------CACAATTTACTTGCGTT-TCGAA-----CTTTTATACTGAGTTTACTACGGCCGAGTTAA------ATTTTGTATT--------CATTAACATTTTGCCGCGTTATAAGCGACAGACATACGCTTAACTCATAAAAAAGCAGGAATAACTCGTTAAATGGTTAGGTTCTCACAGAACATTCA---AGAGCAGTTGTCGTTT-TAAG-AACTTATAATTTAGAATCCAAGTAATTTATGTAAAAAACTAAAG-ACTACATACGCGCCCTAGTTGGTAGAGCTATATAAAGAATCGAGTATATATATAATTAAGGTTTGATGACCCGATCGATGAT-AAACATAAAACCAAATAAACAACAAGCAAATGTGTTTTAAAAAT---------CTAA
GCAGCCACACAAACCGACCGCCCCTCCCCTCGCACGTACACACACCCCCCACCAAAAAGAAAACCATACCATAA--CAAAATTACTTAAAAGTTGATCACATTTCATTTCCTTTGTCGGAACCGCTTCTTGTGTTGACTTGACAACATATTATTTAATACTTCAGTTTACATTGTAATTTGTATTTACGTTGTGTCGCGTTATAGGCGACAGAAATACGCTTAACTC---AAGAATCAAGAATAATTTGT---ACTATTAGGATTT----ACACATTCATTTAGAGCAGTTGTCGTTTATAAGAAATTTCTAATTTAGAATCCAAGTAATTGATGTAACGAAAGAAAGAAATACAAAGACTTCGTATGCGTT--AGCTATTTAATG----GAATATGT-----ATTAAGATTGGATGATCGGATCGATGATAAAACATTAACTAAAATA---AACAAGCAAATGTGTTTAAAAATTAGTCGTTTATTAA
>gry 3194526 3194879|3148 chr3L 3192818 3202384 scaffold_12 550321 559992 - 472033|1811 2259
GGATGATAC-TGATATAA------TGCCGCTTTAGTT----TAAGTGTTTTAAAGTTTACAAAATACTATCACTGGTGTTTAAAAA--------------TTTACTACGCCTA-----CTCCCTCTTTATT---------------------GCTAACAACAA-----------------------------------ACATACATACATAAATAACTATAT------ATTTAGAGAGTTGCATAGCGTAATACTTGAGAGTGTGTGTGATTGTATTGTATAATGTATTGTTAAATGGGCCAAGACGCACTAGACATTATTGTTAGTTGATTACGGCGTTTTAGATAAGCAGTGCTAAGTCCTGGTCAGT-ACCGCAAGTTGCACATATTTTCGTACATCCTTTGAACGTA--CAGTAATAAATATAAAGCATACAAATATCGTTGAAA
ATGTTATCCCTTAGTTAAAGCGTGTGCATATTTAGTTAATCTAAGTGTTTTAAAGTCC-TAATATATCATTG-TGGTATGTAAAAAAATTCAGCTAACTATTAACTCTCTCTTTCTCTCTCTCTCTTTATTTGCTAAAGTGAAACAAAAGCAGTTTACAACAAGATTAATAATTATATGGTTAAATAGACAGACGGACAGACACATGCGTAAATAAATATATTGTTATATTTATAGACTTGG-----GTAATACTTTAG------TGTGATTGTGTTGTAGTGTGTGTTTATAAAT----TAAAAGCGACTCGATATT--CGTCTGACAATT--------------------------GGCCTGGCCCGCCGCTGCGAGTCTCACAT----CCGAAATAGATATGCATATAATTAGATATATGTATTTAGTATA---------TTAAAT
>CG12034 3204251 3204460|3149 chr3L 3202749 3204397 scaffold_8 701607 703279 + 60173|1544 1709
-------------GGCTGTGTATAGCAGCC---AAGCTCAATGCGCATTTAAAATCCACGTGTAGCGTACTATAAGCAGCGATATATGT---TTGACTAGAGTTATAGCGCTCTTACTTGATCTTTTTATTCGTGTAACCGTCAATGCAATTCCATGGTCTCTTTC
TCTAAACTTGGTGTATTCCATATAACAGTTAAGAAGCTCAAAAAGCATTTAAAAAACAGCCCAAGTGCTCTATATTAATACATCTACGTGTCTCGACTA-AGTTGCA--------AATTGAAGCTCTGCCTCAT-------TCTATGCAATGAAATGGTCTCTGTC
>CG17737 3207993 3208236|3158 chr3L 3207792 3208311 scaffold_40 30695 31240 - 16126|201 511
GCGGTCG--AACGAACAAAC---CGTGTGAATCTTCATACCACTCTTTCATT-CTTA---AGCTCTGCAACAACACCCA------------------------------------------AAAACTTGGAAAAGTTCTTTGTTCCGAATTATTCAAACTCTCTTGATAGAA-----CATAAACATACAGAAGCAATAGACCATTTACTGAGAACAATGTTA-----------TAAATAAAATTAAATGTTCAATTTAAATAAATGAATGTGTGCGGGCGCTGTCGTAGTATAATGGGTCGAAAAAATTAT
ACTAATGCCAAGGGAGAAACAAAAGTGTGGATATCCATACAAGTCTTACACTGCATACATAACTACACACTCATACACATATTAATATAAATATATATATATATATATATTATATGTATACCAAACTTGCTAAAGTTCTTTGTTCCGATCAACTAAAA--CTCTTGATAAAAACATTTATATAAAGACAAAAGCAATAGACCATTAACTGCGAACAATGTTAATATTACAAGTTAAATAAAATTAAATGTTCATTTTAAATAAGTAACCGAGTGT------------------------------ATTCAT
>CG11505 3215072 3215328|3162 chr3L 3211608 3217815 scaffold_40 35893 42417 - 104617|3989 4247
TTCAAAGGAGACGGGCTCCGGTGGCTCCACTGGCACGCTGTCGCCCACTGGCAGCCACAAGATGGACCTAGTCTTTGGTGATCCCGCCGTCGTGGTGGCGGCCGTAGAGAAAAGCGGCCTAGCCACAGTTTCTACCGAGAAACGCGTCGCAGGTGGAGCCTCGCCCGCCGCGTTGATCGGCAAGCCAGCTGGTGGA--CTTCCGGCCACCAACACAACCCAAGGCAGCAGTGCTGTCGTGGTCTCTGCCAAAGAGAAAG
----------GAGGCCATCAAGGACGGCGCTGTC------TCCCCCACGGCCAGCCACAAGCTGGAACTAGTCTTTAGCGACACCGCCGCCACGCCCACAGCCG----ACAAAGTTGC--AGCGACTGTCTCGACTGAGAAGCGTCTGGC---CGTAACCTCTTCAGCTGTT----CCAGCAGTGCAGCCGGGCAAAGCTACTGGCGGCACGCA-GACTCAACCTGGCGGAGCTGT---------TGCCAAGGAGAAGG
>CG11505 3215441 3215771|3162 chr3L 3211608 3217815 scaffold_40 35893 42417 - 104617|4364 4761
ATAAT--CGTCCCAATGCCTC---------------CGTTCGCCCACTGAGCAAGGAGAAACAGCAGCAACATTACGGCTCTGCTACAGAGCACAACACTAATGCCAATATCGGCTTGGGGGCTAGCGGAAACCGCAAGTCCAGGGCCAACAACTCTTAAAGGACGGAGAGAGGAGAAACAAACCGCGTTGCCAAA---GCGAGGCATCTGTGAAAC------ACCTTGCAGGAT---------GCCTCTAAAGCTGCATC-CGACTGTAAA----------------------TATATGAAATTCC-ATGTG-TAAATATGAGCAAA-----CCTTTTTGTTAAACCTATAAGAGCTAGAGATATCTGT-AAACGAACTAAGGA-GGCATATGACAG
AGAGTCGCGTCCGAATGCGGCGCAGATTGCTGGCAGCTCGCGCCAGCAGAGCAAGGAGAAACCACCGCAACATTATGGATCATCCTCTGATCACAATACGAATGCCAATCAGGGC---------------GGTCGCAAATCGAGATCGAATAACTCTTAA----------------AAACAAAGCAGGTCGCCGAATTTGCGACAAATGTGAAAAACATGAATACTTTGCTAGGTGACGCCGCCGCCGCTTCAGGTGCATCACCCCCATCAACCCCCCCTCCCCCCCTCTTCTGTACATAAATTTCCAATGTGTTAAATACAAACAAAAGCCGTTTTTTTGTTATATCTATAAGCGCTATAGATATATACGGAGCTAACCAAGGAGGGCATAAATAAG
>CG11505 3215830 3215852|3162 chr3L 3211608 3217815 scaffold_40 35893 42417 - 104617|4820 4842
CAGTTGCCGCTGCTCGTTAGGAC
CAGTTGGCGTCGC----------
>CG14959 3251210 3251288|3203 chr3L 3250550 3252576 scaffold_40 88850 90830 - 43071|736 815
ACGATTTGCACTTAATTAAATATTTATTGTGTGTCTCCAAAAGCAAACA-AACTAATTAAATTAAACGCCGTATGCAAAA
G-----TGCAAATAAATTAATATTTATTGTCT---TTGAGCAGCGAAAACAACTAATTAAATTAAATG----GAGCAGAA
>CG14960 3259581 3259791|3207 chr3L 3258368 3260905 scaffold_40 97149 99931 - 37421|1359 1609
GCAAGAGCTGTTCCACATGATGGGAGTTCCACATGGAAGTCAACGACCACCGCGTTTAATTAGCTAGCACACATTTAGTCAGCGACTTTACGAGGACGCAGCTTTACTTACACCTAAAACTATAGTTACGAGCCTAGTGTTT-----AATTAAATTA-TTTGCCCCAAGTAGACTTAAAATCAATG----------------------------------ATAATTTGTAATAAATAGTCGTAATGCAAAA
GCG---------------GCTTTGACCTTC-------GGCCAACGACCACCGTGTAAAAT-------------TTTAGTCAGCGACTTTTCGGGTGCGCAGCTTTACATA-AACTACTTTTAGAAGAACTAGTTGAAAGTTCGAGAGAATTAAATTAGCTTGCTGTAACTAGGCTTAAGACGAATATTGATAAACTATTTAAATTATTTATGATATATGTAAAATTAATAATAAAAAAAAGTAGC-CAAAA
>CG12017 3274060 3274425|3221 chr3L 3273184 3274417 scaffold_40 110691 111828 - 29608|902 1299
ATTAATCCACAAATCCAAGCCACTCCACCTGAACTCTGACCTCCAATGGAGACATTATTTAT----TGTATTTATTTGATTAACATTCGTGGTACGACGCTGATTATTAAATAATCCATAAGGCCCTAGAGCAAAATTAATTTTAGCACAATGAATGAAATGCCAGTAAACCAATTTTAGCTGTAAC----CCTTAGCC------------CCCTTAGTGCAATGCCTTAA-ATATATGACTAAATTTTAAAAGTGTACCTTTAATGAGAAATCGAAGAACTGTTTCGGATACA--------------TACGCAGCGAGCAAAACAAACTAGACATAAGTTATTTATGCCAATTATTTATTGTATTCGTATGTTATATG-----ATGCTTATTAAAGA
ATGTGCCC-------------------------------------ATGGAG-CATTATTTATATAACCTACTTATTTGACTTACA-TCTTATTATGACGCTGATTATTAAATAATCCCTAGAGTCCTAGTTCGAAATTAATTTTAGCCC--------AAATGCCAGTAAACCAATTGTAGCTGTAACCCCGCCTTAGTAGAAATTTATTTGACTTTAGTGCAATGCCCTAACATGTAAATTTAATTTT---AGTCTTACTTAAAAAAACAAATGCAGTAAATATTTCTGCTTTAATATTAATATTTGTTGAATATTAAGCTGATGCAGTTAGCCTTAAGTAATTTATTTGAATTATTTATTTTACTCGTATGTTTTATGTTATTATGCATAATAAAAA
>CG12009 3282235 3282495|3231 chr3L 3281839 3282803 scaffold_40 120760 121734 - 24679|447 729
AAAGGAAAACAGGGAGATGCAGCGAAGGACAGATAACAATCCTGGCAAGGATTATTCACCCAC----TTAGCCCGAAC------------CGGAACCCCGTT------CACCTCCTAGTTCCCAATACGCTATCCCACTCATTTGCACCTAGGCAAATAAATTTAATAATTTTTTGATTTCCTAGTTTTATGGCCATTTCTCAAAGGATAATTGCGGACGAGCGTTGAAATTTAAGTTTAGAATTGTTGTTCCGACCAGTTAAAGAAACAAACTACAAAAAAA
AA----------GGAGTTGC------------CCGACTCTCCCTTCAAGCAACACCCGCCCGCAAAATTCTCCCAAAAGCGGTAGCCTAGCGGAGCCCATTTGAAACCCAGGTCCGGGCTTCCGATGCTGT-TCCCACTCAATTGCAGCTTTACAGAC--------TATTTTTTGAATTTTCTAGTTTTATGGCCATTTC-----------TTTCGTACGAGAGTTGAAATTTAAGTTTAGCATTGTT-----AAAAAACAAACAAGACAAACAAACAAAAAA
>CG17723 3296545 3297012|3243 chr3L 3295242 3296832 scaffold_12 2493626 2495136 - 68265|1320 1637
CGACAGCCACATCAG---------GCGCAACAACAT---GTACACTTTGCCACGA-CCAAAACGGAAACCGCAACCGCAACAACAAAGGCCGCCACAACAGCAGCAGCAACATCAATACGTGATATAATGTACGAGCCACGCGCCAACAACCTAGTGGTCTCCA--------GCGCACAGGTGGACGTCAATCTCGGCCTGACGGTGACCGCCCAGCGGCGACGGGAGCTTCAGTTGCAGGCCGAACAGCAGTATCAGGAGCAGGTG----TCACCACTGA-----GTACCAGGAATGGCGACGAGGTGGCACTCTAA
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>CG17723 3296545 3297012|3244 chr3L 3296907 3297008 scaffold_12 2495207 2495361 - 55|0 155
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CTTCTTGGCAACTTAAACTGTTCTTTAGTAGAATTTACATATAAAC-AAATTACGTTTATAGGGCCAGTCGACTTGAGCCGTGGTTAAGCGTTGTTGTTATTGCGCGTGTCTAGTTTAAAACAAAATATTGAGCGTGTCTGTGTTTTTGTGAAGCC
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AATGAAATTCAATATATA-------TTATTATTAAAATATATAATTAGAGCCTAATAGAAATGCATCCTCCAGCTGTAAATATTAGACTAAGAACTATCTATAGTTATTTTTTTCTTGTGCGAAGCAAAACACAC---CGAATTAAAGTATACACTAAAAACGCCTGGAA
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ATCCCGATCTCTCGATCTCTCTCTATCAATATAGCTCCTAAGAAGAATTATCTAACTATCTAGCTTGCGTCATATATATGTATTTTGACTGTAGCCTATAAACTAGTCCTAGCCTCAGTTCTGGGCACATGCAGTGCATGTTCAATTTGTAATTGTATTCTAATAAC
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AGCAAATAAGTATATACAAAATTCCAGCTAAGCTTAAACAAAATTTCTTCGGACAATTGCATTGGAATATTGACCGCGTTGGCGGTGCCAATTG-TTTTTGTATTTTTTATATACATATATAAATGGTAAATATTTAATTCTTAACCCACAACATTGCCAACTGGGCAAACAAAATTCGAAACAAAACAAAAAAAAAAAAAACAAAAAACAAAAAAAAAAAAAACAATAAAAATAAACTATATATAAATATATGAAAATGTGTCTTGCAACGTTGAAACAATATTATGTA---AAACAGTCAATGTTCTAATTGCATTATAAAAATGTAACTATAAGTTTGTTCGTTGTATGCTTATGCTTAAATTTAATTTTTTCGTAAAACAAAACAAAAAGAAAACAAAACCAATAAAAATTATTATATTATATGTGAAAA
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GGAA---------CGCAGCT---CTTGGAATTATTTCATAAATATGTACATTTTTTCTATATATATA
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TGGAGATCGGCTGTCCCTTCCCCTTCGAATCCCTCTGATTTTGAATG----AATTCATAAGCAATAAAGGCAGCGCGACAAACGA
-----------------------TTAAAATCCTGCTAGGGTCAAATACAACAATTCATATGTATTAAAGGAAAAACAACGAAGGA
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GCACATATGACAGTTTATTATTAAATTAAAACACTTGTTATTGATGAATTAAAGTAACACAATTAATCATTAAACTTGTTTT
-----TAATTAAATATATAAATGAAATAAAATATTTGTTATAAAAAACTTATTGGA-------------CTATGCGTGTTTT
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>CycJ 3451057 3451637|3412 chr3L 3451564 3451825 scaffold_38 722631 722871 + 230|0 84
TATATATGTATTTAATATATATTTGAAATTATCTTATAAACTTATAAATAC-----------AATATGTCAAAAACTCAACAAAA
TATATACGACTCTAAAAAAAAATGTATATTTATATATAGATATATATATATATATATATATAAATATGAGCACAATTTAAATTAA
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AAATTAAAGCAGGTCCTCTCAGTGGATGGCGTACGTTTCTATTGTTAGACCAATATACGATCTACAACAAATATCAGCCCAACAACAACCCAGCTACACCCAGCAACTAAACAACCCACAAAACAACCCAGCAAACAACTCAGCAACAAATAACAACAACAACAACAATAACAACTACAACAACTACAATCGGCAGCCATAATGAAGAGTGTACGAAAAATAACAAGTTTTCTACCATAATTTGTCAAATTCTTGCTTCGATTTCAGATTGTAAATTTTAGTGGGCGTGCGAGAGGAGTGTGAAGCGGAAAATGGGGGAGGGGGGCGGCGGCAACAGCGGCAGCA------TTTCAGTCAAATTCGTGCCTGGGCATTAGTTAGTTTAGTTATTTAAGCTATCAACGTCGACTTCTTAGCGCCTTCCA-------CAATAAGGATACTCAGTTTAGTCAAATATTGTTTTGCGCAACAGGAGCACAGGAGTTTATTT-TTTTTTTGTAAATTTATACTAGAGCTATTTTTTCTGCAAGAAAACGTTTTTGTGCAAGTATTGTGTTTTC--ATTTCTCTAGGTTTTTGATTAAGCAA------AAAGCAAATATTCTAGATTTTTCTGTTGTGCTGTCTGTGTATACAAAATGAAAAAATCCAATTATTCCTTGTGTTTGTTTTT
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AGTTCCGATAAAGAAATCATCTAAAACCTCA---------TGCCTAACTATAGTACTTTCACAATTCAATAAATATCATAGATTCAGGTGTCTGCAA-ATGTCGCAAGCATAAACAGATCCTATTATATATATACATATGTGT---GAATGTGTATGCATATTCCT--TCCTTCGAACAACTATAAACTATAGCGTATATTTGTTGCAAATGTCTGTGAGAGTATTTAATTGTCGGCTTGCGCCGATAGCCAGCTCTTGATTGTTTCATTTATATACTATATTATTATTTTG-AACGCT-CTTTTGTCATTTAAAAGAAAAT---TTTGCTGCGCTGTTTAAGTGATACATTTTTAATTATTATTAATTAAAAAAACAAATAATAAATGAATTTATGTATAAAGCAAACAATTAAA---------------AAACAAATAAATTTAAATCATTTATACCGTAT-C
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GCCATCGGGCGGCGGCCCAACTGGCCCCAACAACTGCCATATATCAGGGATGCCAATGCCATGTTCTGTATACTCCAATCCCAATCTTGCAAACGTCAGGGTCTTGCAAACGTCAGGGAAGCCATGCCTAGCTCCGTATACTCTAATCC-CAATC--TTGCAGCTGTGCGTGCGCCTTGCATTTTAACTCGTAGCCCTTTAAGTTCGAGCTGTTGCGTGTGTGCGTATACGTCTGCTCGGCACTGTGTATTTATGGAAAATTAC------CCTAGTTAATAAATGTGTCGTGTTCTCTTGT
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GGATCGCCGGACATGCCACTGTACGGAGTGAACACTGTACCGT-----TTGTTGCTGAACTTGAA--AATGAAC------ATTGAATAAAAC----------------GCGAATTTCCAACTATTTGCCATTGCATTTGCTT
>CG32266 3774841 3775094|3855 chr3L 3775064 3775154 scaffold_6 688642 688750 - 1923|0 33
AATTAAACATACATAGCCATTG---ATTATCGAA
AACCAAACAGCTTTAAGCAGTGCGAGTTATTGAA
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A
A
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ATAACTAGGAGGTAACATTTAT---AAAATAT----CTATTTTCCAGCTATCTTACACATTGTGTGTTTGGTTAATACATACGACTATTATATTTAAGTTCACCAGTCTAGACTGGTGTATTTCGCTTATCGAATAAACAAATATTTATTTTATCAGCTGATAACATAGTT--AGAGGTT----------------GCATTTGATATGTTTCGATTTAGTCATACGCATAATTTAAAACTTCATGTAGTTTTAATTTAATTTGGGTATAATAAATAT-----AATTGATCGACTAA--CAATAAC
ATACCCTGGAGATAACAATTGTTTTCAAATTTGAGAATAGTTTCCAGTTGAAAACTTGATTATGT-TTTATTTACAACATTAAACAATT----TAAAAGTTATAA--CAAATGTGAGATGTTTCTTTAATCCTATACA-AAATAGGAAATTTAT-----------ATAGTTCTAGAGATTCTTGTGCAAGACAAAGACTTAAAATATAATTCGATTT--------GCCCTACTTAAGGTACCAT---------------TTTGAGGATAATAAACATTTAAGAACAAATTAACAAATACAACAGT
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ATATTGTA
>CG12006 3797157 3797499|3885 chr3L 3797203 3798234 scaffold_9 804257 805418 + 4363|0 337
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TGGTAAGACTTAATGCAACAGTTAGCCCTCCGTGAAAAGCAAACAAGTAACAAATTGAAATTATTAAC--TTTACGGCCTTAGGAACAGTTTTTAAAACGTTTTCG-------------------AAACAAGTTTTTTTTGTGAGTGAACGCGTTTTCTTTTTTTGTACTTTTGTGGTAGTTGATAATTTTCATTTTAACTCAATAGTTTTGTATTAGGCGAAAAGTGTCTAAAGT----GAGGCAATATATTTAAGCGTAAAGTAATATAATAATTAGTGTCATTTTTTAAGTTCTTTGAAATAAAGGTTCAGTAAAATAAAAGAAAATTCTTTTTG
>Scsalpha 3801532 3801915|3887 chr3L 3800141 3801969 scaffold_9 805419 807411 + 65592|1468 1973
A--TAATTAAAGGCCATAACCAAA----------------------CCGGAATCC-----GTACG---CCGATCAAAGCGTATACGCAA-ACTCATGATGATGAACCTAACGTTAAGCTAAAAGTGTC--GAAAATCGA----------------AATTGCATTCGAGCGAA--CCCAAATAAATTATTG---------------TGAAAAATTACTA-------GAGAGAAACGAGAGGCGT---TGAATTGTGACATGTATTCCA-AGAATTAAGTTAACT-ACTGCCGTACCACC---------------------------------AAGTTGAA-----CTAAAATAACTCGCACCAAAACCAAGATTTCTAAT-TGTTATTGCACTCGGCTCATTGTTTGTGTTGCGAACAGATTTTTGCCTTAATTTTAAATGCCTGCTCGAATTATCAATGCGAATTGTATCTGAATGTGTAATAAATATGC---ATAAAAACAGGAT
AGTTAAACCAAAACCAAAATTGAACAAAGTGTGACAAAAGAAAATGCCGAGGTACCACAAGTACGACTCAGATGAAGGAATATGCAAAGCAGTAAAGATTATTAACTAAA--TTAAGCAAAAAGTGTCCGGAGAAGCGAAAACAAACAAATAACTAAATGAATTATGTCGAAATCCTAAATAAATTATTGTATAATTCGCCCAAATGTGAAGTGACTACGAACAGTATAAAAACCAACGATCTGAACGAACTGAGCTATGTATTCCATAAAAATAATCTAATTAACTGCCGTACCACCTTTATATATATATATATATATATATATATATAAAAGTTGAAGAAGTTTAAGAAAATGCACCGCGCACCTAAGATTCGAATTATGTTGTTGCACTCG---CTTTGAATGCACTCAGAAAAGTCACCGAAATTTATTTTAAATATGCTTTAAACGAACGAAT---AAACAAATCTAAA---GTTGTAAACATGCAAAATAAAAATTGCAT
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ATCTGCCGCCCATTGAACAACTGGCGGACTCGCGCACCTTAAAATTCACACAAAAAACAAAAGAAACAAAAAAAAAAAAAAAAAACAAACGAAAAAAAAGAACTACATAAACATAACGGCATACCTAAGATAAATATAAATAGCAACCTAATCTAGTGGAACATAATGTAGTTGACAAAAACAAAAGAAAGCAAGAAGAAGATGAAGAGGAAACAGATAAAAGTGAAAGAGTGAAGAATGAAGAAAGTAGGAAGTAGGAAGTAGTTCATGTAACAGAGGGCGAGTACAGAGCATAGGAGCAAAAGGCCGCGTCGAGTTGGATAGTAGCAGCAGAGCAGACTATGGTGGTAGGCGTGAGGGGGAGGGGGGCGGGAGATGAGGGGGTTGCTGTTTAGCAGCTAACGGGACTGCAAGCTGAACCAGGCGCGTTAATGCAACAAAGTGTAAAACAATTGTTAAAATCTTCCGCAAACAACTAAAAAAAAAAAAGCAACA-------------------ACAGCAAAAAATCAGCCGGCAAAAAAAT--TAAAACTTAGCAAACTAGCTCGAGTAGAGAAACAAAAACAAACAGTAAAAGAAAGAAAAAAAAACACAACAA--GAACAACTACAACAAGAAA-----AAATGCTGTATATTTTGTGCCATTAAAAAATAGTCTTTAAAAATATATATATATATATATATATACATATGAAAAAAGAAAATCGAGTA-CCGAAGAAGCAATAATTGAACACAACGACGGCCCCACGGACGGCAAACTGGAACGGAACAACCAAC--CCGGACTGCGCTCCTGACGGACGAATAAGGAACTATACTAAGCT----------AGAGAATAAACCGTTATATGTTGCTTTAGTGCTGGCAAAT--------GCAGCATAG------CCAGTTGACCGTTACGCTTAAAGACTGACAGTCGTGTCCGATCGTA------CAGGCAAACCTCACACGTACAGTAGCTTCCGTTTGAATGTCCCCCAACGGTGTTATCGTAAAATATCATAATAATATGTATTATAA--TTGAAATATTTGTCATTTTGCTTTGGTGTGTTTAATTGAATGCGTTTTAATTATGTTAGAAATCTCAACCAAAAGTA--------AAGCAAAACTCCAACTGAAATGACCGACAGCACAGACACCCTA---CACTTGGCTCGAAA-----CGAGACTGCTGCCACTATTTTACTGTGGGCGTGGCTAGTACTATATATATACATCTATTTTGTATGGCAAAATTTGTAATTTGTAAAGCTCTTCGAGTTAA-TCTCACATGAAAAATGAAAATATGAACAAAAGCTCTCGAAAAAAAATCAACATCAATTCTGTTTCAAAATCAATCAATAATTTTGTTATTGAGTCAAATTAAATAAATATATATATGCGTATATATATTTGCCTATTACCAATTATATGATGATAAATTTTGTGAAATCTTTTAAATTTGAATTT---CCTTATTATGTTTA---------GAATTGAATTCTTTATGTTTTCTTTATAATTTCTGTTCCTTACGGCAAAGAAGCTGCAAACACACACACACACACACACATTAATTTTCGTTATTAATCATAAGTGGAGTAATATTGAAATATAAAAATATAAACATAAAATCAGAAATGAGAAATGAGAAAGAAATTGCGGTACGTAAGAGCCAAGCAGCTATACATTTATTGTTAAACAAAATAATTAGCTTAGCGTATAAATTACATATGTATATGTACCATTTAAT-ATATATAGGCAACTGAAACCAGAAAAACTAAATAAAAAAAAAAAAAAAAACAAAA-------------------AATAAA---
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CGCACAGAACCCAATGCATTTGAATGGCTCTAAAGCGGGTCTATACCCGACTCATG
CCCACAGAATCCCATGCATATGAATGGCACCAAAGGGGCTCTATATCCAGCGCATG
>Awh 3844423 3845229|3948 chr3L 3844143 3845443 scaffold_9 859195 860724 + 30601|292 1419
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AATCCTCCATGGATGAATTGTCGCAGGACTCGAGCGTTCACTGTATGCCCAGCGAGGTGTGACTGCAGCAGTCCTCGCCAGCGCGTGCTCATCGCTAGCTTCAATAAAAGAAATATACGAAAAAACTGAACACAATGATCAGTTAAAGCTATGTGCATCAGCTGGCTGTGGGCTGCTTTTAAGCAACAACAACAACAACAAAAACAACAACAACAAAAATAAAACGAAAAAACGTCCTTTCCTAGTCAAAATTTTATGTAAAGCGTCGTAGCAGACAGCAAACGCTCATATGAAATGAAAAACAAAAACAAAAAAAACAAAAAAAAAAAAACATAAAACAAAATATTAAAAAAAAAGTCGTTAAAACATTGCGAGTATTTCAACACATCGTCGAGGATCGTCAACAATCCATCAGCTGTTTGATGCTTTGAGCATCCGGAAACGCGCCCCAGTCCACATAGAGTCGGCAAAATCCAATATCTCATCTCAGAATACTACAAC--------------ACATACATTCCTGCA---TAGCCTATAAAACATAAAACAAAAAAACCTAAGCATAGTTTAGTTAATTTAATTTAAATGAAATTTAAATTTAATTTAGTTTAATGCC---TAATTGTTAAGTGTTTTGCTCTCTAACTATCCAAGCAACTATCCATCTCTCTCTCTTTCCCTCTCTATCTCTCTCTCGCTCTCTTGCTTCCAAACTAACTTTTAGTTGTTAGGGTATACAAAAAAAAAATGCAGCTGCTTGCCAAGGCTTTTGTAAAATATTTATA-GTATA----------------TATATGCCTATCATGAGAAATGTTGTTATTGTTTATTTTCTTGTTTTTTAAATGTATAAAAAAAGAATACCTATATATAAATATCTATATATAGACATA-TATGATATACATAC---ATATGTAACTGGCCAGGCATTTTGTACATAGTTGTAATAGCCGAAATTGATAAGCAACGCAGATTGATTAAATGAAAATGAAACTAAACTAAAACATTTAGTTAACACAAATTATAAACAACTACAATTAATGATGAATCGAAATCAATTA------------TAATGCAAAGAAAAACACACTTTTTAAAAACAATCG
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ACATG--------TACTGAAAGATTGGATATTTT----------------------------TGGAACTTCC--CATCAGGTGTCTTGA-------TTGCAATTGCACT------------GCAAATTCTGTATTGCAAAACAGAGTGTGATATGG-------------------------TTTTGG------------------------------TAGAGATACTATTTT-----------ATATAGCCAACGGACATG-------------------GAGCGGCTTATTA----------GAAATGCAGAATCGGTTCAAAGCGTTCGGCGATTAAACTATAAACTATTTT-------TGTGTAGAAATAGCTCCCAAAGCACCTTAAA--AAATAAAAAAAATAATAATAATATTTGGTCACTAACGCGACTCGAACTCGGAACTTCG-AAGCGAAGGTCGCACTCTCTAACCCCTAGGCTACGGCAGCGAAACTCTCGGGATAGCCGAGAT
ATACGGCAGTCACTATAAAACGCTTCGACGAATTCATCATACCCTCCCAATCCCCAACGTCATCGAACTTCCAGCATCAAGTGTCTTAAAATTTGTTTCCAATTTCTTTTATTTTTCATTAGTTTAATCAGCGTTATTGGAACGTGTGTGATATGGATAAAGAGGAACTGAGAGATAACTATTTTAGATAGATGCAGCGCAAAAAGGGTTATGCACACAGATACACTATATTCTTATGGCAATATATACACAACACATATACATAACCCGACCCGACCCCTAGCAATTTATTATAGTATGCTAGATACTCATTAACTATTTTCAATGTAGAGCGCTTACA--ATTAAATATTTGATCTAAATGTTTAGTAGCTGTAGACAATTTAACTTTATTTAAATAAACATAAAAATATTCATGTGTTA-----AATGGGATTCGAACCTAGTGTCTAGTGCGTTACAATACCAACTGTTATGCGCTGCGCTACAGC-TCGAGCGTTTCGCGGCGTACCAAAT
>CG1079 3877791 3878365|3989 chr3L 3878198 3880357 scaffold_9 898701 900839 + 82327|0 204
TCATACAAATATGTATTGTAGCAA-----------------CGAATTTTTTAAA--GCTTAGTTTCTCAGTAGATTTACCACTACTTAACTATAATATGCCTTAAATTCTGTTGACTAGCAATATTTTA----------------GGTATTTCTATTTTGTGGCACAGA--ACGAATATCAAATAAAAGTGCAAAATTGTAACAT
TCACTCACATTGCTGTGTTAACAAGGGCATTTCCCATTGGCCAATTGTTTTAGACCGTTTAATTT----GAACATTAATTTCTGCTTGAGTTAAA---GTTATAAAGCATTTTGGTTAAAGCAATTTTATTTAAAAAAATGTTCGAATGGCCTTTTTTTGTGGCATAAATAACAAATATTAGAAAATATGTTTCATTTGGCTTGT
>CG14977 3880888 3881034|3990 chr3L 3880472 3882670 scaffold_721 3673 5823 + 65844|447 613
AATCCGTCGTCGGATG----TCCGACCCACTTGCAGATTCTGTTGGCAAGCAACCGGA---------CAAAGACCCCA-------CAATTGGCGCACTCCCATTATTTACCTAATCCTCCTCTTTATTTGTCAAAAAATACATCATCTGTGAGCTCTTGCTCGAAAA
AAACAA-CATCGGACGCAGATCAGCGCTTGCTGTGGTTTCTGCTGGCG-GCAGCCGGAAGCGAGAAACACAAACAACAGCAAATACAATTGGAAAACGCCCTTTATTTATCTAATTCTATTGTTTATTTGTCAAAAAATACATCATCTGTGAGCTCCTGTTCAAATA
>Sc2 3888421 3888565|3996 chr3L 3888023 3888900 scaffold_153 4147 5022 + 20232|402 559
GTTG------------GATGTGGGTATCCCCATGACGCATTCGCTGTATTACCTATTCCACATTATACATTTACACATTTGGCTAGCGTTTAACAGGGTAGTTGTCTAG-TGAACTTTGTGCTTTCGTTGATTTAAAGCAAATACAAATTGGAGAAGC
ACGGATTCATGAACAAACTGCATTTGCAGCTACAGCGAAAACGCTG---TACTTATTCCAATTCATAAATT---AGAATTAATTAGCTTCGCTAAATATAAATGGGTAGAAGAACTATGCATATTCGCTCAACAAAAACAAATACTTTTTAGGCAAAC
>ida 3891285 3891440|3997 chr3L 3888910 3892070 scaffold_153 5237 8417 + 115422|2388 2621
TTT------CCGTCTGTTGTTAAATTCTAAAT---------------------------AAACTTGTTCTTACAA--------------------------------CCTAAGGAATCTCAATCT-------TACCTAAAGTTTTTCAATTCACAAGCACACAGCTGAATTATT-----TTGACTATTAATAAACGTA-GTTTTATTAATTGGTTTAAACCGCAGTGGTTGCTT
GGTGAGCGAGTGCCAGATATAATATTTAATACAAGTGCAGAGTAATGGGACAAAGGACAAAATTTGTTCGTACAATGTTTGCTTAATCTGAACTTCTTCAGCTATTTCATGGAGCAGCCCATTCCGCGTGAGTACCTGGACGCGTACGGTCCGCGAGCGAGTGGACACATTATTGGCTGTTAACTCTTAATAAACGTATATTTTATTAATTTCTTTAAACATTAATTGTTAGAA
>Eip63F-2 3918546 3919387|4028 chr3L 3918560 3918693 scaffold_105 12039 12190 - 4444|0 161
GCTCTTTATAGATTTCCAATGTAAATATTTACAATGTTTATTTTTAAACCA--------------------------TATATGTACAGATATA-ATATAGATGTTTGTAGTACATCGCGTATGCAT-GTTATGATCGTGCCAGATAAATATTATGAAACTTT
GCTGCTAATATTCGTTCAATATAAATATTTACA--GTTTATTTTTGAACAAATTGTACAAAATAGAACTAATAGTTGTATATATACAGATATATATATATATATATATA--------TATATATATCGTTATGATCGCGTTAGATAAATATTATGAAATTGT
>Eip63F-2 3918546 3919387|4029 chr3L 3919010 3919120 scaffold_105 13026 13156 - 1804|0 132
GCACTTACAGCGAGCGGATTTTCACTGATATCCTCTGGGTCCGCAATCTTGG----------------------CCAATTCGGAACACACACACACACTAATGGATTTGCGATGGATTCGAATTCGAATCCCG
GCACTTACGGCAAACGGATGCTCGGTATTTGTCTCCGGATCAGCCAATTTGGCTCAAGATACGCGACACTTGGCCCGCTTTTAAAAACACACTCAAAAAAGTTTAGTTGAATTG--TTCAAATTAAAATGCAG
>Eip63F-2 3919455 3919524|4030 chr3L 3919455 3919586 scaffold_24 1412045 1412164 + 1758|0 69
TGCATACATATTATAAACAAATGCTTAATAAGTAAATATCAAATTACGATATATTTGGTATATACTATTT
TGGAAACAAATCA-AAACAAGTTCTAAATAAATATTTAAATAACGAGAATAAATGTAAAAAACACCAATT
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GAAT-CGCCGG
GTATGCGCCGG
>CG10853 3932143 3932217|4044 chr3L 3931707 3932188 scaffold_105 22372 22803 - 8630|447 492
AGGACCCCGTTCGGTGGCGAAAATGTGCTCACATTAAACCCAATAA
AGAGCT-------AGCCCGAAAATGTATGCACATTAAACCAATAAA
>scrt 3971591 3972121|4090 chr3L 3970023 3971714 scaffold_105 56995 58608 - 75865|1653 1776
GCATAGAATACATTGGGCGCGCTACAGAAATCTCTAAGGACTTGAAGCCAAGTCGCAATCCGGCTCGGGTGACCAGACTTAGACATCTCTGTTGCACAACCGATAAACAGAAGCGGAAGGATGT
------------------------CGCAAAT------GGAATCGGAG--GAGTCGGAGTGGGAGTTGGAGG---------CGTCAGCTATGCCATGTAAATGTTGAGTAAGTGTGGCCGAATGC
>scrt 3971591 3972121|4091 chr3L 3971735 3972736 scaffold_105 58618 59510 - 16240|0 435
TAGTTAATTTACCGTTAAAGTT------AAAGTTACCGTTACCATTTACAACTAGGT----------------TAACCGATAGCCGTTTTTATAGAAGA----------------------TACAT-----ACATCACAATACGTCCAAGAGCAAAGTGTAGTAGAGTAACACAGAGACTGTAGAAATTCGCATTAGGCAGCCAAGCAACAAAATACTCAATGGGTGTGTTTTCAAAATCTGTTATTTGGTTTGCGAACTCATTTTTTTAAAAGGTGCCTCTAAACGTATGCAATGGAAATATCCAAATTCATGGTCAGATTTTGAAAACAACCCCATAATAACCAACTCAAAATGGTTCTTCTTTTAAGCATAAGTGAGTTGAACATTCCTAAAAACCAAAGCATTCCACAAAACAAAAAAAAAAAAGAAAACAA
TAGTTAATTTAAAGTTAATGTTAAACAGAAAGTTATCGTTATCGATTACTGATCGATAGCCGTTATCGTTATCGAACCGCTAGCAGTTTTTATGAATGAAAAGAAAAGAAAAAAATACGATTACATACTTGACATCACAATACGTCCAAAAAGCAAGTGTAGTAGAGTAACACAGAGACTGTAGAAATTCGCATTAGACACCTTAGGCAGCAAATAC------------CTTTAAAAA---------------AAAAACTAA-----TTAAAAAAAGTATTAAAAT-----------AAATATAAAAAAGCGAAAACAAACT----AAATACACTTAGCGAAACCTAATC----TCGTTCTTCTTTTAGTCTTAAGCGAGTTGAACATTCCTAGG------------CCCCAAAAAGAGAAAAACACAAGAACCTA
>CG1134 4006473 4006598|4125 chr3L 4006351 4008299 scaffold_8 4796177 4798181 - 78087|122 262
-----GAAC-CAACGAAGATGCCAACAAGATCACCTTGTACCTGTGTGCGCCAAACTTTTTATTTGTTAC--AATGCTCATGTACGGCATTTATTTAAAATT-ATTGAAAGTCTTGACA--TCGGAA----TGAAAAAAAA
TTGTGGATCTCAGTCAAGAT-------AGATCAACT-GTACCTGTCT-CACCACAAGTCTT---TGTTACCGAGTGTGCA-GTTTTACATATTCATAAAATTCGTTTCAAGTGTTGACCATTCAAAAGTTTTGTGTGGAAT
>Gr64d 4017116 4017384|4135 chr3L 4017068 4017224 scaffold_8 1095420 1095584 - 3797|48 173
CCCCTCTTAGCACTTCATTTTCATTTATATATGCGCCATAAGTCCTTCTACG-------TCGTATTTGCAC-AAGATTATGCACAGATAAGCACA---------CAATTGGCATGGGAGCCAACAA
TACT-----GCACTTAATCCTATTGCATATTT----TATAAAGCTGTCGGCGAGCGAGCTGCAATTTGCACAAAGATTGTAAACAGATAAGCAAAACAGATATTCAATTGGCAGGGCTGGCATTAA
>Gr64d 4017116 4017384|4136 chr3L 4017279 4018888 scaffold_8 1095651 1097292 - 41906|0 105
TTGTCAGTCGAGTACGGAACATGGCCAGGACCACTGGGGATCCTGCCAAGCGACGCAGGTGCATGTCTCGCATCAAGTTCTGGCGAAGATCGCGCGTGGGCAGCGA
TCAGCAGTTGGGCATAGGACATGGCGAGGACCATAGGTGATGCGACAAGACGGCGCAAAAGCGTGGCCCTCATCAATTTTTGGCGGGCGGCACGCGTTGACTGCGA
>Gr64d 4017469 4017509|4136 chr3L 4017279 4018888 scaffold_8 1095651 1097292 - 41906|195 235
AGTCGTTGAAAAAGATACAAAGCGATTTAAGCTTTCCTTGA
TGCAGTGCTTAAGCATAAACCGC-------GTGTTCGTTGG
>Gr64d 4017565 4017639|4136 chr3L 4017279 4018888 scaffold_8 1095651 1097292 - 41906|291 365
TAAAAGCTTGGCTTCTTCGCATCAGACAGGAGGATTATAAGTACAGTGGATCTTTCCAGGAAGCCATCAAGCCTG
TCAAAGAAGTGCTGCAACGCGCCAATCGCGAGGATTATGTGCACAACGGTTCATTTCTGGAGGCCATCAAGCCAG
>Gr64d 4017696 4018082|4136 chr3L 4017279 4018888 scaffold_8 1095651 1097292 - 41906|488 880
TCCTCATAATCGCGCAGATCTTTGCTTTGATGCCAGTTCGAAAAGTGAGCTCCAAGTTCGCAGAAGACCTAACCTTCACCTGGTTCAGCGTTCGATCCTATTACGCCCTGGTAACCATCCTGTTTTTTGGTGTTAGCTCTGGATATATGGTGGCCTTTGTGACAAGTGTGTCCTTTAATTTTGATTCGGTGGAGACCCTGGTCTTCTACTTGTCCATATTCCTTATCTCTTTGTCGTTTTTTCAACTGGCCAGAAAGTGGCCAGAAATAGCTCAGTCATGGCAGTTGGTGGAGGCCAAGTTGCCGCCTCTGAAGTTGCCC------AAAGAGCGCAGATCCCTGGCGCAGCACATTAACATGATCACCATCGTGGCCACCACTTGCTCGCTGG
TGTTAATCATTGCCCAAGTTTTTGCTCTAATGCCTGTGCGCGGCATAACTTCAAAGCATGCGGAGGATTTGAGTTTTAGCTGGATGAGCTTACGCTCTTGTTATTCGATGATCGTCATCGTATCCTTTGGTATCGTGTCTGGTTTTATGGCGCTGTTTGTCATGCGTATCAACTTCGATTTTGACTCGGTGCAAACTTTAATCTTCTATGGCTCCATATTCGCTATCTCTTTGGCCTTCTTTCAGCTGGCCACCAAATGGCCAGCTGTTGCCTTGGAGTGGCAGATGGTGGAGTCACAGCTGCC------TAAATTGCGTACAGAGAAAGAACGCTCTGCATTGGCTTTTCATATCAGAATGATTATATTGATAGCTATGATGTGCTCGCTGG
>Gr64d 4018143 4018417|4136 chr3L 4017279 4018888 scaffold_8 1095651 1097292 - 41906|946 1220
TGGAGCACATTATGAGCATGTTGTCCATGGGCTACTATGTCAACTCCTGTCCCCGATGGCCAGATCGTCCCATAGACAGTTTCCTGTACTTGAGCTTCTCCTCGGTCTTCTACTTCGTGGACTACACACGCTTCCTGGGCATTGTGGGCAAGGTGGTCAATGTGCTGAGCACCTTCGCCTGGAACTTTAACGACATCTTTGTGATGGCAGTTAGCGTAGCTTTGGCTGCTCGCTTTCGTCAGCTTAATGACTACATGATGAGGGAGGCTAGATTG
TGGAACATATCTTGAGCATGCTGTCCAGTATTTATTATGTGAATGCCTGCCCTGTGCTGCCGAATCAGCCCATCAACAGCTATTTATTTATAAATTTTTCAATGTTTTTCACATTTGTCGACTACACTCCATTTCTGGGTTTAATTGGGAAAGTGATCAATGTGCTGGCCACCTTTGCCTGGAGCTTCAATGATATATTCGTAATGGCCGTCAGCGTTTCTCTAGCGGCACGTTTCCGTCAGCTAAACGACTATATGCTCAGAGAAGCCAGATTG
>Gr64d 4018476 4018630|4136 chr3L 4017279 4018888 scaffold_8 1095651 1097292 - 41906|1283 1437
CCCACCACTGTGGACTATTGGATGCAGTGCAGGATTAACTTTCGCAACCTTTGCAAGCTGTGCGAAGAGGTGGACGATGCCATATCCACCATTACATTGCTCTGCTTCAGCAACAATCTGTACTTCATCTGCGGAAAGATCCTAAAGAGTATGCA
CCCACTACCGTTGATTACTGGATTCAGTGCCGCATTAATTTTCGGAATCTTTGTAAACTCTGCTCAGTTCTGGATGATGCTATATCCATTATAACACTCTTATGCTTCAGCAATAATCTCTACTTTATATGCGGCAAGATCTTAAAGAGCCTGCA
>Gr64d 4018697 4018859|4136 chr3L 4017279 4018888 scaffold_8 1095651 1097292 - 41906|1509 1671
GGCCAAGCCGTCTATATGGCATGCCCTGTACTTCTGGTTCTCGCTGGTCTACCTACTTGGTCGCACCCTCATCCTGTCCCTGTACAGCTCCAGTATAAATGATGAGTCCAAGCGACCACTGGTAATCTTTCGATTGGTTCCCCGGGAATATTGGTGCGATGAG
GAAAAAACCATCTGCATCGCATACGGTATACTTTTGGTTCTCGCTGGGCTATTTACTCTGTCGCACTTTAATACTCTCGCTTTATAGCGCCAGCGTTAATGATGAATCCAAGCGTCCATTGCGCATCTTTCAGCTGGTACCCAGGCAGTTCTGGTCCAGTGAG
>Gr64d 4018917 4019006|4137 chr3L 4018909 4020661 scaffold_8 1097592 1099369 - 45677|8 97
CTAAAACGCTTTTCGGAGGAGGTCCAAATGGACAATGTGGCTCTGACTGGCATGAAATTCTTTCGGCTAACACGCGGCGTTGTCATTTCG
CTCAAGCGCTTTTCGGAGGAAGTGCACATGGATCAGGTGGCCTTAACTGGCATGAAATTCTTTCGGCTTACACGTGGCGTGGTCATAGCG
>Gr64d 4019067 4019240|4137 chr3L 4018909 4020661 scaffold_8 1097592 1099369 - 45677|181 368
GTGGCCGGCACAATTGTGACCTACGAACTCATTTTGCTGCAATTCAATGGCGAGGAAAAGGTGCCCGGCTGTTTCGAAAACTGAATTTT--------GTGGAAGTGGCAGGG-----GGTTAAGTCCGCAAAATATATACTTTGTTGCTGTGTTGGTCC-TTAATTATAGATAAGTGCAAAACAACAG
GTGGCTGGCACTATAGTTACCTATGAGCTGATTTTGCTGCAGTTCAACAAGGAGGACAAAGTTAATGACTGCTACGAGCACTAAGCTCTCGAGCCCAACGAAAGTTCCACAATTATTAGTTTTATTCGCAAA-------------TGTCACGTTAAACTATCAATTATACATTAGTGCAAAACAACAG
>Gr64e 4019151 4019240|4137 chr3L 4018909 4020661 scaffold_8 1097592 1099369 - 45677|265 368
ATTTT--------GTGGAAGTGGCAGGG-----GGTTAAGTCCGCAAAATATATACTTTGTTGCTGTGTTGGTCC-TTAATTATAGATAAGTGCAAAACAACAG
GCTCTCGAGCCCAACGAAAGTTCCACAATTATTAGTTTTATTCGCAAA-------------TGTCACGTTAAACTATCAATTATACATTAGTGCAAAACAACAG
>CG1136 4042262 4043197|4150 chr3L 4038685 4042272 scaffold_8 1119205 1122890 - 43587|4026 4036
ATAGTAGAGAA
ACGTGATAGGA
>CG1136 4042262 4043197|4151 chr3L 4042616 4043297 scaffold_8 1122967 1123733 - 5912|0 699
CCCGACTCACTCAACGAGGCACCAAAACTAACCGTAGAACCTCAACC--------------------------AAGGGGAATCCCCCGACTTACGATTAACCTGTACATATAACCACGCTCAAAGCTTT------------CCTTTCTCAAGGTCCCACTGTTTTTTTGTTTTTTCTTTACTGCACG-----------CACACACACAC------ACAAAGAAAACGA-CATCTGTGTTAATTAATT-TAATGCTTAATCACATCCAAATGTAACATAATTTATAATTCGAAACACTGTGCAATTAGCGCTTAGAATAAGTT------------CATTAGGGGTACTCACTGTCGCACACGAAATGTAGATTGTGTAAGTGATTGGGGAGAAATCGATTCACGTATTAATCTTGCCATATTAACAAAAAGTAAATTAATA------AAACACTCTGTTCATCACTTGGAACTCCCCATTCTGCCCCTTAGCGTA-------------------------ATTTATATCAATAAAAATAACTATAGC-------------CGGTTTTTTGGCCAATAGCTGTTCATT-TCCGAGGAATGAATACCCGTTGCCTAAAAAC-CTTAGCCATGTATTGCGAAAAATGTTATTGTTAAGCAGTTTGAA---GATAATAAAAACGTATGTATTTAAATTATAAATA
CCCCACTTCCTTCACAAAGCACCAAAACTAACCGAACAGCCTCAACTTTAGAAAGAAGTGACTAGCGCCATGTGAGGGGTGTTCACTCACTGAAAGTACTTTTTAAAATGGGAAATTTTCAAAAGCGTTAAGCAGTGAATACCCTTAATGGAAAGGCATCACTTATTAATCTGTACATAACCACGCTTTAAACATTTTCACAAACACACGACAAAACAAACAAAACGAATATCTGTGTTAATTAATTGTAATACTTATATATATTTA----TAACTTAATTTATAAAT-AATCCATTGTGCAATTTGCGCCTAGAATTAGTTAGACTAAAGTTTCATTAGGGACTTTCACGGTTGTGCAGTGCCCGCAGCTGTTGCAAA-------GTGAAAATAGTTTCATTTATTAATCTTGCCATATTAACAACACGTAAATAAACACTTAACAAACAC--------ACACTAAAAGCCACCCACACACTCACATA-CATACACACACACACACACACACACACACACACACACGAACAAGCACACCTAGAATTAAAATCAGTGAGTAATTTCTTTGCCAATAGTTGTTCATTATGCAAATCACAAAAGCAAAGTATATATATATATTTTATTTCGTGTTGCGATTCGATTTCTTATAAAAAAATGAGCACCCGTTGCCAAGAAGTTAT-------AGCAATAACAA
>CG18869 4045384 4045455|4152 chr3L 4043385 4048475 scaffold_8 1126177 1131269 - 95276|2066 2142
ATGTTTGAATAATACTGTTTCATGTACCAAATAAGACT-----GCGAATAAATAATTGTAAAGATCTCGGCAACATC
AAATTTTAAAAACAAAGTGCTAACAAATAAATCAACCTTGGCAAGGCATAAAACGTTGTA----------CGAAAGA
>dib 4047627 4047834|4152 chr3L 4043385 4048475 scaffold_8 1126177 1131269 - 95276|4380 4647
GGTTATTGGGTATAAGTAAGTCGCCAGAGCATTAAGACTGAGAAACTAGACTCGTGTCACGTTTAAATAATTCGTTTATTAATT-----------ATTTTAAATTAGCTCATAATTAAT-----TATAATTAGTGTAAATTATATATAACTAGACTTGCATTTTATGTGA--------------------TTGAAAGGCTGTGGGTGTTTTGGTCT--AAGTACTAAAGAGA----------------------ACGACTAAAAGGCA
-----------ATTAGCAATT---CAAAGCCGAAGCACCGAGTGGCT--ATTCGTTT--------AGTACATTGCTTATTTACCTTAAAAAACGAAGTTTAAATAAACTTTTATTTAGGAAATATATAATTAGTGTAAAT--CATATGACTAGCGTTTTTTTTTTTTTTAATATATTTTATTAGTTATATTTGAAAGGCTGCGGGTGTTTTGGTCTACAAGTACTACAAAAAAGATCTCCATGTTTGATAAAATACAATAGAAAGGCA
>CG14989 4074194 4075209|4175 chr3L 4073959 4074320 scaffold_8 1165874 1166209 - 7157|236 386
GCGATCCCCACCTTCCTGAGGGGATCGCTCCCGATGGAGGCGC-TAAATCACAAAACCATATATATGGATCGAGAATTATCTGATTATCTG---------ATGTTTTGTTGTTCTTCGTT--------------TTTGAACTTCAGTTAGT
GC---CCACAGCTT-----------------AGATGAAGGTACATAAATCAC--AACTATATA-ATATTTCTGTTGTTACTTTGTTGTACACTAAAATATACATTTTGATTTTCTTTGCCGCACTCTGCGACAATTTCCGTTTGTGTTTAT
>CG14989 4074194 4075209|4176 chr3L 4074321 4074466 scaffold_9 1343615 1343765 - 1928|0 159
GCTATTGTTGTCATGAAAAAGTATCTCCCATATATAATCTATAT---------CGGAAAACGTGTTACGAAAGTTTAGTTAAATACTGTAAAGAGATAAAAACA-----AAAACTATAGAAAAATCAAAAAAAAAATCAAACAATTCAATATAAATAATA
GCTACAAGTTTCATGTGAAA-TGCTTCCCTAAAAAGAACAATATTTGAGTTCCCAGAAAAAATGTTATGGAA-------TAGACG-TATAACTAGTGCAAGACATGGTTAAAACCATAGAAAAATGAACGAAAAAATATAAACCTTAAGTGTAGCTCATA
>CG14989 4074194 4075209|4177 chr3L 4074467 4076237 scaffold_8 1166321 1168234 - 24086|0 835
CATAGAGAAGAATATACGATGAGGAGGAGGAGCAAGCAAACAAAAAAAATTCCCTATGCGAATCAATTAATTTGTAACTAATTTCAATTACAACTAACTATAG----------------AAAAGCTATA------------------------GAGTAAGCAAGGGGGGGGACTTTACCCCCCACACTC--------------------GAGAAACAGC-AGAATCAC-GCAGGGCTTCCAGTGCGTCG--------CCTCGGAGGATGAGGATGCCCTCCCAAAAGGCATCCGAAATCCCCGGGACGGACACAACCCGTATTTAGGTGATTGGTCAAGGAATTGGAC---TGAGGAGACACAAGAAGAGATATATGAAGATGAACAACCAATTAATATC-AATGTACACAACATATCGTGCGGTAAACACTAC--CCAAAATCAAAAAACA------AAAAAAAAAACACCCAATCACATTTATTTGGAATACACCTTGGTTCGATGGAATCAGCATATCAATTT-ACCACGAGGCAAAAACAAGTTGGTATCTAAAGAATTTCCTTTGTTTTGGCTTACAAGTTATTGGCGAATCTAAAGCATTG-AGATATTTCAAATCAGCATCAATTAGGAGTGTCGCAATTAGGCCAAAGTGCCAACCAAGAGTTTAGTGTTGGTTACGGCCCTTAAACGCAAAAGCAACATTTATAA---AATATATACTTGTACTTACTAACGAATA-ACACATGTAA-----TTGGTCTATATATATATCCACAAAATGAGTTGCGATTGCAAATCAGAAACTCAGACGGGCTATACTGGATCTACC
CACAAGGCCGCC---------------GCGAGCAAAAAACAAAATGAAATTCCCTATGCGAATCAATTAATTTGTAATTAATTTCAATTAAAAACAAATATAGCAAACTAAATAAGCAAAAAAACGAAAAAAAACCAACAAAAAAAAAAACACAAATAAGCAAAACATAAAAATCAATACTTCAAAATTAAAGTTCTCAGCTCGTAGGAGAGAAACAGCAAAAATCACAAAAGGGCTTCCAGTGCGGCATTGGCATCCATGGGATACTGTTAATTCGGTT-----AGCCAGATGCAGATGTCAGCACAAATAAAACC------TAAG-GATTAGTTGTAGCATCCGCCAGTTGTGCGGAGGGATGGAGCAAAGCGTAGAAAT-CACAACCAATTAATATCAAAAATACACAACATATCGT--CGTAAACCCAATTATTTACATTAAAAAACACGCTACAAAAATAAAAAAATAAACTATTATAATATCAATTTTTGTTTAATT-AATGGAATCAGCATATCAATTTAACAATGGCAGAAGAAAAAGTTGATAAACATTAAATTTTC--------------AAAAATAT------ATCTATAATTTTGTCTAAAATACAAATCAGCATCAATTAT--GTGTAACAATTAT----AAATGTTAACCAAGTGTTTAGTGTTGGCTA------TTGAAC----AACCCATATGAATGAATCAATATATATATATGCATACATATGAATATACATATATAGCTAATTTGGTCTAT----------AAAAAATGAGTTGCGATTGCAAATCAGAGGCTCATA----TTAAAGAAAAGCGACC
>CG14990 4077806 4077876|4180 chr3L 4077827 4078889 scaffold_8 1169143 1170285 - 15101|0 54
TTAATAATACATTAAAATAATAATACTCCTCGAAAGAGGCCATCT-----TCTGT
TCAAAAATACACTGAACGAACCATTTTTATGAAAACAAAATTTCCATTGCTTTGT
>Fit1 4089919 4090653|4192 chr3L 4087451 4090015 scaffold_8 1178752 1181303 - 123367|2528 2626
ACGGATTGGCGCAGTCTGGAGCATTGGACTGGAGTCTT--GAGTGCCAAGCACAAACCTCGTCGCATGTTCTACAGTTTTATCTACATATATTTACCTA
GC------TCGACGTTTG-----TTGGCCT-CCGTCTTACAAGTGCCAAGCACAAAC--TGTCGCATGTTTAATG--TCTATCTGAATTAAATAATTTA
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AA
AA
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T---------------GCAAACAATTAAGT-------------TTTATTTAGCTGTAATTAAATATA----TAATTAAGTGTAAATTAAA-TAT
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TAAGAGGATATAGTC------TAGTCTAGCTACAATAGTTTAGCTCTTAACACAA--CATGACATGGCGATGGATATTGATGCGGACACGGACACGGATACGGAAGTACACGTACACGCACAGACTCCAAAG-TTAACCAATAAGCGTGAATGTTTATCCAATAAGAAAGCACACATGATTTAACAAAATTAT
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A----CTCAAAGAAGGTTTGAACAATAAAAACTGAAC
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AAATTTTAATTAATTTTAAACTAAAGAGAATATCAATAGGATTTTGAACTTTGATAACAGACCGCTGTTAATAGCATTTATGCAACAGTTAGAGCCACTGTTAGCAGTCGCTTCGCTCTATTCGCTGTTAATAACATGCATGCAACTGTTAATGCTGTGCTCTGCTCCTGATCGCGGTTT-TCCTGAATTGAAACT
>CG7447 4385443 4385785|4483 chr3L 4384462 4385579 scaffold_9 5081077 5082230 + 52742|991 1179
--------------------------------------ACAGAACTGCATTTCCCCACGCT------------ATTATTAAATGTTAGTTAACTTAATTGACCACTCCGTTCATGTGTAGC--TAGATGCTCCTGCTTGTAAGCCATTCCCGAATGCGAGTCGAGTGCCTCTGTAGTCTGTAGAATTAG
TTGAACGGGGGGGGGGGGGGCGTGGGGCCAGCGCCAACACAGAACTGCATTTTATTACGCTCTAGAAATTAAAATGGTTTAGTTTAAGCTAAAGAAACTTATCTATTTTCGTTTGTGTAACTGTAGCCCATCCCGCTTGTAAGCCATTCCCGAACG-----CAAGTGCCTCCGTAGTTTATAAAAAGAA
>CG7447 4385443 4385785|4484 chr3L 4385597 4385778 scaffold_9 5082244 5082394 + 2066|0 185
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TAGTACTTAAGCG----CACGTGTCATAAATGTATGTATTAAAATCCAATGCTCTAGTTGTAA--------------TCTGC-----------TATGTGTCTAGTATTTGTATATATTTAAATATATATGTATCT-GTCTTTATATATATAAGAGTGTGGCGC-----TAAATATACTTTTGTATT
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>CG11347 4402504 4402865|4501 chr3L 4399417 4403341 scaffold_9 5100394 5104189 + 66945|3318 3752
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>nAcRbeta-64B 4417939 4418598|4520 chr3L 4417074 4418595 scaffold_9 5123072 5124509 + 60270|865 1562
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AGGAATTATCGCTCCAGCCATTTTGCGGC--AACTAAAAGGTTA--AACATTGC-AACATTGCAACAATAAACGAAC-----------------GTAAATAATA-----CGAAACGAGTTAAGCGGATTTTTAGATTTTAAT--------AACAATAATTGGCACCTTCTAGGGC-----TCGCAGCAAAACAAGTTAATAACAAATAAATTTAAAAAAAATATCT---------CATTAAACGCTTCACATTTAGGCATAGAAT-------TCATACAAAACAAATCAAAAGCAA-----ATTAATCAATTAAAAAGGCAGGCCATAAAGAAAACTAGTGGAATTGTGAACAGATCTTTTATTTAATATATAATGTGTGAGTAATTGACTAA-ATAAATA-ATAGAGTT-GGTTTAGTTTAAGCGCAATAAACTCTGATAACTTGACGGTTTTC--TCAGCTTGTTATGTT-----AGGCAATTAAGTA-AAGCAATT-------------TAAGATTTAAA------------CTAAACACAATTTGTAAATGCTTCACGCACAACAATGATAAGCAAAGAAAAC--TTCAATGGAAAAATTCAAAACAAAAGCAAACACACACCAAAAACCTGTAGACACAACACCAATGCAAAGCCAAAAACACGAAAACTTATAAAAATGCAAAGTTAATTAA
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ACAC-------AAAGTATTCTAAGCCTAAAACAGCCC---AAAACAATTTTGGAA-CAGTTG--CTGCCAATC
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AGATCAAAGTACAAAAAGACAAATGAAGTTCAGAAGACGAA-ATCGCATCGAAACAAAGTATTTAGTTATTGTTGAATTGC------AAACTCAAATAAATAAAGATAAATTATTT
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GCTGCATCCGGCCTGGAGGAGCAATACGATATTGATTTGCGTGGTCAATTCTAAAATATTCCGTCTTCGACGTCAACTGGTTTGTGGTTTAACCCAGACCGCAAACTATATTCAAATGCTAATCGCCC------GAAAAGAATTCTTTAAACGC-------AGAATTATTT-------CAACTT-----AATTAACATTTT-----ACCAATAAAGAGAAAACACAAAACGAACCATCTATAGAT-----ATAAATTTAATCAAC
>CG11349 4455872 4455942|4557 chr3L 4452764 4456107 scaffold_40 30448 33561 + 32813|3372 3445
GTATTTTA-AAACAGAACATATTATA--ACATAAATTAAATCATACTTATCAGCATTTGCTACAAGAGCATACC
ATTCCGTATAAACTGTCAATTATATATTATATGTATTTCAAAATATAGAACAGCAATTGCTGCAAAAGCACAC-
>CG7465 4462223 4462334|4566 chr3L 4461977 4462374 scaffold_40 41546 41980 + 12514|282 400
ATCATCCGAT-AAAGGCTTCACTAGGTGATCGAATTGTGCTCATTTTTGAGTGCAGACCCTAC---TATTAGAATACCTC--TTTTTCATTCA-AATACAATAATACGATAACGAATCC
ATCCTCATCTGAAATGATTCACTAAGTGATCGACTTGTACTCATTTTGGAGTGCAAGTTAAATATACATAAGAATATTTCCTCTTTTCGTTCATGAAATAAAAATATTACGAAACATAA
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AGATG-CTAGCCCTAAACTAGATCGTTAAGGTCACCGCACACGCCTCCATCTGACAATTGTGATTGCTTTCATGTACAACTAA--TCATTATTATCGAATCACTAAACTTAGTC---TTATCTTAGTCAATGTTACTTATA
AGATGCCTATTGCTAGTTTTAATTATAAGTAT-----ATAACGCCTGCATATT-CAATTGTGATCGCTTCCATGTACAACTCACTTTATCATTAGC------CTATATTTAGTTGTATTATATTTGTAAATATATTTTTTA
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CTT--CAAGCATAAATTGAAATGAGAGTTTGTTTTGGCTGTTTTTTTTTTTTTTGCC--TTTAGTTCAGGGTTTTTCTTTTAAATTAAGTTGTTAACT--TAGGCTCTAGCAA--TTAGATTATGAATAAATGAACTTAGTTAGCATTTGTCAGAGGAGAAGGGAAGAAGATGAAGTGAAGAGAAGAGTTCAAGTTAAAGTCAAGTGAACCACCAACCACCTGCCTACAATCATTCGTATATCATATATGATAGCATAACTGAAGCATTACGATAAAGCTAACAATAAGACAAAC---ATTCAAAAGCCTCTCCGGGTGATAAATACACACACACACACACTCACATACTGCTACATACACACATTCGTA---------------TATGCGCATA--TTTAAGCACAACTCTTAAAACTAAGCAACAAATGCAACAACAACAACAACAACAATAGCATGTAATAACACCAAGATCTTAAGCTAAAAGTGTTTTAATC--TGAATATTTAATATATATATATATATATATATATGTGAATATATATATAAAGAAATGTAAAACTCTAGCAAAACATG-----ACATAGCGAAAAACAAAATGTTTAGTCTGATAAAATGTAATAAATTGTTTAATTTATTATGTATATTAATGGAATGTCATA--TGGAAATCTGTTGAGCGTA----CTTAGTAAATCAAAT--GTCGAATGTCGGCGTAAATTTACCAATAATGTATTTTTTGTATTCGTCTATAACAAATAACTATCTAATTTTATTCAAAGTGTAATAGGAATAATTGATTACCAAACACAAAACAAACAAATGCAAAAGGTGAGTTACAAAATAAAGGGAACATTTAAGCCAGGAACGTTAACACAAATATCAAAAGGGAGAATGAATTGAACAAACGAAAGAGAAAATTTGTAACAAATGAAATTTATAAATGTCTAATGAAATTAACTAAATGTTCAAGTTTGTCAGAAATTATATATACATACACATATATGAAAGAAAACAAAAACTTACAAATTGTACAATGTC
>CG32245 4571203 4573147|4696 chr3L 4570587 4572050 scaffold_40 183565 184936 + 23070|652 1546
AT------------CAGCTTAAGATCACAAAAGTTTCGGCTTCGTCGACTCTAAAATGTCCTGCACAATGTTTGAAAAA---------------TATCCTGTTAG----------CATAAAAATACATCAGGAATTTG----TATCATATATGCATTTCCTTTA------AAGAAATGCATATCCAAATATCGATAGGAAAAAGTGTAACTGAACAGGCTTTTTTCTCCAGTCGAAAATATTGCTTCATTTTCAAAGGCTGGGCAACTCTGACGACCAACTTAAAAATGTGTATCTCAAATCCCCATATCCCTTTCCCCTGAGATGCACATTTTGAGTTACTATCCTTTAGGAAATGCTGGAAAGCTGGCTATGTAATTCTTGTTAGGGAATGTAATGTAATGCATTTTTCTGGGCTTTTTAAGCAGCAGCTCTAAATATAATTGTGCAGAGCGTTTCAACAGAAAAACCCAAGAACAAAAAACAACCAACGGAAACAACGATTCAAAAGAATCAAAAATCTTAGTTCATAACACCGATAAGTGCGATTCGAATGCGTTAGTCGACTGCAGATCCTTCAAGAAAGAAACGAGGGATCTGAGGTCAAATAGATACAAAGATACAAACCTAGACTAGTTTCATACGAGGCGAAAATAGAGTTTAATATTTGTAGCTTTACGACCAGAGGATGCAATTCTAAATATTAAATGTAGGAACTAGCGGTGCAACTCAAATTTAGCACACACAACACAAAAATCAAAGTAAAATACTTACTATTAAAATCATACCATATGATGTGCGGTCGTTCAGGTGAAAATTCTAAAACCAACCAGTTTTGAAAGTCTTGAATTGTGAAATTTGAAATAGTCAAAAATGGTTGGTTTGGTTTTGTCTTT
ATGCAAAGGAAAACCTACCCCAAAGGAAAGGAGTTTCGGCATTGCCGAATATTGAATAAGCTGCACAA-GTTTAAAGAAAGAAGGAAGCGCCACTGCCATGTTAATTAACATAGCCTTAACAGTATGTTCAGCAGTTAACATTCTCAGCTGTGCAGCGCATTCCACACATAAGAAACACACACGCACACATCTAC-------------ACTGAACACATACAACGATTCAGAATAGAA-------------TCAAAAACT---TAGTTCTAGGTACCATT----AAGTGCG-ATTTCAAATGCATTGATTCCACAATATGGAAA-----AGTCAGGAGTACTA---TTTATAAAATAT---AATTCAAACCATTATATTCACATAATGGA----AAAGTCAGGAGT--------ACTATTTA----------TTAAATATAATGCAGACCATTGTTTCCACA-------------------------CAATGGAAA-----AGTCAGGAGTACTA------TTTATTAAATATAAAATTTAGACCAATTAGG--GTCTTAAGCAA--GCAAGCCCGT--AGCGACTAGTGAAAATTCTAAAACCAACCAGTTTTGAGAATATTAAAACGAATTACACCAATTAGCATAAAAGACAGTGTTGCA-AACTGCTGCTTTAAAA--AAATAAAGTAGCGAAAAACAT----TGTTGAAAATGGC---------TAAACTTGTCATTCTCATGCCAAAAGCTAGCCAAAAAT-------------GTAATCCCC----ATTTTTGGCTG-------GAAAATGGCTGAATTGAC-----------ATATTGGATAATACATTTTGCGATACTCAAAAATGGTTGGTTTGGTTTTGAATTT
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TCGTCAAATCTAGTTGTGAAATGTTAAGTAGAAGAAGGTG-----------------CATAAAAAAG-----CTGTCGA---------AATGTGTTTTTGTAA-----------ATGTTTAGCC-----TATAAGATGTTAATTCGTGGTTA------TCCATAGCAAGAACAATACATATAGTCCAAA-------TAGACGATAGATAAATTTCTTATACATACATTATATATGCATGTATATATATGACATACA
>CG32245 4571203 4573147|4698 chr3L 4572479 4573185 scaffold_40 185418 186257 + 6985|0 824
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CCGACTTATATAGCATATATATATATATATATAC-AGAGTTCATCGGACGACAGCCAGTTGAACGAATTCGCTTTCAACAGCTGCCTTATAAGAACTATATGTATATGAATAATACCTACC----TAACAAACTTACAAAACCCA------------AAAACAACGTAATCGACGACTTTCTCACACACA------------TATACAATAAATAAATGTAATACGAATTTATTGTACATACAATAACCAA--AAAACGATATCGATAGACAGAACTGTTTTACCCCATACTTAATAGA-ACTTTAAAGTATATATATATATGTACAGTATGTATATATATATATATATATTTATATATATACTATATATATAGTACGGAAATTCTGCTCATGCGCTGCATCTCATTGCTGCAATCGCCAGTTACGTATCCAATTATTGTAGGGTTTATGAAAATCGAAATTCGAACTCAAATTCAATGTCAAAATATCAAATTCAAATTTGCAATTGCTTAGATAAATTTGCGTGTAGTGTTCATTCCAAGTCAGATCTCACAAGAGTATTCTTTTTAGCGCACTTCATTACAATTATCAATAAATTCTATATGCATACATTTAAATAAATATGAACAATTCAATAATCAATTACATGCAACATACATACATACATACGAGTATTAATTATGTACATTTTTGCCTTTGAACAATTTTTAAACGAAACGATTTCATTATTACTTATATATACATACTTATATATTCAAACAGGAAACGTACAATAATAATAAAATTATGCAACTTTTTTGGCATCCAAAAAAGCGAAAAACACAA
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CGTGGCGGCCGCAATTGGTTATAGAAGCCAATTAAGCGACCGCCCAAATACAAGCCGCCGGACTTTACCTAG---CGCCTAGCTCCTACA-----------TAGTTAATCCCAGATCCCAGCCCTCGTCCTTTAGTCTAAGCCGTTTGCCAAGATCCACGCTGGGAGCGA------------AGCGAACTCCAGGCAAAAGTAAAGAAAATGAGAAACTAAATGGAAAACCAAGCAAAACTAAACTTAATATAATATATACAATCTATTGTTAGGCAA
>Rpd3 4609963 4610318|4743 chr3L 4610248 4611466 scaffold_40 233929 234964 + 10899|0 75
TACAAGCGATCCAATGTGGCGAATAACGCAGAAACTAATTT---AATCAAATAAAAATATTTATAC--ATTTATTG
TACCCGATATCCAATTGGATAATTGCCTGAAATTTTAATTTTGCAATTAATTTCTGTTAATTATTCTTATTTAATA
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CCAGGAATTCGAGGAACAGCAAGAGGAAGAACAACAACAATATTCGCAATATCAAAATTGATG-CAGCAAAAGTGCATTTAACAAATTGGCG----GCTTAATTTGTATTGATGCGTTATTAACCAGCAA--------ATTAAATAATTATAATTTAAGTGATATATA---------------CACAA------------TTTAC--AATAAATACACCTACACATACCAATCATTTAGATAC----ACACACATTATATATATATATATATATATAT-AACACCCTATA-ACGACACAATAAATGCATAAATAAATA-TATATATTAATT--ACT
>Aats-leu 4809576 4809886|5011 chr3L 4805212 4809628 scaffold_40 517050 521411 + 151901|4469 4521
GATAAGGAAAAAGTATCGTGAAAGTGGATAGATAAAGTTGAGTAGTAAAAGTT
AATAGCCAAGAGACAACCAAATGTTAG--GGGTAGGCTAGAATAGTTTAAATT
>Aats-leu 4809576 4809886|5012 chr3L 4809751 4809854 scaffold_40 522616 522748 + 4475|0 132
ATTGGTACTTTTTAATCATGTTTAATGTTAAATATTTATAAAAATTGGACTAGTTGTAAGCAG-----CTGCTTTACAGGATT------------------------GGTAAATGCCTAGAATCATAGGAATA
ATTGTAATTTATTATTTAAGTTTATTGTTAAATTTATATAAAAATTGGACTATATATGTGCAGGCTTGCTGCCTTACAAGAATTGGTTACATTGGGGTTATTTTGGGGGTAAATGCCTAGGATCATGGGAATA
>CG17150 4866426 4866674|5088 chr3L 4866182 4866673 scaffold_40 596806 597263 + 16721|247 504
CTTGGTAACCAATGCTCGTAAAAACACCGATCGATTAGTGGATTGATGTGGATATGCAAATCCATCAGAATGGCGTTTTAATAAGGTTGTAAATCGCCTCG-TAATCAAAAC--------TTAGCCAGGGTAGGGAACAATAAACCCATAAAGACTCTACTTCGACTCTCTGACTTCGTGGTAATCTGAGTATGTAAATTGCCAAATTAAATTGAAATTAATTCGAATACTCTTGAAAATTAAGC-AGAGATTAGTGC
TTATGTCAAAATTATCAGTATAAACATCAGACAACCAGT---------TGGACCAATAA-------AAAAAGACATTTTAATAATGTTGTAAACCGCATTGACAGACAATACAGCTCATATCAGTGCCAGCGGGGTACAACAAACCCATAAAG-----ATTTCGGCGATAGGAACTAG--------------------------AATTTAATCCAAATTAATTTTAATATTCTTGACAGTCGAGCGAGAGACAAACAC
>CG17150 4870301 4870387|5093 chr3L 4869977 4870675 scaffold_40 601624 602396 + 31324|328 414
AAGTGATCAAGCAGAGTGATGCTAATTATATGCAAGTACTGGAGCTAGCCATCACCTTTGGCCAGCCTGTGCTCATCGAGAATGTGG
AGGTGGTCAAGCAAAGTGATTCCAATTATATGCAAGTGCTCGAGTTGGCCTTAACCTACGGTCAGCCAGTGCTCATTGAGAACGTGG
>CG17150 4870460 4870551|5093 chr3L 4869977 4870675 scaffold_40 601624 602396 + 31324|548 639
GTGAAAAGCTCGACTCGAACTTGACGCCCATTCTGGAGAAGAACGTCATCAAGCACAAGGGCGGTCTGTTTATCAAGAGCGGCGACCAAATG
GCGAGAAACTGGACTCAAATCTGACGCCCATATTGGAGAAGAACATTATCAAGCACAAGGGCGGGCTGTTCATAAGAAGCGGCGACACAATG
>CG13705 4879133 4879317|5103 chr3L 4879040 4879138 scaffold_40 610800 610898 + 6553|93 98
GCCGCC
AGCCCC
>CG13705 4879133 4879317|5104 chr3L 4879194 4879343 scaffold_40 610923 611054 + 3155|0 123
GAAGTCCTGACTTTGACAGTCTCAGATTGAAACTAACAATAAGTCGAGCGTATTAGTCAATTTGAATCCACTATGAACAACCCGAGTACAAACCCGAACTTACAATAATAAACATTTTTAAAAC
GAAACCAAGGCTATGGCAATCTTAT-TTGAAGTAAACG------CAAGCGTATTAGTCAATGAGAACGAGTTATGAATAGTCCGAGTACAAAAAATAA--GACAACAATAAA-ACATGTAAAAG
>Rh50 4899710 4899891|5120 chr3L 4899161 4900853 scaffold_40 629233 630658 + 41833|564 753
TTAAGTGTTGTGCCTGTCAGATTGATCACAGTTCACGCGACTCTAATGTGCCTTGTCTAACTACTTACGACTACCTTACT--------ATTATTATTATTATTTTATTTACATTATTTTGTTGTATGAAATGCACGCAATGCCATTGTGCCTGCCCGCATCCGAAATCAAAGTTATCCAAATTTTCTGCC
TAGGA-------------GGAACTTTGAATGTATACCCTGCTTTACTGTGTCTACCCTGTCTACACATG-CCAATTTATTGAAGTGGAGTTTCGAATATTATTCTTTTTTTATTATTTTCTATTCTAAATAA-----------GTTGCACTTGCCTGCGCACCACAT-----------------------
>CG32233 4930761 4930906|5164 chr3L 4930073 4930845 scaffold_40 673004 673750 + 16258|729 813
AACAAATGCCACAATGCAGGGCGTGCCTATAAATTTTTCACCAAATACATTGGCCATAGGTGCAACTGCAACTGCAACTGGAATG
AACAAATGCCACAGCACTGGGCGTGCCTATAAATTTTTTACAAAATACATGGG-CATAGGTGCAGCTGTAGCTGGCATTGCACTG
>CG15212 5105881 5106076|5363 chr3L 5104548 5106434 scaffold_12 147309 149442 - 5613|1682 1920
GA----GAAATTCGCAATAAGCTTCGTTCAGATTCTAGTC------------------------CAGCCAATTGGGAACCTTGCCTCCCC-------------CACTACATTCGATTTTCAAACCGTTTTGTTTAGACAATACCCAATAAGCACAAA-CACACAAACACACA-CAAAAGCACATACATACGAGTAAAGTATACGTAATCGTAACTAAAATAAATGTTATTTTCATACAC
GGCCGCAAGTTTGCCAGCCAATCCCGTT--GACTCTAGTCCATGTACAAACACCAACAAACACACAACCAACTGGGAACCTAACCTCTCCGCTTGGGCCTAGGCACTGTGCTGCATTT----AACCCTTCGCTTAGA--------GATAAACACAAATCACTCACATTCACAGCTTAATCGTAAACTT---AACTAAATAAATATAAT--TCACATAAAACGACACAAACATCACAAAT
>CG4603 5109382 5109619|5364 chr3L 5106675 5113976 scaffold_12 150022 157272 - 206458|2898 3140
TACGTCCTGATCTTCGGCACCGTCTACATTGTGGCATTCATGCTGTTCGCCTACTACCTGCTCACCACCTAGCCACAATCGCCGTGCGAGGAGTCATCTCATTAGCAGTACTACCTCCACATCACCGCCTACCTAAGTTATTAATTATTGAATTGAGCCCAGCCGCCTGT-----ATTCATGTTAGTCCCCTTTTAATCCCTTTCGGAATGCAATAAAATATACCTTCATCTACACTAGGCAA
TACGTACTGATCTTTGGCACCATTTATATTTTGGCTTTTATTCTGTTTGCCTATTACATACTCACCACATAGTTTCAATC------CAAGAAATTGTC--------------AGCTC----TTGCCGATTAGTTTCG-CATTCTTTAGCAAAATTTATACAAACTCCTGTGGTTCATTTATTTAACTCTCTTTCTACGCCC----------------AAGCAACTGTCATTTG--------AG
>CG4611 5112587 5112626|5364 chr3L 5106675 5113976 scaffold_12 150022 157272 - 206458|6258 6313
GCTAAAAAGT--------TTAAC------TCCCAATAAAGTTTATT--ATTATTCG
AATTAAATGTAAATTAAATTAACATGTAAGTTCAACATGGTTTATTAAAGTATTCG
>CG4618 5114331 5114420|5366 chr3L 5114203 5119607 scaffold_12 157376 162851 - 168710|128 240
T------------CCTTACCTGTTTTTCATTCTATTTTGTAACTACTGTGAACATCGCTGTTATCCATAGCCCGTAAGA-----------AATTATATTTATGTACACCGCT-
TTATATTAATGTGCTTAATCCCTCCCACAGCTGTACTTGGAAATTTTGTAAACACAATTGTTATTCATAGGCCATAAGACATAAGAACATAAGTATATGTACATGCATCACTC
>CG4623 5118004 5118266|5366 chr3L 5114203 5119607 scaffold_12 157376 162851 - 168710|4076 4374
GCGGAGCAGCGGGACAGCAGACTTTGTTAACAAATCCTT-----TTACTGTTAAAGTTGGGCACATATAAACACACGAACATAAGAACGCTTAAAGCTACGCACTGCTGATGAAGGATGCTTGGGGT-------GTCATGGTAAGAATCCG-GCGGTGGAGGAGGATGAGGAGAAGAGCGCGCGATCCAGTGCCAGCCTCGGCTGCTTGCTTAGTAATATCATCATCGTTTCATATCATCGT-------------TGCTGA-------ATATACAAAAA---TTTGGTATAAATTCCAA
-------AGCCGGCCAG----ATTTGTTAACAATCATTTTATTGTTGTTGTTAAAGTTGGGCACATATAAACACA--AACAAAAGAACGCTTAAGTCTACGTGGTAACAATGCAAGATCCGGAAGGCAGAAACAGTCAGCGAGAGAATGAGAGAGGAAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGCGCGGAGCTGCGATTGCC----CCATGAACTATGAACTATGAACAGCGCACAGTGCCAAAGTGCGAGCCTCAAGCTGCTGATATCATTGTATATAAAAATCGTTTGGTATTAAGTTCTA
>Aats-ala-m 5123703 5123801|5367 chr3L 5119639 5126302 scaffold_12 162871 169712 - 245960|4313 4411
GTATAAGTTGTGATTACCCTCCAAAATGTGCTAGCTGTAAGCTTGCCCTTTGAATAATTGCTCATGTGAGGAGCGAGTAAATGGCGAAGTTTTAAGGAA
TTTTAACTTG------CCATGCCACACGCCCTTAATAGAAAATTG--TTAAGCTTAATTGTTATTGTGAGTGGT-ACTATATTGCAGACTAATAAATGT
>Srp54k 5128405 5128726|5369 chr3L 5126584 5128723 scaffold_12 169777 171936 - 112678|1829 2230
GCAGGTGGCGTGTAAATTTAACGATTTTTATATGATTTTGTTTTCGCGTAGTTCG-----------TAATTTGTTAGCCATTTG-------------TTTCCATTTGTCCAAGGCCACA--------------AAAATTGA--TACGCGTTGTGGAAGCGAATATAGC-GTATATAGCCTATAAAGCCCATATAGATGTGCAAACAGTTAACAA--------------ATTCGGTTTTTGTACGGCTTGGCAGCCACAGTG-----------------------TCAGTTTTTATAGTTT---AAACAGTTTTCTGTACACGAACTAATGGAATTAGCATGCCTATCAGAATACCAGTAAGGCAATTGAACTAGATATAAAC--AATAAATAATTAATATAT
GAAAGCTTATCTTATATGTAAAGATTTTTGTATGATTTTGTTTTTAAATAGTTCGGTTCTTAGCATTAATTTGTTAACGGTTTGCAAGCGCGACAATTATCCTCGTTTCCATGGCGATATCCTCTTGTTTAATCAAATTCAATTACAATTTGTGAAA------ATAGTGGTAAACAGTGAACGAAATCTATGTA-------AAACAGTTAACAATTCTAGTTAGCGGTCTTCAGTTTTTGTACGGTTTGGTA--TACAGTGCTCTGCAGTCGCAAGATTTAAGCTAAGTTTTTATTGTTTAAAAAACAGTCTACTGTCAACGAACAACTAAAATT-GCATGC--ATAAGACT--CCGTACGGAAA-TGAATTGAATAAAAACTAAATGGAAATTTATCAAAT
>CG4669 5210458 5210581|5483 chr3L 5210445 5211352 scaffold_12 272514 273556 - 4006|13 152
TCTGCGGCTAATGGAT--ATTTTCTTTATTGAACGAATT---ATTGTAGATTTTTAACGCCTCCATATATGAAATTGTTTATAGGATTTACAATTTGG----ACAATGAA-----TGAAA--AAATTTTAAGTACATAAA
GCATTGCAAAATCGATCAATTGTTTATATTTAAATACTTTTGCTTGTACATTTATCATTTGTGAGCGGCTAAAACAGCTGCCTCGTTGCATAACTTGAGTTTACAACGAAACGTTTAAAACCAAAGTTCGATTACGTATT
>CG4769 5336278 5336745|5647 chr3L 5335383 5337751 scaffold_12 428613 431079 - 63036|902 1455
A---ATGTTTGAATTTGATTTTGATGGTGTGAAGAAATGCAGTGTTATCGCGGCTTTACCGACTAATAAAGATAAATCAATTTTAAGCAAAAACCAAAACCACACACAAGTGAACAAGCAACATCCGCAACCACCAAGTCAATGTTCTCTCCGCTGAAAAATATAAACACAAATACTATCCCAATATGCGAGA-GCCAGCCAACCAAACGATTCAAAATAAAACTAAATAGCTAAATCTAAAACATCCTTGGTAACCTA------CTGATGGTAACCAAACAAAGATCGGATCGGAAGATTCAATGAGCGGGGGATTGAGGCTACAAAGACTACAGGAGCCTAG-CGAAATGATTGATGGATAATGTGACATTGATTGTGTATAGAATCGATAAATCAATTATGTATTTAAAACAATAAACAATTGACAAATAAA---CGGAAATGAT-----------------------------------GGTTGGTTG------------------------------GAAAATCATTTCTA-------GGCGGGACATC
ACATGTGTTTAAATTTGATT----TGGCGTGAAGAATTGCAGTGTTAACGCGGCTTTACCGACTAATGAAAATAAATCAATTTTAAGCATAAA---------------------------------------ACCCAGGAAATGTTCGTTC-----------ACACACACACACAAAATTCAATTAATAGAAATAACAGCTAAT--AACAA---ATAACATGCCAGAACAGGAAAAACCAAAATGCCTAGTATAAACGAGGATGCACGAAGATCAATGGCCAAGAATAACATCAGGA--------AAACGGGGAGTT----CAACTAAAGC--AAAGAGCCTAGACAAAATGAATCATGGATACTATTACATGTATTGTGTATAAATCTTAAATTCAAATTATGTATTTA----AATAAACAATTGAAAAGAAAAACCCGAAAGCGATTCGTTACATTTTCCATTAAGATTCGTGACTCTTGGACTTGATTGAGAAGAGATATAAAAGAACGAAAAACAAACAAAAATCATTAATAATTCTCTGGTGGATCAGT
>CG4780 5341266 5341326|5652 chr3L 5340534 5342168 scaffold_12 433881 435519 - 57888|733 796
TCTGAAGACATCGCGTTTAGTTGAGTTTAAATTAAATGTACTCTATTT---TGTAAAATGTTAA
TAAAACGCTTATATCTTGCACGAGTTTTAAATTAAATGTACTCTATTTAGGTGAAAACCATTCA
>Sras 5538776 5539050|5868 chr3L 5537740 5538922 scaffold_8 347933 349126 + 40783|1057 1219
TTAAGTTAATTTGTATGTATCA----ACCGCTGCCAT-------ACGTCGGTTCATTCATGTGTACATAAATATTCGTGCATATATTATGTTTATATGTAAATTGCATATCCCATTCGAGCCAATTCCGCGCACAA-----AAAAAAGACTTCCGATGAAAAA
AAAAAAGGAGTAGTATG-ATCATTGTATTGTTGCCATAATCGAGACTTCGGTATCTCACAGCCCACATACATATATATTTATGTATATTATTAGTTAGT------CATATCATAGG-AAACCGACT----GTACAATGTTTAGATAAGTCTTCCGTTAAATAA
>bc10 5539812 5540711|5869 chr3L 5539513 5541564 scaffold_8 349525 351653 + 24564|308 1364
AGGGTCAGCAGTGCGCCGCTTATCTTTCACTCCCACACAAAGAAAGCCCCCGTAGTCATAGTCAACGAAGATAAAGTGCTAATAATAACTACCTTTTTACGGAATTACGTTCGCGTTGTTACAGCTTTACATCCTCGAAGAT---CGGAGAAAGTCAGAGGAGCAGGCGGAT----------ATAAGGGATTAGGGAT-AGCTTGACTAAGTCGGTAAAA------------TCAAGTGATCAGTG---ATACAAGTGATGAGTGAGT-------------CCGACCAGGAACAAAGATTGTGTGTCT-----------AGTAATACCCATTGCATTATT------TCCAGCCC-------TCTATA---TGTTAC--CTTCATAATTCTCTTGATTATGAATTGTAATTGTATTGTATGTTTTG-----------------------------------TTTTTAAAGCTTAGA----CGAATTTAGTTTATACGAAGAAAGCGCTACGAAAACGTATTGTACATCACCCCACCCAAAAGCCCTACCCTTCAAATCAAAAGAAAAAACCCCTATCCAACCCACTTGTCAATGCAACTTA-CGATTAGTCATATATGTTATATATAGATAAATACATTATACAAAACGTAATTGTAAAGAAAACTAAGGCAAACCACACATTCACTGCGCATCCTTGCTGAGTTGCTAAGTTGCTGAGCCAACGAAAGCTGCTGACATCGGTTGTAATTACCCTGTCGTGTGCACGTGCAAAAACTGTATATACAAACAAGCATATAACTTACACCGATCGAAATATATAAACATTATATACA--TAAAATGTAAACGAGAGACAAGCACAAATATGTAAAAACGAGGAACGGGCGGGCGATTATAACTTATACAAATAATATT------GTTCGATT--------------TTTGCGAATTTGT------ATGATTTGAGCGGTATCCAAAAAAACGGAAAGT----GTGGTAGATG--------------TAATGAAATAAAATTTAAATAATGATAAACATCT-
A------------CGCCG--------------CCAAACCAATTCAACAGCAGTACACAGAATACAGG-------AGTGCTA--AATAAT-------------AATTACGTTCGCGTTGCTACAGCTTTACAATACATACAATTTGCATACACAAACAAAGAAACCAACCAACAAACAAACAAACAAACAATCAGTGATAAAAGTGAGTGAGTCAACAGGAGAGGAGGAGAGCCGAAGTGTGTGGTATCTACGTACGTAACTCGTACGTGAAAGTTTGTAAACAGAAGAGGAAACTAAACTATATATCTGTGCCCACTCAAGAAAGCCAAATGAAAATATTAACAAGTCCATCCCAACGCGTTCGATAGCCTGTTTCTGCTGCTGGTATTTTGTGTTTATGTATTTTAATTTAGCTAAATTTTCTGCCGCTCCCCCCAAATCCAATTCGTATTCAACTGTTTTATTTAGAATTAGAGGCGAGAGTTTCGTTTTAAC-----AAGCGCTAC-AAAATGTATTGTAAAT----------------------TTTCTGATTATGAGGAGAGGTAC------------CCCGTCAATGCAACTAAGAGATTAGTCATATGT----TATTAAAATAAAC---------------TAATTGTAAAAAGAAAGAA-ACGAATTATAATATTGCTGTGCGTCC----------------TTGCTGCGCCAATGGA---CGTTGATATCGGTTG----TTCCCTGTCCTGTGCACATGC--AAATTGTATATATATATACACACACGACATGCAT--------ACATATATACATTACATTTGATTGATATATAAATGTATAAAATAATCAAA---ACAAAAACAAAGAA-AAGTGTTGGATTTT---TTTTACGAATTGCACTTCGTAAACTTAATTTAAGCAACGACAAGTTTTCCAATTTGTTTGGACACGAGTTTAACAAAAAAAAAAAAATCACAAAATTAACGTAACAGAAAAGAAGAATATCTATTAAAAAAAAAACATTAAACTAAAATAAAACAATTT
>CG5146 5563864 5564315|5887 chr3L 5561947 5564510 scaffold_8 375961 378409 + 37041|2009 2518
TAGATCCATCTTGCTA-----GCTTGATTTCTTTA-----ATTATAGTGTTCTTTAGATAATTATTCTTAATTTTAAATA-------TGAGGATCCTCAA-TGCCTACACAGAT---------TTATTTC---GTAAATATTTTGT----TTATAAAA----------------TATTTTTAATTGACCATTTGTAAACAAGTTGCATTTATTCATAGAAGGTCGTTTTCGATTTATTCAGCTTTAGGTTTCTATGTCATTTATATAAGGCCCATCTGGGCCCACATTTATTGATTTCTAAAAGAAAATAAAAATTGTAAATATTTCGCTTAAGAATTACACTTGAATTTACATTCGGCGTGCACATTATACATATTTGAGTCATTTACTGTAAC--GAAGTTCTTAACGAATTAATCTAATCCTAAGATCCTCAAGAATCGAATGTATGTGAAATTTT-TATAGTGTGGTGAGCATCTATAAGACTTTGCGTGTTTGGTA-----TCGT
GAGAACAACATCAATGCACGCACTCTAATCCCCTATCCCCCTGAAGTCAGTCTTAAGAAACCGGTTCGCAATTATACTCGCATGTACTTAGAACCACCAACCAGCTGGACACATCATAACAAATTAGCTCTAAGTAGTTATCTTGTAGGCCTATCAACAACCTAGACATATTATTTTTTTTTTTTAACCATCC---AACGAGCTCCCTGCAATTATATCATAATATTTTGTTGTTTTTC--CTTCACCTTTTTCTTAAATTCAT----------TTTTTTTTTACATTTATATTTTGTAAGCGAAAGGCATTTATTGTTAATGTTT---TCTAGAACT-------AATT---ATTCATTGTGTAACATTTA-ACATTTAGTTCATTGATTTCTACAAGAAAATAAAAACAAATCAA-CAACTGTAAATAGTGCGAACGACTAGGAGCATATCGAGTCGTATTTAGTCTAAGCGACATACGTAA-------TGTATTTAACGAAACTTTAT
>CG5150 5571087 5571299|5890 chr3L 5566731 5571202 scaffold_8 379456 384007 + 148764|4561 4698
GAATCCCAATCCGGCGATGATTGACGGACAGAAGGACTCTTAAT------------TAGCGCATC----------CACTAGACGATTCTCACGTACGCTTTATCGTTTTAAATGAATACTCAACATTTGACAGGTGCT
-----------------TGATTGACAGCTTGAATGACCCTTAATTTTAATTAAAAGTCGTGCTCCTTGGAGGCGATAGCAAACGATTCTCACGTACGCCTTATCA--TTAAGTGAATACTCAAAGATTGCTGTGGGTT
>CG5150 5571087 5571299|5891 chr3L 5571258 5573210 scaffold_8 384064 385989 + 4073|0 45
TTCAATAAACGTTTTCCTATC----AATGTTAAAAAACCAAATGTA
CGCAGATAATATTTCCCTATCTTCAAATAAAGTGTACCCAAATATG
>mthl2 5580764 5581135|5903 chr3L 5580622 5581211 scaffold_33 641081 641713 - -2201|169 586
TATTTTCTTCTCTTCGAATTAATCAATTTAATAGTAAAGTATAACTTTTTTTCTCACA-------------------------------AAATGTATGAATATATTTCACTTCATTCTACATTCTATATAGAATT--CATTTAATCACAAAATGTATGAATATTTTTCTTTATATGACGTGCATCGACT--ATAGAAAATCGACTATAGTGTGCCACAATATATTTTACTCAT-CATTTCCTAATCAAACTATTGCAAACTTAACTTTGAGCCGAGGAAAAACCCTGTATGTCTATCAAAACTATGAGTCA--AAAGTATGACGCGATGCTGAAAGTA--GTTGCCTTTAAATATTGAAGTGATAAATGTAGAAAGAAGAC------ATTTGTATGGAAATAAACTAAGTTTGTAAAT
CG---TCTTCAGAGCGAGCACAATAGATAAGCAACAAAATGTGGTTATGTTTCTAAGACCCAGAAGAGCATTTGAAAGGTTGTCGGCTTAAATTTAAGAATATAGTACA--------TACCCCATAGATGGTATTGACATTTAA--GCGATAGGTTTAAAT-TTTGTAACTATTGCCCATACAAAAGCTTAATAAAAAACAAAATATAA-ATGCTTGAAAA------GCACATATAGTTTATATTTAAATGTTGGTTGTCATGAATT--AGCAATGTATTGGCCATATTAGCTTCTCAAAA-TGTCAATCACTCACTCAAGTCTTAATATCTAAAATATGATTAGATTTGTATATTTAAG---TCAACCCATAGGACAGGCTTATCTAGCTATGTGGCAACATA-----TTTCTAAGC
>Blimp-1 5622762 5622896|5939 chr3L 5617215 5623289 scaffold_8 431262 437631 + 190703|6215 6351
AAGGTACATGGTACATGGTATATGGAGCAGCTGCAGACCAGACCAGGAAGTGATGTAATCCAAGTGCAATAAAGTTAAATAGAGTTAAGCGACAG--ACAGGCAGACAGACAGACGATACCCCTTAAAACAAAAAAA
ATCCGGCAT-------------TCAAGTATCCGTA----------------ACTGTAATTCAAGTGCAATA------------------CAACAGCAACAAGAACACACCTAGAAGTTAA----GAGAACCGTACGG
>lin-28 5631067 5631331|5950 chr3L 5630110 5631176 scaffold_8 448497 449495 + 28391|1010 1126
GAAG-TCCTTGGATCTTGGACTGGTA---GTTGGAAGTTAGAAACTTCCTTGACAAGTACAAAATGGAAATCTAAGAAAAAACACGCATCAAATCAAAGAAA---CCCACGTACAAC
GCAGCTCCCTAGCGCAACGGCTGGGGCATATTTGAAGTTGAAAA----CTTGTAAAATAC---ACCTAAAAATAACGTACAAAACGCATCAAATCAAAGAAATACCTCACGTACAAC
>sif 5720501 5721986|6046 chr3L 5716657 5723584 scaffold_8 546921 554044 + 100223|4481 6156
ATCAGAAAAAGCAAAGCAAAACGTTTAGTATCAAGCTAAGCAAGCATAAGAACTCTTAATCCACAACTTCAAATCCTCTGTTCGATTTCTCAATTTTACCTAATCAAGTGTAAG--GCAACGGCAACAGAAACAGCTAAAAGCAAAGCAAAGCAAAAGCAGAAAGCAGAAA-----------------GCAA-----------AAGCAGAATGCAAACAGCAGAAGCAAGCAGTTCAAAGTTCAAAGCAGGCGAACCCAAAAGCATTTTTCAAGCTCAATTCTGCGATATGAAGATGCATTGAATCACCGGCCATCATCGGTGTTTGGTGAATGGATGTGGTTGTTTTTTGAAGAATGCTTGGCTTCGGTTTGCTTTCGCTCTT-------TTTTAATG---GATAAAAC--------ATCGAAGA-------GTTTTTGTCATTTTTTACGTTTGCGTTTTTAAACGGGAGAAGCACCACGAAAGGGATGTCA-----CAGATCCTTTTTAGAAAGAGAGAACAAACAAAAAAAAAACGGAACAAAACCTAAAGCATAAATGAAAACCAAAAGAGAAGACTTTCATTT---ATATTGATTGTATTTAAAGTGCAAAACATATAATAAAAGCATAATTAAAGCGAAGGATTTTGAGCAAATTTAATATGAACTAAGTGAACAGATTTAACAAAATTAAGAAATACGAGAACAAATTCAAATGCATTTGTCGCT-GAAAAGACTTGAAAGTAAATTTCGATTTAAATACATACATTTATTGAGGACAAGACGAAGAAGCAGCTGTCAAAGCGACGAGGAGGGAAACCCGTAAACAAATTGCAACC---ATAGTATTTAGGCTTAGAGAATTTAAATTATAAAAAAGAAAACAAACGAAGACCCCAGAGATTTGCAAAAAAAAATATAAGAAAAAAGAATGAAACAAA-------AGTCAAATGCAAAGTAAGCAAAAC--------------CAAAGGGTTGAATGAAAAACATTTTAGCCAATTAAGCCACACACACACACACACAAACTGAAGCAAATCAACACACTCATAAGCGTAATGAGAAAATTTAAATGAAAACAGCAATG-AAAATGTTTAGTTCGTAGGAAGTACACTGAAAAA------------------ATACATAAAGATACCATACA----------------------AAATCCACACATACACATAAACGAAAAATAGCAAAAATTTAGTCAAAATGTTAAATGGTAAACTAAATGAAACCGAAATAATAATAACGAAGCAAATG---ATTCCATGCAATTAAAT---------TGGGCTAACAGCCTCCACAAAGAATCCAAT--------CAGCAAATACAAGCAAACAAAAATTAACTCAAAGC-----------AAACTCAACACGTTAAA-GCGGGCGAACATTAAATTAAACTATAAAACTATGCAAAGAAAAC--CAAATAAATGAAAGTACATAAGC--------------------ATAAAAAAGCAAAAGAAACCCAAATAAAAAAAAAGAC-AACAC-CTTCTAGCAGAATTACAATAAT-----AATTAAGAACTTCACTTTGAACACTTTGAAACAAACACACGCGAATCGATATAGTTAAACAAAGGAAGCCTATTCCCAGCCCAAC
ATCAGAAAAAGCAAAAC-ATACATTTAGTATGAAGTTAAGCAAACATAAGAACTCTTAA--------ATAAATTCTTTTGTTA-------CAATTTTAACTAATCAAGTGTAAGAAACAACGGCAACAGTTCAATCAAAGAACACAACACA-CAGAAACAATACGAACTAACACTTTTCCACCCTCCCCCAAAATCCCCAATCAAGCAACTTGCAAAAAAAAAAAAAAAACAA---AAAGAATAAA--AATAAAATCCAAAA-------TAAAACTTTATT------TAT-------TATTAACTAATTAATACTGAAACAAGTGTGTCAAAATGTTAAAGTTGCTTTTGAAAAAGTGAATAGTCTCGAATTGTTTTTAAGCATAAAAAACATCGAATGAAAGATAAAACAAAATATGATAGAAAAAAAAAACAAGTTTGTTGTTTTTT--GTTTACGTTTTT-AATGAGAG--------CGAAA-AGATGCTAACTAGCACATCTTTTTT-----------------------------------------------------------AAAAAGAAGACTTTGATTTATAATATCGATTGTATTGAATGTGCAAAACATATAATAAACGTATAATTATAGCAAAGGATTTTGAACAAATTTAATAAGGATTAAATAAATTAATTAATTAAAAAACAGAAA-ATGTGAACAAATTCAAATGCATTTGTCGCTGGAAAAGACTTGAAAATAAATTTCGATTTAA----ATACATTTATTGAGGAGAAAA-------------------------------------CGTGAACAAATTGAAACATTGATTGTATTTAGGCTTAGAGAATTTAAAAT---GAAAACAAAACCAACAATCGCAAATGAAAACCAAAAAGGAAAATAAATAAAATACAAACAAAACCAAATATATTAAAAAAATGCAACTTTAAACAAACGTTCTAAAAGGCAACAAGAAATTAAA--AAGAAAATCTTAGAGAATTAAGCAACACGAAC---------------AGCAAATCGATACACACTC-------------GAATTAAATCTAAAGCTGCAATGCAAAATGTTTAGTTTGTAGGAAGTACACTGAAAAAAATTAGAAAAAACAAAAGAAATAAGAAAATACCATACAGCAACCACAAAAGAACACACACACACACACACCCACACGTGAAAACAAAATAGAGAAAATTTAGTCAAAATGTTAAATGGTAAACTAAC--------AAGTAATACTAACTAAAGACAAGAGAATTCCATACACTTAAACAAAAACATATTTATAAACACACACTAAATCGAAATGAGTTTTGGGGATTACAAATCCCAGAAGACAATGCAGCATTCAGCGCCAAATACAGCAAAACCTAACTTGTTAAACGCGAGCAAACATTTAAATAAACCTAAACAC----AAAAGAAAACTATATATATATATAAATATATAAGTGTGAACACGACAGCAAAAAAATAAAAAAGAAAAACAAAAACAAATAAACACACAAACAAACACTCTTCTAGCTAAATTACAATAATATTAAAACTAAGATCTTCAC-TCGAACACTTGCA---AGAGATGCGAAAACCAAAATACATGCATAGGTAAATTCCAT----AGTTGAAA
>Ubp64E 5735332 5735449|6053 chr3L 5728340 5736137 scaffold_8 559817 567979 + 210500|7665 7832
TCTGGCGAGTAG-------AAAACAGTCGCGGCGAT------------------------------------------CATAACAAAAAAAAAAAAAGTACACCAAACCATGTATGTAAGC-GACGGCAGACCATTAAATCCCAGATCCTCTTTTGATCACCGGCCAC
TGGCCCAAACGGCACCAGCAAAAACGTTGTCGTTGTACCCTTCCCCCGTTCCCTTGCTGGCTGTAGACTCGCTTGTTGCATAATCGGACCCGCAAATACATACCA---CATGTATTTCAACTAACCAAACGCAATCGATTCAAATCTACGATTCTGTCGACTGCGCCT
>Txl 5740937 5741060|6061 chr3L 5740704 5742092 scaffold_9 2874115 2875601 + 63211|233 370
---GGTTCCATTGA----------AATTTTCAGCGTTTTTCCCCAATGACGTCCCAGCATTTCTTTTCA-ACTTTGGACTTACAACTAAACAATATACAACAAATGCATAAAAAATCATACAAAATAAGGATCAACAA
ATCGGTTAGCTTGATATTAAATTGAAGTTCTAGTGTTTTCCCCATCTTATTAACCAGGCTTGCTCCTTGTACTTTCGACTTAAAATTAAGCAAAAAAAAAAAAACTTATAGAAATGCATTAACAATGACAATTAATAA
>mule 5749520 5749795|6068 chr3L 5749207 5749532 scaffold_12 622073 622404 - 14716|337 349
CTGGATGCGGATA
CTGGATGTCGTTG
>mule 5749520 5749795|6069 chr3L 5749560 5752497 scaffold_12 622429 625641 - 56565|0 262
CCGATGCGACTGCGGCGTGTGCATTTGTTATTGGAT-------------------------TTCAATTTCGCATGAGTTTTGTAAACGTTTTTTAACTGCTGATGATGAACATATTAGAAATAGGAGTAGGCGTAGGACTGTAAGCTATAAGCTAGAACA--TAATTGTTGCCTCCCAAAATCATCCCCAACCTTCACCGAAGCACACAGTCCCATTAGAAACTAAGGCTATCATTAAGTACGATAAAAAAAAAGAAATGAAA
TTGTTGCATATGTTGTTGTTGTCGTCGTTGTTGGCTGGCAACGGCTGGCAAACGGGTTCGCTTGGATTTTACACGAGTTTTGTAAACATTTTTTAAGTGC---TGATGCATATATTAGGACTAGGA-----------CACATAAGCTATAAGCTAGAGCAACCTATACCCGACCCCC-----TACCCCCCACCCTCACATACACAGAAACAAACATTTTTAGTTTAAGTTATAAGCGTGTTTGGC------------------
>Pmi 5754949 5755669|6071 chr3L 5753561 5755407 scaffold_12 626699 628712 - 23973|1541 2127
GGGATTTGCAGGAGCTCTGAAAT---------GTCCAGGT-GCTGGATTAGGCCTGTCCCCTGTCTCGCGGACGCGTAATACC------------------------TAATAAGTTAAGTTTAGGCACATAG-GCGAATGCATTTCTTTTAGATTTTCGAACGATTTTAACACAATGTATTGTCTTTCGTGAAACTTTTAAATGTTCCCATAAACC--AGTGTCCATGTCCAGTGTTCCCGTGGCTGCCACTT--------GCACTGGCTAGCATGCTCATAACTTATTACGGTCCCCAAGCCCAAG--TTAGT-CTTAAGGGAGGAGCAGCCTC---------------------------TGCACTGTA-----AATTAAGCAAAGCCAACC----TCTGTGTATAAAGCGAAACCCATTTATGATTGTTATTAG------------AGTCTAGTTGAAGATATCAGCAAA--CGAAA-------GTCAAGTAA--ACGCGATGCGAAT------GTTACTCCCGGCTT------------TAAAGT---TACTCCATAGCTAAGAGAGTCTAAGAGTGAGTGCG
ACGACG---ACTCGATCTGGAATCAGATAATCGGCCAGCTAGCTAGCCAATGGCTGCAGTCTGCGGCAATACGGCGCGTTATCTTGAACTTGACTCAAGTATTTGGTTAATAAGTTTAGTTAAACGCCATTGCGCGTATGCATTTCTTTTAGAATTTCGAACGTTT-----------CGTTTTTCCTAGTTAAATTTTAAAGTGGTTCAA-AGTCCGAAATGTCTATG---AATGTTTCCATAGCTGTCTGTTTGTTTTTGGCAGCTATTAACTTGCGCCTGCATTATTTTGAATGAAATATTTATGTTTTAGTATTTAATGGCCAAGAAGTCTTTTTATTAGTTATTGTTCAAGAGATAGATGCACTGTACAAATAATTAAGCAAAATTACTTTGTGTGTGTGTGTATAAATAATAATAATAGTGATTGTTATTAGTATAGAAATTAAAGGCAGTGCAAAGAAGTAAATAAAGTCGAAACCAATATGTTATTTAAATACACAATACAAATAAAACAATTGTGCCGCGCTTGCTGTGAATAACGAAAGCATATATAATCTAACAAACACACACAAAGAGTGTGTGTG
>Pmi 5754949 5755669|6072 chr3L 5755459 5756289 scaffold_12 628768 629481 - 2500|0 213
CTTCATGCGGGCTGGTTCTCTCCCTTGTTCTCGTCTCAGTCGTTTTGTGCATTCTGCTGGCAGTGGTT---GACAGCGGCGACTCCGATCGATCGAGTGGTGTGTTCCAGTGCGATCCGGTAAGGAGCTGACCCACTCACAGCACCACCTTGATGCCGAGGCTGCAGCCAGAGCGGTCTAGCCATGGACTCCAGCCACATAGCCGTGCGAGTGG
CGTCATGCGGGCTGCGGCTGCAGTCTGTG---AGCTCAGTAGGCTTG-GCGAAGTCATCGCAGCGGCTTTGTGCAATCCCGAACGCGATCAACCGA----CAAATTCCAGTGCGAACCAGCG----------CAAGTAAAGGCTGCGGC-GGATGCTGCCGCGGCAGTTGTAGTTGTT--GTTATTGTGTGGAGTGA---AGTGGAGTGCGGGA
>Pmi 5755944 5756255|6072 chr3L 5755459 5756289 scaffold_12 628768 629481 - 2500|493 831
CACGTCGTAGTCCCTCGCCGGCCGCCGTCTCTCAGTCGTCGTACGGCAGCCTGGGTTCCAGCCAAGATATACACAT--TCGAGTG----------------------GACAAGGAAGGCGTTGCAAGCGAATCCACTCCCTTGCTGGCAGCTGCTCAGCGGTCCATCAAGACGTCCTCATCCCTCACAGCCTCAGTCTCAGCCTCCTCCACGACGCCTTCGAATTGCCGAAGGAACCCGACGCTCCAC---GAAGACTGCTTCAATTGGCGCTCGGTGGGACTGCTGGTCATGTGTGCATCCGCCTTGGCACTGGCCGCCTATTTGCTCTGGAGACAAA
----TCGT---------------GCAGTGCATGTGCCTGTGGGCGGCAACCTTAATACCAGCTGC-ATATCCACATCGTCGCGTGCCAGCACCTACCTCAGGCTCGAGACTAGCGCGGAGC--CCAACGAGCATACACCGCTGCTGGCCGC----CCGCGGCA-----------CTTCATCCCCC---GATTCAGCCCGGACAAGTGCGACGACGGCT----GTTGGCACAG--------CGATCTACACAAAAGAATGCTTTAATTGGCGCATCATTGGACTGCTCTCGATGTTCATCAGCGCCATGGTGCTGGCCACATATTTGCTCTGGCGACAAA
>Pmi 5756618 5756796|6074 chr3L 5756600 5759012 scaffold_12 630314 632623 - 74990|18 199
CCCAAAC---GCCGGACTTTGGCTATCGACTCAGTATCGTGGGTCATGGCATATGGTCGGATATGGAACTTCAGGGTCGGGGAACTCTTTTCGATCCGATCGGTGTCGGCACAGTGATTTTTACCCACACTGGAAGCAATGAATGCCACGATGATTGCCCGGATGTATTGCATAAGCTGGAA
CATCAGCTCCGTCGGATAATGGCTACAAGCTGCATCTCGTCCGACATGATATTTGGAGTGGGGCCCATTTGCATGGTCAGG---CGCTGCTGGATGCGGGCAAAGTTGTAAACGTTTTCATCACACACACGGCCAGCGAGGAGTGCAGCGAGAACTGTGCGAATCTGCTGCAGAGCTTGCAG
>Pmi 5756864 5758632|6074 chr3L 5756600 5759012 scaffold_12 630314 632623 - 74990|267 2109
AGGTCGCATGTGGGGGAGCTGCCCTACAACTTTCTGGTCGCCGGTGATTGTCAGGTTTTCGAGGCACAAGGATGGCACTATCGGAGCCAGTATCCAAGGGATCTAAATGGAATAGACTCGTTGGTGATGGCCTTTGTGGGTAACTTCAGCGGCAGACCACCCATCGATTGCCAGTTGATGGCCGCCCAGGCTCTGATCCTTGAGTCTTTAAAGCGTCGGATTCTGCAGCCAATTTACCAACTCTTCGTGTTGGGCA------------------GCTATACGGACGCACTGCAGCGGGAACTGAGGCACTGGCCGCACTACGCGAGCCACCAAACGTCCAAGTGAAGCAACAAAGAGATGATTCCAAATTATTCCTCTCGTTT---ATTGTACGCCA-AACACAAACACAGTATACAAAGAAGCGCAGGATGAGTAAAGCGGT-TGCCACCGATAAGCGAATCAGGGATCCCC-----------AGGATCGGGCGCTGGC--CAGGATCGGGGGACCGGCGAAGCGTTGCGCATTGGGTT--------AATTGATTGGATGTTGCCTAAGACTAAGGACTATAAACTTAAA----CTACAACTGGCGATCGG-------TTAGTCGAACTCCAGTTTCCGAAAGCTACCCTCGATGGACTCGATTTGTGAAACGAAGTTGGGTCCGCCGGTGGAGGCCTTTCCGGCATTGAAGCTGCTGCGCCGCTGGATGCCGCGATCGGAGCGCAGTATGCTCTTGTCCAGACCGAGAATCAGGTCGCGCTTGGTCGCCAGCTCCTGCTTCCACAGCTCGATCATCTCGCGCATGGGCACCTTGCCACCCATTTCCAGCGGCAGACAGCCCTGGTCCACGCTCTTCATCAGCTCCTTCTCGCTGCCGTAGATGATCAGGCGGTTCTTCATCTTGGAACTGACGCGGTTCTTCACGAAATCAATAAGCCACTTGAGTGTGGATGGTACATTGATCAGGTGGATCTCCTTGTGACGCATGGGCAGCGATTGCTCACCCCACTTGAAGATGCGGGCAAACTCCGTGGGATTCCAGTTGGTCACATGCGCCGTGGTCACGCCGGCGAAGTCGCCCACATGCGTTAGCCCAGTGATCTGTGTTTCCTGATCCTCCATCAAGCACTCGTAGGTGAGGAAGTGCGCCTTGGCCTGGTCGCAGCTTGTGTGGATCTTCGGATTTAGCCCCTTGGCATTGATGACCACCACGCGGCGACCGTGCTTGTCACGCTGTGGCACCGCAAATATGTATCCCTGATCGATGAGGTCGCCGAGACGCGGCTCCAGATAGTCCAGCTGGGTGCTCATGTGCGGGAACGTCCTCCTGATGTTCAGGTACTTGAGCAGCGTCTGCTCGGCCATCGGCACACTGAACTTCTTGGCGCGCAGGAAGCGCAGCAGGAAGGTATCGTCGCATCGCACATTCTGCAGATCCTCGTTCTTGGCCACCCAGTTGCGCAGCTGCTCCAGCGACTGCTCCCGCGTGCATCGATCCTCGCGCAGCTCCCGCTTGGCGATCTTCAGCAGCGCCTCTGGCAGGCCTGTCGTCTCCCCCTGATCCTGCACCATATTCTGCTTTCCTTCTTCGCTGGAAG------------ATCTGCGATTCGTTGGTTCTGCTC--TGTGGT-CACGCG-ATTGGCATGGACTGCGGTCACTACAAAGAATGATAAGAAGTCCACGGATTAGTCGGGTTTTTTCTCAAATCCACATTGTATGATTAATATTTATACTATATATATGTATATGTTCTTA---AAGAGATTGAATTTACTTACTTACATACTTGTAAAATATATAATTAAATT
CGCAAACATTTGGGGGAGCTTCCGTTTAACTTTCTCATGGCTGGCGACTGTGAGACATACGAGGCGCGCGGCTGGCAATACGCGAGC-AGCTTCGAGTCG--CTGCCCCAGGCCAGCTCCTTGGTGTTGGCCTTTGTGGGCGATTATAGCCAGTGGCTGCCGAGTCTGTGCCAGCTGCAGATGGCCAAAGCGCTGCTCTGGGAGTCGCAGCGGCGCCTCAAATTGCAGCCGAGCTATCAGCTGTATGCGCTGCGCAATGTGAGTCGCAGTGAAGGGGATGCGGATGCACTGCGGCATCAGCTGCAGCTCTGGCCGCTCTATGCCGGCCAGCGGCTG-----GTGAAGTAA--AACTGAAGCTTCCAAGTTGTTCCTCTCGTTTTTTATTGTACTCCACAAAACAAATAGTTTACA-AAAGAAGCGCAGGATTAATAAAGCGGGGTGCCACCGAAAAGCGAAGCGAGTGCCCGCTCCCAGCCCAGCGGAACAGTTGCTGCCAGCCGGGTAGATGAGCCAACAAAGCGTAGCGCTGCGTGTGCCATTACAAATTAA--GGATAATGCCTATTGCTAAAGCTTAAATGTCTACAATGTCTACG-CTGTGCATCGGATGCATCCTAGTCGAACTCCAGTTTCCGAAAACTGCCCTCGATGGACTCGATCTGTGAGACGAAATTGG---TGCCCGTGCCGTTCTTCTCGGAATTGTAGCTACTGCGTCGCTGTATGCCGCGATCTGAGAGCAGCATGCTTTGATCCAGTGCCAGGACCAGATCCCGCTTGCCGGCCAGCTCCTGTTTCCACAGCTCAATCATCTCACGCATGGGCATGATGCCGCCCATCTCTTGGGGCAGGCAGTCGGCATCGACGGCCTTCATCAGCTCCTTCTCGGTGCCGTAGATGTTAAGACGGTTTTTCATCTTGGAGCTGACGCGATTCTTCACAAAGTCAATCAGCCATTTCAGCGTGGAGGGCACATTGATCAGATGAATCTCCTTGTGACGCATGGGCAGCGATTGTTCGCCCCATTTGAAGACGCGCGCAAATTCCGTGGGATTCCAGTTGGTGACATGCGATGTGGTGACGCCCGCAAAGTCGCCCACATGACTCAGACCCGTGATTTGCGTCTCCTGATCCTCCATCAGGCACTCGTAGGTGAGAAAGTGAGCCTTCGCCTGGTCGCTGCTTGTGTGAAACTTTGGATTCAAACCTTTGGCATTGATGATCACCACCCGCCGGCCGTGCTTGTCCCGCTTCGGCACCGCGAATATGTAGCCCTGTTCGATGAGGTCGCTCAATCGCGGCTCCAGAAAGTCCAGCTTGGTGGCCATGTGCGGGAAGGTGCGTCTAATGTTCAGATACTTGAGCAGCGTCTGCTCAGCCATCGGCACGCTGAACTTTTTGGCGCGCAGAAAACGCAACAGGAACGTATCGTCGCAGCGCACATTCTGCAGATCCTCGTTCTTCAGCACCCAGTTGCGCAGCTGCTCCAGACTCTGCTCCCGCGTGCACTTGTCCTCGCGCAGCTCCCGCTTGGCTATCTTCAGCAGCGATTCGGACAG---CATCGAGACGTCGCTATCCTCCA--ATACCTTGGTCTCCTTCATCACTTGGCACTGTTCCTTCTCAGCTGCGGCT-GCTGCTGCTGTTCAATGTGGCGTATGCGTAATGTCA--GCCGGCTGTTTGGAGAGAAGGCAGCAAGAAACATAAGTAAGCATATAGTTAATTTT---------ATTATCTATTTCAATTTAGTAATACATGAAAATAGTTTTGTTTACGCGAGCGCTCG---------ATCCACAAACGCGT-AAATATTTTTTTAACT-
>PGRP-LD 5757191 5758632|6074 chr3L 5756600 5759012 scaffold_12 630314 632623 - 74990|612 2109
AGCAACAAAGAGATGATTCCAAATTATTCCTCTCGTTT---ATTGTACGCCA-AACACAAACACAGTATACAAAGAAGCGCAGGATGAGTAAAGCGGT-TGCCACCGATAAGCGAATCAGGGATCCCC-----------AGGATCGGGCGCTGGC--CAGGATCGGGGGACCGGCGAAGCGTTGCGCATTGGGTT--------AATTGATTGGATGTTGCCTAAGACTAAGGACTATAAACTTAAA----CTACAACTGGCGATCGG-------TTAGTCGAACTCCAGTTTCCGAAAGCTACCCTCGATGGACTCGATTTGTGAAACGAAGTTGGGTCCGCCGGTGGAGGCCTTTCCGGCATTGAAGCTGCTGCGCCGCTGGATGCCGCGATCGGAGCGCAGTATGCTCTTGTCCAGACCGAGAATCAGGTCGCGCTTGGTCGCCAGCTCCTGCTTCCACAGCTCGATCATCTCGCGCATGGGCACCTTGCCACCCATTTCCAGCGGCAGACAGCCCTGGTCCACGCTCTTCATCAGCTCCTTCTCGCTGCCGTAGATGATCAGGCGGTTCTTCATCTTGGAACTGACGCGGTTCTTCACGAAATCAATAAGCCACTTGAGTGTGGATGGTACATTGATCAGGTGGATCTCCTTGTGACGCATGGGCAGCGATTGCTCACCCCACTTGAAGATGCGGGCAAACTCCGTGGGATTCCAGTTGGTCACATGCGCCGTGGTCACGCCGGCGAAGTCGCCCACATGCGTTAGCCCAGTGATCTGTGTTTCCTGATCCTCCATCAAGCACTCGTAGGTGAGGAAGTGCGCCTTGGCCTGGTCGCAGCTTGTGTGGATCTTCGGATTTAGCCCCTTGGCATTGATGACCACCACGCGGCGACCGTGCTTGTCACGCTGTGGCACCGCAAATATGTATCCCTGATCGATGAGGTCGCCGAGACGCGGCTCCAGATAGTCCAGCTGGGTGCTCATGTGCGGGAACGTCCTCCTGATGTTCAGGTACTTGAGCAGCGTCTGCTCGGCCATCGGCACACTGAACTTCTTGGCGCGCAGGAAGCGCAGCAGGAAGGTATCGTCGCATCGCACATTCTGCAGATCCTCGTTCTTGGCCACCCAGTTGCGCAGCTGCTCCAGCGACTGCTCCCGCGTGCATCGATCCTCGCGCAGCTCCCGCTTGGCGATCTTCAGCAGCGCCTCTGGCAGGCCTGTCGTCTCCCCCTGATCCTGCACCATATTCTGCTTTCCTTCTTCGCTGGAAG------------ATCTGCGATTCGTTGGTTCTGCTC--TGTGGT-CACGCG-ATTGGCATGGACTGCGGTCACTACAAAGAATGATAAGAAGTCCACGGATTAGTCGGGTTTTTTCTCAAATCCACATTGTATGATTAATATTTATACTATATATATGTATATGTTCTTA---AAGAGATTGAATTTACTTACTTACATACTTGTAAAATATATAATTAAATT
AGTAA--AACTGAAGCTTCCAAGTTGTTCCTCTCGTTTTTTATTGTACTCCACAAAACAAATAGTTTACA-AAAGAAGCGCAGGATTAATAAAGCGGGGTGCCACCGAAAAGCGAAGCGAGTGCCCGCTCCCAGCCCAGCGGAACAGTTGCTGCCAGCCGGGTAGATGAGCCAACAAAGCGTAGCGCTGCGTGTGCCATTACAAATTAA--GGATAATGCCTATTGCTAAAGCTTAAATGTCTACAATGTCTACG-CTGTGCATCGGATGCATCCTAGTCGAACTCCAGTTTCCGAAAACTGCCCTCGATGGACTCGATCTGTGAGACGAAATTGG---TGCCCGTGCCGTTCTTCTCGGAATTGTAGCTACTGCGTCGCTGTATGCCGCGATCTGAGAGCAGCATGCTTTGATCCAGTGCCAGGACCAGATCCCGCTTGCCGGCCAGCTCCTGTTTCCACAGCTCAATCATCTCACGCATGGGCATGATGCCGCCCATCTCTTGGGGCAGGCAGTCGGCATCGACGGCCTTCATCAGCTCCTTCTCGGTGCCGTAGATGTTAAGACGGTTTTTCATCTTGGAGCTGACGCGATTCTTCACAAAGTCAATCAGCCATTTCAGCGTGGAGGGCACATTGATCAGATGAATCTCCTTGTGACGCATGGGCAGCGATTGTTCGCCCCATTTGAAGACGCGCGCAAATTCCGTGGGATTCCAGTTGGTGACATGCGATGTGGTGACGCCCGCAAAGTCGCCCACATGACTCAGACCCGTGATTTGCGTCTCCTGATCCTCCATCAGGCACTCGTAGGTGAGAAAGTGAGCCTTCGCCTGGTCGCTGCTTGTGTGAAACTTTGGATTCAAACCTTTGGCATTGATGATCACCACCCGCCGGCCGTGCTTGTCCCGCTTCGGCACCGCGAATATGTAGCCCTGTTCGATGAGGTCGCTCAATCGCGGCTCCAGAAAGTCCAGCTTGGTGGCCATGTGCGGGAAGGTGCGTCTAATGTTCAGATACTTGAGCAGCGTCTGCTCAGCCATCGGCACGCTGAACTTTTTGGCGCGCAGAAAACGCAACAGGAACGTATCGTCGCAGCGCACATTCTGCAGATCCTCGTTCTTCAGCACCCAGTTGCGCAGCTGCTCCAGACTCTGCTCCCGCGTGCACTTGTCCTCGCGCAGCTCCCGCTTGGCTATCTTCAGCAGCGATTCGGACAG---CATCGAGACGTCGCTATCCTCCA--ATACCTTGGTCTCCTTCATCACTTGGCACTGTTCCTTCTCAGCTGCGGCT-GCTGCTGCTGTTCAATGTGGCGTATGCGTAATGTCA--GCCGGCTGTTTGGAGAGAAGGCAGCAAGAAACATAAGTAAGCATATAGTTAATTTT---------ATTATCTATTTCAATTTAGTAATACATGAAAATAGTTTTGTTTACGCGAGCGCTCG---------ATCCACAAACGCGT-AAATATTTTTTTAACT-
>CG5537 5785877 5785926|6101 chr3L 5784445 5786627 scaffold_12 1318919 1321212 + 65084|1614 1700
ATACTTGGGTCTA-------------------------------------TCTCGCAGACTTGACGACTAAGCGCTGCTTAGGATAG
ATAGGTAGTCAAAAAAATGAATAAGCAGCAGCAGCAGCATAACAACAGCTCCTCAAAGACTTGACAACTAAGCTCGGCTTAGGATAG
>CG5537 5786012 5786175|6101 chr3L 5784445 5786627 scaffold_12 1318919 1321212 + 65084|1817 1982
ATTGCATTTGAGACACACAGACAAATAGA-CGACCCCTGCGGCCAACCAAACTACTACTTAGCAACTGTTAGCTTTTCACAACTGGCTTTTAATGCAACTCTCAAATACGTTACGTTCGTTACGCACTATTGTAAATATAGAAACGAAATAAATATT-TAAACATT
CCTGCTCTAGAT-------GACTATTAAATCGGAGGTGGAGGTCA--------ACTACTATGCAATTATT-------------TGGCTTTTTATGTAATATGCAAAAATACGCGACTCGTTTATC----TTATGTAAATAGAAACAGAATAAATATTATATATATC
>CG5568 5847290 5847466|6162 chr3L 5845533 5847494 scaffold_17 1409055 1411066 + 42597|1774 1993
TTTTGCATATTTAATTATTGTAATGTTTATGTTGTATTT----------GTATTTTTATT-----------GTATTTGTATTTGTATTTGTTGTAT------TTATCGTAAGCTTTTTAAGAGGTTCGCCA-------------TCTTAGGCATTTTTTCATATTCGCCGAGTAAAAT---AATACCGAAACACATATCGATTACAAAATCGTTAATACA
ATGTGCTCAGTTAATAACAGACAGTTTTAAGAAAAATTTAATAAAGCGGACCTACTTAGTACCAAAAATTAATATTTGTTTTGAACTTTGTTGCACCTGAAATCATTGTGGACGATTTGGAGCATGCGTCAATAACATAATCACTATCAAACAAGAACTTATATTCTACAAGTAAAGGACAAGTGACAAAGCACATTTTAAAGA-AAACTTAATAACAAA
>CG32408 5865298 5865311|6178 chr3L 5864537 5865709 scaffold_12 1429471 1430751 + 25049|877 890
GGCGCATGCTCCAC
GGCGCATGCTCGGC
>CG32409 5874774 5874864|6188 chr3L 5873518 5875552 scaffold_12 1438070 1440061 + 89398|1266 1370
GAAGAATTACACATGCCT--------TAGGACACTTTAATTAACGAAAA-ACACTTTACACT-----TATGCTTAATAAATCTTAGCCATAAGACAAAACATAAA
ACCGAAACAAAAACGGCTGCATTAACTAGGACTTTTTTATTAACAAAAACACAATTTACACGATAAATACAATGATAATATTTAAGCCAC---ATCAAACCTATA
>CG32407 5897455 5897517|6206 chr3L 5896042 5897525 scaffold_12 1471566 1473081 + 31876|1522 1587
ACAACTT---GCCCAACAACTTTGTATTATAGTGTAAATAAAAATACGATATTTATTGACCATACC
CTAATTCCAGGCCTTATATACATATATAAT----TAAATATAATGTGAATATTTA---ACCCAACC
>CG33523 5903234 5904075|6209 chr3L 5901140 5903682 scaffold_12 1476763 1479297 + 18152|2237 2763
TATTTACTTAGCCCGTGCAATTTGACCAGGCAGGAGCTAGACATTGCCG---------------CTCGCGATAGCCACAACAATAACGAAGACGACTGCGAC----------------------------------TGTCCAGAGCTGGAGAACTGTGCCTGTGCTGTTGATTTGATGAATCTAGGTCTGGACTGTGCCGATACGATGGACCAATACGATGGCGAATGCCTCGAGGCACTGATACAGGCGCATCTGCAGCTGTGCCT---CAGCTGTCAGGGCACTGGTGATTGGCAGCTGGGCGGCGTTGCTGCCGGCGGCCATTTGCTGGGATTCATCGCATTCGCAAGGAAGATGGTGCGCGTCGTTCTTTCGCTATCGCTGCTGTGCGGCATCTTGTTCGTGAGCTTCTACCTGGGAAGCAACTACGGCGGAAAC---------------TCCACCACC------ACTACCATAACCACCTCCCTAGCCACAGTCGA-----CTCAGGCAGAGGCAATCGTCA
TATTTACTGTCTCAATGCAATCTGACCATGCAAGACGAAGCCACTGCCAGCGACCAAAACCAACCCAGCAAAAATGACCACAACAACAAAAACAACAACAACAACAACAACAATCAGAACAACGACGACTTCAATATGCACAGA----GAGAACTGCGCTTGTGATT---------TAAGCCTAGGTCTGGAATATACAGAT------GATGAATTCGAT------TGTTTAGAAGCGTTACTCCTGGCTCACCTTCAATTGTCCCTGCGCAGTGGCCAAAGCGTTGGCAGT---CAGATGGGTGGTGTGGCCAATGGTGGTCATCTGCTTGGTCTTGTTGCATTCGCACGTAAAATAGCTCGTGTGCTTCTTTCACTCTCCTTGCTGTGCTGCATACTATTCCTAAGCTTCTATCTGGGTAGCAACTATGACGGCCACAATGAAGGCGGTGTTCACATCGCTTCGTCAACAACAATAACAACAACAACAACCACCACCGACCTATCTCTGGTCGATACCAGCATCA
>CG33523 5903234 5904075|6210 chr3L 5903963 5904333 scaffold_12 1479388 1479826 + 1462|0 117
ATACATATTTTTGTATAAATCTTAAGACCTACCATAAGAGTAA-----CAATTTCGTGTTTCCTGATATTATTGAGTAAATGATGTCTCGCGCTTACGAGACAATCTCCCAATCTTTT
ATATATATATGCATATACTTATACAAAATTACTATATAGATGAGCACATAAATTAGTATTGTATTTTAA-ATTGAGTAAATG-----------------GGCAGCCTCCAACCCGTTT
>CG32406 5999575 6000157|6337 chr3L 5998551 5999767 scaffold_9 3985324 3986600 - 51859|1085 1364
CTAATG------------------GAGGAAATCG------------ATCAACTGGTAGCACAAAATTACATTTAAGT--TCTGGTGCGGCAAAATAGTTTTGCTTGAATCGAACCGATACCAAGAAAATGTGATACTCTATGAAAAAGAAA-----------AACACAGAC--------------------------------------------ACTGCAAATGAAACGCCTAGCTGATAAATGGTGAAAGTATCTCTAGTTTAGTTTAGTTTAGTTCG
TCAGCGATTTATACTCAAGTCTATACGGAAATCGGATCTCATACTAATACAACTTTAGCACAAGATTGCATTTAAGTAAGCATGAAAAGCAAAATAATTTTGCCTAAAAATATTCTATACCA--AAAATGTGATACTCTATGAAAAGAAAAAGGACACAAAGAACACACACACACGCTCATACACACACATCAAATACACTACCCAACACGAATAACTGCAAATGAAACGCCTAGCTGATAAATGGTGAAAATAATTCTAGTTTAGTTTGCTTTTTTTTG
>CG32406 5999575 6000157|6338 chr3L 6000004 6000405 scaffold_9 3987345 3987747 - 13528|0 156
TATAAAAATAATTCAAAAATTATATAATATTCCATGTAAGGAAAACTCTATGTTAAATGTTGTTGCTGCTTCCCACTGTTAAGCATAAATAAATATAT--ACCAAATTGAAATGCATATTTAAATGTAAGCAAAACAGAC-ACAAACCGAAAATCGA
TATAATAATTAATTAAAAATGATATA------TATGTATTACAAATTATATGTTAAATGTTGTTGCTGCTTCA-ATTGTTAAGCGTAAATAAATGTACTAAGCAAA---AATTGCATATTTTAAATTAAGATAAACAAATTGCAAACAAAAAA--AA
>yip7 6010059 6010126|6358 chr3L 6010108 6010287 scaffold_38 748747 748924 + -109|0 22
TAAT----CATGATTTTACACAT
GAATACGAAACAAATGTACACTC
>Jon65Aiv 6014036 6014095|6365 chr3L 6013120 6014080 scaffold_9 1088739 1089594 + 13271|931 975
GAAGGAGTCAGGAACTACAATTTCGCTTAAAAATAAAAATCATTT
TATTAAGTTGGT-------ATCTTGATCAAATATATATATGAATT
>Jon65Aiv 6014036 6014095|6366 chr3L 6014084 6014224 scaffold_9 1080190 1080317 + 313|0 11
AAAAATTCAAAA
AACGAGCAAGAA
>Jon65Aiii 6025608 6025647|6378 chr3L 6024696 6025682 scaffold_9 1093889 1094808 + 17390|934 983
GCACAGCAT--AAATAAAAACGATTAATGA--------CTAAAACCAAAA
GAACTGCATTCAAAATAAACCAATTGATCATCTCGCATTTAAAGCAAACA
>tan 6030508 6030789|6390 chr3L 6029683 6030674 scaffold_9 4054545 4055576 - 26342|886 1063
-----AGAGACTGAATGATCCATCAAATA-CGCCC-CACATTGATTTGCATTGCATTAAAACTAGCTAATAGTGCCCAAAA--ATAAATGTA--CTGATTACCAATTATGAAGTTAGGATTTACGTTCGTTTGGTTAACTTCTCACCTTAGTCTTAAGCCCCATAAAAGTTATAAATG
GAGGTGGAGCTGGAGCTGTTGACCACATGTCGCCCGCCCGTCGAATTGCACTGATACCAATTTAGCAAGTCTTACATAAGATTTTAAATCTAAGCTAGTTA-----TAGGAAGT---GGCCGTCGAGCGTGAAAATAATTTAATCATTTGGCGTCGAGTGCCACAAAACTTATTTATG
>CG6610 6050000 6050046|6417 chr3L 6049934 6050201 scaffold_9 582095 582348 - 2943|66 116
CAAGGTTCCA---TTTGTA-AACATAAATACATTTGTAAAATATCAAAACG
CAATTTTATACATTTTCTACAATCTTAATAAATATGAATAAAATGAAAATG
>CG6619 6055221 6055483|6424 chr3L 6053263 6056484 scaffold_9 590281 593440 - 75000|2055 2330
GT-CAAAGTTGTCTAGACCGTAACGAGATCCGTCTCAAGAATAATATGAGTGCACCATGGGTAGAGGGTGATGATCAAATAGTTTTGAAGTTTGATAGGCGTGTTCAGTTAATAGAGGTTTAAAACTAAATGTTATTTTAAATGAGAAAGAATTGAATGAGTATGAAAAAAAATATTGAATAGAATAAAAGTCGAATCAATCATTTTGATTAGTCTGGTAATTA--AATTATTATTTAAAAATAAAAATAGA----------ATTTTCTTTCTAAA
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TCCGA
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TAT
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CAATCAGAAATCCAGGAGTCGAACTCAGCTGCAGCTGCGTCCACTCCTGCATCCCTCAATAGTCTAAGCCAGCAGCAACAGCAGCAG------------------------------------------CAGCAACAGCAGCAGCAGCAACACCAGCAACAGCAGCAACATCAGCAGCAGCAGCACACACCGAATACACCATCCTCCAGTGCGGGATCATCGGCTACGATGACCA------GCCAGGTGATGTCGCCGCAGAGTCCGCTGGGCAGCTCCTCCGCTGGCAATCAGGCTAACAACAATAATAATAATAATAACAACAACAATAGCAGCACCAACAATAACAATAATAACAATAACAACGAGGAGCAAGTTAAACACCACCAGCAGCAACAGCAACAACAGCAGGCATCCAGCATAGCAGCCGCTGCAGCAGCCGCCATGTACATGGATCCCATGCGCTACCAGCATCCGCACCACCCGCATCCGCATCCGCACCAGCATCCGCACCTGAATCCCGCCCACCATCCGCACCTGTTCCACACGAGCGATCAGTTGCAGCACTCGCA------------------GCAGCAGACCGTCGGCGGCACCAGCAGCAACTCCCAATTGTCACCGGGTGCCGGCAGCAACAGTGGCCTGCCACTCCAGCCGCCCAGTTCCGCCTCGCCGGCCGGATCCGCATCCTCGGTGCTTGGTGGCCATCTCAATCTGAAT---------------CCGCTGCACCAGCACCACCACTATCAGCACCACCATCACCAGCAGCACCACCACCACCAGCAGCAGCAGCAGCAGCTCCACGCCCGCCGACTCTTCGAGTTGAGTCTGCAGTTTGGAGCGGCGGCGGCACCGGGAGCGGTACGGCACTTTAACAGCTTTGGCGGGGCGGGCGGAGCGGGTGGCGAATAGCATTCGTCGGCCGCCTGGTTCGGCTATGAGTCCTCCTAGGATTCGGCGTCGAATGGGTGGCCGCATTTCAAGCGGGAGCAGCCCTAGAATCG
CAATCAGAAATCCAGGAGTCGAACTCAGCTGCAGCTGCGTCCACTCCTGC------CAACAGTCTGCACCAGCAACAACAGCAACAGCAGCAACACCAACAGCAACAACAACAGCAACACCAACAACAACAGCAACAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAACAACAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCTCACGCCCAATACGCCCTCTTCTAGTGCGGGCTCCTCGGTGACGATGACCAGTCAGGGTCAGGTGATGTCGCCGCAGAGCCCCTTGGGCAGCTCCTCAGCTGGTGGTCAGACGAATAAC---------AATAACAACAACAATAATAGCAGCACCAACAAT---AATAATAACAACAACAACGAGGAGCAAGTGAAGCAACAACAACAGCAA---CAACAACAGCAGGCATCCAGCATAGCAGCCGCTGCAGCAGCTGCCATGTACATGGATCCTATGCGCTACCAACACGCGCACCATGCCCAT---CATCCGCACCAGCATCCGCATCTGAATCCCGCGCATCATCCGCACCTATTCCATACCAGCGATCAGCTGCAACATCCGCACGCCCAGCATCTGCAATCGCAGCAGACGGGCGG------CAGCAGCAGCTCCCAGCTTTCGCCCGGGGCGGGCAGCAATAGCGGGCTGCCACTGCAGCCGCCTAGCGCCGCCTCGCCG---GGCTCGGCATCCAGTGTGCTGGGCGGACATCTCAATCTGAATGCCCACTCGGCGGCGGCACTGCACCAGCATCATCATTACCAGCACCATCATCATCAGCAGCACCATCATCATCAGCAGCAGCAGCAGCAGCTGCACGCCCGTCGCCTCTTCGAGCTGAGTCTGCAGTTTGGTGCTGCCGCCGCGCCGGGTGCAGTGCGTCATTTCAATAGCTTTGGCGG---CGGCGGTGCGGGCGGTGAATAGCATTCGTCGGCCGCCTGGTTTGGTTACGAGTCCTCCTAGGACACAATGCCAGACGGGTGGCCGGAATGCAAGCGCGAGCAGCCCTAAAAGCG
>vvl 6766057 6767489|7112 chr3L 6767174 6767368 scaffold_23 1552275 1552436 + -724|0 199
AAAATTTGAAAATAGCATTTCACAGT---GTTCTTAAAATCT-GTTACTAAATTGGCGACTGAAAAAAATCATTTTAAACATATATACTTAAACAATATGA-ACCATATTGAGTTCCACGTTAGACAAGCTCGACTGTATGCAAATCTTTAAAGAATAGAAATAAGATGAGGTCCGTCGATGAGGTTGAGAAATCATCTT
AAAATTTGTAATGAAGCTTTAACAAGTCAATATTTAAAGTCTTGAGAGCAAATTAACCACTGAAGCGATTGATTCTAATT-TGTAAGGTTGGATAAGAGAAGAAGATGTCTTTGTCAACTGGGAAAGTGCTCGA----------------AAATTATATGGATAGCATATGTTCAGT---------------------TT
>vvl 6766057 6767489|7113 chr3L 6767369 6767425 scaffold_38 589281 589339 - 2850|0 58
TTTTACCAGTGCATTAATCTGTGTTAAACTTCAGCTTAAATAGGAGC--AGGGAGTGGA
TTTTACCAGTGCATTAATCTGTGTTACAACTTGAACTAAGTAGTAGTTAGGGCAGTGGA
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ATTTTAGTTTG-----TTTTAAAGTTTGAAAAACT
ATTTTTGTTTCCAAACTTTCAAAGTTTCAAAAACT
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TATCTATATATGTAAACAGCCGGCAGA--CGGAGGATGCACCCACGTTCAGACACACACACACACACAACCACTCACAGTTGGAAAAACTGCAGCCAAAGAGGAAAGCTAAAATTAACCAAAATTATAAGAATACGAAACCCGTGACAAAACACACAGTAAA
TATCTATATATGTAAACAGCAGGCAGAATCGTAGCAAAC---------CAAACACA-------ACATAATTAGTC-----------AACTGC-GCCAAAGAAACAA---AAATTTAAACAAAATT------------------------AACACAC-----A
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TTTCCAGTTCACATACTCTCAAACTTTAT-----TTTTAAAAAACAGAATATAA---------CTAAGATTAAACCTTGCACTTGTCCAATTCCAACCATGCCACTTTCGGCTTGACAATGAACTGATCGCGCGGCAAACTGTCCAGCATGCTGGCCTGCTGGCGGACGTACTTCACCAGTCGCTCGATCTGCGCGTAATCATCACAGTTCATCTCGAAGAAGCGGCGCCACAAGGCGCAGGCCAAAACCCGATCGTCGGACATGATGCCCTCGTCGTAGGCGATTAGGGCCGCTTGGAACTGCTCGGATAAGGTCTCGATTTGCTGACGGGTGCGTGAAGGATTGTGAGCCTGTTGGGAAACACATATGAAGAGCATAAAGATTATATATATAAAGGTGAACTAAAGTAAAACCTACTCCCAATTTCTTGGCGCGTGTGTTAACATCTCCCCACATCGCCTCCACAATGCAGTTGCGCAGGAAGCGTCCATCCTCGCCCGTTTCGG
ATCTTAGGCT--------TAGAAGTGTATATAGACTTTAATAAACAAACTAAAAGAACATTTTCTATGCATCAACTTTACACTTGTCCAGATCGAGCCAAGCAACGTTAGGCTTCGTTATGAACTGATCCCGAGTTAAACTATCCAACATAAACGCCTGTTCCCGTACATACTTGACTAGACGCTCAATTTTGGCATAGTCTTCGCAGTCCATTTCAAAGAAGCGACGCCACAGAGCACAGGCCAGCACTCGGTCGTCGGACATGATGCCCTCGTCGTAGGCAATGAGCGCCGCCTGAAACTGTTCAGACAGGGTCTCGATTTGCTTTCGCGTACGTGAGGGATTATTGGCCT--TAAAAAGCA---GTAAGGAAAATAAACA----ACGCACTACGTTGAACTC---CAAGACTTACTCCAAGTTTTTTGGCGCGTGTATTTACATCTCCCCACATGGCCTCCACAATACAGTTGCGCAGAAAGCGTCCATCCTCGCCGGCTTCCG
>Surf1 6933469 6933494|7289 chr3L 6929943 6933710 scaffold_38 791585 795308 - 90898|3756 3781
AAAAGGGAACCCAAATCAAACGCACT
------GACGCCAATTT--ATGAAGT
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TGGAA---------AAGTGGCCAAGTCAAG-TGTAATTTTGTAC----------------TCGTCAG------CGAG--------TTGTTT--TATTTTTTGCTTTCG-CATGA--------------GTTTTATAATATATTTTTCGGCTCCGCTGGGAGTTAATCCTT
AGCAACCAAAAATGAAATGTGCAAACTAAGCTATAATAATGTATACAAATACACATTGGAGCGTCTGGAAATACGAGATTTAGCTTTGTTTAATGTTTTGTGCATTCGACATGATATGCATGTTCGATTTTATATAAAAAATTTCTTAGCTGTGC------TTAGTCCTT
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------CCATCCTCA-----------------ACTTGGGATGGCGTGCAT-----------CAATATTACCTCAAAGGACACAATAATCACGTTTAA--TTAGGCTCTAAGTAGTGGCACAGTAAAAGTAGTTGCATAGCGCATAG---AAGGGAAACT------ATAATATACATGAATATAAATAGAAATAAACACAAATTATTTATAAAA-
TGCGGCCCGATCTTATTGGGCATTACTACCGTACATGCAAACGTGTGTATGAGTTATTTTGCATTATTACCTCAAAGG-----ATAATCAAGTTTAATGTTAGCTATTAAGTAGTTGCAGA-CAAAGTTAGTTGCTTAGTGCGTAATCCAAGGAATTCTTATCAAATAAAATATAT-CATATAATTAG----------CAAGTATTTATAAAGC
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GAGACCACCTAGAGAGAAGCATGGGCGGGAAACGGTATTTGTAACTGTAACGCGCATTATATGAATACCAATGCAATACAAATGTGAACACCACAACACACCAATACCAATGCCATACTCATG---------AACACTCAGACACACACAAACACAT------ACACATTTAATGTAAACGTATATCATGGCCATGCATATAATCAGAGGATTCCAACT--AAACCAAA-----AAATACTCAAGTAAGCGATCGATTAACAATTGCATAGTGAAATATG---AAGATACATATATACTTACATACTACTTACATACGA------------ATTACTAGACAGGTAT-ATATATATATATATATATTCACAATATATATATACATCA-TTATTTCTTATGCTC--GACAGGCAACAAGC--------ATTTTTGTACAAGCGAGTTATGTATTAGTAA---------------TCGTAGCCTAATACATAGTCAAAATATATAAAAACTA--AGCTAATTTTGTAATTA
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A
A
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CATTACAGCTGCACTTGGC----TCACCGCTCCTCAGCGATGACTGTTTGGAGTGCATTGCAGCAACGGCCACGGACCATAAGCCAGCAATGTGCGGG--CCAAG-------------CCCATGTAGCATCTATCGTATCTCCCGGCCGTATTGGCAGGATGCGATACGG--------CTCGGTCAGTTCATTGCAGCACAGG
>CG14823 7041951 7042182|7396 chr3L 7041882 7043463 scaffold_38 992322 993927 - 7397|70 301
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ATTACGAGAGTTGCGTATCAAATCCAGAGTGTGCCACAGAAACTGTGCGCAGCTTCATAACATCATACGCCAG---GGACTGCGACGGTGATGGACTGATTCTGTGTCGTGATCACATAATGCTTCATCAACTGGGACCGACAGGCTGCCT---ACAGAGGACGTTGCCGGCTTTTTCCAGAAACCGCATGGATGTTTGTCTGAGACAGAAAGAGCTTGAATAGAGACGAGC
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ATGGGCTTGCCACCACCACCATCACATGTTGAGCGTTATTCGAGCTAGTTTTAAGTCATTTGAAAATAAACTTTGTTTGAGCCATCAACCATTTCC---ATAAACAA
GTG---TCGCCCTTGCAACTATCCTAGTTT--TCATTAATTCTTACAATTTTAACTTTT-------TAAACATTCTGGAAGCGTTAAGCTGTCTACAGGATAACCAC
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GGGC
AGTC
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AGTCATCGTCCAAGTTAACGTCCCAAGTTTACA----CATGTTACAAA----------CGCGAATGCATCCAACTCCAAGCCGTCCAAG----CGACA------------------------ATTTCGAATTTCTAAGCAGGAT-CTGAAACACAAATCAGCACACACATAGTTGTTACAGTTGCAATA--------------------------TTTTGAGAAATTATACA-------------AATCTTAAG----------------------AATTCCCTGCACATTCCA-----------------ACTCAAGGTCCGCAAATCCTTAATACAAAAG---------------ACAACAACTTTCCAACTC--------TTAAATATATTTGAGCACA---------------AAAAAC-------------------AAGGCATGACAAAAATACTAGCATGTACTACTCAACTAAA---------------ACTTAGGTTAAGC
AGGCATCGTCCAAGTTAACGTCCCAAGTTTACAAACTCATTGAACAAAGACAACAAGTTACAAACGCATCTAA-TCTAAGCCGTCCAAGCAAACGACATCAAACAACAAATTAATACAAAACATTTCGAATTTCTAGGCAGGATGATTTTGCACAAACTA--CTCCATATTATTGTTAAAGTAGCACAAGCCCGATCCATGGCTCCCAGAGTTATTTATGAGCAGTTATACACCAAGTAGCAACTAGTTTAGAGTGGGTCCAACGATGGGTCCGATGATTTCCAGCACATTCCAAAGTACACACGTAAAATATTCCAGATTGAGAAACCGCTGAAACAGGTGCGTCGTGGATTCGTCACAAATGTGTTTCAATCCAAAAGGTTTTTCACATATTTT-GCACACTTTTCATCGTTTCCAAGGACCTCTTACATTCTAATCGTTAAGGCATGACAAATATTGT----TGAAATTCTTAAATATATATATGTATTTGAGCACAAAAATAAAAC
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---------AAACCCA-ATCCCAGC--AATT--AGCGATCTTAAAC--CAGCTAGAGA--------CTATTGTAATGT---------------------TACCTTTAATGCGGAATAAACTTCGTATGTTAATTTTGTACTAAAA
GTCGTAGCTGAACTCATATTCCAGCCAAACTGAATTGATTTTAAACAACAACTAGAGAGACTAAAGCTATTTATATATGGTAGACAATACGGAAGCAGATCTTTATAATGCCTAATAAAATTTGATTATC--TTTTACACACAAA
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TCCTGGCGGAGAAG------------GAGGGGCACATGCCGC--GGAGAA----GACACACGCGAGATGACCGCAAG---------------------------------------------CGGGATCGTTCCCGGTCTCGCGGTCGCTCCCGTGGTCACTCGCGTGGTCGTTCTCATGGGCGTTCTC
CCTCTGCAAAGGAGCATGAACGCCCAAAGGTGGCCGAACCGCCAGCAGAAAGTCGCCACAAGCGAGATGAACGCAAGAACGCAGAAGACAAAATCCGCGAGCGAGAAAAATCTAAGCGCAGTCGAGAACGTTCCAGTTCACGCAATCGGCACAGGAGTCGATCCCGTTCCGCTCAACGCAGACGTTCTC
>CG8616 7214112 7214200|7553 chr3L 7213979 7214915 scaffold_12 606254 607198 + 54168|133 255
TACAACCGAT----------------TACCGCACAGATTAAGGACTTTCTTTTTCACCTTTTGGAATAAAACTCTTTTATTGCC-------GTGCGATG-----------GCGAGAAAAATCA
CGCGACTAATATATTATTTTTATCCATATTGTACATATCAA-----TTGTTTTTCACTTTTTGGAATAAAAGTTCTTTATTGCCACAATGAGCGCAACGTTTTCTTCCTCGATTGACAAATCA
>Neos 7217001 7217086|7555 chr3L 7215691 7217837 scaffold_12 2832516 2834567 - 64949|1344 1429
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A-------------------------------------TCGGAACACTTTA---TTAATAA-------------------------
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----------TTATAATTGTTAATGGATTTATTGATGTGTATAAATG--TTGTAAACGATGATA
AGCTGATCCATTTGTATTGTAAATGCTTTTATTG-TGTATATAAATGAATTG-AAATTGTGATA
>CG8605 7300093 7300205|7657 chr3L 7299033 7300121 scaffold_9 2551979 2553042 - 63004|1065 1093
GTGATGGAAATTAATTTAAGCTAGTTAAT
------GAAATAAACGCAAGCGTGGCAAT
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ATTCTACAAGTTATGGAATTTCATTGTACTTATACCTAACTTTGAATGCATTGAATTATTTTCTAGTATTTACCTTATATTGTATTATTGAATAA---------GATATTGTTACTTGGTATTTTGCGATCTAAATTTATTGTATGTAAAATTGATAAAACTCAAATACATTCAACACTTTTGTTTG
--------------------TCGACGCATTTGTACCCTGCTC----------------TTTTTTAAGATTTGTAAAATATGGGAATGTTTAGTGATTCTTGAGTGCTACATTTATTAG--ATTCTCTGTTGTAATTTTTTCTTATTCATATTTTTTAAATGTTAATT-------GGGCTTTATTTTG
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GATGAGTTTTACTATCACGGCAGCAGCTGAGTAGCGGTTGCACTACCCATGCCC----------CTGCCAATGGGTCACACATTCTACC---ACACGACCAGCAATCGAAGAACGGCGCCTGTGGACTGCTGGCTGCTCTGCTGGTCGCCAGCGGCGGCCTACTACCATCACCACCAAGCACACCAGCAGC---------ACATGCTGATGCCGACGACA
GATGAGTTTTATTATAACGGCAGCAGCTGAGTGACAGCAGCAGCTGCTTTGGGCGGTGCATTTGCAGCAACTGCGCCACCATTAATACCCATATACAACTTTAACGCTTTTAACGGTGCAT----CATGTTGGCTACTCTGCTGGTCGCCGACG---------CATCATTATCCTCAACTGCAGCAGTTGCCGTTCTTACATATGTGGATACCACCGCCA
>lark 7315418 7315843|7666 chr3L 7315636 7317924 scaffold_38 896029 898342 - 71464|0 307
GCCTTGGTAAAC-CACATACATGTTACTAAAC----------CCAAACTAACCATTACTCGTACACTTA----------------------------------AACAAGAAGATGGAAA--------------------TACGTGTTTAAGCAT---------------CCTCCCTATATGCAAAACACGCCAAAAAAAAAAA-----------AGAACTAGACAACGACGTGCAACCTCTACACATT------CAACCGT---AGTACCAATAAACGCATAATCAGTCGAAACTGTGCAAAAATAAA
GCAATAACAAACGCAAAAACAAAATAATAATCATCATCATCGTCCATCTAGGCATCCCTATCATACCTATCATAATTATGTAGCACTGACTGATAATGACGACAACAATAATGTGGCAGGTAACAAATATTACCAGCATTATATGTTTCATTATTTCATCAAAGAAGTTCATTCTTAAGCGTAAATAACTACAAACTATTGGATTTGTGTGATTAGAATAAACCAATAAACTTCAGCACCAATATATGTTTGTGCGATCGTGAAAAAAGAAACAAAAATATAACCATGTGAA-----GACAACATAAA
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CAGCCAAAGAGGCAAAAGAGGGAGCAGTCGTGAATTGCGAACGGCAGAGCC------------------------TCTTTTGCCGCCAATCCGGGA------------------CAGCAGCAGGCCAGCAGC--------CAGCCGACGCCTGCGTGCCTCAGTGCGCCCCTGTTGCGTTTCCTGCAGAAGCTGAAGATATTCTGAGATTTATGTTA-----------CCCTTTGCCAAACCGAAAAGCCCACAGAGAACCCCTACCTTACTGTCAACCGAAACCAGAGCGATGAGAACGGAAATAGGAGGAGGATAGGATTTGGATTTGATAGTGAATCGGATGAAATGGGATGGATAACAAAACCAACAGCAGCCTTACAGAAAATTGTTAAGCCAAAA
CAGCCAAAGAGGCAGAAGAGGGAGCAGTTGTGAATTGCAAATGGCAGTGCCAAAGCCCACGCCAGAGCCGCCTCCTCTTTTGCTGCTAATCCAAAAGCAACGCAACAGCCACAACAGCAGCAG--CAGCAACAACAACATCAACATCAAGCAGCCTGCTTTAGTGCGCCGCTGTTGCGTTTTCTGCAGAAACTGAAAATTTTCTAAGGATTTTATTATGTATTTGGTTCAGTTTGCC---TCCCAAAGCTGCTACAGAGCAAATGGTTTGAATTTATTTGAACACAAAACTTAGGAAAT---------------------TATTGATTTATTGATTGATAG-----------------AACCAACACAGCAGCAGCCTTACAAAAAAATGTTAAGCCAAAA
>qm 7327290 7327578|7672 chr3L 7325175 7330689 scaffold_38 905884 911110 - 150636|2260 2556
TTATACACATGAAAGAAACAAAAAGAAATAAACGGCAAGAGAAACCGGAAAAATAACAAGAAAATTAACCAGATTGCTGAAGTGGAAATGGAAAACTATAAACTATGCGAACATTTTACGGTAGAAACGACAACTAATAGCCGAGAATTTACAGTGCACGCCCAGATGCAGCTAAACGCAAACGCACCTAACATTTTGCCCATATACTATATACTACTAATGAAA-ACATTGAAATATATGTAAATGTATTTAAATAAA-------TATTTATGCCAAGTTGTCAACTAAAGTTTAA
----------------------------TACATGGCACGAAAA----------------GAAAACTACTACAAATGCTGAAGAGA-----------------------------TTTATTGTGAAAG--------AATAGCCGAGAATTTATTGAGCACGCCAAAATGCACCT---CGTAA-------TAACAATGTGCGAATAT--TACATACATATATTGTCATACACGAAAGTATCTTTGAA-ATATTTAAATAAAAATATTGTATTTATGCCAAGAT-----TGAAGGAATAC
>CG8583 7337979 7338313|7679 chr3L 7337797 7338058 scaffold_32 263175 263472 + 12901|182 298
--ATCCACTGTCTACATGGACAGTGCGACGGACGGACGGACGGATGGATAG------------------------ACGTCCTGAACCC----------CAATCAAC-CTCAACCTCC
ACATCCAC-ACACACAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGGGAGAGAGTGAGAGCGAGAGTTTCTCATGACATTGAGCGAATTTCGAACCCCTCCACAGAACAATCGTCTTTTAATCTCC
>CG8583 7337979 7338313|7680 chr3L 7338090 7338299 scaffold_32 263516 263756 + 5402|0 261
CTTTGTTTTCCTT----TTAGTAAATGAGTTTCGCGTGGCGCGTGGCGGAGGCACACCAAT-GCGAACCCTTCCTTCGCATTTTTACTAG-TTTTGTAATGGA-----------------------------AAAGACCCCG-AACTAGTGCGTAAATAACTATA---------ACTTCATTTTACCGTGTACTGTACT-AAACATAATTAT---AATGTACTGTATATTTAATTATTTGGATACAA---GAACTAAAAGTG
TTTTATTTTTTTTTTAATTAGTAAATGATTTT--------GCGTTGCGAAA----ACCATTCGCATATTCTT--------TTTTAACTAGTTTTTGTAATTAAAGCAAACAAACAGACAAACGAACATGGATAAAGAGCCCGAAACTAGAGCGTAAATAAATAAGTAAAAGAATACTTCATTTTAATGTCT-CTGTACTAAAACGTAATTATATAAATGTACTGTATATTTAATTATTTGGATACAAACGAAACGAAAAGAA
>CG8583 7337979 7338313|7681 chr3L 7338300 7338684 scaffold_50 202456 202845 - -2023|0 13
AGACACGTAAATAC
AAATGCAAAACTTC
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AGCTGTGTACACAGCTGTAGCCTCAGAAAGAAGAAATTAATAATTGCACTACGATCTTATGTGACGGTAGATCTACCGCGACAACAACAGCCCTCATAAACTATAACAAACAACAAATAAGGAAACTAAAGCAAACGCAAAACAAACCAACAAAAAAAAAAAACCTAAAAAGCAAAAAACCTAA--AAACAAACAAAAAAAAAAAAACAAACTACAACATACATCGTGTTTA--ATATATTTTGAAATACACGCGAAGAAAACGGTTATAGTTTATGCCTAGATTTACATATAT--------------------------------ATATTGTATCG-GTTAGCAGCAAAG---GGATGAATTATTTA------------AAAGCAAGCAAAAACCACAAAAGAGAGAAACCAACAAACCAACTTGTTA-AATTTATGTTTTTCACATAACGCAAATTCTAAAT-AAAATGACAAATATCA
GGCAGC--------CCAAATTCTC-----------ACTATGAAATGCACTACGATCTTATGTGACGGTGGTTC--------------CAGCC-----------------GCAACAGAAAATG---CTAAAAGAAAGAAAAAACAA--CAACAACAACAACA-----------TAGAAGCCCTCATTTAAAAAACAAAAAAAAAAAAACAA--------CTGCATTGTGTTTATTATATATTTTGAAATAT--------AAAAGAGTTATAGTTTAAAACTAGAATAACATATATAAAAAAAAAAAAAAAAACAAAAAACAAACAAAAAAATGTATTGAAAAAGCAACAAAGCGCGAAGAAATAGTTTACGGCTTAAGCGCAAAGCAAACAACAAACAACAAACAAACAAA--AGAAAACAAACTTGTTACAATTTACG-TTTTCACATAACGAAAATTCTAAATAAAAATGACAAATATCT
>smid 7359356 7359590|7695 chr3L 7358985 7359389 scaffold_32 279710 280116 + 15296|378 411
ACCGATCAACAATAATGAGTTTGTTGATTTAGCA
ATACCTGAACGCT--TGGCACTGTTGTACTAGTA
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AAGGCGCCACTGTATTTCCTAAGCCCTAAAGCAATTGAATTTATTGTTTGTTAAAAACTAAAATTATAAGTCACCTCGTTGTTAAGCATTAAAGAGATGAATAGTGAATAAA
GTATTTTGGCCG----TCCTTAGCATTTAAGCAATTGAATTTATAATTGTT----AATTTAACTAATTAGTGTCATTGTTGTTAGGCATTAAAGTGAGAAAGTGAGACAAAA
>CG32379 7371163 7372156|7710 chr3L 7370381 7373676 scaffold_32 298169 301236 + 102938|783 1781
TTTTTAATTCATTGATGGTAACTGCTTGATAGAAAAGTAATTCGTTTTTAAGTGACCACTGAGATAGCAGTTAATTTTTAAGATAGCTGCTATTTACTATGATATTTATCAACTTGATTAAAGAAATCTCAAGATATGGCAAGAATGACTAGCTCCTTTGGGTTATCAATATGCTCTATATTTTTAGATTTAAATTATC-ACTTACAAATATTTTAAATTCAATAGATATTGTATTCAAAATTGAAATAACTGATTATAAATTTTGGTTTTTTATGGAACAATATTTTCCAGATATTATGTAAGCTTTTGTTGATAGTAAATTAGATTTTTCTTTTAATTGATAACGATATAATTTATTGGTGGCTTAGATAGCAAAATGCGACTTTATCTCAATCAAAAAGTTATTTCTTTGTGCTTACATAACAAGT---ACAATTAAGGCAGTTTCTAAGTAAACCATCTAAATATTATTAGGCCTATCAAAACTATTAGAAATTAAACAATTGTTT-TTTTACTTGCCTAGTTTCTAAAGCAATATTTCTCTTCTTAATCTTTATATGTAATAAAATAATAATTATTGTTATTTAATTCACCCAGCGACTTTCCGGATACCTATCAGGACATGATGTCCGTTGCGGATGCGGGTGCCAAGGCGATCATTTACTCAACGAATGGAATATATAGCTACGGAAGTACATATTATGTGCTATATCCAACATCCGGCGATACGACAGACTTTGCGTTTGGAGTGGTGAATGCCACAGTTGCCATGACCATGGAGCTGCCGGCTGCAGGTTTCCAGGGATTCGATCCCTGGATTTCCCAAATCGAGCGATTGGTCACGGAAAGTTGGGTGGGAGTGCGAGCCATGGCCGCAGAGGTGATAAGACGCTATCCGTCGTAATCGGGCTGTAAATAAATAGACATTAGCGTCGAGTTGCGCCAGCTCTGATTTGCGGGTCACTCGTGCGGGAGTTTTGGAGTGGTTTATTATTTA
CTCTAAATT-------------------------AAATAATT-------------CCAATAAGTCA--AATTAAATCAGTAAATAATTGGTATT----------------AAATTAATTAAAGTAAGGTC-----ATGTTTATAATAGCAAACCTATTGCAGAAGGCAGACCGTGATTCGAATCTTAATCTAGACCATCGAGTTATA-------------------ATGCTGTCTTCCCATTTACAA----TGTTGCTGGAT----GTTTTTTAT-----------------------------TTTAAGTTGAGAATAAAGTTAAGCTTACTTTT--TTAAAGACCAC------------TAGCTCACAAATCCTAGGGCCAAGACAGCCCAACAGCCAAGT--------------------ACAAGTCTGAGAATCGAGCAAGGATTCAGTTATACTGAGGAATTATGAT----------ATATATGTTCTACGCTAAATATATGTCTATGTTTCAAGACAGATTTTGAAAA-----------TTTTTAGTCTAAGTATAACCTATTA-AATAGCTCTTTTACCTTGCTTTTCGCAGTGCCTTCCCCTCAAATTACTTTGATATGATGGAAGTGGCGGATGCGGGCGCCATGGCGATCGTACAGGCTACCAATGGCATTTATAGCTACGGCAGTGGATATCATTTGATGTACCCTACGTCCGGTGATTCCATAGATTATGCTGTGGGCGTTGCCAATGCAACGGTGGCCATAACCATGGAACTGCCAGCTGGCGGATTCCTTGGCTTCGATCCGTGGGTCTCGCACATCGAGGGCATTGTCACCGAAAGTTGGGTGGGTGTGCGTGCCATGGCCCTGGAGGTGATAAGACGTTACCAG-----ACTCGGTCGTAAATAAAGA-----TAGTCTTGTGTCCCAACAACTTTGATTTCGGTG----------------TTCGGATACGCTTCTAATTTA
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ATAAA
ATAAA
>CG8562 7373672 7373859|7711 chr3L 7373677 7373792 scaffold_32 1064557 1064663 - -510|0 115
TAAATTAATCTATAAAACACACAATATACACAATATACCCACTGATGATAGAGACGTAAACGTTACAATATTTCAAATATTTTTCAGTGGATTGTTTATAAGCTTTCTTTGTTATG
CGGATCAAAGTCTGCAGC------TAGTCACATTTCTTCTTCGTATAGTCTA---GCGAATATCATGAAAATTCTATTGCTTTTAGCGGTTATCTCTTTATGCTCTCGCTAACATG
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--------------CAACTAAAGC---CCTATCTTTAAATGTGT--------------------AATAAATTGGAAAACCCTC---------------CTAGGGTAACCTAACGAGTATTTGAGTCTATGAATTCTTTTCCATAAACAATATACGAAG-----------------TTCTTGAA
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CGATTGCAATAAGTTCACAATATTCATATATTTTTTTAATGCAATGATTAAAA
TGGGCATTTTTA-TTTACGATAAATATAT-TTTATATTATACAATTTATGCAA
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TAAAAAAAATTAAAACAA
CAAAAAAAATTTAACCAG
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GGAGCAAATCCCAACCCACAAGTATGTGGTCTGAGCGGGTCACCGAAAGGTTTGGTAGTGTAAAAAAGTGACTTGCAGTTCTATTCGGATTTGGGAAGCAATCCTAAAGAACATCTCTGAACTTTAGGGCTATTTTCCAACATTGCATGGAACTTAAGCAGCAGATTTTCATGTGAATTGCAATTTTGGGTGCGGTTTTCAATTCACATTGTACCGGGCATGAGTATTGGCATTCTGGCGGGCGAGACAAATTGGATGCTG--CCGGCTATCGTCATATTTCACGGAC---TGCAATCAATAACGATAAACACTTGAGTCGCAAATCCAA----------TGTCCAGAATCCTGTCCAACAA--CGGCATGCATATGGATGAGCCAATAAAGAAATCAACAAAGCATGTCGGGCGATTGAAAAAGTATTGCAAATACCCCGGATAGCTGGGGATTCGGACACGGAATTGGACTCCAATCCGGACAATATGC---------AAATGCAGCTAAGC-----AGAAAATATTCAAGGACGATCCAGCCCCACCCCCTTCAACAAACGCTCA-AGTTT--ATATATTCATTTT-GTGTCCCTCGTCCCGCGCATAAATTTTATTGTTGTCAACATTAAATTCTAGTCGTG
CAAGCAAATCAAAGCGCCGCAGC--GTAGTCTGCGCGACTTGTGGAAAGACC----------------------GCATCATACTCTAGATTTCG--------------------------ATTTTGTTTTTTTTTTTTTTTGTCGTGT----CTCAAGCAACAAATTG------AATTTGCA-------------TTTGCAAGACAAATTGGAT--GGCATTGAAATTGGCAATGGGCTGGGT-------ATTGGCAGCCGGGCTTACACTTCTCATATTTCACCAACAGCTGCAATCAATAACGATAAACACTCGAGTGTCTGACCAAAGCGAAATGCTCGTCGGAGCCCTTGTCCGAGTGTCCGTTCTGCATATGCATGAGCCAATAAAGAAATCAACAAAG--------GCGAATCCCAAC-TATTGCAAATACCC---AAACACCAGAACACACACAGTGGAT--------ATTCGAAACAATATGCCAAAGGAGAGAATGCAGCCAAGCGACTAAGCACATGTTCAAGGACAATCTC------------------AATGCTCAGAGCTTGGATGTTTTCATTTTTATATGTATGTAAGTGCATATAAATTTTATTGTTGTCAACATTAAATC---------
>CG7546 7490414 7491263|7853 chr3L 7489767 7491343 scaffold_32 439022 440821 + 27114|683 1768
GGGGCAGATACGGAGACGGAAGCCTGGCCACCTAATGCTTC-TTGTACATTTTACTTTAAT----AAATTGTATTTAATTTAGTTAA-TGGTTAAGTTCTGTTTAAA--------------------TCGAGAAGACGACGAAGATTGCGACAACACCAACACACGGAGTGGAC---------CCTTAGCAAATGCTTCAAACTATTTAGA---ATAATAATATCCAACTG-------ATATTTATCCACA---CACACACAGAGATACACACACACAATGGGT--CAAGACGCAACAGAGCCCAATCAAAAACAATTTTTG-----CGGTGCATGAATGAGCA-----------------------AAATAAACACACATATTAACCGAAACAATGGCGATTGGAATTGGATTAAA--TGGACTTGGATATT-------------AGACCACACACCGAGCGGA-----ATGCTTTCAATTGTCCCAAA--------------------------TGGCGGTGGCGTCCCCGC-----------------GTCGGATGACGTGCTGCAAAATCAG---AACAGACCCGTAG---ACCCGTGACG-------------------------ACAGCCAAATTC-----------CGAATTCCAGCCAAGTATTTTGGCCG--------GCGCCAAATCGCCATTGACGTGAGCCGATGGCACATGATTGCTGGACGGCCGATGACGACCAA--------------TCCGGAATGTGCAG-ATC-TATTCAAGTGGATAAGCCTTCAGCAGAAGCATTACCGGAGGCATATCC---ACACCATCCCATCGTAC--CAGCAACCCGCACCATCCCATTTCATCGTCATCGAAGTCCGAAGCCTACGCTAC---TCTTGTTATTGTTGTCGCCTGCAATCGAAACACGAAA-----ATGTGTCACATAAAAATGTTGAGAATATTTATGTGCAAAAAAAATAAAATAAAAACAAAAAGAAATACCAAGAAGCCGTAAAGAAAAGA----------------AAACATATGAATAAATAATAATTATAAAT
CTGGCGGGT----AGGCGGGCGATTAG-TGCTTAGTGCTTTATTGTAAATGTTACTTTAACTAAAATATTGTATTTAATTTAGTTAATTGGATAAGTTCTGTTTAAAAGCGGCTCGATTGCAGCCTGACCAAAAGGCGGTCCACGCAGTCACATCAAGTGCTCGGGAAGTGGATGATGCTTCGATTCAATACACACATATATATATATATATATATACATATACCTAAACGTATATATATATTTATATATATATTACACACACATACACGCATATATAATTAACTGCAAAACTACACGAAATTGAAGGTCGAAACATTTTAGGACAACTCTGCATTAAAGAATAAAGCTAAATAAAAGTACATGAATAAATTAAGCCACAAATTAAGTTAATTATCGGCCAGTTTAGCTATTTTCAAGCTTAACTTGGCTATTTTCAAATGTCAACAATTAACATTTCAAGCTCATTTAGCTACTTTTTGTTGCTCAAAGCTAACATAGCTATTTTTGGCTATTTTTGAAACTGGCTATTCAGCTATTTTCTGTAAAGGTAGTTGGCCACACTGCTGGGCAATTGGCTCAATTGATCGATGGCGTCCCCGTGTCGGATGACGCAGTGGCCACACTGGCCAGCAGACAAAGCCGTGACGACAAACAAATTCCAGCCAAATATTTTAGCCGCAATTAACGCGGCCAGGCCCCATTGACGTGCACGGATTGTCCAGATATGGGGCTTGGCCAC--ATGATCAATTCCGTTATGGATCTCTGGAATTTGCAGCATCTTGCTTGAGTGGCTAAAC--------------------GAGGAATGCGCCGTAAATTGTCCATTCATATTACAACAACTATCACAAGATAATATA-----TATTAAA-----AAATTCATGCCACATGACTTGATAATGCTACGGCATCTGGCCATAACGGCACAACTTGACGTTTCCATTAAATATCACAAAAA-----------AAAAAAAAAAAAGGAAACACGAAAATATTTGTCACATAAAAATGTTGAAATAATTTATGTGGCAGGCACAAAAATCTGAATAAGTAATAATTAATATT
>CG32372 7500995 7501963|7861 chr3L 7499990 7501386 scaffold_32 452979 454439 + 28155|1125 1576
GTCCTCCGCCTGGGGGTTTGGC-----------TCCTCGGGGGGAATCCCCCGAAAATAACCA--------------------CATTATTTTACTGTAAATCGCAGAGGGATGGAGGCGGTGGAATCGATGGAGAGCGGACGGAGCAGCATGCAAACGGCGGAAGGAGCGAGTTTCGGATTTGTATGCCTTAAGTTAACTTAGTTCTTATGTTTT---ATTTAAGCCATC------------------------GCTAAATCGAACAGTTTGTCAG-ACCAAACGCTTTTTTGTTGAGTTTTTTCGTCGATTTTATGCAAAATTTGATAC-GATTACTGGGTTTTTGATGTAATCCTGCATTCGGGACAAACGTACGAGGACAGTCTTATGATTTAAGCTTATTTGTTGGGGGCTCAATTTCGCGTATGTGTGCTTTGGCGTTGGCAAGCGG
G--------CAGAGTGTGTGCCAAAAAAAAAAAAAACAAAAAGAAAACAACAAAAAAAAACCAGAAAAAAAAACACGCACAACAATTATTTAA--ATAAAAAATAGGCGCTGGCAGGCGTGGGCGTTG--GGTGTGGGGGCGTGGCATGCATCGAGCAGCGTAACGAACAATTT---GGATTGTATGTCTTAAGTTAATTTAGTTTCTATGATTTTCGATTTAAGCGTTTCGAGCGTTTCAGTTTTCAAAAGAAGAAAAACCGAACGAAAAAAAAGAACCGAAAGAAAAACCGGAAAATTCGTTCG--GAATTTACGTGAACCCAAGGACAGATCGACGGACT---------------------------GCGACCGGGGACTGGCTTAAGTTTTAAGTTGATTACTGGGCGG---------GTGGGGGTGGGC-GTGGCGAGGGTACGCGG
>CG32372 7500995 7501963|7862 chr3L 7501653 7501967 scaffold_32 454473 454790 + 12204|0 351
TATATATATTTAATAACTGTATACAC-GTATGAACGTTGAACA-TCTACAAGTAGGTACTTAGAGTTAAA-------------CGACAGCAACAACAAATC-------------------GCATCGAGCTAATGTT-AATAACGAAAAGCACTCACTCACATACAAACACACAAAACCACACACACACAAACACAGCCGTAGTCGTGCACATGCACAAACTGAAAAAAATACGAATAAAAAAAAACGAGAAAATATATTGTTATCAGTTCGTTAACAAAATGAGAAAATAGATTTTAGCGTGTAATTATACGA------AAATGAAAATGGTATTCTAAATAAAATCATAAA
TATAAATATTTAATAACTGTATACACCATATGTACGTTGAAAAGTTTACAAGTAGGTACTTAGAGTTAAACAAAAGGAAAAAGCGAAAACAACAAAAAAATATATATAAACAAAAAACAAACATCGAGTTAATGTTAAAGAACGAGAAAAAC--------------ACACACAAACACACACATACACTCACACAGACGTAGCAACGCACAT--------------AAACACAAAAGAAAAA-------AATATATATTGTTATCAGTTGGTTAACAAA---TGAATTTAGTTTGTAGCACGTAATTATATAAACAAATAAATGAAAATGGTATTCTAAATAAAGTCGTAAA
>lqf 7510983 7512226|7871 chr3L 7510594 7512810 scaffold_32 470772 473139 + 44835|451 1925
ACTGGCGTCGATCAATCACAACAAT--GTAAGCAGAAGGAGCAGCGGGATCATCAATTAAGGGAAAGTCAAC-----TAATAAAGGCCTGAC----TGGTGTATAAGAAGCTGTCCAATAGCGTTAGCAACAA-TAGCAGCAGA-AGCAACC--AACTTTGACT-CTACATAACTGCAGAGAGGGAAATATGAATTAATTAATAA----ATTATGTGTAAGGAAGTATTATTAAAGTGTAAAATATGTGATGTAT-GTGAGAGAGAAAGCCAAGATCCAGCGAAATAGAAATTGAGGAGTTAA--ATAGAAACAGCAACGACACCCAGCCAAGATGAGTAGA-AAAGTTGTGCGCA----GGAAGCTT--ACAAGT----AAACTGAACTTGAGTCTAACACATTTGCAATAATTAAATCTGTAAAAACCAACCCA---------TTAGAAATCGCAACCC-----------------------CTTACGCCC----TTCAGCTGGGGAAT-----CCTTCACTGTCAGTCTTCAAGT----------ACTTCCTTAGTTGATCACTTACTGTTAATTAATTTCTATCCTTGTTGGGGAAAGAACCAAGAAG-----------GCAGCCGCAAAAGGAGATCAATCGA---GTCCAACCTAATGATGCAAAT-TGAAATTAAAAA-----------------------------AATTGTTATATAGCTTTAAAGA---ATGCATTG----GTAAAGCGAATAT----GTTTAA----------AACCATGTTAA-----------ACAAAT--------TATATGTGCTT-GTAATTGTAAATTTTTTTACGTTCATTTTTGTA-----------AAATTTATT-------GTGCGCGCATGTTGCAGAAACCAAATACAATTATTAATGGCTTTTGGCTATCGA-------TTTTTAAACACA--TTTTTACGATTTTTTCGAGTTGACAGTTGATTTG---TTTGTGCATTCGCTTTTGGTCCACCTTCAAGTCAC--------------CAATGCATACGCGAGTTTGCTGTTGAACATTTTTATAGCGAATAGTTTAAAATTTACAAAAACCTTTGAACACATATACAAAGAACAAGATTACAAGAGCAAATCGAAAACTAAAACAAAACAAA-ATAAAATGATGGTATACATTTAGGCTAGAATACGTAACGAATTGTATAAGAGTAACTTAATGATAAACAAAATATACATATATATATATATATAAAAGAAAGCCGATTCGGTGTGAAATTATGCTTAAGAGATTTACATGCCTGACTAGCAAGCGTATACACCCCACAACGCTGATACCCTTTTATATATATGAAGACACACAACCCCAAAAATCACATATACACTTGCAAAC---------------TGCAAATTTTAAGCATATTTTCATATTATTAAA-ACTTTATTTTAACT
---GGAGTCAATCAATCA-ACCAATCAATCAGCAGCAGCAGCTAAAAAATAACAAATAACAGCAACAACAACAACAATAACAACACATTGACGGGGTGGTGCATCGAGCGA----CAACAACAACAATAACAAGTAATAGCAGAGAGCAGCCGCAACAGCAACAACAACAAAACTGAAAA-----AAAAATGAATTAATTGATAACAAAATTATGTGTAAGAAAGTATTATTAAACTGTAAAATATGTGATGTGTTGTATGATTGAACAACAACAACAA---CAACAACAACCAACCAACCAACAACAACAGCTGCAACAGAAACAAAACACAATGTTTAAACAGAGATACGTGCAATGTGTAGGCTTCAACAGTTTTAAAAGTTTTATTTAATTGTAATAGCTCTTCGAAAAAAAA-----CAAAAACAACTCCAAATGTATAGTTAATAATAATAACACGAGCATTAATGCAGCACTGAGGGTTTACGGCCAAAGCTCAACTGCGAACGAAGCGCATTCAAGTTGAGTCG-CAAGTCAAAAGCCCAACTATTTAAATTGGCAGCCCAC-----ATTTATGTTAAACGTTGTTGTAGAAACCAAAAACAAGCGAAAAGTTAAGAAAACGAAACAAAATATTTAATGATCGGTTCAATACAA-GATACAAATACTAAATTGTAAATGCAGCAGCGCAGTGCGATAAGATAATTGAATTGTTATATAGCTTTAAAAATCTGTGCATTGTCTAGAGAAAGAGATATTCACATTTAACAACAACAACAACAACACCAACAACAAGAACAACAAACATTTTTTGTGTATGTGCTTTGTAATTGTAAATTTTTTTAAAATTTTTTTTTTACGTTTTTTGCGATATTTGTTTCTTGTGGCGCGCACA-GCAGCAAAAAAAGAAGAGAAACGCTAACAAAAATTGATAATAATAATCATTTTTTTAAACACAGTTTTTTATGAAATTTTTCAAAATAGAATTTATGTGCGTTTTGTGTGTG---TTTTGGGCCACCTTTCGATAAAACAAAAACCAAATGCAATGCATAT-TATTTTTGCTGTTGAACATTTTTATAGCGCATAGTTTAAAATTTACAAAA-----------CATAAACAAA--ATATTATTATTATTATTATT-----ATTAAAAAAAAACAGCTAAAAGAGAATGGTATACATTTAGGTTAGAATACGTAA-AAATTGTATAAGCGTAACTTAATGATAAACAACAAATATAAAAAAACA---------ACAAAAATCAAACTGATGTGGAA--AGGCTTAAGAGATTTACACAC---ACACGCATATATATATAT------ATATATGTAAATATATATACATATAAACATACACAACTCACACATATACATATACATATATAAACACGTGCTAAAGCAAGTAAAATTGTAAAGCATATTTTCATAAAATTAAACACTTTATTGTAAC-
>CG7526 7543335 7543441|7913 chr3L 7543216 7543417 scaffold_0 4071659 4071871 - 5574|119 213
-TACCCGAAATTATTATGTAATGCT----------TGATGCGCACTTTATATAAATATTTTTGTACGACT-TTTGTATGCCTGACATTTTTCTTA
TTATTTATAATTATTAATAAATAATTTCTAAATAATGATTTATTTTTTGTA-AAGAACATTTGTAAAACTACATGAATTTTTGATACATTTTTTA
>CG33275 7612985 7613528|7993 chr3L 7611624 7614382 scaffold_32 586326 589232 + 71679|1517 2155
AGGAGCTC----CTGGAGCATCGCA--------------TCTAGAT------ATAGT--------ATAAATCCCCATTAATAGCTTTAGC--AGAACGGTTTCATCGGATCCCATGTAGTATCATCGTATTACGTTCGATCGCTAATT-TTATTTCATTATTTTTGTTATTTATTATTTATTACATTTTTAGTTTTCGTTAATTTGTCATAGTCGCTGCTTTTCGT---------TTTGCCTTG----------------TTTATC---------------GGAAAAATCAGTCGAAATTATTGAATTCAGCGTGTCAATGTCGAAGCAAGTTTCATACATATCTAGTTCTTAGTCCACA-CAATCGAACGATCCGCACCACACAC-ACACAGAAATCGATGGGAGC-CATGAGCAGCACCCG-AAAAAGGGGCGTGGCCGATGCCCAACAT-------ATCTGAATCGAACTTCATTACGTACAGTTAGTTG--ATATGTAACCTAAGTGCCTATAGTTAAAATAATCGTAAACGAACATTAAAAAAATATATCTATACTTCATAATAACTCGATAAATAATT-------TTAAGCGAAAATTTAAATTCAATAAATGTTGCTTCAATGTAAAACTAA
TGGAAGTCGAAGTTGAAGTGTCGCAGTTTTCATCTCAGTTTTCGATGCCCGCATAGTTAGTTACGAGAAAAATGAATACATAGCTTTAGCGAAAAACGGTTTCATCAGATTCAGATTTACAT----ATAATACATATGCATACTTATTATTACTATTATTTTTTTGTTATTTATTATTTATTTTTGATTTTAGTTGCGTTAATTTTTTGTCATCAATTTTCATCCTATTGTATTATTTGCCTTGGATGCATTTTCTTACATTTATCACATTCTCTGTTTTTAGAAAATTTA---AAAATTATTGAATTCAATGTGTCAATGTCGAAATATATTTCA--------TAGCTCTTAATCAACCTTAATCTACGCGTACAACCCACACACAACACACAAATCGAGGGGCACACACACAAAGTGCCAGCCGAAATGGGCGTTACC-ACGCCCAAAAGAAAATCAATCGAAATCGAAATTCATAACGTACAGTTAGTTAATATATGTAAATTAAGTGCCTATCTTT-AGATTATCGTAAACAA----TATACATACATAATTGCATATCTTTACAAAT--ATGAATAATGTATACAATTAAGCAAA-----GAATTGAATAAATGTTGCTTCGAAAT--ATTTAG
>CG12262 7695309 7695432|8058 chr3L 7694005 7698006 scaffold_0 5172553 5176403 + 161117|1317 1441
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GACAGATCAATGCAAGG--------CCATGTTCACC---------ATCACCCGCGCTGCAGTCCTCATTCACAAAAACGATTAATAAAAAAATATATATAAGTACTTAAAA------ATAAAAAA
>CG7409 7728942 7729121|8085 chr3L 7728248 7729533 scaffold_12 1818360 1819771 - 36584|746 1030
T---------------CACAGTCTATAGCAT--------------CGTAACTCCG--------------TGTTTTGTTCTTAGTTACTTTCTGTTGGAGCTA---------------------------------------------------AAATTAA---GACAAAAGTAATGCACATATTTCTAAG--------ACTAGAATTGGACTCTTTTTGTTATTAACAAAGCAACGTTTGTTTAGTTAAATAAAATAAAAGTTTAATTTATTAATAATGAATTCA
CACACACACACACACACACATACATTAACACAAGCTAGCCTCAGGCGCAGCACAGCATGTGGAAGCAGTTGTTTTGTTTTTGG----TTTTTGTTGGCGGCACTGCCTTGCGCAAAGCATCCGAAAATGGCACTCGAGACGAATTTTGTTTACAAATTAATTTAATTAATTTAAGATACATTTTCACAAGCGACAACAAATCTTATTGGACT-TTTTTGTAATTAAC-CAGAAACAATT-TTTAGTTAAATAAAATGAAAGTTTAATTTATTAAAAACGAA----
>Hn 7737022 7737115|8094 chr3L 7734274 7737035 scaffold_0 4074475 4077480 - 86797|3080 3093
GTAGAATTCATATA
CTCG-ATTCATATA
>Hn 7737022 7737115|8095 chr3L 7737070 7740366 scaffold_0 4077858 4081235 - 93538|0 45
AATGAATCAAATAATAAATAACATGCAATTATGTAAGTTTTTGTAA
AATACATTTTATAATTTATG-CAAATAATCATATGATATTTTGTAA
>CG32365 7868442 7868761|8270 chr3L 7867158 7868733 scaffold_0 4237201 4238911 - 45383|1461 1802
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GCTGAGCCCATACTCGCACCGATGCCCAAAACCCACCCCAGTG-------------GCATTTCT----------CGCTCCGTTTCAATTAAGTT-----------TTTTAGTTTTTATGTTCTATTACTCGCTAGTGCCTC---TCTCTCTCTCTCTCTCTTTCGTTTAGCTGTTAGCCGTTCCTTAAATTAAATTTCAAAT-TTTTGATTTACGTACGTTATGTATATGATATTATTTTAATTATGTATATGTATTTAGTTTCAGTTTCTTATCGAATACGC-CGCATTTCTACATTTA-ATTATTTGTATAGTTACAAACTAAGTTTCGCAGTATTTATA
>CG8277 7869795 7869961|8271 chr3L 7868779 7870044 scaffold_0 4239417 4240743 - 23743|1126 1300
AAGCGATTGTTTAGGTCCTCTACGTTAGTATATTTTTATTTTTGTACACCAGATTCG-TAAGTGTGGAAGATATGATTGGCTTGGTGTATATGAATATTTACTTGGAATTGCCCCTACAAAATTGTTCTATAGACT-------AAATTAAAAACCTAATTTTCTATGCGCAACAA
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TAAAT--------GCATTTACTACACACACACACATAGAC-AATCACACACACACACATATCACAACAAATTATTTAGTTGATTCAACTCATCATGCTTTAGGTCTGAACAGTAATGTTTCCATTGGCGGTGCGGCCGGAGTGCCAAGTGCTGCCGCCGCCGCCGCCGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCGGCTGCTTCTGGTGGTGCTGGTGGCGATGGCAAATCTACTGAAAAGCCGACCAGTTCAACGAGCGGCGGCAACGCAGGCACCAGCTATGCCTCGGCCGTTAAAGGCGATGAACCGGCTGGTGGCGCCTCGTCCTCCACTTAGGTGCAATTCAAACAACAACAGCAATAAGCGCAACTGGTAGCAAAAAATGATATAAGAAAAAAAAG-AAGAAAAACTCACTCCTCAAAGTACTAAGGACGACGATGATAAAGTGATTGGATTTGGGTCATGCAGCTGGCGACAACTTTGG--------------AGGCGGTAGCTCTGTGGCGTCAAACAAAAAATAAAGTAAATAAATGATTAGGTCTTAGACTTA-----GCTTTTAACGTAATCAATGATGATTCTTCCTCGGTTTATAAGTAAAAAAGTGAAAATGCATAAAACAACATAAAACAAACCCTTAACACATAAATGAGTGACTACCCCCCCCCCCCCTCCCCTCCTCTCTTCACCCTGCCGCAAAACAATTTTTGTTAGTTATAAGT-TCCGTTCGTGGCGCTGCCATTAATAGGAGAAATGCTTTTGTCATACAATCTTAAGTTAGCTGTTATATTTTTTAATAATTTGAACA---TTAAAATTTCATATTAATAAAATTGCCTTTGTAAATTTACATGCATATATTTTTCGTTTAAGCCCTTGACAATCCACCGAAAGTAAATA
>CG8005 8173404 8173438|8587 chr3L 8171053 8173408 scaffold_9 2444028 2446315 + 81812|2441 2445
ATATA
ATATA
>CG13679 8177231 8177293|8593 chr3L 8176866 8177329 scaffold_9 2663222 2663729 - 18560|434 497
TTCAACGGACTGTGAATCCTACGCCTCAATAACAAATTTTTAA-ATACATGATTTTAAAATCCA
AGCGCCAAAATGTGA---CCAATTCTTGACATCCTCTCTCTAGTGTAAATA-----AAGATCCT
>CG8006 8187424 8187576|8608 chr3L 8187512 8188066 scaffold_9 2463428 2463968 + 5416|0 65
GCTGCTCGTTAATTAATTTAAATACTACGCTTT-ATTAAATTAAGAACTGCTGACAGGGATACAAA
GCTGCGCGTAATTTAATTTAATTTGCAAGCTTTTATTAAATTGCAGCCGGGTGAAAGC--------
>CG8012 8189766 8190149|8611 chr3L 8189153 8190990 scaffold_9 2465831 2467579 + 15723|693 1098
AT-CCTGCTGCTGCGGGCCAACCGGAATACTAGGTGAATTTGTAGCTATTCCGGGCTTGTGTACAGTGGCAGCAATGTTCCACTTACTAGAAGCAGTGTGATTGGATTTACAAACGTAAGCTGAGTATAAGAAATTAATAACTTTT----TTGTTTGGTAAATGTAAAAAAAATATTACTCAAAGTGATTGCAATTGCTACAACTAATATAACATTTAAAGTGTCCCTTGTGAAATTAATGTTCCTTAGATTTA----------TAACTAAAATCTATAGCTTTCTTTTGAAATTGAAAATTGGCCCACCTTTAGATAATTCTTTAAGATTATTAATAAACA-ATCCTTGTATAAATA-----TAACAAATATCGAAATGCA-ATAAATAACTGTCAACTCGAAAA
TTGCCTGTTGCT---------------------------------CTTTCATATACTTCAATATATATGCAACTATATT-----------------TATATGTATATGTCCA---------TGGGTGTATGAAATTGATTAAATTTAAACGCGCTTTGTGTGTGTGTGGTGTGTGGTGTGC---GTGTGTGTGTGTGTGCAAGTAAATCTCATATTTTACGCTGTTTTT---------ACGTTGATTCGATTTAGCGGCTGCTGTAAATAAAAT------------TTTAAAA----AAACACACTCATATTTATGAAATC-----AAAATGCTAACACACACACACATGCACACACAAAGACCACCACATACACAAAGACACACACATACACACACACATAAACA
>CG13678 8196789 8196898|8621 chr3L 8196308 8197610 scaffold_9 2473024 2474298 + 15951|523 666
A-----TCCATGGATTGTAAACCCTGCGGAAGATATTGCCCCATGAGCTTGGCTCATGGACTGGCATTTATTT-------------------TCCATGCAACCCCTACTTGTGAT----------GCATTAAACCGTTTAGAAT
ACTGTGTGCATAAATCAT----------GGAAATAGTGCGACATGTTTTTAGACCATG----GGCATATATTTCGCATACCTGCACCTCCAATCCATCCTCCCCCCTCTTGTGATTTTGTTTACGACATAAAA----TAAAAGT
>CG8023 8204369 8204515|8630 chr3L 8204166 8204382 scaffold_9 2481150 2481366 + 7804|209 222
GCCAATTTCCAAGG
---AATTGCCAATG
>Rab-RP3 8272172 8272452|8716 chr3L 8271620 8273260 scaffold_9 2568731 2570592 + 64490|576 964
ACCTA---AATC-----------CGCTCTTTAGTTTGCTTTTACTTTTGTGATCAAATTGTTCTTGTGGCTATATATTAGTATTC-----------------------------------------------------------TAATGCTTT--------AACCTAATCCTAGACACTAACTTTTACACAACCAT--------GTATTTATTTTTGACGATAGAGTACAAA-CAATCTCACACATCA---GCGAATCGAGCCAACAATGTCAATTACAAGGCAATGC-------------TCAGAGAGGCAAA--TACGTCCACTTCTCTATTTGTAATTTGTATTCAATTTGATATGCGACAGTGTCGAAATAAACTCGTTTATTTT
ACATCTCCAATCGATTTGGTTTTCGTTCTCTTTTTTCACTTTTATTTTGTGATCATATT-TTCGTGTGGCTATAATTTAGTATTTATATATATATTTATATATACACATATATATTTATATATATGTTTTAATCTTGAAACTGTTAATTGTTTTGTGTGCAAACTTAATTTATTCATTTAACATACATACAAACATTCATATTTATATTTATTTTGGTGGCTAGAGTACAAAACAATCTCACACATCAAATGCAAAACGAATTAACAACGTCAATTACAAATTAATGCATTAATGTTCAGTTCGTAACAGTAAAAATACGTCCAATTCTGTATGTGTAACG---AGACAATTTTTT---------TTTGGAAATAAACTTGTTTATTTT
>CG13671 8276160 8276293|8718 chr3L 8273995 8276405 scaffold_38 232600 235095 + 54643|2228 2423
CGAA-------ATCCCCCTGAAATATAACTTTAGTTAAAAGTTACCGTT-----------------------------GATATTTCCTGTAG------------------ATCGTAAGGCTAAAGTTGTCTCTTCATAAGATATTTAACACTCATAGTTGTATAAATAT--------ACATACATATAAACAAAGG
TTTATAAATTTATCTCAATGTGCTAGAATCTTTCTAAAAATTGACCGTTAAACTAGTTAGCATAAAAGTATTGGGTAAGATTTTAGCGGGAGGGAGCTCACTTAACTGATATGTTAAGCCCAAAATAAGTTTAACTAAATATTGTTACCAATAAGTCTAGTATAAGCATTTAGTAAATCATCAACAAGATTAAAGA
>CG7066 8279196 8279280|8720 chr3L 8278171 8281297 scaffold_38 235209 238629 + 84542|1183 1273
GAGTTTATTTCGTGACAAATAAATATAAGTA--AAAGTGCCAGGAGGACGTGCTCGAAACA--TCGAATAAAACATTCAAG--AAAACAAA
-----TCTTTAATGCTTCAAGGATTTAAATATTCAAGTGCCGAAAAGGGTGCCTAGAAATACTTCAATAAACAAATTCAAGCCAAATGTAT
>CG7081 8314123 8314227|8756 chr3L 8311207 8314492 scaffold_9 4845354 4848710 - 80305|3199 3305
TAAATAGGAATATAGTGCATGTGATGGTTTT--ATATGTCTTTTATTAGTTTTAAGCGAAAAGTGGGCTGTAAGTAATAAACAAATCATTTTCATATTCCGCCAAAT
-----------GTATTGTATTTTATGATTTTTACAATAGAAATAAGTATTTGTATGCAAAATGTG---CGGAAGGAATGAG--AACTTTTTTCACTGTGCTCT---T
>DNApol-alpha50 8318295 8318352|8759 chr3L 8316894 8320119 scaffold_9 4858364 4861536 - 145712|1413 1470
TTCTAATTTTACAAACTAACATAAGAAAATAAAAGGTTAATGAATATTTCAGTATGCA
GACCAAATCGATGGATTTTTAAGGCAGCATCAAAGA------AACAATTCA--CAGCA
>CG7112 8325336 8325671|8763 chr3L 8322435 8326044 scaffold_9 4864042 4867867 - 170312|3028 3480
AGTCCAGTGATCCGGCCAACTGTTATGACTGAAAGATCTTCAGTTT---ATTATTTTTAAGTT---TTTTATGTATTATTT---------CTATGATTAAGATATGGGTTATCAGCCCACGAGCTGAG----CTCCA------GGAATGTTTTCGAAAT--------------------------ACTTTATTAATACCC------------------------ATTACTTATCATTGATTAATTTA-----------ATTACGCGCTTAACCTCACACCATGACACACAT---------------------TGAGAATCTTTATTTAGTCGACTCTATGCAGGCATTGAACCC--CTCTGCTGTTTCTGTTAGTACCCTAAAACCCGGGTTGCTTATGATTTTATTGATATT--TTGC-GTTGCAAATAAAAC-----CCCGTGTATATAAC
CACCCAGTGA---AGCCCAC----ATGAC---AAGCGCTCGAGCGTCAAATCAGTTTTAAGTTCCACTTTTTGCATTGTTTACCATTATATCATTATTATCTTTTAAGTTGTTGGAGTATTAGATTGGTTTACCCCATCAGTTGGAAAGGCTTTAAAATTTGGGTTCTTGTATCGAATACCTGCAACCTTGTTACTCTCCTGCTTTGCCATCGACCCTGCTCCAATTGTTTATCATCGCATTATTTATATGCCCCCACATGAAGAATTTATATGCATACCCATATATATATATATATATCTATATATATATATATGTGTGTATATTTAGTTGA-TTTATCTACACATTGACCTTAACTTTGCTGCTT-TGTTGAT------------------TTGATTGATTTATGAACATTTGTTGCTGCTGCAAATAAAACATACACCCCAATATATAA-
>ImpE1 8353974 8354097|8800 chr3L 8353777 8354506 scaffold_9 4902402 4903206 - 16413|197 322
TTCTCACCAGATTGCCCGGGACTACTTACTCATATACTACAGATAATACAATT-AACTGTTTGGCATGCGGTCTTTTGGTGTATTGCAATAAACGGACAGCCGGGCAGCCG-ACTAATAATCCCCC
TT-GCATGGAATTTTTCA----TAATTACAATTACATTA---ATAATATCATTCAACTCTTT-------GGTGTTTGGCAGAATTGCAATAAATGCTCAAAAAAAAAATAATAATAATAATAATAA
>ImpE1 8364281 8365128|8810 chr3L 8363568 8365263 scaffold_9 4914510 4916122 - 57504|716 1633
GCGACTGCGCCACCTGCA--CCACTCACAGCATATGCACTCCAACCACTTGCGGTCACCATTTCGAAATCAACTGATTGATTGACCCGCTCCTGTCTTCCGAAACCTTCGAATCTATCGCTTTACCCAACCCAATATTCGAAAAGATTTTTGC-CTAGCATTTAAGTGGA--------TATTTAAAAATTATTTATTTATTTATTATGAC-CTTAGCTGCGCCCTTGCCACGCCCAATTGCCACCTTGCTATCAAAGGGGGTTTTCCCAGATTCCCTTTGAGCCAGTGATGTTTGTCAATTGAGC-CACTGGGCACAACC---CCAATCCACATATGACACCACACGC------------CACAAAGGACACACCACCACCCCACCCACACT----------TCGCCCCCATTTCGACTATTTATTCTACTCATCTAAACCATCAAAACTATTTATTTATACCCCCTCCCCCACAAACAGACACTGAAAAACACTCGAAATGAATTCTTCAT----TTAGCTTAGTTTTATGCAATTTTTTAATTTATTTAAATTATTGGCCAGGCAAACCAGTAACCGAAAAAAAAAAAAACGAAACAAAAACGAAAACGAAAACCATGAAATGATGCATTTTT---ATCGATTAATAT-TTTGTAAATAAG--AGTAAACGTGTTCGATGTACATGATAAACGACAATGCCTATAATGAAA---TGAAACATAGAGTATCCAACATAAACAATCCGATCATATCCCCTATATAGTTTATTATATGTACGTGCGT-GTGAGAGACACTCA------------CACACTTTTCTCACAGTCAAGACGCATCACAGTAAAACTAAAAAAAAAATTAAACAATAATAAAA------AAATATATTTTTAGAAAACTATTGAAAAAAAAAA
------ATACGATCTACAATCGATTTGCAAC---TGCAAC---ACTGTTTCACAACACTATTTCGTGCAC----------TTTACCCAC-ACTGTC------AATTTGCCAATTATGTGC---ACCAATTGAAATATTT-----GATTTTTGCATTAGCATTTAAGTCGATTTAACGCTATTT---ATTTATTTATTTATTTATTATTTTGTTTGACTGCGCCA--GCCACGCCCAATTGCCACCTTGCTAGCAAGGGATG----CACAAACATCCTTTGACCCAGCGATG-CTGACAATTGTGCGCCCTATGCGCGATCTAACCAATACTCCCGCTAACCCATACTCCCTTCACACAATCCCAAACTTCATATCGACAAGCTATACCCATTATTCACACACACACACACACACACACTATTTATTCTACTCATAT--ACCCATTGAACTATTTATTTATGCCTACTTTTTAATACCC---TACAGAAAAA-----------AATTCTTCATTCGCTTAGCTTAGTTTTATAAAATTATCTAATTTATTTAAATTA-TGGCCAGGCAAA---------AAAAAAAAAAACAACGAGAACAGAAAAAAAATCAACAAAAACAATTGATGCATTTTTATAATAAATTAATTTGTTTGTAAATAAGTTAACAAAT-TGCTTGATGTACATGATAAATGGCTA----TAAAATGAAATTGTAAGGCATAATGTA-CCAATATCGAGACCCC-----TATTCACTATA----TCTCTATATATACACATATAGTGTGGGACCGTCACGACGGTTTGCCCAGATTTTCATCA-AGTCAAAACGCATCAGAACAAAAT----AAACCATTTAAGAGAACATAAAATGCATGAATTAAATAATAATAAAACAATTAAAAACGAACA
>Jon66Ci 8366288 8366326|8813 chr3L 8365621 8366293 scaffold_12 2892725 2893421 + 1838|736 741
GCAACG
GCACCG
>Jon66Ci 8366288 8366326|8814 chr3L 8366294 8366331 scaffold_12 2896953 2896990 + 486|0 32
ATTTTCGATTGAATAAAAATATTTAAAGTGCAA
ATTCGTAGCCCAAATAAACTAGTTAAAGATTAC
>CG13667 8381236 8381302|8829 chr3L 8377047 8381770 scaffold_9 4930038 4935047 - 137665|4461 4581
CACCGTATTTA---------------------------------TTTGCGTATAGTTCCTATTTGT---ACAGTTTTGG----------ACGGAAA---TTATATATTTGC-----ACACA
GACAACAACTGACCAAAGAGAGGCTTCAACTGTTAGTTAACAATTTTGTAATTAGTTTATATTTGTCGGACGGATATGGGAAATACATCACGTACAGCCTTAAACATAAGCTAACAATACA
>mtrm 8387676 8388050|8832 chr3L 8385905 8387772 scaffold_9 4939937 4941697 - 47694|1821 1935
GTGA---------------ATCGCTGGC--ATGTCCATCTTTTATCATACACTAAGAT-TTTAAAATGTTTTATGTGAAGAGAAACTTTGTGATTTTAATATATGTGGATAATTA
AGGATGTCCTCAACAGGCTATCGCTGGCTGATATGC-----TTAATATATATTTATGTATCTTTTATTTTCAATGTGTTGCAAGATTT----ATTAAGATCTATTTAGATATTCA
>mtrm 8387676 8388050|8833 chr3L 8387773 8388082 scaffold_5 854114 854431 - -1667|0 310
AGTAGGTATTCTAGAATTATTG-------TAAAAGACCTGGTGTCTT--AAAGCTCGTCGTTTTTAGCCTTAAATAATAAACTCTAGTACACTTTAAGAATCTATGTAATTCCTAAAATGTTGCTCCGAAGCTCATTTACAA-----ATTTAAATTTATTTCGTAAGCTAGCAAATTGCATAATACTTTTTGTCAAAAAAAAAAAAAAAAATTGGGGTATAAACGCTTTTGTA-----------AAACAC--------ACATTTTTAAAATTAATAAACTCATAAGAATCAAATGCATATTAAAAGGTTAC
TGATTGTGTGTGAGAATGTTCACCACTATTAATAATGTTGGTACTTTTATATGCATGTTATCGATAAGTTTATTTATGTAACT---GTGCACGTAGAACGGCATTAGCATTCATTATAAGCTGTTAATCCCTTCAATTAAGAAAATTATTTAAACTTATT----------ACTATTTAATGAAAATAAATTGTCAAAGACATATGTAAA---TCCATTATAATCTCATTTATGCTTGATTACCCAAATACAACCTACAACATTTTTATCTCTATTAAGCCAAT--------------TTTTAAATGTGTAA
>exo70 8389766 8389858|8834 chr3L 8388093 8390779 scaffold_9 4941732 4944424 - 145712|1687 1790
ATGTTAAATGCAGGCCAGGCTTTAAGTGCATTCC-----TTGTAAGTTCGTTGGGGGGCTTTAATTCAAACTCAATAAATATCGTTTTAAAAAAA------GTA
G----------AGTCCAACCTGTA---GCATTCCCCATTTTGTACGTTCGTT-CGGCTTTTTAATTCCAACACAATAAATATCGTTTTAAAAAAATATTACATA
>Cbl 8401357 8402344|8851 chr3L 8400347 8401453 scaffold_9 4953426 4954678 - 52068|1124 1264
TTTTGTTCACAGCCTGATC-------AGCCTGAT-CCGCCTGCTCCGC---TGCCGCCTGTGCTGC----TATTTATATACATATTACTCTTATGATTACC-----------------------------TTTGGTTCGTT
TTTAGTGCAGCGCTT-ATCAAAATAAAGCCTTTTGACGCCTGCCCCGCGCTGCCCGCCTGTGCTGCCTCTCTCTTATACATATAATCTTATTACGTTTACATATATATATATATATATTTATATATCAAGTTTGGTTCGTT
>Cbl 8401357 8402344|8852 chr3L 8401454 8401491 scaffold_0 4650688 4650725 - 1851|0 37
TATACAGTTATATATGCCTATATATACATTATATATTT
TATAGATTGAGATATATATATATAGATATTATATATTT
>Cbl 8401357 8402344|8853 chr3L 8401492 8403176 scaffold_9 4954717 4956607 - 15324|0 1029
TAGATTTTACAACTGCTATTGTTTATATAAGTTTAATGTTTAGCCTGCAGTTCGCAGTGGCAGTTTCGAGTTTAATTTTGTTTGTTTAGCTGTAACATATTTAAATTATTAGCCAAACTC----ATGCAACTAACATCCACAGACCAACGCACAC---ACGCCCAATCACAAGCACAAGTACAA------CCATAACCATTGTCCATCCATCGAGCACATGCATAACGTA-------------------------------GTTAAAGTTCTTTGACCGGAAGTCGCTCATCAACCATCGTTGGCTATCGCTTCCTCTGTTTTCTCTCCGCCG--GTTTGGTTTGGTTTGGTTTGTGTGCG---TTCGTTTAGTTG------TTCGTT-------CTTCCACTCTCACGCTCTCTCTATCTATTGAT---CACGTTCGCCTCTGTTTATGAATCATATTTTAATCGATTCGAT--TCGCCCTCGATTGCACTTTTGTACAT--AGGCACTATGGAATTT--ATAATTGTAACCTGTTCTGTATTATTCGTTGAATTTTCTCTTTCACATCCAGCTTGATTATCCCTTGATTA----------------TGTATGCCGCAG---------------------TATTTTTGTATC---TATCCCTACTCTAGAATCATTCTCTTAATCATTGTACTCCGTTATGTGT-TTATTTCATTTTAGTTTATTGTTTAATACTTCCAAAGATACATTTAG-------TTTGTAGTAGCGTGCGTTTACTTC---------------CCCCCATATCAATTCAATTTTATTTGTAAGCAGCCAACGCGC-------------------TGCCCTAAGACTGTAATTTATTATTAACAA-----AAAAAAAAATCGAAAAAGTTTAAGAAATCAGGCTAAACATAGGAGGCCTCGAATCGATCGATAATTTAGTTA-GATTGTA--TGTAAATTAATTATTG--ATTTCCTG---------TGTCACA-----AGGCCA
TAGA---TAGACGTTCTACTCTATAT-TAAGTTTAATGTTTAGC-----------------------------GATTTTG------------------ATTTAAATTATTAGCTACAATTTTCATTGCAACTAACAGCAGT------GCGCACACAAGACGACGAGCAGCAAATCCAATTGTAGAGTAGTCTTTAATATATATATATATATGATGCATATGCTTGTTGTATGTATTTATTTATTTATGTACGTATGTATGTATTCATGCGCGCTGAGCGGAAGTTACTCATCAGC---------GTATCGTTTTTTTTGTTTTGTTTTTATCAACGCTCGCTTCTATCAGTTTTGTCTGCGCACTCTGTTTCGTTGTTTTGTTTCGTTTTGTTCATTGCTTCTTTCCCTGTTTCTTCTTTCATTCATACGCTCGCTCGCCTCTGTTTATGATTC--ATTTGAATAGTTTGTGTTATTATCATCAGATGCGC-GTAGTACATGCAACAATTCTCGATTCTCAAAACTTGAAAAC----CTATATAAATATTTGTATGGCCCGCTTTTAAACTGTTGTAAATACCTAGTTATTAGTGTCATCTTTTTTATTGTATTACACAAGCAAAAAACAAAAAAATACCCTGTATTTGAAACACGTACCCCCCCTC--------TTCCTTTCAT-ATGAAAACAAAAAACGTATGGTATTTTTTTTTAGTTTATGATTTGATACTTCCAAAGATATGTTTAGTTCATGATTTATAACATTTTGTGTTTGTTTTAGTTTTGCAAATCGGTTTTCATTTAGATTTATATATATATACATACATATATGACATATAGATATATGTATTTGTGTTTTCTAAGACTGTAATTTATTAATAATAATATTTAAAAAACAAAAAACAAAGGCTACAAAA------AAGGCATATTGTATGTATAATCAA-CATTAACATAATTATTATTATAATTATTATTTTATTATTGTAGTTAGCTAGCCCTAAACTGTCACAAGCCTAGGCCA
>Cbl 8404284 8405171|8856 chr3L 8403590 8404335 scaffold_9 4957033 4957858 - 28252|796 912
AGTGCC-----------------------------------------------------------------CAGCCGTCGGATTGTTAAATCGGATGATAGTCTTTAACCGAACAAA
AGTGCCACGCTACCGCACCCGCCCCGCCCCCAAAAACACAGTGTGATGCCCGCCCGGAGGAGCAGCGATAGCAACTGTCGCCTTGTTGAGTATGAT---------------AACGAA
>Cbl 8404284 8405171|8857 chr3L 8404336 8404654 scaffold_0 4654169 4654476 - 1500|0 326
AAAAGAAAAAAACAAAA-TGAAAACAATCACCAGTCGAACTTCTCTAGCTCAAAC-ATTTGCATATTGT-TATGATAATTAGGTTGTTTAACATGCGAAATTGACAAAATTAGCATTTTATAATCGGTGAAATTGTTTTCTATTAAT--GTAGTAAGTTTCTTAAATTCGTGTTAATCTAAAATTACTTTTTAATTTATATGTAGGGCAACTTTGTATTTCATTGTGAAACTATACATATTGCTTTTGTGTTTGTAGCAAACCCAATTAGTTTTA---ATGATTTGAATTATGATAAAAGTGAACAAGAAATTTGTATTATTAATTC
AAAATAATACAACAAAAGTGGAATTTATCTCAA----AATATATTTATTTCAATTTATTTGTATATTATATATTAAAATATATTTTAAATATATATTAAACGTGCATTAATTAATTATTATTTTTATTTAAATAACTTTAATCGAATTAATAATAAATTAATTATATAATAATTAATATATATTTACACAT--GTATATATGCAAGATATATGCTGTGCTCCTCGTA----TATATATGTATATCTAATGTCTGTA---------ATTTGTTTAATATATTGTTTGTTTGTTTCAAAAAGCGAGCACAAAATTTGCATTGTTGATTC
>Cbl 8404284 8405171|8858 chr3L 8404779 8406041 scaffold_9 4958033 4959449 - 12466|0 502
TCGATTTAGGAGCACCA----------------AAATACACGCCTGTACCCCCCAATTAGGCTGG-GCTATGCGATC---CCAGGAGATTGAGTC-------CTTGAAATTCCCCACTTGGCGTAGCCAGCACAAGCAATTC--------ACGTTTCCCCGTTC----------GAAAAGTTAATGACTAAAATGAGA----------------------TTAAAATATTGCCAG--------------TAAGGCGGAAATGAAATTTAAGCACAACCCTTGGATATCAAATATA--GCTATGTA--CACTTAAATTAAGAC-TATCTAACTTCTTCCTATTAAGAG-CAAACAAATATATA-AGAAATTATAACTTGTATTTA----------CGCAG--------TTCTGGAAG----AAACACTTGCCCACCCCGAAACAAACGAAGAATATATATATTCAAATTTTCTTGCTCTCACAAAAAAAAAAAAAAAATAAAAA
TCGCTTTAAGAGCACCACGCCCACTCCCTCCCCAAACACACACACACACACCTCATCTAGATTAAAGCTAAGTTAGCAGCCCAATAAACACACACACACACACACGCACAACCATTTTTGGCGTAGCCAGCACAAGCAATTAGGCGTAAAAAATTCGTTCGTTCTCTTTAAAGAAAATATTTAATATATAAAAAAAAAATATATATATATATATATATATTTGAAAAATCGTCAAATTCTCACACTATTTAAAGCAAACA----AATTAAGCACAGCCCATTTATATCAAATATATAGCTATATAAACACGTATATTAAGACGTATTTA----CTTCCTATTAAGAAACAAAAAAACAAAAACAAAAAACAAAAAGCGAATTAAAATCAAAAAGCGCAGGAGAAAAATTCTTAAAGTAACAAATAATTGCCCACCCCGAA-TAAATTAAAAATTTATAT-----------TATGCTCTCTTACCAAATAAAAGACAACAACCA
>Gug 8444718 8444986|8903 chr3L 8442767 8446811 scaffold_32 1045372 1049694 + 76127|2180 2480
GTGGACAGACAGCAATTGTAGAGAG-------CAAGCAACTGAACAAAGACAATACTC--GGGCCGCGGCCGTGAGG-AACTGCTTTGTGTGATTTTTGTGTTCAAGCGTTTACATTTTGTTTTCC----------ACACGCACAACCACC----CAACATACTCACA-AAACAAACATCAAAACAT-CAACATCATCTGCA-GAGACGACGTCAGCGTATGGCTCAAGA-ATCCAGAAACCAGA----AAACCAAGCGACTTTAAGTTGCGCAACGCCTTGTCACGTTTTTATGTAAAAA
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>Gug 8445099 8446616|8903 chr3L 8442767 8446811 scaffold_32 1045372 1049694 + 76127|2603 4536
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CTC
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GT
GT
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AGCAACAGCAGCACCCAAATCCCAAAAAAAAAAAATAAATAAAATATATATAAATATATATATATATAAACAATATATATAACAACGCATAATAATATTAAACGCAAAGCAAGGCAGCAAAATGCAAGCAGCGGAAGCGCACGCACAAAGTTTGACGCAATTAAATATTAATAATTATTATTATTATTATTATTATATTATGATTATTATTTGTGTAATGCTTAAGTTGTTACAATTAATTTATTAGCCACTAAGCGCATTCACTTTGCA---GAGTAACAA------AAACCCAATTGGAGTTGCGCTACGTTTGCTCCGTTTGGCGTTGCCACCTTTCTTCTAGCGTTCCCATGCCTGA-GCTCGTTGCACCTCAACGCTGAATCCAATTAGACTTTTGTGCCATATAAATGTGTTGCGAGGATTGCATA-------AACAACTAC--AACAACAACAACAATATACAAAAAATAGGCTCAAAATATT-----TAAAGCAAAAACCTGTCCACCATCGAACTTTTAAGCAAGTGCAGTTTGTTCAGATACATGTTCTTTAAATCATATATATATATACATATATATATATCTAGC-TACAGTACGTAAATTATAAAGCTCAATGTTCAAAGCGAATTGTTCCTTTTTGGTGTATTTAATCAAGCGAATTATATAAATGCAAAAGATACAGATACAAGATGCAAGATACAAGATACAACTAGTTGCTGTTATGGCTCATTCTGCGGGAGCTTCTCCTAAAGTTCACAGAAATTAATACGTAAAACAAGAATTTAAAAATTTAAAT---------GTTAATGAAATACAAATAACCGAATTATTGTTTTTCACATTTTGAAAGCTCAAGGAAT-------CGTATGAAAG------------------------AAAATGCTTATTAATGGAATTTAGTTGAGTAAACGGACTTTTTGGGAAAAAAAATATGAAAAAAAAGCAAAATACTAGAAGACTTACAGCTTTATACGCATGAAACAATGAAAAATCTA
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A---------------------GAGGTTTTCTTTTCATATAGAGTAGCCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACAGGAAAGCTTATTGTGGGTAAAACAACAAAACAGTGAATGGCAAACGCAAATAGCTAAGAAATACAAATTAAAGAAAACAACAAAAATAACCCCAACGAACATTGAGATACGCTCAAAT---------------TTCAAATGCATTTTCCCC-----------CAAACTCACACACACACACACACACACTTCTACTCTACGCAAATATAAA--TAAAAGGAAACCCGAAATGA-------------AAGTTTAACAAATAT-TTAAAACAAATGTTGCTCAA-AAATTGCCACCAGAC--ACGAGAAGAGTGGA---CGATGTTTTTATGAGAAAGAAAATATGAAGAAAAAAAAATGCTACGCATATTTATTTGTGAATGAAGAAAATCTGTTTTGATAGCAG--TTTTAGTTCTTAAGTAGTATTCTACTATATACATACACACCCACATGCATATTTGTATTAATTATAGAGTTTTTTAGTCG-----TATTTCATTA-AAAATTTTGCAAAAGTGACTCTTTGCAGCAAAAAACCACTCAAATACATCACAAGA---ACGTATAATAAAGAAAATAA------------------------AAAATAAAAAAATAAA---AGAAGAAAAGATTTTGAAGTCAAAATATATATAATAAATTTGAAATAATT--AAACACATCTAAATGAAATCGGCAAATGCGATTTTCAATATAT--------ATTGAAGTTGTAC---TATGTGTATTAGAACGTAAGTCTTCTATGTTTAAGTTCTAATTTTAATTG--TTTGCTATGGCTATATTCAAGTTTTTTAACTACACGTATCGAGCGAGCGCGGCGAATGCATCGTGTTTATA--CCTTTTGTTAAAAATGAATGTTGTACATTTTTGAATTATATATGTATACACGTTTACATACACATTATACATACACATACATACATACATATATATATATATATATATAACTATAATTAATGCATATTATAAACACGTATGTCTGTAGTTTACTTAATGTACTTTT----------GAAGCAAAAAGGCCCCCAACTGAAAAACTAAAATCCGAATTATAAAAAAAATGAAGTGAAAATAAATTCCAAAATAC-----AACAAATTTCAAATGTATAATTCTGAAAATTTTCGAATTTGAATTTAAAA--AATGAAAATAAATAAACATCGAAT
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TTGCGACAAACTTGGAC-TCGCGACGAATGAATATGAATCATAATTTGTGGCGGC---------CTGTTTCGATAAATGATAAGGGGGGCCCAGGGAG------GGCGAACGGT---GCGGAAAATAAACAAAGTATTG-----AGTTCACTGCCAACGGCTCTA------------------GATTAGACAA--------------TTTCCTATCCA--------TTCCAGTTGGATTTTATACAGCGACATAAATGGGCTTTGAAGTGTCCAAAGAATACACCTAGAATTCTTTCCCTCATTAAATTTCTATAAACCTAAAATCATTTTGTATTTAAG----TACTTAATGAAATTTCTAT
CCGCGACTAAGGCGAGCAGTGTGACAAATCAAAATGAATCACGCTGCCAGCCGACTGCTGATAACGGTATTAAGAAACAATA-------CCCAGAAGGAATGGTGATGAACCATATAGCGAAGACCAAATACACTATGGGAAAAAGATTGC-GCCAATGAATCTATTATGAAATCTTACTTTTGAATAGGGAAAAAATAAGTATTAGCTTCTAATATATGTACTATTTTCGATATAATTTTACAGGGAAATTTAAC---GATTGGTAATGCCCAAATGATATAAC---AGTTCTTTT-----GAAAATTCCGATGAATTGATATCCCTTAAGGATATAAAATATTATATAGAGGAATTCCGAT
>mRpL12 8931443 8931529|9329 chr3L 8931429 8931544 scaffold_38 104921 105033 - 2515|14 110
GATCGGCCACGGTGCCTTCGTTTATCCACTTTGCG---------TTTAGCTGCTAGTTA-CTGTTTTAATAAAAAGCCAGGCAACATTTGCTGTAAA
GCTAA-------------CTTTTTACCACTATTTGGCACTAATATCTAGATGCTAGTTATTTGTTGTAATAAAAAACGTGACAGCACATGCTGTAAA
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GCTGGTGGAGACGCCATCTACTAAGTCACCTTGCCACCGTCTGCTGCAGCGCATTCCAAAGAGTATTCGACGCTTCTTCTGGCGCGGACCACGACCTTCGATTGGCATCGCTGTCTGTGTACCATATGTAAAACTTAATTTAGCCATACTGCAATCTACCATAATCATTTCTTACTTTTACTCGGATT---------AAAGGACCGCATGTGCGT
AC--GTGAATGC----------AAGCCCTCTTGCCAATATTAGCTGCGGCGCATTCCAAAGAGTAT--------------------------------------GTAGAGTTTTCTGTGTAACATATGTAAAACTTAATTTAG----------------CATTAACTTTTCTTACATTTACGCTGCTTTTTATTGAGTAAAGAACATATGTATGT
>CG5021 8941843 8942331|9337 chr3L 8942198 8942252 scaffold_990 4268 4322 + 1747|0 54
ATAATTTTCATTACTGTTAGATTACTATAAATTATTTAGTTTATTTTCTTTTTTG
ACAATTGTTATTATTTTCAGAGTTCTGTTTCTTCATAGATTTTTTTTTTTTTTTG
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TTGTCTACCTCATTGGGCAGATGTTTTTGGGTCTCTCTAATACCATATTTATATACAGCATATACAATTATTTTTGATACTTTCTGTAGCCATTTTTACTCAATTATTCAATCTTATTTTGTATAAAGTTCAACACTAACGAATAAGTCTTAAAAAGTTCCATTTCTGAAAATT---GCTGAAAAGAACCGGAAACACACACAAAAACT---------------------GATCTGATTTTGGATCGAAACAGACTATCCGAATATTTTTGAC---TAAATGTCCATATT-ACAACACATAATCTATTTAAATGAAAGTTT-------TAATCTGAAGCTCTCTCATTGTAATTAAAATGCGATCTCCTCTCACTCTCTCCCTCTAAATGTACTTTAACAAAGCTCTCTTAAAAATTGCACATAAGATCATCAAAT--TTGAGTCAATTTTTGACGCATTTACTCATATGGAATTTTAGTAAAATAAGTCTGCAAA-TTAACTAACTTTAGTACTTAACGATG---GTTAAATCCGGTTTA----GCCGCCGATCAAATTTAGCATTGTTCAATTCAAAAGTTTGCCTTTTTCGAAAAGTTGGTGTTTTGTACATTTTGATTGAATCGCATTCATGA
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AGTGGATTCTA-ACCACTACAACGTA----TTCTTCTGGAATTCCACGCATCCATGTTACACTTATAAAGCCTTTAGATCCATGTCCACGCTGCGGTATGTCCGTTTTATAAGTTATTTGTTTGGGCTTTT--ACCCCCGCCAGATTTGT----------------------------------------TTTTTCTACGAAACTTTTGTAAGTTGC-ATATTGAACAACTATTCGGTAATAAAGGAACC------TTTTAGAGAGAACCTTTTTAGAGAGTTCT---------------TCGAGGGCAAATATAGC
GACCTCAGCTGCACGATCACAACTTGAAGCCCCTAATGAAATTCCATG--TTGATGTTGCTTTTATAAAA-----------ACGTCCAACCAGCT---TGAACGTTT-----ATTATTTGTTTTTGCTTTTAGATCCCGGCCCTTTTTTTTAAGTATAGAAACCAACAACCAGCCAACACAAAACAAACATTTATCGACAAAATTTGTTTAAGTTACAATAGTGAGGAATTATT-GGTAATAAAGGAAGCTACAATTGCTGTAACTGCCCCTGTTATACTGCCCTAGATCCCGACCAGGATAAAGATTTAAGATTAC
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ACACAACCACCCCCTGAATCCGAGGTTGAGCACAAACTGAGGTCACAAAA-GTCTATTTTTGAATGGAGGTGCATTACTCTTTGAACTTACAGATGCGTGCATATATATATATATATACA---AAATGTAGTGCGTAGGTCCAG-ATATATAC---AGCCGTATATTCTATATACACATAAACTAATAATCCA
GCG-----ACGTCCTT-------------GTACAATTGTAG--CACAAAATGTCTATTTTTAAATGGAG----------------CATTACAGAT---TGCGTATACATATATGTACACACAGAAACATAGAGAATAGAAACAGAAGATATACTCGAGACGTAATATCTATATATAAATA----TATACTCCA
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ATTCCCCTACTTCTTACCTTATTAAAATATGTTATTATTCCTTCTTAAGTATTCTTTCGTAGGCAATTTG---GTGTAAATGTATTTCA---AATATTTTTGTGG---CCGCATCACAAACGGATTGAGAAGCATATTTAATCAATATGAAACACAATTATTAAGAAGTAAACATAAACGTATAGCTGTGATAAA-ACTATAATAAACTAACGAAGAGTACACAAG---AAATAGCAAGCTGAATTAC---------GAATACTGGAACGAACAATCCATTGTGTTGGCTGA----TGATAAAAGAG-AAAATGTCTAGTAAATATTGTAAATTGTGGCATGGCACACAACAAATATCTAACCCACGTACGGTGTAAGCCAAAAGTTACATGTAAACCACGAAAGAAAAGAAAAACCAGAAACAATAAATCTATGTGTCTGATTCATGTGC
ATTTTTATACTTGTAAGTTTCTTGCAAT-TGTAAGTATATATGTGTGTGTGTGCGTGTGT-GATTGTGTGCGTGTGTGTAGGTATTTTATGAAATATATTTTTAAAAACCAAATTAAAAA--------AAAACAAAATTAAATATAAAAATATATATCTATATATGTATATGCATAAACGTATAGCTGTGATAAACATTTAAATAAACTAACGACAAATACACAAACAAAAATATGAAGCTGAATTAACATGAAAAATAAAAATGAAACAAA-AACCCACATAGTTAAATTGAAATTAATATAAGATTAAAATG------AAATATTGTA---TGATACGTGGCTTGCGTGTGATA---AATCCGCATATTA-------CATAAGTTACTTGTAAAATATTGAAACCCTAAAGGAACAGCAACAATAAATCTATATGTCTGATTCATGTGC
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AACTATCAAGTGCAG--ACGGGTGCATGTGCTCCCGTTTGGCTTGGAA----TCGGTGCCTTGTACATTTAATTAGCGTTTAGTTGCCATCGT------CTGCGTAGTGTCTAAGCTGAATTGTGATATTTTGCAGTTAATTAGGATTTCCAGGTATTTGCCATCAGTATTTATC----GTATTTATTATGCAATTTTAATTGTTCACATGATTTCGTAATGGATTTATTGTCTTTGGCATTTTAATGCGGCATAAATAAA
AGCTGCCGTGCGGAGCAGCAGTTGC---TGCTCCCATTTCAGTTGTTGCTCCTAAGTGCCTTATACATTTAATTAGCGTTTAGTTGCCAGCGTCGTCTGCGGCGTAGTCAGTAAGTTAAATTGTGATATTTTGCAGTTAATTAAGATTTCCAGGTATTTACCATCAGTATTTATCCTAAGTATTTATTATGCAATTTTAATTGTTTAAATGATTTCGTAATGGATTTATTGTCTTTGGCATTTTAATGC-GCGCAAATAAA
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AAGAAATATTT--GGTAAACATACTTAAGTTGGAGTCATCTTCTGTTGTGATTA--GTGAGAAACGTGT-GCATATACTTTGTAA---GCTAATCTATGCTACATATAAGATCGTTTAAGAACCAAGCTGCAATCA--TATACATTGTTAATTCGTTTTAAGAGTCTTTGGTCAAAATAAACAAATCAGACATCGAA
ACGCAGCTTTTCCGGTTGTCGTCC---ACTTCGA---AGCTTTTGTTGTGATCACGGTGTGCAGTATATAGTCTATAAGTTGTAATTTGTTAATTAATTTTAAGCGC-AGCTTTCGAATAAAGCAAACTTTAACAAACAATTCTTGGTCTATCGATTCTTATCGCATCT-ATCGATCAATGCGAATCGATCGT----
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ATATTT
AGACTT
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T---CTAGTCTCTTAGTCATAATCACCTAGTCTAATT----------------TGGGTATGACGTTTAGTTTGTTTAAAT----GCGACTGCGCCACTGTAATTCATCATCATCATTCTTAA-GCTCCAACATCTCAGATTCATAGAAGTAAATAAATGAGTGAAAAACCCCAAAA------GAA
GCCACTAGTCTTAT-GTTGTAAGTAGTTTGTTTAACTGTCAGGTAAATAGAGCCTGCCATGAGCCTAAGTCCACACGAATCCACACGACTGTCCCATTGTAAATTATCA-CATCATCCATGGCGACTCATCATC----GTTCTTAGAAATAAAT---TGTGTGAAACCCCCCACAACATACTTAA
>Tequila 9065966 9066072|9449 chr3L 9065666 9066377 scaffold_9 3451309 3451899 + 14173|310 416
GGGAGCATATACTCACTTTACACTTTAATATCCACCTTCTTACATGACTACTAATTTATAAGAATTTTGTAGTGAACTTGCTAATAAAGCAGACTTTTTTAGAACGA
ATAAAC---CACAAGCTATATATATTAATATATATATATTTAGGCCCCAACAA--------------------GCGCTCGCC-CCAATGCTGTC---------ACAA
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GGATTAGTTTTAGTT-------CCGGCCTTGACAT------GTTCCTAATGT----CGCACTAGACATACATATGTAAATTTTTTTTGTGCACTTTGTATTTATTATG-----CATAGAGTATTTTCCAAAACGATAGTTCTTATCGTGCAAATTAGAGTTAATCGA-----------------------------ATCTAAACGAAGCTGGCGCTACGACTT----------------TTCATGTACC
AGAGTAGCCACAGCTGCCACGCCCCCCCCTGATATAATGTAGTTCCTATATTTAAGCGTTATAATCGCATATATATATATATTCTTAG------TTGTATTTATTGTAACCACCAAAGTTGAGCTGCCGTGAGGCGATGCCCTCACATTAAAAACAAAATAAAACCAAAAACAAAATAAAAACTTTTGCTTGCATTACCCAATGGAAACTGGGGCTAGGCACTGATAGGGGGTCTCACGTTTATGCGTC
>CG13315 9071168 9071443|9457 chr3L 9071350 9072587 scaffold_9 3462632 3463973 + 29192|0 96
TTGGCATTATATATATATACATATATGTATATATGAAAAAAAGA---AATAAATGGCAAAGATTTAATAAATGCATTCTAGCGCGTAGATAAGAGAA
TTAGCATTTCTCATA-----ATATATTGACAAACTAAAAACAAATTTAGTCACCGTCTGAGCTAGACAGAAGGCACTTTGAACTATATATACGAAGA
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GCTAAGAGATACAGATACGAATCCAAATGACACTTAATGATGAAACAAAAATGCTCAAAAACCATAATCTAAACGCTTTCGCTTGTACATAAACTATTCATAAATA
----------ACAG---CGAGTACAGCCGACTT-------TGATATTGTTATACTCTATATATATACTATATATAAT---GCTTGTGCTTAAACAATTAATAAATA
>Dhpr 9109558 9109863|9496 chr3L 9109676 9109864 scaffold_9 3130440 3130580 + 3027|0 193
GCTTTCGATCGTTTAATGT-----GGTTCTGCTTACACGATTTGGGTGGATAACCTCTTGAACTCGGGAGCTTAACG-AGCGTTTAAAGCTTGCTTAGAGTACAATCTTTAGTTTGCTTAGTTTGGAAATTGTTTCTACGACTTCTTCTTCTTCATAATCTTCATGAATAAAACCATACCTGTAAATTGAAAGG
GCTCGCTTTCGTTTAATGCTTTCCGTTTTTGTTTACAGCATTTGGG---ATAACCTATTGAAC-CGTGA---TAATGCAGCGTT--ACGCTT---------------------------------------------ACGTCTTTTTCTTCTTCATGATTTTCATGAAGAGCACCATGGCTGGAAAGAGATGAG
>CG4641 9118278 9119656|9504 chr3L 9117447 9118971 scaffold_9 730960 732601 - 30042|955 1739
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ACAGCTAATGCCAATTCCCTAAAGGCAACAGTCTGGCTCTACTTAAATGTTGTTCGTT---ATCTTTTAGGCACACACACACAACAAACAATGAGCACGATAAACGTTCTATATAGAGACTAAAAACCCGAAGCGCTC---AGCTTGAGAACCACACACTGTATTCA-----ATTAAGACAAGCAAGCACATATACTCTCACAGACAGGCGGGTCGCTGCGACTATACAATAAACACAGATAATCTAAGACAACGATACAGCTCAATAAACTCAAGCCCCGACCAGA-TCGGAAGGCCATATAGTAAAAGTTCTTGGTATAACCCCTTCTCTATCGATGCGGTCGTTGTAGTTCTCT--CAGTCTCTGAAACGGATCTTCGAATATCAGCTTATAATCGAGCAATAATATATATATATATATGTAT------TTATATATATATGTGTATATATCTAAGTCAACTACATATTAATACGTATTCTAGTTAAAAATATAACATATATATATATGTGTGTATAATTTAATTGCGCTTGATTAACAGTACGAATACCAGCCAAAATTTCAACTCATAGTCAAATATTAA-TGTTCTGTTGCAAAAGCAAACGTAAT------TATAATAATATTAATTAAATATACTCATTGTTAGCACTAGGAATTGTGCATAACGTA-GACAATTTCCTTTCAGCTTCAAATACATATACATATATATCTATGTATATGTATGTCTTCTTTATGTATATCGTTGTACACTGTTATTGAAAGTCTACTTAAATTAGTT
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A------------------------TGTAGCACTCAGACACG---------GGTCTTCGAATATCAGCATCCACAACTAAT-CGAGCAATAATATGTATATATATCTAAGTG--AATTAGAA---AATCCAGTTTAGCAGCATTAAGTTAGCCATTCGCTTGAACTTGCCGCCGCTAACAAAAGCCAATCAATTTCAAGGTCAATTCAGTTGGACTTATTTCCCGCTTCTGTTCGCTCCACTTAGTCATAGGATCTCTGCACATCTCTGCAT--AGTAAATTA--ATCGAAGCCGATGACGAGCGGATCCGTCAGATATATATTGTTGTAA-----------TTGTATGCAAAACAC-TAGCCTAATTAGTTAAATGTTTTCCGTGTCTAGTAAAATGGTCTAAGTTAATGTTGGATGCCAGAAAGAAGATATTTGAAATATTAGTAAAAAAGCCTAATCAATG-----CGATACTTTGTTTGCGATACTCGTCGAATAGTAAA------GTTCATAACTCACCA---------ATTGGATAACTTCATA-----TTCACATAACCGATATTACCGATAACAATGGATAACAATGATGAAAACCCAATATATATGTACGTATGTAAGTCGCAAACTGAATTGTATGTAATTTTTGACCCCGCCCAGTGAGTTAATCA-ATGTTTTAAGTCATAGTTTACAAAACCTTCTGTTCGAAAAACAAATAAC-AAA
AGCTTATTTCCATGTTTTGCAGTGTTGTAAAACGAAAACAAATTCCCTTAAGGTCCTGGTAGTCAAGTTGACACGTCTGTTATGTACAGTTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGGCTTATAGCGTGATCTAGTTCACTTGAA---AGAGAACCATTTG---GAACTAGTT----CCAACAGCACTGAATGCAAACGAAAA--AACACATTTTATATGCTATACGATTTCTGTTA---CAATATACTGTTAGTGTCTGTGTGTGTGTATGTATTGATTTATTTACAATTGTCTCGAATTATTAGCTTGGCACTCAAACATATTTAGTTATAGGGGGTGTTTTGTTTTATTTATATTCCATAGTACATATTGCT---TGTTTTATACGCCGATGAAACCAATTTCTGTTT-TATTGTATTTCACTGCATAGTTATTTCGATTTTTCATATGTTTATCTATTAATCGGTTATCGTTGATCGGTTTTTGGGGTTCTTTTAACTGCTCACATCCTGTTAACGGCTCTCTATTATCATTTATCGGCTGAGTTTCTACAAGTTTCGCTTATTCAAAAGTAAC------------TAACGAACACAAAAA---GGCATATTTTTATAT-TGTAAG-----AAAAGAA------GTTATTTT-------GCACAAAGAAACAATTGTATATTTTAATGC-TAGCTCATTATAATTAATTCTGCATTAACAATTATTTAAA
>CG4641 9118278 9119656|9506 chr3L 9119621 9120393 scaffold_9 738022 738950 - 17304|0 35
TAAAATTTCCACCTTAAAGCAAGAAAAAAACTATAA
TATAAGTTCCACACTTAAAAGGTATATAACCAATAA
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ACCAAACTTACTTTTATATTATTTTATGTCACCTCAAAAACTTTGCATGTTTCTCA-----TTTAATAC---TGCTTAGAA-------AATTGTTTGGCACAAGGTTTTAGTTGTAC-TTAATATATTTTATATAC-----ACTTTCTTATTTT-CATTTATACG-----------AAATGAAATCAAACAA------AAATCAATTAAGTCGAAA
AAGTATTTTGCGATAATAACTTTTAAGTGTGCCAATAAAATGTAACGAATTTATTAAAGATTTTAATACATTTACTGAGACTTTAATTTATTGTTT--TTTAAATATATATTTATGCTTTGATTTATTTCATTTATAGGAAATTTTATCATTCTACATCTGAATGTATTCAAATTTAAATGAAATTAAAAAATATCCTAATCTAAGTAACATGAAC
>CG4477 9225282 9225285|9635 chr3L 9224317 9225310 scaffold_12 2194643 2195659 - 7162|1023 1026
TCAT
CCCT
>Glu-RIB 9259329 9259408|9669 chr3L 9258991 9260168 scaffold_9 920246 921275 - 16487|350 429
CATGAGCATGCGCAGGAGTCGCGACTCTGACGCACTCCCTGCGCGCCCACGATCCGCCGAATAATGGCCAACAGCCGCCA
CACGAGCACGTGCAGGAGTCGCGTCTCTGACGCACACCCTGCGCGCCAACCATACGACGAATAATGGCAAATAGCCGCCA
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GAAATGGTCATCTGGTCATCGAGCGTGTACAGTGGGGCGCCTCGGATCGCAGCAGGCAGCTGACGATGCCGCTGCAGCGGCCCATACCCTATGTGCTAATCACGCACATTGGCGTGCAGTCGATACCCTGCGTCAATCTCTACAAATGCTCCATCAAAATGCGCACCATACAGGATTCGGCGATTGCGGAGAAGAACCTACCGGATATACAGTCAAATTTTTAC
>PGRP-LA 9311401 9311607|9744 chr3L 9311300 9311609 scaffold_12 3377444 3377751 - 16293|108 314
GTTTCGGAGGAGGGTAACATCTACGTTGGCCGCGGCTGGGACTGGGCCAACACGTATGCGAACCAGACATTGGCCATTACCTTTATGGGCGACTATGGCCGGTTTAAGCCCGGTCCCAAACAGCTGGAAGGTGTCCAATTTCTGCTGGCCCATGCAGTGGCCAATCGAAATATTGATGTGGACTACAAACTAGTGGCGCAAAATCAG
GTTTCCGATGAGGGCAACATTTATGTGGGTCGCGGCTGGGACTGGGCCAACACGTATGCGAATCACACACTGGCCATCACCTTTATGGGCGACTATGGCCGCTATCAGCCCACCGCCAAGCAGCTGGAGGGCGTGCAATTCCTTTTGGCCCATGCCGTGGCCAATCACAAATTGGATTTGGACTACAAGCTGGTCGCACAAAATCAG
>PGRP-LA 9311673 9312287|9745 chr3L 9311610 9312376 scaffold_12 3378085 3378911 - 5992|63 813
ACTAAGGTGACCAGAAGCCCGGGTGCATATGTGTATCAAGAAATCCGGAACTGGCCGCATTTCTACGGCTGCGGAATGGACGAAGCACCGGCCTGCGGCATCGAATTGGGCATGAAAACGGAATCGTGGGACGCCAAGCAATAGCTACAGACTTT---------------TCTACCACCTAAGTGTA-ACCAAGCACAA-----------------ACTGTATTT------TAATACATATACTAAGGCGAATGGA-------GCTTTCTTTTAA----TCGGTTATGCTGGCTTCGAAACCAAAGTAAACCGGTTGGGAG------------CAAGCGGTTTATTTATAG------------TAATATATATATATATAGTG-----TCTCTCTTCCTCTCT------GGAGCTCTGTTT-----------AGTTTTACTGT-------------CGCTCAAAAAGCTGGAAATTCCCAAGCCGCAGTC-AACCTCTATCAGTGCCAATACCAGTACCCCTTTTATTCCCTCATAGACTTTAACACTCATCGATCTTGTGTGTGTCTGTGTGTGTGTGTAAATATATGAGAGCCTTTGTGCGCCAGTACAACATCATTATCGGTAG-------CTTCACTTCACTTCACTTATATAGACG-------------------ATGTTGTGATCGCTGTGGCTGCCTTTGTCATTTATCTGCCTTTCAACGTGAATATATGTACAATGATAATA
ACCAAAAGCAGCAAGAGTCCCGGCATCAATGTATACCGTGAGATTAGCAAATGGCCGCACTTTTACGGCTGCAACATGGAGCAGGCGCCCAAATGTGGCAGCGAGCTGGGCATGACGGCTGCCTCCTGGAACGGTGGGCAATAACTACAGACTTTAAAAGAACTCTTAGCCTTAACACCAATACACACAACACACACACTCGCACACACACACATTACTGCATCTTACAAGTAAACCAAATAAAAAAGTCAACGTAAGTTTTCGCTTCTTGTTAAATATTCAGTTATATTTGTT------CGGCCTTAAACCGGTTCGAAGGTGTGTGCCTTACAGGTGTTTTATTTATAGAGTACGTCTCCTCAATCTCAACTCAGACAAAGCTCTCTCTCTCAAACTCTCTCTGTCAGAGTCTCTCTCTTAAATCTCAAAAGCTGTATTGTTTATATTGCGCTGCGTTC-GAAAGCTGGAAATTCCCAAGCGGGAAACAAAAACCTATCAGCAT-------------------------------------ATACAGACGGGTTGTATGTAAGTCTATATATGTATATATATATATATATATGCATGCG-GTTAGTACAACATCATTATCGACAGAACTTGTAGTCGCTTTTTTATACATACACACACACACACACGCACACACTTGCACTATATTGATGCTGTTTAAGTTGTTGTTAT-----TGTTTTTTGTTGTGTTTGTGAGTTAATTAAAAGCT
>PGRP-LC 9320156 9320206|9749 chr3L 9318804 9321284 scaffold_12 3384651 3387044 - 29586|1413 1468
TAAGTCATGTATTATATAAAAATTACAAGTAAATAGAGTCTTAAGAAA-----TAT
TAATTTGTATTTTAAGTGAATGAATAAAGTTGGTAGCTTATTAAAATAAGTTGTTT
>PGRP-LC 9322123 9322281|9751 chr3L 9321578 9322277 scaffold_12 3387067 3387739 - 22829|545 701
ATAGGTTAAGAGCTATTTCGATATTTTGCAATACTATCATTTATTTTCGTATTGATTTTGTATCATAGGTGTTCTCCCATTAA-TGTGTGGCATATTCGATTTAGCTAGAGTAACGATTCGTTTAAAAAGAAAATGTGATATTA-AATAAAACAAAA
GCAGCCTAAG-------------CTATCCAAAA--ATAATTGAAGTCATGACTGGTTTTGT--------TTTTCTCTATTTGATTATGTGGCATATTTCCCTAAGCTAGTAGACGTAAGCTTTCAATACAAAATTGTGATATTATAAAAAAACAAAA
>PGRP-LF 9325269 9325436|9754 chr3L 9324813 9327778 scaffold_12 3389341 3392381 - 114703|477 674
AAAACTGAAAGCAAGGGGAATGAAACTTGGCTAGTGCCAT---------------TCCTGTGCCATTTTTCAAAGTGATATTAATTTAAGACCTAATGTTAAGCATCACAAATATCTCACATC--------------CAATAGGTGACAATCTCCTTCGTATTTATAGAAATAAACATGCCTTTATTGAGTTTC-AAC
AAAACTGTA--CAAACGCCCTCGCATTTG-CCAGTGCCATAGAGCAGGGTATTCATTCCGTGTGGTCAACCAAA----TATTATTTTAAA--TTAAT--------TTATAAATACTTTACGTTTGCTGCGCATATCTCGATAAATAACAACTT------TTTCTTTAGATATAAATATGCCTTTATTAAATTTTTAAC
>CG32039 9333438 9333951|9764 chr3L 9332920 9333674 scaffold_12 3398491 3399273 - 9019|622 861
AAGGAAGTGAACATCCATCCTGGTGTGGCTTATAAAGCACATCCAAATTTGTTCCCACATCTTTACTGACTTTTGTGCAAAGTTTTTGTACTACTCCGTATTTGTATTTGTATTGTATACACCTGTTTTTCCGATCTACATATTTCATGAATCTTCAGAAAAGAACATCTTGGATTCAACACCATACAAACTTTTAGCTGGCGACCAAAATGTACAACCAAAAATAAAA---TTTAAACC
GGGCTTGGAAGAAACTCAACCGCAGCTGCCTTTACGGGTTTT-----TTTGTGCCCAATTGTTGACTGTGTAT----CAAGGCATTTGTATTAATTTGTTTTCAAAT-----TTGTGTAAATATGTACTATCAAACTATATTTGTGATTAAGC----------------------CCAAACCCACACATACC---------------AAATTTTCAACCAAAAATAAAAGATTCTAAATC
>CG32039 9333438 9333951|9765 chr3L 9333675 9334016 scaffold_7 1194295 1194649 - -342|0 293
AAATTGTTATCAGTGATCGTAAAAATGCAAATGATAAGTTGAATACTTCATAGAAGGATTGGATCGACAAGGTCAAAATTAATATCAATATTACCTATTGGTTCACATTGTCATTCCAG----TTTTAATAAATTAAGCATTGTGTTGTAAATGTCATTTAAATTATACATCTTTTATATATTATCT---ATTGGGAAT----------TCACTGAAAAATTTGTCAGTTTCAATTGACTTTGACTACTGGCAATAAATATTTTTACAAATATAATATTAAAAAGGAACTTAAA
AATCTTTCAACAGAAATTATTAAAATGCTATAATTAAATTGTTAACAGCGAAGAAAAGTTTATCCGATTATTTCAG---TAAAGTTTTCCCCAACTCATTATTCA-----TTATTCAAGAAGATTCAAATGCATT-GGCATTGGGTTGGCAATGAAAATGCCTGCATCGATGCGTCAGGCATTATGTGGGAATGGGTATAATGATATCATTAGTGAGAGTCGGGCGACTCTCAATTGGATGATGTTGCGTGTAAT---TCCCTTGTCATTTACGAGTTTAAAAGATTAAATAAA
>CG4446 9335669 9335994|9766 chr3L 9334543 9335672 scaffold_8 1617210 1618337 - 48674|1138 1141
ACCG
ACCG
>CG4447 9339129 9339187|9767 chr3L 9336064 9341024 scaffold_8 1618541 1623194 - 129345|3174 3240
GCCTAAGACCAAGACTGATTCCGCTCCAAAAGCCT--TAATAAATGTAAATGTTT------AAACTT
-----ACATAAAGACTGATATTGATTATAAAGTTTGCCCATAAATGTCACTGCCTTTTATGAAATAT
>CG4452 9343892 9344245|9772 chr3L 9343432 9345119 scaffold_8 1625445 1627185 - 53324|472 850
GAGACGATGACTTCCAGCTGCAGGAGCGGCAT--------GCCAGGATACACGATCCATAA---ACTCTGGCTGCCGCGCC--CTTTTAGTTTTTCGCTATACAAATTTATATTTTTGTACTTCTGCTTTAATTGTAATATAGTT-TTACAAGTTTGTTTCATATCACTCTTTTTATGTCGCT-CATCCCTGCTACGCGAATCCTGTTCCAACTCCCTCCTTCCAAATGTAACCCAA-----TCATCAGTTAGAAAATGTAATT---CGAATTCAACTTAACGAATTCTTCTTTAGTTTAATTCACGATGGAACAACACAAAACCGAAGCATTGTTTACAT-CTTAAGAAATATAC-AAAGTTGGGAAAGAACCAAATG
---ACGCACACTT--AACCCAATGAGCATCATTCACACACACCGGCACAATCGTTCTATAGTGCAGTGTATTTGTTGTAATGATTTTTAGTTTGTCGCTATACACATTTAGACTATTACATATATTCTTTAATTGTAACATAATTATTACAATATTGTTTTATACCATT--TCTTATGACACCACATTTCCACAAACTCAAACTGTTTTCATCCTTTTCGTTCTGCTTTCATTTCATGGTATTCACCAATTAGAAAATGTAATTATATAGGCTCAACTTAATAAAATGTTCTTTAGTTTAATTTGCCAGATGACA-CACAAAACGAAAGCATTGTTTATAAACTTAAGAAATATATGAAAGTTGGGAACA---CGAACA
>Hsp67Bb 9347392 9347596|9775 chr3L 9346811 9347397 scaffold_0 5058456 5059072 + 10034|620 625
CGATAA
CAGTGA
>Hsp67Bb 9347392 9347596|9776 chr3L 9347558 9348598 scaffold_0 5059658 5060545 + 13646|0 45
CACACGTATACACTCGCACTCAGAAAGCTGT-------GCACTCCC
CACACGCACACGCACGCACTCGCGAGCTTATTTACGGAACACACAC
>Hsp22 9348723 9348917|9777 chr3L 9348599 9348724 scaffold_1284 3508 3672 + 2117|163 164
AA
AA
>Hsp22 9348723 9348917|9778 chr3L 9348725 9349076 scaffold_6 12510 12810 + 458|0 208
ATAAGTTAAGATTATACTAAA--ACCGATAAAATGCTAGTGAACTCCTATGTTTAGATATTCCAAAACCTATCAAATTTAAGTTCTTGTTAAATTAACAAGTTAATTTTAAAACAATTGTGATTCGGTAGCCCGCAAGCCCAATATTTTTATGTAGAAGAAAATAAATATTCGAAAAGACTATATG--------------ATCAAAATA
GTATCCTACGATCAGCCTAGGTCGCCGGTAATTTGTTTTTAA-----TTTGTTTATAGATTTATAAACTT--CATATTTGATTT-------AGTTAACACATATATTT---AACACTTAG----CAGGAATACGCA----TAATAGTTTTT----------AATAATTATTAGTAT-TACTATATGCATTATATTGAAAAATTAAAGTT
>CG4461 9350034 9350216|9781 chr3L 9350112 9350888 scaffold_0 5064602 5065287 + 22116|0 109
CTAACTCAAGGTGAAC-----TATTTTCGGACACCAAGCAATTGCAGCCGAACATTTAAATTGGATTCAAACATAAATAAAATACAAATTGTACCCGTAGTTGATATAAT
CAAATTCAAGGTGAACCCATCTATTTATGGCCAACGAGC---TGCAGC-GCGAATTTCAATTAGTTTTGAATAGAAATAATCT--------------------------C
>Hsp23 9356506 9356714|9795 chr3L 9356496 9356574 scaffold_0 2997108 2997191 - 353|10 87
AGGACTCGTTCCGAGAG--------ATGCCCTGCATTATTTAACCATTATCAAAGTCATACATCTGT-TTTATAAGCT
AAGCTGCTAGCTGGCCGCCACACCCATTCCTGTTCCTGCTCATTCATCATCA----CATACCTATGTATTTATTAGTT
>Hsp23 9356506 9356714|9796 chr3L 9356575 9357309 scaffold_0 5070750 5071516 + -3999|0 162
GTAGTTATCCAAGGACACTTCACTCA--TACACAATAGC-----------CATTAAGGGTGTCCTGCTTT-------AATCTTAGTTTGGAATATGTATTACTAAATTGGCGAAATTAATATTACCCATAAAAAT---AAATAACAAGTACACTTACTTATAA
ATAATAAAGAAAAGATATTAATGTTAGTTAAACAACTGTGAAAATACGAACTTGAACTTTTTCATTCTTTGGCCGCCATTTTTATTTTGGAACTTTTGCAGTTCACTTTGTTCAATTCAGTTCCCTTTTATAAGTTCCAACTCATAAATCCCGTAACCTGTTA
>Hsp27 9358775 9359231|9799 chr3L 9357982 9358791 scaffold_0 5069840 5070661 + 15397|859 875
AAGACGAAAAGAGGAAG
AAAACGCCAAGTAGAAG
>Hsp27 9358775 9359231|9800 chr3L 9358803 9358918 scaffold_0 5068679 5068806 + 423|0 127
AAGAAGACGAGAAGAGGAAGAAGACTAGAAGAGGAAGAAGTCGTGAAGGAGGAAGAAGACGACG-----------AGATTCGCTGGCGAAGC-ACGAGAGAAAGAAGAATTTAAAAGAAGAAACGGGA
AACGGCAGCGGCAGCGGCAGCGGCAATGGAGAGCCAGACGCTGTCGTCGACGGCGACGGCGACGTCAACGCAACTAAAATTGCTGAGGAAACTGCAAATGCAAAAACAAAAGAGAACGAGAAAGAGAA
>Hsp27 9358775 9359231|9801 chr3L 9358935 9359594 scaffold_27 368250 368902 - -687|0 335
CGGAGAGAGCAAGACTAAAAAGGACACACCACAACACACCCAATGTATTACATTCACACACATCACATCATTACATCATCATCATAACATCCTAGACTAAGTGATTTTAAACTCCATTTATCATAA---TGCATAAAAAAAACAAAATTTTAGTGTGTATTATTAGG----------CTAAACAACTGGAGGATTCATTGCTCCCTT--TGAGTTTATACTTTTTGTAACAAGAACAGGCGCAACACTCGG------------------GAGAATTTTGCATTTCATTTGTGAATAAACGAATACAAT------AAATACAAATACACGAAAAGAA
CAGCAACAGCAACAGCAACAACAACA----ACAACAACGACAACG-ACAACAATGAGCTGCATAATGCCAATACA--ATCA--ATTACAACAAAAATCAGTCGCCATCTGAAATTGTCTACCATAAAAATTCGCATCAAACACAAATTGTTA---CGGATTATGCAGGAGATGTGCCCTCAGCAGCCGGAG------TTGCCGCCTCACCGGATTCACAGTCATCGGGGGAGGCGCAGCCGGAGGATGCGGTGCATGCGACGCCGAGGTAAGATTTTTGTGTATGACATACGAATACGCTGAAAAAGCTCTACAAAATGCAGACACATTCTTTGTG
>CG3672 9379987 9380127|9822 chr3L 9379170 9380102 scaffold_12 2606608 2607472 - 45016|820 937
GATTCAGATATTGATCTAGATCCTTATGGATTTGGTGGATCCATCGCATCGCCTTGTATAGGTCGTTCTGTAGAAAGTAGCTAAGACATTTTCACATATTTATTGAA--ATCCTTCGC
TGTCC--------------------------TTGCTGTACTCG--ATATTAGCCTACGTACATAG---------AAATATCT----TAACTCTAAATATTTATTCGATGATATTAAAT
>CG3672 9379987 9380127|9823 chr3L 9380103 9380321 scaffold_8 4261007 4261248 + 3433|0 29
AAAATAAATAGCAAACTT-----TAAATAC
AAAACAAATGCTACAGTTGTTAATTAATTC
>CG3689 9386137 9387264|9826 chr3L 9384999 9388953 scaffold_12 2613036 2616876 - 109300|1170 2465
GCAGTTCCATTAGCGCCGTGT-GTGTCGTAT----CTACCCAACTCTAATCT-------CAAGAGTG-----------CAATGCCATAGAACAACAAATCGAGCAAACAGAACAGATCAAACAGAAAAGAAACA--AACAGATCGCAAAA--GCT----GGCGCAGGCGACTCCTTAGTTAGTT--TTGATTCTAGTCCAATTGTACAACATGTCGAAAATCAAATTCAAATTGTATTT-TTGCTCAGGACTGAGT-GTTGGCATATTTTGT-TATTTCCCGATTTTTATCATTCGAAATTCAAAGATTGTTCTTGTA--CTTAATTTTGTAAATATGTCGACATACTTGTGAGACTGAGCGCAGCAATGTTATCCTTCTATTTACATATTTTATTTATTTCCTAGCTTCTATTCTTACTTTTGTGAAGTGTCATGTGTCGTTCATCTTAAGGTTGTTGTGTATTTATCGAAAGCAATCCAATCCATCGGGCAGGCAG------------CAGAAGAGCATTGTAAC-GTTGCTGGCTGTCGC--AGTCATGTGCCCAAATCTCGCGTGTTTTGCAGATTTGCACGCATGC-----------------TGGGCAGTCAGGTCGCAAGTCGCTCCTTAAAT----TAAGCACTCGTTTATGTAAACACAAGCAAATACTGTTTATACCTTTTTTGGCCCTTACGCATTCGCTGTGCGCTGAAATGAACTGATGTTGTCCACCAGCTGAAGCATTTCAGCGCACAATTCGAAC-CGCACTTATCATGTATAATG----TTGCTCTAAAT------TGAAATTATGTTC--ATAACTGATATTAGGAGACATCGCTGGGCCAGCAAAGTGCCGGTCATGCTTTGCAAGTCGCAGC--------------------------------GAATCCAATTAATTAGTCTAACG-----TAACCAACTATGAATGTAAAACGAA-ACGCATACGAC-------------TCTTTATATCATACG--------GCTGCGAAATGATTCTTAATATGTAAATTGT-----ACAACCGATTGTAATATCCCTAGATGATATA----TCCTGTGAATTTCA------------ATGTTCGTTGATATCT-CTACATACATGAATTCTGTCTCTATCGTTTTCCGTAATCTAGCACTATTTGCTGTACCCAAAAATTATAAGCTTGTTGCTGCGCCATTATTCGAGCTATACGACAACTCGCAAGGATATGGACCCATTATCTCATCTCTGCCGCAGGCCCTCTGCAG
GCTGTTCCAATAGCGCCGTGTTGTGTTGTGTAATCTCACGCATCTGGCATCTGCCCAACCAAGCATAGAGCTCTTCCTCAACGCTCTA-CTCAAGAGTGCAAATAAACTGAACAAACAGAAATGAAAAGAATCAGAAACAGATCGCATAATGGCCCCGAGGCGCATACAATT--TTAATTAGTTCGTCGATTCTAGTTCAATTTTT-----TGTACAAAACTTACTTCAAATTGTATTTGTTGCTCT---CAGAGTTGTTGGCATATTTTGCGCATATCCCGA--------------AATTCTTTGATTGTTCTTGTTGTATTAATTTTGTAAATATGTCGACACTTCTGTAACCCAGAGAGC-GCAAT------------CCTACACACGATACTCATTTT----------TTCTT------------TGTTATGTGTTGAGCCTTT---------------------------------ATTAATCGGGCAGGCAGGTGAACAATAGTTGAAAGTGCATTGTAAAAGTTGCCGGTTGTCGTCTGTTAATGCGGACAAATCTCGCGTGTTGTGCTGATTTGCGTGCATATGGCAAATGCAACTGGATTAGGCAGGCAG-TCGCA-GTCGCTTCATAAATAATTTAAGCACTCGTTTATGTAACAACAA-----------TTATAACT---------------------CTGTGTTTAGTACTTCCTTGACATCATCCATT---------------GTGCAACACTCGCGTTCACACGCACCATGTATAATGAATGTTGCTCTTAATGGTAATCGAAATTATGTTCTTATCACAATAATTAGTAGACTTTGTTTGATGCCCAAAAT--TGATGGCTTTTTAGAAGTCGCATCCGAATCGATTTGAATTTTGCGCATCAAGAACAGAATCTATTAATTTAGTTTAACGAAGTATCAACAATTGTGAATGTAAAACAAACAAGAAAACAACCATAATACAAACTTTTATATATCATACGTAATTACGGCAGCGAA----TCTTTCTTATGTAAATTGTTTTGTATAACCGATTGTAAT-TATCTAGTTATTGCAATAATCATGTGATTACCATAACCCCTTATTATATCTAATGCTCTCTGCTACATACATAAATTCTGTCTCTATCGTTTTCTGTAATCTAGCACTATTTGCTGTGCCCAAAAATTATAAACTTGTTGCTGCCCCCCTATTCGAGCTGTACGACAATTCACAAGGCTATGGACCCATTATATCATCGCTGCCGCAGGCGTTGTGCAG
>CG3689 9387338 9387582|9826 chr3L 9384999 9388953 scaffold_12 2613036 2616876 - 109300|2539 2817
ATTCAACTTTATCTACATGTAAGGGCAGA---CGGAGGAGGGGCCCACGTCCAGCAATAGTTAAGCATCAACAGCAGCAGCAGCAGCACCAACGATAGCGCTACCTAACTGATTTCAGCACCACAGATCAGCCCGTAG----------ATTTCCATTTCAT----------GTGTGTGTGTAA-ACGTACATAATTGTATTGCAGATAAAATGGAAAG----CCAGTCTCTTTCACTTGGCA------AATAGAGTCGACAAAATTTTGTGCTTTATTT
ATTCAACTTTATCTATATGTAAGGCAAAGGCGCAGATTTAACGTCGCTGTCCCTCACT--TTCCCCCTAGATAG-----GCTGCATCACCAACGATAGCTCTACTTTATAATTTACAGCACCTCAGCTGGGCGCGTCGCATGTTGATGATTTCCATTTCATTTGTATATGTGTGTGTGTGTGTTACGTACATATTTGTATGGCAAATTAAATGGAAAAAGACCAAGCGGCATGTGCTTGGCATATATAAATAGAATCGAAAG-----TTTACTTTATTT
>aay 9398310 9398751|9834 chr3L 9397607 9398483 scaffold_1285 2927 3866 + 39828|703 939
GATAC-GTATACGTAAGGCGGTGGGGGA---------------------------------GTGGCGAATTTAGTATTTGAAATCAACGTGTTATAGCTC-----------------GTAGTGATGCACATGTTTATGCCCAAGTATGTGTGTAATAA------------TATGTACGTTAGTTCGTAATTAAACAATAATAAAAAGCGATAGTAATAAATGGAAAACGAACAAGTG
CGCACAGTGGGCGGCGGGAGTTGGGGGACAGGAGAAGCACAAGAAGGGGCGCTTTGTCACCACAGCGAATTTAGTATTCCAAATCGGCGTGTTATAGTTTATAAGCAACTAATTTAAGTATAAACCTACATATTAAAATATATATATATATATAATGAAATATGTGCATGTGTGTGCATAAGTTTATAGCCACTTGGTAAACAATAAAAACAATAGTAAAATTAAAATTTACCAATG
>aay 9398310 9398751|9835 chr3L 9398484 9399219 scaffold_2 4337629 4338336 + -1411|0 309
AA---------------------------ATCAACTTTGTTACTGTTAACTTAACAGAAT--------ATGTTAAGCGCGCACTGTTAGTGAATCAGCAGAA-GTTGTAAAAATACAGGGTGCGCCCTTATGCTAATGAACAGTTCACGCTTTAGCATCCAACTGTAAGCAATTTATTTAATTTAAAGAAATTTCATGCACATAAAATATGTATAAAAATAAATTTCTGTATTTATATGTT------TATGGCGAACAAAAACGAAAAATACAACAAAAGTTTAAATAAAACATTCATTTTTCTATGGAA
GATCGATATAACTGACCTTGATGTTAAACATCAATATCACTCATTTTGTCGTGGCGAAATTTCAACATATTTTAACTG-GCA-TATTGGTAAACCAGAAAACTGCAGCGGAGATGAGCGTTGCG---TTGAGTTACAAAATATT-----------AATGGAACTGTACGTA-------TGAATGATCGAAGCTGCGAATATCTAAA-TAATTATATATGTGAGCTCATAGAGTGAGATATTATGCACTATAATTAAATAAAATTATATTCTTGATAACTGCTAAAGTGATAAATTTACT---------AA
>Shc 9402382 9402626|9838 chr3L 9401029 9403480 scaffold_12 2627345 2629816 - 107206|1413 1690
ACCGGAGGGAACAATCATACGTATAGCTACCACCCATCATATACATAACAAATAATTATATATACTGGCATCAGCGTACACGATTAGATTTAAATATTGTGCACTCGT--AGAATATCTTTTATATATCGTC------TGTGTAAAAACGAACCCATATATTTATGGATTGAATATAAACATATTTACAAATATGTGCATGTCTACAGTATTTTCCATTCGAATGCGAATAAA------GATGA-------------------TAAACGGAACACAGA
ACCATAT---ACAACTCTTCATATA--------CCATTATCTATAT-ATATATACATATATAT------ATTCGTGTACACACTTAGATTTACATA-TGTGCACTTGTAGAGAATATCTTTTATATATCGTCTATCATTGTATAAAAACAAACCCATTTATTTATGGATCGAATGTATACACATTT----ATATGTGCATGTCTACAGTATTTTTCATTAAAATGAAAATAAACCAAACGATGCATTTTACTCTCCATTCCATTAACCAATTCACAAA
>MTF-1 9411870 9412656|9846 chr3L 9409734 9411933 scaffold_9 2249714 2251748 - 85621|2189 2255
ACTAAGAACTACCTATGTATGTACACTAATCCCGATGACCCAAACCAAATCCA---CGAGCCCAGAG
A-TAAGGCCGCCGCCAGCAACAACAATAATTTTAACTACAACAACAAAGCCCAAAGTGTACCCCGAG
>MTF-1 9411870 9412656|9847 chr3L 9411934 9412098 scaffold_9 2251987 2252159 - 1677|0 179
AATCCGATCATCAGAAATTTGAAAC-------------TGGTATTGGGCCTGTAA-AAAGTATTTTTCCCATTAAGAAACCAAAAAAAATTTTTACAAAAAATATCAAAGTGCATTTAAGTGAAACGATTCAATCATATGTGAT-CCCAGCGGAGGCTGGCCGCGCTATCCCAAAACCTA
AAATTGACAAACCAAAGCTTTAAACGTGTAACCAAGTATTGTATTGTGCCTATGAGAAAGTATT----CCATGTAAAAAATGAATGAAAATTACAATTATTTTGTTATTGTTGTTGTTAGTTGTTAAATAAAAACAAATGCAAAACCCAACGTCGGCTGGCCGCGCT---CCAAAACTTA
>MTF-1 9411870 9412656|9848 chr3L 9412199 9413042 scaffold_9 2252281 2253148 - 7184|0 519
AGGATATGTGTCGCCTTATCGGAAAATAAAACATGTCAGACTACGAAGTATA---------CGCCCAA-TTGATACACATGCACAACTGGACAGTTGATAAATGACCGTCTGTTCCCTTTAATCTAA----AGCTCTTA--CTTGTTTTTTGAATCATTTTTAATATTTAACACGTTGAATATCTTTGAGTTTATCTACAACTAACAAATGTAATT-TATTA----CCACCCCAGATCAAAAGCGATCCATGCCTTAGGGACGTAATAATATATTTATATGTGGG-----GGACTTTCATTT----------GTTAAACTGTATTAATCAAA-------------------AATAATAGAATACTATTATACTATATTATGTTTTTTTGTATGGAGTTTATGACGCTTTATATCATGCCAAATATGAACAGAAACATATTTTCTACTGTTTTCTTATATACCCAAGTTAAATCATTTGTATAAAGTCGAATAAAACATAAAACTAAACTTG-------TT
AAAATAT-TGTAACATTTTTTAAACAAAACAAAAATTA----ATGAAACTTAGCTTCGGCATGCCGAAGTTGAAATGCTCTTGCAGTTAGGC--TTGGTAGCCAATTCTAAGCTTTCTTTGAAAGTAGATCAGTTCTTAAACCTATTTTCGGTCTGACTTTAATCCGTT--TTTGTCAAACTATTAAAAGTTTA-CTACAATTTATAAGTGCAGCTATATCAGATTTCGCGCTATATTCAATCTGATC--------AGGCACATACATGTATATATGCATACATACCCTATGATTTTTATCTCCCTTGGAGCGTTACACAACACTCGTCACATAGTACTTATGAACCCTGCAAGGGTAGAGCAGCAA-ACAGTTAACCGTAACGCCTTGAATTCAACATGAATTGCTTTATATACGACTACTTG---------ATGTATACACTATATATATTTTATA-ACTGACATTAAACCAACTGTATAAAGTCGAATAAAA-ATATAACTAAAACTGGTTTCCTTT
>CG3529 9424377 9424733|9860 chr3L 9421251 9424712 scaffold_12 2827414 2831055 + 95973|3418 3855
--GTGATCTCCGCCAGCACCATCATCGGCTCTAATTGTTTACTCTTTCAAATGTTATACACACCCTAACATACTTATCCGTAACGTCTATTTG-------------------ATAGCAGATACATAGTAACACTTTATGTAAAATGCTTTTA------TTTTTTACAAAAACAGCAACGATAACTATTGATTAT-----------ATTCCAAAAAAACAA--------------GCGATCTTTT------GTTGGTCTAATTGTAAGC---------------------------CACGTCTACACATTGATGGTAATT-TAATG--TATTACGTTAC-AAGTCTATTTGTTGTTTATTTATAC----------ATACATTATAAAGCTAATTTATTTTACAAAATCGAAAAGAAAAACTAAAACA---AAATGGAAA
GTGTGAAGTGCACCTGCG-------CAGCGCCAATTGTTTACACTTTCAAATGTTACACACG-CCTAACATATTTATACATAACGTATATTCATATGCATACACATATATATATAGCATACATATA-TAACAA-TTATGTAAAATGCTTTTAACTATTTTTTTTATTAATTGGCTTTCGTTTCTTAATCATTCTGTTCACGAGAAATTCCAAAATAACAACTGCAACGACAATTGTAACTTATTCCAAAATTTGCTCTAATTTTAAGCTAAGCAGATAACACACACACACGCATACACACACACACATTGATTGTAATTGTAATGTATATTATGTTATAAAGTCTATTTGTTGTTTATTTATACATGTACACGTATACCTTAAAAAGTTAATTTATT-------AAAGAAAACAAAAAACAAATCACTGGAATGGAAA
>CG32038 9426391 9426419|9862 chr3L 9425756 9427080 scaffold_12 2832559 2833805 + 6479|705 733
AATACCGATCAGACCATGCCCAGACCAAT
-----TGACCACGGCACGCCCTCATCACT
>CG3552 9433282 9433322|9866 chr3L 9431786 9435216 scaffold_12 2838465 2841820 + 74676|1549 1590
AACACAGAGAATAAATAATCAGAGGCTTCTAACTA-GACTTA
CACACAAGGATGCTATTAGTTGTTAGTCATAAGTACGATTTT
>CG32043 9445927 9446544|9880 chr3L 9445815 9446604 scaffold_12 2851795 2852559 + 14987|112 801
GATTGGGGTCGGCGTGGCGCCAAGGACAGCGGTGGTGGCGCCACCTGTTGACACGCATAGGC--TGTTGCAG-------AAGGAC--ATGGCAGAGGATTCAGGATT----TCGGCCCATCCCCCATCATC--CTCCCAACCTGTCCTAGATTATAGTTTTCCGTTGATGTGCATC-GTCATATTAGTTTTTTAGTGTGCTCCTCGTTTTTAGTTTATGTTTCGTTTATTTAGACTAATTTTACACAAGCTTTTTGCCAAATTTTATAAAACTATGCAAATTTTGTATTACGTTTGACGACGATAAAATGAAATTGTTGTACAACGATCGATCATTACCCCAAAACTATGCAATGTTATTCCTTGAAAAGAGATTATTACATTTACACACAAACAT-CACACATTTACACACTCACCAACACGAAC------GACACGAGTATAGAAAATCATGC--TAATGC-----------------TATTTAATATGGTA-ATATATAAATATATATTTTAGTAAGCCAAGAACAAATGATATGTATGTTAATGTAAAACCAATCCTAACTAAACACA-ACATACGATATACATACATATATATGGAAA-------------------TTGTTTGCGAACCCAGA-------AAATATATATACACAACTAGCAAGAAGCGATTGAGAGAAAATCG
GACTGGCGTCGGCGTGGCGCCAAATATGGCGGCAGTGGCGCCACCTGTTGACAATCGTAGGTGGCGCTCCAGCTACCTAAAGTATCAAAATCGAAAGAAACAAAACTAATAAAAGCCCAACAACTATTATTAGCTCTTAGCTCTTCT--ATTTACACCATTTGGTTTATTTATGTTAATCATGTTGTCTTTGTCCTGT----TTTGCACTTAGCGTATGTATTTCGTTTGTAGTCTAATTTT--ACAAGCTTATTGCCAAATTTTTTTAA-----------TATGTATTATGTTAAACGAC--------TAAATTGTTGGACGATGAACACG------CCCTGAACTATGCAATGTTATTCCTTGAAAAGAGATTATTACAATTACGCACACATACACACACACACAGACACTCACACACATACACATGTAAACTGTCATTATAGAGAATCATGCGTCAATGCGCAACTATTGAAAGTAATATGTAATAGTATATATACATATACATATATTTTAGTAAGCCAGGAACAAATTATATGTATGTT----CAAGACCCATCCTAACTATATACACAGCCTCTACATAAATACATATGTATATAAAAAACATATAAAGCGAAATTTTGTTTGCAACAACAAATATACATATATCTATATACATACATAGCAAAAAAAAAAACAACAAAAAAAA
>CG3654 9459540 9460479|9891 chr3L 9454823 9460498 scaffold_12 2867640 2873559 + 200533|5016 6137
CATCGTCGGCGTCGTTACT-AATCGGCGGCGCACGAAAGATTCAGGCACAGATAAAGATAAGGATAGGAATTTTGATTAGGAAC---CCAGCGCAGATGTACATATTAAGAAATGTGTATACCTATGTGATTCGCCATCGCTAGTGAGCAGATAATTGATAATTGGGTGAAATATAGAAATGTCTACGAGTTAATCCATGGACACACAAAACACACATATTAATGCAACGTTTATCTCCCAGTTGACTAACTGACACTATTACTAACTGTAAGATAAGAGAGTAGGATCGGATATAGAGAGATGTAACTGTTCATATTTCAACGTGGCAATGCTTTCAATTTTGACTAGTTTATACATTACGTCGATAAGAAGTTTGCAATGAATTTTGTTTTCCATTTAAATTTTTTGTTATGCAATATTTACCCTCCCCGAAAATGTTAACCCCCCACCCTCCTCCCATTTGTGTTAT-TGTATATAGAGAGCCTTAGTG-------TATGTACGTACTACGTAGTTAGCTTTCGAATTAAGTCAAAGACCCT--------------CAAAGA------AACCATGCTAACGTGTTGCAATTTCTACTACC-TTTTATACGCTAAGATAACGAGTAATTACCATAGCATCATAGAACGACACAGACCCAGATATCCACACACATA----------GAGCGCTAGTTTAAGTCACTA--ACAATAGCAAGGGA--CCGTCCCGGGATGGTTCTCTACCAACTAACGAACTAAATGAAA-----GCCAGAGTTACTATCGCTGACTGAAGTTG-TGAGGCGGGACAA-----------CCCAA---GACGTACTGTT---------CATTCAA------------------------------------------------------CCAAAAACTATACAGACG----------------------------AAATCATCCATCAAG--GTCAGGCGATTG--CGATTA--------CGTAAATG---AGAACTTTTCACTAGATGTTCAATGTATTTATATAG--------TAGTAATACAATATTTAAGTAACAAGTGCAACAATAAATCTTAACGCGATATATCG-AA
CAGCGTCGGCGTCGCTACTAAACCAGCAGCGCAATAAAGATTAAGGAGGCGATAA--ACGATCCAAAACATTTTAAGCGGCAGCGTTTAAAAATATTTGTACATACAGCTACATATGCATAAATGTAT---------------------------TTATAAATATTGTAGTATATACATACATATATATATATATATATAGATTTGTAGGTTTTTCAGCGTG--GCAATGCTTG----CAATTTGACTAGTTTATAC--------------AGACATAAATAT--------ATATGCAACGATTTGTGTGTATATAT----ATATATAAAT-------ATATAAAGCAACTAATATGTT---TAAGTAACGCGTTTGCAATGAATTTTGTTTTCCATTT---TCTTTTGTTAT-------------TACTTGAGAACATATATATATATTCTGTGTGTTATTGATTGTATATGTATATGTATATATATACTGAAAAAAAAATCAACTTAGCAATTAGTTAGACTACG-ATTAAGTCGAAAGAGCTCGCCTCAGTTAATACAAAGATTTAAGCACACTGCTAACGAGTGGCAATTTCTACTACCTTTTTATAC---AAGACACCTAATGCATAATATATGATTAACACTTACCATAGG-CAACATATATAGACATCTAACGTGAACGGGAGTCGTAGTCTTAGACAGCATTACAATAGCAATAGATGTGGGCCCAGAGCCGTACGCAA--AACTA---AACTAAAAGCAATTACTTCCTAAACGCCTGTCAAAACTTGCAGCTGATAAAGCGTTACAATTTTTAGATGTTCCAATTTGATGTAATTTTAAATATACACATACAAATATATATATATAGATATCATCTACCAGTGCTATAGCAAACGGATAAACACACTCGAACACACACACACACGCAATTTTGACAAACCAAAATAGCAATAAAAAGCAACCATAAGGCAGTCAGTCCATTTTCCAATTGGAAATGGTCATAAATGTGAAGAACTTAAACTTAGATGTTCTATGTATTTATATAGTTGTAAAATTGTAATACAATATTTAAATAACAAGTGCAACAATAAATCTTAACTCGAAATATTACAA
>Or67a 9505282 9505283|9934 chr3L 9504371 9505444 scaffold_7 1935855 1936963 - 16026|932 933
AT
AT
>CG32048 9567727 9568461|9978 chr3L 9565336 9567843 scaffold_12 702961 705486 + 69566|2588 2745
GAGCAGGGCTTCGAAACGCCCA------GTGGACCAGGTCATAGGTTAAAGGA------TACGAAAAGTGGAAGTGGGCGTGCATG-------------AGGAACGAGTGA----------------ATGAGTGGGTGCAACAGTATTAATTTAGGAG
GAATCCAAC-----AATAACCATTGAGAGTGGACCAGCTCTTAAGTTATAATAGTCACCTAAGCTAAGTCGT-GTGCGCGTGAATGTGAGTGTGTGAATGGGAATGAGTGAGGGTTTGAGAACGAATATGAGTATGTGAATGAGTAAGAGTGTGAGAA
>CG32048 9567727 9568461|9979 chr3L 9567929 9570911 scaffold_12 705595 708603 + 51493|0 589
TCAACGTCCGTTTAAGTGTAA-------------TATATCTATGTAATGTATATCTATTTAGCAATATC---TTCTAGCTCAAAACTGTGCCAAAGTCGAAAGTTTATAATACTCGAAAGTTTGGTTAGCTTCCGGGCCAGCAGCGATAAACCTTAAGTAAAAGTATTTGTGAAACATA-----ATCTTAGCATATCAGCAACGAAGAAACTTACTCAAGTTCGCAATAATCGTTTGAAAGTATTTTCTCTCCCCTAAATGAAAAACTATATCTATACACCTAGTGATTAAGCTAATGAGTCTAGTCTAAACTGATTAAATTCGATACTGTTATTTTTGTAAATTGTTGTATTTTAA---TTCAATTCATGCGTGAC--CCGCATAATCTTTATTCGCAAA--------------AATG------CAATAATCATGGGGA---ATGCATTAATTAGTTGCCAGGCTGAAAAGTTA-------TGTGTAAATTACAATTTCAAATATTCATTTGAATATGGAATAT-AGGCGGCAAAAATGAACGGCAAACAACCAGAAATAATAATAAAAATCGCATAATTATGTAAAAA
TGAGTATGGGTATGAGTATGAGCACGAGTTGGAGTATGAGTATG-AGCATGAATATGAGTAACAGTATTAAATGATAGCGCAAAACTT------GTTTTTTAGTTTGCAATTGTT--AAGTTCTTTGAATTTCTAGTCCTGCAA-GGTAATTTTCAA---AAGGCAAATAGAAAATATACTACAACTGCAGCATATCATAAAATAAAAAATAAATTATATATC--------------AAAGTATTTTCTCTCCCTTTAAAG--------TGTCAAAGTAACTAGTTGTTAAGCT------------CTAAATCGCTTTAGTTAAAAACTATT----TAGTAAACTGTTGTTATATAAATGTTCTGTT-ATGCAAAACTTCCAAAAAATGTTTGCTCACAAAGTCGGATAGAGCGAAATGATTTAACAATTGTTATGTGAACAAATGTCGAAAACAAACGCAAGATTAATTGGTTGCAGCAACTGTTAAATATACAATTTCTCGT-TTTATTTATTAACTAAACATTAAGCTACAAACAACAA-AACAGGCAAACAACAGCAATAAAAAA----GCATAAAAATAATAAAA
>CG3222 9574160 9574292|9981 chr3L 9572848 9574366 scaffold_12 709964 711496 + 24977|1356 1505
ATCCGCCGATCAATGT--------CTTTATATATGTTTTTTTCAATTTAAAATTTAAGCTTAAGAGCTCGGAGAGAAAATGAATGCAATTACTTTGTAATCTGAAAAATAAAATTCAACGTTTTTAAAGTT---------TCTTAGAATA
ATCCTACCATCAAATTAAATTATGCATTCAATATATTGTTT---AATACAAATTCAAG--TAATGCATACGATTG--AATAAATTCAATAGACTCATGAAGTTCAAAATTA---TAAATATATAAAAAGCTGAAGCCACATGCTGGAAAG
>CG3306 9576410 9576495|9984 chr3L 9575576 9576917 scaffold_12 711896 713435 + 14779|899 988
T----TGATCCTTTGAATTTTTTGTTACTTTCGCTTCTACTTTTCGATGTGGCCTTAAATTAATATATTGTAAATCGTTGGTTGACCCAC
TCACATAATAATAGCAAAGAGTTGTTAAAATTG---------------------TAAAATTAATATGTTATGC-CCGGCGATTAACCCAA
>LanB2 9597338 9597927|9995 chr3L 9592983 9597930 scaffold_12 730430 735336 + 256570|4380 5015
AGCT-----CTGCGAACAACCCCACTTCCCA-TAACAACTACTTCAATT-TTAACTAAGAACGAAGATCTGAGACGAG-ACGAACAAATCAGATTTATGATAGAACGTAGACGTTGAATGAAATTATGTAATTTTAGTGCCTTAGCCGAAATATTCTGTTTAGTG--------------------------------ACCCAGCCCAAGGATCCAAGGATCCACAAAGGAGACCAACTGAGCAACGTTAAGCTTTAACGCATCATCGTTCGCCTACTGTATGCCATATACTATAATGATACAACGGATACAAGAGGATGGATGATGGCCACATCGAGAATCAACTGCCAACTGTGCTTCACCAGTTTCAAGCCAGCAACG---GACTGTATTATA-TGTTAAAAATGAGACACTAAACGAAACACACAAGACCTTGTACTCCCACAATCCGACAATCCAATCGCATATCTATATCTCTACCGTA-GCTCCACCTGAAGTCTATTCTAAACACTTATATATTAACATATTTGTCATCTACGTTTAATGTGCCAATACAATTACCATGTATCTTT-GTGTATAAGTCGCTTAAAGAGTTTCCTTTCAAAATATAACTTTTCCAACGTTGTAAGTTTGT
ACATACATACCCTAACTAAGTGCACTACCAACTACCGACTACTTCAATTAACATCTAAGTAC--------GAGGCGAATACGAACAAATCGGAATTA------GCCGTAGCCGTTGAATGAAATTATGTAATTTTAGTCTTTTAGCAGAAATATTTTGTTTAGTGAAAAAAACGATAAACGAAAACCAGAAAACAAAAACAAAAACAAAAACCAAGAAATGAACAAAAAA----CATTGAGAGACGTTAAGCTTTAAAG---CATCGTTCATATATTA------ACAAAATAATGTGATGCAACAAATTT----------------------------CTTAACTGCCAATTGTGCTT---TAAATTCAAGCCAGCCATGGACGACTGTATTATACTACTATATATTGAAAACTGTGCCGTGTACA-----------ACTC-----------CAAATCAATTGCATTTCTATATCTCCCCCATATGGTTATTCCATATTGCAATCTATACAT-----TATTAACATATTTGTCAACTACGTTTAATGTGC-----CAATTACAATATTTTTTTCGTGTTTAAGTCGCCTAATGAATTTCACCTTAAAATAAATGTTTTCCAACGTTGTAATTTTGT
>CG8336 9605644 9605745|10000 chr3L 9604714 9606620 scaffold_12 738230 740260 + 69502|942 1121
CTGGCAGCCAGT----------CACCATTTTCA----------------TGGCTTTTTTAAATGTA---------------AATAC---TTATTAATAAATAAATGTTGG----------------------ATTTACCAAGTCAGTGGTTTAC------------CACAAGAAGGTAAT
TTGACAGCGAGTTCGTACAACACACCTGACTAAATGCTAAGATGAAAATTTGCTCTATTTACTGTAGGATGTTCCAGAGAGAATACAAATAATTTGTAATTAAATGTTTATACTATTATAGAAAAAATACCTATATTGCAAGTTATTGTTCAATGTCCCCAGGGGTCATACGAAGGGCTG
>CG8329 9612854 9612973|10004 chr3L 9611890 9612888 scaffold_12 745640 746669 + 10236|1034 1074
CAAGGAGACTCGATCAATGA------TGAATCTAAATCAAA
----AAGCCTCGAGTTGCAAAATTCTTGATTTTAATTCAAA
>CG8329 9612854 9612973|10005 chr3L 9612889 9613021 scaffold_9 1099670 1099782 + -1115|0 86
TCATTGTCTATCCAGATATTCTGATATTTTTGTTCCACTTTAAATGAACCTATGTAAATATATATATATCCAC--ATTGAGCAGAAA
ATAT--------AAAGAATTATGAAAAAGCTATTTCTATTTGTTTTTAGCAGTATTACTTTATTATTATTCTCTTTTTTAGCGAAAA
>CG18179 9614043 9614093|10006 chr3L 9613024 9614107 scaffold_12 747902 748941 + 20762|1035 1095
-ACTCTTAATAAATCCTTTGTAT---TTTTTTAATAAAA------TCTTTATATGAAATAT
TAATCCAAATTATTATATTGAATGAAGTAACTAATAAAGAAGTATGCTACAAAAGGTGTTT
>CG18180 9615774 9615860|10007 chr3L 9614891 9617148 scaffold_12 749471 751594 + 60504|910 996
TTGACTTAGGAACAGTAATGACAATGTTGAGGATTCTTCAGCAAAGTCTTTGCTTTTCTAAATAAATTCATTCGAAAACTGCAAACC
---------GGACAATA------------------------------------TTTACGAAACATACCCATATGGTCAATACCAATA
>CG16717 9654758 9655011|10039 chr3L 9653861 9654769 scaffold_12 788865 789833 + 50856|958 969
CATGCCTAGATG
GAT-CGTAGATG
>CG16717 9654758 9655011|10040 chr3L 9654988 9655416 scaffold_5 5117741 5118172 + 1479|0 23
AACAAGTTTTGAAGACACCTAAAC
AACGAATTCAAAAGCAATATCAAC
>alphaTub67C 9657236 9657319|10042 chr3L 9655686 9657237 scaffold_12 790192 791715 + 85773|1558 1559
GC
GC
>alphaTub67C 9657236 9657319|10043 chr3L 9657262 9657501 scaffold_44 793218 793488 - -726|0 64
ACTTCAGTCATTACAATATCCAATAATTATGTGTAAATAAA-------TTAACCAAGAGTTTGAA
GAATGACTAACTACAA-----AATAAAGCTCTGTAAAAAAAAATGATTTTACCAAACAGTTTCCA
>CG16719 9660018 9660195|10046 chr3L 9658591 9660207 scaffold_12 793526 795202 + 23910|1548 1759
CCAACGGATGGATTTGTCGGTTCTCCGAGGATCCGGCGAGA---------------TTATAGCTCC---TCTTTTGATTCAAACCTGATGTTATTGGATATATTTGTACTGTATATTTTGTAATTT-------ATTTTAAACCCTTAAATAAGTATTTCTTTGGCCTCACTTT--AATAAACAAAAATTGTTACGT-------CGTTCAAAA
GCGATAAGAATTTTAATTGGGTCTCAACCGCTTTGACATTAACATTAATTAACCATTAATAATTCCTAGTTTTTCGACTTTCTCCT-ACGATAT---ATATATTTTTTTTCTTAATTTCTTAATTTCATCTTAATTTTTGGCATTTATA-AAGTAGTACGATTAATGAAATGTAAAATAAAACAAAATTGTTGTGTTATGCCCCCTTAAATA
>UbcD4 9673677 9674428|10063 chr3L 9673187 9673769 scaffold_12 807519 808075 + 26430|490 589
CTTGTC--CCAGCCGCACTAGCATCAGTACCATTCGCGGCGGTGGCAGCACCAAGAACACCGGCCAACTT-----CAGCATCAATCCTTCAGAACGGCAA
CTTCGCAGTCAACCGTAC-----GCAGCAACAATAAAAAGAATAAGAACAACAACAACAACAACTAAATCAGAAGCCGCAGCAAAACATCAG--CAACAA
>UbcD4 9673677 9674428|10064 chr3L 9673770 9677453 scaffold_12 808468 812071 + 106246|0 712
TCACGCTAAATTCTTGTACACTCACGCACCAATATATTTTCGTAAATCTTATCCACGAAATTACATTG---------------CCCTGTAGTTATA-ATAATTCTCTGATCTGTTCTATAATTT-----------TATTATGATT---------------AATGTGCACATCTTTGCCGCTGGGTGGGTCACCAGA---AGGTTGAGCCAAAGGCCATGCCCGCGCCCCATTGAGCATGTGGT---GTTATGTAATTGAACCCAGG-TTCTGTTTCATTAATTTACGTGCAGTCGCATTTACTTGCAGGCTCTTTCTTAAACAGTACTGTTGTTTTCCATTTCAAGCTTAAACTAAAACACAAACAA-AAATGATTTACAAAACAAAATAAATGTGAAGGCGAGGAGTGTATAACAAATCGAAGTCTTTGTAAATTGCGTTAAGTTAATAAATAAATAAATAAAAATATTAATAAATGTCTAATGAGAAGTTATGATTTCGGTTTGTGAAGAAGAGGCT----GCAAACTTAAAATAGATTTTTGTAAATCATGCCTAGACTGAAGAATGGAAAATGTAATTTACCCTAGATTGATTGAGATATGTAATGTATATTACTATAATTCTTGTTTAATCCATTTTTTAAGGCTCTGTCTAATGCCAAAATTGAAATAAAATCCAAATTCTTGGTGATTTACAAACCAAATAATTGC
TCACGTAAGGTTTTTTTTTTCTCCAAAAAAAAAATATATATATATATGCAATTCATTAAATAAAAGTGAGTACCGGTACTGGCCCCCACAGTTCTTTATTACCTTTTTTTCTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTGATGTGTGCACTACATTTAAATATATATATATTAATTGT--GTTGCGTTTCCGGCTACAGGCTGAGCCTAGGGCCCAGCCCCCCATCCTCTCGACATTTGATTATGTTTTGTAATAGAACCCAGGGTTCCGTTT-----------GCGCAGCCGCATTTA----------------------------TTGTT---------AAGCAAGGACAACAACAACAACAACAAATGA---GAGAAACAAAATTTTTAAAAAAGAAAAATTTATATATACAAT-----------TTACTTGC-TACACTTAAAATATGCATACGAAACATTTTTTGTCA-TCTGTAACTGG----TTTAATTTAAGTCGA--AAGGCGAAACGAAAAGCAAAGTGAAAATTAATTTT---------------------AAAGTTGAAAACAAAATGAAACCAAGCT--------ATAAGAAA--------AAAAAAATCTTTGT---------------------------------AAATTGCGTTAAGTTAATAATA-----------ATAAAC--AACTATTAA
>CG16711 9682549 9683656|10066 chr3L 9678312 9683172 scaffold_9 2891130 2895808 + 131224|4646 5302
CAGTCAAGCCGGGCTCAAAAGGAGCCAGCACCTGGATCGGGAACAAGGACGGCCAGCTATGAGGAGCAGCATCAGCAGCAGGACTACAGCAACTATCACGCCT----CGGCCAAGCAACAGCAGCAACAGCAACCA-----CAACTTCCAGCAGC------------------------CAACAATCAAAACCACAGCAACAATAGTAGCAATAAATTTTGTTATCCAACGGCAGCGGCCATGGAGAATATGTTCCAGAACAATCAGATGGCGGCCGCTGCCGCCGCACGCGAATCCCTGCTGAATTCATATCTTTATCAAAAGGATAGCGATGCCGGCAATTATATGGCGGAGCAGAGCTACTGGCAACAGCACCAGCAACATCACCACCAACAGCAGCAGCAGCAGCAGCATCAACAACAACAGCAGCAGCAACATCAACAGCAGCAACATCAGCAGCAGCAGCAACACCAACAACAGCAACACCAACAGCAGCAACAGCAACAGAAGCAGCTCCAGCAGCAGCAGCAGCAGCATCAATGGAGCGCCAACAACGGCAGCAGCAACCAAAGGAGCAACAATTATGCCAACAACTATGCGGCGGCAGCCGCTGCCTCCATGTACATGCAACACTTCAATCCCTACATGCAACAGAAG
CAGTCAAGCCGGGCTCACAAGGAGCCAGCGC------------CAACGGCAGCCAACAGCTACGAGGAGCAACCACAGCTCGACTACAACAGCAGCAACGGTTGCAGCTACCACGCAGCAGCAGCAACAGTTGCCAAGCAGCAGCCCTCAGCAGCAGCTGCAGCAGCAGCTGCCGTCAGCAACAATCAA---------AATAATCACAGCAATAAATTTTGTTATCC---------------GGAGAACATGTTCCAAAACAATCAG------------------------------CTGCTCAACTCA------------------------------GGTTACGTCGCAGAGCAGGGCTACTGGCAGCAGCACCAGCAGCAT---------CAACAGCAGCAACATCAACAGCAGCAACACAAGCAACAGCAACAGCAGCATCAGCAACATTGG-AGCAGCAGCAACAGCAACAACAACAGCAGCAGCGGCAGCGGCAGCTATGCGAATAACTAT-GCCGCTGCGGCAGCTGC-------------------------------------------------------------------------------CTCAATGTACATGCAACACTTTAATCCCTACATGCAGCAGAAG
>CG16711 9682549 9683656|10067 chr3L 9683173 9683221 scaffold_12 819411 819459 + 1822|0 48
GCGGCGCTGCTGGCGGAGAAGGCTGCCCAAGCGGCGGCGGCGGCTGCAG
GCAGCGACGCCGACGGCGACTGCAGCGTTGACGGTGACTGCAGCTGCAG
>CG16711 9682549 9683656|10068 chr3L 9683222 9684279 scaffold_9 2895855 2896915 + 28964|0 520
CGGTCCAGAGCAGTAA---------------CGGTAGCAATAAGCACGGACGCTTCGGCGGTGACTACGGCT-AGGAGT---------------CGTCCGGTGGGTTCACGGTTCAGCT-AACCGAAGCGCAAGACACTTT-----------AGCGCATA--AACATAA---ACATATAGGCATATGTAACACTTGCGTGTAATAATAACTATAT--------ATTTAGA--GGCATCGTATAGGCCGTTTTACCGCCAGGAATTGGTAAAGGATAAACCATGATTTTCCTTTAGT------------TTAATACAC----------------AGGAACAGCAACAACAAGGTAACCGGAACGCAAACAACAATAATTTATAAACAACAAACAAGGTGGTAAACACAAGCAGAGAGCAGTAAACATAAAAAAAAACTTAAATTGAATTAGTAAAAATTTGTTATTGGTAGTTTGTTAACAAAAAAGAAAAACACAAAAAATATGAAAAGAAAACAAAGAGG
CGGCGCACGGCAGCAACAGCAGCAGCGGGAGCAGCAGCAACAAGCACGGACGCTACGCAGGCGACTACGGTTGAGGTGTACCGGAGCACACCTGTGTCCGGGTGTCCGGCAGCACAGCTGGAGCGGAGCG--AGGCGCGTTCATTTAACCAAATCGCATATTAACATAGATCATATATAGGAA----TAATAACTACGTGCATAATAAACTATACCCGGCGCAATGGAGGCCGGCAACGTATAGGCCATTTTAACGCAAGGAATTGCCAAGGAA------ATACGTTTCCTTTAATTAATTAAATAAATTAATATACAACAAACAAATTAATTAACAACTGCAACAACAAGGTAAACG----GCAAGCAACAATAA-TTATAAAGAAAAAACA-------------AAACAAAAATC--TAAACAAAAAAAAAACAACACACACAATTAGTAAAAATTTGTTATTGGTAGTTTGTTAAAAAAAGGTAA-------------ATTAAAAAAAAA--------
>vsg 9690170 9691663|10076 chr3L 9689546 9691440 scaffold_9 2901299 2903217 + 24115|656 2134
GCCGCCACCGCCTTTACGTCGGCCTTCAATGCGGCAGCCGGAGCTGCGGCGGCCAGCAGCAGTGCCGCATCCACGGATGCGGAGCGCGTGCGGTTTGTCCAGCCTTCGATACCGCTAAGGTCGCCGCCAACGCAGCCGCCACCACCACCAC--CCACCCACATGGGTGGCAGTGGTGGTGGTGC----------------------------------------------------GGCTG------------------CAGCTCCACAAAACTGCTCGCCGTCGGCCCGAGATCGGTTGCTGCACACGTAATTTAAAAGCGGGGAGCC---------ACACCATATTACCCA------------ATATAATTAATATCCAAAGAGATGCCCCTATACCCCGATTCCCCAACAAAACACACACACACACACAGAGATACAAACGGCAGTCAAGTAAAGTCAGTTCTTAAATTGAAACGATAACCCCCTGAGCGGATTTAATACGGGCCCAGATAGTAGGAGCAGGCTCTACATTCTTGAATTACTTCCCTTATCTCAGTCATACAGAAAATGTAAAAACAAAGTAAATATTTTTCCTTTAATGCATTGCATTCAATATGTAAGGGTACGGTTTTT--TGCAAACATCAGTTTATCAGCAA--CTTGAGCGGATGTTCAACGCCTTATATAAGAGGAGT-CCGGGGAGCCTGTCACAGGGTCTTCCCAGGGCGACCATGAACCGAGAAATGAGTTATGAGATCGAAACGAAACGAGACGAGAGGAGTAAGAACA----------------------AATAACAGCAAA-TATGTGAGACTGCTTGATAGCGAGAAAGTGAAGAGATCAGAAAGTGGAAAGCGGCTGGCGACGGCTTTGTTTCTGTAATTCATAGGGAGCTACGAAAAGGAAATATAAATTTTTATTATATTTAC------------ACAATTTTTG-AATAACTAAAATCGATTCATTCT----AGGAACTAAGAA----------TACATATGTACTACCT-----AAAACCGAGCTAAACACAATGGGAAACGCGTTTCAATTTT--------------------CTCATTTAATGTGCATTTTTTCTCCGGTCTTTGCCCACTTGT-TCTATCGATTCTGCTCACCCCGCCATTCCCGGGGTCCGTAGTATTGCAAAA----AATCAATATAGCTACTAACGATGCACAGCAACAGGATTTACGGATTGCCGTGCACGGTTGATATGCGTTT-------------ATATGCGATATAAACAAATGTACAC--ATGTTTGTA--TACTGCTGAAGTAGATTTTGATTCGAGATTCGATGA-----AAGCCCCATGTTAATGCATACACGCAAATGTTGAATATTTTGTACTAGA---ATGGA-----AACTATACATATGAATTACGTTTACCTAACCATACCGCGCTTGCTGTTGGA
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ACAAATTAATCTCATAATTACATC-----------------------------TATATATATATAT---ATATATATATAGGCTTAGTGAACAAAACTTATTGTATATCCAGTAAA--ACTCGAAACGGCTTATTAAAGAAATACCTAAAGCTATGTATGTAT-------TGTATATCGTGTACGATAATAAATATTTTAAAACTTT
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CTTCACAAGCGACGGTTAAT
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ACATTAAAAACGGGTTTCTATATGTCTTAAGATTAAATATTTTTAAAAATATAAATATTAGTTTAGGCATTACATCCAAAGT
AAACAAAA-----------ACAAACAATAACAATAAATAT------AAATACAAACA--AATTTAAAATTTGTATTTAAAAT
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ACGATTCGAGTTTTAGTT-GTTTATTTGTAAATTAAAACCCA--TTCGAGACGCTGG----AACCATGAATATGCCCGAAAGATGATAAATCGATCCAATAT--ATCTTCAAAATGTCCGTGTCTG
ACGACTCGAGTTATAGTTTGTTAAATTGAAAATTACACACAAAATGCGAGACGCAGCCAACAAACGGAAATGTACCACAATATGTTTAAATTAATACAACATCTATCTTGGAATAATAGGAATCTG
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GGGTTGTGCAGCAGCAACTGGAGTTGGGTAATAGCCAGGCTCAGTTTTAGGCCAAATTTAATTAGTCCTTTAATAAGTATTCAAAGTATTAAAGCCAAGCCGCGTT---------CCC----ATAATACAAAATC----CAACAAAAACAAGAAAATACAAACGTATGA-------------------------------CGAAATTCTG--GTGATCGTGTTAACGAACTACCTGC-ATTAGTATTTAGAGAGAAGGATTGTATAGCCTAAAGTAAAAC-ACACACACACCTGAATACCTATTAGATTGTA---AGGATTGCAGCTGGCCGCAGACATCTATT---GATTAGGGCCCGGTCAAAAAGGAGGAGTGCCGAGAACTCAAGAGCGGGAGGAAACGTTGTACCTAAAATGAAACATGACATGGTAGGGCAAATGTGGCACATATTTTGCCATAA---------AGAGCTAAGAACAAAAGAATAGAGTATTCGTAATTACCTACCGATAAACGATAACCGATAACAGATGACCGATTATTTGTTCGATTCTGTTCAAACAAGGAAAAGACTCCACTTCGTTAAGCATTAGGTGAGCACTTTGGATCCTCATTAATTATGCCTTATGACAAGATGTTTGCTTAGTGAAAAATATTTATGAAAACAAAAGGAAACT----------TTGCATCACACA-AACACAAACAAA-------AACATATTTATTTGGTTTTTCTCGTTGATTATTTTCTCGTCTCGCGCGTATTATTAGCAATAAATATTTTGCATATACATATATTACATACATATATATATATATATACAAACATATATATTTACAATAATAAACTCGGTTTAGTCTCATCGAA--AGAGCAAT--GAACATGAAGAAGCATTCTTAGAAACAAAATTATAAACTATTTAGCTTCAACTGGCGTAGTGATAATTAGTGTCAAACACACACAAACACACAAACAAATCCCAAAATCCCACAACTACAAAAAAAAAAAAAAGGAAATTAAAATTTAAAGACAAA--GCAAATGAGAAAAGAA--ATGTCGCGTACTTCGCTTAGCGCACACTTTTAAAGTGAATGCTCCGT-TGTGACGTAGCCTCTGTAAGTTTTGCCTTTTTT------------------TTGAAA--------------------------------
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GCGCACTCTTCCTATTCAAATATCGCGCTATTTAAATCTCTCAACTTATGCTGTCCGTG-----------------TGTCGTGTGTGTGTGTG-TGTGCTTG--------------TGCATGTGCGTGTCGTGTATGTGTGCGCCTGTATGC-CAGCCATATCATATG------------TGTGTGTGATAAAATTCGTCTATTATTATGAATACTATTAAATGTATATGCAAATAAACGCAAATTATTAATGTT
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GTTTGGGAAAGACTC---------TTTCAGATGCCAAGAACAACAACAAC---AACAACAGCATAAAAT----TCAATGGAACCCACTTC--ATAATAATACTGAAAACGATCA----------ATGTCTATGTTACTAAAACGAAACACTAACGAATCAATCTAT---CTATATAGGATATATACA---ATTGTTATACTAATCTTAAATGACCACTAACGACGCCA---TATATA-----CTATACATATATTACGA--AACGAACCCATGTTAGGTGAATGCAATACTACAGCAGGTGTGACACCAACCGGTGAATCATCTTCAATATTATCCGTATAAATATAGATGCTCGCTGATTCCACGATCAGATTGCATCCACTCGAGATAATACTAATGATGATTCGTGGGCTTGGAACCCTGATCCAAGCTGCCCAAACGGTGCAGCAATGGATAACGAAAATCTCCATGCACCCATACTATATACACATATTTGGAGCATGTGCATATAGTATGGC---TTAGATTGGAGACCAGAACTATATGCTATATGCTATATAGTGCTAGATGCTAAGATGATTGTTAAACTATTAACTAGCAAATGAAATGGAAACGATGCGACCCAAGACGGAAAAATGATAATGAGATTGAACCTTGTCTTAGATGTAAGAGCAATACTAAA-----------------------CTATTTATTGTGAGCATATTCTATTTAACGCAG-------------ATCCCGTGC--------------AGCGATGAGCTCAAGGAATCC-----------------TCTGGGCGA------------------------ACCACAATCACCAATTGTAAATTGTTCCCCGATATCGTGGCACATCCTTTGGAGCCG-CTCGCACGGGTTTCTCAATGTTT---ATTGTTTGAGTTTGCATGCTTTTTGCTTATATCTATATTATATGC-ACATATATATATATATATATATATATTTACCTTGAAATTGTTAAACTGCAAATTATAAAAAACCGTCAAATATCCCGCTATAAGTAAGTTATACAAGAAACCAGGCGACCGCGCCGAAACAAATCTGTGAGTTCGAAATATGTCATTCAAGGATATTAAATTCAACGCGCACGTTCGGATTATGCCACCCCTATAAGGCCCCATCAGTCCCCCTTCCAGCCGTCTGAGGTCGGCCCTTTAGTTCGCCCGCTGACCCCAGGCAATAATATGAGGATGCCTTTGCCTGCTGGACGAGCAGCCGCGGACTCAGGGCCCAGATCTTGGCGTATGGATGGGGGATGAGGCCGGGGCGAGATCGAGGAC-------------GGGCCAACACAAC-TCTCAGACTTTACCAATTACTATGACCAGC------AATGTCTATACGCAA---CTACACTACGATGTATAAC------TAATATGAAATGAGAAACTAAATAAACGGCAAG-TTTTGAATACTCGCGACGAGAAGAA
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GCCCGATCTGTCCACAAACCAACCATACACATACACATAACTGCAATGACCAAAACCCAGTGATTTGGCTGCAGCAAAACACCAATAACAAAAACAAAAATACACATTTGAAATTCAACTTTTACATGCACGTTCAAAAGAAACTCCACACAACAATGT---------GCTATGTGTGCA---------CGAG----GCATGTTTAATAAACTTTTAGACATAAAATTAACTAAACAAACC-
>CalpB 9866293 9867266|10235 chr3L 9864693 9870915 scaffold_12 1341393 1347846 - 163651|1600 2692
A---TTACTTG--------CAATTGCTACTAATCTAATCCTAAGTGCGACGTATACTTAATCTACCTGTGCATCATATTATTCATGCATTCAAATGAGAAAGCCAACACACAAATCCATGACAATGCGATC-CGGCGATGCAAAGAGATACACTCACTGAGCCAACAA--GAGAATCTTAT----------------CTATATGACCATATC----CGGAAATACAAA-TCATGTGGCGA--AATTGGAGTGGCCTTGGAACGGCACGAGGTTGCTACGAGTATGCACGGTAAACAGTATAAATC----------------------------CCGCATACACA------------ATTCAAAAAATTAACGCTATAGATTTTTTTT------------TACCATGCTGCGCAACTGGAGGGATGACTAAGAGCAAGCATCAATAGCAAATCCACTCCATGCAC----------CTCGTCAAGAGCCGGAAATTTACTAGTACAAACAGTGCATTATTACCTTACAATCGCTATGAGACGCTCGGAAAGCCATTAGAACGCATCGACAATATTTATTAGATATACGGAATGAATAAGCATGTATTTTTGTAACATCGTTAGCTCCGAGCAGTCCACATATTTGCCCAGGTGCTAGAAATAAGTCCAGCCAAACTCTGTTACCCAAACAAACGTTGTTATTATTATCAGGAAAGTAACGCGAAGCGAACAAGCCAACCAACTCATCGAATATTTATAAGCTTAAGCAGAATTTCAGAATATCAGTCAATTTATTGAATCACATCAAAAAATGTA---ATACGCATATATTTTGTATTTAGTTTTCAGATCAGTAATCTCAAAACATACCTTAATTAGGCACCCTCTATGTCAAAATAAGTGTTTA-ACTAACTGAAATTAACCAATCGGGTTTAGAGGCTCTTTTTGTTGGATGCTTTTATATTTTACTATAATTTTTGTGAATTAATCAAAGTTACTCTTGTATGCAATTGTTACTA--TTAATAATT-----------TGTTGTCCGACTTTTTGTATGCATATAAA---TAAAATGCAGTGATGATTCAAT
AGAGCCACTCAGTCCCAACCAGTTTAATCTTAACTAATCCTAAGTGCCACGTTTACTTA-------TATACACCATA-TATACATATAT---AATTAGATGCTCTACA--------GATGATGATGCACTCATGACGCTGCAG--------------CGAATCAACAAAGGCGAACCTTATCATATAACAAACGCTACAGTAAGACCACAACTAAACGGAAATACAAATTCATGTATGCATTAATTTTATTGACCTTGAGGAGCCTCAAAGCGGCGGCGC-TCGACGAGGTAGAAAATAAAAACCAGAAAATCAACAGAACATGCCGATTGCGCTGTGTGTACAGAGGCATTATACACGCGAGATACTGGCCCAGTATATATGATGTATATAGTATATATAGCGTGC-GCATAGTTGTATTTATGACTAATGGC------TAAATGGAACTGGGCCCCATTCACATTCTTCGTTCTCCGCAATAGCCAAAAAGCCGCCAGTACAAAATGATAAATG-TGCTTTATATTAACTA-----------GCAAAATGCTGCAGCATATAGAAGTTTAACTCTTAAAATATCGAATGTATA------TTTTTTTACACTATTGCAATCTCTTG-----TCATCTATTTGTTCAGGTGCTAAACTCAAACTCG---AAAACTAATCGATCAA--AAATGCGGCTATTA--------------------------------AATGAACTCTCC-------TCTGTATCTAAGGGCAGTTTGTGGAAGCCA-------CAACGAATCACTTTTAAAAGTGTGTTTATATGAATAAAGTATAAAAT--AGTTTCGACTCAATACTC-------------------------------GGCAAAACAAGTTTGTATACGAAAAAAAAAAAGGAAAAGGTGATTCGAAACAAGTT------------------------TACAATTCGTATTAAATA--TGAACTAATTTCTATGTGTAATTGTTATCAACTTTATGACTAAAGCGTATTATTTTATGCTGTTTTCTTTCGCAATATTAAATTTAAAAT----TTGTGAGTAGAA
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GGCGGGATACTGTTCAGTTGGCTTTACGTTTACGTTACGTTACTTTAATGTTACTGTT-CGCATTAATTAAGTTTCTGCTGCCTCTTTATTTATTTGAACTAAAATGACTTTGTATAAACCACTTGCGATATTATGAAT------TACACAACAGTTGATGTTGT-TGTT--------------TCGAGCCCAACATATATAACATGCCTTAGTACG-AATTAAGTGTATACCTAAGCTATAAGT---ACCCACTCGGTTCACTTTTGACTTGAATTGTTAACTCGAACGCAATTGTTTTGGCATACAATGTGTTTA
AGTTGTCGCTTGTTCAGTT--------------------TTATTTTATAGTTACAGTTGTGCG------------CTACTGCCCGTTTATTTATTT-CATTGAAATGAC-TTGTAAAAATTAACTAT-ATATTACTTATAAATAATACACAATTATTTACATAGTATGCTGACCACTGAAGTCGCCCCGCCCAACATATA----ACGCCTTATTAAGTACTTGTATGTGAACATTAATCTTAAGTCTGAATTAACCGA--CAGTTTTGATTTTCCATGTTAA-------GCATTGTTAATGGCCTTCAAT-TGTTTA
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ATTTTCGGTTTATATTTTGATGCGAATATAAATTTTGTAAAAATCCAAAACTGTTACAATTATCATTATTAATATTGAACATATTTTATATATATACAACAACTTGTAAATTTATAAAACAGCAACAATAACACACGCTAAATA-ATAAATAAAGAGATGATTAGTTTTTATAGAAATCCAACCCACCAACCGGTTCAAGTTTCAATG
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TAGCCTAGACTGACGAGCACAAATGAGAGCATTCCCAATCGA--CTGATTTGCATTTATA--CGTGTCGTCCCTATTTTAATATGTTGATGTCTATGTTGACATTTCTAGTTGTATTCAATTGTATGTTCGTGTGCTGTCCCCTCCATATCTGCCAGTACGAAATACTCGT--ATGTATTATTTTTATAAAT
>Ard1 9947814 9947970|10305 chr3L 9946258 9947816 scaffold_12 1418317 1419891 - 44957|1679 1681
ACA
ACG
>Ard1 9947814 9947970|10306 chr3L 9947834 9947936 scaffold_12 1419938 1420048 - 3326|0 116
TGCTGGCTTCGACGTTTT-----------TTGCATTTTTGTGCATTAGGGTTTTGTAATTATTTAACAA---TAAAAAACGTAACTAAAATTAAAACAAAAGTAATGACAAAAAGAT
TGCATGCGGCGGTGTTGTGCATTTCATAGTTGCATTTTAGTGCATTA-GGTTTTGTATTTATGTAATAAAGGCATAAAACGCAATTAAATT-----AAAAGGAAATGACAAAAAGGT
>dpr6 10015004 10015255|10389 chr3L 10014983 10015260 scaffold_42 592914 593170 + -476|21 297
GATCCGCCTTCCGAAAATCGGGACAATC--------GGAACACCCCCAGAAATTGTTGCCATCCTCTGGGCAAATACCCGAATGCCACGCCCATGAAATGCCATTTGTAGAGGAGCACTTG-------CATTAACTGACAAACGAACCCGACAGC--CATCCACTGTGCTGCCATTTTGTTTTCTTTGTTGCGTTTCAAGCTCCGATGCACACGAAAAAAA--------AAAAATAAAATCACACATATACTCAGGGATACAGATTTGAATCAAAAA
AATCCACCAGACAAAACTGACGACAATCTTCTACTTAGAATAAAACAAAAAAAAATT-----------GGCAAAAAAAAAAA---------CATAAATTAAAATATATAAATGTGCGCATGTAAGTAATATTTATTGCCAAG-----CCGAAAACTGTATACCCTTTACAGGCA---AGTGTTAATTGTTGTGTTCC----------GCATTTGATAAAAATTTTCATTAAACATAGAAACTTATTAATATTTATTGA---ATATTTAAGCCCAATA
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ATCGTA-------TAATCCAATGACAT--CTGTATTCGATGAACAACATAACAAAAATGGAAATTAATACTGAAGACTT--------------------------TATAAGAAACGCACACAGTAAATCTTTCGGTTTTCACTCGGGTTGAACTGACTTCAGTTCACTGGATAAATATTTTTCAAAATTTACAGTTTTTATACAGGAATAGAAA
ACTCCAAGATGGTTAACCGCAATACATCGCTCTCTTTGATTGGCATGACACAAAGAATCCAGCATTTCTCTGAAGACTTAATATTTAATTGCCTTTGGTTAGACCTATTAAAATGGCACAAAG-----CTTTTGACTTCCTCTCTGGTAGAG-TGTTGTTAATCTGCCAGAGCCA------TCAAAATTCTGCAGTTATATAATGCAATAGGAA
>CG32063 10442067 10442427|10887 chr3L 10439786 10442068 scaffold_8 5136898 5138984 + 76950|2294 2295
TT
TT
>CG32064 10466696 10466882|10916 chr3L 10465190 10467454 scaffold_8 5166181 5168566 + 69547|1506 1792
ACTAGCAT-------------------TGAAAATGCAGT----------CGGTGTAATCCGATCGGATTTAAAGCCGAATTGCTAAGAAG------TGCGCAGCAGATAATTTTTTTGTGTAAAAGAGTCCAATGTCAGAATG--TTTTG--TTAA---------------GATGATGCCTGTGTCCAAA---------------GTTGTCAAATT-----------------------TCTTGTGAGATGTAAAATATATAGAGG--------TTTTAAAAATGCA
ATATGCACATACGTGTGTGTATATTTATGTATATGTACTTCTGCACTTGTAGGGCAATTTG--CGAATTTGAGGCTTATCTCCTTCTCAGATTCACTGTCCTACAT---ACTTTTTTATATGAACGAGGAGGATTGTACGATGCATTTTGCTTTAAGCCTGCAAGGCTATCGATCATAGCTCGGTACACATTCAACACGCTGGTGGTCGTCACATTATGTTTAATATATGTTTTATGTATCTTGTAATATATATAAAATATAAACGGATCTGCTCTTTATACAAACT
>CG32062 10564080 10564337|11045 chr3L 10564050 10564675 scaffold_669 5151 5795 - 13214|34 340
CTCCGAAAC-----CTGAAGAGATCCGACAGTCGATTGAACACTTTTGCAAGACATTGTGT--------AAATTAAATAATTTTTATTAAATCA-----------TAACATAAAG------CCAACTGGAATCATCAAACAC---------CATTTAACAACATTAACAATTTCAAAT-------GCCGCCATTGAGTATTATTAATAAGCTAAACATACGATCACAAA---AATATTTATAGATATGCGCGCGAATATGCAGATCCTTATCTAGGACATGGCATTGGACCAGTTCCTGGATACGGG
ATTAGAGACTAACACTTTGGAGAATCGA--GTTGAGTCGACAAGTTATGATGAAGTGACGTTTGAAGCAGAATCAAAGGTTTCACCTTATGCCAAGATCAACAACTAACAAAAAAAGCACACAAACTAAACAAACCTAACACAAGTGGAGACATCAAGAAACTATCGCATTCCTAAATCATATTTATAACAACTTATTTTCATCAAGTATTTATCTAATGAATCGCAAACGAAATATTTCTAGTTACGCGCGCGAGTATGCGGATCCTTATCTAGGACATGGAATTGGACCCGTGCCAGGCTATGGG
>CG32062 10564468 10567368|11045 chr3L 10564050 10564675 scaffold_669 5151 5795 - 13214|479 688
GCTACCATGTACCGCGGTGGATTCAATCGTTTCACGCCATATTAAGAACAATCTACGCCAGTCAGCCAAATAACGCACTTGAACTACTCTCGATGAAAATGCTCAATATATGAACAAAGCAAAGCAAATAAGTAACTTAGACGTAAATACTCCTCC-CTAC-GTGCAGTAAGTAGAAGTTACAACTAAACCGATAGATGCAGGATACTCA
GCAACCCTGTATCGCGGTGGCTTCAATCGTTTTACGCCATATTAGA---AAGCTTCATAAGTCAGCCAAATAACGCACTTGAACTACTCTC---GAAAATGCTCAATGTATGAACAA----------------AAATTAGACGTAAATACTCCTCCTCTACAGTGCAGTAAGTAGAAGTTAAATCTAACGCAAAA----CCAGATGCTCA
>CG32062 10564468 10567368|11046 chr3L 10564710 10566214 scaffold_669 5827 7483 - 34522|0 1790
GACGCTCAATGTCCTTGGAGAGTTGAAAATCAAAGCTAAGCAACAAAGAAACAAAAAGAACATAAACAAATCAATGTCGTCCAGTAAAAGCAAAAAAAAGCTAAACCAAAAAGGAAAATATACGCCGCTAAAC--GCAGTTCTATGGAGTTTATATAAGTAAAGCAAACAAAAA--AAGAAAAGAACAAAAAAAAAAATATTAAAACATAA-ATTCAAATTGCAAAATAGTTTTGCAGAGAATGAAAAGAAAAATGTGCTTCATGCGTAGATTTTTACC----AGAACAAAAGCTGAAACTTTGTGCGGCAG-----ATCAGAATTTATATATGTATACATATATATATAT-------------TACCGACATGATATATAGTTATTATACATA----------GGGCATTGTATTTGTATATCAAAGCAAACCAGGAAAGAGAGCAATGTTTTAGGTACTTTTCATGCTGAAACATCATCAAAAAAATTGATATATAAAAAACCCTTGGGTTGTTGATTTTCAAAACTTCGTTGAACTAAGTTAG-------TCCTTATG---ATTTACAAAT-------TATTCTAAAACAT---------TAGCATTGTAGTATGTAGTAAGGGAAAGTAACAATGCAGCCACAATAAC---AAATCAAATTGTATATTATTTGC-------------------GAACTGTT------AAAGCACAAACAAAAATTT------------ATATTT---------ATTCGTATG----TACTTTAGATTCATATATCTATAA---TTTGATTACCCAAAGAATACTCATTTCTGTATTGT-----ACCGTATTGTCAACGAATTTAATTTTAATGCATTGCTTG--GTTGTTCCTAATAATTTTATATATTTTGGCAGCTAAAACCACTCACACTCAACTCACGACTCAATTCGA-ATTGCTCAAAAAAAAATCGTAGCGCATAGGTAAATGCAAAAGATCAACACGTAGACATATCCTTGGAATATACAATAATATTTACTTTAAATGCCGCCATAGCAGCAAAGCAACAAACAAAAAAAGAA-----AAGGGAAAAATG-----AAAAAAAATATATATATATATATTAGTTTTAAAAGGTCAAGCTTCCAGTGACAAAAAG-------------CCATTGATGAATGATGTGGAAATCGAATAATAAGCATTAAAAATTA---AAATTTTTAGCTCTTACTCCGTAGCACTTTCCTTGTGTGTTGTGTAAAGAA-ACAAAGC-AAACAA--------------------------------ACAAAAAATTGAGAAAGAAA-------ACGACGTTTCAATGTTGTTCATTTTCGGTGTAGACCGAATCGAAACTTCCCTAAGCAAACTAAGAATTTATTTTATACACACTC----GAATCTACTGCACACACGAAACAAAAAATGAAACCACTTTTAACGTTGTGTATTTTTCAA---ATGTT----------------------------------------AAAGATTAAAATGCTCAATGGAAAATAAGCGAACAA--------------------------------------ACTTTGATTCTTAGGCAGCTACTGTCGTCAAATTTAAACTAGTTGTTTATCAACCGTACTATGCTAAAACAAAAAAAAAAAAACAAAAACAAGCTACTATTGTGTGTGTGTGTAATCGTGCAATTCTTTAGGTGTTCTTCGAATT--TCCT-----TAAAAACCTACTACCAATTACT
CCCACTCAATATA--TGGAGAGATGAAAATCAAAGCT------------------AAAAGCAGCTGCAAACCTGTGG----CAATTTAAGCAAAATAAAATTTAA--AAAAAAAAAACTAAAATTTTTTAAACAAAAAAATCAATGTCGTCCATAAAAACAAAAAAAAAAAAAACGAAGAAAACAACAACAAAGGCAGTAT--ACACAAAATATTTAAATGGC-AATTAGTTT---------------GCAAAACGTGCTTCATGCGTAGATTTTTACCAAAAAAAACAAAAGCTGAAATTTTGTGCGGCAGAATTTATATAAATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATACCAACAGGATATATAATTATTATTATTATTATACCGATAGATATTGTATTTGTATATCAAA----------AAGAAGAGCAAT-TTTAATGTATTTGCCAATTCGAAAATTAACAACCGAAA---------AGAAGAACATTTATTTTTTG---TTCAATAGTTTTGTTAATTAAGTTAGCTTTATATCTCTATATATATTAACTAATTTGATTATTTTCTGTTTCATGTATTTGTATATCAGTGTAGTCTGTAGAAAGCAACAAGAA----ACAAACCCAATCGCCCGACATTGAATTGTATATTATATTTTTATATATACAAATACACAAAATTGACAAGCAAAAAACACAAAAAAAATGTTGCCAAACAAAAAACATTTTATCAGAACAGACATATGAGAAAATTTTACCTTAATTTCTTTATACATTTTTAAGTCTCCAAAGAATACTCATTTTATTATCGTCAACAATTATATTTTAAAAAAGTTTTGTTAT-CTGCTTTGCTTATTATTGTTCCTAGAAACCTT-----TTTCGGCAGCTAAA---ATGCATAGTCAACTC---AATGAACATGATATTGCTC------AACTTGTAGTGCATAAGTAAATGCAACAGATCAACACGTAGACATATCCTTGGAACATACAATAATAATTACTTT-AATGCGGCCGTAGCAGCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATATATATATAAATAATGAGTATAAAATTAAAATATTAATGCATAATAGTTTTTAAC-TTCAAGCTTCCAGTGACAGAAAGATAGAAAGAAAACCCAGAAACGGA-AACGTGAAAATTGTGTAGTAAGCATTAAAAATAAAATAAATTATTAGCTCCTACTATGTAGCACTTTCTTTGTGTGTTGTGTAAAAAACAAAAAGCTAAACAAAAATGAAGCAAAATCAGAAATGAACATTTTTCAAAAACAATTATAAAACAAATAACTTCACATCGTTTCAGTGTTGTTCATTTTGGGTCTAGACCA---CAAAACTTCCCTAAGCAAGCTAAGAATTTATTTTACACATACTCTATAAAGTCTAATGCACAC---------------AATTCACTTTTACAGTTGTGTATTTTCAAATGTATGTTGGAAAAACAAATCCAAAGAAATAACAAAAAAAAAAAGAAGAAATATTAAAGTAAATAATTATAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATGCTCAAGAAGTAATTTGACCTCGTTCTCTATTTCGATTCTTAGACAGTTACTGTCGCAAAATTTATGCTAGTTGTTTATGAAT-----------------AATATAAACAAATATACCTTTGATTCGTTTTCCTGTGTATGTAACTGTGCAATT-------GATCCTTCGAATTTATCCTTTTGATCAAAATCCAAAAATATTTACT
>CG32062 10564468 10567368|11047 chr3L 10566215 10566505 scaffold_4 4519106 4519319 + -2322|0 297
TGAAATGAGGGAAAAGTGAGAAATGAAAATTTCATCAACTCCAAAGAGCTTCAACTTTGATGGTTTTTTTATTTATCTTATC--ACTTAGCAACTATCTCAGAT-TGTACATATATTATGATGACATATGGTATTTTACCTTATTCCCCTCAACGCACACACAAAACAACACACGCACAGGCCAGGATCCTGGGAAATCGAAGCAATTT----ATGGCATACTCACACTTGTACCCTCATTAAGGTGTATTTCTTGTTTGATTCTCTCACATGATCATGCATTAATATATACTAAATT
ATAATTG----------------------CCTTTTGAGCTCTA-----CTCAAATTCTG-------TTTTCTCTATCGTTTCGGGTATAGAAAATTATTAATATACTTACATACATT------ACATAGAATATCTTAGCT---------------AGATATCAAAAATCGAAT-------------TATTTGAAATTTAAATCAGTTTCCAAAAAACATTTTCATGC---------CAAAAAAGTAT-----TTGTTTTATTTTTTTAAAATAAAGTAGAGTAAAAAGTA--AAGCT
>CG32062 10564468 10567368|11048 chr3L 10566506 10568595 scaffold_8 5272873 5274942 + 43374|0 977
TACGTTGACATTTTTAAAGCCAAAGTTTATATTTTAAA-TGATTTTTAGTTAGGTATTAGTTCGTATGCTGACGACAGATGACACAAATGGATAAGTAAATGATTACGAACCTAGAGGGAAAAACAATAATGAAAACTAAATCGAACCCAACAATTGCCAAATTAAATGTAGCTTTCAAGTGAAT---TACAAAATAAAGACGTAATTAAATTTAATGAA---TTTTTCAACTAGCGCAAAAAAAAATA----GTTTGCCAA-----AAAGCCTAGTATA-------CTTTTTGGCCCACCCCCAGCACAGGAAAGGAAAAAAAATTCACAGAAATTTGGGTTTGATACGCAAATGGCAGGAGGTACGAAAACCATCTAGTTATAATGCAAACTTAAATATAATACGGTATGGTATATACATTT---AAATTATGAACTCAACTTCCACCGCAAACTTTTAAAAGAAAACTAAGAAAACACAATTTTTGTCTTAAGCAATGCGTTGAAGAAAGTCAACCTACAAGTAAATTATAAATGCAAAA---AAACGCAACTCAATCAAACACCGCAGCTATATGATATAACATACGATATATGATGTATATGATAATGTCTTCATTTATCCCGAT----------CCATTTTGTGACCCC---------CAAAAAT--------------------------TCTGTAATCTGTGTAGTCTAACCATAAGCCAGCGCCAGCTTTTGTTTTACTTTCACATAGATCAGATGCCTAGGCGTCATATAAAGTATAAAATATAAA----GTATATAAATATATATTATATGGAAA--------------------CTCTAATCTTTAATGATGTGCCAAATTGTAAGTTGTACCATTTGTTTTTATGAG-------------CAAATGCAAAACACAAA-TTGAAATAAAATATGAATTAAAATATAAAACAAAAAACAT---TGAA
TACGTTGACATTTTTCAAGCCAAAGTTTATATTTAAAAATGATTTTTAGTTAGAT-TTAGTTTTTATGCCGATGACAGA---CACAAA--AATAAAATAATAAT-----------------ACAAAATGAAACAAATCAATTCAAACCCAACAATTGCCAAATTAAATGTAGCTTTCAAGTGAATAGACACTTAATTAAA--GTAACAAAAATAAAAGAAAAACGTTTAAAATAGCACAGAAATAAATACATATTATAACAACTAGAAAAACTTAATGTATATCACACTTTTTGGC--AGCACACACATGAATAATTGAATAAAAAACAAATACTTTTGGGTTTGATATACAA--GGCGAAAT------AAACCAAGTAGTTATTA---AAAATTAAACATTATA-----TAATACATACAAATGAAAAATTATAAACTCAACTTCCACCGCAATTTTTTAATACAAAA---ACAAAACACA------GTCTTAAGCAAGGTATGAACTAAAGTCAACCTAAGTCTAAAT-----ATGTAAAATGCAAATGCAACTCAATCAAATTCT-----TATAAAAGATATTTTAGTTTTTATTTAACACTTGATTATCTGTGCGCCCATCCCTCTTACACACACCCAATTTTAACACCCAGTACAAGAGCAAGAATGAGAATTACGAATCTTTAAGCTGTAATCTTTAATCTGTGTAGTCTAACCATAAGCCAGCGCC-GCTTTTGTTC-ACTTTCACATAGAGCATACGCATAGGCGTTATATAAAGTATAAA-TATAAACTATATATATAAATATATAATATATGAAAAAAACAAAACAAAAAAAAAAACACTTATCTTTAAAGATGTGCCAAATTGTAAGTTGTACCATTTGTTTTTATGAATGGAAAAAGCAAACAAATGCAAAACGCAAAATTAAAATAAAAACAAAAATAAAGTA-AAAAAAAAGAATATATATGAA
>hay 10607869 10607919|11096 chr3L 10605099 10611684 scaffold_8 5311542 5318066 + 318174|2826 2879
ACCTAAGAAAAGCACAAACCACTGTGAAGCATGAATAAAATTCT---GAACAAA
-------------ATAGACTGTT-TACAGC-TTAATAAAATTATTTCATTCTGA
>CG8009 10613317 10613578|11098 chr3L 10613164 10613580 scaffold_8 5318712 5319107 + 5210|159 428
GCACCGGCCAGCTTCCAGGACGTTTATTTAGTTAATTGCTAGTTCCCTTACCCTTTTCTTTTTTCCTACATGTTG----ATTCGGACACCCTCGCTTTGTAAGCGTATTTTTAAAGTACCTCTTATTTCTCCCCTACACATTTTGTTTAATTATAGAA----GCTCCTTTGTACAAAAAAACAAAAAGAAAAGAAATCAATTGTTAAGCTTTATGTGTTTCGTTAATGGCGTTACCCATCGCTGCCAAATACACCAAGCGACATTTCAAT
---------AGCTGT--ATACGGATATTAATTTCATT-----TTGCCTTGCCCTACTAATACAATGACTATGATGCATACTTCCAAGATGATAGCTTTTT---CGCATCCAAAAACTTAGTTTAATT-------CATACATCAAATTTAATTGTTTAAGTACGCTTCATTTGGTTAAATTATAAAAAAAGAAAAGCTCCATTG------TACATATACTT-GTTCGAGCTCTTATTTCTTTCTGC--AATCAACCAAAACAAAATTAAAT
>CG18628 10614001 10614096|11099 chr3L 10613596 10614095 scaffold_8 5321319 5321787 + 2376|430 527
ACATCTCCATTTGGAGCAAGGCGTGACGGCAACTT---CATCGATCTTAAACCGCCTTTAACTTTTAATAAAGAGCAATATTGAACAAAGAACATAAA
GCAGC----TTGCCAGCGATGTGGCACGGCTCCTTGGGAATGGGCAGCAAAGCGTTCTCAA-----AATAAAGAATATTATTTAAAAATCAATATGAA
>CG14154 10616825 10616861|11102 chr3L 10616273 10617075 scaffold_2 3906124 3906828 + 2053|557 593
AAGTGAATTGGATTTTAAAGTAACGCCAGCTAAATTT
AACTGATTTTAGCT---AAGTAAC--------AATTT
>CG14153 10618270 10618562|11103 chr3L 10617128 10618388 scaffold_8 5323932 5325182 + 10889|1260 1401
GGGAATACTCTGCATTTGACTTTGC--ATCAAAAAACAT----------ATTGAATAAATCCC------CTCAAGAGC---CATTAGCAATTTTCGT--TGAAAGCGTGCCAAGAAAACTATTTCTGTCTGTACTCGGAACA
--------TTCGCAATTGGGTCAACAAATCGAAATAAATTCCTGTGTCAACTGAATACGTCCCGAATGTGCCAAAAACATGCAATACTTATTTGCTTTCTGGGCGTGTGCCAAGAA---TCTTTATAATTGCGGCCAGAAAA
>CG14153 10618270 10618562|11104 chr3L 10618389 10618638 scaffold_6 4470995 4471255 + 491|0 181
GATCAATTGCATCCGATAAAGATACAGATT---GCAGCTGCTGTAGAGTCAACAT-GCCAACACAGTAAATATTGGTTTATC---CCTTTAAAAGGCAAGAATAATAATAATTGTATGTAACAAAACTATGCTTAGTTAGTTCCGTAAGAGATACACAACA-ATAAAAGTTATTTTCAGAAG
GTTGAGTGGGAACCAAAAAGAATATATACTTATGCAGCTAGTGTGGAGCGATTATCGTGTTCGTGTTTGATAATTGTTTCTCGTGCGTGTCCATGTTAAGCAAATAAACACGAAAAGGGGGGTAATATAAGCTTAGACTGATTCAAGATAGTTCCGGGCCTTGTGAATATTATTTCTATAAC
>CG8003 10636874 10636924|11133 chr3L 10635155 10636874 scaffold_8 5340101 5341807 + 65017|1778 1778
T
T
>CG8003 10636874 10636924|11134 chr3L 10636879 10637151 scaffold_16 1770491 1770783 + 36|0 45
TGCTCCTTTGTAACGCCAATAAATGTAACATAAAACCAGAAACCTA
CGTTCGGTTGCGGCACTTGGAATGAGGACACAATTTCAG-GCCTTG
>CG32068 10638313 10638383|11135 chr3L 10637293 10639246 scaffold_9 1725012 1727082 - 24849|1061 1141
AAACCTTAAATCTTATCTTTTACCATCAAGT----------TTGATATTTTGAAATATAAAATCGCTGTGTATAATCAATA
ATACCTTTGTTATAGCTTTGAACAAGCAATTAAATACATTATTATTATTTGTAAA---AAGATCGACGTGTG----AACCA
>simj 10663058 10663327|11178 chr3L 10662747 10663150 scaffold_9 1747542 1747936 - 12166|314 416
AAGGCATCCACCTAACGTAGATAACAATTGACAGACAGAAACGTAAA--ACAAACAGAACAG-AGCAGCAGTAACAACTATTATTA-------TGATGGTTTT
GCACGAGGCTCTATACATGAACAGCAACAGC--AACAGGAACTGGAACTGCAACTGCAACAACAACAATTGCAACAACTATAACTTACTAACTTTATAATTTT
>simj 10663058 10663327|11179 chr3L 10663151 10663553 scaffold_0 6393766 6394135 - 550|0 176
CTTGATTAGGTAATTTTATAATTTTAACAAAACGCAAGCAACAACAAAAAAAAAACAAACAATTTATAAGAAACCAACATCAAATATACACGTAACTATTAATTATGCTACTTGTAAACAATAATTATACATAATTATACAAAACGGATGAAAGCAAAACAGAGCCGATCTAAACAT
CTTCCTTGAGAATATTTATGTGCATAAGGAATCAAAAAAAA-AACAAAAACAAAACTAACAAGTCAAAAGAAA--------AATTATTCAATAATTTGCTGAAACACCTGAGTGTCAAAAAAAAACAAAAA-----AAAAAAAACACGCAAAAAAAAAAAATAAAAAATTTGTAAGT
>CG11811 10665825 10666548|11180 chr3L 10663554 10665827 scaffold_9 1748395 1750307 - 38987|2350 2352
GGC
AGC
>CG11811 10665825 10666548|11181 chr3L 10665882 10666207 scaffold_43 259321 259639 - 1405|0 351
GAAATTGTTTGTGAACTGATCGACGACAGGAAAAGTAAATTATAGAAAACTTATCATTGGAAACGGCAGGAAGCTATAGGAAAACCAGGTACTCTTTATGCATATTGTAAAGAATTTAGCTTATAAGA--GAAACTTAAAAACTTTCCGAAGATACAGAATATCAAACTTCATATTTTAACTAATAGTTTTCTTAAATAAAATAGAAATAAT---ACTCTCCATTCAATAATCG---------------CATATATAAGAGCAATATC----AAGATTTTAGTTTTATGTAGAAGCAGACTATTTTTGAATTC--TAGGACAAACTTTGCTTATATTGTGAAAAATACTTTG
GAAAGCACTTGAAAACTGATGAAAACTTGGAAAATTAATTTGCCAAAAATTTAT------GCACACTATCAATTTGAATGCGAACTGAA--------ATACACATAGTAAAATATTGGCTGTATCATAATGAAAATTGAAGGAAATCCAGAGATGTAAGATATTA----------CTTTATTAATAAATTTAT--ATCGAAATTGAATTCCTTGAAGTATGCATGCAATAATTGATGAGAATTTATATATATATATATTGGCTGTATCATAAAATAATAAAGCTATTTGGGGATCGAGACC-TCCTTGAAGACATTAGAAACAA------TTATATTATTAAATTAACATTG
>CG11811 10665825 10666548|11182 chr3L 10666336 10668172 scaffold_9 1750365 1752049 - 24921|0 253
TTGACTAATGGCATTTATACTTAAGAAATGGCTTGTATTTATTATATAC-----------TCTCCTC------------------------------CTGTCCACCTCATCATTGTTGTGCAAATTCGTTGTTCTAGTTGTAATTTTAAGCTGAAATTTGTTGCGCGCCGCTTCACGGTCGAGAAAACCGGAGAGGGCGATTAAAATGGAATCAATAAAGCGAACATTATGCGGGTATATTGTATTTTCACAAA
TTGACTAATGGCATTTATACTTATTTGTTCGACTTAATTTATTATATATACATATATAATTTTCCTCTCACTGCTACGTTGTGGAATCGTTGTTCGTCTGTCCTCGTCCTCGTTGTTGT-------TGTTGTTGTTGTTATAATTATTAGTGCAGATATAATGTGCTGCGGTGCGTG---------------------------------AACAATAAAGCAAACA--GTTCAGACTTTTTGCAATT--ACAAT
>CG12523 10775930 10776064|11343 chr3L 10775103 10776541 scaffold_12 1127162 1128745 + 27317|925 1070
-----TTGTGATAACCCGTGATTTTATTGTCT-TCATTCCACCCACCACATCTCACATCCATTTC-----TCTGTTATGCCCCACACCACCATATTTGTTAAATAAAACTTTTCTGTTTGATCATTTCCCAAAAAAAAGAGAAGTA
AAAAGTTTCCACAATTCGTGATAAGCTCAAGTCTCATTCTGCCT----CATCTCATGCTCATTTCATTAACTTGTTGTTTTTTGC-TCGCCTTATTTGTTGAATAAAAGTCTTT------ATAATTTCCACAATCAA---------
>tna 10848415 10848609|11442 chr3L 10846883 10850203 scaffold_12 1207131 1210699 + 106111|1716 2019
GC-------CAAAA--------AAAGGC---------------------------------------AGGGGCGAAGCTGGGAGAGAGTTGGAGAATT----------------------------------------GAAGTGGCAGAATACCATAAATTGTATATAGTATTATTAATTTTAATGAAATGTGCACTAGACGCCAGTCGCGTACTTCA---------------ACCAACATTTTCGTTTCCTCACACAAACCAACAGCAGCAACAAGTAAAAATACACAAAAAAAAAAAACAAA
GCAGTGTTGCGAAGTGGTTGTTAACGGCGCCGGTCCAGTGTTGCACAACGCCTGTGGTTGTAGTTTGAGATACGAAGC---GAATGATTTGAGAAATTCCTTAACAAAAAAAAGAATGCAAACGAAAAACAAAAATTAAAAATGGCCTAA-ACCAT-ATTTGTATATAGTATTATTAATTTTAATGAATATCGCAACAAA-GCGAGTTGCGTAATTCAAAGAAAAAAAAAAACAAAAACATTTTCGTTTCCTCACACACA-----------------TACACACACACACACAACAACAACAAC
>CG14149 10853681 10854146|11445 chr3L 10853102 10853733 scaffold_12 1214925 1215618 + 11925|648 703
CTAAACATATATGGAATAATTAGATGAAACCTAGTTTTACTAAGC---TTAAAATA
CTAACTAGATGTTTAGTCAATAATTAGCAGATGAGTTTTGTGAGCGTGTTAATATA
>CG14149 10853681 10854146|11446 chr3L 10854090 10854329 scaffold_6 2429293 2429526 + 1677|0 56
GGATGCCATAAATATTTAGTGAATAATTAGCGAAGAGGTGCTTACGTAAATATTCAA
GGTTATCACAAATATATATTTAACGATTAGCGGGGGGGTG-TTATGGAAAACT--GA
>CG7941 10864558 10864651|11461 chr3L 10864288 10864605 scaffold_4 2465847 2466178 + 3198|304 351
GCGGGAGCGGAAGTCTTATGTGATAACATTTTAAAAGAGCTTTATTAC
AAGGGATATGGAGGTGGAAATGACAATATGCGAACGATACTCTGATAC
>CG7941 10864558 10864651|11462 chr3L 10864606 10864748 scaffold_4 2468190 2468344 + 210|0 45
GATTTAAAAAATGTTTTAAAATAAAGAAGAAAAAAATTACATAAAT
AATTTACACAAAACTAGCCAATTGAAAAAACAACAAATATATAAAA
>CG18349 10866358 10866463|11464 chr3L 10865923 10866511 scaffold_38 1016916 1017502 - 15692|462 573
---TCGAAATCGGGACTAGAATGTGCCA---ACATACATATGAAAAGCTTTATTACGAATCGTAAAAATGTAAATGTAGAAATGAAATAAACGTCGAAGATGTAAAGAAAAC
GAGTTGAAA----------AGTATTCCAAGTATTTACAAAATAAAAGCTTTCTT------------AATGTGTATATATGTTTTTAATAAACGAATATGATGTAAAGTAGAT
>CG14147 10947215 10947429|11569 chr3L 10946994 10947297 scaffold_8 4513595 4513966 + 8459|260 375
GAGATT---CCAAAAACATCCATTGTCCATA----------------------AAACCTCTGACTAGCTCCCTCATGGCTC--------ATAATTTATTAGGTCAATAGTTAAGCT
GAGATTTCCCCTAAAACACCAATACACTACATCAGACACACACACACACACGCATACACTTATCCAACTGCATGACGACGCTTTCATAGCTAATTTATTACGCACAACGTTTAGTT
>CG7888 11033198 11033606|11657 chr3L 11030585 11036599 scaffold_8 4615381 4621620 + 152109|2938 3368
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>SuUR 11042490 11042972|11662 chr3L 11042869 11044086 scaffold_8 4630549 4631757 + 22064|0 106
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GAGCATTGAACAATTTAAAAGTTTCAACTGTGAGCTTGAATTGTCCATTTAGTTCACATGCATATTTTAATCAGTTTTTTACAATT-CAGA---TAAATTTAGCAAC
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CTGGAAATCGAGATGCAGA--GCGCTGTATGCAACTGGTTTTATA--TATAGAAATCAAATTGCTTTATCAA-------TTCTGTGTAAATAAATAA
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ATGAATTCCTTATAATACAATTATACGAAATGGAA
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AATTTCATTTCATGTTTTTTCTATTTCTATGAGCCATGTGCAACATTAAACAACTAGG----TAGTTACAT-T
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CCAACGGATGGTGTGCTAGTGACCGATCTGTAACAGCCATAAAACTAAGAAAACCAACACCAAAAACCAAAACATTC-GACAACTATCTTTCCAACACCAC
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GGCAGCATCATATGAGGCTAATGGGAGGGCGTGGTACACTTGGCCGTGGGCGTGG-GCGTGCAAAAGGGGCGTGGCGATGCACTCGACTCATTACACAATCCCTCCGAATAAGTAAATGGTGAACAAGAACATGAAGAAGAAGAACAGCAGCAGAGCCTAGCAAGAAAAAC--CTCACGTCTGCGTCTCCATCGAAACCCATCCAAAAAAAAACAACAAAAAAACAAACAAAATATTTAAATAATATTATTAACAAAAACAACCCATAA----AGAGGCAAAC-TTTGGACCACAA---TTCAACACAACCCC----------AAACAACTCAACAAAAAAG-AACAAGAACCAGAGGAGAAGGAGGAGTAGGAGCAGGAGCAGGATTAAAAACAAACCCAACCACAATTATGTATTTTGAGAACGAAAAAACAAAAACAAAAAAATCCTAAAACAAATCAACTGCAGTTGCAGGCAACTCAAAACTCTTATTGGACTGACTTTTTGGCTTATAAGAAAAAAGAAAAAAAAAAGAGGAACTTTTTGAAAAAAAAAA-------------------------AAAACCAAAATCAAACGAAAACAATACACAA----------AATATTGCAAATATTGTTAAA---------AAACAAAAAAACAAAAACAAAAT----------AACGGTTGTCGATTTACCGTTT----TTAAACACAAAAGCAAAAAGGCAAAAACAAAACCTACCCAAATTGTAAGAGAAAAGAGAGTATTAATCGTATAAGCTATGTATGAGAGTATGTG-----------TGTATCAGC----TGAGCGAGAGAGCGAGAGAGAGCAAATACAAATTTCTATATAGTAGTTGATCACATATATATATATATATATATATGGAATATGTATGTATGTTTTTCTTCACGATCTTATTAGGCTATAAAAACTCTATATGAAATATATATATACATGCATATATATATATA-----TATTTAAG----AGAAGTTGAGCAGA-------------------CGAAGAAGAAGAGGCAGAGCAGAAGAA--GAAGCGGAAGCAGCTGCAAACAAAATAAAATAATAAAAAAACAAAGTTGATGTGATATTATATAATAATTATAAATATTGAAACACAAATACACACACACACACTCACACACATACTTAAAAGAA-------AAGAAAA---GAATAATTTGAGATTTAAATTTGA--TTTGTTTTGAATTAAAAA------CAACTTTAAACCCAACTAAGTTCAACTAAACTTTACACAAAATTA----AATTAAATTA---------AATTCTTTATTTTTTTCCTTCTTCTT-------------------TTCTTTTCATTCTTTAT--TTAAACATTT-TTCTTGTGCAGAGTTCCAAACTC-------------TAGCT------CTAAATACAATATATATATATATAAATTCACATGTATATGAAATATTTATAATATTTGATGTGTTTCTAGCTTAAGATTTTAATATTAAA----AAAAAAAACAACAACAACAAACAAAA--------------AGCAGA--GAATTCAATGTGTGTAGCTGTGTATTTAACTGTAGTTTAGTT--TATTAAACAATTACAA--AAATGACAGAAAAACTAAAAATTGGCTAAAAAAAAAAAAAAAAAATAT-ATATATATATATATGCTTAATAATATATATATATATATATATATA---TATATATATATCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTACAGTGGGGCAGCTAAATGTATTTGTGCGTAAA--ATTTAAAAAAAAACAAAA---ATCAACAAAAAATTTGAAAAGAACTAAAAATTAAATTGCGCAAAAAAAATGAAAATAT-GAAGCAAATGTTTGGAAAATCTATAAAGTCATCTGTGTTAATAAATTTTAAAATAATTTATAAAGTAGCGTAAAAGAAAAAAAAAACAAATTAAAAAAAAAATTAATAATTAACAAATTCT----AAAAAAACAAA--TTAAACAACTTTTGTAGCTGCAAAAAAAAAAAACAAAATAAAAAAAACTTTTCAAAGTATTTGACAAATTTAAGCTAAATTACATT--TAAATAATTTACAGACACACACACACAC-GTGCAAAAACAGAATTTATTTATACTTCAAAATAAACCCCCCTCCCCCCACACAATAAAAAGATNNNNNNNNNNNTTAAATAGGTTTGAATTAGGGTGTGATTGTAGGTAG
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TAATAAGATGAAGAACTCATTATATGATAAATGATAGAG---CGGAAGGAAAATTACACAA-----------GAGAAGATACAAT---------TTAGATATTTAAAACTTGCTTTAAACTTATTTAGGTTAACCCAGGTGTAAATGCCAAGAGTA-----AAGAGCCCTCTAACGAATAATAAATGTTTTAGCCATCTTAAA
GAAAAAGAGGAGGGGAATAATATAATAGGATTTATATAGTTTTAGAAGAAAAATTAAATAATTGGGGGAGTTAAGAAAAAAAAATAAAGTGAAATAAGGTGTTTAAA----GTATTAGAAAAATTGAGGGTAAATTAAATGTAAATAGGATGGGGGGATATAAGAG------AGGGGAAAAAAAAGAATTCA-----TTTATA
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CCTTAATAAAATTGTTATTACTGCTTC
CCTCAATGAAATGCTAACTGAAACAGA
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ATTAATTGGTTTAAAGTGTGCAATATAACTTTTGAATTAAATTTGTTA--CTGCTTAATCTTCG
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TCATCCTCT---CCCCGCCGTTCAGTGCAAATAAAGTAGTAGTTCGTGATTAGC
TTATATTCCGAGCTTTGTAAATAAATATGTATATAGCTGTAAGACGTAAATAAC
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A----TGTAAGCTGAAAGTCTTATGCGTTTTATTACG------ACGGTTGTAAATTAT----------ATATTTGAGAATT
AATTATGCAATTTTCAAGAGTTATAACTTCTCTTCCATGCCCAAGAACTGTCAATTAGTTTAAAGGCAATATGTCAGAAT-
>CG18815 11603555 11603946|12318 chr3L 11602906 11604698 scaffold_0 7353593 7355679 - 44015|673 1173
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TTTCCATTAAGCACTTTAGCACTTTTAGCGCGCCTTCGTCTCGTGCATTCCACATTTGCGCAACAGCAAGAAAATATAAATACAATAATAACAATTAACGAAAAATAC--ACTAAAATCGGGAAAATACAATTATTTAAACACGAATAAAAATAAAAATCACAGTAAGCAAGCTTCAACTGGACACAAACAAAACACAACTTAGCAGCGGCGACTTTAAAGAAGTCGAATTA-AAAGTTGATCTTAGTCAAATTGAGGAAAGTTAGACAAGCAATCAATTAAATATAC-TACGCAATA-CCACGTATAATCCAACCCAATAATA-GAGCGTGATGCTAATGCAGGTTGTGTTGAGCGAGTTTGTCGCGACTCTCGTTGATAAAGACACAATTGAAAGCTAGCTACTTTCAGTACACACAAATT--ATGTGCTTATTTT---TTCGTTCAGTTTATTAAAAAAAAAAAAAAAACAAAACAAATTAAAAACTACCAATAAAGC
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GCAGCTCGGATGCAATGGAATTTGCTATACTACAATA----TATGTATAGTTATAGCAAAAGTCTATGCTGTGATTTGGATTTATACACAAATAGTGCTGGTGCCTATCTAGTAATAGAAATAACTAACAGTTTGTACATACTCCTAACTGCTAAATGTATTATGTGCACAGTTGATTGCCCCACGTA----AACAAACGCTCAGATAAGTTGGTGCTTAGATAGTTTGTAAATATCTGGTTAGCATACCACTCCCAAGTATAAGCACATGTTAATTAATAGCTGTGCACTTCTTACGTCTAGTTTGTAAGCATAGTTTCTGTAAGATTTCTGGTAATAGTGACATGTACATAAGACAAATAATATTTTTACATATCTCTAAA
>CG32091 11616441 11616851|12332 chr3L 11616793 11616970 scaffold_70 180838 181013 + 45|0 58
GGTTAAAGTAATATCAATTCGAATTGTACAAGAATAAAACCCATGTTTTGACGATTCAA
CG---AACAAATGTTACTTATAAATGT----TATTAAAACC----TTTTGAAAATTGTA
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TCCTGACGCCTACTCCTTTGT-----ATAGATGCCA-----CTTACATTAGGGTTAAGAATTCGATTTAAGATGAAGTCATGACCATAAAGTTTGATTTAAGTCTGATTAGATCACAGCGTGTTTATGATTTTCAGACCATACCATACCATAAAAACACAA------TTAAATTCATTTTACCATTTATTTATTT-------------------------TATCATGTA
CAAAAGAGTGGATAGCTTTTCTAAAAGCAAATGTCACTAAGCTTATATTTTTGTTAGGAAT----ATTAATAAGAATT--TAACTGTTAAG--GAATTTAGA---AAATAATTAAAAAAAAGTTGAAACTTGTTA---CAAATGAAACAAGAGAATTTCAAATTTGCTTTAGTTTATTTTTTCATATATTTGTTTTTTAAAATTTGTTGTTTGTTTTAAATATTGTTCA
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TTCTCCTCCCAATTAGGCATTAAGTTAATAGTCTCA------TTGCTAGCTTAAGATGCATACA-----TGTATATTAAATTGTCAGCCATCGTTCAGCCGATGGCCAGCACATGACGTTTGGCAACAACATAGGCTCAGAAATATACTTGTTC
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TGGT
GGTT
>Sug 11662408 11662772|12372 chr3L 11662425 11665509 scaffold_0 7422088 7425067 - 17654|0 351
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TTTTTGAACATTTTATTTTATAGCCTTGAAGAAAGT------CTGAAAATTTCTTAAAG---GTCCTTTTTTGCCTCATATCTTTTCATTTGGT--ATGCGATA-CTAATATTTATATACACAAAAATATTATTTTAGATTCACAATAAAT------GCGAAAGATATCGCATAAGCTTATCTAATAATGTTAATAAACGAATTTCTCGTA------------------------------CACATACGGCTTGCTGATAG-------ATTGTTTTTAAATATATATATAT---------ATATTAATTTTATATATTTAAAGTACATTTGACGAAGTCTGCTCAATCACAG
>CG7319 11684439 11684518|12383 chr3L 11683028 11685478 scaffold_0 7445695 7448208 - 87963|1472 1564
AGCAACGATTTC----ACTCCTGTTTATAAATATGGTAAAA--TGTATTTAAT-----TAGTTGAGTAAACACAAGACT--CTAAAAGCTGTA
ACCAACGATTTCATAGACTTCT-TCTGTGTATATTATAAAAATTGTATTACATAAGTGTAGTTTGGTACAATAGAGACTACATAAAAATTGTA
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TGCGGTAGATGGGAACGTCCAGGGAATTCAAGTACAAGACATATTTTAGCATTCAAACCAAAAAGATCAGATCTGCTGCCGGAATTGGCTTAACTTTAAGATCGCGGTGGAAACGAAGGGGTCACTAAAGTGCCTGTCTCACA--GCCCATTCGATAGCCC-CCTAAATACCTGTTCCAGTGTCATTTTGCTTGGGCAAGAGTAAAACAGATTGGTCGCATTTAAAAAATGTTGGCATGTATTCAA-GTATTTGCATTTTTGGCGATTTT
CATCGCCGAGG-----ATCGAGAGACATCAAGTACAAGATGTA-TTCAGCATTCAAACCAAAAATATCTTTTTTTAAATAGGAACATATTTGAAATGAA-ATCAAGTCAG----GGAGTAGCCACGAAAGTGCCTGTTGCATGTTGACTATTTAATAGCCAGAATGAACCTCCTTTACGGACGAATTCATTTAGTGAAAATGTAACGACAATTGAAT-TAATTAGTATATGGCCGCGCGCATTTAAGGTATTCGCATTTTAATCAAGCTT
>Bmcp 11701829 11702065|12399 chr3L 11701813 11702230 scaffold_625 4547 4957 + 1979|16 282
AACACTGTATTTACTTTAATTTAGGC--TTCTATTTTAGTTACATATGTAGTGAACATGAAATATTTATAATGTAA-----ATTTTGTATTATTAGCGCATTTCCCTTGCTCGAAGCTCGGACATTTTCGATAATTTTACATGTGCATCTTCGCTGTAAATATATGCATTTAGTAGCATATGCTACTGAATACAGA-ATGTACATTTATGA--------------ATATTTTCTC--------AATAAACTGTTTGTTGGAAATCTC
AACACT------AGTTTAATTTAGCTCGTGCAAGTTTAGTT----------------TGAAAT---TATAATTTAACACTCATTTCAT-TTATCAAAACAATTTATTGAATT--AGTTCGAACTT--------------CACACGAATCTTTGCTGTAAATATGTACATTTAGTAATATATAT------ATATATATATATTCATATACGACATACCAAACAACGATATGTTCACGAGAAACAAATAAACAGATCAATCGAAATCTC
>CG32087 11707395 11707564|12403 chr3L 11706827 11707488 scaffold_0 7467322 7468014 - 13692|619 719
GCA----GCATATACTG---CTATTAAGCTAGAGATAACTAATCACTGAATTTTGTAGACTTAAATCCACAATGAAGTGTCTTGTAATGTCCTATATCCTT
TCACAATTCATATACTAACCATACCAAGCC--------CCAATTAT--AATTTTGGAATATATGATC--TGATG--GTGCCTGG----GTCCCATATCCAT
>CG32087 11707395 11707564|12404 chr3L 11707521 11710733 scaffold_0 7468052 7471612 - 26194|0 43
GAAACTCTTGAATTTAACGTTTTATATTCTTTATTTTAATATAA
AAAACATTTAAATCAAATTTGTTGTATTATTTATTTT-------
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AGAAAAAATAAAAAAAGATAGTTTCAATAAA
GTAAAATATTTGACGAAATAAACTCATTAAT
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TC-ACAAACGATT---TTAATCGAATTGAATTGCATCTAACCATTGTCGTGCAAACACA-----------------ACACTAACCAAAGTATTTCATAGTCA------------------TCGCAATATGTACACCTCGGTACT-----TTTAGCCCAATCTACTCACATTTCACGCTTTGTAAAAGTTTCCTTTTGTTTTAAGTCATCTCATGCACTGGCCCTAGAATTATAAAGATTTTTTATTAATTCCACTTTAGTTAATGCCATATGCCTTGAGTGACTTGGCCAGTCGACCCCAACACGCTTCCTTAATTATTTTTATGTTTATTTGTTACTCGACTCGAATTATTGTTATTGATTTAAATGCAAACATACGTACGTTTTGTGTTCGATTAAGTGCAATCCAAGCTTGAGTTAAA--TCCAGCTGCAACTGTCTATTATT----------TACTTAGTAAATGATTTTTAGTTAATATTATAAACCAAATAAAGCAACTC
TCAACGAAGGACTAACCCAATCCAACTCATCTCAGTCAACACACAAATACACACACACACACACACACACATGCATCAACTAACCAAAGC-TCTCATAGTCACAGTTAAAAATCGAATCCTTGTTCCAGTTGCGCATCTATGCTAACTATTTAGCCCAATCTTCGCACAATTCTCGCTTTATAAAAGTATTTTTCATTTTCGTATTGTTTAAT-TATTAT-----GATTTGTAATTATTGTTTAGTAACTCGTATTTAATTTGT----TATTGCTT---TTATGTAACCAGTCGG-------GCAGCGCCTGAATT-----------------TTGCCCCGCTGTGA--AAAGTCATTGATTTA--------------------------------ATGTGCAATTTAATCTTAAGTTAAATGTGTAATTCAAACTGCTTATTATTATACTTACTATGCATAGTAAAAGCAGCTTAGTTAATCAGACGAACCAAATAAAGCAACGC
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GTCACCTGCGC-ACGTGCTTGGATAGAAGCTCCCATGGGAGTTGAGTTCATCACGTCATCAGGTAGTCGAGGACATGTGGCTGTCACATCTCGACGGACCTGCACTCAGGGTCTTTAAA---ATTTGAGTAGGTCTCCAGCAATGGACACCGAACCCCCATTTTCTTAA----TAACTATGAAAACGTGCTCCTCTGAGAGCCTT
AATACCTGCGCTGCGAACC---ATATGATTCCCATTGGGAACTGGCTTCAGCG-----TTAGGCAGCCGTATTTGTGCTCAAACCACATTACGGCGGACCTGCACTCAGGGTCTTAAAATCAAATTGAGTAGA-CACCAGCAATGG-TGCCGAACCC---TTTAGTTAAGACATAATTACAAATGCCTGCTCCTCTGCGAGCTGT
>RpL10Ab 11797605 11798165|12475 chr3L 11796771 11798180 scaffold_8 2590452 2591848 - 57187|870 1436
GTTGAAGCACATTCCTCGTCCCAAGATGAAGGTGTGCATCCTTGGCGATCAGCAGCATTGCGACGAAGCCAAGGCCAACAACGTCGACTTCATGGATGCCGAGGCTCTGAAGAAGCTGAACAAGAACAAGAAGCTGGTGAAGAAGCTGGCCAAGTCCTATGATGCCTTCCTGGCCTCTGAGTCGCTGATCAAGCAGATTCCTCGTTTGCTTGGCCCTGGCTTGAACAAGGCCGGCAAGTTCCCTGCCCTGCTGTCGCATCAGGAGTCTATGATTGGCAAGATCGAGGAGGTTAAGTCGACCATCAAGTTCCAGATGAAGAAGGTGCTCTGCCTGTCCGTCGCCGTCGGCCACGTTGGCATGAAGTCCGACGAGCTGGCCCAAAACGTCAACTTGTCGATCAACTTCTTGGTGTCGCTGTTGAAGAAGAACTGGCAGAATGTGCGCTCCCTGCACGTCAAGTCCTCCATGGGACCGCCCCAGCGTCTTTACTAGA------TGCGCATACTTCATTTTTCTTACATCTTGAAATAAATAAGATCCTACATTTTTGTAATGTAACTTAA
GTTGAAGCACATCCCACGCCCCAAGATGAAGGTGTGCATTCTGGGCGATCAGCAGCATTGCGACGAGGCCAAGGCCAATGGCGTTGAGTTCATGGATGCTGAGGCACTCAAGAAGCTGAACAAGAACAAGAAGCTGGTTAAGAAACTGGCCAAGTCCTATGACGCCTTTCTGGCCTCCGAATCGCTGATCAAGCAAATTCCACGTCTGTTGGGCCCCGGCCTAAACAAGGCTGGCAAGTTCCCTGGTCTTTTGTCGCATCAGGAGTCGATGATGGGCAAAATCGAGGAGGTCAAGTCCACCATCAAGTTCCAGATGAAGAAGGTTCTGTGTCTGTCCGTTGCCGTTGGACACGTCGGCATGAAACAGGACGAGCTCTCCCAAAACGTCAGCTTGTCGATCAATTTCTTGGTCTCGCTGCTGAAGAAGAACTGGCAGAACGTTCGCTCCCTGCACATCAAGTCATCGATGGGCCCACCCCAGCGTCTGTACTAAATTGTTGTGTGCTCGCTGCA---AACTAATATTTT-ATATAAATAAAAT-TTACATTTCATCAATGT-ACGTAA
>CG7264 11804584 11804806|12478 chr3L 11802889 11804585 scaffold_8 2791711 2793511 + 64141|1825 1826
TG
TG
>CG7257 11917320 11917436|12590 chr3L 11917313 11917451 scaffold_36 724101 724226 + -551|7 125
AAAGCTCAGGAGGCCAATAGGTGTTAACAACTGTATATATTGGCACATACATTTAACCTTAACACCCTAAAAAAGAATATT-ATGATGATTAAAGATATA-TAATTTTCTAACTTAATC
AAGATTT----------TCTCTGCAAACTACT-TAAATATAAAAATAAATATGAA----TAACATTATGTAACCTAACGTTAATGTGGATTGGAATCGCAGTAATATTCGAATGTAAAT
>CG7252 11923154 11923196|12596 chr3L 11921446 11923177 scaffold_0 3437162 3439061 + 40603|1894 1919
ATGACCGATTGGCA--AATAAAGAAA
ATAATCGAGTCACATTAATAAAGGAA
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GTGGTTTCAATAAACAATATTTAAAGCAGAGTATTAAAC
ATTCATTAATAAAAC--CACTTAAAGCTGCAT-TTTCGT
>CG6947 11954695 11954877|12622 chr3L 11946986 11957705 scaffold_0 3456175 3467501 + 142635|8433 8655
GCCAGCC-----------------------------TTGAGCT-------AGCTTTCTATATACTCTTATATGCACTATCCTACGACCTTAGTTGTTATTTATGAGTTATGAT---TTATGTGAATGTTCCGCTTGTTCCAC-TTCTATACGTATTAAATACCCAATAATGTACTCTAACCATATAAGCGCTACAATAAATTCAAAATAGATGAATTACAAAC
GCTAACCATTAAAAAATGCGACCCTACACGAATGACTTGAACCCATGTAGAGCTTAGACGATGTCTTAAATTACACACATATATAATTACTTTTGTTATTTAAGAGTTACTATATATTATGAGAA-ATTCCGCTTGATCCAAATTTTATACCTAT------CCAAATA------TATATACATATATG--------TTTATTTACCCGAGCTGAACTTT---T
>CG6931 11965793 11965948|12630 chr3L 11965541 11965808 scaffold_0 3479550 3479814 + 13507|252 267
TGACTTTCTGTAGAAA
TGAATCCTGGCAGTAA
>CG6931 11965793 11965948|12631 chr3L 11965942 11967572 scaffold_0 3479815 3481428 + 41300|0 6
AAACTGC
AAATTGT
>CG6928 11981679 11982003|12644 chr3L 11981550 11982076 scaffold_0 1456114 1456651 + 3028|129 470
ATA---------AAAGAGAACTACCATTGTTAATTTTATATGTACTTAAGTATACGTTGGAACACACAACTTATTTATGGAAAGTTCACTCTCATGCTAGTATACAAATTAGCATTTAAAGCTCT--CTAAAC------TTCCTATTTATTAATCTTAAATACGCCCACATTTCATTTCAAACTATTTCATTCCTATGTTTTATTCTCCCCCGAAATGTTTAAGCTTTAATTGTACATACACACACATATATATAAGTTCACATAATTGTTTTAAATTTTGTTCATAAATTTAAATACTCTTAAATGTGAAAATTTGTAATATATTCTGCAAACGTTAAAAT
ATATATCGATTCATATAGAGCTATCGAAACGAAAT---TGTATACGAGAATGT-CGCTTCAATGCACAAAGAACTAAT---ACTTTTAATACTTTAATGTAAAATCAAACTGCTTTTGTACCTATTCCTAAGAATTGTGTTTTTATCTGTTAATCATCATAATCCACTTGTTCAATGTCATTCCTAATTATTCCTTAAAACAATTTCAAAGTCGAATAACCTATTGTTAATTGTATATATA-----AGATATTTTGTAATGCAAACTTAGTTTAAGCAACGTTTATTTATACATGTTCTAATGCTTTAAGTAACTTATGATGC-TCCTGGGTTCA-CAAAAG
>l(3)j2D3 12091797 12092003|12782 chr3L 12090955 12092124 scaffold_0 1578385 1579425 + 5742|852 1059
TGTAAATATTAAGTGTTATACGTAGAAGTAGCGTGGTGTTACTTTTTCAGCAAAATATACAACTAAAACAGTGAATATTTAATGTAATATTGCTTCAACTTCAAATTAATCTAAATATATATATATATATTGTAAAAAGCTAGATT-TTGCATTGTTATGATCTTACAAATTAGTTTCTTAAGTAAAAATAAATGCAATGAAATTATA
AATAAAAATCGAACGTT----GAAAAAGTAT--TTATATTGTTTGTTTGCTAGAATATTT---TAAGCTTATTAATAAGTGATGTACAATGTCT--------------ATCCAA-TAAATGCAATGACTGCCTCGAAAGCTGAATTATCAAATTTAAATCATTTTAC---TTTGTTTTT--------AATAAAAGCTTTTAA------
>CG11560 12095007 12095135|12785 chr3L 12094000 12097754 scaffold_0 1579426 1583496 + 68827|1075 1261
CACCTCACCATGC----CAATACCGCATATG----------------------TAAATTAGCTT--------------AAGAATTTATTTATATTGCAGACTCAATGATTTGCTCACTTAACGTAGATCCCCAATAAATAAATAATAAAAATTAGAATA------------------AATATATAAA
GGCTTGAGTACTTAAAGCCATTCTGAACATGGTCTAAATAGAATTAAATGACTTAAATTAATTTGCTGCCCCCTCTTAAATAATCCCTCAATAAAATGTAATTAATTTTTAGTTTGATCTGTGCAAGTTTCCGATCCTGAGCTACGGACGAATGCAATACTTTTGTTCAAGGTTGAAACTGTTTAAA
>Lsp2 12105463 12105643|12789 chr3L 12103168 12105658 scaffold_16 120980 123442 + 123728|2308 2489
ATCCTGGACCCAACGAATACGAACCCCAAAACGAACCAACGATATTGGATAGATTACATATGTTTTCCTTGTTATATCTTTGTCTGCATCCACTTACCCCATAGAGATCGTAATTTAACTCAATTTTTACCCAGCTTGTCAGTCCACCTTGTGACCATCGAACAATAAACGTA-TTCAACAC
------AGCCCAACGAACTCAGACTCTGATCTAATACAATAACATACTTTAGCTCTC-TGCACTTTCCTCACTGATCAAATACTCACAACTAC---CCCCAT--AGATCGTGTTCAATCCCACTAGTTAT----GTTGTCAA--CAGCTTGTAATCAATAAACAATAAACGAACTTTAACGA
>CG11534 12107701 12107783|12790 chr3L 12106167 12110626 scaffold_32 381163 385592 - 167485|1545 1663
C---TGATCAAATCAGAGTTCATTGTGCTGTGTTGGTT------------TTTAATA-TGTTAT--------CATATGTACATA------------AAATGTAACTATAAAATGTATAA
CACGTAACCCGGTC--ACTTTAAAATGTTGTGTTTTTTAACTCGTATCTGTGTAACATTGTTATTTTTAATGTATATGTACATACGACCGTCTCGTAGAGGCGATTACTAAATATA---
>RhoGAP68F 12116776 12117329|12795 chr3L 12115455 12119218 scaffold_32 389853 393638 - 188361|1326 1953
CAACTGGCCCGGC--CACCAACAAGTCCGTAATT-GTAAATTGTTTGATTTTAATGTTAGTCCTAAGTGAACCAATGGTTAGCTAAAGAGAGAGCACACAAAAACGCAACAGAAACTAGAGAACAGAAGGCAATGTCGTGTATAAAGTGTACTGTAATCCTAAGTTGAA-----TTTTA-----------AACTGTGTGTATGTGTGT-------GGAACTGCTTGTA----------GCCCCAACTCCACGCCAACTGTCCA------ACCCCCCCGAAAATCACAATTATTTACCCCCAACAAGCGCTTAATACGATTGATTTACCAAAGAAATTTGCTCG-TGTTCGCTATGCGACGAACAGGAGAGAAATTTGA-TATGAGATGTTATTATTATATACTACGTATT-------AATTCAACGCACATTCCCCCATAACCGAAAACGAATCT--TGGTTGCGTTGCTGAAGGCACATGCC---GAGCACAAGTGGAGTTGTGGCGAACTCAAAAATCGTACTGTGTAGTCTTGAATTTCCTTATAGTCATACAAACAATTTTTATAAAATAACGGTATTGTTAAAAA------------------TAAAGCAAGTGTTAAAACAA
CGGCACCGCTGGCACCACGAATAAGTCCGTAATTTGTAAATTGTTTCATTA-AGTGTTAGCCTTAAGCCCGCTAATGG-------------GAGCACAGTGAAATGCGCAAGC----------------GTTATTTCGTGTATAAAATGTGTT-TAATC-TAAGTTGAAAACCCTTTTACTTTTTCTTGTAACCTTGTAATTGTGTGCAAATGCAGAGGCTGCATGTAAAGGTTCTCTGCGCCTATTTTAATCGACCTCTTAACCGTATACTCTCCCTTAAAT---ACTTATTTAACAT--ATTAAAATCAAGAATAGTTAATTTACCAAAGAAATTTTTACGGTGTTTTATAAAACAGGATGTGGCGAAGAATCGAAATACGAAAATTTAATTTTATACAACAAATACGCACAAAAAAAAAAACACGCATTCC-----AAACTAAATCTAAGCTGCTGAATTTGCAAATGCGAGCACCTGACAGAGAAATCTGTTGGAATTGTAGAAAATTCACAAACATAAGTGTAGATTATTGAATTTCCTTATAGTAATACAAAT--TTTATATAACAAAATGGTATTGTTAAAAAAAAAAAAGAATAAAAAAATAAAGTAAATGTTAAAA---
>eap 12124187 12124280|12799 chr3L 12122732 12125402 scaffold_32 396702 399301 - 61949|1513 1606
TGTATAGGAACTATAAGGAATCTAAGCCAAGCAAACGTAGCTCCTAAAAATAGCGTTATCCCTAGAATAAACATGCATTTATATTTTCTCAATG
AACGAACGATATACACAAAATATAAGCATAGT-----------------------TTATGATTCAGAAATAAATGTAACTATAATTTTATATTG
>Nrx-IV 12130189 12130953|12802 chr3L 12127889 12131433 scaffold_32 401598 405347 - 149876|2330 3257
AC---CGGTCGCAAGAATAT---GCACATAAATCGTTTTTA--AATCGCCTTAGGCACGCAAC--AGCGACCACTCAGACAC--ACCAAAAGATAAAAAAAAAATAGATGAGA----------ACGAAGTGAAAATCAAATAGACACGGAAAAG---------GCTCACCACGCATAACAGACAGAAAATACTTTTCC----ATGCACTGCCAATTGTTTTGCGCAAGTAAAT---GCTAAGATTTGATTTATAATTGGT---TGGCTACATTTTGCACTTATGTTTTTTTTTTTAGT-CTTTGGTTCTGTCTGACGGCA-------TTATTGAAATTTCTTCTA----------------------------TCACAGAATACCGTCCATT----TTTAGTTAA--TTTTATGAACTTTTTGTTTGCAAAATTGAGTTAAAAACTTATTTAAGGGAGCTGCCCG----------AGTAGCTCAACAAAAGCCACCTAT--------------TTTATGTATTTCTAT-----------TGCGCGAGTATGTA-------AGAACG--------AACATTCCATTATTTTTAATATG---TTTTCTCGCTTTACGTTTAATTTAA--------AAATGTCTTCTACTTTACAC----ACAAAAGAACATGAAAATCATTTTGTGGCTAAACAAAATCGGCTAC----------TTTAGTAACACAAAGCATTAAAAACAAATTGTATTTTTGGAAAATGCATTTTGAACGTCTTGACTTGAAATTTTCAAATATACA---TTAGCATGTGTATATAGATATATATAGCAATAAAAAAATATATATAATTACAAAAAAGAGACAATGAAAAAATTAAAATTTTT--ATCTTTCAATAAAAGAGAACTACAAATAAATGAAATTGGTTGT
GCTATCGAGTGCAGCAATCTCTGAAAAATCAATCGCCTTAAACAAAAACCAGCAACACACAACTGAGCGACGACTCGTACACAAAACAAAAAACAAAAAAAGAATATATATACATATATATATATAAACACACAATCAAACGAATTAGGAAACGAATATGATAAATTATCATTGATAATAGATTCGAAGGCTTTTCCCCACAACACACTGCCAATTATTTTGAGCAATTCTTTTGCTTTGAAATTTGGTTAACAATTGGTTGCTGATTACTTTTTACCTTACTTTATCGTATTGTAACATTTTGCTTCTGTTTAATGGCAAATCAATTTTTTAATTTTTATTTTACTTTGTACTTTGAACGAACACTCAATAGTCATCGAAGACCGTCCATTTTTGTTTAGTTAACTTTTTATACACAATTTGCTTACCAAATTAAGTTACGATTGTACTTTAAGTTGCTGCACGCTCTACAGCCCGTCATCCAGCCAATTACATTTATATGTTGTGCACGTATTCATATATATATATATGTCAATATATATATATGTATGTATACTTGCACAACAATACCAACAACATTCCATTATATTTAAAACGTTTTTTTCTGCCTCTACTTATTATGTAAATCTTTTCAAATGTCTTCTAATTTACACAAAAACAAAACAAAATTTAATCATTTTTGTAGTAAAACAAAAT--GCTAAGTTGTAAAAGTTTAGTTACGAAATGA---GAAAATGAATTGTATTTTTGGAAAATGC---------------AATTGCATATTTGAAATATACATATTTGGCATATGTATATATATATATACATGAACAGTAGTATATACACTGT------GTGTTTACACTGACATAATAAAGATTTTTTCAAATTTCAATAAAAT-TAATTATATATACAAGAAA--AGTCGT
>CAH2 12156695 12157302|12833 chr3L 12155326 12156848 scaffold_32 434769 436286 - 31827|1434 1624
TTAGAGTTCTGCGGTG--------------------------GTAAATCGAAGGTTAAATCGTTAAATGCCTAGCT----GGCGCTTAGGCGTCCAATTAAGCGCTGTAATTTA--CATTTTCCGCT-----CTTGTTCGCCGTCGCTGTTTGTTGTTCAAACACGAGTCCCGGTAATTTCCTTCGGCAAG
TTAGAGGCATACGGCGCAGTTGCTGGCCCACAGACCCGGACCGCAACGCGAATGTTTTGT-ATTAAATACATCGCTCCCGCACGCTTACTATTTTAATTAAGACCTGTAATTTAGCCGGCTCCGGCTACGGCTTTGTTTGCACGCTTTG-TCGCAGTGTGAGGACGTGTGCCGGCAATTTGAATTGGAAAG
>CG6910 12161229 12161780|12839 chr3L 12160459 12161420 scaffold_19 1691597 1692541 + 44035|775 968
GCGTACTTATATACGAGTGATGTTTAGCTTTC--TGAATGCTTTTACTTTATATATAAGACAACATTTATACCTGTAATATAATATAATGTGTATGCTCCATGTATATCCCCATATATATATACCCAAATAACCTGAAAAACAAAAAAGTTTTAAAAAAGTACTGCATACTTTTTGGCAAGGAATTTTTTGAAA
ACA-----------GAGTCGAGTTTAGAATGCATAAAATCATATAACCATATACGC------ACATATATATACTAACCATAAACCTATATTTATTATTTACTAACTTATACTGATCTATATACATAGATAG-CTGTTCCCCACTGCGCCCATAAGAAAGCA------ACTGTATGCTAAAAACTTCTTTGAAA
>Est-6 12164492 12164528|12841 chr3L 12162558 12164538 scaffold_35 772253 774197 + 49752|1961 2003
GTTACATGAA----TAAAATCAAAAATTTTTCGTTC--TGTGT
GACAGCAAAAGTTTTATATTTAATAGTTGTTCGATCGATTTGT
>CG10426 12254981 12255423|12925 chr3L 12251709 12256031 scaffold_38 1104655 1109354 - 115013|3680 4232
A----------CTACTGAGATGC-------------------------TAACCAAAGCTAGGCTTCCTA----ATGGCCGCCTACCCACGTTGAAATCTATTTAGTCATTTACTC------------------------GAATCTCAAAGTGCTAGT------------------------------------CAAAGCTTTCCTACGGTTGTGCGACGCCTTTGTATTAACCCGATTAGATTGTTATCCAGTGC-GCTGTCGGATATCGAAGTAACGATATAACCATTACTTACCCTGC---AATGCTGCGGTAGATCTTAGGCGCTGCCTTTCGCCTCGAGGCCTTAGTCGTAATACGTTCCTTATGAGATTATCTAATACATACTCGTGCAACAATTCTGTACCTCTACTCTGAAGCACAAGCTTAGTTCGTAGATAAACTAAATCTGATAGTTAA-AGTTTAGT-CAAATATTGAAATGAAATCGAAATATGAATTACTTTGAATGTGTAATGTTAACTAGCAGTAAATATAT-----TTTATGCATCT
AAGTAAAAGTGCTATGGATATACCCGAATTTTAGTTATTATGGAACCATAATCTACGTGCAGCTATTTAGTTTATTGCTAACTAAATATATATATAACTATATATATATATATTTATATAATTCTATCAGTGATAGTTAAAACTCTGAAATGCTAGTCTTGTTAACTATACCAAAGCAGCTTAAAAACTGTCCCAATGCTTTACCACGGTTGTGTGTGGCCTTTATAGCATA-----TAGTTAGTTATTTAACTCAGTAGTCGAATATTCAATACGC----TACTCTTTA--TACCATGTTCGAATATTGT--TAGATCTTAGGCGCTGCCTTTCGCCTTAAGGCCTTTAT-GTAAAACGTTCCTTACAAAAT----AGAGGCGCAGTCATAATGAAATCTTTT-------------AGCACAAGTTTAGGTT-------AGTTGAATCTATTAGCAAATAACTTAGTGCAAATATATAAATGAAGTCAAAA----------GTTGAATGTATAATTTAAAATAGCTGTAAATTTATATATATATATATATAT
>CG32105 12309367 12309853|12984 chr3L 12308041 12310790 scaffold_955 3271 5897 - 85042|1337 1841
ATGGCCATTGGCTGGAAT---GACAGGGAAGCACCGAGGCGATCGTGGGATAGAGACGAATTTATTAGCGTTAGAGTGGCAGGATCCGATGGAAAAGGGACGCG-AGGTCCTTGCTGTTACTTTAAAACGTAGCGCGTAGTTGGCACCTTCCGCATTCGGCGCATTAAGTTGGAGTCGTAGAACCGGATACAAGATACATCAAATGTGATTTTTTTAAGCTAATTGAAATTTTAAGATTCTTGGCGATTTGAAGGCGCAGAAAAACGGGGCGGGCAGCACATCTTTTTGTTGGTATAGACTCTAGAGGCAAACCAAAAAAAAAAATGTATAACTCCTTGAGAAATGGCAAAGT--GGTCAATGCGCCCTCTTATGTTTGTAAATAGTTTT--AACCACCCGAGAAAATTGTTAT-------TAAATGTAATTTAAAAGTCAATAA---TTGTATTAGCAAGTGCAATTTAATCTGTTCCCCTAAAATATACATCTTAACCGAATT
ACGCC---GGACCCGAACACGGACACGGA--CACAGACAGAGTCGT---ATCCAGACGAATTTATTAGCGTTAGAGTTGCGGGCTCCGGT----AAGGAGCATGTTGGTAGGCACTGTAACTCCTTAGT-TAACGGCAACTAAGTCATTTCGCCAGTTGGCTTTTTTTGGGAAAGTTG-AGATTTTAAGTAAAAATG-ATCAAATGTGA--TTTTTAAGCTAAACGAAGTTTTAAGAAAATTG----CATTACAGCG-ATATAAACGACACGTAATGCATAATTTATTGTTAGTTCGAACT---------------------AAGTACATAAGTA---GAGAAACCGAAAGATAAAATCAATGTG--AGCCTATGTTTGTAAATAGTTTTAGAACCA------AAAATTGTTATAAAAATGTAATTTTAATTAAAACATCAATAAATTATATATTAGCAAGTGCAGTTTAAACAG----CTGGGTATAAATATCTTAGTAAAAAT
>CG10418 12311074 12311185|12985 chr3L 12310791 12311083 scaffold_1151 769 1061 - 15342|288 297
GAATACCACT
AGGTGGCGCT
>Pbprp1 12370841 12370904|13038 chr3L 12368968 12381153 scaffold_12 50331 62880 - 275511|1980 2044
CGCTAA-CCAACCTAAATATATCCCGATCCACGATTCCCAAGAGCAGCAAACAGCGCAGGATGCG
TATAAAACTCACTTGAACAATTCACGATCTATAATTCCCAGCAGCAGCAGACAGCGTAAAATGCG
>CG10616 12448126 12448226|13129 chr3L 12446477 12448689 scaffold_12 1826121 1828427 + 59096|1751 1863
GCAGCTGG--GATGCTGG------GATGACCGAACCAATAAACCAATTTATATGAAATGT----TTTTATACAGATACATTAATTGCATGTGTGCCCACGCACTCACCTCTCT
ACAGCCGGAAGATGCATGACTATTGGTTGCTTATTCGACTAACCATTATACACAATATACGCAACCCAATCCGAATACATTGATTGCATACATGTGCATACACATAAATC---
>CG10681 12476423 12476594|13162 chr3L 12472453 12477785 scaffold_0 5210480 5215948 + 106374|4417 4588
GCCTAATTAGCTTTAGTCCCTCGATATATTTATCTTCATATAATAACTTATTGGTTTAATATTTGTATAACCTGCTACTACATACAAGGACACAATTCGTTTAGTTAGATTTAAATGAAATATGCGTAATAATTTAAGAAACTAATGGCTTAAAATATAATCTGGTACTTGT
TCAT---------TAGTTCATAATTAGATTTATTT---------AACCTAA-----------------AGCCTAGTAATGTATTTGTGTATACAGT------------ATTTATAAAAACTA-GTGGAATATTATGTATAAGGAATAAGTTAGAAAATTATTTGGTACTTAT
>vihar 12479096 12479422|13164 chr3L 12478224 12479784 scaffold_0 5216548 5217963 + 42960|919 1261
AGTTTGGCAATTCGTTGTCATA---TATCCTATGCTCATATTGCGGCGTATTTATT--------TACATATAGTGCAAGCAACTCCACTCATCCGAAGACCTACTGCCAACCAACAAACCAATCATCAATCACCACCGTAACACAGTACCATCAGTTAAGTGGATCACCAGATCAATTTCAACAACGTTCAATGCTGATAGTTCATTTGGCAAAAGACCCCGTGCGTTTCTTATGTAATTGTCGATCGATTGACGGATAATCTGGTTTTTATTCTCATTTCTTTCCTCCTCCCTACAAATTAATGATAAATGAATGTATTGGTA-----ATGTAATTTTAAAA
AAACTGGCGG--CGGCTCCAAAACTCATTCTATGCTCATATTGCGGCGTATTTATTATCATTTGTATGCGTGGTGCAAGCAAC---------------ACCTACACCCCGCC-----------------------------------------------------CCACATCTCACCCTTTATATTAGTTCATGCTG-------TTTTGGTA------CATTTGCATTTCTACTGAATTT-------CATTGATAGGTACTATTGGATTT-----------TTTAATTTTTGCAGCAAATTAATTATATGT-AATGTAATGGTATATGTATGTAATTTTCAGA
>CG10686 12493099 12494061|13180 chr3L 12492893 12494122 scaffold_0 5231231 5232296 + 15551|210 1256
TGCCGCCCGGCCAGTGGAAAGCCACT--TTAAATATACACCAACCACAACCAACAAACCACAAATTGATAGATGCGAATTGAGAAGAGCGTAAAGTAAATATCCTATTCATTGCAAAGCTAA-TTATTCGAA-GCAAACCAATCAAGTGACCCGAACGATCGACGACACACAGGCTCTTATTATCAGGAATTTCGAGTTATGGATC---CAGCGGCATAA----TATATTTGTATAA-TTAAATTAGTGTTACAATTCTCACGACGTCCTGGGGCGCACTCCGCTGCTGCCCGCCCACCACCACCGTGTGCTTGGCGATGATAAGCGCTCTACGATTC----GATTAATGATTAGCGACTAGCGCGAATGTGAATGTGAATGTGAACCGAACCGAACCGAACCGAACCGGCCATGTGTTAGGCTTTGTGTAAATGGCTGGTTCCAACGCCTTGCGCTGAGCAAAAAGCACGGCATTGATAAGAAGGAGCAGATAATGGCA-CGCCAGCATACA------TACATATATTTAGTAAGAA--------CATAGTTAAGCATAAG--TATGAAAAGCTACAAAAAACAAAACAAAACGAAAGCAACCATTTAGCAAGGAGAGGAGCAAGGAGATTTGGCGGAGGAGCCGATAACAACAATAATGAAATTAATGGAGTAAACCAATTAAATCCATGGAATTCCCAAATCTAAAATAAAAGCTAACTTAA----TACGTTTTTATTTGAATGAAAGAGTAACAAATCGATTGTAATATTGTATTTCTTGTGGGCGTAAAACAT--CGACAAACGCTCGACCC---GTTTTACTAGCATTTAAAACAACTATTATTTAAGAGC--ATTTTAAACATGAAAAAAAGAAAA----------------TAAAATCGGCAGCTACGCGCTTCTAT------------------CAAAAGCACAATTGTAAAAAGTCAATC-CAGCTCAGCTGCAATG-----AATGAATGAAGTCTCCCGAATGAAAATGTTAAACGAAAAAACCCCAACAAAAAAA
TGTCGCATG---CGTGGAGTTTCCTTGCCTAACTTTACAAAATCTAAAAACA------------------------------------------------GTCCTACTCATTGCAAAGCTAGTTTACCCGAATGCAACCTAATCAAGCGA-CCGACCGATCGACGACAAAAAGGCTCTTATCATCATGAAGAATCGATTATGGAACTAATAATGGCATAAACAGAATAATTGTAAAATTTTACTTAGTGTTGTAACGCTCATGACGTCCT-GCGCGCACT------TTGCCCGC------CCACCGTGT----------------TGCTTTGCTATTCATAAGATCAATCAAAAGCGTTCAGCAGCCATAAAAATA-------------------------------------------GGTTTTTGTGTAAATGG---------------TATGCTGA---------ACGGCAATAGT--GATGCAGCACATGATTATAGTGAGAACATACACACCTCTACATATATTTAGTAATAAATGTGAAGAAACATTAAGCATAAGTCTATGAAAAGTTAAAGAAA------------------AACTCT--------------------------------AGGAGTCG------CAAATTATGAAATTAAAGAAAGAAA-CAATTAAATCCATGGAATTCCCAACATT--AATAAAAGCAAACGCAACTCGCATGTTTATATTTTAAAACAAGAAAAAAAA---GGGCCTACAACTATAATTAATGTGGGCATACAACATAACATAAATTAATTAATTCAAAGCGTTACTAGCATTTAAA------CTTTTTTAAGAACAAATTTTAATGATGGAGAAAATGGAAATACATGCATATATATTAAAATTAGCAGCAACACGTACATATATTGAACACAAAAAAAGAAAAAACAAAAATTGTAAAAAATAAAACACCTATCAGTAGTAGTGTGGGCAACAAATAAATTTACTTAAAACTGATTGTTTACATAAAAAGC------------G
>CG10688 12509367 12509462|13188 chr3L 12507855 12509444 scaffold_0 5247906 5249464 + 44902|1547 1629
-GAATTTCGAGCTTACTCAG---CAGTTGAAAATATTCCATTTTTATACATG-TGTACAATTGTTAACCAAATTTAATATATA
TGGCTTTTGCATTTACAAAATTCCAATTTAAAA-----CATTTTTATTTATGATGTATATTCTGTAA--AAAATTAATCAATA
>CG10688 12509367 12509462|13189 chr3L 12509459 12511169 scaffold_31 791697 793455 + 67203|0 3
TTAA
TCAA
>ara 12569609 12569965|13258 chr3L 12569603 12570033 scaffold_0 5307073 5307528 + 4152|6 397
TCGGATATAGTACCATATATATAGCCACATTATG---------GGATCGTGCAAGAAT--CGGACGGATTTGTGTAATATTAAATGTAGCCGTTTAGCGCGTTAAGTAACTTCAAGTTTCATTCAAGTTATGCATATATGTATCTAAGAGTATATAGAGTACCAGATCAAA--TGTTTCTCCTCTGACAACTGCA----ATGTAAGCTTAGGCTAAAAAAAAACTT-------AAAAATACTAAACTTAATTAGCGCAATAAGATTGTAAACTGTGATACGTTTTTCATTGTCTAACAGACTTCACACTA------AACACTTCGTCTATATGAAACACATAAT-CTAAATAATTTTAAATCGTTTAATAA----AATTCTTTATAATCATG
TTTCCATTCAATCTATGTACATACGCAGATTATGATTTTTCTGGGCTCGTGCAACAACAACGTAATGGATTGTGTAATATTTAACA--------------ATTAATTAATAATAATATATACCACATTGGTACAGATGTACCATACAAACTACAACTACAACTTAATAAAAGCCGTGCATTGTCTTA-AACTATATCTGAAGTAAGCATTA--TTAGGGACAGCTTCTTTTATAAACAGGCACATTTCAACTTAGAACTTAAGATTATAAACTGTGATAAATTTTACATTGTTTAACAGACTTCAAATAAAACAACAACACATCGTCTCTAT-AAATTTATAATAATTAATAATTTAAATTCGTTCAATACAAATAAATCTTTGTAATCCTA
>caup 12594649 12595755|13291 chr3L 12594744 12594951 scaffold_0 5337618 5337836 + 10683|0 223
GGACAAGTGCAAGT-TGGCGGGCAATC-------------CGCGATTACGATTACGAGTACGTTTAACAGATAGCGATAACTACACTAATTATTTTGCAATAAATGTAGCTTAAGTATGGCAATAAAACTTTATTTCC--TACCATATCATAAATTATTTCGCTTTATAACTTTAATTAGCATATTCACACACAACCGCTGAAATTCTGCGAGACGAACATGTC
GGACAAGTGCAAATATCGCCGGCAATCGTTAAGGGATGCCCACGATAGCGATAGCGATTACGAT--AACGATAACGATA-CCACACTAATTATTTCGCAATAAATGTAGCTTAAGCATGGCAATAAAACTTTATTTCCCATAACATATCGTAAATTATTTCACTTTATAACTTTAATTAGCATATTCACACCCATCAATTTAAA--CAGCGACCCAGACATCTC
>caup 12594649 12595755|13292 chr3L 12595455 12595906 scaffold_58 403172 403574 + 1670|0 318
AATAGTTAACTAAACGTAATAATGTAATTAGCCACACACATACACACACACACCATTCGTTTGATAAATTTGTAGAGAA----------TTTTTAAGTATCTGTGATATATGCATATAAACACATACTATACGAGCAATTATCTGCGCTAATTTAGTTAATTCACACTTTACTTCTT-----CGTACACAAAGGCACTTGCGTTCGGCAAACTGGTTCGAGACACATCTAATGGCATTCATTTTGTAATTGTAAATAGTATTTATGTAAATTTTCAAATTTAACAATAAATAAAGTTGAG---TACACCATTTATTCGC
AATAGCTAATTGGCAGTACTGATG------------CATATACACTCTCACAC----------AGAAGTATGCAGTGAAATTTATTTTTTTTTTATTTATTT-TACCATTTTTGCATACATACGTAC-ATACATACATATATATAC-------------ATCCATACATATATGCCTAGATGCGCGTATAAATGTACTCGCTT---AGAAAATGGAAGGAA------------GTTTTTTTTTTGGCACAACGAAAAGTCTGAAAATCATTTT---AATTTATATATATACCCATCTGATATTTACACTATTTTTTATA
>CG32111 12616614 12616825|13319 chr3L 12616094 12616783 scaffold_0 5362557 5363200 + 15591|563 735
ACAAGTCTATTTGCATATGTTGACGGCATACTCTAACCAGATCCTGGTGGATTTCCTGCTTAACGGCCGTGGCCATCACA---ACAGCCATCCCTTTGCACAGGACCTTCACACATGCGGCTGTGTGGCATGCCTTTTTGACAACTCATAACAATCACTCATCATAAACAAAG
ACAAACATATTTGCATATGTTGGCGGCATATTTTAA-CAAATCCTGCTGGATTTCCTGCTCAACAGACACCAGATACACACACACACACACACACACACACACTCGCATCACACAT-CGTTGGCTCCGCATGCCTTTTTGACAACTCATAACAATCACTCATCATAAACAAAG
>CG32111 12618749 12618987|13320 chr3L 12616876 12620607 scaffold_0 5363661 5367636 + 25152|2284 2536
ATGTGG-AAAGCCCAAATGCCGATGCATTCTCGATTCGTGGCATTAAGACAAAAGTAAACTTGATTTTGGTATGAAATTGATTCATTCATTT-TCGATCCATTGAGTCAGATTCTTATCCGATGGATGAGC-CGGTCAGCATCACCACTTCCAACTGTGT---GCACATCCAACAGGTAGTCGAAC--CAGACAAAC----TGTCTCCACTTGCAATGG--AGTCTCGTTTCCATCCTCTTCGCCCCTTTCAA
ACCTGGCGAGGCACAAATGACGATGTGGTTTTAATTC-TGACCTTAAGACAAACGTAAATTTA--CGGAACACACATTTGATTCATTCATTCAGCATTCCATGGGCCCAGG---CCAGCCAATGTGTTCGTATAGGTAACAT-ACCA-GACAAACAGTCTGCCGCATGCTGCACACTTGGCTGAACTGCAAACACACCCCGTTTATGCTCTTGCAGAGGGTATCATAATTTCATTGGGAACTGCAACTCTTGA
>CG32111 12619060 12619158|13320 chr3L 12616876 12620607 scaffold_0 5363661 5367636 + 25152|2617 2720
CTAATATTTGACTGGGAATTCAGCGAGAGCCGGGAATCCTTTGATGGCAGGATATCGTCATTCAGCT---TCGGAAAAATA--ATTTATTCGATAAATTTCGAT
CTAACTTTTAA-----AATTGCCAGAAAATTTCGAATAACTATACTGTCGGGCATCCAATTTAGGCTTTATCTGAAATGTATTATCGTATTAAGAGATTTAGAT
>CG32111 12619219 12619253|13320 chr3L 12616876 12620607 scaffold_0 5363661 5367636 + 25152|2796 2830
GTTTCCATAGACCATTATGTCAGCTAGAGAACATG
CACTTCTCAG----CTGGTTTGCATAAAAAATATT
>CG32111 12619310 12622227|13320 chr3L 12616876 12620607 scaffold_0 5363661 5367636 + 25152|2887 4308
ATATCTCACCAAACAACTGTTGAATGATTCTTGATGGACTGGA--TGAAAGCAACTGGATTTAATT--ATGTTAATTTGTAATTTTAATATGTTATCAAAAA-----AAAAACATCGAAGTAGGATGGAGTTTT---ACTGATGCGCTTTCCAATCGAATCGAATTTGGT-TGATTTTTATTAGCATTCTTATTGGATTACTTTTTGTAAAAACACATATGATTGCATAATATAATTGTATTAAATGTGTATTTTTGTAAACCTTATATAGTTTAAACATTTAAACGAACAAATTGTTAAACATGGCCAATGATTACATGCTAAACCAAAAATTTTTGCTGTATTT----GGACAATTGTATTTATAGGTA--------------CTGATTAGTTGATATTAATATTAAACATAAACAAGAAACATGATGTTATTCATAA---ATTCAATCACATCCAAATGACCTATCGAAATTAAATATATGTTACAAGATATAACAATGTGAAATTGTACTAAAATTGCAATGGTTTTCAATAAGTTGACTCACA-GGAGAAAATAATGTATACATTGGAATTTTATAAGAACATATTGTTCACAGCTCTACGCTTTTTTGAGGATTATCATATATTACAAAAAAAGAATTATTGTCTTTAATTTTATATAAAATTTTTAAAATATTCATAATCAAATATATGT---TGTTGTTAGTTTCATGAACACAATGAAAAAAAAAACAGA----AAAATTCCCATCCAATAATAATTTAA-------------------AATATATTGGA-ATAATTACTTTCACTCA--ATTTATTAAGTGATCAAGACATCTT-----ATGCAGAGATCTGATTT------TAATTTAGAGTTCAGTTTCCGATCTTAACAATTAAAT--AAATTACTTTGCTAATTATTTA-ACTCGATCCACTTAGTTAAAGATGATCACGCATACGCAACCATTG-CGCATTAATTTACACATATGCCTAAG-----AGTATGCAACGTATTC---TTTTATG----CACTTTCTAAAGCATACTTATGTGGTTAATTACGTGCTGCAGC-ATATTTTCTTTCCCATAAATGTCTATCGCAGTTTAGGTGTGATCTCAAATTTACTTTTGTATAAATCAATAACTATTCTATTATCGATAAGATGTTGTTCAAAAGGGCTCTC---TTCTTAGTCGATCATAGAAAGTGATCATAAACTTG-TATATCATGTAACATACATTAGAGAAAAGAATTCG----TCCACTGCCAACATAAAGTCATAG---ATACTCAAAACTGTTAAAAAAAAGTATCATTTAAATTGTTAA---------------ATACTGTAATTCTTTTAACATTGCATTTAAATT----ATAAGATCAAATTTACCC--AATTTT
AT-------TGAAC------TGGAAATGTCTTGAGAAACCAGAACTACAAATAATTGGCAACCATTAAACATAAACCAGCTCTATTTAAATG---GCAAAACTCTTTAGGAACCTTTAAAAAGTATAGAAGTTTATAACGTATACATATACC---CGAAGTAATAGTAGTATTATTTACATAGAGACTTTTGTATAATTGTAGTTTATTGACAATAACAAGA----ATAAAATATTATTTGTAAGTAATTGTTAATGAGAATAGAAAACAGCGTAA----TTAAGTTTAGTAATACACAACGAAGCCCAA--ATCAAGTATGAATC--AATATGCTCGATGAAAATGAAAGAATAACTGAAATAATAAGTATACAATTTGTTCTTCTATTTATAAGATATAACTATTTAACATATATTGAAGGAATCAATATAAACGAAGAATATTCAGTCAGCTCTAA-----------AAATCAAAAATGATTTAC---------------TTAACTTTGTTAAGACTTGATACCTTCTTTGAAATTTGATGCATATTTAAAAGAAAACGAATATATT--------------ACTACTTATTTACATATAAATGCAATCCAGAGCA-TAAAACACGATCCATAACTAGCAATAT--------AATTGAAATAAGCTTGAAAAGTTATGGATATTGAAAGAT-TGTGAATGTCCTTAACTC--TGGATATATTTATATGAGAAGCAGGTTATAAAAGTGTCGTGCAATCCACATTCGAGTCTTCTTTCCTAACAATCAATATACGAAACATAAACACGTTGATTCGTCCTTCATTCAGCGTTTAGCAGTGCTTCGATAATAAAGAGATTGAAATTAGCAAGCAATTCGGAATGTAGAT-----TCTCAAATACCATACGAAAATCCAATTGATTTTTATTTATATATGATAGAATT--------ATGACTTCCCCTAAATAATTATCGTTTCATGGTTCTAAGCGTACTACGTAGCAACTAGATTACAATGTCTCTGCATTTTATAATTTCAGTTTTTAGAGTA---------GCTTAATTATGTGATATACCTATATTTTCT-----ATGCATCTTTATT-TAGTTTGGAAAGGGTACAGAAAAGTGTCTCCAAAAAACCATTAACTCT---------AATGCGAAGCCAAGTGAAGCCGCCCACGCATTCTTGTCTGCTTA---AAATTACTCTTAAACCTGATTTTTGAATCGGTAATCGTTAAGGATTGAATTTCAAGATACTTTTTTCAAAGTGAGTTCATAGTAAAAATGAATAACTTAAAAAGAAAGAAAACACATAATTTTATAAGCAAAACTGATGTATAAATCGTCATCATCATCATATAGGATTGGGATTCAAAATAAGTTCAGCTTTAATATGAATTTT
>CG32111 12619310 12622227|13321 chr3L 12620608 12620852 scaffold_0 5368100 5368341 + -123|0 266
AAATATAATCGGCTATAGTATCTTAAGTTCTTTTAAATGCTTGTGACTTAAAATTTCGATTTCACACAGTAACTTTTGTGATTTAA---ATCTTTAATTAGGCTATTAGGTATTACAAGTTGAGTTAACAAGAGTTAT-GCGAATTATATATTCATTATTTGATAACAATTTTATTGATACATCACATACAATACGTCGT---AAAGCTCAAATATTTTAAAGACAACTAA-----TTTGTAGGG----------GGACAATGCTCA
AAGTATGATC-----------CATAAGCTTTTTATAATAGGTACTGCTGCAAG----GATCTTTAAAGGGTATTCCTATTATCGAACATATGTCTCATGAAGTTTTAAAAGATTAC---------CAAAAATAGGCACAGCGATCTTTATAATAATTATATTTTTACAAATATATTGA-ACTTATCGTTAAGTATTTTTTTCAAAAGATTTACAAACATAAGCATAACTAACTAACTTTATATTGTTAATAATTAAGACATTGTTTA
>CG32111 12619310 12622227|13322 chr3L 12620912 12622369 scaffold_0 5368409 5369815 + 12432|0 1436
TAACCCGAAACCGAGCTGGTCGATAAAGGACGGCTGCGAATATAT---TTATTGTTTTCCGCTTACTACCTGAATACGAATTAGCATTGGGACCCACCCCTCCGCCCCTGCCAGCCATATACATATGTAGAAACCTATCTGTATACGAAAGTAATGTCTTGAGCAGACCCTGGATCGTGCCCCATAAATCATGCCAAACTGCGTTTGGGTATAGAAAGTCAAAGTAAACTGCCATCACTTAAAGTCATTCAAGCATTTATTTATGTCAAAACATTGTCCGCTTAGCTGCTGCGAACCTTTTGACAGTCCCCGAGGAGGTAGGGATTCGGGATCGGAATCGGGATTGGGATCGAGAGTCGGAGGGGTCAGTTGGCCAGTCGAATGTATAACTCAATTATAGGCGGCTGTGTGCTCA-------CCTCGCAGCGGGGTGTCGGCGCATTAGCCACTCCTCCATATCCTGGCC-------CTCAGCCCTCGGTTCGCCGTGAGTTCC---CTTTTTAGC---------------------GCTAGACCGGATCGGATAATGCACATGCGGCGATCGGGGTCATTGCGGTTTTCGGGATCTCCAGTCTGCAGTCCCGAATCTGCTGGACGAGATAACCCCGACTAGACTGCATAGATGTCATTA---GAAACCGGGCACCAACACGATCCTCAATGAAATAACCTCTCTGTT-----------AGTTTGTCTTTATTATCT--------CTTCCCTGGAGGGGGGATTC--CTGTGTGGCC--------------------CGCATCGGATGGCAC---------------ATTGTGACCACGATCGACCTCCAAGGTACAGGCCTCCCTGTACATGA-TTCTGTTTAACGAGAACAATGTTCTTGCAATTCTGCAAACGATGGCCACACCGCCGTTGCTTCGTTGGCGATCGCCTTTACTTACAGTTTCTGGACCGGATCTGGGGAGGATCGGGGCGATCCGCAACCAGGTGAGGGGATAACAACCACACGATGGC----ACCGAATCGTGCAAAAGTACAGCGACGG-ATGGCAGGTGGCGCCGATGCGAATTTGAATATG--------GAATGTCAGTCGGGCATATGGCTAGCAAATTTGTATTGTGTGGGGGGAAACCTTGTTATGGGCT-----AAAAATAGGGATAACACACTCAAATTTACATAAAATTTATAAACTTCTGTTATCAATTTGTAGGGCCAGCTTTCTTATTGGATTACATTTACCTTTCAATCTGTTTATATTTATATTTTATAGCAAAAGAACTAAGATTTAAAGCTTGTCCTTACACTTATACTTACTTGTTACTTACACTTACACATAATCATACTTCATAAATATTCCATTCCACATTAATT--ATCAGAAGACATAAAATAAATTATTTAAAAGCTCT
TAAATCAAACCCACCCTGTTCGTTAATTGTCTAACG-GAATTAATAGAGTATTGTTGTTTCTCTGCTGCCTGGATGTGGGT-AATATCGG---------TCACATCCCCATCTGCCATGCTCAGAG----------ATCTATATATTATGGCAGTTGCCAAA--------TGGAGCAT--CACATAAATCATGCCAAACTGT-TTTGGGCATAGGAGAGTCAAACAGAATACGATCACTTAAAAGTATTCAGGCATTTATTTATGTCAAAACAAGCTACATTAAGCCGCTGGCAACCCTCGACCAGGACCAGAACGA----------------GGACCAGGTACTAACAACAACATCC--AAGGGTCATT------------CGTATAACTCAATTAAAGACGATTCTGCCCTCACGCACACCGTCGCAGCGGGGTGTCGGCGCATTAGCCACTTTTCTACATCTTCGTCTGCTGATTTCAGCAGTTGCTCAATGGAGGACACTAGACTGGTCAGCCAGACAACAACAACAACAACAGCAACAAGGGGTACAACAATACTGCTGCGACGATCGGGGTCGTTGTGGTTTGAG-----TCGGATTTGCAGT-----------------------CACTGAATAGACGCCACAAATATCAACAAATGAAACTTGAACTGAGCATTTTGTAGAATGAATGCGTCCCTCTCCTTACCAACATGCCATTGCTCATTGTTGCCCTGGTCTGGCCTGCCTGGAGTACAGCTGCCGCTGTGTGGCCCAGCCCGGCCCGGCCCGGCTCGTATCGGCCCGCCTGCTCAATTGAATCCAATGCTGGCCACGACCGACCTCCAAAGGGCAAG-CGCAGAAAACATGATTTTTGTGTAACGAGAACATTGTTCTCGCAG-TCTTCAGGCTG-GGCCACACTGCAATTGCTTCGTTGGCGATCGCC-----------ATGCTCGGTGGGCTCCAG--------CGGGTGTGCAGTGTCCGGGT---GTGCCAGGAAATACACGATTGTTACAGCCGGATCGTGCAAAAATACAGCGACGGTCTGACAGGTGGCGCCGGCGCCAATTTAAATATGAGTACAGCGAATGATTATCTTGCGGATGTTCAA-AAATCCACCTC-----------AATGTTGTTAAGAGCTTGCGAAAAAAT----TCAAAACAATCTAAGCTGAA-ACAATGGAAATAGCTCTAATAATGTGATTTGGTGCAAA------TATATATTCAAATCTATCTTCTAA---GTCAATATCCTTTGTCTCAATTGAAACAATGAAGAT-----------------AGCTCTATTTCCTTTGTATT---------------CCTTGCTTCTTAACCAACAACTTTAGCATAAATTGAATCAAGACAAATAGCTCCAATAACAAGACGGTTTT
>mirr 12682904 12684090|13392 chr3L 12681836 12683043 scaffold_0 5441658 5442944 + 54116|1105 1323
CATCCAT---------------------------------------CGGCGGCATCTCCGGATCCGGA---------ACTGGGTGCGGCC------CCAATTGCCTCGCCCATCTCCGCCTTCCG------CTCGCTGATCGCCTTCCGGGAGCAGCA------------------GAAGCTTACGCTCCTGCGGCCGTAGTCACTCCCAG-TTTCGAA
CACCCATCGCAATCGCACTCGCACTCAGCCTCAGCGTCCGTGTCGGCGTCGGCGTCCCCTGATCCGTACGCATTGCCGCCGGTGGTTGCCAATGGATCAGCCGCATCTCCGATTTCGGCATTCCGGTCCCTGTCGCTGATCGCCATACGGGAGCATCACCTGCAGCAGCAAGCACCAAAGCTGGCGCTGCTACGGCCGTAGCCAGGCACGGATTTCGGG
>mirr 12682904 12684090|13393 chr3L 12683090 12684217 scaffold_0 5442985 5444097 + 12307|0 1143
AGGCCCGGGCTTGAAAGGTATAATTACACTTTCGGACAATAATTTACAATGTGATTATTCGGTATTTTGATT-AACGCCGCTTATACCAAATAGCAAGCAAACGACAAACAAATATAACCAGCTGATAATCAGCAGCGGTTCCCCTTTGGCATGGGCCCCCAAAAACAAAAATTTGATTGAAAACACTGCAAAAAAAATAAAAAGAAATAAAGATGCAAACAATTCGACGCGAACAAAAAAAAAGTGAAACACACCCAACCCGCTGCCCCAGACGTTGTGCAATTTTGTGGAGAAGATAATCCAAAAACCATTCGAAGATACGTTAATTT--AATTACATACAACTTATGCAATCAGAGCTTATAGGATGTAAA-TTGGAAGATATATAGCAGGGCGACATCAATGA-----------ATACAATGAATACATATACATACA---------TACATACATACATGCATACCCGACCACTAACATATAACCGAGAGATGGCAGATGGCAGGTGGCAGA------TAGCAGATAGCAAGTGGCACGTGG---------------CAACTGGCAGATCCGAAACACCCACTAAATTATAGAAGCACACATCCTGGCAGCTAGGTCCACTTCT----ATCCGGTAGATTACGATTATATCATTGCTTTTTTGATC------------------------------GATTTGAGT----TCGAAAAAAC------------------------------------------------------TAGCGGTACCCCTTCAAGGTCCTGTGGCAGGACCCCCAAGAACATATCAACCCAAGTCTGCTGACCCCCCCCCCCCCACGCAATCCAATCCGATCCTTAACCTTAACCAATCCTCTTCATTTCCCAATCGAGCGAGCCCAAACACCCAAGCCAAATGTACACGAGCAATCATTGAATTAGCTG-TTATTGTTTTTATCGTCTTAAGTTACCAATTTGTTCCTGTCGTTTATAAATTTAATTTATTTTACTTCGTATGTACCATAATTTTCTACGTGTGTAATTATTTCCTAAACTAGAGATCCATGTATTGC-----TGTACTTTATGCACAAGTTGTAAGTATGTAAGCTCGCGTAATTGTAGCG
AGATCAGTTCCTGTAGCAGATCGGGCAACTTTCGGACAATAATTTAC-ATGTGATTATTCGGTATTTTGATTAAACGCCGCTTACACCAAATAGCAAGAA--------------TCATCCCGCTGGT--TCAGCAGCGGTTCC---------------------------------ATTGACACAACAGC------------------------------------------------------------CGCATCAAA----CTGTCAAGGACTTTGTGCAATTTTGTGGGAATGCAAATCCTAAATCTAATTGAAAATACATTAATTTTAAAATACATACAACTTACGCAATCAGAGCTTATAGGAAGTAAATTTGTAAGAGTTAGTGAAAAACGACCCCAATGACAACTAGCAACATACAAAAAACACACACATAAAAAACAAAAATGCAGATTAATATATGTAT-CTCGAGCACAGGAACCCAACCCA-AGCCCAAATATAGCCTGATCCACACTCTCTCTACACACACCAAGTAACCAGTTGGTGCTTCTGTTCGATTAGCTGTTAGATTAGAATCACAAAGCTGGT--TCGAACCCCGCACTCCCCATGTTATGCCAGCGCTTTGAGATCTAGCAAAGTAATTATATACATATATTTTTTTGACCTTCACATATAATTGGCTTCAGACCGGCGCTGATCTAAGCGGTATCAACAATATGTACCATATATACATATAGATATATATATGAGTATCTTACACATATTAAGTTAATTGAAGTACCATGTCATATGCTTGTATCGGGTGGACATAAAACATATCAAC----GTCACCAAGCTCCAATCCAATCCCTGGATCCAACACATACCACACCAACCGCCCGACCGCCCGACCACCCGACCGCCCTGACCCAAACCAAATATGCAAGTAAATGCGAGCAATGATTGATTTAGTTGTTTATTGTTTTTATTGTCTTAAGTTCAAACTTTGTTCCTGTCGTTTGTAAATTTAATTTATTGTA-TTTGTATGTA-----------TATGTATGTATTTATTTGATAAATTGGCAAATCACGATTTACCTACTTATACTTAGTGTACGAA-TATACATATATA------CATAAATATA---
>Ptp69D 12714945 12715515|13427 chr3L 12713642 12715215 scaffold_0 2593882 2595487 - 56016|1374 1653
GTTAGATATGTATATACTTATACGAGTACAGAATGCACGTGTTGGAACATCAATGCATCAAATGTGCTATGATAAATTATTTGTATATTTATAAAATCTTTTAATAAAGTATTTACAAG---AGCAAGCGTA-----ATTTTTTTAACGAATTACGTTTGCCCGACACATAATATACATACAAATATAAATGTAGTGTATACGTA-TCGTATTGATAAAACTACCAAAGGAAAATAAGTAACATATTTTATAAGATACAATGTAATAAAAACTGAGAATA
ATAAGATATTGATGTACTCATAGAAG--AAGTGTGGATGAGTTTACACATACACAATACATAGATATTATAATAA------TGTACATTTCAAGAAACTTCATATAGTATGTATTTAAGTGCGGCGGATGTATACACATTTTTTTACCAATTTATTTTTAACCT--------TATACATATATTTGTATGTCT-GTATGTGCGTATTTATACTGATAAAGCTACCAAAGGAAGAATATTAATTTATTTTATAAGATTATGTGTAA-AGTAATAATAAATA
>Ptp69D 12714945 12715515|13428 chr3L 12715216 12716026 scaffold_0 5501450 5502374 + 3104|0 359
AGAATTGTACTTTTTATGAGCTTGATAAGTGTGGTTTACATTCTTTTTGGTTGTGTGGATTAATGGTT-----TTCGAATTTTCTTATAATAGTTTT-------GAATATTTCACTTATCA----GTTTGTAAAAATGACTTCATTATGAA-CGTATTTAATATTACACTTTTCATT----------TTGTAAATATGGGAC-------------AAAAAATCCATAAAATTAAGTAAATGTATTTATCGTTTTTCCGTATTC--CTTTATGTGTATTGATAAATTATAAGTACTACAA------------------TTTATTTTTAATAAAATAAAAATAAGCAGATTTGAATTGTTTC
AAAACTGCCTGTCTTACAAACTAGA-----ATGAAATACACTTTCTATTTTTGTATGTATGTGTGATTGAGCGTAAGGACATACTTTCAACAATTTTCATTGCAGAAAGGTTTCCATAAGATATGACCAGTACACATGGGTTCATTATGAAACAAATTGTATATATTTCTTTTTAATAACAATCCACTTGTAAACATAAATGTTATTGAGTTCTGAGAAGTTCCAAAAAACCAC----------------TTGTTCCATAATCGAACTAGTCTGAAATTTCAAATGACAAGTTCAAAAACAAGACAGCGTCGATACTTGGAGTACCAATTGACTATAAATAAATTAATTTAACATAATTT
>CG10984 12727105 12727349|13442 chr3L 12724816 12727138 scaffold_0 5475785 5478201 + 74317|2417 2450
CTGACGCATTGAAATTAATAAATTTTTACAAGAT
AAG-TGTTTGGTTATTCAAATTTATTTGCAAAGT
>CG10984 12727105 12727349|13443 chr3L 12727139 12730069 scaffold_0 5478735 5481839 + 47601|0 271
TATAAACACAGGAATGTGTTTCTTCGAAAGATTTG--TGAACTAGAGATACTTTCAAAGCC---------CATTTTATTTAACTTAACATTTACGTGAAAAATCGATTTGTTTTTAATGTGCACTTAAGTTGTCAAAAATATTTCTTGCATAATTAACCATGTCCTGTAAATAAAGTAGGTATGAAATTTGATACATAACAA---------------------TAGATATATAA-----------AATAAT------------------CTT
TATAAAACCAATAATTT--TTCTTCAAAATCTAAGACTGAAATGCATAAATTATTTAAGTCGAGTAACATCTTTCTATTTATCAATGGACTTACCTGA----TTTATTTTTTTGTCATATTC----------TTCAAAATATTCTGCGCAAGGCTAACCATCTCCTAAAAATAAAAAAAGAATCAGGATAAA-ACAAACCAAAAATATGTTCTCAGCTTGATATAAATATGTAAGTTTTTTCTCTAATACTAAGTACCTTATTTTTGTACTT
>CG17667 12769560 12770048|13465 chr3L 12769108 12770073 scaffold_0 1800175 1801011 + 11235|460 988
GAAAACTTTCCAAAACAAACCGAAACCAAACGATCGAAGATG------AAAAGAGAATCCTATCCTTCTCCTCCAGTTTCGAGAACAAATTCCATTTTGACGGCATTTTTGATAGATTATAAATAGGTATATGTATATCACGTATGTATATGGCTAGTTAGTTAACTACTTTGACGCGGTATCTAGCCTAACTATATAGTCTCTCCTACAATGTTTCCCGCACAACAACTGAACCGAATCCGTTGTTAGATTCTAGTTGTTAGTCGGAGTAGGTTAAGCCGCCTAGTCGCTTAGCGTTC----------------TGTTCTTTAGGGGG---------ACTCGGTA-AATGGGATCCCGCACCAAAACTCCTGGCACTGT-TCTAGTTTTAGATCCCAAA----ATCAATTTTCATCGCAACACTTAAATTAATGTAAACCCATAGATACACTAGT--TGTTAGCTTTAGACTTTTGCCAA-AATACAATAAAAGTAATTATTGTACATAGTAAAAAAAAAGAAAACCA
GACG----------------------CACACACTCGCCGCTGCTCTTCAAAAATAATTCCCA-------AAAACTGTTTCGCAAACAAATT----------GACAATTTTGTTA---TGGAAATTGCAGCAT-----TTGCCAACGGATACGA-------------GACTTGAACTCTGTTTGAATTGTAGTTTTACA---------AAAGAAATTCCCG------ACTTGTAGTGGG--CATTTTTAGGTT-TAGCTCC--------ATAGTTTAAGACACCTAGTCGCATAGCCCTTGCTGTCATCATGGACATGTATTTCATGTAGTTCGCTCGCATTTCGTATTTTGGTAGCAAGAACAAAAATTATATATTCTATGGTTACGTTTAGAGCACACATCATATCGATATTTATCTTA-----TAACAAATTGTTAGCTCTTAGACATTTTCCTACTCTTAATATAGACATTTTGCCAATTACACAATAAAATTAATATTTGTAAATAGTAAATAAATTACATGAGA
>CG11006 12786777 12786989|13484 chr3L 12784686 12786997 scaffold_0 1813690 1816280 + 60776|2433 2668
AAGTAATTGACGA--ACGGAGA-------------TGGCCAGCCAAGTGTGTATTAATAAG--TTGTACATTACCTAATTTAAGCA--GAAATTATAGAATCCAAGATAA-TTACCTTAAACGCG-ATCGATTTGTAAGTCGTACAGCTACAAAGAAAACCAGCAATATTTTTTCAATTTATTAAGCTAGAAACA-CAAATACAAAAACCCTCGAGTTGT-ATTAAGTAGAAAATT
AGCGAATCGAAGCCTACAACGACACGTTGCGCCTTTAGCTATATATTCATATATTGATAAGTTTTGTATATTGCCTAAGATAACTATGTACGTCATTAGTTTTAAATTAATTTAATTTTTACGCATAAAAGTTTGTAGATAAAAC-TTTACAAAAAAAA-AAACAAAA------CAAAACAGAAAACTAAAGAAATCACACAAAATAACTACACAATTATAATTAAGTATGTAATA
>CG32108 12798466 12798597|13490 chr3L 12796640 12798807 scaffold_0 1823772 1825949 + 27676|1915 2052
AGGATTTTTTGGAAACACACTGGTAACAGAAAATCT--TCTGAACAAGCACCATCTGAGATTATAACTTATTGTTTTACCATATAA----GCTAATTAGTTTTAACACTCGTCTAGGGGCAATTAAGATAATATTCAG
--GTTTTTTTTAATAAACAC--GTTATTGAGATTTTAATTTTAATAAATA---------ATTAT-GTTAATTGCTTTTTAAGAAGATCCGGCTTATGAAGTTTGACGCTCT-----------TGAAGATTTTTTGAAT
>CG11009 12826773 12827117|13517 chr3L 12824107 12827180 scaffold_0 1851294 1854418 + 48012|3063 3417
AAGAAGCTGCATACTATATTCCCTTACGAAGAAATGCTAAATAACTAAGTAATTACTGCTCATTCCGTTGATGAAACTCTACACGAAATTATTGTTGTTTTCGGGCATTACAAATGTGCTTGGTTGGAATATTTGCTTGGAATTGTTGCTAATTAAATTCTTTCATAAGCAGCATATTCTTCATATGCTTTGATTTCTGGTCACAAAATTAGAATTTTGCTCTTT-------CGGCTTGATAAATTGTATTATTTTATATATGAACATAACATTAACCAACTTGTTGTTATATGAGAAAAACAGTACTATTTTATCCGTT-ATAATATATAAACAATTT--ATTATATAAAAGTA
AATTAGCCTGTCAAAATTT---------AAAATATATTCAACA------CAAGCACGGCTCATTCCGAT--TAGAATTACACACAA----------------GGGCACACGTAGTTTTCTACGTTCAACTATAAATTAAGGCCTGTTGCTGTTAGCATTATATCATAG--AGCTTTCTCTTAAT-TATTTTGGCCTAGCCTGCGAAAAT----ATGTTGATAATTAAAGTAACGCTTTGTTAAATTTGGCCAT--------TAGACAAGACTTCGA------TTTTATTGTATTAAAAAA--TGTCACATTTCGGCTGTTAATGCCCGCTGAAAGGTCTCAACCAAATTAAAAAC
>Ent3 12830423 12830868|13520 chr3L 12828223 12830576 scaffold_0 1859004 1861203 + 98174|2268 2439
GC--GATATTTGAATTTATTAAGACTTGGAAAGAGTCCATGCGACACATTGTACACAGCCATATCTAAC------ATTAACAAGATTCCGTTGACTTCAATTT-------CAAATCCTAAAAT--CTAAATTAAATGCTC-CAAGAAGTGGCAGAAATTTAGATTTTGAAAA
GTCGGTTGCTTG-------------TTGGACATGGCACAT--------TTGCAGATACTCAAGTCAAGCTTGTGTATCTACAAGATACAATTTAGATTAGCTCTGACTGACAAGTCCAAATATGGTGAAAGTGGAAGCGCGTTAACAGCGAGAGAGAGTTCTCATGTGAAAA
>Ent3 12830423 12830868|13521 chr3L 12830617 12830839 scaffold_0 1861246 1861476 + -1236|0 240
ATTAACTTCACTCTTTCGTC---------TTTTCATGCCCGCGAACAATAATTTT--CAATAGTTAATAGGTTTTTGGCTAGTTGGCTAGTTAAATGAGTAAAAACCAACTGAAAGTCTTAACAAAACCGTTTAAATCAAAT----CAAGTAATGCACATTTAATGATGATCAATTTTCTAGCGCTTTGATGTGGCTA---ATGAAATACGTAAAATGTCAGATTTTCCGAGTATATATAC
ATTAAGATTACCCTCTTAATTGGGCAAAATTTCCTTACGTGAGGAGGGTAATTATGCTAGCCTTTAATTGGCTAACATTTCCTTTCATATGTAAGAGGGTAATTA-----TGATAGTCTC----CAATTGGAGAAATGACATTTCGCGAGTGCTA-GCCTTTAATTGGAAAAAATGCCCTTTCCCATGAGAGAGGGTAATTATGATAGTCTTTAATTGGAAAAATTGCCTTTCTCATATGC
>Ent3 12830423 12830868|13522 chr3L 12830868 12832325 scaffold_0 1861495 1863000 + -7093|0 0
A
T
>CG10749 12947517 12947601|13629 chr3L 12946759 12947716 scaffold_42 12222 13229 - 20545|831 921
CAATGGAGATACAATT--TACATAAACATATTATTCCGATTTTGGTTTTCTTAATAAATTA----TTAGGTTATTTTGTTAAAATAGATAT
---TAGCCAGTCAATCAGTCAATCAGTCAATCAATCCCCCAATTGTTTCCATCATTAGTTATCATTTAGCCTTCATTTGTGCATTGGTTAC
>CG11267 12990681 12990854|13672 chr3L 12989877 12990808 scaffold_0 2033001 2033999 + 23417|918 1046
ATCTCGCCTCCGGACACTGTCTCACAATTCTATGAATTCTATGCTTTTTATTAGTATGTAACACACCCACAAACCCGAAACTAAAAACTACAATAAAAGCTCA-TGCAATATTTTTGTTTGCATTGCGC
AT---------GGCTACCA----ATAATTCTATGAATTC--TGTTTTCTATTAGTGCGTAACCC----------------------CCTACAATAAACGTTTAGTGCAATGTTTTTGATTGCATGACAC
>CG11267 12990681 12990854|13673 chr3L 12990809 12991074 scaffold_25 162966 163243 + -124|0 46
ATGGACCGTCATTGAATAAATTTCGAGTTACTTGT-TAAAACTAGCA
GTGGACAATAACTAAAGAAACCAAAAGGTAAATACATAAATATATAT
>CG11268 12993423 12993635|13674 chr3L 12991075 12993867 scaffold_0 2034000 2036688 + 65359|2408 2655
TGCCTCTGATCTGGGGTTCA---ATGT------CACAAGTCGCCATGGCAAACAA--AACAAA--------------------ATTCTATTTTAGGTTTAGGTATACAAGGTATACAGCAGTTCTCTTTTGTATAGCAAAAAA----AAAAGATTTACAAGCACATTGTTTTTTCCAAATAAGTTTTCTAATATTTAGCATGTTGTTTTGTATTCATAAACTAGTCAAAGCATGTTGCTGAACTGATA
CAGCC---ATATGGGGATCAAGTATGTCAGCCACACAAAT-GCAAATGTAAGCAAACAACAAATGTAGCTATAGTTTTCCCTCAGTCTCCTATACTTTTGTATGGGCAAACCATACAA-AACTCAAGTTTGTGCACACAAGAACCATAGAAAATAGTGAAGAACATTTTCTGTTATTA------TCTACACTATT---CGTATTGTTT--------TCAGCTAGGTAATATACGATTTTTAAATGTTA
>RpS12 12998585 12998741|13678 chr3L 12998146 13000605 scaffold_0 2040420 2042813 + 90206|445 612
ACA-GCTGCG----------CACTGCCTGCTGAATGAGAGACTACGTGAAAGTTCTTTTTAAGCTATTCGCTAATTGAAAATAAAACGTATTGAACCTGAATCCAGATGAAAAAATAAAAGAAAGTCGACCTTTTTACATTTTTGGAATGTTCTATTATATTGAAAAA
ACATGTTGCCGTAGCCGTTCCCCTGTCTGCTGAATGAGAGACTACCTGGCAAGTTTTT-------AATTGCTAAATAAAGAAAAAAATACCT--ACAAAAATTTTGTAAAAAACAGAGCGGAACGTCAA----------TTTTTGGAATGTTCTTTAGTGT------G
>RpS12 13010049 13010384|13692 chr3L 13008976 13011216 scaffold_8 1241884 1244194 + 50800|1219 1559
AAGGAGGAAACGAAGGAAGGCGAAGGCGGTAACCACCAGGAACACCAACAGCAACCAAAAGAACTGAGCGAGTTT-TGGGTCGGAGCAGATCGGAGCCAAGCCGAGCTGGGCTGAACTGGCTGGCTGGCTGGCTGGCTTAATTAAA--AGGAATTATTTTTTGTAGCGAAATCAATTTTGCAATGTTATTTAAT-GTTTTCCCCCCATCTCTCATTCTCCTTTAAATCCCACTCAGCTTTATAAAATTGAATTGAAATTTTGCTCGAAAAATAATCGAATCCTAATGTTAAGTCTAAATTTAAACAAAATTGATTAAATGCCTCTGTGCGTTTGT-AGTGT
ATGCATGAAA---------------GTGTTATCACACTGGTATA-CAACAGCAACCAAAAGAACTGAGCGAGTTTATAGGGTGGAGC----------------------GGCAAAA--------------------TTTACTTAAATCTGGAATTATTTTTTGTAGCAAAATCATATTTTTAATGTTATTTATTCGCTTTTCGTTTGCCTCTATTTATC--------TCTACCTATCGCTGTTTAAATGAAATAGGCTTTTGCTCGAAAAAT-----AATGCTAAAATTAAGTTTTTAATTAAAGTAATGCATTTAAATTAATTAACATTAATATCAAGGA
>RpS4 13017775 13017859|13701 chr3L 13017040 13018209 scaffold_8 1250575 1251788 + 41000|753 885
----------------------------------------GGCGCAGGAGT-TTAAGGACTTTTACCTTTTAGCATAACACTCTGTACGTT-TAGCTACGGAATTACAAGCCGA---GAACGTAACA---CAT
ACAACATGCCAGCCGGACAGCAGCAGCAGCAGCAGATTAGGGGACAAGAGTAATGAGGATTTTTACCTTTTAGCATA--ACTCTGTACGTTAGAGCTACGGAATTACAAAACAACGTAAACAAAACCATTCGT
>Syx13 13020343 13020848|13703 chr3L 13020126 13021779 scaffold_8 1253283 1255115 + 24010|227 871
TTGTTTTATTTTTACGCCCATATTCA-----------------------------ACAAACACACGCAAACATACACAACCCACACACACACACA-------CGCATAGATTTTTGTAAAACGATTTTTATAAGAAACAAAATATTCGATCGTTGAGAACTCTGTTTAATCACCAAGTGAGCAAAGACAA----CAAGAATGTAGAGGAAAAGCTAAAGCAAAAAATAAAA-ACAAATACCATATT----------------------TATAATTATACATATATA----------TCTACATATATATACATAAGTAAATAAGGATACTGAATCCCACTTAACTTGCATATAAACAAT-------ATTCAGCGCTTTTAAATGTTAA-TTATTTCTTGTTAAAAACGATTATCGCGA--GCAATCTGAGTTTTGCATTGAAATTTGTAAAATTTTTGTGTTTAGTTTCGAGA--------------AAGCGGAA-------GGCGGATTGCTGA-------AGCCGTCTGCGGCTTTAGTATTCCCTTTTGATATA---TGTTACAAGTTATATATA-------------------AGTGAGCCAGCAATCGAAAATAAAATAAAC------CGAACAAACCAA
TTGTTTTATAGATATATCTATATATATATATGCGTGTGTGTGTTTGTGTGTATATATATCTATATACATATATGCACATTACGTACATACACATAAAATAATTAACTAAAGTTTTGTAAAACTATTTTTATAAAAAATAATGCATT---------------------AATCACAAAGTGAGTAAACGCGCGCGCCAAGCGAGCAAAGACAAAAC---AGCAAAAAATTAAATACAAATACGAGTTTAAATCCGAAACGCGTTGTAGATTGTAGTTATGTGTATGAACAACAAAAATTATAAATATAAATTTAAATATATGTAAAAGAAATGGAACAGTTTAAAATAACACAATAACAATTTCAAATATTCAACGCTTTTAAATGTTAAATTATTTCCTGTTAAACAAAAT-ATCAAAACAATAATTTGCGTATTGCATTGAA---TGTACAATTTGTTTTTGTAGTTAAGCGATTAAATAATATACTACGTTGAATAAACTCGGTTGATTGCTTATCGGTCTATATGCTTAAGACATTAAAAAAACATTTATATATAATCTGATTGATTTTATACATATATTTAATTAACCAAAGCCATTTAACTCGTAGTCCGAATTTAAATAAAAGCGCGATGATTAAAAACA
>CG11279 13021400 13021470|13703 chr3L 13020126 13021779 scaffold_8 1253283 1255115 + 24010|1481 1551
CTTACTCTAGGCATAAGTACTCTGTTGATAACCAAATGACCTGCATATTGTATAGTAAAACATTTCTAAAA
TCT--------TATA----------TGAAAAACAGGTGTGTTTAATTCTTATTAGCTAAAGGATGCTTATA
>trn 13091459 13092035|13771 chr3L 13088180 13092033 scaffold_8 1332597 1336490 + 127713|3487 4102
TCCTCGA---CCTATCGACGCAGGCAGCTGAGCATCTATGCTTAGTAGTCC--GCTGCCCAACACTGTGATGCCAAAACCCCCAAGAAGCCCACTAAAACCACTCACTCCCCTCCAGACACAATTAGCGTGTAGTTAGGCGTAAGGAAAACATTGTAGTAGCTGTAATCGAAATACAACCTAGGCATTAAGTCAGAGAAAATCTTGCCTTGTACATACTTAACTTTAAAGCAC----------TCTTTCGAACCTATAGAACACTGAAGGAT---------CTCCAATTCTATCAGCACTTTGCCAACACTACTGTTTTCCTCGTCCCCCTCCGAACATAAGTTAATCGTAGTCTTTAAGATGAATTGTAAATGATATAC--GAGTTTAGATAAAGACAACAAGCACTGAGAGTCAACGTAAGCTTAATTTTAACTTATTTAATTT--ATTGTTAAATGCAAAATCGT--------ATCAGATGCAAACAACT-----ATTTATGTATTAGTTAGAACAAGAAATTTATGCAAATTTAAGCGACAAAACAAAATATCAAACGAAAACAGAAAATATACGCAATGAAAACAAAACTCATTTGAAAACTAAAAAATAC
TCCTCGGAGCATTATCGTCGCAGACAGCTGAGCATTTATGCTTAGTCGTTCGTGTCGTTGTCAACTGTGATGCCAAAATTTGTAA-AACCTCCCTGTCCCCCGTCCCCCTCCTCC--ACACAACTTGCACTTAA------AATATGAAAAAATTGTAGTAGCAGAGCACATAAGAT-ACTAAAGCGCTGAGTT------------------TACACGTGTCAGTTAAGAGAGTTAAGAATTCGTCTATCAAATTTC---AATATCGAAACATATTATTCAGCTCCAGTTATATGAA------------------ATTCTAATAGTCTTAATACG-ATATAAATTAACAAATATTTTAACGAATATCTGACAATTGTAAGCCGCAGTTTACACGTGTCTGTTA---ATTGAAAG-------------------AGTTTATTTAATTTCGAGTATGCCATGAAAAATATTTGAATTTCATTAGC--CAGATAATTGGCACGTGTACGCGCTGTTTAAAAACATAAAACTA-------------AAAAAAAAAAAAAAACAAAAAAAAAAGGAGAAAATAC-TAAGAAAAACAAAA--CAAGCAAGAACTAAGCAAAAC
>caps 13251259 13251707|13968 chr3L 13249567 13253671 scaffold_8 1532343 1536616 + 135380|1733 2227
CTAGAAGCACCACCCCCGCCTCAGCTGCGGGGTCGGGGTGGTG--------------------GTGGTGGCGCCAGCACCGCCAGCGGCGCCG-TACAGCAGCTCCAGGTGCCCAGTGCAGTGGACCAGGCCTCCAACTCCTTCGCCCAGCTCAGCCACATTCACTACATGACTAACAAT----GGCCAGCAGCAACAGGCGCAGCAACAACAATCGACCTCGAAGATGCACCACTCGCAGCAGGATATGCGTTTGCTGGCCTGCAACGGTGGGAAGCCACTGAAT---GCTACCTCGCTGCCGCGCCA-----CCGACCACCGGTG----GTGCAGGAGAGCACCTTGTCACACTATAGCCAGCCGCTTGCCAA---------CGGGATTCGTCTCACCCAGGACCACTTTAACCACAACCAGAACCAGAGCCACAATCAGCACTACGGAGGAGTCTATGCCAAGCCGTGTGATGCGATGTCTGAACCGGGATA
CTAGAAGCTCCACCCCCACCTCAGCTGCGGGGTCGGGGTGGTGCCCCCTCCAGTCATAACGGTCCAATGGCATCCACAACCTCAGGAACGCCGCTGCAGCAGCTGCAGGTGCCCAGTGCTGTTGATGCGTCGCATGCCCCCTTCGCCCAACTCAGCCACATCCACTACATGACCAACAATCCGCAGTCAGCGGCAACAACAACAGCAACAACAAC--ACCCCGC--TCTCATCACTCGCAACAGGACATGCGACTGCTGGCCAATGGCGGCGGCAAGGTACTCGGCCTAAATGCCTCCCTGCCCCGACACATGGCAGGACGTCAGTGCGGTGTGCAGGAAAGCACCCTGTCCCATTACAGTCAACCACTTGCCAATGGCCATGCCGGCATACGCCTCACCCAGGATCACTTCAATCACAA-TGGCATCGGCGGCGGAGCCGGC-----------GTCTATGCCAAACCCTGTGATGCGATGGCCGAAGCTGGATA
>CG14113 13303466 13303652|14030 chr3L 13302723 13303744 scaffold_8 3781313 3782243 - 3299|785 976
TTGCATTAAATGTTTTTAAGTTTTT---TTTTATTGATTTGCGTTCTGCCTTCTGCCCTCTAATTGTCAACGATCAAAGCGCAATTTTAATTATTCGAAAATATGTAAACAAGTTTCG--CAATAGTTGGCAATGGCTATATTAACAATTGTAATGCAAAATTAAAGATATTTTTTCTGTGCCAGCAGTAAA
T-------AATTTATTTCAATCCTTAAAACTTACCGA-----GTTATGTATTTCAGCATGCGAGGCTTAAAAATCAAAATA-AATATTAAATA----AAAATCGACAAAACGTTGTCATTTAATTATT--------CTAAATCAA----TCTAAAACTTCTTCGAAAATTTCTTTTCT-TTTTAAAGGCAA-
>Nplp2 13331045 13331175|14059 chr3L 13330703 13331326 scaffold_8 1633406 1634121 + -2099|420 600
GACGTTGTTGGATGGCCATATATCATTACATTGAAAACGAC--TCCAA------------TAAATGTTT----------------TAACTTTAACTTTAGT----------------TGTTACATACATGAAAACTAAAAAATGAAATTAAAACGTTA----ATTGTTTTTAGCACAAAAA
TGTATGGATAGA-GGTGCGATATTAAGATCTGCAAAATGGCAGTCAAATATTTAAATAATTAAATATTTATCATATGCGCACGACTAACCACATCTCGAGTCTCTCAAAGAGAATGCTTTTCAATATGAGAAGAGTTAGTTTTCAATCTATTGCTTCAACCCATTATTGATATGATATTGA
>SNCF 13353010 13353146|14091 chr3L 13352054 13353934 scaffold_8 1659661 1661540 + 20468|1079 1216
CCTGTGGAATTATAGAGGAAAAAGTCGGATTGAGCAGGCTG-TTAGGCTGGGATGGGGCATTATTATAAGTTAGTCGCTAGTGTTTAGGTTGTAATATTTTATCAAATAAAATATCACATGGAAATTGCAAAACAAAA
AGCGC-------------------TCCCGTTGGTCATGTGGTTTAGGCTAGGGCTGGGCATTAGCTTAAGTT-GCGTTTATAGTTTAGTTTGTAATATTTTATCAAATAAAATATGGCATTAACAT-----------A
>ImpL1 13357853 13357948|14093 chr3L 13356220 13359855 scaffold_8 1664600 1668217 + 48729|1742 1857
AAAGCAAT---GGCTACACAAATCTC------------ACCTAATTATAGTATTTATTTAATTTATTACAACAAATAAAATTCTAAACAACGATAAT-----CATCTATATTTGAT
ACTGTGGTCCGGGGTGAGAAAACCTCGGAGCAGGCCAAACCCAAGTCTGATAAGGATAAACTTAAATAC-----GTGGTATCTTAATCAACTAGTATCTTAACTTATTTAAGTGGT
>CG10724 13390052 13390401|14124 chr3L 13388245 13390848 scaffold_8 1629205 1631961 - 115865|1844 2334
A-TGCGCCGGCCGTGAA-------------------------------GCATATTTTTATACTTATCCAGGGA---------------------------------------------GAGCAGCCAGCAGCGCCCTG------GCTTCATTTCATTTAAGTGCAACAGTTTAC----ATTTAGATATTTATGTCTTTTTCCCCGCCCTCCCCGCACACCTCATGTCATGTCTTTAATTTTAAG-CCAAAAGTGTT----TGCTAATCA----------TCATATCATGGATATTCAACTA-----------------CTTTG--------------------CCCCACT--ATCATTTTCGTATGTGTTTTTCGAACAATTTTTATACTACTGGAACTACGAACTACGAAAGGAAACACAAAGATATGTAAAGTACGCCAGCGTACATAAATTATTGTATTATGAAATGAAATATACTAGTTTTTGCATA
ATTATGCCAATAGGAAAAGAGCAACGAGATATATATAGCGCAGCCAGCGCATATTTTTATACTTATTCAGCGAGAAAGAGGAGAGACGGATCCGTTTAAAACCCATTGAATTGCCGCCGAGCTCCTACTAATGCTTCGGAATCAGCTTCATTTCATTTAAGTGCAACAGTTTATTTAAATTTAGATATTTATAT----------------TACGCACTCATTATGCC----CCTTAACTTTAAGCCCAAAAGTGTTTTTCTGCCAATCATATTTTCTTTTTGCATGATGTGAATTGAAATATTTAAACATGAGCTATTCTTTGAAATAATTCCGTCAAACCAATCCCACTTCATTATACTTGTATGTGTTTTAAACAAATTTTTGATACTTATACAACT--GAACTAC-AGTTTAAACAT----ATGTATAAAGTGCGCCTGCGTACGTAAATTATTGTATTATGAAATGAAATAAATTAGTTTTTGCAT-
>CG10732 13420835 13420912|14161 chr3L 13417004 13420863 scaffold_8 1657776 1661584 - 105701|4117 4156
TGCTTTATA-----------ACTTTGGTGTTGGATTTATT
AGCGCCATACTAAATATAATAATATGGTGTCGGGTTCTTT
>CG32130 13456701 13457468|14193 chr3L 13454955 13459997 scaffold_0 1078834 1083680 - 155235|1875 2648
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TGATCGCAGTATATTTACAGGACGACCGTTTCGAAGCAGCTACACAAATTAACCAAAATCAAGTAAT------CGGGGGATCTAATCTATT---GTTTCAAATTTCTCGGAGGAAAGCGACAAATTT----TTAATTAAAGCATTGTTTGTGAGCATCTGA-TTAGGTGTGCTG-GTGAAGTTGCATCGAA--------------CTCTTTGCTAGTATTT---------------------GTTAAATATA-----------------------------------------CACATATTGCAACATATACATGCGTACGTAAAC-----------TAGG--ATAAGTTAATAATGATATAAATG-------ACAGTGCCTGCATA-----------TTATTGAATTGAAAATGGATATTATAGTGAAGAATGTTACAATT------GTTGAAT------------TAGCTGATAA--------------TTCAGTCTTATATCAGAGTTGATG---AATTTGTA-----AAGGATCACCAGGACAAGCAAGA----GTATGATCTCATACAAAACTACACACATGGTAATGCACTGGTTGGCAATCTGCCGA-------AGATAGGTAGCTCGAGT--------------CTTGCT-------AATTGTTAAACAAACAGGAAATATTCTAATGCAATA----------------CTTTTTGTGCTACTAATTATT---AAAATAAATGTAGATATTGTTCACACTA-----
>CG10741 13476003 13476351|14213 chr3L 13473333 13476529 scaffold_0 1101702 1104724 - 55246|3031 3381
A--GGAGGAGCAAGCGAGCAAATCACCCACCAACCCGCACACAACCCGATCCCGATCCCGATCCCAATTCCCAACAGAACTCAACACAACCCAACCCAAAAGCAACCCCTGATCCTCAACGATTCAACTCAAGAGCTGTTTTTATTATAAATATTTCAAACTACACAATTAACGTTTAAAGATCTCATGCTGATGTGAACGGAAATTCTTCAACTGCGAGTGTATTACAAGTTTCTGATATAATGATTTTATTGAATATTGATAACGGTTAGCGCGCGGATATAATTATATATATATATATATGAATATTTACATATATATGGATAAATGTGTATGACAAAGTGTATACGT
ACCGGCAGTGCAAATGTGAGGA------------------------------------------------CCAACTGAA-----------------------------------------------------AAGCTGTTCT---------TATTTAAAACTACACAATTGATTTTTAAAGATCTCATGACGATGTGA----AAATTCTTCAAATGCGAGTGTATTACAAGTTTCT--TATTATGATTTTAT----TATTGA-------------------------------------ATATGAAT------ATAGTTATGGA--------------AAAGCGTATACGT
>CG10743 13489708 13490223|14218 chr3L 13488806 13490212 scaffold_0 1118447 1119896 - 39288|906 1494
--------------------AGACGAAGTCGAAAGGAGCACA------------AATCGATTGAAAGCAAATATGTTTTTTAGTTGTAAGCCCAAAACCTGGCCAAGGATCCCCAAACTGAATGAACTGCCACCTGAACCAA--TTATGCAACCAAATCCACAA--AATTGACAATATTAGTGAGAATTTATCTTATCAAGGCCACGC---CCAAACTTCCAAACATCTTTCGAATGAATTCGAGTCAAAATTCTTTCGT--------------------------CGACCTAAGCATACCAGCAAACATTTTGGAAATTTTTATATTATC-----TGTAACTAACATTTAGGCTAATCTGGAAACGGGATGTAATGACATCTTCTAAATAAGCATATAACGATGATAACAAGAAGTATTCGCAATGGCATTGA----AACGACCTTGAGAGCGAGCATAACCCCTATAGACTTATCGC-CCATTTTGGAGTTTATCTTTTGTACTAACACATAACTGTATT------GACGGATATTTTGTAAAATACATACTACGATGCCTTTTAC---AACCAAACAATATACATT
CCGTTGCGAAAGCGGTTCACAATCGGAGTCGCGGTTAACATACTTATGCGTAATAATATAATTATTGTTAATCTAGTTTTAAGTT-CACGCCAGAAACT--------GACCCTGAAGCTGATCAACTTTACGATCTAGCCAAAGTCGGACATATAGACTTACAGCCAAGGAGCTGTATTTGCAAGAATTTACCAAGGCGA-GCAATGTGAGCCAACCATTAAGCAATTTATCGTAAAAACCAACGACCAATCAATGACGTATTAACAAGGCAGGCTGCTCAATGCACAACTACCACATACTA-CATACCTTTATGAAATTTGCACTTTTTTACTCGTATAATTAACA-TAAGACGAATTGA----------GCATTAACGTCTTCCAAAG-----------TATGAGAAACTGAAGTATTTAAAGGAGCATACATATTAACGACCTGGAAAGCAATCGAAAGTCT----GGCATATAGCACAATATCCGAGTTTA---TTTGTACTAACACTAAGTTATATGTTATTAGCCCGATATTTCA-AAAGTATATAACGCA----TTTTTACGGAAGTCAAATAATTTGAATT
>CG10743 13489708 13490223|14219 chr3L 13490219 13492522 scaffold_0 1120475 1122990 - 70554|0 4
TGGTT
TGGTT
>Tsp68C 13810306 13810310|14551 chr3L 13809266 13810336 scaffold_1 5381726 5382815 - 41566|1070 1074
TTGAA
--GGA
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TAACTTATTGGTTGTCTGAGAAAGTCATT--TCGTTAGTTTTAAGAATGT-CGAGCATAAAAATAA----AATTTTTAAAAAAATTAAA
GCTGTTG-CGCTAGTCT-----AGTTTTTAATGATTAATTGTAAACGCATGCAATTCAAAAGATAACAAGAATATTCAAAAAAATCCAA
>CG13737 13848151 13848295|14573 chr3L 13848149 13849640 scaffold_1479 661 2332 + 20045|2 160
GGAGGATTCACATTCAGTGGATGGGCAAACATG--ATGCATTACTCCCACACATAGCCCCACATAA---TATACGATACCTACTTAGGATAGTGCTTAAGTCTAGAT---------GTTAGCTTAGTTAACGTACGATAGATACAGATACAGTTGCAGA
GATATATATACATATGGTATATATACACACATGCTATGTATAACT-------ATAATCTATCACGAGTTTAAAGCTCTTTTGCATAATTTAGTGCTTAAGTTTAGTGTCTACAGTGGTAAGCTTAGGTTTCCTATATTAGCTATACA-ATAATAATAAA
>Gl 13899453 13899915|14622 chr3L 13896804 13899534 scaffold_0 7572906 7575626 - 142684|2693 2774
AAAGGATCGTGTATCGTGGCAATGGAATCGGGGTCAGGGGCAATCTGAATAGGATAGAATTTTATTTGTACTGCTAGCACAA
GTGGG-----------------TGCGACTAGTGGGCGGGGCAATATAGCTAGGCTAGGTTTCTAATTGTATGGCTAGCACAA
>Gl 13899453 13899915|14623 chr3L 13899611 13900230 scaffold_11 1648711 1649397 - -1772|0 317
TGACCTAAACAAGTTAGCTAA---ACGAAGAGCAACTGA----GAAATTATAATTCTACACTTAATTTATGTTTTTTGTATAAAGATTATAAACCTATTGTAAA-ACTAACTTTGTGTTTAACTCCAACAAAGCCTGTTTCTGATACTAAACTCAAGCGAACTAATACCGGTATTATCTATGAAGTCTATAGCAGGGGAGAACTATGTGAAAGACATAACTAAACCAGAGAAACAAATCTAATTTGCATACGTGAGAATAAATAGTATATTATATATTAAAGGTAAATATATTTTGCTG-----ATGTTGTATAACTC
TGACATACATACATGAGTTAATTTACGAAATTAAATTGATGCCAAATTCATGGTTAGATTGTTGAATTAAAT----------GAGCTTACAAATGAATTTCATATGCTAAACGCAGTTGTATTTACATATATGCCTGTTTTTAATACAAAACT-ATTCGA--TAATGGCGATATAATT-----------------GGACGAGCTATATTTATGAACTTCTTAAATTAAAAAGATAACAATGAA----------ACAAATTAATAAGGTGTTATA-GTTTGATATAGAAATATTTATCTACATATATATTAGATATATT
>CG32137 13927112 13927908|14655 chr3L 13926025 13927907 scaffold_0 7606811 7608692 - 63365|1112 2014
TTGGAGTAACCTAACGACCCGCTGGAAGGTCTACGCCACCCTTCTGTTCTTGATGTAGGACGGGA------------------ATCTATATATTTTTAATATTTATA------------------TTTATACACA-ACAAACA---ACACACACAAATCGGAGAGCCTAGGCATCATAGGTAT---TGTACTTA-----------ATTGTTATTTGTATACG---GGAAGCATTGC--CCTTCTTCTG-TTCGTAGTGAAATCTATCTAATTACGCTTTATTAATTTTAAACACTTACCGCATATTCGATATGATTATTGTACCTATTGTAATTACTGTAATGAAACCGTACTCGTACCTATGTTTAAACACAAATCGTCTCTATTCTCTCTTTATTTAGTTTATCCTTAATTGATTTTAAATTCCGATATGGACCCCACAACTAATTCGAATCGAGAGATAAATGTTTTTAAGGCATGCGGTGTTACT---TGTTGGGTCCGTTTTGGTCAAAACTGTTAACTGATAATCAAAAAAAAAAAAAAAAACAAGGAAACATATCGCACCTTTATGTTG------------GCGGCTTAAAAAGCCCCCATATCTCGGGAGAAACTGTTGCGATTCATCAAAATCAAAAATAAAA---TCAAAATCAAAATCAAAATCTGTACGTAAGCAAATATTATGTGTAAGCAAGGCATTTATGTTATAGCAA-------ATAGAAATATTCATCAGCT--------GGCAATCGGAAGGGCGCAGGATTAGTTGGAAACTGTGCAACAGACAAAACTTGCCTTAATGAACGGACAATG--------------AAATTTTAGATTGTTTAAATAACATAACTTACCAATAAACTTACGATTATACCACAACA
CTGGACAAATTTGACGACGCGCTGGAAGATCTACGCAACTCTTATATTCTTAATGTAGCCGGGCAGAGCCGCACTTTAAAATGAGCTATATATTTTTAATATTTATACACAAAAGAGAGCCTAGGCATATATACATATATACATTTATATATATATATATATATATATATATAT-ATATGTATATATATATTTATGTATGTATTCGTTGTAATTTGTATGTATTTTGAAACGATGCGACCTTCTTTGGTTTTGTAGTGAAATCTTTTTAATTACGCTTTATTAATCTTAAAGAC-----------------------ATGTATTAATTCTAAT---TGTACT---------CTCGTACCTATGTTTAAACAATA----TTTCTGTACACAAATTTTCTAAATGATTGCTA--------TAGCTTCCCCT------CCCCCCACTCCCCCACTCC-------------------------CGCTCTCTCTTTCTGTTTAGTTAATCTTG--TAATTCGCTTAAGATCTAATGCAAAATCAAAAAAAAAAAAAAGAAACATATCGCCCATATG-GTTGAGCGTCTGGCGAGTGGCTTGAAG------CCTTTTCCGGCTCAAAAACTTGTG-TTTGCGATAACTGAAATCAAAATGTTATAAACTTATCTCTATTATTGTACCTAAGATAAT-TTACCTTTAAGCAAAGCATTTATGTTAAAACAAAATATATATATATATATATATACGATATGTACAAGGCAGACAAAA-----CGGAATTGTATGCGAACTTCGCGTTGGAC--AACTTGCCTTAA-ATACGGACAATGATACGGAAAGTTTAACATTTTAGATTGTTTAACTAA-ATAACTTACCAATAAATCTA----TACAACGCAGCA
>CG32137 13927112 13927908|14656 chr3L 13927908 13927971 scaffold_7 1574936 1575009 - 1935|0 0
A
A
>CG9028 13936923 13937279|14671 chr3L 13936991 13937594 scaffold_0 7919978 7920523 - 2038|0 294
GTTATCAGTAAAATAGTCTAAATCTATTC-TTTTTGTACTTTGTGTTCAGTTCTATTTTTGTGTTTGTCATCCCAGCATAGATGCTCATCTTGCCTAGTGGTTTCAAGGCACTAGCAACTAT--GATTTTGAATTAATATTACGACAAATTGTGCAT---TTAGTTGAACGATACATAAATAGAGAACTTGGCGACTTGTAAAACAATTACGCACTCCCAGAACCGCTTACATTTATATATAGAACAAATACATCAACACGAACTTTGCCTTACGAACCATAATAATAAAACAAA
GAAAACAGAAAAGTG--CTTCGTTTATCCAATTTTGTTTTCTTTACTCGCTTTGTTATGTGCGTTACTTATTTCAA-------ACTCCCTCTCTATAAAGAATTTGTTGCCGTACTGTCCATTCGATTTAGCATTTATTTAA----------TGCATTCATTAGTTGAAAGCAACCT---------------CGACTTATGTAA-----ACGCGCCA--------------------ATATCGAATAAA-----AAACACACACTATGCCTTA--------------ACGAAAAA
>Hsc70-1 13942897 13943038|14675 chr3L 13939500 13943625 scaffold_0 1387514 1391854 + 123387|3664 3828
TGAAGTAGAAATTTACTATGGGTTCTACAGTTGATTTTAAAATGGT--------TTGAAATCCGCAGCATCTCGACTAATCT------TATTCACCTCTAAA-ATCTTTCGTAAAT--AAATTTAGAGTGTTCTGATTTC------TACATTCTACACGTGCTCG
TTGCTCAAA---TTATTGTTATTGTAGCAACTAATTTGTTAGCCCCCTCCCCCGTCAATATACCCACCCCCCGAACAAAATTATAGAGTATCCAATTAAAAGTATCTTTACCAACCGAGAACTTATGGCCTTTTGCTCTCAGTAATTAGATCTAAAAGGCATTTG
>CG9040 13953687 13953885|14690 chr3L 13953494 13954032 scaffold_29 1383864 1384372 + 21|222 422
GCAGTTCGAAAAAAGGATAAATTCCCCATAGTCACTGAAAGTTTTTACATCAAACTTTTAAGAGGACCAAGAGACATCTTGTAGAATCTACATTAGTCTGGGAATATTTCATATGTTGTTTTCTGTACAAAAAATCCA--TATAAAAATACAAAGATAAGGAGACGTTTTGTAATTTACCAAAAATATACATTATTAATCC
GAACATCAACAACAAAACAACACCGTTAAAAACAAGAAAACTTTTTAA---------TTAAAACAAACAAAAAAAATAATAAAAAATATATAC----------ATATTTTTAATGCTTACTTATGAATTTTAAAGTCATTTTTAAAATTGCAAATATATG---------------TTGATAAACATA---ATTTTATATCC
>26-29-p 13961730 13961837|14702 chr3L 13959608 13961992 scaffold_0 1410941 1413179 + 103929|2137 2255
ATTGTCCCGCTCCCGCCTACATATTTCTTATTTTGTGTACTCTTTTTATTTTTACGCCCACAGGGCGCT-------AAATATGCAATACATTTCAT----AAACTCTTTTGTAATCCAA
A-------GCCTAAGCCCTTATATTT----GATTTTGTACTTTTTATTCTGTCACGCCCCCAAAGGGCTTTAAAAGAAAAATGCAATAAACCATATGTCAATACTCTTTTGTAATCCAA
>CG17361 13963098 13963319|14705 chr3L 13963090 13963328 scaffold_12 2140169 2140444 - -380|8 275
TCCTTGGCAACGCTTGGCAAAATGTAGCCAACTAAAAT----AGTAATTAATCATCTTGTATCATCGTTTTAAAAA----TAAGTTC------GATATATTTTTAAAGTAG-----AAACAAGTTA--------------GCGACTAATAATGAAAGTA-CATATGG--AGTGTAGTTTTAAAAACAATTT-CATGTTCTCATATTGACAATAAG---ATAATAAAGA------AATGATAATCGGATCGATTCACAACAGTTTTTAA
CCTTTGACACGCCACAGAAATATT-------CTCAAATTTGGGGTAGATTGTTTTTTTATACCATTTTCTTAAAGGCCTTTTAATTCTTCTATGATATATATTTCATTCAATTCTTGAATAAGTTATAAATATTAACTCTATAATTGATTATTGAACTAACATTCGAGTAGTATATCATTAAAAATATTTTGCACGTTTTCTTTTTACTTATAAACATAAATTTAAGACTTCCTAACAATCATCCACCCCTTTTCCGACCATCTGC--
>CG9007 13983137 13983140|14715 chr3L 13975231 13985529 scaffold_0 6637805 6648571 - 236213|8602 8631
T--------------------------TAG
GTGCAAGGCCATAGGCTGAACAGCTGATGG
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TATGAGACGG---CGGCGGCGGGGGCTGA------------------------AATAGCGGCTAACGAGAGTTACTTAGCGTTTAGCACGTAAATACTAGAGTCCACCCTGCCACAAGCGAACCACCCTGAACATAAGAGCGCAGATTTAGTCGTAGCTTAGCCTCATGCAGTTTGTATAAAGTTCATCTCTACCCTGCATTCGCAACCGCAACCGCACCCGCACCCGCACATGCACCCACCCCCGCAAGCAAATCAAAAGTTGACCCTAAGCTATTGTTTAATATTTTAGTTATACATACATATATATATATATATACATATATATATGAAAGCTGAGGGATTGCTCAACTCATGGCTTTCTTGTTGAACCAAAACTATGCGCATAAGTTGAACATTTTAATTGGTAAGTGTATTTTTAGTATGTCTTACTTCCTAGTAATCAAGTATCCTAGCTATTATTGACTCATCCACTTCCATTGCCCACGCTTCCGTTTCCTTTGCCGCATATACGTATACGAATTTTACAAGAGTTTACTCCATTCAATAGCTTGACTCCTTCCCACAGACGCATTCAATTCGAATAAGTTTGCATTTAAGTAGGTTTTTGATCAATTTTATTTGTGAAAGCTTTAAATGTGCCCTACAGTTAATTA------AGCATACATATACACTCATACGTATGCAAGTATGTATGTGTGTCTCCTTTAGAATATTTAAGAACTGGTGTGAGATTTGGCAGCCTCGCTTAGAACACTTCTTTACGCAACAGTTGGCCAGAATTTCCATAGAAAATAAATTAGAAGATTCT
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TTTAAAGCTAAATGTAA-AATACAAAATAGCAGCATATAGAA--------------ATACACACAA-------------CAAAAATATTAATCATTCATATGTGTG------AAAAAGCAAACTACTTACTATATATATTAATATATATATAAATGTATTATGTAGCAATATATGTCCTCTATGTGCTAA------------------------------------------------ACTCTTAGCGTAACCCTTAATTGTATATTAATGTAATGATTTGTTAAACTAATTAATATTTAAAGCCAAACGCGTT--TTTTTTATTAAATTTTT-AATGACGTTGTAGTCATAACACTTAAGAGCTCACCCAACTGGCCCCTAAAAACATTGCAAAACTAATTAATTGTTTAAGAAAGCGATTAATT-------AACGAACTACAAATTGAAAAACTGCCATTTAAATATGTAT---------------------------------------TTGTTAGCTGCTGTTGAGCATTTGTTTTATTGCGCATTTAATTAACTACTGTACAATTT-------CTGTACTAATTTTGGTAATTAGAGTCCAA---ATATTCGAGTAGCATTTAAGTGAACAATTGAAGCGTAAGATGCAAATGCA----ATTCATTTCAATTA-CGAAAGTCGCTGTAAAATAAAAAAAAAATAAAAAACTATGAGCATAAAATATATATAAACCGAACAAACAATTATAAATGTGTAT-ACATATTTAAATAA--CAATGGCAAGAAAACAAAAACAAAAACAAAACCAATATGAACAAATAAAACTTTATTTTATTGTTAAAGACTG-AATGTGAA
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CTTGCG--AACTGCTCATTGAACAGCTTT
GTAGAAATAACATTCAATCGACTAATGCC
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AATATACTCTTGTTCACTTTGTGCACAGAGTACAACAGCTGCAGC-TCTTAAGCTTTCCAATCGGAAGTCAACAAATTATGTAAATGTATAAAAAGGGTTGCATACTTTTAGGATGCAAACGAAATCGA-AAATTTAGTTTTAGATTTTGTA
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ATACGACACTTAAATGCCGCTTAGA---------AAAATTCCCAA------ACACTGAATAAACTAAATTATTAAAT
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TTTTCTA--TTAAAACTGTCCAAATAAAAACGTCTTATTT
TTTTATAGTTTGAGAGGGTTTCAACAAAACTATTTTAATT
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TTA---------------CTCAACG----TGCG----------------AAATGCAGCCAAGATGGAGCA---------------CGGCTGCATCCCCTACACCTCTCAGTCATTCATCCGTGAAGC-AAAATGTTATTAGCAGAACTACATGCTACCCCTTATATACGAAATGCGAGTCCAAAATTTTATAAAAACTTTTGATAGTAGCAATCAAAACGCAATCAAGAAAATAGGTAATT----TTTCGAATTTTACTCTCGTCAGGAATTTTTTCAAATTTGAATTGGATGAAATCTCACTCTAAATCTAAAATTTAATTTTTGAAAACTACCAGATATTGTAA--AAATCAGAAAATGCCTGATCTAAAGCGGTTCTTTAATGAGACCCGATAGGAGAAAAAGAAATTAGTGGAGGAGAGAGAATACGTAACGAG-------CCCATTTTAGTTTAGTAAGCCCCCAAACGCCCCTGTTCCCCCACACTCTAAGTC-TAAGTGCGAAATTGTATTTTGTAAGCCAGAGAGTGAATGAATGTAGAAGTGAGTGCGTGTATGTCGCGGAGTGAATGCTTTTACCGAGTGTGAGTGCGAGCGGAGTGCCTGTTCAATGTGATCGTTTAGCAAAAATTAACTATAAACACTTTAGCCCCTAGAGACCTAAGCGAAAAACACACCTACACC-------TACATATTTAATTTGTATTATATTTATGCATACGCGCATATGT---AATGTAACCAGCAAATTGCCACAGCACACAATTTCAATTATCACCGAA----ATGAAGAGCAATAACTAATTTGTAACTGTAGTCTACTGATAAACCTAAAAACTGAAGT----CTTATTTACGTTAACATGGCCATAGAAAAGCGTCCGAGCCACGGCTTTTGTAATTTTGTATCTTTCGTAGACAGCCCTGACTTTTGCCAGCCATCAAACGCATTTCAAACTAAACTGTGT----ACACCTACATA-------TTTATATTTATTTTTGATTTTTTATCGGTTTTTATATATTGTATTAAAACAAATGGAAAAAGAAAAAATACAAAAACGTAACAAAAGAAAAGAA
TTAATTTAAAACGCTGCCCCCAACGAAAAAGCGAAGCGAGCAAGCGAACAAGTGCAGCTGAGGTGGAACATATCACGCCCCATGTCCGCTGCA-CGCCCACACCTCTCAGTCATTCATCCATGAAACAAAAATGTTATTAGA-------------ATTTCTTTTATACGAAATGCAAGTCCAAAATTTTATAAAAACTTTTGTCAA-AGCAATGAAAAAGCAATGAGAAAAAAAGAGACCCCCAGTTATGGACAACCCTTTCAAAACGCAACAAGTCAAAATCAAATCAAATCAAATC---------------AATCCGATATCTGGATAC-ATCGAATATTGGAACCGACTTCAGAATTGC--GATCTTTGGAAACTGTT-------GCCCATCACTGTATAAAGAA-------------AAGGAATACGTAACGAGTCCTCCCCCCATTTAGATGATTTAAGTCCAGTAAC-------------------CTAAGTCGTAAGTGCGAAATTCTAATCTTTAAGC----GTATGAATGCGTGTATGAGTATGT----------------TTGAATGTGTTTTTTGAGTGCCTGTGTG---TGAGTGCCTGTTCATTGTGATCGTTTAGCAAAAATTAACTATAAACATTATAGAACGTATA---CTAAGCGAAACTTATATTTGTATTATATTTATACATATTCTATATATA-AATATGTATACAAACATGCATATACGTAAAAGTTGCCAGCATATT-------TAAACCATTTAAATTAACAACAAAAAGCATTAGCAGCAATAACTAATTTCTAACTGTACTGAACTG--TAATCTAGAATCTTAGTTGACGTTTCCTCGTTTTAAAATCGATAATCAGATGCATCGAAGCCCC----------------------------AAACTCTTGAAGTAGGCTATCCAGCAAAAATATGTTATACAATATTATATTATGACGATTATATAATATAATATTATATATATAAATAAGT---------------TATAAAGCCCTTGGACGCATCTTAAAAAAAAAAA---ACAAACAAAAAAAAACAAAAGCA
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AAACATGCCTTACACTTATTTTACACTACCTGACATTGTTTTGCTTGTGCACACCAGCCTGACACACACACACACACACACACACACCAAATTTGTAGTATTTCTTTAGCTCGGACTCGAATACAAAATTTATGTACGATAAAAATTACCCACTTCTGTGTGATAAGGAATATAGTTTTATTACTTTCATTGACAAGTCCATCAAATTGGGATAACAGATGGAATACTTGCAAGAAACAATTGCAATGAAAGCAGCAAA
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--AGGGTTATAA----GCAGAATAATTCATAAATCATAGTTTAA-------
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TTGCTGCATCGCCATCGGCAGCAACA------GGATGATTACAGA-----------GGAGATCCAACCAAACATT--------GATGTTTTTCCTAAT--CTATTCATCTATATGTCTCTGTGTGT---ATATGTTTGTATATTTTTTGAGCGCTACTTTTAAAGCCTATCGTCTAAATGTGTAAATAACT-----AACCTCAAGGTATAATTAT---------------AAAGTTTAACTGT---------AACTATTTATAATTGTAAAGCACAGTT------------TACACGTGTATCAGATGCTTAAATATTTGTACAAC---ATTTATATTATTTG-----TGCTGAAACAAACTACTCATTATAATTTAAAAGTGGAAGCAACGTACATTATTTTTGCTAATATCTGTCACGTGCGAATCGAATTGTAACTAAT--ACTATATTTATACGTGCACGATTATTGTGTCGAATCGAATAT-------TGAATACTGAAGTCTACTTA----TGAATGCATTGAATTGAACAACTTGTAAAATCCATATACGTCATCAAGTTCATCAACAATTG---AACAGCCATATTTATAAAAAGAAAACCCAACCTGATCGTG-ATCTTGTGAATATGCTAGAGCGCACGACTTTCATTCTATACCCGCATTATCCATATAAGATCCAAGTGCCCCTCCAAATTCAT----GTTGTATAAGAAAAATGTTTAT----GAATAGTTGTGCTGTGT--AACTGAGCGCTCTG-----AAATCATTCTCTTTATTGAACTATGTT-TTATTTTGTTATTTACTGTGCATTTCTAAGTATTTATTT-TAAGTGTTATCCTTATCAATTGGCCACTTTCTCGAATTGAAACATTCCAGTCAATTTTGCTGCTATTTTTGTT----------------------------------GCTGAATTTTAAACACATCATTTATTATTAATACGAATCTCGAAA-------CGAATCCAGTTCTCAACGGAACAGAAATTGTCAATCAAATATATTTATTTATTGTTAAATCATTATCATTGTTAATTTATGAATTTTTCATTTTAGCTACAGTTACATGCGTATTGCAGCATCT---AAACAAAAGCCATAACAAGCGAATAAGTGTGTAATATTATTAAATAATCTTCAAAGCATATTCAACAAGAAATGCATTACGACGACCATTTTTAGCAATGTTGC-TTTTTACTGTGATTTGTTAATAATTTTTGCGTAA---------------ACACCTACAAACGAAATTAAATATAAATTAAAATGTTTGATAACATTTGCTGATCGTCGACTT-----------------AACAAGAGTCAACTTTTTATACAACAAATATGATA---ACAATAACAATTTGATAATTGTAATTATATTAAGCAACAATTGGAAGAATTGCCAAATTTATTT-TAGCGTATAAAAATTGAAGAGTAAA---------------------TATTGATACTTGGTTCCTGTTGAATAGCATATATTATTAATAATAGTGGCATATTCTAATATATATTTGGAAAATTGCTCTCTAATTGGTGCTTCAGAATCTTATTCGATTAATCGAAATTCGTTAAAGTATTTTTAAAATGATTTCATGCCCAAAAACAAACGAACAAATATTGTAGACTGCTTTGCTAAAACGTTATAGAAATCTGATGTCACATTGAATATTTCGTTTGCCTAATTTTAAATATATTATATACATATAAATACATATATATATATTTTTTATATATACATGTTCCATGTACGTACTTCTAATTCCACAATAATAATTT
>CG9384 14730963 14732971|15552 chr3L 14732684 14732958 scaffold_0 351582 351848 - 190|0 296
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AGTTTGCTTGTTTTAAACTTTGCAATTA-CAATAGACCCTAATGTTGAGACAG-----AGTTGGAATAAACCTAATGCAAACAACTAGCTAAATATATGTATATAAAGCGT----ATCCCGGACACAAGCTGCAAGAATTGTTTGTGGTCAATTTGCGTTTATCCTTAACAAGAAATCCTTTGAAAAT-TATATAAAACAGCTGAAATGCACGCTTGTTAAACCTAAATGAAGC-------------------ATGCGTGCAATTCGTGTGCTAACTTAATAAATCAAACCAAAATA
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GCAAATCG------AACCTATGCAAAAC-----TAAATTAA-----ATGTGTCGAACAAAC----------------
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GCAACTGGCGTCGTTGAGTGCGCCGGCAAACGCCACCGCCTGCTGCACGTGGCATCAACGTCTTAAATAAAGACTTTAGAGTCTTAACAGAAAACGAAAAAAAAAAAAAACGAAAAGAAAAGAAAA--------AAAAAAAAC-------
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CTGAAATGGCCACCGTGG---CGCTCTGCTGCACAACACGATGCGAGCTATCAGGACTACTGGCATCGGCGCATCTCGCAGGTATCTTCAACGGTGCTGGACAGTGACTCCGTCGATTATCAGTAGAGATTC-TCCCACGGGTATTCGGGTTGTGCAGC--CTCGCTTGCTTTTTTAACAC-AATACCAATTGGCCAGCATCCCATTGGCTTATTATATTAGATAACCCAAGAATTGATCGATGACTCTTGCTATAACAAAACTAGAACAAATTTCCGTTTCACTGGTAAATTCAAACCAAATTATTATGATATAAAAGGTAACACCCATAGATAACTATGTGTGTGCGCAGTTCCGTTGCA--------CCCAACTTGGCTTCCATTCCCCAA-----TCTTCCGTT--AATGTTGTGTTCCGCATTTGTCCTCCGTTTATACTATATATATATATATGTTTTATTTTATGGATATTAAGTTGGTAACTAGAACAGACT-TAAATGCCACTGGTGGATACTGTAACTATA---CTATACAATATGAATGCATTCACGAATCTAAAGCTCTTATACAGACTTCCTACATATCATCTTCCAAATGCGCTCTCATTGAAGTCCCATATTTTTCAAGAATCGCGGTAA---TAGACAGGAACCTTAACACA---------CCCACACGA------CACATAAATATTGAAAACTAAGTGCACTT-AAACATATATTGAATATAATGAAGCATTACTTATAAAAAATTATATTCAATATATATTGTTAATGCAATTTTTAATGTAAGCGTTGAAAAAAAAATAAACCGTTTTAA
>CG13466 14907438 14908165|15731 chr3L 14908163 14908946 scaffold_20 991947 992742 - -2790|0 2
ACG
TCA
>Tom 14935163 14935576|15759 chr3L 14934441 14935591 scaffold_0 6793081 6794127 + 32851|730 1151
ACATCGCCAGGATGCACAGTTCCACTTCTCGATGCACCGGGAAAAACTCCAATTGGCAGCTTTAAGTGCAAGTGTCTCCGTCCATTGGTC--GTCGGATGGATGCGGGTTCAGCTTCGCATGTTCGTAATCTCAGGGTGATATTAGGCATAGATTGGATTCTTTGGGCTCGCGTCCCAAGGGAAACACAACTCTAATTGATATTCAATTATCACAATCAAGCGTTACTATCGTTAACTCATTGTGATTT----ATCGTGTCTTATTAGCCTTAAGTTAGTCTTAGCCGAATCATTGTCTTCCATGTTTGTTTGTTAGGGTCTTCGTATAAGAATTAGGCTAAGAATCATTGTCTTCCATGTAAAACTTTAGCTATAAACACTAATATCATATAAGAAATAAATAAATCGAA--AAAAGGAAA
CCA--------------------GCTCGCCGATCCGTCAACATTGA-------TGTCAGCTTTAAGGCCAAGTGTCACT-TGCTCCAGTCAAGTGTGGGGCATAGTGATTCA-CTTGGCACGACCGCAATCTCAGGGTGATATTA-GCATAGATTG-------TGTGCTTGTG------------CACAA-------------TCATTTAACACAA-CTAGCA----CATTTGTAAATTATTGTGATTTTATGATAGGGTATCTTTAGTTTTTA--------TACGAAAATCATTGTCTTCCATGTTTGTTTGTTAGG---------TAACTTTTAGGCTAAGAATCATTGTCTTCCATGTAAAATATTTAATTTAAGC----------------AAATAAATAATTAGAGCTAGAAGAAAA
>Brd 14938244 14938460|15761 chr3L 14938277 14938384 scaffold_44 142988 143097 - 1955|0 115
ACTTTCCAATCAG--CTTTAAAGACTCCAACGGATTCGGTCTCTAAACATCATCCGCAACAGCTTTAACTC-----TCCACACTGTGCAAGTGGAGATTTTAAAA-TGAAATGCAC
ATTTTTCAAATAGATCTTTGAA------AATGAATTTGAGCGCGAAACGTCACCCACCAAATCTTTAACCCAAATTTCCACCAAGGAGGAATGGATACTAAAAAAGTGAGAGACAC
>CG5114 14949684 14949751|15765 chr3L 14945482 14950718 scaffold_0 6803569 6809011 + 46502|4592 4659
TTAGGTTTTAAAGTTTTGTACTGTGCTATATATATGTAAATAGTAAATACATATTAAAATTTATCTCA
ATA--TTGTTAAGGGTACAAATACGATGCTTAT---TAAATTTACAATAACTTTAAAGATGTATTTTA
>mnd 14956476 14956929|15771 chr3L 14955101 14957138 scaffold_0 6813891 6815927 + 68551|1376 1876
GACTGCAGGACTCTACGACTTTGGGAAGAGAGGGCCTTTTGTGGATGTATCGATCAACGCAACTATAGAAGGGAATATCTTGTA---GTTAGGATAAGTCTCAATTTACCCCTAAGATAGGTTAGCAACGCGAAATTTTGAAAAC-------------------CTACGCACAACATTACAAAAGTGTTATTGTAAA---------TAACTCAAATGCATTCTGGTAGGGAAGTCCCTGCTTCAATTAATATTATTTGTTAGTCGTACTTTTAATGTATATTTCAAACCCAAAAAAAATGAGTTCCTCGTCGAAAGCAGAAGTACGCCTGTTATAC-AAAATGCGAACCAATTTTTACATATTA---TACAAGTAATTAGGAGCTTATTCAGTAAGTAATAATTATTATTGATGCAACTTTTTGCGAAATGTAAAAAATCGAATT-TGTTTTGTATAAGAAAGTTAAT--------AATAAACACAT---TAAACTTTAAT
GTTTGAATAACTC-------ATGGCAAGCAGTGCCTTCTTGTAGGAAT-----------CAATTATTCAGTAGTTCGCATGATAAGCATTTGGGTAAGATTATTTCTGCCCTTACTTTTATAGCGCACAGCGGGCTTTTCCAAACACCAATTTTGTTAGTGTATATATTTACAAAATTCTGAAAGTCTTTGAATAAAGCAGGCTGCTGAATCAATAGCATT------AGTATATCTATATTATATGTAATATTATGTAT--------------ATTTATATATCAGTTCCTCAGCATCTAAGCACAATATCCAATAGACAAACACAAATCCAATACAAAAATGCATTACAATTTTCAGATATTATTTTACATAAAATAAGTA------CAAATAAGTA-----TATTATTGATAAAATTTTGTAC----TTGCGTAAATCGAATTATTTTTTATAGAATTAAATAAAGTATGCTAAAAAAAACACACGAAGAAGATTTAAT
>Prosbeta2 14966481 14966580|15780 chr3L 14965901 14971003 scaffold_0 6826492 6831214 + 122890|580 684
AGCGATTCCCCTTTCTACCCTTTTCGTACATTTA--TTATAATAAAGCTTCGGCAGGATCTATA---TGGAGTGGTTCAATAAAGGAAGCCATGCTTCATCTTAA
GGC-ATGCGGCT--------------TAGGTTTAAGTGATAACAAACAT------GGAATTATGGTTTGATGCGGTTCAATGAACAATAAAGCACTTCATATAAA
>CG32148 14989139 14989383|15799 chr3L 14988907 14989157 scaffold_0 1134082 1134336 - 2053|254 272
GATGAATTCGTAAAAATTG
AAT--ATTGGAAAGAATCG
>CG13463 15020717 15020830|15830 chr3L 15019923 15020909 scaffold_8 5112214 5113205 - -1315|874 1010
GCACTG------AGCCTTATTGA--AAGTTTTCATAAA-----AAACCAC----------TCCACTACATGTTACATTATTTTCATTTCATATTTTTGGGATCAGTCATTTATAAAAATAAACAGTTTATTAAAAAA
GCAATTCCTAACAGTCCATATGATTCAATTTTTATAAATTCATAAGCCCCTTGTTTTTGATTTGCTTACAGTTTTGTTGTAGTTATTTCTAAATATTTGTAC--GGAATTTGTTTAAATGCAAATATTATTGCAAAC
>Aats-gly 15062819 15062949|15854 chr3L 15059313 15063276 scaffold_0 1187404 1191273 - 124052|3565 3777
CTG-------------------------------------GTTGATCAAGGAGTTTCTTTCGCTTGGCACGC----ATTTACAGAGTTTCAAAGTTTTCTTATT-------------TTTGTATAAATAAAA-----TTCAATAATTCAA------------------TAATTTCTTATAAAATT-----CAATAAATATGCAACATTTAATG
TTTCGATTTTCTGTTCTACATTTTTTTATACGCGGTGTGCATGGATCAAAGCTCTGACTTCGT---GCATACGGATACCTAAATGCATTTAAAATGCTCTTTTTGCAGACGCTTTAATTTGAATAATAATAAATGCTTTCGCTAATTCAAGTAAATTAAAAACGCAATTAGTTTTGAATAAAAGGAAGAAAAAAAAATACCAAAAATTCAA--
>CG6854 15075789 15075996|15875 chr3L 15074586 15077947 scaffold_0 1202466 1205851 - 140447|1266 1496
TGGAACAGCTCAGAATGCCTAGATTAAGCTCAAGACTGTACATACGCCCACTAGCCTAGATCGTAAGCATTATACTTAGTTCGTG----TCCATGCCATGCTATTTGATTGATTTCTAGTTGAGCGCCACT-----------------CCAAGGAAAGCTGGGAGTGCGCCATTTACGCCTAAGCACAAATACCCTGGAAATAAAAATGT--AACATTAAAATGATTTTCA
TTGCCCGTTCCCAATTTCC---ATGAATATAAAGACTGTAAATAAGCATCC----CTAGTTTGTAAGGATTAAATCTAATCCATAGTTATCTATGCCATGCGACTTTATCCATTTCTAGTTGAGCGTTGCCACCGGCCCGCCCAACCACCAACGGGCTCTGGT-GCGCGCCATTTA-GCCTAAGCTCAAAGATC-TGCAAATAAAAACCGTAAACGTTCAA----TTTCGC
>CG6854 15077957 15078238|15876 chr3L 15077980 15078306 scaffold_0 1205900 1206226 - 788|0 283
CTAAAGTGTTTAACATCCGATTATCAGACGTACTTTTGTTATCGCAAAACCCCAAAAGTTTGGGATAACTTAAGTATTAC-------------------TGGGTGGGTATAATACGGTATTT------GCGAATTGAAAATTTTGACCTTTTATGAAAGAGGCATTAATAATAAGAAACCCTTTATAATTTCTCCTAAGCTTAAGTAAACTACGATGTTACTTTCCGTACATTTTTAATTTATATGAAAATCTTAATTCATATATATTTTTTGGATGCGAAAA-
TTAAAAGGTATAATATATGATTTTTCGATATAATAACGATAGTTCGTTA---CGATAGTTCGGTAGTACTTGATTCTGACCTCGCTTTAAATCCGAAGGTGTGCGAAAGAAAAAAAACATTTATTCAAATGAATTCATAGTTTTTTCACAAAATCAAAAAGATTTTGATACTTGAAACCAATGTAAAGTTT----TAAGATTATGGGAAC-----------------GGCATGCCAAATAGCTGTGAAA---------TATATATTTTTTTTTCATTAAGAAAG
>CG13458 15081563 15081632|15878 chr3L 15080045 15082362 scaffold_0 1207376 1209645 - 54919|1589 1682
TCGCAGTC----CACACCTTAGTTTTT--TTTTAATAAAAAGACAAATATCGAACAATTCTG------------------ATTTGGACAAGGTC
GCTAAGCTGTAACACCTGTTGATTTCCCATCCCAGTAAACGGTCAAG---CGATCGATTCTGGAAGTTAAGTGCCTTGCAGGGTGGACCAAGAT
>CG17081 15093166 15093284|15890 chr3L 15091469 15093283 scaffold_0 1216087 1217850 - 39602|1820 1945
TTGATAGTA--TACTTATGCATACGCTTCTTGTTTATTATGTTA------ACTCAAATTTATTGTTTGGCTGGGTTATCGAAATTGTAAAAATATAAGATTGTCAAAAATAAATAAAGATTTAATG
AACAAGCCAAGTGATGAAGTCTAAGATTATTTTTAATTTAATTGTATTATACTCAAATACGTTTCACATTTGGGCATTAGGACT--TAAAGCTATTTAAATATCTAATCTAATCTAATTTGTATTG
>CG6859 15111199 15111308|15904 chr3L 15109851 15111444 scaffold_0 3454316 3455960 - 56083|1399 1523
AGGATCAACAAAACTTGGATTATGCATCCGTGCATAGGCTAGGCT-AAGACAATTG----GAAAATTATAGTTTATATACTTGTATATTTTTAATAAG------ATCTGTATTCTCA----GAAG
GCTATAGCCACAA--TAGATT---------TAAATAGTCTAAGCTAAAGACAATTGCAACTAAGATTATATTATAGA----TGTCTATTTTTAAAGAGGAACATATTTGAACTTTAAAGGGAAAA
>FucTA 15118404 15119656|15911 chr3L 15117845 15118742 scaffold_0 3461594 3462531 - 31623|561 968
GTTCAGGTTTTAGATGCGATCCAGATCGTGGGCATGGGCAATGT-------------GTAGATCAAATG-GCATTATCATTCATCAGTGAGTCATTCGCTTCTGAATTTGTTGTTTC-GTAGGTAT--------------------------------CACCATCTCCACTTTC--ACTATCACTAT------CCTTTCACTTTCACTATACACCGGATGGGT-CCCGGAAATACAATCGTGCA-ATAGTAAGTCT---TAAATCGAAATCGAGTCAAGTAT------AAAGTTTGAGAAATTAATAATTGCCAAATAT---TATATTATTTGAATGATTTTCTGACACCTATCTATTCTATAAAGTACTTAATAGAATTATTTAAAAACTTCCCATGTTACTAGCCC
AATGGGGTCATCG------TCCAGATAGTGGACGGCGCCGGTGTCATTACATAATCAAAAAATCCAATACGTGTCGCTATATATATTTAAGT-ATATATTGTTG---TTGTTGTTTTTGTAGGTATGTTTTAACGAAGAACCGGGTCAGAACCGCGAGCAACGTACTTGTTTTCTAGCTAGAACTAAGTGCAACTAATCGCTTCAAATACAAAT-GCATGTATGCATATAGATATATGCGTGCATGTATTAAGCATGAGCAAATCGAAAATCAAACGAGCATGGGGCAAAAGCCTCGG----TATAAATCGAGGAATATAAACATGTTCCTTCCAGGATT----GATACA-ACCGCTTACGGACAGT--TCAATACAATGAGAGAAAAAAGCGCATAGAAACTAGCCT
>FucTA 15118404 15119656|15912 chr3L 15118914 15119337 scaffold_0 3462539 3462953 - 2954|0 457
GACTAAAGGATTCCCGTGCCGACCATTGTAACATATACAATACCAGATGCATAAGAGAACGTAGAAACCTAGTCTAGATATATATGGATATACAAGTGCTATG-----TATACATAGTTCGGTAATTTATATAGTTGTTTAAACTAAAAGC--AAGTCCAAAATAGACCGTA---ATGATTAAATGACAGGCAAGTTAAAGTAGTTCAACATTAAAAGGCTTAACTCAAATGAGAGGAG------GCAT-----CAGCTATATA-GATTAGATCT-----TTTGTAAGTGTTTTTGTAAGCAACCAGCAAAC-ACAATGGCTCGACCTGAAATAAGTTGCCTGTTATTAGAGCGCACTTTCTTTTCCAGGTTTAATTTTCTGTATTAGGCTCTATCTAGACCGGCTTTTAGTTGAAATATTAGCTGTTGAGAGCTACTTGTA------AAGGTTTCCC
GACTAAAGA--TCCCGAGCAGATCATTGTAACATATACAATACCAAATAAATAAGAGAAATTAG---CCTAGT---------------TATACAAATGATACGGTACTTATGTGTATTTCAGTTGTTCAAAGAGCAAGTCCAATTTAGCGCCTAGGCCAAAGACGAAACGGACACACAAATATATGTTCAGTAGCGGAATATATATATATACACATATATATATATGAAGTAAGCTGAGCATAGAGCATACATACATATATATACGACTACATATATATAATTATAAATCGTTTTGTAAGCATTTTGTAAGCAACAAAGTCAAGATATT-TTTAATTTGCAGGCTTATAGAT----------------AGTTTCGATTTAGACCTTAGTTCCAA--TAGCTTCGCTTTTAGTTGGATCAATAGTTGT----AGTTAATAATATCGCACAAAGTCGCGC
>FucTA 15118404 15119656|15913 chr3L 15119338 15123881 scaffold_0 3463186 3467676 - 177551|0 340
AGCCTG----TTGACTAACTACTAACTTTATAACCGATTCGCACAAGCCTACATATGTATATCTGATATAAATACAAATACAATCTGCA----TTCCTATTTTTCATGAAATATCA--------TATGGCGTATTATCTTAGTT-CGAAC----AGCGCAATGTGTGTGTTTTTTACAATTTTTATCAATATTTGTATTTATTGTGTAACATTTTATTTATAAGTATTGAATAATATCATATGTGTGTGTATTTTGATTGTGAACTTGTTTTAATTTTAATTTTTACTGTGATACAAAAAAAAATAATAATTATAATAAACAAGAATTAAACGG-TGGCAA
AGTCTGCAGCTTGGCT--CTCTTAGTTTTCT------TTCGCA-------ATATTATTGTATTTAGTATG--TACTTAATCAACGTGTAACTCTTCTCATTGTTTACGT--TTTCAGTCCTGTGTATAACTGTTAATTTTAGTTGTGAACTTGAATTGAACTGTGTGT---TTTTACAATTCTTGGCAATATTT------ATTCGATAATGTTTAATTTGTAAGCATTTAATAATATCATATGTGT----ATTTTGATTGTGAATTCAATTAATTTTTAATTTTTACTGTGATAATGAAAGATGAAATAA--ACAATGGCAACAAATACAACAAATGGCAA
>CG6876 15126112 15126397|15915 chr3L 15124387 15126738 scaffold_0 3467779 3470092 - 115119|1743 2069
GAGAACAGCTCTATCCTTATTTTCTATAAAATTAAGCACTTTTATTTGGAGATTTGTCG---------AATGTATATTGA------------GTTAGGCGTAGTAAAGCTGCATAAGAGATTCGAATTG--------------TTGTTAGCTGAGCTTGCCGACTTCCAGTTTCCGTTGAATGGCCTCCCACGAGTTGTTCAGCAGCACGGCGAGAATGCCGGCCACCGTGAACACGCCTCCGATGATGGAACAGCAATTCGTGGCGAAGTGGCCAAATGAGCTGGGAATACACAACACAACCAATAA--AACTTGTAAAA----TT
AGGCACCGCGA-------ACTGCTTATAAAATTAAGCATTTTTATTTAGCGATTTGTCGGCATTGTGAGATATTCGATGAGCTTCGGAATTTGTTAGGCCTAATAAAGCTGGA-GAGATTCTCGAAATAGTCCACATATTGGTTCGCTAACTGAGTTTGCCAACTTCCAGTTTACGTTGAAGGGCCTCCCACGAGTTGTTTAGGAGCACCGCCAAAATGCCCGCCACGGTGAAGACGCCGCCAACAATCGAGCAGCAGTTGGTGGCAAAGTGACCAAAGGAGCT-GCAGGACATATTATATATGATTACCGACTTCTTGAAACCTTT
>CG6878 15127625 15127730|15916 chr3L 15127258 15128886 scaffold_0 3470394 3472020 - 60324|373 535
-----------TCCTGCTGGCATTT-----GACTAGAGTTACTAAACAACCACAACCTTAAGCCCTA--------------CTCCAATCTTGTTTAAA---------------------TTACGCTA------AGTTATTGCAATAGAGATGTTACAGAATTA
GAGCTACCTGACCCGGATTGCATTTTGATTGATAATAATTACACTTCTCCCGTATCCCCAAACCCTCAACATAAGCTAAGTTTTTAAGTTATCTTAAAATGAATGAATGCTTTAAAAATTTACGCTATGTATAAGTTATTGCAATAGAAGAGTTGTTAAGC--
>CG6888 15173776 15173851|15972 chr3L 15173128 15173826 scaffold_8 3664661 3665350 - 21867|659 709
GTGCTTAATACAATAGGCTTTATACTAAAGTGTATGGTAGCCATTAAATAA
A--------AATATACATTTTATAGTATGATAAAGGAGTGC----AAGTAG
>CG6888 15173776 15173851|15973 chr3L 15173827 15174167 scaffold_0 3509169 3509503 - 2669|0 24
AAGATACTTATGAACATTCAAACAA
AAGAAACTTAGGAAGTCTTACTTGA
>Tollo 15205421 15208091|16009 chr3L 15200116 15205744 scaffold_0 3533135 3538830 - 234165|5598 5921
GTGGGGTTAGCTTTAAGCAGAGGGTTAAAGGCAAGGTTAAGTTGGAAGCTGGAGAGGATTAGGAGAATCAGTATTTATATGATTAGCTGTTTTCTGAAAGAATGATTTTAGTTCACGCGTTTCCATTTTATTCTTAATGAAAAGCTTTTATTTTTCAAGTTCCTTACGCTTCAAGATGGTAAAGAATATTTGTTTATATGATAAAGTCAAAACGCATCATAAGAACCGTTTAAAGTCCAGACCACGATCTTGTTCAGTTATGAAAAGTGATCTGGAATAGCTGCTGGCCGAAAAAAGAAGTACCCTCGCTGAAAACAAGTTTAA
GTGAGAGAGAAAGGGGGCATACGAGCGAAAGAGAGCGAGA---GAGATATGAAGAGGGAGAGACAAACTAAT----------TTCGTTATTTAATTAAA-----CTTTAAGCTAAAG---------------CTTAAGGAAAA----TTAATCTAAAA-----TCAAACAAAAATAAGGCAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGACAGCATTA---------TTAAGAGTTCGGTTCAC-ATTTGGTTCGGTTC--AGAGCTAGTTCAAAACAAGTTCGAGCTACAAAATCAAA------AGTTAAAAGAAAGTCAAA
>Tollo 15205421 15208091|16010 chr3L 15205758 15206071 scaffold_0 3539064 3539448 - 12377|0 390
CAAAATAAAGAACAAGGGGGAATTGCATTCAATATGCAAATGCGA-GCGTTTAGCGATAAAAGCCTAGTTACATGTTGAAATAGCAAAAGTAAAAGAAAAATCGAATGGGGAAA----------GAACAGGCAGCACCAGGAACAATAACAACAG-----------------CAAAAGAAAAA----------------------------------------CAGTAAAATAGCTGGC---------GAGCCAGGCAATTGTTGTTTGTTGGCCCTGTTCTGTTTTCTTACGGCCAGCTATTTTCAGTTTCCTGGCTCGCAGCTAGATTCTGAAAATTGATGTTGCATGCAACACAGCAACAGCAACGAACGAATGAGAACTACACGGGG
CGAAATGAAATGAGAGTCACAGTAAGAGCCAATATGCAAATGAAAAGCGTTTAGCGATAAAAGCCTAGTTACATGTTAAAATAGCAACAACACAAACAACAACAACAACAACAATTGCAGCTGGGGGCAGGCAACAGCAAGAACAACAACAGTAAAATACCAAATAGTTGGCCAAAAGAAAAAGGAAGAGAGAAAGAGGGGTAGAGGTAGGAGGCCCGAGCGGCAACTAAATGCCCGGCAACGGGGGAGAACGAGCCAATTGTTGTT----GGCCCTGTTCTGTTTTCTTACGGCAAGCTATTTTCAGTTTCCTGGCTCGTAGCAAGATTCAGAAAATTGATGTTGCATGCAACACACCAACAGCAA-GAGCAACTGC-AACCAGTCGGGG
>Tollo 15205421 15208091|16011 chr3L 15206091 15206328 scaffold_34 1040115 1040358 - -1384|0 255
AAAGGCCTAATTGATAT--ATTTTTATTAAAATTAAACGTGAAGTTTAGAAAGATAAAAAAGCCGAAAGATACAGCCCAATATATTTATGGCTAACAATAATACTTTTAG----AATATACAAAAGCGTATCTAGAGAATTTGACAGTACTGTCATTCAGAATTGATATATTTTTTTCTTTAATGTTT----AATTTTGAGATT--TTTATCAGTGAAGATCCTATTTATTTTCTGTGTAGATCAAAC------AC
AAAAAGATAGCTTATATCGATATTTATCAATATCCCA---AACATTTATCGATATCCCGAA---AAAGGGAGCAGTTTATTTTATTTTGAAATAAACTTGAGCTTTTTCTGCTCAAGATTTAAA---GTCTCTTG---CTCTTAGAGTTCTGTGCTCAAGATTTAAAGTCTCTAGCTCTTAGAGTTTTTAAGATTAATGAGATTGCCTCACTTATACAAAAGGCCTTCGATTCATATATAAAACAAACTGAAGTTC
>Tollo 15205421 15208091|16012 chr3L 15206329 15206749 scaffold_0 3539462 3539783 - 7362|0 433
CAACCAGTCAGTCAGCAACAAAAG-----GCAGCAGC--AGGCCCAAAAGTATTTCTCTTGGCTTTATTTTTTCGTTCCTCCTTA------TTCTCCTTTATTTTGTCGTTTTCCTGCATTTTTTGTTGTTTTCTTATGTTTTCCTCGTTTTCCCCGTTTGCAACGCTCACTCGTTAGTTCATCTTAACTGCTGCATTTTGCTATAACAAGCTCGACGTGTGTAGAAGATACACCCGTGTATCTGTATCTGCAGCAGCTGTAGTTGAATCCGCATACGAATTCGTATCTGTATCTGTGCATCTGTGGCTGTAAATGTGACTGCGCGGGTTGGGAAAAATAGGCAAAGGCAACGCAAAACATCACAGAGCTCATGTCTGGCCAAAAGGAAAATGGTAACAAAAAGCAAACCTTAGACGTTAGACGGTATACGTTA
CAGCCGGACGGGCAGGCGCAGACGTTGTAGACGCAGCCAAGGCCCAAAACAATTTTTGTTTTCCTTTTGTTATTTTCTCTCTGTACCAACATTTTCTGTTTTTTTTTTTTTTTCTTGCTTTGTTCGTA--TTTCGTATGTTGT----------------TGCAACGTTCACTCGTTAGTTCATCTTAACTGCTGCATTTTACAGTAACAAGCTCTGCGTGTG------------------------------------------------------------------------TGTGCGTGTGTGTGTG----------TGTGTGGGGCATAGAAAAT------AGGCAACGCGAAACGTCAGAGAGCTCATGTCTAGGCAAAAAAAA------AACAAAAAGGGAAGAGAAGAAACTGAAAAGAAATTGTTA
>Tollo 15205421 15208091|16013 chr3L 15207305 15207790 scaffold_0 3540677 3541370 - 5370|0 702
AAACCCGACAAGGCCAGAAAAGGAGGAACATGA---GAACAGAGCCG--------TACAGATTAGTTTGGTCTTGGCGATTAACATCTACCAGCTTGTG---TGCTTCGCCCCCTCGACTTCCACCCATATCT----------CAGAAAAT---------------------CTCCAGCTC---------CACTGACTTGCCAATTTAAAAAT------------GCATTCCAAAAGCGAGAAACCAGAAAACTAGTTAAC--------AAATCCAGCACACTCTCTTTAGA-AGGATTCACTTGGTTT------------------------AGACTGTAAAGAGTTAAATGTATATAAG-------------TTAAATGTTAA-TTGTACGTTTATTTGTTTAATCATTGTGATATTTTGTTTTATCAATAAGTCCTAATTTAT---------TAAGATGCG--------------------------------------TACCATTTTCCTACCATCCTATGTTT--------------------AGTCGTAA--TCTTATCCTCATTAGTTAGTCTAGCTGTTAAGTTAATCAATT-GAATCCAAACCTACA----------------------------------ATCCCCGCCTACCAGATACAGCCATATTAACTCTATGAAAATGATAAAATTAT
AGAACTGCAAAGAACAGAACAGAAAAGAACTGAACCGAACCGAACCGAACATTGCTACAGATTAGTTGGCT----GCGATTAAAATCTACCTTGTTGTTGTTTGTTACGCCTGTTTGTCTTTTCTCTCTCTCTTTTTCTTGCTCACACAGTGCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTATCTCTCACACTCTCAGATAGCTGCCAAGATAGAAATATCCAACTAAATGCATTCCAAAAGCAGGAAACTAGTTAACTGTTAGACGTTTACATAAGTTCGTTGCGTTTCGTTTCGTTCCGTTCCATTTCGTTTCGTTTCGTTTCGTATTGTGTGTAAAATTTGTAAATAAATTGATATAGTTAAGAGGAGCCCCCCGCTTAAATGTTAAATTGTACGTTTATTTGTTTAATAATTGTGATATTTTGTT----CAGTTAAGCTTAAATTATGTATGAAAATAAAACACAACACAACACAACACAAGAGAAGAAACAACAACTATTAATATTATGTTATTTCTATGCTATATTTGTCCTATCAATAATTATTTAAATTGTAAACTCTTCTCCTCATAAGTTATGTTAGTCGATAAGTTAATTAGCCCGAATCCGAACACATATCGAACACACATACACACGCACACACGCACACAAACATACACACACCTTTTACAGCCATATTAACTCTAT-AAAATGTCACACATGT
>Tollo 15205421 15208091|16014 chr3L 15207850 15208641 scaffold_0 3541417 3542184 - 4558|0 254
GAATTATGCAACACGAATCAAACAAATTGAGAACATAAATCGACTGATTACATGTGTACTATATATAAATATTC-------ATAAAATTTAATTATGATTTACTCGCCGT-----TTGTTGTAAATATTGTAACTACCCGCACACCTATGAATATGTATTGTATTTTGTAACTTTATGTTTTCTAGTTTATAGCGAAAAAGCGAAGAGTA-AAAACGAATCACAAAAATATATAAATGGCAAAAAATTGATAATC
GAACTAT---------ATTAATATAATAAAAAGCATAAATCGACTGATTACATCTAGA-TATGTACATGTATCTGTTAGCTATAACCCTTGATTATGATGTACGCAATGTGCTTGTCGTTGTAAATATTGTAT-------------------------TTGTATTT-GTAATTTTATGTTTTCTAGTTTATAGCCAAAAAGCGAAAAATATATAACGAAAC---AAAACTGATAATCGAAAAGAAAAGAAAAA--
>Toll-6 15307029 15307470|16141 chr3L 15302328 15307963 scaffold_0 3629390 3635229 - 254349|4818 5335
CGGGGTTAAATCTAGAGG---TTAAGCAGAGAGAGATAGAAAAAAAAAAAACAGCAGGAGACAAACT-GCGCAACCAGTG----------AATTTA---------TAAAGATTAAACGAAAACT----------CTAAACTAAACAAAAACTATGAAGTTAAAAAAGATGTGAAGAGTGGCAGGCAGTTAGCATACTTTTTGGGATGGTTCACACAGACTGATACTTTTAGTTCTTT-AAATAAATTAAAATTTATTACCCTGTAAATAGAGCCAGAGGAGAAAACGA--AATACTATACC------------------------------TTAAAATGGGATTTCAATAATTAAACAACCAT-TGTAAAAAAGACACAAACGGTTTTTATGTAAGGGCCTGTACATATTTATATATATTATAGAAATCTTTAATTTATT--TAATATTTCATAG-------CTATCACAAATATAAGAAAAACCATGTTGAACAAAAATAAATGTATGAGAAACAAA
CCAAGCCAAAGGGCGGGGGGCGTGACCAGTACGAACAACCAGTGAATTTATAAGCA--AGGCAAACTAACTAAACTAATGCTAAAACTAAAACTTACACTTACACTAAAACTAAAATTAAAACTAACATTAAAACTAAACTAAACTTAAATTA--AAGTCAAGAGCGAAGAGAAGGAAAGCA------TAGCATACATTTGGGGGCAGTGGA-AGAGACTGATATTTTTAGTTGTTTGAAATAAATTTGA----CTTAGCCTGTACATAATACCCACGACTTAAACAATTGATATTCTAACACGTTCGCTAATTTATTGCATTGTATAAATATATAGATATAATTCAATATATATATATACATATATATAAAAGG---AAATCCATTTAGCCTAGGCATTTGTACATACAAAGAACTACAACTTAAATTATTAAAGCATTAATTATATTTCAAAGAAAAATACCATTGAAAACAATTGCAAAAATAAATCAATAAAATATAAATTTGT--TCAATAAA
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TAAT
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GTTTATGACCAACAATCGATGCTACAAAAGGCAGGCGTACCTGGTTTTTATAATACACAGAATCCCAAGGAAATCAAAATACAAATGTTCCTGCTTGATTTCATTTTACGTCTGAGCCGACTTAAATACGAGCCGAACAAGTAG
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GCATTGTGCAATGGGACATCAATTGGGCTAACAAAGACCATTTCTGCTCTCTGCCCTTCTCCGCTTTGCCACCTGCTAACGCTTATCGCCTA--ACTAACCGCTCAACTCTATGCAGGGGTGATCACACAGAGGTGCTGGAAATTGACTATGATCCCACGGTGATCAGTTTCAAGGAGCTGCTGGATCTGTTCTGGAACAATCACGAGTACGGCCTGACCAAGCCCATGAAGCGTCAATATGCATCACTGATACTCTACCATGATGATGAACAGAAACAGATTGCCGAGGCCTCCAAGCTGGAGGAGCAGGAGCGTCGTGTGCCCGAGGTGATTACCACGAACATTGCGCCCAAGGAGAACTTCTATGCGGCTGAAGA
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AAATTTACTATCACTAACTTCTCCCTTTATAATACCATTAATTCAACTAAACGAAACACGCATCGTCATTATTATTATATATATTGGATTTTTATTTTATCACATTTTTTAAACTACATATTTATTAAACGATTATTATGCACTGAT---TCCCAGCTGGTTCTACGGTACGGCTTTATCTTACTTTAAAGTCT-----AAACTGTAGACAAAAC------CAACTGCGAATGCGCTTTAGTTGTTTTTTAACGTAGAAAACAACTAACATTTTGGGAAATTGGGAAATTGTGTTAAACAAA------------TTAAAGAGATAAAT-------ATACAATAAAGCATTTGCAA----------TTGGCTGATGAAATA
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GGTGAGGTAGCGTAGTGTACAATAAAATTATGTAAAGCAAAC---------------ACGTTACCCA-------AAAGAAAAAAAGTTAAA
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AATCTTTCA-----AAAGTTGAGCAAATAAACTGTGAGCAAAATAATCTCAGC
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AAGGAAGCCAAACACGCAAAAAAAAAAAAAT-GAAAAGATA-ATCCCAAATCCAACAACCTTCCCCTAGCGTTTAGCCAACTTGCTCGAA----TTTTAAGTTTTGTATTCTTTTTGCAGGTTTGAGCAAACAAACTGCAAAAATATCTTTTGCGAATTATTTAATAGTTTTTAAGATTTTTCTTGATTTGATGAATTTTTTTTTCTTTCACTTTTGATTTGTATTATTATTATTTTTATTTCCTTATTTTGTAATCTCTAATATATTCACGCTGTGTATTTGTTTAGTTTTCAATTGATTATCATTTTGTTCAATTACAAATTCTTTTTGTTTAATTTGATAAAAAAAAAAATAACTTTTGGACAGCCGATTCCTGCCACGCTATAAATTCACTTTCACTTTCTTACTGACCGCAATTTGAATTTTTAATTAATCTGAAAAAGGATTTTTCTAAATTTTGAACGTTTTGCGCCTTCTTTCTCTAGTTTTGTATTTTGTGCTATACTATATATGAATATATATCTAACTAA---AGCTGCGCCTGCAACAACAACAACAACAACAAGTACTACTTACAGACACACGCACACACACACACACACAAATAATACAACACCTTTTTACATTTAAGTGTATTTGTAAGCAAATCTGGCACTAGAAGCGCAGAAAAATACTCGAAAAAGTACAAAAACTACACAAAC
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AATATTATGTAATTTGATAAATTATCATGAAGCAAGC---GAATTAATTGCCAGTCACGAATTATGCAATTTATGCT--------------ATGTGTAAACTCTTTAATATTACACATGCTCAAATTCCAAATTATGTCTAGCTATATATATATATATATGTACATGTATGTGTGCATATGTGACAACTGCAGCATACCCAACTCACAGTAAGAAATGCTTTTTATACACATATATATATATACACATATATGTCATATATATATATTTATTTAATAGTTTGATTTAAGCTACTCATTTTTAAGGGATACATTCTCATTTATTTTTCTCGAATCTTAAGCTAAGCGAAAAGACAAACG--CACGCAAAAAGTCGGCGAAGTATAATTTTGTAATTTAAGACAACGAGCATTTATACACATT-AATATATA-------------------AGCAGATATATGAGTCCAATGAAAATACATT-TATTATGATTAC------
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T---AAATT----------------------------GCATTGTTTTAC-TCTTGTGAGATTGAATAAAT-------------ATGTTGTCAGCCGAATTAAA--AGAAAGGTTTTCAACGAGAGCAAATAAAGT
TATGAAATTCGATGCATACAAAAATGATTGACACAGAGGATTCTTTTGCATATTAATTGATACAATAAATTAATACAAGCTAAATCTTGTGGCCCTAACTAAATCGTAAAAGTCTT--AAGTGATCAACAGGTTT
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CAGAAGTCAAAGAAGGGCTGACTTACTGACTGCTAGACCTTTTAC--CTGACCATGATTTGAAGATACTCATTAGCTTTACAAATAATTGGCAAGTAA
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CAGTTTTAAAACTTG
CAAATTAAAAATGTA
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AGCGA----TACCCTCATAACTAC-----ATAATTATATTTCTTTTTGTATTCATCTTGTACTTTTAAACACACATGTATGCTAACACACAAACGAACAATCGCAGGATACGGAAGGATTCTGTCGTCTGATGGGAGCCGAAGCCGACGTCAGCTTTGCCGTCGCAAACGCTGCCGCCGCCGCATTTCTACTGAAACTAAAACAACAACAACAAACAGACCGACAGATAACTGCAACAAATCGAAGCCAAATTTTTCCAGCGTTTTAAAGTTGAGCGATGTGTACGTAATTGTATAATTAATTGTTAATTGTTTCTCATTTGGTAGCGCTTTAAAAGAAAATGTTTGTTGTGTCGCGCGTTTTAGCAAATATGCATAGTGTTAGATTCAAACCGAGACACACCCCCCATATATACATATATAAATAGATATATATATATAAACATATGCATATGCTTACATGAACGTAAAATGTCGTTAGCAATTCACAAATGCTAAATGTTCTTTGTAAAAAAAAAAAAAACTAAAAACAAAAAAAAAGTTG--GTTAAAATTTCAAGGAAATTTCTAA--------AATGCCTTCTCCCCAAAAAATTAACTCAAATTTCTCGAAAAATAATGCAGTAA--GAATCAAATATATATATATATCTATACATATATATAT--------------AATTGCTA--AAAATGCTT----------------ATTGTAAAATGCCTAAGCAAAAAACTGATAAATAATAATAATGCA-----------------------TGTAGGGCTTATAAAAAAGTACTTGAA---TTTGTAAATTGTTTATGCATTAAAATGATAATTGCATAAAGAACGACAAGTAAATCAAACAAATAATTTAAAAAGAATTTCACAATAAGCCCTTACAACAGCTTCCTATCAAGCTTAAAAAATGAT----------------CTAACATACAATGA--AATTTAGACCTAACCTAGTACATAACAAATTTCAATAGTAA-AATTAACAAGTACATACATATA---------TCTAATTAATAAGTTTCAACAATTGTCGA---AAAGTAATGCAATCTGTTAAATGTTGT-----GACAGCTGCGGAAGTCACAATATG--TTGCTAAGGAACCAACTCGAAATAACAA----AACATACAAAATCGCAGCTATAACTTTTAATGTAGGTTTTAATGCAT---TTTATTTATTATTATATAGTTTTTGTTTCGTTGCTCCCTTGAAACTCATAAACATACATTTATATATATATATATTATTCATTCATATTAATTTATTATTGATTTTTATTAAAAATGATTTCGCAC----TTTATTATTGTATAACATTATTTTTATTCAAAACGTTGTTAACTTG-GTAAACAAATTAGAAGTTTGCTTCCAAATTAAACTTAAGAATAGCATTTAACGAAAATAAAATCCACTAATTTATATAATGAATAAGGTATTGTGACACAAACGCAAATAAATCAATAAAACACAAACCCAATTGCACAGTAAAAACTAAATATG---AAAACGTACTATTTCTAAGATAATACGTATACAAAAAGTAAATATATCAAAACCGCATTAAAAACATGACATTTTATTATGAGGGTGAGCCGGCA----GTCGAGAGATCTATAAAAAGAGCG-------AAATTT
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TTTAACAGT---ATTTTTTTTCTTGTATTTATAAATTTGCATTTACATAAATTCTTT-----TTGATTTTTACAAAG---
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CTAGATATAATATTAAATAAATGTTTTT-----AAAGTAAATGATAATGAAAACTGTGTTTTAATTGTTGGTTTATATACTGTAATTTAA--TGATATTCCAGTGCACTGCTATTTTAACTTTTAAATGCGTTCATTCAC
CGTATTGTACCATAGAATATTTGCGCATCTCAAAAAGTAAATTTTATTAAAATTATTGCTTTAATTGGTGGGCAATATAAGTTGGATTGAGGTAGTAGCGTAGCGCCCCACAGTTTTCTTGGCGAGGAGCCATCATTCCC
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GCATTAACC-----ATACGGCAACTACATTTAACTAAATACTTAATGTATGTCAAACAGTGCTCAGTTTTGTTGTTTCCTTGATCTAATGCATAAGCCTAAGCATAAAACACATTTGTCATATTAATCATTGTAGCGTTAAGTTAATCTCAAAAGCACTTTCACTACTATAAAAAGCGCCTCATGACGAATCTCAAGTTG----AAATTTATATTTAACTTTATTTCCA--------TATACACATAGTTCATGATATATGTACGTACATATTCCATTTAAACGCACTCACGTGTGTAGCAAAATAAGTTTTTAATTAAGCGATCTCAGCAAACA-AATTTTGTTATTTGTCACTTAAACGC--GCTCGATGCACAGAATATGTGTCTTTAATTAATTGTGTCTTTTATTTAAGGATCTTTAAAATTTACTTAATGTGTAATTTAATTAAAACAATTTAAAAAATTCCAAACATCACAATTTGTATTGAATTGCCATTAATATGAAGAGCATTGGGTATCCATGGCGTTTG-GCAGCTGATGT
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AAGCCAAGTTCACCATACAGGGAAAATACCTCCAAGTTAATCTATTTGTCAGCAATCCTATGTGCAAATATCTAAAAAATCCAAATAAATATTTATGATTGA
----------TGCTATGC--------CACAGTGAAGGTATTCAATGTTACGAAGAATCTATGTGCAA-------------------------TTATG-TATA
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TCTTACCAAGCATATCAATATGTTTAAGTATGCATTTATTTG
---------------------------GTGGCCAT-------
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AGACAGTTAAAGGCTCAGTATGCAAAGACAGTATCCACATTTATCACTTGTAAACTATTCTAATCGCGCAGATATTCCAGTACAATAAAACGACCTAAGTACATATAA
AT-TTGTAAATATATGAAAATACTAAAATGCAATCAAAACTTTATGCTGCTAATAAAATGTAA---CAAAAATAAGCCCATAT--TTAAAGGATCTCATTA-ATATAT
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TTAATATACAGATTACCTACTTGGAAATTTAGTATTTCTATACTTATTCACAAAGTT--TCACGAATTTCGTATTGTTTATACCTTTTTCATATAGCATCCCTCAGAAAAATGTTAGTCTAACATGGAAT-TTAGATATTTATGTACCCATATCTGTATATAGAGTAAAGTAAATAAAGAAATTTAAAGAAATCCTTAA
TTAATATATATAT-ATATATATATATATATATTATGTATATATCAATTTACAAAACTGTTTACAAACGACGCATTGAAAAAA----TTAAATATAG----------------GGTAATATAATAGATAATATTATGTATTTAGATACATATATGTATATATAGTGTTAACTATATA-------------GAACCGTTAT
>Arf72A 15949444 15949622|16827 chr3L 15948987 15953035 scaffold_8 3445057 3449059 + 206290|462 653
ATACTTAGCCAGTCCTCAGACCCCCAGAT--------CCCTGTGTAAAAAATGTGTGTCCAAAGCATCGCC---AGCTAG--GGAACGTCAACAGCTTTTTTCAAATTGCAGATTGCGCAAAAAATCCACGAACCGAAAGAAACTTTGTAATAACTTCTAGTAATATAATTATTAAATTATAGGATTAAACA
TCAC-------GCCCCGAAAACCCTAGATGAGCCTGCCCCCTTGTAAAA-----TTGTCCAAAGTGTCACCCAGAGATAGTTGGAAGATCTATAACGCTTGC------GCAAATATCCAAACACATACACACAC-----ACAACTTTGTAATAACTTCTAGTAATATAATTATTAAATTATAGGTTTATAAT
>CG6017 15956117 15956902|16829 chr3L 15954484 15957786 scaffold_8 3450539 3453894 + 103304|1675 2558
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GATAAATCCTATCGGGATGCGAAGACGCTTCAAATGCCCATTGCGCATGTCTAACGTTTCATGTGCTAAAAAGACAATGCTTTAGA------------------TATGCCCACCCGATTAGC---TCCGTATTATTTC--TAGTGATTTGTAATTGGAACGCG-----CTGCTGCAAACACA----------ATGATTTAACAACAACTAAAAAAAACAACAACAAAAGACAGAAGCGTCGTCGCTGACCGATATCGGATCCAGCAAAATAGGCATTTATGCCACCCACACACATACACACAAACACACACACAACCACACACACAACCACACTCACAACCACACACACACACATGAGTACATATAGTGTGAATGTATTTTATCTGTAATTACAAAGCTCTGTACATTTTTCTACATAATTTTTA--ATTTAACTGAAACACGAAAA---ACACACTTTTTTTGTTACTCTGAAGTATTTGTTATACCAAAAA-------AAAAAAGTAAAAACACCTGCACCGAACAAAATGTGCAACATCAATCGCAACAAAATCAAAAAAAAAAAAAGAGATAGTTAAAAGGCGTGCAATATTTAAATTTTCAATACACACACTTCAAACTCAATGA----TTAAGAACTTTCTAAAAAAGCGCACAATAAAAGCAAAGTACGAAACTTTCAC---ATTTGTATTCTAAATTATGTGTATTCTAAAAGCAA-----------------GATTATAGTAAC-------TATACAAAA------------AAAAATAAAA-------------TAATAGCAGATGCCTTTGTGTTAGCT-TGAATCCGCAT----AACAATGAGATTAGGTATCCAAGCTATTGTTAAAAGAA
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TGTTTTTGTTTG----------AATATTTGTTAAAAATATAT---TTTTGCTTTATAAGACCAA
CGGCTTAGTTTGGATGACGTGAAATATTTGTTAAAAATATATATATTTCGCTTTATAAGAC---
>Notum 15996601 15998020|16881 chr3L 15996931 15997878 scaffold_12 1540803 1541882 - 17261|0 1136
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TACTGTAAATAGTTGGCCTGTATATAGATATAGCCATAGACTGTATAGCCGACCCTCACATTGTACATACATGCATATAAACACACACACACACACACACACACATATATATATATACACAAATTGATATATATATATATCGGAG-CTATTCCAATTCCTAAATCAAGC-------AAAAGACATGCGCATAGTACCCAGTTATTAAGCAGAATTTATTTATATATATAAACACACGCACACACACGAACACACACGCACACTCATACGCATACACACATACTCGTACTCGTATTCGTATTCGTATTCGTATTCGTATTCGTATTTATTCATTCGCATTC----------------------ATTTCTGCGCAACGAGAAACT-AACACAAATGCAACCACAAGACTGTTTTTTATGTTTTCTATATTAAATATATAGTTTATATATATATATATA------TATAAATATATTTTTTTTGTAATTAATATTCAT-AATTTATTTATAATTAGCTCGTTAAGCTTAAGAC------AGGAGCTG--TTTTGCAGAGCGTCTAGACTTTTTCAATTGCCCGTTTGCCGAGTTTGATGTTCGTTTGTTTGTTTTTTAAATGCAAATATATAAA-TTATTAATAACAAATTACAAATTAACAATAACAAATTACAAATTACAAATTACCTACCTCAAGCAAAACGATGAGAAATTATTAGACAGCTGCCTTGAATAGCATATTGCATTTTGTACCTGTGCAAATATAAATCAAATATCAAATACTTTTAACATTATTTATTTATGTAAATTAGCAACAATTTTTTGTTGTTGTTGTAGTTATGCTAAATGCACGCATTCCGTTCAA-AATAATAATTGTACTTAAAAAAAAAATGCAACAAATTCAATTCAATTGCAATTTACGCAATTTACTGTCAAGCCGAACAACTCGAATATTATCATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTTAAACTTTAGTT-GAATAAATGTAATCAAATATTGTTAAGTACAATTAGCAATT-------AGCCTGTACAGAACCGGTTAAAGTTTAG-TCTAAGGATTGTTGTGCTTAAAATATGCCTAAGTTCGATTTAAAAAAAAAAACAAAAACA
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ACGGTAGAGCGATATATA------------TATTGGATATTCTTTTA--------ATATTAATAGA-
>Mbs 16044196 16044868|16925 chr3L 16042852 16046822 scaffold_12 1589613 1593868 - 33717|1624 2425
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GCAACAATTTACAACAAACAAAAGAAATAAACAAAAAAATAAAAAATAGAATATCCTAAAATATTGAAAAAACAGCATAATCGAATATCGTAATCGTAAT-CGTAATCGCAAACGCAAACCGCTATCGTAATCGTAATCGTAATCGTTATCGTTTCTTTAAATACTCGAGCTGCACACATATATTTA-CATACGTACACGCATACCTAGTTAAATTCTTAGATATCGTACACCCATCGTCTAGCCTAGAGATATTCAGAAACCATTTTGATGAACAACTTTAAAGATTCTTCCACCATCGATATTGTTTATTATCATTATCATTATTATTATTATGAGACAAACAACAACAAGAACAATTTGCATTGTTATATTGAGCGCAACGTGTA--ACAATAATTAAATGTACTGTAGTT-AAATTAAGTTTATAACTTTTGGG------GGCAACGAGCACTTAGCAGGCAAATTTCTATTTTTGCACCGC--TGTACTTTTAGCCCAGAGCAAAATAATATATGACACATACACACATATTGTATTGGAGTTATATGAAATAATACAGAATATAACGTTACAAGATATAGCAC--------------------AACATATGGCAA---CTATATATACACACACATAAGT----ATCGTATACATACGTTTAATCAAAATCAA---AAGCTACATCAAAAATCGTAAATCGTAACTCAACGCAACCCAAGGATTTGCCCAAATGCTCAACTATGCT-----GCCCACGCACTACTTCTACAACAAC-------------------A
>Mbs 16046105 16047289|16925 chr3L 16042852 16046822 scaffold_12 1589613 1593868 - 33717|3801 4663
AATTATGTTTTACTTTCAGTGTATGTATGTCT------------------GAGAACCTATATC----ATCGAGAAGCAACAATTTTACTTTAGTTACCAGCTGGAAGAAGGCTGAAAAAGAATGAAAATGAATGTTAAAGCCAGCAAGCCGATGCAAGCGAAAGCCGGATATTCGCGTGAAAATTTC----AAAATTTGTTTATTATTTGTGTT-----AGGCCGTTAAGCATTAGGTGAAACCATGTTTCAAATATCGTTGAGAATTGTTTTGTTCGTTTTA-------------------------------TATAAAGAAATCTTA----------TGTATTTGGTCAAAT----------------TTTATATACAAAATAGAGCAAATTATAAATAATAAACTTACACAAATCAAGCTTAACTATATTTACATAAGCATACGCAACGTGTATAACGATCAGAAGATCAAAAGAAATGAAATGGAAAGCGAAAACCTTTACATACA--AACTGAGAACATAATCATCAAATGAGCCCTAGTTACATTACAGATTAGTTTAACTACATG----ATACATATAAATACATG-----AATATATATATATATATT-TTTTCATATATA-------------------AATTATATATACACATTACATAATACATATATATTTAAAGCAACAGAATCATAAGTTCAACATGTCAATGTGTAATATCATCGAGGATCCAGACCGCCAGTTCATGAGACTCCGGAGATGTGTCGAAACCAGCCCACGC---GTCAACTTACTAAG----------TGTAATCATT-----------ATCATCCAATTGTAATTGT--TTTTAGT
AATTATGTCGTAACTTAAATTTACTCAAAAATAACAAAAAGAAAAACAAAGAAAACCAACATCAAGAATGAAGAA--AACAATTTCGTTGAAGCGATCAGTC--AACAACGC--GAAATGATTTCAACTAAATTATCAAAAAGAAAAGTT--------------CTGTTTATTAATATTATGATTATAAAAAAAAATTGATTATTATTTTTGTGTGTTAAGGCATTTAAGCGCTAGATGAAACCATGTTTCGAAAATCGTTGAAATTTGTTTTGTTTAATTTCTCTCTCAATCTTCCAAAATTAATATATATATTATCAAGAAGTTGAAGAATGGAGCGTGTATTTGGTCAAATTATATATACACATACATTTATATACAAAATAGAGAAAATTATAAACATCA---------AGAAGAAAGTTAATTATAGTTATAGATGT----------TGTCTAACGGTT--AATTTCAAACAAAA-------------GAAAACCTTTACGAAAAACAACTGAGAACATATTCATCAAATGAGCCCTAG-----TTACAGATTAGTTTAACTATATATTGCATACATACAAACATATATTTTTCATATATACATATAAATTATATACATACACACCCATACACACTCACACTCACTCACATATACACACTACAC-ATATACACATGTTTAAAAC-------TCAT----------------------ACAGCTTAGAGGATTAAA-----CTGTTTGTGA-------GAAATGTTTTGAAACCAGCCCACGCAATGTCAACGTACTAATTTATTAAAGCTGTAATTGTTTTTAAAAGAAACTCATTTAGTTTTAAACATAAATTTTGT
>Mbs 16046105 16047289|16926 chr3L 16046823 16047089 scaffold_12 1594063 1594264 - 1743|0 267
GCTGCACAGATAAAGGCATCGGTGATACCATCAAAAGCTATAGTAGCTACATATATAGTATACCCTTCAACTGAGGAGACAATTTCGCAAAAGCTCCATGGCGCTATCCTATAGATCGGGATGGGTTCATCACTGCGTATGCCCAATTATTTCTATTATATTGTTATTTGAGTACGTTAAGATAAGCAGACACTTTTAGTTCTCTCCTTCACTTCGAAACGTATTATATACATT-TACATCGTACTATATTTTACTTTCGCTTATAAC
GGCGCTCTAGTACATGCACAAGAGTTGTAGTTTAATGATATA-TAGATATATATGAGATGTATACTCCTAATTAGA----------------------------TATGCTGCAGTTGCATATG---------TTGCATATGC---------------ATATGGACGATTTAATTCATTATGTTAA--------TTTAAGTTGTTCACTT----TTGAAACGTATTATATATATCGTACTCTATACT-TATTTCAATTTCGCTTATAAC
>Mbs 16046105 16047289|16927 chr3L 16047128 16047316 scaffold_12 1594266 1594434 - 7042|0 167
TTATTAAATTCGCCTAAGAGA--TTTTGTGTTA--CTCGTAAATGGAAACGATAATCAAGCATAAACAACCATAAGAAC--GTGAATTGTGTAATATGTAAAATTGTGTGAGAAAATATTTATGAAAATTTGATTCAAATACGAAACTTAATAAATGTGATCGCAAGC
TTATTGAATTCGTTTAAGAGATTTTTTGTGTTACTCTCGTGATGGAAAACGACA---------AAACAAACTGAAAAACAAGTGAATTGTGTAATATGTAAAAT--TGTGAGAAAAT---------------ATTCAAATACGAAACTTAATAAATGTGATCGCAAAG
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ATTTATTAGCCAATCAGCAGCTAGGCAGATGCTTAGTTATTATTATTATTATTATTATTACCTGTACTAT-CGCAAAACCAACAAAATTGTATATGATTAAGCCGAAAGTTGAGCACGAGAATA----------------------------------GTGATTAGTAAATTTACGATCTGAGCGTCGAGCGTGAGAGATTTAGCAGAATTGTGTGCAGTACTACTACATATACATATATATGTATAGTATATATTAATAGGGATATAATAATACACATACATGTTTGTCTCGTTAATGTTAATTGTATAATTTATTGAAAACAAGTGCAAATGATTGCAACA--------TATTCATTAATTTCTGCTTTGTAATTATGTCATTGTAAACGTATTCAAAATAATATTTTCTATTTTCTACATATATTTTAATTATAAATGCCCATGTTATTTTTATATACCTATGTACATCACGCGCGTATTGAATGA---GTGTTTGGACTAAGAAAAGTTTTTTTATGTAAAAGTATGTACGGAAATCGAGCAATTTTTAAGCTGGCGGCACAGGCAATGGAGTGAGTGGAATGTTTTTAACTGAAAGAAAATTAAGATGAAAGTTCTTTG-TTTTGCATTTTATTTAAAATTCATATTTACATATATA-----------TTATATAAATACA-----TATATCAAAATATTGTGTTTTGTTAGAGATCTGTGAAATTTTAATCTAAACTCGTGTAAATAGCAGCATTAAAAGATGATGAAACCATGAATA--AACGTAAGCGCAGCTATGTATAAAATCAAAAAAACTATATTTAA
>CG5284 16060456 16061190|16938 chr3L 16061175 16062791 scaffold_0 2865068 2866605 - 63147|0 15
TGAGAACAAAATTCAA
TATGAGTATTATTCAC
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G----GAATTCGATCAGCA-------ATTCCACCAACCATTAAACATAACCAATTTTACAATTGTGCATTTTTGATATCTTAAAAAATAATATTCCTTTATTAAATTTAA
ATTTTGTATTATGTATGCACAATATAATTGAAATATCCATTACATATAACATGTATACCGAAGAGTTATGTGTATAATGTTAAAAAACATGCGACAAGAAAAAGATTTTG
>Taf4 16085332 16086623|16951 chr3L 16082497 16087094 scaffold_12 1657272 1661970 + 145578|3021 4515
TCGCTGCTGTTGCCCAT------------------CAATCGCACCGTCTTCTCCTCGCCGATC----------------------CTCCTACTCCGTGGACTGTCGTG----------------TTGTTGTTTTAT---------ACAGCTTTACGATTTCATCCACTTGCAATATATTTTAGCC-TCAACTTTAAATGCGTCGCGTGTCCCCTGTTGTTGTTTCTTTTTAGTTAGGCGGCTCTATTTAATTTCTATTTTTACATTTATTTACATAAATCCTAAATTCTAATCGTATTTGA-----TTTTAAGCCTAATTTAAAGCTCGTTTATTTTTCCAATAAATTCTCTGTAAAACTTAAACCAAACCAATCCAAAAACAAAACA---AAACCAGAGTAAACGAAGAGAATAAAA-TAATAG-AGAGGAAAGTAAAAGAAGGTAAAAGAGAGCGCGCAGTCAGCGGGCGTTTGA-TTTGTAATTTGTAACATAATAATGTTTGCATCAACTGCATTGACGGCCTTATCTAAACGATATAAAC--ATAATTATTAATATTTAATTATTTAGCTTAGTTTGTTAAACGAAAACGAACCATAATTCCTAGATTTTAAGTAAAAAGCAAGGGCGCGTGAAGAGAAATCGAAACCGAATTACAGATAAAGGTTTTTAAAACCAAC-TAGATCGAAACAAGTTCAGCAACAG--------------CAAAACAAAAGAACACATCAAAAAAAG--AACCGAAAAATATCCATTTA-------AACATCCATTGAATTAGGTTTAGTTGTTTAAAAAA---GATGTAATTTTTAATTACCCATAATGTATA--------AACGGAAATCAATCGTTAGGCAAGACCACAACAAACCCAACAAATTGTAAATACAT----------TCTAGGCTACGGTTTTTCTAATAGATAACTAGGTAAAAACGCAAACGTAATTAACAAATTATCGATGGCAAGGAGC---GATGCGAGCGCAGACAACTTGGCACACCGAAAAAATATGTTTTTATTAGT--GGCGCTCGTTCATCCATTAAGAATGG-----CGATTCATTAGGCTCCATAGAT-CCATAA--------------ATCCCCTAATCCA----ATCTGAACTACACACAAAATAGACAAATTTTATAC-AATTAGCTCGATAAATCTTGTAAAATAGAGTCCCGT---------AAAAAAATTATAACAAATAAATTGACAACAATTGATGTAATTCAGTAAACCTAAGCAAAAAGTGAAACCATTCTAAGCAAATTCTTTGTGTGTAAAAATTAATATGATAAACAAAATGCAGATGCAACCGTAAACAGCGCATAGTTTGGTAGGCATATAACTGAATATAT---------------ATATAT-----TATTATTATTATGTTTTAACATTAA-----GCAAAAAA------------ATAAAAGAAA---AAATTGAGAAAA
TCGCTGCTGGCGCCGCTGTTGTTCACATACCTACGCACCCATACGAGCTCTCCTGCGCCAACTCCTGCTCCAACTCCAACTCCAACTCCAACTCCAACTCCTGCTCTGGCTTTGGCTCCAGTTATCATTCTTCTATTAGCGTCTAGCAGCT----GCGTTCATCAATTTGCAATATTATTTAGCTGTCAGATTTAACTGCGTCG------TCCCTTTGTTG-----TTTTAGTTAGGC-GCCCTATTTAAAT----------AACGTATGCGTAGAAATACCAACT--AAATTGTAATTAAAAGTTTTTTAAATCTAATTTACAAATCG----TTTTCCAATTAAATAGCCAGCAACACTTAAACCAAACCAATCCAAAAACACAAAAGAGAAACCAACATCAACAACAACAACAAAACTCACAGTAGCAAAAAACAAAACA----AAAATTCAACGTGCAGTCAGCCAGCGTTTGATTTTGTAATTTTTAACATAAT--TAATTGCATTAATTGCATTGACGGCCTTATCTAAACGATATAAACATATAAATAATATGATTAAATTGTGTAGCTTAGTTTGTTAAACGAAATCGAG-CGTAAATTCTAGACTTAAGTTAGATTGCA---------------GCATTCAAGTCGAGGAACATAACATGGTTTTTAAAACCATCATGGCAAGCAAAAAGAATAAAAACAGAGAGAATACAATTTAAAAAAAAAAAATTAAATAAAACAAAGCAAAAGGAGAAATATACACATAATATGGCATAATACATTGAACTAGTTGTAGTTGTTTAAACAAATTGATGTAA-TTTTAATTAGC--TTATGTATAAAACAATTAACAGAAACAAATGGT-------AACAACAACAAAAAAAAAAAAAACAAAATACACGTGTAAAAAGTCCAGACTAAGTTTTTTCTATAGTTTAACTAGGTAAACGC---AACGTAATTAACAAATT---TACGGCAAAGAACTAAAACCCGAACGTAG----TTTTAGACACTAAACATATGGTTTTTTATTAGTGAGGCGTTCGTTCAACC----AAAATGGTTCATCCAATCAATGGATTATGTGCATATTATAATGTTCTAGCAGGCGGTTCTTTAATTGAACACATTTGCACCAGCCACAAAATAGTTAAATTTTATACAAAGTAAACAAACGAAAATTGTAAAATACATTTATATTCGACTACGTACATATTTAAAACAAATACA--------AATTTA---AATTCTGTGTGTGTGCTAAACAGTTACAATATGATCAAGCGAA----------AAACAAACAAACAAAAAAAACAGTCGAAAACAACAAAAGTAAAGAGCGCATAGTTTAGTAGTCATATAACTAAATATATTATATACATCTATAAATATATACATACATACTTATTATGTTTTACAATTAATAAATACAAAAAACCTATTGTATGTATAAATTAAGTTTAAAATGAGAAAA
>SsRbeta 16095963 16096245|16958 chr3L 16095655 16096873 scaffold_9 1047804 1048906 + 43587|308 618
GCTGCAGGACGGACGGTTTCCTCGCCACCACCAAGAGATTTCTTTGCAAAGACCCATTACAAATTCCGTATATT-TTGTTGCTTTAGTTTCAAATTGATTCCATGCGTTGTTCATCTATTCAACCCACACATCTAATTTA--------------CTCCAGTCTGGGACTGTCGTCTG-GAGACGGG------------CGTTAAATCGTTTTAGATTTGATTCGAGGGCGCATTGAGTAAAAAGTGAATAAAACAAGTCCATCAATGTTAAGCCTAGGCTGCTTTTCTAAATAAATTAAATAAAATATAAA
GCCGCCTTGTA-----TTTTGGAACAACAAATCATAGAGATTTATGCACCCATCCAATGCAA-TTCCGTATAACATTGTTACTTTAATTTCCAATCG-TTCCATGCGTT---CATCCAACCA-CACATTTGTATAGTTTATGATTATGTTGCCGCTCCACT-TGGAATTGTAATGGGTGAGGCGAGAGCCAAGTGTAGCGTTAAATCGTTTTAGATTTGATTCGAAGACGCATTT-GTAAAATGAGAATTAAAGAAGTCCAT-----TCAAAGTTAAGCTATTTTTCTGTGTCA-----------------
>CG16838 16101726 16101950|16961 chr3L 16101424 16102746 scaffold_9 1121468 1122827 - 13653|326 607
GCATCGTTTG---------------GATTTAGTTTAATTTTTTTGAA----------ATTGGTGGAGCAGCTCCGCCGGCTTTGTTTGCAA--------TTTATTCAGATCGTTT------AAGAAGAGTTGATCTTTTTTAAGATAGCTTTGTGGACATGAAGATGTAGCTATTATGAGATAAACCTAGAACTATTTACAATTTAACTATGATAAACTAACTACGACCTCATCCTATGTTAATAAATCAATCAA------------------ATGACATGT
GCAAATTCTATGATGTGAGACTGGAGATTGAAGTTCATTCGGTGGCACGCCCCTCGCGACCGTCGTGCGCCCCCGCCACGTTAGGTGGCAAATGGAAAATTTATTCACATTGCGTTACGCAACAAAACGTTGATCTTCTTCT---TATTCTAGACGATATTAGTTAATGACTATTTGGCGGGCGCCCGCTGCTCTTCTACA---CAATAATTATACACTAA--ACGACCTGAGC-TATGTTAATAAACAAAACAATAACAACAATTATTTACAAGGAAATGT
>CG5027 16196031 16196400|17084 chr3L 16194669 16196031 scaffold_9 1221761 1223074 - 71237|1371 1371
A
A
>CG5027 16196031 16196400|17085 chr3L 16196109 16197978 scaffold_9 1223612 1225553 - 47722|0 309
TAGTGCATTTCCGAGCAAGATCATAAAAAGCTAGGAACA---TACAAGAATATGAAAT-GATAAATCCCTATAAGAAGTCGTAGAAGACCCCACCCCTCCTCTAGACCACTTTTCTACCGCATATAAATGTAAGCCAAATCTAGTCCTATGTCAGTGTATGTCATTGCCGCTTGGCACGAACTTCCAATACGCTTTAAGATTCGC---CATCTGACA-CAAAGAAGTCCATACGTATTTGGGCATCTAGTTTTGTTT--------CTCGTTT-TAAGTTAGTAAAAGTAATAAA-CATGATTTAGCGGAT
TAACATATGGCCGAGCGAAGTCTGATCGACTATGGAACAATTGGCAAAACTATGGATTAGATGTTTTATTATGAGA-------TAAAGCTCTTTTTGATTTCCAAGACTCTTTCTCAACTCTTTCATATATGTCTCAGATAGAAACCTAAAGCAATATA---CATTCATATATGGCAAGCTCTCAGAATTTGTCTGCAAGCATGCATACATATAATTTCAACGACATCCTGAGACATTTCGACATTTTGTTTAGTTTAATAAAGATTAGTTGATAATTTCGTAGAATCTGTAAAGCACGTTTGTTTCGAT
>MED10 16197919 16197999|17085 chr3L 16196109 16197978 scaffold_9 1223612 1225553 - 47722|1936 1995
GGACGTGCTCGAAGGACACGCGACCTGAACTTTAGATTGTAAGCCACATGTTGGAATAAA
GAA----CTGCAAATTTTAGTTTTATAAGCCTTAAAGTACTATACACATATAAAAACAAA
>CG13067 16236912 16237178|17122 chr3L 16235795 16237054 scaffold_9 1265751 1267049 - 13203|1291 1443
GACTGGATGAATGGATCGTGATCTTAACCTGACTGCTGAACTGGACCTGAATAT--AAACATATACACATCTATTGCAACAAGGATACACACCTTCCTGCTAACCACCTGCAA--------CATCCAATCTTCTTACATCCCTGGTGTTAGTT
G--CGCACCACTGAACCACG---TCAACC---CCGACCAGCCAGACCTGTTTTTCCAATTGGATCCTGATTTTATTTAAC-----TATACGCAATTTTAATTTCCTCGAGCAATTATCATGTGCTTAAGCTGTTCCTTTACTCGGTTTTTGTT
>CG13067 16236912 16237178|17123 chr3L 16237128 16237219 scaffold_9 1267101 1267202 - 3357|0 50
AGAAAGGGAATATTTTTGTTGAAATAAATACTGCATTTTGCGTAAAACGTA
AGAGAGGGAATATTATTGTTTGAATAAA---TGCATTTTGCGTAAAACGTA
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AAAGAGAGAGAGAGAAATCAG---TGAAGGTTTTG------TAAAGTGAAATCA---------AATTGTTAAAAAACAGATTGTGAAGAGTGGGTTTGATG-----TTGAAATATATT------TCGATTGA-----ATTTAAAAACTAAA
AAAGCAAAAGCCACAAATCATGGCTGAAAGTTTCGACCCAAGGCAGGGACATCAGAAATTATGAATTGTACAAAAAAAAA----AAACTTTTGATTTCATAGTAATTTAACATCTATTACCTTGTCGTTTAATGCTTAGTTAGAGACTGCA
>CG4982 16267148 16267287|17162 chr3L 16266300 16267157 scaffold_9 1302785 1303575 - 13884|907 916
AACAACGAAC
AGCATCTACC
>CG4982 16267148 16267287|17163 chr3L 16267199 16267747 scaffold_3 2735548 2736044 - -1687|0 88
TGTAACATATTACCTCTTCTGTATTGCAAACTTAAATGTACATCAAATATGCAATAAATAAAAACGTTCGACGTAAAGGTAATATCATA
TATATCCTATTCGATCACTAGTATAATGGATTTGAACTTA-ATTAAATTTG-AGCTAATTAAAGTGTGTGAGAAAATTGAAAGGCCCAC
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GTGACTTTTAATAGATTTGAGTCTATTTCTGTTAAATTCCTTGGCAATA----TCCGGGCTGTGTGCTTTTGCCACATCTGTGTTACATGTT----------TGTACATATCTCTCTTGG---GATCT-CGAGTGGTACTGCT--CTGGGGGTAATGTACGCCTTATGGCCAGC
ATTTGTTTACAAAAAATTATCTTTTTGCCTGCCAAAGTGCTTTTTAATAGATTTTCGATTTCTATTTTTGAGCCAGACTCACGACAATTGTTGTCTGGTTTCTCAACGAAATTCCTTTGGCCCGATATCCGGGCTATGCTCATAGCAGAGGGTAATGTACGCCTTATGGCCAAC
>Nplp3 16283719 16283955|17177 chr3L 16283076 16285846 scaffold_9 1319385 1322284 - 45345|736 986
ACCAGTTACCCATTGGAGATCCAACCATCCATA-TAGCTCACCCACACGCCAGCCAATCAGCGCTCCTGTTCAACCATAACATTTCCTGCGGATTACTT---CAACCACAAGTTC-TGTGCCCTGTTTATAATGCAAGCAAATTCAGCAATGAGAAGGAAAAAATCACAAAAAAA---TGTTTAGACACTAAAATACAT------TCCAAGCAATAAATACCTACCATACATGTTATAGCGAGCGAAAAAA
CGCATATACGC---GCACACACGCCGACACACACTCACTCACACACGCGCTGAACACATGTAGCCACCGGCTAATCC---CACTTCTGAC--ATTGTTTAACCAGCTGAAATTTCACGTGCCCTGTTTACGAAACAA-------CAGCAACAA------AAAAATCACAAAAAAAAATTGTTTA-AGATTATAATAAATAAAATGTCCTTACAAAAAATAATTCC---------TATAGCGAGCGAATTTA
>CG13060 16285641 16285726|17177 chr3L 16283076 16285846 scaffold_9 1319385 1322284 - 45345|2923 3015
AGCGTTCAAATTGTT-TGTT-TGTTAACCAATTATATGAAA---ATAAAATAAAATTCTGAAAAGTATTATTG-ATCCTAAATTATGA-AAAA
A--AGCCAACTTGTTATGTTATTTTCATGAAGTAAAAAAAAAATATAAAAAAATATACTT-AAAGTATTATTGAAAAATAAATAATGATGTAT
>retinin 16297874 16298056|17190 chr3L 16296666 16298053 scaffold_9 1334274 1335647 - 26457|1264 1494
GGATCCATTCAACAGATTAACACGATGAACTC--------------------GCCAAAGCTATGATACTTCTATT-CTTAACT--------CCCTTTCTGGACCTAATAACCCACAAAAAGCTTTCTCCTCTACGTCTTCTTTCTTCTGCCATTTTCTGTAGATTTCTTCTGTA----------------------GCGTGCTTTCAATAAAGATTTCGCATTTGCATTTA
GGAACAAAACGCGACGACAACAAGATGAAACCAAAGAGAAAAACACAACGTTGCCAAATTGATTTTACTTCTTCTACTTAGCTAACACATCTTCTATCTGTAGTTGATATACT--------CTTGTCTGCCTTTGACACTTTGTAGCTGCCATTTTCTA-AGCTCTTTTCTGTCTTTACTCTTACATCTATTTACTTTTTGTTTGGAATAAAGAATTCGTATTTGCAATCA
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TTAACAGACGTCACCACAGAGGCACCCACAA--TCAACGCCTACCACGCGGGGGGCAGCATA------AGAAATGACGACGCCTCTGATCAATTCGTTTTTCACTTTTGA--GCAGCCATTTCCTTATGTAACACCCGTCACTCGCTCGTGTT-----TGTTAGCCCACTCGAGTTACTGTTACCGCTCGTTACC--ATTATTTACTGTACGTT------TAGGCCTCCTT-ATTACCTTGTTATTATGTTTTTTTATATTGTTATGACCCACAAACTCTTTGTCACACTTGTCGA--------------GCTCAGACTCGATTGTTCAATAATTTAGCGAGTGCCTTGGCAATCTCTTGTA------TTGCTGTCCATT--------------------CAAGTTCCAATTTGTATTGTGTAAAATAGTTGTGTTTATATTAATTAATTTATTTTTTATACTTGTAATAAATTAAAAACTATTTAAAT------AAATTAATTTATGACAAAAAAATA
>mRpS34 16313993 16314035|17205 chr3L 16311887 16315308 scaffold_9 1358696 1362221 - 116760|2301 2355
G------------CCTGGGGACGTTGTTGAAATATTAAATACATATATTATACAC
GGCACTGCATCCGCCTTAGCAT-TTGTTGGCATATTAAA--CTTTTAATTTACAC
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TCACCACAAGAACTTATTTCTGTGCATCGTTTGTTTATTAAATAACTAGTGTCCA-----TAATAACTTCATATTTGTAAAA
CCACCCATAGAGTATGCTT---------GATTGTTTATTAAA-AACTACCCTCGACATATTGATAAGTGATTAATTGTGTAT
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ATGGC
-----
>CG4842 16334692 16334777|17227 chr3L 16334466 16334746 scaffold_7 466298 466589 - 1332|237 291
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TAAATAAATATTTTGCCTGATTCACACACAATAAGGTGTCGTATGTTCAAATACC
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TTAGGATATACTCGCTGTATCAGCATTACTACTACTACTACTATTAAATATAAATAAATACATATAT-ATATATATATAATCATAGTCGCCCCTCCCGCTCCCTTTCTCCATCACTACTCAACATTTCATAAATTAGTAATCGTCAAGTTTCGCTATCGGA--ATTTTTAATTGCAATGCATTAAAAAATACACACACAACACGCACATTTTCGAGTGTCGGTAATTGCAATAGCTCAATATTCGTCAAATCATTAAAAAATTAAAAATATATATTATATATAAATGCTGTACTCGGTGTTAAATTCAAGTTTTCAATTGCCTTCAGTAATTTATATAGATGTACTTATTTTTCTGGCAGCTACAACAACTTTTGCCTGTTACTTGATTGACTTTAGTTGATATGGCCCCCCTGTAGGTGATATATAATTTATCTGATTGTCAACATTGAAGTCAGAAACACAATAATTAATTTAATAATTTATTACAAATTGCTGGCATATTATTAAAAATCTTTGTTATCGAGTCTTATATTAACTGAAAATTTACTGTTCTGTACTTTTGTTGCATTTTGTATTGCATAGTTTTGAGCACACCCAAAACAAG---AGATTTGGGCCTTAAAA
>CG4680 16361268 16361601|17263 chr3L 16359825 16361407 scaffold_9 1411564 1413219 - 58652|1564 1734
TAGTTGAC----ATGGCTAGACGATCTCACCCTCCAATCGATCGG---------CGGTCCAGTGAGATAAGCGTATCGAGCATGACCTAATCCCT-----TGGAGCCTGTGACTAAGCCAGGGCAAAGTGATTGCCA-------------CCTCATGCTAATTACCCCGAT
CGGCTGGCGGAAATAGGCAAATGCTCTCTGCTCCAAA--GATTGGGTTTAGTCATGGGCCAATGAGCTAACCCAAT--GCCATGACCTAATCTCTTTCTCTAAATGCTGTGACTAAGCCCTGGC--AGCGATTGCGATCGCGATTGCATGCCTCATGCTAATTACCCCAAT
>TMS1 16380419 16380647|17284 chr3L 16379760 16382379 scaffold_9 1432867 1435472 - 81904|682 931
GCGATTTT--------AGTAT-----ATTAACGT---CTAGGAATG-GTGCTTAAACGAGCAAAACGAGAATG--CCAAAACGGAACGCGGAGAGGAAATAGTATCCGAAACTGATGCAGATTAACCATACACAATTTTGACTCTACATGTGGTGTCTACTCATTGATCTTATTCTCAAATTGCAAA-AGTTATCAATATATAAATTAATCTATTATATATACATACAAATACAACAGAACTTAA-CCAA
GCGGCCTTTAGCCAGCAGTATTGAAAAATAACATATTCTATGTATACGTATATAAATTATAAATGTAAGCGTGGTCTTTGATGCAGCCTGGACATGCCAAAATGCAACGGAACGGTGC---TTAAGCG-----AATGTTTGCCATG---GTTATATTTACTCATTAATCGTACTCTCAATATATAACTAACTCTATATATATATATATATATATTATATACAATATCTGGTGTCG-AGTGCTCACTCCGA
>CG33158 16456958 16456977|17375 chr3L 16456198 16459220 scaffold_9 1529963 1532589 - 80484|854 873
TTTGGCACTTGACCGCTCGG
TTGAGCAT------GCCGAG
>CG33158 16461703 16461829|17378 chr3L 16461668 16461868 scaffold_10 4297991 4298209 + -325|35 184
TTACCAA-----------GAAGTTTTTGATTTACCTTGGATGCCGGAAATTTTACTGAGGAATGACATATATTTTTATACATTAAACA------------ATTATTTGATGAACAAATAAAAAATAAATGTTATTATCTTAAAAAAAAAA
TTATCGATATAATGCTCGGCAGCTGTTTGTCAAGTTCCGATGCAGACTCGTTTATTTTGACAGGACATTTGCCCGGACTTGTAGAACACGACGCATTTTCGTCGCATTACGAGCAATCGAAAACCTAATTACATTTGTGTCACTCGAA--
>st 16465663 16465726|17381 chr3L 16463927 16465914 scaffold_9 1538085 1540260 - 80859|1903 1988
ATATACTTACTACGGAGCTATGAACTCAT----------------------CAAATAAACAACAATGCCTAGAATTTTCAAATTAA
CGTGTCCTTCAGCTGTGCATTGTCCTCTTTGTTTGTTTGCTTGTTTTGCTGTAAATAAATTTAATTTCATTTGCATAATAAATTAT
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ATTTCTCAATT---TGCCAGCGATTTGCTAACGTTTTGTTCCACCTTTTAATTGTTGTTGATGTTTTTTAATTGGTCTAAATAAAATACAATTTTCGAACAGTACACTAA-AAA
ATATTCTTCTTGAACGCAAATTTTTCATTTGATTTTCATTTTGTTTTCGAGTTCTTGTTAATGTTTTTC------TTTGAATAAAGCGAATCTTT----TATTGCACTAATTAA
>mbf1 16541129 16541740|17481 chr3L 16540970 16541910 scaffold_9 3819499 3820554 - 14682|159 936
AATGATGCTGCCGCGTCCGCCGCCAGTGGTGCTCCACACACGGTCACCTCAGGAC----GCAGCGCCCGGCAACAGAACCATCAACACACGGATTCT---GGAGGCTGGAGCACTGT---AAGCGGCAGACGCAAATAAAGCATTAT-CGGGAGGCTGGAGAACCAAATCAAATCGGGTCATACAGCAGCAGCTGCCGACGCAGCAAACACAGAAGCATACAAAACC--------GAAGATCTAACTAATCACCACTATGAGCGCCAATTTTGCAGTTTTATT----TTTGTACAAGCCAAGGGTTTTGCAACA---------------TTCACAGCGCTTGCCACTTGT--------------------CACTACC---------------TTTGCCGATAAA---TTAACCATTGTAATT----------------------------ACCCAC-AACACATACAGTCACACACGAG-ATGCACACAAGTCGGAAACGGAAGCGAGACGGACGTGAAACGCAAAAGACTAATCTGA-------------TATTAA--------------------------CGCGCTCATAGCTTG---GAGTAGTGTTATTCGTTCATTTTG-GCATTAGAGTATGTTTTGAAACTTAATCTAAGTTATGGAATTAAAAACAAGACATAAAAAGCATGTAAAACACTCTAATTTCTTTCTT------------TTTGTACACCCAATCAGCCGTACAC--AATATTTACATAAACG---ATCCAT
GATGATGCTGCTGCGTCCACTGTTGTGGTCGCTC----------CGCCTCTAAACCATAAAAATGCCAGAC------ACCAGCAACAACCGGAGTCTGGCGGCGGCTGGAGCACCGTCAGCAGCAGCAGGCGCAAATGAAGCACTATCCGGGAGGCTGTCGCACCAAACAAAATCGGGT-------TAGCAGCTAACAAAAAAAAAAAAAAAAAACCA-ACAAAATCACGAGGAGAATGAACGAGTTAATATCTACAACAACAACAACAACAGCAAAACAACCACAATCAATCCAAGCAAACGAAACAACAACAAAACGCATTAAATTCTTTGCCACATTTGCTTTTTCTTTTATTATAAATGCACAACCCACCACCCACCCACCCATTTATTTTGCTGACAAAAATTCAAACATTGTAATTCAATATTGGAAAACAAAAAAAAAAAAAAACAAACAAACACACACACACACACACACGCACGCACGCATACCTCAAGGGACAATGCACAAAAGGACAGACACAACAAACTGAACTCAGAAAAAGATTTATTATTAAATTGAGTCGCAAACAGCTTGAAATGTTGCGCTCATGGCTAAAATAAATTGTTTTGTTTATTAGTTTTGCTCATTTTGGCATATTTTAAAA---AATATACAT------ATTAATATATATACAT-------ATATAAATTATTGT--TTTGTTTATTGAATACATCATGTTTATGCATTTAAATGAAAAAACATTGAATATATACACACACACACACACAC
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GTCGCAAAGCAGCCGTTAATAAACGACAGAGTAAGGTTAAGAAAACAGTTCTAACACGCTGGATACCACAA
ACCTT---GTAATAAATAATATCTAAAAGAATAAAGTC----AAATATTTTCTATTTAATGGACAACATAA
>Rpn12 16549154 16549280|17487 chr3L 16549229 16549445 scaffold_0 6915921 6916147 + -471|0 55
TATAATAATATGTAATTACATTGAAAACAACAAGAAATTAAATTT----AAAACTC
TATAGT----TGCTTTTTGTCTGAAATTTGTCAG--ATTACATTTTCACACATCTC
>CG4169 16551284 16551375|17488 chr3L 16549539 16551351 scaffold_9 1635027 1636780 - 73993|1787 1855
GTATATAAACACCTGTACATCTGTTAACCGTA-ATGTAACGACTAAATAAACCTGATCAAGGGGATCGA
GTAGATAATC----------TTGTTAACTGTATATGTAATT------TAAACCCTGCCGGCGAGATCTA
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GAACCGAAAACAAAACTTCAAAATTGTCGACACAATCAAACTGAACACAAATAAATCCCCCCACTATGCACATAGA-------CACCATACATATAAACGTATATTTGCGTT---CAGATTTGTTGAATTC--CTTCGGTTTT--TGAAAAATTACATGA--------AAATAATTTGAATTGGCTTATTTTTAAATTATTTC-----AAAATTTCTAAACCGAAAGGTAACAGATTATATTTAA------TGACGAAATTACGGTTTCTTATATAAGCTA-------TTTTGTTATGCTTCTAAAAACAAATGTTTTA--------TTACC------TCTTTAAAATATGTAAACTAGTTTTCACAATATATTTTAAAAAATTGTTAATTT
GAACCAAAAAAAAAATTACAAAAGCCAAAGCACAAATACTTTGGGGGCAA-------CAACAATTATACGCATAATATATTTTCACCATAAATATACATGTGTGTGTGTGTTACATAAATTTCTTGCTTTCAGTTTGGGTTTTAATGCTAAGTTACAGGCAGAAAGATAAACAAATGCAGT--GCTTGATCACAAGATATACCCTATAACAATTTCAATACCCTAACGT-CTAGTTTTCATTAAAAAAGTGTGACCATATACCCTGTTTAAATTTCAGCTGAATGTCTAGTTGTCGTGAATTAAACTCCAGATGTTTTAATAAAGTGTTACCATCAATTTTCTAGAAAATCTAAA--AATCTTTAATATATATTTTAGATTTTTATTTCTTG
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CAACTGTGTTAGCACAA---CAGCAAAAATGATCTATATATATATATATATTTTTTATAATTTATTGACATAGTGCTCTATTATATATATATATACATATGAATCTTAGGAGTTCCCCTAGTGTTAGTTCTCTCTAAACAAAACAGCATATATATATGTATATATATATATGTGTGTGTGTATGTATGTGTAAATGTGCATGTATAAAGTCGGCATAATGTAGTCGTTAAGTTGAACGTGATTAGCCTACTCCTCGTGTGACTTTTAGTTGCGACATTCTAGCGCCTGATTTAATCAAATTTAAACCCCCTCCCCCCCTCACCCCAACTCCCTTCCCTCTCCCGCTCTCTCGCACTCTCTC---CTTCAAGACCCGTTCAAGAAATGCAATATTTTTGTATGTTTTTTTTTTAAAAATTAGTTTCATGTGT---TTTATTTATTAATTGAATGTACAAAACCCACACACGAATGTATATAGCAGTTGAGTAAATAAATTTGTAATTATGTAATG
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GCCCACATATCC
ACCTACAGACCC
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TGAAGATGA------ACAA--AACCACGAT
TGACAGTGCCTGATTACAACGAACAATGTT
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GCAGC-----TCAATCAATTAACAATCAA
TAAACATTTTTCAGACAGATAAATTTTAA
>CG9692 16671488 16671693|17595 chr3L 16671512 16672325 scaffold_12 674505 675145 - 5642|0 209
AAATTGATCATTTAGTTTTATATGTGTTTGAACTTGTTATGTTGCATCAAAATTCTAA-TTCAAATCTTATGAGC----------AATCTCTGTGGCACGTAGACTTACGA-------CCTAAACTATG-----GAAGCCCCTGGAGATTGAACTGTATTTTGAATATA---CATTGGCAAATAAAAAAGTTATTTGATT--TCAATATC
ACATTTTTCATTTA--TCAATCTTTTTTTAATTTTATTACGTT-------AATTTTAGCTTCAATTTTTATATATTATTTCTTAAAATTTCTGTTTCAAGTCGTATCACGCGCCCTTCTCTAATCTGTGCAGCAAAAGCCTC---ACATTCCGTTTTCTACTGCTTGTAGCAAATTCGAAAGCGGAAACGATTTTCAAGTGGCGCACATT
>Dab 16688601 16689248|17607 chr3L 16682525 16689013 scaffold_12 682998 689359 - 207550|6452 6886
TTTGACCAACTGTTTGCCAAGGCAT-CGGGGCAGCGACC-----GGATCCGGACATCGATAACCACAACTATGCGGAGATCGATGTGGTCAACGACACGGACTTTTCATTTCTGGCCAATCTCAATCACTACTATCAGCAGCAGCGACTGCACAGCCTGCGACAGAGCTTGAATCGCCATGTTTACTGCAACTTGCCAGTCCAGCAGTTGCAGGAGCAAGTGA-ATCAGCCGATGAAGAAATCC-------ATCGCCACATCTACA--AGTCCCTGGCATGAGCCAAA------GGTCAAGTCGAAGCCGCTGCAGCAGCTGCTGAGGAAGCCGAAAAAGTGGAAACTCAAGCGCACCCTAGATGACTTTCTAAAGTGTCTGATTATTGCGTCCTCGGAGCATGTGTACGATTATGATGTGCTGTGGTAGGATTG
TTTGATCAACTCTTCGAGAAGGCATCCAGCATAGCCAACGCAGAGCAGCCGGAGAGCGACGGCGGCAACTACGCCGAAATCGATGTCATCAACGATGGCGACTTCTACTACTTGACCAATCTGAATCACTACTATCAGGAGCAGCGGCAGCAGGCGCTGTATCAG---CTGCGCCAGCATGACTACATCAATGTGCCC------CGGATGCAAACCAAAGCCACATCCACC-ACGAACAGTCCCTGTCACGAGCTCCACAACAACAACAGCAACAAGAACAAGTCCAAGTGCAGGGTCAAGCTAAAGTCGCT---GCAGCTGCTGCGCAAGCCGAGCAAATGGAAGCTGAAACGCTCTTTCGATGAGATTGTCAAGTGTCTGATTATAGCCTCATCCGAGCATGTCTACGATTACGATGTCCTTTGGTAGAGTCG
>Dab 16688601 16689248|17608 chr3L 16689067 16689901 scaffold_12 689441 690244 - 2327|0 221
CATACGATATTTAATTCGCCACATATATCTAGTCAACTCAATCGCC----ATTTAA---ACTTGCAATATCGTAACACTCCAACGAGGACTGTAGAGTTCCCTCTTACTCCCAGTTCTGCCCAAGC------------CAAAACATCA--CACAGCT--------CTGATCCTAT---TCCAAAGCCAGATTGTATAT------ATAGATTT--ATCCAGCA
TATACTATATATATATATATATATATATATCTCCTAAACAATAGACTGTGATTTTATGTACATTCTGTTTGGTAA-----AAACGAAAAGC-CAGAACGACTTGCTACGACGAGGCTACCCAACGCTAGAGGGCGCTGCATAACATCAACTGCAGTTATTATTAGCTAATAATATGAATTCAAGTCAAGTTTGTATATAGATTGAGAGATTTGCAACTACCC
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GAAAATAAATATGATTAAAAAGGAGAGAAAGAGCCTTGCCATATTCGATTGC----------TACTCGTATC-TCTAAGTTCGTCTA-ACCGTCTTTGTAATATATTATGTATAGATGT---TATAATTTGTACTAAGGTTAAAAGACTCGAAACTGAATAAAACCCTTTTGTGATATTTAAATCAT
GCCGCTCCTTGCCATATGAAACGACTTAAGCGCTCTTTCCACATATTGTTGCAAAGTATTTTTAGACATAGCATCTAGGTTTCCTTAGACGGAATGTATTGTATATTGTGTATATATATTTCTAAAAACTAT-TTAAGA--AAACAACTCAAAA-TGAATAAACAATTGTTGTGATATTTGAA----
>Nrt 16741620 16742837|17654 chr3L 16737098 16742610 scaffold_12 732510 737904 - 149537|4738 5888
GCAAACCAAAATCCCAACAGATAGGCCCTCGCTTCTAAACTTTTTCACCTG-TATTGGTCCGCCTGGGATCGATTATCTCATTCGGCTTTGTTGCGCCTTCGGTTTCTATTAAACTTAAAGTTATCTGGAATATTTCGAAAATTTAAAAATACTTTAGCCATTGGATTTTTAAGTAATAATCGATTTCTTTAAATTTAATACGAACCGATTACCTAATCAAAGCTTAATACTTCCCGACTTCGTTTCGTGTTTAGTTTAGCATAAGTTAATCTAATGTTTATATATATATAAATATATGTGTAACGGATATTTAGTTCTCTTAAA--GTTTAAGTTGAAAG-TCTTAAGTTATG----CTGACTC-------------------------------------------------------CATACGTTTCTTCAT--ACGAGTACGTATTCTCTAATCTTAACATTAACGAACACATAAACACACAGACACAAACA---GCAAAAACACAAATAAAACATCACAAAATATA--CAAAATTATACTTAAAAAGTATAGATC------TGCGTCTTTCAACTATTCA--------ACACACT-------AATCTATATAC-AATACTATAAAC-----CATATACAACTTTATAGGAGTAAATGCCACAGAGGTTTTTGATTTACGAAAAAAAAAGAAAAAACCAGCAAACGACCAACGACGAACATTTTTTGATAGAATTTTAC--AAAACT-------------CAAGACTCAAGAGAGAAGAAAACCGAATTCATAAACATTT---ACTTGGGCTTGGAAATGTCAGACT-------CGTTGCAAG---TCTGAGATCGAAGGACTTTTCCAAAAGTTTGAA----------GTGTTGCAAACATTTCGAGACTGTCAGG---------AATGAATTTAGACAT------CTATTTAAA----CATTCGTTCATTTCCACATTTCATTTAGGAGTATCTATAATTACGCATATACATATATAAATCGGATATTGTATGGATAAAACATTTTTGTATAGCTTTATATGTATATTATTAATCGAACCAACATTTTCTATTGCTTTATACAAGACT------TATCCACAACAGACTTTGAGCATTCACAAAT
G-AACCCGGAATCCCCTTCAACCAGCCC---------AACTCCTACTCCTACTCCTACTCCTGCTCAGA-CTATGACAATGTTCGG--------------CGGTTT--------------ATTAACTG-------TCCCAAGTTCGTTTATCCTT--GCTATC-----------------TCGCCTCCT----------------CCCTCTCCCTACCCA-----TCGAGATTTCCGACTTCATTATGAGTTTAGTTTAGCCTAAGTGAATCTAGTGTTTATATACG---------------AATGTACATTTAGTTCTCGACAATTATTTAAGTTGTAAGTTCTTTTAATATAACGCCTAACTCCACAGCAGCAAATGCATCTAAGTATGTCTCTACTAAACGTAAACATAAACATAAACATACGTACATATATCTATGATAATGTATTCTTTAATCT-----------------TAAAAACACACACTCAGACAAACACACAAACACGAATAAAACACAACAAAATATATTTGAACATATACTTGTAAAGTATAGACCAAATTTGGCGTCTTTCAACTATCCAAAAAACACACACACTTTCACAAATTCTATATACTAATTATATATATATATATATATACATATATATACGATTTATAGCTGGAGCGTTT-----------------AAACAAAAAACCTT----TGACCAACG----ATCTTTTTTGATACAATTTTACATAGAACTGGGGCGCTATAGACAAGACTC--GATATTACAAAACTAAAGAATCAAACAATTTAGATTTAGATTTAGTGAGGCCAGAACAGGAGAACGCAGCAAAAACGCAAAAATCGAAAA------CAAAAAGAACGAAGTAAATATACGTGTGTTTAACATTT-GAGACTGTCCCGTGGGGCTACAATTTACATAGACATTATGTACTATATAGAGTTGAATTGATTTAGTTTGACA-TTCATTTGGA---ATCCATGCCAGCCCA-ATACAAATATGCATC---------------AAAACATTTTC-TATAGCTTTAAATGTATATTA-------ATCAAACATT---GATCAACTTATGTAAAACTAGAGTCTATGTATAA-ACATATAGAATGTTTATAAAT
>Nrt 16741620 16742837|17655 chr3L 16742611 16744888 scaffold_12 738093 740405 - 66702|0 283
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TGAAATCAAAAAAGAGATCTTCAAACATAAAGAATTTAACATTATGGTCATGATATGTGTACAGATGATCGAATAATAAAGAAGGATACATTTATATTTCAAGTTTTTCTGTGTGCGTGCGAAGCGAGCATGAGAATGTTTAAATAAAAAGCCACAATGAAACATAACTCTTAAATGTTTTAACTAACAACTAG--TTACTAACTAATT---ATCGGTA-----------CACAGTACGCAGCCGAA--------TTGTCACAGTCTTTGCATGGTCAA-----
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----GAAACCATTTGC--------------------------------------------------AAAGGCCTTCCA--AAATTTAATT-AACTGGAGCACGTCATATCCGGGCGCAAACAAAGCAAATGAAAAAACAATAAATATGATCAACAACAGCAGCAAAAACAGTTGGGAG-ACGACGCTCGAAACAG---AAAAGAAGC--ACAACAAAATAAAATATAATAAGAGTAAACGAGAGCAAGCACACAAAGCGACTTTATCAATCGTATGCCACACAGCCAGCCAGC--------------CAGTTTCAATTAAAAATCTTTATTATTA-TTAAGCTAAGCT---GAAAT-ATATTAACCCATGTCACAATTG-TGTTAGACTTTTTTGAAAAGCGATG------CGAAACCAGTTTGAAGAATTTATGAATTTGTCTTGAAATGGAATATGTATGT---------ATGTGTTATTTAGGA----------ACGGCAGTTTCGTCATTTTGATTTGGAGCCTGTAACAGTATATGAATATACTTAATTTTTGAATTATATGAAATAATTAATATGTAAAAGCAAAGC
>CG9706 16750311 16750510|17659 chr3L 16748564 16752193 scaffold_12 758148 761728 - 181114|1768 2021
CAATCAATAGTGTGATC------CGGGGCCAG----ATCGTCATAAAGATCCAGCACCCACTTGTAGGTACAAACAACTAATTCTAGGATTAGCAGACGTTTGCATTCTGTAGGCTAGCGAAATTACAAATTC----------------------CCGCCTTGGTATTGTTTTTTGTATAACTAATTTTGATTCCGAAGGAAATAAAATCAAATGTTGAATTGA----------------------GCGAATGA
CAACTAATCGTATGATCTTCGTTCTGCGCTAGGCGCACAGTCATTGGTA-CAAGAAGCTATAAATAGAGAACTAGAACTAGGACTAGGACTAGGACCCAATTGCAT--TATAGGCTAGACAAATTGTAAATTTTTGTAATAGCCGCGGCTCTCAACGGCCTCCGTATTGTTT----TGTAACTTATTCCATATGGAAATTAAATTAAATTTGATGTTAAATGGAATACAGCATTGGCATTCAGGCTGCGAGTAG
>nudC 16784679 16784801|17685 chr3L 16783556 16785323 scaffold_12 792130 794038 - 29318|1182 1329
TCTA-----------ACATTC----TCAACTTAACTTGTAAACTT-----TCGATTTCGCACTCTTGT-----CACTTTTACACATTTTAAATGTAAATCTTTTTCATTTTCCAACCACACAATAAACTAATGCAAGCAAAATGAAAA
AATACAGTTTACATGACTTTCGTATTCCACAAGTTTTCTCAACTTCAGTATCTAACACACACACACATACACACACACGCATACATTTGACATGTGTG-CTTCTGCATTTTTC--CTACAC---------TTACAAATAAATTAAATA
>TSG101 16809653 16809845|17716 chr3L 16808180 16810254 scaffold_32 802023 804046 - 66803|1497 1709
AA------GAGCCATGATTTCAACA-GTTGCCG---TGATTTCTTATTCGACGGGGTAGTGCGAGCACG--------TGCAGACGATTTATATGTTACCATCAAAAATATTCGATA-AGTTTTAAGCGCAAATTGAATCTTAAAAATTGAAATTATA-ATAACAATAATCCTAAATAAAACAAAGGCCTCATGTATGTTAACGCCCACGATCA
TAGGATGTGAAGGATGTGTCCAATATATTGCAGGAATAATTTCATTTGCAGTTTTCAAGTGCAACTAATATTCAAGCCGCACACAATTGATATGTTATTAT--AATATATTCGGTATTGCTTTAAGTTTAAATTAAATCTTTGAAATTACATACATGTATATGAATAAACCCA-----------------ACGTACGTTCGCACGCGCATTAA
>CG32161 16812243 16812254|17718 chr3L 16811426 16814875 scaffold_32 805022 808237 - 50333|836 847
AATTGGTGCTAT
CA------CAAT
>CG9715 16817476 16817618|17720 chr3L 16816927 16817590 scaffold_32 810378 811060 - 15447|606 720
GGATTAGCCAGGGTCATGGAATTTATTTCCTGGTGGGTCACCTTCATTTTGTTTAACAAATGCCAACAGATTTCACAATGGGTATCTTAAAGATATTACCCAAAAACCGAATAAA
-AATTAGTTTAGTTTAAGAGA--------------------------TGAGCTTAACAAGTG------GATTCACTCGTGGGTATGTCAAGGATATTACCCAAATACCGAATAAA
>sina 16822622 16824209|17725 chr3L 16821278 16822622 scaffold_32 816602 817927 - 66769|1366 1366
A
A
>sina 16822622 16824209|17726 chr3L 16823282 16824167 scaffold_32 818271 819124 - 9055|0 948
GCTTTAGTTTAATTTAGTTCGTAAGGTCCACACACCTGGAGCAGAGCTGCCTGCGCGTGCCCACGTGCCCACCACCTACTACAGTGAACGCTAGGAACACACAGACCCACTCACCAAAACGAGGAGAACAGCAAGAAAGGCGAGGAGGTCACTCATCCACTCGAACATGTACTGCAAA----GTCTAGTTTAGTTAATGTAAATTATTTTATACA--------------ATACTTGTAAATGGTAATAAGTAAAACGAACAGTTTAACGAAATTAACAAACCTAATAACCCACAAAGAAAAGT-AATATTTG-ATAGCGATAATCTGTAATAACTCGAGAGTTGTTTGAAAGTTGCAGCCTAAACGAAACTGCGACCCGCAATTTTGTTCATGCCAAACCATCACAAAATA---ACAAAAACACACTAAAAAAAAAAGAAAACATTTTTTTTCGCAATGCTAAAAAGACAGTTGCCCCTTC--CCATTTCCCCCCAAGTCCCCCCAAACATA------TAAAGCAATGTTAATGTTTAAATTTCTATCTAGTTAAGA-CGATCTCCCCGGTTTGGCTCA--TGTTTTGGTTTTGATTTCCATTCGGCCAACGTTTCCCAATCGAAAA---CGGAAGAAAAAT--TAATGATTTTAA--GCATCTGCACCGTAATTAGCTTTTAATGCGCCGATTTACCGCGCCAC------TACCATATGAGATCACTCACACAGACACAAAACTACAAAACT------------GAAATAAACATGATTAGTAAAAGTAAACAATGCTCGTTAATTATTG-AAATTAATCTGGGGGAAGCTGAATTACAAAG---AAGAGCTACGCCACTTTATAAACTTGTCGATTTAAATCAGTTATCTGTTTAATTTGGATTATCTTTGAGATACTTGGGTTACTTCTAATGCGTTTTAAAACGT
GTTTTAGTTTAATTTAGTTTGTAAG--CCGAACGGCGTGGGCAG------CTGC-------CACATAACGTACATCCAT---------------AAATACATAAATACA-TCCCTAAAA---GAAAAACAAACACACACACA-------CACACACACACACACACACGTACACTAAATGCAGCCTAGTTTAGTTAATGTAAATTATTTGATACGAACAACAACAAAATATACTTGTAAATGCTATAAAAGTAAACATCACTTTTAACGAAATTAACAAGAATAA-AATCTATAAATATATATAAATATATATATATAAATAATATGTAATAACTCGAGAGTTGT------------------AAGCGATTGCGAC---AATTTTTGTTTATGCCAAAAC----CGAAACACACACAAAACTACTTTTCTTTAAACAAATTCGCCCTCCCCTCCCACTCAAAAAAAGACAGTCAAATTTTTAGTTCTATCCAAACAAGAAACAAAAAAAATAACAAACAAAAGCAAT-CTAAAGTTTAAATT--TATATAGTTTAGACCGATCTCCC-------GCACAGTTGATTTTGTTTTGTTTCGCAAACACTCGAAATTG--CAATTGGAAATTGTGAATGAAAAGCGGTTTTTCTTTTAAATGCAACCGTAATGTATTTAG-TTTTAATGAAAACAAAAACCAACACACATACATTCACAAACACAAACACACACACACACACGCGACAACAACAATTAAAGAAGAAGAAAAATAAACGTGATTAGTAAAATGAA--AAGTCTTATCAATGAAAACGAATGAGAATACAAAAAGTTTATCTACAAAGTGCGAAAGTT-------TTTATAAAATTGCACGCATACAGCATATATATGATATATTTGTATGCCCTACTAGA------GGGTACTTTGATTATGTCATGAAATGT
>CG13029 16826319 16826510|17728 chr3L 16826017 16826964 scaffold_17 1751722 1752541 - 923|302 493
AATATTTCTGTATATCCACGAAAAAGCATTTGTAAAAAGTGGATGTGCGGATACTAAACATTATTACAAAATATGTATGTGACACTTAATACAGCCCAGATCCTGGCACTGCAAAGTGTGTGAATGCTGCATTCTGAGGCGGGATCATCACTGCATCTTCACTGCGACTTGCGTTGGCCACACTAATTACAG
--------TGTGCACCCAC-----------TGTCAGATGCTGGTG----------------------------------------------CCGCCACGAGCCTGGCACTGCCGTCTCTGCAACTGTTGCATGCTGAAGCGGGATCATCATTGCAATGTGACGGCCAATTGTGTTGGGCATCTCAAT-----
>CG13029 16826569 16827103|17728 chr3L 16826017 16826964 scaffold_17 1751722 1752541 - 923|552 982
GTACTTTTTCTGGTTCACAGTTTACATGCATA--TTGGATCACTTTTGTCATTGGCAACGCATGTAAATCTGCT-TATAATTGATGAACAAATTCGGAGGCAATATGTTGTATTACACTTTTCACGCTTTTTCCTATTTCTCAAACCAATGAGC-----------TGCGAGTTAATAGCACTGAACATAAGTTTCATCATCAACATCTATGCCTGCATTCTATCACTCATAATGTTGGGATATCAGATACCAGCATTGTATCTGAATACCA--------------------CATTCTATACGCCAAAGGATTATAGATACAATCAAGGGCTACTGGGCAACTTCATGGCC-TTCATGGGAAAACGAGGCCTCTGGACATTTATTTCGCCCAGCATTAGGAGTCCTCTGCCCCACGATGGAACTAAGTGGCA
TAGCCTGGGCTGTGGCATTGCCTTCGTCTACAATGTGTATCATCTGTGGAGCCAGCGCCAGATCTTGTTCAGCGATCCCATTGGCTA------TTTGAGTCTATCTATGGGCTTGCG--GATCGTGAGTTTCCCGGGTCACAACAACAATGATCCCACAATCGATTCGAAATTGACCTGGCTTATCATAAATGGCGGCGTTATCA-----AGCTCAATATTTTCGC-CATGATATTGGCCAGTTCGCACCTGATCCTGCAGCTGATCATGATTAGCCGCGGCAGCTGTTTGTATTTTGTACGT-----GATCGTAGCTACGATT-TTGGCTTTTGGCAAAATCTGCAGCTGGTGTTGGGAAAGCGTCTATTCTGGACCATGTTGTCGCCGCTTGTGCCCAGCCCCCTGCCCCACGATGGCACCCAGTGGCA
>CG9951 16830173 16830258|17730 chr3L 16828414 16830544 scaffold_32 822288 824440 - 68679|1790 1934
TTACGCGGA-----------------------------------------------------------ATCACTTGTTTACCAGTGCCAATCACAATAAACGAATTGATGCACGCCAAGCGTTCATTTTATTAGTAAAAAATAAA
TCGAGTGAAGGGGGAAGAGGTGAGAAGGGTGGAGAAGGAGGGGCGCCCGCTTAACGATATTAGTATATATTACTTATGTATTAGTGCCAATTACAACAGA-----TCACTCACGCAAAGCGTAGTTTCTCGTAGCCAATTCTCAA
>CG11915 16872088 16872423|17778 chr3L 16868366 16872374 scaffold_32 869091 873025 - 105804|3978 4286
TCATAAGCCAAGTCAAGCCAAGCACAGCCCAGCACAATCCAGTCCAAGCCACATCCAAAACCGAGCACG------CTGTACACGAATTTAGTCCCAGTTAAAGATCCAGT-----CTCCAGAA-----TCCAGCATCCGCTCCTCT-GACTGAGGGTAAACACCCGTCCACGGGATCCCAGAGATTCCGATCTGTATAAACTATGTAATTATACTAAC-----GACCCAGAAAAAAGCCTTGAACCCAAGAAAAAACGAACGATTGAAGGATTGTTTACCATAGCTGTTAGTTTACTTAACACTTTTGT
TCATAAGTCCA---AAACCAAACAAAGCACA-CAAAAT---GCGCACGCTGTA-CAAAAACAATGCACGACTATTTTGCACCCAGTTCCAGTACCAGTTCCAGTTCCAGTTCCAGTTCCAGTACCAGTTCCAGCATCCACTCCGCCAGACTGAGGGTAGCC------------------------------------GAATCATGT-ATTATACTAACGACCAGACCCAGAAAAACG---------CACGAACGATCTATAAATCGAATGAGAGCTCTATTGAATTGTTA-TTTATTTATTATGATTGT
>Lmpt 16886854 16887754|17790 chr3L 16885510 16887736 scaffold_32 889794 892005 - 54827|1404 2458
-----------------GGCGTCTGCAACGAGTC-----------------------TGGATGTGGGAGAGCTGTGGAGCAG-------------------CAAGCTTAAATTAGCCATAAAC---------AAATTCAACGAAATTATGGATCAAATCAGAGGGATACTTACAAGTGGAAAACGATGAAGAGGAATATACACAGATGTATTAAACGATATACA-AGAGATGATAATGCCTTACACTTAC------ATTAGATATGAGAAAATTAGCTGAA-------------------------GCTGATGATGA-------------TGATAATGATGATGAGTCCTACTAAATC-------------------AAAAGCAAATCAAAT--TTTGTAAAC--TTCAAGTCGATAGTGTTAG----CTAAAATCTATGGTAACTT--TGCTTTATCTTCACGCGAGTAGAGCAGCACATCAGATTGTATAGAA---------ACTTATTA---TTTGTAATTGCATTTCAGAACGAAATCAAAACCACTAAACAACAAAAAAAATGGAAAAACCCAAAAAAATCAATATGAAATACTGATCCAATTGTAACTATTGTTGCCACAT-----TGAAAAATGTATGTTTATTTATTTATTTTAAGTTT---TAACCAAGCGACGAGCGAGTCGAACGCGATG---AAAGTTTCCTAACCGCTGGTTTCAGTTCTAAACAGTTCTATT-------GTATTAAAAACCACACACGATTTATGTTTGATATATATATATAGTAAATTATGTTTATTAAACAGCAACACAAGGAACACACACGCACACAGACACAAGTCCTAGCCATTGAATGAATTGTTTAGTTTATATTATTTTCGTTACGATCCCTTCGTCCTTTTATCTATTTACCTATTTTAGAGACTCCGCTTACTTGAAGCACTAAATACACACACACACACAAATAATAATGATAATTGCGACACAACATTATATCAATGTCCTTAACTATTTAATGAAATTCAATCTAAATAAATTAATAA
ATGGCAAACCAAACTGCGGAGTCC-CATCAAGTCAATCAAATGGCCACAGGAGAAGAAAGAAGGGGGAGAAGAGCGGAGCAGCTGGAGCGGAGGCGGATGCCCAGCGTTAATTAGCCATAAAAATTAAACAGAAATTCAACGAAA--ATGGATCAAAAATCAGCAAT------GAGCGGAAGAT--------------------GATGTATTAAACGATATATACAAACAAAATATTGCCTTACTCTTACACATATATTAGATATGAGAGAATTAGCTAAACAAAGTCCTAAAATCAAAAACAATTTCAAATGAAGAAGCAACAAATTTTTGACTATTGT-ACGAGTGCTTGTATACTTATTAATATATAGCTGCCAAAAAAAAAAAGAAATGCTATATAAACAAAACAAATCAAAAAAGAAAGAAAAAAAAAATCGCTTGAAATTTGATATTTTATTTGTGCTTAATT----------GTCAAATTGTATAAAATATATACTTATTTATTATTTTTTGTAAATGCATTTGAGCGCGAAAACAAAACC-TAAAACCTAAAAAAAAAAAGAACAAC------------AAATGGAATAT-------ACTGTAACTATTGTTGCCACATTTGCATAATGTATGTATGTTTATTTATTTATTTTAAGTTTTTCTAACCCACACACACAC-ACACACACGCAGTGCGAAAAGTTTCCTAACCGCGGGTTTCAGTTAAATATATACTTATTTTAAATGTTATTAAACAAAGCAAACCAT---------ATATATATATATATGTGTGTGTGTGCAT--------------GCCAACACATACACACACATGCACACGTCCTTGCAAT----TTAATTGTTTAGTTC--------------------------TATTTTTTTATGGTTTCGTATTGTAAATGGAACACTT------TGCGCTAACTAAACACCCACACATTATTATT--TTACATATGC----CAACAAAATGTCAATGTCCTTAACTATTTAATGAAATTAAAGCTAAACAAATTAATAA
>Lmpt 16886854 16887754|17791 chr3L 16887737 16888153 scaffold_2 2368869 2369274 - 119|0 18
ATTATCAACGAA-AATGAA
ATTAAAACCGAATCATTTA
>Nc73EF 16932741 16933344|17825 chr3L 16930215 16933531 scaffold_12 881315 884900 + 41542|2939 3599
GG----AGATGG-----------GTCTTGATGAAGATG----------AGATTGGGATGAAGATGGAGATGGAGACGATGAATATTAATTACGAT----TATATTTTGT-ATTGAAACGTATG----CAGACTCTTTGATACGATTTTTTGCTGACGAAATTGTTAAGAGCATTGTGTGAAAGTAATGAAATGTTAAATATTAGTTTAGTGAAATTACAAGAGCTAACGGCAACCAAGTAACAAATAACACGAAATGTTAAGTGTTTAGTAAAGAATCAAACA----AAACGAAAAAGAACTACAA-------CCACTCACAGCAAGTCTTTAATACAAACTAAAGAGCCAAGATCTAGTAAATAGCCAACTAACCTATGCGCATACATTTGAAGTGATGAGAACTCG----CATAGGAGGAGGATATCACTATACTTTCGGAATGAATAAAACCCTTTATAATCTTATTTCTTATTCCTATGTTTAATATTTATTTTATTGTAATATATATAACTAAACTATCTCAAGCCACGCGAAGTTTTGACACCCTTTATCG---ATCGCAGGC-CAAGAAATCATT-AGTGTTTTTGTTTGCCTAAGTTACACATTTTTGTTTAAATAAATGAACAAGTATA---ATACTTAACAATGACAAACC
GGCGTCAACTGGGATATTTGGCTGGCATGATGATTATGAAGAAACCGAAGAGCAGGAAGCAGATGGAGTTGAA----ATGAATATTAATTATGATTATATATATTTTGTAATAGAAACGTATGCAGACAGACTCTTTGATACGATTTATTTCTGACGAAATTGTTAAGTGCATTGTGTGAAAGTAATGAAATTTTAAATATTAGTTTAGTGAAATTGATGAAAATGATGAGCAAAATCCAACAAG-AACACGAAATGTTTAGTGTTTAGCGTTAAAACAAATACAACAAACAAACAAAAACAACAACTGAAATCCAATCACAGTAAATCTTTA----AAGTAAAGAATTCAAATTCTAGTAGATAAAATACAAAAC-ACACACACACA-------CAACACACACTCGCAAACATATATATAGAAAGCAAAAACATTTTCAAAATGAA----------TGTAATTTTATT--TTACTTTTATGCTTAATATTTATTTTATTGTATTATATATTAATTAACCATCTCAA--CAACTTATGAATTGCAAGTCCTTGTTGCAAAACGCAAAAGAAAGAAATCATTAAGTGTTTTTGTTTGCC-------------TTTGTTTAAATAAAAGTATATATATAAACATATATATATATATATATAT
>CG3799 16959401 16959660|17859 chr3L 16955774 16959516 scaffold_12 911340 915079 + 148107|3777 3918
CTTCCGGCTGC----TCTTGGAAAACGGGGATAATA-TTAACTAGCAACGCCAACTCCATAGTCC----------GCAACCAATAGCCGTACAC-----------TTTAGGAAATGTGATAATTATTTAAATCGATGTTAGT
TTCTCGCCTTCGCCATCTCCCAACCGGCCACTCATAGTTGGCCGAGTATTCAAATATTATAGTCCATCAAAAGATACAATTTGTATAAGTACATATATACAACAATTTAGGAAATGTGATAATTAATTAATTATGTATTTGT
>CG7728 16985438 16985529|17883 chr3L 16981838 16988135 scaffold_12 935552 941769 + 256414|3634 3725
TTTTATTCTCGAGAGTAATCAATGGACAATTCTTAGGCATTTTGCTGTATAAAATGTAGATATAACAAAATAAAATGTTTTTAATAATTGAG
---TAGACCCTAGGATAA----------------------------GCGTGAAAATAAATTTGTACAATTTAGAATGGTTTACACAACT---
>Fit2 16992065 16992378|17888 chr3L 16989811 16992393 scaffold_12 942190 944733 + 120335|2302 2632
TACCATTTATTGCTCGATTTTAATGGCAGGCAGTTTCAATTGTTCGAATTTTGTTAAGATAAACCACTGTTTTAACTGATAACCAACTGATAGACTCACAACTTCAATGCAATACATGTATTTAATTTCACTTTATTTACCTTTTAACTCGTTG---TTAACTAATCTTGTTGATGATTTTTCACCA--------CGAAAATC------GCTTGCCAATGGCCTTTTTGCCTGCCCAACACCTAATTAGACTTAACCGTGGCCTTAGCAATGTTTTTGTATAACTAACTCTTAAGTGTATATTTAAATAAAAATCCCATATTAAAATTCAA
ATTGAATATTTTTGCTAATTTATTGA-----------AATCTTTTG----TTGTTGA-------CAGTGGCCTTGCTTAGAGCCCATT------TTTATAACCTGACG--AATGTCCCTAATCATTTTTGGACGGATGCCTTTTTGAAGCGTTTATCTTAACTAATCCTG--GATGGATTCTAACTGATTTTAACTGAAAGTCTACAATACTAGCCAAGGGCGCTTTTGCCTTCCTAAC-----------TTTAA---------TAACTGAGCCTTTCTACAACTAACTTTTAAGCAGAAAT-------AAAATGACGCAT-----TCTAA
>CG7730 16994851 16995077|17891 chr3L 16994489 16994999 scaffold_9 1757570 1758079 - -797|367 533
GCTGATTCCATGGTTCGAGCTGTCGGTTTATTAAGTGATTTAGTGATTAATAGATTGTGATACAACAAAGATTTGTTAGCCATCGTGACTCA----------TTTGTACTAGGATTG-TAATAATCTTTT-------AAGCCTTTATATGCGTCTTCTAAACCTAAT
ATTGGATATATG-----------TGCTTTACAAATTTAAGAAACGCGTCACAAGGTGGAATGCACAAAAAA----AAAACAATCAT-ACTCAAAATATCAATTTTGTATTTTTCTTATTGATAATCTGTTCGTTATGAACGCTCGACAAACATCATCTGTACCAAAT
>CG7730 16994851 16995077|17892 chr3L 16995069 16995756 scaffold_9 2860489 2861283 + 11564|0 8
TTCCGATCA
TTACGATCT
>CG7842 17002098 17002119|17899 chr3L 17001009 17003320 scaffold_9 2865291 2867742 + 103870|1095 1116
TCTTGTATAAAAATTCAGTTCG
TTTATTAAAAAGATTTAGTTAT
>CG7853 17009634 17009731|17905 chr3L 17007884 17010327 scaffold_8 573067 575554 + 80390|1861 1978
A-----ACGATACCAAAA---------ACACTCACATTTTAGTTGAATTGGAAGCATGGGTTTTCTATAAGAAAACCATTAAATATAATTACTTAATTA-----CATTCTAA-ACAAA
ACGTCGAGTGTACCAAAAAAAAACCTTAAATTTAACTTTTAGTCGAATTGGAA-CAACAATATTCTATAAGAAAACTATGCACTATGCTTAAGTAAACATAAATCATTTTACTATGAA
>TpnC73F 17011847 17013649|17907 chr3L 17010909 17011885 scaffold_32 1474606 1475620 - 24476|1031 1069
ACGCTATTTTTACAACGTATGATAGATATAGTCGAAAGT
AC----------CAATTTATGCTGGAAACAATTCATAAT
>TpnC73F 17011847 17013649|17908 chr3L 17012456 17013703 scaffold_32 1475686 1476967 - 37402|0 1353
AGATGATTCACCATCGAGTGATGATTAAATTTTAGTTACTCGCTGTCATTGATTTATGATCA--TAGTCGTTTTGGTTGCCCCATCATTAGCCGCTGGCTTTCCAGTCGTTTTTGCAGTTAATTATAAACACTTGGA----ATATTTGGCAC--ATTTCAGAGTCCGGTCGCTTGGAATTCGGCGAGTTCGTCCAGCTGGCTGCCAAGTTCATCGTGGAGGAGGATGCGGAGGCCATGCAGAAGGAGCTGCGCGAGGCGTTCCGTTTGTACGATAAGCAGGGCAATGGCTTCATTCCCACCACCTGCCTGAAGGAGATCCTCAAGGAGCTGGACGACCAGCTGACCGAACAGGAGCTGGACATTATGATCGAGGAGATCGATTCCGATGGCTCCGGTACAGTGGATTTCGATGGTGAGTGCCCATTCCGTTTGATATTAATACA----------------------------TTCTAGTGGCTTTC----------------------CATTCACATCCATATCCATATCCACCCACATGCATACATACATA-------TATATGTATAGT---------------------------------------------GATCATAA----ATTTCGATGATCTTGAGATCGCTCGATTATGACAGCTTG-ATGTGATCAACGCTCCCATGGAGGAGCATATCGTTGGCTATTTTTGG--GCGCGACACACAAATTCGATTC-------CACCACACGCATTTTTCATTCTCGGAATAACGTACATATTTACATTTTGTTTTCGTG--------TTTATGGA-------ATATTTATTTATAAATGCATATAGCGGTTGCTCTGGCGCGATGGCATCGGTTTAATGTCTGTCATTTTGTTTAATTTACAGAATTCATGGAGATGATGACTGGCGAGTAAATAAACGCAATGCGTCTGCCACCCACCAACCGCCAACCCACCCTGGAAAACACCACCCACTTTCCCACCCTCCCAGAAAAAAAAAACAACACACACATGCACACTCTACACACACACACAGACGCACACGCACACCTGTTGGACACACGTTTGTTTGCTCCTGTTTGCACACTTGTTTCGCTTTTTATTTGCATTTTGCCCCAACCATTTTACCATTTTTTTTGTTTTTGTTTCGCGGAGCAAACAAATCCACGTACTTCAGTTTGACA-ATGCCAAACACGAGTAGAAATAGAACTTTTGTACTACTTTTTTATACTAAAAGAAGCAACGGAA--TACTGTGTATGCGAA---AAAATAAATGT-----------TATGCCA----TGGCAAAAAAAAAAAATGAAAAAAAAAAACC
AGCTGCTTCAATTTCG-----TGGTCATATTTCATACAGAAAGTGTCATAAATTTATGAACAATTTGCCGTATATTATACGGAATTATTTG-----AACACTTCCAGCTACTTGACAATTTACTAAAAATATATGCATACTATATTTGATTTTGATTATAGAGTCTGGTCGCTTGGAATTCGGTGAGTTCGTGCAGCTGGCTGCCAAGTTCATTGTGGAGGAGGATGCCGAGGCCATGCAGAAGGAGCTGCGCGAGGCGTTCCGCTTGTATGATAAACAGGGCAACGGCTTCATTCCCACCACCTGTCTGAAGGAGATCCTCAAGGAGCTCGACGATCAGCTGACCGAACAGGAATTGGACATCATGATCGAGGAAATCGATAGCGATGGCTCCGGTACAGTTGATTTCGATGGTGAGTACAAA-AAAATATGCTATAGATACATATGTATGCATTTAGCTTTTGGAATCGTTTCTAGTCGCTTGCGAAAAGCGCCCACGTAAACACACACACACACCCACACCCACACACACACACACACACACACACACAGCCCATTTACACCCACAGTATGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGTAAACATCAGCTAGATGCTTGGATGACAACGCGGTTCTGTTGATCTTGAGTT--CTCGATTATGACAGCTCGCCTCTGAT---------CGTTTTGGAGCATATCG-AGGCTATTTTTAGGCGCGCGACACATAAATTATATATGAAAAAAAAACAAAAACAAAATAGTTGTGTGGAATTACGAATTTCCATATATTTTGTTTTCGTGGCATACATTTTACAAATGAATATATTTTTATTTATAAAGTCGATT--CTGTT--TCTGGC-------TGTCGGTTTAATGTCTGTCATTTTGTTTAATTTACAGAATTCATGGAGATGATGACCGGCGAGTAAATAAACCCAG----------ACCCAAGAGCCGC--ACACACACAGATACACACTG-----------ACACACACAG--------------ACACACACAGACACTACCACCACACTTACACACACTTGCACCCACCTGTTGGGCACACGTTTATTTGTTTATATTTGTACATTTGTTTCATTTC-------------------------------------------------------GTAAACAAATCCACGTATTTCAATTGAAAACAAGCCACAAATTAATAGCATTA-AACTTTTGTACTACTTTTTTATACCAAAAAAAAAAAAAAAAACAACAACGAAAACAAAACCAAAATAAATACAAAAAGCTGTGTATGCAAAAAGTAAAAAAAAAAAAACAAAAAAAAAAAAAACC
>rogdi 17019626 17020715|17916 chr3L 17019240 17021079 scaffold_32 1480373 1482056 - 37224|394 1556
GACGGGAATGCGCCGGGAAATGGAAGCCGGGTATGGAAACCCTTGATCGATGGCACTGGTGGATCGGCGACAGAAACAATAACAACAATAATAGCTAATAAAGAAC-CGTACTTGTAATAGC-GAAGTAAATAATGTTAGTTGAAATGTTGCTACTGGAAACGGCACACCCATAATACCCATGCATACTATACTATATACTATACTATACAATACAATACTTTAAAACACTATACTGCTATATACAGTAGTGTATAGAAAGTTATATACATACATACATGCATACAACTAGTTTAATGTACACAATCAACATTCATGTT--------------AAATTACGACTACGCAGAACCTGAGTTCATCGCTTCACGTCACTCCAATTATGCATCAAAATGCATCTAAATAGCATTAGGCTGAGAATTGAGAACAGAGAACGTTTGTGAAAACCAATTGTGTTT-GTATGTGTAACAAAATGAAATTGCTAGATAATTA-TAGTTTATTCGTACATGTAAT------TTAATG----------TAATGTAATACCATGGCCCT-----------------------TATTTATGTTTGCTACGATGCAACAAAATCCACCAAGTCAGCAGTCAATCGGTACTTAA--AGTCGGTACTTACAA-CGTTTATACCCCCTAACACAGCCCCCTATATACATACATACTTAGGTGCACA--CGGAAGGGGCATCTACATCGGCATTTACATGATATTGTTGTAATAAACCAAACCGAAATGTGAACAGAATTTTTAATTGTACTAAACTAAACACCGTTTTGTATTCGTATTCGTAATTGTATATCCGTAATTGTATTTCGCGTACTCGTTAATGGTTAATGGTTAAGAGCGCCCAATCCTAATCTAATCCAAAGTCATTTGTATCAACGGCCTTT-ACTTCTCGTTTACTTTATACATCTACCAGGGAGTTTATAAAGATATAGAAAGTTATTGAATGAGATGCAACGAAAACAATTACCACTGTACTTATTGAATATTGCAATT--GCCTAAGCACCCCACTAAAT--GCATGGGAA----GAGAAGAC--AACTATTTATGTAATCACTAAGCGTACTTACTGTCCACATTCATTTACTTGTTGTTGAATAAAAATTACCTTTTACCAA
-ACAGGA---------TAAAGGATATATGTGTGTG------TCTGTTATTTGGCA-------------AAACAAAACAATAACAACAATAATAGCTGATAAAGAAAATGTACTTGTAATAGCTAAAGTAAATAATGTTAGTTAAAGAGTTGCGCTTTGTGACCGCATAAC-GTAATACC-----------TACTATATAC-------------------------------ACACATATATATATATATATATACAGACATATATATATAGAGTTATATACACCTAACTAGTTTAATATACACAATCAACATTCATATTGTTCATTGCGCGACAATTTATAAGTAT--AGAATTTGTTTTCATTGCTTCATGTCACTCCAATTATGCATCTAAATGCA-------------------------------ATAGAA------TGAAAATTTACTGTGTTTTGTATATGTAACTAAATGAAATTGCTAGATAATTAATAATGAATATTTATAGTTAGTGCGGCGTTAGTGCGTACATTAATATTATAATGATATAGATATAGAGATATAGATATATCTATATATATTTATGTTAACAA--ATGCAAAAGAAGT------GTGGCAAGTCAGTTAGTACTTAACAGATTGATATATATAAATATATATATATATATATATAACG---TGCATACATACATTATTAACCTTACGATTTAACTGAACATGAACATTAATATTTACAGAATAATGTTGTAATAAACCAAACCGAAATGTGAACAGAATTTTTAATTATACTAAAC-----ACCATTTTGTATTC-------------CATGTATGTATGTGT------------------TGTGTAATAATTAAGTGCGCC------TAATCTAATCCAAAGTCATTTGTATCAACGGCCTTTTACTTCTCGTTTACTTTATA--------------TTTATATAAATGATGA------------GGGATGCAACGAAAACAATTACCAATGTACTTATTGAATATTGTAACTATGCCTGTGTAATTAACATGATTCGTATGGAAATTTAAAGAAGATGAAACTATTTACGTAATCTCTAAGCCTATTTAATGTCCATATTCATTTAATTGTTGTTGAATAAAATTTGAATTTTACCAA
>CG7724 17023674 17023792|17919 chr3L 17022237 17024689 scaffold_32 1483296 1485590 - 75111|1437 1557
G-TGGAGCTAATCCCCTATTACGATAGCATACTCCTCGATA-TCCTGAGTGGATTTGTGTTTACTGCCCTCTTTGATGTCCTGTAAATATCTTGTTAAATAAAATGGTTGTTGTTTGTATT
GCTCGAACTTTAAGCGTATTACTCTTTTGTACTGC---ATATTTCAGAGTTTTGTTATGTTT-------TCTTTAG------GTAAAT------TTCAATAAA------TTTGGGTGTTTC
>CG32175 17162302 17162619|18079 chr3L 17162605 17163207 scaffold_9 96492 97149 + 15787|0 14
CACGTGCATCGCTGC
CACGTGCATCATTGA
>CG7707 17209924 17210013|18155 chr3L 17209875 17210091 scaffold_164 4415 4650 + 837|52 169
AGATGTATGTG--GACGAAAATGCTAA--------ACAAATT----------AACGATCATGT----AACATTTAATTTGAA---TACAAGATATTTGACGTTTTATATA-CAAAAAA
GTCTGTCTGTTGCGAAGAAAATTTTAATAATCGCTGCAAGTTTTGGACCTGGAACTGTCATGTTCGGAATACTTCAATAGAAGTTTTTCAAGTATTGGAACTTCGATACAGTAGAAGA
>CG7692 17322725 17323402|18301 chr3L 17322591 17323576 scaffold_32 597642 598750 - 7367|143 994
------CACGCTGTTGACAAGTCGAGCCTGCT----------ACCGAGCCAGAGGCGATGTTCTACGTGCCCGAAACGAATGCTGGCGAAG---------------------------------------GGATGTTCGTTGGTTGCGCAGCAGAGGAAGGGAGCAAGGAAGATGAAGTGTATAGCTGGGAAAATCGAATTCGTCTCGGTTGTTAGAATGCAATTAGCCTGGGGCACAC------------TTGGTATTTGCTTTGGCTACCAAAACGCCAGGAT-TTTGATGAAATTATTTACGTGTACATCTGTTTGACCAAGTTTCCGGCTCCGGCATTGTATTTCGGTTTTTATTTG--------GACTGTAACGCCGCC-CGAGGGCCTTTAAAAAAGGACTCTCA----------------------------------------------TCGAGTCCAGGACAACACTCAATGGAAAAA------------------------------------GCAAAC-------GCATCCGCACTTCAATTAACTGCCTAATTGATGTGCATTGTGGCT-CTAAAAAACC-AAATTAGCTACACGCGGCGGAGAAGCTTTGTAACATGGATGACGACGACGGCGACACGTG--GCTGCTGGTGTGAATTTAAGTGGCATATATGGGATAGAT-TTTCTTCTCATGTAAGAAACATTGTTAGTAGTACTTAGCTCTTATAAAGATATTGATACAAACTACCATTAATATTCTGTTTAAAACTTCAATATAAATATATTTATA---TATATTTATATATATAAATATATTTATATATATATAAATATATTTT
AGATGGCAGACATTTGCTTAGCTGGTGCTGTTTTGGTCTCTCGCTTCGCCCGGGGC-------TACGTGCCTGAAACGAATGCAGTCGGGGTTGCATGCCGCACACACAAACACACACATCCATACACACGCACGTACGTAAAC-GCACACCAGGGGCAGGGAG-ATTGGGCATACAG---GCAGCTTGGAAAATTGAATTTGCGTCGCTTGTTAGAATGCAATTTGCCCGGGGCATATATTTGATGTGTATGTGTATTTGCTTACGCTCGGACTGTGTTAGGATGTTTGATGAAATTATATATGTACAGAAGTCCGCAGACAGGGACTAAGC----------CATGTTGGCTTTTATTTGGTTAACGCGACTGTGACGCTGCCTCGAGGCTCTTTAAACCGGGTGTGTTAGTGTAAGTGTGAGTGTGTGTATGTGTGTGTGCCAACCAGCGTTAGCGTGAGTCTTGGGCGACAATTGTTGAGAAAATGAATGCAGCTTCCATAATAATTCACATACTTCCATGCAAACCTAATAAGCGCTCACACTTCAATTAACTGTATAATTGATACGCATTATGCTTACTACAAAACCTCAATTAGCCACACGCGTCCG--------------------GTCGGCGGCTGCCACTTGAGATGTTTCGGGCGTAACCAATAACAAAATTGACAACAAAAATAACACACACCACGCCGGACACGTGTCGAGTGGTGT-------------GAATTTTGATGCGAA----CATTATTATTGTGTTAAAAAC-----CATAAATCCGACTAGAGGCCGCGTTGATAATCCTAAAAACCATTGACTAAATTCAATAATAATCA
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CACAGTTTTGTGGGCCAAACTACGATCTTAGGGTTTTCAGCGTGATATACTAAAAGAT-TGCCGGAAATTGCAGGAAACTGATCAAGGGGAATTCCTCTAAGCGATT---TGCCCT--TGACTTACTTT------AAAAACATAACTAAAGTAACTTA-----------TGGGTCCTATCTCGGGATTTCCCTTCCTTACTTTTCTCAACTTTCCTGCAATCCGTTGATA-TTGGTAATAAGCGAGGCACCTAA--TTGACTGCTAAGATTATCATCAAGTTTGAAAATGAAATATCTTTAAAAATTGTATATTTCACACTTGCGCTAATCTTTGAACTCAATTAGTTTCATGTTATAGAGGGATCCTCAATAGATTAACCAAT---------TTAAAGTCAAACATCCAAAGTTAAGC-TTCACGAACTCATTATTAATTCATATGAATTCCCATTATATTTGTATTCATTGGCTTCCTTCTTGCGGATCTCTGGTGAA-TATTTGAATTAAAAGTGCTTAGGGTAATCAATTTTCCAAAAAGCACTCTT----CTTCTCAACATATTCGCATTCTTCTTGACTATATAGTACAAATCGGTTGTCCATTTAGTGTAAGCGA-------TACGTACCTTGCCATTCTAGATTTAAGACCTATCTATAAGGATTCTTAAAATGAACCAG-GTATTAGCCATAATTAACTGTACAATCGATTAA-GTGTATGTAG-GTTATGCCAGATTCTATATCAGT-----------------------TATTGCAATGCAAGGAAAGCGAGCTAGTCA------GGGCCAGA----------ACTTTA------AGGTGATAAGATTGAATTTCGATGTAAAACCATAAAGATTTATTTTTGC-AAATAAAGTTGACGATCAAAAC----GAGCCAGAAAA
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----AACGACTCGCAGCGATTTGTTATTGAAAAGTCGCTTAGTCGAATGTTGCCGGCAGGCAAAATTATATAGCATATAAAAAATAAACTCACATAAAATAGGTACC-----AAGCGAACG--
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GCTTGCCCAGAGTTGGCCACAGGCACCGATACACACACAAATCCAAAATCAACACAAGAGTGTTGCCAGCGTATGTAAGTTAAAGCC
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ACAAGACAAAATAGTGGAACTACAAAAGACTGAGTGCGCATATTAGTTGAGCTCATTAAAGTAAAGTTTATATACAATAGCTATATAGCTACGGCAATTACAGATCTGCAGATCTACAAGTATGTGGCATATATAGTGCAAAATTAATGCGTTTTGTGTTAAACATGAAAGCAACTACAAGAAAAAATGAAATATCTATAATCAAAACAAATAACAAGTCCGTTTCAGCTGGCAACACTGTG----TGCTAAAAACATATTTTTTTATAAATCCATAACCAAGATAACATGATAAAAATCAAATGAAAACGAAAAAAAAAAGAAACATAAACATAAAAAACTGCATAACATAC--CAAACAATACATATATCTATATCTCTAGTGATTAA-TATCAAAGTTCCTATGCGTAATAGTAATTTTTAAAAGCCATTAACGTATCGTAAACGGGAAAGGTTGAAGGGGAAAGGTAACTTAGTCGAAAAAAAAAGGAAAATTAAATACGTACATAATACATAAGTCGCCAGGCAGGAGCGTTG-GGAGGCAGGGAGAAAGTGGAAGTCGTGTGTAGTTGGATATATACATACATATAACCAAACATATATCGTAGTAGCCATAGCCATGCAGCTTAAAATAACAAACACACACACACACACTCACACACACACACATGCGTATATGGATATATGGCTGGGTTCGGTGCGCTTAGTTTAAGGGATTTTTGGTATAATACTATATTTAGTAGTGCTAACTAAAAAACAAAAAACTAGAGAGGTACACAAATTCAAGCTTCAGCATATAAGAG-------AACAATTTTATGCACAAATTTGCTCAAAATCAAAAATATAAGCGAAACCTTTCGCAAAAGTAGTCGAAATCAAAATTAGGAGGACAGTTCTAGAGCTAAGTAAGGATAAAAAGAAGAAAAAAATATAGGCATGGTGTGCTTATATACGAGGTTCCATAGTCACACACACACACACACACACACACAGATGCAATATACACTGTAGATAAATATGAGCAAAAAGTTTTTCCCGCTCT----------GCTCTTTAAACAAGAACTTTTATTTCCAACTAGAAAACTCGAACAA
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TCCAATAGATGCTCTGCTTATCTATCTATTCAGTAGAAGGCTGTTTTCATGTGTTAGTTCATAGCTAGTCTATTGAATATTATGTTTATATACCATTTCACCCCCAAGACAATTGTCGAGTAGCTCTGCGTGGGGTTGAAGATGTCAAAAGCAATTCTTTGCTATAAAATACTTATTTACCTCTTTTTTTGTGTGGAATACTTAAGCGGATTGCGCTCGTTCTTTTATTCTAGCAATAAACAATATTATGTCTTAAGCGTGAAAGCCGCCTAGAAA
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GCG-------TCCCA----------ACTAGCAGATAGTTATGTTAAACTAATTAATAAAACTAAACCCACAGTTCAAGAGAG------TTGTGTGTTTCGGTT
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GCGCGACGAGAGAAAGCTAATCCGCAGCAAAAGAAAACAAAAACAAAAACACACATTGCAAGATTTCCAATAAATGTTTACCTTAATTGTTAATTAGTTATCATTTTGTCTAGTTTTTTAGCCCTAGTGCAAGAGTTATGTATTTAGTTAAGCGGTCTTTTCTGGACTCCGGAAAACCTCAATTAAAAT----TTATAAAGCGCTCATATATAAAATACGTACG-------TACAATGCTTATATACATA-CATACATATATAACATATAT----AATTAAATTCTTCGTGTAAATCTCAACGTT----------ATAGAAATATAGAAATTGTCTAACTACATCTGTAGAATTACATATTATATAGTAATTTTACAGTTCACATATGCGACCATAATACACAAGTTAATGTACTTTGTAACAAGAGCAAAACATTTATTATATACACAC-----AACAATACGAAATCTACATAACTTTATATATGTTTTATGTATGCATCTATATATACATATACATATATATATATATATATGTGTATAATATATAATTGCAACCTATCTGTGGTAGTTAAATTTTAGTTAAAATTCAAAATAAATGTCTAAGCTTGTCATATA--AAAGAAATACGAAAAGAAATTAATGGAAATATAAATTATGCTTAAAGAGT
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GCAGCAACGGAATCTAGTTGCACACGGCAGTGTCCAGCGCACGTACGTAGCATTAATAACCAACCACAACAGAAAACAAAAACAAAAACAAAACAAC-AACAACAACAGCAACAACAAAATACCAAC--CAACAATAGAGCAGCAGAAATTAACTAATTGCATTATTATTTAATTAATAAATGACTTA
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TTTTAATTGACTTTGGGGGGCTTGTGGCCATTCTGTCGTACCTACTACCTAAGTACTTAGCAACGTATACGTAGTCAAGGAGTTTCTGTTGAAGACCCTCATTGGATAACGAGTATCTCAATGGTGGGACACATTCCTTCAGTCCAAGTCAGTTGAAGGAGCTGCCTGTCTCATTTAATCTTAAGCTATTATTAA---------CCCA---------TCACCATATCAGGGCT---------GAAACATACTCTCTTCTAAGTGAACCCCCACTCCCGATCACATAATCTTAACA
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AATGGCAAT----AATGCCGCCAGCTAATAGTAAATGTAATAAAA-GATAGCCT
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CGTTG--GATTCGCACATAG--CGTAAAATGAGACTTGAACATTTCCCAAGCAAGCGTTGAA---AATTGATCAGTTGAGCGATAGAACTTAAGATTTGTACAGCATAGCGATATAAATGTATTTTGAATTATTGAAAAATTGAGATTAAGCTTGTAAAGAAAAACAAAAAAAAAACTAAAATAGTTGCTTGGGAAATGGTTTAGGATTTGAGCTAAATGAG-CACTAAGTGTAAGTATGTGGATAATTATCAGATGAGGAAGAAAAAAACCAGAAATACAAAATACGAAATACCTAACAACAGACAGACAGGAAAATACTGGCAAACACTATGATTCTGTATTTTGTAATCTTTGAGACGTAAATAAATGAATAAATAAATCTTAAAATACGGCATTGATATGTATTTTTGCGAGCACATATACAGAAAAATTGCTTACAATAAAATTACAAAACTATCAAAATTGCAATTAACTATAAATGTTGGCAAAGCTATGTGAAAAACTGCCCGAAACAATAATCTAATTTTAATA-TATAGATGTACAATAAATGGCTTGCTTTTCGAGTGTATCCAAGCGTTATTTGATAGAAAGAAAAAAATGCTAAACAAAATAAA-ACAGAAGAGTTACATGT---TTCAAAT-ATAATTGTGCTATATACTCGCATATATCCAGATGCTT-TGTAAGTGTATTAAAGACTCTGCTTGAAAAAAAAACACATCAGTTAAATGTACCAAGTATTAAACAGTTGAAATAGAGTATATATATGCGAACATTGGGGTAACAATATTTGACCCCACTGTGCTTAACTTAAAAGCCTAATTGCTCTCCAAAACATATCCCAACAAATATATCTCAACCGTGTGCTATAATTTATTGGTAAATTTAAAATTGAAAAAAAAAAGAAAATTAAAAAAAAAAAATAAAACACCAAAGCTTGTGCATACTCATAACCCATATCAATTGTATCGATGTAAGTTAATTACTAACTA----CAGA---ATCTTAGTTGAGGACACACTAAATATAAAT-ATATATTAAAAAAAAAAACAT
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ATTTAAACGGATTTTCAATCGGAAAAATGC----ATTTATGCGTCTCACTGGACTTCATTTTGCTCGGGACACAATATTTTTAATGAATGTAGTG
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ATCC-----------------------AATACCATTGCACCTTTCTTGCTGCCCATGGGCTAACGGAATTCGCTATATTAAAC------------------TCTCCACTTGTTTGAAATTCTCAATGT
>CG7441 17817387 17817713|18806 chr3L 17817367 17817514 scaffold_2 1574599 1574738 - 1643|20 147
CTCTCGGAAACATTGCAATTGTTATAAGTGTAGTACAAGTATACTTAGGTAACATTACTGTTAAATCTGTCGTTTTTTTGAAAATCGCGAACAGCTTTTGCAGCAGAAGACGAAGTCAAGATAATATA
CTTAGCTAAAGATCGCAGCTGTCTAAGTCGAAGCACGAGACTACGAATTTATTAATACTGTTAGA---GGGATTTTATTGATATTCG-AAATATTATTTGCACATTAACATGG----AAGACAATATA
>CG7408 17847873 17848912|18839 chr3L 17848311 17849428 scaffold_14 2747960 2748930 - 8607|0 624
AATCAATCAACTGTTCTATC-TATCAAAAAAGACATTATGGACTTACTTTGTTCGTCAAAATGAACTAAGA----GTAAAAAAAACGTACGAAAGTTAAAACCTTTAAAATGTATATACATTTTCTTGTCCATAGCAGCATGTAGAACAGAAAATTACGATGAGTTCATAATAAAATATG---AATTTAAAAGAAATTTCGAGTTAAGAAATAGTTGTCCTTCCAAAAAGGCATTT------TTAAAAAATTACCAATCTCAATTTTCGCTTTAGGCATAAAGTTTTATTTTAATGGCAGTTTTATTTT-----TATTTTATTTTAAT----TTTTCTATAAATGTCATGGAATATAAATATGATATAAAAATTGTTGGGGACGAATTAATAATTTTGATGTGAAAGGAGACGTCTTTCTTTGCCAGAAATATGAATGTATTAAGAAATTTGTGAAAAACATCATCTGCCTGAGAATCATATTTTATAAAACTAGTCTGTTTATAAAAATTAAGTGTTTCAAAGTCAATCCATTTACTGAACTATATATGTTAATAAGATTTGATGCATATCAAAAAATTGAATAAGTGCGATTCCGTGAATTACAAAATAAATATAATTACTTG
AGTCAATAAACCGTTAAAAAACAACTTGAAAGACAGTAAGGAAATCTATATTTGGGCAGGCTTTGCTAATCTACTGCAAAGTACAGGGCATTAACTTAATGCCTTTAGTATGTATATACATATCC--------------------------------------------AACGAAATCTGGCGAATTTAACAATACTCCCAAATTA--------TTGCCATATTTGAAAGGTAACTAGTAACTAGAAAAAAAGCTAAGCGAAATAT--------GGCTTGAAGGTTCTTTTGTACAATAGCTTCAATTCCGACCTATGCTATATAACTCATATATTATTTAAGGCGCATAGTGAAAAAATATCATACCAAAACT----------------TAATTTTTCCCCGA-------------TCATAGTTGAAAATAGAAGTG-------GAATCTATGAA---------------------CGTATCGTATAGAGTGTGTGTCTTTGTGGGA--TAGGAGAGAGAAATTC-------TTGCTTATATGCTTCTATT--TCAATTCTCTCTCTTCCCCAATATTTTAATTATTACAATTTTCTAATTTA---------TGCTCATATTTG
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AGCAGAGTTGGATATTCTCAAACCTAATAAATTCGACGATAACAAAATTGACTGTCACAAGGATGC
TATTAGTTTGTAGGCAATCAA--CAAGTCAAATC----------AAATCGTATGCGATATGCATAC
>mus304 18077933 18078106|19097 chr3L 18075170 18079326 scaffold_85 10783 14681 + 28593|2853 3047
TTATAGTTAG------CTTAAACGTTTTAGTAATATATACATA-----------TAGGTGTGGCGTTAATTTATTGTGAAGTTTCAAATGCTATGTTAAGAATTGAAAAGGCTCGCTGCACAAA----TTTAGAGCTTAAAAAACGCATTCCAAAATACAAATATGTAATGCAGCGTTTAAAGAAACCGCTAAAT
TTAAAATTGGGAAATCTCTAAGCACTCTAATTATTTAAATATACTTGGGGAAATTACGAAGAGCCTTACAACAATGTTGA--TGCAAATCGATCGAAACGATTTGAATCGTCTTTTTCACCAAGAGTTCTTCGATTTTTAAAAAAGTGTGAATTTTTATAAAGATTCTTAGAA--ATTAAATTGAACCCGAACAC
>gk 18110368 18110679|19137 chr3L 18109903 18110652 scaffold_0 4840973 4841757 - 15565|480 855
CCACTG--------GATCCGAAC-------CTTAAGTATTAG----GATGTA----------------------------------------GGCGACCCCCCTCAACTTTTGTACCATATGTCTTCTCAC----------CGTTCGATAAGCTTA---------TCTTGTAAATTACCTTGTAAATTAGATCTAAGTACCGACTTGACTGAAGTGACTGTAGAACTGTAACCTCTTGTATCTGTATCTACTGGCTACAAGATCTAGGTAGCTTGTAATTACATATAGTACGTGTGACTAGTCACGATC-----------CGATTTAGCATTACGCCTAGTCGTTAGTTGGA--TGCTCCTGTAATTGTTAATAAA
GCGCCGGCTAATGTGATCATAGCATATTTAATTAAGAACTAGTTTAAGTGTACACAACAAACACACACGATTATATCTATCTGGGGCTCTATGCCGAACAGACTCACCTATTGTACTATATGTTTTCACGCTGTAAGCCGTCGTCTAACTGGCTGAAAGAAAAGTGCCTGCAGTTTGCCAT---AATGGAGCCTG-----CGGCATGACTGATGTGAC----AATTTGCA---------ATTTGTATCTATTAGCTGTAAGTGCTAAGTA----GTCATT--------TAAGTGTGGCTAGTCTATCTCAATTATATGTTAGTTTTAGCATTATGCCTAAT-GTTAGTTCGAGGCGCGCGTATAATTGTACAAAAA
>CG7330 18118606 18118883|19145 chr3L 18116920 18119213 scaffold_0 4849295 4851870 - 37674|2032 2366
AGAT---------------CTGAACGGATCCGCCTCCTCAGGGGC------------ATTTCGTATCGAGGA------------GGGAGCA---GGAGCATCCGGATGGAGTC---CCCTTAGTCAGTCGCATCGGACATCTTTGTTAATCATCCATCTCTCGGCACTCACATCCAGCTGCCATGTGCTGTCCTTGTACACCA-----CATCATTTTGTTGTACTTTTAGTTGATTTTAAGGGTTTTAATTTAAACGAACGACCGCCAACAGACGTAGGCGCTTAGATTTAT-------GAGTAAGCAAATAAATAAACAAACCAGTTGGAAAAA
GGAGTGGTCGCATGTCGGACTAGGCGG---CACTCGAACATGGGCGGGCTTTATTTTATTTTTTATTGTAGACGTCGCAGTTCCGGGGGCATCTGCAGCATCTACATCGCATCGTGTAGTCAGTCAATCGCAT-GGACATCTTTGTTA-----CGTTCTTTCCAACCCCAACTCCAACT--------CTGTTTCTATTTATCGTCACTCTTCATTAATTCGTACTGTTAGTTGTTTTTAAGGGCTTTAATTTAAATGACAGACAGC--ATAGGCTTAGACTTATATAAGTATGTACGAAGAATAAGCAAATAAATCAAC------------AAAA
>CheA75a 18217962 18218105|19276 chr3L 18217149 18218180 scaffold_0 4962016 4963073 - 21480|863 1018
A-GTCATGGCAGCAATGCAAATTTTGTGAGAATCGTCACAACGAACAGTTTTTAGTATTCATGAAAGTAATAGAATGTAGTTTAAATGTTTT----ACACAATATTCTATATATTCTAT-------AACAAAATAAATGTCTTTGAACGTTGAACG
ACGTCTTG------ATACATACTTTTATACAATT-TCAACACAATCTATTATTTTATTTGATAAACTTGCAATAAAGGTCTTTAAAAGCGATGGAAGCGAAATGTTTTAACAGCTCAGTGGACACAAATGGGCCAAAAGCCT---AAGGTTGAAAG
>star1 18540671 18541585|19590 chr3L 18537089 18541104 scaffold_0 5275922 5280049 - 51311|3973 4434
CCCAGTTTAAGTAGGAATTT-------CCTTTAAATAAGCCAATA--TTATAGTATGCATTTAAATGATTTTATAATCCTTTCTTATCCAAATATGAA-TGAAGAACTTAAG-----ACTAAGCAGTATTAATATGTGTCTACGTAATAAAAACCGAGA-----TCAGAATTAAAATTCAAAGATTTGAAAATGAGTCTGTACAACCGCACATCGATATGTTAGCAATATATTTAACTGAAGGGGGCTGAAATGGATTACATTTTCTTATTGCCTTGACAGCTAATAACATATTAATAATTAATATAAACTGTACAACCCACAATTTGAATAAATATTTTACTGCC-AATATACCCTCTTAAATAAAATATACGTAAATCCCCATCCTTTTACTA----AGTAAATAAAGATATATAATAATATCGGAATCTTAAGATCCAATCTTTTTCTTA---GTGCTT
---AACTTACCAATGAGTTTTAATGCATACTTAAATAAGCGAAAAGCTCTGATTAAACGTATAAAGGTATGTGTGTACTATATTTAACTA---ATGAGCTTAGGCATTTAAATATTTACTAATTTTTTCTACTAAATGTGT--GTGGTACAAACTTTCACTTTCTCACAAACAGTATTATAAGAG------------------AACCCCACA---AGTAGTCAACCATAAACCCAA------GCTGCTGCC----CTTAGCTTTTCTTAGTTTTTTAAC--CAAATATTA----AATACTTCAAAACATATTTAATACGACGAATTTTCAGAAATAATTTAAGATTAAATGTAAGTTTTAAATTGAAATCCAAGGGGTT----ATTCTTTGAATGGTGCATTAGGCAAAAGCATATAAATGTAATAGAA--TTAAGTTTAAATAAATTATTTAAATGTGCTT
>star1 18540671 18541585|19591 chr3L 18541105 18541500 scaffold_55 35201 35632 - -3568|0 447
ACCTAAAA----TAAAATGGTTGCTTCTCCCGTAGATTAATAAACCAATTAAAT---AACTAAGCTGATTTATGCAATTAAAATCGCAAAAGTCGGATTTGTATAAAATAAGCATCTTAGCCAGAGGTAAGACAGCCAGCCAAGA-CGCCCGTAAAATGTGAAATAAAAT------------------ACTTTTCTGCGAGGAAAGGCGCAGG---ATGCATCCAGTTGGGTCAGAGCCACCATAAAAGTCCGCGGAAAAGTCAGCCTCCTGAGATTTAATTGAATATGTAGTAAG--------CTAAAGTAGAGACTATTTTAAATTATAATTGTAAATATATGAGAATCTTTCCCAAAA-----AAAAAGGATT--------ATAAAAACAAAAACTGATGAAATC-TGTTTGTTTGACAAACAGTATTTCATGGAATAAGCTG-A
AACCAGAAAGTTTCAAGTATTAAATATTTTATTAGAGAGCCAGACTTTTTAAGTACGAAAAAACTTGATTTAAGCATC---AATTTCTTTCTTTAAGAGTGTGTAAAAT---TTTGTTACACACAACTGAGAAAGAGTATTAAAATCGTACGAGAAATCTTGATAAAAGTATGCCATTTTTTAGTTTGACATTTTAACTACTAAAAACCTAGATTCAAGTATAAAATTTATGTACACACAGC-TTGAATTAAGTATGAAATTCATATT--TTAAGTATAACTTTTTATGCACAAAGAATCTTGATTAAAGTACAG-------CAAAAAATAACTGTAAACATGGTACAGGCATTCTATGCATTATCAAGATGGCTTTTTCAGTAAAGAAAAAAAAACTTGATTCAAGCATATTATTTTTGTTTCTAGTATGAATTTTAAAAAACTATG
>star1 18540671 18541585|19592 chr3L 18541501 18542879 scaffold_0 2779219 2780581 + 2868|0 85
AAATTCTGTAATCTATGCTAAGTATTT-TAATAATACAGATATGGTAAATGTGCTTCAAAAATAGTCAATAAAGCAAACTTTGTAT
AAATGCTGCGAG--ATTCTAAGTGTTAATGAAAGTTGAGTCTTGGGAAACAT--TTAAAAAATGTTAAATTGCACAATTTTTGAAA
>CG7271 18555402 18555402|19601 chr3L 18553887 18555441 scaffold_0 5291335 5292844 - 58313|1528 1528
A
T
>CG32199 18579180 18579262|19621 chr3L 18577056 18580141 scaffold_0 5303479 5306373 - 27730|2195 2278
TATATATATATAATAGCTGCCATTAGTGGGGCATGCAAATAAATAGC-CATTGCCGAGGGACGAATCTCCCATCGGCGCACTTT
-ATA-ATATCGAGTTTTCGCTTATAAGATAAAATGTTAATAAACAGCTCAATGCCAACAAA--AGTGGAACAATGCCGCCTCTT
>CG6897 18589724 18590014|19631 chr3L 18587891 18590016 scaffold_0 4141117 4143471 + 58722|2090 2445
CCTCTACCCTTCGCAGTTCTAGATGGTAGCAACTA--CATATGTT----------ATTTTATAGGCAATCT----ATGCAATAACTCCTTTTCACAGCCAAAAGAAAGGAGGACTTGTTTTTCAACTGCAATGATCACCCACCGTTTAT------------------------ATATATTTTGTATGCGTAATTGTATGTTCTTATAG-AAATCTG------------------------CCAAATAGTGAATTAAGTCGTGCGTTTATGTCATTTATAAACTTAACTCAATGCCTTTGTCTAGTTTAGGGTACTTAATAAAAGTCCATTCGATGCCATATTTAATGTAATCAAAA
C------------TAATTTGCAACAACAGCAACAAATCATATGATTAATATTCCCGTTATGTAGACAAAATTCTAATGCAATAA-TCCTTCTCAGAATTGAGTTAA--GATGAGTCG-----AAACTGCAATGTAATCCCACCGTATATTACCAAGGCCTTGCTTATCGTTTAGTTTAGTTTAT-TTTTTAATTGTGTACGTTTTTAGCAAATTTAAATAATCATTGTCCATTTAGTTGCCAAAATAGTTGTTTAAGTTGT-------CATCGTTTGCAATTTCAACCTAATTGTATTGTC-----------AATTCATTACATTCATTTCTATTTC---TTAAAAATAAATAAAA
>CG6896 18631514 18632436|19687 chr3L 18630764 18632153 scaffold_0 4184865 4186482 + 26616|816 1669
AAACTTAGCGAACTACTAGAGTCACAGGGTATTAGAGCAGCCAGAATTGTCAGA-----------------------------------------GGGATAGGCCAT-------------TTGTTAAATGGCAAGAAAA------------AAGTGTCTTTTTATTAG-------------ATTAGCCGTATT-----------CAGTGAGTGAATT---GTTGAATGTTGATTACACAAATGC---ATGTTGGTTTTG--------AGAACGGGGTTCGATTCTGTGAGCTCCTAGAT------------------------------------------AACGGCTGAAAGTCGTTGCATTTTCCTAGCAGACACAACAACACACTAAAGACACACACAACCAATTATACGAAACAAATTTA----TACAAATATACAACCATATGTATACATTTTAA------------AGAATATTAAAAGAATTACGTATAAAATAATTGTGAGCA----GTTTACCTTAGG---CGATATATAACAACTAACTAAATCAAAATGAAAAAACATCAAAAAATATTTATATAGCA-------ATGCTAAGTAA-----GAACCTA--ACTTAATAGATTTGCTTGGA------GTGCATTAGGAAT------ATCTGTGTTTC-CGTGTGTGAGTGTTACAACCGAAACAGGCGAAGTATTATGC--------AACAAGTAAATATTTA-----ACTA-----AATATATAGTACGATAGCAAAATTGTAGTTAAACCGTGACAGCAAAGTAAAGCAAAGCAATGAGACGAAATGCATAGCACTCAAGCAATTTCCACAT
ACAGCCGCTG--CGGCAAGGAAAACAGGGTATTACAATA--TACAATTGCCAGCCGTTAAGCTTACCAAAACTAAATGGGGTTGGGGTTCGGGTTGGGACAGGGTATTGGGCGGGACGGGTTGGGAAATGGGTGGGGGAGTGGGGGGGTTTATGTACGTGTTAATGGGGAAAAATCAAACAATTAGCAATTTTGAAATGCCTGGCAAAAAGTGTCTTTTATTAGCATTTTAGTAGAACAAGTTCAAAACATAAATTTTAAATAATGCAAAGCAGGGTTCAATTCTATGAGCTCTAAAATTCAAACAAAAAAAGAAGATTTAAAAAAAAAAATAGAAGAAAATACGACTCAAAGTCGTGGCATTTTCCTA----AGCCAGCAGTA----AAAAACATATATAAAAAAAAATACGATGCATGTATATGTTTACATGTCTTAAATTTGATCAACATGTTCTGAATTTCAACTTTGAGAATTTCCAAAAAAAAAAAAAAGAAGCAATTTCAAGAATAGCTTTTCATTTCGGAATCGAAACTCAGTACATGAATGTTTCAAATTACACTAAAAATGAAATCCAATTTGATGTGAGCCGTTTATGTTAAGTAGTTTTTAATGCTAAGAATTAAATGATGTGTTAAGAACTTTTGTTTATTGCTAGTTCTTTAACTTTTGCTTCGTGTGCATGCGTATGTGAAATGGCA-AAGCAAAGTATTATGCAAGAGTATAAAAAAAAAATATACATACATACTATTATTAAAATATACTAT--TAGCGAAATTGTAGCTACAT----GCAGCAAAATAAAATAATAAAATCAAAACAAAACAAAACATCTAAAGCAATAGACAAAT
>CG6896 18631514 18632436|19688 chr3L 18632154 18632457 scaffold_19 2811828 2812120 - 1004|0 300
ATAAGTGT---CTAAATGTTTGAATTGAAGGAATGTTAATAATGCCAGGCGGCATAGAGATTTATTTTTTAATGCAACTACTTTGCTCTGCGTTATGTAAGTTGAGTTTTGTTGAGAGGTACAAGAATATATGTATTATTTATGTAGCA-----------GCGGTCTTTGTATATAAACCTACA---CAATTCCAAAAGATGCAAAAACAACGCGCAATTAGCAAATGAGACTTTTTCGATGAATGTCAAG-GCATTAGCTGAACGTTTTGTAAAATAAACAAATGAAATACGAAAAAATT
ACAAATATAAACCAAATATTTACATAGGAGAAA-GTAGATTATTC-----GGCAAAAAG-------------TGAGGCTTTTTTCGAGTGCATAGAACAATTGGCGCCGTGTAGCGCAGATGAGAAATGTTTCATTTGTTTTTG--GCATTTCTTGTTGTGCGTTATTTGTTGAATTAATTAAAATTCAATAATAAAATTGTTAAATGCAAAGCTGAATTAAC------GGCGCTTGCGGAGATGGCCAAAAGCGT--GCGGAATGTTTAATAGCATAAATAAATAAAATGCGCACAAATG
>GNBP1 18643036 18643142|19700 chr3L 18642794 18643181 scaffold_0 156174 156558 + 9317|243 356
TAACTAAAATCCATGATTTAGGTAGATGTTTATAA-AATTACACATAAGTGAACGTGCCGATCGAAATCT------ATAAATCTATAAATAAATAAAGTCCTAAGAGAAACTCA
AGATTATA--TAAGAACTGACATACATATGTATAATTATTATACGT-----TATATACTCACTCAAATATTTAAAAATAAAAATGTAAGTCGGGAGTGGTCTACTAGAAGATGC
>CG6885 18710905 18710962|19739 chr3L 18709671 18713135 scaffold_0 6366032 6369295 + 62736|1253 1310
AGTACTTTTAGATCATAATTCGAGATAGAACTTAATAAATTAATTCAAATGCGTAAAA
CCGATAAGTAAATTATTAAATATAATA-AATTTAACTAATAAACAATAAAACAGAAAA
>MED11 18711748 18711877|19739 chr3L 18709671 18713135 scaffold_0 6366032 6369295 + 62736|2156 2292
TCTTGCGCTATCTTTAAGGGTAAGGGTTTTAAATTTTTTAGAGTGCATTCCGA-------AAAGGCACATTTTGTCAACCAATTGCGTTAATCGAAACATAAGTGACACTCTTTTTAAGAAATACATTTGCATACTA
TTGGGCGGTGGCCTGCCACCGAA-------------CTGATAGCATATTCCGATTAAATTAAGGATATTTTTTGT--ACCCATT----------AAACTTAAGTTACG---TTTTTAA-------------------
>Aut1 18715646 18715742|19743 chr3L 18715038 18716721 scaffold_0 6371368 6373297 + 45097|620 778
GACCCGCCATGCTT---TTCAATATTGACGCAATA-----AATATATAACTCATTAA-----------------------------------------------------ACGCAAGTTTGTGACCTAATAATTGAATAAAGA-TTTGGACAAACGCTT
-ACGGGACAATTTTAAGTTCAATTTGAGAGCAATATAACAAATAAATTATGCATTAATTATAACTAAACAACGTATACTAAACGTATAATAAAAGCAATCGCTGCGGCATACTCAAATTTATGCTTCCCTAATACAATAGAGAATTTCAATAAATATTC
>l(3)neo26 18787232 18787613|19837 chr3L 18786971 18787301 scaffold_7 2809739 2810029 - 4859|276 350
GTGATTTTTTTAAGTTGTGACTAGAGAACAAGATACATATGCTAGTTGATGCT-----AGTTTCTAAGTTTCATT
ATTGGTTATATGTTCCTTTATTGG------------ATATGTTTTGTTGTGTTGCTTAAGTTTTTAAGTCTAATT
>l(3)neo26 18787232 18787613|19838 chr3L 18787495 18788107 scaffold_0 6437305 6437847 + 3212|0 120
GAAAAAAAGAGGCCATAGATATTTATTTGGCAGGAGCACCAATAGATAGCCGACTTAGTTTATAACTTAATGATGCCGACATTTTCATGAAATTAAAAAAATAAATAAC--TTAACAAACA
GAACTAAAGAGGCCATCGTCAAA-ATATCGCACGACTA-------ACAGACGATATTGGTTGTATATCGA-----CCGACCGCCACA---AATTATAACATGAAATGTTCGTTAACATTCT
>Cat 18793158 18793453|19841 chr3L 18791542 18793453 scaffold_0 6441407 6443173 + 89610|1631 1928
GCTGAGCGAGCGGATTCGACGGATCAGACTTGGTTTTTGGCCTTAATTACGATTAATCCAATGGAACTAAT--TATTCCAACACCAACACCACCACCACCAACACCACCCATTCCGAAATTGACTAAGAAAGGCGAACGCTTTTCGGATCTTTGGTTGCGGGCTTAAATTGATTTAACCACGAAATGTGTCTTGTCTTGTTTTGATATTCAAAATTGTTTAAGTCATAAACAAATTACACTTACAATGTATATGTATATGCAATGAATATATAATAAATTCTTTATTTTTTGATATAA
------------GATATTCCAGCCCAG---TGGGTTTCG--CTTAATT----TGCACAGAGTACAGCTTATCGCACTTTATATCCAACTTC-CCACTGAACATGCTGTCAGTTCTTTGGTTGC---------GGGCAATTTTTTGTGGTACTTCAATGCTAGCT-------ATCTTTCCCCTGCGTGTGCCTTGTTTT-------------AAAATGCTAAACTTAGCAATAAAGAAAACGTATAAT-----------TGTAACAAAT-CGTAATAAA-TCTTAATATTTTGATATAA
>CG6856 18834064 18834480|19891 chr3L 18831471 18834303 scaffold_0 6479760 6482725 + 46950|2859 3115
CTCACATTGTTTGCTCATCTCGCAAAAGACTAC-AATTTGTGCCTT----------TAAGTGCAATAAGCAGTGTAATTGTTAAAATATTTTAACGGGGACTTCTGAAAAATAACTTA-----ATTTTTTCACAACATTTTCTTACTGCATTTGAACGTTAAACTATTACA-TTAAAGGGAATTGGACATACAAAGATTAATTATCAATGCCAAATTATTTTAACATACAAGGCATTTTAACATAATTTGTTAAAGT
TTCACATT-TGTGCCTTTTGTGCAATACAGTATGAAATTGTGCCTTTTGTTCAAAATAAGT-CTATAGAAAATGTAATTGTAAATATATTTCA--------CATTACCAGATAAGTTGTCCATGTATTTAAATAGCGATTATTCTAAAAATATATACTTGTCACTAATAAAGTCAAAGTTAGTCGCAACTGCAACGGTAAAAAATAGATGC---ATTCTTTTCACTT------TAACTTAACCAACTCTGTTAAAGT
>CG6852 18835232 18835317|19892 chr3L 18834511 18844757 scaffold_8 2936677 2947053 - 319341|778 866
ATAGTGTTCTTACTCTGTTCAGAACTCCGTTTTATGTAAAAAGTTTGTTAATCTTCAAAGTCCTTAATAAATGCTTTTAAAAT---TTA
-TCCTGTTTTAGTT---TACAAATTTTAAACATAAATAAAAAATGTAGTG-----CAAATTTTTCAATTA-TGTCTAAAAAATATGTTA
>Ugt 18843039 18843511|19892 chr3L 18834511 18844757 scaffold_8 2936677 2947053 - 319341|8874 9381
TGAACGCGTAGTTAAATCAACATGTTTAGTGAATTTA-----AATATC------GATGGATAAACACTTGATTACTTAG--CTAAGAGCCATCTCCGAAATAACGACTAAACACATTTGTACATTTTAATTAGAACATAATGCGATTGATAACGTAAACCCAACTCAAAAAGAAAACAGCTCACTAAAGTCTGAATTGTGTTTTGTAACTCGATTTCGAACGATTTTCTTGTCTTGCATTCCAAGAGCTACTAATTAAGTTAAGCCGAAAT---TAAATGTCATCATACTAAATACGCGCCTTTAAGTTGAAGATTGTCAAATGTATTAAAAGTTGGAGTAAATAGTAATTAATTCAGCGTATTTTATTAACCATTTATTTGGGATGGTCAG----GCCACTTTACCCCCTCGAAAAGCTTTGGTGACTGCGTATGTGCGTTAGGTGGCAACGCCAAATTCAAATAAAGTTTTCAA---AAATCTCAG------------TATTTCAA
T-----CGCTGTCAA--CCTTTTGTTTAGTAAATTTAAGACTAATGTCCCTTATACTTGGTAAATACTGAATTAGCTAAGCTTAATACCAATCTAGCAGGCAACAAC-----------AGACAAATTAATTAGCAATTAA---AATTGAAAAAAAAA----AACAGTGGAAGCGAAAAGCTC---CAAGTCTAA------------------------AAAGATT--------TTGCATTCCAAGAGCTTCTCGCCACG---ATTCGAACTCGATAAATAT----ATAATAAATAAATGTACTGAATGCAAGAAGCTATGTACGTCATATTTGTTCGATTTAATAAAAACTG-------------TACGAACCATT--TTTAAAACGGTGTGTGGTGTGTATTTTCTGCGTTGCCCAACATTGA-----------ATTTGACATCTGGCAACGCT--GTCAGAAAAACGTTATGGATTTAAGTCTTGGCTGTTATTTGTTTACTTTAT
>RpL26 18865029 18865183|19912 chr3L 18864318 18865180 scaffold_8 2967697 2968709 - 40162|817 1028
ATCG-----------CCGGCTAAAACTCTGCTCTGGACAACTG------------------------------------------GGACGTCGCTGTTTACTGTTTTTACCGTAACGCTTAGTGTAAAAAACAAAAC------ATCTGAAAAAAATCGCGTGTGAAAACGGCGCCATTCTTT-ACAATAAAGGAAAGTTGATTTTCACAAAT
ATCTCCCAAGCACCCCCAACCACAACAGTAACATGTGCAGCAGCAGCAGCGCAGCAGCAGCAAAAGCAACAATAACATCCAATGCCAACGCCACTGTTTACAGTTTTTACCGTAACGCTTAGTGTCAATGAGAAAACGAAATTGTGTGAA-------GTGTGAGAAAATGCCGCAATTCTTTAACAATAAAGAAGAGTTGAATTTTCCCAAT
>CG6841 18873770 18874255|19918 chr3L 18870612 18874053 scaffold_8 2974589 2978032 - 185580|3189 3494
GT---TTTAAGTGTGTTT------------------GGATTAAAC-GCGTGGAGCCTAGCGCTGCACTTCTCTATAGCCTTTAATTATGCGATAAACTTGTTTGAAGTGTCTGAAGATAAACTCGAAAAGAAACAGGACAAAACTGACAGCAGCTCCACACCCAAAGATCCCCAAAGCATACCGGCATTCTGTAATGCCAATGGAGACAAATCCGCCAACTCCGCCCTCGCATTTGGGCTTCTGAGGAATCCACTTTCGCTCCTCGCGATTCACCAAGCTTACTTCTCGCTGCCAGCGTAGTCTGT
GTTACTTTTAACATATCTAAGAACCAATTACTGAACGAAATAAACGGCATGCAGCTTAATGCAGCGTGTGCTTGTAACCCCGAACAAATGTGTAGATGCCATGGCTGTGCTTGCGGATGAGCTCGATGAGGAACACGCCAAAGCTGAGTGCGGCGCCGCAGCCAAAGATGCCAAATGCATAGCGACATTCGGTGAGGCCAATGGAGACAAAGCCGCCGACGCCGCTTTCGCATTTCGGCTTCTGTGGTATCCATTTGCGTTCCTCGCGATTCACCAGGCTAATCTCGCGCTGCCAGCGTATTCTGT
>CG6839 18884487 18884520|19932 chr3L 18883358 18884544 scaffold_8 2987499 2988680 - 66084|1129 1162
ATGGTGATCAAATAAAATCCCCAACTTTTCAGAA
--GCTGTTCCAATAAAG---ACAACTGTTTAATC
>CG6836 18920595 18920668|19982 chr3L 18919421 18920643 scaffold_8 3028050 3029119 - 44136|1185 1233
GTGTGCCTATGAATGTTTAAGCTTGTAGGAAATAGTAAAATTGTGATAA
GT-TGGTTAGGGACA---AGAGTTATAGCAAAT-----GATTGTGATAA
>CG6836 18920595 18920668|19983 chr3L 18920644 18921771 scaffold_8 3029444 3030370 - 10931|0 24
ATTTAATAAAATCATGTTAGCTAAA
AGTTTTTAAACAAATATCAGCTTGA
>CG6812 19030869 19031408|20101 chr3L 19030071 19034300 scaffold_8 3149800 3154207 - 64571|804 1345
GATCGGCTCGACAATAATCCTGGAATTGA-GGGAAGACAATTGTGTGTTAGTGGTATC-CGTTCTCGTCTCATGTTTTATGTAGCATTTACTGTTTTAGATTGCGCAACTTTGCAGTTGCAGTTGTTCCGTGTGTCATGTGTCAATTGTCGTAGTTGCTAAGCTAAAAGGAATCTCAGCTGTTTTAAAATGTAAATCTCGGACCTGCTAGGTTTTTCTAATTTGTTAAATTGTATGATAAGTTATCATATCTAGTGACATCCACATCCAAAAAAATGTATTTGCTCATAAGAACCTTAGCAGGGCTAGCACATAATGGGTATTAATATTCAAATATGTATGTCCTAAATCGTGTTCATGTTATACGTTATTTTAAAACTGTAATAATTGACAATTTAGATAATTTTTCATTCTGAAACTAACTAAACTGAGCTGCTGAGCAGGAGAATGCTTTTACAAGCCACTAATAACTAACAAACCAAACTCGTTGTGTTTCGTATTAGAACTAATTCACTCATTGTTTAAAATAAAAGTGTAAAAACA
AATGGATTTGGCAATAGGCCAG--CTCGACGCTTAGACAATAAAATGTTAATTTTAGCTTGTCATCATC----GTTTTGT---GCATTTACAG-----AAACGCGCAACGT----------ATTGTTCCTTGTTCTATGTCACA----TCATA----------TCATGAGTTTCCTGTTCGTTTCAAAA---------------TTCTATGTATTTTGACAGTGTGAATTTGTATGA---------ATGTGTA-----------ATTTGCATAAATCATTTTCTACATGATGTTCT-----------ACTCACTTTATATGATAGTATTATAATATATATA-------------------TATATATCATTCGAAAAC--AAATAAAAGCCATTGCAAATA---------CCTTAAAT--ATTAAA------TGTTGAACAAA---------TTAAAAGTCGATTACGA--AATAAA---------------TTTAAATAGAAATTGATTAAAACATCGCTTGAGCTGTGGGCTTATAAACG
>MESR6 19059824 19060019|20135 chr3L 19058911 19060081 scaffold_8 3177889 3179048 - 51222|914 1118
GCTTATGGATAACTAGGGGTTCTTTCGCCCGCCACTGCGAATTAGATTCTGAATTTACAAAACTCGTTTGGGCGGGAAAACTCCACGACTAAAAGATACCCGTAGTGATTTCGAATTAGAACCTAATGATGGAAAATCCAATACTAATTATAATAA---------TATTTTTTACTTTGAAATATACGCGAAGTATTTATTACAG
GCATAAAGACTGGAACGAATCCTTTCCCCTT----------TTCGATTC--GACTGAC---ACTTGCTAG-------AAACTTCAAAGTGATTCCACAACCGCAGC-------------AACCATATGAACTAACCCCCAATGCTAATTTAAAAAGAAAACTACTTATTTTTTATTTATAAACATACGTGACGTATTTATTATAC
>rept 19222220 19222375|20308 chr3L 19220672 19222300 scaffold_8 1678983 1680614 + 95878|1556 1650
AGTCTAAACTGACATCGCAGCAACCCCCCAGTACATTCTCATGACTATTT------TATGATCAATAAATAAGTTT--------CCTTGTATCTA
TTTGTG-------GTCGCCAGAAACTC---GCACATTCTC-TCATCATTTACTAAATAACAGAAATAAATATGTTTACAAAATGCACTGTATCTA
>CG14084 19227363 19227420|20312 chr3L 19226514 19227630 scaffold_8 1690849 1691949 + 19843|897 958
TTG----TTGGTAATTTTATAAAATATATACCCACATATTTGTATGGTTTAGTGTAGTCGAA
TCGGGCCGTGTTTTATTTTTTAAATATATTTTTAAATAACTACA------ATTGTGGTCAA-
>CG9666 19232007 19232097|20317 chr3L 19231844 19233739 scaffold_8 1694979 1696924 + 95863|181 302
GAAGAATT-------------ATATCAGTTGCATTTAGTTTTGGACATTATATGTAATAGTATTGT-------AAATTGTAGCACATTAAAATTGATCGTAT-----------GTGTTTTCT
GAAGAGTTTAGTTAAGATTACATATGAAATGCATTTTTTTTTGACAATTTTAT--AATACAATTAACACGACAAAAACAAGATTAACAAAAAATAAACGAATTCCATGCAAACGTTTCTTTT
>fal 19263604 19264094|20342 chr3L 19262297 19263799 scaffold_8 1721175 1722648 + 26073|1329 1536
AAACATCCACCAGAGAATAGTTCATGTTAAGTCAACAAACAAACGTATGTTATTGTTTCCATTCGCTTCGTTTTCTTATAT-----TTAAT-AAACTATATTTCATAAAAAGATGTACAAAT-ACTCCAACGGTTGCGTTCGTAGTGCGGCCATTCTTATTGCCATTTACATTTTGTTATCCAGCATA-----GTCGTTGAGTTTTTT
CG--TTGGATTTGAAGGTCGTCAGTCT----TCAAAAAAC------------TTATTTGTATTCGCCCAATTTTGTTCAATAACTGTTACTCACATTATATTT--TAGTATTCAGTACAATTCATGTTAAATGTTTTACTCG------------TTTGTTTATTTTCTAGATTTAGTTCTTCAGATTATGCACGTAATCAAGTTTCTC
>fal 19263604 19264094|20343 chr3L 19263800 19264398 scaffold_8 1723602 1724242 + 17530|0 337
TTAGTTATTTAATGTTCT-TTAT----TTTTATTTTTCGTTTCCATTTATAGTTAAAACTGTGAAATCAGTGGAAAGACAATATGT-----TCTTAAAATATTCATTTATTAGTTTATACAGTGTTTA----------TCATAAT-CGACTTAAAACTAA--AATACTAAACCAAAAATTTCAACAGTTCACTTGAAGACATCACAATTCAAACTCAGGTCTTTATAACATAAGGTACTTACTAATCTATATAAATAT--------------------AAGATGCATTTGTCATATTTTTGATAACCGCTTTGAAATATACACAAGAGAAAACAATAA
TTGATTGCTCAACATTCTGTTATGAGATTTTACTTATTATCATAAGTCGCAATT----CTCTCATGTCTTTGAAAATACCAAGTGCATAGATCTTACGATAG-CGTTTATTATTTT-TACAGTTTGTGAGCTTAAAATTCTTAATTCTAGTTAAAATTAGGTATTTAAAAACATAAAATTTCAACAGTTCACTTGAAGACATCACAATTCGAATGCAT-TTTTTATAAT------CACTAACTAAACAATATAAATATGTATATGTTATTATATATTTAATAAACATATG-AATAACTTGTATAACCAATTTGAAATATACACAATGATAAACAATTA
>Chd3 19415187 19415496|20519 chr3L 19415223 19415847 scaffold_62 898 1473 - 10|0 279
ATGAATTTGAAACAGAAACCAAATTGTTAATTTATAAGTTTACTTTTCAAGCTTGCCTAAGCGCAGCTATCTTTAATATATAGTTATTTTGCTCCAAGACTTCACTAAAAATATAAGAAAAGTAATAGCAGTACTATTACTTTTTTGTTCGACTGTAACAATTTTTCGCCCAGTAAATATTCTATCATTAACA----TTCTTAG-TAATTTAAGTGTTTA-ATTATGTTTGTCAAATTATTTAATTTAAAACAGAGAAACAAATAAAGATGAGTTCGATG
ATAAATTGAAAGTAACAATTCATTTTTTTAATAATATGACTACATTTTAA-CTAATTTTTGAACAATTTTAAATAACCTGTGACTATTTAACATGTACTTTTTATTCTGA------------TAATATACATGTGGTTATTATTTTGTTAGTATGGAGAGGGTTTTTTGTAGCTGTGTTCTTCATTTTCGGCACATGTTTTTAGCTAGGCTAAATATTAATAAAATGTTTAACAAGTGTATCAATATTACACAGATAAACAAATTAAGCTTGATTCGTTT
>CG12519 19438253 19438311|20540 chr3L 19437158 19438261 scaffold_8 1894891 1895914 + 18871|1140 1148
ATTACTAAT
ATTAAAAAT
>CG12519 19438253 19438311|20541 chr3L 19438262 19438662 scaffold_8 3477744 3478164 - -1914|0 51
CTGTGATCAC--ATCGGAGACAACGATAATAAATGGAGATATAATAAGACGT
CTGTGATCATTAAACAAATTTAATTAAACGAACCGGCTATAAATTTGTATCA
>CG14098 19512361 19512554|20611 chr3L 19512030 19515264 scaffold_8 1970577 1973837 + 114772|339 553
GTAATGTTCA----------GCTTACCCTTCTGCTGAGACCAGGTCAGCTCTTTGTAAACGCCGTTGCTGTGGACCTTGGCACCGTGGTTCTTAAGTATGTCCACGGGCATTGCGCGGAAAAGGAAGTGAAGGAAATTCTGTGGAG----CAAAGAAATTGAAAGT--GTAAATTTAAAATTATTAGTAAA-----TTTAATGTATCGTTTCCAA
ATAATGCATATAGGTGAATCACCTACCCTTCAGTTGAGACCAGCTAAGCTCCTTGTAGACACCATTGCTATGCACCTTGGCGCTATGATTTTTCAATATATCCACCGGCATCGCGCGAAAGAGAAAGTGTAGAAAATTCTATGAAGTGTACACGAAAATTTTAAGTTTGTTAGACCCAAATCAAAAGTAAAACCGTTGTGGTATATAAAAACTTA
>CG9300 19519949 19520031|20613 chr3L 19517623 19520031 scaffold_8 1976605 1979007 + 72513|2394 2476
AAAAATAATAAAGGTCTTTAGTGTTTCCTTAAGTTTGTTTTTTACTGAATAAGCCAAATAAACCTAGAATTAACTTTTATTTA
CCAGCTCATAAAAGAATTCTGTTCTTAACAAAATTTGTTGTTAGTC--ATAAGCTTAATAAATGTAGAGCTAACGCCCATATA
>CG9330 19554243 19554376|20652 chr3L 19551637 19554379 scaffold_8 3357160 3359802 - 128410|2642 2782
ATTAAATGTAATTATTAATTACTATATTTGTGAAAC--AGCCTAGCAATAAATTTATATTATGCCTGACACA-AGATGAAAATTGTATTTTCGAAAGGATCATAACAAATATACTC----AAGTTTATTGATGGGATTTAA
ATTTTATTTATTTTACAAAAGAT---TGCGTGAAACAAAATATAGCAATAAATTTGTAGTTTGTCAAAGATATTTAAAAAAGATTTAATATAGAAAATATCA-ACAAAATATAGTTTGTAAAACTTACGAAT-AGCTTTAG
>Taf6 19566479 19566645|20657 chr3L 19566151 19567358 scaffold_8 2029443 2030550 + 26894|360 526
ACGCCAACTCGCTGATCATTGAGACGGAGATTGTGCGCGCACCGCCCGAGCTGGACGATCTCTCGCACCTGGAGTAGCCAGCTTAGTTCGTAGTCCACATTTTGTCATATTGTATGCAATAAAATAAAAAATGCGGGTTCCTACCCCAAAAAAATGTAACCACACAA
ATGCCAATTCGTTGATCATTGAAACGGAAATAGTGCGCGCACCGCCCGAACTGGATGATTTATCGCATCTGGAATAGCCTTATTCTCACCTCTCGCCCCTTTTAT-------TAGTCATTTAAGTGCAAAACCCTAGTTTATAC----AACACATGCAAT-------
>CG9368 19567437 19569381|20658 chr3L 19567806 19568292 scaffold_8 2032155 2032624 + 19477|0 509
CTCGATTGCATGACCATAT---------TTTGTTGCACTTAACTTGTATTTTGCGTATCACTGA--TCTTTATTTCCGTATTTTTGTACTCTCTGCGCCTCGCATGCACTAACCTC-TCAGGTTTCGCCATACCAGATTTTAAGAACGGCAAGGTGGTGAATCGCGCTCGAGGATTCGTGGTGCGGATCTTCGATGCCATATGCAATTGCGCCAACAACAATGCGGCGGCGGCCACGACGCGTTTCAAGCTGAGAAGCAACAGCGGCGGAGGGGGAGGCGGCGGAGGTGGTGGTGGCGGAGCCAGCGGAAATGGCAAGCGTCAGCAGTCGCAGAATGAGCCGGAAACCCTAGTCCTGACCAAGAAGAAGCCCGCCGGCGAAGGCAAGAAAAAG---AAGGGAGTCAGCATGGCCGATGACGTTCAAGCCGGCGTTCGACTGATGGACTAAGCTAGCTATAATGGACAATGGTTGTCCATGCAATGGGAA--------AACATAATCAAAA
CTCAATCGCATGTGAATATAAATATATTTTCGTTGCACTTTTCTCGTCAATCGC---TCACCGAACCCTTTAATTTTATATTTTCATA---TGACTGCCTTG---GCACTAATCTTGTTAGGTTTCGCCATACCAGATTTTAAGAACGGCAAAGTGGTTAACCGTGCCCGCGGCTTTGTGGTGCGCATCTTCGATGCCATCTGCAATTGTGCCAACAACAATGCGGCCGCTGCCACGACGCGCTTCAAGCTGCGCAGCAATGGTGCC------AGCAGCGGTGCAGCTGG---------------------TGGCAAGCGTCAACAATCGCAGGATGAGCCCGAGACACTGGTGCTCAGCAAGAAGAAGTCAGCGGCGGATGGCAAAAAGAAGTCCAAGGGCGTAACCATGGCCGACGATGTCGAGGCGGGCGTTCGACTGGTGGACTAAGCTC-CGAAAAT---CAAAAGATATCTATTCCATGTTGAGTTCACGGAACATAATCAAAA
>CG9368 19567437 19569381|20659 chr3L 19568293 19569548 scaffold_8 2032842 2034021 + 8337|0 1152
TTACCACCAACCCCTTCCTGAACAATGAACTCTTACTCAGCAATCG--TCTACT-GTCATCTTACCACCTTAATGGATCCTGTCCAGAAGCATTTTCTTCGCTCAA-ACGTCTTAGGCACAAACCAAATTCTACGTCTTCCCCTTGAAGACCACCAAGTTTATGGTGTAAGCCCTGCAAAGGAATCTTAAAATCGCATAGAACAGGGCTGATGGAAAAGCTTTAGCTCTCTACTATATTGTTTGATATACCCAAATGTGATCCCAGATC--------GTAATGTTAACGAAAACTCAACT---CGAAGCACAAGCAACTCTTCTAGGCTAGTTATGAAAGGAGAAAACC-CCTATATACGACATTTGTAT----------------------ACACTCTCCAGCTCTCAGACATTATTTGGTCCCCACGCACAACACAATCAACGGCATTACACAATCCCAGTGGAATCGACGA----GGGTTTGCCCCGAATCTCCACCTAA--TTATAACTACGATATATCAAATTATATACCTAACTATATGTGTATG-----TGTATGACTATAGTTGTCTACG-GAACCACCAACCTATTTAGATGTGTGTGTGTAGCAGTTAAAAGTATTTCCAAACCAAACCAAAGCAGCTAACAACAAACGGTTCAATATACAAGCA--TTAATGTGTACTGATTTTATATACAATGTACTAACTACTATATATACGTGTGAATGTCATTAGACT--CTTAGTTGTTTACACAGGTTTCCTCGAACATCCTCATCAAATTCATCAACTAATCCGCACA-CACGCTCTAATCGGATATATTTTTGTGAGACCCTTTTTGGAGAGATCTACATACATATATAAAGACACTACTCCTATACCGAAACCGAAATTTAAGATATCGATTACTCTCGATTACAGAGAACTTTGTACGCAGATTTGCAAGGCAACCATTTTGTATAAGATTTGCATTTATTTTGTAACCTCTTGAATGCAAAGATCTCCCTAAGTTTGAATGCATTGCTAAGCCAATTGGATGTTTATCGATTACA-AAATGTATAA-GTATGCGTTA-TGCAAACATAAAACCGTTGTATTTAGTTAAT-----AATATCAGCAATAAACTATAAC-ATGTTTGAAATCA-
CTCCCAATAATTTCATCA-AATCAATTAGCTTCATTTCAGCATTCGAAGCTATTTATAAGACTAGCATTTAAAAAAAAAATAT------GTATTTGCTTTGCTCAACACGGAAAATGCACAAA------TTTAAGTCTTCCCCT---GCATTCGCAAGCTCCCTTCAAGGGCACCGCAACTCTATCC--AAATCCAATCAAAAACTATAGTTGTATATCTATAAACACATTACTTTATGCTTTGTTA-ACCTAAATGTGATCCAAAAAAAAGGAAAAGCAACATAAATATTAATTCGACTGCAAAAAGCACAAGCAACT--TCTAGATTAGAAATTAGAAAAGAAAAATGATTAAAAACAAAATGAATATGATAAAAGAAAGATCTCATCTAAAACACTTCCTCTATCAAAAGTT----------CACGTACAGCACAATCAATGA--------AAGCAGAGCCGAATAAATAATGTCAGATCTTTCC---AACTCCACCTAAACTAAAAATAACTATA---CAATTTACACGCGT--TTATATTTGTATTGGAACCGTATAA-TATAGATGTGTATATGAGCC-----CCTATTTAGCTGTGTGTGA--AGTAGTGAA---TGTTTTCAAA---AATCAAGG-GTCTAATATTATA----TATATATACAAGCAAATAAATGTGTACTGATTTTATATACA-TATATAAACT----TATATAC------------TTAGATTAATTTAGTTATTTACACCGCAATAC-CGTACAACTTTCTATACGTCGCAGAGGTTTCCGCACAACAAACTCTATC----TATATTTTTGTGAAACCCTTTTTGGAGAT---------TACGTATAAAAACAAT----CTATACCAGAAACCAAAGAAAATATATTAGCAA---------AAAGCGATTTTTATATGTAAAACTAAACGCC--------TGTAGAAATTC----TTTATGATGT-CCCTATTCAAAAAAAGGA------TACGTT--AAT---TTGTTAGCTTAAGTTAATGTGTGTTGCTTAAATATATGTGTAATATATATAATATTGTGCACTAAATACTGTTGTATTTAGTTAACAACAAAATATCAGCAATAAATTGTAACAATGTTTCAAAACAG
>CG9372 19573535 19573627|20663 chr3L 19572296 19575823 scaffold_8 2035526 2039030 + 139680|1305 1420
GATATACGCAGTACTGTCTTCAGTTCGATGGTACATTCAATTTACTTGGCATTAGAATTAACAAATGCTATGGTCTAAATA-----------------------AACTAATTAACC
GATGAACATAT-----------ATTAAAATGTACAATAAATTTACTTGGCATTAGC-TTAACAAATGCTTTGCTCTAAATACATATACCTATGTAAATACTAAAAATTGTTTAACA
>CG9376 19578521 19578748|20666 chr3L 19577752 19582068 scaffold_8 2041134 2045430 + 170153|780 1025
ATCTAATAATA-AAACTCTTCATTCTGCCACCAAGATTATTACGTTGCGCTGCCACTGAAATCCACTCATCCACTAAGAACCACGTCATCATCCCGTCTAGTCAGCAGCTTAGGAACTA-----------CCAAAAAGCAATTACC---ACTTTAATGTTACATGTTTAATCATATTACTAGCGTGGATTATTAATGAATTCTTTTTAAATCAATCAA-TAATAAACTAACAAATTATGAA--TTT
ATCCAATAATGTAATCAATATATCCTGCCACCAAGAAATTTACGTTGCGCTGCCA-TCACATCCA--CATCTATTGAAGCAAACCGCATCGT--TGTCTAGTCAACTGCTTATGATTTACATACATATACCAAAAAAGCAATTAACAATACTTTAATGTTACATGAGTAAGCAATCTATTAGCATGTACAATTAAT---TCATTTTTAAATCAATCAACTAATAAACTAACTAATAACACATCTTC
>asf1 19585095 19585660|20667 chr3L 19582094 19585446 scaffold_8 2045778 2049041 + 98790|3085 3469
GAGCTGC--------CGGCAGTCCG-----AACAATGAC---CACACTAACACACTGTCTCTCACTTAAACCAACATGGGCAACAATGGATAACTTAGC------ACTCCTGGTCCTCGTCCCTCTTTTTACTTCTAAGTAACTAAGATTAAAGCAAAAATATATGTATACATTAAATTATTTCACAAAACATGCATTTTCTTAGCTATATTTGACTTTTCTGTGCGCACTTATTTGTGT--------TTGAAGAATGACTAATACGTTCATGGCAAAGTTCAGTTGGCCGTGTTCAATAGAAATGATACCCTTTTTTTTATTAAGAAACTCTATTATCAATTATTGC---ACTTGTACAGCATTAATGCCTAAATAGAAATAAT
-AGCCGCGCCAGCAACAGCAGTTTAACTGTAACAATCACACACACACACACGCACATACACACTCACAAATACGCAGTGGCAAAGACTTGTAGCCTCCCGCCCAAACACAAGCTCCTGGTCCC----------ATTAATTAAGTAAGGTAATTTAAACCTCATCGCTGTTAACTAAATAAATCCTTAAGAAAC-----------ACCACACTAGCCTCGATTGGATGTCCTTTTGTGGGTTAACTAAATCGAAGAATTATAAAT------------AAATTAAATATGTCATAATTTGCATAAATTGT-TTGTTTTGGATTTTAGCAAACGATGTTGTCATACATTGCGATACGTGTTTTCGATTGATACAGACACGATATTAAT
>Gbeta76C 19654918 19655251|20735 chr3L 19653439 19654918 scaffold_8 2123808 2125138 + 65690|1523 1523
T
T
>HLH106 19732583 19732829|20797 chr3L 19728966 19732857 scaffold_0 1585665 1589650 + 147452|3771 4088
GATAGTA------------------------------------------------GTGAAGTACA-TAATAAGTGGCACGAACGTGGTGTGGATTTTCAGCAAATGAATACCCGTTTGCTATTCAAAAGAAT-----------TACAAATGCCTAGGTCTTTATAATTACG--CTATTCCTCTGTTTTCCACGCCCGGTTATGCTTAGATTGTAATT-----TTAAAATTATTTAAT----ATGGACATTTTATTTGTTTATTATTTACCGTACTTGTTAAACGTATTTATAACAATAAATATTTTAACAGATTTACA
GCCAGCACCGCGCGAAATTAGTTCAAATATTATACTTTTGTTAAGATTATCCACGGTGAAAGACAGCAATTTGAATGAGAAGCATGTCTCGAACTAACAGAAAGCGAA-AAGCATTGAATGCACGCAAAAACTGTTTTTACTGTACCAGCACGAAAGTCTTAGCAACCAAATCCCACACGCTTTTTACCTGCTATCATTTCTGTTTAGTTTGTAATTAATTCTAATACACATTTAATACAAATGGAC-----ATTTGTTTACTGATAATGG---TTACCACGTATATTTATTTCAATAAATATTTGAACAGTTTAATA
>CG15881 19740634 19740780|20802 chr3L 19739939 19741413 scaffold_0 1600126 1601695 + 25846|720 928
-----------------------------GTGGAACAAATGCAA----------TGACTAGTTTTAGGTGGATTTATTAGCAGAAGTCTCAT---GGAACTGCCAAGCCAGAAGGCATTTACATGCACTCCGTTGTATTACAAGT-------------TGTTTACAACAAGTACATA-------AATATAACAGTCTAAAAAGCACAAA
ATTTGTAGGCTAACGGAGCTGATAACAGCGTGCAATGAAGGCAGTGCAGTAAATTGCTTAGTTGTAAGTGAAATTATTAGTAATATAAACAGACAGGTACTGCCTAGCAATATGTTACTAAC--TAACCGTGCTGT-TTACAAGCATTTGGAACTTTATTTTGCCAATAAATACATAAAACAATAACGTATCATTTCACTTCCCGCAAT
>Kap-alpha1 19743664 19744241|20804 chr3L 19741727 19743956 scaffold_0 1602172 1604324 + 87758|1981 2286
CACCCTACCGCGCAGGACATCGTTTAACTATTCAAATACGAATCCCTCAAGTCCTAAACACACAGAAGCATATGCAACAGGAAGCGAAGCCTTGCCGCCGGGATTTAAATGAAGGCGGCCAGAGC-ACGGACATGAAAAATAGACCGCATGAGAAGGCGTCTGCCTTGCCCAAGTGCAGTCACTACTAGCATTTAAGGAAAGATGGT-------CGTTCGGTCGGCTCGTTTCTTTGTTACAATCACTCACCTGCTTATTGTATCAGCGT-----TTAGTTCTATAATTTTCGAAGTGGTCCAGGA
CAT------------GACAACAGCAAACACAGAAAATAT----------AACCATAAACAAATGGTAATCTCTGGA--CGCATTCAGAGTCTAG-TATCGGAATGTGTCTAGAGCCGGGTACAACGACAGGCACTGACAAC--ACCGCA----------------------GTGTGCAGTC---ATTAGCATTTAAGT-CAGACGGCTCCCCGACATTTGTTTAACGTTTTTTTTTTTTAACGTTGTTTCTCT-TTTGTTACATACTCTTTATCATTATTATTATTATTTGCGGAAGCGTTCCGAA
>Deaf1 19763034 19763366|20809 chr3L 19762108 19763248 scaffold_0 1617324 1618443 + 56399|942 1159
GCAACGTAACGAAATGTACATACAAATTTTACTACTAATTA---ATACGATTATAGGAAGTCGACCCCCCCTCCCCCAAGTCGCTAAAGTCCTTGCAGTTCGGTTCAGGTCAAACACCTGTAGTCCACTCCCACTCCCTTCCCCCTCGACCCCTCTCTTCCCCCAAAGTTCCCATTAGAAGGCCTGCATCCTCTTAGACGTATGTCCTACATTAATGT
GCAACGTAACGAATTGTACATACAAATTTTACTACTAATTAAATATATGATTATGCAAGG-------CCCCTCCCCCA-----------TCCCCATTATCCCAATCAGATAAACCAATT---CCCTGTTCCAACCAGGTACACATGTGTCGCATGTGTCC------AGCTCC--TTAGCAAGCCC---TCCCATTAGACTTATGTCCTATTATAATGT
>Deaf1 19763034 19763366|20810 chr3L 19763260 19764559 scaffold_0 1618835 1620091 + 22365|0 106
TACATATAACTATATAAATATATATACATTTTACTATTGAACGTAGGGCAAGCCAGCAAAGAAAAAAAAAATAACAAAAAACAAGCGAAACGAAAGTAAAATTAATT
TATATATGTATATATATTTATATATACATTTTACTATCGACCGTAG-------------AAAACAAAACAAAAACAAAAAACAA-------------------AATA
>CG32221 19770081 19770259|20813 chr3L 19767143 19770303 scaffold_0 1623600 1626402 + 61089|2985 3183
GGCCTTATTCGTTTAACAACGAATGTTTCTTCA-ATCATTAC-----------CAAAAATACAACGTAAATTATTTAATATTTATACGCAGCTTTATTC-------GTGATCTTACCACTTTGAGTGGTATTTCTTTTGTTAGTGCACAACGA-TGTAACTTTTTCACTGCATAATTAAAAAATTACGTCATATTTAAA
AG-----TTCGTGGAGTCACAGAAGTTTATACACATCATTATGCATATTCGCATAAGAGCATACCAATATGTATGCAGTTTGTATACCAAATAATATACTCAGAATTTGATAAGAGTATTTAAAATATTTTCCCCTCTGTTATATTACACTAAGTGCTAGTATTTTATTCTAAATATTGAGGCTTACTT----TTTAAA
>Paps 19794453 19794774|20825 chr3L 19792541 19794906 scaffold_0 1642278 1644727 + 109159|1942 2351
CCCGCTGCT------------------CACACTCGATCCGCAAC--GTGCAATTC-------------------------------------------CTCCTAGTTATAGCTCGTGTGCTTATTATACA--TAAATATTTCAAGCTAAAGGCGCTTACCACTTACCACATCTTTTTTCCATTGTTCTAAGC-------CGAAATCCGTGGCTGTCCCCGTGTGTGAATGT-TGTGCTCCTCCTAACTAAATGTTCGTATCGTACAATCTACTTGTATCTACACTTAAGTCACCCAA-TTCTTTTTATC-TTAAGCAAAATATCGTGCAGCTATTTTGTGGACGGTTTTTAATACA-----------TATATAAATAATAAAA--TAGAAAATTACTTATTGAACTGATT
CCGACAGCCCGTTGATGCAACGGAGGGCAGTTCCGCACAACAACTAGTGCAATTCGCTTAGCTATATATATCCTTTATGTCTTATGTTTTACACGATTCACATATTTGTATATAATGTGTTTGTTGTTCAAGTAATTTGTATGTATCTGAGACGCATATCTCG---CATGTCTCGAGTCAAATTATGTAACCTATGTATCCTAATCTATGTGTGTGTACATGTGAAAATGTGTGTGTTT------------TGTTCTAATCCAACAAT-TAATTGTGTTTACATTTAAGTTGTCCAATTTCATGTTATCTTTAAGCAAAAAATTGATCGG----TTTCTGTACTGATTTCAACGTAATGAAGCGCATTTTTTAAATATTTGCATTTAATAAATGACTATCTTAACT--TT
>CG7757 19846170 19846353|20859 chr3L 19844134 19847530 scaffold_0 1691899 1695171 + 138710|2124 2315
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ACAA-------TTTAGCGACATCTAGCTGTTTAGACCACAAAATTTGTTAAAAGTTT--------AGATATATAAGC-----TTAAAATTATAAA----------CATTC--TGGTTTTATGTACAAAACTGTGCATTTATTTTTTTGTATACGGATCCTCCTTAATG-------TTGGACTGTATAAACTC
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ATTTCTAT
ATTTTTAT
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ATGACATATTAATTGTATAAAATCATAGATTTTAACTTTGGCCATGACTCTGTTTCTTTTTCTACTGATTTTATATGAAATAAAACTATACAAGTATAATTATATTTTTAATAAGAA
>fat2 19958327 19958448|20970 chr3L 19958434 19958700 scaffold_0 1473266 1473547 - 3815|0 14
ACAAAGAACATCTGC
ACCATAGATGTCTGC
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ACAACAACGAGAGGCTCCCAACTGGACAACTATTAAAAAAGAGC----------AGAGGACCTATAGACGCATCCTGCCATGATATCTCTTGATTTACGATTTC
GCCCTGGACAGAG----------TGAAAACTATTGCAATAGGATGTTTCTTATAAGATGACCCATGTCAATAAGCTACAAT-ATATCTGTGGACATTGGAATTC
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ATATTTAAT--AACTTTATTTTATTTTTG------TTTAAAATTAATTAAT-------ATACGACTCTGTCGCGTTGCTATAT
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--GCTGGAAAGTTGGCTGAACAAAATGGGGCAACTGCCAAATATAACTGACACAAGTTTTTCTTGTTCCACACACACAATTTCAGTTATTTCTAAGTGCAAATTAGTTTATAACC
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AGAGCAATTAGTTTAGTATC-------TGAG---TGCTATTTAA----------------TGTACAAAAGTACAAATAACAGTTTATGTGGTCACTAATTTAATTTAATTTGTTTTTGAATACAGTGA--------------TGATAAGCTAAAGTTTCATCAACATATTTTGTATATTAATGT-------CCTCTGT--------AATCGATCACTTGTTACATTAATCTGTTATGTTAATCTCATTGCAGTTCTGATTACTTGTACTCCCGATGTTAAGTGACTTGTTAACTTAAAATCAAATTCAAATGATGTAAGATGTATTACTGGACTCTGTTTAAAAGGGTTTAATTTCAGTAA--AGCTAACAGGCTGAATAAGAACATAATAAATTAAAAAGTTGACTATTTTTTTAATCGGCTCATTCT----------TGAATTTGATAT----------GTAAAAACATTAGCTATTTTTAC-ATATTTTA
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GTAGTTTTAATTACGC-ACTCGCCTAACCACATTGAGTTGAATATGAAAATTATTATTGAAAGTATTCGCTGTATATTCCAATT-TATGATACATAAAATA--TTATTATTGCTGCTATAACATAGCCGCGATCATCGTTTTGTCTAATGAATGCAATAAAGAATGTG-CACACAGTTGTCATGCTTTCCTTGACTATCA
G-------AGACACGTAAACCAATTAATCAAAT----TTGGATATTTCGATTCTGA-TAAAAGTATTTTTTGTAAATTCCAATTATATTAAATATATATTACTTTAATTTTGCCTCTATTATATGATAATATTCA----------TAACGAAT--AAAAAAGAATCAGACACATAAATGTAAACTATTTGTTTGTTATTA
>Clc 20177299 20177576|21160 chr3L 20177494 20177876 scaffold_34 720325 720674 - -506|0 95
TATACCCCATCACACAAAATAAGAAAAACGACATGAAAAAGTTAGGAAAAAGAACAAATAAAAAATAAAACCAAGGAT-------------ATGAC
AAGAACAGAATACAGAAAAAGCGAAACACGAAATAGAGAACACACGAAAAATATATAAAGAAAAATAGCAGCAAAAGTTAGAAATAATTTGATGGC
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GGTCAAATACCAGAAGATGATCAACAAAGTAGCATTATTGTTTTTTTGGGCAAAGTTCTCAGC--TCGAATTTAATTTAATGTACATGAAGCATTTAAGGCTCATTTGCTTTTAAGTCATAATTTTA--TACATACCATATGTAG
---TTATTACCCCAAAATAGTACAATTAATGCAATTATTTTT--------CAAAATCATAAGCGGTCAGCCCTAACATAATGCCGCTAAAATATT-----ATTAATAATTAAGAAGTTATAAAGAAAATAATATATCATATGCAG
>rdgC 20197992 20199395|21177 chr3L 20198133 20199199 scaffold_5 2488323 2489291 + -3670|0 1116
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GAGTGCCTGGA-----TCGCATACTTCTAGTTAAACTTTAGAAATTCAGT-------AGTGTCCACGAGG---------------------------------------------------AGACCAGCGG------AAGACACACCCATACGA-----------ACTCACA--------CAGAGCCCCCATTACACGCGCTA------------ACTCAACACACACAAACATACGTACACCACGAAAGAGACACAAGGCACTT----GAGACTGCGTAAAACTGGCAAAACAAACCAACTATAAAACTACACTATTGATATATATATATTAATATATTTAATGTAATAATTTA---ATTGTAAACAACATTTAAAAACAAACTGCATAAAGTGTTACTTTTAAGGCATC--------ACCGAAACAA-----------CAAATGGGCAAC-AGTTTTAAGACAAAGGAACTTTT------CAATCCT------CGAAATAGCAGCTAAACCTTGGAAACCCCAACAGCAGCAGAAAGATAAACTAAGAACAGCAAACATTATATAATACGACAAACTTATTATGAATAGATGTAAAAATGGCATAGTCCAAACTAGTAAGAGAATATTTAACGAAAATCTGAACTAAGA
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GCACAAGATACGAATACTACAGCCGGCTGATTTCATTCATTATCGTTACGTTTATGTTTAGTTAAACCGAATTCATTAACTCTACATACAGCGCGCAGGCTTAACTTA------AGAAAATCCTCTCTTTGCACCATAATATTCCAAATTTAAGTTGCTGTTTAAATTTACCCGCT---TGTTTATTG-ATTAAGTTAAAGATTCTTTTTTGTTTTCGGTTAGCTATTTCCGTTTGTAACTTGTCAATCGCAAAAATTTGGGCGACTCTCACACGCAATTATATATAT----------GTTTCCAT----------------------GTTTTAAAGATA------TAAATATACAATCTAAT--------------------------------------------AAAGATTTTA---------ACATTATCAAAATCATA-TAAAATGTTTTGATTTCCTAACGATTATTATCGGCATTTCGATATCTTGCACAGAGATACATATTGGTTATCGATTCGAGTTATCGAAATGCGAATTCACCTGCATTTTTAAACAGCTGACAGGAGTGT---TATTAATAAGAAATAATTT--------TGTTGGTCTTAAC-CAATTATGCTCGAAATGTAAG
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ACG---AAATCAATTAAATTTT--CGGATAAA--------ATCGCGTACAC-ATTTATTAAATGCTTTATTCGGTTCGGATA------TTAAT----CTACCTATACATATATAACTA-AAAGAAAATTATTAAACGTG
GGACACAGATCTATAAAAGCATAACAAATAAAAATCTATTAACGCATATGCAACTTATAAAATGCTTTTTCAGTTTAAAACAAGTAATTTAATATAACTACATATATACATATAATTATAGCGAAAAACACAAAACGCA
>Snap 20249389 20250419|21215 chr3L 20249672 20250180 scaffold_0 6498216 6498797 + 380|0 599
AAAGAAAAACTTTATTATTTCCAATGTGGAGTGATTAGAGGTGTTACTTATGTTTGTCTGTTTTTGCGTTACTCTTGTTATTTGTGTAAGT-------AGCCAATCAATCAG--TGGGTTAGCTGATGTTCCATTTGGATGCGTAAAGTACCCTATAGAAATCTGT--ATCCACTACTATAATAAAT-TGAGAACTT---CATT--CTATGTGTGTAATGTGTTAGATAATTTTGAGATTAAC-----TAAAGAGTCCCTGGTAGCGAAAAT------------GAATTTCAAACCAATTATAATTCCATTTAGTGCACTGAAATAAAA---------------------TTAAACCTAAAGT-----TTAGATTGTACGCATATACACAA-----CCTACAAATAAAATATATGTCCACATAAACATTACCGATTACCC---CGATAAATAT------------CCAAAAAGTACACGGAATTCTAATAAATA-CTTGAGGGTCACATTTATAGAAAATTCCATCTC----GCAAAATTTTAACGATGTTTAGTAGAT-CAACATGTACGAGCGAAT-----TATAATCCAATAAATAA
AAAGGCAAACAATAATATT----ATTAGCAATGCTT---GTTTCAATTTATTTTATTATGTTGCAATAATGATATTATTATAAACACAAGTTTATCGAAATTGTTTAACGAGTCTAAGTTATTAAGTTGTTTGTTTAGGCGTATTCTGAGTTAGACAACAAATTGTCAATTGACGGCGATTAGAAATCTTACAATTTTGACATTGACTACAAAAAAAATATTTAAAAGTATCTTTTAATAAACATAAGTAAAGAGATTTCGATGGCGACGATGCGCCCGCATCAGAATTGAATATGGATTGAAAAAATATATATTATAATTAAACGAAGCATTCAAATCGTTAGTAGTTTTTGAATTTAAATTTCAAATCAAATTATAAGCATACAAATGAAAATGAAAACAAAAAAAAAACAT-TCTTAGTAAAAATAACATATATTCCAAACAATTAATATGAGTATATATTAACGAAAAGTA-----AATTCCTTAGAATATTTTGAGGGTCGCAGTT-----AAATTCCATCTCAAAAACAAAAATATTCAAATATTTGGTAAATACGAATTGTATGAAAACATAAATAAATTATTTAATAAATAA
>Snap 20249389 20250419|21216 chr3L 20250181 20250539 scaffold_16 741678 742033 - -1300|0 239
TATTACGACGGAGCGACGAAGATTACGCGGTCGTCGAGGCCGAAGCAAGAATAAATAAATCAATTATTGAATTTATTGAATGAAGATCTCCAGGAAACACACAACACCACTGAAACCTGACCCAACACATTTAATTA-TTAATACTGCAAAGATCCTGGTAATGCCTCTATGCAAGCGTTACCACGGATATTTCCAATTCAAATACTTTAATAAAGTTAACGCTTGGATTAATCCTGTCA
TA--------AAACAAAAAATATCATTGTGTTGCTTTAACTTTAATGAAAATTTACAAAATTGTCTTTTTAATTATCTACAAATTATTGAAATGAATCGTATATGATAAATAAAAGAAAACAAAAAAAAAATAAGTAGTTAAT-------------TGTTAATGTATTCA---AAGTGACAACACGTAAAG---CAATTTAAAATTATTAA--------ACGCAAATACAAATTCTAAAA
>eRF1 20286731 20286970|21236 chr3L 20286412 20287010 scaffold_0 5537868 5538506 + 12910|342 634
GAAATGTAT-CTGTAGAAATGAATTTGCCACTACGTTCGACCGCAAACTGAACTGCAAC------------TACAACTATATGAATCCAGGAAATCAAATAGAATATTTAAATAATATGAGAAAACACAAA----------------CCTTCTTCCATTTTTACGTTGTTGGCGAA-AAAAGTAAAATTTTAA----------ATAATGCATATAGATACAAAC------GATAAAATGTTAAATCGAGGAAAACATA-------TTAAAATGCAACCGTTTTACGTGAACAA
ATAATTTTTACTTTTCCAATCAGTTAATCA--------GACCGCAAATTGAA----AACTTGATTGATTCATAAAAGAAGCAAAATCGAAAAGAGCAAATAGAATATTTTAATAATACACAAACACACACACGTACACACACACAATCCTTCTTCCATTTTAACGTTGTTGGCGAATAAAAGTAAAATTGCAAAAATACATATATACCGTAAATAAAAAAAAACCACAAAGATATAATGTTAAATCAAGAGAAAAACAAAAATATAAAAAAGGAAACCGTTTTACTTGAAACA
>CG5618 20290375 20290535|21240 chr3L 20290312 20290525 scaffold_0 5540419 5540625 + 1237|68 222
---ATTATTTTCTATGTGAATTAAGCTAATTAATGGAAATCGTTCAATTGTACATTTCATTGTAGTTATTACTTTGT-GATAAAAAATACGCCTTTATTATGTAAACTCGGCTTAATCTCTATTTTGAATATTTAAATAAAAATCTTTCAAGAAA
TTAACCATACTACATACAAATGAA--TAAGTACCTACACACGTGCATATGTATGTTATGTTGGATTTGTGTTCGTGTCGGTATGCCACAC--------------AATTAGGGTGAACCTTTATTTTAGATATTTATAAGAAAGTGGTTTATAGAA
>kin17 20291983 20292185|21241 chr3L 20290689 20292432 scaffold_0 5541353 5543006 + 62076|1297 1500
C-TGCGCTTTTCTAAGTTAAATTCTATAGTTGTACCTTTTTATGCCTAATTTGATATATATGTAAGTAAAAAATCTTAACCATTTCGGAGAAAGGCTGAAATCGAACTAGACAAAAATCTGCACATAATACGTTCGTTACTTAAATTTGGACTGCTCAGCATTTGGGTTAATAAAACATGACTTTTTAATGAAAATAACTAGAA
CTTGCACACTGCTA---------------TTTAAGCTAATTATTTAAAATAAGAACAGATTTTAAGGGCATATTTTTTATTATATGGTTCTAAAAACGTAAATGATATCTTTTAAAATCTGCGTAAAAT-----------TTCAATTCTGCAATCTAATAATTTCAATCCATTTAAGAT---------ATGCATAAAATTGGA-
>in 20303767 20304103|21244 chr3L 20300949 20304329 scaffold_8 2444692 2448034 + 98106|2930 3279
--------CATCTTGGAAGGATACTACCAACTTAGATACTGGCTATGCGTAGAATTCTTGCTATAATATAAACACAAATATTTAAAATGTGGTTTTAACTAAACAAATTACTTTTATATAGGCATTCAAACAATTTTTTAAAATTATATTTAAGAATGCATAATTAATCATTTTCAGCAATTCTATTACGA-AAGCATTTG-ATTTAGGGGAAGTGCAATTTTGTATTTTCAAAATTCGAAAAGCGCAAGCTTGCCAAAACTCTAAGAAATTGAAAAATATGTACATTTCCTCTGAAACGCAG-CGAATAAATATGTATGTATGAAGGTATT--TCAAGAGGAACACAAA
TCGATGTTCATTTTAACCAGTTAATAGTATTATAGAAATTGAGTCC-CGCTAAATTGACGAGATGG-GGAAACATGAAAAGCTAAAATCT-------AATAATCAAGTGAATTTTAT-------------TAACGCTTAAAAATGAATTGGAAGACAGTCGTATAATTCATCATCAATCAATCACTCGGGATTAACATTTATGTTAATATAAAGTTCCACTCTCTTTCTGGAAAGTT----------AAGCTATAATAATTTCAATGGATTTTAATAATGCTTGAAAATTAGTTGAAAGTCAGTCGTATAATTCATCATCAATCAATCAATCAATCAGTTGGGAATTAAA
>RhoBTB 20315540 20315562|21251 chr3L 20314342 20317899 scaffold_8 2457881 2461380 + 98399|1334 1356
CACCCAGCCCTAGGGCAAGGAAG
CACCCAGCCCTGGGACAGGGCAG
>RhoBTB 20315633 20316241|21251 chr3L 20314342 20317899 scaffold_8 2457881 2461380 + 98399|1431 2056
ATCACTGCGCTTCATTGTGATCCTGCCGGTCCTGATCTGTTTTATCTGTACGATTTTAAGTATTTTGATACTTTTCCAAATCCATACATAACAAACCTCAAGGGCACGATTTAGAGTGGTCGGGGAGATAAGGGTTGGAAATGGAGGGGGCGTGGCGCGTCTGCTTTTGACATTACGCAATATATAGAGCGCAAATTTGCCTTAGTGATTAACGATTAATAAGTCCAACGTAGCTCGACCCAG-AACAAGGGAGCATACTGCAGAGTGCTTCGGATTTCTTATATTT-----ATACGCCTATATAAAACGCAAAGCATAGACGAGTATGTATGCACATGCACCTCGGCGCTGCGAAGCATTTCGCTGTATTGCCTTACGATATATCG-------GTGTACACTCAACTTGTTCTGCACGATCCCTCCCATGGAATGTGGACAGCCGAAGGACGCAGACATGTGTATATCCATAT-ATTTGTACCTTTACCTAAGACATGTATGTATGTATATTTTTGAATTCCTACTTACGGAAACATTTGTCTAGCCATAGC-TCTAAGCAATTCTCTACGA--TAAGGACGCATTTTGTACAGAATGATAGAATAAAAAAGCAATTACGAACAA
GTCACTGCGATTTATTGTGATTCTGCCCGTCCTGATTTGTTTCATCTGTACAATTTTGAGTATTTTGATACTTTTCCAAATCCACACATAACGATCCCCGTGGGCA-----------------------ACGGGTTGGTG----------------GCGTCTGCTTTTGGTATT-------------------------------------------------------TGAGCTCCGCACAGAAACACATAAGCATTCATTCAATTGCT-----TTTCTTATATGCTTCAAATATGCCTAACTATAGTGCAATATACATACGCATATGTACATATGT-----------------AGTATGT-----------------ACATATCGAGCCAGTATGTACGATTA---TGTTTTATTTGTGCGCGCACTTTAAATGCAGAAA---TAATGATGGAACTGTATGATAAACCAAATCATGTGTATACTT-------ATACTTATGTATTTA-AATTTTAAATTCCAGTTTAGGGAAACATTTGTCTAGCCATAGCTTTTAAGCAACATAATATGACCTAAGGACGCATTTTGTACAAAATGATATAG-AGTAAAGCCATTATGAATAT
>fbl 20325024 20325296|21258 chr3L 20324716 20325424 scaffold_8 2467535 2468248 + 15121|314 616
TCGCTATAACCACAT----GTTCCTCCCAAGGGCAC-CCAACGTGCGCCAGCCGATTGAAGTGCATGTACAGTAGACCTAAGATCAATAAGGCAATGACAATGGCAATGGCAATGACTTTGGTCCTTCGCAGTTCATCTCGGTATTTATCGTAATTCTT-TCTCGGCTTTAGTTGTAAC-----TTGATGACGCACAAATTGTAAATGCATGAAATTA----------------CGTATGTATGGATAAAGTGCCTGCTAGAAA--GCAAC-GAATTTTGGCCCGATCAAATGGCGAACCACA
----CACAACCAGATAGTCGTTCCCTTAAAGTGAATATCAAACTGTATCA--TAGTGGTTGTGCATCTACAACAAACGGAAG------AAGGCA---ACAGAGGGAATGACAAATAGATGCAGTGGGTGCATTT--TCTCGCTATTAACAATATTTTTTCTCTTGGATTAAGTTTACACAATTTTAGAGGATGCACAAATTGTAATTGTATGAAATAAAAAAAAAAAAAAAAACAAAAAGAACGGATAAAGTGCCTGTTAAAAAACGCAACAAAATTAAGGCTTCAAAATATGCTGCTAAATA
>Psn 20368891 20368997|21325 chr3L 20366263 20374194 scaffold_0 5643188 5651270 + 227771|2840 2958
ACTTGAAAAGACAAGGA-CACATCAA---GTGTCTTA-----CAGTAT---CATAGTCTAACAAAGCTTTTTGTAATCCAATTCTTTATTTAACAAAATGCATAGTAACAACCTCGACT
A-------AGACAATTAGCGTATAAATTTGTGTACTAATATTCAGTGTAACCGTAGTCCAAGCTACCGTTTTACAATACA-TTCTCTATTTAATAAA--GCGTAGTAACAAACAAAAAA
>CG5872 20371967 20372208|21325 chr3L 20366263 20374194 scaffold_0 5643188 5651270 + 227771|6078 6345
AACAAATGACATTTAGGCAATCAATTTA----------------CAAATAGTTTTTCAGTTTAGACCATTTCATTTATTATTGATTTTGTTAGTTCTCAATTTGATCACATTTGATTCACAAGTTTCCTCGCTTGGCTTGTTCAATTTCAATGGCCGTGAACAAGGACTTAAAGTTGCCAGCGCCAAATCCCTG-AAATAGTAATGATCATGATTTA---------CTTGTTCTTAGCAACAGTAGGTTAAGCAATAAATCTTACATT
AAATAGCAAAGTTATAAGACTTGATTTAATTGTAAGAGCCCATCCACATAGTTGTT--GCAAATGCCTTATAATAAAATATTCATATCATTGCCTTTAAAT---------TGTTAATTACAAATTGCCACGTTTGGCCTGTTCGATTTCAATAGCTGTAAAGAGAGACTTGAAGTTGCCAGCGCCAAAACCCTATAAATAAACATAAATACACATTAGAAAAAGATCTTATTTAGGAAAATAGT----------ATCCAGCTTACGTT
>CG5910 20384238 20384455|21336 chr3L 20384045 20385104 scaffold_0 5661580 5662781 + 35608|194 495
GATTTCGAGGGGAAGTCATGATGTGAGAAAACTTGTTGTACAGCGTGAAGTCAGTCATAGAGAAGTAGGATCTAGTCGTAGTA-----GCATTCA----------AATAAGTGTACTTAGTTCAACAAATGTCCAGTGGTAATCAAACTTACTTGCTAAGCAT-----------ATATTTAAGCGTTAATAAATACACGTTTATAATGCTAAC-----------AGACTTTAGTT-------------------------AGCGTGTGGC----------------------TTAGATCACT
GATTTGGGCGGGCCCTGGGAATAGACTAAAATCTA--GTGCAACAT------AGTCATAGTCATGTAGGCACCATGCGATGCAAGGCGGCAATTATTTAGCCATTATTAAGTGTACTTAGTTCAA--AATGTTTTGCACAAATCAAACTTACTTGGTAAGCATTGTATATGAATATATTTAAGCGTTAATAAATATAAATTTGTATGACTAAATATGTGGGTTGGGCATTTAGTTCTCTCCTATGCATAATAATGCACATAGTTTGTAGCCACATATTACATTTATTTACGTTTAAATCATT
>CG5932 20395860 20396115|21344 chr3L 20395471 20396006 scaffold_0 5672367 5672903 + 19008|390 545
AAATCGGCCAATAAAAGAATCCGTAATGC------ACCGATTTTAACACATAGTTTTCGGGCTACGTACCCG---AATTTATTGGGGGGATTCAAATGTCCAAGTCGGCGACAAGTCAAAGAATAAACTTAACCTTCAAATAATAAAATTAGTATA
CGATTGACCTCTAATTG-ATCTGTTAGGTCAGACAATAAATCTGAAAAC----TTGCCAAGCTATTTTATTGCTCAATTTATTGGCGAGCTT-ATTTGATAAGATTGAAAGCACATTTTTGATTTGAATCACATTTGAATTGATAA---TAGTATA
>CG5955 20403292 20403443|21351 chr3L 20401557 20403347 scaffold_0 5681227 5682839 + 54033|1768 1840
GACGTGGATCGAAC--------AACCGCATC----TAGTATT----GCTAAGTAATGAAATCC-AATCGCATT
GATGCGCACACAGCAGCTGGGAAACCGCAACTAAATAGTATTCCACACAATCGAATGAGATTCGAATGGCATT
>CG5955 20403292 20403443|21352 chr3L 20403348 20403946 scaffold_0 5683064 5683726 + 3119|0 105
TAACACTGCATTTATCTAGTGAATAGCAACACAAACCACTGTAACAT----TTTACCTTTTAAAATACAGTAAGGCATTTAT------TGGAAAGGAAAACTATTG
TAAAAACACGTTTTTCTTTTGAATTGCAGCACAG--TAATTTAGCCTGGTCTGTGCACACATAAACACAGGTATGTATGTATGTGATATGAACAAGAAACACACAG
>CG5969 20408119 20408635|21355 chr3L 20407333 20408733 scaffold_0 5688927 5690432 + 10856|863 1522
TCCTCATCTACCCCGGACTGTTAC------CCTATTTCCATTAAC----TTTAAGTCGGTAGAGCACTCTTGT-------ACAT-----ACATACATGCTACATATA-TAGATACAATTGTTTACA-------------------------TGCCAGCGAGGGAGGAGAAAGTCGCCTGTAAAC------------CGTGTGTAATCGCTTTTCATTGCATAAGTTTCGATAACA---------------GCGTGGAAAACGTGTTGTGTTGTGT----------------AGTGTTCTGTGTGCATAATT--TGTATTAAAAATATACATGCATAAGTGAAATGCGTCTGCTACTCAG-----------AAATTATTCCCTAATGGAG----------GCCGTCAAAAGATTGCTGCCGAGACCGCGCAAAAAAATCTACAATCTAGGCGCTTGCTTCGAAC---------TGGTGGATA----TTCCTAAGGTTAACT-----------AAAACATACATTTATTTGTACTCTCTGCTTGAAAGGGGAGTTCTGTATAAAGTATACTGACTTCGGGGATTTTATTATATTGATAAATTAATTTTATGTTTTTGAATTT-----TATATTATATGTTTTCTTTTTGATTGAAGCACAAA
TCCACGGCTGC----GACTGTTACATATGTATCATTTCCAATTACAAAGTTTATGTTTTCGCTGCGTTCGTTTGTTATAAGCATTAGTAACATTAGCGTTAAGTAAACTAATTACAACTATCTAAAATAACATTCTTATTTGCGACTCTGTGGTGAGTGTGAGTGTGATAAATGACCTATAATCGTATACGTGTGTCGTGTGTAATCA--TTAAATTGCATAATTTTCGATAACAAAACACGCTCTCTACACGTTGTAAGTCTTTTTGGATCTGTCCATTCAATTGCTGTCAGTGATTTGTA-ACAAAATTGGTGTATTAAAAATAAATATTTA-AAGGGAAATGCGTGCTTTATACGGCTGGAGCAAGAATATTGTGCGCAAATATGGTTGGATTAATGCTATTAAGAAACTGCTGCCAAAACAAACCAAATATATTTACAATTTAGGCGTTAAGTTTGAGCTAAGCGATGTGGTGAGTAACGGTTCCAACTGCCAGCTGGTAACATTAAAAAGCATACGATATTTATTGCTGTTTGGTTTGG---------CCATTTAAATTAGTTGGCCTTAGTACACT---TAAAATTGACTAACAGTTTATTTCATTTAGAAATTGTAGATAAATTAAACGACTGATTCCCGCTAGAGATGAGCG
>CG6020 20430827 20430929|21372 chr3L 20429105 20432285 scaffold_0 5702027 5705241 + 77777|1770 1875
GCGGAGCGAAGTAGCTGTCTGTGTTGATTGGAAATTTTTAGTTGGAATTGTTTAAGGCGATGCGTCAATAAAGAGAA---GTCGAAAGACCCAATGACAACGAAGG
ACG-----------------TTGTGAATTGGAAAATCTTAGT-----GTGTTTA----------TCAATTTAAATAAATTGTCTACAAATTAAACG--AATAAATA
>CG32425 20444635 20444941|21383 chr3L 20443738 20450817 scaffold_0 5707779 5715046 + 114575|989 1301
CTAATGTCGTGTGGTCGCCAATCGCAAGAACCATTGATTCTTGGGCCCCCAAATCGAATACATCTGATACTAGCTGAACCACACGACTACAGCCACAACAACTACCAATTCTACCACCAAGCAGAACAACAAATGCTATACAAATACCAAATCTACACGAGCCGCCCACAACCACGCCCACGCCTCCTGCACTTAC---TCTATATGTTATTGATTGCCGTTATCCAAGTGCTGCCCATCATTCTG---TCAATAAATACTTTTCATTTTCAAAAAAGAAAGCAAAACAAAACAAAAAACCACCAACAAAACC
CTAAATTCGCTTGGGTGCAATCAACAAAAGCAA------------CAACAACACCAACTACAAC------------AACTACACAATCACAGCGACACCAACAACAGCTACGACAACTA--------------------------------TTTGCACTCTGACGTCACAATTATGATGGC-TCTTCTGCTATTGCGGCTTTTTGATCTATTGGCTGCCGTTATAAAAGTGCTGCCCATCATGTTAAAATCAATAAA-ATTTTTCATTTTATTTG-----------------CAAAAGACCA-----------
>CG32425 20447528 20447953|21383 chr3L 20443738 20450817 scaffold_0 5707779 5715046 + 114575|4167 4682
CCCAGG----GCCAAAAGTCAGT---------------TAAGAATGTTTTTTCCTCTCTCCACATCTCGATGTCGTCTCTGATATTGGCTCAAATGGTAGCTATA---------GTTAACCATCTAGATTTAGGCAATATATATATATATAATGCGCGGATCTTAATCTGATCTGATATTATGCTGTACTTAAATT-GGCATCCCAGTTTTGCCTCGATTCACCGTCTTA-TGGCTGTCTATATAGCATAAAATCAAAGCTAGCAACGATCACCCAGCGATCGTTTCATTGAGTTACAAAT-------------CGTCGATTGAAT-ATTGTTTTAAGTCACGAGGATTTTT-------CCCAGCAAC----------CACACGGAA-------------------TATGTATTAGTTTCGGAACTGTGTTAATCACCTAAGTATTTAGACACTATTACCTAATAAAACTTTAA----ATAAAATTACAATTGCTAAAGCAACT------CAAAAA
CCCAGGCTGAGGCTCAATTCAGTGGCACATCAATTTAGTCAAAACACTTTTTTCACTTTCTC--TCTGGATGTC---TACGAAACAGGCTCAAA-AGTAGTTATATGATCTTTAGATAACCATATATATATAT---ATATACAATTATATAAAACATAGTTAT--ATATACTCTCATGT---GCTGTACTTAATTTTGGCAAAT--GATTTGCCTAAATTCAACATTGGAATGACTGTCGA-ATAGCAAGAAATCAAAGGT------GATCACGTGGCGATCGCTTCATTAATTTGTCAAAAAAGAAAATTTAACAATTATTGAATTATTGTTTTAAATCAACTGTGTTATTGAGCATACCCGACAGCAGTTATCAGATATATGTAAAAGCGTTAACCCATATTACTATGTATTAGTTTCGAAACTGTGTTAATCACCTAAGTATTTAGTCACTATTACTTAATACAAATTAAATGCTATGCAAAAACAATTAAAAAACTGACTTTTATTCGGAGT
>CG5104 20456128 20456599|21393 chr3L 20455954 20456396 scaffold_0 5719178 5719609 + 10125|174 480
--------AATCAG----ATGCGCTTC-TGTACATAGCTCGAGAAAA---------GCCAGATTGGTTTGTAGCTTAAGCTAAGACAATTAAATCTTTTGT---------------ATTGTATTAACCTAGCACTAGAACATAGAATGTCCTTTATATTCTCTTATTAACAAGTACAATAATTCCATTTTGTCTTTTTAATAAATATATATATATATATATATATATCTTTTATACATATATATATATATATTTACATGTTATGTATTTAATTTAATCAGTACAGTTTTCTTTAGTT-TATGTACAT
TCTATAGTAATTTGTACAGTACGTTTCATGAATATTCTTTGAAAACATTGTAATATGTATTATTAATTATTTACTTA---TATAGCTCTTAAGTTTCTTACGTGGACAATTAAAAAATTGTATTAATCTAGTTTTAGAGTTTAGG-TGTTTTTTCTTTT---------------------GCTTCACGTTTGCTTATTAACAAATTTTCGTTGGTTTA-----ATATCAATTATACATACACATA----------CACAATATAAATTTAATTTAATCAGTACAGTTTGCATAAATTGTATGTACAT
>CG5104 20456128 20456599|21394 chr3L 20456399 20456761 scaffold_0 5719664 5719935 + 6709|0 201
TTCTCTTCTCTGTTTTGGTTTTTAATTTAAAGAATGGCCCGATCCACTTTGTTTCTGCAGCTTTAAAGTTTATTTATATCAACTTCTTATTTTAGTTTCTTCTCTTTTTGCGGCGACAATTTACCTA-GAAAAGTGAAATGAAAAATTGTAGATCAAAAGTAGCAGATATAAAAGTTAACAATAACTGGTTAGACTATTTTA
TTTTTTCTTTTGTTTTGGTT-----TTGCTAAAATGGC-----------------------------------------------CTCATTTGAGTTTCTTCTCTTTTGCCGGCGACAAATTACCTAGAAAAATAAAAACGAAAATTTTTTAAATAATAAT-----TTAGTAAATGAATTGAAATGCAGTTAAACTATTTTA
>CG32431 20621863 20622290|21592 chr3L 20621610 20622049 scaffold_0 5899843 5900251 + 4596|279 482
CCGTGTCTGGGTTAGGTCAAGCTGGTGATGATGATGATGATGCTGCTGCTGATGCTCTTAGCCGTTCGCATCATGAT-CATTTC-----ACTGGCAGTGCAACCTCAACTTTATCGTTGGCATGCGTATGCTTGAC-----------CTGTAAGTTCACTGGACACGCATGCGCCTCGAAAAGCAAAGGAATCATTTGAAAGAC
------------CAGGTCAAGCAAGCACTCGCT-------TACAGATACAGATACATTCACAGTCACAGATACAGATACATTTTTGGTTGCTGCTAATGCG--CCCAGCTT-------GGCATGCGTAAGCTTGACTTGAGCTTGACCCGCAAGTTCACTGGACACGCACTGGAGTCGAGCCAGAAATGATCAAGACACAAGAC
>CG13252 20677500 20678370|21655 chr3L 20676034 20677528 scaffold_0 5952697 5954252 + 24700|1571 1599
GCAAGAGACCTTTCGAAATACTAAAAATA
-----AGACTCTGGCAAAAACAAAAAAAA
>CG13252 20677500 20678370|21656 chr3L 20677653 20678038 scaffold_0 5954349 5954727 + 1845|0 416
CACTCTAAATTAATCAGTTTAACCGCATAGATAGGAATACCAAATACCCAAGCCTTTCTAATGCCTTTGCCTTTATTTG-TTTGGTATT-----GATCTCATTTAAACTTTTCACTCTTCACTTGCA---------------ACGAAAACAAAAATTAATCGAATGAAAACTACACGAAAATATAAGCAACGAACTTAAGCAGCAACTAAATCAAAGTATTCTTATGAAATTACGCAAAAATATTTAATTACAAACGAAACAAGAGTTACTATTTCTAAACACACGCAAATGATGTATGTACATACTGTATGCCTTCCTCTTTCCATCGGAAGTCGACTTTTTAAAC---TTAAAGTTTGATT-------TAAGAGAAATATAATACCAAATCATACTTAGCAGCGAGTAAGCAAAA
AACTTTAACTTAATTTTTTT-----------------TTATTTTTATTTTATTTTTACTTCTATTTTTTTTTTTTTTTGTTTTGGTATCTAAAAGATCTCATTTTAA--TTTCAC-CTTCACTTCCAAGCAGACATCCGCAGACGCAAAAGTAAAGTATTCTTATG-AAATTACGCGCAAAGAAAAGTTACTA---TAACCAGCAAAAGAAAAAAAAAATGA-AAAGAAACGAAACGAAAAAA--AAAAAACAAAAAATACAAGAATTTTCAAGGAAAAACAAAAGTTCAAGACG-AAGAACATGTTGTATA--TACATCTACGGATGGATAGTA------TTAAGCACACCAATGTTTTATTATTATAATGCACAAACTAAAATGCCAAAACATATTT--CAACAAAAAAACAAAA
>CG4186 20703849 20703921|21707 chr3L 20703439 20703875 scaffold_0 2050471 2050924 - 12745|418 467
TA-----------------------AATGTATCTTCCTATTTAATTATTT
TGTGATATGTAAACAACAAATTATTAAAGTATATTTCTACATAGTTATGT
>Pitslre 20706606 20706801|21711 chr3L 20705440 20706644 scaffold_0 2051967 2053121 - 10585|1244 1290
A----ACTGTGCACCTGCAGTGT---CAATGGCAGA-CGGGACCGAA
AGTGTGCCCAGCAGCTCAAGTGTGTAAAATGGCAAATCGGCAGCGAA
>Pitslre 20706606 20706801|21712 chr3L 20706799 20707034 scaffold_0 2053250 2053461 - 2711|0 2
CTG
CTG
>Pitslre 20710549 20710778|21713 chr3L 20707349 20711998 scaffold_0 2054318 2059012 - 155949|3459 3705
TTCTGTGTGTTTTAGCCCATTACGATTACGATTAATTGTTATGTATAGTTAGCGATGTAAG----------------TGGAAAATTTCGTTTAATTGTATGTGTATAAATATTGTTCCATATATAATTTAAAAAGCCATACAAAGCAATTGGGATGTATAATCATTTTTCACCTCAAGAGCGGCAATGCCATGTGGGTGGGTCAATTCAAGGAATATGAAAGTTGGCTATAAAC-ATATCGAAAATT
TTGTGTGTATACAGATTTGTAGCCAATTTGAATAATTGTTATGTATAGTTTAGCGTGTAAGATGAAAAAAGAGGAAACAAAAAATATCGTTTAA-TGTATGTGTACAAATATTGTTCCAAATATAATTTAAAAAGCCATAC---------------TACAAACACACAACATGCTAAAA-----AATCTCA----------CCATCTAAACCATCATGACGGAAATCTAAAAACGACGTCAGCAG--
>CG4289 20713948 20714224|21715 chr3L 20713473 20714022 scaffold_0 5983660 5984225 + 22981|481 574
TGCAATCAGAATACGAGGCT----------GGCT------ATATAGACGTAGTATATAGTTACGCTGTAAATTGAG---TTTCCCCGTTAAATG
----AAGGCATGACAAGGCTTATATAACTTGGCTTTATATATATATACTTTATATATATATATACTGTATATGAAGAATTTGCTGCTTCAAGTA
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TTTGCGTTTATAGCATTTAAGGTTTCTTTATAGTCAACAGCTAATCCATATCCAAAAGTACATACACACACTCACATATACACACTTATGCGATACGA-----TGTCTATACAATGTAATAATAAAAAGTTTACATAAT---AACAGGTTTGAATTGAAAGAAACTGTTTAATTAAGCG-CAAAAA
TTTGCGTTTA-AGCACTTAGG----TTTAATTGTCAACGGCTTATCCATATCCATAATTGCTACCAAAAGTTAACTCACACATA--TATACAGTACGAATATATATTTAAAAAATATAATAAAAATCGGTTTGAATAATTGAAAGAAACTTTAATT-ATGCAATTTGTTAATCTATGCGACAAGAG
>CG4365 20733832 20733922|21733 chr3L 20733836 20736242 scaffold_0 6010279 6012878 - 6848|0 86
TTTCCTCGAAAGTTTCGAAACTTGTGATTTAATATTGGATTTTAATGGTTAATAAAATTAACGATGTGTGTGAAGTGCGGACAATGG
TCAGCTCGTACATTTCACGA--TCCAATTTGGTAGCGGGTTTAAGTAGATACGACACAGAAAAATGTGCTTG--GCGGTAGCGATG-
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GACCGCAACAACGACAACAACCAC-TACAGCAGATAAACA---------ACAAAGAGCAGCAGCAGCAAAGAAAGCAACTACAACCGACAAAACA-----------AACAGAAACAACAACGCAGCGAACGTGA-------------------GAAACCAACAGGAAGACGATGGGAACTAGTTGGA----TAGATATATAGATAAGAAAAACAAACGCTCAG--------CAGCATAAACATGAAGTCGTAACTTATATAAGTGTGTAAAATTAATTG-TCACAGCCATTTGATTCTCGATTCT-----GTCGGAGATTCAGATTCAGATTCAGAGAGCACGCGGGCTGAGG----GCTAAACAA----ATATTAATTAT-----CCGATTCTGTATGTTGTGCTGAAGT-----TATATAATTGTGT-ATGTGTGTGTC--TCTGTGCAAAGGTTGCGTCGGCATGTTCC
GACAGCAGCAACAACAGCAACAACAAACAGCACACACACACACACACACACACACCACATCAACAACAAGAAGAAGAAGAACAA-CAACAACGCAGCTCGCATGCCAACAACAACAACCACAAAGCAAACTAAACTTAAAACTAAAACAAAACAAATTCAAAAGGAAAAGGAAAAAAGAAAAGCCAAAACTTAAATGTAGAAAAGCAAAAAACCTATGTAAAGCCCCAATTCAAAAAAAACA-AAAAACAAAAATCTTGCAAGAATCCAGATTGAGTTGAGCTCAGCTGTGTGGCGCTTGCAAATGGGGCGTTGGGTGGGCGGGCTTGTGGAAAGTGGGCAAACGAGGGGGGGAGGCGCAAAATACCAATATGTTAATTACGTATATGAATTCTGTATGTTGTGCTGAAAGTTACATATGTATTTGCGTAATGTGTGTGTTAATTTGTGTAAAAGTTG---CGGCATGTTCC
>Pka-R1 20767928 20769906|21756 chr3L 20768387 20768904 scaffold_9 1791987 1792533 - -634|0 610
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CTTTTCAACTTTTGAGAACTTGTCAAAAAAA---------------------------------------AAAAA---------AAATAAACAAAAGGAA----AATGGAAAAAAGAAAACAAACAAAGAAAACAAA-AGATATATAGAAACGCATTTCATATAACACTTTTTCTACGAGTACTGGTTGATATATACACATACACACACACACACACATCTTTATATATATATATATATAAATATCTACACAGAATTTCTTTATAAAGGAACATGCTGCCAGCGAAA-------ACCAAAATAAGAAACATTTCATTTAAATATTCATTGGAGATCTGAATGTTTTTTACAGCAAAAACAAAAATAAAATATAAACAA-AACATAAACATATTATATATAAACTTAAGATACCATACACACACACACACACACGCATGCTGAGTTAAAAAAAAAAAATATCAACAAATAGTCTAAACTATAATTTGTTTGTGTTGAACG--AAAGCGAGCGGGCAACAGATAATTGTTTAA-ATATATTTAGTTAATTATTGTTTCAAAAATCGCATTGAAGTCAAATCGAAAAAGAAACACAACATTTTTAATTGATTAA
>Pka-R1 20767928 20769906|21757 chr3L 20768956 20769148 scaffold_4 3916115 3916298 + 982|0 192
TTCCGTTCTTCAAAAATGTACATATGTCAAGTTTAGAAAGTTGTTTTATTTTCTTATATTGTAAGACTGTAATTTTGGAGTTTTGGGCTTTAAAAAAAAGCCATACAATACTTTTTAATCACGTTATGATAGTTGAAAATTTAAAATTAAAATTGATTGATTATACACATTTCTTGGAATACCTCTAAAGTTT
TTACGTTTCTGGGAAAGGTAGCTTGGTTAGTTT---ATAGTTGATT-ATTATTTTCAATAGT----TTTTATTATCTTTGTCTTAACATTGTGTAAAAGTACATGTTA-AATTTACAATGAAGCTATTTCGATTCAAAATTTACAATGAAGATAAACTGTGTATATCACACGCTTAAAAAATTTTCGAATTCT
>Pka-R1 20767928 20769906|21758 chr3L 20769228 20769461 scaffold_4 3919243 3919475 + 2892|0 239
GGTTTGCCTGTGTGTTGGGTGAGTGTGCGTGTGTATCTGTGTGAACTAATGAATATTGCCCAAACGAGAAGTTG----CATTTACAACACTCAGAAAAAAACGCAGCCAACAAGAACATTTGTGTGTATATATTTATAAAGCTTATATCTGCTCGATAG--ATCATGAAACATTATCTACAGCTGTTGCTACATCACACGCGCACACACTCATCCACCTCCTCTCAAACATGAAGTCATA
GGCGTGCATGTGTGT---GTGTGTGTGTGTGTGTGTTTATGCATGTTAATTAA-ATTACCGTTATGTGTGCTTAACAACAATCCCAAAACCCACAACAACA---AATCGACCCACACACACACACACGCCCGCTTACACGGCGTAACCTCCATTGAGAGTAATTATAAAAAAACATCAACAACTATAAAAACACTACACGCACACACTCTCTCTCTCTCTCACACACACACACACACATA
>Pka-R1 20767928 20769906|21759 chr3L 20769633 20769964 scaffold_9 1792924 1793254 - 8214|0 291
TTTGTAAGGGGTCTGCGCCGTGTGCAGGCCACGCCCATTT--------GGGCGTA-GATGGAACCCGCCGGCGGGTCAGA--AACGAAAATAA---AAGGCAAAATCGTTTTGAGGTCACGGAAAAATCAACTTTAAGCCGACGTGCAGGCAGTGGAGGCAAGGAGATCGAGTG---GAATACAA-TTAAATTACAAGCATAATATTATCAATGTAAAATCGTATGTAAAAAACAAGGCAGAAATCCATAAAAAAATTGACAACAAACAAACAACAAAAAATAAACAATAAA
TTTTTAGGCGGTTTGCGCAGTGTGCAAGCCACGCCCCCGCGCCAGAGAGCGCGTGCGAGTGTACCCGCCGGCGGGTTAGACTAAAGAGAGCGAAGCAAGCTAACAAAAGCTAAATGCTATGAAATTGCAAAATGAGAGCC------------------GTAACGAGAGCGAGAGAGCGCATACAATTTAAAATAAAA----AATATTATCAATGTAAAATCGTATGTACTATAAAGAGAAAAAACAAACAAAAACAAGAAAACAATACAAAAAAAAAAAAGCTAACAACAAA
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TGTTGATATGTTAAGCTATGCAACTAGACTAGACGTAAATAAATACACGAAACTAGGCTTACGAGTAGAAATTAACTACATTAAACGCG
TGCTTATGTGCTAAGTTATGTTAA-AGGGTGGGTGCGACTATGGATATGTCACTATATATAT-ATTCCATATATATTCCAGATGACGGG
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CGATAA---TCATCCGG-----------------------------TTTCAGTTCGGTTTCA--AGATCAGCGCCGTTAAATCTAGTTTACGACAGAAATGTTTTCATTTGGGCAGTTCACTAATAACTTGT
TGTTGACGCTCTTCCGGGCCTCTGGCTTTTCGCCAGCACATCTTTGCCTCAGTCCATTTAAATGAGATCGGCGCACATATATATATATATATATATATACATATATATGTGTGTGTCTA----------TAT
>CG11456 20777959 20778181|21767 chr3L 20777572 20778799 scaffold_9 1805607 1807087 - 10660|490 782
CTACAGGACTTCGCAGACCAAGT-GATCTG-GAGAATCCAAAAGTTATGCAACTCCTGTCCACTTGTTTGCTATAGTAATGAAAATAAGTTACTACCGAGTTACAAAATAGATTTAAACG------------------------------------TTTATTGTCTGAGTTTGAATCGAATATCAAAACATATT-CACTATTTGAGAGTG-------------CAACTGAGTAG--TACAGCAAAATG--------------GAAAATAAAACAC--TCAATATAAAATTGTT
TTTTGGGCATATGCCGACGATTCCGATCTCCAAGAATCGCAGATATATATA-----TATATATATATTTA-TATATATATGTGTATTCTCTACTAGTAGCT--CAAAATCGTTTCAAATGAAATATGTTTTTGTGATTTGTTGTGTTTTTGTTTTTTTTATTGTCTGCGTTTGATTTGAACATCAAAACTTGTTTCACTATTTTCGAGCGTATGTAACATAGGCATCTGTTTCGGTTATAGATAAATGTTGATATATTCGAGATAAATAAAACGCGATGTGTGTAAAATTGTT
>CG11458 20839983 20840188|21851 chr3L 20839631 20840043 scaffold_28 1905234 1905747 + 12987|473 533
ACACCAAAGATCCCCAAGCGAATCACAGAAAACACTCCAGCAACCACCCGATACAAAATGA
AAAC----AACCAACCAACCAACCAAACCAAACGCT-CAACTCCCGAACCACACACAACGA
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CTTACAGCTAGTCGCC---------------------ATCCAAATCGATTAGTTTCCGCAATAAAGAATACAACTC------------AAGGCTGTGTCCGTTA-AGCCGCATATAAAAAGTGCACTAATTTAGATTGCAATTACCCGGGTTGAAGG-----TAAGAGCTATGTCTG--CAAAGCCCAGAGTGCAGCTGCAGTTT--TTATAGTGACAAACGATCAGCCATATCCGGTAGCCCACG---GTGGACTAATGATGGCATTAAGCGGCAGCT
CTTCCCATTCCTCCCCCCCTTACACTATTTACGTTCACTCAAAATCGTTACGTTT----AATAAA-AGTGCAACTCTTGCGACGACCTGGGACTGTTTTCTCTGTAGGCATA-AAAAAAAGCGCACTAATTTAAATTGTAATTACC--GGTAGTCGGTTCTTTATCCCCTTCGGCTGTCCACAAACACTGCTGCAGCTGGGGATTAGCCGCGGTGACAAACGATCAACCATATCCGGTAGCCGGCGCGTTCGGCCTAATGATGCCATTAAAATGCAGCC
>CG10585 20963733 20963988|22003 chr3L 20962505 20963787 scaffold_9 4410195 4411375 + 58713|1232 1290
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CGCATAGCGCAAAAAATGACAGCACACGAACGGGTTCAGGGTTATAGCATAATGACATT
>Sin 20967314 20967394|22005 chr3L 20965659 20967318 scaffold_8 1182395 1183995 - 70039|1701 1705
CATCG
CAGCG
>Sin 20967314 20967394|22006 chr3L 20967378 20968170 scaffold_8 240474 241226 - 12224|0 16
AAAAGACCAACAATTTT
AAGCAATTAACTATTTG
>siz 21008518 21009283|22057 chr3L 21005638 21009303 scaffold_8 1218405 1221964 - 186175|2917 3781
GT------CATCTATTGTACATTTTAGTTATTGAGCAAAGCGATAATTATA-----------------ATATCTATATAGCATATTGAATGA---AATATCTGTATAATCCGAATCGAAACGACCCGAAC-----GCCATTTTCT-----------TCAACACCTAACCCACACACAGCGTACGAGTATATAGTGAATTCTT-AATGTTCCTTCGTTCTCTGCTAATATTAATGTAAATAAATTAAACATTTGTCTGTTTTACACTATCTACACAC---TAAAATAAGTTTCT--AAAACTATTTGTATATACATCAGCATACTATAATA--CACCCACAATCTATGAAAATTATTCTCTAAATATGCATATGTATTATTGTATAACTCTAATCCTCTCCAGACACTTG---------------------AAACACCAATTTACCCCTGGGCAACCTTCTATGCCCATACCCGTTTTGATCTACCCCT----CCCCTTACGAATTACAAAAGCGATTGGCGAAAGTAGTTTCATTAGCATATACTAAAAACTA--TATCCCGATAAGTGCGCGCTATGTATATTATATATTTTGTTTACCCTAC-ATTTTCTCTGTGTAACTAAAAAGTGAAGTTCGTGTATACCGC--GTGTGTGTGTATATACCCTGAATATTAATTTAAAAGCATTTAGCTATAATTATTCATATTTATAGAGCCAAAACTACCCAAAACCTAAAATATTAAATACGAGT-ATAAC-AAACACGAAGTATATGAAAACAAAACA----------------ATATGTATATGAAAAAGCAAAAGACTTAAAAATTTCAATAAATGAAAAGAAATAATACC-AA
ATATGGCGCAATTTATGTACA-TTCAGTTCTTCA-CCAAGCGATAAATATATAATACGCATCCTACACACATCTATATAGCATA-CGAGTAGCTTGATCTTTGTATGATCCGAATCGAAACGAACCGAACCGAAAGCCATTTTTTTTTTGTTTAAATCAACACCTAACACACTCAGCAGCTACAATT------TGAATTCTTAAATGTTCCTTCGTTCTCTGCTAATATTAATGTACATAAATTACATTTTTGTCTA-TTTACGCGATTGAAATACGGTTTAAGTAAGTTTTCAAAAAACTAATTGTACAT--------ATACTACAACATTTATCAACAATTTAT----ATTTATCTATAACTAATTATCTAT----TCAAATACCCTCTATGATCGCCGTATACTCGTATACTCGAACAGCGGCCAGTTAGCATAAACCAACTTTTGAAATACCCTTTCAGCAGCTAGTTGCTTTCTTTTGTATCTAATCCCTTCTATCAATTACATA---------TAAATGTAGTTCTATTA--------CAAAAACCAATCAAACCAATAAGTGCGCGCTTTGTATATTACG---TTTTCTTATCCCACAATTGTGTTTGTGTAACTAAAA----ACGATCGTATATACCGCGTGTGTGTGTGTATATACCATGAATATTAACTTAAAAGCAATTAGCTATAATTATTCATATTTATAGAACCAAAACTACCCAAAACCTAAAATATTAAATAATAATAATAACAAAACGCAAAGTGTACGGAAAACAAACACCCGATATATATACTTATATATATAT---AAAGCAAAAGACTTAAAAA-TTAAATAAATGAAAAGATATAATACCAAA
>CG10566 21067004 21067153|22132 chr3L 21066998 21069997 scaffold_8 1282417 1285506 - 104048|6 169
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GCAGAAAATATCGAATAGTCGCCCATATCGATTAGTTTTGCCGGTTT-------------------------TGAAAATGCAAAAGCGGTTGAATTGTAACTTTTCGCTAAACGTTTCAAACTTTTTAAGGTTTATTTATTTAAATAAAATGTATATTGGACAC
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TAAGAGGACCTTAAGTAAATTG-GCAAGTCTGAGGAATTCCA---ACAATTATTTGCTGAGACATGCACAATAAATTTCTTTAATTGGTAGTCAATTCACT
TTAG-----CTTAGG---ATTGCGTCATTGTATTCGATTCCAGGTAAATTCACTTGAGTACAAAGGCAAAATGAAACGTTTT--------GTGAATTCAAC
>chb 21116450 21117119|22180 chr3L 21113903 21118862 scaffold_0 3933633 3938643 - 144542|2613 3494
TTGCGGGAGCCCTTAATA-GGATTCCTGCATCAGCACCACCACAAAC-------AAGACACAGACGCGGTTGCTTCCCTCGGCCTGAGAAGGAAGTGAGGAG-----------------------------CGGCGGACATTAAATA---------------ATATATTATTACATTA-----ACTAATTATTTAT----------------------------------------------AACTAATTATTACCGATCAT--------------------------------CCGTTACTTGTGTAACTGCTCG--ATGCATATATTCAGCAGATGCAAATGCGGCCCGAAAGAAAGTCAAGGGCCATCGCCCATCTAATGTGAGCAGAA-AAACTATTTATACAT-----------AAACGGGAACTAAAGCGAGTAAATCCGCAAAGTGTACTAAAA---------TTGTAGCCAAC-TCCGCAATCCTCACTTCTCACAT---CAGTTGTACGTCTTTTTACCAGCTCCTAACTATTAACGCTGATTCTGTTTAAT------TTGTAAGCCTATA--TACCGCTCTTTATGGAAACT----------CAGACG-TGTGCTTTTCTACCT----TTGTTTCAGGCGACTTTGTATCCTTATTTCGTTTCCGCTCAACTAAATTCTAATTACTATTATTAATACGATTCTGCTCTT------ACAACTGAACTATTTTTGTAATTAATTTAAATACACAAGCCCACACAAAGGATTAAAATCAATAAAAAACACTTATAGGTTATGTAATAATATTTATAAATTAATTAAA---------------------CGAATAAAACAGTTAAACAAAAGTCCC
TTGC--GAGCCGGCGGCACACACACACACAGGGACACGCCCACACACAAACACAAAGACACCAGCGCGGCTTTGTCTCTTAGCTTATGCAAAAAGTGAAAAGTTAATTAAAACAACAGCAAAAAACTGCAACAACAAACAACAAATACACACACGATTGATGATATATAACAATATAGAAAACACTAATTATTTATATATATATAAAAAAAAAAAAAAACAGAAAATGAAAGAAAGAAAGAAAACTAATTATTACTGATAATAAGCATTAAGCAATGCGACGATGCTGACAAAATCAATAATTGTGTAATTGTTTATTATTAAAACACGCAGAGAAAGTAAA-----CCACAACAAAAAACAATTGTA---------CCGACAGGCACAGAACAAACTATTTATACACGTCATTAACAAAAAAAAAAACAAAACAAAAACAGGAAACAAATTTAAATAAAAATTCAAATCTTGTAGCCAACAGCTGACAGTCTCTCTCCCAACACACACACACTGAAGTCT---------CTGCCCAGTTTTTATGCTTTCTATAATTAATATAGTCTTCTATCCGTATAATTTCCTTTAGTTATATAAGTCGTAAAAGGAACAGTTGTTTTGTTTATGTACGCTAAATTATTTTTAACGTCGTCCTGCCGTCATTCTGTTTAATTTCCGCTCAATTCTAAACAC--------ACGCGATTTCATCTTTTTTTTAACAACAAAACTATTTTTGTAATTAACTTAAA-----------ACACAAAAAA--------AAAAACAAACAATTTTAGGTTATGTAATAATATTTATAAATTAATAAAAACAGTTCAACTAAAGAAAAATATAACGAAAAAAAAAAAAAAAACGCTC
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--TCAAGTGAGGCGGATCAATCATATCTGG-----AAACACACACATATGCCATAAATTAAAGCTGCTTTTGCATTTTTCTTGACCAAAGGATTTGACTAGTGCCTAAGTTGAGAACAGTTAACTTTTACTCCCTAGACTCTTTGATATATATATATATATAAATTTTATA-TATGTTATGATATTGTTTTGC-AAAGCTAATAAAA----------CTAGACTTGAATTATATTTGTAATTT
>CG10512 21141436 21141935|22204 chr3L 21141708 21145214 scaffold_0 3963090 3966450 - 63112|0 228
AACTAAAAACATGAGCTTCGGCATTCTTTTAGGGAATTAGCAATATTTAGTAGAGTAAAGACTTGCAGTTTGCAAAATAATATACATAAGTAGAAGTACAGCTAAATTTCTGTTTAAAACAAAAACTATCTGTTTTAAAATATATTGATTTTGGCACTTTGAGATACCCATGCTGTGTTCAGCAATTTCAAAACTATTAAAATAAACAATATACTCTTC-GATAATCAA
AGTTAATAATATATACTCCAG-ACTCTTCGA---------TAATATTTACTA---TGAAGGCTAGCATGTAGCCCTTTACTAGGCAT--------------TTCCACTCTTGTTTCACGCGACAAATATTCGCTC-----------GTTTTAGTTGCTTTCGTATTTCT---CTAGATTCA---ATTTGAGAACAGTTAA------CGATTTACACTCCAGATTCTTTG
>CG10508 21149625 21149895|22207 chr3L 21147479 21150997 scaffold_0 3968548 3971804 - 67233|2255 2525
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AGGAGAGGGGCAAATT----CAATAAA----TGCCAAGCCAAAATGTGCCT----------------------------------------TGAGAAACCTTAGA--------TTTGCCAACTAATTGTAATTACTACTTTGTGTTACCTTTGT-----CTAACTGAGCCTAACCGA--------------------------------AAACCGTACCGAAATGGCAAAGCAAGTGCAACT---------------------------------------GCTCTGTCTAGAGTTTATGTTTCTGTGTCTCAC---TGTTCTCTACTTATGATTTTCCGTCGATGTTTAGTGCGGGTGCTCGATTTTTTACTT-TTTAAGTT----------------CAATAACCATTATGAT---------CGTATTTATACAGAA-ATATATTTGTTACTAATTAATCAAA
AAAATTAGTGGAAATCGTTGCAACGAAATTTTACAAAGCCAACATGTGCCTGTTTACAAAAAGTGTGTAGCTAAAAAGTGGAGCGAAAGGACGAAAGCTCGTAGGATTTGTGTTTTGCCAACTAATTTTAATAACTACTTTGTGTTTATTTACTGAGACTTAACCGAATCTAACCGACACCGCAAGTGCCTAAAATCTGCAGTATATTTACGCCATTTCGAAAATTTTCTACAGGTAAAACTTTTAAGTTTTCATTTTTTACTCTCTCCCTTTCCTCTTTCTCTCTGTGTAGTCTTTATGTTT-TGTGTCCTGTTCATGTTTCGTTCTTATGAATTT-TGATAATGTTTA--GACGGTGCTCGATTTTGTATTTGTTTAGGTTGAAATATTACATATTACATTAACAGTTAAGCTTTTAAAGTACGTATTTATACAACATATATATTTGTTACTAATGATTAAAC
>Eip78C 21198265 21198462|22259 chr3L 21197871 21198460 scaffold_0 4019725 4020263 - 25256|398 598
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------------ATCCCAC--------------------------------------AAATGTTCTACAATCTGTATGTTTAAGTAAT-TAGCGTTTAACTAA---GAGTTGGCAGC--ATTAGATACAA--CTATCCGACATTAAAGCAAAAGGCAACCAATTTATC--AGATACAAGATACAAGATACAGATACATAGT
>Eip78C 21198265 21198462|22260 chr3L 21198461 21200055 scaffold_0 4020472 4021991 - 25841|0 1
TA
TA
>Z4 21223329 21223387|22280 chr3L 21220219 21224237 scaffold_0 4051558 4055551 - 142943|3238 3296
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GACTGGCCCTAGGAGCGGGGCCGCGAACACTACACAATTCTGGCAATCGATGAGGACTG
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GTTTTAGC-----TGTGGGCACGCTCAAGATCTCTGGAGGACTTTTG-CACACCCCAATTTGAAACCCACTCCCTGACACCCACAACCGAACCAACTTTACAGACAACTGAACACGAAGACAGAAAAATACACACACGAACCTTTTCAATATATATTTACATTTAGTATATGTATTAAACACTCCAGTAAACTAAAAGAA-AGATTTCTTA---TTACCCAAGCAAAGGAAAAAAACTAATTCAATAAATCAAATTGTTCATTCGGTCCGTTTCGCACTAGGCTGCCAGGGATCTCAAGCCAGATCTCTTTGGTTGCCTCTTAAATATCGTATCTAGGTTTAGTAATAGTATAGACAAAACTGCAAGATGAAAGCGACAAAAAATGTATAAA------------------------------------CATAGA-GTTTATGTGAGAAACTTGGAATATAATAAATGTATGTATTTACAAGATAACTCAACAATTACACTAAATAAATCGATT-TAAACACAAACATTTGATGAAAATTAAGTTCCGAAATCGGCAC---AAATCAATTCAGAAATAGTGATGCTTCCTAACACCTAGTGATCC--CCGTAAAATGTAAG--------GATAGGTGAAC--AATCCCGCTTTCCACTTCCATAAACTCCAGATTCACACCCAA-AACAAACAAACACAGGCCGCAAACACGCC-------------CAAATATATGCATGCACGTATATATGTCAAGCAACTTGAAATATATAATTGTAAAG
GTTTTAACAGATTTATAGAC-CAAACAGTAGCTACACTGGGCTCTGGACAAACTCTCATCCGAAATAC--------ACAAGCACATCCG----CATTTTATACACA----CACAAAAGTACACACTCACACACACATGCAAC----AAACACACACACATACTTAGCTTATGTATT-AACACTCCAGTTGACAACAACAACAGATTTGCAAACGTGATCGAAGCACTTCACAATTGCTGG--CAAT-GATCA-------CATTTGGGCCCTGGCAT-CTGGATTGGCAATTGTTCTGGAC---------TTGGCGG----------AACGTGT-TAGGCTTAGTTTTAGCATAGAC-AAACCACAAAAAGAATAAACTAAACAATGTAAAAAACAAAACAAAAACAAAAGTAAAAAAAAAAAACAGTTCATAGATGATTACAAGAGATGCTTGAATTATAATTAA-AAATATATATAAAAAAAAA---------------AAAAAAAACAATTATAAACGTAAACACTAAATAAAAACGAAG-AAAAAAAACAACACGCAAAATTGACTTTAGATTCGACTAGCTTCCCAAC-----GTAGTCCAACTCAAAGACGTAAGCCGATCCCGACATCTGAGCTGAGCTCGATGTTGCAGCAGCTTATGAAGCGGAGGCACACCCACTCACACACACACACA---CACACATACGACTTATATTGTACGGCAAATGTAAAGATACGCGATTGTGTG---AAAAATTAGAACCACAAAAGATGAAAG
>CG7663 21229913 21230543|22286 chr3L 21228903 21230415 scaffold_0 4061415 4062888 - 23833|1075 1647
AGTTCCTGACTGGATCCTATCCATTATACACATCGACTTGGATGCAAGTGTCCGTGAAGAAGGCTGACAATAC--TATAGCATGTACTAATCACCAACTAACTTTAGTAGCTTAAAACTTAAGACCTAGACTAAGTTGTTGCTAGA-----TGTTCTAAGA--TCTTTGAAATGCCCAAATGTTTCTTGCCCTCGGTC--TGTTCTGCTTGGGTTATAAATCAATCCGTCCATGCATCCATCGATT--CTTTCACGCCGGA--------ATTTATGGT----------------CTTCGCGCCCATAAAGAGCAAACAATGGGGCTCGCCCAAACACAAAACACACAGTATC--------------TCGGGCGACCCCAACGAATTCTATCTTGTTATCCCATTAACTGCGAA----------CAGAT---------TTATTTGTCTGCGTGTCTGATTAATATTTACGTCTATTCTCAGATATGGAAATTTGAAAACTGGATGGAAAAGAGTCGTGGCTCTGTTTGGGCGACCTTTCGATGGCTTAATAATAAACGGAAATTTTTTCCGGGT
A---------------CTCGCGCTCACACTCATCCA-------------------GAAGAAGGCTGATATTACCATATAGCATATACGTATCTTTAGCATATAGTAGAACCCCACTAATAACGAGCTATTGTTAGTTTCTGTTAGCCGAATTGCTCTTGGCATTCGTGTACATAAGTATATAACTCATGTCATCTAACATATTCCTGCTTAACTT---GATTGTGCCGCGCAAGCTGTCATATATCTACATTGACAGCACATGAATATTATTTATATTAACAACAGCAACTGCCAGTTACATCCAAATATAGCTAAAAACAATAATTATTAATATACAATA-ATGTGGTATTTGTTTAAATTTTGGTCTGATGACCCCAACAAATCAACTCTTGGTTATAGATTAACCATAAAAGTTGATAATCATATGACGTTTTCTCGCTTGACTAGACAACTCATTAATATTT----------------------ATTAGTCAGCTGAATCGAA-----TCGTGATTCTATTTGGAGTGCTCTT--------------------GTAGTTCTTTCCGGGT
>CG7658 21234892 21235014|22292 chr3L 21233882 21234892 scaffold_12 1823198 1824263 - 10502|1122 1122
A
A
>CG7658 21234892 21235014|22293 chr3L 21234893 21235049 scaffold_0 4065278 4065410 - 780|0 121
TCCCCGATTGGATACCCCATTCAAAGCCTAGTCAGTGCTTTTGCTAAACATGAGTTATATCTAGTTCTAGAAAGTCTGTACATAAATCCCCCAAAAAATAAAAACATAAATAGTTACATCAA
ACCCTGCAAGGAG--TCCACTTAATTGCCGGCCAGAACT-------AACAAACTATAAACATAGATAT--------TGCTCGTAAATTTCCGGCAAGATAAAAATAAACATCATGACAATAA
>CG7632 21239814 21240039|22298 chr3L 21238678 21240111 scaffold_12 1827623 1829080 - 45553|1176 1407
GACCGCCTTAACATAGACCTCGACATATAGACC---CGTGTACAAACTAGCGGATTCGTGTACCTTACTCCTAATGTTTAATTTAACCCAACGCAGATTGATGATATTTACTGGATATTATATGAAAATTAATCTCAGTTGTAGACAATACCTAAACATTGGAA---AATTGGTTGCTTCTATTTAATTTATTATGTACAATCAATACCGGCAATAACATTAATGTTAAACA
G--------AATATATAGAACGGCATGAACCCCTTACATGTACAAAGTAGCTAGTTATTATCTATTGGCCGATATAGATATTATAACAGAAATTATACTGCTTGAAT---CTAGATATTAGGTGACGATAATGTT------TAACCCACGCTTGATAATAAAAATACAATATGTTGCTTCTATTTAATTTAAT---TACCGTCAATACTGGTAATAACATTACAGTTAGAGT
>Rab26 21267852 21268049|22323 chr3L 21266992 21268649 scaffold_12 1845406 1847194 - 28747|1017 1218
TTGAAATTGGCCA-ACTTGCGGATGACAGAAGAGCCATATCCTCCCGATCCCGCGCACAAAGACAACAATA--AGCCCGCAGCCAGTTGAGATGGGAAGTGGGGCACTCGAAAGGAAGCAGAAGGACACGTTCGATGGCGCAGAGTCGAAATTCTGCATTTATTGAAACAAACCCAAAAC-GACAAAAAAGAAAATCACACA
TT-----TGTTCATGCCTCCGCACAATGAAAA-------------------CGCGCACAAAACCAACACGAGTAGCTCACA---AAACAAAGCGCAAATTTGTACGACAAAAAAAAAAAAAAAAAACAAA----------CAAACAAAAAAAATAATAATAATAGAAAAAAATGCAAAACTGACAAAAAA----------TA
>CG7338 21271783 21272077|22324 chr3L 21268684 21276441 scaffold_12 1847233 1855013 - 328700|3205 3517
AGGTGTGTGCAAATGGATGGATAAATAAGTGATCGATGGACAGTGCGAATAACTTCTGAAATGAGTTTATATTATTGTTGTTACATTTAAACCTCTAAAAGTATGAAACCTACGAAGTGTCCATTCGGGAAATGTCACCCGAAAAGTACATAAAATATGTACACAAAAATCCCGCATCGATAATTTTTTATATGTGACTGCGTTGTATAATAGG---AATAATAGAATTATATTCACAAACAATTGTCTTAACTTAATGGTAGAGGCAATACA------------ATATACATACATATA---ACATGGATA-
TTGAATTTGTAAATATAT------------------------------CTAATTATACATATATTTATATATATCTGTGCATATATTGAAAT------------------------------------AAATTGTCTCACGGACACAACACAAGTTA-----------------CACTTTCACTTTTTT------------TTTGTATAATAGGTATAATAATAGAACTATATTCACAAACAGTTGGCTTAACTAA----TCGGGGTAATATACGAATAACATATATATATATAAATATATATATATAGATAG
>CG32437 21293658 21293708|22339 chr3L 21293391 21294377 scaffold_12 1875142 1876258 - 2673|281 364
ATTGTTCAGTACG------------------TTTGTAACGGAA---------------ATACAACTTACATACATCTTTTTATG
ACGATTCGATATAAATTTTAATCAAGTGAATTTTATAAATAAATTGTGGGAGGGAATCATTTAATTGCTATACTTATTCATTTA
>CG32440 21294881 21295070|22340 chr3L 21294725 21295606 scaffold_12 1876266 1877263 - 2599|156 379
CTGTACTAGAAAGCTAGAAAGCTACTAGAACAACATTCCGTTCT---------GCGCCACTTTAAATCGAATGTCTG--------CCCACTGCCCAC-----GCCTGGCCCAC------------TGATTGACTCCTTCGTCACCACATCCATCCACCACGCCAGTCATCCATCAGATGTCGCGAAATGTTATATACAATTAAAACTCACCCTCGTGCCACTGC
CAG--CTAAACTGTGTGGTGCATTCTAACAAAATGATGTATTTTCGAAACAAAGTGCT-CTCTATATCAGCTATTTAGTTAAGCTACCATCGTCTATGAACAGCCTGGCCAGCCCATAATAATTGTGATCGACT-TTACGCATCCACATC---------TTCCAGTCACCCA----ATGC-------TTTAATATAC-----AAATTCCCACTCGTGCCAGTGC
>CG6014 21357111 21357919|22398 chr3L 21354041 21358288 scaffold_12 1933021 1937478 - 96345|3278 4271
AAGTCCAGGCG---------GCAGTCAAATCGCCACGCACTAACCAATACTAAC-----------CGATACATATCGATCACAATTGGTTCCACATACGCACCGTTGCCCAGTCGATCCCTTTTCGATTGTTTTCTTTGTGCTTTAATTAAAACAAACCACAAGATGAACACGCAAAAGTATTATTTATCAGAAGAG-------AAGGAAGAATGGAG---GAACATCGCTGCGAAGCAGATT--------TTGTCGGTTAATTAATTGCA---TTTCGATCGAGCAGGAAACCC------AATCTCCATGCGC---TTCGCTAGCTATTT-----TAGTACTGTACAGTAAAGATATAC---------TATATATAGGTCTAGGATATGGACACGCCACATACTCACGC-AGCACACAGGACACACCGTAAACACACGGCAACCAGTCACGCA-TGTTTCCTTAATAACCGAACTAGAAGTTAGCAATCAATTTTAGAACCAATAAACCCCACACA-----------------GACGCAAAATCAATTTTTTAA--ACTC-----AAGCACAGAACCA--CGGATATATTTATAGT----GAGTAAAGCG-----TAAGATTGAATGGAAAACTCC----------TTTGGGTCAAAGTCCAGCAGTGTCCAAGTC-------------CCATGCCTCCCCA--CACTGGGTTTGCCTATGGTGTCCTCGAATCGGGCACAGCGAAGCAATAATTTA----CTACTAATAA----------TCTTTTGATAACATCATCGGATGGTCACCGA--------CCATTTCC-----------TAACTTCTAGATTACAA---AACTATATTTTACAAAGA-------TGTATGTAATAACTAAAGTATGTTTAAATGTAAATTTTTATGTATTTTTTAA----TACCTCAAACGCGAAAGGCAAAACAAAAAAAAA------------GAAAAAAA
AATCACACACACACACACACACGCACAGAGAGACGCACATTAACCAATACTAATGCAACGGCAAAGTAAACATATCG------------TCAACAAACTTTTGGGTGTAAACGTGTTTTCTTTCTTTTGTTTCTTATTTTGTTTTATGCGAAA--------------AACACGTAAAAGTATTATTTACAATAAAGGAAAACGCAAGAAAAAGTTGAAATCAAACATTATAAGGTAACAAAACATTTGCAATAGTCGTGCACTTTTTTGAAAATATGCGATTAATGAAATATTTCCACGCAAAAGTTCACGCGCGCACTCAATATCGAGCTCTATATGGTAATGTACAGCCAATATATATACATTTATATATATATAAATATAAATCTATGATATGATATATGATAGAACTAGCAGATA-AACACACT-CAATCACACA-----CACGCACACATTGTTTCCTTAATAACC------AAAATTAGCAAAAGCATTTCAA---AATAAACCAAACAAAAGAAAGAAGAAGCATAGAACACAGCTTTTTTTTTTTAATGACTTATAAAAAGCACAGAACAATGCGTATTTAATTAGAGCAAAAGAATATAATGCTTTTTAAACTTAAGTGGAACGCATCTCTCCTCATTTTTTTGTCAG---CCTGTTGTGTCTACAACCATACTCAGAAGGCCACGCCTCCTCAGCCTCCCCCGCCACCCATGGGTTATTCCGACTGGCCA---GGAAGCAATAATTTATAAGCCAAGCATAACATGAGAAACTTTTTTTCTAACCACAACAAAATCTAAAAGAGATGAAACCCATTGCAAGGGCTAAGCGTAACTATTGTACTAACAACTAACTAGGTTATAAATAAATATATTTTATATTTAATAATTATTGTATGTTTAAATGTAAATTTAT-TGTATTTTTTAATATGTACCTCAAAAGCGAAAGAGAAAAAGAAAAATAACAAAACTAAGATGGAAAAAA
>CG33288 21366711 21366711|22402 chr3L 21363559 21368045 scaffold_12 1944527 1949014 - 100663|3284 3284
A
G
>Aef1 21370051 21371714|22406 chr3L 21369053 21370735 scaffold_12 1950707 1952547 - 72755|1106 1892
CTAGGACGAATGCCGTTGGCGGCGCACCACCAT------------------CAGCAGCAGCAACACCAGCACCAC------------------------CATCAACAGCAGCAGCATCAGCACCACCCGCCGCCTCCGTCCCAGCAGCAGCAGCAG---------CATATCG---ATCAGCGTGGAGTCACCATAACCACGTTGCCCTCCGCCACGACAGTGGCCCAACATCACCAGCAGCATCA---GCACATTCAG---------------GATGGCTCGCCGCACCATCATTTTAATGTGGCCGCTCTAGGGGACTTATCCAGCGCTATGCAATTGGGCGCTGTGACGGCGGACGGGAGCTTTGTGACCATGGGCGGTGTTGTGGTGGGTCGCATCCAGCACACACGA---GAGGAACTGCAGCAGCTTGGAGTGATCAAGGTGGAGTCACCATCGAATGGTGGCACAGCCACGACGTCAGCGACGGCGGAAACGCAACGCGAGGGATGAGTCGATGAGCTGCTCCTCGAGTACATGCTCAAGGAG---------------GAGAATGCGGATGAAGAGGATGAACAGGAGCATGAGTCGGAAGTGGATGCGGATGTAGTGGAAATTCAGGAGCAGAAAGAGGAGCAGCGATCGAGCCAGAAGTGAGCCATGTT--TGGTGTGTACGCTTACGTTGTTGTTAGTTGTTTAATTGTAGCG-AACATTGTTGTTGTTGTTAAGGT-----TTAAATGTGTGACTAAG----AACTTACCAAGATGA
CTAGGACGCATGGCGTTGGCGCAACATCATCATCTCCATCACCAGCAGCAACAGCAGCAGCAACAACAACATCATCAACAGTCGTCAACGCCAACGCAGCAGCAACAACAACAGCAGCAACAACAACAGCAGCAACAACAACAGCAACAGCAGCAACAACAACACCACATCGAACACCAACGTGGAGTTACCATTACGACGCTGCCGTCCACAACGACAGTGGCACAGCATCAACAGCAGCAGCAATCGCATCTACAGCCCTCGCATGGCAATGGCAGCTCGCCGCATCCTCATTTCAATGTAGCCGCCTTGGGTGATTTGTCCAGCGCCATGCAACTGGGCGCCGTGACAGCCGATGGCAACTTTGTGACCATGGGCGGCGTTGTGGTCGGACGCATACAGCATCCGCGAAGCGAGGAGCTGCAGCATCTGGGCGTCATTAAAGTGGAATCGCCAACGAATGGCATTGCCGGC---------TCCACAGCTGCCGCACAACGCGATGGATGAGTCGATAAGCCACTCCGCGAGCCCAGACTTAAGGAGACCGTTGACTCAAATGATATCGCGTATCTGGCGCCAGAGCAGCAGCA-------GCAGCGACTACGGCGGCGGCGCCGATTTAACAAAAGATAGA----CCGTAATCGTTGCCGTTGT------TGTTGCTGCTGCATACGCTTACGTTGTTGTTAGTTGTTTAATTGTAGCGAAACATTGTTGTTGTTCTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTAAGGTCTAGCTTACCAAGCTGA
>Aef1 21370051 21371714|22407 chr3L 21371015 21371199 scaffold_2 921678 921870 - 1224|0 195
TTGCTAATA-GCAAGAGCA--AACTAAACCCAAAAGGCAAAAAGCATTACGTGTACGAAGAA--CTTAATTAAAATATTTCCCAAAGTGCAACCCGTTTCAGAT-----TGTAAATTGTTGAC-CCGACTCACTTTTAAGTTGTTTAATTTAGCATTTAAAGCTTAAGAAAAATTGTTGTACAACTCAAAGTTGGT
TTGGCAATATGCAGCAGCAGCAACTAAATACAA---TTAATATACAATACATACACATATAATTCTAAACTAAAACTACATATAACATATAACTGCAATTATATAATTATGTAACTAATGCGCGCCCATCAATTCATTATATGTTTAAGTGATCATCCAAAATTTAAATCAATTTGATATGCATTTTATATTTGAT
>Aef1 21370051 21371714|22408 chr3L 21371292 21372041 scaffold_12 1953511 1954292 - 10414|0 484
CGTAAACTTGTCAGCAAAACTTAAAAAAATATCCTGAACAGAAAACGGCAAAGAAAAATATTCTAATAGTGTTAAGTGGTCGAAAC------TATCTAATTAGCTCTTAGTCCCTAGAGA-----------------GCCATAGTTTTTAAATCAGCGTTTTGTTAATTTTAA------TTGATTAGTCTTAGTAGTTTTAATTTCAGCA--TTGGCATAATTTGGAAACACAAAAGCTGTCACGCTAGCCTTCGTTTAAATAT-------------------------TAGTTAATGAAGTAA--ACACAAAGTAACGCTAAT--TAATTCATAACTAATTACGATTATGAGATAGTAAAGCAACAAGTTCTGTACAAAGCCCAACTCCAA-TTTGTATGTAT-AAAGCGAAAGCGAAAGAGTTTAACTAAATTGTAAACGAAAACCTTTTTAAAAGAGAAAATAATATTTTCTAAAAATACAA
CACACACATCTAAGCGAAATTTTAATTA----CTTAAGTGGCA---GGCAGAAGCAACTAATTATATAGTCTACAATTATATAAACATACTATAATTAGTTGATCCTTAGTTTGTAATTAATGGCCGCGCGCGCTTTGTTGTGGCCCATGAAAGTGAGTTTTGTTAATTTTAAAATCTAGTTTTTAGTCGTTATAGTTTTATATTTTGCAAATTGGCACAATTTGAAAC----GAAGCAATTACAAAAACAACAACAAAAATACAAAAAAAAAAAAAAACAAAAAACGCTAGTTAATGGAGTAAGCACACAAACTATTACTAATGCTAATAT-TAATCAGATAATATTGTGCGATAG-AAAGCAACAAGTTCTGTACAAAGCCCGACTCCAATTTTGTATGTATAAAAATGACAGCAGGAGA---------------AAACAAG---------AAATACGAAAATACTATTTTCTAAAAATATAA
>Syx7 21381493 21381976|22417 chr3L 21380648 21383113 scaffold_38 250485 253043 + 63573|884 1473
AGCCTTCCGGCATCTCCGAATGATTCAAACCAAACTAGTAAATTG-TTGTGAAAAGACAAGAGTTGCCGCATGCAGGCCCCTAAACCCCGTAATTCCCCACCCAATCCTTTGGACCTTAGGCGAGATTATGGCTTTAATCCT-TAATCCAACTT--------------------CCAATACTGGCTGAAATCG--AAAACT------GCGACTCGTAGACGAAGATATAGTGTTTTGAGGAGTATTCAC--------------CGGCACGTGC--------------ATCTGTTATATTTGCT-------TTAAAAACAATTTTATATTTTATGTGTAC---TACTTTTATTATTACGCACCCTGTATATTG-ATTAT-TAGTATTGATTA----------------ACAACTGTTGGCTTCAAATTCTAATTATGTTCCGAAACTCATTCGCCAGCGCTTTGTATTGTATTGTATTGTATTTAGAGTTAAGAGGCAG-------AGGAAGCCATATATGCGATGGCAT------ACACACATGTACGA-AAAATGAAATAATAAACATG-AAAATCGAT-----CCTGC
AACTAGAAAGCATCTACACAT--TTAAATAAGAACTAGTAAATTGTTTGTGAAAAGACAAGTGTTGCCCCATGCAGG----------------TTCCCTATC--------GGCACTTTAGACGCATTTGTGGCTTTAATACTACAATTTAAATTAAAAAAAAAAAAAATAAAAAAAAAAATTGGCTAAACACGGAAAAACTTATGGCGAAATTGGCCAACTCAGTTGCA-TGTATCGAAAAGTATTTAACACACACAGTTAAGCGGCGCTTACACATACAAGCATCAATATGTTATATATACTTATTCTCTAACAAGTTATATTATATTTTCTATATATATGTATAATTATTATTATAAATAATGCACATTGTATTGTATTATATTGATTGAGTGTGGCGCATTCTCAAATTTGTTAGCAGCATGTTCTAA-AACGATTCCAAACTCATTTGCAAGCGCT----------TTGTAATGTATTTAAGTTTAAGAGGAAGGCATACAAAATATATAAATATACGATGGTACATGATAATACACATGAAATATAAAATTAACGAAAAAATATGTAAGATCAATGCAGGCCAAA
>CG7519 21427624 21427751|22466 chr3L 21427003 21430031 scaffold_0 5631298 5634228 + 76318|633 763
TCCCTCGCTCTAGCTTAGATTAAGTTGTAAAGACTGGATGCATATTTAGCTGCAGTTCGTCTATCTACTTTAGTAAACAATCAAATTATTTTTATACAAAAAATAAAAATATAACGACCGC---CTTTAAA
-------------CTCAGATCAACTCGGAGA---CGGCTCAATGATGCGATCCAGT--AGCTGTTCAACTTGTCCGTCAGTTAGTTTAGGTTTA--AAGTAAATAAATTTACAGCATTTGTTAGCTGTAAG
>CG7529 21437698 21437809|22477 chr3L 21437698 21440282 scaffold_0 5639667 5642148 + 98321|0 139
TAGCCACCATTCGACAT----ACAAT----CAAGGAAGTGTAAATTA--TTGTTT-CAATAACAAATTAATGTTACATTTTAAATTAAA-----------------GCAAACGTTTTTTAGCTTAGTAAACAAAATAGAA
TAGACAGCCTTTAAGATTTTCACAATTTTCCCAGAATTTACAAATTCACTTGCCTGTGATAACAAACGAATATTGGGATTCCAATTATCTACTCTTTTAACATGTTGTGAACTTGTTTAGCCCAAGTAAA----------
>CG7597 21455623 21456527|22487 chr3L 21454853 21456893 scaffold_8 2846053 2848420 - 40904|786 1959
CATTTGCTGTTTGCTTCGCTACTTAATGTGAAGGAGAGCTACATACAGCGTGAAGGCGAGGAGTGTTCCTGGTGGCACTAGTAACTAGCCGTAACTAGCAATAACGTAACCAATAAGGGATTCTGTTATCCCTGGACAGGGCCAGAATAGGTTGACTTAGACTTGCTCT-----AGCTCTGTCGAGTTAAAGACA--GCTTCAATAAAGT--CTTGGCT------ACATTTATAAAATGCT------TTATATGTTGGGAAAATTGAATCAATCGCTGTATAA--------------------ACGAGATGTTATATATTCGCAAAGATAAATATTTTAAAAATGATTT-TATACATATTTTACTATTCAATTTAATTGCTATTAGTTTTTTTATTTTTGAATAAACTGGCAATCTGAAGACAACGTGCATGATCGAGAATA----AAAACTTCGCGTAACGAAATT-------GTAAACTGTTAACACAGTACG---------TATTCGCAAC----AGCAAAGGCGAT---TTGTAAGTGACCATGTTT------------CAAAGCTACGAAAT--AAGCATATATAACGAGCAGTTAAAGATTAGCATTTTAATTATAAAGAACTTGTTAAATA-----------------------------------ATAATAGAC-------------------------------------------TACAGATAGTGTATTGACTAGTTTAG--------------------------------------TTTATTGTTAAGTATGT---AAGAAAGGTGTAAA-TTATAAATGAATTTATCAAGTAAATATGTACT----ATGTATTTACCCAAGCACAGGCATTTGATAAGTTTATATTTTAATATGATGTTAGAACGCACACAGCATCAGATTTACTTTGCAT----------------------------GATGTGCGTGAGACTGAAATCAATTC-ACTTTAAATTGTGTAAATAGGTTGA--ACATTTCTAACATTACACACGAT-------------CAAACAAAATTA---CAATCTCC--AAATGCAAATCAAATTGACTAAATT--------CATTATTGGTACATAAAATCCTACCCAAATAAAAG-----TTAAACATACGAA
CATTTACTCTATGCTTCATATTTTAATGAAGAGGAAGACTATAAACAGCGAGAAGT---GGAGTGTGCCTGGTGGCAAAGTTAA-------TACCTA--AGTTTTGTAACGAATTATATAAATAGTTGGC---AGGCAGAATCAGTTCGGGTTGACATG---CTGCTCTACCAAAGCACTCTATTCTTTAAGTCATCTCTTAAACAAAATAACTAAACTAAGATAACATTTAAATAGTGATGAATTGCTACAAAATGGGCATTTCGAATTGACCGGTGTATAATATTGTAATATGTATATACTATTTACTGCTATATATTCAAACAAATAACCTATTGGAACATAATTTGTTTATAATTTTTTTTATTC------------TCTAGACTAATAACTTACATACATATTGGCAAT---AAAAAAAAGAGCACGAGAAATAACATAATTAATCAATCCGTATCGAGTTTTGTTCACATCAACTTTTATTTTGTTACAAAAATTGACTATTTAATGCTTTTAGCTATGACGTTAGATTTTAATTTACAACAAATTGGAAAAGAACGCTAAGATTCAAAATAAAAGCGAGGTTTTGAAGCAGTTAAAGGTTAGCATTTTACTATTAAATAAATTGTTATATACAAACACATATATATTTATATATATATGCAAACTGATAATAAACATGCATAGAATATACATACATAACAAAGTTACAAATAAGTTAGTAGTAATAGTATTATTATTAGCTTGGCAACATACTCATGTTGTCCGTAAAAAGCTATAAATGATTATTTTGTTAGGTATATTTAAATAAAATTGTAAAGTTAATGATGAATTTATCAAGTAAATGTGTACTAAAAAAAAAAAAACCCATACAAATAT-TTTAAAAAGCTTATATTTTTTAATA----CATAAATCAAGCCGGATAAGAATAAATGTGTATAAAAATTACTTAATAATAAAAAAAAACAAATCTGTGCGAGACTGAAAATAATTCAACACAAAATTGTGCAATTTGAATAATTAAAGTTGTAAAATCATAAATGATAATGATGAATTTCAAAAGAAAAGCACACCAATCTCCCAAAGCGTAAATCAAATGGATCTATTTGGTTTCCAAATCATATTTAAATAAGAATATATCGAACTGCAAATCCGTTTACACGAAATAA
>CG7611 21461506 21462007|22490 chr3L 21461019 21461513 scaffold_8 2861710 2862204 - 32957|487 494
GGTCCCGA
AACCGCAA
>CG7611 21461506 21462007|22491 chr3L 21461573 21461941 scaffold_8 2862460 2862877 - 3214|0 433
CCTGATTTCGATATAAAGCTTAATGCGTACCGCTCTG------ATGGCGCATCGGGGTCGTCGTTGCTACAA------ACTGCCATTAC----AACAATATGTATGAGCAGCATGACTTACGATTAGCATTAA---TTACTTAAGTACATT----------------------AATACGAAAGGAGAGGCATAACAT-------CATATCTACTATGCTA----TAACAAGAAATCGATTCGTTCTCAGATTTCTTTTTTATATATGTA---TGCATACGGCGATGCGAATTAATATTT-----CCGGCCTA--TATTAGCGACT--CTTCTCGATCTTTTCATTTATTAAAAGTGCGATCGACCTGCTTGGTTTTCAAATTATTAAAGATTGCCATTTGATTTGTTCTATGCAGTTTC-CGACATTTAGTATG
CCCAATGTCGATCTAAA-TGTGGTGCGCATGCCCCTGCAACCAGTTGCAATTTGTTGCCGGGGCGGCGAAAACACAAGACTGCCATTATCCAAAACAATGTGGATGAGCAGCATGACTTACAATTAGCATTAAACTTAAATAAGGTACATTGACATTGTCTCACACATAATCGGACACAATTGCAGACGCACGATGCGCGTATGTATGGATACTGTTCAAAGCTTTTCAAGAAACAATAGTATTTTTGTTTTGTTTTTTTATATTTTAAAACTTCATAC--TCATATGTATGTATATTTATTTACATGCCTATGTATTGTCGATTGGCTTTTAGTTTTTATCAAGT-TTCAAAATGTGGTTAAGC-----ATTTTGCAAAT-------AATTGCCATTTTAACTACTTTGTCTACTCCCTCGATATTTCGAACG
>Pros54 21472306 21472424|22497 chr3L 21470784 21472421 scaffold_8 2833275 2834901 - 69265|1565 1692
AC-CGCATC-------TATGATTATATCTA-ATAAGCTCGTTTAAAGCAT---TTGTATGCCCATTAAAATCATTTGTAGCCGTCTTTCAAATTATGCTTCAAGTGAAAATATATAAACAAATACACA
ACTCCTATCTCCACGTTATAAATATATATATTTAAATTTGCATTAAACAGAAATCATAAGTGAGCTAACATCTCTAATA--CAATGTGCAGATTATGTTCATGCTTCTAATA---AAACAAACATACA
>VhaM9.7-2 21474237 21474545|22499 chr3L 21473677 21474501 scaffold_8 2541527 2542405 + 15325|658 933
TGTCTGTCACCCTAATGT-ATTCGTTTCAATTGTTTTGTTATTGTTTCTTTATCCCGGAT--TTTCCGAC-----ATTCTGTATTATTAATATCCACTTATTGTTCGAAGCATAAAATAAATTGTAACCGCGGTCGCTCTTGGCAAACACGTTGTAGAAAATCATAGATAAACAACATATTTTTATGCTTTGTACGCGCAAAGATGTAAACTTAACGTTGCCTTTTTGGCCAAGCATTCCCAA---TAATCGAGTGTCTTAAAATGAAGATTGAAA
-AAAGGGAAATATAATGTCATTCCTTTTAA---ATTTGTTATTTTTTCTTCCATTAATATTGTTTTCATCGTACAATTATGT-TTATTAATTTCCCTT------------CAAAGAAAAAACTGT--------TTAAGTTTG-------CATTATA-ATATTTACAAATAAATA----ATTTCCATA---TGTATATATGAAGAAACGAAATGAATGTTGTGCTTTT-ATTAATAATTGTCAAAGGCAAGGCAAGGCCTTCAAAAGAAACTTACAA
>CG7634 21501569 21501628|22524 chr3L 21501549 21501753 scaffold_1 3654755 3654950 + 367|20 79
AGCTTTGTATTATTTGTATAACCAAAAATATTGATTAATAAATTCTCAGTGCAATTATAA
CACTTTATCTACTTTATATAATTA-----ACCAATTAATTAAATATTAACGAAACAGTTA
>Smc5 21506200 21506456|22527 chr3L 21505720 21506978 scaffold_0 6652667 6654029 + 21045|525 783
GGAATTTATTTATAGGAATGTTTTGCTTGCAGAGAGACTTCCAACAGTTG-CTGCAGTGCTTAGAAAATCAAA-TTAGCGACGTTAACAAACGAAAGAGCGCTATTCAGGGCCTTTGCCACGGAGAAATTCCAACCAGTAGCAAATTTCCTTTTAAGAAGGAATTTAGGGAGCTGGAAAATATAGATTTGCCCGAACTACGAGAGGCAATACATGACTTTCAGGCACGATTGGAGTGCATGAAAAGTGTAAACTCCGAG
AGAACGCCAGCATAACATATTTACATTTACAGACTATAGTCGACAAGTTATCTGCATCACT--GCAAGTCAAAGTTAAAGATATTGCCTCAAAAAGAGTGGAAGTGCAGCGTCTATGCAATGGTCAACTGCCCAATAGTAACGATTTTCCATTTAAAACAGATTTTGAACAGTTATCAAACCTGAATGTGGAGCAAATTTACGAAGCCATAGTCGAGTTTCAGGCTAGATTAGAGTGCATGAAGAATTTAAATTCTGAG
>Smc5 21506527 21507148|22527 chr3L 21505720 21506978 scaffold_0 6652667 6654029 + 21045|857 1378
GCCATCAGCAGCTATCAAGGACTGCAAAATGAAGTCAAGCAACTGGAGGAAGGAATTCAAGAGTCTGTTAACCAAGCAAAGAGCATCGAGTCTGGCATGTCCAATTTATACGACAAATGGGAGCCCAAACTTAATAGCTTGGTAGAAACAATCAGTACCAAGTTCAGCGAATTTATGGAGTCCATTGAATACGTGGGAGAAGTTGTGTTATCCAAAACCGACAAAGTGAGAACTTAAA-CTGT-------CCTACATAAAAAC-------------------------------------------------------------TTTACTTCAAATGTATTTCACTTTATTAATTCT-AGTATGACTTTGACTCATATGGTATTCAGATAATGGTCCAGTTCAGGAGAGGTCTCCAGCTGCAGCCGCTGGACAAGTTTATTCAATCTGGTGGCGAACGCGCAGTGTCCATCGCCATATACTCATTGTCCTTGCAACATGTCACCCACGTGCCATTCAGGTGA
GCAATTGCGGACTTTCGTCAGCGCCAGAACGAGGTGGAACAATTAAAGAAACTCATCGAAGGCAAATCAAATGAAGAAAAAAATGTAGAAGCTGAAATATCAATCTTATACAATAAGTGGGAACCACAACTTACCGCATTGATTGAAACAATAAACAAAAAGTTCAGCGAATTCATGGACTCAATAGCATATGTTGGAGAAGTTGTTTTGTCGAGAAATGATAAGGTATGAAATTAAACCTGTGCTCATCCGTGCACAATAACACAAGTGTGCATTTTACGATGTATCCGATTGCACAGGCAATTCCTGTACAGTTCCTTATAATCTATATACTATATATTTGTCTATATACTTTTTCAGAACGATTTTGACTCGTATGGCATACAAATTATGGTGCAGTATAGGAAGGATGCAAAGCTACAGACTTTGGATAAATATGTTCAATCCGGTGGAGAACGTGCCGTGGCCATTGCAATCTATTCCTTGTCGTTGCAGCACGTTACACATGTGCCATTCAGGTAA
>Smc5 21506527 21507148|22528 chr3L 21507024 21507984 scaffold_0 6654270 6655222 + 8335|0 124
TTTCTAGGTGTGTCGATGAAATAAATCAAGGCATGGACGCTACAAATGAACGTCACATATTCGACTTGCTCCTCAAAGAAGCCACCAAGCACGGCTCGGCTCAGTATTTATTTGTAACACCTAAG
TTTGCAGATGCGTTGATGAGATTAATCAAGGCATGGACGCTAAAAACGAACGCCATATTTTTAATTTACTTTTAAAAGAGGCCACTAAGGAGGGTTCTGCACAATATCTTTTTGTTACGCCCAAG
>Smc5 21507209 21507365|22528 chr3L 21507024 21507984 scaffold_0 6654270 6655222 + 8335|190 359
TTGCTTCGAGACCTGAACTACAACGAACATCTCTGTGTTTCCATTGTTCACAACTCAAAAACTGTTTGCCATGGCATGCAATTCCCGATGGCTTAGACACTTTGGGTCATCCAGATTTAC-----TATATGTATTTTT-TTATATTAA-------ACACTACAAAACATA
CTGCTTCGTGATTTGAGCTACAACAATCGCTTATGCGTTTCGGTAGTTCACAACTCTGCATCTATCAAACCTGATGTCAAGTTTCCGCTGAACTAGATGTTTCAATTTATATTAAATTATGTCGGTAAAAGTGTTTTCAATGTATAAATCCGTTTTCAGCATAAAATAT-
>AP-2 21546796 21547194|22569 chr3L 21546630 21547253 scaffold_0 6545322 6545910 + 17325|172 600
TAGGCTATGTTGTATATTGCCACAGATTGAAGCAAGCCGTACTTTAAGA--------TTAACTTTCCATACA---CTAGGCACAACATTAA---TAAAAATTATAAAATTCCTGTAAATTAATTTATTTAGTTAAGTGTAAATTATTGGACATTTTGTATATCTATAACTGTAATTTGAATGTACA------------ATATTCAAATATATTAAATACGTATAATTTATTTAACTTAGAAAAATACATCGACATTTT---GTGAAAAG-CACAAAGCTTTTTACAACTAATTCAAACAAAATCTTTACAAATACACTTATTTGTATGTAGAAACGATTGAAATGCTCTCATTTTTAATTTTTTAAGTAACTTACAATTTAAAGATTTTAAAATTATACAAATGAATAAAATGTGTTTTTAAAACTAAA
TAGACTATACTGCA---------ACGCAAGAGCAACTCGTATTTAAAAAAAAAAAAGAAAACTTTTAATACAAATTTAGGTACAATATCTATTCTAATAAGTACTAAATTATTGTA----AATGTATTTAGTTTAGTGTAAATTATTGGAAATTTG-------TAAAACCGTAATTTTAAAGTACATATTAAATGCATATGTACACACTTATTATGTAT-TATGATTTCTTTGAATTAGAAAAGTGAATCAACGTGTTTCCGTCAAAAGTCACCAAGGGTTTTACAAC-ACTTTAAA---------TACAAATATCCGGG---------------------------------TTTTATTTTTTAAGTAATCTACTTTTTAAATATTTTAAAATTATACAAAGAAATAAAATATGTTTTTAAAAC---A
>CG11307 21553349 21553714|22576 chr3L 21553658 21555710 scaffold_0 6590043 6592197 + -6195|0 63
TAAATTTCATCTAAACTGAAACGAAAA----TAAAAATAAATATCAAGCATAT---TATACATT
TAATTCTCGATCACACTGCAAAAAAGACTTGTGCATATTTATTATAAGTATATATCTATACATT
>CG11306 21562116 21562163|22585 chr3L 21562142 21564136 scaffold_0 222991 225016 + 33256|0 21
TAAATATGCAAAGCCCAAAAAT
TAAAAGTTCAATGACGAA----
>CG32445 21574421 21574551|22595 chr3L 21573312 21574513 scaffold_0 238606 239808 + 49606|1113 1211
CAACTTAGTTGATGCTCCCA--AAATTAGGCC----GCTAAAATTCAATTGGCAGTGCAATCAATAGGGTTAGTACTGGCTAAAGTGCATTTATATTAT
CGATTTCCATTTCACTTGCAGTAATTTATAATATTGGCTAAAAATTATTTCATACCAAAATCAGTAGTATCAAT---------AACGCATTTGTTTCAT
>CG32446 21575949 21576440|22599 chr3L 21575799 21576506 scaffold_0 240477 241308 + 13561|150 751
GACGAGTTCCTCAGCAAGTTTCAGAAGTACGGCAGGCTGAAACTTGAGGTATAGGG----------------------TGTGGACCCCAGAGGAT-------TGAAATATCTTCCACGTTGCCGCTCCGAAAGCATTCGATTTGGGTCGC--------TGTTCAGTGA-----------TATTCATGGGATACATACAAATTTTACTCTTAACCAAATCAAATATAGG--AATCATATACAAATTTTACCTTAGTA-TTTGCTCTTGC-CCAAATTGTATGTAGC-----------TCGTAGTTAACCAATTGAGGTGTTATTATATTATGCATTACTTATG------------CTTAGATGAAGAATTT---TAAATTCAAATTTAACTAATCAAATCGTACAGCCAACTTTTTGCCTAAGTATGCAGGTGCCGTATTTAGGGGTA-CTCAAGTAAATCCAACGTAGTT--GCCAATAAATGAT---------ATACGCCAGTTGCCCTCTTATGACTAATCGTA---------------ATATTACAAATTTTACCATTTTA-AATATCAA----ATATATACAAATACATTTTAACCTT
GACGAGTTTCTCAGCAAGTTTCAGAAATACGGCAAACTGAAACTTGAAGTCTAATGAAATGAATTGCCGCATGGATATAGTGATTGCCGTTGGCTTTTGTTGTGAAACATCCACAACG------------AATCATTCGAAACACAGCGTGATGCATACGTTCAATGAGATGGAATATTTAGTCAGAAGAAATGTATACATTTAACTTAT-TCAAAAGTTAATACAAGCAACTTATCTACAAAGTTTGCATATGAATTTTGCTTAAACTCCAAATTTTAAGTAGTGGAACAATAAATTGTAGCAACTCAAGCAGAAAGTATTTATATTCAACAAAAACAAAGAGTTATACGCCCCATAGATGCAGAATTTAAAAAAATTCAATTTATAAAAATTAAGTAGAGAATGCAATTATTGACATATTTGCACTAATCAAATATTTAGAAATATTTTAAATATTTCCAATGTAGTTCAGCTAATCAATAACAACAGACAGATATGCCAATTAACTTCTTATGATATACCATATTTACGTACATAATTATAATACAAATTTTAACATATTGCAATTTTAAGATTATAAATCAAAATATAAATTA---TT
>CG33291 21599862 21600146|22621 chr3L 21598741 21600159 scaffold_0 267130 268505 + 60900|1132 1436
AGTGAAGTGAAGTGATGGAGCTCTGCTTCCACACACTTCTCTCTCGACGAAAT-------CGAATTCTTATTTATTGCATTGTTTTTAATTTA-ATCTCTGAGCTTT--------TATGTATTATAATAGTTTCCCTGCCCGCCCCGACCTCCTTTCCCACCTTCCTAGTTGTATTTTTGTATTTTCAATTTGTTCAGCGCACTGTTAACCTCTACGAACCCCAAGATGGCCGAGC--AGGCGGTCCTCTAGCTA--TTATTGGTAGTTGAAATTGTTTCTGCATTAAATGAAGGAAGTAAAATT
--------GCGGCTACATCTCGCTCCTTACCCAGACTAACATATACAGCATATGTTCTGCTTATGTCATATTTATTGCATTGTTCTTAACGAATCTCTTTGAGCTCTCGTTCTCATATGTATTATAACG----CCCCTTATGCCTAGACCTATCCCTAAATACTTGTAGTTGTA-TTTTGTACTCTCAACTTGTTCAGCGCACTGTTAATTTAAATGCTAGTTAACGTGGGACAGCTTAGAGCGTCCAGTAGCAAACCTGTAGTTAGTTGAAATTGTTTCTGCATTAAATGAA--AAATAAAACT
>CG11249 21608231 21608359|22627 chr3L 21606772 21609028 scaffold_0 276339 278674 + 66463|1522 1679
TTCC--CAAGTGTGTGTAGATAGT----------------TTATTTGCTTTGGTGAGTAAT---TGGAATGTTAACGCGTTGGCCTAGAA----TATACAAAACA----GATACAGATAAATACATACATAAATATATAGATACACATTTCTACGCTG
TTCCAGTGACAGAATTCAGATATTACAAAAATGAATTGAATTACTTGTTACGAGAAATCATGTATTGATTCGGAATGTGTTAATCTTAAATTGTTATCTAATATGTTGTATTATAGAAATATACATGTACATACAT-TATAAACAGATCGATACACTG
>CG11248 21616758 21617072|22630 chr3L 21616514 21617171 scaffold_0 287986 288611 + 7249|255 573
ACGAGCATAATTTAGTTTTCAGTCAAATACTTATAAATTTCCTATTTAGTACCTATTTGTTTAGTCTCAAATTTTGTTTTCCTAAAAGGGGCAATTAGTGAATTGAGTTTTTGTGCCTAGTCTCATAGGCCTAATTTTCAATCAGATCCAACTTAGTTCAATTTATATAAATATTTATTTTGTTGTCTTTTGTGTTCGTTATCTTTATTTATG---TGTAACGCATTCTGTTAGTTTCACCAATTCTATATACATACTAATT-GCCAAACTATACCAATATTTTTTCTACAAGATATATAAACCATTGTTGGTTGCCAC
GC-CGCAAAA------TGTCAGGCACATCCCTTAACGTAGTCATTAGAATAATTAGCAGATTTGTGTTTAGCTTCATTTTTTTTGTCGTATTACTTAATGTACTTAAATTGTTTTCTCTGTTTTTTCTG-TTGTTGTCTCTCCAAAAGCAATT-------ATTTATGT--TTGTTAATCTTATTGTTTGAAATGTGCAAC-TCTTTGAATATGTCATGTAAAACAACATGAATAGCCCACCTAATTGCTAAACACACTAACTAGTCCTACTGTTTTGGTTTAATTCAAAGATGGTTTACA------------TTTCCAA
>Rpb8 21663484 21663542|22676 chr3L 21662819 21663491 scaffold_0 7722158 7722810 - 30015|669 676
ATTTTCTA
GTTTTGTA
>CG14572 21676192 21676283|22684 chr3L 21674495 21676307 scaffold_0 350700 352671 + 29838|1937 2046
TG-------GGACGGAAGGTACTCATTAT--CATTGTTAACAGTTCAGTATTTA-------AAGTTACTTTTGTTTATGAAGAAATAAA--TGCTTTCTTTTGTTATTTA
GGCTCAGGCTGACTGCACGTCCCTCCTATTACATTGTTAACAGCTTAGAATTAATCAATCCATGTTACTCTTATTTAAGTTGAAATATATTTGTATTCATTTGCAATCTA
>CG7370 21704264 21705167|22706 chr3L 21705021 21705360 scaffold_18 2734140 2734463 + -168|0 146
TGTGGAGATCTAAGAGTAGAATAGGGTTTCTTTATTAAACATATTCAATAGTTTATGTCGACACTAATGATAAATATAATCCAAATCAAAATAATTAGTCCGCTTTAATAAATCCCAGACCAAAATAAATACTTTGACACCGAATAC
TGTAAATATTTAAGAGAAAAAAAG--------CTATGAACACATT-------TTAACCAAAAAATGCAGTTATGTAAATTTTAAGTCGGTTTTCACAGCAGGCTTTATAAAATC--AGTTGGAAA---ATGTTTT--TATTGAAAAT
>eg 21751163 21751822|22764 chr3L 21748446 21752473 scaffold_0 427569 431451 + 55051|2961 3678
GATTAT---------------------------------CTCGTGATTGCCGGAGAATTCGCTCGCGTGCCAAAACAATTTCGAAAACCATAGGCTAAGGTTTGTAAAAAGTATTTAATCAACTTGGGAGATGGGTTAGATGGGTTTCATTATGATTTCCGGTGACATTACTTCTGCTGACTAGTAAATGTATGATTACTTTTGGGAAATCAACGTTACTGTTACAAACATACATAGCAA-ACCAGTAAATCAGTAAATATTTAAAAATTGTTGTAATTTCCCACCTACTTGAAACAAAACTACAACAAGCATAAGCGAACCCATCAATTCAAAAACAATAAATATTTTAAAATGCCGAAAGACATTAAACATTTTGGTGCCAGTAAAAATGATGTACAAATATCCATATTATTATTTATAACTACAGCTCAATGACCTTAAGCAACCCTAAAATAATTATGTTTATTAACTTAATATATGTATCATATAATAATTAGCCCAATTTACTTTGATTATATTTTCATTGTTTTCT--------TAACTTATATATAGGAATTCTTTAAGACTAAGATAGAGAATATTAATTTAGAGTGTTGTTCTCGTATTGACCTTTTGTTTGTTTTATTATTTTTAAATTATTTATTTT------CTTAGA-----AAGTTAAGAATATTAAAATGTAAATGAGGA-----ATCAAATAAAAATGTGT
GGACCCACACACACACACACATAGCCAGGAAGTTGAGGACTTGTGATTACCCGGGAATTCAACAGAGTGCCA---------TGGAAGCCTTCACAT---------------------ATCAAAGTGGGC----AGTTCGACG-------------------------------CTGTGGCACAGTTACTCTGTAATCCCACTTG----------GTTTTTAGCAAAAGATTTGATAGTGGTGCCAGTGAA--AGTATGTACAAATAAATTGTTTTTAGCTC-----------------AATTACAGCA--CGTAGGC---------------AAGATTTGAAATACTCGTAAACACATCTAAATATTAATAATGTT-----TAGCCAAATTTATAAACTGACTGTCATTTAATTGTGTTT-------------TTATATTAATTTATTTAAATATAACTATCATT-TTAATTTGCATGTTGTTTATCATAATAGACACTCTGTTTGTTTTTTACTTTTAAATAATTTATTTCTTAGACATGTAAGTTATGCAAACACAATGTAAAAGGCAGCAAGAAAAAATAATAATAATAAAAAAAAAACAATTAAGAAAATCATATCTATAAGTTTATTTCTTTTTTAGCTGTTATTAACAGCCGAGAGCTGTATGTTATTAACATTATGCTATAAA-GAGTATTTTTTTTCGGTATACATATGT
>CycH 21757070 21757250|22770 chr3L 21755847 21757070 scaffold_0 433622 434845 + 53245|1250 1250
A
A
>CG7407 21757942 21758414|22771 chr3L 21757302 21758215 scaffold_0 6018132 6019104 - 16784|694 1003
A------GTGGCGCCGAGCCTGGGCTCACCCTACCTGAATGTACAGACTTGTGTGATCTATTAGTTTAATGTTTAAAATTCCAAGATTTGG--TGTTGCCTC--------ATACGGTCCACTAAGTGCGGGCAAGTCTTTAGTCAGAGAGCTATCTCAT--------------CAGTCGATGATGTCGGAATATAATATCTTAGTTGTATGTAAATTATATGTATTCCACTTCGATCTATGTATTTTGT---GAGTTCCTGGTGTTATTAATATCTGATTTAGATTTGTAGTAAATGGCTGTTCGG---C
ACAGTTTATCAACCAGAGCGTGTGATTATCACTTTTGTGTGCATGGATATCGGGAAGCTTCTGTATC--TGCTTAGAATGGCAAGGTTTAGGCTGGAGCCTTAATGTTAAATACTTAACACGAAGATCCTGGAAG-----AGGCAGCGACGAGTGTCATTAATTTACAATTAATAGTCAAAGACGAATAGATTTTATTCTGTATTTTAGTGTCTTTTATATATATACA----TGATGTATATAAGTTATAGAGAAAGCATGTTCTACTTCAAGTATTAACTAATTACGAAGTG------TGTTTGGGATA
>CG7407 21757942 21758414|22772 chr3L 21758216 21759006 scaffold_8 4141002 4141726 - 5697|0 202
TCTTAGTCTCTTAAATCAGCTT-TCGAATTAAGAATATATGTATATATTTTAACGTGTTACAAGATAAAAACTCGCGATCAGAAAGTGTATAGATTTAAACACAATTAATCGCCAAATTCGTTGGTTAGATTTAAATTGTGTTCATATAACTTTG---GATTTATTTGTTCAATAAAGAATGTTTAGCTGTGTTAAGATGTAA
TCTAATTCTATCAACTTGTTTCCTTAAACTTATATATTTTATATATATTTTTACATTTTCAGCGATAAAA---------TAAGGAGTGAATAAATAAAGACACATTTAA-AAAAAAATATGTTCAT-ACATTTGACCACTGTGCATGGGTCGTTGTTTGGTCACAATTTTCAGCGAA-AGTAACTGAACGAGTTCCAATGCCA
>CG7414 21761369 21761699|22774 chr3L 21760901 21762683 scaffold_8 4144152 4146043 - 17383|576 964
GAG----GACGTTAATGGC-----GTTGACGATGACGACGGCGGCGAGAAGGCTGAGGGATGCGAGGAGT-------------------------------AATTGCTCTTGTGATTGTGATACAGCACCTCTTCTCAGCTCCACTCCACTCTACTCACCTCCTGTTCG--------TCCCCTTCCTGCTGTTTTACGCTCAGTTTGTGGCCCATTTGCCGCATAAGTTTCAAGTT----AAAACATTTTTCTACTATTGTGATTTCCCAACTAAT--TTCGGCAAAACGTACAGTAACTCCCGTAAACAACAAATTTATG----TACCAAATTGTGCTACCAAGTAATAAAGATGTTTCCACCAAAATCTGCGGATTACTGCTCCCAA
ACGACATGCCATCAACTGTTAAATGTGTGATACAACAAAAAGAAACAAAAAACAATGGATAACAAGGAGTTTACAGCACGAACAGCAACAAGACAAAAATAAAACACTCATGTTTTCGTTATTCAGGGCCCCCTAATTATGTACTTTCGTGCTTCCTGTATTTGATTTGAAATGAAATAATGTTAATGCTGTTTT-----CTTTACGTG----------CGCAAATTTTTCAAAGTTTAAAAAACATTTTTCTACTATTGTGATTTTTGAATATATATTTTGGCAACCACAACAATAAC----------AACAAACTCTTGATTGTACCAAATTGTGCTACACAGTAATAAATAGTTTCCAGACAAAATCTC--ATTTATGTTTCCCAA
>Nopp140 21769722 21770528|22777 chr3L 21768908 21769738 scaffold_8 4151178 4152079 - 26370|939 957
AAAT--AGTTAGTTAGCGC
TATCTAAATTAGCTAAGGC
>Nopp140 21769722 21770528|22778 chr3L 21769739 21770218 scaffold_8 4152223 4152720 - 11906|0 521
CACCCACCCGCAAGCACACACACACACACTAGATGCA----GTTATATTATCGGATTAACCCAATTTTAT------------TATTTGCTCAC-----------CACGATAGAAAAACGCTGCCGGATCCTGGGGCGAGCGAGCCAACAAAGATCTGAAGCACACGCGCGGCAAGTCCTTCAAACACGAGAAGACCAAGAAGAAGCGCGGCAGCTACCGAGGTGGCCAAATTGACGTAGGAGTCAATTCAATAAAATTTGACTAGATTTATTACACC-TATAAAATAATCCTTATTCTAACGGATATAACTAACTAGTTTAAGTAAAATATTTGCCTTACGCAATAGTTCCGCCAA-------CATGTAAATTCTTTCCAAACTCTTGATTGACTTCGGGAAGTCCGTACTTCCGTTTTAATGTGAATT-ATTCGAATGCAAATTGGCGGTCGACAAACCCGTGACCAAGCAA------ATGGTTATTATGACTTTAGCGGATTAAACCCTTTTTTTTTCCT
CATACACACACAAGCACACACAAACACTCGCAAAACAACATGTTATATACAAATAATAATACAAATTTTTATATAATATATATATTTATATATATATTAAAAAACAAAATAGAAAAATGCTGCCGGTTCTTGGGGAGAGCGCGCCAATAAGGATCTAAAATTCACGCGCGGCAAATCCTTCAAACATGAAAAGACCAAAAAGAAGCGCGGCAGCTATCGGGGCGGTCAAATTGACACGGGCGTCAATTCAATCAAATTTGACTAGATTTATGTTACCACATAACAT-ATGCATATTTTAATACATAAATTTA------------AAAATATTTAGTTTGTAAAA-AGCCAAACCAACTTGGTTCATATAACCCATCGTCAAGTTTTCAAT---------ATTATGTTTATTATCGCTTCTACTTGACTTGACTATCTTATGAATCGGTGTTCAGTAAATCTTTATAAAAACTATGTTTCATGTTCCAATTGAATTTCGCTG-CAAAATTTTTTTCTTTTACT
>Nopp140 21769722 21770528|22779 chr3L 21770509 21770724 scaffold_20 200580 200779 + -1110|0 19
TGTATTTTTTAATAACAGAA
TGTTTGTTTTAATAGCAATA
>mub 21859106 21860542|22874 chr3L 21858971 21859153 scaffold_8 4257610 4257798 - 7825|146 193
ATTCAACAATCAACCGCTAGCTAAGCAACAGCCACAGCATCAACCCGA
GTGCAACG--CAACTA--AAACAAATAACAACAACAACAACAACAAAA
>mub 21859106 21860542|22875 chr3L 21859213 21862087 scaffold_8 4257866 4260993 - 56934|0 1517
GGCAGAAGGAGCTG-----------GAGAAGGAGCAGCAGTAACCTGAACGTCAAATGTTAATTCATAAGCAATATAACAGAAGCGG--CAAATGAAGGATAACTTAGCTCATACATTTGACACTGTCGGCAATCACACATTGAATACATTACTGAATACACTCATACCCACGGACACACTCACAGACAGACTCGA----------AGAGAAGCATACATACACGTTATATTTATTCATTGATTCTTATTAATTATGATACTTTC-ATTAAGTTTTAAATGCAAGGGCAAACAAATACAAGAACTTTTATGTTAGA-CCGTTTTCAAGGGGCCCAGCGGATAACGTGGGGCCACCCGAAGTAAGAACAGAACAGCAATTAATTGTAAGATTAGTCAAAATGAAGACAAA--------------------ATAAAAAGTATAAGAATCAATTAACCACATACA-ATTAACATACGAGAAAACAAACGAA------------------------------------------AAGGCAGAAACTTGTGCACGAGCATGACCAAA-AAGGAGCGACAAACACGAGGAAGTGAAATG-------------------------TTTGAGCACTAAAAGAACGGATATGAATGAAACATTGAAC-----------------AGACAAGCAGCAAACAAACCAAGCAAGCAA-------AGACAGACAGACAGAAAGAAGA-------TGATCACAGACACCACATAAATT--TAAATATTTACTGCA--AATTGCATCTAGCTTGATGTTTGCGTTTGTTAGTTTGTTATATGTTTACATATATATTATA---------------TATAGACACGGCGATGTATTGATATGATAATTTTTTATTTTATTATTTCTATTATTGTAATTGTTATCGAAATTGTATTTGTGATTTTTGAATATGTTTAGACTGATGTGCAAAATTGATTCTGTTTATTAATTACAAGTAAACTACATACATATAAACAATTATGGACTAATTAATATATCTCTCTCCTTCGTTCTATATTCTAATCAAATTACTCATTTATT--CAAAATTAGACTTAATTTGTTGGCTGCAACCAACGTGATAAACGAACATCTATCTAACTAGCAAAGGGATTCACAATTGAAT-TTCGTATCAAAACGTTGTAGTTTCTTTTGAT------TGGTTTCTAGTGAAAATTCCTGCTATTGGTGACCACATTAAATTTACATACAAATTAGCGAAAACAATTCGAGTTACAATAATA-TTTTTAAGCACTTTTGCGGCGATTAAAAAGACTTTCT----GAAGCGTGGAAAAACGAGGAATGGAATTAAAT------ATATTACAATTATGCTTCAATTAAAGTATAATTTAAATTTATTAGCTGTTAAATTTATACGCAAATCGAAACTTAAAACAAAACAAAAAAGAACCACAACAAAAGAGAATATCAAAAATAAATTGATTTTCAATGTTA----CAATTAA
GACAGTGGAAGCGGCATTTTTCAATAAGCAATAAGATAAAAAACATAAACATAAAAAAC-AGTAAACAAATCATATGACAAGGTCAAATCACATGAAGAAGGAGC---ATAAAGCATCAGATGTCATACACAGAAACACAGCTCCCACACAGACACACATCCACATATCTACAGACACATATACACACATCCACGCCCATACAAACATGTAAGCATATATACACGTTATATTTATTCATTGATTCTTATTAATTATGATATTTTTTATTAAGTTTAAAATCAAAAAATAAAAAATTAA------CCTTATGTTAAAACCGTTTTCGGGCGCCAAACTACACAGTTAGCGCGCCCTCAAAGTAAGAACAGAACAGCAATTAATTCTAAGCTTAGTCAAAATGAAGACAAATGCAACAAAGCAGAAAACAAACAAAAAACATAAACATAAATAAAATAAACAAATATTAACCAACAATACAGCAAACAAATCATAAGAAACAACAACAAATTTCTAAATGCAGTTAAATCTTAAGCCAAGTAATTGTGCGTGTGCATAACCAAATAAGAAAAGAGAAAAAGAAAAAAAAAGAAAGCAAACAAAAACATAAATAAATACACTTATAAAACTCAAAAAGGGTATAACAAGATTTAATTAAACCAAGCCAAGCCAGGCCAAAACAACAAGCAAACAAAGCAAAGAGACAAGCATAACAAAAACAAAAACAAAAAAAAAAACAAAACTAAACAAAAAAAACAAATAAATGAATAATTATTTTCGACATAAATTTCATGT-GTTTGTTGCTTATATTCATATGAATTACATCGATTCATATAAATATAACGCTGCACAGATTACATTATAAATACATATATTAATTGATATCATAATTTGTAATTTTATTATTTTTATTATTGTAATTGTTATCGAAATTGTATTTGTGATTTTTGAATATGTTTAGACTGAAGGACAAAATTAATTCATTTTATTGATTA------AACTACATA-ATATAAA-AACTATTGAATAATTAAATAATTAAATTAAATTAAATTAAATTTAATACAACTTGATTTTCAATTTTCGAAATTAGCTATAATTTGTTGAACGCGAAAGA------AAGCAAAAACTGATCG---TAACATTTGAAGCCAAATTTATATATTTGTTAGACAACGCTTTTTTTTATTTTATTATTATTTGGTTTTTAGCGAAAA------------------------------CGTTAAAATAAGTGTCAA-AATTTAAATTACAATAATAATGCTTAAGCACATTTGCGGCGATTAAAAAGACTTTTTCTGCTAAATGAGAAAATGAGAAAAATGGATTTAATTTTATTAATATTGCAATTATGCTTAAATTAAAGTATAATTTTATTTTATTAGCTGTTAAATTTATACGCAAA------------------------------ACAACAAAA-----CATCAAAAATAAACTGATTTTCAATGTTAAACTTACTTAA
>CG7442 21872359 21872482|22882 chr3L 21872121 21872783 scaffold_8 4276616 4277287 - 6726|239 385
TTCTA-ACGTAATCTTATTTTAAGGCAGCCTGCAAATA---CAAAGACAAA----TACATT---TCTCTTCAAATGTGTTATAACGCTAAGAACAAACCATA------------CTATACATATAAAATATTTAGCATTGACAGAGC
ATCTACAGACAAACTAATTTTAAGACAACCACGAGACAGTTCAAAGACACAACTTTGCATTATATATCACTAAATGCAGCATATATTTACATATGTGCTCTACATATTTTTTTTCTCTTTAAATATATTATTTATTTATAAGCAACT
>CG14562 21883184 21883293|22886 chr3L 21880556 21884528 scaffold_0 4431577 4435691 - 125450|2691 2881
------------GCGATCTA------------CATTCCTCGTTAAAATAGTTTAAACCAAAATTATCATATTGAAAATTGATAA----GATTGATATTAAC-------GTAGCAAAGAAAGCTTT--------TCCACTTTTACCAC--------------------------------------AGACCG
ACAGTCCGGATTGCGGTCTAGATTGTTTGGATCATTCCTCTTTTAACTAGTTGAAAAC----TTATCATATTGCAAATTCAGAAGATTGATTGATATTAACTAGAGGTTTAGAACAGAACGTTGTAGTTGCGGTCGACTGTCGCAACTTTATACTGTATCAGTTTATTAATTTATATATATATATATATAG
>CG7448 21884671 21884692|22887 chr3L 21884575 21884709 scaffold_0 4436243 4436410 - 4852|111 150
G------------AATAAAGCATTTTAAG------TTTCC
GTCATTATACCTAAATAAATTTTTTAAAAAAACGCCTTCA
>CG7470 21916238 21916634|22919 chr3L 21915809 21916845 scaffold_468 4288 5369 + 22918|434 955
--------------------------ATAACCTTAAACTGAACTATTCTTAGATGTAGCATACCGAATCG-CGTTCCAAAGTAGAGTGCACTTTC-GTCATCTTTTAGAGGAGTGCATTTTGAGCGAAGG-GTAATTACGTGGGGATAAGTGGATCCGGATCCGAATCCCAATGTGGATGAGGGCGAGGACAAGGATGTGCAGCTCCGATGACAGCTGCC-GTCGTGGCCACATGGGATATATTAATTTGAGTGAAAAATATTTGCAGAGACAACTTGTGTAATTAATAAAGTAAGGGAGAGAAAGTGGGCGAAGGTTGTTCAAACTGTCAGCCCTTGTCTTGGGCCCTCAAAGTTTGCAGCGAAAGTTCCGC----------------------------------------------------------------------------------------GCTGCAG----ATGGGGGATACAAGAAAATAAAATTAACTGG---AAGAAAGCTGGAGAAA
TTTTATTGGCTGTTATGTTATTTTGTTTTACCTTATAATGACAAACTCTGTAAATACGCGCATTTAAACGATAATTGAAAGTAAACTGTGTTTTTGGCCATGCCGTGCACCTGCATCAACGCAGTGAAGGTGTAATTA---------ACGCTGTTGCGGGC-----------TGTGGCTGTGGCTATGGCT----CTGTGCA----TGATGACAGCTGCCAGTGGCGGGCACATGGGAGAAATTAATTTAAGTGGAAATTATTTGAGCGGGCAACTTATTTAATTAATAAAAT---GTGTAGAGAGCTCTATAAGG----GAAAACTGTCAGAGCGTGTCTTGAG--CGCAAAGTTTGTGTGCAAAGTTTAGCTCCAGCCACGCCCACCCAGCTGCACGCAACGCCCAACGCTGAACTTGAAGCGGAAGCTGTGGCTCCAGTTGCTGCTGTTGCTGTTGCTGCTGCAGCAACGTTGTTGACAGTGAAAATTAAATTAAACTGACTCAAGCAGCCCGAATGCA
>Act79B 21920685 21921031|22926 chr3L 21920474 21920715 scaffold_0 4474902 4475143 - 17549|211 241
GCATCCAAGCCACCCAAACCAGATCAACATC
ACATCCAAGCCATAAAATCAACAGCAGCAGC
>Act79B 21920685 21921031|22927 chr3L 21920800 21921020 scaffold_0 4475333 4475535 - 3956|0 225
AAAAGTATCTTTAAA-TTACATTTAGTTGATGAAGAAGTTTTAACATAGATAGAGAAAACAAGAGAAAGAGACGAGAAAAGACCGGAAACGAGCGGCAACGCCTTCTTTTTTTATTATTATTGCTATTTTTATTTGATTTGACTCGGAATTTGTACTGCTTGACTCGCTTGCCAGCGCGTAAAGTGGCCAAAACAATCGGTTGTAC----GTACAATAAAAACCAA
AAAAGTATCTTTAAAATTACATTTAGTTGAAGAAGAAGC------------AGAAGATGAAGTTGAAATAGAGGACAAGAGACCCAAAACGAGTAGGTAGAGCATCTTTTATATTTAGTTTCGAT-TTGGAATTTGATTTGTTTTTAAGT---TACGG-------AGCTGACCAAGACAAAATAAATAAAAGACAATCGGATGTACAATTATACAATATATATGAA
>TyrR 21997916 21999122|23002 chr3L 21995803 21998007 scaffold_0 4577209 4579362 - 79386|2193 2284
GGCTGGCTGGCGGGGGCGGGTGGAAGATATAAACCGGGCCAATCATGGTTCGAGCGGGAGAGCGTAACTCAAAGTTTGTGCCAAACTTAAAT
TAC--GCTGATCTTGGC-------AAATCTAGGCGGCAGCAGCAGCAGC---AAAGGGAGAGCGTTAGTCAAAGTTTGTGCCAAAAGTTAAT
>TyrR 21997916 21999122|23003 chr3L 21998093 21999126 scaffold_0 4579453 4580501 - 7517|0 1141
CATATATACTTTCAAATGCGTTCTTGGTGAACTCATTTTGAAGAAGTGGATGAATTTGGTAAAGTGTAATAGATTGAATATAATTTTTAATGTTTAACGTTTCGGCAAAGTGAAAAGCCCCCA----------CATTGGAAAGTCAAAGATGAGACTCGAGTGTATATATAGTTTCAAAC-----TAAGTTATT------------------ATTTCTAGCCGTAATTAAAATACTTTCATTTAGTTTTGAACATTTTTTTAATATATTGTTGTTTGGAATCGATTGAGATGTACCACCAC-ATTAAGCGTAGAT----TGTTCAATACTCATACTAAAATGGGTTGTGCTGCGATTAAAGTGAGGATGTTGCCTCAAGGCACAGCTACTAGGAAAATCATAAAAATTACATGGTAAAGAATTATACATGCATTATACTCCAGCTAAGTGGCATCCCAAACGAGAATAGCATCAAATTGAATTTAATACAATTAAATTAAATGTTTAGGCACAAAGAATTGTGGCA-ACTTTCGTGTTTCAC-CCTAAGCGTATGGA-TAACCAAAAAGGTGTTTGTTAAATTAAATCTGCGCTCAAGATATGTAAGCAACTACTAAGCTAAAT-----------------AATAACTTCCAAGAGAGAAACGTTTTC-TAGGCATTACTTTAACGATTTGTATTTA--------TATGTACTTTAATTGTAGGTAAACGATAAACCACTA-TACCTAATGTATACTTTCAAATACGCTTTGGACTATTTGTTAAATAATTTAACGA----TTAATTGTTTTTATGGCATAGCAACTATTGTGTTGAGTGGG--------CAGCTTAAAGCTAGCACAT---------------------CGAAACTTACTTAAGGTAGAT---------AAATGTTTAACTGCA-CGTTACGAAATGCAACAGAGTTGGCGAAAGGACGTAATTCAATGGATGTGTTAACTCAAGTACATGC-TATATCGTAAATGTATATCACAATTTATGTCTTTTAACGACGATGTACGATAGTTTCACTAATTATATTGTTTAACGAGAAAGAGCGAGCAAAGCGTAAATGAAACAAATAAAAGACACATTCGAATTAAAGTTATAA
CATCTAAACT----AATATGCAATTTATAAATATATT---GACAATTTTAAGCAATTTCTAAAAGCTACGTGTTAAAATAGTTTTCTTAGACTTTAACTATTTATTTGTGTTAAGAGCTTCTCGTTAATTATTTATTTATATGTCGA----GCGACTCTCGCTTAAAATAAGTCTCTTACTTTTGTCAGGTGTTTCTGCCATTGGATGGGGCATACCTGGCCGTAATTAGA-----------TAAATCTAAAC---TGTTAAATATACT---------CATCAAAT-AAATATAAAATGACAAATTTGCTTAGATAAGAAATTAAATAAAAATATAAAAAAAAAACA-ACAGC-ATCAAAGTTAGAGCAAAAC--AAAAATACAGCATCC---AAAAATATTAATATTAAAACGTAAA-----ATACGTAAATAAAATAAATAAAAAATGAAAACCAAAAATGAAA----ATCGAATTGAATTT----------AAATAAATGTTTAGGCACAAGT--TTGTTGCAGACTTTCATGTTTCACTTTTCAACGCATAAACTAATTATATAGAAAATACGTAAATAAAATATAAACT-AATATAAATAA-----TGGTTAGTTAAATGCGCGCGCTCAACTTTAAGAAACTTCCAACAG----CTGTTTTCTTAGGCATTACTTTAAATACTTGTATTAAATTTTAGGTAGATGAATTAATTACAAATAATCG--AACTTGTTGTTAATGTATGTATACTTTGAGGTACGCTTAAAAAGATTTGTTAAATAAGTTAATTATACGTAAATTATTTTCATGGCTGAGCATCAAATGTGTTGAGTGTGCAAAGGCACAGCTATAAGCTTAAATACCTAATAATAATTCACAGAAAACAAAAATCAAATAAGTAAAATATACAAAACAAAAATTTAAATGTATTATTGCATTGTGCAATAGAGTT--------------ATAAAATATATATACTTACATATATATATATATAAATCG-----GTGTATAAAATCAAAAGAATTTT---GATGATGTACGTTAATTTCACTAATTAAATTGTTTAATTAGCAAATGCAAAATGAAACAAAGCAAATGAACAAAAAGACAGATTCGAATAAAAGTTATGA
>RpLP0 22011157 22011329|23013 chr3L 22009088 22011300 scaffold_8 3482943 3485207 + 82517|2220 2363
GCTGGATCCCGATTGCAGAATGCCCTCTGCGGCGCCCGCGAACCATCGCTTCCGCTTTCGGCGTTTACCCACTAAGACCCTTTGTTATGTTTTCTATGTGCAAATTATTGCCGCGGTTTGACGGACCCAATGGCGAGTTGCATT
GC--GACACAAA-----------CTCCTGCAGTGGTCGC------TCAGCTACAATTTCAATGTTTAC-----ATGGATTTTGGCCCAGCTGCCTA--TGCAAATTATTGTCGCGGTTTGACAAACTCAATGGCAAGTTGCATT
>msopa 22016926 22017144|23022 chr3L 22016914 22017028 scaffold_27 97808 97911 + 1618|12 114
AATTCTTCGAAAGGAAGGAGGCCACAATCTTGATTTAAGAACCCATTGGTACACCCATATTACACGCACTGCGTTAATAAATTATTTTCATTTGCGTCGCAAT
AATTC----------AGGAAATCACAATGTTGATCAAATCATCCAGCGTATCTTTGGCATTCGACTGGCTGCTATCATGTGTCTTTTTCATATGAGCTGAAAT
>olf413 22176501 22176648|23197 chr3L 22176000 22178869 scaffold_8 3674375 3677909 + 55099|533 687
GGGGATTGAAAGGGATTCGGCGGCAGA------CGAAGCAACAGCAGCAGCACCACAGGCACCACCGTCTCAATACACTAAACTAACCGTACAGCTGAA-GTGCAGTTGAAAATCAGTGAAAAGCGAAAATAGGGTACTGAAATAGCAAACGAA-
GGAGC---AGACGCATCCAATGGCACAGCAGAGCGAAGCAGCAGCAGCAGCAGCACAGGCACCACCGTCTAACTACACTA---------TATACATAAATACTCAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGCAAAGAAAAG-------AAAAACAAAAGAAA
>Ddx1 22199687 22199865|23220 chr3L 22194470 22200518 scaffold_8 3703301 3709010 + 227697|5299 5478
CGCGGATCTGGAGCGACATTTGTTTGCTATGCAAGGAAAGGATGTGGTGAATTGAGAAGTGCAAGACCAACTCACGCGGAAATACTTTTGCGG-CACAAACACACAATTTTGTATATGTAGGAAGTCGGAGCTCAAGCTCTGCTATTAAAAATAAACATTTAATTAAACTAACATTAAAA
A------CTGGTTCGATTTTGGGTTGTTACACGA-----------------------------------------TCCGAAATACTTTCACGGTTACGAGTACATA-----------------------------------------------AAATACATAAATAAACTAACATTAAAA
>Csp 22205612 22207587|23223 chr3L 22203164 22205639 scaffold_0 7018293 7021097 + 41637|2925 2952
GCAATTGGTCCAGAAGTCAACCACACAG
ACAGTTGGCC---ACGCTAACCAACCAG
>Csp 22205612 22207587|23224 chr3L 22205652 22205718 scaffold_0 7021192 7021271 + 2576|0 79
AGTTTGGCAATCCGACAAAGCGTCTTTGACCATCGAACTTGTTATT--------GTGCATATAT-----CGAACAAATAT
AGCTTAACTCTAACAAAAAGCGTCTTTGACCATCGAACTTGTTGTTAATTCTGCGTGAAAATAGTTAAACAAACAAATAT
>Csp 22205612 22207587|23225 chr3L 22205850 22206110 scaffold_11 662289 662541 - 113|0 270
TGTACATGTCCACGCGAATATGGGATCCATTTACTTAGATCTGCATGCTGAATTACATT--ACCACACACTGCCCGAGCTGCAGGATGACCAATGAATAGATTGATTGACTCAGCC-----TTTCGTTCCTTAGGTCTGCGCCAGCCGTACTCAAGTCCCCCATTTTAAAGACCTCCTTTCAAGATTGTTTTCCAAGCTTTCGCA---AATTAAATGAAATGAAAATTTTAATTTCCATCCAAGACATATTCAAAGAATGTAGCTTAAGTT
TGTCCATGTCTAC-----TATGAGAACCGCAAGGCTGGCTGCGTGCACAAGGTGACACTCAGCAAGACACTTCGCGAAATTATAAACGA-----GAAGGGCTTCTTCGTCTCGGGCGGCGCTTTGCTTTTCTATGTCGTGCCCAAAAACACGCGCATCGAACA----GGAGTTCATCCATCAACAGCG----ACGACCTCTCGTCTACAGTTGAGTGGAGAAAGAATCTTAGTTTTTATTGCTTGTACGTTAACAAAGCATTGATTAAGTT
>Csp 22205612 22207587|23226 chr3L 22206111 22206446 scaffold_0 7022156 7022472 + 4358|0 351
TGACGGATTTTAGTTTTATCGTTTCTTATGCAACGCGTAC-----------ATTTTGATTTCTTTTCACT-TATCACTGTCTACTTCTCTCTCCCCCTCTCTTCACT----CTAGATATGGTTAATCAAAAATATTAGTCAAGTGCTGCGAGCGAGTCAAGACCCGGGTGCTTGCGTACACCACACATTCAGATACAGACACAGAAAACACAAGCCCCTAAATCGTAACAGAAGAGAAAACCAGATTTATTTCATAATTATTAGTGTTGTTTTTAAAATGCGCGATATGTTGAAGCGAGTAAACATAGAAACCAATGTATTTATTTTAAGCCGTAGCACTTAGCTCTAATTT
TAATTGAGTTTAGTTTTAT-GTTGAACATATAA-GTATATTTAATTATGTTATTTTAATTTGTCTTTACTGCATCACTCTATTGTTTTCTCTCTTTCTCTTTTTCCTGCATCTAGATATGGTTAAGCAAAAATATTAGGTTCATGCTTCAAGCGAGACAA-ACCCCAATTCATGAG-------AGCGTTTTGA-ACAGCCAC-----ACACACTTTTTTTATTCCT-------------------TTTAATTGTTAAAAATTTGGTATGTTCAATAAATCGGAAAAAAAAATATATATATATATATACACACACTTATATTTATCATAAGCTTTAGAACATAACTCTAATTT
>Csp 22205612 22207587|23227 chr3L 22206860 22208230 scaffold_0 7023131 7024724 + 11746|0 842
TTATTTTGCACTAAATTGTTAAAGC-----------CAGAACTACTTATGTAAAAAG---GATGAATTGTCGAGCGACGCGCCCAGCAGATTGCT--------CCGATCCGATTCTAAT---------------------GCAAATGTAAATA---CGAGTTAAACAATTAAGCATCACACAGTTAAACAGAGGAGGACGAAGAAGAGGACACTTTGAAGGGCGATCCAATTAACGCAAATATAAATTATATAACAGATATTAATAATCCCCTCTATATATAAAACAATTAAATACGAG----TAATCAAAAGTTGAATTGTAACCCCCGA-AAGTATTGCACATATTTAT--GTATTCCAAATTGT----------TTCAAAATTGAATTGAATCTAATTAATTTTTGTT------------------------------TGATTGTTAACCCGCTTTTAAATGTAAATGAATGCGATTAGTCCAGCAGTAATTAACTTTTATATTGTAGTATCCCATT--CTAAATCATTGACATCAATTATTGCCGATCAGCTCCGGGCCAGG---ATAAAAGTCCTTGGGCGCCTGGGTCTAGGGCCGGGATCCGAGAGTCGCCGGCTCATCTATAGTATAAACACGCATACATATATAAAATTCAAT-TATTAATAATTACATTTTACGGTCTTGCGTGTGTATTTATTGTTCGTACAAGTCAAAGCAAAAATACTAAGTAAACTAAATTTAAACTT-AACAATTGTTTCCAAATTTCAATTGTATTCTGG------TCTAACACGAAGAAGCCGAAATAAA---------TTTATTATACAAACTCA
TTAGTTTACACAAAATTGTTAAAATATATATATATATATAAACACATATGTAAAGAATCCAATAAACTGTTGCTCTTGCTGAACAATGGGTCGCTGATGCAGACGTATCGAGCTCTAGTCTGTGGCCTATTGTGTTAACTGCAAATGTATATAAGTCAAGTTAAACAGCCTAGAATCGCGC-----------------CCAATGACAGAAC---TTGAAAAATAACTAAATAAATAGCAATCAAATTTAAATA-----TAGTCGCAATCCT---------TAAAGTATTCTTATCCAAAAATTTATTCAAAAATTGTACGCTATTGTCCATTAAGTATTGAAAATTTCAATCGATTTTTCAAATTGTATTATTTATTTTCAAATTTCATTTTAAATAGTTTGCCTTTTGTTGTTTACAACATATTTCATTGAATTAACCAACAAATGTTGTCTCATGTGTATTCGTAAATTA-TGCAATTAGTCCCAAAGTG-------------TTGTAATATTCCAAAAATTATATCATCGCTATCAATTATGAAGAACCAGCACATGTACACACACATAAAATTC-------------------------AATACAA-------------ACATATATTATATAT---------TATATAAATTTCAAAATAATGAAAATACCATTTTAAAGTTTTGCGTGTGTATCTATTGTTCGTACAAGTAAAATAAAACATTTCCAAAAATTTAAATTTAAAATTAAACAATTGTTTTCAAATTTAAATT---TGCCAGAAACAAAATAAAACCAAAAAATCAATAAAAAAAAATAACTTATATAAAGCAATTCCA
>CG11489 22216942 22216990|23233 chr3L 22216400 22217571 scaffold_0 7033113 7034212 + 39629|545 593
GAGGCTCATGGAGTGACTAGACAGCCAGAGAGACACAGGCATAGGCACA
---GCTCATTTAGG--------ATTCACAAAGGAACAGCCAT----GCA
>CG11489 22217044 22218177|23233 chr3L 22216400 22217571 scaffold_0 7033113 7034212 + 39629|647 1218
GCTTAACTTTTATATGCAAA--CAATTTGCCATAAAGAGGAGGTAGCAGGAAAATGGG--------ATGAGGAGCTAGCATTAAAGGACTCGATCGAAGCACACACATTTTACACTTACGAAATGCGGACG--ATGTGGGGGCGTTCCGCGTCGAATTTTTTAAGCTTTTTAA----------TTTTTGTACTTGAGAGCTTTAAAATGTAATTACTAAAGAAGCGATTTTACTTTTAACGACAAAAGCAAACGAGAGAAGTAGCGCAAATGTTTTTCAAGTTTTATTTCGACGACGTGCATATAAGTATATACATACATATACACATATATTTTTTATTAACTGAGAAACAAAAACAAAAGACAATGACGACAATTTTT-AGTCAACAGATGCCTAAACTGACTGACTGAAA-----------AGGAATACATTTTCATGCGAAA----------CCAAGTAAAACCAAATCAGTGAGAAATGCTAAATAGATTGTACGAACTAGCAAAATATTCAGCATCACATAAATAACAATACCTTCTATAATATTAATAAGCAAGTATGTGTATAA
G-----CTTTTATATGCAAAACAAAATTGACAT--AGTGGAATTAATATTACGATAAATATATATTATGCTTAATTAGCGTTTAAGCCTGAGAGCAAAATGTAGAAA----------ACAAAACAAGGAAGAAATTTAAGATCGTAGGGCAAGGAGTTTTCGAAGCTTTTTTAAATTAACACGATTTTGTACTCGAGAGCTTTAAAACCTTTTAGCAAACAATGCAATTTTATTTATTATCAAAGAGA-----GGCAGAAACAGCAAA----------ACGATTTATTT--------------TATGTTAGTTCTTTCACTTTCATATATTTTTTGTATT--------------AATAAAAGACAATGACGACAATTTGTAAGTCAACAGATGCCTAAACTGACTGATTGCAAAAAAAAAAAGCAAAAAGAAATTTAAATATAAAAAATAATCTTTTCGAACAAAACTAA---------AAACTCTAAAGATATAATAAGGATTAGTCAAATATTGAAAAGCGC--AAATGATAATA-----TAGCATGTTTATAATAATTTAAATATTTAA
>CG11489 22217044 22218177|23234 chr3L 22217589 22217723 scaffold_0 7035268 7035403 + 2894|0 138
TAGATATCGAGAATGTTCACAAATACAGATGT----AAACTCAAATATTGACAGCTTTTTAGCAGAGTGTAGTGATTTTGGTACATTTAACCGAACCCATTTGTAGATGTTTAGGCCTATGTTGATTACGAGCAGATTT
TAAATATTTA-AATGTAGATAACTAACGACATTGTTACGATTGAATACAGCCAGCTTTCTAGCAGCAAGTAGTGATTGTGGTATAATTAACCAAAAATA-TTGTAGAACTTCAGCTGAATA-CGATTGTGTGTGTATTT
>CG11489 22217044 22218177|23235 chr3L 22217754 22221828 scaffold_0 7035608 7039720 + 217651|0 470
TTGCAAAACTTATCATTTAACCATCCGTGAAAAAGAACCTATCCCAGATCATGTAATTCAAAAAGAATTAAAAACAATAATAAATCATTGCATAAAAGTCTTTGTATCGGAATTGAAAACTCAAAATCGAAATTTAAATA-----------CTACCAA-TGATAAC-----------TACT-GAGAAATCATATT-ACAAAATAACGAA---AACATATTTTACTACTTGCCTACAA---GTATTTGTACACAAGCCTACAAAGTAACATTGAACGTGACCAAATAATTTAATATTGCGGAAGATTTTTCCCCCAAAC---------------TCATATTTAATATACA-CACACGTGTGCGCATGTGTCCAAATGAAATTTAACAGAAATTGAAGCGGAGGAGCTGCACGTTCGCGGGAGTGGACACATATTTCAATAAGCCGAAATAAAGAATATACATACCGATCCGA
TTGTATAATTCATACTTTAAATCTCCGATAAATCAA-------CATGGTATTGCAATCATACAATAAGAAATATCAATAATA------TGCAAGTAAATCTT-GTAGTGGAATTGAGCATTCTCTAATGAAATTTACAAAAGAAAAAGCTTTCACCAAGTCAAAACGCATATGAATTTGCTAGGGAAATCAAATTCACTAGGCAAAGAATTAAACATATTTTATTACTTACCTACAACATGTATTTGTACACCAACCAAAAAAGTAACATTAAACGTGACCAAATAATTTAATATTGTGGAAGATTTTTCCCATAAACACGTAAAGAAAAAAATAATAATTAATACACATCTAATATATACATGAGTAACAAAATAAAAATAA----------------------TGCAATTAC-----CATGTATACGTGTTAAATTGATGTG---TGCAGAATCGCCAGAG-GATTTCC
>Aats-ile 22226575 22226659|23237 chr3L 22223462 22226954 scaffold_0 7041166 7044775 + 147820|3156 3248
GCTTA-CGGAGCT--ATTGGTATTTA-ATTGAAAACGAATCGAAACTGAAATAAATGTTGTCAACTTTTCAAAAAAGTT----TTAAACCTTA
ACATGTCGGTGGTTGATCGGTATTTATTTTTGTGCCGAATCGG---TAAAAGAAATA-----AACTTTTTGAAAAAGTTGCAATTGAGCTTCA
>CG32450 22264271 22264518|23262 chr3L 22263725 22265090 scaffold_0 7093539 7095125 + 9057|608 903
TTAAATCA-ACACTCAGTTGGATCCCCACTCGGATATGACTGGGG-------------ATCTTAAA-----ATCGAGAATCGAGGAAAGTACCTTCTCGAATCCAACCAGGCTTTGTACCCTTCTA-------------AGCAACA------AAATCGATATGA--TCCTTCAATTCC--------GTTTAATGATTGAGACCTTTTTTGCGACTGGAAAAGTGTCAGCTTTGGGCTTTCTCGTTTGGCGCAATAAAATGAAGTGATTGTTTGGTTTTTTATGTTGCAAAAACACA
GTAGATGATAAAGCCGATCGAATAAAATTTGAGATAGTTGTGGGGAAGCCGCCGAAATATCCTAGGCGCTTATCAACACCGTAAATATATGTTTTTTTTTTTTTTTTTATCTGTTATTCCTTTTTATATTTATGCTTGGAATAACACAGCGTAATTCGATTTAAGCTCATCCAATTTTCATTGGGAATTTTCCATTTTAGGCAATTCTTTGTCCTTAATAAGTGTCAGCTTTTGG-------GCTCGCTGTGATAAAATAAAGTGACTTTCAG---TTTTATGT------------
>CG11438 22401777 22401919|23388 chr3L 22399103 22403649 scaffold_0 7263496 7268044 + 90944|2952 3094
GCTCAGTGGCGAATTCCATTAGCGAAACCTATCTTAGAAATGCCCACAAACGTACACACACTCACAAACTAAGAGACTTGCACGGAATTCCTGTTTTGTTGTCTTTATTCTAGCGAAATAAATATATTCAAGTACGATACGAA
GCCGA-----------------------CTAAGTTGTGCATG-------AGGCAGGTGCTCCTGGAGCCTCACAGACAT------AATCTCTGTTTTGTT-TTTGTAGTTTAGCGTAATAA--------AAATTCGATATTAA
>CG11437 22403632 22403701|23388 chr3L 22399103 22403649 scaffold_0 7263496 7268044 + 90944|4916 4933
CATTCGATGTGTTAACTT
ATGTCAAATAGTTCAGTT
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TGAGACGGATAAGATGCTTTCGTAGCGATGTCAATTC----------AAAACATTCCAAAGGTAGCAATAAAGATT-------AGATAAACTATCAGCACTAA------------------TTGAATCTGTA-----GTACTTGTAGAGCATT
ACAG-------AGACCCTTTC---ACGATCGGAAATCGACAAGAGGAAGAAGAGTGCAAAATTGTAATTAAACATTCCAAACCAAATAAAATATACACGCGAAACGCGTCCTGTGCAAAAGTTCAATGTATATATATATACTTGTCAAGCATT
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AAAATCAGACACTAAACGACGGAGCACAGGTTCAGCCGCCTTTAAGTGGGTCACCATCAGTCAGGGGCT-TAACCTTG------------------------------------CCGCATCTACAAATACAC----TGGGTCGGT-GGTTCAACTAATAAATATGCCAGAAA---------------------------------------------------------------ACACCAGACACACAGATACCCCGCACGCACACACCA-----------------------------GCACACTACCGC
TTTGTC---CACTTAA---------ATGGGTCGTTCGGCCCACACACAAATTACTAACAGGCTTTGCCCCTAACCTTGGGAATACGACGACAATATACTACACTACACTACACGTTGCAACTACAACTACAAACTGTAGGTCGTTTGGTTCAACTAATAAATATGCCAAAAATACGAAAATACTCGGACGCACAGCACAGACACCCACACACACACACACACACACGACACTCACACACACGTGACACACACACCCCACACACACATCCCACACACACATCCCACACACACATCCCACACACACACAAACGC
>Trxr-2 22485713 22485863|23461 chr3L 22484017 22485760 scaffold_0 7364859 7366603 + 77140|1712 1759
TTCCGTGCCTTGGAGATAGGTATCTTGTGGTGAGAAACAAAGCATATT
TGAAACGGCTTGGAGCCGAAACCGTTACCGTTCGAGTTGAAATATATT
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TCGTAAAAATGTAAATCTAATTAGACGTCAAGGGTGAAAATCA-TTATTGCACCTGCATGAAAATTTAATTAAGCACACACAATTATCGAAGTTACAAGCTGGAAAGGCGCAAATCGAGGTCCAACGGGTTTGTTACAGGCCACAACAATAAATTTGCATGCTTAATAACGTTTAATG
TCATAAAAACGGAAATCTAATTAGACATCAGGGGCGAAAATCATTTATTACACCTGCATGAAAATTTAATTAAGCGCACA--------------ATTAACAGGACTGATGCCATT--------ACAGTGCACGTTCCTGGCT---------TATGTATGCGCTTTATAATATTTAATG
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GGAAATTGTCCGTAGAATTTGGGA----GTGGGAATTCTGTGAAAAGTAGCCAATAAAGTTTGTGTAAAAACTTG
--ATATTGTTC-TGAATTTTGAGAGTTTGTGGATTATTTATTGGATTTGGCTAGCGAAAT-------AAAACTAT
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AAGCCCCGCTAGGCTCGGCCCTGCCCCGGAATGAGCTACCCAT
AAACCAAATAATTCATGCAACTCCAATTTAACCAGTTTCTTTT
>CG14453 22628345 22628495|23605 chr3L 22628324 22628437 scaffold_1 2149405 2149527 - 575|22 126
A-CGATTGCTACAGTCGAAGAGGAGGCTGCTGCAGCTAGAAACCTGTCGAGTCAGACA-----GCTAATACAAGCCAAAGATTGATGTT------TTAACTAAAT
AGCAGAAGCAGCAGTCACAGGGTGCGCAGCAGCAACAAAA----TGAATACTCAAAAGCCTATGTTAATAGTAACTTAAACTTAATGCTAAAACATAAACTAAAT
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TC---------CTTGAACCACACCTTGATGGCGCCAGCAACTGCGAGGGCACCCGAAT---------CAAATC----------------------------------------AGTCTAAAACGATTC-------------TCCTGTAATTATTAGCAAATTTGTCAATCTTT--GAGCGCAATAAAATAAAG---TTTTATGTTTTTAAA
ACAGCTGACCATCTGATCCATGAC-TGATGCTCATTCCCATTGCGACGCCACTTGAATGTCCACCACCAATTCTTGCTAATGCATCGCCAGGTGCAACGATATTTTCATTTCGAGTCTGCGCCGAGTCTGTAATCAAAGATTTTTGTAATTATTAGCCAAATTGTAAACGTTTCCGAGCGCATTTTAATAAAAGTTCTTTCTGTTTTAAAC
>CG11367 22666881 22667289|23637 chr3L 22666682 22667470 scaffold_8 1963513 1964405 - 7991|201 716
CAGGAGCCACTTGGGGAACGGAGTCCT----------------ACAGGACCCCCAGCCAAAGAGAATCTCCTGGACTTTAACAGAAGACTGCGTT-------------------TTTGCAT-TACCTAGT---TCAAACTAAGGCGGTTTTCGAGTTGTTTTATTTATTTATGCTCAAGGCAATGCCATTGAAACCAAACATTAAGCTAGCCTTAGCAGATAC------GGATTCAAAT----CACACTCGTTCCCTAA---------AACTGTATGA---GGGTGTGTCATGCTTCACAT---CACACATTACTTCTAAGAATTCCTGAGATGTACATTTATAAA------------TAAGTCAAAGCCTCGCTCAAAG---------------------ACCGCTAGCTCGAAGACTCGATTGTTGGTCAT----------AATGCTGCTCTATAATGTTGTTCAATTATTAGTTTGTAAGCGAATAAGCAAATAAATGAGCTCTAAAGTACAA
CCAA-------CGGAGATCGGGCTCCTGCCTCAGCCGGAAGTGACAACGCCCGCTGACGATG-GCGTCTTCT-GATTCGAATAGGA-ATTGTGTTAAATAGTGCTAAGATATAGTTTGCATATGCAAAGTGAATTAAATTA---TTGTTAACTAATTAAATTAGAAATTTAGAATCAAACAAAAGAAAC--ATACCAAATTCTAAATGCATTGTCGCAAATACTTGCGAGAGTTTAACTAGTGTACAGTCTTTGCCAAAACAGAATCGAACTCTCTTAAATGAAAATGCTGTGCCTAAAATATCTATATACAACATATATATATATAT-ATATATACAATTTTAAAATTGATTATATTTAAGTCGAAGCCTCGCTCAGTGTCATTGGAATGTAAAATGCTCACAGTCTGCTTTTCAATTCGATGTGCGCTCTCTAAGCTCTCAAATTCTGCTCAATTATATTGATCTTATGTTAGGTAATAAATAATATATAAAATA------TTGTAAATTTTCA
>CG7369 22681559 22682457|23646 chr3L 22680794 22681789 scaffold_8 1978204 1979238 - 44557|776 1071
CCCCAATACAGGGTG--------------------------TAGATTAAGCTACGCTTAAGCGCTTGCCATGATTATTTTTTC---------------------------------TACTAAGCCGTAAGACCGGGGATATTTTAGCCTAAGTTTAATGAACCAAGGAGTTCACCGGGGTATCAAGCCTCAAGCCCTCCTTAACCCCTTA-CTCCGAAAGAAGAGCTTCTGAAGC----TGGGGTCGCCAAGTAATAATTTGTCAAT-CATTTTTGTTTTCAATTATTTCCGTTAT
CATCAGTAATAGTTGACTCTTAAGCTATTTAGTATACATACTAATTTAAGTTACGCTTAAGCGCTTGCCATGTTTATTTTTTTATAAACTTAAGTTTTACATAAGTCGATTATACATTTTAAGCCG---GGTTGAGAATTGTTTAGGCTAAGCTCAG-----CAATTAGTTCA-------GACAAGACGCATGCGCTGC--AACTTCTAAGCTGCAAATGA----CTTCAAAAGCCATTTACTGCATCCTTGAAAGCCTTTGTCTGTATATTTTCTTTTTTAATTAAGCCCATTCT
>CG7369 22681559 22682457|23647 chr3L 22681842 22682500 scaffold_8 1979443 1980192 - 6688|0 754
CTGCGAGACGTTGCCAGTAATTTTATTTATTTAATTAGACCATTGGG-------AGGATGGGA---------------ATAATGAAAGAATGTACTTAAGGCCGTACACGGCTAACAGCTA------ATGCAACTAATTTAGT-------------TATTAGCGCAAAATATTTGGTTTATCATAATTCATTTTAATATAATTATGATGAAAACCAATCTGACAAAGCTACATGAGTACGCGATA-TCCGTACGTGACCAGTATTTATATTTATGTAT----ACAATTTTATAGCTAAATGAAATC-TTTTTGATATTCCGTAATTACATCCGGGTACATTCTAACGGATTTCATTCTGATTCTGTCTCGAGGCTT---TTTGCATCAGCAACATATATGGGCCTACTATCAGTCGCAGGC-CATTAATACTTTCGTTTAAGGAAACCAACAGAACAAGTAAGAAAAAACAGAAGGAGAAGTACACCTTGT----GCTTGAAAAATGCTTTTTCTTAATAAGAATTTGATTTTTAA-CAATGTAGTTGC---------AAGATTTTGCA-----ATATTGTGGATGAATTCATTATT----------------------------------GATATTAATTATAACGGGACTAAAC----------------ACACCTTTAATGATAAAAACA-------------------GCTTTCGAATAAACGATATGAACAGAACCAGTTCCCAAAACA-
CTCCAGAATGTGGCCAGTAATTAAATTAATTGAATTAAACAGATAGGAAAGAACAAAATGAGAAGAAAGAAAAGAGACAGAATGAATGTATGTACTTAAGGCATTTTATTGCTGCAACTTATCTTATATTTAATTGGTTAAATGTATGTAATACTGTATTACGGCGACGGAAAGAAATCATATTTATACATAATGTCATAATTTATTTGGAA---CATTTGACAAACTTGCGTGTATGCGTGTTATTTTGTAAGCGAACAGTATTTATATTTATATATTTACACAATTTTATAGCTAAATTAAATCATTTTTAATATTCGATCGT----TTCGGAGACGCT-------------------TTTGTCCTTGAAGCTTCAACATTTATTAACAATTATTAGCAGTGCAGCATAATTCACAAACACATAAATGTTTTCT------------------ATATATAAGATGAAGAAGAACAAAAAGTACACCTTGTGGTAGCTACAATGATGCTTATCCTT--TTAAGATATAATTTTTAATCAAGGAAACTACTTATACATAATAAGTATACATACTTATATTTCAGAAGAAAACAAAAATACAACAAATAGTGGTATGTGCGCGGTATCTCTACGATATTAACTATAAAGGGACTAAATCGACAAACAAGGCCCAACATAATCGATTTAAAAAACAAAAAAAAAAAAAAATCACTGCTTTTGAATAAATCAACTGATCAAAAACGATTCTCATAATAC
>SPoCk 22718329 22718593|23673 chr3L 22716415 22718520 scaffold_8 2050315 2052632 - 83427|2189 2395
CAAAACGCAAGCGCTAGAGAAGATTTGCACCCCAAAACCGAGTAAATTAAA----TAACTAACAAAAAAATC-CATTAAAAAAGTAAAACTATGCCAAAA-CAAGCGAGGAGCGCGG---------AGAAGTGCAGTTCGAAAGAAAAGCCGAAAATAAGAGCGACGGACCAAGGATGTGTGTGTTTAATTTTACATTTGACTTGAC
CAAAACGCAAGCGCTAGAGCTGAGTTGCACCCAAAAGCCGAGTAAATTAAAAAATTAACAAACAAAAAAATCACAAAAAAATAGCAAAACTATGCAAAAACCAAGTGAGGAGCGTGGCAGCGTGAACGGAGCAGAGAGCGAAAGAAACAGAGCAAAT--GAGCGACAAATCAGCGAAAAGTGTGTTTAATTTTACATTTGACTTAGT
>SPoCk 22718329 22718593|23674 chr3L 22718521 22719916 scaffold_8 2052806 2054313 - 493|0 77
CAATTAAGAATGATTTAAT-TGTTATTGTGGGTTTTCAACCAGATTGCACAGCAGGGATTTTCATA----GATTTGAA
CAATTCCAATCGATTTCGTATGTATTTATTAGT-----AGCAAAATGTA-ATCTGGAAATTATGTGTTGTGTTTTGTG
>SPoCk 22719101 22720554|23674 chr3L 22718521 22719916 scaffold_8 2052806 2054313 - 493|646 1634
ATCCTACTCGTTCTTCCCCACAGAGAAGCAACCGGATT--ATAAACAAGTGACCACTTACTATAATCCGAGTATGTTCACCGGGAAAGTGCAT-TACCACTGGGTCACAGTCAACATACATAAAAATAAAACGGATGCGAGACAAAA-AAGGCATGAAATGGACAAAGCTAAGCGAGGCGTAG-TAACGTAAAACATGGC----TTTTTTTTGGTATTATTGATAAATAATTTATTCGGTATTTGAAAGCAAGCATTCAATTTGTGTAAAATTGAGGCAAATCAAAACTCTAGCGTGCTATCAA----------------------AATAAAACAATTTTTGACGAACTCATCCCAAATCAACTTTA--AAAGGAGAGTTCAGATCAACAA----AAGATTTTTGTATGTAATCAAAAATGCTATAATTTCAGCATACTTTGTGGGCGTTGATGTGATGCT-TTGATAATTAAGTTCATGATTAATGGGCTTACCAAAACGAAGTAATGCACGAAGCAAATGAGAAATAC---GAAGCAATCAGCACCGCGTTTAC---------TCGAATGTAAAGAAATTTTCGCTCATATACTTAAATAAAAA---ATAAATTCATAGGAAAGCATGGTTCTTTGTACTATTCTGTTGTTTGTTGTTTA-----------AATTGAACTTTGAT-----GCAATAGATTACTAAACGGCAAAAGAAATTTACAACTAAAGCTTATCCAGAT---TGTAGTCA-AAAGTATACA-TCTCAATAAA----AAATTAATGAATTTTGAAAA-------------------------AATAAACAAAT-TCTATAGATTACCAAT--ACTTGGGTACCCCTTA---TAAATTAA-------------------CTTA---------------------------------------------AATATCATTGACATAAAATTCATATCATACCAACTCAG
----GACTCACCCTCCT---------AACTATCTGATTCGATAACTAA---CCCAATTATTATTATC----TTTCTCCAACAGCAGCTTCAATCCAGCAATAATTCAAAGGCAGC-TGCATTCAATT--GACAAATTCCCGACAAAATGTAAAATGAAATGTGCAA---TAAGAGTAGCGGGGAGAACGCAAAGCGTAGCAAATGGTTTTTTAATAATTTTGTTAATTAATTTATTCGGTAATTCA------------GATTTGTGTACAAC---AACAAA-CAAAACTCTAGCGCGTTGACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAAAACAA--------AAACAAAAACGAGAACAATTTTCGTAACAAACAATTTTGATCCAGAAATTTAAGATTC---TGTTCAATAGACAATTCAAAATATTCAA-ATATTTATT----TCTAAAATTGCGCTCTCAATAAATATTTGTGTACTT--TGAGTTATCTGAAATAA---AATTCATTAACTAAATGGAATTTATATGAAATTAATAACCACAACAGTTAAAACATATTGTTAAATGTAATGCCTTAGTTGCGAATATATATATATATATATTTATATATTCATAAG-AAGCAAG-----TGGTATCA-CCAGCTATTTATTTATTAACAACACAGCGAGTCGCAATTAGGTTAACAGCAACAAAAAAGCAATAAGGAAAACAA---TACAAACGGTTTTTTTTCAAATATATGTACTTATAAAAAATAGGTTCTCATTAGAGTTGAAATTGCAGAATATCGTAGATTTCTTGTATCAGCAGCAAACTTGCAATAAACAAATATTTATTTATTGCTAAGAAATATGAGTAACACCTAAACTATATTGAAGGTGCCGTAACCAGACCTCTTAAATATTCAAAAATCAAAGTGTTTAATGTTCTTTAGAGCGTCAACCAATATCATTAACATGCGATTCATATCATCACAGCTCAG
>SPoCk 22719101 22720554|23675 chr3L 22720149 22721403 scaffold_8 2054314 2055522 - 2154|0 446
AACTGCCACGGCTTCATTTTCTAGAAATGATTTTATATTTTTAAGTTATA----------------AGTCTTG-----TCAATTCCCAATGATATATCCAAGTTTTT-----TTTTTTAATTTTGATATTTTTTTTTATAAA---TTTTATCGATAATTAAAAACAATTTTGAAATACTTCCCTGGCACTCCCACTAGTCGAGTAACGGGTATTTATAGTCGAGATATTGGACTTTAGCGTTTTCATTTTTTTATTTGAATGAGCTT-GTATTCAACATTTTTCACAAAATTTCAACTTGGTTATAGCAATTTATGCGCACCCTGCAGATCGCATTTAAAGGACCAATCGTTAAATACTT----CATTTGATCACACACATTAAGATC-AGCTTACGCTCAACA---AAAACGCACTCATATCATGGCAAAAAAA---AAAAAATGA
CAAAGTCACAGATTCATTGTCAATTTATG-TGTAGTATTTGAACGTTGCACAATGCACCGCACCGGAGCTTTGAAGCACCATTTCTTCTAGACATTTGAAATCTATTACCGATTAATTAGATTAGATGATGCATATCACACACATTTGTATGAAAAAGGCAAAA-------GGAAAGCTACTCAGCAATCGCCTTTGATCG-----CGCGCACTTCAAAC--ATCTATTGCACTCT----TTGGCATTTTGTCGATCAAGTCAGATTCTTAATTAACA------ACAAAAT----------TTGTATACTTTAATATGGACCAAGCA------------------------TAAATATTTAACACAATTGTTTACACACACAAACATCAAGCTTAACTCTGACACTGCACACACTCATATATCATGGCAAAGAAAATGAAAACAAAA
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TTCCTCTATATTACAAGACTCAA
TTTTTTTATATTACAAGATTCAA
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GCCGTGAAGTATGGCAACGCCGCAATGCCGACAATTGGTACTCTCGTTTGGCGCCAATACTAACG-ACAACAATGTAAAACACTAGAGCACTCTGGCGAGAGGGCACGTCAAGTGCAGAGAGAGTCCGAACCCGAGTCGGAAAGGGGCGGGGGAGCCAGGGCGGTCGGAGAGTGTGCACAAAAACATTTGCCGGCTGCTTAGTTTT--TTTGCCGGCGCAAAAAGTCGAATGCGAGCGAACGCTG--------------------AAAGCTTCCACTCTCCCTCCGCGATT
ACTATGAAGTTTGGCAACAGCGTCA-------AAT----------ATTTGGCGCCAATGTTAAAGCACAACAA------ATACAGTAACATGTTCACAAGGAG--------AGCG------GCGTTTGTGTGCGTGT---------GTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCAGAGTGCACACAAAAACATTTGCCGGCTGTTTAGTTTTTGTGTGCCGGCACAAAAA----AAGGCTAACGAAAACTGGCAACAAAGCACACAACACCAAAGCTCCCACTCTCGCTCTCCGGCT
>CG33169 22798001 22798337|23750 chr3L 22797811 22799823 scaffold_8 2152582 2154677 - 5806|252 615
TGTAGTCATAAAA-----------TGTAGTTTA--------TAGTCGTGGTCAGTGCAATTGAATCGTTGTAAAGACATATAGCCTTAATAGTACAATTAAATCACAGTTCGTCCATCCAAAAAGCATGTTTTACATAAAGTGGATTTTCCATGACACGAACAACACCCTGCTGTTCAAGTGCAGTTCCTGGGAAT--TTGAGATTTGGGGACAAAATGTATCCGAATTACGGTCGT-TGGTGGTAGTGTT--GAAAACCGTCTAGCGCTTTGGCGGTTGATTAAAAAAGGGCACTAGGAAACGGTAAAAACCGTAGCAGAGGCAC-TTCAATATGTAAATATGTGCATAT--GTATATTAGAG
AAGAAAGACCAAAAGGAAACTTGGCGTAGCTTAAGCTAGTGTAGGCATCAACGATGATATTATGTACTTGTGCTCGTGTTGAACATTAATCTTGTAATTG----------CGTCCTTGTCAAATGTGCAATTT----------GTTTTTAAAT-------ATTACACTATATTGTATAAACACACACCAGTTGAATAAATAAAAGCGACGAAAAAGAGCGGACTGGTTTAGTGTTGTACAACGCAAATATTCAGGCAGTCGTGAAGCTAATTGGCGGGTCGTTTGAA-----TATTTTCAA--GGAATACATTTTTGTATATGTGCGTGCATTGGGCTAACACACACATGCCGCGATACACACA
>CG33169 22798884 22799054|23750 chr3L 22797811 22799823 scaffold_8 2152582 2154677 - 5806|1294 1474
CGCGCCCCTGCACAGTGGTGAAATGTGTTGTCTAGGGGTTCAAAATCA--------AAACCAATTATTTGATTAAATATTAATGATTAATATAAATGACAAAATGTAATACATTTGAAAATACCTTCCCAATATCTAACTTCAACAAATAAAAAAATAGTATTAAAAGT--TTAAGCAAAA
AATGCCAACAACAATTTACGCAAATTA-----TATGCGGCAAACATCAGCTGTAGTAAAACAATTTCTAAATT--ATATAAATCGTTTGTATGTACATACATATGTCTTGCCTTTAGACTGTACTGTGCGTTGTTC--TTTTACTAAGTGAGGCGCTTCGATTTATCATCCTTGTTCTTAG
>CG33170 22799806 22799866|23750 chr3L 22797811 22799823 scaffold_8 2152582 2154677 - 5806|2241 2258
CAGCCTTGGTAGTTTCGT
CGTCATTTAGGGATTCAT
>CG33170 22800984 22801389|23751 chr3L 22801179 22803108 scaffold_8 2155076 2157121 - 58072|0 244
AATGCTAAATAAGATCATATTATCATTC-----TGTATCTTAATTATTTTACTATTTTCTTTAACAGATCGCCCGGCGAGAAACTAGTGGATGACATCAAAAAGGAGGCCAAGAAGATACTAGACGACTGA------------CTGGCGGAATAAGAC----CACAAT---TTTAGTT----------TAAACCAATTTATCTATGATCAAATAAAGAGAATCTATATGTGTAAAACTAGACAAA
AATTTAAAATAAACTGACAATATAAATAACAAATGCATTTCAACAACTCTTCACATTA--TTCACAGAACGCCCGTCGAACAAATTGTGCACGATATCAAAAAGGAGGCGAAAAAAGCTTTGGACGACTGAAGAACGTATTTACTTGCAGCTCGAGACGAAATACAATATATTTAGTTATTCTGTGTTTAAACAAATTTATCTATGATCCAATAAAGGAAAGTTTAAAGTTACAATCTAGATAAA
>CG11109 22807530 22807564|23755 chr3L 22805076 22807981 scaffold_8 2159559 2162591 - 47232|2700 2742
ATAAATTCAACTTCACTG---AAATTTTTTGTTTAT-----TG
TGAGCTGGAAATACATTGTTTAAGATAACCGTTAATACCTGTC
>Ssl1 22814629 22814808|23759 chr3L 22811947 22814690 scaffold_8 2167225 2170121 - 76681|2937 3020
--CTGACTTTCTA-------------TAGATAGATATTTCGAACTTCCACATAAC-------TACGCATTTGGGGCAAACAAAA
TCCTGGCCCTCTAGCATGCAGCTTCCTACATGGGAGCTTATTGCTTTCAGCTGACGGGTTTGGACGCAATTCATGCATACAAAA
>slif 22827090 22827670|23768 chr3L 22824637 22827090 scaffold_8 2190663 2193118 - 93150|2584 2584
G
G
>slif 22827090 22827670|23769 chr3L 22827191 22827733 scaffold_8 2193496 2194188 - 11050|0 625
TTAGCTAGCACGTTTATGTGAGAGAGATGAATAGATTGCGCATGGAAATTAAATGGATCTGCC-------ATGGGTCGGCTTT----------------------GTTGTTCCGGCC--CTGGGGATCTGTTATTTCTGTGCGC--------------CTCAGGACTT-CTAGAGGGAGCTCAGAGCAAACTC----TATTTTACCATTTTAATGTTTT-------------ATCCCCATTTCAACAATCCA------ATTTTAATCA----------------GCCCAAACGATTCCGC--------------CGCAATGCCCC--GTTTGTTGTGATATTTGTAAATATACCTATATATAGATTAATATTGGTCGCA------TATTTGTATGTTTGTCACAATTACTAT---CGTTATGTAAATGGAA-TTGTATCATATTATGTGTGTCATCGC-------------------CCCGCGTAGCCGCATTTAGTGTTTAAGCTCTTTAGCTGCTAAG--------CCTCCCGCCCACA--TTTGTTATTATTAGCCAAAAGAGAAACGAATTTTGTCCCTTC--TTGATTATTAAAAATGCAATAATGTTCAA----CATAAC
TTAGCTTGCATGTGTTTGTGAGAGAGATGAATAGATTGCGCATAAAAATTAAATGATTCTCCTTGGACGAATGGGCAGCTCCTGTTCCACGTAGAAAACTCGCGAGTTGTTGCGTTCGACGAGGGATTTGTTATTTTTATGCGCCAGAAATTTAGACACACACGACTTCCTAAAGGCCGCTTAATGCAGACTTTTAATATTATTTTCTTTTGATATTTTGTATTCGTATTCGATTTTTATTTTAGAGACTCATTTATGATTTTGATTATTTTTTTTTGTTTTTTTCGTGAACTTTGCTGCCTTTCATTTCTGTACATAATGCCCCCATATTGTTGTGATATTTGTAAATATATATGTATATAGATTTATAATGTTCGCATATATTTATATATATATTTGTCACAATTCTTGTTGCCGTTATGTAAATGCAATTTGTATCATAATATTAATATTGTCATAGATTTTTATGCAATTGTACAATCCTAAGCTAGTTCTGTATTTAAGTTATTTAGCTGATAAGTTAATGCCCCTACCGAACATGTTTTTATATTTGTTCACAGAAAGAGAAACGAATTTTTCCCCAAAAGTAATTTGTTAAATAAAACGAAATGTACAAAAATTAAAAT
>CG11131 22833939 22834109|23779 chr3L 22833167 22834157 scaffold_8 2206508 2207528 - 38446|778 994
GC--CTCCGATCCGAACCTGGGCACATTGAACCAAATTGATCCTGAAAGTACACTCA----AGAAGTAAAG--TCGAACGGGCCTCGTCCAATCGACTGACTTCTTCTT--TTGG-----------------CCCTTCCT-----AATACTTATTCACTCAGTTG--------------TCACAGCATATGGAATAATAAAATTTATTCACAAAAAA
GCTACTGAGACCCGAACTTAGGCATATTGAACCAAATTGATCCTGATAGTACACAGAGCGTAATAGCCAGGCATTGGAAAAGTTTC--CCATTTGGTTAGTTTCCACTTGCTTGGCTAACGCTCGACACGTTCCCTTTCTTCTTAAATACTTTTACCTTTAGTTTGTCATTTGTACTCCCCAAAGCATAATGAATAATAAAGTTTATTCACCAAAAA
>CG12768 22848087 22848140|23795 chr3L 22847709 22848237 scaffold_8 2217592 2218121 - 13533|396 457
GAAAAGCGGGGACCGATGTCGCCTCTAAAATTATTGAATTTAG--------AGTTGCGTAAG
GGAGTGGAGAGTACAGT-TCGCCACGTGAATCGAGGAATCTAATCCGTTCTAGCTGTGTGAG
>CG12768 22857203 22857373|23808 chr3L 22856810 22857403 scaffold_8 2229116 2229693 - 3953|421 617
CTCCCATCACC--AAGGCGACA--TCGTGTTAGATAGCATACTAAGGTGCACA------AATCAAGTCTGTTCAATTTGCCATTTAAGCATCTCTCT-----------AAGGCGTATGATA--GTCTATGGATAAGTCTTTAAATCAAACAAGTTACAAAAATGCGACCAATAAAATT---GTATCATTCCGAACTC
TTGCGTTAAACTGAAGCAAACAGCTTGTGTGCGTTTGTGGGCGTGGCTAAACGTTATGTAATCCCGTTACAGCGTTTAGCAATAAATGAGTCTGTATATGTGCCATAGAAGACATCTGATAATGTGTATTAATAAATTTATGACT----TTAGTTCTAAAAG------AAATACAATTGACGTGCGTTTTCCGTTTC
>Mes2 22880141 22881492|23842 chr3L 22880078 22880431 scaffold_8 2261447 2261794 - 21505|63 353
AGCTCATCCAAATGGTGCACGACAATCCAATTCTCTGGGACTCCCGTCTCCCGAATTTCAAGGGCGCCGAAGAAGAAAAGAACCGAGCCTGGGAGCACATAGGCCGCGAGTTCAACGCTCCCGGGCGTCGCGTTGCACGGGCCTTCAAGTCCTTGAGGGAATCCTACCGCCGTGAACTCGCCCACGTCAAGCTAATGGGCAATGGCTTCAAGCCCAAGTGGAGTCTCTATGAGGCCATGGATTTCCTGCGCGATGTCATCAGAGAACGAAAGTAAGTATAAGGAATAGTAT
AGCTCATCCAGATGGTGCACGATAATCCCATTTTGTGGGACTCCCGTCTGCCCAACTTCAAGGGCGCCGAGGAGGAGAAGAATCGCGCCTGGGAGCACATCGGCCGGGAATTCAATGCGCCCGGACGTCGCGTGGCCCGCGCCTTCAAATCGCTGCGCGAATCTTATCGCCGCGAGTTGGCCCATGTCAAATTGATGGGCAATGGATTTAAGCCAAAATGGAGCCTGTACGAGGCCATGGATTTCTTAAGGGATGTCATCAGGGAAAGAAAGTGAGTAC--GGAACAATAT
>Mes2 22880141 22881492|23843 chr3L 22880432 22880774 scaffold_273 559 871 - -628|0 353
TTTAGTGAACTGGTGACCAGGTGATTCTCTTAAATTTAAAACCGTCAAGGAAGTTTCATGCCAATATCGACTCCTGGGGTTGACCAGTAATATAGAGCCCGTTATGAATTT-TGCATTCTCTGCTTGACCCATTATTGCCACAC-CACAAATCATGTCAC-------TAAAAATGATCTTCATCCAAATGGCTTTACAAAAGCAAAAGCAATAATAGAACACGAGAGAAGAGCGCTTAAATT--TAAAATTTGACAGAAATACGAGTCATTCTTATAATCGAATAGTAAAGTACATGAAATTCTATATCAACGAATAATTATTACAGAACGTATTGCACTTATTTCCAAGTTTT
ATACATTGTATGGT-------TAGTGCTATTAG--TGAAAAATATCAACGGCTTTCAAGACCAAT--------------TTGACAAGTCATATAAATGCATCAATAAAGGCATACGTATAAAGGTAGAAACACTAATATACCATATACAAATATTGATAAAACAATATAACAATATAGTACATGCAGTAGATTCCATTAAAGAAAAACTAACACAAGAACATGCCAAACAATGCCTTAAATTCATACAATCTT---TAAATACAAG-----------ATTGAAAAACATTG-GCATTAGACAGAATATCATTAA--AAATATTCCAGAACAT-CTATTTTTACCAGCAAGGTTT
>Mes2 22885232 22886087|23848 chr3L 22884329 22886070 scaffold_8 2267116 2269067 - 36443|1046 2047
ACAGCGGAGGAGA---------------AGAGCGCTAAGTGTACGGGTGTAATTATA-----------GTAGCCAAAAAAA-------AGTACATAATGGAATGATGTTGCTGCTCAGAGCACTTATAACTGAATTTTCTTGCCA--------------------------------------TTATATATTACTTTCCTAAAGAAATACAAATTTACTTGCCAATGCCAAATCTGTGCCATACC------AAAAGGATCAAT------------CAAATATGAATGATTTTCTAAAACATTCTCTAATTTTTTCGCTC--------------------CTATTAACAAAAATGAACCA-----------AACTCAACGAAAAGACAACACAAAGACGTAAACCAAGAAA--TAGCAAAATAAGAAACATAGATTAATTAAGCTTTAAATGTTAATTTCGTTTTAAGTCGATCAACTGTAGTTCATACTCATGCCAACGTCTCATCACATGAAACAATTCTTTATATAACCTTTTATTTTACCCAGATTATATCGCCTATATATAATATAACTTCTTGTTAAGTTGA--AAACGTAGAAATTAGAAAAGAAAAGTTTTTAACTT-----------AAAAAAGCGAGCATATTACTCATAGTTTCATATACAGCGATATGAATATTAACAATATCT-GAACAC--------TAAATGAGAACAGCTTTAACAATTTGTCGTTTT------TGAATAA---AACACCATCTTTGGCAGTAATGCTTTGCTAT-CGATGTACGCAGACAATGTTTTGGCCATTCAGCCCAATTTAAATCAAAAATTTTGAAAAAGTTTTCCGTTTTTCGGT-------GGATATTGAGTAATAAAGTACCTTTAAATATAAAAAAATCAAACGTGTCTACCGAACATGAACATAATCAGCCGATTTTTATTAATTTAAATCCGAAATTATTTATAG--TCAGGAATAAATATTTT
GCGCTGGGTGGGGTCTCCGGGTTTGGGTTGGGTTCCGGGTTTCTGGGT-TAACTCTAGTTTTTAAGTCGTAGCAGAGAAAAGAAGTAGAGCTCATTATGGATTAATGCAGCTGCTCAAAGCA-----AAATG--TTTTCTTGCCAATAATTTACCACACATATTCAATTGTTTATCTCTCTCTTTCTCTCTCAATTTGCCATAAAACGAACAATTT-----TCAATGCCAAATTTGTGCCATGCCAAAAAAAAAAGGAACAATACGTAGTTATACCAAATGTAGCAGCCCCTATGGAAAACTTCTTTAAAGCTATGCCCAAAAAAAAAAAGCAAAAACACAAAGAAAAAAAAAAAACAAATACAAATATGAACTCTATGAAAAG---ACACAACAACAAAGACAAAGAAAGTTAGAAATGTATGAGATTTAGTTTA------TTATAAACGTTAATTTAGTTCTAAGTCGA----------TGCATACATACACAAATGTATC------TAAACAAAGTGTTC---CAGTTTTTCGCTGCAGCCTGAATCTATC------------TTTGAATCTTTTTGCCTTTGAATATACACATATATGGAAAAAGAACATGTCTTAAATTCATATTTTTTGAAATAATTATTTATTTTCCTAATGCTGCCAAATTTAAAGAATT---TACTAACTAATTCTGGAACATGTCTTATATAGATATTTAAAGCTTATCTTAGCCAACGTCTCATCACACGAACAACTGAAACTCGTAATTTACGTTAATTTCTTTATATATTTTTTTTTTAAATAGTTCTTAATTCA---AGTTCATTTCGAACCGAAAACATTTGAAATCTTGCCAATGCGTAGAGAATTGCAGCATTGTGATCTTTTAAGTTCTTTTAAGTTCTAAAGTGGCAAATACATATTAAATATATTAGCAT----------TTTATATAAATATATTATTAAATCTATTTATAGTTTCTTCAACAAATATTTT
>Mes2 22885232 22886087|23849 chr3L 22886071 22886297 scaffold_49 52727 52947 + 2195|0 16
ATATCGATACCAAATCA
ATATCT-TGCAAAA--A
>CkIIalpha 23037104 23037303|23969 chr3L 23035914 23037409 scaffold_49 338298 339759 + 66893|1199 1413
GAAGTTTTTTCATTTTGATGAATACTGTAATTCG---------AGTTTGGGATAG-----AAGCCATTTAACAATATGATAATTATGCAAAAAAAAAATATAAAATCCGAAGAAAAATAAAATAACTTAAGCTACTGTCTTAAAAATGACTTCAACTGTTCGTTAAGGGATTAAACAGAGAAATCGAATAAATTCCTCACA-GTATAACATCTAA
GACATGGATTTACAATGTAGAGTATATAAACTTGTATCGGAACAGCACGGGGAAGTTACAAAGACCTCTAGAAGCACGTTGA------ACGGAGAAAGCATTAAATGCTAATGCTGAAAAGATTAATTAAG-------------AACAAATTCAATAGAATGCATCGGCTCGCAATCCAGAACCATAACACCTTTTTCATACATAGAACA-----
>CG33217 23066026 23066052|23978 chr3L 23065184 23066034 scaffold_44 979636 980373 + 1207|868 876
AAATAAAAA
AAAAAAAAA
>nAcRalpha-80B 23212129 23212303|24090 chr3L 23211844 23212343 scaffold_54 8909 9425 - 11727|324 498
TTCAGACGAAATAGCCGCCGTCCCCGATATGGATATCGGACCCTTAGGGATGAAAAGTCCCATTTTAAATAATCCAGCATTTTCCCACTCTAAATGCCTTCCTAAAATTCACAAAAGCTGTTTTTGTGTGCGCTTTATTGCAGAGCATACAAAAATGCAAGAGGACTCAACTAAA
TTCAGACGACTTAACAGCTGTTCCTGATCTAGATTCTGGAAATTCAGGAATGAAGAGCCCAATATTAAAAAACCCCGCCTTTTCTCATTCAAAATGCCCACCTCGAGTTCATCGGAGCTGCTTTTGTGTAAGATTTATTGCAGAGCATACCAAAATGCAGGAGGATTCTACAAAA
>nAcRalpha-80B 23217574 23218383|24094 chr3L 23217506 23218139 scaffold_54 9426 10085 - 11287|68 692
GTTAAAGAGGATTGGAAATACGTTGCTATGGTATTGGATAGACTTTTTTTGTGGATATTCACGTTGGCAGTTGTGGTTGGGACCGCCGGAATAATTTTACAAGCTCCTACGTTATATGACGACCGCATCCCGATTATTGAGCAAAAGGATTTGGACTTTTCAGGAACATCAGCCGGTCGCTGTAGACCTCCACAATAACATTATTATATTAAAAGAATTT----AATTTTAAACTGAGGTGTATCAGATTATTATTA-----CAAAATGAACTTTAACTAA-TATTTTCTGCAGGAAAAAATGTTAAAAATTACATATGTGTGTATTGAAGGCTTTAAGTAAC---------------AAATTACCTATTTTTTA------TTTTTGACCACATTTAGATATTCCAAAGTAAT-TTGGTATTCTTAGGCACTTCAAACCACGACATTTTTTTTATTTATCCTTGTCAAC-------GAACTTAAA---GAATAAAATTTTA----ACATTTTAATCTTAAACCAGAAATGCAGAAATGTTGATTACGATCTTACATATTCGAAAGAGCACACAAAACAACAAATCCATAAAGT-------------GTTCAGCTTTTCAAATATA
GTTAAAGAAGATTGGAAATATGTCGCAATGGTGCTGGATAGACTCTTTTTATGGATCTTTACATTAGCTGTTTTGGCGGGTACAGCTGGAATAATTTTACAAGCGCCAACTTTGTACGATGATCGGATTCCCATAATCGAACAGAAAGATTTGGAGTTTGCTGGAACTTCAGCCGGACGCTGTAGACCAGCGCAATAGCGTTTTTATACTAATATAACCTATAAAATGTTGACCTGACCATATTTAAATTATTAACATGGTTTATTACGATTTTTGTATAAGTATCATCAGTATG-AAATATATTTAATATTTTTCTTTTGGTCGGTAATAGCTTAAATTAATTCAAACCATAAGAGAAAACTATACAAATATAAAAGAACTTTCTGA-CATGGCTAGATTTACTAGGCTGTTATTGTCAATATTAAAAACTT-----------ACTCCTTTTAAGTATCGATTGCATCCCGCCAGAAACTTAAATATGAGTACAACTTAATTGTACAGTTTAAAGCCGTTTGTTTCATGCAGAGAATATGATGAATAAGTCA---ATGTTAAAATATAAGCCGAAAAATATATACACAAAATTGTTTACAGCTAGTTTCAGCTCTTTCAACGTA
>nAcRalpha-80B 23217574 23218383|24095 chr3L 23218140 23218420 scaffold_772 5443 5724 + -1093|0 264
CATTTACAAGAAAAAC----------GGTTTAGTGTGAAAATAGCTTCGAAGAAGTGCAATCATCCGTTACTCGTAGAAAAAAAGGGTACACTAGATTCGATGAAGGAAAAGGCTTAATCGCATAAGGAGTATTAATTCGATGCAATGTCCGTCG-GTTAGT----------CTGTATAAATGTCAAGATGTCTCAGCTTAAGTTTGTTTAAGATTGTTGCCATGCCCGCATTAACGAATAAAACCCGCTCAAAACTGTCACCCA
TATTAAGAATAACAACCCCAAATATGGGTTTGGTA-------GACGTTAAGACTGTTGACTCGACGGCTAA-CGTAATAAATAAAGTT------GAGGTCAGCAACACAGATGTAAAATTG-ATAACAATTTTTG--TCGTTATGATATTTGTCATATTAGTAGGACATCTATTGTACAAAT-TATATACGTATCATAATAAATGCATAAAAAAGAGATACCAGAGTCACACAAATGACCTGGATAAAATCTAAATTTTTTCTTG
>CG32230 23275361 23275447|24117 chr3L 23275227 23275473 scaffold_33 162556 162774 + 5810|138 224
ATTACGTTTCCCTAGCAGCTGCAATTTAAAAATGTAAAATGAAATAACTTCAAATTATAAATAAACATAGTGGATTTGAAAGCGTAT
----------------------GATTTTCAGATGGAAATTGTATTAAATTAATTGTCAAAATAAATGCA-------TTAATGTGC--
>CG13405 58001 58168|74 chr3L 57963 58742 scaffold_9 2149806 2150707 + 7000|38 273
TTTCCTAG-CGGAGTTTCCGAAAATTGA------------------CGGGGAA-----------------AAGTTATGAAAATACTTGAATAATTGTGGAATATCT----------------TCATATTTTACATATATACATATCTA---CACATATCAACGACACTGCACT--------CAATAAAATGGGAAAGGATGGAG-----GGAATGTGAATAAAAAATGCAAGAAAA
TTTTTGAGTCGGAGTTATCGACACTTCAGATTCTGAAGTCGGGTATCGAAGAAAATGTCGTCCCATTGCCAAGTGTTTGAAATACCCAAATTCTTGTACCATGTATTTTCAATTCGTTGGAGTCTTTTTCTAAATACACAAATATTTATTTTACATATCGGTTTCTCTATATTACAAGACATAATGTAATAGCTAATGAAAGAGTTCCTACAACCTTGAACTAAAATGTCAGAAAT
>CG12483 81151 81454|121 chr3L 80807 81899 scaffold_9 2212829 2213875 + 782|459 765
GGACGTCTCTTATGTCAGACATTTCATAAACTTGTTTTTCTATTTGTTCTTACACTTACACTTGTGCATTGGAAATACCT---CCTAGAAGAAGAAAGCCGACAGTACAGAGCTTTAATTAATTACCGCTGCTTTGTTAAAAAATGTCAAAATTTGTTTATCGCACACTCCGCACACTTGTCGGCGCCAGATTTTTTTCCGGGAGCTCAGTGTCATAATTGATTCGAAATAGCGGTGCTCCGCAACGTAATGGGTCACACGCACTCGACACTCACTTTAAATAAATGCGAAACAAATCAAATACAAA
TGGCGGTGCTGGCGGTGGA------------------------------------GCACA---GGGTGCCGGAGGTCGCTAAATGTAGCACGGCAAGGGCGGCAGTGGCGGCATTT---------CCGTTTC---------AAATATCA---TTTGCTAAAGTCACA------------------GGTAAACATTGCACTTGCGCACCTGTGTCGTACGGGGCGACACGTAGCAGCGAGCCG--------------GCACAAATTCGGCA-GCACTTCAATGGAAAAACGACAACATCAAATACG--
>CG7047 159840 160221|205 chr3L 160111 161369 scaffold_62 102560 103801 - 49766|0 112
CCCGCAGCTTTTAGGATTGCTGTG-TATCACAACTTGTTAAGACCG-ATTTGCGCCATACAACAATTTAAACTTATTTAACTTATACTTAACGTTTTTTAATGTTTCTGGTCT
CCTCCATGATTGTCACTCGACATGATACAAAAAATTGTTGTATTAATATTTACGCCATACATTAACTAATACTTATTTAAC-TATTTATAAC---TTGTAACGCTTCAAGTAT
>CG7042 166054 166185|209 chr3L 166097 169630 scaffold_9 2367431 2370925 + 106873|0 88
TAGTTTATGATACTGCATATGATAAGTAATTATGAATGTTGTTCTGTTTTTTGTTTGTGGGTTTTAGTTACTAATCCACATTTGTTGTA
TAGTTGGTAATACTAAATA--GTTGATAATGCTGTAAGTTG---TAAGCAATATTTG-----TTTAATTAATAACTTATTTGTGTTGTA
>Gyk 185626 185745|220 chr3L 184635 185841 scaffold_9 565066 566477 - 41480|1060 1245
TC------ACAGCTAATGTCTGGTAACGTTCATGTTCTTCTAT--------TCGTAAATCAATTGCTTG-GTTTTTCGTATTCGAAATTTCCA----------------------------------------------TTTATTACATATA---CATATAAAAATGTTAATTAAAAACGTA--AA
ATTTCCGGACAACTCCATGCTGGTAAGTTACGTGTGCTCGCATAGCAGATACCCTACATTTATTACTTTTGCGTTTCACATTCCTAACTTTTAAACAACCCGAAGCTATTTCCTTGGTAGGGTATATTTAGGTTTGTGTTTTATTTTTGATAGTGTATACAAAATTTTGGATTTAAAACGTACAAA
>CG7028 191416 191645|225 chr3L 191090 194284 scaffold_9 573504 577155 - 99637|355 707
ATC-------------------------------------GACCGA-------------CGAAGTTAATGAAA---CGTAATTTAATTTCGCAT---------------AGTTCTAAGACAACAATTCCCT---------AACTCAGCCGTTAGCTACTAGTTATCGTTTGTTATTTTAGATACATCTGCTCAAC-------CAAAAATCA---CTAGATCATTACATCTACACAAGC------------GATCTAAATATGTTCTGTGGTTTTAAGCTCTATGGCGTTTTGAGAA----CCGAATTA-----------------TACAAAATATTGG---TATTCAATTAAT
ATCCGAGAGAGAGAGAATAAACGTAATTCAATAATTTCTAGACTAAGCAATTACGTTAGCGATGTTAGTTAAAGCGAGTTATTCGAGTTATTATTATTATCATTACCGAACTTCAAAGACGACCACTCACCCCCAGACAACACACATCTATTAAATAGAATACAGCTTCTATCTTTCTACATACAATATATAAATATATATATATAAATAAAATATATATATTTATATATATGCAAATACTTTATAAGCAAATGTACATAAGTTTTGTGGTTTTTTGTTGTAC-GCGCTTTGTGAAACGGTCGAATTGTTATGTGTGTGCGTGCTTACGACTTTTTCGATAGATCTAAGTAAT
>thoc7 195168 195229|227 chr3L 195166 195921 scaffold_9 580512 581279 - 30709|2 67
GTTAGAAGCGC----TAGCATGTACAATAAAAACAAAAAAATAAAATGTCATGAACTATAATATAC
AGTTGGAGTACAAATTAGC-TTTACAACAATAAAAAAAAATCAATTTAT------TTACAGTAAAC
>CG17142 201479 201692|238 chr3L 201317 201520 scaffold_18 1533943 1534122 - -99|170 211
TTATATTCGCTGATGTCATCGATCAGACGATGAATAGAGTAT
TTGCATCCG--GAGCTCATATCTTATAGTATCATTAAATTAC
>CG17142 201479 201692|239 chr3L 201657 202115 scaffold_6 1128702 1129140 + 7951|0 35
CCTCAATAAATAGGTAATAGATGATGGAGACTTTAG
CCTCACTTGAAACGCACCAAACAGCAAAACGTTTAG
>CG17142 201793 202200|239 chr3L 201657 202115 scaffold_6 1128702 1129140 + 7951|141 471
GTGAGCCATTTGTCATTGCTCTGGTTCCAGACGAGGGTGTCATTATTGGGCAGCGGATCGCCTGGCGCAATGAGGGTCCAGCTCTGCGTCATCGGACTATATGCAAAGTTTTTGGAATTTGGCGGCGGAGGAGGAGCTGTTTGCGTTACGACCGACGGCTGGGTGATGGGCACGATATTGGGGTTGGCGAAGCCAGAATCAACTCTCTTGTCGTTG--CTGATGTATTCCACCTGAGACTTAGGATGCGACCCTT------CCCATGGTGCACCCAACAACAAGACGGGAAAGATCAACACCACAAGAGCTGCTAGTGGGATGAACGCAAG
GTTAGCCATTTATCATTGCTTTGATTCCAGACCAATGTATCTTCATCCGGCTGTGGATCGTGCGCATCAATCTTTGTCCAGGTTTGACTTTTAGGATTGTATGCAAAATTCTTGGAATTGCCTGGCGGCGGTGGCGGTGTTTGATTGAGCAAAGGAGGCCGCGTTATTGGCACAATGTTCGGCTTG-----------------TCTCCTGGCTGCGCACTTATATATTCCACCTGCGACTTGGGATTGGAGTAGTCAATGGCCAGCGCTTGGCCCAACAGCAA------------CAACAACACTGTAGATACTCATATG-TAAAAAAAAA
>CG17142 201793 202200|240 chr3L 202116 202186 scaffold_6 1129807 1129884 + 561|0 77
TAGTTATATTTATTTCA-ATAGTA----ATACACAATGATTA-AAGCAAAGCCATCGATGGTTGCATTGCTTA-GCGA
TAGCTGTATTTATCGTATAAAGTATAATATATGCAATAGCTGCAAACATAATCATATATGCTCAATTAGACTATGCAA
>E(bx) 217633 217830|256 chr3L 217312 218212 scaffold_62 233629 234647 + 17547|439 650
GAAATAATAGCCCTTGAAAACTTTAGAACAAATGATTATAGTTTATAAAGACACTTCTAACAA------TTTGAAAAACGTCCTTCAGTTATGTATTCTTATTTTGAATCAAATGTTATATAAAC-ATATATTATCAATAAAAACACATATAATTAATTATAATAAATT-------ATGTACATATTGACCATATTTAGTAACGTACACCAG
GAAACATTGATTGTTGGTACAATTGGAAAAA---GTTACACTGGATTAAGCTGGGTTTAACAAAATCATTATTAAAAAC-----------AAAAATTATGATTTTCA--CATAGGTAAAATAAACTAAATTCTTTCACTACAACAAAACATACATACGTAGAGTGTATCCGCTCTGATATACATATT-ACTGTGTATATACATATATATAAG
>E(bx) 221848 222571|259 chr3L 221727 228701 scaffold_62 238395 245627 + 257953|128 1106
TTATAATTATAATGTAAAAGT--ATAAATGAGGAA----TAGGAAC----AGGACTGTGAGGGTTGCATTTGCTGATT-----CTCGACCGAAA---TGCCAATTTGTTTTTTGTT--------CCATCCTACGTTTAAGTTAAGTTTTTTATTTATTCAACCCGAGCGGCATGTCGCTG--------------CTTCACTTGCACTTTCTATACGTTTCGTTTGGTACACCTAATTTGTTTGTT------TGTTGTATT----------TTAATGAACATG--AATTGAATAC-ATTGCGTTTCCTA--ATTTG----------------TATACATTCCTAAGCTGTAAACAATAACTT-------ATAGTTTCCAA-----GTACAGCAACAGA------------CTTATTGAAATATGAAC----CAAGGCTTACTATTGCAAAATAATTATTCAACAAGCAATTCTCC-------------------------ACACAG------------------------------------------GAGCTCGATATTTAAAAATACATGATACCGAATAATTA-------------------CTTAAATATGTCATATTTATTTTGTTTACATAATTTAAAAAATATAAA---AATGTATT--TAGCCTAAAAGT-------------------GTGAATACCTTATTAAATAT-AAGTAAATATTACATAGTGAGTAGGAAGCACATTA----------------AGCTTATTAACTT--------AACAATAATCCAGACTGTCACCTAATGTTAAAAACCAAGGCAAAAGTATTAGA-ACAACTTTGC-TCCGATTAG-CTTTTCTTGCCTGAGGGACATTTGGTTTC-------TTAGTAATACATCGAATATTTGTAAAT--TGTAAAGCGCATTTTGCAATAAAACCTATTATGCAAC---TACACTAATT
ATGCAA--ATCATATAAAGGCGAGAGAGCGCGGAACTTTTAAGCACTTTATAGACAGTAGGCAGCGTTTGTACCGATCGACAACACAATCGAAAAATTTCCGAGACACATGTTGTTTTAATTAATTATGTAAAATGTAATTTAAGTTAACATTTACCACAGAACATAACGCATCTTGCTATGATTTGAAGTAATTTTCATTTATTTATTAGAAAAGTTTTGTTTAATAACTATCAATTATTTGTTAAACTCTTTTGTATGGAATACTCCACAAGTGAAAAAGCAAATTGCATATGATTATGTCTCATACGCTTTGCGCCTTGTGCGTACTATGCACATTCCTTAATGGCATGTAAAAGTGTGATTCGAGCGATTTCCAATACACGTCCAGCAAGATAGAAATAATTTGTTTGGTTAAAAATTGCACAACAAAAGGCTTTATTTTGCAATATAATTATTTGTCAACTAATTCTACAACGTACACACGCAAACGCACATATACACAGACAGACTCATTAAAAATTAGATGCAGTTGGTGAATATTCTATAAAGTGCATTTTTGAAAAT---TGATTATGATTAATTAAACGTATTTATTTAATTCCTTTCATTAAGTTAT-TTTATTATATTTATACAATT--AGCGATGTAAATTTAATGTAATGCCAGTTTAAAACTTATCGATAATATTAAGAAAACAAAAACATGATAGAAGATAAAACATATATTATTGGTTGAGCACATAGCATTTCAAATGAGTTTTACCTATAACGTATTTAATTTTTTAGCGAGCAATTAAACAGACTGTGACGTAATTTTAGCGACCAGGGCAAAAGTATTAGACAAGACGCTGCATGCGTATAGAATTTTCTTGCCT-AGTTTCATTTGGTTTTAACTCTATCTCTATTGTCTATGTTACTTGTAATGTATGTAAAGCGCTTTTTGCAATAAAAATATGTATGAAATATACAAAATAACG
>DIP2 233761 234041|266 chr3L 233048 238214 scaffold_62 250818 256091 + 216553|800 1088
ATACACAATTATTCTTATGATGAAATCGCCGTATTAAGAAACGTTACAAAACGTTGTCTTCGTATCATAATTCAAAACAAC-CGCAATCCA----CAAAAAAACAGAAATGGCTCATTTTGGTAACACGCACGCCTAATTACACATTTCCTTTTAGAGTATTAGCAAAGATGGTAAAACATTCTTACAATAAAATGACTATTTATCTTTATATGACCATATAAGTGACAGCAAACATTTAATATTTAATAGTATTTATATAAGT---TTAAATAAACCACAATTTACAC
ATA----------------------------------------------------------GTATTATAGTCCTAAATGATGCGCAATTCAAATTCATAAGTATGAAAAACAATTATTTATTCATCA------CCATATAATGAATTTTCCTT----GTAATTGCGAAAA--GAAAAA-------ACAAAAAAA----CATTTAGATTTGCATGA----------------------TTTAAACTTAGTGACATCAACAAAAATAACTGAACTAAATTGCTTTTTCCTT
>Tudor-SN 242818 243034|269 chr3L 241764 246389 scaffold_62 260635 265424 + 188151|1202 1439
AAGATGCCCGGAAACG---TGGAGTAGGCCTGTGGCGTG----GAGCGCGTTGCTAGCCGAAAAGATTGTCTGCCACATACCCGCCCTTTATATA-CATAACAACAAGCAAGAACTTAAAGAATATGAAATTACTAATTCTATCTATACACCAATATATATG---ATACATATACCACATTGGAAATACACAAATACATACATATGAGCA----------ATGGCATGGAAGAACACG
AATACGGCTCAAAGCGTGCTGCAGTAGGCAGGCGGCGTGTGGAGCGCGCGCTGCTGGCTGAAATGTTTGTCTGCCACATACCCGCCCTTTATACATTACAACAACAAGCAACAACTTAATGAATATGAAATTACTAATTCTATAAACACACCAATTTATATACATATAAAAATATATGATGCGTATAACCAGATTAGATACATTTGAGAAACAAAACAATATGGAATGGAGGAAAGGT
>fwd 289739 289890|299 chr3L 288752 294343 scaffold_41 878436 884159 + 177207|1138 1303
GAACGGTTTTTTATGAAGATCTAAA---------TGGGTAATCATAATA-GCGCATAGAAATTGCCAAGCTGGT-AACCAACATAATGGACTGACTCTTTTGTAAAGGAATTATTGTATAT---TATATAATATGTTATTATCACCGAAAAAAAAAACAAAAAGAA
GAACGGTTTTTTATGAAAATCTAAGCGAACGGATTGATTAATCATCTTGTGTGC---TAAAATGCCGATCTGATAAACCAAAA---------GAGTATGTTTAAAGAAAAATTTTATATATATGTATATAAAACG-------------AAATCAAAACAATAA---
>CG32344 305447 305460|305 chr3L 305460 308779 scaffold_41 908193 911582 + 119385|0 0
G
G
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TTAAGTAAACTATGAGCTCGAGATAGACAGCTTAATTAAGTATTTTATAGATAATCCTTTTCAAGGCTTTTCTGTTTA-TACCCCGGCAGAGGGCATTAGAATAATAAATATTATT----TCTATATTATATATATAAAACTAATATTTTTAACTAAT--------------AGATATTTTCCTGAAAAATTACAATTTC---------CCCTTACAATATGTAGTTTTTCTTTT----------------------
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CAGGAACTGAGATTATTGCTCATCTGTGAACTCTGGTATTCAT-ATTCATTATG
CTGGACGCTGGATTCATGATTCACGG------CTCGTATTCATGATTCATCAGG
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CAAAATACAACACTTATTTTCGTATTCGAATTTGATTTGAACTATTTTAAATTCCATTTGTTTTT
CAAAATCCATAACTTAAGTTCGTATGCGGCTTCGCTTTGCCGTTCCGTCTTTTTCGTGTGTTTTT
>CG6905 341370 342028|329 chr3L 341533 344563 scaffold_9 1969112 1972149 + 169661|0 514
ACCTTCTTTTGGAACCCAAGTCCGTTCTTATTTAATTACAGTAATTACATGCCAG--CAAACAGCTATCACCACCTAATATCCCGATCCATATTCCTCGCTAGCGGCCGTACTTCTGGTAGACCCACTCCTTGTTGTCCAGCGGACAGACCAGGCGCGTTTTCAACCAGCGCGCGATGCAGTGGTAATGGAATGCGTGGTTGCACTCGCCCCAAGCCACAGTGCACTCGTCTTGGTTTGCATTCGGGTCCGCCTGGCACTCGATGCACAGGTTCATGATGTGGTTACGGCAGATGGCACAGTTGTCCACTGCTACGTCCCATCCCCACATGGCGTGCGCAACCCATTTCTTCACCACAAAGCGCTCCGTCCTGGCCTGGACAGCTCCTCCACTACAGGATGGCTCTTCGTCATTGAA---GTCCATGTCGTGGAAGTCCTCCGTCTCCTCAACCTCTATCTCCTCGGCCATGG-------TGTG----AAATTACGAATTTTTTTTCTT---TTT
GC--------GCAGGCCTAGGC---------TTAATCACTAGAATTTTAATTTTGTCCAAACATGCATAAATACA-AATACGTTAATTAATCAGC----CTAGTGGCCATATTTTTGGTAGACCCACTCCTTGTTGTCCAGCGGGCAGACGTGGCGCGTCTTTAGCCAGCGCGCAATGCAATGGTAGTGGAAGGCGTGATTGCATTCGCCCCAGGCCACGGTGCACTCATCCTTGTTGGCATTCGGATCCGCCTGGCATTCGATGCACAGGTTCATAATGTGATTCCGGCAAATGGCGCAATTATCCACGGCCACATCCCATGACCAATGCGCATGCGCCACCCACTTTTTGACCACGAAACGTTCCGCTTTCTTTTGGCCG---CCGCTGCCAGACGCTACATTGTCCTCGTTGAACTCCTCCAGGTCATGGAAATCCTCGGTTTCCTCCACCTCAAGCTCCTCGGTTATGGATCCATTTTTGGCACAAGTTTCCATTTTTTTTTTTTGTGTTT
>trh 350055 351113|333 chr3L 350053 350758 scaffold_9 3178802 3179658 - 8281|2 873
AGACTTAGGCCAAACTAAAGCGTTAAAGGAAACATTCAATGTTGTTAAATAATTCTTAAGTATGTAAATTATGAAACACACTCTGAGACCCAATGAAATTATAGGAAAAATACTCAAGACGCAATGAATTAAAACGAAAAGTAACA--------AATTGTAAGGCTAATCTTAATTAAAGTTAATGATAAAGTA----AGACTTGCATAGAGTGCCAAGGAATAGGAAACCGAACAAATGCGCT----------------AAATAGAGAGCGAAT---------CAAAACGGAAACACGGCT--------TAATCTAAACCCCCGCCCAACC---------------------------------AATTGTTATTAATTATTTAAATCAATTGTAA--TTTTACCAAC------------ACATAAAAACGCATATATATAA-----------GATAAGCTCAATATGATATGTAAACATTAATATATATTTAAACATTTTTACAACATATCAAATGCTTCCTCCTTTAGGCTTAGGATTAC---------------CTTTA-----AACGACACTCGCTCTAGGATATTGATTACGATTCGATTCCCGGAAAATCGACTCGATTATTA------------------------------------CCTCTAAGAGTTCAGCTAACGTTTGTCTAT-TTCCGTTTCCTCCCTATTGTATATTTAATGAAACCTTCTAATAA---AATCTAGTTA---AAAATACATCAACAACAAAATGCCAAGGCAAGAAAAGCTAAAAAGTGTAA-TTAAATTTTGTATAAACGCAAAGAAA-GTTTCTCCCATTAAAGGCTTAAAATATTAAAAATGGTA
ATATTTGGCTCAAATGCGAATGTTAAA----ACATTAAATGTTGTTAAATATTATGTAAGCTTGTAAATTATAAAATAATATTAACAAAACAAAAAAAAACAACAAATAACTCACACGACAAAACCCATTGAAATTCAATTTAAAATACTCGGCAAATATGCAATTATCGAAAATTAAAATTAAATTTAAATTAGAGAAGACTTGGATAGTGTGCCA-GCAACAAGAAGAAGAACAAGCACAACGCGAACAACAATATAAAAATAAATAATTAATAATAATATGCATAAATTAAACATAGTTCTAGCATTTAATTCAAATCGCAGCACGCTCGTAATGAAATCAAAATGCTTATGCACTAATTCTAATTGTTATTAATTATTTAAATTAATTGTACATTTTTACCAACTACAACTATCGTATATATATATATATATATATAGCTATATATATGGATACAGTTAGTGCTAAAAGTATG-ATTAATATTTA-----ACATTTTTACAACATATCAAATGCTTCCTCCTCTAGA-TTACGATTACGTATTCAACTTAATTTTTTAAAAACAAAAAAATCAACTCTATT-TCTTGAATTCAATTAGTTTTACTTCAAATAAAGTATATATATATATATATATATATGTATATATGCCTCTAAGAGTTCCCCTCTACGAGTTCTGCTTACGTATTTTTGTGTTACGTTTTTTGCCTAAACTTAAACAAATTTAAAATAATAATAATTGCATATGTTTATGTAAAATACTT----AAAGCAAGTCTATCACATTTTTAGCTATTAAATGTAATTTAAATTTTGTATAAATCAATTCAAATACGTTTTCCATAAAAAGGCTTAAATATTAAATATGATG
>trh 350055 351113|334 chr3L 350904 355068 scaffold_9 3180502 3184582 - 134012|0 212
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GCGCGGCATGACCAGGCAGCCTTCGAGCTGCCCGCTTGCCAGCAAAGGCAGCAGCAGCAGCAGCAGGAGCAGCAGCAGCGCGAGGAGTTGGCG-----CAGC----ATCAGTCGCAGGAACGTTGGGACTTTGTTGGCGCACTGGGCAAGGTGGCGCGCATGTTCTTCAATGCGCGCAAGGGCAATC---ACTAGACAGGGAACGTGGAAGGG
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AGGCGAGAGCATATCGAGAAAAAGGCAACATAGCAAAACAGAAGCTAAGCCAAACTATATACAAAAGCAACGGCG-GAAGTGCTTTGTTTTGGCACGCGCCAAAAC--CAGTTGAGAATTAGAGTTTCTATTTTTATATGCAATGCAATT-TATATGAACA---CAGGAACAGTTTTTGTCCACCTTGCGCTCTATTTAATATTCAGTTTTATGTCTATTATATTAATAGGATAAATTCGAAAAAACCCACAAAACTTGCAAATATCTAAACAGTGA--AATGGAACAGAGATCAGAGTTAATTTGTACGTGTATCTAAG
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TAGAAATACAATTTACAATACGTTTCGCTTCATTTCGGAAACTTTTCTGTTTGAAAAACACGTAAAGTGCCTACAAAGGCCCAACACAATGGATGTGGGCCCAC-----AGCGACAGCGAAACCTTTAAGAA
>klar 417790 418649|420 chr3L 418537 420730 scaffold_9 3280999 3283140 - 71691|0 116
GGACAGAGCGCGACTAA--TTAAGCAGGCCGCTAATCGT-TGTAGGTTACCGT-TACGTTATGTTAAGGCATTTAACAGCTGTAACTAGAGTTAACCAGCGCAACCAGCCACTTAGG
GCGGCGCGTGCTGCGCGTTTTTCGCAGCATGCGAAACGCGCGCACGTTTTTATGTAGGCAACAACAAATAATTTACTTAAGACGAGTATCGTTAAGCAATCTAA-CAGCCAGTTAGG
>Cypl 525649 525761|544 chr3L 525699 526402 scaffold_3 664214 664938 + 26397|0 62
GCCAAGGAGGTGGATTTTTTGGAGGAACTGCTAGAATAAGTACGATTTAAACAAGCGAAAGGT
ACACAATA---GAACATTTTTAATAAATATTT--AATAAGGA-AATTAAAATAACAAAAATGT
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ACGGGAGC-TATTCACCGCGCG---ACCAGCAACCAAGCCAAAAACCGACGGGAGTAGATAGATTATTAGGT
GCCGCAACATGTGGAGCGCAGGTGCAGCAGCAATCAAGCCAAAAACGAAAGCAGTTTGAAGAGTTATTAAAT
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TTGATTGTGCACACATTAAAT
ACAATTATA-----ATTAAAT
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ATAATCTGTTTGCCTTAATTTCTTACTCAAATGGCTAGCGAATTACAATAAATTCCTTAACCAGGCATGTAATCGCGTTATCATCATTATTTACAATTACAACAGCA-----------GCACGCACACACAGGCACTCAGTCGCACACCTTCGTATCTTGGAAATGGATGTGGACGAGGAACCAGCAGAAGACTTTGA--ATGCACCAAGAGAAAT-TATATGGTTGAAAGTGTATTTA--CTAGTATGGCAATAAATTAAAATTTTTTCAATGATCAAA
ACAACCTGTT-GTCTTAATTTCTTACTCAAATGGCAAGCGAATTACAATAAATTCCTTAACCAGCCGTGTAATCGTGTTATCATCATTATTTACAATTACAACGACACACAAAGCCATACACACACACACACACACACAGCTGCACAGC--------------------------------ACAACTGTAGACATTGGTCAGACACTGAGAGAAACGCACGTGTGAGAGACTATCTCTAGTTTATTCTTATAAAAAATAATATTTTAATCAAATTAAAAG
>CG32345 605166 605177|632 chr3L 605162 605692 scaffold_32 718374 718919 + 11050|4 15
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TCTAGACTGTGA
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TCGAATATAAACAATTTTGTACTTTTATAC-------------------------GTGCAGACCATTCCAAAAC-------CAAACAGAAGCAG--CAGCCGAACGCAGAGTTGTTGAAAGAAACATACATTCATAGTACATACTTGTGATAAATGACTTTAACTGTGCAGATATGTGCG------------AAGAAGGCGCATCACTTAAGT----TTAAAATTGAGTTTTTAATGTTATATTGCATTTGAATAAATGTTTGCTAAATAAAT
GTAAATATAAACAATTTTGTACTTTTATACACCTGTCAGATATATACGAATGTATGTATGCAACAAGCCACAGCTCTTATACAATCAGCAGCATTCCAAAAACACGCATAGTTGTTGAAAACTAAATAT--------TACATAATTGTGATAAATGCCGTTACTTGTGCAGATGTGTTTTTTTTTTTTAAATATGTATACACATTTATTAAGTATTTTTAAAATCAGTTTTTAAATGTTTAATTGCATT-GAATAAATGTTTGCCTCTAGAAG
>CG3402 635070 635619|683 chr3L 635293 637797 scaffold_12 2128433 2130858 + 60749|0 419
GTGG--TGCTCGGAGCAGGGTCTCCACAGACTACAGCAGTATTTAAGCGGCATTTAA----ACTATC---CCCTCCACCGCCCCTCTGGGCTACGGATCTCT-----TTGCCTCCTGCAACCTATGCGAATACTTAGAACTACCATATTATACATATTAAT-----------TCATTACG-TATGCATATCGCACAC-----------------------ACATGTAGCCAGACGTAAATGTAGCACCTAGTAATGCTTCTTGTTGAATTCG-ATTTCTTTGCCTC------------------------------------------TCCATCACTTGTTGAACGAATCGCCAAGCTCCTAAGTGTAAAACAGATTGCCAAA-TACCGATACAAACAAACACTCCCAGAAACAACAGGC
TTAAATTGGCTGGTCCCCAAATTCCATACAA-GCAGCAGCATTCAAGCGGTATATAAATTTACTATCTAGTACTTCACTGCCTCTCATTGCTAAGGATCTCTAATTAGCGCTCTTTGGAAACTACTCGAATACTTATTTATATATATATATATATATAAGCATATATACTTACCTTTACATTATGCATATCGTGCACAATTTAGCTATATTCGTAACAAAACATAGATGCATATGTGAATGTCGCA-GTAGAAAAGCTTCTTGTTAAATTTGTGTTTCTTTGTCTTGGCTTAAGTTGATAGCTAAAGTCCCCGAACTAGGTTGTTATATTCTCCGCTCGTTGTACGATTTGCCAAGAAACCGTGT---AAAGAAATTGCCAAATTACAACTACAAG---------CCACATGCAACAAAC
>MED30 636513 636585|683 chr3L 635293 637797 scaffold_12 2128433 2130858 + 60749|1387 1466
GCATAGGGACTCT----AGATGTATAATATAGTATAAATA---AAACTAAGAAACATTGCCAAACAGCAATCGTAAAGAC
ATCGAAATATTTTTATCAATTCCAAGCTATTGTTTATTTATGTAAATGTAATAAAAGAAACATACAACAA----------
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AC---CCTTGACTTCTACT
ACATACTCTGACTGCCGTT
>CG3371 666411 666597|709 chr3L 666135 668174 scaffold_12 2158979 2160860 + 55619|276 462
AATGCTCCAAACAGTGAGCGCCACATGAAGGAGAACGAAGAGGAGGAGGAATAGCTGCAGCCAAAGAGTGTAATCTTTGCAAACTGATGCATCTAGAAGATGCACATCGGTCGGATGCAATCAATCATTAGATCTAAGGTGAACATAATTTGTATTCGAACCAAATAAACGCAATCAAACCAAGTTT
---------AATAGT-----------------------ATAAGTGTACGGATAGC-----------------ATGTCTAGCTTGTAGCACATCTCGAAGATGCA-----ATTGGATGCAATCATAGAATACTTGTATATT---TATAAATTGTAATTTTACCAAATACAACAAACCAAATGTAGCAC
>CG3344 669474 669522|711 chr3L 668600 671758 scaffold_12 2160954 2164135 + 71784|1044 1096
ACAAATTAGCCGGAG----AAAAGCGTTAAAATAAAGATTATTTTCGAAATGT
GAAAAATAGCCAAAAATGTACGAGAAATAAAGCAAAGATTAATATAAAAC---
>CG3279 675013 675553|712 chr3L 672112 676392 scaffold_12 2164193 2168481 + 130900|3137 3702
TAAT---TTTAGCTAGCAAACCAATAGCCAATGATCTTAGCCCAAATTCAAATGTTATAGAAGCCTGTCCATTCCAATTTCGTGAGTTGATTATTTATTGTTTAGTATATTTTATTTTTACGAGATATTCTGTGGAAGAAAGCTGCAGATTACGCACTAATCTATATAAGATAGGATGGAGTATTACGTGCAATAAGAGTCGAAGCTTAGAGTAGTTATCTGCGGTCAATCGATGTCTATATATTTTGTTGTCCTTTTACCTTTAAGATTAAATTGACCTTCTTGTTAATCGATGGAATTCCTATTACTTTTTAATTCTTACCGCAGATTTCTAACCTATCACTCGCGTATCCGCCATCCTAGCTTACGTGTACAAAGTTTAAGTGGTTAATGTTTGGCGCCTGGTTAATAGAAACTAATCCTACT-------CTATGACTCGTGTTCGCGTTCGGGACGTATTTTTCGTAAAAATTCGAATTGAACATGTACGTATCTAAAAATCAT-AACATAGCCGAAAGC--------------TATCAATAAATAAAGGAAACAGTAAAAA
TTACGGGCTTGAGGAGCTCACTAAT-----ACGATTTTGG----------ATTATAAAAAACGTTGGCGCATTCC---TTGTTGAGATAATTGTTTATTTATTATTAGTTTTCATT-------AATTTCC------------------ATCGCGAGTTAATTTATAT---GTATATTGAAG--------------AAACTCTAAACTCTAA-----------CGGCTAGCACAAGCC---------------CTACTTGTCTACAAAGCTTAATTAACTAT---------------------------------------------GACTTATGCCCTATT-CATACATATGAG---TGTTAATGTATTTAAATAGAACGTTGTTCGTTGGTTTTCGCGACTGGGCGCATACATATTAACTATATCAAAATAACTATAA--CATATTC-------GGACG--TTTTAGCTTTAAATTCGAAGTGAATATTTACAAATAATAAAATAATCGAAACATTCGTAAGTAATACAAGTGTTTGTATCAATAAATTAAGCAAATTAAACAAA
>CG13894 676620 676814|713 chr3L 676490 678925 scaffold_12 2168536 2170947 + 79739|130 353
GAGTTTTCTAATCGCGGACCAGGACAGCACAAAACATAAATGTGATGAACAGTGTACATATGTATC-----------------ATGTAGTATTATTAAATCGTACTACCGCCAAAACAGTTGCTTAGGTTAACAAAGAATCTCCACTCGCATAAAGCTGAACCTAAT-TAATTAATTTATTAAT------TACTCTA----AGTACAATAAAATG-GAATTTAT
G------CTCGTCTCAATTTGACAAAACACAAAACAGAAATGTGATGAACAGTGTACATATACATAAACTAGCTAATTAATTGAAATAGTATTATTAATTTGTCTTACCACAA----------TTTGGATA--AAGTAATACACATTCGCGGCAGACAGAATCTGTCGCCATTCGTTTGCAAACAAGCGGTACCCGATGAGATTACAATAAAACATTAATTTAT
>CG13895 689466 689666|725 chr3L 688904 689471 scaffold_12 2182254 2182871 + 3638|661 666
TATAAA
TATAAT
>CkIIalpha-i3 692185 692241|728 chr3L 692128 692553 scaffold_12 2193385 2193816 + 3922|69 133
TCTTATTGACGC-CACAAAAATAAAGTTTAGTTTTTATATGTAATCTA-------CAATTAAAAT
CAATCGTGATACGTACATATATATGCATGTAAATATAAGTGTAATTAAGTCCAAGCAATAAAACG
>CG13897 721209 721395|765 chr3L 719929 723167 scaffold_12 2222033 2225300 + 31190|1400 1601
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GTCTGCGCTC-CGGCTGAGCGGCAGCGTGAGCGTGAGCGTGAGCGTGAGCTTTTCAGCCAATTGAGAGAGTAAGAGAATTGAGCGAGTTATTAACGAATCAGTGCGCCGGCTCGCTGCACAGTGGGCGGAGAGCGTCTGAAGTGAAGTGAGAA---TATATTTGTTTGTCACGAATTTTTTTTATAA-TATATGTTTGTACA
>CG13900 810242 810417|888 chr3L 809935 810586 scaffold_12 2327471 2328099 + 4356|322 525
ATCGTA--------CATCTATACT--------AACTGCACATTAAATCACCGAT---CAACCACTAATCGACTGCCGCATATTTAAACTAGCATATAAGTCAGTG--CAAACTCGACAAATTGCACAACCTAAATATAAACCCCTAATCATAAGCAATTTTTAACTTA------AATAAAAGTAACTGAAAACAAAGC-CAAGA
TTTATATGTGTAATTATTTGTATTTAAGCGTAATATGCACATAATACACACAATACACAACCACTAAATGACTGCC---TATTTATACTA-CATTTAATTTGTTGCACAAATTCAAACATTTGTGCAACAAATTTAATAGCCACACACGCTATGTAATTTAAGCCTGATATTATAATAATAATAAATGTACACAAAGCACAAAA
>CG13900 810478 810533|888 chr3L 809935 810586 scaffold_12 2327471 2328099 + 4356|595 652
ATCTTCTTACGTTGGGGTATGTTGTGGCGCTTAATTC--TAACTAAATTATACACTAG
---CTCTTGCGCTTTGGATCCTTTGGGTAATCGATCAAGTAACTTAAATATTAACTAG
>CG13900 810714 810768|889 chr3L 810587 810821 scaffold_11164 47 288 - 2690|138 194
TTTAATCGGAAAATTCCAATGACCATTAGACCATTACATTAGGAAC--ACTTTCAAG
TCTTATATACAA---CCCATAAATTACGGATC-TCGCAAGCGGAACTCACTTGCAAA
>CG13900 810955 811001|890 chr3L 810822 814331 scaffold_12 2328100 2331709 + 178210|143 189
TTTTCGTGGGCAAAACCAACAAACGCTGCACCTAAAACGTTTTAAAG
ATCTCGCAAGCGGAACT--CACTTGCAAAAATTAAAA----GTAAAT
>CG13900 811178 811229|890 chr3L 810822 814331 scaffold_12 2328100 2331709 + 178210|411 463
ATGCCAGCAAAGGAACACT-TCAATATCATGGAAACTTTTCTTTTTTAACTAG
TTGTCGATGCGGAATCGCTCTCATCATTACGTA----CTTCTTTTTTA---AG
>CG13900 811409 811409|890 chr3L 810822 814331 scaffold_12 2328100 2331709 + 178210|664 664
G
G
>CG13901 820199 820314|895 chr3L 820261 821156 scaffold_12 2336776 2337633 + 32723|0 58
ACGACTTAGATTGTA----ATACACAAAGTATTATTATTAT-TATTATTATTGTGAATT
AACGCACAGCATGTAAAATACATACAAACTATTATCTTTACATATAATTATCACGAGCT
>CG13902 823512 823589|898 chr3L 823584 824834 scaffold_12 2339434 2340702 + 42536|0 5
GCATTT
GTGTCT
>dpr20 836245 836812|907 chr3L 836549 836652 scaffold_8 115504 115603 + 2098|0 106
TATCATCAATTTGTACATGAGCAGGCACGCGTAGGATTAAGCTAGGATTAAGGACTAAGCTCGAGTGTATTTGAAATCCG---GAGAGAGGCCAACGAATTTCCCTA
TAGCATCTATTTGTACATGTAAAAGCACACATAAACTTAA--TTAAATTAATA--TAAGTCAAA---TATTTGCGTTTGGCGCAAATGATGCCAACGAATTTCTATA
>dpr20 836245 836812|908 chr3L 836681 836805 scaffold_8 115735 115878 + 2928|0 143
TAACTAGGACTAGGTAAATTGAGAGAACATCGTTCTCCCGTAGCTC------------TTTTTGTTGATTAATTGTAAAGTTTTTGAATTTGGA-------GGGGCAGTTATTGGAAATAACTTAAAACGCAGCCTAAGTTTAA
TATATGCAAAAATATGAAATAGGCATAAATTGTTCTCCTGGTAGTCTTCTTGTGTACATTTTTGTTAATTAATTGTAAAGATTTTTGGAATAGACACATAGCGGGAAGTTATTAGAAATAACTAAAAACTAAGTTAAAATTAAA
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GGAGACTTCGATCGGTTGGAAAGGAGAG---------------AGAAGTGAATTTACAGGGGGCAGT---GCGGAGCTTAAGA--GGATCCG-------GTGAGATATTTTTCTATTTACTTATAC------------------------------------------AGCAGAGGAGG-------AGGAGATCAGAGATCGAGCACA--------------------------CCTATATACAAAGTG----------------GAGAAGACGGATGGATATATATATAGCCAGCCC-------CACACCATATATACATATATATATATATATACCT---TTAAGCCTAGGCAACAGCGGAGGATGAA-------------------GTGCGGAAAATTCACTTTTCTAC------------CAGGAGAACTCAGCTTAGCTTTCGATAAGA-TATAG-AGAAACCTTCGGCTATATATAA-----AGTTATAC------------------------------------------------------TACGCTCATAA----------------------------ATTAACGATCGAAAAC--TGATA----CCGATCGCTGGTAGATTGCAACTGTTATACAGCAACCACAAAATATTGTAAAGTAAATT----------CTATTATTATTATTTGTTTGTTAAAACCTACGATTACTATAAT---------TACCATTATGATTACTATTAAAGATTATTGT-----------------------------------------------GTACTTCTAATA---GTTGTTGGCCAGGCGTTA----------------TAAATGTGTCATACCGTAGCGATATAG-------AGATAGAGCGATACATAGCGTGTG---TGTAAACTAAA-----------------ATGTAACTAAGTAG-------------------------AGGTGGCCCGATTAACTTA---------AAGAGCGGCAGCAGCAACTATT--TCGAGAAATAATAAAT-TGTATATTTTTTAAGAAAGAACGCTACACAGCAAAACTCA----AAGGCGAGAACACAAAGGACCGCAGTAAGAACTAAAATTGTTTTCAATTTTACACTAATCGTTTAGGT----------GGCAAACTCAAATACAAATTTACGGCTCATTT--TTGTAAGTTACTTACTAAACTAAAGTCCAGCAACAGAAAAACCAAGAGTAAATGA--TTTTTAAGGCTTGTGTATGTCCGTTTTTAACTATCCAAACATATAGCCTAGTAGCTACGAACCATAAGCAATACG-GCAAGTGCAGTTCTATACAAACGAAATTGTTCACGCGGCTAAACTAATTAAACAGTATAATATGTACCACAAACAA--------------TATTCTAAATCTGTTTTACGCATAAGAACGGGGCAACAAACAGTGAGCAAGTGGGAA------ACACATCAATGTAACATTTAGAACAATAAGTGTTGAGAAG--GAATGAGAAAAGCAGCCAGAATAGTAATAAAAGATATTGCCATAAATTTTAAAAACCGTCGAAACCAATGC
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G
G
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>bab2 1123981 1125499|1239 chr3L 1125455 1127485 scaffold_9 454550 456743 - 66822|0 44
ATCCTGGGCAGGGGCGTGGCATTGGGACACACGCTGGGGTGGGGC
GT----GGGAGCGGCGCGGCCAGG------CCGCTGGGTTGGCGC
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GAATGGAAATGGACAGCAATGAAACCTTAAGGGAACAGATTCTCGGGACCACAGAGCAGTATAATTCACTTGGCAAA-TGAAAATATTTTCGTGTAAACAGATGTTATACAGATATATACAAAATATATTAACAAGCTCAAGATATTAGGCAAATCTTTTTATGAAATCTCAACCAAATATACTCAAC-AGAGAATATTCAAGTTAAAAATCAAAT
A---GGAGACCAACATCG-------CGAAATAGGACGAAACCTTGTTACGCTGGGACCATATGCTATATACCGCAAACTTAAAAGATATTTATATATATACAAGTTATATTCA-ATATGCAA--------ATCGATGTCTAAATGTTTGGCAAACA--CTTAATTTATTTCAACT---TATGTCTAACTATTGCATCTTAGCACTAAAACTTAAAT
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TTTATACTTTTTGATACGTTGATTCACGATATATACATA------AATAAAAGTAAATATCTGGTA
TTGATAATGTTCCTGAACTCCCTCCATGCTCTGTAGAAACTGAGTACTAAGAAGGTATATTGTGTA
>CG32335 1185403 1185445|1322 chr3L 1185440 1186349 scaffold_9 2376306 2377221 + 39598|0 5
TCTTCA
CGTTAA
>CG9119 1186838 1186934|1324 chr3L 1186663 1187941 scaffold_9 2376066 2377321 + 53441|182 284
ATCTTATCTGCCGTATCTAGT-TGTAGCCGACTTTTCCATTGCCCCAACCCCCAATAAATAATAGTA----AATAAACAAA-ACATAAGCTCGAAAACAGAAA
-----------CGTTAAGGGTATGCCGCCAACTATTAATATTCCTTAGC-----ATAAGCAATAGAAATCCAATAAATAAATAAATAAATTTATGTAATCAAA
>LysD 1194257 1194286|1333 chr3L 1194230 1194772 scaffold_9 2389177 2389744 + 31376|27 71
ACTGATTTTGACC---------------CCGATTAAAACGATTGC
GCTGATCACAATTGGATTTATGTTTTGGCCAATTAAAGTAAATGT
>LysP 1201613 1201788|1342 chr3L 1201249 1202375 scaffold_9 2399833 2400939 + 24182|453 628
TCTCGCCCCCTCCCCCCCCTTCACACACTCATACTAAATGAAAGTTGTTGCCAAAGGAAGATGAGAAGAAGAGTTGTTTGAAGTACAAAAATGTATCTTCGAGATAAGTATCTGTGAGCTGAAGACATCTTAATCGGATAAAGTCGAACAATAGCCAGTTAGTGTTATAAATCATA
-----------------------------------------------------AAATAAGAT--------------------CTAGGATAATGTGCCAT--AAATAAAGCATGGCAAGCTCTGGGC-----------------TTGTATAATAGACTTTCCACTTGCAAAATTATT
>CG9192 1220664 1220831|1350 chr3L 1219612 1221929 scaffold_12 2504271 2506732 + 55936|1190 1360
AGCTTCGTGTTTTAGAAGTGGAAGGTGTTATGTTAAAGATATGGAACTGAAGCTATTACTTTCCCA-CTCAACCCTCCTTTTTCCCTTAGGCTGAGTTGGAAGTAGTCACCTTAGT--GTAGGCATAGTTTACGTATAGACTAAGCAAATAAATTCCCATGTTTACTCACA
C----------------------------------------TGTAACTCAC-CTACAGCTGCCCCAGCTCAAGCAACCGTT-------AGCTTTAGTCGTTAG-----AGTTTAGTCGTTAGGCTTAGATTATGTTAA----ATGCGAATAAAATTCT-------------
>Klp61F 1225100 1225499|1351 chr3L 1222294 1229033 scaffold_12 2508105 2514676 + 190294|2987 3390
TTGCATTCGATGACAGTAGTAGTCTCCCCTTCCCAGTAACCCGTTTATGTTAGTGGATTTCGGATCGCTGTGTTTGTTTGGCTCTTCTGGATATTCATTTTATCTGTATATCAATCTTTGGAATTTCGTACATTTATTATTTAAATAAACTCAGTATGCTATGTAAAGTTAAGGAAATCTTTAGTTCAAGTGCAGGTTTAAGATATATCAGAAGGTATTCTTAAACTTCGATACTATTTTTTAGGGAAGAAGTGAATTTGGTTTTTTAATGATGTCATGCCTTCCAAGGAAGCGCTTTATAATTAATATAATCTTAACTATTTTACTTATCATATTCTCGTTTGTGAATTTAAATTTGTTGAAGTTTT----TTTTCATAAAACATTTAAACATATTAAATATC
GAGCATCCAGCATC--CAGCAGTCGCTAATT-GGAGCACCTCTTTTAAATTTGCCTGTTC-------CTTTTTATTTTTAACTTTTTT---------TTTGCTTTTTGTGTCATCTTTTGAGATTC------TTTTTTAATACAATATGCACA----------------TAAAGGCACCTGTACTAC-AGTGAACGTTC--GATATAGTGAAATAAA----TAAAATT--------------------GAGATAAATGTA------TACCGATTTTATG------------GCATTTCTTGGATAATCGGATCCCAAGAGTTTCGC--------GTTTAGCTTGTATAT-----TATATTGAATTCTTACTGTGCTCAGGAGAC------------------TC
>Rac1 1284411 1285299|1410 chr3L 1284017 1285270 scaffold_12 2575159 2576463 + 1757|417 1465
CACCGACG-------------------------GACTCTGCTTA--AACGTAATATTATTAACTATAAAACCATTATGTAACCTAAGCGTGGCCAGGCTAAATGGCTCATCCG---------TAGTTTCTTTGTTAC------------AATTTTGCCAC------TAATTTCCGCTGCTAGGGGGGGATTCCCCCAACCCAACCC---------AACCCAACTCT--------TGCTTTTGTTTCGT------TTCCGAGTT------CTGAG----TTTGTTTCGAGTGTTCTGTAATTCATAATCCAATTATTCTGTTTATTCGTGCATT-AATTTCAACTAAAAGTTAAAAGCGAGATGTTTCTAGACGAAATGGAGAACTGTAAACTCTAACTGTATTTTGTATTATTTAATAACTTTTGTAATTAAAATTAATGTTGTAAAACTGAGGTAAAACCAAAAACAAAACAAAACAAAAAAAAAAAAACAAACGAAAAACCTAAAAAAAATGT------GAGACAAGTACGAGAA------TAGCCGCATAA------TGAGCATAAAGCATAGATGTCGCATAGATGTTGATCGAAGGTCCTGCGGAAGGGATCAGGATATTGAGTCAGTAAAGTAAAC-GTTCCATTGCAA---TTACACTTACATTATTACATAC-----TTGTATTTAGATGTTGTTGGATATCGAAGCGACGGCGCGGGCGAGTAACAACTTTTTAAACTTTTGCTAGATCCAGGAACTA--------------TCAATATATATACATGTATGTATAAGAT---------GAAAAGTCCTTCGTATACTATGTACTGAATTAAAGGCATCAAACTG-AGCAACTTTGAATACTTTGTATTTTAAACGACAGAT------------------ATTCAAGAAACAAAAGAAAAACAAAAAA-------------------CATGAACGAAGCCAAGATAAT-------------TATATAAATGTGTCTATTTCAATGGAAATCAATAAAGCATAATAAAAGG
CACCCACGAAGCATTGTATTTGTATTTGTCGTCAAGTCTATTTAATAACGTAATATTATTAACTA-ATAACAATTATGTAACATAAGCAGCAGCA-ACTAGCGAGCTGACTCGAGAGGAGTCCAGCTTCCGGCATACTCCGGACCTGGTCAGCCTGCCACACGATGTATTTT---CTGCTTTGTTGAAACTTGCCCACTTTAAAACAGGGGGAAAAACCGAATTTTCTACTAACTCTTCTTGTTCTGTTAGACGTCCTTAATTGTTCAACTAAGTCGTTTCGTTTCGTGTGTT------------------TTTGTTTGTTTGTTTATGCTTTCGATTTGAACTAA------------------TTTCAAAC-ATGTGCATTAATTTGAACTAAAAGT---------------------------TAATTAAAATTAATGTTGTAAAACCAAAAAAAAAAAAAAAACA----AAAACGAAAAAAAAAACATAACTAAATAGAGTGAAAATTGTATTGTAAAGAGCTGAGCATAAAGAAATGTTTGGCCTCGTAAAGTAGGCGAAAGTTGAAAAATGATGCAGTGCAGCAGCCAGT-AAACGTTCCACTGCACAATGCAAGACAACAA------AAAACAAACAATTACATTATAAAACACACACTCACACACCCACACACACACATTGTATTTAGATGTTGATTGAAACTGTTGC-----------CAAGTATCAAA----GGAAGCTAGGTAAAGGCAAAGAATTAGGCAGAATTGCAGCTAAACAAATACACAAACGTATATTAAATTAAAATCAAGAACAGATTCATGTATGAGATGCGCTT-CCTAACGGCATCAAACAGCACCAGATTTCCAGATTGTGGAAACTAAATGAAAAATTAAGAACGTTTTTAATTGCTAAAAGAAAGAAAAAAAAAACAAAAAGAAGAAAAACCAGGAGCTACCATACATAATAATAAGATAATGTCCTTCGTATACTATGTACATGTACTGATTTAAA-ATACACAAAGAAAACGCAGAAAACAA
>CG9186 1295251 1295461|1415 chr3L 1294149 1296836 scaffold_12 2585200 2588154 + 88274|1302 1578
AGTCGATTGTTGACCTGGCCCAGACAATCAGCCCTGTCCATTACCTAATCCATCCATGCCAATAGACTTGGGAATCCGGATTA-----CGGTTGAACAGCAAACCAATAGCAATTACTCCACTGCCTTTGTGTGGCAATTAGT------------------TCG---TTTTTATTAGTATCTTTTTGCAGCTCTCGA----------AGACAACTCTAA----------------ATATAGTCAAAAGTGATTTAA--------------CACGGTT
ATCCCACATCCAGGTGGGCGCATTTAGCCAATTGTTGCC-TAATCTTAATCTTTTAAGCGAAT--ACTTGTAGACCACGATTAGTTTTTGGTAGAATGGAAAGTTA--TACAATGGACAAAATGGAATTTTAGGCCAGATGGTAATAGTGGTAATGAAGCATCGAATGCTCTAGTAAAATCTATTTACATTAGTTGATTTAATAAACAAACTGGTATAAAAGAAGTCCTCAGCTTATATTGTTCCAACAGATTTCATATTTTGCATTCTGCACGAGT
>CG9184 1305314 1305536|1420 chr3L 1305500 1306599 scaffold_12 2597303 2598604 + 5571|0 37
AGTAC-TCTAATCCAATCATTGATTAAAACTTAATAAA
AGTCCATCTAAACGACCGAGAACTTGAACGCAAATAAA
>CG2213 1315832 1315883|1425 chr3L 1314349 1318098 scaffold_12 2606547 2610172 + 98639|1575 1626
AAACCTCGCTTAAAGAGCTTTAAATACAAATCAAATGTTTAATTTATTTAAA
-------GTTTATTAAGCTTTGTGT----ATTAAATG---AATTTATGT---
>CG2211 1316769 1316948|1425 chr3L 1314349 1318098 scaffold_12 2606547 2610172 + 98639|2530 2727
-ATGCACCTTGT----AGTTCTGAGACTCAGAATTCAAACAGCC---------ATGTTAGTCCAAACTTTCATATGGTATAAACTCCCTATTAAGATCTCGTTAAAACCACTGAAGACTTGAAATACGTGTAGTGCACTCTAAAAATTGTGCTTTTAAAAATAAAAACCCAAGTAATCCG-TAAGCGATCATA----A
AAAAAACTTCATATAAAAGTCTGATATT--AGATTTAAGCGGTCTGTCAATAAATGTAAACTCTTTCTCTTATTTATTGAAAA---------AGAATCTCGCTGTCAGTATGGAAGCATGGAA------------CATTTTCAAAATT-CGCGGCCAAA---ACAGAGTCAAGTGGTTCGATATACAATGTTACTCGA
>CG2199 1322989 1323353|1432 chr3L 1322138 1323296 scaffold_12 2614452 2615767 + 21483|997 1378
TTTACGTTAGCTTATT-GCTATGTTAAGTATAATTCTT-------------------TGAATTTTCAATGGCTAA-------CTTTGAAAGGGTCTATATA----AAGTTGATAAAAGTCGATGAAAACT-------------GCAATTTATAACAAGGTTACTTCATAC----ATTTTTAACTATTATTAAGTTCAATTCAAA--------------AGATAAGTTTAATTTGTATATTAAGACTTTATTATAACCGCATTGGTTACACCACTTGTACTCACCAAGAGT----ATATAAATTAGCTTGAATGTAATAAACATATTTGTACTGAGCGATGAACTGTTAATAAA----AAATGGCAAAAAGCTAC----GAAA
TACAGACTAGTCTGTTTGTTATGCTAAATAAGATCTTTCAGTTCGTACTTAGTCATATCAACTATCGGTCCATTATTCAGCTCTTGGAAAAACTTAAGATATCAGAAATTAGTCAAACTAGCTCTCAATTTGATACTTTTAAAGCTCTCAATAAGAATATTAAATCATACTAGGATTACAAAATGTTAGTTAGCTGAAGTCAACTTCTTTCTTGTTGTACAAATTTCTTAATTGCATTTT----CCTTACTTTTTCAGATTCGTACACAGCAATTCAGGCCTTGAAGGATGCCAAAATGACTGAATTTAAATGTTTTAATTTTCTTTTTAACTATTTGTAAACAGTACAAAAACTCAAAAATACAACAAACTAACACGGAAA
>CG2199 1322989 1323353|1433 chr3L 1323352 1324146 scaffold_12 2615996 2616844 + 5762|0 1
TT
CT
>Ptp61F 1326022 1326128|1437 chr3L 1326026 1326609 scaffold_32 685578 686297 + 8971|0 113
CGGCA--CAGCCCATCCAGGTCAGCACCAACACAAAGAAACAAA----CTAAACATATCATTTTGCATTACTGTAGCTTCTAATGCC-----TAAATAAACTATTTTTAAATTG
CGGCAATCGCTCCATTTA--TCTGCATCAACAGAATGAAAGAAAGACGATGAACATATCATTTTCCATATTTGTAGCAACTAATTTCACAAATAAACAATCATTTTTTAAATGG
>Ptp61F 1327140 1327859|1438 chr3L 1327399 1330053 scaffold_32 687204 689908 + 71426|0 537
-TGCCCCG---TAGCCACTAAGTAG-TCGTAGATCAGTAGTAGCAATAGCTGTATGACGTATTTAGTTGCCGTAGGAGACCGATTCCTCCCCTGATACCCGATTTCCGACTTCCG---ATCCCCACCTGCTCGTCCGCCTGACCCGGCATCTAATGCGGGCA----ACGAAT---------------------CAAGGACG-ACGTGCAACGGATCGGAAAGGATCAGAGATCGGACGGAATCGCAT---CGCAACGCCATGCAATCGCACACGAATTG--CGGATGGCGGATTGATTGAGCTGAAC------GAACGATACAAGATGCATAAATATTAGGGAA-TTTTTTATATACGAAATACAA-------------GAAGGAAAACAAAAGAAACAAAT-GAAAGAAAAGAAGCAACTAAAC------------TAAACTAACGAAAATCGGGTAGAAATCACGT-----CAAATGTAGATT-TTGCGCAATAGACTGACATTTTAGATCAAATTTATTTTCTACACTCTAAAAA
TTGCCCCTATCAAGCCAGAAAGTAGCCCGTAGAT-----GTAGCAAT-----TATCA-GCATGTAGTGGCAGTAGCGTGACAA---------TGAT-CCCAATTCTGGGCATATGTATGTATATGTATGTAGGTCTTATCGAGCTAACATCAAATGTCAGCGCGACACAAATACTTGCACATACACACACACACACAGACGCAGACACAAACAAACAGATACACACACACATAAGAGACACTCCCGCACACACACACACAGATACACCCACACGAGTTGGACAGGCGGCAATGCGAAAAAGTCGCATTCATTGAAACGATA-ATGACA-ATGCATATTAGGGAATTTTTTTATATATAAATTATAAAAAAAAAAATAACGAATGAAAAAAGAAGACAAAAACGGAGATAAAATAAATAAATAAACAACTGCAACATTTAAACTTAGGAATTCGTTGTAGCAGTAAGCCGAGCACAAAAGTAGATTCTTGCGCAATAGACTGACATTTTAGAACAAATTT-TTCTCGATACAATTAAAA
>CG9173 1405405 1405592|1533 chr3L 1404815 1406970 scaffold_9 3624437 3626435 - 57371|645 851
TTTTGTACGTTTAAATTTTGGCTATATAAATTATTGAGTGATGAAAAGAGAGCT-ATTGTTGACCCTTAATAGCCAGAAACAAGTAGTCTAAGTACAGAACGTGTTTTCTCACCTCTGCTACCAAGTTTGGTTCAACGAGCTGCCACCATGCCACCATGCCACCATCCGGGCCACCC-------ACTC-----------CCACACCT
CTTATTATG-----ACTTTGGCTGTATA----------TGATGACCATTTCGTTAATTTTTCGTGCTCTATAATCAACAATAGTTGCTTTTGATAC-------------------CCTGTACGAAGTTCGTTCTTTTTGCCTGGTAACATGCCCTTAGGGTATGTCTAGCGCCATCTCGAAATGAATCAGTTTAGTTGGCAACACCT
>stet 1458961 1459704|1603 chr3L 1458787 1460825 scaffold_9 3700468 3702591 - 53192|193 1108
AATCCCAGGAGGATAAGCGATAGGGATGATCAGAAT--TCGATCCTTGTTTCGTATTTAATTGATATTTTGCTTACATTTTGTTCATTGCGTT---------ACATTGA----------AGTTTTT-----ATTGTTTTTGGACGTCGATTAAGTTTCGCGTTTATTGT-----------TTTGTTAACCCTATATCTGTAGGATCAGATATGAATAT-----------------------CTCATTGTTTGCTTACGTGTCATGCGACGTAAATT---ATTTTGTTTTG---------TTTGCTAGTT---------------AAGTACAAACATATTGTAA-------------------GAATCG-TAAGAGAA-----TATTTACAACAAATC----GAACTGATTAGGTGTAACATAATGCTCAAGGAAT------TACACATTTTCTACATATTATT------AAGATTAACCAGAAGAACCAGAAGACTTTATATGGGAGCTAATAATGAATAAAACTCCACAAGCTGTAAATTAGAATTACAAATATATGTATATGCGTGTGCTTTAAGGACTATATGGAAACCGATATATTGGCAATGCAAGCGATTTATTCTAAATTT----------------TACAGGCCTTATA-----GCAATTGAGATTACTACCTCAACAACAACT------GATAAATAATATTAAATATATTCCAAAATGTTGAA-GTAAATCGGTTTCAATTTGATATAGCCGAGCGTAACTG----------------AGCACTGCCAGCTTTAAGAAATCAATTACGACCAAGCACCAACAGAGTAAAGCATAAATTTACATATTTTCTATTTACACATTTTGTTTAACTTGTAAATAAAAGTACATTTAAATTTTAAAAAAAAA
----CTAGCAGAAAGAGCTCT---GATGATTAGAATTATTGATTTTTGTTTTGCGATTCGTTGAAGTTTTTTGT-TATTTAGTTTATTTGTTTGCCAACTGGACAGTGAATAAGTTTATAGTTTCTATTCAATTGTTTTTGTAAGTTCATTTACT---GCGTGCAATATACGTACAGACATACGACATATATATATCTATATATATATATATATATATATATGTGCATTTGTATATAGACAATCGTCTTTTCTATACGT---AATCAACGCAATTTCTCGTTCTACTCTAGGCTAGAATTTCGATATTTACATGTCTCGTTTCAAAGTACAAAATTTTGGTAAAGAAAACAAAATTCAATTGAAATCGTTGAGAAAAATATGTATTTACAAGAGATCATCGGAACTGACTAGATTTA----TATGCTCAATGGATTCGAAATACTCATATAATGACTCTTTTTTCTTAGAAGTTTAAGCAAAAAGCATAATCAACTTTAATTGAAAAGTTTAAAGCATTAAG-------AAGCCGTCAA--------ATAAACTAGTTTAAATGCTGCTAATATAAT-------TCGAAACCGAGAAA--------------GAATTATTCCAAATTTTCCACAACTGTCCCACTGCAGGCCTTAAATATATACAAACGATATATTTATCCCAAGACTACCTCAATTCGGTAAAGAGT-----AGATAAGTTAAGATGCAAAATATATTTCGGTTTCAATTAAATAGAGCATA-CGAAACTGCCCTTATGAAAGAATCATCACTGCCAGCTTTAGTGAA-----TGCAACACAGCACCAGCTGAACA------------------TTTATATTT--GTATTTTGTACATTTTGTACATA-------ATTGAGACTTAATAAAATAA
>CG12084 1474902 1475285|1623 chr3L 1474908 1476822 scaffold_9 3717971 3719884 - 71268|0 530
GCGGATATTTAGGATAACACGTA-------------GCTTTAGGAGTCGAGTTTGTTGTAATGTTTTTTTTCTGCTTCCTCTGTTTCCCGTTTTAAAGCAAGTGCATGTGTTATGTGGTTCAAGAGATTCTTCCTTGACTTTTATGTTTAC------------------------------AGCGAGAGCAGCAGATACATAGATGCAAGTTTAAACTATGCGAGAGTTAAGCAA-------------CTAAATCTAATGATGC-------------------AGAAATATTCGATAATTAC----ATAATTACTAGATTATATAT----------------------------------------GTATATGA-TGTATCACATGTTGTAAGCC----AGCGATCTTTTT-------------AGGCC---TTCAGAAGTGTAAATATTGTT----------AAAACCGGAA--AGAGGAAGA-CATTGGAGTAGCAAGCAAGGCTGCTGGAGATTAAATAAATCCTTAA
GCCAGATGCTAGCCCTCAATGTATGCCAGAGTCTAGGATTTACTATACGAGTTTGTTGTAAAGTTTGT----------------------GTTTAAGGCAGCAGCAAGTGTTA--TCGTTC---AGATTCTTCCTCGATTTTTATGTTTACTTCAACAAAAAAAAGCAAAAAACAAGAAAAAAAAAAAACAGAAAGCAAACAAAAACAAATTTTAA--ATGCGAGAAATTAGGAAAAAGCAAAATGGGAGAAACATAAAAACGCGCGTGTTTGGCTAAAAGAAAAGAACACTAAATATCTATTATAATAATTACTAGATTATATATATATACATATATATATATATATATATATACATCTATTACGGTATATAACTATATATCATGTTGTAAGCAAACGAGCGATTTTTTTTAAGACGAGATTAAGGCCCTGTCGGAAACTGTAAATATTGTTAACGAAAAAAAAAAACAAAAATAGAAGAAGAGAAATGAAAAGGCAAACGAAGTAGCTGCATATTAAATAGAACCCTAA
>pUf68 1480383 1480744|1627 chr3L 1479640 1482997 scaffold_9 3722349 3725824 - 107871|835 1328
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AGAGCCGAGAGCGGAGAGCAGAGACGGATGCGAATGTATCTTTAGGCTTACGGATACGGATACGGATACGGACCTATGTCTGGCAGCAAACAGCCTTTTTTTACTTAGAAATTAAA---CGAACAATTATTATTTATTACTTGGCGCGCAAGTCACAAGCCACGAATTGTGGTCGAAGGAGATTGTAAATTTTTGGACAAAGTCAATGATTGATGAGCACAGTATCTATTATAATTAAATAATAACTATAATGTGGGCAGTTGAAATGTTG----ATAGTGATTGATGTATTAACGATCCGATCCCGATCCCGATCCCAAGCAATTGTCGCCAGTTTCTGTA----CAAATTAAGCCAAGTGCAAGTGTTTTCCCCAACATGCACGTCCAACAGTTCATTTTTCTGTCGCATACACACAAAACCTACAAGAGTGTACATTTTAATAATTTTGAGCGCTTAAAACTTACAATA-AAAGTCTAGTTTCCCA-TAAA
>cue 1486745 1487358|1633 chr3L 1486892 1489354 scaffold_9 3730489 3732858 - 65660|0 489
GGCGCGACGGACGGACGGACATCCACCTGCGCCTCAAAACTGAACCTTGTGATAGTCGTCGTCGTCGAGTGCGGATT-----TGGTGTATTCGAGCTTGAAAAGCTGCTGCCCGCCCGGCCCTCGACCCCGTTAGCCGCCAAGGTGCTCGCCCAGGCAACCAGCAACTAGAAACCAATTACCAACCAGCCACAGCAATGTGCAACCAGCAACAGCAGCCTAATACTTAACACTCGCCTGGGACACTTAACACTCGCCAAACCAAACCATTTACTTAAGCCGAAGCAA-CATTTTTACTTAGCGATCTTCGGTCTCGTTAATTTATTCGTAGGATCATTTTACGCCACAATTAGGATTTTAGCTAAAAGCAGCAAC------ATTTTTGGATTCTTAACTTCTTAATTTTTG------ATTCGGTTTC----ACTTTGAATACGTCAT-GTTGAAATGAATGCAAGTCGCGCGACTGACATTAGCTTTAAA
GGCGC-------------CTGTCCAGTTGC---------------------ATAAACGTTCACGTCGTGCACGGATCGATCAGGCGGCATTCGAGCTTGAAAAGCTGGTG-CCGCCCGCCAC---AGCCGGCTCGTCG---------TGGTCCACGTCGTCGCCAGGT-------------------GCTCTACCAAAGCTCGCACATAAACAAAGACCTA-------------GCTGAATTCATATATTACTTAATTGATGGAAACGTGTACTT-------AGCAATCATTTACGTTTAG----TTTTGGTCTCATTAATTTATT---------ATTTT---------TGAGGAATTTCACCGTGTGTAACGTTCATGTAGTTTTTAAGTTTTTAGCTTGAGATCGGTTGAAGGAAATTTTGTTTTGAGAAATTTGAAAAGGTTTTAATTGAAATGCAGTAAAGTCTTCTGACTGACATTAGCTTTAAA
>CG12090 1506944 1507045|1641 chr3L 1506905 1508951 scaffold_9 3744919 3746965 - 75092|39 143
AACCTATCGAGGAAAGCACAAGTTATTCGCCTTCTGAATTGTACATAGTCTATAAACTTTATATAAATTGAATCGAATAAAAACTGTAAA---AATAACTAATAA
AAATAATATAG----GCACATGTT--------------CCAGACGTAGTTTGAAGGTTATTAAAGATTTAAAT---GTTCTTATTGTAAAATTAATCACGAGTCA
>CG12091 1518461 1519127|1649 chr3L 1518463 1518679 scaffold_9 3755865 3756082 - 2211|0 245
GCGAGTCGAGTGCAGCTATCTGACTGAGGACGGAGGATTACCCATTTACGCGGGCGAACGAACTGTCTTTAAACAATTTTTGTCGAAATGTACTCACTGATATTTGCGACCCAATA-----------------AAATTTATTCAATGAA---AAACAACG-AATGCAGCTTGTAGTCACTTCGTGAT--------AAATTCATTAAGCAAATAAATATGTGTAAACAATAAAGCTGTACGGAAAAC
GCAAATGCTTTGCAATTATTGAACTGAGGAT-------------TATATCCAGGCG-----ACTGTC--CGATGAACTGTTAGTCAAATGTACTCACTGATA-TTGCGATTTAATAAAAAAAAAAAAAAAACCAAAATTATTCATTGAAATTAAACAATATAAAAGAATTTTTGATTTTTCCGTGATTGCTGAAAATATGCATGAAATGCATGAG-----GTAA--AGCACAGCTATGCGAGAGAC
>CG12091 1518461 1519127|1650 chr3L 1518775 1520342 scaffold_9 3756178 3757786 - 59724|0 462
GAGTGGTGCTCCAGCCCATCCTCCCTAGTGATTAACGTTTA-----CTTGTAGTCCGTACGTGTTTAGTTAGCTTTAGGAGCCAGTTTCGTGGTTCTGTCTACCGTTTAAGCTGCATGTTGAGATTGAGATTGTGATTGACGAGGAC-----------------GACGACCCTTT-----GACCCTTTGCATTGTTAGTTACATATA--------TACGAGCAAACTCATTTTCGAACCGACGAATCGACT--TCGACGCATCCTGGTGAG--------------CGACCCGCGCCTCGATTGTATACATAAC-CCTCGC-----------------------------------TATAAGTAGAG--------AATGCG----AATTATCTGCCCGATCTGGCGATCTCTGTCGTCAGTGGC-----------GTTCTAATCACCACAAACAATAAACAAAC
ACTAAGTCGTCC------TAATCCCTAGTTATTAAATGTAATTAATTTTGTAGCTTGTACTCGTTTAGTG---TTTAGGAGTGAGTTT--------TGTCTA-TGTTTAAGCTGCATGTTGAGATTGTGA---GGACAGACACAGACACACAAACAGACAGACAGACAAACAGATAGACAGACACTTCA-ATTGTTAGTTACATATACCCATGGCCACGCCCACTCACATACATAGACATACTAATCGAACTATCGACGCATCCTGGTGAGGCGAGCCCAGCAATTAATCCAAGTCTAAAGCGTATGCAAAATGCCTTGAACCATATATACATATATATATATATATATATTATGTATAAGTAGAAGCGCTTTTAAAACGAAAAAATTATCAGCCGAA----AAGATCGTTGTCGTCAATAGCAACGGTTGCGAGTTCTAATCAATTAATAAATGCGACATAC
>CG32313 1528359 1528496|1653 chr3L 1522726 1528440 scaffold_12 968755 974227 + 215000|5897 5983
ACCTTATTAAATTTATATC-TGTGCGGAACTTCCAGAATT----TTGTAGATTTTCCAGCGGTATTCGAACTAAATCGTATATATCA
ATCTCATTAATTTTCTTTTATACACTAAAATT---GAATTGAAATTGACAATTAGCCGAAAATGTTGG--CTATATTGTTGCTGTCT
>CG12099 1538895 1539100|1658 chr3L 1538815 1542179 scaffold_12 982740 986381 + 97335|80 333
AGAG---CTAGATGATGATCGCTTATGAAGTTACAA-----------------GATTTATTGT--------ATTTTTGTTTTTATGC-------------GAATATTTCAACGTTATTTTAAATAACAAATGCGATTGTTCT--ATCATTGAAGAGGATTTGGAAAATCATTCAGCTA-----ATCTATAATTTAACCCAACTTATATTCACAATACACATAAGATAACCAATAAAGGCAGCAAGTAAAATATC
ATCAATCCCAGATGACATTGATTCCTGGCATTATTATCCAATTAACACAATCTAATACATTGTAGTAAGAAATTTTTGTTAGTGCGCGCCAAAGTCGCGGGATTATTTCAACGTTATTACAAATAAC--------TTTTTCTGAACCAT---AAAACCTTTATAATTTAATTAAACCATATTCATATGTATTTCGCATTAATATATATATATAACA-ATATATAAT--CCAATAAAGGCAGCGAG-AGCACGGC
>CG7879 1543332 1543714|1659 chr3L 1542189 1546653 scaffold_12 2444976 2449752 - 119283|1160 1548
GCAATGAGCTTAGAGCCCAAATAATTGTATAATGTAAATAGATAATGTTAAGCCAGACACCAAAAATATTATATATATAAGCAGCATGTACATAAACTTGTTTAAATAAATCGAATAAACCGTGTAAGAAATGCGTTTAAGCATACAAAACCCAGCGAGCGACTGGGAAACTATCATTAA----CATCAACGATG--AAGTATCATTATATTTTGTTTCTGTGCATCCTTTCTTTAGTCTTTTTAAGACTTCACGTAATTTAAGTTGAAGATTTATACCATTTTTTTGACATTACAAATTGTGAATAAATAAATAAAACTTGTTTCATTTATATGAATAAAATATATTACATAGACACAAAAATACTTCCTATAACATGAATATAAAAA
GCC-TGGGCTCGGCGATTAAA--ATCGAATAATAAATGTAAAT--------------------ATATATTGT--------------------TAGGTTAGGTTAGACA-----------CCATGGCAAACAGGGTGATAAGC---CAAAATGCAGATGGC---------ACTATTGTCAAATGCCACCAAAGCTGTTAAATATCATTATTATTAAACATTGTACAT-----------------TAAAGCTTCA-----------------------------------------------ATAAATTACTATACACAACT----------GTATGATGAAGATACAATT------------AAGATTGTCCATAGCATTTAAATA----
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CAAAACTCGCCCACGTAGTAACTGTACTTAG--TTGTCGCACTTGT-----AGGTATTAACTAAAAA-------------------AAAAAATACAAAAAAAAA------------ACAACAATAAAACGTAGCTAATAAAACACAATCGCCGAT--------------CAGCTGTTTGGCACGCAAGCGCA----------GCGTTGC---------CAGCTGTCGGAAAAAT---ACAAACAACATTTGGAACACTGGAATATGGCACAGACAAA---------ATGGCGCGCACATTCAAATTCGTGTCTGCGCGCATTGTTTTTA
>CG12105 1594227 1594577|1701 chr3L 1594084 1594273 scaffold_32 1268056 1268275 - 3239|172 221
ATAAACAA-GCTATTTATTGATAAATAAAGCGGA--GAATATTTCAGTTA
ACAAACAATGAAATCAAATGTTAAATAAAGAGAACCAAATATTTCAACTA
>CG12105 1594227 1594577|1702 chr3L 1594320 1596326 scaffold_32 1268515 1270736 - 64782|0 285
ACACCAGCAGAACAGCAAACCAACC-------CACCGAATCCCACCCAGTG-GTGTCCCGTGTCCCGTGTCCATTGTCCCGTGTGTCCAGCCAA---CTTTGAGTGCAATTAAAAAATTGTCCG----CCATGCGA----GGTAATTTTTTAAGGATCTCA-ACTCGACATTCAGTTACGTTATAGTGAGTGATTCGTCCTAGT--------CGGTCTATATATGTACATATATCTAACGTAGTAGTAGCCTAGTCTTATGTGTATCCTAGTGTTTAGTGTAACTT
--ATCCATATAATCACGCCCAAATTGGAGCAGCAGTAAATCTGTGTAAGTGTGTGTCCTCCGGATTGTGTTCGTCGCCCCTTAACCCC--CCAAGAGTTTTGAGTGGAATTAGAAAAATGTTCGTTGTTCATACAACAATGGAATTTTTTTAAGGATCTCAGGCATGACATTCAGTTAACTTATAGTGTTTGTCTCTAGCTAGTTTAATAGCCTGTAAATATATGTATATGTATGTATT----TGTTAGTTTAGCTCTA--TATATCCTAGTGTTAGTTCTAATTT
>GC 1606710 1607044|1712 chr3L 1604155 1609248 scaffold_32 1279110 1284343 - 212771|2644 3075
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AGAATGAAGCAGACGAGATTATATTCCACTTGCTGCAATGTATTTCCTTGCCTAAGTCCCTTAGTGTCACATAATGTGTGGGTGATAAAACTGATAATAAATGTTTAAATGTTATACCTCAGAAGATGACAATTTTGATTCCAACTCTTTCTTCAGAGCGTACCGAGTCAGAAAATGATTATCT--TTCCAAGATTATGATATGAATTCCCAAGTTAAGGTCGTTTTATGTGTTTGTGAAGTATATTATAATCGGAGTAATAAATTTTCAAGC-TTCACATAATGGATTTTCCTCGAAAAACATGGAACAGTTATCAAACGTATTTCCACAAAAGGCGTGAAACTGCTTTCCATCTGGACTTCAAATTAGTCTACTGGGAGCTA-----GTCACAGGGTATACTAGACCCTTGGGTGCTTGACTGTTCTGTT
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AG-----------GAACGGGCCCGGCAGCCGGGAGA----GCGGTGACCGGGCGAG----GGTGAAGCAG-GAGCATAGGACAGGCTGAGCAGGATGAGGAGGATGAGCAGCTGGAGAGCAGGTAGCCAAGGGAGAGAGTGCGCCTG--CGCAGGGAGCGGATGAATGATTA-------CGAGCAGCAGCAGCAGGAGGAGGAGGAAGAGGAGGAACTGCATCGCGGCCTGGCAAACAAGGGTTGCTATACGGACTGCAGCA--CACCGCGGATTCCCCCGA-------GTGCGCCGACTTGGGCTGATTGATGGAGCAGCAGACGGAGGAGCAACTATGTGCCCCCATTGTATGC--TAATTTTCGAC-------ACTCGAAAACATTGTCT--AGATCTTTAAAAGCTTACAGAACCTATCTAATGGAAAACCAAGAGCATATTTATTGAATTAACTTTGAAAATGCATTTTAAAATGTTTTAGCGTTGCGTAAA--TAACGAAATGAAATCGAT---------AAAGAAAACCAAAA------GTATTTTAATGGCAAACTCACAAGTAAAA---------TAGATGTGAAGCAAA---AAATATTAGTCATTTATGCATTACTGTCGTACTTAAATTAAAGTAAACCGAAAACAA------AACGAGAAAACTAAGGAAACCAACTAAACGTACTTAAAGAGACACTCACACACACACACACACACACACACACACCGAAAGCGGTTATTCAGGCGCGTATTTAAACCATTTACCAATCAAACATTCAACCCAGTCAATCCAGGCACCGAGGTTCTCCCTTCATCTTCATTTTCCAACTCACTTCCGGGGTGTGGGGATCCTACGGATCGACCAGACCTACGGAGATTCTACTACGACGCGTGTGCGACTACCTATCACATTAAGTACTTAACCGTAACCAATATCAAAACCTATATTCAAGCAGACGACGGCTTATATTGTATTCGTATATGTATGTAGTTTGAGGCATTTTCAAAGCTTGTTCCTGTTCCCAAAGACGTTTGGACATTTTGCGAACCACTGCACAGGACA--CTGGCCAGCAGCTAGAC-CCATTCAGATTCAGATCGAAAGTATATATATATATGCATTTGCGTTTTCGACGGCCGGCACTCCCAGTTGGGATGTCCGCCGGCCCGGATGGCAGTTATCACAGTTACCACACACGTTCCACAC---------GGACAGGACTAGAG-----ACGAAACTAGAGGAAACGA-AGCTGGGCAAAT--CCGTTGCAATAA---TAACTCACTGAC--------------CGAGTATAATGG--ATGTACATTTCGTAATTGATCTATTTTTTT--------ACACCGATCCG---------------------------------ACAGCAATATTTT-----CCGTGGACTCCAC--------------------------GCCAGCGATCCG-----------------------------AACAG-AACCGTAGA----TATTTACGCAAGAG----------TCAGCAAACG-AAATGTAAAACACATATATTATATATTTAGTATACAACAATATGCATGCATGTATTTATGTCAACTTTTTCAATAAATTCTACAAAACTT
AACGAGAGAGACCGAACGGGCGCAGCAGCGAGAGCAAGCCGCGGCGGCAGAGAGCGCGCCTGCGCACCAATGGGCGGTGGGGTGGCTG---CCGACAGAGAGTGTGAGAGTGAGAATGGCAGTGGG---AGGGAGAGAGCGCGCGCGGCTGCTGAAGGAGGAGGGTTGCCTGTGCCGGTCGGTCAGCGACAATAGCAACCACAATAATAATAATAACAACAAC-----------AACAACAGCAGCAACAACAACAACAACAACCATACAGTTTTCATTCGATAATGTTTTGTGCCGGGTTGGCTTCACT--------------------------------------TTGTATGCAACATTTTTCAACACTGACAACTCGAAAACTTTGTCTCAACACTTTTCGAAGCTTAAAGGCAAGAATTGCAGCCACACTGAT----TACTTAAAGAATTAACTTTGAAAATGCAATTTAAAATGTTTTAGCGTTGCGTAAAATTATCGAA---AAATTGATAAGAAAGCAAAAGAAAACCAAAACTTAATATTTTTAAATAAACAAAACAAAACCAAAGTTAAATACTTAAATGTGCAGCAGAGTCAAATATTAGTCATTTATGCATAACTGTCGTATTTAAATTAAACAAAATGAAACTCAACTATTCAACCACAAAATCAA-ACCACAAATGAAATATATATAAATA---ATTAAGCTATTTAAACA-------AGAGGCACCGAAACCA-------AGTTTAATTTTTATACCTGCTAACAATCAAA------------------------------TTTCCCCTTATAGTTTTTTTTAATACTTATTTTA-----GTGTACTTCCCCGCAATT--CCAAACCAAAGAAG-TTTTAAACCAAAGCAT-----------TAGCTTATATACAACTTATTC----------TCAATAAGCATATTCAG------------CTATATTGTATTCGTATTTG--CGTAGTTTGAGGCATTTTCAAAGCT------TGTTCCCAAAAATTTCTAGAAATTTTGCGAACCACTTAAATGAACAATTTTGCAAATTGCAAATTGTAAAACATATTCAAAACAAAACT-------TATATGTATTTCTATATTCGAAA---------CTATATTAAAATGTCAAATGAAAAACAAAACAAAAAATATAG-----AAACCTGTTCAAAACAACTTTAAAGAACATCAGTTGGGGGTTTGAGAATTTACATAGAGCGGCAGCTGGGCAAATAAATGTTGCAATAAACTCAACTCAAGAATATATAGAGATGTAATAAATATTATAAATATATATATTTCGTAATTGATGTATTTTTTTGTACGCGAAAACCGTTTCGCTAAACACACAGGAACACAATAGGATGACAAAAAAAAGAATATTTCAATGATCGCAGCCTCCGACGTTAGATTTTGGGCAATGGAACGGGGGCAGGGGTTCGTTGGAGGTGTGCATCATATAAAAAAAAAAGACAGCAAACGTAGATTTCTATTTACGCAAGAGAAATAAAAAAAAAGCAAAAGCAAAAAAAAAACACATATATTATATATTTAGTATACAACAATATGCATGCATGTATTTATGTCAACTTTTTCAATAAATTCTACAAAAA--
>n-syb 1615213 1615798|1719 chr3L 1614703 1619500 scaffold_9 2290729 2295394 - 59359|556 1176
GCAATCCCGCTGCCAGGACGAAAGTTTCTCGATTAGTGTGCTCCTTCAGCGGGCGAAAACAAAGCAGAGAAGACAAAAGAAAACCAAGAAAGGAAAACTCAGTTAAACTAGAAAATCTCGAGAATTGCAATGAAAACTCAATAATAATTTTCACTTAGACG----ATGTGCACGAGTTGGTGTGAGAGGTTTTAAGTAACTTACG--TCATAATATTAATACTAAATCTAATGC---------AGACGCTCCGGAC-AATTTGAAGTTGTTGCTAATTTGTTTATGGTTACATTATTTCATGCATAAAA-------CGGTATATATA-ATTATAAATATAAATACAAATCTAAATACAAATACAAATATATGGAACTTGAATATTACGAGTGACTCCAACCACTACCCTGTACTACCACCCTATACGGAACTAGCATCTCTACGCTGCACTGGCAACAAGGAGCGCCAGTGGAAGCAGGAGGACAGGCGGTCGCTTCCCGA----------TGTTCGCAGCTCTTTGAACTCAGTTTCCTTAGCAAATCGACTAGACAAAACTAACAGAATCATAACTATTTCGGAACAGACGCGAAACCAAAGAAATGAAATCTAAGC-T
GTAATTAT-CGAACAGTTGAAACAGTTTTCGATT--------------GCAAATAACCTCTAAAAAAAAAAAACAAAAAAAAC-----AAACAAAAACTCAGTTAAA----AAAGTCTCGAGAATTGCAAGCAA--------AATAATTTCTATGCAGATGCGACAGATGCA-----------AAAACATTTTAAGTAAATTATGACTCATAATATGAATAATAATTATAATACAAAACTAAAAGACGCTCCGGACAAATTAAAAGTTGTTGCTAATTTGTTTATGGTTACATTATTTCATGCATAAAAACAAACTCTATATATATACATAATTAATATATATATACATATATATATATTTATATATATGCATA----------TACGATTGAAGCTA-----TGCTATATA----TATATTGTACTTAATATACTTAACCCCTGTGCGCTGGCAACAAGGAGCGCCAGCGCTGGACAAGGTTCA---GGTTGCTTGCCAACAAATTTTCGCATTCGCAGCTCTTTGAACTCAGTTTCTTCGGCTAAAGCATGACAAAGAACAACAAGAA---------------AACA------AATCTAGAGAAAC----TCTAAGCTT
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ATCAATTTAGACGAATAGTTCTGTGCATTTTAAACCTTGTTCAAATCAATTGATATAATTATTTACACGATATATTTAAAAATACAAAGTTAAAACTTCAAACTGTAA
AATA--------------------GCATTTATAACCAGATATCAAACTATCG-------CATTTGTAC----TCGTTAGGACCAGAAGACGAAAGCT-----------
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GACGGACTAGCTTGTCGCTTTTAATATAAATGTTTCCAACACGCCGAGCGAGACCCCATAGTTTAGTTTTACACGATCCTTGCTTATTATGTA-----TAAAGTTCAGTATCTGTATATTATAATGCTATAAAATCAAACCAAA
AACGGACACACGCGCACCCAT-----TAAATGTTTCT------------------------TCTAGTTTTAA-----TCATGTCTATAAAGTATCCATTAATATATAATATATGTAT------ATGCAATACA--CAATTGAAA
>CG17249 1629462 1629513|1724 chr3L 1629047 1632083 scaffold_9 2304547 2307582 - 103379|432 508
GTTTTCACTTT-------------ATGTACACCTAATCCTACAATATATGCTTA------------ATATTACTGTA
GTTTACATTTTTAATGTGAATTACATTTAGACTTAATACATAAATATATATAGAGATAAGTGTAGCATGTTGCTGTG
>CG7967 1634964 1635168|1729 chr3L 1634082 1638782 scaffold_9 2311832 2316719 - 110227|1082 1308
-GCGTACACATCCACATTCACACGTATTTAGGAATCGCTTCCTTGGCACAGTTATAGCTTAGAGCACCAGTATAATGCCGCATAATCTC---------CTGCTAATCGCTCGTTTGAGGACGAAAGT-AAAACGAAATTCAGATTGACTGACGTTGGATTATT-----AATTTTAAATAT---GTATGAGTTGTTC--AAATTTATTAAAATTGTTTCTAAA--GTC
CGCAAATAAGACACTAATCCCACACAGTT--GAATC------------CAGTTAAAGCTTGGAGCACGCGCATATT---TAATAATCTCAACTATTTGCTGGCAATTGCAAG-CTGCTTACGAAAACAAAAACGACAACCAA--CGGCCGATGTTGAATAATTGTTGAAACATTATGTATTGAATATGAGTTATTCAAAAATTTATTAAAATTGTTGCTAAAATGTC
>CG7971 1637775 1638092|1729 chr3L 1634082 1638782 scaffold_9 2311832 2316719 - 110227|4033 4382
GTGTTAACCGCGTCGCTGCGCAGGATGTGCGGCGAGTCTTGAGGCA-CAGGTGCCCCCCACAATCATCACCA------------TCATCGTAGTCACCTCCTCTAGTCAGAATCCTAGTT----------TTAAGATAGTTGTTATGCGCATTTAACTTGTTTTACACTGCATTCCGTAGCCCTAAGTTAGTCATCTGCCCATGAATTTACTAGCGAAATTATATTGTAG--------CGCCGATAAAAAGCCAATAATTCTCGTTTGTAAGCCTTTGCTCGATTATTTGCTAGTTCTAAGCTGCGTTTTAATAAAAAAAAAACAGACATTATTTGTTGC-ATCTCAAAA
GTGTTAACAGATTCGCTGCGCAAAATGTGCGGCGAACTGTAAGTCAGCCGGAAACCCCCCCAACCCTAGTCAGTTATATATATATAGTCGCAATAGGCAAAACTAAACCATGCCCTATATGATACTTAAGCTAAGAGAATTCTTTTTTAGACACATTCCCTTCGAGATTAAGTTGTAAAGTTTGATTTAGGCCATTT--CTTTGAATTTATTAGCTAAATGATATTGTAGACACACGGCCATGATATAAGGCCAACAATACTCGAATATAA-------TTGGATTACTCGCTAGCTTTTA---------------------AATAAATATTATTTGTTGCCATTTCAAA-
>CG7971 1638410 1638652|1729 chr3L 1634082 1638782 scaffold_9 2311832 2316719 - 110227|4752 5065
TGACTGCTTATATCCATTACACGATTGAGTTACAATAATTTT-----ACACCTTA----TTTATACAGCAC-GAACTCTTGATTTCTTC---TAAATGGTTTTATTTTTT-CAGCT--GACTCAGGAACTA-CTTATAATTTGATTATCTTAACTA-CTCGC----------CAATCTT-CTTTTATATATTTGTAGCTAT--CAAATTGT----GTGTCATCCTGAT---------------TTTTCG---TAATTTAGCCAAGCCGC---------------AAATAAACTTTGTCACTTTACCGA---TTA
CAG------------GTTATCCGCTTGAGTTGCAATCTTCATTTCCAATGCCCGAAAATTCTGTAGAGCACCTGATTTACGATTTATTTGATTAACTATTTTCCTTTCTTACAGCTCAGACTCAGGAATTATCATTTAATTTAAATTTCTTAACAAATTCGCTTTCTAAATGCAATATTATTTTTGTTCATTTGCCATTGTGTTAAATTGTATTTGTATTTTCATGATAAAAACTTTATTTTTTTTTCGATTCAGTTCAAGCAAACGGCTTTTGTTTGTATGCACAATAAATTATGTCAAT--GCCAAGTTTTA
>CG7971 1644122 1644636|1733 chr3L 1643951 1644735 scaffold_9 2322828 2323676 - 10264|191 783
GAGTCCTGGCCGGAATCCGAAACTTGAAACCCTCGACAATCGTAGCTTTGTGTTTGTTTCCTTTGCTCTTTCTTTGGA-------------------CTCTACAGTCATGACTTTTGATTTGTTCC--------------------------------------------TTATCGTACATAGTAAACTGTAAACACGTGCGCTTAGAGCGTGAAAACCAATGATACTATGTAACT---ATCAATCAACTGCTTAATACATTTTGT--TTTTCGTCTCTACTCCTTCTTTTACATTGCATTTGAAACC----------ACAAAAGGGACTCATATGAGAAAGAAAGTAAAAAGAAGCGAAAAGCCACGTACAAATGACTCACACTTAGTTTTAACAAAGCTAACACTATTCAACAAGCTATAAGAACCAATCCAATCAAGTGAAATGTTTCAAATGCCTTTCTGCAATATATACTTTCGATATCCTAACACTTGCCAAGACAATCTTTTATTTGAATCCGTGTGCAGCGAGAGTGAGTAGAGTGATCAGGGATCTAAGTACGTATGGGTTCTCCACTAGCCAACACTTTACAC
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AGATTCTTTTCTATAAACAAAGTAATG-CTAAGCTGACACGGTAGAGCGAGGATGAACGTTTCAAAGTTGTCTGGGTTTAAT-AAAACCACTCAAAAACT--------------AA
AATTCTTTTTCTATAAACAAAGTAATAACTAAGCTGACAAAATAGAGCGAGGATGAACGTTTCAATGTTGTCTGGGTATAATAAAAAACAAACAAAAACTCTAATAACAACAGAAT
>RpL23A 1650722 1650877|1741 chr3L 1650828 1651932 scaffold_9 2332126 2333235 - 53012|0 49
GCGCTGCAATCTGCGGTAACGTGTGGAATGGGCATCGCGTTCTACATTTT
GCA-TGCAAAATG-----------GGAACGTACATCGCGTTTTACATTTT
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CT
--
>drpr 1699121 1699831|1798 chr3L 1699131 1699730 scaffold_9 2398172 2398735 - -1111|0 633
TTAAGTTGTTTCCTAGAACTTCAG--TTCATGCTGTTATGTATTTCTGTGTAGCGTAGCATTTGTCTTGCATTC--------GATATGTAATTGTAGTTTTCTTGTAGTTCTTGCTCAACAAAGCCATGTCAGCTCAACCAATTGTAAATTATTATTTAGGGGCCCTTTACAACC-CAGCAACGGTCCT--------CACTTTTGTAAATGTCTCCTTCATTCGACCCAAATTGTGC---TAACATTTATGCTCATATAGGCGACTAACTCCCTAAGTGAAATCATATTAAATTAAGTACCTACAACACCTCTTCCTGGTAAAATTGCAGAGTGCCTGTGAGACAAACTCGGATCGGAGGTTGCAATAATTTTAAATCGAACCC----ATGCATATACAGATTGAAATCAATAGCTTAAGTATATGGTATTTATATTTTTAATA---AGAAACTTATTTTTAGAGTGCATAAACAATACATTTATAGAGATCATTAAA-----AAAAAATAAAAAATTAGTTCAAATATTGGAACGTTAACCCATTTATAACTACCCTGAAAATCGTTATGTTATCTTCATATACACATATCAATTCTGAGTGAAACGTGTATAATAAAATGAATAATACAAAT
TTAAGTTGCTC------ATTTTAGACATCGTACATCTAATTAATTGCATATATAGTAGCAACAGCTCTTCCCTCTCAGTAATGAATTGTGCTGTTGATTATTGTATAGAAATTGTGAAACATTGGCGTCTCAGGGAGGC--GCCGGACATTAGCATT----ACCTTTTTAGAGCCGCATCGGCGGGGATTACGATAACACCTACATAAACATATTTTCATATCAAAT--ATTTAAGCATATGATATTTATATTTTCGTAAG---TTAATTGTATAAAAAAAATGCAATGAAGGTAAAGATCAAAGA-----TTTCCCAATA---------ATTGATTGAAAAACAAA---AAGTCAAAA-----AGTAATTT---ATCGAATGCCAAAATAATTAT-CAGAAAAAAAT--GTAGCTCAAATTTTTGTAGTTGAAATATTGGAGACTTACAAAATTGTTT-----GTTATTATACAATCTATTTACCTAAAACATTTACCTTTTAAAATGCAAACAAATA----AAATATT--AAAGTTTACCCAT-----------CCCAAAAACATGACACCTTCTTTGCTGCGTCGCTGCGACGCTAAGT---ACATATATTACAAATTAACTCAAATAAAT
>drpr 1699121 1699831|1799 chr3L 1699816 1701905 scaffold_9 2398793 2400901 - 81853|0 16
GCAGCCGG-AACAGTCA
GCAATAGGCGACAGGCA
>CG18173 1719386 1719762|1812 chr3L 1719188 1721199 scaffold_62 311059 313135 - 26765|232 687
TATCCCCCGC----------------------------GTGCCCTGTGATTTAACTGAATT---TAATGTAGAAGTAACTATTAGAAATGCAATTTATGTAGGGAATTGTGAAATTAGGAATCTATTACAGTCCA---CTTCAGTT---ATATATTATCTTTATGATTTAATTCCTACT--TATTTACTTGA------TAATGCTGTGTAACTAGACTCGCAATTGGAAAGGTTTTCAAATCGATTAGGTCATAATGGGTAGGTTTTATTTCATGTGGAAAACTTTATCAGTTGTCATAAACTACAATGT--------TTAAATTATAAGCTATTGCATTTAAGAAGCTTAACTTTTT---------------------GTATTGCCTA-TATCTTATTTTAAGTAAACAT--AGTCTGTTCCTTTGACATAATT--AAACATTTTAATCTACTTG
TTTTCTCTGCTGTGATAAGGCCTACCGAAAGTTTATAGGTCCCCTCAAATTTTGTTTGTTTCTATTATCTAGCAGGTGATAAAGTAATCGTGACTAAAGTTCATATACGAATAAATCAGAGTATATAAAAATACAGAACTTTAACTTTAACAAAATGTTTCTGTACATTAATTAATACTAATATTTATTTACATAGATTATTTCTATTGAAATTAATTCT--------AAGATTTGCAAGTC-----------AATAAGTCGAGTTTTTTAAGTAAGGACAGCCTTA-----------AAACTTCAATATATTTGCTTTGTAATTAGAGGCTAAC-CATAAAAATAATTTTGTTCTTTCAAATTTAACGACTGGAACAAGGATCGGCTAAGATCGAAAAAAAAACAACCAGTACGTTTTTTAGCTTAACACAGTTCGAAACAT----ACCTACTGA
>Cht2 1736078 1736164|1824 chr3L 1734993 1736115 scaffold_62 327708 328842 - 18506|1228 1267
TGTTCACGTAGTCATTAAAATCCAAA--TTGTATTTTTAA
TGTTTACAGCTGTATAAAAGTGCAAAAGTTATAATTTTAA
>Cht2 1736078 1736164|1825 chr3L 1736116 1737919 scaffold_62 329163 330904 - 70539|0 56
GAAATTGAGGGAGTGCTCCGGTAGCCA--------TAGTCTTAGAAACACATCACCT
AAAGTCTAACAAGTGCCTTAGTTTTTATTATATTTTTGTTTCAACTGCAGTTAAGCT
>Dhc62B 1742704 1742790|1830 chr3L 1741942 1755289 scaffold_235 1873 15357 + 713860|908 1009
GC------TCTATTGGGAGCCCA-AAAAAGTATTATAAAAGTATTTGACGCGAAATTATTCTCAATGA--------GCATTTATTAAACCTTGTTTAAAAAT
ATGAGACGTATATTTTATTCATACAAGGAGAAACAAGACACAAACAAACGC-ACATTATGTTCTTCGATGCGTGTGGTATTTATTGGAAATTGTTCAAAATT
>CG13933 1755341 1756133|1831 chr3L 1755362 1755959 scaffold_174 13 703 + 6867|0 739
TTAACGATCAGT-----TCTGAAATGACTGAATTT----ACTTTGATATCGA-----AAGC----GAATAGTT---ATGTATACTTTTT--GTTATAA---CACCTAATTAGATCGCTAAATTCTCTTAATTTAGGGCCAAAGGAGATACGC-----TTGATCTGA-AGCTGTTGCGTA-TGAGATATGAAAACGTTTTTAAAGTACCTAGACACAACATGAAACACACACAAGAAGCCAATTTAAATAATGTCAAATCAAACACGTGCAATTTCTTTGATACGAATATATTG----AAACTATTGTGGGAGAGACACGCTCATCTATGTTTTGTAATTCTATAC----GTACAACTTTGTGAACTGTAATGCGCTTTACACTATACAAGCACATCCCGCCCCCGCACCCAACGGCCCCTCACCCCGT-------TTCCAGTCCCTCATGCTGCGTAAGTTATAGTAGGA-----------------------CATAAACTTAAGGCTGTTTTTTGACAAACATTTCGGG-----TGTTTTAGAATTTTGTATATTCGAACGGAGGAGCGAGGC-GTTATGT----------------------------------------------------AATTATTATTGTAACTATTATTATTGTTGCTAAAC-------------TGTTGTTAATCTCTGTATCTATAATGTCATTTTCAATCGAATTGATAACGCTATCGAT
TTAACGACCAATGACTACTTGAAATCAATCATTATTGCAATTGTTATGTTGCCCCTTAAGCTATGGAATATTTTACATGCAAATTTCCTAAATTACAAACGCACACAACCATAT-GTTAAGTATTTACAGTATATATCAAATATATATATATAATCATGCATCAAATAATTATTATGAATTAAGATATGAAAACG-CTTAAACGTACCTAAAAAC----TTAAACAAAAACAAACATC---------------CAAATCAAACATGTGCAATTTCTTTTATACGAATCTATTGTTCAAAACGCTCATAAG----------TAAATTATGTATTGTGAATCTATTCAATTGTATAACTTT-----------TACGTGTTGTGCTTCAAATGCGCATAT--GCCCCGCACACAGCCCACCATCGCCCCCTAAAACTATTCTTATGCCTACCACGACAGAA--TACCCCAGCACAGACGCCCAGACACATTTCTTTCATAAATTTAAGGCTGTTTTTTGATAAATAATTCGGGGTTCTCTTTTTAGAATATTGTATATTTGAAGGCAATTTAACAACTGTTATACACATATATATATATATATATATATATATAAATATATATATATATATACATAAAATTATTATTGTAATTATTGTTGCTTATAACAAAAACAAAAAAAAAGGAGTTGTTAATCT---GATCTGTAATGTCATTTGTAATCGAATTGGTACCGATATCTAT
>CG13933 1755341 1756133|1832 chr3L 1756027 1758330 scaffold_174 778 3311 + 96268|0 137
CGAGTGGAGCGGCCGAAGGACCAATGAATC-------------CCAACCGCAGCGAACT--AGAGTCAATCACTA----------------CTGTTGCCCCTAGGCTATGTAATGTTTAATACGCATATTCGCCTACC
CCAGTGCAAGGGCATTCAGGACGTTAATTCAACTATTTTGTAGCTGAAAGTAGCTATTTTCAGAGTAAACAGCTAAAAACAATTGAATTTGTTTCTGATTTTTGCCTTTTTATTGCT--AAAATCTGATTTGGCTACT
>CG2021 1760540 1760574|1833 chr3L 1759209 1761361 scaffold_174 3914 6205 + 86156|1422 1465
GATAGC---------GAATAAAACCAGTGATTCTCAAGACTTAA
AGTAGCTCTTAGTTCAAATAAACTCATCAAATTTTA-TACATAA
>alpha-Spec 1762643 1762713|1836 chr3L 1762135 1764270 scaffold_174 7173 9103 + 61705|529 599
AGAGCCTGCATTGTCTTATTTAGTGGCGCCTGAGCATATGTCTTACAATTTAAAGTATATTTCTAAAAACC
A----TTGCGTTTCCT--TCAAATGGCGCCTGAGAAAATGTCTTGCAACT-------TATTTCTAAA----
>dlt 1773157 1773224|1850 chr3L 1772893 1776119 scaffold_174 18767 21996 + 70222|290 375
GTTTAAAACTGTTGGTTA-----------------TGTCATTTAACGTTTAT-GTTTCGAATAAAGTGTTCCCTTTTTGTATGTGT
GCTCAAGA--GTTAGTTACATATATCATTCTCATTTATCATACAATGTTTGTCGCTGTTAATAAATACTCTATTTTTTGCAAAAGA
>JTBR 1785538 1785766|1854 chr3L 1782569 1786871 scaffold_9 904389 908564 + 175872|3024 3283
CC------------CTCCGCCAA-------------ATCATCGATTCCCTTCCCCAAGTGATACTCATTGACC----GTACGGAAGGTACATTATTTAATTTAGTTTAAGTACATACACTCTGGAAATACCATGTTAAAATTCATTTGCTAATACTAGGGGG--TTTAATATATTGCATACTTGTGGAATGCTTGTTTTCAGGGGACAAACACAATTCGGCGTTAATAATATGCATAACATTTTGCTTCGGTAATAACAA
CCGCTGAGCAGCAGCCATGCCAAGGATACTCAACGCATCATTGTGTACATACATATATATATATATATTAAACTATTGTAAACGATTTGCATAATTTATTTAGCTTTAAGTACATTAAATTCACACACAC----TTAAA---------CTAATACTCGGGGGAATGGAATATATTGCGAATATCGGGAATGCA-GCTGTCCCGGATCAGGGACAAGCCGAG---------------------------------------
>CG13935 1816168 1816368|1884 chr3L 1816020 1816231 scaffold_9 975426 975643 + 1016|159 225
CTTATTTAAGTTATGCAACAAATTTGTAAAATAAAGATTCGAAAAAAAATTCAAGTGGA---AGAAC
CTAATTTAAGTTGTGAATTTTTTCTGTAAAATAAAGTTTC----ATCAACCTAAGTGAACTTATAAA
>CG13935 1816168 1816368|1885 chr3L 1816368 1818064 scaffold_9 975898 977558 + 34655|0 0
G
G
>CG1919 1823810 1824323|1889 chr3L 1823533 1824821 scaffold_9 985944 987301 + 30963|293 915
GGAAGTGGAGCAGT----CCGCTGGATGCACCACCTGAAGCACCACCTGCACCGCTAACA-----CCACTCTTCTGTAATTTATTAAGCACGTTGACGACCTCACAAAACGGCTGATCGAT-CCACTGACGAAGCCTGCTAAAATACTCAGTACCACAGTCATGTCCATCAT--------------GTCCTGCCGTGGATTCCCCGGACTTTCCCG---GCAGCCTCTGTCTCCCTCACACACACACACACACATTGCCGTCTCTG--------TCTCAGCTTTCGCGCAATTCTCTCTTTTGTTTGTTAATCAACCTTCTCTTTAATTGTAAATAATGAAAACATCGAGTGAGGAACAA----ACGCCCATCCTGCCAC--------------------------ACGCCCACGAAGAAGAACCAACCTGAAAAGATGAAGAAAAACGAACAAAATGTAAAAAAAAATAATAAA----AAAAAACACATGTATTATAATAATTTTG-------TGTATACTATAA--------------------------------GTTTGAAGCTGAAACGGCTG-ACAATGCTATAAATACAAAATGTAGAGAATTATAAAAATTCAAA
AA----GGAGCATTTCAACTGCCACGCCCACCATCCAACCACCCAACCACTCAATCACCATACGCCCACTGTTTCATATTTATTAACGCACG-CAACGACCTGACCAATGCGCT--TCGATACCATTCCCG--GCCTGTT-TAATACTCAAGTCAATCACTTTGTAAATAACCGGAAACGGATGCGGACGGGCAGAGGAATCCTCCTGCTCACATATGCTCCGTCTCTGTCTCTCTCTCACACACACATACACACACGCATACACGCATACACATACCAGCTTTCGTGCAATTCTCTATGTAATTTAAACATGCAACTTCTTTT--ATTGTACATACAAAAAAAACACGCCCATCAACAATGCCACGCCCACGAAACCACGAACAACGTCATTGCATAAACGATAGATGATCATGAAGTCGAAGAAAATGAAGAAGAAGAAG-AAGACGATGATGATGATGAATAGAACAACATAATGGAATATACACATACACAAATATAAATTTGGAATATTTATATTTTGTAACATGTCTCATAATTTCTGCCCTAACTATTAAGTTTTTTAATTGAAACTGCGACAAAATGCTATAAATATAAAATGTAGTGAATTACAAAAATCCAAT
>R 1842646 1844188|1913 chr3L 1842431 1844861 scaffold_9 1017120 1019572 + 52944|231 1969
GACTTCCAAAAACCACCAAAACTAAAAAAACAAAAAAAAAAATATATAACAGAGGAGGAGGAGAGAGGAGCAAAAGTATAAGCGTAAAGTAAAGAATTTTCAAATTTTTTTCGTTCTCGTTTCG--TTTTGGATCCGATGGCAATTGTCGAATTGAAATAAC------CAATCTACTATATACAAGCAAAACTTAAACTGACAAATGTTTTTAACTGTTTCAAGTT-TTTGTAATTATTACCAT------------TTACTACTATTATGATTG-TACTAT----TTTTCGCTGATTAACCATTAATTCATATGGGGAATTATTATATATATATATCTACATATTTAAATATATTTGTCGTTCG---------TTTTTGAGCCGTTTTTTAAATTATGCAACAAGTG-------------------AAACATTCGTAAACTAAAACATTCGTATTT-------------------ATTGA--TTCTTTTCGATT------------------GTACTCTACACATCTACAACTA------CAACTACTTATACACGCGAAAGCCCAACCAACAACAAGTATA---------TCTTTAAATAGAACCGAAAACAACATTCGAAACACAAATCAAATTAAGCTAAAC------------TAAATTGTACGCCTAAAAGATAAAGATAACAAATTCCACGAGAGAAAT------GAGCAAATAAATCGAGAAA-GGAAATGAATCATGAATAAGGA--ACATATTTTATAAAAATATTGTATGCAA---ATGATGTCAAAATGTTGCAAACAACCAGAAGTAATGAGCCCCCTCCCCCTTAGAAATTAGTTTAAAACAAATTTACAATTAATTGTTT-ACCACGATCAGTTGCATCAAATCTGAACCCCCCCCCCCAAACACACACATACCAGCCACAT----------------CCCACACACACACACACACATTCGCAACCAGAACTCACACACACAAACACACCTACACAT----TTCCGGCGCGCTCTCAGAGAGCGAAAAAGCTACACGAAAACGGAAGCGGAATCGAGACAAGAGGCTCCTGCGGCCAAGGCTCATTTCC---GCTTCCTGGTAAAAAGAAGAGGAGCAGGAAGTGCAGAGAGAGCCACAAATTCTAGAATATTTAATACATAAGAAATGGTTTAACACAAACTAAACTGTC----GTGTCAATCCCAAAATGAAAAGAA---ACCTAAAAACGAAGTAATTTACAAATAT----TTCATAATAAACATTGCATAAACTTCGCGTACGAGTAGTAACCAATATGCCCTTAAATCAAAGTCTAAACACAGCCAACAACCAACATTAAAAGTAAACTAAATAAAACCTAAGCCCAAGCGTA--TATATTAAATATATGATAAAGATACAAATCATTTTTGAACATAATAAACAACAAACAAACCAACCGTTACAAT-AACATAATGTAATAATGAG-------CGTGTGAAAAA-------------TGTAATTGAAAAACCATTTTTTCGAACT------TGTTTCCCTACTGGTCGCGTTTTTGGGACCCCACACAGAGCCTCTGATCTCAGAATCCTGGCAGTCCCGAATTCGCGACGCAGTAGGTCGACATGATCGAGCATCTTTTAATTATTAATAAATGTATTATGTTTATAAAAAATTAAAAAGGAAATGCAAAAACAAAATAAAAATTAAATAAATTCA
GACTTCCAAAA------AAAAAAAAAAAATCATTAAAAAAAAACCAACATAAACAAAAAATCGAAGGAAAGCATACAAAACCCCCAAAAGTTAAGATTGTCAAAATTGCAATAACCAAGCTCCAATATTTACAAAAAAAAAAAAACATACAAAAAAAATAATAATTAAAAAAAAATAATATAAAAACACA--TTTAACTGAC-AATGTTTTTAACTGTGCAAAGTTCTTTGTAATTATTACTACATACTATTACTACTACTACTATTATTATTATTACTATGCAATTTTTGCTGATTAACAATT-------------AATTATTGTAAACAAG------------AAATTATATTTGTCGTTCGTTTTTTTTTTTTTTAAATATTTTTTTAAATTATGCAACAAAAATTCAAAGCAAAAGAAAAGCAAACATTCGT-AACTAAAACATTCGTATTTCTTTTGTTTTTATTTGATAATTGAATTCCCTTTCGATTTATACACACATAACATAAACACAATAAATATATACAAGAAATTTATCGTATACATATATACATAGAAGATCCATAAATAATAAACAAATGTCGTTGCTCTTCAAAAAACAATAAGAA----GTTTAAAATGAAAATCAAATTAAGCTAAACCTAAATCTAAATTCAATTGTATGCCT-----------ATAACAAATCACTTGATAGAAACCAAGAAAAAAAAAAAAAACAAGAAACAAAAACAAAACAAAAAAAAAAATCACATATTTTATAAAAATATTGTATGCAAGATGAGATGTCAAAATGTTGCAAACAAACAGAA------AATCCATT----TTTAGTAATTAGTTTAAAACAAATTTACAAATAATTGTTTAAAAATGATCAATTTCTGTGTAAGTAA-----CATTAACAAACAAACAAAATGCGAGTACATAATTAAAAAACAAACAATTGCACACATACATATATATACGCACAC---ACCCATACATCCATACACTCACACACATGACACTCCGGCTTGCTCTGAGAGCATGCAACATTTAAAATTAAACAATAA-ACAATAAAGAAATCATTCAGTAGTGTTAAATGCAAAGTTGCAAAGTTTTC---------------------GATTTGC-GCAACAATTTCAAATCCTGTTATATTTAACGATTACAACAAATCCCAACCAAAACATGAGATTCGTCTGTGTCAATCCAAAAACGAAATAAATTTATATAACAAC-AAGAAATTTAAATATACACGATTTATAATAGCCGTAACAGGTA-----------ACAAGTAACCAATATGCCCTTAAATCAAAGTCAAAAGAGAACATATAAACACACACAGACACACAC-ACACATAAGAGAATCCAACGTGTAACCATAATAAATGTATTATGTTTATAAAAAATAATAATAAAAAGAAAAAAAAACAAAACAAAAAAATTTAAAAACAAAAACAAAATAAAAATTAAATAAATTCATGTAAGAAATGAGAAGTTTTCTTGTATTCTTAAAATTATATTTCCATTTTGCTTTGTGCTGCGCATTCGCTAACGTTTTACTGGCTT------GAGTTTTGGA---CAACACTTTGATTGGCCCA----CCAGAAATAATACGAATACGTG--CGTGGAATTTTCAAATATT-TTTGCTGTATTTTATACTTGGAATAT----------------GAATATAATAG----------------
>HBS1 1846415 1846564|1918 chr3L 1846188 1846486 scaffold_3 3607507 3607879 - -1038|271 377
ATATGAATTGATTAAATCGAAAAGACGCTGAAGCATTGGAAGAGAT-------TTCGGTCTG----------------------------ACCATTTTAGCGGTATC
ATACAAATTGGATAACCCAATAAGTCTCTGAAGCCCCCAAAGGAATTGTTAAATTTAGTCTTTATTACTAGTTGAGAGAACAAGAAACGCAAAATTCTAGCACTAAC
>HBS1 1846415 1846564|1919 chr3L 1846487 1848690 scaffold_9 1021250 1023491 + 114103|0 85
GTCGATGACCGCGCTGG-------ATTTTGTACGAAATTTTAGTTAGATATTAACTTTTGTTGATTTCCTAAATATACA-TAGTTT
G----AGTTCGCGCTAATAATCTTATTTTTTACGAAATTTTAGTTAGTTTTTTAATTTTGTT--TTTTGTAAATAAAAGCTAGTTT
>dre4 1855105 1855292|1927 chr3L 1853256 1855130 scaffold_9 1031297 1033194 + 53623|2008 2033
AATATAATAAACTAATGTAAGAACTA
AATCTAGTATATTTAT-TAATA--TG
>dre4 1855105 1855292|1928 chr3L 1855132 1855274 scaffold_9 1033519 1033651 + 1792|0 146
AAGCCTGTGTGGCACTCCGTTCGTAATCTAGCTCTCCTGTTACCATTGTCTATCTGTTA---AAGGACCCGCCACCCCAATCCCCCGTCAC-TCATTTTTGTCACGCTTCAAAAGTTGTATTACAAATTAAATATAATACGATACAT
AAAACCGTGT----CCCCGTATATAAACCACATTGTATTTCACTGTTGAACCTATGTCACCCAAAACCTCTACAATCTTTTTTCCCTTTACATCATTTATG----------AATGTTGTATTACAAATTAAATAATTTAAAATACGT
>dre4 1855105 1855292|1929 chr3L 1855290 1855657 scaffold_9 1033846 1034219 + 11361|0 2
GGA
GGA
>CG13937 1860087 1860219|1932 chr3L 1860041 1862340 scaffold_12 1661876 1664234 + 62934|46 205
ACT-AGCTCTGAATTCTTAGACTTTGCTAAAAACCAATGAATCAAGTTCAACGAACTCACAT----------------ATTAGCCGTCACAGTACGTAATTGCAAATGTTGATAATACTGAAGAAAACAATAATAAAATTAGCTA-------TATTT---
GCGAAACTTAAAATTCATAAAGTTTAGCGAAAGGTATAAAATAAAAGCAAAACAAAACACTTAGACACATACGAACTAATTAGCCGTCACAGTAGGTAATTGCAAATGTTGATAATAATGAATGAAACAATAATAAAGTTAATGGCAGAAACTATTCACA
>Aprt 1867424 1867780|1939 chr3L 1867219 1867514 scaffold_2 28057 28364 + -790|228 326
ACTAGCAAATTTTTATAAAAACTAGACAGACGCATATTTTTATAACGAAATATATTTGGCTC----TGATA---ACAGAATCGTATAATCT-CTCAATG
ACAATAAAAATACTACTAAAATTC--TGGGTGCATATTTTTAACTTTTATTATTTATTGCGTGTAATGATATTTACAAATTAGTCTAATTTACAGAATA
>Aprt 1867424 1867780|1940 chr3L 1867565 1868483 scaffold_12 1668490 1669413 + 26994|0 215
GACACCTTTGAGCTGCAAAAATCCGCCATCAAGCCCGGCCAAAAAGTCGTTGTCGTTGACGATCTACTAGCCACAGGTGGTTCCCTGGTGGCCGCCACTGAACTCATCGGCAAGGTGGGTGGCGTTGTCGTGGAGAGCCTGGTGGTCATGGAACTAGTTGGACTGGAGGGTCGCAAAAGGCTGGATGGAAAAGTGCATTCCCTCATTAAGTACTGA
GACACATTTGAGCTGCAGCGCGCAGCCATCAAGCCGGGCCAAAAGGTGGTCATTGTCGATGATCTTCTGGCAACGGGTGGCTCACTGTTGGCTGCCACGGCGCTGGTACGCAAGCTTGGCGGCGTAGTGCTGGAAAGCTTGGTCGTCATCGAGCTGGTGGCATTGGATGGCCGCAAGAAGCTGGACTGCGATGTACATTCCCTGATAAAGTACTGA
>Aprt 1867855 1868092|1940 chr3L 1867565 1868483 scaffold_12 1668490 1669413 + 26994|290 527
TGACATATTCGGAGCCCTCACCGATCCGAAGGCATGTGTGTACTTGCGCGATTTGCTTGTTGATCACATCCGGGAAAGTGCTCCCGAGGCGGAGGTCATCGTGGGACTGGACTCGCGGGGCTTCCTCTTTAATCTCCTCATAGCCACCGAGCTGGGCCTGGGATGTGCTCCGATTCGCAAGAAGGGCAAGCTGGCGGGAGAAGTGGTTTCCGTGGAATACAAACTGGAGTACGGTATT
TGACATATTCGGCGCCCTCACCGATAGCAAAGCCTGTGTTTATCTGCGTGATTTGCTGGTAAAACACATACGCACCGTTCATCCAGATGTGGAGCTTATAGTTGGTCTGGATTCGCGTGGTTTTCTCTTTAATCTGCTGCTGGCCACCGAGCTGGGCGTGGGCTGTGCACCTATACGCAAGAAGGGCAAACTGGCGGGCGAGGTGGTCGCCGTAGAATATCAGCTGGAATACGGTTCA
>Aprt 1868169 1868218|1940 chr3L 1867565 1868483 scaffold_12 1668490 1669413 + 26994|605 659
GTTATCGTCACTCGAGGTTATTAG---ATTGGAGCACTAATAGTGCTGCGA--TG
GTCAGTT-------AGTTTATCAGTCCATCAAAGTGCTATTTTACATGCGTATTG
>CG5687 1917163 1917463|1989 chr3L 1917208 1918268 scaffold_12 1739625 1740724 + 41167|0 302
AACTCGAAGCCAAAACTCGAACTCTGGCGGGGATCGACGC-TCCCCACCGGCCAATTCCTTGTGTAACCTCCATGTAACCTCCATGTACAAAGA----------------------CCAGTCGCAATCTGTTAACTGTCCTAGTTTAGTCGAAAGAGTGATTTCTAGTTCTTAAG-TCCCAGCCGAGGTTGTT--GGCTCAGTATTCTG------TACACACACTTACTAATGTTAC-TACGAAATGATTTTATGTTTAGTTCGTTTTAAGACACC--------------TAATAAAACCTAT
AATACCAAATAGATGCC----TTCTACGGCAGACGAGAGCATGACCAACGTAATATTCCTGGTGCAACC----TGTAACCTCCATGTACAAAGCTATCCTAGTTTGTAGTCAATTTCGAGTCGCAATC--CTAACTGTCTAAGCATAGTCGAATGAGTGATTTCTAGTTTGTAAGCTCACATCTATGGCTATCCATGGACAGTATTTTACTAATTTTAATATTTTTACACATGTCACGTGTGAATTTGTCCTAGTACTAATTGAATTTACAACGCTGTTCTTTGCGTTAATAATAAAATGTAT
>mu2 1926266 1926513|1994 chr3L 1924296 1927284 scaffold_12 1746133 1749169 + 93374|2036 2331
ACGTT------------ATAGTTTT-----TTTTT-------------TTGTGTGTTCTCCGCTTTTTGTTATCATTCGTTAG-CCATTATTCCAAAATTGTACATCACACATCGAAGTCCCAGA---CGAAATCTCGTTCATACCTTAAACTTATGATATTTGTATTATATATAATTGTTTGTATATGAAGTTTTGGT------TCCATC----ATAACTGTGGCCGCACAATATTTACTTGTTACTTTCCTAATGCCTGTCAAATACATCAATTACATACGT----CTAACACT
TAGTTCAATAGATGTAAATAGGTTTAAAGATTTTTGTAAAGCAAAATATTGTGAGATTTGCCTTAGATGTCGTCGACAGCGAAACCGTTGTGCCGGCTGGCCACGAGCAGCATCAAAAATTTAGAGTACGTAATCCGAATCAAGTCAGTAATCACCTAGTTCCTACTTCTACGGCCTTGATTTTTTCTGATATTTTGATGCTGCTTCCGTTTGAAAGACCTATGCCAATTAAGTATTTGGATATTATATTC-TAATTTGTATTTACTTT-TCAACTTTATAATTGTTATTTAAACT
>CG1927 1950255 1950350|2001 chr3L 1948829 1950313 scaffold_8 4353929 4355430 - 75446|1455 1517
AACACAAATGTTT-TTGTCACACGGTCAACAAAAAATAAATGCAC---TCGTTTATCACTCAA
AATAAAAACGACTATTGCTTCACGTACAACAATAA-TAAATGCACAAATACTTATTTCCTGAG
>CG1927 1950255 1950350|2002 chr3L 1950348 1951037 scaffold_8 4355482 4356211 - 28181|0 2
GCT
GCT
>sls 2023711 2023913|2090 chr3L 2023205 2024122 scaffold_8 4435770 4436810 - 25055|666 924
TCGGTGGACGACAACGAAATAAGAAACA-------------------------------------------------CTTTAGTCTTAGGTTAAGCGTATTTCAATTGTATTTTATATAACAACAACGCAACGGGGAGAACCCCCTTGATTTT--CTAGCTTTTTG-TACTTTAGTAGAGATG-ACGAATGTGAGGATGGTGTAATGTAATG--TAGCATCCCATTGATAGCGATGCCCACGACCCCCGATCA-AAGAG
---GTAGACAACAACAAAAACCAAAACAAAAATAATAACAAAAACTCAAGCAAATAGCCATGACAAAACGAATGAAATTTAGG--TTAGGTTAAGCATATTTCAATTGTATTTTAATGAA----------------------TTCTTGATTTTTATTAGCTTTTTATTACTTT-----TAATGTACCCATGTAAAGAGAATGTAATGTTCGGATTTGCGT-CCAGCAACAATGATGTCCACGAAACTCAATCAGAAAAG
>sls 2074027 2074520|2113 chr3L 2073087 2091110 scaffold_8 4499217 4516942 - 958716|1037 1561
ACTAAAACTAAGCCAAAACCGAAACCAGAGTTCGAAACCTAGCA--AAACCAAACGTAAGCGAACCGTGTTCAAACAAACAAACCAACCAACATCAACAAACCAACTCCAAAGAATGCTCAAAAAAGAATATATGAAATGAACAAAAACAAAACAACGACCGAGAAGAACTTTAACTATTAATCCCCGAGTTACTGACGTATTACATACAGTTACT-ACTACCCCT-CAACCTATCTATATATACATATATGATCAACTACTAGTCGTAAAAGTTTGAGTGAAGAATATTTTAGAGCGAGCCTGTCGAAACTTTCA----AGGATTTTTCTAAACTATCA-------------AACGAACGAGTTA---TATTTACTAACCATTGCAAAATGTAAAAAGTGAAATGCAGCAAAAACAATAAACAAAAAAAGGATTAAATTAAAGATATCTAACACGAA------AACGTAACCGAAAAAGCAGCACAAAAATATGAAAACAATTTTTAATTGA-AAAATAATAAA
ACTAAAAACTTAGCAAAACCAAAACCAGAGTTCGTAAAC-AGCAAGAAAACAAACGTAAGCGAACAGTGTTCGAA----------------------------AACTCCAAAGAATGCTCAAAAAACA-------TAACGACCAAAAACGAAAGGA--ATTATTCATATATTTATATATGCATATCT---TTTTTTACACAACGGATCCCTATACTGACGACTTTTACAGCCCAACTAACTAAATACTT----TCAAAAACTAGTCGAAAAAGTTTGAGCGAAGAATATTTTAAAGCGAACGTTACGACAGTTTCATTTTATATTTTTACTACAATATGATTTCATTTAAAACAACGAACGAGTTCTTTTAATTACTAACC------AACTTCAAAATGTGAAGCCAAGCAA-----------------------CAATTTACGATGTTTAACACGAAAAAGGTAACAAAAACAAAAAAAAAGCAAGTTTATTTAAAAAGAAATTAATATTAATAAAAAAATAAT
>zormin 2106142 2106388|2122 chr3L 2105218 2106583 scaffold_8 4526044 4527560 - 14583|1089 1373
ACT---TGTTTAAATGCAACTATTATTATTATTATTATTTGCTTTATGATTTGTTCAATGCCAAAGTTTCGCCTTATTGTGTGTATGTATTTATTGCGCCCCCGCGTCACTTA-TTCGTCTTGTGGGCTGATGATGGACTTACAA-AATGTCGCCCAAAAC-----AACCCATTATACATGCATACAACAAAGGAATATAGTATTACTTGTGTTTTTGTCGAAAAT----------------GAAATAAACAAATATTTA-------AACGA-----AAAGGAAC
GCTACACATTTAAATAACTTATATATACATATACATATTTA-TTTATGATTTGTTC-ATGCCAAAGTTTTACATTTTATTGTGTGTG---------------CGTGTCTCTAATTTTGTTATTTGGTTTTGATTTGGACCTGCGACCGTACGGATCAAAACTGGCAGTCCCACTGTATACACA---GCTGTGGGCGTATAGTATTACTTGTGTTTTTGTCGACATTTCAAATAAATCACTTCGAATCAAACATATTATTGTTTCTCTAACAATTTGTACAAGAAC
>CG15822 2136733 2137336|2144 chr3L 2136424 2139332 scaffold_8 4556437 4559183 - 62431|326 944
GAGATCTGGACAAGCTGTCCCAGTTGAAAGATGAACACAAAACGATTTCCCGCCCAATTAACCAGCGCCATTTGCTTCTCTGCCGATCCTCGACATTCTTGCCATTAATTAGTTGGCATACTATTTTTGCTGTTTTCCCAAAACCAATTTTAGCCCATGAGCTAAAAGTTTTTGTCTTTTTTATTTTGTTTGCCATTTTACTTTGCATGATTGTTCACTGTTTTCTACCAAAATTTATTAGTTCGATTGAACTTTAGCTTAAAAGATATACTAAAATGCCTGCGCAAAAGGTTTTTAAATATTTTATGTTTGAAAAATGTCTTTTGCTTATACTTTCTCTGCTTTAAATATAGTA---GTAGAAATATTTATTTAGTTAGTTCAAATTAAGTCTAA-----------GGCTTGCAAAAATTAGAGAATTCCCAAATGGTTAGAAAATATATTTAAAGTAAGAATTTAAATTCACTTACGGCCAGTCGAAATTTTTGC-CATTAATCATATGTTTAATATTTATTTATAACTATTTCTCCCACACAGTCACAGTCACAAAACATAGTGCAATTAATATCGAACATGTTTTACCCCAAAAATAAAGCTAATCATTTATAAT
GAGATTTGCCCTCGC--CCCGAGATCCAATAT------------ATAACCCGCCTAATTAAGATGCGCCATTTGCTTTGCTGCTT--------TGTTCTTGCT---------------TGTTGTTGTTGTTTTTTTCTCAACGTT-TTTCTTGCCAAAATG----AATTTGCTGGCATTTTTGTTTGATTTTAT-TTCTAATTTATTTAAGTTTTCTCTTTTAGCT------------------------ATTTTAGCTCATGAGCTAAAC----------------AAATTCTTTCAGCATT---TGTTT------TGTTTTCCTTTAATTATTATTATCTTTTAGGAGCAGCGCATGTTTTAGTATTTATTTAAATAATT--AATGTAGTTTAATTAGTTTGTTTTGCTTGCGATAATTAGAGAATTCCAAAATAACT--TAAACACTCTCCAATTAG------CAATTCATTTATTGCT-TTTGATTTTATTGCACAATAATTAAATAATTAATATT------------TTTAGCAGACACAATTTGAGTCGGCAAAAATATTTATATT--TATTTAATATTTCT-----------------AAATTACGTAAATT
>CG5704 2153154 2153240|2157 chr3L 2152375 2153292 scaffold_8 4573549 4574483 - -6618|900 1012
TAATAATACACTGTAACTTTAGT-------------TGTAAAGGTTTTAAAGTTTGAG---AACGTGAACACACGACAAGTATTAAATTT--AAACTATC--------ATATT
TAAAAATATATTTTATTTTTCGTAATTAGAATATGCTGAAAGAGATAAGAAGAATAAGTATAACGCAAGAACATGCTATG-ATTAGGCTTTCAAAAAATCTTTGCTAAATGCT
>CG5707 2172690 2172919|2180 chr3L 2169625 2174172 scaffold_8 4591613 4595812 - 124655|3212 3442
CTGCTGCCAGCATCTCTGAG-ATTCAGTCAGCAGCGCGATGCGAAAATTTCCGATGCGAAACAAGATATTGATTTCATTATGCCGACGTGATGCTTTCTTCAAGCCTTAACGCTTTAGAGTAATAATATAGACAATTTTATACGATGTTCAAGATCCTAACAAGTTGGATAGATACTTTGCTTGTACTAAGTATTCTAACAATAAATAATGTTTGATTTAATTAAAACCAT
CTGCTGCACTCATCTCTGAGCAGTTAGTCAGCAGCGAGA-------------GGTGCAACAAAAACAATTAA-----------------------------AGGTTTTAAAAAGTTAGGTT--TAATATAAACCAG-------------------------AATTTAGATAGA-------------------ATTTTA--AATAAATCAAATTGTAGTTAAACAGAAACAG
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GCAGAAACACAAAGAGGAGGAG-----------------------------------CCAAACGATTGATATAATCAAC----------AGAGCATTTACGC-------AATTTGTTTTTGTTTGGGTTGTTTTTCAGTTC------------------ATTTCAGTT------C
>CG9018 2218816 2218957|2231 chr3L 2214131 2221020 scaffold_8 4639476 4646432 - 310814|4703 4884
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>CG9018 2219167 2219309|2231 chr3L 2214131 2221020 scaffold_8 4639476 4646432 - 310814|5161 5316
AGATCGTTATCCAAAAACTATGGGATGTTGTTCGTCACTGCCTCTATTTTATGTTACCTAGTCTAGTCGTT---TGTCGGCTATCCACATTT-TGTATTAATAT---TTTATTTGCATATTAAAAAAGAA------ACCGAAGCTAATCTAATGCA
TGTTTATAAACGAAAAACAAT----------------TTACTTTTGCTTTGCATTAAATGTTCGAATTGGTCCATTTCCAATATATATATATATATATTTATATACTTGCATTTTCCCACTCGAAAAAACGCTCCTACCTAAACTTTTAAGTTGCA
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ATTCTAT-----TGACC--AACCAGCTGCAATCATTACTTAAGCTCAAAACTGTGCACAAAACTAAACAAACCCCAAAAACGGGATAATATTAACCATGTGGTGCTTCGTTTTCGTTCTTCTCAAATGCTATACGAAATGTTAAAGTTGAAATGCATTGTTTTAAATATAATAGTACATAATTTATAAATGATTTATA---------TATTTATCTATATATATT-----------ATGTGTATT-----------------------TTATATGTTTACCCTCCAG---ATCATCTGTATTATACGAATATCTATATAAATATATGTATATGTAATATATCTAAAGTTTAAAATAATGTTTGTCACATTTAACTGTGCAGATTAATT
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GCCAGAGTCAT--ATAAAGTTGTTA--------------TAGCCATTTTCGAAAAC-----------GCTACCATTGATAATTTTTTAGTTATTC-------------ATTTTGTTGTGTAAATAGTTGTGA
>ecd 2247113 2247179|2254 chr3L 2242729 2249348 scaffold_8 4664246 4670979 - 223957|4647 4762
-CGGGATTACAGGAATTAG---------------------TATAGTCTTAAGTCCATT-------AAATAAACGTCAATGTGAATATTTCAATGT---------------------
ACAGGAACGCATCATTTAGCATTTAAGATTACAATCGCATTATGGGCTTAA---CATTCAAATCGAAATATACATCTCTATATACATGTACATATGTGTGTGGGTGTATGTGTGTG
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GTCCGTATCCCTCCACTTTCTTAGGCTTAAGATTCAAACTGATTTGTTGTCGTTACTGGGTCTCATTAAAATTTTGGTGAATATTTAT
----GCAACCGCCCTCGCTCTCTGTTTGAAGGCTT------------------------GCCTCATTTTATTATTCATAAGTTTT---
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CTTCGTTTTCTTGCTTTAGTTCTTTTTT------------ATATGTTAGCCACAATTGTTTGTTAAATTTTTTCGCT--------TATAGGTCCTAAACTGTATGATAATTTAA-GCCAGCCAGATATAGCCAATAATT------ACCATCTGATTAACACTTCACTTA---TTTATCCTATATATATATATATAAAAAACCATAAACACTTTTCGATTGCTTTGTAAAATGTTTTGGAAAAAATGAGAAAAGTAAAACA
>mRpL23 2356373 2356440|2361 chr3L 2355777 2357049 scaffold_8 696564 697850 + 48997|597 680
TTTTTAGTGTGTAATCGTAGTACTTTTCGTTT-CAACGGGTAAATAAACATTTATTTCGAAAGTCC---------------GAA
ACTTTTAAGT-TATATGTAGCTTAAGTTGTTTGCAACGAATAA--TAACATTTATTTTGAAAAACCCATATTGGCTGAGTAAAA
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GAGCCTTT-CGCACGGTCCCTTTTGAAACTAAAAATTCCTCCCATTTGATATTTTAATAAATGAACACTCTCAAATGCAATTTTGACTTTAAATGAAGCGTCTCTTATTAAAAACTAAACCTG
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GATGTATCTTTAAGATTTATATGATATCGGGTTTCGGGTTCCTTTTACAGAGCATTCAAAGATTGTAAGCCTACGTA--TAAGCCTTCTGCAGGGGAAACTATACAGGGTATCTATTATTAATAAAATATAAACTGCATTCGATTGATTCCTTAGCTAGGTGTATCTCAAAGATTTATATGGGATCGGGGAAGTTTCGTGTTTTTCTTATAGAATATTAAATGATTTAAGCCTACATATAAGGTCAA--CTATTAAGGGTATCTATTATAAATACAGTATAAACTGCAATCGAGTGCACAGATTACAA
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TATTTTTTAATAAAAACTACATAATTCGAAATAAAACCGAAACATAATA-GGATACAAATACT--------AAAATAAGCAAATAAAACTTAAATATACGTAAATAGAACTTGAGTACACACACGAAAAGTATGATATAAAGAGAGCAATGGTATTTTACCTTAATTTTTTCTGTGCTGTATTCAAA---TTAACAATGGCAAATTTGTCAATTTGTTAAGAACAAAGCACATAAAATTTTTATGTACATATATGTAATTAAATTCTACGTTTGTTGATAGACCAGTGTTATTTCGTGATAATCTTTGTGTTGTCTGAAT---ACACATTAAGCTGCTATCATGTGATATAAATCGGTGTAAAAAGTTATAGGTTAG-----------------GTTATAGTTATGTATATAAATATGTATATACGATGACTGTATAAAGTACGAGAGTATATAAAGATGTGCCCACAGGTGTGCGTGTGGTATTTGTAAATAGTTTTGGAAGAATACATAAGT--------------ATGTACGTTTTCAAAG-ATAGT----TAGAAAATATTTCGTTACAAAAGTA---
>CG16758 2482236 2483068|2445 chr3L 2482867 2484014 scaffold_62 171855 172942 + 49778|0 216
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ACGAGGAAACTTCGCAGCTGCGATCGTCTGGTTGATTTTAAAATTATTT-------TTAACCCTAATTCAA-------------------GTTTTAAAATTTACAGTATAAGCTAAAATATAGATAATAAGATA--TAAGCATATGCGTAATGATTGAAGCCTGGCCTCCGAGCAGGTGGATCCAATTTTGTTGATCGTTTAATGTCCATTTTAAAA
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TTGAATTCTAGATTTTAAGCAACAAAGTAGCCAAAAACCAAAC-CATAT---ATGCATACTAAGGACTCATAAGATCTATGCATAC----CACATCCAATGCGTTTAAATATATATTTATAGAAATATACCATTAACATATTATGTATTACATAGTTATTTATCTTATAAAATAACTTATAAGAGTAAACGTATTTTATTTGTACAACAG
>CG32295 2509349 2509382|2461 chr3L 2509289 2510310 scaffold_62 196737 197731 + 213|60 93
TGACATATGTTTCAGAATCAGTTTCATAATAAAA
TTGT-TCTATTTTGTATGTATTTTAACAGACAAA
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--------AGCCG------------------CACATCCTTCCGCAAACCGTTTCTTTT----GGCAACATTCAAT-----------------ATT--------------CAAAAT--AACAACAAACATTTTCTAATTATTTTACCAACAAGCTTGCAAAACAACAAC-AAAATATCTAAAGATATCACACACACACACACACACACACACACACACAGAGAAGAACATTAAATCGTTTAAGTAAAAAGTGCATAA-GTTCTAATGAG-------AATTAGATTTTCCTATAAC-------ACACACACTCTCACACACACACACACAC-------TCGTAAAGATGTGCTTATGAAA---GCAAAGGAAACGTTTCAATTAGTAAATGTGCTATAAAAAGTTAATCTTCAATTGAGTGCACAATTTTAGGCGAGCGTTAAGCAATGTATTTA-ATAAAAAAACAAAAAAAACAACAACAAAGATAGAGAAGAAAGCGGCAAGGAAAACAGAATAAAAGAAAAACCAAACAATTTTCCAAGCTCACTCGTCGAGGTTTTTCATTTTTGCGCCCGCCCAATTCATGTTTTGATTAAAAAAAAACAAAACAAAATACAACACAT----------------GCATATGTATTATAAGGATTACATAAATAAAATCTAAGAGAACAAAATGAGAATACGCAGTTAATTTGTACACAATGCACATATATAAAAAAAAAAGAGAACAATTTCATTTCAAATGTGAATTTAGAATTGTGTGCATATTGTTTTTCTACTTAA-------------------TATATATTATTTGCCTACAA---------------CTTCCTTTTTAAGCGAAATCAAGAAAATAATTAAAATCAATTGCAATTAGAATTTTCTGTT
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AGACAATGGTCAAATGAATTACGCATATCGACGT-------------------TTATCCGTAGTAGCCACACTCAC--------------TCTAATCAAAACCAAAATGGAA-------------------------ACACACCGGCAATTGC---------------------------------------------------------------------------------GCAATGAGCATGT------TTAATTGACAATTAACTAACAATGTACTGCTACACGTGTAATAAAATAAAGCACATTAATAACCCATA----ATCA
GGCCACTGGACACGGCAATT-TGCATATCGACTTAACAATTAATCAAACCCCCTTAAACTTAGTAGCCACATTAACACTTAAAGGCGGATTCCATTTAGATTTAACAGAAAATCTTTAAATATACGATTTTTAACGCACACAAATGCAGTTGCAAATGGAATCTTGACGCGATACGTCGTCACATAGACATTCTCCCAATCGACGGTAACCGCCTACAACTCTAACCATGACGCGCACAGAGCAAGCAATTAATTAATTAACAATTAACTAAATATTTACTGCTACACATGTAAC--AATAAAGCACAGTATCAAAACTTAGCACACTA
>Pxn 2593269 2594017|2531 chr3L 2593662 2593708 scaffold_32 1401272 1401318 - 3889|0 46
AGTCACAACTGTCGCGCTTTACTCAATTTGCAGTCGATTTAATTTGT
AGCCACAACTGTCGCGCTTAACACAATTTGCAGTCGATTTAATTTGT
>Pxn 2593269 2594017|2532 chr3L 2594015 2594806 scaffold_32 1401460 1402213 - 25937|0 2
ATG
ACG
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AACAATTTCGTAATATTTATTTCAATTTGAGATT------TGCGATATGCGATTTGCGATATGCA--------ATTTGCGATTT-GAGATA---------AAAGAGAATA---TGAACTCT-GGCAGTGAA------CATACAAATATAAAACGGAAATTACCTTTATATACTAAAACTATAA--TACACAATGGGCTATAATGCAATAATTAGCTATAAAAACAATATGCAGCTTAAGCATACGCAGT--TTTCTCCACACAAACTTTTCAGCTTTATCTCAAAGTGCTCACAGTATA---TGAAATCATTTGGCATATTTCAGTGCAGCTTCAGTGCTATAAAAAAAACTCACCCTTATATCAATCCACTTTACCAAACGGTTTTTA-----TGATT-----------TTCGATATATTTGATTATGTTTCAAATACGAGATTTGTATTTGTAGTAGATAAT--ATTGAT-TACAAATATATAATTATGTTC----TGATTTGATTTCTATGTGTTTTTCGTTTCGGTTGATTATTAATATTACT-TACTTACCACTAACTAACCATAAACAAATGGCTATGGCTAAATGTGTTCTTTGCTATT-TTGTCATATAATCACAA----TAATTACATTATATTAATTTTTCGGTGTTGGTAGAAATGATTGTTAGTAAACTAAAAACAAAAAAAAAAAACAAAAAAACAAAAACAAATACAAAAACTACGTATATAACATAGTATATGTCAACTACTTAACTAGAAATAGAAGTGACTACGTTTAAGGTTACTATAAACTAAACAAAGGAATTAGCTTAGCTACGAATGCTCAATACTAATACTATACTAACGATTTCGATATACGTTATA--TAGCACCTTATATTATTCATTACTCGACATATATTTTGTGTTAGTTGAACCTTCTCTT----GGGCAATCGAATTGCCCGTAAAACACAGTAAGAACAAAGCACCAACAATAGATTTATAAGCTGAACATAAAGTTTT-ACATAATTGTTAGTCGTGTCTACTCTGAGTAATTGTCCGCAGCCGAAGACCCGTTCGATAAGAGAGTAACGAATTTTTAAACATTTTCC---------------TATATACGCAGCTTGTGTAGTACCATTAAATTAGGCTCTACAAATCGATACAATAAT------TGAACAA---CTACTAAGAATTATGAAATAGCTGTGCTGCGTTTAGGGCCAGGCTAACTGAAAACAGTTGCCCAAAACGCAGTGAACAGTTATTAAAAACTATTTATATAGAAACAAAACAACAACAAAAAAACTTTATAAATGTTAATAGTGCAAA-TTGTAG----CAGAGTTTAACTATATATTTATGTGTGTTTTAAATGTTATTAAC---------TTTATATAAGTAGCAAACAAAATGTG------------------------CAAAATGTGCAAAAAAAAACTAAAGAACAATCCAAAAAAACAAAACAAATAAGTAGCTTGTTGTTGAAATGTTTAAATGTTTTTTAACCGAAAAACAAAAAAATTAAACAAAATTGAACCCAACTTCCTTAAATGGTACCCAATCACAAGTAATTGATGTATATGTATTTTGCATACATATACATATAGAA-CATACGCCTATATCTACACCTATACACATTTGTATTTGTGTGTAATGTCATTGTTAGTGCTGTGTTTGTAAATGTTTAACATAAATACAATTTTGG--------------------AGAAAGCGCGATTATATAT--------------ACATATATATCTAGTAGATCGC--GGAGCCCACCTACTGATAATTA-----CATATATGATGAACCCACAATAACAAAGTGCTAAATGAAATATAAATCATTTCTTGAAAGAAACAGACAAAATAATAAAACTACATTTTAGACTCTTACTAAAAT--ACCGTTAAC--TAAAGCTGCTGCT---TAGCTGTGGAACTCCTGTCAGATGGGTGATAAAATTGAACTTTGATTTTGTAAAATACACTTTGTATAGCCTACATACACATACACACACACATACACATACATACTTATAACTGTAATTGTACCTATGTATTTATAGTCCTTATACAACTCGTTGAACTACACACAAGTATACATGTACATACGTACTCATATGTACTTA--TTACTATGTACTACTTCCCCCCAGCTATTGACTTAAGTACAA-----TCCAAAATGAGAACTCTATAAAATGATTATATGAGAAACATGAAAACTGATG-ACTGTAATTGTATTTTTGGCGCAAGTTGTTGCATTGACATTTTTTTGTATGTATATGTTTAATTAAAAGTGAAAGGGTGAAAATAGAAGAGCTCCAGTTCGAGCTATTTAAATGGAGCCGCTGGCAGGAAATTTAATCACATTTTATGAAAGTCAGTCGCTTATCTTTATACCTATATATATATATACATATATATATATATACCCATGTATACATAACTTTACAATTCTATACGATATCTATATACACCCAGTTATTTTGAAAATTTAAC-GCATACCGATGTGCTAATGATTTGAAAAGTAAAAGAAACGTGAAAAATAAAGTCTCTCTATATTAACTGCAAAAA
>Mrtf 2703217 2703319|2649 chr3L 2702885 2704912 scaffold_507 13 2111 + 85289|397 502
GCGGTTTTATGTATTCATATG-GCCCTCAAAGCGGCAGGGCAGAATTTTC--TAGAATTCATTAATATATTTTCCCAACTTTGTTCCGTATCGAGAAAAAACAAAA
GCGG-CACATACACTCACACACACACACAAATGCACA---CAAAATGTGCATTGAAATGGGCCAATA-ATTTGGACAAACTTGTTGCTTTGCCCATATAGACGATC
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GACG--CAAGGCGGGCGGAT--GCGGACAATAACACCAGC
AGCGGCGACGACGGGACAATAAATGAACGCAAACAACAAC
>CG12093 2756092 2756139|2704 chr3L 2755581 2757539 scaffold_12 41138 42944 + 27839|540 587
GCCAAATGTGTTAACTATTTGTTTTTAATAAACCTCGAATACTTTGCC
---AAACCTGTTGACTAATTACT---------------GCACTCTCGA
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TTGAACCACGGTGCGCTATAAAAAAAAAAAAAACAACATTGAATATTATAGAATTTATGTGTTTTTTACTGTCAACATTTGGGTGCTTCCTTTGAGTGCACTCCCAAACACACACACACAACATACACACACACGCATACGCAGCATACATATAAACGTTCCTCAAATTTACTTAAAACAAAGAAAAAAAA
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CAGCCGCCGGAGTC---CGCTGCATAGGCCTAATCTTAAG----AATCCACACAAAT
CAGTCGCTTGGATCTATCACCGTTTAGCTCTAAGCTTATGCCACAATCGACTGAAAT
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ATCTATTCAGGCTGAGGGGCTACTACTGGTA
ACCAGCGCCAGATGGGGGGCAGCTACTACTA
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GCAGCGCCAGCGACAGATGAGCAGCTGAGCAATGGATGCATTAGGACCGGATCCGGCCCAATCGAAGTGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGATGTGCGACATTGACAGTGACAGAGCGCGACTCCCGATCCACGACCGAGTAGCCATGTCATTTGGACACTGAGCCAGCTCTGGCTTTCAGCATTGTAATTATTGAGTGTTGAAAATGATTTTTACAGCAAATAATTGATAACTAAATTTAAAGTGCACACATATACACGCACGCACGCACACTTTCATACGAAACCCACACACACTC-----ACGCACACATTTACTGTAGTCTTACATTTAATTTAAAAACAAAGTAGTAAAAAGCAAAGCAAAGGCAACATAATGGAAATCATATTAAATAAACGAACGATATAATTGAATGCGATTAATTAGGCAACGCCTTGTGGACTACGAGATGATCTATAAACGGCATGGGCTGTTTATATGCAACTTATATATAATTATATATAAATTATATATATATATATAAAAGCTAACCGTAGAACAACGAGAACAACAAACAAACGCTCAAAATTCTCATATTAATTT----TATTACAACATATTTTGTTTAAATTTCAAATCAAAATAATGAA
>CG32488 2998492 2998592|2989 chr3L 2998242 2998832 scaffold_8 4047176 4047783 + 43|271 371
ACCGCATACAAATTGTAAATTATTATTGGCAAAAAATTTTGCATAAAATCAATACCACAAAGGCCGCCTGCTACGGCCTGTCTTCAATGTCACCCACAAAT
AGCGTAAATAAACCGAAAG--GGGATGAGCTAAA---CTGGCAAGACATCGA----ACTCGGCTCGGTTTCTACTATTTTAGTTCATCCTTTGCTTTAATT
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CGTTTTCACTGTAAGAAGAACAACACCAAGTTGAAATTCGAACCCTAAGCAGGCGCATATAGAACGCTCTATGATATAACGTAGCGATAGACTAACTACGATCACATAGCCCGGGCCGTAAAA------TGCAAAGATCCCCCCA-----------------AAAGTCCTC---------ACGTTCGAATC---------TTGTCTAATCCTCGTTCTGTTGAC-----CCTCTTACGATTTAATGCTTACAACTTACATTCGTACGTGTAATATTTATATGCATCGTTAAATGATAA--CTATACCT--------------AATGCATATATAATAAAGATACTTCTTAATAAACAAAA
CAAATACACTGTAAGAAAAACAACACCAAGCTGA---TCCAAAACTAACAGAG----TTTATAACGCTCAATGTTTT----TATTATTATTATTATCAATATTGTAAATTCTAAAGTTTAAAAGAAAACTAAAAACAGTTCTCCATTTGCTTTACTTGATAGAAACTCCTTTCAAACAAAAAGTTTATATTAAAAAAAAACTCTCTTAACTGCTTTCTGTTAACTTCTCCCTCCTATTTTATATTGATTACAATTTACATACTTATATGTA--ATTTATGCGCATCGTTAAATGATAAAGCTATGTATAAACACGAAATGCAAATACATAGATATTAATGATACTTCTTAATAAATACAA
>CG32486 3039436 3040256|3032 chr3L 3039736 3039934 scaffold_8 1295521 1295708 - 1252|0 200
CAATAGCTATGTTAA-CTCTACTGTTAGTGCTGGTGGCGAAATGGATACGATACGATGGACAAGACGACTGATGTGTGTTTGACTAGCGTTTAATGATCTCACAGGAAGGAGCCAGCCCACGCTAACGCGATAATACCGATAATAACCATAAAATAGCCGTAGAT-TAACTGTCCGGACGCAAGGACCTCGAGTCCACGGC
CAAAAACTATGTTAATCTTTGCTGTTAGTGCAAGTGGAGAA-TTTATGTAGTGTGACG-ACTTTAAAAATGAT---------AAAATATTTTATTGATCTCACTCGAATAAACAAATACAAACAAGC-TGATTTTTCTAATTGTTCGGTTAAAATAAATACGTATACGATTATTTCAAC-CGGATACCCTGAGATCATGGC
>CG32486 3039436 3040256|3033 chr3L 3040137 3042433 scaffold_8 1296109 1298326 - 71872|0 138
ACGCTTTCGCTGCTCAGCGAACTA-AGATTTTCAAATTAGCTTAAGTTTGTTGTTTCAAACTCTTGAATGTGCAAAACCTAGATATAGTTG--------------ACTTATATTTTCTATC----AATGTATATGTAAT
A-GGGCTCGTTATATGCAGTAGTACAGATTTTGGAAATAGTTTAAGTATGTTGTTTCTAACTCATAAATGTGCAAAATATAGATATAGCTAATACATATAAATATATATATATTTTCTATCTTAAAATGTACATGTACT
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TTTAAGTTGAAATGCGAAACTGCCACGAAACTTTATTGCTGCCCGCAAACCCGCCCGCCCCCGCCACGCCCCTAATAACTAACGCGAAAAATACTCAAAAGTTTGCTCTCAAGTTCAGCTGAA-TTTTTTGTACTAAATATAAGTTCTAATTAAAGCTTAAGTTTAAGTAGTTTATATGATGTAGCTAAAAAGGATTGCACACAATCTAGA-AACAGTGTTGCCAACTCGCCCATATTCAAACATTGATTTCAGTTACTTTTCTCAAACGACAGTTGGCAGCACTGTTTAAAAGTGAACCAGAACACAAACACAAACACACACACATACACATATCCTCCGCTAAGCTTTCGCATTTGCCGTTCGATTCGAGTTCGAAAATTTTATTTGAAAAAAAAAAATAGGGTATTTTTAGCAGCGGCCGAACTTTTTATATATTTAACTGTGATAATCACATAAGAAAACCGATCAAGTAACAAGAGCATGAAAAATTTATTACCCATACAAA----AAATAGTGCCCTATAAATTTTTAACAAAATTACAAATTCCTTCAAATTCTGCCGCTTAAACGCAACACGAACACATAATACCC-CTCTAAAT-ATGTTGACACACA------AAAGTTAAACATTTTCAAGTTTTAACTGTAAAATTTGTATTATA-CGTTGTAATTATTTAGTTAAAATAAACA-----ATTCAAAATGT
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CATTCGCCGGGTCGCACGGC-CGCAGAAGCTTTAAGGAATCTCATAATTTTATTATGCACACACTCAGAGCAGGCG-AGACATACCCAAAAAGGAAAACAAAACATAAT
CAAGAGATAGATCTCACAGCTCTCACGAACTTGAATGTAACCCATAATATTATTGTGCAC--------AGCAATTGCAGGCAGCCCCACA--------------ATAAT
>prominin-like 3098867 3099451|3083 chr3L 3099046 3099243 scaffold_9 174950 175205 - 941|0 255
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GATCTGCCAGCGCAATTCGAGACAATGATATAAGAGTAGGCGCGATATAGTAAAGATTAGTTATAAACAAAAGTAAATCACAATACTCCATAAACAAACACAAACACATATATAATTATATGTATATTGTTTAAACACATTGAAAATGTTGCCAAAAGAATAGCATGAAAAGAGTTGAAGAGGAGGAATAGCAAGCGATGCGATTGGGTTGAAATCTATATGAATATGCACAGCTAAAGCATTTAATAAGTTAATG
>prominin-like 3098867 3099451|3084 chr3L 3099257 3101299 scaffold_9 175238 177380 - 15997|0 239
AC---GGACGG--------AGGCGGTTTGTTT-----------------GAGAGGTGGCAAC--ATGGATGATTTTA--TTTTGAACCCACACGCCCACGGCCCCCTTTTTCCATATATGTACCCCCTACTGAGACTGTACTTTTAGTTAAAGGCCTATACAAAAAAATAACTGAAATTATATAATTTAATTAAGTAGTATCGTAGCATCACGTG-------------TGTTATCACTTT
GCATTGGACGGCGTTCAAAAAGGACTTTGTTGGGCTGGCTTTAAGAGGAGAGATATGGCAAATGACGTATGAATTTCATTTTTGCAACAACA-----ACAACCCAATTTT-----------------TACTGAGACTGTAATTTTAGTTGAAAGTTAGTTC-----TTTATTTAGAGTTATGTAATTT--------------GTAGCATCACGTGTTGAAATATTTTTTATTTTTATTTT
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TCTGCC---------ACGCCCTCCC----CCACGTCAATACAGCTGGTGTCTATA-------ATAA------------ATTAAACGATTTAGTAATTGT-AACAAATGCTGTAACTAGTTTCGCTTTAGTTTAAACGCAAAAAAAAAAAAAGAAAAAAAGTT---AGAATTTGC--AGAAAAAGTTATTGTT----AAGTCAATTCTGTTCTTTTTCCTTGCCGCATGTGATTTGCCTTTCCGATTCACATTTAAATATTGTACAATTATTAATTTCATAAATCATTTATGAACGGACTTCGCTTGCCCGCAAAAAAAAAAACATAACAAAACAACATAATAATAATAGTTATAAACG-----------------------CAGCCTGTG--TTAAATTTTGGTATTCAA---TTTTAAAAC----------------ATCACAGTGACAAAAC-GTTGAGCCTAACAATTTGTTGTTTTTTATCAACGAGAAACAAACATAAACAAACTGCCAAATAAAAAAATAA--
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CC
AC
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TAAAACGTGATCACTATGAGATGTTTAAACAT
TAAAATTGAATTGATTTCAATATTTTTGACTT
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ACAAATGGAAAATTTACAGCGTGTTGTTAAATGGTAATTAGATGAA
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AAGGATACTAGGAGAAGGCGGAAGGTAGAATGAACA---GATAAAAAACTCATTG-TATTATATACAATTATATATTTATTATTTG--TTAAAGTGAAAATTAAGTAAATTATTATTCTGTGA--AAACACAAAACAA
CAGGAAACCAACGGAG------CTGCCGACTGAGCACTCTATAAAATACAGATTTCTAATATATGAATCTTAACAGACTTTACCTGGTTTATGGTTATCTTTCAG--ACTTATTTCACATTAATCATATACAAAATAA
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TTTATTTTGCCATTATAGACTTGGCAATATAAGGGGTATTTTACTGATAAATTATTTTATATATTAGTTTTAAGCATAACATCAGTTCCGATGCATCTAATA-----AAGTAGGTGTATATAAAAAA------CGCTTTTAAATCCA
------------CTATAGACGTAACA------------------------------TTTGATGTCATCTTTTCGGATAAGATCAGCAGACAAAAATGTGTTATCTTTAATTAGGTGTATATAAAAAATTTGCTCTCATTTGGATGTT
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GGAAAGGCTTCACCTCGCATAAGATACACAGAGA----------------------GCAGGTGCATCTGGAGGAAGATAATAGACCTTTCCGGAACCTTCACTTGCTACTACTAACACCTTCCCTAGCTTAATAGTCCCCGGCAACATGTGCAACC-------AGAGGATGACCCCAA--ACAACTTGGCTTTAT----TATCG---TTTCTGCAATATCAACTCCTATAAAACACATACAAAATTTAAGTCCATTTAAAGCATTTTGCATTAATTGATTTAACTGTAAGCTCTGCAATGTG-------------------CATTCCTGCAATTCTCTCCTAAGCA---ACTGAATAATGATCC-CCGATCATTTATAGG----------------CGATAAATGCATTTTTAAGATGCTTCTCGGCGCAGTTTTAAATAGTGCAAAGTGTTAAAGCGTTGTTTTCTAATGCAAAGACGAGTAGAGAAGAAA--CTATGAGTACATAACAATGATGAATATA-----TGATAATTTTTTACC-TAA
A------CCTGAGCGTACATAAAATTTAATGATATATCCCTAAGCTCAGCATACTAACACACACACACACACACAGACACAACAGCTTT--GACGTCTTCTCT--------CAAGAACCCTTCGTAACTAAACTATCCC-GGCATTATGTGCAACGTCCGCAGAGATATTGAGCTCCACGACAACTTGGCTTTTTAGTTTACCGAATTTTATGCAATACGTATTTCTATA---CACATGCAAAATTTAAGTCCATATTGTGTAATTTTTATTAAT-AATTAAGCTTAAAACCGAACATTATGTGCGCCCATATTGTAAAAGCATTCCTGCAAACCGCTGC-GCGCACTTACAAAATACTTATTTGCTGATTGTGCAAAAGGTATGCACAAGTTTATAGATAATTGCATTTTAAAAAGCTTTCGCAGCGA---TTTGAATAGTGCAA-GTGTTTATATGTTATTTTCGGATACGAGGACGACTATAAGAAAAAATTTATAAGTAAATA-CAATGATGAATATAATATATGATAATTTTTTACTACAA
>CG32270 3190477 3191691|3146 chr3L 3190049 3190506 scaffold_1 1708384 1708802 - -1663|442 478
GTGCG-----ATATAAT--AAATGTTTGTTAACTAAA
TTACGTGAAAAGATGATCAAGACATTAGAAAAATAAA
>CG32270 3190477 3191691|3147 chr3L 3190507 3192629 scaffold_12 547459 549804 - 44191|0 1351
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CTCCGTCTCCGTCTGCACTTAGGATTAGTTAGGCCGTTGAGTATTAAAGTGAAAACTAGCCCTGATTGTGTTCTTGTTTGTTTCTGCCATTGGAATCCGCGCGTCACCAACAAGGCCCACATGGCCCATTCAACCCATTCAGAAGCCGAGCTCTTTCATTTTATTTTGGCAATACTATTTACACAGTTGTACGGGTCGGTTGGGTTTTGTTGTTTTTTGCCAAATGCCAGGCCATAAAAGCTGCGCCAAGGTTAATGCGCACACATTCCAAATTCAAAATGCGTTTGCGTTGGGTCTACCTGGTCTTTCTGGTGCTGCTGCTGGATCAACTGGCTGCGGCAGCACGCCGTAACCGAGCTGG--CAATAGGATAAGGTCGCGGAATACAGCTGCTGCTGTCCGCGCCAGGAGCCAAGTGCAGCCGCGCATCGTTTCCGGCAGCACGAGGCGCACGACATCGGCAACCAGGTCCAACGCTTCCCGGCCACGGTCGCGCATCGTAAACAGCAGC--TCGAAGCGCGCCAAGAGGAGAGCTAACCGACAGAGATCAGCAAATAATCGCACAACTAAACG------CAGCAATAAAACCTCCGCTCGCATCGTCGGCGGCGTTCAGGCACGCATCGTGGGCGGCTCCACAACCTCCATTAGCTCCATGCCATATCTGGTGCAAGTGCATCGTGGCAGCGCGCTGTGCGGCGGCTCGCTAATCCGAGATCAATGGGTGCTGACTGCCGCCCACTGCGTCTCCGGCCATGCCGCATCGTCCTTCTATGTGATCGGCGGCACCTCCACGCAGAACGGCACGGATGGAGTGGTACGCACTGTGACATACGCCGGCGTGGCGCCCAGGTTCACAACCAAATCCATGAACATGGATGCGGCGCTGCTGAAGCTGAATGCGACCATGACGGGCACAAACATTGGCACGATTGCCTTGGGCCAACGCATGCCAAGGCCGGGCACTCGCGTGCGCATTGGGGGCTGGGGCGTTACCAAGGAGGGCGGCGATTCGG---TCACAAATCTGAGATCTGTGCAGCTCAAGGTCGTTAAGCAGAAGGTGTGTCAAAATGCCTACCAAGGATCGGCCACAATTACCAACTATATGTTCTGTGCCCAGGGCAAGAACAAGGACTCTTGCAGCGGCGACTCCGGCGGCGGCGCTGTGCAAAACAATCGACTGATGGGAATTGTGTCCTTTGGCATGGGCTGCGCCAGAGCTGGCTACCCCGGAGTCTACACTAGAGTGGGCAGGATTCGCAGATGGATAAACAATACAATTGCTAACAATTGA-TATTAATATATTAAATAA----AGATTTGTTAATATTAATTAAGGTTCT
>CG14967 3194642 3194892|3148 chr3L 3192818 3202384 scaffold_12 550321 559992 - 472033|2013 2272
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-----TCATATTTATTTAA---------TATACTAAATACATATATCTAATTATATGCATATCTATTTCGG----ATGTGAGACTCGCAGCGGCGGGCCAGGCC--------------------------AATTGTCAGACG--AATATCGAGTCGCTTTTA----ATTTATAAACACACACTACAACACAATCACA------CTAAAGTATTAC-----CCAAGTCTATAAATATAACAATATATTTATTTACGCATGT
>RpL28 3204442 3204836|3150 chr3L 3204661 3204885 scaffold_40 28018 28243 - 7202|0 177
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--ATGTTAATT-TGTCCACAGGCTGCTCTCCGTCGTGCCTCTGCAGTTCTGCGCTCCCAGAAACCCGTTCAGGTCAAGGCTAAAAAACCCGTTCAGGTTTCGTCCAAGAAGCCCGAATAAA-TGTATTTGATATGGGAAAATTGAGGAGTTGTTTTCTACTCGAGAATAAAAAAAAAA
>CG17746 3220474 3220693|3165 chr3L 3220347 3220784 scaffold_2 3432737 3433135 - -1493|127 362
TTAGGGTTACAGAAATAGCGCTTAGGTCAACTCTTTATACTTAACAGCGC-AAGTGTTCTTGGTTAAGTTTTATATACACACAGT-ACGCCACACAGTCCTTACCAAAATATTTGCTCCGATTATTAATAATTGTT--------TTAACTG--TAACCCCACGATGCGTGTATATGCCTTGTCTAACT--ATTTAATGTATG--ATTTACTATGCTTTGTGATGCCCGAGCAAAAT
----------------AGCATTCGCGATGCTTTTGTACCGTCGCCAGCACGAACTATTTTTGTTTAATGCTGACTCAAACTGGGTCGTTTTATATTGTTTTCGCATTAGGATTTTTACAAACTATTTAAAATTGTTAATTTGTACAAATTGTTTAGCCACATCTCACGTCAACGCACCTTGTTAACCTCAATTTCCTGTACACCACTCATCAAGCTC-----------ATAAATAT
>CG32275 3274129 3274589|3221 chr3L 3273184 3274417 scaffold_40 110691 111828 - 29608|975 1299
TCTTTAATAAGCAT-----CATATAACATACGAATACAATAAATAATTGGCATAAATAACTTATGTCTAGTTTGTTTTGCTCGCTGCGTA--------------TGTATCCGAAACAGTTCTTCGATTTCTCATTAAAGGTACACTTTTAAAATTTAGTCATATAT-TTAAGGCATTGCACTAAGGG------------GGCTAAGG----GTTACAGCTAAAATTGGTTTACTGGCATTTCATTCATTGTGCTAAAATTAATTTTGCTCTAGGGCCTTATGGATTATTTAATAATCAGCGTCGTACCACGAATGTTAATCAAAT
TTTTTATTATGCATAATAACATAAAACATACGAGTAAAATAAATAATTCAAATAAATTACTTAAGGCTAACTGCATCAGCTTAATATTCAACAAATATTAATATTAAAGCAGAAATATTTACTGCATTTGTTTTTTTAAGTAAGACT---AAAATTAAATTTACATGTTAGGGCATTGCACTAAAGTCAAATAAATTTCTACTAAGGCGGGGTTACAGCTACAATTGGTTTACTGGCATTT--------GGGCTAAAATTAATTTCGAACTAGGACTCTAGGGATTATTTAATAATCAGCGTCATAATAAGA-TGTAAGTCAAAT
>CG32275 3274129 3274589|3222 chr3L 3274551 3274855 scaffold_40 112624 112941 - 6286|0 38
AACTTCTTTCGGAATTCCAGCGATTATTGACCGCATTCT
AATTTC--GAAAAATTCCACATAGAATTGACCGCATTCT
>CG14968 3282868 3283054|3232 chr3L 3282879 3283616 scaffold_40 129598 130435 - 39978|0 213
-TATCCTGGT---------------------------GATCCTGCGTTGGCTCCGTCAATGAGATGTGA-TGTGTTAGTTACTTAACGTCCAGTGTTCACTGTATCTGTAA--ATTGTGGTTCTCTCACCTGGTAGTTGCCTCATACAGCTAATTACCCAAAGCCTAAGTGTTAATACGATTTGTAAAC----GATTTT----CTAAAATAAAT
GTATCTGGGTCTTATATATATTTGTATTATTTTGTGGGGTACGGGATTTGCGGAGTCAAT----TGTGATTGTCCTAGTTACTTATCGTCCAGCTAATGCAGATGCTGTTGTTATTGTACTTCTCTCACCAGGTAGTTGCCTCATACAGCTAATTACCCAAAGCCTAAGCGT--AAACGAACTGTAAACAATTGATTTTTTACTTAAAATAAAT
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CGCGAATACCATACCCATAGCGATGACAAGCCTGTATATGTAATGATTGTATTTTTTAATTTA-------TATATTTATTATTTTACCTGTTCTGCGAGCCCTTGAAACGGATCGCGGCAATCGGCTTCTGTAGCGGAATAA-----ACAAATTTGCTAGTTCGAAAACGAC--------ACTTGGCTTGAGG-----TTAAATGTCTGTTT--ATTCGTATGTGTGTTTTGTTTCGCACAAGAAAAAAATATATA---ATTCTTTTAGGTCATAGTCTTAAAGCTAGG--------TTTAATTTGG---TAAATATACACTACGGTATTTACAAGGTGCATATATAAATATCCATT
CGCACATACTACTTCTATATATACGATAA-----TATATGTATAATCTATTTATTTTCATTTACGACGTTTCAATCCGTTTTCTTCCCCCCCCACCTCCCCATTTAAG-----------ACTCTGCGTGAGCAATAAAATAACAATTACAAATTTAGCAATGCACAAACGAATTGTTTCGGCTCCTCTTCCAGGCGTTTTTAGTGTATACTTTAATTCG---GTGTGTTTTGCTTCGCACAAGAAAAAAATAACTATAGATAGTTCTTAGTCTAATATTTACAGCTGGAGGATGCATTTCTATTAGGCTCTAATTATATATTTTAATAATAA-------TATATATTGAATTTCATT
>CG11526 3305806 3306374|3251 chr3L 3306233 3306345 scaffold_9 2282914 2283009 - 2266|0 112
AAGCAAGAAGTTATTAACGTAATTGTAAGCATTAAGAAGTACATTGATATAATCCATGTAGCCCGACCACGATTGAAACACCAACTACTCACTGAATTGGCAATAATTTGGCA
AAGCATAAAGTTATTAACATACTTT------CTAAGTCGACAATTGATATAATC---GCAAACC--------CTGCTAAACTAATCATTCAAGAAATTGGCAATAAATTCGTG
>CG11526 3305806 3306374|3252 chr3L 3306372 3309477 scaffold_9 2283034 2286182 - 168625|0 2
CTG
CCG
>CG11526 3306442 3306457|3252 chr3L 3306372 3309477 scaffold_9 2283034 2286182 - 168625|71 86
GGCAGGGCTGCCATCG
GGT-------------
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CAAAATCAAAAGCGTTCATTAGAGGAACCTTCGATATCAGCGTAAGAAGA-ATGTTTTTTAAATTTGAAGAAACT-------AGAGAAGCAAAGCTCAAA--GCATTTCAAGGATTT---TCGAATTTTATTATCTTCTATGCTT---CTCATATATAACTATATATTGCCTTGAGCCTAACCAAAAACAAAACA----------------------CTTATATAACAATTGTATAGCCATATACATATGTGATATATTATATATATATACATGGCAAATCAAGACGAGAAAATCATTTTTAGCATTATATATGCACTTTATTGTTGGCAAGTAAAACTGCACTTAAGCCTACGCGTTTATAACAAATTAA
CAAAAAAAAAAAAAACAATAAAAATAAACTAT-ATATAAATATATGAAAATGTGTCTTGCAACGTTGAAACAATATTATGTAAAACAGTCAATGTTCTAATTGCATTATAAAAATGTAACTATAAGTTTGTT-CGTTGTATGCTTATGCTTAAATTTAATT-----TTTTCGTAAAACAAAACAAAAAGAAAACAAAACCAATAAAAATTATTATATTATATGTGAAAATTCAACTTCCGTTTGATTTTCTCATTGAACATTAAACAATAGATGGCGCCTGCGGCCGGGTTTAATTTTCGAGGCATTTTGTATGCATTTTATTATTGGCAAGTAAAACTGCGCTTAAGCCTAGGATTTAAGGATA---TAA
>YT521-B 3354633 3355132|3291 chr3L 3354550 3357736 scaffold_38 586091 589480 + 90207|85 764
GCCGCATCGAG--------------GTTTAAAA----CGAGATCGTGCTCCTGGCCTCGCTA-------------------GAATCGGAAAGTGTAATCCTAATCCTCTCGCGTGTGAAAATCTAAAGAGAAATA------------------TTGAATGCGTT--ACGGTATAAGCAAAAAGTTAA--TATGATAA------AACCGG----------------CTATCGTCTAAAGTCG--------------------------------------ATACAACTCTCTTTCCCCTTTCTCTCTGTCCCGCTCAC-----------CAAACACCCCCACCACCCA------------------------------------CACTAAGATTAAAAACAAACTTACGACTTAAGCAAATTTC-AATACAGCAGAGATCTTAATGCTAATTAAATATTTTAAACCACAAAAATACAAAAT----GAAAGAGAGAAAATGTGAACTTTATTTACCTCCCAAAGCGAAAAGTAGCGAGAGAAAGCGAGAGAAAGAGACTTTAAAGAGACGCCCAACAACAACAACC-ACAAC----CAACAACAAC--ACCATGAACGAACTTAAGTTAACAT--GAGCAGTGATCAATCAGTGATGTGTGTATCGTGTGTGCCAAACCCCA
GTGTCGTTGAGTATTGTTTACGGGTATTCAAAAAGTGCGCGAAAATCCTCCCAACCAACCTACTCCATCTCAAGAAATGATGCACAGAAAAGTG---TCGCAA--CGGTCGCGTGTGAAAGTC-GAAGAAAAGTAGTAGAAACGAAGATGTCTTCGAATGCAATGAAAATCATAAATGAAAAACAAAAGTAAGCTAAGTGAGCAGCTGGACCCACGCACACAGCCCCAGCGCCAATAATCGTTATGCAAATCCAATCGTACGAACAGCTCGTCTCTTATACACAACACTC---CAACTCTCTCTCTCTCTCTCTCACTCTGTCTGTTTCCTACACTCTCACTCTCTCTCTCTCTTTTGCCTAGCTATATGTCATGCGAAAGTTCTCTATGATT-TAAACAAACTTACAAAATAAGCAAATTACAAAGAAAAAAAAAATCAT----CTAA-TACATATTTTAAACCAAAACAAAAAAAAATACAGAAAAGAGAGAAAA---AAAATATATTAAGCACAAAACGTGAACTTTA--------------------------TTTAAAAGACGCT--ACAACAACAACCTACAACAGCACAACAAGAACGTACCGTTAACAATGTTAATGAAAAATCAAAGCAGTGACGTGTGTGTAATGTGTGTGT-GTGTGTGCT--------
>sty 3384669 3386487|3337 chr3L 3384676 3385715 scaffold_38 640718 641901 + 16035|0 1243
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>sty 3384669 3386487|3338 chr3L 3385756 3388481 scaffold_38 641948 644979 + 88028|0 973
GGGTCCATTCCATGTGTCCGGTTTTTTACCCGAGCAAAAAGCCTAAGGCACAA-----------------ATGGGATGCTGGATCG------------------TGGACATATACACCCATATATATACGGA-------------------------------------------------------------------AAATATTTAATATATGATTTAAAAG----------------------------------GATATATAAAAAAAGAGG-------AAAGAAAGAAAGAAAGAAAAATTAAATAACCAAAGACTGCAAACAGATAATTATTAATTATTAGAAATGTTATTTAAAAAATAATTT----TTTGCTTAAAACAAATCGAGTGGCGACGAGTGGAAAACAAAACTGA---CGAAACGAAAGCGATTAGGAATTATTT---TTCGAACGATTTTTTTGTATTATTTGATTTTGTTTTA-CTTGCTTAATTAACTCTTCAGTTCAACGTTCAATTTCTAAGTCAAATTCTTACTTTATAAACATAAC-TATAATAGTTGTATGCAAATAATTCCAATGAATTTTCCACAA----------------ATGTAAAGTAAACGGGGC------------GAAAGTTTTTATTATTTTCATATACAAAACTGAAAAAAACTGAACAATTTGGGGCAAGCGTAACAAAACACCATATTATATATACCTATATACACACACGGGAGAACTTTTAGAGAAATATTCAATGGCGTA--------------AATTAGTCAAATATTATATATACCAAGTCCAGTCCATTTTTGATGTTGTAGAAAGAACAGAAACAAAAACCGAAAACTGAAAACTGAAAATTACACAAA--------------------AATATTTTAGAA-------------------------CTTTACGAATTTAAATCTTAAAATT
GGGCGCGTTT--TGTGCGCGTTTTTTTCCGCGCGTAAAAAACGCGACACACGACGTAAGCTTAATTAAGGGCGGGACGCAGAGCGGGAAGCTTCGAAATTTAATTATATATACACACGCCTATATATACAAATATTAAATGTATGACTTAAAGATAAACGCCTATATATATATATATATACCGATATATATATATATACAAATATTAATTGTATGATTTAAAAGATATACAAACAACAACAAAAAATGTTTAATGTATGATTTAAAAAAAAAAAGGAAAAGGAAAAAAGAAAAGAAAAGAAAAAATAAATAACCAAAGACTGCAAACAGATAATTATTAATTATTAGAAATGTTATTTAAAAAATAATGTTCGCTTAATTTAAACAAAAACTAATTCAAACAAAACTAAAAACAAACTAAAACTAAAACTAAAACGAGCAACAACGCATTCAATTGAAATGTGTTTTTTTTTTTGTTTTATTTTAATATATTTTGCATTATTAATTTTTGG---CGAGGTTGTTTTTTT--------TTTTTATGTTTCAAAGTCAACTTTTTCTTAATGCAAGCAAATAATTCCAATGATATTTCGAGAACACCAATGAATACAGTCTGTAAAGTAAACCTAGCCGGAAACAAGCGAAAGGCAACTTTTAGATAAATATATATACCTAATGAAAACATA-----------CATACATACATACATA-CATA-CATACATACATACATACATACAT------ACATATATATATATATTATATAGCTGAACACAAGACACCGCAACTAGGCAAACATTTTTAAGATAA----CAGTCCA-TTTTGATGTTGTAGCTAATGCAAAAAAAAA-----------GAGTATTCAAAATTATGCACATTTTATGTCTATATACGATCTATATAGTAGCAGCAGCAGGAAGAAGCAGCGCAAATGCGGTACGAATTTAATGGCTAATATT
>eIF5B 3412186 3412507|3375 chr3L 3411885 3412674 scaffold_38 675779 676634 + 13699|374 751
GCGATTTCGCCTGCCAAAATTGCAAACGTGCAACAGACGAGAGATTTTCGCTGGAA-GGAAGCAGAACCCTA-----------TCA------AACTACAGACTGTGTGCGCTTGTGGTGAATCCTCTATAGTCCCGAACAGAGGA------TCCTTTCTCTT--AAGCTTAGTTTC--------ATTTTTATGGTTTACAGCCGTAGCCGTCGTTGCAGTTGTCGCTTAATGAACTCTGT-TATAATGGTTTTAAATCAAATTTTTTGTATAACGCCTTTTGCG-AACATCCA----------------TTTTGCCTGCGA-TTTTTGTTAGAGCCAAATTAGAAATAAATGCAA---TAATGTTGTACAACGGAAAA
ATGTT------TGCCAAAAT----ATTATATAAAAAATGAAGAACAACAACTGCAACTGCAATAGAAAATTAATGCTTGTAGCTCAACTCTTAACTACAGACTGCTTCAGCTAGCGACATGGCCGACTTGTCCCTATGCAAAATAATGTCTTAGTTTTTTTTAAAAAATTAGTTTCTTTTTATTATTATTTTGGCTTACAGTC---GCTGCCGTTGCCGTCGCCTACGAAAAAAAAGTGTGTTTAAAGGTTTTAAATCAAATTTGT----AAATGCTTTTTGCACAACAACAACAACAACAACAATATTTTTTGCCTGCGCTTTTTTGTTA----CGCATCGAAAATAAAAGTAAATTTAAAGTTGTAC-----AAAA
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TAATGACCCTTTCATTGTTCCTTAACTGACATCTTTAATTTGGCATTCCAAATTGAATTGTAAACCCTTATAGTTATAAGAATTTTTAATTTGAAAGCTCCCGCAAACGTCTGATTAAATTAAACAAGGGGCATTGTTCTTTAGCGAATTATAAATAATGTCTTCGTTGTTTTTAGTTAATGCATCATTTTTGTTGAGTTTTTGACATATT-----------GTATTTATAAGTTTATAAGATAATTTCAAATATATATTAAATACATATATA
TACTAACTTTTTC-TTGTTTCTT--------TTATTTATTATGTAAAACAAAATATAACGTAGATCCC---------AAGATTTTGGCATCTAACATC---------CATCCAAGCAAA---AACGCAGATTAGTTTACCATTTAAAAATTTGAAGCAACCATTTTTTTTTTTTACT--ATGAACTATTTAATTTAAATTGTGCTCATATTTATATATATATATATATATATATCTATATATAAATATACATTTTTTTTTAGAGTCGTATATA
>CG32267 3455075 3455353|3415 chr3L 3454773 3455449 scaffold_38 730958 731646 + -1275|322 628
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AACAAAAACAAGCAGAACAACACAACAACACACCAACACTATTGCAGAAACATGTTCTTTTCCACTTTCTTGTGATTGTATTTGTAGAAGCAGCAACAACAACAACAACAACAACACGACAGTTGCCGCTGCCTGTAACGGGAGCTCT--CGCGTTCTAAGCT-----AAACTAAAAATAGTGCTCCAAAACAGTGTGGCCAAATGCTTAAAGCTAATAAATGCTAAGCGAGCGACGAGATGCGCTCCAAAAAGCTTTTGTGCCGCCGCTGTTAATGGTGTGACCAAAATGCGGCTAAA--------
>ImpE2 3494505 3494733|3473 chr3L 3494253 3494521 scaffold_9 373909 374167 + 5827|255 271
ACAAATAACTTATAATA
ACAAAAAACCAAATATA
>ImpE2 3494505 3494733|3474 chr3L 3494522 3494719 scaffold_9 377498 377743 + 3477|0 255
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ATTTTTGCATCTCCATCTGCCACAAAAGGCAGACGCAGAGAAGTCGCATTGACTGAAGCCA--TTTTATCGCCATTTTTCGACACACAAACACACAGCAGAGAGAAGAAGAAGGTTCGGCAGAGTTTGAGAGAAAAGCAAAAGCGAAATACTTTCCATAGTTGTTTAAGTGCAT-----GCAACAAATTATTTATTTCATTTTCG---CAGGAATTTATTTTTAATAAAAACAAAACACAAAATACATTAAATAAA
>CG32264 3700729 3700923|3757 chr3L 3699229 3700975 scaffold_9 666669 668553 + 43315|1771 1967
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CGATTGCAATGGCAGCAACTTTCCAACAAATTACAGCAACAACAACCCAAACAATTGTATTTTGTGCAGCATAAAATTGTCAACAAATATTTAAAAGCAAAACATTAAGAAACAACAAAAAAAAAACCAACAAAAAATC--ACAAAAAAATACAAAAAAAAAGAAAGTTTAAAAATAAAAAATGCGATAAGACACAA
>CG10855 3787366 3787490|3879 chr3L 3786656 3787393 scaffold_9 794227 794948 + 4725|778 805
ATGTCAATAAATATATTTGCTTATTCAA
CTTTTAAATAATATCTACTCTTGTGC--
>CG10855 3787366 3787490|3880 chr3L 3787415 3792349 scaffold_9 794980 799806 + 93459|0 82
GCTCTTGTTTTAATCGAAGCCGGTTTAAGC---GATTTTATAAATATTATTATATTAA----TAAATTATTAAGTGGTGCATA
---------TTAATTTAGACCATATTCAACACTGTTTCTTTTAAAATTA-TATGTGAAGGCCGAAAGTAT----TGGTACATA
>CG32262 3792674 3792807|3881 chr3L 3792350 3793494 scaffold_9 800133 801297 + 29932|356 522
GACAGAACGAATAGGA-ATCGCGGAATAGGTGTGATA------TCGACAAGAAACCAAATTATTTAG----------------------TTATTGTGAACACGAGGGTT----ATTATGTAAATAAGAGGCTCTTAATACCAATAAATATGCATGTTTAGTACACAA
AACATAATTGATAGCATTTTATTAAATTTATGTGATATAAAACTAAATTAACAACCAAATTTGTTAGTAGTCATCGTATTTACTTTGTATTATTGT--CCGTAAATGTTCTGCATAACGCTAGCGAGAGGCTATTAGCAACAATTTATATAT-TAATAACTATATAA
>Acp63F 3799455 3799516|3886 chr3L 3799324 3799514 scaffold_21 750966 751152 - 1438|142 204
ATATTGTTCCAATATTTCCATGCATATATGTTTCAATTAAAGGCATTATAAA---TACCTATA
ATATCCGTCCAATATATCGATAAGAATATGTTTTAAGTGTAAAAACTATAAAAGCTAGATATA
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AGAGGAGGATTAGGTAAATAA
ACAATAGAATTAGATAAATAA
>Ubi-p63E 3882791 3882999|3991 chr3L 3882872 3883804 scaffold_721 6223 7159 + 58432|0 139
ACTAAATACATTTCCAAATAAACACAATTTAGCACGCACT------------TCACTCTAAATAAATATGAGGAGATTATGGATGGCCACTTTCCTTTCTGCATTGTCAAAAGGGAAGACATCAGAAAAATTCTAAATTT
TTTAAGTAGAAAAGCAAATACA---AATCAAATGGGCATTATTAATTATCGAACACTGAAAATCAAGCTACAGAGTTGCCAAATT----TTTTAATTTCTGCAAAAT-AACACTGGACCTAAAGTAAAAATTCCAAATTT
>mge 3891389 3891754|3997 chr3L 3888910 3892070 scaffold_153 5237 8417 + 115422|2569 2964
-CATGAGAGACCCCCTACCACATACGCATATTAGCTCTACGATAACCGGCATCGGAAATCCGGAAATTGCCACACGTTAGC-------TTAAGTTTGTCGATACCAATCAATCCCAGTCGAAATCGAGCG---GTGCAGGACGTCCAGCGAT---TCCCCCCAATAAA-GCAGCCACCCATTAA--ATGCCACTTCACAGCGCAGCATTTACGCATCCACACTCTATGAACATCCGGCCCCCAAAAAAAGGACGTCCTCATCAATCGAAACGAGCCGTTG-CAAAACTTCAGATAGGTGTTAGCA--------TTGCAGTTGGCGTACAG----TGTATAAACAAGCAACCACTGCGGTTTAAACCAATTAATAAAAC-TACGTTTATTAATAGTC
ACATTCGATATAC------ATGCATGTACGTTAGTTTTGGGTTTACCAGC---GGGACTCC----AATGCCACACGCTAGCATCTAAGTCGGATCCGTCAGT-CCACACACACACACACACACACACACACACGCACATGCCACACAGCAATAGATATTCCAAGTAACCAGAGCCACGCCTCAAGCATTTACCATCGCGATGCAGCAT------AGCCATA---------------GCCATCAGAGAATCATCTTGGACACATCTCG----GAGCAGTTGGCAGAACTTCAACTAGGGTTTAGTACGAGTATTTTGTAGTTGGCCTCCAAAAACCACATCAAATTCTAACAATTAATGTTTAAAGAAATTAATAAAATATACGTTTATTAAGAGTT
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A------CGCTGCAAC-----TTCTCACACACACACAACACACACACACAACACACACACACACACAAACACACATTCCGCAGTTAAGCCAAAACC---AAAAGCTGACAATTTCCGTTTGGCCACGTTTGCCGCACATTCCGCTAA-----------------------------AACAGA-----AAGAAAGTGTATTTATAAAAAAGAGAAGGA----GAATTGAATTGATCATGATTGCATCA-GACGTAATAACATAAATTACTTTTAATTTAATATTATTAAGTACCCAAAACGTACGGATGAGCTTTTAGAATGATTATAATTCTATTTTCAACAACAAATAACCAACTACTGCATTTTGGCACGATTTAAACAATACAACAATATATACAGAACCAAGAAGCACTCAATTAACGTGCCATGACCAGAATATGTGGAAAACACATAAACGCAACGAATTGCCTTGTGGCTCAATTGCCG-CCAAATTTCAAAT-------------TTAACGTCTTTTTAAACGTCAAACACAACGTTTACAGAGTTGTTGAACAAAACTAACCACCTGAATTTCAATCAATA--GCTAAGCATTTAAAACGCATGTTAATCAAGAATCAAAACAGTTTAAAACAAATATACTATGTATTACGACACATTTAAATGATATATGTATTTTAAATGTTATTCAATGTTGAAAATAAATAATTATTCTTTTAACA
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ATTTAATA
CGTTCACA
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TTTTATTAATGTTGTTATCTTGACTGCCTTTTTCAATTTAAATATTTTAAATCATTTTTTTTGCCAAGGATTTAAATTGAAATCTTTTAAAATATGTCTATTTACTAGGAAAATATTACAAAAATCATTTAAACTTTGTTTTTACAAAGAATAACAAAAATGGACATACACTTCAAATCGATATAGAGTACTATATCAGGGTTTTACAGGTGTTTCGAGAACAGTTTCCTAATCGAAAGCTCTGAACAAAAAGATAGTTTACTTTTG
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AAACATTTGA
GTCCATTCAA
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TG-------------------CACCAGCCCCAAGT-CCAAAGGAATCCCGCACTTGTAGCACCTTCCTGTACGGGAATGGACTATGACTGAATGGATTCCGACTGCGGCTGCGAATCTCTAA----CGACTGCTAACGTAAACCCAACCTAGTGTAATCTACTCGTACATAACTCACAACCTACTAACTCACAACCC
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CCATTATTTTTATTTAATATACACATAAGTATGTTATTTAATTTTTATTATA---TTTATTTTATATCTTAGTTAATAATTTCAGAGAACTAAAAATATTGTTATTAACTTGCCAAAAACTAACTTTTTTTTATTTTCAAAATTTAAAA----ACAGTTTTATTTCAGTCTACAATATT--TAAATATATTTTTTTTATAAACAAAAAATTAT------ATTTATGCATATGTTAAATTATGTTATATTATACTATATAGTAATAACATTTATTTGTATTTT--TTATTAATTAAAACTTCAAATTTAATAATTTTAGCTCTTTTATAAT
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G
G
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AATGAGAAGAGTTCAGTGCGGGGGGATCAATACGGGGATTGGCATCGAATGCGTGAGACTATCTTAATTTAGAGCTAAGTTTCGAGTAGGTTAAGGAATTAAATGATAATA-ATTATATGAGCTGATATAATCTAATTTTGCAGTTTCTGGTAGATATATCAGAGAGATAACTGAGAATCTCTAAGAGATTTTGTCTAGATTTGGGTCCTTAAATTATTTAAGTATCATGTACTTCTCGG---CTTA
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A------AGGAGCATTTCAACTGCC------ACGCCCACCATCCAACCACCCAACCACTCAAT---CACCATACGCCCACTGTTTCATA-----------TTTATTAACGCACGCAACGACCTGACCAATGCGCTTCGATACCATTCCCGGCCTGTTTAATACTCAAGTCAATCACTTTGTAAATAACCGGAAACGGATGCGGACGGGCAGAGGAATCCTCCTGCTCA---CATATGCTCCGTCTCTGTCTCTCTCTCACACACACATACACACACGCATACACGCATACACATACCAGCTTTCGTGCAATTCTCTATGTAATTTAAACATGCAACTTCTTTTATTGTACATACAAAAAAAACACGCCCATCAACAATGCCACGCCCACGAA
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AGGATACAGAAAAGAAGAGCAAT
------CGACCAAGAAGATCAAT
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GA-ACAGTGCCAGGAACAGTTCCAGTTG
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GCCTT-----------CGCTTAAACCGTGTAATTATTAATAATAGAACATAGAAATAGAAACATTTTTCTACCAACGAAACCCGTTTACTGGGCTAATCGCTGTGACTGTGATTGGTTTGCGACATTTATTTCATTATATATATATATATATATATATATATATATATATTTATATGTATAAGACAATTTTACACCAGTTATTGTATTGTACAACAGCTCGATCAAGTAATAATTTAATAAGCAGTTAAAATGCAGAAAGGACT-TGAACCATTTTTTCTCTCTCACTAATTCTTAACTTAAAAAGACCCAAACAAAAAAAAAAAACACACTCGAATACCATTTTTTTTTGTGACTGCCAACCCAATCATACATATATTGAGTGGGGCCTTAAGTAAACACGAAGCCATGTTCAATGGGTATGTCCCAGGGAATGCTAAAGAACTCGCCCGGCAGCTGTGTGCAATGCGACGAGTTGTAATCGCGTAAATGCTTGCGCAACTGAAAA--TAACAATAAAATGTCAATGAGAAGCAATAAATTCTTAACTTAATTGAT-AACTTACCAAAAACA
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TAATCTCATATTAATAT-------TAAACGACGAGTCACTCGCACA-------
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GGATCTGAAATCGGGCCAGAGGACC-----------------------------GGACCATCATCACCATCAACAGCGACCGATCGGCGTGAACAGAAAACCAAATCAGTTTTATGTGCACTT----------------CAGAAACACTCATTCCAAACCCATTCCCCATAGGCACCCCCCATCCCATAACTATTTATTCTTTGGTTATT------------------TATTGAGATCCCACAATCCGCCACTTTCAAATGGTTTCCTACTT-----TACCACTACGCTCTATCCTTCATATGTTTCCCTAGTTTTAGGCAAAG-------------------CGAAATTG---------------AATTGTCAGACTTGTTAAGTTTCAGTTATACCTACGCGGGATTTGAGGCCATCTGAACGAACAGATTAGCCTCGAATGTTACAATATGCAAGTTAATAATATCGAGAAAATAAACACAAACGAAGTAATGAAGCGGCAAACATGGAAAGGCAGAAAATCGTTTACAATAAGTTAATATAGCAAATGTATATATTAAATTATTTATTTATTACTTTATTTGATAGCTGCGAAATAATAAAAAGTTTACTTTTATTAAGCGACAA
GTA---GAAGGCAATTCACACACACGCGCACACACACGCACACACACACACTAGGTATCCACGGCACCATCATCAGCA------CGGCGTGAACAGAAAACCAAATCAGTTTTATGTGCACTTATCTTCATCCCGTCACCTCACTCACTAACTATTTACTTATTTATTTATGCCACCCTTTTCACCTAAACTATTTATTTTTTAATTTTTTTTGTTTCTTTATCGAACTATTGAGTTT-----ATTTTCC-TTTTCCAATCGCTCGCTGCGTATTCGTATGGCAAGGTTGCCTTATCTGCATAATTCTTTAGTTATTAACGAAGAGATCGAAACGAAAATAAACGAAATTGTGACGTCATTTCTCTCATTGTCAGATTTGTTAAGTTTCAGTTATACATAAAT--AATTTAAAGCTATCTAAATTACGCGTTTA------AATGTTATCAT-----------------------AAAAGGCAC--------------AGCGGCAAA-ATGGAAATGCTGAGAATCGTTTAAAATAAGTTAATATAGCAGATGTATATATTAAATTATTTATTTATTACTTTATCTGATAGCTGCGAAATAATAAAAAGTTTACTTTTATTAAAA-----
>CG15014 4304637 4304754|4398 chr3L 4303661 4305731 scaffold_12 1099320 1101277 - 84182|1004 1121
ATGAAAATCAAAACCGCCCAATTAAAGATATATAGCAATGACCACACCTAGGTATAGATGGACCATCTGCTGTGCAGACGAATATAAATAAAGCATCCAGTTATTATTTACTTCTGTT
---------------------TCAACGAAATCTATTGA----------------------GACTGTTGTCGCTGCTAACTAATAAAA--------TTTACTAATAATTTTGTTAAATC
>CG18314 4350239 4351759|4436 chr3L 4350238 4350738 scaffold_9 5019501 5019875 + 3722|1 501
ATGATAGGCTAGTGTGAAGTTTCGATCGTTGTTCAAATCGGTAGAATGATTCATTTTCCTTTTGGCCGCCCCTGAACGCTTCGATTTGGTGGGCTTACCAACAGAGCGTTGCAATTTTGCCTAGTTCCCTTAGTGGGTCAAATTCAGTTTCCCGAGCGCCGCCGATGAAGCATCCAGGGTCCCAAGTCGAGTGTTTGTCGTTGAATATTGTTGATCATTGTGTTGAA-TTGATGATATCTTAGCCACAAACATGCCAAATGCGAAAATACCGAACGAATTCGAAGACGAAACATTGTGTATATTTTGTTGTTGTATTGTACATTTCATTGACGATATTTTGTACATTTAGTTATAGTTTGAAACTAATTTACACACCAAAGAGCAAGTGTTAACGATTTTTAAGTGTAAGTGTTAGAGCCGTATAAGCAGATAGCAAGAGGCGTTTCGACAAATATAAACAAAGAACGCAGTAAATAAACGCAAAAATGATGAAAATGCAT
TTTATAGGTT----TAATATAATGCTCTTTTTTC-------------GTTTCATTTTCT-----GCCGCACATGAGCAG---AACTTGGCTCAGGTTTCAACAGACTGTTGCGATTTTGCCTAGTTCCCTTAGTGGGTTAAATTCAGTTTCCCCGATCTGGCCCGGGTTGTGCTCA-----------TGTATGTTTGTAGTTAAAAA---------ATAGTATGAAACTCTGAAATATGTTATCCACA-----------------------------------------------GTGTATATTATTTCATTGTGCATCAATTTTCAAT--------------CATT---------TTTCAATTCATTTTACAAACGA---------TGTTAAAGATTTTCGTATGTAA--GTTAGCGAATTGTAAGCCGGAAGC-AGAAACGTGTTAAAAATTATATACATTAATATATGAAATTGAGTGCAGTAAATTAAAAAGTACAT
>CG18314 4350239 4351759|4437 chr3L 4350739 4353112 scaffold_9 5020084 5022435 + 60689|0 1166
AGTTAGATTTAGATTTTCATTCTCCTCAAAAAAAAATACAATAATTATCCGTAAAAATCCCCCTCCCAAACCCATCCTCCGTAATCCCTTTGAGAAGAACTACAAAGTCCTGCAAGTAAATAATTGGTTGTAATTGCATTGAGCCATTTCCTTAACTCTCTATATA-TCTCTCTCTCTCAATATATATAAACACTTACTTGCCTGTTTGCCATATAGTTGCATA-TTTACGGGCCGTTTGGC---GCTACGCGACATGCCAATGAAAGCACCACCCCACAGTCACAGCCACAGAAAAACTGAAAACTAAAAACGCAACCACTCAACCACTCAGCCACCATACAGCAAACCACACAGAAACACCAAAAACACCAAAACCACAGACACGTTGAAAGACATATTCATATTTCTAGACC-TAAGCTAAGC----TAAGAG---TTTTTAGCGTATCCAATTATGATTGATTCACCGATTGATTGATTGAATTGATTGACGATTATTATTGTGTATTTATGAGCTTACC-----------ACGTATATA-TATACTTGTACTTAACTCTAGCCATATACATATACATATGTAGC----------------------AGCGATCTAATTCTAATTCTAATTCGTAGACAAGAGACAATTCACTAGGCAAGAGCAACATTTCCGTTTCCGGT--------------------------TTACAATTCGAAC-----------TTGCTACAACAAAAACA----------------ATATACGAA-AATCATATGCTACTCGAGCAGCAGGATTATTATCTAAAGATTGCATAAGTATAAACCTTTTTCAAAGTCCATATTAAGTAGCATTTAGAATTTTACAAAATGAAATCGTGTAGCGTTTATTAAACAATTTGCCAAACTTGACGACGG-----------GCCGAAATATGAGAATT-------------CAAAATTCGGAAAATC----TTCAATCTTCGCACGCTTTG----CGAATTGCGCTTAAGAAACGAAAAACCAAGGCCCACTAAACGAATA----TAAAACACAGCAAATATG--TTAAAATC--CAAAAAGCAAATAAGCCCAAAAAGACATTTCCAGTAGTTCTTAG-----CCATACAACATACAACTATGATACTGAA
AGTCG---TTAAATTTTC---------------AAGTATA--AATTGGTTGTAAA----------TCGAACAAATGATAAAT-----------GAAAAACAAAAAAA------AAGCATGCATCTCTGTGTCATTGCCACAAAACATTTAC----------ATATAGTTGCGCTCCCCCACAATAACTGAAT-CGTACTTGCCGCTTGGCCACATAGTTGCATATTTTATGGATCGCCGGAAACGGCTACGCAACACTCCAAGCAAA--------------------------CAGAACTTTAAACTAA------------------------------------------------------------------------------TTGAAAGACATATTCAT-TTGTTAGACCGTAAGCTATGTTTGGTAAGAGAGTTTTTTAACAT----AATTATGTTT--------------CGGATTCGATTGTATTATG-----TATTGTGTATTTATGAGCTTAACAAAAAAAAAAAACGTATATATTATGTATATGTGTGTATATAG-CGTATATGTATACATATCCAGCTATATACCCCTTTAAAATAATAATTAATCTACTTCTATATCATGTTTCAAATTCAAATTCAATTTTCAA---AATGGCTGCATTTCCGTTTGCCGTTCCCCTTTCCGTTCCGTTCCGTTCCGTTTCGCTTCGAGCAACAGCTCTTTTGCCTAAAAAAAAAACAAACAGTGTGTACACACATGTGCAAATAACTAGACGCTTGGCGTGTTAGGGGTTTATTCTCTCAA-------------------------AAAGTCCATATTTAGTAGAATTTA-------ACAAACCAACA---------ATTTATCGATAAA--TGCCAAAGACAGAGACGGAAGCGTTGTTAGCAAAAAAAAACGTAGTTCCACGCGTTCCGCAAGTTCCGCCAGATCGTATTTCGAACTGTGCACGCTTCAGCGTTAAATTTTGACTC--AAATCGAAAATTTAGAAGAAATAAACAAACAGTACTTAAATAAACTGAGTTCGATTTAAGCTCAGCGAAAACGAAACCAACACGAAAC-ACATTTCCAGTAGTTTTTAGCGCAACCTAACTAAATATTAATACAAAACTAAA
>CG32240 4363460 4363526|4451 chr3L 4363332 4363753 scaffold_9 5044154 5044558 + 6652|136 205
TGATCAGGGAGGTAAAACCA-AAAGATTTGAATC--CAAAATTAATAGAATAAATACTGCGAAAATTAAA
TGGCAACGAGGCTAACGGCACAGAGGATTGAGTTGGCAAGCTTGTGACGGCATTTATTTCT--TATTACT
>CG15022 4440039 4440144|4544 chr3L 4439977 4441278 scaffold_40 15137 16595 + 17367|67 192
GATAATCAACCACCGAAAAAAAACCAAACCACAAGCACTGCATCTAGTTTTAAGCTGTACACATTAAAAGCAT-------------TTTTAACAAAAAATA-------AAATGGAGTATTACACCA
--------------GAACCGATGCCACACAA----------ATTTAATTTTAAGTTGTGCGAATAAAATATATCACAAAATCAACACATTCACATGGAATATGCTGTTATATAAATTAATCGATCG
>CG32244 4485131 4485246|4596 chr3L 4484883 4487132 scaffold_40 67012 69235 + 57465|272 387
GATTCCCGTAGCTAGTTGGTGAGCGGTACTCCCAGGGTCCTGGTTCCGGTCCATAGTCCTTAGCTCTAGTTTAGTCCGAATTTTAGCCATAATAAAACTTTAATTTATGAATCACA
GATCCACGTAGTTAGCTGGCTTTTGGTACCCTT---TCCCGGGTTGTAGCCC---GCCCCTAG-TCTAGTGTATTAAGATTTTTAGCCTAAATAAACGTT--ATTTATTTTGTTCA
>Tie 4491545 4492082|4602 chr3L 4490650 4491878 scaffold_40 75005 76316 + 3871|1011 1374
TTTCTTTCA-----TTGTAAATATT-TATTTGTTGAGACAACAAAATACGTTCTA---------------GGCCTTACGATTAATGAATGGCGCTACCTATGCTTAGTTTAAAGTTCGTCACTTAGTTCTTCTAGTCTGTATCTAAAATCCCATCTTCGAGTTGAGCTATTT-------CCCCTGGATGTAGCCAAGATTTGACTGCACAAAAGGAAACTTTGAAACCCCGTCGTCAGTAATAAGAAAATAAATCGTTGATTTAGGCGTGCAGCGCATAGGATCT-ATGTAATTG-TATTGAAATCTAGCTATAGAATTGTACAAATAAATTAATTAAAGACGAAATATAATTATGAATATTAC
TCTCTCTCAAACTCTTGTAAATATTGTATGCGTTGC----ACATGATTTATTTTATGATTTTATTATTTAGGCCCTATGTTTAATTAATGGCGCTACTTGTGCTTAGTTGATA-TTAGTCACTTAGTTCTTCTAGTCTATATCTAAAATTCATTTCCCAAGTTCAGCCGCCCAACGTAATCCGTAGCCTTAGTCGAG--TTGACTGCA--------------------CCGCAATATATGGCACAGAGTTTAGTTTTGAAATTTATTTTTCTCAACATAGGACTTAATATTATTGTTATCGATATAGAAATATATAATTGTACAAATAAATTAATTAAACACGAAATATAATAATTATATTTAC
>Tie 4491545 4492082|4603 chr3L 4491892 4492048 scaffold_40 76341 76491 + 3103|0 173
CCACCAACTAAC-TGTGCATCTCAACCAATC-------CATCCACA-ACTCATCCACCGCCCACACATCTCTATTTGCCCACTTGTAGATCTTTCGAAATTCTCCTTCCTTGCGACGTCCTTGTCGAGCAGTATTATTTGTAT--------TTTATTGTTAATTTTCCATTTCG
CCACCAACTAATGTGTACATCAGGCTCATTCGCACACACACACACACACACACCCAC-ACCCACACACACTTCCTGTACCA----------TTTCAAAATTC------------GCGTGCTTGTCGAGCAGTATTATTTGTATCTGATATCTTTATCTTTGCCTCTTAGTTTCG
>Tie 4491545 4492082|4604 chr3L 4492061 4492425 scaffold_40 76902 77272 + 23972|0 21
CGCTGACTGAGCCAACCCCTAC
CGTTGACTGAATCACCCCATCC
>Src64B 4575361 4575487|4700 chr3L 4574204 4575556 scaffold_40 191696 193146 + 26233|1339 1476
ACAGAGTCCAGCCTATTCACACACATCACCAACACTCTCTCACACGCA----TACACACACGTACGATATATATATATATA-----GTATATAAAGTTATACATATATTA--TACATTTATATGCATATTTACTATAA
GCGGTAGCGAA-GGAGTCGT-CACAACACCCACACACACACACACACAATACAAAACACA-ATACAACACATCTATAAATATATATATTTATAACGTTATCTATATATAACGTAAATATTTATACATATTTACTATAA
>CG32236 4646774 4646929|4803 chr3L 4646767 4648904 scaffold_40 292553 294725 + 11257|7 165
TGGGAGCCCACATATCGTCCGCCTCATTATGCAACTGCATTAACATAAGTCCAACGAACGGATTGCAGGCAAACTGACTAAATTGTAGCACATCTTTGTGGCCCAATGCAGCAGAATGTTGTTTTCTCTCACAAAATGCAAAT---AAAATTATGAAGT
----AGCAATCATGGTGGCAGCGTCAGCG-GCAGCGGCGTCTCCTGTGGCCC--CGAAAAGTGTCCACTGAGATTTCAAAATCTGTAGCATACTTTTCTGCGCCACTGC-GCACA-------CATTTCCGACAAACTCCCACCATAAAAATTATAAAGT
>CG7514 4668414 4668642|4837 chr3L 4667426 4668489 scaffold_40 323926 325090 + -3041|1157 1237
TTTTTAAATAGCCATGTTCAATATTCAATAAAAAATATAGTTTACTTTATAG----CATGAAATAGTTGCGTT-CTGCATA
TTATGATATACCAATAGTCGAAAATCATATACAAATCTATTTGATTGTTTAAGATTTATAAGATATTTGAGATATTTCATA
>CG15876 4675096 4675169|4849 chr3L 4674882 4676888 scaffold_40 331912 333918 + 19125|268 362
GTTTA----------ACTTAAT----CTATTGCA-----ATTTTAAATTTACTAGTTT--CCTTAATTGTTGACGATTAAAAATCATTGAACATG
ATTTACGCAATTTGTATTTTATTTTATTATTGTACATTGAGTTCCAGTTTCGTATTTTGACCTTAATTGTTGACGATTAAAAATCAAAGAATTTC
>CG12493 4733240 4733396|4933 chr3L 4733376 4733643 scaffold_1498 2140 2418 - 3459|0 20
GCGAAAACATCACATGTATCT
GCAGAAATTTCAGCTGAATCT
>Dhc64C 4788215 4788513|5005 chr3L 4787047 4788282 scaffold_40 494587 495861 + 32445|1213 1288
AAGTAATTTTTAAATCTGTTCCCCATTTCCGATAAAGCTTACTAAATATATATACTCA--------TAGCAACCCC
AGACAGTTTTGAAAACT-TCCCCCAATCCCAAAA-----TAATAAATATATATATACACACACAACTAACAAGCCC
>CG32237 4830282 4830436|5039 chr3L 4829916 4831370 scaffold_40 547399 548742 + 65065|370 536
GTCTGGATGACTGCGAATACACTTGTACCTGAACTTCTCGTTCGCGACTTGATTCTCTCACACCCACCACCACCCACTAACTAGGCCGTAA-----------GTTTTGCTATTATTTAACGATTGAAATCAACG-AATAAATCCAACGAAAATTGTTATACCATAAC
G----------------------TGCGCCAG-----CTGCTGCCTGCCTGGATACGATTAGAGCC-CCACCAACTCCT-ATTAGGACGTAAGTAAGGAACCTGTTTTGCCATTATTTAGCGATTGAAATCAACGAAATAAATCCAACGAAAATTGTTATAATATA--
>CG32235 4840656 4840693|5056 chr3L 4840369 4841142 scaffold_40 558206 559049 + 15213|362 399
TAAAAAATTGATTCCGACTTCGTCAATTGTCACAAATA
AAAAAAATTGATTCAG--CTCATCAATTGTCACAAATA
>Con 4919262 4920114|5146 chr3L 4917580 4919802 scaffold_40 653510 656114 + 32554|2058 2758
GAACCTCCGAGCAAACTGGCGTTTCATTTAAA-----------------------AAGAAAGATACTCAACTTATCGCAGGATGATGACTACCACTACACTCTACTACATAGAATTAGTTTAAACGGTTAGCCATAG---------TGACACTT----TTGGTTTACTTGAGCAAGGTACATACTACAGTAAAA-CTTGGAAAGCGCTAAACGTCTTAGAATGAGAGACAGA-GCTGGCCAAAACCACTAAAT-----------------------------------GAGGCATGCCTGTAAGATAAACGCAAATGCAGAACATAACACA-----ATCGCTGAAAGTTGCAACGATAGCCGTTAG--------TCGATAGGCAATAGATGA-TAGCAGATAGAATATAAATAATAATT-AATAAATGTAATAGGTAAACGTAAAATTCCCGGCCACCCGCAGTT--------------CTCCCTTAGAGTTTAAGTCTGCTTTTTAGTTGTAAG--------------------------------------------ACTGTTTGCTACC-------CTAAAATTCTCGCCTGAAAAAAAAACCTTGT-------TCCGGGAAAATTACACAGCAAACACTTTTCTGCTTTTGTCCTACTTTCGCCGCACCAAAAATAAAAACGAAAACATAAACAAGA
GAACCTCCGAGCAAACTGGCGTTTCATTAAAACTCAAAACTCAAACTGAAACCGAAACCAAAACCGAAAACCAATAGTAAAAT-ACAAATACAAATACGCTGTACTACATAGCTATAGTTTTGAC---TAGCCATAGAGCTTGCAATTATATTTGAGATTCGTTTAATTGAGCAAGGTACACACTACAGTAAAAACTTGGAAAGCGCTAAACGTCTTAGGTACAGAGTCAAAAGCTAGGCCCCAATACTAGATACAAGCTGGGGTTCAGCTAAAAGTAAGGTCCATCAGAGGCACGCCTGTAAAATAAA------TGCAGAAACTCACACACATAGACAGCTAAACGTTCGATTGATAGACGGTAGATACACACTCTATAACTAAAAGAAGAACAAAAAAGGAAATATAAATTAAAGTTTAATAGATTAGA---GTATATGCTTAGTCGTCAGCCTGGTGCCGCTTCTGGAACCGGGCGCTCTCCTAGCAGTTAAGATTGCTTTTTAGACATAAGCCACATACTCTCCTCTTCGACCAGCTACTTGAGAAAAGTCATCTACAGCCTGCAACTATTGCCACTGCAACTGTCGCC---AAATATTTCCTCTTCAAGACCTCAGAGAAATTCTCATGCGAATCGCTTAACT--CTTACTTTTACTTTCGCCGCACACAACCAAAGAAAATAACTGAATATAAAT
>Con 4919262 4920114|5147 chr3L 4919803 4920985 scaffold_40 656333 657633 + 32075|0 372
AGACTCAACTCCGAGAATGGTTGCTG-----AATGGTGACCCCGACGTTTGGT--------TCTACATTGTA-----------------CATACTGTCT-----TGGAGATGTGGTGCCCTTGGGAAACGAGCTTCAACACGTT--AATTACGAAA--------------GATACC----AGCTACAGTCCTGTAAATATGTAAAAAGGGGTAACAAAATTCGATAAATTTAATACTA---TAAACCTAGCTGATAGCTGTAATGATAGACTCGACTTTTCAACAACTTCAGCAGCAGATTCAGA---TTGAGATATAGAAACCGATACCAAAACCATTACCGAAACTATAAGCCCAAAACGAACCCAAAAGA
AGTTTTCAACCAATGAGTTTTAATTGTACATACTCGTGA-GCAGTCATTTGGTCTAAACTATCTAAACTAAAGTGGGAAGCGGCCATATGACACTTTCTTCATATGGAGTCGGTAGAACTTTTCGAAACGAGCTTCAAGAAAACAGAAAAACAAAAAGAAAAACAAACATAATACCCCTAAACTAAAGTCTTGTAAATATGTAAAAATGG------AAATTCGAT--ATTCGATATTAATTCCAACCTAGCTGTTAGCTGTAGCATTAGTCTCCACTTTGACAAACTTGAAGCAGCAGAAAAAAAAATCCGACAAAGACAGGAGAATTCAAAAACCA-----AAAACCGAAACCGAAAAACCAATCAAATTGA
>CG17030 4960828 4960941|5217 chr3L 4960825 4960950 scaffold_4 2672265 2672384 - -857|3 117
AGGGTATACTGTACTATATGTAAATTATGATGTAAATTAAGTAATTAAAGATATCACCAAAGTTCCAAAATAGGTA-ATTCCAATCTAAATATAAGAAAATGAAATAAGTCAAGC
-------ACCAAACTGAAACCAGGATGAGACACGAATTGAAGCCCCAAAACGAACACACACACACGAACACACACACAGCCCCACACATGCATACGAAATTAACACAAATTTTGC
>CG12027 4992355 4992443|5258 chr3L 4992304 4992449 scaffold_40 764988 765137 + 481|51 151
AT-CATCACTAAAAATAATCGTTTTA----AATGTTGTT----AAAATTTTCGCACAATTCTTAATACTTTAAAAATTATA---AAATGTTTATGTTAAAA
ATTCGACACAAAAAATAAAAGCTGCATAATAAAGTAGCTTTAAAAAATTGCGTCACACTTGCATACCCTGTAAAAAAAATATATGAAAATTTAC-------
>CG10672 5114387 5114418|5366 chr3L 5114203 5119607 scaffold_12 157376 162851 - 168710|196 238
GCGGTGTACATAAATATAATT-----------TCTTACGGGCT
GTGATGCATGTACATATACTTATGTTCTTATGTCTTATGGCCT
>CG10671 5118026 5118342|5366 chr3L 5114203 5119607 scaffold_12 157376 162851 - 168710|4098 4483
GAGCTGAACCCTGGTC-------AAGTCAACAGAGGGGAGAGCAGCCATCAAGCATAG--AAGGAAT-------------TGATAGTTAG-----------GTGACGGATTGGAATTTATACCAAA---TTTTTGTATAT-------TCAGCA-------------ACGATGATATGAAACGATGATGATATTACTAAGCAAGCAGCCGAGGCTGGCACTGGATCGCGCGCTCTTCTCCTCATCCTCCTCCACCGC-CGGATTCTTACCATGAC-------ACCCCAAGCATCCTTCATCAGCAGTGCGTAGCTTTAAGCGTTCTTATGTTCGTGTGTTTATATGTGCCCAACTTTAACAGTAA-----AAGGATTTGTTAACAAA
AAGCTGAACCCAAGTCTTAGACTAAACCAGCAACAGGAAA--CAGGAATTGAATAAGGTTAGCGAATCTTTTTTAACCGGTAGTGGCTAGTAAAATCTTTTGTAGCAAATAGAACTTAATACCAAACGATTTTTATATACAATGATATCAGCAGCTTGAGGCTCGCACTTTGGCACTGTGCGCTGTTCATAGTTCATAGTTCATGG----GGCAATCGCAGCTCCGCGCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTCCTCTCTCATTCTCTCGCTGACTGTTTCTGCCTTCCGGATCTTGCATTGTTACCACGTAGACTTAAGCGTTCTTTTGTT--TGTGTTTATATGTGCCCAACTTTAACAACAACAATAAAATGATTGTTAACAAA
>Gen 5123792 5123812|5367 chr3L 5119639 5126302 scaffold_12 162871 169712 - 245960|4402 4422
AGATTCTGAAATTCCTTAAAA
GGTTTTTATTTACATTTATTA
>CG32423 5134622 5135548|5381 chr3L 5134325 5135645 scaffold_12 179321 180584 - 8809|302 1317
CTATAATATATTAGTACCCCATTTGAGTACTATATAAATTGGACGAGAGTGAGAGCAAGCCGGAGGCGGAGAA---GCGGAAAAGCCAAGGAGGGAGGAGA----ATCAACATCAAAAGCAGAGGATCGGA--TAAAGGAGTCTACAACAACCACCACATGAACAACAACTAGAAGAGG--GAACTGCTGAAGCAA----CAACATCGG--CAGAAGAA-----ACAAAAACCCAGCATCCAGAATCTAGAGAAAAGCCATCCCGTAATGCCGGGAAAATCCCAGAGAG--CGGAGGCAGAAAAATAA------TGTATAAATAAGGCGGTTG--GATGTGAGGATGAAGTTTAGGGGG-TACATGAATGCGAAAAG---AAAAGCCGGTCTCCGAAGAGACGAGCGCATAGGACGCGAGAAAAAAAGTGAAGAAAAGCAAAGACTTAACTTAAATAATAGAGAATAGTTATACACTAAATAAACAACCAGAGATGCAAAAGCAGCGCGGCAACCATTGCCAAAAGAAACAGCGGCAAGTGAGAGAAAAGAGCAGTCGAAAATAT--TTACAAAAAAAAAGAACT-----GCAGGATGCAAAG-------AGAAAGGAAAGTCAAAGAAAATTCACT-----TGGGGGTCGTAA------------GAACTTGAGG------AAATCTGCTGAGAAAAAA---AAAACTATCGCAGATTAGAGTTAAGTTAATTTTGTTAAGCGCAAAAGTAAAAAACCACTGCATGGGGAAAACCGATGGCAAGAGCGATGTAAAAATAGAAGGGAAAATACAAAGAAACTATTTTGCTAAT-TTTGAGCTAGCAAAACCTAAGCAGACAGAAATTTGTGAAATGAAAGATGGAAAAAAACCGAAAC---AGAAACAAAAATAAATGTGTGTGCAATGTATGTTAAAAACTCGT-------AAGGAAAAACAGAGCAAATAAAAAC--GAAACAAAATCCATTTCGATGATGATATATAAACAAA
ATATAATATTTTAGTACCCCGTTTGAGTACTATTTAA--TGGACGTGATGGAGGGTTAGCGTTGGGAGCATTACGCGCTGGAATAACAATAATAAAAACAACAACATCTACAACAAAAACAAAAGAACTGGCTTGAAGAAAACAGCAACAAGAAGAAGCAGAAGAAGAAGCTGAAGAGGAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGCCACATCAGACCAGAAACAGTTTGATAACAGTCGAAAATGCTGTTCCCTAAAAAAA---------TAATGTTTAAAAAAATAAAGAAAAGCTAGAGAAAGAGAATTAAGAGTTATGTATAAAAGAGAAAGCAGCAGAAGCAGCAACAAAGGAAAGAAAAATACATACATAGATAAAGTGTAAGAGCGAGC-------GAAACGGAGTTAAGATGAGAGCGTAAAAAAGTGAAGAAAAGCAAAGACTAAACTTAAATAATAGTTATTAGTTATACACTAAAAAAACAAAC----ATGCTTAAACAACA-----------GCAAAAGTGAACG--AGAAAGTAGTAGTAGAAAGGGGTCGAAGATTTCATTGAAAGCAGGAAAAACTTACCAGAAGGGGGCAACATTTTCTTAGAAGAGGAGTTAAAAGAAAACAAAATAATAATAAAAACGGCAAAACTGCAAACATAAACTTGAAGCAACAACAATTTGCAAAGAGAAAACGCAAAACTCT----------AGTTAAGTAAATTTATTTAAGGAATAAAACAAAAACAAAC----------------ATAACAACAAC----TTGCATTAAAAGAGAAAATGGGAAAAGCAGCGCATGTAAATGTTTAAGCAGAGAAAAAC-------ACAAACATTTGTGAAGAAACGAAGCAAAGCAAATGAAAACCGAAGAACCCAAAAAAAA--TGTGTGCAATGTATGTTAAAAATTAACGAAAACAGAAGAAAAACAAAATAAAAACAAACAAGAAAGGAAATAAAACAATTTGATGATTTAC-AACAAA
>CG32423 5135715 5135755|5382 chr3L 5135671 5136908 scaffold_12 180902 182138 - 22527|44 84
TATAGGTACTAAACAGTCTATTCACTGGTAACCCATACTAG
TATAGTTACTAAGCAGCCTAAACACTGGTAACACATTCTAG
>CG32423 5136403 5136413|5382 chr3L 5135671 5136908 scaffold_12 180902 182138 - 22527|789 799
GTCTTCGCGAG
GTCTTCGCGAG
>lama 5317562 5317942|5627 chr3L 5317554 5320069 scaffold_12 410488 412980 - 106730|8 414
GCGCTGAGGAGCAGGTTTCTTCTTTTAACCCGTAGAACCCAATCGAATTTGTACCCAAAACCCACCTCCATCCATTTTGAAAACTGGAAAGCAATAATTGTC-CTAGATTTGGTAATTAGTGTCCTGTCTTGTCTCGTATAATTTGTGTGTTCCTAGTTGGTACA-TATCTTACGTCCATAGTCTTCTAGTGTCTACTGTACTTATGTAT-GTATGCGTGTCC-------------AATCGATTATTGTCTTCCAGCTG-TACAGCTTTTTATTTTCCGTAGGTCTTTTGTAAATTAGCAACGAAATTGGAAATATATTTTTTAGCAACAAATTTTTGTACTTTAGTAACTATTAACAAA---------TTGTAAAGAAAATAAAAACAAAATCATGAAAAACAACA
GCGTC-----CCAATTGTTCTCTGTTA------TGTTCCCCATCGAATTT---------------CGCCAGCGACAACAGCAACTGAGAAGCAATAATTGTCACTAGATTCGTAACTT-----------TAGTATCGTCTTTTCTGTGTGTTCCTAGCTGATAAATTGTCGTACGTAGATATCAATTGTGTTGCGTCCATAGTCATAAATCGTAGTCGTGCCCGTAACATATCAATGTTCAATTATTGTCTTCCAGTTGATATATTGTTTCGTTTTATTTTTTTTTTTTTTGTTTT-------AAATTGTAA----AATCTATAGTCTCAAAT--------TTTAGTAAATATTAATAGATTTTTTTTTTTATCTATGAAATGAA---ACAACAACTGAAACCAATA
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CAACTATATCACACACAACTGCAACAGCAACAACAACAACCA----CACAACCGACATCCAA-CTGAATGTGGGAGCGTGTG-GTAGAGATAGAGCGCGTGCCCGCCATGGTAAGACGCCTCAATCCTCGAGA-GTTGTGTGTGGTAATGTCAGAGCGAATGGAGAGGTTTACAGAAGAAGCAGTTGGAGGAGTCAAGGAGCTGCATTGTTGTTGTTGTTGTTGTACTTCTTGAATGTGTGTGTGTGTGCTCAGCAGCAACAAGAACTAAA-GCAAA--ATATACTATAAGTGTAAACAACAACAGCAACAACAACAACAGCAACAAGAAGAAGAAGAGGAACAAGAAGCAGAAGCAGAAGAACAGCCACAGCAAACGTCACTAATATAAATGGTCGTCGTCCCTTCCGTCATCGAGCGTCGTACGAATGTCATCACGTTTGGTTACCC-ACATTCTTAGCTA----------AGAAATAAAACAAATAAAAACTCAAGTA-AAGAATGA---TTAAGTAAAAAACAAAATACACACACACATACGCTACACCATGCAAAAAGATACATTTATAATTTTACTCACGCAATTTACAAAACAAACAACAAGAACAACAACAAAAGAAACGCAAATTCGTAAACT---------TAAAACCA---CATTATAAGATAAAAAATGAAGCGAGTTCTGTTTTCGTTGCAGCGAAGAAGTTGAATCGTAATTATTGTTTT-----GCATAACTAAAAAATTTATTAATTATATATATA--------TATATACAAATTTAAGCGAATTTTTTGTAGTAAAAACAAAAAA--AAAAACGAGAAAAAAAGAAAACTAAA
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TAGCAACACCAGCAGCAGCTGCAACAGCATCGAATGCAACGCGAGCGGGAGCAGCA
TGGCCACAGCATCAGCAGCTGCAGCAGCAGCAAAAGCCACAAAAGCGCAACTAGCA
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TCGACAACATCCGT
TCGGCAACAACAAC
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TCCACAATTGATCAATTGTT-----------AATTTAACATTTTACA---AAATAGAGTACATTTAATTTAAACTCAA
------GTCGACGGCTTGTTCAGAACAAAGGAAGTGAATGGTTTTCACCTAAATAGAGTACATTTAATTTAAAACTCG
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AAAACTTAAACCACTTC
AAAGATTAGAATATGCC
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AGAAAAAAAAAAAAAATAATACATTGCAACAAATAACACTTTTCATTGAATTAATTTGTATCGTAA
AGAAAAGAAAAAAACACAACAAATAAAAACCAAACTGATTTTCAATTAAATAATTAAGTACTGCAA
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ATGAAAGCAT----AAATTGAAGCTATTCAAAAACTAGTATAAAACATT-TGACTAAACTAAGCATAAATAGTATTAGAATCGTATCAAAAT--AATCGAAATTCCGACACACTTGCTATAACATGTCATTTTTTTTTTTCGCTGGAAACCATTTTTTACTTTAAAGCGCATTAGGTAATTTACTTTAATTAATAGACACGCGGAATCAATTAAGTAGCATTCAAATATAAATTATTGAATTAGTTTTTAAACGATATCGATACAAAAATATAT--ATGTTTATATATATAAATATATGTATTTGTGTAAATCT-GTGTACGCGCGTTTTTGGCATCA--------AAAGGCTAATTAATGTA---ATTATTGTATTAAAATACCAATAAAAAGTATAAAAACATTTCGAGTCATTAAACAAATCGAACAAAA
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TTTGACGATTT-TCTCTGTGATTTCGAAATTATGAATTGTGATTACAAATACAA----TGTTAGGTATTCTGAATGATG-TGCGTACTGAGCACAAGTCGGTCGTATGGATGATGGTCGTATTCCTTAGCTGCAAAACCATGTACAGTATTATA
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TTTAAACTAGAGCGATCTAAGTTATAGCCGTGTTCCAATGACACATTCCGC
--------ATAGCG--------------------CCAATGAGGCAATTGGC
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CGA---AACCTGCGTTTGTAATGCCGATAAGACGCACTCATCAAAAACAACCTATACCTCCTCCACAACC------------------TATCCCAACTCAAATCCGGCCTCGGTCGACTTTAATAAACAATTCAACGGCTTCAATGGAAACACGAATTTCGGCAGCATAATGAACGCCATGTCACTAACCCAATTGCCCGTCGTGCCGCAGGCACCTGGCCAGCCAGCCTTCTATCCACCCGACAAGATACCCAAGGGTGCTGTGATCGCCTTCATGCCAGTGGTCATACTGCCACAAGAGTACTACGCCAACTGCGATGAGAACACCATTAAGACGGCCAACAAATATCAGAGTATTGATCCTTTCCCGTTGGGCGTACAGCCAGCCTCCATACCGAACAGCTTCAGTGTGCACTCGATTCTCGCCGGCGCCGGACCGAAGGACCAATGCATGTGCCCATGCTCCTGCACACAGAATCTG---GACAGATACCATAAAAAACGCGAA---ACTAAGGCTGACGATGCTGTCGAGGCAAAAGCGGCTGTTGAGGAGACTGTAGCGGCAGCTGCCACGCCTGCAGAAGTGAAGGTTGAGGC---ACCTGTTGCTGAAGCAACCACACCCGTCGAGATCAAGGTTGAGGCACCCGTTGCCAAAGCCGCCACACCTGTAGAGGACAAGGCTGAGGCACCTGTTGCTGCAGCTAACACGCCCGTCGAGACCAAGGTTGAGGCACCCGTTGCCAAAGCTGCTGCGCCTGTAGAGGACAAGGCTGAGGCACCTGTAGCTGAAG-CTGCCACGCCCGTCGAGATCAAGGTTGAGGC---ACCCGTTGCTAAAGCTGCCGCGCCTGTAGAGGATAAGGCTGAGGC------------AGCCGTTGCTGGAACTGCAAGTCAAAGCTAAGAGCCGACGACGACCTAGAC-AGCACAATTGACGTCTGGACGTCACCGAAAGTACCCAAAATCCCAGTTCCCGCTCACAACTCCCAGCTCCCAGCACCGCCCGAAAGCCCTGCACTACTCCCCAACCCGCAGCACCTCAACTAACCCAATTGCCAGTTAACCAGCTTTAGTCTAAGTGTTTTTATTAACGAGAATACTCTCAGCCAGGAAAGGATAAAAAAAATGAAAAAAATGGAAAGAAACTAGAAAAAAAGTTAATAACTGCCGTTGAATGTGTTC-----TTTTATTTTTCTTTAAAAAACATAATAATTTTGCTTTTGTGTTTGTACTCGAAATGCACTCCAAGCTTCCTGTCAACTAAGACTCT---AACTTCCTCTGATA-AATCATTTTCTTAAATGTTTTTCG-----TATGCATTT--TGCACATGTGGCTAAAAAGAAAGAAAAAAAAAAAACTATGAAAAACGATGTGGAAATTTAAA
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GAAGGATAAGCCAAATAAGAGCGTTACCACACCGCCAGTGACAACGG
TACGGATAGACCAGTAAAAGGCATTACAACAAA---AGTAACAACGG
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TAAAAATAATTTTCGCCATATATTCATCGCTTCTCTCTAACATACCTAAAGAAATTAATTTTAGTTCAGAGAAGTTCGACTGTACTCGTAGTTTTTAATTTAAAAAGTTTATGCAATTGACGG---------CCGCACCGATTC-----------------ACAAGCTTTCAGTTTTTGGTACTTAT-AATCATCCATCC-----------------------------------AATCGACCAGATCAGTTCCAAGAGAAGACTGAATGTT--------------------TTTCCGAATGAAAACCAGAACCAAGCACAGCTA----------------ACATCAAACGAAGACGCTCAACTAGATGACTCATGTTCA----TGTAGAGTATTCTACAGTATTTGCATATCAATTTTCGCTCAATTAACGCCCAGACACAAAGAGCATACCCCTCCGCAATTGTACGT--------TTATTTTTTTCTTTAGCAAAAGTCGCAGGCTAGTCGGAACTAGCATCGAAATATTACACTCGTGCCTTAATTAGATAGAACTATTATGGTGTAGTTCGTAGTGCCT---------GAAAACAAATTATTGTTA--TAAACATACCTGAACGACTGACCTGCGACTAACCATAGAGATCATTGAATTGCATAAACTTCAGCTAAGCTAGTGCCTTAATTAAG------TGACCCAGAGAAAGGTAA------------------------GCGAAACTC---CGCCCATTAGTTTTAAGAACAAAACATTCCCTTTTGAACTCGAATATTCCGCACAAGTTACCTTCTT---TTAAAGGTAACAATTAG-GTCTGTATTAATCATCCGTCCTTTGCACGTATT----------TGTAACATTTTCTAAACCGAGAATTTAGCAATGTAT-----------TAAAGCAATACATACGTCTTTTACCGT-----CCCATATACAATAATATGTGTAACATTTTTATGTACAAACGAC-TTTTAGCTAAAGCGAAGAATAATAAAG---TTTTTATTGTATACAA-------------------------------CAGCTGAATGCAT
TACAAAGAATTCTCACCATATAATTA-------------------------AATGTAGTTTTAGATGCAAAAAACCAGCCGCTAGTTG---------------AATGTTTATGCAATTGTCAGACAACATTTCCGCACCAACCATGACACATTACATCCAAAGAGACTTTCAGTT---GGTACTTATGAATCATCCAATCTACAGTTCATTAACACGTCCGCAACAACAGACAGAGATAGGCTGGCGCATGTTCTACGGAAGACTGACTGTAACTGCAATGCTTCATCTCAATTTCTGCAGCAACAACAACAACAACAACAGCAACCACAACGCCAACTAAACATCAATGAGGCTCATTCCACTAGAAG-CTCAAATGAACCATTATCGCGTGTATATCAATATTTGCATACCAAATTGCGCTCAATTAACGCACAACGTCA-----CCTACCCCTCGGTCCCCTTCCGTATTATCAATTAGTTTTGTTTTTGTC----GTCGCATGC-GCTTAGAACTAACAAC-AAGTAAAACACTCGTGCCTTAATTAGACAGCATTGCTAT-----AGTTGAAAGTGCCTTTATATAAAATAATCAAAATATTTGTAGTTTCTCATACCTGAAAAATCGCGATGCGACGACTAACG------ATTGGATTGCATAAACTTCTAATAATCTAGTGCTTTAGTTAAGATTTCAGTACCCAAAAAAAAAAAAAGTTGAGAATAATAGTTAAGCAATACGAAACGTAAACGTCCAATACTTTTAAG------ACCCTCCATTTTTTATTCGAATATT-TACAAACGTTAACCAGTTAAATAATAACTGTCTATTAGTGCTTGTCTAACTTGTAACTCTGTCTTACAAATTGTGTACCATATGCAAAAGTATTTAAACTG----TTTTACTATATACACACCTACATACAATACAATATATATATATTTTTATATATATGTATATATGAATATATATATGTGTAGCTTTTTTGTACAAACGACTTTTTAGCTAAAGCGAAAAATAATAAAGTTTTTTTTATTGTATACAAACAAATACCAAAATGCATTGGTTTCCACTTGCATATCCATGTAT
>sinu 5533417 5534628|5866 chr3L 5534551 5535532 scaffold_8 344334 345314 + 45188|0 77
CCGTGGCAGCTGGCACACTTGCACCAAGGAAAACACAAGCCAACCAAGAGGAAAACAAAACAAAAACATTCCGTCCCC
TTGCAGCAGCATACAC-----CACAACCATAAATACAA--CAAC------AAAAACAACACAAAAACATTCCGTCCCC
>sinu 5534693 5534698|5866 chr3L 5534551 5535532 scaffold_8 344334 345314 + 45188|172 177
TCGATG
ACAGCG
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---TAAAACTGAAGATAAAAAGCTTCTCAATTGTCAAAGACGCACATGGTTTAGCATTTAAACGTACAAAACATAGTAATAATGCATGGACGGGCCTTTTATTCATTTAAAGACTGTAAACACAATACATACATATAAAGATTGTTATATTTTACGAAAATAACTTGTGTAATGTGCATGTGTGAGTGAATCGCTAGC--AAGCCGCTGTCAAAATGCACTTTTATAAAGGCACCGCTAGTAATGTTTATGATTTATTATTTGTTTAAGAGTGCCCGACTAGT
>Sucb 5536885 5536973|5867 chr3L 5535572 5537617 scaffold_8 345633 347613 + 72965|1388 1477
TATTATTTATGTTCTACAATATCATTTGTATATAAGATTAATCTTATCATTCTGCCCATATTGAAAATGATAAAA-GTTTGTGAAAGCCA
CATCATTTG------------------------------------------CTGCC-GTCTCTGCAATGATAACGCGGTCGCGATA---A
>Msr-110 5540848 5541527|5869 chr3L 5539513 5541564 scaffold_8 349525 351653 + 24564|1619 2388
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GTAACAACAACAACACGCCTGTGATTGCTGCTCTGCGAATCGTATCTGGTTGTCTACGTCGTC---------------------GTCGTTATTGTTTCCA---------------TATCAAATTGTAACTGTGTCGTCATCCGTTGCTCGATTCCGAAAACATCTCAAAACTAATGCGTTTGCATGTGTAGCAGCCCCCAAAACGCCAAAAATGAAAACGTCAATCGATAGAAATTTTGAGTTTTGGCCCCTAAAAGAAATCTCTTTATATATGTTTCCACCTATATCTCCTTCCCCACTA-------TATCTATATAT-GTATTTGTATATTTTCGTAAAAAAGATATTGTATGTATAACATTCCAATCGGTCCTCTCTCAAGTTTTGTGAGCCTTGAAGAAAAATCGTATTTGTTTTTGAATATA-----TGTCTACAGTTTTGAAGTATTTTTCTTTTCGTCCTTT--------------------TTTCACAA-----------TAAATCCGATGAAA---TTTGTATATAAATTCTAGTATTTTATTTTTAATAC--------TTTTCTGTAGTTTTTAGTAAGTAAACAAACAAACACGAA------------------------------AAAAAAAACACCAACAAA-------TTGTACATTTTTTATATACATA-------------------CATTTTGAAGCGAATAAAATTGTGGATAATTGGATATCAAAAGATACTGTGTGTATTATAATGGAGG
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ACCATTAAGCACTACCAATTAAAATATTACACATAAATAGCCCAAACAGCTTCAGAATAAGATTACTGCGTTATCTATTATCAGACATAACGAATAAGCTCAATCAAATAGTAAAACTATTTTAC-TGTTGAGTATATTTTCAATTACTTAACTAACGCAAATACAAAATTTTTGTATTTCATGTCTATATTTTGTACGA-----TACCAAACACGCAAAGTCTTATAGATGCTCACCACACTATA-AAAATTTCACATACATTCGATTCTTGAGGATCTTAGGATTAGATTAATTCGTTAAGAACTTC--GTTACAGTAAATGACTCAAATATGTATAATGTGCACGCCGAATGTAAATTCAAGTGTAATTCTTAAGCGAAATATTTACAATTTTTATTTTCTTTTAGAAATCAATAAATGTGGGCCCAGATGGGCCTTATATAAATGACATAGAAACCTAAAGCTGAATAAATCGAAAACGACCTTCT
ACTTTTTAACAATATCAGA-ACAATTTTCCACACGTACA---TACATATCTCCAG----------CTCCATTATCGCTTATTCAATATCCT---TCAGCTCCCTCCAATTACATAACAACTTAATATATTCCACGTACATACATGTACATACATACGTCAAATGTACCATCGTTTAATT----GTAGAATTTTTGTATAAAGTTTCGTTAAATACA-------TTACGTATGTCGCTTAGACTAAATACGACTCGATATGCTCCTAGTCGTTCGCACTATTTACAGTTG-TTGATTTGTTTTTATTTTCTTGTAGAAATCAATGAACTAAATGT-TAAATGTTACACAATGAAT---AATT-------AGTTCTAGA---AAACATTAACAATAAATGCCTTTCGCTTACAAAATATAAATGTAAAAAAAAA----------ATGAATTTAAGAAAAAGGTGAAG--GAAAAACAACAAAATATTATGAT
>spo 5564030 5564533|5888 chr3L 5564518 5566174 scaffold_3 5757657 5759395 + 55467|0 15
TAAATTATAATTTAAA
-AAATAATATTTTCAA
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AGTCCAGACTACAGTCGCATACTCATAAGGAATACTCAGTAAATAGTTAAGGGGAAATGCAAAATGTTA
AGT---------AGT--TATTCTAATCAGCAA-----AATAAATAATTAGATTTAAATAAGAATTTCTA
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AGGGAAAACTTAAGATTAAATTTAGTTTAATAATTTAATAAAAACTGTACTGATAATGTCTAAAAAGAATATAAATGACCATTTGATATGGAAGTAGAGGT
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GTCATATATGTGCGTATGTTACG-------------TTGCATACGGTGTACATCGAGTATTTTATTTGAATTGTT-----TGCCTAGAAAACTTATCAA---TCTATGCAACTGCAACAAAATGTGACTTGAACTTGTTTGCGCCAATTAAGTT-ATGTACGATGCAAGAAATGTGCTGATTAGCAATAGTCGATAATCT---AATAATAAATTCAATATATAAAACCAAAAAAAAAGTTTA
TTTGTATGTATATGTGTGTTCTGAATGTGTTTATGCGTGTGTGCAGCATATATATATATTTATATTTGTAATATCAAATATGCCTAGAAA-CTTATCAAAAATCTATGCAATTGCAA----ATGTGACTTCAAATATTTTGCGCCAATTAAGTTTATATACATTGCA-GAAATGTGCTGATTAGCAATAGTCGATAATATTAAATAAATAAAATCAACATATA-----AAAAATGAAGTCCA
>CG10590 5575029 5575735|5894 chr3L 5575246 5575369 scaffold_13 1661208 1661323 - 945|0 126
TATACACTAATTTTTGGTTTTGTAATTTCTACTGTTCCATAAAATAACATTTCTCTACTTACTTAAATTACTAA---GAAGCTTGCTTACACAAAATATTTGATATATTTCCGAAGATAACTTTTAT
TATTCGATTAATCTAGCTTTTATAATTTTCGAGTTGTGTTGAAATAAAATCATTCTCCATATTTAAATTACAGGCTTGTAGCTTGTATAAATTGAAGATCGACTGTG----CGA-------TTCTTT
>CG10590 5575029 5575735|5895 chr3L 5575371 5575482 scaffold_13 1503914 1504033 + -471|0 123
CTTCGGAATTATAAGACTAGACGTTTC--------AAATGAGAAAATTTGGGAAAACATTGT---GAAT-TAAAAGCTCTTTCTGTTGCATTTACGTTTTGCTAGTTTTAAGAGTCAATTAATC
TTTCGGA--TAGCAGCCATGATTTATGTAACGTAGAAATGTATAAATCTTGAAAAAAAACGAACAGAATGTAATGAATTTTTTTTTTGCAGTAGAATGCAGC--ACATGAAAAGCCCCCGAATT
>CG10590 5575029 5575735|5896 chr3L 5575483 5578071 scaffold_8 387933 390604 + 102680|0 281
GAGCCCTGCGACTGCAAACCCACCCCCAGATCTGTATATCATCCTAATCGATTAACAATTGTATTTATTGAGTAGAGTTTTAGTTCTGTTTCACAACTTTAGCTCCAGTTGGCTCTCCTCTTTTCGTCTCTTTGGGTTACCCACTTCTCATGTTGGTGTG-----AAAATGAATG------CCAGTCCAATATATTCGCACCAAAGATAAAAGA------------------TTCAGTTTAACGATGTATACGCAAACTACATATATCACCTAAAAGGTTTA
-ATTCGTGCGGCTGTAGAGT------------------TCAATTGAAACCATTTACAAATGTATTTATTTTGTAGTCCTTTAGTTCACCCACTTGTGTTTATATATATTCATTTTGCTCTTTATCAATGCTC----TTACAATTTTCTCATATTGGTGTGGATTTAAAATGAATGAATTAACCAAGTCAAAGAGCTCACACCAATGATAACATAACAGCCGAAACGTCGCCCATGATCTGATCTATGTATATATAA---ATATATGGCACATATACTGTGTA
>CG12756 5581106 5581227|5903 chr3L 5580622 5581211 scaffold_33 641081 641713 - -2201|557 670
ATCCGCATCTGATAAAGCACTATTTACCTTCAAAGTT--------TTTAAATTAAAATTTGTACATGAAATAAAGCGAATGTAGATTTACAAACTTAGTTTATTTCCATACAAA
ATTTGTATATACTAAAATACTTTTGATATTTCACATCATACTAAATTCAACTTTAAATAAATAAGTAAAAGAATATGAATGTGGGCTTAGAAA-----TATGTTGCCACATAGC
>CG12756 5581106 5581227|5904 chr3L 5581225 5581419 scaffold_8 391573 391749 + 8476|0 2
TAA
TGA
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TGCATGTAAAAAGTGCT-TAAAAATCTTGCATAAAATATCGAAACACAACACATAGAATCGCATAAGAGTTCAAATCTAAACATTAAGATAGTTAAAAATTGTGC
>Sse 5633641 5633825|5955 chr3L 5633740 5636206 scaffold_8 453554 455988 + 60193|0 85
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TACACACATC------AA
AGGAGAAATCGGATATAA
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TCTATGTGCAGTCAACTCTACATATTTCTTCCCTCCTTATAAAAACGTACTGATCTTTCGTTTTAAATTTCAAAATCGATTTGTTCTAAATC---GCAACGAAA--------CGAAAAGTTTTA-AGAATTAAAACATTTTTAAAGTAAACATGATCTTTAAAATACTTATAATTCAAAAAACAAAAACGTTACAAATCCACGCGTAGTAGGAATTAAATAAAATTAACATTTTTTA-AAAAAAAAGGAT
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G-AAGCAGGA---CAGAT---TATCGATCATG------------------------------------AACACCGTGCGTCTA-CATACAAGCCAG---CTAATCCATTACGAGCATATTATCTATGTACTATTAATATATATATATATATAATTGTTTTTAAGTGTCGCCCCTATGCGACTCCCCTTTGTATCCCTTGTATACCTTGCGGCAATTATTTGAATTT-TTCATTGTGGCCCC------AAGCATCTCATAAGTTATGAGTTCCGAGTGATATTCTCCCGGGTTTTTATGTAGCTTCTAGATT-----------------------------------GAAACTAAATCGTACGAACTTTAATAAATGGCTATCAATTATTTTCAATAGCAT
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TCATATTTTAAAAAGCTGTCGGAAAAATATAAGAAAGCCCTTTATATTGTAGGGTAACACTTCTATATATATTATGCAAAAGGA
GGATCTT----------------ATACTATACACAAGATCTTTAAAATATGGTCTAATGCTCGTCCATAT----TACGGCACAA
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AAAATAATTA-----TTAATCGGGGTTTCATGGGGCGGGTCAAATAATATCGAACTGCAAAGGGAACGATAGGTGAAAGTAATTAGGAATTTGTTTTGTTCTATGCATAAGTACATGTGATATAGTTTACGG-AATTGCGGGCTGA--GCAACCCTCGAATTTAGTTAGGC--CTACCAACTAATTGAAATATTTTGTATCCGACATAGGGCTAAGTTTTC-----------------------TATTGTGAAAGTGTAATATGAATAAAAATCAAACAATGGCATTCAGCAAAAACGCAACC
GCGTAGATTAAGCTGGTAGCTGGTAGCTGATAAGG-GTTTTCTTTTTTATCGAACTGCAAAGGGAACGATAGGTGAAA--AATTATGA------TAAGTTATATA---GAGTTCTTGTGATATAGTTTACGACAAATGCGACCAGGTTTTAGCTCTTAAGTCTGTCTATATTATTGCGAACTTAACCAAA-ATTGCGT-------TTATGCTTAAGTTTTCACAATTGTACACTAAATTATGCGAGTTATCAAACGGAATTATAAATAGAATTTAAACAATACAATT--GCAACCCCGAAACC
>Jon65Ai 6027531 6027574|6383 chr3L 6027458 6027542 scaffold_9 4043333 4043448 - 2|104 115
TGCAACCTCCTG
ATGAATTGCTTG
>Jon65Ai 6027531 6027574|6384 chr3L 6027543 6027545 scaffold_9 1096991 1096993 + 273|0 2
TAT
TAT
>Jon65Ai 6027531 6027574|6385 chr3L 6027546 6028363 scaffold_12 2693330 2694157 - 12034|0 28
AAAGATGTTTTAATAAAATAATGAAAATA
TAATCCAAATTATTATATTGAATGAAGTA
>CG10472 6035324 6035364|6396 chr3L 6035311 6035585 scaffold_12 2695518 2695805 - 2658|13 64
GCG--------TTGATTTTGATCTTAAA---ATAAACGTTTATTTTTGGGTT
TTGCAAAATTCTTGATTTTAATTCAAAATCTATAAATATAGCTGCTAAAGAA
>CG13295 6047436 6047488|6415 chr3L 6047415 6049174 scaffold_9 4082026 4083751 - 64468|21 85
TTG--GATTTTCTCATGTGCCTTATTAGTCAAAATAAACATAGTA----------ATAATTTATA
CTAATACTCCTCTCATGTGCCTTACTC-TGACAATAAGCATAATAAATTTTAGACATAACTATTT
>CG10467 6067151 6067247|6437 chr3L 6066175 6067229 scaffold_9 608271 609364 - 23885|1038 1116
TTATATATACGTATATGTACCATGTATCCGACTATTCAAGCAACCCGTAATTATTATAACCAATAAACCAAAAGCACGC
TCATGTATGCATATA-ATCCCCTGTAGC-GAGAGTTCAAGCC-----TTTTTTTTTTTACTAATAAACTGATAGCACGC
>l(3)mbn 6097833 6098685|6482 chr3L 6097371 6098245 scaffold_9 664060 665023 - 22278|555 985
ACGGGTGATCTGTACAAATTCAAGTACATACTGGACTACAATGGACACGAGGAGACCGGCGGTCGCAATGGTGACAAGCAGGGTAGCTACTTTGCAATCGGCGAGGATGCAGTGCAGCGGACCATTGAGTATATTGCGAACGAGTTTGGATTCCAGCCCCACGTCAGCTGGCGGAAATTGGACGCCAAGGA---GGCGCTGCCCGAGGAGAATTCACTGAAGCACTACGAGTTTAAATGGTTTAATCAGGAATAGTAATGATACGGTGATTT-TCCGGTGGATT-----ATTCCAAGACTAGAGTAGGCACCTCTTTTCCCCATGCTGTAC------ATAACAATTTTTG--GTTAATTTCGAATAAATACAACGTTAAAAGAAATGTTTTTTTTTTTTTTTAAATTGGGTTTTA-TTTTGTTGAAAGTTT
ACAGGCGATTTGTACAAATTCAAATATCTATTGGACTATAATGGACACGAGGAGACGGGCAGCCGGAACGGCGATAAAGTGGGCAACTATTTTGCCATCGGCGAGGATGCGGTGGAGCGTGTCGTCGAATATATTGCCAATGAGTTTGGCTTCCAGCCGCACATTAGCTGGCGCAAACTGGAGGGCAAGGAGGCGGCGCTGCCCGATGAGAACTCGCTGAAGCACTACGAATTCAAGTGGTTCAACAAGGCAACCCAATAATTAATTAATCTAATAAGTAAATTTATAAATTCAGTAAAAAAAAAAAATAC--CCTGTACTTATGGAGAATGAATTGAAAAGAGTTGTTGTTGTTGTTCTTGAAT-------------TGGGTTTTGTTTTTTTTTTTTTTTGACTT--TTTTTATTTTTGTTAAAGGTAT
>l(3)mbn 6097833 6098685|6483 chr3L 6098246 6098681 scaffold_43 352038 352479 + 3680|0 474
TGGTGGAGGCATCGCGGCGGGTAAAGCGCCTGGTAATCCACAAGCTGGCGGATCTGGAGGTATTATCGGTGCAGGAGCTCCAGGCGGA------------------AGAAAAGTCTCGGCTGGTGGAATTGG----TTC--TGGAAGTGCAATTGGAGGAGTCTCTGGAGGAAGCAAAGCC---------TCAGGAAACGGCGGTGCAATTGGATCTGGAAGTGCAATTGGAGGAGGGGCT---ACTGGAAGCAAAGCTTCAGGATTTGGATTCGGAAGTAATATTGGA---GGAGGTGTTTCAGGCAGCAAACCTTCAGGGTTTGGATCCGAAAGTAAAATTGGAGGACCTGATTCAGGCAGCAAAGCTTTAGGATTTGGATCCGGAAGTAAAATTGGAGGAGGTATTACTGGCACCAAAGCTTCAGGATTTGGCGGAGAAATCGGTTCTGGCCGTGGAAGTGCCTCAAGTGCA
TGGTGGAAGCGCTGGTCGTGGTGGCGCACCGGGCGCTGGTGGCGCTCCAGGATTCGGAGGTGCTGGCGGAGCAGGGGGAGCCGGTGGATTCGGTGGCGGTGCTGGCAGAGGAGGTGCACCTGGCGGTGCTGGAGGATTCGGTGGTGGCGCAGGTGGAGCTGGTGCTGGAGGATTCGGTGGCGGTGTCGGTCGGGGAGGAGGCGCTGGAGGTGGTGCTGGAGGTGGTGCGGGAGGAGGTGCTGGAGCTGGAGGCTACGGTGGAGGAGCAGGAGCTGGCGGAGCTGGTGGATTTGGTGGTGGCGCAGGTCGTGGA------------GGCGCTGGAGGTGGTGCTGGAGGAGGCGCTGGAGGTGGTG------------CTGGAGCTGGAGGTTACGGTGGAGGCGCAGGTGCTGG---TGGAGCTGGTGGATTTGGTGG------TGGACCAGGTCGTGGAGGCGCACCAGGAGGT
>CG18779 6104332 6104497|6490 chr3L 6104182 6104401 scaffold_9 689062 689267 - -360|153 227
TTAAAAGGGAAAGAA----TCCTAAGTTACAGAACGCAGTTTGTTGAATATTAAAAAATGTAGAT-TTTATATGA
TTTACAGATAAGGAAGGTCTTTTAGATAATTGAAAACA--TTGTCAAGCAGTACGAGTAAAAGCTGTCTACACAA
>CG18779 6104332 6104497|6491 chr3L 6104402 6105102 scaffold_9 4321622 4322315 + 12964|0 103
GTGAAGTTGCTTTCA---CTGTAAGCAGCTTTAAACCCACCAATTCTGCAACACTCTTTGTTAT-----CTTCCCCAACACTTACCTACTTTCGGTTTTCCCTT
--GAAGCTATATTAAAACTTACAAAATAAATTAAAT------GTTGATCTAAACTTTTTGTTTTGTCTATTTTTCCAACCCTAAAGTCCTGAAGGTTTGCTTCT
>CG18778 6105260 6105365|6492 chr3L 6105158 6105341 scaffold_9 675432 675605 - 545|102 193
CCGGATGCGAATAAATAAGTTGACTTTATTTATCCAATGTAAAAGATTCGTAGAAT----------TAGAAAAGTAAATAGAAAAAATGTAT
CCGGCTAACAACAAATGGAACATTCCCAAAAACCAAACAAAAAAAATTGCAAATATACAAAAATTATATAAAAATAAATAAATAATATATAT
>Lcp65Ag2 6106936 6107100|6497 chr3L 6106896 6107479 scaffold_9 4324247 4324790 + 13719|41 205
GTGAAATTGCTTTGACCTTTAGCAATTTTAAAGCCATACTATCCAACTCCTTGTTAATAGCCCCAAACATTACCAAACCAATCCTATCCCTGTTTTCAAAGGATGGGAACTAAGTCAACCAGCACCACTTGTTAAATATTAAAGGAATTTAATTACCTGAACTTA
G------------------AAGCTATATTAAAACTGAATTA---AATTAAATGTTGAT--------------CTAAAGTTTTTGTGTTTTCCTATGCAAACAGTCAAAAGTAGCTCATC--------CCTGATCGATGCTAAAGA----CTACTAGCTCAATTGA
>Lcp65Ag1 6108644 6108781|6502 chr3L 6108086 6108686 scaffold_9 4321024 4321647 + -2628|620 662
ATCAATAAGCCTAAAGTGTTATTAAAGAAAAAATTATTACATG
CCCTAAAGTCCTGAAGGTTTGC-----------TTCTGAGCTG
>Lcp65Ag1 6108644 6108781|6503 chr3L 6108687 6108902 scaffold_9 684056 684270 - 7922|0 108
GTTTTTCAACATTTTTAACTAGTTCCTTTTTAATGTCGGTTAACAGGAAATAGAAAACCTTTAT--------------TACCGTTCTTATCAAGGAGAACAGAATCTAA
G-----AAGCAATATTAAATG---------TGAAATAAATTGACTGTTTAAAAAAAAATATTATTGAAATTTGTTTTGTACCGTGTGTATTACAGAAGCAAGAGTTTAA
>Lcp65Af 6110251 6110326|6506 chr3L 6110119 6110288 scaffold_9 694846 695010 - -79|143 180
CAATTATGAATAAAACCTCAACAGATTGATTAAAGATA
AAATTACCATTTGCATTTCTATATGTTAGCCA------
>Lcp65Af 6110251 6110326|6507 chr3L 6110294 6110692 scaffold_9 689290 689719 - 14841|0 46
GCTATCCATCGTTAA--------------TATTGTTTTACTGAAAAA
G--AAGCAATGTTAAATTTTAAATAAATTGATTGTTTTCCTGAAAAA
>CG32405 6113170 6113362|6513 chr3L 6113235 6113307 scaffold_9 694949 695010 - 350|0 72
ATATCAGGGTTCTAAAGTATTTTAATGTTTGCTCCAATGATCATATTTCATTATAATAACATAGTCGATATCA
AAATTACCATTT----GCATTTCTATATGT-------TAGCCATATTTGATTGTTATCAATTCAGCTACATCA
>CG32405 6113170 6113362|6514 chr3L 6113308 6114625 scaffold_9 677063 678276 - 26647|0 60
GTATTTCCTCTTTGTGTAGTCAGTATCGA------AAGCAGTATTTCTTTATATTGTAAAA
AGCAGTCACAAATGGATCATTGGCTCGGACTAAGTAATCAGTATTTTCTTGTATAATAAAA
>CG18777 6124347 6124380|6536 chr3L 6124250 6124399 scaffold_9 689191 689353 - 2088|101 143
GTTAAGGAGTTGAAATAAATTGTTTAT---------AAAAGAA
GTTAA--ATTTTAAATAAATTGATTGTTTTCCTGAAAAAATGA
>Acp65Aa 6125990 6126227|6542 chr3L 6125977 6127923 scaffold_9 691842 693758 - 22403|13 255
ACCTCCGCTTTCGA---GGAGATCCTGTAAATACCACCTTCCCGAATGAACCCACAATTCCAACCAACCAGCCATACAGTGAG--GTGCTAAGGTCCTGTCCGGAGGAGCTGTCCCTTGTCCCGTGGCAGCCAATCGGTCAGTCAGTTAGTAAGTCGATCAGTCAGTCAAGTCAGTGTCGTGCATTGTTTTCTATTTTCCTTGTTACTCGCATTAAAGCCGAACTTTCGATTCTCGAAAAAAA
---TACACACACAAACTGGATAACCGAT---------------GGATAAGCTCATTATT-----TGTTTAGTCTCTAAGTTGGTTGTGCTGTGCATCAGTCA---------GTCCATCATTCCGT--CAGTCAGTTAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTGAGTGCAGTTAGTGTCGTGCTTTG----------TAATTGTTAATCGCATTAAAATTGAATTTT--------------GA
>CG13297 6130542 6130665|6545 chr3L 6130265 6130862 scaffold_9 698239 698919 - 4066|354 508
GACACCTCAGAAAACATTATTATTTACAATCCAGCACGAATTTA--------------------TTTAAAC-AGTTTGCATTGCCGACTGTTTTAGGCTAGCTTATAAGTTGAGATGTTACATTTGT----------TAGCAATAAAAACAATCG
G-CTTCTCA------CCTATTTTTTA-GACTTAGCTCAAGGCTAGACTTTGAGGTTTTCCCAGTTTTAGGCAAGTTTGTGTTAATGTTTGTTCTA------CGTATTAGTTAAGGTGCTTTTTCTATGGTTTCCGAATCGACTTAAATTAAAACT
>CG10289 6143498 6143747|6560 chr3L 6143157 6143723 scaffold_9 712826 713391 - 11385|365 659
ATCATTCAAGCGATATTGTGTCGACGAGAAATTGTAAAA-----------ACGCCTTTGATTTGCTCTTTGGTCATT-----------ATCATGCATA-CATATTTATATAAATATA----TACCACATACTACTACTA--------------TACGTACATATATA----------------------------ACAGGCTGCATAGTACAACAAAAGATTTGTGTATTAGCAAAAGGCCGAAACCCGCCCAAAACCAAAATGCAAATTATCAAACAAAAAAAAAAAAAAAAAA
AGCATACATAAAAAAATGTGTCGA---AAAGTTGTAAAACATAAAAAACAAAGCCTTTGATTTGCTCTTTGAACATTTCTTATACATAATCATGCATAACATATTTACATATATATACATATACTACATGCTACTACTACAATACGTACATACTATATATATATATAGAACTGATGTACAAGCCTATATATATATATAAACTATATATATATACAAACGATTTGTGTATTAGTAAA--GCCCGAGCCCGCCCAATTC---------------------AAGAAAAAAAAAAAAAA
>CG10289 6143498 6143747|6561 chr3L 6143742 6143924 scaffold_9 713852 714071 - 4291|0 5
ATGCAC
ATGTGC
>CG10274 6152626 6153003|6568 chr3L 6147945 6152716 scaffold_12 2837372 2842112 - 109797|4813 4929
AGATGAATTGATTGTGGCAGTTATATATTTATATATAAAGATTGTT-------------------TATAAGTAGCTTAAAAAATAAATT-----TGCCCTATT--AAGAGCTTAAAT
ATACGCCTAGGCTTAAGCAGGCTTACATCTAAGCATAGACATAGTGACAGTTTAATCTACCAACATATAATTA---TAAAATATATATTGAGTATGCTCTTTTTACATAGCATAGAC
>CG10274 6152626 6153003|6569 chr3L 6152718 6152812 scaffold_12 2842113 2842198 - -539|0 95
ATTCAGGAGAACACAGAATACCTATGTGAATTCGACT-TAAGTTTAATGATTCTGGTCTGAATGGAGAGGTTGCATGTCAAATATCATCTTTTCAA
GTGTGGGATGCAAGGAAATATTTGCAGAAATGCAAATATATGTTAAACTGTAACTTTTTAAAAGCAATACTT----------TGTAATCCTTATAA
>CG10274 6152626 6153003|6570 chr3L 6152813 6152832 scaffold_12 2848890 2848909 - 1035|0 19
TACAAATAATACTGTACATT
TATAAATAAAACAATATATT
>CG10274 6152626 6153003|6571 chr3L 6152833 6152917 scaffold_12 2851674 2851758 - 586|0 89
GAACAGTGTGTGT---AAGATGGATATGATATAGTTTTAAGCTGAAAATATT--CTTTAATACTATTTAATATAATGTCCTTAACTGTAG
TAATAATGTGCGTTTCAAATTAAACATTGTATTCATTTAA-TTGAAGATATTGAAATTAAACCTTATTGACTTAA----CTTGGATGTCG
>CG10274 6152626 6153003|6572 chr3L 6152918 6155797 scaffold_12 2842113 2844929 - 130449|0 124
GA--------TTTGGCCAGCGTTTAACGCTGTCACAGATG------------------------------GTAAATCAATCCTGGGTTTT-TTTTATGAAAAGCAATACCTTATAATCCTTATGA
GAGCGGATTGTTTGATAAGATTTTGAAAATGTTATCAATGTGTGGGATGCAAGGAAATATTTGCAGAAATGCAAATATATGTTAAACTGTAACTTTTTAAAAGCAATACTTTGTAATCCTTATAA
>D19B 6156121 6156363|6576 chr3L 6156074 6156223 scaffold_12 2845184 2845320 - 549|49 157
TTTTTTGTATTTAAATCCCCCCTTTAAACTGCTTAAGTTTGTACT--TTACTAATTGTATTCA----TTTAACAATGATTTAATATAATAAACAGTAATAAGTATTGAA
TTATTTTTATTTAA----------TATACAAATAAAGTTCATATCAGCAATTAATATTATTCAACGCTTCAACGATGATCT----TCATTAACCCCACAACTACTTGAT
>D19B 6156121 6156363|6577 chr3L 6156228 6158763 scaffold_12 2846053 2848569 - 87183|0 135
GCGGCAGAATCAAACGGAAATGCTTGCGAGCAAACCCGGCCTCCGTTTCCGATCATTTCATTATGTGTTTCTATGAAGGACATATGAGTTATAGTTCTCTAAGGATTACCAACTAGTTTTCGTCACTTTGCAATTT
ATTGAAGCGGTAA---GAATAAGTTTTGAGTAAGTGTGAGCAATTTTTTACATTTAGTCATTATGAATC-------------------TTACAGCTATCCCAGTCCACTTAAAAACCTTTATGAACTATGCGAATT
>D19A 6159782 6160327|6579 chr3L 6159869 6160290 scaffold_12 2857325 2857760 - 1315|0 472
TCATAACCTAGCCACA-TCCATATGTATCCA----CTTCCAATGCAGCTGACACTGTCCGGAAAAGTTGTAGGCATGCCTCGAATTGCTCTCTAGCTGGATCAGATTGTAGGTTTATAGGCACTCCAGATTATTCGAGTGCATATTACAATATGAACACTTCATACTTTTTACGTACTACGTTTATACATACATGCAATATATGTATTATTTTGTTTTCCGTGTA----ATATC-TCCCGTGCTTACTTAGAGTAATGGATTAAAAGTAATATTCATAACGC--------------CATTGGAGTTTCCATCTGGTGGGCGGGACTA-----------AGAGACCACTTTGCAATACCAGTGATTTTTACAAA-TATATTTTAATA---------------ACAAAAAACAAATTTTTTAGCCCGCAAGAACATTAATCAAACCTTAATTTAATTAAAATAAGTCATTTTTAG
TCAAAGCCCAGCAATATTTTATATATAGCTATAATTTTTTACAGCTCCTCAGTCTTATAAGAAACTATGATCTATACCCTCGAATTGCTCCATAATTGCTTATTGTGGCATGAACACAGTAACTC-----------AATGTATTTTACAACA----------ATATTAATTTTACCATACATTTATAAATAC-------ATATGTAT--TTTTGTTGTCTATGTACTGCATAGCATCTATTGCTTAATTAGAATAATGAAATTCATATAACGTACTTAAAACGTGTGTTCGTTTTGCTTTGCAATTTC--TCCGAAAATGAATACTACCCTCAATCGTAGACACC-TTATGCCGTAATAGGGTATTTTGTACCTTATATTTAAATACCCTTCCCCATCTTGGCACACACCTCATTTATGAGCTCGCAGTTATA-TACTCATACATACAT---ATAAATTTAAAGCATTTCTAG
>D19A 6159782 6160327|6580 chr3L 6160316 6163173 scaffold_12 2857777 2860544 - 131655|0 11
GCAGCAGGATTG
ATATCGGAACGG
>CG13298 6166065 6166427|6583 chr3L 6163687 6167936 scaffold_12 2860554 2864780 - 100619|2606 3025
AACCCACACTTGGTGCGGCAGGCGGTGATGGGGCATAGCCAGACATTGGGCCCCACCAGATGA--------------CGCCCCCACTTCCAT---------------------CGACCATTTTCCATTGTTTAGGGAACTTCTTGCTCTGC-----------TTATGTGTATACCAAATTTTTGCTATCTACTTGTAGATTTTTTTGATCGCATTTTGTATCATTTGAATCTA--------ATCATTATCATCCATCCATCACTCCATCTATCATATAAACGGCCGG-ATATCGCGGAACGCAGACATTTGCGCCCGGTTCCGACTGTTTGCAATCATTTGACGACATTAAGACACTCTCTCATCAAAATAACAAGCAAGTGAAAGTAAAAAT-AAAAAAAAATTGAAAAACT-AGAATC
AAGC------TGTTGTGCTGTGAGGT--TGCGGGACTGCCAGTCGCC--GCCGGATCATATGGTTCATTGAACTTTCCACATGCACTTCTATGTGCATATAGGTCTTAAAGCAAGCCAATTTTACAAAATTTTAACAATGCTCAAAACTGCGTAAACAATTTGTATTTTTGTACAACCATTTTGCTAGCTATTTGTCGAGTTTTAAAATAATTTCCATCATCATTCGTAACAACATTGAACATCATCATCAATCATCCA-----CCATGTATCATGCCAATGTTTGGCACTTCAAGACACTTATTCA---GCTTGAAGTTCCGACAATTGGCAATCATAGAAC-ACATTAAAACAA-CTCTCATCAATATAACAAGCAAGTAAAAGTAAAAATAAAAAAAAAATTGTAAAACTCACATTC
>LanA 6177778 6178121|6595 chr3L 6177716 6189814 scaffold_12 2871469 2883716 - 481136|64 441
TAAA----------------GAACTTCGG---------AACGACTTAAG-----GACCTATGATTTATTTGGACAACGACTACGAAAAACTGCCAGGAAGAATCTTCTTTTGCCGACAACTGCTAATCAAAGGACAACGAACGATCAAATTTCAAACGAACAAAATCGACGGGTCATAAAAAAGTCATAAGGTCTTCAAAGTAATAGATCCTTAGCAAAGATGCCAGTCGTATATATTCCTAGTACTATAAGCCAAACTGCGTGCCAAT--TCTATTAAAGCCATTTACATTTATATATCCTTTTTAAAACTCCTTAAGAGAATCTTGCATTTTTGTAATTCCAATAAACCAATA--AAATAAACATTTTAATGAAAC
CAAATATAATTTGCGACTCTGGACTTCGGTAAAGGACACACGATTTGAAATACCGTCATATGGTTTAAGTAGCCAACG----TGGAGAGATGACAA----------CATCTGAAATGAAATGAAATGAAAAGGACTACGAACGAACAAA----ATACGAACAATATCGACGGGCTGTCGAATGATCTGGGAGTTCTATATAACAAGGACTAACAGTATAGCTAAACGTCGTACATATTTCTAATA-TATAAGTAAAAATTTGTGCCAATAATCCGTAATATCCAT---AATTTGTTCAGATATCTTGTAACTTT----GAAAAT-----ATTCCTGTCAATTGCTTAAATAAATATTGAATCAACAACTTAATAAAAT
>CG10226 6208264 6208447|6607 chr3L 6208017 6211975 scaffold_12 2891603 2895700 - 154965|271 521
AAAGACTACGGAA-AGACCAAAAGAAATCATTAAAATTAAGTTGGAAAACATTTTTCTAGTACCACAATGAGGCACGAAAGTATGCAG---TGAATTTTTCTTAGCTGTTAGTTGGGACAAAA---------------------------------ACCAATCTAATTTGGC----------------CATAAGCAAAATAGT-TGTTAAATA-------------AATGAACATATAGATAAAGAATTAT
CAAGACTATGCAGTAAAATAAAAGCAAACATT--GGTTCAGACAAGACACA------------AACCATAGCCCATAAAAGTATGCTAACTTTTATGTTTACTCTCTGTATGCAAGTAAAAAATAGAGTATACACTTTATAGAAATACCTGATAAGATCAAACCGGCTTAACATCTTGGGAGGGCCAGCATAGTATTAATAGTATGCTAAATATTTTAGTAGTGGCTATCAAAAAATATATAGAAGTTTAA
>Mdr65 6214447 6214537|6611 chr3L 6214483 6218376 scaffold_12 2897690 2901698 - 166993|0 54
ATATTATCTAAACATTTATATAAATCTCACCAAAAGCCAAAATACACTTGCCACC
ATTTGAATTGAAATTTTTTATTATTAT--ACCAAAGTTAAGATTTATTCACTGTC
>Best2 6219879 6220584|6614 chr3L 6219852 6222206 scaffold_12 2903499 2905803 - 53934|27 892
CATTATTAT----------------------------CAGTCG---GATTAGATTAGTTAA----------------------------------GACTTGATCGGAATTCGAGCCA-------CGTAATTAGGTTTAAGATGCAATGGCATTGTGCCACCCAGAACCACTAAAAATGATATTATTAGTAGCCTGAAAAAGAAAGATTATTGCAAGGATTTTATCCTCGAAGTCAAGTAATCACTTTTTTATTAGCAATTCAAGCAGCAGATCAGATAGTC--TCATATCGAGTTTAACTTAAATTCAATTT-----AAATGTTTAACTAAAATTTA-------------------ATAATTCCAATTTCTT---CAAACCCTTTT---------TACTTCATAAGACCAGCTCAAGA-AAATTCTAGTAAATAT------TGAACAAATAT-----------------------TACGAAACGCGTGGAACTGCGAATAGCATTGTATATAACTATCTTAGTTAATAGGAAATTGACTT-------ATTGTTTTGGCACTTGCCATATAAG---------CTAAGCGTTTGAATCTTTG--AATAACT--TTTTAATGAATCTCTATCTCGTGTAGGCAGTGTAAATACTTGTAAACCAACACAGTATGTGATATGCGATTGTTATCCAGCTAGATTTTGTATCTTTACAAGTACAGATAAATAAGTGCCTAAGTTTGTATGCTGTAATTATAATCCGCTGCATGTGAATGTAGAAAATGTATGCAAATGTGTCCTTTGTACAGATGAAGAAATCACTTCTTATAGTTATACCTTGAAATAAAATCCATCACTTAGCAAAGCAGA
TATTGTTATGGATGAATAGCTTTCTAGGAATCGTTTATAGCCGCATGGTTTGGCTAGTTAGCCCGTAAGCAGCTGATCCGCTTATAAGCGGATTTTACTTGAACAGAGTTAAACATAGTTATACTATACTTAGGTTTTA-ATATTTTGGCGTAACGCCACCCAGAACCATT-TCTACGATATTA-TGTTAGCTTCAGTTATGAAAAGTTGTTCGGAAACTTTA----AGAAGTCAG------------------------TAAGCAGAATATCGCATAGTCTGTAGAGTTGATTTAAACTTAAAGTAACTGTCAAAGAAATGTTCTACGCAATTTGAGATACATTATAAGGAACGCATACTTTCACTATATTGTACAGATCGTGTTTAACAAGAGTACCACATATCACCCTTTAGACATAACTTCCACTTAATGCACTTTATGGATTCCTATATCTATTTCTTGTAACTCAGCTGTACGGTCCTCGTTATGAAGCGAA-GTCCGTGTATATATATATGTTAACTAATAATAACTGGAATTTCTTATAATTTCTTTGGCACTTGCCATATTAGACTAGTTACACAAGTACTTTAATGCATGAAAACAATTACTTTTATTAAAAATCCCTATCGTGTAGGCAGTGTAAATA----TAAACCAACACAATATGTGATATGCGATTTTTATCAAATTACGTTTTTAAGTCTTATAGTCTTATATA------------------TAAACTATAAAACAATTCTGCAATGTATCTATATAAATAA-ATACGCATACATATA---TGTACATAT----AGGTCAACTATTAAACTGTCAACT----ATATAAACTGTAAATAAGCTGATGTAC
>ImpL3 6233436 6233692|6623 chr3L 6230688 6234396 scaffold_12 2915978 2919570 - 109901|2948 3230
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CATGTGCACTTG
TGTGTGCGCTTG
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TTTCATCGTCCTTTTTGTATATTCCATTTATTC-CTCTATGTATTTATTGT---------ACAACTATGTGTATTGTATGTGTAAGTAAAAAAATTGCATG---------------
TTTTTAATATATTTATGTATATTCCATATAGTCATTCTTTGTATTTATTGTAACCTCTTAATAATTTTGTGT------TGTGTAAGTACACAAATGCAGTGTCAAGTATTATGGGT
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----------------AATATTTGTTTCCAAA-----CCTATCTAAATCTCGTGATTGTCTTTTTGTACGTTTTAGTAGCAAATAAAAACGAGATTCTTA-ACATTCTCTACAAAAT
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------------------AATTTGGACCTCATCATA---AACTATTCATTTACAAATGATACCAATCATTATCTGCTATATAACTCT----TGTCACGAATGACGACTATTATATAATTACCTTTTGAGAATTTCTCTTAATATTTAATTTCTCGATATGAACGAATTATCGAATCGTTACT---TTACTTTAATCTTGAACTAAAAAACAA
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-AACATCCCGCACACTATCTCCGGAAAAGTCCGCAATCTGCTGGTAG
TAACACCGAAGCCGCTGCCACTGACAGCGCCCAACAACAAC----AA
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ATGTATCTTGAAACAGAACTGGTTTTATGAATTTGACCATGTTAAAAATTGCAAAGAAAGATGTA------AATACATAGTGTTGTG----AAT
GTGTTTCTTAAAGAGAAACAAATACTTTAAACTTTAACGTATTAAAT-TTGCAGTGTGAAAAATACTAAAAAATACTGAATGCTGCAGGAAATT
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GCCGTCTCCGT-----------TTTGGATG---------------CCACCCACCACTCCATCCACCAACCACCCACATTTCCATGGCCGCTTATGCCTCTGAATGCTGTTTCCAGCGCGTGTATCCGAAAAATATAAAAAAAAAA
GCTGCTCCTGTATGTTATTTAGTTTGGCTATATAGCAGCAGTTGTCCCTCCCCCACTAGAGACCCCAACTAACCGTCCCTCTAT-----------------AACGCAGTTGACTGCGCGTGTATTCCAAAAATGTCAAAAAAAAA
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GATAATGTGGGAAGTCCAGAGATTAATGGATGTTTTACTCTTTGCATGGATCACTAATGCTCCGCCTCTCTCAAATCGAGTGCGAATGATATTCTTAG--TTTTTAAATGTGTACACCACGC-CTCGTCCTCCTCCACCTACCGCCCCCCGCCCGCTTGAGGGCAACACTGCTAATAGTTTGTAATGCGTATTTTTGCTAAGTGTATACACCAGGAGGATGAAAAGCAAAGGAGTGGAGACGATTAAAACAAAAAAATGAACTTTTTTATAAATCGCATGTAGAACTTATTTTATTTGTTATTTAATGCCAACTAAGCGAGTTTATAATTTTAATTAAATCGCAACGCGGATGATGACAAAGGCAAAAAATATCACCCAACCAAATCATCAACTGCCCGTATTTAATTGCAAACAATAGCCATGGATAGAGCAAAAGCAATAACGACTTCCCCAAACAGCACGTCGTTCTCTTTACAACGTTACAAAAATGAAGGCATCAATTTTTAAT-GAAACATTTGCGTGATTTTACTAAGCATAATATATGATGCACTATGAGCAT--ATAAATGT-AACAATAAAACAGAAAATGTAATTATACAAAAATATAATTAATGGTAATTAAATGTTTCCAAATTAAGCATAATAA
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CAGTACGCCAGTGCCGCCAACGTGGATCTCCAAGGAGACGACCTGA------------------CGGGGGCGGCAACTGGAACAGCATCGGGACCAGCAGCAGCTTCATCTTCGACAGCAGCTACA----CAGCGATGAGATTGAAAGAGTGGGCAGGCTTAGAACGGTTTCAAATCCAC--------ATGCAAATTGTTTCCAAAAAGGTTAACGTTTCATTTTTGAGCTTACATATGCAGATATTTAAGTAGGTGTTTAATTTTTTTAAATTGGCTTTTTATATTGTATATTTTTTATTCATGCTCAGAAGAAAAACATACAAATCGTTTAGTAAGGAAAA
CAGTACGCCAGTGCCGCCAATGTGGACCTGCAGGGCGACGATCTGAATGCGTCGTCTACGGCGGCGGCGGCGGCGGCAGGGACGGCAGTGGGGGCGGCGGTTGTTACAGCAGGGGGCGTGGCTGCAACAGCAGCAGCTGCAGCGACAGC--------GCCTGCAACTGTGGCAAATGCACAGCATTAAATGCGATTGGTTTCAACAAGAGT-----TTTCA-----------ACGTGTGCTAAAACCGAACTGGGAGC----GTTTTATAATTTG--TCCTGATAATATATATATAT------------GTATATACACATATATAT----------------
>dikar 6714252 6714591|7057 chr3L 6713722 6714874 scaffold_9 1106491 1108006 - 15713|717 1244
GAAGGCTGGCGGACG--------------------------------------------CGACGGCCACATCCATTCTACTCACAGAG-CGCGAATCAGAAACAAGACAGATACATTGAACTCACTTGCATACCAAAAGCATCTTTGATTTATTTTTTC--------------------------------------AATTGATCT----TTTGAGTTGCCGTAATTTTATAATTTCTTGAGCCAAAATACTCTTCGCTTACAATTTCTGTT------GCTGCAGTTGAAAAGC----------------CAAATCGCCAT------------------CATCAACATCGTCGATAAACCCAGGAT-----CAGC-ATAGACGGAACAAGGATG-------------------------AGCACTTAATTTCAGTTTTGCCCATCATTTAATTTTGTATATGG--AAGAATTGGTTGGATTTCGTTTTCAAAAA---------------------------CAATC-T
GAGAGAGGGCGGACAGCATTTCACAATCATATATCACACATTGAGAACAACGACAACAACAACAACAACAACCACAACAAACACACAGACAACAACAACAAACAGAACAATTCAAGCACACGCACAT--CTATCTAAAGCATATTTTGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAAAAAGTTGCTGTTTAATTTGATTTACAAATTGATTTGTTTTTCTACTCTTTTTAATTTT-CAATTGTTTTCACTTAAACAAAATTTGCTTGCAATTTGTGTTTGAAGAATTGTCATTAAGAAACAGAGAGAAAAGAAATACAAAGCATAAAAAAAGAAAGAAAATATCACATTCTCATCGACGCTTAACACAGGCTGCCGCCAGCGAGAGACTGAGAGAAACTGGACCAAATATTGAAGGAGACGAAACAGCACTTAATTTGAGTTTTGCCCATAATTTAATTTTGTGTGCGACAAACAATTGGTTGGATTTCGTTTTCAAAAAAATAAAAACTATAACACACAATATGAACAATTAT
>CG10107 6718373 6718585|7065 chr3L 6717508 6721313 scaffold_38 534710 538289 - 92468|888 1100
CACCAAACGATTCTCGCCCTGCGAGCTCGCGATCCGGATGCGCACATGCCCCACCTGCCTGCGCTGCTCCAGTTGCCACAGCTGCGGCACCACCTGTAAATACGCCATTACATTACATCGGTTATTCAATTCTATGTATCTAAACGTTTGACTCTAAAAAACTACACTAAACTAAAACTATAAATAAAGACTAAATTACTATGTATGAAATAC
CACT-----------------CGGGTGCA-GACCCTGTCGCAGACATGCCT------------CCGCTGCAGCTGTTGCAGTTGTTGCGCCCATTGTAAATA----ATAAAAATA----------------------------------------AAAAAAATTTATTATACAAACATTTAAAATA-----------ATTATGCCCAACAT--
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AAATACTAACAGATTAAATTCTGTGTACTTATCA
AAATGCTAACA---CACACGCCCTACAGTTTTAA
>CG10103 6727963 6728221|7073 chr3L 6727997 6728159 scaffold_22 1650480 1650634 + 2270|0 166
ACATTAATAATCACGTATATGTGTAAGGAACTATTGATCATTTTGTTTTTTCGATTA--AGTAGTTAATCAGAC-TTCAAAAATGTA-TAATCTGAATTGAAAGATGGTTGACCTATTGCTTTTCATATTCGCAATCTTGATTCATCTAAAAACAGCCTAAAGATTA
AAATTTATCATCATATTTATGGGTCAAGTGTCAAAAACAATTTTGTTTCTTCGAATATTAGCAGTTAAGTAAACACATAATGCTATATTAATATTGAGTGTTCAATAGTTTGCGTGCTGTTACTAAAATTTG---------TTTATC---AAACAGCTTATATATTA
>CG10103 6727963 6728221|7074 chr3L 6728219 6728480 scaffold_38 573893 574142 + 10984|0 2
AGC
AGC
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GGA---GGGCAACAATTATAAATAAAATAAGATATGATTTGGTTAACTTCAGTTTTGAGTTTGAGGCGCGCCCGTTGGTCGTTAA---GTGCATACTAACAAATCCAAAG----TGCAGCTTTGTTATTGTGTCTGGCAACAAGCGGGCGTGCCTCGGCCGCTGCAT--------------GTTGCCACACACAATTCCAT--TGGCGCGAATATTGTTGCATCAAAA----GTAATCAAATA---------------TTGTTAAAGGTTTATGTTTTATCGGAGTATTCAACAATAAAGACAAAAAAAAGTGAAAAGCTAAACGTAAT-
>Prat2 6885940 6886046|7251 chr3L 6885678 6886223 scaffold_38 739077 739561 - 3058|263 369
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AA----TGAGGATTAGATAATGGGATAG--TTAGCGTAATCGTAAAATTAAGATTAT-----CATCTCCACATATAAATTTTCACGT--------TATAATATAAAG
>CG10077 6923434 6924276|7283 chr3L 6922172 6923442 scaffold_38 784263 785484 - 36524|1383 1391
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TTTTCAG--
>CG10077 6923434 6924276|7284 chr3L 6923443 6925460 scaffold_38 785876 787767 - 48676|0 938
AGGCCCTGCGGTTCGATAG---------AGGCTACCAGATTGTAG--------------------ACCAGCTCTACTGTAATTTCCTTTCCCCA-CACGAACATTACACGCACATCCGCACACCCACCCGTATTAAT-------------TGTACACA-----AGTCACGATCACAAGTCCAGAGAC-TTCAGAGGGAAGATGT-TAGATGAGCGTCGGTGATGTACGTA-------------------------------------TCGTGTAGATCTCCTCCGCCC------ACATCATAGCTATATAATATGGTTTAATCTGGAATCAAATACGCTTTTAATTTGATTAA-TCTCTTTGTTCCCCCCAAAACAAAACAAAACAAAACAAAAACCCCACATTTAGTTGATAAGCTTTTGGTTTAGTCAAATTGTTAGGGCATTCGAGTGCCGATCATCGATGTTGTTGGCATTTATCTTTCCA----GAGCCCTGGGCGTATTTGATTTCTTTATACAATTCTCGAATATTGTACGTATCTATTC---ATACACTGCAAAATCAATG--TTTGCAATGCTCCAAACGAACCCAAGCCAAAAGAGATTAGATACAATCGAATAATGAAGGAACACTAAGTGGGATAAAGCTCCCGGTACACCTTTCACACTATCGGACACATTTACACATAAGAAACAATGTCAATTTCGTGGAATCAAATGCGTATTATTATGTCATCTTAAACCATATTATGTGACTAGTCTAATGAATTGCTTAGCTGGACACTTTTCACATCGTAACAAGAACTTCAAACATAA-AACACAAAAACAATAAAACATCAAAATACGTTCAAAAATTTGAAATGTAATTCCATTTTATGTCAGCAGCCCATAAGTATGAATTGA-TAACAAGATATGAATAAAGGAATTAATTAGA
AAATCGTAAAGCCAAATTGTACGAGCTAAAATAACTGGACCTTAGTATTACTTGGTCTTTGTTCTTTTTGCTCAAATAAAATTTCCTTTCCTAATCACTAACACCA-AGACACACATACACACCCACGCACATACATACACAGACACAGACACACACACAGACAGACACGAACACACACACAGGCACATACAGAACAGAAACATACACATCAGCGTAAGAAACTTGAGTATAGATTTAAATCTTAGAAACACTCTAAGGTCCCAGACTTGTGTAGATCTCCTCCGCCCACACATACATATTAGCAATATAATATGGTTTAAACTGGAATCAAATACGCTTGCAATTTGATAAATTCCCTTCACGTTTCTATATATACATTTAATCA----TCAAATCTAACACGTAGTTATTAGGCATT--GTTTAGTCGAAACATTTGGGCAAACGTTTGCCAAACATCA-----TTTGGCATTTAGCTTATTATAATGAGCCCCCAGCGTATTTGATTTCTGTA-ACTATTCTCGAATAAC-------TCTATTCTATCGATAATGCATAATTTTCGAATTTGCAATGCTCCAAGCG-------------------------------------------ACACT---------------------------------------GACACAGAGACAAACAAAATATAATGTCAATTTCTTAGAATCAAATGCG---TATTATATCATCTTAAACCATATTATGTGACTAGTCT----AATTGCTTAGCTGAA-ACTTAC---------ACAACAATTTTCACGATAACAACACCAGAAAAAT--AACAATAAAATAAAT-------------GTATAATTCCATTATATGTAAAC---------GTATGAATTGATTTACAACTTATGAATAAAGGAGTTCATTAAA
>CG10077 6925733 6927705|7285 chr3L 6925498 6926942 scaffold_38 787812 789361 - 31336|239 1690
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TAAATAAAACAAAAAAAGGTGTGGTCG-AAATAATGAGGGGAATGTGTT----CTCCCTGCATTTTGCTGGTTATCTGAAGTTTTTTTTTTCCACATATGTGTACTATTGTATTTTTAGTTTGTTGCCCTACTTTTTTCTATATAGTTCTTTAGTTGTGCTTCGTCAAGTAAACTA-ACGTACCATATT--------ATCAATTTGCTGTCAGTCAAGGACTCAATGGCCTAGCAAAATACGAGTAACTGAATAATAATAATTATTAGAAAAAAAAAAAAATAATAATATTAATGCTTAAAGATCGTTTAAAAGTTGTGTTGGATACGCTCTTTAAAAGACTGGCCAGTTGGAACTTGATTAGTCTTTCTTTGAAGGGTTGTAAACTATTTTTTTTTTTT--TTTGTATACTATTTTTTTTAAGTTTGTAATTCGGAGTTGAAAATATTTAGTTAAATTTTGCGGCC-AAGAAATTTTTGACTGATGCCTATTTTTCGTAGTTTATTTGTAATTACCATAAAAGTATTATTATGTATATTTGTATATTACGTCGCTCCT----ATATGTATAAAACCTAAATTTGTGTGTGAACAAAAATATCATCAGCACTTTTTGAAATGGACTTCGATTTTT-ATATGGCAAACAAAAAAAAAAAAAAAGAAAAAGAAAAAGAAAAGTAATGATAAACCAAGAGAAAAAGTTAAATGTTAAAACCAAAAGTTGTATACACAAAACAGATAAAAGAAAAAAGATAAAAAAGGTTAAGCTTTATATACAAGTTGAGGGTTGAATTCTTAAGTTTTTAGCAACGCGGAACTCTCATCACCTAAGCTCCGCGCCCAGGCTACATCTACAACAGCTCAGCTACAATCGATATACAACAACAACAACGACAACAACAGAGCCGTAACAACATTTATTACGTAAGCCCTATC---------TAATTTAATCATAGATCGCACACAGGGTAAGTACTAGGCTAATTATCAACCAACTCTCTCTCTGTCTCTCACCTACCCATCCCTCTCCTCTTAATCACCATTGTCATTATACGACGCACCCCCGACCCAACCAATCCCAGCGCTTGCCACATCTCCATGCTCCATACCCAATGAATCCTTAGTACCCTCTCATCACATTCTT--ATTATCTAACC---------TACATCT--------------TAAGTTTAATCAAGCCGTCTCTTGTATGCATTAAGCTTAAACAAAAGTCAATATATATAAATAAAGATTTGTGTATTCCAAGAAAAAA-AAAAAAAAGCATAAAAATGAGAACACAAAGGTCGAGGTCCACATTTCTGCAGTATAGAAAAAACATATATCTGTTTGCCAAAGATGTATCGTTGTTAATATACGCTAAATAGTATTGATGGCGAAATTTTTGTTCAAA-------------TCAAAACGATAAAATATGTA
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AAGCACTTAAGTCATGACTATATATATTCCTGATCAGTGTCAATAGC-CTAATGAATGTGTCCGTTTGTCTCCATGCAAAAGTCATGAAATGGGAACAATCGGGCGAGAGTTTTGTTTCTTTATAAAC-AATTTATGTTTGATATTTTAATCAAACTTGGAATTTGCG-AGCTCTG
>CG10077 6925733 6927705|7287 chr3L 6927329 6929486 scaffold_38 789362 791560 - 85600|0 427
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CTTTTGCGCCAGTAGCTGGCTAACGCTAGCTGCTCTGTTGTCTTTTTTGATGCGCTCCATAACCAATAACCGAGCAAGTGTTG-CTGTGGATCAA-CAACATGCCCAAAAAGAAAAAAAAAATTGCCAAATGGTTTTGTTTCATTATT---TGATTCGTCGTCGTCGTC-------GTCGTCTGG---CAGCGA-CCGTCAGCGATGAATCGGCCAACACCGACCAGCCTCTT-ACTCTTACTCTTACTCATTATTCCTGCGCTTTCGCTTTCACATTTCACTCTTTGACTTAATCGATTTTCTCTCACCATTCGAG---TGGGGAT-AAGTTGAGCGTTGTGCATTTACAGGTTAATTTGTG----CATTGCATGCCTTAGCTCTTCTCCCATTTCCGTTTTTACTTTTCAGTTTTTGCTATTTTTA
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TCTTAG---------TTATATTCTGTTTTTTAAAA-----ATAAAGTTTGAGAGTATGTGAACTGGAAACT
GCATAGAAAATGTTCTTTTAGTTTGTTTATTAAAGTCTATATACACTTCTA--------AGCCTAAGATTC
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AATAGTTCAAGTATTTCGCTAGATACGCC------------------------TAAGTATTCCTATATCTATTCCTACAACCAAATGTCGTTCC-----------------AGTTGCAATATAAATATAAACATTGCCGTTGCAAACGGATACCCACTTTATACAGGATCCGGATTTCTGTTCCATCTGATCATTAAG--CAAACATTTACACAACAA-ATGTAAATTTT----ATAAAATAAACAATA
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GCGCGTC-GGGCGGCGGAGGTGGTGGCATTTACACTTAAAGTTGGCGAAA-TTTCCAGTATTTGCGAGACTAAAC-TGTAAATATCCGTATTCTTTTCTGTAGCTGAGTGTA
GCGTGTCTAGGC----------GTGGCATCAAGACTTAAAGTCGTCAACATTTTCCAGTATTTACGAGACTAACTGTGTAAATATGCGTTTATGTTTGTGTTTTTTTATATA
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G
G
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------GCACAGCTAAGAAATTTTTTATATAAAATCGAACATGCATATCATGTCGAATGCACAAAACATTAAACAAAGCTAAATCTCGTATTTCCAGACGCTCCAATGTGTATTTGTATACATTATTATAG
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CAGAGTTCGAATAAATCATTTCAGCCCCTTAAACAAAATCACAGCAGGCCTTTAAACAAACTTCAA-GCTGCTTTGGCCTAAGTC----AAAATTAAAGTTACAAAAGAAAAAAAAACCATGTCCCGACTTTTGCTGCAGTGCCGCAGAACTTTGCTGATCCTTCGCCATCAAACGGCGGTGGAAAATGAGAAAGGACTCTTTGGCAAACTGCTGGGAAAGTG----CCAGTCCTT----------TGGCAAGGATGAAAAGGATCTTGGCCAGCAGGAGGAGGAGGAATCAAAGAGATCTTAGTTAGGAAATTCAAATG
CCCTGCAAGAAGAAGG------ATCCCTGCAAAAAGGATGATAA-AGGCTCTGATAAAGGCGGAAAAGGTTCTAAGGACCAAGGCGGTAAAAAGGGCGGTTGCGATAAA------------------------GGTGC-GTAACACAGAACATCTCGGATCT-----------ACG---------AATATGTATTTAACCTTTGACA-------GGAAATGTATCGACCGGTCCACGTTGTAAAGATGGTAAGGGTAAAAAGTAGACTC-CCATCACGTGGGACAACAAGCAAGACGCGCTCTCCTC---CATTCCAAAT
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GCCAAATCGATCAGGAAGTCATCTCACCGTCTATTCCCATGGCATGGCTTCCAACGGTTTTCATTGTACA-------ATACCCACACTTGGAGCTACAGA---ACACAGAAACATGACTCCGGCATAT----GGGCGGTAATAAAGAGTTCG-CCTCCAGTGTATTGGAGTATCTGGG
TTCTAGTTTATCCG---GCCAACCAAACGAATACACTCAAG---TGCACACACACGGGCGCGCATGCACACACAAACACACACACACACGCATACACACACCCACACACCCACGTGAAGGCTTCATTTGAGAGGGCTGTAATAAAGAGAGCACCCCCCAGTGTATTGGAGTATCCAGA
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CCCCGCATTAGCTTGTTCATGCTCATCATGTAGTTTAAGTCCAGACAACTCCGCCCTTCTCCAACCCGGCTTGTGTTCGTGTTTTTGCATATGTTTATTGCATGGACGAAGCAACAAACATGGGCAAACAAACACCGGCAACAACTTTGGCTCTGTGTAGTTGACTTCGACTCTGGAGCTGAGGGATGTCATCG--CCAACGCCA---------------ACGCCTACGCACATGC---CTCATACACACACGCACTGTACATACATATA--------CATATACACACACACACACGCACACA------------------CATGCTCAG---CTGGCCGCTCCTGGGCGCTGTGTCCTTTGTCGGCTCG-CTGACGTTGACATTTATTGCCAGAGAGATAATAATAATGTAATAAAAAGAAAAAATACAATTTAATATT
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CTCTCACTTGTTTTATTTTGTTTTAATTTATTTATTATGCATTTTAAAGCTT--GATTTTTTATTTAAGAATTGTAGTTTGTCATTTTTTTTTATCAGTACCAATATCAATACATATATCAATTATGATTTTGGTTTTTAACTACACAATTTGTAAATAACGCGCGTCTATAAAAAGAACTCTCCTA---CACATGTATAATCGAATAATGTCTAAAACTAGATGTTAATGTTAA-TATGAAAAAGACAATTTTTAACGTTTCCTTTCTTTTAATACTAAGTTAGAGTTGAGTAGTTTTACTAACTAGTATTTTTTTTTTTTTTTGTTTTATTTTTGTGCTCAAATACATATATATATTTAAGAATTTCA----ACAATATTTGTCATGCCTTAACGATTAGAATGTAAGAGGTCCTTGGAAACGATGAAAAGTGTGC-AAAATATGTGAAAAACCTTTTGGATTGAAAC
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G-----------TTTATTTGTTATTGCTTGTCGCTGATTA--------------------------------------------------TTATTAA---TAAAGTGTTCCGA------------------
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AAA---ATGTCTCCAAGTCTGAGTGCTTGTATATA-ATTACATAATTAATAC------------------------
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AAT--TGGATAAAAAACTATAACTAAATCTCGTTTAAGCTAGTAGTATTAG--GTATTTAATAAAAGCGCGCTGTAAGGAAGTCT
TGTCTTAGATGCAGAACAAAAA-----------------TAGTAATAGTAAAAGTAGCAAATAAGAG----------AAAAGTTT
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TATAACTTAAATAA--------CTAGATAATAGTCTTAAACGGTTTATTAACAAGGCCTC---AACGTACCTGCTGCAAGCTGCTTGCTAGTTTGTATGTTCTTAATCATAAAGAGAGAGAGAGAT---ATACATATATACGAAAAAAGATACAGAAAGAGTATTGGAATGCTGCCATATTTGAGAGACAGTTTTTTTTTTTTGTTGTTTGCTTAAATTCTAACGGAAATGCTTGATAACAATATGCAAA--GCAATAATAAAACAATAATTATATGAATAAACATTCAATA
>CG14830 7224659 7225045|7562 chr3L 7224957 7225573 scaffold_9 2427443 2428115 - 34605|0 91
-TGTTATGCATATGTACATATGTATGTATGTACATACATATGCGGT---TTGATGAAAGGGGATCCTTTGGGCGGAGAAGAAATATGAATAG
AAGGGGTGGAGAGGGGAATATCTATG-----GCAAACACATTCAACTAATTACTGAAGCGAGGGCC----GACCGATAAGTAGT-TGAATAG
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TACACTG---AAACACTATTTGGGTCAATTTAAACGAAATACGAATATATATCAGCAACAAGTATACCTAATTATACAAGCCACAATTCAGCGTCACATATTTTCTACCATACGTCAAGAAA----------CAATCAAAAACTGCGTAACTCTGAGCTTCTTTGAAA------AACCCCACAAAAAGAAACATAAGACACGATGACACACTTA---CTATACACAGGACAGGAGAAA-----------------GCTATTTACAATATAAATATTAAATATGAGATATGTGTACATGA-TTTGTACATTT----TATATCACGCCCAAAGGACAGTGTAACTAAGTCTAAAGTATATTTGTAAACTATTTTCTGAGCACAGATTTTGTATACATTTATTAGACACGCGCTTGTCCCCAG----------------------TGAGGCAGCCTTCAGCTCTTTTGCTT-------ATACACAACTTAGGGCGTTCCTTC-----------CCATTACCCCACCCACTTTTATGAATCCAGTCTCCTTC
AAAACTACACAAATTCT-TTTGGGTCAATTTAAGCTATAGCTAAATAT----------CGAAAATCGATAATTCCTTAA-CGAAATTTCAATGCAAAACTATTTGAAACGCCAGTGAAAAAAACCCTTAAAACAATCAAAATATGCGTAACTCCGAGCTTCTTTAAAACAAACAAACTTCACA--------CTCAACACACACACACACACTCAAAGCTATTTACAAAAAAAGAAAAACATAAAATAAATAAATAACTAGAAAAAAAAAAAAAACAAAAAAAGAATAAACTTCATATGAATGTATACAATGAATATATATCACGCCCAAAGGACAGTGTAACTAAGTCTATAGAATATTTGTTAACTATTTTCTGAGCACAGATTTTGTATAAATTTATCGGACACACGCTTGCACACAGCACTGTGGGCACAGTGAGTGCCTAAAGTAGCCTTCAGCTGTTTGCTTTTTTAAACACACATAACTTGAGGC--TTCTTCAAACAAACAAACAAACAAACAAACAATTCCTGTAAA-------CCATCC
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TTCTAATAAGTTGAGTCCAGGTGA--------------GCATCGTTTGAAAAACGTATCTCAAAAATTGTCAGCATGCAATCAAATTGCATTCAATGATTCAATGATAAACGATAGAAACATTTTTTTTCGCTTCTTGTTTACTGGCCCCGAACTAGAAATTTATAATAAGGTAAACAAAACAATCGCGTATGTATCTATTTATGTATTTATGTAATGTAGTTGTTTGACGGTAAGCCCAA-------TCTGTTTGTAAATGTTTAGCA---AATTGAAATTCAAATGGTGCATAACTAATAATTGACGGGGCATGGGTGCATACCCGAAACTCGTACCCAATTGTTCTAGACTT--TACGTTGCTACGAAACCAATACAAACACAACCACACACACACACACACACCTCTTTTAGGGACTATCCTATGTAGGAGCGTAGGGTTTGCTGAAATTGTCACAATTGAGCAGACAAATCGA--------GCATCACATATAGAATTTATTAAACACAGACACAG--------------ACACTGGCACCCAGCTGCGTTTTGAAGACTTTACC---------------------------GACTTATAAAATAATAATTG
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AACTAGATGACATCAAACTAAATCGTATACAAACATATATCATCGTTTACAA--CATTTATACACATCAATAAATCCATTAACAATTATA
AATTAGTTTATGCCA--------CATAT-------CATATCACAATTT-CAATTCATTTATATACA-CAATAAAAGCATTTACAATACAA
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TTTGGAGTTGGCCATCGATGGGTTAATTGGCGACATT-CACTTTTAAGTTACAGCAACCAAATTTACG-------------
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CGACGGCT----GGCTATGGAGCATCCG-----------TAGATCTAAGACACATCGTTGCAATACTGCCCCTTAAACTAGCTTTAAAATACAGTGTTTATTTTTGCACA
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GT
AT
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CGAAA
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ACAAGATGTTCAACTAAGGATGACAATTAAAACGCATCTTCTGTCGGA-----------TTACTGACTATGAAACATTTTGAATGGGACACCAGATCACCAACTTTAGACGTCACGGACCTTGATTATCTTAAACTTGAATTACCATTGAATAAGAAACTAGCAAATTCGTCATTTTTTCATCAGTATAAACATTTTAAATGTATTTGAAATGCAACACATGAGTTTTAAATACTTATAAATATTATAAAAATTGCAAAAATTGA-------------ATATGGCAAGCATTAATTGTTTCGCATTTTCTGTAATTGGCTTTAATGTTTTAACATTTAAAATAAAAATCAAATCTTATAAGGAACAACAATTCTTGAGCTAACGCATTGTATCGAAATGCAGAATACACATTCGCTTTTAATTTGATGTAGTTAT-----ACTTATATGTAT------------CTATTAAATGAATCGCTTATTATTGTAGTTTAATTTAAGCAAAATATACAAGTGCATATGTAAAGAGCAA----GTAGGAAAGGAAAGGCCTGGGAAGTGAAATGCTTTTAAAGTCTCATTTTTT-ACAAGAACCAAGCAAATTTTTACGCTTGCATATTTTAAT-GAAAAATATACATACAATATTATACAATAACAAACCGAAATGCATAGATAAAATTTAAAACACTTATATACAAAAACACAACCCATAATAATAATTCACATACAGCCGCAACATACAAAAAATTCATATACT-TAATGCTAATTTTCGTAATGCACACCTTGCA-----GTGTATTCAT-AATATTCTTACATATTACAAG-ATTTAAACGTCTTAGCATCACCAGTGTAATGGGTTATAAATAAAA----TATTTGTGTTAAAAACATACAGCAAGAAAAAAAAACAACA
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C
T
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>CG7457 7695750 7695844|8058 chr3L 7694005 7698006 scaffold_0 5172553 5176403 + 161117|1759 1853
TGTAGTCTCATCATGTGTAAACCATTTCCTTGTGTTGTATGTCCCAGAGCATTTTTTATTGTTTGACAATTATATAGCAAATCTAAGTACAGTAA
TCT-GCTTGATTATGTTT------TGTTATTGTGTTTAAAGTCCCA-----------ATTGTTT-ATACCTGT-TGACATATATTAATATAGCAA
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CAAAGTCATCGTCAGCGCTCGCATC---------------------TGCATCACAACCAGCGGCATCATT---CGCAGCAGCAGCAGCAACACTCAAACTTCCATCAGCAGCAGCAACAGCAGCAGCAGCAGCAACAACAGTTGCAGCTGCATCAGAGCATCGGGCAGCCGAAGATATTGCCAATGTTGCCGCTGGCGCCAGCGCAACTCGTTACGGGCAGCGCCTGCCAGCTGACACAGTCCAGCTACCCGTTGAGCACACCGCAGCTGATGACGCCCAGTTTTCTCGAGCCGCCACAATATCTGGCCGCCATACCCGTGCAGCCGGTGATGGGGCCGTTTCCGGTGGCGCCCGTGCTGTCGCCGTTGCCAGTGCCGGTATCGGTGCCGGTGTCGGTGCAGGGGCAGCAACCGGAGCTGCTGTCGGGCGCCGTGGTGATGACCACGACACAGAGCCAGCTGCAGGATCAGCTGCAGCGCAAGCATGACGAGCTGCAGAAGCTGATCATGCAGCAGCAGGACGAGCTGCGCATCGTCTCCGAGCAACTGTTGCTCGCGCGCTACACGTACCTGCAGCCCGTGATGCCCGTCAGCTTTGCCACTACCAACATGACAGCTGCC---------------GGCACTCCTGTGCAGCGCAACTTAACTTTCCGGGGCAGCAATGCCGTGGAGCCGCAGTTCAATCAGTACGGCTTCGCGCTCAACACGGAGCAGATGCTCAATCAGCAGGACCAGCAGATGCTGATGCGCCAGCAGCAGAATCTGCACAGTCAGCAGCAGCACAATCACAATCTGCAGCAGCAGCAGCAGCTACAGCAACAGCTGCAGCTGCAACAGACCCACCAG---CATCAGCAGCAGCAGCACCGGCAGCAACTGCAGCTGCAACACAGCCTGCAACAGCAGCAGCAGCAGCAACAGTTGCAGCAACAGCAGCAGTTGCAGCAGCAACAGTTGCAGCTGCAGCATCAGAGCAGCATGTTGTCGCGTGAGGACATGGAGGACATTGATGCCTTTCTCAATCTGTCGCCGCTGCAGACGCTCGACACGC-----------------------------------------------AGCTA----------------------AACAGCAACTGCAACGGCAGCAACAACAACTCGAATGCGCCGCAGAATACGAATGAGGACTCGCTGCTCTCGTACATGCAACTGGCCACCGAATCGAGTCCTTCGCTCAACTTTCCCATGGGCATGAGCGATGACGGCTCCGAGACGCACAGCGAGGACAACCAGATGATGCACAGCACCGCGCATCAGCAACATCTACTGCAGCAACAGCAACAGCAGCAGCAGCAGCAGCAACAGCAACTGTTGCAGCCGCAGCAGACGAGCAGCTTTTTCGCCACGAATCCTTTCCAGTCGATCAGTGGCAATGAGAACCAGAGCCATCTGCCCAACGATCTGGAGATATTGCCATATCAAATGTCGCAGGAGCAATCGCAGAATCTGTTCGATTCGCCGCACGCGGCT---GGCAAAACTCAATAGTATATGGCCA-----------GCCTGGGGGCGTGGCATACTAAGAGAAATGCCTGAACTTCTTGGACTAGTCAGCTGCTGCCCCCAGGTCTAATGCATGCCACACAGTGTATTAAGTAAAGCCCAATCCTAAGTTTCGGCACATTCGGCTCTCTTTATCGAACATACACAATACCTAAA----AAAACTAGTTGTAGATCTCAACAGACTGAGTATTAATCTTAAGCTTAAACTTAACTCCCTATTAACTAACTATGTATGCCATTAACTATTCATGTTTTCCATCAGGCAGCTCG
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GAATCGATGACAACAGCAATGCGAACGCCAGCCCGGA----------------------CAGCCAGCAGACGCTGCCGCGCATCCTGCAACAGCATCCGGGCGTGGAGCTGGACAAGCGGCTGGTTTTTGTGGGCACGGGCCGCATACAGACGCCGCAGATGATACGCGAGATGAGCATCGTGGAGCCGAACGGCACCGAGTTCACCTCGAAGCACAGCATGGAGTGGAAGTTTCTGTTCCTCGACCATCGAGCGCCGCCTATCATTGGCTATATGCCGTTCGAGGTGCTGGGCACCTCCGGCTATGATTACTATCACTTCGATGATCTGGACAACATTGTCGCCTGCCACGAGGAGT
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TGTGAGTTGTACAGCAAGAACTTTTACGATGTGACCTATGAGCTGGATCAGGAGGCACTGCTGAACGTCTTTCTGAATCCAGCGCCCGTCGTCGAACCACATCAGACGGACATTGGTGCCAGCAACCAGATTACCTTCTACACGCATCTGAAACGCGGCGGGCACGAGAATAGGGATGCGAGTCTGTACGAGCTGGTGAAATTCGTGGGTTACTTTC
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ACCGCCAAGATG
CCCGCCTAGCTG
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CATTTACCTGCATACAATTAT---ATAGAAA--TTTAAGAAAATATATGAAA
CATTTAATTATTTACAAATATTGCATAAAAAGTTTTGAAACAATATGTTCAA
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T-ATAAAAA------TGTGACTTGAGCGATACGAGTAACCACATCAACCATTACATTTTAATGATAATGATAATAATTCAGTTATCGATAATTGATAA--ATGATAAA--TACTAATAATTTTTAGTA-AACAGACATGAAGGAAAATACACTACAAAAACTACACATATATGCAATATATATACATACATATATATATTTATATATATATGTAATTAAACAAGTTATATATGTATGATAAGCAGACACACACACACACATCTACAAACACTCACACACACACAAACACATTTGTAAGCTGCGGCCTGCACCGC----ATATTTATTTTAAACTTAACGTAAAGCTAAACGCAAATTAACTAAAT--------GAAAGAAGTAAACAAAAAAAAAACAACAACTTAACTTTATAGTGTAGCTTAAAAAACAACAAAAAGCAAAAGAAAACCAATTTCAGAACGCCGACTACAAAAGTCTCTCACAACACTTATCGATAGCTCGAGTTATCGATAGCGTTTGCCGTGG--TTTTATCTATCGCAGTGGCAACCCTGTGCGTACTGTTAGCTGCTCCTCAATCGCTTAACAAACCGACGTTAGCCAAGTTAGGATGTTAACTGAAAACATAAAACCCAATTACCCTATTACGTAGAATTGTTAATTTTTACCTAGCCTCTTTTGTTATTAGTTTTTACGCAAGAACCTAAAACATAAAAAAAAAAAAATACAAAAAAAAAAAAACAAAGTTAAACACAGATTTATATAGATATATATATACATATATTTTCAGCGCACCAATTTCTAAGTTTTTAGCTAGTTTTTGTTA-----AGTTTTCTTAGGTAATTTCTTGGCCTCT--TTCTCTGAAAACCTTTTAAGCAACTAAACAAAAAATCGTGCATACATATGTAAATAATTTCGTTGCCTACTCCTCAAATTTGACTCAAGAAATAAAAAACTAAAAAA---AAAAAAGGTTATTTGTAAACAAAAATCAATGTTTTTCTATGATAAACAAGAGGAAGATGAACTTACGATAAAAATGAAAGAAAG--AAGAAAAAAACATTTAAAAAACAAGCAAAAGAACTTCCCTCCTCATTGCCCCAGCTCCAGGCAGCT-CTTAGTCTAAGCGAACTATTAT
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AGCGATGCTTGAGTCTGGCCCCGGCTAATGCTCAACTCTCCCAATAAGCGTATTCCATAT--GAACTCTTTAGTAG---------GCCTTAAGTAC---GTCTCGAACACTCACGTGTGCCCATGCGTAATCATGACTGTATTGCATACTTTCGATATTCGTAATCTCACAA---AAAAAAAAACAAAACA-CACGCGTCCAATCAGTATAAGGTCGTAATTTTAGAATTCTTTTAAGCGGTTTTTTAATTATCGCCATTAAATGTTGCGCGCAAATGTTGAAGCGTTTGCGTTGTTTTTGGCGTTTTCGATCATTTATG--TAACGCTCAAAACTAAGCGGAATTGTAAATAGTACTTCTTAATATGTCTATCTATACATCTACATATATATATATACATATACCATGTCTATAACTTTATGTTCAATGTAATCGTATGTAATATAACTAATCGTATTAGTGACTTGAAATCGCATTCACGCACTGA--AAACAAATCGGTTCGATTTCATTTTGTTCGGCTTGTCGCCATACTGCTA-AAGCTGTGAATGTTTACTGAGTAAATTTAAAAAAAAAAATAT----TCATAACGATTAATGTTAAACTCATTCAATTTGTTTGAGACCGGCATCTACAGCATTAAGTTGTATTATA-ACAGAACATGATGATGTTTAAGATTTAATATATAAACAATGAT------ATGAAACTTCA
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CACGTGGCACAGCTAGCACAAGTTATCTTTTATCATTTTAG-------AGTTTCCTTATAAGTTACCCCGAGGGCAATTTTATAAAACA-----ATTTTATATATTTGTTGTCGAAGACTGATGCAAAACGTAACATACATACATATATATATTTTTAATGCACCGCC--GCGCTGGTGCAGACCCTAAATTATTAAGATGCAAATTTTTAAGAG-------CCCGCTCGAATGAGACCGGGTGTACAATTTATATTTGTAGCCATAAAGAAAAAAAAAACTTGAATTCTCATAAAAGGAAAACATAGTTTAAGCACTGAATATATGAGAGCT---TTTAAGCCAAGAA
>CG7565 8061582 8061944|8505 chr3L 8061614 8061801 scaffold_8 4311832 4312038 - 4665|0 217
TGTCTATAAGTTCCTT-------TACGTGCAATTATTTTAAGTTAAGAGTCATTCTTTATATTATTTTAAGCTGCTGCTGTGCAA----CAAGTATT---ATATTTAATGT--TTATTTCTAC--------------TGCGATACTTTTTATGTGTGTATATAGACATAGCTGTTCACAATCAATGTAACAAACGACATGTAACTGCTTAAAAGTGCA
TGTGCACAAACCTCTTGGCTGTTTACCTCCTATT--TTTATGATAA---------TTTAGTTTTACTTGCGCTACTGCTGTGCAATTAACAATTGTTTACATATTTTGTATAATTACTTTTATGATTTGTATATTTTTTTTATACTTTGTTTGTGTGTATATAGCGATAGGATTTCACAATCAATGTAATAAATTACATGTAACTGCTTTAAACTGAA
>CG7565 8061582 8061944|8506 chr3L 8061802 8066298 scaffold_8 4312204 4316714 - 133786|0 158
AAGTATATGCATCAGAAGGATAAGGAGATCAAATATGTGTGTGTGTTAGTCGATCTACTATACCGTGTGTGTGATATCTATTTG--------TATTTCTATA-------ATGTACTCGGATCT-TTTGTACTTTCCGCAAAACTCGTCTGAAGTCAAGT
ACGAG--------AGAATTACTTGTACTATATCTGTGTGCGTGTGTCTGTTAGTTCA-TATAGAGTGTGCGTGATATATACCTATATACACCTATATCTATATATATATATATACAAGTATATATTTGTATTTCTATATAACCCCATATACAAACATAT
>Arp66B 8087435 8087902|8526 chr3L 8086949 8088742 scaffold_12 1755487 1757456 + 69164|628 1197
TTG-ATCCGATCCAATCGGCTTGCAGCAGTT--ATTTTTGATTTATTTTTCCATTTAAAATTGATTTATTGATTTATTCTCCAACTATATATATATATATATACATTGCGATTCGGTATTCCACGCTAAAGTA-----------TTAGTAATTATTCTTTTCTATATGTGTTTAGCTATTAACTC-----------------------------TGTGTAAATCAGTTTCGTTC---TGTTTAATT-TCGTGTGATTTTG---------TTAGGCTA----ACTATAAAGCAACAACTCCGATGTCTGCCAGTTCAACCCCCTATCTAAGGTGCATTATTTCTAGAA--------------------GTCGACTTTTATAC---------------------CATACTCAAACACGATCACACACAGTCACACCGATCTAAGCTCTTGGAGAAATCCCGGCTCTATACACAATTAAATACGAAAACGCTCTACTTGTCATAGAAATATTTAT-AATTGCAATAACTGCAACCAATTCAAACACTGAATGAACAAAAAAGGAAAAACGAAA
TCATAATCGTTTAAAGTGCGTGGCTGTCTGTCGAATTCCGCGTTATTATT--ACTTATTATTTTCGTTTTGATTTCGTTTTC-------------TATATTCAATATGCGATCACGTATTCCACGCTATAGTATTGCTTAGCCGTTAGTAATGATTTTC-----TATGTGTTAAGCTCTAAAGTTGTCTAAAATGTTTCTATATATCAGCAATACGCGTAAATCATATTTGGCCAAATGTTTATTTCTTGTGTGATTCTGATTTTGAATTTAAGCTAAAAGATCTTTAAACAACA------ATGTCTGCCAGTTAAACTTTTTA--TAAGGTGCATTACTTCTACAAGATTATATAATTGTATATGTGTAACTTTTTATATCCCAAACACACATCCAACACACATGCATATTCACAAACAAACACACACACACCAAAC--GGCTCTTCATTGAATCCC-GCTCCAAACACAATTATATATGAAATTG---TACTTGTCATAGTAATATTTATAAATTGCAATAACTGCAAAAGGTTTATATGC--------AAAAGAGAAAAAGATGAAA
>CG7550 8097558 8097683|8531 chr3L 8092404 8098406 scaffold_12 1761127 1767170 + 240045|5447 5577
GTCGTTATCTCGCTTCCCAGCAGCTAACACCCTCCTATTTATTTGCCCATAATCA---ACCGTTGGCTGATCGTATCAGC--CAAGTATCTTCTGTGTTATTTAAATAAAATTGCCTCCTTTTTTTGTATA
AGTATCCATTAAATTTATA-----TGTAACCTTAATTTATTTCCACTCAACATCACGTACAGCATGCCAGGAGCGGCAGCTTCAAACATTTTCTGTGTTATTTAAATAAAATTGCCTCTTTTTTTAATATA
>mRpL36 8098531 8098598|8532 chr3L 8098503 8099379 scaffold_12 1767475 1768364 + 15833|32 121
ACCTAATTAGGCATTAATAAAAGCATTTCTTTA---AATATGTTCATAAAT-------------AAATAAAAGAAAAAT------AATCC
GAGCATTTGTTCCTCAAAAAGAACCTATATCTATGTAATTAGTCCACTTATTTCTGTTTGCTTGAATTAAAAAAAAAATTGGTTCAATTG
>Uba2 8099270 8099385|8532 chr3L 8098503 8099379 scaffold_12 1767475 1768364 + 15833|806 932
AAAGAAGTTTTTATTCGAATAAGTTCTCAAC--TGCGCACTAAATTATGCTCTTGATTCCCTGTAATTTCATT----------CTGATTTAAAATAAAAACACATTTTTGTGGATGA-----TAAAA
AACGAATATTATGTTCAAACTTATATTTAACGATTTTCAACAAAGAACGGTTATAATTTCCATTATTATTTTTACAGGTTAGACCAATTTTAAATAGAAATAATACAAAGCGAATTAATATGCAAAA
>Uba2 8099270 8099385|8533 chr3L 8099384 8101888 scaffold_12 70788 73292 - 103370|0 1
TA
TA
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TTTCTTCAGCTGTAAATAAGTTTCCCCAACACAAGGAGAGTTCCAATTTGGTGCACGGCTCCAACTTCTTAAACAAATCTGTGTCTACTTTAGTCGTTTAGCCGCACAAAACGTACTCGTAATTCGAAATGGCTCGGGACATATGAAGCAATAGCCGCCGAAAAACAACATAACCGATGATAACCTACAGCAATCATTTATCTGAGAATTTTTTGGGTACATTCTGCAGAAAGCTCTTTTCAAAATTTACCTTCGATCGATTATGCTATTTTTGCTGTATGAGCTATATATGTCCAGAACCCCCCTACTTATATATACGTTGTATAATACTCAAATGTCGTGATAGTAGC------------AGCTTGCGAATTT-GTCTGCTAGCTCGTATCTAGTA----GTTTATAAAAATAACTCCCTCCTAC-----TTGATTATGTCCAATTAATCGAGAAGCATAACATAAAATATCCAGCAGAACAGAACAATAAGGAAAATATGCATTGATGTCCTTGATTTACATATAGAATGAAAAATACCTAATGTGTTAATTTAAAACTGCAATTTGCATACAAATTGTCTATAATATTTAAGCTTCGTCGGAGATCGTGTTCGTTGTAGAGAACCCAGATGCAAGACTTAAATCGGAGTGCATAACAATCAAAACAAAAACTGAAATAAATTTAAAACCCACTTAA
TTTATTCAGCTGTAAATAACTAGAAGGCGCACCAGGTGCCTAGGCAACTGCTATTCTACACTATCTATTTCT-----CTTTTATATATTTTAGTCTTCTAGCCACA----AGCTAATTATAAT-----ATTTTTTTCTATAGTTAAAGTTAAAGCAGGCG---------------------------------------------GAATTTCCAACACACAATTTGCGCTTAACTTTT----------------------------------------ACGTGAAACAGAGAAGCAAAAAAAAATTATTAATATATACATTGTATAATACTCAATTGTCGTGATAGTAGCCGAGACAAAAGTAACTTTCAAGTTTTGTCTGCTAATTTTTATTTAGTACACAAACAACAACAATAACAACCATCAACAGCCGCTGCGCTTAGCAAAATACTTGAGTGCGGTAA-ACAAATTGAACAACAACA-AAAACAAAAAACAAA----------------TTAATTTAAATTTAGTATGCAAAA------------------------ACATTTTGTGTGCG-------CGTATTATTTAAGCTGTATTCTAG-----GCTCAA-GTCGAGTGCTTAAA--CAAAATTAAAACTATGATACAAAACAACTAAAA--AAGGCAAAAAACAAT--------AACCTTA
>CG13676 8116559 8116577|8544 chr3L 8114543 8117445 scaffold_12 86256 89108 - 79874|2067 2086
AAAGTTCGCTTGTAAT-AAG
CAAGTCTGTGAAAAATCAAG
>CG7498 8128727 8129268|8556 chr3L 8128472 8129168 scaffold_12 101118 101854 - 14855|278 788
TTTGCATGACGTATACGCAACGTGGGCCGCAATAATGGATCTAATGGAGCTGCTGCATCAGCTGTTCCTTCACATACTTGACATTTTTAAGATCTACATCAAGTTTGCACTGATCACGCTGGTCATCTATTTCCTGGCCGAGTGGTACATACTGCGATATGGAGCAGAATTGGAGGCCGAACTGGACGCCCATCTGGTGGAAGGTGCCGAACTCAGGGAGGAATCCCCCGAGCGACCTGAATCGAATAGCACGCTGAGCAAGGTGTTTCGCTTCGTGGTGAACTTTTTCATCCTCTAAGCGACTGGATTGAAGCCACTTG-----------------------TCAAGGTCAATCGCAAAGCTGAACAGTTGAA-------------------TCGGTTGCTTTTTC---------GCGGAATTGC-AATTCAATTCAGGCA---------------GCCACAAC--TCAAGGCTCCCGTCAAGAGAATGTAAAATCGAACCAGTTGCATT
TTTGCATTGCGCATACGCAACGTTGGCCAACGGCATGGATGCAATGGAGCTACTGCATCAGCTATGCGTCAATATTGTTTGGATATTCAAGATCTATCTGAAATTTGCGTTCATCACAGTGATCATATATTTAGTAGCCGAATGGTATATTGTGCGCTATGGCATCGAACTGGAGGATCAGCTGGATGGGAATGTGGCGG------------------------CCAACGATCGTCCGGCCTCGAATAGCACGCTGAGTAAGGTGTTTCGTTTCGTATTGAACTTCTTTATCATTTGAG-AACTAGATT--AACCACCTGATACACGCCTTAGCCATAGCCAAGCAAGGTCAAAT-CACAGCTCGTAATTCGAACTCGAATTCGTATTCGAATTCGGATTCGCGTTCGAAGTGATTGCGGAATTGCAAATTCGCTTCGCGCGCTTTGTTTTGTTTTCGCCGCAACCGTCAAGG---CCTGCAAGAGAATGTAAAGCCCAACCAGTTAGCAT
>CG7498 8128727 8129268|8557 chr3L 8129169 8129565 scaffold_12 102044 102421 - 418|0 100
GTTTGGACTAGCG-ATTGCATAATAGAGCTAACATCAAACAACAAACGACCTCATTTCGGAAATCGCAAAACCCCGAACACACCGAAGATAGACCCAAAGT
CGCTATACTAATGCGCTGCTCCACACAATCAATACAAGGCAAC-AACAACAACA--ACAACAACAACAAGACGACAGCTACAACAACAATA-ACCACAAGA
>Nmt 8150081 8150372|8571 chr3L 8144589 8150119 scaffold_9 2418930 2424465 + 186394|5795 5834
ATAAAATGCGC-AGCAATATCAATAAAAATGTAACGTTTA
ATAAAATGTGCTAGCTATGATCGCAAAAATCGTACAT---
>mthl7 8152622 8152622|8574 chr3L 8152552 8154490 scaffold_3 2900797 2902602 - -7003|70 70
G
G
>ERR 8156877 8157465|8577 chr3L 8157160 8159220 scaffold_9 2430454 2432637 + 80833|0 384
AAAGGATT---------ATGCGGG-----CGCCCAA---------------------ACTAGTTGATCTAGCTGATAAGCAAAGGTGCAAATATAGTCTTAGGTATA-------------------TATGGATGTATACTAGA-GTAGATTAAGCGTAGGATAAGCCATGTATATAAATA-GTAAAATACTTGTCGGGT-AAGATTAGTTCGCAGAAAAAATCT-------CTTTTAATGGACTACC--AACTAC----------AGCAACTGGAAAACCCTACTTATCTTCTAGAATCGGGGTGTGCTTACACT---GGTTAAAGGCGCATATAGGTGTTATGTGTCTAAAGTTGTGAGTCACAGATCTTCAATAATTTGTTCA
AAGCGAATCCCAACCACAAACAGGAACAACTCCCAACAGCAGCAGCAGCATCAAATTGCCAGTCGATTTAGCTTCTAAGTTCAGGTGCAAATATCGGTTTAAGTTAAACTAGTTACTAATCTCCAGTTTGTAAGCATTCGAGGTGTAGCTCATAACTAGTGTATATAGCGTGTCTGTGTATGTGAATTATGCGTAGAGTAAAGAGTACATCGTATTGAAAACTTAAATAGCCATTTAATCAACTATCAAAACTACTTGACTAACATGTAACAGGAAAG--------AACATTTCGCTTCGGTGTGTGTTTTAGCCGAAGATTAAATACCCTTGCAGACATTAGTTTATAGCAGTTATACGATATAA---TTATATAGTTTATACA
>CG7387 8165459 8165518|8584 chr3L 8165233 8167045 scaffold_9 2437812 2439650 + 55778|273 332
AATTCTCAATGTACCGGCCTCATTGCGTTTACAATATATTGGTAAACACGAACATTGATT
AATTCTCAATGTAAACATCTAATCAATTTCACAGTAAACTTGGGATTTGTAACA------
>CG7375 8170480 8170686|8586 chr3L 8170504 8170976 scaffold_9 2443453 2443986 + 9356|0 285
TATAGGGAATCGCAAGGTCTCTTACTTTAAGCCTGTCCATACACCTCCCCCTACACCCGCTAACTG-------------AAGAAGATGAA--------------------GCAAAACACAG----------------------------------------------------------------------ACGAACATCGGCGACAACAAATTATTGTAATAAACGAAAACAAAATCCACTGCGTGCAAAGAAGAAGCCGAGTCAAGTCACCAATTTCTAGTTTT
TATAGGAAATCA-AAAGTCT-TTAATTTAAG------TAACGGCCTCTGCCTGCTGCTGCTGCCTGCTCCAATGTTTCAATGATGATGAATGCGCTTTTATTAGTTCTATACAAAAAACAACAAGCAGCGGGCATGGAACAAAAACAATAACAACAGGCAGATTGGCCGCAACAACAACAGCAACAACAACAACAACAACCGCAACAACAAATTATCGTAATAA--------AACAACCACTGCGAACCGAAAA-----CGAGTCGAGTCAGCAACATTTTTTTTT
>CG7213 8205761 8205910|8634 chr3L 8205655 8205835 scaffold_8 606015 606216 - 277|118 203
G-----------ATGGCAAAGAAAATCCGAAAATAAAAACACTGAAAAATATTCAAATATATGCTACATAGTTATTTGGAACTCTG
GTGCTTACACAAGTTTAAAACTGAAATTGAATATAATCTTATTTAGCTATTGTACAATTTTTATTATATTATTATCT--ATTTTCA
>CG7213 8205761 8205910|8635 chr3L 8205836 8206553 scaffold_9 2490906 2491567 + 15087|0 74
ATGGTCAAACATTTTACGCTTTTTGTTTAATTAAAATTGCAACAGGCTACGTAGTTCTCATTGCAGCAACAGGAG
ATGGTCAAACATTTTACGCTTTTTGTTTAATTAAAATAGCAACAGGAAGCAGGATACTTAAAGCAACACCAGCAG
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TATTTGCCATAAGCAAGAAAGCAATCAAAACCAATCAAAGCTGAA-------------------------------------------------TCGTCTCACGTATTTAGCTCAAACTTTATCCTTAATAAGCCTCCAGTT---TGTGGCCTCA-------ACTATATTTTGGAATCTGTTTTGCTACTCCTTACTACAATTTTATAACCATTTCGTTGAGTTTCACGACTTTGGTTCTTCTGTACAAGAGTGTTTTCCAAGCGAAATGTTAGAATCCCCT--------------TTTGTATTTGCGCTAAGGCAACCAAGAT------ATAGTGTAACCAA-------TTTAGCCGTAAGTTATGTGTAAGTGAA---------------------------------ACACAATCATTGTATAGATCTTAGTT-CCAAAACTTTCTATCTGTAGTGT----------------ATATCTTTATG------------GAAATGCTTTAAATGCAACAATTGCAAGAATGATGTGAGGGA------TGCATAGCTACA---TATACGAAAGCTTTTCTTTTGGTGTGAATCTATATTGTATATCCGCATACGTATGAGACGAGTATATATATATATTCCCATATTCCCGCCCAGAAACATCGGTTTTACTCAAAAC--TGTCAAGTGTAAATAAATGCGACTTACTGTTATCTCTGA
TATTTGCCATAAGCAACAAAGCAATCAAAATCAATCAAAAGCAAAAAATTGAAAGAAAACAAAAAAAAAAGCAAAAGAAAAAAAAAAGTGTTATTCGTATAATGTTTCTAATT---AGTTTAACGTT--TAAGTCTTAAGTTGCCGTTGAACTTACAAAGTGGCTAAACTCTTAAATC--TTTTCCCCCTTTTTTATACACACACCTAATCGTTGCGT-------------TTTAGCCAGTGTGAGCGAGCGCATATTGACCCGCAACTCCCGTCATCCCCTGCGCTAACTATTAACTTGTAAATGTGCTTTAGCTAGTTAGTTTTGTTCATTCTGTAAACCAATCGCCGTTTAGTCCTAAGTTATTGGTAAGCGAAAAACAAAAACACAAAACACAAACAGAACAACACAAACAATCATTGTATAGCGCTCAGCTGTTTGGAATTTGTATTTGTATTTGTTGTTGATATGCAACAATATTATTATGTCTAATAACTATGAAATGCTTTAAATGCAACAATTGCAAGGA--ATTTTAAATATTTGTTTGTATTGTTGTAGCTTATGCGGCATATTATATTTTA----TAAGCTCAGCTCCAATTTCG-ATATGCCTGAATC---TACATGCCTTTTGTTTTTAATTCAATCAAACAAACAAC---------CAAAACTATGTCGAATGTAAATAAATGCGATCTTTTGTTATTCTCGA
>CG7201 8264233 8264530|8705 chr3L 8264290 8264845 scaffold_9 2560735 2561347 + 16077|0 274
AACAATGACCAACTCCCATGCGAACCCCTATTGTTGACCTCGTCTAGATGTTAGGATTA---CGATTGAGTTGAGCGCGTCCTCAAAGTCACTTGCTTGTAATTAACGTGTACTAATTAAT-----------TTATAATTATTTATTTTATTTACGCATTG----------------TATTTATTGTTAGTCGTAGGCGTTGTTAATTGCTTAGATTT----GTATCCATGTTTGTCTAGTGGTCTGTAAATAATTGAAATTGTGGCATAATTCC
AGC-----TCAATGGCAATGCGGTCTATATGTGAAAATCGCGCCAACTCGTCTAGTTTAAGCCGAATAATATGAGTGCACATTGAAAGTCATTTGCTTGTAATTAACATACACTAATTTATTTTATTTATTATTATTATTATTATTATTATTATGATAATGATTATTCTGCTGTAACTATTTATTGTTAGCTGTAGGCGTTGTTAACTTTCTAGCTGTTAGCGTATC---ATTTGTT--ATAGCCTGTAAATAAACAAATTTGTGGCATATTTAC
>CG7197 8272442 8272697|8716 chr3L 8271620 8273260 scaffold_9 2568731 2570592 + 64490|954 1357
CCCGC-CACACATGCTACATATTAGCTAATTAATCATTAACGACTAGCTGTCTAGAGAAAGTAAACCAATTTTGATATAA-----------------------------------------------------------------------ACAATTTTTAAGCGTTTCCAAATTGTTTGAAAAGTTGTTGCCAAGCCAATTTT----------ATTTAGTGTAAA---------------------------ATACGTCCGAACAGGAGT------------CCCTCGATGA---TTTAAATCTACGTGTATATGGATAATGTCTAGGAGCTAAGCCAAT-------TTAACTAC---------------GATACTTCCA--ATAAAATTACAAAATAAACGA
CAGACACACACACGGACGCCGCTAGTTTATAGTTAATTAA----------TTTAGACAAA-TAAATCAATTTTGATATAATTGTAACATGTAAAGACATATATATATATCTATATCTATATATATATATATATATATCTAATTATACGAACGAAATCTGTAAGCGTTGC--GATTGTTGAGAAA------GCCAAGCCAATGTTTTTTACAGTGCTTTAGTTTAAAGACTCCTGCCTTTGTTTACACACACACACACACACACACAGAGATTTATGTTGAAAGTCCTCAGTAAAATATAAAATATATATATAT-TGGTTCATATGTGTGTACTAAGATAATGCTAATGTTAACGATCTAAGCAGCCAATTAATTACTTCCATTATAAATTTATAAAATAAACAA
>CG7194 8276311 8276565|8718 chr3L 8273995 8276405 scaffold_38 232600 235095 + 54643|2442 2556
TAGTGGAAGAAAAAAGAAGTTGAATCAAAAGTCATTTCGGCCGCACATTTGAT-TGTTTACATTGTCCCTGAACTTTGTTTA----------AAAATA---------AAGCTACG
TAGTTGCAGTAAAAGTATTTTTGATCTAAAGGCAGCTGGGC---ACACATAATGTATATGCATT-----TGAAATATGTTTACTCGTTTTGAAAAATACTGAATTTTGAGCGTGG
>CG7188 8281088 8281327|8720 chr3L 8278171 8281297 scaffold_38 235209 238629 + 84542|3213 3465
AACAAAACTAAATAAACTTTTATGTGTAACAGCCACCACAAGAAAAACAT---CTGACACGGATTTTGGAGGCAGATTT--------CTCATTC--TAGAAAATTATTCGCATTGAATATTAATA-ATGCCGTGTACATTT-GGCTTTAAATTT---------------ACAGACATATATATCCAATATAAAA------CCCATGAA---ATTTTTCCATTTAATAAACACCAC----AAGAAGTAAGCTCA
AATACCATCTAATAAAATTCAATTCATTCAATCGACTACAGAAACAACTCGTATTGCCATAAACTATTGTATAAAACTTATATATAGCTCATACCTTGGAAAGGTA----CATTTTATGTGCATATATGTAATATTTATTTCGGGTTTACATTTTAAAATTTATTGTGTACAGATATATACATACACAATTGAAGATGATTTAATAAACTTATTCTCCCTTCATATAAGCTCAGCCATTAAGCGAAAGGTTTA
>CG7188 8281088 8281327|8721 chr3L 8281298 8284615 scaffold_38 238814 242082 + 52403|0 29
GAGGAGCGAAAACAGAATGAACGCCGCCAG
GAGGAGCAAAAACAAAATGATCGTCGCAAG
>CG7188 8281540 8281658|8721 chr3L 8281298 8284615 scaffold_38 238814 242082 + 52403|297 440
GATAGCTCAAGCCGGAGCCAGTTGCCCAAAATAGCTCAATCA------GATTATCCTCGAAAACATGCTGATCACTTTGCAAAAGCTTCCAGTAT--------AAAATTCGAT----GTGAAAAACCATTTTAAACG-------
GATAGTTCGC----AAATCAGTT-----AAACAGC-CAATCAAACAATGAATAACCTTGAA------CTGACCACTT----ATAGCAATCAATATCTTTAATGCAAATTTAATCGTAACGGTATGCCGTTTTAAACGTATACCT
>CG7185 8284434 8284977|8721 chr3L 8281298 8284615 scaffold_38 238814 242082 + 52403|3500 3689
CCAAGGGGACAGTCAGCGTGGGACATTATAGACACTGATGCGCACTGGATCATCAAACAACAAAC---AACTAGCATTCCTGCACCGCCGTCTTCGCAGCAGAATTTCAATATTATTGTACTCTAAAATTTCGGTTTATTTAATAAAACATAAACGTAT--GAAAA---AAAGAATTGTTCCAGAAAAAA
CCATTGAGGCCGTCATCGCGAAACA----AGACGCGGTTGGACAGCAGCTACAGATAGAATGAACTTCAATCAACAT-----CAGCGTCGTCTACACCGCAGAATTTCAATATTATTGTACTTTAATATTTCGGTTTATTTAATAAAACATATATATATATGAAAACTAAAAAAAATGTTCAAAAAAAAA
>CG7185 8284434 8284977|8722 chr3L 8284683 8285178 scaffold_38 242113 242600 + 19624|0 310
CTGCCGTA--AGTGGAAGTTGGAACCATCGCCAGTGGACCCGTAATCAAGTGTAAAGATGCAACACAGATATACTAAACACACTCTATTAACAAACAATAA-GCCGCAGCTTGGTGGGATGACAAGCTAGCCACAAT-TAACAGATTTTCGATTTGTATCTAACATTACCAATACGTAGGATATGAATATGGCAAACAGCATAGTT-CTTCTAGACATACTATAATAAGCCGAAATGCTGACAAGATTTTAC--CAACGACGGACGG---------GGACTGCCTCTGGATCCATCCAACTTCACATCACA
CCGCTATACAAGCGAAAGC-ATAATTAATAACAAGAAATACACACCCAAAC-----------ACATAAACCTCCTAGACACTCT-TATTAACACATAATAATGATGCAGCAAGCTGA------AGGCCAGCCACAAGATTATGAAATTTTGATTTGTATCTAACATTACCAATACGTAGGATATGAATATGGCA--TAACATAGTTTCTCCTAGACGTACTAAAGTAAGCCGAAATGTTGACAAGCCTCTACAACAACAATACACAATTGAACGACGGACTGCCAC---GCCCACACTAATCTACACCCTA
>CG7182 8318365 8318474|8759 chr3L 8316894 8320119 scaffold_9 4858364 4861536 - 145712|1483 1592
GAGCCGGATTGTGAACCGGAACCGGTGCGATGTCGCCTAGACTATTTATTGTTGCTAGCCTAATGATTACAATACAAAAACTTAATAAAGATAAATACGCAAGCGGCAAA
ACTCA--------------------------ATCATTTAGTCTATTTATTGTTGGTAGCCTAATACTTATAATACGACGAGTTTATA---ATAAATTCAAAAGCTTCAAT
>CG17352 8326302 8327384|8764 chr3L 8326045 8326318 scaffold_19 1066467 1066708 + -2514|260 276
TTCATCAAGACTTATCC
GAAGTAGAAA-------
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CTTA-CCCACAGAGTCCCACTTGCAGGCACTGCAGGCACGTCTCTCCCGGCA----------GCAAAGGAGTCAGGGCAGCGGGTCCAATCCGTGGGGATTTCAACGAGCCCGTCATCGTTATCCGCTGGGGGTGAACTACCCACAGCAGGTGGGTCAGCCACAACGCCCGGCAGCACGGCAGATGAGTGCACCCAGG------GAGGCGACTCACTTAGCATTTCACTCACTCTAGGCTTGCCCTCCACCACGGCAGAGAGTCCTGTGACAAC--CGACCAGAACCAATTGCAGAAACAAAGTCCGGAGCAGACAATCAGCAATTGCACGGAGCACACCTTCCTAAAGAGATCGTGGTTGGTGGTGCAACAGGTTCCACCTGGCAGGGGTTACCGTGTCCGGAGGCTGCGACATACCTTCTCCTCTCCTGAAGCATTCACTAGCGATGAGCTGCATCTGCCGTACCCGGATTTCCTGAGCTACGGCACTAATCTTCCACATGAACGGAGCAGTAGTAATTTCGGATCCGAGTTGTCGAGGGACCCATCGAGTTATAGTGTGGGCAAACGAGCTCGCTTGACGCCCGAGGACACAAGTGGATCGGAGACCATTACCCAGGAGATGGAGCAATCCAACCAGACACTCCAGTCCCATGTGATAGTGGAAAGTCACCCGAATCACAGCGAAAGTGAGAGCGAAGCGGAGCAGCAGGTGTCCTGCTTTGGAGCCGTAGCCCAGCGGCCCAAGAGGCGTCATCGGGGTCATGTGAGGAGCCGATCCTTTAGCAATGCCA------GAGGTGGCAGTGCCGGAAGGAGGCGTCTCATGCAGCGCAGCTCGTCGGCCGATCTTTTGATGAACTACGCGACAATG--GCGGTATCGACGCCACAAAAAACGAGCGAGGCAA-----TGCAGCGATTGTTCTTCATCT-GAGCGGGAGATTCAAAATGGAAGAGTGGACAAGTGGAACGATAGTATTAAAGCCTGGTGTGATTCTGGTCGGATTCTAGT------------CACATATAAATAAATA------AGCCTGTTTCTTACTCGAATGTTATTAGCTTATTGAAATTCT--TAATAAATAATTAACTTCAAC
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ATGTACTAAGTTTGTGTTTTAATCAGTTGCTTTTAAAATTTGGTTTTTACAGAAATG------AGCGACTTGGAAACTCGCACAAGGCCGTCCCAGGACG--------AATC-GGTGCACTGCAAGGTGTGCGATGCGCCCTTCAAAACGCTGCAGGATTGCCTGGCGCACGAGTTGCTTAAGCACACGATAAAGCCACAGAAAAAGCTGCGCAAATGCTTGGATGCCATCACAAAGCTATTTGCCAGCGAGCAAATTCAATGCGAACGTCGCGTGCTAAAGGCGACACTTGCCCAGGCACCGGCTGGCCAGCATTTGCGCGCCGTGCTGGCTTTCTATTCCGGCAACTGTAATGAGCTATCGGCCTGCTTTGCTCAAGTGCGAGAGACCCTACAGAAACAGTTGCAGGGTAGGGTAAAGGTTTATCCCTTCGGCTCGCTTGTAACAGGTTTGGCTTTGAAAGGTTAGTAAATCCCATAATTATTGTCGGTTGGTAATACCTTTAATTATGCGCTGCTTCTTCTGCAGATAGCGATATTGATCTGTTTCTGGAGCAAACCGAC-ACCAGCTCAAATAGCATGTCCCACCGTCAATTGTTCAACAAGATCTACAACTTTTTGCGGCGCACCGATTGCTTCCAGGATGTGTTTGCCATACGGCACGCCCGTGTACCCATCATACGCTGCAAGCATGTCTATAGCGGCCTCAGTCTGGACATTAATATGTCCAGTCCGAATAGCACCTATAATTCGCGTTTTGTCGCCGAGTTATTGGGCCGGGATGTGCGCATGCGCGAGCTATTCCTGTTCCTGAAATTGTGGGCAAAGAAACTGAAGATCATTGGCAGCGGCAGCATGACCAGCTACTGCCTGATCACCCTTATCATATTTGGCATGCAGCAGCGTAGACAATTGCCATCGATCAAGCAGCTGCAGGCACGTTGCCCGGTTCTGGAGGTGATGGGCGTTAATTATGCATATAGCTTTCAGCAAGTGCGTCCAATACCGGCCAGCTTGACCACACTGGATCTTATCTCCAGTTTCTTTGAGCTTTACAGTCAAATGGAATTTGAGAAGAAACTGTTGTCACCCTATTTGGGCTGCGCATTGGACTTGGAGACGGCCTTTTCGACGCCGGGCAAATTTCCCGAGTATGAGGAACAATTAAAGGCCATGCATAAAGCTACGGGGGAGCAGCCGGAACCGTTTCAGTATCAACGCTGCGTTTGCGTTCAGGATCCATTCGAGTTGCAGCATAATGTGGGCCAGTCCATATCCATAACTAATCTCTGCTATCTGCGCGAGTGTCTGGCCCTGGCCACTAAAGCGTGCAGCGATAAAAGATTGGTCTCAACGCCTGCCAAATTGTATGACTATTTGCTTTTTGGTCTGGCCGAGAAACTGTTGCAGGGCCAA----CGCCTGGACCAGGAGCAGCC--GGCCAAGGTGCGCAAGCAAATGTTAAATAAACCAGAGCAGACGCCAATG
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G--------------GGCGTCATTTATAATTTTACATGGCATTTAATATTTTTAGGCTACAGTCTATTGCGTATTGATATGTAATATTTTTTTAAAACGATATTTATTGTGTTGGAATTAAAAAGCCG-AACGAACGTACAAAATGG
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ATCCAAGTGTCTGAGAGAT
ATCAAAGCAATTGAAAAAG
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ATTGCTGAAGAAGTTGTATAAGCAAGCCAGGATATTCGATGCACATCAAAGACAAT-------------------TACCTACAGC------------TATATATATTCTTGTACGC-------------AAGCCAAC---------------------------------AAACTAACAGCAA----------------------CGTGAACTGGTCGCCC--CTACCATAC---------ATACA------CAAACATTTATAACGAATATAATCCCTAGAACCAAGCAAACACTATTGGAAACGATTGTAATTCATAATAATGGATAGCAAAG-------------GCATACATTTA-----ATATTTACGA-AACTACTTAACGGCAACTCAAACAAGAGAGCTCTTCGTGTCTGA-----------------------------------------------------------------------AATCGAAACTTATTTGTAATATTACCAACTAACCCCTCCACCATTG---TAACGCTTTGTTTTCAACTCGGCGCAACGGTGATCCGAGTTGTGGCCAGGTTGAAGCAAAACG-------AAATTGAA
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TCTGTCAGTTAGTTCTGGTTTCTTAGTTATTTGCATAGTATTTAAGTCAAATATTAT-TCATAATCTTTAATGTTAAT--TTATAAACAAGT--ACACGCATGTATATTC-----GCATATAGAGGCAAATTGTGTTATGTGTCGACTCATTTTGAGCACTCGACGGCAAATGTTAACATTTTTAATTAATTCATTTATTTGTTGTTTTGTTGTATGCCAATTGTC--AGTGTCAAGTATTTTGTATGAATGCAAATTTTGCCAATCACTCGAGACAATTGTTGTCAACATATTCTGAAATATGTGCAAAACAATCGCATTTTGATTGGCAATACAAGTTTGCCTTT---------------TGTATTA-----ATTCAAGTTTATTCGCATATTTCAAGCGCTTT-------TGTCCTGTATTA----------------------TATGTAACTTTCACTTGCCTCTG-ACATGC---------TATGTACTT-------ATAGAAACT---CTATATTTAACAACTTGAGTTACATGAA---ATGCCTGAAATGTAAC----GAAAGGAACCAAGTTAAAAGTTTT--TCCTCGATAGTTGTAGCTAAATATGTCACAAATATTATGCGAGCTATTAGTGCAGAGAGTTTTGA---TGAATAATACTTGAAAGATGTGAGAATCGCA--ACTCGTAATCGGCTCGTTTATTAGAATTCTCTGCTGAATGCGTCCACTGTTTAAAT-TTCTTTGCCTAAGATTTAAA-----------AGCTCGAACTACTTATTGTACATTCAAAGTATTTTGCATTTCTG
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GATGG----CAACCCA
GGTGGACCTCAACACA
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AGAGTCCAAGTTCGGTTTGGAAAGGGTCCATTAACTAAGTCAGAAGTTGGCGAGGAACTCCTTAGTAACTTGGGATCATATGTGTTTATTTTTCATTTTCAATAACAATATCTAATGTGCTAGTGTATTTAGCAATTCGGTTTCCATGCGCTCTCCTTTTTTCGGTGTTTCCCTTATTTTTGTTTTGTTTT
-------AATTTCATTTTG-----------------------------------------CCAAGTTATTCGAG-----------TGGTTTTTAAAGTTGTTCGACGGTGCCCTGCGTGTGTGTGT-------------GTGTGCGTGAG--------TATTTGCTTTTGTTTTTATTTTTGATTATTTGT
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---------TAGCTCAAGCAA----------------------------TTTATTGACGCTTTA-------AATTCGAATAAAGCTGCAGGC---G
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AGGATGTATTAATGGATGACAGGAAGCAACATACTTAAACTAACATTGTGAAACCGCTTTTAAAAAAATATTAAACCCATATATAAA
AGG----------------------------------------------GCAATCTCTTGTTGGAAT------------TATACAGG
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ATTTGTAAAATCTGTATGTTTTATCAATGTCTATATGT-ATATGTATGTGCCTTAATAAAAGAAGTAAAACTTTATA
ATTTGTTAATTTTGTAATTTAGATCGGTACCAAGGGCCAAAATATAGACATCTCATTGCTTATTGTAAAATTTTAGA
>CG6638 8548123 8548521|8971 chr3L 8548432 8548460 scaffold_32 1170278 1170306 + 2060|0 28
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AGACTATTTGTTGCATTTATTTTTTGTAG
>CG6638 8548123 8548521|8972 chr3L 8548461 8548515 scaffold_32 1166564 1166608 + -164|0 54
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AGCGCTATAAATAGTTATCAGGGGGAAAGAGTGT----------TAATATTTTAG
>CG6638 8548123 8548521|8973 chr3L 8548518 8549958 scaffold_32 1170371 1171787 + 72585|0 3
AGAG
AACG
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AGCGCAATA-ATTAGTTTC--------------TACGTTTAGCTT----------TCTACTTACTTTATCCCTTAGTAACAGAACACATTTCAGTTTAT-----------------------TTTAAATAATT--TTGCTTTATTGAAAATACGCTTCTA-------------------TATATATGTTCACTTTCTGGCTAAGTACTCGCATTTCAAGT------TATAACGTTCAAATGAATTC-----AATGAAAAAGATTGTATGTTTTGTATATTAATTCCTACGTTTTGATCTAAATTAAA---CAACAATATGTTT----------AACAATTGAAT
ACCCATTTAGATTAGTCGCATGCGTATTTAAGTTACTTTTGCCTCATCATTTTTATCAGTTCACTTTACAATTAGGTAA---GTCATAATTTCATTTATTCATTCATTACACAAACATCATATTTAAATAGTTTCTTGCTTTATTGCAAATACGCGTCTATAAGTATATATAATGTACTTACATAAGTTCACCCTCTTGCTAAGTACTCGCGGTCTAAATCAAAGATAAAGTGTTCTTATGAATTCATGAGAATTTAAACGATT-CATCTTTAATATATT-ATACCTAAAATCAGGTTTAAATAAGAAACCAACAATCGATTTTTAAGCATTGAACAATTGAAT
>CG5989 8576354 8576461|8990 chr3L 8574760 8578024 scaffold_32 1197830 1201103 + 124316|1697 1813
GCGGGGTCCTCTGGTCGTTAGCTATTTGGTAGACTGTGCTTTAAAGATTGGACTGTTAAGAT-CATTTTGTTTCTTGAGAGCAAATAAAACCGTT--------AAACCAAAAGAAAG
GCGAA------TGGT-----GCTAGTTGCTTAAGTTTGC--AAAAAATTGCAGACTAAAAACGCGTTTTGTTTTATAAAAGCAAATAAAACTGTTAAACACTGAAACTAGAAATACT
>CG5978 8595978 8596190|9006 chr3L 8593904 8597724 scaffold_32 1212878 1216677 + 172894|2113 2355
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CGTACGCCGTTTCCGAATTTAAAGCCACAGCTTGCGCTTAATTTTATGACCTGAGAAATC-----GATATTCTGAAGAGCAATA-CGTTAAGCAATCATTGACAGCGTCGCAAACGCCAAATCTATCAAAACGCACGAGTCGTATACTCAAAACTCTGTATTTACACATATGCT-----TTTGATAAAACTTTTAATTTTATAAATTTTTTTTCATTAATAAACTAATGAATTTTAACATTCT
>CG5971 8605456 8605829|9017 chr3L 8604296 8607194 scaffold_32 1222823 1225773 + 96373|1326 1794
-GATCTGGACGATTACCTCTA-GGAAATGAGTGTGCCCGACAAACCGCT-------GGTTAATTGCGCATTTTTCTC-ATTTTCATTCACCTTGG-----------------GGACGAACGTAT---------ATGTATAGGAATACTTT--------------------------------------TTGACGCTAATTTTAAAATTCGTGGCTGGCGCAAGCAC----TGAAATATTTTGAAATATCATTTGACGGTCACTTTCGACATTTTCTGCTATTTTCTGACTATTAATTGAATCGATTCTTTTAGACTTTGTGTGTGTCATAAATCTAAGTAAATGTTGCGCCCATAATCTATTTCTA---------ATCCGATCCGTTGACCAATAAGTTATAGAGAATCCCCTTCCTGTTAGCCCTAAGCAAATAAGAATAAACTAGA---------TAGTTCCGCAAT
TGAACATGATGATTACCCTTATAGAAAATAGTAGGTAAGCAATTTTGCTACTTTTCGTTTAATTGCGCATTTCAAACAATTCTTATTCACCTTGGCCGTAGAACGAATCGAACGACGCGCGTACAATTTTGAGATATACGAAAATAATTTGAATACGTTCAGTTTTTTTCTTCTCTCTCTGTCTCTTATGGTTGCTAAATTTAAAATTTGTGGCTGGCGCAGGCACATAAAAAAATATTTTGAAATATCATTTGAGGGTCACTTTCGAAATTT------------------TTAATTGAATTCACTCT-----------TGCCCATCATAAATCTAAGTAAAT-CTAAGCAGACAACTAACGTTTATAAATACATATTCAAAATGTTGACAAAC---TCACACGGA-----CTTCATATAATTGCTAAGAATATTAGTGTAAATTGAATAATAAATTTAGTTTCGCAAC
>CG13305 8618859 8619031|9030 chr3L 8617634 8619238 scaffold_32 1236234 1237856 + 30504|1425 1601
GTGATTTGGACAGATCGTCAAGGAGGTCACGGCGAACATCGTTGGGACATGGCGCAGGGAAAACTCTGAGAT-CAGACCTCGATTTGCATACTCCATAACATTTTTCCCATCCCCCCCAAAAACTCTCT-GTACATACCCATGCGAACT-CGCA-TAAATCGTGACTTTTCATAATT
GTGATTTGGACGGATCGTCGAGGTGCTCATGGCGAGCATCGCTGGGACTTGGCGCAGGGCAAACTCTGAGCTGTTCAACCCATTTTGCATAAACTATCGCCTGCTCGCTCTCTCACCGTGTCTCTATATCGTTTGCATTGTTGAGAACTGCTCAGTAAATCGTGACTTTTCATAATT
>CG13305 8619115 8619179|9030 chr3L 8617634 8619238 scaffold_32 1236234 1237856 + 30504|1685 1749
AGCATCCGAAGGCCCAGGAAAAGCGATTTGAATCCCAGCGAGGCACGAATCGTTACAAGGGCGAG
AGCATCCCAAGCAGCGGGAGCGACGCTTTGAAACGCAACGCGGCACAAATCGTTACAAGGGCGAG
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TTCG----------------------TATGTTGATGACCGACTATTAAATACCGTATCGAAAGCACTGAAAACCTGTTGCAGCAGGCGTTTCTCGTCGAGAGGCCACAATCTTTGTATTATAATCGTATCGTATATATATATATATATCACGCGCACTCCTTTACTCTGCAGAACTTAAGTGGAACTGGAGTTTTTAATGTTGAAT-----TGTTGA-AACTTGACCA---CACGTGTCCTTATATTAATTAAATATAAATTCTCTTATGGCTATC
>CG32022 8694227 8694387|9115 chr3L 8694149 8694996 scaffold_32 1319689 1320537 + 16902|81 251
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ATTGTAATTTTGGATTTTATTGCAACTAAGTTATCTGTTA-AAAGTGCTCGA---------------TATAGTTTGCTTAGATTCCTCACGGTTTTTGACAACAAAATACATAAGACAAATATGTATTTTTCACACAAAAATTCTGTAAAATGATTTTGCATTATTCGCGA
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AAACACACACACAAAACACAAATACACACAACACACACACACACATTAAACACACACAACCAAACAGCAGCAACATTTTATAATTAAAAAAAAAAAAAAAAAGCAAA-GCAACAAATAACCGACAACAACAGGAACAACAGCTTTCAGAAAGAAATGCAGAAAATGCAGTCAATTTTGAGATTTGAA-GATATTTGCTTGAGAAAACTTTTATAATTTAAATTTTTTT-----------------------CAGAGCTT------------------GCGAGAGTTCGTATAGGTTATACATTATAAATACATAACACTACACATCTCCTATCTAT-TTATAATAATAATATTTTGAAGTTCATGTAATTTAATTAAAATAATGAACCTAAAATCATATATAAAGAAGAAAAGAAAAAAAACAAACAACAAAT----AAAATT--------ACCAAAAAAAAG----------TAAAAGGAAAACTACAGAAGTTTTGCAGCGTTAGC-----GAGAGA-GAGAGAGAGCGA-------GAGCGAAAGAGAGAGAGAGAGAGGACGAGAGTTTGCTTATAGAGTTGGCTGATTAAAATTTAA----ATGAAAAATAAATG--AAATATATGCAAAATATGCAAAGATCAACCAATCGACCCAACAAAA---CGAGTTACCCGAGTTACAACCGCTTCTGCTACTTGTTTTTAGTTCATTTTATGTTTAGTAGGTAAATATCTGTGTGCTCGTAACGAATT--GATTTTACAAATGATTAAAAGAAAAACGATTAAGAAAAACTGAGCAATTTTCATA-TTTTTACTTTGTATTTTGCAATAAAAACTGAATTTACTTATATAAGTAACAACAATAACAACAATAACAAACTC
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GCTACAGTTTATGGCCCACTCTGATACCAACCAA
GTTG-AGTTGCTAATACCCTGTTATAAAAATAAA
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GTCGTAACTTTT---------GGCTAATTATAATAATTCCAGTTGAAATTTTTGTAAACATATTTACAAC----------TGAGCTTTTCTA--------------AAAAGTGATTTA--CCCAAGGCTTATTTTCGTTTTCCGATCTC--GCTCCAAGTGT---TATTTAGAAGTACTTAGCGATAACCGAACAAAAA---------ATTCCATGTGACAGATTTGAAGCGCTTTTTTTTCCATACACTCTGCAACAA-------GCAACTTCAAACTCACAGACAGCCCATAGGATTTTTTTTATCTTCACTTTATAGACATACCAAAAATAAATTTTCTATTTTGTATATTCACATACAGCTGAGGATCTGTTGTGATTTATTATTCTGCAGGCGATGCAAGCTGTTGCTCCTTCAAGTCTTTACGCAAAGTATTCCAAAAGCATAATGCAGGCACATAGCTCCTAATCTAAGTATGTAAATACATACTCTAACTATATACATATATATCTCTTTTTACTGCAACAACAACAATATATATATATATATATATATGCCTAGTTATTTAAGTCTATTCCAAGCTACTTC-TCTAAGCATGCGTGTGAATTTCAAATGCTTGTCCAAAGCAAAAAAAAAAAAAGTATTTATATTTG----GTGTGGTGTTTAACTCAATTTT------------ATATTCACTTAAG---------------------------TAAACTACGTA----------TGGAACATAAACATTCGCCAAAGGATAA-------ATATTC-------CGAACATGAACAAACTCTT----ATATCATTTTACAAGGCTGGCCGAAGA--ACACGAATAGGGTCGTAAAATATG----------------ATCAATTTTTTCCAAA------TGAAAACAAATAATAGTTAAGCTAAAGTACGAGTA
>orb2 8916239 8916837|9316 chr3L 8915887 8922583 scaffold_38 90773 97169 - 112272|440 1163
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CGGCGGCGCTGGTAGGCCGCGCTGCATGATGAGAGACGCCAACAGAGAGAGCAACGACATCGGTTGTTGGACGCAGCGCTGGCAGTGCCCAGATTACTTACCAATACACATCACCAGCAGGCGCCGGAGCGGCAGGAGCGACAGGAGCGCCAGGATAGGCATGATCGTGGACACCAACAACACGAGCGGCCGCAATCGGAGAGTGAAGGACGCGAGAGACGTGCACAGCGCCGGAGAAAGTTGTAATTAGTATATAAGGCAAGCACACAAACGCACGGATACACTCACTAAAAATGACACAGATACACACACACAGACA-----CATACACACAAAACACACGGGCCAAGGCGAGGCTAAAGTAGATCTAACCCAAGAATAGTCACAACACAAGGTGCAATAGCGCCAGGGCCTCGAGCACAGGCTTCAGTCTGCTTGCCAGCCCTGGGCAACAGCCA--AGAGGCGGCCCATTAATGGGCGAACATTTCTGGGCAACACACTCGCCAAAAAAAAAAACAGCATAG-TTTTAGTTGTAATTTATTT--CAACAAGCCCCCCTTTT------------------------------------GGAATCTGAGTTTTCTTTTGGAA---GACGCATGCACAGTATTTTTTGTACTTTA---TTTTAATCGTTTTTTTTTTTTCTATATATATAT-----------ACATACGAAACAATTAAGGAA
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TGAGATT--TAGGTACTTGGACTACCCTAAGACACTTGTATTATGTTCTGGAATTTGGTTTG---TTTTAAATATATGTATAATCTATATATATTTATATA
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CGTACTCCTGAGCGAACTTGTTAGATAA
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TAGTATTCATAGTAGTGTAGTGATAGATTTAACTTTTAACTCTAATGTTCGTAAGAAATAGACGCTATATTTGCCCTCG
TATTAGTTATATCTTCTTCTTAATAAAAATA-----CAGCCAATATGTTAATTAAGACAATTCGTAATCTTAAATCTTT
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TTATAGAAAAAACATTTAATATGTAGAGTACTATGTACAATATAT---TAACAATTTACAAGCTAAAATACAACAA
TTACAAAAACATGTTTGAGTATATTACG-ACTTCATAATAAACATATGCAACAAATTACAAACTAGAATACAACAA
>CG5288 8957089 8957233|9345 chr3L 8957178 8959598 scaffold_0 8036575 8038803 + 55355|0 55
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----------------TTAATCACAATTTTATAACCTGTATATAATATTAGTAAAT
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-TGTGTTATCCTGTTTTTAAAGTTTCATG-ATTTCATGATTG--AGACGACGAGTAAACCAAATAAAT-------------AAATTCCAAGATTCATTTGAA--------------------TTTAATGGGAATTTATGGTAACACTCGATTAATAAA-------TAGC--TTTATTCAACTTA
TTAAAATATAATGTGTTAAATGTTTAACGTATAGAAATAGTGTTATACGACGAATAAATTGGAAAAACCGTTGAGCAACCGAACTTCTTGCGTATACTTAAAACAATTGCATACTCTTATGCGCTAACAGAAATTTA------CATTCGTCTAATATAATCATTTTAGCGTTTTATTAAACTTA
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AGATTTGTTTGTT----------TACAACAACCGCAACACTGTAAATCGCAG-----ATGCTTT-----TATTTAATAATAAAAACCTATTGTACGGCCAGTTGGGATAC
AAATTGGTTTTTTATTAAACAATTACAAGAAAAACAATACACACAAACACAACAAAAATGTTCTGTTAATATTTAAAAATTGCAAAGAAATGTATATTATATATATATAT
>smg 8964490 8965442|9350 chr3L 8964625 8965817 scaffold_0 8043678 8045077 + 15772|0 975
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GCTCTAATTCAGACGTCGACGACGAAATTGCATACAATATATATATATATATATAACAATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATGCATGCATATGTTAATAAATGATATAATATAAACTCTGCATCGTGACCATGAGACTGACTAAGATTACTATATTCGCAACTATAAGAACTAGAA------AAGCTGGAAAAATAAAACAT------GTTTGAAGCTACAAACGATA-CACACAACA---CACGCGAATCAAAAACGTTGCTTGCTGAA---------AGTCACATAATGAACTATATATATATATATATAAATATATATATATACACATAATTTATTTTAAATTTAAAGGAACGTAATTGCTGAA-------------AACAAAACTTTAAACTGTAATTGTAAACACTTAAAGAAATTGTCTTATATTTGAGTTGTAATGAAATGCAGAGATGAGGTTTAGGAGCATAAAGCTAACGCAACACATATTGTATTTTGTATAAGTAGTAAGAATATAAGCCAAAAAAAAAAAACAACAACAAAAAAATCAAAAACTCCCATGCATGTTAT--CAGACATTGT-ACCACATATATATATTTACAGATATATATTTTATATGTTTTGTTTCGCTTTTAGGCTTATTCAATTGTTTGTAATCATGTGCTGTATATGATAATGATGGCAATCGAT----TATGTTGT--TTATTGTTTTGAGAATTGCTATATATAAACATATATATACATATATATGTCAAATATCGAACGCGATTGCTTTGTAACTAAGCTTAAGCTAAAATATAAA-CGAGAGTGGACCGCTGTAGGCCACAGACAATTATAAGAAAATTTAAACAAATTGTTAGCTTAAATAAATATTTTGTGTGTACAAATTGAACGAAATGCATAAAAATTGCAAAAATGTATATACATACATAT
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A---GAGTTGCATATCAGTTAAGTCA-CGTTGAAGTTTATATACTTAGTATGTTC------TCACTTTAGAGGCATTAATAAAATTCTGGTTTCAGACAGTTCTGAAATAATTAAAGACTTTGCAAAAGGTCTCCGATTAAAAAAAA
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AGATATTAAAGTTTTAAAACGGGGTATACCTATAGTTTAATTGTCTATAGATTAAGTTCTCTAAATCATTTATACATATATACTCATAGTACTCATTTTGATA-TTATACAGATTCTAGCCTGATTAGTACCTAAGTTCAGCTTAACGTTAAGCCATTAAAGTTAGCTTAAAATATAAGAGAATCAA
TTGCCACAGATACTCAAGAC-----------------------TCTGCAG----------CTAATGCCTTTG-------------ATATTAAAGATTGTAATATTTAAGCTGAATTTCGCCTGATTAATAAATAAGCTAGCATTAAGTTTGCGTAAATAAACGT--------CTATATGAATATAAA
>Argk 9022809 9023222|9418 chr3L 9022675 9022933 scaffold_9 3411044 3411306 + 11152|136 271
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--AGCACAAATCAACCAAAAATCGAATAAAGCAACGTCATGCAACAGCAACATCAACAACAACAACAACAACAACAACAAAACACGACTCACAATATAATACAACATGACACGTGATCAAATCGAGCGCATAGAAATT--TGTAGCGTTTAGTAAACTT--TTATGTAGGCAACTAAAAAA---AAAAAACAAAAAAGAGCAAAAGAAAACCCTAAAAGGAAAAGCGATCAATTAACTTTTTCTGTTAAGTTAAATAAAACGATTTTTGATAGATAATAATACAACAACCGTAAACAATTATAAAATTGGCAAGCCTTTATA---CAACTTACAATTTTCTTTCGTATGTTAAACTATGTTAACTTAAAATTAAATTTTGTTCGGCCACACAGCAA-----ATATGAATGCAAGAAACGGCATAAAAGACTTGAGCACTTCAAATGCAAATGAAAAATGTAAACGAATTGTAAACAAAAATCCAACAAAAATAACAGGCAGTTTGTTGTAAAAAAAAAAAAACAAGTAGAGCAACAACAAACAGCGACAAAAATAAGATAGGTAGAGAGAGAGAGCGAGGGAATGAGGGAAGATAAACATCATTTTATAAGCAACAACAACTGTGATTTAAACA--------------AAATGCAAGC--------AAGCAAAAGA-AAAGCCAGTTACCGCAGCGGCAGCAACAACAACAACAACAACCAATTGTTAAGCAAATTGTCTAGTTAGCTAAGTAAAATATTAAAAACATTTAAGAAAAACAACAAACAAAAAAAAACGTGTTAAAAAATGATTGTAAACCAAGCAAACACACACAAAAAACAAAGACCAATGTCAAATTGTTAGCTCAA------TCAATTGGCGAAAAAAAAACCCAAAAAAAAAAATTGTTAACTTTTGTAAGA-TGAGAATATGTAATGTAAAGTTGGCGCTCAATTGTGATAGAACAACAACAAACA----CAACAAATGTAACAACAACAGCCAACAGATCGCACACAATCCGATCCGATGGTCGTTTTCGTTCGCCAAGCGCCGCCATTTGTGTAGTTTTCCAAAAGTGATATTAGCAGCTTATGTAAAGCAACAATTAA-CAAATGCATATTGTAAACAACACACGTCTCT
>bol 9075573 9076632|9462 chr3L 9075535 9075712 scaffold_9 3466440 3466601 + 1466|39 179
CAAAATTTGTTCTAGTTTTCTGTGTGTAAAATGAATTGATTCCAAATTATTATTGAAGTGTTAATGTTCCGATTTAGATTCGCTTGTAGAATGTCTCATTCCTTAATGAAAATAAAATTAAGCCC-AAAACAAAAACGAAA
CAAAATTCGTT----GCTCCTTTGTGTATAGTGTGTATATATAGAAGTTTTTTCTAAATTTCGAAGTTA------------GCCCAAACAATTACCAATT--GTCAAGCAAATAAATGAGAGCCCGAAAACGAACTATTGA
>bol 9075573 9076632|9463 chr3L 9075968 9076064 scaffold_9 3467030 3467145 + 1557|0 115
ACAACGTCGTTTCCCATCACATTTTACCCACTCAG--------CCAGCTAAAAAAC---CCCGAACATAACCGAAG--------CGTTGCCGAATCATATCCAAACTTCTTCAAAA
ATAACATTATACCCCGAAAAATGCCCCCCACCCAATCCCTACCCCAACTAGAGAATAGGCCAAGAGAGAGAGAGAGAGATCAGTCGAGACCAAAGCATATCCAAACTTCTTCAGGA
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AATAAAATCATAC-----------CAACAACTA----AACTGCAACAACAACAACAAC------------------------------------------------------AACTGCAACGACAACTACAAACTACAACAAT-----------CTGCGACAACAACAACAACTACAACAATACCACGCTATATGCTATATATGTATGCCCCTCAACTCTGATCGAACTGCAGCA-------------------------------------------------------------------GCAGCCGCAC-----TCTTAGTTTATAATTTTAGTTGATTACGATTATGTTAATATGCCTATGGTTTAATTTAATTTATGCTAAGTTCGGAGCTTTAGTTTTTGGCCACACACACACTAAAAAATATGTATGTACATGTAATGTAA---------ATTAGTTGAATGCCAT-------------------AGCGAGGGAA--------------------------------AAACTAAAATTTATATTATTTAATCTTCGATTTCTTTTG---------------------ATTGGACTCATTTTATTTTCGGTTTTGCTTGCTGTAAATAGCAGAG-AATGAATGTAAATA-GTAGTAGTTGGCACAATCACTTTGCTTATATATATATATATATATATAGTATATAACAAATACCGATATAATACGTCATATAAATTACGAGACATATGTATGAAGTTT
AATAAAACCAAACTACAACAACAACAACAACCATAACAACTACAACAACCAGAACAACTAGAACAACAAATTTTCGTAGTCGCAAAGATTTTTCGTTGAGAGCTGCCCGAGCAACAACAACAACAACAACAAGCAGCAACAGCAGCAGCAGATGCAGCAGCAACAACTACAACTACAACTACAACA-ACTACAACTTAAATAACTAC------------------AACTACAACAACAACAACAACAATAACAGCCACTAGAACAACGCTGCAAATCCCCGCATCGCTCTCTGCAGTTGCCCGCAGCCGCACAAAATACAACATACATAAATTTAGTT--TTAATTTTAATTTAGCATATTTTTAATTTAACT-----------------------------------CTCACACACACACACACACACACACACAC-TGCGCTCTAGGCGTCAATTATTAGTTAAATGCCACGCCCCCCTCCCCTCGCTACAGCTAGGGGGCGCCCTAGGAGAATTAGTCAAAAAAAAAAGGCAAGCAAAAATTTA----ATTTTATATTTTTTTTTTTTTGTATTAGAAACTGCGCCATTTAATTCAATTAATTCTTCTTTTTGTTGTGATGCCTGCGCATAATATTGTAGCTAACGTATACATGTAGTTGTGAGCACACACAC-------ACACACACACACACACAC-------------------------ACGCGCCACACACA----GATGAATATGTTTTGAAATG
>bol 9080495 9081097|9466 chr3L 9081024 9081122 scaffold_8 2569364 2569459 + 2348|0 73
ATCCGAAAAAAAGAAAAACATAAAGTAAACAAATTTTCGTAGTCGCCAATTTTTCGTTGAGAGCTGCCCTGAAT
ACCCAAAAAAAAAAAAAACAAAACAAAAATACATAAAAGTAATTTGCATTTTAGCGTCAAAGGCAGCGCTGCAT
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GGCCACGCCCC---------CAAGGAGGCGACGGCA------------ACAAGTGACAACAGCGCACAAGAGAGTTAAACTGTGCAAGGCGCTGAAAAACAACAAAAAAAAATAAAAACAACAAAAAATT----AAAGCAAAAC------AAAAAAAACAGATGATTAACCA--------------------AAAACTAATTTTAACTAGCGATATGGAAAAATGCAAAAGGCAACATA--TTATTGTTAAATACTAAAAATAAAAATTTAAATAATAACAAAAAAAATAAAGACACACATATTAC--GGACGAGAGTAAAGAATATTGTTAAATAGATTTACGCAAA--ATAAAAAAAAATTTAAAAAAAA
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GTACGAAATGAAATTAA-AAATTGTCTTGACACGCACCTTA
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GCGCCTTTGG-----GCGGGCATTTTGATAGTCCCCCGTTGTTGTTCTTTTTTTTTTTGCAGACAATGCAGCGTCATTAATTGCTAGAAGAACTTACCCGGCGTTGCTCGTATTATTTGAATATTTATGATTTTTCATGCTGTCCTATCAGCAGCAGCATCTGCAACTG-ATGTAATATGTACTTACGTACATCAAGCATGCCATGCGTACAACCATTGTTCGTGT-TTCAATGCGTATTAAAATTTTGTTGCCCACTTTCAGGCATT
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AATAATTCATATGTGATATGCCAGAATCTGTCGTTATCTCTGTAGCGTAATTAACTAAG-TTTATGTAGTAGCCATGTTCA------AAGTTCCAAATTACGAGTTTCATTTAGCCAATTGTTGTAAGCACAAAGTGTA----------ATCTAGTGAAGCCGCATCATATATAATTGTACATAGTTAAGTTTGAAGAACAAGAAATTTACATAA---TTGGCAATGTGCTTTCAAAATTAAT-TTAAATATCGCAAAGCTGTTAAAAATTTAATAAAGGCATATTTATATCTAAAGAAA------AAGTTGTTATTTATCGAGATATGCGCAGCAAACGTAAAGTATTTATAA--------ATTAA--TTTAAAATAATA----TTTGGTTGACCACACGGAATGAATACCCTGCTCTATGGCACTGG-CAAATGCGAGGGCGTTTG--TACAGTTTTTTTTTTCTATTTCAGTTCATCTCTCAGTTGATAATCCTCTGCCAGTTTGCCCATTTTGATGCCCTGAGCCAGCAGTTCTTGAGCGACTTTCCTTTGAGTTGTACTGGGCTCGGACATGCCCAAAAAGCCCACAATGAGTCCATCGAATGGCGGCTCATCTGTGGAGGCCGACTCGCAGCTGGCGTCCCAGCCTCTGGCCACATAAACGCTGCCATCGCCGCCCACCACAAAGTTGTAGTTGATGTCCTGTTTGTCGAAACTTTCAATGTGCAGGGTTTGCAGGTAGCGCATTCTAAAAGTGCACGATGCTTGCGTGTCGCAGGACTCTGTTGAGGTGCTCACAAAGCGTACGTTTTTGGCAGGCAGCGTCCAGGGGGGCAGCGCTTCCAAAGCTGGCTGAGCTAGCCAAGCAGCACGTGCAACAAACCTAAGCGGCGCGTTGTTGAGTCTGCGTACTGAAACAAATCGTTGGCTTT
>Klp67A 9336578 9336874|9767 chr3L 9336064 9341024 scaffold_8 1618541 1623194 - 129345|516 818
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>Fdxh 9344146 9344297|9772 chr3L 9343432 9345119 scaffold_8 1625445 1627185 - 53324|749 904
CATTATTGTTATATCCCGC-ATTATTAATAA-TATATAACGACTGTTGAATTACCATTTGGTTCTTTCCCAACTTT-GTATATTTCTTAAG-ATGTAAACAATGCTTCGGTTTTGTGTTGTTCCATCGTGAATTAAACTAAAGAAGAATTCGTTAA
CA-CAGCGTTGTTTATTGCTATTATTCCCAGTTAAATAAAGATTATGTTTTAAGTGTTCG---TGTTCCCAACTTTCATATATTTCTTAAGTTTATAAACAATGCTTTCGTTTTGTG-TGTCATCTGGCAAATTAAACTAAAGAACATTTTATTAA
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AAGCTGCTAGCTGGCCGCCACACCCATTCCTGTTCCTGCTCATTCATCATCACATACCTATGTATTT-------ATTAGTTACCATAAATAGTATAACGAGCTAAAGACT--AATAATAAAATAATCTTAGTAAA---------CCAACTGAAACGGAACTCA
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AATGGAGTATCCTGCCCAACTGATCTGATGTGATCCACTATGATCTGCGCGCTCTTTCTCCCCCCAATAAGCTCTGCTCTCTCAAGTATTCACCGCTGGTC-----GACGGAGACCCCGAGATCCACATAGAAAGTAAAATC--GAAATACTA----------TTTTTTATACCGCACACCAAGGGGCTTCAAAAGCCATATCGTGGCCAGCGGCCCAACAATCCCTATGTTCTCCTCTT------------TATATAGCAAAGCCCATAAACAA-TTTGAGACTGCAATGATTAACACAAAACAC
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GCGGCTAATAACTGGCCGCTCCTTATTCGGTCCGATCCCACACTGATTATTTTGTCTTTCATTTATTTATCGTTATAAGCAACAGT----------AGCGATTAATCGTGACTATTGTCTAAGACCCGCGTAACGAAACCGAAACGGAACCCCCTTTGTTATCAAAAATCGGCATAATATA-AAATCTATCCGCTTTTTGTAGTCACTGTCAATAATGGATTAGACGGAAAAGTATATTAATAAAAACCTACATTAAAACCGGAT
GCTGCTCCTGTATG--------TTATTTAGTTTGGCTATATAGCAGCAG--TTGTCCCTCCCCCACTAGAGACCCCAACTAACCGTCCCTCTATAACGCAGTTGACTGCGCGTGTATTCCAAAA---ATGTCAAAAAAAAAAAAAAAAAC---------TAAAAAAAACAAGAAAAAAACGTAAAACTATAGATTGTATATGGTATATGTAAATGGTTTAATTAATTGGAGCTTTTATCA--AATTTCCTGCAAATAAAGCGTAA
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AAATGATAACAATGATAACAACAACAACAACAACAACAACA
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AGCCATGCAAGAGATATCAGCATATTTGCGAACAATAGTTGCTAATGTGTTTACATTTTTTGTACGTGT--CATAAACAGAAAATATGCATAACAATTAATATGAAATTAGCATTTAAGATATAATTATTAACAAACTAGAGAAAAACAC--AACGGTTCCTGTTTGCTTTAGTTC---ACTTTTGTTGTACGCTTTGTAGTTTTCTG--TTATGTTAATTAGTTCATTTGTTACAACCCACGCACTTGAAAG--------------------------CGCAGTTGAATGTTAACAGCAACA---TTAACAGTCTGTAGTTCAATGCAGTTAACAGCAGTGAAGCAAA----------------------------ATGAAAAAA------AAAAATAA---------GTATTAGCGAA--TAGAATA----TTAATGATATTCAACAACTGTGCGTATCTTCC-ATTGCAGCAAACGCGATTATTACGAACAGATATATAGCGAATATATGCTATA---ACTGGCCCACATACTCAATATACCAATTTGTCGAACCAAATTTCATGT---------ATTCTGTAATATTTAGTTAA---------------GCATTGCAATAATAGTCCA---------------AAATAAAGTAAA-----CTTTCGATTCTATTTATATATGCCAAGCA
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GCCCACTAAATCGGATCCGTTACACAAGACACACGAAAATACCTGACAAATTGTGATTACAACATATATAACTTATCATTTAA---CATTTAAC-----TACATACTTGTTGGTCGTAACTTATTTCGTTTTTTCTCGAGCAATAAAATCAATTG---AATTCAATGAATTCAGGTGTTT
GTCAGCTCGATCGGAACCGTTACACAA----------AATACCTGATAA-TTGTGATTACATT-TGTATAAATTTTTATTTTAACTCTTTTAACATTATTGCATTGTTTTTTGTCGTAATTTATTT--TCATTTGTCGTGCAATAAAATCAACAAGAAAATTTAATCAAT----------
>CG3967 9388785 9389233|9827 chr3L 9388983 9389416 scaffold_12 2616942 2617334 - 7749|0 254
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GTTTTAATCGGAAGGACAGTAGATGCTGCTG-------------GTGATCC-------------TTAAGTTCTACAAAGGCGCCTGTTTTTTTTGCTAAAT--ATCAAATG-GTTGCATCGACAA-----CACAATAAACATCGTGTGTGAAATGCAAAAATAGAAATTATTGCCTTGTTTATGGTGTGAA
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CAAACATACACATATATATATAGAGAAAGTGACACATACAGAGAGAGAGAGCGA
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AACTTAGG--TGGAAATTGATTTTACCAAAGGTAATGCAATGTACTTAAAGGTATTGTTGAGATTTCAAAAATAATTCACGAGCTGAAACTGAAACACGAATCAAAAACTGCCTTGAAAAAGAT-GTCGGATGCCGAGACT---TGGTACCAATATTTTAA---TTGGCAACTAACACAACAGTTTTTTGAAAGTGAAAAAGTTAAAATTTGTCGTTTAG-AGTTTACAACAAGACATATAATATTATACGACACGAT
>CG3891 9414003 9414639|9851 chr3L 9414244 9414418 scaffold_6 4320393 4320623 + 2442|0 230
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TAAGTATAAGATAAAAAAAATGGTTTTTCTGATAGAACTCATTTCTTAATAGTATTTTTAATAATAAATTGTTATGTTAACCTTAACAATAGTTGTTTAGATAGCATCGGAAGCAGCTGTTAAGATAACATTAACAGCGACTGTTAAGTTAATAACTGTTAAATATAGGACTTATTTGACTTGTGATATATTCGAGCTCCTATAAATCTTTAACTGAATAATCAAAATGTT
>CG3891 9414003 9414639|9852 chr3L 9414637 9415111 scaffold_9 2254853 2255327 - 25714|0 2
TCG
GCG
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TTTCCATTCCAGTGATTTGTTTTTTGTTTTCTTT-------AATAAATTAACTTTTTAAGGTATACGTGTACATGTATAAATAAACAACAAATAGACTTTATAACATAATATACATTACAATTACAATCAATGTGTGTGTGTGTATGCGTGTGTGTGTGTTATCTGCTTAGCTTAAAATTAGAGCAAATTTTGGAATAAGTTACAATTGTCGTTGCAGTTGTTATTTTGGAATTTCTCGTGAACAGAATGATTAAGAAACGAAAGCCAATTAATAAAAAAAATAGTTAAAAGCATTTTACATAA-
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>phol 9426977 9427476|9863 chr3L 9427157 9427645 scaffold_12 2833910 2834405 + 6786|0 350
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CAAGCGTTGCCGATGGCTGTTGTGATCTGAATCTGAAACGAGCGCATTGAAG---AGAAGCATCTTCTGT--------------CTGTACAGTTAGTCGTAAGAGCCGTAGTTATCTAAGCGGGCGTTGGCGCAGAAAGTGTCCAGGGTGGAGCACATGG---TGCTGGCTGCCCTGTGCTCAACTGTTGCCGCTGCTGCTCCTGGCTGCTACTGCTGC-TGCTGAGCCCACAACAAATTAGCTGCTAAGTTTTAATGGTAATGCGATTTATAGGTTTGAAATTGAATTGATTGGAATGCCCGGCACGATGGTCAACAAAGTTGTAGAACTTAGTTTTTCTATACCTTAAG
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ATCTCTAATAGCAGTA--TGTAAATTTAATTACAGAAATGTATACAAATTAGCATAATATAGTTT
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CTCGCGTCCAATGCGGTAAAATTGGTTGAATCCGAAATAAAATCGTACTTATGA
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ATAAAGTACATTGTGCATCTTGTAATATTTCGAGTTAAGATTTATTGTTGCACTTGTTATTTAAATATTGTATTACAATTTTACAACTATATAAATACATAGAACATCTAAGT
>CG3428 9460395 9460569|9892 chr3L 9460569 9461682 scaffold_12 2873771 2874969 + 31063|0 0
C
T
>CG32037 9463745 9464109|9894 chr3L 9463720 9464101 scaffold_12 611612 611962 + -2527|33 398
CCCAACATGTAGTAGAATTTATGAATATGACAGCTATGAGATCTATCTCCAGTTAAGAGTTAAGTTTAC---AAGTGGTTCGCATCCATTATCTAACCATGTGCATATCATTTCAAAACCTTTGCCATACGCCCGCTCACCGTTTAGTGCACATCCATTCCCATTCCCATGTTTGCAAGCCATTC-GTATCCAGCCCATGCACCGTGAAAAAATGTGGTCACAATTGAGGTAAAACTAATGTTAAAACCAATACACAACACATTTTCAAAACATTGAAAATATACTTCTTATTTGGTTATTAAAGCGTGAAGTGATATGCAACCGTTTT-----GTTTTCTATTGAATAAAATAAAATATTAAATT
CTTAACGCCTGGCTGCACTTGCATACACAACATTTATG-----TGCCTCTTGTGCAGCGCCCAATTTTCTGGAACTGGCACCCA-CCGTGGGCAAGAGTCATGCATCC--------AGCCCATCCAAGGCGCAGTCTTATCAA--AATGTGAATCTACTGCATGGCCAAGCGCTGCCCGCCTTCAAGAAAACCGCCGGTGGAAGCAAGACCTATGTGG--ATAGCTATGGCAAAACTCATGTAAGCGCAACCATTCGAC------------CATCATAAGCCGATCATTTAT--GGGTATT----------------TTCAACTCTTTGTTGCAGCTCTTTAGCGAATTTGACGATTTGCTTAACA
>CG32037 9463745 9464109|9895 chr3L 9464102 9464764 scaffold_12 611599 612239 + 30041|0 7
TTTTAATA
TTTCACTA
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AGCACACTAC----CGAGCACCATTATG------------------------------------------------CCGTTTTAGCACGTTTTAGTACACTCGCGA------TTATATA-ATGTAGAGAGTAAGCTAGTTGATAGCCGTTCAGAAACACTTTTAGAACAGT--------------TCTGAACGATTCAAGCGGCATTCAAACTGGAACT--TTACTAAGTGCACTTTAATA------------GTTTCCTATTGATTTCCTATTAATACCATTTAGTATGGATCTGTAAGAGGCTTAGTTACGTACCATCCTCCAAAAATCCCCACCCTTTCCTCTCTGTTCTAAAATAGTATTACTCCTAAAGCAAAAAAAAAAAACCAAAACTAATGTTAT------CATGCCTTTCCCAC------TTTTACTTTGTTCCGTGGCAAATTCGCGTGATTTG---------------------CGTACATTATTTAA---------CATTTTAGCATGTTTAGTAAGTAAGCGT-------------------------AAGAATTAGGATTGTAAAGCCTATTTTGCAATCGATCAGTTCCAAATATGTTGAGCTAAAT-TACTCAGAGAATACATTTTTTTATACGAAATCTAGCCGAGTAATAAGTTACATT---GAATTGCCCCGATATTCACTATGTGTAA---ACATACTTATTTTGTTGCATACATATTTTTGTATTTTAATTATAG---------------CTATTAAAGAGAAATACTTAGCGAAACTAT--CAAGTA----------AATAAAAC--------AAGAAACACAAGTTGAAACATTTTA--------TTTTGCATTTAAAAGTCTGTGC------AGACAACGAAGCAGATTTACTTGTAAAATGATGAAAAGTT-----------------------------------------------------CGAGCCGCAGAATTATCTGTCATCTGTA-TGTAAATATGTATATTGATATATGAACGCAACGAGTACTAAGTATATCTGCCCAGAAAAGTATTTAGAG-------TTGTCCATATTACATAT---TCAGAAGAACAAAGATTGATATGAATGTTTACTTTTTTGAAAAATGTTTAAAGTGTAAACCAAGCAAAGATATAAAATATATACACCGAAATAAAAAGATATAAGAGAATGTCAACTGAATAAATGCATTAATATTTTACTG
AGCGCATTACTAAACTAGTACCCTTAGGTTAACTATATTCGAGTGCCTATCCAAGTAGCACACAGCACCAAACTGTCCGTTTTTGCACGTTTTAGTACACATGCAAATGCAGTTATATATATATATATAA-ATATTTGTTGAGTACATTTTAGTACCGAATCTA-AACAGTTAACTAGCTTAAACTCTGCTACTTTAAACCAATATCGAAGTTGGAAATGATTCTGAAACACACACACACACACACACACCCTCATACATTTTATTTTGATGTTAGTACATATTAGTATCAAGGTAAAATAGACTT--------------TTAGAGCACTTTCTTTTCTCCCCTCTCTGTTCTAAAAGAGTATTACGAAAAAAACCAAAATTGCAATCATTTATTATTTTTGTTTGTTGCAAGCACTTGCAACATATTTTTTTAGCATGTTTAGTTTATAAGCAACATGATTTGGTTCTAGGTTCCTAAAAGCTTTGCAAGCCATTCAAAAAAGTTTTTATTTTTGTATATACATTTTGCAGGCTTTTCGGAGCCCAGCCCAAAAAAAAAAAAAAAAACAAATTAAATAGCCAAATTGGCAATGAGTTA-CTCAAATTATATTTTTTTATACATACTTATGTAGTATAATTTTCTAAAAAAGAAAAAGAGAAAAAAACTGGAAAATTAGAGAATTATTCAATTATGCGATATTCTTAATGCACACTACATTTTTGTTGCTTA---ACATTTGTATTTTTAATATAGAAAATTAAATAAAAACTATTGAATATTAAAAACTCATACAACTACAACAAATATTAAAATAATAACAAAACAGCACCAAAAGACACCGAATAAGAATCAAATTAAAAACAGTTTTTGCATTTAAACCTTTGTGCACTGAAAAACAACGAAGCTGATTTAACTGTAAA---GCAAAAAGTTAACTTTTATATTAGGTCTTTAAAGACGGTAGATCAGTCAATTGTTCAGCTAGACGAGATCGAGAATTATATAGTTTATATGCTATATATATATGCAAAGCTGTTGGAAATAATCTAGTTCTTTATAT--------TGAAAACTATTTGGAATTGAAACTTGTCCATATTACGTATTGATGAAAAGAGCTAAGATTGATATAATTGTTTAC-TTTTTGAAAAGTGTTTAAATTTCAAACAAAACAAGCCCGGAAAATG-----ATCATAATAAAAATGTAACATAAAATAAACACTTGTTAAAT---TTTAGGCTTATGCA
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CTTTCTAGATAAAATCTAACTATTGTTAGATATAAAACTGCGCCCACATTTTGTACATTTT
TTTCCTAGATA---TCTAACTATTGTTAGATGTAAAACTGCGCCCACACTTTGTATATTTT
>path 9468481 9469624|9901 chr3L 9469596 9469673 scaffold_12 616946 617047 + 592|0 55
ATACTTCACCATT---------------------------TAGGAGAGAGGCTCCG
ATGGTTTCCTTTTGGCTTATCCAAACATATATATGGGAACTTGGACATAATCTCCG
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CATACATATGTACCAG--------AGTCATAAT---ATCTATGCAAGTGCAAGTGCAAGTGCATTATGTAAGAATTTCTTGTGCAATTTATATTTTCTTTGGAAACGCAGCTCATGTAATAGTCTGAGAGTTGTTCGAATTTATGATTTTATGCTGACAGATTTGAAATCTAATGTATAATGTTGGTTTTTCTTTGATTTGAATGAATGAATGCCGGTTTTCGTTTCACTCTGTAAATG--------GAAACAAAAGTGGTTTCATATAATTT---TGAATACATAACAATTTTA----AATTATATA-TTGTACGAAACATATAACAAATGTATACA----AAAAGATTT
>CG3408 9480759 9481525|9910 chr3L 9481113 9482644 scaffold_12 628692 630161 + 50876|0 428
CGGTTCATTTATTTGAAGCCTTAGAGCGCTGGGCTTCAAATGGAATAAATCGCTAAAAAAA-------AATCTCGGATGCATTGCGCGTGTGTGGAGGCAAAATTCAAAATGAGATACGTGTTGACCACCTGAACGAGTTATACGACTGCTACTTTGATATACCATTATCTGTAATTTACTGCCATTTATTTTGATAGACACTAAGCCCACTACGTCCA-TTGAAGGGAGATTTTAAAATAAAAAAAAAACACACGTACTC-----CGCAACTTAAGAGGC-CACTTTAAAGACACCG--AACTACACTCAATCACTCAGCTCAATCGAACTCAGATGAATCTACAGCTAACCTAACCATAGCTCAAGCTCAACTCCATAGTAACTGAATGGCAGTTCCAAACTAGCCAAAGCATAGAAACTACAGACA
CGATTCATTTATTTGAAGCCATAAAGCGCGGGGCTTCAAATAGAACAA-----TAACAATAATCATTTAATATCGGATGCATAGCGCGTGTGTGGAAGCGATTGAAAAATTTTAACAAGTGTAGACCACCCCAACAAATTAGAAGAGTGCGATTTTGAAACA-------ATCCAATGTACTGCCATATATGT-----ATCATTAAGTATA-TACGTCCAGTTGGCAAGAAATTTTTACCTCACACAAACACACTCACACACACACACACAGCATCAGAACTATAATATAAATGCAATGTAAACTACTCTCAGTCA---ATCTCATTTGAA-----------------CTAACTTTA-CATAGATCAA-CACAAACTCATAGT-ACTGAACA-------CAGTCAAACTGCAACACTAGAACTCAACACA
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TGTGCGCAAGCAGGTGGTCAACATCCCATCGTTCGTGGTGCGCCTGGATTCGCAGAAGCACATTGACTTCTCTCTGAAGTCGCCCTTCGGTGGTGGCCGTCCCGGTCGCGTTAAGAGGAAGAACCTGAAGAAGAACCAGGGTGGTGGCGGTGCTGCTGCCGAGGAAGAGGAGGACTAAGCTGCAGTGA--AGCTGCTGTTAA------------ACGCAGTTATTTTATAATGAAAGAATTTGAAATATTTACA-AATTAAATGTAAAGTTCTTTTTAACAAAAAAAAATTGCCT
>RpS9 9484229 9484407|9911 chr3L 9482919 9484779 scaffold_12 630166 632090 + 41436|1498 1691
ATATCGCTTGGACAGGCGACAACATCGTCGCCAGGCTCTCTCAGATATAAACTCTGT--------TCTGTTCAGTAAGACCACTTGGGAGTCGAACAGGCGCCAAT--GCTTGTACCGACTCTCAACGTCTGTAGATTGCGCATGTGACTCC-----GTTCACACCAATCGAAAATGCAAAATGCCCGCCTAGC
TTATCTCTTGGACAGCGGCGGAAATCGTCGCCAGGCATCAAAAGCCAATAGCTTAATAAAAAATAAATGTTCAGTAAGACCACTTGGGAGTCGAACAAGCCGACATGAGCTTGCACCGGCTCTCAACGTCTTTTGGTCATGTAGTTGAGCCCCAGTTGTTCACTCAGACC-ATATTGCAAAGCTC---CATAGC
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AAGGTGTTCTATGAACTGCATTCAAAATAAACCAATTGATCATCTCGCATTTAAAGCAAACATTTA
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GAGAAACCCTACATATGGTTAAGATTAGTGCAGGATTAAGCTCATTTTGATATGTAATCAAACTAGTTTTTAGTATTTAAGCAGCATTATAGGGCACTATCATTCAGTTGAGTGTTGAACAAGCATTATTGTGTATGAACAAATGTGTTTTTAAGTACGATATAATTACATAGCATATACATACATAACAATCATCGCA----A
>CG6767 9657523 9658312|10044 chr3L 9657502 9657983 scaffold_12 792389 792839 + 11628|21 516
TCCTTTTGTATAGTAAGTTCTTTGTTTAAACAAACTT----TTTGCCGTTTTCTGATTTTACAAGTTAACACGAACGATAAATTCCCAGTTGATTGGTGTAAACATTGGCCTGCTCTTAGAGAGAAATTTAGATTTGTAGATTAACACCGTAGAAGATATACACTCAAA---ACACACACACTCACACAAACACACCCACATGTACACCCACACACACAACAACA---AAAAATTGTAATTTTACACTGTGCAAC---AACTTTTTG-ATGATTCTTTATTGTAAGCTCATAAAGAAAAAAAAAACGC-AAAATACTTGCAAGTTCAAAAC------AAAATCTAGTAAAATTAAGTAAA-------ACAAAAAAA-------TACAATTGAAAAGAACATAGCAAATAGGCGTTAAAAAATAATAAACAACCAAACAAACAACAAAAATAAAACTAAAGAAAAAAATACAAAAAAAAATATTACAGAAAACTAAT
TTTTTTTTTAAAATTTTTTTTTTGTTAAAAAAAATTTGAAATTTCCCCCTTT----TTTTAAAAGGT---------------TTTTTAGGTTTTTGG----------------------GGGGAAAAGTTAGTTGTATAGATTA-TGTAGTAAAAGATACACACCTACACACACGTTCACACACACACACACATGCACACACACACACATGCACACACAACCACATACAAGAATTGTAATTTTACACTGTGCAACAAAAACTTTTTGAATGTTTCCTTAACATAAGTTT-------------TGATGCGAAAATGCTTGCAAGTTCAAAACAAATAAAAATTTTAGTAAATTTAAGTAAATAAGTATACAAAAAAAAAACAACCACAATTGAAAAGAAATT------TAGGCGTTTAAAGTAAACAAA-AAACAAAAAAACAACAACAACAAAACAAAAATAAAAAAAATTTAAAAAGAGACTCTGAA----TAAT
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AAATTCGTATT-ATATGTGTGAAGTCATTAACTTATTGGATTCGCCAGCAAGCATCGTAGACCAAATATTTAGTGACAGATTATTAGTCAAATATTT-----AGTGCAAACCATAAATATTCACATTGAA-ATGTAGAAAAATTAAATGAATATGTAGAAGAATATATA----TATAAA---TGATTATATCTGGA----TG
ACGCTGGAATCGATTAGCAATAATATAGGACAATATTGG------CATTAGACAATGTAGA-CACATGTTTGG---------ATTAGCCAACGAGTTTTAACACTGTGCAACAAAACCATCAAAATTACGTATGTGTGAAGATTTAACAGAAATGCATAAAAAAAAATAATAGTATAGAAATTGATTAGAAGTTAATTCCTG
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ATTGGCCCTTGGCCCATGGCGACGACGACTCAT--CGCTGAAGAGATCG-------ACGGCTGGGAGCACAAAGAAACCGCACCGGGCACACACTTCCACACAGAGATACATAGCTGAA--AACATTCGCACGCGCGCATTTCAAATGCCTTCGAAA----------------------------------GGAACTCTTACT--TTAAGCGTGGTTCTAACTAAATGTTAAACAGAAAAAATATTACATAATGTTGTTTGTAAGTGAAAAGTTGCGTATTTATACAGA-----AATTAACTTTTATATGCCTA-------------------TTATACACTGAACTTGAGATGCAAATATAACTATATTTATACAGAACCACT
----------GGACGACGACGACGATGACTTCTTCCCCCGGAGGGCTGGGCGCAACACGGCTGGGAGCACAACAA----GCAC---ACGTACACGTACACACACTATTTTTTAGCTGAAACAACATTCGCACGCGCGCATTTTAAATGCTTTAAAAAAACAAATGAAACTAAATGAAAACGAAAACTAAACAAAACTCTTTTTAATTAGATGTGGTTTGAACTAAACTATAAACTTAA-------TCAATAATCTTGTTTGTAAGCGAAGAGTTGCGTATTTATACAAAATAATAATTAACATTTATATATATACATATATATATATATCTATCTATACACCGAAATTAAAATATATACATA--TATATTTATACAAAAATGCG
>nbs 9694359 9694431|10079 chr3L 9692940 9700633 scaffold_12 2371558 2379425 + 238029|1478 1554
TGTCGTGCC----TAAACGTAATTAACCGTCGCTTGTGAAGTTACTTTATTTTGCTAACAATAAACTTGCGAAATAT
GTCAGCATCAATATACATGTAATT-----TCTCTTG--------CTATATTTTGCTATCAATATATTTGCGAAACAC
>CG6749 9705185 9705354|10080 chr3L 9701085 9706406 scaffold_12 2379696 2384748 + 170377|4350 4519
TTGCTACCATTTAATCAAAACTATTTACGTAGACTAAATAAAACCGTGCCAAACTGGGAAAACCCTAAAAGATACCACTCTGTGTGCCCTGGGATTTGCTAGCAAATTGGTCCACAAACAACGATCTTAAATTTAAATACGAAAACTTTAAATATAACACAAAATTGCAC
TAA-----ATGTGATCGA----------------TGAATAAGTGTGTGATGAAT---------------AAATGC------------------ATTT--TTGAAGATTGATCGTTGATGATGGATGTTGTGGGGCAAGGCAAAAAC------------------------
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GCCCGAATATACCAGTTATACCACGCACTTTCCGATGCTCCACTTGCA------CGATTCCACGCTGGCAGCCACCACGATAATCCGTCATCA-TCAGAGCA----------------------------------ACCATGAGCAGCAACAGCCGGAGAAATC----------------------------------------CTGTCCAGCTCTCAGCCAAACCCGCCGGCACACCATTATTTCCACCACGCTGACCAACTACAATCAGCAGCTGGCGGCCGCATTTCCCGATGCTACGCGACGCTCCTCCATCGGTTGGGAT---------ACCACTCCGACCACGCCCACCCCGCATGGCAACGCCTCCAAGCCGGTAAGGATTACGCTAATCGGCGAGGCACAGCCGCTGCAGAGCAAGTCATCAACCGGATCGCTATGCTCGTCATCATCATCGTCGTCGTCATCCTCCTCATCATCAACATCCTTGTTGGCACAAAATGCC-------------AATGTGGTCAAGATGCGATATACCAATGGCTGTCAGAGTGTTAAGAACGG------------ATCGAGTGCCCATTATCAGCCGTTGTACAACAGCAACAAGATGACAAGCCCAACCGTAACTATAGTCTGATTTGGATACCAGTTTTCAGTTCTTCAGTTATCGAACCACAACTAATTTGTCTTCTGACTGGCGCTCCCACATGG-AAACGCAGAATTCATAATTGTGAAAATAGACCTAGTACAAGATCTTAATTTTTTGTAAGCGCCAATATATTGTATTTGCATCTTAGCCAAGAGAAAAGTCCTGGAAAAGCAGTTTAGTAAAATATTTTCGTATTAGGCATACGTACTTTAAAATATCTCCATATA-TGTATATGTATGTGTATGTCCATTGCTTCAATATAATGTTAAACTTAAATTTAATCGTCT-------TTCTGCTGGCTTAGTTTTGGCTTCCAAATGAAACTTTGTTAGCCAGATTAAAACATACA-TATATTTAATAACCGCCAATCTGAGCATTTTCAAGAG-----------------CCTCCAAACGGAATAAT--ACCCATTAGCACAAGGGCTATATACTCTTT----------GCATATATGTATAATCTAAAGTTAGATC------------CTAGTTAATTTTCCAT--TGTTACTTGTTTT---TGCCTAAGTTTTAGTCTAAGC--TAGTGAGTTTTTCTTGTTTCAATATTCCCATAATTTGT-----------ACAATATGTCTAATCTCGCTAAAGAGGAGAAAAATTGATA-------AGAGCTAAATTG----AATATATTTTCTCCAAGAGCACAATAATCGTCAAGTAATTAACCGA---------TATTATATAAC----GCATACTGTATGTAAACCACT-ATTAAAGTTAT-----AGAAAGTACCTATCAATAGA-----------------------GAAA-----------GATAAACTAGC------------
GCCCGAATATACCAGTTATACCACGCACTTTCCGACGCTCCACTTGCAATGCAACGACTCCACGCTGGCGGCCACCACGATAATCCGCCATCAGCCACAGCAGCAGTTGCCATGCAATGGCCACGGCAGCAATCACACCAGTCGCAGCAGCAATCACAGTAATCACAGCAGCAACAACAGCAACAACAACAACAACAACAGCAATTGCCGCTCTCTTAGCCAGACGCGCCGTCACACAATCATTTCCACCACGCTGACCAACTACAATCAGCAGCTGGCGGCCGC------CGCGTATCCGCGTCGCGCCTCCATCGGTTGGGATGCGGCCGAGACGAACGCGACCATGCCCACTAC-CACAGC--TGCCCACAAGCCAGTGCGTATAACGCTTATTGGCGAGCCGTTGCC----------------CCAACAAAATGGC---GGCTGCCACAA--AACGCCGCCGACG----------CAACAAAATGGCGGCTGCCACAAAACGCCGTCGACGCAACAAAATGGCGTCAAGGCGCATTTCCTGAATGGCTGCCAGAGCGGGGCGCACAGCGGCGCGTCTGCGTCGGGCGCACATTATCAGCCGTTGTACAACAGCAACAAGATGACAAGCCCAACCGTAACTATAGTCTGATTTGGATACCCCAATACA-----------ACCCAGTTGCAACAGAT--------------GCGCTACCAGAAAATATATAAAGAACGCGTCAGCGGGCGCTTTTAGTTA--ATAAGCTACAAATTCTTAGAAA--------------TATGAGCATATTA---------------------------TCTATAACTATATATATATATATGGAAAACTT------AAATATACCAACAAACTATATATATATACATATATCTA-----ACAATATACTCTCAAATT----GTTTGCAGTCTTACCAAATTCAGTTAAGAAAACTTAAGATTTCAATTAGAAAAAAAAAAAACAGA--AAACTATAAATTATAGCTATACAGCATAGTTTTCAGTATCTATAAGAGAATAGCCTGCATTTTCTTCTCCATGTACAATAATTAAATAATTAAAACAA----TAAATAATCATTTAATTGAATGGCACAGCTCCGCAACT---AGTTAAATTCGTGTACTTCAACTAATTAAGTGTTAATTATGTTATTTAATTTATAGCCCTAAGTTTTAGTATATTCTGTAATTATTTTGTTTCGGCTTAATTTAACTGTACTATAGTCCACGAACTAACATAATGCTACAAATAGTTAGTATGCATATATATCTATATAGTATTATAACTATATAATAATAATCTTCTTCTTCGTCGAGCACAATAATC-----GTAATTATCCCAAAATACTTCTATGCTAAAACAATTGTAAACAATGTGAAGCTTATTAAATAGAGCTCTTAGCCAGATGCTATTTATCTATAGAATTGCTGCGGTTCGTTTTTCTTTGGAATTCACTTTGTCTACAGCCTGGCCCACACTCGACT
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---------------AGCGGGGCAACTA-------------------------------ATCGATTGGACATGGCCTGGCTGG----CTGGCGGGCAATTTTGATACGACGAGCCAAAAGCGAATCGACTTTTGCGAATTCATT---CAACTACATTTAATCCCACCTCCCCAAAAATATACTTTTAATTATAATTTCGCAATGTTTTATTGTAATATTTC--ATGGAAGC-AATAAAGTTACTC----GATAACAATAGCAACAAAC
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AAGCAATATGCAACACAATATTTACAGGGTTCTAACTGACGTTGTTCGTTGATGTTGATGTTAATGTTGTCCGCGTAGGCGGCTCATCCGTAACTTAATTTATTGCTACTAAATGCTGTCGTAATGAATTCAATTTATA------TATACATTTACCTAGCGTAAAACAGGTAAAAGTACGTATATTT-CAAATAGCATCCGGCGCAAAATGTGCTTTCCATCAATGAAGTATGATACAAATCTATTGAAATTGTAGCTGCG-AGATATTTTACAACCAAGTGCACAT----TATAAACTAATATACGAGTAAATATAAAAATTTGTAGCGTTATGTCTAGTTAATGCTTATTTGATCTGATCTTCTCCAATTGAATAACGAAACTGAACTCTCAGCCCAACCTCCAAACAAAAAGCATTCATTTGCATTTAA---------TTTTCAATAAGTGGAAATTTAATT------------TCTAAACTCACACAAACACACACACACAAAAGTGCCACAACAAAAAGTAAATTTAATCAAGAAGTAAGCCTAACGAGAGAAATTCCAGGAAGAAAAAGCGCATTGGAAACACGCTGTATTTGAAGTTGAGTATGAAATTGATTTGGCCTTACTTTTAGTTATTTATTAAAACCAATATGTACTATAACGATATAACTATTATAATAACAATTACGATTATCATTGTGAATATAATAGTTTTTAGC-----AATGCAATACAAAAGTTTCAATAAAGAGCAATGTAAAAACCTTTGTATAAACCACAAGGCACACCTATCATCCAATATGAGAACAAGAAAAC
>Cdk8 9811032 9811125|10190 chr3L 9809756 9811119 scaffold_12 2499353 2500824 + 14174|1482 1576
GATACATGCAGCATTTTTTCTACAACACCTACTAAT----TTCTAGCCTTCTAAGTATTTAA---TTTAATGACCTTGATAATAGCAAGTAAAGT
GATATTTACAAATTTCTATTTTAAATAGCAATTAATCTTGTTGAATTTTCCAAAACAGTTAAACAGTTAAAACACTTCCTAGTGACAGTTAAAAT
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GAGACT
GAGACT
>Gap1 9813042 9814508|10192 chr3L 9812699 9813964 scaffold_0 6205260 6206558 - -3377|363 1399
ATGAAAAGATGTAAATAGCAGATACACGAGTATATATATATCCCACAGTATGTATGTACATGTGTAT-------------------GATTAACTTCATTATACCAGTTAATTTAGGCGTAGCAAAAATTTCTAAAAAATCAACTAAACTAGGCGTTTTGCCCAGAG--GCGACACACGCGAAA-AGCAAATAATTCTAACG--CAATCTGAA-----CGCGAGAAAAATAC-TGCGAAAAGCATGAAA--------AAAACATACATTTACATGTATATTTACTTTATATAACTGTCATACAGCT---AATGTTAA-ACAACACACGATATGTATTCGGCAAATTCTAGAATACAAACAAAAAGCATTGTTAAGAACAAATTTACTT--------CCATTTTGCATATACAAACACATACGCAC--------------GCACACCTATATTTATTAAATGCATTTAATTTCATATTAAACTTAAAACGAAAAACAAGTTAATT--GTTACACAAACACGATTTGGTTAGCTTCGAC-----TTACTTCCACCGATTTGTTTCCAAAGCTCTTCCATATTAATTACAC-------ATGTAATTTACATCTAG----AACTAGAATGT---TAAATAATCT--------------AATTTTTGC-------CATATTT--AGTTCAGTGTTCATCAATCGCATTGAAAAGTGTCTTCCTTCGCCGCGTTCAATCATATTGCCTTTTGTTTATGCATTCCAATCCAATAATTTGTGCATTTCTTAATTCTAATATCTGCATA------ATGTACATAGAGATACGAAACGGAGAAAGAAACACGACGAGATGTTGCTATGAATTTAAATTGTTTGGAGTTTCCAACGTGGTTCATATACATATAATTTCACTTGCATTTTAAGGACACAATTATAGTTTACTTTTACCATGCCTAGCTGATAAGTTGTTGGTACAAAGAATCGAAAATAAAAACATAGATATTTTCCAAGGGAAAAATAAAGCGTATCGCCAATGGATAA
ATGGATATACGAAGAAGATGCATATACGAATATATATATATACTAAAAGGTATATGTATCTATGGACCCCCTGAAACTTCTGCGCAGATACGCATCAATTTGCAGATGGATTTATGTGT-----ACATATACGAAGAAGTATAT-ATCTAGACA---CGCCTAGTGTATAGATACATGCGAAACAGTATATGTATCTATGGACCCACCTGAAACTTCTGCAGCAGGTGCACATCTGAAAATTATTACATATGTAATAAAATTTTCATTTGTATGC---TTCACTACATG-AATTTTCAGATGGATTTGTATGTTCATATACGGAATAGTGTGTATCTAGACACGCCTAGTATGTAGATACA------TTCTAGAAACGTGTATGTATCTGTGGACCCACCTGAAAAATTCTGCCGCAGATACACATCTGAAAATCATTGCATATCT-TATGCAGTAAA---ATTTTCATTTGTATTAACTGCGCATCAATTTTCAGATGGATTTATGTGCACATATACGGAATGGTGTGTATCTATGCATGTAATATGCATTTATATATGTATATAGTGTGTATCTA-TACACACACCTGTTGTATATAGCATGTATCTAGACACACCTAGTGTATACATAAGTATTTCTCTACCTACCTGAAAGATTGTGCACAGATACATATTTGAAAATCACTGCATATTACTGGCAATAAAATTTTCATTATATCTGTGCATCAATTTTCAGAGATATTTGTATGTACAT----ACGCAAAGATGTATGTATCTATGTATAGTAATATGCATATACATAGTATGTATCTATGGACACGCCTAGTATATAGTA----TATGATATGTATCTATGGACACACCTAGTATATAGATACATACTAAGT--ATATGCATA---------------TTCAGAGATACA---------TATTTGAAAATTTTCACGCAGATA-------GATACATAAAAATGAAAATGTA---ATTGATACTT---------AATGTATTTGATGTTTTTTATGATTTG
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ACATTTTTAGTGATTTTATGTGTAAAACGCCAAAAAAAAAAAAAAAACATTTTAGATAA-------------GCGATCCAA------AGCACAAAATTTGATAAACTAAACAAAAACAAATTTAACAAAATGTTTGCAGCCCACGGCGAACGATATAACCAAAAATATTGATGTATGCACCATATTGTAATTAAATAAAAGTTACAGAAATAAATGTGATAAATTAAACAAGTCAACAAACAAAATACCGGAAGCC
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AAAGAAACCA--------------------------------GGCTCAAATTCTGTTTCGATCAGTTGGG
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GCAATAA-----GCAATT------AATTCGATGTTAACGTAAAAAGTGAATAAACTAATTAAGTTATAACATTTCATAGAATTGTATCGGACATAGC-TTTCTTATTGCAGTT
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--------ATTTAGGGCTTATAGAAATAAACTTATTGAACG--AACTCATTTCCACACATATTTATTAAACATTTAAATTCAATTGTTTATCGAGTTAAATTGTACGCGTACATTGTCACAATCCTTTA-ACTGTTAAAGTTGC-TCAATCTCA-------ATCCTACTTAGGTGTATAGACTGCCTGCATCATG----TATATATCTTGTCCATTGTACGTATTTGTTTTTTGTTTTTAGATAAATTACATACATATAATTAAGTACATTTCTATGTATAAACAGTAGTTAGCACATTTAAAA
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GTTAAAATGTATGATCCTAAGATTATATTATATAATA---ATTAGTGTCCCAATGAAATTTT
G----------CGGTCT--AGCTCAGGCCAGATAAGACGCCCTAGT-TTTAAGTCAACATTT
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TGTTCAAA
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TAAATTAAAGCTGTACAGTTAGAAGCGCCACAGAAATGCCACCGCTAATGCGGCAGCCAAGTCAGCAAATGTAACTAAGTGGGCTGCCCGCTGGAGAGCTATCAAGATGTGAAGCTTGGCTGTCGCGCAAATGATGCAATGCAGCAGTAGGTGCACTAGTGGCAGCAGCACCGAAG--CATACCAC----ATTATACCAAAAATATAATTAAAAAACAAAAAATATATAATAAAAAAAGCTAATAACGCTAATGATGAGCTCCTTTGGATAATATCAACTTCGGCGACTGGTACTGGTGCAGCTACTGATATTGCATTTGGTAGACTCTCTAAGTTTTAAGTAAGTGCGTGTATACTTTACATGGGTTGGGACTAGGTCTCAGTGGGTTGGG----GCAGCTATGTACATAGTACTCTTATCTAAACTTATATGCCAG--CACTAGAAACATTAGTAAAATGGACAACA-------------AAAATGTTAGTAAAGAATGTAAAAATCATATG----------TATTGCTATTGATAAAAATAACTGTTCGA--AAATGAAAAGAATAAGACGCATTGTTAGTTATAGAAGCTGCGGCAATAAT--TTAATATTTCAAAGTCTACTTAAATT------TCATTCATTTGTTTGCTAT----------AAATATCGTTTCGATTTG----AGGGCTTTACATGCGAAGCTTATTGTCATCATAAATTGGAATAAGTTTCATAATAATCACCTGTATATATTTGTAAGGCCTAGCTAATAATGTAAATATTTACAATTATGTAAATAT--TTACAATCAGC--------------GGCAGTAACCTTCGACAACACATTTTGGCAT---GATTAACATATGCATATGTTTCGTAA---------------TGTTCCTATTCAAGCTTTGTATTTTCAACGTTTTCTAAACCAGACAACATTTAAAACTAACAAATTTACAAATGCTTCAATCTTAAGACGTTACTGTCTCTTCCATTAAACAGCCATTGTATTAACT--AAGTATGTATGTACATATTTGAGTACCATTTCTTATACTTTTTGTTGGGGTGCCG-TTTCTATCTTCGCAA-AAATTCATAAAACGCCGAGCTAGTCCGTTTCCTCCAAAGTGTCATCCGCACTTTTTGAGTATTCCATAAAGTATTGAGCATATGCGCCCAGCCCCAACC--TTGCTG--------TTGCTC-AAGAGTTT--GGAACTTTATTTGGAACTTCTACTTTATCATGTCCGGTTGTATTT-------------CCCTAGAAAG-------------------------------CTGCAAGTCACTTTGCCATTGCCTGTCAACAAAATATTTGCATTTATATTT-GCTAAGCTGCCCACTAAAGTGTAGCACCCAAGAATTCAGTT-GTCTGAAAGCATTTCGCCCGGTTTTCCGCCTGGGTCGATGGCCCATGGTTGCATATGTAGTCCTTTTCCCAGGATGGCATTTCGCACCTCCCCCAAACCGTTTTCTCTGCGCTTGGCGCCGCCGTTTAATGTGTCACATTTAAAAATGCATGCGACTGTCCACCTTAATGGCCGGTCGACTATTAAATGTTATGACCATTCGCAAGCCAGGGCATGGCAGGGCATTTTACTGATCAAAATTGTAAATAACAATTGCATATATGT--TACGTATAAATTAAAGCTGCTGTATTTAACTAG--GTGTGGTAGGAGTATGTGTGTAATTTTCCAAAAAGAAAACCATTTG--------------------CAGTCATAAATATTAATATTAATA-------------------------------ATTAAAAATTATAAATGCGCGCCAGTGAAATTTGTCGCGACAGTTAAATGAATGTTTAATGAGTAAATGCATGTTGCTATAAACCGTAAACAAAAAATGAGAACGAAAAACCAAAAATAATCAAAACAATAAATCCAGTTAAGAGTATAGAGTACATATAAAGTTTGTATGTGTATGTACAAAAGTTAAATTGAGTATTATAATCAGACATAATAATAACAATAAAAACAAAAACTACAAGCATATATTAATGTCACATGAGATTGTGTTGATGATATTTTGTTACAAACAAAATGTGAACACATTATAATGGATTATAAAGTTG-TTTTAATGTTTAAGTGAGTAGCGCCAGCTGAGCGTTAACGAGCATTAGGATTAACTACGTTTATAAATAAAAGCAGCAAATATTTAAATAAAG--TTTTTAGTTATTATGA--AA
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GTGCTAAAAAAAAAGTAAGGGGTCCTGCAGGATAACAGCCATTTCT--CACTGCTCTGCTCAGCTGTAGTC-TACGCCTAATTGTAATGCCTAATTTATTTATTTATTTAACTTATTTACCCATCTATTTATCAACCCATCTATCGATAATAAATCAATTCT
GGGGCA------------------------GACAATTGCCATCTTTTGCACAGC-CAGATCAA-TGTAGTCTTAAACCTAATTTTAATGTCTA----ATTTATTTATTTAATTTATTTGCTCA-CTATTTA-----CTATTCACTATTAATAACTCAATTAT
>ect 10167014 10168110|10536 chr3L 10167175 10168398 scaffold_8 4856828 4858076 + 19295|0 1094
TAGAAA-----------GAGATATCGCTGAAAGAAAGGCTTCCCTTGCTCTCTCTTTCCCATTCCATCA--CATTC----------ACATATCTCCCTCTCTCTCTC---TGCCTATCT-TTCTCACACACACACACACGCCCCGCACGTATAGCTAAATTGATGT-----------AACACCAACAAACACAACAGCAATAAGAATTGTTCACTTTGTGTAATTTAT--TTATTTCTAGTT---------GTAATATCTTTTTCGTATTTATTTGTGTAATTAAACAAAGCA------ATCGATCAGATT-------CGGAATTAGATATCATTATGTAAA--CAACTGCCTATCTCACTCGCTCTCTCTCTTACTATGTCTATGTCTGTCTCTCTTATGCACACACACACACGCATTTAAGCACTATCGCTAT--CTCTTGCTTTCACACATTTGGCTTACAATTGAACATTTTAGATGAAACAAAAGATGTATATCTTTTTGTACCTTTGGCTTTTTCTCTAACTTTTTTCGGCTCGCATAATTTTCCG--AACGTAAATAACGCAAATTTTGTAAAAAATATGGAAAAAACT-CAATCAAACTTAAAAATCAGCAATAAATTGTAGCTAAAAGTTGAACGCTTGAAAGGCAGCGC-----------AAAATTTCACAAGAAGAAATAGAG-------------------------AATTGTTAAACTTTGCGTTTTAGG-TCATCTAATTTATAATTTATTATTTATTTATTTATTTATTTATT---TATTATAAAAACAAAAGCAAGAAG------ATGAAGAACAAAACCACA-----------AAACA---ATAAATTTGCTTAAATAAATTTGCGAAATGAAATTCCTTGTGCAACTTTTAATGGTATTGGATCTGTGGAATTGGAA--------ATTTTGTGTTTT-------TATTTCTCGTAGCATACTTTCAAGCGTCACC---------TTAGGCGAGGTGCTGGTGTCTCTGTCTGTCCTCTTCCC-----CTCTCTGTCGCTC-CACACTCACACACTCACACTCATCATTAGCAGCTTC
TGTGAACATCGCGCCGTGTGGTATGCAACAAAAACTGGCTGAGCTGAATGGTGATTCGCCATTTTGGCAGGCATTTTTGTTGCTAACCGTGTCGCAAGCACTCACGCAAATACATATATACACCCACACACACACACA-------CACAGATAGCTTAATTTATGTATGTAAACAACAACAACAGCAACAACAACGTCAACAATAATTGTTCATATAGTGTAATCTATAATAATTTTTAATTTTTTCTTGCTTCACATCTACTTTGTTATTAATTTTATTGTTTACAAAAACAACAATTATCGGAGAAATTATCAATGCGTGTTTATATATGCATTTCCAAAGTCCATTATATATATATTTCTATATGTGTTTTTCTATATCTCTGTCTCTGTCGCT--------------------------CACTTTCCCTCTCACTCACGCTTTCACACATTTGGCTTACAGTTG-ACATC--------AAGAATTAATCTCTGACTATTT-TATTTTTGGCT-----------TTTTTCTGGCTCGCATACCTTTCCGTTAACGTAAATAACGCAAATTGTA-AAAAAGTAAAAAAAAAACTGAAAACAAAATT--AAACCAACTGTAAATTGTAGCTAAAAGTTGAACGCTTGAAAGGCAGCGCACGATTTGCCAAAATTTTCCAAATAATGAAAAGTGACGTCAATTACATTTTCATTGCACAAATTGTTAAACTTTGCGTTTTAGGTTCAATTATTTTGTAATTTATTGTTTATTTATTTATTTATTTATTATATATTGTAAAAACAAAA-CAAGAAGTAAACAAAAACAAGCAAAGCTGCACACACACACGTAAACACACAAGAATTTGCTTAAATAAATTTTTCA---TGAATTTTGTGTACAACTTTTTGAGAAATC-GATTGAAAAAACTAAAAAAAAAACCAATTTGTGTTTTATTTAAATATGTCCC-TAGTTCACTTTCAAGCGTCACTATTTGCATAATGGTCAAGGTATTGGTAACACTTTCTCTCTCACTCGCTATGTCTGTCTGTCTCCCTCCCTCTGTCTCTCTTACTCTCAACACTAGCAGCATC
>CG32056 10194432 10195019|10562 chr3L 10194338 10196127 scaffold_8 4881378 4883179 + 46899|124 797
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>can 10237854 10237933|10614 chr3L 10237222 10237881 scaffold_8 4923487 4924112 + 7885|697 726
TATAAACCATCGA--AAGTTTCAAATAGAA
TTTAAACAATGGATAAAAATTCTATCAAGA
>can 10237854 10237933|10615 chr3L 10237928 10238039 scaffold_8 4926972 4927087 + 1974|0 5
TTATTG
ATCTCG
>CG12303 10403636 10404205|10843 chr3L 10403693 10405997 scaffold_8 5097933 5100440 + 26937|0 663
TATAGGATTATCAAAAG--------------------CACTATTTTCGAAATAAATCTGG----------------GTGTCATTAGATATTAGA------TGTTTATAATATCTTAACATGGTGATTGTCATTTCT----------GGTGTCAAATATTGTTGCACAGCGGAACTGTAAAGTA-----AACTTTGGTCACAGCCGTTTTCTACCCATAACTCTCCGCCCAAAAACTGTAATTACAACGAAAATACGTTAAAATATTTTGCCGGCAAGGTGACGCCT----------CCCTTGCGGCCTCATTTGCATGCCCGCTGGCTGCACTTGTCGCGGCTCAAAAT--CCACTGCCCAA-----ATGGCCAAATGGCAAACT---------------GGCAACCTGCAA-----------------CTGGCAATTGGCAACTGGCAGCCGGCCAAAGTTGCAACTGCCTCCGAAGGTGTCTTCGATTATTGCCAAACATTAATTATTTGCGCGCGATTTGGCGCCCGCC-----------------------------------------TCCTTTTTTTTGTGAAAGGCTTGGGCTAGTAGTTCAAATGTTTATTTTTCTGCTCTCCCTGGTGTATCTTTGATT----ACTGACTACACA
AATAATAGAATAAAATGTCTTTCCTCGCATTTTATTTTACTATATTTTAAATCTTACTGGCCAAGCTGAGGAAATTGTGTTAATAGACAACATAGAACACTGTTTACCTCAATTTCACCTTATAATAACCACTTCTTCTTCTTCAATTTTTCGACCTTTCATTCCTATGGCAGCTATATGATATCTGTATCTATGGTTCTAATAATTCTAAAAGAGTGTCTATTCCTCGGCGTGCTGTTCTTTCCTGCGACTTTCCTTCTAATA-TTTGTAGG--AACTGACTCCTAGAAGCCTCACTCTCCCCACTCTCTTTGCCTACACCCTAA-TCCTCCAACTGCAGCTAACAATTACAAACGCCTCATTTGCATTACCAGCGGGCACACTTGTTGAGTTGGCTTCGACAACGGGCGAGCTGGCCCGCTGGCGGGCTGGGGATCAGTAACTGGC----------AGTTGCGAGCG---CTGGAAGTGTCTTCGGTTATTGGCAAACATTAATTATTTACTCGCG-CGCGGCTCTCGTCTAAGCCAACTTCTGTGCTGTGGTTGTTTTTGTTTATGCTTGTTGTTGTTTTTGTGAAAGGCTCGGGCAAGTGATTCAAATGTTTATTTGG----------TGGTGTATCTTTGATTGCAGACTGGCTGCACA
>Dhh1 10433565 10433828|10883 chr3L 10433395 10434671 scaffold_8 5128747 5130118 + 1505|191 485
GTG-------------GTTATGAATG---AAAAACTAG---TGAAAACTCAGGCATTAAAATTAAACTCA---ACTAATCACTTCATTCGGAAACAAAACGG-ATCAGTT-CCAAGAGAGGCTGTATCAGTCTCTTTCCTTACAATTGTATATCGTAGCCAGTTAAACCGTTTTCTTAATTAGAATACTCAATGTCGAAATAGTTGATAGCATGTTGGATACCATGAATGTTTTTTTATGCAAGCAATAAATTGCAGAATTTGTTACCAAAAAAATAAATGAA-------TTAAA
TTACTCATATTCCAGCGCTACGAATGCGCGAATCCTAGTCTTGAAAGTCTGACCACTATAG--AAACTCAGGCATTATATTTTTCTTTTTGAAATGAAATGGAATCAGTTCCCAAAAACAGCTGAATCAG-CTATATATATATATATATATATA--------------------------TATAACTTTAAGTG--------------AGCATTTCACGCGCTATGTGAAATGTCAAGTACAAACAGAAGGAAACATA------TTCTAAAGAAGTATATAAACTTTTCGTTAAA
>CG6527 10532112 10532309|11012 chr3L 10532092 10532263 scaffold_8 5237916 5238123 + 3062|20 207
AGACTGGAGTGTCAATTATCCCGCC----CGAGC---ATTTTGCCCTAATGGCTGCAATGACTGAGTAATTGGTTAG------CAGCCCTACCT------------TGTCTTTCTGTGCGCCTCTATCGGCC-----------AACATTGTTGATGATGAGCCTTCATTAAAAACTAAGAGCGTGTCT
AGGCGGGCTTGGCAATTAACTAAGCACGACGAGCTGAAGGTGGGCGTAATAGCTACAATGTCTAAGTAATTGGTATGTGGGGCCAGGCCAGACTCTAAGCTCCAGTTGCAGTTACATTCACAGTTACCTGCTGCTTTCCTCCGAACAACAATGCTGATGAGCCTTCATTAAAAACTGAGCTTCTGTCT
>CG14151 10601627 10601687|11091 chr3L 10601428 10601695 scaffold_8 5304540 5304766 + 3111|199 259
AGGTATTAAGTGTTTAAAGTATTGATTTTTATATTTTTAAAATAAACATGAAATTGAATGC
A---CTTAAAT-----AAGTATT------TCTGTTTCGATAGCATGGATAACACTTAGCAT
>E(z) 10608515 10608584|11096 chr3L 10605099 10611684 scaffold_8 5311542 5318066 + 318174|3488 3570
TAACGAGTCTACTTATG-------------AAAATCGTATCATACAAATTGAATAAAACTATATTTTTGAAAACACACCTAAA
-----AATATACTTACATTTATATTCCACCAAAATGATATAT--CCAACTAAATAAATATCTATATATTGATCCATGCTTAAA
>CG32066 10614340 10615147|11100 chr3L 10614143 10615828 scaffold_8 5322007 5323680 + 51601|211 1098
TATTGGAGGGGATCGGTGGGCG--------CGGCCGGTGTGGGCGGAGAGTTCATTAACGTTAATTTCTATGTGTATGCGTATCGATTTAAATGGTTTTTTACCTTTATTTATGTAATTAGTAGGCTTCT-------GTAT-TATTTGTAAAAAATTGTGA------------GCGAGTGTTGTGCTAGCAGG----AGGCAACCTCTAGTTTTATTTTTACCCTGTGTGCATTTCCAGCATTTGT--------TTCGTA---CTGTTTTAGACTCCAGCCTCCGCGTAACGTAGCAAAGAAGTCGGACAAAAAGTGGGACGCATATATCAGCAGC------------AACAATATTTAGTTGTTAATCTAGCCCTAATTTTAAGTAATGCAAGGAACCCA----------ATTAACCTAAAAACAAATTAGCGCAAAGTTTAAACTGATGTTTGGGTATACGAGATGTATGAGATAAATCCTAAATTCCACTAATG--CAGAGATTATAAATATAAA-ACAAAAAAAAAAAAACATTTTTAAATCAAATCTAAAGTATTTTTTTGTACATGACAATGTGTTTAGAACGTGGTGTAAAGATCTAAAGAATGCATAAACTAATTGATTACTATAACAAACGAATTGTACGACCTAAAAT-GCCTACAC-ACAACTGAACCA-CAAGC---TAAAAAGCGGATGCATTTATATATTTTCACGC----CGTCAACTTTGATAAACGTATTTAAACAAATCTACAACAGA--ATAAACTTGAGCTGCGCAATAATAATAATTTTTAAGATTTACAAATAGAAATAAAGGATTAATAAAATGGCAAAACTTAACGCATACAATTTGTACCAAAAAAAAAAATGAAAGAATAAT
TGGCAGAGTCCGGCGTGGAGCAAGCCAAATCGTTTTGTTTATGTGTAAAATTTG-TAACGTTAACTT---------TGTTTAAAGATTTAAACGGTTT------TTAATTTATGTAATTAATAGGCTTCTACTACGAGTATATATATATATAGAATTATTATGTTTAAATTGTGTGAATGTTGTGCAGAAAGGAGGCAGGCAGCATTTAGTTTTATTTATA---------CATTTCCAATATTTGTCGTATTAATTTGTAATCATATTTTGTTCTCTTG-TTTGGCGCCTCCTTGTGAAGTAAACATGCAAA----------TATATATCAAAAACAACCAGAAACAAAACAATATTTAGTTCATAATCTAGCACTAATATTAAGTAATG-AACAAACCTATTACAAATTGATTAAC---AAAACAAATTAGCGCAAAGTATAATATGATG-----------GAAATGAATATCCTAAATTCCAATTTCAACTACTAACCAGAGATTATAAATTTAAATACA-------------ATTTTTAAATCAACTTTAGCATATTTTTTTGTACATGATA--TAAATTACAATTAATTATAAAA--CTAAAAA---CAAAAAC---------------AAAAACAATACATACCAACTAAAATGGCCTAAACAAAAACTGAACCATCAAACATTAAGAACGCAGATGCATT--TATATTTTCACTCTGAACAAAAGATTTGATAAACATATTAAACCGAACCTTTGTATGATTATAAAAGAATGCTGCGCAATAATA-----TTTTAAGACTTACACAAAGAAAT------TTATAAAGCTTGTA----TTAAAACGAACAAAATCAATCAATCAAGCAAGCGAAAAAAAAAT
>CG6463 10667124 10667261|11182 chr3L 10666336 10668172 scaffold_9 1750365 1752049 - 24921|864 1011
ATTCACACTTAGTACTAATTAATCTACAGCAAATCG--------AAATGAGAAGAGAGCAATAAATCCGTTGATAAGCCAGTGGCTTTATCAGCTAAAAAATAATTGAGCTTTAATCAAATG--AATAAACCTGGAACAGCACCACAA
--TCA--------ACTAGTTTGTTT---TCCAATCGTCTCACACACTTGAATTGTATTCAATAAAAACA--AAAAAGCCAA------AATCAGCT----TGTGATTGTATTTAAGTCGCGTTGCGATAAGCCGAGTCGAACGTTTCAT
>ninA 10668304 10668481|11183 chr3L 10668342 10668679 scaffold_9 1752051 1752349 - 8108|0 148
TTTAACTTGTATTTTAAATAGACTTTAGTATTATGAACACACAGA---TGCATCTTTAGAT-AATACTCACATTGTTCAAA-----CCTTGTTAAATTTCACTCAGCGACTCATTTTTCTAAACGCAACAATGAATTGTGATAAATAAA
CCGCAC---------------AATTTACGATTA-GAACTTTTAGAAATTATATATTTAGGCAAATACTCACAATTTTTACAAAAGCACTTTTCCCATTT-----------TTATATTTCTATGC---------CATTGTGATAAATAAA
>CG6418 10850211 10850516|11443 chr3L 10850204 10850571 scaffold_12 1210909 1211378 + 9524|7 448
ACGACGAGCCCAATAAACTGATGCTGCTATTTGGTTTATTTCTCTTCATATTATTTAATGTGTATTTGCTTTTGTTCCATCGTTTAAAATTACAACTTATGAACTAAATTTAA------------ACATATTATATATAATCAGATATATAC-----------------------------------------------------------------CATGTTCATTCATAAAGATTACGTTAGTTAAATACTCG---TATGTACAACTCTCTTCCTTCGCAGCCAGTTCCAGCGAACGATCCCACAGATCCAAATAAAAATATTCATTAATTGTAATCATG---------------------------------------------GTTATGTGTATTTTATTTTGAATAA-AATCACATTTGCGCAT----------CCC
AAACCTGAATCG--AAAGCAATCCTCC-----------TTTAATTTCATATTGTTTAATGTGTATTTGCTTTTGTT---TCGTTTAAAATTACAACTTAAAGGCTACCATTAAATATATATATATATATATAATATATATTTATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATCCATT-ATATATATTATGTTAGGGAAATACTCGCTATATACACGCTCCATATCACACTCAGCCAATGC-------CGATTC----------AATAAAAATAGTCATTAATTGTAATTCTGTGATCATTTATTTTTGTTTTTTTGTTTTTGTATTTCGTTTTTGTTTTTATGTGTATTTTATTTTGAATAAGAATCACATTTGCGCATATTCCATGGCCTT
>CG6409 10854641 10854738|11448 chr3L 10854610 10857436 scaffold_12 1216815 1219537 + 31280|31 138
GCTTCCTATGTTAAGAGTC--GCTAATGGGACCATCACGAGATT-TGTAGTCAGCGAAACGAA--CTAAAATAAACACAAATATTTACA-----TGCTTATATAAAAA
G-TCACGACCTCAACTTTCCTGTTAATTGCTTCAGCATGTTATGAGGAAGAAAACAAATCGAAGTCAAAAATAAA-ATAAAAATTTACAATATGAACACACTCAAAAA
>CG6404 10858208 10858421|11449 chr3L 10858354 10858621 scaffold_12 1219648 1219916 + 8757|0 71
TTCCTCCATCCTGTAA----TCGCCGCTGAGCGCTGTGTCTTGTTACGTTAATTTAACCCCTTAGTCTATAG
TCATCGTGTGCTGTCCGTCTTGGCCGATGAGCGTTTGTTGTTAATGTTAGAACCGTACCCTTTAGTTTCTCG
>CG6391 10869394 10870077|11471 chr3L 10869129 10871090 scaffold_8 4434142 4435945 + 49192|282 998
AGACATCGGGATGCAGGATCCGGATGGCAGGCAGCAGTAACCACACATGCACACCACACTTAACTGCGAGACTAACACTAACCCCAAAACTAAACCCATACCGAGAAC-----CAACCATACACATTTTGACATTTTGGAAATTAACAAATAGACAGGCAGTCTTCTAGATTATGTTGGTTAAGCGATACTTATG----TTACCCCGCATCCCC------------------CACATAGCCCCATTTTCG-TTTAAGTTTAAGTCAAGGCGTTCATTTATGTCTTTAGTAAGTGTATCG-GAACTAAATTTATATG-TTTACTCCAGAGCGAGTGGAGAGGAGGTGAAGAAAACAAAAACGCTACTCGATCAATGCTAAGCGATAACTTATTATTATTCGAGATCTATAACACGACGCAAAAGTAGGCGGAAACAACATGTAATAATTTTTGAGCGAATA--GCACTTTTTGCAAACACGAAATGGAACTAAACAAACAAAATCTAAAACTAGATGAACTAAACAACAAAATCCAGAATAGCGATATCTATTAGATTTTTCTACTCTTTTTTATAATTTACTCAAAAGGCGTCTTAATTGATTAATGTAACAAGCAAACCAATTGGAATCGGCTTTAGC-AAGCGCAAAAGGAGATCTTAATTAACTATGCTAAGCTGCCTAAATAAAAACAAAAACTATTTAAGCGATGACTAACG
AGACA----AATGCAGAA-----AGAATAATCATCTATAAGCACACAC---CGCCTCACACAAACAACACACACACACAAAACACACA--CATACACAATTTGAAAACACAGTTATTCACCCACATTTTGACATTTTGAAAATTTACAATTAGACAGGCAGT-TGATAAATATTTTCGGT------ATATTTAAATCATTTACCCAGCACCCGCTCTCCATTATATTGACTACAGTCCGCATCCTTTTCGAGTTTAATTTAAGTCGAACGCTACATTTATGTTTTTAGAAATTGTATTGAAAAACAAATGTATGTACTTTAAATAAGAGAATGCATAAAAAAACTAAAAAAAA-AAAAAGAAAACTAAATTAACAAAGAAGAATA---------------AAATCTATAACATT---------------------TAATATAATAATTTTTGAGCGCATAGGGCACTTTTTGCAAA-ACGAAA---------------------------TACGTGTACTAA----------CAAAAATTATGATATCTATTAGATTTTTCTACTC--TTTTATAATTTACTCAAAA-ACATC----TTGATTATTGTAATAAA-----CAATTGGAAATGGCTTTAAAGAAGCGCTAAA----ATCT--ATAAACTATGCTAAGCGGCCTAAAAAATATAACAAAATGAAAAAAGGAAAACCAACG
>klu 10955673 10956436|11576 chr3L 10955460 10956269 scaffold_8 4521198 4522172 + 7590|217 1064
CCGGAAA--TCTCTGCGAAGACTGAGGAACCTTAATACTACCTACAGTTTAAATAATAGGCT--------------------------------AAAGAACCATCAACTAATTTTGTAAAAGAGGAGTTAGAGGGCA----------------------------------------GCACTCATATGACCACCCAACGTATTAGAAGTTTAACTAGTTCTA--GTTGCTAGATCCTTTCGCGCGTCAAATGAACCCCCAGGAGTTTAGATAGC-----CAGGAT----------------------------------CTTCGATACAGCTAGCAATTCCATGTTCCACACCTAGGCT-------------------ATACTACACTATATATAGATATATATATATAGATATGG------------------GTCAGATCCATCGTC-----------------CCGATGATCTGATCTCTCAGCA-TTTTGAGCAACGTTGAAATTACTAAGTTAGACTCGC---TACTTAGGCTTCA-----------------TAGGCACGCCGCATTGGAA---AAGGC-----------------------------ATTACTTTTGTACTCCTAATTTTAATTAAT-------------TCTTAATTTATT------TGTAACATTACTCAGCAGAATGTAAA----------CTTATACCACAACGATTTGTATTAATTTAATTTTACCTTATTTAATATTTAATTTAACTTAGTTTTAAGGGATGCCTGCCTACACAAGAACACAAACAAAAGACAAAGAATTCTCCCTAGGGCTCAAAAAGAAAAAA
CTGGAAATCTCTCTGCGAAGACTGA-GAACCTAAATACTACCTACTGTTAAAGGCTTAGGTTTATACATATACATACATATAATTTTAACTTTAAAAAAATC--TATTTTAATTTGTACTCAAGCATCTAGCACGCACACACACACACACACACACTGAGACAAATACACGCGGAGTTAACTCAGACCACCACCCAACGTATTAGCGTTTTAATTAGTTGTAGGGCAACGAGAGCCGTAC-CACCCCCAATGGAGGGAGACAGGCTTAGTTGGTATTCGTAGTATTGTATTTTTGGACAACGTATTGTTGTAGACAACGTTCAGATACAGCTAGCAATTCCATGTTCCACAATTTAGTTTATAATTCCGTCATATTGAATACTTTTATACATGTGTATGTACGCGCATGTATGTGGTCAGCTAGAGATTAGTTTGTTAGTTAGTTCGTTAATTAGTTAGGTAGAGGTCAAAGATC-GGCCTCTGGGCATTTTTGAACAACATTGAAATTATTAGGTTAGGCATGCAAGCATCTAGGCTATATTTTGCTATATTTAATGTATGTATTTAGTAATTGAAAGCAAAGCGGACAAACCATAAACAAACAGTAGAGTTAATTATACTTTAATTTAAAATTAACATTAATTTACGCTAACTTATTTTAGTTTATTAAACTCTGCTGCATTGCGCATTTAGTTTTTAACGTTCTAGCGCTTAAAAGACAACAATTTGTATTAATTTAATTATAATTT--------TACAATTTTAC-------------------------------ACACAGA-AAAAGACAAAGAATTCTCCCTAGGGCACAAAAACAAAAA-
>klu 10955673 10956436|11577 chr3L 10956344 10956365 scaffold_8 4522216 4522239 + 1266|0 23
TTTGACAGG--CCCAGCTTAGTGC
TTTGGTAAGCCCCCAGCTTAGTGC
>klu 10955673 10956436|11578 chr3L 10956392 10959066 scaffold_8 4522261 4524804 + 93482|0 44
CGGTGTCTGTATGCAGCAGCATCCAGACCATTTATGACCTGTTAG
CGGTACCTCTACGCGGCCGCGGCCAGACAGTTCATGACCTTTTAG
>CG6327 11010304 11010927|11636 chr3L 11007854 11010305 scaffold_8 4590600 4592999 + 22437|2832 2833
CA
CA
>CG6327 11010304 11010927|11637 chr3L 11010306 11010679 scaffold_8 4593817 4594252 + 6826|0 464
ATCAGCAATCAAACAACAAAAGTATTTCGATTTAGTCGGTGCCACGCCCTCAAGGAGTTGCGGCGGTGCGAAGGGGGCGTGGCATTAAGGTTACTTAGAGAATTCTTGTAGAAGTGATTTTGT-ATCGTAGTGA--TTTTGACAACAA----------------CTTAGTCGTAATTAGTTCCTACTCGAACTAAGCT-----------AAAACAGACGGAC--GCAGCTGA--------------------------------------------AGTTTGTTTTCGTTCTTCAATTATTTTGTTTTATCATTGATTTACTCTGTACATTATCGACGCCCTAATTCAATAATCATGACATATTACCAAT---TACACAAATAACCGCTGTCACCT---TTAAAGGGGCAGCAAA-AAAATGGCATTAAAAAAAATA-ATAAAACTTTTTGAA-------ACAAC
ATCTACCATCATCCAAACAAAGTATTT-GATTTAGTCGATGCCGCATTATCATCGA-----------------TAATTGTGGCATTAACG----TTAGAGAATTCTTCCAGAAGTGATTTCGTAAACGTAGTGATCTTTTGACAACAAAATATATCGTAGTTATAGTAGTTGTAATTAGTTCCTAGCTGAACTAAATTAGTTACACACAAAAACCGACAGACAGACAGTTAAGCAAGTTAACACACACACACACACACGCATATATAAAAAATGTTAGTTTTGTTATATTTTTCGTTTA--TTAAAATATCATTGATTTTCTCTA-----TTTTTATGCCCTATTCAATTATTCATGACATATTACAAATATATACATACGTATCCAAAATGACATCAATTGCATAATTTGCAAATAAAATTGAATTTAAAAAAATACACGAATTTTATTGAATGATTTCATAAT
>CG6327 11010304 11010927|11638 chr3L 11010736 11014642 scaffold_8 4594332 4598120 + 84238|0 212
GAGATACTGCTAATCTAATTTAACGTAGTCTTTAATGAAACTCTTCTAAGCACAGGGATGTCTAAGTTAAGTTTTTAACTAATTTTAGGGCTAACCAAAGTTTTCTAGGACTC--------CGAAACCTCCCGCCTCG--------CCCCCTGGTTAT--CCTATCCCGCCCCATCC---TTTCCAACTCGATCCGCCACGATCCCTGATATA
AAGTTTACGCTAATTTAATTTAAATTAGT-TTTAATAAAACTCTTCTAAGCACAGGGATATCTAAGTTAAGTTTTTAACTAATTTTAGGGCTAACCAAAGTTTTATAAGATTCTCCCTCTGCTACACTTTCTCCAACGTTCCCAATCCACCAGCTTACCACATACTCAATCCCATCTAAATTTCAAACTAAAACCATGAAAATTAACAATGTC
>CG6321 11033388 11033625|11657 chr3L 11030585 11036599 scaffold_8 4615381 4621620 + 152109|3148 3389
ATTCCCCATGGCGTATCTTA--ATATGGCAAAATGTGTTTATTATTGTGGTTATCTGCTATCGTACTTTAAATATGACTTAAAAGGATGTGACTGTGCACTAAACTACTTATCAAGAAGTTATCTACTATATAAAGAGATATATGATATACACACGTTTGTTGTACAGATTCTTGGGCATGACGCT-AAAAATATCACAAATCTG-TTAAATTCTATACAAATACACAACAATTAGTTCAGA
ATGAATAATTGTTGATTTTATAATATGGCAATGAGTTTCAATTGCTT--GTCTGTTGTTATCGTATTTTAAATAATCCTTATAAAGATACGACTTAGAACTTAATCAGCTAT---GTAGTTATAAATTATGAACATACG-ATAAAATATGCGTA-------TGTAAACATTTTTGGGCACACTGCTTAAAAATATCACAAATTTGATCAAATTTTAAAAGTATTCA---------------A
>CG32075 11036668 11036720|11658 chr3L 11036621 11039010 scaffold_8 4624065 4626417 + 42188|47 99
ATACGCAGATTAATATTAAATAAAGTAATTAATAAAAACTAGTACTAGATCCA
----ACCACCTTAAATTAAGTTGAATACATTAGAAAAGCT----CTAATTGCT
>CG6310 11042990 11043077|11662 chr3L 11042869 11044086 scaffold_8 4630549 4631757 + 22064|138 232
CATACCAGGATCTAGTTCAAATTTAA-------ATCATATGTGCAAACAACTAATTGACTTACCTACCAATAATCTTAATTCCTAATAAAAAAAA
CAAA--AGAATCGTTTTCCATTCTAATCTGTTTGCCGTATATGT-ATTTCCACATCCATACACTTGCACATTTCATTGAGTGCACATAAACAAAA
>l(3)01239 11047413 11047657|11665 chr3L 11047363 11048234 scaffold_8 4634745 4635560 + 23625|50 306
GAGCG--ATTGATTACCTCAC----------CACACCGTATTTATTGTGTCTATGTTGAGAGGGAACTCTGCCAGGATTTGCGAGCGATAATCCGCGTTTATTGAACACTTCTAATGTTGTATGTACTTCTAGCTGTAAGGCGCAGTTCGCGAAACGCCTCCAATCGCACCTTCACACCAACACTATCCATCAATTCCCCTCATTTAAACTTAACCCACTCTGGCCACGAATTAAAGATACCTTAAACTTCCGATTG
CCTCGGCAGTGAATACCAAACGGCAAACAAACGAAGCGTGTTTATTGTGTC-----CGATGAGGTTCTTTGTGCGGCGGCACTA-CAATAAT--GCATTGATT--ATGATTCTAATGTTATATGTAATTTTAGCTATAAGGCGCAGTT----------ACACACACACACACACAGAGAAACGCCACTCATCCA-TCCCCTCAAACAA--TTCACCCACACAAGCTACACACAACTCACAAAGTCGGCCCACAATTA
>JIL-1 11052696 11054569|11666 chr3L 11048679 11052699 scaffold_8 90853 94864 + 145476|4176 4179
CAAA
CAAA
>JIL-1 11052696 11054569|11667 chr3L 11052700 11056668 scaffold_8 95940 100010 + 67684|0 2181
CATGA---GGATGACGACGGCGATGATGTGGAGGTGGTGGAAATCAAGGAGGAGCCGCGAAAGGAGGGAGAGGAGCAACTGCGAGCGGTGCT--------GCAGTGGGAGGGCGACTTCAGGAG--------GCCACGGATGTA------CAGCTGACCACACTCATCGACGCAATGGC-CCATCCAGGACAATGACAAC------CAG---------ACGCCGGCCAAAACAGAGGGTAA---------AGAACCAGAGGGTTTCAGTGACCCACAAGAA-----ACCCACTAGCCCCCCT---------------CATGAGGGGGAA------------------------GGATCCGCAAGACGCACCAAAGATCCTGTCAATACAGTTTTTCAAGTTTGTTATTCATT--AGGTTAAGCTTCAG----AACTCATTTCGCTTA-----TCGTTTTTTTCAATCACGAAAAACAAAAAGCAACTTAACGTTTACACCTTTAGAAGGACGGTCGGTGTATTCAATATGCAATTTGTTGTGCTAGTTAATTA-TTTGAATAGCTTAAATGTAAAAAGTCAGACACAAAACGGGAATATAACA-----------AAGGCAACTTTTGCA-----TTGATCTTAGCGCGATTAAGACATACAAAAA-----------CAAATACCG--------ACAACAGAACACAACCAACTAATATGATA-ATAAGATTTGCAATTAGTTTAGTGCAAAATTA--TGATTAAGACAAAATTGAGAAAGATATTCTTAGGGCGCCTATA-----------TTATATACAC---------TACACACACAGTTT----------------------GCTTTTAGTTGTGCTTTATGTTAAGTTATATACATTATTCTTAA-----CACACTATCC-CTGAACTAACTAAAAAAAAAAGAAATACTTCCAAGCATGTATTGCCAAATGCAATATGAATTAGCTAACACATTTAAATGTAATTGTGCTTGGCA--------ATGTTATCTAATTGCATTCAATTAATTTCAGTTAAAACTAAGGGGAAAAAGAAGCCTCGCCCGAAAAACCATTTCCACATGA-AATTGCGAAGCTCTTCTTTGA---GATCGTGTCGAAAATATAACGTTTTTCGCACACAAAACTCAACTATTGGGGAAACGTGAATAGTCGTAGACATT---TGTTGATGGCAAACAAAGATTTAATTG---TTTTGTTAAGTATTTTTGATGTATATTTTTTATTTTTCTGAAAATTCTGTATCTAAATAAGATAAAGCAATGGATAGCGATGAAATCTAAATAAAACTTAAACAATTATATTATTTTAAACTCGCTTGATTTGATTTGTATTGTTTTCAGTTTGTATGGCCCGCATTTGGTCAGTTTTTAAGAGCACCCCACTTAAACCCTCCGCTGACATAAACTTTTAAACCCTAACCCAAAATCCAATTCACATATCGAACTGTATAAAATTTGCGTTAGAGCTGGATAATAAAGAAGGAAACTGATTGTTGAGGTCATGGTGT--AAAT--TTTAGTATAAAACAAATAACATT------TATATTAAAAGTTGCCTTCTAACAAGTTGCCTTAGAACACACAC------------AAATGTAAAGCCCAATAACTCCAAAAAGTCGCAATATGAAAAGTTAAACATACCCTTTACATTTTATAAGCAAAC-TCATTCGGTATGAGTT---TAGTTTTTATGGGTGCGATCATTGGCAATCCGTCGTA---------GTTTAAGATCACTGGAACTATCAATGA-----CCATAGAATCTGCCCA-------ATCTACACTTAC-----------AATGGACGCAACAACCGATGGGG----GACAATTAGTTAAATGTAAGAATAAAGCAATCAAATCGTATTGA--ACTCGATTTTTGCA---------GTTCGGC-----------CAAAGCATAGTTATGTTAAC---------CAAACAATCGAAGGCGTTTGATTGATTAACATTGAAGATCAGTGGAGACGGAGGCATGGAGTTGAATATGAAA---------CAAGTTGCTAGCGGTTAAGTCACCAAAGTCTGTACATAAAAACAATATCAAAATGCAGTTAAAATAAAGCATTTCAAATGATAAG
CACTCACTGGAACAGAAGGCCGAGCCGGTGGAAGTAACAACTGTCATCGACG---------AGGAGGAGCAGCGGCTGCTGCAGGCGGTGCTCGTAGCGGCCAATGGAAGGTGGAC----GGAGCGGCAAATGCAACGGCTGCAGCAGCGCAGCTGACGGCA--GATGAGCGAATTGACTCTGACTTGGACAAGGAAAACGCTGGACGGAAGACGATTACGACGGCGCAATCAGATGGTAACAATTTAATAAACCTATACACCCATATGGACACACGCAAACACACACACACACACACACATACATATATATACATGCATAGATGTGAAGATGATGTTTAATGTGGGCCTAACGGATCATTGAGCAGCACCAAAGATCCTGTCAATAGAGATTTAGAAG-TTGTTATTGTGTAAAGTTTAAGTATAAGTTGAATTTGACTTCGATTAATTATTGGAATATTTAACTCCGCACACACACACACACAC---ACCTGTACACA-ACAAAACAAGTTTCGTTG---------------TTGTTGGATTAGTTAATTGTTTTTTATAGCGT-AATGTACAAAGTCATAAGCAAAAAACAAACAAAACAAAAAAAAAAGGAAAACAATTTTTGTAAACTCTTGA----AGAAAAATGGTGGCAAATGTAAATTTGGTTATTGTAAATTTTGTTTGGAAAATAAC-GTATATTACAAAAGAAAAAGGCATACAATTTTGAAAATTAGTTAAGTGCAAAGATAGTTAATTAAG-CTATTTAACGAAAGGAGATCTAAACGCGTACACATATTAATAGTCTTATATACATACATATGCATACATATATAATATTAAATATTACAAATAATAATACGCTTTAAGTTGTGCTCTATGTTAAGTT-TAGAAATAATTGTTAAACAGGCATGCCAACCGCAGCAACAACAATAAGTATAACATAGAACATTGAAAGTGAATTGTT---TATGAAATTTACTTTTTCATATTTCCATCGATACATCTGCTCGATGTGAGCGATATATTATTTAATTATGTCAAATC--TCCTATTTATGATTGA--------------CTCTTC-----AAGCATTGCTATATAATTATTATATAGCATTCTTTTAATTTAACTTTACCTACAATATATTGTT------------AACTTATGTTTT------CTTTGATTTGTTTTATGCATTTTGTTTTGTTAGCTAAAAGAAATGAAATTGAAATTTCCCCAAATCTCCCCAACACACAAAACTTAAGAGCGTTTATCATCTGTAT-GAATTAAAATGAAATAAATGTAAATGCAAATATC-AAAAAAAAAAAAAAAAAGGACACCAATTTA---------TATTTGGTTTGT----TTTTAAACTCTGACAAC-------------------AACAAAAACACACATA---------TCTACATATTTTTTTAAATT--------GAAATTAATTGATAATTGAAATTGTGGAA------------AGGCGAAGAACAA------------------GAGCTCATGATCCCGAAATTGTTTAGTGTAAAGCGATTAACATTTAATAATATATT-AAAGTTGCCTTTTAACAAGTTGCCTTAGAAAACAAACAACAAAATATGAAAATGTTAAACAAAAT--CTCCAACAAAAAAGGAAAAGAAAAG---AAAACATGAATTATCGCTTAGAGGAAGCCAAAATACAGAATGCGCTGGCTAACAAATACGAGC-CAAGCGTTGTTAACGAGTTATGCAAGAGAATTTTTACAAACGTAGCAATAGTCTATAAGGTTCCAATAGAATATATATACATATATATATATATGTACCACAACACCCAAGTTTAAGCAACAAATGAAGGGACGTCAACAATTAGTTACAAGTTAAGATCAA-CAATCAAATCGCATAGAATATCTTATTTTAGCATACGATACGGTTCATCTATAAGAATAGCATATTATAATTATGAGAATTACGAGTTGCGAAAAGTTCGAGGCGTTGGTT---TTAGCTGTAAAAATGA----------------------GAATATAAAAACCACATATTAACTTGCTAGCGTATAAGTCACCAAAGTTTGTATATAA-----------------AGTTCAAATAAAACATTTCAAATATCAAT
>CG6279 11067314 11067379|11685 chr3L 11067264 11068775 scaffold_8 107855 109266 + 31349|63 128
GGTTTATTTACGTCCGTGCAGCTTACGAAATAGTTCAATAAAACCAAACTAAAATTTATGGTAATT
A--TTGTTCATGCCAAAAGATCTCAAAAAACA---CAGTAAA--CAAATTTGAATCTGTTTCAGTA
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CGAGGAGCTTCTCCTGATTTACCTTCTTATATTTTCATACTTTTAAGCCATTTCC
CGAGCAATTGTTCTTAATATATCTAATACTATTTACATATTTTTAAACAATTCCC
>Sod 11086220 11086399|11700 chr3L 11086157 11086999 scaffold_0 6685618 6686531 - 24120|65 303
GCGATAATCTATTCCGATGTCGGCCACTGTGCTGATCTACTCTATTTAGCACTACCCAC---TGGAGATATACAAACGATATACATACTTCTAA-----------------ACATAAATAC------------------------------------ATAGCCTGTGGTCTGTTAGTTG---ATACGCAACCTTTGAGGTTCAATAAATTGGTGTTTTGAAATTGCCCCATAAACAAAA
ACA-------ACTCTAGAGCCTAAAAGCATTTCAAGCAAATGCATGCATAATAACCCACAAATATATATATATAAATATTGTATATGGATTTAATTTAGTGTATCCACGGCGCGTAAATACGGTTTAAACTTTCGATTGGATATATACGTACATTAAAGAGATTTTCCTTTGTTAGTTGTTCAAAAGCAACCTTTAAGG--CAATAAA-TGGTGTTATCAAATT-----------AAAA
>Mnf 11088241 11089031|11703 chr3L 11087972 11088986 scaffold_0 6692297 6693353 - 27467|315 1187
GGCCCA-TGGGTGTAAACGATTAGAAAGCAAAAACAAAAAA--------------------------------------GTATCTCCATCTTGTATATTGAATTTGCCAATCAAAAACCTATACCTAAACCCCGAAATACAAATCAAATTAAATAGCCACACACGCAGAACTTAAGGAACATGAACGCACGCGAAGAGCAATGTATATGT--------AAATTGATATGGAACATTTTACAAATAGCAACTGTGAGATGATTGTGTTTGAA-ATGTTGGCCATGCAGCCGTTCAACGGCGGCGACTTATGCAAGCACACATTTTGAAAATTCGAAAA----------CCCGATTCGAAGTAACGACTTTATCCCCTAGATCTGACGAATTCAATATGCTCGATGACGCTACTCTCTAAGTA-ATATAATAAATTTTAAG-TTTACAACAAGGTAAAGCAGCA---------------------AACAAAGCAAAATTATCTAGATATATGCG-----------------------------------------ATTGATTATTGTA-ATGATTGATGATT---ATGATGTTTAAGATGTTATAGCTATGTGACCGAATTGTGCGAGAAACGTGAAAAAAAATTTGGGGAAAATTAAGTAACAAGCAAGCAAACCACACAAGTAACAAACAAACAAACAAACAGGCGAATGAATAATATTACCTATCTACATACCTTTACCTATATCGATTTAAATAT-AATATATATATATATGTGTATATATATATATGTATATCTATATTAATATATATACAAATTATTAAAATACAAACAAAAACAAAAATGATGAAAATAAATAAGTAATATCTACAAA
AGCCCACTTTAAGCAAATTTCTAGAAAGCAAAAAAAAAAAAAACTAAAACTAAAACAAAAACAAGAAGAAAAAGAAAAAGTATCTCCATCTTGTATATTGAATTTGCCAATCCCGAACAT-------------------------------------------------------------------CAAGCGAGAATCCAAGCGGAAGCCCCAAGAAAAATTGATACGAAAATGTTTATAAATAG-AACTGTGAAATTGTGTTGTTTTAAGGTGTTGACCGTACAACGGTTAACCGGCG--------TGCAA--ACACTTTTCAAAAAAAAAAAAAAGAAAAAAGCCCCCAT----ATTTACGAC-TTAACCCTTAGCTCTGACGAATTCAATATGCTCGATGACGCTACTCTCTAAGTACATATAATAAATATTAAGATTTAAATCGAAGTAATGCAAAAATAACACAAAAAGAAAAAAGCAAAAAAAAAAAATTAAATATATATATATATATATACCTAAACCTATATATATATATATATATATATATATATATAGAATTATATACGATTGATTATTGTAATGATGTTTAAGATGTTATAGCTATGTGACCGAA-------------ATGAGAGAAAATAGGGGTAAAACCAAGCAA--------CCAACCACACAAGT----AACAAACAAACAAACAGGCAAATGAATATTATTACCTATCTACATACCTTTACCTATATCGATTTAAATATAAATACAAATATATATCTATATATAAATATATATATATATATATATATATATATATA------TAAAGTATATAC-------AAAATATTAAAAGTAA------AATATCTACAAA
>Mnf 11088241 11089031|11704 chr3L 11088987 11089562 scaffold_0 6693498 6694082 - 23233|0 44
TGCGTGCGGATCCAGAAGCACCGGCAGAACAAGGGCAAATAGTGA
TGCGTACGCATACAGAAGCAGAAACACAACAAAGGCAAATAATAA
>Ufd1-like 11095911 11095987|11709 chr3L 11093597 11097095 scaffold_0 6698790 6702666 - 127553|2804 2908
CTCTGTATCTCTAGTTCTAGTTATATATTGT-----GTGACACATAGAAATTAAAGGAA---------AAACCTC--------------ACAGGGGCAGCGTCAA
A-ATGTAACTA----CCTAGTTGTTTAATGTTGCACATGGCTCATAGAAATAGAAAAAACATGAAATGAAATTTCCACAACATCAAATTACAAGTTGAGCGTCAT
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ACTAACCGATTGAACAACAAATATTTACGAAACATTCCGAAAATTGACTTAGCTTTTGTACTCGTATTTATTTGCTACTATATTGTTAATGAATATAACACGTTTTTCTCAATGTGCAACATATTTCACATATTTGTTAGTCTCAAAAGTT-ACCCGATTTTCTATTTACT-TACTTTTCAAGCCATGTGTAGCATTTGATAGTTTTGCTAATTAATTAATAATAATTAAAACTCTATAAAGCTAAGGTGTTAAATGAATACAGCCCATACTTAATTACTTGCGAAAATACATCAAATAAACTAAATAAATGCTTATATAATTTCATTATCAATCAAT
AATTAAGGCGCCCACAACTACAATTT----------------------TTACCTTATGGAATAGC------------CCACATTTGTCATAAATACAACTTAAATTT----------------------AAATTAATTAAACTGAAATATTAACTCGCATTTCTCTCAACTGTTCTATATATCCCAAGCG--------AACAGCTCTGGTAAATAAC------------AGACTCT------------CGGTAAGTCGATTTCACAC-TGCTTAACAGAGTCTAACATTACGCTGTAAACATTAA----------------------TAACATGCAAT
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GCGGAAGGACTCGAATTATTGTTTTCTAAAGGGTTGTGTGCCAAACTG------AGATCACAATTTGGCC---TGCAGCCGCAACGC---------TTAAAGTGTGTGCTCATTTA-ATTACCATAGTCAGTAGCATTTCTTGCCTAGTTTTGCATTCTGTGCATTCGACAACGCGATCAGCATTATTACTTATCATTAACATATAGATTGTCTAGTTTTTCACAGCATGCTCAAAGTGTACGATTTTATCAAATGTATTTTTATGTATGCGCCTCGGCAGTATTATCTATTGATGTCCAA--TTGTG-CTAGCTTGTAAGTTTTAACATATATTATCAAATAACATTTTATACGTGTAATAACGTTCAAGGGTGGTCCCATTTTTTTTGCTGAACAACATCTTGCCTCGGAAACTATATGTTTAACATTGAGATGAATTAAAAATC-----GAATAGTGTATTAAAATGATATTATTCATATAGTTTCAAGTGCCAAATTGTCGACAGATTAAAAAAGAACTCATACTTACCACCCTATAATATTTATCCAGAGGACTCTGCCCAGATTTTAAAACTAAA--AACGTAGAGCAATTTTGTATTCAAGTAGCAATGCATCGAATAAA---AAGCAATATTGAAAAT
GGGG-------CCAATT----TTTTAAAAAATAATGTGTGCCAAACTATTTCTAAGATTAGCTTTTGGCGGAGTGCAAACGCTCTTCACTTTAGTGTTTGGGCGTGTTTTCATTAGTATTACAATTACCAGAAACATTTCTTGCCTAGATTT--------TGCATTTAACAAA---------------------CACATACTTATATATTTATTAATATTACTCATCA--------------GCATTCATTAA-TGTATTTTTTTATAGAC------------TTTTCTCTGCATGCTCAAAGTAGTGTCCAAGTTCAAGTTTTTAACTGATATT-TGTAGTAA------ATGCGTGTACTTA---------GTTTTTATATTTGTTTT------------TATGCCTCGGCAG---TATTTTATATATATATATATATGGAAAATCTTTTTAACTAGCCAGTAACAACACTATCAT-CGAACATTTTCGGGTGC----TTTTGGTTACAT----GCACAACATTTGAATGCAACATTAAGATATTCA-----------------AGATCGTGTAACTGTCTCAACGTAGAGCAATTTCTCACTCAAGTAGCAATTCAATAAATAAAGAAAAGCAATATTTAAA--
>GlcAT-P 11150895 11152364|11759 chr3L 11150344 11151388 scaffold_0 6762455 6763505 - 8776|599 1125
TATATAGAAATTTATATTCAAGTTATGAACTGCACTGAAATCGCC-TACATGTAAATACTAATCACCAAATATTGTAACCAAATTTTTACAAGTCCCGCTAAAGCAGGGAGATGCGCAGGGATTGGAAAA------AACTCTGACAAATGGTATTACGAGATTTATACAATTTATACAATTGAATATGGAATGCGATGTGCCGCAAAGACATTAGTTAGGTACTTACAAAATCTTACAGAAATAAAATAACAACCGAGTCTTGATGCAAACTCGAG-----TTAAGCAA---CTTAAACATTTTCCAAAAATATCTTAC------AATGTTTCAATGATT-----AACTACACAGATACCGAAATACGTCTAAAACTATTCTCTTATTCAAGTAAACTACAACATAAAATGTTTAAACCTGACAGGGCTAATAGCAAGGAACTTCAATCATTTTTAAACAAAATACAAATACCTTTCAATAAATT-------GATAAACTTTTCTTAAAAATTTTCAAAGCAATCGC
TACATAAAAAAATATATTTTATTTAAATGCTACATATATATTTCTATCAATTCCCAAACTAATTATCAAAGATC---------TTTGTACAAATTCCTTTGAGG---AGTGTTTCACAGTTTTTGGAAAATCCATCAAATTGGGGAGAAAAGATTTGGTGGGTGACGTTTCGTGTTCACATTTATTTCAAA-GCATCTATACGAAAAATCATTTGAGGCGTGTTTCACACTTTTTGCAGAATCCAAACT--------TTCTTCACGCAATTTTACGATTTTTTGGGCTAGGTCTTAAACTTTGTCCGAAATGAACTTAATAAATAAGTGTTTCTGCGATTTGGGAAATTCCAGCGAATTCCAGGAAATTCCAG---TGATCAATTAGCGAA--AAACTGTTGTATGAAA-GTTTTTCCTTACCA------------------TTCGATCCGCTTCAAAATAATTTCAAAAATATTT-AATAAGTTCTTCCGTGGCAAATTAAATTCAGAAATTCTCGGTTTAAAAGC
>GlcAT-P 11150895 11152364|11760 chr3L 11152053 11153928 scaffold_0 6765587 6767295 - 43374|0 411
GGATATTTACTGTAGTTAGC-------TAGTTAGGATTAGCAAGGAGCTCGC----------------------CGTATCCAGGTTGGCTCGCTAGCATATTGACCGTGGCTCAGACGGATTGTACAGGTACAATCCGGCGCACGGA---------GATACCAATCAGAATTGATCAGATC--ATTAGTCGGTGTACATTATTATCATAATCATAT-------------------------------------GATTAGTTAGGCTCTAAGCGCACACATACCTATGATAATTCTTTGCACCGTAGTCTTTGTTTGTTCGCA---CACCTAATCGAAACTTGAGTAAGC--------------------TATTGTATCATATCTCAGCGTCCATGACTACTTTGTAAATAAT
AACGGGGGACGCCACCTTGTCCAAGTGTAGTTAGGCTTAGTTAAGTGTATGCGAATACGATTGCTATACGATTGTGTATGCA-GCGAGTGAGCTCACAAAGTGTCCACGGCTTTGACCAGTTGTACAGGTACAAACTTGTGTTTAAGTCGTCTCTTTATAACGACTATCATTAGTTTGCACAGACTAAATTATGTAAATTATTAATGTAACCACACATACAGATAGACGCATACATATACACATTAAAATGTAACTTAGTTAGGCTCTAAGCGCACAAGTTTATACGGTA---TTTGAAATCATGGCCAAGGCTTGATTTGAAACCACATAGTTTAGACTCCGCTGCACAGACAGTATATACCTTTTAGTATTGTATATTATAGTATCCTCTAT--CTATTTTGTATATACT
>CG6199 11172113 11172372|11783 chr3L 11171866 11173178 scaffold_0 6788178 6789552 - 42982|261 586
-GTAGCTAATTTAAGTCGTACTCTTTATATCAAACTGCCATATCGGCCACTCCAAAGAACTGCATACTAAGCCCA--------------ATGAACAATTTATGTTGA--------------TGGAATTGCGGCATCGGCCTTCTATTTCTGATGATTT---------------TACATACTACTTTGAGATCGATAGCTTTAGGATACTCTGATGAATCTGTTGCAGCCTTAAGTTAATTATAAGCTTTTTTACCAAGTGCAAAGTGTTCAATT--------------------TTTGAATAAATTAATTCAATTATTA---AATG
CGTGGCTACTGAAAACTATTTTTTTT-------ACTGCCATAAAGGCCACTCCAAAGAATT-TATATTTAGCCTAAAATAGGAGAGCATATAAGCAACTCGAATCAAATCTAGTTTAGTCTTGGAATGTGGTCTATTGCCTTAGTTTGCGATTTGTTTGCCAAACATCCTGACTAAACACTAAGTTTGTCTCGA-AATTCCAGGGT-CTGACACAAAACTTTATAAGCATTAAGTATACTGTAATTTTTTCGAATGGTTTTAAACTCTCTAAATAAAAACAAACAAAAAAATAATACATACAAATAAAATCAATTTTTAGATAATT
>As 11180366 11180743|11790 chr3L 11180350 11182510 scaffold_0 6798565 6800796 - 94589|16 460
ACTATG---------GTCCAAACTGCAAGTGCAAGT-CTGTCATC--TGGAACTGATACCACCACC---------------------------TCTCTGGGAAGAAGATTTCGAAGACTTTGATCGGTTTGAGTTCGTTTTGGGTTCTGCCATTTATTTTTGATACGACCTGTTC-AATGAGACAATATATACATACCCAATATATGTGCTCAATTTATATGGTGCGACGGCGAAGCGAGCAG------ACCGAACGGAC------------ACGCGATTTTGTTTCCCTTCTTTAGCCCAGTTAATTGTACATAAACACACACATAAACACGCCACATACTACATTATGTGAACTTACCCTAGGAACAACACCCACATTTAAAAACAGT---------ACGCGCTGAATATTTTCCTAAATAAATTTAAAGTAGTTCGGCGAAG
TCGCCGCAAAGGGATGTCAAAATGGTTGATACACATACCTCCAGCAACGCAACAGATACCACCTCCGATAATTTATGATGATAATGATGATGATGTTGATGAAGACGATAATGATTTATTAGTTGAGCTTTAGTTTGTTTTTGAATTTGTCATTTATTTTTGATACAATTTGTTCAAATGAGACAATATATATGTGT---GTGTAAATGCTCA----ATATGGCGTGATGG-AAAGAAGGCAGGCATGAACTAAGCAAATTCGGTTTGAATGACTTTATATTGTTTACTTTGTC--GCTCAGTTAATTGTATATAA------------------CATAAATTACATT-TATACGCATACTC--------ATACACTCATGTAATTACGTTTGTAATGCAGCACGCATAAAATTTTGCTGAATAAATTTCAAGTTGTGC-GCCAAT
>CG32083 11254113 11254291|11873 chr3L 11253951 11254419 scaffold_17 2526021 2526431 + -713|168 359
AAAATTCTGCAAT---TTTAAGTTATTTTACAAATTACAGGATCAGAGCTTTACGAAATTCAAACTTAACTC--TTTTTTCAAATTTATATGCTA----ACTAATGCCATATACTTAACTAAGATACCAATAGTTTTAACCTTTTTATATATA---ATATTTATAAGTTCAAAAACGCTCAC-TACTACTAC
AAAACGCCACAACTAATTTTAATTTTCGTACAA--------------------------------TTAACTAAGTTTGTTTGAATTTATAGCTTAGAATACAAATA--AAACAATTCATTTGCATATAAATAATAAAAACAAATCTATATATATACATATACATAAACTATATAGTATATATATACAAATAT
>CG6175 11261869 11262797|11887 chr3L 11261288 11263007 scaffold_0 874746 876431 + 19259|651 1678
AACTAGCAAATAAACGGGGATAGGATTTTGGAT---ATTGGATAAATCCGACCAAAAACAT--GTAGACAAACTACGACGTAGACAG-GGGGGGGGGAGTGGAAGAGACAACAACCAAC--GCACTAGTCAGCAAAGCAACAATTGGTCAA-AACCAGAGCCAAGAATTAGTAGAACCAGGGGGTTTAATTGGATGGTTGGGGAGGGGGGAGGGGGTGGGGAAAGCGGGTGACATGAGCATTTCATTCAGGGACAATGACCATATAAGTACTT-------------------------TATCTATATACATTTATAAACAC---ATAAACG-ATATCAGTGAGTATATCCGAAGTCAGTCAGTCAGTAAAAGGAGTGCAGTTGAATTAGGGGTGAAACAAACAACATACCATTAAT-TAAATTGAATTAATTATAAATGCTTTAAACGTTAACAGTGTATTTTTATGCACACACCCATATACATATATATATGCTACGTTTATAAATATATATATATATATATACTTTTTATGATTAT-----CGTTTTTTGATTTCCAGCGAGCGTTATATTTTTGATTTTCGTTTTATTATATTTACATTTGGCAATAACACTTTGAACTCAGGTGCCTTTATTTTTTTAGTCAATTAAGCCTTGTTATCTTATGCATAAAAGGGAAAGAGCAAACAAACAAACA--AACAAAACGAACGCGAATTGATTGCAAAATGTCTACATGTAATGCAAATAAATGAAGCCGTAACAACA---TGTAAATTTAATTAACTTTTTATC-----GCATATGCAAAT------------------------------------------CCATATGTATAAACTTAATTCTGTAAATA-GTCTAAAAGAAAAAAAGGAGAAAACAATGAAACATGAAATGTGCAAATCTTA-ATTTTTGTTATGCATAACTAATTTGAA-TCGAGCGACGGGCTCCAAATAAAAATGCAGAAATGTTGAATTTCATTTTGAAAATGAAACGAAT
ACGACGGGGCAGACCTGGAACTGGAACTGGGGCCCGACCGGGC-AACCGGATCGAGAGCAGAAGAAGAAGAAACACGCACTAGTCAGCAACGCAAACAGAGCAACATGCAACATGCAACATGCAACATGCAAC-ATGCAACAAGCAAGAAGCAACAAGAGCCAACAATT-------CTAAGGG-----------TAGTTAGGG--------GCGGGTTTAGAA-------GCCAAGCGCATTTCATTCAGGGACAAAGACCATTTAAGTACTTTTATACAAATACATAAAATATAACATATAAATATATGTACATAAATACTATATAGACGCATATCAGCGA-TATCGCACAGATTAGTCAATCAA----------------GAGTCA---GCGAAACCCACGAGAATCCTTTCATATTATTTTACTTTATTTT-------------GTTGCCAAGGGA----AACGCATTAATTAAAATGAAT---TAAATAATACGTTTAATATTAT-TATATCCCTTCTTCTTTTTTTTTATTATGCAAACATTTTTTGA------------GTTTTATTTTTATTT----GTTTACCTTATTTACATTTGGCAATAACACTTTGAACTCAGGTGCCTTTA-TTTCGTAGTCAATTAAGAGTTGTTATCTTATGCATTAATG----------AATCGATATGCATTAAATAAATGTATGTGTAT--------ATGTATATATACTAAGTGCCCAT-GTTGAATCAGCAACAAAAAACTGTAAACTTAATTCAATTTTGTTTTGGGAACATATCCAGATGTAAACGCTATAAATACTTACACATGTTTCCCACTTAAAGCGCGATGTACATAAAACAAAATATATATATATATATATATAAAAAAGAAAACAGAACATTTAAATAT-ATTTAAGTATCTATTACAATTTTGTTACTGA-AACTTATTTGAATTTGAGCAAGAGTTAACTAATAAAACTGTTGAATT-----ATTTCATTTCGAAAATGA-------
>CG6163 11335933 11336551|11977 chr3L 11335544 11336351 scaffold_0 956802 957541 + 4891|437 862
TAAAATAATCGTCAGATGTAAAATCACTAGCTATACCGCATGCCCCTACTATTGAAAAACCTTTTTGTAATTCCATTTTCTACTACTCCGCAAATAAATA--CATCACT-AAGATATACATAATATTTAATTTGTATATTTTGGTTGGAAATAAATTCACTTAGCATATATATTCCAATTTGTGTAGTCTAGAAACTTCCATGTATTTCTGAAGGATTAATGAATTAA--AATTAAATTAGGGCTCATTCA--ATGCGAAACTGAAATGGATACTACTCACGTTATATAACCGAGTGGTATACATTTCATCAATATCAATTTCGAGAAAAATGCGATTGTAATTTCCGAATGAAAGGAGATTTATTCCATCTGAAGTGCTTTGCACTCAATCAATTGCGATAATCGTGATGCGATGCGACGGATTC
TACACTTATCGCCAGATGTAAAA---CTAACTACATTACA-----------------ATCCAATTTGTATTTCCAATTTTCA--ACTTTGCAATCGAATAAACATCACTTAAAATAAACAC----------------------GCAGTGGACCATTCCAAAAAGCGTCTGCGTATCAA---ATATGAAATAGTAA-----GGATTTTACAGAAGTATTGAGGAATGACTTACTAGAATCAGAGAAGATTCAGCATCTGCAATTTGCCTGGAATATCTCTGAATTACTTTTCGGATTGCCATAAACAT----AATGGGAAGTTCTCGGTAATCACGTTC----TCGCCGTGTAAA----------TCTCACTCAAAACGCCTTTCCTTGAGCCGTTTCCTGGAAT-------------------GTC
>CG6163 11335933 11336551|11978 chr3L 11336544 11337039 scaffold_0 957631 958172 + 22591|0 7
AGACTGAG
AGACTGAG
>CG6140 11437512 11437714|12146 chr3L 11437638 11437981 scaffold_26 1570356 1570702 + 12574|0 80
GTTTTCCTCCCTTGTTCCATGTGTTACACATTCATAAATTCCATA----TTGCAAAATTTTATCGTTGGAAATACAATCGA
ATGTGTCGATCACCTTGTGTACTTT-CAAATCGACGATTTGAATAAACCTCATAAAGTTGCATCAGTGAAAGGCCTATCGA
>Sgs8 11482914 11483005|12190 chr3L 11482870 11483155 scaffold_5 6264370 6264666 - 3999|44 154
AGATGTGCCC------TCAACC--TAATCGGCACTGACCTTTTATCTGCTGGCATTTAAAACTGCTGTCTAATAAAACTATTATCATTC-----------CTGCACGACCC
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AAAGAATGAGACATACATTGCAACAGCGATAAAACGT-------AAAAAAAAAAAACATTTAATTAAAT
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TATAAAACCACATGCGA---ATATGTATTTATTGGATTTAA--------AATCTGCTGTGTACCTGTGTCTATGTCGAGTTAGGATATGCATAGACATCGAGTTTAACTAATTAAATTAAGCTATTAAGTT--------TTGTTAACATATGTCAAACTAGC-TGGGATCATGAGAGTTGCGTTTTTCAAATATATTCTGATT
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AATTAAAACAGTGGAAATTGTAACTATTTTATTTCGGCATCTCAATGACATTT----TCTATCATTTTTAATGC-CAGTTTGTG--CTCAGAAAGCTAATTCAGAAATTTTAAACATTTTGTTTAACTGGGTAGCGGCAGTTGGCAGTGCTGGCCCTGGGCCAAATTGTAGACCCGCCCCTAGTTTACCAAGCCGTGGTCCAAGATAGATGTAAAGTAGCAAAAGTTTGTTTTTACAG-----TATTAAAGCCCCGACAGTGCGTTGGATTCAATTCAATTCAATTCATTTAATTTAAAATTCGGGCTATAGCCAAATATCAACAGGTATTTAAATAGAGTCATAACATTCGGATCA--TAGAAAAAAAACAGGATCATAATTAATATACGACAGTTTGTAGCCCTATTGTCATTAGGATCTAAAAAATTTGCAGGATTATCAATCGGTTTTATCTGACTAAAACTAAAATTCCAAATATCGCTTACTGCCAAAGCAGCTTATGTGCGGAAAATATTCGGAAGATTCTTAAATAGTTGCGATCCAAAGAATATTACATACTATATTATATGATGATCCACGGTGTATTCACTGGGTCACTCCAACAACCGTTAAAAATAAAACTACAAGTTTTT---------------ATTTTTTT---TATACAATAGGATGACATTTTGTCGTCCCACAAGAAA--------------AAAAAAAAAAGAATGAATAAATCATTTTAT------AGTATATATATTTTTCTAATCAAAATGAGCAAAGTTCATTTAGAACG-ATTTAATGCGCTAACTGCACACTAATTAATATGCACAAAGCCAAAACATTTCTTTGCTAAGAATGTTAAAGATTTGC-------TTGACTTGTAATAAACAAACCATAAACAAAT---------TGTATTTATG
>Pi3K68D 11748598 11749670|12437 chr3L 11749401 11750534 scaffold_0 7516148 7517327 - 40384|0 325
CCAGATCCTAGGGACGAGCTCTTTTGA---------ACCTCTTGGGACACTCTGCCTACCGACAATCAGGCCTAGGATAATGCA---ATACTAATATATGTTTGTGCCTGTCTTCTTTCGATCGCAATAATACTTACTTACTCGAAGTGATTGTACATTCCATA----------------TACCAATAT-TAAAAATAACATAACAGTAGTAG---TATTATTT-CGTAAAATGTGTGCCT---CAAATGTAAATATTTTATAATGACCGCAAACA--------------------ACATTCTTTTGGACATCTGAATGTAATTAT
AGCGACAATCTGGCCTAGTTTTATATACACGTACACACTCAATCGAACCCACACACTCACAACACTCACAC----ACTCACACACACATACACATATATGTTAGTGCCTGTCT--ATTCAAT-GCAATAATACTTACATACTCAAAGTGATTGTACATTCCACATTATACTTATTATATTTACTTACATATACAAATAACTTAGCTGAACTCTACCTATCATTTGTATATAACGTGCACACATACACACGCACACACACTCACAAACCGACAAACACATTGAGAAATGGCACACATATACTCTTCTAGCAATTGGTATTGAGCTAT
>Pi3K68D 11759991 11760572|12440 chr3L 11754542 11760620 scaffold_0 7522683 7528815 - 220909|5623 6399
TCCATTTTAATT--GTCCTCTACTACTATC--------------------AGTACTACTACTACCAAAAA-TGCAAAAAAGCAACTACTTTACACCCACAACAACTACAC-------------CATCTAAAG-----------------------------------------------------------------------GGTTTCGGTTCAGATTGGTTC---GTTTCGGAG----------GCAATGACAGATTAGTGTCTATAACAGCACTTACTTAGA-CCACCTTATTACACAAAA-ATACTAAAGTAATATATATACATATATGTATGTGCCCTCATATCGAAATTCGTGCCTTCCGCTATTGC-------CGGAATA------ATTTTGAAGTCA------GCTTATATATCG-----------------ATGTCCAAAATGTCGTAT-TCAACTAGTTCGCAATGTTTGGAATTGGTTTCTATGTATATTCCCGCGACTGAAAACTTCAAAATTTAAAAGAATTTAACGACTGTCAATTGAAAAGTGATGAAATGAGAAGAATTAGTCACTTCTTTTTAATAACCATGTATTACGAAATGAACAAATTGTGATTTGCTGCTACATATATCCAT-----------------TAATACACTTATATACAAAAATAAATA----------------CATACATATGTTTAATTCTATCGTGTACCATTGTGAGAGAACAAATAAATAATTTCTTAAAC---AAATTGCA
TACATTTTAGTGCAAACTTCTACTACTATCCATACTAAGTACTACTACTAACTACTACTACTACCACAAACTGCAACTACTTAACTA-TCTACTACCACAACAACAACACCCACCCAGACCAACAACTAAAGTGCAAAAACCCAAGCAAACCAAAAACAAAACAAAAAAGTCAGGCGAGAACACATATACACAACACGTCACCAGCTAAAGGCAAAATGGGCTCAGGGTTTTGGTGTGGATATATCGAAATTA-AAATAAATGT---TATTAGTGCCCACTTAAAACCACCTGCACACACAGCATACACTATTTTTAGAAATTAACGT-----------TCTTAAGTCTAAAACTTGTGCCTTCCACGACTGCGCCAGAGCCAAACATTAGATATAGTGAAAACAAAAGTTGGCCATATATCAGCAAAACAACATTTAACATCACAAAAGTGAGATATCTAAATTAGTTT------TTCGAAATTTGGTGTTTTGAATAC--------------------GAATTTGACAGATTTGTCTGGCT-TCATTTTGGTTGTCTATCAATCAGATTAAAT-TTAACTTAATTTTGA-------GTATTATGAAAG----AAATTGTGATTTGCAGCTACATATATACATACACACATACAATATTTTAATATACATATACATATATATATATATATATGTATATATATACATACATATGTTAAATACAATCTTGTATAACGATGAGACCAATAATAAATAATGCCTGAGAATAAAAATCCCA
>CG5964 11764159 11764224|12447 chr3L 11763663 11764253 scaffold_0 7533307 7533847 - 408|536 601
ATATTGTGGAAAAATTTGTGGAAGCACAAATAATAACAACTGAGATAAATAAATGTATTACTTGGC
------TGGCAAATCTT----AACCTGCACTGAAAACATTTAAAATAAA-AGAAACACTATTTCCA
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-AAATGGAAATCAAATGGAGTCC--------AGTATTTTGAATATTGCATTTATATTAAACGAAACTGCATTTATCTACAAAC
CAGATGACATTTGATTCAAGCCCAATTGTCAAGTATTTTT-GTGCTGCATTTATAATAA--------------ATCCAGAAAT
>CG32094 11784989 11785444|12462 chr3L 11784214 11787782 scaffold_0 511147 514574 + 71963|803 1313
ATTGTTTTAAATTTAGCGGCAACACTAACTAATTAAATCTATGAATTAAACTTAGTGGTTTAGTTATATTTTCAAAAAGTGCATTTGAAACAAAGCTAAATGTCATTACTTTT--CAGTGTGTACTGGTAACTTTAACACCAATTC------CGGGATAATTAGTACACCCAATTATCCGGGTCCATATTTTGATGACATGACCTGTACTTACAACTTGACCGGGCCCCTGGATACGGCTGTTCGAATGAGAATTACTGACCTATCTCTGGGCA------------CTG---------------------CCAATAATGAAAATGATACTTC---TTACTTGGACGTAAG-----------TGATATTTGTTAACTATTGTTAACTATATATTTACAAACGGATCAATCTTATAGGTGTATTTATCGGCGGATCAAAAGCGGCATATTGTTAAATCAACGGATAACCTCATCCTGTTGTCACATAGCAATCGGGCTAGTCTGGTCTTCCAC
------------------GCAACA----------------------------TAATGGGTAGATTCTAT---------------------------------ACCTCTCTTTCGGCAGCTTGTACCGGCA---TTTACAGCGATGCGGAGGGTGGTATTATAACCAGCCCCAATTATCCGAATCCCTATTTCGAGAATCTGAACTGCACGTACTATTTACGGGGACCTACAAATACAGTTGTACGCATTAATATCACCGATTTGTCGTTAAGCGAAACACAGCCGCCTGCTCCAGAATCCGATGAACTATCCATTCAAGCAGAGGATCAGTTAAGCTATCTGGATGTAAGTGTTCTTCGGCTGATATATTTGGACTAT--TCAATAATTGATTTGCACTCAGGTTTATCTCACACG-------AAATGAGAGCGAAAAGCAGCGTTTCGTCAAGAATCTGACCAATCTATTGCTGATCTCAACTAACAATCAAGCACGCTTGGTCTTTCAC
>CG5946 11790937 11791090|12465 chr3L 11790598 11791060 scaffold_26 1893806 1894289 - 402|384 510
TTTCGTTGTGTTATATTCCTCTTTTTT-TATCTGTTGTCTCTTACCAGCT--CATCAAAATCCAAGAGTTCGCCAAGATTTCGGCAATGTGATTGAAAACCAAGCGAATAAAAACATTAATTAGTTT
TTTCTATGTATTTTATTTTTCGTTATTATATTTACTGGTTTGCAATAAATTACATAAAATAACAACATGTTTCCATTGTTTTAAAA-------TAAACGTAAAATGAAAAAAAAAAACTATAAAGTT
>CG11597 11794275 11794425|12468 chr3L 11794061 11794361 scaffold_16 158923 159229 - -1096|233 336
CACTCCAAAG--CGACCTTTGCCATTCCAAACTACTCATATACTCATAATTTCGTAATCAATAAAATACGTGTACTTAGTAAAACATGC---------------
AAATAGAATGGACTATCCTGGCGA--CCTGATAAACTGTCTACATGGAAT----AAACCAATATGAAATGAGTACTAAGTATATAACGCTCTCAACGAGTAAAG
>CG11597 11794275 11794425|12469 chr3L 11794362 11795542 scaffold_3 4552426 4553626 + 15122|0 63
TTTAATCGCTATCTGAATCTTATCCCAAGTATTAATACGGTTTGAACTGGCCGAACCTACCGAT
TTTAGTAGTCAAATAAACCCCATCTCATGCACAA----------AACACGCTAAACCAACAGAT
>CG32095 11798157 11798243|12475 chr3L 11796771 11798180 scaffold_8 2590452 2591848 - 57187|1428 1451
TAAAATAAAACCAAATTAAGTTAC
TCAAATGCAATCCAGTTACGT-AC
>CycA 11801144 11801598|12477 chr3L 11801024 11802634 scaffold_8 2789621 2791293 + 46302|143 654
GTGTTTTG------AGCCGCTGTCATGGCCAAATTGTATATTAGTTTAGTGTTTCC----ATGTAACATTATGTAGTTTTA---GTTATAAGTGTACAC---AATGGATCAA----TTGCAGTTCGGTCGCAGTCA-GCCAGTCGTATAAAAGCTTCGCATTGGTTGGCCGA----TTGACAA---GCTCCCGTTGCAAG-TGCCGGACAATTTTATATGTAA----GCCATATAAAAGATAGTTGCCAAAATATACGCGC-----------TTAACAACATTCGCGTCT--GTCCACGGTGAGAGCTTGTCATGCCAAGCGGGAGCAGTAAGAACTTCGGCAGTCTTAAAAACTATCCGATTAGCCAATTGAAATTGGAGGAAGC-CACCGGACA--------CAACATATTAGTGCTGCTTATGCTAACGA-TATTTTATAT-TTCAACCTCTTTATGTTAAGTATGTATGTTTTCGTGTTTATAAATTGAACCATACTAACGTATACAA
GTGTTTTTTACATCAGCATCAGCCATGATCAAATTGTATTGTAGTTTAGCGTTTTCCAATGTACACCCTCTAGTAGTTTTATTCGTTGTAAATGTAAGTACGACTGCATTAAGGTTTTACTGCCATGCTGCAAACGCGCACGCTGAATACAA--CGAGCACTGCCACACCCACACCTACACAATTCGTACACTTGGCAAGCTACTGGACAATTGTATATGCTAACTGGCCATATATGAGATGA--GCTAACACAGGAGTGCGATCGATTATACGATCCAGGTTCAAGTCCAGGTCCACGGCGAGAGCTTGTCACGCAAAGCGTGCGCAGCA-----------------GCAAATCATATCACAAGATAAATCGAATTGAAAAAACCGTAACGAACAATCTTAGGCTACTTACTTATACATTTTAAGTTATTGATTACATTATTTGTTCGATGTCGTATTTTTTATTAT---TTCTTACGTATTTATATAACCAG--ATATGTATGTAAACAA
>CG12521 11821282 11821460|12495 chr3L 11821106 11822115 scaffold_0 7702097 7703153 + 1625|189 391
GGATCTTAAC---ATGCGTTATGTGCCAAATTTAAAATGCAAT---AACTTATTCGAGATTTGAGTGAATTTAATCTCTTGAACTATAATTTATAA----TAAACTGAT---CGTGTCGGCGGCGACACTTATTTCCGTCCGTGAGTGAAATAGTTATT----TAATAAATTTCGA------AACAAATGTGCTTA-AAAGTG
CAATTCTAGCTATGCACGGATTGTACCTGCTAGAAAGAGAAATTGAAGCTGCCCTGCCGTTGGAATGACAAAAG------GAATTATAATTTATAATATTTACACTAATTGGCGTCTCTCAAGCAATATCTA-----------AAAACAAAAAGTTATTCGGCTACCAAATTGCTGGCACTTAACAAATAAACCAATAAAACA
>CG5906 11844391 11844593|12516 chr3L 11843562 11844465 scaffold_0 410316 411127 - 14026|867 943
TGGAACTAAAATTTTGGGTGTCCTTAAATAAAATTCTTCTTTGAAGAAAATCAGCAAAGTAGA--AAAATTCAAAAT
TGCAAATAAAAGTCTGA----CCTTAATTAAAGCTCCTTCATTACCAGTGGCACCCAAAGAAATCAAAGTTCTAAGC
>CG5718 11896550 11896682|12566 chr3L 11896667 11898571 scaffold_0 455678 457574 - 86533|0 15
ACATTTATGTGTAGTT
ATAACTATAACTATTT
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CTGCTAGGCATTTGCCAGCTGTTCGTAAAGTATTAATTAAT-----TGCAAATAAAAAACCAATATCAGTGTA
C------GAATTGGTTAATCATCCCTAGT---TTAATTAGTGACCATGTAAATATTTATCATCTATTTTTTAT
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AT
AT
>prc 11932820 11933068|12615 chr3L 11932822 11933857 scaffold_8 3696134 3697143 - 30173|0 252
GGGAGCATAATACACATCCCTCTAACCACACCACCACACCCATATTATAGTAGATCAGTTCCAGAGGGGCTCAATTTTAGAACAGCTTAACCAACTGCCATCTACAAACCACCTATTTGTATTTTGATGCAGCTTGCTCTTGAGCACTTAAGTGTTTTTTCGCATACAATTAAACGGTTTCACTGCCAATTCTTGAATATTTTGTACGAT--TTGCAACTGTAATTAATATTTAATAA----CAAAACACAAT
GGATGC--------CATC------------------------------AGCAGTTGAAT------GGGGCTCAAATT---------GTAATCACATATAGCTAACCAATAACCTGTTTGTA-TTTGACGCA-------CTTAAGCATTTAAG----TTTTTGCTACTAATTTAAGAGTCTTACTGCCATTTTTT---TACTTCGTACACCGATTGAAATTGTAATTAATATTTAATAATAACCAAGACACACT
>viaf 11965800 11966099|12630 chr3L 11965541 11965808 scaffold_0 3479550 3479814 + 13507|259 267
TTTCTACAG
TTACTGCCA
>viaf 11965800 11966099|12631 chr3L 11965942 11967572 scaffold_0 3479815 3481428 + 41300|0 160
GTCATAGCCAAAGCATAGCCCTCATCCAACTTTAAGTTCA---GTGGGGTGGGTAAATATTTTTAGGATGAATCATCAAGTAAAGCCCAATCCAAAACCGGCAAGCGGATCTTTTTTTGCGGATTCACTTAACTAACAAATCAAACATTTAAACGCAGTTT
-----------------------ATCTCATTTTAAGATCACGTGTTCGTTAATTAACCATTTC--------ATGTTGCAGTACAAC--------AATCTGGGAA-------TTTATCTTCAGACGGTCTGTGCATATTTGTTAACAAATTAAAAACAATTT
>Grip163 11967214 11967699|12631 chr3L 11965942 11967572 scaffold_0 3479815 3481428 + 41300|1334 1712
ATTTATTTCTTAGTACTATTTCTTTAGTTTCGGTTAACAGTTTTGTTGTGTTGTAAGTTAATATTAATTTTCAAATAACCGGCTCAAATTAAAAGAAAATAATTTAATTAGTAACATCTAATAGTGTTTTAATTGAACTCGTATTAAATGCCGAAAAAACTGTTTTGAATATTTATCCATATCATTAATAGATTTCTGTTTAATATTTAA---GAAAAACTTTTAAAAGAGACAATTGTCTCTAAAGTAGA----ATGTACGTATTAAATATTGTAATGAAACCAATGTCGACATGATTTCTTGAAACTGTTGATTCGAATTTATAAATAAATGTGCTTAT------------TTATG-TATGTCTTACCATATTTAAT
ATTTAAGTGAGAGTAAAATCGCATTAGGGTCTGCCACTACGTTTCT---ATTTCAAATTTACAT-AATGTGTAA-----CGGCTTAAATTTAAAACCAGCCAGT-GCTGTGAAATATATACCAATGGCTCTAATG--CTTGCACTGTGTG--------ACCCTTATGTATATTAA--------ATAAATAACCTGTTGCTTAACATATGACCGGTTCAGCGTTTTGCAGC-CCAATAACCTTTACAGTGGCTGCCATTAACATATTCGCT----TGGTTTAACAGCAGTCACCATAATGTTCACTAACAGTTT-CTGGTATTTCTTAGTGAGAGTGCTGACAGAAGCTGCCTGCTATGATTCGACTTAAGGCGCTCACT
>Grip163 11967214 11967699|12632 chr3L 11967573 11972324 scaffold_8 1901994 1906735 - 48454|0 129
CCAATAATTGTTAGATAGGGAATTTATCTTGCCATTAAGCTGAGCTTAGAACATTTTAAAAAATATTTATGCATGCATG---GCGTCTCCTAAATGTAAAGCTTCGGTGAAGAAAATCAGCTTTAAAGGC
CTAGCGCTTGAT---TAGGAATATGTTCTTCCCACCA---TTGCCTTAGCATA----AATACTTATTTGTATATATATAATCACGATTCTTTGGCATA--------GTGTTAAAATTAAAACGTTGATCC
>CG5684 11972345 11972817|12633 chr3L 11972325 11973495 scaffold_0 1445307 1446595 + 10499|23 630
TTCGTACTGATGGGGAACGTGGTCGTGCACGACAGGAAGTTCGAGCAGG----AGGAATCACCGGGTC--CGTCGGCATCTGTGCAGGCCACACCACC----------TGGCCAAC--TGATCCTAGCCGTAACAACACCATTGCAGTAATCTGTGG-----------------ACAGTCGACA--CAGATCGTT-----------------------------CCCATTTGTGAACAATTA---TACCCCGTTGGCCATAAAGCTAACTTCTTGATGTTTCCCACGCAAGTTCAGATGAA-----------TAGGCAACCGTTC-------AATACGAAAACATGGCATAAACTAAT--TGTAAATCGCATAGAAATGAAAAACCG----------GCAAAACTAAAATA--------------GATTCAATTTCAAGTTCTGCATGTCTTAAATGTGTTACGAATACAAAACTAAGGTATGTAAAATTAAGCTAAAAC-TGTAAGCCAATGAGCGAAACAGAGAATATTGTGTATTTGT------------AAAAAGAGCAAAAAAACAATATATTTAAAACTTTTTAATT---------TAGTGT
TTTATCCTGATGAAGAACGCCGTCGTGCATGACAAGAAACTCGAACAAGTTGCTGGAGCTGCTGCATCATCATCATCATCATTCACATTCACATTATCATTATCATCATCATCAACATTGGCTGCTGCTGTCTCTCTCCCAGCCCCGTTATGAGTGGGAGAGGCAACATTCACAACATTCAACAATCGCATCGTTAGAAAAAAAAAAAAAAATAATAATAATAATCCAACTATCCACAATTAAGCTATTGCAATACAAAACAATTTACTTACACGAGATTTTCTATGC--TTTTAAAAGAAAGTTTCCACACTCTGTAGATGTTTTACAACAAATTTAAAAACATTAAAAAAAAAAAGAACTTAAA---CTTAAAAAAAAAAAACAGTTAAATTTAAGCGAAACAGAAAAATTACCTTTGTTAAGGAATCACTATCAAGATCTGTATGTCTTAAATGTGTTA-------AGAAACAAATTATG-AAATATAAGCTAATATGTATAGGCCAA-------------------CGTGTATTTGTATAAAAAAAAAAAAACAAAACAACAAATCAATATATTTAAACATTTTAAATTAGAGATTTATGGAGT
>rols 11982162 11982444|12645 chr3L 11982077 11982987 scaffold_0 6531604 6532483 - 30371|85 377
ATGTCGATTGTTGTGTATTGTTGTACTCGTCGTATACCCTTCGAATTAATCGCTATTCCTACTTAAGAGCTACCCTAGACCTTAATTTTTGCTATTTATTGCCTTCGAATGTTT--TTAATTTAAACCAACTGAAACTATCATTGTAATTTGTTTTTAAATTTTCTTTTTAATTGTGTCTGCGCATGTAAAAATTAGTTTTATACTCTGATTTAGCATAGGCATCAGTT--CTTATCCATAACGAATATTAAATAAATGCGAATTCTTTTAAGAT------TTAATAAACACA
ATGTCCTTTGTTG-----AAACGAATTCGAATCACAATCTT--AACT--------TTCTAATTTTAGAATTAGCTCTTAACTCTGTTT---CTATTTATTGCCTTTGGAAATTTGATTAATTTAAA-------AAAT--------TAATTTGTAT----------TCTTTCATTTTCTTTACGCATGTAAAAAATAGTTGTA---ATAAATATACATTAAGTTTAAATTTGCTTA------------ATAAAATAAATACGAAT--TTATAAGATCAACCCTTATAGAACTTA
>Sema-5c 12041458 12042081|12716 chr3L 12041502 12045234 scaffold_0 1530623 1534201 + 129509|0 611
GGAAACCCGCGATCTTCGATATCCAAAAGTGCCATC-----------TAATGACTATGGAAATGTT------ACAACGAGAGAGACAAGTTTTATTTTTGCGCCAAAGCGATGCAGATGCAAAATGTTCCTTGATTGACTCACATTGAGTCGTTTATTGAAGCTAATTTAGCTGGTTATCGAATTAAGTAGTTATAGCATGTAATATGTAGCACACTAAATTTC---CCCACAGCTATGTTCAAAAAGT-ATTTTAGTTGGTTCCCTAAATTTCAGAGTGCAGATAACGT---ATCTCTATTTTTGCTTTTAGTATTGTAGATACTGCCATCAAAAATTGTTGTATAAATCGCGT---AAGCTTATGATATGGCCCAACCAGCGAGACTGACCGTTTATGATTGTCTAAACAAATTTGTTAAATTTCACAAAATTAAAGCAAGC-AGCATTGCTTTAACTAAATTAAATATACTTATTTTCAGAACATATCTTTAACTTATCATATTTTATAGAATTCGAACTGACATAGTCGATCATGTTAAGAATAGTCCT----TAAGATATGTAATTGAATAAATACAGTTTTACTAACCGACACAGTTGCTTGGATT
AGGATCTGAACAGCCCCGAACAACCCAAGTGCCATTGTTGCCTTGTGCAATCCGAATGGATTTGTTGAACCGACAACGACGACAACGAACACATTTTGCACGGCCAGCC--TGCA-----AAGACGTTCCTTCTCTGACTCATATTGAGTCCTT---------TTATTAGCCTAGTTATAGATTAAGTTAGTCTTTAAGTCTAAT--------CGATATATTTCGGGTAAATAGTT-TGATCAAATTGTGACATTACTTGACT-------TTTATGTGTACAAATATTATTTAATCAAATTATTTACCT------------GGACCGCAATTACAA-------TGTAATTGGCTTTTAGTGCATATGA-----------AAGCGAGACTGA-AATTTAAATTTTTCTGCGGAAATTTGACCCATCCC---AAATTAATGTTGTCTAGCATACGT--------GTTAAATACGTATAATTT---ATCATCGTGTTAAGTT---CTATGTTGTTAAGTTAGCACTTA-GGGCTTAAGTATGTTAAGTATAAACTTTTTATAAAATATATATTTGAA---------TTTTACTAACCCAACCGGTTATTATGCTT
>yps 12095473 12096053|12785 chr3L 12094000 12097754 scaffold_0 1579426 1583496 + 68827|1719 2443
AAAAGGATCCGAAAGGATCTAAATCGTCAAC--CGACAAACAAAAACATCGTCAGCAGTAGCCGCAGTATATAACTACAATCGCAGAAAAACAGCAGCAGCAGCCCATCCT--------------CAACATCAGCGAC--CAATGCAACATCATGGTGCAATAAG--------ATCAGCAAATGTTGCAG--------------------CAAATTTTGCTAAATGAGCCGCCGCGTTTTTTCGGTTTGTTTGCTTTTTGTTTAGTTTCGTAGGGCAGAGAATC-AATTGTACAACTCATACCACAACAAAACTAACATCCTC-----------AAAATTTCAATCAAA----TTCAAAAACA-----AACAAAAAATTGTATAAAATTTCCATCAAGCCTGGCCGTCGTCAAAAAATTGCATAATTGTGGAATTTTTATTGTATGA------------ACCAACAAACCAAACACGAAAACATAAATAAATTTCAATT-ACACTGCA---ATTTAGATG---------GCGCCGGTATACAATT-------------TACTTTAATGATTATT--ACCATTTTTTATTTATTTATTCT---TGAAAGCATTGTTACCCGTTGTGCGTTAAGCAAACCCATAACTCTA--AGTTACTCGATTTAAAGAT----------------CATTAAAAACGTA----------------AACCTATACCA
AGAAAACTGCAGCAACAACAACAACAACAACAACAGCAAATAAAAATAAAAACAGTCA-AACATCAG----AAACTACAAC--AAAAAGAACAGCAAAAGCAGCAACTACTGCATTATACAGAAACAACAACAGCAACAACATTGCAGTAGCATCA-ACAACAAGAAAAATCAACAAGCAGAAGATGGAGAGAAAGAAAGCATCCATCTATAAATTTG--TAAATGGGCCGCCGCGTATTTTA----TGTTTTGTTTTCATCTGGGGCAAGCGACAGGAAAACCAAAATGTAAAATTTACA-AACGATAAACCAAAAATGGACAAAAAAAAAAAAAAAATGCAAACAAAACACTTCAAATTCACTTCGAATGATATATTTGATAAAAACATATTTATGTGTGTGCATGGC--AGAAAGTGCATAAATTTCAAA-TTGTATTATAAAATCAGCAAACACTAACAATAAACATCATAAAAATGCATATATATATTAGAGGCAAAACTGCATACATATATATATATATATATATGTATATATATATTTATACACATATTTATACAAAAATAATTATTTGAACATTTATGAATTTGTAATTTTACATGAAAGTTTTGTTGTGCGTTTTT------GCCAGCTTTCAATTTTAAGAGTTTCTCGTATCGAAGATGTTGACCTAAACACCATATATAAAAAATAATTAATTCATTTATGCAACATACAACA
>CG11538 12103371 12103380|12789 chr3L 12103168 12105658 scaffold_16 120980 123442 + 123728|213 222
CGCAATCACC
AACAACCGCC
>CG5645 12107716 12107822|12790 chr3L 12106167 12110626 scaffold_32 381163 385592 - 167485|1563 1707
AGAGTTATGATAAATCTAA-----GAATAAAAGTTCATATATAGTTATACATTTTATAGTTACATTT------------TATGTACATATG--------ATAACA-TATTAAA------------AACCAACACAGCACAATGAA
A----CATACTGCATATAAAGGCGGGGCAAATATTATTATATA----TATATTTAGTAATCGCCTCTACGAGACGGTCGTATGTACATATACATTAAAAATAACAATGTTACACAGATACGAGTTAAAAAACACAACATTTTAAA
>l(3)neo18 12111440 12111586|12792 chr3L 12110919 12112351 scaffold_32 385725 387231 - 54202|552 726
AACCCTTGTAAT-------------------------ATTCTTTAAATACCATTGTTAGGATCCCGTTTTGTGGGAAATAAAGTGTGAA---ATCGACTTCGCAACATCATCTTATTCACATTTAATAATATAAAAATTACACAGTAGTCGAATAAATACTTAAGACTTAGCAAA
AACTCTGCTGATTTCAATTAATTTGTTTTCAAATTTGGTCCTTTAATAGACGTAATTAAGACCTCGAGTTG-AGGAAATAAAATGTGAAATGATAGGGTTTACAGCATCAACTCATACA-ATTAAATAACAT--AAATTTTAACGTAGATAAATAAATA-TTAAGTAGTAGCATG
>CG5642 12117389 12117497|12795 chr3L 12115455 12119218 scaffold_32 389853 393638 - 188361|2014 2130
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ACCAACTACTTTGTAAACGTTCGTGAACTATTTAATATTCCAATTTGGACTCATTTGCTTTGGTATCAATAAAAAAAGAAAACTTCTAATGCGGAGCAACGCAGCAAAAGGTCGAAA
>Rh7 12138148 12139928|12814 chr3L 12137794 12138189 scaffold_32 412048 412392 - 682|354 395
AAAAACCAAGAAACTCGAAATAAATGTGCAAAAACTTTAAAA
AAAAGCCACAAAA------AAAAATGAATAAAAACTTTAG--
>Rh7 12138148 12139928|12815 chr3L 12138206 12138370 scaffold_32 412936 413092 - 2419|0 167
AAGAGAAAGCGGGGAAAAAACCATTTAATTAGCATA-TTTAAAATGCACTTTGACATCAATTTTGTGTGTGCATTGTGTGTTTGTGTGTGTGTTTCACTTAAGCAGCTTGTATTCAAATTAGTTTAACTCAGTAATTGTTTGA-CATGC-AGTACCTATTGTTTTTGT
AAGCTAAAACAA--AAAGAAACATCTAATTAGCATATTTTAAAATGCACTCTGCC--CGGCTTTGTG-------CATGTGCTTAAGTTTTTGTTGAACTTGACGAAACCTAATTTGTATTTATACAATATGCTTACCATATGCTTATGCTTGTATCTCTTTTTTTTTT
>Rh7 12138148 12139928|12816 chr3L 12138690 12138811 scaffold_32 413093 413207 - 2122|0 123
CAATGTCTACTCTAAAGAATCTAAAAAACTAAGCAAACGACTTTGATAAAGTCAATGAGTACATGTACCTGTAAG-AAATGTAAGAA-TAACAAAAAGAAAAAAAAAAACGAACACGAAAGTGC
CCATGTTTTTCCTAAAGAG--------AACAATGAAACGACACAGCTGCATCGAATATTTGC-TGCAACTGTCCGCAAATGCAAAAAATAATGAAAAGAAAAGAAAAGCCAAACAAATAAATGC
>Rh7 12138148 12139928|12817 chr3L 12139286 12139338 scaffold_32 414490 414536 - 2336|0 52
GCAAAGGCACAACGACGACACAGTGGTGATAGTAAACATATTTAATGAGCTTA
GCATGGGCATGGCAACGA------AGTGATAGAAAACATGTTAAATGAGCTTA
>Rh7 12138148 12139928|12818 chr3L 12139927 12140844 scaffold_32 415176 416074 - 51708|0 1
AG
AG
>thoc6 12165972 12166371|12843 chr3L 12164652 12166457 scaffold_35 774685 776511 + 48506|1323 1758
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GGCGTGGAAGCTAATTGAGCAAACTTTAAAGAAACTATCTCACTTGAAGCACCTCGCAGCTGTTACGTTTGATTGAAAGCAATTTCAGCTGCTCTTGGGCCACATTGTCACGCAAAACACAATTGTCATAAGTCAAAGTCCCATTTTCGCTTTGCACAAAGCTCTCTATCATTCTTATCAGGTTCTTGGAAATAATTTTCTCATCTGAGCGCAGA---GGGTGGCGAACGGGATTGTCAAATATTAGAAAGAAATCATCCCAATGCCCTGAGCCTATAATTAGATAAGTGAACATTAGTTACGGGCACAGTAGTTCATAT-CAATCAAATTCCTACCAAAAGAAACATTGTTTCGCTTTGACAGCCAATGTCCACTGCCTTGATTGGCGGGATTATCGTAGACGTAGCCATAAACTGGACTCTTTCCGTACTTCCC
>thoc6 12166441 12166442|12843 chr3L 12164652 12166457 scaffold_35 774685 776511 + 48506|1839 1840
AG
AT
>Adk1 12174343 12174483|12848 chr3L 12172688 12175038 scaffold_12 497877 499993 - 22751|1757 1904
TAGAATGCTAATCCATTAGGAAACCGGTACCAAAGTCAACATTTCTAGTGCA-CTTTTTAGCGCGAAA------CACACAATCTCAGAGCTGAGCACAAATGAATGCGAAACACCAAATAAATTAGTCTAAATCTATGTTATGTTATG
-AGTTTGTTAACCAATTCCAAG-------CAAAAGAATTTATTTGAATAGCAACTCTTTAGAACCTAAAACCTGCACAAAATCC---------GCACAAATCAAAGCTAAACACCAAATATATAAGT--AAATCTTAGTCGAATAACT
>CG17144 12180176 12181048|12853 chr3L 12180177 12182385 scaffold_38 1041675 1044078 - 54705|0 1034
GCGGTCCTC--------TTTGTCCTGTACA--------TAAGTGTA-------------------------GATATTCATGTCAA---------GGGGGAGAGTATTGTTAAGTTTTCCCTACTTTTAACTGAATCGATTTTCATTTACTATGTGTGGTG--------GGGGGAGGGGGTGCGGTGATTCGATGGAGAGGGGGGATATAATGAAACGACCTATCAGCAGGCAGATAAAAAATATTACCTTAAAGCGTTACGCATTTGAAACAGAAAGAGAAATATATCTATGCATATATGTAGATGATAATAACTAAAGCATTTACGGATATATGTATGCATATGTATAATA---------CAAATGTGGTGAACAATGTTAACAATTTGAGGGCATTAACAAAGGACAAATTAAAGGAGCAACCAATACTATGGA--GAAACTGTTTATACAATACACG-ACGCATACATATAAATGAGTTATAGGTA-----------ACATATACATAATGATAAACA-ATATACA------ATGTACGGTTAGTTATAG--TGTATAATTTTTG--TATTTAAGTTTTTACAAACAGCAGAAACAGAAAGGGGTTCGTTTCGCAGTTCAGAGTTTAAAAAACATTTGCGGTGTAGCCAGAAACCGAAGAAACAAAGAAAAGAAAGCCAACTAGAAATATCCTGCAATA------TACGTGAA----GTTGAAATT-----------------------------GTCGAGTCGATGAGA--AAATGTTAACAGCATAAGAGTTAAAAGCAACAATGTGGTGTATTAAATG------TTCATAA-------------ATCTACC-----------AATAAGTGTATTTTCAAGGTGTAAAATGTTATATGACATCAATTAAAACGAGTTCGAGATTTCGACAAGCTCCATTGCATGAGAGGGCAAGAAATGTTAAGCGTATGTTATGCGAAACTAACAAAACTACAATTATACAAAGAATAAAGATTTATAAATAGAGAATA
GCGGTCATTAGACGGCGTATACCCTGTAAATAGCCAAGTAATTGTAATTGTGCTTCAGCTTTTAATTCGGCATTATCCAAGGCGATCTGGCAGCGGGGGAGAGTATTATTTAGC--------CTAATACTTTGGTCGGTTCTTGTGTTTTTTGTAATTTGTTTAACTTTAGGTTTGATGTGCGCACACTTTA-----------AATAT-------CAACCTATCAAGAAGCAACT--AAAATATTACCTTAAGGCGTTACGCATTC-----------ATAAATATATAAATAAACAGTTAATGAAATAAACAATTAAAGCA--AACAAGTACATTAACACATATACAAAACAAAAGAAAACAAAAAATGGTGAACAATGTTAACAATTCAAATGCATTAAAAATGAATGAATAAA---TCCATACTATATTATTAACTGAAACTGTTTATACACAACACACGCGCATTCATGTAAAGCAAACGTATATACATATAGACATACATATATATATATATATATATATATACATACGTTGTATATGGTTAGTTATAGCATATATAATTTTTGTATATTTAAGTTTTTACAAATGGCAACGAC----GAGCGTATTTTCCGTTCTTCAGAGTTTATTACGATTTTCTGTAATAGC---AAACAAATAAAAAAGAAAAACAAATACAAACGGAAAATTCCACGCAATATCTTTGTATGTAAATCATGTTAAAAATAAATATAACTAATATTAATAAACAAACAAATTAAGTACACCACAAGAAATGTTAACAGCATGCGAGACAAAG--AACAGTGTAACGTATTTAATGATTATTTACATAATATATAATATACTATATACCATGTATTTCAAATCAAGAGTATGTGCGTGGTGTACAATGTTATCTGAA--CATATAGATCGAGATAAAGAATATGACAA---------CATGTTAAAAGAAGA----------GTATGTTATGCAAAACTAAC-GAACTACAATTATACAAAGAATACA-ATTTATAAATAGAAAACA
>Pbgs 12243909 12244238|12920 chr3L 12243770 12247042 scaffold_38 1097327 1100786 - 86267|147 528
TG-GTCTACGTTCCATGTCCGATGTCTTGATACC-----ATGTTCATATGTACAT-------------------GCGTAGATTAGAGTGGACCTCTTAAAATCATTAATGGAA----AATGGAACTTTTTGTAACAGATAGTGCAATTTTTGTAGGATTTTCTAATTATTTATACGGAGCT-CTCCATATTTTATACTTTA---ATAAGCAAAAGAATAAATATTCAGGGACCAGCATATTCATTTTACCGATTAAGTGGCTTA-------AATAAGACTCAAAGGCTTTTACTTACATCAATATAGAAGTTATTCTAATACATTAAGATGTGTATTCAATAAAAGAAGTCCA------------CTCTAGTCTCGAATCAA
CACGGCAACAGGACA-ATACGAAATGTGGCTCTCTCTTGGCGTTCAAGTGTACTTAGACAACCTCAAAGAAACAATCTAGTTTTAAGTCGAAAGCGTGCAAATATTAGTATAGTTACAATTTAAATATTTGT------TTGTCCCATAAGAGAAATATTGGCAATTCATGCCCACGGTTCCATTTCCCATTCACTGCTTTATATATATATATATATATTTATATTTATATATAGTTGTATTCA-ATTGTCATTCAATATGCTTATCAGCCCAACCGATTTGGAAGGCAAATGTGTTCAGCCCCAT--------TTCGATTGCGTCACAAAACGTTTCCAACTTTGGCATTTCAATTACCGAAAAGCCAAAGCGCACAATCAG
>CG4300 12245600 12246404|12920 chr3L 12243770 12247042 scaffold_38 1097327 1100786 - 86267|1969 2907
CAAGCTCAGGTGGACTC---------------------------------CTCAGCAGCAGCAGTAGCTACTTCTAGCGCACCAC------------CAACCGCCAGTCACACACCAGCATCACACA------GCATAAGTCAG--GAACCGGGAACCGT--CGGAGAGATGCTCCAGCTGCACTCCTACACTGTCACTATCCATGGAGCAGCAGTCGGAGTTCAGGAGGAGGAAAATATGAATAATGGAGCCGTGGGTCAATTGAAACCGCGACCAAGGCGTCGAAAGAAGAAGCGTGTACACTACCATCACACGCTGGTTTCTTAGTCCAGGAAACACGGA--------ATCCGATGCACAAGCTAATCGCCATCATCGAAACCATCGCAACAAAACCCAAGACAGAGGAAAACACGCACTTCCAATGGCTGTTACTTACAATTGAAAACCAAACCAAATACTGAA--CCCAATTCGTTTACGCTTAAGTTAGGCTTTAGTTCCGTTTCTCGTTCACTGATTTCAATGCTAAAAACTAAGACAAAAGTACAACCTTTAAGCAAGGACAG--GCTAAAATAATAACT------TATGTATTCGTGTTTATTTGA-ATTACGCCTAA-GCATAGCATGTTGGCCAAC----------TATTTGTAATATTTCGTATAACGTGTACATCTATATAATGTAGA--CCATATGTTTAGTTATCCATTAA-CAAGCAAAGTGGAGCGGG-----------------GAAGGCCCAAGGATCGAGGATGTGTGTATGTGGGTGTGAGGAAG-----------------CGTA-GCAGGAACACCAACT--TTTATTGCTGTAATAACGATTAATACCAAACATTTTAAACGGGAGAACTAATAAAG-----TTAAATAAATAGTCGTACGCAGAAATA----AA
CCAGCTCAAACGGAAGCTGAAACACAATTAAAGCTAACGAGTAGTACGAACTCAACAACAGCACTAACAACAACGAACACATCGTGTCTCCACAACGCTATCTCCAG-CACACAACACGTTCTCACACCCGCAACACAAATCGATCAAATCGAGCTCAATAACAAGGAGCCGCTGATACTGCACAGCTACACCGTGATATTGCATGCTGCT-----------------------AAATCTGAGCAGTTGCCACA-GAATCTACACAAGCGTGTGCCACGTCGTC------AGAGGCGTGTGCACTATCACCATGCCCTGGTTTCCTAGTGGAGGCTATTCAAATGTAACCAAAAAGACAAACGAACTAATTAGCATCACCGACATCAC----ACAAAAACAACAAAGAAACAACAAACAGACTTCCAAGGGCTGTAACTAGCATCTGATAACCAAACCAAATATTTAAAGTCCAATTGATATA-ATTTAAGTTAGGATTTAGTTGTGTTTTACGTTCATTGATTTTAAAACTAAAA-CTAAGTCAGG---------CTCAGGCAGAGGCAGAGGCGAGAACAACATATGTTTTGTACTTAATTGTGCTTATTTAACATTATATTTAATATCTAGTACTTTCTTAAACATACATAATATACTTATATGCTTACTTATA-TATATATATATATATACT-TAGAATTCATGTATTTAATTTTCAAGTAGGCACTCAAAAGTGTGTGGATGCGAAATTTAGTGTTAGGAGTATAGCAGATAGCTGATGTTACTTGATACGTTTGAAAAAAAAACTATAATAAAAAGTCGTACTCAGAATAAACAATTGTTTTATTCCGTTATTTGCTATTGCAAAAAAAGAATGAGGTTGCAAGATTTAAAAAAAAGTACTTAAATGATTTAACCTAATTAAACCTAGCCCAA
>GRHRII 12313059 12314025|12988 chr3L 12312994 12313267 scaffold_38 4096 4359 + 575|65 283
TAATTAACAGCGTTTTTCAGTTTTTCATTTTGTTCCCCCAGCCGAGTAACTCAAAAATCGATTC------TATAATTGTGTAAAATAGAAATCATCTAAAAACAGGGTAAATCTAACTATTGTAAATACATTTACTCATTATTTTGAGAAGA----ATATTGTAAAAAAAAAAGATTGTAAAGTTTAAAATAAATATGAGTTCATGTTCAACGACACAA
TAATTATGAGC-----TCAACGTTTAACTTTGTCGTGAAGGCAGC---CCTAAGAAAACAGTTCAAGCAATATGTTTCTCCAAAACGAACGTGGTCTGAAA-----TTTTAGCTAACAACTCCTTTTATGTTTTATTGGGAAATTGGGCATATGTCATACTTAGTATAATAGAGATTAGAGACTCATGTCTATATATTAACTC-TAACAAGCGAAA-AG
>GRHRII 12313059 12314025|12989 chr3L 12313268 12313469 scaffold_37 207880 208078 - 1776|0 210
AAAAAATAGATTTAACTTCTGAATGTTTCAAATGTTGCCAATTCGCCAGCGTGTAATCCGATATAAGCAACAATAATTACAATTATAATCAATGTGCAATCAGAGTCAGTTACAATTTACAATT-ATATGA-CTGAATAATTGGACTATGAATATATACGACTTCA-----AATGAGTTTCTCTCATTAG--CAGGGCAACTTTGTAATGT
AAAAAACAGACTTGAATTTTGAATATTTAAATTATTATCAACATACGAGCATATGCTCAGATAG----ACTAAAGTTTATTATTTTAAT--ACGTGCAAT---AGTTTTTTGAAATTAATGTTTGATGTGAGCTTAATA--TGCGATATTTAT-TGTGTTAATTCATCGATATTGAAAATCTATTGTCTGTTCATGCCGAATTCTTAACGA
>GRHRII 12313059 12314025|12990 chr3L 12313640 12314462 scaffold_1151 3510 4392 - 20698|0 478
GAGCAGCTGGCGATGGCGGTAGCGGCGGCGGCGGTGGCGGTGGATGCACCGGACACAGTAGAAGCAGCAGCAGCAACAGCATCAGCCGATGCGGATGCGAATGTGGCGATGGAGGACGCCTGCTCCTGCTGCCATTGCCTGAGCAGGGAGCTGGTGCGGCGGCAGTTGGAGCTCCAAGTG-CTTCCAG-------------------------------------------TGCAGTGAGGCGACTGCCAGTGGATTTGA--------TCCGGCTGGCTGAGTGGCCGGAGCTGGGGATTCCAGCGATTCCCTCG---------------------------GTCAACGTGGGGAGTGGC-------------GTCGATGATTAGATCACCGGGGCGTGCAACATGTGCTTAGATAGTGCTAATCGAGAGTTAAGTCTTCAAACACAATGGGTGTGCTTAGAAGTAG-CGTAGGATTAG
GCAGAGCT---------------GGCGGCGATGGTGACGGTAGAGGCACAG------GTAGGTGCGACA-------------------------ATGCGC-----GCAGTGGAGGATGCTTGCTCCTGCTGCCGTTGCCTGAGCCAGGAGCTAGTGCGGCGCCAACAGGGACTCCTAGAGTCGCCCAGCACGGCCGCCGCACACTAAACCAGTATAAGCTGCTGTGAAATTTACAGTTAAAACGCGGCCACTTTGCGTGATACGCGACTCCGACTCTTCCAGTGCTCATGA--GGTTGTTCGAAAGATTGCTTTGCCAGCGGGGCATAGCAAAGCAAGACAAGGCAGGGCGGGGCGGGGCAGGGCAGGGTGTTGCCGATGATCAGATCATCGAGCCATGCAACATTTGATTAG-TGTAACTAACTGAGAATTAAGTCTTTGAACAGTGTTCGTGTGGATAGTCGTAATTGTAGGCTTAG
>Ncc69 12342593 12342659|13014 chr3L 12342332 12342659 scaffold_0 1641854 1642174 + 2301|280 350
AAGGAATATAAATACTGTTCTAGAAGTCGAGTTAAATTCATATTTAAATGCAGTGCTAATAATTT----TT
AAAGAAAGGAGAAAAAGTGTTGGAAAAGGAGAAAAAACGAAATTGAAACG-ATTTTAAACAATTTGAAATT
>CG32104 12367750 12367815|13037 chr3L 12366899 12368734 scaffold_12 48511 50330 - 33386|925 996
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ACAGCTGCA---TAAGAGTTGAATATCTTTATGAATATTAATGTTACTGTATGAAACGT------CTCCTTG
>CG14122 12373485 12373543|13038 chr3L 12368968 12381153 scaffold_12 50331 62880 - 275511|4920 5009
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TTGAAATCTATAAGTTTAATTTGCGAGTATTTAGATAAATTTATTATTTTCACAAATTTGCAGCAATTTTGGTCAATGGAAATCACTTGA
>CG32103 12377452 12378001|13038 chr3L 12368968 12381153 scaffold_12 50331 62880 - 275511|9251 9853
GATGTCTGTCTTAATCTCGTTCCAATCAGGTTAACTCGGCTCGGCCCGGCCACCTCGGCTCTGCGGCCCCGCTCTGCAGGGCGGATCGGGCTGCGGCCGGGATCGGGTGCGGCTGGTGATCCGGCTGACGCTGTGCTCCATTTTGTATAGTAGTAGCGTTAGGTTAAGTCGGCTCGGTGGTCGCCACTCGCTCTCTGCCGCAATGAGACAGTCTCGTGCT---------------GCTTCTTTCCTTAAGTGTAAAGCAGGCCTCTTCCACGTTCTGGGT-TATCCGTTTTAAGTTTTTATAGTTGAATTAGTTTTTGGTTATTTTCTTAAAATATAAAATAAGTGATACTATGGCTAATTTATTTATAAACCAAACGCAAAGGAGAAAATGCAACATTTT---------------GCCGTGTGCTAATCCCAAAACATTTCTTAGGCCAACAATCCTGCGACCTACAAGTAGGTTTAGGCCACTCTATCTCTTAAGAGCTAATTTATT--------TACAATTGTACGTAGGCTACGACCTTTGTTGAGGGCCATCGCTCTTAG--------------TGAACTGCTAAAAACACACATACC
TTTGTTTACCCCCTCCTCATCTC-------------------------------------CTGCGTGGCCG-TCTGCAGTGCGGATGGTGCTATGCC---GTGCGAGTGCGGATGGC------TCTAGTGCAGTGCTCCATTTTGTATAGTAGTAGTGGTAGATGTAAGATATGGCGTGCCCGCCATTCGCTCTCTGCTGCATTGACAGACTCTTCTTTTTAAGACAAATGATTAGATGCTTTCCTTAAGTGTAGAACAAGCCTCTTCCATGCTCTTGGTGTATATTTCTATATAATTTATAGTTAAATTAG-TTTTGGTTACTTTCTAAAAATACAAAATAAGTGATACTATGGCTAATTTATTTATAAAT----------ATGGAATATGTGAAATTTTAGGCATGTGGAGCAGGGCGCGATCAAATACCCAA--GTTTCTTA----ACTTATCCTACAATCG--CAGTAGGCTCAAGCCGTTGTAACT-TTAAGTGCTAATTTATTGAAACAAACACAAAAGCAGGTAGATTATGTC--------AGAGCAGTATGTTTTAAATAAGTCGCGTGGTCGCAGTGCTATGTCTATAAATACC
>Gap69C 12388973 12389282|13044 chr3L 12388910 12389174 scaffold_12 1768128 1768385 + 3090|63 276
ATGCGCGCATTTAATGTAACCAACTGAATTGTGTATTCATTCTT--------CGACTTCAAACATAAAGT-GCAACTATTCCCG--ATTATTTCCACAGTTTAGACCAATTTTGTATAGATCTACTTAACTAACGAATTACTTAGCTTAAAGTGTATGC-CAGGATACTGCGAGGGATGCGAGATGAGAAAATACATATTATGTTAACAAGTGT
GTACGCGCATTTAATGTAATCAAC-GAATATTATGTTCAAACTTATATTTAACGATTTTCAACAAAGAACGGTTATAATTTCCATTATTATTTTTACAGGTTAGACCAATTTTAAATAGAAATAA-TACAAAGCGAATTAATATGCAAAATATATATATATATGAAATTCCAACGTAAGCACCTTCCCCATCTAATTAT----CTAACAAGTT-
>Gap69C 12388973 12389282|13045 chr3L 12389204 12389522 scaffold_12 1768415 1768725 + 10894|0 80
AAACCGTGGCGAGCAGCTTATGCGATTGTATTTTTTG--TATTCCATTCGGTTGTCAAGTTGTGTCTCCTTTGTTTTATGT
CAACGGAAGTGAAGCATTAGTG-AAGTGTATTTGTCAGTTATTTTGATTTGTT------TTGTATTATTTTTGATTGTTGT
>toe 12396455 12396578|13053 chr3L 12395506 12398152 scaffold_12 1775835 1778390 + 70470|1015 1198
CCATTTCA--TTCCTATCGCTTTAAATCGAGAATTTAGTGCAATTTTT--ACATAATTTATTCAGTTTCTATCACTGCAAACAAAACTTCTAACCGCGTGCTGAGTACAAATAAAATCGAAA--------------------------------------------------------CGATAA
ATTTGTCAGTTTCCTATCGCTTTAAATCGAGAATTTAGTGCAATTTTTTAACTTAATTTATTCAGTTTGCAT----------------TCAAAACACGTGCTGAGTACAAATAAAGACGGAATCGATATATGTATACATATGTATATATGCATATATAGGACAATACATGTAAGAATTCGACAA
>eyg 12436979 12437215|13114 chr3L 12436628 12437616 scaffold_12 1817638 1818632 + 24257|430 705
ATGGGCGACATGGGCGACAAGGGCCACCTGGTCTAGATGGGCGGCGGCAAAGTCTAATTGAAAACCTGAGTTGTGCGCGCCTCTGTGATTGACAGTGGCAACA-------------------------------AAAACAAAAGCA--GCAAAAGCAACAGCAACTACTGATGCAATTGCAATTGCATTTGAAATTGCAACTGGTGGAC-----TGAAATACGAGAAGCGACTACACACACA-GTGGGCAAACAAATCGAAAAACCAAAGTTAAAA
--------------------GGGCCAGCTAG-CGACAT----GTCGGTAGATTCTAATTGAAAACTTGAGTTGTGTGCGCGCTTGTGATTGACAGCGACAGTGCCCCGCGCTCCGTCCCCGCCCCCCTTGGCTCCACGCCGGCGCAGGGCGGAGGCGGTAACATTCA-TGTTG----------TGCTCCGTAACTTGAGACTGGGCGACGCTGGCGACAAAAAAAAAGTAAAAAAAAAAAAATATATAAAAACAAATCG-AAAACCAAAGTTAAAA
>CG10657 12465772 12466089|13154 chr3L 12465618 12467380 scaffold_12 1841823 1843488 + 67977|168 506
-GCCCGCCGTGGAGCAATCCCCTTAATCCCGTAGGCTAAGCTAGGCTAGGTCTGGATACCATTGAGACAATCGAC------------AAGACGCGCGGGCATGCACACTTCGTACCTATTTAAAAGCATCACCACTAAGTTGTATAA--CTACGGTCTCGCGGGAACTGTGACT---CCCTCCAGTGGGTCGTGGTCCTCCAATCCTCAGAATCCCATAGTTGCTGGGCCTGTGGCTG-AGTTTCCACAGTTGTATATTCCATCCATGCG---TTACGTTATCTTAAATGAATGTCTATTTAAATATATGTATATACTTATTCTTGAGAATTTTAATTC
TGTACGCTCGGG----------------CTTTAGGCTAAGCTAGGCTAGGTCAGAATACCATTGAGACAATTGACAACAAACAAACAAACAAACACAAACAAACACAC-ACACACAAATTGTCAGCCCTAAACCTTAAATTATAAAAATCTACAATTATTCGACGGCCCGGGCTGCAACATCTAATTTGGCACGG--ATACAGGTACCGGAA----------ACTGAAGTTGTAGTTGAAGTTGTTCTAGCTCTACATCCCATCCATGCAGACCCATGTGCGGTTGCATGTATG-CTATTTAAATATATATATATATATATAT---ATACTATATACAT
>CG10638 12472345 12472436|13161 chr3L 12472390 12472452 scaffold_0 5211924 5211988 + 1020|0 48
ACCAGATGAGCGCCTTGTTGCTGTATCACGAAT--ATAATGTAATAAAT
AGCAAAAGCTTAGCCAGTGCACATGTAAATAATTATTAATGTGTTAAAT
>CG10646 12476413 12476571|13162 chr3L 12472453 12477785 scaffold_0 5210480 5215948 + 106374|4407 4565
GCCATTAGTTTCTTAAATTATTACGCATATTTCATTTAAATCTAACTAAACGAATTGTGTCCTTGTATGTAGTAGCAGGTTATACAAATATTAAACCAATAAGTTATTATATGAAGATAAATATATCGAGGGACTAAAGCTAATTAGGCTTAACCTGTA
CTTATTCCTTATACATAATATTCCAC-TAGTTTTTATAAAT------------ACTGTATACACAAATACATTACTAGGCT-----------------TTAGGTT---------AAATAAATCTAATTATGAACTA---------ATGATTAGCCAGTG
>CG10654 12479716 12479756|13164 chr3L 12478224 12479784 scaffold_0 5216548 5217963 + 42960|1581 1623
TTCGTTTTATTTGTGGTTTCAATAACA--TCAAGCTAACACAA
-------TATATATGATTTCAGTAACTCTTGAAGCTAACTCAA
>CG10522 12481937 12482303|13169 chr3L 12482149 12483960 scaffold_0 5220365 5222124 + 62509|0 157
ATGAAGGATATATATTAACTAAACGAATGGACAAAGCAAAATACTACAAACTGAGTAGTTGTAGTTATATCTAGGGTTAGGATATGCTATACATTTGGATTATTATTATTTTAACTTGTCAGAACATATGTTT---TTTCACAATCTTTTTCATGTGT
---AGGTTTACATATTTATAAGTC-----------------TGTCTCTAAATAAATACATGTGTTTGTATGTAGA-----------------ATTTAGCACAGATTTACCTAAACCTCTAAGCCCAAATCATTATATTTTAATATTTTTATTTTGTGT
>Pcaf 12495025 12495292|13181 chr3L 12495282 12499685 scaffold_0 5233715 5238061 + 174158|0 10
TGCAGTGATTC
TGCGACGACCC
>eIF-2beta 12499038 12499100|13181 chr3L 12495282 12499685 scaffold_0 5233715 5238061 + 174158|3898 3965
ATTCTCCTTAT---TTAAAACTTTTTGAATTTTTATTACCAGTAAAATTTCAA--TACAAAAAACCAA
ATTATGTGTATATTTTCAA----TTTGATTTTTTATTG--AGTAAAATTTCAACATATAAATATACAA
>CG10627 12501161 12501577|13185 chr3L 12500940 12503253 scaffold_0 5240697 5242989 + 74942|221 703
AGCGGAATGACGAACTAACCTCTCACGGGAATCGACAATTG-----------------ACACAGATCCTGGATGGAGCAATAAATCTCTTTACTCTAAGGTGCTCAATAACTTAAAAAAAAAACAACT-------------------TAACTCTCAAACGCATTTAT------------TCTGCAAATGTTCACTGTCTTTTGTGTTCTAA---------AGATGACATATTTTTTGCCATTATTTATAAAGTTCTTTTCAAGTTTATTTATACATATGTACATTGTGAAAGTTG-CAATTTTAT-------GTCCTTCGCTATTTTGTAATTGAAGAATTTAATGAAAATGCAACCGCTACGTTGATTTTTTTGTTGA-GCTGCTAGCGGTAACTATTGAAATTATAAAAGAATTGATAGTAGAGATTAATGAACCTAATCAAGTTTGTATTGCTATTTTCTATAAAAGTATTTTTTAAACA
AGTGTCAATAGGAAAGG----CTCGTGAAGCTAGACATATGTGCTTGCGCATAATCTCGCACAGACTCGCATTTAACCAGCGTGCTTAATTGATAGACTTTACTCAAGCAATAAACTTAAACACAGCCTTAATATATACACTATCAATCACTTACAAATGCATTTATAATATAGTAATATACGCATAAGTGATTCATTTGTTGTGTTATAGTTTTTTATTAGAT----TGTTTTTTAATATAATTTACAA---------------TGATTACACTTTTAAAAACTGTTCAAATTGTCAGCCTTATTGTGCGAGACTTAATCTATGTAATTGTTAAAAGCTGTCGGGCTTACTAAACTATTAGATTCCGTTTTTTATAGACAATTCGAGAGAT-----TTTCAATTCTTGCCAGATTCAACGTA---ACCGCAGACTGTTATCAATATTGAACCGTGGTT--------AACTCATCTTTATAAG
>Tsf2 12504383 12504694|13187 chr3L 12504136 12507821 scaffold_0 5243934 5247852 + 107461|288 747
GCCACTAGACTCACTTAGATTTCAGAAT-----------------------TCTACAAGCATCTCTAGCAC-------------------AAAGAGAAA---ACATATCAACATTTTTACA-----TTCCAAATATGATTAAGTTAAA-----------TGTGAAATCCCTTCCGTCCGAA-------------------------AATG---------AAACTCTAACTAGCCGAA--AAATATCTGTTGAAGGCTATAGTTT-ATAATTTATAAAGT-CCTGTGCCTTATTATAGT-------------------ATTTGTTTGT-----GTACATACCAAC-------------------------TAAGACCGTCCAAAAAATGTACCTAGGAGATGTAAGCCGAATCTTTTACAACCGCTTATGTAAGTATACAAATAAAATAACTAGATAAAGG
ATTCTCAATTTCTCTTCACATTCCAAATAGGGTAAAACATTACTCAGAATGACTAGTAACATTTCGAACGCCCAATTCGAATCTCACACAAATGACAAACATACATATCTATGCGTATATATATAGTTCGCAGCATAAGTTGTTTCAACTACATTTTTTTTTAAATTCTATTCTGTTCGCAGTTTTTGAGCTGACTCAAGTGCCTTAATGTTTTCTTAATCACTTTGATATTTCGAACGAATTATCCATTGTTTATTACAGTTTAATCGTCTTTAAAGTGTCTGATGCGAATTATACTATACACGAAATGTACAATAATTTAATTTTAAGTCATAAAGATCAACATTACGAATAAGAGTATTCTCCGTCCAATACCGTCCACAAAATTTATAT--------TATACTGAATTTTACA-AGCCATCCAGATTTTTATACA---CAAACGTCTGAAAAAAGT
>CG4069 12509371 12509458|13188 chr3L 12507855 12509444 scaffold_0 5247906 5249464 + 44902|1552 1629
TATATATTAAATTTGGTTAACAATTGTACA-CATGTATAAAAATGGAATATTTTCAACTG---CTGAGTAAGCTCGAA
TATTGATTAATTTT--TTACAGAATATACATCATAAATAAAAATG-----TTTTAAATTGGAATTTTGTAAATGCAAA
>CG10632 12511456 12511761|13191 chr3L 12511343 12511672 scaffold_9 2624765 2625219 - 1693|182 468
TTAACTAATATAT--ATACTTTAAGCATTGACCATTATTTAGACGTTACATTTTCTTGTGTTTGTATCTAAAAGTTTGTATCTTAAAAGTATCCAACATTTG---TTATTTC--CTATTTTGTGCCC-----------TTTTCTAGGGACATCCAATATAATGTTTCATTTAATATGTGTATTTTTTAATCGAAAATAAAGCTT-------------GTATGCTTTTTAATGCATTT----------------------------------ATGAATTAA-----TT
CTAACTAAAATCTGAACACCTGAAGCGAGAAAATCTATTTGG---------TTTTTTCTTTTTCAATATATGCAATCATATTTTAAA----TTCAATATTTGCATTTATTTCAACTGTTTGAGAGCCAAAAAAATTGAGTTTGTAGAG-CGTGGCATAAAGTATTTTGTTTTAATTATATTATATTTAAGCTTAAATAAATTTTTTTATATTTTTTCATATACTTTTGAAGGCGTTTGACGTTTATTTCTATTCTTCTTTTGAATAAATAAATAAATTAAAAAATTT
>CG10632 12511456 12511761|13192 chr3L 12511673 12512797 scaffold_0 5249615 5250704 + 36996|0 88
TTACCTGAATATTGTTGTTAGCACAGTCTACATACCACCATACAACTTTTAACATTGACCATGGAATCGTGAAAGTATTTGTTTTTCAA
TCA-TTGCATATTCTTTT--ATAAAGTAT-------ACCAATTATTCTTTGTGAGGCACTATTAGAT-ATAAGAACATTTGTATTCCAA
>snRNP69D 12707306 12707569|13422 chr3L 12707322 12709179 scaffold_0 2587035 2588968 - 12273|0 301
TCTTTGTAACAGCTACATCTAATAAACAA----------------------------------TATTCGATAAATATAGAATATAAATATTCTTTGGATAAATCC----ACACTGTATGCATTT----------ACTATGTACGAACAACTGACAAATGTCTTCAGCTAGTAAAGAAACTCCATCTGAATATGTATATTGTTAAAAATCACTCTGTGTAGTAGCTCAGGAAAAATGTGTTTACTTGGCAACAAATTGAAAGAAGACTCCCGCCATTAAATTATGATT------AAAAATGTT
-----GTATAAAGTACAGAAAATAAAAAAAGATAACCTATGTATGAGAAAAAACAATTACAAGCGCCCGGTACAAAGAAAATGAGGGCACTTTTTGAAAAAATTCTATTCTATGATAAGCATTTGGTGTTGCCCACTCAAAACAAACGTGAAAATAAAACTTACATTCTACAAAGTGACGT--TTTGATTATATATATTA-TAAAACTCA---TGAATTTCCGATTTGG------GCATTTGCGTCGGGCTAATTTTAAAACGGGTTCACAACATTGGATGAAGCTCTGTTAAGAGAATGTT
>Klc 12720557 12720759|13436 chr3L 12720461 12720665 scaffold_0 2561842 2562058 - -766|103 229
ACATAAGCTCTCAAGCATACATTAGCAAATAAACAACGTTTTAT-ACCTTGTTATTTCAAA---------------AAATATGTACCGCTTTTAATAATAAACCAAATATATT--TAACATAATCCT
ACTTTTGTTTAGGAGGAAAAATCAAAAAATATGTAAGATTTAATCAACTTATTGACTTAAACTTTTATAAATTACGAGATATGCTTCCGTCAAAGTTAGAATTCGCTTGTTTTGATAAGATTAGAAA
>Klc 12720557 12720759|13437 chr3L 12720666 12721208 scaffold_0 5495520 5496195 + 16733|0 94
AAATATTATTTGTTCATCGCCCACAACGGAATCTTTAAGTTTATGAT-TGAAAGCTAACAGCAAACACACACTTTATTTATTCATTCCTTAATAT
GCACATTCTTTGTCGTCTGGTCTTTGTGGAATCAGTGTGCTCCTTATATATAAGCTAAC-TCGAACATTAACATTATTTATTCATTCCTTAATAT
>CG10973 12727179 12727240|13443 chr3L 12727139 12730069 scaffold_0 5478735 5481839 + 47601|42 112
AAACAAATCGATTTTTCACGTAAATGTTAAGTTAAATAAAATG---------GGCTTTGAAAGTATCTCTA
AAAAAAATAAA----TCAGGTAAGTCCATTGATAAATAGAAAGATGTTACTCGACTTAAATAATTTATGCA
>CG10971 12742379 12742833|13446 chr3L 12739313 12742561 scaffold_0 5491456 5494788 + 121721|3172 3364
ACATTTGTTGTCAAAAGGTTTTTGTTTATTATCACGAACCGACCTATTGCATTTTATAAAACGGCATGTTCACGTTCATCAAAGACACTTTTAGCGTAGTTTATCTAAAAGAAAAAGACAAGTATGGAATATATGTGATAATCATTT-----CAAAATTTGTAAAAGTAAATAAATTATATGATAA-----AC
ATATATATAGATATATGATTTATTTATATT-----GAAT--ATCAATTATATTTAATGAG--GGACAACTCGCGTTCATCGAAGACACTTTTAGCATAATTAATCTGAAACGAGAGCAACAGACTCAAATAATTATTCTATTCATTTTTAAGCAATACTTCT-----TGAGTGTAATATATGAAAACAGTCAC
>CG10971 12742379 12742833|13447 chr3L 12742707 12742783 scaffold_0 1779099 1779175 + 1758|0 76
AATGCCCGTCATGACAAATAATATATCTACACAATATTTACACTGCGGTCATTTTATCCTACAATGAATCCGTAATA
AACACAAACCATGCCAAATAATACATTTTCACAGTACAGCTGCGGCAATCCCATCAGTCAATATTCGATCTGTAGCA
>CG10971 12742379 12742833|13448 chr3L 12742784 12743685 scaffold_0 5507668 5508586 + 33369|0 59
ATACCATATTT----------ATTAATGTTACTAACTTTACAAACATTCTTTTTTGTATT
ACATAATATTTGTTATCGACAATTATTTTTATTAAAATATAATAATTTCGTATTTTTATT
>CG32106 12747898 12747943|13451 chr3L 12747612 12747981 scaffold_11 955280 955654 - 715|320 365
TCCAAACAGTTGGAAGAATACATTAAATTAAAATTACTTTAAAAAC
--TAAAAAGTTAGATGATTAT-TGAAAACAAAAGTGTTTAAAAAAT
>Atg1 12759078 12759283|13458 chr3L 12758337 12761055 scaffold_0 1787628 1790342 + 103735|821 1052
TTACTCGGGCGGATAGAGCTATATTCCAACCATGAAGCACCGGCAATCTTCACAACATCAACAACATTTCCTTAAGTTATTCA--CCGTTTTCGTTGGGAGTGCAAACATGTGATTGAAACAAAAAC-----TACACTATCCATACATAGACATACCTACAAATAATTTA-------------ACAACCATTCACACCTAATTTCT------GGCCTTCAAAGTTTCCCAAC
--------------AGAGC-AAATTGGATCCAT------------------------TCGTCGATAATTCCTTAAGTTATTTAACCCATTCAAGTTGAGCGTAC-AACATGTGATTAAAGCAAAACTACGTGTACTCTATATTCATACATAAATAGCAAGAAGTAATTTAAATCGCGAACAACACAACATTTCAAGTGCAAGATATTAGCAAAGGCTTGAAAGGATTTTAAA
>CG10754 12786975 12787059|13484 chr3L 12784686 12786997 scaffold_0 1813690 1816280 + 60776|2653 2676
TAATAAACAATTTTCTACTTAAT-
TGAAAAAATATTACATACTTAATT
>CG10960 12798829 12799685|13491 chr3L 12798808 12800595 scaffold_0 1826617 1828307 + 44647|21 930
AGGGGCAATGTCCACCTGAGGAGCCCGAAAGGCAAATCGCGATTCGCAATCCGGAAGGCGAAAGACGGACCGGAAATCACTGTTAACTTG------CTGTTAATATACGTTCGATTTAAG------TTCGCGTTTAGTG-CAAGTCTTTTGGCGTTTTCGATGGATGAATTTGTTTATAGAATTTAATATGCGCATAGATTT-----TCG--------TTTAAGCATAGCAA--GATTCAGATGAAGATGAAGAAAATTGCAGGAAACTATAACTAAGAGCGAAGACTGAAGGTCAACTGCAGAAAAGCCGCGATAATATTTTTTTGCAGCCATAGAAAAGACAACAGCAATTTAAGAAAAAACATATATACCTATATATATATCCATATAATGTATGTATGCT--TATTTAGTGTTATTCATTCAACCAACGAAATCTGTTTTACAAAATTTTAAGCCATACTTGCATTTGTTCGGATTTTTAAGGTGTTTGCAAGCATTTCTTCGATAATTCTTAATCTAATTGTACTATATTGTATGTCTATATGTATATGAACTTTATGTA-TGTGTAG-CTGTTTGGGTCTAAATTTCAAGAAGCATTCAGTCGATTCACTTACCATAGCTCGGTTAAGTTGTAAGCCTCGCCATTTGCCAATATATTTATTTACGCCAAGTTAGCGAGAGGAAGATGTTTATATTTTATTTAATAAAACCAAAATATACGCATTATTTTTTAATAA--TTTTCCAACCGATATTTGAATTTAATT-------TTATGATCGCTG------AAAGCT---ACACAGAAATCCCGTCTATCATTGTTAA---ACTTGCATAAAGTATTTATGAAAAAATTTAAACAACTGATGAAAATAAAAATATATCAATATATTTAATATGTT
AGG---------CAGCGAATGGTGTCGAGAAGTAAACTGAGCT------------------------------------CTGTTAATTTGTATGATTTTTTAAAAAATATTTTATTTAAATTTAACTTTATGTTAAGTGAAAAGTCGAGTTCCGTTTCCAATTGATGAATTTGT---TAGAATTTAATG---GCACAGCTACAAAAATCGAAAACAGATATAAAGAAAGCAAGTGACAGAGATAAAGACATGGAAAAGTTCG-------------AAGAATGAAGACTGAAGGTCAACTGCATTACAGGCA-GATAATA------GGCAGATATGTAAGGGCTCTCTTTAAACTAGGCCACACGCCATAAAACTAT-----------CGCAATTTGTGTTAACTGCTACCTTCAAGTGGCCATAGAAAAGACAATAGATAT----CAATAATAAAATACATATATATATATATATATATATAT-ATGCACACGCAACAAATTCT---ATAATTCTGG------------------GCATGTGCATATTTA--------TTATGTATTATTTAGATTGTCTGTGTGTTATTC----GAAACATTCAGTTTTTTTTTTTAGC------CTGTTTAGTTTTAAGCCACGCATTTTGCCAACATATTTATTTAC------TAAACG-------GTTTTTTAATTCATTTTTAATATGATTTTTATATA--CATTATTTAATATCAAACATTTCGAATCGCAAATTAACTAAAAATTATTAAATCGCGATCGCTGCTTATCAAAGCTCAAACGTTAAGGCGTTATATATCATTGTTAATGTATCTGCATCCA----TTTTGAAAATATTGATGTAAATTATAAATATATATATATATATGTGTATAT-ATATTTG
>CG10948 12818198 12818871|13511 chr3L 12817588 12819791 scaffold_0 1844699 1846894 + 41068|712 1418
GTGACTTTCAAGTCGCTAGTCTTGTCTGAAGCCAAGATAATTGCTCTGGCCTCAGCCTATCTGGTGCTGCATCCCTATGGCGTTGAAATCGCCAACATAGCCAGTTACTTAAGCGAAATGCTGCGCAATAACGCT-GCCCCCAGTAACCATGATGATCTAGCCAATATACTCGGAAAGTACACAAATCTCTTCAAGCCGGAAAAGGAGAAGTGGAGATTCTGTGGCTTCAGCGAACCAACTGAATCTCAGACGGAGTCAAAGTGAGGGGATGAATGCGGAAT-----GTAGACTCGAATAA----GATGACAATTAAATGCTTTAATTATCTTACAACTATATCATAATGAGTAGCGAGTAAGCGGAGGAAAGTGAAATGTTAACCAAAGGAAAGACGCAAGTTTTTCAATGAAATCACGACTTAATGAGACCAGATCCAGGTTTAAGGGCAAGTACTCGAAGTTAACTCAAT------CGGAAGAAA-----GACACCACAA-ACTAACTACCGTTTCAATTATTTAAATAACTCAACCTAAAGAATATATATACACTTAAGCTAAATGAATTCAATATATACA-AAATATAT---ATACATCA---ATATTTT--AAATAAACTGAGAGGCAGAAGGTCGCGTTGCTTTTGTTGAACGGAAGCGAAAGAATGGAACCAAATAAATTGTATGCTAAACT--ACAAA
AGCAACTTCATGTCGCTGGCGCTAGCTGAAGCCAAGATAATAGCGTTGACCTCCGCATATCTGGTGCTGCATCCGCATGGCGTCGACATTGCCAGCATTGCCAGCTATCTGCGTGGAATGCTCCTCAA-GTCGCTGGAGCTGAAGAGCAACGATGACCTAGCGACTATACTCACAAAATATACAAATCTCTTTAAGTCTGAGCAGTCAAAGTGGAGTTTCTGTGGTTTTACCGA------CGAACCTT---TGGATGCAA----ATGCAATCAAGGCGCAATAAACCGCAGGCGTTAACAAAACCGAGAACAATTCAATGCTTTAACTAAGTTACGACTATTCTATGCCTATTGGTAAGGGAGGAGCGCTAACTGACATGTAAACC-----AAAAATGTGATTGTTGCAATCACATA-------AATGAGACCAGTTT----TCTAAGAGTAGGAACTTCTATTTAACTTAAGGATACACAGATAAAACAATTAAAACAACAACAAGAACTACTGTTTCAATTAATTAAACTATTAAAC------------TGTAAATGTAAGC-----AAATTGAGTATGTACACAAATATATTGAATACATAATGCATATTATGGAAAGACACCAAACAAATGTTGCTAAAATTGCTTTT----------AATGAAATAACGAA--CCAATAAATTTTATGCTAAATTTAACTAA
>CG10948 12819004 12819615|13511 chr3L 12817588 12819791 scaffold_0 1844699 1846894 + 41068|1560 2201
GACGAGAACGACTCTCTACGCTGTCAACTGGAGGCCATTCGTCACGAGATGACGCTGGAGCGCAGTGATTATGTTCAGCGCGAAAAGCAGATAAAGGTACTTCAGGAAACCATTCGCAACATGCAGACCCAGTTGCTGCAGACGAAGCTACGCGAACAGAAGGACAACAAGACCATTGAGCAGTTGGAACGAAATCTCAAGGATGCCGGCATTAAGCAACTTCTGTTGAAGACCAAAATTAAGGAAACAGTGGACAAATTAAGGGACAAAGAGGCAAATAGCGCTGGAGCCTCAAATGCTTCAAACGCCTCAAATCTCGACTACAGCAGCGGGGATTCGTGTAGCCGGGAAGGCACAGAAATTATCCGCCCACAGGCA------------------GAACCGGAAATAATTGATATCGATAAAGTGGATGATGATGTCCGCATCATAGAGCACCAAAGCGGTGTGGTGGAGATACACGAGATCGAGGACGATGAAAAGCAGGAGCCCGCTAAGGATTCTACGAAAAGCAAAGCAAATGAGTCAATTATGGAAAATGTTT---CAAAGTCGAATCATGAGGAGACTATAA----ACAAAAGCA-----GCAAAGAGCAAATCCCAACAGTGGCCGCGGAAGAG
GATGAGAACGACTCGCTGCGCTGTCAGTTGGAGGCCATACGCAATGAGATGTCAGTGGAGCGCAGCGATTGTGTGCAGCGGGAGAAGCAAATCAAGGTGCTGCAAGAGACCATACGCAACATGCAGACGCAGCTGTTGCAGACGAAGCTGCGCGAGCAGAAGGACTGCAAGACCATCGAGCAGCTCGAACGGAATCTCAAGGAAGCGGGCGTCAAACAGCTGTTGCTCAAAACCAAAATCAAGGAGACTGCAGATAAGCTAAAAGACAAGGAAGCCTACAGCACCAGCGTTTCAAATGCTTCCAATGC---------CGATTACAGCAGCGGTGACTCGTGCAGCCGAAATG---CGGATGATCTCAGGCCAAGCGAAAAGAAGGATATCGCACTGGAGCTAGAAATAATTGATATTGATAAAGTGGACGACGATGTGCGCATTATTGAGCATCAAAGCGGCGTGGTCGAAATTCATGAAATCGAGGATGATGAGAAATCGCAACCAGCTCCAG-----------AGCCAAACAAAGTTGTTGATGAAGCCAAACAATTGCCCATTGCCGATCCATGCCCCAACTCTAACAACGTGGTAGCAGTCGTGCAAACAGC----TGCATCATTGTCCACACCAAAG
>CG10948 12819681 12819800|13511 chr3L 12817588 12819791 scaffold_0 1844699 1846894 + 41068|2267 2377
ACTGTCCAGATCACAGATGATGATGAAATGGAAATCTCCGACGATGAGCGGGACTACGATAGACGCGGACACAGCGCCAAGCGAATTCGCTACGACAGTGATGGCTTAAAA
ACGGTCCAAATC---GACGACGATGAAATGGAAATCTCAGATGATGAGCGCGACTATGAGAGGCGCAG---------CAAACGCACCCGCTACGACAGCGATGGACTCAAG
>CG10948 12819681 12819800|13512 chr3L 12819794 12820304 scaffold_0 1846897 1847490 + 7017|0 6
GAACTTC
GAACTGC
>mRpL20 12991092 12991139|13674 chr3L 12991075 12993867 scaffold_0 2034000 2036688 + 65359|17 64
CATAGCCTTAAGTAGGAGTTCAAATATAGATATTTGTATGTTTTAAAC
---GGCTAAGTGTTTGCATACAAATATAGTTTTATATATTAACTGAAG
>CG11255 12993933 12994236|13675 chr3L 12993927 12994838 scaffold_0 2037057 2038021 + 38521|6 375
AACCGGATGCGGAAGC----------------------------------TACAGAAACCTTACACACATCGGACATCGA--------------AGGAGCCAGA--CAAAGCGCAGCAAGATTTGCAATTGTTAATTAAGTAAAT---GAGAGTGACTAAAA-GATTTTGTTAAC---ACTGATAATTGTTTGTACATACA--TATAACCCACACTCAGACACATACAAAAGCATACACATGTGAAATGACATGAACAAATAGAGAGAGTGAGG-CTTGTGTCTTATAGA------TAGAGCAATATTCGAATTTAAATTGATAATAAAACAAAAGTGACACGCGAGCGAGACACAAAAGTCAACATTTT
ATCCAGAGGAAATATCCACCCATACAAACACACACCCACACACACACACACACAAAAAAACTACACACACAACACAATGAACCGACAAACCTATAAGAGGCATAAGCATTGCGCAAATAGTTTTGCAACTACTG--CAAATAAGTTCGAAAAGTGACTAAGACAATTTTGTTAACACTACTAATAATTATTTGTACATATAATCTAAACTCACACACACACACATAAACACACACACACACACAGTTGGCAACGAAGATGTGAGTTATGCACGGCCTTGTGGTTTATATACAATGTTAGAGCAATATTCGAATTTAAATTGATAATAAAATACAAAACCC-----------ACAAAAACATTCAAATTTT
>CG11253 12998705 12998772|13678 chr3L 12998146 13000605 scaffold_0 2040420 2042813 + 90206|576 646
TTG---TGACCCAGCGTCTAGTATACAAAATAATTTTTTCAATATAATAGAACATTCCAAAAATGTAAAAA
CTGTTTTATCTGTTTACTTTGTATTGACGTTAATC------ACACTAAAGAACATTCCAAAAA--------
>CG17300 13060334 13060450|13749 chr3L 13059055 13060434 scaffold_8 1302108 1303366 + 10048|1377 1478
CTTATTTCAATTTGTGAACACATGTCCGTGTAAAAAATAAAAATTTGGGTGTAAGAGGAGCTCTGGTTGAAGATGTAATTAAA-CAACTATGAACAAACAAC
CTTATTTTAAGT---------------GTTTTAAG----------TGCTTGAAAGATCATGTTGCGTCTGAAACATTATGAAGGCAACTCTGCACAAAAGCC
>CG32119 13220810 13221070|13932 chr3L 13220726 13221149 scaffold_8 1497454 1497886 + 3484|84 385
-GCGCCACTTGAAGCGCCACC--CAATGTCATCCGTATCCCATCCGTCCCATATACCCCTATGCCCTTTTGGATCTTCCCGTGCTGTGCAATCATATGCAAATACAA--------ATATATACTCTTTTTTCCGGCTCTGTGCAAATGTTTTAACCCAAATATTTTGTAGTCATGCAACATTTATGT---------------AGACAGGCTGCAAACA-----ATTTGCAGCTG----------AGTGAGC-GACAGGGCACTGAAAAAATTCATAGTAATAGTAAAAAAAATTCCAAAGTA
GGCAGCGGCAGCAGCAGCAGCGGCAGCGGCAGCAGCGGCTCTCCCG-CTCGTGCGCTCGCACTCCCTTTTTG------------TGTGCAATCAT--GCAAATAAAACATTTTTTATATGCATGCCTTTGTGTGTGTGCGTGCAAA-ATTTTAACCCAAATATTTTGTAGACATGCAATATTTATGCTACAGCAACAAGAGCAACAAAACTGCAAACAGGCGCAATTACAACAATAACAATAACAGTCAGCAGACAGGCGGGCGCAACAACAAATA----TAACAGCAACGTTTTTGATGTA
>CG14107 13354301 13354425|14092 chr3L 13354004 13355967 scaffold_8 1661963 1664136 + 32643|331 456
TCTAGAAATTAGGATCAACACATCATTCCTC-AGCTATTTATTGTCATTTATTTATTGCCAACTATAAATTGTATGCCATAATCAGTGTTTGAACATGTTTATTGCATTGGGCTATGAAGCAAAAT
TCTAGGAATTCCCAGCAA------ATACCTCAAACTATTTATTTTTA-CTATTTATTGTTAGCTGTAAA---------------AATGTGCAAATACACGAAATTCCTTTAACT-----GAAAGTC
>CG10171 13360548 13360661|14094 chr3L 13360647 13362138 scaffold_8 1668692 1670208 + 50921|0 14
TGCTGTTTTGGATTA
GAGCGTTTCTGCCTA
>CG10191 13362240 13362576|14095 chr3L 13362352 13363905 scaffold_8 2684861 2686488 - 61089|0 255
CCA-----------ACACGTTCAGTAGCCTTTGCC-------------GCACATAACCAGCCGAACATTCCGCAGGTACTGGATGTGTCCATCGAATCTGGGTCGGACTTG------TGCTCCTGTTCCGCGCGGCTGGACGAGATCAGCAAACTATTGGACTCGATCGATGAGCGTGTGCGACGATTGGAGGGCATATACTCTTTATAGCCTTCTAAGCTCCCTAAAATACAATTAAACGTAGTTA-AAATTAAT
CCAAACACACTCGCACACACACAGCTGCCTCATCCCACTGCAAGCCCAGAGCATAACGAG-CACACCTTCCGCAGGTATTGGATGTGTCGCTGGAGTCGGATTCGGGCTCGGATTGCTGCAGCTGTGCCGCTCAGCTTGACGAGATTTTCAACCTCTTGACGCAGCTGGACAAACGTTTAAGTCGATTAGAAAGCTTGCACTTTGACTAAAGCTTTAGCTTGTGCATACTTCAATTATTCCTAAACATAAGTTAAT
>sens 13370176 13370781|14100 chr3L 13366890 13370185 scaffold_8 2694180 2697599 + 32037|3772 3786
AGAGAAC-----AAA
ATAGCATTTTTTGAG
>sens 13370176 13370781|14101 chr3L 13370186 13371149 scaffold_8 2697855 2698950 + 23814|0 757
CCGAGGCTAGGCGGCAATCTCTGATCCAGGAGATCCCAGTATTAGC-----TAAGCAGGAC------GAGACACACACTCAAAACCAGATGATGAT-----GATGATGATGATGATGATGAAGGTGGAGCAGATCACAGTTGGCCCTAAGTCTAAGTCGTTGCTATGAAGCCAAAGTTTGTTTTGTTTAGGCCTTCGCAAAGATTT---ACCTAATCGTAAGAATTATTGTTAAAACATATTAGCTAAGATACTGCCTTAAG-TCTGTACATAGTTAT------------------CCCAAACAAGACTCTTTTTTATAGCCGTTAAACCCTA---GCTTAATGA-------------------TTAATCTAATTTATTGCAT--AAAGCGTTTTTGATTTGATTCAAACTT------------------AACCCAAAATTG-----------GCAGCTAAACGTACCAAAGAACAACCTCAAACAAATGAACTACCACTTGGCGACCACTTGTCTAAATTTAGTTT---CCTAATTTATTTAAGTTTATTGATGGCATCACCCACATTTATTTATACGA----------TCTATGCGAATTTTTAG-------------------------------------------------TTTATTCTTATTTTGTA------ATAAGCCCAATGACTTAT-TGTAATTATATTTATTAGGAGCGTATATGATTTTTGG--AAAATAAAGTTGAAAGCTAAA
AAGCGGGCGAGCGG------GCGATCGATGGGATCGCAACATCTGTAGATATATATAGAACATGTCTGAGACACAAACC--AGACCCAGTGGGGATTACCCGAAACCAGTAACAACCACCAAGTTGGCAC-GCCTGCAAATGCAAAGTCGTCTAAGTCGTCGCTATGAAGCCAAAGTTTGTTTTGTTTGGGCATCCGTAAACATTGTTAAGGGAACCGAAAGAACATTTCTCCCATTTAATTTGCTCAATCCTAGACCTAAGCTCTGTACATACTGACAAAAAAAAAAAAAACATACACATACAAGACT-TCTCTAATAGAC-CTAAATACTGTATACTTAAGTAAATATTATTTAGAACTAAGCTAACATAATTTATTGCATAGAAAATGTTTTTTATCTTTTTTCAATTTGTTTTACCCTAAATACCAAATCCAAAATTGGCAAAGAAAACGCAGCTAAAAGTACCAAAG----ACTCCAAAAAAA--AACAACAACAACAAGAAAACTTGGCAAAGCTTGACTTTAACATAACTTATCGAAATTTGTT--TGACTCTACCATTGTTTAATT-TACGAAATATTTATTTTTATATAAATTATTTAAGCCTTATTGAAAATGTCCTCGATATGGATTAGCGTTAGCTCCTAAGTTTTTATTAACATTTTGTATTATTTATAAAATCATTTCATTGTATTTAATTATGTTTAAT-------TGTATTCCTTTTAGCAAAAATAAAGTTGAAAGCTAAA
>CG10154 13409770 13409800|14154 chr3L 13409799 13412325 scaffold_8 1650051 1652460 - 18941|0 1
CT
AT
>CG10133 13423134 13423255|14162 chr3L 13421063 13423183 scaffold_8 1661956 1664200 - 53910|2318 2378
TATATATATTATTGTTACATAATTTAGTG-----------TTAAATAAAAAACTGATACCC
TACATATATAATAAGTATATAATTTAATACAAACTAGACATTTAAAAAAAAACCGA----A
>CG10133 13423134 13423255|14163 chr3L 13423184 13424212 scaffold_8 1664377 1665384 - 40500|0 72
TAGAATCCGGAG-AAGTATTTATTCTCAGGGATTGTTAGGTGAATTCAAAACCCTTCTTGTTTTCAGTGTATT
AATAGTTGGGAGTCAGTGTTAAATTTCA-----------------------------TCGTTATCTGTAAATT
>CG10116 13430153 13430202|14169 chr3L 13430002 13431565 scaffold_0 1050685 1052195 - 24902|151 200
GCTGCGGATCCAATAAAAAAGCCAAACGAATAAAGGAAACAAAGGAGCAA
------GGCACAATAATAAAG----GCGAACCCAGCAAATAAGAGAAAGA
>CG10089 13440774 13440804|14175 chr3L 13440502 13441092 scaffold_0 1061942 1062609 - 10026|348 379
AGTCCAGAGCAAGCCGTCATT-AGGCGAGGAG
AGTTCTCAACGCAACGCAATCGAGTCGACGAC
>CG10089 13441961 13441995|14176 chr3L 13441263 13443252 scaffold_0 1062638 1064710 - 58160|775 809
TTACCACAAATAAAATAATCATCCGCTTCAAGTCA
T--------------CAAGCGGCCGCCTAGAAAAC
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GGAAACC--------------CAAGTGCCAAGCAGCTGGGACGCCCTTTTGC-----TAAATATCTACACCAATGCAGCTAGCAACTATATTTTGGATCCGGACTATAGCTACTT-AAACAC-TTTACCCCATA--ATCTTGAACAATAATGCGA-------TACACCTAGAAGAGATTCAACGATGACTAAATGCGACTATAA---GATTTTTATCGTACATCACGCGTCTGTTTTTTATCTACATACATATTATTATATAACGTATAATCCATGCCACATATGCAACCCTATCATACGTTGTTCCCATT--TGTATACATATTATATC--ATTGTTTGGCCTCGATTGCCGAAGCCGTGTTGCGTCCTTTTAAAATGTTCTTAGGATACATACAAAGTAACCACTTAGTCAGTATTTAAGGCCCGCTCCATTCCCGATCCAGGGTTCTTTTGTATATGTATTATTGATCGAGATTTATAACCTTTTCGATAATAAACTTTGATAATTGTGCAACCG
GCAAATCCGTATCTAATATGGCAACTGCAGAGCAGC-AACACTAGTTTTTGCAGGTGTAAACCTTAACAGCCATAGCTGTAGTTAATGGAGCATATATCCGAATTACTCACATTTAAAACACGGCTGCCCAGTAATATCTTGAACAATAATGCAATTTATACTATACCTA-ATGAGATTTAATATTGCCTATAAGCGACTATAACACGGTTTAGATCGTACATCACGCGCA----------------------------------------CCATG--------------TTCTCACAGGTGCCTTCCATTTGTGTATACATTTTATATCTGATTGTTAACTTTAAGATTTCGAAACAATGTTGCGTCCTTTTTAAAATGTTTCTTAATGCACACGATTTGTATTATTA-----TATGTAG--------------CCAATATATGTTTTGTATGTATGTGTATTA-----------------------------------------------------
>CG10711 13485593 13485650|14216 chr3L 13482580 13486842 scaffold_0 1111613 1115759 - 122985|3295 3354
TTTCAATGTGAATGTGTGCTTGTTGTTATGGTTAATAAAGATA--TTTGACTTTTTATTT
TTATAATATAAAT---------------TGATAATTAAAAATAACTCGGATTTGTCTCTT
>CG10710 13490220 13490475|14219 chr3L 13490219 13492522 scaffold_0 1120475 1122990 - 70554|1 265
AGCTGCGGCCAGGACATTCAGGAAACATCCACACACAGCACTGCCAAAGATT--TAAGTTTAAGATCAGCTAATGGCCGGCCCAGCTTCGGTTGCGGTTGCCAGTTGAGGGTGGAGAACAGCAAC-------CCATGCCGATTCCGTCCATGCGGGCTGTCCAACAACGCGATCAATGATCCTCAGCCACGCTTCCTAGTCGTTCATCAGTTTTTTTAGTGCCTAATAAAATGTTATTGTTAACAAATAAACTCAATGTTTAACC
AGCAAC-CCGACGAGCTTTACTTAGTTTACGCCGAACACACTGCCAAAGATTGATAGATGTAAG---AAAGAATTGTCAGCACAA--------ACGAACAAAAGTTTTGGCAAGACAACAATTATCTAAATACTATGTTGATTCCGTCCAAGCTGGCTACCTAAT----------ATAGTTCATGGCCACGCCT-CTAGTCGTTCAGCAATTT------------AAGCAAAGTTATTGTTAAC-AATAAACTAAA-ATCTAACC
>bru-3 13511865 13511943|14230 chr3L 13510832 13512074 scaffold_0 4631979 4633290 + 27877|1155 1270
ATGGTCGTCAAC------------CATGCTATGTG---------------------AAAACGATTATAGAAATGAAACATGCAAAG---CGTATGTAAAA-AAAAAAAAAATAAAA
ATGGACTTTGGCAATGAATTTCCACATGCTAAGTGAAGCAAAGCCCCAGCAAAAAAAAAAAAATTATAAAGAT-----ATACAAAAATCCATATGTAGAATAAAAAACAATTACAA
>bru-3 13512193 13512690|14231 chr3L 13512182 13512544 scaffold_0 4633307 4633729 + 9726|13 446
CCACTATA-------------------ATAACCTTGGCAGCAGCTTTAGGCCAACCTTACCTTTGCCCACTGAA---AGCTCCAACCACAATGCCCACATACCCTATACATTTGCCAGCTGGCGCAGCGGTACCTACTGCTATCGCAACCACAACAACAATAGTGAAAACTACAGCGATAACAACA---------------------------ACAACCACAGGAACGT--ACCCGATTCCCAATCCCAA-------------------------AACGATACATCATCCAAC------ACCAATTGCTCCAAAGTTGAACTGGTCGAGAGACTATTCATGTGGCAACAGCAAAAGCGAAAGGCCTAAAAGTAACATCAAACACAACAGCAACCATAACAACTGCAGCTACAATAAGGAGCAACTATTGATGGG
CGGCTACAGCTACAACAACATCAACAAACAACCTAAGCAACAATTTTAGGCCA------CAATTAACCAATGATCGTAATACAAATCGTAATACA---ATGCCCTATACTTTTGCCAGCTGGCGCAACGGTACCTATTGTTATCGCTATAGCACCAACAGCAGCGGCAATAGCAACAATAGCAACATCATCAACAACAACCACAATAATAACCACAACAACAGCAACATTAGCATGAACAACAATAGCAGCAGCAACAACATGAACAGCAGCGACAACAATTCCTGCTCTAATGAAAATAATAACTATTCCAAAGTTGAACTGGTCGAAAAGCTGTTCATGTGGCAACAACAAAAGCGAAAAGCTTAG---------CAACAAGAAAAACATCCACAACAACAACAGC------ATGGATCAACTTTTAATGGG
>bru-3 13512193 13512690|14232 chr3L 13512545 13513501 scaffold_0 4633856 4634839 + 37680|0 145
CAATCGGAGTTCCTTAAACGCAATTCACAACAACCAACTGGAGCAACAACATCAGCAACAGGCGCTTTGCCAACAACTACCGCATTTTCAGCAGCCACGCCCACATCGGCAGTAACCTCCGTATCAGCAACAGTGACAACAACGGC
CAATCGGAGTTCCTCAAGCGTAACTTACTTCAAC-------AACAACAACAGCAACAACAGCTGCAACAGCAACAACTGCAACAACAACAGCTGCAACAACAACATCTGCAACAACAACTGCAACAACAACAAATGCAACAACAAC
>CG8745 13825261 13826015|14555 chr3L 13814913 13825291 scaffold_0 3011831 3022356 - 479909|10615 10645
CAAATCAAATACAAACTACTTTAATTTTTTT
CAAATTAAAAAAAAACCAATTGGATTTTTTT
>CG8745 13825261 13826015|14556 chr3L 13825304 13825635 scaffold_27 451933 452272 + 1135|0 359
ATGTTACGTATATTTTGTATAACTACA-----------ATGTTTTTTTCACGTAAATGTCAAT-TATGAAATTCGAAACTTCTGTGCGATTTCTCGACACAACATTTAATTTTTGGTAAATACTGTTTTGCTTGTCAAGAGGGGTGAGACT---------TTACTGATCACGTTGA------TCCGCCTAATTTTATAAACGATTACTTGCAAATATGATAGATGTAAGCAAAATGTAGAATATTTGTAGAATATTCTACCTTTTCTGGGTGTATGTGTATATAAAAACCCCGATGAGTATGCAAATGTTTGATGCGGCTAA-CGTTGAGTTACAAGTAGAGTTTTGTTGTGTGAATAAA
GTAATA-GTAAACTACACAACGCTGCATATGTGTTTATATGTTTATGTAATGTACGTATGTATGTATGTAATTATGTATATATATG---TATATGTATATATCGTTATATTGTAGTTATA---------GATCGTTAGCTGGGGCGCAACTCACTAACATTGCTTGATTGTGTTGGGTTTTCTTCGCTTAAGCTTACAAAAAACTTATCGCATAAATTATGTATGTAAATAAATTGTTGTAAATTAGTTATATACGTCTATATATATATAAATATATATATATATATATATATATATATATATATATTATTGGTACGAAAAATTGTTGCGTTC-------AGTGTCAGTGTGTAAATGAA
>CG8745 13825261 13826015|14557 chr3L 13825636 13827418 scaffold_5 878025 879706 - 77581|0 396
GGCAGTGCCTGCTGGTTGGCCAATGCCACCACCAACAACGTCTCTTCGCCCGGGCACAAAATAG-CTTTAGCCAC------CAAGGATATTTAAATTATTCCATGATCCCCATGTCCGCTGTTCCCATAAAAAATTAGAAGTAATTCGCAAAATTTCCATTTTTTAGCTGTAGTATCAACATGTTTATTTGCTTAGAATTAGACCCACTTATCTGTAATCTACATTTATATTTTTACGCTGTATAATCATTATCCTCTTCGCCAATTATCTTCTAGTATCTAGAAACGTAGGGAGCCCAGAACGAATTTCTTGAATTGTTATATCCCCAACATCATGTATATATGAATTTATG---------AATATATTTAGTATATGT-TACAAATGTTGTTAAA
G----------------------TGCCGCAGC------CGGATTCTCG-CCGAGCCTGTCTTAGTTTTTAGTTACCACACGCAAAGAGATTTATGTTTACATATGTTTACTGTTACTTTTTTTTTTTTTTAATATTATTATTA--------------------TTAGCTGTAG---CAATAT---------CTTACTGTTAGCCA----TATCTTAGATACATAGTTGAATTTCCATTTTTT-------TTTTGCTCTGCTTCTA----CTTCTAGTATCTAGAATTGTAG--------GCACAAATATTATTATTTTTCTCTATTCTTTTTTTTTTTTTTTGCTAACTTATGGAACAACAAAGTATATTCAATGTGTATATACAAATATTTTTAAA
>Rgl 13872150 13873082|14601 chr3L 13872068 13875512 scaffold_8 2759459 2762903 + 128980|94 1162
TCCACAGCCGTGCCTCTGTCCCAATTGTGGTGTCTGGGATACGAGGGCGAGGAGTGAGG------------------GTTAAGGATTATACAT-----------------TGGGGGGGAAATTGTAAATAGC-----TAGAGCTTGA--CTCGCCCATGACAAAACTGGATAAACCAATTTCTATTTAGGTTCGTAACTCGTTTAAGTTATTTATTTATTATTTGAAAAGTGCAAGGATAGTAGAAGGAAAGAAATCGATTAG------------TGCGATTACCGATTATTTC------------GATTGATGTCTATTATTTCA-----AATGCTGTCAATTATCACTTAGCCAA---------CTTTGTAATCTCTAATTTTTCGCAGGCCTTGAGTTGTATATGATTTAAAAGCCCAATCCAAAACATATATTATACAGAGACT-CTACTGGAATATTTGCTGATATTTACAAACACACATATAC--ATTAAGTATATTTACTTATATACAACCATTGATATTC-TAAATGTGGTACAATAATTTTAGATCTTGAAACGGATATTGAGTTT------------------------GTTTAAGGATTCTCATTGTCTGTACTTAACTTTGAGGTCTTAAAAACACAAACAACAAAGAATATTTGTATAGATGTTTTTACCCACAGTACGTGTATTATA--------AATACCAATTTAAATATAAGTACTATATGTAACATTTTTCGAGTGGAGTGCACAACAACA-------AATATTGTTT-TATCGATACTTTAGCCGTATAAGAT---ACCGTATTTCAGATTCTCTAAGT----TATCTACATTGAAAATTAATGAGAGAA-TGAAACAATTATACACTTACGGTATACACTAAGAATCTGCTTTGATTTATACATATTAAATATGATTAATATTTAACTACAAATTTAAGTTAACGAAAGAAAAGAAGGAAAACAAAAGAATAT-TGTAAATATAAAAGTGAAAATCGATAATTTGTGTTCTTCTGAAAAATAAA---TTGTACCAAAAGAATGAATACT
TCCGCACTTGTGCCCCTGTCCCAGTTGTGGTGCTTGGGATATGAGGGCGAGGAGTGAGGCAGAGATAAAGAGAGAGAGACAGAGATCAGAAACAGAACCGAAGAGCAAGATGGTGGAGCGCTTGTATATAGTATATAGAAAACACGATCCGCGCACATGACAA------------CAAGTTTTA-----GATGATAA--TGTTT---TAATTTATTTATTACACGAATAG----ACAGCAATCGAATAATATCGATAGGCTGGCACAGTTTGAGCTGCAAGTACAGTTGCGCTCTTGTGTGCAACAGACCGATAACAATTTGCTTATCGATTAACCCGTCAATTAGCCGGTAGATAAAACCGCAACTTTTGTAATCTCCGTTTCCGTAAATTCCCT--------TATAGTGTCGGAATCTTTTTT---TCACAT-TCATGTGGAGTCTAAAACTGGAATAATTGCTGATATTTATAAAAACATATATACTACTTATCGATATTGATATTGTTTAAGCGATGGATATACAAAAATTTAGTACAATAATTTT-GAGGTTAGCATCGATATTAGTTTTTGTGGAACCAGACCACACAATATGGCTCGTGGGCTGTACGAGTATGTACTTGATTTTGAAG---CAAACAAACCAAC-ATGATATGTATTTGTATAGATGTTTT--ATTGCTGTACGCGTATTGTACAAATAACAATACAAATTTGTAACTAAATATTTTATG---------------GGGTTGCATAAAGAAACGATAATAATATAATCTATATGTATATACCATTTTGGTAAGCTCTCCCCATTTTACAGCTAGTTAAGATATTGTATTTGTTTGTATATTTAGCGATACAATTTAAAGAATTATACA-------TATATATCGA-----TACCTTTATGAAGGCATATTAAATATGAGCCCTATTTAAA-ACAAAATTAAGT------------------------AAAGAACGTGTGTAAATATAAAACCGAAA----GTAAGCTGCCTTTTACTAACAATTAAGAATTTAAATCAAGTAAGTAAGTACT
>CG8833 13891144 13891191|14619 chr3L 13891088 13891152 scaffold_0 7560313 7560379 - 702|58 66
CATTTTAAA
TATTTTAAG
>CG8833 13891144 13891191|14620 chr3L 13891181 13894200 scaffold_0 7560403 7563455 - 105990|0 10
CTGTAAATAGT
TTTGAGATATT
>Meics 13927913 13928031|14656 chr3L 13927908 13927971 scaffold_7 1574936 1575009 - 1935|5 73
ATAACTACAGACTTCGTGTAAGGAAATCATTAAATTTGAACAATCTGATGTTACCA----------AAA
ATAATGTTAGATTTTGTGTAATAATAATATTAAATTACAACAATTTTATGTGATTATGAAATGTTTAAA
>Meics 13927913 13928031|14657 chr3L 13927972 13928046 scaffold_7 1584295 1584355 - 319|0 59
TATAAGATTATCCTGTAGCCCCAGCATAAGACCATTAGTTATAATAAGTGTTAAGTAGAT
TG--------------AACCCCAAAGCAAAAATAAATAATATAAAGATCAGTAAATAAAT
>CG13738 13938379 13938417|14672 chr3L 13937802 13938424 scaffold_14 1688716 1689388 - -2382|670 708
AAGTCAATAAAAACAAGCTTTGATAATGTTTAGCACAAA
AATTAAAAAAAAAAAAGAATAAACCAAATATAG------
>CG17364 13946355 13947023|14681 chr3L 13946177 13946494 scaffold_0 1395583 1395920 + 3633|187 355
TCGTTAATTCAGCTCAGTTTATTTACAGTTGATATTTAATTTGTGTACATTGGCG---TTGGTTAAACC-TGTCCCCCTGCTTGTCTAATTAGTGTTTAAA----------------TTGACAACTCTGTCTAGTTAAAAACGATAAACTT---------ATAAACAAA
TCGT-AACACAA-TCAATTCATT---GGCTCATTTTTA---TGTGTACATTGGCTCATTTTGTTAAATCATATCTCTTTTGCCGCATTTTCATAGATTAAAAAAACAAAAAAAAAAATTAAAACCCCCGTC-----GAAAATACTAATTCTTGGTCTTTCAACAACAAA
>CG17364 13946355 13947023|14682 chr3L 13946746 13948163 scaffold_0 1395921 1397232 + 36127|0 284
CCCTTAGTTTGTATTTTCATTTATCTATCTCTAAACTCTAGATCTTTCAGT--CTTTAGTGTACGATCTTTCAATTGTTGAATTTGTACATTTGAATAGTACAGACAGTATATTTGAATCATTACTTTAT-TTTTACCATCTATT--GTTCTGTGAAAAATTTAGATATTCTATCAGATATTATATATCGCAAATAATGTCCTTACATATACATTTAAATATCGTATCTCTTTAGTATACGAGGAAAATGCAAATGCTAGA--CGCATTTTAAATTAAGTACTAA
TACAAAATTTGAATATTATCTTTTTGAGTTCCCAATTA-----CTTTCAATTACTTTGGAATCGGA------AAGAATTGCA-ATGTAATTGCGAAGAATATTGAGGATAGATTGATACAGCTTCAAAATACTTTACAAAATATTACGTCCATTGATAAAATAATATTT--------ATAATTTATA---CTAATAAT----TTATA---ACAATTTAATA-CATATTGCTTCAG-ATCTAAGT--------AGTTCGAGATCCGCAGCATAAAT--AATATTAA
>CG17359 13963150 13963421|14705 chr3L 13963090 13963328 scaffold_12 2140169 2140444 - -380|64 284
GAAAGCTGCTTAAAAACTGTTGTGAATCGATCCGATTATCATT------TCTTTATTAT---CTTATTGTCAATATGAGAACATG-AAATTGTTTTTAAAACTACACT--CCATATG-TACTTTCATTATTAGTCGC--------------TAACTTGTTT-----CTACTTTAAAAATATATC------GAACTTA----TTTTTAAAACGATGATACAA
ATAAATCAC--GCAGATGGTCGGAAAAGGGGTGGATGATTGTTAGGAAGTCTTAAATTTATGTTTATAAGTAAAAAGAAAACGTGCAAAATATTTTTAATGATATACTACTCGAATGTTAGTTCAATAATCAATTATAGAGTTAATATTTATAACTTATTCAAGAATTGAATGAAATATATATCATAGAAGAATTAAAAGGCCTTTAAGAAAATGGTATAA
>CG8783 13964639 13964993|14707 chr3L 13964442 13964816 scaffold_0 2509981 2510319 - -799|202 390
TTCAATTATTGTCAAACTATGTTTTTCCGTGATTTCATACAAATTCAAAAAATTACTCATATTCAAAACAGCGTTACATTTTAAGCTTCGCGCCCATTGTACAGCTTTAAG-GTATATCGATAAGTGGGGAATATT--------CTGATGCTCTAAGA--GCCAGATTAAAATAAAATATTTAAAAAAT
TTCTACTTTTTTAAAACTATATCGGCGCGCAAATTTCGTTTTATTTAATAAATC-CTCGTCTTCAGA---------TATGTTA----------CCATAGGAAAGATCTAAGTGCATATTTGTCACTGTAAAAAATAGAAACCAACGATTTCTCTAATATAATTATCATAAAATATATTAGTTAAATATT
>CG8783 13964639 13964993|14708 chr3L 13964865 13967021 scaffold_0 6626492 6628703 - 103017|0 128
AGTTTGGGACGAATTTGCATTCCTAGATTTTAATGTTGAATGTTTTTGTTTAGTTTTTGAATATAATCTATAAAATAGGTATGCATCTAATTTTGTAAAGTTTGCGAAGCAAATCAATTTACGCTTGTA
A--TTTATAATAAAGAGCATTCC--AAATGCAAT-TTGAGTGTAATTCGCACACTTTCGCGCATAATCCATCCA-------------TACATTTGGAAAGTGGGTGA--TAAATT-CTATAAGCTTGTA
>endos 13994838 13995505|14723 chr3L 13995102 13995229 scaffold_8 1906863 1906990 - 2023|0 128
TGGCGAGCCGAGCAGCGCGAAATTTATTGCAACAGTTATATATATCTCTATCTTTGTAACATTAAACTAACTTACCCTCGTCGTACATAGTTGTAAG-TATTACGAGCATAATAAATTTAAGTTGGAGC
CGCCAATCTCAAGAACATTGAATGTATTATGGCAG-CACGTAACCTTTTAACAGTTCTATTTAACAATATAATATCCTGATTGTATGTAGTTGTAAGTTATTGAAAACGTAATAAACTTAAGATGTAAC
>endos 13994838 13995505|14724 chr3L 13995308 13995701 scaffold_8 1907059 1907431 - 12239|0 216
TTTACTCACCACTCAACACTCACCTCTACTGTATCCACAACCTCAAGTGCAGCCAGTTCTCCGTTCCCCACTTCAAATGCTCTATACCTAATTTTAATGAAAAACCTAATGCTAAGATGGCTGCT-------------GCCGGATTGTGCGGGCA----TTTCGCGACAGTTTAAACTGAAATTCTAGCA--CCATGTTCCGTGTTTCCCCCGTTAA
GCT--------TTCAG-----AGATCTATTACACCCACAAGCTA--------------CCCTGATGCCC---CCCAATGCTCTATACCTAATATT-----GTAGTCTATTCCTAGATTGGCTGATCTATGTGCACTAAGCCG--TTGCGCTGGCGCTCTTTATGCCGAATTGTAAAC---AATCTATGCAAGTTTTGTTTGGTTTATTCCCAATTAC
>blue 14008945 14009108|14739 chr3L 14008947 14014704 scaffold_0 1814576 1820328 - 267088|0 181
GCGCACAACAC--------CATACTCGCAGTAGTCACGCCTGTCCCTATATTCACCACATTTTAATCCCG------------CTCAGCAGCTACCCACACCAAATCGCAGTCGCATTCCTCTTTGTAAACGAGTTTGTATTTGTATTGTAAGCTCTAATAAAATTATCGCAAAGTTAATACA
ACTATCTACATATAGATAATATTTATACACTAGTCA--CCAGCTCGCAGCCTAATTAAATATTAATATCGTATATGATAATACTCGCTAGTTTTCCA--------CGCATACGCATTCCCCTTTATAAACATGT-----TTTGTATTGTAGGTGC--ATATGATTCTCCAAATATAATTACA
>Fbp1 14059845 14060068|14780 chr3L 14058957 14061910 scaffold_0 1864340 1867031 - 63894|912 1138
GTTCCCAATACGAAGTTCCAAATATGTTAAACCGATCGTCTGGCCAGCTGCTATTCAATGGACCTATCCGAAAATCCCCTGTCGAACCCTAGTTTTAATTAATCGAATCTAAATCAATTTAGCAAAATAGCAAAATGTTAAATACTCTTGTAATTCATATATATATATATATATATTTGTCATTAAAGTTTTTTGCAAGCAATGC---AATGCAATCAAGCATTAAA
AGACGCGA---------CCGCATATT---AACCCTTTGCCTGATGGACT-----------GACCGATCGATAGACCCTAAATCATACGC-ATTCTGACATATCCGA--------------AATGTAATAGTTAAATTTCATATTTTC-TGTAATCCCTAAATAAAGCTA------------------------TGCAAGTGATGCATAAGTGCATTGAAAAAAAAAA
>Sox21b 14077642 14078282|14796 chr3L 14077634 14078005 scaffold_0 1884935 1885273 - 10561|8 377
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TTCC
TCTC
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CACCCAGCGGCAAGAAACCTGGCGGCAGCACACCCGGCTCTGTGCAGTCGCAGTCTGGCGGCAGCGGAGCGCTGAGCTCCAGCGGAGTTGTGCCCCAAGTGCAGACGGTGCAGTCGCTTCATCCGATGCAGAGCGTACAAGTCAAAAAGGATCCCGATGCACAACAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAACAACAACAGCAGCAGCAACAGCAACAAACAATGACAGTAACCACCACGGCCGGGGGCCAAGTGCAACA------GCAGCAGGT---GCAGCAGGTTCAGGTGCAACAGCAACAG------------------CCATTGCAGCATCACCAGATCATCGATTCGTCTGGCAACATGACAACGCCGACAACCAGTGCCCAGGCG------GCCGCCCAGCAACAGGCGAACAATCAGCAGCAGCAGCAGCAACAGCAGCTGGTGGCCCAGTCAGATGGTAGTGAGAGCGGTACGCCGTTATCTATTGCCCAGGTGCAAACGTTGCAGGGTCATCAGATAATTGGCAATTTGAATCAGGTGAATATGACTGATTTTCAACAGCAACAACAATCACAACAACAACAGCAGCAGCAACAGCAGCAGCAGCAACAACAACAACAACAAACAACACAACCACCACAGACGCTTTGAGTAGCACGTACAGCTCTGACGAATCGAACCGAA-TCATAGACCCCCTTTATTATA---AACCCAATCCCTGACTTGG--TTCTCCAATATGCTTAA------CTCTTCCCGGAATGTGT
>Trl 14717958 14718164|15538 chr3L 14716322 14720093 scaffold_0 335190 339087 - 97213|1837 2066
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CCGCCCAATGCCGGCCGCCTAATCATTCCACCTTAACACCCATCCACTCACATACACATACATGTAACACAACACCTCCTGCACATACACTTACACACACACAAGCACACACACACATACACAATGTTTGTAAATAACAAAAAACA-------------TCCGTCAACAAAT-GAATGCTT--ATTTCATTT--TGTATAATTTTTGTT---------------------
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TA
TA
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AAAACTTCAAAGATATCAACACCA
ATAATT---AATATCTCGACGGCA
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ACGACTGA-------------GCCAAGCAACCAACTAAAGATCTATGCG---------TAATCAAAACG-----------AGTATTTATACAAATATTT-----AACTG---------TGCAGACCTATTTCTAAATA------------TCCAATATTGTTTCAAACAAGTTAAGG----CAAGAGAAAAGTATTTAAAGGGATATCGAAAACATGTTTTATTCTGTATCGTAAACGTC--TCTTTCAAC-TGTTATATAAATTGTAATTCGAAATCGAAACCGAATCGTGATGTGTAT
ACGACTGACGATGCTTGCATCGCAAAGTTGCTTAATATATATATATACACACACATTTTAATCAAAATGATAATGTTTATAATATTTATACAACTATTTACTACAACTATCAACTACCTACACACACATATATACATATTTATACACGGCTCGAAGATTGTTGCAAACAATTGATGGGCGATAAAAAGAAAACATAGTATTGAATTAACAAAACA--------TTTGAATTGTATTTGTCCTTCTATTAACTTGTTATATCAAATGTATTTCAAACT---------ATGGTGATGTTTAT
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GCCGTATGCTGCCATTGTATCATCGTCAGTTTGTAAGCGGCAATTA--GCTAATAATTGCATTCTTGTTATTAGTCACCCTCACACGACTTGTATTACATCCAAATCCCCATCTGTGTTTAGCCTAAGTTGATAATGTATAAACAATAAAAAAAATAAACAAC
ATTTTACATAAGCTCTGCTTCATCA--AATTTTTGAGTTGCAGTGACTGCACGTAATTAAACTTTGTTTTTTTCTCATATGTTCTCGAATATTGCAAGCTTTGAA--AACATCAATGTTTGTCTT--------------CTAACTAAAATATAAATAATTAAT
>CG5295 14741755 14742244|15557 chr3L 14741916 14744990 scaffold_0 6659493 6662361 + 65845|0 338
ACTTCTTCATCGATGCGCATACACCAAATGTGGAGGATAGTAAAACATCAGCGCCACAATTCTCCCGCCTGGACCTGGAGACCGAGTCGGATGCTAGTGTGCTAAGTGATCCCGAGGTTGATCAGACTTTTAGCTCCACGGCCTCCACGCACAGCAGCGACATGTATATA----------GAAATTGAGGGGTAATTAGTAATGGGGAGGGGGCAATCCTCTTAGGAACTGTATCGAAACATCTCCAAAGCGGCTCGTAGCAAAGCGAAAAGCCTAGTAGCGTTTCCATTAGTCTAAATTAGTCTTAGTACGACCAACGTATGTACCTAACTTAACTTA
ACTATTTTATAGATGAACATACGCC---------GAATACTAGCCCCTTGGCGACGCGTATCGC----------------------------GTAACCGTAGTCAGTTTTCCTGAGGCTGAACAAGGTTTAA-----CCGAATTGTACATA-------AACATATATATGTTGAATACCCAAAATTGTATATGCTTCAGTTATAG-----------TCTTTTTATAATTTGTAACGCAACGAACCCAAAGTGGCTTGTAGCCAAGC---------ATTTGTTTGCTTAAAAACATATATTA-TATTATAAAAACCTGAGTACCTAATTAACTTATATTA
>CG5295 14742365 14742453|15557 chr3L 14741916 14744990 scaffold_0 6659493 6662361 + 65845|477 567
AGCACTTACAAACTAAACGACTATAAATGCACCT--CCATAACCCTTCACCCACTCAAGCATTAAGTCCAAATTTTAAATCGTTGGCGCAG
AGCCC--------------ATCTCGAACGCACATTGTAACAACTTCCAAACCACTAAATTATT------AACATTTGAGTATTTA----AG
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ATCTGTAGGATTAGTTCCATCGGCTAATTAAGTACCTAGTTAAGTTCAAAAAGTACCA---ATAAACTTCGGAGAATGCCGATTCTTTTGGCAT---CACGAAATCAATTTGATAAACTCTTGCATACGATTT---TATAGTTTTCGTTGCTATATAAATTATAAGA
CTTCTTAATGATAATGATGTAATTTCGATAAG-----AGTTCTGCTTGATAAGTCACATAGTTTGACAATAGCATAAGCCCATCCATTT-GCATTTGCACGTAA----------AGACGTTTGAACACATTGCGGATAAAAATGCCATTCTTATATATTTTACAAAA
>gnu 14767639 14767737|15577 chr3L 14767576 14768318 scaffold_0 6682519 6683127 + 8729|63 164
TTTTA-TATCCTGTAGGATTTCTGCTAATTTTAAAC--TGTTTTATGTCATGTGGATTTGAATTTGTATGTGAGATTTTAATAAATGTTTAATGTGGTCTTG
TTGTGTTCTCATGT--------TCCTAACTGTAACCCACGTTCATTATTGTACCCAATTTTATATGTGTCCAATTTATTAATAAGAAATAATTGTTTTACTG
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GTTCTTCTGGGACATCCCC-----CTCCATCGAGTATCTGTGATGTGACCCG----ATCAAAAGGTCTATAAATCGGCACTCCGGCTTTAATATCCAACTGTGATGACGAGAACACAAGACTGACTGACTTGTGTGCCTTGGAGGTGACAAAGTTCGTCGCCTCTGCCAACTGTAC-ATATCAAACTAGCTGCTAAAATGTCTTCAATTATGCTTTAATGTAGTCTAAGTTAGTATTATCATTGTCTTCCATTAGTTTAAGAAAATCATTGTCTTCCATGTTTGTTTGTTAGGGTAAAAAAAACTAGCTTAAGAATAAAAATCCCTCGCGGAAAGAAAACAAT
--------TGGAAATCTGCAGAAGTTCCG--GACAACCTGTGATGGGACTTGTGTTGCGGCACGATTCCGAAATCGGCGA-AAGGCTTTAAATAAGTTCTGTGATAGCGAGAGTACGAGACTG----------------------------AAATCATGGCTCTTGCCATTTGTACAATATTAA--TAGCT---------------------CTTTAAT-TAGCCTAAGT--ACCTGATCATTGTCTTCCATCAGCTT---TAAGTAATTGTCTTC-----------------ATGAATAAAATCATATATTGACAAAAAATATGTC---------------T
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-ACGTTCTTTAATATTTAAAACTATACTGTAAGTGTTAAAAAAGTAAATCATTAAAGAGCGTCCTAATTTGTTATAACAAAGAAAA
GAGGTTCTTTAATATTTAAAGCTTTATTCTAGTAATTTTTACCATTTAT-ATTAAAGATCGTTACAAAAAGTT--------TAAAG
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GTGTGTAGCGTAAGGCAATAATACGGTTTAAC-AAATCAAGTGAATTCTTGGTGCCAAACATTTAGTGGTTTAGTAAGCAACCCCAGCGTGCCTTTAGTAGGTAGGGATTGACCCTCTGTATGATGTGATATTAGCTGAAGTA-------------------CTTGTAAATTTAT------ATCTATGGCA---------------------------------------ATATTAAAGACATGGA-----TGACATGATGGCTAGATAGTAA--------------ATACTCAT---AAGTTTCAATTGTACCA------------------ACCAAAGCAGCGTTGACATTTTGCGCTAA--------------------------------------TTTACCTATGTTTACGGC--TAGTCTAGAGT-----AATAACTAAAATGTTAACAAATTTTACACATTACTTGGGTTTTCTTTAAAGAAAAACTCACACAGA-------TAAGTTTATATGAAGTGCTTTATTGTTCATTGAACCGCATCAAACCATAATTCC------ATGTTTGTTATCACTTAAACCTA--------
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ATTTTCTCATTAGATCAATTCTTGCTTCTAATCCCCTCAACCGGAAAATAATATCCAGAATTTATACATTCGTCCAAAAATCAGTAAATA
AGTT--GCAACAAATAAAGCGTTAACGTTAATCCAATCAGCCAGAAAATGATGGCTAATAGATATAGTTGCTTTT---------------
>ind 15008053 15008160|15815 chr3L 15005677 15010354 scaffold_0 1145030 1149353 - 70526|2434 2542
AATCAATCACCTATTAAACCATAAGAATAATGTAATTGTACAGTAGATTTTAGTCTGTTTTCAGTCATAAGTAT-GTTAAAGTAAATAAATTTTAATCAAAATGAAAAA
ATAATATTGTTGATTAAATTTTA-GAATGTTAT--TTGTACAA-AAACTTTAATCCGTTGTCATATCTAATAGTCATTAATATAAAGGTTGAATAGTCTAAAATAAAGC
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ATTTCAAAAATTAAGAAAAC--A
ATTTCATGAACTGATTAAATCAA
>CG18649 15018822 15019083|15829 chr3L 15018902 15019522 scaffold_0 1154855 1155455 - 4472|0 197
CTCTAATGGGAATTAA----CCCTTTCTATTCTTTAT-TGTCTTTATCTACACGCTTTCACCGGTCGTTAGACGTTTAAACAACTGTTTACACAGAAATACACAGTTCATCTTCAACAACCAAATAAGTAAAGGTTTTTATG-----------TTATTCTAGTAAATACACACATTTCTGGAAACACCCATCATAATT
--TTAAGGAGACATAACTGTCCCTTAATAATACAAATACTTCTACCTCTTAATGCT---ATCTTGCACTCTCCATCTGAGCAATCGC-------AACACAACCCGTTCAACAGGATCATTTAAATA---AAAAGTTTTCCTATACACACGCACTTTTCTTGTTAAATATATAAATTTGGTGATTGACCTATTAAAATT
>cp309 15031500 15031930|15834 chr3L 15031354 15035898 scaffold_0 1161581 1166059 - 141619|157 650
GCCCAGGATAGCAGAGTTGAGTTCCATCAAGAAGAACTTAACTGAATGCCCTAACTTTAAGTGAAGCCATATCGAAGACACTCTGCAAGCATGAAAG-CATCAAGGATGTTGGACA--------AGCGATCCATTTTAGAGTTAATCACCTGTACCATTTCCCCTCATTATTAGATCTTAAGCTGTTGT---------AACCTATTTTAAGCGTTCGCGCAA-----------CCACAACAAACCTAGAAATGTAATCGTCTGTAAGTGTTATTT---GTATTTACCGCCCAAATGTAG-----------------CCATAAGCATAATGCTAATCCATGTCCCAGTATTTTGATTGG---------TTCGACTGACTATTGGCTGACAAATCCCAGAGTCACTTACATATATTTAGTTTTATTTCATTTGGGTTC-----TGACTGTATAAGTTTCCTGCTAAGTTGATTAAACCAAATTTATTTCACATTCG
-----------------TGAATGCAATT--GAACAATGGAA--GCGTGCTCAAAATATTAG-------ATGGTTAAGAGATCCCGTTCGTAAGACAGCCATTAATGATAGTAGATGTGTATAACTGCGGCCTATATTAGTGTTAA-----TGTTATATTCCTGCTAACTG-TACGTTTTAAAATGTTGTCTAGTTATGAACTACTTGTAAGTACCTAGTTAAGAGCCAAAAATCCTCACCAAACCCAACATAATACACGAATGTTAAAGTTAATGCAAGCATGTACCCGCTAATTATAATTTATAATTTTAAACCCCTGTAGATCGGATCCTATCTCA-ATCCCAGTATTTATATGTGTTAAAACCTTTCGTTTAATTACTTACCTAAGTACCC----GCCACTTGAACTACCTTAATTACGTTTAATTTATGGACCTGTGCGACTGTCTTTGATTGTTTTTAAGCTGATTAAAGCTAACTTA-TGCATATTCT
>CG6945 15056076 15056612|15850 chr3L 15055037 15056343 scaffold_0 1183069 1184497 - -1622|1235 1559
AATATT--ATCCCCGAGGGGGACAGAA---ATCGCCTTACAACAGGATGCCTAGAAAATATGGA-AATATTTTATATAGTTAACAGCATTTATAAAC------AAATAACTGACTAGCTAACTA-ATAAGTGTATAAAGGA---TATTTACCCTA---ATCGAATGAT-----------ATTTTTATATGAATATACCGATTGGATACTGA---TATATTCACCGAGTTTTCTT------------AAGACTAACT-------ACCGACAAGCAATAACAAATAGATAAAAATAAATATTTTATATTAAAATAT-----ATGCGA
GATATTGCATTTACGAACTGAACTGAATCGAATGTGTTGTAGGAAAACTTATAGTTATTGTTAATAATGGATTGTACAA--AATATAATTTGTACACTGACTTCAATATACACTAATCTATATATACATTTATATAAATGAGCTTGTTTTTTCTATCTAACAAATAAGAGATAACTAAAATGTTGTTTTGATTAAGCCAACTGGAAAATCACATCATATGCAACGTTTATTTTTTGTGAATCTTTCAAAACGAGTTAAATAACACCGATCAGAAGGACCACCCTAACCACCCTCACCATTTTCCATCAATTTTTCACCCATGTTA
>CG6945 15056076 15056612|15851 chr3L 15056371 15058655 scaffold_0 1184550 1187115 - 77322|0 283
CCTATAAGGTTGTACGGAATTCTC-----ATGCACTTTCACCTTTTAATGTGATTAACTAAACTAATTTTGTAGCACTGAGAAACTACAAAGCAAAAGCAG-CTCAAACTATTGGACTCCTTT----------------------------CGAATTTTAAGTTCGTTAGCCAAATTATTTAGGATCAAGA---AAATAACAATGCTCAAAAGATCTGCCAAATTGAAAACTGACGTATTGAAAGCAATTT-----ATCGAACGACATTCAAATTTTGTATTGA
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>CG16959 15085129 15085471|15881 chr3L 15084216 15086660 scaffold_0 1211305 1213629 - 89614|922 1315
AATCCCCAATCTTCAAGCTATTT---TCTGTCCGGTTGTGATGACTTTTATTCTTC--------TTTCACCGCATGCCCAC-----CTAATTTACCCTATATTACC------TCCATTACCCTTTGTTTTTGTGTTTGCATGCTCAGTGTTTATTGATCGATGCGATCATTTGTTATTCAATTAACCATTTTGTTCTCTTTTAGGTGGTTTTTAGAAATATTCGGTTAACGT----------------GTTCGATAGGAT----------GAGACAGTGCCATTAATGTATTACATCGACTAATGTACGAGTTGTATTTAAGGAAAATCACGATAAGGGAAATAAAAGAATTTGA---AAGACTAACAATATAGAGTCTAGAAATGAAATATAA
CGTCCCCAGCTATAGTTTTACTTTAGTCTATCCCATGTCGAACTCTTGGATTTATCTACCCAATTCTCAGCGCATGTCTATTTCTACTTATTTA-CCTATGTTTCTAAGCTATCTATGGCCCGCAGTTTTCG-------ATGCTTTGCGATTTCATATTA----GATCAATCG------ATTTAATCGTTTCATTTCCTTTTAGGTGGTTCTTAGATATATTTGGCTAACGTTCGCAGCCAAAGCTTGGCTTTAAAAGACGCCAGGGTGGGAGATTGTGCCATGAATGTATTACCCCAGCAACTGTATAA---ATGTTTAAGTGAACTGTAGATAATATGAATAAACATGTTTTATGTAAGTCTATCATATTATGGTCCACGAATTTTGTATA-
>CG13457 15093193 15093321|15890 chr3L 15091469 15093283 scaffold_0 1216087 1217850 - 39602|1849 1945
CATTAAATCTTTATTTATTTTTGACAATCTTATATTTTTACAATTTCGATAACCCAGCCAAACAATAAATTTGAGT------TAACATAATAAACAA
CAATACAAATTAGATTAGATTAGATATTTAAATAGCTTTA--AGTCCTAATGCCCAAATGTGAAACGTATTTGAGTATAATACAATTAAATTAAAAA
>CG12316 15096767 15097063|15894 chr3L 15096871 15097656 scaffold_0 3443463 3444192 - 1568|0 224
GATCTCCCCACACAGACCAGTTGTAGTTCCAGTTGCCGATCCAATCCCATTGATCTTGGCCTGCAATAGTATTTGTAT-----------TATTTT---------TTTGAAGAAACGTCTG-TAAAACTGTTAAA--------TCACTGTAATAC-TTAGGTTTATTGTAGTTAATTAGGAGTTGTTGAACGTTAT--GATTTTTAGCTTACATATATTTTGCAAT
---------AGACGGGCTTGTGGAA--TCCAATTGGCCATTGGCCACTTTTAACTGTAGTCCATATAAATATATACATATATATCTCTATATTTTTTGTTGATGTTTAAAACGAAGCCTGTTAAAACTATTGAAAGAATATTTCGTAGTATTACTTTAAGTGTATT--------TTTAGAACTGTTGACCTTTATTATATTATTAATTGCAAATTATTGTGCAGT
>Pdi 15102589 15103446|15900 chr3L 15102508 15102764 scaffold_17 785769 785998 - 1156|81 271
ATCGCTATCGAAATTTGATCTCTCTTGACAATTATTTA----AGTATCGCG-----------TTCATAAGTGTAAGAAATAGTGTTATTTATTCAGAGGTATAAACTTTTGACTAAAAATACGCATATAGAACAAAAATAATTAAAATGTGTGTTTTTCTTGTTTCGATAGTTCCAAAAATATCGATACTA
A--ATTAAC-AACTTGGCTGCAGTTTGTCGATTCTTTTTATTAGCATCGCAACGCAAAGAGCTTCCTAATTATAAGCCAAAGTGTTTTATAATTAAGGCAACAAAATGTTGACGAAAAAAGTTCATAAAAATGAAAAACAACAAA----------------------ATAAAAAAATAAAAAACGATGCCA
>Pdi 15102589 15103446|15901 chr3L 15102765 15104869 scaffold_0 3448177 3450280 - 105096|0 760
ATCCAACAATTACCACACACCCACACAAACATCTGCACACACAAAAATCCAACAACTATGAACAGAAACAAAAAGCCACAAC---TAGCAACGTACATTCTGTAGTTTACTTCTTAAGTTTCGGCGCATGTGGGCCACCGGAGTTTCCCCATTCGCCGGCTGAGTTTTTATCAGTCGGAGGATGGGGTCAGCTGGTC--GCCAGTGTAGCCATCGAAGCTT---TTTGCCCGCCCA---------------CGGTTTTTATTCGC--------ATACTTCCG---TTGTATGTAGTACATTTGCGACGCAGATAACGATGATTACAC----GTCCGCTGTTTGCATG---AACTTAAAATTCAGTTTTAATGAAGAATTAA---AGAAAAC-----GATAAAATTTTAA-ATGTAATACTATAAGTTTTCTATTTTGGAATTTTTAGAATCATT--GAAAGAACTGATTAAGAACGTAACAAATAAAGTTGGTAACAACATTAAAACAATAACATT------------GGTTTTTAAGGGGGACGGATTTGTAATTGTTTTGAGGGATTTTTTAAATTTTATTGGTGCACTTACTAA----TTGGGCGTGT----ACACTTTATGTGTGCATAGCGCCTTATTTTGG-------AAATAATGAATAAAATATATTCAATTTGTTGAGAGGAAAATTTAACGTTAAAGTACAATTGTCTTAGTTTTGACATTTGTTTTCAAATTTAAATTTGCCGCTTACTT
A-CTAACA---AAAACACAATTAATCCAA-----GAAAAAAAACAACAGCAACAACAACACACACAACCACACAGCAACAACAAATAGCAACGTACATTCTGTAGTTTA-TTCTTGTCTTCGGTCGTGGAT----------------CCAATT---CCAATGAGTTTTTGTCATT------------GCCCCCAGTCCTGGCCGTGGCACAATTTAAGTCCCAACTTGTTTGCCTAATAAATAACTTAATTTAGTTGTGATTTGCAACAACAAATATTTACGCAATTTCACATCGTA---GCGCGAAGCATTTGGCAGCGCCTTCGCCGCGTTCAGTTTTTGATATGCGTAGTTTAGAATTCAGTTTTATTGAAGCGGTAACCGAGAAATCAAATTGATAAATTTTTAATGTGTAATCTTCTAAGTTTTCTATTTT-GAATTTGTAGAAGCATTGAGAAAGAACTGATTAAGGACTTAATAAATAAAGTTGGCAACAACATTAAAAACAAATGATTTCATGCTATCGCATATTTTAAAATGAATGTAATATTCAATACTCGATAGGGTCTATTGATATGTGTATTAGATATTCCTAAATATTTAGGCGAGTTTTAAAAAAATATTCATGTATA-----TTATTTTTATCCATTTAAATTATGTATTATCTATA-----------------ATGATTGAATTTTAAA-----------TCAATTTAAATAACCGCCCTAACATTTGTATTTCGCGGTTATTT
>CG32147 15108320 15108507|15903 chr3L 15106598 15109292 scaffold_0 3450952 3453574 - 31125|1975 2164
ATTCCGCAAAATATTCTTCCAATATCTGTCTTTTTAA-GAATTATTTACATGTGTGCTGTTAAGTTGTTTAAGAAATGAGTTTTATTCTTTTTAAGATACAATATTTTATATTTACTTTTTATTACAATGAAACAGAGA-AGCAATACAACTGCATTAATAATTACACAGTCTTTTTTGCGTTTACACAA
-----TGAAAGTATTCGGTTAGTGTAATTTTTGTCAGTGTACTATTTGTATGAACAGTTGCAAGCT-TATAAAAAAC---CTTTATTGTTATGAGGA-----------------ATTTTTGAATTCTATAGTATATACATGGCAATACTCTTA---------------AGCTTCTTTTG-----------
>CG7003 15119494 15119923|15913 chr3L 15119338 15123881 scaffold_0 3463186 3467676 - 177551|177 613
GGTGCAGAAGCTCCAAAGTTGAGGCTACCAGACACCATTTCCCATTTTAAAAACATGTTTACTTATGATTCGCCAAGAGGCAGCTATGCTGGAATTTGATGTATACGAAGCTTTTTAAGACTTTTTCACCATTTCAGTATGCATTTTTTTTGTAGTTTTTATAAGGAATTTGAATCAAAACCTGTGCCATTCTCAACATTCTCAATTAAGCAAAATGGAACTATTCC--ATTTACAGCCCAGAAAACATTTTAAATTGTTTGCCATTA----TTTGCCA-CCGTTTAATTCTTGTTTATTATAATTATTATTTTTTTTTGTATCACAGTAAAAATTAAAATTAAAACAAGTTCACAATCAAAATACACACACATATGATATTATTCAATACTTATAAATAAAATGTTACACAATAAATACAAATATTGATAAAAATT
ATGCCAG-----CTATGGAGGAGGCTAACA------------------AAAGAAAAGTTAAGCAAACATTTGTT------CATTTTTCTTGTCAT---ATATAAGCACAGCTTGTTTTGCTGTCTTAGATGTTTGAGAA---ATATTACGTATACGTT---------------GCTAAAGCCAATGAAATTCCGAACGATTGCCA-TAGGCTGATTATTATTATGCCGTATTTTCATTTAAACTATAATTTTTTTTTTTTTTTCATAAAAACGTTGCCATTTGTTGTATTTGTTGCCATTGT--TTATTTCATCTTTCATTATCACAGTAAAAATTAAAAATTAATTGAATTCACAATCAAAAT----ACACATATGATATTATTAAATGCTTACAAATTAAACATTATCGAAT------AAATATTGCCAAGAATT
>CG7011 15126128 15126222|15915 chr3L 15124387 15126738 scaffold_0 3467779 3470092 - 115119|1759 1888
CAA--------------CAATTCGAATCTCTTATGCAGCTTTACTACGCCTAAC------------TCAATATACATT---------CGACAAATCTCCAAATAAAAGTGCTTAATTTTATAGAAAATAA
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TATGCAAACTCGATTGTTTGCTTTTGTGCGCA--TCAATTTCAGTTTAAATGCCAACTTTATTTGATTTTTCAATAAAATCAAATATAACTCA-ATGCAAAAATCTCAGATACTTTTGTTTAAAAATA
>CG7804 15437456 15437880|16313 chr3L 15437576 15437974 scaffold_7 4753614 4754023 + -633|0 346
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TATCTGTTATT--TAAATATATAGATAGATGTAATAGATACTACATTTAAA
TATTTGTTGTTGTTAAATATGTACTTT-------------TTATATTTTAT
>ran-like 15449652 15449963|16331 chr3L 15449701 15449940 scaffold_24 664475 664742 - -2082|0 274
AGTGTTCT----TTCAAAATTTTCATA--TTCTGCAAGTGCAACGATGATCTT-TGCTTACTTTGTGCC------CATGGATGAAGACATTCAGCTGAAGTACTTAATAATTTTTAAATT--TCTAAATTTCTAAATTCCGA---------TTGTTTTCGAA---GATTCTAATTTTTTTTTTGTAATGGACGTAAA-------TTTCAAAAATTCAATGGTGTAAAATTGCAGGCTCGGATTTATATTTCTAAAAGACTAATGT-ATCCCACTA
ACAGTTTTACAGTTTATTATTTTAAAACTTCTCGTAAATAAAACGAAAGTCTTCTAGTTCCCTAGCTACGTCAGACAGAAATAATAGAATTTTGCT-------TTGTTTATCTTTAAATCTGTGTAATTGCCCAGTTACCGAGATATTAACTTGATCGCAAGTGCAATTCTCTGATAGTTTTTTCAACAGACCGAAAAAAAGTCTCGCAAATATATCGTATTAGTTGAATGAGTGCCTGTCTTTGGAGTATCGATAAAAAGACGCAATTAAAAGA
>ran-like 15449652 15449963|16332 chr3L 15449941 15450115 scaffold_17 2143061 2143229 - 1308|0 22
AGATCAATATCATGATCATGATT
ATACTGCTAAAAAAATTTTGTTT
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CATTTTGATATATATGTT----TATATGTATATGTATATTT---GATATAGTGCAAAGTAGCTTTGCCAAATAAATACATTCCAAATGCTAGATATGTGTACATACATACAT
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ACGGGAAATGCCCAATGGCAT----TTACCATCAACTCACTCGATTTTGTAACAGATTGTTTTATTACATATTATGTTGACTTTATAAATACGTATGCATTTGGAAGATTTGAATTATTGTCAAAAATTGCAAGTATGTAG--TAGTTATATACAATAATAGTCAATATAATAACAATTCTAGGTTAGCTAGCAACTTAGTTAGCTGGATTTGTTCTAAG
GCAGCCAACTTAAAATGATATCTGATTTGTAACAATTTAATTGAAT---TAATATATTGAT---TTACATAT----ATAACTATATATACAAATATGCATTTGGAAGATTTGAATTATTGTCAAAATTTGCAAATAGTTCGATACGCTTTGTACAAATGTTATTCATTAAATAACAA-----------CAATTAGATTAGTT---TGGGCATACTTTACA
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GACCGATCGCATGGGATCGAATGAGTGGCAGAGCCTGATCTTTGTCAATTCCTAGATAGTCAGTGCTTCC----------TTCTGTGCATGTACGTTCGACTGGACATGGGCAAAATCACACTAGATGATAGTGGGCGAAACGAGATGTGACGAGAGACTTGCTTAGTTTTCGGCTAGCGACTAAGTAAATATCACTTTGGATGTTAGTGGTTGGG--AGGCCACCGTGGTGGCAAATCTTGGCA-----TAGGTTCATCTCGCATATAAGTGTGTATATGAAGTAAATTGAGAGTCGTCGCCGTTGGCCAATGTAAATAATACGAT--------------------TTCTGATTTACAATTAAGAATGTGT------------------------------TATAGAGTTATAAGA----AACGTGTC----ATCTGGATGG----CTTGCCATTTTTT--TTTTAATGTCAACAACACTCATGTGAATTGTATAAAGTATAAGGTTCAAACTAACATCAATTTAATTGC
-------------------ACTGATTGGCCATTGGTTATGTTATTTGATT-------AGTCGGTGCTTCCGTTATAACTATTCT-TACATCTAATTTCGACTGGAAAT---CAAATTCACATTAGATA--------TAAAGAGAAATATAGCG--------GTTAAGTTATCATTTTGCAATT--------------TTAGAT--TAGCCGTTTGGTAAAGTCCTAGTGACGACATGCGTAGGCACATTTTATCTTTTTCTAGTATATAAATATAAAT----------TTAAAACTCTTCCCAGTTGGCCG-TGTAAATAATTCGATACAAAAGTCATTGTATGATTTTTTCATATTAAACTAAGATTGATTCTGATTAAGTTCTATATATACATTTATATATATATATATATAAGAGCAAAACATGTTTATAGTCTCGTTTGTGCACTAGCCAGTTTTTAATTTTTAAATCTAGAGCAAAAATTGTAATTTTTTAACTTAGCATGTCCAAAGAGAAACAGGCTCTAAGGC
>mex1 15482716 15483088|16371 chr3L 15482891 15483927 scaffold_0 3810568 3811760 - 12567|0 228
TCTGAGG---ACATGAATTTATACTATAGGCCATATTAAT--AATAACTCCGTCGAAATCGAAATTGAAACGAACTAAGAACCA-----AAGCCGTTCAGTGCATGACT-----TAATCTAATCGCGT----------CGGATGCTCGT-TATGGGATTTTTTCTTATCTATAGATAGTTTGGGACTCAA----TTGAATGGGCAATTT-GTGCGTTCTTTAGAAAGGT
TGCGAGGCTCAAAAGAATTTATAATATAAGTTATAATAGTCAACGAATTAAATAATAATAATAAT--AAACGAAATAACAACAACCTACAAATTTTGAGCTGTGTGTCTGTCAATAATCTAATCGCGTATCGCTGAGCCGGATTCCCATATAATTGGTTAAGTCTTATC---GGGTCGATTGTGCCCAAATAGTTGGTATGGCCCATTTAGAGGGGTTTTTGGCTGGGT
>CG7945 15485571 15486592|16374 chr3L 15485742 15486607 scaffold_0 3814107 3815033 - 27344|0 911
TCTGTCCACCGTACTGTATAGATCACCATCCTGGTCGGAGAGTATGAGTTCCCCTTGAATTCCGAAGATGAAATCCACTGGCTTGATGGGAAACGATTGATTCATATTCTCGTACTTATTGCTCTCCAAGGATAGGCGGTGCCACGTCTGCTCCAGGATGTCGTAGGCTAGAATTTCTGGTACCTTTCCAAGGATGAAGTAAATATGGCGCTCGTGCTCGCATCCCGGACTCTTGGGTCCCATTTGGACAGTCAGAAAGTGGGTGTCATTAGCACCTATATGGTGTCCACAATCGATTCTCAATAGCTCCGCGTTGTTACGCATCAGATCGAAGACAAACAAACGGGGTGAGCACGTGCTGCCGGGAAATCCGATGTCCATGACCCACAGTCGACTCAGTGCATCCACCTGGGACCAGTGTGCCTGTTGTACCAGAGAGCAAT-CATCATG-----ATCCCCCATGGAATGAACATCGATGTGGGGAAAGACGACAGTGGGCATGGGAAAATAGGAAACCGGCCATTGCGCCTCGATCAAAGTGGGCGCATCGTTGCTTTCTACATTTACGCTGAGAAACACTCGCGAAAAGTGCATCGATAGATGACGGACTTTGTAGCTGGATTCGTTTAAACCAGATTCGGATAACAGCCAGGCGTC------CGTGGCCAGAATTAGACCAACAATGAGAAATCCCAAGCCGAGGACAC---CATGTGTGACCATCTTTAAACGCG--------AATTCAGACTGAGCTTAGG-------GCTAGAGAAC-TCTGCTTACGTTGTAAGTGCCCGTTCAAGAAGTCCA-------------------CCAAAGTGTCTACATCAGCAGTTGGG--ATCGGGTGTC-GCCG--------AATATATCGGCGACCTGCATT
CCTTTTAATGGAACTGAATAGTGCACCATCTTGATCCGAGACAATCAGTTCGCCCTGCACACCAAATGTAAAGTCAATTGGCTTGATGGCAAACGCCTGACTCATGTTTTCATATTTTTTGCTTTGTAGCTCACGACGATGCCAGGTTTGTTCTAGTATATCGTAGGCCAAGATATGCGGTTGGCCATCCAATATAAAGAAGATGTGGCGCTCCAGTTCGCAGCTACTTGGCTTGGGGCCCAGATGTACCACCAGGCTCTGTGTGGCATTGGCCTCAATGTGCTGACCACAATCGATGCGCAACAGCTCAGCATTGTTCCGTATCAAATCGAAGACCAGTAGCTTGGGCGCACATTCATGGTTTGGCCAGCCCACGTCCATGACCCACAGACGGCTCAGGCTATCCACCTGTGACCAATGTGCCTGTTGCAGACGCGTGCAGTCCGTCTTGAGCTCAGCCTTATTTGCATGGACTTCGCTGTTGGGAAAGATGACCGTGCGCATGGGCAAATAGGAAACGGGCCACTGTGCTTCGATCAGTGTGGGAAAGTCATTATGCTCCACGCTTATGCTGAGAAACACTCGCGAAAAGTGTGTGGACAAGTGACGCACGTTGTAACTGGAGTTGTGGAGACCCGCCTGAGACAGCGACCAGCCTCCACAGAGCCCCGTTTCAAGCAGAGAGATCAAGAGAACAACGTAGACACGGAGCCGCGTTTGTGTGTCCATCGTTAAGCGAGCGGACTGCAACTGGAACTCAGCTAAGGCGGCCCCCCAAAACAACAACTGCTTACGTTGTAAATGGAAATTGGCCAAGTCAAGGCAGTTAAACACATTGGTCAAATGTGTCTATCTCAGCATTTGGGATATCGTGTGTCAGCCGACAAATTAAATAAACCGGCAACCTGCATT
>CG7945 15486655 15487077|16375 chr3L 15486643 15489470 scaffold_0 3815084 3817958 - 45135|12 533
TTAAATTGTTTTTTGGTCTATTAACTATTCATAGCATTATTATCAAAC---------------CAAACGAAATACATCACCAAGCTAGATGAAACGAATAATAAAGAAAGCAGCATATACACCAGGCCAGCAGTGTTTGA-------------ATCAAG---------------------TAAAATATAATTTTAATATT----TATATTAACAAACTAA----------------------------------------------ATGTTATAAGCTAGGAAAGCACATGTCCTTCGCATTCAAGACCCGATCACTTAGGACCCATAATGCATCATTGGAGGTGAAGAAAATCTGCTGAATGTTCTTCGATGTGATATATATGATTTCGTTGCCCTCGGCTGTGATGTTGGCTAGTTTGGCACATCGTACGACAGCTCCGAATTTGGGGATAACATAGTACAATGTTCCGAAATTGTCGATGATCATGCTGCGACTGCTGCCCAGAAGACTGCCCAAATGT
-------ATTTTAATAGCTATCAATATGCCGCAATACTATACTGGAATTATGTTATGCGAGGGCAAACGATAAAC----CAAAACGAAATTAAATACACAATATGCCGA--CACAAATAAATCGAATC-GCATTGTTTAATAGTTTTTCTCTTATCGATGTTTATTGCTTGGCGCGCCACTAATCGATAATTTTCACGTTCACCCACACTAAACAGCTGAGCAAGTGCCGTTAGTTTTGGTTCCATCTTATCATCTGCACATTTTGATTTCATAGGCCCGGATAGCAAATGTCTTGCGGCTTAAGCACACGATCGCTGAGCACCCAAACGGCGCCTTCTACTCCAAAGAATATTTGCTGTATATTCTTAGAGGTTAAATAAATAATCTCATTACCCTCGGCGGTTAAATTTGCCAGCTGAGCGCAACGCACAACTGCGCCAAATTTGGGCATCACATAGAACAGTGCTCCGAAGTAATCCATTATCATGCTGCGACTGGGGCCCAACAAACTGCCCAGTCGA
>CG7739 15525992 15526344|16401 chr3L 15525921 15527866 scaffold_3388 11 1955 + 68822|71 488
GGTGGTCGCCCCATTAAATGTAAATTAACTAATTAACACTTTTGATTCAACCCATAAGATGAGCTTTTAATTTTATTATTATATAATGTTGATTAATATTCCTAAAAGAAAGGAGCGCTCTATTAACTCCATTATAAGCTTTCCAACCATATTGATGTCCTAAAATGCCACAAACAAATTGATAAAAATGTAAAGTAGAACAATATTTGGCGGACCATCTCAAGGCGGCTTT----TAAAATCATAGCTCATCATGGAATCAATAGAGATGCTCCTTTACATAAT----TTATATTTGTAATATGGTTTAAGAAATGTGATAATATAAAA----AAGATAAAAAATAATAA-----------GATTCAATACGTTG------------------------------------------
G------------------------CAGTATCTTAACAATATTTCATCAGCCAA----------TTGCAAATGCTTTATTGTAT-------ATTTATCTCTTTAA------------TTTGTTTAACACAATTTCCCAATTTCCCAAAATGTTAGTTGTTTTCTACGTTAAAAAACAACTAAAGCGCATTCGCAGTTG------GTTTTGTCTACAGTTT-----AGACTTTAAAGTAAGATAAAGCCGTACCGTAGAACCAGCTGGGA---ATCAGTGCATAATAATCGTTTAATAAATATGTAGTTTAAAAAATGTGATAAAATAAAAATCCAATATATATAATAATAATGACGATGCGTGTTTCGTTTAGTTGAATTAATGGTATTATAAAGGGAGAAGTTAGTGATAGTAAATT
>Tfb2 15544024 15544210|16414 chr3L 15537715 15548613 scaffold_0 3864223 3874863 - 403398|6539 6754
CCCGGTATTACGA-----CCAATTATTGGGAAGTTATTT---------TAGAAG----TAACAT------CTGTGCCCATTTTGTTACAAGCTAAAATTTTAA--AATATGGTTT-AATAAGGG--AGTGTGGGATTACACATTTATCATCGACATTCAACATACAAGTGGAATAAAATTAAAATACACAAGTATCATACACATAAAAACAGAAAA
CGCCGAATTACTATACTTCGTATTTAAGCTAACTCATTTAATTGTATATATAAGCGTATAACGTTCTTAACAGTTGCCCTATTGTAACAAGCACAAATTTGAATTGTTATTCTTTGAATAAAGGCAACTGTGG----ACACGTTC-----------------------TGTAATAAAA---AGGTATACCTCCATC-TATATATAAATATATATTC
>CG7656 15551058 15551460|16418 chr3L 15549896 15551862 scaffold_0 2052794 2054815 + 61637|1312 1738
TGCAGCCAGGCCAGGGTCGCGTCATCTCTTCCTCCCACTCCTGCCCAGGGCGGCGAGCCACCGCCTTTTAATTTCTCCAACATTATTACTATTATTAATTCTAATTATACACGTTTCGAAACTAAACCGAACAACTGAGAAAACAATTATTTAACAAGTTTATATGTACCGAGGGTAGTTGAAACAATGGTCCTACGCTGATTTTATCTACTCAATT-TTACTTTGATAACTAAGATGATG----ATCGTATAAGCTACAGGTTATATGCATGCGGGCTAACTCAATTC--------------CCAGCCTGTGGGCAAGCAA---TTAAGA--GTTCAGGGACTTCTCCAAATCCAAACATTTATACGCAGAAGAAACACACAACACAGAAACAAGAATAAAACCAATAACACAAGAAACTCAAACA
TGCAGATAAAC-------ACGCTCCACCTTCACTCTGCTCCTGCCCTAGGCGTCTG--CGTAGCATTTAAATG-----AAGATGAT-------ACTAAGTGTGAAAAGAAACG-----------AATCGAGCTGCTT-GAAGACGCCC--------------------CCTAAGGCC----AATCGCTGGTTTATCATT---TCTCTCAACACAATTATTATTTTTTTACCATAAATTATGTACAATTGTAAAACTGAAACGTGAATTATTTCTTAGCTGGCCCGCTTTATAATATCCCCCAGCTAGCCTCTGGCTAGGCACGTTTTAAACCCGTTCATAGAATTT--CAAGAGCTTGCGATTCCTTTTAAAGCAACTAAATACCACT----CAAAACTGAAAACGATTATACAAGATCTATATATA
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ATA
ATG
>Eig71Ef 15621914 15622003|16502 chr3L 15621531 15622209 scaffold_0 5934004 5934867 - 3485|561 656
AAGAATGCCCACCAGCAT------TGTGATTACCACAAGGGAGCGCAGCTAAAATATTAAAAGTGATTTTGTCCAAATAAATGCATATGTGAAGAG
AAGTATCTTTAACAACGTAATTTATATGATGGCCATAAG--CTTGTAGT--AAATTTTATATTCGACTTTATTCGGCTGCAGATACATTTGG----
>comm2 15662850 15663147|16542 chr3L 15661765 15662915 scaffold_0 2174955 2176190 + 5122|1266 1332
TATTGTTACTAGACT-TAAGTAGGCCACAAACTAATTATTAATAAATTATACACCTAACAATTTAAA
TATTGTTATTAGCTTCTAAGTAGACAACAATGTGACGCATAATAAATTATACAAATATTATACTTTA
>comm2 15662850 15663147|16543 chr3L 15662949 15663994 scaffold_0 2176231 2177323 + 20500|0 260
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ATGCTAAATATGGCTCGCCAGGGTGTGTGTAACACCGAGATCTGAACCGGCTGGATGGTCAAGATCTCAACGATACCAACCAAAATGTGCTCTGTGATAATTGTTGCTGTTGTGGCTGTTGGCCGCGATTCGATGCGATATGATATTTATGTACTTAGATTCAACTAAGCGCTGTGATTATAGAAAAAGAAGGAA------AGACCACTCGCAACAAATGATATAAACTA--------------CCTGTACTTATAAAAAT
>comm 15687583 15687925|16568 chr3L 15687269 15688631 scaffold_0 2201723 2203206 + 26133|315 802
TTGCCCACC-----CAGGGGTCAGAGGTCAGGGAATAAGGGGTCAGTCGAGGGTTTAGGGCCGGGAGTAGCA------------------------------------------------------GCCCAATTGCTTAGTCACTTGTAAATAGTTGCATCGTCTGC-----TAATGTTGTTTG---------------------------CCCCATGTAATAACATATATCTCCGAGAATGTACCCTCTCCCTCCCTCTA----------------AGAAAATTTAGTTTTGGTTTTTAGTTATCTGTTATATATTATTGTATTACGCAAGACTGAGTATTATTTATTGTA-CTATGTATAA------AACCGAATTGTCTATCGATTAAGCCCTAATATC--TAAGCGAGAGTTGAAGAAA-------------------AAATATAAAA-------CTCGAATGAACACATT---GCAAACTAAA
TTGGCCAGCAACTAAAGTGGGTTAAAGCAAGGGAAAAGGGGGAC-----AGGGATTAGGGCTGGGGATGGGGATGGGGATGGGGATAGGGAATTGGGCCTGATTTTGGATTGGGGTTAGGGATCATGCTTACATGCTTAGTCACTTGTAAATAGCTGCATCAGCTGCCCCCATCAAGTTGGATGAATCTAAGCAGGCACCTATAAACACACCCACACTCACACACACACACACACACACAGTCACACACATTCACCAACTACAGCTCCTATATGTGTAAATGATTTGATTTCG--TTTTAGTTATTTGTTATA---TCGTGTATTATGCAAGACTGAGTATTATTTATTGTATCTAAATAAAGTAATTTAAACAAATTGCCTATCGATTAAGCCTAAATGTTAATAAAAAAAATATCGAGAAAACAAAATATATATATATAGAAATATTAAAAATTATGCTAGAAAAAAACCATTCAAGCAATCAATA
>CG6151 15775372 15775962|16653 chr3L 15774006 15776152 scaffold_0 2289428 2291669 + 19466|1541 2252
TTCAGAAGCTAGCTGATCGGGATTTCGAGGAATCGAAGAGCTGGG-TGTGCCGTGAGAAAACAAGACTCAA-----AACGCAACATTTGAAGGGCAAAC-------------------------------CTAACCAAGAGAACATCGGCAGGCAATCATAAACATAATCATGTGCAATTTCTGATTGT---TCAATAACCAACGCAAATGGATAACAAAAGTTTTTAAATCCGATTAGCTCTGA----TCTCTTTCTAGAGCAATCCAAATTACTCGATCAGAAAGAAGCCACCCAAAACAA-------GATCATTAAATTTTAAACCATTTTTGTATTAAATGTATGTAAATGTATATTGGTTTTAAAAGCGTTTTGCGTTTTCTGTATCCTATTAATTAATTGTGTTGCCTGTGTCCCATCATTCCAA----AACATTTGGTTTC-----------------------------------------AACTAAGTAGAA--------------------ATTGCAAATAAATTATTGAACGACATCACTAGCGAGGTGAAAAAAAAGATCATGTAAAATTTATGTTTAGTCATAGTTTAAATATACCTTAAATATATTTAAATGCATAATACTAAAATGTTTAAATTAATGCAAATAACACTATAAAT-----ATTGTATGTAAACCATATTAAAATTGAATTAAAGATA
TGCAATCGGTAATGGA---ATATTT----GGATCG--TGGCTGGGATGTGCGGTGAGAAAACAAGACTCAAAACGCAACGCAACGCATTAAAGGCAAACTACAATATACAAAAAAAAAAAACAAAAGAAGCAAAGTAAAGCAACATCACAAGGCAAATTTCTAACTAA-CGTGTGCAATTTATTGTTGGGTATCAATTTCCAACCGGAACCTAAATATAAAGGATCTCTCTCGGTGTAGAGCTGAAGACAATGTTTATAAAACTGAGCAGATAATGGAAACCTCAAAGAACCTCTTCAAATAAACCGTCTAATCATTGA---TTAAA--GTTTTTGTATTAAATGT----------------------------TTTGGCGTTTTCTGTTTTATATT-TCTAAT--TGTTGCCTGTGT---ATCATTCCAATTCCAATTTTTGGTTTTAATGTTAAAACAAAAAAACAAAAAATCAGAAACTTATTTAAAATTTAGTAAAAATAAAACTATAATTGACCATATTTAAATTAAATTATTGAGCGATGGCAT------------------AATTGTATGCAATTTATGTTTAGTCATAGTTTAAATATACATATAATATATTTAAATGCATAATAC----------AAATAAATATAAATATATATATAAATAATTAAATGTTTGTAAACCATATTAAAATTGAATTATGCATA
>CG6151 15777453 15777466|16654 chr3L 15776305 15778457 scaffold_0 2292768 2295024 + 16259|1368 1381
AAGCTAACCGAATG
TAACTAA---AAAG
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ATATAAGTAAAGTTTCTCGATCTCTGTACTGGAGATC------AAGCTTTTCCAGACATATATATATATTCTACGTTAGGGAACCACAAACACACCTTAAC--TCGAAAATTGAATGCGATCAA---TTGTATAGGACATTTTTAATACGAGAAAGAACAAGATTTTCATACCAAAAAGAAAAAAAGAAAAG
ACACAGATAAAGTTT-TAGGTGTTTCCCATGGATCTCTCAGTAAAAGTCTTTTAGACTTTTGGAAAGATGC-ATTTTTCAGCAGCAGCAACATTTTTCAACATTCATATGTATATAGCAAGCAAGGACTGTATAAAATTTTGTAATTAACATACACATACACATTTTCATACCAAAAATCGAAAAACCAAGG
>CG6169 15786246 15786703|16666 chr3L 15786597 15789525 scaffold_0 2302616 2305910 + 94402|0 113
ACT--TTTCTTTGAGTCAATCACACACACTTCCTTTTAAAACTCTCAATTA--ATGCA-TTTCCGCGCAAAAGGCCCGG--TTACCGGGAACACCGAATAGTATAGGAGGCTCT
GTCAATTTCTATG------------ACTTTTCCTTCTTAAATTCTCAAACATTTTGCATTTTCCAAGTTAAAAGGCCAGTTTTGTAGGCAGCATACATAAAAACAATAATCGTT
>CG18081 15799054 15799620|16673 chr3L 15799123 15799713 scaffold_0 7925990 7926448 - 7940|0 510
TGACCGATGTGGCTGCGTGCATAT-ATAAATATATCAAGC--------TGATCGA--AATCGACGAATTTCCTACCAGTACGAAACTTTTGAAACAATAACTTTACAACAGCCCCGACAAAACAAAC-ATCAACATTTAAGTCGATGAGAGGAGGGCGCGTAAAGTTAGAACATAGTTTCCAAAGCTAAGGGCCCAGCTGAATTTTTTATATACACACTGCTGACTTTTGGTTTATACTTTGAAAATAACACATATGGCTACCACAACAATACAAAGAAAATTTACACATAGTAAAATAAATACTTTTGTTTTGATTTTTATTTTCCCTGAAAGGCAACTAGCAATTTGAGTAACAATAATTACTTGTGCTTTGTCTTTGATTTGGTCTAT-TATGAACAACGATGCTGACAATGTCGTAGTTTTGTATACGATTTTTTTACTAAAAAACCTTTGAATACATCATGTAAATGAGAATTTATAAATACAATAAAAACAGTATAATTGTTAAA
-----GGTACGGGTGCGGGTCAATAATAAGAATGACAAGTATAAAATGTCATCAACTAAACGACGAGTTGCCTACCAGTACGAAAAAATTGCAACAATA-----------------AAAATTCAAACAATCAATATT----------------------------TTGAAATAAAATGC---AAGCTCGGGCGCCAGCTAATCTT------TAAAAACTATATACATTTGATT--TGCTTTCAAATAAATATTTTACTTTGTCAAAATAATTATTAGAAAACT-----------------GCACTTGGGTTCT------------------AGGGCAATTATTAA-----------------ACTT----------TCTAGTTTTATACATATATGCAAAA--------AAAAAAATGTGTTTTTGTA------CTTTGTAAAAATCAA-----AAAGAATTTATGTAAATGCAAATTTATAAATACAAGAAAAAAAAT---ACTGTTAAA
>CG15715 15801137 15801417|16676 chr3L 15801348 15801510 scaffold_0 7926260 7926448 - 8138|0 88
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AATA
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CTGTTCCATATACACATTTTTGCATACATTATAAACCTATAATTTAATAATTATATTACTAGAAGTTATTACAAA
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CATCAGTGGGAATTAATGTTTATAAATATATGATAAAATTTATACATATTATGAGACCAAGCAAAAGCAAACAAGCAAAGCCTGCAAAACAATACATAACTATGCGCCGACACACACACACAAACCCTACACACACACACACACACACACACGCCAACTACAATAACAATAAAAACATTGCTA-CACTTATATAAAAAATGCAAACAATCCTCTTTATGGCATTGCTTTGTAACCCTTCCTAGTATAAGCTCAAGTTTT------------TATTTTTTA----ATACTATTTACAAAGCACATTTGTTATTTATTTTATCTTATTTGATTTTTTTTTGGCTCTTTGCTTTGTTATTTGTTTTTTACATATGTGCGTGCGTGTGTAATTTTTATAAACGAAAGCAAAGATACGCCACGCTTACC-CATTGTACTGGGTATTCTACCCACTTCTAATATTTAAAAACAAAAGCAAACATACATAAATACCTATGTATAACTAATAATCATTGAACTTTTATATACACCATATATATATATATATACATATTTTAAGTGCGTATATTTAACAAAAAATAATAGCAAGGGGAAAAACTAAGCAAGCTAAAAGATATAAAACAGCTAACAAAAAGAAAAAAAAAAACCAACAAAAAAAAAATGAA-AAAATAAAAAGAATAACTATACATATGGGCAGAGAGATAAAATCAAATTCAAAATAGCATATATTTATATATATTTTTTATTAAAGCGA----AAAACAAAAAAAAACAC----ATACTTAAAGAAAAAGAAATCAATT-------------------------------TACGTGTACTACAA-AAATTTATATATACATCTTATATATAATAATGATATATATATATATATATATATATAGATTAGGCGTATGTATACACCACTTTGCTTAAGCTAAGGCATGTATAAATATTTCGTAAATTTATTA-----CCACGTTTATGCGCTTGTTTCCTATTCGTGATTTTCCGTTAAAAGTCCAAAAATTGTAAGCAACATTTTCTGCCGCATGGCTAATCACGCATACGAAGCTTGCCATAAACGTAGTTTAATT
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ATGTGGGCTGGCCAACTAG-------------------------------------CCGCAGCCCCCAGCACCTTCCTGCAGCTCCTAGTCCC------GCTGCTCTGCA----TCTGCAATTCATTTGATTTAATGTTTAATTGCCGCGACAATCGCTGCCAATGA----------------CATATGGGAGCAGAAGGCGCCTGAGGAGCTGGGACAGCATTATGTGTATATGCTTCATTCTCTCGGCGAAATATTAAG-ATAATTAAGCAAATA-TTTTTATTGTAAAAATCTC--------------GTAGATCGTAATGTTTGCAGTACTAGTAG--------------TAGCAATGAAATAGG---ATTTCGAATATAT-------TGTATCCCTCGTCGAACCGGGTGCGCTAG----
TTGT-GGCCAGCCAAATAGACTCAGTCACAGCCGCCTTAACGGCCTCTGCCACAGACCGCAGACTACAGCCACAGCCTCCTGCTCGTCGTCATTCAGTGTCAGCTTTGCAGTTTTCTGCAATTCATTTGATTTAATATTTAATTGCCGCGACAATCGCTGCCAGCGAAGGCGCGCCGCCCAGCCAGGTTGCAGCATTACAAAC---AACAACAACGACAACATTTCATAT---TGCTT--TTGTCTCGATGAAATATTAAGAATCATTAAATAAGAACTTTTCATTGTATAGCGCTCATGTATGTACATATGTCTATATTTATGTGTGC-GTGTGTGTGGCCATGCCGCACAACTAGCAATAAAATAAGATTATTTTCTATGTATGTAAAAACTTAAACTGAGGCACAACGCATCTGCCCGCGCC
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-ATAAAAGTGCGTTT---------------------GAAAGTATTATT----TAAGCCATCCAAAAC----GTTTTCAGTGAAAATGCTAGCTTACCAAATGAACGATTATCA----AATATTCAAAATTATT-------CTCGTAATATGAAACATGAAAATATAT--CAAATCGATATAAACTAGGTACTAACATAAAGT-------AATATACATTTTATAG-----AGATTTAAGGTGCTTTTAAGAACTTTTTAATTTAATTTTAATTTAAGAACTTTTAAATTGGATTTAAAAAT-TTTGCACTAAATGTAGA---------AAGTAAAAAATACACCTCCGACTTGCAAACCAATCAA----ATAATTTTCTCTTAAATAAGTTAAATTACCGACAATAAAATAAGGATTAAC----TTATATTTATGTTAAGGTT--TTCATATTTTTGAAGATTTACAGAATGTA-------TGCATCTTTTCAGGGATACTAATATTAGCCTATATTAAAAATGTAT-GCAGTTTTCAAATAAAGTTAATTTTT
TATCATAATATGCTTTTTCACTTCTGAGAACAAAAAATAACTACCATTAGAATTAGCACTACCAAATTGTAGTTTTTAACCCAAAGACTTAGTTACTAAGAAAATTATTTGTACTATAATATATATATTTTTTAATAAAGATAACGTTAAAAAAGGTTAATATAAATTGCATTTTGATTTTAAATATGTATTCTCCTATAATGCGCTGAAGCAGCTGTTTAAAAGGTGCCAGAGTTAGAGCG-----AAAAAAGTTT--ACTTTATTTTA--TTGTGAGCTTTAAAAAGGAGTTTGAAAGCAATCGAACTAAAGTTAAGCTTGCTCCCAAACAAAATAGTTATATTTATTTAATAGGGCGAGTAACGCTATCGATTCTTGTCGAATCAATT------CAGAGAAAGGAATAGGAGGTAACCGAATCATATATATTCAACGGATACATGGTACATTT----AGTTTCAAAATGTAGAAAAATTGATTTTACTCACGCATAAT---------CTGTAAGAAAATTATATAACAAATATCACAT-TAGTTAAATTTT
>CG5222 16068690 16068739|16940 chr3L 16068004 16070857 scaffold_0 2872320 2875230 - 144544|701 770
AAA-CAT--------AAATGTATT---CCTTAC-------ACCTAAAT-AACAACACATCATTACGCTTA
AAATCATTAAATATAAAATGTATTAACTTTTACGCAACCGACCTATATAAACAACAATATTATAAAACTA
>Zn72D 16071855 16072788|16941 chr3L 16071111 16073472 scaffold_0 2875649 2877977 - 51461|767 1730
GCTTTGGCTGATTTGCGTCACGCCAAATGGTTCCAGGCTCGAGCGACAGGCCTCCAGTCGTGCGTCATGGTCATACGCATCCTCAGGGATCTGTGCCAGCGCGTCTCTTCCTGGCAATCGCTGCCCCAATGGTCTTTGGAGCTCCTCGTAGAGAAGGTCATCTCGTCGGCTGGCTTTCCCATTTCGCCCGGTGACTGCATGCGTCGCATCATGGAGGCCTTATCGTCAGGCTTTCTAATCAACGGACCGGGCCTGCTGGATCCTTGCGAGAAGGACCCCACAGACGCTCTACTCGAGTTGACCAAACAGGAGCGCGAGGATCTCACTGTGTCCGCACAGCTCTTCCTGCGCTACATTGCCTTTCGACAGATTTACAAAGTGCTTGGCATGGAGCCATTGCCGGCGATGAAGTTTCCAATGCGTCCATGGCGTGTCAACCGCAAGCGACGTAGGTCATCGGGCAAGGCAGGTGGTGCACCCGGCACGGAGACCGAGTCCAATGACATCGATGAGACCGGCTCCGATGAGAAGGTGGCCAAGAAGGAGGGTGTCGGAGGCACTCCTGCCAGCACCTAAGCGGCGAG---------AATAGG-TTATATACACGTAGTCGGCTACTAATATTACAATTTCTCTCAAGATAAAAGCGCGACCAGGCGTCACT--TAACTATAACCAACTCTAATCTATACACGAGTATTCAAACCGATTGGGGCACAAGGAGCTAAGCATGTCCAACATGTTGCCCAATCGGCGATTAGT-GAATCCCAAATTACCCCAACTTTAACTAACAATATTTAGTG-GATCATAAAACTTGTATTTTTCTAGCATTAGTGCAAGGCAAGGC--AATGTATTCAGTTTGAATGTGAACATTATGGCCCTC--------------ACACTCATATACACAAATACTAGAACGAAGCGGATTTTAATAAAACGTATTGAACAATT
GCACTGGCCGATTTGCGCCACGCCAAATGGTTCCAGGCACGTGCAACCGGATTGCAATCGTGCGTAATGGTTATTCGCATATTACGTGATCTTTGCCAGCGTGTTTCTTCGTGGCAGTCACTGCCACAATGGTCGCTGGAGTTGCTCGTGGAGAAAGTTATTTCATCGGCTGGCTTTCCCATCTCACCCGGCGACTGCTTGCGTCGCATTATGGAGGCTTTGTCTTCGGGCTTTTTGATCAATGGGCCTGGCTTGCTGGATCCGTGTGAAAAGGATCCAACCGATGCTCTGCAACAACTCACCAAGCAGGAGCGCGAAGATCTCACTGTCTCGTCACAGTTATTCCTGCGTTACATTGCTTTCCGTCAGATGTTTAAAGTACTTGGCATGGATCAGCTGCCGGCCATGAAATATCCAATGCGCCCATGGCGCATCAATCGCAAACGACGTCGCTCATCAGGCAAGGC---TGGAGCATCCGGTACCGACGCGGATCCCGCCGACATCGAAGAGACTGGTTCCGATGAGAAGGTGGCCAAGAAGGATACAACCCCAACAGCTCCCGCTACGGCATAAGTGCTAAGCAATTCATCAATAGGAATATGTAGCTGTCAACAAATATGAATAACAGTTTTTTTCTCAATCTAATTGCGTTACAAAATACGATCAATAACTATAACAATTTCCATTC---ACAC---TAATTAA----ATTTGGGCACTCATTAATTGTTGTGTCCAGCATATTGCCCAATTTGAAAGCAACAGCATTAAATAGTATCCC----TCAACTAACAATATTTAACACAATAATTAAA--GGCATCTTTCTATACTATGTAGAAACTAATGCAAAATGTATTC-GATTAGCCGTGGAGGCGTTGATCCTCTATAGGGATAAACTATATACATATACTCAACTGCCTCCACCACGCG--TTTCAA------ATAATAAACAAAA
>Zn72D 16072855 16073045|16941 chr3L 16071111 16073472 scaffold_0 2875649 2877977 - 51461|1846 2051
GCGACACTCAGGTCAATTACCGCGTGGAGGTCAACGCCGAGGAAGCCGCCCTAATTGTGCTGGATGAGTCTGTCTCCGTTAAGATTACCCTCACCTCGCCTTTGCTGCGCGA---------------TGCCAATCCCGGGGAAGCTGCCACCACTGATGAAGGTGAGGGCGATTCCGAATTCCTGCCTCGTGAGCCCTGCCTACGT
GTGACACACAGGTCAACTATCGCGTCGAGGTGAATGCCGAAGAGGCTGCCGTAATAGTGCTCGATGAAGTGGTCGCGGTTAAGATAACACTCACATCACCTTTGCTGCGCGAATCATGCGAGGGTGTCGGTAAGCCGGAGGATGCTGCATCGTCTTCGACAGCTGC---CGAAACTGACTTTTTGCCACGCGAGCCGTGTCTGCGG
>Zn72D 16074111 16074293|16944 chr3L 16073968 16074744 scaffold_0 2878672 2879440 - 9568|168 357
GTTTCGAGCCTCGAGCCTTGAGCCTTAGCCTAGAAGCTCTGTGAGCCTAGAGTCTTGAGTGTGTCGTTCAGTTAGCCATCTGTAGCGGTAGCTCAGCCCTCCCAGGTTGCTCCTCTTCCCGC-ACGACTGCCGCTGC-ACTGCT--CCGCTCCACTCCAATCAA---ATCACCAACAGCGGATCGTCACG
GATTTGAGCCCTTAGCCTTGAGATGCTATCCACTCACACTACTCACA------CTCAGGTG------TCTGTTAGCCGTCTATAG------------CTTTCCAAGCTGCTGCTGCTGCTACTCCTACTGCTACTGCTACTGCTGGTGGTGGAAATCGAATCAACGGATATCTCATA----ATCGTAATG
>Pgm 16091314 16091395|16955 chr3L 16091260 16094208 scaffold_9 1043874 1046988 + 107446|58 139
AGAGTTCCTGTCAGCGAAGGAACACTGAGATTACCAACCCATCCAACTACAATCTCCTCTTGTACCTCAGCGAGGCATTTCC
ACAGACAAGTTCCGGAATAGATCA-TGTCGTTGTC------TTTATTCGAAATCCCCTTTTGCAGCTGCGTGAGGCATTT-G
>CG5161 16096251 16096364|16958 chr3L 16095655 16096873 scaffold_9 1047804 1048906 + 43587|624 737
ATTTGTTAAAACCTGTAGCCATTAAGTAATTGTGTAATATAAAACTTGAAATAATTTAAAAGCATAACTTTACCCTTTCTTATACAGTTGAGAAGACCCGAAACCAATGAATAA
--TTGTTAAGAAT---------------------TAGCATATAAATT----TGATTTAAA--------TTTA---------------TTTAGAAAACC--------------AG
>CG5151 16104742 16105719|16963 chr3L 16103091 16105369 scaffold_9 1131779 1134262 - -1221|1968 2721
TAACAGATTTATTTAATGTAGGTCTGTCGCCAACTTTTGCGCTGGTACGAAAAGACTGTTTATTAGTCAGAATTTAATTTGTAAATTTGAGTAACGAGAGGAAAGAAAAGTTAGAGAATGATACGGAGA---AGACATATGTATAGTTGCGCTGCCGCCTTTTAAGCACTCACCACAGACCGTAGA-----AGGTTCATTTTTAAGTTATGTA------------------ACATTATTTCCATTCGTCGCTTGATAAAAGTAATAAGTCGAGAACGTTTTTGTAAAAACCAAGAAAGCAACAAACTTGAAAGAGACAGACACAATACCATAAAAACTGAAGAAAGGGAATGAGGAAAGTAAATAACAACACATA--------------AGT--GAATATGTAATTGTAATTTTATGAATGAATATTGTATACACTTTAGTTTCAATA---ACTCTAGTT--------TTAAATCGA--AGCCAACCAACTCTTAACTATACTCTATCCCCCACCCCCACCCCCCTATCCAAATCCCCTTATCCC-----------------------CTATTATTATTGTACGCAAGGCCC-ATGTGCTGGAACACACGAAAACACACACAAACAAACAATTTTTAGTTCAATTGAAATT--------------TGTATTTGTATATTTGCTAACGGAATTACGATGTAAAGAAAA---------------------------------AAAAAAACAAAAAA
TAACAGATTCAC--------GATCTGTCCAAGAACTTCGCGCTGGCACGAAAAGACTGTTTATTAGTCAGAATTTAATTTGTAAA------CGATGAGAGGA-----------------GATACACACACACACACACACACACACTCGCAC-ACACACACTCACACACACACAAAGACACGCAGAGACACAGACACAATTT--AGTTTTGTACTAAGCCCTCGGTTGGAGAGATCATTTCCATATGTCGCATGCTAA---------------AATATTTATACATAAAAGAAGGAA--AACAAACAAAATTGAGACATCTATATATATATAGAGA------------------GAGAGAACATAACGGTACATATTGTATTTTGTTTTAGTTGGAATATATAACAATATAGTTTTTAACACACA---CACACACAACAAATTCAATCTATACTCTATCTACCCACCATCAAATCAATCAGCCAACCTACGATTATCTAAACACACTTCGATATATACATAGATCTATATATATATATATATATATATATATATATATGTATATATAGTTATTGTATTTGTATGATGGCCCCAATGTGCTGGAAC--------ACACACGCAACTTTTC---TTTTAGTTCAATTCAAATTGATATATATATATATATATATATATATGTGTGTGTGTGAACATTATATATATTAAATATTTGTATTAATCAGTTAAATTTGTATATAGTTAAAGTATGGAAAA
>CG5151 16104742 16105719|16964 chr3L 16105370 16105611 scaffold_12 1330186 1330426 - 2480|0 263
TTCTCAAACCGTAAGACTTT----GCATGGTATTTG-ATCATAA--------TTTGTAAACTTACCGCAGGTCTTGTG--TCTAAAAAGCTTTACTTGAGGTAAAATATTGCCAAATTTA-----GTGAAATACTTATCTTTTGT-TGTCGAATCTCCAGAGATTTGTGCGGCACCTCCAATATATATATATACATATATATATATATATATATACATATATTTTTTTTATGTTAGCCTATGTTTATCTATT-ATGTTAAAGTT
TTCTCAAAACG---GACTTTACGAGCACGTTTTTTGCATGATAAAATGCAATTGTTTAATGTTATAACAGGTCTTATGCTTCTAAAAAGGTTTA--------AAAAAGCAATCAAAGTTAAGTAGGTGTAAAAATTATTTAATGTACGTTAAATATAAAGCCA----------ACAGTCAAAAAATATACATACAC-TACATTTTTAT-TATATGCATAAATGCAGTTTATGCTCTTAAATAATTGCTTGTTTAGTTTAAAGCT
>CG5151 16104742 16105719|16965 chr3L 16105714 16106003 scaffold_28 1551570 1551850 - 158|0 5
CTGAGC
CTCAGC
>CG5018 16191381 16191497|17081 chr3L 16191434 16191658 scaffold_9 1218849 1219073 - 6749|0 63
ATGGAGCGCCGCAGGATGAAGTTGAAGTGGAGTGGAGTGGCGAAGCTCCAGCATCACTTTGGCT
AGCACACGCCCTACAGTAGTCTCTAGTTAAGTTGTAAATGCGAAAGAATAGAAAAACTGTTGTT
>PDCD-5 16196337 16196451|17085 chr3L 16196109 16197978 scaffold_9 1223612 1225553 - 47722|236 374
TTCGTCCGAAATT-----CCGCCCAACATCTAATTTAAGTTATGCCCGCTCCTCAC---------ATCCGCTAAATCATG-TTTATTACTTTTACTAACTTA-AAACGAG--------AAACAAAACTAGATGCCCAAA
TTTGGCTGGAATCGAAAATCAACTGAAACCTAACTTAAGTTTTCCCTGTACACAACCGAATAGAGATCGAAACAAACGTGCTTTACAGATTCTACGAAATTATCAACTAATCTTTATTAAACTAAACAAAATGTCGAAA
>CG13053 16224292 16224343|17111 chr3L 16224340 16224689 scaffold_9 1254300 1254676 - 7066|0 3
TTCC
TGCC
>CG13049 16246388 16246516|17136 chr3L 16246107 16246391 scaffold_3 3717592 3717847 + -998|295 298
CAAA
AAAA
>CG13049 16246388 16246516|17137 chr3L 16246392 16247595 scaffold_9 1274136 1275289 - 22772|0 124
GGACTTAGCTGTAGGATCACCCAGCTCATACACTCCCATCCGTCCTATTAGATTGTAGAAACTAGCCCAAATCTTCATCTCCTAGAGAGCAGCAATGCTTGGCGAATAAACAATTATCCATTAAT
ATGTGATCCTGTAAAAACAACCTAGACTAAGCCCAACACACACTCACTTAGACC----AAACTACAC-------------ACTAGAAAGCAA-AATGCTTGGCGAATA---AATTGTAAATTCAC
>CG4962 16259968 16260307|17153 chr3L 16258341 16260695 scaffold_9 1286792 1289328 - 13221|1884 2276
-GATCTGG---------ATGTCGGAAAGGATACCAGCCCCCCGTTGAC---------GACCCCGATTGA---AGTGAGAACATTAAGCGGATAATTCGCA--TTTTGCTGCCGTCAAAGTGTTGAATTTGCATTTCGTAGTCAGAAGCGGAAATACAAATTGTGTACAAAATCCCTCAAAAACCCAGACACCCACTTGGAGACAGAGACAACTAGAGAACTAAGGACAACTAACGGGAGGCGGCGAGAGCGAGAGAGATTGATGAAGGATCAAGTT-------------TCGTTGATTTTGTTATTATGGTGCAACTCCATGCATTGTGGCTTC--------------ATAACATTTTGTAAAT---AAACGATAAATGACTCTTTAAACGAA
CGATCAGGACCACAACAACATCTACAACGACATCTGCATCTGCATTACCAATCGGCTAATCCCGAGAGATTGTGTGAGATTCTTCAGTACAATGTTCGCACGCTTTGCCGCTGTCAAAGTGTGGAA---------------CACAAAATAAACCCCATTTTATCATTAAAGT------GAGAGACAGAGACGGAGATAGACAGAGACACAGCCTGAGAGTGAGAG--------CGAGAGAGAAAGAGAGAGAGAAGGTAGCAGGAGAGATCAAGTTAATGCTGTATATATGATTATATTTTTTGTTATTGTGCAATGC------TCGTGGTTTCGACTTAAGTAAATAAAAACAATTCAAAACTCTAAAACAATAGATCACTTTTTA------
>CG13043 16270481 16270603|17165 chr3L 16270428 16271280 scaffold_9 1306459 1307368 - 30852|66 189
ATCCATGGCCAGGCCCACTCCGAATCCTACTCCTCTCACTGTTGACAGGTGACCAGGATGCATGTGCATCGCTGGACGGTTTTGTGATACGAATTTTAAATAAATAAATGTTTTGCTTTGAA-A
A---------GGAAACCACCCGCAT--TACTC----AACTGATGCGAAGT----AGGA--CGTGCATTTTGTTGGACGGCTTTGTGATACGAA-TTTGAATAAATAAATGTTTTGCTTCGAATA
>CG13041 16284211 16284283|17177 chr3L 16283076 16285846 scaffold_9 1319385 1322284 - 45345|1343 1472
GGACGCAAA--------------TGTGATACAGTATTTACGATTTTTTGTTTCAATAAATGTTTTTCGTTT-----------------------------------TGTCATAACAAGTTA--------A
GAATGAGAACATCAGCTATTGATTGTGATAGGGAATTTATGA--TTTTATTTTAATAAA-ATTTTTCATTTCATTTAAAAGAGCACTTAAAAAGGCTATTAATAACTGGCATAGAAGTTTATATATATTA
>CG4925 16314004 16314121|17205 chr3L 16311887 16315308 scaffold_9 1358696 1362221 - 116760|2324 2445
ATGCCAGTC----TTCTTATTCCATAGTATTCCATTCCAGAGTCTAACCCGCGTGTAGATAGTGTACAAATCAAATGTTCGTATGTTTAAGTGTATAATATATGTATTTAATATTTCAACAA
AATCTCGTTGAGATGTTCACTGTACTCCACTCCATTCCATAGTCTAA-CTGCCTGTAAATATAGTTAAA--CAAAT-TCGTTGCGATTAAGTGTAAATTAAAAG--TTTAATATGCCAACAA
>Pdh 16318486 16318583|17207 chr3L 16315505 16320054 scaffold_9 1362532 1367245 - 142218|3225 3327
GTGGGTTAATTCGTTCACATCCTAAACACATGCATTTTACAAATATGAAGTTATTA-----TGGACACTAGTTATTTAATAAACAAACGATGCACAGAAATAA
GCCAACAA-------CATATCCAAAAGCTGAACAATACACAATTAATCACTTATCAATATGTCGAGGGTAGTT-TTTAATAAACAATC---------AAGCAT
>CG4893 16320004 16320443|17207 chr3L 16315505 16320054 scaffold_9 1362532 1367245 - 142218|4937 4987
ATATGTTATGTTTTCACAAGAATTTTGCTTGAATAAATACACTTTAAAATA
TTAGGTCATATC--CAAAATAATATT--------------------AAATG
>CG4893 16320004 16320443|17208 chr3L 16320055 16320653 scaffold_9 1367568 1368195 - 14507|0 456
ATGGGGTAACCACCGTTT-----TTCACCCTCTCATAAATCTGTATTTCTAACTTTTGTGTT-------------TCCCTAGTTAAT---------GTCTCCCAAT---------------------------CTAATTTATCTTTGTGTATATAATA-AGTTTGTGATAATTTAAGTGCTTACAAATAAACTTATATTTTTGATTATAATTTTTGAGTTCCTTTACTTTGTTTATCCTTCTTTGTCCTTTGATACGTAAAATTTT------GAAGCGGCCCAAAAAGAGTTCAAAA------GTAAATCCAAATCAAATTTATATACATTTCATGGCAATCAAACCCATGTTTGGTAGTCTTAAGATAACAGATAAACTTTTAATATTACAATTTGTGAAAGAAATTTAAATATCACATATGGAAACCAAAGATATAC-GACATACATATGTAGAT
TCGACATGCTCGACATTTACACACACACACACACACACATACACATCTCCTTGTTTTGTCTCACAATTTTCCTGATCTTTGGCTAATTTATTACCCGTTTTCCAATGGTAGCACCAGTTATTTTTGTATTTCCTTCATTTTCCTTTTCTTATTACATATAAGTTGTGA----TTAAGTGCTTAAAAATAAATTT---TTTTTTATTA-----------------------ATTTACAATTGTTTGTTTTATTTTAAATTAATTTTTACATACAAAGCGGCCCAAA---AGTTCAAAAAAGTTTACACATCAAAATCAAATTTATATACTTATTATATATCTCAACAAAGTAAAATACATTTATAAAATA------GAACTTTTAATAATACACTTTACAAAAGATGAAT-AATATAAAATACTTATACCAAAGATAAACTGACATACAAATTTATGT
>CG4784 16331150 16331277|17223 chr3L 16331156 16331541 scaffold_9 1382268 1382604 - 10675|0 121
TGGCCTGATGATGCGGATCGTGGTGATGGATCAAAGCCGGCTAATGATCGTGGAACAAAGTGAGGAGTGACTATGACGTGTTTCCTAAGAATAAATGCAAGACAGAGCACCATTGTGCCAAA
-----AGATGTCTCTGAAAGATTTGATGAATCCTGGT-------------TGGAACTTAGTTGAACGTA------------CTCTTAAGAATAAATGC-ATTCTGTGCACCATAGTGCCTAA
>CG16807 16338312 16339779|17235 chr3L 16338306 16338869 scaffold_9 1389095 1389641 - 9015|6 629
TGAATGTTTATAT------------------------TTCTTAAAGAAATTTTAATAACGCTATTGTGCGATGTTGTTAACTATTGTACTATATATTATTAAATTTATTGAAAATAAATTAAAATCACGTCCCATTTTCCCCTTTTTG-TAAACTGTGAGAAGAGTGAAGTACAGG-AGAATTGACAAACAGGAAATTAAAATGTCAGTCAGGGCTTTGAGAACATTTACACATACCTACTCTACGCAAATATAAATTTGTATTTATATCTAGAAACTAATCAAT-TGTGCGCTCTAT-------------------------------------TATTAATATTATATATTAATGTCAGTTGAGCCTGCGTTTTGCTTTCAAGACTTTGTACATCAGTTTGATTCGAAGCAAAAGTGAGAAAGATTTTGTAACTTGTATTTGTTAAGCGATGAAATCAGGAACCCTATATATATAACAACGCT-TGGTCATAGAGGAACATAACATATATAACTTTACAAATATATTTATTGTTAACGAGTTTCGATGCCGTGTGTGTAGTAGAATCCATGTAAAAATATATTCCTCATCTCGGGGAGTGCG-TGTTCAGTTGTGAGCTAGTT
TGATAATTTATATGCATGTGTGGATGAATGTTTATATTTCTTAAAGAAATTTTAATAACGCTATTGTGCGATGTTGTTAACTATTGTAC--TATATTATTAAATTTATTGAAAATAAATTAAAATCATGTCCCTTTGCGTTGTACTCGTTGAACTGT------------ATACTTGCAGCCCTACTATATACTAAATAAATATATTAACGATAT--------ATATGTATATATATATA------GTATATATATATATATATATATACATATACTATAATTAATGCGCGCGCTCTACTACGCATGTAATACATGCGTTAATATTTTAATTGATATATTAATATTATATATTAATATCAGATGATCCCATGTTTTGCTTG-AAGACTTT---------TTTGATTCTAATGCTAACTCAAAATGAATT------TTATATATATT------TGAAATCAAAAGTCAAGAAAACCTATCAAACCTACTATCATATACATATAAAACAGATCGAAC--------CATATTAAATTTAAACGA--TCCGAT--CTGATTTATAGCCGATTTTCATTGAAAAT-----------------GAATGTGTTGTTAAACCGT----TGATT
>CG16807 16338312 16339779|17236 chr3L 16338974 16340051 scaffold_9 1389761 1391122 - 3112|0 1078
GAGCTGCAGACGGGCCCACTCAGCCAGAGGATATTTCTATATAGGTGTTTATATATAGATCGAATGGGCGGGAGAGAATATGTATAATGCAATCATT-------------------TTACACATCGTTAGAGGTTTGT--ACCGCACAGTTCAAACTTTGCTAGAATTTCAA--AAGTAATTGTAG--------TTAAATCTGATC--CGAGCGATCCGTTATTGGATCGG------------AGCCAAAACAAAA----AAATCAATTGGGTTGGGTACCGTCTATTAGAATCTATTAAATAATTGTCTAATTA-----------------------------------------------------------------------GTTCATTGTTCAAATTTTGTGGAAATGTGTTACTCA--------TGTTCGTGTTATGTTTCAGATTCGGGGTTT--------------------------------------GTGTCTAGCACAC---ATAGCGAAAAGTAAGAGCAA---------ACAAAAATAAACTCAACCTAGATTGTAAACTATGTGTGTAGCCTAGAATTCAGCTCAGA------------------CTCGTAGATCCGTAGGAAACCACAAAAGAGGCGAATGATCAAGAGTGATGAGGATGCGGATGAGATATGCAAATGCTTGTTGAGATCGGGCAACATCCAGTTTTGTATAGCA------GCGAAGATTTTAAAGCAATTTTCTGAGATGAAATAGAGATAC---TGTGCACTAATTAACTGAA---------------------TCATGATCACAAGAC------------------------------TTCAAGATCTAGGCAGAACTTATATTCT-------TATCCAAAAT-AGTGTGTTTGTCATCCCCCCT---CCTGATTGTTTGTGATCAAATTTTGATTGATTGTGTAACGCTGTAAACATAGATATAAATTTATATATTTTTTTTAATTATTAACTATTTCAAAA------CGCTATTTTTATATATACAAAATCAGTAGGGCTGACAAGG
G-----------------CTCAGACTATGGA------------------TGAACAATGTTCGAACGAGTGGAA--------ACATAATGCAATCATTTTTATCAAGATGTCCCCTGTTGGACATT-TTACAGGTTTGTACACCGCACAGCTTAAAATT--CTAGAATTTCAATTAACTAATCCTAGCAAATAGTTAAAGTTTGATCATTAATCGATCGGTCCAAGAAGCAGATAAGAAGAAGCAGTTAAAGAAGAAGATGAAAATAACAGATTTGGGTAGGGGAAATTAGAATTTATTATGTAATTATTTAATTGTCTATTTAAAGTGTTGTCGAGCTCTATATATACATATATATATATATATATATACATATATAGATCTATATGTTCATTGTTC-TATATTGAATTGATGTTCGGGCCAACCGAACTAGTCCGTGTTATATTTTTAATTTTGGTTTTTAAATTGATCAGTTAGAAAAAACAAGAAGAAGTTCATATTGTATAGAAAACTTGATGTCTAAAACTAGCCACGATCTTTTAGCACAACAATAATATAGATCTAGTTTTTAGA-TATTCAAATTGCTAACAAATTAATGCAAATCCTGTGCACACATAATTTCCGTAGATGT-TGGGTAGTTGCTCCCGAAAAGAAAATTGAAGATTGATGAAAA-GCAGAAAAGGTACACAAA-GTCCGTTAAAA--AGATCAAATCTGTTAATGGGAATTACTCTAGATAAAGATGTTGAAGCA----CCTGAACTCTGCCAGGGGTAAAAGTTTGCACTAG--AATTGAATGCCAAAATGCTAAAACCATCTGATTATTGTAAGACCCAGCTACATAATGCTGATAATGTATGTAGTTCGAGGTCGGTTCGTAATTTTTATATGGGCAATATATACGGAATGAATGGGCGTGTCTGCTCCTATCAACAATATTGTGTGTG-------TCTTTTTGTTTTTGTAGCGTTTC---------TTTGTTTTTTTTTTTTTTCTTAGATTATCTGTGAATTTGAAATTGAACCGCTATTTTTATAGAGAAGAGA--ATTAAATATGAAAAGA
>CG4753 16344229 16344385|17239 chr3L 16343604 16345517 scaffold_9 1394494 1396276 - 35568|644 802
ATTTTCATACCTGAGT--TTTATAAACTCTGCAACAGTTTTGGAATATACGACCTATGGACTAATAACTCAACTGCACTGACCATAGAAATATTATGTACATTGAATATGTACGATAAACCATTGTAGTTAACTGAATAAAATAACATTTTATGCGAAA
ACATTGATTTCGTAATTATTTAAAAATTCGTTGTTTGTTAACGAACGTTTAGTCAATGAGCCAA------------GCTGATAATCTCACAATTATATCT-----ATATATACAATTAACT------TTTAATCGTGGA---------TTTATGCCTGA
>CG4729 16347030 16347330|17241 chr3L 16346744 16347137 scaffold_9 1216891 1217297 + 1823|319 436
CATCAATTTGCGTACGTAGTTGG-TAGTTGTACACCTAAGTGGAAATTTAATTGTTTGATCAATTGTATTTTG--------GCGAGCATTGCAATAATTAAAT-TAAACAGAACGTGA
CATCAATTTGCATGGACAATTGAATTGTTGTGCCT----GTGTCTGTCTTGTTGTGTGCTGTGTCTGATGTTGCATGCAACACGGGCTGGCCATTAATTGAATGCCAACAAGCCGTGG
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CTTTCGAATTCGCATTTAG-----TTTCGATTGTCGTCGAAC------TCAATTATCTACAAATGACTTTGTAAAAGGCAGTCCTCT---CACAAATCTCTCTGCTAAATGGATCAATTCGTGA---------------TTCCTATCCGGACGATTT------AAAGTGTTTTGCATGTTTTTCTTGTCTA
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C
A
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>CG6664 16978136 16978708|17882 chr3L 16977985 16981324 scaffold_12 931999 935466 + 88473|170 799
GAGGATGCAGTAGCTCTCGCA-----CAGGGATACAGAAAAATCATGACTTATTCAC--ACACTTTCACACGAAAACACACTATATTCATAAACACGCACGCATGCAAGCAACCAGTTTAACGATCCTAAAAACATAAGAAAACACAGAAACAAAAGATGAGAAAGTAACTATCGTAAGCTTCTC----CAGGGCGACTCAAAGTCGCCACATTTATATATGGTTAATATGTATATGTATGTT--CTATTTGATCAAAATCTCTTAAAACCTTTCAAT----AACGGAATTCCTAGGCG-----------------AACGAATATTTAGCGCTAATGTTTAAGATTTGAATGTTTTTCTAATTTCGCTCGGTTCCAGTTAAAGTTAAGTAAAACACAGCTAATAATGAGATATGGAGGATATAGAGGATGAGAATGAGGATGGACAGCACACGCTAACCAGATCGTATGAATTTATAAAAAGGGTGAATTCTATTCATGTCGAAACCATTTTCCCACAATTCCTTCGC----ATGTGGGCCTAAAAAATTTTGAAGTATGTTTATGTAAGCCAACAAAAATAAAGTTCAACAATT--------TAAAATTAAATAA-----------AAA
GCCAACATATTTTCTCTCCCACGCTCCACACTCACAGACAACACACACCACACACACGTACACTTACACACGCATACTTA-------CATATACAGGCACGCAAGCAAGCAACCAGTTTAAC-------AAAGTAT---AAAACACTAAAACCA----------------TTATGTAAGCTTCTCTCTATGGAGCGGCTCAAAGTCGCATCATTTATTTCTATTTGATATCAAAATCTCTTATAGTTATTGCGACAAA----CGTAAACACTTTCAATTATCTACGGTATTCCTACACATCGCTGGTGGCAGGAATTATAAATACTTAGCATTAATGTCTAAGAATGAAATGTTTTTTTTTTTTACTTTTGAT-CAGTTAAACT-----------------------AGAAATGAAGAATAGAAAGAA-AAAAGCAGAAAGCAACAGCATATG-----------------------------------------------TAAAACCAATTTCCCACTTTTTCCTCGCATGTATGTGGGTCTTAAATTTTTTG-AGTATGTTTATGTAAGTCAAC--AAATAAAGTTCAACAATTAAAATTTATCAAATTATATAAGTGGCTTAACTAAA
>CG6652 16985599 16985812|17883 chr3L 16981838 16988135 scaffold_12 935552 941769 + 256414|3795 4013
AGTGCACTGCAATAGTTTCCACCCATGTCCAGTTCAAGTTAGTCCTTAAGCGGTGTTGAGTTATATAT----ATATTTTTCAAGCTGAGGCCCGTGTGCCCGGCGCAGCTGGAGCAGTTGCATCAGTGGCTTGGCGAA-GATGGATCGAATCAAGCCCTTGATGCAGTTGCTCCAGCGCCGGTCGCACAGTCGTTGATTAAATTTTAATATAAACATTT
TTT---------CAGTTTT--------TCTTTTTC----TAGACTTTAAGCTGCGTTAAGTTATATTTTTTAATTGATTCCAAGTAAAGAGCTCCGTAGGCGCGGCAGCCGTAGCATGTGCAGCAATTGCTGGACAAGTGCTGGTCCATATGGATGGCTTGCC-CATTTGTGCCAG-------------------GATT---------------TGGTT
>a10 16988381 16988460|17884 chr3L 16988260 16988471 scaffold_4 3437529 3437764 + -282|150 232
TCAATCTCTATTTTACGTCGTTTTTAACTTAAGTGA--TTTTATGTTGCTTTAATTAACGAATAAACTGCAGAG-AAGCTTCA
TCGTTATTTAAACTACATAAAACAAAAAATAAGTAAATTATTTTGTCGTTTTCATACCTAAAACACTTGCAATGCAAATTTTA
>scaf6 17002117 17002190|17899 chr3L 17001009 17003320 scaffold_9 2865291 2867742 + 103870|1114 1195
-ATCTGCCAACGGTCATAACTTCCCAGTTTTTTGTTTCCTT----TAGCCCAGAAAATATACATTTTTAT----AAAAGCGA
CATCCCACAACTGATGTCGCATTTCTGTTCTTTACCTTCTTCCGCTAGCCAAGAGAATACATTTTTTTTTTATAAAGAAATA
>CG32169 17032007 17032063|17932 chr3L 17031463 17032858 scaffold_6115 76 1462 + 38001|590 662
AAGACTGATAACCCAAAAATATAAATGCAAGAGAACAAAACAAAACAAAAG----------------ATATGC
AAGACTGATAACCC-AAAATATAAA-ACAAGAATACAAACAAATGCAAGAAGTATATACAATTATATATATGT
>CG6512 17203876 17204369|18151 chr3L 17203102 17206348 scaffold_9 155734 159170 + 117480|949 1564
GCAACGATCTTCGCTCATGTGGATGGGGAGTTTTGGTGTGGTAGT-----TCGAGGGTGCCGACATCTGTTTGTTTTTGTTGTAATCCCTAAACGCGGACCGGAGAAAACCCCGACATGTGGCAGATCGAGAAGGCAGGGCTCAAGGAGTTCCTAGACCTTCTG-GAGTTACAGT------------------TCTCCACGACGCGTT-----CATTATT-----GTTTTTGCATAATTTTAAGATACCCACATGGATAACTTGTTCCCG---TGTTGAGC-------AATTAAGTGCTAGCCTGTACTAAATTCCCCGTATGCGTAGTTTCAAAATGGCAATAAAGAATGGAAATGACCTGTCAGTGTG---GAAAAGCGAAATTAAACGATGTTATCAAGGCGAAAAATAATCGAATCAGTGT---TGTTACTGCCTTACG------------------------GTTTAAACCCGTTTTCG---------------------------AAAACAGCAAAAG----------------TTGCAAAATACATACAATGTATTGCTTCATTATGTATATTTCATACAATAAAATGTTAT-----GATAACATTGGA
GCGTTACTTTTGGTTTCTGTTG-TTTTTTTTTTTTTTGTTGTAGTCTTAGTCGCAGATGGTGAATGATGTTCGAATGC-TCGGACTCC---GACTTGGAACGCTGAAGTTCACGTCCTGCTTTAAA-AATGAACTCAAATCTTTGCCTTTTCCAACACACCTTGTAAGTGAAAGTAAACGCTATCTATCTATCTTTTTACAACACTTTTCCAACACTATTGGGAGGCGTTTGCCAAGTCTTTC-CTTTTCGCCCGCGAAATTGTTAGCCGATATTTCGAACAGATTCTAGTTGGAAGCTGAGCTGTGCTAAATTTACCGTA--------TTCTAAAAAAATATGTAAAATGCAATAAAACTATAAATTTTTTCGAAAACTCAAATGCAGTGTTGCGTAACCTTCCAAAAATTGTGACATCACATTAAATATTACGTATTTATGCACGTATTTTAATTTAAATATTTTGTTTAACTTCATTTTCAATGAATTTTTCCTATAAAAATTTAATTAAAACAACTTGGGTCAAACTCTTGACTCTTTTTAAAGATCAGGCTTTTTTTAACTAAGTTACAATCATTTGAGGCATTTAAAAAATATAGCTGGATAAATTTAGC
>CG6497 17217986 17218425|18170 chr3L 17217950 17218138 scaffold_32 481418 481619 - 3215|36 223
CAGAACTAGAAACAAAACTCCAACGAGGAACAGAGACTAAACTAAAATGCCAGCCCATGTCTGCACAGCTC-AAAACAATATCTAATG---TTGTCTAC-GGCAAAATATTTTGCAAAGCGTCTTTTT---GTTTTGCCCGATTTCTGTGTC---------------------------CTTCAGGCC
CAGGACAACAGAACAACTGCTAA---------------AAACTAAAACG-----CCATGTCTG--CAGCTCAAAAACAATATCTAATGTTCTTCTCTACAGGCAAAAATATTTTTGCAGCGTCTTTTTCCACTCTTGCCACGCTTTGTTGCCAACGCTTTGTTGTTGTTGTTGTGGCTGTTTCTGTTG
>CG6497 17217986 17218425|18171 chr3L 17218261 17218337 scaffold_32 481763 481884 - 3859|0 121
GGGCCCCTTCTTAAAGCCGTTTTATTGTTTCAATTG--------------------------------------TTTGGCTTG-------GCAGCTTTTTATGGCCGCATTGTGCGCCGGGC
GAGTTGCTCCTTAAAGCCGTTTTATTGTTTCAATTGTTGTGCTGTGCGGGCGCCTTCTTTTGTTGCAGCCGCACTTCGACTTGCAGGCGCGCAGCTTTTTATGGCCGCATTGTGCGCCAGCC
>CG6485 17285221 17285271|18266 chr3L 17285245 17285973 scaffold_32 554753 555494 - 18944|0 26
-CATTGATTAAGTCTTAAAGCAATAAA
TTGTTTACTAGTTTTTAAGGCATTAAA
>CG6479 17302429 17302579|18284 chr3L 17302429 17303962 scaffold_32 581059 582651 - 63570|0 164
ACAGTGGAACTAGTGGCTATGACTTTTAATC--------CCACCCCTA----ATCACTCCTTACTTCTAAGCATGATCCTTTGTGACTCGACTAGCGTTTGGTGACTGGACAATCCTCATCATTCGTT--ACTATGAAATTATACATTTGTAATTATTAAGCCAA
GCAGCGAGAAAAATTGACTTGGCCATAAAGCAATGGCCGCCACGCTTATTATATATATTTTAATTTCTAA----CGTTTATTGTTACTCGA-----------TGGCCCGACTAGCCATAACATATATTGAGCTATTAAATTATGCA-TTGTAATTATTAAGTCAA
>Mip 17310206 17310676|18291 chr3L 17310130 17311378 scaffold_32 586564 587898 - 28124|83 649
TCTCGCAGAG------AATCGCCGTAG---CACAGGAAAACTTAACCAGACTAAC----------------------TAATCCACCTGTATCTAACCGTATATAGCATGTGTGTTTCCTCCGCGATGGGTT------------TCCGTTCTTAGTGTCCATGTCGCACTAGGTTGTCCGGAGTTTCTCCCGGTCCCGTGCCACTGAAAGTCAATTCCGAAAATGTATGAAAGCGCTCGCCAGTCACCGGATCCTGATGACCGGCGATCCGTATCGCCGCCTCGATC--------------ATCCAGTATTATACGCAT-------------TACATACATATATGTCGGTATGTCTAGT----------CAACTATGTATCTACT-----CTAGC------ACCTAGTCTCCACGTATACA---AGAGGAACTTTCGGAAGAATATCGCTTTAATTTAGAAACGTTAA--CTAAGTTAATGAATTGTGCATATATCTTTATACTTAAATATACATCAATACATACCAAATGGCAACTATTAATACGAAATACAAATACGTTGAAAGT
GCCCACAGCTCCGATCAGTCGATATAGGCAAATAGAAACATGGAGACAAACAAACATAATATATGATATAACTAGCAAAACCTAACTGTGTATAACAATATCTA-TATATATATAACATATAAAATGAACTAGTACGTGCAACTCTTTTCCCATTGAGATTCTCGC-------TGTTCTAAGATCCTTGTGGCA----GGAAGTGGAGGTCAATTCCGAAAATGTATGAAAGCGCTCGCCAGCAACCAAAAACAAATACGTTTAAAATCAAAAAGAAACTTTAAACTAAATTATAATGAAAGCATTTGTAATTTGCATATGTACTTGTGTATTCAAATATGTGTTTTCGTTAGTCCAGTATTATAAAAATAACCAAGCATTAACTATATGCTAGCCGAGCTACCCGAGCTAGTCGTATATAGAGAGTGGTATATATACACACATTTCTGTGCAATCTAGAAAACTTAAATTTAGTTTAACGAATTGTGCATAT-TTTTTAAATACGTATACATACCAAAGCATACCAAATGGCAATTACTATATATATATATATATATAAATTCAAT
>Cad74A 17333010 17333715|18308 chr3L 17332952 17339431 scaffold_32 613264 619853 - 286262|60 876
CCGCAGCTCATCTTCTGCACGGGAAGGTCCAGGTTCAACCACTGACCACCAACCAACCTA--------GTAGACTAGTGGCCAAGACTCAA-------GCCCCCTTTGCACCAGCGG-----AGATCCCCATATCTCCCAGGATCTCCGCT-CGGCAATTGCGAACCGGGACTTCTT-----TCTGGCA--GAGATTGGTAGACGATAGAATGCCAAATCAGTCCATATACCATAAGCTTAAGCATACTATGCGCGTGATCTAGAATGTACGTGTAGCACCAAT-TAGCCTCTAGGATAGTGTTTA-------CATATAAAGTAA--TGTATAAAGC-----GTAGGGATTTTTAAATTGAAATGGTTAGCCTAAGTCGAGTCAGTTCTTTGTGTCATTTGTGCTGAAGTG--CTGGTTTCCCTGGCGAA---------TTTAGCTGGTTTTCATTTGGCACTTTGGCAGGTC-TGGAATGCATTTATTTT---------------------------TTATATATTTATCTTATCGTCTATTTGCCTATAACATGCCGAACAAGTGCAGTATAAACATCGATCCAAACGACGTCCAATTCC--------AGCTCCACAATCCAATCCTCGACCAGGAGTCCAAGT------------------CAGGCCATGTGCGTGTCGACCGAAAATGAGTCTCCCGTTTTCAAACAGAATGCATATGCTT-TCGCTATTAA-GTAAATATATTTATATACGACTAAGTAGTTTGTCCAATGTGAACATGTGTGCAAATAAATTCTATTAACTACAAAA-GTG
CCTCAGCTAATATTCTGCACAG------CCAGGAACAGCCAATGGCAATGCTGAATCTTAATTCTAGTGTAATCTAGTGCTCAAGACTCAAGACTTAGGCCTCATCTGCACCATCTGACAACAGATTTATCCAATCCGCTAGTTATCCGCTATAACCAGAGCAGAACAGGTGCACATGAGGCTTGGGCAATGCAGCTGGCCG-CGCCAGTTGGCCAAAACAGTCCAT-----ACAAGCATAAGCATACTATGCACGTGATCTAGTATGTACATAATACACCTATGTAGAGTATAGAAGAGTATAGAGTACGCTAATCTAATTTAAACTGTATAAAGTCGAAAATGAAAACTTTTAGTTTTAA---GTTCTCATATAGAAAGTCA-TTTTATGTGTCATCTGCGCAGAAAGGGCCGAGTACCCCATTCGAGTACTCCAGCTTTGAGTAGAGTTCTTTT----TTTTTGCAACTCATGAAATAATTTTGTTTTATTTTAGTAAAAATAAATGGCATTTACCTATATATTTATCTTATCGT-TATTTGTCTAGCAAATGCGTAACAAGTGCAAAATAAATATTACTTAAAATGCAGCCTGATTTTCAGCAGGAAGTTTCACATCCTGACGCTAAGCAAAAGGGCAGAGTTGACGTGTGAAACTAAAACAAATTATATGCAT----AACATATATATTTGCCACTTACCCAAACAAGGTGCATATGTTTGGTGCCATTAAGGTAGAAATATGTATTTA-----------GTTTTCGAATGTGAACATGTGTGCAAATAAATTGTATCTACAACAAAATACA
>CG13728 17345283 17345431|18317 chr3L 17343527 17348315 scaffold_32 625450 630640 - 89387|2183 2380
CCACTAACTACGCTAGTTGTACTTAGAGTAAGT------------TAAGGCTAGCTGTTCCGCATTGCAAGGACTTACCTTGAATAATTAAATGAAATATAGCT-----------------AAATTGAATGTTTTGTATT--------------------TATAATATTATTAATAAAGGTATCTCAATTTCTATTAA
-----AATCGATTTAGTTATAGTTCTTATAAATACCAAAAATAAATAAATATATTTAGTGCTTACTCCAATTATTCTTAGTTGATGATTTGGTTGGATTTTGATTCTGTATATAGATTTGCAAACACCATATTGTGTAATTTTTCATCACCAAGTTTAAGTCTAATATTTTAACTTATAAAGTTTCCAGTTCTA--AG
>CG13731 17349280 17349286|18318 chr3L 17348370 17350680 scaffold_32 630707 632875 - 23276|985 991
ATCTAGA
ATTGAAA
>blot 17361283 17361812|18331 chr3L 17361254 17362563 scaffold_32 647715 649066 - 40406|29 631
AATCAGGGGAGGACCAGG----AGTAGGAAACGAAGCATTCACATTCAAAAAGACTTGTTGCATCCAAAACAAACGTATCTGTATCTGTAATCCGTATTGCATCTACGGCACACCTAACTATAAGCTACGAATAACGAACCATGTTCATACGGAAAGTGTATCTTCTAGTTGCGAGTTGTAAATAGAAAAAGAGAGAGAGATAGAAAGTGT------------------AGAGAGCGTCCCTAGATTTAGTTCTA----CGATCTAGTTTCTTAGCTTAAG---------TCGAGAAAATTCTGTTGTCATTGTTCTTCATCT--GGA-----------------AATCAGGATCAGAAAAAGATTGAGTATA---CATTTA---GCCTAAGCACGT-------TGAACTATCAAGGATT--CGAGTGCCTGAAAAAAACATGAATTAACTGAATTAACCCTAAGCTTTTTCAGCTCTTAGTAAGT-CCGTA-GGCATATGACCCCATAACCTAAGTATCCATTGTAA--AGTTACACTAAAAACACAACGATTCCGAAAACGATCTTATGTAATAAATAGAAGGATTAGTAAATTATGATCG
ACC---ACGTTGGCCAGGCCCCAGACGGAAACGAAGCATTCACATTCAAAAAGACTTGTTGCATCCAAAATAAATGTATCTGAATCTGTA--TAGAATTGCA-----AGCAGATCTATCTTTAAGCTACGAACTACGAACTATGCCCATATGCAAAGTGTATCTTCTAGTTATGAACTGTACAT------ATAGAGCATTGTACCTAGTGTTTAGTTTATGTCCACATAAGAAAATTTTGATAAACACAATTCTGTTGTCATTCAGCCGCCACAACTAAAGAATGTCATATCCCGAGGATTACG-TGTAGTTAAGCCTTATCTTAGGAATATAGTATAGAGACACAATCAATTTCTGAATGCATGTGAGTATATTGTATGTATGTGCTTGTGCATGTGTATGTGTGATTTAT---GTATTTGTGCGTGTCTGTTCAACATTTG-ATTATATGTACTATATTTTAGTCTG------TCCTAATATATACCGTGTAGTGTAGTATAGTATAGTGTACGCATCTGCGTTAATTTGTCAAGTGAACTGCACAACGATTACAAAAACGATTTAATGTAATAAAAAATATAATTAGTAAATTATAAAAG
>noe 17364806 17366224|18334 chr3L 17365237 17365507 scaffold_24 1335642 1335927 - 379|0 307
GTATAGTTTCAGAGAACAGA-TGCGTTGTAAAAAATAAAAAAGTGTATGTTATATTAACATGACAAGCAGA-GTAACAGTGCGTATGTGCAATAAACTACAGTTTTAATATTTTTGTAGCAAAT--ATCATT--ATATACAGCA----GAGCAACA----------------------GTGCGTATGA-----GCAATAACTTGCAGTTTTATTATATATTTGTATTAAACATCACTATTACCAGCATATTAAGATCTCGATAAATGACTACTCGTTTTAATATATTTTATGCCTGGCTTGGCATTTC
GGAACGGTGCGTGGAACGGGTTGGGTGGGGGCATAGAAATACATGCATATTAT-------TGGCATGCAAATGT----GTACGAATTTGC-ATTGCCTGCAATTGTAGAATCGTAGAAATTAATAAATCATTTAATATACAATAAATGGAAAAACAAAATACAATGAAATCAATCAATGTACGTACGATGTGTGTGTGCACGTGTAATCGTATAATATATATATATATAATATTAATTTTGTC-GAATTTTAAAGAATCGG---------ACGCTTTTAAAAGTAGCTAAAATTGGACTTGTCCTGTC
>noe 17364806 17366224|18335 chr3L 17365508 17367243 scaffold_32 651266 652986 - 46039|0 804
AATACACTAAAAAA-----AGAGAAGACTTACTTAAATGTGACCTAGTAGATAAA----ATCATCATCGTGTTATCAGGACGACCGCAAAAAATCTCTG---AAAATCGTACAAAAAAATATTAAAACCT-CAAAATGCATTGGTGTGTGTGTCCCGTTCGTGTAATCGCTGGCGCGCC--ACGCC--------CCCCGCCCCTCCCACTGTCACGCGCTCGCCACGCCCCC--CAGTTGCCGCC--CCATTAGCAGCGGGCAGATGGACAACGTGTGGGTGGCCCACAAGGACATCTAGTAACACG-ACGCCCAACAGCAGCCGCAAGGTCTGATACGCCGCCCGCCACGCCCATCGTGTTTGGGCGGCAGAGGAAG--------CGGTCCGGAAGCGGAAACGGAAACGG----AAACGGGCGAGCAAAATGGTGGCGCGGTATCGCGGGCAAGGCGACGGCGCGTCCACAAAAAATAACCATAGAGACGTTTAAGGCAAATTCTAAATGAAC-AAAAGTATAAACCA---------------------------------AAAACAATTGTAACGAGAAAACAAACGA-ATTCAAAA--ATGAGCA--ATATGAGCAACA-ACTAATAATGGCAAAAAGCAAAAACG-ACAACTGCAAATTACGACACAACACCTTCG-AAAAGACCTCAGTAATAATAAAAACAACAACAAAAACACGTGAATGCTTGGTGGCTGCAAAGGAATGCCTTCGTCGTATCGCCCTTTTTTGGA------CTTGGCCAAGCTATTATTGTATAA
AATACACTAAAAAAAAATGAAAGCAAACTAACTTAAATGTGACCTAGTAGTTTAAAGATATCATCATCGTGTTATCAGGACAA---AATGAAAACTCTGAAAAAAATCTAAAAAAAAAATATTAAAAACTGCAAAATGCATTGGTGTGTGTGTCCCGTTCGTGTAATCGCTGACGTGCCGAAAGCCAGTCAAAATCCGGAATCTGGCGCAGCTCTTGGCTCTGTTGGCCCAAAGCAATTGCTGCTTATCGAAAAAAAAAAACAAACAAACAA--------------ACAAAAACAAC-AAAAATACGCACATCTGATAGAGACCGGTGGGTGAGA----------GCTACACCCAGAAAGTCCCAACAACCAAGAAAAAAAAAAACCAGCAGGCAAGCAGCAGTTGCTATGATTCCCAATCAGCCCGGAGAATGCCTGTGGAATACGACTGACGA----CTGGCGCGTCCACAAAAAATAACCATAGAGACGTTTAAGGCAAATTCTAAATGAACAAAAAGTATAAACCAAAATGAAACAAAAAAAAAATACCATGAAAAACGAAATCAATTGTAATGTG-AAACAAACGATATTCAAAAATATGAGCAATATATGAGCAACATACTAATAATGGCAAAAAGCAAAAATGAAAAACTGCAAATTACGACACAACACCTTCGAAAAAGACCTCAGT-ATAATACACAT-----------------AATGCTGGGT-GCTGCAAAGGAATGCCTTAGCTGTATCGCCCCTTTTTTTATTTCACTTTTGCAAATGAATTATTGTGCGA
>CG3885 17387039 17387366|18358 chr3L 17387130 17390476 scaffold_32 675535 678853 - 168903|0 240
TCTAGGGATTGGAATCTGAAAGTCAGGGAGCGGTTCAACCGGGTTTTATTTTTAAGTGCAATAGTATTTAAAGCGC--TGTTTCTGCTGATTGCAAAATATATGGCGCGTATATTTAAACAGATGTGGATCTGCGAATGTTCGAAACGTCCAAGAGAGAGGGATCGCGTAGTGAAAAATCAACGAGACTAGGCCTTAAAGGGAACTTTTCAACAGCTAGCCATTGA--AGTTGATTATTGT
GC-----------------------GCGCGCTGCTCGG--AAGTTTTACTTTTAAGTGCAATAGTATTTAAAGCGATGTGTTTTTTTTAAGTCAAAAATATAC-GCGCACATAATTAAACAGCT----------GACTCTTCAAAGC-TGTGCGAGAGAGTGAAAGAGCAGGAGAGAGGTGGAGAGCC--AGATGAAGAGAGATCTCTGGGAGAGAGCGCCACAAAACAGTTGACGCTTGT
>CG33052 17392565 17392846|18361 chr3L 17392727 17394183 scaffold_32 680636 682105 - 44201|0 123
ACACGTAACACGTGTAAATTCAACTTCAAATCATCTTTAATTCGA---ATTTTCAGCGGTGTTTGCTTA-ACTTGACCAAAAGTATCAATTTGTTGCTCCCTGAAATATTATATTTTTTAAATT
TTACGAATC---TTTGCACAGAA---CAAAGCTTGTTTAGATAGATATATTTACATTGATATTAGCGTGTGCATGTTTAGAAATAT-----------------ATATATTAAGTTTTTTTAGTT
>frc 17396840 17397112|18364 chr3L 17396886 17398243 scaffold_32 684855 686255 - 61101|0 260
CTT-------------------------CATCTTAGCTCAAACTCAAGCCAAAGCCATACGATATGTTAAGTGTATTCC---GTACTGTGTACTTCAATTGCGATCTGCGATTCGCGACAACGTTCGTATTTGATTTTCCTACAACCACACAGCGCATCGTCTCTGTACATATATCTAGCTATATTTCTATAAAAA------TGTAATTTAGCAATTATGTAATTTTAATCACTTTGTACATTTGTCTGCATGCAACTGTT
TCTCTGGAGAGTTGGAAAGGGAAGGAGCCCGCGTCGCTTGCACTGCTGCCAAAGCCATAA---ATGTTTTATGTACCCATAGAGAAAGAGTATCGCGAATTCGACTTGAGACCAACACAAAATGAAGCACATTGTTAACTGTCAACTCTGAA-----------CTGTACATATG--TAGTTATGTATTTAAAAAGAAATACTTATATTTAAGCACTTATGTAATTTAAATGTCTTTGTAAATTTATATAC--GCAATTGCT
>CG12229 17399731 17399790|18366 chr3L 17399149 17401749 scaffold_32 687058 689670 - 95043|651 713
CTTTACGGCGTGCAGTTGTGCAGATTACA---CAGATAATAAACTCTAAATTAAATGTATCTT
ATTCATGACGTGCAGTTGTAGAGATAACATTTCTTATGATACA-TCAAAATTAAATGTATATA
>CG13733 17443046 17443207|18409 chr3L 17441565 17443936 scaffold_12 436535 438969 - 16464|1742 1917
TCTGATTTCGTACCCATTATCTGATGGATATTCAAATTTATGGTTTTTAGATAAGCTTTTTACAAAATTTCTTCTGTAACCGAATATCTCTGTAAAAATTGTTATGTACATACATATATAGATCTCTTATGAACAGTAAATG-----------ATTAAA---CTAACCAAACGGAA
CAAGATTT-----------------GTCTATTCGTATTTTTTGTTTTTAATTAAATTTTT----GTATTGTTTC---AACGTATTAAAAGTGTATGCATAGCGAAATGACGTCCCATA---ATTGTTAGTTAACAAAAACTGTCGGCTCATTCATTAAAACTTCGCCTTGGCGGAA
>CG6322 17477114 17477378|18448 chr3L 17477035 17482371 scaffold_38 202793 207933 + 162388|87 372
TTTTGATAC---CAT---TACTTTATTGTACTCACCTGTGGGCGTACGCAGACAATCTCCACTTGCGATCTGCCCGCTGGGCACGACTTACTCATCAACTGTTTTTGTTATTTCAGAGACAATAGCCCAA-----------AACATTTCAAGTTTTCGTTTTGTATAACACAATTTGTTGTTTTTGTTAGGCGAAAGGCAGATGCAGCGATGTTGCATTTCGTAAATTTAAGACTTTTTTATTGAAATTGTTAATAAAAAATACAT----TTTTGGTAGAGAATTG
TTTCCATACATACATACATGCTATATATGATGCATACATCGGC---TGCTTATAGCCCCGATTTGTTATAAGCTCAATTTG-----------TATTTACTGTTTTCGTTG----AAACACAATAGCCCAAACGTTTTTTTCAATCTTTCACCTTTCAGTTT--TATAACACAATTTGTTATTTTAGTTAGGCGAA--------------ACAATGCATTTCGTACGTTTAAGACTTTTGTATAGAAATTGTTAATAAAAAAAAAACAACATTTTGGTACAAACGAA
>CG6311 17490590 17492217|18449 chr3L 17490567 17493947 scaffold_38 723045 726479 + 96038|23 1909
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>CycT 17517772 17518062|18473 chr3L 17516581 17520876 scaffold_38 751109 755789 + 106011|1433 1888
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C---GATCAATGCGAGGT-GGGTTTTTTTTGTACATG--TTGAGTTTTT--GTTAGGTCTAAGAGAGAGGACACATCAGATTTAAGCGCGGAAGAGAGTATAAATTACATAGCTGCTAGGCCTA-TGCATATATGTATATATGTATACACACATACATATACATATGCATAATGTATATATACATAGTAAATAATTATTATGTATACAGAGAAGCAAACATGCTAAAAAGTAAAATTCTGTAGTAATTAATGATCTATTCATTGGCTTTAGTGTTTTAATTGTAAC-----ATTTAATTATTA-------TTACAATGCATATTGTTATTATTATTGATTATTATTATGATTATTA----TATTATTATTA----TATTATTATTATTG--ATTGAT-TGATTGATGATTGATTATCGATGAAGA--------GTTCTTATTGATATTTGATATGTGTATGT-----------------GAAAACTTATAGCTACGAAATA--------CTGTATACACCTACAACAAAGCCTAGCCTAATATAACTAATACCTAACCCTTACCATTACCCTAATCCCCTCCCCCCCCCCCCCCTCTAACTATGCCCGCTTCTCCCCTTTAGCCCAAGCCTACGCCCTACGGTTACATACACATACACTACCAGACGTAGCATACGAGT-----TCTACAAAGTAGTTTAAAGAGA----AAATAACTGTATTTGTGTGCGTTTTCGGGCTCATTGTTTTTGTTGCTTATTTTATAAA------GAGATGAGAAAT----ATTTCATAGTTCTAATTAGGTTTATGCTTATCGATAGTTTATTTATTTAAGTGTTTCTTCTATATACCTATATATACCTATATACCCTGCCCAATATCCTAACTGGAGCCACAGTAGACACCCGTTCAGGGCGACGCGCCTAACAAATGTTGTAGCTTGTGGTCAGCAACTTTCTTGTAATTATTAACTTTTAAGTTTTGTATATTTAAAGAACAGAAAACAAACAAACTAACTAAAAACACGGAGCAGCAGAGCAACTAATTCTGTGTGGTTCACTTAGCGGAGCTGCGCGATTCAAAAGAACCAGCTCCGCAAAAATGAACCACAAGAAAAAAAAT----AACCATTCTTTACGAAATCAACTTGAAATACAAAACAAA---CAA--CTTTTGGTCTGAAGTTTATGTCTGAAATATATTTGTTAACGC-----TTTTTGTTA-CGTCACACTGCCACAACTC-AACCAA--TATACAAAATAGAAAAAA-------------------------AAAAAACAGTTCCA-AGTTCTGCAAATGCAACACACACACTCACACACACACACAGACAGACA--CACAGCGACAATTTCCAAACACTGCCCAAA-CGTGCAATCTCTTAAATGCATAAACTAAACTAAAGTTAAACTAAAGCAAAAGTAGAAGAAAGTTAAAAGATACCAACAAACTCCTAGTTCTATTCTATTCAATATTTCTTTTATACTTATGTAGTTGCGTTCTTCTAAGTACCTTTATCATTATCCATTATCCATTATCTATTATTATTATTATTATTATTAGAGCAACAAAATGAAAGAGTTTACGTTTTTCGATTTTTGTTCAATGATTGGAAGAATGATAATGATGATGATGATGATAATGATGATGATGATAATGATAATAAACGGAAGTGAGTTTTGAGTTTAACTCTGTTCATTGTAAACA-TTTTTTATGATTATTTTTTATTTTTTATTATTAAAATAAAATTATTATTTC
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GCAAGCT
ATACCCT
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ACAAATCTTTTTAT
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TATAATTGTAAATGTATGTGAAATGTGTATGGA----TATATAAATATCTCACCCTAATTGATCCCTCTACACCCCCACAAAATCTCCCTAGGCCTTTTAGTGGCGCCCATGCACTTGAAACAAAGACACAAAACAAACCAAAAAATAAATGGGATACAAAATTATAAAGGGTCGAGATAGAAAAGTATGCCACCCATATCTTTTGTTGAGCCCATTTTACGCTGTGGTACTTAATTAATTAACTACACAAGAGCCAGCAGTAATACGAATGCTAAACACACACAAACAACTATTGCTAGAACATATGATTATTGCCTATTATAACGTTTA--ATTACTATGTTTAATCCCTTTGTATGTAAATCAAACGATGCTTATGCATTGCAAAGGGTGCAGAGTCGCATTATCTGCGCCAGTTTTATGCAAATTCAATAAAATCGAA
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>CG32177 17612698 17613699|18582 chr3L 17613148 17613411 scaffold_29 950668 950949 + 146|0 288
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TCGCAAATAAAGGCAAATTGCATTTGGTT---AATGATATTTGATTATTTTTTTTCCTTTTTTTGT-TTGGCCAGCTTAATTGTCTCGGATCAATGGCATATTGAACTCCATGTTGGCCAATCCACTTGGCCAAGACTCTCTTATTTATTTAAGCCAAGAGAGCGCTTCGTATTTGTGTGCTGTCATCGTTTGGCGAATGAGTCTTAAATGAGTGTGTTTCGAATGAGTCGAAGAGAGTGAAAGTGTTGCCGGCTGTTGCTTCTTCTTATATTTTGTCGTC---GTTGT
>CG32177 17612698 17613699|18583 chr3L 17613451 17614549 scaffold_38 868778 869858 + 44198|0 258
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AATAC
AATAA
>TORC 17626887 17627484|18599 chr3L 17627075 17629979 scaffold_38 881145 884171 + 108580|0 442
TACTATGAGGAGGCTGTTGCGGCCATTGAGAGCGGAGTGCTGCTGGAGGAGGACTACCAGGCGCTGCTCGGAT-----------------------------CAGAGGCGCTGGCGGATGAACAGGTGGTCA-CAGTCGAGGCCGCCGGAGCCGCAGCAGCAGTAGTAACAGTTGAAGAGGCAGCCACAGTTAGCGAGAAGGACAAAAAAGATTTGGAAGTTGTGGAACTTCTGGTGTCCGGTGTTATGGATGACCTGGTGGACTCCAGTGACCTGGACGAGGAAGTGCGCAATTTCTTTTTTTAGGC--AGCCAGCAAGTCATTTTTGTCGTTA-ACACAACTGATGGAATTTTCGTTTTTAACACAGATGAGGAAGTGAATTACGTTTTTTAAACGCATTCACTTGCCATTTCTCGATTAAATGCCATATTACTTAAGCTC
TACTATGAGGAGGCTGTTGCGGCCATCGAGAGCGGCGTGCTGCTCGAGGACACCTACGAGGCGCTGCT-GGATGCCGGCATTGCCATGCCACTGCCGTCCTCCAGTTCCGCCGGCAGTTGCCCGGATGTCCAGCAGC--AGGCGGCGGCAGCAGCCGCAGCAGCAGCAGCAG---------------CAGCTAGCGACAAGGACAAGAAGGACTTGGAGGTGGTTGAGCTACTTGTGCCGGGTGTCATAGATGATCTTGTCGACTCCGCCGACTTGGATGAGGAGGTACGCAAGTTTTTCTTCTAAGTCAAGC---CAAGCTATCGATGACGATACACAC-----------------------ACACACACCAACAGACA------------CAAACACACACACACATCG---------TAGATGTAAGCTTTGTTATGCCC
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T
T
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TGACCCCCTTTTAGTAAATAA----------------CTCATGCTGCCTTTT
CTAACAGCGTCAAGTAATTAATTAAATTTCTGTAACTTTCATAATGTTTTTT
>Adgf-A 17716977 17717711|18708 chr3L 17716466 17719853 scaffold_38 963590 966970 + 73959|582 1400
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CTAGCACGGGTGGTGGCAGCGCTTTTGGCTATGTTCTCCCTCCTGAACGCCGGCCTTTGGCGCTAGTCTGGA-----------CTGCCTACGATTTCTAGCGGACCAATCTTACACGATGATAACATTGGCACCGGATGCCTCGTTTATACTCAGCTGTGGCACAGTGTATTTGGGTCTTACACTGGCTTCCTATTCACGCACCTGTTCATCCGAATTCATATCCCGTACGCTATT------TCGTTTTAAGCTAATTAATATTGATTAGTGCTTAGGTATATTGTTAAGTTCTTCTGCTCACTCGACTTTCACGTTAAGTACATAAGAGATT-TCGCACTTTAATTGATCTGTTT---------ATAAGCTTTTGTACTAAAACCTCTG-----AATAAAGAGTTCGGCTTA--------CTAGCTCGTAATGC-CGCAATTCATATGCAACTCGGCTAAAAGCAACCTCAGGATAAATGCAATCAGTTGTGCAGTCAAGCTTTGCCATGCTCGGGCCTGGAGATGGTAACGTGAAATTCATAATCCACTTATGATACTGTCTCTTGAACTGGCGATATGGATCTTATATAACATAGAAGAGTCATTAAACGTTAA---ATTTGCA--ATGAGCTTTGAAAAATAATC------------TTTTATAAAGATTATATCAATTGCCAAGAAGACAAATTTACCATGAGGCT--AATATAGCTTGGGTC------TGATTATATTTAATTTAGCTCCCATTATAGACCCACTCATAGAGAGTAAC------ATTATGATAAAGAACATGCTAGAAATGAA
>Msi 17720182 17720226|18709 chr3L 17720149 17720828 scaffold_38 967470 968158 + 24156|34 78
CAAGTAATTGTCAAATAAAAAACAAAAATTGTAAAAAGGTGTTTA
TAATTTGGCGTGCTAT-------ACAAATTTTGATAAATTGGTTG
>NUCB1 17763319 17763344|18766 chr3L 17762882 17764820 scaffold_0 7921677 7923633 - 65842|449 478
GCATTCCCTTGCTAAC----GCATTTCTTT
AAACTGCAACATTAACCACAACATTCCTGT
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AAGTTAACAATCGGTACTATTTTAAGAT--TTCTTACCGAGTGTATTATATAATAGTTCCCTTGGAATGCGACTACGTAGGCGTACCTTGT--TAATAGGCCAAAAAGTAGAGGAATTAAGTATACGATGCAGACTATTGGATTACATCGTAAAGTTGTCAGCATAAATATATCACGTTTAAGTTTTTTTTAGTTCAATAAAAACAAAAGAGGCAAACAGAACAGTTTCGAAAATAACGATTATGCTTTTGCTCTGTAACAGTACAGTTTAAGCCTAACAGTTCCATAACGACTGTTAATTGTAACTGCATCTGGCAGCTCTGTATTTTGAAATGTAAAAT-GTTAGAAATATAACAATTCATGAGTTTTCGAATTTTAGTGATTCAATAAAAAATACAAGACTATAAACCTTGAAAACAACA
CAATAATTAAAATGTAACATTAAAATATATTTGTTAATTAATGT------TGGCAGTGCCGCTGGATTGCGATTACCATGGAATTCCTTGCAGTGCTTAGCCGTACCGT----TAATTTCGATAACGATATCAATA--TCGATTATAT---------ACCAGCACAGTCTGGCAACGTTGCAGATCTTTCAAATTTGACTAAGAT--------------------TTTTTAAA--------------------------------------------------------------TTATTTTTAATTGCCTTTTACC-CTCTTTTTTTTCAATTATTGTATTGTTATTGTAATTCTATTTAATG--TTTTTAAATTCTGTGAAATGAATACAAAGTGCATTAC----AATTTAAATGTCAACA
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TA----CGGATCGAGGA-------------TCAGAATCAGGATCAGATTATGCCTTTACTGTGTGCGTGTTTAGCCAAATAAGCGTGTGTGTCTGTGCATGTCCCTATAGTATTA
CAGAACAGAATATAGGAACATAAAAAGAGCTCATAATGAGTATTTAATTATGCCTTTA----------AATTAGCTA---AAATGTGTGAGTGTGAGTGTGTACATTTTGTATTA
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ATATATA
ATGCATA
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ATTCGACAATAAAATC--------AATTGA-------TGAGATTACGAAATTTATTTAATAATTAAATA-------------TTCAAAT
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C-CTAACATAGAAAGGATGGCAAGGGCAACGC----------------------------------------CATTTATAAATGTA--TTGCATAATGTAAACTTAAAGTATTATCCCAGTGTATGCT-ATATAAGACCTGTTACGCAAAAGTCGTTGCTTTTGTACTATGT-TTATCTTATATCCCGAATTAAGTGTATACTATCTTA---ATGTATGCTAAGTGGCTTGTCAATT---------TTTTGTGCCTGTTATCTGTTACATAATATTGAACCATCTTTGTTATATTTTGTTATGAT----TTAAGTCCCAAAAAT--ACAAACGACAAAAATTGATTCAGTT---ATTAACTATTCCTATTGCTTGTGAAGACTTAAAGAGCTGACCTATTATTTGTTGCCATA--------TTTAATTTTCA
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AACTAGTCCGTCGGCTCCTTGTACATAT
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TAAGGCTAATTGGCTTTGATGCTGCGTCTGGCTGAACAAATTTGTAAAATGAATGAAGATGTAAAACGGATAGTTTTTTATTAACGGATTCGTGTGTAATCGCATTTAACAAGCGATTATTATTTATTTTCTTATAATTTATGAGCATTGCAACCACTTCTAGTTGATCTTTGTGCTGATG
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GAGGCAGGCCACCACTTAGTCACATAAGTCTGTAAATATTTA--ACTCTTTAAACAC--TTATTTATTAATAAAACA-----TAATTCAATCAACCGAGA
GAGGCAAGTTCCCATTAGCTTA---AGGCCTGTAAATAATTGTTATCGCTTAAATGCCTTTAAATATTTATTAAATACTTTTTAAATCACAAAAACAAGA
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------------AATTTCTAGAGTGTATATACGTCAGACGA
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GCAAATTGAATAAAAAATTAGCAAGAA------GTTAATA
GTAAGACAAAGAAAGAAAGAGAGAGAAAAAAATGTTCATA
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GCA---GAATGTTCGAA-------------AAAATCGAAAAAATTAAGAAGTGTAACTTTATAATTTCAAGTACTTTCCGTAATCAAAACTTTTAAATATCTCTCTCAACACAAATTATAACTGTAACTATATTTATAT
GCAACGGGACCTTCAAACCGGCAGCTCTATATATGCACAATAATTTCCATTTTTCACTATGTTAAAATACGAATTTT---TTATTAAATTTACAATAAATTCTATTCGGTACAAGTAACTATTGCATTTAAATAAACAT
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AAAAAAAAAACGCATCTTGAGTAAACCACAAACACAACTATACACCTGCAACTGCAACTGCAACTGCAACTGCAACTAGAACAACAGTCCACAGTCAGTCAAATAGTACAAAGGAAACACCCAGCGATCGGTCTATCTGACAACTATTCCCGACTCAAAATTTCTGCAG-----------GACCCCCCACACACCCCC----TAAGTTTACTCATCAAAGCGATTGTGATAATGGTTTTGTTTCTTTCGATATAGCAACAACAACA---ACAACAACAACGAGTT--------------TTCGTTTTAGATATATTTGATTTATAT-----------------TATAATTAAATCT-------------AATTAACGAAAAATGTATTTAGTTTGTAAG--CTTTTGTAA------TCGTCCTGCTTAGTCCTTAAGCGATAAGCATATTAAAAGCTACAGAACTCAGTAGAATATTTATAAGGCCTGTCAAAAGTTGTATCAATTTTTTGGCAGGCCACAAAACAAA
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AAATTGACGAAAACAACCGACACAATCGACAACAACAACTACAAATTCATGGCCCCAACACGAGGCTGATGGCTCCT--AAGCGCAACTTGTGATTACTTTTCGTTGGTGAGAACTAGCGCTCCCTAAACTAACTAGGGAGAGAGAAATGGAGATGAAATTTATGTGAACGATTTGCAAAAATCTCAAAAAATATGAACAGAAAAAAAAAAACAAAACAAAAAAATAACAATTTGATAATTTTTGAGTAACATTTAAATTCTGGAC---AAATTAAT--CTGAGTTTTGCCGTCGCTGAG----GAGAAAATTCTAGTGAAGGCTGATTAAAATGTTTGGATAAGCGCAAATGTGATAAATAATTTTGCTAAAA-----CATATTTTAAGTGCTCATTTTGGTAAAGTTATTTAAG-CAGCTAAATTAATACTAATTAATATGATTAATATTTTTCTA---GTTTAGTTTAGTTTAAT--TAAGT----------------------TTTTTTTCAAGATGGTCGGCCCAG---------------TGCAAGCAGCAGCTAGTTTTCATACAGATACGAACCTAAAT-ATAAGTCCGATT-TTCTACTAATACTAGAACTAATAATTATGTATTTAGATTAGTTTAAGTTCATAATACCAATTTTTAC--AAAACTCTCTTGGTGTCTATTTACAAGTACGACGACGAAACAAATCGCATCGATTTCACTT-TTAGGTAGTTGGCTTCTT-AACTTAGCAAATAGTTATGAAAATATTATGATATAAAAAATATATTTATAAATACATATATTTTTGTATAATTATTTTGCTGTTAA-ATGTAAGTTGGTGTTCATGTATGTATGTGTATGTGTGTCAATTTCAGTTCTAGGTCCATTATCATAAGCAATATTC--CTAAGACTACGAGT-ATTTCGAACAATGAACCAAAAACATT-TTCGTGTCACGAGCATGAACATAGTACAAGAATACAA-TAGAAATCTTTACAGA----------GCAAACAGCCAAATGGTTGAAAATAACCTAAAGTAATTTAAATTTA-----------AGCATAAAATAATTATATATAAATATGCAAAAA
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TAA
TAA
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CTTGTAAA-----TAAAAACATGCCAAA---------------TTAAAAAACAAATTTGAAAAGAGTGGCAAAAGGTGTTAAATATTCTATTATTGGTTGTAGTCTCTGCTA-------------CTTTTTATTTTAACTGTTCCTTGAAATTAGCCGAGTTTCAAGCCAGCTAT--TGAAAATTAATTGCTGTGTGTGGACAACGCGGAATTACAACGCAACTTTTCAAATGCAACTATTCCCAATTCTTAGTCGATTTTCGAACCACCAATAG-------CTAAAGCCATA
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GAGCGGGCTCCCGGTATGCCGCTCGAGACGGTTGTATTTATAGCGCGCAGATGAGTGCGT---GTAGAAGTGTGTCCAGGGGAGTTGCAGTTGAATGCAGAGC--TGATTAGTAGACCAGAATGTTTACTATAAG--------GAGAACATTGATATTTTTTACAA------------TATGTAAATTCAGTTTTATATTATCC----TTCACATTCGCACACACCGGC
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ATAAACGATAACTTTTAAGCTG
TTAAGTCATATCAATAAATC--
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TAGCTGGATTTGACATTCAGC--------------AATACATTAATTAGTTT-------------TGTGTACATTTCATGTGTATCCCTTAATAAGCTATGATTAAA
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ATAAATTGATGGAAACAGAAAAT-AATAGTATTTATACGTCTTAGTAATTAAATAACAATTTTGAAACATACAAATTATATTTAATGAATTAATATAATACATTGCGAATGGATGATGAACATATGAAGAGAAAACGCAACTTATGTAATTTACTATAAACAAATATATTTATAGTTTGTGCTCTTACTACCATTTTTTG------TTTACAAATGTATTTTGTTTT---
>CG18811 18633578 18634292|19690 chr3L 18633845 18636450 scaffold_0 446128 449002 + 66203|0 540
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GCATTGCTTATGCTCGTGGTAATGCTCACTTGCGCAGCATTAAGCAGGAAGACATATCGGGCAATCGGTTATATGGTGGCATGATCGTTTGGCAAAAACAGGAAGCGGTACAATTGATTAAGGAACGATTGAATGCAAAGCACTATGGTGATGACTTCCACAATTATACAATGATCTGGCAACGGGACAAGCTAACACTTATGGTGGATGATGAGATTTACGGAGAGATCTACGATGGCTTGCCGTTTTTTAATGAGAAGTGTTTCATAATTTTTGGCGTTACAGTGGGCGGATTTCTCAATTTCGATGATAATATTTTAATGAACGATGTAAAGCCATACAAGAATCAACAGCCCCGCGCCGCCCTTTCGTTTTGGCAAAGTCGTGATACCTGGGCTTCTACTTGGGGAAAAAGCAGCGCGATGATTATCGATTATGTGCGTGTTTATGCCGATTAGAAGCCATA--------CATTAAATTAACAATGTTAATTTAACTATCGT
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--------TTTGACTTAAGCAAGGAAGCACAAGGTTTATTACCAATATCAATCCAC---AGATGTGATGCTGCAACCAGTCTCGACACATGCGGAAACCCATTATGCCAATCAACTTC
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TGGGTGCGACTCCTTAAAC
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AATTTGATCAAGCAAAT
G-TTACATTTCGTGGAC
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CTTTAGCTTCTAAGTTAGGCAAATAAAGTACAAATAGTAGTATGCAAATGTA
C-----------AGCCAAACAGATA---------------------------
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AAACAACAAAAACAGAAAACCAACAACAACAAAAAGCAAATGAAAAAGAAAAGAATACTTAAACATTTTATGAAATATATGTAAATAACAAAAACATAAACAAAAACAAAAGCAAACAAGCGCAAAGTTTAAAAAACAAACAAACCAACCAATCAAATCTTGATTGCTATGCGAAGAACAT----GAATTTTACATATATATATATATATATATATAAAGGATATATGTGAATATGTATGCATAAGGAAGAATGATCATCACTACCACCAACAACCA-------ACTACCACATACACACATTTGTTGATTCAATGTTAATTATTATTATTATGTTAATGACTAGCTTTACCGTATGTTTAACTAATTGATTAATTTGTCTTCGTTTAAGTTGTG-TTTACTTTTAGTC------ATGTCTCTTCTGAAGGATCTGTTC-------AGAATATTCA-----------AATTCAGCTAAAATTGTGGAAAGTGCAAAAATATCTTT-------CTTTAGAACGTAAAGAGCATAACAAATTTTATTTTATATAAATCTATACACACACACACACACACACACACACACTCAAATATATATAGCATGATTATATATATATATATTGGGTAACCCTC--CATCCCGCTCTCCCCTTGAC--ATATTTTAACAGACTTCCTAATTTTTTTTTTATAAATGTTT---------------TTCCTTTTATTATTCGCGCCAATTGTCTTACATAGTATTTGCGTCTACTCTA-----AACATAAAATATCTT---------AAACAGAGAACATTATTAAAACAAAATTTGTCATCTTCGT-GTATAACAAAAAAT-----TAATACTTGTACATTTTTTGTTTAAAGTTTAAGTAACTATCCAAGCAACTACCTGCAACACGGGAAACAACAATAACAAAAATCGAAAGCCAGAGCATGAAATTCTCTTTAAAGAAAAAAAAAAACCTAAAACAAAAAGAAAATACAAATTAACAAAAACAATGATTAGATATT
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------------------------------AGAACGAGTTTGTCGTGAATTTTAAGGCATTAGAGAATACATGATAAT-GCACTAACTA---TTAGAGTGT---GTGTCTACATATATATATATATAAATAATACTAATAGTATAG--AATTTATA---TATATATATATATATTTTAGCCGATAATTTTAGTGGTCAGTTTTACGTCTTTGTCTTTGGAAGAC--AGTCTTTTATAAAAACAAAAAACAATTAGAACTAAGTGCAAAGTGATACAAAGGTGCTATACCCACACATTCAAAAAAAAAAATAAATAAAAGGA-----------GAGAATATTATAAAACAAAAGA------AGAGAAGGAC-------AAACAAGAAAAAT-GAAAAAAGCAACGCGAATCGG-TAGATGCCAAGTTTTGGCAGTCGGAGAGCAC---CCGATAAATCAGCTAATCGAAATCTA-ATATACC------TAGGCCTAATTGTGTAATGTAATCTATGGTTTTTAATGAAACAAGCTAGCAAAAACAAAAAAAAAA
>Indy 18793891 18794481|19843 chr3L 18793539 18794431 scaffold_0 6443566 6444462 + 2467|392 999
TTGAGGAAAATTTA---GGGAATTTTAAACGAAAAGTGCCTTTGCTGACAGCGAAAAATGTGAAAAATATTTAACTATGTATACTTGCATTTCAGAGTTGCGAAAAGTTTTGATACAAAAGCATTACCTACTGTTTAGAAAAATGTGTTAAAAAAAAAACGTATCGCAATATAC---TGTTAATCAGGAATTGAACACCTGGTCTACGCACTCAGCTAAATATTTAAATACAAATTAATGTTACTTAATTGTTGCATTTAGCATAAAAATGGAAA-AGATTTGGAAAAGTTAGAACAGTTTGTTCAATGGCAGCCCTGGCCTGCTAATATTTTAAATAACTAGACTGAGAGAACTTACATA-----------TTCATACATGTTTTTC----------------AACTTGTAAAAATTTTTAAATGAACAACTCACTCAATACTTCATTGCGAACCAAAATGAACACACAAATAGCGGTAGGC-TAAGCTTAAATGATACTGTGTACATTTTCAGATGATTTATGTTTTATA----------------------TAGTTTGTAAAAAATATTAAAT----------AATAAAAAGCTCAAACGACAAT
TTGAGAAAATTCTGTGTAGAAAATTACAACGTGTATAGCGACACCTGAGTATGTCAAAAGTTAACAATAATTAGAGAATGAAACGAAC-TTTCAGCAT-ACGAGCGCATTTACTA--ATAGCCTTAACAGTTGCATCAAAAAATTAACAAAAAAAAAAGAAGAAAAGAATATACATATGTTAATTAT-------------------TGCATTTAGCGAAAA--TCAAATGT---TTTATATTGTTTGTGTATAATATGCATCAAAAAGAAAGAAACAGGCATTGAAATGT-------ATTTTTATACT---------------CTTTTTTTTTTAGCAACTAGACTGACGGAAAGTGTTTAAATTTCTTTTTTGCATATGTAATTTTTGTTTAAATTTAGACGGAACTTGTGAAAAC----AAAAGAAAA--TTACTCAATATTTGAATGCGTACGAAAGTTAGCACACAAATAGCATAAGTTATAAGTTTTATGGATAATTTGTAAATTTGCAAACGATTAATGTTTTATAGTTGTAAAGTCAAATAAAAGCTCAACATGTAAAAACTATCACATATTTTATGGCAACAAAAAGT---AGCTACAAT
>Rad9 18835303 18835611|19892 chr3L 18834511 18844757 scaffold_8 2936677 2947053 - 319341|849 1216
CTCCTCGTCGGATTCAGAAGCTTCACCGCTCACCAAATCAGCCATCATTCAGTTTATTAAATACTATTGTAAACAATTTTTTA--TTTACTGCAGTTACGGCGCTGCCAGATCAGTTAAAA---CTGCAAACTGTTGCTCACAT-GGGCGCAGTTGAAG------GGGATATT-------------CTTATGTTTGTGATATCTATGCTAACAGATCCGTAGAACTACAA-----TCATAAAAATTATTAACGGATAATGAATGGTATTAGTAACAC-TTTGCCCATTACT---------CAGAAGACGATG--TAATCTCAATAA--------------GCGCAAAACATAA---ATTTTAAAAGCA
CTCCTCATCCGATTCAGACGCTTCGCCACGCACTAAATCTGCCATAGTTTTGTTTATATTAT-TTGTTGCAATCGAATTGTCAACTTTACCG----TATTGTGTCCATAAATCGATTGACATATCGGCAAGCCGATAAAAATATCGATTGTATTTGTGGACAATCGGCAGATTTCTTTTACCCCAACTAATTTTCCTTTATTTTATACC-ATAACTTTTTACAACATTAACTTCTTTTTGAAATTTATGAATGAGTTTTTACGTTTATTTTTACCAAGCTTACTCATCAACACAAATTTATAGAAAATGCTGACTAAGCTTACTTATCAACAGACTGCGCGCATAAGAAATAACATATTTTTTAGACA
>Rad9 18835907 18835937|19892 chr3L 18834511 18844757 scaffold_8 2936677 2947053 - 319341|1536 1566
TGCACTCAACACAAAGCTGCGAGTGAAAGCG
GGCGTTCACCACAAAGTTGCGCGTGAAGAGA
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AGCAATGCCTATATGCATACATAGACATCAACAACGAATCGAACTCAAGAAACTGGGAAGCATTCATTCAAA---------------TATGCCTATACCATTTTAAACTGATGATAACAAAGACTACAGATACAG-------------------------------------------------------ATACGAAAGCGAACTG---TCTAATTTTGTA--GTATCGTCAATTCTTAGCACGTAAGAGGAGCGCAAGATACACCAGATACAGATACA---ATACACATAAAAT-ATACACA-----ACTTCAAACTGACAAGGAGAATCCTTTTGGCAGCCGCATTTTTTTATATAATTTAACC---GAGAAGCGAACCTTA--------ATTAATATATTAAC-----TATATATTTCCCTTTAAACACTTATGAGC---TAGTTCAAAAGTGGATA--------------GAAAACAATTGCGTAGTCTGAACCAAAACATATATAA---TAACATATTGAGCAAATT----------GAATAAAAAGAAAGCTTTAATTAACTA----TTGTATACTACACTCAGCGCTAGATGGAAACTAAAGTGAAGAATCAAATTTTTAA---CTATATATTA-GATACGCTA-AAACTAAATTAATGGGAATGAAATGTT------CATCGCAAATGCTGAGGAATTACTTTTAACTTACAAATGAACGCCAATCGAGAAGCAGAT-CAAACCTAATAATAAATATGGAAAAGATCAACGTC---------------------------TTTGGACTGCACTGTCTGCCTTACTA--AATACCAAATGAAAATTTATTAATAAATTGCTAAAATAATGAACTATTTCATATTAAGAGCTAAACAATAAAGTAAAGCAGCATTGTATTAAATTTATTAAATAGATTCTTTATGTAGATACGAAAGCAAGTTAACTCAAAATAATATGAAATAAAACCAA--CAAAAATACAA
AGCAAT----------AAACAAAACTAAAGTTAACCAAGTGCAACGAACAAACTAAACAGCATTCAAATTAAATAACAGCATAACTTTATGCCTAAACTGAACAGAACAAAGATTAACAAACAATACA-ATACAATATTTTGAATACCAAACAATAAGAAAAGAAAAACAATAACAATATTTATTATAGTATTTTAAAACGAACAGCAGTCAAATTTTTTAAAGTTCCGTCAATTCTTAGCATGTAAGC--AGCGCAAGA------AGATATATATATATATATATCTATATGATGATACAGATACTGATTCTTAACTGACAA----ACCACTTTTGGCAACAGCATTTTTCTATATAATTTAATCAATGACTAGCAGCTCTTATCAACAAAACAAAAATAATAACAAAGTTAACTATTTCCT----AACCCCTATGGTTCTTTATTTAGAATGAGAAAATGTTTCATATATTTAGCAAGAAATGCGTAGTCTGAACGAAAACATATACATAATTGACATATTGAGACAACTTTAAAAAGAAAAAAAAAACCAAAGCTTTAATTACCTAACACTCGTATACTACACTCAGCGTTAGTT--AAAACAATGAAAAAGAAAACATTTTTAAAAATTATATACTATGCTAAATTATAAAAAAAAACAAGGAAACTAATACGTTAGGTAACTTAACAAACACGCTTTAAGGAAAACTAAATTAAAAGTGAATTTCTAACTAAAAACAAATTCGGAGCAATTACTGAAAA--AAAAAAATAAGCAGCATACTATATATATTTAAATAAATACTACTTGGACTGCACTGTCTGCCTTACAATTGATAGAAACCCGTAGTCGGACACAAAATCCAAAAAGTAAATCTCTATG----AATATGCTCTAAACA-TAAACCAAA----CCCTATGCTAATAATA----ACATATTCCTTACATAGGTAAAAAAGAACTAAAGTACGCGAATTTATGCAATGAATTCAAGTTATAATTTTAA
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AGACTAC--CCCGATACTCCTCCTTCCC---CCAACATATCCCCCACACAAGCTGAGATATCGTACGTCAGATACGTCAAGTGCATTTATGCGTGGGAACCGCTGGAACAATTTTGACGGCCATCCGTTATCGGTTCTCACCATGTTAACGTAGCATTTACCACTTAGTTGATTCTGTTATGCATATTGTATAAAATACAATTAAAATATATACACATATA---AAATTT
GCTATACAATCCGAGCCCCCTAATCCCTAAGTCTACATATAT------AAAGCTGAGATATCGTACGTCAGATACGTCAAGTGCATTTA------------GCTGGG------CTGGCGAATGGTTTCTATCGAT--------CGTTGCCAACGCATTTACAAC--AATTTTTTTCCTTGTTAAC-TTGT---AAATACAATTTAATTGTAAAAAGAAACACACACACAC
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AAAACA-ATTCCACGGCCAAATTGTTAAAATTAACATGTGCTGTGAAACAAGTATTGCTCGCA-GTTCAGATGAGCAAATGACAAAATC-------AATCTCATATTATTCTGAGATAATGAAAATAACATACATATCCCAAATTCATGTACATGTGTAAACTATGTGCCTTTTTCCATTAACGACACAGATAATCGTGAAATAAAGCATTTCACTTTGTTTCTTATCAAAAAAAA
AAAACGTATTGTGCGACAGCATCATTGACAAT-----------TGGGTCAAGTGGTGCATATATATTCCCTTGGACGGATGACAACACCCCCGAACAAGCAACAATCTCTCTTAGAGAA---AAAGGTCGAACTTTTTGCGGATTTTTGAATTTGATTTGATTTTCAGCTCCTACCAACTAACAG----GGTATTTGCCCATTAGAACATTACACTTTTTTTTTTGCCAAAAAGTA
>CG3893 18865846 18866159|19914 chr3L 18866073 18866783 scaffold_8 2969809 2970552 - 14847|0 89
TTCGTGTTCAT--CAAGAATTACTCCCACTGCCAAAGAACAAAAACCAAAACATTTTATCGGGGCTTATACTCGTTAT-TATAACCAAAA
CTCGAATTTATAGCCAAAGTT-----------TAAATATATAAAACATAATTATTTAATGCATGCATACAATCTATATGTATATATAAAA
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TTGGTATAATCATTGGAAATAAAATTCTGAAAAGTT
TTGTTGCAATTTTTTTGAATATTCGATTAAACAGTT
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AT---TTCACAATTTCACTTACAGGGCGGACCTTTGGCCACGAACATCTTGCATATCGATATTACCCTATTGCATCGTGAGAAATGCAAATGCATGTTGATGACCTTTAAGGAGGAAATGCTGTGCGCCAAGCATCGTAATGACACCGTCGATCAGAATCCCTGCGAGGGTGACGAGGGTGCGCCCATGATCTTGAACGATACTGTGTATGGTGTCGCTGCCTATCGGCTGGGCTGTGG---CAGAACTCAGCTGCCCTCGGTCTATACGGATGTGTGGTATCACATAAATTGGATCAATAGTATAATGAA
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ATTAGCTTAGATTGAATTAAAGAATTTTTTGCGAATAATTATACAT
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TTAAAAACCTTAAGCCTCTTACAAAATGTAACAAATCTAATGTAAATACTTCATAGCAAAATG-GTCCGTATTAATAAGAACA-ATAATAGAAATTAATCTAAATGTGTAAAATTTAAAAGGCGTA------GTGCATATC-CAGAATTAAATAAATAAACACAATAGCTCTCCAAGAGATACCATTTTTATGTTAATAACCCAGTAATAAG---TTAACAGATAAAAGACATTT---------TATTGCGCAGCCCAAATAAAAGCTTTAAAATAATTAAGC------ATAATAATAATCGCATGTCTACCCAAAACCAATAAAATAGCCCTAACAAAAGTAACAGAAACAATAAG--AGTACATATTAAAGA---AAATAAACAATGAAAGATTTAAATGAT-TGCAAAGTGCTAAGGAAATTACT-TTGTAAATACTTCCAGCTATCTCAAGTTGATGTCAGTGACGTACAAAAATTGAAAAAGCAAAATAAACCATATCTATAAATGTTGTA-TATATAGTAAGTAATCTTAAGTACAGCTGCGCCAAAAAAAAAAGAACACTAGACAGCCAGTTTAAAACTAACCAAT-AAATGTGAGTTGATGTATACC-----TTACGATAAAACCATAATAAACCCTTGATATTTGTG
TTAAATAAGATAAGCAACTTTCTCTCTATCA-AAATAGTATATAAATAT---------AAGTGTATTTGCGATGTTAAGATCAGATAAAAGTTATTAAGGAAAATACTTAATACATAATTATCGCACATTTGGCTCTTATCGTTGAGTCACGTACAAAAGCAAGGCAAACTTTAATTTATTTTTTTTTTTTTTGAGGCTAGCCAGAAACAAAGCTTTAAAAACTAACATTGATGTCCGAAGGGATAAGGCAAAGCTAAAATTAAATATTTGAATTGCCTGAGTGCGTTAAAAATATTAATTGTAAAT-------AAACAAATAAAA-------AAAAAAAACGA-ATAACAAATCAGCCAGTTCATATTTATTATCAAAAAAAATAATAAAAATAGAAAACAATATTCATATCGCTAATTGTATTATTATTGTACATA-----------------------------ATATACATATAT-------------------ATACATATATATATTTAAGTATATACTTGCTAA----AAGTACAGTTGCGCCAAAAACAAAAG-----------------------CTAATCAATTGAATGTGTGTTAATGTATACCCGAAATCAAACCAAAAACTGAATAAACACTTGATATTTGTG
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ATCAAAACACCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTAATAAAAATGGGTTTTCCCATGGCCAAAATCATATAAT--ATAATTCCAAGCGCCGTTTTTGGTCCACAAGGTACATTACAGTCAACAGAACTTGAAACATACTGTCTCAATGTCAGCAGACACTGCAGCTTTAAATGTAAATAATTTACATACAATATCTTCAAGTAACTAAAACACAGATCTTTTCTCACTCAAGCTACAGCTTTCACAATATTGCGAAAACTCAAATGCTA-TAATCTATGCCATGGCCATATAAAGTTTTACGTTCTATATAATTTAAAGTAACCAAAAAT-ATAAAGAACAATATCCATAAAAAAAGAACATTTTCTTTTTTTAAGATTT
ATCAAATCGCTTGAGGTCCTCCC--------AACAAAGAAGG-------CACAGCGATCAGCACGTGACAAATAAATGTAATAG--GTATCAAACTTCAAAAATGAATAACCATTTA-AAATATAAAAACATAATATATAA-----AGCAAACATTTGAGA-AGATATGCAAATTAACAGCAGACTTGACCTTTATTAAATAAAGACAGCGAGCGGGGAAAAACAAAGATGCAA----GAAAAGAAAAAGAAAATTCAAGTGTAGCTAATTTCCATTGCAAATAAGTTAATCTCCACATAGTCCAAGACCTAATCTAATCTAAGCTAATATTAAAAGGCTGCCAAGCCAAAATAGGATTAGTTTGATTCACGATTT
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GGGGAGGGAGGGCCGAGGGAGGGAATGGGTCCGTCAGGCGGGTAATCATAGTCTAAGCACTGGGC--------TGAGCTCACATCC--------------------AAAAAAGAGATTCAAG----CTTAAAATATGTAAATAATTTATACTC-----TTGCCCAAAATGTAAATAACTAAA-----------AAACAAAACGTAGCAATTAAC---AAATTGATATTT--TCTAATAATCTATGC-CAATGTGAACTCAGCTTAAGTCCAAT------------------------------------TGAAGCTATATTTGTATTTTGATTTAAGCTCACAAATTGTTTTTT---TATATTTATTAATACTATTATATA--------------------------------TTCAAATTTGAAGCGTAGCAGAAAATTGTACAGAAAAGGCGTGCTCAG-GGATGGGAACAATGATAGATGTATAGT--------AAAAATTCTATAAAATGTAAATCAAAATTAATTTTCAACTAAAGCTAGTAGGTCAAGTGATATCCAGTTACCGATCTTTT-----ATCGCTAATACTCTATTTATTTTTGCACTTTGTTCTGCAAATATATAATGTTG--AAACAAAAATAAAACTAAAAGACAATGACAAGAAAGCAGAGAAAAATGCTTTAAAAAATAACTTAAA-------------AGAAAAAAACAAAAACA-AAAAAAATACCTCTTACAATATGTTTATGTG--------CAAAAGCGTTTGCAGAATTGTATATTATTAAAAGTACAATAATTTTTCAAGCGTGTTTTATATAAATT
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GTCAGTTGCGATTCGCTGAGACACCCAATATGTCTCAGTACCTCCTATCTGCCGCGATGCTGCCCTCTATCATTGTCTCTCTTTGTGGCGACTGCTCTACGACTTTTATTGTTTTAAATTGATTTAATTGTATTTACGCTGT----GCGACGGGGAGGAAGTGGAAAAAGTGACAGAAGCGACTTCCTATTTAGCAAAAGACTAAGTTTAAAGCCCTGTTCAACTCGACATAGTCCGACATCCCCATCAGTGTTATTCAGGCCTCTGGAGGCCCCTGTGTGCGTGATAAGAATCGCTGCTCCGGTGGAAGTGTGGTGCTCATAAAGTTCTCATAAAGGTGTAGAAACCGCGTGAAAAAACAGCTGAGAGGTGCTACAAGT-CCAACGCCCCCTCAAGGGCAA-ATTGATGAACAACGACCCTGACAACGATCATTGATCATGTCCGACCAGGTACCAGTTAACGATTATTTCATAGTCTAAACATATGTTCTAT----TGTTAAAAGTAGAAAGGGT
TGCAGGCCTCTCTCGCCTAGCGCTCCTCTCTCTCTCGCTGCTGCTTAT----CACGAGGTTGACATCCATCATCGGCTCTTTGTGCGACTGCGG--CTACGAGTTTTATTGTTTTAAATTGATTTAATTGTATTTACGTTGTTCCGGCGTCTGGTACGA---------------CAAAGTGACTTCCTGTTTAATAG----------TTTAAGAACTGT-------------GCTGAACACTTTTCTCAGTGCACGTCAGTTCT-TGGCGG-------GAGCTTGATAAGAAG---TGATTGCAAAAAAGTGCTAAGCGCGTG----CCTCCACAAGCTGCAACTCCTAAATTCGACAAAGACTTTAAAGTGCTAAAAACAACAACCAACTTCCAAGGCCAACATTAATTAGAGGCT-------CAACGATTTCTAGTGGTCCCCACGCAAGAAT--------------------GTCTGAACAGGTATGCTATTTTATATTAATAATAAAATAGAT
>CG3808 18963767 18963781|20027 chr3L 18963198 18965841 scaffold_8 3081851 3084329 - 85921|583 597
CGTGTTTGTTGCCGG
------TGCTGAC-G
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TCATGCGCCTTTTGCCTTAGCAACAATCGAA---------------------TCG-CCGCTTCGCT-ATGCTACATGTTGCAGAAACACATATCACTATCAGAAACAACATGTTGCCAAGAGCATTTTGTGTT---GCTGAGCGTGTACGTGTAAACTAATGGGAGAAAAAC-----TATTGTTTAGTGCAAATTATT-------------------------AAAACAAA-----TTGTTGTCTATGATAT-AAAGTTTTATGCGCCGCTTTTTACGTGTTTAGACAGAGAGCAACAGATG------------------------------------------------------------ATTGTAGTGGAACTATGGCCGCCAGTTTAAGTTAACTACCGATATGGATCATGTATATTTATGTTATCTAAGCCAATTAATTTAAATACTATTCTTAGTTTCTAACACTAACC----CCAAACAAGACAAGAAACAATGCAACTAAGTACTAAACCACAACGACCACCAACACAAATCGTAGTTCAATTATTATTTTAAAACTTGTTTTTAATTAC-ATCATC--TGTCAAACAATCGAGTTACCAA--TCCAATCAATCAAACAAACAA--AAGAAGCACAAAAACAA----AATGCATTTAACTCTTATTTACATAAAAAAGACTGATTTCCAATTAAACAATATATTAATTAATTGCATATGAATAA--------------AGGTATATATAAATATAT-------------------------ATAGACAATTTATGAGAAATACTAAATAAATTATTGAATTGCTAAAA
TTGTGCGCCTTC-GCCTTAGCAAGAATTGAAAATTGAAACATTTAAAAGCCATCGATTGCTTCGCTTATGCAAAAAACAGCCTAGCAACATATCATTGC---------------------AGTACTATGTGTATAAACAAAGCAAATTAACATAAACAAAATGAAGAAAAACCCAACTATTGTTTAGTGCAAATTATTCACTGAAAACTAAAAAGAAAAAAAAAAAACAAACATATTTGTTGTCTATTATATGAAAATTTTATGCGCCGCTTTT-ATGTGT----ATAGAGAGCCACATTTGTCTATAAATATTATTATTATTATTATTATAATTATAACTATTATTATTATTATTACTGTAATTCTTGTGGAATTATGGCCTCCA-TTTAGTTTAGCTATGGA-------CGCGTTTATTTATGTACTCTTA------------AAATAATATT--TAATTTGTAAAAGCAACAACAACCCAACAAGACACGCAACAATGCAACAAAAAA-------------------ACCATAAATTATAGTTCAATTATCATT-----ATTTTTTTATTATTATTATCATAAATATTATATTATTTTTTTTTAAACGTTTCATCAATCAATCAATCGACAAACAAGCACAACAACAACAAAAATGCATTTAACTCTTATTTAAATAAAAAAGACTGATTTCCAATTAAACAATACATTAATTATCTGCATATAAATAAATACACATATATATATATATATATAAATATATATATATATATATAAACACACATATAATAGAAAATTTATGAGAAATACTAAATAAATTATTGAATTGCTAAAA
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ATTTTGTTGAACAAAAGGACACACATTAAGAAAAA----AAAATAAATAAAATAAAAACAAAATAA---CAGAAATCAAATACTAGAGAAATCATTTTTTTTTTTTTAATTCCAATCTCACACACAAAA------CAGAACATGAAATCAAATAAATACATATTTATAT-------ATATATACAAATCCTCAACTAAATATATGAACATGTATGTATGTA---TATCTAGCTAA---AGAATC---------GCACAAA
>nkd 18968991 18970181|20032 chr3L 18970063 18973865 scaffold_8 3088267 3092296 - 104606|0 120
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G---------------GACTGCAGACCA--TAAATGTTGCTTATGTT----TCTTATGATTAATGTAGCGCAATTTGTAATTTAA--TTAGCAT---TTTACTAAAACCCAAGATGATATT
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GCATCTATAATCCGTGTCACAAAA------TCGATCCACCATGCCTATATAAACCTATACATAAAAATATC----GTCTA-------GTGTTAAGTGTGAT--TTTTTGTTAATACATGTGGTTTTATATTTCGATAAGTTTTAAAATTTA---TAAATTGTATATATCTTGAATATTTGTATTGTGTGTAAAC-----GAACGTTCACACTTTGAACATAGGATATTTGTACTGACAAAGTATAACAATAAATTGGGTACTTGAAA
GCAATTACAAATCGTTTAACGAAATTGTAGTTGATCGATCAAGGCCACGGGGAGGGAGAGGGAAAAGGATCAAAGGTTTACTAAATTGAAATATTTGTAATCATTTTGGCTGAGCGATATTGTATATTTTCTTTATAA-TTTTATAACTTAAGCTGGCTTCAAAATATTATATATATTTGCAAATGAAATGAACATGGTGTATGTTCG-ATTTTTAAGTGGGGAAATTTCT--TGATAAACTTCGATTGTAAACAGTTTGTTTTATA
>CG3797 19025028 19025533|20096 chr3L 19025454 19026352 scaffold_8 3145258 3146204 - 26210|0 100
TGATATATCTCCACAC---------------------GAAATATATTACTAAACTTACGGTGGATCACATAGAAAGGATGCTCGTCTCGGTTTCACATCCT
CGATATATCTCTAGACTTCACACCTTACCACTATACAGACATATTTACTTATATATATGTATGCATATATAAGAAAGATA--TGTATTTGTCTAATATCTC
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GATCAGTGTGTGGGAAAGAGTTTTGTTCTGCCGCCCAGTCAATGTCAGGATTCAACAACAACAGCATTTGCGGTGGCGGCCAGCTCGCCGCCACCCATGGCCCTGACATCCAGCAATGCGGACAACATGTCACCAGCCAGCACCACCAGTTCATCCACCTCGACTACAACCACAGCCGAGGCTGTTTCAGTTGTTGAGCTGGTGCCT-------GCCAG--------CGCTGTGGATTCCAACAGCGAGTAGCCGTAGTTTCTGGATGCGGACAAGTAGAAGCAAAACTCATTTTCCTACTTTGGTTGTCG---AATACACACAGACCTAATAAACAAAAGAAACACACACACTTATCTATGAAAAATAAAATATAATATAATTATAATAATAATAATATATAATTTCTAGTTAATTTTGTAAGTCTAACAAAAAAGAAAAACAGAAAGAAAG-----AAAACAAAACAAATACAAAAATGTTGAAAAGCTACAAAAATATGAAGAAAACGAAAAGATTTGAAAATCATTCACACTAAAA----------GAACATATATAAAATATATTTATATATAATGTATACATACT-TATAAATATATAAAAAAAAAACCTTATGTACA---TGTTTGTATTTAACTCGTAAGCCAAGTCAAAACAAGTTGAATATAAAAG---AAAAAAAAATAACTTAATCATAATAAAAAGAAAAACACGAAACGCGTTATTTATAAAGTTTAAACTTAAACAACAACAAAAATCTGTTTTTATGCGCATGGCTTTTTTTTTAATTTTACTAAAACCAA---CGTTTATAAATTACATAAATGTATAATTGTTATATACACGTAAATAAGAATACAATTTATAAAATATATTCTCTAATACAAATACGGGAAGCCAGTTTGAATGTTACAAAAAAAAAAAAAACAAACATTTGAATTTGGCAATGAATCGAAAAACTGCAAGCAAAAAATTAAACACTAAAATGAGAAATAAACTAAAAAGAAAACAAATATTTTTTTTTGCTAAAAGCAACAAATACCAACAACAGCAATAAAAAAATAATAGCAGCAACTTATTGTTGTTGGGCTTGGTTATTTTTGCTAAGGTTTTAGAGGCGGGATTTGGCAGCCCTCCAACCAAAAAATAAAATTAACCGAATTAAAATAAGCTAGTTTTGAACTAGTTTTTAAGTGTTTTTAAACAAAACAACAAATTG---AAAATGATATTCTAAATACGCTGAAATGTGCAAAAGTCGAAGAACG--AACTCAGAAGTCGCAAGGCAAAGGATTCTTATGT--------GCATGAACTATATGCTAGCTATATATATGCCTATATAGCTAGTTATATGCAGTC
>CG10419 19064378 19064739|20139 chr3L 19064739 19065576 scaffold_8 3181536 3182424 - 27500|0 0
G
G
>fz2 19108157 19109460|20183 chr3L 19107430 19108586 scaffold_8 2568888 2570062 + 30561|819 1293
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AAACTATTTGCATA--AGATTCTAGTCCGAAAAGCCCTTAAAATATTACCAACAACAACGACGACAACAAAGACAAGAGCGAGCGAGGAGAT-----CGAGAGTGGAAA---AGGCTCTCGTGCAGCACGAGAAACCGGAGGCGCGTGTGTTCTGCA-GCCATTGG---------------------------AGCGGCTTTTCT----TTGGTTCTTTCCATTAG---TTTCTTCAACGAAATAGACTGAGAAA-ACGAAACGA--TAAGTAAATACCATTTAAAACATAGAAGAATACCATACAAAAAGAGAGAGCAAAGCGAAAAGCATAACAACTCTGCCCCCTCACACTGCCAAGTCAGAGCCACGAGCCATATTTCGAAATTACAAGTAACTTTTAATCAAACCAACTAAACTATTAACCTTAACCTTATATATAC---------TACATATATATATATATATATATA
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AAGAAACGTTTGCATGGAATTCGTTTATTTTTTGTTAATCTTGTTTTTGTCGTGTTAATTGTATT--ATAAAATTGTCAAAAAAAAATGCATTTCATATGTAATCTTAACTAAACTCTTCTTGCTGTGTTGAGCTGTGTCACAGTTCGCTGACATCAAAGCGCCAAAAGTCAACCTCAATATCCTTAGACTTCTGCTTGTGGAACTTGTAGCTGGCTTCGATGTTATAACGCAATTCAGCAATTACGCTACTCCGAGCGCCCCACTCTTTGGACTTCTTTTGAATGTAAGTGCTGCAAAAA
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ATATTTTCAAAATCAAGAAAAAGTGGATATATTTTTG-AAAATTTCCCACAAATTTCAA
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ATTATTGAAAGTTTATAAAAAC----AATTTG
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GAGAAACTTGA
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T
T
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ATTTCCCTTCATGCTAAACGAATATTCCCCGTGAACAATATCTGTATTATAAAACTCCACAGATACGTTGTAGTT----------AAAATTTTAAAGCTTAGTTTACATTTCGTCTTA-ATTGATTCTATT------------------TATTTTTATTTGTA-CATT
>CG33062 19407198 19407361|20513 chr3L 19406864 19407561 scaffold_8 1871897 1872541 + 1293|363 526
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---------TGCATGGCT--------------AGGGCAGCATTAC------------CCCCTTTTGTATGTCGACATTACCGGTAATATCAAGT---------------------TTTGCCATAAACTAGGGCTGTTTCATAGGT-------TTTGTCTGCTTG
>CG18294 19440276 19440302|20543 chr3L 19440210 19441557 scaffold_8 1896798 1898074 + 26532|92 126
AA------AACTTTAAAAGT--AATAAAAAAAATC
AGCCATGCAACTGTGATCATTAAACAAATTTAATT
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TCCTCTATTGT---TTTAAAGCC--ATGCA----------ACTGTGATCATTAAACAAATTTAATTAAACGAACCGGCTATAAATTT-----GTATCATAAACTATTTGGATTA-------CCTTGCCTTAAGGTTTGCCT
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AGCCCTGCACGAAGTTTATGAGCTGCCCGAGGTGAAGAAGGAAATCGAGCCCTATCTGGAAATGTATAAGGAGCTGGCTGGCCACACCGGGCTCAGTTTCAATGAACCGGAAGATGTGCAATCGCTCTATCTGACATTGCTCGCGGAACAGGAATGGGGTCTAGAGCTGCCCGAATGGACCAAGCAATATTTTCCCGAGAAAATGCAGTTCCTTACCGAACAGAGTTATGTGTATAATGTGTATACGCCCGAGATGCAAAAGATCAAGGCGGGTCCGTTCCTAAAGAAGATGTTCAACGAAATGCAACAGAAGCGTAACGAAACCCTGAAGCCCGACAAACGCAAGCTCTTTATCTATACGGGCCACGACTCGACTGTGGTGAATGTGCTCTCTGCTTTGAAGATCTGGGAGCGTCAGCTGCCACGTTATTCGGTCATGGCATTGTTCGAGCTGCACAAGAACAAAGAAACCGGCGATTACTGGGTGGAGATTTATTTCCGCAATAATCCCAAGGCGCCAGCTGAAAAGTTAACTGTGCCCGGCTGTGAGTTCCAGTGTCCGTTGGATAAGTTGCTCGAGTTGACTAAAGATGTGGTGCCCAGCGAGGCAGATGCCAAGCGATGTGATGCCCAAAATGAGCAGTTCACAGAGCCGCCATTGCGTGGCCCATAG
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TTAATACCCCATTTCAACGTCAACACCAAAGGCCGCGATTC
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AGCAGT-ATTAACTATG--TAATATCTTAATATGAAGTGCTTATATAAGAGGCTTCTGATAGCTATATAAAAAATATGTATTCGCATCCGTCTGATTGCT--GTTTGATTG
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AGTATTAGACTCAAATGTATTACGGCGAAAACAAAAGTACATTAATGTGATTTGCTGCTTA----ACCTATTAACTATTATAAAGTTCATTTTGTTTGTTAATCGAAAATAATTAAATTTGCAGTACATA---GCGAAAATATTGAATACACATTAACTGCTTATCCTATTAAAAAAGGTGCCGCTCTCTGGCCATCCTTAACATATTGCCATAATTT--CTAATTA
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CAGGTAAGGCACATTCTTAACTA-TATCATTTGTAAATATAATGTATTCAGTTTTGAT
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ATGTGTGTATATATCATTAA-CAATTTTAGCAACACGTATTGAGCAAAAGGCACAACCAAACCATTCGATATAGGAAATAGTTT
A---AAATCTACTTCATTGCTTTAGTTTGGCGGCACGTATTAATC--TAGGCACAAAAAAAGCTTTGCCGATAGTCAATAGTTT
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CAGCTAAAGCT-ATTCGTAAGTTTTACAAACTATATTTTGT-TGATATTTTCTATATTAAAT
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GTTTGGAATAGCAACCGATATAATTAAATGTATTTTCTTTA
--TTGATATATAAATATATATGTATATACATATTTATTATA
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AAGTATAT-TAAAGATTTAAAAAACAAAG----AGCTTAAAATGAACAACTCTAGAGT----------------------AGCTTATTAAATAAA--TGCAATT-GTTAAATATCAAGTGTTATAATTTA--AAATCATTTTTAAATAATTATGTTATATAA----ATACGTTTGCAAAAAACTTTTCTGTGCATCTAATTGAATTCTGAAT---TATGCGAAATATAGTTTGAAATGAAAACAATTAGTTTTTCACCAGCGTCTTAACTAGACCCAAGAAATTTAA
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CCTAG--TTACGCATAGCCTAAGTGAATGCTCCTACAAC-----------------------AATTAACCGAAATCAACTATCTCTTTATATACTCA---AAAACCCCCCCCAAAACACTGTATGGTATTATCTATGTCATATGTCATACATATATGTATCTTCATGTCC-GATATCTGTGTGCATCGTCTCTTTAGTTTAAACAATATGGACAACAAATT-----GAAGCGTTGATCGCTTCACTTAAAGTTTTTCCATAACCTCAGTCTTAACCTCCATGTTGACTTGTAAGGGTTTGGGACAAACTT--------ACCCATTTGT-TTGGATGCAATTCCTA---TGCTGAAAAC--TTATGATTTATGTTTTGTTTAA-------------TTGT-----GTAAGCTGCCTTTGTAATATATTTTTTTAAAAAATGCCGTAATTGTACATTTAATTT-AGTCATTAGGTAGA-------TTTCAAACTTAAGAGCTTAACCGCAACACGCTCCCAACTAAAAACAAAAAAAGAGAAAAAACCCAACAAAACAAAATCAAACCAAAACAGAAAGAAAAAGAAAATGTAATAGAGTTGGCCTCAGGCAATATATAGGAAAAAGTGAAATATATATATATGTGTAAAGCAAAATAGT---CAGGGATATTTTTTATATAACGAAATTTGCTAAGAGATCGACGAAAATGTTTTTTAAAGAAGCGCAT----AATATAATTTTGTAGCTTGCAT-TGGAATTACTTCAATTACAACAATTTTGAAGCAATTCCATT-TCCGGTAC---TTACTTTTT------CGATATGCACAAAATTCAAAGCTTCAGTGCCTTAAAGCAAATATTTGAGAATCGACAAAAACAAGCAAAAAACAAAAAAAAAAAATACAAAATAAAAAAAACTATATAGTAAAAATATAGTTTGAAAATCTGTAAAATAGCTAATGACCGCGGCTATGACGTGGAACATGTGCGCTTTTCTATATTCCTCCCACACCATAAACAGAACTATTAAATATTTGCAATAATAGATTCCATAAATTGTCCGCTTTATTTAAATTCAAAATGATTCCACTCGAAAGCGCACATCACGCTGCATACAAATAAAAATATATATATATATATATATACATATATTATAAAAAAAAAAAATTTCAAAACGAATTACAAATTTAAAATATTTCTATATACACTCAATA-------------ATATACACGCTATATATTTATACACTAGTTGGATGTTTAGCTACTTATCATAAGATGCGTCGCAT-------GCAAACATTTCGCTACATTATGTAAAT----TCCATATTAAGTTTAAATTTAACGACTCATACGAATTAGCTGTAATCTTAATTAAAACAAAAACCGAAAAAAGTAATCA
>CG8786 19603024 19603709|20684 chr3L 19602497 19605960 scaffold_8 2064205 2067610 + 28020|554 1265
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>Oat 19612535 19612652|20694 chr3L 19612505 19613738 scaffold_8 2074995 2076267 + 57044|34 183
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AAGTTCAATCAAATAGCATTTAATTACTCACATACCATATAT-----ATAGCATTTAACAAGTTTATATACTTACAATTATGTT---TGAAAAGTCTGAAAATACAATACGTCCCATGTGCAAATCTTAAATAGTTTTTAAAGTATCTCC
>CG8780 19616061 19616480|20696 chr3L 19615280 19616976 scaffold_8 2080147 2081807 + 36980|849 1310
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AGGATCTCAATACGGATGCGTTTCTGCGCGGTCGCAATTTCTATTTCCATCAAAGCTGCGCCAATGTCATGAGCAGCTACAGGCTCAACAAGGAGCTGCTCAGCCAGGCGCAGGCTCAGCGGGAGGCGAACGCGAA------------------------------------------------TACGGCAACGCCGCGCAGCCTCTCGCCATCGCCGGCTCAGTCGCCGCAGCAGAGCGTTGCCACCCCGGCCATGGAGTAGACGGCGAAACG-----------AGCAATCAAAGCGTGAATTTATTACAGTTAATTAATTCAAAATATTGT------GGTAGCTAATGAAACAAGTTAAGCAAAACGTCATGTTAAATTGAGCATGACAAGCGCTCGCCCAAAAGCGGGCTACAGTTTTTCTCTTCCTTTCTGCGGCGTCGCCTAAAAGCGAGCAACA--
>CG8765 19649197 19650090|20731 chr3L 19649933 19651847 scaffold_8 2120365 2122279 + 51267|0 164
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AA--ACAAGCGA------AGGACGCAGAGATCAAGATCTCGATGGACT---CCAAATATGGCTAGAATGCGTTACGCGTTTTAGCTGTTAAGTGTTATTTTCAAGAATGATTTGGATTATTAATTTGATTTATGATTTATCCCTATCATTTTTTA-ACTCGCCAC
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CGCATCCAAGC---AGCCCCAATCCAA-ATTCCTACAGTCACCTACAAACTACTCGACTTTTATTATTTCAATATACTCAAGACTTCTTTTATATTGTACTCTTTATTTTGACTGTGCCGCGTTTTAAATCGCTACAAAAACGCGCTCGGCTAAGTCTGCTGTGTTAC-GTTATTAAAAAACAAAAAAAAAACAAAACAAAACAATGAAAACAAACAAAAAGAACAACAAAATTGACAAAATGACAACACAACACAACAACAACAACAACAAGAAACAGCAAACAAAACAAAACTTGTGTTTTTATATACTCATTTTTGTAGTTTTACGTTAATTTGTATGTGTATATTTAAAAAATACCTAATAAAAAATAAAGTAAATCGAAAAAAAAAAACT
>CG32209 19666236 19666609|20744 chr3L 19666562 19667963 scaffold_8 2138693 2140085 + 86361|0 47
GTCAGCGATCTTAGCCCCATGCCCCCCTTGAGCCCCGAGCTCTAACCC
GTCAGCGTGCGAGAGAGTAAGAGAGATCGAGAGAGAGAGCTCAATTGT
>CG8743 19679119 19680527|20750 chr3L 19678746 19679858 scaffold_8 2147807 2148930 + 12065|421 1222
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TATTTTA-----TATATATTTCAACAGAAAATATTCTAGAGCTTGTTCAGCTTA----AAGTTAGCAAAGCGTATATGCGTATACTTAATGCAGTTGAAGTTTATT---------GAATGTCTGCGTTGATG-CAAACAGCTACTTATTCA-------TATTATAGGGCCAGTGAAT-GGATAACCTGC--TTTTAATTAAGTCTCTTAAGGGTGAT--GCAAAAATGTTATGTATATTGTGGACAAAATGTTCATTAAAAAATCACCCAGTTTACAAGCAGCTGCCAGACTGGGTAAGAAATACTATA----TAAAGTGTTTATGGTGCATATATTTAATATATAAAATATTTACACTATCGATTTGCGGTTTTTTGAGACAAAGCAACAGACCACAAGACTAACAGCTTAAGACAACAAAACATCCTGGTACCGAATAGCACTTTGCTTAATAAATATACGAATATATTTAGCTTAAACACGAACTCAAACCGCATGATAAATGGTCAAAAGTGCCCCAAGGAGCAATTTAGTGTTAAATGCTTTAGATTCAAGTTGTTTTAAGTGCTGCAATTTTGCATGCAGCTTTTCGCTTGAAATTAACGAAATTAATGATTTTGTAGGAGTTCTGTTGAAAC-AGTTTATCACATTTAAATGAAAAACGAAAACTGGTTCCACAATTGACGTAAATTTCGTCAAG-------TGTGA---TTTGGCGAAGCGGAAACCGGGCA-GCCAAATATCTATGCGATATTTAATTTTATATGTAAATCTAAGCGCTAGT--CAACAACGT
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CTATTA
TT-TAA
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AAGTATGTAT-GCATGTGTATCGAAAACAATTACTAAATGCATATACATATTAGAGTAGCCATTAAATAACAAATATAAAAAGAACCGTCTAGTCACAAGGTCTTCAGACTAGTTATTGATTTATAATAATAATGATAATAATAAATATTATAATACTTATATGCATACCTATTGAAGCATAAAGCGCGCACACACACACACACACACAGCCCATACCA----GAAAAATCAAAATTTAATTCTCCAACTTGCGCAGCTAAAAAAAAAA------------------------AAAATTACCAACAATTTAAGCAT-AACTGAAATTAGTTATTTATATTTGCACAAGTAAAAAACAAAAAAACAATTAACAATATATATCTAAATATATAAAAGAAATGAAAATGTGTTTTTGCTAGTATGTAAATTAAGTGCGTGTGATTGTACGTAATTCTTAAGTCT---AAACTATATACAATATTTAAATACACATATATATTATATAAATGTATATATGTGTGTGTTGATGCA-AATATTGCATATATTGTTATATACTTATATACAAATATATATGTCTATGTATGTATGTGCATAATTTTATTAGCTATTTTAATTGATAATAAAAGAAATTGTGAGCAGAATTGCAGAACGCAGTGATCTGTTTTCTAGCTGTATCTATGTATATTTTTAAAAATATATAAAATTTGTTAAATTTGCCATATATAAATATAAACAAAACA
>Gyc76C 19684785 19685702|20757 chr3L 19685414 19685654 scaffold_0 5581940 5582134 + 726|0 243
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GCACACACAGAAATTCCACAGA------TATTAAACT
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GCTTAGGAATATATATATATATTTTTGCACAGATTTATTTGAAAAACAATTGTCTATAATTT
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ATTCGTCCAGCTGGAA--AATGACATCAATACATTATATGCATAATTTAAATTGAATTATATTCTTAATAAGATTTGTAAAAACTGGATTTAAAAAACAAT
>cyc 19747635 19747831|20807 chr3L 19746013 19752616 scaffold_0 1608862 1615397 + 128171|1784 1985
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A------------------------AAAAAACGTACTTTG
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CGTGGCAATGTGCGTGTGGCACTGATGCGGTATGGTGGTAATAATT--ATGATAATG---------------TATGTGGTAGTAGTTTTCTTAACTCCTGTTAAGTTCCA--ACAACCGAG-------CGAGCAAACA----------------------------------------------CCC-----CTGAATATGCAAGATAATGAAATAATACATAATTATAATAATATAAAAGAGTTCAGTTATAAAATTGTATATGCAATCGAGACATGTCTACAAGGTGTACGAAATATGCAT----------ATATTTATACATATATACATTCAATATTCATTTAATGTTAACAACAAAATAACACACATGAAAACATTGTGAAAAATTAACGAAAAGAAACCATACAACCCCGCCCAGCCCTGCCCTCCGCTCCGTTCCGTTACAGAGTTTTCTATTCATTTTCATTTTTAATGTATAATTTATAAATTTTCTGTAGCAAGAAATTAGCAGCCATGGTTGTTCACGATTTGTAAACCAATGACAAAATAATAAATTAGAAAATAAATATA-TGTATTTATATTTTATATATTTTTTTACATCGTTTGCTCTTCATTTATGC-TCAGTTATAATTATTTAATTTAATTGCATCAACTTTTTGTTCGT-------------------------------------AGGACCCA--------------------------TGCCTAGCCCTTTATCAGTTCCCAG--------AACGCAATCTAGACTCAGACGCACAATTTTA----------TATAT-------------------CGGTCCACTTAGATAATGCAAGTTCTAACTGTTGCGGGTGCTTCATAACATATACCACGGGGCATTTTCAATAAACAGTCCGTTAATCTCTAAT----GAATATAATTAACATTTTGCGTGCGTAAAGGGAAAGTATAATAAATGATATGACCAT--ATGCAATACGAATAACAAAAACAAAAAAAAAACAAAAAA-AAGCCGAGCAGTTAAAATACATATTGTGAAATAAATTGGTAACTAAATCGAAATGCATATTTGATATTAATTAATTAATTATGTATGTACTTGTAATATTAATTATTAAACGTATACAATTTTAT-AAAATAAATCATGTGCAA
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>Mi-2 19816206 19816289|20831 chr3L 19815886 19823927 scaffold_0 1660540 1668727 + 401043|339 449
GCATCTCCTCAATATCTATGTTAAGAGCATTCGTATTCCATGCAAATATACTTTA--CTCAAGCTAAGAATTTAAATTTCT-------------------------ACACG
GCATCC---------------------CATTCAAATTCCATGCAAATTAATTAAAATCTTCAGCTAAGAATTTAACGCTACGTATAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACAAA
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GAATAAACGAATCAAACAACGCAAAG-CTACTTCTGGATAAAACGATAAACGAAACAACAACAACAACAACAACAAACAGGCTGCAGTTGCAGTTGCAGTTGCAACCAATGTAAAAAGGCAAAA----AAAGAAACTATTATACATAAATATATATATATATATATATATATATATTATTATA-TAAATATATTACACACCTAATCTAGTAAAAAGCAACACC
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TTCGTTAGATTTGATAAGTTAATAATGAA--AGCAGATTTTCGATATCAGCAAAATTATACTTTTTTATTATAATTACTATTATTATTATTATTATTAGTGTGTTGTGTT-TATTTTATCCAATTTAACGTATTGGACATCTGTAAAGTCTT-----CAATTC--ACTTAACCTCATTTAAAAAAAAAAATTTAATAAAATCACAAATCATTTTCCAATTG--AGGTAACAAATAATTAAAGCACCGATATACATATATATTTTAATGCAAGTT--------------ACTTAACAATTGCTATGGACAACAAATAACGCATATTTCCATTTAAAGAATTTTAATAATTACGATTCTATTTTAAAATCA---TGTACATTGCAAAATGAATTTGTGTATGCAAATCTATTG---AATTCTATACGAATTCAATATTTATAAAGTATATTGTAATTAGCACAGAT-------------GACATTTAATAAGAGTGTTTACAAAATAATG-----AAATCCAAAACAAACAGTTTAGGAAATTAATAAACAAAAATCTA
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ATACTGCTGTGATCAGCAAACGGCAGCGCTATAGCGACAGCAGCGCCAGCATCGGCAT------------GGGAGCCAGCGGTAACGGTTCATCGACACGCAACAAAAGCAATAATCATACACTGCCAGCA------------------------GACAGCAACAACAAGCGA------------CGTCGCTCTGCCATGGAGCGAAGCAGATCGAACAGCACTGCCGGCGGCAGCGCAGCGACGTCTCATGGGCTGCGCACACGGCTCTCAGTGCC
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ATCAGTA---
GTTAGCAAAT
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TTA---------------TTAGATGGTTTTCA---------CTGTTATTATTTTGTGCATATAGAATATATGGCAAAAATATCTATTTTCTTAAGCTTCCGATATTGTTGGCCCACAGCTTTAATGATTTTGTGTTATGCATTTATACGCACATGCCAAAACAATCAACATG-----ATTTAT-------ACTTTTTGTTTTTGTTTTATGCTCACGGCTTGGCT---TCAGCAAAC---CCCAACTTCAATTGTGGAATATTTCGA-----CTTGAATTAATAACAACATTTTTCTTACAGCAAATAA-------ACAAATGTTACTGGGC--GCGTCTAACA-AATATATTTAATAAATTTGTGTTCGT-------------------
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ACTCACAGCCGCCAGCTGCGCGATGAAATTGCCT--GCCTG-------GTGCAGGCGAC--------------AGGCTGCACTTGTTGCCG--------CCCGCTGAAAGGAAATTGAGCGA-------GAGGAAAAGCAAAATACATGAAAATGAGTTTCCTTTCGG-----TTAATGACAAGCAATTAAGTGTTTAAATTGTTTCAA
>CG32219 19883023 19883472|20889 chr3L 19883254 19884219 scaffold_0 1736922 1737812 + 7932|0 224
GGATTAAGGAGGATTTTCACACTCACCCGTGGTTCCATTTTCCTGCTCGCTCAAATCGGCCAAAGATGCCGAAAGGGCGTCATTCATCCTGGCCGCCGATGACGTCATCGCCTTC------GGCTGCGTTGCATTTCCGTCGGCCTTAACAATCAGATTCGCTGTTGCATTTGTGCCATTGCCCGTTTTCGCAGTTTCCGCATTGTGATTTACCATGGCGAAAAG
GGAATCA-------TTTCGCACTTACCCGTCGTCCCATTTTCCTGATCGCTCAAGTCGGCCAGGGAAGCCGACAATGTTGTTGCCATCATCGCCGTCGTCGTCGTCGTCGTTGTCTTCATTGGTTGCGTTGCATTTCTGCCGGCTGTTACAATAATG------GATGCGTTCGTGCCATTTTCCGTTTTCACAATTTTCGCATTGTGGCTTACCATGGCAAAGAG
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TCATCATTATCATAGT--TATCATTATGAACTGTGCCCAGGCCGGGGTAAATTTAATTAAAACAACAAACGCGCGATGTTCCAAAGAAAGCAGCCGTCGCTGGAAATTGTAC-GTGGAAACGGAAGTGGAAATGGGGAGACCCCGATGTTATCGTGACAAGCCCAAATTAAGTAGCGCACGGGGTTACATCAGCCAGCCAGGGGACAAAAC-CGGCGGGTTGGGCACTCAATTTAAAGACCAAACCAAGGCAAC------------CAGCGAATATGGCCATGAGTTGGCCAGAAGATGAATGGCAACCGAGCCGGAGG-----------CTCATTTCATAG------ACCAACACCCAAAACGAAAATTTAAATACATTCTACACCCG
TTATAATTATCTTAACCCTGCCACAATGAATCGTT---------------ATTTAATTAATATAAAACAACTGCGACAAGTCAAAGAA-------GTTTCCAGA----GTACCGCGCACA---ACATGGGCGTGGG------CCCAAGCTATCGTGACAAGCCCAAATTAACTGGCGT-CGGGGTTACATCAGCCCGGAGCTGGTTAAAGCACGACCAACGCGTAACTCAATTTAATG-CCGAACGATGTTAACTTAAAGAAAGGACAGGGTTCATAGTTCTAAGGTTGCGAGCTGTTTTTTGAAAGACAAGTTCAAGGAATTACATGATTTTATTTGAAAGTAGCTCAGCTGCGGTTAACGAGAATATTTAAACAAAA---ACAGTTC
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TAAGCGCACCTA--AATGTACCAATAGAACCGTCGGACGAACGGATGAGCACTCGTAGTTATATAAAGGGTAACCACCCATTGTCAAAAGATCCATACGTAC-ATATGTGTATAGTCAGTCAGTAAGCGTTTGCATATCTGCGCAT-----CTCAAAACTCTGTATCCTGAATCTGCCTTATGGAGTGGAGACCTTTCAAGAAAACGAATATTGTATATTTTTTCTTACATGCGTAATTTCTGTTAATATATTGCCATATGTACTTATTCATATATATTAACACAACTTACCTCTCAATACATGGTATTTTTAAGGTTATTTACTTCATTTTTAGCAAAGTGAGTAAATAAAACAAACCTATTTATATTGTAAAGCTTAAAATAAAAACTGTGCAATAAATA--AAACTAAATAAACA
GAAATACATTTGCTAACTTTTCAA-------GTTTATAAAATCGATTAGAA----TATTTTTATAGGATGTGG--------TTTTAAGAGTTTTGTATATACAATGTACATATAAATATTATTTATGCA-TTGATTATATCCCGATTTTGATTCAAAACTTTAGTTAATAAACCC-----------CAAAAACCTGTCAATAGATTAAGTTATTTGTAT-------------CGTATATTTTGACGATATAATTGTTTATTTAAATTTTCTGATGAACGAAAATA-------TTTAAGTAAGTGATAATTTTACAAGAAATGTCTT--------------------------AAAGATCCATATCTTTAGAGCAATATGAAAT---AACTGTGCAATAAATATTTATTTAAAAAAACG
>CG7433 19931552 19932060|20950 chr3L 19931488 19931989 scaffold_7 5285536 5285992 - 76|66 522
GTTATCGAAATGAATAATAAAGTAAATTAATTT-TATCCCT--CTGTTAGCCATGGCGTATGTTTATCGATTTCTGTTCAAGGTTGGGACACCATCAAGCGTTTAGCTTATTTTTTCACATATGATAGAGCACTCATAATAAATTTATGATATAACCAACA-----AAAAATATATTAGCTTCCTTAGAGAAAAAAAG--------ATAGGCTAATCTTATCGAAATGCAGAGTATTAGATATATAGAACTGG-TTATAATGCTGCAATAAAATTTTATTGTTGAGTGCTTTTTCTCCTCTTTATTGGAACGTATGCTCCATGATTCCTCTACTCTGCTAGTTAGCTTTGTATAATTAAATACAAAATATGTTTAATGGTCTCACATGGAAGACCATAATACTTATATATATAATACTTACTCCATATGGTTTTCAATAAATTGTGTGACAG--AAA
ATAACAGCAATTGGTATAACAGTAAACATATTTATAACACTGTTTGTTACTCATGGC-----TTGGCTAATTTCTAT--AAGACTCGTATGT--TCAATTGGAAGACTTGTTATTCC------TGTAAAACAATTTAAATAAAT-----ACTGCACCAGTATTATTGTAAGTATTTAAGC---ATTAGAGAATTAAAATTTTAAATATGGTAAAATATTTTCCCTATGCCAG----------CACAAAGCTAAACGAGAATAATAAAAAATAATTTTTTTTTTCAAA------TTTCCTAATTTATGGCATGTAAGCC-----AATTTTCTGGCTTGCT-GTCAGCTCTCCCAAATTAAATATAAAATATGTGTCCTAATCT-----------TCACAACTGTTTTTTATGTG--------TGTAGAAAGTGGCCAACACACTTTATGACTACCAAA
>CG7433 19931552 19932060|20951 chr3L 19931990 19933296 scaffold_0 6632034 6633309 + 54391|0 70
GAAGAAAAAGATACGAAAAAGATTTAATGATTGTGCTCTGAAAATTGCAATGCGTGCAATATAAACCATAT
GCTTATATAT-TATAAACAAG----------TGTGCTCTGAAAAATAAA---TATTTTATATAATCTATCT
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ATAAA--TCAGT-------TTAAAACT--TA
GCAAAATTCAGCATTGATATGCAAGCTAGTA
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CACCAGAACA-------------------CAAGAACAATAATTTGCTCGACTCGGAAATGCAAACATTCCCACGGCCGATGGAGTTCTATAAGGCAAAAAAAAAAAAAAGAAA
CAGCAAAACAAAAGTAAAATGCTGAAAACCAAAGAAAATAATTTACCCAACT-AAAAATAAAAAGAACAAAACTGGCAAACAA----TATTGTGCCAAATAAAATAA------
>NPFR76F 19993837 19994562|21006 chr3L 19993953 19994638 scaffold_0 1741996 1742752 - 6705|0 728
ATTTTCGAAACGCATTTCTAAGCA------------------------------ACCGACGTGGACGGACTCTTATTGAATTGTGCCAGTAATTC--AAGCCAAAATAATGCAGGG-----------AAACGCCAGCTGGAATTCGGATGTCCTTTTGTAAACCGCACTCAACATGGATGGGCAGAAAAATGCTGATAAATGGCAAATCAAGTGACAACGATGCCGAAA-------------------------GGGAGGTTG---------------TCTAGCAATTGGCTGAAACAGCTACAAAAGTCA-TTGATATCAGATGTTTGTACATATATCTATATGTATA---CAATATATATTTTATGGATGGTGTATGTG-GTGTGTAAGTGGGTGTG-----------TTAATGGAGTGTGCCGAGGGCAGAACTGCCGCTT-TATACTGCTATTTTTTGTCGAATTTTCCGCCGCCATTCAAGCCGCGACAATTGCCGGGCCATTTCGCATATTTACAATGCCTCGCAGGGTG------------ATTCCAACTC---CAAATTCCCCAAAGAGCAGTT---TGCCTT-TGTCGTTTTCAATTTGTACCTACTCGCAACAACTGCCAGACGACACTTGTCGTTTTGGTTTTTGGCTTTCGCCAGTCGCACGGAATTAAATTTCGGGCGAGCTCTTTTTATCCCCAATTGTGTGGAAATATGTCAGC
ATTTTCGAAACACATTTCTAGGCGCAATTGCTGGTCCTCGACAGTGGCAAGGATATCGACGACAACAAAGT-GTAGGGGAATGTGACATAAACTACAAAGCTGAAA--GTGCAAAGTTCTAGAGTATGGGCGCATGTTGGCGTGTGGGAGT--GGCTGTTAGTCGTACT------GTGTGGCACGAAAAGTGCTGATAAATGCCAAATAAAGTGACAACGATGCGAATATTGCCGCGCAGGGACGCCAGGGGGGGAGAGGATGGAGCACAACAGTGCCCCAAGCAATTGGCTGAAGCAGCTTCTCAAATCGCTTGGTATCAAA--TTTGTAAGTGTGCGTATGTGTGTCTGTCTGTGTGTAT----------GTGTGTGTGTGTATCTAAGTGGGTGTGACTGAGCCGCATCTAGGCAGGCCCCAAAGGCGTTGACAACCAATTCTAAACATATTTTTTTCTTTATTTTTACCGCT----TTACATTCGCAGCATTCGCTGCGCCATTTCGCATATTTGCGCAGCCTTGCAGGGAGTCGGGCGAATCCATTAAAACGCCGGCATACTCCATATGGGTCGGCTATATGCGTCACCTCGATTTCAATTTCAAAATTCTGCGTCTAACTGTCGCACAA-ATGCTTCGCTTCA---CTCGGTTGTCGT--------TGGAATTAAATTT--GTTGTGCCAATTTTTGGTTCAATTGCGCGGAAAAATGTCAGC
>NPFR76F 20007948 20007953|21018 chr3L 20007162 20009987 scaffold_0 1757151 1759914 - 88581|826 831
GATAGG
GACAGG
>CG14186 20031922 20032864|21063 chr3L 20031838 20033906 scaffold_0 1782500 1784659 - 28461|84 1220
ATTTAAG----------GCGACA--------------------------------------------------AGTGTAAATATCGAACT-CTTAGCAGCTGTTGTTCAGTTATCGGCTTTTTATATGTACGGCATAATCGAAACGCAAT------AGAACTCTTATGCATA------------CCCAAAT---------------------CTTAAGCTTTAAAG---TCGTCTCTTAAGGAT------------TCACACTGATGCCCTTCGCTGGCCGCTAGAACAAACCCAAGGGGGAACCGATAATATGACAACCAGAGAACTCAATGGTTAACCTTGAAACTAGTTAACTAAGCAAATATAGTGAATACTCGTACTGTTAAAGAGGAAAGA-------------ATATGAAATACCTATATTTAC-CAGATAGC---AGATAGATGTATTCATGTACTTACGCATATATACAATATGTTACCTACATAGATATACACATAATTGATATACATTACAAACGCGAGTATAGAAATATTTACAATTATTGAAATCATT--TTACTCACACATATCGTCTTAAGATACAGAATCTTTTGGTTTTTTTTAAATCGTTGCGGCACTTTTACGGCAAAGGCTTCCCAAATTAGATCCTCAGTCGATTAGGATCGCCTAGATTAAGTATAATTTTAGCGAATGTGTTTTGTACAATATTTGCATCCCGCAAACGTAGAAGTGTATATTAGT-TATTTACATTGTTCAATTCA-AGTTTTAG---------------GTAATGCCTCTTGG-------TTACATTCTTGATTTTGCAGTTAGTAAAACATTTGTTA--CACCTTCT--------TTCCTTTAGATGCGTTTACGTGGCAGTTTAAGCTTCTACCTGAGCTGTATATAAACCGAGTGCAATAAAATAACGAATATTAAAGTTTAAT-TATACACTAA---CCAATATACAGAGGCA---AATGTAATAAAAACATATAGACAAACGAATCGATCAAAGCGGATGACAAGGAAAT-------CTCATTGTAAACTTGTATATA--AAAAATATAAACGCAAATAAACAAAAAT----------AATGTATAAAGGCAAGAAA
ATTTAAGTACGAAACCAACAACAATTTAACTATTGTATATATTAATATATACATATATATATACAGTATGTGTAGTGGAAATCTTTAACTAACTAGTTGCTGTTGTTTAGTAATTGGCTTTTTATATTGTT--TATAATCGAATATCGACTATTTAAAAACAATAATGCATAGAGATTGTATACCCAAAATGAGAAAAGGAAAACAAAAGAACTTAAGCTTTAAAAAATGTGAATATTGAACATCTGCAATTGCGATTGCGATGATGCCCTTCACTGGCCGCTAGAACAAA----------------------------------------------------AGTTTAGTTTGTTAA-----------GAATACTCAAGTTGGTAGAAACGATAGACACCACATAACTTATATGAAATACATATGTGTATATAAAGAGCTAGATATATATGTGCTTATATGCCTACATATACGGA-----------TTATATAGATATGCGTATGC---ATACATGTTTTAATATTTTAAGTAAACATATCGAC-TTTAGTGAAGATATTTATTAAATATACATAT---------ATATATAAACGTT--GTC--------ATCGTTGTGGCAGTTTAACA--AAAGGCTTC-----TTAGTTGTAAATTCAATTA-------CTACAGTAGGTATCGGTT------ATATGCAACAGAAAGCAATAAAAACTAGCAAACGGTTGAGCGGGTTTTTTTCTATTTGTACAGTTCTCGTCATAATTTTCAAATGTGAAAAATATTATAATGCAAATTTAAACTGTTTAACATAATTCACATTATAAT---CAAATCAAATGCTATGCGCCTTTTGTAAACACTTTCCGAAAATGTAAATGAATAG-ATTTCACGTTACTATCTCAAAAGTATGTAAATATTTTCCTATAAGTTAAATCCTATATATTCTTCATAAATGTACTTAGTTCCGATA-ATAGCGATATCCACTGTAGTAAATCAGATTTGACAAATG-------CAAAGAAATTTGTAAGGCGTTAATTACATGCATAATACTCATGTATATAGTATAAGTATACATACATATTTATATATATATATTAATGAATTGTATAAAAAGCGCATA
>CG7365 20058137 20058299|21079 chr3L 20057090 20059505 scaffold_0 1798465 1800824 - 54942|1175 1372
TGGGGCCCGTTCTCCTCCGTGAAT--TACTCC--CTGTGATATCGCACCTAAGTCTTCTTCGCTAGCTTGCCAGTGTATTTGTAGTCCTAATTAGCCGTATGCCAAGTGT---------AAATACAAAACTTCGACGAA------AATCAGAAAGTCAAATAAAATG---ATATTCT-------------TAAATTAC
-------CTGCCTCATTATAAAATCCCATTCCGACTGTGATATGTCGCCTTAGTCT------CGACCATACT----TGTTTGTAGTATTCATTTACGCTTCGATCAATATACGCTTAGAAATTAGAAAACTTC-ACGACTTGCCTAATGCCTAACTCAAACGAAGCGCGCATAATTTATTGGCTACCCAGCAAAATCA
>CG7348 20064284 20064417|21085 chr3L 20062798 20065769 scaffold_0 6011801 6014845 + 41954|1627 1761
CCGATTAATTCTAAGCGACATTCATTAAATATAACAATATCAGACGATAACTATAAATAAAGGGAACTAAATAATTTTGTATTTGATCGCTGTATTCTACTATCAAATAAATGTATA-TTTGCATTCAAACTGAA
CTGAATTGTTTTGGTCAA--------GAATAAAACACTTTTGAAGAAGGTCTCAGCCCCAAAGCA--TAAATAACCTGGT---TGAT-GCCATTTTTGGGTAGAGATCAAATTTAGACTTTTTAGTAAAACGGAC
>CG7328 20073047 20073203|21088 chr3L 20073111 20073460 scaffold_0 6022719 6023063 + 7215|0 95
ATATTGGTTTAAT-TCTAGC--TTAGATTAAGTCACATTGAAGGAATTTATTAAGATAAAAGCCTGGCAACAAAAATAGCAAATTGCATTAAATAT
GAACTGGGTGAACATATAGCAACGCGACAGAGTCGTAT-------ATTAATTAATTTTAAA------CAAAAATAAAATAAAGTT--ATTAAATAT
>CG7323 20083452 20085412|21093 chr3L 20083498 20083930 scaffold_0 2004545 2005067 - 1015|0 535
AAGTTCTAAATTACATATAGAGAGACAAATGAGTACATATACACACCACTTATGTATAGGGACTATATTTATATAAATGTATATGGTAAAATGAGAAGAACGAACTGCATCTGCATTGGAGGCACAACAGTTACAATATACAACCGCAATACAAAAAAAGTGTTAACTGTAT---TTTTATGTACGAATACTTACAAATATTTAGATCATATTTTA----------GCCAT--ATTAACCCGGTAACTAG-----------ATGCATTCGTGTACAA---ATATCTTATCTTCTTCTCGGATT-CATCCAAGGAGCATACGCAT---ACATAA---TATATATAGTACGTGGTACTTAGAAGTTGAACTTAAATGTTATTGCAA----------------------------------------------CTATATCTACTTGCA-----------ATTTATTTACAAAGGAATAAAAACCTAATACAAAAAC----------AAAGAGTAAAGTGCAAGAAAGCTTTATTTACAC
AAGCATTAAATTGTATTTTAGAAGAAAACGTATTTTAAATACATATT--TTAAATATA-----TATACACATATACATATAC-TGTTTAAATAAATAGCTATTCCCACAGTATTATTTAGTGTGCAAT--TGAAAATGTATTTTTAATATATATTTCTAATATCAACTCTATGGCTCTGATAAATATATATCTATATATATAAAGCTGGGAGTTTGCACTCAAAAGGCTATCTACTATCATATTAAGTAGTATTTTAACCTATGTATACCCTCTCAATTTCTTTCTTTTTTTTTTTTTGGTTTATATGCAAG---CATATATATTCGATATAAAGCTATAAATTCTTGTTCATAAATGGAACTCAAGCTTGAATGTTTTTGCAAGCAGCCTCCAAACGCAATCTACCTTTATATTAACAGACGAGCACATCTATATATACATATACATATATATATATATATATACATATGTATTCATAATAAATACAATAACTAATCATAGTAAAGAGCGTAATACAAAATAGCTTTATTTACAC
>CG32223 20102513 20102571|21104 chr3L 20102330 20102517 scaffold_22 1078013 1078191 + 1961|184 188
AGAAA
AGAAA
>CG7306 20134284 20134330|21128 chr3L 20134205 20134291 scaffold_19 1673234 1673326 + 1756|86 93
GCACACTG
GCATGATT
>CG7306 20134284 20134330|21129 chr3L 20134323 20135674 scaffold_0 6058903 6060159 + 24064|0 7
TTAATAAA
TAAATAAA
>CG7298 20135906 20136038|21130 chr3L 20136028 20136576 scaffold_23 1457806 1458355 - 4936|0 10
GCCCAATTATC
ACTGAATTATC
>CG7017 20144276 20144523|21138 chr3L 20143945 20144419 scaffold_0 1998840 1999268 - -1561|360 505
TTGAAAGGAATTCATGTACTTTGTGGTGGGAAGTGTTAAGTTTTATGACATTCATCCATTTACTTTTTACCATGGAAATGGGTCT--ACAAATATTAGCTTCTCGAAAAATGTCCAATAAATGTGTTACTCCATTGAAACCTGAAA
ATCGATTAGATAAATTTACTC--------------ATAAAT------ATACTCATTTTTTTATTTGCTAAC----CAATGGACCTTGATATATATTATTT----------------ATATATATAT-------------------A
>CG7017 20144276 20144523|21139 chr3L 20144420 20144491 scaffold_0 6063568 6063635 + 1437|0 71
CCTTACCAAATCGCATCCAATTTAAATATCCAATAAATCGATCCAATTCATGGTGGAGGTCAAATGCATTGC
CCTT--CAAATTGTAATTAATTTTA--ACCAATTAAATCAGACATAAATTTGGTGTTAGTCGAAAGCATTGC
>CG7017 20144276 20144523|21140 chr3L 20144522 20145599 scaffold_0 6063668 6064758 + 37778|0 1
GC
GC
>CG6933 20152343 20152455|21142 chr3L 20152204 20152475 scaffold_0 428273 428546 - -1268|163 278
GCATCTCCTCCAGCCACGTCTGTTTGCCGAGATACCTTT-TATGAAATATATAAATAAATACCAATGCTGAAGGCATTC--AAAAGAAACTAATAAAAATGTTGACTTCGACCAAG
-------------------TGGATAGCTTAATTAAATTTAGGTTAGATTTATGAGTACCTACTAATTGTAAATCTCTTATGTAAAAAAATATATACATATGTGTATATAAACTGTT
>CG17233 20167016 20167311|21153 chr3L 20166906 20172819 scaffold_0 1974449 1980308 - 162217|113 461
CATTCTGTTTTGC--------TAAATTTCAAATTAAGATTTATTTGGTAGCAT-TTCTTAAGA------AGATAA---------TTTACCTTAAACACCCGCAAACAATCAAATTGTGTTTTTCTACCGACGTGGTAAG-------GAAAACATTATCAGCATCAACACTATACATACTTACTAATTGTACAT----ACTTAGTTTAAA-----------------CTCTAGTTACACAATCCAGTTGCAGACATTTAGTTAACTTTATTTGT-TATGCGGATTTTAATTTAAGTTGTGAATTTTTAGAATCTTAGAGTTCCCTGAATAAATATGAAAGAATCACATAT
CACTTTTAGTTGCATACCACATAGATTT----TTAAGTTGTCTTTGGCAATGTGTTTTTCAGAACGCATAGATCAATACACTTCTTTATGTTTTACCGACCAACACATTCAAAATTTGCATAGAATCGGTATAAGTAAGCGCACTACAAAATAGTTTTAGCACCTACAGTATAAATGAATTTTAACAATAGACAAAGACATAGTGCAGAATTTATGGTTTGCGGCCTTTTATTTTTAATGTCCA--TGACCGAAGTTATTCTATTTAGTTCTTATATATATATTTAAATATTAGCTGTACAATTCAGTTGCTTTCAAGTTCATTCAATAATTG-AAATAAATTGCTTGT
>CG17233 20167369 20167708|21153 chr3L 20166906 20172819 scaffold_0 1974449 1980308 - 162217|533 897
AAGCCATTGTTACCAGGACCCATTATCAGTATCAGGAGGTCTCCTGATTGCG---TATCCAAGTGCTGGA--CATTAGGACATTAAACGCCAAGCCCCAC-GTAATGCTGCAATAAACTCAATGAGTTGTTATT--TTATTATATACCAGAAGACACGCAACAGCTTAGTTTTAGTGCAAGACACATATTGTACTGTGTAGGCCTTTAGTTTAAGATAGAG------TCTATAGTCTTGGACAATGCAAGTGCATGCCATGTAAATAGCTATACAGATAGCTATAGCCGCGCATTATATCGTACATATATATA-----------TATATATATATATCGAACTTAAAGTACTAAATAATAGAGTA
---------TTATCAATAGCAATAATAGGCTTT-----GTTTACTTACTGAAGGTTGTTCTGGAGCTGGAGCCGCTTGAATAT--ATTATTAATGTATACAACAAAGCTGCAATAAACTCAATGAGTTGTTAGTTATAATCATATAACA----------------TTAATCTTA-----------AGATTGTGCTAGGACGGTTTTTCGCATTGCATGTCGCAGTCCTCTTTAGTCT---GCGATCCAA--TCAAGCCATAT-----GTTATACACATCGC-ATAAGCACACACTATGTTAGA-GTGTTTATGCTGTGACTGGTTGTAGCAAGGTATAAAACTT-ATGTATATAATATTATAATA
>CG32227 20202700 20203285|21179 chr3L 20202690 20205110 scaffold_0 2483716 2486035 - 62264|10 613
CACCAAGATA-TAATTGTACATAAAACCAGC-ACAAGAATAGCAGTATATGTTTAGTATAGTTTATAATACGATCTTGTAAAATACGGGTAAATATAATATATACATATATCAGCACCATACGAAACGTAGACCACCTGGA--------GTAGTAGTTGTGTTTTTAAAGCTAGGATTAAAGA-TCGTCTCAATA----ATATGTAAACTTGAAAATCGAAAAGAATATAGAATGTAGTCTCCACAGCTCTTCTTTAAGCCTAATCTGTTCAATCTCTCGTTACACTGTACATATATAAGTTAGCTAAGGCTCACTGTAGTTTAAGTATTTATTCGCACTCGGCTATGTACACAAACCAGTTTATATTGATTTAATTAATGGATTTTATTTGGCAATTACTTGAATTTATAATTAGAGAATTGGAATTATGAAA-TTTTGTGATC-TTCATTTTGTGCTTGTAAGCATTGGAAAAATTCTAGTCAATACATTAGTCAAAATTAATTAGCATTTAAAATCAAAAATGTTTTTGTTTCTAA-CAGTTTTAAAGCCTTTCTATATCACCCCGACCTGTAAGATAAGAAAATAAATAATAATGAATGG
CCCCTCGACAGCTGTTGTACATAGAACGGGCGAGCAGAACAACA-TCCAAGTTCA------CTTAAGATAGTATCT-----GTTACGGGTAGATACAA---------ATATCAGCA--ATACGAGTATAGGACCACCAATAGGTTAGATGCAAGCGTTGAGTTAT--AATCTAGATCTAGGCATTCATTCCAATAAAGGACTTTTCAATTATAGATTCGAGTAGAGCTCAAGTGGTTA-------AGGGATCGTTTAAATTCACACTAATCGCTAT---ATGATATATTATGTATATAAGTGAGATATA--------------------------------------------ATACCTAGTCATTCAGATTTAAGTCAAAGCTTTGGCCTCTCTGGT-CTTTTGTTTATAATTAGAAACTTTTGATTGCGGCCTTTTTGTGATTATTCATTTAACACGT----TCACTTAACAAAATC------------TAGTCAAAATTATTT---ATCTAATATTCATTTAGTGATTATTTTCGATTAGCTGTACTTAGTTCGTAGCTTACATGAA-----AATAAACAGAAATAATAAATCGAAAATGA
>CG17122 20207225 20207298|21182 chr3L 20206806 20209495 scaffold_0 2487085 2489707 - 78882|422 496
AGGGATATGAAAATTGAGTTTACTTGTAGTTCCAATTTTGTTGAGTCTTGAATAAATATGTGCAAAGT-CAAAAA
ACACAAGAGCA---TGCATTCAATGATTGTTAT-ATTTTGTTTCGGC-TGAACAATTAAATAAAGGGTATAGACA
>CG32226 20230970 20231300|21199 chr3L 20229682 20233121 scaffold_8 2930278 2933696 - 117635|1348 1751
TGGAGTTGAATACTTTATTTGTGCATTCCTATTTACTTACGG-ACGATCCTGTTTGTTGTATTTATTCATATTTACAAGCTTATATGTGACCATGCC-----------------------AACGCTTTTTCCAAAGTATATGAAAATAAGA-----------------TGTTTCCTATTTAAGCTATTTGAAACGTATTATTTACACAT--ATTTATTTATAATTTATAATAATAATTTATAAAAGTATGTATCTAAGTCAAAT---GTTTAGT-TTAAGTC--------TTTTGTTTAGTTTAACAAATCCAGCAGCCGTGATTGTATTTCCTTTTTGTAAGCAAATATATAATGAATTACGAGAATA---AATATATGTATGT---------------GATG
CCGTTTTCAGTA-TTTATATGTATACTC-----TGCACACGGAATGGGTATATAGAACGCATATACCTTAAACTTTAAGACGAACAGTGACGATTCAGCAGGCAAAACTTCAGCTGCTGGAAAACTGTGTGCAGAGTATAGTAAAGTCAAACTAACTTGACTGCAGTCTACTTCCTTTTTTCATTA--TAATATGAAAAGCTTATACATCAGCTTAATTGT-ATTGAGTGTATTTATTTCCAGAAGTCTGTTGTTTTATTAACTATAATTTATCATTAAGCCTACAGCCATTTCGCTTGATGCAGCATATTTA-----TATATTTATTTTTCTGAATTGT---CTTATATATATTAAATACCTATAACGTGTAATATGTTTACTTTGGTGGTAATATTTAAATC
>CG5585 20279572 20279926|21229 chr3L 20279632 20279870 scaffold_0 5530039 5530304 + 6614|0 265
CCGCCTTGGGATTCCGACCTTGACTGGCGAAAAGCACCAGGCCGGATTCCATCTCCAAAATCAAGTACAGGAAGGG-----------AAAACT-------CGCCATTCTGCTGCTCATCAAAGACATTGTCACAGCTGCGACAGTGGTTCCCTCTTCATCGGCAATTA-TTTGGTAGTTTGTTTGCAGGAGT------ACATTTCCGGTGCCATTCGGTCCAGTTTGCCCT--TTTTTATTGAACAAATATCGGACGCCCATATAT
TCGCCTTTGGATTTCTCACTTGACCGGCGAACAGCAACAGATTGGTTGACTTCTCCACAATCATATACAGAAAGGGTCTGTTTAGCTGGAATTTCGGCGGCGTCGACTTGTTGCTCAGCACGGACGCAGTAACAGCTGCTGCGGTGGTGCCCTTTTCATCCACAATGATTTTGGTAGCATGAACACAGAGATTGGCGAACAAACCATCTGCCATGCGGCTTAGATTTGAGTAGCTTTTATCAAATAGATCGCGTATGCCCATCTGT
>CG5585 20279572 20279926|21230 chr3L 20279923 20283132 scaffold_0 5530365 5533471 + 91529|0 3
ACAT
CGGT
>DNAprim 20293671 20293746|21242 chr3L 20292433 20298747 scaffold_0 5545543 5551807 + 191667|1268 1421
ACGTTGTACA-ACATAAATTAACTAAGGTACATATAT-------------------------------------------ATTTAAGCATCGTA------AATAAGAAAAGTT----------------------------ATATTATTCCATG
TAAATATAGATATATAAATGGAATCAGAAATGGGAATTCAGTTCAAAGGGAAAGGCGGACTGGAAGGGACTCGACTCGCGACTAATGCTATCTAGCTTAGAATAAGAGAAGTTTTTAAATGCGTGCTGTTGTTAAGACTGAACTTTACTGGATA
>Ide 20305508 20305632|21245 chr3L 20304330 20309572 scaffold_8 2448339 2453529 + 190758|1210 1342
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GGTAGTCTTAAGTTTCTAATCGGGTAGTGTCTGTCT---GGGTTTATGGTT----GCTTTTTTTGGTTTAATT----TGAATAAAATGTAA----ACCTCTCACAAATATAAAATAATTTGTATTAGAACCGA
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ATGTTGTGTTTTTTTAAATGGCATGTGAACTGTTATAATTCTAAATTTATTACAT---TGTAAAATGCGTTTTTATTACAAGGAAGAAACGTG
CTATT---------CAACTTACATATGTACTAT-ATATTTTTGTGTTTGCTTAATAAATTTAATATGTTCTAGTTTTCTAAA---------TA
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TACGGAAACCCGTTTGTCGTTGAGATGCATCTGGCCAAAGCTAGAA--ATGGAAAATTCGTAACTGGTACATGGCCCTTCATTTCTGGC---TTTGCTACCTTGACGCCACCAAATCGCCGGGGAGACCAAAGCGGTTGTAATCGCCACCATAAATGTCCTTAACTAACTTGTCCACCTTCCTATTGTCACCCTTGGTGGCCAGTTGGATGGCCTCTTCGAAGGATGTGCAGCCGGTGAGTAGACAACACAGGCCGAGGAATGTACCGCCGCCCAAGCTGAACA------ATACATTTCATTTAGCATCGTTGCAATAATGTGTAATTTCATGAAGAGCAGTCTTACCTCGTGCCCGAAATCCGCTTGTAGTTGTCGGGACCGTAGACCGCCAGGATGGAGACTCCGGATCCGACGTTCACCAGAATAAACGGAAACGGTTGAGAGAAATTGAACTGCTGCTTTTCGCTTTTTCTACAAATTGTATGGTTAG-------------GATCTA--CAGACTCCTTGACGCCAGCGCTTGGTCC---ACTTACAGAATGTCACGTGCGTTTTCGTAGTAGTAGCACTCCGTGCGATTATGCAGATCGGCGAAGAGAATGCCTTTGATGAGCGTGTCCAGCTCGTCGAATTTAGCCAGCTTCATGTTGACTTGGTCGCGGAAATCCTGCTCGAACTTGAATGCGCCACCGCCGGTGGCACAAACCGTGGTCACCAGCTCGGCCATGCCCTTCTGCTTGGCAAGCGATAGGAAGTTGCCCATGTCCGTGGTCTGGAAGCGAATGAAATGCAAGGAGCCGCGTCTTTTGCGTATCTCGACATTGTCCATCTGAAAAACGATAGGGATTACAAAAACCGCTTAGGGCGAATAAATATTACCTATTCTAAGAAT-----------AATAA
TACCGAGCAGCGTTTGTCGTTTAGATGCATCTGGCCAAAGCTACAAGCAAGGCCGAAAGGTAAATATTACGCATAAGATGATTTGTAATCTATTTGTTACCTGGAAGCCACTAAATCGCCGGGCAAGCCAAACCGATTATAGTCACCGCCGTAGATGTCCTTGACCAGTTTGTCCACCTTCCGATTGTCACCCTTTGTGGCCAATTGTATGGCTTCCTCAAATGTCGTGCAGCCGGTAAGCAGGCAACACAAACCCAGGAATGTTCCACCGCCCAAGCTAAACGGAAGACAAACAGTTAGTTGATGATC------ATAATTGGAA----CACAGAGATCG--CTTACCTTGTGCCCGAAATGCGTTTATAGTTGTCCGGCCCATATACTGCCAGTATTGAAACACCTGAACCGACATTCACCAGGATAAAAGGAAACGGCTGCGAGAAATTAAAGGCCCGCTTCTCGCTTTTACTGCAGAGCATAGAATAAGAGAAGGTATTTGCGGTCAAGTCGGAGCATCTGGCGCAATGGCTGGGTCCGGAACTTACACAATTTCTCGCGCATTCTCATAGTAATAGCATTCAGTAAAATTGTGCATATCGGCGAAGAGTATGCCCTTGATGAGCGTGTCCAGCTCATCGAACTTGGCCAGTTTCATGTTCACCTGATCCCGAAAATCCTTTTCAAACTTAAAAGCCCCACCGCCAGTGGCACAAACCGTTGTTACCAGCTCGGCCATGCCCTTCTGCTTGGCCAGTGACAGAAAGTTGCCCATATCTGTCGTCTGGAAGCGTATAAAATGCAGAGAACCCCGACGCTTTCTGATCTCAACATTGTCCATCTGAAATGAGAGTGTGAGAGAAAAA-----TAAATTCCAATATGC-TTGCATATGTGAAAAACCAAGCGCACAAAATAT
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TTTTATTGACCTGTCCACGAATTGGATCCTA---AAAAGAAAACTTTAAAACATCCACTTAAAGCATGTATAAAAACGT---------------T
TTATATTAATA-GACCACAAACT-TATGCTAAACAAAAAGAAGCCTTTAAAGATCCATTGAAAACATACAAATAACTTTCATATAATCGATGTGT
>CG5571 20325526 20325885|21260 chr3L 20325642 20327092 scaffold_8 2468611 2470018 + 35528|0 285
TCACATTGGATAACCCATATTAAAAATGTGCCAAATCT-TATACATTCATTGTTTTGA----AGAAACCAAATGCGCCGTACAAATATACATTCAAGATGT--------CTGCTGAT------------------------TTCCCGTAAAGCGTACTATTTGTTCTTATCAGAACAACTCG--TGTCTAGTTTATTACGGAATTTTTTTAGAATAACACAAACCTTAACAATAATTGTATAA---GTAGGCAAAGGTAGAGAGAAGGCTATTACCGTCTTGTTTT
TTAATTGCTTGAACTCACAAATAAATTAAGTAGTTTTTATGTAGAGACATTGTTTGGATCTCAAAAAGAAAG---ATCATTAAAAAGTACCTTCTATTTGTTGAATGGACCGCAGATTAATTTGTGTTTGCGCGAGCAGGCTTCCTCTGAATTGTACTCTTAAATTGT----TAAGCACTTGATTATTTATTTTTATACCCATTATTATTATGATGATATATTTATTTGCATTTGCCTTGCGGCTTGTTTCCAAACGAAATAAGATTTCGGTTAACAAATTGCATT
>trbl 20330129 20330691|21264 chr3L 20330106 20331352 scaffold_8 2472338 2473701 + 40771|23 748
TTGGAGCTCGTG---------------GAGTCACCCACGGGTTGCATTCTGGGACACGCTGGCGCGTTGGCTGCATCCGGCTGAATGCCGACTGATT---------AGCCGCCGGGACTGGGCATATCGGATGATATGACACTGTGGACATCCTGGCCTTCCG-GGTCGCGCCGACTCCGACTGCGTTCCACGTCGTCTTCC--------TGCAGGTGGTACTGC-------------------CAACAAAGACTT-------------AAAGCTTAGAC------------------ACACAAGAACTCACTGCCTTCCAA---------------------------------------TCGCGCTGCAGCCCCGATTCGATTCGTTCAAGAATCA-----CGCCGCTCC----------GCAGCCTCCTCT----CTGCAACCGATTCTTCCTAAAACCTACCTATGTACAATACATTTAACATTTTAATTTTTTTGCAAACTGTTGATCTTATCAAAGGACAGTCGCCCTGATTTGCTTTTGGGCTTTAAAACACATTAGTTTCCATGTTAAAAAAT-GCAACGAATGCAAATTGTTATTTATTATTTAATACTTCTGTATTACGCTTTGTGTACTCTTAAAA---------------------TCTTGTAAGTGAAAATTGCAAAAAAGAACATAATACATTGAAATTTGATCTCACCAAG
CCAATGTCCGAGACAGAGCCGGACACAAAGCCACTGAAAGCTCGCTTTCTCGTATACGCTGGCGCGTGATCTTGAGGCGTTAACTCGCTTTCGGATTCAATGCTTCACCTCCCGCCCCGAGGCGCATTACCTGCTCT--CTACGACGATAGCCGAGGCTAAGGCGGCCGCGCT-------------CTCCACGTCATCATCCTTCCTCGATTCAGGTGGCGATTCAGCCTCCAAAACTCGCACACAAAAAAGACTTTGTAGCCTCGCTCACACCTTACACGTAAACATATACAATTAAAAAAAATAACTCACTGCCTTCCAAATGAAACGAATTAGCTCGTTCTAAATGAAGAATCCTTTCACGCGTTACAATCCGCATCCGCCGAATCCTCGTAACAGCAGCTGCAACTCCGACTGCGACTGCAACTGCAACTGCAACTGCAATTGATTCTTCCTAAAAGCAACTTATGTACAATACAT---AAATTAATATTTTGCTGTAAATTGTTGATCTTATCAATTGATAG---------------------------AAAGCATTATTTTCAATGTTTACAAATGGCAATGAATGCAAATTGTTATTTATTATTTAAATTTTTTTTA--AAGTTTTGCATATTATGAAAAGAAACAAAAAAAGAAAAATAGCATAAAAAGTGAAAATTATGAAACGA---ATAAAACATTAAACTTTGATCTCACTTTA
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TATATTTGCAAATATATATTGATTCGTGTATACAA
TATAATATGAGATCGGAATA---TCATGGTTAAAA
>CG13248 20340942 20341627|21276 chr3L 20341026 20343550 scaffold_8 2482092 2484560 + 94557|0 643
GTCAATTCTTCCAATT----GGAACCCAAAGCTTCAACCCGAATACAGATCGTGAACTAAAATCAAATCAGTGAAAGATATACAGTTGTTATGGTTTCGGCTTATTATTT--TTGAAAT-GTTTAATGTACATAGATAAAACTACTTCAATTGGTTACTGTTCTTTTGAGAAAAAGATTATAATACTTATTTTCTATGTAATACCAAAAATATGTTTAATTATGTTAGAACTTTTGTTAAATCAAAGGTTTCT-------------GGTTTTGATTTATTATTATTTT-----GAAACTGATACTGTTTAAAGTCCTGTACTTAAAGCATCTCTATATACATAAATAATCCATTTCAAATTATATGC--ATTCCAAAAACCCAACGTTGAACGAGACATATAATGGAATTTTGGTATATAA-------CATATTGTGGCGAAGTACCTTATATTATA---TATACATAATATCAAGGTATAGCTATTTACA-GTGTATTATTGCAAACA-ATATCGCAGAAATGGTAT---TACACACAACAAAAAACGTATTTACTCTGCAAACGTACAAATAAATTTATTTAACGTTATGCACACATGGCATTTGTTAAACTATAATAGTACACACATACATGTCTTTAAAT
TTAAA-----CCAATTGCTGGGGACATTATTATATCATCTGTATTTAG----------CAAAGCACAACGGTCTGTGACGAAACATCCTT---------GGCTATTATTCAATTGACATCGATCAAAGTATTGAAATATAATTA---CAAATATTTATCGCTCGTT---------GAAACTAATATGTATGTATGTCAGAAGAACACAAATAAAAGTAATT-------TATGTATGTTTAATCAGAGTATCCCCTAGTCGACGATAGATCCCGATCTGCAACAATTGTTAAAGAAAACGAGTACCTCTCAGAGTCCCGT--------------TATGTACTACCACAAAAC-TGTCAAAGTGTCTACCTACTCTTATACTCTTATATT------CTCTTATATT----TATTGATGTACAAGCTTATTCATTGTGTACATGAGTTACACAAATAATAATTTAAACATATTAAAAATGTATATTCAAGTATATTTGAATTGTTTCATATACATATGTAAAAATCTATATATATATACACAATATGAAA--TATTTA---TGAAAAT---CAAAAACGTTTAT--------------GGATTTTCTTTGGCAAGTTTTAAGGACATTTAAATATATATCTGTGAAT
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TTAAATATCAAACACTATAAACGTCAGTCGGTTAATGCGAGTAATTAATCATTAAAATTAAAATGTAGCTT--TTACAAATAGATCTAAGACGTTATTAATTAAACA------TTGAGTCGCTTACAAATCTTTTAAGCCC----------AAAAATGTTTGTTTGGTTAAAAGAA-----GAAAGGGTT-TAACTATATTAAAAAA--CAACAATTTATACCGAATA
TCAAATATTGGAAGCCATAG--GTTAGTTTTTTATTCCA--TAAGTTGTACATAAAATTAATTTGAAGCCTAATTTCTAAT---TCTTACATTTAAATAACTAAATAAGATATTTGAT---CTTACATATATTCTCCATTCTGTTGTGGAGAAAATTCGGCGATTACTAAAAAGACTTCCTGAACTTCTTGTAATCGCATAAAAAATGTCAAGTATTCTCTACGGATT
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GTTATCTTATCTGCCAATGTGGAGATATTTTACGGCATTGAGTTTATTACCGGCTAGTAAAGTCCCATGTCATTTATTTTTAAAGAAATACTATCAAACTAATGTAGTTGTACATATAAAATAAAGAATATATGTAAATTAATC------GAATTTTAGCAACGTAAGTCAGTATTGAAATCGGCTGTGACACAAATTTTCAATATATTTTTTATATAATATCTGGAATGTTAAATTCAAATAAAGTGAAAGCATAACCAATTTTTAATAATTGAAATATTATCGAAACTTCAACTTATAAATGTATGAAAAAATAGTTATATATATATAT
TT--ACTTACCT---AAATCATAAACAATTTACG-----------CATATCGGCTGTAAAATTTCCA----ATAAATTATAATATACACATTATCAAAATAA-GTAATTGATTG---------------ATTTGTAACTTGATCTCGCCAGTTCATTTAAATTATAATTTGCAATTAAAATCGACT--------AATATTTACTAATGTTTTCGAATGA-ATC----ATGT--------AATTGGGTAAAAACA--------TTTTACGGCCTTACATATTATTACA-----AACCGAAAAATGTAACACAATTTACTTTAGTATGTGTAT
>Las 20364439 20364583|21323 chr3L 20364236 20365441 scaffold_8 2516395 2517625 + 38349|230 384
AATTTCTAAGCCTTTCC------TAGTCGATCATGGATAGCTTTA-GTTTAGCCTTTTATT--CGCTACACACGCGCATGTTGTGCAATGTATATATTAGACGACAAATTTACTGTTTTGAAATAAAATCGAATTGTTTTTAGC-TTTAAATGAA
AATTTATTTGCTTGTATATGCGGTAATTGCTAATAAATCGTTAAATATGTATCTTGTTAATGATCTTAGGTATACACATTTTATGTGAAATATAGTTAGAAAGACAATTCTA--GATTATATGTAACCTTAAATCCTTATTAATATTTATCCGTG
>mRpL15 20368946 20368999|21325 chr3L 20366263 20374194 scaffold_0 5643188 5651270 + 227771|2907 2960
TTAGTCGAGGTTGTTACTATGCATTTTGTTAAATAAAGAATTGGATTACAAAAA
ATTTTTTTGTTTGTTACTACGC--TTTATTAAATAGAGAA-TGTATTGTAAAAC
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ATCAAATGTGATCAAATTGAGAACTAACAAAATCAATAATAAATGAAATGGTCTAAACTGAAAAACTATTT
TTAACA---------ATTTAAAGGCAATGATATGAATATTTTATTATAAGGCATTTGC--AACAACTATGT
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AGCCATGAGAGGTGGTAGACTTCAAATAGACTTAAGGCAGACTTGCTGAACTCGAGGTTTAGTGGACCGTTTAGATTAAGGTATGCAAACCCAACTAGTTATTAAGAA-ATGATATTTGCCATTCAAGCATAGGCATTTCAAGCAACTCATATCTTGAATGCATTGTTTTTTAAAATTTGTTCATATTATGTGTTGTTTTTCCTATTTGTATTGTGTGCACGACACATCTGATTACGATTTTGTTATACACACAACACAGCATCCCCAGCCACAGTTATTTAAATGATTTAAACGTAAATAAATGTAATATGTGGCTACAAACTATGTGCATTATTATGCATAGGAGAGAACTAAATGCCCAACCCACATATTTAGTCATACAAATTTATATTTATTAACGCTTAAATATATTCATATACAATGCTTACCAA
>CG5195 20388531 20388613|21341 chr3L 20387840 20390518 scaffold_0 5664176 5666941 + 81967|751 833
ACGGTTTTTAAAGCTATTTAATTTAGACAGTTGAAATATTTTATTTTGTACACATAAATAAAGAATTTATTTTATATATAAAG
ACAGTTATATAAGTTGTTT-------ATAAGTTTATTTTTACACATTATTGATATGAATATTAAA-CTATTTTGTATA-ATAA
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AAACACGCATATATATATAGTCTATATGTGTCTACCTATGTGTTAATATATATATAATGTGTATGCGTTATTTGTATACAGCACACTCAGACACATACAAACACAAGCACACAACATGCAACAGTTCACCAA--CACGTCTCTCTGTCTGTCACCCAAAAAATTTCCATTTGCCGCCGAATTTGCTTATATTAAAAATTGTACATCCAAAAATTTGAATATTACTCACACACAAACACACACGCAGACGACACGCACACACATACACACACACAACCATAGAAAGCAGTCGGCGTGCCAACATCGCGTATACTTAATGAGAAAAGCAAATAAGCA
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TGCTGTTGATCGTCCACTAGCTTTAGGTTATTGTATTAGTACAGCGATTTTACGATTTTAGTTAGTATCTAAGCTTATTTTTAACAACTGCTACTGCAGCTATGC-------TATACGCTCAGGCTGAT------AACTAAAGATTTGCATTT---GTTATCGAAATCTTT------AGAACCAAAGATCTGCATGTGCGG--------GTGTTAAGTTGGCCCATATAATTTGATATATA----GCATAATTTCAGTATTTGCCATATAATTTGAC---TAGCTAACATTTTAACGTGAGACGCTTAACT---AGTTTTAACAAGTTAATAGCTAGCTTGTAAGTCTTATATGTATAATAAGATATAGTTAA----------------GCAAATAAATGTTGAGTTTAGATCGATTTATTATATACACATTTAAATTTAACATTTTCTAAATATTTA
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AAGACACCATAA---------AGAATACAAACATATTTGTAATC-----------AACAATATGCACATCAAACCATTAAACCGACAGGCGAAACGAAAAACAGAACAATGAAACGTTCCATATATTGAGGAAGCAGTGTCAATAGC----CAGCCAAACGTATTCCAGCTCACACAACACGAAATAATTTTAAACCTATTCATCAAATACATAGGTAC-ATACTTACATATATAATAGCATACATAAGCATAACTATGTAG----TAATTTGTAAG-CAACAAGTTATAACG----CCTAGGCAAGGGGTTCAACAGATTTTTCTATATACACATCAATTTTATACTGTTTTTTTTTTTTTTTATATGAAAAAACGCCACCTTCGTCATAAACTGAACTAAACTTGGATTCGCACATGCAAAACAGCAAAATGAAACGCGATTCAAAATATCAAGATTATTTTCTGTATTCAGTGTGCGTTCAAAGTTTAGACAACTATACAATCATCAATTCGCCAAAAAAAAAAAAAAACACATAAGAAACAATGCATTCTAAGAACTTTGACTTTACAGACACATATATACGTATATATACACACATATATATATATATTCATCTAGACATATTGTAGCTGAATCAT----CATAACAATCATAATTTTTGTTCG-----CATCAGACATGTTTTAATTTTCT-AGCATATAAAAGTGAAAACTGAAAAGTTCGGTAGGCAGGCAGCTACCCCGAAAAAAAAGAAAT-----ACACATAAACTTACACAATAGTTTTAAGCTAAGAA------------------------------TGTAACCG-TTTTTATATTAAAAATATTTTTCAATATGTATTTAAAAAACAAA
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GAATAAAATAAAAGTAAATGTATATATA
--------------TAAAAGTTTATCCG
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ATGTACATA-AACTAAAGAAAACTGTACTGATTAAATTAAATACATAACATGTAAATATATATATATATATGTATAAAAGATATATATATATATATATATATATTTATTAAAAAGACAAAATGGAA
ATGTACATACAATTTATGCAAACTGTACTGATTAAATTAAATTTATATTGTG----------TATGTGTATGTATAATTGATAT-----TAAACCAACGAAAATTTGTTAATAAGCAAACGTGAAG
>CG4825 20456272 20456484|21394 chr3L 20456399 20456761 scaffold_0 5719664 5719935 + 6709|0 85
GAAGTTGATATAAATAAACTTTAAAGCTGCAGAAACAAAGTGGATCGGGCCATTCTTTAAATTAAAAACCAAAACAGAGAAGAGAA
G-----------------------------------------------GCCATTTTAGCAA-----AACCAAAACAAAAGAAAAAA
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TCAACTACATTCATTC-CAAAGCATACAAAAATAAAGAAAAAGAAACCAAAGCTAAACAAAAGCTAAAA
TCAATTGCATACTTCAACAAAAAAAAGAAAAACAACAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATGATA
>knrl 20530982 20531982|21478 chr3L 20530970 20531744 scaffold_0 5799254 5800122 + 8447|12 910
TGTTATCACATCGTTTAAAACAACTAACCAAATTGCCAAAATATGCAAAAGTCGAGCGGCCCCCGACGAGCGTTTTGCATATGGGGACCG-AAAAGTATAACACAAATGTTATCTT---TCCATAATT-TATGCAGTGAATTATAAACAAATTTTTCGGTTACCCACAAAGC----GGCAAGAATACAAGATCAGAAAACCAAAAAAAAAATAATAATAAAATAAAAAAATAAAAAAAAAACATAAATGAAAAGCTAAAC-AAATGGTAAAAGAAAAG---AAACTGAAACAAAA-TATGCAAAGAAGGCAGCTTATCTGTATCGCGAATGCATAATATCGTAGTGGAATTTGTAATCTATAGGTTTCGTTT----TCTTCTAAGCTATAAACCATATATAAAGTATAATGTTATATGACTAGCTATTACTTAGAC----------------------------------GTTTC-------------AAATCCCCCAAGAGTATTTGTTAGTTTAAAAA---------------------------------------ACAATCATTGTTCTATAGAATAATCAGCGCTGG----TAGACAAATTGTACTCGTTT--TGAGGTTCGCCCGAGTTATTAGTCACAATTAGCAAATTTTAAAGGTACGAAAATCCATGGATGTTAATGTACATGTAAAGCAAAGCGCACCAAGTTGTATAGCAAATAGCATAAATTATTAATCT---TAATGTTGCATAAGTATTTTTCAT---TTTCGTGCGATGATTTGGTATGCAGATCA--------------------GGCGAAATGATGGCCGAGAAAATTATTATTGATGTCACCACAAATAAATACAAATAAATACAAATAAATATCTAGAT
TATTATCACATCGTTTAAAACAACTAACGAAATGGCAATAATA---AAAAAAAGAGCCGCCGCATACCCAAAATTAGCATTTGAGATCTGAAAAAGTATAACAAACGGCGCGAGTCGAGTTCTTAATTAGATGCAACGCATTAAAAGCAAATATTTCGGTTGAGCAAAATGATATGTGCGAGTATTTTAGAAC-GATGAC--AACAAGGAATGA-AATCGAATCGAGACGAATCGAATCAATTTGAATCGAAATCGAATCGAAACGAAACGAGACCAGCCTAAATTGTTGCAAAATTATGCAAGAGAGG--GCTTATCTGTATCATT--TGCATAATATAGTAGCGGAATTGTTAATTTATAAGCTACGTTTTTAGTTTTATATGTATAGCATAATATACTAATTATATTTATACGAAACAGACACACACATACACAAACACACACATATACATAAATACAATACCTAAAGTTTCTTAATAGGCATATAAATATTTCA--AGTATTTCATAGCTTAGAAATTCTCATGTTAATGTGTGTAGAAATTTATATGAATATATATATATATGTATGTATAAATTTAGCGAAATTGAACTTTAGAC-TATTGTATTTGATTGCTTTAGTT--ATCGAGTTATTAGTCACAATTAGCAAATTTTTATCTT--TAATATACATATAAATAAATAAATAAATAAAATCAAA-GCACCAACTTGT-------ATTGTATAAATTATTATTCTAGACTATTTTTTGCTGGTATTTTTCATCTGCTTTGTAGGCAAATTGAAAAAAAAAAACACAAAAAGAAAACAATAAAACTGAGAAATGAAATGCATGAAAAATACTATTGATAT---------------TAAATAAACGCAAATAAATATTTAAAT
>knrl 20530982 20531982|21479 chr3L 20531745 20533897 scaffold_0 5800551 5802730 + 62190|0 259
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GCTTAGCCACG---CTGATTGTTA----AACACACTCGATAGACGACATGGCGGCAATCGGTCGTTGGGCCTAACACTATGCAAC--AAAATTTG------GTAAAGACA--AACAAATGTTTATCATACTTAATATACAATATCAATTTAT---ATTTCTTTTGAAACATTCTTTAAACAATACAATACAAAAATACTTATTGAACTTTGG--AAGGAGCTTCAAATATCTGAAACAACTTAAGCACATTTAAGTTTTA
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A-TTGATTGCGAGGGGGTAAAAAAAATGTTGTAAACTACTC---GTCTTATCTT-TTTAAGCTAACTGTGCACC---------------------------------------------ATGGGGCT--AAGTACCACTATTGTGTTTCCTTC--ATTTAGAGTTTATATTTTAAGCATAGTTTTTAAAATATCTTGAGGGTATTCACA-GCAGGAGACGTATGACTTATGGCAGCTTAGGCTT-----GAAAGTAATTGTTTTCTTATTAAGT-----AAATCTTTTGATAGAAAACACAGAAAAACTCCTA-----------CATTATTTTCTAA----CAGTTTTAAGAAAAGAACTAAGCTCGAT-----TTTCTTACTTTTAGCCA---GTTTCTTTTTCGTGAGATAAGTCAAGAGTCTTTTCTGCCAGTGAGTGCCCTTGAAATTAATG--------GTTACAA---------------GTTAAAACTTAAAT----AATTGTACATATGTTTTTTATCAATTATAAATAGCTGATACTTAACCGCG------GCCTGGCTGTTGTTAGTCTTTGCAATTCACCCTGAACAAGGGCCAAGCTACCCACAAAAAAAGAAAAATAAGGTTCGGAAATGCATACAAAGTATGGGTAGAATGGGTTCCACGTATCCTGATAAGGATG-ATTAAACAAATGAATTGTTTTCCAAATCCTTCAAAAACAATATAAACACACTCACACACACACACACACACACATAAACACAAAATACAAATCATGCACTAGCA------CAGGAGATCAAGCAATATTTTTGATTATTCATTC-CGTGCCGCACCAAAACTTTATATACA-ATATACGAGTAC------GCCCCAAACAATCTTTTGTGAGACTATAAACATATAA-------------TTTAGGATTATTAC------TAATTACAAAACTAATTTATCGTATGTACAAATCGATAAAACCTTTAACTTAAGTAGTTGAAAAAAATATACATATATATATATATATATATATAAACGGATCGCGCAGAGAACCAAATTTGTAATAGAACATAAGCAAAAGCTACGCACCGCACAAATAACATAATTAACATTCAAGGGGATTGTCACAATTGAATCTATTGGCTAGCTTAAGACCTGATCAATTCAGTTCTTGAGTTTTCAGTTAAGATGCCAATAGAAGCCATCGTGAACACGCCCATATTTTA---ATGGGAATTTAGCCAATTTAATAGACACGTAGAAAATAAAATGAATCGGCAA---CTTTAGATAAAAATTGAATGCTAACTATAAGTTTTGAAAAAATATCAACTAAGCTGAACTATTACGACACCCGGCCACCCCACCACCTCTCCTCAACACGATATGTTAACTTTTTTTATTACACAAAAACAAATCCGGCGCTCTTGTCGCATAGATTAACAAATTGCAT-AATTAAAGTTT
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TTTCT
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A
A
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TCTTAGTTTTTGTATAT-TTGTTTAAAGCAATAGATGTTTAGACTAACA-TGCTGATAATGCAAAACTATATACACACACACTCACACACACACAAACAGACTCGACACACACACACTCGACTCACACACACAAACACATAAGAAATTAACTACGAATATAGAATTTAGCACCTACAACAGAAATACAATAATTTTGTACAAGGCCTTAACTAGTAGAGTCAGCAATAATAT-AAATAAGTTGAAATCACTAATAAATATGAAGTATACAAATTTATATAAAGTA
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CCTACCACGCGCACCAATTGGGTCTAAGTCGGGCCCACGGCTTGTGAATCATGGTCCATGGGACAAGTCAGTTGCCAAAAATAGCTGTAGAATTTATTTTTAGAATGATTTTTAGCA-------------------GTGCTTCAAA---TGCATCAACTAGCTAAAGGAACCGGCTTCCAAATAGATCAAAAATCCATTTATTTGCTGTCCACGAAAGTTGACAGAAATCCATTCTTGTATTATATGTATGTATTCGATATATTGCATCATCTCAGCACAGTTCTAGTCCTTTCA--TAAGCA----TATATATATATATACAACAAGAATATATATATATGTACATATTGAGATCGTT---CATTTGTCAACTAAGCGAATTTTTGAGAAAAAAAGAAATGTAGAGTTCCAGAATCAACGTTCTATTCAA--ATAATGCGTAGTTAAAACTTTACAGTTTACCAAAAAAAATTTGATCTAATTCAATTA-CAATTTGCCAATAACTTATTCGTTTTA-----TGGTAGTTTTGATTAAATCGATCAATTTAGCTTAAAACTTGTAGCATAATTGAAAACATTTTTAACGATGAT------------AAGTCCAAGATGAACAAATTTTGAAATTGCTGT--ACAAATA
>park 21128590 21128687|22190 chr3L 21128358 21128596 scaffold_0 3949325 3949610 - 5609|291 297
ACACCCT
ACACCCT
>park 21128590 21128687|22191 chr3L 21128604 21130545 scaffold_0 3949890 3951724 - 88404|0 97
TCCTTCGTCATCGTTGTACGTCGGCC--------------CGACGGGTCCTTTTTGTTTGTTGACTACTTTTAAATTGTATACCATAGTAAAGACTGC
ATGTT-GTTTTTGTTATGCAGAAGCCGCTTTATTGCTTTACGTTTTGTTTTTTTTTTTTGTTCACTCTGCT--GGCTGTAT------TTAAAGACTGC
>CG33054 21131252 21131300|22192 chr3L 21130611 21133248 scaffold_0 3952030 3954499 - 74185|692 742
GCCATTTACTTCA--TAGCAACATAATTATAAACGACCAGCTCAACAGAAT
-CGTTTTGCTGCACCTGGC-ACATAATTATATACAACCAGTTCGGTAGAGT
>CG33056 21132097 21132299|22192 chr3L 21130611 21133248 scaffold_0 3952030 3954499 - 74185|1563 1782
TGTATATAGCCATCTTTGTT------TGACACTCGAAATGGTTTTGCTTGGGA------CTTGTGGCATCATATGCACCAAATACTTATATAGTTGATAAGAACGATACACCTAAGAGGTT--TTTATAGCACACAAAGTTTCCATATTTGGTTATTTATACTGTATTTAATGTATTAATAAATAAAACA---CGTCCTCGAGAGGATATTAACCAAAGA
TGTATATATAAATAGTTGTTAATTAATAACATTCGAAATGGGTTTGCATGGGGTTTTTTTTTTTGGCACCAAATGCACC-GTTACTTATCTAGTTGTTAGGAGTTTT----------GGTTAGTTGAGAGCACAAGAAATTGACATA---------------TGTATTTATTGTA-CAACAAATAAAAGACACCGCCTGCTGGCTGGCAATAAACGAAAG
>CG10510 21141992 21142058|22204 chr3L 21141708 21145214 scaffold_0 3963090 3966450 - 63112|285 355
AAATATGTGGCATTCAAAGTTATGTTTAAATA----TAAAAATGAGCTCAATTAAATTGAATAATAGTTAA
AAAGACTCGCCACACTGAAAACTCGTGAAATAAGCGTGGAAATGTAATTCAAAAGTTTGACTAACAGCT--
>CG12975 21149833 21149969|22207 chr3L 21147479 21150997 scaffold_0 3968548 3971804 - 67233|2463 2599
ATTACACCCATGTGCTTTTTGTACCATAATCCCCATAATCCCCTTTCTCCAGACGCGCATTAATATTAAATAAGTTTGTTAGTTTTAAAGTTTGTTTATTTACGAGTTACTAAAAACAATTGGAGCTTGGATGGAAT
CCAAAGCTTAAATATAGTCTATAG----------ATAAGTTAGTTT------------ATAAATATTCATGTATTTCA--AGCTGCAAAGTTTGTTCATAGAAAACTTG-TATGAATAATTGGATTCTGGATGGAAT
>CG9391 21200522 21200681|22262 chr3L 21200403 21200591 scaffold_1266 3214 3364 - -1878|119 188
GTACCTAACAAACAAATTGACTACGCCTAGTCACGGATATTCCAAATAAACAAATAACGATTGTTTCATG
AAGTATGTCTATTAAATAAGCTACA-GTGCACACCGAAACTCT--TTTAAAATTTAA-------------
>CG9391 21200522 21200681|22263 chr3L 21200592 21201392 scaffold_0 4029238 4030022 - 34852|0 90
-AGCTGGCACTTGAACTTC-CTATATATATATATGTATATAAGTCGAAATGGGACTTAACTAACCAAAAGCATTTTAAATATACCGACCAT
AAGCAGACCATAAATCGTCGCCATCTGTGTATTT--------------------CATGACTAACCAAAAAGCATTTGATCATTATGATCAT
>CG9389 21202231 21202330|22265 chr3L 21201702 21202237 scaffold_1266 2791 3277 - -2662|549 555
CTTGTAA
CTCGTAA
>CG9389 21202231 21202330|22266 chr3L 21202246 21204224 scaffold_0 4030557 4032591 - 26118|0 87
TTGACCACCAGAAAGGCCAGCT---TTAAATTGCATTTTAAAATTTTAGTTGTTTAATAAACTGACAATGCATGGTTTTTCCATGTTT
CTGCTCATCA-AGAGTTTAACTCCATCAAAATGCATGTAAACCAGTAAACATTTTGGTACACGAATAACGGTTGCTTTCCTTTTGCTT
>AcCoAS 21205047 21205545|22268 chr3L 21204454 21207581 scaffold_0 4036200 4039598 - 137679|793 1434
ATGGTAGC--------TGTTGGACCAACTGGCAG----CAGCCAGGATCCCTTAACCCAAGGCTTTC--TCCGGTTGCACTG-ACCACTCCACTTTGCCATCG--------------------------CATTTCCACCACTT-------ACGTATCGCGATTACGT--ATCCTGTAAATCTCCCTC-----------------TACTTATATGAAT-----TACCCACTGCTTAATGTTTGTTCCGTTCCGGGCTACGGCGTGGTTAGCACCTTTCAAATTCTACTTAGCTCGTAAGCCTAAGCGTGTGCGTAAGTAAGTGACTGGATG--------GTTTCCGAT--------------CCCAGTTATATATCGTCTATATGATT----------TTGTGTACTTGCCTGTTC------ATCGTAGTTGACATGCTCACCACGCACACATTTTC-----CAGTTCTTTTGTTTCTTCGTTGTAGTCGTAGTTTAAGTTCTCGCT-AATTCGTTGTGATACAAATTTAATTATATCTTACTTATGTATGTATTTTTAGTAGAATTGATATGAGACAAAATATATACACGATTCCA--------------------ATTGTCGCCACAATTTA-------CA
ACAGGTCCAGACACAGAGCCAGACCCAATGACCGATCCCAGTTACTCTTCTTTGGATTCTAGCTTTCAGCTTAGCTCCTCTGCAAACCTCTACTTAGCCATAGTTTGCTGCGCTCGCATTTAGGCTGGCCAATTCGACCAGTTAATATCCACGTATGCTATTAACGTGAAACTTGTAAATCTCTCTCCAATCCTTTCTATTCGATACATATATGCATACATATATATATTACCTA-----TGTTTAGCGCCAACTGTTGGCCCCGCGAGGGGCTTACAGATTCCACCTAGTTTTTAAGC-----TGTGTGCGTAAGTAAG-GATCATATGCAACTGTTATTTTCGATATATACGTTATACATATATTGATATTTTGAATGTGTGAATTGGTTCTGAATCGTATACATAAATGTCTTTATAGAATGTAGTTAATATGCTGAGCACGCACACATTTTTCTTCACAGTTCTTTTGTTTGTTTGTTGTAGTCTTAGCCTAAGTTCTTGCTAAATTCGTTGTGATACAAATTTAATTATA--TTGATTATGTATGTATTTTTAGTAGAATTGATA--ATACAAAATATATACACGATTTCAGTAATACCCATTAACAACACATTAACACTACATTTTGAGTTTCTCC
>ppl 21214329 21214529|22275 chr3L 21213118 21215642 scaffold_0 4043684 4046324 - 46413|1381 1597
-ACCAGCA-GCTAATCCTAACCCTAAAGCATCTTGACTGTAGCCTTTAAAACGAGTAATTGTTAGCATTTGTTATCAGCTGAATAACGCTACACTCATACCCA--AATATCACCAACCAAACTCAT------------CGCCATACACACGTTGTTGTAGCTCTTGAAATTTGTTACGAAT-AAGAATCAACAATAAATCCAAATGTTATATTTAAA
AATCGGAATATTGCTGCTAACC---AAACACGCCCGCTGT---------------TAACTGTTAATCTGCACCAAAACTCACACACACACACACACAAACTCATTCATTTTCACACCCACACGCACACACTACATACGCACAATGTCCACGTTGTTGTTGCATTTGGATTTCGTTACGCTTTAAGAATAAACTGAAAAGCCAAATATTACACTTAAA
>CG12974 21215855 21216043|22276 chr3L 21215758 21216592 scaffold_0 4046400 4047277 - 18186|98 343
ATTACTAAGCCCCTTGGCGCCCCCAAAAAAGCCCTCTTCGATACTA-------TAATTCTCAAATAATCCCAGCTAAAGTTTAGTT-------------------CAAATTTTATCAGGGG----GGGCAACTTCTTCTGCGTTTTTAT-------TCTTATTTATTTGCATGTTTATAACGATATAAGTGTA---------------CAGCTGTAA-----ATATATAAAGCCGTTCTAGTTCCG
GGAAAGAAGA----GGGCGCC------AATGCATTTCTACATAATAATCCATATAATTCTCAAATAATTCCCGCCACAGTAAAGCCAGTAAACAAGTAAAGCAGATAAAGTTAAGTAAAAGAAAAGTGACGCCAATTGTAGTTTTTTATCAGACCGTCTTATTTATTTACGTTCGTTTAACAATAGATGTATATACAACCTGCAATTGCAACTGTGACTACAATATACATATACATATTTATACT-
>Edg78E 21230604 21231125|22287 chr3L 21230548 21230773 scaffold_38 101718 101974 + -1025|56 260
TT--------------------------GTATAAAACCATTTATCTATG-TAATA-GATTTTGATTTATGTC------ATTTATTTTTCCACTTTCATTTATACTCAACGCATTATGATTTCCGAACTACAATAGTTAAATTTTTGAAAACCAATCCAGCGGTGATGCACAGATGAGATAAATTAAAAGAAACAAAATCT-CGTG
TTCAAGTAGGACCTACCTATTGGCTGTAATATGAGTCAACTTTTTTGTGATGGTATGAGTATGTTGTATGTTTTAGTAATCTGTATATGGATATATATATATATATAATTTACCATATTAAAAATAATATTCTAGTTGAAAATCCAATTCCCATAGTAAAATTAACGCAACTTTAATCTAAATTGATTAAAACGTAATTTAAACA
>Edg78E 21230604 21231125|22288 chr3L 21230774 21231037 scaffold_38 104815 105054 + -574|0 281
GATTTCGATACAG-ATCATTTTCGTTTTTAGTAATGTAGTAAAGATGGAAAATAA-ATGTTTCATGTATATGTATTCATATGTAAATGAACATATGTATAGTTCTTCGAAAAATATAGAAGCGTACACTATCTTCAATAGAAACAAATTTCAGGCGGATGGAGTTTACATTTTTAAACATTTCTTTATCTTAACATTGCTCTTTTT-------TCTTTCAAATGAACAATTTGAAGAATGTATATGTTAGTTAAT---------GATTTCGGCAGCCAGTAA
GATAACCACGTTGTACCAGCTTATTTTTGAGCTGCCTGGAAA------TAAATAACATCTTCCATTACTTTGTATTGTTTAGACAATTTCTATATG-ATACAACTTAACTAAATCCCAG--------------TTAATAGCTCCAACT---------ATGGCATTTCCATATCTGGA---------ATTTTAACAATGCTATTGTTAGTTGTCTCATCCGAATGACGAGTC---AAATCGTAAAAGTAGTTTAATTAGCATGCAAATTTCGGCACATTGTAA
>Edg78E 21230604 21231125|22289 chr3L 21231038 21232181 scaffold_12 1820525 1821718 - 29003|0 129
TCTGGAGTAGCACCAGCACTCCAA-----------AGCAGCAACCCCACATCT--AAACTGCGGCCAGTCATTGTTATTTAG-----------------------------GTAGTTATCGTTAATAAAG
GCGAAGACAGAACCAACCAGTCAACCAACATTACCACCACCATCCACACGACTTGAATCTGTGG-CAGTCATTGTTATATAGAGACATACTTTCGCATGTTTTAATTAGTTGTAGTTATCGTTAATAGAG
>CG11309 21235499 21236445|22295 chr3L 21235402 21237410 scaffold_12 1824378 1826457 - 61185|113 1233
GCCAACGG---------------------------TGTGGTAAATAGAGCTTATTTATTGTAGTACAGAT-------TGTACAGG----------------TTTTTATACTTAATTGT---TTATGCTATGTGATCGCGGCAGAGGACTCGGCTCTGCTATAAATACACAATGTACAT--AAGCCGAGGGGTTTTTCGACTGCGCTTAATGGGGAAGTCGTGAAGGATACCAAGAAACTGGTTATGTACA-----------AGCTTAACCCTTTTGTATTGCGCCCAAATTGTATATTTCAAAACTTTATAATTTATTTCAGCTCGAGCATCAATAATTTCGCTTTTTTGAATTGATATATAAAGAAGAGCTTACCATTTTATTATCGTTTAAATATTTTTTCGTCTTACAATATTCATTATCTCTAAAGCACTTATTTGATATTTATAA-CAGAAACACCTTTAAATAATACAGATCAAATATTATTTTATGCGTATATACAAATGTTATTGTAATTAGTTTTTTAGCTTTTAATACTTTTTAATGCTATTAATATGCAGCGTTTGTGTGTTCATTATAAATGTTTCACTGTAATTGGGCTTAT--TTATTGTATG--AAGTGCCCATTTACAGAAGTAACTTGTCTTCCGATCACCGGCAGATGACCTACATCTTCTTCACGAGTAGAATCC----AAGCAGCGAAAGTGTTAATAACCCGCAAACCTGTTCCCGAAATCCCAGCCGT-------------------------------CTGTTACATCATTCTCTAGACTCTTTCTTGGCAACATGAT----CGTTTTCAATTGTCGGTGTCCACGCTGGAGGTCAGTCTCGGTTGGATTTACATGGAAATGAT----------TGTTTACTGGATATATATTT----TTTAA----AAATAACTGAGCTGAGGCAACAGGGAAAAAAGCCAAGTGAG--------------TTGATGACCATGCCAGCTTCCACATTTGTCTGTGCTCATGTTCGTCTGGTGTTGC---------TTATGCTGAATTTTTTCTTTTGCCT----TGGTTAGTTCCTGGG-------------------TCTGGTTTG
AACAACAAAAGCAAAACACAAATTCAGTATAAACTTGGATCAATTGGGGCTTATTTATTGTTGCATAAATGATTCTGTGTATCGATGTCACATCTCTTATTTTTATATACTTAATTGTTGATTATACTGCTAAAGTCTGGCTCTGGCTCTGCCTCTGCTAAAAATACACAATGTACATACACACCAAAAGGTTGTTCG-CTTCGTTTTGC------GTCTTGAAGGATAACGAGGAACTGGTTACACAAACACGCGGCGGTGGCTTAAAAGAGTTG--ATGCGCTC------TGTGTT---GAACTGGGTTAACCCTTTAAGGTCTCGCTTC---CAGTTTATGCTATTGCAGTAGTAGGGAATTCAGGCGTGA--GTTTAA--ACCATTTAAACTGAAATGGGAATTGTGATGTATAGTA----------AAATAAATAATATGCGTAATCGGAAACATTTCTAAAAACTACATTTTCAGCTTTGGCTTACCT-----------TGTTCTTATGATCATT------------------------TACTAT--ACATCCAG-----GTGTG---------GATGGGT-----TAATTGGGCGGATGGGTATTACGTGCTGAGGTCCCATTAAGAG---------------------CCGGCAGTTGACCTACATTTCGGCC---GGTAGAATACGCAGGCGCAGCGAAAGTGTTAATAGTCGTGAAACCTGTTT---GGAGCCCAGCAGCGGCAGCACTTTGGATCTGCGGCTGTTCCGAGTTGTTGCATCATATTTTAGACTGTTTCTTGGTATTTGTATTTCATGTTGTATCTTGTT-TTAGCATTTTTGGGGGTCAA---CTGTCGCATTTACATTGAAATGACAAATTATATATATTCATACCATATATGTGTGCAATTTGATGCCACATAAATGAAGCAACAAAAGAAAGAAAAAAAAAAGGTGCGAACCGTCGACGGACTTGTTGGCCCTG-CAGCTTCCACAATTGACTGCATAAATTTCCGTCTGATGTTTCTTTAAGCATTTATTTTATACTTTTCACCTCGACCAATATGGTTAATTCCTGTGCCCATTCATTATGGTAGCATCTGCTTCG
>Pc 21239977 21240039|22298 chr3L 21238678 21240111 scaffold_12 1827623 1829080 - 45553|1345 1407
TGTTTAACATTAATGTTATTGCCGGTATTGATTGTACATAATAAATTAAATAGAAGCAACCAA
ACTCTAACTGTAATGTTATTACCAGTATTGACGGTA---ATTAAATTAAATAGAAGCAACATA
>Pc 21249147 21250264|22299 chr3L 21249192 21249226 scaffold_12 1829081 1829115 - 2927|0 34
TTTATTGGCTAGTTTTAGTTACGGCGTAAATTCCA
TTTATTGGCTAGTTTTAGTTGCGGCGCGAATTCCA
>Pc 21249147 21250264|22300 chr3L 21249267 21251800 scaffold_12 1829148 1831820 - 55953|0 1091
GC-----TTCGACCCAAACAAATGTCGGGAAAACAAACCGGAAAACTGATACAATTGTAAATAG----ACAAACCAAAATGCGAGAAAGTTGAGAGAAGAATTATGCAGAGAAATCCACACTAAATGTTGCTAAGCATTTTCTCTTTAGGACTTAACTAATTTATTGTATTTATTTTTAGCGTAGGTTTTAGTTTGTTGTTTTATTACAATGTTTAATGTGCAAGAGTAGT--TTAAGCA--AGCGCAAGTCGGGTATTTACTAAAT---GAC----TTTATATATACATAA---------------ATTTTCGCTCATTTTTTTTATCAGCATTGCA-ATGATTGAATATTTTCCTATTTAAATTAAAAATTTATTTTTCTGCAATATCACTTTTTAAGATTAATCTGGTTGTCATTTAGTGAATAGGCGAAATGCTGCGGCTGCTTAACTTGCCAATGCAATAGAT---TGTAAAACTTGCAGCGTAGATAAATATGTATGTACATGTTACATATATTTACCACATATTGTATATTTTT---TATAACACTTTGAATCTGATTGAAAACAACACAAGACACTCAAATGCTAAGAAAACTCCATGCGAAACCGAAGCAATTGTTGATTACGCTTACAAATATATACAATAGAAGATGCATATATTCGAGTAGTCACCACCACGTTTGCCGAGTTGGCTATCCCAATGTTGTAATTGTTTAATATTATATTTCCTCGCGCCGACTGATTTTACAAA--AGAAAACCCCAAAAACATATATACAAT----TGTAGATTTACAAATATTTTTAGACTTTAGCTAACCAAAATCT----CTACGTAATATTTATTTTAACATGTTCTCTTAGCAGTCATT-CAAGACTCAAGTGCTGCCTTTATGGGTT--CAGAGCGGTGCAGTGCAC----AGATAATTCCAAATC------GAGCCCATAGACTCATTACTT---------------AAATCCTATGTCTATTTCACAATTTTTTTTCACGCTATGA-------------AACAGAAAAC-TACGTGGGAGCTGCGGGGAATTTACAAACTCCTGCTTATTT
GCCGTTTTTCTGCTCCAA------------------------------ATTCAATTGTATATAGTTTTACAAACAAACAAACAAACAAACAAACAAACAAACCA---ACAAAAATCCATGCTAAATGTTGCAAAGCATTTTCT-TTTAAGAAATAACTTATTTATTATATTTATTTTTAGCCTAGAAACTAGTTTGTTGTTTTATTACAATGTTTAAAGAGCAGCTGCAGCTGTTGAGCAGCACCAAAAGTTGAAATTCCACAAGGTTTGGACAACTTTTGCATCTGCACAACGCCTGTTGGTTCATATAGTTGTATGTCTTGTAGTTTAGCAGAGTATATAACACCATATATATTTATTTAACATATATGTATATTTTTCTATAACAAC----------TTGAATCTGAC-------------AAAACCAAAACAC------------ACTCATACACGCAGAAAATCCATGCGAAACT-------GAAGTAATTGCTATTACGCTTGATATACACATTTACAACCTACCATTAATACTTATATACAAGTATATTTATTAAATTAAGAATGTTACAAATCA-------------------------GCAGCAGCGTCAATATTTCCTTTTTTTTAT--------------------------------GTGGTTTCC---------------TTTTGTAACCCAATATTGTAAAGATT-----TTATTGTTTTTAGCGCTGACTGAATCGGAAAAGTACATAAACAAAAAGAAATGAAAGGAATAACATATAAGTTGATGCATGTGGTTAGATATTAGCTTATTATTATCTACTCCTGCATAATTTATTTTTTAGGTTTAATTTTTAAGTTTGATTGCTGGA--GAAATGCTGACTCTATGTGCTGCCCAAAATGTGCAGTGCGCAATGAAATAAGTTCAAATTTCTGTGGCGCTCATAGATTCAGCGCTTTTTCGCATAATTTACACACACAATTTCTTTTTAAATTGTTCTGTACATTTTCTGATCGACCTAATTTTAATAAACAACGCACAAATGAAACAAAAGTCATTTATGATTTTTGTTTTGTTT
>CG7324 21271521 21272193|22324 chr3L 21268684 21276441 scaffold_12 1847233 1855013 - 328700|2930 3688
ATAATCATAGTCCCATCCCTG---CCCTATGTCCTGTCCCCCCACAAAACTGTATTAGCCATATTCTATGAGAACCTGACCGATTCTTTATCCTTGTGCAATGCGAC--AAGCTTTTAAACG--------------------------------------------------TATCCATGT---TATATGTATGTATAT------------TGTATTGCCTCTACCATTAAGTTAAGACAATTGTTTGTGAATATAATTCTATTATT---CCTATTATACAACGCAGTCACATATAAAAAATTATCGATGCGGGATTTTTGTGTACATATTTTATGTACTTTTCGGGTGACATTTCCCGAATGGACACTTCGTAGGTTTCATACTTTTAGAGGTTTAAATGTAACAACAATAATATAAACTCATTTCAGAAGTTATTCGCACTGTCCATCGATCACTTATTTATCCATCCATTTGCACACACCTCTACTCTTCCATGGCCACTTGCTGCGAGCTCCTCCTGTTT-------------GCCGACGCATGTTGTCGCTCGTGCTCCGCCGTTCGCACCAGACACTCTTCGTAGGTCCATTTGGGGAAGACTCTCTTGTACAGGTACATGAAAGCAGTGTCGTAGGATCGCAACTGCCCATCAAAGTAGCACTTCATGTGGCCGTGCGTGCCCAGTGACTCCTTAATGTGTCCCAGCCGTCCGCACTTGGTTCTTAGTTTCACAGGCTTGAAGTACTCCACA
ACTACTA-AGTCCCCCCTTTGAAATCCAATATCCTGCTAGAACCCAA---TGTATTAGCCAT----TAAAAGAAACCCATAGA---------ACTGTGCAATGCGGCTTCAGCTTTTAACCGTGCCCCGTTTTAAAAAAAAATATATATATACATATATATATATATCTATCTATCTATATATATATATTTATATATATATATGTTATTCGTATATTACCCCGA----TTAGTTAAGCCAACTGTTTGTGAATATAGTTCTATTATTATACCTATTATACAAA------------AAAAAAGTGAAAGTG-----------------TAACTTGTGTTGTGTCCGTGAGACAATTT------------------------------------ATTTCAATATATGCACAGATATATATAAATATATGTATAATTAG------------------------------ATATATTTACAAATTCAACTACTGTTCCATGGACACATCCT-CGAGCTGCTTCGAGTTACGGCGAACCCCCGCCGCTGCCTCTTGGCGTGCATGCTCTGCGCTGCGCACAAGGCATTCTTCATAATTCCATTTGGGGAAGACACGTTTATAGAGATACATGAATGCAGTATCGTATGAGCGCAGTTGGCCATCGAAGTAGCACTTCATGTGACCGTGCGTACCCAGGGACTCCTTAATATGACCCATGCGACCGCATTTTGTGCGTAGCTTGACGGGCTTGAAGTACTCGACG
>CG6049 21354224 21354541|22398 chr3L 21354041 21358288 scaffold_12 1933021 1937478 - 96345|189 513
TTTTCATT-----TACCTGCGATCGTTTTCACGCGGTTCAAGAATCTCCAGGACCACCTCGTTGGCCTGCTCGTTCGGATAGGTGGCGTTCCAGCGGTTGTAGATCTTGTAGCGATTGGGGCCGCTCACCTTTGGCATCTTGTGCTGACATATGAAGCGCAGCTTATCCGAGCAGGGCCGCGCCGACCAGCGGTACTTGAGGCTTGGATCGTAGATGGCACAGTTATTATCAAGCGGTTGGCTGTTGGAGATAAGTTGCACATAGCTAGAATTGTTGCTTAAGCGTTAAATCAATCTACGGAAATAA--AGAAAGAAAGGAAAGA
TTTTTATTTTACGTACCTGCGATCCTTGCCACGTCGATCGATTACCTCCAAAACGACCTCATTGGCCAGGGAATTGGGATAGGTGACATTCCAGCGATGGTAGATCTTATAACGATTCGCTTCACTCACTTTTGGCATCTTGTGCTGGCATATGAAACGCAATTTATCGGGACAGGAGCGTGCCGACCAACGATATTTCAAGCTCGGATCGTAGACAGCGCAATTATTATCCAATGGCTTGCTGTTGGAGATAAGTTGCACATAGCTAAAATTGTTGCTTAAACATTAAA-CGACCCGCAAAATAAACTACACAAAACTCAATCA
>CG5664 21372465 21372759|22409 chr3L 21372195 21372752 scaffold_12 1954714 1955322 - 12940|301 635
AATACGAAAATATATCTAAGGCTCCATTAAATTTAAGGAATTTCATACCGAAAGTTCAAACTTAATTATTTTAAGCCCGTTAATTAGTATTTATCTAAATGGT------TTCAAATAAGAATGCATTTGATTCGTTACCGTTTGTCATAA---------------ATTCCGTTTCTGTATTTCTCCA----TTGCAAATATATATTTATGC---------------TGTAACTAAATACACAATTACGTACACATTTACATATAAATACAGCTACTGCGCATGTACATACATACATTAATAAATATATAT-------GTGTATAATTACATAATA
AATTCAAAAGGATTTACAAAAACGAATT---TTGAATAAATTCAATATCAGCATTTCCAAGAGAATCAAATCAAAA-----ATCTACCATTCACTGATGTGCTGCAATCTCCCAATAAGAACCCGTTTAAATGTTT---GTTTTTCATACTTTTGTATTTTTGTTGTTTCGTGGCTTTTGTTTTTCAGTTTTTGCAAATATATATATATATATGTATATATATGTTTTTAACTAAATACACAGTTACATACACATTTACATATAAATACAGCTACTGCACACACACATATTTATGTAAATATATACATATAGCTTTTGTGTATAATTATACAATA
>CG5656 21376064 21376211|22412 chr3L 21375547 21376124 scaffold_33 820156 820591 - -426|524 584
TTAATCTTAACTTTTTAGCTTATATAGTTCCTGAATAAAGAGAATAAGCAAAGAAGCAACA
TCAACAGTAATTATTGTACTTACGTAACTTATGAACAAAAAAAAAAA--------------
>CG5656 21376064 21376211|22413 chr3L 21376139 21377982 scaffold_38 246605 248376 + 66149|0 86
-AAATCCCCTAGGAATAAATATGTTTAGAAA--------------TTGAATAAAATGATCTATTCTTAAAACAAATTGCGGAGATTC
TTACTTCATTAATACCAAATATTTATAGTAATAAATAGGATCCCTTTGAACCAAATATTTTATTT---------GTTGCGGAAGTTC
>croc 21407876 21408508|22447 chr3L 21407883 21410537 scaffold_38 278820 281730 + 108217|0 787
GCCTGTGGGCTGGATTCTCGGCGACTGGGCTGGGCTCTCTTGTATATTCCTGTAAATACATACACCATATAATATACCCAAGAACGAGTCTACACAGCCTGGGGGTGGTGATCCCTCGGGGTCCA-GAGTCTGCTATCTCAGATC---------TTTTTGTTTCCAACTTGTT-TTCGATTTA-----------------TCCGTATACGAAATAATG-----------GGGGACATAGCTGTTAAG-----------CAACCGCATTAACGTATTGTATTGTATTAACTGTATTTG--TAATTGTAGCTCGTAATTGTTATCGAATTTA-GGCATAGTCCCAATTGTCTGCTACGCAATTTGTGATGGGGTTTTGCTACACAGAACATAAACTTAAATT--------AGAGCATTTTGTCAATAACTAAA--ACTACCGCATCGGAT-----------CGATCTATC--------------------ATCGCCTAGTA-----------CACTAGCCTAGCCCACGTAAGCAATAATAAATTATACAACTAAATCGTAGCTATAACATAACTATCAAAACTAGCGTACCACCAATATGAGCCGA------------ACAAAAAGTGTATT---------------------GAAAATATGTTAAAATATCTCAA------------------------ATCGTGTGTTTTATTTGGCCCCTTCATATTCGGAGCGACTTTCGCTATTCCATCTGGCCATTGAGCATTTGGCTGGCAAAACAGACTTT
GGCGGCCTTCTGCCCAGGGGGCGTGCCAGCTGTGCTCTCTTGTATATTTCTGTAAAT--------------ATATTTCCAAGCACGACTCACAGCAGC----AGCAGAAAGTATCTCAATGTCAATGAATTTATTATTGTTTATCGAATTGTTTTTTGTATTTTTGTTTTGTTGCCCGGTTCAGAGGTTCTTTGGCAAATTGCGTATACGAAGTGTGGGCCAAGCGAGCGAGTATTTAGTTGTTAATTTTATACAATCTAATAGCATTAAACACTAATAT--TAATAACTACAATTAACTAACTAT---TAATAATTGTTATCAACCTTAGGGCGTAGTTA----TGTCTGGTATGCAATTTGTGATGAGTTTTTGCAACGATGCGAACAATTTTCATTTCCCTCGTAGCGGAGTTTTTCCAATGAGAAAATGAGAATTACATTTAATGAAGGAAAACCCTATTTAACATCATATTATATGATAGTGAATCGCTTAGTAATATTATAATTAACTAGCCTAGCCTACGTAAGCAATAATAAATTATAAA---TAATTATAAACA-AAAAAAAAAACAAAAACAAACAAACAACAACTATTATCAAATTAGCGTATAATATAAAAAGTGTATTTAACAAAAAAGCAAAAAAAAAAAAACTATGTTAAAATATCAAAAAGAAAAAGAAAAAGAAAAAAAATGATTGCGAGTTTCATTT---CCATCTACGCCAGAATCAAAGTT-GCACTTCCACATGGCA----------TTGCTCGAAAAACAGACTTT
>Hr78 21427858 21428146|22466 chr3L 21427003 21430031 scaffold_0 5631298 5634228 + 76318|870 1165
GCGGAATTGAGAAGAACAGGGCGCAAG-CAGATTCGCTAGACTGCCCAAAAGCAAGACTGAAGA-----TGGACCAAGTGCGGGCAATACATGTAGCAACTAGGCAAATCCCATTAATTATATATTTAATATATACAATATATAGTTTAGGATACAATATTCTAACATA-AAACCATGGGTTTATTGTTGTTCACAGATAAAATGGAATCGATTTCCCAATAAAAGCGAATATGTTTTTAAACAGAATGTTTGCATCAGAACTTTGAGATGTATACATTAGATTATTACAACACAA
GCACGGTATACACAAA------GCAAGACTGATGGGT--GGCAGCAAGCAAGCAAGGGGGATGGCAACTTGCGCCTAGTGCGGACAATAC-----------------------TTAGCTATAGCTTAAACATAAATTATATATTAT-----AAACATTATTGCATTATACACGGCGGAAATTCATTTTCCTGCCAA---AAAGTTGAGTCTAACTTACGATTTATACGAG--------CTGACAAAGCGTCT--------AATGTGAGCGGCGTCCG-------ATTCCAATTGGC
>CG33214 21431390 21432055|22472 chr3L 21431650 21432356 scaffold_0 5635454 5636177 + 17679|0 456
TTGAAATATTAGACTGTAGT-------------------GGCACTGTGTAG----GCGGAGTGTGCATGTTTGTGAGCTTGCTGATTTCCATTTCGGCCCATCCAT---GACCCCATTCCGAAACCCAGAAGTATACTTTCACTCAACCCTGTCTGCCTTTCGATATTTGTGTGAGCAATTTGTGGCTTAGTCGTTTGTAAGACCAAAAAATACGCGAGA--------AAGGAGAACACAATCAAATA-------TACTAGTTCCATTCTTAGGGCTCTTTTCGTTAT---------AGCTTTTTTGTAACAATTTCACTTGTATATTAAATTGTATTTTTGTAAACAAAAGCCCCTTCTTTTTAACTATATCCACATGGAAGGCATCAACAGATGTTTCTCTTTGGATCAATACCAGAGCGCTAA-TACGGCAGAGCGCCTAGTTTTGAGTACAAA
TGTGAA---TCGACTGTAGTTAATAATTATATGATGCTAGTTGATATGTAGTATCGTAAAATGTGTGTAGGTTAAAGATGTGCGCTTCCCTCGTTTACCCGCGCTTTTAGTTTCCATTTTGG-------------ACCTCTTCCCAATGCAATCAGCTAT------TTTTTGAGAGCAATTTGTGGCCTAATCGTTTGTAAGACCAAAAAA---GTGTAATTCATTTCACAGAAAACTTAAGTAAATAAGTAATTTGTACGTTTTATTTGATTGTGTTATTTTATTATTATAAACGAATCATATTTTTAAAAA--TCAAATG-ATAGAAAATTAACTATTTTTAAACACGCGCAC--TCTTGCTGAACTTGTCGTGGGTCGCAGTATCGATA-ATTTTTATATTCTTATCGATGTATAAGCGCAACTTGCAGCAGAAGG--TATTTTCCACTACAAA
>SAK 21445982 21446906|22482 chr3L 21444741 21446563 scaffold_8 2854434 2856321 - 42733|1305 1951
TTCAAAAGTTTAT-ACTTTTTGTATAAGTGTGAGGTTAGA------AAATTTTAGTATAAAATATATTATTGTTACGTACGTTTATATATTAAATACGAGATAAATAAATTT-----------ATACTTTTATAC----TTAGTAAAATCTTTAGACTAACATTGCCTTACTAAACTGATGCTACCGCATTTACAAATTACTACGGCAGGATTCGTATTGCTTCAAA---GTTGTAGATGCA-ATAGTGAAATATACACATTAAAA--GTAATTTCTT--GTACAGAT-----TTTAAAGACAATCATGCACGGATGGATTACACTA----TGTAATAATAATAAGTGGCGATTAACTATCCGTATATTAATAAAATGCA--TTCGGCAATTCAGAAGAATCAATTTGAGCAT---AAGCACCTGACTATTGTGTTGGCATGGATTTATTGATTGCAATGTAATAAAAAACGCAAAAATAATAAATGTAAACTAACTTAAGTCAATGGACGGAAGAAAAAAGTCAGTGGAACAGTACAGTAGATAAGAAG------CATAATTTC-----AGTGTAACATTTGATTTG-GCAGTTTAAACATGGT-GCAACTGCTCAACTAA--------TAAAACGATAAACAGTC
TTTAAAATTGTATTACTCTGTATCTTAGTAAACTAACAGAGCGGCCAAATTCAATCAT----TTTATCATATTTACGCCTGTATTTTTATTAAA-ATATCGTTAATAAATGTTCCCTTTATGTATCCTTTTTGACGAGTTTGGCGGCAAATTTAAATATCCATAACATAATTGGATTTAGACATAGTTATGTTTATATTATTGCTAGATCAGGCGTAAATTATTAAAAATGCTTTATTTGTATGTAATTATATACATATGTTAATAATGTAAATACATAAGTATGAATAAGCATATGTACGTAAACATGTACAAATATATTTGAATGATCTTATAATAGTTATATGAAGTGTATAA--AAGCGCAAGGTAAATAAAAGAAAGTTCAGCCAATTAAAAACAAGAACTTGTGGACGGAAAATATAT-ACTTTGGTTCAAACATGTGTGTAT-----GTCAAGTGAACCAACATTTGGACATAAGATAGTTATGTAGACTCTA-TCGATGTAATGAACACTTAAATTTGGAATGTTTTACGGTGGGGTACAAGTAAACCCGTTATTGCTTAAAAGGATACAATTCTGTGTGTACAATTTGCGTATCGTAGTCGTTACTGGCCTAAAGTTATATTAAAATAAAGAACAAT-
>SAK 21445982 21446906|22483 chr3L 21446750 21449736 scaffold_8 2523022 2526029 + 84860|0 184
TTGAATCAAAACTTAATTC-----------CAAAATAGTTTTTTAAGTTTGAACAAATGTACTTGTATTGTAAATTAAGGGTAAATATATTTTTTACGTTTTCCCCGTGCTTATCAAAATAATTGACA----------CAAAAATTATTCAATGT-------AACTATGCTTTCTTTTGTAAGTT
ATGGTATACATTTTTTTTTTAAGAAAAAAGTAAAATTGATTTTGTATTTTAAGGTAGCTTTCATGTTTTATA---------TGAATATATTTTATATCTATT--ACATTGATAGCAGGATGCTATATATTTTGATATTTATATATTACTGAAAATTGGTACAAACTTTGCTTTCCTTTTCAGTTT
>CG32442 21462056 21462530|22492 chr3L 21462100 21463433 scaffold_8 2533629 2534983 + 23647|0 430
CTCTATTGCTGCTAATAATCACCGCCACTCTGAGTATTGATTGGATGCAGAAAATAGGCTTTCGAAATTTTTCTTTAATTATACTCAAAGTGGTGCTGATATCCAACCTGTCCAAGTTCTTCCTTCTGCCCATTTTGGTGTGGCGAAATAACACGACCGTTTTTGGCCGGAACTTGCACCATCTTCTGGTCATGGGACATCACCTCTGCTCCCTGGTCCTCGCCTACCAGGCAGTCGGAGCCACTAGGAAGAACCTTCGATGGTGGGCTCTAACTTTGGTTGTTATAGCTTTCGCCTTCAAGGAAACCGCGAGGCAGTTTGTATCACTAGTGGTGGAGGACAATTGATTATAGAAGGCTGAAAATAGTAAACCAAAATTTTATTTAACAAAAATATAACTCTTCAAAGACAGCACTTTGCTCTGAAATATG
CGATACTCTTGATTTTAATTACCGCAATTTTTAATATGCGTCAGCTGCTCAAAGTCGGTCTGCCGTCAGTAACATTAATTATTCTTAAAGTGGTGGCCATTTCTAACTTCTCAAAGTTTTTTCTCTTGCCTATATTGGTCTGGAGAAGTAACACGACCGATTTTGGACGTAACCTGCACTATATGCTAGTCACTGGTCATCACCTTTGCTCCTTAATAATGGCTTACAGCGTAGTCGGTATCAGCAACAGTCGTCTCCGTTGGCTTACTATAATATTGGTAATTTGTGCATTTGCTGTTAAGGAGTACGTTAGGTATTTAGCAGCATTTAAGTTGGAG-----TTGCATATATC-------------TTAATTATAATTCTATT-------------AATTTTTAAAAACAA-ATTATAGTCTGATATATG
>Mkrn1 21464444 21465309|22494 chr3L 21464391 21467043 scaffold_8 2836591 2839218 - 54476|57 1011
GCTTCTGAAGCAGAAG--------------GAAACAAAAAAAAGAAACATCAGCCCAA--AAGCATTAAAATTTGGATGTAAAGTCCCAGGAACACGTAAACAATATTCACACACGATATATATAAACGATACTGAGCCA-AATATCGAATGCGAAATTAAACAAAATAATGTATTTGGGTACCAAA-TTTAGGTTACATA-----------ATATTTATT-----CTCCACTTAATGCAACGAAATTTACAGCA-ACTTTCCGTACTTGTATTG------AATTAAATTACATTTAATACCTTTAAAATGTGGTTTTACCAAAACC--AGAAGGAACCTTGATATATCATTAA--ATTTCAATACACAACTTTAAGAGTTAAGCAGGAAACAG--TACATT-------------TTCAAAACTGGTGAC---------TGTA-----AATTATGGCTTTCAGACTGAATTGTAAAGAT-AAAAATGCATACATTCTTTAATCGGTTTTCTACTCA---TTTTTTGAAGTTTAACAACTACAACTAAGTGAAACGCACACACCA--ATCCACATGA----GCACATAAATCTGGATACTTGAATACATTCAATATCGAATGAATCTATGTATCAAACCGAGCAGAAACTATTCCCTTTCGCCGATAAATAAAATTTTTGTTATTGTTATGAGCCTTTGTGTTAAAGTATTACTGTTGCATACCTATAATTCAGTATAATTGTAATTGTTGGCCACAAGCGTAATACCCAATCCACTGCAAATATGATATGTATAACATCTTTACTGTATATGAATTTTAAGTTTATACTTTCGAAATGTACCT-----CTTTAAAATGTTTTATTTTTACTGATACAAATGTAATGTGTTGTCCATGGGAAAAGCAACAATTAAATATACAAAGGGAACTAGCATATGAACCCAAAATGTTTAAA
GCTTTTCGCGCCAAGAACAATAATATTATCGGAGCAACTATAAGTAACATATGCATAACTAAAAGTTAGAATCAAGA---AAAG--CAAAAATAACATAAACCTTA--CAATGCTGATATATATATATATTACTGCATGAGAAAATCAAATGTGTAATTAAAAGTAAGAGATCAATTAAGTACCAAATTTTTGTTTACATACGGAAATAAATATATATATTTTTTGCCCAACTTAACGCAACGAAATCAACAGAACATTTTCCGCAAATGCAAAGAACAGCAACTAAATTGTAAAGAAAAACCAAAAGATGCGGTTAAAACTAAATTTAAGAAATTAATATTGTAAAACACTTATCATTTAAAAATAATATTTTAAAA--TAAACAAAAAGCAGGATACATTAAACAGTTAATTATTCAAAATAGGTGATATAAAAATGTGTATACACAACTATGCCTTTCAGACTGAATTGTAAACATAAAAAATAAGCAAATTTTTTATGATGTTTTCCACTTACTGTCCTTTAAAGATT---ACTTATAAATAAGAGATGCGCACACAGGAATATTCAGATGCTCATGCACATACATATGTATACATA---TTATTAAACATAAAATTGTTTTTTGT-------CTATCGGAATCT-----------------------ATTGTTTGTATTGTTACGAAACTACTTATTACCTAATTA--GATATTAACATATAATTGAACAACA---AAAATGCAGCATACATTCTTTGTACTCAACACA---TATACATAAACTATATTA---ATTTATTTGATTGTAATGCTCTTTGCAAATTATTGATACATACTTAGGTATTTTATGTTATGTTATTACCTGTTATACCAACAAA-------TTTCATAGAAAACAACCAATTTAAATAAATTAAACTAAACGAAATATTAAGTTTGTATATTCCAA
>CG7181 21472804 21472912|22498 chr3L 21472734 21473634 scaffold_8 2834965 2835882 - 9367|75 187
TCTGCATA----CGAGACCACACATAGTTAATACGCTTGTAAAGTAGAGAGCATCAATATATCAATAGTGCCCCTGTTACGGGGAAATAAACTATAGTGCATTGAGCCACAAA
TCTGGATGACTTTAAAACCATAAATA-CCATGTTGCTTGTAAAT------------GTAGATTCAAAGTTACCATAATA-----AATTTAACTTAACTACACAAAGCGCTAAA
>CG7177 21477801 21477978|22506 chr3L 21477520 21480269 scaffold_8 2542640 2545463 + 61065|312 519
CTG-------CTCTAAATGTTT---------AGCTTCATGCACTTTTGGCAAGTCATACTAACAGCTCTACTCTATGTTCTCGGCAA-----TATAATTGGCACGA--GCGA----AAGGACGTGGATCTGGAGATAGATTTTAAGTAAAAAGTTGTCAAA-TGTTACGGGGTTGTCTGTAAATAT-TAGTCAAAC-GCTTCTTGTTG
ATATGAATTCCTTTAGAATTGTCGTAGCCGCCGTTCCTCGTATTCATGACAAGTCATA--AACATTGCTACCCAAT-TGTTCGGCAACTGTTCTGAACTGGCACGATTTCGATTTTGAAAATATGGATCTGAAGTTAGTTATTAAGTGAAAAGTTGTCGAATTATGAGGGGATTGTCTGTAAATATGTAGTCACACAGTTTTGAGTTG
>CG7173 21489489 21489491|22511 chr3L 21489462 21489784 scaffold_8 2812779 2813085 - 8825|27 29
ACT
GTT
>capaR 21492815 21493021|22514 chr3L 21492915 21493002 scaffold_7 3022785 3022880 - 1884|0 95
TTTGTAGTTTAAGC--CAAGGACGTCGA------GAACAACCTTTTGTAGAACTAATTTAAGAGCTAAGAATTGCGTATTGGGAATTTAGTGATAT
TCTGTAATGTAAGCTACACAGATATCAAAAAGTGGAATTCCCTTTTATAGAACTGCTTTTAGCTATAATAATAACATGTACGGCTTAAAGTGAAAT
>S1P 21547634 21547665|22570 chr3L 21547254 21547660 scaffold_153 10214 10646 + -2067|417 452
TACT---------TCCACTTTTAAAAAACGGTAAAA
TATCAAAATGCAATTCAATTGCAAAGTAAAGGGAAA
>S1P 21547634 21547665|22571 chr3L 21547661 21549275 scaffold_0 1458361 1459987 - 40908|0 4
ATAAA
ATAAA
>MED1 21562166 21562548|22585 chr3L 21562142 21564136 scaffold_0 222991 225016 + 33256|24 429
CAGAAGAAAGACAGCCGTCATGAGATATTCCTGTTGCTCTATGCGATTTTCTCTTAAAGCTAGCATAGTGAGTTAGTTTAAAGCCATTAGTTACAC---GATT-----TTGTTTTATGATGCATAGAAACTAAGGATCTTATTAGGCAATTTCTTAACTTTATTGGCAGAAAAATGATTTAAAACTCCAAAGGAAATAAATAAAATTTTACAACACGATGGCGAATTTGGTACAAAAT-----CTCAGAGATTATTCCCGATTCTGTTAAGTCGATCAAACCGAAATCACCTTATGCTT--TAAAAATGCATTAGGTAAATCTTAAGGAAAGCGATGCGATATGTA---CGATAAAATC---GCTCTAAATATGTTGTAGAGTATAATAAATGT--ATTCAGTTGG
CA---------------TATTGAGCTGCTTCTTCAACTCGCTGCAATCTC------AACATAGTTCAATTAATGTGTTAAAGGCCTTTGGCTGGACTCTGACTGTGAGCTGTTTTTTGTTTTTTA------------CTTGTCAAATAGGATAAGAAAAACATATTTACAATAAATATTTAATACACATACAAATATGTATGTGCATGAATATTGAAAAAATTGATTTTATAAAAATTAAATCCTCAAAAATTTATCAATATATTATTTAGCT-------CCCGAATAGGCTTATTCTTAGTGAAAATCCATATGGACATCTATTTCAAATATTTTACTAAAGGCATCTTGATAAAATTGGAGCCCTGAGTA--GTGTAGGTAATAATTAATTTGAGTCTAATTGG
>CG7160 21600295 21600317|22622 chr3L 21600296 21601831 scaffold_0 268984 270502 + 17815|0 27
TAA------ACGAGGCACTGAAATGGAA
TAAATAGTGACCAAACGTTGAAAAGAAA
>CG7158 21608235 21608579|22627 chr3L 21606772 21609028 scaffold_0 276339 278674 + 66463|1526 1916
GC--GGGCTCA----------GCTCAAAGATTTCGGGCTCCGTTGCCGAAAAGGCCGACACATGAGGTTTTAGAAAATTAGTTACTTCTTGTTGGCATTGTTAAGTCTCGGTGAATAAGAAACACAAGTGTTGATTTCCCGTAAATAGTCTGTATATACATAGAACGACG---AAATTCCCTCATATGATTACGGGTA--TTGATTCTGTACAGCCGCAATTGATTAGCCCCTAGTACAGCGTAGAAATGTGTATCTATATATTTATGTATGTATTTATCTGTATC----TGTTTTGTATA----TTCTAGGCCAACGCGTTAACATTCCA---ATTACTCACCAAAGCAAATAA----------------ACTATCTACACACACTTG--
ACTCAAGCTCATATTAACCTTGTTACAATTGTTATGGCTT--TTTATGCAACGATCAA-----------TTTAAATGCTAATTTATGCTTATTGCCACGTGCACACCAAAGTAAG---AAAATATTCGCGTAAACGT----TATATACCCTGTATATAGAGAAAAAGAAGTGCAACTGTCCTCATAGGCATAGGATTAGGTTTGTTATTTAAATGTACAGTCGTCGAAGGATTTTTGCAGTGTATCGATCTGTTTATA-ATGTATGTACATGTATATTTCTATAATACAACATATTAGATAACAATTTAAGATTAACACATTCCGAATCAATACATGATTTCTCGTAACAAGTAATTCAATTCATTTTTGTAATATCTGAATTCTGTCACT
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GTCGAGTATATTTGTACAGATGTTTTGCCCCTGTGAACACACATACTCCAGTAAGTAATAGTAATAGGCTTAATACCCATTTGACTAGCCAAGTAAAGCGATCGCCTAAGCAAACACGAAATGTT--GTACATACTGCAATGGCCCCGAGCCACACACACACACACTCGGTGAGCAAGCCAATCTCAATAAAAG--------------------AAAAGAAGCCGA
GTTTGGCAAATATCAAAAGAT-TTATGCCTCTATAAGCAATTAGGCCCGAATAATGGGCAACATTTAAGAAGAAAAACATTTGTTTAACCAAGTAAA-CGATTGTTTAAGCCAACACGAAATGTTATGTACATAATGCC----------------CACAGGCACACACGATGAGCAAAT-ACTCTCAATAAAAGCAGATAAAAAACAAAAAACAAAAAGAAACCTA
>CG32447 21626643 21627443|22640 chr3L 21627271 21627966 scaffold_0 298471 299245 + 11896|0 226
GTAATCCCGAGGAGATCCCAAGGAGTGCCGAG------------CATCGAGAACACTGGAACTGAGTATTTTTTCTTAACTTTAAG------------------------------------------GTACGGCTCCCAAGGAGCAGCAATAAGAAAATGATATTCCACGATCATTTCACATAGTGTAATATTTTTGTCATAACTGCTAAGATCTTTGCATCTAAG
CT--------GGAGGAGCAGAGGAATGCAGAGAAGCACTGGAGCTATCGAGAACACTGGAACTGAGTATTTTTTCTTAATATTAAGCTGCAGCACAAAGCGCTCCCCGCACACCCCCACACGCCCCTAATACGGCTCCCAAGGAGCCGCAATAAGTGAAT----------AAACGGAATAAATAGTGTAATACATTTGTCATAATTGCTAAGCTTTTAGGTTATAAG
>CG11247 21658166 21658739|22673 chr3L 21658092 21659824 scaffold_0 334600 336281 + 61908|83 680
AATCCAGGAGTTGATA---GCCAACGCCAAATGCGAGTGTGCCATAGAAGAAGGATTTGTAGAACTAGTTCTTGCCATTTAGTTTAGTGTTTAGTAACCCAAAGTTGCAGA-ACGAAACCCAACCAAATAATTTATCCCAAAGATATATACTTTGTAGTACAGGTCATTTTAATGAATTACTACCCTTAATCCCAATTTTGCTGCTACCAAAAAGTATAATTTGAAGAATGTATGAGTTAGTGTTGTCATAATAATTTCCCTATTAAAGGAAATTAGTTTAAGAACGAATTTCGATGCAATAATTTATAAAATAATAGGCATAACACGATTGAAACCTGAAATATTTTTGTATGCTTAGTCTTGCCAGAGCAACAGATTGTCCCGGAGTGAATCTATAACAGCTCAAGTACAATACAACTCATTGTGGCCATGCTTGTAAAATTAATAAG------CTTAATGCATTTAGTTGCCATTTGTCT----TTTCCAACAA--AAGTGCAAAATCTGAAG--------TGTACAACTGAAATGCAAATCAAAATACGCAAGTGAAAAAATGAAATGAATAATAAATATTATTTGTGACTACA
AAAGCAACTATTGCTCAGTGCTTCTGACTAAAGCGATTGTGCCATAGAGTAAACGCGCTTAGAATTAGTTCTTGCCATTTAATTTAGCTT----AAACCCAAAAAGTTAAATAGAAAATTTTACCAAATGATTTAGTCCAAAGATGTTAGGATTTAAGCACCGATACATTGAATTTA--------CATTATATTAGTTTTGCCTTTACCAAAAA--------------------------------------------------CAAAAAAAA------AAAAAACAAGTTTTATT--AACAACACATGAAA----ACACACAAAGTGA----------ATATGTTCCGTTAAACGAAAACTTGCCAGAGCAGT-GCTTACCGCTTAGTTTTTACTCAA-AGTTCAATTA-AATTCAATTCATTGTGGCCATGCATATTTATTTACAGAGTAGCATTTAAGTCCACATCATTATCGTTAGTTTACAATGTACAACCATCATTTACGAAACCAAAAAAAAACCATTGTATAATCCCAATATTAATTAAGTATTGTAGATGTACACGT----TAAGAAGTAAATACCATTAGCAAGTTTA
>CG14569 21664565 21664774|22678 chr3L 21664764 21666129 scaffold_0 341152 342557 + 28775|0 10
ACTTTAAAACT
AATTATAACCT
>CG14568 21666650 21666777|22679 chr3L 21666159 21667590 scaffold_0 343414 344770 + 22214|512 639
AATGGGTCAACCCTAATTTGCTAGAAATCAAATGGAATCGACTCATTAGGATATGCATTTATTACTTTGTCGCTAAATAAATTGTTGTTGAATATTTTAATTTAAATAATAAAATAATTGCGTTAATA
GA----------------------------------------------------------------------------AGAATATTGTTG--------------------AGAATGTTTTTGCGAATT
>CG14565 21677085 21677265|22685 chr3L 21677152 21678426 scaffold_0 353520 354938 + 26348|0 113
CTTTCCCAAGGAGGCGTGCCAGGACGAATCAATTAACCCGGCGCGATGGCCACGGGGACTCTGTTAAAGTTTCTTCTTAACTCCTTTTGTTACCTCTTCAATATGCTTATCGAA
TTTTCGCA----------CCAGAAAG-------CACTTTGGAGCGGTTTCAA----------GTTAAAGTTTGTTTTTA---------------TGCTAAATACGACTATCGAA
>Syn1 21680345 21680373|22688 chr3L 21679198 21681687 scaffold_0 355987 358354 + 73363|1220 1248
-ACGAGGTTGAATTGGAAAGGTAGTCTGA
AGCGACATTTTGT----------GCCGGA
>CG7145 21770651 21771329|22779 chr3L 21770509 21770724 scaffold_20 200580 200779 + -1110|149 222
TTGGGTTCCGTTTTCAACATTTCGTTTAACCCAAAATGCTATCCGCATCGATTGGGGCAGTTCCTTTACCCGAA
AGAAGATC-----TCAATATCTCAACTCAATTGAACTGATCT-------GATTTGATCTCATTTTGCGCGTGTG
>CG7145 21770651 21771329|22780 chr3L 21770725 21772160 scaffold_8 4153882 4155329 - 42806|0 666
GCTGGCCGACAGAAGATGCGCAAGGGGAATGGGATGAGCAAAAGTAGTGAAAACCAGACAGGAATCTCATAT-AACTACTAACTA---TATAAACAT-------ACTTAAATGTATTTTGTTGAAATACTTTTAA-ACATCTCCAACACCCAAAGACCTGCCCCGTAACCCTACA------TACCTAGTTCA--GATAGCTTCGATTTGTATACACACACACTCTAAGAATCTCA----AAACAACCCATGAGAATGCCTCGAAAGTTTGTAAATTGATATGCTGA-TACCTTCGAACTACAAACACACCATGACATGGATATTTTAAATGAATACTATGTAAT--ATCATTATTTTACG-ATTTAAACGCAATGTGATTATTTAATTATATATGATTTATAATTAAATG------GCCCGCCTTATGTT-------------------TTATTCGTTATCGAAATTGCTTGAAT---TGGTTGAACCGTTTTCAAT-TATAAAATACTTAATGTACACACCTATGTATGTGAAATCAAAC-----GACAATACATTCTGAATACTAAATGTGAAAGATCATGAAGAGATAAAGTGAAACCTAGTTACATGTAACGTAAGCATCAAATTCATATTAATAAATATAACAAAGAATTAAAAAGAATTAT
-------GATAGAAGA-------------------GAGCAAA-----TTAGAAAACGACAGGAATCTCATTTAAACTACTAACTCATTTATAAATATAAAGGGAATGTATATGTATTTTGTTGAACTATTTTTAACACGTACCTTTCTCCCTAACAGCC-CCTAGTTAACCGACACATTTGTATGTAGTTAAACGATATATCAAATCTCT----------GCTGTATTTTTCTCGCCTCGAACAACC-----AAATGC--CGAAAGATGTAAAATTGATATGCTGATTACATTTAAAACTCACACACAGAAACCTAATGTAACTCGAATTATAAAATATGTTTTTAATTACAAAGTAAAGTTTTTGAACCGATTGTGATTATTTAATTATATA-ATTTCATAATTATTTGATTTGAATCGGCTTTGTTGTCATACCCAACGCAATAAAGTTACACGTAGTTACTATTGCTTATATACCTATATATACCGCTTAATGTATATATAGCAAAGTATGCATACAC---TATACATACAAGCAAACTACTTGACAATACCACTTGAATACTAAATGTGAACAAACA--AATATGAAAAATACAA---AGTTACATA-AACACAAAATTGAAGTTCATTCAAATAAATAT----ATAAATTCAAAATTATTGT
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ACAGACAAATTTACTTCACTTTAAGATTAAAACATTTTCACATTCAATTCCAAATTAAAAAACAATAATAATTTTTTGCTAGCACATATCCTAGTTATTAAAATCTCAATCTGGCTCTGGACAGCAAATTGATT---AGGATTGTTTATTTCTTTTTTTTACTGCTGTTTATTATTTTTTTTTTCAAATCGAGTAATGAAACTCTTAGATTTAATTTTTTTTGTTTTATTTTTCCAATTTTAGGCTTAAGTATTAATGTTGATCATTACCATT----------------ACCATCCA--TCCGTTAATTAATAAAACACAACGCTCTGTCAATGCTAAATA
ACAGACAAATATATCTGTTGCTCACTTAGAGCTATTTTTATAT--------------AAGAAGGATATAGATTTTTGGCTATAACTCGGCGAAATCCTTAAGG-----ATCTGGTATGAGCACACTTTTTGACTCGCAGGATCGTGCGTCAAATCGATCCGTAAGGATTTAGTA----------CAATTAATATAATGAAAACCTATGTCAAACTTAAATTTATCCTAATCTTAAAGTAGTCAGGACAAGTATTATTGTATGCAGATATTATTGTTCGGCTCTCACAGGAGCATGCAATGCTATAATTTATTACTATTCAAAAGTTGCTTATAAATAAATA
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AATTTATATCTACTTATATTTGTACATACAAAATTGTTTTCAGTTTAATAAAAATTTT---ATTTAAATTACATTTAATTTT
AATTTAAACAAATTTTTAGTTTAATA---AAAATTGTTCTCCCTTAAAGCGAAATTTCTAAATTTAAATAAGATTTCGAGAT
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GCATAAATAACACGCATGATTCGGCCATTGTCCTTTG
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GCAAGCAAATTTAATAAAATATCCAGCAAAAGTTTTTTAATTAACCAAGTGCAG---------------CAGTTGGCCGGCAATAGCGTACACCTCGT-------ACCTCAACTTTCTACAGCATCTGCTTCA
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CTTTAAGTTTCTTAAGTTCTTATAAAATTAAAATTCAAAGTACTTCCAACGATA--------TTTATATCATC---TAATATGTATAATATGCAGGA--------------AAAACTTTACATAATGTAAGACTT------------------GTATATATATTAAATTTAAG-----------CCAAAAATTATTATTAAAAT--AGTTGCATAAGTAAACAATTGCACTATCACTTACAAAACTCAAAAACAGGTTAAAATGTGCGTA-------A
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AT--ATTTGCATTGAGCGTCAATATATAAAGCTGTATGACTTTCAGCAACATTGGATACACAATTCATTTAAAGCCATCATATTTAGCGCTACCTCATTTTA-ATATTTTTTGTATAAGAATTCTTACAAAATTAACAGTCTA------------------------TCGATATTTACATTCGTATTATTTTGTGTGTTCATCAAGACATTCCCCACACTTTTTAATAAGCACCTCCTATTCATTATTACAACTATT--TTCTATTTGCTTTTAAGTATGTTTAACA
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ACA--CAGACGCAGTACGC-ATACG--------GATATAGAATTAACATACTCAG--------TGAGTGTACGTAATTGGTGTGTTAGGTGAGGGACGATATGTGTTTGTTGCATGTTGCTGTACATTGCATATGTAGTTGTCGTTAAAA-GATTTGTTAATTGTTAGCCGA-------ACTCTTACAGGA------------------------ACACACACAACGAAACGAGCATCGTTG-------AAGGCAAAT-----ACTTGTATTAAG-ATACGTAAATGTAATTATTCATAAATTAATAGATGAAATTTGCTGCAATATTTGTTAATTAAAAATTTACAAAAATCTATACATAATTATA-----CAAAAATAAATATATTTTTATTAATAACTCTGGCCATGCATTAT
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CACTCTCCGAAAGAACAACTTCAAATTGAGGCTGT--ACTCATTAAACACAAGATTTTAATGTTAGTTTATTTATGTATTT-----------------------------------------------TATGTACTCGTAACCGTGAAAGTATTTCGGA-----------------------------------------TCGTGTAACAACCCAAAATCGAACCAG------TTTAGACTTTTAAGCGTTTCAAGAATAAAGATTGTGATTGC
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ATGCCATAGGGCAAGCGATTCTTAACCGAGTATTTAGCTATATAGTTTTT--GATAATCGATCATTGTGCATTATGCTTACGAATAATGAGTATATTATTCTATTGTTAAACTTAATAATAATATTTGATATATGATAATAACCCAACTAAACCCATGTCTGCGCATATAAGGCAAAAGTATTCAGCATTTTGATACAT-TATTTGTATAAATAAAGTGCATATGCAAACCAAATGATCA--------G
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ATCCATATAAATATATATAATAACTAATAATATTACGAGTAAAAAGCGATTTCAATAAAAATGAAAATATAAAAAAATAAAC
GCCCGCATATAT-TATACAACCA-TAATAATATAACGAATGCAA--CGATTTCAATAAAATTAAAATTAAAAAAAAA--AAT
>Ten-m 22226873 22229428|23238 chr3L 22226955 22228661 scaffold_0 7052409 7054408 + 26331|0 2115
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>Ten-m 22226873 22229428|23239 chr3L 22228699 22239553 scaffold_0 7054460 7065622 + 494549|0 878
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GTAGAGGAGGATCTAGAGAG--TGAAGCTAGCAATGAAGCCATGGAAGAGT---ATGACGGGCCA----------------GAGGACTACTTGATAGCTGTGGATAAAGCTGTCCGCATGACAAACACCGAGGCAGCCGAAGAGCAGTTTTTGTAATTACTTAGGTGAAAT--AAAGCAGCGATAAACGGTAAGCGATAAGCGATAAGCATTAAGCACAACACACAAA-----ACAAAAAAGAAAACAAAAAAACACGACACAGTTCAATTTAACTCATTAATACAGACTTTAATCGCGTTTAAAGTTTAATATTAGTAACCAGGCAAACCCGAACACTAACGAAAAACAAACCAGCAATTCACGTAAATTTCTATAAATGTACGTATACAGAACAAATATATGTATGTATGTTGATGTTGAGTTTAGGGTAACAATAGGGATATGTTTAGACCA--TGTGCAACATTATATGTATATTTTATAAATCTGGCAAATCTAATGCAAGGCGAGC-ACCTCCTTTCAAAGAGAGCCCGCCAGCTCGTACGACATACGAGAGGCGTATAAAGTGAACATTCTTTCCTTCAGGCATATAGATTTGTAGGAAAAAGGAGGGCTAGAAGAAAACATAGAACTCTGTCGAATTCCCTGAAGACAAACCACGTTTTTCTCGGTATCCAAAATTCCAAGGAGAACCGCCTTTTAGATTCAGTCTACAGAAGTCTTATTAGCCAGTTGCATT-CGATGTCA---GACAAGTATTACACAAAAAAAAAAAAAAGGAAAACAAAAGAAACGAAATAAATTACGCATATTCGAATAGGTA-ATATATTAATATACATATATCATAAATTAATGTAAAAAGTTGAGAGTCCCCC
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GCTGCCACTTGCCGCATGCTTGCCAAATGTGGTCTAAGCCGACAGCCGGCAGAGACTTATCTATGGGATGGGGCCGGTCCGCTGCTGACAATGCAATGCGACAGCTATTTCGACTATTTTTCCATT-AGAAATCGACGCAAAC-GAAATATGTGATAAGCGCGCCACGCACTGTTTACCTGATATGC--ACATACTGCTTTAAGCTA----AATGATTTACGAAATCCAAGGCGAGACGGCGACATTGTGCAATGGCTATTCGTCCATCTGGCAACGCTGCAGCCGCACAGTGGGACGGCCAGGCAAAATTGTCCACGATTGAGGATTTGTTTCAAAATTTATGGCGTGTTAACGGCTCATTGTAGACTCTGTATTTATTTGCACAGCGTTTTTCTAGAGCTTCGATTTAGCCCGCATTATCGCAATTTCGCAATCGCACCCATTGTACTTGCCGAGGCAGCGATATTATGGTGTCGTTGC-AATTACCCCGTCTGGTAAAGGCGGCTA-CTTTTCGGCTGCAGCTTGTTTGTTTTGCAAACAATGCCGCAGTCATGTCGCAGCCGCCACT-------TTGAAGTGGGCAGATGGCCAGCGGCAGCATGTGGCATGTGGCATGCAGCTTGCTTTCCAATCAGCTGATACAATCTTCAGGCAGCGACGCTGACTGCCGCCGGCGTCGAATAGTTTTGAATGCTCTGCGATAGTCGCACAGTTGATAAGGCATTAAAAATAGTGTACAAAAAATAAAAATAAATA----------AATTATAAACAAGAAAAATGTGCTAGGCCACATTTAAGATTTATAAGCCGCACGATTTATGAACAGAACTATTTACAATTATTTGTTTTATGTTAATTATGTTTAGTTTTTGTCAGATTTTGTTTGCTTTAGTTGTCGAGTGTCCACTGTTTGTGCTTTAAAATAAATTAACCAATTATTCTTAAATTGATTTATTAAATTCCATTTTTCCAAGCTCAACA
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GCAGACAATTGGCCCGCTGCTGCGGCTCTCCAAGGACTTTATTATGCCAAGGATTGCGCGTTTTTAGCGCGCTTAAAAATGCTTTTCTTGTAGC-------AGC--CCAGCCAAGCAGGAATCAAATCAAATAAAATATTCATTTTGATCTTTGAACTGTGCATAAATATGCACCCGCCAACT----------GCCACACAGATTTGCCAGCATATAAAAATATATAAAAATGCGGTTTGGTGCCGCACTTTATCATCATCCTGGCAAGGACGAC
>CG6838 22648154 22648784|23623 chr3L 22647814 22648255 scaffold_17 551903 552395 - 1765|408 509
AGTATAGAAAATATCATTTTAAATTTAACTTGAACGTTATAACGTCGGCATTTAACTGGATTGAAAAAGTTATGAATATATAAATACAACTATTTAGAGCAT
AGTATTGAATAATCCATTATA--TTTTCTTTACGTATCATCATGACAGCATTTGATCGGATTGGAAAAAGCATGAAAAATAAGTTTCACCTATTTAAAA-AC
>CG6838 22648154 22648784|23624 chr3L 22648313 22648961 scaffold_0 7543773 7544404 + 8493|0 512
TATCAGCGAAACACCCATGGTGACCCGCAAAGCAGCGCTGGCATGAGAAGCAGCAGCAGCGTCATCAGAGAGCAGTCTAGTAATAACGTTTTTATATATTAGCTGTCGC---------GATTATG--CAGAAAGTTTTCAAGGACTCCAAGCCGATAGCCACGTAGTCTTGTTACAGAGGAGCAACCACTTCACATGCCTCATATCGTTCTTGTATACACAA------ATAGCAGAAACAGAAGAATCTAAAACAAAATT------GAAGCGGTAGAGCCAGCTGTACAATACGCGTAGTGTCTTTTAAATATACATAAATACACCATTCAGATTAAGAATGTAACCA----TGTGCATTAAGTCTGTGCACTTTTTTCTAAGTTCGAT------TGTTTT--------ACTTTGTTTTTATCCATTGCAGACTATATGTGCACCTATGTTTTGAAATTACAATTTGCATTTCGGCTGGGCAGCTTTTAATTTTTTCCGTTTATCATCAACTT
TAGC--------------------------GGCAACATCAGCACTAAAAGCAACCGAAGT---------TAACCATTAAATGA-----TTTTTATATAATATATGTCACTCCAATTTAGAATATGTCCAAAAAGTTATAAACAATTCCAAGCCGACAGCTGTGTAGCATTGAATTTGAGAATCGA------------TTTCAAAAGATTCTTGTATAAACAACACCATATAAACTTAAACGTAGTGTCTTCAGCAACATTATACACAAATACATTGTACAACTTGTGCATTATATGCAG-----ATGAAAGATATGCAAA---GTTATTTGAACGAATGATGATATCGCAATTGTGGAACAACCATTAGCTCTTAAGTCGAA--TCGATAGCTGCTGTTTTTCTATGGCATTTTGTTTTCATTTTTTATATATTATTATTATTATTA----TTGTATCTGCATAAGGCATTTC-------TAAGTTTTAATACTTT--GTTAATCTTGAAATT
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AAAGCTACA---------AGTGTAAGAAT----ATGAACTCGACTCTTTTTGGC-CTTTGCACTTTGTATTATAATG---ACCCGTTGAACAATTTTATGCACAATA
AAGCTCACATACTCTCGTTATATAAAAACTTAAATTAATTAAATTCAAATTAATGTTTTACATTTTGTATTTAAATGTAAAATCGTTTAA-AAGTCTCTGCACCAGA
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TCTCCCCGGGATGGAGGCTT-----------------------TAAAGTGGACGTTATATACGAAGATAGGTT--ATTGTTTTCTGTGTAAACACTGTATCCCACGACTTCGCATTGAGCTTGTTTTTA------GATGACCCC------GCAAACATTTTATGTTTCCGTAT---------------TATCTGT-----------TGCATTGGGTTATATTTGGTGGGAAAATTAAGGGAGGGATGGGCAATGTGAGAATCAAAGCGCAAACTCGTGATGTTGGTTGATAAAGCAAA-------ATATATAATTCATACT------------------------------------TGATAAATCGA-----TATAGCATATTGAAGGACCTAACTATCGACGGCTAGTGGAAATTAC----------------------------------------------ACTGCAATGTTAAATGCCAGCCACTCCAGAAA------AACGGCGAATCTGATCCGGGACAGGACGTCCCGC-ACAGCGA-----TTGAAAAGAAGAGCAAATGCG---ATATATTTTTTGTTAAGAACAAAGGATTACCTAAGCACTT---------CAGTAGTTTGTG--CTTCAGTACGTAG---------CAAGCAAGAATTGAAATAAATTATTATGAGACAACAAA
-------GGCGAGGAGGCTTGTTTTGGGTGCAGTTGTTGTTGATGCTGTGTGTGCTTTTTACTCAAATTGATTCAGTTTTGTTATTTGTAAGCCGCCCAACCTACG---CCACCTAGCGCTTGTTTTTAGCAACCGAAAACCCTTTTATATCGAGCTATATATATTCACATATATATATATATATATATATCTATATACAAATAAGTGTATTGCGAAGGATTCGAAGTGGAGGCAATGGAGGCGACGG--AAACGGAGCATCAAAGCGCAGACTTGTGATGTTGATTGAATTACCGGATATATATATATATAAATTATACTATAACAAAGTGTAGAATATATTTTAATTTTGTTGTATAAAAAAGCGAATGTTTATAAAAAATTATCGAAAATAATAATTGTAAATTAGTGCAAAATGCAAAATCAACAAAAATAAACTAAACACACGGCACAGTTGCATTTCGAAATGCAAAATTAAATAATATCGAAATATTAAATCTGCTAACAAGGGAATTAATTAACAATTAAACGATCCACTGCAGCAAACACTTTGGATCAAAGAATCCATATATACACATATATTTTGTTAAAAACAAAATTATATTTAAATAAATAATAGAGAACAAGAATCTGTGCACTTGTGTTCGTAGTTTGTGCTTCAATCAACAAATGAAATAAATTTCTGAGCAAAAAATTA
>jim 22729817 22731752|23683 chr3L 22728720 22731388 scaffold_8 2073284 2076097 - 39052|1301 3122
AGGAGAGACAG---------GAGCCGGAGGCAGGAATTCAAAGTTAATAAACACAAACTATTCACCATACTTCATAGGTTC--------------GATTAGTTCTTTAGTATTAGACGCAAAAC----AAATTCTCCTAGTTTTTAAAACTAATCTTAAAATCACAAAACACAGTTTGGTAATGGCAAACGAACGAACCGAGAGGAGCTGAACAGAACGCAAACAGGACGAGTACTAGTCTTTTTGAAAAGGACTCTAAACTTCTTTAATATA---------------------------------------AACCATGAACATAAAATGCAAATGGTCAATGTGTAAGAGAAGTAATGAGCAGAATGAAGGAGAGAAACGAG------AGCCAAAACACAACGTTATACGATTTCTATTTGTTTTAGCACCCCAACAACTTTTAAGACTAAAAATACATCAAATATTTATACACACAAAAACACACGGACACTTTAGTACAGGCAAATTTCGTAACCCTTAATTTTGGATACAATTAATCGAGGATATACCACTT--AGGCGTAATACTAGGATAGCTC-------CGATACAATGAGTATGAACATGTGACGTGATAGATAGGGCAGCTATTTGTGGCGAAGGCAGAAGGGGCAG--AGCAAAAGGTTGAT--GGCAAAGAATAGGATGGGGAACGCAGACGTTGGCGCTGAGTAATTTGATTTT--------------TGAAGCAGCATCAAAATT---TGAGTTATATATA--------------CTTCAGATATGTTGATGT--ATTGGAGTTTTTGTTTA--------------------------------ATGCGCATGGTTGATCG-----ATTTACGCTTGGCTCAGCCAAGGGGATTAGCCAATGGGCCACCAAACTCTTATTAGAAATTT-------CTTTTTCATTTCAATTGATATGTGATTTTTAAAGTGTA------------TAAATGAATACTGGAATGCAATTTAATGATACGA-----TAAATCAAGTATAAGTTATGAAACCTTAAGTACATTGACTTAGGATT--------------CATTTGTTGTCTTCCCCAACTAATTATGTGTAATTTATGTTGAGTTTTTATTTAGTTATTAGGCAC-----GCATACGTTTAACCCAAATATGTCCACACTTTTGCACACACAAGGCAGACAA----------------AAGAAATCAGCTGGAACATCTTGTTTATCAAGCAGGCAAA------TTCGAATGTGACTCTTCAGGTGCCATACACAAACATAAACAATAGTCAAAAGATTATGGATAATCGCGTATCAATC-CTCCAACTTATACTCAGTATAATCTACCGTAATGATGACCACCCGATCCCCACCATCTAAGTTCTTCCCCTGCCAACTGTGTGGATATAAT--------CGACAAATTTAGTTTCTTAACAAATTTTCCAATGTACCGTCAAAGCATTTATAACTGTTATTGATATTTTAGAATATGTTTCCTAAAAAGTATACATATTTTATGTATATGTAGAAAACACCGTGGAAGATAAGAAATT-ATATTCAGTTAGTCGTTTCACTTTATCAAGT-ATCTACTCATTATTTCATAAATTTAATAATTAGTCAATTAAGTTTCTAATGCAATCAAAGTAAGTGCTCCGAATACGGTTTGTTTTCACTGTTTTAAATTTAAA---GTTTATGAATTATGTTTGGATATTTTATTTA--AATTT----------TTTCAAT----AAAACAATTATATGATTTATCAGA
AGGAGAATCGGAAAAGTTGCGAAATTGAGGCAGAAAATAAAA-----CAAA---AAAATATTCACGCTATTTAATAGGTTTTCATGATAGTTCTGGATAAGTTCTTTAGTTTAAAATGCGACAACACGAAATTCTCCTAGTTTTTAAAA---------AAGAGTCAAAACACAGTTTTG--------------------GTCAGACACAGAACGAAGCATGAACAG-ACGAGTACTAGTCTTTTCGAAAAGGACTCTAAACTCCTTTGACACACACACACGTACACACTCACACACACACACACACACACACAACCATAAACATCAAATGCAAA------ATGGTAAAAAAAAATGTGGACCATTTGGTTCAAGAACTTTGCGTAGATTAACCAAAACACAACGTTATACGATTCCT-TTTTCTATAAAATTTCG-----TTTTAGGATTTT---TACTTTTAAAAACTAT---CATAAAAATATA---ACATATTTATAAAG--AAGGTTCATTA---------------ACACACAACACGAGTTATACGATTTCTAGGCGTACTGTTAGGATAGTTGGTGAGAGTGCGACAAGGAGAGAGAGAGAGAGGATCGAGGGATAGAGAA--CGAGAGTGGGAGATTTGTATGGGGCAGCTAGCGAGAAGGGGATTGGGGGGGGGTTAAAAAGG----CGTCGACGTTG-CGCTGAGCAAATTATGTTTATATCGTTTGGCAAGAAGACAGCAGCTAACTTATATGATTTATATATAAATATATAATTTTGCTTGTAATATTTGAATATTCATTTGAATTGATCTTCAGACAACTGAATTGAAATAATATAAAGGATTTTATTTATATAGTTTATTATGATTATGTACACATAAAAC--CCTATTAGTTTACCTTGGGAGTTAC-----TCGTATCACAAGCTAGCGAAAACTTGCTTATTTTTATTGAGATGTGATTTTTTTATTATAATTAAAAAGCAACAAAAAAAAAGAAGATTACAACTAAAAAATTCGAACATGCAATTTATATTTAAACAATTATACAATTTGTATTTTAAGTTGTAAATTTATTGGAAACAAACATTTGTTGTCTACCCTAATTGTTTGTGTGTAATTTATGTTGAGTTTTATTTTATTT--TAGTAACTAGCAATACACATTTAAATGTAATATGTCCAATTATGTCCACACATAGGCAAAACCCCGACCCATCCCCACCCACCAAATCCGACA-CACAAAATGTTTATAAAAATAGCAAAAGGTTATCCAGATGTGACTCTTCAGGTGCCATACATTAA--TGAACAATAGTCAGATATGCACTTACAAAAAAAAAAAAAACACTCGAACTTCTACGTA-------CTATCCAAACGTTCACAAATCTA-----ATATTCTGTATTTCTCCATCTGTATCTGTGTGGATATAAAACTGAAAACAACAAATTTAGTTTCTTATCAAATTTTCCAATGTACCGTCAAAGCATTTATAATTGTTACTAATCTAATAGAATATGTTTCCTATA--------------------------------ACAACAAATGAACAGAAATTAATTATAATTTAGCAATCCCCCATTTGCAAGTAATCTACTCATTATTTAAT------------------------------------------------------------------------GCTATATATATATATGTATGTATGCTATATGTATGCAATTTTTATTTCTTAATGTTAATGTTAAGTTTCAATTCGAAATCAAATTACGAAATTGATTTGT
>jim 22729817 22731752|23684 chr3L 22731389 22732341 scaffold_8 2076260 2077307 - 48206|0 426
CATCCCACCACTGCAGCAACTGGGGCACAACAACAGCAGCCATCGGCGCCGCAGCAGCAGCACCATCCG---------------------------------------------------CCGCCACCTCCGCCCACGTCGACCGCGCATCACATTGCATCAGCGGCCGCCGCTGTCACCGCGGTCACGCCCTCATCCGCCCACGCCTCACCAGTTGCGGCGCCACAGACTGTGACGCTCTCGATCACGCTGCCGCCGCCACCGGCCTCCCATACGGTCCATCCGGGTCACCCGGGTCATCCGGGTCAT------CCGGGCGTGGCTAACGGGGCAGCGCCTCCGCCAC------CAACTCTATCACACGCGATTCCCATTCATCCACACATACACTCGATATTCGGATCTCTATGATGTCATCAGT
CATCCCACCACTGGAGCAGCTGGAGCGCAACAACAACAACAGCAGCAGCAACAGCAGCAGCAGCAACAGCAGCAACAGCAACAGCAATCGGTGGCGGCAACAACAACAACGCATCTTGCCCCGCCGCCAGCGCCGCCGACAAGTGCGCATCATATCACGGCAACGGGTGCCG------CAACAGCCCCGCCCACATCCACACACGCCTCGACGGTGGCAGCGCCGCAGACGGTGACATTGTCCATAACGCTGCCGCCGCCGCCG--CCGCCAT-CGGCGCATCCGCCGCATCCG---CATGCAGGACATGCGCTGGCGGCCACGCCCAATGGCGTTGTGCCCGCGCCGCCGTCTGCGACCCTGTCGCATGCAATACCCATACACCCACACATACACTCGATATTCGGATCTCTATGATGTCATCAGT
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TTTTACACATATAGATTCTCTTTATTTGATCATAGATAAATTGGTTTA----------AACTAAA---AT
ATTGTAACTTTAAACTTTCCTTTATTGGATCATAGATAAATTTGTTTAAACACAGAATAACTAAATATAT
>Arf79F 22802345 22802922|23751 chr3L 22801179 22803108 scaffold_8 2155076 2157121 - 58072|1274 1957
TTAAAC----------------------------ACTAAAATTAAAGCAACAATATGAATACA-ACTAACTCTGATTTCAAGCGAGCCGAAGCAGTTAA----CCAGCAACCAGAACCATAGAAAGAGCGGCTGAAGGACATCCAACATCCAGCGGTAAACGGTGGAAATCGACATCAGAAGGAATTTTCACAAAACAGCAGCAGCGGCACCAACACCAACAACAAGAGCAGCAGATCTTCGCATAACTTAAAGGGCTCCGCATGTCCGTATTTCCAAACAAGAAA-----------------------------CTGAAATTGTTTATTGAATTGCAAAAACATAAC------------------------CTTTCAAG-------CAGCATATAAA-GAACGCTATAATATAATTTAAATTCGTATACATAATTATTGGATGTTTAAAAGCAAAT-CGAGTAAAAGAAAAGCCCAACCAATCACACAAGAAAGGAAACTATAGTATATGGTATAAAAATGTCTTTTTTAAGTTATTTTTGTCCTCTCCCTACCCCTCATCAAAATATATATTTCTTTTTAATTTTATA---ATATTAAAGTAATATTAATGAGAAA---AAACTGTAATTGTAATTGCTCTTTAAAAATACAA-----CAAATACCATTTTAATTTTTAACC
ATAAACTACAGCAACAGCAACAGCAGCAGCAGCAGCAACAACCACAACAACAAAATAATTATACACTAACATTGATTTTAAAAG---CAAAGCAGCAAAATCTTCAACAGCAAAAGCAACAACAACAACAACAAAAACAAAAACGGCAACAAGAAGAAGAAG---------------AGAAGACAACGGCATTAAATAAGTG----GGAAGTAATATCAAGAGGAAGCATAGCG-----------AACTTTGGGTTCTGCGCATTTCCATTTTCCAAAAAAAAAAAAAACACCCGCAAAACCGCGCCGCGCATAATTAAAACTTGTTTAAGAATCGCAAAAACACCGCACTCAAAACAAAAACAAAAAAACACTTTCAAAGCAGCATCAGCATATAAAAGAACGCTATGATTTAAATTTA---TATATATATAATTATTGGATGTTTAAATGCAAAAATGAGTAAAAAGAAAACCCAACCA-CCACAACAGAAG-------------TATG---------TATCTTTATTAAGTTAGTTTTGCCCTTTCCCT------CATCAA--TATATATTTCTTTTTAATTTTATATATATATAAAAGTAATAATAATGAGTAATGAAAACTGTAATTGTAATTG-TCTTAAAAAATACAAGAAAAAAAAAACAATTTGAATTATT----
>Chro 22807541 22808442|23755 chr3L 22805076 22807981 scaffold_8 2159559 2162591 - 47232|2711 3168
ATGATTGGTAATATTTTTGACTTCCTTTTAACTTACAACTCGTAAAATCATTAAGTAAATCTTTGTCGTAGAAAGTTTTAAAGTTCCCGAAATGCATAATTTTGCTTTTAACAAGAATCGTTAAATAACAATGACGG------ACTTAGATTTAAGTAAAATTACATTAGTTATGAATTGTAAAT---TATTTAAGTTCTTTTTAACTCGAAAACAAAAAGATAACATTATGTATCTCCATTAAGATAGCACAAGCAGCTATGGGAGAGCAAAGCCTAAATGTTATCAGACTGCATTTTTCAAATGCTTTTCTAAGCGTAGGGTTGAAATTTTCTTGATCAAATACCACTAGCGTAGGTCTCACTTATATCACTCATAAGCCGGCTTACTTTTGCAAATCAAAACGAATGTTTAAATTATCGAGCCCA-----ATAAACAAAAAATTT---CAGTGAA
ATGATTATTATTATTATTA-------------TTATGTATTGTACATTATTTAAGTAT-TTTTTAAAATCGAA-----TGAACTCAAAGCAAACAACAACAATGCTTGTATTCATTATTTTTAAAAAAGAAGAGAGATATGCCACAAAAACTTAACAAGATGCA---TAGTTGTAAAATATAAACAAATATATAAACTGCAATTTAAATTAAAATAAAACAAGAAATTCATGCAATTTCA--------------GCGGACTTTGGATA-CTAACTTTAAATTTTAACAGA------TTTTC----GCCTTTCTTCTCTTTGGG---------------------GCTATTCGCATA--------TTATATT--TAATAAGT--ATATAAAAATGAAAAATAATTTAATTATTTTTATTAATTAGCTGACAGGTATTAACGGTTATCTTAAACAATGTA
>Chro 22807541 22808442|23756 chr3L 22808432 22808628 scaffold_8 2163487 2163666 - 7760|0 10
AATCATGTTAA
ATAAATATAAA
>Qm 23027471 23027554|23961 chr3L 23027053 23027540 scaffold_52 643624 644042 + -1091|437 506
AAAATGTCACTTAAAGTTTCGTAACTCAGAAACAATATACAAAATTACCATTTCCTGAGCACATATATAT
AAGATATCTTCAAAAGGCTCTCA--TGAAATACGATTTGCGAAAC-----TTTTTTGGGTCCATGCCCA-
>Qm 23027471 23027554|23962 chr3L 23027541 23027719 scaffold_52 644849 645028 + 10997|0 13
TAACACATTGAAAT
CAATA-ATAAAAAT
>CG32350 23081494 23081735|23992 chr3L 23081557 23082242 scaffold_33 57150 57830 + 4798|0 181
AATATAAAT--ATTATATTATAAATTTTATATTTATATAAAAAAGCTATATCTGAAATTATTTTCTTTAATTTTCA-ATGTATTATTCGTTAAAATAAATAAATGTACATAAATCGATACATTATATGGCACTGCCAAGCCACCAATTTTCTATTTTAAATGTGAGGTCTTTCTTAGAAATT
ATGAAAAGTCCGTTTGATGATAATTGTGATTTT----------AACTTCAACTGTTGTTAATTTACCTAATTTTAATTTGAAATATTAAAGGCTACTAAAATATGTAT-----TTGATACATTATATTTAACGGAAATGTCTTTAATTTTCTTCTACCTGAGTCAGCTTTTTAAAATAAATT
>alpha-Cat 23252515 23252678|24101 chr3L 23252640 23252855 scaffold_44 309987 310202 + 11605|0 39
AAATTGATTTTCTATCAGTATCAA-TTAATTACCATACAC
AGG-AGACGATATAAAATTATAAATTTAAGTATTATATAC
>CG12581 9772 10200|7 chr3R 9436 10069 scaffold_3 869284 870013 - 15324|345 750
GAGTTCA------------TTGGGTTGATCTGGGCCTTATGATTTATACAA-------AATGATTACACAACGTTT------AGCGATCTAAATAT-CATCTA---------------------AACATTCT--TGATGTACACCAGATTGAGAA--GACAGGGGCTGAATATTTTAACGGAGCTCTGG-----GAGTGTAATC------------------------CCACACGGAAACCAACTCAA----CATAAATGAATATTTGTGCCTTATTAGGTTTATGAATAAAGTGTGTGCGCTCTCTAGTAATCATGAA----------TCCATG-------------AAATACCATACATAAACCATT-TAGTGTGTAGAATATAATGATATCTGACTATGTAAC
GCTGGCAAGCGTTTTGAGCTTAAGCCAAGCTATTCCGCATTACGAATGCTATCATCTGAATGAGTACACCCGAATTGGACTAGGAGAACTATATATACATATATATATATATATAGAATATTACAACATTATAGCGATGCTGGTCAATTTAGAAATGGAAACGAATCAAGCGACCAAGCTGGGCTCCAGCGACAGACTTTAATCAAATTGGGTAACCAAAATCGATATCGATATCGAAATCAAATCAATTATCTACAATGAATATGTGTGCCTTATTAGGTTTATACTTTAAGTAAATATTTT------TAAACATGAAAACTCCTTTGCCCATAACCAGATAAAAGCAAAGACAACATATTATCGATTATAATAAATAATGTAGAATAATATAATACACTACAAC
>CG12582 30196 30295|19 chr3R 29928 31592 scaffold_21 53882 55517 - 45592|268 372
---TACGGAACGTCTTCATTGACAACTTTAAATCAACGTTTTATAAATAGCTTAACAATATACAATTCAATAAATAGCAATT--AGTGTTGAGCACCAAACACCA
GCGTAGGGGATATACATATT--TAATTTTAATGCAACATAT-ATAAATAACTTAACAAA-------TCAATAAAT-GTAATGGAAATATTTAAATACACATATGT
>auxillin 52584 53244|33 chr3R 50292 54397 scaffold_21 67427 71704 - 144302|2386 3179
AACGCGTCTTA---------TATCTACATATATATATATCACAGTTAGCCCGTATTTTCGTACTCTTAGCTGAATCTAATGTAAATTCATGTAAAAGTGTGAGCTTTAATCTTTAAAGTTGAAGTATTGGCATATG-------TATGCGTATGCAATTTAGATAGCTCAAA-CAAAC----TTTAAAAATTATGAACGCCCGAGGACATTCTACTTAATTTGCGTAACAGAAAACCCGAATCCAACATTCCCATT----------------GCATCCAACAA----------CAGTCCGCCCAAAAATAACGTCGGAAA--------GTTAAGAACAAAGCCTTCAGACTTC-GGCGACTACCCAATGATTTCACGC---CTTATCCAT-CAAACAATAGAGATCAATTATTCGTGTATA---TTAATATACACTTTTTCGCTGTAATTAGATTAATTGCGGTATGCCCT-----------TGACCGATT----AGTCAATATATGATTATATGATTAATCTATAAAGTGATGGAAGC--AAAAAGTATG-GCATTTGTACATAGCTGT-TCCGAATATAAA---ATGTAAAACTA---GTAAAAAACCATTTGCTTTTACTTTTTAG------CTGTGTACATAAATAAGCATATTAGAG------------GTTATCTAAA----------TTCCGTTTCAGCATTTAA-----------TGTTTGCCACTATAAA------AATAAATTCTCTATACGTTTCCTTGTGAAATGCCACTGTTAAAGGTAGAA
AATGCGTCCTAAAACTATAATATGTACACATAAACATAT-ATAGTT--TTGACACAATCCTTCTATTAGCTAAAACTAGTTTAAAGCCATTTAAGAGTTTAAGCTTTAATGTGTAAAGTAAAAGTATTTGTGTATGCCGCATTTAGGTATACGCATTTTAGTTAGCCCAAAATGAACCCGATTTGAAATTCTAAAATATCTACGGACAATTTACTTAATTT-TGTAATTAAATCTTATGCGCCCACATTCCCATTTATGCCCATATTACGAGCATAGAAGAAAAACTGTATTCAATACACGTAGAAAGTGTGTGTGCAGCAGAGGCTGTTGATAATACAATTTAAGGATCTCTGGCGATTAGCCAGATCCTTAAAGCAGTTTTATCTGTGCACGCTATAGCTATTATTTGTCTGACTAACGATTTAATATATA----TACTCAATCAACAGCTCAATTATAATTGGCGTTCAAAACAAAAATGACCTGTTCCCAACCCAATATGTGATTATA-AACACGCCTATGCAGATATGGAAACTGAATAAGTTTATATAATTAAATATATATATATATAAATATGAGTACATATATAACTGTTTGTAAAAATTAAT--GATTATGTGTGGTAGACCAATCCAACTATACTAAATAGGATGTAAAAGCTCTGATTTATTGTTAACCCAAAAGAAAACCTTTTATTTTCAGCATTTAAATCGAAATCCATACATAATACACAAAACTAAGTAATAAATTCTCTATGCATTTCTCTGTGAAGTGGTACTGTTA------GAA
>abs 60711 60764|41 chr3R 58807 60783 scaffold_55 118889 120878 + 112834|1915 1972
ACCACTACCACCACCAAATTAAAATAGTAATAA-ATAGAT---TAGTATACATACAT-
ATTTAAGTTTACACTATCTTACAAAATAAACAAGACAAATGTGCAAAACATATCCTTA
>Gel 66660 66780|48 chr3R 64114 66897 scaffold_55 127529 130401 + 103419|2641 2788
AACCAATGATTC------AATTCTCAGCAAAATTTACCAAAAAA--TATGTTTGTTTTTGCCTT---------------TCTAACACCTATGTTTATCTAATATAA----CTTTAAAATAAATTTCAATATGGCCACTGTTTAGCACA
TGTCGAACTCTCAGCTAGAATACTCAGCAAAATTGACCAAAAAATTTATGTTCGTTTTTGCCTTAAAAAAAATACGAAAGAAAACAAAAACTTCAATGTAATGTACTCTTTTTTGTATTAAATG--GATATGTTTTTTACTCA-CAAA
>CG14639 73907 74036|57 chr3R 72189 74105 scaffold_55 140630 142513 + 37011|1850 1979
AAAGTTGTAGTAAGAATCCTATCGCTTTCATTGTTTTATATCAACCATCATACTGTAGTAAATTTTAATTTATTTTTAATGCAAAAGTCGAAAGTCGAAAGAAATATAAAAAAATTTAAATCGAAACCCA
GGCG----AATTTCCACCGCATTTCTTTCATTCAATTCCAACAATCGCCGCATTTTAGTTTATTTTAATTTATTGTCAAATCAATAATC--AAATCAAAATAAATATATCCAATATCTTAACCAGGCATA
>CG1092 93936 94166|71 chr3R 92981 94073 scaffold_55 166773 167852 + 38604|961 1098
AAGATCAAGACCATTTCTACCATATATTTAGTTTACGAGATACAATAAAAGCAATAACATTCTCATAAAGGTGTACAAACCATTTGAAAAAAATGGCTTTCACTAAAAAACAAGCGAAGTTAAGATACCCAAATATCA
A----------------TTCCAACTAGTTGTAGTTCAAACTGTAAGCCAAGCTAAAATAATC-AATAAAAGTACACAGGTCGACT--AGCAGATACCCTTTACTGAGTTTTAAAGTGCTGCAAAACAGTTAAATATTA
>cpx 123284 124307|101 chr3R 123095 126079 scaffold_55 201828 205333 + 42778|210 1615
TATGTCAGTCACCAT-AATAACAGATAAATAAATA-----TGATGATAA-----------------------AACACGTGTAATACTGATAACATAGCCCA--TAAACGGAAATTAA-TTTAACTCAACTTAATATTGAATTTGTTAATA--TGAGATCAGTTCATTTACATGGGAACCATAAATGAATTAAAACTACTG--CGAATCT-----------------AGAGCGTAATATAAC------TTTACC-------------------------CGGCAGC-----------------------------------------------------AGCATAACGCCTTT-----------------TAAACACTAAATC--TCAAAATCGACGACAGCTATAATTCGAAATGCATAATCAAAATCCGAACGAGGCGGTGAACTTTATGAA------------------------------------------------TTTTAAAGTAGCTAAATCGCGTACCAAATCATTTAAATCCCAACTATAGTGAAAGCCTTTAATAATATTCAAATCAC-TTTGCTACGATAATAATGTAATATACTCAAACCC---------------------------------AATATACAATACATAATCGTTGTTTAGCTGATAACATACAACAAAAAGTAACGAAATAATGAATATATTGAATCGGCACGATGACACTCGAATGCAAATAGAAAAAAGAAT----AATAAAATAACATAAAACAAAAATACCAATCCTAAAAAACATTAAGCCAATGGTGCGACAGAGGAGGCTACCGAGTTTGTCGAGCCGTCGAAGTACATACATATGTTGCTGAAA-------------------------------TCACACTGGACTTGAAATCCATCTATA----------------AGTATAGATATACA------TATTATAAAATAAATCGGC------GAACATGTTAGAATGGTCATTCAAATACAC---------------CCGTTGTGTATATATGT------AAATTTCAAG---AATTTTACTAGGAGTAATAATACTTGCAAAC-GAATTGACTGCAGGATACGTTAAA-------------------ATGGCTGATTCTCTAAATTGTTTTTCATAACCAAGAAAAAATGGTTACAAATATATGAAAAAAGATT-----CAGTCAATTTGTTTTTCAACGTTTGACTCAA---ACATCTT---TAACAGCTGTTACATTTTGTTTTTTTCTTATACAAACATCATAC-------------------------CTACACAACAATTGAGA-ATTTCGAACTCTTTGAGACAGTTAATGATCTCTCTGATTGATGCTTCTGAAAT
TATGTCAGTCATCATAAATGATATATAAAATAATAATAACCAATAATAATATCCCGAATTTTCAAAAATAATAACTGGAGTTAACCAAAAAAAAAAACCCGATCAAATGCCAATTGATTTTAAATCACACTCAACTTCAATTTGTTGCTAATTAATATAAAGTTGCAAGCAAAGAAGCAAAAAACAAAACAAATATTATGTTCGAAACGTTCTGCATAATATGGAAAAAGCATAAACTAATATTCTATTTACCATACTTATAAACCCGACTCCTAATTCGGCAGCAATAAATCAACCAAAGAATATATAAAACGCCGCAATAATTGAGGTTTATGTGAAGCATAAGGATTATATACTATTATTATATCATAACAATTAAAACAATTAAAACGAAAGCCAATAATAAAACAAATAGCATAATAATAATAATAAAAACGATGCAAATTCAATGAAAATTAAACATATGTATGTATGAAAACAGGACGGTGAAATCCTATTGAATTTTAAAGTAGTTAAAGCATAAACCAAATTATGTATAAACGAAATATAGTAAACGCCTTTAATAATATTCAAATCACTTTTGCTTCGATGATAATGTAATATACTCAAAGCCCCAAAAAAAAAGAAAAAAAATGAAAAAAAAAAAAAAGAAAAATGCATAACCGTTGTTTAGTTGATAGCAT--TGCGAAATTTACGATAACGATAACGATAAAGAGTT--CGAGATCGAATTCGAAATCGAAACTAAAAAAAAACTGCGATTGGTGCGACA-GAGACAGAAAC----------AGAAACA----------GATTTAATGGAGGTGTTGCTGAACCATGTCGAACCGTCGAAATAC--------GTTGCTGAAAATCTCTTTTTTGGACTTTAATAACACACGACACACACAAAAAATAACCACTATCTATATACCCGAATAGGATTTATTCTGGATACCAAGTCTTCTATAATACGATACACTAGCCTATTTATATATATATAAATATATATATATATAAACAAACGCCAGCTTCTTCTATTGTTGATATATTTCCGACACGAATTCAAGCTAAATTTTCCCCAATGTG--AATATTCGCTAACAAAATTGACTGCAGAGATGGTAAAAAACAAACAAAAAAAACCTCATCGTTGGTACTCGAAACGATTTAACCAAAAGACAAAAACAAAACCAAAATTAAATTTAACTCAATTACTCACGATCCGTTTGTTTATTAA------GCTCAAGAGATATTTTTCCTAACAGCTGTAACATTTTGTTTCTTTCCTATACAAAAAAAATATTAAAAAAAAAACAAAACAAAATACACAACACAACAATTGAGACATTCTAAGCTATTTGAGATACTTACTGAACATACTGATTGATGCTTCTGAAAT
>cpx 125512 127268|101 chr3R 123095 126079 scaffold_55 201828 205333 + 42778|3018 3650
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TTTAATACAAGTTTAAATTATGCAATAAATAATATGTAAAAATTGTTAAATTTAACGTTAAAACACGTGCAGCTCAACATAATATGAACCAATACATTGTATACCTTAAGCTTACGAAAATTGTTAAT
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GGC
GTC
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A
A
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TAT
TCT
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AATCGTTTTTTGG-CATAGACATAAGTGTTTTTAAAATCTCCAATCTGCAGTTCAACAGTAATAAGCAAGGCGCCGTTGGCTGCTT-------ACTCACGT--AGATAAACTCTAATAGGCCAACATCAGCGCAACCATCTCTCGTTTTTCAAACACACACACACGCTAATAGACCACAATCGAAACAGATTACGTTTTATAATAACTCTTCTTTACATAAGTACAATGAC--TACCAATTGCTGTTAATAAT----TTTTATTTTGAGAATTTTTATGTTTTTAATGGTCTTGCATAAGTCTAAGGGCATTACGATTGCCCATCACTTAAGTAGTTGACATCTGTGTTCTACATTTTACTTTTTGCCTACCGCTT--ATGGACAGCTTAACCCAGCTTAGCTCATAGCAAACAAGCTTAGTTTTAAGTTAAAATTATAGACCGCAGCCGGATTGTACGCCACGCAACACGACGTATAACGCGGGAATATGTAAAATCTTAACACATCCGAATTATA--------AATGTTAATAAAAATCATATAGAGACCCTAACGA
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CGC-ACGAATGTAATTTGCATCACT
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GTGCCTTAG--GCGGGGATCTGCTGAAAATGTGAAGCGAAAC-----------TACAAATTTTCATTT--------------GCTTTGTCGGTTGTAATTTATTGTAGTGCACTTGAGAACTGCACTTAAAGCAAAGCCATTGCC---------CATTGTTCAGGCTATTGATGTGCAACGTGACGTATGATTGATTCTTTTCGATTTGTGTTTGCCAATGAAATCAAGGCGATTTATTACAGAAAGTCCGAATGTGTGAAAAATGCGCAAATTGATGCATGAACAGAGATTAGTAAAGTGCAATACGATAAGGCAACAAAAATGGGAAAAGTACACAGAAGCTCAAAAGCGAAGCCTTTGAAGTGTGATGCGACTTACGTAAAGAGTGAAAAATATTTATATAATATAAATACTAGCTGTTATTTGCCTGCTTTTCCCGATTCGAGTTTTATGCTTAAATTTTTCGACATCAATTTACCGCCGGTATAAAATTTAAATCTAACCGTG-CTAGCATGGTCTTCGCTTAA-----TTTATGCTTACATCAAACAAAGCTCCAGAAGTATCTAAGAAATTT
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CCATCCCATTGCAGTTCCGGCCGCCCGCTGCGCTATCGGTCTGTGACAGAAGGACGCGGCGCTCTCAGCCTGTGCGCCCCTTCGGCCCTGCCGCTGGCCATATCCTTCCAGGGGGCGCCACTTATGACGCCATCTACGGCTAATGCGACGCCGATGAGCGAGTTCCGCGCCAGCTGCCGCACAGTCACAGACGACGAGTGCTGAACCACGAGGAGCA
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ACCTAGGGGCTTCCTCCATTTACCAGCTCTTTCAGCAGCTCCAGCACGTCTCTACGCATGAGAAAATGTAATCAAACACAAAAAAAAAAAAAAAAACAAACTGTAGGATTCACATACATACTTAAATTCAGACAATGAAAATGTAAGCTGAAAAGTATAGAAAAAGCCGAAAAGCTTTCTTTCCGTTATCGTCACATTTT-TGTGAGCAAAATTCGCAAATGCGTTATAATTACGTTAAAAACAAATTATATATATACATCAATTATATATACAAAATGAGATGTATGTGCTTATTCTATATATACATTACTATATATAATATACATTGTGATTTCAATCGAAACTCGTCTCCCGTTCCCGCAAGGGAACGCCTTTGGAAGGAAAACCAAGCAAAAGTCTGCATCTCGTTAGAATTTGACATGTTGAATTG--------CAAAT-------TGTTCA---TCAAATTCCAGTAGATTATTTTCGTTATACAAATTGAAAACGTTCTCATATGTTATATAAATATATATG
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TAG----ACTAGTGCACTGAAGCAGATCATATTGTTTATATACTACTATAAGACTTTCCATTTAATTCATTGATATTATTCTGCAATCTCTGCTAGTACACCTACGTTTTTATATTGTTACGATATCCAAAGAATTTGTT----------GATATTTATGAGTAATCTCTGCTAGAGCAC
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GTCGCGGCGCTGCCATGATCATCGAATCGCTTCTGCTGTTCTACCACATCAACTGCTTCAAGTGTTGCGTCTGCCACGTCCAGCTGGGAGATGGCCTCAATGGAACCGATGTCCGGGTGCGAAACCACAAGCTGCATTGCCAAAACTGCTACTCCAGCGATGACGGCATTAAGTTCAGCTGCGTCTAACTGAGCCCTCGCCATGGAAACGGAAGTGGATTATTGAATAGAACTGGGGTTGTTGCTCTGTTGCTTTTGCAACATT-GATTGTTGTTGTTGTACTAGTA---ATACATAGATATTAAATAGAGATGATAATTCGTACGTTCACATATATACAATACATATA---TCTACAT---ATGTTGAGAACAAAGTC----------------------------AAATCCAAAACGTT--TCAGATTAGTGTTAATCGCTTTAATATGCTTCCCTACGAAATTATGTAA---------------------TGTTTTAACTCGGATTTAAAAGTTTTATACAACGCATTCTACATGTTATAAAT-----CAAACTCTATACATTTTACATGTTTAAAT--------GCCAAGCTCTCTAACATTGTAACAAAGTAATGTGTGTTG-AAACTTAAAAAAAAAACCAAA-----------------------------AAAAGGATTAAC---TTTAAACGAAGTGTTAAAATTTTGA-AATTGTTTTGAAT-TTATATTTACACCTCTACTC---TACACATCTACACA-------------ATCTACTATTTCTATCCGAAAA-------------TTCGCTTTTAAATTAGTTAG----------------------------------------TTTCT----------------------------AACTTTTTGTACCCGCTACAGCCCA-------CTTAAAATACCTAACGACGCATCCAATGTACCTAAAA-------------AAAACTATATACAAACACCCATCCACACGCAACTCACTAACATAATTAT-----TATATACATACCCTTAA------------------ACTTGCATGAGGTG-AGCATATATCGCGAAAGATTTCATTTCTTATA-------TCCCTTATTTTTATTTATTGTAATTTCGCATAAAGTTGAAAAT---TTGTATATTATATACACATCT------------------------TGGATTGTATGATTAATT--------------TTTAAACATGA--TCGGTATATGAATAA---TTTTTCTGTATAAATACATCAAAGAAGATATAGTTTAGTTTTTTAATAAACTAT
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TAATCAACCAAGTA
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GATTGGGAGAACTGGTGGCCAGAGGAGCCGCCACAAGCGGCAACC---------GCCGCGCC----------GCCAGAGGA----------TCCAACAA-------------CAACGCCAGCCCTCGACTGGATCTGCTGTCAGCGGCTGCAGAATCTGGCGCTTGTCGCGCAATGTGAAAACCAAATATTTCTGAAAGTTGAAGAAAGCACTTTAAACTTTTTACCTGATAATTGAAAAATTGCTGTTAAATATAAACATTAACAAAAGGAAAAACGAAAACGAAAAAACAAAAACACAAATAATTATTATATTTAAACCTAAATTAAAAACAACAACAAAATTCACCAACGAGTTGAGAATACTTTAAAAACCAATTATTATTATTATTATTATTATGTATTTTAAAATAATATACAA-AAAAAAATTGCCTACAATTTTTGCTATTTAAATGTTAGTTTTGTAG---TTGCTTTTGTTTTAGTGGTGCGAACAAGCAAAAATTGATTGTAAATTATAAATTT-----TAAA--TACCATAAATGTGTAAAATA-------------ACATAAATATACATATATACAT---------ATTATAATAAAACTTACTTAAGCTTATTGACTATTTAATTGATAAGG-TTAGCAAATTTTTC----AAGCTGCTTTTCACACTCACACTAGACTCACTAAATGCAACCAAAAAAAAAATAAGAAATATTAAAAACAGCTTCCTCCAGCTTTCTAGTACCAAAAAAAAAACATTAAAAAAAAAAACTGAAAAAAATTGCAAACACACTGTAAAAAAACTTAATCGA---AAAGCT---ACACATATACGTACGTGCATTTTTTGGCCTTAGATTTTC-CAAGCTTAAGAGTACACAAAGTAAA---AAAA----------------TAAAACAAAACAAAAAAAAAACATCAACACGAAAAATAAATATAAAGAAGCTCTATAAAAAACA
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G
G
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AATATTTCATTTTAAGTACAT----TTGCAGCTTCACAATTCTCTGGCTGTGGTTTA-----------------------TGTTTCATATATTAAAAACTAATCT---CTATGATATAT---TATATTTTA---TATAAATTAGGCGAAATTTAATTACATTAAT--TAGACAGTGAAGTGAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTAAATATAA--TTTTAAT
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CAGAGAAACAACTCCGTTCTTGTTAATATTATAATCCAATAAGCA
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CC-----------------------------------------------------------CAAGCCGACAGCGCAGCTAAAGGCAACCAAAAAGTGTAAATTATTTTCAACCAAACACACA-TGTATAAAGCTAGTTAAAAACTATTTATA---GCTTCGGAGGGGCG-----------------------GCAG-------------------------------CGCAAGCCCGCAT------------TGCGAAAGTTAATCAAAGCTCCTTTAGTCGTTAAGCCTTCTAGTT-TAGTCTCTAAGTCGTACCCTTAGTCATT---TTCGCATTAACCATTAGCTTACTGCCATGTCAGCGTCCGAGTTGGTTGTTTATTAATTTTAGTTTGTTGCATCTTTGTCAGGACCTTTTGCCTAGCTCATTCTTAGTTTTTG-----GCTGCCAAAGTATTATACCTAAAGAGAAGTTAACTAGATTCAATAACATAAGCAACTGTCGCGACGCTCATTGCATCTTATCTCAAAATTATTTAACAAGCCAGTAAATCGTGGACAAACGCGGTCACTGGCTAACACTCAATCTGTCGACTCTCATGCATCTTGTTAGACATCTTTTTCATATCGTTTACATCTAATAACAAACGGAAATAAATGTTTGTCCAAATACGTTCTCTTGTTATCTGTAAATCATGAAGTATGTATATTTATGACATATCTACATATTGTATGTA--TATTTTTTATATTAA---ACAAAA-------------GCCTGAGCTGATG
CCCATTGTCGCTTAAACTGTGTATATATATATATATCTAGACCATGTGTTCTGACTAATGGCAAACCGATAGTG--------GGCAACTTAAAACTGTACATTATATCAATCAACAAACACATTGTATAAAGCTAGGTAAAAGCTATTTATATGTAGTTCTTAAGTACGTAATCTTATCGGATTCATAAAGTGCAGTCAGGCATAATGTCATTTGTTTTGGCTTTGCCTCAAGACTGCATGAATCTAACCTATATAAATGTGAATCAAAGCTCCTTTAGTCATTTAAAACTATAGTTGTAGTAACTAAGTCGTATGTTTAGTTCTTTAGTTCGCAATAACCTTTAGCTAACTGCCTTATCAGCGT-CATGTTGATTGTTTTTTGAATATTGTATCTTAT-TATTTGCATATACGCATTGTAAAA---ACTATCAGAATTTGCGTAATTTGCCAAAGTATTAAAGCTTTAATGTAGCT--TTAGGTGAAGCGACATTAAA---------------CGTGTTTTCCCATCTCAAAATTTTGTAA----ACGAAAAACTAACTACTTTGTTTGTCACGCATTGCCACTCAATTCGTCGACTCTCATGGACAAAGATCGAGATTTT----------AGTGCAAGCAACAACAATAACAATTATCAATCTCTCAATATAAAAGCCT------CATAGAAAGCACAATAATTATATAATCATG---TACATAAATGCTGCATATATCTATTTTTTGTATTAAATGACAAAATTTACGAAATGTTATATAAATCGATG
>Tim17b1 1126711 1126911|1130 chr3R 1126424 1126730 scaffold_17 1002277 1002614 - 5595|320 339
AATTCTTCGCTGCGTCATCG
ATTCCT--GCTGCGTCATCG
>Tim17b1 1126711 1126911|1131 chr3R 1126800 1126982 scaffold_17 1002679 1002915 - 1438|0 157
TGATTGTTCG-------------------------AATCTGAT---------ACTGGCGGCATTCCCATTTCAATTTAAATTCAATTGTCGTACAGTGCAAGTTTT------------AGAATCATAAATATATTTTGCTTCGGCATATTTATATAGA
TGATTGTTCGGCGGGGCATGCGGCAAGTGCCTCGAAATTGAATAGAAATACAATTGCTGGCACATTCAGTTTCATTAAAATTCATTTGCCGTGCATTTAAAGCTTTTTTTTTTGTGTACGTTTCATTGTTTTCTTTTTTTATAGTAGAATGTTCTTAA
>CG1161 1182303 1182467|1174 chr3R 1181552 1183878 scaffold_35 1032307 1034447 - 59111|786 957
CAAGGGGTTCGGTTTGCAGCTGGCGGAGATTAGGAGGCGCATGGGCGACTTAA-GACACGTATTCCA--AGCAGTTATCCTTTGC----GAAATTCCCCTTTGGATCAAATTGATTATCTGTATATTTAGCCAGATTTTATGTTAATTAAAATAAACCAAAATATGTTTGTC
ACAGCAACATTATGTGCTGGAGCCG----------------TTGGCGACTTAAAGACATGTATTCTGGCAGCAATTACGTATTGTATTTGAAATAGCTCTTTA----ACACTGCTTGTCTCATTAATTGG---------------ATCAAAATTAATTAATAT-----TATT
>CG31542 1195973 1196156|1184 chr3R 1195483 1196069 scaffold_35 1041016 1041578 - 336|524 621
TCTGGATGTC-GTGCCACGGGAGAACGTTGGGATCCCAGCAGGCGCTACGCAGCAGGCTACACAGATTATAACGCTCACAACATGACATGACAGTACT
AC-GAACGTCAATTCGTTTGGAATGCTATCAGATTCGGACAGAT------TAGTAGGCGACCCAGACCCAGATGCTCAGTCGGCGAATGAACAAAAAT
>CG31542 1195973 1196156|1185 chr3R 1196070 1197047 scaffold_35 1042584 1043640 - 994|0 107
CCCAAATTTCAGGTTAGCCAAATTTCCAGTTT-----------------CGACCT----GTTTTCCGGGTCAATAAAGCCAATGTGACCGCTAATGGGTAAAGTAAAA
TCCACATTT------AGCAAAATTTTCAGTTTTTCGTTCAAATACTATGCAATCCTAAGGACTTACGG--CATTGAACCCAATGTGATTGCTGATGGGCAAGTCAATT
>RpII18 1198067 1198125|1187 chr3R 1197518 1198121 scaffold_35 1043819 1044409 - 25507|564 622
CT---AGTACTCAACCCCTTTATCCATAATAAA-TCATACCGCCTAAGATTAAGCACAA
ATGTAAGAACAGAA------TAGCTATAACAAATTTATTACATTTGAAAAAAAAAACAA
>CG14667 1201651 1201822|1189 chr3R 1200773 1201984 scaffold_35 1046767 1047957 - 18969|905 1076
GGAGGCTGGGAATTGAATGCTAGCGCAGCACTATATGCAACTTCCAATTTCATTTTAGAGCCCATAAGAACGAACGACCTTATCCATGCCTAGAATGCGGAATGATCTTCAGCAGCGTTTCCGAATTGCAGAACCACTTTTCGACACACTCAAAGCAAATCCGAAAGTTCAG
GTGGATTACAATTTACAAACTA---------TATAACCAACATCCAACTATCTTGCAGGGCGCACATCAATGAGAGACCTTACCCTTGTCTAGAATGCGATAAAATTTTTACTAGCGTATCGGAGTTACGGGCGCATTCCACTATCCATG------AAATGCGAAAATTTAG
>CG14667 1201879 1202183|1189 chr3R 1200773 1201984 scaffold_35 1046767 1047957 - 18969|1139 1244
GTGTGAGCCTTGCAACATGGATTTTATAACTCGCCGAGGCTTGGTGGCCCATACAAAAACAGCACCGCATAAGCGCCTTGCCAAATATATGCAGGATGAATTCGAT
GTGCGAGCCTTGTAACATGGACTTCACAATGCGCAAACATCTCGTAGCGCATTCAAATACATATCCACATAAACGCACAGTGCAGCAAATGCAGGATGAAATTGAT
>7B2 1203533 1203701|1190 chr3R 1202406 1206561 scaffold_35 1048119 1052179 - 110259|1186 1390
GGTAACTCGCTGATAACGCGAGCATACACGACGTTTCCATATGGGTGTCTAAT-----------------------------ACTATTATCTATCATAGCTGGTTATCAATGTTGTCCCGCAAGCGATGTCTAGTAAT-------GTTTCTACCCTTTCCCGAAAATAAAGTTATTCGTATAGTACCAGGGCTCTAAGCCGAAAA
A-TATCCTAAGAATAACTTAGCGCAACATTACTTGGCCACCTAAATATTTGTTGGCTTCTTTAGTTTAAAAATTGTTTATCCACCATTATATATCATAGTCGTTTCTGAATGTTGTCCCATATGC-ATATATAGAGCTCATAGCAGTTTCGAAGAACCTATAGAAATAAAGTTATTCAGAATAAACTATGGCTTCAAGCC-AAAA
>CG1172 1221903 1222911|1208 chr3R 1221667 1225102 scaffold_35 1065724 1069003 - 62832|251 1384
CGGCGCAGTCTACTCC-CACTAGTCAACAGCATCAGCAAGGAGCCACAGCAGCAGCCGCAGGATCAGCATCAGCAGCAGCAACACGTTTTGGCCAAAGCGGGCAACTTCATCCGGCGG----AGGAGGATTGTCACATACTCAGTTCATGGCACAAGGAACCATAAGGGGAATGTACAGAAAATAGCAGAGCATCAACGAGTACAACAGCAACAGCATACTCATAGCATTTATC-AAAACAAGCAACAATTGCAAATTGTTGCCCTGTCTGCCTTGTTGCTGTT---GCTTTTGTTGTGGCTGCTCGCCTTGTTATGCTTTGTTTAATATGTCTATATATAAAATTTGAAACAAAAGATCGAAACCGAGTCGCTGAGAAAGGGAATTCGAAATGGTGAATAAGAATAAGAGTGTGAGAATGATATACATAAATCATACACTTACATATATTTTTTTGATGATAATTAC--ATGATAAAACAACTGATTTAGGCAGTGCAGAAGATATATACATGTCAACTGTATATAAAAGCAGATATATAGCAAATAGTAACCGAGATCTTGGCCACTTGTCTTGAAAACTGTAAGT-----------GTGTACATTT-TCAT------AAAAACCAACATAGAAGGCC------------------------------------TCTATTAACTAATTGTAAGCAAGTGTTAGATCATTTGCCCGATGTATATGTAATGTAAAAATAAACGAGAAACGTAGTATTTGGCCGCAATGGAAAGCA------------------TGCAACAAA---------CCATTTTTGATACTGTACAA-------------------------AATGCCAAGCACAAAACTATGAGAATG----CGAATCATAACACACAGAAC----ACACAGATCGTTAAGCGAATAACTTGCTCAAATGTAGTTAACAAGAAAGAAGGGAACACATCGTGAGGAGGGAGGGCAGTGAATGCGAGGTGGGGAGTTGGAGAGTTAACCCAAGTACCTTATAAATGTATATGATTTAATTTGCGTTTGGAGTCAATAACTTATCTCTGATGTACATGAATTTCTTGTATAATTTTTTAAATAAATTTGGATAGTCAAATGA
CAATACA-CCAACTCCATACTAGTCAACT----------------------------------TAGGCATCAACAGCAGCAATAAGCTTTGTGAAAAACGGCAATTGGCTAGCAGTGACAACAACAACAATTCCAAGCACTCCGGCAATAACACAAAGAGCTTTAATGTAAA---GCACAAAGAACCAAAACA---------AAAACATCGACAACTAATGTATTGCATTTATCTAAAGCACACGCGAAATGCCAATAGTTA-------TGTTTTGTTTTTATATCAGCTTGCCTTATTGTTGTTCTGGTTGTTGTTGTTGTATTGCTATTGCGAAACATACAATTCTGAGCAAA------------------TACAAAAAATTAATGAAAAATGCCTATAAATATAAAAAT----------TAAACATAAAT---------ACATATATTTTTTTGATAATAATTATGTATGTTAACAAAATTAA----------GCAGTCGCTATAAAGA-----ATAATTTGTATAAGCTGCTGTATTG--AGTAGTAATATTCAAATATGCGCATGAAATTCACAATTAAAAATCAAATAAACAAATGTACATTTCTCATGAAATCAAAAACAAAACTAGAACTGCAAATTCAGAAGATAAACGTATAATAATAACAAATTGTTTATTAACTAATTATACGCAAACATT-----------------TGTATGTATTGTAAAAAAAAT-----ACTGTAGTATTTGGCTGTAATGAAAATCAAAGCAAACATTCGCTTAATGTGTCGAAATACTACATCAACTTTTGATACTGTACAAGAAAGCATAAATGTAAAAATGTTGGAACGCCGAGCACAAATTTAATGTAATAATCTTTAACAAAAACAAATGAAATTCCAAAAGAAATTGTTAAATTTAATTCTTGCTCAA-TGTAGTTAACACAATAGTA------------TAAAGTGGTTGGACAAGGAA----ACGTTAATATCGGATAGAGTAACCCAAGTACCTTATAAATGTATATGATTT---TTGCTTATAGTTTTAAAGCCATAACAGAAATACA-ATGAAGTGCTTATTTA---TTTAAAAAAAGATTCTAGTTTTGTATGA
>CG12162 1295162 1295288|1253 chr3R 1294405 1296395 scaffold_15 1542854 1544844 + 75172|775 907
GAGGC-AGTTGTTCACCCGTAGTTAAATGATTTTAAAACGCAA--TCTTTTCTGACAATGCATGC-GTACATGTGTTTAGTGCAAATTACAATA--ATCAACAAGGACGCAGAGCCAGTTTTGATTCTCAGCC
TAGACTAGTTGTTT---CGTGGTTAA-CGATATTCAAACTCAAATCTTTTTTTGACCATTCAGGAAGTACATGTGTTTAGAGCAAATAAAAATAGAATTGATTAGCA---ACACCCAAGCT--------AGCC
>Snr1 1298388 1298481|1255 chr3R 1297545 1298389 scaffold_15 1545403 1546247 + 54440|843 844
TC
TC
>Snr1 1298388 1298481|1256 chr3R 1298439 1300256 scaffold_15 1546628 1548370 + 82692|0 42
CATTATGCATCCCAAATAAATGTGTGTCTGTCGATTTTAAAAC
CAATATATACATATAATAAATACATGTCTGTCTATTTTAAAGC
>CG14670 1310630 1311115|1263 chr3R 1310305 1312916 scaffold_15 1559276 1561925 + 61624|329 824
TGAAATGAAGCAGATGTGAAAACTCATATTATTCCCCGAACCCTCTAGTTTAATTGGCCCTTAAGCAACTTGTACTTTTTAGGCAAATTTAGGTCAATTTATAACTACGTAAAAACGTTTATCCTTATAAATATTTACAAGGTGATTCTTCTTAAGTGGCTTTACGAAATAATAATGGATAATTTAATCCACTAAATTAAATACTGCCAAAGAGAATTATATGTTAAAGGAAGTCTCAA---AATATTTATAATGACA---GGTACATTTGTTTGTTCCCTATAA--ACCAGTGTTTGGAAATTACTTCGTAAGATAATCGCGTTTGTTACCATTGTTATCGCCATCGATTCCTCTGCATACGGGTGTTTTTGAAATTTGAATTTAATAAATACATATTCGATCATTGCTGACCTTAGACCACTGAGAT--TAACTGCCGCACAGGTCTTATCTTAAATTTAAGATGGATTTTTTTATTACATAATTTTTTTATTC
CTTAATTATTAAAG---GAGTTCTTATATAATAC-------------------------------TAACTATTTATTCCTAACTATTTTTGTGTAAACTTATAGATATATATACATACTCGAACTAACA---GTTTGGAA----------TTTTAGAAGCATTTAGATATACTTGT---TAATTATATCC----AATTATATAATTTCAAATTTCTTCAC---TTAAAGTGAACATTGATTCGATGCTTATAATAACATATTGCATAATATTTGGATCATTAACACTGCCAATCTTCAACAG--AATTC--AAAATAATATTGTT--CTATAACTG-------CATCAA---------AAACG--------TGAAATTGCCATTTAACCAAAATATATGTG-----------TCTTAAATC-TTGAAATCGTTATAATTGAAAAAATATTACCTT---CCCAATATATATGTGTTTACC-----------------
>CG31550 1315116 1315216|1266 chr3R 1314174 1315991 scaffold_15 1563241 1565151 + 72181|1019 1168
CACTACCTAAAATG---ACCCCTACCCACATAACT----ACCAATATCCT----------AGGTCCACT--------------------TATTCAACTGCAACTTTGCTGAATAAAATGTCCTCGTTTAAAT------------TAAACA
---TTCACAAATTGCTAACCACAACGCATAAAAGTTATAACTGATGCTTTATATTTTGTAAGATTCACTTTCTGGACCCGTTCATATTCTAATCACCCTCATATACACGAATTATAAAGTTCTTATTTATATATAAGTAGTACGTTGACC
>Itp-r83A 1364374 1364584|1310 chr3R 1362872 1365537 scaffold_15 1617945 1620934 + 80200|1545 1849
GTCTGTAAGAAATAG---------------------AATAGAATACTAATTTTGGCACATAATTTTG-GTGAACATTCC---------ATGTGAACCCAAAGGTATTGGCCC-----CCTTAGCCACATTT----ATCCTATTCAA-------------AAACCATTCTCA--------------ATATATTCAATGCGGGATGA-ACAATTTAAT-CTCCAAGAATCGTTCAA-------TACCCCTAGTAATAACCAAAAATC------------------ATTTTGTATTAGATTCGAATTC
A---GCAAAGATTGGGCCAACGGGTCGAGGCCAACTAAAAGCAATTGAATTTTAG-ACATTCCCTTGTGTAGATCTTGCACTAGATAGATGTAAACGTTAAAGTATTGCCACAAATTCCACAGTAACTTGTTAAAATCTCAGTAGAATCAATATATATCAAAATATTTCCGTTGGGTTTCTACTTATATTTTCTACTCGAAAGGAGACGTTTTACTGCTCCACTTACAACTCCACTTATTTTTATCCTAGACATGATCAATTATTCAATTTGAATATGCCTTAACGTTGTATTGGATTCGATTTT
>Snm1 1383263 1383514|1325 chr3R 1383416 1385700 scaffold_15 1369157 1371590 - 56660|0 121
ATATAAGGCTTGCCTTTTAAATAC----TTTACATATGTATTTTGGTTGATATATATATATATTCCCACACTATTT-------AGTTGCGAACCGT--ACATAATGAAAT----------AA
ATACAAGGCATTATATTTGATTACATTTTTTATATGTGCATATTTAATTATATATATATATAT----AAATTATTTGTATTTCATTTTCCACTAGTTGACATAGTAACACTTGTTTATAAAG
>Rheb 1395840 1396213|1332 chr3R 1393239 1396330 scaffold_15 1379473 1382833 - 87631|2986 3395
------GGCGGCTGAGTAGCTAAAACTACGGCCGAAC--TGTTGGAAATACGGCAAATCGCTATGGCAATACGAAAATCGATTATCTCTTATCTACACAGTTGGGTCAGCGTGCATGGCGGGGCCGTACCCTTTGTGCGCAGCA--GGAAAATCTAAAAATCTAATAGACCTAGTATTCTTAAGACCACACAGCAAGTAACCAATATCAAGCGATCTGAATGCGTCCGCTA-------------AACGCTGCCCAGCAGGTTTTGTGGTTCGCGTCTGGCGCAACACAACAGGTTTAAGTTAGTACGTTTTTTTTACAACAACAATTCAGTTACAAATTTCATATAC-----AAATTCTGCAA--------ACTTTTAGTTTCAATTTAAATATAATTTTTCAAAATACT
GCACTTGGCAACCG-GCAGCCAGCAGCCAGCGTTAACCATTTTGAAGCTATGGCTCGT-ACAATGGCAATACGAAA------------------------TTGTTTCAATATCTATTGTTATGAAAACACCTTGGTCCGCAAGAAGGGAAAAATTTACAAACTAATAG---------TCTTAAGTAATAACAGCAAATGAAAAAGAAAACATAAACTATAATCATCAAATATTTAGGGATCCCTAATGTTGCCTAGCAGCGTTCGTGGTGACTGTTTA--GCAACAAAGCAGGTTTAAGTTAGTACA-CTTTTTCACAATAACAATTCAGTTACAAAGTTCATATGCAAAATAAAATATGCGACTTATATTATCCTTAGTTTCAATTTAAATATAATTTTTACTAGTAAT
>CRMP 1400742 1401063|1339 chr3R 1400961 1401265 scaffold_35 87435 87674 + 8966|0 102
AGGTATGCTGCGACTACGGATTGCATGTGGGCATCACCTGGTGGTCGAAGTCGGTGTCTGAGGAGATCGGCATTCTGTGCAAAGAGCTTGGAGTGAACTCCTT
AAGTATGTTGTGACTATGCTTTACATGTGGGCGTAACTTGGTGGTCCAAGTCGGTTTCCGAGGAGATTGGCATACTATGCAAGGAACTAGGCGTAAATTCGTT
>CRMP 1401765 1402463|1341 chr3R 1401762 1402141 scaffold_35 87934 88276 + 5416|3 420
TCATGGTTTATTTATTTATGTATGTTATTTATGATTTTGATTTCCTATTATTTCCATTGTGTATGATGCAC-CCTGTACATA---------TTATGCGGTATGCGGCACTCGATATAACCCCACGAA-------------------------AAAAACATAACCTAGGCCGATTGTCCCCTGTACGTGGTCCACGTGATGAGCAAGTCGGCGGGCATTGAGCTGGCCAGGGCACGCCACCGCTACCGCGGGCGATACATAATGGGCGAGACCCTGGCCGCGGCCCTGGGCACGGATGCCACCTGTTGCCAGCACTTGGGCTTCGACGCCGAGGCTGCGC-ATGTGCTCAGCCCGCCCTTGCGGCC-----CGACAAGACGACCCCCGAGTTCTTGATGAAGCTGCTGGCGAAGTAAGT
ACATATGTTACTTGTTAAT---TGTTTATTTTGTTTTTAATTTATTATTATTTCCATTAAGTATGATGCACTCTTGTACATAAATAAGAATGTATGCGGTATGTGGCACTTGATAATACTCCAATAAATATAACCCCCGATGCTGCACTTTTAAAAATATAAATT---TTGATTGCCTGATACATGTACT-CATATTATGTGCAAATTAAATGGCATCAAAGT------AGCGCGGCACCAATAGCCTG--------------------------------------------------------TGCCCGTACTTAAATC---------AAACAGAGCTATAAGCTAAATCAACCTTTGTGGCCAGTAACGATACAATGACGGCCGAGATCCTGATCAAGCTTCTGGCGAAGTAAGT
>CRMP 1402762 1402981|1342 chr3R 1402752 1402989 scaffold_35 88405 88642 + 10121|10 229
AGACGCCGCTCTTCGTGTCCGGCCTCACCAGCAAATCCTCCGCCGAGCTCGTGGGTCGCGCCCGTCGCAGTGGCTACTGCGTGTTCGGGGAGACGCTGGCCAGCTCACTGGGCCGCTCCATGAGCGCCGTGCCCAAGGGCGACCGCATCTACGCCATCACCAGTCCCCCGATCCGCGAATCCGCCGAGACACCCAGGCAGCTGATGAAGTCCCTGGCTTA
AGACACCTCTATACGTTGCCGGTGTAACATCCAAGTCCTCTGCAGAACTCGTAGGTCGTGCCCGTCGTAGCGGCTATTCCGTGTTCGGTGAAACGCTTGCAAGCTCTATTGGCCGCAGTATGAGCAGTGTTAGCAAATCGGAACGAGTTTATTATATTACTAGTCCACCAATTCGTATGTCGGCAGAAACGCCAAGGCAATTAATGAAATCTTTAGCATA
>CRMP 1403315 1403550|1343 chr3R 1403312 1404791 scaffold_35 88700 90243 + 33344|3 238
TGACGATTTGCAGCTGACTGGCAGCGACAATTGCACCTTCAACAAGGAGCACAAGGCGCTCGGAAAGGGTGACTTTACCAAGATTCCCAATGGCGTCAACGGAGTCGAGGATCGCATGTCGCTGGTCTGGGAGAAGGGCGTGCACGCTGGGCTTCTGGATCCCTGCCGCTTTGTGGCCGTGACCAGTACAAATGCAGCCAAGATATTCAACATCTACCCCCAGAAGGGACGCATTG
CGACGATCTACAGGTGACAGGGAGTGATAACTGCACCTACAATAAGAAACAAAAAGAACTGGGTTTATTTGACTTTACTAAAATACCAAATGGTGTTAATGGTGCTGAGGATCGGATGTCGGTGGTGTGGGAGAAGGGAGTACATCAGGGCCTTCTTGATCCATGTAGATTTGTGGCTGTAACTAGCACTAATGCCGCAAAAATTTTTAATATTTACCCACAAAAAGGACGAATTG
>CRMP 1403619 1404092|1343 chr3R 1403312 1404791 scaffold_35 88700 90243 + 33344|350 823
CCGTCGGCTCGGATGCGGACATTGTGATCTGGAATCCGAATGCCACCCGTACCATTTCTAAGGATACCCACCACCATGCCTGTGACTTCAACATATTCGAGGGCATGACTGTGCACGGCGTCTGCGAATTCGTCCTGGTGCGCGGACGGATCTGCGCCGAGCGCGGGAATGTGCGGGTAGCGGAGGGCTTTGGACGTTTCATTCCCACACCAGTTCGTCCGCCGTTCGTATACGACATCATCGAGGGCAAGGTGCAGTCGCAGCCGGAGGAGCAGCACGAGGAGAAGCAGAACGGCAGCATGGCCAAGCGGTTCGCTGAGCTGGACATACAGATTCCGGTGCAGGAGCCCATCAGCGCCATGCTGGCTGGCAACCTAGCCATGCCGGCGGAGGGATCTCTGTGCAGCACGCCCTCGGTTCGTGGTCGCGTCGATGGAAAACGCGACTTGCAGGAGTCTTCCTTCTCCATAAGTG
CTGTTGGCTCGGATGCTGATATTGTTATATGGAATCCACAGGCTACACGTACCATTTCTAAAGAAACCCATCATCATGCTTGTGACATAAATATTTTCGAAGGTATGACTGTTCATGGTGTGGCTGAATATGTATTAGTGCGCGGACGAATTTGTGCCGAGAATGGATCCGTTCGCGTTGCAGAAGGGTTTGGACGTTTCATACCAATGCCACTACGGCCGCCATTTGTTTATGACATTATTGAGGGAAAAGTGCGATC---ATCTGAAGAGCAGCACGAGGAAAATCAAAACGGCCACTTGGCTAAAAAATTTGCTGAATTAGACATTCTAATACCAGAAGAAAAAAATATTTCTGCAATGCTAGCTGGTAATATGCCATTGGCGGCAGGAGGTTCCCCTTGCAGCACGCCATCTGTGCGTGGCCGTGTTGATGGCCATCGAGACATGCAAGAATCATCTTTTTCGATTAGCG
>CRMP 1404160 1404913|1343 chr3R 1403312 1404791 scaffold_35 88700 90243 + 33344|891 1597
AGGAGCTCGACAGGTCTGGTGTTCGAGCGTGCATCAAAGTGAAGAACCCACCTGGCGGAAAGTCTTCTGGATTCTGGTAGATCACAGACCCGATGTCGCATCGCAAGTCGTGTGGATGCGGAATCGCACAATCTCCGACGACAGTGTAAGCCAAAGTCTGCGCTC-------ATTCGACAACTAAA---CTGGCATTTAATATAGATCCCTGAAACAAAATCGTAATCTAATC----AAAT------TTCAAATAAGTACATAAGAGCATAACCACAAACCAAT---TAAGAAGGTATC--------------ATAGACTCTGCTTCGTCATTTTGT-ATTTAGAACCGATTGCCTCTTGTTGATACAATTTTTGTTAAGATCATCAATTGAATGAAATGCATCAAAGCATTTGAAGTCGAAAATCAAACATTATGGCTGCTTAGGTA-----TTTTTCGCTGAAATCGTTTATTTTAATACTTTGTTTATTTACAAGGAGATTTAG---------CACAATTTA-ACTCTGTTAAATTCATGACACTATTGCAATTGTTTAT-------------TGATTACCCGATTCG-AAGTAGAGCACATCGATCATGCCACGTGAGACAAAGA-GTGCTTGGGAGCAAATTCGGCATTTAATCTGAGGATGTCTAAAAGT-------AATACTTCAATCGATTTTTTGATA
AGGAACTAGACAAATCCAGTGTTCGTTCTTGTATTAAAGTTAAGAATCCGCCAGGCGGGAAATCATCTGGATTTTGGTAAAGCA---ACTGG---------CGTTATTTAAGGGTATA-ATAATCGCACAA----CGCGGTCATTATAA-CAAAAATCTGGGCTTATATAAAATTAGATATCCAAACACCAAAAATTCCATTCATATACCCTCAAATTAACTTAAATATAGCCGCGAAAATTGTTTATTCACATCAATTTCTAGGTTAATGAAGTGACATCAATATATTTGAATATAGCTTAATTTTCGTTGAATATACTCAGTGTTTAAATTTTATGAATTTGAAGCTACGTTTAATTTTTGGTA------TTTTCAAAATAAATTATCAGAATATGTACA-CAATATAATTGCTATTG---ATTTTACGTTA---CTTTGTAGGTATGCACTCTTTATTTAAAAATGATGA--TTGACAAATTATTTAATTAAAAATTAACTCAAATTACGCATTACAATATACAGTTATTTACGCTTGATACATAATTACATTTGTTTCTTCAACAATATACATAAATACTCATGTTGCAAATAAAATAC-TCCCCTATCTGCCTTTTGACAAATATGCATTTAAAATCTAACTCTAATATAATTCAGAGGGTAATTAGGAGCCTAAGTAAATGATTC---CGAATTTTCAACA
>Vha26 1419077 1420429|1351 chr3R 1418283 1421141 scaffold_3 1394275 1396961 - 50707|828 2306
A----TTCTATAAGTGCAAAACAAAACATAACTAACCAGAAAGAGAACCAGCATCAACACCTATTCAGCAGGAACAGTTCAAGTTATTACAACAGAAGCTCCACCCACTAAATATTGAACCCAAGTAAACTTATCCTTTGGCAGTCAGGAGGCAACAGCTAGGATTATATTTGATTGCAAAATACTTTTGCCGTTGTCTTTGTAAAGTGAAATTGAAACACTCAAGAACATTTCGGTCCTTGTGTACGCAACAGTTTTAATAGTAACCACACTAAACGCGCATATATATTCTCC------GATATATATGTCTGTATGCCAATACTTATTATATAGTTTAGAGGACACGATCCTAGGAGCATACGAAAGCATAATACGAGTTTGTTAAAGTTTGTTCGTTTTTTTTTTAC-----------ATATGCACATATTTCTGAGCAGTAGGTCTAGATATGTGCTTATATTGTATACATAC--ACTTTAAAATTTTGCATACATTCCTGTCCAAGAATTTTTATTTCAGTTTTCCCCTCGTTTATTGTACATTATTTTCTGTAGTCTTTGTTAACTTTTTATATGTCTATGTCGTTTATGTT--------CGTAATTATCAAGTGCAGCGTTCAGGAGGAACAACGGCAGTGGATCGCCCCTTTTACAGA--------------------------GCCGCTGGCAGGTTGCGCATGCGACCACACAGCATTGTTGCTCAGCGAAGCACCGAAATGGACCTAAACCCCCGATTTCGCTTCTTCGAGGGCAACGGACGCTTGTGCAACTGCCACTGGCTCA--ACGAAAGCCCCGAA-AATCATC-AATGTCTGTTGTTG-----TTGAGATACCGAGAGTAGAGAATACACACTGCTTAGCACGCGACACTTAATACCCATTCATTACACATGCACCAACGACGATGAAGT-----TTTGCCAAGTAGCTAAGTTTGTTGAC------------------------CTGACCATCAAGTGCAGCTTTCACACCCTCATATAA------CTACTTAA-----------AGAAAATATAGAAAAATGGAAATTA-GTTTTGCAATTTAGGGGACTGCCGAACTGC-----CACCGTTTCCACCTGACGCTGCGCCATCATATCAGGCTCTAAAAATCAACACACCATGTTCAAACACACGACTAGCATACAGGAGCAGGAGCTACAGTAAATTTGAACCTTGTATTCGCATGTTCGCCAATGTTCATAGTGTATTCTTCAAGCTCATTTTCTAACCAAGTTACCAAGTTCAATATGATGAATAACTACAAGATTAGCAAACA--AATACAAGTAGCATATGCGTTATTATATAACATCGAGTACTATATACATTACATGAAATACAAAATGCAAGAAAAATTACTT------TTAAACAAAATTTATGTTGAATAAAAAACAGTATTTCCAAAAACTAAACTTAA
AAATTTTCTTTAAGTG----AAAAAACAGAACAGTTCA-------AGCTTATAACAACAACAA--CAACAAGAAAAAAACAA----------------------CCACTTAATAATGGA-AGAAGAAAACTCATACTCTTGAACTCATTTAACAA-AATTGTGTCTATTAATTATTAT-TATTATTATTGCCGTTGTCTTTTTATAGTCAAACTGAGAAAAACAAAGAATGTTGGTCAAATATGTAGGCAACAATTAT----------GTGTTAAAAGTACTTACATATTTGCCAATTATGATATATTAGAGTATATTTCAACAGATA---------------AACACAGTTCTAAGTGCATTCAAATCCGTAA-AAGAGTTTGTTAAAGTTTGTTTTCTATGAACTAACCGGCGTTAACAATATAAGCTAATTAT--AATAACATTCCTCAATACTTTGCGATCCGTTATTAGTTCTGGCGATTCAAGTGCGCCTTTATCATTTTTGTAAAATTCTTTTT---GTTTTGCCCTTGT---CTGTAAATTTTGTTGTACA-TTTTTATTAACTGTTTGTTTATTATTGTTATCCCCTTTTCTTTAGCCATGTTATTCAATTGCAATGT----GCGTCACAGCGGCAACAATTATCAATGTTTATTAACATAAATGATAATTATCAATGTATGTGCCACTTGCAGGCCGCACGCGTGCACACTCAGCATTATTG-TCCGCTTGCCACCGAAATTCATTTAGTCGC---ATTTCGCTGGCTCGAGGACAATGTGCGCCGGCGT-CCAGCAACTGGCACATTTTAAAGGCCATAAACAATCATCAAATGTCTGTTGTTGAACCAGTTAAATAC----------GAATACACAGT--------------------TACCC-----TAACGCACGCGCAGTTAACGAAGTATTGCCAAGTGGCCAAGTAGCTAAATTTGTTAATACATATAAAAGCCTTCATATTTTACCTGCTTCCAATTCCAAATCATATATATATATATAAATATATATACTTAAATGTAAAATTGAAAGAAAAGAAAAAAATGGAAATTATAAGTCTCAATTTAAATGGCTGCCG--CTGTTGACGCACAATTGCTTTATAA--ACGCACGTTCATATCTGGCTCTAA-----------------TCAAGTACAC---------ACAGAATAA----------------------TTGTATTTTAATGTTTGC--GTGTTC------------------------------------------------ACGAAAAATAACTACAAATTTAGCATACAATAAAATCAATAGCATATGCATTATTATATAACATCG------------ATTAAATGAATTAC-AAATGCAA-CAAACTTACTTTTAAACTTAAACAAAATTTATGTTGAAT-AAAAACAGTATTTCCAAAAACAAAAAACAA
>CG1427 1428794 1428908|1360 chr3R 1428671 1428866 scaffold_17 2403842 2404017 + 3449|123 195
CAAATTCTTCGACATTTTCAACAAGTGCTGGAACCAGATTTTTCAAACTAAAAATGAAAAAATTATGAGCCTA
CAAGTTCTTTGAGATCTTGGACAAATGCTGGACACAGCTC----------------AAAAAGGCACCAGCTTA
>CG1427 1428794 1428908|1361 chr3R 1428874 1429014 scaffold_0 3917358 3917490 - 0|0 34
CAACAATCAAATAAAAAACCTATTTTTTAATATTA
CAGAGAGCAAATAACAATTGTATCCGGTATT-TTA
>Atu 1441593 1441664|1371 chr3R 1439745 1442778 scaffold_17 2413695 2416930 + 77908|1965 2048
CAACGATTAAGCTAGTT------------CAAGTGCGTTCCTTGATTACACCAATAAAAGTAATTTTCAATTTTCACGCGCTGA
CGATGATTAGCCGAGGCACAAACCGGAAGCCAATATGCTCACAGCT---ACTAATAAAA--AATAGTGTATT---AGGGACACA
>RpL13A 1451592 1451679|1380 chr3R 1450149 1451676 scaffold_17 2425625 2427177 + 62364|1522 1625
G----------------GACAACAACAAGGGCAGAATTACATACGTTCAGATGCGTAGAAGTTTTTT--AAAAGAGAATAAAACAACATCT-AGTTTAAAAAAC
GCAGTGCCCGACCACACAACAACAATACGAGCAGCATAAT-------------CGTAGCGGTTTTTTTAAAAAGAGAATAAAACAACATCTAAGTTTAAAAAGC
>CG31549 1458892 1459043|1391 chr3R 1457992 1461290 scaffold_17 2427302 2430641 + 95983|920 1081
GATGCGGATGAGCAAATGGTGGCATTTATCGAATTTAGCGTCATTTTCAGTAGTTAATTTAAAGAACACGAC-----TAAAATACAACACAAT-----ACATTAAAAGTGCGCAGTTAAGATTTCTTGGATTTTTCCTCTCATAATAAACTAATATATTGAT
AAAGTAAA-AAACAAACGCAAATCT-------GTGTATGGACACTGTTGGCATTTAATCAAAAATAAACAATAATCGTGATAAACAGCTCAATTAGCGGCTTTGA----TCGCAATTCGAATTTCACAACTTCGAGCTTCGAGAGAGCGCCAGCAGA--AAA
>CG12171 1460188 1460362|1391 chr3R 1457992 1461290 scaffold_17 2427302 2430641 + 95983|2312 2510
GAACGGAGTTTTTTATCCATGCATGCATTTATCTTATTTTTTTATTTTTAATTAAA-------GTAGCGCGCTTACCTCGTGT-----ATTTCAAATACTTTTCAAGGATGTGAT---TCTATGTAAATGTAATAGTTTGCTAGAAATAAA-------TAAAATGAAAACC--GCCCTATAAAAATTGGCAACGTACGC
G-CTGGGGATAATAAACATTATGTACATTTAATCTG-CAGTCTATATTCAATTATATAGTTGGATAACATGAGAACAATATGTTTCTCATTTGAGATGTTGGTTAAGCCTTAGATCTGTCTGTTGCAGTTGGGTACCTTGTTGGGGTCCTGACGGTCTTTATATGTAATCCGGGCCTAATAAAGATT------------
>CG12170 1464305 1464379|1395 chr3R 1463014 1464890 scaffold_13 53806 55573 - 68167|1291 1379
TAGTAGCGAT--AAGTTGTTAACTATTTTTTAGA-------GATCCACGTAAATAAAATCCTTGAATGTTTGCATA-----TTTTTAGG
GAGTAATATTTCAATTTTACAAACATTGTTTAGAACTAATTGTTGCATGTGAATAAATAGCTTTTCTTTGTGAATAGTTTTTTTTTAGG
>sec23 1478193 1478354|1405 chr3R 1477954 1478506 scaffold_13 68665 69174 - 4920|241 422
ATCGACTCTGGCTCTAGTTTCAGGCGCTTGCTTCCCTGGCGAAGTCGAAGAAGGCGAA---CGACAC---CTGGAATCAATGGTCCAGGCAATGAAATTAC-----------GAATATACAACCACTTATTCCAATTGA--TCGTCTTAT-AACGCAATAAACTATTCAAATTATGTTCAAC
A--------AGCT---GTTATACGAAATGAAATGCCTG--TAAGCCACGTATGGAGAGTTTTGGCACAGTTTTATTTTTTTGGCAGAGGCAATTACATAATTTAATCCCATATAATGCATATGTGTAGATTCCGATTGAACACGCCTGATAAATACAATAA------TAAACCACATTCATA
>MED27 1481928 1482060|1409 chr3R 1480892 1482305 scaffold_13 70816 72202 - 66064|1046 1189
GGATTTTTAAGTAATTTAACGCCGATAGTTGTAACTTGTATACTTCATTTATTTCAAA----AACAAAAATTA----TATGTACTTTGAATGCATG---CGGGCGGATTTTTTAAAATCGCTGCGCCCGACTGAATAACTACAA
GCA----------------------------TAACTTTTATACTTCATTTATTTCAAAAAACAAAAAAAATTATATGTATGTATTTTGAATGCATGCGCCGCGTGGATTTTGAAAAATCGCAACGCGCGACTGAATAACTACAA
>CG1109 1490761 1491168|1417 chr3R 1490548 1493337 scaffold_3 4001079 4003906 + 55897|233 696
TC------------------GCTATCCCACCAACACTGTTTTCTGCCAATCTCCTTTGCATCTTTTGCTTTGTAATGCT------GAAATCAATTTATATTATGAAAAGAAAAGAAAAGAAATTCGGTTTGTAATATATTATACGTGTTGTGTGTAATTTTCCGACTTTTTTTAAGAGTTTTTTACAATGGAGTCTCTGGAATAGGAATTTTACTTACATGGATATTTGTTTCTCTAG-------GAATAATCAAGATTTAACATTTTATTCTGGTTTTCGAA----CCATTTAGGTTGAAGATGAAAGTTAGC----------ATTTTA---------GGTACTGTATTG-GCAGTTCTTTTAATTAATTCCGATAATTACA-ATTTGATGTTTTAGTAAATGATGAGATACTTTGCACAAATTCGCTAACTTAATTTTAATAAAACTGAAAATACACAAGAC
TCCAGCACCCAACTTGACGCACCAACACAGCAACAACGGCAACAAACACACACATACACAT-------TCTGTAAACACACAAGAGAATCAAATATTTACTTGGCATGGCAAAGTCAAC--------TCCATATTAAGCTTAACACGATTTATATTAATTTAGAACTATTAGAAAA-------CACAATGGATTGT---------AAATTGTAACTGCA-GCTTGCTTGTATTTTTAGCCGGGCGGCATCGATAAAACTAAACCGATTAAT-TGACTATCGATAGTTTCATTGTAGGGGCAAATGCAATTGGGCGCGCCGCCACATTCTATCGAGCGGAAGTGGTGCAAGGTGCATTTCCGCTGCGATATTC-AATAATTCCATAGCGAATATTGGTGCAAATTAAAAGAGAGCAGACAAAAATTTGTAAGCGATATGGTGCTATAA-----------------
>plx 1537679 1538566|1459 chr3R 1535138 1538661 scaffold_3 4053662 4057326 + 148959|2638 3702
CGGTTCTGATTTATTGGGAAACTGCTGCGCGGATTTTACCGCGATTAAGGCCCGCCGGCAGAACGGGCAGCTTTCAA--ACCCAACGCTACTCATAACCTCTTCTGTTGCGGCTTAGATAC---GATTAACCCAACCTATAAGATACAAA---CTTAAACTTCGTTTTCAAATTGTGTGTATGTGTCGATGTGCGCACAAAATGTTGCCATA---------------GATATTGCACCGGAAGTTATGCAATCGTTATAAAC-----------------TGATGACCCAAAAAAT-----------TAGACGAGTATAGATGCTTATAGGAATA-----------AATTGGAT-ACTGCTTTTTCAA----GGTTTTATAAATTTGG----------------------CTACCGCATCAAAATCGAAGCTTATA------------------ACCTTAGGCAAAATCAAAAGGCATTACTG-------------AGTCTGTAGTTTGTTTAAGTTTTCTCCTACTTTTAACA----TAACATTTAACGAATTTACTTAGAAGTTTACTTGTTGATTTTCGTGTTTCTTGAGTTCTAGACCATTAGTTCTTAATGTTATTTTTAGTTT--------ACCTTTATTTGTACATTTCACGCAGGGTTTCACTTTG----CAATGTAAACTAAAAGCAAATACC---TAATGTATAAAAT-------GATGATACTTGCTTGTACAT-TGTTCTTGACTAG-GATACAACTTTCTGAAATCTCTTTTGTTATGCTTATGATTATGGTATTTGGATTGTATTGATTGTTTACATATACA----TATATGCGATTATGAACTATAAAAAATACAAAAATACAAGCAAAGGAAAAAATAATTGATTTTGTGTAAAGTACTTAAAT--ATTGCTTAGCGGGACGGTTTTT-ATCAGGCGTCCTGAG--TTTGTGTAGCTGATTTCTG-TTAGCATATGAGTAAAACCAACAATTACATGAAAACAAAATAAAGTCATA-----------AATTATTTAATC--------AAA
CGGTTCTGATTCATCAGCAAGCTGCTGCGTAGCCTCTACCGGGAGACGATTCC----------TGAGCAGCCCTAGACGCCCTAACGCTTACCAGTACA-CCTCAGTTGCGGCTTAGATGCAAAAATAGATAAAATCAACAAAATACAAAAGCTACAAATTTCATT---ATGTTGCATGT-----------TGCGCACAAATTGTTGCCATACATAAATATGTAATGGAAATCGCCCC-GAAATTACCTAAACGTTATATACATAAATATATATATATATACAGACCCTATATATACATACCTATATATATATATATATATATATATACTAGTACTTATACATGGAATTGGATAAATGCTTTTGCAACAAGAATTTTATAAATTTTGGCTAATATAAATTGTTCGTAAACCACCTTAATCAAATCGACGCTTAGACTATATATAAATCCCTATATATATGGCCTGATATAAGGAATTTGCTTAGCAGAGTCTCGCAGTCTCTAGTTTCGTTTAAGTTTATCTATTGTTCAACATACTTAATTTGTAACGAATTTAATTAG--TCTTACTTGTTGAATTTAATGTTTCTTTAGTTTTAGTTAATTAGTTTAAACTGTTTCGCCTAATTTTTTATCAAATAATCATTTGTACATTATTTCTATTGGTTCTTATTGTAAACGACAAAAACAAAAATCCAAAATCCAGCAGCATATTAAATAAATTCCGATAACATTTGCATGTATGTGTACATTATAGTAGCTATATAAATTTC-GAAATCTCTTC--TTGGACTTG-GATTA----------ACTATATTGATTGTTTAAATATACGTACTTATATGCGAATATAAG----AAAAATTAAATAAGTATATACGAA---------AATTGATAAAATGCATCATTGTTAAGTAAACTGCTTAGCTGGACTCTTTTTCATAGAGCGTCCAGAGTTTTTGTGTAGCTGATTTGTGTTTAGTCAATGAGTAAAGGAAATCAT---------ATAAAATACAGTAATAAATTCAATAACAATTATTTAATCGGCATTCAAAA
>CG1239 1560389 1560424|1473 chr3R 1558969 1562284 scaffold_3 4079236 4082715 + 84927|1576 1611
GAAATAAAAAGAAAATCAAGAAATGAAAATTATCTG
TCTCTA-----------------TCAACAGTTTTTG
>CG1236 1563631 1563996|1475 chr3R 1563746 1570166 scaffold_3 3715350 3721902 - 226941|0 254
TACTGAAATTATTGAAA--CACTTGTATTACGCCGATGACAGTGCTCGCAATGAACTGATCCGTAAATGGTCGTGGCCACTCAGAATCGAAATTTTTGTGTTATTTGCG-TGGGGTATACTCCCAATCTTTTGATCATTAACAAACAAAAT-TATATTCCTTTATAATGTATGTGGGTGCGGTCAAGACCTTGGTTTTATGTATTATCGCCTAGAACAGTGAGTTTATAAAATTATAGACCTTATCTTATTAAGT
TACTGAAATTATTGCAATCCATTGATATTTTGATATAGAAGTTACACGCTGC-ATTTGATCGGTA----GCCAAATTTGTTTTGAACCGAATCTTTAAAAATGGTTCAGCTTAAATATATTTGGTGTGTATTTAA----AACAAAAAAAATATGAATTCCGT----GTTCAAACAGGTTCAATTGAAAGCCGAGTTGCAGCCATGAT--------------------TAAAATTTTA------ATTTTAGCGGGT
>Madm 1571473 1571789|1477 chr3R 1570673 1571766 scaffold_3 3722107 3723246 - 49768|837 1168
AAGTATCAGCTTAGTATTCAGGGCATGCCGGC-----GCGTATTGTTTTTATTA----TATTGGGAAATTACACATTACGATTTTATTAATACTATTA--TTTGTTATTTTTATAT---------------------------ATATACCTATATATATGTGTATATGTATGTATGTATTTGAAATAATATTTATGTATGTATGTATCATAAACGATGTTGAACCAGGCTTCCAGGCTAAAGATTTCGATGACGTGGGACACGCGGCAGACAAAGGTGGGTCGCCTCTCGCGAGCACGATGAACATTCAAAATCGCAGGAACACTTAGCGAC
AG--ACGATGAAAGTATTCGGGCGAAGCCGGCGGGGTGCGCATTGTTTTTATTAATGGAATGAAAAAATTACATACTACGATTTTATTGCTACTATTATTTTTGTTATTTTTATATACCTATATATGTATTGCATATGTATACATATATATGTATATATACGTATATGTGTGTATGTACTTGAAATAATATTTATGTATATGTATATT-TAAAAGATGTTGTACAAGGCTTCCAAGCAAGAGATTTCA--GACGTGTATCCCACA-----------------CTCACTCGAACACACACATAACATACATATACACATACACACGCAGCTGC
>jagn 1606089 1607030|1504 chr3R 1605942 1607036 scaffold_3 3758088 3759132 - 24631|147 1155
-----------------------TCTAAATACTCGCCAAACTAGT-AAACGCCGGAA--------TGCAGGGCTAGTTGTAAATAATTTG--------GAAACTTGAAACTAACTCAAAACACTAGTGCACAAAAGCGTAAT-GAAACTATGGTAAACTAAAGTTATGCAGCTGTTAAGGTATCGCACACTTAGTCATACAGGAAGGGAAACATATGGTCGAAACTGAGCGAAGCGTCGGCGGTAAGGTTATTGTT--AGTTGAAAGTTAGTTGATACCGTTTTCAAATTGATTAAATAGACTCTTATCCATATACACATGTACACCTATACACATAGACATACATATATAC-ACACATACGCAGCCTTGTGAGGTCAACTAAAGACAAGAAGCAACTGAAGCCACCAAATTTCCCCGAGTCGG--------------AATAAAAACTGAAAACCAACCTAGAGATCACTTCATTTTTGCTCACTTACATTTCGACGTGCCTCGTGTTTGTTAGAAACGTTTTATATATATATT---TACACATGAAAATATGCGTACATCAGTTTATGTTTGCGTCCACGGATGGTTACTTCCTCGCCTAGTTGATAATTAGTTCACTTTTCTACAAATTTCGAAACCGTTTCATTTTTGCCAGTACGTTAATTTTGAATTTTATTCATCGAACCGCACAGTGCCATGCTTTA-AGGCGTCTGGCCGGGTGCTGAACGTTTGAGAACTGCCCCAAACTATTTACAACCTTCTGTCACTGTTTACACACTACTATAAATAAGGATTGAAATGCAATTTGAGTGTTAAAGCAAAGTTCTTCAATTTCTGATCGT-CAATAATACTGTGTAATGACAGGCATGTCGCCAAACTAAACTGAGAATTGAATTTT----AATGTAATGATGTTTTTTAAATCGTAATTTATTATTCGAATTTTTAAGTAGTTTTTTAAAAATCGATCAATAAAGATGCATATATATTTGTTCTTCTGAGTGGGT
ATCAATAGAGTCGTGAAAATACTACTAAATACTCGCCAAATTAGTGAAACGTCAAAGCAAGATGCTGTAGGGCTAGTTGTAAATAATTTGAAAAAAAAAAAACTTAAAACTATCT-----CTCTAGTGCACAAAAGCAAAACAGAAATAATAATAAATCA--------CACATTTTAA--------ATAATCAGACATA-------------ATATTTTCAGAAA-GAATAAATTACCAACGTTATAGTTATTGTTAAAGTTAAAA---CGTTCA-AGCGTTACATACTACATTAAAAAAA-----------------AAGTAAATCTATAAACAATTATCCATATACATACGATACACATGCAACCTTATAAAGTCGAGTCGACA-ACAAAGCAACTGAAGCCACCAAATTT-CCCAAGTCAATAAGGAAACAAAACGATAATAACAAGATGTAAACTTAATATTCTCTT--TTGTGGTCTACTTACATTTCGACGTGCCTCGTGTTTGTTAGAAACGGCTAATATACTTATTAAATACTTATTAATGTATGTCTATATTGATACATATATG-----ATGAATGAGTACATTTGAAACTATTAGTT--TTAAAACAATTTTCAAATGGTTTTTATTGCGTTTTGTTTTT-------CATTA--TTTTAACTACATAATTTGAAATGCACAAT--CATTCAATATATTTGTGTGTTTGTGGATAAATTTTTTGTAAACTGCCCAAAATATTTTACGATTACAGTTATTTATTTA-------------------ATTGAAAT----TTTGAGTGTTTAAGCAAAG---TTCAAGTTTTGATCATACAACATTTTTATAAGATAAAATGTG-------AAAC---ATTTATAA--AAAGTTTCACCAATTACAAACTGGTTTTTGAATGGTCATTTACTATCAGAATTTATAAGTAGTTTTTTAAAAATCGATCAATAAAAATAAA-ATATGTTTGTTCTTCTGAGTGGGT
>CG1193 1612843 1613190|1509 chr3R 1611927 1614750 scaffold_3 3763630 3766442 - 116436|919 1319
TTGTACGGGCT----GCTGGCCCAGCAC----CCTCGATAATGATCGTAT-------------CCCATGTGTACTTCCCGATCACAATTATTTGTAA---CCTGTATAAATCGTACTCGTTAGCCGTAATGTTTTGTTTTATA----------TACGCTTAATTGCTCAAGTGCCC-CACGCCCAGCATTGCTCCTCTATGTACGTGCACACGGTAATCTGATATCTTATAAATACATAATATATATATATATATTTAATTTGTAATA----TTTATTCAAAGGAATCCTACTGTAGGCTTATAGCAACATAATGTATTTTGTAATCAACATATTTGAAAACAGAGAAACGAAATAAATTAATCAACACC-----------TTTTGGAT---CCACAGAAC
TTATACGAACTATGTGCTAGCGCAGCACAAAATCTATAAAATCCCCGTATATTTACACCCATACGTATGTGTACTTCCAATACGCAAACTTTTTTTAATTCTTGTAAAAACAATACATATATGTATCGATATATAATTATAAAAAATGTTTCCTGTGTTTAATTGCTCAAGAGCACACACGCTTCACATT-TTGCTCTA--------CACACAG-------------------------ATATACACACACAACGGTATTTTTTAATACACATTTATTCGACAGAATCCTACTGTAGGCTTATAGCAACAAATTGTATTTTGTAATCAACATATTT-AGAACGGA-AAATGTAATAAATTAATCAACACCCAGCGGTCTTTTTTTGTATATGTTATAGATC
>Rpn5 1617128 1617291|1510 chr3R 1615039 1617270 scaffold_3 3766511 3768747 - 96876|2176 2319
TCCTGTTCCATAGGTGCTTAGAATAGTGTTTCCCCCTTGAAGCGCCTATCCACACGCA-ACTGTAATTGTACTAACCCCTAACCATCAACATTTCGATTCTCTTCGTGAAGTTTGTATTCATTGAATGAACTACAATTATTAAA
TAGCATTT--TAGGTTT-----ATTGTGTTTTCTTATTGAAACGTCTGCCCATATACATACACTTATTGTAATA----CTAACCAACTACAAATTTATTATTTTGCAAAAGTTTGTATTCATTGAATGAACTACAATAATTAAA
>CG1218 1619045 1619106|1512 chr3R 1617690 1620213 scaffold_3 3769014 3771549 - 73831|1386 1447
TTCGATTTTTATTCCGCAACCGTATCATTTTTACAAGCATTAAAACTAGGAAGTTGAGCACA
TGTGGTTTTTTTCTTGCAACCGCAACCTTT-------AATTAAAATATAAACAGCCACCTTA
>CG10979 1624117 1624348|1515 chr3R 1622102 1624467 scaffold_20 1122718 1125172 + 64738|2162 2423
ACGGAAC---CGGAAATGGAAGTCACCGCCACCATCATCGTTTCTACTTTCACAGCTTTCGGTTGTCTTTCCTACTGGATTTTTACTCAAACTTTCA---GCTGGTCGCATTCGCATCAACCGTTTTGAATGTAATTCACTAGTGTCCTTATTGTAAAAC--------------CAACTAAGCAAGAAACAGAATCCCT---------AAATGATAAATACGCTTCGAGTATTACGCGGTAAAAACAACCAAA-ACGAATTG
GCGGATCGTTCGAACAT-----------TCTGCGTCAGAGTTT-----------GTTATTAGCTGTTTTCGCTA---AATGTTAACTTGACCTCTCATTTAATGTTTAATATAGCATGTAATGTTTTGA---------ACTGGTGTCCTTATTGTATACTCCCATGTTTTTTCGCATCTGTGC--GTTTCCATATCCATTTTATGTTAATGTGATAAAAAC---TTGAGTATTACACAGCTTCAATAACCAAATGATAAATG
>CG31555 1637432 1639018|1529 chr3R 1638807 1639061 scaffold_20 1141058 1141321 + 1617|0 223
CAACTATGATTAACTATTGTTTGC--------CAATCAAATGCTAAAAATACAGCTCAACCATGTTTTGATTCGATGACTTCAA--AAGGGGTTGATGCAGAGTTAAAGGCGGAA--AACATCTGCGAAGCGTCAGCGTTGATAAATGTAAAACAAAGCAAAAAGCAAATAAAGTTTAGCAACAACATCTGAGAGAAAGAAACAAAAAGCAGTCATCGAGCGAT
CATATATGATTAATGATGGTTTTGGTTGGTTGAGACAAACTTCTTAAAATGTACTATGACACTGTATAAGTCTTGCGATCCGAGCGAAAAAGTTGATTAAGGGTTAAAGCTGAAACTGAAAGCAAACATGTTTAAGCGTTGCGAAATTCGAAA------AGGAATCAAATGAA---TAACAACAACAATTACAATTGCGAAGT------CGGCAAATGAGCGAT
>CG31554 1642913 1643006|1534 chr3R 1642060 1643006 scaffold_20 1144239 1145191 + 11192|967 1060
AGCTGAACGAGTCCTGGGCAGCAAGGCGCCTCATGGAGGCTTTGAGTCACCTGCCACCTAGTGGCAATAGCAGCACAAATTCTGCACCCGTAAG
AGCTAAACGAATCGTGGGCAGCCCGGCGGCTGTTAGAGGCGCTTAGCCATCTGCCGCCAAGCCACGGGGATATGAATAATTCGGCGCCCGTAAG
>CG10999 1644481 1644550|1535 chr3R 1643232 1647167 scaffold_20 1145262 1149144 + 134188|1321 1395
GTGGTGATTGGGAATAGATATTCGCCCATTCTTTTACTTGTGATAAAGAAGTTTTATGA-----TTGAAACGAAA
CTGGAATTGGGAATTTGACAT--GCCCGTT-TATTACATGTGATAAAGGA-TTTGATGAATATATTATAACAGCA
>CG10981 1651961 1652298|1539 chr3R 1651483 1652170 scaffold_72 157913 158617 - 6257|511 734
GTTGCTTAT------ACTATTTCACATTT--TTTGCTCTGT-GAGCCTTAATATAATATAGTTTAAAAAAAAACGCTTAACTATGTTAG--AGACGGCAAATAATG--TCTGTTCTTGTGATTCAGAAAAAAT-TAGTTATTTAAGTTGTCCTATGTAATCAGTGGCGCCCAAAAATATTTGAATACAACTATAAAAACTAAAGACTTCACTTTTGATGTATGA
GACGTTCCTCCATCAATTATTATGGATTTGATTTGACTTGTCGAATCATGGTATTAT-TACTTC--------ATTCTGAGATATTTTAGCTATAAGAAAATTGATGCATTTGTTATTTTGTTCATTATCGAATGTAATTAATGAA------CAATGCAATTAAAA------AAAAATGCTATATTAAAAC-AAAATAACAAACGACTGAAGCTTATATAAAAGA
>CG10981 1651961 1652298|1540 chr3R 1652171 1652570 scaffold_0 6316943 6317357 - -1735|0 128
AACCATCTCAGGCTAGAATAATATAAGAACGACCGAAAGGAGTGTCAAAGTATTAT-GTAGGCATTTTTCCAAACGCAATTTAACAATGTAACATACATATAATATAATAAATAAAATGGTCCCAACGC
CACCACCTGCTGCAAG-ATTGTAAATTACGTGCCTGAAGTTGTGGC-AAGTACTATCACAAGCTCTGGCCCGTGCACCGTGTG------------CCGCATGCCAAGGCCAACAATATGGTCCGGCCGC
>CG1208 1664006 1664504|1551 chr3R 1662515 1664922 scaffold_20 2093762 2096049 - 41141|1595 2095
GGATCACAGAAGGACTCCATGCCATAGTTTATTCTAGCTGAATGCCATTGAACTCGTAGTTGAATAAGCAGCCCTTGAAAAGATACTTTTGAATACTTTTTATATGTTATTTCTATTTTCAACGATTTACAAGAAATTACCTCTGGCACAATTGAACTTCAGCCAAGATATGTAACCTATTCTTAATTTTATTACAATTTTTTCGGACTCAAGGCCAACCTAGCTTATTGGTGTTCCACGATGTTCAGATACGTAGTATAGTTTAACTAGTTCCTAAGTACTCAAGGTCACGCCCAAATATCTATATAAGATTC--AATGGACTTCCACTTCCACCCAGTTACATATGTACGTGCTCTCCTTTTGTATAAACCACCTGCTGTATAAACACACGTACTTTAGGATTGCAAAGACAAATACCTATATTTATACTTCTGTGTGCTAATTTTAACAAATGTACATATATATTTGATAATAAAAGTAAGCTGTACAGGAACCTGCA
-----------------------AAAGATGATTCGAGCTAATTA-------------AGCAGAACAGGCCATGGGCAAAATGACGCATACG--------CCGTGTGCCACGC---------ACAATGTACAATA-----------------------------------------------------TTTATCATATGGTTTTATTAGTTTAGACTTATTTATTTTTTAAGTACTCAGC------CAAATGTTGTGGACAATTTCTCCAGCTCGATAGAGAACGAGATT-CGTCTTGCTATTTTCGTCGTCTTCTTAATGTATTT-----------------GATATGTATGTGTTAAGTGTGTG----------CGGCTGTAAAGACATGTGTA---TATGTTTAAATAAATGTGTATATATAAATATATTATTAGCAACCCACTCAAATATACATACATATATGTTGCATTG-AACCCTCCGATAACCCATCACCCGGC
>CG1213 1672134 1672300|1557 chr3R 1670725 1672458 scaffold_20 2102199 2103905 - 78652|1410 1591
------------AGAGCTGGTCCCTTAGTTGATAGTGCCCTTGATTCCATAATGATAAGGATCCCTCTGCAAGTATTTTACTGGCTAGTGTAGTAAGTCAAACTCAATTGTTACATGT-TATTCTTGTTAAGTCGTAATGAAAATAAAAGTCTAGTAATAATATTATTATAAACCAAC--AA
TTCTAATCGTTATGTACAGGCTGTTAAGT--GTAGCCTTGCTGATCCTATATGTATAAGT-TGTATATGCAAGTATTTTATTGCCTACTTTTAAGAATATTGTTTAATTGTTATATATATATTATTGTT-------------------------TCACTAAAAATATCAAAAAACAGCTAAA
>ECSIT 1683623 1683636|1567 chr3R 1682298 1685244 scaffold_21 2210471 2213456 + 127591|1359 1372
ACAAATTGTTGAGC
GCGTGTTATTTGAT
>Obp83cd 1935339 1935457|1893 chr3R 1934985 1935497 scaffold_21 2007532 2008055 - 9683|354 480
GCAGCTATTATT--------GTAAGCAAAATTTATAAATGATTACATACTAATTTAATGATAAAAGTATGCTTTCATTTGTCTAGATAATATTTCCGAATTTTGAAATATATAGATCTTACAATGT-
GCAGTTGTTAGTTACACTGAGCGAATAAAAAGTGTGTCTTGTGGCATGTCTG-CAAATCAGAAAGCAAGGCGAACGTTTA-------AATATTTGAAAACTTGAAAGAACGCGAATCTTCAAATATA
>CG1076 1948993 1949143|1907 chr3R 1948409 1949828 scaffold_21 2022838 2024262 - 21194|652 802
CGGCTCAGTTTTGGCAGTCACTTTTGGGGAGGTGGGGAAGTTTAATGAAGGATTTTGCATAGTTTTCAAATGCATACCAAATGCTGGTGATACAATGTCGTTGGAACAGTTATCGAAAATATATACGCACAAACATAGATATATTCACAAA
TATACGAATTGTTGTATTAAATATGATGCATATAGA------TAGTAGAAGCTTTGAAAGGCTTTTGTCATTGTTACAAACT--CGATGCCACAAT-TGATTTGAAAAGTTTTGGAAAATAGAAAAG-ACAAGAA-----------AAAAG
>CG31563 1979300 1979596|1948 chr3R 1978650 1981095 scaffold_21 2055541 2058372 - 11696|799 1161
-----GCGCTCTAATTATGGCTTGCAGC------------------AATGCGCTGAAAAGGTCTGAAAGGGGTTATGAAAAAAAAAAAAGGAAAGGGTAGAAGAAAAGGCCAAGACTACGCTGGCCCAGCTTTTCACTTTCGATTTTA------CTGCTCTGCATAC--------CGGCTGCATTGTAATTAGCAGCAT-----CTCACTTTCCTCATTGTGGCATTCAAATGCTTCCTC---------------CTGCCCGAATCATTT-------GCTCATTTGCATGCGAGCCGCTATAAGGCCATAAAACA--TTTCTATTCAGTTAGCATCCAATCCACCTAAGTTATGCCGATTCGC
CATTTATGCTCTAATTATGGCTTAAAGCCGCAAGACATAAATCAAAGACCCAGTAAAGACGTCGACCAACTGCCTCGGCGCATATTAAATCCTACGCTCAACAAAAATAACATACAAAGGCCAGCCTA--TTTTCACTTTCGATTCAGTCTGAGCTGACCTGCATGTGGCTGTGGCTGCTGCATTGTAATTAGCAGCATTTGAGCTGGTTTTTCTTTTATTGTTATGCAGATGCGATCGCATTGTTAGCCTTAAACTCGTCGACTTCTTTCGATTTGGCTAATTTGCATGTGCGCCGCTATAAGGCCACAAAACACATTTCTTTTC-TTTGGCATTTAG-----CTAATTTATGCT-CTTCAG
>CG1077 1995958 1996032|1955 chr3R 1994882 1996144 scaffold_21 2064701 2066023 - 4648|1244 1324
TTCTAGTAACTCTGTTAAACA------TAGATTTAGGTTGTTGATTTCTCACGTTTCCAATAAATACAAGACTTAAATATA
TTATAATCTGCCTGTTGAACAGCTTTTTAACTGTAAGTTAGCAATT------GTTTTTATGGAGTCAGTGATATGAGTGCT
>NPFR1 2019872 2021136|1973 chr3R 2017802 2019874 scaffold_21 2081140 2083227 - 60903|2206 2208
AGC
AGC
>NPFR1 2019872 2021136|1974 chr3R 2020252 2020561 scaffold_48 39418 39754 - 1809|0 340
TTTTGAAATATTTGTGTAAATATCGTTTTCAAATTTGTTCGCCTTAA---TCTTACTTAATAATAATAATAATAATAATCTTTACTCCGATAATCATTAACGTAACATTTCTACT------------------TGTAAAAATATTTCTGATCTAAGGGGCTTGCTCT--------TTTCGGCTCCACCTTGAATTACTTTTCAGTTGACTAACTAGGCGTATATTTTTGTCAGTGTATGCATGCGCTCCTCTTATCGTTGCCTTGTCGAGCTGTAAC--TCTTGTTGTTGCCATGTTGTGACATTATTTGCTTTTGAGCTGCAATCGATTATGACCCGTCT
TTCTTTAATATTTTTTGTATTTCCACTTTCGGTTTTTACTGTTTAAAACATTTTATTTAATTGCATATTGTATCGTTTCTTGCGCTTTTTTATTTACTAATTTAACATGTTTGCCCTTTAGTAGTTGTTGGCATTTTAATTTGTTTTTGTTTTTAAGTTTTTGTTATGCATCATATTTATGCTTTGCTTT-CATTAGTTTTAATTTG--TTAATGCATTTATGTGTGTGTAAGTATATGTAATCGATTTTCTTATCTTTTGCTGTTCGTGTTATAACTTTCTTAGTGTTTTCTTTTTGTTTTTTTTTTTTTTTTAGTATTGTTATTGTTTGTT-CTTGTTT
>NPFR1 2019872 2021136|1975 chr3R 2020562 2020604 scaffold_21 2083550 2083591 - 2173|0 42
TTTGTGACACATTTTCAGTTTGGAACAGTACTAAATTGGCAAT
TTTGTG-CACTATTACAGTTTGCAACAATACTAGATTGCCAAT
>NPFR1 2019872 2021136|1976 chr3R 2020666 2021142 scaffold_21 2083744 2084252 - 2192|0 519
AGACTTAACACGTAT-TGTCCAGTGATCCAAAGCCAAGCTGAGTTAGCCCTAAGTTAAGAC-----ACACGCGACTAAGAGCTCGAAGCCTGTAAAC--------TATTCTTAAACGACCATG----TCATGGCATCCATCATCAACTCGGAC-TAAGTCTATGGTTAGATCACTTTCGTATCAAATGCCGAAAAGTAATTGAATGAGCCC-CCAATTAGATTTCGGGTATTTGATAAGTCGAATACGCCTAAGACTCGAATAAGTTCTCTCAACAGTTCCTAGGAAATATTTTCGTTTTATCTCAGCA----------TTTCTTGGTATCA-----TCTAAGC--TAAGGATTAGCTATAATTGATGTTCTGTTCGCTATTCAATAATGATAGGATAGGT--CGAAGTCCACTAAGCCAAAGTGAATTTAAAGTATAGTATAGTATAAAGT------ATAATTGTAA-AAGATAACT-TTAAAATAAATGTCAGCT--GCTCTTAAACATTTAATGCAA
AGAAATAACGAATATGTGTTGACTGATTGAAAGCAAAGCTGAGTTATATTTAAGTCTAGGCGGGATAGTTATGAGCTACAGCCAGATGTATCTAAACATAATGTATCTACTATAACAATTATGATTACAATTACAATTACGATTCATTCATATATACACATACGCTTGGCTTAAGTTT-CATCAAATACTGTGATTTAATTGAATGAGCCCTTCAATTAAATTTCGGGTAATTGAT-------ACACACACAACTCTTCAGTTATAAGTATTAGTAGATCCATATACATATATACA-TTTATTTAAGTAAATGTTCCACTTTGTTCCTATTAACGCTTCTTAACTTTAAGGCTTTGTAAGTATTTCGCTAATGAACCTATTTCCATATTATCAACATAAATACCTAAACTTAAGCATACAATATTGATTTA--------TGTAACATAAAATGTGTCCATAGTTCTAATTACGTGTCTATTAATAACAATCTCAGCTAAGCTCTACGATAATAAGTACCG
>CG15589 2032904 2033403|1988 chr3R 2032687 2034060 scaffold_21 2120126 2121498 - 13151|217 790
ACGGGGTCTAAAGGTCTCGGAGCCATCTCTCGGACGGTATGGGGTCGAGATGACAGCAAAGTTCGTGGGAGTCACGTCAAAAGTCCGTCTGACGGATGCCTGCCTTCTGGGGATGGGCGGTGTAATTATGCAAATCGTACTTTAGATAGGATAGCCTAGCCATATATAGAGG----------------TTCGTCAGACG-------------------------GCAGCTGTCGGCGGCGGGT-GGGGGTTGGTGCGCAGGGGCAGGGACGGGGCTTCATTAA---TACGCTGTAAATAGAAAAGTT-----TGTTT-CGTAGTTTAATTAGCACCAGCACCAATTACTGGAGGATGCTGTTATTTTTAGCCATTTAGCTGA---ATTTTAAGTATTTATTTCTAGCCTACGACTATTTTTAAACCTAACCCGAC--------TATTTTTAAC---TATTTATTCTGTTGTTATTATGCGATTAGTCAGCGAGCATTGTTC--AATGTCCTTAAATTATTCAACAAAATCATGTTGTACCACCAGAAATAAACCAAACT-------TATTGAAA
GC----------------------------CGCAC------GAGGCGAAGGTTCGCCAAAGTTCGCACAAGTCAGGGCCGGGGCACGGGC-ACAGGTGCCAG-GTGTTGATGCCTGTGGCTGTAATTATGCAAATGCTACTT---------TAGCCTAGCCATACATGAACGCGTATAAGCGACTATATACGATATACGCACACGCACACACATCTATATATATATATATATGTGCGTCGGGTCGGTGGAAGGCGGGCTGTGT--GTTTCGGGGCTTTAATTAGTGTGTGCTGTAAATAGAGAATTTCTTCGTGTTTAAATAGTTTAATTACAA--AGCAAACATT---------CACTGTTATTTTTAGCCATTTAGTCAAGTTATTTAATGTATTTATTT--------AAATTATTTATTTAATTTATTTAATATATGATATATATTTAATTCATACCTTATTTAATACTGTTATCCACTTAGTCAGCATCAATTGTTTTAAAGCTGTTGAAGCTCCTAAAAAAAA------------AAAAAAAATAAATAAAGTTTTATATATATTATAA
>Osi2 2039104 2039214|1993 chr3R 2038568 2039501 scaffold_21 2126429 2127398 - 43311|551 684
CTTCGAGGACTCC------AACCACCTCCG-------CGTTGTTATTTATTCGGC-CTTCGGCCTTGTTGCATTCCTATAAGAATATTTATTACGCTA-ATTGTAAATAAA--------ATAAAGTTTGTAAAA
ATC---AGGTTCCGGTCGAGACGAGGTCAGGTTAGGTCATTGTTATTTATTTTGCGCCCTGGCCATATTGCATTCCTATAAGCATATTTATTACGCTACACTGTAAATAAAAGTCCAATATTAAGTT--CAAAG
>Osi3 2043640 2043675|2000 chr3R 2043037 2043683 scaffold_21 2131012 2131623 - 30853|603 638
AGCTAGTGTTATGTATGTCATTAGATCAGGAATGAA
GACGAATG--------------GGCAAAAAAAGAAA
>Osi6 2062025 2062603|2019 chr3R 2061293 2063077 scaffold_21 2155159 2157125 - 60232|757 1489
-----------------------ACAATTGGTCAAGAGCCAAA----------TTAACCGAAGGACGAAGGCCAAGGAG-------AGAGAGAGAAACAATCGCTAAAAATGATGAC--------------CTATATTTATATTTATTTATAAATTATTTA--TTTTAATTTATT-------ACTTGAACGAGAAG--------------TACGAGACGAACAAAGTGCCTTCCATTA------------------------GACAAAAAAACAATCACTTAATAACAAGACACACCCAAACACCA-----AACACCACCTTTCATCCAGAACCGCCAATAACCTCCACAAAGG---------------AATCTTTACTACTTTCCGCACTCCTCACTCT-----------TCACGCTGTATCTCAA------TTTCATGGCTGCAC-CTTTGATAAATGGACTGCAAATCTTTGCGACTAGTCG-ATCCATCAGTCAAAGCCAGTCGCCTCGCCCATCTAAC-TGTATCTATCTCTCATCTGTTTCCATCTATCTCTGT-TCTACGACTATCTCTATCTGTACCTCTACCTTAATCTATCTACCTATCTGTCTATCCATATCTGTCTGACTATCTGGA------------CTTTCTCACTTTACCGCCCGGGAAAGACCAACCGAATGCTGCTAAATCAAAGAATCAAATAATAATTCAAACATAAAAAATA
GGTGACAGACCGCACACAAATCGATGGCTGACAAGGAGAGAGAACATTCGCTGCTAAACAAAAGAAGAAGAACAAGAAGACGACGAAGAAGAAGAAGGAGAAGGAGAAAATGATGACCATTTCATTAATGTCTATATTTATATTTATTTATAAATTATTTATTTTTTAATTTATTTACCTAAACGTGAACGAGAGAGCGGGCCGATGGCCCCCAACACCAATTAAGTGCCTTCCACAACAAAACTCTCAGCGTCGCGAGACGGCCGAGAAAACATTTACACACACACACACCAC-CACAAACAACAACAACAACTTCACTTTTCATCTACGCACACCAAAAACAACAACAAGAGCCAACATCTACCCCAAAACCTAATTTCACTCTGTATCTGTATCTCTATCTGCATCTGTATCTCTGTATCTTAACTGTATTTTCATGGCTGCTCGCTTTGATTTATGTGCACAAAATGCTTGAAACTAGTCGCGCCCATAAATCAAAG------GCCTCAGCTATCTATCATTAATCTGTCTATC-TGTCTATCTGTCTATCTGTGTATCTGTCTATCTATCTATCTATCTATCTATCT--ATCTATCCATCTATCTATCTATCTGTTTCTGTATCTGTATCTCGAACTCGAACTGTGTTTTCCTACTTTTACCGAAAAGAAAACTCTAACAAATGCTGCTACATCAAAGAATCAAATAATAATTC-----CGAAAAATA
>Osi9 2087372 2087832|2048 chr3R 2085705 2088913 scaffold_21 2193191 2196943 - 67522|1928 2594
GCTGCATGCCAAATATTCTGAATGCTGAATGCTGAGGCAACCGT-AATCAGTGCAATACTCGGAGGG---------------------------------------------------------CCGTCTAATTTAT-CTATTTATTTAATTTATTTGTATAGCATAGTTCATGCCAGGCTTACACACTTAAGGCGCCATCA-----AGAGAAATAGAAGGAAA-----GGTAAATC-----CCGAACCCACACAAATAGGTCTAAG-----GAATCAGCAGCTAGG---GACTGCCGCCAGAGGGG--AACACCTGGCGTCG--------------------------------------TTTAATCTATTCTTAAAAATGACTGCCACTGTCGTATTAATACTCAGAGCTTTATTATTTAAAACT-------CTACGCTTAACTTAACTTAA-CTCAACTGAACTCTTAACCAAACTATTAAACTAAACTGCCTA--ACTCTGAACTGCCGCTAGGCGCAGAAAAAGCCCCCCTGGCCAAGCCCTCCCCCACACA---------------AAACAATAAAAGAAAT-------------GCCGCATTTAT----------------------------------------------TCCGAACAT
AT----TGCCAAATACAACAAA--------------ACAACAACAAATTAGTGCAATACACAAAAGGAAAAAGAGAGAAAGAAGGGATAAGAAAACACAGAGAGAGAAAGTGAGAGCGCATAGCTCGCCTAATTTATATTATTTATTTAATTTATTTG--TAGCTTAACTGAAGCAAA----AAAC-----AGACGCCATCATTGGGAGAAAAACAAAAGAAAATTAAGAGAAAATTGTCAATGAAATCCTAGTTAATAAGCTCAAGCAGAAGAAGCAGCGACTACGGTCGTCTCCGGCAAAAGGGGGCGGCACTTGTGGGCGGACCCAAAACTGAAACTGAAACTGAAACTAAACTCAACTTAACTATACTCTGTAAACTGACTGCGTC--TTGTATTATG--TGAGAGCTTTACTATTTATTTTTTTTTTGCTTACGCTAAACTATTTACAATTTCATATTTATTGTTGAATAAACCA--AAACCAAATACTTTAGCACGCTGTACACTGCCCAGCAACAACAACCACGCCCCCCACAAACCACCCTCACACACACGCACAGGCACACACATACACGCACAGAAATGAAACTCAATAAAGCCGCATTTATCTGTAACTGAAAATCGTTTTGCATTTGACAGGCGTATATAAATTCATACACACAC
>Osi12 2107527 2108217|2076 chr3R 2107008 2107617 scaffold_21 2218299 2218928 - 22863|547 638
GATGGAAATCCAGATAGACAGGAAAGAGCAAG-AGGAGTGGAGGAGTGACCCCAAGTGTTACATAGCTGCATTTATCTTCTGGATAAATCAC
ACGCCACACACAGACACACACACACACACACGCATGCACACAAAAGT-----TAATAGCTCCAAAGCTGCATTTATCTTGTGGATAAATTAC
>Osi12 2107527 2108217|2077 chr3R 2107618 2108210 scaffold_21 2219648 2220322 - 9254|0 711
GGACGGCGGACGGATTGTAATTAGATATACACATAACTCTCTTTTTGCAC----TTGCACTGCTGGGCAGAAAAGATGACTTGATGCACTTCCAACGGTTCAC------TCGACGCACTGTGGCACCTATGGGTACATCGGATGAAATGTATCCAGAACGT---GCGTTCCCACTGGGCACTGCGGATT----------------TTTTTATAATGATTAGTATTTGCTTTAATCGATTACGTTTTGTTTAATGTATCGCTCTGCCCTGCTCTGTTCTTCCAGCCGGGTTTACTGTTG-----------------CTGAGCCCGGCATCTGTATCTT--------------TTTTTTCAACC-----TGTATCTGTGTATCTGCAACT---CACTGTGC---------TTCAATTCTTA--------------TGGCTAACTGCACTTGCTATTTTCAATTACCTCTCGTACTTCCGCTTCTG------------------CAGCCCGTTTCCAAGTCCAACTCATTC-CACTGGCGCACTTT--GATTAACTCTAGCCT------GTCTAACTGTACTTAGCCACTAGGTGTAATAATTTATTTAACTTTATTATTTATTTACCAGCCGTAAGTGTAAATCGCATGTAAGCAGCAAAG-TTTTCAAAAAACAGAAAAGCAAAAAAAATGTATACAAATAAAATCACTGATA
GGCAGGCTGGCAAAATGTAATTAGATTTTC-CAAATGCTTGCTGCTGCACCTTTTTTTACCCCCCGACTAAAG-------TTGATGCGTTTGCAACGGTTAATGGCTGGCCAAGGCACAGTTGCACCTACAGATACATCGCTGCAAATGTATCTGTAACGTCGTGCATCCATTTTAATCATTGCCATTTGCATAATACAAATCGATTTATGTAAC-ATGAGAATGCGACGCACTTGGTTCCGTTCCGTTC---------CTATTCTATTCTATGTTTTCCC------GTTTACTGCTATACACTTGAACTTCTGTCTGAACTTTGTATCTGCATCTGGCTCTGTCGCTCCATCTATCCATCCATCCATCTATCTATGTATCTCTAACTGCACACAGTTCCTGTTATTTTTCAATTATTCATTCATTCATTCATTCGCTCGCT-CACTCACT-TATTCACTTATTCATACTGTTCTTTCTTCTGGTCTACAGCAGCCAGCCACACTCTGCGCCCGTTTCCAGCTCATTTTCACGCGCACATTTTTTGATTAACTTTAATCTTAATTCGCCTAACTGTAGT------CTAG-TGTAATAATTTATTAA----CATTATTTATTTCCTAGCTCTAAGCGTGTCTCGCATGTAAGCAGCAAAGTTTTTCAAGAAACACAAAAGTTACAAAAAAATAAATAAATAAAAACAATTACA
>CG15594 2114195 2116719|2082 chr3R 2114848 2115891 scaffold_21 2226997 2228010 - 9854|0 1112
GATGCCATCGCAAGAGAAGGAGCAGCAGCAGCAGCCGCAGACCCACCAGGTGCAACTTCAAAGGAGCTCCGGGTTCAAGGTCGCTTTCAACGCCTGGCATCTGCGGAATCCGAGGGCCGCAAGCTCAAGAAACTGAAGAAGAAGATCCAGAAGCTGTTTTTCCCCCTACTGATTGCCTACAAGCTCAAGTTCCTCACCCTCATCCCGGTCCTAATCGGCGGACTCACGCTGCTCGTGGGCACCACGGGCCTGGCCGGCTTTTTCTTCGCTCTCTTTACGGCTGTAATGAGCCTGAAGAGCT---CCGGAGGTGGTGGCCACTCCAGCAAGTCCCTCGTCTTGAAGAAGCTCTGATGAGTGGCGCCTTAAAACCCAATCAGAATACCTATTTGCCTAGAGTTGG---------CCCACTGCTCGGCC--------AGCATTGATTTATCCGGTCGGTCGGTGG------CTATAAACAAGTGACGTCGCCGACTTTCAGCGATAACAACGACGCGCCCGCAAATGAAATGAAGTATGTAAATAACAGCATTGTCATCCTAAAGCGAATTTTAAATACTCTGTCTTAAATACTGGT--ACCTTAGACGCAATCTTTAATATATATATT--AACTATTAGCAGCTCCATGAGAAATTCGAGCTTTACGAAAACTAAAATTTCTTTTTTAGCCTTCTAATTTTTGGATACATTTTTCTTACGTTAAACATAACACGGTTTGGTTTAAGGTTTTTC-TCTTCATAAA---GTCAAATTATTAAATATTTTG-----CATAGATGGGCTCTTAATTATAAGTATA--TATTTATCTTGAAAAAAT-------GATCTTGAAAAAAAACGTCTTTAA-------------------TTATTTTTTACTAAGCAATGAGAACTATATTCTTCCTAAATTTTTACTATTTCGATTCACTCGCCTATTTATAAAT--TAATATGAAAAAATTGTTATAAGATTATATATTTCTAAGTTATTTTTTATAATATTCAGGACGTGCTTACCGTTAAATTATTATCATTTAAGTTCAGTGCAAAGTCTAAAAATAAATTTCAAATTAATTGTATGTGTACCCATGCT
GATGCCGAGTCCAGCAAATTAGCAGAAGCAGCAAC------------------AACATCAAAAGAA------GTTCAAGGCCGACACAATCGCCTGGC---TGAGACCTATCAGAGCCGCAAGCTGAAGAAGTTAAAGAAGAAAATTCAGAAGCTGCTGCTGCCGCTGCTCATTGCGTACAAACTAAAGTTTCTGACACTGATACCCGTTCTAATTGGCGGCCTCATCCTGCTGGTGGGCACCACCGGGCTGGCTGGCTTCTTCTTTGCCCTGTTTACGGCCGTAATGAGCCTCAAGTCATCAACAGGTGGTGGTGGGCATTCCAGCAAAGCGATTCTTTTAAAGAAAATTTAGAGGCCAACAGCGTTTGATTTAAGATTTAGTTCCAGTTTCCTCTAATTAGGGCCCGGCCCTCGCCGCTGGGCCTCAGTTTAAGCAGGCAGTTAAAAGGCCAAACGGCGATGGGCTTTATTGATAA-----TACACTAAAATTAAGTAATATTAACAAAGCGGCCGCAAGAGAAAAG------------------TTTCTTAGCCTTA--CGAAGTTTCAATACCCTTATCTTGGTTCAAATTGAATTGAGTTAAAATTATTTATTTATATTTTTAAGATGTTTGTGTAGACAATAAAAAATAGTGCATT--------TAA----TTGTATGTAGTGTATTAAGTAATTGGGGCATTCTGATCACAAAAAAACAAGTACTTTATCATTAAAATACTTTCAGCTTTGTTAGCTTGATAAAATGGTATATTTTTGGTCAGACAAAAACGCGGTCACACTCTTAAATTTAATCAATTTTTTCAAGGCAATTCCCACAGAACCTCAAAAAAAAAAAATTAAAGGCATAGCTAGCAAAGTGCTAATATTTTATTAGGTTTTTAGAAAATTCCAATTTTGCATTTTATTTAATTTTGAAT------GTTATTTGTTGCTGCCGCTAAGTGCGAATTATTATTAAATT-----TAGCTAGAATATTTCCCAAAGCATTTATGGC-TATTTA--GGTAAGTT-------------TTCGGCTTAAAGT-----AACAAATTTAATATCTCTCGAGTA---ACCCCTGCC
>CG15594 2114195 2116719|2083 chr3R 2115995 2117899 scaffold_21 2228096 2230205 - 6258|0 843
CAGCAACCGGATGCCAAATAAAAGTACCGCTGACACTCGAGCTGCGATACATTCC--------------------GCAGACACTTTGCAGTTGGTAA--GTCAGGGTTTTGGGCATGAAAAGTGACGACAGCAAACGCGTTAACGAATGTCGACTGCTGACTGCGCTTAGTTCCGAGACACGCGCTTGCATTTGAATGTCTTTGGACGCCCTCTGAATATATAGAGTCTATACTCGTATTGGAGTGTGTGCGACAGGGCCAGAGTTACACATGTGCGGGCCACCCAGATAAGTCCATTTGTCTCGTCTGGGCCACGCCTAATTCAGTTTGGGCGTTATTCAATTTCCCGGCCAACCTGTACTT-------CCATCTAGG--CAACTTGT----GTAACTTGTGTAATTGCAGAAGCTGTATTCGCTG--CCACCCTAA--TATTGGTGAAATTTAATTAATCCTATTACATTACATTATATAC--------------------------------ATTGCAGACCATCAGCCAGCGGGCGTTGTCGGAAATTTA--------CATAAAGACGGGCTCAAGGAAAGCCTTTAAATGGAATCCAAAATATTCTCAAGGCCTTCAATGTTAAT---------------GGCCATGTTATTTAT-GAATTTTTAATAT----------------AATTTTCATTGAGTCTGCTCTGGACACACAAATTTGATTGAATTTTGCGGCATCGGTAGGTTAATTTTAAATCGAAATATTAA----CATTAATTAATAAGGTAAA----CGATGTGTTTTTAAGTTTAGATAAATATAGAATTCCAAAAATAA
CAACAACCGGATGCCA---GAAAATCGCATTAACACT-GAGTTGCGCCAAAGTCTGTTCATGATATGTGACGACAGCAGCGCGTTTGACGTTTGAGACTGTGAGGTTTTTTAATATG--------CGTGGGCAGAC-CCTAAAAAACAGTTAACCGTTACATGCGGTACATGGCACTACGCTGGATCGCACTCTAGTAT-TTCGACAGCCAATTGAA-------------------------ATTGTCTTCGCCAAGTTCG----TTCGCACTTGAACGTCATTTAGTTCCGTTTACAAAACACATCAAACACACACAATTTTCATTTTCATTTTCATTTATTTTTCTCTTAAGCCTACGCTTAATATGGCTATTTATGGCCGGCTTTTCACAATAATTATGCCAATT----AAAATGTGTCCTCTGGCCCATAGTAATTTATTCAGCGCATATTTTCCACATAAACAAATTAGCTTCTACACTCAAAATAATTGTTGTTTAGAAAAATGGTTTTATGAATGCTTATCGTTAAATGAGAGAT-TCAGAAATTTCACTTGTTTCACAATGAAAAGAAATATGAGAAAATCAAAATGGA----AAAATTTTCTAAAATGCATGAAAATTCACTTTTCTAGAATTTAGAGCCATGTTTTTTTTCGAGTGTATAAAATTGATGTACCTGCTAAATATTTTCACGGCATATGCCTTGAATA---ATATTTTCATCAAGCTTCGGATTTGCGCA---TAATGTTAGA-CAAATAATTAATAAGCGTAATTTAATTACGCAAATTTGCAACAGAAAATTAAGTTGATTTAGTTGGCGAATTTT--------
>Osi14 2126300 2126472|2093 chr3R 2125657 2128000 scaffold_21 2238102 2240690 - 70277|684 927
AAGCGGCTGGGAGA----CAG-----CTCAAACAGATGTGCCTTCGTTTTGAAACC------------------------------TTTAGCCTGTAGTAATTTATTCGAAATGT-------------AATTAACT----AATTTATTGA--------CACACCACGCA----CACATCACCCGCAAGTCAAGTCGAATGTATGA---ATAAAACCAAGAGTATTGCACCCGAAAAAAATATAA
CAGCAGCAGCAGGAGCAGCAGTAAGCCCTTAGCAAATGTGGCTGCATTTTGTGGCCAGAAATGTGCCTTTTTAATTTGAGAAAGAACTTAGCTTGTAGTAATTTATTCGAGACGTGAAGCTGACGCGTAATTAACTGTTTAATTTATTTAATTAATTTCACATTACACAACACTGTACAAGCTGCAAGACACAAC-ACTGTACAACACATCAGCTAAAGAGTCATGACAATAAAATCGATTTAT
>Osi15 2128898 2129375|2095 chr3R 2128419 2129702 scaffold_21 2240888 2242300 - 34847|503 1117
GCCGGAAAACACCCACCGATCCATCCATCCCACTCTGTACTAGCC-TCTATCTTTCACCTGCTATATCTTATCCTACCAAAGCGTCTCCCTTCT-----TCAACTTCCCCCCACTTCATCACCATTTCCACAACCTATCCC-----TCTAAGACTTTCCTGAAGAATGGCCTAATTC-----------GTAGTCAATAATTATTTAGTTACATTTAGTTAGTTAGCTGCGACATACCAAAAAAAATC------ACAAAAAAAGAGAACT--------------------ATTGAAACGGTCCCTCGACT----------------------CTTGGCTAGCCCAAAGGACAATGCTTAAGGATACTACGGCCAATCAATGATTGCGCCATAATTATTGCACATTTCCCCATCCACATGTCTCTTGGCGGTCGTACATGTCACTCAGGTTC--------------ATCGAAAGCAACGAAGA----------------------------------------------------TTATGCCTGCTAAAGAGCTTACTTACTAAGTATTTATTC-GTACAACTTAAAGCAATTGAATAAAAATGATTCATCAAATGC
GCTGCCAAGCA--------------------ACACAGT--TAGCCGGCTACCTTCCACTTCCACTCTC----ACTCTCAAAAACTTTCCATTCTACTGCCCATTTTCCTCGCCTTCCTTAACCCTATTTTCCACCCCTCTCAAGAGACTTAAACTTCC-----ACATGGCTAAATTCGTTGTAGTGTTGTAGTCAATAATTATTTAGTTATACTTAGTTAGTTAGCTGCGACATACCAAAAAAAAAAAAAAAGAAAAAAAAAGAAAACTTTAAGATGAGAAAAAACATAACTTATAAAAATCCACGATGAATGAACGAAAATCAATGACGACTTGGTAAGCTC--AGGATAACGCACACGGATCACA----CACATAATGCTTGCGCCATATTTATTGCACAATCAAACATGC-----TCTCT----AATCAGACATGCAGCTCAGGTTCATAAATGAAAGTTAATTGAAAACTAAGAAAAAAATCACAAAAAAAATCACAAGAAAAGAAAACGATATGTTAGCAAGAAATTCTTATGTCTGCTAAAGAGTTTACTTACTAAGTATTTATTTAAAATAATTTATAGCAATTGAATAAAAATGATTCATGAAATGC
>Osi17 2152520 2153033|2123 chr3R 2152362 2153025 scaffold_21 2271329 2271987 - 16310|158 699
GCCGGAGGTCGCCAATTTTCGGGAGAGAGAGAGAGAAAGAGAGACGTTAAACGTGAACGAGCAACTTTGAAGTCAAAATTTCCTTGTTAAAAACCGAACTGTAAATAAGATAA-----AACACGTAGTCTAAGCTTAATTTATTTGTTAGACTCTTATTTATTTATTTATTTATTTATT--GTAGTTGAATGGTAAAAAACTAAATGTCAATTTGCGCTTCT-TTGTCACCTAGTCGCTGCTTTAATATTCATTCTGATTTTGTT----CAATTT------------TACATACAAATTATTCACTTCGATC--GGCTGCGGTCAGTACACTTT----TTAAATTTCCCACCCACTCGTGAATGGCACACGAATAATTCACAGATAATTTACTAAAAATACCATATAATGAAATCAGAATGTTTATTAATTGGCGGCCAGACGGATGCGGCTGCAAATTCAATTAGTCAATACGCA---AAAATTGTTATTAGAGGAGTTTTTGTCGCCAGCAC---ATAAAATGGAAAATAAATTGAAATT
------------TAAATTGCGGGC---------AGCGGCAGCTGCATTGAGTACAATCAA--ATCTTTTGAGTCAACAATTCCTTGTT--AAATCGAACTGTGAATATGCGAATTATTTAAACCTA-TTTAAGTCTAATTTAATTGTTAATCTCTTATTTATTTATTTATTGATTTATTTATTAATTGCGT--------ACCGAATGT-AATGTGTGCCCCGATTGCCGTGTCAATGTCTAATTAATATTCATTCTGATTTTGTTGCAACTATTTATTTTTCTGATATTTATACAATTTACACAATTTTTTTAGGGTGACATTTTACACCATTTGGCCTTCAACTATTTGAGCTCTTGTTGCAATAACAATAAAAACGAGCGTGAAAAATAGCAATAAAAACATGAAATGAAATCAGGATTTGCATTAATTACCAGACTGGCAATCGAGGCTGTAAATCAA------CAAAAAACATTCCATTTTGTAGTCTATAGAAATATTGTTGCTTACATTTATTAAAAAAAAAAAAAAACACAAATT
>Osi18 2157286 2157536|2129 chr3R 2156792 2157553 scaffold_21 2275510 2276257 - 33435|496 781
ACATGGGTCTAGAGACCAAAACCCCCCTTACGAAATTCGGCCAAACTGTAACCTTATTTATTTC-GTTCTAAGTTAAGTA--GCTGAAACACACCGCTCTCGGCGTATTGTTTATTTATTTATTTAT------TGAGAAGTGTACAAAGCAAAGACCACAAAA--AGAACCAAACCCCCAAGGCG---TTTTAAAAAGGTACTAAGTGGGAATTAGCTCTGGTGTCCCTTTGT--------------------GTAAATATTACTGCAATAAAAAC-ATGCAAAAA
CGTTGAATCCGGAACCGAAA---------------------CAAGCTGCGACTTTATTAATTTTGGCTCTATTTTAAGTAGTGCATAGTCGTATTGTTTTTA----ATTATTTATTTATTTATTTATTATTTATGAGAATTGTACAAAACAAAAAAAAAAAAAACATAAGAAAACCCACAAGAGGAAACCCATAAAAGGAAAGAGGATGAAACCAAATATG--TTTCTTTTGCAGATAGGTCGGGCAACTCTGGCAAATATTTATGCAATAAAAACTATGTAAAAG
>Osi19 2162663 2162918|2133 chr3R 2161635 2163545 scaffold_21 2280528 2282516 - 41100|1105 1397
ACCACAAGGATGAACCCCTGAGAGCCCAGAGGAGCAGTTTGGAGCCAGCTAGTGGGCTCAAAAGCACAGAATCATTTGTTAA-CTGTTAGGAATATTC---GGTGACTTTGAGCCACTGTTTCAC----ACTTCCAGTGCTGC--CGCCCACTTCATTAGACTTTAATTATAATATTTA-TTAACTATTTATTGAAAACAAGACCT--TAAGCA--AGCAGAGAAGCAAACACCAAAATAAAGTAGAC-----AAATAAATGCCTTGAA-----------------TATGCTG
GCCGGCGAGCGTATTCCCCAAAAGCCGAAAG-------CTGAAGCCACAAAACGGGC-------CACGAAAATTGTTGTTAATTTGTTAAAAATTTTCCCATTTGTTTTTGTGACTTGATTTGGCGAAAACTGAGCGCGAGGCTGCGCCGCATCCCTAAGACCCTATTTATAATAACTATTTATTTATTTATTGAAAAACACAAATAGTAAGAAACAAAAAACAAACAGAAACCAAAACAAAATAAGCCAGCTAAATAAATGCCTTAAAAATTGAAGCAAAGTAATTTTTCTA
>Osi20 2166819 2167152|2137 chr3R 2165749 2167149 scaffold_21 2285332 2286810 - 63742|1114 1501
A---CGGGGAAAGTCATTCGCC----CAATTGTACATACCAAGGAATT---------TGCGATCCTTCCCAGGAAGGATG----GCTGCGAGTCACACAGACCAAATGGAACCGGAACCTGCCCCAGGCCATAATTGTAGTTGTTAGGGTTAGGAACGCGAGAGTTTTAGCCATTCTTCAGCTCTAACCACATCCCCACTTAGCCTGATTTTACCATCTTCTTCATACCATCTTCT-------------TTCTCATTGACT------------CTTCGTCCTTTTGCCTTCGTTTCTTTGTCACAAAACGACCAAAAACTG---AATTTAATTAA------TATTTATTTAATTTATTAAAAA-TGCAAAAATTTAAA--ACATTCAT
ATCTTAGCTCGCACCGCTCGCCGCTGTTAATGTACATACCAAGGAACTGAGTGCCACTGAGCCCCTCTGCCGCAGGGGCGTGGCACTTTGAGTAAT-CAGACCAAATGGAACCGGAACATG-CCTAGGCCATAAAATTAGTTTCTTAAGTT-TAAGCGCTCGACTTTTAGCCATTCTCTTAATTTTCCCAC-TCCTTACACTGCCGTCTCCTATCGATTATTCCCTATCGACTTCTCTTTACTGCTTTGCTTTCTTTCACTATGCATTTTCCCCTTCGCACTTTTCCCAT--TTTCTCCAACAGAAAACGACCAAAAATCAAGCAACTTTATTGAAAATATTATTTATTTAATTTATTAAAAATTGCAAAAATTCAAATTAAATTCAT
>CG10298 2169409 2169522|2142 chr3R 2168670 2169414 scaffold_55 3556 4291 - 26660|752 757
TATCTT
TATTTT
>CG17919 2170733 2170818|2145 chr3R 2170202 2170733 scaffold_55 5064 5593 - 19005|535 535
T
T
>Pak 2185188 2185974|2164 chr3R 2181355 2186553 scaffold_15 2072128 2077775 - 137748|4313 5227
TTGACAACCAAGAAGAAACCGCTTATTTAACCACTACTGATGAATTACTACTGCAGAAAACAACA---------AGAACAACAACAACAATAACAACAACAACACCAACCACAATAGCAACAATAACTGTTATGCAT--ACGAACAGATGATGAATTATTAATGATTATGAGTACTATTATTAAT-TATTTATATAAACGTATTATATGCGCATATTAT-TATATTA-TATCTATTC-TAACGAGACAAACAGCAAAACTAAGAAT-AACTGCATATGGCAAAGAGACACGCGTAGTTCAATTTTC------ACAAATCGGTTTTCTGTTGATTAAATACAGTAAAAAAAATCACACGTTGCTTTGGCCACCACATCATCGAAACATGTTTTCAAAATTTGTTATACCAAAACATAAACTTAAATTTGTATAGATCCAAAATTTGTT----------------------TTGTGCATTTTGAATGCTTTTCAAATTATAAGCCTAAAGATCATGTAAAATGAGTATACAAAAAAAACACACACACTATAGTTGTCAACATTAAAACATTAGAATTTGTAACTCTTGCATTTAAA--------GGAAATGAAAATATA--CATACAAATTTTTA--CATTGTATAAAG--CACTTCATTTGATTTACTTCGTCATTACATTACA----TTTCTATAAGAA--AGCTTACAAAATAATGATATGAGAGTATGAACTT------TGGAACGCTGT--TACTAACCCT-ATGACTT-GGAGTATTA------------------------TCGCTGATTTTAGTAAAAGTTTCATTTAG-TTCATAAACTGCTTTATTTAATAA-------AAATATATTTTTATATG----------------------ATTTTAAAA
TTGACAACCAAAAAACAGCAGCTTATTTAACCATTACTAATGAATCACTATTACAAAAAGCAACAGCAGCAGCGAGAACAGCAACAACAACAACCACAGCAACAACAACAACAACAATAGCAACAATTTATGCGTATAAATGAACAGATGATAAATTATTAGTGTTTATGATTATTTATATTAACGTATTTATATACATACA-CATATATACTTATTATATACATTATTAACTACTCGTAACAAAAC------CGAAATCAAGGATCAACTGCAACACACACGTAGCCAAGCGTAGTTCAATTCACACGGCAACAATTTGGTTTCCAGTCTATTTATGA----------------ACATTTTTTTTTTTTTTAAATT----CAATGTGTTTCCAAGCCTTG-------AAAACGTCAGCAAACATTTTTTCAATTTTAATTTTTGCTGCTGATTTGTTATACCAAATTATCGGGCATTTTAAATGCCTTTGAATTTGTC--TTTGATAATCG------------ATACAAATTCATTAAACAC-CTTTAATT----AAACCTACAAATTAAAATTGGCA---TTTGCATTTAAATATCATATGAAGATCATAATATAATAATACTATGTTATAACAATTGTATAAAGAAAAATTAAATACATAAATTTTATTTTAGTTTTTCAACTTTGTCTATAAGAAGCAACTGATTAGA-AACGAAAAAAACTTTCGAAATTCTTGCGCAAAACGCTATAACACTAACTTTAATCACTTAAGAGTATTATTTAACTGTTTCGTTTGCAAACTTTTGTTACATTCAGTGAGAATTTCAATTAGTTTCTTAAACTGCTTTATTTAATAAAAAACGTAAATATATTTTTTTATATATGCGCTTGTAAGTGTTTATTATATTCAAG
>TfIIFalpha 2208252 2208333|2179 chr3R 2206040 2208478 scaffold_15 2089619 2092066 - 96819|2293 2377
CC-CGCAGTCATGTGATTTTAATGTTTCATAACTCAAATGCATTATTGTTCAACACAAAAT--ATAAACGCACCACTGAAAATCG
TTATGTCGCCACACTATTAT----CTGCATGCATTGTATGTTTTAATTGCCAGTGCATGTTCGACAACTGGTTTATTAAAAATTG
>CG10277 2213035 2214026|2185 chr3R 2212672 2216969 scaffold_15 2096446 2100798 - 100289|400 1497
GGCGAGCTAGTTCGCCGCGAGTCCTTAGCCTGTAGGTTGTAGGTGGTCGTCGATCCTTGAGAGATGAGACATG------AGCCCAGCCTGGGTACGAGTTTTTCGTTTGGGTTCGCGATCAGCGCTGTGGCTGCCAGCTTCTTTGTTTTAAACAATTAACATATGTTTATTATTAATATTAATAAATATGTAGCCGAACCTTGTGTTGGACTGTGCGCTGTC---CCACTTC-------------CAGGGCACCCACCCACAAAAATC---CACACAGACACGATACACACACACGCGTCATTTATGTGCGTATAGAAATTGTGATTTATTTTATATACATTTTACA--ATTAACCCAATAATTGGCAAACG-AAATACAGCCTCGCCGGCAAACTCCCAACCAAAAATGTAAACGATAGATGGAAGAGAAAAAATACCAAGTTACCACATCTAAGATTAAATTGTTTACCTGATTCGCATGAATCTTTGA-------TTCAGTTGTTCTACAAAATAAAAAAAAAAACAAAATATTAAAGCAACACTCAGCACACCTATTAAACTGAATCACGAACATAGTTACGTTTTAGCTAAGATCGTCTTTTTATTTCGATGTTTTTGAGAACTGCTTTTCAATACTATTACAATGAAAACAATTAAATCAA------ATGATTGAGAGGCACTGGCCTGTATATTGTACATTATTCTCGTTTTAACTAATTTTAAGTTT-ACTGTGTAGCATATGAAACTGAAATCCATTGATGCAATAGATTGTCAACTCATCTTTTCTTTGAAGAGCA-----------GAGTCTTTAAAATATGATCAAATTATATTTCAAGTCAAAACCGATGCCA-----CACTCACACACAT------------TTGTGATTATTTTTTCCCAAAAATAATTAATTA-------------TGCAACAAA--AATGCTGTTC----CCATAAA--------------AACGAAATCAATTAGGGC---ATAGATGCAAATATATATATTTAAAAATGCTGTGGCAGTGTAACCTAAATTTAATTTACTTTCAACAAAATAAACGTAATGGACCTAAG
GG---------TAGACGCGAAT------------------AAGAGAGTTTAGTTTTCTAAGGCATAGTTCACACCAAGCAGGCAAAAGTAGTAAAGTGTAGGTCGCTTGGACGCG---GCGAAGCTGTGGCTGCCAGCTGCTTTGTTTTAAACAATTAACAAATGTTTACCCTTAATAT----AAATATGTAATTGTAATTGTATTTGTAATCATCATCGTCATGCCGCGTCGATCATGCATGATTATGATTTGCACCCAAAAACATATTACATTCATACATACTACATACAAAC-----ATAAATATGCGTATGCAAATTGTGATTTATTTTATATACCTTATATATTATTAAC---ATTATTGGCTTGCGTAACTAAAGTCGAACC----ACACACAAAACAAAAATGTAAAATGTTTACCTGA-----------TTCGGATACAATATTCGATTTTTTTTTGTTT--TTTATCCACTCAACACTCCGAAAGAATATTAAACTTTCATACAAATAAGTCAAAAAGGAAAATTAATCAAACATGTGTAATTATACCAATTGA--TTGAACACTAGTTTTAATATGCATG---TAAAATTTGTTTTCAAGTCAGAAACTC---AAAGTTATGATCCACCAC-------ATGTAATCCATTTATTATATTTTGTATGATTGTTA---------CTCTATA------ATTATGCTCGATTTAACTAATTTTAAGTTTTGCTGTGTAATATAT-----TTAAATTCTCCAATTCGAT--------------TTTTTAATGTAAAAGGCAATACGAATAATGAAACAAAAAAAAACGTTAAAATTTTGT----AGGGATGACGGTTTTCAAAATGCATTATCAAAAATAAAAGTGCTAGCTTGTGATTATTTT--CTCAAAGATAATTAAATAAAAAAGAAGCAACTGCAACTGATGAAAACTGATCACAACTATAAATATAAATATTGTAAGACGAAATCAATTAAACCTAAAGACATAATAAATTGTGTGTTTCAAA-----------GTGTAATCTAAAATTAATTTAC----AATAAATTAAACGTAATTGAAATAAA
>CG10272 2268992 2269451|2243 chr3R 2263800 2269024 scaffold_15 2160656 2166083 - 178586|5704 5736
GCGAATCAAATTTTATACGTTAAAAATATTAGC
GCAATCAGAAAGAT---CGTTAAGAAAATTAAC
>CG10272 2268992 2269451|2244 chr3R 2269139 2270679 scaffold_15 2167253 2168598 - 26893|0 342
AACATATTTTGTATATCTGT---AGGTCTAGCAGCATCGCTGCAGGATCATGTCCGTGCCAGAAAGTACAAGGAGGAGACCGAGGAGCGTCAACGACGTGCAGCAGCCGCTGCCTCGTCTTCGGCGGGACCGCCTGCTGGCATGGAACTGCCAACGCACTATGCTCATCAGGCGCCTCCAGCCCACAGCTACCACCA------------------CCATGGTGCA---------AGCATCAATGGAACACCGCACAAAGTAGAACGTAAGCATTCCGTTGATTGCAGAAAAATTACTTGAAAATATAGTAAGGCTTTTAGCTCTAGTAACTTGACAAATTTAC
AATAAGTTTTGTTAATTTGTTACAGGACTAGCCGCCTCGCTGCAGGATCATGTGCGAGCACGCAAATACAAGGAGGAGAACGAGGAGCGACAACGACGCGCTGCAGCCGCTTCATCATCATCATCAT---------------TGGAACTGGCGCCGCATTTCGCTCATCAGGCGCCGCCCGCCCACAGCTACCATCAGCCGCAACAGCAGCCGCATCATCATACAGCCGCCAGCATTATCAATGGCACGCCGCACAAAGTGGAGCGTAAGC--------------------------------TATAGTAACACTTGAA------------------------
>CG10272 2271424 2271735|2245 chr3R 2270765 2272101 scaffold_15 2169214 2170533 - 17455|694 1025
CCA--ATGATCG-----ATTGCATTGA-ATTGACTTGCATTGAACTGAATTGAATT----GAATTGAATTGATTGATTGATTGACTTGCATACCTCAA---AATTCCTCAAACAAA--CTAAACAAAAAGCAAAACCGAAAACATGTTTGTTGTTGGGCGAAGATACGATCTTGTAATAACCATAAATAATAAGCAGAGTACAAAAAACCTGATGAAAAACAAAGATTTCAAATCAGAAACAACCTACAAAAGACAACTTTTAATT--TTTGCGTTTAATAATTTA-CCTACTAAAAGTACAGAATTTATATGCCAAAAAAAAAAAAAAATA
TTATAATAATTATAATAATAATAATGATAATAACAACCATTGATTACCTCAAAATTCTCAAAGCCAAACCCAATAATCATTCAAAACGAAAAACTAAATCGAAATCAGCACGAAAATCCCGAAAAAATGCCAAAACCTGAAACGTAAATGTTGTTGT-TGAAGAGCAGAGTACAAAA-AAACACAGCTAATAGTATAATTAAAAAAAACAACAAACAAAAAAAAAACTTAAAA-CATATA--------AAAAGACAAAACATGATTATTTTACGTTCAATAATTTAATCTA--------ACCGAATTTA--------------AAACAAATT
>CG10267 2284396 2284545|2256 chr3R 2284328 2284653 scaffold_15 2183130 2183422 - -656|79 228
CGCAATCAAATTCAGTAGAGTATACTGTCTTATTTCCAGATATAATCCCTTATAATCAGTAATACTAGCTTAAACGCTAACGGATAGCGTATTCATAGTTGTAAGAATGAACTTCATACGTAAATAAAGGTTATTTTTGTTAAAAATAGA
GGCTATCA----CAGCAACATTTGCTTTCTT------AGATACATTTGC-----ATTATTAACAATGG-----ACACC-----ACAGCGTA-------TTGGAGGTCTGTGTCTTATTTTTAAGTAGGTTCTAAATTT------AATCCC
>CG2330 2296567 2296739|2269 chr3R 2293767 2296681 scaffold_35 909903 912830 + 142812|2853 2993
GCCAAGCAAGGCACTCACTGTTTCTCTAGAGGCAT-----------------------TTTTTGTGTGTGATTTGTGCGCCAGCGAAAAATGGAAAATATTTTGTATGGATTATATTCTATTTTATAT---GCTCTATTTT
-------AATGCACAC-----TTCTCTAGACTTACTTTAGGAAACGTTTCCTCAACTATTTTTGTATGAGCTTTGTTTTTTAT-----------ATATATCTTGTATTCGGTGTATTCACTCATTTATCTATCTCTCTTTT
>CG15186 2319995 2320755|2296 chr3R 2315855 2320279 scaffold_35 941044 945445 + 100753|4588 4909
ATTGGCGCGAGGTATCAT--CAGCTACC-----------GTCCAGGAACAAAACTCAAT--------ATAGTTCAC--TTAGCTATCAGAATCAATCAAAAAAAATTAAGGATTGAATGGGTGTTAATTATGAGTTAGCATACACGTTTGTGTACAAATAATTACCCAAAATCAAAACAAACGC--------ATGCCAC--ATTCGATAAA----TAATTAAAATGCCACAGCATTTGAGTATTGAGTTGAAAATGATTTTCCAATTATTAAAAATTATTTGCTAACAAGTATGGGATTTTTAGAATCATAACTCAGTGAAG
TCTAAAGCGAGGCTTCCTGACTGATACTTAAATTTTGGGGTCTTGCACTTAAGCATTATTCCGACTAGTAGCTTGCCGTTTGCCGTCCTG--CGATCAAAA------------TGAAACCATATT--TTTTGGACCCACCCACGTGTTTGTGTATGG--TATTAGCTAGTCTTAAATGAAACGCCAGAAAGTACGCCATCGATTCGAACCAATTTTCATTAAAAT---------------------------AAGCATTTTTCAA-----AAAAATCGT-------CAAGTACAAAAAGAGTAAAAACACAATTCGATGCGG
>CG15186 2319995 2320755|2297 chr3R 2320280 2320522 scaffold_7 4316229 4316448 - 143|0 244
TTAAACGTACATATT--ATAGTTTGTATTTTATTATTTGGGATTGAGTAAAAGAAAATTATAAATTTCAATAGCTACTTGTCTCACCTGATTTTATTCGATTTAATTACGGCATTGTTTTTACGGCTAAGTGAATTATACTGAATTCCACAAAGGAGTGTACATTTCTAAATTCTCATATATCCACTTAACGTGTTTGTATATGGCTAAGTAAGGATAGATTGTGAAACAAAAGCGGAGCAGCAT
TTAAACGAAAATTTTTCATAATTAGAAATAGAATTTAAATAATGGAGAGAGGGAGAGAGACTGATTGTGA-----ACATAATTCAGCGAAAATTATTGGA----------ACAT----------GCTTCAGAACTTATAATATATAACATATATATGCGTATTTGTCTAAATTTACATAGATCCTGTACATTTATTGTTAAATGCATGTTCAAAGAAGGATTTTCTGACAACAATTACTCAAAAG
>CG15186 2319995 2320755|2298 chr3R 2320523 2321741 scaffold_35 945446 946714 + 3415|0 262
TTTGTTTCTAGGAACTAAGTAC--AAAACCCATTTTGGAAAGTTATTAATTTAACCAATGCAAGTCAAAATCAACCCCGATCTATGTTGTACATATTACGTTAAAAACAATTAAGTTGTAGCATTTAAATGTTGGTCCCGAATA-----------------GAAGTCATGTAAATTCTACAAACAAAGTTATGT----TATAATT-------GTTTCTGAATTCGGAGAGAATGCAAATCAGAAATACAAAATAGAAAATTAT
TTCAGTTCTAGG--TTAACGACTTAAGATTAATGTT---------TTAATGTAGCCTAATCAAAT--AATTCCGTTCCGTTCGAAATTGTA----------TGCAATTAATTAAGTTAATACTTATGATTGATTGTACATAACATGTCAAGCGAGTATTTCAATTCTATGTAGAGTGTATTACAGAAATTATTTGTAATATAATTCAATATTGTTGTTCAATTCGGATAAA--------CATAAATATAA--TAGTCAAATGT
>Pif2 2375297 2375705|2359 chr3R 2375489 2376406 scaffold_35 1008426 1009436 + 1984|0 255
GGAAGTGGAACCATCTGCTCCCGGGGTCATGTTAATGAAG---------------ACACAGATTAGACA----------------GCG-----GGCCCAGGTAAAAGTTGGTCATCCCCAACTTATGCCAGTTAGTGCTGTGTAAAGTTTTTGGCCTCTTCCAAAAATTAATTAAAAT--CAGTTTCAACCTATGTGACACGAGCAAACTTACAAAAGAAATTACATTACATGCCAAGCTGAGTCAACT-ACAGGG
GGAGACAGAAGACACTGCTGCTGGCAGTATATTAATGAAGCTCACAAACGAAACAAAAAAGATGAAACAAATTGTGGCTGTTGCTGCGTGTTTGGCTCAGGTAAAAGTTGGTCATTTAAAAGTTATGTGAATTAGAAC---ATAAAACTTG----CTGTACGTAAAATTAATTAAAATATCAATTTCAGCA-ACATAACAAGACCAG---TACATGACAACAAACAGCGCACACAGACCCACAAAAGCTCACAAGT
>CG2336 2407738 2407991|2408 chr3R 2407813 2407851 scaffold_35 1050016 1050055 + 1653|0 39
CTGGCTAATTGAC-TTTCCGGTTGGGCAACTCAATTACCA
CTAGTTAATTGGCATTTCAGGCTGCACAGCTCCATTAGCA
>CG2336 2407738 2407991|2409 chr3R 2407938 2408588 scaffold_35 1050145 1050766 + 13527|0 65
TAATGGAAATTATGAGTGACTTTGTATTGCG------------ATATTAAAAATTCTTTCTGCGAA
TAATGAGAATTCGAGACAATTTCGAACAGCGTATATATATTTAAAATTAAAAATTCTTACCGCGAA
>CG15179 2456743 2456907|2475 chr3R 2456798 2458126 scaffold_35 1125036 1126343 + -2329|0 111
ATACATTCTCAGCCTGCTAAGGAAAGCTTTCATAAAATAGCGCAAGTGTTGAAAATTGGCGCTTAGAGGCCTGCAAGCCGGCTTACAAT--AAAGTCATTTTCCATTAAGTA
ACATATGCACAGTCCATTCTTAATGCACTACACAAAAGA-CACAAGTGTTTGAAATGAGCTCGCTAGAAAATGTATATTGTAGAACAACGAAAAGTACTTTTCCATGAGGTA
>CG31286 2468136 2469070|2490 chr3R 2468156 2468989 scaffold_35 1141882 1142715 + 42544|0 833
GTAGGCACCGAACGCTCGGACATGTTCCCTGATTCGGACCGCATTGATGGCGATAAATCCACCGGCATCCTGCGGCACATAGCCACCATGGACGTCCATAGATACGAGCTGTTCGTTGTAAAGAGCTCCCACATCCTTCGCCGCCTTTCGGGCGATGGCACGGCAATAGCCTGGGGCCAGTTCCACGGTGACCTTCCCGGAGACCCGCTGCTCGGCCAACTCGATACATTTACGGGCATAAATTGCCTCGGGACTGAACCAGAAGCCATTGTACACGTAGTCGGCCATGCGATCCCGGAGAACCTGCTTGGTGCGGAGTACTTCGCGGTCCAAAGCAAACACCTCGAGGTCCTGGTGGGCAGCAAAGAGGATGGTGCCTCCAGGCGTCTCGTACACCCCCCGGGACTTCAGTCCCACAAAGCGATTTTCCACGATGTCAATCCGCCCAATGCCATATGATCCGCCAAGCTTATTGAGGAAATCTAGCATCTCCAGGGGTTTAGTGTAGACCCGACCGCCGGGCAAATCCTCCACACTGGAGGGCAGTCCCCGATCAAATTGAATGACCAAGTGAACCGGATCCCGTGGAGCCCTTGTCAGGGGATCGACTGTCATCTCGTAGAGATTTTCCGGAGCCACTGTGTTGGGATCTTCGAGTATTCCGGACTCGTAGCTGATGTGCAGGATGTTGGCATCGGTGCTCCAGGGTGTGGCTGGCTTGGCGCTTACCTCGATTCCGTGTTGCTGGGCATAGGCAATGAGGTCCTGTCGACCTTGAAACTGGCAGCAGAATTCTACATCCCTCCAGGGAGCGATGATCTGGAAAAAAGTCGA
GTAGGGACCGAAGGCGCGCACATGCTCCCGTATGCGCACCGCATTGATGGCTATGAAACCGCCCGCATCCTGCGGCACATAACCGCCATGCACATCCATCGAGACCAGCTGCTGGTTGTAGAGCGCACCCACTTTATCCCCAGCCTTGCGTGCAATGGCGCGACAATAGCCGGGCGACAGCTCCACCGTCACCTGACCGGTGACATGCTCCTGGGCCAGCTGAATGCAACGTCGCACATAGAGCGCCTCGGGACTGAACCAGAAGCCATTGTACACAAAGTCGGACATGCGATCGCGCAGCATTTGCTTGGTGCGCAGAACCTCGCGATCCAAAGCAAACACCTCCAAGTCCTGGTGCGCTGTATAGAGTATGGTTCCACCTGGTGTCTCATAGACGCCGCGAGACTTCAGCCCCACATAACGATTCTCAACAATGTCAATGCGTCCGATGCCATAGCTGCCGCCCAAATCATTTAGAAACTTTAGCATATCCATTGGCGTACTATACACTTGACGGCTAGACAGATCCTCAACGCTCGTGGGCAATCCTTGTTTAAAGTGAACGCACACGCGATGGGGCTTCTGTGGCGCCTGTGTGAACGGATCGCGGGTCAGCTCGTAAAGTGTGCTAGGTGCCACAGTATTTGGATCCTCAAGTACGCCCGACTCGTAGCTAATGTGCAGCATGTTGCCATCGGTGCTCCAGGGTGTCGCTGGCTTGGCTGTCACCTCAATGCCATGGGCCTTGGCATAGGCAATCAGATCCTGTCGGCCCTGAAACTGGCGACAAAACTCCACGTCGCGCCAGGGTGCAATGATCTATAGATGAAATGA
>Taf1 2481518 2481775|2498 chr3R 2480425 2481936 scaffold_3 2683526 2684921 - 20203|1129 1416
TGATAGGGAATAATTGTTAGTTGTTAGAAAATAAAACGTCGATTTAATAA----------TAGGATTGAGCTTCGCTGTGAAACAATTTTATACACTTTTTACAATGCATTGTTTTAACGGATTTTGAAATACT--ACAATATGTTCTCTGAA---AAAATATTTCCTTTTCATGCCAATATGTTTTTAATT------------ATACACTT--TACAATTTATGAAATCTAATTCAAAATATGTTTTTAA-AATATAATTTTCATAACTTTAAATAATGCCTAGAAA
ATTCA---AATGGATTTTATTTTATAAACATT--AACTTTGATATATTGAATGATTTTTTCAAAATTGATTGTC----TACGACAAT----TGCAGTTTATATAAGTATGTTTTTTTCTTGTCTGAGCAAGGCTTAACAATTTCTATTTTCAACATACAAAATTTTCTTCT-AGATTTATAAATTTATAAATGCTGTAAAACGAGTGCAACTAAAACATTCGGCGTAACTGAAGTTAAAA---GTGTTTAGCAAAATGAACTTTATAAATT---ATAATTTTAATATT
>CG2358 2485015 2485165|2503 chr3R 2484722 2485808 scaffold_3 2687486 2688674 - 24440|303 545
ATGGGATCGCTCTTATTTTGTAGGTACAGTTTATAAGTAGGA-----------------------------AGTGCACAATCTCGAGCCTGTCTGCATTTT-------------CAAA----------------------TTCCTTAC----CACCCCAACA-GTAAGACCATT---------------------GTGCGGAGTTGAGTTTCAATAAAGATACGAGTAACGATTTTT--AATA
A----AGCCGTCTATATATGTAGTTACAATT--TAAGTAGGATCTGCGCGCATAGTGATGCCAGGGATGATGTTGCACAATCTCGAGCCTGTTTGCATTTCAGTTTGATCTATACAAAATGATGTGCATTTGTACTTTGTTTTGTTATAAGACACCCCCACACAGAAGAACAACACATTAGGTTCAAATTAAAGAGTCCGGAGCTGAATTTCAATA-----------AACGATTTTTTAAATA
>Ccp84Ag 2513287 2513762|2543 chr3R 2511538 2513651 scaffold_3 2725316 2727534 - 47081|2034 2429
AATGCTCAGGAATAGGCCACCACGACCCGATAATTGCCGTTAGTTGTTACTGAAATAAAGGATGTGATCTAATTGAATGAATATCGAGTTGGCTTCTATTATGTTTGGCA-ATGCGTGTGCTTCATTACCTATAACCTATACAGGATATAGATCTGTCGGGTTAGAGTGTTAATACTGCAATT---AATCAACCCTGCAGTTTTGCTGTCCGTAACCATTATTTTGACACAAACGA--------AAGATATTAGAACCACCTATAAGTATGACAATCGACTGAATGT------CCCAATCTACATTTAAATTCTTATCTG------TAGGGGCGCAAATTTACATAACACAT-------AAGATTATGGAAACATTAAAGAAAAAAATTGACTTTA
GATGACCAGATAGGTGCTGCC-CGACCTGATAATTGCCGTTAGTTGTTATTG-AATAAAGAATGTGATGTCATAGAACAAGCTCGTTGTTTGATATTAAAATCTTTCGCATAGATATTTGGATTTTCACAGCAACCTAAAGTAAGATTTTTTTGGAAAGAGTT-GAGTTTGAATACTGCACTTTTGAGTGTACTTTGAAG----------CAAACCCATAATTCTTCTATAAAATATGTTCTTTGGTTTAGTCGACTTACCCATAGGATATATTATCGAAGAGCTGTAAGCCACTTAATTTACAGTAAGAGTTGCATATGTTACCTTAAAGCTAAAAGTAATCACAAAAAATTCCCAAAGAAATTA-AAAAACATTACATGCACAAACTTATTTTA
>Ccp84Aa 2530542 2530625|2558 chr3R 2529775 2530632 scaffold_3 2743414 2744469 - 32750|952 1073
GAACTGACATTCC---------------------ACATTGCCCA----GCTCTTTATTGTTATAGTTTTACGAACGA----------CTTCTATATATATAAAAATATATT---TCACATTT
AATGTTGAATTCTTGTTTATAATCGTATATAGAATCGTTGCTCATATTACTGTACATTTATTTATTGCCATCAACAATAAAATAATGCATACATGTATGTTAGAATATCTTGGATTACAATT
>Ama 2590564 2590983|2620 chr3R 2589627 2591355 scaffold_3 2812316 2814103 - 50315|941 1452
TAA------GCCCTCAACGT-CTGATTTCCATTCCCACGCAACAAGACTGGAA-CCCTCACTTTCTCCTCTCGTCTCGCTTTTTCGGCAATTCGC-----------------------------------CAGTCCGGATGCGGTCTGT-GTTTATATTATTAATGATTCATTCAATTAGCTCCCATTCAGACTTCATTATTTTCGGACACACTTGAGATCGAGCCACCGCTTGTGCCTTATGAATTTTGCTCTGCATCCGTCGG--------CTTGTGCAAACACACATTAATATGCTT---AAGTAAATA---ACGTTCTCTGATAAAGTTTAATCGGT------CTTTTCCTATGTGGTT-GGGTTGGCTTGTATACGGTGTAAGTT-------AAATACCA----TGAGAGA-----ATAAACACCTCTTGAAGCAACGAATTAAAGGGTTTGTC---ATTCAATAAAACTAAGCCAGGAG-----ACAAGGCATTGT---CAAAAGT
TCGGGCAGTGCGCGCCGCGTACAGAGTTTCCCACGCTTGAAAAAAGACTTGAATTCCTAATTTAATATTTTCG--GCAATTGTTTGGTATTATGCTCTTTATATATACGTATATGTCTGGCCGCGGCTTGCAGT-CGGATGCGGTCTGTAGTTCTTATTATTAATGATTCATTCAATTAACTCTGATTCCGATT----------------CACTTGAAA-CGTTTGAATGTTTGTGCCTTACGAA-CTCGCTTCCCATGCGTGGGTCGCGTTTTCTATATAAATAAACAAATACATACATCACAAATACACACACACACACACATATATGTACTACTTAGGGGACGATGTTTCCTACACGATTCAAGATAATTTGTAC-TGCTATAGGTTTTTTTTAATATACCACCATTGAGAAATGTTTGTACAGTCGTCTTAAAG--ATAAGCGGAATCTTTTATCTATGTGGAAAAAAGGTGAAATAAAAGTTCTTATCAGGTAATATGTGCACAATT
>Dfd 2627662 2628153|2671 chr3R 2627581 2628172 scaffold_3 3615651 3616312 + 10237|85 673
AATCAGCAGGGATATCTTCAAGATGACTTCAGCATTGTAAATTAAATAC---------CCCTATCATTCTATGTAGATTTTAGTTTTTCATTTTGAA---TCAATGACCTTGAACTTC------------------------AGGCAAGGTTA--AAGACAAATCGGAGTATACAGTGAACG----TAGTTAGTTAAGGAC--------CGACCATTAGGTAGACGACTCCCATTT-TATAATGTTGTAGTCCCAATTCCCCACAAGT-------------GTTGTATATGAGTTTTACTTAAGCACCCTAGGATTCAGGTTTAAGAGTTTGTATAAAGCCTAGAA---------------------CGATTCGTCATAGCAAATAAGTGGCATA--AACTTAGCGTTAGAATTGATTATTTGTATAACTATGATAACTATAAATATTATTA--AAGAATGTA-------GTTTGCATCTGTTGTGCGTCTCTAGATGTATGTAAGTTCGTACTTATATTTTATTGATACAA-ATAAAACCGCTAACGAGAAGTATATCAAAATAAAGAGAATATATTGTATATGGAAA
AACCCACA--CACACCCCCAG------CTCAACCATGTACAATGAGTCCTTCAGTTAGCCCCGCAATACTTTCCGGCACCCACTTCCTAAGTCTTAAGTCTCAATCGGATCGAAATCCCCCTTTTTCATACACCCGGCGATACCACAAGGTCACCGGGCAAATTCGGAGTATACAGTGAAAAATATTACTTAGTTAAGCCCAAAACCAACGACCACTGGGCA-ACAACTTAGGCTTATGTAACGTCCTCCTCCCCATTCTACCTTAATATAAAAGGAGAACATTGTAAATTAGTGCTACTTAA------------TTAGAGGTACG-TTTTGTATAAAGCATAGCAAATTATTTGTAAGCAGAAGCCCAATTTGTCATAGT-TGTAAGTGGAATAATAGTTTAAAGAAATGTATGATTAAATGTATAATTATTATTATTATTATTATCATTATTATTATTGTATCTAACTAGTTGCATCTGTTGTGCG----TAGATATATGTAAGTTCGTGCGTATATTTTATGGATACAACAACAAACAAACATTTATAAGTACATAAATATACCTAGAC-------AATATAAAAA
>ftz 2691496 2691950|2750 chr3R 2689317 2692054 scaffold_3 3507824 3510892 + 61773|2600 3117
GGTCCGGCGATGCTC--AGTTA-----CTCTCTTCCCCAGAGCGGAAC--------CGAAAGCCGTACCGCCACGAAACCGAAGCGCA--------CTTCTCTCGACCATTTGTAGGTGACACGCAAATGACACAGCCGAGAACGAAGCTGCGACGCGATGAGTTGCACAGTAGAGG----GCGCACTCCCTACGGTGCCCAGGACATTTTGGGCACAAGGACGAGTGCGCAAGTGCAGAAGGCAGAGGCAAAAGAGGCAGCGCAAACAGAAAAGGAGCCTTG-----CTGCG----CGCGGAACCCAGTGGCTGGCCATGATGGGTTCTCAGCGATCGATTAGCTG-------CGGCCAAACACAAGCCCAAAACACTCAGCTGGG-AGTGATAATG-GCCAAGAG----ACTTGGAGACTGACACACATGTTTTTGTACATATAGT--AGTTAAGATAT----TCCTATCATAGAATTC-TATTTATTTAAATATACGAGT--AAAGTA-----AA
CATCTGCCGCTGCCCTAAGTCAGCCCGCACGCACACACACAGAAGCACACACACTGAGACACACACACACACACACAACCGAAACAAATGCGCCACCAATTCTCGACCATTTGCCGGTGACACGCAAATG--------TATAACG-AGATGCTGCGCAGT------CGCAGTCGCCGCACCGCGCACTCCCTACGGTGCCCAGGACA---CAAGCAT-AGGACGAGTGCGCATGTGCAT-AGGCCGAGGCCGAGACCGAGACCGAGGCCGAAACGACTCCTCGACAACCTCTGATACCTCAAAACCCAGTGGCTGGCC---ATGGGTTACCCGTTGTCTGTTGCCTGGAGCGCTCGATTATCATCGAGCCCAGGGACTGTGGCCGGGCATCGATAATGCAACACAAGCTCAACTTGGAGACTGATTAAC---TTTTTGTTTCTATTGTACAGTTTATATATATACATCGATTACATTAGTCATATTTATTTAAATATATATATTCAAAATACTTGTAC
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ACATTTGT----ATAAGTCGTTAAAAATATAGTATAGAGAACCCAGTA
GTATACATCATAGTAAGCCCT--GCATCATAGTTCAGAAA----AATG
>CG1979 2884185 2884393|2973 chr3R 2884321 2884447 scaffold_3 3198951 3199083 - 1481|0 78
TTTATATTTAAGGAGCTACGTTTTGGCCTTCGAGTGATTTTCA-----TCCGCAATAAA-ATTTTAATTTCACAGCAT-
TTTAAATACAGAGTGTAGATTTTT---CTTCGAGTAACTAACACTGAGTGTTCACTAGATATTTCAAAAACATAAAATG
>dj 2885925 2886238|2977 chr3R 2885523 2885950 scaffold_3 1215560 1216221 - 5223|638 664
AGCTTTCGCGGAT-TATTCAATGAAAT
AGCTCAGGCGAATAAATGCAAGGAAAT
>dj 2885925 2886238|2978 chr3R 2886018 2886661 scaffold_16 699889 700494 + -3710|0 242
ATAATATACAATACGGCATTTTACCGAAAAATTAGATTTTATTTATTTAAA------AAAATAACAAGGGGGAAAACAGT---TAATGAGCATGTAACCCCCAGCTTTCGAGTAATGAGTCCGTGGCAAGATTTCGTCGTTCATACGGACAGACTGATAGTCA--GACGGTCATGTTTGTTAAGGAATCTATCTATAT---------ATATATATATAGATTTATATATC--ATATAAATAAA
ATTATATACATT----TTTTTTAAATAAAAACTTGTTCCTTTTAACGTAAATATCTCAAAATCAGGTAGATGAATAAAGTCGGTTGTTAATTTGGAGCCAATAACATCC-ATTAATATTTTATTACCAA-------TTGTGTAAACATGAAAAGTGGGAAGCGATGTTGCTGTTTTTTTTTAGCGTTTTTGCTTGTATTGGAACAACAACTGGATATAG---TATGTATCGGGTATTGACGGA
>djl 2887529 2887638|2982 chr3R 2887353 2887588 scaffold_3 1217309 1217526 - 3940|179 244
ATGGA----CCGATCAAAACTAGCGCGGACTCATCAAAAAATCAAAAATATG--GAATTCTTTAAC
AAGGAAGCTCAGGCGAAAAAATGCAAAGAAATGGCTGAAAAAGAAAAATGTGCTGAATTAGCTAAC
>djl 2887529 2887638|2983 chr3R 2887589 2888353 scaffold_16 699882 700600 + -5105|0 54
ATGTTTGATTG-----ATTTGTGGTTAATAAAAACTTTTCCCATCTGGCTTTTCA
GCCATGGATTATATACATTTTTTTTAAATAAAAACTTGTTCCTTTTAACGT----
>CG1988 2889779 2890011|2987 chr3R 2889985 2891491 scaffold_3 1219640 1221034 - 52301|0 29
ATTAAATTTG---AGCAGTTTAAATCGGAA
ACCAAACTTGTATAGCACATAAAGACAGAA
>CG1965 2897047 2897349|2989 chr3R 2894047 2897080 scaffold_3 1223387 1226473 - 103451|3155 3188
AGTGTAGGGACAAACATCGCTCACATCAATCCTA
AGTG------CATACATTACATAAATTTATACCA
>CG1965 2897047 2897349|2990 chr3R 2897081 2900217 scaffold_3 1226683 1229893 - 113687|0 299
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ATAACCATATGTTTATT-TAAATATTTGAATCGCTTAT-TTTGTTGGTTAGTCAAAACCCTCGACAACCAAATTTCAATAAGAAA-----------AGAGTCTGTAGTATATAAGCTAATTCGGGACAAAGCCTC---------TTGTTTTTTGATTGTCTTACGTAGATTAGTACTACTTTGAGCAACCTAAA-----AAAAGTGATACAAATTCAGACACTCTTAACTTTATTGATTGTATTTAGGAGACTTGCGCGCATAGCAAAAATAAAA-CAATTTTTAAATTATTTACACAAT
>CG1943 2902998 2903509|2992 chr3R 2901248 2903536 scaffold_15 1478976 1481194 - 23423|1987 2537
AGGGAGGAAGGAGGGAAGGAAGTGTGCCCGGGAGCAGAAGCAGCTGCCAAGCATTTAATGACTCACCATCACATCCTCAGACCGACA-----------TAAGAATCATAAAAC--------TATAAATATACATAACTCGCTTATAACATACGTATACA-CCTATATTTAGAGGCGCATTACCTATATTAACCTGCTGATCAGCCGAAGAAGAAGGGAAACTGA---TTATATTTTGCCAAGCAGCACTCCAAGTCGTTCTTCCTTTCGCCCTTTCATTTTCATGTCCCACATTTGTTCTATTGT----CTAAGTAACAGGTTTAA-AATGTCTAACGAAATTGTTGAAA--TTAAGTAACTCGTGATTCCGCCCCACAAATACGGATGATATGGATTGACTTTGCTAAAATCTACCACCTACTAAGCCTAATTTAGCATTTGTACTTAAAGTGTCCAATCGAATCTTCTTATAGTCTGTAAAATTCGTCCAAACG--AATACCAATATAACCATCGATGTATTACTCCAAATA-------AAACATTTAA
AAGAAGAAAGATGGCTAAGCTGTGTG----------------GCTGTCACGCATTTACTGACGCTC--TCATACACTCATGCATACACACAAACACACCAAGCATCCTCAAGCCCATTATACATTTATAAATATAAATCGCTTAATATACACTTATATAGCCTATACAATAATATTCATATTTAAAATCGGCTTATACGCAAGATGCCTAAAAACGTAAGATGAGAGTTATGCTTTA-----------TACCAACCTCTCTTTATCCTGCTCTCTGATTTTTGCATTTAATGTTTTTGTTTTTGTTCTATTAAGCAAACTATTTAATAACGTCATACGCAATGTTTTAAACTTTAAATGACTTCCGAATCCGCCCTA-----ACGTACCATACAAAT--------------------ATGGAAGAAGCCCAACTTTGCATTTGTACTTAAGTGTTCCAATTGAAAATTGTAATAGTCTGCAAAATTTGTTCTAACTTCATTTCTAAT---TACATATATGTATTATTGCAAAAAATAAACTAAACATTTAA
>CG1939 2908866 2908973|2998 chr3R 2907933 2911249 scaffold_533 1245 4498 + 73394|950 1065
TCCGTGTCTGTGCGTGCCATA-CGAGGTCACTTTATGTGTTAATGCAAATGA-------TACCAAACCAATTATACAATTTAAAAGCTTGTTAGTGAAATATATTGCCGAAACGTG
TGTACGTTTGTGTGTTCGTTATTTATTTTCCTCTATATGTTTATGTATGTTCACACACTCACAATGCCAGGCACAATAAATAAAGACGCCTTCGCTGGATGCTATTACGACAAATA
>alphaTub84B 2914306 2914582|3002 chr3R 2912833 2914956 scaffold_533 6415 8650 + 115269|1489 1803
GCGT-CACGCCACTTCAA---CGCTCGATGGGAGCGTCATTGGTGGGCGGGGTAACCGTCGAAATCAGTGTTTAC-----GCTTCCAATCGCAACAAAAAATTCACTGCAACACTGAAAAGCATAC----GAAAACGATGAAGATTGTACGAGAAACCATAAAGTATTTTATCCAC--------------AAAGACACGTATAGCAGAAAAGCCAAGTTAAC---------TCGGCGAT-AAGTTGTGTACACAAGAATAAAATCGGCCAG-ATTCAGTGTTGTCAGAAATAAGAAAACCCCACTGTTTTTCTTT
ACACGCTCCACACTTCCAGCCCGCACAGAGCAAGCGTCATTGGTGGGCGTTGAGCACGTCGAAACCAATGCCCACGCATTGCCTTCGTTAACAAGAAAAAATTC------ATAAAAAAAAACACACTGGAGTAAACGATGGGGA---------AACCTATAAAGTATTTTATTGACAGAAAGACAAAAAAAAATATATACACAGCAGATAAAAAAAAAGAATATCAAAAAATCAGCTCTAAAATTGTGTACGAAATA--AAAGTCAGCGAATAGTCAGTGTTGCCAGCAGAAAAAAAAGTCGAGCGCATTTTCTT
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ACCAA--------CGAATACTATC------------TATATGGATACTCCAAAAACTAGCTTGCAAGCTCTATTGAGCATCGG---GATTTGACTTGAGCATTC
ACCAAACAAATGGCGCATCGCATCACGTTATTATGATATATTGATAATC----AATTAGCTTGCGACCAGGACGATGCTCCAATTCGATTTGACTTGTGCATTC
>CG10098 2951868 2952236|3040 chr3R 2951987 2952238 scaffold_15 1531107 1531415 - 7283|0 309
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TTTATTTTATAATTTTCTATGTTAGTTTTGTGCAATTATTTTGATGTTTTTGCTTTTGCGTGATATTTAA-TTATTTTTATAGAATTCATTGTCTCCTAATGTGCAATCATGATCTTCATTTCTAAGTATTATTCGTCCTTTTTTTTTTATTAAAAAAAAATTAATTTAATTGCAGCTTGCATTTAGCAGCTAATTAACGATTTAAATACTTGCATACAAATATATACATACATATTAAATATACAAACATGCATAATATA--GCTCTCAAATAAACGCATAAAAAGCTGCATTTATACAAATATCCATG
>CG31248 2956610 2956636|3045 chr3R 2955874 2956742 scaffold_15 1533931 1534798 - 29473|746 772
AATACAAAAGTAAATGTTTGTAAAAAA
G----AACAACAAATTGTCTCAAAAA-
>Fer1 2967466 2967701|3056 chr3R 2967392 2967935 scaffold_15 1542865 1543445 - 11589|74 381
GTCTCGCAGGACTCGCTGGCGTGGCAAAGTCCTGAAACGAGTCACTGAGAATGAGATTCATTGGAAATCCT----ACTAGTCAAGCCTTGCTAGTC--------CTGGCATCTA--------------------ACACATATTAACCAACTTAATAATTATATGAAGAAAACATGTTCTGTGGTATTTAATTGCTCTAAGTTCGCTAATATCTAAATGT-----TATACATAGTGGTTTAGTTTAAA-TCGAATAAA----------------------------------CATTTCACACAAATCA-
-----------------------------TCTTTAAA--AGTATATTACAACAATTTGCAGTGCAACTCCTCTCAACTAGTCACGC-TTGCTAGTCAACGACATTTAGTGTCTACTTTAACATACATATACTATATACATATATTCCAATTTTAAAAT-ATATTAAAAAAACATGTTCTGTGGTATTTAATTGCTATAAGTTTGCTTATATCTAAATGTTATACTATACTTAGTGGCTTAGTTTAAAGTTAAATAAATTCGACTATTTAAATGAAATGCAACGTGTACAGTTATTTTAATGAAATTCT
>CG2656 2976921 2977001|3062 chr3R 2972015 2980083 scaffold_15 1544830 1552944 - 235784|5181 5261
AAAAAATCAATTTTTCATATTGCTTAAGAAAATGTACAATATTTTATTTTTAATAAAAAATTAAATCTAATCAAAATGCAT
AAAGGGTC---TTCAAATGCAATGTAAATAAAT-TAAAATA----GGTATAAATATAAAAAACAACATAATTAAAGCGTTT
>sas 3008834 3009424|3082 chr3R 3008475 3011485 scaffold_15 1584997 1588093 - 91736|386 1017
ATGGC---------GCACAATGCCCTAAAAAGC--AACTAGAGTTAAAGCAGATTCTTGTAAATATTGAAGGAAATGGATGTGGAAGAATAACTCAGTGTCAGTAAAGGAAAATCCTGAATCAATCACATTAAATCAGATGGAGCAAGCAATTTTCTGAAACCGGCGCAATATCAAAAAATTTGTTCAAATCGAAATGGCCGCCATGTTGAATGTAGTGGTTAAGTAATCT---AAAAGCACATACC-------TTTTGTTAAACAATTTGTGACTTGTGTAAATAGAGAGAGATTGAGACAGAAGCAGACACCCTATAGAAGAACCAATTGACAACAGCTCCACAACTCAAATTGGCCTCGCT--GGGCGTAT------------------CGATTCTATTGGCGATTTCAAAATGCATACGAGTTTAGTTAGTTTAACTTGTAAATTGTAGCTTTACACTAATCGTAATTAAAGGGCGCATCAGCATCAACAGAATCCGCAGCACCAGCAATACGATGCGTTCTTCAATTAACAGTCCATAAATATTTAAATTAGCTTTTAAAACGTACATAGATATGCATATATGTATGTATGTGAGTATGGATAAATAAAGAAAAGATAATAAAACCC
CGGGTCAATCCGATGGGCAATACTCAACGCACCCAAACTAGCTTAAAACAATGTTCTTGTAAATACTTCAAAACTCA-------------AACTCAGTGTCAGTAAAA------------------ACGATGAAAAGAATATAATCTTCCATTCCC------CGGCGCAGGATTTAAAGGAT-GTCCACACTAAAA-GGCCGCCATGTTGTATGTAGTGATTAAGGATTCTTCTAAATGAACTAAACATTATTTTGTTGTTAAACAATT-GTGACTCGTGTATATAGAGAAA-------------------------TAGAAGAGAAAACTGAGA----CACCAAGAAACCAATTGGCCTCGCCTGGGGCGTGTGAAATGTTAACGTTTGCGCAATTCTTCTAGCGATTTCTAAATGCATA--------GTTAGTTTAACTTGTAAATTGTAGCTTTACAA-----ATAATTTAAGAACG----------------------AACAACAGCA---------GTTCTTCAAGTAACAGTCCATAAATATTTAAATTAGCTTGTAAA-CGTACAGAGATATGCAAACCT-------------TATCAATAAATAAA------ATATTAAAATTA
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TGCTGCGGGGCCAACGACGGGCATTATGCAACCCACGCAGACGACACAGAATGGAGGCAATAAAAATGTTCCACTCGATCCTTTTGGGGCGTTATAAGGCGCCATCGCAACACGCACTCACACAAACACGCGCACACACACACATACACACACACACACATACACACACACTCACATACACACATGTTAAGCGCTATAACCTCATAGACCAGCAAACATTACAAAATCACACACACACACACACACACACACACACACA-CACACACACACACACACACAGACATAATATAA---TATATATAAATAT-------------ATATTTGCA-GATATTATAGAAA----AAATGAAATTCACGAAAAAACTA--AGAAATTATATATGTTTACAATATGCTTCATACGAAAAGGAAAT-GTTAAG--AATTCTATAATAATGTTGAGCA------AAAACACACACACATTTATATATAAATATATAAATGAAATTGCTATATACATATACGTATATATATACATATATATTTATATTATTACTAC----AAAATATAAAATGAGTTTGAC----TATATGTATACATCTATTTATGTAAGTGTATGCAAATATTTCCATATTTAGCTAAAGTGAAA-CAAAACAACAACAAATT--ATTAAAAAAAAAGGAGCAAATAGCCTATGTGAAATATACCTACGTATATGTATGTACATCCTTCATAATAAGTGTAAGCAAAAACCTGTAGTTGTGTCCTACGCCAATCACTAAACCTAAAGGTAAACAAAAAAAAAAAAACACGTTTAATGGAATCTGTTAAATACTGAAAATATTGTACACTGTCAGAA-----ATGATATATAAATATTGAAATCAAGTCTTTTATAGACGCCATAAAGCTATAAACTATGTTATAATTATGCTTAAGTGAGAGCAAATCTG
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AACATAACTAATTTTGTATTGTTATGTGTAATCTAT-------TCTATTTTATTTTCACACACGATTTTGTTTATTGTTAAAAAT-TCTTGTTGATTTCAAGGCAGTATAAAATATGCAAAAAAT-GAGAAATAACTCGTATTTGTAAA-GCATTCCAAGCTAGTTTCAATTTGGTCC
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AAATTTAATTTGAGAAGGCGAAAACATTTGTAATTATTAAGTATTATTTAACAACAAATTCAAGCAACGCATATGTAAAATGTGTTGATAATATGTTTAAATTCTAGAAAAAACCGCAA--CGTTTATTTA-------ATATGTGTTATACTTTAGTGCGTACGTTGTGTTAGAAATTTATTTAATTGCTT------CTAGTATTCGATACAAAACTG--ACATCATATACGTACATAG-TTCATTTCAAGAATGTGTATATAAAG------CATAAAACGTGTATGTAGAAGTTTTCCTACA-GC
CAAATTCA-----------------ATTTATAAATGTTAAGTATTAT-----------TTCAATTTGTGAGGAGTTGCATTATTACATTCGTATATTTAAAACGAATAGAAATCAACTATTCATATATTTATGTGTGTATATGTATTATGTTATAAGGCATGCGTTGTATTAGCCATTTATTTAATTGTTTGCTGCACTATTATTTAAAAAAGAAACACTAAATCAAATCCA-ATATAGATGTAGTGCAAATATATCTATATATAGTTGATTTATAAATTGTGTAAATAA---------CACAGGG
>lap 3024148 3026631|3096 chr3R 3025386 3026336 scaffold_455 2261 3237 + 3153|0 1067
GCGGCAAGCTGAGCTATGTTTAAATAAAATTTATATAAATTATA-----TAAAATATTTTTATTTTTTTTTTATTTTGCGCTGCACTGGAATTAATTGCCAAAATCAAACAAATTAATTGACTTCCAAAACTTTCATCAACTCCA------ACCCACCACCCCCTTAAGTGAGTAATTTTTGATGGTTCAA--------TAGTTTATTCAACTATGTATCTTC------ACTTCACATACCATC-CCAAATGCTTAAAATTCTGTCGCTTTTATACTCCCTTTAATGGGAGTCGTCGGTCCGCCATGGCCATGAATTCTTCAAGATTATATAGCAGTAGCTATAAGCAACACTGTCAGCTTTTCGC-----TGATACCCTTCAAAATTAATCACATAAGCAGAAAAGTACGCTATATTTTTGCACCAGCCAAAATGCAATTTTATTGCTCACCAAAGTAGGCAACAATTTAGTGGAGAAATCAAATAACAAGGTTGACCAGGACTTTAGCATGTCCTACTTTTGGAATAGGTGGGTCAACTCTCGTAGGCAAACAACAACGCAAATGCAATAATCGTTAGAAGCAAACAATCATGTATGGAATTTTCATTAAGGCTAAAGTTAATGTAAACCTAAAGCCCCGAACTCGAATCAATGTACACT-TAGCAAAATTATACACTCGAAAATGACAAAAAAATGTTTTATGACAATATATATACGCTGGTGTTTGAGCTAAACTATACTCATACT------------------TAGGACT------AACTAACTTAAAA-------------CTGCACTTACTGTCTACACGACGCATGCGTTTAGAACTTG-----------CAGAACT-AAAATTATTAGAAAATTG--------------CGACCACTTGAAT--------GAATCTAAGTAAAGGGTCAATAGACAGTGAGATATATTTGGCCGACAATTTGCAGAGAAGCTTGCTTAGA-GGGTTGGCTTACCAAATCGAATGTATC--TTGTAGATAAC----------CATCGATCGTGCAATGCA-GAATATCTA
GCAATATGCTGAACTATGTTTAAATAAAGTTCGCATACAATACACGTTGTAACAGATTTGT-TTTAAATTTAATTTTATTAAGCAT---AATCGGTCCGGAAAACTGAATCCATCTATCTTTATATAGATAATTCATTTCGTTTATAAGTTGGCTAGCAAAATCATAAAGCAG-AATTATTTATTGTTAAAACAAGTTTTTTTTTATTTGGTTTTGATTTTGCCAATATAAATCAAATGTTCTCACTTAAGCCTTAAAATTTTATA----TAAAATTTCCTC--ATAAAAGGTTTCTG--CAACATACCAATAAACTATCTATCAAAATATTGTGTTTATTTTTAAAA----TGTCCACTTTTCGAATTTGTGATTATTTTTAAGATATTGAAAACAAATATGTAGCTAAAGTATATTTTAATA-------------ATTTGTGCTATGCCTATAAGTAGACAACACTTT-----------TAAATAAACAG------CGGGGCGCCG--------------TAGAGTAGG-----AAACTCTCTCA--CATATATACACATAAATGCAATAAT--TTAGAGGCAA-CAATCAGGCATGGAATTTTCATGAAAGCTATAGCTACAAAAAATCCGAATCT---AGCTAAATTTTACAGGAACTATAACAAAACGGCAAACTT---------AAAAAAGTGTTT-ATGCCAATATTTTCACGCTGCTGTTCAAGCTATACTTTACTCTTACTCAAAGGAAAATCTTATTCTAGGTCTATAAAAAACCATATTAAAAAAAACTTAAATTCTTACGAGTACTTTCTACATGAACAAAGTACAAAGTACATGTACTATCTGGATAAAACTAAAAATTCCCAAAAAAATGTTGGTGGTTTTCAATAAACACAGAAATTAGCATGCAAACCTAAAGAAAGGTAAAAAAAATAACTTAATTTATTT-------ACATTAAAAAAAACATGGTTTAAACTGGGTGGCAACTCTGCTCAAATATATTGAGTTTAGGTGACGCAGTTTTTGGATTAATCTAGCAATCCAGGAATATTTA
>lap 3024148 3026631|3097 chr3R 3026344 3026547 scaffold_17556 389 585 + -1661|0 217
GAACTATTTATGT--TTGAATCAAAGTGTTACTACGTTTCTATTAGTTTGTGTACTCTCTCTCAACAGAACCCCTATTACAATTGAATAAGA--------ACGCATAGAAAATAAAAGACATTTTTGTCGCAATGAATTCTTAC---AATTCGATCCAATCTCATGGAAATGCAAACTACTCGAGTATGTAATGTGCACA-CATTCTCATTAAATAGG
GAACACATCATGTAAACAATTAAAAGAAACGCCAGAAATTTATTTGT----------------AAACGAATTGTTAATGCATTTCCATAAGGTAAATTTTACCCAGCGAAAGTAAAAGAAAGAATGTACACCAAATATTTTCACGAAAAGCAGAATCATTTTTATTAACATAAGTAATAT-----TACATACTCAACAGAGCGTCAACAGAAACTTCT
>lap 3024148 3026631|3098 chr3R 3026548 3026620 scaffold_1502 2312 2388 + 755|0 76
AGTTAAATATATTGTGTATTATTACAAATTATGTTGAAACAAACCCAACTCTAAAGC----AAAACAGAAATGAAAT
AGCCAAATACGTTTGTCGTCAATTTTAAATATAACCAAGAAAATGTAATTTTAGCATTGTTAATACAAAAATGATAC
>lap 3024148 3026631|3099 chr3R 3026621 3026678 scaffold_407 1689 1749 + 2420|0 10
GTTAGTGCAAA
GTAAGTGCAAA
>CG14609 3029010 3029084|3102 chr3R 3028502 3029432 scaffold_17 5625 6643 + 24474|524 651
ATGTTTTG------------------TTAGGTATTCGATTT--------GCAGCTGT----------------------TGCAGATAAAATTTTA-AGTAACT---TAAATTTTG-CATGCTAAAAAC
CTCTTTTAGTTTAAACCAACAAAATTTTAAGTCTTCAATTTTTTAGAGAGCAGATGGCCAAATTTTTTTTAAGAGTCCATATACATCCGATTGTAGAGTAATGCAATGAATTTGGTCATAATAAATAG
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CTCCAATCAATAAAATAAAATAAAAAAA
C-------ATTAGAATAGGAT-------
>CG10050 3076418 3077470|3141 chr3R 3075458 3076862 scaffold_17 61428 62859 + 48551|1010 1461
TAGCCG-GGGCAGAAAATACCAAATAACTTGCAGGTGCCTGTGCTTTATAGCCAATTTTGTGTTCCGGTCGTAGCCGTATTTGATTTAGTGACGCTAACATTATAATTTTCTACTGATAAGTCCGAGATGTGACCTTTGATGTTATTCATACAGTGGGTTTGTTTCTAGCATCCGTGAGGGCTCTAGTAAACACGCACTTGACGATGGCATAGCCCCGCATGCAAGCATTCGTCTCGTCCTCTG--AGGATTACACATTAAAGATTTCGTTTGTAATTAAAAAGTTCTGCCTAGAAC---ACTCACTGCCTTCAGCTTCGCAGGCCTCAACGGAATCGCCAGTGGCTGGCCAAACATATTTGCGCACCAGATCCGTATTTAACTTATAGTCCGTCATCAAACCGGACTTTTCGAAAAAGCAGTGAAAATAGCACTGCAA-GTAATCTTTGAG
TGAACGCGGTCACAATATGGTTAATGCTCTGTGCGGAAACGTGCTTT-----TACTTTTAATACATACTATAAACTATTTGTAATTTATATACAC---AATTATGTGTGCATATATGTGTTTCCAAG---TGATTTTTGGA---ATTTAAACCATGGGTGTGTTTCTGGCATCTGTTAAAGCACGCATCATAGCACACTGTGCAATTGTATAGGTCCTAACACATGCATTCTGTTCATCCACTGCAATAATTATAAATTAAGAGTTAATCATGTT-TTGTATATTTTTGCTGATTGCTCTACTTACTGGCCTGGGATTCACAAAACTCTATGGAATCACCCGTTGCTGGCCACATATATTTACGCACCACATCCGGATTCAGCTTGAAGTTTTCTATTATGCCAGCTTTTTCGAAGAAGCAGCGAAAGTAGCACTAGAACATATTCAATGAG
>CG10050 3076418 3077470|3142 chr3R 3076891 3077454 scaffold_17 62887 63482 + 12611|0 601
CACCTACCATGCTGGTTACCTTATCCTTGTCATCTGGCAAATCCCCAGTGTTATTAAACTGCAAGACATTGGCTGAAA-GAGGCGATAAATGTAGTCATATATTGCCTTCGTTAACCTTTGCA---CTCACTCATCGACGTTATGAAACTAGCATTGCAGTTACGATTAACCTCGTCAAAATCTACGTAGTCAGCCTCTCTAGGAGCTGAAGTGGTGGTGGATATGTCATCCACATCGCCATCGAAACTATCATAGTTTATGATGAAAATATCACCATTATCCTTGGCGTGATCCTGTAGAGCCCTGGCACAATTCGGGCTCAAGATCAGAAAAGCAATGACAGCAC--AAGCTCTAACTAACGCGGAATACATCTTGAACAAACAA--------AGTGCTGGATGGGATTCTGTGACTGACCTTTTAT---AGATCACATTCTCATGCATTGAATAGATTTCATTG-----------------TGCCATGCACAGTTACAATAATTTGACATATTATTTCCGGAAATTGAGTACCAATAAA---GTATACTTT-TAATGAACTTCACACAAAAGAATCTAGCTTTTCAGTGATTGTTCAAT
CACATACCATGCTGGTCA---TATCCTTCTCATCGAATAGCTTGCCTGTGGTATTAAACTGCAGCACATTCGCTGGAATGATAAAATGTTTAGATGCATAGAAATATTTAATTTGTCCTTACAGGACTCACACATGGGCGTAACAAAACTAGCATTACAGGCATGCATAATCTCGTCAAAATCAATATAGCCCGCTTCTCTAGGCGCTTGGGTTGTGGTCGATATGTCATCCACATCGCCATCGAAGCTATCGTAATTTATTATAAATATATCGCCATTGTCCCGGGCGCGATCACTGAAAGCACTAGTAAGCCCGAGACTCATGCCCAGCACGGTCAACAGAGCAACAAAAATTTGAATTTTTAGAAACATTTTCGCAACGGTAAACCGACTTTAATGGAGGTTACGAGTTTGAAACTTATTTTATATGAAATATCGACCGTCAATTAGATAAACAAATTGCTCTAGTGACTTTAACACTACACGCAATAGACAGTTTCA-TAAGCAGA-ATAATATTTACGGAAATGGCGTGATAACAAATTGGTAAATATTATAATAACTTTGACACAATAGT-TATAAATATTTAGTTTTGGTTGAAC
>CG10050 3076418 3077470|3143 chr3R 3077455 3077959 scaffold_17 63694 64242 + 5004|0 15
TATAGATAATTTCTCA
TAGAGATAATCCC---
>SytIV 3095035 3096533|3168 chr3R 3094772 3096617 scaffold_17 82120 84070 + 22540|268 1987
GG--------------GAGGGGCAGGAACCTCCTGGGCGCAGGCGCCCCTTAATGAGGGGGAAGGGAGCAGGAGCAGGCAACCGAAATGGGAGTCATGTGACCTCGTTGCCACCATGAATTTCTCTTTGGTTTTTGGCATATGATTGCATATTGATTGAGTT---TATTTTCTACTTTCTACTTTATATTTCACTTGAT-------TTCTGGGAGATCACTTGCTTTGAGTTTGAAGCAAGATTAATGCGAGATAATTGGCCGTTAACGCCACAAGCAGAAAAGAAATATTTACCAAGCAACCACTAACTAAATTAAATGTATTAGAAAATGTTTAGGACCCTAAAAGTGCATGTAAGTGTAAGATAATT------CAGAAACATCTCAATATAGACATGTTTAAATATGAGAATAAGCAAGGCAGGGGAATTCTCAATATATTTTAAACTGACACCGACTTTGTTGCTATATATTCATGTATGATTTTCATATCAAATAGTTGAAGTTAT--ATTTAATGTGCCCACCACTGAAGTTGATTTCCTC-----------AAAAGATATATTA-TTAACCATACATCTGTATAAAATATTTATGATA--TCTAACGTTTAAGCATACATATGTCTGTACAATTTAATTTTAATTATTTGAATATTTTAGTTTGATTGTAAAG---------ACCTAAAGTATACCATCGCTTTAAT---GGATACAAGACATCAAATTTGCACACCCCG--GAAGCTCTT---AAAGTTTTGTCCAGAACGAA----------------GCA--AAGATAGATGCTTACTGCTTAACACTTTATACGTACTCTTAAAAA---TAAAAACA----AATAACTAAAACTAATGAAACAAATAAAACTAAACCAA------ATTGAATCTAGAGAGAACACGCAGCAGAATGCTTA-GCACCAAGAAGCTACAAAACCACACAC--AAATCGATCGAAA-AAGTCAGAAAACATTGATTCGGAGAGGAAACCAACACAATACAATAA----TGTAAG------CAGCATAGTACATGTAGGAATCA-ATTACCAATAACATACTCTAGAGTATAACCACTCAC-----GAATAGCTCAAACCGAACGCAATAAGCACTACAGGTGTATCTAGCGGCACTACCTTTAAAGGCAACGGATGGAGGAGACCCCGATGA-------AAGCATAGCTTAACGAAGACACCGAATCATTATCCACTACTGATATTAAGTGTACTGAATACAATTATAAACTATACCAGATCTATATAGACATCAGCCCGCTTCTACGTATATTTTGTAAACTGAGTGTTAGAGCATTAAACTTCATTGAATAACTACGTGCATACAACCATAAGGATATATACAAGCATACATAGCGATTCGCGAGAATCGCAGATACAACTTCAATTCGTGTCCA-ATCAAAACTTCAATTCGTCTAATGGAAAAACAATAATTACCAA--------------TACATATGCAAAGAG-------------------------------------TTTGTGCAGAGGAACCCAAAT--------------------------------------TATATGAGATG--TGTATAATTCTACAT---TATATGTAATTGTAATTGTAAGCTACATCAAATGGTTAATTTCAGTAATAAAAG-----GTATTATATAAAACAA
AACTCTTCAATTTTATTTGGGGCAGCGACCC----GGCGCTGGCGCCGCCTATTCAACCACAA--AAACAACAACAGGCAAACCAAGT----------TAAATATATTCTAATTTTTATTTTCATTTTTATACTGCGTGCATAACCATAATTTAAATGAATTAAAGATTTTAAAATATTTATTTTG-ATTATGCTCAATATATTTCTTTTGTGGCATAAGGCACACAACATTTGAAAATAAAAAAGTTGAAGAAAA--AGTAATTTAC----------AAAAAGACA-------CAAGAAAAC-TTAAGTAAATTAAATGTATTAGAAAATGTTTAGTA-TGTAACAACGCGAGTAAATGTAAGAAAATTAATTTAAAAAAAAAACATGATACACACATACTTATA-ATGAAAAT---TAAAACAGG-------TACACATACGTATAAAAAACTTCAA-TTTGTTGCTGTATAAAAAT-CATTAATTAAACGTTG---GGCTAAAGTTTTTAATTATATACAAAAATAATTGAGCTTGAATTTTTTTTTGCATTGTAAAATTACATATTACCTGAAGAAAATTGTTTGTAGTCCATTTATTATGACTCTGCCCACCATGAATACATTTG---GTA----TTTGTTTAATATGTATTTATATTGTAGCTTAAATTTAAAGCATATATTTATTTCATATTTACCACAAACTGAGTTCCGAACACCAAACAC--AACTAGGAAACCCCGAAGAAACTATTTGAACAGTGCTTTACACAACAAATTTTCCAAATGTGTCCGCAGTGAGACAAACGCTTACCGCTTATATCTTTATATACATATAAACAAACATTAAAAACAAGAGAAAAATAACAACAAAAAAATCCAATCAAAATAAATCGAAAAGATAACGAAACTTGAGAGAACACGCAGCAATTTGCTTAGGCACCAAAAAGCTACAAAATCACACACAAAAAAAGAACGAAACAAGTCAAA--------ACCCAAAAAACTAAACAACACAATAGAATAGTACTTATAAGATGGCAAATCATATTGTATGTAGAAACCACAAAAGTAATTATATTATGTAGAGTTACGAAATACATAGATGGCATAGCTCAAATGAAAC-CAAAAGGCATTATA--CAAATCTTACGGCACTTACCCAAAC---------------CTACTTCGATAATATTTCTAAGCCCAACTAAGCAAAGCTTACTACGCAAACTCTACAAC-------AATTGAACCG--TTTAATTGGATGCTATGAGAGACATTTATA-ACAGCAGTTTGATAAGACA-------TGGACAGAAAATGCAAAAAAATAAAAACAAAATGAA-AAGGAAACAAATGCGAGCACAA-AATGCATACTTTAATATA-ATCATAGCCCCAAAAAAGAAAACAAAAATTCAAATTGTGTCCACAATCAATCTTCAATTCGTCTAAAGTGCATACAATAATTAAAAAAAAAAAACACGATTTTCATATACATAGAAATATATATACATACATCAAAATATAGTATATACATACTTGATGCAAATGAATATATATATACTTACTGACATATATACTAACATCATACATGCACACATATAAAGTGAATGTATAATTCTATATATACATATGTAATAGGAA-TGTAAGAGACATTGAATGGTTAATTTCAGTAATAAAAACATATATAATATATAAAAAAA
>Mst84Da 3191902 3191985|3281 chr3R 3191767 3191945 scaffold_7 142781 142967 - 5162|147 210
A--------------------CCAGTTGACCCGGAAACCTGTCGGAATACTTCCGGGAACTATG
AAAACGTCTTCAGAACGAAATCTAGGTGCACCACATTCAGTACAAAATGCCTCGCGTAAATGTG
>CG31513 3215204 3215406|3319 chr3R 3215334 3216484 scaffold_17 224306 225617 + 3967|0 75
AGAAGTGGCAGCTGAATTCCTTTGTCGAC---CTCAAATCCTCAACTATTTCATTTCATTTAATTTGATTTATTTC
AAATATGGCAGTGTGATTCCATTGTCAGCAGCCTCAAATCCTCAACTATTTCATTTCATTTAATTTGATTTATCTG
>CG14598 3267246 3267714|3381 chr3R 3266565 3267745 scaffold_17 282238 283358 + 2911|713 1251
GAATCCATTTAATTAGATTAGATAAGCACCATTCAAAGGCCGACTTAAAATATAAAATAAATTAGATACGACACAACTGAGATAATGAGTGGAAACTATGCGGTATTATTTAAAAGCGACTGTTGAAGC-ATGAATTCACAACAAAGTATTCGA--AGATTTCAAATGTTGATG-GATTAAATAATTTATGAATGCACAAAAGTGA-CCATTTCGAATCATAGAGGCA-ACGCCATCTGTTGCTACTTCGTTATG--------------TGAG--------------GTTAT-CTGTTTTA-----------AATTAACACCTTTGTCAAGGGAAAA---GTGGAAGAAGCGCAAAATTAATTCC------------------TAAAATAATATTTATCGTAAAGGAAATTCATACACCCTTCTTAGCG---ACCAATGGATAGCGTTTTACCTTTTCCAGAGCTTCATCGGCATGTTTTTAATTGTAGTACATATATTTAAAATAAACTGCTAATGCAATGTAAAAAAAAAAAACCAA
TAAA----TTAATTAAATTAGTTAAGCGCAGTGCAACAATAAAATTAAATTAAAACAATACAAAGAAGCCAAGCAATTGAATCGAACATTTTTTAAGTTGCGCTTTTATTTATTAGCAACAATTAAAATTGTCAGTTCGTGCAAAAATCCACGATTAAATGAGACACATTTATGCTAAAGAGAAATTTAGCTAGAAACAAAAATTAGTCAGTGCATATTTTACAAAAATATGCCATTAG--ACAAATTTGTTATAAATAGACACAAATTTGAGCCTTAAATGAAAAAATTATACCATTTTGTAGCTAATGGCAATTACCAGTCTAGTCCATCGATCATATGACAAATGATTGCATGATTAATTCTGTTGTAGGAGTGAAAATATAAACTAATGATT--------TGCACTACGTTTACCCTTATGATCGCAGATCAAAGAAGCAGAATTGGTGTTTTC-------TCTTCAGGGCGACTTCAA--------AAGACAGTCTGATTAGGCTGGCACTGAAACAT----------------
>alphaTub84D 3358334 3358873|3487 chr3R 3356983 3358334 scaffold_533 6552 7903 + 102259|1351 1351
A
A
>alphaTub84D 3358334 3358873|3488 chr3R 3358335 3358545 scaffold_44 793197 793457 - -620|0 268
GCGGATAGGTGTGCATCCCT--------------CAAAATCTTGCT----------------TATTTTCATAC-GCTCCCACTCGCATGTATAAATTTTCTGCGATAATGTATAGCG---AACAAAGAAGAAAATAAAAACCCAAGAAAACACC----------AATTTATTAACC------------ACGTTTAG--TAAAAGGCACGAGAAAGTTAGTACTTTAAAATTAACTTTAATTTTATATATGACCAAAAGTCATGCATTAA
GTATATTGTTACGCATGCTCGGAATGACTAACTACAAAATAAAGCTCTGTAAAAAAAAATGATTTTACCAAACAGTTTCCATTGAGATG-----ATTTT---CGATTTTATATTGCACTTAACAATTAAAAATGTAATAAAACAAATAAATATTGCAATAAAAAAATTTTTTAATTTTTCTTTTTTAAACTTTAAGCATACAAAGTATAAAACGAATTTCATCCTTAAATAAATAACGATTTGATTATTTTTCTAAAATGATACTTTAA
>alphaTub84D 3358334 3358873|3489 chr3R 3358869 3359291 scaffold_2 5926291 5926690 + 1932|0 4
ATAGA
AGAAA
>alpha-Est2 3370801 3370956|3501 chr3R 3369599 3371475 scaffold_17 403958 405839 + 47256|1202 1360
TTCTCAAATCTAATTCTAAGGTTAATATAAGTGCTCCAGATGTTCTACGAAGTTACCATTTGAGGGTAAATGTCT-TATTCCCAAATATCTTCTTTAAATTCCAATTTATCACTTGTCTTAAT--AATGAATAAATATAGATATATATCACTCATATTA
-----AAAGCAGAACCCAAGCTTGATTCCAATGCTAGATATAT--------------ATATATATATAAATATATATATACATATATGTAAGAAAGAACTTCCAAACTATATGATATAGTACTTCAATGTATGTATGTGCATATCTTTTATAAGTACCA
>CG31146 3519423 3520040|3662 chr3R 3517191 3519630 scaffold_17 578448 581177 + 77846|2525 2791
-------AAACTCCAGGGAGCGGCTGCCAAGAATCCTTCAGGACTTTCA--GGACTTCCCGCCGTGCC-----------CGCAATGCGGCGACAGACAGCTGCCTGCCTAGTCCCCTCCAGTATTTGTCCGGATCCCAACTCTCCGGTTTCCTCTGGTCTGA---------------------------------------AATTTTACGGGGTCTGCGTAAATTTAATAATACATTTTGGTGTAAAGTTTATCTTTGACTTGGCGG
TAGTCGTAGACGCCAAGCAG-AGCTCTCAA------TTTGACACCATTAACGGA---CCCGCTGTGCCGAGCAGGGCCTCGAAATGCAACGACAG-CACCAGATTTTGGATTCCAGTGCAATGAGAGTCGGCTGCCAAATCCTTTGACGGCTTGTGGCTTGAACTGCAGTGAAAGCCACTCACGCGCGGCAATACGCTCGCAATTTTCAAGTGTTTGCGAAAATTTAATAATACATTTTGGTCGAAAGTTTATCTTTGACTTGGCGG
>CG2616 3550098 3550140|3669 chr3R 3549436 3550142 scaffold_17 590686 591415 + 27302|665 727
-AGAGATGGGTGGCTC---------------CTTTGTAAATAAAGAGCG----CATATTTTAT
TAAATCCCCGTAGTTCGAGTCAAGCACTTTATTTTATAAATAAACCATGTAATTATATTTTAT
>CG3066 3588218 3588287|3704 chr3R 3587536 3589542 scaffold_17 623832 625877 + 44268|731 800
TCAACAATCGTTACGTTCTTACCGCCGCCCATTGCGTCATTGGTGCGGTGGAAACGGAAGTAGGTCACCT
TCAACAATCGCTATATCCTAACCGCTGCCCACTGCGTCACGGGCGCAATCGAGACCGAAGTGGGACAACT
>CG3066 3588357 3588643|3704 chr3R 3587536 3589542 scaffold_17 623832 625877 + 44268|871 1157
AACTACCGTTCGGTTGGGGGAATACGATACCAGCAAGGACGTGGACTGCATAGATGACATTTGCAACCAGCCCATCCTACAATTGGGCATCGAACAGGCCACTGTACATCCCCAATATGATCCTGCCAACAAGAACCGCATTCACGACATTGCCTTATTGCGATTAGATCGGCCCGTTGTGCTTAATGAGTATATTCAGCCGGTTTGTTTGCCTTTGGTAAGCACACGAATGGCAATCAATACCGGGGAGCTCTTGGTGGTCAGCGGGTGGGGCCGAACCACAACAG
CAACCGTGTGCGCCTGGGCGAATATGATCTCAGCAAGGAGGTGGACTGCGTGAAGGGCGTCTGCAATAAGCCCGTTCTGGAGGTTGGCGTCGAGGAGGTCATTGTGCATCCGCAATACGATGGCAACAGTCGGGATCGTCATCACGACATTGCGCTTATACGTCTGAGTACACCTGTCGAGCTCAATGAGTACATCCAACCAGTTTGTCTGCCCTTGGCCAACGCTCGAGCTGCCATCAACAACCAGGAGCTGCTGGTTGTCAGCGGCTGGGGACGCACGCTACTCA
>CG3066 3588757 3589154|3704 chr3R 3587536 3589542 scaffold_17 623832 625877 + 44268|1322 1727
CCCGCAAGAGCACCATAAAGCAGCGATTGGATCTGCCGGTGAATGACCACGATTACTGCGCACGAAAGTTCGCCACGAGGAATATCCACCTGATCAGTTCCCAGCTCTGTGTTGGCGGGGAATTCTACCGCGACAGCTGTGATGGCGACTCCGGCGGACCGCTGATGCGAAGGGGTTTTGACCAGGCTTGGTACCAGGAGGGCGTGGTCTCCTTTGGCAACCGCTGCGGACTAGAGGGTTGGCCAGGTGTCTACACTCGGGTAGCCGACTACATGGACTGGATCGTGGAGACCATTCGTCCCTGA-GCAGCGGAACGAAGGCCGCTTTTG-------TTCTGATAATGTTTTAATTAAAGTCAAGTCGAGAGTGCTCTTTGGGCTGGGCGCCCATCCTTTAATTAA
CGCGTCAAAGTAATATTAAGCAACGTCTGGATGTGCCCGTTGCTGATCCCAATTACTGTGCGGAGAAATTCGCCACTCGGCGAATTAATGTGATCAGCTCGCAACTATGCGCAGGCGGCGACTTCTCGCGAGACAGCTGCGACGGCGATTCTGGTGGACCTCTGATGC------GTTACAGGGAGGCGTGGTATCTGGAGGGCGTCGTCTCGTTTGGCAATCGCTGCGGACTGGAGGGCTGGCCGGGCGTCTATACCCGGGTGTCGGAATATATTGACTGGATCGAGGGCGCAATACGTGCGTGAGGCGTTGCAATGGAGTGCAGTTTGAGGGCAACCTAAAATTAAGTTTTAATTAAAGAGCGAGCG-GTGTGAACTTAAGCAAAAGACGACGCATTTTAATTAA
>CG10086 3618846 3619221|3740 chr3R 3617104 3618993 scaffold_17 664985 666772 + 55821|1798 1956
GGGCAGTTATCGCGAAAAATCACGACTATATCTTATCTCGGCAGTATTTATTTCTTTTACGGTTCGCCAGTGTACTTACCAA-----AATGTTTACTATATATGT------ATGTATATCGGAATGATAAACAACCCAGAATATAAAAGTGTCTACTGG
TTGC--TTATC-----AAAT----GCAATATCTTATCTTAACAGTATTTATATTAATCAACGCAAAATTGTGTTATACCCAAGCGAGATTGTTTGCAAAGTGTCTTAGGCAAGATATTTCGTA--GATAAACAAAC---AATATAAAACCGTCTTCCGG
>CG2641 3622242 3622321|3743 chr3R 3621311 3622716 scaffold_17 669092 670441 + 25897|931 1012
AAAAAAGAAGACATAATCTCATAAAATGATTTTACTTTGATTTAGCTTTGGATGTTACCAATAAA--CATAGTTTAACCGTT
--------------AACCTTATAA---------GCCTTGTATCAAGTTTATACTTTTTTAAGAACCTCATTTTTTATACGTT
>CG31472 3637259 3637640|3756 chr3R 3636375 3637521 scaffold_17 691269 692399 + 38583|892 1163
GCACTGGGTTCTGGAGTTCAGCTACAGATGCATTGAAAATGTCTTCCAAATTAAGTTGTTATGCGCAGGATAATAGAGGAACGTTTAAAGCTGCTTCAAAATAAATGTTAAGACATAACCAACAACTATGTACATCTGTACAAGCTTAACTACCAAATACAAATTTAAGATTGCCTTTAAATATTGTCATAAGGTGTAAG---------TGAAATTACAATTCCTTTTTAAATTTGAAAGTACACTAGCTAAGATCACATCCTAAAATATGG
GAACAAGGCCTAAGAATAGTAGATGATGCGCATTTGTAATGTCTTCCAGAATAATTAGTAATGAGGAATAT-ATAAAAAGATTTTGAAAACTAAACTATCGTAA---TTATAAAAGATTTAAAAACTGT----ACGGGTAAAAGTT--ACTAACGAAGGCATAGTT---------TATACAGAAAGTTGAAGCGTAAAAGGCAGTCGTCTGAAAACACAATTATTTTCTAAA--CAAACACAAGATAGATGAATTAATAATCAAAAAATTGG
>CG31473 3638607 3638733|3757 chr3R 3637752 3638622 scaffold_17 692829 693667 + 10126|875 890
TACAAAACTATTCAAG
-ATAAAAATTCTCAAG
>CG31187 3678969 3679630|3796 chr3R 3677246 3683246 scaffold_17 744678 750965 + 134994|1739 2624
GC----TTCCGTTGGG--TCTACTTAACGGCTAGTACAAACAACAACAACTCGGATCGCGCTCTTAGGGCTAAAGGAGTAG-------------AAAATT------AAGTTGTACGCGATCACAGGAAA---AGTTATGTTATTATGGGACAAAATGCATACAACAATCACTAATTTATAGGCTAGCTTAGCTAA-----------------------------------------------------------CATGCCGAATGATAGGGGAA------TGGATTCAGC----------GAACATGCAAGTAAAATCATTCGGTGAAACGA---CGATACTTCTATCGATAC-------TCTTTACATATTTAGGCTTAGCT-----GATTTTCTCTCGAACAAATTATCTCGATATACCACTTTTGATTGGCATGGATATGTAAATTTTTTAAGGCTATCAGCCACTTTAAATCGAGACA---AAACGAAGAGCACCCAAAATTGATTTTTGT-------------TTTTCAA-----ATACGTATGTCAAATTTAAGAAAAC-----ACTAGCAGTTAAAACGAATTTAAACGTAGTGGCACATACGAGA-ACAAAAACGGTAACTGCAGTTAGATTTTAAGT---GTTTAACCTTCAACTTACGCTTA--------------------------------------------------------------------------TATTACCAATT--TTGAGAACCCGTTTGAGATCTGTTCAAAACTGCAAGTAACGGAAACATGAAATCGATTCTAAATTTAAAAGCAATTTATATTTTACAAAAATGAAACAATAAACGTGCAGACACAAACCAATCTAAA
GCAAAGTACAAAAGGGAATTCAGTCTAAGCCAACAGCAAAC----GCAAAGTGAATAACGAACTTAAAGAGAAATGTGTTGTGCTTGACTAGTTAATGTTGGGGCGAGGCTGTTTAGTATGTTAGGTAAGCGAGATAATTTTATATGAGAT-AAATGCAAACAACAATCACT-ATTTATAGACTAGCTTAGCTAAAAAATAAAACCCCTGTTTTTCTCTATTTGGGGGCTGCACGACGACGCTTAGCCGTAGAGCGGGACTAATGAAAGAAACATTTATCTGTATTTAATTCAAAAGCAAGAAAACGAAAACAAACTAATTACCTTAAAGAAAATCGTTACATTCATATATATAAGTACATATGTATACATTTATACATATACAACTAAATTATTTTTCCATCAACATATATACACACA-------TGCATAATATAACTATGT---TTTGAGAAGAC--TTATCAATTTCAGTTTTAGTCACGTAAGCGAACTGAATTTCATGTTGGAATATGTACCTATACATATATACTCAAAATATATATGTATGACAAAATGCATAAATTATTTAATTGGCAGTT-AAACGAATTTATATGTAGAGGCACATGCTAAATTTAAATAACAAAAATGCATTTAG-TTTTAAGTACAGTTTGAAATTCAATTTACGCTTAGCAAAAAACTTACCTTCCCCATCCCCGTTCCACTTCACCATATCCCTCCTGCCTCCTCCACCCCCCCCCCCCTCCCTTTCCACTTAACTAAGGCCCCACTTAA---------ACAACTTAAAACAAAAAGAACTTAAAGATTATTCTAAATTTATAAGCAATTTTCAAATT-TACAATTGTGGCAATAAG-----AAAAAGAAAACCACGCAAC
>CG10092 3714972 3715058|3826 chr3R 3712977 3716043 scaffold_42 62317 65244 - 89772|2010 2096
ACCAATTAGACCTAAGGCACCGCAGTTAACACAATTTATATTTATTAAAACACTTCGCTATAAAATGCAGCCTAGTGTTGCAGATGC
TT---TTAGTTTTATCGAACTA-ATTTAACATAGTTTTTATTGAACA------TTTGTAAAGAAATGCAACGCCGCTTTGTAG----
>CG31284 3726477 3726866|3834 chr3R 3722787 3733130 scaffold_42 73005 83316 - 373764|3758 4268
CAG--------GAGCATTTACTGCACCCCATTCGGAATAT-----------TTATAGATCA-----------------------CAGTTTGACCTTTTTTAGACGTAAGGGGGTCGTGTAGGC---------CCCAAAGAATCCAGAACATTGTTGATATTATCGTAGCAGCGAGTTGTAGTTAAACCAATTTTGATATCGATGCGCCAGGCGCAATATGCA--TACGCTATATAGCCATATATCCTAC-ATACACTACACTATTGATACAA----------------------------ATACTATAACTAGCGTTTAGTTGA--------ACTAGAGGCGAGCAGTTGGCAGGATTGATT--------------------TGTGGCTGGTTCCAGGCTGTGTC--TTTGTTGTTTTGGCGTTGTCGTCAGAGAATCGTTTATATAGTAATT---------TAATGCAAATTATTACTCTTAATAAAGTATATGCTATATATCTATTGTT
CAGCTCCAGCAAGCCATTTACTAT-TATTATTATTATTATTATTATTACTATTATATATTATTATAATCATCCAAATCCACATTTAGTTCGAAACTCTTAGCCCTTAGACTCTTCTTGTGCGTGTGTAATTGCCCCAAGATCCCCGAAAAATGTTGATATTAT-----------ATTGTAGTTAG--CATATTTGATATCGCAGCGTCTGTCGCTCTACATATTTATGCTTTTTAGCCATATAACCTACTCTATTCTACAATATATATATAAATATATATATATATATAGATATACAGTTATACAATTAATAAAGACTAGTTGGTAGGCTTTATTAGAGGCGAGAAGCTGGCAGGTTTGTTTTTGGTCCGCATTCGGTAAAATGTGTCTGGTTTTAGGCTGTGTCTTTTTGTTG-TTTGGCGTTGTCGTTTGAGATGCGTTGAAATGATAATTATATATGAAAGATATATATGTTTTATATGAATAAACTAT---CTAAATATCTATTGTT
>Taf7 3734851 3735445|3835 chr3R 3733388 3735124 scaffold_11 3337901 3339651 - 70539|1484 1807
GAT-----ACAGATATA---ATACAAATGGTGGACTAGCATAAGTTATAATAAAAACTATGTACATAC------ATATTCGGATGTTACTTCAAACT---ATTTACGAC-------------------TTCAACGCCAGTTTCTGTTGTTAAAGTAAACCTTAGACAAGAAATTTTGCCATATCATTGGTCAACTCATTATTTGTGTAAAATTAAAGTGTTTCCTCAGTATTGATAAGAATGAT--TATTTGCAAAGCAACAGAGCAC---------GACAATTGAATCTGTTTT---TAAGTATTTATTGCAGTGGACTTATC
ATTTGATCATAGTTATATCTAAGTAAAATGTGAATT---ATAAGCTAAATGAAAACATGTATATATATTATCTAATATTAAGATGAAATTTTATATTTAGATTTAGGACAAATGAGGTATATGTAAATATCAATGTCAATTTTTGTAATAAAAAT-------------GTGTTTTTAATATATATTTA---AAATGGGTGTTTTT---AATTCAAAGAGCTGCATGAAAACTAGAAACAAAAACAAAATTCGTAAATAAACAAAGCATATTTTATCAGATACTTAGCGATGTTTTGCCTATCGATACATTGCCGCCGATATATC
>Taf7 3734851 3735445|3836 chr3R 3735382 3737780 scaffold_42 84309 86636 - 97825|0 68
TGGGCAACAAAGA--GTTATGTATTTTGTACTA---TGAGTAAAGTTCCAGAGGCAAAACCAGACATAA
TGGGCAATATTGATGGCTATTTCTTTTGTACAAAAGTTGGTCAATTTGCAGGCGAAGAGAGAGAGAGAG
>CG2678 3741903 3742178|3845 chr3R 3742029 3742590 scaffold_4232 320 899 - 783|0 184
AGGTCTAAACTTCTGTTGTTGATTCTTACTTTGAATTTTCTTAAATATGATTCTTTTGTTACTTTCATAAGC-------------TCAAAAT--------TAATATTATTTAAGTTTCGTTTTAATTATATATTTCACAGAAACTCAA--------------ATATACTGAGAATAAGCTCTAAA
AAGTTTTAATTTATGCATTTGGCTTCCA-TTTGAATT-----GAAGCTGATTTTTTGCAAACATCTTAAAGCAACTGGGCGACATTTAAGATGTGCTTTGTAACGCACTTGCAGAATGGTTTAAATTATGCA----ACTGGAACTTATTTTCTTGCTTAAATAGATGCTTAAGGAATGTTTTATA
>lds 3749955 3750211|3848 chr3R 3746148 3750689 scaffold_17 639611 644229 - 113673|4036 4311
GCTTGCTTTTAACGTTTCGTATTTTATCAACTTCCATACTTATTTTTTGTCGTTTTGCAAATGCATTCCATAGATAACCATTTTATGTTTATTTACAGCGAAATA------TTTATTCAAGATTATTGTAAATTTTGTTTAA-------TGTTTTCATTTCTTTGTTTCAAAGCTTTGTATTAAAA--TTAACTAGAATACCATTTAAGTTGTTTGGTGATTTATAATGAGTTCCATTAAAATTGAAATGTGT----TCTACTATGTTTTAATATC
GCGCCAATT----ATTGGAAAATCTCTAGGCTGCAGTGCTGAGCATTGGGCAAACAGAAAGGCCATT-------------TATGATTTTTATTTACAGCAGAACAAACTTCTTTTTTCA-----ATTGAAAACTTTATTTTGAAGCATTTGATTTAATTTTATATTTTT--AGTTTTGCATTTAGGCCTAAGCTACAATCAAATCTGAAGTGTT----------------------TTAAAATTTTAATGTTTTATGTTTAATATG-TTTAATTGT
>Os-C 3805211 3805546|3906 chr3R 3804439 3805984 scaffold_17 704550 706106 - 7199|831 1171
CCGAGCCAAATTTAATGTGACTACCATTGAAGG----AACTGGACCGGAATTGATTTGACTTTTGTATCTGCATAGTGAATCTTAAACAAGTGAATAATATTTGGATGTAGTTTGGTTTCTTGAGTTTCTTAAAAGAATCATTGTTTAAATATCGTTGTAGTAATATTTACATTATATTAAGACATGGTATAACATATTGTCTTATAAGAGGTATTAGTGCTACCCCTAATTATTTTATTTTGGTTACATCAATATATAAGCTCTCAGATTGTTGTTTAACCTTTTGATTC-AACTATTTCGTTTTCCGCACTGGTTAAAATATAATAGCTATTGAATCCA
CCGCACGCTATGTAATTCGATT-CCATCTAAAACCATAGTTGAGCGGCAATAAATTTGTC------AACCGCTTAAT-----TTCAAAATAAGAAAAGTCGCTGGTTCGAATCTATTTCCCAGCAAGCC-----AGTTTTGTGGTTCCAATCCTGTT--------------------TCGTCACACGGATTCGCAT------TTAAAAGGAAGACATTTATTATTTGTAACAAGTTGTCTCTTCTAAAGGCAATTTATATATTTGAGAAATGAAACGGAATTTCCGGGTTCGAACCGGCTTAAATGTCGCTCGTGT--ATATGAAAAGGCTGTGAAAATCC
>CG2698 3831007 3831432|3938 chr3R 3830824 3831041 scaffold_9 3168775 3168973 + 2966|185 219
GTTGGCATGGACCAGAAACTACGAATTTCCTTTTA
GTGGGTTTGGTCAGGCGTTGCCGAGTCTGCGTTTA
>CG2698 3831007 3831432|3939 chr3R 3831353 3832721 scaffold_55 207067 208280 - 31492|0 92
ACTAATTGCTTAATG----------TAAAATTGTGATGTGTTTAAACTTA---GATACAAAATGTCTTGCAAATATATTTCTGTACTAACTAA
ACTATTTTCCTATTGATACAAACATTTAATTCGAGACTTGTTTAAGACGAAAAGATTTCAGTTCTTGTGTCTAAGCAATTCTAT-TTAACGAG
>CG3223 3836589 3836740|3943 chr3R 3834251 3837446 scaffold_247 8366 11547 - 66418|2457 2693
TAAGGAT-CGGAATTGACTAAAAAGCCAACATAATGTGCTTACTTTACGG--------------------------------------------ACTTATATTTATTCTGCTGCTGAGGATTCTGA------------------AGCATTAAACT----------------------CCCAACTTAAGCAAGGAATATCTCTTAATAACTTTTAATAATTAAATATACGTTTAGAGG
ACGCGATGCGGAAGCAGCTTAGCACTAAGCAC-ATGTATTTATTATGCTGCTGCGGCGGCGGCTGTCGTCATATAAATATATGCATATAGATATATATATATATATATAAATACTATATATACTTATGTACACGTAAGCGATTTAGCATTATGTTGTTGTTGTTTGTAGTTGCGTACCTCAGCATATGCAAA--------CACAATAAGCTCCAAGTACT-CATAGAAATAAACAGA
>CG2702 3841897 3842330|3946 chr3R 3839531 3841999 scaffold_247 12977 15472 - 60453|2461 2586
GAACTAA----TAAGTAAATATGTAATATTGATTAATTTAA-----------------GCTTTAAAAGTTTATATTTTTTACTTCATATCGCG-TTATATA-ATAGTTCATTACAATGGCTAACAA
GAGCTGAACGTTAAACAAGAGCTGAATTTCGATTAGATAAGACAACAATATTAACATCGTTTTAAA----TAGCTTTTATAACTTATATCGTTCTTGTGTATATATATCATAATAATAACTAACAA
>CG10903 3857692 3857871|3952 chr3R 3854219 3858684 scaffold_227 12657 17211 - 110619|3846 4025
ATAAAGTTGTTACATTTAAAATTAGTGACAGACCTAATCTCTAATTGCGGCTTTGTCTATATGTTTTAGATCTTGAGTCAGATTAAGGATATTACAATGCCGTTGGATGTTTATATACATATGTATAAGTCCCGCTGCTATTCATCTTAAGTAAAACGGACACATCTTTAATTCACAAAA
GGA---TTTTTAAATATACAGTT-----------TAACGTACAA-------TTTGCGTATTTATTTTAAAC----AGTTAAGCT-----------------------------TAAACCTATG----------------------CTAAAGTGAACTAGACTGCTTTTTGGCT-------
>Tom34 3862227 3862381|3954 chr3R 3859022 3862389 scaffold_749 212 3622 - 159101|3273 3443
GCGAAATTCGTTTGTAGTGCCTTTTGTTTTTCCTCCATTTCATCTTCT-TTACTTTACTCACAG---TGTCATCGCGAAATTTAACTTATTTTTCAA--AATATC---AAATGTACTTA-----ACTGTTTTATAAATATTGTTCGAATTTAT--TTCGTTTTTAAAGGTA
TGAGTTGCCTTTTACAGTAGCTTTTACATCTCATCCACTCTTTCATCTAACAATTCACCAGCGAGTCTTTCACTGTGTCACTTAATTTATTTTCGAATCACTTTCTTAAAGTGTACTTAAGCTTAATGTGTTTTTAATTCTGTACGAATTTATAATAAATTCAAAAAAATG
>CG7918 3911455 3912767|4007 chr3R 3908909 3912077 scaffold_29 911115 914185 - 113056|2625 3304
GATGGTTTGGGGATCTGAAGTGGTTAAGCTGCTGGTG-------------GTTGAGTTAAATC---------CCTGATAGATTTCCATTTTGCACTGCACTTGCGCAAAGG-ACCAGACACTTCAGAGCCCCGAGAGTCTGGCGCCTTGCAAACTTTTCCATTCCCAAACCCCTTACACCTCCTTAGGCCCATAAGTTTTCTATACATACCCAACGAAAGTGCTCCGCTTAATGGAATATCTGCTGGATTTCGACCATCAGCAAAGTATTAGAATCAAACACTTATTAAATTCAAAATTTAATCGGTGGACAGGGAAGAGTTATCTGTAAGT-------AGCCAAAGGTGTGTGCTATAGTTAGAATCGTTGGGGGGGAAAACAAGCAATCCGATTTGGGATGCATACATAGGTCTAGAGTGGCACTAAGCGGGGCGAAATGTTTTAGACAATAAATATTTTAATGTTAATA----ACCAATCTATGATAACCA-----TGCAAAGTATATGATATGATAGCTAATA---------AAATAAAT-TAAGCATAA----GATATACACATTTACCGAGACTAGAAAACCCTACAAACCAAAACTCTAAA----GCATATCCCAATATAGAATAATACTTCTTTTGTTGTTCCGCAGAATATATCAATGAAAAGCAGACATA
GCAAACCCCACAAGCTGA--TGATGATGATGACGATGAGTTTTGGGATGAGTTGAGATTGATCGAGATGGCACGAGCCGGATCCGGCTTTGGCATTGCATTTGTCAAGTGGTACACAACATTT-------CCGAGAGCCCCGCGGAATG--------TTGAGACCCAATTTTATGCTATCTC----------TAGATTTTGGTT-------------AAATGCTCCGCCAAATTG---------TGGATCCCGCCCCTCCCCACTCT------GTCGAACACCAATTGAATTCAAAATTTGAGCGGTG-------------TTTTTGTAATTTAAGGTCAGCCAAAGGTGTGTGTTA-----------GTTAGCGACTAGTAGAAGCTATTAGAACGGAGTTGTAGTAA------------------AAGTTGAGGCAAATGTTTTAGACAATAAATAAATTAATGTTTATATATTATTAAGCTATGAGCCCAAAAAGTGGTAAATAGTAGAATATAGTAATTAGTCTATGCAGCTAAATAAATGTATACATAATAATGATAACAATAATAATCATAATGACTATACTCTCCCGATACATACCATATGCATTACATATCCCAA-ACTGAAGAAT--TTTTTTTCATTTATCATAGCATATAT-ATTGTATAACACGCATA
>CG7918 3911455 3912767|4008 chr3R 3912429 3912838 scaffold_29 914570 915117 - 1308|0 458
GTTTTGTTTGAATATTCATGAGTGTAGAGCATACGAAGATACATACATATAGCTACATAGATGTCAATTTTT-GCGCAAGCCAGCAACTTATACTTATACGGATATATAGACGTCTCC-------------TTAGCGCCTTTGCCAAGTTGCCTAACTGAGTTCACTCT-------------------------------------------CATTCTGAAAATCTTTGTTCTCGGTTGAAGTACTTTGTTATTTGTTAACCGTTTCGTTA----------------------------GCCGATTCGATTCGTTTTCCAGTGAG---------------TAATGTGCTAAACAA-GTTTTTGCTTTTGTTGAACGTTTCCATT----TAGCACGTAAGTGATAAGTGTAACAATAACTAAAATTATTACTAAATAA---------------ATAAATG
GCTCTATATAAATATACACACACA-----CACACACACACATATATATATATCTAAATATATTTGTATTATAAGTGGAAAAGAGTTATATATAGATATATATATATATATATATATATATATATATTATATTTCGCGTCTATGCCGAGCTGCCTGAATTAGTTGACTTTGTTACACTTAACACATACGTATTAATTAATATATTATATTATATATTATAAAAAACT--GTTATTTGTTTAAATATGTCTCGAAATGTTAACATATTGATTATTGTCACTTTAGTCCATGCCAAGTCCATGCCTAATTGGTTTGATTTTCGTTTAAATTTAACTCAACTCTTCATTTACCTTCCAACATAATTAGTTAGCTTAAGCATTTCGTTTGTCTTAGTCCCTAAGTGAAGCATGTTACAATAACTACAGCATTAAATAAATAAAACATTTATGTCAGCAGAAAGC
>CG7910 3915156 3915290|4012 chr3R 3914354 3915361 scaffold_29 918295 919291 - 24016|837 975
AACACCAAGCGAGGATCGGGGGTACCTGCTCAGTTTTC----CATTTAAGGTTAAAGGTTAAATTTTGTTTAAAGTGCTAATATAGTTGTGAAGATTAAAGTGAACTTCGTTTAATAAATGACCACCAATATTTGTTTA
CAGCCCGAGCTCGCA----------ATAATCAATTTCCTAGACAATTAAGTATAACGGTTAGCTTAGGTAACGGGTCACAA--------------------------------AATAAATGAACAAC--TCGTCATTTA
>puc 3947058 3948023|4044 chr3R 3946202 3947427 scaffold_29 937400 938705 - 32661|993 1377
G--ATAAGGTGCCTGCGGAAAGCCGCCGTCAAGTAGCAGCAGTGAAAAGAAAGAAA-----ATGTGCACCCAATTGCCGCATTCTTTATGATCAAAACTAAAATTGATAAAGCTGTACGTTTTTCGAAGACTAGTAGA------AAATGATCAAGTT-TTGATGTATTTTATAACTACTTGTTTACTGAAACTAAGGA-ATTTTTTACCTGGCTGAAAAAATTTAGATTTTATTAAGTCAGAAACGGCGAGAGGGCTGATACTTCCTATTAAACAAGGTGATGCTAAATGGTTTCTGAAGCCACCTCTGCAACGTGTAAATAAAAACGTTCAATATCTGTACATACAAACGTACCTAAAACAAAACACAAGGGAAAGAAATACCA
TCCATCAGGCG-----GAGGCGCCACCGCCGGCCCTTAGCTGTGAATAAAATAAAACTTATGTGTACATTTAAGTGATGCGAAATTTG-----AATGTTTCTATAGAGAACACTGGATTGATTGAAAGGATAGATTGATTGATTGATTGATCGCTTGATTGATCGATCGATTGATTGACTGTTTGATGTGAGCGTGTATATTTTGTACCT--------AAATATG---TTTACCCATCCAAAATTGGGGCAA--------AATTC--ATTGAGCATA--------AAACGGAATATATAGTCTAATTTGTAATTTGTAAATC------TTTTGTA-ATGTATTTTAGAGCACAGCAAAAGAGAAAAACAAAAAAAAAAAAAAACA
>puc 3947058 3948023|4045 chr3R 3947451 3952953 scaffold_29 938729 944418 - 135677|0 755
GCAATACCTTTTAAGAGCTTTTGTAATGTATTTCCTTTTCGCCCCTGAACCAACCAACCACAAAGCGAAAACCACTAAAATAATCCAAAACAAGCAACTGG-AGAAATTGTTTAAGAGAAAGAAAACCTCGTACATGTTAATTTAGTTTAAATTTAGTTGTAAGCGATTCTTAACT-TACCTACCTACATATATATACACACGTAAAC----------------TATATTAAACTTCACATAGAACAATGAAATCCAAAAT-GCACTGCAACTATTTCTGCTGACTTGCCACACAA-------------ATCGAAC-----CCAACCCAATTCCCCCAACAATATTATAAACCCCGCCATATGCAC-AGCAAAGATCTTATCAAAACTGTTCTAAGTTTTATCAATCCGCTAT------------------------------------------------AGCCACTCT------AATAGTTTAGTTACTT----------------------CTTGAAAGTGAAAAAA------------------GTTTGTGTTTT-CTAGTTTTAATTATTTATATGAA---------------------------GCGAGTGTGTGAGAGGATTATG----------ATTCATTTCGTATTAGATCGTAAGTCTATT--AAGCTAAG---CTACACCTGAGCAGTGTAACGCGAATGCTAAGTAAAAGGAAATTATAAT--AGTAACCAAA------CCAA
GCAAGAAAAATAGAAAACTTT-----------------------------------------AAACGAAAAGCATCAACTTATTAAATCTTGTGCTGCTATTATAAATTGTTTAA--------AAACCTCGTAATGTTTAATTTAGTATAATTT--ATGATAAGCCAATCTTAACTATACATATTAAAAAAAAAAAACAAAAAAAGAAACAGAATAATCATATGCATATAAAAAAAAAAAAATAACAATGAACTTTACAATCGCACTGCAAATATTTCTGCTCACTTGCCACAGAACGAAATACCCTGTACCGAAAATTTACAAATCCAAATC----AACAAT--TATAAAG------ATGCGTACTATCTACTATATTATCAAAACTGTTCTAAGTTTTATGCGACTTCTGTTCCCAGACACACACACACACACACACACACACACACACACATACACTCAGTCACACTTTTGAAACTTATTATATTACTTATATGTATTGTATATTTTAACTTTTTAAAGTGAGCAAGCAACATTGTTTGGTTTGTGTTTGTGTTTTACTAGTTTTAGTTATTTATAAAAACAGATGATCGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGGGAGCGAGAGAGTTGTATGCAATCTGAATTCATTTGGT-TTAGTTTTTAAGCATATTTTAATTTAAGGCTCTACACCCAAAAAGTGTAACACG----TTAAGTAAATAGAAAACATAAACAAGTAACCAAAAAAATATCAA
>CG7891 3954333 3954568|4046 chr3R 3953491 3954433 scaffold_29 944608 945630 - 31729|910 1048
ATAA----CGAACACCGACATACACACAACTCCGTACCCTCTACACTCACACAC----------------------------TTAGGCACTATATCTCACACATATT------TTAATTTTATTGTTTTTGTATTCATT
ATTATAGCCTAACACACACACACACACACACACACACACAAAACACAAACACACACACATTCACATTCAGATATAAACAAATTTATGCACTCTCTCGCATACACATTGAACAACTAACTTAATTTGCAGTATATTAATT
>CG7891 3954333 3954568|4047 chr3R 3954434 3954884 scaffold_10 2968890 2969235 + -1182|0 134
ATATATTTTACATTTCGCTTATATGCTTCGATGCGGATTATTTTCAACTGGAATTTTTGCTTAGCGAAAACTGGAATGCGAAAGCAGCGGAAAAGCATAAATTATAAAGACGTTTTAAACTATAAATATATATTA
AGTTTTTCTATTGAACTCTCATACGCTTAAATTGGTTTTCATTTCATTTTGTTGTTTT------------------------AGAAGCTGAAAACTAAATACTATA------TTATTTTTTATATGTATATGTAT
>CG18249 4047588 4047889|4169 chr3R 4045825 4047667 scaffold_29 1050375 1052270 - 28203|1839 1946
GCCTG------------------GTCGACACTTTGGCTTACTCGCTTATCCTTTCTCCGTTT----------CTCAAAACAGCAAAGCTCCAGTGAATAGACGTGAGA
ATTGGCGTTTGAAATTTTTTTGTTTTATTATTTTTTCTTTTTTGTTTTGTTTTTTTTTGTTTCCACTTTTGCCCCCATCCAACAGAGCTCAAGTGATTAAATGTGAGA
>DNApol-iota 4062266 4062528|4188 chr3R 4059967 4062430 scaffold_29 1065173 1067650 - 109700|2350 2521
TGCAGTGTATCCGAGCATCACATCGTTTTTAGTTATAATGG--TAAAGAGAATAAATTTGTTTAAATATATGA-----TATATTTTTGTAGGTATACGGTTACAGAGTGCATGCTTTAGGGTGCCGCATTGGACGAACATAAGCTAGGATAAATAACTAGTGGGTTTCTTGA
TGTCGTGTAGATGCGTTCAACGCAAATTCTGCCTATTTTAGATTAAAAACGATCAG--TGTTTGCATATATAATACTTTATATTTTTATAGGTTTGTGGTATTAGCATGTATG---------------TTAAATGTAAATGTCTATTGATGAGCTGCTGATGAAATTCCCAA
>CG33722 4071372 4071907|4195 chr3R 4069935 4071422 scaffold_22 500133 501630 + 61318|1458 1509
TAGATACATACATACAGTCTGTGTGATATTAAATGAA-TCCGCTTTATTTCT
TAGATTTTAGCGAACACTTTGCGTGATAATAAATAACTTTCGCTTTTTTTAT
>CG33722 4071372 4071907|4196 chr3R 4071447 4072093 scaffold_22 1455360 1455976 - 2305|0 474
TTATATAAAATGAGAATTGTCGTTATATTCTTTATCAAATGAAACTGGAAAACTGACAGTAATACGCTGAGCCAGGCTTTAACATGTTCTTTTTTTTTTTAAACATGTGTTAGAC------AAAAATCCACTATCGCATAACAATCATGAGCTGGCAGTGATAAAGCATTGCTAATTTAATTAGACCGCGACAAATTTCTTA-----TTGTCAATGTTATCATTACCATGTTGTAAATTCAT--TTGCCAATACATCTCAAAAGTGAAATGTACATCTTAAAAAAATTAACGTTTATTGGCT-TTCTGAGTGCTTGTTTTATTAACTGCCAAGGATTTGTCAATTCGAACCCAAAGAAATCTTATGCTGCCTCAACAATGGAACTGATGAAACTCCTAGAGGTGGAGGATGAACTGGTAGACAATTTAAAGGGCTATGTGAAAACACTGAAAATGAAATTCAATTTAATGGAAAG
TTATCGAAACATCGAATAG-CGTCGAATCGCTTATCAATTG-----GGGAAGCGAATAATAACAACAAGCGGCAG----CACGATGTACTCTTGTTTGGTAAACGTTCGGTAAACGTTCTAAACGATCTACGAGTATTTTTAAGTATTTATCTCGCGC--------CAACGTCAACTT--------CACGGCAAATGTGCGAAAAAGTTGACA--GTTGGAATTGGCACGTAGGCACCTCAAGATGGCCAA--------AGAAATGCACTCGCCGGCATGGACGATCCGAATTCTATCCGCCCTTCTGGTCGTGGGCATGGCCAGTGGCCAAGAAGCGGATGG--CGAACAGAG-------TCATTCCACCTCGGTTGCGGGAATGGTGCAACTGCTGCAGCTGGAGGACAAACTCATTGAGAATCTCAGCAACTATGCGAATGAACTCGAAGGGAAGCTCAATATAGTGCGCAG
>CG33722 4071965 4072122|4196 chr3R 4071447 4072093 scaffold_22 1455360 1455976 - 2305|534 664
ATCCCT-AATAGATATGAGTAGAGAG-AACATGGAAATGAAGAGTGATTATGAATCGTACTTGGGAAATCCGTTGAACAGCTTTCGACTAATACATCGCCTACACACGAGTTGGAGAAAATGGTATCAATA
TTTGTTGAACAAATGCGGGCTGAGAGCAACAAGGCCATGA---GCCACACAGAACATTATGTGTCCAATCCGCTGAATGCATTTTCCCTTATACGACGCATGCACGAGGACTGGACACACTGGCAGCTGTA
>CG33722 4071965 4072122|4197 chr3R 4072094 4072644 scaffold_22 1557099 1557630 - 1310|0 30
TGCCATTAAGGTCGAGAA--TAATGCTTTAG
AGTGAAACAATTGGAAAAGGTAGTAAATGAT
>CG33722 4072177 4072330|4197 chr3R 4072094 4072644 scaffold_22 1557099 1557630 - 1310|85 238
GGCACATTGAAAATGCCCGACTGATGAGAAAGATGCTACCAACCTCGTCGGATTTGCAGCAGGCGTGTCGCGGAATCCATGACTTGATGTACTTTTACGATTTGAAGCCAGAAGAACTGGCAGCTGGTAACTTAGCAGGGTACTCGCAGCCAGG
AACATTTGGCATATGCGCATGAAATGCGCTCAGAACTACCCACAGCTTTCGATCTTCAGGAGGCCAGTCGCAGTATCGAGCTCCTAATTACGTATTATGAACTGAATCCCAACGAATTGGCAAGCGGCAAGCTATTAGGATATTCCCAGCCAGG
>CG33722 4072393 4073050|4197 chr3R 4072094 4072644 scaffold_22 1557099 1557630 - 1310|307 584
AACAGGACTGACAGCTTACGATTGTTTAGCCCTTGGCGAGTTTGGCGTCCAAAATCAAAAGGATGATCTT---GCCGAGGCTTGGTATAACCTTTCTTTGACTCGTTTTGATAATATAATCGAA----AAATACCAAGTGCACAAGGCATGGGCACTTCTCCTGGCGAAGAATAAGCAACTTACTGAAGCCTTTCAACATTTCGAGAACAAGCCTGAGGGAATAGTCGCCAGTAATG-------------------AAGTTATACACTTTGAGGGTGT
AGCTGCTTTATCGGCAATGGATTGTTACGCCTTGGGAATGTT---CAACTATTTCCAGAAGGAATATACGAAAGCTGAAATTTGGTTAAA--------TGCCTCGCTTTTGAAATACGACTCAAGTCAAGAGGCCAAGTACA----------GTATCTTCATTAATGAAAAA--AGCATCCATAAGTGGTTGGGTATCCTTTCGATTAAACGC---AGGGAGAACTCTTTAGGAATGTGGCATATAAACCAAGCAAAAACTGAACACTACGACGGAAT
>CG33722 4072393 4073050|4198 chr3R 4072645 4073120 scaffold_22 1456836 1457354 - 4415|0 460
GTTGGCGACTACGCAAAACTGCACTGCTGTGGTCCAAAAACCAAGTAAA---AAACTCCACTGTCGCTACAACACCTCCACGACTCCCTTCACGCGGATTGCCCCTCTAAAAATGGAGGAGCTGGGCTTAGATCCGTACATGGTGGTCTTTCACGATGTGATTTACGACACCGAAATTGATGGGATGCTAAACTCGAGTG-----ATTTTGGATTATCCGAGTCTGTTTCTGGTCTGAAGTCTG------------------AGGTGAGAACGTCCAAGGACTCACATATAGTAGATGCT---AAAACACTC------------AATGAGCGCGTAACCGATATGACCGGACTCAGTATGGAGATGAGCGATCCATTTTCGCTGATTAATTACGGCTTAGGTGGGCACTTCATATTGCACCATGAC--TTTCA------------TGAATATACGAATACG
GTCGGCAACTATG---AACGTGGCTGCCGTGG-CCAATTCCCCACAAAGTCTAAGCTACACTGCGTCTACAATAGCACCAATTCCCCCTTTCTGAGGCTGGCCCCGTTGAAAACGGAATTGCTTGCACTGGACCCCTACATGGTACTCTATCACGATGTGATAACACCCAGCGAGATTCGCGAACTGCAATACCTAGCCGTTCCCACTCTGAAACGTGCCA--CGGTCTTTAATCAGAAGATGGGTCGTAATACTGTAGTCAAGACGCGCACCTCCAAGGTGACCTGGCTGACAGATTCTTTAAATCCACTCACGGTTCGTCTTAATAGACGCATTTCGGATATGACGGGATTTGATTTGTATGGCTCGGAGATGTTGCAGGTGATGAATTACGGCCTTGGCGGACATTACGACTTGCACTTTGATTATTTCAATGCCACCATTGTGAGTG-AAGAATACG
>CG33722 4073108 4073152|4198 chr3R 4072645 4073120 scaffold_22 1456836 1457354 - 4415|518 530
ACCAGGCTTAAGC
CAAAGGATTTGAC
>CG33722 4073108 4073152|4199 chr3R 4073121 4073574 scaffold_22 1459884 1460351 - 5845|0 31
AAGGGGATCGTATAGCTACTGTTTTGTTCTAC
AAGACGATCGCATCGCCACTGTTCTGTTTTAC
>CG33722 4073208 4073373|4199 chr3R 4073121 4073574 scaffold_22 1459884 1460351 - 5845|91 256
CTGAGAGAAGTTGACTCGGGTGGCGCCACAGTTTTCCCGATGCTTAATATTACGGTTATGCCCAAGAAGGGATCAGCGGTTTTCTGGTACAATCTTCACAACTCAGGAGCTGTAAATTCGAAAACTTTGCACACAGCTTGTCCAGTGATAAGCGGTTCGAAATACG
CTAACTGATGTGGAGCAAGGAGGCGCCACAGTGTTCACCATACTTAACCAGGCTGTCAGCCCTAAGCGCGGAACGGCTCTTTTCTGGTACAATTTGCATCGTAATGGCACAGGCGATACGAGAACCCTGCATGGCGGCTGTCCAGTTTTAGTGGGCTCCAAATGGA
>CG33722 4073431 4073578|4199 chr3R 4073121 4073574 scaffold_22 1459884 1460351 - 5845|336 487
TGCTCACGAAGTGGATAAACGAACTGCCGCAAATGTTTGTCACACCATGTATGAAAGACTCGAACCTACGCCCACCCCAAAAAGAATAATTCTGTAATCTGTAATGGAATTAAATTTAAA------TTAAATTTGTTTTCC--CTTTTCTGG
TAATGACCCTATGGATACGTGAGCGCATGCAACTGTTTACCAGGCCTTGTCTAAAAGAAACTACCTAGCTGAATAGCCAAGGCACTCAGTGCTCCAAATTGATTTGTATTCATATTCGGAACGCACATACATTTTTTGTCCGACTTTTCAGG
>CG7549 4085910 4086449|4217 chr3R 4084049 4086024 scaffold_22 514901 516773 + 71084|1937 2054
GCTTAACTAGGCCTATCCCAACGCTATCTGAGATCTAGGTTAAG---AGTTCACGATCGAGCGCCTCTGGTCGACTAGCCGTACGTAGTCAAGTCCTTTGCTAAAGTCAGCGGTTTTC
GCTAAGAC---CATATTTAGTTGCTATCTGAGATCTAGGTTAAGTTAAGTTCAAGATCGAGCGTCTCTGGTCGATTTGCCGTACATAGTCAA-TGTCTTGCGAAAGCCAACGGTTGTC
>Mcm2 4093544 4093653|4221 chr3R 4090825 4093665 scaffold_22 251014 253942 + 172002|2792 2931
GTT-TCAGCCATTTACTT------------------CATCTCATTTAGTTATAGT------ATTCATGTTTTGTTACCCCCATTT----TCGGTCTAATAAAGTTTGATATACTTATGTATGTATTTATACTA-AAATAG
ATTACCAAGAGTTTACCTGAACATATTCACGTTTTAAATCTCATTTAATTTTAGTCTCACCATACACGTTTTGTT--TCCCATTTTATGTATGTCCAATAAA----GATTTGGTTATGTATCTAACATTTTTATAGATAA
>ato 4104787 4104996|4232 chr3R 4102002 4105045 scaffold_13 3003984 3007325 - 80205|3253 3465
ATTCCCGGATCCCGATCCCAGTCCCAAGTACTATTCTCAGTTATTGTTGGAGCTTGCCAAATGTTGTAGCTACTTTGTATATATTGC---CTGGAGCCCAGTAGTGAATTACCGCTTAAGTATTATGCTGTTTATTGTTTAGTTAATTAGCCTAAATGGAAGACAATGATTAAGACTAAGGAAGACAAAATAAAAGCACCATTAATAATTTAA
G---CAGGATCGCAGCCAACACCCTA--------------------------TTTGCCAAATCTTGTACCTTTCCTGTATATATGTCAAACTAGAGCCCAGTAGTAAATTATTGCCTAAGTATTATGCTGTTTATTGTTTAGTCAATTAGTTTCAATTAAA------AATTAAG--------AGCCTGAATAAAAACA-----AACAACTTTA
>CG31463 4119240 4119331|4245 chr3R 4117917 4121017 scaffold_13 3021261 3024474 - 69763|1371 1464
GCTT--TGGAATTTCACCCATTGATAAGGCAAAGTTTGATAATCGGCACAATAATGTCCAAATAAGAATAAATTGATCGTTGTGATTACAATAC
ACGTACTCGAAGAGTATCAATACATAGCTCACATTTATATAA-------------ATCAAAAGGAAAATAAATCTAACA-AAAAATATCTATGT
>mRpL1 4128410 4128493|4249 chr3R 4126485 4128455 scaffold_13 3030074 3032206 - 57705|2151 2198
-TTAAAACAGAAGCCTATGTATTTTTGTTGATGGAT-TGTTTGTGCAT
TTTAAAATATTGTTGTCTTTTTTAATGCTAATGGATCCATTTGTGCAT
>mRpL1 4128410 4128493|4250 chr3R 4128486 4129528 scaffold_13 3032540 3033585 - 53320|0 7
ACAGTCTA
ACATAATA
>CG11698 4138755 4138819|4259 chr3R 4136959 4139786 scaffold_15 668403 671352 - 68754|1895 1994
GTTTCT-TGTTTGTT-----------------------ATGGCAATAATCATATTTA-TATTTTATAAAATACAA----------TAAATAAGAACATAT
GTTTATATATTTTCTTTACATTTATACGAGTAACATAAATGCAGATAAGAGTTTTTACTGATGTGTTAAACACAAAGCGAATCCATAAATATCAGCACAA
>eIF4AIII 4140436 4140589|4261 chr3R 4140431 4142112 scaffold_15 671997 673714 - 58943|5 172
ACTAATATTCTATCATTACTTTTATGTAACGCACTTTTCCTAGCCGTAACAACAAACGA----------ATGAAGTAAATACATTTGAAGAGTATTTGAATTTCAATAGACAA---CCAAAATCTGTATA-ATAATAATAAATAACACGTAAGAATTTAATACAGAAA
TTT---------TCATTTCTACTAACTAGTTTATTTCACTTATGTACAACTTCAACCAATTTCTCTTAGCTGAAAAGAATACACATGAAGAGTATTTGTCTTACAACACACAAACGTCATAATCTGTATTTGTAATTAAAACTAACGATTAAGCATT-AATACAGAAA
>Ctr1B 4144625 4145285|4264 chr3R 4144002 4147105 scaffold_15 675864 678660 - 80538|635 1375
ATCAAGAATATC--GCTCTTAATTGTTTATATATCT---------------TGCAATTGTTATAAACTAAGCCCTTATCAGTTCTTGGTT-------------CACACATCAAA---GAAAAAGT------------CCCGTCCCCACGTAATTAT----------------ACAAATTGTTTAAAAATA----CAATTTTATTCGATAGTTACACTT--GGTTTAATTGTTATTGATGTAATCGTAGCATAAATTAGTCAACTAGT--TTACTTAATGAGCATATTGTACAAATAGTGTAGTCATGAGAACAAGAACCTAT-----ACAACGCGTATTCATCTAAAGCGATTAAAGTACTACTCAATACTTTTGACTTTACAATATGTTTTTATAAGCAATACACTTTATTTTTGACCACCCCGAACTCAAAACGCAAACAATCCGATATGAGACAAAAAAGAAGGCAAAGTTAAATCTCCAGGATTACATGAAATTCGTTATGAAATGCGAACATTACCAGGTCTGAGTCCTG-ACAGCCCACAACTCACATTTGAAGGCCTAACTAATCACGATACTCACCTATCACACAATAGTACATATTTTAGTTTAGTTAAGATCTTGAAAAATCTTTTTAACAAATATTTTAGCTGTGAT----ACATCTGGGCAGGTAATATAACTAAGCAAACCTTATGATTATGTGAATCATCTCGCACACATTTTTT-TACGACACTTT
ACAAACTATATTCAGCTAAGGCTCACATATATATTTACACCACAATATGTATGTATAAATTTTAAAATAAGCCTGCAACTAGTATTTTTTTTAAGGAAGGCGCCACGCCTTCAGTCCGAGCATGTTTCTTGTCAGCCCCCTTTACCGCATAGTTATTATAAAAGTGGCATTGATAATTTGCTTGAAAAAGAAACCAATTTTATTT-----TTAAAATTTCGTTTTGAATTTTAT------------GGCATAAATTAGTCAACTAGTATTTACTTAAAGAGCATAATGTACAAATAAT-----TATGAGAACAAGAACCTAGGTTTAATAAAGTTTATACATTT--------TATAACACAACTCAATACTTT--ATTTT------TGCTTTTTTAACAATTAAA-------------------------AAGTTGCCTATAATT--------GTAAAAAAAAAAATGAAAAGAAAATCTCCAAAATTACATCAAATTCGTTT----AAGCAGAGAGCTCCATGGCGCACACCTGTACTACACCTAGCAATTATTTTAA-----AATCATTTAGACCCTTTGCCCAATGTCTAACTAAACCCTATTTAGTC-AATTCTTATGTGGGAG----TTGTTAG------TTTTACGTGCGAGCTGGACATTGGCGTACGGACCTTAG---AGTAAGCCTTAC-ACTAAGTATAT--TCTCGTATATGTATCATATATGATTATGT
>CG7443 4150624 4150764|4267 chr3R 4149490 4150671 scaffold_15 679393 680450 - 4903|1188 1235
ATTATCTTATCCTTACCCACACCTTATAACACCTCTCTAACACTAGCT
ACAGCTGCAGCCCCAGCAACAGCTCCTGACACAGCTCCAGCCGCAGCT
>Arf84F 4167573 4167608|4285 chr3R 4166145 4169175 scaffold_15 697183 700286 - 115584|1513 1548
ATACAATTTATTTTACTTCCTTATTTCTCGACCAAG
ATACATGGCA----ACGGC--TATTTCTCAAGCAAA
>CG18193 4169871 4170040|4286 chr3R 4169267 4169988 scaffold_15 700660 701360 - 5244|641 787
AATCAACAGAGATCATGCAAGCAAGCCCACAAAACA-------------------CAAATACTCTGTACACGAATGCAAATACCAATTGTA-ACGACACATACATTAGTTAACT---------AGTAACGTTTCTGTACATAGGTAG
GCT-ACTAGATTATGTTCAATTATGGCTGCCTAAAATCAGATGGACTTAAGCAGCCATTCAATTCTTATATAATTGCATATAATAATTATATACTTAGTACACGTTGATGAAGCTCAACATGAGGTAATGTTACTGT---TTAGTAA
>CG18193 4169871 4170040|4287 chr3R 4169989 4170726 scaffold_15 753931 754706 - -701|0 63
TTCAAATACGGAAAATCAATTATA----------TAATAATAATAATGTGCT--TTACTTCAAA
TTCCACTGCCTAAAATCATTTTTAGTTCGGATTGTTTCAATAGTTGTGCATTGCTTGCTGTTAA
>DppIII 4173077 4173190|4289 chr3R 4171123 4174904 scaffold_15 755186 758973 - 126455|2007 2120
GAACATTTCGCATTTAACATTTTCGCCTTCATTATCAATTCAATTTGTTAACTATGATTTTGAAAAAAAATATATAAAAATATATATAGTCATCTAATGACCAACAATTTTAAA
--------CACGGCTGAAAATTGCATATACAT--------------------GTTGACTCTGAAAATATATAT-TAAATATCTTTATACACTTTTTATTGCCA--------AAC
>CG7331 4177428 4178539|4291 chr3R 4176956 4177431 scaffold_15 761321 761796 - 19726|499 502
GCGG
ACAG
>CG7331 4177428 4178539|4292 chr3R 4177869 4178541 scaffold_2 4800911 4801587 - 1359|0 740
TACCCACTATGTAAATACAATATATATATATATATATATATA--------------GGCTTTTGTAGGCTCTAGGACGATGGAAGATGTATATACATAGGAATTGGAGAGCTCATGTCACGTTTCAAAGTTTCCGATGCAGCAGTTTAGACCCTAGACACAAATACATACATAAGCAAGTGACCCATGCAAATGCATATAGATGGCTATAT-------AGCTTGTGCATATGGTAGTAAGTTGGGCGTACTCGTCGCCTGTTTGTTTGTTTGTTTCTTTGTTCAAGTGCCTTTCGCCTGCTTGTGAGTGAAAAAATCATGTATGTACATAAATAACTATAGATAACAGCAATTAATCAGAAAGCCAAAAGGTTTATTTCTGCCGGAAGTCAGCAAGTAAGAACTGTTCGATCTATGC-------AAATGCATATCCACTAATCGA--------AAGACTTGAAGCATAACGAAATATATCTATCCTAACTTAGTTGGCACTGT-CAGGAAGTTGAAGAGAGCAGCTAGTGTTTTGTTTTGTCTTTAATCGTTGGTCGCTC-------TTGCTTAT-TTATTTGGTTTACAAT-TGCAAAAT-----------------TATGAATATGAGAATCGAAATTCGAGTATACATTAAAAAAA----CACTAAACGATAAGAGTAAGAACATTTATACGTACATATAAACAATGAATAAAAGCAATT---GTTAATCAAGACACT
TATATACTATATATATATACTATATATATATATATATATATATATATATTATAATTAGATCATGTAAGCCCAGTGTCTA-GTAGCAGGCTGAAGAGTGAGAATTTCAACACATACA-CAAATTTCAAA-TTTTAAATACCGCAAAACAAAAC---AAAAAAAATATATATATA-----------TATATATATACATATATGTACATATATTTACCAGAGAAAATGCAGATCGAAAGATTTCGAGCAA------CAATTGTTT-----------------TCCAAGCATAAATCAC--------------AAAACCTATGCATATAAACAAATAGCTTTAAATAACAATAACAAAGAAAAAAGGGAAAAAG-----------AAGAAAATAGAGAACAAGAAATATT-GTTGAATGCGCATTCTAAATACATATTGAACATTCAATCTGTGGCAATATTTGTACGCTTAGCTGATAAATCGTTTTTCATATATTTGTATTTGTATTCGTATTTGTATTGTACTTTTAGTGCTTAAATTTAATTTTGTAATTTGTATGCACAATTGAAATGCTTTTGTTGTTTGCTGAAGAACGTGCGAAATATCAGAGGCCAACATGAAATGAAATTGAACAGTAAGGAATTAATGTGAATCAAAAACAAATTAACTAAATGACAACTTTGTAGACTATTTAACAAACCCAACAACAATGAACAATAATAATTATAGTTATATGAGAAATT
>stck 4185449 4185745|4302 chr3R 4184318 4185729 scaffold_42 408414 409910 - 63542|1155 1532
T------------GCCTTGGA---GCGAGTCT---------CAGATCCACACCAA-------------ACAGTGCCTT-TGTCGTTGTAGAC------CCGCT---TTCACTA-----------CCATTTTTAACATTTGA----GAAACTAAAACCAAACAAACTAAAACCTCTTGTGCATGTCCTTTCCG--------TCTGTTGTAATCCGGTT----------GTGTGTA-------------ACTTAAATTTTAAATCGAGA----ATCAACGGCATCAATAGCTAGGGAACATAACATTGTGTATTAAAAGCCTTTAACGTTGTTATTTAATGGAATTTTATTTATATATAAATGTTTTTAAAATTATAAAA
TGGATGAGCTGCAGCCTCGAACTGGCCAGCCTTCCATCACACAAATCTACACCAAAACGTGTTAAGTCAAAGTGCCTTCTGTCGTTCAGCACAAACGACCGCTTAGTTCTCTGTTTGTAGTTGTCCACTTCTAACATTCGATGTTAATTCTCGAAACTAAAAACTTGTGCCTTTCTTCACATTTCTGTAACATTGTAATTTTTGTTGTACTGTATTTCTAAACAAAAGCGTGTATTGTCTTGATAATGCTTATCTTTTAATTGTAGCTGTTAACAACGGCAAGCATAAC-----AAAACAAATTATTGTATTGACAGC---------TGTTATCTAATTGAATTTTATTTATATAC--ATGTTTTTAAAATAAAAAAA
>stck 4185449 4185745|4303 chr3R 4185730 4186236 scaffold_20 1283242 1283716 - 4611|0 15
CGTAATGCTTATTCGC
A--AATATTAATTCAA
>CG11737 4346881 4347103|4497 chr3R 4345315 4346886 scaffold_3 4998768 5000359 + 60525|1601 1606
GCCAGC
GCTAAC
>CG31259 4351771 4351846|4501 chr3R 4350449 4351948 scaffold_3 5001770 5003354 + 42514|1385 1460
ATGGGTTTCCCCCATAACTTCGCATACCTACTGTACAGTAAAAAAAAAAAACAGAAACAATAAATGTGTAACACAA
ATGG----------CAACTCCAAATA-ATAATTTTTAGTAAACAAATATTTAAATTAAAATATATATATAATTGCC
>CG11753 4479464 4479576|4652 chr3R 4478843 4480123 scaffold_17 619135 620340 - 35748|624 739
CTCGAAGCCACCAACTTGTGATGCCTGCTACC---CCCCCAACCAAGCCACCCAAAGCAGCTTCTGTGTACATGTAATTTATTGTTAAACTAGCGTAAGATTACATAGCATATAAA
GT-GAACCCACAGATAGATAAACCATGTGATTGTGATGCTAACCAAGCCACCC-AATTACTCTAAACATACTTTTAATTTATTGTACAAC--------AATTTAAGTATATATAAA
>CG8032 4492819 4493076|4658 chr3R 4491129 4493526 scaffold_17 631878 634479 - 98094|1737 2052
GTCTAAGCTAATCAACGACCAC-TCATCGATTTTGTATTATAATTTATTAACGTTA----------------TTTTGTACACTCTTT-----------AAACGCTTTTTAGCTAGTGATATTTAATTTGTTCGATTGTAATTTATTTTGCTAG---CGTCGTAAAACGATTTAACTC------ATTTTTGTACATCCCTTG---TGAGCATTTGTTTTATTT-------TGTTGATGCAATTATTTTGTAATTTATTT----GGAACCCGCTTGTACATTACTA--TAAATAAAAGTT-----ACGAATTAGCTGA
G-CCGAGCTGAGCAACGATAACAATTTCGTTTTTGTATTATAATTTATGTGCGTTACGTTTCTTATTAGCGCTTTTATTTATCGTTTCATTGCGTCTAAGCCACTTTTTAGCTAGTGATATCACGTTTTGTGTATTTTTCCTTTGTTTTTAAGTTCCATTGTGCATTTGTTTAATTATACAAGATTTTTGTTATTGCTTTTTTCTTATCAAATATCAAATTCCACACAGCATTCATTTATTTATTTTGTAAACAACTTCTAGAAAATCCGCCTGTAAAATATCAAGAAAATAAAACTTTACACATAAATATATAAT
>CG8036 4499278 4499453|4668 chr3R 4497394 4499282 scaffold_17 637128 639021 - 110976|1892 1896
GGGAC
GCAAC
>CG8036 4499278 4499453|4669 chr3R 4499330 4499642 scaffold_47 550411 550740 + 1653|0 148
AGTTACTACTTACTTCCAATA-TTACCATTCCCTCTAAGATTGTTAATTGCTTCA--------TTGATTTGAACCTTA---CATCA------TGGAAATAAAATATCTTT-----AATAAAAATAGTTAA--GCCGAACTATATACCTT
ATTCACAAACAACTTTCGATAATTGCCTTTCAATGAAGCATTTGTACCAGTCTAACATTTAACTTTATTTGAACCATAATACGTTACTTATTTAAAGATAAACTGTTTTTGTTTAAGTAGAAGTATTTGATTATCAACTGATTT---TT
>mRpL19 4500882 4500924|4670 chr3R 4499657 4501667 scaffold_15 1205158 1207154 + 78997|1265 1321
-------------TTGCATTTGTTGTTC-ATTTTTTAGAATAAAAATATCGAAAAAA
ATGCTATATGGCCCTGCATTTGTTATTCTAACTTGTAGTCTAATAAAACCAAAA---
>CG8043 4503883 4503955|4673 chr3R 4502831 4504488 scaffold_3 1070100 1071808 - 48489|1059 1131
CTTACGAACTGATTTGACCAAATATTGTTATCATACTATTGTTATAAGTGTAGTAAATGTATATAGTCCTCGT
CCTATTGA--AACTTGA--AAGTTTT----------TAATGTTAGA--TGTATTAATTGTATATATTCCTAGG
>CG8112 4540899 4540990|4706 chr3R 4539842 4541519 scaffold_15 1263177 1264878 + 70045|1058 1164
TCAATTAGTTAAAC-------------ACTACTTTTAAACTGTCTGTACACAGGGCGTACGCTTCGATTTGTATTTTAGGTAAATAAACTTAATG--AAATTAACAG
CAAAATATTGAATCGAATTTTAGTCTTAGTACTTGTAA----CTTGTACACATGGCGTACGT-----TTTGTATTTTAGGTAAATAAACTTAATGAAAAATTCGTTG
>CG8116 4543765 4543783|4709 chr3R 4543383 4548948 scaffold_15 1267754 1273240 + 70290|435 453
CAGTTGATAAGCCGCGTTG
CAGTTGGT---CAACGTTG
>CG11760 4545720 4547051|4709 chr3R 4543383 4548948 scaffold_15 1267754 1273240 + 70290|2719 4170
CCATATAGACAGAAACATCCAACAGCCAACTAGCAGCAAATATACATGCGAAAGTTTAGCAATCTATAAGATCGAAAAAGGATAATATGCGGTGTAAGGAAATTTAATGAATTTGAAAAGCAGTAGGCAGCTGAATTG-CTCATGGCCGTGGAGAAGAGAAACCAAACAGAAAGAAAAAAAAAACAAAACAAAACACATATGTAGCAT------------------ATTAATAATTATGTATAGTAAGGTTTATGATAACATACACACACTCTTATATACATATATTT------------AACGGTTTTATATAC---AAAAATTGTTAACATTTAAGCATCAATTGGAACCAATATAAGACAACAAGCAAAAC-CTAAAACTTGAATAATTTTCACAATTTTAAGATGAAAATTTTTTTGTAAAAAGAA-AAATATCGAAAAACAGCCGAAAAA---CAAATTTGATGTGTGGAAATAATAATTTATAATAGTTCACAGATAGCTCGAATCTTAA-----------AAAGAATTGTAAAAAAA--------TCAGTGGAATGTCTCACAAAATCTAGT---CAGCATCAAAATCATGAAA-------AACAAATGGCCGAAAGGCCATTAAAAAAATTCATTACCACTAAGAGTCAGCGTTTAGTAGTTCATACCAATATTCAAAAGGCGGAGAACAACATAATTAAGCCCAGTTAAAAGTCTAGACCATGTGTGTACTTTAATGAAACTACTTTATATAAACCTAGCAAATAGCGTAAATAACATTTTCAAGACGTCACTAAAAACAATGCAAACCCGAGCGGGCAACCGTTTACTAGAAAGCGAACAACAAATTAGCTAAATCATATA--AAACATTTATAGAGTGTTAAAAACTAGGCGAAAACCCTCCATTACACTTCTCCCCAATTCAGCCTATTGGCAACTCGAAACGCCCTTTAAATCACGCTCAATTATCCCCGCCTGATAGGATCCGAGGATTGCAGCTCCTCCAATGCTAGTCACTAATGTTCACAAACATTTTCTAAGCTAGACCGAAGATTGTGTAATAATTTGATAAGACCTTTGTGTGGTTTCATAGCAAAATAACGCACAAATCGATAACAAAAACTCTCAACAGTCCAC---AAATCTCATGCTTTTAAAACAAAAGAAATAATTTTACTGAAACCAAACAGCTGGAAGCTAGAAGCTGAAAGAAAACCAAAGCCACATCCTACGTTGAATAATTTACCTGTATAATATT----------TATGTCATTTCGTT--AAACGCAAAATGTTAACAT-ACTTTTAAAGCGCG--------------------TGTAAAACG-------------GATAGTTAATAAAATAACGACAACAATATTTAAAAGAACATATACACTCGATGAAAATGAAT-ATTAAAGATCGAAAAAAAGA
TAACAT--------ACAAGCAACAGCCGCAAGACGAGACATTTACACAGTACTGCATATATATGTACTTAACAAAAAAACAA-----------GTAACACAGATTAGCAATATACAAA---------CAGATGAATTGAATTATG-----AGACATGAGAAATGAGATGGTCCGCAAGCCAACATATATACATATACATATATAACATATAGCATATAGTATATACATCTCTACTTGTGTATAGTAAGGTTGATGATAGCATACATATATGTGTATATATATACATATACATTTACTTAAAACGGTTTTATATACGAGAATAATTGTTAACATTTAAGCATCAATTGGAACCAATACAACAAGACAGCCAAAAAGCTCGAACTTGATTAATTTTCACATTTGTAAGAC--AATGTTTTTTGTACACATAAGAAATGTGACCATACGCCCAGGAGAATTCAAATTTAATATGTAAAAATTAC-ATAAATAAAA----AAAAAAAACTCGAGCCCTTAGGCATATTAGTAAATAATTAAAACAAAACAAAAATCCCAATGGAAAACATGTTATTGCCTAGTGAAGAAAAAGAAAACCGTGTAAATTCTGCAACAAGTTTACCCAACAATAATACAAAAAATAGTTAATACTTCAAGTAAAACCGTAACAAATACAATTAAAATAGAAAATTTCAAAACTGGC----CCACGGCAAGTTCAAA----AGGCAATGTGTGTACTTTAAAG-AACTACTTTATAAAAATCTAGTG--------------------------------AAAACCAGTGTAAATC----------AATGTTTAAGTAGTTGAGAATTGAAACTTAGATGAGTCACTTAACAACAATTTACAAAATG--------------------------------TATCCCCACC---------------CTCGAAA--TCCATTTAAACACATTGCAT------CTCATAAAAGTGT------------GCACACCAAATGCTAGTCAAT------------CTGTTTCT----------TAAGATCGT------------TGGGTCAACTTTGTGGTTGCTT------------CACGATT----------AACTCCTTCTAGTCAGAACGAAATCTCATGCTATTTATTGGTGCATCGCGAACCCATTAAATCAAAACCATTTAAATGTAA-----TAAGACACACCTAAACTA-ATCCTATGTTGGCAACTTTAATTGTATAATACTTATATATATATATATAATTTCTGTTAAAATGCAAAATGTTAACACAATTTTTAAAATGCGATAGTCGAACAACCAAAGGATATAACACAATTTAGTTATAACGAAAGGAAATTAAAAACAAAACACATTTTATGACAAATTATATACACTTGATGAAAATTACCAATTAAAGAACAAGAAAACAG
>CG8136 4548649 4548776|4709 chr3R 4543383 4548948 scaffold_15 1267754 1273240 + 70290|5869 6006
GACTTCCTTTATTCCTAACTCTTTCGACCCCAAATTCAGAAAGGTATTTTAC-ACTTGGCAATGGCCCTGGCCTCAGTAGTTCAAAACACTCAGTCAAATA--------AAACCGAAATTC-ATTTAGACATCCCAAT
GCCACCATCTGTTCCCAG-----------CCAAATTTCTAGTCATATTTCCCAAAATTTCAATTGTCTTTCAAGCATTGCATTAAAA-ACAAACTCAAATATACACACTATACCGGTGTTCTATGCAGTCAGTATGA-
>CG8145 4550399 4550450|4711 chr3R 4550397 4550901 scaffold_10 1966811 1967322 + -932|2 53
TACATCTCAAGATGCCATATGTTTTATCAATATACCAAAAAAAAAAAAAAAA
TAGATCCACCTTTGTTATATTGTTTTTTTATCTACGAGCTAAAAAAAAAAAT
>CG8159 4554039 4554092|4715 chr3R 4553738 4555026 scaffold_15 1278574 1279996 + 15079|311 389
ACCTTAATGAGTCCATC--TCAACCTTTAAAGC-CAAATATA---GTTCACAA-------------------TTTGATT
GATTTAATTAAATAAATAGTTTACTTGGATAGTGCAAATATATGCGGTCCCAACGAATTAATCAAAGGCAACTTTGATA
>CG8202 4561339 4561557|4720 chr3R 4557839 4562073 scaffold_15 1284381 1288630 + 142189|3580 3812
CAATCGAGCTTGTAAATCCTATGGTTATTT---ATTTGCTGAGATTATATATTCTTATGTGCATGAATCTTTTACGGATTCATAGCCCGGTTCTCTCCTACGTTTTTGCTTAACCTTGACGAGGAACCGACAAATTTTGTATTACATTTCTGTGCAATTAAA--AGTTATAA--CGTTTGTG-----GATATGAA--TAAAAATTTTACCATACCTACGTAGGTGATAAACGC
AA----------TAGCTGCCAGCGATAGCTGCCACTCATTGAGATTAACTATTCATAAG-GCGGAAATTGGT----GATTTGTCGCTGAAACGACTTCAAATTTGTTGTGCAATC--------AAATGGCTGAATTAAGACTTAAATATTTATACAGACAACCTACTTGCGAATTGCTTTTGACTGAGTTATGACCTTAAGAATTTAAATGAAACTTAGTTTGTGCTAGCTAT
>CG8223 4579522 4579832|4739 chr3R 4577766 4580202 scaffold_15 1309309 1311736 + 94510|1831 2183
GGG-------------AATCATTCCAGTTGCCCAGTGGCACACCAGCACCCACTCACAACCAAGCCCTTAAAATAC--ACCACACT----CATCGGCTACTTAAACCAACCCACACGCATTAAACACCATTCAACTGTCCTATACCTCGAACCTACATATTTA------TGCTACTTGTTT--GCTGTTTTCTACCAAAATTCTC--TGTAAGTCTGTAAGTTTACAATCACAATTAGTGCTAAGTGCGTACATAAAATAATGTTTT-GTA----TTAAAAGAAAAACTAAGTAGGAAGGCAAAAAGTGTACAC----AATAAATACGGGAGATTTCCCCCA----GAAAGTT
AAGTCGCTCGAAGACTGCACATTCCAGTTAAATA----CACACAAACACACACTCACACACGCACACCAACAACACCAGCAACACCAATACATCAGCTACTTAAAACT-CACACAAACATACGTATACACATGCTTATCCTATCCC---AATCTTCCTATTTAAGATTATGCTATTTGTTTTTGCTGTTTACTACAATCATTTTCACTATAAGTCTGTAAAATTACAATCACAACTAGTGCTAAGTGCTTACATAAAATAATGTTTTTATACTATTTAAAAGAGAAAACGGTATCGAGAGCAAAACGAATGAATCAATAATAATAAAAGCAAAATTGCCTCAAAACGAAAATT
>CG8236 4596745 4596878|4758 chr3R 4595416 4596998 scaffold_103 62879 64454 - 39918|1381 1516
GCCATTGATTGCCATTACGTTGATTAGTTAAATTCCCTGTTGTCTGAATATGAATGGTTGCAGTCAAATATAAATAAATTGTCCAATATGTTTAGAGAAATATAAACAAATATACATAACATAAAAT--GAAATAA
GCCGATCATTTTCATTAGATTTATGCAT--ATTTGAGCGTTATACAAA----ATCAGTTAAAATC--ATATAAATTAATAGTTTTGTGTTAGTTAAAAAATATATTTAAAT---CATATCAATACATGCGCACACA
>CG8351 4631742 4631958|4797 chr3R 4631529 4632039 scaffold_3 3776812 3777299 - -227|230 454
ATAGAATCATTCAGAAATCCAGA--GAACACTACACCCTAATCATCAAAACTCACTTGCATTTCTCTCCTAATTTAACACGTACACGTATTACTCGGTCATACCTTCGCATTTCGCACGCTTCGAAGCA---AGAACAACAGCAACAATAA--TCCACTGACC-TATCTGTATATGTTTAATAATAAAACACAAAATTGAAATTTGTATTTTCATAACATCAGAA
TAATAATGCTTAATATCTTAATACTTAATTTAACACACAAACCACCAAAAC------------------------AAAACACACGCACACCACACTACAAATGTCTAACATTTCGCCAGCTCCCTCACATACAAAATTATTGTTGCATTTGCTCTCATTAACAGTACACAAATATAAACGAAAATAAAACACGA----------TTTATTCATGTAATACCTTGA
>CG8359 4632906 4633303|4800 chr3R 4633182 4633496 scaffold_0 1620653 1620911 + 1119|0 121
TCTGTGTTTTGCGCAATGTATATATTATACGCTTACTTTTGTAATTTTTGATAATAATACAATAGTTGTAGAGTTATTTAAGACAATGAAAAAAACATTAAAAACAACATTAAATAATGTAT
TCTATGATTAGCAAAGTGCATA-ATTATTAACAAGCCCTA------TGTGAGAAAAATATAAGATTTTTATAA--------------GAGAAAAACTGTAAATATATTATTGTATA------
>CG8369 4648505 4648563|4816 chr3R 4647019 4649890 scaffold_3 499553 502287 + 45609|1620 1693
AAGTC-----CAATTTCAACACTTTTGACGATTAAACA------TCTTTCA---CTGATTGTGCAAT-AATATA
AAATTGCGAACAATTGCGAGCGTTT--ACAACTGAAAAAATCAATATCTAAAGTCTAATGGCACAATCAATAAA
>CG8379 4652820 4653007|4817 chr3R 4650276 4654373 scaffold_3 503883 508037 + 133017|2618 2881
TTTTGTAATTATATTTTAAATATTCAAATCTCTGGATGCGTAAACTCGATGTAATCTATAAGATTTAAAGTGCTTTGCGAGACTTTTATAGC---------TAAAACAGTGCACTTA-----AAGCAAAAACATAT---------TCTGTGCAAGTTT------------------------------TTTACACAAGTATACAAAATATA---------------TAAAT----ATTACGTGTATATAAAA----TCAAACCA
TTATATAATTATATCCTTAATTATTCAATCTCTGGAAGCATACACTCGATGTAATCTATAAGATTAAAAGTGCTTTTGCTAGCTTTTGTTACCTTTCGTTGTCGAGCAGTGCACTTATACATAAATATAAATATACATAATTATGTATGTGAAAAATTATACGTATATGGCTATCGCTACTATTTATCATTATAAATGTATTTTAAATATATTTCGTATATTTGTCTACATTTTCATTGATTGTGTTTTAAAATGTTGGGACTG
>osk 4763090 4764123|4939 chr3R 4762948 4764238 scaffold_3 626724 627973 + 16283|150 1244
GTTGGGTTCTTAATCAAGATACATATATGCAAATTTTGACTGGGCTGGCACCGGAACCGACAAAATAAGAACTTTTTGATGATTTTACGATT-----TACGCTGATGG-----ATCGCTGCTTTTACG---------GAATT-----CGCTTAGTTTTAATATGTTTTATATGTAGTATGTTCTCTGTCTTTGTTTATTTATATGTTCGTGCACTTGTCCTAGTCCATTATTGTATATTATTGTGTGTTTTGTGTTCTATGTTAGATTTAAACTTCTCAATTTTTCGCTGTCTGT-----GATTTGTTTTGCCAATGCCATTGATTTTCTGCACAC-TTTTTGCTGCTATCCCAAAAGCTGTGTAAAATAATCAAATGCAAAATAAGCGCAAGCAGCTGAAAACTTCTCTTCAAACTTTTCCGCTTTTCCCAAAACCATTTTGCTTTGAAATCTGTTTTTACCAAATCAGATTAAACTGCAAAATGGAACTTAAATGCAAATCATTGCAATGCTTATAAACTGTTTTTTGTTCTATATACTTTTGTGTGGGTCAAAATTCGGCATGCTCCTGTATCACACAACCTGCCACTTGCCCTTAAAAAGAAGGGCGCAGTGGGCGTGGTACGTATACATATGAGCCATGCTGCATTTTGGCCGTAATGAAAATGCA-CTGCTTTACTTGGAAAATTCGCTTGCACAAAATCAACGCCGCGGCTGATTTATTATTGATGTGCTCAAG-CAAATTCAAGTGAAGCATTTGCGCGATTTTCGTCTTTCTGTTTCCGTTTGCAAAAAAGTTTA-TAAAATGCTTACACTCTGCTGCAGACACGCCAACCGGAAGTGCGCACTAAG--CGCTTGTTTGTAGCACAGTGTAGAATTCTGGCGTAATTTACAGCTCTACTTTAAAGTCTTCTAGATAGCTATCTAC------------------TATTTATAAACTTATTTATTGTCTTGAATGTATGTTAATTGTATGTATTGATGGTGATCACGTTTTTTTTGT-------CCTATAACAAGCTGCAATGTAAAATCCAAAAAAAAA-ATGAAAAAATAAAATAAAAGGGAAATC
GCTGAGCT--------GGAC---TGGAGGAGGAGTGGTGCCGGTCTGGCACCAG----------GCACACGTTTTACAACTATTTCAAAATTGACGGCACGCTGTTTGCTCTAATTTTTGTTTTTAAGCCAAAAATTGAATTTGGAATGTTAATTTTTAATATGTTTTATGTGCGTTTCGTTCTGTGTTAGTCTTTA-------GTCCGTAATTCTATGTGATAAATATGTTACATGTTTGTATGTTCTATGTGTTCTTTGTGA---TTCCCCTACTCTATCTATCGCTTTCTATTGTAAAGTACATTTTGTT-ATATCTCGAATTTTGACCAATTGTTTTTGCTGCTATCCCAAAAGCATTGGCCAAAATTC----GTAATATAA-----------CAAAAACATTTTT------TTTTGTATTTTTCTCAAATATTTTTTCCTAGCA-------TTTTTCCAAGT--------GTTGCACGCACAGAGCTCAATGGAAATTG---------CTATAGACTGTGT----CCCAACTCTCTGTTTCTTATGCCAGCTTTGCCCATGCTCATGTAT---AAGAACTG--ATCTACTCT-----------GTGCATCAG----CGAATATATACATCTGAGCCATGTGCCAAGTTGG-TGTCATGAAAATGCATTTGCTTCACTTAT-AGCCTGGCTTGCACAAAATCAATACCGCGGTTGATT--TTATAAATGTGTTTAGGTCAATTTTAAGTGAAACAATTGCCTTATTTTCGTGTTTTCGTCTT---------GAAAGTTTATTTAAATTTGTACACTGTATATTTAGCACGTTCATAAG-TGTGCGCGCTGAGGCGGCGTGTTT-TCTTACAGTGTACTTTCCTAGAATGAGT----ACTCAAATAGTTGCCTTTGTACAAAGATATATACACAAATTCGTCACTATTATAATTATAAACTTATTTATTTTCTTGTATGTATGTTAAATGTATGTGATGAT-GTAACTTTTTTTTTTTTGTATGTCCAACCATAACAAGCT---ATGTAAAATCCAAAAAAAAATATGTAAAAATAAATGAAAACAAAAATT
>CG11963 4768557 4768750|4944 chr3R 4767125 4769142 scaffold_3 632746 634841 + 60536|1582 1781
AGGGATACAAATTTTGTAATAAACAATGCAGGATCGAGCCGGATGTGTTTGAGACTTACACCATCAAAAAGAAGGAAGCCATTGTTTAAATTCAAAATCCAAATTTGCCACAAAAGTTTCATTGTTCAAAATTTTAATCTCAAA---TTTCAGATGTAAACTTCTGAC--CCGCCACATTTTTAAAGAT-TTTCATAATA
ACGAATACCCTTAATCTGCCGATGGATACGG---------GGGCGTGCAAAAAATTTAAATTAATAAATTTAA-------CTTCTTTCATTTT----TCCAAAATTATCATATAA-TCAAAATTTTCTATATATTATAGGCAAATTCTTTAATATGATAACCGCCAACGGACGTTTAATTTATATTGTTATTTCATTATA
>CG11967 4808363 4808553|4993 chr3R 4807515 4809907 scaffold_15 1630192 1632574 - 98003|866 1158
-----------GCGAAACAT-----GCCAAGAGGACCAAATGGATT-----ATCTGTGATATGTG-------------GGCCTTATACCGCG-----------------------------------------------ATCGGCATTTACA-ATTTACCAATACTTAGGATTGTT----TTTCGTATTTATAAGTGTGTAATTGT----------------TTTTGTATATAAACTTAAGGCCTACAAAGGTTTAAACTTACAAATCTACGAAAAATCAACGAAGGAGATGG
TGCTGTAGCCTGCGGCCAATTCTCAGCCAGCGGTGCCT--TGGATTTATGTGTCTGTGATATGTGCAACACAATGTTGGGTCTTCTACAGTGTGCTTATAAATAGTTCTCCCCTACTGTTACTTGTTACTCGTATCAGAAGTGGCATTTACATATATATAAATATGTCCTATTGTTAGCATTTTGTATTTATAAATGTTTGTTTTTACATGTAATGTGTGTTTTTTGTATATAAACTTAAGGCCTA--GAGGTTTAAA-TTGTAAAGC-------------------------
>CG11970 4816121 4816371|4999 chr3R 4815146 4817058 scaffold_27 481215 483088 + 21637|1074 1363
GAGGCTCA---GGAGCGGAGAGGCTTGGT--AACCACGTTG----AATATCC----TTACCGGTTACACTTTCTTCGATTTTGTTTAAACA-------------ACACTTGTAATTTAT-CTATGTAAGCAGAAA---GATCGCAAATATTGCTTTGTACTAAGTAAATATAATGGACAACGATAAGATGTCCCATCCAGCAACCAATTTTATGGAACAGTTTA---------TAAAAAATAATATATATATATATATATACAGACCCAATAAAACTCAGATGAAACCAG
GTGGAGCACACATATGGCAGAGGCTTGTTAAAACTATGTTGTTTTCATATTCAGTTGTTTGGATTTAACTTTTATCATTTATATATATCTATATATAGTAGTTTACACATGTAATTTACGATTTTTAAGCAAAAAGTTGAACACAAATTTTGCTTCGT---------ATAATATGAGAATTGAAAAGTTGGGCAATGCA-----CAGCTTCATTAAACCTATTATGTTTATTTTGAAGAAAAAGACCTACACAGCTGTACATTAATATAATAACAGACAGACAAAA----
>CG11975 4820356 4820561|5001 chr3R 4819365 4820919 scaffold_27 485549 487023 + 57065|995 1211
AAACAAATCCGATTGTTGCGAACGCCTTTGATGCATCTATACAA------TTATATATCTCCATGGAAAT-GTGTTATACAATATTACTTATAAGCATGCTTTAAA-ATACGTTAAAAGTCGAGTTCACATAAA--TGTAGTTATACCTTGAGACATGATTGTGGATATTTTATATTTTATTTGAAACATAAACCGATAATCCAAC-ATGCTCATTT
AGTCGAA--CAATTACTG----------TGTGGCACCTATATAAGCATATTAATATATATACATGAAATTCGTGTTACACAATATTATATTTAAGCATGCTTTAAACCTACCTTA-----CAAGTTCACATAAAACTGTAGTTA-----------ACAATTGTAAATGTTACACAACTAATTTGACTC----GCCGTTCTTCTAGCTGGGATCGTTT
>CG11980 4830973 4831053|5009 chr3R 4828903 4831920 scaffold_27 495920 498997 + 86636|2302 2383
TATAATACGACTTAAAGTTATGCTTTTGAAATTGAAAAACAATAA-TTAGATCGCATTTAATTCTGGTGTTATTACGCATTT
---GACACGGCTTAAA---------------TCAATATACAATAAACTAGGTCA-------------TTTCCTTACAAATTT
>CG11982 4833579 4833761|5011 chr3R 4832432 4835911 scaffold_27 499757 503313 + 76559|1192 1501
CTGGTA----------------------GGGCGATGCTAAATC---GAAGTGGA-----------GCGATGATCGAT-TGATATTCAAAATT-AAGCC-------------------------AAATATTGGCCGC-ATATATATTTATAA--------------------------------------------------TAGTTTCTCCTCACGCTT-AATTTTGTTGTTGTTCAAAATAACGATTTGTAATAAACAAAACGGGACATACGATTCCGTTGGCTCTGCAAA------------AATCAA
TTCGTGAATGCATATTATGAATTAATCGGGACGAT--CGAATCTGGGAAGTGGATGGGATGGGATGGGATGCTAAACCTGATATTCAAAATTGAAGCCTATGCAGCTCAAGCGTTAGTACACAAAATCTAAACAGTTGCATATATTTATAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACAAAGAAAAAAAAGAATGTCTTAACAAAATCAATTACACACACGCTTTACTTTTGTTGTTATTCAAAGTACGGGCTGGTAA--------ACAATATTTGCAAATTTGTTATCATTTCACATTTGGCTAATGCAATAAA
>CG11986 4842444 4842544|5014 chr3R 4840082 4842490 scaffold_27 508169 510642 + 61356|2594 2668
ATGAAAT---------------------CGGGCAAAAGATAAA-------CCTCATCAGTAACTAAAGTTCCATA
GTAAAATGAACAGTTATATAGGTATTTACAAAAAAATTATAAGCTCTTCTCTTAATGAATATTTAAAGCTTTGTA
>CG11986 4842444 4842544|5015 chr3R 4842491 4842790 scaffold_27 514484 514822 + 2516|0 55
GTTTGTA--GTACATTAAGTTTATTTTCAGTAAAAACCAAAATTTTTATTCTCAAT
CTTTGTATAGTATTTAAAATTTATTTGCATTAAAAACCAAAAGATTTGTTCTCATT
>CG11990 4867664 4868076|5044 chr3R 4867963 4868120 scaffold_27 542554 542700 + 2662|0 113
TAGTTAAGATAAAGTTTTTCGTTCAAATTGTACAATGTAAACTACAAAACACAAACATCTGAGAGCAAGTATCCTTTGTATTTTTAGTGATAATAAACAGTTAAAAGCCATTCT
TAATTATGCTAAAAGTTT--GTTCAACTTGTACAATGTAATCTATGAAACTGAGCTA--AGAAACAATATATAATTTGTATAATTAGTTTTAATAAAAATATATAAGACGAATC
>Mst85C 4877471 4877957|5050 chr3R 4875326 4879488 scaffold_41 364194 368626 + 16389|2364 2891
CGATAGCCATATAAAACCCTAAACCATAAGCATTAAAGTGTAGATTTGTA-TGTCCGTAACCGTAAGAACCCAGTTGATAGCATGCAAGAATACTCCGCCTCCTTATTTTTTTATTACTATTGAAAATAGATAGATGTATGTGATTCAATCTGGAATGT-----TCCGGAATATTCGTTATTTGAAGCAAGTGAGTCGAGAACAGATAA--CTTTCGAGAGACGCAACGGCGGACGTCAAACGAACACCTGACTTAAGAAAAGTTTT-TCTAAGATGAACTAATTCATTTTACTT---TTTACATCAATTTATAAGCACT----------TTTTACAGTATAT-----------------GAGTTTCTGCAGTAAA--GTGGATCGAACGAGCTGAATCTACCATATTGTTTAAAATATACTTTACATTGCGTTTTTGGAATCGACCTTTCTTTGCTGGCTACTAAAATTAGAAAGATACGTATTTTTTGCAATTGATAAAGAATAAAGAATAAAACTGTAAGCAAAA
CTGTAAGTG------------------GAGGTTTGATGTGT--GTTTATAGTGTCCATAAGCA-AAAAGTAGAGTTAGCAGCAT-------------GTCTGTTTATAATTTGATTAATTTTACAA--AAATAATCATATGT-ATTCATACTTAAGTGTTTTCCTTTCATCTAATTAACATTAAAAATAA-TAAGTCAACATTATTTCATGTTTTTTTAAGGCGGCCTGGCAACCCTTACTCTG-----TTACTCAGTAACAGTTGTATTTAACAGGAGCAATAACAGTTAACGCTGATTGGCGCCTGTTAAAAACCACTAAAGTGATTATATTTAAGTATATAGCTTATTAATTTCCTGGAGCTATTGCCGTCACCTTTGGTTCGGCAGAAATGTGTCTAACGAATTGATGATA------------------TTTTATAATTCAGTTTTCT---------------GTTACAAAG------------TGCTGTTAAT--TGGATATGGGATCGTAATGTTAATGTAG
>CG11033 4887927 4888967|5060 chr3R 4886292 4887947 scaffold_41 375446 377215 + 70585|1772 1792
GCCACTGGCAGCTGGAGGAGG
ACACCGACCAGGTGACGAAAG
>CG8420 5077016 5077160|5309 chr3R 5076931 5077075 scaffold_3 6262910 6263038 + 6563|85 144
TATTCCAGTTGCAAATGGACAAGCGAGATCCGGACAAGAAAAGTAGAAGACGAAGGCTCA
------AGTTGTAGTTGCTCCAACTA-------ACAACATAACTTTTA-ACGAGTGCTCA
>CG8420 5077016 5077160|5310 chr3R 5077129 5077425 scaffold_20 746613 746967 + 784|0 31
CGGATTGAAATATATATTTAAATTTAAACAGA
CGAATTGCCACACAAACATCAATTAAACCCAC
>CG8436 5085973 5086124|5318 chr3R 5085861 5086141 scaffold_631 4788 5054 - 2193|120 274
AATGTATTTTAACTATAGATAACTTTTAAATGTCCGCATGGTGAACCCTTA---ATTTTTGTTAAGATGACGAAAATGTCTGTCTTGAATTCAACATAGATTTATTACATTTAACTTTGTAAAGGTGATTACAAAATACATTATTTTAAGCCTGA
--CATTTTTTGAACAAAAATTACTTTTAAAT-TCCACATATTGGTTTATTACACATTTTTCTCAAAGT--TCAAAATAGTTATCAAGA--TCAAAACATATATATTACATTTGATTTTCAAAAAATCTTTAAATATTACATTGTT-------TGT
>CG8444 5087895 5088315|5321 chr3R 5087305 5088526 scaffold_13 358157 359351 + 36806|590 1055
GGAGGAGCAGGAGGAGTTGAGAAGCGAGAGGAGCAGGAGGAGCGAGAGGAGCTTGCGTTACGCTTTGTTATTTCGTCCCCCTTTTAAGTT--------GAAATTTGCCAACTTC------------------TACTTCAATCCAACAGCGGATAAATTGTGTGTTTGTGTGTGTGCGGACAGCTGTCGCAGTAGTTGGTTTTAT---------------TATCTATAAATAAGTATTAAAAAACTTTTCAGTTTTCAATGCAGTTGCGGGCGTCGCAACAAT-TCCATAGAAATTTGTTACAT-TTTCCTGTTTTGTTGTACTTTTTAGGTTTATATATATATACGAATATGCACAACATACTCGCCAAGTCAGTCAGTTCTTCAAACGATTCATCATATGTAAATTATCAAAATGTGAAGTGTTGA-AAAGTAAAGTTAAATATATATAGCCTAAAAAG-ACAAA
ACACGTGATAGAAAAACC--------------GCACAAATCGC---------------------TTGTTATCTCG--CCTCATTTATGTTGAGCCAGCGAAGAGCTCCAGCTCCAAAACAAAATCCTGTTCTAAATTCAATTCATTAGCGGACAAATTGTGTGTATGCGTGTGTGAGCAGTGT-------GTAGTTGGCTTTGTGTTAACCACAAGCTATACGTATAAATAAGTATT-AAAAACTTATTACTTTTAAATGCAGTT-CAGTTATTCCATTATCAACTATAATAATTTGTTATATCTTTTGTGTTTTGTTGTACTTTTTAGGTT----------------------AAACA-----GTCGAAACAGTCATTTCTTTA----TTCAAACTTATGTAAATTATC-AGCCGTAAAATGTTAATAATGTACCGTTAAATAAATATAACCTAAAAAGTCCAAA
>Vps16A 5095811 5095958|5324 chr3R 5092804 5095849 scaffold_13 364141 367219 + 124098|3074 3115
T---CAAAACATTCGTATTCATAAACAATTATTCATGTCTAT
TGAACTAAACATTC-----CATAAATAA-TATATATGTCTAT
>CG8121 5162603 5162987|5364 chr3R 5160916 5162946 scaffold_33 336323 338283 + 49208|1770 2165
TAAAAGTATTTGCCATCCATCTATGGGGCTCACAACGAAATTGCACAATCTAGACCGTCCGAATGCAGCTCAAGATAACCCTGATGCTTCGCACTCAAACATTGCTTAAACTATAGTGTACATTCCATCCACCAGTTTAGTGCCTTAGAGAT---------GCGCCTCTCGAATACC----ACAAATTTTAACCGCGAAT---------------CAGCGTAATTAGTTGTAAGTCT-ATTCCGTC------CAAACGCATATGT-----TTTTTGTATACTGTTGAAGAATCGCTGTCTTTATGTATGAA-----TGTCAAAATATCGTGTT----TTTTATATTCATATATAGATGTACAACC-CGAATTGTAGCTATG--TATCTAAAATATT
ACAATGTG-CTACTAACATTCCAAG-----CACAACGATACCGT----------CCGGCGGAGTGTTACACAAGGACACC-----GTTCCACACT----------------------------------CACCAGTTTAGTGCCTTAGATGTGTTTAAACAGTGTCTAGTACATATCAAAAACGAATTGCAATTGCAAATTTTTTTACATGAATGCAAAGTATTTATATTTAAGTCTCATTCCGTCCATTTACATACATATATGTATATGTAATTATGTTTATTTAAACAATC-------TTGTTAATGAGATCTTTATCGAATTAT-GTGTTTAGATGTCATATTTGTATACACA---GCAACCGTCATTTGTAACAACAATTTTTTAAAGCATT
>CG33936 5184127 5184921|5388 chr3R 5183596 5184261 scaffold_33 357331 357981 + 30709|544 686
ATTTC--GATATTGTGCCAGTAACAGTAACAGTAGCCGTAGAATGATAATAACCAACTACACATGATAAGAGTACATATATATATATATGCTGCGCTATAACAA------GGAAAGCAACAAGAAAAACAACACCAGCAGAAA
ATTGCGAGAGATTGTGC------CAGTAACAGTAGCCGTAGAATAATAA----CAACTACATATTATGATAG----TATATATACACACGCTACGCACCAACAAATCATTAAAAAGCAACAACAACAACAACAACAACAAACA
>CG33936 5184127 5184921|5389 chr3R 5184262 5188061 scaffold_33 358343 361706 + 30626|0 732
GCATAAACACACAC---------------CACACAAAATCACACAGA-------GTAATGCTAAATGAATCGATAAA-AACTGTAATTGTAATTTAATTATAATGTAAACAGCAATTTCAAGCAACAATAGTTCAGAGAAACGATAACCAAATACCCCGCAAAAA------TGAAGCAACAACTGGAACAACAATTTCGATGCTCAACAACGTTAAGCT------------AGCAACGTC-----------CAGCAGCAAGCTGCGGCAGCAACTTGCCACAATG-----CACCAGGAAGCAGCGTTCAGCGGCCAACACCTTTGAACCAGACGCGT--GACAGCGTTAGCAAGTGCAACAACAATCACCGCCG-CGTTTGTGGAATACGCAGAGCAAACGCAGCAACATCAACAACAACCAGCACAACCGATTGCCTTGGTCGCCTGCTGAGCTGGGCCGAAAAAAAAACAGTCTTGAAGAAAACACCTTTCATCGATCAACGTTGAAATAGTTTGTTATTCCAAATACAATTTGAAAAT---TGTTTGTATTTA--GCTAAAAATCCAACAAACAACACACGGCCACATTTGCAACGACAACAAGCACA-CAACAA-ACAACAAACCTTTGTTTCATGTTATCAAACACCGCAACA------ATCTTTTAGTAAGACAATGTGTGTCATTTGTTTTTGTAATATGTTGGAGTGTATTAAATAAAAAAAAAA
ACACATACACATACATATATATTTATATACGCATATATGTATATAGATATATATGTAAATATAAATA---CTATAAATAATTGTAATTGTAATTTAATTATAATGTTAACAATAA---CAAGAAACAATAGTACGAA--AACGTTAACCAAATACCACGCAAAACAACAACTACAACGGCAACTGCAACAATAGCTGCTCGGAATAACATCTATAAATTCATCGCAGTTGCAGCAACGACGAAAGTAGGAGCAGCAGCAA-CAGCAGCAGCA-CCAGCAGCAAGATCAACCACTATCACGACACATACAGCATCATTCTAACTTGAACCAGACGCGTATGAGCGCGTTAGCAAG-----CACCAATCGCCGCTAACTGCTGTGACCTACG------------------ACCTGTAACATGTAGCTGAACGA------TTGGTAGACCATTTAGATG-------------------------------------------------------------TTATTCCAAATGCAAGTTTCACATATTTTTTTGTATTCGATGCTTCGTCAACAACACAACACATACG-----ATTTCCAACAACAACAAAAACAACAACAAGAAAACACGCATGTGCAAATTGTTACCAATTAC-ACAAAAGAAGATAAATTTTATGTAGACAACGTGTGTAATTTGTGTTTGTAATGTGTTGCA------TATATGAAAAGCAAA
>CG18473 5190452 5190560|5392 chr3R 5189215 5191061 scaffold_33 364021 366092 + 55201|1255 1437
ACCTA---------------------------------AAAAGTTTGTTAT-----------------------TCTGGTAGCATCTCTTATCA--TGTTTTTCTTGT--------TGATAAGATTAGCGCGGTTCTTTTGG--------CAATAAAAAATGGGCGTGTCTTCGAACTCAAGC
AAAGATTTTAAGTGAACTTTGCACCACCGTTTGCGGATAAGAGTCTGTTTTGTTTCCATATTTAATTTTGACCATTTGTTTGCATCTCTGTTTAGTGGCTTGTTTTGTTCACGTTATGATAAGATAAGCTATGTTGTTTTTGAGAGCCCAAAATAAAAAAATTGGGTGTCTTAAAA--TATGT
>CG8129 5193321 5193488|5394 chr3R 5191614 5194122 scaffold_33 367512 370087 + 77046|1788 1977
GATTCTCTTCTGTATATATATATA-TATAGTACACATATGATTTATTCACT---------------TCAGCAGCGCAGCAAAACTTAAAGCTTTAACTTAGAGCTTAGTTGTATTAGAGTAAACATAATCGTAGTCGAAGTAGAAATGTAAATTAGGTGTAAATAAATATAC------ATAGAATACAAA
ATAAACTTTATATTTATAAATATACTATTTTGAACATTTTTTTTTTTTAACTTTTATTGCAGAAAATTTGCAGTAATGCAATTATTTGAGCTTAAACTTAGAGCTTGAATGTAT----ATTAATAAAGTCGTAAACTTAGTAGAAATGTAAA-TAGCATTAAATAAATATACAATTTGATAAAAAGCCAA
>CG8132 5228196 5228340|5421 chr3R 5227218 5230146 scaffold_33 408700 411442 + 95467|996 1140
AGGATTGCTTTAAATGGGAAATGGGAAATCTTCAAAAATTCAAGAATCTGTCGTTTTAAGCACCTTTAAAGCATTGCATTTATGTTATTTGATTGTATATAAAATTTATTAGGCCTACACACACATATAACATTGATTTCTGTCG
TTTATT------------------------------------------------------------------ATCGCATTTAT------------------------------------CAAATATA-AATATTAAATATTCTTA
>CG8135 5233432 5233579|5425 chr3R 5231424 5233852 scaffold_33 412012 414502 + 105719|2092 2262
ACTTTGGATATGGA-TAACTCTTTATTTCAATTCGT-------TACCGAGTATCTCAATA-------------TTTCGCTCGCGCTTAAGTATTTCCCGATGCCACTGCTGCTGCTGCTGTTCCT-TTACACCCA-TGTAGACCATTCAGTTGAATAAACCACTAAAGAGG
GCTCGAAAATTGCATTGTCTATTTATGTCTATGTATACCTTTATATATATTATCTCAAAAGTTGTTTAGTTAGTTTAATTTACGTTTAAGCTTTCCC----------------GCTGCTGTTCCTGTCACAAATATTGTAAACATTTCAATAAAAAAAAAAA--AAAATTG
>alpha-Man-II 5242461 5242986|5432 chr3R 5239395 5242636 scaffold_33 421295 424329 + 112507|3093 3289
TCGCAACGTGTTATGGCAAAGGATAAAGCAGAAACTGAAGCCAAGCGACCATC-TCACAACCTATGAATCTCGGACGCTAATCCACTG---CAATACAGGCAATCTTCGTTTAATGTT------------CGACTTAAGCACTGACTGCACCGAAAGACGTAATGCGT-----AATCCATACTACGTATCATTTATT
---TAACGT----TGGCAATG---ACAGCTGAAAT---------GCGACCATTATCTCAGGCAGTAATAATTGGAACACCTTTGACTAGGTTAATACACGCAAACTTAATTTATTGTTAAGCACGTTACATTACTTTAATACTGACCAAACAGCAATAC--ACTGCGTATATGAATCTCAATTACGTACATTTTATT
>l(3)10615 5257879 5258261|5455 chr3R 5257394 5258043 scaffold_33 439885 440613 + 8941|595 778
CGTACCCAAGGACCAAGGACCTCATCCACAT--AGCCCATCAATCTCA-----------------CAGATGCCAGTGGCGGATTCCCCCCGATAAAGGCATCGAATCGAATTACATCGCATCCATTGGACGAGGACGAGGACTAGGACTAAAGGACAGTGACTGACGCATCCTGCGCTCGTTTG
CGATCATTAGAGCCAAAGGATTCTTCAACATCAAAGTAAGCAGCCTCCAGAAAGCTGTTTTAGTTCAGATGCCAATTGCGGAATCGCTCATATAGAAGTATC--------------CGTATTCGTTTGAT-----CGATCGTTCGCTCTGAAAGGCTCTGAC--AAGAAACGAAGGCTCATTTG
>l(3)10615 5257879 5258261|5456 chr3R 5258096 5258349 scaffold_11 1480824 1481088 + 2730|0 179
AAAAAAACCAAACAGAAATAC---CAGAAACAATACCAAGCAAGCCAAAAACCAAATAATACAAAGCTAAACAGACGCCTCATTACCAAACATCGAACGTTTCGTTGTCGTTTAACA-------AAAAAAAAAAAAAAAAAAACCAGAAGCACAGCAA---CCAAATTCAA-TTCAATCA
AAGAAGATGGAAGAGAAAGGCGAACAAAATTAATGCAAAGCGAG--AAAAATAAAAATAAAAAAAATGTAACTAAAGTATTATTTTAAGGCAT--AGTTTTTTGTTGTAGCAAAATACACACACAAAACGAAACAAAAGAAAACAAGAAGAAAAACAAAAACAAAACTAAAATCCTATCA
>ps 5272249 5272628|5469 chr3R 5269542 5272929 scaffold_33 452500 455724 + 92825|2909 3299
A--TTGCAAAGAACCAATCAACA-----GAGAACCAACCACACCGCAATTTTCTTTACCAATCCCAATCCCAAATGCCCCACCAAATCCACACGTTTGAACCCACGCACCTGTGAAATTCCCGGGCGGGATTATATATTCCACCAACCAGAAACCCACTCCCGTTACCGATCCCAATCCCAAGCCCCTATTTTTTAATTTGGCCCTAGAGCCCATTAGACATAGAAACAAAAGCCAAGCAGACACAGGCACATCATTGCAGACTCATTCCAGAGAGAGAAAAGAGGGTACGACTTATTGAGAGAGATATCCCATTCTAAGCATACAACGCA----TTCCGTGAGACATTCCGATAGACATTCGCAAAGGCTTTCCCAATAAATTCATTGAC
AACCGACAATAATACCAACAACAACAACAACAAGCAAACACTTTAAACCGTTTTTCAGCACTCCCCGATCCCAATTCCC-----GATTCCCATGCCTAAGCCCCTTTGCCT------------------ATTTTGTGTTTAACCA-------------TGCGATTACTTA------------------ATGGTAGGATTTAGTTATAG----TTATAGACATAGACGTAAAA-------AAAAAAAATCAAGCCATTACACATTCCTT--------------------------------GACAGGCATTCCAACCGATTCAGACGATTGATCAGTTGCTTGACTGTTTTGCATAAGCATTCCTTAAGGCATTCCCAATTAAAC-----AA
>ps 5273572 5274387|5470 chr3R 5272950 5277796 scaffold_33 455743 460294 + 62570|622 1548
AATAAAAAAAACAAAAAGTACCATAACTAATATCCGAGTAAAGCAACAAAACCAGCAATCTTAACAGAACATCAAACAAACAGGCAAAAAGCAAAGCAACAACAAACAAACTACCCCATACCCTCGACGGTTTTCCTCTAAAACTTGTTAATTTCTTTGAGAAACGAGAGGAAAATT------TAAAAACCTAAAACTAAA-AAGAAATGAAATGAAATGAGAAGGGATTACAAAAAGGAAACACCAATTGTT-------------ATGCTTGCAGCTCAGACTTA-AGCAGTTAAAAGCGAAAATAATAATAATAACGTATTGCAAAAATCCATAGATTTTGTTCCAAGGCCTTCACCTCAAGAGATTTGCTACTAACGCCCTTTGCCTACT-----AACGCCCTTTAAGAAAGT----GAAAAACGAGATATGCGAAGTAGTGAAAAATCTG------TAAAAATACTATATGCGTACTACCTTCTCAGCTATACATTGTTGCATTTGTTTGTCACGATCGTTAAAACGTAAAAACCGAAAACAAGTTATATTGCCAATGGCCAATTGCCAGTTAGACACAAACTAGTTGCGAAAGAAGAGCGTTTGGGTTTTTGGTTTGTTTGTGATGCGTATGTTTGCGTTGCGTGTTTTGTTTTTGGTAC--------------TCCCAACCAACTTATACG-----ATACGATACGTTACATGGGGCATATATACATATGTATATGTACACAGTTGTTGAGTCTTGTTTATATATAT-------TATCTACACACATATGCCCATACATATATATATATAC------------------------------------------ATATGCCACCACCCACTTACACACTTACACACCGCCCCCCCCCC-------CAAAAAAAAAAAACACA
-----------------------------------TAATCAAGCAATCAAGCAAG---------CAGCACAACAA---------CAAAAAACAA--CAACAACAAAC-AACTATCCCCTATTA-AAACGCATTTCCTCAAAGAACGGTTCATTTATAAAAAGAAAAAAAAAACAACTAACAAACAAAAACAAAAAACAAAACAACAAATGCAAAGAAAACTAAAGGAAGAGTAAGCCCAAAACACAATAAATTAAAAAAAAAAAGGAAAAAAGAAGCT--AATTTACAACAAATAACAACAGCAGTAGCCATAAAAACA-ACAACACACATCCACACA-------CAAGCACATACACATTTAAAAAGGCATTAGCAATGCGTTTTAACTATTGCTAAAAAGATTAGTAAGAGAATCCCAGAGAAATGA---ATTCGAACCCTTAGCAAATTTGATTTGACAAAAAAAGAA-------ACTACCTTTTA----TCGTAATGCTGAATTTGTTTGCCACACTATTTAA-----------------------ATTTGACCAAGGT---ATTGCGAGATACACCTGGGCTGAT---------ATTTCGCCTGCCTTTTTTTGTTG-TTGTCA----------TATGTTGCGTGTTCTCTTTTGGGCACTCTGATAAACTAAATCCCATCAGATGTATACATAAATATATATTGAGTTATAT---TCACATATATATTTATATATTCATAAGTTTGCTG-----CGCTTACATATAGAAAGGCATGTATGTATATGTATGCACATATGTACATATATGCACTTTATACACTAATTGTTGACTCGTGTTCATATTACAGAAAATACATGACACGACACACACACACACACACACACACACACACACACATTTATGCATAATACACCAATACA
>CG8147 5322312 5322452|5500 chr3R 5320447 5322487 scaffold_33 504207 506241 + 77016|1898 2059
AACTTGGCG-----GGGATCAAAGGTT------AAGTGAAGCACAATGAGTCTAAGCGACAAACGTATTATTCTCGTTTAAGAGAGAAGCCACTAGAAGATAA----------GCAATCGTTTAAGGGGGATACTAAAATAAATAATTGAAATCTAAAAAAA
CGTTGAATGACTTTGGGGTCTTAGATTAATGCAAAGTCAACAGTAATTATTGTACTTACGTAACTTATGAACAAAAAAAAAAAAAAAAACATTTATAAAATAGTGTATTTAATGCAATTGCT------AGACTTTAAAATATATAAATAGATAAGCAAAAAC
>CG8149 5331428 5331588|5510 chr3R 5330321 5331546 scaffold_3 4806136 4807416 - 29837|1196 1323
GAAAAGCGAATATAATTATTTAAGCAAGCAAATACAATTGTAAATCATTTCGGGAGTAGGCCCTATCATGTATCAAACCCCAA-----AGCCACCAATGCTTGTAGTAATTAAG----CAAAAATTCA
AATAGACGAAAAT-GTTCTCTAGAAAACCCAGCTCAGTTTCCACGC---TCGGG--------CTGTTCT-TATTAAGCCACAATTAACCACCAACAATGCGTGTAGCCGTTAAGGGTATCTAACTTCA
>CG8149 5331428 5331588|5511 chr3R 5331547 5333359 scaffold_3 4807903 4809767 - 52021|0 41
ATAAACACAAAACATGACCACTGAAATTCAGGGTTTACATTA
ATATAAATAGAACATT-CTACT--AATACTATATTAATATTG
>Rlb1 5340534 5340550|5517 chr3R 5338830 5341594 scaffold_27 806788 809591 - 63145|1907 1923
AGATGATGTCAATGGTA
-GATCACGTTTGGGTTA
>CG8165 5346562 5346660|5520 chr3R 5343878 5346738 scaffold_27 812220 815103 - 117886|2772 2873
AATTTTCTTACCTTTT---AGTTTTTTTCAACTATTTAACATTTATTATTATTTTTTAAGATCAAAAATTGTCAAATATTCAATAAATACTTACTTAGAACT
CGTATTGTACCCTTGTCAAAGCTAAACAAAGCTATGCTACATATTTTAGTCTCTTTTAATTTAA------GTAAAATATATGTAATACACCTGAAAAAAACT
>CG8176 5352326 5352964|5524 chr3R 5349785 5352519 scaffold_27 819820 822548 - 115775|2682 2876
TTACTCCCCACTCAATAGACGGCAAATGGGAACGAAAAATGGCAATATGGCAATAGGCTCGTGAAAA-ACTAGAGAAATTTTTGTAACTAATCTTAAATATGAGACAACCACATATACACCCAAACCATATTGAATTAGGCACACGAATAGAGGAGCCTACATAGTTTTCTCTGAGCTTTTTATTATACCCCCCT
-----------------------------------------------TGGCAATTGGCTCGTGAAAACCCTAGCGAAA--TTTGTATCTAAAACTGAAAATTGAAA--------------------------GATTTTGTAATACGACAAGACGGGCATG---AGTTTGTGAAGTGGCTGTTATTCGACTCACCT
>CG8176 5352326 5352964|5525 chr3R 5352667 5353000 scaffold_27 822659 822936 - 4414|0 346
GGACCTATTATGTATTTTTGTACACACAAAATTCTGTTTTTCACGCGAAATGTTGAATCTGCCTGCGGGAGGTCCGAAATGCGGGCCTGCAAAATCTGGATGTATTATTTGTTATATATATACGTATGCGAGTATATATTATT------AAAGTGTATTTATTATGTTTAACTGAATATGATGTAAACGAACGATATTGTATGTAGCTATGTAGATATCTAAAAACAA------------------------------CACACCGAACGTTAATTTTATGTTCACTTTTGTACACACAAC--------CAAATCCAAATGTATT-----AAATGTAAGATACAAAAC
GGATGTATTAT-------------------------------------------------------------------------------------------------TTGTTATATTTATATACAC-TATATATATATTATATGCTTAGAAATGTATTTATTATGTT-AATTAAACGCGATGTAAACAA--TACTTTGTACGTAGCTATGTAGATATCTAAAAACAAACAGACACCCTCATACACATACTACAGCGTGGGAAAGCACGTTGATTTTATGTTCACTTTTGTACACACAATAACACACACAACACCAAATGTATTAAAACAAATTCAAGATTCAAAA-
>RnpS1 5379374 5379469|5544 chr3R 5378397 5379409 scaffold_27 1643582 1644618 - 43154|1040 1075
AGGACACTGATCGACTCCTAGTTTCTACAATTGACA
AGAGAATTTAGTAACACTATTTCATTTGAATTGGTA
>CG8199 5383159 5383509|5546 chr3R 5381594 5383508 scaffold_27 1647221 1649105 - 67357|1603 1983
ATTCCAGATAGGTGCCATAAAG---ATGCT--AACAAATCAGAAATCAAAACGAACCGAGAGACTCGATCGAAAGTGCATTTATTATGATTAAGCAATAGGCAAACAGTTTTTTGTGGGTTCAACCCGTTTGTTATGACTCATCTGTACAGGTGGGTCGGTGGATATGT----GAAATTAGACACTTTGGGTTTTT-------GGGTTTTCTCTGACCAACGAAGAGGATAAACTT-------GGTTGCATCCTAGGTCTTAATTTGCACATACAAAGTGACCC--ACTCTGGTGCAGGTGTTATGAAAAGGTGTT-----AAAATTTATTAAATTTGATTTACATACAATATACATATACTG-AAACAATACGAATACAA
-----AAGCATGGACCAAAAAGCAAACGCTTCAATATACTACAAAACATAAC---CGGAGAGACTCATTAAAAAGTGCATTTATTAAGCTTAAGCGATCTTTTGTTCAGTTTTAAGGGTTCCAAACCATTTGC-----------------GATTTGTTGTTAAATATGTAAACAAAACTGAAAACAT---GTTTTTTATTAAGAGGCATGCCATGCAAAACCGTTATAATATACATTTTCTGGGCTTTTATAGTCGTACATTTTTCGAAAACACATATTTACTCGAGCTTAGCCTTAAGTACATTTGAAAAATGTTTTTCAAAAATTTATT-AGCTTGATTTACATATAAAATACAAATACAATACGCAAAAATAACACAA
>MBD-like 5387135 5387255|5548 chr3R 5385367 5387393 scaffold_27 1651603 1653733 - 38430|1981 2123
GT-TCAATGGTTAACCCCCATGCATCTACCAATTCCATTGTAGGCTCTA--------ACATCTCTATCGTATTGACCCCTATT-------------CGAAATCTACATTTAAGACTAGTGTGTAATAAACCAAATCCAACTCC
ATGCCAATAGCT--TGGTCATTCACTTAGATATTCCATTATGGCTTCTATATATTGTATAACT-TATTATATTCACTTCCAATTCATGAGGTAAACCAATAGCTTGATTTTCGTTTCCTCTGCAA-AAATCAATGTGAAAACT
>CG8228 5391587 5391814|5550 chr3R 5389689 5394725 scaffold_27 112577 117720 + 240155|1928 2172
-------AGTCTATTTTGACT---AGATAGCCCCAATTATATTGTTAACTATTTATTAACTAAATATGAATGTGCATTATGTATTAAGGTATTCCATGCATTGTACCAATTCAAATCCATTGGACTATTTAACCTTTTAAGCGTAACCATGTAAACATATTTATTGTTATTCTCGAGGGTAACACCAGGCAACGCCTTGGA------CAAAATGT-ATTATATACAACTATGTGTGTACAAAATT
GAGCCAGAGCTTATTCCTTTTCAAAAAAAAACCTATTGCTATTGTTAACTATTTATGTA-------------------------TAATCTAATCCATTTATTATAT---TTTTAATTCTTTG--CTAAATACTATGTAAAAAATA--TATGT-AACATACTTTATATATACATAAAGAGATAAAATTAGCTACGTTTTGTAGTTGTTCAAAAAATGATTGCCTAAAGCAA---ATGTAAACAACT
>CG16789 5394703 5394918|5550 chr3R 5389689 5394725 scaffold_27 112577 117720 + 240155|5239 5261
AAGGTAATCACTGGACTTCTTAT
AACACAGTTTCTGAGCTTTCTAT
>CG8273 5406586 5406946|5558 chr3R 5404166 5406898 scaffold_27 1669634 1672415 - 73647|2550 2936
TGATCGAACGTTGAATAG-----------GCTAATTTCTAGATAGT---------------GAATATAATAGAATCCCCACAC-TGTACATAAAATTAGCCCTATATTTAAGT-TGTAAAATCTTGTTCGTCTCCTTTGG----AGCGATGA-CAAATATAGTGCTAACATCA-----------AAAATGATTGT-TAGTTT-----------------GACTAAAATTACTGATATTTGATGTACCCCTAACGTTAT-CATTTCTATTATTTATACACTACTTACTTT-----------AATGCTGTCCTTAATATCAGTTATAAATTACCTGTTTACTTCTAGTTCCTTTTAGAAATGCAAGTTTCGTATTTGAAGTGTATTTCC
TAGGAAATCTTTGATCTGCTGGCGGCATTCTTAATTTCTGCCTATTGTAAGTGTTTAGTTAGAAAAAAAAAAAATATATATATATATATATATATATATATATATATACATGTATGTATACGCTTCTGTATATAATTAAGAATAAACTACGATTAAGTAAAACATTAATAGCACGCTTTATTTTAGAGAGATTATATAACTTTTTAAATTTTAGAAAAAGAGAAAGGCCAATGGAACTGGA--AACACTTAAGAATATGCATAAGTGTTAGGTTCAAGAGATCTTCTATGCGGAGTAAAAAAACTTCACCATAAAAGCTTTTGTGAA-CAAATATCGAATTTTATCGACCGTTAGAGTTAAAAAGCT----TTTGTGGTATGTGGCC
>CG8273 5406586 5406946|5559 chr3R 5406935 5407458 scaffold_27 1672450 1672973 - 233|0 11
GACACACACATT
GGCAAACCTCTT
>CG8301 5411764 5411879|5565 chr3R 5411461 5413187 scaffold_27 1676691 1678346 - 16539|318 459
-------------------CCAAGTGGAACAGCAAACAGCATA-GATTTCTGTTGTAGCCAAGCACAGTGCAGAAACTGCAATGC-ATTGGAGCGTAG----CTCCCGAAACTCAAGCTTA-CATAGACCATATACATACAT
ATTGTACCAATGATATAGTCCAAGTGGAACAGCAAAATGAAAACTATTATTCAGTTAGCAAAGCAT--CAAAAATACTGGAATACTATAAGGGTGAAAACGCTTTCAAAAAGTCACGCCCAGCACAGAATTTTTAAAT-CGT
>CG8301 5411966 5412373|5565 chr3R 5411461 5413187 scaffold_27 1676691 1678346 - 16539|546 988
TGGATATTCCGTAGGGCATAAACCATATAGCTATATCTCTGTCCATTT--CTTCGATCGGTCCCTAAGGCA-----------CTCCAGC--CGCATATCTCTT---TCTAACTCTGAGCCATATTAATCTCACAGAACGCCTTTAAACACTACCAGCACATACATACATATATCCATTTGACCAC----TTAGCGATAAGAAATAAGCAATGAGAACATACAAGATGTTATACGAGCAATCTAAGCTTCGCGGCGAACTTTTAATGCTCAAGAAATGCATTTATTTCCAGATGAAACCGATAAGTATTTACAAT---AATTACCGAAAATGTATAAGAATATTTAAAATATCAAT----------ATACTATGGATTTTATTATGTGTAGTTGCAGATATATTTACCAAATTCATGTTCCGAATAAACATTCATGTGACCAAA
TGTAT----------GTAAAATTCATAGAACTACATATATTTCCTTTTTACTTTACTCACATTCTGCAGCATTAGCTCTAAGCTCTAACATAGCGTATTTTTTCCATCCAAATCT--------TTAATCTTGAATACCTATTTCCATGCCTCTCACATAATGCACAAACAAGACCATTTGGCGACCATTTTAGTGATAAGAAAAAAG--------GTAAAAAAAATGT----------ATTTATGCT------CGAA-----AATG-----AAATTGCATTTATTTAAAAAAAGTAAACACACATATTTACAATTACAATGAGATAAAACGTATTTTAA-----GAAATATCAACACCTGTAGTAATACCATGTATATAAGT-TGTGTTAGTGCA-ATATATTTACCAAATACGAGTTCC--ATATACATGCAAAACATAAAA
>CG8286 5415005 5415302|5568 chr3R 5413707 5415281 scaffold_27 1678720 1680395 - 74800|1298 1711
------------------TCAGCCAGCAGCCATT----------------TGCTTTGTGATGTCC-----------------------TAGCCGCGATC-------------CCCGATATCCTTTA------------------------------------------------------------ACGATTTTACACTGTTTTGTT------CATTTAAATGGCGTGTAAATAGTAGCATAAAGCATAAATAAACCCATGGTCCGTTGTCAGAGAGTACCACAAACAAACACAAATCGCAACAAAACACACTGAGCACTTACATTTAATTAGTTTATTTAATACAATACAATAATTATAATGTAGTACATTTTTCTAATTATGTATAAA-AAGAAACAATATGCGAGAACAAG
ATGGATCTGTCGAGCACTGCGGCCAGTTGCCATTGTTCAGCCAGGGTTTATTTTTCGTGTTTTCCCCCACTTAATGCAGTCACTATAATATCCACAATCTATCCCTCCGCTGCCCGCAATTGTTTACGCACAACAATCGCGGCACTTTCTGTTTTGCCTACGCCCCCCAGGATAACCCCAAGCCTTACGATTTTACACTTGTTTGTGTTGCAACTCTTGAATAGCGTGTAAATATTAGCCTAAAGACAAAA-----------TCCGATAACTGAAA----CACACAACAACACAAAACTGAAAAA-----------CAATTAAATTTAATTAGTTTATTT-----AATATTATAATTGTAATGTAGTACATTTTTCTAATTATATATACATAAAAAACGATTAAGCAAAGCAAG
>CG8312 5450301 5450798|5615 chr3R 5448834 5450740 scaffold_15 1378426 1380438 + 72819|1565 2133
GCGAA---ATGCTTTAATTACAACGGAAACCCGTCTACAAATTGTTATTTCTGCACACCCGTCAGCGACCATAGCAAAACACAAAGTGCAAGAAATTGAAATCC-------TAGTTGTAGA-------TTAGCTATTAGC-ACCTAGTCGTTAAGTCATTTGTTGTTGGTTCATCG---AGAGGAA-AACCTAACGATAT---------------------TCGCCCATCCCCCATTTTCCATCCCATCATCTAAATC-------------------------------------------TGTGCCCCTTGATCCAAAAATAATGAATTT------------------------------------ATATTGTACGCATT----TGTAAATAAATTAGTCGCCCTACGCACTGCATGTACTATATACATTTACACGATTGTCATTGATGAACTGTATCTTACTTATCAATATAAATTATTATC-TGAACGGTGTGTG--TGCTGCACAGAGGAAAGTGTGAACAATAACAATTGGTTAAATTATATATATATGATATCAAAATTTGAT
-CGAAAGTATGCTTTAAT--AAATAGATGTCTCCCC---CATTGTTATTTCTGCGCACCCGTCAGC-----------AACAAAAAGTGCAAGAAATTGAATTACTTATTCGTAGTCGTAGCCCTAGGTTTAACTTTAAGCTGTTTAGCGCATAAGTCATTTGTTGTTGGCTCATCATACAAAGAAATAACCTAACGATATTATTGTGTAAATGTTTCTTTATTGCACAAAAACCATTATATATTCATTGATTTTTGTTTATATTTTTATTATTATTATTTTTTTATTTTTTTTTTGTTTAATATGTCCCCCAATTCACAATTGATTTGTTTATTCTTATCGGTCTTCCCTGCACTCTTCCTGAAGAGATACTGTTTGATTTGCTCTGTAAATAAACTAGGCGCCCTAAGCACTGCATGTACTATA--------------TGTAATCCATGAATTGTATCTTAACTACCTATATAAATTATTATTATGAAATATATGCAACTAAAGTAGCGAAAAATGTGCGATCTATACGTTCTTCTTAGAGTCTTTAGAATTTATCGGAGAGTTTCAT
>CG8312 5450301 5450798|5616 chr3R 5450771 5451736 scaffold_15 1381843 1382824 + 24877|0 27
TAAAATAGAAAGAACCTAAACCAATTTT
TGAAGTGAACAGAAATAAAACGTGTTGC
>SpdS 5458829 5459394|5630 chr3R 5458024 5458913 scaffold_49 356408 357291 - 35232|814 901
CCAGGTTGCGGAAAGATTC---GTGTGTATCTGTTTGTTAAAAATAAATATGATAATAATATGACTTGTTTATCATCGCTTCTTAAAT
--AAGCTGTTTAGACATTTAAAGCATTTTTGTACTCGGTAAACA-AAATTTAATGATTTTATACATTGACAATAAAATATTTTAAAAT
>SpdS 5458829 5459394|5631 chr3R 5459013 5459137 scaffold_27 1478614 1478767 - 2150|0 154
CAGTTATTTTACTGTTGAAAATAGAACAAATTGTAATGTTTATTACGT--AATGATATATACAGTTGGCTCTATTTA---------------------------ATTTTTGTATTTGTAAGTGGATGC-TGGGTTAACATAATGAGACTTATTGC
CAATTATTATTAAAGTGAAAAAATAAAATATT-TGTTGTTGACCAAGTTTAATAATGTTTACAGTTTGCTATATGTATGGTATAAGTATATCTTATGTGTAGATGTCTGTGAGTTTTTGTGTGGGTGTGTAAATAAACATAATGAGAAATATTGC
>SpdS 5458829 5459394|5632 chr3R 5459138 5459670 scaffold_33 860058 860554 + -991|0 283
AATATTTTACACGACCGAATGTTACTCTCATTTATATAT-CGCA-----------TATATTGCAAAACTTTGAAAGGAAGCGTTTCTTATATGCAAAAATGACC--------TTAACTGCATGTGAATAATTAACTAAAAACT---GATATTCAATTTCAATAACTTAATAGAAATTAAATCTTCAACCTGTTTAATGACTAATTAAATATTGTTATAGTTAGGAAACGCAATTGATACATAATTACAAAATTA----GATGTAAAATATGTACAATCATTTAA
AATAATGAATATAAATGAATAATGCTTTTACATATAGATTCGCAATAAATTTGTTTGTCTTTCAAATGTTATTAATGTA----TTTGTAGATGCTTAA-TGAGCACGTTTAATTCAATTCATGTAAATTTTCATTTTCAAAATTTCGATTTTCATATGCAATTACA-GACAACATACAAGTACATAATATGTATA-----TAAGTAAGCGTGTATATATGTAG-ATACTTCTTTACTATACTTTCACAATAATACGAGTATTTAATTTGTATATTATTTTTCAA
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GTAAGTAGGGATTGAGATGCAAACACAGATATACAGATACGATAAAGATACAGATACAGATACAGATGCATATGCAGTTACAGATATATGTA-ATACCGACACAGATACCGATACCGATACCGAAACGGATACGATGCGATAGGGGCACCCAACGGCTTCTGAGT---GCTGGAAGGTTATTAATGC-AAATCGACGGTTCCTAATGGCTGGCTACAAGGCAGGCATGTTGTGTGTGCACATACTCCCTTGATGACAAACTTACTCCCAC-------------GTTGCTAGATGTACTCG-------CATTTGAACTC--TATTT--------TATCGAAAAT----AACCAACGGTGTATGTAACGATTTATGCTACCTCTCTCACAGATACTGT-TGAAAATAAAGTCCCCGATTA--ATGTGAAACATACATAGATACCCATGCT-AACGTGCATACTACTAGATACTTTACT------CTAGATCGAA-ATGGCCGAAACTTTAGCCAATACACCAATGCTGCTAAGGA--TTATAAACGTAATTGCATGTAT------------------GCGTAATTGATAGTGATC---------------TATGTGTAATTT--AA
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>CG8358 5503442 5503501|5673 chr3R 5503441 5503640 scaffold_20 1156685 1156887 + -959|1 67
ATCATAGATTTATAAT-------CATCATCATAAATTCCTTGAACCAAATAAAAGTTGATTTCAATA
GCCGCAGCTCTGAAATGTTAATCCTTTAGCTTTAAGTTTTATAATGAAATGA---TGCATTCGAACG
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ACGGTCGCTCAGATGGTGTCTCGCAATTT----GGCGTAGTCGTAGCGTTAGGCGTGGCTCTTATACCA-TAAGTCAGCACACGATCACAACACTCACTCCTCACATACACACCAGAAAAGAAAAAGAAGAAACACTCAATCACTCATAAAACATCCACAAACGCATGCGTACATGAAACACTATTCCAATCGAAGAAAACCACATTTAATATACCTGAATATTATGCGTATTCAGAGGAGAGATGTTAACAAAAAGCAAC--ACAAGGAACAAGATGATTTGGCGCCGACAAGGGAAACCATAAGTTTTACGCTAGAATTT------------AACAACCAGAGG--AAAGCTACAACCAATTTATTGCAAAAATCAGTTTGCAGTTTATTA--TTTTTGTTTCCTGTAAATAAAGGAAATTAACAATAAA--AAAAATGAAAAACTTA
GCAGCTAGCTGTATGG------GCATTTTTGGAGTAATAGTCGTAGCGTTAGCCGAGGCCCCTATACCGTTAAGTCA-------------------------CACACACACAC---------------ATAAACCTGCA-----------------CACACACACACACCTTCATAAACACTTATTCCAA------AACACAAACTTGAGCAGA--------------------AAATACGGTATGTTTACGAAAA-CAGCTGGAAAGGAGCAAGA--------------------GATACATTAATTTTACGCTGGATTTTCGCCACAGCAACAACAACAAATGGAAAAAGCTACAACCAATTCATTGCGAAGTTACATTTGCAATTTATTAACTTTTTGTTTCCTGTAAATAAAGGGAATTAA-AATAAACTAAAAATCAAAAGGTCA
>nmdyn-D7 5507139 5507224|5677 chr3R 5505845 5507211 scaffold_3 1833331 1834701 + 50787|1313 1391
TCTTAGTT----TAGTTTTTA--TTTGTTTTCAGTTAAATGCATGTTTGCCTGTGTGCGTTTATCAATAAATTACAAGT
TTTCAATCACCATCGTTTTTATGTTTATTTCTTGTCA-----TTCTCCGAGGGTGTATGTGTGTAAATAAATTACAAGT
>nmdyn-D7 5507139 5507224|5678 chr3R 5507213 5508894 scaffold_3 1834884 1836571 + 69037|0 11
CAATGAAAATAC
CAAATACAATAC
>CG18542 5512440 5512867|5680 chr3R 5511506 5512976 scaffold_55 86905 88258 + 43811|992 1423
TGCGTTACCAATGGTGCAATATAGATGATAGATAAATGGATTCTGTGGAATCTTATTTAATATTTACGTATTTATTCTGTGAACTTTACATTCCAGTCACATATTGCGTCCCGAACTCAAATCACACCGAATTATGCCCTTGATGGCGTTTCTTTATCGATTCGACAATGTTTAAAGCCAGTTTAGCCAATATATAGTAAGCTAATACTCCACAAACATTCCTGCATGTCGACAGACTTTAGCCGTTGTCGGCTCGACAAAGAGTAAATTCCGTCTAGGATTAAGAAGAAACTTTATAATCTCCACACTCGAAGTTTTAATAATTGTAAACACGTTGACACTGCTTTTGTCCTGTTTTAT----TATCTCTGGTTTATTCTTTGACATATTCTATTTAAATAAATAAATAAAATATTTAGTAATAAATAAAA
TAGGATGTAGAAAAAAGACTACACTCTCCATATATAGAGAATCTCGGGAAACTTA--------------------ACTGTGA-------------------------------AACTTAAAGCAA---------------TATTTATATTTGTTTGTAAATT-----ATATTC----------------ATATAT---------GTATTGTATAAACATTCCCA------AACACGCGATGTACGCAGTCCACACGAA-----------TTTATTTATGTCCCACAAAAGACATCGCATTTT-----------GTATTAAGAG----AAATATGTTAGTTTCG-TTTTGTCCTGCTTTATTATATATATCTTGTTTATTCTTTGACATATTCTATT----TAAATAAATAAAATATATATTAATAAATAAAA
>dmt 5539850 5540397|5710 chr3R 5538920 5539922 scaffold_55 112047 113048 + 15515|1002 1101
TCGCATTGCCTGTT-------------------------TATTATTTATATTTTTTTGTG--TCGCTGATAAGGGGAAGTAGTCGTTTTTAATTTAATGT
TAACGTTGGCGTTTAGTTCGTTTGTTTTCCTTATTATTATATTTTTTATTTTTTTTTTTGGTTCTTTAATAACATG--------GTTCTTAACTTGAAGT
>dmt 5539850 5540397|5711 chr3R 5540022 5540276 scaffold_15 47511 47750 + 880|0 270
AATGTAACTAACCAAGTGCTTGCAGTGC------ACTTTATGCAATTCTAGGTTAAGCTAAGCATGTATTTTTATTATCAAAAGCTTGGATTATGTACAGCTT-TGATGTTTCGGTAT--------TATAGCCTATCATTATGACTAAACTA-AATAAATGAAAAATCTTAATCTTTGTGAATTGAACTATTTGTTAGTCCAAGGGAAAATTTTTCCAAATGAAATAGAAGTCAATTTTATATCATACATAATTTCCATAAGGTGGACTTA
AATGATATTAATAACATGGTTGAAGGGCGATCTTAATTTATA-AGGTCTACATTACGCATGCTAAATCTTTCTA-------AATCTTACTTTGTGTGTACCTTATTATGTATATGTATATTTGATATAGAAGATATTCTTATTATTCAACTACAATATAACAAAAATTGTCATATTTATTAGTT-ATCTATTTATCC-TCTAATGAGTAAT----------------GAATTTGGTGTTATATCAAAAAAA-----TATAAATCATTTTTA
>dmt 5539850 5540397|5712 chr3R 5540277 5543217 scaffold_126 4282 7285 + 105618|0 123
TTTTTATTGGTTTTTTCT-TCAAATTTCTATTGAATCGATATCGATAAATATACATGTGCATAAGTCATACTTTAGAAAACATATTTTATTTAAA--AGTTTAATAATTAAAACATAGGCTTCC
TTTATATAGGTGGTTACCATGATATTTTTATT-------CCCTGGTTAATATACATATTTATATATTGTAGTTTATTACATTTCCTACATTCAAATAAATGTAATAATAAAAGCAAACTTGACC
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GTTTTGGAGTGGCCGAAAGCAAAATATATATACATGTAATAGACAGTTTTGGGAGGCCTATTAATGACACTTAAAAAATCTTATTGTTGGAGATTTAACTTATAATAATTATCGTGCAAAAATTAAATAATTACACGCAAAAATAATTTAAATAAAGAATAATTTAACTACGAAAAATATC--AGCTGGTAACAAAAT
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CAAAACCTATCACACTTTAAACT---GTTTTATTA--AATTAAGC-TAAGCGTTTGTTAATGGCACAGTTGTAA--AAATTTAAAATAAAAGCAATAATAAA
CAAATGTATTTACCCTTTTGAGTCTGGCCTTATTATTAGTAAAGCTTAAATGATAATTTATAATAAAGATATTACCAATGTTAAATTCAATGCAAATGTAAA
>CG8417 5586868 5586930|5764 chr3R 5585169 5588796 scaffold_15 2264023 2267645 + 98950|1809 1871
AATTCTCAGTTAATCGAAATATTTTGTACAGTGCAATAAATCCATTAACACGTTTTGGTGGTG
AATTTGTAGTGTTTTACAAAATTTTA--------AATAAATGAAACACGCTTCTTTCGTCACG
>CG8478 5591561 5591858|5766 chr3R 5589119 5591601 scaffold_15 2267646 2269961 + 26482|2602 2642
ATTAAGCGATTCGTGTGTAGCCTAGTCTATGTCTAAGTTAA
ATCAAATACCT------TAGTTTAGGTTGTGTTTACATTAA
>CG8481 5595149 5595752|5769 chr3R 5594508 5595865 scaffold_15 2272942 2274254 + 42957|660 1323
ACGTCAACGCCAGTAGTAGTG--------GGCTTGGCTAAATTG-GGCCATACCCAGCCCGATCAGAGAGTGGCAG-TGAACTAGTCAAATT-GGCAAATGCTTGAAATTCTTTACGGGTTTTACCTGCCAGCAGCTGCTTCGAGCCATAACCTGTGGATGCCAGGCAGT----CTGCCAAGTGCATGTGTGATTGCCTCGTTGCTCTGGCAATTTGCAAAGCAAAGCTAAAGCTTTTGATTCCATTACACCGATAAGCAACCATTCATTCACCAAGCGCTTGTGTTGATTTTTAAATATTACTTTCCGCATGTATTTTTT-------------AAACTTTTTGGTTCTTTTTGTATGACAAAAGTGATCCGGGCTGTTCGGTACATC-----TATAAGGCTAATGTTAACCTAATCCTAACTGTTTAGCAA----------------TTATGATTTGTTATAGT-TTTGCTCAAGTGTGTGCATAATTGCTCCTAGACAAAAATCTACCTGCAATCTACCTGCAATGGTGATGATTATGATAATAAGAAGCTCAAGTATCTTCCAACGAAAC-ATAGC--AAATAGACATATCGAGCCT-------TAGCATTAAGCACTCAACGAAGGGCAATAACTTCAAATAAAACGTGTAGAAACTAAA
ACATCAGCACCAGTAGTAGTAGTAGTGTTGGCTTAACCAAGCTGCGAACGCTTCAAGCTTGACCGGAGCGTGTCAGTTAAACTAGTCAAATTAGGTAAACGCT-------------------------CTTGGGGCTG----AATATATAATCTAATACTGCCCAGCGGCAGAGCCGTACTATGCATAAATATATACC------CTATGAGCGTTT----------------GCTTCTGATTCCATTACGAT--TACACAAACAAACATTCATATTACGCTCGTGTTGATTTTTAAATATTACTTTCCGCATGTATTTTTTGTTATCATTTCGGAAAATGCTTGGATACACAAGCACGTTAATTG----CCGTGTTATATAATATATTGCACATAATATATTCACGTTAATTTAGTTATGTATTATTATTAATTTATAATTCATACTCTTATGATTTGTTGTGGTGTTTGCTCGAATGC-----------TTACTAGAC-AATATCTACCTACA----------------------TATGAT-------AGCTCAATTATCTTCCAAATAAACTGTAGCATAGATATACATATCGAGATTGGAAACATAGCATTAAGCAAGAAATGAAAGGCAATAAATT-ATATTAAAGTTGTAGATATTTTA
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ATATATATAAATAAATATATGTATTTGAACTATATTGGCGGATTGATTTTTAATTAAATCTG
>RpS29 5604508 5604800|5777 chr3R 5603133 5604885 scaffold_15 2282301 2284119 + 23990|1444 1866
ATGTGTCCTCTTCGCATTTTAACGCGGTAATCGCGTATATTAATGCATATTAATGTATGGAGTCGTCGGATGTCGGGGACTCGGTAAATTAGTATGCCGG--CAGCAAC-----AGCAACAACA--ATAATCATTTGGGGATTTAA-----GCAAGGACAAAGCGCATC--------------------GAAGCA---------------------TTGATTC----AATATAGCCAGAATGGCCAAC---AGCAACACCACAA-------------AATGCCAACA----------------GTTACCACCTTCCGCGAAGGATCTTTGTTAAAGCACTAGT---------------------------------------TTTGTTTAAATCTCCGCCTGATTAAACCCATAACAAGAAAC
A--TGTCCGCTTCAACTTCG---GCGTTTCGCACGCCAATTAA-GCATATTAATTTAGGCAGTCGCTGAA---AAGAGACTACGTTTATTAATATGCTGGAACAACAACAACAAAGCAACAACAATATAATCATTTGGAGATTTAAATAACACAAGAGGCAAACACTTCTGAAACCAACATACAAGCCAGGAACACATGCTAGGAGTGTGCCACATTTTATTCTATAAAAATAGTAAGATAATGCAACCAGAGCAATATCTCGAATGAGCATTCACCAATGCAACCGAGTTGACGAACTCCGTGTTACCAACGCCGCACAACCGTGTTCTTTTATACACTAGCGTTAATTCCTATTGCAGTTGTTACCTTCTAGGAAGGTTATTTGTTTAAATCTCCCTTTGATTAAATACATAACAAGTAAT
>CG8500 5612580 5615059|5786 chr3R 5612487 5612805 scaffold_15 2291724 2291951 + 4252|96 322
GCATCGGATGGCCAAAGAGCCAGATGGCCAGATGGCATGGCCATGTGACCCGGGTCACATTGCGTCGAGCTGAAGTGAACGGAGACGACGGTGACAGACAAATACTCGCCTTGGGGCAGCACCCTTGGGTGGGGGGTTGCTGGCTTAGGTAGCCACCCACACGGGCCACGCCACACCACACCACACCACGCACC-GCACACACCACTTACACCATACCACATACCAC
---------------------------CGAGTTGGCA---------------AGCAACATT----------------------------GGTGACAGACAAATACTCGCATGGGGACACTGGCAGT----------------ACTCGAAATGCATCCCACACACACACACACACACACAAACACA-AACACATTGGCATATA-GACATGCA-TATACCATATAGCAC
>CG8500 5612580 5615059|5787 chr3R 5612830 5615411 scaffold_15 2291970 2294784 + 35058|0 2618
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AGAGAACGGCCGGCATAACAAAACAAATATATTATTAATTTTAGATGAAAA----TAATAAGACAGC-------ATTATAAGTATATTTTGCATA---CATCGATTTTATCCG-------CAACTCCTTCTCATCTACAAGAATAGAGAAGGCACACCCTCCCACCTCCCCTCATTCATAAAATCCCTCACACCCACACAACACAAAGATCACAAAATATATACATATTAACACATTAATTTCTTTGGATTCTGAAAACTGCATCTGAAACGTAACGGCATACATATCAAATACATAACATACTAACAT------TACATGACATACTCGCACTTACATACTAGATGTGTAAATTACACAGATATCATAATGCTATAATATAAACTATACGAATATACACATGCATATGTATGTATAACCCAAATGAAAAGCCAAAGTACCTACTTAAAAGACATACCATTTTATCTACTTACTACTAAACTAAAGCTATATCAAGTACACGGTGTGTATTTGCATGAGA---ATCCATTTTCACTA-ACAGAGAAGACTCAAGATGGACAAGACAATTCTGAAGCATTTGTGGCATTGAATCGTGTGTCCTTATTAGATATGGATCTGTTTCGTTTGCTGCAATGTCTCCTAACTGACTATCAATCTATTGCTGTAAAACTATTTACCACCAAA----AACGTTAAACAAATGGAATATTTGCCACTAACATCAACTA---TATTGTATAAAATAATACTCACA--CAATCAGACCGACGACCGACA---CGAGAATC-------CTGAGAAATTTAAAATTGTTTCCACTTTGAAAGATTTTACACAAAACACTTGTTTATGTACGTAAAATGTATTTGCTTACAATTATTTGCTGAACTTAATTAACAATTAACGAACAGTGCATAAACAAATTAGCTTTAGTCAATGATTATGCCACACGTGTAGATCCGATGTTGCAGGCAGTCGGTCGCATTCTACCGTATCCGGATCTTCATGCCACGAAACAAGCACAATTTTTGTCGCTCATTCGAAATTGTAGAGTTAGTGCTTATGAAAATAGAAATACATGTACATCGAAGGATATGTGCAAAAT-----------------------------TGGTATATAAGTTGCCTGTTTTAAACAAA-------AACGAACACAATGTATGTTTAACTTCAAGTA------------AAAACAGTTCACAA---------AATTGTGGTATTTGCTAAATTTTAATAGTTCGGTTGGCTTATA--------AGTAGGCGTAGGAGTTAAAGTCTATTAGACGGTTAAATAGTTTCGCGTCGTTTTGCTGTTGTTTGATATTAAAAGGGCATTAGGTTTTTCAATTTTGTATACCCTATTCAGCTAGGCGGAGAATAATTCCAATTAACTGCTATTAAATGTAATGTAATTTTTTGCCAAATTCGTGGTGAACATGAAACAAGACAAGTAATTATATTAATTATGACTTTGCTCATTTCTTATGCACACAGTAAATCACACAATAAAAATGCCATTTGATCGTTGTTTGGCACTAATTTAAATAAATAGTGATCAGCTAATTAAAGAGGAAAACATACACACGCATATAAAA------AATATAACATAGTACATACTTATC-------TACTATATTGTTGAATTTGTGTAGTGAAATTATTAACCAAGATTTTGATAGCGGACCAATTTGCGTATAAGATTTCAGAAATCAATTTAGATAAATTCTCTTAGTTTGCCATAGA---AAACAAATGCATAAATAGTATATTATTATATAGAATTCTAATGCCAGCCTTAGTT--AAATCTTA-------TGCATGCAC-TAGGTTTTTGCTTA--GTTTTCCTAGATTTAGTTAAGTTTGTTGGGCTCTTGACAGCAAAACTGGTTATGGCTTACATGTACGTGCCGTGTATTGGAGTACA--------ATATAATA--------TAATACATAAAATGGATAATTAGTTGCATA------ATAATATTAAGGAAATGTAATTTATATGTAATACAGCAACAATATGTATGTATATGTAATTCAAAAGTATAATTTAAAATACAACGAATGAATATATTTACACCG-AATTATTTTTAATTTTTTTTTTTTATGAATATACAT-TACAATATAATTAT-TATACACA-------CAACATATTAGTTGT----ATATTGAGCTAGTTTATTCATGAT---------GAATATTTTATTACTGCTTACATTT--TAAATATGCAGCTAACACAGACAGACACACTCAATGCTAATAAGATGTTGTAAATATGAACAAAAAATTCAGCAATTGGCATAATTGGTATATGTATATA---TACAGGCAATATATACTGATAATATATATATATATACAGTTTTGGAGTGGCCGAAAGCAAAATA--TATATACATGTAATAGACAGTTTTGGGAGGCCTATTAATGACACTTAAAAAATCTTATTGTTGGAGATTTAACTT-ATAATAATTATCGTGCAAAAATTAAATAATTACACGCAAAAATAATTTAAATAAAGAATAATTTAACTACGAAAAATATCAGCTGGTAACAAAA
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>CG8526 5629133 5629861|5793 chr3R 5629354 5632180 scaffold_29 429172 432080 + 104107|0 551
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AAGCGACAGAA
AAGCGACAGAA
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GCCGACG--ATGTACGCAACTCCAG
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ATATAGACTACGTATTTTTGTTTATTGTTAATCTTTGTGTTTATCGAACATTGTATCAATGTGTGTTATTGTTGGTCTCGGGGCACTTGTTTGTGCCAATTAATAGGAACTAAGCTGGTAACCTTTAAGCTGCTGCTGCTGGC-GGCACTATTAGACATTATGAATAAATAATTA-AGCAAAACATTATGAATTATGA
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>Syn 6045501 6047805|6219 chr3R 6042771 6047288 scaffold_33 460680 465598 - 116897|3095 5187
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>Syn 6045501 6047805|6220 chr3R 6047377 6051120 scaffold_33 465719 469748 - 80928|0 557
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>CG14685 6592218 6592485|6732 chr3R 6590282 6593443 scaffold_3 5076631 5080049 + 59442|2199 2582
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TTTCAT------AAAGTCATGCTTAT-----------ATTTAATAT-------AAAT----------ATTACTGCTATCGATAAATACGCGTGCAT--TTACAATTTTTGAAAATATGCGATCGATCAGATGGATAAATGTAAAATTCGGTATTGCAATTATTTTATGTAAATGCTCT
>Rbp1 6611243 6612194|6753 chr3R 6611767 6611970 scaffold_47 55521 55718 - 3542|0 208
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----ATCAATTTAATT--ATCTTCTTATGTAAATACTTACTGTGACATGGTAACCTCTTATGCTCAGCATTAGTTAATTGGCCACCGATACTT--AGTTCTTAATAGGTAAAATATCATATGGGCTTAATGTTGTAAATGGCCAT-TTAGTCATTAGCATTCAATTGGAATGGAAACCATCTAGACACTTTGGCAATGAAACATGTACAAATACAAAACCGT
CAGCACCAAAATAGTCGAAAATCAATATGGAAATATATGTATTACTATTATAATATTATTTATACAGTTATCTCTTATTAGATATTTATAATTGAAGTTGTGCAAACATAA---GTAAAGAGTTCTTTTTATTATTATTTTCTTTATCAGTTACAACTTTTAAATTGATCTGGCGATGTCCTTA----------AATGATAAATCTCTAAATATAATACTGT
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GTACCA
GTAACA
>CG4509 6674202 6674224|6802 chr3R 6671262 6674289 scaffold_47 120945 123983 - 107500|3055 3077
AACGATCCATTCCAAGCCCCTAC
TGCTAACTTTATGAAACATTT--
>CG4511 6681490 6682351|6810 chr3R 6680997 6682132 scaffold_42 306736 307814 + 38766|493 1194
--------CTACGGGCAGTCCATCCCACAC----TCTCGATTACC---CAAGCTCCAGCTTTCGTTCCACACTCCCACACAAGATACACTCAAAAGCGATGGAGTAACAAAAAC--------GGACACACACAAATCAAAACCTAGCACATGGATCT---AAACCAATTAGGCGTACTCTAGCGTTATTTATTTAATTATACGATTCCGATC---CCTCTGCTACGGTCCC---------ATCGCCACCTAGTGTAAGTG----------GCTAATTCGGTTGCCTTCCCCCCCGATTATGTGCTTTAATATCTATCAGTTCAATCAGCTGCCTCGAAGGCTGCGCCACTCTAGCGAGCTTAAGCGAACTCAAAATTTGATCTTTATGGTATTTGCAATTCCAAATGAA---TGTGCACCCTTTGCGTATATATGTTAAGTTGAGCATAGTTTTACAAACTGCCCTCGCCCTCCAGAAAACGGTGTACGTAAAACAAGAAACTAACATACACAGAGCATAAAAGACAAGAAACTAAATATCTGGCATATATATATTTTTAAAATTTCGATAAAAGGT-GTATTGCATTTCCTACAGTAGAGGTAACTAACACTTACATATGTACAAG-TTTTTATATTTATTTTTGTAATTCTACAAA-GCATCAA-AGGAAATCAACG----ATTAAATAGCATGTTCAAA
TGTGGCGCCTACGGCAGCCGCAACATAAACAAAAACACAACCACAAAGTAAACACTAGC-TGCTTGGCACTTTGTTGCGCCTGGAACACTCAACAAACAAACAAAACAAAAAACATCATATGAAATGAAAACAAATCAAAACCTAGCACATGAATGTAGGAAACCAATTAGGCATACTTTATCGTTATTTATTTAATTATATAATTCCAATCGAGCTAATGCTACTAACCCTAACCTTAACTCTCCATGTCATTGGGGTGCTCACTGCGAGCTTATATGGTTGCCTTTCCTCC----TTTATATTTTTACA-----------------------------------CACTCTAGTG-------GCCAGCTAAAAGCC---CCTCTATGTTGTTCG---TTCAAAATAGGCCTTGCGCGCCTTTGGCACA-ATATGATTAGTTCTAACTCGTAATGAACACC------------------------TACGTAAA-----------------------TATAAAAGACAAAA----------CTGGCATAGATTTTCTAACAATATCT-GACATTTGGCAGTGATGCATTTCCTACTGTAGAAATAACTAAC----TCACATGTACAAGTTTTTTACATTTATTTTTGTAATTCTACAAATACATCAACATGAAATCGACTTCACATTAAATGGCAAGTACGGA
>CG4570 6683568 6683796|6811 chr3R 6682593 6683713 scaffold_42 307967 309039 + 25277|1010 1174
CCAAGCTGTGGATTC-----------CAATCGCACCCTGATTCTTGAAT--GTTGTATTGAAAATAACGACGTTCATGATCTTGTTTAA---TTTGACATATTAT-TAAGTTTGTAGTGGCCATATAATGT-ACATGGTACACTCTGATTAGATTCG-CGGCGTA
CCGAGCTAATTGTTTATCTTTTGTGGCAAATACA-CTTGATTATTATATTAGTTGT-TTAAGCACAAACACATAATTGCTTTCATTAAACATTTTAGCTTACAATGTAGGTTTATTTT---TATAGGATATAACATTGAATATGATTGTTAGAATTGAAGGTGTC
>CG4570 6683568 6683796|6812 chr3R 6683714 6685700 scaffold_3 1175321 1177358 - 47680|0 87
GGATTAAATATCTTCATT-----TTTTGAAACTATAACTATAAAAAAACATATACATTTTAATAAAGTGTAAAACAATATAATATCAA
GAAATAAAT-TCTTCAATAACAATGTGAAATTTATAAGTATGCAAACACTAA-----------GAATTATATAAAAATAAGACATTTA
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GA
GA
>CG4596 6700380 6701311|6823 chr3R 6700421 6701385 scaffold_3 1197395 1198340 - -450|0 947
GACCATAAGTGTGATATAAAAAACGTAAATTACATACGCAGATCAACACATTAAGTTTCCTTTGGCCAAATTTGTTCCTTTCAACTTGACATGATCGCGTGTCTCTGCAATTGCAGCTTTAGTGAACGGAAATACAATATATTATATATATAGATATCAACGCCACAACATACATAATCCAAGCCCTAGAAAGTCTTAAGTTACTAGAGATCTAACACTCGCACAGCGTCTATAAAGCAAGGAAAACTTCTCAATAGTTTGGTAGTCCGAAACTGAAATAATCTTG---------CAAGTGTCAGTCAAAAGTAGCAATTGCTCAATAAG--TTAGAAGTTCAAATTCATTTTT--TGTCTGAACAGAAATGATGGGGTAACCCCACTTAACCAAAT-------CATCGTAATTTCGAAAATAGTTTACCGCATTAGCTGCTTGCTTATCTCAAATCCATCCAATATAGTTTATGACAATTTGCAAGGTTATCAAAACAAAAAAATACAGTAAACTGTTGTAGATGGGCACTTGCCTACGAACTTGAAACTCAGCTTTCCTTTCCTATAACT-------CAAAGCCAAATTT----AAAACTGTTTACGGAACGTAATAGCA------TTTACAGAATATGA-TGCATTTATCTTCAAAATGAACTAAAACCAAATAAAACAGCCAACTTAATGCGCAGTTGACGTGATGG-AAACTTTTTCTTAGTTTTAAACAAACATTTTTTATTTCTACGTCAATAAAAAAAAACGCAGCAAAGCCACACGGACATTTATACACATAC----CTATATAAGCAAACGTTTTTAAAATAGAAATTCTATATGTTAAGA------------ACCCGAATATCAAACACTTATTGAAATGAATATATTA-GCCAGAGAAATAAAGCCAATAAA-ATCGTATAGCAAACACAAGCAAA
AACCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAC---AATTAAATA---AAAACGAGACAACAAAATTTAATTAGCAAAA----------GCAACGCGA-ACCGTCGCA------GCCAATTAAAG---TAGTGCTCGG--GTGCAGT------CATAAATTAATTTGAATTCCATCTAGTATGGGTTTAGCCCCCCTTTAACTTATCTGGTATT----ATTTATGATTTTCATA---TGTGTACAACAATATAA--TCCCAAGCACTACAGGCGCATCATATCGAAATATTTTTGTGACGGTTTCGATTTTCGACCATATGTGTGATAAACCCAATTAGAATCATAAAACAAAACAAATATCTGCCATGCGTACAGTCAGACTAAAGT--TTCCTTTTGGCCAAATTTGTTCCTTTCATAGCCTTCATATTTATTCTAGATATTAGGTTACTTCTCATCT---ATATACTCGA-ATAGCCGTTGAATGTT----------TCGAACTAGCTGATTACTGCAATTTCTTGTTTATTTTTATATGTTT------------TTTTTGTTTGTTTTCTTCTAATTCTTAGCACAAGGCCAAATTTTTAAAGAACAGCTAAGAACACATTATAAAAATATACTCCAGCGATGACGATTGCATTTA--ATGATTATGCATTTATATTAG--AAAACAATAGTTTAACAGCGTAGTGGCTATAAAGGCAAACTTTTTCTTAATTATAAGCAAACAAATTTTTTAGCTATAAGTATCAAAAACAGC----CAATACTATATATCTATATATATACAAAATATGCGATATAAGCAAATGTTTTT-AAATAGAAATTCTACAATTTAAGAGGTATATTTAACAACCGGAAAGCCAGCGCTAA---AGATG-ATATACTCTGCCACACACAT--ATTTATTAAATATCTCCAATGAGTCGTGAACGAT
>Sodh-2 6703788 6703988|6826 chr3R 6703590 6703938 scaffold_3 1207860 1208241 - 8976|200 385
ATACACA----------CTCTTATCTATAAACCGAATAGTTCTTATTTTTGGAGCCTT--GGAGCAA-----TTCCGAGCTTGGT-----------------TTGTTATCGCCTTCAAATTTTTCGCCTATATTTAGGTTGGCTGCTGACTTATGT-ACCTACATGTGGACATGCAGATAAATATA
GTATACATCATAGTAAGCCCTGCATCATAGTTCAGAAAAATGTAATACTTGGTGCGTTACGGAACAATAAATTTGTTAGCTTGGTACAAAATTTAAGTTATATTCTTAGAGTTTCAAAATTTTAACACGATTTTTA--TTCGCT--TAGCTTCAGTGGTTTATCTTTAGACTTGCAAAAAAATATA
>CG4674 6720957 6722145|6838 chr3R 6719981 6721123 scaffold_3 3797592 3798755 - 42539|1007 1216
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GATGCAAT---CATTGCCACGCCCCTATGTAGTTCATTGCCGCCCAGTTATACCTAAGCTTTGCCCAGA---AACGCTTCAGGTTTACTTTAGAGTGCTAACAAGCAT--AACTATTAACTATATTCTGGA-GTTGTGTATCTCAATCAAATGTTACAAAACGTATCTCGAATGAGCAAATCGTAACGAAACGAACAATGCCATCAAATT
>CG4674 6720957 6722145|6839 chr3R 6721223 6721691 scaffold_3 3798863 3799334 - -1407|0 512
ATTTTTTTTATACACATTGATATTGGAATACTTTTTGTTCAATTGTATTTTCTTTTCAACAAAAATGCGATTTGTTTCTTTGCCGTGTTCT--------TCATAACTTAAAAACTTGAATAGCCAGAAAATATTGAAATATATTATATACTTGCGAAGTATATCGAATCCTAAGCGAAAACTATTTTGACAATTAACTTTTACTAGGCATACATATTATATTCGAACAAATTCAA---AATTAGTTTAAAATAAGATAAAAAATTGCTAAACGAATTATTTAGGTAAACGAACAATCAAGAGAATTTAACTTTAGAAGTCTGTCTTCGTTTGAACTTTATTG---------------------GCTTAGACAGCCAAACCTTGCGCATTTCTGAGAATTGAATCTTGCGAATTACTCAAAGACTCATGAGTATTTATGTCACCACTCACTATACTCGAAACATATTTCCT------------GCCCGCCTATTTATCTTCCATTTCTTATTTA
ATTTTGCCTAAATGCAACAGCAAAAACCTTGCCTTTGTATGGCTGATTAGACTCGTTTATACTAACGCCAATTTTGTGTTCGCACCTTTTTAAAAGGCGTGGTAGCTACAGACGTTCAATAACTACCGAATAGT----TAGCTTGTTGGCTT---AAATAAATCGTGACTAGATTTAAACCATTTTAAGCGAATATTTTAAATTAGTTAAACGAAATTTACTCAAATATCGTCAACTCAATTTGTTTGAAGAATCATAAAGAATT------TAATTTATTTTTGTATAATATTATACTGTAAAGCACAAATTT--TAATTATTTTTTGCATAAAATATCTTGCAATATTTTTTCCCAAAAAATGTTGAGACAGC-------------TTTAAAAAAACTGTTAATTATGAAT----------CCCAT-ATTATTTATG--ACAGCGAACTGTGTGTGCGTTTTATTGATTTGAAAAAAAGAAACCTTTTTTTTTAAATTCCCCATTTTCTTTA
>CG4674 6720957 6722145|6840 chr3R 6721779 6722135 scaffold_3 3799410 3799719 - 2781|0 376
TTACTATTTATTTCTCTCACTGCATTACGTGTTTAGCATTTAAGTACTTAAGCACAAATCGAATATGTTGAAGGATGTTTTGGTTCTTCGAAGACGCGAAGAATCAATGAATCAATAAGCTTTAGTGCCTCTGTATGATGAACAAATCGAATGGTTATCG-TTGAAAAAACACACACAAAAGTA--TCGACGAACAATTTTTATACAATGTCAACTTTTAGTTTTAAGCGCACGAAAGTATATTATGTACGATCAAACGATTTCGTTAAGGTGCTTTACAAATCAC--------TATTTTTGGATACCAATTTTT---------TTTGTTTTCCTTTTGATTTACACACACGAAAAACTGAATAAAATGTTAATATA
TTGTTATTTATTTTTTGCACC--------------ACATTTAAATAATT-------------ATATTT---ATAATATTTTA----CTCGAATACGCACAGCTAAAGTGAACAAATTCGA---AATGCTTTCG----------AAATGAAATGTCCACTGATCGATAATCGATATCCAAAACCAATTTATCGATCGATACTTGTCCTATGTAAG---------TTGCACAAACCAAATCAAAACAT--------AAATTATTTCGCTAAGGTGCTTTATTAATTATTCAGCGAATATTTTTGGA---ATATTTTTATTGCTGTATTTTTTTGACATTTGATTTACGAACGCAATGGCGCCAATAAAATGTTTACATA
>CG4706 6965326 6965472|7122 chr3R 6963061 6965371 scaffold_3 4086450 4088741 - 112543|2270 2315
TTCTCATCAATATTCACTTTACTAAATTACTACGTTTGTATCTCAT
TTCAAATCGATATCAATCGCAA------ACAGCATTTGTATCTGAT
>Ugt86Da 6985203 6985469|7145 chr3R 6983790 6985246 scaffold_3 4104522 4106030 - 61713|1493 1536
GCTCAAGTGATAAATAAGTTTGGTTTCCATGACCAGTTTAAATT
GTTAAA-----AACTAAGCTTAAGCCCTAAGACATGTTTATATT
>Ugt86Da 6985203 6985469|7146 chr3R 6985247 6985453 scaffold_3 2389383 2389612 + -711|0 239
AGGGTGCTTACAAACAAATTAGCTTTTAACTGGCAATAATAGAAAAATACTTATTAAGTATTAA--GAATGAATAAATTAGGTATAGAGTTTCATGAAAACT----CCTTCCCATT-----------TTCAATTCAACTCCAAAGTAAAAACAGTGAAATTT------TCTCATA----------ATTTTCTTAATGTATTTGTTTGAAATAAAATCAACAAAAATATATTTGGTATTTA
AAAGTGATTGCTGTCAATTGAATATT--GTTAAAAATAAGTTGAAATTATTCCACGCGTAAAAATTGTAAAAACATATTATGCACTGTTCGCTCTTATAATTGATGGCTTTCAATTGACTAAATTTATTTAATTAATCACAAATTTACAAACA--CAAATCTACCCAGTTTTATAGTTGATTTATATTTTTTTTATATATTTTT------TATATTAGATAGATAGATATTTTAAAATCG
>Ugt86Da 6985203 6985469|7147 chr3R 6985455 6985672 scaffold_3 4106031 4106252 - 2553|0 14
GGATTTTTCCATAAA
GTATTTT---GTGAA
>CG4757 6988798 6988868|7151 chr3R 6986849 6988837 scaffold_3 4107375 4109340 - 64318|1988 2027
GCATCTTTAATAAATATCTTATCATAAGTGATGAAATAAA
AAATATGTCAATGTTACTCTTACACATATGATGACATGAA
>Ugt86Dh 7003225 7003679|7166 chr3R 7003148 7003564 scaffold_3 2342026 2342441 + -2091|77 441
AATTAAATTATTCCTGTCAACAGCACATCCAAGACATGGCCAATCGGCTACCTTTTGTTTTAAAAAGTGTGTTAGGCAA----------AGGTGTTATGTGTCATTATAT--TGTAGCATTGTAAACCTAGATAGGTTTAAATAAAAAGCATTGTAAAAGCGATCTGATCAT--GTACAGCCATGCGAATGTTCTACCAAACTTTACTTCATGATTCGCCT---ATCAGCATTACAGTTTATAATTTTACGT-CAAT---CTATAAGGTTAATCTATAATATTTGATGGTATGTGTATGCTG---ATATGAGGGAAATTTA-ATCGCCAGTATCGTAAAATAGGCGTATTTATTGTAAATGTTTA
GAATAAA-TATTCCTATAGCCAATGGCTCGACAATCTACGATATTGGACAAATACTGCTTTATCTAATCTGAATGGCAATTACCGTTTTAATCATTGTAAGTGTTTATATGATTTTGTACTCCATAAGTGTCTATATATGTATAAAATATATTATATATGC-ATATG-CCATTGGTATATTAACTCGGATGCATTTCCAATTTATTCATT-TGATTTACACGGAATATGCAACCGAGTTC-CAACTCTATGTGCAATATGCTGCTATGTGAATTT---ATATCTAATGAATTTAATATGTCGTCTATATAAAAGACTTATATATAATACGTACAAACAAATAAGACTATTCGTGTTACCTTCTTA
>nocturnin 7034179 7034357|7193 chr3R 7034216 7034334 scaffold_3 4166043 4166177 - 3470|0 142
CAATAACATTACATCGATTGTGATATTAGTTGTTAGATACATATTAGCCTCATAC------------------ACAACCGTTGCAC-----TACAGTTTGCAGCTTTTACAAATGATAATCCAAAATTCAC-AATAAATAAAT
CAATTACAT--CATAAATTGTGATATTAGTTATTAGATACATTTTAGCCACTTGCATGTACATGCAAAACTTTATGACTGTTGCACATCAAAACATTTTCCGACCTT----AATG--AATTCAAATTTCACAAATAAACGAGT
>Tctp 7036622 7037006|7195 chr3R 7035748 7037194 scaffold_27 1309682 1311331 - 30905|900 1505
ATGGATCCCAATCCCCC--------------------------------------------AAACAAAAC--------GGAAC----------------CTATACTCATGCATACCT----------------------TCTACACACATATACATATTTATCAGATGC---------------TTAGTTACAATTTTGAAAGTCTTAAATTTATGTTTAAAAACGCTGACAAAAATGCCTGTCTTCGATCAG----------TGCGATTTTATATCTAATTTCTTTTTACCGGAGCGCTTATAAATTCGAC-----ATTGTATG-------TTTATTGTT-------------------------------------------TAATCACAGCG-AGCT--AAACAATTCAATTGCGCC---ACCTATTGTAATTAAAA-----------TAATAATTTGATAGCAACACCTACAAATTAGTATGCATTTTCGCTAA--------------GATATCAAAAAGCAACGA------AGACCGAAAATGGGAACACCAGTACTGAA--------------ATTAAACGGAACACCTATACAAAACAA
--AGATCAAACTTCGCCTCTGTGTATGTCTCGATTTGCTGACTTGCGGCAACAGTAACAATAAGCATAGCCTAATGCAGGAACAGCAGCAAAGCCACCACTGTACATACACACACCCAAATATGCAGACAGATAGCAGACACACATACTCACGCATACCTATTACATATTTCTAACGGATTTTATTAGTTACAGTTTT-----TCCTAATTTTTGGCAACAGTTCGACGAAATTTATGTTTATGTTTAGACAAGGTCCAAATTTGCAATTTGATTTCGCAATATTATTT-----AGTATCAATGAATATAACTGTTAATTGTATGAGCAAAATTTGTAGTTGTAGCATGAGACGAACCGGGAAGAACAAGTCCACCAGGAGCCACACTCACAAAGTAGCTAAAAATAACTAAATTATGGTAAAAACTATTGTAATTGAAAACAGCGTAATTTAATATTTTTATAGCAACAAC-GCAATTTTGTATGC--TTTCGTTAACGTTTTGAATACGGATTGTCAAAAGAACATGATATTCTGAAAAAAAAGTAAGAACATTTGTATGTAATAAAAAAAAAAAACATTAAACGGAAACCATATACACA--AA
>CG4820 7043601 7043620|7201 chr3R 7042256 7045748 scaffold_42 377094 380862 - 50768|1444 1463
ATCCAACTAAGTGAAAATTG
ATCCTATATCTTGAAAAAAA
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TGATGAGATGGTATCTGAATGACCT-----TTGTCGAAAAACCTACTACCATTTCTGCTGCCTTCCTTCTGATCG--------------------------CAGTTGCAATACAA-------------------------------GTTGCACT---TGCTGCGTGTG
>RpL3 7048862 7049171|7205 chr3R 7047617 7050667 scaffold_3 1862529 1865417 - 130939|1310 1620
GCTGTCAGGTTAATCTTGATCATGGGGCGCACAAGCAAGCCCCTGGTTAATTGAAATTGCCTGACGAGTGAGCATGACAAGGAAGACTGCATCTCCGCTCGCCATTCGTTTGCGATGAGGCGCACTTCCTGTTCTATCTCGC-CCCACATAAACAGCGCGGCTAAGAAGTTGGAGTTGTTGCGACACCCCAATGGATTGCTACATTACGCTCGTTTCTGACCACTGCGTCTCCAACTTGACCATCGTCCATATCAGGTACAAGAGCAAGAAGAAGGCATTCACCAAGGCCAGCAAGAAGTGGACCGATGAT
GCTGC---ATTGACC--AATAATGTG--------------------TCAATTG-----------TGAGTAAGCACGTCATGGAAGATGTCATCTCCGCTCGCT-TTCAATTGCGATGAGGTGCGCTTCCCGTTTTATCTTTCGCCCGCACAGAC---------------------TTGATGCAGCGTTC-GATCGATCGACTCCTCGGCTCTGTATTAATTCGCAACGTCTCCAAATT------CGTTCCAATCAGGTACAAGAGCCAGAAGAAGGCTTTCACCAAGGCCAGCAAGAAGTGGACCGATGAT
>RpL3 7050573 7050897|7205 chr3R 7047617 7050667 scaffold_3 1862529 1865417 - 130939|3038 3157
AC-----------AAAATGTCGTGTCCGCGTTCAATTGTCT--------GCTCGCTTCTACCACCAACTGCTGCGGTAGGG-CAGCGATCAATAAACA-----GATTTTGGCTAAGCTGA
GCGCAATCTTTGTAAAACATCAATACAAAATACACTTGTTTGGCTTATAGCTGGCTTCTACCGTCTGCT-TTGCGGTAGAGTCGGCG--CAATAAAGAAATGTGGTTTTGAATAAGCTAA
>RpL3 7050573 7050897|7206 chr3R 7050785 7050977 scaffold_3 5566382 5566548 - 170|0 112
TGTACATACCCAGGCTAAATTGTTATTTATTATACCTCCTTAGAGCTAAAAGTAAAATAATATTAGGACACTAGTAAATAGTTTATCTACAATAAAAGAGTACCACCAAACTT
TGTGCATATCAATGGTGG--TATTCCTTATTTTATTTATTTAATTTTAAATTTAAATTCAATTTA-------------TAAGTTAATTAAGTTAATAAATTGC-ATAAAACGT
>scpr-C 7052100 7052312|7209 chr3R 7051204 7052188 scaffold_3 1866986 1867989 - 44182|911 1011
GCATGGAATGGA------CTTCGATTGATGGGACAATGGAATTTGATTAATATGTAACA------TTTTAGTTTAAGAGTGCTAAAAGAATAAATTTTAAT
GGAATGAGAGAAGGGGCGCATTAATAGTTGATGATTCACAATT---TCGAAATGTAATACAAAGCCTTTAATTTAATAAAAC---AAAAATGCATTTGAAT
>scpr-C 7052100 7052312|7210 chr3R 7052189 7052449 scaffold_3 4596569 4596828 + -1333|0 126
TATTTATGTTTGCTGTAAGTAACGGATTTGTGCTATCCAAACAGCTGTTTGCCCAGCAAGTGGGCAGCCCCCTTTATACACCC---TGTAACTGTGGATAAAGTATTCCAATTTATTGGTGATAATT
AAAAAATGCAATCCATA----------CTACGCTATATTCTTGTGGGTTGCCATAGTAAATGTGCAG-------TAGATAACTCGGTGCATCTGTCGTTTA-----TCAAAATGAGATTTGAT--TT
>CG17726 7053893 7053960|7211 chr3R 7052450 7054207 scaffold_3 1867990 1869782 - 73855|1491 1563
TTATCTATTTAGGATCTGTTTGTAGGGTTTTAA-ATATGTTGCACATGAT----TGTTGAACAAAAGTACGAA
T-ATAACTTTTGTATTTATATATATATATGTAATCTGTTCTATACATGATCTACTGTTAATGTTTCAATCGAA
>CG17721 7061639 7061788|7220 chr3R 7061126 7061697 scaffold_3 1876694 1877334 - 1692|581 643
GTATCACCTAGTGATCATGCA--GCCAGGCAAAGCCATATATCAGCAT--AAGCGTGCACTTA
TTATAGACAAACGGTAATACAATGTCAACTAAAGCAATATCACGACGCTAAGGCGCACACTTA
>CG17721 7061639 7061788|7221 chr3R 7061699 7061783 scaffold_42 388076 388168 - -192|0 94
TGCAAGGCTCAACGAATTT--TATATATAACATTAAGTCGAGAGCAAAGAAGTCTGATTAAGAT--------TTTAGTTCTGAAACGAATAAAAG
CGAATGTCTCTAAAAATGCACTAAAAATGCCATTCACCCAAAAATGCTGGAATTTTAAAAATATGCAATTATTTTGATGCCGTAA--ATTAAAAA
>CG17721 7061639 7061788|7222 chr3R 7061784 7062628 scaffold_15 1735449 1736299 - -815|0 4
TTAGA
TTCGA
>CG31441 7063225 7063349|7225 chr3R 7063115 7063360 scaffold_15 1737014 1737280 - 1675|130 265
AATTCATGTGGACTGC---TGAAAGTACAAGTTTATTATAAGATTCCTAAATTGAACAAATTGATTCTATTTTTG-ATTTGATGGTTCTAA--AAGAAGAAATAATC-----AAAATGTACACCTGTGACATCAAA
AATTGATTTGAATTTTGTATTCATATACATATGTATAATAAG---CTCAAACTTTTCAACATGTATCTGCTTTTGTATGTGTAGGGTATAATTAAACAATAATAACCTTCATGAAGTGTACATTTGTGATTTTCCA
>CG31388 7065760 7065838|7233 chr3R 7065588 7065799 scaffold_42 392003 392215 - 2044|176 219
ATTCATTATTGCCAGTTG----CATGTTAATTATATATACCGAA
ATTATTTACGACCTATTGGAAACTTATTAATTCTGAATTCCCAA
>CG31388 7065760 7065838|7234 chr3R 7065800 7065857 scaffold_3 1865731 1865789 - -449|0 41
TT---GATATTAATAAAGCTTCCGTTCCGCGTTCATGTTTAA
CTTCAGATATCAATATAATCTTCTCTCTCTATATATATATAT
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ATGCT-------------TTTTCGATTCTTAGTCCATAATTAAGTTGGCAAATAAA---------AGCTAAAA-----GAGC--------TTATCATTTGA---------------------------AA
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GGACGGCTGAAGTCCGTTAGCGCTGCGTCCACGTTGTTCTAATGATATTATCGAATCGGTTATTTAAAACTGAAGCACAGCCAAATTCATTGTATAAAGCGGAACTTTTCATTTATGTATTTATTATAAATTAACGAGTGTGTCACAAATCGACTTAAATTTTGGGTTTAATTAGCGCAAAGTACATACATACACAAGAAATAATAAAATTTAATAACGACGTGGAATTGTTTTCAAAACATACCCATACTAGATTTATTTTCTGCACTTTAATAACTGCTGTTTACATGCACCTGCTGAAAGGCAATATCGTTAATAAATACGATACCGTTATCGACCAGTT----
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GTGGAGGAGTTGGCTATGCCAACGATGCCACCACCCCA--------GAAT----CAACCTACGAACCCTGCTATGACTACCACAAC-------------------AACAACTGCAA------CAACAGCAATGCCGAAAGCGAAGCGAAAACAAAAGTTAAAAAGTTAAATCTACGTAAGAAATACAACTGGATATAAT----------GCATATATAA-----------CATTTGTATTATGTGCACACTCACACCAAAGAGGCAACACTTTTCTTAGGTATTCCCCGGATTTTTCTTTTGGCCTGT-CGTCGAAAATGAATAGAATAACCACAACCACAAGAAAGAAATCAAATTGCAATCGGAAAATATTTCTGTAGAGCCGTAAAATATTTTTTTTAAAATTTCGCAAAATGCCGTCGTCGCTCTCTGGAGCTAAACAAAAGCAACAAAATACACAATAATAGGCGAAAGTCGCATTAGGTTTAATGCAACAGCAAAATCAAATAAAAACACACTTA---CACACACATACACACACAATATATATAAACATGCCTCAGCCTAAAACGTGAGCGCTGAAAAGTATGCAACGCTTTTGATCATCTACCAAATGTTGTTCCATCAAAAGAAAAAAAACAAGAAATATAGTGCAAATTTAAA----ACCTGAGCCGGTAAAGACACCAGCACTCTCACACTCACACCTACACACACACACACACACACACACACACACACATAAACGCATACACTACAATTGTATCTATACAGAGTGTAAACTGTACTCTGACCGTTGGGGATGCTAGTTGAAATTTTTTAAAAAATATTTTTACTA---TACGTTTA--TATTACAAATACATACATAGTTGAGCAATCTATTAATCTACCGAAAGTTGACACACATTCCAAAG----------ACACAAT-------CTAATCACAAACAAACACATACACACACACTTTTACACTTCGGTACA------GTTTTCGC---AGAAATTTAAAGTGTGTTTTTCCAGCCGATTGAAAAGTTCTTTGC--AGCTGGAGCTGTAATTGATCCAATTGC-----AGACAAACTTTTCTGAACATCTTTTAGACGGCAATGTTGCACAA-GCTTTAAAAAAGTGTCCTGCAATGTTGTCGCAAGAACAT--------------AAA-----ACAAATTAACCAA--GTTCAGGTTGCTTATTTCCTTTT-----------AACATTAAGCACA-ATTCAATGTCTATAAAAAAGCAAAAAAAAAAAAAATACAAAAAAAAAAAATAACAAAAAAACAAGAGAAAATTAATCAAGAAAAACGTAATAATTCGCGAGTAGTATTTACAAAGAAAAAAATTAATAATAATTTGTATTAGCAGCGGGCGTTAGGGTAGTTAAATTTATT---------------TAATGTTATGCAAACAAAAATACAACCAAAGTTTATTGTTAATGAGCTAAATTTGAATGCGATTTTTTATTTTAAAACATGGCCCATCTTTAAATAAAAATTTT---TGAATGCACCTAATTGTGCACGCATATTAATTTTTTAAAAC---CAACACACACACATACACACAA-ACACACACACACACACTAGTCTGTTATTTATGTACATA-----TACGTTTAATTGAAT-AGCATTCGATTTAAGTTTATGTTTAGTTTAATTTACTTGGCCTTAAGTTGCAACAAATATATAAAAAACCAAATATATACACAAAACAAGAAAACCAC-
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GGGAAAAAAAAAGTTGTTAGTT-----TGTTTAATGCAATTAAAAACAATTAAATAAATGCATATACATCTG-
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--------------ACGCTGAGCGCTTAAACTGCTTTGTTGTAGACATTCGTCGTTAGTTGTTAAACTGAAATATGCTGAATG----TTAATTAGACTAAGTGTTGTTAGATTGC--AACAGGATCTGGATATCAGT-GAATGAATTGTTATAAACTTA
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TTTTA------AAAAAAA
CTTTATTCGTAAAAAGCA
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TCTCACAGCCCATTGTGTTAATCGTTTATAATTA---ATTGTTATCAAGCATTTAATAAATGAATACCTTTATATTTGTAACGTACATTTATA
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TAACATATTCAATCAGGCAAT-ATATATTTTAATTTTATTATTGCTAGCTTTATTTA--------AATAATTTAGTTTTAGAACAATTGATTTTAAAACT------TTCCAAAAGCCAATGCGTTGGTCAAGTATTTCTTACTCTTTG---CTCAAACTCATACAAAGTA--CCAAATTATAATCATATATAAATATTGTCAATTTATTG-----------TATTTACCAACTCATTGTTATAGTATGTAA----TTTTTATTGTTTATTAAATA---AAAACATTGTTATTCAAACCAAA--------AAGTA----AACCGCCAATTGAAA-----------------------------ATTCATGTTTGTA------TGTATATCGAT------------------AGCTGCCAC-TGCCGATTACCTCGGAGC
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C---TCGCCATTCCAAGCTACCGCACTC--------CACTCTACTT--CGATCCAGGTGCTTCAGTTTTAAACGTGTACATATTGTATTATTGTCCCATACGGTAAGCTTTATATTTATAGT-CACCTAGATTA-----GTCCAGAGATGCTCATCTGCCTCATGAACCGTGACTCCTTGTCCCGTCT-----------TGTACCATAGCACAAAAAAAAATTTTAGTTTATTTTTATTAAAATTGAAATAT
CAAATCGTCGCT----GCTGTGGTATTCAGTGTATATAGTGTATTTTCTGATACATATA-TTTATATATATATATATATATATAGTCAAGTTTATCTATA--GTCAGCTTTAAA--TATAGTACGCTTAATTTATGTCTGTTAAAAGATGCTCATA-GACCAATG--CCATTCATACTTACGCTGTTTAACATACTCTGTTTACCATGTGACCAAATAGGGTTGGCGCTT-TGTCTGTCCGATTGAAAATAT
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CATTTCAATTCCATATTATCGTCTTTGTTCCAGTTAAAATTTCAATGGTATTAATAGACATATTGCTAGTTAAGTCCCAGTTTAGCAATAGTTTAACT
GGTTCGAACTTCAAAG--------------CCACTAAAATTTTAAATGTATTATTAA------------------CCTAGATTATCAATGTTTTAGCT
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GCCGAGCCAAAG--ACGAGCGGCAACTTATGTTCGATGTCTGGAGCCATGGGAGCCCCGTTATTCCT----------GGTGGCCGG
CCTTCGTCTAAGCTCTGAGCCGCAACTTATGTTTGATGTCT---GCTTTGG------CGTTAGCCCTTAGACGGTGGGGTGCGTGG
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GCCACGCCTCCACGTCACAGTAACCGCCCACATTGGAGGAGCCCGGTA--------GAAATTGCTGGATGCGGAGGTTAACGACGTCGATGTCGCGTTGTCTTGTAAATA-TGTAAATTGAGTTTTTGTTTACGTTTGTGTTTGTGTTTTGTGGCTCAGTCTCTAAGTATTTTTATACGTAATTAAGTAAATAGGTGGAGAGAGCATATGTGCTGGCTAGGCTATATATAGTCAATC-----------TTGGCTATGTGGCAAATGGGACATATACATTTTGTTCACACACGATCGCATACCTAGAGATACTAAAAACGAGCAATCGAATCCGAATCGAATCGAATCCGTAACGAATGTAAATAA----ATGTTTAATCTTAATAATAGAT
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CTGCTTATCGACTAGTTCTAGCCTAATCTCTCTAT-CCAATGGTGCAAGCTCATAGATATATATATATATATATATAACCTTTAATTAGATAATATCAAATGCCACTCATTCACACAAATG--AGACAGTCGAGTCTGTGTTTG-----------------ACTTGGACTCTTCTCTTTTAA------ATTAAATGT----AAATCATTTTA----CTCGAGCTATTT----------------GATATGATTTGGATTTT-------------GTTTAATATTAGCT-----CTTGGTTAGTAACTGTTTTAGTTTCGAGCCTGGGCATAGTTTC---TGAAAAACAAACGTTT---------CTTAGTTGTACAATGA
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GGCTTCGAAATAAGAAAAAAAAACAATTACTACTACTGCAAGAAACAGCAACAAATTGTTACTAAACGGAC-----ACACACAAAATGCATAAGTTTTATATATTATATAAAAAACAATTCTAATTGCAAAGTCGAATAATGAGAATGGCGTGCACAAAAGAAAAGGAACTGACAACATGTAAACTTCGAAACGATTATGGGGAAAAACCACAATGAAAAACTGTTTGAACAA------CAGTCAATTAGCTAACTTTCATTCCATGCGCATACAATAATGTATTTGGCAAAAGAAAACAACCGTTTTTTTTTTAATATTAAATAAGAAAATATTTGTTCTAATTTGTATTTTATTAATTTACATTATTTTAACAAGTAGTTGCAATTATTATGTGCGTGCAATTTGTTTATGCTTTTTAAAAGTATTTATTAT-TATTTATTG-TATTACAAAAAATTAAACAAAAACAAATGAAGAATCAATTTTAGATTTAGCGTTCTATAAAACCGTAAACATATCGTATTATTATCATATTAAATTGAATTACAATCACATTTCATTGGCAGCTGCAATGACACATGCATTCTCGATCTGTATTACAAATATACTATATATATATTGATTTATATATATGTATTATTTTACTATTAAATGTTTAACTGTTTCTTCGGTTTGTTTTTAACAAATGCAAATATGTCGTTGATATATATATATATATAGACACATACACATATTAAATTGAAAAACACTTTTGTGGGG-----GAGTTATAAGGGGTCGTTAGTCGAAATTATTAATGA--AAAAAAAAAAATAAATGAAAATACTATTACTAATGAAACCACAAA-----AACCATGCGTCGTTCGATTTTTATATGACTTGAGCTTGGATGTCTG-----TCTTTAAAAAGATCCATCGATTATTTTGTTACCAGGCAGCAAACTTGTATAATGGTTATATATAGAGACTCCAATCATACAAAGATCGATTTTGTAAAGACTATAATTTTTCTTTA--------AATGTTGATTATAATTTGTGAAAGTTGCACTTTTCGTGCCATC
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--TCGAAAACAATGCAATACAATTTCTGTTAGATAATTCATTAA------TGTACATTTAATTATATATAAAAATTGTAAAATAAAAAAGAGTACAAA
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GCTGATATA--------GTATTTAAATTAAAAAACAAGTATTAGATATAAGAAATAAAGCAA
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GTCCGCTTCAGAAGTAGCTTAAT--ATTGTGTTGCTAGTAAAATTATTAATTATACCGAAAAGTGAATGGCTAAAAACAAGTAGTAGGCAGTACGCTTTTTAA---TATATAAATATTAATCGACTCTGGTTCGTTCTGTGAAATGTAATTGACAGACTTCTTCTTAAATTGTCACTAAATAAAAATAAATA-ATTTATAACTATTATAAGTAACGCAAAAGCAAATACATGTT-----------ATTGAAACGAATATGAAG--ATTTTCAACGTATCAAC--GTTCAAACACTTTGAATTTCATTTGGAATATTTTCCCGTGACTGATGAA
----GTGCTCGAAGAACCTAAATAGACCGTGTTTAAATCATAGCCTTAATTTATAAAAAAAAA--------AAAGAACAA--------CAGGACTCTATATGAATGAATTTAAGCTCTAATCTCCATTTATATTTTAGGTCAA---CAATT-----AGTTTTTTTTGGAAGAATGTTAACTGAAAATAAAAATGTTCACGAAATTTGTAAATA----AATGCTAAATGCATGCTTAAAGGAGAAGGCTGAA--GAATATGACGCTGTTTACAGGGTATCTGCTAGTCGGACTCTTTTGAACAGCAATCATAATTGTATATTGTGGCGCATACA
>CG14712 7458662 7459426|7589 chr3R 7458974 7460901 scaffold_27 1321248 1323375 - 40907|0 483
CTAAAAAAGAAACGCAACATTAATTTCATGCTTGTATTCTTTACTTTTATTAAAAGTTTTAGAACTCTCTGCCCTCCTTTAATCACCGCGTTTAAGTTTTGTGTGTTGGTGCATATTT---------GTGTTGCTTTCTCC----------AGGGTTTCACTAACGCATAG-AACTTTCGTTTACAATGTGGATTGAAGTGTGTTTGTAAAAAAATAATAACTTTAAAATTAATTAAATATATACCATGTGGACGTGGATGTGTGTTTGTGAGGGGGTGTGTGTTGTTGGTGTATTAGGTGTGTTTTACATAAAGTATACTAAAATTATGTGTTA-AAGCAAAGTGGCTGCCCTTAAACGAAAATTAAAACGCATAAATGTACAATTTGCTTAAAGGGAACTTTAAAATAGACATTATTTGTT-----AAGTTAATTAGGGGGTAGGTTTTTAAAAAATAAATTACAATTTTCC-----TTTGC
CTAAAAACCAACTTTAAAATCAAAAGGATTTATA-ATTTGTCACTTTTATTAAAAGTTTTATATCCTTCTCAATCTCCAACTCCATTCCATTTAAGTATTTCGTGTTCGTGCGATTTTTTGTGTAAAATGTTGCATTTTTTTTTTTAACTTAGAGTTTGACAAAAATGTTGTGAATTATTTTTAGGATTTGT---------TGTTTTTAAAAAAGTAATAACTTTAAATTAAATGTAAGTTA----ATGTGGACGTGTACGTGTGTTTGTG------TGTTTAAAATAAATGTAA-----ATGTTAAAGCAAAATTGTACAAGTTTCTTATGGAACAAGAAACGTATAAAACCATAAA---AAGTTAAGTAAATTATATGTATAAATTGTTAATATGCATAAATAAATTACAAATTCTCTTATGCTGCAGGGTATTTCATTTGCTGGGTTTTAAAGCG-ACATTCTGATATATCAACTATATGT
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ATCT----------------------TCGACGGGATCATTGG-------ATTTGCGTGCTGCACTCATCCTCCCACCAATCCGTAGTCGTCTCAGTCTCCCACTTTTGTTA-ACTTTCACTGCTTTAAAAATAAATGTAGCATTGAAAT---GCTAATTGAATGTATCGAGATTAAACAAAACGAA
TTCTTGTCATAATTGTGGTCATATTATGGATAGGTTAAATGGATATATAATTTACGTGCAAAAATAGTTTATCTATCGA---ATCGCCGCCTC--TCCTTGACTTTCACTATGTTTTCACAGCTCT-GAGATAAACGTTGCATTAAAATATCACTAATTGAGTTTATTTAT-----------TGGC
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AGCGAATAGGGCCACAAATAGGCATTCCATGCTACACCCAA---AGTTTACTTTCAACTAAAGTCATAAACATTTAATGCTCAAATATTTAAAGTAGTAATTTGTCTTGTTTCTGAAGTGATGCCACGCCACGACCAATAAATAATAATGTCATTCCTTTTATACTAGACCAAA
AGCAAGCAGT------AAAAGGCA------ACCGTAAACAATTTGGTGCACATTTGATTAGAAAACCAAACATTTA------------TTAAAA------------------------------------------ATTAAATAATTAT-----------------AAACATAA
>Ho 7506595 7506698|7631 chr3R 7505540 7508078 scaffold_27 1393726 1396265 - 64690|1107 1213
GAAAAGTAGGAAATACAAATGTAAGCTCTCTTGAGCAAGTTAGAATTGTGATCACACATTTATTTAGTCGTTTG--TTAAATAGTAAATAACCTGAAATTTG-TCTG
GATATGTTAGTTATACATTTACAACCTTTTTTT-----------ATTTTTATGATATATAAACCTAGTTGTTAGACTCAGATTATATATATACGCATGTTCGAGCCA
>CG14717 7523289 7523384|7653 chr3R 7522459 7523315 scaffold_27 1417120 1417997 - 21090|851 877
AGAAACACCTATTTGGTTATCGTTTAA
AGAGACATCCAATTGGTTATCCTCGAA
>CG14717 7523289 7523384|7654 chr3R 7523316 7523445 scaffold_27 1418793 1418947 - 311|0 69
AGTGACTTTTATATAAAATTG-GCATTGCTATATTGGCTGATATTTCAGCACTCAATATACTCCACCGAT
AGGCGCGCATATTGAAAATTGTGCATTTCAATGACAGC--ACATT----CATTCCAAATGTTGACGAAAT
>CG14718 7527809 7528442|7659 chr3R 7525689 7528071 scaffold_27 1427146 1429297 - 22702|2222 2522
--------------AAACAGTCCAGTCCACCTCGTT-----CTGTCTGTG----TCTGTGTCTGTATCTATACGTGTTATCTGTTTTGTGTATCCGCATCTTTTTGTACGAAGGA-----CACTTCTGC----CTTCTGCATCCTGCTCCTTCCGGACTTCTAAAAATTTCAAGTGATTGGAACGCGAACTGCGTCGTGATATCCAGATGCAACTTCA---ATTGAATTGAATCGATTCGATGCGATGCCCATGAGCTT---GTGAGCCCCATCCAAGAACAGCAAGAGCCAAGAACAAAA
TTTGATCCAATTCATAATAGGCCTAAACACCTTACTTCAAATTGATAGTGATAATATATGGTTACAGTTAT-CGAGCTGCCAGTTTTTTTTAATTTAATAACAGTTTGCTAAGGAGCGCCTACTCCAGCGAAACTCTGGCCTCCCAAACTGTCAGTGTTGTTAAAGTTTTCAA-TAAATGAAAAGTG----GCGTCTTTACATGTAAACCTAAAATAATACTTTTTCTTCAATCTATCCACTGATCCATCCA--ATCTTTAAGTCAACCCCTTTCATCCTCAACGTAAATTAATAAATAAA
>CG14718 7527809 7528442|7660 chr3R 7528174 7528361 scaffold_27 350974 351218 + 3744|0 246
CCTCAGATTGCGGGACAAT----GCAAC--TTGCTGAATGGTAATCCACTTAATCCGGGTAACTGAATATTTTACCCAGGCACAAAAG----------------------GCAACCGGAC--------------CCACCTGGCCAGC---TCTAAACGTTTAATGAATTTATTTACTTTCCCGACGCGTGCAGTCAGTGGCTCAG--------------TGGCTCATTGGCTCTGCGGAACTGCACT
CCCCAGCTGGAGGGAAAACAATGGCAATAATAGCTGACAGTAAACCCATTTAATCCGAGCAACTGAATACTTCAGCACGGCACAAAGGATATGCAACAAAAAAGGACTCAGCAACCAGTCTCTTGGTTGGTGCATCACCTGCAGAGCGAATCTAATCGCTTAATGAATTTATTTAC--CCCAGACTGCTGCGGCTACTGCCCCCACCCGGCACCACACCCAGTCAATTGGCTCCGTGGCAAACCACT
>CG14721 7562374 7562565|7706 chr3R 7561192 7562375 scaffold_35 1025702 1026884 - 45367|1203 1204
AT
AT
>CG14722 7569448 7569762|7710 chr3R 7567782 7570410 scaffold_17 1057109 1059630 - 79986|1709 2064
A---ACGATATATTTG-------CTAGCAATGATTTATAGTTGG----------TGGGTCAATGTGAGGCGATTCTACAAACACTTCT--------GTTTACATGAATTAATGC----AATGCTTAATCTAATGACTTTTATGCAGTAGTGTATATTCACAGATTTATTAATAGTAAATGA--ATGAATTGACCCATCAAGATAGAACCTCTTTGAAACCGTCAAAACGTAGTAGCTACCCCAATCCCTA--ATATGTTGGACGAAGA-TTTTACACAAAGTTTCACAATGAAATGTTATTGATAATAGAACTGATTTAAAATAAAATATG----TAAACCCCAAACAGAAATAAA
ATATAGGATGTCTCTAACTCAGTCATACAAAAATCTGTAGCTTGGCATTATATATATATCATTGTTAAACATTT-----AACAATTTTTAGCTGTAGTTTTTAAGTCTTTGTGCTGTAAAAGCTTAATAAAA------------GTTAGCATGTACCTAAATACATGGCATTAATATATAATTATAAATGGGGGCACCATCCAAGTCTCTAGCTTAGGC-------GTATCGTATATGCCCCAGTAGTTATCCTATTTTTGGTGCTGATTTTTATACGGGG--------GAAAATGCGTTTGATATAATATCAA----GAAATGAAATATATGCTTAAAATGTAATATTGAATATA
>HisCl1 7614149 7614302|7755 chr3R 7613280 7615571 scaffold_17 1842455 1844899 + 89055|958 1111
ACCGAGTTTTGATTGGCAGTATCCCATACGGTGGAAGATTTGGTTTTCATTTGGAACATGACCGACCCACTTGTGGTTAACACGGAGATTGAGTTGCCGCAGCTAGACATATCAAATAACTACACAACCGACTGTACTATAGAGTACTCAACAG
----ATTGTTTAATTCCAGTATCTCATACGGTGGAGGATCTTGTATTCATTTGGAATATGACCGATCCGCTGGTGGTGAATGCCGAGATCGAGCTGCCACAATTGGACATATCCAATAACTATACGACCGATTGTACCATTGAATACTCAACAG
>HisCl1 7614364 7614743|7755 chr3R 7613280 7615571 scaffold_17 1842455 1844899 + 89055|1175 1554
GTAACTTCACCTGCCTGGCCATTGTGTTCAACCTGCGCCGACGCCTGGGTTACCATTTGTTCCACACCTACATCCCCTCGGCTCTGATTGTGGTCATGTCTTGGATATCGTTTTGGATAAAACCAGAAGCGATACCCGCCCGTGTAACTCTGGGAGTGACCTCACTGCTAACCCTGGCCACCCAGAATACCCAGTCGCAACAATCGCTGCCGCCGGTTTCGTATGTCAAGGCTATAGACGTCTGGATGTCGTCCTGTTCGGTGTTTGTATTCCTTTCTCTGATGGAATTTGCAGTGGTCAACAATTTTATGGGACCGGTGGCCACAAAGGCAATGAAGGGGTATTCGGACGAGAACATCAGTGATCTGGACGACCTAAAG
GTAACTTCACCTGCCTGGCCATAGTCTTCAATTTGCGTCGACGCCTGGGCTATCATTTGTTTCACACCTATATACCCTCGGCGCTAATTGTGGTCATGTCATGGATATCGTTTTGGATCAAACCGGAGGCCATACCGGCGCGTGTCACCCTGGGCGTTACCTCGCTACTCACGCTTGCCACACAGAATACACAATCCCAACAATCGCTGCCACCGGTGTCATATGTTAAGGCAATTGATGTATGGATGTCCTCCTGTTCGGTGTTTGTATTTCTGTCGCTAATGGAGTTCGCTGTGGTTAATAATTATATGGGTCCGGTGGCCACCAAAGCCATGAAGGGTTATTCGGATGACAATATCACAGATCTGGATGACTTGAAG
>HisCl1 7614808 7615117|7755 chr3R 7613280 7615571 scaffold_17 1842455 1844899 + 89055|1627 1962
CATCATCGGGAATCGATTATTGAGCCCCAGTACGACACTTTCTGCCATGGCCATGCCACAGCCATTTATATAGACAAATTCTCGCGCTTTTTCTTCCCGTTTTCGTTCTTTATACTCAATATTGTCTATTGGACAACGTTCCTATGATGGATGGAAAAGTTTCTCCGAAGGAAT---------AGAGCGTAAACAATAATAATACCAAGCGCATTTGTTTAAAAATGTATATTATCGTTTGTAAGCCACAAATAA--TTGC-ATTAAAGTATGT-------------ATTATATATTGATTACCA-TGTAGTGTATAAATAAAGGAAAGCGTTTAA
CATCATCGGGAGTCCATAATAGAGCCACAATATGATACCTTCTGTCATGGTCATGCTACCGCCATCTTTATAGATAAATTCTCGCGCTTTTTCTTTCCGTTCTCGTTTTTCATCCTTAACATTGTTTACTGGACGACGTTTCTTTGATCCAATGTGGAGCAGCTCTAAACTAGTTATTAAATAAAATTAAAAAACAAAATCATAGAAAGCGCATTTGTTTAAAAATGTA---TAAAGTTTGTAAGCCACAAATGAATTTGCAAGTAAAATATATGACATACGTATAAATCACATATAGTACATTATTGTATTGTATAAATAAAGAAAGGCGTTTAT
>CoVa 7645884 7646030|7779 chr3R 7645315 7648340 scaffold_3 4631025 4634220 - 101476|581 741
-GCGGAGAACACTAGTTTAAAAAC----ACAGAACACAATATACACGTTACAGCGACACTAGCTACCTACTATCCAATGTA--TGGTGCGGATGAACATGTTGTTGGATTGCTAATAAAT-GGAGATTGCAGTAAGGCTACCACACCAGCACA------AG
AGCGG----CGTTTGCTTTAACGTTTTTCTTTAGTTTAATTGACACATTCAAGAAACACACACAAACAATT--CCAATGTACTTCGTGCGGATGAACATGTTATTGGATTGCAAATAAAAAGGAGATTGGAGTAAGGCTACCACACATAAACCCCCTTCAT
>sad 7705373 7705476|7843 chr3R 7705420 7708063 scaffold_3 1213225 1215855 + 82790|0 56
AATTGTAATCGTAGTCTCTTTAGTTTTATATAAATATATAAATGTCACATATTTAGT
AAGTGAAATTGTA--CTTTTTATTTTTATACAAATATA----------ATTTTTATA
>CG31368 7718020 7718107|7848 chr3R 7714214 7721964 scaffold_3 1222806 1230632 + 357031|3846 3937
TTATTGTTCAGTTGCTCAAATAATTTAATTTCATTAAGTTCCAACAA---AGTTAAAGTGACAAATCAAAAACGCATAGAC-CACACTCCAT
ATGCTGCTCTGT--------AAATTTAATTCCAATAATTGGTAACAATTCAATAAAATCGATAAATACAAA---CAACGACACACACACAAT
>CG14731 7759252 7759365|7890 chr3R 7758543 7759454 scaffold_2 4558206 4559113 + 7925|739 854
ATTCAGTTGTCTTCTGTCTTCGCATCTAAAAGTTACAAATTGCATTTTAAAAACCACCAGAGTAACGAAGGAACTAAATGACTATGTTTTTAATAAA-GCAAATAAACAA-ATACA
ATGGAATT-TATTATG-----------ATAAGCTAAACAAGCTCGTTTAAGAGAGAGATTTGTAACCGCAAAATTAAGGGATTGTCCCCTTAAGAAATACACATTTATAAGATATA
>CG31211 7778471 7778487|7917 chr3R 7778384 7778532 scaffold_27 1463747 1463866 + 1842|87 103
GCGCGGAGGAGTTGAAA
GCATAGA----------
>CG31211 7778549 7779880|7918 chr3R 7778533 7779640 scaffold_41 28747 29897 + 26452|30 1227
GCTCGCATAAGGCGCAGCAAACGATCCTTCGAGAAAGTCATTGACGACATTGAGGATCGAGTGGCCAAGCAAGAGCTGCTTGATGAGCAAACACTGCTGCGACATCGCAAGCGGGAGCTAGAACGCTCCGTAACTGGT-GGTGGTGAGC-ATCGTCGACCGGCGGCCAATCCAGAACCGCCCAGTGA------------GTCGGCTAGTCAAGCAACCCAGGAAAAGCATCAGCAGTCAAATGGTAT----AGGTGATGCACATAAATCCAAAGAACTCCTAAGCATACATTGCCATCA----TTTAGGCAAAAGACTCAGTCGCAAGGAACGGACCACCCGCTTTAGCGACAACAAGGACGGCAAACAGCAGTCGCAGAGCTTCGTGCAACAAGTAGTGGCGACCGCTGTGGTGCCACCACCCGGAAGCCTAAGCAATAGCAGCCCACAAAAGCTGAAGCCCGTTCCCAATCCGGCCACTAATCTACTGCAGATGCCGGAGTCGGTGGCCACCATGCTGACTGCGGCTGACAAGGCGCTGCACAAGGCCAACAAGTCGTCGCATAAA---AAAAGCAAGCGCCGCCACTCGTCCCCCTCGTCATCGTCTAGCAGCAGTGG---GAGCAGCTCTAGCAGCGATAGCGACGACAGTAGCAGCACCTCGAGCGGATCCAAAACTTCAGGCAGCCGC------AGCA-----------AGCGATCCAGTC----GGCATGGACACCGCAGCCACCACAGCAGCAG---------------------TCGGAGCAAATACGAACGTCGCGATCGCGACAGAGA--AAGGGAGCGG------------------------GCGCGGGAG-CGAGAG---CGGGACCGTGATAGGAGTCATCGCCAGCATCGTAGTAGCCAGCTTAGTGGAAGTCACCACCAGAAACAGCGCCGACAT---CGCGAGTCCAGCCATTCAGGCGAAGATGCTGGCGGTAGCAGCAGTTACCACCGCTCCTCGCGGCAGAGCAGCAGCCGTAGCCATGATCATGGCAGCAACCGTAGCCATGATCACGGCAGCAGCAGCAGCGGACGGAAGCGGCACCGCACGAGATCCCGCTCCAAGTCGCGAAGCACTCACCACTCCAGCTCGAAAGCATACTCCTCCACTTCCGCGTCGCAT---CCGCGCAAGCGCCATTAA
GCACGCATACGAAAAAGTAAACGTGCTTTTGCGAGAGTCATCGATGACATCGAGGAGCGTGTGTCGCTGCAGGAGCAATTGGATGAGCAAAAACTGCAGCAACACCGCAAGCAGGAATTGGAGCGTTCTGAGGCTGCCAGGCATTGCGCTCTCACCGAGCAACGGC--ATACGGACCCGCCTGCGGAAGAAACAGCAACGACGGCT------TCTGCCAATGACAAGCTGCAAAAATTCAATGGTATGTGCAAATGATGTGCCTGTGGGCAAAGCATTT---AAAATAGTTTGTCAAAAATGTTATAGGAAAACGGCTCAGTCGCAAGGAGCGGACAACACGCTTCAGCGACAACAAGGACGGCAAACAGC---CCCAGAGCTATGTGAGCCAAGTGGTTGCAGTTGCGGCGGCGCA---------------AAACAGTATAATGCCTCAGAAACTAAAGCCAGTACCTAATCCGGCCACCAATTTATTGCAAATGCCTGAATCAATGGCAAGTATACTAAGTGCTGCTGACAAGGCGCTCGACAAAGCAAACAAAACATCTAAAAAGTCCAAAAGCAGACGTCGCCAGTCGTCCTCATCCTCTTCCTCTAGCAGCAGCGGCGACAGCAGCAGTAGTAGCTCTAGTAGCGACAGCAATACCAGCTCCAACAGTTCAAAGACCTCCAGCAACAGCGAAGGGAGCAGTACTCGGAGCAGCGCCGCTGTCAAAAAACATAGGCATAGCAGCCACCGTCAGAGCAGAGCTCACAGCGGTCACAGGCAGCGAAGCGACTCAAGCCGTAAAGCGCATCACAAGGGTCAAGGCAGCAGTAGTATGCACAATTATGACCGTCATCACAGTAGTCGAGAGGGTCGTGATCGCGATCGGAATCGTGACCGTCATGCTGTTTCCTA---TAGCAGACAGCATCATGAACGACGGCGACGCCATCAGCGGGATTCCAGCCAGTCAGCAGAGGAAAAAAGC---AGCCGCAGCTATCGTCGAAACTCGCGACACAGCAGTAGTCGTAGCCACCAGAGTAGCAGCTATGGTAAACATA------------------------GAGAGAGG------ACTCGATCACGCTCCAATTCGCGCAGCACACACAACTCCCATTCG------------TCTGTTTCAGCTTCACATCAGCAGCGCAAGCGCAAGTAA
>CG31211 7778549 7779880|7919 chr3R 7779673 7779742 scaffold_471 8425 8494 + 432|0 70
TTGTTAATATTACATAATTATTATTTCTTCTGTTTAAGATGCTTTTTAGTAAACAGTTTTA-AATCAGCCT
TTCTTAATACGCCA-AATTTGTATGTTCTCTAGTTATTATAATTGTACATTGATAACTAAACAATTAACAT
>CG31211 7778549 7779880|7920 chr3R 7779743 7781132 scaffold_21 1235445 1236879 + 56439|0 138
AATAAATTAAAAACTCAGAAAAATTTGTTTTTTTTTCATGTGTTATGCGAATATCCTCATAATAATTAGATATATTTTTAAAGTTGGACATACGGGAATACGGGAAT-TAAGTTCCCAATAATACAAACAAGTAAACTT
AACCACTTGAAAACACCGAAC------TTATGTTTTCATGTGCCACAGGAAAGCTTGCAAGATTATC-----TGCCGTCCAAGCTGT-CGCCCTGGGCTACAGATATGTCTGCTTTTACGATGGCAGCTGCGCAGATTT
>Hsp70Ab 7786440 7786673|7928 chr3R 7784166 7786594 scaffold_21 1239145 1241557 + 114036|2302 2463
GGCCAAAGAGTCTAATTTTTGTTCAT--CAATGGGTTATAACATATGGG-TTATATTATAAGTTTGTTTTAAGTTTTTGAGACTGATAAGAATGTTTCGATCGAATATTCCATAGAACAACAATAGT----ATTACCTAATTACCAAGTCTTAATTTAGCAA
AGCAAAAGCAT-TAAATAGTATTAATTGTAACAAGTTAAGATGTTCGATCTCACAACCAAAGAATTATTTATATTCCTT-------TAAGTATGTTTGAATTGA--ATTTAATTCAATAAAAATAGTTAAAATAACCTAGTTTTGAGTATTTACTTGGGCAA
>Hsp70Ab 7786440 7786673|7929 chr3R 7786595 7786675 scaffold_21 1052849 1052920 - 667|0 78
AAATGTTATTGCTTATAGAAAAAATAAATTATTTATTTGAAATTTAAAGTCAACTTGTCATTTAATGTTTTGTAGACTT
AAATGTTAACATT---------AATTTATTGTTAAGCTAGGATGCTGTAATAAGTTCATATTTTATGCTATGTTCATTT
>aur 7790376 7790550|7934 chr3R 7788684 7790715 scaffold_41 897152 899177 - 52692|1794 1989
ACACATTCT-TGTTTAATTTTCAGTTAATTCCTTTTAATTACATTTTTAGTTTAGGGCT---CCCCGCGTAATTTAATTATGGCATCATAAATTTTCATTTATATAGA-TACGAGAA---------------ATTAACATTTAT-CAATTAAGTTTATTATTATCATTAGCAATAAAGTTTGTGTGTGTTTTCGAA
ACTCATTTTATACTCTTTTTGTATTTGACTGTTTCAGTTTTTATGTTAAAATTTTGTCTGAGCGCCGGTTAATTTAATTATCTCATTAAAAA-----AAATATTTAGATTAAGAGAACAAAAAACATTTATGATTATTATTTATGCAATTCATTTCATTAT----GCTTCAAATAAAGTTTTTGTG---TTTCAAA
>CG18347 7796898 7797200|7937 chr3R 7793201 7797033 scaffold_41 901930 905661 - 46810|3923 4073
GGCGGCTTGGAATGAGTGCGCGCCAAGGCGGATTGACAAGACCGAAGCATTTTAAATGTACTCTCTTTGAATATTGAATGTGTATGTA-----------TATCGTGTTTAAATGTTGTTAAAGCTGTCCA---TGAATGT-AATCGTGAAG
----------AATG---GCATACGAAAGTT--------ATCCAGAAGCATTT---------CCTCTCTAAATGTTAGATGTACATGTATGCGCTAACGCTATTGTTGTTA----TTGTTAAAGCTGTCTAATTTCGATGTAAAAAGTGAAA
>CG18347 7796898 7797200|7938 chr3R 7797127 7797578 scaffold_41 905769 906270 - -917|0 105
TACATATGTATTTAGAC-----------------------CATGTCAGAAGATAACTGATGCTCCAATGACAATAAGATAAA---------GCAAATTAATCGCTG
TATATATATATATATATATATATATTAATGTTTATATATATATGTGCACATGTATGTGTATCTATAAAGGTAATAATAGAAACTATTACAGGCAAAAGAACTTCTA
>CG12201 7798591 7798627|7939 chr3R 7797579 7798639 scaffold_41 907939 909052 - 32260|1092 1128
CTTATAATTAAAGGTCTCTTCCCCCCCCTCATATTAA
GAAATGCTTGCCA--TTCATCTCTTATTTCAATGCAA
>Ect3 7829080 7829239|7973 chr3R 7826881 7829369 scaffold_487 5262 7810 - 86403|2329 2489
TCGTCGGCCTAAGGACCATTGCGACTTGCATCCATCGCTGTAGCCATAAATCATGCATCATCATCCGTATATGTAGATCTAAATGTAAATTTATGCGGTTTAAG-TTCTTTGCAAGACATTAAAGCAACTCCGAGACGGACGCGTCCTGTCTGCCTCGTTA
CT--------------------------------------TAGACAACAACAGAACATCATGA----TATATG-----ATATATGTACATTTTTTAAAATTAAGTTTTTTTGTAACGCATTGA---AATCTGGTGATGGCTTCTTTTTTTCT--TTTGTAA
>CG14735 7861123 7861249|7999 chr3R 7859098 7861325 scaffold_1 2800824 2803347 + -3414|2364 2527
GATGAAGATC--------------------ATTATTTGG-----ATTACAAACTAATTGTTGCTAAATTGT--------TTGTTGTTAAATTGTTTGTA----GTGTTTAGTTTTAATGTTTATTGATATTGCATATGATATAATCGTATATGTTTACCCCGAA
AGTGTGGAACGGCGAATACAGGGATATACGACAATTTCGCGATAATTATAAGGAAACCCATAAGAAATAGTTAAGCAAATTATGGCTGCCGCTTTTCTACAATTTTTTTTCTTTTAGGTTTGATTTATGTTAAGAGTGACAAAAAGACAAACATATAACTAGCG
>dpr17 7936706 7937144|8078 chr3R 7936543 7937137 scaffold_35 404297 404882 - 7576|172 676
CTCGCCTATTGAACGAACGCCTGGTCGCGGCGTCCGACTTCCAATTATTTGTAAGCTTTTGCGCCATCTGCAGTTACGTAATTTAGGTTAGAGATTAATTAAAGGCGGCCTTGTAAATAGCGGAGATGACAACAGAGGCAGAAGGTGG--AGCTGGAGCAG-GAGCAGGAGCAGGAGCCCAGTCGAAACCGAATTGACGATTCTGTAATTAGGTTAAACGTTGCCATA---------ACTCTCATGTCTGCGTGTCT---------------------------------------------CACATTATCCCCATACCATACTGCATT-------------AAATCTAATGTAAAATTCAATTTAAGCAGA---CCCCATTTCAAGTTGTGAAATCGAATCAATAATTAGATTATTGTCGGAGAGAAATATTATTAAATGAAAATAATAAAACTGAATCATAAAAATCCATCATAAATAACAGGCATTCAATAAATCATGTGAA
CTTGTGACGTGACTCGCTTATTGAGCGCCCAGCCCGGACTTCAATTATTTGTAAGCTTTTGCGCAATATGCAGTTAT------------------------AAGACGTCTTTGTAAATAG------------CAGCGGCCCAAGGCGAGTGGACGGGGCGGCGAATAGAAGGTGCAACT---------------------TTCTGTAATTAAGTTAAATGTTAGCGCATACCTGCATACGCTGTTGTATGAGTGTGCGCTTGTATGTGTTGTACATTTAAAAGATATGAACACAAAATTGAAAACATAATAAGCGTAATATAATTAATTCCTAGACTAAGACAAATCAAATTCTGAAAATAAATCAAAGAGATGTTGCCATTTACAGTTGTGAAA-CAGATCAATAATTAGATTATTGCAAATCAGCTAAACT---------------TAAATCTGAATAATA---------CACAAATAAACCCCAATCAAT---TCATGTAAA
>dpr17 7936706 7937144|8079 chr3R 7937138 7937559 scaffold_7 3788078 3788511 - 901|0 6
ACTTTA-
ACTCTGA
>CG3809 8025105 8025196|8201 chr3R 8023950 8025362 scaffold_35 563352 564673 - 34906|1155 1261
AGGGGACCGATGCATATT---------------GTGTCTTTGCAAAACTTATCAAGTGACGAGTACCATTAGGACCTTAAATAAAATTTAAAGTTTTCAATATACTA
GAGGCACATGCTCATTTTCAACCAAATTCAAGGGTATATTTGTATCTATTTTATAAATGGGAGCACCA---------AAAATTGAAGTTGATTTATTTATTATTTTA
>CG10014 8049685 8049770|8228 chr3R 8048446 8049712 scaffold_35 592302 593511 - 27184|1289 1316
ATGAAACCATGCTGTGTTTATTAATTTT
CTGAA--TAGGATTTTTTTTTTTTTTTT
>CG10014 8049685 8049770|8229 chr3R 8049713 8050906 scaffold_35 593826 594996 - 30014|0 57
CCCTTAGTTGTTAAATTGATGTTATCTGCAAGTGAATAAACTGATCGAAAAGTGCTGG
TAATTGTTTATTAAAGT--CGTTATCCACATATAAATAAA-TAATAAAGACATTTAAA
>svp 8121166 8121860|8305 chr3R 8119255 8122408 scaffold_35 693573 697021 - 76241|2130 3015
--------GATCTCACAGAAATCGCAGCCCCTTGTATTGTA----------------------------AATGTACTTGTATCTATATCGATAGCGTTAGGTAGACCTAAACCCTCTGTAA--ATGTACTT-----------ACTTTAGTGCCTATGGCTAGTTTCTATCTATTTATTGCC-TTAAACTAAG-CATAATTTATTCTAGT------GGTAATTACATAGATTCAATTAGTGAACTTTTGCCAAAAAATTTGATGAAACAAAGACTCTAAGATGAGG------GAGGAGAAAAAAAGAATCTTAAGAATATATATAAAGCTGTTGCTGTTAAACAA-AAATCTAATCCTGGCTTGTGTTTTTACT----TGTTATTGCTTACTAATGCTTTACACCGCTTGTTGACTAAT------------------------TTATAGATTATTTATTT--ATTTGTTTATTACTTACTACAATTGGATTACTAACAAATACC--------ATACTAACTCGAACTAACTTATGAACTGATTAA------------------TGCTTCATCTTTGAAGATACAGA-------------------TCTTTCCAAGTGAGATCCTAC-TAGCAG--TTGTTAAAAACCAACTATAGATTTGTTGATTAAATT------GGATCTATTGTAGATCACGAGAAATAAGTATAAACAAAATTTTGCATTATTTAGAA-----GCCGTAAAT--------TTGGATTCGTATAATCTGAATGCATTAAAA--AATAGCTTTTCGTTTGCTATGCAATG-------------ATCCATTTGTTTAAACTTTCTAACGAAA---------------TTAAACAACTTCATCATT
CCCCTACCCAGCTCCTAAAAAGCCGGTCGATCTGTTTTTTAGTCAGTTATCAAACAGTTTAGTTTAGCTAATGTATCTATCTATGTATAGCTTATTCTCTATGTATCTATGAAGTACTTAATTATGTATTTTTGTAAAGTTAATTTTAGTGCCTAT-----TTGCTTATGTATTTATTGCCTTTAAACTAAGTCTTAACTTATTTTAGTCATTTAGCTTATAACAAAAAATAACATTACCAAAAAATGCATACAAAGAAAATGATAAGGAAAGTGTAGGGAGAAGCGTAGCGAGAAGCTCGAAGAAGACTTAAGAATATACAC--TGCTGTTGCTGTTAAACAACAAATTGAAACCTAACCTGTGTTTTTACTTTTGTTTCATTTGTTACTAATTCTTTA---AGCTTGTTGACTAATTTTAACCGTTGTGTTTACATTTTGTTTTATGTTTTTTGCTTTGACTTATTTTTAATTTACTTGAGTT---TTGCTTACTAATACTATTATTGAATACTAATACTAGAAAAATTGATAATCGATGTAGTTTAAACCAAGTGCGTCTGCTTGCTTTAAGCACAAATAGAACAATTGAAAAACAAATGCTCTTTTAAATTGTCAGCTTACGTAGAAGAATATTTAAAATTCCA------AGTTGTTGAGAACATTTTACAAAAATTTTCTTTTTGTCACAAAGTTTCTTTTTAGATTTTGCTTTTAATTATTTATTATTATTTTCTTCAATATTCTTCATAGATTTCATCTTAACTTTCTCAATTTAAATTAATTGTTATTGATATATTCTTTAACGTACTTTAATAAACTTTTATGTGAACAAATTTGCTTATGAAAATCCTTATCACTTTTTTGAATAATTTCTCTATT
>svp 8126724 8128509|8310 chr3R 8125243 8128959 scaffold_35 705778 709520 - 76508|1664 3699
CACACGATGTGGCGCCAATTGACAACAACTTGATCATCGGCCGCAGCTGTGGCGGCTGCAA------------------------CGCTCAACATCAATTCCGGCGGAGGCGGCATCGGCATCGGCGGCGGGGGCAGTGGCAGTGGCGGTGGCGGTAGTGGAGGCGGTGGCGGAGTCGTTGGATGTGGCAGCCACAACGTTGTCGCTGCCAGTCATGACC---AGCTCGCCAATGTTGCTGTCATGCAGCAAACATACGGCAGCGGCGGCAGCAGCAGCAGCAGCATCAGCGGTTGCCACAACGGTAACAACGGCAGCGGCGGCAGCATTTGCAATCAGCAG---ATCAACAACTACGGCAACAACAGCAACAACAATGTCGGCAATCATATGAGTGCAGGCAGTTTTTTCGGTGGGTCCAACAACAGCATCCACAGTAGTGGCAATAGCAATACCGATTATATGACCACGCCAGCCACCGCTTATGCGACACCAGCGACAGCAGCCACATCCA------------------CGGTGAACACCACAACGATGCTGTCTAATTACTGCGATGCCGCCACCATGATGATGGCCGCTGCTGCAGTCAATGCAAATCAATGCCTGCAGCAACATCACCAGCGCATGTTGCTCGCGGGCAGCAGCAACAGCAGCAGCAACAAC---AGCAGCAGCAACAGCAACGGC------------------GCAGCAGCAATG---CCCTCCTCATCCTCGTCTGGCTCACTGTCATCTGCCTCATCGACCCCAACAGCAACAGCAACTGCGACTGCAATTGCAACAGCAACAGCAACTGCAGCAGCAACAGCCGCGCAGCAACAACAGCAACAATCGCCGCCAAATTTAATCGATATCAGCGAAGTTCCTCTCATTGTGGATGTCAAGTAGTGTAATTATTTATGCATCTAGAAATGGGGCTATAAACCAACCTTGTAGATACCCCGCCCCGCCCCCACCACTACCACAAAAACCATAAAACCCCAAAAAAAAAA---CAATTGAAAAATGTAAAAAAAA-------AAAGTTGGAGGATGAGCGCCGCGTAGCTTAATTGACT--AATTTTCCATTTGTAGCTTTTGTTGTAACTTTGTACATAACTCCTCGAAAAATTCAAGTTTTTCTCTAGGCCACCCCAGCTGTGAGCAAAAC-CAATCT--CAGCTGACATATCCAAGAGAACTTCAAAAGTGAAGCCCCCAAAAAAAGTAAGAAGGCGCCAAAAA-------------AACGTCTTTACA------------------------------------------TATGAATGTGTATAATATTTAAATGGCACTGAGTTCTACTTAA-TTTTAGACCACAAACACTTGAAAAAATCAATGAAAAAATAAGAATTGTG------------GAAAGAGAAAAATCCCCCCTAACACTTTCAAAAGACA-AAACATAAA-----GATAGTTAAAATATTTATATATGTAATGTAGCATATACACGTATATA-GTACATATATGAATATATAAA----------------------CGAAACTCTA--CTCCCAGTGGTTTGCAGAAATATACCAAAAATTTTAAGCTATGTTTACTTGATGTGTGGCAAT----TTTTATGTGTGCTTTAGCAATTTTAT------TTTTACTTTAAGTAAAATTTAAAATTTATAAACA----------------------------------TTCGATTCTCGACTGGTTTTTCTCGGCGGATGTATCTCAAAGATGCTT-----CTGTATGGGAAGGCCGAATTGT-------TGAAATACGAATGCAAAATTTAGCGAATTTT----TTATTTAGTAACCATTACGAGTAAAAACACAAAAT--GTTCAGTGCAAG-TTTCAGTTCTTAAACGATTTTTTCGTAAGCTTAAGCATTATCTTATTTATGTGTATAGAGTATGAAAAGTTTTCTATATTTTGTAATAATAAAAATTTGCGTTTATAATG-AA
CACACAATGTGGCGCCAATTGACAACAACTTGATCATCAGCCGCAGCTGTGGCGGCCGCTGTGGCAGCCAATCATAGCAACACTTCGCTCAACATCAATCCCTGCAACAACAACAACATAACTAGCAACAGCAACATTGGCGGCGGCGGTGGC---------GACGGCAGCGGCAGCGATGGGTGTGGGGG---CATTGCTGTTGCTGGTAATCACAGCCACGATCACAACAATGTTGCTGCCATGCATGCAACATACGGTAACGGCGGCAACAACTGCAGCAACA---------GCCTCAA---------------------CAGTATTTGCAATCAGCAGCAAATCAGCAACTACAGCAACAACAAC---------------------ATGAACGTCAGCGGTTTTCTTGGCGCCGGCAGCAGCAGCAGCGATTATATGGCCAAT-GCAACAGCAGCTGCTT-----------CTGCTGCATATGTGACACCAGCAATTGCAACAACAACAACAACATCAATGCCAGCGTCAGTGAGTACAACAACAATGCTGTCTAATTACTGCGATGCAGCGACTATGATGATGGCCGCTGCCGCTGTCAATGCAAATCAGTGCCTGCAACAACACCACCAACGATTGCTGCTGGCCAGCGGGAACAGCAGCCACAGCCACAGCCATAGCAGTAACAACAGCAATAGCGATGAGCAATTGGCCACGGCAGCGGTCATGGCCTCCTCCTCTTCCTCAGCTGGCTCGCTGTCATCGGCATCGTCCACACCGACAGCAACGGCCGTCTCGACAGCC----------------------CAGCAGCAACA-----ACAACAATCGTCGCTGCCATCGCCGCCAAATTTAATCGATATCAGCGAAGTTCCTCTCATTGTGGATGTCAAGTAGTGTAATTATTTATGCATATTGAAA---------AAACCA------------------------------------ACAAAAA----AAAAACCAACAGAAAAAATCTCTAATGAAAAATGTAAAAAAAAAAAAAACAAAAACAAGAAACGAGAATCGTGTAGCTTAATTGTTTTAAAATCTCCTTTAG------TTGTTGTAAC-TTGTACATAA-------ACAATTTTCAACTTTCACCCAGGCGCCCACAACTGACAGCCAAATGCGGTTTTGTATTTTGTAGATACAAAGCTGCTCCCTGGTTAACTGTTGCAAAAGAAAGAAAAAGATTAAAATAAATCCTAAGCGTTTAACGTTTCAATATTTTTGAATTCTCTTCTTTTTTTGGGCGTCCATCAGTTCTACTATATGTCTGTATAATATTTAAA-GGCACTGAGTTCTACTTAATTTTTAAATCA-----AATGAAAGAAAACTAAACTAAAGTAACATTTTTGATATATCCTACCACAAACGAAATATAACAAATAAAATACACAAAAAAGACAAATGTAAATGTATGTTAGGCAAAATATTTATGTATTTCTTGTAGCATATATACATACATATAGAGACCTATAACTATATAGGTCTATGCGTTCTATAGTGTACTTTAAAGTCTAATCTCCCAGTGGTTTGCAGAATTATACCAAAAAT------ATATTTTTACTTTATGTGTGGCAATTATATTTTGTGTGTGCTTTAGCAATTTTTTACTTTATTTTACTTTAAGTAAAATGTAAAAAATAAAATCAAATAAAATCAAATATCATAAGGAAATTAAGAAATACAAATTCTCAAC----TTCTCCAAAC---CATGTCTCAAAGATGTGGAAAAAATTTAACGAAAATACAAATTTTATTTTTATTATTTTACAATGCAAAATTTAGCTAATTTTTTTATTTTTTATAAACAATTAAAAAAAAGCGGGCAATACCAATTCAGTGCAAGTTTTCAGTTTTAAAACGATCTTTT----AGACTAAGCATTATTTTATTTATATGTATA-AATAT-AAACGTTTTATATATTTTATAATAATAAAAA-TTGCGTTTTTAAAGAAA
>CG10013 8150771 8150936|8337 chr3R 8150692 8150871 scaffold_3 3172798 3172953 - 515|79 183
AGTTCA----ATCCCAGCTGAACCAAGCTATTAAAAATAAGATTTGTTTACATTTATCAATATGAGATGTTTTATTTCAAAATATGATTTAATTAAACTTGCATT
TATTCATAGCATCCCACTTG------------CCAGTTGATATTTAATTGAA-TTGTCAACATGGTATACTGTA-TCCACAGCAT--TTTATTTTAGGTTCCATT
>CG10013 8150771 8150936|8338 chr3R 8150910 8151058 scaffold_3 3172961 3173101 - -37|0 26
AAATATTGAAGCTTTTGTAATGTAAAA
AAATTTTAACGTATTTACGATAATAGA
>CG4115 8188648 8188975|8378 chr3R 8187623 8188970 scaffold_3 5823599 5825079 - 35248|1185 1576
GAGGATCGCGATCAG----GATCAGAATCCGAATGCGAATGTGG-GCTGGCGGAAGGACCAGCGACACTCTCCAAGTAAAACCAAAAATGATATTTCCCAAATCGGCAGCGGGAACGATGATCGATGTCAACTATATGTCTAATCTCCGATTGTCTTTGAATGCAAAGTTTTCTGGCCAAAT-----------------TGCTGCATGATATACTT----------------------ACTTATGAACC-----CTATCCTG--------------------GTAACCACCTTCCAATTCTCTGCGCTCTGTTCTGTCTCATCAACTAGTTTAATTCTTAATTTTGTATTAATTTATGATTTTCTTTAATTATAATAAAAGATTCGAAACGA
AACGCTCAAACTCAGACGAAAGTAGCATCTGGAATTACGTGTGGAGTTGGAGCCTCGAGCAGCGA----CTCCAAAT-AAACCAAAAATGATATTTTATGTAGCTACCACATATATG-----------CATATATATGTTTA---TGTGTATGTATGTGAATGTATGTGCTTCTGTGCGAACAGATTTGTTCGTTTCGGTGCTGC-TCATATACTCTTTGCTAGTTACTCTTTGAGTGTCTTTTGAACTTCCGACTATCCTGAATGTCTTACGTAATTTTGTATAACCATTTTTCCAATCTCTGCGC-----TCTTTCTCATCAATTAGATTAATTATTAATTTTGTATTAATTTATGATTCT-TTAAATTATAATATAACATTCCAAACGA
>GstD3 8199452 8199535|8396 chr3R 8199421 8199532 scaffold_20 1556456 1556578 - 1156|31 123
TTCATTTATAACGATTTTA------------TTATCATTTTATTATTTATTTATTTTATTAGTTGCCACAGATATTGAATAAAGTGAGAAGAC
CTAATTTCTCATAAATATACAAATTATACATTAATAATATTTATATTTATTTAAAACTTTTGTATTGATATACGTTCAAGAAAGTAAAAATAC
>CG17639 8211257 8211348|8410 chr3R 8210873 8212997 scaffold_20 1561182 1563261 - 38475|386 485
CAGTTCTTTAAATTAGTGTTACAGTAGCGAAAAAATATTTAATATT-TAATA---TCAGTTG--TGTAAGTGTTGTATTAAATAAATAAA--TTGTTCTG
TAATTAGCTACA----------AATATACATAATATATCAAATACCATAATATACTCATGTGAATGTTAATGTTGTACTAAATAAATACAATTTGTTTTG
>CG33098 8214037 8214519|8411 chr3R 8213313 8214967 scaffold_20 1563262 1564982 - 59033|748 1298
CCAACTATGGTGACAAAATGACCCTCAACGAGGCCAAGGAGGCTCTTAGCCACGCCCCGATGGCCAAGCCCAAGTCCTTGGAGGAGCCGCCCATGATCGATTACCCGGCCTTCTGTCGCATGCTAAGTGGAATGCGGAAGCGGAAAGGGGAATAACGTGCTATTTT----TGGGAGAAACTTTAAAAGTTTA-----------CTTTAAATTCAAATCCATTAAATATTTTCTGATTTAATGTTTTT----TTTTCAGTTAACCTACTA-ATATACAAGCTCTTTCATTTCATATCATTTACCCTATGAAATTTATATTCTTTCTAGAT---------CAATT------TTGAAAACCTTTCGCAGCTATTGTTGCGTT---TCTGATTATGATTTTAT------AGCCTTAGATTGTTATTT---------GATTGGTAAATA------TTTTGAAGCA-------GCTGTGCCGATTTGA--CAATCGTATTAGCCTTAACGCCAACTTTTGTTCGACTTTTTATCAAAATAAATCGTGAAGAACCAGC
CCAATTACGGCGACAAAATGACCCTCAGTGAGGCAAAGGAGGCGCTCAGCCATGCGCCCATGGCCAAGCCCAAGACACTGGAAGAGCCGCCCATGATTGATTATCCTGCATTCTGTCGCATGCTCGGTGGGATGCGTAAACGCAAGAACTAGTAGCTGGAGGCGTTGAGATGCAAGCAGAGTTACAAACTGAAATGTTGCAAGAATTTAACTCAATTTCATCAAG---TTTCTATAGTATTGCTTATAGAATATACCATTATGTTATTGTATTTTGAAATTTTTTCTTTT----GCTTTTTCCCATCATAAATTATCTCTTTATTAAAGTGAGAAGGACAATTAATAAATTGAAAA---TTTACGTTTTTAATTGCCTTGAATTTAATCA--ATCCTATTGGCAATGCCTCACATTTCTAGCCTCTCAGAAGAACTAGCACACATTTTGTTTTTGCAGCAATTTGTGGCCATTTTGATTTGGTTTCTCTGTGTTAACCTTAACGCCAACTTTTGTTAGACTTTTTATCAAAATAAATGGTGCGCAACCAAA
>CG4940 8228057 8228203|8429 chr3R 8225208 8228581 scaffold_20 1571240 1574594 - 127452|2896 3042
CAGCGAGCGAATAAGTGGCCTATTTCACTCTCCGAATTTTCCCGGATATTACCTGGAAAATGTTGTGTGCAATTATTATTTCTACGGAGCAAGTGACGAAAGAGTTGTGCTTCACTTCACATATTTCGATATCGAGGGCATTGGAAG
TAGCGAGCGGATTAGTGGACTATTTCACTCCCCGAACTTTCCAGGATACTATATGGAGAATGTTGTATGCAATTACTACTTTTATGGAGC---TGATGAACGCATTGTTCTGCGGTTTACGTACTTTGATGTCGAAGGCATTAGCAC
>CG4940 8228260 8228602|8429 chr3R 8225208 8228581 scaffold_20 1571240 1574594 - 127452|3101 3436
TTGTGACCACCAAACCGCCAGCGATTACATCGAGTTTTCCAATTTCATGAGCACGGATCGAAAGTTCAGCAGATACTGCGGAAAGCTTCCCGATTTTGAAATGCGTTCTGATGGACGTTTCTTTCGAGTCACCTTGCATTCCAATGATCGCTTTGTGGCCATCGGATTCCGCGCCCTGTACACCTTTGAAACCGTTTCAGTGAATAATTCCATCACCGATC------TTCGGGATAA---TGCCTCCATGCAGAGTTTCGTCTCAACAGCGTCAACTCAGCCGGTTGCAAATGTAAACAAA---TTAATTGCAT--GTATCTTATGCACTTATAAA
ATGTGACCATCAATCGGCCAGTGATTATGTGGAATTTTCAAATTTTATGAGCACAGATCGCAAGTACAGCAAATATTGCGGAAAATTACCAGACTTCGAAGTGCGTTCTGATGGGCGTTTCTTTCGAGTAACCTTTTACTCCAACGACCGTTTTGTGGCCAATGGTTTTCGCGCTCTTTACACGTTTGAGTCCATAAATACCAAAAGTTCTTTAACCAATCCGGATATGGGGGACAGCACTGTGCCCATGCAAAGCTATGTGTCTAGTGGATCGCAGCATATACCTAGAATTATAATCATAACTATAACTGCTCTAATATTTCCTATACTTAAAAA
>CG4940 8228260 8228602|8430 chr3R 8228584 8228743 scaffold_16 810717 810896 - -392|0 18
ATACCAATCTTATGTTTAA
ATATTAATACTAGTTGTTT
>CG5167 8233742 8233824|8438 chr3R 8232444 8234834 scaffold_20 2413359 2415847 + 57705|1306 1388
TGTCTTTAATGAGGTGCATTCGATGTTATTAAAAATACATATATGTATGTATGTATGTTAAATATATTTATCTTAATATGAAA
-------AATGAATGGCGCCGGGTGTAGTTGTAACT--------------------------TACAATTGTTGTATTCGCAAA
>CG5196 8237192 8237380|8440 chr3R 8235470 8237590 scaffold_20 2417118 2419120 + 54288|1773 1981
CCCGGATCGGGCAGAGATCAA-------TCGATGGCATTCTGTGCCACATTCGGCTTGTATATAGAATTAGATTCCGCTTGGAGACTCGACTGTTTAACGCTTAGCCAGGCCGTCATCCCGTTTACTCTGTTAAC--AATGTCGACCAATAAATAACG------CGAAAGTTTGGTATCAGTTGC-----TGATGTGAATCGAAATTAA
ACCCAAATGGGAGCACACCGAGACAATTTCAATTACAATATACTGCAAA-TCGGCTTGTAAATAGTGATAGAAACTCTTTAATGGCTAGATTTGATCAGGTTTTATAAG-----CACGCAGGTTAGATTATTAGCTGAAAGCCAATATATAAATGATGATGTCTCGAATGATTGAAACGGATAGTATGAGGAATGCGAATGAAAACAAA
>CG17202 8249189 8249334|8443 chr3R 8246690 8251579 scaffold_20 2429295 2434156 + 126625|2683 2896
ATCTCAGATGACAGCAGCACGTGCCAGCACACACCAAACGTAAAAACA-----AAAACATCCCATTTAGAACGCATTCATTTAGAAGAAATGTTA-------------------AGTATTTTCCGGAATTT----ACATGTAAATAAAGCG----------------------------------AAATA------AAGCATGAGCGCATGCAG
--------TGATAATACCGAGTGAATCATTATACTAACTGGCTAAGCTGACTTAAAGCATACCATT-AGAATGGATTC---TCGTAGAAATGTTACCAGTTTGTAAGACTAAGAAGTGTTTTAAGGTATTTTCCTAAATATTAATAAAACGTGTATGAAGGCACGCAAATTCCTTAAATGGCTTCAAGTATTTGATAACTATAGGCATATGAAT
>Sas 8253559 8253599|8445 chr3R 8252031 8255150 scaffold_20 2434322 2437453 + 101030|1573 1623
ATCA----------TGGGTTGGGAATTTAAATACACTTGTAAATGAATAGC
GTCAGCGGCGTTTATTGATTACGTTTCTTAATAAAAT-GTAATAAAATTCC
>Pros25 8258184 8258279|8454 chr3R 8257053 8258260 scaffold_20 2437577 2438749 + 45405|1147 1224
ACTTAAACGCCCCGCTAAGATTACCACAAGCTAAGCTTTCTTAATAAGTACG-GGACATTAAAAAACCAATAAAATTT
ATTTTGCTTCACGGTCAAAA--AACCCAAGCTAAGCTTT-TTAGCGAGTACGTAAACAATGAA-----AATAAAGTTT
>Pros25 8258184 8258279|8455 chr3R 8258261 8259679 scaffold_581 108 1542 + 47216|0 28
T-ACAACTGGTGTTA---------TTTGA
TGATATTTGATATGAAATAAATGATGTAA
>CG5844 8261232 8261365|8457 chr3R 8259964 8261466 scaffold_3 716713 718224 - 69166|1299 1435
TTGTGCCATATCCAAACAAAATTATCTGTTCCAAATCATTTAATTTAATTTTGTACATAACGCACCTATTAC---CAGTTTCAAACTGATCCATTCGACCTTTCTAACTTATTCAAATACATTTCCGTAAACGGATC
-------------GGGCAAACTTAGTGCATAGAACTAAATTAAAAT-ATTTTGTATATAATAACATCCTTACATGCAGTTCAGAACTGATCAACTTGAATTTGTTAATTTATTTAAATACATAACCGTGAAACACTG
>desat1 8272664 8273338|8465 chr3R 8271533 8273771 scaffold_3 728600 731013 - 67640|1165 2005
GCAGGTTGAGCGTAGGGCCAATCATGGGA-GGGTTTAGCAGAAAATCAATCAAATT---CAAGTAAAGCAAAGAAACA------------TAAATTTCCATTTTGCAAATGTCCGCGGAACATATTTCCTAACAG------------------------------------------------AGCAGAAGCCCATTTAATTAATTCTAAGATAAAGCGTTGATGATAACTGTTTGTTGTATCTCGAAAAACTTTATACCGTCTGTGTTAAACCAGCTCCGGAAATGTTTTTATTTCGCTC--------TCTTTTTATGGGGA---------------------GACGC-----------------------------------------------------AAAACTAACTTTGTATTTATACACGCATATAAT-TGCTTAATACCTGGATATTTATGT-----ACAATAGATGGCAATTGGAGATTTTCATTCACTGTTATCTCGAAATCACTTTTGTAATTTGAGAGAAATTTTCAGTTAAAAATCTAAAAGAAAAAATGATACAAATGGAGGAAAACTTTCCGCTTCAAAGAAAAAGAAATACCTGCAAATGAAAGATTTTAGTATTTAGCGTAAGCCAAAAACAACAAGAATTATCAAGGAACTAATATATATAA-------ACTATATAATAAACGATCGATGTTAGAACACTAAAAGACACTTTCACCTATACATATGATATTTCTTTAAATGTTATTAAATAAAATGGGAAAACGCCTC---TGGGAAACAAAACATCCCAGTAGACTTTTCCA----TAAACTGAAAATGTC
--------AATTAAGAGCGGATCACGCGCTAAAGCCAGAATGAATTGAATCAAATGATACAACAGAAACAGAGTAACAACATAATGAAAGAAATTTTCAATTTTACACATGCCGGCTAAAGGATATTCAAAGCAGCATAGCAAAAAAAAAAAAAAAAAACCAAACAAAAAAAAAGAACATACAAACAGAAACCC-TTTAAATAATTTTAAGAAACGATGTTAATGATAAATATCTGTTGTTTATC-AATAACTGTATACCGTCTGTGTTAAACCAGCTCTGGAAATTGTT---TTTCGCTCCACATTTGCTTTTTTTTGGAGATGCATAGAGTCAGCCGATCTGGACGCCAGCCAAGTGTACAAAGTACTCCGCTGGGCAGCAACTGGACGGCAGCCAGATAAAATTTATCTTTATACTTATACATACACATACCATGCTATATACTATTACATATATGTTATAAACAAAGAAAAACCA------ATTTTGATTTATGGTTCAATTGGAA--------ATATTTCGAGCCTAA-CTCCAGTTTGTAG--CAAGCGAAAGATTCAGTTAAATGTAATGAAATT----GATT---ATAACGATAAATGCCT----ATAAAAGATTTTAGTATTTATAGTGAACCAAAAAGAACTAACACACAAAAGAAATCATGATATATTATATGTTTACGATATAATAAACGATCTATGTTAG-ACACACAAAACCTCTTGAACACTTAC--ATGAATTTTGCAAAATTGTTA-TAAATAAAATCGAAAATCTCTTCGTTTTAGCTTTTAAACAGTAGACTTGGCATTTTCACTCGTAGCTCGAAACAGTG
>CG18549 8281728 8282084|8476 chr3R 8281126 8282298 scaffold_3 737760 739125 - 35616|638 1137
TTCCGTT-----------------------GTGGGACTCAGAGGATCTAGAGTATTAGATGCAGGTTCTTGT---TAGAACTCTAGGGCTAGGGCCATTTGTCCGTGTTTGT----------------TAAATTCCTCGGAATGC-----------------TTTAAA---------TCCGTGCGACTGCGT---------CGTCTTCCTAGA------CAATAACTGATAAGTGTTGTTGCGCGCTATTGTTGCTA--------AATATACGTATTTTAATGTTGGCATTCCAAAAAACGTAATTGTAATC-TAGTTGTCTATGTTTT---------------------TATATGTGTGTAT---TGTATATGTG------------------CGTTTATTTATTTTAAGCGGCGATTGTGCAAATATAAGATAGTA--------AACCACAAATTTGGAGTATTATAAGAA-ATATATAACGAATTTTAAGAAAATAA
TGCTGTTTGTATGTAAGATTAGTACTTGTATTGAATTTGAGATTGCTTAGGGTA----ATGCACGCTTTTGTGTGTAGATATATATATATATATATATATATATATATGTGTGCATACATATGTGTCCTATGTACCTGTGTATGCATATATGTTCATTGTTTGTTAAAAACCCTTCGTGCGTGCATTTGCGCGCGCGCCGGCGTCTTCCTATACATATGCAATAATAGTTAA---TTGTTGATCGCTAATGTTGCTATATGTATGAATGTTTGTTTTTTAATGTTGAACATCC--GAAACGTACTCATAATTGTAGTTGTAATTGTTTTTTATATAAATTTATAAATATATATATGTATGTATGTATGTATATGTGTATGTATTTGTTTATCCATGTTAATTTATTAAAAGCACAAAGCGTGCAATTGTAAATTTATATTGTCTACAATTACAAATGCAGCGCCCAGTTTGCATATGCGCTGCCAGCATTAAATATACAC
>CG12267 8288125 8288140|8479 chr3R 8286032 8288166 scaffold_13 2014568 2016791 + 74920|2212 2231
A----TTGTAATCATAAGGG
AATTGGTTTGAAAATAAAAA
>Hsp70Bbb 8330400 8330822|8493 chr3R 8329353 8330605 scaffold_21 1051628 1052875 - 57328|1059 1273
AGCCAAATAGAAAATTATTCAGTTCCTGGCTTAAGTTTTTAAAAGTGATATTATTTATTTGGTTGTAACCAACCAAAAGAATGTAAATAACTAATACATAATTATGTTAGTTTTAAGTTAGCAAC-------AAATTGATTTTAGCTATATTAGCTACTTGGTTAATAAATAGAATATATTTATTTAAAGATAATTGCGTT--TTTATTGTCAGG
A---ATAGAGGCAGTTATGAAA----GAGATTTAAGTTTAATCAGTATTATAGTATAATGGGATCT---CAACCAAAAATCTTT-GTTGATTAAAATATGATTTATTTA--TGAATGTTACCTACTTATATATAATAGAATTTAAATATATTAAATA----------AAAACAAATTTGTTAAATGTGAAATGTTAACATTAATTTATTGTTAAG
>Hsp70Bbb 8330400 8330822|8494 chr3R 8330608 8330744 scaffold_3 1084389 1084543 - 58|0 168
GTGAGTTTGCTT------------AAAAACTCGTTTAGATCTGTCCTCGAGAAATTATTTATTTAAATGCGATGGAGAGTTGGCGCCGAATCGAAAACTTTA--------------CGCGCTTAAAA----GCACGAGTTGGCAT--CCCTATTAAACAGCTGTTCGTG
CAATATTTGCTTGTACTTGAATAAAATAAATCAATTTGAGATTTGCAGAAAAAATCTTTTA--------------ATACTTCATACGAATACTAATACTTTATACGAGCAGCCGATTGCGCCTAAAAGACTGCATAAATTGACTTGATTCTCTTAAAAAACAATTCGTG
>Hsp70Bbb 8330400 8330822|8495 chr3R 8330745 8330981 scaffold_55 113403 113678 + 5789|0 79
AAGATAT-GCAGTGCAAACGAAAAACCCGCCTACAAATATTGTTATTTTGATTAGATTACGGATTACAA-AATGGAACCG
GCAATACCGCGGCACAAGCAAA-----------CAAACTTTAAAACTTATTTTAAA--ACGAAATATAACAATGGATCCG
>Hsp70Bb 8333683 8334105|8498 chr3R 8331750 8333890 scaffold_247 13 2171 - 120281|1952 2179
AG-------CCAAATAGAAAATTATTCAGTTCCTGGCTTAAGTTTTTAAAAGTGATATTATTTATTTGGTTGTAACCAACCAAAAGAATGTAAATAACT-------------AATACATAATTATGTTAGTTTTAAGTTAGCAACAAATTGATTTTAGCTATATTAGCTACTTGGTTAATAAATAGAATATATTTATTTAAAGATAATTGCGTTTTTATTGTCAGGGA
ATTGCATTCCCCAGCATTCTAGTATTTAGTTGAAGCTTTATGTTCCTCCGACTGAT-CAATGTTTTTGGTTG-AGATATCTCATTTTATGCCAAACACTCACTAGTTAAGAGAATTAATTGTTAAACTATTCCTAAGTTAGCAACAAATTATAGAATAAAACATTAATTTATTATTTTCAAAAAAGAA-------ACTCAATTGTCTTTGAATTTCCTTTGCTTGGAA
>Hsp70Bb 8333683 8334105|8499 chr3R 8333891 8334027 scaffold_3 1084389 1084543 - 58|0 168
GTGAGTTTGCTT------------AAAAACTCGTTTAGATCTGTCCTCGAGAAATTATTTATTTAAATGCGATGGAGAGTTGGCGCCGAATCGAAAACTTTA--------------CGCGCTTAAAA----GCACGAGTTGGCAT--CCCTATTAAACAGCTGTTCGTG
CAATATTTGCTTGTACTTGAATAAAATAAATCAATTTGAGATTTGCAGAAAAAATCTTTTA--------------ATACTTCATACGAATACTAATACTTTATACGAGCAGCCGATTGCGCCTAAAAGACTGCATAAATTGACTTGATTCTCTTAAAAAACAATTCGTG
>Hsp70Bb 8333683 8334105|8500 chr3R 8334028 8334264 scaffold_55 113403 113678 + 5789|0 79
AAGATAT-GCAGTGCAAACGAAAAACCCGCCTACAAATATTGTTATTTTGATTAGATTACGGATTACAA-AATGGAACCG
GCAATACCGCGGCACAAGCAAA-----------CAAACTTTAAAACTTATTTTAAA--ACGAAATATAACAATGGATCCG
>Hsp70Bc 8336966 8337008|8503 chr3R 8335033 8336972 scaffold_247 13 1959 - 119970|1952 1958
AGCCAAT
ATTGCAT
>Hsp70Bc 8336966 8337008|8504 chr3R 8336976 8337138 scaffold_21 1241409 1241546 + 332|0 32
AAAATTATTTCGGCTTAAGTTTTTAAAAGTGAT
AAAAGCATT-----------------AAATAGT
>hug 8354510 8354798|8521 chr3R 8354073 8355471 scaffold_47 207876 209245 + 10457|467 789
GTCACGACAAGGGC-GCGAGGACAT----GGCACGGCACGGAATCGGACTGCGGATGGAGGACGGAGGACGAGCCCAGGACAAGGTTGAGGCCA------GGCGACTGGCC--CTTGAGTTAACATAACCAAGCCATAATGGCCAGCTGAATTCGACGCGACGCAAAAATAATCCACATATATGCATAGTGAATGACTACTCTACTAGTTACTAGCGCTATAACCCTGATTTGAGAGGAACTAATG---------------ATGTGTATATACCGTACATATATTTA------TTATTTATTTAAATAAATTGTGTAGCCCCC
GCCTTGGCAGTAGCAGTAACAGTATCATCAGCGCGACTAGGA--CGAACGGC-----AAGGACAAAAG------CTTGAGTAAGGTTGAGGCCAGTCATTGGCGCATTGCCAGCTCCCCTTAAACTACTCA---TATAACGCCC--CAAAAATCGACGAAA---ACAAATAATCTACTTATCTT--------ATAAC-ATTATATTTG----TATAACTAGGCCCAAGTTTTGAGAAGAATTCATATATGCGACCAGCCATATGTTTAAATAAATTGCAAACCCTTGAAAACTTTAATTA-TTGCTCATGTTGTGGGCGCTTG
>CG31355 8448384 8448492|8619 chr3R 8448184 8448450 scaffold_47 317036 317317 + 3120|208 330
CAA-------------------------------GCTGTGCCT-------------------CATAATGA------TGCCAGACAAACGTCTCGAAATGAGCTCGCACCGGGACTGCAACCTG
CAACCCTGCCGCTGCTGTTGCGGATGCTGCTGCTGCTGCGGCTGCGGCTGCGGCTGGGATTACGTAATGAAGGCACTGCCAGACAAACGTCTCGAAATGAGTTCACAC----ACTGCCACTTG
>CG6359 8455175 8455790|8629 chr3R 8454912 8455299 scaffold_21 8383 8812 - 20375|271 430
GCAGCTTAGTCCGGCGCAATCGAAACCCCCTAACCATAGCAATGCAATGAAGCAAAAACTCGAACGAAC---AAACCT-------------------GCTACGAAATCTTTATGGGAA-------------GCCGTGTGAATGTGTGTGCTTGCCCGGAT
GGATGCGGATGCGGATGACCAGGAGATAGCAACAAATAGCAATGCAATGAAGAAACAACTCGAACGAACAAAAAACTTAAGAAGGAAAGAAAGAAAGATTACGAAACCGATTTGGCAAAATCCGACCGTGTGTTGTATGTGTGTGTGTGTTTGTGCGTGT
>CG6359 8455175 8455790|8630 chr3R 8455363 8456330 scaffold_21 8903 10017 - 2332|0 584
GCGATACGAGGCGGGAAGTGCTGCTGCTCAGTTAATGTTGAGCCCCTCTCAGCCCCCGGGGATTAGTTAAAAACCAGCATTGGGA-ATTTTTAATGCTAAATTCAA--GTTTATAT-----GGTATACATA------ACAATATAC---ATACACATATATATATATTATACACAATACACATATTTACGAATAGTGTACATAAGACATGCCTACTAC-----------------GCCCT-----------------CGCTAAATGAG-----------------------------TCTCGAAA----GTAGGAG----------CTGCCCCTCCCAT--------------------TTTCCCGATCCTCAGTTTCTTCGT----TTTGAACCATTGCAGCGGT---AATG--AAGCAGCAAATAAAATAAGGGAGCCATCCTGACCCC-----------------------AAAATCGATCCCTTGTAAGTG-TATGCAAATTATTGAATA---TTTTGAAACAGTTTAGTGAATAA------TATTGTACTTCGAATCAAATTAAA-ATAATTCAAAAATA
GCCAAAGCAAGCGGACA---TTGTGGCTCCGTTAATGTTGAG--------------CGCGCTCTAGTTGAAC-----TATTGGGATTTTTTTATTGCTAAATTAAATTGTTTATATGCAACGGTATACATACAATACAAAATATACTATATATACATACATATATA-TATATAAAATAT-----TTACCTAATAGTGTACATAATACATGCATAATTCCGGCATTGACTGGTCTGGTCCTCGTCTCATTCCGTGGCCCGTCAATTGGGCCAGGACAAACGCTCAGTAATGGACTTTTTCTCGAAGCCGCGTGCGAGCACAGTCCTTCTCCCCCTCCCCCATCAACCAATCCCATCCCCATCTCCCTACCCTTAGTCGTTGTATGAAATTTGAATAATTATTGAGTTTGAAATTGCAAACAGCAAACGCAAAAAGTTACCC--TCCAACTCCATGGATTAGTAATACATTTATATATAATTATACAGTTGCAACTGTTTTGCAAATTACTGAATATTTTTTTGAATCATTTTAGTAATTAATATGTGTATTGTACTTCGAATCAACCTAAACATAATTCCAA----
>CG18616 8458698 8458756|8632 chr3R 8457954 8458738 scaffold_21 11785 12549 - 31808|751 794
ACAACAAATTGTGTATATAAC---TAGACGGAATTAAAGTGCAA
GCAACAAATTGTGTAAATAGCATAGAGAAGGATTCAATAAGCAA
>CG6234 8478309 8478635|8655 chr3R 8476531 8480668 scaffold_21 30498 34853 - 40434|1970 2349
AC---TCTCTCAGCACGATGATGCCAACACCATGGTGCCCTGTAAATATTTATTAACTTTGAGATTTCGATAAA------------------------------AAACTTCAGGCT-GTTTCTTTGGCCGGATGTT-CATTTTGGTTACTAAATTGTTGACTGAGAGCAGCTGCAAGCTAAGCAAACGAAAACTCGAATTGAAACGAAAGCATTTGCCATACTGTTTAATTTTAAATGCACTTTAGCCACTAAG--------AATTTGCAAAAGTTCGACAAAAATATTTAT-ATTTAGACTTT--TATAGAGTTAAGCTCTTTTTTATTGTG--TCTGATGGAAAGTCAGAATAAATAA-----TTTCGATTGGTCAAC
ACCTACCGCCCGGAACGCTT---------CTACGGCGCATTGTAAATACTTTATAACATTGAGATTGCGTTTTACTTCTTTTTTTTTTAAGCGAAGCAGCACGGAATCCTCGCGCTAGCTTCTTCAACTGGTTGTTAAACTTTCGACTCCAAATTAT--GCGTAGAATATCAACA---TAAAAAAAGAAAAAC-------GAATAAAAAACATTTGCCATATTGTTTAATCTTAAGTGAATACTTTTCTCTAAGTTTTGCCCCGTTCAAGAAAACTCGA-GCAATTATTTATCACTAGGACTTTGATCTAGATTTAAGCACAGTTTTAATGCGACTCTGATTGCGAGTCAGAATAAATAACATATTATCAACTAATTCAG
>CG6225 8486219 8486588|8661 chr3R 8484875 8486571 scaffold_21 41802 43514 - 61501|1388 1794
GGACCAGAGCT--TTCAGTGTACAC-------------------TGTCTGTAATTATG------------TAGATTTAGTTAGCTATGCAAAT---TTTAAGAGAGAATCTGGGACTAACAAGAAAACGAACCAATCAATAACTGCAACTGTTAGTATTTTAGTAACGTCATTTGGCCCTAAGCATCCAGTTTTGATCGAAT--AAAGTCGCACCCTGCCACCGAATTTCCCCTTTTTAGGAATAGGTATTTACTTAAACCA-----AATACGTAATATGAAATGTATAATATC-CTTATTCGTAATCG----ACCAAAAATATGT---TAAACCTGTTTACATTA--ATACGAGCATTGTCT-TTATACTTAAGAAATAACATTGTATATTTTTCTAAATATAATT
AGACGAGATCTAGATAAGTGTGTGCGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGTGTGTGCGTGTGTAATTAGTTTTAGTTAGCAATGCAAATTAATCGAAGAGAGAATCTGGGACTAAC---------AATTAAGCAATAAATACCATTATTA----------ACTGTTGCTCGGCTC-GATCCTTGAATTCCATCCGCATCCGCATCCGCAGCCTGTTGC---------------------------TCTACTTAAACCAATGCGAATACGTAAT-TAAACTGTATAAAATTACTTAACTACAATTAAATTACCAAAAATATATCTGTTAATTTTCGTATATTAATATATAAACAATATCTATCTTAGTTAAGAGATAACGCTGTATATTTTTCTAAATGTGATT
>CG6225 8486219 8486588|8662 chr3R 8486572 8486856 scaffold_17 122103 122410 + 2183|0 33
TGGAAAATACC---------ATTT--------AA
TTTTAAATATCCATACTTTTATTTTTTTTATAAT
>CG6188 8501728 8501798|8675 chr3R 8500041 8502092 scaffold_3 894019 895965 - 54251|1717 1813
-----------ATTTA--------------AGTTTTTAGTTGTATTCACATAAGGCCACAAGAC-ACATCCATATAAATATACATAAAGTTCCTTCG
GTACCATCATAATGTATTGCCACTGTGGACACTTTACACATATTTTCACACACAAATACAATATTAGTTTTGTTTAGAGAAACTTTCCGTTATTTCA
>Arp87C 8519696 8519954|8686 chr3R 8517353 8519942 scaffold_3 913322 915988 - 91805|2472 2739
CCTGTTT-ATAAGCTTAAACGCCATTTGTAAAAGGCTAATTAAAATGTATATCAAATCCTTGTGTCAGCTAACATGAAGTA-CCCTATAAATTGAAAAGTAAA-------ATGTGTATGTTTTACGCATCAA--GGGCGCAAAGTATTT-AAAATGCTATTTATTGAAACTGCTTTCCCAGCCTAGAAAATAAAGTACTAAAATTTATAA---------TTCACTTGCGGATAATTCCTTCCCAGGTTAACTCTTAAACAATAAACCA
TTTGTTTAATTCATTTAAACGCTATGTGTAAAAGGCTTATTAAACTCAATATCAAAACCATGTGTCAGCTAACAACAAATATCCCTACAAATTGAAATTGAAATAATTTTGCATGTATGTGTTATGCATAAAATAGGCGCAAAGTATTTAAAAATGCTATTTATTGAATTTGCTTACGCGGCATAGATAATAAAG-ACTAAACTCTAAAAACAATAGATTCCAATCGATATTAAATGCAGCCAGAATTGAATGTTTGCCAGTGGGCCA
>Past1 8529804 8529871|8698 chr3R 8529118 8530440 scaffold_53 213628 214987 + 40414|727 794
TGTCCTGTAGCATACGCATACGCACACCCGATCACACAGCCTCACAATTCCCAAAAAAAAAAAAAAAA
TCCTCGG--------GAATTCATACAGAATATCGCACACCCT------TCCCTATACAAAAGACGGAA
>CG12279 8531340 8531541|8699 chr3R 8530473 8534233 scaffold_53 215014 218794 + 104444|936 1162
AACATT----------------CAGTCTTTAAACAAATTGATTACAAA---------TCTATAAAATGATATAATAAACTACACGCTAACTTCCTTAAATTCACCCCAACTGCGTCCGATCCTCAGCTTCACCTTGAGTGGCACGCTGAGTTTCACGCAGTTCTCCATGGTGAGGCTAAGGACTTTGGCTATTTTTTTGGCCTTTCCCGTTGGCACCTCGAAAATGA
TAAATTAGGCTAAAACAAGAAATAATTCTAATAAAAATCATTTGTGAAATTTGTTACCCTATATGCCAACATTTAAGCCTAAACTTTAACCTCCTGGAGCTCGCCCCAGCTGCGTCCTATTTTCAGCTTCACGCGCAGCGGCACATTTAGTTTGACGCAGTTTTCCATCGTGAGACTTAGGACCTTGGCCACCTTTTTCGCCTTGTCCGCGGGCACCTCGAAGATGA
>beat-Vb 8760257 8760535|9009 chr3R 8759872 8760656 scaffold_27 1769936 1770716 + 10463|428 753
TG----------TAGTT----TTCCTCGTTTCCGGTTTTGATTGCGTTATTTTTTGTTCGGTTCGATTTGTTT---AACATTTTTGTAGCTCTAAGCAACTGAAATGCACGTGAGAATTTACAAACAAAATCA--------------ATGTAATATTAACG--------------TATAATTCTAATAAAATGTCTCGGAGAATTTTGTGGGAAAAAAT-TAACTTAAGCATAGGCAAGCGAATCC-TGTAAATAGCCTTTAAGTGTGCAATCGAATTATAAGAACAATGAAATCATCGTCAATAAATAAGCAAGCAAACAAATTA
CGACAGCAGCAACAGCTGCAACCGTTAGTTTTCACATTTAATTCGGTTTTTATT-------TTTAATCTGTTTGTAAACCGTTTTCTAGCTTTAAGCAACTGAAATGCACGTGAGAATTTACAACTACAACTATAACTGATACGTGTGTGTATTATGCACATGTGTGTACATCACTATAAGAAAAAAAAAAAAAAGAAGATAAGTACAGATAAATCAATCTAATTTAAGACGCGGCAAGCTAAACTGTGTAAATAGTCTATAAGTATGCGTATGCAATAC----ACAATTAAA-AGTCATCAATAAATATGAAAGCGACGCGCTAG
>CG7242 8788764 8788975|9050 chr3R 8788411 8788765 scaffold_481 7543 7882 + 4675|359 360
CT
TT
>Cyp304a1 8791495 8791652|9054 chr3R 8790265 8791637 scaffold_1554 5 1418 + 54942|1251 1420
AAGT------------AGCCAAGATATTAGAGTTATCTATTTTTAAGACAAAG----TAATTTTACTGATTACGTTAGCTAGTTTGCTTGGATATTTTTTGAGGAATT------TTATTCCGTCACATTTCAAAAATATT-----CTAGAATTGCCCAATACTATTATGT
AAATATATTTGACTTGAAACATGTTACGAGTTGTGTCTATCTCTCCCACAGAGTTGATGAGTTTCTTGTTT---TTCTGTCAATTATCTGGTTTCATCTGGTGGATTTATCCTCTTATTATCTTAATTTTAAATAATTTCACGGACGAGAATTTTCAACTGCGAAGATAT
>CG7091 8806140 8806266|9074 chr3R 8805574 8807462 scaffold_549 2221 4133 - 14841|607 790
CACTTATTTGTTTAAATGTTTTA--------ACTTTTTTGTACTTTCGAAG------------------------------------------------CATTTTATTTGT-TTACTATAAATGTAGAGTTAATTGTGTTAAAATAAAAACAAAATAAATGTAAATATACAATATACATATCAA
TAATTTATTGTACATATTTTTTAATCCGTCCATTGTTTTGTGTTTTTAGCGTATATTTACAATTCAATTTGGTCCTTGTGCTTAACTTTCTCTTTTTCACATTTTATTTTTGTCACTACAAATT---------TTACCTTAAAATAGAATAAAAAGCGTTGTGCGCGT-CAGTATAAAAAACAA
>Paip2 8809963 8810345|9078 chr3R 8809449 8812004 scaffold_549 5887 8625 - 38230|532 935
AGCCAGCCCATATCTCCTGCCCGCCACAGAATCACAAACTACCCCGAACCCGTACCACGTGGACCTCATACGCGAAAAACCTTAGATAAACTGAAGACCCATTGCTAAGACTAGACTAACAGATTCCGCTAATGAGATTGATAT-TGATATT--CTGACCAAGTTGAGCCAGATGGAGCATTGGGAGCAGTGGCTCATGAATATCTTATTTCTAGATACCAAAATGCTGGAAAAGAAAACTAAATATACCAACAAACTCCAAATGCTGGCGACCGAAATGCAAACGAAT---CATATTAAAAAAAAAACCTTATAAAAAACAACTGAACCACTGCAAA--AATACAAAAAATATGTTTAAAAGAAAAAC-----------CAAC--AAAGAAACAAAAACACAA
GCCCGGCCCCAATAGTCTGAACTATATAACCTCACACATCAGCGCTTTCAGATAA-----GTGTCTGAAAAGTGACATACCGAGGATATTCCAAAATCCCA-TGCAATACCTTGATAAAC----------------GTTTATATATGATATTCACCTCCCATGTCTTACCAAAAAAAAAAACAAAAAAAA------ATCAA-GCCATTTTTCAAACAGGCAACATGTCAAAAAGTAAAAAAGAATATATAAAACAATATTGAA-----GAAATCTACGCGCACATACACACACACGTTATGATATGTACATTAATCAACTCAACCGA---AATGCAAACGAATACCATAAA------CAAAAAAAAAACTTAAATTCATACAACCAAAAAAAAAAAAAAAACAA
>CG31342 8816785 8817265|9081 chr3R 8816005 8817264 scaffold_482 4573 5950 - 33168|861 1425
ACTCGTACATAT---ATATACAAATTGAATAGATATATATATATATATATATATAGATCTATA------TACACCATATGTATAGCTGACACTTTGAAGGGCTACCAAATTTACAC-----CTCGAATTTGTTTAGATGCGGAAAAGTTATGAGAAATTTACAACATGAAATTCAAGT--ATTTTAGGTTAACATATACACGCGTAACCCTTACACACACAACTGTGCAACTTAGTATCCTTATGCAATATTGGAGTGCCTCTGATTTTGTTCATTGATGTTGTTTTCTTTCATGTTTTCATTTGTTTCGT---------GCGAAAAGACATACGCATCTGTCGTAACATATAAGATGTGATAAAAATGAGTACTCAAATTTAGGCAATTTT--AAACGATACATATGTAAATGCTTTTTGATTTATTTTATTAATAAGTTTCCGTGTG---------------------------------------TTATTTCGATAAACA------------TATTACTTA-------TGCGAAAAATTCATTAAAGCAATTCCACGCAAAT
A-TCGGTCACATTGAGAATATACACTTCATATTTGTTTGAATAT-TATAGAAACAAAATTATAAAAATTTACAACAAAAAAACTAAAAAAAAACTAAAA----ACAAAATGTAAACAATCACAAGTATTTATGCTAATTCGAATATTTTTCAAACATTTTATATTCGTAAATTGAATTGAATATACACATACCATATACACACG----CGTATTATACAAAACTGTGCAACTTAGTATCCTTATGCAATATTAGAGTGCCTCTGATTTTGTT---TGATATTTTTTAATATGTATTTTTTATTCGATTAGGTTTTTAATGGCAAAATGAAAAAAACATCTAT-GTAACTT-TAAGATGTGATAAAC-TGAGTACTCAAATTTAGGCAATTTTTAAAAAGATATATTTGTAAATGCTTTTTAATTTGTTTTAGACATATATGTCCATATAATTTTTGTGTTAATATTTTGTCAGTATACAATTATTACATTATTACAACATACAAGTATAATATATTATTATGTAACTTTATTGCAAAAAGTTCATTAAAGCAATTCCATATGCAT
>CG31342 8816785 8817265|9082 chr3R 8817265 8818133 scaffold_482 5957 6833 - 34876|0 0
C
T
>CG7488 8822592 8822647|9087 chr3R 8821073 8823247 scaffold_1 4152034 4154309 + 72495|1660 1735
----GCACTTGTTGATTACTTGTACTTTATT---TGTAACGTT----------GCATAAACCTAAGAG---TTCAC
AATCGGGTTTGTTGTTTCCT--TCCTTTATTAAGTACAATATTAAAACAACAAATATTAGTTTAAATGCTATTTAT
>CG7518 8833366 8833436|9093 chr3R 8833018 8833796 scaffold_13 10206 10990 - 22137|365 435
TCCGCAGCAGCAGCCGCCACCCGTTCCGGGTGCCAACTACTGCGACAACGTGGCCGCCGACTACGGCAGTG
GCAACAGCAGTCAGCGCAGACTAGCGCCTGCAACAGCTACTGCGACAATGTGGCCGCCGATTTTGGTAGTG
>CG7518 8833504 8834127|9093 chr3R 8833018 8833796 scaffold_13 10206 10990 - 22137|507 823
ATTCC---CACCTCTTCGTGCAGAACAATCTGCTGACGCGAATGGCACAGCCG------GCGGTTCCGCCGGACCCATTTGGCTATGACTTCGATCCCTCCTCGGTGGTGCCGGGCGGAGGATCGAAGGCGGCCAGCGTGGCCAGCGATCTGAACGAATTCCTGCGCCGCAGCCCGCTCAGCCAGCGAACATCGCCGTACAGCCAGGACGAGAATGCCGCCGCCCTGGAAACCTTCGTGCAGAACATGAACGCACTGCAGATCGCCACGGATGCGG---------------AGTGCTCGCGGCTGAATGGCACGGGA
ACTCCAGCCACCTGTTTGTGCAGGGCAATATGCTGACACGTTTACCACAACCGTCTGCGGCGGCGGCACAGGATCCCTTTGGCTATGACTTTGAGCC---------GGCGCCTGGC------TCAAAGCCCGCCAGCGTCGGCAGCGATCTGAATGAATTCTTGCGTCGCAGTCCGCACAGCCAGCGCACGTCCCCTTACAGTCACGACGAGAATGTGGCA---CTCGAGGCATTTGTGCAGAACATGAGCGCCCTTCAAATAGCCAGCGCCGCGGCTAGCGATGCGGAACAGTGTGCGCGTCTAAATGGAGCAGCA
>CG7518 8833504 8834127|9094 chr3R 8833810 8834121 scaffold_13 10998 11309 - 5528|0 325
CGAGCGATGTGGCCTCGGCGGACGCCACCGCCGGAGGAGCTGCCAATGCGGCCGCCGCCTGGTGGTGAGCCA-----CATGACACGAGGTGCGCTGCCTGGCCAGCAGATTGAGTTGAACTCCTCACATTCATAACAGTCTCTCACATACGCAGACATTTCATCGATGAAAAGCAGAAAGAAAAAA-------AAAAAAACGAAACATAAAAATTCAAAAAACCGAAAACGCATCCAAGAAATCATTCAAAATGACTTAGGAGTCAATTTCAATGTTTCAACAA--AAAAGAGAAAAATAAAGAAAAATTAACTCAAATGGAAGTT
CGGGAGATGCGGCCGTGGCAGATGCAACAGCGGGTGGCGGTGGAGTTGGTGCTACTTGGTGGTAAAGTGGCAATGACCATGACAACTGTTGC--TTCAATGTCAACAATACAAACACAAACACACACACACAT------CCTTCACATACATCCGCGCGCCCGTGTTGGCCAACATAACGCAAACATTTCATTGATAAGGCGAAA-ACAAAAATACAAAAAA----AAATAC-CCTATGAAATCATTAAAAATGGCTTAGATGTCAATTGCGATGTTTCAGAAAGCAAAAAATACAAATAAAAGCAAATTAAATTAAATGGAACTC
>CG11656 8836682 8836808|9096 chr3R 8835596 8836687 scaffold_13 12957 14050 - 23371|1128 1133
ATTGGT
GCAGGT
>CtBP 8847400 8847465|9108 chr3R 8846519 8847997 scaffold_13 22990 24366 - 65559|891 960
--AGAGACAGAGACAG--GCGAGCAAGGGAGCGTTATTACAAGTAAAAAAAAAAACAAATCGAAACAAAA
TAGGAGGCTTAAACAGATGCCAGGGAGAGAGCGTTA-------CAAACAACATAACAAA-----------
>CtBP 8851195 8851905|9112 chr3R 8851085 8851367 scaffold_13 27865 28118 - 6413|111 284
GCATCTGCTGTCCAACTGGCTGCACCTGAGAGCTGAAGAGCTGGAGTTGACGATGACAACGGGCAGTGGCGCAATGGAGTCCAGCACACAACAACTGGCAAAAAGAAAATCGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGTAGGCGGCGTAGT-ACGAGCATTGTGGAGCAGTAGACCCCAT
GCTGCTGCATCCT-------------------------TGCTGGAG--GAAGGCAAACAAAAATAATAATATAAATAAATAAAATATTAAAAAA---ACAAAAAAAAAAAC-AACAACAGCAACAGCTAGAAAAACTGGTGTGACAACGGGCCGTGTTACAGGATGGAACTCAC
>CtBP 8851195 8851905|9113 chr3R 8851480 8851667 scaffold_13 28244 28427 - 6781|0 195
TTTGTTCCGGTTGAGAAACGGATTGCTTGCGCGCCTGTG-CCAGCGCTTGATTTGAA-TTTTTCCAAGTTTCTATGTTTTAATTTAAAATACAATACATATTTGCATTACCAACTCCCGAAAGAAAGAAATCAACAACAAAATAAAAACAAAATACAACATTAAAAACAACGCAGGAAAACG------AGGAGTAT
GCTGCTCCTGT-----------ATGCGTGTGCAACTGCGCCCAGCCTTTGATTTGAATTTTTTCCAAGTTTCTAAGTTTTAATTTAAAATACGATAAATATTTGCATTACCAAC-CCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACAAACAAAAAAGAGAAAGAAAGAAAGAAGAAAACAAAAGAAAAAGAACCTAAGGAGAAT
>CtBP 8851195 8851905|9114 chr3R 8851684 8852047 scaffold_13 28483 28888 - 16355|0 261
CCCACACACAACACGCCTCAAAATTTACTAC----GTATTTAGACTTTAATTTGTAACTATTTAGAATTTTACAGTTACAACTTAAGATTTTTATTTGTATTGCAGCCAATTGTAAGTG-AAAATATGTTA-CTACATATAAGCGCAAAAACAAATGC----------------------------AAATGTTGGAAAATTTTAATTACGAGAAACAAACAAACAATTATGGCATACAAACAAAAAA-----CAAAAC-AAA
CACACACACAACACGCCTCAAAATTAACTACGTATGTATTTAGTATATAATTTGTAACTATTTAGAATTTTACAGTTACAATTTAAGACTTTTATTTGTATTGCAGCAAATTGTAAGAGAAAAATATGTTACCTACATATAAGCGCAAAAACAAAAACAAAACAAAAAAAAAAACACACACACACAAAATGTTGGAAAATTTTAACTTAAACAAAAAAAAAAAAAA-----ACAAACAAATAGAAAAGTGAGTAAAACAAAA
>l(3)87Df 8857172 8857317|9118 chr3R 8855636 8857174 scaffold_13 33208 34961 - 20277|1849 1851
CAT
CAT
>l(3)87Df 8857172 8857317|9119 chr3R 8857217 8857915 scaffold_0 5345933 5346642 - -118|0 105
TAGGATACCAAGTAATCCTGGCATTGTTAAATCCCTTGTGTTGTAAACTACCTTTTGTTACCAAACTTTATAGTAGCCAATATA-----TTATATATATGTTGTAA
TAAGAGTTCAATTAATATTCGC--TTACAATTCGCTTAAGCCTTCATCTGCCTTAAATAATTTATGTTTTTACTATTATATATAAAATGTTATACAATTTTCGAAT
>ry 8863652 8863748|9122 chr3R 8862220 8863653 scaffold_13 40142 41629 - 78736|1501 1502
AA
CA
>ry 8863652 8863748|9123 chr3R 8863720 8863843 scaffold_4 2559447 2559592 + -574|0 29
ATACATAGTGA-ATTAAATGTTTTAAAAAT
AAATTTGTTACTATTAAAGCTAACAAAAGT
>CG11668 8865793 8865906|9125 chr3R 8865806 8867454 scaffold_13 41672 43319 - 58239|0 100
TTAAATGTGTTCTATGCAATTTCAACTTTTTAAAGATAAATTATTACATTTAAAACAATTGTTGAAAAAATTAAAAATTTTAAAAAGCATATTTAATAAAT
TTAAATGTGTACAGTACAAT------------------AATGATTATAATTAA--TAATTACTTAAATTAT-----AGTTCTAATTGAATAGTTGTTATAT
>Hsc70-2 8873035 8873106|9129 chr3R 8869883 8873161 scaffold_13 43435 46980 - 125633|3461 3537
TACGATCCACCGACCTAAATTATTCAGTCATTTTTTGATTAATAT-TATTTTGAAAAT----AAAGTAGACCTTCAC
AGTGACTGGCCGGCACGAG-----CAACAATTGTAT--TGAATATGTATTTTGAATTTATGCAAATGTTACGTTAAA
>CG31157 8874869 8875035|9131 chr3R 8874026 8877491 scaffold_13 49981 53488 - 83720|870 1123
GACACCTAAAACTTCCTTTTTGTTTTAATTA---------------TATTGATATATAAAAATCATAAACAT--TTTCAGAATGAAATTATA-----TGTGACC-------------------GTTAATCATG----------AAATCATTTGCCAACCATATAACGTT-------------------TTAAAC-------------AATGCGCATAAATTATTTTTAGCCAAT----CAGAAACGTGTTTTG-
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CGTGGTGGAGTTTGCCTCGTTGTCGGACATGAAGACTGCCATTGAGAAGCTTGATGATACTGAGCTGAATGGGCGTCGTGTGCATTTGGTCGAGGATCGTCGTGGCGGACGCAGCGGTGGTGGTGGCGGTGGCGGCGGGGGTGGTGGTGGCGGCGGAGGCGGTGGACGCGGTCGTTCCCGTTCTTCCAGCTCACGTTCACGCTCTCGCTCGCGCAGACGTTCTCGCTCACGTCGCTCGTCGCATTCGCGCTCTAAGTCGCGCAGCCGCTCCAAGTCACGCGGCGGACGCTCAAAGTCCAAGTCACCAGTTAAATCGCGTTCTCGCACACGTTCGCGTTCAAA
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CTCAATTTTAGAATGTCGTGTTGTTTATGTTTTTGTTTTTGTTTTTATTTAAATGTTCACACTTTTTTGTTATTTGTTTGAGTTGTAAAATGGGCCACGAACTGTTGGCCACGTTCAAATGTGTGTCTTATGT----AAACCAAG-----TTACATATGCATAAACAATAACAACAACAACAACAACAATAACAATAACAACA-ACAACAGCTACATACATACAACAAACACAACAAAATGAA--AAAAAAAAATTACAGCACAGCAAGAACTCACGCGACGTTGAGA-TTACCGCATGCTAAGCTCAC-----AAAATAACAAAAAACAAAAACAA--------AATCAAATCAGTTCAAGCAATCAC---
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CGAA------CCTAGACCTAAGGCTCCATTCTATCTTATGCATT
TAGATAACTGCTTAGTCTTAAGCCTAAAGT-TAATGTATGCACT
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GGTATTGGCTCCGTC--GAGGAGTAAACCTGCCATTTAGTTTGTTTTAATGAGAGTT--AGAGAGAATGTGACATCGACAACGGTAACTGTCTAAGAGACAATTAACTGCATCAGCAATGGAGA---GTGAGAG-----CGTGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGACACAAAATAATGCGA--GCGTGAGCGAGAGAGAAAAACAATTGAGAGCAATATATTGTTAACGTACTTGTCATCCATTGACGCACACACACAAAGCATTGACGAACAAGAACAAGAAAAAGAACAACAA--CAACAGCGTAAGACAAAAGAGAGCGATGATTTTTATTATTGGAGAGTTTTGGAGAGTGTTTTTTCTTTGTTATTTAACATATCAATCTTTTATTTTCATCTGAGCTGGAATTTTATTTTAAATACTTATAATATAACCGAACTGAGAGCTTTATGAGA--GAAACTAATGCACAAGTGAGAGCGTAAAAACCACACACACACACAAACACACACAAGCATACACACATATTCACCATTTGGTGAATTTTGGCAGAGAGAGATAGCATTGAGTC-TTTCTAGTAGAGTTAAATCAGCTGAGCGTAGGTAACTTAACGAACAGGC-AGAGCAAAATTAAAT--ACGATCTATTGACGATATCTAAC--------------------ATAAAACCCCATATTCACCTAGATTGGAATATA--TCCCGTGCAACCCAGTTTTTAACTAGTTGTT--------------------ACAACAGCGCACAATT----TTTTGAGAGTTTAGCAGTG-TTTTTGAACAGGT----TTTTGAGCAATCA-ACACAAGTTAGTTTATTTTTCAGGCAACCCTATTTCGATGATGTAGTTGATAAGACTTTTTGGTAAAAAGTAAACAGTGAAGACGTTA--AACCAATTTTTTCTAATTATGCACGAATGATAAATAAAAAGGCATGTGAG----------ATATATAAAATATGTCAGATTTGACAATATATAATACGACAAGCTGACAACATATTT--AAAATAAACTGTGAGAGCGGGTAAAATACACAAATAAAT-AAAATAAAACAAAAACTTAA
>CG9288 9606391 9606517|9865 chr3R 9600964 9606572 scaffold_55 367082 372643 + 155605|5930 6056
TTTTGACCCTTGTTTTGTTGTGCTTCTTCTATAAGGCCTTTGTATTTTAAATTAATGATTCATACATATATTATATTGCTCAAAGTCAATGAGGACTTAAATAATAATAATTTTGACAGTAAACCAC
--------------CTGTTTTGTATAGTGTAAAAGGAAACTG----TCAAATAAGAAGTCGATGCACTTTTCGCATTG--------TAATTGTGGCTTGATTAAAGATTTTAAGCACATTATCTCAC
>CG9286 9607790 9607808|9866 chr3R 9606657 9608290 scaffold_55 372707 374408 + 34959|1217 1238
A---TATTTTTTACATTTAAAA
GATTTATAATCCACATGGAATA
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GCTGACCAGCCCCACCCCCCAGCTGCCCTGCCCTGCGTATGTGAGTTCCTTACTAAAGAAGCGCCCAAATTTGCTGAGCGTTGTGCGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCCTGTGCGCGTGTGTATATGCGTGAGAGCTCTTAAAATTAATTATTTGTGATATATTCTTAAAGTGAC----AAGCGCTAGGCTTAGTGTATATAGAAGCGACTCTCATCTATCCAATGACAGAAATAGAAACAACACTTCCTACAAAAGTATTAAGTACGAGACGGTATGTGTCCA--CTGGCCACGCCCCCAAATACAGTGCCAAATCATAG---------GCGGGCGGGCAG------------GTGAGTTGCGCCCTTCTCCCTTCGAATTGAGTTGAGCTCACAATTGGAAAACAGCAAGCGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGCGAGAGAGCGGGAGAGAGAGAGAAACAATTGTACAAATTTTAATTGTTTAAGCGTGTAAATATT-ATAAAGAAAGTGAGAATAAATAAATTTAATTAGCGAATTTCTTG--------CACATTTGAACTCGTCGGTACTTTGTAATTCCTGTACAT-------CAATTACGCATTTATTTATAACTAGTTTTATGTTAATTATTGTATTTAACTGAATGCCATAACGGTCATTCGTTTATGCTAATAAATTGCTATCAAGTACATTTAGTTGTCTTAGTTGTTAAT-TTTAGTTGTTAAGTAAAGAGACAATTGCTTGAAA--------AATATTCATATATCAAATATACAACAAATATTC-TTATGCAAGAATAAA
>CG31517 9774833 9775054|10075 chr3R 9774107 9774904 scaffold_42 523574 524278 - 20224|758 829
ATCCACCAGCAGACAGCTGTCGAGATGACCAAAGATGCTGGAGCCACCAAGGGATCTTGCAGCAGCATCTCG
----CCCAGC-GACAGCTGTCAGG---------GATGCTTCATCTGCGAAAGCTACGGCAAGCAGCTGCTCT
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GTGTTGTTATTATGTTATTTGTTGTAAACCCATTATTGCTGTTGTAATTGATTTGATGTAATT
ATGTTGTTTTTGTTTTATACCCCGT----TTATTATTGCTGTTGTCGCTAATCTGTTGTTGTT
>Orc2 9792725 9792803|10093 chr3R 9790771 9796359 scaffold_53 560581 565935 - 196376|1998 2081
GCCATCGGCGTAATTTTAGAACATATTAATTTATTATCTAATATTGTTAAATACAATTACAAT-----TTCGCTTTTTAAAAAT
CCGCTACGCT---GTTTAGAACATATTAATTTATTATCTAAT-TTGTTAAATACAATTACAATTTGCGTTTGTTTTTTAAAAAG
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AATCTGCACCAAGGACTATCCTGTGCCCGATAGCAAACTTGTGATCCAAAAGGGTACTCCCATCATAATCTCCCTCATCGGAATGCACCGCGATGAGGAGTACTTCCCCGATCCGCTTGCCTACAAACCGGAACGGTATCTGGAGAATGGTAAAGACTACACCCAGGCGGCCTATTTGCCATTCGGCGAGGGACCCAGGATGTGTATCG
TATGTGCAACCAGGACTATCCTCTGCCAAATAGCAATCTGGTCCTTAAGAAGGGCACCGAAATTATCATTTCGCTGCTGGGCATGCATCGCGATGGGGAATACTTCCCGGATCCGCTCAGCTATCAGCCAGAACGCTTCACTGAAGAGCATAAGAACTACAACCCCATCGCTTATATGCCCTTCGGTGTTGGACCGCGTCAGTGCATTG
>Cyp6d5 9856985 9857206|10166 chr3R 9855832 9857204 scaffold_21 1833397 1834671 + 30528|1157 1397
GCGCCCGCATGGGAAAGGTGAATGTGAAGATAGCGATTGCCAAGGTTTTGTCGAACTTCGATCTGGAGATCCGGAAGGAAAAGTGTGAGATTGAGTTCGGCGTGTATGGAATACCGCTGATGCCCAAATCAGGTGTTCCCGTGCGTCTGTCTCTCAAAAAGTAG---------------------CTCCTAGTCTTGTAATTAAACCATGTAAACCGTATAATAAACGTGCAATTTGTAAT
------GAATGGGCAAGCTGAACGTCAAGATTGCGTTGACCAAAATACTTACGAACTATAACTTAGAAACGCGCCAGCAAAAACGTGAGATCGAGTTCACTGTGTACGGAGTTCCCCTGCTCTCAAAGGGAGGTGTTCCTATAAAGCTCTCCAAGAAAAAATAGACCAGAAAAATAATGAAAATCCCCACACTTCTGTCACTAAATAATGTG------ATTACATTCATGCCACC--AAAG
>Cyp6d5 9856985 9857206|10167 chr3R 9857205 9858558 scaffold_72 32733 34085 - 9153|0 1
GA
GA
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AT
GT
>foxo 9912698 9913698|10225 chr3R 9911785 9913736 scaffold_72 91799 93806 - 26745|1018 2204
GATAAATCTGGTCGCTTCTAATCTAACATACATACATACAATACATATACATAGATATATAACTACAATTATATAGTTATGCATTAC-ACATAGAAACGAAGCATACAAATAATACCAATTAATCACCAATAATTAGATGCTACAATTTGTGAAATTCTCTGAGTGGCAGAGAGCTGA--------------------------------------GAAAACATCTTTGGCCACCAATGAAGGGAAATTTGAATTGAATT-----------------------------------GAAAACACGGTTTAGTTATTAGGTTCAACTTTGTACATATTAATTTTAATAACCTTGACGTAATGAAACCCACAAATAATAA----TAATACTTCTAATGATAATAAACAACAAGAAACAGCGTAAAACGTAAACTAAATGTTC-----GACAACTAAATGGAAAAAT---ATTTGCTAGCCAGCAGTCA--TCGAGGAAAATAGAAACAAGAAAATGGCAACAGAAAATATAAATGAAAAACATAAGAAATTAGCACAATTATGTAATAATTAATGCTTAATTAATGTATTTAATTGAAG--------------------GTCTAATTGTAATTGTATATTTTTTTCTATAAAGAGCAAAGAAAACCCTTAAAGAAGAATACAACTTGTGTAAAAATTAT--GCTTAAGATTCGCAATGATATACGTAATAAATTCTCCGATTAGTTAGCACACATCAAATCAGCTCGGCTTTAAAAATAAAA------------------CCCTTTGTTACA--TAATTATGCCAAC---------------------------ATCCATA---------TGTAGATCGTAGACCTATAA-----------------CAAAGATTTGAGTGTAATACAATTAATTTCATATATTATTAGTAAATGTAAATGTTGATAGGCAAAAGAAAAAAACAAAATTATAACAGAATAGCCACAAAACTCAAAAACCCAGCAGAACTAAAAGCATAAAGTAATAAGCAAATAAATGCGCATCATTGTGTACTATTATGGGCTAAATGTTAATTATTAACTAGATTGTACAATTCAAATGTAGTTCATACTATTTAA---AATGCAAAAACGGAGTGAAGATGAATAAACTGATGATTCAATATAAGAA
GATTTATCTGGTCGCTTCTAATTTAAAATATACACATA-AATACACACATACATACGTATAGC-ATACTGAAACGCGTAAACTTAACTGCATAGTACCATAGAA-ATAAATAATATA----------CAATGTTTAGCGCTTATAATTAGTAGAATTCTCTGTGCATTGAAAATATAACAAATTAACAAACGAACGCAAAAAAAAAACATAAAATGGAAAATTACATTGAAATTTCTTTGAAAGAAATTTCAGTTGCATTCAACAACAACAACAACATTTATAATAACAACCCTTGCAAATATTTGCTAGTTAGTAAGTCATTTTATGTACATATTAATTTTAATACCCTTAGCGTAAAGTGAACCACAAATAACAAAGCGTAAGACGTAAAACGTACATAAAAATATATATACAA----------AAAATTAATGTTCCAAAAGATAAAAATATGCAAATATTCAATTAGCAGAGCGACAAGTAAATCAAGTAAAAAAAAGATAATAAGATGAT----GAAAACTTAAAA---------AACCAATTAGCACAATTATATTATAATTTATGCCCAAT----GTATTTGATTGAAAATATTTGTCCACATACATACGTGTAATTGTAATTGTACATTTTCTT-------------AGAATGCTTTTAACGAAGTCTTTAAATCATATGTATATTATATGCTTAAGATTCGTAATGGAATACGTAATATTCTTTGGTACTACTCTGTGTGTGTAAA--TAGCTCGGCCCACAGGCCCAAATGTGGCTAACGAGATTTTCTTTTTGTGAAAAGTCGTTAATCCAATTGAAAACTGAATGGTAAGAGAACGCTGGGCTATAAATGTTTGTTATAGATAGTAATCATACAAGTTAATCAAAACAACACAAACAAATTGAATGTAATTCATAAAATAT----TAATCTAAGTAAATGTAAATGTTGCTAGGCAAATAAACGTAAAGAAA----------------ACAAAATATAAAAA-----------TAAATATATTACCTAAC---TATACCTATGCGCATATTTGTGTACTATTATGGGCTAAATGTTAATTATTAATTAGATTGTA-AATTCAAATGTAGTTCATAATATTTAAAACAATTACAAAATATATATTATATAAATATATATATAGATAACGATGATAA
>CG3153 9917926 9918149|10230 chr3R 9917512 9918089 scaffold_15 2701364 2701991 - 27487|414 638
A--ATACAAATGCGGACAAG-------------TGCACTCAATGTTAGCTTTTA----TTAGTGGTAATTCTTAAGATCGTATCTGCGTATCTGCATATGCTTAGTTTAGGGATTAAGTACGGTTAAGTGAACGAAAACGAAG------------------------------------------CAGGCCATTATTGCGGCATCCAGCCAGTGACGCAATATGG
ATCAGATCAGTTCAGTTAAGAGAGAGTGTCGATTGCTTTGCATACTAGCTTGTAAGTTTTATTTGTTATTATTATTATTATTAAAACGTGTGT---TATGC------AATAGATTAAGTACAATTTAATT--TGAACATGAAGTTGATATTGAATTTGAATTTCAATTTGGATTTAAATTCTGATCTGGGCAATATTGCGGCATCCAGCCAATGACGCAATATTG
>twf 9949910 9950199|10261 chr3R 9949721 9951252 scaffold_15 2736653 2738137 - 57146|189 484
GTCTGAATCCCGATCCCACCGAGTCAATTCTGTTTATCGCCCTTCTACGTACTGTT-TCCTAGCAGAGCATTTAATTTATTGTATCC-AATCGTTTATTTCTTTTGTGTTGTGTCTATCCCGTGTCTATATGTGTCCGTACGTCA-GTCGATATCTTTAGAGGCACTAGGCATCAACTGAAACATCGCATAGCAGCCGCCAAAGTGGGCTTCCTTAAATGTATTCTTGTCTATGTAACTTTAGATGGACATATATGCAATTTATT---TAAATTAAAAAAAGTAACTAAGTTCACA
GTCTGAAGCCC------ATCGAGCCAAAC---TATACACAATTTATGTTTCCTGTTCTTCTCGCAGAGCATTTAATTTATTGCATTTGAATTGTGTGCTCCATTT---TCATGT--------TATTTAAATGTATCCG--AGTCATATCTGTATCCTTAGTTGCACTAGGCATCAACTGAAACAACGCATAGCAGCAGCCAACTTGGGCTTCCTTAATTGTATT---GTCTGTATAACTTCTAAAGGACATTATTGCAATTTATTATTTAAATAAAAACAAG---CTAAATTTACA
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TCAGATCGGTATCCGCAACCGGACCACATAATAGCCCTAAGCTAAATGC---------------TAGCAGTTAATTATTAAATTACCATAATTGTGACAACTC
TCGTGC-----GCCACCATCTATTAATATTATAAACATCATTTTGGAGCTGCTTGTGCTTCGTTTAGTAATTAA--ATTAAATTTCCATAATTATGACGATCC
>CG3199 9989323 9989347|10316 chr3R 9988664 9989533 scaffold_15 233732 234623 + 3787|696 720
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-GGCGTTCGGGACTCAAAATCTCTC
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CCGAGCTAGAAACTAGATTTAATTGCTGTGAGACGAGAGACGGGAGCTAGAGTTAAAGAGGGGGATAATTAAGTTTATAAATTGTTTTTAATTGCGGCACAC-------------------------------------GAAATGCTGCGCTA-------AATGTAAATTAT-------------AGATACGTACACTACCTT---TATACTATATACCTATGTATACCTATATATGCGTACATACATTCATATATAGATATGTTTATATGTTAGGCAGCGCTGCGCTATTTAAACCTGTACTATATACTAGATGACGACGCGTTTGTCGAATGTTTATTCTTGTTTGATCTTATTGTTAGTCCCAAACTGTCAGCCCCTTTGTAATTGCCGCCAATTTGCTTGCAAGGCCCAGCCCCAGCCCCA----AAATATGTTTAAATATATTTTCCTC---------------------------------TTTTGTATGATT--AGCTTTAATTACACTTAAAAATGCCTAGTTTAGCTATGAGAATTATTAATCTTAATTCACACACACATTTAGTCGTTAGTCTCTGCAAGTTTAAATGCATAACTG-ACTGCTCTGTTTGC----ACATTTAATTGGCCGCTAAAAATAACTGTTAAATCTAACTTGTAACTTTTAATTATAATTTATATGTTAGCTTTCAATAGTATTCTTAATGTTATTGTCAATAATATATTGCAAATGTTGTCAATAATATTGCAAATATTTGTGCAATCGCGACACAATTCAGCCGTC-------------TACTTTCCCAAGGCC---------AACTAAAATG---------CAAATCAAATTCTA--TGAGAAGATTTTATAAACAAAATAAAGTAAGAAT-GTGTTAT
>RpII15 10135299 10135566|10437 chr3R 10132134 10136780 scaffold_53 329157 333539 + 102052|3348 3615
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CATCGGACGCTGTATA-GCGGCTTATTTCA-----------------------CACAATTGTGCAAATTGCGCT----------TAGTCTTAAAGTACATAATAAAT---------TTGTAATTTGTAATCT------------------------AAGAATGTTTGAGTTCTACTGCACGCTGTGTCGGCTAC----GTTTCCATTGTGCGGTCGCAAATGCTT------CTCATTCTTAA---------------CTGACTGCG--
>CG31321 10139897 10140134|10441 chr3R 10139535 10140082 scaffold_53 336177 336714 + 13293|363 559
------CGTACTTAATGCCAGTCCGTGTTATATATATATTTTTATATATTTATAATATAAATTGTATATTTTTTGTATATTTATAGGGAATTT--TTATAGCATTTTATATTACCAACGAGTTGATCTTTAACTTTCATTTGCTGAAAGTGTGAGTTTAAAGTTAGTAAGCATATTAAAAAC---AGTTGTAACTAG
ATCAATTATATATACAACTATTCTCCTTTTGTTATATACTTCTGCAAAAGCCAAGTTTAGATCTGATTCTAAATATAAACATATATGTAAGTCAGTCGCAGGAGTTGATGC----------TTTATTTCTTGCCTCTGGGCACTGGGAGCAGGAG---AAAGGAAATTTATATAAAAACAACAAGAGTGATAGCTAG
>Crz 10141332 10141439|10445 chr3R 10141071 10141452 scaffold_53 349488 349892 + 4105|288 412
CCAC---------TATCCGTTCAATGTGA---AATCTATTGTAA-----ACTAGCAAAAAATGCTACAAAAATGTAAAAAAAATTGTTGTAAACGGTTAATAAAACACAGGATTTTTATGAATTA
AGGCGGACAAGAATATAAGTAAAATTTGATTTAATTAATAATAACTGTTATTAGCAAGAAATGCTACAAAAATATTAAAAAAA-------AGGAGAAGAAGAAACTAATTGATATTGGCAAA--A
>pr-set7 10144481 10145597|10446 chr3R 10141453 10144626 scaffold_20 465492 468676 - 61352|3308 3460
GGAAGAGCTCTCCAGGAGCTCGCGAAAGGGGTTGCGGTACAGCCTTAAAACGAAGACTATTTACC---ATGTTCAGGGCAGAGAATCTTTAAAATAATAAGACCT----GGGCTAAACTGGTTTTTGGCTCGAGGGAATCTTTCTTAGCTTTT
G----------CCATTGGCTCATGACAAATGT-------CATTATCTAAATAAATAATAGTAGCCTAGATATTCTTTAATGAAAAT-TTGAAAGAAACAAAAACTGTTAGTGCAAAATATCGTAAAGGATAGAGAGCATCATCATCATATTTT
>pr-set7 10144481 10145597|10447 chr3R 10145408 10146391 scaffold_20 468702 469725 - 12554|0 219
TTGAATGAAATCGA----AAAACTGTTGACCATTTGAAAAGAGATGA------TGATGTTGATGA----------AGCCACGCATTCACATTGACAA--GAATCGATTGTACACTATTTATATAGATATTTATATTAGATACATGTGTAATTTCTAACTATTACGTACTATTTACTGCCATAG----AGCTATACACTCCCCCT----CGCACCTGTCCC
TTGTAAGGCATCGATTATGAAACTGTTGAACATTTAGACGAAGTTGAAGCGATTGAAGCTGATGATTATGACATAAACATTGCATTCACATTTATAATGAAATCG--TACACACTATTTATATAGGACTAGGTAT---ATATATGTAATATTGCTAATAATTATGTACTATTTACTGCCATAGTGCTATCTATATACACCCCGTGCACCTCGCCAATCCC
>CG3321 10153259 10153473|10454 chr3R 10151339 10153426 scaffold_20 474471 476701 - 32971|2179 2364
GATCCTTCAG---GATGCAACATCCGCAGTTC----CCTTAGCTTAAAAACATTGAAAAACCACAACATTTACA-----CACGAAGTTC------GCCCAAAAGGAGGAGCATCATCGATAGTGGAGCCACCATCTATCGATCACTGACTATCGTTTTTGTGTTTTCCTCTGATGCTTGTGCAAAA
TTTCTTTAAGTTTATTGCTACCACAACTGTTCGCAACATAATCAGAAAACCAGGCAATAACAACAACAGCAAAAACAACAACCAAATTCCATGGGGCGCAAGCGATCGGACAGTGTTGCTCTTAGA--------CTATCGA--ATTATCGATCGTGTTTGTGTGTTTATCTGAAGTTTGTCTAAAA
>spn-B 10155133 10155331|10455 chr3R 10153616 10155522 scaffold_20 476702 478550 - 36270|1585 1783
TTGATTGAATTTATTCTGTTTATTTTGTTATCGTTTAATTTGTTGAATTTAAAATGTGTAACGGCGGAGCGTTCAATTAGCCATACGATTGTCTTATACTCCTGTTAAATTCAGCGGAATATTTTAGGGTTTAATAATTTAAATTTACTTAGTTGCCAATCAGGTTTAGGTATCATTAAAATATATAAAAACAAATTTA
--AACATGATTTAATTTGTTGAATTGTTTAT--TTTAATTT-TTGAATTGAAAATATTTAACGGC--------TACTGATCCGCGCG------TTATAGTT--------TTCATTGTTTTTTTTTGTACACTCACATTAAATATTTATTT-GTTTTTTTTTTTTTTTAATTTTCAT----ATATATATTAGCA------
>mRpL11 10338357 10338415|10651 chr3R 10337471 10339438 scaffold_709 4486 6458 - 67738|918 977
ATTTGCT-TATTTGCACTGTGCTTTTAATTGTTTAAAATACATTTATACTTAAAGCGTAA
ATATACTATATAAAAAC---ATTTTTATATTGTTAAAATACATTTATAACTAAG----AA
>stumps 10433221 10433804|10768 chr3R 10430388 10433223 scaffold_22 428313 431190 + 145145|2962 2964
GCC
GCC
>stumps 10433221 10433804|10769 chr3R 10433517 10434033 scaffold_22 431354 431852 + 7871|0 294
TTGTATTATCT----CTGTAGTCTTCGGTTTCAGCGACTAATTGTACATT--TGTGAAACGATTGCAAGCAACCAAATCAACATATC-GCTAGCCTTTAAGTATAGATCCTAAGTCGATACCAACAAACCAAGCAGCTGACATATCAACGCGATTCATTCAACTCTAGGAATACCCACCCCATTTAGCGCTAAGATACCCACCTTTGGCATGCCGCTAAGCATGAAAAACTCGTTCATTCTCGACTCCTCAACCCGCAAAGTTAAACGCAATAAATTTTTTTATATATAAGCAAA
TTGTCTTATCTTTAGCTATCGTTCTCGATCTT-----TTAAATGTACATTATTTTGAAACGATTGCAAGCAACCAAAATAACATATCAGATAGTCTT--AGGCCAGGTCTCGA------ACCAACGAATTGCATGTTTGTAATTCTAGAACTAAGTATTC--CCCCTCCCCCCCCCCCCACATTT-GTATTAAG---------CCTAGCATGCAGCTGAGCATGAAAAACACATATTTTT------------CGCACAAAGTTAAATGCAATAAATTGAATTCTTTA--AGCAAT
>CG14853 10443744 10444709|10780 chr3R 10442353 10444771 scaffold_22 440831 443114 + 41282|1485 2532
AACCATATATGTGTATACTCGTATATACTCAATCCCAAAACTGTGCAGAAATTCTTTTGGTGTGGATAGTGCTGACGATTTGCTTACAGAATGATGTTTGATTTCTTGCCCGCTGCACAGGGGCATCTATATATTCTTGTATAACTATTTATATAAACACACTCCACCCTTTGCCCGGCTAGTTTTTCCACTAGTGCGATCGCTTTACGAACCTAGAAACCGTCCCTAACTGCATAC--------------------TCTCGTATCTCGTATCTTGTATCTTCACTTGCAA---AGTTTTCTC------------------CCTAGGACAAACATATCGTACAAACTCAATAAGTACTTATATATACATTAATACCTATTTATACTATTATATATTGTACAT--GTTAAGCCTAGAACCCAATAA----AGATATACTCG-ATACAGTAAGCTGAGAATGGCTAAGGATTAGGTGATTATACACACACACGGAATGCGAAACCGAATCAATATAGATTTACATAG------ATTTACAAGTATATATTTTAGTAAG--ACACCCATTCAGAACGCACAGGACTTGGAAT-----------GCTTTACATTTTT-GCATTTGATAGAGATCGATTTTTTCCCCAGG------ATATAGAAGAATG-AGAGTTACGAAGCCAAGGATAAGTCTGATATGTCTATAAAACAGACGGAGGATGGAACGAACGATCGTAGAACTACAACTGAAATGGTCCAATGTCACAAACTACGTAGAAGATTGTAAATATATATATTTTGTATCAATTAAGCCTGTACTAGAGTCTATATATTCGTT-CGATTTCGTTGTATAAGTTAATCAGGGACATAACTCTAAAAACTCCCCCAGTAATAAACCGTATATTTAATATTATTCATATAAATATTTGTA---TCTGATATGTGTAGCTCTTGGCTAAGTTTTCCTATCTGTATTGTTGAATTATATAATCCAGA---AGGTCTGAATGTTTACGGAAGACAATTGTAATAAAAGTGGCAAGAAAGCTG
GGCGCTA------------CGCTCATTCGCAATTT---ATATATGCATATACTATATATATGTGTGTG-----------CTATATACGTAACTATATTCTTGTACTTG-----------------------TACTCGTACACAATGAGTTAAATGTTTACACT---TCCTTTGCCCAA----------AACTAGTGCATTCGCTTTATGAACCTAGAAACCGTCCCGAACAGCATACAACAAATACTAACTATACTATATAAAATTCCAAATGCAATAACTTTAGCTGCGAACTAGTTCTTTCGTTCCCAAAAATCCAAATCCCTAGACAAACATATCGTACAAACTTAATAAGTACTTAT---TGTAGTCATATTTG-------TATTGTGTA-TGTAAATGAGTATAATCTACGCTCCAATAATAATGAATATACTTATATATATTA--------------------TATATTATGATACATATACAT---ATACATATGTATATATATATATATATACCTAACGTATTGTATAACAGAATCTATTTTAGTAAAACACACCCATGCAAAACGCACAGGACTTGGAATATTGTTGGATAACTTTACACGTTTAGCGTTTTATAGAGGGCGACGTTTTTTCCAAACAATTTATATAATATAGTATTTAATTAGGAAACGGATAACGGTTTGGATAAGTCTGATAATC------TGGATGGAGGTAA-----ATAGTACTACAACTGAAATGGTCCAAAGTCATAAACTATATTAAACGAATACCATAAACAATTCTTGTTTGCATTAAGCAT---TAAGATTCTCGTGATTTATTAAGATTTTCTTTGAT------TCCGTATACGTAACTATATATGTATGTATAGTGCGATCC---ACATTTTCCAATATACATACATATGTACATAACCCCATAGATATGTATCTCATAA------TGCCCGCTCCATG-AGCTTAACTAAATGACGAAGACACATATATGATTATATACT--ATATAACTACATTTATACTTAGAACGAGATTT
>His4r 10452148 10452337|10788 chr3R 10452012 10452456 scaffold_20 346003 346506 + 9063|136 383
GCACGCCCTC------------------TAACCTCCACA-TAATAAATAACCATGGAGTTAACT----TAACTACATTCAAAATACTTGATCCAATTGAATCTTAATCAGT---------AGTATTCAACGCAAACTTAACCGAACGCA----------------------AATATTTTATAATT-TCACAATATACGGACTAAATAAATCAAAAGATA---TCACATAGAGAACTCAATATCATGCA
ATGCAGCAGCAGCAGCATTGGATGTGAATGACGTATGCATTGATGCAGGAT--TGGAATTAATCAATATATATATATACATAAAAAGCAGCACATTTAATCCTCAATCATTATAATCTTGAATATTTGA-GCAAATCTAAGCAGTAGTAACTACAAAATGTTGACAAACAGAATATTCCATTATTATTACCATATATAG--TATATAACTTGTATGACAATTTTTGCTTGCAACCTTACGATGAAGTG
>CG3505 10484900 10484950|10807 chr3R 10483975 10488923 scaffold_20 375259 380099 + 120249|973 1034
A---TTGAAGTAAATACTTGGTACAACAAAATGTTCAGTAAA--------ACAAACTAAAAT
ACAATCTAATTTTATTTTTAACAGTGCGAGTTATGTTATTGATTTTGTATACAAATAAAAAC
>CG3508 10486558 10486905|10807 chr3R 10483975 10488923 scaffold_20 375259 380099 + 120249|2779 3141
AATAAAATAGAAGAGTATGTCACTCCGCCGTGTGTAAATAAAAGAC-TCAATTGTGGTAGA--ATGTGGCGATAAATGGACATAATCCTTGTTTAGTTTTTAAGTCATCTGTGGACGCCTAAATTGTGAGGAGTTCCTTTCAATCATCAAATAGCTCATCAAAAAGCATTCATCAGAAAG---AATTAGCATTACTTTATTATCTGCAAACGACGCCTCCCAATTGTATTTTTGTTGGTCTGTATGGTGTATAGTTTA-GCGGTGTTGCCTCGAAGTGTTGATTTTAATGGAACTTTGTATAA--------TGAAAAATCGATTTGTAGATAAATAAAGAGTTAAAACATGAATTCGAATAAC
AATAAACTGATGCACTATTACCCTAGCC---ATGTAAATAGATGACAGTACTTGTGTTACATGATTTAGCGAAA------------CTGCGTTTA-CTTTTAAGTCGTTTTTAAAC-CCTAAGTTGTAG--------CTATAAGCATTACAAAAAAAAAAAAAAAACATCATTGAAAGAAGATAATTGAAGTTACTTCA--AATTGAAAATAACA------AAATGTCCTTTTACTGAAGTTTAACAAGTTTGTGCTACGCTTTATAACCACAAAAATCTG---CCAAAATTGCTTTTAACAAGTCACGCGTTAAATTTAAATTTGAAATTAAGAAAACAATTGAAATTTTGTATAGAA-AAC
>CG3509 10490469 10490544|10809 chr3R 10490155 10490574 scaffold_21 2287230 2287648 + 2752|344 419
TTATGATTTATATGTTTTTTTTTCAGTACATGTGAAACTTTGTTTAAATAAAATTGATACTTTTTTAGTTCCTAGC
AAGTAATCGGAGCG---------AATCGAATATCAAATTTGATTTAAGT-TAATTCACGGTTTTCCTTTTGTATTA
>CG3563 10619213 10619350|10954 chr3R 10617904 10621750 scaffold_22 1047132 1051045 + 44698|1439 1576
GCATCGGAGTTGGTATGGATAGCAGAAATTACCCATATTCGTGGACTAAAGGTGGTGTACTGATTGACTGATTGATTGACGTGTTGGTGGTGAATACATATATTTCGACTGCATGCCAAAAATAAAAAAAAGAAGAAA
TCATGTAAATT--TATG---------AGATATATATACATATGGACTAT-GGTGGTGTATTGATTGATTGATTGATTGACGT--TGGTGGTGAAAA------TTTAAGCTGCATGCTGCAAATGAAAATGCTAA----
>CG14855 10624141 10624193|10959 chr3R 10623923 10624193 scaffold_22 1053614 1053890 + 6590|218 281
CAGTAAGTGCTGTTGTTATA-----------TATGAAATAGAAGTAATAAAAAGTAAATCGTTG
TATTGAA----GTTCCTATAAGTTGGACTTTTATTGTATAAAAATAGTTACAAGCACTCCAATG
>CG3631 10707783 10708348|11036 chr3R 10705851 10707844 scaffold_29 1164848 1166709 - 74582|2022 2087
TTTCAGCTCA----AGATTGGGGCTAATGGCCAGCACTAGAGCTTTAGGAACTCACTTTCCACATC
TTCTAGTACCAATTAGATAAGGCCTA--GGTTGTTATT--AGTTTTAGTAAGCAGCTTGCCAAATC
>CG3631 10707783 10708348|11037 chr3R 10708147 10709551 scaffold_29 1166752 1168095 - 20434|0 236
ACCATCTCTTAAAACTGTTCTTAAATATTGA-------------ACTACAAACCGATC--CATAACAACATATCCG------ATAGTCTAGTTTAATGA-----------ATAGTTACGGTTGTTATTTAATAGGTAATATTTTAGAAAATTGCAAAGCTCAGAAAAAATAGTTTTGTAACTTGAAAAGAATTTATAAACAATCAAAAATAAACACT---TGTTTATTTCTTCATCA
ACGATTTCTTAAAA---TATTTAGAGATTGATTATGTATCGATTACTTCAGACCAATTGAAATAATAGTTTATATGCACAATATTGTTTAATTTCATGTCACACTTCATTGTAACTATTAGTTTTATTTA--------TAGTTAAGATTGTTGCCTAGTATAAACAGAATA------CAAATTGAAAGAAA----------AACAAAACTAAATATTCTCTGAGTGTAGTTTCCTTT
>CG33332 10714682 10714874|11039 chr3R 10712304 10714747 scaffold_27 1045835 1048167 + 79719|2426 2491
GTTAAATGAACCATAAAAAATCCAGACGATCCGTACCGCATGTTAATCTTAAGCAATTATGTAATT
----GATGAGCATTACATAAATTAGGAAATA------------TATTCTTAAGAAAGTATACAATT
>CG3731 10718018 10718109|11041 chr3R 10715064 10719699 scaffold_27 1048345 1053062 + 195120|3045 3170
GA--------GGTTCCGCCCCGCTGTTGTTGGACATTGTAGTTTAATTCAAAAGAAAATTTCACCCCCAGAGGATCAGT--AAACCG---------ATAATACTAAAA---------------GTT
GAACCATGGCGGTGCTAAAACATTGTTGCTAGCCG-AGTAGTTTAATT--GAAGAAAATTTGA-TGCAAGAGAATCAGTAAAAACCAAAATAAAATAAAACACTAAAATAAAATGCAGTAATTGTT
>CG3817 10725306 10725341|11045 chr3R 10724156 10726014 scaffold_42 86943 88853 - 43250|1240 1288
CTTTAATTACCAAATAAA--------TGTTAGCT-----TTTCAATTAA
----GATTAGTATATAAAGGTTTCTGTGCTAGTTCTAGTTTTTAATAAA
>CG14861 10841587 10841759|11194 chr3R 10840994 10841884 scaffold_42 248049 248876 - 5437|612 784
TCAACTCGCGTGCAAGCCTCCAATACAGACCATACAATTCGGATTCAATAGTGTTGCGCGAAATTTTCAGTTAAATTACTAAAAAAATTTTGAGTTGTATTATGGACTGACCTTGTATCTACTCAATAACTTTATATAAATCATTTGCCAATAAAAAACAATCCAGGAACGAA
ACAACT----TCCAGTCCTC---------CTCTTTTATTTGTGGCCTATAGT--------AAATTTTACGT---GCTATTTAAACCA-----------------GCCTGACCTTGTGCCGAAGCAA----GTCCCATAAATCACGTTTCAATAAAACA--------AAACGAA
>RpL10Aa 10863796 10863872|11224 chr3R 10863307 10863992 scaffold_8 2591274 2591931 - 18407|492 569
A-AGTTTCCTAATCGAAAGTGTAAAGAGTAGTGTCTATTTGTGTAAAGTATGCGTGCAATAAAATTTCAGTATTATTA
ATTGTTGTGTGCTCGC-----TGCAAACTAATAT---TTTATATA------------AATAAAATTTACATTTCATCA
>CG3987 10967259 10967444|11342 chr3R 10966092 10967262 scaffold_3 5152589 5153866 + 19223|1309 1312
TCAA
GCAA
>CG3987 10967259 10967444|11343 chr3R 10967331 10969594 scaffold_3 5155993 5158352 + 70053|0 130
AATATTGTATTTCTGATTAACCAAAACTAAGGTGTCTTCATATAACTACTACATTTCTCTACATATTTTA---------------CTGAATAAAAGTGTTTTTGCTAACCAA--ATGAATAAATACAAATG
AATATATCATTTGTCATGTATATATATATATATATATATATATATATTTTATATATTTATATATATTTAATCTAATTTCAACAAACTGCGTATAACTTTTCTATTTGCCCGATAATCAACATTTGTTTATG
>Gyc88E 11015305 11015325|11390 chr3R 11012984 11015651 scaffold_3 5219341 5221938 + 98292|2499 2519
GCTAATGAGAGGGTATATGTA
GC--------------ACTTA
>CG4196 11028168 11028699|11398 chr3R 11027293 11030631 scaffold_17 793602 797185 + 64407|1022 1631
GCGAAGCCTT----TATACTCCAATCGAG---------ATTGCCCGCTGACGACCCCACA--------ATATTATGAAGATTTAGTTTTAGTTACTACCTGATAAACCCCACTTTTCTTCGAGGAGCATCAGGCA----------------AGGATCGTGTTG-AACTAGTT--------TAAAACTAGAAAT---------GCGTTGATGTTTTTAACGTAGCTTTCTTCTTGCCAAACATCCAAAACAAAAGTGCCTTCAGTGCTTTCCGCTTCGGCCATGACATACATTTTTAGTTCACACAATTAATTCTTTTGTTTTCCAATTGTC--TAGTATCGCTTTAAT-TTGTTTGTTTAGTTTCGGTTTCGTGTTAAGTATTAAAGATGATT-----GTACATACGCGTGTAGAGCCATCGCGATGCCCACGCTCCTCTGAGTTGTATCCTTTCCTTCATAACGCAGATCCTTATTCGCATATTTGTTTACGTAGCCGTGTTTACTTAATGGAAACAACCAAAATGAAACTTTGTAGATTTGATTATTTATGCGA---ATTTTGTAT--------GAAAAACT----AATTAAATTGAGCAAAACAAAG
ATTAACTCTGATAATCTATACTGATTGCGCACTAGCCTGTTGTTTGTTGATGACCCCGCACTCCCCCCATGTAACAAAAAAATATATGAATTTA--AGCTG-----------TAGTTTTCGAGGAGCAACAGGCATTATCGACTAGTAAATCAGATTATTTTGTAAATTGTTGCACTTTATAGAGCCAGAGAGTGAGAGTTAGAGAGGATGGAGGTAGTGCAGTTTGCT--------AACAT--------AAAGTGCCTTCAGTGCTTTT-GCTTTAGCCATGACATACAAATTTAGTTGCCGAAAAGAAATTTCAATTTTTCCGCCAGACATTAACACTGCTTAAGTATTCAATCTATAATTTC---TTTGCTTTAAGTATTAAAGTTTTTTTTTTTGTATATACGCGTGTTTGTTAACTAGATTGCCTAAGCTCCTCTTAAGTAGCTCATTT------------AAATTCCTAAT----TTTGTATTTATGTAGCAATGTTTACTTAAAAAAAAAAAGAATAAATTCAATATGTATATT-GACGATTTACACAATCTGTTTTATAAAGAAATTAGAAAAAGTGCAAAACTGAATGCTTAACCATAAGT
>CG4203 11036979 11037071|11404 chr3R 11034218 11037294 scaffold_17 798439 801594 + 104515|2935 3036
-CAATGAGATGATTATG-CAATGTA-----ACTTTA--AGCTTTTATTTTTATCTACGACCTAGCGACTAAGTTAAGACTAAAGATGTTCTAAAGTTGTGAA
ACGACCAAGTGCATATATCGATTCATAAGCATTTTAATAACTATTGTTGTAAGCTAA------------AATTAAAGACTAAGAAAATTCTACA-----AAA
>CG4210 11040470 11040531|11408 chr3R 11040092 11040881 scaffold_3 1621915 1622665 + 25425|378 456
CTTGATTTGATTTTCAATTTTTACTACTTTATAGTAGGGCGATAAATAATT-----------------AATAATACTTG
CTGGTAGTGTCTTTCGATCTGT-CTATTTT-TGTTAGGCTTATAAACAAATCAGTGCTTATTGCAATAAATAATACTTG
>CG12241 11047678 11048093|11411 chr3R 11044624 11047804 scaffold_3 1626911 1630007 + 142062|3104 3234
GGCTTGCTGCCGCCTTGTAAGGAGCTCCACAATCGTTGGCAATCAACTGC----GTATCCAATATCTCATTGCCCCCTTCTCTGTTCTTTCATTTCTAAGTGCAATCGCAATTCTTTGAATCGAAGCTATC
GTCGGCCTACGGGCGTTTACAAA----CGTGATCTGTGGGAATGCATCGCAAAAATGTTCGATATTT-----------------TTTTTTTATAGATTTGCGTAAT-GCCATTCATTAAGTATGTACAATC
>CG12241 11047678 11048093|11412 chr3R 11047808 11050133 scaffold_3 1630233 1632554 + 81090|0 321
TTTTTAAGTACTTCTTTGTTGT---CGTACACCTAACTTAAGTGCT-TTACCATAACGATCTGTAGCTGTAACTATACCTTTAAAACGCCCTATGTATAGCTCGAGCCGTTTGTTTACTTAA-----TGTCCATCCATTATTATAAATCCTAGACCACACCAATC------------------TACTAAATTACAAATGTAACGTACCTTT-AATTGAAATCAAATCTTATAAAGTACAGACATATTTATTAC-TATATACACATAGATGTTTAACTGTCTAAA-TGCATTTCATTAAAGTTTAA------TATATATATAT
TTGTTAAAAACTTCTTTGTTGTGCGCTTATCATTACTTTAAGCCCCATTTGCATGCATATATATATACATATATATACATTTAAA----------TTTAGTACTTGCTATTTAATTACTTTAAAATATATCCATCCATATTTGTAGCTCCCACATAACACAAAACCCAGCACACAAAGAATTGTACTAAATTACAAACATAATGTACCTTTGAATTTAAATCAAATCTTATAAAGTA--------TTTATAATATATATACACCTAGATATTAAACAATCTAAAATGCATTTCATTAAAGTTTAAAACACATATATATATAT
>Caf1 11053069 11053291|11414 chr3R 11051263 11054065 scaffold_3 1073320 1076137 - 115547|1952 2215
AGCA----------------------------TCTGTTCCGCC-----------TCCTATAATACACACCAAACTACAACTGAATCCGATAATGTTTTGGCCGT-GCCCCGTGTCCAGCTATCCAGCCTAAATGGCAATGGGTACTCATTTTAATTTATATATATTTACATATTTTTAAAAACAAAATTTAATTAAGCTCTCA-TTTGTCAGCAGATTGTACAATCTATGAATTTTTAATTAAAAATGATTAAAAAGTCAAGAA
AGCAACATAATTTTATGTTTTTGGCAACTGTTTCTCTATCGCCCCCCTCCCCGTTCCCATAATAAATAT--ATGTAAAATTG---------TTTTTTTGGCAACAGCACTGCG---------CCAGCTTACCTGGCAGCTGGTACTCATTTTAATTTATATA---TTACATACTTTTTATA-------TTAAATAAGCTCACATTTTGTCTACAAA--------------AAACTTGCATTAAAAC------------------
>mRpS10 11056075 11056238|11416 chr3R 11055402 11056104 scaffold_3 1077644 1078354 - 27057|703 732
CCGAAGCCAATACTACAGTAGACCTTAGTT
C----------ATTAGATTAGATATTAACT
>mRpS10 11056075 11056238|11417 chr3R 11056219 11057411 scaffold_3 1078862 1080043 - 29924|0 19
AGTCGTATCTTGACACACAC
AGCCGTATCTTGACATTCAT
>Hsc70-4 11072038 11072339|11425 chr3R 11068434 11073862 scaffold_3 1080523 1085972 - 198914|3843 4186
ACCATTCACCCCCACACCTCAATG--CAACCATACAGTAA--CAGTTCTCCAAACAATTTACCAACCAAACACAGTAGAAGAGTTGCTTAAACAAACTTGGATTCTAAATTAGGAACTCGCCAAACATACAAACGGGTCAAACGACAACTGCTCCCCGTAGTTCATTTATA-------------------TAAATTATAAATTCATACTAGAACAAAACCAAACACACTGCTCC-----------ATAATA-GTATATATTATATTATTGT----CATCGATCGATCATCCAA---ACTATTTGCTTGTACTTGAATTCAATAAATAAATTTGAGAATTGCAAA
ACAACTCGC----------CAATGAAAAACCACACAATAAACCAAT----CACACAATTTACATTTTACACAAAACAT------------ATTCAACTTGGATTCTAAATTAGAAAAT-ACCAACCACAAGAA-----CAAACGACAACTGCTCTTGAAAGTTATATTATAATAATACAACTGCAACACGTAAAATATATATAAATA-TAAAAAGAAACCAA--ACACTGCTCTTAACATATAAGATAATACATATATATTATATTATTATCGTACATCGATCGATCATCCAAAACAATATTTGCTTGTACTTGAATAAAATAAATCAATTTGAGATTTGCAGA
>CG4285 11081390 11082789|11429 chr3R 11080154 11085947 scaffold_3 1093623 1099410 - 138017|1347 2983
GATTTAAGCCATTTTCTTTAAGATGCCCGATC--------GCCGGCCAGAAGAGCATCCTAAAGAAAACGCAGGCTCCAAAACCACACCACATCCAACCACACCCCGCCCCCCCTGGATAGCTAATCAACGTAGGTAACCAACCAATTGCTGCTGCAACGAGAGACAGATCCTGTACATATATACGAATATTAAAA---TAAAATCGCGTCATTAAATATTTGTAGAAGGTA---ACCAACTGATTGTTAGATTTAACCATGACTAACGATACTCAACCCAGAAGCGGCATAT-AAATCTGCGTGTTTGT---TATGCACCTGTATATCTTTG--TACGTATGTAATTGAATCTGTACCA--------------------------------------------------TACGATATGATATGAAACGATAGGATAAGCAAAGTTAGAGCGGGCAT-TAAATCAATTATAACCAATGTATTATGAAGATATTAGCGG--AAATGTTGAATACTTA---GCATATATGAAATTGATCATTAAGATG---TCAAACCCTAC------TGCCATCTGCCATTTTGCCAACGTTAACTGTCAATAATTGTGTATGTATGTA-ATATTTAAATAATGAATGTAAGAAACTCAAGTTTTTATATACAACTAAAGGAAGCTGACCAAAATTCAATGTATTTCCCTGCTGCTCATTCCCAAAAGATGCACAAACATT---------GCACATACGAAATCTAGG---ATAAACCAAT-TGACATAGGCATACATACTCGTAAATAGAGGAAACCATAGGATACGAATTTAAATTGAAAACTCATTATCATTTTATTCCCGCTTTATATAAGACGTCGGCAAACGTACCGACCGACA---AATGCTTTTC------------TAATTTCCAAAGTTTCCATCTTTTACCA------------GTCGAATCAATG-------AATGTACCATATAGAATGAAACTGCATACATCAGTATGCATTTAGGCGTAAGAAATCGTTTTCAGTCGTTT---TTGTGTGGGGTTTAATAGACAT-----TAGACGGTTTCCTG---ATCGATAACGAAGGACTTGCTAGAGAATAACATTCGTTTAATTCTTGAATTGGGCGGGTCCTAGACAGTCT--AATGCCAACGATATAAGCACGATATGAAATTATATGTATGTACATGGAATACAGATAGAA----GAGCAGCGCTCCA--CGAGAAGTGGGC--GAATGAATTCTTTAATTCAATTTGCTAGTTACTAGTCGTAACCACACTAAGCCAAGCG-------------CGTTACTCAAGCAATTAGTCGAAGC------CAGAGATACCCCCAATAAAATACATAGATAC-----TACTCAGTAAATT---ATCCTGGTTTGTCCTGCCCTT-------------------AGTTCTTCTTTAAGTTAAGCTACCCCCATCCCACTTACTGCGGATGGACGGAGAT--GGATGAGGAA---AGCTTGCTCGAAAACGGTTCCTGTTCCGCTTTTGGTTG----TAATAGATCTCTGACCTGAAAACTGT----------------------------ATTGTGTTCAACGGATGCTC
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ACAAATAATTTGCTTATGTAAATTAACTAAACTGCCTGCTTTGACGTCAA------------------TACAGAAAACTGGCGCTTTCCATATTATAATAATAG-AAACA----------------CACACACAAACACACACGCAACCACACACACACACACACATACAGAGACATTCTGAGACACACAGGACAACACCA--AGTGTCTTCCATGCAAAGAAAGAAAGAGTGAACGCCAATTTTGATAAACTCTAAAGGAAAACGTTAATTATTATGCGGTAAACTCAAAGAAAAGCAGACAAGAAAGAAAAGAAAAAATATTACCATTAAAAGATACAAAAAAGAAAAAAAAAAAAAGACAGAAGAAAAATGTTCTTTTGCAGCAAACGCATTCCAAATTTACACATGTTTGCATAGATGCATGCATACTTTCAAGCAGTGCAAGCCTGTGTGTATTACGCATACACGCTTGCATAC--TTTCAAGCAGTGCAAGCCGTTGACTGAGCGCTGTCCGCGCTGCGCTGTGAATGGCACACGCTTGGTCGCTGTCATTTGGAATGGCAAATATGGCGGCACTTTTAACACTCGATGCTTTATACAAAACTGTTGCAATATTTTGT-------------TTTAACATTTTCTTTCTTTCTTTTTCTT-TGCTTTTTCTGCCTATACTTTTTTTTGGTTT----------------------------------------------------------------GCAAA------------------TTAGTTTACGTGTTATTATTTATACA-----------------ATTCGTATGTAAAGTAAAAA------AGGAAAGATTTGTATTTTTGTCGCCAGCTTAACTACTGTATTAAT--TATGCTAATATATTTACATTGTTTATACA-ATTTAAACAAA---TCGTGTTTGCAGAATGTTGTGTAATATTTGCTTATTTATAAGTTGCC---ACGCCTATTATTTAGAAACAAATTCAAAGCAAATGCATAAACAAATAAAATCAAATACAAACAAAGACGACAAAAAAAAAAATAATAATTACCCGCACACAGCGCACATCATTCCACATCTAAGCATTCACAATTAAACAGTTCTTAACATCCTTCTATTTAAATATGTATTTGAAATTAAAAAACGAAAACAAAAACAAAAA--CAAAAAGAAATATTATTTGC-CTCTTCGCTAAATTCGGCTGAAAATGTTTTCTTGCCCTGGTGAGAAAGTTAAAAGGCAAATACGAGCGTAACATTAAATGTCATTATAACGAATGAAATGGAAAA---CAATTTGATTTATTTACGATTTACATAAATTAATTATTTATATTTTTAATATATACATACATATATATTATTACATACTATACAAATACAATACCATGCTGCTGCAATTGCACAAATAAAGTATTTTTCAACATTTCAACTTTTTTTTACACAACAAAAACAAAAACAA
>Tm1 11133398 11133715|11456 chr3R 11131936 11135108 scaffold_3 1151906 1155149 - 52907|1656 1983
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TTGTAAAATGTCATATTGTAA
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>Aats-ser 11167812 11167939|11481 chr3R 11166437 11167928 scaffold_55 235225 236728 + 56349|1417 1538
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GCAGGACGAACAAAATC---TCAGCTCATA-GTACTCTTATAAAAAGATCTTT-----------ATTCTTAGTTTTAATATAAAGGATGTAAAATATATGAAAAGTATTTC-TGACC
TTTG-----ACAAATTTCATTCAGTTCATGTATATTGGTATATATAAAGCATTTGCAGCACATAGTATTTAAGTTGAAAAGAGAGAA---AAAATACATTTTAAGTATTTTATAACT
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GCGTTTCAAGTCCCACCATCCAAATATGGA
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ATAGTTTATTCATTTACTCGAGGGTATATACAATTAATGTTAAAACTAAATAATGATCGAACAATTACAAGACGACTTACATAATTTAACTAAACTCTAGAAC-TAAGCGCTACATG-AAATACTTCAAAGAATAGTGACAATTGTGGCACCATTGTAAAATAATTCAATTCCATTAAAGATTCATGATTTTAAAATA
ATTATTTGATTTTGTATGTAAGGGTATTTACAATTAATATTAAAACTAAATAATGTTCGAACAACTA---GATGAAAAACATAATTTAATTACAATCTAAGACATAAGGACTACACATAAATACTTTCGAGAGCAG--------GCGAAAAACTTGTTGAAT----CAATTCCATTCGC--------ATTACAAAATA
>CG5044 11184534 11184982|11487 chr3R 11179454 11187450 scaffold_13 2206518 2214649 - 280925|5539 6010
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TGTAGC----TGCAGTTTGCGTAGTTTATAGCCCGCAAATTCGTTTCTGCTTCAGTTATCCTTCGTCTTCCTGTTATCCTGCACCATTCTACAAAGCCAATGCTTTAACATTTCCAATTTTTATCACCATTCAGTTGAGC------ATGCAT--TTTTTTATCTGCCTG-----------------ATATCTTTTGCAAGATGT--TTACAGC-----GAGTCCTG----CTAAATCTCTGAAATCTCTTTTATCTCTATTCCAAACAGCGACTAAATCATGGCCAACAT-----------GTATTTACCCTTCTAACGAGCGTGAAATTTGATGCATTTATATTT------------TATACATATATATTTTATATACAGTTATGTA--------ACAAACACTATTTGTGCCTAAAGAAACAGTAGCAATCAATTAACAGTAAATAAATTGTAGAATGTATATATATTT
>CG5063 11188324 11188551|11488 chr3R 11187543 11188548 scaffold_13 2214888 2215893 - 37367|805 1038
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TCA
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TAAACTGTATATGAAAGAGCTTTTAATCTTAGCCAGTGAAATTAAAGCCAAATATATATCTTCCATTAAAAAATATAAACATTTT
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TTAAATAAAT------AAAAGTAAATAACTAAATGAA---TGTAATTAAA
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A
A
>CG4699 11626744 11627664|11964 chr3R 11626774 11626878 scaffold_41 575700 575774 - 1829|0 104
ACTTTTAAACGATTTGTCAATTTTTAAAGCCACAACACACACACACCCACAAATCAGCCGGAGCAGACCAACAAATTTTAATTTGTTTCAAACGGTTTGGTTTGC
AATTTTAAATAATTCGTCAAATTTTAAAGCT---------------------ATCAGCGAG---------ACGCCTTTTAACTTGTTTTCAAGCATATTGTTTTC
>CG4699 11626744 11627664|11965 chr3R 11626898 11628097 scaffold_41 575868 577101 - 1351|0 829
ACTCTAAGCAATCGTCTAAGTTATTTAGTTCTACGAGCCCACAACAAAAAAAA---AAAACACAGATACGCTACACACAAGTACACAA----------------CAAAACAAACACGAAGCAGAAGCGAAAATC-TTGAAACAATGTAAATACAAGCTAAACGCATAGAGCTAAGCAGTTACTGATAATTGTACACTAACCAACGATCAAGAAATCATCGAACGCACCCACCACGTCGCGTGGACGTGGTGGATGCGGTCGGTTGGAGCACTGGTCAGCGGTTAAGT--AGGCACCACAACAAACCCACTTGGGCTTCAAGCCGAAG-TGCGCTAATGATAAAAATATTAAGCTAATCTAAATATATATATATATACGAAAACATTTAAATATATACCATATGCATACATTAACGTGTAAATGCCGAAGAGAGCAGTTAGC---------TGAAGATTTGAAATGTATTCGCAC-CTGCACACAAACGATATAACAACTAAGCTATA-------------------GAAGGCAATTATCTGTAAATTGATCAAGCTTAACCATTAGCTAACCAACCATTAGCCTTTAGCCCAGCAAGTAATCAGTCGGCGTTGGGGCCGTGTTTTTCTTATATTTTAAAAAGTTTATCAGCTGTAAATGTATAGAGCGGAATTCGAAAGGCGGTGTGTGAAAATGGATCGAACGATAAATGTATGTATATGTATTTTAGTTGCTTAGGCGTTTTCATTTCTACCT------TATAAACACGTTAGCGGCTAATTGTAGCAATTAATACTATAAAACACAAAAAA-----AAAAACAAAAA
ATTCTAAGCAATT-TCTTAGTTATTTAGTTCTAAAAGAAAATAGTAATACAAATACAAAACACA----CGCCGCACACCCACACACAAGAACTCGTGAAATATTCAATGTAAATAGAAAGAAAACGAGCTAATCATTAAGAGAAT---AGTAAGAGATATATGTAGGAAACTAA-------TGGATAA---------ACCTAATGAT--AAAAATAATTATACTAAACTA---------GTTTAACAGAAAAACGCGATCGTTTAAAGC------------TTAAATTAAGGCAACAAAATAAATCACTTGCGGCTTCAAGTCAAAGGTGCGCTACCTTTAAA--------------TTAAATACATATATA--------AATCTAGTTATATAGATCGTCTGATCGCAAAAAAA-GAAAAAAACGAAAAAAATAATAAACACGTTAATGTTAATGTAAAAAATGTATTCGCGCACCACAAACATAACAAAAAAAAAGAAAACTACATTTTTGCCAATTCAAAAAAAAAAGTAATTCCTT-----TTGATTATTTTTGCCAG--AATTAAGTAATTTTTAAA---------AAAATGAAAACAGGCGAAACTATGA-------------ATATCTAAAAGAAAT----ATATGTACACATAAAAATGGATATATTAAGTGCGCCACGT-AAAATGGATTGA------------------TGTATTT-AGTTTTTTAGGCGCTTTCATTTCTACTTCTACTTTAAAACAAAAATAGTTGTTAATTGTAGACATTTAAATTAAAAGATAAACTTAACTTTGAAACACACAAA
>alpha-Man-IIb 11648660 11649840|11986 chr3R 11647282 11649846 scaffold_27 72397 75244 + 63852|1388 2921
G-----------------------GTGGC---------------------TGCAGTGTATTTAGCG-------------GAAATAGTTATCATATTTATTTG-----TGGTTT-AGTTCTAA------TAGTTAGTGGTAAACGCCAAGTGCAAAGTTTTCAGCTTTATTTAGTTCTCGTCACGTCTAATGTCTGTCTCCAACAGTTTTGAAAGTACAAAGCACACGACATAGTTATAAACATACAAACATAGGGTGGTTAGGTTTTTTTTTTTTTGTTGATTCATGTAGAATGAA--AGTTAATGACTAGTTCGAATTCTGTTCGTCTGTTTAAAAGATCAAAGCGTAAGAAGAAACGA----------------GGCTACG-------------------------TCTAGTTACC----------TGTTGACTTTTCTAAA------AAACGTATAT------TTTATTCAAAAAGGTATAATA--TTACAAACTACATGTTA-GCCAGAAATTCTTTAAACTCTTTATTTATATAAATCGAC-------------------CCACCCAAATA-AACCTTCAGCTCGACTTAATGCAAT-----AGGCCAAAATACCCAACTCGACTGCCCTGAGCAATGCATTCCGCTTAAGCCTCCCAGCTTCATACCCTAAAATAT----ATGTGCAATAAACTTGAAC---------------TAAATCGC-------ACCATGG----AAATGAAACAGCTTAGATTAAGAACTAGCTTGAT-------TTTAGAATGAAATATTTAGAGAGCAAATTAAATCAATTTTT----GTTTTCGTT-----TGCGCGATTAGCGTTCGCATCGATTTGTTTAGACTGATTAGCCTAAAACGATTGCAAAATT-----GGCATGTAATATTAATCTCAATTAATCTATTCACTCCTAGCCCTTATCCAGAATTAACCAAAACACAAGTGTATGTAGGATATAAGTTTTAAACGAGCAACGTAGTGGGGTAGCAAAAGTATAAGCCAAATATTACATTACATTCACTAGCAA----------------------------------------TATTGTAAATAGTCGAATAGGATTTCCAGGCACGGTAAA-AATAGCTCTAATATCCGATATACCACTTATAGATTTAAGCTAAGCCCTCTCTCAGCTCTGGTATTGT----------CGTATACG-------------AGAGTCATTCAA--------ATAGTTACT-ACTGAAT--------------------------------TCAGAAACAAA--GCATTCAAAGCAAGCAAGACATAAACTCTAAAA-TATCCAGAACG------TAGGGATAAAATGACGAAGGATGGGATGGATT--ACTTCTAACGGAAACAACTGT-----TTTGTGTATTTATTTATAAAAACTTATTACTATATATC------------------TAATTTTATGGATACAAGAA-AATAAAGTATTATATGAAACC
GCCCCGCGAGGCTACTGGACAGCAGTGGCAGTTAGTGTAGCTCCTATGCTTGCGTTGTATCTCATGTGTAACAAACGACAAAATATTTATTGTATTTATTTGATGGTTGATTTAAGTTCTTATATATTTAGCTTTTACGTACGGACAAGTGCATGTTATTTAGCTTTATTAACAGATCGTACACTCTCTTTCGCGTCTCACACA--TTTCAAAGTACAAAGCCCAGAGCATTGTTAT-CATATACCAAA------------------TTTATCTATGTGAATGTATATGCAATAGATCATTTTACTGCCCGTCAGCATTCCGTTTAAGCAACTGTCATATCCGAGCTCTATAAAAATCTATAACTCTAACTGTGCGGTCCACAATTTGTGCAATAATCCTAATATAATCTTAGTTAACTCCTACAAATTCTTAAGTTCTATAAACTAGATAAAGTTAAATCTTCTGTTTATTTTGCAAAGTTTGTTAAGCTAAAACCAACAGATTATGTCTCAAACTATTCTAATATTTTTTCTAGATAATTATACATAACTTTTGGTTTGTAAGCTCCTTGGACATAACCTCTGACTAGATAAAATCCAATTTTGGTGGATCTAATATGCAAATT--CTTATATACATAATTTATCTAACTTAAGGCCAACAGA-CAATATCTACATTTATTCTAATTTGAAATTGATTTAAACATTTTTTTTCTTTTGTAGCTTGCCAGATTGGCCTTGGTTACAATTAGTAGAGCTTAAAGATAATACTTATAGCATATAAATATTTAGCTGAAAATATTTAGACCGCGTATTAGTGAAAATTTGTTCAGTTTTAGCCACAAATGTTGAATTTTTGTTGCCTTCTATTTATTTAGACTGATTAGCTTAAAATATACGCAAAACGAAGAAAAAAAGGAAGAAAAACAAAAATTAATCAATGCTTATTTAGCAAATATCTCAATTAAAGAAAGACACTTGACTAACGGACGGATGGATAGCAGAACAAAAAGGAAAAAGAGT----------TAAGCCAAATATTGAAGTACATTAAATACCTAATACCCTATAATTATGTTCGCTCTAATTTTTTTTTATTTTTCTTGTATATAGTTCTAAA--------AGGCACGGTAAACGATAGCTCTAATATAAAACCGA-AACTAACCCATTTAGGCTAAGCAACATTAC--CTGTAGTGCTGTACTTTATAAACGTAAACGAATCTTTGATATAAAATACATACAAAATATTACATAGTTACTAACTAAACAAAATATTTACAATTGTAAAGCCTCACATGTACCGAAAACAAAATGCATTCAAACCAAGCAA---ATATATTATGAAACTACATAGGATAATACACTGAATGAAAAAAGACGAAAGCTAAGCAAGAACAGACATTTTATGAGTTGGATTTTAAACATATATGTATTTATATTTGATAATATATATGGAAATATTAGCGTGACAAATTCAATGTAATTTTATGAATTCAAAAAGAATAAAGTATTAATTGAAACC
>CG4576 11655992 11656044|11993 chr3R 11655665 11656013 scaffold_27 85675 86017 + 11473|332 353
CCCAATGTCCTAACTTAAAGAT
TCCAA--GCTAAACTAAAATGT
>CG4576 11655992 11656044|11994 chr3R 11656014 11659103 scaffold_27 86753 89822 + 73562|0 30
TACTTATAACTAGAATAAAAGACATAACTTA
TGCTTAGGAAATGAA-AAAGTAAAAGAGTTA
>spn-E 11669829 11670138|12003 chr3R 11668023 11669830 scaffold_41 659492 661418 + 40632|1936 1937
GA
AA
>spn-E 11669829 11670138|12004 chr3R 11669840 11671611 scaffold_41 661647 663445 + 57521|0 324
TCGTTTAATAT-------------GAAAACAGCTGATTTTGAACTTTTTGATTTCTCATTTCTTTTCTTAAAGGACACACTTCACTTGTTTGGTTTAAAAAAATGACGTATTCATGGAATGAAAACAAGTTTTGAATTGAATCTAAACCTACAGAAATCTTCATTACGTTAAATATTTTCTATGTTATGTTGAATGATCTCTCTTCGTTCAATTACGAAGTGTAAAATGTGAAATATAATTTTTTGTTAATTACATCTTTAAAGATATCA---------TTAAATACGAAGACAGCTATACTAACCA----GTTCATTACAAGCA
TCATTTAATATTGCCGATGGCTAAGAAAGTGTTTCATGTGAAAATCATTATTGTCTTATTT---TTCTTAAAACAAA------ACTAATTGAACTTAACGAAA------ATTTATGATATTA-------TTTTGTCATTACTC-AAATGTATTACAATC---ATTTAAATAAACGCAAGCAATGTTGATCAAAACGATTTTGAAATATCCAAATGGGTATCCCAATAAGTATGCTATAATTTATAGAAGCTCTTATGCCGATATGCGTCAGCGGGGAATTATAATAGAAGCACGCATGTAATTATTATTATGTTTTGTTTTATTT
>CG4546 11674006 11674158|12005 chr3R 11671936 11674016 scaffold_41 663952 665987 + 83817|2117 2127
AAACAAATAGC
GCTCGCCCAGC
>CG4546 11674006 11674158|12006 chr3R 11674083 11675384 scaffold_41 666066 667327 + 48364|0 86
ACACTTAGAGAAACAGGAGAAACGTATCTTTGGTTAAATAAATTTG---TCCCTAGCCACA--------GACAATCACTCACCTTCC
ATATTGTTCAAAACAAAATACACATATATTCGGTTTAATAAATTTGAGCTCCCTGGAAAAATTGTTAATGTCTACCACTTACTTTCC
>CG3303 11735609 11736090|12065 chr3R 11735760 11735997 scaffold_41 739054 739331 + 2915|0 287
TGTCGCTGGCAATTGACGAGGATGTCAGTCAGGACATGAACAATGCCCATCTGCCTA-----TCATTTTGGTTGTTTTGACAGGATTGCGTGGCGCAGAG-------CACTTACATC-ACGAAGTTGTTTATTAGTTCTAACATTAATAGTTATT-ACTG---GCGGAAAT-TATGCAA------------------------GAGGCAAAA-GCGTTTATT----TTGAAGG---AGCGAAAGGAGGAAAAGTGAGTGTGACGTTTTAGTATTATGCAGTCATTAAG
TGCCAACGTCAATTTCTGCGCCTGTCAGTCAGGG-------GCTCCCTCCCAGCCAAACAGCTCAGTTTAATTGTTTTGACAGCTTCGTATAGTATTAAGACGTTCCCTGTTATATCTACCCAGTTGTTTATTAGTTTTAACGTTTATGTTTATTGACTGTGTGCAGAAATATCTGCTCACCCTTAATGGCGCTCTTGACATTGAAGCAAAGTGCGTCTATTAAGGTTAAAGGTTACCAGAATCGAACAAAAGTAATTTGCAGGCTTTAATATTA---AATTGTTAAG
>CG3303 11735609 11736090|12066 chr3R 11736040 11738230 scaffold_41 739800 742117 + 62533|0 50
TTTGAATCTCTTGAACTAGCTAGTTGAAAATAAAATAACAAAATCAACTT-
TGTAATTTTCTTAAATTAAAAGAGACACCATTGATTAGTTAAAGTAATTTG
>CG5470 11752285 11752333|12082 chr3R 11752318 11752563 scaffold_41 758945 759155 + 3022|0 15
ATTCGAATCAAACAAT
ATTTTCATTTAACAA-
>CG4221 11758226 11758614|12086 chr3R 11756535 11760492 scaffold_41 764723 768382 + 105072|1753 2157
GATGTTCCATAGCCGGCGGTAG-ACACCACAAAGCACA-GAGGCAGGCCATATGAGCACAGATATAAAGGGAATTTATGGGCAAAGAAAACTCTTGAAAAACAAAATAGTTGATGAAGTGGCAGGCAAATTTTAGCCATACACGGACTTTTGGGTCCTCAAGTCCCCAAGTCTTAGTTCAATGATTAACCGATATAATCTATTGGTTTGGATATAATTTAAATTGTTCTCTGTAATCAGCCACCACTTTGCCCGAGCTAAATGAGATTATTGTAAATTGTATATATCAAACTGACGCAGGACAGAACTAGCGTAG--CATAGAGCATGTTCAGTAGACTATGTCTAAG------------TAGACTAATTCTTGGAGTAATAAATTATTTTCCCCACCAGAAACG
GGGATCCCA-AGCTGAAGCTGGTACACGTTAAAGCAAACGAGGCAGGCCATATGAGCAAAGATGT--------------------------TCT----AAACAAAATATAT---------ACATGCA---------CACACACACACACACACACACACAAAATGTTAATTGTTAGT---------------TGTAGT-TGTTATTTTGTAAATA-----------CATACTTAAGCGGCTGC----------------------------------TGTATATAT--------GGCTGGAGAGGATTAGAATAGGCCATAGAGCATTTTTAGCTAGC---ATTTAAGTAGCGCGGCTTTTAGACTAATTCTTGCA-TAATAAATTATTTC--------------
>blp 11760360 11760668|12086 chr3R 11756535 11760492 scaffold_41 764723 768382 + 105072|3941 4090
GTATCCTTGTTG--------TCCCAATCGAACTAA--TTAGCTGATAATTGATTTAAAAACTACGTGTTAAGTACAAAAAATGAAAGTCTGTTG-------CTGTAAATAGAGATTTACGAACATGAAGACAAGTGTAAACACTTTCTGA
GAAACGTATTTGCTTTCTACCTCCGAAAGAATTAGCTTTAGTTTTACATTGATT---AAACTAGATTCTAAGTA-GAAATGCGACGTTTTGTTTTTGTTGCCTGTAAATAGATACAAACAACCATTTAGCACATTATAACAATGTTTTTA
>Sap47 11782607 11783132|12109 chr3R 11782373 11787916 scaffold_41 806232 811884 + 94750|254 853
AGCGAATCTATCAATTGAAAGTAATATTAAACCAATAACGAAATCACACAATAAATAAATATAGAAG--TAATGCAACTAATGGATAACAAGAGTATTATAAATTATATAA----------ACACATATAAATATATATCCTGAATAAAATCGAACTCGACAA---AAACTCTCATTTGCCATTTAG------CGAACTGCAA-----AATAATATCAAATA-TATATATATATATGTATCATATGACATATAATTTGATTTCAATTATC----------------------------------CAATAACAGTTTAAGAAAGAGTTAAAG----CCACAAACCAAATTTCGAACAAGTTGAGTATGACCAAACTGATCAAGAAATTCTTATATACAACTATATCCTATTGATACAACTTTCGCTCTCTCTTTGCAATTTCGTGCTCCTTTTTATTCAATTTGCAATTCAATTTCATTTACAAAAATTTAGCTAGATGTAATTTTCGTTGTCTTCCTTCCTTCGATCCAATTATAATTTTGCCTCTTCCTTTGACACAT-----TTCTCCACATGTTT----TAAACAAAAAAAAAAAAA
ATAATAAATATCAATTGAAA------TGAAAGCAACAACAAAACAAAAAAAAACGTATATGCAAAACCCTATGGCATCTAACGGATAACAA-AGTATTATAAATTATATAATAATCAATATACTTATATATATATATATCTGATATATATATATATATGATAACACAAACCGACATTTTAAGTCCAGTCTAAACAAACTGTTGTTGCCATTCTTTTCTACTAGCATACAAATATTTAAATAAAAT--TCTATAATTTCCACTTAAGTATCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATATAACCAAAATTAAACGTTATTTAAAATTTAAATTAGCCCCCAAATTCATTTTGGAACAAGTTGAGTATGACCAAAATGAT--ACAAATTCTTAT--------------TATTAAAATA-----------CTCTTTACAATCTTGTGCTTTTTC-------AATTGCAAATCCATTTAATTATTGATG--TTCGCTATACAACATTTTTGT-GTTTATCAATTTTCGAGTTTCTTAT------TCTTATTGTTTATACACATATACTTTCCCCAACTATTTCGGCTAAATTTAAAACAATATA
>Sap47 11785275 11785462|12109 chr3R 11782373 11787916 scaffold_41 806232 811884 + 94750|3273 3473
TTAAGAGCTTATATCGTAGTTTCTTCTAAGTTGGCTCTAAGTTTATAACTATCTTTACTTTATCTTTCTTTCCATTCCTTTCCAA-CCTTGTTTC-----------CTCCTTAATTGATTAACCTAA-TATTGTTAACCCAAAACCCAAAATCAAACCCGAATCCAAATCCAAACAAAATACAAAACTATTCGAAACCACA
TTAAGAGCTTATATCGTAGTTTCTTCTAAGTTGGCTCTAAGTTTATA---------ACTTAACGTTTCTTTCCATTCCTTTCTACTCCTTGTTTCTCTTTTACAAACACATTATTTGATTACTCTCATTATTGTTA---CGATACCCGAAACCCAACC--AATCCAATTGC--------------------CGCATCAACA
>CG5516 11790371 11790479|12110 chr3R 11787917 11791276 scaffold_41 812686 816349 + 52796|2779 2902
TCAAGAGACCGATTTGTGGTCTGTAGTATGTAGCTTTACTAGTTTAG-------TTTTCCC--ACACTTACACCGAAAATGAACATACTTTTG------GTACTGTATTGTTTATATTTTAATG
TAATTGTAACAATGCGTATAATACATAGCCTAGCTTTAGTAGTTTAGTTTATTTTTTTCCCGGGTGCTTTCACC--AGATTAACAAAAAATTGCAACATGTCATAATTAATTTCTTTTAAAATA
>Rbf2 11793680 11793862|12113 chr3R 11793820 11795476 scaffold_41 819652 821240 + 38642|0 43
TGCTTTTGTAAAAATAA-AGGAATAACTGCCACTCGTAGTTTAA
TACATTTGAATAAATAATATTGCTCAATTTCATACATA---TGA
>Hel89B 11809048 11809187|12122 chr3R 11808289 11809081 scaffold_41 837574 838361 + 42644|769 806
----ACTACTGCTTCCCACTCTAAGACTTCCAGTTTTA
AGTCACCACTTTTTCCC-CAATAAGACTTGGAACATTA
>srp 11829226 11829807|12149 chr3R 11827888 11829487 scaffold_3 4867576 4869502 - 48673|1665 1994
GCGCGACACGCTGTATGTCGCACGACCAAAGATTCTGTTGTT----ACATTAATCTCATAGCTCCAAAGA-----------ATTTATAGCCT--GTATACCAAGAGC----------AGTTCTCAAAG----------------AACACTCATCTATCTA-----------------AAATCTATCGAATCATTAGTTGTACATACGGTCTAAATCGATTGATACTTACATTTTCGTCGAATTTTAATGGTC---CACTACTCGAAATTTGTTA--TGAAATACTAGTTTAATTG-TTAGCAAAATG--CCAACAGCATAAAATCGATTC
AACAGACACGCATTGT----CATGACCAAAGATATTGTTGTTACACACATAAATCTCACAGCTCCAAAGAAATTTAAATCCATTTTTAGCCTAGGCATTCGAATTGCGTTTATCAAAAGTTCTCAAAGAACTTGCAACAGCAGCAACACGCACACACACACACACACACACACACACACACACACACACTCGTT--TTGTATATAC-ATTTAAGCAAATTTATG-TGACATTTCCATAAGCTATAGAAAGGCCCTCACTACTCGAGTTTTGTTATTTTAAAATTTAGTTTAATTGTTTAGCGAAATGTCCCTGCAGCATAAAACATACTT
>srp 11829226 11829807|12150 chr3R 11829509 11830101 scaffold_3 4869531 4870070 - 6558|0 327
CATTTAAAATTTTGTTATCAAATCGAATA--CCTTTTGAGATTTCCTACAATCAAATTCCACTTAGATATTAGCCACAAATCATAGTTAAGTCAACCAAAAAAAGGCAAATGAAAACGAAAAAGAATAACAATCGAAGTAACCAATAATCTCATGCAA--TTAGCTATTAATTTATATATTTTTTAT-----AGCATTAT-------------------TATATATTTAATG-CAATTTAAGTTTTAGTCTGGTATATTTTTTAACATCATATTTGCAATATTAATTTTATTTCTCTTGAGTTAATAAAAGACAATTGTCCCTGAAAT
TACTATAATTTCTATTATGAATATGAATAGCACACTTGAGATTTCTTACCATCAAATTCCACTTAGTTTT-----GTAAGTTAT--CTATATTCATCAGCAA-----TAATGAAAATAACAAATA--------------AAACAATAATCTCATGCAATTTTAGTTAATAATTTATACATTTTACATACAGAAATACTATATGTATGTATTTATATATATATATATTTAATGCCAAATTAAGTTTTAGTTTCGTACAACTTTTTACTTCAT-TTTGCAATATTAATATTATTATTTTTGAACAAATAAACGACAAGTATCCAAAAAAA
>GATAe 11844476 11844855|12165 chr3R 11843984 11844616 scaffold_3 4889266 4889871 - 19319|532 672
GCTAGCTTTGACTTATGGCTTAAGCTACGCACTAAAGTAACCTATAGTTAACCAAACCCAAATTTCAAAAATTGCCAAAATATTTATTTAAGCCCTAGCCGTTAGTCATACTATATAGCCAAGACCAATGTCCCAGTTAGA
ACTACATACTATT------------------------TAAACTATAGTTAACTTCACCAAAATGTT-ACGATTGATAAATTATTTGTATAAGC-----------------TTAGATAGGTCGAA--AATATCCCAGTTAGA
>GATAe 11844476 11844855|12166 chr3R 11844669 11844766 scaffold_3 4890371 4890471 - 2311|0 101
TGTCTTCCTC---CTTTTAGTCAACTGCTTACAGCAAATAGTTTTGAAATGATTTGTGCCAACCACTTAGGATC-GCTATACTCTATATAGAGGTAGTTTAG
TGTCTTCCTCTTACCCTTAGTCAACTACATGCTACAAATTATTCC-AAATGATTTGGGTTCCATACATAGGGTCTATTATGTGCCAACTATGAGTAGACTAT
>GATAe 11844476 11844855|12167 chr3R 11844799 11845631 scaffold_3 4890509 4891527 - 24926|0 56
CGATTTTGTATGTTTAAGCCTCTTTTTAATTCTACAAAATAAATAAGTTGTAAACGC
TAAGCTAGTATACTTAAGATCATTTTAAAA---AAAAAATAAATAAGTTGTAAACGC
>pnr 11866035 11866639|12188 chr3R 11865299 11866355 scaffold_3 4919215 4920246 - 26355|773 1116
-----AGTTAAAAATCTGGACACTGGCTCTGTGATGTGATCTCCTTCCTCCTCCTAA---ACTGCA---CCCTCACTTGAAGCCTTCCTTGGAATCATGGCATTGAAAAGACTTTAGACATTAGTACTACTCGGCCTTGTTTGCAATT-TCGTTTAATTAAGTTTAGCTAATTGTGTGACTTTCTGAAACGTATTTTCG------GAATAGCTTAGTTCTAGCTAACTATCATGAA-----TTAGCTATGTTTAATTGAATTTTGGGTCGCAAATGGGGTTTTTTAGTTTAAGAGCTGCCTGAATGGCACTTAGTTTTTATTTCTTGTAAATAACTAATAGCAA
GCGGCGGCGGCGGCGGTGACGGCGGGCACTGTGATCTCTTCTCCACAACACACACAGCGTACTACAGACACCTTCGTTGGAGCC-TCGTTGGA---ATGGTATTGAAAAGACTTTTGA-ATTAGTTTTA-----CATAAGTTGCAATTAGTTTTTTATGGCTTGTAAATAACTGCACGAAAGTTTTGTACAAATATTTGTTTATCGCCTTGTTCCGTTTCCCTTAACCACTACGTAAGTCTCCAGTTACTCTAAGGTTTAGTTTTGTACACCAATG-------------TGTAAAGTGTTTGCATTAACCTCTTTCTCTAATTAGCATAAATCATCCATATCAA
>pnr 11866035 11866639|12189 chr3R 11866445 11866865 scaffold_17 2534730 2535125 + 1031|0 196
AATGTAGTTCCATTTAGGTCTTTATCATAAACATTATCTTGTTCAAGTAGCTTAAATATTTTATGAGTATTCCGCACTTCCCCACCAACCCACTTAATAGAACATTTAGCAGTTAGTCCTATGTAGAAGTCTAGAATTAATATCGTAGCTCTGATCCATTTAATATGAACGCTAAATAAAGATTGTA--TTAAACTA
AACGTAAAGATCTCAAGAACTTTTTAATCAATTCTTTCTT-TTAAAGAACTCAAGATATTTTGTGAATGCAAGGATTCTTCAACTTAAAGAACTTAATAACTCTTTTAAATAAAATTCAAATACATTAATCAATCTACAATATT--------------TTGAATATGA----TTAAGAAAGATTTTTGTTTATTTCA
>CG5013 11876305 11876417|12194 chr3R 11875431 11878700 scaffold_3 4930436 4933590 - 82090|937 1056
CAATTATACAA-------TTGGCTTTTTTTATGCTGAATGTCAAATCTCTCTTAGTTAATGTTCTACACGGGAATGCTCCCAAACATCAAATAAATATTTGCCTGTGGTAATCGCTTGAA
AAATTAACCAGAAAATGCGCGGGCTGTTTGTTACACAGTGTTA-------CTTATTGCATCGATTTAACATAGCTGCTCCTCGATT---AGCAGAGCGTTGCTTATAATAAATGCT--GC
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ACTGTGCGCTTCCCGTA--GCTAAAAAAAACCTTAGCTATAGACAA-------GCGGCAGCTTA------AAATTATAC--------------GAAAAAAGAGACCCCTCAAAACACACTGATCGAGCAAGTCCTCGTAAACTACATAAATCATTTATTATTTAACATAGTTGTATGCTTACGGATCGGCACATATATATTCACGGTAATAATGTGTGGTAACA----GAAGCAGCAGTGAGTGTCGAAAGCAGGTTAACAACAGTAACAATAATTAACAG--ATTACACTATTACTATGTCTCCTCCAACTATGTATTGTAATTTTACTAATAACAAACG----------ATCGGTCTATGTATTAGCACTGAGTTGTGTTTCGTATGCGATTCAATAAGATTCGATTGGCTGAGTTGAGATTAAAGTGGCGACTGTGACTGAGACCGGGTTCCATTAGACAGCTTGTTAGTTTAT-----------GCCTACGCTATT---TTGTTTGAATTGTCAGTAAAAGCAGTAGC---ATGTTAAAGGTTTGTGTATACTTGAAAGGTCATTGTTTTTGCAACACGCGCCTACTAGGATCGATTCTTGTTATTATTATGTCTGGTTATGTTTTCAACACTCTCAACACCCCTCAAATTGTTTCAAGCCAAG-------------CGTTGGGCTCAGTGCGCGCTAAA------AACTCTAATTTATAC--TCATATTAGCTAACCGTAGTTCTTACCAAATAGCACTTACCCCTTAACCATTTTTTAGTTTA--AGACCCATTCAGTTTTACCCGCACATACACACTTATTTCGAT--GCCGAGAGCACGCATTACACGCAGGATAACATACACA-GTAGAAACGCAG---CGTATTTTT-GTAACATCCTCATGAACTAT----ATGCGAAAATAAATGTTATATTTATAAATTAACGAA
G-TGTGGACGAGCCGTATTACTATTTAG----TTAGCACTGTATAGCTGTTCTGCTACGGATTATGATATAAATTACATATTATTGCTGATCAGCAACAAGATAAGCTCTCTAGCAC------TAAGGGCGCCACCTTAAACCACATTAATAATTTATTATTTAATATAA--------------------ATACGTATAATCA------TAATTTTTAATAACAAATCGAAGCAAAACTTGG----AAAGGCAGGTTAACAACAACCACAATAACGAGTAACAATTGCA-TACTACAATACCTACTATTATTAA-----------TTACTACTAACAAATGTACTGCAAAAATTCATCTACGTATTAGCACTGGGTTAGATTTGGTATTGGCATATTCGTATTTCGATTGCCTGAGTTGAGATTACAATTTTGAGTATGTTTCACATGTCGTTAAGTTAGTTCCTTGCTTATTTTACAATCATTTAAAGCATTTCCTATTAATGAATTAAAATTTCAAGTTGATACAGTTACCATATGTTAAAGATTTGTGTGTTAATAAAA--TAACTGTTTTTTC------------------CCGAAACTTATTATGTATTAACCTTGTTATGT---CGCTGTTTCCAAT-----TGAAATTGTTTTAAGCCAGGGCAGACAGAGGGCCGAAGCACGCAGTGCGATTTAAAGAGAAAAACTACTATTTAAACAATAATATGATGCATGCAAGCTCGTAACTAGATAACA----------AACAATTAACTACGCTAGCAGATTCGTTTTGTTTTTTTTTT---TAAACAATTATTTAGCTTAAGCTATATCAAGTTTAACAACCACACACACACACACACATACAACCACGTACTCGTATTTTTTGTACCATGCCCATTATTTATGCAAAAGAAAAAATAAATGTTATATTTATAC---------
>sxe2 11912754 11912951|12214 chr3R 11910703 11912846 scaffold_3 4972012 4974276 - 44868|2301 2393
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AGCCAAAACAGAGGCGAATA------------ACCAAAAAGTAAT-CTATGAACTTAGTGTACATCTATATATATATATAAAGGAGTTTGTCC
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TAATTATCGTGCATCGTTTACATCGTGCATGCTCAACTCTTGTTATT-GTTTTAATTTATTAGTTGTCTATATTTAAGTTTGTGTGATTTTAATTTAAAGGAATCTTAAGCTTAGTTAGCTTCAATTTAACAATTTGCATCGACCGAACTTGTGCGAAATTCGCCACTTCCC------------------------------CACACACTTAGTCAA-ACCCACTAAGTTAGTCTAGCGAAAATTGTTTGTAGGCTGATCTTAAGTTGTCTAACATAATTCGAATCGTACTAAAGGATAT--AATGGCATCG-ATATTTGTATATAGTGGTAAAAAC----------GAAAAAACAAAATAATAGAAAAGTCATTCTCATTGTGCA---GTTGTTGGTATTTTAGTCTAGGCAT---TAACAATTAACTAAATCTATATAATTTATAAACAAATTGCATACAAACATCATAATGTTGT----ATCTTGCCCAAAGAACAAGTTTATTTATAAAGATGAGCTCAAATAAATATATTGAAAATATTGAGAAAAAGAAAACGTTCATTTGTCTAGACTGACA
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>tara 12085227 12086024|12375 chr3R 12085453 12086217 scaffold_3 5169513 5170273 - 15466|0 642
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TTGACTTCTGGCTTGTAAACTTT-------TGGTAAATAAGAAATAGTTAAAGAATA-AGTCATATAC----
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CTAGAAGGTGTACAATGTAGTCCAGAACGCGAGGCAGTCACATTGCTGCGCGCCACTTCACATTCAAACTCACGGGATAGCGTATTGAATAATCCGAGTCAGGATTACATACAACAGGCAACGTCGCAGCACACGTTGCGTTATCCTCCATCCGCGTCGATGTTGACGCCAACACCAACTACAAATACACCGACACTTCCGTTGTAATTTATATAAATACAGAAATCAGAAAATAGAATGAAAACAGCAAAAACAAAAAAAAAAAACTATATAAACAAAAACTTAAACACCACAAA--AACACAAGCAACAACAAAAAAAAAAAAAAACAGTAAAAAAAATGCAACAAAAAAATACAAACGAAAACAAAATAAAAGAAAAAACACAATTTTATTATTATTATTTTTATTATTTACCAATTTTGCGTTTATGTTTATTATATAAATTATTATAATTATTAATTATATTATTAATAAAAACAA--AGGAGAAACAAAACAAAACAAAAACAAAAACA
>Zip3 12134313 12134424|12424 chr3R 12134037 12134419 scaffold_41 90551 90941 + 5630|297 439
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GTGGTTCTCCAAAAAGGACTTACGCATAAATACTTTTATAACTGCTAAGCAG-----CAATTGTAAA--TAATTAT---TGTACTATATCTGTTCTATTTATCTAGATAGTATTAAATCGAAAATAAAAAATATTACAAATAA
>CG17930 12155295 12155345|12445 chr3R 12153914 12155321 scaffold_41 122699 124106 + 35401|1396 1422
GTGGCTTCTATTTATTGTTTGTCCAAT
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ACA-----CATTTACATAGCTATTTACAAGACACACACGCCCACTCA---------------ATACTTAACTACACCCACATACATATATTTT-AGTTAATTTACAATTTTGATAGACTTTGAGAGAA----AAATATCTATTTTGAAATAAAAAAAAAGCAGAAAATGTGGCAGAAGACATAATAAAACCCACATTGACCTCAT--------ACAGTT------
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AGAATATTTGCAGAACCGAATGATGTACATACATAA-----ACGTT--------------------------GAAACTTAG-TTGGCAAACAA-------AAATATTATAAATTTCTACACGCTAC-TATCTAAATTTGTCTAAATGAAAATCAATAGCTTAATGTGTTTTA----------------------------ATTATTTAAAGCT------------------AATAAA-----
>CG14881 12261416 12261789|12570 chr3R 12258020 12263077 scaffold_41 319016 324407 + 118224|3724 4097
GCGGTTTTCCCAAAGCGATTTGGAGCAGTTTGCCCAGTTCACCGGCGACCACAACTACATCCATAGTCTGGAAACGCCCACCGAGGAGCGCCGCGTCCATGGAGCCCTGCTCAACGCGGTGGTGGCTGGTATAATGGGTACCCAGCTCCCTGGTCCGGGCACCGTGGTTCTAGAGCAGAATTTCAAGTTTCTGAAACCCTGTCGTATTGAGACCGACACCGTGGTGACCGTACGTCTGCTACAATCTCGCAAGATTTCCACCGTGGAGTACGATATAAGGCAGAACGACGAGGTGGTGTTCGCCGGCAGCGCCAAGTTGCTGACTCGCAACTAAAAAGACTAGCTTTGGTTCAATAAAAGTGGATGTTAGAATA
GCGCTTCACTCAGCAGGATCTTGAGACATTCGCACAGTTTACTGGAGACTATAACTTTATACACAGCAAAGACATGCCCGTTGAAGAACGGCGTGTACATGGTGCCCTGCTTAATGCAGTTGTGGCCGGCATCATAGGCACACAATTGCCAGGACCAGGCACTGTGGTGCTGGAACAAACCTTCAAGTTCTTGAAACCATGTCGCATAGAAACAGACACCCTGGTGACTGTGCGTCTGCTGCAAGCGCGTAAAATAGCCACCGTGGAGTACGAGTGCAGGCAGCACGACGATGTGGTCTTTGCTGGCCATGCCAAATTGCTGACACGCAAAGCTGACCCTTAG--TTGGTGCAA-ATAAATAAATGT----ACA
>CG14882 12270425 12270534|12575 chr3R 12267782 12270854 scaffold_41 329023 332255 + 65463|2844 2955
TGGACAAGTCTTAGGTGCAGTCAAAATAAAAGCTTCATTAATTAAGCCCTATAAATAAATACCTTAATATATTAGTCGTTTGTAACTCTTACAGAAAATTTGAATT--TTTA
T--ATAAGT-------------AAGATATATTTTCCATTGTTT--------TTAACATGCGTTTTAATCAA------AATGGTAAATTCAAAGACACGTTTAACTTGCTTCG
>CG14883 12283386 12283928|12591 chr3R 12283226 12283882 scaffold_27 1727752 1728347 - 9939|160 683
GAG-------------TCCTTCAGGATTTGAACGAACGATAACGACTTAGATCGACGCACACACATACACAAACTGTTTGCATTTAGCTGGCAGAGCTTAGCCCTTAAGACAAACTTAAGTACGCATGTGTTTTTGTAGAAGCTTTAGAAAGTATTATCCCAAGCTTACCGGTACCAGTGAAATGGAAGATATAATTTAGATAGTTTATGTGCTTTACTTTTGTTTACCTGAAGCTTTTATTCATTTTATTGACG-TCCTAATTTATTGATGTTGTT----------ATTTATGGTTTTCTTTTGTTTAACGACTCCTGTATTTGATACGAAAATGTTCTCAAATATTTGTATGATGTACTATATT-TCTACTATGTACTCAACACAATCATATGCCTTATATGGTGTATGATTTTTGGATGCTATATATACATACAACAAGCTTTCCTCAATTCCCCTTGTTAC--CCGAATGTATTCCATCAAATCCCTACAAAATGTTTACCAGCATTATATGTATATGTC
GAAAATGAACAAACGTATTTTCAAGATAAAAACGAAACACA------CACACACACACACACACACACACAATTCATTTGCATTTAG--------------------------------------ATTTATTTGTATAGATTCTGTGCACAGTTTGATTTTAAAGGTTT---TTCCATTTCATTTGAAGTGCGAACATGAATTGTTCATGCACATT--TGTTGTGTGCCTAAAG-------TGAGTTCTTGAATACTTCGAAGCTTTTGAAAGTATTACCCAGTAAAATTGAAGCTACTTTTATACT---------CTATGTTTTATACACAAACG--------TATTTATGTTTTATGCTAAGTTATTTATGCTTTATTCGATGTAG----ACGCTATTTATGAGGCGCAGGT----GCTGCAATTTATATTTGCTATACAATTCCCACACGTCCTTTTATTTTTATTGAATATACTTTATTTATTTATCGCTATTTCTT-------GTTATAAATATATGTT
>CG14883 12283386 12283928|12592 chr3R 12283883 12285950 scaffold_27 1728966 1731244 - 16401|0 45
TATACCAAAAACCAGAATTAAAAACTACTTTTATTGTGATTATAAA
TATTCTGAAGAATATAAATATCATTTACCTTTATCCGCTCTATAGA
>Gyc-89Db 12306559 12306794|12611 chr3R 12306558 12306669 scaffold_27 22858 22952 + 12|1 117
AACTGGAGACTTGTTTGTCTTGGAAAATCCAGGAATATCACCACTATGGTATTGAAATATAAAAAACATATTTTGAGACAGAAAATCTTGTAACCCT------TTGGAAATAATCAG
GATTGAAGTTTT-------------------GAAATATTCTCATTATTATAT---GCTATTGTAATCCTCTATTATGTATGCACA-CTTGTAGTCTTCAAAGATACGAAATAATCAG
>Dhfr 12307582 12307601|12613 chr3R 12307091 12308220 scaffold_27 30593 31739 + 38695|510 529
TAAAATAATACACTGATTTA
TAAAACTACA-ATTTATTGA
>CG31448 12369584 12370032|12675 chr3R 12369402 12370681 scaffold_20 1037299 1038542 + 4816|232 737
CAACATTACCATCAAATCAAATGACTTAAAGTTTGTGACAAACGTATCAAATCGAGTGATTCCGCAGAGAAAGGACTT----CAAATGTGATAAGCCCCTGGTATTTGTTTAATTTAATCAGATATTCGCATTTCAAAGCTATTCTATGATGATTCAAAACAAGTTGACTGCCGGATGTCCT----AGTTGTCACAATG----CAAATTATAGCCCGACACCCACTCGAAATGTGGTTTAATCAAATTGCATTTA-------AAATGCAAAGCGAGGAAGA----------GCCAAGTGTC-GCAAAGAGAAGCGAAATGCAAATC------------TCTGGTTGGGAAATGAAAGCGCGAACGGCAGA--------GAAAATGAATTATTTTATTAACGCTTAACAAAAGCAGTTCCGAAAAACACTGCGCTCATAAATATCAA-------AGTGAAGTCAATTCCCCGCTGCTCTATTAAAATCACATTACGCATCGTAAAAT
AAGTACTTTAAGCAAACAAACTGA---GGAGTTGGTAATTCACTTGGAAACCCG--------CCCAGGGAAGCTATTTAAGTTAGCTGTAAAAAGTGTA-AGCAGCTTTACAGGTTG-TCAGCTACTAAGCTCTGACTGATATCCTATAGCCGTTTTT-----TTTGCGCGTCGTGTCCCCTTAAAACTTATCGAAGTGAAATCGATTTTTTATTCTATATGGAAATAGGATGCAGCTCAAATAAATAAGCTTTGTTTTCCCCAATGCCAATCTTTCAACATTTTTCTCTGGCAAGCTGTCAGTCAAGGGAATTAAAA--CAAATTGGCTAAGTATAATTTAGTTGTCCGTGGCCAGAATGAATGACAGCCGTAGACTGGGCTTATAGTACGACATTTGAGGCTAGCACAAATCGAACTAAAAATATCTGTCAATTTTATTATTAGCTCAAGCAGCCAGAACTTTTCTGGGACGACCTATTATAATTACATAACGCGCCATAAAAT
>CG14889 12391943 12394335|12694 chr3R 12390386 12394172 scaffold_366 4 4041 + 72030|1628 4303
TACTAGTT-----AAAAGGCAGTCCCTATTAAAAAATATAACCAGCACTCATTGCGCCAAAGTCGAAATGAAATGCGACTTGAAATAAAACCATTCAAAACTCACGCACACGCACACCCACGCCAGAACACACTCATACACACAATCGAAC--------AGCAAGTCCTTAAGA----------------TGAAAAACTCAATTTAATCAAAGCAAAACAATGTTCAAAGTTAA-GAGGCCGCGC-AACGCTTGTCAAATGTGCTCAGTTA---------ACGTCTATACATAGATATATATAAATTTGTATATG-------ACAGGCGTACTACTATATGTATATCAATTTGTACA-AAACGCACCCATGTACAGA----------AAATCAAATTCGA------AATAGCAGCATGTC--------AGTGCCGTGTA--------------AGCAAATC--AATTG-------GTTGCACAAGGCAAAGAACCGAAAACCCCCTCC---ACTCAACCCGCATGAGAAAAAAATTA-------------ATATTCATATCATTTAAAATGCCCCA-------------------------AGAGTCAAATAAGTATTTATGT--------------ATACAATCAAATAGCGCAAACATACGTGTGTCTACAGA------------AGCGTATTTACAAACATCAATCAATCGAATCAACTAACACACACTTTGAACCCAAACCCACACTAACATGCATACTCACTCCCACTCCCACACA-----------ACCACACACACACACACACATCAAACAGTTGTACAACAAACCAACTAACAAATATGCAATGCAAATATTTTAATTGCATTTCATTCGCCGCCGTTCTATGCG-------------------AAGCAATTGCTACAGGAGCAGGAAAGCCGCTTGAAAATGCATAAATCATACGCACCGTGGTACGTGAAAACACCATGCGATGGGATGT----ACTGAATTT---CAAGTGCTTCCCCGAGTGCAAA-GCAATAATTTCTGGATTATGACGAAACCAAGTCGCAATCATCGGCAATTAGCCATAAGTGACTTAATTACTTGCTTAATCAGATTATTCTTAACAATTGAACCGAATGACTCCGTGCCACTTATGCTGCGTCTGCTCCTGCTGCATT-TTGCATTGTCTTAGGTGCCGTCCATGGGCTATGTCTGAATATTCGAATAGAACTCGTTCATACAAAGCATTATTGCCAAAGCTTCGATGTGAAACACAAGGCTAAGGGCAGA-----AATCCCATAAGTGTTT---GTTTAAATAAGGAATTGTGCTAATTAAAGGTGTCGAAACAAAAGAATTGTA-AGATAT-----TTTCATTCAGAACTCTCTTGATGTCTACA-----ATTAATAAGTACAGTTTAGTTACTTATACGCAAGCACACAA------AATCCACATAAAAGAGGTTTATACATACACGGTAA-------------------CGT--------ACTCTAATATC-------GATAACAAAGAGCTATTCAAACCAATTGTGCATATTTTTCAGTGTTAATGAACACAACTTCAATAAACAAGCAAATG--TGCAGAAACTAGTTAGGCGAAAGATGAATTCTA-----TAGTCGATAACTGATGCTTTTCAA---TTGAAACCC-------------------------------AAGCTTGAAAAAGCTTCG----------AAACTGGAGATTTTCTCCTGAA---------------------------------------ATGCGAAATAAAAA--------AACAATAAAT--ACATAATCTT------------------------ACCACAAGTATGT-ATCCTAT------------TGGTTTCAT-GGACATCTCAAACAATGTAACGCAAA---ACAATTCTATTTATACAACAACA-AAAATGAATGCATAAATTAAAATTTACGAGTAACTGCAGCATTTTCAATTTC--AACGCTCAAACTAG---GCAAAGGACGAATAAAACGGCCTGAAAATCAAACATAATCAATGCAAATGAAATAATGCCATGGAAATAT-GATAATAAAAGT---ATATATACGAG------TATATATACTGCCATTTGACGGCCTCAGCCCTGCATATTTTCGCATAAAAGTTGAATGTGAATTATCGAATATGCAAATGGC-AAATGGAAATGTTTGCAGCTTTAATGTTTACTCAAACGGCAAACGGCATCGAAAATCAGAAAGAATATGTCAATTTGTTTTCAATTAGATGTGTCTCGTT----GTTGTAATAATCCC----AAATGGAAAACAAAATACA--CAAGCAAATT-GCATGTCAATTTTCATTTAATCCACTAAATGTCAAACAACCCCAAATGTGTACATAAGCGG-----TAACGGTAAAGAACGTAACTTAATCGTAATTAATTATTAATTTTTTCTATCCCTTTTGACCTCTCAACGTGTTTACTTGCATCTAGCTATGTCTTTATATAGATACTTGACAT----CTGTACTATCTCTAGATTCTCTCACTT---AATAACT-ACGAACTCAACTT----TCTCGATCAATAGGCTAGAATAATGAATTGTGTTTTTGC
TACAACTTACTGAAAAGTGCAGTCTA-ATTATAAATAACAAACA-----CATTGCGCCGAAAAGCGAATTAAATGCGACACAAACTTA------TCAAA---CACACACACACATACTCACATACAAACACACAAACACACACACACGTACGCACAGGAGGCAAAACTAAAAAATATACGCTGAGCTTTGTGGAAAAAATGATTTAAGCAAACTA----AATATGCATAGGAAATGTTACCACGCTGGCTCTCGTTCAGTTTTATTGTCTATCTATATAGTCATATATAAATATATATATATATATTTATATATATTTATATATATCTGTGTAAATGTATGTATATCAAATTGTACATACAAGCGCCCATGTACATAAATACATGCGAAACCCAATACGATACGATATCAGCCGCATGCCACTTAAAAAATACCCTATATTAATATATAATTGAGAATATCGAAATTGCATGCAAGTTGCAGGACGCAAGGCACAGAATACAAAATACGAAAAACAATATACAAAATAATACAAATATGTGTATGAAAATGCATTCATATCAAATGAAACATAACAGAGCTGCGGGCATAATGTGTTTAGCAGAGCCAAATGAGTATTTATGTACACAGGCAAGCAAATGCAAACAAAAAAAACAAACATAATTATTTCTATAGAAACACGCGATCGAACATATTTACAA----CTATCTATTGAATCAACCAA---ATAAATTGAGTATATAAGTATATGTATATACATATATATATATATATACATACATGAGAAGGGGGCAAATATACAAATAAGCAAACAAACAAGTTCT----CAAACATGCCAACGAACATGCAATGCAAATAGTGTAATTGCATTTCATTTGAAACTGCGCTGTACACCTATCCGAGAGTACATTCAAGCAAAAGCCAATGCAGCAG--CAGCTGT-------TGCATAAATCATACGCACCGTGGCACTTGAAAGTTGCA-GCTAAATAATATTGTGCCTGCATTTTGGCTAAGGCTTTCT----TGCAGATGCAACAG---------CGTAACTCAATTTGCTAGCTACTTTCTTGATTGACCCATAAATTTCATTGCCAGCCGCAAAGTCAAAATCTTTTAAGTGCT--GCCTGTAGCTGTTGCTGCCACTGCTGCTGCCACTGCTGTTGCCGCATTGTTGCATTATCTTAGGTGCCGTCCAGAGGCTTTGTC-GTATATTCAA----------TTTATAGGAA-------TGCCAAAGCTTCAGTGCTTGACAAATGGTAAACAGCAAATACATAGTATCAAAACATTCTCAATTTTAAATAACCTA-------AGTGAAAAATGTAAAGAAAAAAAAAATATATATATATATATATGTCTTTGAAATTTGTCTCAATGTTTGCGTATATATTATCGTGTTTGAATGTGTTATATGTCTACAACAAAGAAACTGTTTAATATACATATTAAATGCATAGAAATACACAATGATAACAAGTTTGAAAATAATCGTAAATTGTAATTGTAATATCATGCGATAACAACAAAGAGCTATCT--TCCAATTGTGCATATTTTTCAGTGTTA---TATGTAACTTCAATACGAAACGCGTTGAAAGCATAAATTAGTTAGGCTAAAGTTTAAATATACCTACTAGT--ATACACAACATATTTGAAGTGTGGGAACCCATTAAATATGAGAATATGAGAACACAACAAAACGTTTGCAATAGCATCGGCTGGCCGGTGAACTACAAAGCGCCCTCAGAATGAACCCCAATCTCCCATAATTAGCCCACAAACACGTACACCCCAATTAAACATGTTTACCAACAATGCATTCAAATAAGCTCTCTTCTTAATTGAGGATATTATTAACAATAAATACATAATTCTATTATGTATCCTATTGGTTTCATCGAACATCTCAAATAAATAAATGCAAATCTACCTTTCGATCTGAGCGAGTGCACAGAATGCACATACAAAAAAAAATC---------------AATTTACAATTTATGACTACTAATACGAGCATGCTATATCGAATTAAAACGAAATGAAAAATAAAAACA--CAGT-CAAGTGGAAAAAT---AAAAAAATATAAATAACAAATGCTAAATGCAAACGAAATCTATTATATGTTCAACTA--CGATAACACTTGCTCTGCA----TTTGCATAAAATTTCAAATAAAACTA---AAGCCTCAAAGGACTTAATGCAAATACGTGT--------------------TGGCAAATTACAATGCATAT--------GTATGTCAATTTGTTTTCAATTAAATGTGTCGCTCCCAAAGCTGAAAAAGTTTCCCGAAAAACAAAAACAAAAAAAATCCAAACAATTTCGCATGTCAATTTTTATTTTAACCACTAGA--TTAGCCAACCTCATG-GTGTACATAAAATGTCAACTAACAATAAGATACGATATTTTA-CATATATATATATTGAGTCAT-------CTATTGAACAGCTAACTTATCCAC--AGTGCTAACTGCGCCTGTCTTCAATT--TTCACATTTTACTCTACTTAACTTAAACCCTTGAACTTTTGTCTAACTAACTAACTCAAGCTGTAACCGAGATCCATAGATTAGAATAATGAATTGTGCGGTCGC
>CG14889 12391943 12394335|12695 chr3R 12394188 12395417 scaffold_366 4076 5388 + 28059|0 169
TTAACTCAATA-----AATAACTATATCTTATATGGGTAGACG--------AACGAAA---GGTTAAACCCCTAATAAGCCGCTAA------TTTTAAGTGTAAATTTGTTAATTACCCAATAAACATGAGGAGTTTGCAAACGGACAAAAAATATACAAATAAATATAT
TTAACTAAATATTAGCATTAAATTTAAATTATATATTTATACATAAATTTCAATTCAATTTGGTCATTAACTTCATAAGCTGCTAATGGTAGTTGTAAGTGTACATTTGTTAATTGCGTACTAAACC--AAGTGTTTCCAATTAAATAACAAATATGT--ATCTATATGT
>CG17562 12442803 12442876|12744 chr3R 12442780 12442870 scaffold_20 955287 955352 + 1153|23 90
TTCAGCAGTACATAGGCAACCCACCGACTCACTTTCGTAATTGCGTCATGGAATTAAATAAATATATA
TTC---------TAGG---------------CTCTAGTAA-TGCTTTATAAAACTAGTTAAATAAATA
>Fas1 12462914 12463770|12763 chr3R 12457315 12465652 scaffold_20 1112031 1120779 + 155883|6164 7133
ATGCATCCGAT----ATGTAAAAACAAATCCAATCCAAAGC-AAATGCAAATCAAACACAACAAC--AACAGTCGTCTACAGAACAA------------------------GAACCAACAACACTCAGTATCAGACTAACTTAACAT---------CCACATGGATCTAAATAATCAGCAC------------CAGTTTGTTG-------ATACCGATCGAAAACCACAAGCAACCCAAACAGTAT---CTGTAATATATACGTCACAAGGAACGATCATCATTCCAACCCAACATGCCCACGTCCACGCCATCTACATACCCACATACACACACTCAGAAAAAAACGCATGCAG-----AAAACTGCCTGCTAAATTTGCTTTTGCATCGACAGCTTCTCCCAAAATAGCTGGCAAGAGAGACTAAGATAAAGTCGAAGAAACCCCTATG-----TTTAAGTATTAAACTCGATTTTCCCTCAA--ACGGCCTTATGTATAATATTGAATATGAAACTTTCTGTAA--AACATTTTAATTTTATGTTCGCCCTATACTGGTA-----------------GCTTACGTTCA----------TCAGCTCGCTATGTTTTAAGTTTAGACCCACACTGACATTGGTATCGTACCATGTAACAACTGATTGTGTTTATGATTTTAAGTGTACATTTTTTGTG--AATTGCTTGTTTTAGTTAATGGTCTAATTTATGATTTATGAAATGAGTTATCT----TAAGTAGAATGCGAATCTCATTGTACATCTCGAAAACGAAGAAGCTAAGCATAAGCAATAAGCGCATCACACACTCTCATACTCGAGC-GCCCACACATTCCCCCTATTCCTATCCATAAATACATACAACATGTAACGAAACAA-AGTCATTGTAAGATTTGAA--AGTGTGAAATTTGATAATAAACTGAAAGTTTTTCATTTGAACCTT
ACGCATTTATTCACAATGTAA----AAATCCAAGCAAAAACAAAATCCAAATAAGAAACAATAACAAAACAATCGTGAACAAAACAATTAAACAACAAACAAACAGCAACCAAATCAACAACAACAACAACAAGACAATTCGAAAATCAAACGATACCAAACTAATATAAACGAATATCACATATGTATAGCACATGTTGTTATACTTGCATACCTACATACAA--ACATGCATTCTATATATGATGAGCTGTATTATATGTGTCACAAGGAGCACGCCTCACAAAACCAGGGCACGCTCAC----------------TAGCCACAT-------CTTCATAAAAAACACACACAGTCATAAAGACTCCTCGCCGGATTGGCTTT---------AACCTTTGGCAGAGT-------------------------GTCATCTGAACTCTTATGTACATTATAAGAATTGAACTCGATATACCCCCTATCAAGGCCTTATGTATTATATGAAATATATAACTATTCTTAATTAACA-TTTATGCTTATGTTCGATATACATTTATATATATATATTTTGTATGATTTAAGTTCATTTTAAAGTCTCTGCTCGCTAAATTTTAAGTTTTATTTCATATTCACAT--------AATCATGT---------TAATTTGTTTGATTTTAATTGTACATTTTTTTTGTCAAT---TTGTTTAAGTTTAT-GTCTAATTTATGATTTGTAAAATGAGTTAACTTATGTAAGAAGAATGCGAATCTCATTGTACATGTCG--------------AAGCAGAAGCAATAAGCGCATCACACATTCTCATTGTCATACAGACTACAAATATACACTAT--------ATAAATACAT--AACATGTAACAAAACGATAATCATGGCAACCTTTTAAACAGTGTGAAATTTTATAATAAACCCAAAAATAAACATTTTTAATTT
>nonA-l 12467943 12468541|12768 chr3R 12467895 12468395 scaffold_10 4325046 4325639 - 756|48 614
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ACAGCCGATATAATGCATGGACCAGTATGGATAATACGTAAATCGACAG-AATGCATCGATTTACGTAGTACACTCGACACGTTTCACTTATTTTTA-GTGAATTATTCATTGCAAAACAATACAAACAAAAAGAGAGAAAAACAAAACAAGAAAAC----------TTATGGAACATACTTAATCTATAATCAACTGATGCACCCAAAACTTTTATGATTTGATTTAATTATTTGTCAAATATGTCATCGTCAAGTCCTTATAATAAAGAATCATACATAAAAGTAAAACCGAGAGTGCAAGATAAAACATTGCCATAAATGGAAAGCAATATTAAAATACTTTTGTTATCCGGGCGGCAATTTTTAACCACCCCCGCGGTACATAGAATCTAACATTTGAATATGAA---ACATTTTTGAGTAGCTTCTATATGTAAAGCATAATTTCTTTAGTACATTTTTTTTTTTTATCTC-TTTGTATTATACATAAAATGCA--TTCATGTCTTGATCATGTTTACCTAAAATATAAGTATATG---CGATGTATATATACATAGATAAT
>nonA-l 12467943 12468541|12769 chr3R 12468396 12469066 scaffold_6 4212448 4213086 - -733|0 156
ACTTTGATTTATGA--GTAAATAATCGAAATCGGACTTGCTTTTATT---------TCAATGTATTTCTCATCCCATCTCTGTCTACTTTTAATAAAAACGGCTCTAACCTAAGGTTTCACTGGGAATTTATGTTGGTAATAAATGTGTTAAAGCGG
GATTTGATTTATAACCGTTTGGATCCGAATTTGGGTTTTCCCCCATTAGGCGTACTTTAACGTGGCTTATTTTCATTCATTTCTTGCTGTTCATTA-----GGTTTAACTTTATTTCCAACTG----------TTGGCA-TATATATCTCCAACTGA
>CG10326 12470474 12470887|12771 chr3R 12469699 12472829 scaffold_3 3771905 3774907 - 77235|776 1270
AGG--------------AAAGCA-----------ACCAGATAAA-CTCATCA-------------------CCATTTGACCAAAAATATAAAA-----CATGCCTAAGTCATCTACTTGCCATTATGCACACATCGCATCACTAAATC----------------------ACACATTAGGCGCATTGAATTTGAAACTATAAATATCTTAAAAGATAAGAGCAGCGCATACAGAAAAAAAAAACTCGGAAAACTAGCAAATCCGTGGTTCTGGCCCCATCACATCTCCTACTATAAGTTTGTAACATGTAAGACAGAAGTATTCTCGAAACGAGGCGTACGGAGAGAGAAAAAAACGCGCAACAAAAGACAAGGCATTTTTGTGATTATTTTGTGAGTTAATTGAAATTTATGATAATCCCAAGTAAGATAAAAAAAGGAACTTAAGCGTCTAATGAACTATA---------TTTAAATAAAGATTTCAACTAAA
ATGGTTAATTATTTATTAAATTATATTATGGATTACTAAATAAAACTCATCAGGCACACACACAATCCATCACATTCGACCAAAAATGCATATATATTTATAACTAAGTCATTTACTTGCCATCTCGTACAC-CCTTATCAATAAATTTAGTCTATCATAAAAGCTAAGTATACTTTGCGCATAATGAAAGTATTATCATTCACATA--AATAGCTAAAAACAATGATTTAAACATAAGATATTTTGGAAACCTA-----TACATAGCT-----------GCATTTCTAACTTTAAGTTTGTA---TGGGCCCTCGAAG-ATTCTC--------------------------------------AAAGAAAAGACATTTTTGTGATTATTT-GTGAGTTAATTGAAATTTAATGTAATCCTGCATAGGT-----ATGCACGCTTAGGCGTCTAAT-AATGATACATAAATGTTTAAAATAAAGTTTTGAAGTGAA
>Cctgamma 12475462 12475700|12773 chr3R 12473490 12475822 scaffold_3 3774984 3777352 - 125725|2051 2303
TAGCCTGCGATTAAC--------CACGTGTATTAATAATGCTTACTATCCTTTAATACTTAATTTAACACTCAAAAGA-AAAAACAAAACAAAATCCCACACACGCCACCCCAAATGTTTAACATTTAGCTTCAGCCAGGCATCGTTGGCTTCTCTGGAAGAAGGAAACCCATCCGCCGGCCGCCT-ACACACAAAATT-CAAATGCATTTGCTCTCATTAACAGTACACAAATAAAATTG---TTAAAACTC
------GCAAAGAACAACAAATACATGTGTATTAATAATGCTTAATATC--TTAATACTTAATTTAACACACAAACCACCAAAACAAAACA----CACGCACACCACACTACAAATGTCTAACATTT-----------------------------------------------CGCCAGCTCCCTCACATACAAAATTATTGTTGCATTTGCTCTCATTAACAGTACACAAATATAAACGAAAATAAAACAC
>CG31498 12491179 12491460|12789 chr3R 12490660 12492619 scaffold_3 3214224 3216130 - 24861|553 846
TCAGTTAGGGGTTTATTTTATGCCCCATTATATATGTCTTGTTGGTTGTGCTCTGTATACAACTGCTTACATAAATTAAAAAACATTGAATTACTGCTAGCTTTCTGTAAAATAAGGATTTGAATGGTGTAACTTACATTTAAAGTTACCAGCACAAAAATCACAGGTAAGAGTGTGTTCATTAAGGATGTCACAAGGTTCGTCTTCGTCTAGTCAAATTTCGCCAG-CGTACCTTTGC-------CTAATTAATTATCGCAGATTCCG----GTTTCGCCCAACACCTTTCCG
TCGTTTCAGGGAAT---------CGCATCGAATGCGTTTT-------------------TAATTGCTT--------------------------------------------------TTTCAATGGAGCTGCCAGCTGTGGCGGCCAATTGCACAGCAGCACCCTTCGATATGGCCACAATCGAGCTTATCAGATGCCTCA-CTTGGCCCAGAGAGATTTTTTGAGGCATTCAATTTCATACACGCCATATAATTAGCTTAAAATTCGCTAAGAGTTGC--AACACCTTTAC-
>Glut3 12615594 12615745|12905 chr3R 12615594 12616915 scaffold_3 3101242 3102809 + 8719|0 166
TGTTTGAGATAT----CAAAGAAATCCCAGTGATGCTTGTAAATGGTCAAAAACATTAAATTAAATGTA-----ATAGGTAAAGTTATGAACTG--TGTAGCCCCATGAGGGAAG----TATAAAGATGAATGACTGATAATAACTATACTATTTTAAAAGGTTTAA
TATTTGAAATATAATTCAGCGCGATCTAAGTAATTTTCCAA----GTAAAATATATATATATATATATATATATATATATAATTGTGTGAATTGACTAAAGCCCAAAATAGAAAACCATTTTATAAAAAAATATATGTAATTAAGTTTAGCATTAAAATAAGCTACA
>CG10349 12710789 12710832|13005 chr3R 12710332 12710996 scaffold_47 448611 449322 + 8071|520 567
AA----TAGGAAGAATACATTTCTTTACAATTTTAGTTAGAAAATAAA
AACTAGCTGGCGGGACCCAGCCTTTCCCGGCTCAAGTT--------AA
>MESK4 12815608 12816041|13107 chr3R 12814298 12815879 scaffold_47 587692 589443 + 21771|1492 1832
AGT------AATA--------TGCCGAAGGA--GGGAGGGGTATTCCACTGATTGCATTCTGTCCCATTGTTGGACTATTTTTAACCGTCC-GCTGGA----------TTATCAGCGCTGC-------------------CCTCGCTGCC---CTGCAGTCGTCGATTGCACCTACAGTGCTATGCAAGTAA---ATATGCATATGGTTATTGCCATGTACGTATATAAATTTGC-----------------AATTGTATGACGATGGACACGCACAAACCTAGTGAGAATTAATCTAGTGCATTAAAGCAATTTTTACAATAATAAGAGTCAATGACCTC
AATCTACAGAATATATTACACTGGCGAACGACTTGTGCAGATGTAGTGCCAGTAAGATGGTGTC------TTGGGCTTTTATTTATAGTTCGGCTGGGTAACATGTGCTTATCAGTGCCGCTTACAGGCCTTTGTCATGTCCAAGCTGGCAGTCTACTGCACCCGATTTCACCTACAGACATTTATAATCTATTTATATGCATATG--TATTAATGTGTACATACTAAGCTTTGTTTATTGTAATGGATTTAAATTGCTTTGCGA-AAACAACAACAAAACATTTGAAAATAATACTTCTGT-TTGATTTGATTTCCATAAAAACCATGATTAGCTACATC
>MESK4 12815608 12816041|13108 chr3R 12815919 12816223 scaffold_47 590047 590360 + -1059|0 127
TAAATGTTCTTCGACTTATTCTGAATG-----TCGTTCAGTGCCCGATTAATTTTACGGATGTAAGCACATGGGCACGAGTTAATATTGCTTAAAACTTGAGGCCAAAGATTAAAATTATGATTCAAA
TATATTTTATTATATTTATTATACGTGAACGATCATTCAAT--TTGATGAACATTTTGATTG---GTAC---GGCAATATGTGATATTCATCAAATAATGAGGCTGACAATGAA--------TGCTAA
>CG31274 12819820 12820369|13115 chr3R 12819801 12820091 scaffold_47 589094 589443 + 1106|19 359
AGT------AATA--------TGCCGAAGGA--GGGAGGGGTATTCCACTGATTGCATTCTGTCCCATTGTTGGACTATTTTTAACCGTCC-GCTGGA----------TTATCAGCGCTGC-------------------CCTCGCTGCC---CTGCAGTCGTCGATTGCACCTACAGTGCTATGCAAGTAA---ATATGCATATGGTTATTGCCATGTACGTATATAAATTTGC-----------------AATTGTATGACGATGGACACGCACAAACCTAGTGAGAATTAATCTAGTGCATTAAAGCAATTTTTACAATAATAAGAGTCAATGACCTC
AATCTACAGAATATATTACACTGGCGAACGACTTGTGCAGATGTAGTGCCAGTAAGATGGTGTC------TTGGGCTTTTATTTATAGTTCGGCTGGGTAACATGTGCTTATCAGTGCCGCTTACAGGCCTTTGTCATGTCCAAGCTGGCAGTCTACTGCACCCGATTTCACCTACAGACATTTATAATCTATTTATATGCATATG--TATTAATGTGTACATACTAAGCTTTGTTTATTGTAATGGATTTAAATTGCTTTGCGA-AAACAACAACAAAACATTTGAAAATAATACTTCTGT-TTGATTTGATTTCCATAAAAACCATGATTAGCTACATC
>CG3534 12824995 12825172|13120 chr3R 12824472 12825545 scaffold_47 594749 595903 + 33360|557 780
ACTCTCCGAAAGCCCAACGTAACATTCCAGTTTATACTCCGTACATTCACAAACTGA-----------------------------------TTCCTTCTTAAACGTCTCCTGTA---ATTGACAGAACTTAAGTGCAATTAACAAA----TTCTGTGATTGACGATTTAT-TACAAATTTAT-GCGAAACCAT--ATACAAATAAATTTTTATATATGGCCCA
CCTTTGTATAATCCCTACGTGGTCGTCTTTTGTA-ACTCCGCGC-TCCACGAATTAAATATTGAATATCACCCAAGCACTTTGGACACCACATTCCATACTCCAAATTTTATATACTGATATATACAACTAAAGTGCAATTAACAAAATTATTCTGTGATTAACCATTTTTATATTGATTGATTGTAAAAGCATTCACAAAAATAAACTTTTACATGTTACAAA
>CG8913 12832836 12832930|13123 chr3R 12832230 12833032 scaffold_47 606090 606963 + 7633|685 779
AGGTTGACAAAACAACGCTGCTCACATTTAAGATTGTTTCCAAACCAAAAAAAAATATATATAAGAGTCAAAACTCATTAAATACCTCAATCTTG
AATTTGGCGATG---------GCAGACGCGAAAACGAATTAAAACAGAAACCCAATTTATACAAAGATGATTTGAGGTGATGTTCCT-AATCTTG
>CG8907 12838135 12838273|13130 chr3R 12837180 12838140 scaffold_47 612114 613074 + 38389|990 995
GACTCC
GCGTCC
>CG8907 12838135 12838273|13131 chr3R 12838171 12838758 scaffold_3 5028376 5028904 + 1522|0 104
GAGAGACAAAAATGCTTCAGATGCCATT-AATTTATTTATGTGTAATAATCCTTCATTTATGTTAAACA-GTGTTCATACGTATATTAAAAAAAAAAAAAGACAA
GAGAGGAAAAAA-------AACACAATTGAATATGTTCGTGTGCAATACCC---------TGTAAAACATGTATTCAACGATCTGTCGATATGAAGAAAA-----
>Pxd 12853624 12853763|13139 chr3R 12850119 12853765 scaffold_47 623338 626947 + 109722|3725 3876
TCCGCTGCTGT----------GGGATCTATGCTTAACTAGTT--GAATACAAATACATTTAGCTTAATCAATAACATAAACGTAAATGCAAAGCCCCTCCCCCCCCCCCCCCCCTTGTATGATAATGTCCCAAACTGATGTACAGAAATAAA
TCGCTGGCAGTTCATACACACGACATCAATCATTAACTAGTTCAAAATATAATAACACTTAGATTAATCAGTTTAAAGATTATGAAATCAAA------------------CTCCATGTATTATATTGTCCC-TTTTTATGTACATAAACAAA
>CG5220 12867590 12867688|13156 chr3R 12867679 12868788 scaffold_47 177279 178423 - 35862|0 9
CAAAATATTG
CAATATGTTG
>CG5208 12872852 12873444|13159 chr3R 12870556 12874231 scaffold_47 650818 654502 + 82859|2397 3133
G-------------TTGCTTTGACGGATTTT---------------CATTTAACTTGATTGAAGCGTTTCA------------------------AATAATTGTG-AAATTATATAGCCGAGTTCAC---TTTGCTTTACTCAATTACGCATAT------------------GTTTGTATAGAA----TATGTATCCAAAACTTACATATGTACGATCGTTTTTACATTTACGCATACTACACAAAAATATTGAT-----ACAGGGTATAAAAATCTCATACTGAAATTGAGAAAGTACTCGACTGTC----AATAAATTTTGATAAT---AGTTTGTTAGAAA--CGTTCTTTTATCCAAAATTGTGTGCACTGTACAAGAAAGGTAGAGAGAGGAAATCATGTTTTATAAATATAATATCGAATGGTAGGTTTTGCTCATTGTACATACTTATATCATTTTATATTCGATAAGGAGTACTTTT---CCGGCATTTTCTGTAGAGATTTATAAAGAATAATTCACCCCACAAATTATTCTTTTTTTTTTTTTGTCATCGAATTAACAACTGGGCTCTCCTATATCTT--------------GTAATCACGATTGTAAAAGGAATATCAT--------AAATACGTTT-----------TAAAATTTAAAAGCAC--CGATTTAAT----GCGCGAT----------CCATGCATACTCATTTAAATGTGCATCCTT
ACAAAGGCATTATTTCATTTCAATTGATTTTGTAATTGAAAAGTTATATTTTCCTTGCATTAGGTCTGTCATTAATGTTGGGTTATTCAGCAGTTAATATATGTATGAATTATGTATCTACATATACATTTGTGTTGTGTTTAATTTTACATATACATAATACACGCGCACAATTTGTAAAAGAAATCCATGGATACACCAAGTACATATATAAATAAACATGCACATGTATGTACATTATACATGTACATTTATCACAAGCAGGGCTCATATACATATAAACTAACGCGAAACAATATTTGAACTACACAAAAAAAATGTGAATCATGTAAACAAATTCAAAATCTGTTTTTTCATCCATAGTAATATGCCCCTAAAAATCAAAATA------------CTTGT--------TATGGCATCAAAC-----ATTTTGCTCATTGTATA----TATGCCATTCTGTATTTAATAGTGAATACATGTCGACAGCTATATTTTATTGAGGTTTAT----AATATTGTACTACTC----TCTTTTATTTTAACTTGTTTGATTGATTTACATATTTTATTTACATTTCCATTAAGTAAACTTGTGCGTAATTAAAAATTTAATAGAATTAAAATTGCTCCCAATGCACATTTATTTATTGATATACATTTCTAAAGCATAACAAATTAACATTAGCGTGATTTAAAGAATCCGATCTATTTTTGTTCATATTTACATTAAC
>Dad 12894858 12896135|13181 chr3R 12894141 12896321 scaffold_47 678952 681203 + 21748|727 2207
CAGTACCTGATGCTGGCCCGTTCGGCAGGACCTCATT------CGGCATC-CCAGCACCTGGTTGAGCCGGGCATGGGATGCGCCTGCGATCAGGTGAGCAGCTGG---------------CGATCGCGCCAACTGCTGCAGAAGGCGCAGAAGCTGCTGACCAGGCTGTGCAGGCAGGTGTGCGCACTGACGGATTATCGTCCGGCGAGGACGAGATGGCGTTGTCTGGCGGGCAGGAGATCGAGCCGCCAGTTAAAC-ACTAAACAACCAATAATTTGGAACAACAAAGGACTGCAAAAGAAATCATTTTAAATGTTAATATACATAATTACGAAACAAGTTTCAATTACTGCTAGTAGACACATCGAAATTAATTTTAACGCATCTGAGTCGCATTAAGAGAGAGAGAGAGCAAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAAAGCGGTGACGAGAAGTCGTAGCGAGTCGAGCCGAAATACATAGTAATTGATTGTTAAAAATACTTAGCAAAAATTGAAATCCTGTGATTCACTCTATATATA----TACACATGTAGGACGTAC---------------------------CGATGCAAGGGGCTAGAGCTCCATTGCCAGTAGCTATAT----GATATGTATAAATATTTAAT-------------CTAACATACATACTTAACAGAAG--GCACATCAGGGTTAATAGTTTTGAGAATGGCGAAAAGTCTAGTTACGATGCA-ATACATTCAAAAAGCCA---CTACATTTTCTATGCGACGTTTTTAGAAGAAACCCAAGCCCATAATTTATACCC-------CACCCAAATGAAACCAAACATCAC---------TGAAATACAAATCTGTT----------CAGTAG-AATCTGCATAGATCCTAGG---CTAACAA--AAAAACACCATTAACAAATTCA-ATACGGTTTTAGATTCTAGCGCATTAGGATCCAATCGGCTT-------------TAGAAAGCACACGTCATG---TTCG----AACATTATTTGTTTTATGTTGATATT-----------TTGACTGTTTTCGTTGTCATTATTACGTA--------------CATTCATTGTTTAAATTAAAAAATCTGTCATTTGTCAAGTGTATAAAAAGATATCACAACACGATACTTACAT------------GAGCTGAATACCATAGAATAATTTTATTTAAATCTGTAAT---CACTTTA-TGTCCATTGA---CGAAGCACCAACTTCGTTTGCATTTCCAACAGTAGCAAATGCGAATTCGAGGAACTG------GTGCTCTATTTGAAATCCGTGCGCTAGATGATCTTTAACCCCTTACCAAACCAAACTGCATGTAGGCCATCCTAGAATCCCAGCC-TTGTATGT---------------ATTTCGTTCTAAGAATAAATGCGATCCACGT-------TAAACATTTACA-
CAGTTTCAG---------CTTCCGGTGGGCGCCAATTGCTTTACGGCAGCGGCAGCGCTATGTTTAACTGGG-ATGGTCTGCAC---GAATCCAATGTGCTGTAGGCCACATGTGCTCCACCGGTTGCGACAGCTCCTTCAAATAGTTCAAAAACGGATTTCGGGACTAGGCAGTAAAGCAAGTATACTGA--GACTA----CAAGCAATTGTTACAAAGAGTTTT------------AAATTG---CGCCAACTGGACTAGCAAACAACTAATAAGTTGGGGCAACAATGGACTGCAAATTATATACTTTTAAAAGTTTA---ACTCAATTATGGAAAATGTTTTAATAAATGCT-------ATATCGAAATTAACTT---------------------ATGGATAAAGCATGCGCAGCAACGGAGATAGAA----------------------------GTGTTAAATTCAA----ATAGTAATTGATTGTTAAACA----TAGCTAAAAATAAAATCCTGTGATTCACTGTATATGTACATTTGCATATGTATGAAGTATGTATGAATTACAATCTAAAATATTTAAGAATGTAGGAAACTATAACT-CGGTAAGAGTAACAATTTCTGATTTATGTACAAATACTTAATTCATGTACATATGTTAGTATGCATAGTCTATACACGTCGCTCATTCACTTGAAGACTGTCGTAAGT--CACAAAATGCGACTATCATGTATATATTGTACAAAATTCATATTTATATCTTGTATACTCTTTAATTGAGAAGATATTTATTTAAAAATTTGTCTGCAAGGCGGTACTCAATGGAAAATATTCAACGTATTTTCTGATAAATCGTATATTTGTTTAAGTTTTGACAGTAGTCAAGTAAATGAGTGATATGTTCTTAACAATGAATGAAACGATTGAAAAACAGAGGTGCACATTTCAGTAATAGCGGATGACATACATACAGGCATTTGACCATCACAATAGTAATGGCTTATGATGGTTTTCGCATTCACATTATTTTTTTTTAGTGGGAACTCAAAATACAAATTATCTTTTTTTTTTTTAATAACAATCTAATGCTACCCTCAGGCATACATAGACTCTATTAGCCAATTATTAATTTGTTAA----ATCACAATATTTTGCTCAATCATTTTTATGTTGATGTCTTAAAAAATTGCTTAACTTTCGCTGAATTTTGTAAATGTTATAATTCGCGTTTTAGTTTTCATCGAGCCCTTAACCCCATACTCAGTTGCCTTTCAATGTGACGGAAACGCAAATTTGAGCACGCGTAAGGCATTTTATACTACACATTCTTAAAATAAATTCTCATTTGGTTTTTGTTAAG-AAAAATACATGTTGAATA----AAAATTTCGCCCACTGTAGATAATGTTGCGGTTCCAATTCCCTCATAAAACTATAAGCCTTCAGTGTCTGCACATACATACATACAT
>mRpS11 12898975 12899060|13183 chr3R 12897294 12899563 scaffold_47 683439 685648 + 75042|1769 1854
TACGATCCTGTGGAATTGAGGGATTCAAAAACACTCGCAAGGGAACCAACATAGCAGCTCAAGCTACAGCGGTTACCATTAGTGGA
TACGATCTTGCGGAGTCGAAGGTTTCAAAAATACCCGAAAAGGGACAAACATTGCAGCACAAGCAACAGCTGTTAGCATAAGCGGG
>mRpS11 12899224 12899289|13183 chr3R 12897294 12899563 scaffold_47 683439 685648 + 75042|2018 2083
AAAGCCATTGAATTGGGCTGGAAGACAGTGCGAGTAAAGGTTCGTGGTCTTGGCCCTGGAAGAATG
AAAGCGGTTGAACTTGGCTGGAAGACAATTAGAGTGAAAGTTCGTGGACTTGGCCCAGGCAGAATG
>mRpS11 12899350 12899531|13183 chr3R 12897294 12899563 scaffold_47 683439 685648 + 75042|2153 2334
TCGGCCATCAAAGGACTGCAAATGGGTGGGCTGAACATCGTTTCCATTACCGACAACACACATGTTTCCTTCAATCCTCCAAGACCCCGAAAGCAGAGAAGTCTTTAATGTGCAACTTGTTAAGACAACTTGTTTAAAAGCAAAATACACAAATAGTCGTTTACAAACAAATACGAAAACAA
TCTGCCATCAAAGGCTTGCAAATGGGCGGCTTAAATATTGTTTCAATTACTGATAACACACCTGTATCCTGGAATCCACCGCGCCCTAGAAAACAACGAAGTCTTTAA--------TTGAAGAGA-AACACTATTGAAAATAGACAATATAAAT---------CATATAAAAATAAAAATAC
>CG5175 12910132 12910550|13197 chr3R 12908358 12910557 scaffold_21 1257397 1259695 + 31356|1920 2496
----------TACAACAGG-CCAGACCACATAATACCCTTCCCTTAGTTGATAAGATTGTCTTAGCAT-----ATCTGTTTCACCCTCTTTGGTA--------------ATTTATGTTCTGACGTAAAGTAACATGTTAAGAGAAAGTTTTATAGCTAGG----------ACTCGT---------CGGGTCGTTTTTCGTC-----------------------------AGGAAAATCACCGTTCTGTCACAGATTCCTTGCTG------------GTTGTCTCCTCGCGAACTCCCGGGTCGCAGACAACCACCGACGAATCTGAC-------------------GATCTGTACCCAGGCAAAAGTGGGTACCAACCGTAGAAAACCCATACTTGTAGTAATCTGTTTAAGAAATTTT-----------TATATAAAACACAT----------------------------ATTTGTGAAAGTC--TTTTCGCCGAGTTCATGTATTGTTTCGCTATATCAAAAGAAAAAAAGAAAA-ATGTA-------ACACATTTCATAAATAAAGTACATT
GCAATTCACTTACGCTAAGTTCAAATCCC--AAGACCCAACCCAATATCTACCCGTTAACTTTAGCATTAAAGATGAGTGTCATTCATTGTTGTAACGTTGTAGTGACCATTTTTGTTCT--TGCAATGTTGCATGTTTAGAGTAAGCATCTAAATTGGGCAAACACCAAATTCGTGCAGCAGTGCTGGCTGCTCCTCTTCCAGCTTGTGGAAGTTGTTAGTTACGCGATATGCACATGAGCAGCCTTTTAATGATTTCTTGCTGCATAGCTGTGCCGCCGGCGTCCAGCGTGGACGCAAGGCTCAGCTATGCAATGACAAATCTGTCTATCTCCCCAGCTAAATGATATCTGTACCCATAGTATATAAGGTACAAAATGAAAAAAGAAAGGAACAAAAAAAAACAGTATAGACAACATTTAAATTTATCATACATAAGACATATGTAGCTATAGCTGTACAAGAACTATAAGATTTGTGTATCTTTATTTTATTTGTGACCATGATTTGTATTAGTATATAAAAAAACACAAAAAGAATATGTAAAAATTCAAATATTTTAAAAATAAAGATCACT
>CG5169 12913449 12913620|13200 chr3R 12911511 12915644 scaffold_563 1171 5489 - 129187|2015 2267
CTGGCGAAGCCGT--AGCAAATTCCGATTCCAAGCAGCCTATTTTAATATATACACAACTTTATTA-------ACGACACCGAGACAACACAAACTGAAACGCTGGAGCAG------ACATATTCCGACATTTAGTGGCCAACAGAG----------------------GACCGGGAGC-----------------GATGTACAT----GTATTTCAATTG-----------------------AACAGTTAT
GCCGTGAAACGGTTAACCAAATTCCAAAACAA---AACTTACATAAACATATATATATATATTCTATATACATACTATACGTGTTAAATAAATCCCGAGAAACAGCAACGGCAAACAACATATTCCGACA--TAGTGGCCAATGGAGCAAGCAGCGTTAGACTTATGAAAAACGAAAGTTTATATATACTTATGTAGTTGTACATGTACGTATTTCAACTGAGCCATGTGGCAAATGTTTATTCAACAGTTAT
>CG5148 12917121 12917663|13201 chr3R 12916122 12917149 scaffold_563 5490 6567 - 8192|1090 1118
TTAAGTAGTTAGGTTTCATATTTCAGACC
TTCGCCTAATTGTTCGCTTATTG-----C
>CG5148 12917121 12917663|13202 chr3R 12917150 12921700 scaffold_13 1753563 1757969 + 202977|0 556
TATTTTTTAAATATATTAGGTTCATGTTTTGGTTGTACATGACGGATTTCTTGGTGGTGTTAAAC-ACGTCCTTGCAAAAGAAATTATATAAGAAAAGTTGTATTTAG-TTCATTTTTTTGTGTTTTGATTTATTTCACGTAAATTACATGATCGATAGTGATAATAGAAAA-CATAATACGTCATAATCATTTTAATCATC---ATAAATTTTTCGCTTAAGTATTAAATAATTGTTTAAGAGATTTATTCGCATTGCAATAGTAATTCTTGTGTGTCGAAGTTGTGCTTT---AGTTCGTTTCCATGAAGTCTATCA-----------------AAATTCATATCGGCAATTGTTAATTTTATGTATTCACAAGAAAACAAATAAAACGTAAGATCAATTTAAAGAGTGAAAATGGCGCGTCGA--------AAAACAGAAGCTTCTTCCTTCCATGT---ATGTACAAATAACAAAAACT------TACCTAAAATATGATGATAAATCAAGAAATTAAAATTAAACAAAGAGCGTTATGATGAAAACAAGAAA
TATTTTTTTTATGTTTTTA--TAATGTAATGTATAAATATTTCAGATCTATTACTACTACTATTTTATATTACTGCA---GAAATCGTACGCCATATATTTTTTTTAAATTTATTTATTTGAGTTT-----------ACGTAAATTACATG-TCGATAGTGATAATAAAAAAACATAATACGTCGTAATCATAATAATCATCTTCATAAGTGTTT-GCTTAAGTATTAAATAATTGTTTAAGAGATTTATTCGCGTTTT--------TTCTTTTTTTTCAAACATTTGCTGTGTAATTTTAATTTTATCAAATCGTTAATGACAATTAGTTGAATGAATTTAATTTTTGTATTTATTTAGTTTAATTATTCACACAAAAACAAATCAA-------------TTGATATGTGAAAATGGCGCGCAAACATTGTTCAAGTCGAAAACATTTATATTTCCTTTTTTATGTACAAATAACAAAAAATAATAATCACTTATAATA--ATGATAGG-CAAAGAATTAAAATTAAACAAAGACAATCATGAAGAAAACACAAAA
>CG31265 12954769 12954846|13248 chr3R 12953673 12954809 scaffold_13 1805289 1806443 + 31292|1139 1179
TTTACTTACCAAATTGAATTAGTAAATTGTTAGAAAGATTT
ACAGCTCATAAAA---------TAAATATTTAAATAAATTT
>CG31265 12954769 12954846|13249 chr3R 12954822 12955016 scaffold_1 1719873 1720076 - -1212|0 24
AAGAAAAATTAAGACTATTATAAAA
GAATAAACTTGTAATTGTCGCCCAA
>CG31266 12959321 12959436|13258 chr3R 12959382 12959699 scaffold_13 1347480 1347755 - -223|0 54
TAAATATGACAAATATATTTTAAAAGCACTATTAAATATGATTTAATCATTAAAG
TAAATA----------ATTGCACGATCATTGTTAAA------------ATTGAAG
>CG5246 12962746 12962926|13264 chr3R 12962741 12962911 scaffold_13 1815179 1815380 + 2337|13 205
AGGTCCAAAAGTC-----ACCCGTGGGGGTACAAAAGCCAAAACCGAACAAAAATAGCAGCTGCCA------------------TCTAATGGCTTCTGCAAATTGATCAAATTAGACTGTAAATTTTATT----ACTTAGATATCAAAGATATCATAAAATATTTATGAACGAATAAATGAACAATTGCGCTT
AGGCCCAAAGCGCAGAAGAAACAAAGGCGAATAAAAGCC-AAACCGAACAAAAATAATATATACAAAATATATACTGAGACAGCTTTAAAGACTTTAGACCTTAAGTCCAA--ATATTGTAAATTTTATCGTAAGCACATATATCACAAA-AGAATAAAATATTTATGAACAAATTATGAACCTATAAAGCTT
>CG5246 12962746 12962926|13265 chr3R 12962912 12963293 scaffold_1 1725418 1725804 - -1711|0 14
CAGTTTAAATAAAAA
TGAGTTAAATTGGCA
>CG5265 12966761 12966856|13270 chr3R 12966632 12968657 scaffold_13 1819722 1821735 + 47048|140 235
ATGTGTTTTCCTAGAACATACTTTGGATCCAAAAAAATTCCTCTTATTCCAATAATACGTTCGTTCAGTTTGGAAAGCTAAATTCATTCCCATTTA
---------ACTGAAACATAAGATAGCACAAAGTAAA------------AAGAAATACATCTGCATAATTTGAA----TACAATTGTTAGCCTTTA
>CG12265 12976093 12976198|13275 chr3R 12975195 12976696 scaffold_20 1319405 1320891 + 21680|985 1092
AGCGCTAATTTTTAAACCTTAAATAT--ACATATATAAAACTCGCTATTTATCAAGATTTTTAATAAAACGCAATGTTAGTCCATCGAATGTATTTATAAATTAAACT
AATAA-ACTTTATGCGCATTTAATATTAATACATATATTACAAAATACAGTTCGCTTGTTTGATTAAAAGATAATTCTCATCATTCG--CGCATTGCTTAGCAGCGCT
>CG5292 12978179 12978216|13277 chr3R 12977608 12978245 scaffold_20 1321641 1322275 + 33701|571 610
--GATCAATTGTCGAGGCCAAAAGCGTGCGTGAAGAAGGG
CTGGCTCATTGTT--AGCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA
>CG5292 12978273 12978829|13278 chr3R 12978715 12983036 scaffold_20 1322312 1326081 + 79659|0 114
TTTCTGTATATGATTCAATTTATTATAATCTTTAAGCATAGTCTAAGATATATTGTATATGGCGTTCAGAACGTATGTTTTAACTCTAAGCATAAATACAATTACTGCATGAAA-
TTTTTGTATATGTTTTAATTTATTGTAAACTTTAAGCATAGACTAAGCTAAAT-----ATGGCGTTCAGAACGTTAGTTTTAAT-------ATAAATACAATTACTGCGTGAAAA
>CG31257 13080689 13081834|13409 chr3R 13081213 13081274 scaffold_20 1422740 1422809 + 2064|0 69
ACCAAAGTTTGCCACCCACCTGCTGTGCTGATTGTTCTAAATAACCAGAAAT--------TATTTCAATT
ACTAAAGATTTTCGCTCACCTGCTGCGAAAATCTTGCGCAATAAGCAAAAATGAGTAGGGTATTTCATTT
>CG31257 13080689 13081834|13410 chr3R 13081794 13082193 scaffold_20 1423135 1423571 + 5718|0 57
ACGCTTGACCCACAATCAACACATTGCTTAGCT-----------------TAACCTTT
ACGCTTGACCGACACTCAATACAGACATATGCTCTTTGAATCCAATTGGGTAACCTTT
>sds22 13218632 13218744|13563 chr3R 13217557 13219963 scaffold_20 1585307 1587628 + 68387|1077 1189
ATGGAACCACTGTAAACCCCTTGAAAGACTAATCCACGGCGTTGCGCCACTACATTTATATCGATTAACTTTGAAAAACTGCGTTTAAAATATACATACAAATTAACCACTAA
-----ACACGCGTAACGTTCTGGTTAATCTTAT--ATCGAATTCATTAATTACATTAATATGAAACGAACT---AAAAGT---TTTAAAATATATATTCCAAATTTGAGTTGT
>CG5873 13271845 13272215|13608 chr3R 13269369 13272764 scaffold_20 1635799 1639093 + 139452|2542 2978
ATGCCAT--------TTGTTTTTCT-----CACGATTTGTTTTACA-ATCTCGATTCATTTTGTTTGACTCCA--------TATCCTGTACCGTCTGTCTTCTATAGTTCAAAATCTTT----TCACTTCTTACTGCTTAGTC-CCTCAACTAGTCTTTGCT------------CACCATCCGCAT-------TTCTATAGCGAGTCAG---TAGTTATGACACTGCCATTTCTTCAGAGCTCTTTCCAGCATTTCCGTGCATGAACCATACATTCTGTATATATTAATATT------AAATAGCAGAAATAGAGCCTTTAAGTTAAAGCATATCGAAGCAATCAAAAAAAAGAAAA---CATAAATAAT-TTTAAAAAT----ATATCTCGATGTAAGTTTTTGTATATGCAAG---TATTTTTTAAATAAAATTT
ACATCATTTTATTAATTATTTTTCTGCATACATACCATATTGGACATAGCTGTACACCTTTGGCAAGAAGCCAAAAACCACAAGTCTTTGGCATTTGTTTTT--CAGTTCTACATTCTTAGTATCTTCCACTACCGCTTAGTCTCTTTTACTAGTCTTCTCTCTTGCTGCAACGCATCCTTCGCACTAATGCATTCTAAAGACAGTCAGTTTTAGTT-TCACACTGCCATTT-TCTATAGTGATTTTCAACATTTCCATGCATTTTCCATACATTTTTTGTATATATGTATTATTTTAAAATAGCAAAAATACAG-------GGTAAGTTACAAGAAGGTCGTTTAACAACATACAAGACCTTTAATAATGTTTAAACATACGAATATTCCGTTGTAAG-TTTTGTATATGCAATAACTATCATTTAAATAAAAAAT
>CG5840 13362570 13362858|13704 chr3R 13361347 13362661 scaffold_20 1715998 1717138 + 36433|1236 1327
GCACATAGGATTATCATATACATATACGTACATTGGGGTGGGTCAATTTTGTTATTAAAGTTATAGTAGTTAAAGGAAGTCGTTAAATTTTG
ACGCA------------ATAAATA---------------GGTTCTGTTTTTTTTTTGTTTTCATAATAATTAAAGTAC-TCAACACATTTTG
>CG5840 13362570 13362858|13705 chr3R 13362662 13362866 scaffold_21 1711522 1711701 - 474|0 198
TTGCTTCTTGAAGAAACATGTTTTTAATTTGGAAATGTATGTTGGTGCTATAGTGCTTTCAAAGAGCAATGATGAGATGTTTCATTTTAATCGACC--CACCCTTGTGCTTAATCTGGGTTAGTAGCTTTGCATAACTATAAAAACTGTGAAGGCCGATTTCGTGATACTAAAATATAAGCAACACTGCTATATTCTTT
TATCTATTAGGAAAAACATGTGTTTAATTTAACAAGA--------------AATACTCTGATCGGACAAAGGCT-GATAATTCTGGTTAGTCAATCAAAATATTTATATCTAG---GGGGTATTTATCGTGCCTTACTAGACTGAT--TGACAGTCAG--TAGAAATACTATAATAT-----ATATCTCTATAATGCTT
>SF1 13370655 13370873|13709 chr3R 13366347 13370660 scaffold_20 1720684 1724928 + 124054|4649 4654
GCTTTT
TCTTTT
>Sgs5 13421721 13421766|13758 chr3R 13421260 13422881 scaffold_20 1769972 1771829 + 12406|478 538
GTGAGGTGGATT-------------CAGTTG--GATCACGTTACTAATATCTTTGTTTGTT
ATGAACTGCCTTGCGCTCAAAATCTCTGTTGACGATCACGACAAAACACTTTCCATTTGTT
>sll 13434033 13434266|13770 chr3R 13433630 13436209 scaffold_15 1111843 1114458 + 50978|403 643
CTAGGGACGTAGACTCCCTTCGAATACAACGCACAGACT--TCCTAGCTCAGCCTTTTATTGTGCTCATAGTAACCCATGG-----CAGATGCCACTTCCAAAGCCCAAACAGAAGCTGCTCGGACTCTCCAAAAATTGTACAGTTTTGTTTTCATAGTTCTAAGTTGAATGTATACTTATATCCTAATCATAAGCGTAGACGACTAGTGAATGTGCTTAAATAAACATTTTATATGTATA
TTAGCG-TGCAGTTTAATTCTGGTTGAATTTCCAAAGCTGATCCCATCTTAG----TTATAG--------GCAACCTATGAATATCCAGACTTTTGTTTAACATGC------GCAGCTAGCCGAATATTCC--TAATTGTATAGTTATGTTTT-GTAGTTCTAAGTCAACCA-----GTAGATACCAACCA---------------AGTCTCGAGGCTTCAAAAAAAATTGTATATGTGTG
>CG14329 13435964 13436255|13770 chr3R 13433630 13436209 scaffold_15 1111843 1114458 + 50978|2584 2847
TAACTTTTTTCATGCCAGCCTCCTGTGACACCTGCTCAACTAGTTGGAGGCGTGGCCACCACAGTAAACGGAATCATTCAGCAGTTGACTGGACAAGTGCAGCCAGTTTACCAAACGGGAGGCTATCGGTCAAGGGATCAACGAAGCAGCTACGGATAAGTTACTAT---------ATATCGA-----ATTTGTATGTAAATTTGTAAATAGTTTTAAGTAATAATAGTAGCG----ATTTTATGTACGAAATACGTTTACAAT
---------------CAGCCGCCTGTCACGCCGGGACAGCTTCTGGGTGGTGTCTCGACGACGGTCAATGGAATAATTCAGCAGCTAACCGGTCAAGTGCAGCCGGTCTACCAAACAGGCGCATATCGTGCCAGGAATAATCGCAGCAGCTATGGCTAAGCCGCAATGCGGGATTCATAACGAAATCGATTAGTATTTAAATGTGATTATA-TATTAAGTAAT-ATTGTAGAATAATATTGAATATATGAAATATAATTAAAAT
>AttD 13451669 13451810|13786 chr3R 13450695 13451838 scaffold_15 1129964 1131077 + 17007|1002 1147
ATCCTTTATAGTTTTATTGAAACTATTCATAGTCACATTTAGTACTTGCACGTAGCCAAGAAAAGAAACAAGTGCCGTATTTATATGCATTA--TATCGAAGATTAAATAAACCATGCTATTAAAAGCGCTTTCT--ACTTGGTAA
CAATTCTCAAATCAATATACAATTATTAATATTTACAATTAAATAAAAAATGT-GTTAAGATGAGATATAAA----ATATAAATATTTTTTAATTTTCGAGAAATAAATTTATGAAGCTCT-----GCATTAGCTTAACAAAATAA
>CG14322 13494850 13494939|13835 chr3R 13494177 13495366 scaffold_15 1182070 1183310 + 34284|693 785
GACGCGTATCATCATTGATATAAATCTGCTTTAATTTAATCAT---TTTTACACACAGACTTGTTTGCATAATACAATTTAATGGTCATAGTC
--------TCGACTTAAAACTGAGTGCTCTTTAATTTTAATACAAATTCTATTTTTCGACTAAGTTATAGATTTTAAAATACTCCTTTCAGTA
>ald 13499431 13499550|13839 chr3R 13498631 13500099 scaffold_15 1186420 1188106 + 45332|800 952
GCACGAAAGCTCAGCTATTTATTAGTGA--------------AATGTCAAAGGTCAAATGT-------------------CTTTCTCATATGTGTGTGTATATATTTAATTCTCATTTTATCGTAAATTAAACATCATAAATCCTTATAATGC
GCA-GAATACATCTTCATTTAGTATTAAGCACATTCACATTTGATGATAGGAGTAAAACACAGAAATATAATGCACTGAATTTTCATATGTGTGTGTGTGTGTATTTAATTCTCG-TTTAGCATAAATGATACATCATAAATATTTATAATGC
>CG7655 13509332 13509476|13849 chr3R 13508384 13510570 scaffold_8 4621656 4623879 + 66449|962 1193
-----------ACTTAATCTCAAA-AGTG--TTCTTACTAAGATCTAGTTGTAAGTTG-----ACATGAGTTTGTAT-------TGAATAATACTTTTCTAAC-AATTTCAGTTTCCGAATCAGAACGAAACAAATA----------------------------ATGAAAAAACTAA-------------------AAGATATA-------------TAAAAATATATATG
GGGCATCATGCACTTGATCTTGAACAATAACTCCCTCCTA--GTTTAGTCTTTAACTATAACCACATACCTTTTTATATTCTCGTACCTAATAAACTACTAACTCATTTAAACCACCG-------ATGAAGCAAATGTGCCTCATCTATCCTTTGACGGAATCACAAGTACAAATTGATCGTCATCGTCTTGGGCTTAAGCCATAACTCATTCTTTGTTAAGAATATACTTA
>CG31360 13511254 13511531|13850 chr3R 13510891 13511336 scaffold_15 1197149 1197579 + 9084|365 450
TTCAATGACGTTTTAATTATAATCGTA-GAGTC--ACTTAATATATAAAGGTTAATGTTTTCTTTTGTACGACCATGTGGCATTAC
TGTA------CATTAATTATAAACGTATTAGTTAAATTTAATTTGTTCAATACAAT-TATTCTCGTATGTAGACATGTCTCGTTTC
>CG31360 13511254 13511531|13851 chr3R 13511337 13511632 scaffold_41 745017 745255 - -623|0 204
AATAATATAGCTGTAACCTTGTTTTTAGAATTTTTTCTATTTAAAATCG--TTGAAAACAAAACCTTGTTTGCTTTAATGAA----TTTATGATTTATTTTAAATAAATTAATTACATAGGCATACACAATATTGCATCTTTTGAAAGAGGATCATA----AATAAACATATGTTTGTATTAATAATAATATTATAAAATATCAA
AA-----------------TGTTTTCTTTTCTTTTTCGAAGTGGACTCGTTTTAAAAACTAAAA----------TTAATGGAAGTTTTTATG--------------------CTACAAACACATGCACA------CAAATTATGTGAGAGGCTGGCGCTACAGTGTGAGTGTGTGGGTGTGTGTATATGTATTATATGATATCTT
>pxt 13548509 13548679|13883 chr3R 13546672 13548693 scaffold_35 1150855 1152848 - 59157|1883 2087
-------------GGCACTTTTTTTGCATCCACTTTTAATTTATTTA--TGGATATTTTAAACTGTA----TTTATATATGCGAATGTGCTGCCGAATTGTATATCCCCGTTTTATGTAACTGCGGCTTAACACAGAAACCAAAATAAAACTGCG-----ATCAATTAAGCT-------GATTTTCAT---TGCTAATTAAGCGT
ATAATGCTCATATAGCACTTTTTT------AACTTGTAGTTGCCTGATTTGATTGTTTTCAAATATACATTTTAATTAATATAAAGTTAACGTTTCCTTTCTTACCCTCAACTTTAAATACCATAGCTTAAAATCGTA--TGAAGTGAATTTGTGAAGGCATCATTTAAAATATTCAGAAATTTTCATAAATCTTAATAAAAC--
>Fsh 13558539 13558952|13891 chr3R 13555567 13558539 scaffold_35 1156787 1159766 - 68464|3133 3133
A
A
>Fsh 13558539 13558952|13892 chr3R 13558540 13558811 scaffold_44 895630 895843 - -139|0 274
CCGAACCCGGGTATTGTGAACTCACCTCTTCCCACCCCGTTGTGATATATGATACATATATGTAATACATACAT---ACGTGTACTATTAGTTAACGCTCTCTTCATGATTTGCTATCTGTTGCAGTATTGCTAGCATCCCACGATTAATGATATTTAACAGCCATAAGTTTAATTACGTTATCTTGTCATAATTAAGTGTTAACTCCTAAGTATATTTTAGCTAAGAGAAATATTGCTTGAAGGAAGGAGCTTGTCCCCGGATAACAACTAAGT
TCAAAATAGGGTATTTTAA------CTATTC-------------ATAAGTGATGTAACCAAATAGCACAAACATTCTATATACATTTTTATCCAATG-TCTATGAAAAATATAATTTC-------GTATT--TAGTGTTCAACTATTGGT--------ACAGCCATTA--TTAATT--GTTTTCTTGAAACATTGAAGGG---------AAGTCTATA--AACTAAAG--AAGATTGC-------AATATTCTGTTGCGCATGTGACGGCTAAGG
>CG7713 13621801 13622039|13938 chr3R 13621084 13624295 scaffold_30 1282005 1285167 - 76223|733 1026
TGGAAGAACCTCCATACAGAAGC---TCGAATAATCTA-----TTAGAATACTTTTTGACTTGACACGCA-ACAAGAACTCCGTCCATGCG-------------CATTTTTTACAATAAGAATTCCATACAATTCCACAG-----ATGCCTACCAAATAGTTTTATATAAATTTATATATTTTACACA-------------------CATTTATACACGATCAATTATACTT---ATGTGTAATTCGAATGCC---TTAGTCTTCTAAACGACAATTAAACAA---ATAGATTC
-GGACGACATTCTTGTCGAATGCAAATCGAATAATCAACAAGTTTAAAGCATTTTAAAATTAGATTTACTTATAAGTATTTTGTCCATACAAACAATCCGTCCACAGTTTATACTCCAATAA---CATAATATTCCATATTAAATGTGTCTTATACATAATATTTTACA--CTTATGTATTTCATACAACACGTAGAGAATATTACACATTAACACAAATAAATTTGTATTTTTACTGTACAAACTAGATATTAATTTAGTTTTTTTTCCGACTGTGGAAAATGCTATAGCTAT
>CG31246 13663018 13663922|13988 chr3R 13663115 13663402 scaffold_4 830854 831123 - 2445|0 302
TCAATTTATCAGGTTTCT---TAAGTAATTTTTATATATTTCTTTAATAAGCTAATTTTCAGTTCTTTAGAACTACAAATT----TAAAAATGTTATCGTTACAAAGGGCTTAATTTCTTTATTTTCAAAATTCTGAATAATCTTTAGCATTATATGCACCCTGTTTGTTATTTATAGGGTTTGAGCAAGTAACAATAGAAGCAGAGGCAGCAACAATGCGC--------GTTCAACACTTAAGGACGCCTCCTCACACATACACAGACACACGCACACACACAGAAGGACTTTCGAACACGC
TCCATTCCTTGATTTTCTGCATAAATTGTTTTCATTTATTTTTTTAATAATCAAATTGTT----------AACCGCAGTTTGGCCCATGATTACCTTTTTTATGCAGGGTATTCGTGCGTCCTTTACATTATTTTATATTATTTTTATCTTTTTGTGGG-------TATATTTTGTAGCTGCCATTCAATTACATTTTCAATCA-----AACAACAATCCACCGGGCAATGTTCAACTGTCGA-----------CACACGCATTCAGACACACACACACACACACACACATTTATACACACAC
>CG31246 13663018 13663922|13989 chr3R 13663854 13664550 scaffold_3 1913723 1914456 - 3538|0 70
ACAACAATGTTGCGAATGTTTGCTT--GCAATCTCACTGGAAAAACTTTTGAAATGCTGCAAAAAAAAAAA
ACAACAGGGCATTTAAAGTTGGTTTTTGTAATTTGAATGCATAAAGTTTTG--------------------
>tinc 13693077 13693234|14019 chr3R 13692326 13693917 scaffold_3 1947676 1949201 - 28105|758 959
AAAATCGTTTTTTAGCTACCAACAAACAAAACAACAAAAGCATTGCGGGTTTCCAAGCTCCGTACTTGTCCGTTCTCTTAA------CTCTAAC---CATAGCAA--------------CTAGTTTCATTTGATTTTTCTTCACA---------------------CACACACACACTGCACCGCCAAAACAAAAAAAAAAA
AAAATCGTTTTTTTAGTTACAAAACAAAAATAAATAGCAAAATTGAAGGC-----AGACGCCCGTTGTTCCGTTCTACTAAAAAAATCTGCAACATGCATTTCAAAACACGTACTTAGTTGAGTTTCATTTAGTTTTCTCAAGCACCACCATTAAATCGACACCACCACAAACAAAATTCATTACTTGCACAGTAAGAAAAA
>tinc 13694285 13694946|14020 chr3R 13694193 13694970 scaffold_3 1949289 1950058 - 34965|92 808
GGGCAGCCACCGCCGGCGCCGTCGTGGGCATCACCATGGGCAGCATGAAAAGGGGCCTC------AGCAACACCTCGGTGGGGGTAAGT------------------------------CTGCTCCACCTTTCCGAGTACGACGAACTTCCTCCGCCGCCGCCGGCCAACCTTCACCATCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAACAGCAGCAGCGGCAGGCCCACTCCTTTGCCCATGGACATCCCCACGACTATGCGAATCTGAGCGGATTGGGTGGCATCAGTGACGACAACATCTCCGAGGAGGGCAAGCTGCTGGCCTGTGTGCGCGATGACAGTATCACCTACGCATCCACCAGTGATTTGGAGCCACCACAGCCATCGGCCCAGGCACCACCACCACCACCACCGCTGCCCATAAAGGGAGCACCCGTTCCTCAGCCACC-AGCGGTAATGCCCCACTCTGCCGGCATCTACGGACGCGCTCCTCAAGCAATGCCCGAGATGATGCAGTTGTCGCCCGAGCACCACCAC---------AATCCACTTCAGCACTCGCTGCAGCATCCACAGCACCATCCTCTTCA---------GCAGCAGCAGCAGAAGCAGCAGACACCACAGCATCCTCTCCAGCAGCAGGGCAATCCGCACCAGCATCTAGTCAGCCCCTTGGCTCCGGTCACGGTCGCAGTTCACACCAACGAAGCGCAT
GGGCGGCCACCGCCAGCGGCGTTGTGGGCATCACCATGGGCAGCATAAAAAGCAGCATTGCAGTGAGCATGGGCATGGGCGGGGTCGGTGGCGCAGGCAGCAGCAGCATCATCAGCGGCCTGCTGCATCTAAGCGAATATGACGAGCTGCCACCGCCGCCATCTGTCAACC------ATCAGCAAC-----------CACCAGC-------------------------CCATGGGCACACCCACGACTATGCGAATCTGAGCGGGCTGGGCGGCATCAGTGATGACAACATCTCCGAGGAGGGCAAGCTGCTGGCCTGTGTGCGGGACGATAGCATCACATATGCATCCACACGCGATCTGGAGCCGCCACAGCCAGC------AACACCACCGCCGCCGCCACCGTTGCCCGTCAAAGGTGCACCCATGCCACAGCCGCCTAGCG----TGCAGCATCCACATGCCAGCTACGGACGCGCGCCCCAGGCCATGCCCGAGATCATGCAAATTTCACCCGAACATCACAAATCACAGCCGAAGCCACAGCAGCAGCAGCAACAGCAGCCACACCACCCGGCGCTCCACCATCCATTACAGCAACATCCGCATCCACAAACACATCCGCATCCGCTTCAGCAG---------------CATCATCTAGTCAGCCCACTGGCTCCGGTCACGGTCGCCGTGCACACCAACGAGGCGCAT
>tinc 13695648 13696493|14021 chr3R 13695249 13697318 scaffold_3 1950783 1952783 - 57818|452 1315
ATTGCATCCAGTTCCACACCCCGTTGCCTGCGTCGCGCCGATTCGGGCGTTCCCAACGAGGCGTTGACACCGCGCAGCGACACCACCTCCACCACCGAAAGTACCAACACCACCTCACCGCCGGAACGCGCCCCCTCCGAGTCCTCCAGTGGCGTCCACTCGGGCGAGGAACGTGAGCTGGAGGTCATCATCCGGCCAAGGGCCAACAGCAAGCCGCCGCCACGCCCCCCACAGCCGCCGATCCAGGAGGAGCCATACGGCCGCTGCACCAACATGCGCATGTCCAGCTTCAATGCGGATCCCGCCGCCACCTCGTCGGCGGTCATCAATAGTGCCACATTGCCGCCGCAGCGTTCTGTGCCGGAGCAGAAGTTCGACTATACGGCTCACTGCAGCACAATGCCACTGCCGGTGGGCTGTCACAGCCAGCAACTCGC---------CGGGAGCGGTAA---------TGGCTATGCCTCCACCTCGGCAATGACCAGTTCCATGGGCGGTGGCGGTATGCCACCACTGCCGCCATCGCAGGTCTCCAGCTTCATGACGCCCAACAGTATGCACTACGCCAATGCATCAGTGGCCCTGGGAAATGTTAGTGGTCAACAGCAGCCGCACACCACGCTGCCAAATGGAGTGCGCTACTCCAATCCGCACTTTCTGCGCCGCCTGCCGCACGTGACCAAGGCGGCGGAGTCGCCGTACGGACACCTGGGCTACGGAGCTGGTCACCACGCCTTCGCAAAGCTGCCGCACGAGACGCATCCCACGATTCCGGAGGATCGCGACTCCGCCAACTACTCGATGGCCTCTGACCAGGATTGCGGACTCTATGTGACGGCCCAGCTGCACTAG
ATCGCCTCCAGCTCCACACCCCGCTGCCTACGGCGCGCCGACTCCGGCGTGCCAAATGAGGCGCTAACGCCACGCAGCGACACCAATTCGATCACGGAGAGTACCAATACCACATCGCCGCCGGAGCGTGCCCCCTCCGAGTCCTCCAGTGGCGTGCACTCGGGCGAGGAGCGTGAACTGGAAGTAATTATACGGCCGCGCGTCAGCTGCAAGGCACCGCCACGCCCGCCACAGCCGCCCATACAGGAGGAGCCCTACGGCCGCTGCACCAACATGCGCATGTCCAGCTTCAATGCTGACCCCGTAGCCGC--CGCCAGT-GTCATGAACAGCGCCACATTACCACTGCAGCGCAGCGCACCCGAGCAAAAGTTCGACTATACAGCCCACTGCAGCACCATGCCCCTGCCGGCGGGCTGTCACAGCCAGCAGCTCGCCAACGGCGGCGGGAGCAATAACAACAACGGCGGCTATGCCTCCACCTCGGCCATGACCAGCTCCATGGG------------GCCGCCGCCGCCGCCCTCGCAGGTGTCCACCTTCAAGACGCC---CAGCATGCATTATGCCAATGCAGCCGTGGCACTGG-----GCTCATCCTC-GCACGTGCCGCACACAACGCTGCCCAACGGCGTGCGCTACTCCAACCCGCATTTTCTGCGCCGTCTGCCGCACGTGAGCAAAGCTGCAGAATCGCCATATGGACACCTCGGCTATGGTGCCGCACATCACGCCTTTAGCAAGCTGCCGCACGAGACGCCACCGACCATACACGAGGATCGGGATTCAGCCAACTATTCCATGGCCTCGGATCAGGACTGTGGTCTCTATGTGACGGCTCAGCTGCACTAA
>CG12347 13732581 13732880|14046 chr3R 13732228 13732909 scaffold_3 1992768 1993557 - 7006|495 835
AGATACCCCACCGTGTCA--CAGCCAAATTGAAATTCCATTTGGCATTTGTTCC--------GAGTTGTTGGCCCATCTAGTTTCATTTTGCGTCCTGGCTTTCGCT----TCTGACCCACCCCAAAGTCCACAACTCTGCCCTTTTCGGTTCCCCTGTGTAAGTGGGTGTGTG---------------------TGTGTTTGTGTG------TGACATTTTGGCAGCAGTTCAACGGAAAAACGTTTGGCAGCACGGCCAGAAAATGATAAGCCTGGCCAGCGAGAAAGAAAAGCGGGTGGAAACAACCGAGGAATCGGTTCACTGAGTAAAATAAAAAT
-GACAGTTGATATTGTCAGTAAGCCAAATTGAAATTCTATTTCGAGTTCTTTTCTATGCCGAAAATTGTTAA---AAGTTTTTTCCCTTCACATTTTTGTGCTCATCGTGCTTTTACCTAAACCAGTGT--------------------ATGTCCGTGTGTGTGTGTGTGTGTAGAATATAGAAACATCTCTTTCTATGTATGTGTGACTCGGTGACATCTTGGCAAAGCTTCAAC---AAAACGTTTGGCAACGTGGCCAGCAAATGATAAGCCCAGGCAA-------------------GAGCCAACCCGTCA--CGGCTCACTGGGCAAAATAAAAAT
>cpo 13793677 13795193|14128 chr3R 13794183 13794294 scaffold_3 2072707 2072808 - 3213|0 111
TCTGGCCCAATACAAGCAACACCCACTTGGAAAATCCCCTGAAATAATGGTGCGCTACATCAACTGGCAGCTCGGGCGTAAGATTTTTGTGCGGCGCCCTTTGTTTTTGGCC
TCTAGCCCATTACCAATGCCACTTTCATGTGTAGAGCTGTG---------CGCGCTACATCAACCGGCAGCTCGGGCGTAACATTTT-GTGAACTGACTTTTGATTTTTCCC
>cpo 13793677 13795193|14129 chr3R 13794381 13794901 scaffold_3 2072878 2073499 - 5215|0 657
GTGTAAGTGG-CATGTGCA----------------ACCATTGGTGTTGCTACTGCTGTTGCAATGCGCTG----TTG--TTGCTTACATTTTGATTATGCGCCTTGTCTTATGCTACACATATTTCACGCTGCTTCCCTTTCATATTTCTTCGCAGCAGCGTGCCA-----------CGCGTAATCCACGCGGCACGTGCCCAACCACCCAACCCAT-CAGCCAACCACTGTACCACCCCACCCACCAAACCACC-------------------GACCACCCAT---------------CGTTTGCCTCGCTGCA-----CTGCCTTCATGTCAAGTGGTTACGTGGCCTTAC---ACGCACACAAAGGCCGTCGTTTGTGAGGAGGGGGTGGCTTAAAAA--------AAGGGGGGGGGTCTACCACTACTACC---------------------------GAGCGATGCGTTAAATTTGATTTTATCCTTGATAAAGAAATGCTCT-------TACTTTTGTTT---TACTCTACCCATTCC--AACTACGCTT----ATGGATTTTT--------ATGCGCGCGTAATTTTGG-GAAATTTATTGAAGTCCTATCGCACAGGTTTGCTGAATAGTTGGCAAGAGCTTAATGGCAT
ATGTAAGCGGGCATGTGCATCAGGCAGCTGAAGAGGCTGGCGGCGCTGGCTCTGCCGGAGGATTCGGCCAGCCTTTGGTTTACTTTGCTTTTGATTATGCGCCTTGTCATATGCTACACATTTTTCACGCTGCTTCTTTTTCAT-----TTGGCGGCGACTTCCCACTGAGCTACGGCGCGTTATCCG-ACGGCACGTGCCCAAGGTCCCCACCCACGCCCTAAATCACACTTAAACGCCCTCCTGTGAGCCCCCTCAGTGAGAGTGCATGTGTGAGTATATATATGTGTGTGAGTGTCTGTGTGTGTGTATGCATTTGTCTCCGCTCATGTCAAGT-GCTACGTGGCCTTTCTTAAAGCAGCCCAGGGC------------GCAGAGCCCAAACTCAAAGCATTCAGCAAGCGAGGCGCATTCACAAGACTCTCCTCCTTAGGCAACCTTTGCACGAATGGAAGCGATGCGTTAAATTTGATTTTATCCTTGATGTAT-AATGCTCTACTGCTCTGCTTTTGTTTGCGTCCTCAACCTTTGCCCTGATTATGTTTTTCAAAAAATATTTATAATGTGATGCACGCGAGATGTCAACTAAATTTATTTAAA----------------GGCTTAATAATGGCGCGCAACGCAATTGCAT
>cpo 13793677 13795193|14130 chr3R 13795052 13795317 scaffold_3 2073631 2073848 - 2727|0 144
TAGTACACGGAAATTCGCATTAAAAATGCATCAATCACTTGGTTCCCACTTGCTCCAGTCCACTCTCCGCAAGCCTCTGCATTTTCTGGCCAAAATGAAA---GGCAAGGAAAATCCAGGGCGGTGGAAGATAAAGTTGCACATG
TGCTTCCCCAAAAAGCGCATTAAAAATGCATCAATCACGTGCTTCCACTTTG-----------------------------------GGCTACAGTTGAAATTGCCAAG--------AGTGGAGCACAAGATAAAGATGAACACG
>cpo 13833113 13833753|14183 chr3R 13832738 13833887 scaffold_3 2122506 2123490 - 8819|396 1063
TTTAGCAAATTTGTATGAGCAATGCGACAAAAGAGAAAATGCCAGAAATATTTTCTCAGCGACAAGAGCAAATGAA----ACCTACACACAT--------AACATAAGAACTGTAAAGCA--CCCAATGAAAAAGTACTGAAACTACGAAA-----ATAACCAAAAT----ACTTGTATAC-TCGTATTGCCTGGCTTAAAT---ACCTTTAGGCCCCTGTTGCCGCTGCTCAAAAATCGAGCTTCGAGCTCCTTTTGCATCACCCAAAAATCAAAAATCACCAAACAAAAAACAAATGATAGCAAAACAAAATACGAACAAGCAAACAAACAAACAACGATCCACACGAACACGTGCTTGCATTTGAAAGAAAGAATCTTAAAATTCACCAAATCGCATTAAGTGTTTCCCTCTCTGTCTAGCCTTTGCTGTCCCGCTCTCTCTCTCTCTATGTATCTCTATCTATCTCTCCATTTCTGTCGTTCTATATATCTCTCTCTAACTTGCCATTGAGTTGTCTTATTGTTTTTGGTATCTGCATCCCTCCTATTATTTGCTCATTCTACGAAAACTCTTTGACACGCAGAGAACACAAATACACACGTAAACTGGTACACTCATCACAACCACACACACACACACACACCTACATCTCTGGCAAAAAAAA
TATA-CATATATAAATAAAATAATCGAT--------CAACACCAAAAA----TTCTTAGCAACGTCAGCAAAATAAAAAGACCTTCCCAAATGGCAATAAAACATACAAACTTTTCGGCGTTCCTAAAACATTTACACTTAGATTGTAAAGCACACAAAACCAAAACCAAAACTTGTACTCGTATTATTGCCTGGCTTACACTGAGCGTTAAGAACCGTAAGGCC----CTCAACAA----------------------------CAACAATCGTATCT---CAATCAATCCAC-AGTAACAACAAAA-ACAACAACAACAACTACAATAGCAAGATGTACTTTTC----ACACGTGCTTGCATTTT---GAAAGAACC------TTCACC------------GCATTTACATTTAAGTCTATCCTTACTTG-------------------------ATTTTTCTATCTTATTATTTTTGGTATTGCATCTCAATCTCAGAAA-------------------ACAATTCTTTCTTTCT-----CTTCCCCTTAATCTCTCGCTCT-------CTCTCTGTCTGTC-----ACACCATCACACAC--------ATATACACATTACACTCTCTCATATGTATACATAGC-------------------A
>cpo 13835834 13835872|14185 chr3R 13834352 13836302 scaffold_3 2123736 2125900 - 59958|1793 1831
CTAAATACAGACAAAGTAATGGAGCAGCCGATGCATCAA
CTAAATACAGACAAAGTAATGGAGCAGCCTATGCATCAA
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ACTCAAATGGCAAT---GCCACATCATCAGACAACTGCTACCGCTTTACATCCCAGCCAGCAGGCGGCCATGGCGCACATGGTCGCT---------GCTGCCGCTGCCGGCGGTGGTGGTAGTGCAG---CTGCTGCTGCGGCGCCTCAAGGCGCTGCGAGTAATGCCGCAGCTGCAGCTGCTGCTGCCGCCGCCGGCTGCTGCGGCCGCATCGCATCATCATTTTTTATCCAGTCCTGCGCTGGCCAGCCCCGCCGGCTCCACGAATAACGCCGCACACCCGGCAAATCCACAGATAGCCGCAAATGCGCCCTGCTCCACGCTGTTTGTGGCCAATCTGGGCCAGTTTGTGTCCGAGCACGAGCTCAAGGAGGTTTTCTCTAG
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CCAAGG--ACGGCAACTA---CAAACTGCAATACCAGCACCAGCAGCAGCAACAGCAACTCTGGCCAGCAACAACAACA----------------ACATCCGGTGGCTTTTATTGAGTTCAGCGATGCAACGAGCGCTGCTCAGGCCATGCAGCAGCTGCAGGGCAAGTATTTGCTCAGCTCGGACCGCGGCTCCATACGCATCGAGTATGCTAAGACCAAGATGCTCAACGAAATATCGCTCATGACTAGCAGCAAGACAGCAACGGCGGCAGCAGCAGCCGCCGCAGCAGCAGCAGCCGCAGCAACAGCA-CATCAACAACTTTTTATAT--TGAATGGCGGATTAAAGGTGCCACCGCCACCGCCGCATTTGGGGCATGTTAACAACACCAATATGCTCGTCACTGCACCA--ACAAACAGCACCACAGCACCAGCAGCACTACCAAATGCACCAACAGCACAACAGCAACAGCAACAGCAGCAGCAGCAGCAACAGCAGCAACAACTGCATCAGAACCACCAACAGCAGCAGCATCAGCAACAATTTCAACT-ACAGCAACAGCAACAGCAACTGCAGCAACTACAAGCGACCGCAGGTTGCACCAACACCAGCACCACTAGCGTTGTTGTTAACTCACTACAGCACCACCAACT---TCATCCAAATCAGCACCACCAAAATCATCTCTTTAGAGAC
>cpo 13837818 13837909|14186 chr3R 13836810 13838290 scaffold_3 2126669 2128420 - 26676|1184 1325
CAACA--------GCAGCAGCATCAACAGCAAGCA--------------------------ACAATCAAGCAACAATCAGCAACAACAAGTAAGAACCTACCTAAG---------GGAT-------GGCCAAAACCATATGA
CAACAGCTTTTTTGCAACAGCAGCAGCAGCAAAAATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAGGTTAAATAGGAGACGG-AGCTGTAGGAGAGTGCGGATTAAAGTTAAGAGAAGGATTGTTCGGGGATAGTGTTATATGG
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AGGAGCGGGTATGGAATCACGGCATGATTTGCTCGCTAAAAAGCTAGAGCGCGAAATGCAGCAACAGCAGACGCAAGTGCATCACCAGACGCAGCAGCAACAGCAGCAGCAGCAGCACCACCACACAGCAGCGCAGCACTACCACCACAGCCACCAGACAGCGCACCACCAGCAGCAGCAACAGCAGCACCACCAGCAGCAACAACAGCAACAGCAGCAGCAACAGCAACAGCAGGCACAGCAGCAGCACCTGAGCCACCACCACCACCACCATCATCACCATCAGCAGCAGTTCTTGATGACGCCGACAGCAACCTGACCTTATGCGACAACGACGACG-ACGACTACGACGCCGCCGC------ACCACCACCCACATCAGCTCCACCAGCCGCACCACCAACAGCAGCAGCAGCTGCAGCCG---------------CACCACATCTACTCGTACGTGCTGCCGGCAGTCAGTCACATAGCGGCCTGAG----------------------GTGGCCACA---------TTTGAGTTTGAGAAAATC-----------------GAGGCAAAGAAGCTCCGCATGCAACGGATTCATGCGAGAAGTAAGAACCTTTAGTTCTAGGCATACAAAAATAACAGAAAAAAAAATGTTGAAAAATCAAAAAAAAAAAACTAAAAACAAAACAAAAATGCAAAAAGAAGTTAATTTATATATATATATGACGGAGAGGAAGCAGCTGCCGCAGACCCGTGTATAACCCCAGTTTAGTGAAATTTTTCGACAGGC----------------------------------------AACAAAAGA----------------TTTGTAGTGAAAACCAAAAAACGG----GATAAACTTGTAGTAAAATATACAATTTACCATAGATCGA---AAGCTGAGCGAACTACTTAACTAAGTTAGTTGCAAATACAGCCGATATGCCCCCTATAAACGAATACACATATATACATACATAAACACCTATATATACATGCATATATATATAGCAA-----GCTGATCGAGAATTTGTTTGTTATTCAATATCCATTTAATGTTCTTTTGTAGCTTGATAAATTGATTTTGTTTGAAGTTTTTGTTTGTGAAATGTTTGCGTTCTTTTATTGTTACTTCTTACCCTACATTCAAAACCCCCCCCCCCCCCCCAAACATAAACGACTTTTCACACAAGGAATTGAGACAT----GAAATTCG---TATTAATCTC----ATAATTTCTA----------------ATTTTTCGA-TATATCAAACAGCGTAAGGGAATAAATTATGAA--------------------------CAAAAAGTGTAGGGAGAAAGAAAAGTATATAATTATAGCTTAACCGAATGTGCCCTTTAAATAGCTCTCTTTCTAGAATTATAAAAAAGTAATATGAAACAGAAAAAAA-----AAAACAACCAAAAGAAAACAATTTAAA--------TGTATGCATTAATGTAATAATTGTATAACTAGTAAGGTAAATTTTCAAAATGTTACTC------------------------AACAAGAAAATTCTACAAAACAAACC-------------------------------ACAACGAG---TAGTCGACGTCATCGTATAAATTTAAATTTATATTGAGGAATACTGAAGAAAGCTGGTTTCGAAATTTATTTGTTACAAACGTAAGCATAACAAAATTTAAATGTGAATTTCA
AGGAGCGGGTATGGAATCAAGGCATGATTTGCTCGCTAAGAAACTAGAGCGTGAAATGCACCAGCAACA---------GCAGCAACAACAACAGCAACAACAGCAGCAGCAACAGCAGCA----ACAGCAGCA-----------------------------ACAACAACAACATCAGCAGCAGGCACACCACCAGCCGCAGACGCATCATCAGCATTTCCATCAGAGCCACCAGCCGCCGCATCATCATCATCATCATCATCTTCAGCACCACCATCATCAACAGCAGCAGTTCTTGATGACACCAACAGCGACCTGACC-----CGGCAGCGCTAATGCACCACTA--ACGCCGCTGCCCCAATACCATCATCAGCAGCAACACCACCATCTGCAGCTGCAGCAGCAGCAGCAGCTACAGCAGCAACAACAACAACACCACCATATCTACTCGTATGTGTTGCCAGCGGCTACACATATCGCCGCCTAAGTGGTGCCGTGGTGCAGTGGCACGGGACGACAGGCGTACATTTTGAGTTTGAGCGGATCCCCCCTCCGCCCAGCATAGAGCAGTGAAGCTCCGCATGTGACGGATTCATGCAAAGGAGGCAAAACTTTAGTTGTA-GTATATAAAAA------AAAAAAAAAACTTAAAAAACGCAAAAAAAAATAT-----------------------------TTAATATATATATATATATT----------AATTTATATGGCAAGCCT-------AACCCAGTTTAGTGAAATTTTT-GACAGGCCGATGATATGTTGAGCGAAAATTGTAGGTACCAAAAATAAAACAAAAAACGGCAAAACAAAAAAGCTTAACAAGAAAAACAAAAACCAGCAAAGGGAATCTTGTAGTAAAATATACAACAAAAAATAGATCAGATTAGATTGAAAGA---ACTTAACTAG-------------ACAGTTGATATGCCCC---------AATAGATATATACATATGTGTATTAATATATATATATTTACATATTTATATGTCTATAAGCGCTGCTACAGA------TTTTTGATCCATTTTTAACTATGGTTGTT-------GCGATAATTTCCATTTAGCTTTTGTTTTCGAATTAGAACTAAATTCACTTTGGTTTAGCTTCATTTACCCTTTCATTTCGA-------------CCCTATTCATGAA-------------ATGGAATTGAGACATTGCAAGAATTTGATCTGTTACTTTTCTTAACAACCTTTATCCATTCATTAAAGACATTTTTAAAGTATAATAACAAAGTTAAGGGAATAACATAAAAAGGAGAAAACAAAAATACATATAAAATTGAAAAATGATAAAAAAAAAAAGAAAACATAATTATAGCTTAACCGAATGTGCCCTTTAAATAGCTCTCTTTCTAGAATTATTAAAAGACAA-AGAAAACGTTAAAGAATTACGAAAAACCCAAAAACAAAATCATCTGTATATGTGTGTATATGCATTAAAGTAAT-ATCTTGTATCTAGTAA--TACAGTTTTGATGTGTTATTTAAAGATAATGAAAGCTAATGAAAAAAAAAAAAAAAACAACAAACCAAAACAAAACCCACTCATACACACATAAAACATTTAACAACGAGAACTAGTCGGTGTCATCATATG---TAAAATCTATATTGAGAAAAACT---GAAAGCTGGTTTCGAAATTTATTTGTTATAAAAACGTACAT-------TTAAATTGTGAATTCGA
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ATGCCGCGCGACACGCTGCACTGAAATATATATTCAAGTGAAAAATGAAAATGTGAAAAACAA
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GAAACCAGAAAT----GCTGAA---------ACTGCTGGCACA---------GGACACTCCAAA---ACTTTCCGCCCAGAAC
GGAACCAGGAACTGTAGCTGGATCCGACACTACAGCTGGTATAATTAGTTTCAGACACTCTCGACACACTTTCCGCCCAAAAC
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CCCTACAAAGACTTGAACTTTTACTAG
CCGCATTAAGACTAGAAAATTGATAAG
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ATAGTGAGAAACTTTATTCCTAACCAACTTTC---GAAATGCTAGAACAATCA--AATCACATTTCTTGCT-------------------AAACCAACGATC--GATTTAATGGGGT
ACAAACAAAAAC---ATTCCTAACTCAATTTCAGAAAAATGCTAGAACAATCAACACACACATTTCTTGCTAAAAAATAAACAAAAACAAAAACCAACGAACCAGAGACAGCGGAGT
>cpo 13838870 13841516|14193 chr3R 13840835 13844620 scaffold_3 2132115 2136679 - 58499|0 893
ACGAGTAAATAAAATCAATGGCATATCATCTTACGTAGCAA----AGCATAAGTCGAG------CATGTATGTGTGACTAC---AAAAAGCGACAAATTC----------------TATTGTAACTAAATGCAAGAGCAGCAGAACAGCAGAAACCAAC--------TATAATTAATTATTATAAAAACAATGTAAAGCTTAAAGGCTAACAAC------------------------TATATATAGTTAAATACGAAAACAAATTGTA-AGCAAGCTTTTTACATCATAATTTTCGAATGG----------TTTTCGAAAGAGTTCG---------------TTCAGCCTTGTTTAAACCAATATAAGTATATATATATATACGGATAAAATCTTACATTT-----------------TTACCAAAGTTGTCCTTACTAATTAA-------ACAAGTTATGTTAACCAATTCACACACAATTTGTTAAACAAA--AACAG--AAGGAACCCACGAGTAA-ATCAACTAATTTTAAACGTTTTTTAAA--------GCTTAGTTTAGTGTAAACGTGACTAGACATACCAAAGGCATATTTGAAACAAAAACCACAGTTGTT--------AGAAGGAAATATGAAACAAAAA-----GAGAAACAT-TTAC-----------------TAATTGGTACTG---TTTTAGCCCTTTTTCCATACAAAT--------------TTTCTTTAAATATTTAATT-----------------------------ACATTATTTC-----------CCCGTCTAACTTTAGTCGAATGTAAAATGCATATTCCGTCCAATTACATTTCGTGCTTTCCTCTTGCCCAAAAAAAAAAAAAAA
ACGATTGA--AAAATCAGTAACATATCATCTTACGTAGCAGCAGTAGCAACAATTATGGAATTACATCTAT-TGTAACTAAGTGAAACAACTACAAGTACACTTATGCTAAGGCAATGTTATAGTTAAAAGCTAAAACAACTATTAGGCAACCATCAATAACACCAATACCAGCAACAGCAACAAAAACAA--CAAAACAAACAACCAAACAACAAAAGAAAAGGCAAGACATAGGCTTTTAAGTAGCTAATTAAAAAAAAAAAAAGAACGGCAAGCTCTAAACTATGAAAGAATAGAAAGAAAGAAGACATTTATCATCTGAATTGGCAGCCGTTTCAGTTTCTCAGCATTGTTTAAAT---TATAGGCATACGCGTATAT--TATTTAAAATTTACATTTTAAATTAAATTTTATAATTACCAAAGTTGTCCTTACTAAATAACATAAACCCGAATTACGTTAACCATTCCCCAC---ATTTGTTAAACAAACCAACAGCAAAATAATCTAATAATAATATAAAATAACAATAAAAATCTATTATATTTAATTTACTTAGTTAAGCTTAAA-ACAACTAGACATACCAAAGGCATATTTGAA---------ACATTTGTTGAAGCAAAAAAAAAAAAAAGGAAACAAAAATATATGAAAAATATGTTATGGCAATTATAATTGGCATAATTGGTAATGGATGTCCAGCGCATATT-TATAAAAATAATAATAATAATAATAATGTTGAATGTTAAATTTTCTACTTCTCATTTTGTCTACTTTCAACAATTTATTTCTTATGTAAAATTTCAATTGACTTTAGTCAAATGTAAAA-GCATACTCCGTCCAATTACATTTCTTGC-TTACTCTTGCCT----ATCATTATTAT
>DNaseII 13846795 13846883|14197 chr3R 13845796 13846867 scaffold_3 2138237 2139307 - 42446|1001 1073
AATCTGAACTAACTAAGACTATTTGTAAAGTTGCGTCAACAATTAAATAAACACCATTTTTGCATTACATTTA
ATGATGCCCAATAAAAATTTATTTCCCAATCTATATCGTAATCTGGATAAATTTAAATTTAGAAAAAGCTTTA
>DNaseII 13846795 13846883|14198 chr3R 13846868 13847262 scaffold_22 619288 619708 - 1522|0 15
ATGCATAAGAAAATTG
GAATTGAAAACAACTG
>CG7785 13848550 13849413|14200 chr3R 13847759 13848589 scaffold_3 2140452 2141311 - 35981|844 890
ATAGTCCACACAAAA------GCCTTGAAC-AAATTAGCAGCATGAG
AGCATCGGCTCAAAGTCACATGCCATGAACAAAATAAGCAGGCTAAG
>CG7785 13848550 13849413|14201 chr3R 13848804 13848982 scaffold_22 619961 620141 - 1867|0 185
TTAAAATGCGAACTTTCAGTATAAAACAAATTATTTAC-ACATTTTAGTTTTAGTTTTAGT---TATTCCTTTGCCATATTTCTTCTCTAGTCAAAAAGAAAAGTTCCCAAGCTGAATTCTATCTCACAACCAAAACAGCTATTAAATTATTT---CAATTTACTTTGTACACATATCTTAATCGA
TTGAAATTCAAAATCAGTTTATTATACGTGTTTCTTACTATATCTATCTGTCTTTCTCAGTGTATACTATCTTGTTATTGTTTTTGTTTAATCCACCAAAGAAGTATCCAAGCTCAATGTGTGCTCA-----ATAATACCTTCCATATTATTTTTACAATTTGCAATTTGTACAAAGCAAAAACGA
>CG7785 13848550 13849413|14202 chr3R 13849102 13849408 scaffold_3 2141973 2142273 - 5589|0 330
AGTATTTGTATAATTTTATTAATGTTTTGTAAATTATT--TACGTAGCTTGACGTAGCA-----TTTGTATTATACACAGAGATACGCGTATCTGCATACAGATACAGATGAATTTTTTTGTAGGAC----------TAGGTGGCCACAATTCAA----TTCTGACTTCATCGTAC-ACATTCCAATTTACAACGGCAACGTACTCGAGCACGGAA-TTACCTAACTAAATATA-AGAATATATCTGTATATCTAATAAATTGTATCTACACGTATCCAACGCTTCGAAAACTGATTAATCCGCGCGCGGACAATAAATCAATGTTATGTA
ATTATTTCCATTTTTTAATGTATGTTTTGTAAATGATTAAGACGTAGCTAGAACTTGCGACTGCTTTGTATAATACACCACTCTATAGA---CTATATTATAATAAATATTAAATTTTCTTTCGTACATTCCTATTATACAAAACCAAAAAAAAAAATCTATAAAAGTTATCGCACTATAGTCGAACTTT--------ATGCACTCGAGCACGGAAATTATCTAACTATATATGTACACTATATTTAAGGATCT------------------GTACTTAACGCTTTGAAAACTGACTTATCCGCGCGCGGACAAT-AATGAATGTTATGTA
>CG7794 13851022 13851100|14203 chr3R 13849434 13851876 scaffold_3 2142371 2144868 - 92168|1678 1756
AGTGTGCTCTGTATCTGACCCTTTCGTCTGCATTTTTGAATCAACGAAATTTTAATAAATTTAACGTATTGAATATTTT
TGTGTGCCTTGTCTTTTAATGCCTGG---------------------------AATAAATCCAAAATTTGGTGTATTT-
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AGACTAGAGAACTCGGCATCCAGCGTTGA--CCAGGCCCAGACTCCAACTCCAACACCAGCTCCGGCTGCAACACAGAAAGTTAGTCTGGCCCTGGCTCTGGATCTCGACGAGAGCGCCTTTCCCTTCGA------GCTGACATCCGACTATGGCACCCTGTCGCCGCTCACCAGTCCCAGGCAGTTCAATTACGTTTGGGTTGGCCAGGACTCCAGTCAGCCCTTCTTCTACA---AGGACAACGTCAGC-----------------------GTCCAGGAGAAGTAGAGCTCATCCGGAAGGCAAGCCGTCGAGTGGAATCAATCGCTGATGCTGAAT---------------------------------------------------AATCACTTAGTGTATACTTAAACGGTAGTCGTAGGAA--CGGGGTTGTGCTAACAGCAAAATCTATGCAAGACATTAAATAGTAAAGAAGATACAATATGCTACAGTTAGCCTAGATAATATTTCACACATCCAAGAATGGTCAGGATAGGAAATCGAGATATCGAGTAATCATGAAATTAAGAGAATCAA
ACCGCAGCGAACTCAACGTCTTCGATTGATTCCAGCAGTGGGCGAGAGCT-----ATTGGCCTACGATG---AATTGGGCATCAATCTGGACCTGGCCGTGGACATTGATGCGAGCCCGCTGCCCTTTGAGCTAGCGCTGACCTCCGATTATGGAACACTCTCACCGCTGACCAGCCCGCGGCAGTTCAACTATGTGCTGGTCAGTCCGGACTCGAGCGAGCTGCTCCTGTGCACTCAGGATTCGCTTAGCCAAGGCCTTTAAATTTGCAACAGATACAATAAAAATTCAATATATCTACCAATTAATATCTATGCAGGAGTCAATCGCTGATGCTGAATTTAAACAAACAAAAAAGGGTATAAACAAACGTTTAGTAAACTCACGCCACAAATAATTAGCTAAATAGTTAAAAAATTGTAGCCGTAATTTTGGGTTGTGCTAGAAGCAACATCTACGCAAGAC----------------------ATATGTGAAACATAGCCTATATCAAAATAACTCCAGCCGCAA-----CAAGCTGAGCAGCCA------CAAGTAAAAAAAAAA--AAAAACATAAA
>sr 13958204 13959471|14323 chr3R 13958699 13958933 scaffold_15 1424255 1424488 + 1601|0 246
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GGGGTCAAACAAAAATAATAAAAACTGGCAAACCTTTTTGGGCCGCAGCAAAGCCAAACAACAAATTAACAATGAGATTTGCCGTAATTCATTTGGCTGAGCATCTTTAGCTTGTCTCTC----------ATCTTTTTGGCATTTTTAATTGAGTTTTATGCC---AATTAAATGTAATTTTCTACTCATTCGCATTCGCATTCGCATTCTCATTCTCTTTGGCTTAGTCGTAGGCAGTCTTCATTT
>sr 13958204 13959471|14324 chr3R 13958934 13959490 scaffold_368 631 1242 + 7369|0 639
TTTAAAAATGCTAACACAAACGAAACACACAAACACTAATTTATT--------GCATTTTAAAATAATTATACATATACGTAATATGTATATCTATTATAATTATTAACTTATTATCTTAGAGGTTTAGATTTAGGTTTTAACATACAGAATACACGAAAACGAACACACACA-------------------------------AATCTTAGCATATCAGTTTTTCCTCTAAGCATTATAAATTGCATAAG---------TTCAAAACAAAAGTTACA---TTTAAAATCGGTAAATGGAATTTTCGTGTGCTAAAAAACGAGAAACTTGTTTAACGGAAACGGAAACGACGAA--------AAAACTTAAAATTGAAAAATGAA----------------CCCAGTGTACTTCCTTAATTGATTCGAAATCAAAACGGCAAATGAAAATGAAATGTTATTATACATTATAAATACATATAT---------TTATCTTGAATACGTTTATGTTCAATCT-----------ACTGTAGAAAAGAAATTTCTTCTTAGTTCGTAATGGT---TTATTTTAAGTTTAAGT----AATTTTTATATTTTTAGTTTACTTTACCTTGCAAAATATATAACAATTT
AAATGAAAACACAATATAAGTCTAACACAAGAA-ACTAATTTATTGCAGTTAAGCATTTTAAA---------------------------GTCTATTATTA--ACTTATTTAGCATCTTAGTGGTT--------AGGTTTAACACACACAG-ACACTGAAACACACCCAGACACACATTGAAAAAGATAAAGAAAATTAAAATTAACTTTAGCATATCA--TTTTTGTATAAGCATAAGAAATAAAAGCAGCCATTTTTGTGCATGTCATAAGTTACAGAACTTAAGAACT-TAAGTTGAACGTGTGTTAGGTAAAGGAATTAAAGCTTGTGCAAC--AAATTATAATTATTAATTATAATTAAAAAATATAATTACAATGTGAATGACGTGTTGAAAATGCCCCTTGTACTTCCTTAATTGATTCGAAATCAAA--GGCAACAAAAATCTAAATTTAATT-TCCAAAACAAATAAATAAATAAATAAAAATCATTTAAATTAAGTTTCTGTATATCACAAACAAATAAGAATATATATAATATATATTTTATTAGTTGTTAGTTTTAAATTGCTTTAGTTTTAAGTTGAAACCTTTTTTATAATTAGCTTATTTTATTTTCGAAAATATATAACAATTT
>Cbp20 13991095 13991161|14359 chr3R 13990443 13994747 scaffold_3 2300016 2303969 - 74308|664 731
TTATTAGATAAAATGACTGTAAAGACTATAAGCCCCCCAATTAGATATTAAA-GCATACCCCTTAGAC
AGATAAGATCAACC--CTTTAG-------------CCCAACTAGATATTAAACAAAAAACCATTAAGC
>PP2A-B' 14002816 14002963|14373 chr3R 14000691 14003044 scaffold_3 2308564 2310895 - 95663|2214 2415
T------CCGCCACG-----------TGTGATCCTG----------------GCGTCGCTGTGAGC-TGTGC-----CCAGCTAAGGC-----CCACTCTGTTTCAACTCTAATTCTA------ATCGAACGAATGTCTGTT----AAAATAATCACACTCATGTCATTTAAAAAAAAAAAAATACATATTTGTATATCTTT
CTGAACACAGCCACACACCAGCGTACTGTGTACGTGTCCGAGAAAAGTGTGTGTGTGTTTGTGTGCTTGTGCGTCAGCCAGCTAATCCTTCAACCAC-CTGTCTTAACACGAATCGTACGAACGAACGAACGAATGCCTGTTGCAAACAATAATCGCACTCGTGTCAGTT--------ATAAATACATGTTTCTGTATCTGT
>CG7940 14013547 14013594|14377 chr3R 14011507 14014416 scaffold_3 2319972 2322820 - 133649|2060 2107
CATTTATTTGAAAGCACCGAAAAATACATGTAGACGCTTAAAAAAGAA
ATTTTATTGTTAAATTTCCAAATA---ATGTCCACAATTAAAAGAGTA
>MED17 14016915 14016987|14378 chr3R 14014792 14016995 scaffold_3 2322891 2325178 - 114524|2250 2322
AAACCCGTCACATGCATACCCACTAGATTGTAAATCAAATTAGAATTAATTAAAGTAAAAAAATTTGTAATTT
AAGACCCACACAC---------TTTAATTGTCTAGCA---TAGTATTTATAATTATAAAAAA---TGTTATTC
>CG7985 14040311 14040320|14400 chr3R 14038922 14040726 scaffold_3 2356606 2358266 - 77975|1404 1413
GAGGCGCCAG
CAGCAGC---
>CG7985 14040388 14040729|14400 chr3R 14038922 14040726 scaffold_3 2356606 2358266 - 77975|1481 1825
CCAAAATCTGACAATTGGCCTCGGGCCAAATATGAGTTACATTGCTTTAATGGACTAATCGCCAACTGGCTGGCAGTTCCTGC---TCCGGATCTTAATCTACTCGCATAGTGATGGCGTTCGAAACGCCC-AAGCCCAGCATCTTGTGGCTTATAAGCCAGGATAATACGAATGTTAACAGCAGCAGCGGCTTCTCGGCCCAAAATACATACATAATGGTAGCATTAGCCACTTGTAATACTAATAACATCAAATGTTCATTTTTTC--TAGACTACTTTGTAAGCAGCGGCTCAATTATACAAACATAGAACATATTCATACTGTAATAAAAAATAAATCAAA
-------------------------------ATGAGTTATA------------ACTGGTTGTTAAC-AGTTGGGAGCACATACACATACATATTTT-----------GTAGTCAAGGCGTTCCAAACGCCCTAAGCCC-------TATGGATAATA------------ACAAATGTTATCA-CCGCTGCGGCATTTCTG-------------------------GATAGCAATTCGTAGT-----TAACATCAAATGTTCATTCTGCCAATATGTCAGTTTATAA------GCTCAATTAATCATACATACTCCATATTA--ACTTTACT--AACATAAATCAAA
>CG7985 14040388 14040729|14401 chr3R 14040727 14041011 scaffold_81 147270 147574 - 4195|0 2
AAA
AAA
>CG14314 14043603 14043741|14403 chr3R 14042199 14043879 scaffold_3 2358870 2360600 - 67583|1463 1613
GCCACCCTGCAATCGAAATGGAACACTAGCTGTCAGCCCAAAACACCAATTTCGAACAATACACCGTGCTCCAGTTG--ATGCTCACTT--AACCCTTAGTTATATGTATGCAAGATAGTAAAAATT-ATCAGTAACTT-------AGCAA
GCCAGAGCACAACTGGAA-GCCCGATTAGATCT-AGTCTATGCCACATAATTAGAGTTTTA-GTTATGCTCGGTTTGCAGTATTTATTTTGAACCTGTAGCCTCTTATATAAAAGATAATTTAGGTTAATTAACAACGTTTATGCCCACAA
>CG7988 14047174 14047199|14404 chr3R 14044122 14047299 scaffold_3 2360601 2363856 - 107242|3219 3258
ATGATCATAGCGTTGGACTTT--------------TAAAC
AGGATCATAGC--TAAACTTTTGTGTGCCACGGAATAAAC
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--TTTTAGTTGTAATAAATTGGTCCTGATTAAATT
GGTTGTAGTTGCAATAAATTGGTCCAGCTTAAAAT
>CG7998 14054222 14054428|14408 chr3R 14053406 14054380 scaffold_42 12197 13229 - 54048|821 1043
GCGATCCAACAAATC----CCATCCGCTACCAAA-----------------------------AAATCGTGTACTTCATTAG------------CGCCTATTGTGAATTGGCAAACTACCCATACTACCCCTAGCAAATCT-TTCGTCTCAAGTCG-----------------GCGTGTCCCAAGATTATATAGATCTGCGCCTAGTGT-GTGGTGTAAAATG
GCTGAACACTGCTTCGCAGCTATCCACTAGCCAGTCAATCAGTCAATCAGTCAATCAATCCCCCAATTGTTTCCATCATTAGTTATCATTTAGCCTTCATTTGTGCATTGGTTACTTA-----------CTTAGCAAATTTGGTCGTCTTAAGTTGAAAAGTGTAAAGCATTCGTGTGTCCAAAGATTAAACAGCCAAGTGCTCATCATCCTTATAAATAATG
>CG7998 14054222 14054428|14409 chr3R 14054381 14056205 scaffold_42 13512 15241 - 16924|0 47
AAACCAGTTGATATCTGAAATAAATAAATTGTAAACTTGGAAAAAAGG
AAACAAGCCCATTTCGGGAATTATAAAGTGGAAGATTAGGAA------
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GAGAAATGCTCACACACCGGCGACAGCAACAACA--------CCAGCGACGCTG-----GGCCACGCC--CATCAGCACGCCGAACGCCCGTTTCCGTCGGCCATTTTGAAGGGATGGAGGCGTGGCGTGTGCAGCATTTCCAACTGTGTTTCTCCGACTGAAAGTGGGGCTC
GAGAAATGCTCACACATCGACGTCGGCAGCAGCGTCCCTCTGCCTCTGTCGCTGCCTTTGCCTCTGCCAGCGTTTACGCAGCAGCAGCACGCTTTAAGCGGCCATTTTGAGTTCTTTTTTTTTTGGCGTG-----CCTTTGCATGCGTGTGTGTGTGTGTAAGAGAAATGCTC
>repo 14064473 14065326|14419 chr3R 14064705 14068045 scaffold_42 24305 27558 - 87765|0 698
TTTCAAAAAATTTGGCGAGAGTCCACAAATTT------------TATATTTAATTTGATAATATTGTTTTTTTAGTTTAT----------------ATTTCCAATCCCTTGGAGTTTTTCTAGCCAGTCCCACACA-------------GTTTCTAGCCACTGTTTTCATATTGCCATAGGTTCCTT-TTAGGTTTAATGACGCA----AGTTG--CAACAACAACGGAATCCACAAGTCTTGCCAAATCATAATG--AGGTTATTATGCCTGTCTAAGTCTAGGTTAATCTAGGGCTAGGGGCTCTGCAACGAGAGCCCCGCCCCCAGAATGCATTCCAAATGTGCCTTACCAAAACGGGTGACGAGTGACCTCCCTCCAAATTGGAAAGCTTCGTTGCCCAACAAACTTAGTTT--TAGTTATTCTACTCGTAGACTAAGTTCCATTTGCTGT----------TTTTGCTGTAGTTAGACAATAAAGTGCTTTTTATATTGTATACTAGCTCATTTGGCTTTACAAATTTTATTACTTACTAATTTTGTAAAATGGCTTGCAAATTTTGTTACAACTACATTCAATTTAGTT---TAATTTCTAATTGTAA---------GCAAT-TACATAAACTAGGACACTTTGCAAATGTATATA-ATAGACGTATAAATAAATCGTATTTTGTACCAA-TAA
TTTCAAACAGT---GCTAGAAAATGTGGATCTACGCAGCAGCAGCACACTTTAAGTGGCCATTTTGAGTTCTTTTTTTATTGCGTGCGTGTGCAGCATTTCAAA--CAGTCAAACAGTGCTAGAAAATGCCAAATATATAGAAAATGTGGATCACAGCCAGTGTT-----GTTGGCATTGGTTCCTTGTTACATTTAA--GCGTAGTTTAGTTGACCGACAACAACAAAATCGACAAGTCTTGCCACAACTTAATGCTAATTTATTA-----GTCTTAGTTTCCAA-AACAAAAAGCTGTTGGCCATTTGCATTGGCCAACACGTACGGAATGCATTCCAAATGTGCCTTATTAGCA---GCGGCCAGCAGCATGAGGCAAAATC---CAATTTGGTTTTGTCTCAACTCTGGCCCAATAATTAATCGCCTAGTTG--TATGTATAAATTGATGTATATCAAAAACTGTTGTGTAGTTAGACAATAAAGTGTTTGTATGTTTGTATAAT-GTTAATAC--TTATGCATACTTTTGTAATTTAGAGCTTCGAGTAGCTGCTT-CAAGTTTTCATATATATAAGTTTAGCTCGTTTGCCTAGAATCTAAATACAATTACAATTTGCAATGTATATATACATAGAGTTAATAATAATACATTTATATTAAAGAATAAAGCAA-CATATTTTGTACCAAACAA
>14-3-3epsilon 14074011 14074388|14425 chr3R 14072987 14074404 scaffold_42 32286 33778 - 66134|1057 1535
TTTAAGTAAACCCCCGCCCTTCCATTTAAAAC--------------------------------------------------------------ACATTATATACCTTCTAAAGTAAATATAATACCATATAATATATATGCATACAACAACAACAACAA-------------AATCAACAAC---------AACACGACAACAACTTCAAGAACAACAACATGGAACCA-ATGCGGCAACAACAACCATA----GCAGTCGATCACCACAA-----CAGCAGCACCCGTATGTGTATCAACATATTTGCAACATGATAACAGCAAGCAAAGCAGCAGGAACACAAATTGTCATCCACAATAAACAGCATGGAAAACAACAGCACAAAAACAGAAAAAAAAAACAACTATCCAAGCAAAATGTTTGA----AAATTGGGCGGCCTG--GTGGGCGT-GGCGCGGCTGTTGCTGCGGCC-
TTTAAGTAAACCCCCGCCCTTCCATTTAAAACAAAACAAAACAAAAAAAAAAACAAACAAAACAAAACAAAAAAACAAACACAAAACAAAAACAAAAACATATACCTTCTAAAGTAAATATAATA-CATATAATATATATGCATACAACAATAAAAACAACACGCAACCGGGTAGTAAACAACAAGTAAAAAAAAACAACAGCAACAACAAGAACAGCATCTGGCAACAAGAATCAACAGCAACAACGATAAGCGACAACCAACTACTAAAAAGGGGCAGCAGCA---------GCAACAACA-----ACAACA--ACAAGAACAAGAAGAACATCAAGAGCAACTA-CAACAACAGCAGCAAGTAGCATGAAAAAC-ACATAACAAAAACA-ACAACAACAACAATTACAACAGCAAAAAACGCGACACGAAACTGAAGGGGCTATCGTGGGCGTGGGCGTGGCTGTGGCTGCTGTTG
>CG18598 14077201 14077262|14428 chr3R 14076594 14078425 scaffold_42 36159 38017 - 78326|669 740
AG---------TAGAAATCAATATAGAT-CAGTTTCAGTCCATTGTATTACAAATATATGAATTACACTTCA
GGCCATTTTCCTGCGAATCAAAATGGACACCAATAAAGAACATTGCAG-AAAATGATATGAA----------
>CG18599 14096824 14096895|14447 chr3R 14096530 14096914 scaffold_42 57501 57876 - 12460|311 382
AAACCACGCCAGTGCAAAGCAAGTTTCCTGTAAATATAGTCAAATAAATATGTACAATATCGGTTTTCTATA
ACA----ATCTGTGCGCAGCC--TCAATTGTAAATATAGCGAAATAAATATGTACAATATGCAATTATTTAA
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TTAACAAGAAACAAAGTGGCGCCGGGTGGGACGACGACGACGGCGGGAGCGTCTGGAACGTCTGTCTCGGCAGCAGCACCAGCAGAAGCGGAATCAGTTCGAGAATAGTAGGGAATTTAATCAATT-GTAAAAAGCAGAAAGCCGGTAGCCCCGAGTCCTGTTCGAAGTCATAGCCAACATCCAATCTAATCCAATCCTAAACATTTATCCG-GCATCCACAAAGCGGCGCAGCGGCAGTTA----------------AATTGCGAAACCAAACCTATAGTATCAGTTCATTTATAGCCATTT-------TTAATGTTCTAATCTACT----CTGAAATTGTTTTATTCCGAAAATCCAAATTGAAACGGTTTGATTTATGGCCGCCTTA----------AACAACAAAT------TATTAATTACAAATAGTAGAACTGTTACGCTGT--------------------------------GCAAGAAATGGAACATTGCGAA
TTAACAAGCAATAAAA--GCGCAG-------------------------------------------CAACAGAAACAGCAGCAGCTGCCGAGTCGGTTCAGGAATAG---GGAATTAAATAAATTTGTAAAAAGTCAACAGCCCTCCCCGCCAACACCCACCCG----CACCACACACACCCGTACACACACACACACACACACACACACACATATACCAAAAGCAGCGCAGTGACAGACAGCTGAGAGCGATAAGGAAGTGACAAGCCAAACC------ATTCATTCAGAAATAAACCTTTAGAAATTTTAACGTTGCTTTCTAATACAATTCAAACTTTTCAATTCGGATG--CCAAACTCAAATTATTCGCCTTTCAACCGCAATGTTCAATTAACAACAACAAAAAAAACATGTTAAACA-AAATAGTAGAACTTTTATA-TATAAAACGAAAAAAAAAGAAAAGAAAAGAAAACGGAAACAAATGCAACAATGCGAA
>eIF-1A 14107659 14108206|14455 chr3R 14108085 14108278 scaffold_42 65961 66160 - 2091|0 137
ACATAAACTAATAATATTTGAATTAAAAACGAAAAAACAA-AGAAAAACAAACGGATATTAGTTATTATTTATCTACCAACAAATCTATCCAA--------CTAAATGAAAA-------AGTAAAAAAAAAAAATAAA
ACACAGACAATCAACGTTATGATTAAAAACGAATAAACAATAAAAATACATA---ATAAAAGCCGTTAACAAAGCAGC-ACAAATTTGCCGAAAATAGAAGCAAAACAAAAAGCAGCCGAAAAAAGAGACAAAATAAA
>CG8064 14112289 14112351|14457 chr3R 14109404 14113291 scaffold_15 1319539 1323403 - 178990|2924 2993
GACGCA---ATACCCTAGA--CTTAGTTGTAT--AAATCCAATTAAAACGATTAGTTATTCCGTGATTTA
AACACGTTTATAGGATAGGACTTTAATTTTACCAAAATCGAATCAATAAAAATACAT---------TTTA
>Dlc90F 14125480 14125764|14469 chr3R 14125031 14125553 scaffold_27 1053282 1053787 + 26180|455 528
AGTGGAGGAATGGCAGGACTGCCGGAATTCGCGATGAAGATGACTTAAAAGGGGGAGGGACTAACAAGATTGCC
---GGCCAAAAATCAAGAACACACAAATC----ATTAACA--ACATCAATGGGGGAGGGATTAACAAGATTGCC
>Dlc90F 14125480 14125764|14470 chr3R 14125725 14127499 scaffold_27 1053992 1055810 + 40446|0 41
ATTTTCAA--TCTAAAAACGTAAATAAAAAGTGTATAATACC
ATTGTCAAATTCTAAGAATGCAACAAACA-------CATACA
>CG7669 14189906 14190007|14554 chr3R 14187201 14191492 scaffold_27 1122707 1126755 + 64135|2934 3049
CGCCTCCACAGGCAGCTCCAACTGTGTTCATTAA----------GTAATT--AAAAGTGTTTAT--GCGAATTTACAAAATTAAAATTTATTGCAAGTTGAAAAGTGTAAAAAGCT
-------ACGCGCATCT--------GTTCATTAATATAATTATTATAATTTCAGAAATGTTAAAAAGCGAATTTACCAAATTAAAATTTAATGCAAGTTAAGAGCTGTA-------
>CG7671 14193584 14193637|14557 chr3R 14191705 14193625 scaffold_27 1126756 1128561 + 38543|1921 1967
ATGTCAAGCCTTTTGAATTCCT----TACCTAAATTATA-TAATATT
ACAT------TTCTCGATTTCTACTGCATTTAAAATACATTTATACT
>CG7671 14193584 14193637|14558 chr3R 14193626 14193836 scaffold_27 1128939 1129112 + 3996|0 11
TCAATTGTTGAA
TCAATTTT--AA
>CG31232 14230168 14230343|14585 chr3R 14229141 14230236 scaffold_11 916256 917436 + 44589|1123 1192
TCGCTGAGAGAGACTGCCA-AAACCATTCCTTCTGCCATCTGAACTTATTTATTTTCCCCTCGCCACCTC
--ACCAACCACGACCGCAACGCATCATTGTTATCAACAATTGGCC--ATTTTTGACCTACTCGCCATTCC
>CG7685 14231530 14231726|14587 chr3R 14231192 14233970 scaffold_27 1163706 1166352 + 52262|340 566
T----------CGCAGGCCGACGGGACCCCGTTCCCACTCCCATTCCTCTTCCATCTCCTCCACCTGTGCACCTAGGACACCAATCTCAAGGATGAAGATGTCGG-----GCGGCGCATCACAAGCGATATTTTTTG---------------TACGAGTACAATAGAATTGTAATTTATTTTAAAATAAGTAGATTGAATAAAAGAAACGAATTCCAAGAAACACAA
CTTTTCATTGGTGCAGCTAAGCAGACCACCGGGCGCA---GAACTCCACTTCTATCTCATACGC-------------------ATCTCAAAGATTACTCTGTTAGTGTTAAAATCGCATCACAAAACATATTTTTTGTAGAACATTTTTGATTACGATTACGATAAACTTGTAATTTATT-----------------AAAAAAAAAAAAGAA----GAAAAAAACTA
>fray 14414091 14415175|14831 chr3R 14411830 14415035 scaffold_27 1392911 1395965 + 98685|2437 3439
TGATCTGCCACGGAGCATGCATCACAGCCAACACAACCCATCACAAGAGCATCCCAAACACCAACACCTTCCCTAGCACCATCCCTAGAAAACCAAGCCAGTCTGATGATGATACGTAAGGCCAGGAGGGTAGGGTTCGGGATCATGGATTTTCCCGACTGGAGCCGTTTCTGTTTGCTGCTTTTAGCACTAGACTAGAAC--------TAACTGTATATGCTAGTG------ATAGATCTT--------------AACGCGAGCCGATCGTTTACCACATAGAGAAACTATCTATACACACGGTATATATGCTAAACAGGATGGGTCGATTTCAACTGATATATTGATATATTTACTATTCTGCTTAAAGTTTTTTTCAATTGGTAACCCCCTATAGTGATCTAAATTGTACTACAACTTTAATATTAAATACTGCAAATTGTTCTTGGGATTTTATATATGCTACCATGGAAATCGGCCCGCCCTGGATTTGTATATATGCTTTACGTACTATATAAATCCTATGCGCATTGTAATTAACCCATGTGCCCAGCCCACTTTTCCCTCGCCCCGCTAAAGTAATTGAAGAATCGTGTACTTATTCGTTTCGTTTGTCTTTAAGTAGCTC-----TGTACATACACCCCACACGTATATATATATAT---------------ATATATTGTATGTCTATATATATATATAGCTCT---------TGGTTTTAATTAGCCCACTGAAATCAGTAGATCCTGATGTAGTAGTCCTGCC-TTTATTTATCATTTACCAATCGCTCACCCGCCAGGCGTCTTTAATTTATTCTCTAGCAATTTAAACTACTAATTTTTAAATCGTAGCGCCTAAGTCTTGTTTTTGTTTTACTCTTATTATTTTGTATTTTATTTTATCATTAATTACCACTACTCTGAATACCTACACTAAATGATGTATGAGTTTTCCGATAAGATCGCAAAGGATTTAAACTTAAGTGAGGCCAG
------GACACGGAGTTGG----------------------------------------------------CCTAGTGCCA-----------------CAGTTCGTTGGGAACCC---------------TACGGTCTACCGTTATA-------TCGCCT-GCGCCGCTT-------------TTAGCTATAGACTAGAACTAGTACTATAACTGTAAATGCTAATGCTAGTTATAGATCTGAAGAAAGAAAGAAAAACGCAAGCCGTTCGTTTAC----TATAGAAAT-----------------TATATACCTAATACGAT-----------AATAGCTATATGTAACTATCTCTATCTCTATCTA---------------------TCTATCTATCTATCTA---------------TCTATCTTTCGTTCTGCGCATTGTAATT---ACATCATACCTCCTCCC---------------CCCCGCGTTCCTACCT---------------------CCCGAAACCTGCCGTAGTTAGTCGCAGCACCCA-------------------CGCTAAA-----TCGAAAATCGTGTACTTATTTGTTAATTTTCTGCATATATAGTTCATATATATATATATAAACAATATATTTATGTATGTATTTTACACTTCCTACAATATCACGTATATATATATATATATATATATATATATATATATGTATTTAAACAACATCATCATATATGTAAATT----TGTAGCGG--CTACTATTTAGTCCCCATTTG----------------CGGGCATCTTTAATTTATTCTCTAGCGTTCTAAACTA-----GTTTAAGTTGTAA--------------------------------------------GTTTTGTCCCCCCGCGCCACCCTCCATACTACCCACGTAAAAC----TTTAAGT----CGATTGATTTGTTCAGGTGGTACAGTT--GTGTCGCCAG
>fray 14414091 14415175|14832 chr3R 14415074 14416561 scaffold_27 1396005 1397753 + 17247|0 114
CTGTAAAACTACCTTGAAGTAAATCGTAAATCAATTACTTTAAA----------AATGAATAATTTTAAAC---TTCGTATAGTAAAAAAGGAAAATTACAAAAAAATAGAAACG
CTGCAAAAA-AGATTGTATTTAATTGTTCATGAAGTACAGTAAAACCTACATCTAATGAATA--TTAAAACACATACTTATAGCATATAAAGTAAACAACAACAAGAAAACGAAG
>CG14305 14425596 14425819|14843 chr3R 14424450 14426089 scaffold_1669 4 1594 + 49925|1184 1437
AACTGACTGCAAGTTTG-----------------------CAAAATCTCTGAAGCCACTCATCACTGAGAATCCTATGAGCACTTGCACGCATAGCGCGTTGGTTTCACAGATATGTGTAAATTGGAATGGTTCCT-------CAGAAATTCAATGGTATTTTTTCAGAAAGATATATCTTTCAACTGTCTGAATCCCATCACCCACTTTTTATTTTGTATGGTATTAATAAAAAACCAAATGGTGAAGTATTT
-ACTTAATGAAAGTGTGGTCATTATATTTTGAATTGGAAACAGAGCTTCATAAG-TATTCATCAGATAGTCAGGTGTGAGCTATTCCATTTCCAACTATGTGTATACATATGTCTATATATATGTGTATGTATAATATATATATATATATGTATATGTATCTATATATATTCATAGTTAGTTGAATTGTTAGGTATACCCTACACTACTTACACTAAATGAGGAATAAATTAA-----AAATTGTCAAGCGTCT
>CG14303 14475409 14475859|14904 chr3R 14473481 14480858 scaffold_27 1464228 1472230 + 220652|2018 2598
GGCTACGA--------------CTAAAGCCGCATATGATGTAAGCCATTTTCAGTTTCTATTTATTCATTAGTTTACTCCTATGCTACATAAATGAATATGTATGTTTTACTTCATATTTTAAGTTTCAGATGTTATAAAAAACACGAAATA-TGTTTATTCGAATTTAATGTCATTAAGGCTACGGCTAAAGCCACATATGA--TGTAAGCCATTTTCAGTTCGTATTTATTAATTAGTTTACTACTCCTATGCTACATAAATGAATATGTATGTATTACTTCATATTTTAAGTTTCAGATGTTATAAAAAACAC---------GAAATAGGC----TTATTAAAATTTAATGTCAT----------CCTTTTTTGAT----------------------------AAAGTTCTTGA------------------AGTTTGAA------CTGATTTGTGCTGTTATCAGTGGTGTCAGT-CGTCCAGCAACCAGTCCCGCAAAAGAAT--------------------------------CAATAAAAGGCGTTGATTG-----TTTTGTAATTATCCAT
AATGACATGTTAATTAAATGTTCTCAATCAGAAGTAGCCAAAAAGAAGATGCAATTACCAATTATTTAAAACATTGATCTAAT--TACATATTTAAATATGTAC--TTTAGTTT-TATTTTTCTGCTTAGATATTCCAATATGTATTTACTAATACATATACTAATCTAATATTTTTCAT----CTATTAAAGTAA-AGATGACTTGCTATTCATTCTTTGTTTGCAGATGGTGAAAAGCT--------------------AATCAAAATGT--TTAGTTTTAAAAGTTATTGGTTTTTGAAGTTTTCTGAAATGCCCATTAATTGGAATAGTTCAAATAAATAAAATATATTGTCACAGAATATGCCTCTTTTTCGCTGCGAATGAGCCCAATTGCTTGGCATTCAAAAATTCTCGCTTTGAAATCCAACCATTTAGTTTGATTACAATCTGTTCTATGGAGCTTTACACGTTCATATTACGCCCATTTAAAGTTCATGTAAACGTATATTTAAAATATCTTATATACGATTGATATACCCAACCAAAAACATTTATTTACGATGTTTATAATTATCCAT
>CstF-64 14486750 14486850|14914 chr3R 14485344 14489791 scaffold_27 1477012 1481552 + 204919|1484 1586
AACTACTCTGGCTGAAACAAATGAAAAATCACCATTTCGCTCATGCATACTATAGTACTTTCAACATTGAATCAATTAATAA--AAAGAACATTTCAACACAA
---CACGCT-----AAATAAATAAAG---------CTCGAGTTTTAACATTATAATATTT---GAATTGGA--AACTTATAATTAAAGATTA-------ATAA
>Gos28 14490893 14491024|14915 chr3R 14490326 14491162 scaffold_27 1481608 1482388 + 28296|571 710
TGACCCGCCACCGCGATTTGGCCAAAGATAGAGCTTGCATTAAACTCCATTACAGACAATT--GAATTTTAGTTTGTTTTTTCC------GACGGTATATGTGTATGATTAACTTGTGATAGCAATAAAATGTACTATAT
---------GTCTCGA-----------------------------TACATTTCTGACAATTTCGATTATTTCTCTATATTTTCCCTTTTGGTATATGTATGTGTATAATCAACTTGTGATAGCAATAAAATTTAATATTT
>CG31231 14493348 14493414|14917 chr3R 14492154 14493412 scaffold_50 336082 337464 + -2430|1387 1455
TTAGGATGCATTTCTAATTTTCTAAGGATTTTCACAAATAAATTTGAG----TGTACCTTATATAACTG
TAAACAGAAAACCCAAGGATTTTAGATGTATGCAAAGCTAAATTTTAGAATTTGTATTTGATTTATATG
>CG7702 14500134 14500401|14921 chr3R 14498128 14500549 scaffold_27 1485625 1488086 + 60502|2040 2378
---CACGGTGTTAAAATCCTAATACGGTTCAAATTCC----------GAGCTAGCTGCACAAGTTTCGAGCCAAAGATGTCCACGACAGTGACGCGATCCCAACCG----AAAGACTTCCTGTGCGTG-CTATCCTGTACATATGTAGGTGCTC-------------CCTGTATTAATTTCCACAAAGGAGCTGATCC-------CATTGCCAGTCCCTAGA-------------------CCCTAGTATTTAGTGAAGCCATCGATGTTTGTGTATTGTACTTAAGATCCG-------CACATTAGTGTGTAATAAAAGATTTTTA-------ATTTC
GCGGGCGGCCTCCTTGTTTTTGTCCACTCCCACCCCCCTTTTTTTTTACGCCTGCTGCACGTACCATGAGCCAAAGATGTCCACGAAAGTGTTGCAGCCACTACGAAAACAAAGACTTTGCGTGCATGTTTATGCTGTATACATATATATATATATATATATGCAGACATATATATACATACATATATAGACATATGCATATTTAAATCGGAACTCCCCTGAAGGAGTCCTGCCACCATATCCCTAGTGTCTAGTGTTGCCATCGCTGTT--TGTATTGTACTTAAGTTTCGATAGCTTTTAATTACTGTGAAATAAAATGCATTTATATAAATATTGC
>CG7706 14505927 14506043|14924 chr3R 14503613 14506198 scaffold_53 223320 225792 + 75208|2341 2485
CCCATT--GGTAGCCCTAAA-------ACACTGGAAATATTTAGTTTACATG--TACTTTAAAACTAGTCTAGGTCTCGTAATTGA----------TGTATTCTATAAGACC-------CTCTCATTGTAACTTTGTAAATGTTG
TACATTTAATTAGTGCTAAACAAAAATGCACAGACAAGTGTTATTTTATCTAACTAAAATATTATTAAGCCAAGGCATTAAATTAAACAATTTTTTTTTATAGTTTAAGAACTAGCTAATATTTGTTCTATTTTCTTTATCGCTT
>CG7708 14510385 14511029|14927 chr3R 14507916 14512685 scaffold_53 227699 232241 + 128649|2554 3367
GCGGAGTAGCGGAGAATCCCATGGCATCTGGGCAGCTGAATGCCCGAAAATAGGCTGCAGTTGATACCAGAGAATTATCCGATTTTATGTTGCGCTTGTTAGGGGGACACAAATGGGGGGAAGTTGGGGTCATCAGATCGTGGAATGGAGTACAGAAAGTATTAGGAAACGTACGTTAAACACACAAGTGCTCAGGTAAAAATTGCAGAAAGCTGATCGTAAGGTTTACATTTTCATTTAGCCAAC-TTATTGTGTATAGTTTCTACAAGCTTAAAGCGTTGTTCTATCGGTATTCATTTTGATGTTA-----------------------------------GAGTATCTATCT--------------------ATGTGTAAATGTTC-------------------ACAAGTCAATTGACG----------------------------------------ACGAATACATATCAATTGCATTTTCC-----TAGCCCGAGAATTGCCTAGGAACACGTATTAACCCA--------AAAGGAGTTAGCCCAGTTAAAGTGGCTATGGATTAAGATGTATGTATA-------ACCAAAGTGACGAGCATTTGAGCAATATGAATTGGCATTCCTGGCATTAGCATAT----------------------------------CGATCATATATACTATACTATATAGATGCATAAAATGTGAATCATGTGTCCTTCCAGAACGAACAAAGCTAAGCAAAACTAACTAACTAACAAACCAATGCAAACGAAACATATCAAAAAAAAAAAAACAAA
GCGGGGT---------CCGCCTGATTTTAGTGCG---------CCGAAAAGTTACTACAATTTGTG-----------------TTTGAGTTGGGCTTCT------------------------TTTTCTTTTTTACATCACGT-ATGATGTATATGATGCA-TATATGATGTACGTTAAACACACAAGTGCTCAGGTATAAAGTGCAGAATGTTGCGTTTAAAGTTTATAATT--ATTTTGCCAAAGTTTTTACATAGTGTTTTGTAGAGTTTTTTTTTTATTTTTATTTTAATTTATTTTAATATTAATTTTTAATTTATGAGGCTTTGCATAGAGTAAATGGAATACATATAGTTCAATTGACGCATAACCAAATGTATAAATGTTATATAGCGTTAACCTGATCGATAAGTCGATAAACGTGAAATCGATAAAAACATATCAATGAAAAACTGAAAGCAACTGAAAACATATCAAATGCATTTCCCCCATTTTGCGCGAGAAATGCATTCAAATACGTATTATTCAATAGAGTTTAAAGAAGAAAAGCGAA-TAATATAACTAT-AATTAGTATATATACCTATTAATATACTAAA---ATATATATGTGTATAATATATATTTTATTCTGTCACGTTAATTTGTTTGTGTCATTTGATGTAGTTGAAATAATTTGGCACTTTTATTGATTCTATGAAATTTAGATGCATATAATGTGAATCATGTGTCCTTCC-------ACAAAGCAAAACA-------------AATGAATCAAAGCTGACTAAACATACAGAAAGAATTAAAA----
>CG7710 14521342 14521500|14942 chr3R 14520683 14521514 scaffold_53 242226 243209 + 18173|781 1008
ACAGC----------CAACTTTCGCACTCTTGCTGAACGT-------------------------------CTAAGCCGTTTATGTTTCC-----TTTCTGCCGCCA---AGTTTTGA------TTGGATTCGATTGGATTTACGGCTCAGTGGTGGTTGGATCAGTGG---------TGGTGC-----AAATAAATTAATTATGTGTCCTGGCACACAGTCAAACAA
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GATTTTCATAGCCATGCCATAGTCAGTCAAACTTTCGTACCTCTCGAGTGTTGCATATTGCGACGCAGAGCTCTAGTTGTTAAATTAAGCTAGTATTCATCCATCCCTAACCAGGGATTGTTGTCGCTGAAGGAGTCGCTGTAATGTGTGCGGCACAGAGCCGCACAAAAAAAAAAAAAAAAACACAAAAACCTTAACCGAACAGATTATCAATTGTTCGAACAAATTGATGGAAAACTTTTAGAAAACAAAATTCTTTTTTTTTTTCTTGTTACCAACTAAG----TGATTATGCATACTTACTTTCAAAGGCGTCACATAGAATGCGCACGGTTTTTTAAAAATTTTGTATTAGTACATTTTATTATGTTTG---CAATTTGTCAAATTTTTTAATCAC--ATGTTTTTTACACCTATGTTATATATATATAAATAATTGTAATCGAAAAAAACAAAACCTATCTTCAAGCTCGTAATCGACGGCAAAACGAAAACGGAACAAACA
>CG31149 14801503 14802160|15244 chr3R 14798444 14803319 scaffold_15 15081 19864 - 106199|3341 4018
CGATGGTTCGGTGCAGTTTTAGGCACTTTTATCGCAACCTTCAGTTTCGGTTTTAAAACGCATTTAGAATAAGGCTATCTACATACATAGGTAATGGCGAACGAAGCAACTTTGCAGAGCAAGAACAGTAGATTACACACACTCCCACAGTGCAAACTGA-----CACGCAGACACAGGATACAGTGAAACACGAGTACAGTAAAACCGAGAGGCGAGCAGAAACAGAAATTCAAAAGTTAACAATACCTAAAAGACAAGAAATTATGCAAAAATGCGAATTGATTAAGACGTAAATTTAATAGCGAGCGAAACGGGATGGCTAGTAGCATTAGAGATGGGACAGATAGAGCGGAATCTAAGCTAATTAAGTACAGTAGGGCGAGCATATTGTAGTTGCGATAACACGATTAGCCAGCAGCGTTTCACATAGGGAATGATAGGCGATGGATGAATAAGA-----AACCAATAACAGCTACATTTAATAA----------CTATATTATACACATAGCGAAATACGTACGGCGGAGCGGAGAGAGCGCACAAAAAGCACAGACCGATGGGCGGATGTGAAGAAAGCAACAAGAAGCCGTGCGGCGGAAACGGAAACGAGCCAAAAATAGTGGACCGGAAGTGCATGTACGAATCATTTTCATAGCCACAAGAGACCGCA
CTATGTTTA----------TAAGCATTTTTATCGA------TAGTTTCAGCTATAGAGCGC-TTTAGATTAGG-------ACGTGCCCATGTCAAGGGGTACGTATATAAGTAATTGAGTACGAACATCGGATGA-------------AGTTGGAGTTGAATGTCTATATACATACTG---ACTGCGACAGACAG---CAGAAAGAACTTGAAC--AACAAGAACAAAAATTTAAAAGTTAACAATACCTAAAAGACAAAAAATTATGCAAAAGTGCGAATTGATTAAGACATAAATTTAATA-----------------------AGCTATAAAGAGGGCGCAAAT------TAACGTAAAC------AGTACAGTAGGGCGTAAACATTGTAGTAGCGATAA-ACGATTAACGATTAACGATTAAC----------------GATGAACAAAGAAGACAGACAACAAATAATAATTACATTTAAATATACATACATACTATATTATACACATAGCGAC-----TATGAGGGGACAGAGAA---TTGCGAAACGCACA--TTGATGGT------TCAGGAATG----AAAAACCCAAGCGGCGAA-------------------------------------TATGTAAAGCATTTTCTTAGCCACAAGAGACCGCA
>dnk 14808180 14808500|15249 chr3R 14807005 14808182 scaffold_42 604848 606015 - 39110|1219 1221
CCA
CCA
>dnk 14808180 14808500|15250 chr3R 14808298 14808404 scaffold_42 606291 606396 - 2433|0 108
TAACACATTCGTATATTAACAATTATAATCCACATTATATTCTCTTCACAGCAACTAGTA-TGTAAGCTCAAAATATTGTAATAAAAACTGTGA-ATGTTTATGTTAAA
TGACACCTTCA-ATTCTAACAATCATATTCAATGTTATATCCTATAAAAATAAACCTACATTGTAAGCT-AAAATGTT-TAATGAAAGCAATTATGTGTTTGTGCTTAA
>gukh 14846670 14848160|15287 chr3R 14844520 14848183 scaffold_20 2304218 2308401 - 80937|2599 4324
TATCTATGAGCAAGTGCAGCCAGCACC---GAGCACCCAGCCACAGGAAGATGCGACTGCCACGCCCTTCCAGCGCAGTGCGCCCATCTATTGGACACTGCAGAATCGCCGCAGCCAGCCAAGGCCACAGCCCGCTGGCAACGTGACCTGCCGGGATGACCTCTACGCCACGCCCATTCGACGGGCCGACCGACTGCCACGCCCAGTGGCTGCTGCTGCG---------------GCAACAGCAGCGGAAGGCAACAGGAGCAACATATCGCCAATTGTGCCAAGGAATCGTTCGGGAGCCTTCCTCACCTCCACGCCCACGAGGAGCGGAGAGGGTGAACGCGATTCGGAGAACACACAACTTCCCCCCATGAAGCAGCCATCCCGCAACTGGACCGATGACGCACCCGAACGCCTCAACACCTGTGCGGATCGCATTGGCCAAAGCAAGACCACGCTAATGGACTTTAAGAAGCTGCTGCTGGCCAAGTCCGCCAAGGCGAGTCCGGTCCAAAGGAAGGTATCCGCCGTGGAGCTGCTGAAGAAGCCAGCCCAAGCCACCGCAACGCCGCCCGTTGTAAAGCCCAGTGGCCCTGGACAGAAGGTAGCATCAGCTGGAAGCAAACCAACGATCAACACCAGCCTAAAGCTGCTAGATCTGAGCGGCTCACCCAAGACTTTCGCCAACCGGAGGATGCTTCGGCAAGGCCAGTTTGGATCGCCCTCCAAGACCTTTGCTCCAAAGATGCGAGGACCCGTGAATATGGTGGCTGCTGCAGCGGCTCCACCGCGAACTGACATCATGTCCACCACGATTCCGGAGGCGAATAGCGAGGAGGATCACTCCAACACCAGCGGAGGATCGCGAGCCAGTTCCGAGGCGGGCGAAACGGTGCC------------------------------------------CTCCAGCTTCGACTTGAAGCGGAACTTCTTTTTGCAAACCGAGGAGAACAATTTCATGCGCGGGGAGCTGAAGCCCAGCTTTGCCAGGTCAAATGG-AGCAGCCGGAGGTGGCAGCACCGAAGGC----GTCAACAAGTACGTGGCAGCTCCGGTGGCGAATCCTCCGCTGCCCTCGTTTGAAACGGCGTTGTAGA------------------------GCGGGTCTAACCCACT-----------------------CTAGCTGTCGCAAGCTATA-------------------------------------ATACATATTCCATAAGAAAAGATACCCATAATC--AGATGAGCAATTCCCT-------TCCGTAGCCAAGCCGAAACT----------------------GCATTTATTGAC--------GGACGGAA------------ACGAGTCAGAAGCGATGCTACTTTATGCAACATATACATAT--------------------------------ATCACTATATATACACAACA-CCTTTATACAATAAACTGTATTTTTTAAATTGTGCTGCTTGTATAAACGGAGATGTTTTATACACGAATACGAATCGTCTGTACACCTACAATATATTTATTTGTAATTTTACGTTATTTATTGCAATTATGTATTACGCTACACGCA-TTGCTCTTTGTTTTGTAGTACACTTGTACGTCTACGAACTGATGAGAATCGCTTATTGATTAAAAGAA-AAAACATTAGATAACACTTG
TATCTATGAGCAAGTGCAGCCAGCACCGTTGAATACACAG---------GCCACGGATGCCACGCCCTTTCAGCGCAATGCGCCCGTTTATTGGACACTGCAGAACCGGCGAAGCCAGCCGAAGCCGTTGTCCAGCGGCAATGTAACATGCCGGGATGATCTGTATGCCACGCCCATACGACGTGCTGAGCGTGTGGCGCGTGCCGCTGCTGCCAATGCATCCGCTTCCAATGCTGCCGCTGCAGCTGATGGCCGC---AGCAATATATCGCCCATTGTGCCAAGGATTGGCAGCGGCAACTTTCTGACCTCAACCCCCACGCGG-TCGGAGA-----CAAGCGTCTCGGAGAATA------TGCCGCCCATGAAGCAGCCGGCGCGCAATTGGAACGACAACTCACCGGAACGACTGAACACATGCGCGGATCGCATTGGTCAGAGCAAGACGACGCTGATGGACTTTAAGAAACTGTTGCTAGCCAAGTCCGCTAAGACGAGTCCCGTGCAGCGCAAAGTGTCCGCCGTGGAGCTGCTCAAGAAATCGACCGCGCCGGCGAGTAATCCGACTG-CGTCAAGCCAAAAG---CTGGCC--ACTGCGACGCCTGGTGCGTCCAAGCCAACGTTGAACTCCAGCTTAAAGCTGCTCGACCTGAGCGGCTCGCCAAAGACCTTTGCCAATCGCAGAATGCTGCGTCAGGGCCAATTCGGTTCACCCTCAAAGACTTTTGCGCCTAAGATACGCGGCCCC---AATACCGCAGTTGCCTCCGTTGTGCCA---CGCACGGACATCATGACCACCACAATACCGGAGGCCAACAGCGATGAGGATCACTCCAATAATAGCGGTGGCTCGCGCGCCGGCTCCGAGGCGGATGAAACGGCGGCGTGTACTGTAGCTAGTAGCACCAGTCCCAGTTCTGTGGCCGTCTCCAGTTTCGATTTAAAGCGTAATTTCTTTCTGCAGACCGATGAGAACAACTTTATGCGCGGCGAGCTGAAGCCCAGCTTTGGCCGG---AGTGGCAGCACCC--CAGTTGCAGCAATTAGTGCGGATGGCAATAAATATGTGAGTGCGCCAACG---------TCACTGCCAGCATTCGAGACGGCGCTGTAAGGAAACAGAGGGAGAGGCAACAAATGCGGGTCAAACTCGTCGCTGTTGGCCGGAGAGGCAGGGGATGGCCGTAACCATATACATATGCATACACACATAAATACATAGATACATATACATATACATATTCCATAAGGAAA------CGTAATCCGAGAAAAGCAATTGCATTTGGCGCTTCGCACACTTCCCCAAACTCCGGAAAGGACGCTGATAAAACGCATTTACTTATCTTATATAGAATGGAACGCATCTATGTTCCGAGTCAAAATCGATGCTACTTTATGCAAAATTTACATATACTTATACAGTTCTAGACATATAAACTAATTGATTGCTATATACAAAAAATATCCATTATACAGTAAATTGTATTTTTTAAATTGTGCTGCTTGTATAGACCGAAATATTTTATAC------ACGAATCGTC------------AAATATTTATTTGTAATTTTACGTTATTTATTGCAATTAAATAATACCTTACATGCATTTGCTCTTTATTTT---GTATGTCTATTCGATTAGGATGAAGCGCAAATAAATAAAATATCAACCGAAGAAAACAT---ATACTAATTT
>NP15.6 14853623 14853737|15294 chr3R 14852969 14854091 scaffold_21 1034918 1036107 + 40481|691 832
ACATTTAGTGACCCTAAACTTAGTCTGTTATGTAATGCGAATGC----------GAAGTGCGGT------CAGTGCGAGTCCGCTCATAATCCGTTAATAAATCTGCAAGTCTCGCCGTGGA-----------CACAGCTGC
ACAATTAGTGCTCTAACCCTTAGTTTGTTTTGTAA-GCGAATGTTATGTAATGGAAAATGCTGTTGCCCGCAGCTGGAACGCGTCTCCTGTGCGTGAATAAACGAACATATTTCGGCACGAAATCTCATTTTGCCTGCCTGT
>P5cr 14855795 14855902|15296 chr3R 14854891 14858565 scaffold_41 857682 861219 + 126368|932 1062
AAATGTAATCCCCCG----GAACATCCCCTTGC---------TCTCTACACATACATATAGTTAAACGCTTGATATTGTTATTACAATAATGACTAACATAA--AGCTCAAGT--------TTATTCCCGA
AAGTGTCCCCACCCATTGAGTGTGTCCCTCTACAGGTAAACTCCCCTAGGCATACAT---GACAAACAGTT-CCATTAAATATACTAAAGCCGGTGATATAATCAACTCATGTACATATATTTATTCACGA
>CG6013 14857998 14858138|15296 chr3R 14854891 14858565 scaffold_41 857682 861219 + 126368|3190 3330
GTGATCCAAGGACCAAGACTGTTTGCTGCCTAGCAGCAAAGAAATAATCAAAACGTTCTGTAGCACCTTTGAACTGTACGCAGAATGTAGTATATAAAAAAAAAAGTGGACGGAATAAATTTATTTATTTATTTAAGCCCA
-------AAGACCGCAGCCTGTCATTTAGATTGT------GAATTTATTGTACTATTTTGTTCAGTTTTTGACTGCCTAGCAGAA--AAGCCCATCAATTGAAAAATG-------TAAAATAACTATTTAGTTTATGCTTA
>ATPsyn-d 14921668 14921792|15342 chr3R 14920342 14921781 scaffold_73 17661 19061 - 33850|1362 1475
ACCGGAGCGCACGAGGAGCACTCTGACACTGGCTTCGTTGGTCGTCTGTTCGATTCGAAATGTAATCCGCGTTGAAGTAAATTACCCAAATTAAATTCATTTCAAATGACAGTT
ACGCATATGTGCAAATAG---TTCAGAATTGAATACGTGTTTTA---ATTCAAATAAAAATATAAT--GAATTAAAATCAAT--ATCAAAATAAACTGAGTCGAGCTGGCATTT
>CG6040 14957184 14957661|15377 chr3R 14954743 14959274 scaffold_15 828609 833153 + 126602|2507 3106
TTCCACTCAGTCTGCTAGTTAAGCCTGCTCAATGCTAAAGGAATTATCATTTAAATAATATACGAAACTGTCATAGACACTTAGTCCTTAGAGT-----------------------------------------------CAACGAATAATATCTTCTGAAT---------TGCTCCATAAAAACAT-------------------------------------ACTATACGTAC-ATACA-------------TATATCTATATCTTTGCCCAGCGTGCCAAATT-GTTTCGCGCGGAAATTGTCATGTAAAAA---TATGCTTAACGAATGCAAACTCAAACGATTTGTGCAACTCTAATTTATTAGTAATCTATTGTTAAGTCATTAATCTAAACGAATATTTATATAT-----CACTATTCGAGGACGAAAAGTTGTATACTTCATAA--GATGGCAACTATCTATGGGTATGCCAACAATTTGATTAGCAAAACTAAACTTTTTGGTGTTTG---AACAAATACATACATGC-ATATATGGTAAACATAAATAAAATACAGTCTAAATAAATAAATGGAAAACTAAAACCCAGA
CCCCA-----------AGTTA-----GCATAATCTCATATGTATT----------TATTATACAAGATTATAATAGGCTTTTAGTCCTTTGAGTTGTAGCTTAGATATATATTTACATACCTATGTTGGGCTTAAGGCTCCCAGAGAATCATATTCTATGCGTAGCATTTTATGCATTATCGAAACATGATATTTACCGAACTATAATTATGGTTTACCCTTAAAACGATATGAACGATACGAATCCCGTAACATTGTATACACTATTTTCCCTAGCGTGCCAAACGAACCACGCGCGGAAATTGTCTTGTAAAAACCCTATCTTCAGTG-----AAACTTTAATTAATTG--------TAGTTTACTCGTAACT-----GTAAGTCATTATTCTACGCAACTATTTATACTTACCTACATTACTT---------ACTTATCATACGTAATAACCGCTGAGAACTATCTATCGAAAGTC---TAATTCGGCTTGTAAAGGAAAAC--ATTGGTGTTTGTTTTAAATATCCATACGTACAATATTTTATACCTATCAATA--------TGCAAATAAATAAACTG----CGAAAGTCTATT
>Cyp12a5 14960255 14960429|15378 chr3R 14959275 14960268 scaffold_33 16586 17586 - 35533|1001 1014
TACGTTTTACAATA
TGCTCCCTAAAATA
>Cyp12a5 14960255 14960429|15379 chr3R 14960368 14961837 scaffold_33 15100 16588 - 15875|0 62
TTGCAAATATT-ACAAATAAAAGATGAAAATATTTTAAATATAACTATTGCACAGATTTCAAA
TTACTAATATTTGCAAATCAAAAATTTAATGATATACAATGTA-----TACAGAAATTT----
>Cyp12a4 14962824 14962862|15380 chr3R 14961838 14962865 scaffold_15 833154 834185 + 28567|1010 1052
CCTA----TAGATATTAAAAGCGATATACAGTCATGGTCAAAA
AATACTGTTGGTTATTCCTTAAAATATATAATTAT--TCATAA
>nos 14985045 14985924|15401 chr3R 14984248 14987974 scaffold_33 36508 40089 - 96176|838 1775
AGAGGGCGAATCCAGCTCTGGAGCAGAGGCTCTGGCAGCTTTTGCAGCGTTTATATAACATGAAATATATATACGCATTCCGATCAAAGCTGGGTTAACCAGATAGATAGATAGTAACGTTTAAATAGCGCCTGGCGCGTTCGATTTTAAAGAGATTTAGAGCGTTATCCCGTGCCTATAGATCTTATAGTATAGACAACGAACGATCACTCAAATCCAAGTCAATAATTCAAGAATTTATGTCTGTTTCTGTGAAAGGGAAACTAATTTTGTTAAAGAAGACTTACAATATCGTAATACTTGTTCAATCGTCGTGGCCGATAGAAATATCTTACAATCCGAAAGTTGATGAATGGAATTGGTCTGCAACTGGTCGCCTTCATTTCGTAAAATGTTCG-----CTTGCGGCCGAAAAATTT------------CGATATATCTACAATTGATCTACAATCTTTACTAAATTTTGAAAAAGGAACACTTTGAATTTCGAACTGTCAATCGTATCATTAGAATTTAATCTAAATTTAAATCTTGCTAAAGGAAATAGCAAGGAACACTTTCGTCGTCGGCTACGCATTCATTGTAAAA--TTTTAAATTTTGACATTCCGCACTTTTTGATAGATAAGCGAAGAGTATTTTTATTACATGTATCGCAAGTATTCATTTCAACACACATATCTATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATGTTATATATTTATTCAATTTTGTTTACCATTGATCAATTTTTCACACATGAAAC------AACCGCCAGCATTATATAATTTTTTTATTTTTTTAAAA----------------AATGTGTACACATATTCTGAAAA--------------TGAAA---AATTCAATGGCTCGAGTGCCAAATAAAGAAATGGTTACAATTTAAGG
AAGTGGA-----------------AGAAGCTCTGGCAGCTTTTTAAGCGTTTATATAAGA-GTTATATATATGCGCGTTCCACACTAAATCGGTCAAAC----------ATCAGCTGCAATTATTATGCGCCTAGCGCGTTCGATTTTA-------TTATATTTTTTTTTAACACTT-CGGTCAGTTTAGTGTAATCAGTAA--------CTAAACACACGTTCAAACTTCAAAA--TTATGTTTGTTTC-------ATAAATTCAATTACG--AGAATATACTTACAATATCGGAAT---TGTAAAATCGTAGGGGCCGATAAAAATGTCTCAAAACTGGCTTGTTGATTTGTG---------------------CCAGCATTTTTGGTAACGCTAAGAATCTTAGCGGTCAGATAATCTGCAATACTGGTCTGATATATCTATA---TATATATATTAATCTATTAATTTTGGATG-GAAAGACTTTGAATTTCGAACTGCCAATCGTGA---TAGAGTATGATTTGAATAT-----TTGCTAAAGAAAAGAGCAATGAATATTTTCGATG---GCAACCTTTTCACAGTACAAGTTTTTAAATTTTGACATAAAAAA---GTTGATTAACAACCCAA-----TTTTTATTACATGT----------TTAATTT-----------TTTTTTTATTTTCGTAT-TATCGCTCATTACCAATATATATCTTTTTTATATATTTATTTAATGAT-CTTATCTTCAA--AACGTATCAATCATGATATTTGTCTACACATAAGAATATTATTATTATTTTTTTTTATAAAAATGCAAAGAAAGTATTTAAAATGTTCGCATTTACCAAAAAATGTTCATGTAAATTGAAGTTGAATTTAATGGC-AAAATGTCAAATAAAG---------TAATTT--GT
>sqz 14995545 14996296|15412 chr3R 14994252 14995708 scaffold_3 4695770 4697238 + 71793|1311 1509
TACAGGCCGTCAGGTC-------GGGGCCAAAAGAG--GCAGCAACGATGAC-------------------ATTAGCTTAGGATCAAC---GTTTAAGTTGGTATGGATACAAGAGCGTGGTATTTTATTC--TCTTTGAATCCATACCAATTGAAACACTGAAAGTAAAATAAGTTACTCATAGTT--TCCAGTTGGC
TATCGGGCGGTTGGCCTCAAAAGGCAGCCAAAAGAGCAAGAGCTACGATGACAACAACCTCTTAAGTTAAGATTAAGTTAGGCTTAGCTAAGTCCGATTTGG-ATTGCTGTCAATGCTTGGTATTCGCTTCCATCTTTGA---TGTAGCACCTCAGTCCGTGCTGGCAAAGTGTGTGACCTAAAGTGTATCCAGCTAGC
>sqz 14995545 14996296|15413 chr3R 14995720 14996344 scaffold_3 4697387 4697945 + -584|0 639
AGCTGGGATTGTGACTGGTTTTTCTTAAGCATCCTTCCAACTTCCAAATTCATCATGAAACTTGTATACGATTCGGCCAAAATCAACTCCATCACTGCCCAAAACCAATAAGAAAATCAACTGCAATCCTACAGTTTCTGTGCTATTTT-------CAACTGCCATATGA-AAGTAATATGTAATATCTAGATCAACTCAGG---------ATTTTAAATACGATAATTATGCACACTTTTAGATATCTATAAGCAATATTCAAATTAAAACCTTGAACTATACAAATAACTCGATTATAA------ATAGTTCACAGTTTTATTTTCTACTAGGAGCAGTACAAAGTACAGCGATAAACCTAATTATATTATTATTATAATGATATATTTATATATATATATTATAGTGTACATAGATTTATGTAA-ATTGTGCTGTACATTTAAACGTATCAACAT---------------TTATCTAGGACGCTAGATATTATTAATTTATCAACTAACTAGTGGAGTAAGGATATTTTCTACTTCTTAGGCCAGCTGAAAG-------------AGAAATAGATTTGAAAATG----------CATGTACAATTCAACCAATAAAGATTGTA-ACTATATATAAAA
AGCGCAGATCCTGTTTGGACTTTCT-------CTTTCCAA----------------------------------------------------------------------------------GCAAACTCAGGTTTTTCGCTTAGCTTTAAGAACACAATTTCTAACCAATAAGCAATATTTACAAGCCAGATAAACATACGCCCAAAACTCTGTTCAACTCGAAACTT---CATAGTTTCGGGTTGCTTAAAG---TTTTTGAAT--ACATTATGATATATCCTGATAAAGCCTGTACAACAACCTATAATATAGAGTATCA--------TAGGTGCCGTACAAAGTACTGCGA------TAGTTATA-------TATCAACAAAAATTTGTACATAT--------TTGCACATACAAGATTATAATAATGTGCTGTACAAGTCAACGTATCAACGTGGTTAATACAATCAACAATCTGTATCTATATATAATTCAATTTTACAATTCTACCGATATGTATAGGATATTTTATA-TATTTATGCAACTTGTAAGCAGCGTTGACTGCAGAAATTTATTTAACAAAAATTAGCAAACAATGTAAAAAATCATGAATAAAAATCGAACAATATTTATAAAA
>CG31475 15026575 15026820|15445 chr3R 15025619 15026846 scaffold_3 4736852 4738189 + 46609|957 1355
CTTAATTCTT-------TACCATCACT------AAACCTTTCACC----------------------------------------------------------CTTTAAGCATTTATAGTGATATTAATTTGTAAGTTATGGCAC-CTAAAATAGCTAATTTAGTA--------GCAAAGCGTCTTTTTGTTAATA-ATTTCTTTA-----------------------AACTACTTGGATCAGATGT-------------------AAAGCAAGATGATGTAAGAAAATCATTTCCCGTGTGATTTTTCAATAATTAGCTT--TTAAGGACACA----------------AATACTCT------------CCGAATAAATATACGTAATTGTACGGAA
TTACACTTTCCTTATGGCACATTCACTTTGTTCAAACCGTCCCCCAGTTCAATCTCACACAATCCCAGCTCACAACGTTTGTCTAAAATAACAATTATATAATCTTTGTGCATTTATAGTGATATTAATTTGTAAGTTGTTTAACATTGTAATTGAAGATATAATACACGCATTGCTATACCTACATATATACATACATCTATATATATAAATATAAATATAAAGATAGAATTAATTTTGTTAGAAGTTTATACTACGTAACCCTTAAGAGCAAG-------AGGCAATTCATTTAAAGTGTGA-TTTTAAATAAAAGTTTTACTTAAGAATGCAAAGCAAATTAAAGAAGAATACTCCAAAATACACAAAAAAAAAAAATATACGTAATTTTGTGGAA
>cry 15041085 15041166|15464 chr3R 15039167 15042750 scaffold_3 4756198 4759854 + 97432|1935 2039
AGGAGTACAAGTGGGATGACCAATCCA-----------ATTTTAATTCGATTTCACAATAAAGA-AACTAT-TACCAGTGAAATA----------TTATATATAA
A-GAGAACAGCC--AATTATTAATCCATGTGTATCTGTGTTTAAATATCGTATCATTATATATATATCTATATGTCTGTACAATAAAATTGTGGTTAATATGTCA
>CG3773 15056450 15056554|15476 chr3R 15055171 15058862 scaffold_15 1714280 1718220 + 146194|1347 1578
CCTATGGGCAG-----AGCATGAGATAGAATCTATGCTATTCGAT-----TTCCAAG-------------------AAACA----TTGTGTACTATTT-----------------------------------------------------ATTCGCGTAGG--CAACAATTACCAAA---------------------------------------TAAGACTGCATACAT
GTTAAGGTCAATCGTTAGCATCTACTTAATCTTATGATAGTTCATAATTTTTCAAAGTGAAATAAATGTGTGATCTAAACAGTTTTTATATGTTATTCTGCGTTTACTGTATTTTATATATGTTTTTTTTTTCAGCTACCAAACGTTTTAAGTTCGTGGATGTCCAACAATTAATCAACTCTCTCGCTAGCTGCTAGGGTGCAGTATCCATGTCCGCTATGACGGACTACAC
>CG3734 15215525 15215588|15643 chr3R 15213365 15217991 scaffold_15 1894761 1899419 + 121299|2243 2309
TCGT---AGATATGGTCGCACCGAATGGAAAACCACAAATAAAATTTAACGGATTTTACTTATAAAC
ATATTTGATAAATTTTAGTTTTAGCTTGCTTTATTCGATTGCGATCAACTGTATATAATCTAAACAC
>CG18493 15217747 15217854|15643 chr3R 15213365 15217991 scaffold_15 1894761 1899419 + 121299|4597 4709
AT----ATGTTG-GCTATTAAAAAATCCGTAAGAGTTTTGTCAACCAGAAAAAATATTTTTGGAAACGGTCTTAGAAATTTAGTTTTCTAAATAAAATCATTTTGAAAAAGTT
CTTTAAATATCGTTCTTCTAACACGTCTAT-----CTTTATTAAGGCGTAGAAATA-------AAA-----TTTGAAGCCCACTCGCTTAAATAGG--CAATGTGTG-----T
>CG5316 15230023 15230042|15654 chr3R 15230017 15230171 scaffold_15 1913190 1913344 + 4683|6 25
AGCTTTACGCCCAGCTGGAG
CACTCCATGCACAAATAAGC
>CG31221 15282990 15286033|15704 chr3R 15282831 15285909 scaffold_15 1979005 1982475 + 45289|159 3727
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TGATGGC
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GG------CGCGTCTCTGAAATGCGGTGGCTATGTAGAATCTAATACGAAATTAACTAATTATACCGAGGGATACGTTGCGATATCGCTGTATG
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AAGAATCCCG--AGGTTACAATA----TTCCAAATTTTTGTTT------AATACTAGTTAATAATAGTCCAAAACTTAAATATAGCTAGAAAGGCCAAACATTTATTGCTAAAT----GTATACATA
ATACATTTAGTAAAGCAATAAAAATAGTTATAAGTTTTTCCTTGAATAAAATATCCGCTAATATCATCT----ATTTAAATAAACTGAGTAGAGGAGGAAATTTATTATTTGTTTTTCTTATGCTTA
>CG11453 15611127 15611252|16025 chr3R 15609957 15611385 scaffold_17 1418869 1420312 + 68047|1181 1317
TCTTT----TCATAGACATAATTCTGTTAGGCTTAAAGACAATTAGTTATTACCAACGGGTGACTCATCCATTCAAGACATCAAGAA-CTGCCGAAAAAAATAAAATAAAATACGCACACAAACA------TAAGCA
TTGTTTATATTTTGGCTCTAAGTC--TTAGCGTTTAGGCATTTTATTTATTA------AATGACTCACACATTCTAGCATTCAATCATTTGGTGAAAGGCATCGGAAACACTTGCCGGCCAAAAGTTGCTTTAGATA
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TAATTTAATATAAAACTG----CTTTTGATGTTGTTCCTCTTATCGCTTATGTGTGTGCGTG---CGCGTGTTTTCTCATTT-GTGTGTGTGTGTGTGTAATTTGT-TTTAAGCATTAATCATTGTTTGTGCTTAAGCTTTTTATTTATTTCTATTAAATTAATATTCTAATTTGTATTGTACCAATTGTTTAACGACTCAATTG
>CG4662 15679354 15680125|16094 chr3R 15676562 15679792 scaffold_17 1509591 1513016 + 67107|3135 3628
ATTTGAC---AATGAAACAAAAGTCCGCAAACAACGAGGAAAC--CATTGAAGCCAAAGTGAAACA---------------------AAGTTCTAGTTACAAAGT--TTTCTTCTAAAGA---ACCAAAATCTCGTGTATAGCTATAGCCTTTATATTTGTTATTTATGAATTTGTTATCGAACTAAGCACCCATCTCTTGTAGCCAAAATATTGAGAACATTTTTAAAATCGGCTCTTGATTGCCATTGTTTTTATAAATGTATAGTGCAAATAAAATTGTTTTGTAAAATTTGTTTTAAATTTTTATTTAGTTTTCATTTCGTTTAAGATTATGATTTCTTAGAAAATGCA-----------GCTCGTTACCAAGCATCAAGTTATTCATCAACT--GAAACATTCCATTATTGAACTGTAGAACTAAGTG------CTTTTATAATAGATATAAAAACTAAAAACTTCGCT-----TGTCAAGGATCTCCA
ACGCTACCGAAACCCAGCAAAAGTTTGTTGAT-GTGAAGAAACAAAAACTACGCCAAAGTGAAACAAAAACAAAAAACTATATTATCAAATTCTAGTTACAAATTAATTTCTTCTAAAGAAACACAAAAATCTCCTGT-----TTTAG-CTCCAAATTTATAAGAAATTTATTTATTATT-----------------------GTTAAATTATAAAAGTAATTTATTAA---------TGAGT-CTGTTATTAATATAAATTTGTA--------------ATTTCTTAGA--TGATTTCAAATTTATATATA-----CATTTCACACAAGAAATGAAGTTGTTAACAAATAAATAAATACATATTTATATAGTTAAGCACTTAATTATTTATTACTTGCGAAAGAGGCTATCGGCGAG-TATAGAAATATGCAGGTTCCTTCTCATAACAGGAGTTAGGCTCAAAATCTCGGGTAAATATGCTGAGAATCTCAA
>CG4662 15679354 15680125|16095 chr3R 15679821 15681985 scaffold_17 1513493 1515834 + 93210|0 384
GTGTGTCTTAACTAATGCATAAATATACAATAAGTCTAGGTACTATATATAAAACTCGAACTATTTGTCTAGATCAACTTGCACTTGGGCATTGAACAAAATCAAAA---ATTATCACAGTTAAATTCCGTGCATTCGACAGAA--------------GACACACTACA---TTATTCTTACTTG-------GTATACAAAATAGTTT----------CATTTGTTTACTTACCG---------------TTGAATATTTTTGCTAAGAACT---------GAATTGGGAATCATTTTGGAATAGTTGCATATACACAAATTGCACGATTAAA-TTAAAATAATTATCT-------TAATAAA-----------TGATTACAACT
GGGTCTCTTAACTAATGCAAAATTATACATTT-GTATAGGTA-----TATAAAACTTGCACTATTT-TCTATATAAATTTGCACTTGGGCATTAAACAGAATTACAATAAATTATCACAGTTAAATTGAGTGCATTCGATAAACACACTTTTCATATCGTTACACTACGAGTTTATATATATTTACATATATATATATAAAATATTTTAAACTTTTATCATTTGCTTAAATGTTGCGATCAGTACGGGTTTTGATAGATTTAGCTAAAAAGATTCAAATGAAAATGGGGAATTGTTTTGGAATAGTTGCATAGATA--AATTGCACAAGTAAAATTATAATAATTATTGCTAATTATAAGAAAAATATTATTTTTAAATATAATA
>CG11447 15688118 15688324|16102 chr3R 15688242 15688338 scaffold_4 6288350 6288439 - 1203|0 82
TTTCTTTTTGATGTTTTAATCTTTGTTGTTATATACAGTTCTGTAACAAATTATATGAATTTAGTTGAGTATTAACAACCCAA
TTTCTATTTATATTATTACATTTTGTTCCATTTTATACTTCTTTAATAACCATTTCGAATTTAATTTAAGCTTAA-------G
>CG4686 15692280 15692521|16107 chr3R 15692128 15696298 scaffold_17 1523802 1528177 + 174126|152 455
G----------ATGCGCGGGGCAGGCCACCTATCTATATTCCATGTAGCACATGCTGAACTGCA---ATTTA-GTGCAGAGGCAAATAAAGCTAA-GCCAACTCTAA----------CATACAACATCATCTAACATAATACA-------ACATCAACTAAATATGAGTTACT-----ATATCCGCTTTT-AGCCATTATTTACAATAATTATAGT------------GAGGGCTTTGCAGCTAATGGAAGATACTTT-------TGAGTTAAATGCGTACAATCT-----CTTAGTGTATATA
ATTCGATATATACGCACATGATATGATAGTTAATAGAAATACA-ATGGCACACAGTTATCTACATATATATATATATAAAATCAACTAAAGCTAAAGCCTAGATGAAGTTACGTGTGTGTACAGCAGCAGCTATATTTATATATTTAGGCGCTTTTAAAAAGCGTCGCTTAGTTTTAAATGTGAGCTCTCGAGCACTTGAATTTAAAAATTCTAGTTTTTTAAGTTTTAATCAGTTTGCAGCAAATGGAAGAAACTTTCTTTTGTTGTTATAAATGCATTAAATCTTTGTTCTTTTTTTGTAGA
>Arc42 15704973 15705034|16114 chr3R 15703573 15706038 scaffold_17 1533820 1536254 + 83910|1417 1478
GATCAAAGTTATATATCCGTACTACTTGTGTCTCGTTTAATAAAGAACGTTTTTAATATACT
----------------------TACTGGCAATTCCTTTTTTTAAAGCTATTTTT-ATACACA
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CT--------------------------------------------------GGAGTTGAAAGCTTTCTGAGTTGTGCCTTT--ACAGATAC--TACTGATTAATTGTTAATG-------TTCTCCATG-TGCTACTAACCGCTGC--------GAGGCTCAGCTCAATGAGTCTCCAGCAGCCCTGGGTTAAGTTCTCCCATGCTGACTCATGTCTTTTCAACTTTGAGTTCGAAAAGGCGTTGTCTGTGTGTCCAGTTTTAACGATTGCATGTTAACTTATAAAAATGGAATTTACATAAGTGCCTTTAATTTAAAAAAAAAAGAAAACAAAA----ACTGAAATAGATAAT-------ATATTGTGAAGTGCTTTGCAAAAAA
CTAAGCCGCCCCAGAAACCAAGTGGATTTAGAATAGAAATTAAATCGAGAGAGGAGATCAAGGGATCGATTGTTGTTGTTTTTAACTGATTCTTTTTTTTTTTATTGTAAATGTTGTATTTTTTTCATGCCACTACTAACAGTTGCACAAACCTAGGATTAAGCTTAAAGTTTTTCAAACGCCTTAAAAATGAATTTTCATATAC------------------ACCTAATTGTATATAGGC---AACTGTGTGCCTTTTATCTACTA-TGCATGTTTATTTAT-AAAATGAAATT----TAAGTGCCTTTAAATTAAAGCAAAAAACAAACTAAACTACATTGTGAAAAAGAATTGCATACGTTTTGAAAAGTTCGATGCTAAAAA
>RhoGAP92B 15738807 15739455|16149 chr3R 15738009 15739577 scaffold_17 1576921 1578709 + 45735|881 1737
AGGGGAATGAGTAGAGAGGACGCGCAATGGAAACGTGGTCAGAGTCATTAGGTGTTACTGTTTACTCGT------TAAGACTTGAACGCACAGTAATATATATATA------TATTTCGAAATGATCCTTGCGGTAAGGAGAC-TTTGTGCAT-----------TATAGAGAGAAA--AGCCT--CTGCGTATTATGCATTTGTATTTTTGCCTTGTTCATAAGCAATCTAATTTGTACGTG------TTTAGCCATATA--TAACAATAT---CACGCGATATCCATA-------------ACGTATATGTATGCATATA----------------------------------------------------TAGTCTTTAGTAGGCCACCATAAATCAA-------TTGTCGAAATTCGATT-------TGTTAGCCCAAGCCAGCTCTCAATTGTTAATCCTTGTTTGAAAGGTTGTGATACTTCAGAA---------------AGGTTTTGTGTTTCCTTAATTTTTTGCATTGCTCTTGAGTACGTTTTGTTAACTTCTCCAACGAAAGAC-------ATTGTGATTT-----------CCTTTTATTAAAAGTTATGATTTCG----------------------ATTAAATTAC--------------------------AGAAATTACAGAAAATTCCAATGTATTATTCAACT-CACGAAGTACA---TTTTCATTGAA---TTATCATTTCGCTGCGCGATGTACTTTACTTTGTATCTTTGCTTTATTAATTTGTAATGCAATTATTATTAT--TTTTATTTTATAATAAAATTATGTATGATAAA
ATTGTAGTTAATAGCGAATCCTT-------------------AGTTAACCGGTGGCGCTTTCTATATGTTAACCCTAAGACTTGAACGCACATTAATTTAGTTAAAACAAAGCCTTTCAATAAG----TTGCATTAAATATATATTTGTATATATATATATATATATAGAGTGAAAGCAACTTAATTCTGTATTCAGCATTTGTATTCTTT------------GCAATTTAAACTGTATGTGTTTTATTTTAGCCATATGTTTAAAGATATACATAAACGATATATATACACACACCCACATACATATATATATTTATATATATATATATATATATATATATATATATATATATTACAAACATACATATATGTTAGTCTGTAGTAGGCATTCATGAATTAACTCAATTTTGTCGAAATTTCACGCGAAAAATGTTCGTTTAAAAAAAATT---ATTGTT-ATCCTTATTTAAAAGGTTGTGATACACAGAAAAAAAAAAGAAAAATGAAGGTTTGTGTTTCCTTAACTTTC--CGTTGCTCTTG-------TTTCCCAATTTCT-----GAAAGACAATTTCTAATGTGATTTGAAATTTGTTGCCTTTGTTGTAAAATTTTTGTTACGCTTTGTACTTGATGTTGGGCTAATTAAAAAACAACCAACTATTCTTTCCAGTTCGAAAAGAAGTAAAGCAAAACTCGAGCGTATTTTCTATGTACATATAGTATATAGTTTTAATTGAGGTCTTATCAATTT------TAATTTGATGTACTCTGTATTTTTGCTTTATTAATTTGTAATGCAACTATTATTATTATTTTAATCTATAATAAACTGATGTATGAATAT
>CG4783 15774523 15774631|16184 chr3R 15774054 15774682 scaffold_17 1619425 1620042 + 3225|508 623
ATATCTTGGCAACAAAGGAACACAAACTATGTAT-------ATTTGAAGATTTGTTACACCCATTCATTAAAACAAGAAAATAAATAATCTGCGTAACGTTTACACGAAAACCTAA
GCATTTTA--AATGAAGAATTACTTACTGTGCTTGAGCTTAAGGTAAACAATTTTTGTCAGCTTGTATTAAATCATTGAAATA------------TACCTGCACAAAAAAATTTAA
>MED25 15837374 15837436|16258 chr3R 15834684 15837488 scaffold_13 2968265 2971105 - 110611|2877 2978
GCTACT---------TAAGAGTAT---------------CGTATAAAAA------------ACCAGAATTAA--GACAGTAAAATATTTTATAAAAT-CCAA
AATTTTAATGTGTTCTAGTAGTATACATTTATATATATATATATATAGATTCACGTTCAGTATCAGTATCAATGTACCCCAGACTTGTTTGTAAATTGTCAA
>CG4836 15842553 15842738|16262 chr3R 15841429 15845527 scaffold_17 1712584 1717234 + 85108|1557 1776
GCAATCTCTTGACCCGGAGTTCTATTGCCC--AGCTGCAGCCGCAGAGAAGATCATTTAGCACGCGGCCATGTTGCCATCCATCCTCTGA-----------------AAAGCGCACCGCGGATGATGAAGCACT-TACGCTG--------------CGCATAACGAATCCCTACGAGATCAGCGTGGTTCCCTTTTCCAAGCCGCGACCAAAGGACTTTG
ATAAGCTCCTTTCCACGGGCTCATTCACTCTTAACCAAATGCGCATGCACAGCGATTCAGCGCACAGCAAAAGGGGCTACAACTCGCAGATCAATAAGGCAGCATTGAAAGAGTGTCCCG-ATGAGGAATTGCCAGACTCTGTGATTGAGGTCATACGCATACCCGCTTCGTATCAAATATGTAAAGAGCACCTGCCGCGACCAGAGCTAAAACCATTCG
>CG4836 15842800 15843580|16262 chr3R 15841429 15845527 scaffold_17 1712584 1717234 + 85108|1840 2620
ACGTCCTCATTCGAACGGGCTCAGTGGCTGTCTCCAACTCGGACATCCACGTCTATGAGAACGGCAATCGGGACATGGAAGCCATGTCCCTGGGCCATGATGCGACGGGTATTGTGGAGGAACTCGGTCGATGCGTCCAGCATCTGCATGTGGGTGACCGGGTCGTCATGGAGTCGGCGTTATCCTGCGGCATCTGTGATCTATGCAAGAAGGGCCTGTACAACATGTGCTCCGGGTTGGTGTACAACGGCTTCCTAAGCACCTACCAAACGCATCCAGCCGACCTTTGTCACCGCCTTCCAGAGTCCATCAGCATGGAGGCGGGTGCCCTGACGCAGACACTAGCACTGGGGTGCCAGGCGTGCTTCAAGGCCAATGTCACGCCCACCAGCAACGTCCTCATCCTGGGAGCCTGCCCAACGGCTGTGGCGGCCGGCATATGCGCAAAGGCCATCGGGGCCAAGCGTGTGGCCATTGCCGGATGTATGGCTCCGGCTCTGGATGTGGTCGCCCGGGACTTCGGCTTCCAAGCAGTCGAGTTCGATAGCAACGCACTGTTCGGAGAGGTCCTTGAAGCCATCTACAGCAAGTTCCGGGATTGGCCGGACTGCGTAATCAACTGCTCCATCTCTGCAATGACGATGAATCTGGCGGTCATGGCTCTGCAGCCATGTGGGGTGTGTGTGCTGGCCGAGTGCGATTCAGAGTGTGCCAGCTTCAATGCTCTGGACGTACTGATGAAGAACATCCGCCTAGTGCCCAGTTTTCGTTCCGCCAATAT
ATGTCCTTATTAGCACTGGCTCAATAGCACTCACTGGATCGGATATACATGTATATGAGAATGCAAATCGGGATCTGGAGGGCATGACCTTGGGTCACGATGCCACCGGCTTTGTGGAGCAGGTTGGTAGCTGTGTTCAACATTTACATGTGGGTGATCGTGTCGTCATGGAATCGGCGCTGTCCTGTGGCGTTTGTGATTATTGCAAACGGGGCTTGTATAACATCTGCGCCGATCTGGTATACAACGGTTTCTTGGCTACCCATCAGTCGCATCCGGCTGACCTATGTCATAGACTGCCCGATAATATTAGCATGGAAGAAGGCACACTCACCCAAACGCTGGCAATGGGCTGTCAGGCATGCTTCAAGGCCAACATCTCGCCCACAAGCAATGTATTGATTATTGGCTCCACCCCCACAGCAGTTGCGGCGGCGATGTGTGCATCAGCAATTGGCGCCCGAAAAGTGACTATTGCTGGAACCATGAGCTCCTCACTGGAAATGATAAGAAAGGAATTTGGTTTCAATATAATACACTTTGATACGAATGCACTTTTCGGTGAGGTGCTCGAAGCGGTGTACAGCAAATTCCAGGAATGGCCCAATTGTGCCATCAACTGCGCCATCACGCCAATGACCATGAATTTGACCGTGATGGCATTGCAGCCATGTGGTGTCTGTGTACTAGCCGAATGCGAATCCGAATGTGCCAGTTTCAATGCCCTCGACATACTCATGAAGAACATACGCCTAATACCGAGCTTTCGTTCCGCCAATAT
>CG4836 15843637 15843976|16262 chr3R 15841429 15845527 scaffold_17 1712584 1717234 + 85108|2677 3019
GTATCCGACTGCTCTACAACTCATGCAATCTGGTCGAGCACATATGCAAAAATTCATAACGGCCACGTATCCCCTGAGCAAGGCGGACGAGGCGTTCCGAGCTGCCCAGCACGAGTCCAACATTGGGCTGGGCAAGGTGATTGTTAACTGTGCGGAAGAAGTGGACGTCTAGGCGATTCGGAGGAGAAGTTCCGAGCCGGCATTGGATAAATTTATGGTGGAAAAAACTGTGTGAAGGCCAAAAACGAAACAACTTATTCTAATTGAAGTTAATTCTGTGTTT--TCGACTTCAAAT-TCGGAATTAGAATAAAACAATAGATTTAAGTATTGCAACAAAAAA
GTATCCAACGGCCTTGCAACTTATGAAATCTGGTCGCGCACCAATGCATAAATTCATTGCCAAAACGTTTTCATGGAGCATGATAGAGGATGCATTTAAAAGTGCGCAGCATGAATCAAACGTTGGCTTGCGAAAAATTATCGTTAATAATATAGAAGAAACAAACATCGGGGGACTGTTCAAAAAAAACTA------------AAATCAATTT-------CAAAGACCAATTGATCGATAATAA--AAATTTTTTGTTCT--CTTAAGGTAATGCTGTACATAGAAAAGACCAAATGGCGGTGTAATAAAAAAAAATTTGATACAATTTTTACTCTCTTAAA
>CG4845 15851893 15852207|16267 chr3R 15849071 15852942 scaffold_17 1719573 1723394 + 145723|2880 3231
ATGCTT----------CTTTGCTGTGCAAAGGC-----CATCAGCCAGCCAGTCCGGTCATCGTTGCCCCCACACA---ATCCAAGTTCA---TAGTTTGTTATTTAATTTTGTTAACGG----ATACAACCGACCTCATAATCCTCCTACACTACA--ATTATCTCGAACACCAGCGCCAAGTCA------GCACTTATCAATCACTTTTCGGCATTTCCCTCGTACAACACATA--AAAGTTGTAAAAT--TTTGTAAAACAAAAATTAGAAAAGAACAAAACAAAGAAAAAAGATTGCGTACCGCTTTGCAAGTAAGTCAAGTAAAAGAATAAATTGTAAAAATGTAAA
GGTTTTCCCTCATTGACTTTGCTGTGCAAAGTCTTGTTTAATTTTCCCCCACTTGCGATATCTATATTTCCAGTCATCCAGCCCTGTCCAGCCCAATTTGTTATTTAATATTTTAAACAAGGCTATTTATTTGCCCCGCTCGCTACCCTATAATACACTATTTCATCTAATTACAATCACCAATCAAATTACATTCTTGTGCACATTTTTTCGGCATTT--TTTATACAACAGTTGGTAAACTTGAAACCTGCTTGATCAAATAAAAAAAGAAAAAGAACGATACATAAG-------------------TTGAAATAAAAT-------GAGATCAAATCCTATTATCTTAAA
>CG4854 15855121 15855290|16269 chr3R 15853762 15857254 scaffold_17 1724327 1727850 + 54303|1447 1682
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TGGCCAGTTGGATTAGAATTTAAGCAGGCAC-TTGTAGTACAATGTCATGATAAGAAATCAAGTCCTATTTAAAATTGACCCAAGATATGTTTCTCTGTCAATGCGTAACACATTTTAAGACAAAATAAAAATACTCTCTGTTGCTTATACTAAAACTGAATCAAAACTTTATCACTGTATTCAATCTAAAAGATTATCAATGGAAAACAGTTGTATAATTGGTTTTACAATAATA
>CG4936 15859912 15860053|16272 chr3R 15859762 15863010 scaffold_17 1729601 1733087 + 83890|161 438
ATTTCGAGCGAGGACTCCACGTCGTCCCAAAGCGACAC-------------TTTACACTTTAA---------------GCAGAAACAC-GCGTGTAATTA------------------CACATCTAATTATATTGA-----------------------------------------------------------------------------TGAAATTTAAGCCTAGCCTAA------------TTATGCGGAAATAAATTAAGAATAGCCGCGCA
ATGCTAACACATAAAAACATTTAGACATATATATATATATATATATATATATATATATATTAATATTAATATATATATACATATATACAACGTGTGGTTATGTATAGATATATAAATGCATATATAAATATATGAATTACAAATACGTAATTGATTATGAAACATTTAACTGTAACAAGTAAAATTTAAATAATTTACGAACGCGGTCTATTGTGAAGTTTGCGTCTAGCCTAAGTTTTAGTCTAATTATGCGGAAATAAATTAAGTATTGCTGCACA
>Indy-2 15871291 15871613|16283 chr3R 15870701 15871343 scaffold_17 1741449 1742100 + 7304|615 668
TGATGGAACTAAAGGGGTTTCAAATCTTGTTATAAATTCTATA-AAAATGATGT
TGTTAGAA--GAGACGATTTAAGATTTCACTAGCTCTTCAACATGAAAAAATGT
>Indy-2 15871291 15871613|16284 chr3R 15871589 15872417 scaffold_17 1739271 1740114 + 20720|0 30
ATTAGAAGCCAAGCAA------AATGGGAGA
ATTAAAAGGCAACAGAGCTAACAATGGCCGA
>Indy-2 15871671 15871807|16284 chr3R 15871589 15872417 scaffold_17 1739271 1740114 + 20720|88 228
TGC----TGACGGAAAAATTGGAGGTGGTCAGGCCGTAAAGAGATGTTGCGGCTTCCATTGGAGGGGCAAGGCGACCGCCATGATTCCTCTCATCACATTGCCGATTATGATCTATGGGGTCTTGGAGAATAATTTGGCAA
CGCGCAGCGAGGAGAAAATCTCGACTGGGAGAAGCTTGAAGCAATGCTGCAAGCTTCATTGGAGGGGCAAGGGGACTATCATCATTCCATTGGTTACCTTGCCTGTTTTGTTTTATG----CCTTTAGCATACAGTCACCA
>Indy-2 15871861 15871977|16284 chr3R 15871589 15872417 scaffold_17 1739271 1740114 + 20720|293 416
GCATT-------TCAATGCATGTATCTGGTGGCCAATATGGCGCTCTTCTGGATCACGGAAGCCATTCCTCTATATTTGACAGCTCTGTTTCCGGTCGTTTTTCTGCCACTGTTTGGCATTTTG
TCATTAGGAGTACAAGTGCATGTATCTGGTGCTGAACATGGCGCTCTTCTGGATAACAGAATGCATCCCACTCTATCTGACATCCATATTTCCGGTGGTCTTTCTGCCGCTGTTCAGCATAATG
>Indy-2 15872044 15872192|16284 chr3R 15871589 15872417 scaffold_17 1739271 1740114 + 20720|483 631
ACTTCGGAAAAGGTGTGCAGCTTTTACTTTAGTGACACCGTGGTTATGTTCATTGGGGGACTGCTTATTGCTCTGGCCATAGAATATAGCAATCTCCATCAACGTATTGCACTCAACACTATTCTAATAGTGGGCTGCAGTCCGAGGCG
AGCTCCTTTGATGTATGCCAGCTGTTCTTTACGGATACCTTAGTTATGTTTTTGGGTGGTCTCATTGTTGCTCTGGCCGTGGAGTACAGCAATCTGCATCAGCGCATCGCGCTGGGTACAATTCTATTGGTTGGCTGCAGTCCCAGACG
>Indy-2 15872246 15872360|16284 chr3R 15871589 15872417 scaffold_17 1739271 1740114 + 20720|697 811
CTTGCACTTCGGATTGGTCATGGTGACTTGCTTCATTTCGCTCTGGATTTCAAACTCAGCAGCCACTGCCATGATGTGTCCAATAGTCAAAGCAGTGCTCAATGAAATGGAAACT
TTTGCATTTAGGTCTCGTTGCGGTCACCTGCTTTATATCGCTTTGGATATCAAATTCGGCAGCTACTGCCATGATGTGCCCCATTGTTAAGGCTGTGCTCATGGAAATGGAAGCC
>Indy-2 15872560 15872615|16286 chr3R 15872548 15873209 scaffold_17 1740115 1740778 + 22020|12 67
CAAAACATTTTTGCCATTTACAAGACGCAGGAAGAGGAGCCAGTGGAAGAGGGAGA
CAAAATATATTTCAAGTCAGCATGACACAAGAGGAGCAGCCCATGGAGGAGGGCGA
>Indy-2 15872674 15872799|16286 chr3R 15872548 15873209 scaffold_17 1740115 1740778 + 22020|136 261
CCCACCGCATCCGTCGACAATCTCGATGGCGTTCTATTTCGGCATCGCGTACTCTTCGTCAATCGGTGGTTGTGGCACCTTGATCGGAACTGGGACGAACCTGACTTATAAGGGCTTATACGATAC
TCCACCGCATCCCTCCATAATATCGATGGCATTCTATTTCGGCATTGCCTATGCGGCCACAATTGGGGGCTGCGGCACGCTCATTGGCACGGGAACAAATCTCACCTTTAAGGGTCTATACGACAC
>Indy-2 15872862 15873197|16286 chr3R 15872548 15873209 scaffold_17 1740115 1740778 + 22020|326 661
ACGTTTTCCCAACTCCGACGAGAAGATTGACTTCCCCATCTTTATGGCGTACTCCGTTCCGTTCGTAGTGCTCGTGCTTATCTTTCTCACGTACTTCTCGCTACAAGTCACACACATGGGTCTCTTCCGGCCGAATAGCAAAATTGGTCAGGAGGTGAAGAAGGGCGCCGAGAGCCAGGACGTTGTCAAGGATGTGATCAAGCAGCGCAAGGCAGAGCTAGGACCGATGAGCTGCCACGAGATTCAAGTCGGTTTGCTCTTCGTTCTGATGATTTTCCTGCTCTTCACCCGAAAACCTGGTTTCTTTCCGGGATGGGCTGACTTTCTGAATGCCAA
TCGCTTTCCCAACTCCCAGGAAAAGGTGGACTTTCCCAAGTTTATGATGTATGCGATTCCGCTGGTTGTGTTCGTCAATGTGATTCTCTTGTACTTTTCACTGCAAGTAACGCACATGGGCCTGTGTCGACCGAACAGCAACATCGGCCAGCAGATAAAGCGCGGCTCTGAAAATAAGGATGTGGTGAAACAGGTGGTCGTCCAGCGTTTTAAGGAGCTGGGTCCCATGACATGCCATGAGATTCAGGTGGCCATACTATTTGTCTTCATGATTCTATTGCTCTTCTTCAAGAAGCCCGGATTCGTAATGGGCTGGGGTGATTTTCTTAACGCCAA
>Indy-2 15873265 15873446|16287 chr3R 15873251 15874208 scaffold_17 1741139 1742188 + 14938|14 252
AGCCATTGGCAGTGGTCCTCCAGTATTTTTCGCAACAATACTGCTCTTCGCGCTGCCCACACAGTACACCTTCTTCAAGTACTGCTGCGGAAAGG---------------------------------------------------------CTCCTTTCCCAGGACAAACTTTGGATGCCTGCCTGTCGTGGGTCTACTGCCAAAAGTACACCCCCTTTGGCCTGGCCTTTCTGTTGG
GGCCATAGGCAGCTCGACGCCAGTCATGCTGTCGGTTGTCCTCTTGTTTGCCCTGCCCACACAGTATACGTTCTTTAAGTACTGCTGCGGTAAAGGTAAGTTTGCCAATCTTAGCTCGGAAGCGCCTCGTCTAATATATCTACTCCTGACAGCACCCTTCACGGGCCGCACCATGGACGCTTGCCTCTCCTGGGTGTACATACAAAAGCACACACCGTGGGGCCTGTGCTTTTTGCTCG
>Indy-2 15873521 15873711|16287 chr3R 15873251 15874208 scaffold_17 1741139 1742188 + 14938|329 523
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GCGGCTTTGCTCTGGCCGAGGGCAGCAAACGCAGCGGCATGGCCAAGATGTTGGGCGAAAAAATGTCATTCATT----AAATCACTTCCAACCTTTGCCACAATTGGCGTCTGCATTCTGATAAGTCTTTTCTGCACTGCCTTCGCCTCCAACGTGGCCATTTGCAACATCCTCATACCCATATTCAGTGAAATG
>Indy-2 15873778 15874061|16287 chr3R 15873251 15874208 scaffold_17 1741139 1742188 + 14938|598 958
GCCCTGGCCATCGAAGTGCATCCCATGAAGCTGACTTTTCCGGCTGCCCTGGCCTGCAGCTTGGCTTTCCATCTGCCCGTAAGCACTCCGCCTAATGCAATTATATCCGGCTTTACGGGTTTGAAAACAAAGTACAT-----------------------------------------------------------------GGCCATCGCTGGGATTCTGCCTACATGTTGGGCCTTCCTATGTCTGCTGTTCACCGGAACCGTGTGGACCATG------CTGATCTATCCGGGGACGACGGAATTCCC------CTCTTGGGCTATTTAGCTCCAATTATAAAATGCCTGCGAAGTGGG
GCCATCAGTATTAAAACGCATCCATTGCTGCTGACCCTGCCCTCCGCTCTGGCCATTAGCACGGCATACCATCTGCCGGTCAGCACTCCGCCTAATGCTATTATTTGTGGATATGCTTTCATCAAGACAAAGTATTTGGTGAGAACAAGTACAGAAACATTCAAGTTTTCAGGTCTACTACTAACTTCTGTTCGCTTCTCTAGGCTATCGCTGGAATATTGCCAACGATTTGGTCCTTCCTTT------TGCTCTGGGTGAACGCGCTGACCTTGGGTTACGTTGTCTATCCCGGCACCAAAAAATTCCCAGATGATTTATAGAGTCGTTAAAACCA-----GGAATGTTAGAAGAGACGA
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CTCCAATTATAAAATGCCTGCGAAGTGGG
AACCA-----GGAATGTTAGAAGAGACGA
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GACAATCCATATCTACAGACATACGAAGACTCGAAGATTCAAGATGGAACATGTGAAAAATTTCTGGTATTCCCAATAATATTT
--CTTTTCTCCTGTATATAAAAACGAAAA----AAGTTTCGCAATGA---ATGTTAAGAA--------ATGCACTATAGCATTT
>CG33934 15874125 15874297|16288 chr3R 15874209 15874622 scaffold_17 1743309 1743860 + -2209|0 112
CTGTCAAATCGAAAGGCTTTGAGGTCAAATGAACTGGATCTTTGTTTTGGCAGCAATTTTGTTGA-----------------GTTGCATGCCGCGTTTGGCAAA-------AT
CCATTATCACGACAAGCTT--------AATAAAATTGTTATTTCTTTT-----CAATTATATTGACAAATCCAAAGGGAGTCACCGCA-GCCAAGCTTGCCAACTTATTTTAT
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AATA
GTTA
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GACGGCAAAACCCTCAGGTATACATGCAAGCACACACACACACCTCTCACAGCT------ACACCAAAAATAATTTAGTTCAAAC-AATGTTCATTTGTATATCTATAATTTCTTGCGGTTTTTATAATTAAAGCCCTGCAATTAGCAGCGCGGGCCCCTCTTAAAGTAATTTATATATTATGAAATAAATAAATAAATTAATTTTAATATAATCATCAT
>CG31209 16070210 16070401|16526 chr3R 16069693 16070611 scaffold_3 6392898 6393864 - 22326|565 781
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GCCGAAAGAACTCGTTAATTACTAGACTGCACCTAATCTCTGTTTAGTTTTAAGC--AACATTTT----CATAGGTTAAGAGAAAACGATTCAAAATTAAAATAAA--ATCTGAAAATCTGAATATATTAAAGCATTGCTAAGCATAAGATTACATACATGTAGTTAAAATTTATAG---AACTTAAGCTCTTGTAAATAAAGTCAAAGTGTTAGTC
>cic 16126350 16127097|16581 chr3R 16126284 16129379 scaffold_3 6456334 6460121 - 28176|71 916
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TTCTATTGGTTAATCTGT----------------------------ATACATTTAAGTCAAATTATTGAGC----TACATATATTTATATATA---------GTTTATATATACAACCCATATTATTCTAAATCTATAAC-CATACCTCCTCTATTGTAC--TATATTCTGTCCCACTCAGAATGCCTTGGCATCCAGCCAAA-----------GAACCAGATTCGCTGTTTTAGTGCGCGTCTAGAG-----TCAATCACGAATTA--------------TATTAGTCTAAATTTAAACCCA-----TCTAATAGCTAGTGCGGCCACAATT--GTTGAAAATCTGGTATCATTCAG--------ATACGTTT---AGACTAAAGCGTTT--------------------------TATAAAGAATGGAGTATATCCA-----ACTAACAGTCGCACCATATTTCGTAACAATTCCATGTCGCTGACACTAAAAATCTAACCAATTCCTGTATCAAAGCAAATGCA
>CG5077 16149172 16149922|16608 chr3R 16149697 16150619 scaffold_20 271454 272525 + 9834|0 304
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AGTTCTCACAAAACAATATATATATATATAGGATCATT--TGAAGGAGC--TGCTTGAGAGGCTTT--CTCATTGACAA------GGACACCGTGCAACACTCGTAACCATTTAGAAGTTAAATGCTA-AAGTGCTTGTAATAA----ATTTAGTGTAGTTTTCACACACAATACACTTTTTTCATTAAGCAAACACAAATTGTACAACTTGAAGAACACTTTTAAATATTTAACTTGAAATAAACATTTGACACATTTCTTTCCTTTCATTTCCAAAATTGTTCTAACTGAAGAACAGTCACAG
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>MtnD 16360901 16361007|16866 chr3R 16358965 16360937 scaffold_29 152528 154609 + 17546|2233 2269
AACGGACCCAAGGACAAGTGCTGCTCCACCAAAAACT
AATGGACCCAAGGAAAAGTGCTGCTCCACCAAGAATT
>MtnD 16360901 16361007|16867 chr3R 16360992 16364048 scaffold_29 155032 158323 + 12291|0 15
CAACGAAATAAAATAC
CAAAAAAGTAGCCCAG
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TTTCTAACTTAAATAAGGTCTAGATCTGTGTGTATGCAAGCGAAGACTCAAGCATTCGCTTCATGCGTGCAGAGTTTATTTTACA--TAAGCATATATGTATGTATTTACGTCGTCCGTTTATGTGTTAGTTTGTATATTACAGTTTAAAGTTTTCGTAGATCTAATTACTGCATCACTTGAATGCAATAAATAGCTTTTAATTAGTTT
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G-----------------CCCGTTCTTCATTTA---GTGAATTATTATTTCATTCGTCATTCGTCATTCGTCATGCACATATATATATATATATATATATATTTTTGATTCCATCTAGTTATCCCATAGTTAACTATGTGACATTTTATTGAA------ATCCCAAAGAAAATTATAGAAAATTTGGCGTACTTTTTACACAATTCATTTGGAGCTTTCTTTCCTACATTTTAA----TTCGTCTCACACACATCACATT-----TACTTCAA---------ATCATTTCACATTCTAAGAAGTATTAAATTATTGCTTTTGTATTTGTCCAAATTAATGTCGTATGTACTCTAAATCATATT-------------GTATGTATGTATATATATATACATATATTATTCTAGATCCTAAGTGTTAGGTTTTTATGGCCGCAACTGGCAGTTTAGAT-------GATAATTTGTGTATTGT
>CG5412 16403760 16403853|16903 chr3R 16402861 16404538 scaffold_22 378087 379871 - 58455|996 1101
CCGAGGGACGGGGGTTTTTTCGTTCGTTTTTAATAATAATTAAATCTTATTATTACAAAAATA------------ATGATTTGATTATAAATTATAATATAATTAG
T-----AATGTAGATTTTCTTTTTCCTTTTTAATAATAATTAAATCTTATTATTACAATAATAATAATAATAATCATAATTTGATTATAAATTATAATAAATTTAA
>CG5417 16406407 16406493|16905 chr3R 16404853 16409969 scaffold_22 380667 385613 - 78133|1614 1725
TC-----GGGGCA----------TAGTCTTAGTTAGA--TTTTATTTGACTGTTTACTGGTCGTTTGTTTTAAACCTTAAATGCATCATTTTGTACGGAAA--------GCA
TCCAATTGAGGCGACGGCGGCGTTAAAATTAGTTAAAGCTTTTAGTTACCTACT-AATACCCGATTGCGTTAACTTGTAAATTAA--AATTTTTACGGTATTTTTGGTTGTC
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GCTGTAGCCAAACACATGCGTTTAAACTGT---------ATCA----------------ACTTTACAAAATTACA-------------ACTGGTTTATAATTGTCAACTTATAC
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AACGAGCTTTTGCCCGACGAGAAGGGCACGGAGAAGGAGCCGCAGCCGGAGGAGAAAGATAATGGAGGAGAAACACAAGACCAGCCGGAGCAAGAGCAGCAGCAGTCAGAGGATAAACAGGCGCTGCAAGAAGATGAACCTGAGCAAAACCAGGAGTCGCACTTAGCAGATTTGGAGCTAGATTTGGCACAGCGACCGCGCAGTCTAGGTAGCAGTGTAATACAGGAAAGCGCCGACTATGTGCTCCAGCTACTGCACGCATATGCCGCCGCCTTCGGACTCTAGAGCGTTTAATTGAGTGACTCATGAAAGCACATATCCGTAAACACTCGCAACTAATAAGTCCAACATTGTTATAAATTATGAATGGCGCTATCAATTAGTTTATAAGTATATATGAAAAAACGTCGTCTAATCATTTAGAACAAACAACTTGTAGCTGTTGTAGATTTAGTTTTG----------TATT-----ACCCAACTGTAAAT---------AAGCAAGTCATTTGATATGATTTATGGATTA---ACAATGCAAGAATAACTAGATGTTCGTGTG-----------------GAGATATGTTTTAGCTACAATCTTAAGTGTTAAATATACATA--------------------TGTAAGCAGATATAC--------------CAAGTAGAGATTAA--------------TTTGTAGCTTACTTCAATTTCACTGCATAACTTAA--------------GAGTGCTCCCAGCTCTGTCCTCTAACCCCATATCTGTTAGAGTTGTATTTACTTTTGTGATAGCAAAAAACAATAAACAAAAATGAACAAATTA---TGTCCTAATATGTA-TATTACTGCATCCCAACT---CATTTTGACA---TTTTAC-----TTTCGAATTTGCTGTGTACGATATTTATTGCCCATTGTTCCGATTATGTATCTATCCATATATATATATATATATATATATATATATGTATACTTAGGCATATCTCAGAACATTTTCTTATATTTCGCTAACGCTCATTTATAAAACAGCAAACATTCGTATACCATTTAGGAAGACACTTGTAATAAGTTA-----CAATTAGAGTAATAAGTT---CGAATAAATCAAACCCACAATAGAATTACAGGCCTACACATAAACATATAAATAATTATATTAGCATAGAACTTTTAATGTTGTACGTTTGACGTTTTAGGTTTAATCTACCACATAGAGCCGATCAGGCATACAGCCAATCAGTCTACTAGTAATATCCATTAT--AGCCAT-AACCGTACACTACTCCATGATCAAATATATTCATTCACAACAGATATGCATTGGTATT---------------GGTGTGTACATACATATATATGAAAAGTTATTTATAATTATTTTCAATTAATCTAACCAGACAAATGCTGTGGCCAACACGTTGTTTTTATTTGACATACAAATATGTAACTGTACGATATGAAATTAAAACTGTAATAAAACTCAATTCACAATATTGTGAATATTTTTATACATATTTT-AACTAATGAAAGAAAGAAAATATCTCCTAAAAAATCTACTC----AAACTGCAAGAATAAAGCAAAATC---CTATTAA-----TGTCACACACCATGAAAACAATAAACACAAACTTGAAAATGAAATTATATAGATGTATTATCTACTATAAATATATATACATATATATATATATTTATATGTATATGTATATGTATTAATAGAGGAACATATATGTGTGCTATCCTATCGACGTTGAAGCAAGCAATTGAAAGTGAAATGGTCAA--CCAGGCATATGCCGAACTATGTTTATATGTTGAATGTGAAAACGATAGAAATTATTATATATGTATCTGTTTTAGTAGTAAGTTTTATGGTAAATATCTATAAAAGAAAAAAACAATACCTTATGAATGTACTACTTACTATCAAGTGGATTTTTAAATAAATGAAAAAGGCAACATTTCATTTCGATTG
>CG5466 16446078 16446990|16934 chr3R 16445535 16447013 scaffold_22 419254 420822 - 36027|557 1661
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>H 16452511 16454637|16939 chr3R 16449831 16454624 scaffold_22 423659 428585 - 91191|3084 5489
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GACATACGAGCCCCCACTCCAGCATTCCCCATGGCCCCTTCCATCCCAGCTGCTTCAGTGTCTGTGGGCAACCCCTCGAGTTAAGTACATTATTGCACTAGTAGCGCTTAAGACGACATTCAAACCACACTACACACATAAAATTATTACATAAGTTAGCTGCTATTTATTAGTTGTAACTCAATTGTTTTGCATTAAGTTAG---CTAGGGTTTATTCTAAGGCCGAGAGACAATTCAAACAACAACAACAAAAAATAGGAAACTGCGAGCTCATCGAAATAAATTTTAGAATGTTTTCAAAATCGTTCGAAAACTATTTATGCAATCAGTTAGGAG-------TATAAATAAAC-AACTAAATTATTT--GGCCGTCATATTCAATAACCAAACTTAAGAGTAAATTTATATAATATATATATATTTTTTTAAATTCCCATAGGATGCACGTCTTAAAGAATCTCAAAAAAATATTTAAAGGCCGTTATATCAATGTCCAGTTGCAACAAAAAAAAAATAATACATTTGTTTCAACTGCTCATTGAAAGCTCGGGCATAAGATTTCTTATCAAAACATTTCCTTGAAACAGACTGAACCTTAAAATTTTTAG--AGAGAAAATAAAAAAC---GGTAAAAAATTTAACATATACGACTGCATCTTACTTTTATATGCATGTGTGTATGTAACAAAACACTTTGAAAATAAGAAAAACTTAAAAAAAGCAAATCAGATTTTTAAAGAATGCGTGTGCCTTTGAACATGAAAATATATCTAGGGAT-TAAAAACGGAGAGTAAAGTACCACGAAAAAACTTACAAATTGAAATATTCACACATATACAAAACTGTTAACATGCATGTTATTCTAAACTGCATGCTTAACGGTATACCATACAAATGAGGTCCAAAATACAGATGCAAATTGCAAACAATTGACACTCG--ATTTTGTATTAAGTCCTGGCCATACTTATATTTTTTTATCTA-ATCTTGTAATT-TATCATATTAGTAATCTCCTATTTCTTAAAATTGTAAATGAATATATAGCAAAATATTTTT---------------------GATTATATTTTGCTATGTTTTCATTTAATAATGAAAATACTATAAAATATATAGATATTTCAAATATATTATATTTAATTGAAAAGTTCAAGATTAAAG-CTCGTTTGAATTGATCTTATTCCTTTCAATTGAAAGCACAGAGAATTTTCCTGTATGGCTGTACTTAATATAAAAT---GGTCAATATC-GCCAACACAAGAATTGCAAAAATGTACAAAAAGAATGCTACGTCTACATATACAGAAAATATTTACAAGAAAC--------------------ACAGAC---------CTATATTTCGTACAACTGAAACTAATACAAATAAATGAAAAGAATATATATTCCTAAAAGTAAAAAAGACAAAAAATA-------TTTCTCATATTTTCTAAATTATTTATATAATACAAATGACTATTTATATGTTATGCTATAA------GTAA--AAATAGTTGTAATATTTGTAAATACAGTATTTTTACACCGACAACAATGTAAGAGCAACAGCAACAAATGAGTAAACAAATAACCCATATTTTTAATATACAACTATTTTTTTAGTGGAT-------ATTAACTTGATATATTG---ATGTATACACAATAATAAAATCTAAACG-ATTCCGTA-----ACCTAAATAATTCCCAATGAACG--CTGACATGTTATTCATAGTTA--GCGTTACGTAAAAATGTAGATCAACATA------------AAATGAAAAATTCTT---------------GAACTGATCCACCTAGGGTCTAT-------------AATATTTTGTTTTAAAATCATAA---TATTGGTACTGTGTACAACGTATTTG-----TTTGATGAAATTGTAGCGTTGTTTTGAATATA--TTTCA-------TCCATTTGTTT-------------------ATATGTAGATCG-----------CTGGCAACGTCGATTTTTAAATGTACTGTGTGC----------------------------------ATTCAAGACGC----TGTTTGGCGAGGTTTTA----------AATACTAGAACCGCGAACCTAACTGAAATACGCGCG--------------------------ATAGGGTTATATAGTATAGTAAACACATATT----GAATACTGCGTCGTCTATATGGTCATGAGATGAGTGTAAAGTAAATCGGAAACAAAACTAGTTTTAGAACAAATAATATATTTTATATACATGCATAAAACTGAAACTGAATTATTGATGTCAAATAAAATTTATACTAAATGATTTATAAAAACTTA
>H 16452511 16454637|16940 chr3R 16454637 16454817 scaffold_22 429636 429845 - 1150|0 0
T
T
>CG5494 16497992 16498538|16972 chr3R 16496797 16498591 scaffold_22 475313 477145 - 78333|1235 1871
-GTGACGAGTGGTCGGCACTTGAGAGAAGTTTAACTTCCGATCGACGACGAGCATCTCTATACACTCTGACTAAC--------------------CGACTACCGAAGCCAGCGTGGCGTATGCGTAACGTTGCATTGCGTATTCGCTCGCCAGTGCCACTTTTATACAGC--ATTCGCAACTCTCTGTCTTTCTATACATTTATCTGTTCTATTACTGCTTCTATTTCTTAACCTCTGTCACAAAAACACACGGAAAACTGAAAGCTACTACACACGGGAGATTGAAG-TGCTTCGTTA--------------------------------------GAAGCCTTCCTTGCCCGCTGGGTTTTGACCGATTTGGATTTTCGATCCAGTCACAGCACACACATCTCTACCTACCTACCTACATACTTCTCTCT-GTACTAGGATTTTCCCTCATTTTTTATCTATATCTTT------------------------ATCCTCCTGTTACTTCGATTGAGAAACGCTGTATGAGTATGTTGTAAATAACAGTTGTAATCTTT-ATGTATCTG--ACCAGATATAGATCTATATTTTATATGAACATGCAAACAGACAAATAAACTGCAAAAATGTATTTG
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>cdc2c 16562857 16563054|17037 chr3R 16562039 16563506 scaffold_22 559596 561065 - 41282|831 1063
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>CG31203 16579328 16579388|17050 chr3R 16578901 16580378 scaffold_22 579499 581181 - 31043|516 586
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AAGTT--GGAAAAACCA--AAAAACCATAAAAAATCACAGATATTCTGTACAAAAAAAAAAAAACAGACAA
>CG17838 16631845 16631962|17080 chr3R 16630933 16631947 scaffold_423 5395 6313 - 23909|965 1070
AACCACACAGCAACCCAATTGAATCATTAAAAGCATCATTAACGGCAACTACAACAACAACATCAACAACAACAGCAACCACACAA---GGAAGTTACAGCCACAA
AA-------------------AAAAATCACACACACAAATAACAGCAGCTACAGTTAATAAATGAAAAACCACA-----CGCGGAATTTAGAAGGCACACCAACAA
>RpS20 16648968 16649078|17089 chr3R 16647908 16650024 scaffold_22 1413564 1415766 + 78860|1111 1244
GATCGGCAGATGCCACATTTTTACACCTCGAAAAGTTTGGCGTGCTAATAAAAACAAAGAACTTTTTCCATACACATTTG--GCCAACTTTATTG---------------------TGCGAAAATTGGAGTACT
GATCGGCTGTCGAACCTTCTCAACATGTTGAAAAGTTTCGCATTTTAATAAATCCACA-AACTTTTCATAAATACAATTGTTGTGAACTTTATTGCATTGTGCATGCTTGTTTTAGTATAAGATTTGAAATAAG
>CG31223 16658154 16658186|17097 chr3R 16656855 16658318 scaffold_22 652983 654472 - 51982|1319 1363
GCAATCCTCTAAAATAAACATTT------------CAAAATAATT
G-AACGCTGTCAAATAAAAATATTTAGTTCTAACACAATTTAATT
>Synd 16665120 16665840|17108 chr3R 16662799 16665849 scaffold_22 659370 662399 - 107761|2479 3295
GCGGGCGTAGGGGAAGAATAGGGGAAGTCGTTAAGCAGTTATATACGCGCAGA--------TATGTATATGCAGC-------ATAACACAGAGGTTAGAG--ACGCATTACGGATTGCGTATTCAGTAAAAG---------AGTCGTTGATGAAAAATTACCATACATATGTATTAGAAATTGTTATGAGCAATCGCTTGCACTATTCGTACTTATCCGGACGATAGTGCGGCATCTAAGGCATTGGGCATCGAGTGGATGCAGCGATCCCAACACCGATACCGATCATCCAACCAACCTACCAAT---------------------------------------------CAACTCACCAACAGTAGCAATGCG------GCCGTTAGCAGGCCGATACGAAC---ATGCAGATATGTAACAGCAAACTTAGCGAATGTCGTCAACAGAACAATAAGTGTAAGCGTCAATGTACGGAATGACATTACAAATTAATTGTATTATGTAATATTTATGCTATGTATAACAAACTGAAACTGAAATTATGTACTTTTTGTCATGATGCGGCGGCAATTTTACTCCCTCTCTGT--GCCGTAAACCTTTTATGTGGTCAGCCGGGAGGCGCAGCGTAGTTTTT----GGCATATTTAGATACTGTACATGCATAGCATTTGTAATGCGTTTCTGGAACATTTTATATTATTTATGAAGTTTTGTGTATACATACGTGTTGGATTATGTATAC---------TGTAAATGTACATTTTTAAATGACCTAAATTATTGAAATAAAAAAAAAAC-CAAAACCCG
GTGGTC--------AAATTAGGTGAAGT------GCAACTGGATGTGTGCGGAGCGTGCATTGAGAATATTAAGTTATCAAGATAATACA---GTTAAAAGTATGTATTGCGGATTGCGTATACAGTAAAAGAAAAGAAACAAACGTTGATG--AAATTATTATG-ATATGTATTAGAATTTGTTATGAGCAATTGCTCACACC-------------------ATGGTGTGGCATCTAATGTATTGAACATTGAATTTGTGTTGAG----CAAAGCCAAT-CCAACCTACCAACAAACAAAAAAATAGAAAAGAAAAGAAAGCAAAACAAAACAAAATATAAACATGATACTAACTCACCCACAGTAGAATTGAAATGAATGTAGCTAAAGAACCAGGAAAAACAGAATACAGAT---TAACACTAGAT-------AAAAGGTCAAGAGAACAATAAGTGTAAACGTCAATGTATGAAATAATATTACAAA--AAACATATTACATATGTATTATGCTATAGCTA--AAACTGAAATGTTAGCAAGGTTTTTTTTG----AATGTGCGCGCATTTTTTACTGGATTCAGCTGGTCGTTCACATTTT-TGTGGCCAATTGCAA---TCTGCGTACGATTTAAAAAGCATATTCAAA-----TATGTGCGTGGTATTTGTAATGCGTTTCATGAACATTTTTTATTATTTATGAAGTTTTGTGTATACTT--GTGTTATAAAAAGTATACGTATATTATTGTATATGTACATTTTTAAATAACTTAAATTATTGAAATAAAACTAAAATACAAAACCGA
>CG15695 16670352 16670709|17114 chr3R 16668517 16670614 scaffold_22 663255 665399 - 41385|1918 2202
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ACCCCGGCCATCCAAGCTGGTGGACTGCCGTTTAACCACAGCCAAAGA----TGCATCTGCATTCCTTAGTATGTTCGCTGTCTGTGCCT------GTATCTGTATCTGTATCTCGAGAGTA---TTGTTGCCAA-----TGGCTATCGGCAGTTCCGATCTCACCCTGTGAGTTTGCAAACACA-------CTCCGCAACTAATTTGGGTTGGACACAAATTGGTTGACAATTATATGACAATTGCAGAAGATAATTGCAGCAATAT-GAACGATAGGAAGACA
>CG15695 16670352 16670709|17115 chr3R 16670615 16670769 scaffold_1887 1354 1501 - 753|0 95
ATACTGGCTCTAATTAACCCAAATCTTTGTAAATATTTTTTAAGCTAGTTGTAACAGCCGCTTAGAAATATAAGTTG-TATCAACAACCCAAATCA
ATATTGTGT---AGTATTCAAGATCATTTGAAGTGTGCTATAGA--AGTGAATATAATACGTTAAAAATACGATTGGTTGTAAACTTGCCA-----
>RpS30 16677074 16677156|17122 chr3R 16676264 16677179 scaffold_22 669462 670374 - 30007|820 918
AAGGATTTTG----------GATGAACAAGTGT----CTACCTTTTACTCCAGATTGATATGATTGTTCATAAAGTAATTTCAAACCTTTAA--ACAAA
GATAAGTTTGCAAAAGGAATGATGAACAGAAGCTGAGCTATTTTTTATTGCAAAATAA------TGTTCATATAGTAATTTTCAACAATTAAACACAAC
>TotC 16699207 16699310|17130 chr3R 16699157 16699717 scaffold_1 774764 775289 - 502|50 155
TCACCATTCAGGACTAAGGGATTTTGA-GAAACATTAGATAAACATGTTGTAAGCTCAAGTCCAAATAAAATATTCCAGTTTGAGAAGATGATTCTT-AAAATTGA
TC-----TAAGTATAAAGAACTTTTAAAGAAATGTTAAAGATACATTTCTTAATCTCAAGGCAGACTAAAATATCTTACTCCAATTAGAAGTTTCTCAAAAAACCG
>CG5621 16732975 16733987|17163 chr3R 16731625 16733826 scaffold_72 73208 75523 + 75070|1398 2445
TAACCTGGGCGGTGTTTTCCTGGTGATGGGAGTCGGCTCCTTCTTTGGCATCTTTGTCTCCCTGCTCGAGATGGTGCTGGGCGTTAAGGAGCGCAGCGATGAGAACCAGGTATCCGCCA---------GGATATAT--------TCCAGCTTCGAGAATACCCCGCCTCACGATCCGATTAGCTGGCCTGCC---------TTTTTTTGCACACACACTTGAAAACATTTACAT------------------------CTCCGACATCCTCCGAAAAACC------------------------CACAGGAAGCCCCAGACTCGGATGCCTCCTCGCTGGGATTCGCCAATTTGGGCGGCGTCTACCTTGTCATGTTTGTGGGCAGCTGTTTTGGCAGTATTTACGGCTTGGTCAACTGCGTGGTGAGCGTCTACTTGAGAGCGCGGGAGAACAAGGTAACGCG-------GATGGAGACC-----------------TATAAATATATTCCAA----------------------------------------TGTTTCGTGACTAAAAGTGG----CGGAGAAAAGGTCGCCC----------TAACGGATTCGTTTCATCAGCT------------------------TCCCAGAACGACAGCTCGGAGCCATAAATACATTCACCACCTTTTCATTTGTGTCGTCTTTAATATTTCAATTTTCCTAATCTCGTTATGTTGTCTACTA------CAATGCCTTGTTCATGAATGCTT--TATGATAGATTTCATCCGCATG-CTACTTTCGCCCTTCCATCAGTAAAGAGTTTACTT-AACATCAACA----CTTTCATATCGGCAGGTGAGCTTCAAGACGGAACTTCTCGACGAGATCCGCTTCATTTTACAATGCTCCGGCAATACCAAAGCGGTGAAGTATCCGAAAAACTC------TTCGCGATCGAATGCCAGCTCGAAATCGAAAGGCTCTTCCATGTCAGTGGATTCATTGCCCGAGGATACCTCAGAAGCTGACG
CAATCTGGGCGGCGTTTACTTGGTGCTGGGTGTGGGCGCCGCCTTCGGCGTATTTGTGTCCCTCCTGGAGATGCTGCTGGGCGTCAAGGAGCGCAGCAATGAAAACAAGGTA-CTGCCAATGCTTTTCGGTTATCTGGAACGCGTTCGCTTTGGCGACCATTTCGCTTTATTATGTACTTGGCCTGTATCCCAAACACACACACATACACACACGCACCCACACACATACACATACACACACACACACAATGGCAACACCTCGTTATGTTCATCACAATTTCCGCCATCGCTGTTGACATTGAGTACAGGAGGTTGCGGATTCGGATGCCTCCTCGTTGGGCTTTGCGAATTTGGGTGGCGTGTATCTGGTCATGTTCGTGGGCAGCTGCTTTGCCAGTATTTATGGCCTGATTAACTGCTTGCTCAGCATCTACTGGACCGCGCGAGAGAACAAGGTAACGAGCAGGAGAGGTGGACGCTCTAAAAATACATATATATATATATATATATTAACAGCTATCCAGCTCCTCCGACGCGTTGGAAGAAACGCTTTTGTGTCGTGACTAAAAATGGGCATGGGCATAAAGGTCAATTGTGACTTAAATAACGAATATTTTTCAACAGCTTGTACATCGATTTATGGGGTAGCATTCGATATCATCAACTTGGTGACCTAACTAAAACTA----ATTTTCATATTTTTTTTTAACAGAAACTCGAACTTTAAATAACAATCATATCTTTGACTAGTTATGCGATATGCTTTGCATGGCAGCTTACCATAATCAAT-------GCATGCCCACCTTTGCC-------------AAAGTTGACCTAAATATTAAAGGAGCTTCGTACATTCCTAGGTCAACTTCAAGGACGAACTTCTGGATGAATTGCGCTTTATTATACAATGTTCGGGAAACACTAAGGCGGTTAAGTATCCCAAGGGCTCGGGCAGCTCACACTCGAGTGGCAGCTCCAAGTCAAAGGGATCGTCTCTATCTGTGGACACTTTACCTGAGGAACCATCTGATGCTGATG
>Atpalpha 16792471 16792621|17216 chr3R 16792062 16793215 scaffold_13 1447655 1448861 + 37055|418 569
CC-TTTTTAACACCAACTCTGAACGTAAATTGTGCGGCTGACTGCACTGCCGATCAGATTCCTGCCATATCACTGGCCTACGAGGGACCCGAGGCTGACATCATGAAGCGCCGGCCGCGCAATCCGGAGATCGATAACCTAGTCAACGAGAG
CCATTTATAAAATGTATTGTAAATTGTAAACATTGTGCTGCCTGCCTT---GGGCAGATACCAGCTATATCGCTGGCCTACGAGGGACCCGAAGCGGATATTATGAAGCGGCGTCCACGCAATCCCGATGTCGATAATCTAGTCAACGAGAG
>Atpalpha 16798895 16799069|17220 chr3R 16798527 16799085 scaffold_13 1456121 1456644 + 15096|410 584
GTTGATTTCGATGGCCTACGGACAGATCGGCATGATCCAGGCCGCCGCCGGCTTCTTTGTGTACTTCGTCATCATGGCTGAGAACGGCTTCTTGCCCAAGAAACTGTTTGGCATTCGTAAGATGTGGGACTCAAAGGCTGTTAACGATCTAACTGATTCCTACGGTCAAGAATGG
ATTGATTTCCATGGCCTATGGACAAATTGGCATGATCCAAGCCGCCGCCGGTTTCTTTGTGTACTTTGTGATTATGGCTGAGAACGGTTTCCTGCCCATGAAACTGTTTGGCATACGTAAGATGTGGGACTCCAAGGCTGTTAACGATCTAACTGATTCGTATGGTCAGGAATGG
>Atpalpha 16799228 16799460|17221 chr3R 16799086 16799820 scaffold_13 1456831 1457514 + 31349|143 375
ACCTACCGCGACCGCAAGACCTTGGAGTATACCTGCCACACGGCCTTCTTCATCTCGATCGTGGTTGTGCAATGGGCCGATCTGATCATCTGCAAGACGCGTCGTAACTCGATCTTCCAGCAGGGCATGCGCAACTGGGCTTTGAACTTTGGCCTCGTCTTTGAAACCGTGCTGGCCGCGTTCCTCTCATACTGCCCGGGCATGGAGAAGGGTCTGCGCATGTACCCCCTGAA
ACCTATCGCGACCGCAAGACCTTGGAATACACCTGCCACACTGCCTTCTTCATATCGATTGTGGTCGTGCAGTGGGCCGATTTGATCATTTGCAAGACGCGTCGTAACTCCATTTTCCATCAGGGCATGCGCAACTGGGCCTTGAACTTTGGCCTCGTTTTCGAAACGGTGCTGGCTGCCTTCCTTTCATACTGCCCCGGCATGGATAAGGGTCTGCGCATGTACCCACTGAA
>Atpalpha 16799533 16801022|17221 chr3R 16799086 16799820 scaffold_13 1456831 1457514 + 31349|457 749
ACTCGTCTGGTGGTTCCCGGCTATTCCATTTGCGCTGGCCATCTTCATCTATGACGAGACCCGTCGTTTCTACTTGCGCCGCAACCCCGGAGGCTGGTTGGAGCAGGAGACCTACTATTAAACACCCACACTGCTACACTCCCACACACACAGCCACATGCCCACACACGAATGCACACCACAACAAGAGCAACCAGGAACACCCGCAAACAACACCTACAAACCATGGAGAGCAACAAATAG-AAATGTTTATGAACCACAAAACC---CACAAAAGCAA-CACAACCACAG
ACTCGTCTGGTGGTTCCCAGCCATTCCATTTATGTTGGCCATCTTTGTGTATGATGAGACGCGTCGCTTCTACTTGCGTCGCAATCCTGGCGGCTGGTTGGAGCAGGAGACATACTATTAAACAGCTAC------ACACACATGCACACACAACCA---------ACACACATCTACACCCACACAA-------CACAAATAACCGCAACCAGCA--------------AAGGCAACAAATAGTAATTGTTTATTTAACACAAAGCCACTCACAACCGCAAGTGCAACCACAG
>Atpalpha 16799533 16801022|17222 chr3R 16799821 16801959 scaffold_13 1457844 1459854 + 39042|0 1340
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TAAGTACAATTTCAGCAACAACAGCAACAAATAACAACAACAAAAACGGCTATAGCAT---------AAAACATATTTGAATATGTTTTAGATTTT-AATTTAATTATTTAAAGTGATAAATAAAAACATACAAAAATGCAAGCGATAATTATTTTAAACGTTTAAGTAAATTTAAATTATAAATTAAAGCTATAAATAAGATTTAAATAAA-----AATAAAGTTAAAACTT-CAAGAAAAACGAAAAA----------AAAAAACAAAACAAAACCAATTTTCGACAACAACAAACCCA---------CAAACAATAAACTAACAA--ACAAGTTTTTAGTAAAATTATT----TAACAAAAAACATAAACAACAATATTTAATAACAGATGCTATACAAAGAAAATATATAGAAAACGAAAAAGCGCCAAGAAACAAAAGCAAAGCTAAGCGCAACTAACATAATTAATACACACACACACACACACTCCACACACACACACCACACACATACACAACGCATGAAGAGACAAATTATATAAGAAGTTTAGAGAAATTAATAAAATAAAATTTAAACAAAGAAAAAAAAAAACGAAAATTTTGACAGAAAACAAAAAACTAAAAAGCAAAAACAAATGAATAAATTAGCGTAGTTACAAAATAAGCTGAGAAGA------TGCAAAAGATAAAACAACAACAAAGTACATTTCGAGCAAATTTGTGGGGCA--------------------------------------------------------------------AAATGCATAAATGAAATTAAATAATAAAGAGGCAAACGCAATTAATATAATTGTTTATATATAT--ACACATATATTATATGGAAACAAAACAAATTTGATTATATAAATGGAGCTATAT-ACAATACTTACAACAACAACAACAACAACAACAAACGAAACCTACCAAACTG---GCGGCATAGAGCCAAACGGACCGGCAACAGCAGCATACCCCATGCCCGGGCAGCGTATGCCCCGCCGGAGCTGTCGGTCAGCAAGAGAGCAAGAGCCGGAAAATAAAAACAATTTGTTATATGACGAGTAAATGTTTA--TAAAAGCCATATAAAAAATATACAAATTTAATACTTATGCTTTGTGTGCATTTTAAGCCCAAGATAAATAA--------------------------------------------------------------------------------AAAACACAAATCTCAAAC---ATAAACATATAAGCCACGCCCA------------------------------
>Calx 16838818 16840182|17259 chr3R 16838589 16840669 scaffold_13 1510053 1512211 + 17426|229 1788
GGAGTTCGCAGCCGCGTTGGTTTGGCTTTGGCTTGATTATTCGCAATGGCGT-------TGGACTTTTCCGTCAAATTGAAGAGGATCGTTACGGCGGAA----AACAGAGCTAACCGATACTTAGAAGC-------------TATTGAAAGATGCTGTAGATGCAGTTTTTATATGTAAACTTATGAAATTGATTTATATATATATGTGCTCGGCGCGATATATAAATATTT---CTTGTGTAAAATTTATGTTAATACTAAAAGTAAAATTTAAAAGTTTAACTAGGTT-TAAGCCAGGCTTATAT--ACAAACCATTTTTACGATTATTGTCTCT----ATTCATATATGAATTGTAAATAC-AGAAAGGCTGCCACGGCTCAGCAATCTTGTAACCGTAACGAGATCATTTACTGTTAT---GCCATATATACTTAATTTAC---------TTTCTAAAGAATAC--------------TATTATATTTATTAT-----------------ATCATTCTGTGTATAACTTAAGTC---------------------------------------------ATTGTTGTTGTTTGTTAAAGCTGTACTTAATCGACCCCATAAAATCAAAACGGGAAAATCGGAATCGATTTAGAGTTTAAATCGTGTTCCGTACTCCAAACTCGATATTGTCTCTCCAT---TTGCCGAAAA----CCATTGTTAATTTAATACATGTGTAAGTTTTAGGA--AAGATCTAAAGGT---TTTAGCCAAGAAGAAACGCAGTCCCTCTAGCCATCTACTACAAATACTACAATTATAACTACTACTACTGATTAGGGGCCTCCTTGACAACTAGTTCTAGTCACCTCACACTATC-GACACAAGTCCAACTAGCAACACTTTC---------------ATTAACTCTGACCAAAGCAAAAGGCGGCACTACTTACTAGCGA------------TTAGCTGTTAGCGATTAG-------------CCAGAAAGACCATCAGTG-TGTCCACACTGCACTATGAAGAACTACACGTACTACCAGTGAGCACTAATCAATTTACTTAAAAAAAGACTTTCTATTCGCTTACGTCGCTGGTATCGAA---GTAGACAAAACTGGATATTAAGGCAAACACCAAAACAA-TAGCGA-----AATAATAAGGAGAATTACTAGAATTGATTGTAAACCAAATGTAACGAGCAGGTACATATTTTTTGTATAATG-TACTATTTTTCATATAACAAAATTGTAGCAAATTAATGGTGAGAAGAGAAGCCTAATGATATTTATAGCCACATGCATAAATTTGTATTATATATTTGGGGTCACACAACTGTACGGGGAACTCGTTGAGAAAACTGCGCCAAATTTAGACGTAAT---TGATTATTAATTACTGCATATACGAACTATTAAACAATTTAATAAATATACAAACATGAATAAAT-AATAATGTACTAAGT---TATACTGTCAACG-TTTACTGCTAGATATTATAATTAAATTTCTTTTTAAATTTA
AGCAGCCCAGACCCCAACAAACACTCACACACACACACACACACACACACACACACACACACACCTACACACCCATTT----AGAATAGCTGTAGCGAAGCCGTAACAA---TAATCAAAATGCATAAGCGAAAACTTTGGCTTATATAAACAAATTGAA-----ATCTGTTATATATATATATGTATAAAT-ATTTATGTATGTAT-------TAACGCTACTTAAATATTGATAATTATGTAAAATTTATGTTAATATTAAAAA------TTTAATGTTTAATTAGTTTCTAGGTGTGGCTTATTTTAATGAAACGGTTTTATTA-TATTACCTATATAGATTGTTTTAAGTATTGTAAATACAAGAAAGGCTGCCCGGGCTCAGCAA------ACAAGCAACGTGATCATTCAGAATTACAAAAACACATATATACAATACACACATACATACATATAAAGAGCATAGAAAATAACGATAAACGATATTTACTAGCTTGTGTGTATGTTTCAGTCGTTCTTTATGCAATTCAAGTCATTATTATTATTATGATTATAATTATGATTATAATTACGATTATGATTGTTGTTGTTTGTTATAGCTGTACTTAACATACACAGTATATACATA------------------------TATATAAATAATG-------------------AATTGTCTCTCCATTAATTGTCACAAATCAGCCATTGTTAATTTAATACATGTGTAAGTGCTATTCTTTAAATATAAATGCATATATAACTAAAAATAAAAA---------TAAATAAATAAATCAAATCTTAGCTCTTGAGCTA--GCTACTTATTA---------CCAACAACTATTTCTAGTCA-ATCGCACTTTTAGGCAACAAACTATTTAACAACTGCTTCTGTAGATTAAACTAAATTGACACTCAATAAAAAAAAATGAAAAACAATAAACTAATTAATGCTCAGACTCTAAACTCCGACCAATTGAAATTGCGGCACTTTTAGTACGACTATCAGTGTTAATTACACTGCACTACATAACTCTA------------------------CTACTTACTT---GAAAGACTTTC-ATTTACTTAGTCACCTTCTATTGAAACGATAGATCAAACGATAAATAGCAACTGATTGATAAACGATTAACGATAAACGATATTAAGGCAAAACACCAAAAGT--TTGTTAAATGAATG---------------TATTTTTTGTATAATGTTATTCTATTTTTTAATACAACATTTG---AAATGGATACCAAAATAAAATACATAATAA---TCAAATACAAATACACAGA----------AAACCTACAAAAAAAAAACT------AGAACCTTATGGGAAAA-TGCGCCAAATCTAGATATAATACCCAAAGATAAAT------AAAAATAAATAATATAAATATCGAATACATTTA-AGTTATGAATAGCCGAAAAATGTATTTAATGCATATATCATCAATGTTTTGCTGTAAGCTTTGAAAATTAAATTGAATTTTTCAATTA
>CG5697 16842482 16842842|17262 chr3R 16841998 16842550 scaffold_13 1513706 1514269 + 16789|511 599
TGGCCGTAAGCTAATCTGTG---------------TAGCATTTTGGA-----GATGCCGCAATCCACCCTGCGGAATTGCATCAGCCGC
T----TTGCTCTAATCTGCGCGCACAAATTGGAACTGGAACTCTTGATTACGATTGCTGCAATCCCACGGATTGGATTACATCAGCCGC
>CG5697 16842482 16842842|17263 chr3R 16842833 16843113 scaffold_15 159362 159682 - -15|0 9
TTACTTAAAC
TTCATGAATT
>Rlip 16845930 16846475|17267 chr3R 16845052 16845955 scaffold_42 10025 10973 - 28996|937 965
TGTATTAA---TTCGATTAATGTATTACT
TTAATGCAAATTTTACTCAGTGTATGTCT
>Rlip 16845930 16846475|17268 chr3R 16846189 16847500 scaffold_17 1752141 1753610 + 15389|0 290
GCAATATATGAGAATTTTCAGTTCAGCTTTTAAGGAGATAAAATACTGCTAAAACATAAAACGGATTCCTCATGCCTAAAGTCAGTTTATTGTTTATTTGGAAATGAGCTAGTTTCAGACTTGACCC-ACCGAAATATATGTATGTATATAGGGTTACCAATTTTAAATCTCAATGTCTACTTGCGATCAAATGCTTTGTTCAAACTATAATTACTGTTAA-ACGGCGCAAAGCCCCAAAGAAATCTTGTTAG--ACAACTTTACTGCTTTCAACAATTAAATGAGAAAAC
GAAATATACGATATTTATCTTTCCAGCTTTTAA--AAATAACTTCATTTTTGCAAATATTAT---TACTTAATCTCCAAAGACACCTTAGCAC--------AACTGAG--------AGGCTTCACCTTAGAGCATTTTGCGGGATTTCACTTGGTTAGAGATCTAAAATTTCCATTCATTGATTTAACCAACTGATT-----GAGTTATAATAAGTGCTAACAGGGCGAATAATTC--------GCTTATTTGTTGCGACTTTG--GAGTCCAATGGAAAACTCTGACGTC
>AnnIX 16895089 16895486|17304 chr3R 16894981 16895582 scaffold_17 1811193 1811938 + 14392|111 661
AAAGAA----------CCCCATCCAACAAT----AATTTATCTCTTTC--GTCTGTTCCACGCTCTAAACTATATGCAAACAGAATGTACAAACAAAATTCCGATATCAAATAGTTG-------------------------------------------------------------ACAATGTATAGTTTTTGAAT-------TGGAACACGTTTTAACGAA-GACGCAGTGCATTTAAGTCGTAGAATCAGAACCCCAGTCTCGCATCCTGTTGATTATTATAACCATTGTGACTTTTATTATTATGACTATGCACGCCACATGCACATAATTGTATCTCTATAATTACTACACCTCAGGCT----------------ACTTGCATTGCTGTGTAGG-----TATACTTTCAGT---------TTTGTTTTGAGTCTCATTTGCAAGATATTTTAACT----------TTTAAAAAATACGAAAATAAAAAATACGAAAAAATGAAATACA----------------------------AAATTCAAA
AAAAGAAATCACATGCCCCAAACCAACAATACAAAAATTGTCACTGTCGTGTCTGTTCCAAGCCTTAAGC-----ACACACATATTGT----ACAAAATTTGACTATCGAATAGTTAGACCACATATACATATATAAATCTTATATGTACCTATATATACATATATATATATATATATATACTATATGATCTACGAATGCAAATGTGGAACACAGACTTACGAGCAACGCAGTGCATTT---------AATGAGGCCTACAGTCGCATCACATGTTAATTAGTATA--------------CATAATT----TTATGCACACTCATTGCACATAGTTTTATCTCAATTTTAACTATACCTTTATATATATATATATACATACATATGCCTTGCTATATCTGCAGCTTATGTTTTTTGTTTTTTATTATTTGTCTCGAGTCTCATTTGCAAAAAGTTCTAAGTTACAATATTGTTAAAAACAAACAAAACGCAACAATAAAAGCAAATAAAATCTAATTAATTAGGCGTCATTTTGTACTTTATACATTTGAA
>AnnIX 16896054 16896261|17306 chr3R 16895883 16897569 scaffold_17 1811960 1813690 + 52286|190 417
ACGGAAGCAGCCG-------GAATATCCGAATATCTATGAGCAATACCCCACTGTTCAAGTAGAAAATGCCAAAAACAAAAAAACGTTGCATTTCCCCAAAAAAAAGTATAACAAAAGCGAAGAACAAATGGAGTTG----GTCTATATACAGTAGTTGTGATGTGTTCTAAAAATCCAATCTACAAAACGCTTAGTATTTTC---------CCTCTGTGCAATAACG
AAG--AGCTGCCGTGCGCCCAAGTATAAGAGT-TGTA-GGGTCTTATACAGCTGTGCAA-TAGAAA-TGCCAAAAATA---------TGCATTTTCGAAGACAAGAG-----AAAGAACCTGAAATTATTAGTGTTGTGAAGTGCTTCAATTCCAATTGTAATTCTCATTAAAATGTTTTTTTCTTAAACG-----TATTTTTGAAAGGCAGCCTGTCTGTAATAGCG
>AnnIX 16896500 16896639|17306 chr3R 16895883 16897569 scaffold_17 1811960 1813690 + 52286|698 865
GGATTTCCTCGTTGGATCGATTGTTAACCATTC---TATTTGTTGTAACTCTTACTTTAAGGCAA------GCATCGTTTGCCAACTGTTTTGCGGAAGATTCATAGCCTATGTTCAATTCATAAATGCA--------------CTGTAAAATCGCGG-----TAAAT
A---TTTAGTACATGATTTATCAAAATACATTTCATTATTTGTTGTATTCCTTTCTTTTAGCCAACTTTTAACTTAATATTAAAAATGTTGTTTTGAAAATTCCTAAC---TACTTGTCTTTTAAATGCTTTTGATTCTTTTGTCTGTGGCTGCGCTTAATTTTAAGT
>CG5745 16930739 16930835|17341 chr3R 16930536 16931152 scaffold_41 756721 757369 - 13919|203 338
CAAAAGCAACAC-AAACAACGCAT-----ATACGTAACTTAGAAGTTA--GTTTATTACGATTTGCGGAATATACCTACACA-------------------------------ATACACGTACGCTACATACATCT
CAAAAGCAATCCGGAATGATGCATATACGATACGTAAAATAGAAATTAGTGTTTACTACTTTTGCTGGTATACATATATATATATATTTATATATATATAGACACACTCACACACAAACGTAAACATCATACATAT
>rtet 16936430 16936554|17344 chr3R 16935639 16936532 scaffold_41 762005 762876 - 32015|812 938
GTGCAATAGGAATAGAGTTTT---TAAACTCACTAGAGATCAA--------CGGAAGTATTAGCTGCACATTATACTTAATTTA-TCGTTTTTTAC------------AAGTATTTTATATTAAAAT
GTACAATAAGAACAAAGTTTTATATTTTTTTTCTACAGAACAATCAGCAACCGCTAGTATTACTTGCACTATATACTTAATATACTCTTTTTCTACCGCCTATTCTTGAAATGTTTTAAGCAAAAAT
>Rab11 16941107 16941877|17348 chr3R 16940445 16941649 scaffold_41 766639 767701 - 48554|662 1270
CCGCCCCAAGCAATTTTCGC--------TATTCCCC----GCAACCGCCAGAACAGCAACATAAACAGAAGCAACAGCAATTACAACTACGACTACAAGAGGAGCAGCAGCGGCCAGAACTGCAACACCAAGATCAGGAGCAGCGTACACCCGATGGACCGCACAAGATGTCTATGCGTTTGTCAGCCACAGTTTGTCATGTGCGCATAAATTGATAATTCAAATCTGAGCCGCCACTCTCCACCACCAACACCACCACCATCATCAGAAGCAGCAGCAGCAGCAAAAGAATCGAAAGCAACAACATCCGGCTGTAGTTAACTGCGGTTTAAACTGAAGTTTTATATAT----------ATACAGATCCATGAGTATCGCATAA--------------------------ATCGACCGCCGCGGAAAGAA---------AGCAAGCAAAAC---TAAACACTCCAAATTCAGTTTAAGCTGTAG----AACTATAATTTATATAAATATACATATATGCTAATATT-AAAATATTAATATTATTAATTTTTCGCAACATAAATATATAGTTGTAATTTCGCGAG-CAGAACAACAACAAACAACCGGAA
CCGCCCCAAGGATACGCCGCGGCAGCAGCAGCCCCCCGCAGCAACAGCCAGAACAGCAGCAATAGCAAGAGCAACAACAATTACAACTACAACAACGGCATAAGATGTTATTTTTTAAACCACAGCCACAAG---------------------------------------------------------CAGTTTGTCATATATGCATAAA--AATAATAATAAT--------------------------------------------AATAACACCAACCGCAA------------CATCAACACCCGGCTGTAGTTAACTGCAGTTTAAACTGAACTTTTATATATAAATGAATGAATATATATAAATGAATAATGAATAATATATTGCAGAAAGATTCAATGGCTCTTCGACATCTGAAGAAAAAAATAGGAAAGAAAAAGCGAAACACTAAAACACTCCAAATTCAGTTTAAGCTGTAGCTGTAACTATAATTTATATAAATATACATAAATGCTAATATTAAAAATATTAATATTAAT-ACTTTTCGCAACATAAATATATAGTTGTAATTTTCAAAGAAAAAACAAACAAAAACAACTAAAA
>Rab11 16941107 16941877|17349 chr3R 16941732 16941874 scaffold_41 768012 768155 - 6811|0 158
ATTGGCCACTTGGT-------AAAACTAGCTGATAAAGAGAAATCAAACAAAAACAGTTGTAAAACTTTAAATGCATAAAT---------GAAACGAAATAACATCATTTGTGTTTGCTATGTTAAGTGTGATTAAATAAATATAATTTAAATAAAACA
ATTGACCACATGAATTCTTCAAACACTAGCTGATAAA---------------AACAGTTGTAAAACTTTAAATGCAGAAACGGCAACATAGAAAGCAAAAATCATCATTTGTGTTAACTATGTTGTGGGTGATTAAATAAATATAATTTAAATAAAACA
>ppan 16943578 16943622|17352 chr3R 16943566 16944666 scaffold_41 770021 771119 - 36630|12 56
TACATTTAACATAAGCTATTTTATAAAGACCATTGGTTAACACGA
CGCAATAAAAGCAAAATATTAGGT--------TTTATTAAATAGT
>CG5793 16954616 16954630|17363 chr3R 16953466 16955693 scaffold_3 4093777 4096090 + 41123|1244 1274
-----------AAGTGAAGAAT-----TTAA
TACAGACTAATAACTGACAAATGACAACTAA
>CG5798 16963573 16963938|17367 chr3R 16961026 16963937 scaffold_3 4524429 4527320 - 97792|2629 3059
ACGCTTCGCTCGG--------TTTCCTTTCGGTTTTTACCCCTTTCGTTTT----AATTGTTTT----TTGTTTTTCTCTCATATTATAGCTTTTAAGGTCTAGTCGCCACACCCTTTTAT------------CATTTACAAATTACCGCTTAACTGTTAACTGCTATT-------------TAAGAGGATAATCGC-----TTGTTTGTTGTTGTCTAGGC-TCTTAGAACAGTAT-TACGCGTGGGCGTA----------------TTTTCAATGGGTGCAGGCTGCATTCACTAAAACCAAGAACTTCAAGTGCATTAC-CAGTGTAA-CAAAGAGAAGCCCGCATATACGCCTGTGTATGCGGGACTATAGTTTATTGTATTTTGCAAATATATTTTAAAACCAAATAAACGAAATTCAATTTCTGA
TAGTCGCAAATGGAACTGTTCATTATTTTTGGTCCCTAGCTATTTGTATTTACCAAATTGTCTGCCTATTATTTTTTTCCT------TAGCTTTTAATGCCTAGTCGCTTCACCAATTTACTGCAAACTGTTGCTTTTATTAATTAATGCTTTGTTGTTGTTCAATATTGGACCTATATTTATAATTTTACAACCATTACCATTATCAGCTAATATTCGGGTATCTTATATATATATATATATATATAAGTAAAAAAAAACTCAAGACGTTACAATATTTGTA---TGGATTTATGAAA------AAATTTAAGTGCATTACAAAGTTTAACCAGAGAGAAGTT-------------------------ATATAGTTTATTATATTTTACACGCATATTTTTAAACCAAATAAAGGAAATACAATTTCTAA
>CG5798 16963573 16963938|17368 chr3R 16963938 16964286 scaffold_35 49775 50097 + 1337|0 0
T
C
>CG5802 16965762 16966178|17369 chr3R 16964581 16965798 scaffold_3 4527642 4528809 - 53596|1196 1232
AATTTGATAGATGATTGCATAGCCCTATGTACTGTAC
AATTTATTATAATA----ATAGCTTTATTTGTCGTAC
>SNF4Agamma 17038250 17038413|17418 chr3R 17035498 17038422 scaffold_3 4612796 4615767 - 100407|3041 3204
ACCTAAACCTACACCTTAACACTTAATTTAAACTTATGCTAAAGAGATACAGCTGTTACAGATACAAAAGAAACAAAAAAAAAAACAATTGCTAAACAATAACTAAGAACCCCAAAACACAACATTAATGATAAAGCAGAGAACATTATATTTGAATATGAATA
ACTG------------------TTAATTTAAACAACAAACAAACAAACCCAAAAA--ACAAACACAAAGTGAGCAAGCAAAAAGGAAA----TAAACAATA------------AAAACATA----TATTCAGAGAAGAAAAACAATTATATTTGAATATTATTA
>CG5862 17041870 17041950|17421 chr3R 17040811 17041915 scaffold_3 1839389 1840484 + 50732|1068 1130
TGAGATTTGTTAGCCATT----------------TGTATAT-TAAATTTATATTTAGATGCGA
TGAGATTTGTTAACCATTACCTAAATAGTTGAAGTGTATATATAAATATATATATAACCGTAA
>CG5871 17048362 17048572|17424 chr3R 17044971 17049306 scaffold_55 366330 370862 - 150478|3590 3917
-------------------------------CGTAGCTGGTTGCCACCT------TCACTGCCTCCACTTTTAATGTTCCTTCATCTTTGGTATTCCGGCTAGCGGTGCTAGCTACTC--------ACGTCATGTCCTCGTCCTTTTTGTATTC------------------------------------------------------------CCTTGAGGTATAAAGTTTGTATAACTGACCAACCC------TTCCAGCATTTATCGTAAGCAT-TGTTTTCTTACTG--AGAAAAACAATAAAAAT---ACCAATTTAATAAAA
CCCTCGACACTGAGATCTCGCGCTCAAGCCCCATCAATGGGCCTCATCCACGTGAACACTGCCTGCGCGTCTGGTCTTTATGGTTTCCTAATTATCTGTCTATGTGCATTAGTTGTTCTTAAATAATCTTAATAATCT-GTCATTTATATATTTATCGTGAAACTCTTTTATACGGCTGTCCTCTAGTATTGACCACATCGGGTCCAGTGTACACATCGATGCGTACGATCGATCCGACTGTCTCCCCCCACATTCTCAAGCATTTCATTTAAGTATATGGTTTTTCTCTGCACAAAAAGCAATACAACTTAAGTGAAATAAATAAAA
>CG5874 17054509 17055234|17428 chr3R 17053546 17055481 scaffold_55 376292 378520 - 48550|1054 2048
TCCACAAGGGTCATACGCATAGTTCGCAGCAAC-AAGTGAGCAGGGACAGCCAGGCTGCAACTGGTT---------TGTGCGTATAT---------GGATTGTTGAATATGTA--TTTTAATTTGTCATCCGTTCTGCATGGGC--------TGCTTCGCTGCCGCCCCTAATTAGGCTATT-ATAAACCCCCTCTCTCCTAAAAACCCTCACCACAACCTCCCGCAGTCAGCAAG---------ACGCCCTAAGAAATGCTGGATATAATGAAACTATTTTATAATTAAGATAATT---TAGCTGTACAGTTGTTTAGA-------ATGTAG--TAAAGGCTAGCGCTT-AAACATTTAGTAAACAGGCC-------------------------------------CGTTCGTACATCCATAAAAACACCCATTCATCCAAGCAC--------ACTGGCATAATCACCTC------------------------------TGGCTGAACGCTTCACTGGAGAG-CAGTTGGCAAGGCGGATGGGCCAGAAGTGAGCGTTTGGACGGATCACATAGGCACACACACATGC-CTCACACATGCATTTTA-----------------AAAC---------------------TGCATATATATACCTAGC-TTATGTAATT-GCTGTCGAGTAA--AAAGTGTGTAATTATCTTACCAAGCAGCATAAAATTTAGAGACGCTGATCGGCGCTCGTATTCATTA------------------------------GAAATCTAATGAAAATATATTTAGTTTTAGATATATATGTATGAG-----------------------------------------------------------------TCGC---AGCCACCACAGCAAAATTAACTTAAATCTTGAAATGTGTAATAGACAAACAATAAAACTAGCATATGTATTTATGGCTTAAATGTT
TCCACAAGGGTCATACGCATTGTGCGCAAATCCTAGGTGGGCCT---CCGATAGGCTCCTCCCCGATTTGCCGTACTGTGCGTATACCCTAGAATGCTATTGCTACAACTGGAGTTGTTTGTGCGTCATTCGTTCTGCATGGCCAGCAGCTGTGCTTGGCTAT--TCGCTAATTAGGCTACTAACCAATCCCCCATCCCAT----CCCCTCACT-CTCCCTTACGTCGCTACCCAGTTCTTTCCCCCGCTTTCCAAAATGTTGGAAATAAATGAACTATAAAACAATTAACGTAAATTAGTAGCTGTACAGTTCTTAGTATATATGTATGTAGTATATATGCTAGCGCTTAAAACGTTTAGTAATCATGCCACAAATACCCACACAAACATAAACACAGTAATATACACACTCATACACACTCACACATACACACTCACACACACACACACACAAACTGACATACACATTTCACACAACCAAGCATATGCATAATGTATGATTAGGAGCACGCTTGACTGGAGAGATGAAAGATGAAATGAATGG--CAAATGCAAATGATCGTACAT-TCACATACCCCCACACACACACACCCACACACACATTATATGTGCACATTTATATGCAAATATATACGTAAATATATATATATATATATGCATACTTAGCATTATGTAATTAGTTCTCGAGTAAAGAAAATGTATAATTAATTTAGCCAGAAGCATAATAAT------ACCTTTTTGGAGCTCACTTTAAATATTACAACAAAAAGAAAAAACAAAAAAATACAAAAACTATATAAAATATTATGAATATTATGAATGTATGTAAAAGAAAACAAAAAAAAACAAGAAAAAAACGGCAAGAAAAAACGAAGAGATAAACCAAAACAAAAATATTGGCAAGAGCAACCGCAGCAAAAATAATATTAATCTTGAATTGTGTAATAGACTAG-AATAAAGCAACCA----TATTTATGGCTTTAATGTT
>CG5892 17071052 17071140|17446 chr3R 17070995 17071655 scaffold_1737 1228 1857 + -2349|71 159
GCAAATCGAACGGACAAAAATTAATATAGAATATTATTTATACTTACATGTAGTATTAAAATAAAATAATGAAAAATAAGTTTTTAATT
ACATGTCAATAGCATAACATATTATGTAAAATGTAATGTTAACTTATTTTGATT-----AATCAAAAGTTGAATCATCAG----TAGAT
>ETHR 17088524 17089330|17475 chr3R 17088475 17089434 scaffold_55 423652 424528 - 18203|50 910
GCGAGATGGGCGTGAAAAATCGCCTTTAACCCGTTTACACACTCGCTTCACTTGGCTGGAATGTGCCGATGACGCTGATCCCGATCCCGATTCCTATTCCCGCTCCTGGTAAACACAAATCGCTTCCTGAACGCTTTTGGCAGCCATAATCGATTTCAGTCAC-CCGCTGACAGCTGCCGAGAATCCCGAATCGTAGTTGGGCTGCCGCCTTGGACATTTCCGTACC------AAAAACAATCAATTTTTCGGGCTATTAAACTCGAATGAATGTGCCAAAGATAAATAACAGCAACGACAGCCGAACAGCACTAA----AACTACCACTACTGGTCAGG------GTTAGGAGTCCAGATATCGACTGGCAGTAAGGGGTAAGCCATTAGGTGGCCTTCGAGGAGCGGAGCTGGCAAATGGAAATGGCTTAATATGCGTTTGGGCGAA-CCATCAGGTCGGCGGATAAACATGATTTAGGTGTATTGAAATA---------------GTTTCCGTACGCCGGACCG------TACAAAATGGCCGCCATTACACG-----------GGCGGCCATCACCGGAAGTCGAAAAAACTGTTGCCTACTTGCCGGCAGCTCAAATAAAAAGCTTAGCTCAATATGCACACAATGTCCACATGTAA-ACACAGCTGTACATACACATACATACCCCCACACGCACACATAGCCAAATATTAATATTTATATTTGTACGAACATATTTATATACACATATTTACATATATATAGTCTGCTTATAAATATGTACAAGGAACCACACGCACACACTCACACACACACGAGAGTTTGTAAGTAAATAAA---TTTTTTATGACAACTCA
GCGGAACGGA-ATGAAAAATCATGTGTAACCCGTTTACACTTACGCTTCAGTTGATTGGAATGCGGC-------CTGTCCACAGTCTCAG---------CTGATCCTGGCCA----------------------------CGCCCGTAATCGATGCCATTCAGGCCGTTGACAAGACCCAAG--CTCAAAATC----------------CTTGGACATATCCGCACACAACCAAAAAACAATCAATTTTTCGGGCTATTAAACTCGAATGAATGTGCCAAAGATAAATAACAGCAGCGACAGCCAA--AGCACCAAAAACAACTACAACTATTTGTGGGGAAGTGTGACAGGGGCAGGGGCGGGGGCGGG-GGCGGGGTGTGCTCCATTAACTGGCATGTAAAGCAC------GGCAAATGGAAATGGCTTTATATGCGCTTTGGTGAGCCCATCAAGACGATGGATAAACATGATTTAGTTGTATTGAAATACATAGTTTATTTTGCTTCTCTCTCCGCTGCGCAGTTTCTTTCCGCAGAGTTTGTTATCGTTCGTTTGCCAAAATGGCGGCCA------GCAGCAAAAAAAAGTGTTGCCTACTTTGCGGCGAC-CGAGTAAAAATCAAAACTAAA-ATGCATA----GCTCGCATGTAACACACA----CACGCACACATACACACACACTCACACACATATTGATAAATATTTATATATATAT----------ATACATATATGCCCACGCACACATGTATTTACCTTGT------ATATCTACTTAGAGGCGCCC-----------------------AATTTGTAAGTAAATAAACATTTTTGTATTACAACTCA
>ETHR 17090694 17090856|17476 chr3R 17089552 17090871 scaffold_55 425135 426390 - 58082|1181 1360
ATCCCATCCTAAATATGCATCCTTCGAGTCCCTGTCCACTGCCAGCAACCGTTAAAGTATTTAGTTGAATTCCAACAGCA-------------AATAGTCATAGTT-TTAGA-AAAATTTTGTTGTAAAGACTGAAGTACCTCAGAAGAAGTCAATAAACGCAAGAGAAGAT--GTTTTT
G-----------------------------------CACAGCAAAAAAT------GGTATTTAGTTGAATTCCGGCAGCACACACATTTAGTCCATAGTCATAGTTAATAGATGAAATTTTGTTGTAAAGACTGAAGTACCTCAGAAGAAGTCAATAAACGCTAGAAAAGATTCGTTTTT
>CG5919 17096765 17097129|17482 chr3R 17094042 17096789 scaffold_55 429658 432539 - 86134|2979 3003
GTGTGCTAACCAACCAAAAATACAC
GAACTCAAAGC-----ACAATACAC
>CG5919 17096765 17097129|17483 chr3R 17096790 17097823 scaffold_55 432969 433993 - 25608|0 385
GTAATGACGTCTAAAAGGGGCTTTTGTTCGTTTGGGTTTCAAATTCGCTTTATT------CAAATGGAAAATAGTGTGTGTCTGTGTGCGGACAATGGGCACAAAGCGGATTTTATGCAACCTCCGCGGGTCGATCAGTTCAGTACAACG------------CTTTTGT-------ATATGTAAATATAACAATACATATATAGTTTGTATAGGCGCACGATATTCAATATGTTTCATAGC-CTAACTAATGTGTTTGTATGTTGAATATCAAATAACTAATTA------GCTTTTAAAATGATCACATTACGTTTCCCATAATCATCATCATCATCGTCATCGTC--------------GCAACAAGAATAAATATGTACAAAAG
GGAAGAATGTATACTTATGGTTCTTTATAGTTTTTATTT-AAATTCGCTTTATTTGTATTCAAATGGAAAATAGTGTGTGTGTTTGGG--------------------GTTTTCATGCACCTCCGTTTTGTTGATCAGTTCAGTACAACGTATAGAGCATCACATATGTTTGAATAATATGTAAATATAACAA--AATAGAGTGTATGTATTAGC---------------------ATAGCACTAGCTAA-ATGTGTGT-TGTTGAATATTATATAAATATATATATATAGCTCATAAAATGATCACATCACGTTTACCATAATAATCATAATTATCATCATCAATCTCTTCCGCAACGAACAACAAGAATAAATATTTACAAAAG
>CG17298 17109644 17109777|17498 chr3R 17109300 17110780 scaffold_55 446846 448210 - 31599|364 502
GTGCAGCGAATACGGTTCACTTTCAATACC--TTTCCCGCT-CCCGA-TCCCGTTCCC-GATCCCCACCAGACCCAGACCAATCCCTTCCTGAGCACCATAACCACGATCCCACAATAAAAGTTCATAGCCACGTAATT
GAAAACCCAA---GCCCAATTCCCAATTCCCATTTCCCAATGCCCGACTCCCGTTCCCTGATCCCACCCAAATCCG----------------------------------CCACAATAAAAGTTCATAGCCACGTAAAT
>tin 17207550 17207692|17614 chr3R 17207322 17207761 scaffold_53 70140 70590 - 11852|252 408
TGGACATCTCGCAGGACGAAGGATTCGAGTCTCTAATTTATTGCAGTTTCAAGAAGAATACATGTTGTAGT--CTAAGGAAAACGCCTCATAGTTCTAGTTCTTTGTTTTATGTA------------TATATTGGACAATAAATAAAGCTTAAGACC
TTATTAAC-------------------AATTTCTAACTTATTTCAATTT-ATGTCGATCAAATGTTTTCTTAGCCAATGCAAATGCCTCATAACTCTGGTACCTTGTTGTATATAGTATATACTACTTATTTTGGACAATAAATAAAGTTTAAGCCA
>bap 17216007 17216171|17624 chr3R 17213189 17216316 scaffold_314 3627 7046 + 45988|3245 3506
GTTGGGAGTGACCATGTCTCGGAGGAGAACCGGGGCTACGTTTTTGTGATAGCCGTAGAAATTGTGTTTTAGCCT-----------CTATGTGTAACCAATAGA-------------------------------------------------------------------TGTCCCATAGCTTTAGTAGCATTAAGTTGTAGTCGTATCT-------------------ACCCGAGAGCTAAATAAAATTATGAATTAAAT
AT----GCCGTACATATTCTGGGGG----CCACACTTTGGCCTTTGTGATAGCCATCGATCTTTACGTATAGCCCAGAAAGGCTGGCTCAGTTTAAGGTAGAGAGACAAAGCGAGAGAGGGAGATAGAGAAAGGGAGGGGAAGGGAGGCGGAGAAAGTTGGAGCAAGTCTCTGGCTGATAGCTTTAGTAGCTTTAAGTTTTAGTTATATATGTAAATATATTTATGTTAAACTCTTTACTTAAATAAATAAAATAATTAAAC
>CG31179 17325748 17325812|17753 chr3R 17324658 17326667 scaffold_53 205664 207692 - 31271|1240 1307
TC---CGTAAACTTTAATCCGTAGACCGTAATCCGTGAATCCAAAGCAGTTCTCAGTTGGAATTTCCC
CTGAGCGTCAG-TTCAATTTGTCGAGCG----CCGTTTAACGAATGCGCGTCGCG-------TTCCAC
>C15 17337973 17338054|17769 chr3R 17337284 17338544 scaffold_53 220469 221656 - 18012|733 819
TCGGGGCGCCATCGGCGGACGGA-----GCCTGAAGTTTGGCGGGAGCTGGTTTATTTGTGATACACTTCGCTTTGTACATAGTTCG
TTGTCAAATAGTAGATCTATATATATATATATAAAGTATG--TGTATAAGGTTTATTTGTGATACAGTTTGCTTTGTAAATAG---A
>CG7956 17352936 17353123|17783 chr3R 17350709 17354360 scaffold_20 693457 697051 - 94498|2340 2552
ACAGAACTAGTTAAAGCTAAGCCGTGTTTGTACT-------------GTAACGCGTTTTCAGTACGTCCGCCAGGGATCTCAGCCTTC--CCGGTTTGCCCACTCACCCG-GAAGCCAACAAGCTGAAGCAGCTTACTAGCCCGCTCTCGAAGCTGGCCA---------AGAACATTGGCTTGAACTTGGACCCCCGCAAGATAGCCACCAAG
ATCTATATGGCAAAAGTATTACCGCATTTTTTCTTTTCACGATTTGCTTGATCCGTTTTTAGTTTTGGTGACAGTGAACTTAGCATTCCGCTGGCCCAGCCAGTCAACAGCGAAGCCAACAAGCTTAAACATCTTACCAGCCCACTCTCAAAGCTGGCCAAAGGAATGCAGAACATTGGTATGAATCTGGATCCACGCAGACTAACCACCAGG
>CG7956 17353190 17353419|17783 chr3R 17350709 17354360 scaffold_20 693457 697051 - 94498|2619 2857
ACCGGAGTCCTCTCACCTACCATCCTCTCCGCCGAGAATTCTCCGCCGGAGCGCGACCCAAGCTCACGGGATCACTTGCTGGAGCTGTGGGAGGCCGAGAAGTGCAAAACCAAGTTAATAGCCTTGTAAGAAGGTCACTAGGCGGGCAATAGCCGAAGCTACAC---------ACTTTTTAATAAATAAGTGCAAGTGATATATTTATTTTCGAAATAGAATGCAAGAAAACGAAAATT
ACCGGCGCGCACTCGCCCACCAGCGTTACGGCGGAAAACTCTCCTCCAGAACGCGGTCCAGGTACCCGTGATCTTTTGATGGAAATGTGGGCAGCTGAGAAATGCAAATCCAAGCTAATAGCTCTATGAAATGA--AATGAATGGAAATAAACTTCAGCTACACCACGCAATTACTTATTAGTATAGTGATATAAAGAATTAATTATCATACAAGTTATAGCTCAA------CAAGTTT
>CG5849 17570082 17570153|18027 chr3R 17567367 17570164 scaffold_29 730997 733815 + 88686|2786 2858
CCAGACATTTGGTCTAACTAGGTATCACATAAGTACAGGCTTAATTACGAATAAATTAATTTTTTTCAA-AAC
CCA-----TTGTATTAAGT--GTGTAATTTAAGTCGAAAGTTAACTA-----AAATAAATTTAACTAAGTAGC
>CG31343 17574647 17574723|18030 chr3R 17571903 17574722 scaffold_29 735389 738147 + 86460|2780 2875
GATAACTCACGTGGTCAAGTATTAAACATAAATT--CAGTAAAGTGACGTAAATC------------------AACAATAAAGATTGTGTGCTCAT
ATTTA----------TATTTATAGAAAATAAATCGATAACAAATCTAAGTAATTCCCCCTCCGTTATTCTTGTAAATACATTCATAGTATACACAT
>CG31233 17578897 17578959|18033 chr3R 17575649 17579086 scaffold_29 739991 743414 + 119222|3297 3379
A--------ACGTAGATCCTAAGTTAGTTATAGATTTCCATTGT---GCGCCCA---------ATAAATTCCATTAATTTCC-
GTATTATTTAAGGAGCTACTAAGTTAGCTTAAGGTCTTCCTCGTTTCGCAGCTATGTATATACACAAATTCTTTACATTTCCG
>CG31198 17583375 17583490|18036 chr3R 17581879 17583447 scaffold_29 747199 748773 + 65163|1523 1595
GCAGGGATTAGCTCCTACTGGAGTCAGGTGCGATCGAGTCACGAGTGCTCCTTAGGCCATAAAGTATTTGTAC
GCCAAGATTAGCCAAT-----TGCCAACTGCATTTGGGGTATTCGTCC-------AACAAAAAGTATTTGTAC
>CG31431 17699244 17699366|18153 chr3R 17697017 17699358 scaffold_22 1788734 1791277 + 41602|2552 2681
AACCGAATATTTTTGAAGCTGCAC-TACGCTTATTAAGAT---------TATGGATAAAGACTGTCTATA-----GAGTTATGAAAAGTAGACTTACAATCTGAAATAAATATATAATTTTTTATGCGAA
TGTTGGCTATTTTC-ACATTGCGCATGCGCTTA-CAAGGTGGGAAGGTGTGGGAACAAAGACTGTGCTTAAACTTAAGTTATAATGTGTACAA-AACAATTACAAATAAGTTTGAAAATTATTTGGCGAA
>CG31178 17700535 17700649|18155 chr3R 17699671 17701555 scaffold_22 1791497 1793311 + 12663|959 1102
ATATCTCATATTTCAGTTCAGCATCTACGTTTGACTATAGAAAA------AAAACGTTACCCT--CTTTGATTTTTCGTTG-----------GAATT----------TGTAGTGATCAAAATATATATATTTTATAAATATTTA
GCTTGCCGCAACGCA-TTGAACGACATCGTATCAGTTCAAATAATTGTGTTAGCCGTTACGCTTATGTTAATATTTAAATGTTAAATGACCAGAGTCCTGATGCCCATGTACAGATGCATACATATATATTTTTTGAACATACA
>CG6656 17703354 17703510|18157 chr3R 17702066 17703402 scaffold_22 1793340 1794609 + 55428|1301 1363
GATG--CCTTCCAGACTTTG-----TTGAAAGTGT------GTGTCGTTCTG-GGTTGTTGTT
GCTAATTATTTTATGTTTTGTTATATTGAAAGTATTTTAAAGTGTAGCTATGTTGTTATTGTT
>CG33092 17706354 17706418|18163 chr3R 17706294 17707741 scaffold_22 1797217 1798746 + -3670|117 185
GACAAGCTGAAACCTTTGTTTTATGATCAAAATTTCTG----TGGCAATAAATATGAAAATTGTGTAAT
AATAAGCTCCCATTTAAGTTCCTTACTCTTAGTTAATGCTAATGCTAATGAAAACGGATGTACTTTATT
>CG6678 17731662 17732904|18188 chr3R 17731686 17733779 scaffold_3 224855 226964 - 38688|0 1376
CATCGCGGCCTGGCTAAAGCGTTG--TAGCTGTACACCGGCTGATCCTCATCCTCAGCCTCAACTGCAGCCTCATCCCCATATTGCCGTGGCCAAGACAAATGCAGACGATGGCTCTTTAGCCGTATCTTTCACTTTGATTGTGGCTGGGAGTCTGCGACTGAGACTGTGGCTCGTGTGGGGCACGTGA-------AGCTTTAGGATGGGTGGT--GCTGTG----------GTGCCGGCAGTCGTTAGCCTTGTCTTATTGCCCGTGTTGGC---------------------------CAAACACTTGGCTACTGGTTGTTTACATATGTACGGGAACGGGAATGGGTATTGGAAAGAGTACTGGTACGGGTATAACTCAATCAGCCCGAAGAGGAGGAGCCATGGGACTCGATGTGTGTGTGGGTCAGGTGACCTGCAACAAATTA------------------------------GCCTGGGAG---TTATGAACCTCAGCAATGGAATGCGTGCTGGTATCTG---GTAAGAACGCACAAAACAAGATGGACTGGACTG-GCCCACAACTATGGTCAAGTTCTAATGAAAACCTAATTACAAAATCAGCCAATACTCTCAAGAGCCGCACATAATTAAGGCGCACACATGACTT-------GGCTTGGTTTTTCCTCCTCCTCGCCCAATTGTCGCCGTCTCCAATTTCCAGTGCTCCCCCCTCCTCTACCCATGCG-------ATGAAAAACGCATTTAAAAGCCACATTAATGACGCGGACTCGATGCGACGACCACTTTGGTAAAATAGGAAATTGCT----------------GCGTTCGGCTGCTCTCCAGATTCTGGTCTATC-------------------------------TGTTTTC------CTTTTTGTTTTTGTATCTTTTTTTT-TTGTTGTTCCCATCTGCAGA--TAGCGACACAAAAACG--GTTGCCTCCGAGCCAAAGTCGAGCTCGCTGCTGTGTTTGCGA-GCGTTTTCAGCGCATTTTTAGTTAATTTACCAGGAAAAACATTTGAAATTCTTAAAAAAGTCGCAACAAGAAGTTGGCTACTCGCCTGGCGGCTGGAAAAAGTCACATCACAACGTTGTCTATACAACGCCTTTCTGGCGTGCTCTTTCGTGAAGTTGGCTATAACAACTAGTCTTGAGATACACAATATTATTTTGGAGCAATATCTATTTATATTTAAGAGCCACAGAAGAGATAACTACTCAATATGCTTTTTCCCATTTAAGATCAAAACATTTGTATTTTATATTTCATAAATAAAATAAAAAGACAAAAGAGTATACAAATATAACAAATTATTTTAATAAATC
CCTGGCTGCCAGGCAGGCTGGTTGCCTGGCTG---GCTGGCTG--CCTCATCGCCTAACTGCCTAACCGGCTGACTGGCTGATCCTCGTGCTTAAGACAAACGCAAACGCTGGCTCTTTAGCCGTATCTTTCACTTTGATTGTGG------GTCTG--------ACGGTGGCTCGTGTGGCTCGTGTTATGTTGTTAGTGTTAGCCTAAGTCGTTTGCCTTGCGGCTTCAACGTGCCG-CACTTGTTGTTGTTGCTTGTTTGGTTTTTTTCTTACAACTTTTTTTTTTTTAATACAGTTGCAGCCATTTGGCTACTGTTTGTTTACACATGTATA--------------------------------------TATAACTCAATCAGCATCTGCAGCAGTGGCCACGTCATTTG------------GGCAGTTGACCCACAACAAATTATTGAACCCGACAGCTCTGGCTGGCAGCAGCGCATGGAAGGAATTCGAAACAACAAAAAAAAAATACACAAATATATATGTATGCATGTATATACGAAAAAAAAGGAA---GTCTGTGTCCATAGTTGTGCGTAAGTTCTAATGAAAACCTAATTACAAAATCAGCCAATACTCTCAAGACCCGCACATAATTAAGGCGCACACTTGGCGTCGTCGCAGGCGCAGT----CGCAGTCGCTGTCGCATAGTAGCCGTTGC--AGTTGTGGACCTTGCCCCGGCGTTGCGACTGCGTCTCGCCATGAAAAACGCATTTAAAAGCCACATTAATGACGAAGAC--AACGATGCAACCACTTTGGTAAAATAGGAAATTGCTAGCTGCTTTCGTTTGAGCGTTTGGCTGCTTT-----TTTTCGTCCATCAGCGGACGAGATCAACGCCAGTCGTTGGAGATGTTCTCTCTGGACTATTCGTCTTCAGCTTTGTGGTTTGTCGTTGTCCACATTCACAGAGACAACCACACAAAAACCACGCTGCGTCGGTTGC----TCTGACT-GCGGCAGCGACTGCGAAGCGTTTTCAGC--ATTTTTAGTTAATTTACCAGGAAAAACATTTGAAATTCTTAAAAAAGTAGCATCAAGTAGCTGGGTACACG----------AGAAAAAGTAGCATAGCA---------------------TCGGGCGGGCTCTATCACGCAGTC----ATAATA-----CTCTATGGTAAATAA-ATTATTT----ATAGTAATTAATTATGTATAATAAATATAGTA---ATAATTATT------------------TTAAAA--ATAATATTAATA-----------ATAATTATAATAATAA----------TATATTAATAGGAATAGCTTTTGCTCAATATC
>CG17843 17741170 17741270|18196 chr3R 17739425 17741269 scaffold_3 230671 232519 - 28346|1796 1909
CGATTTACTTTAAAATCTTTGACTAATCTTAACACCT---ATTGCATGAACGA---GTTTTGTG----AACCAATTTTATTAAATA----AATTAAATATAAATAACATAGACA
TGATTGGGCATTAAATCAGAATCGAGGTTCAAGACTCTGAATTGGTTTAATAAAATGTTCTACGGGAAGATTAATATAATAAGGTATTGCAAATAAATATGAATGAAATATAAA
>CG17843 17741170 17741270|18197 chr3R 17741270 17744617 scaffold_3 232913 236195 - 59969|0 0
A
A
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AT
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>sar1 18185676 18186440|18682 chr3R 18185513 18188036 scaffold_3 692795 695289 - 88923|172 969
GTCAGCATTAGCAACCACCACCA-GCACCATATT---TTCAAGAACACCACTCAACACTCAAAACCGAAAACTTGGCTACAAAATTTCCAAAAATGATTAGAGACCGCAGAAAGAACAGAACCCAAGGGATGTGAACCCAGCCCAATTCAAACCGTCAGACCTTAAGCAAAACGAAGCTGCGTGCGCAATTTCTAATTTATACAAAACAATTACAAATATTTCATAATAATAAAAAAAAAAAAACAGAAAACCATACAATGTACATCTGTAACACACAAGAAATCGCGGGAAAAACAGAACACAACATCAAAGTGAAGACAACTTTTCTATCTGGAACATCGGGATACATTGTAAGGAGCTGAAGGATGCG-------CGGAGTGCGCAAGGGAAACTTTTAATAATAATTATG----AGTAACAAATTATAGCAAATTAAA-GGTGATTTATTTAAGAGCATGTGCTTTCAACGAACGCTGTTTCGCCAATAAAATGTAGCCACCTACCTTTATTTCAAGTTTATGAATTGTAAATGTCGCTATTGATTTCCTAAATAGTTTACTTTGGCCGCAAAACATTATGTACATCCCTATAAGGATTCGACCTCCGATAAATGGTACACCTTAGTTTA--GCTAAAAATTTTAAGTTGCATGT-CATCGATGTACTTTGTTTCTTTTATACAATACGAAAGGGAAAGCAATTTATATAAAA--------AAGCATTTTTGTTT-----GCAGACAGAATTCTAAATAAAACGGAGAAAAGTA-ATTTTGTAAAATACATAAA
GTCATGATTAACATAAACCACAAAGTAACAAACAGAATTCAACAAC--CACACAACA----AAACAAAGAACTTGGCTAACAACAAAACAAATATAAATTTAGAATGGACAAA---CAGAAAC-----------------------------------GACAGTAAGCAAATCGAAGCTGCGAGCGCAATTTCCAATTTCTACACAATGATAAACAATAGATCGTAAATGAAAACAAAAGGAACTAAATTAAAAAATAAAGCAAA------AAAAAAAATATTTTTTAATAAAAACAAAGTGCAAAACCTCTTCTAAAAA-----TTCAACGTAGACGCACGCAGGTCGCCAATAAGAAATAAAAAACGGGAAACTTATGGAATGCGTGGGAGAAGCTTTTAAAAATAATTATGTATGAATAATAAATTGTAGCAAATTAAAAGGTGATTTTTTAAGGACCATGTGCTTGC------TTATGTTCCATAAATAAA--------------TTTTATT----ATTTAAACATTTTAAATAGCCTGTCAAATTTTTTAATTTTTGGTCTTTTGCTATTTTTCTATAT-TACTTGCCGATTTATTTTCCACGACCAAT------------TTAATTTGTTGCTACATCTTTTAAGTTACATGGGAAACAATTTATAAGAATGCAAATTTACAATAAAAAGATGACACATTTTTGTATAAAACCAATTAAACGCATTTTTAACGCCCAAGCAGAAGGAACCTTAGTCTAGATCATTAAGATCACATTTCACTAGAAAC-----
>CG7071 18190230 18190306|18683 chr3R 18188616 18192441 scaffold_3 695629 699446 - 123530|1650 1727
ATAGATGATCTGCGAGTAAAAATCGTTCTTTGTCGTTGTATTATTTCGCTTTGCAATGTT-AGGTTATATAAATAGCT
AAAGTAACTTTAAAAGC------------TTAGCGTTAAGTTTTTTT--TTTGCAATATTTGGGTTAGATAAATA---
>PyK 18198204 18198464|18690 chr3R 18196480 18198460 scaffold_20 1240722 1242738 + 112060|1736 2053
ATTCTGCCGCTCAGGAAGTACCTGGATGCGTCGCAGCTGCCGCG-----GGCGTC-------GCGTTGATTACTGTTAATAACCAAGTTAATTTATT---AATT----ACACA-ATATTCGGAATATTGGAAACTGCAGGAGGCTGC-TGGAACCGCTGTCAGAAGCGCCGAAGGCCGGCCCG-------------GGCCTCAAACAGAC--------------ACACAAAT-------------ATACTATACCATTGTTGAATAATAGAGATTTCTTCGAAAATTATAATAAAGTCATCACTGTATTTATGTACGT
A-CCGGTCGCTCTGACTAGAGTTTCATGCATCACTGTGTTGGCGTTTAAAGCGTCTGTGCGTGCATAAATTACTGTTATTAACCAAGTTAATTTATTTAAAATTCTCAACACATATATACGGATTATTGGATATCGAAATTGAATACATACACCCGCTGCCC-AAGCGCCACAGAATGGCTCGCAGCCGTGGAGCCGCTCTCACACACACACCTACACATATATACACAAATCTAAACATGCAGAATAATTTATCATTGTTAAAT-ATAGAGTTCTTTATAGTAACAAGGATTAA-TAAAAACTATATGTATACATAT
>CG7069 18201194 18201301|18694 chr3R 18200918 18208872 scaffold_20 1245008 1252911 + 131596|281 408
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AGTG-----------CTAATTCGTGTAGAAAGCCT-------------GGTAGAACAGACTAAATTGCTAATGGGATCAATATTTTTAGTAGAAGCTTAAGAGCTTTTAAGGAAAAATTCCTTTTACT
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ATTCATAATTTGACCACCAACAAATGCCTTTAACAAATAAA-GTAAATACCTAAAAATATTGTACAAATGTTACTATATAAATGTTTTGTGTTGTATATATCTTAAAAAAAATACACCCAAAATAAATTACCTATATAAACTTAATT
AAGTAGATTTGGAA----GAAAAACGCCTTCAATACAAACGTGTCCAGGTTGAAGACTATTTTTTGAAG--TACCTCGTATATTTGTTGTG--ATAAATTTCTTCAATAAA---CATTCAAAATATATTTCTCA-ATGTACATAATT
>CG31169 18212150 18212277|18697 chr3R 18211198 18213918 scaffold_20 1256585 1259081 + 28928|987 1114
GTCCTAGATTAGTAGCTCGGCTTTTCGATTCCCCCAATAGCAGCATGATCAGCATCAGCATCAGAAGCATGATATAGAATACTTTACTTTTTTAAAAAATAAATGGTGTTAGATTCAATCTAAATAAA
--CGCAAGTAAGAAACTC---------AAACAACCAAAAACACA-----CAACAATATTATCTAATTTATCCCGGTCAAAGTGTTCCTTTT-------------GGTAATAAATTTGATATGAAAATA
>CG7059 18217806 18218084|18702 chr3R 18217081 18219241 scaffold_20 1262599 1264746 + 51804|736 1036
TTGTGGAGCACTCCTCTCGACTTTTTTGGAATTTACATCGATATGTGGCCGACTGCATTTACTTAAGCCTTTGCCGCTTAAAGTCCGAGAACATCGGCTGATAAGGATATTATGACTACTATTTATTGGTCTACACCATCTGATATTTTCGGCCAAAAATATACAATTTATACAAAATATAATTGATGGAG--AAGATTACATATACGTACATAAATATAATAA-------------AAATAAGCTATTTCGTTGTATGA----CGTCAAATTGGATG---CTACACCAAAAAAAAAAAAA
-----GAAAACTAC-----ATATTTTTTAAATAAACCTAAGTTTTTAGC--AATAAGTTTACATA---------------------------------------------TATGTACATTATTTATCAACCCAC--------TTTTTTTTAGTTAAATACA---AACTTTTACAAGTTGTCTTTTATTAAAGTAGAATTATTTTTTAATGATAACAGATGATAAGCGCATCACAAGTAGATAAGCAGTTTGCTTGTCTAAGATTTGTAAGATTTTATGATCCTAGCTGAAAGATACGTGAG
>CG13855 18234243 18234379|18718 chr3R 18230162 18236639 scaffold_20 1272385 1279064 + 185856|4373 4625
AC------------------------------------------------------------TATGTGGTTAAAATGA-------CTCCCAGTA----------------ACTCACCTTTCG-------------------------------AAATTTGGGT--TTAGCTTGTAATTCAGCGCCTAATTTAACATTTACAAAATTTTAACAATTCAAATATTGATCAATCATTACAAGAAAAATTAAATAAA
ATGGTATCAATTGGGCAACAAAATATCAAAAACAAAAAAAAAAACAAAAAAAAAACGTTAAATATTTAGTCAAATTAAAAGTTTTATCCGAGCATATACGAACTATTTTCACTTACTGTCCGGCCATTCTGTATCTTATATGCAGCTGTTATTAAATTTGAATAGTTTACTT-TAATTCAGCGCCTAATTATAAAATTACAATAATCAAACAATTCAAATTTTGA----------------------------
>CG31170 18239248 18239999|18720 chr3R 18238210 18243332 scaffold_20 1280673 1285787 + 162521|1097 1896
CTATCGATACAATGACCGTGCGAGTCCTGCCGAAGTAGCCAGCGAGGCCAAACCTTCCAGCCTCAACATGAACATTCGTTCGAAGACCGTCAGTTCCCCTGTCTCCAAGCAGCCCACTTCAACGGCTTCTGCCAAGCCAGCGCTGTCCCAGAAGAAGATCGATCTGGGTGCGGCAGCAAACTTTGGAAAGCCAGCTCCTGGCGGTGCTGCTGGCATTCACTCACCAACTCACCGTGACACTCCCACCA------GCGTGGACTTGATGGGCGGCGCTTCGCCATCGCCGTCTACTTCCAAGGCAAACAATAATACGCAAAGCAATAACAACGATCTGCTGGACGATCTGTTCAAGACCTGCTC------GCCACCGCCGGGGCAG---------GAGAAGACGCTGAACAGTGCTGCCGTGATTGTGGATGACGATGATGACTTCAATCCGCGTGCCAGCGATGCTA--GCCA-GCAGGAATTCGGCGACTTCGCCTCTGCTTTCGGGCAGCCCTCGGCGGGATCGACGATCAGCGAGCCACCATCAACGGGCCTGGTTCCGGCTGCG---AACGATGAGTTCGCCGACTTTGCGGCGTTCCAAGGCTCGA------------CAACGTCGACATCTGCGCTGGACGGTAATTTGCTGAAGACTGCCACGCCGGCGAACGATTCGTTTGACCTGTTTAAT---------TCAGCTCCCACCTCGACGGCAGCAGCCACAACGGCTACAGATCTCCTGGCAGGCCTGGGCGATCTGTCCATTCACCAAAGCATGCCCATGG
TTATCGATACAATGATCGTGCTAGTCCTGCTGAGGTGGCCACTGAGAGTAAACCCACAAACCTCAACATGAACATACGCTCAAAGGCTGTTAGCTCGCCGGTGTCTAAGCAGCCGACATCCACTGGCGCCTCGAAGCAGCCGCCAACACAAAAGAAAATCAACTTGGGTGCTGCTGCCAACTTTGGCAAGACGCCG------AACGCGGCCGGTATTCATTCGCCCACACATCGTGACACGCCCACCACAAACAGCGTTGATCTTATGGGCAGCACCTCGCCA--AACAACAATAACAACAACAAG-AGCAATACGCCGAGTAACAATAATGATTTGCTGGATGATCTTTTCAAGACGTGTGCTTCGACGCCACCACAGCAGCAGCCGCAAGGCGAGAAGACACTTAATAGCGCAGCTGTTATTGTTGATGACGATGATGACTTTAATCCGCGTGCTGCTGACGCTGCTGCAACGCAGGAATTTGGTGATTTTGCGGCTGCTTTTGG--------CAGCGGT-----CTATCA-----CCTCCATCAACGGGCATACTGCCGACGGCAGGCAATGACGAATTTGCGGATTTTGATGCATTCCAGAGCTCTAGCACTGCGACAGCATCATCAACGTCGGCCCTGGATGGCAATCTGTTGACGACAGCAACGCCAGCTAATGATGCCTTTGACCTGTTCAATGCCGCAACGCCAGCAGCTGCGCCAACGGCAGCA---ACAACCGCGACTGATCTGCTGGCCGGATTGGGGGATTTATCGATCCATCAGAGCATGCCAATGG
>CG31170 18243831 18244778|18721 chr3R 18243335 18246764 scaffold_20 1286012 1289555 + 127754|624 1669
ACAATATGATGCCTCCCATTCCCGCCGTCACGGGCAATAATCTGCTCCAGCCCATGTCGGTG---------ACCAATAATAACAATAATACCAACGGAGGCGCAGTCCCCGCCGCTGCCAGTGTCCAGTCTACCGCTGTGGGCGCCACCTGGTCGGGCGACCTGAAGGGCGGCAAGATGAACATTGACCTGGACAATCTGCTGATGAGCAAGTCGGGCAAGCCCAGTGCCCCGGCCCCTTCGATGAATGCCCTGAAGACCAACAGTCCGGCAAAG------GCGCCACTGAATGTGCAGACGGGTGGCGGATTCCCTGG------ACTGTCGCCAATGACCAGTCCGAAC---ATTTTTGGGGCTCCGGCACCGCAGCAAAGCATTCCACAAA---------ACCAATCAGCATTTGCCAACTTTGGAGCTTTCCAGCAGCAGCAGC---------AGAATCACAGCAATAATAACAATAATAGCTCGTCGGCATTCGACTTGTTTCAATGATATTTTTTAGCCTAATTTAACCCAACCAACCTACTACCCAAAATGTCCACTCTCACATT--CACATTTCC------------ACGATCGCTAA--ACTTGTCAGTTCTATATATTATTTACGTTTTCCTTTCCCCTTGCTGTACAAAGTTTGCGACACGTGCAATTTGTTTCTAAATTCGTTGTTAAACAATTTACCCCCGATGCAATTTTCCGGATCAAACCCATTAATTCCACATCCGTCCTGATCGTCCACTCGGAATTTGAA-------------------AGTCGTCATCAAATGCAATACACAGAGTAGTTGAATAATGGTTGTACTAAACGGATTCGTTAGCACAACGCGCGGACGGACGGCTGAGCGATCCAACATTGAAATTGTTA------AACAAAATACTACACGTAATAAAATCAAACAA---------------TTTTAGCAATAGTTAACGTTACGATGTGTCTGTATATAAATTGAATGTAAAGCAAATATGAAATATAAAACAATTGAAACCAATAA
ATAACATGCTGCCGCCAATTGCTGCTGTCACGGGCGACAATCTGCTGCAGCCGATTTCCATCTCCAGCAGCAACAACATCAACAACAATATCAATACAAATGGAGCCGCGGCGTTGGCCAGCGCACAGCCCACAAATGTCGGTGCCACCTGGTCGGGTAATCTGAAGGCTGGCAATCTGAATATTGATTTGGATAATCTGTTGATAAGCAAAGCTGGTAAATCGAATGCGCCAGCACCTTCGATGAATGCGCTGAAAACGCAGAGTCCCGCCAAGACGCAGGCGCCGTTGAATGTGCAAACGGGTGGCGCATTTCCGGGTATCACGCCCTCACCACTGACCAGCCCCAGCCCCATATTTGGGGC------GCCGCAACAAAACATTCCACAGATGCAGACACAGCCAGCAGCATTTGCCAACTTCGGTGCGTTCCAGCAGCAACAGCCACAGCATCAGCAGCCCAGCAGCAATAATAATAAT---TCCTCAGCGTTTGATTTGTTCCAATGATATTTGTTAGCCTAATGACGTTCCACACACACAC-ACACCACACGCACACACACCCTTTGTCTCTTTTCTTGTATAAAATATGCGAACCCTGATTATTTGTTGAAGCAAATTATAATTCCCAATATCCAAATGTATTATTAATTGTAGTCTGAGCTCTTATTCATTTTCCTCAGAA------GTTCCAAAACCGATACCGAAAAGAA--------AAAAAAAAAAAGAATTCCATATCCGTCCTG-TTGTCCACTCGAAGTTTAAATACTTTTGCGTGTTTAAATGTTCGTCAT-AAATGCAATAAA------ATATAATTAATGGTTGTACTAAAGCGATATTTTAGCGCAACAGTTGGGAGGACGGCTGAATTGTCT----TTAAAATTGTTACAAAAAAAAAAAAAAAAATATATAATAAAATAAAAAAAAAATAAATAAAGAAACATTAGCAATAATTAA-ACAGTTATGTGTATGTATATAAAACCAATGTGT-GAAAATACAAAAT------CAATTTAAA--AATAA
>CG13852 18248397 18248568|18722 chr3R 18247625 18249825 scaffold_20 1290130 1292414 + 84065|793 1006
GAATCACTGCATGGAGCCGCGAATTTTCGCGATTCCGGCGGCGGTGGTGGTGGTCTGCGCTTGCAGTTGGACTTGTGAT----------GAAAGCGCTCTG----------------GCAGACTCGTGTATTACGCTTTAGTTAGTTACCGCC----------------AATACTTTTATGTTTCGTTCATTGCTTCATGGGGTGCCTCCCACT
GAATCACTGCAATTGGTGGACAGTGGTGGCAATAGCGGCG------------------GCTTGCAATTGGACTTGTGATGGGCGGGCGCGACTGCGCTTTACTTTCAATTGTACTCTGTCGCTATTTATATTACGCTTTAGTTAGTTACCGCCTTTCCTTTTCTCGTTTATAGCTTTTAAGTTTTGTTCAGTGCTTCATGTGG----TCCCACT
>CG31160 18284957 18285012|18749 chr3R 18281636 18287971 scaffold_53 519421 526013 - 161577|3668 3723
GGCTGTCGCCGGGGAATCTCCCCACATCGCACTGCCTCAAAAGCGGATGAGTAATT
GGGCGCCGTTT--------------------CTAGTTAATAAGACAACGA-TAATT
>AP-50 18289763 18290333|18750 chr3R 18288306 18289905 scaffold_53 526014 527650 - 94639|1484 1644
GGCGC----CCAAGCATCCC---CATCACGGAGCAAGATTATCACAATTGAATTTAACGAGAT-GAATGGAGAAAGTGTTACCGCAT------CTATTGGTATTTC-CTCAATCAAATTGAACCAGCAGC-TTATGTATTCCAAGATTAGTTC--CAGCAA
AGCCCAACTTCAGGCCTCCCGGAAGCAATCGAGCAAATGTATCACAAGGACGACAAAAGAAAGAGAATTTAAAGCTTTTGCCAATATTCAATGTTATTGGAATTTCTCTCAATCAAATTGAACAAATGTTGTCGCATATTCCAAATTTAGTTCTTCAGCAA
>AP-50 18289763 18290333|18751 chr3R 18290011 18290335 scaffold_53 527725 527974 - 6482|0 331
TAGACATACCACTACTAGGTACTATGATTTACCCTACTATGTAAATGTAAACTATGTTGTTTTTATATGCGTCGCGGGACGTCTCACAAATCTCACGCTCACGTTTCACAACTCTAATTATTATTTGTATTATCGTATTATAAATATATATATATATGTATATTTAATCATTATTTTCATTGTGCAAAGAACAAAGGCGATAAATGCAACTAAGCGTATTTAATAGACCAAAACTCTGTCA----GCGCTATCAATATTGATATTC-AAGTGTTAATAATATTCGAATTGTTTAATAAATAAATTAGCATGAT----ATATACTAAAAATGA
TAAACATACCATTATATTATATTATTATTTACAATATTAT----------ATTATGTAATTTTATTAGACTACGCG---CGTCTTA--------AATCTCACTTTTTACA--CCTAATTATGATTTAT------GTATTAT-----------------TATATTAAATGTTTGCCCCCATGG-------------------------------ATGTATTTGATAGACAAAAACTCTGTCAGAGCGCGCTAATAATATTGATATTCAAAGTGTTAA------TCGAATTGTTTAATAAATAAA-TAGCAAGATATGCATATACTCAAATAAA
>CG7054 18291598 18291660|18752 chr3R 18290781 18292395 scaffold_53 528266 529998 - 46808|880 969
-------------ATTTGTGCATATATCATGCAGGGTTTTCAATTCCCCGTCAATAAAGT--------------TTAACCAATTGCTTAT
CTTGGACTCCAAAATTTATGCA-ATATGCTGTAGTCATTT----TTCTGGTCAATAAAGTCAACCGGGCCCGTATCAGCTGGGTGTCTTT
>CG18594 18292344 18292410|18752 chr3R 18290781 18292395 scaffold_53 528266 529998 - 46808|1750 1811
TCTGGCCACCAACTGATCAGCTCTCTG----------TGAAATAATAAATATTAAATATGTA
TCGCGCCCACATCAAGTAAACACTCTGTTCCAAAACATAAAGCAATAAATTTTCCATAAGCA
>CG18594 18292344 18292410|18753 chr3R 18292404 18292758 scaffold_2 4179211 4179565 - -1112|0 6
CATAAAA
TATGCTT
>Nrx-1 18309579 18309697|18776 chr3R 18309568 18311618 scaffold_1087 2818 4585 + 27825|11 145
G--GCGGCA----TGGTCGCAGGGAAATATCGTCAAATTAGCAAT----TAATAGTGCAAAGTGAGCCGAAAGTGAAAGTGAAA------GTAAAAGTCCCCCTAAGATACGAGAAACAAAAAAAAAAAAAAACA
GCAACGCCAACGCCAGCTACAAACAAACAGCGTCAAATTAGCAATACGACAGGTGATCCAGGTGATCCGAAAGACAAACCCAAGTACTTTACATCATTTATATTTAAACGCATGCAACAAAAAACACAATAAATA
>CG7048 18313701 18313761|18779 chr3R 18312963 18317349 scaffold_53 555742 560243 - 200166|755 815
ACTACGGAGAACGACAGAGACACGAGACACGGAAAGCATTAAATTATTAAACTTATTAACG
TCGACTGGTCGCAGAACAAATATGATG----------ATTAAATTATTGAACTTATAAA--
>CG6919 18342612 18342971|18818 chr3R 18342086 18343626 scaffold_42 568884 570209 - 5666|623 995
ACGAAAAACACATATGGCGTATACTTGATTTCAACTCCAGTGCTTCACAATGTCTGTTCATGAGATGAGTGCGCAGTGCACAGCAAGTGTTCTCCAGAAAACCAGATTGCCAGCTTACAAATACAAATCACTCGATAAAAACATTCCTCAAAATGGCTGCTAAGAGGGCTAAA--------CAAGAATTTAACCAC---AAATAATAGCTAAAGCAACAGCCACAGCAACAATACGACAATCCCACAGATTA--AATAAAGCCTTCAAGAGCAGCAAATTGACGTGCAAAATAAATTGAAATCTTATAGAAGTATGTATTTCGACATACAATACATATTTAGGTGTCATGGAGTCAGGAATTTCATAACGAGA
GC------------------------CCTTTCAGCTCTTCTTCT-----ATGGCTTATGTGCAGCTGTGTGTGT-GTGTGTGTAAAGTTAGATGCAGCACAACCTAT-----GCTAGGAATTCCAA--------ATATATGTATTAC---------CTATATATAGAGCTATATATATGCCCAAAACTATGACCACGCTAAGCAACAGCTAAA--AATGGGTTTAAGCCGAACACGACAATCCCACAGAAAAATATTGAAGCCTTCAAAAAAACCA-----------AAAACAAA----------AAAAAAACAGATAATCCGAAAT-----------------------------------------TGATG
>CG6921 18381846 18382222|18861 chr3R 18381112 18382353 scaffold_29 1081491 1082802 - 46611|753 1212
TCGGCGATGCCGAAAATGGTG-TCGTTGGGATTTC---------AGTTAGCAATTATGTTT--TTTAGAGCGGGGCTTAGTTC-------------GTAACTCTTACCTTTACCTTTACCATTACCAACTATCAGTAGTCTGTAGTCTGCGGAGAATAACTTGTATAATGTTTATATGCCGGGCAGGCGGATGATGATTCAAATCCAAAAAGTAGCTAGGACCCTAAGTGCGTGAATGTGGCCATGTTTGTGTGACTGAGT----------ATGTGTTAATGTTTTTCTAGCTGAGCGTGTATGAGAGCTAGTGT-----GATAGAGCTTATTAATGAAATGCAG-----------------------CCGTAA----ATCGTTTC----------------GCAAAACAAGAAAAATTCAATAAAACTTTAATTTTGTATATTTAATAAAACCAAAAAA
GCCATTTGACTGTGCACGGGGCTTGGTGGGGTTTCTTTGTTTTTAGTTTAACTTTACGTTTTGTTTAGAGCAGGGCTTAAGTCTAGTGTTAAATGTTTAATCCATAACCCTAACTGTATATGAAATGATTCTGAATAAT---GAGCTTCTTAAATGTAGAATGTATAAAGTTTAT------GCCAAACAGCAGAAGATT-ACATCCAAA---TACCTAGGCGTGTAAGT--GTTAGTGTGCGAGTGTGCGTGTGCCTGAGTGTGTGTGTCAGTGTGTGAGTGTGTGTGTGCGTGAGTGTGTGAGTGTGTGCGTGTCTGTGCATTGCCCTAAGTATTGAAATGCAAGAAACTTATTGTTAATTTTTTATTCGAAATTTGATTGTTTCCAATTATATGATTTCTGAACAAAATAAAAAATCCAAATTTATTTGAACTTTTTTTTATAAACGAAAGGAAAAAA
>CG33110 18405439 18406120|18886 chr3R 18405126 18406290 scaffold_29 1109525 1110834 - 18150|341 1226
ATTGAAAATCGAA--AGCAGTGAG-----AAAAGTGCTTCCAGGGATTGCCCAACATTGGGGGGAACAAATTTTACATAAACGGACCAGATTGGTGATGGC------AACGGACGGAAC--------GGAAGTAG-TTTTGGTACAAAGGTTTCAACTAACGCTAAGCTAAGCTTAAGAGCCATAAATACAC---------------GAGCGTGCAC----------------------GCACACACACACACAACCACAGAAGAGAACGAAGAAGAGGA-----AGTCCGC---------------CTTCCGATGATCGATCGATCGAGCATGGGGAACACGGGGCGTATGCGCAACATCAATTATAACTTGGCGATT-ATCCCCTCGCCAGCTTCGCTTGATTGCTTCGCTTCGCATCGCATCGCATTCTCGCCATCTGTGGCTGCATTCGCATGTGTAGAACCGTACAACAAACTGGGTCAATTTTCGAGATCT---GCCTAATGTGTAAGTCGCCTAATTCTAGAACCTCACGAACG----------------------------------------AAACGCGTTTA-------------------------------------------GTCTTTAATT-----CCCTTAGGCTAA------------GTGATTATTGTAAT-TGTAA--------TTGTGTATAGACGATTTGTAAATAGCCTGTTAAATGTTAAATATTTGTAG------------TCCTAAGCCAACTAGTCTAACTTACAAAATTCGCACGAACAAATACGGCGAGCACGAAATTAAAAGCCAAGACAAATAAAAACGAAGAAAAGATAAATAAAATAAAACCGAAAACCAACCAA
ATAGACAGACAAAATAACAGAGAGAACAAAAAAATGCCTCCAAGAGCTGCTC------GCTTGCTAAAAGCTGTAAA-ATACAATAGAAATTGGTGTTGGTTCACAAAGCGGGCAGCTCGCAAATTTGGAAGTCGTTTTTGGTACAAAGGTTTTA------TTTTAATTCAAATGGGGAGCCATAAATGTGTTTAGCTAGAACTGCAAAAAATGCCCAACAAAAAAAATAACAAAAAAAATAAACAAACAAAAAAAAACGGAAGAGAATAAAAAATCGAATGCTTAGCCCGCATAGATTTTGATTTTCTGCCAGGGGTTATGCAATATAGTGTAGATAGAAAGATAAATATGTCTGGGTTTAATTTTGTTGCACCTACTGACCATATAGATAACTTTGCTTGATTGCT----------TGTCAATGTATCTTAGATAACTAT---------------TGTAG------------AACTGGGTCAATTTTTACGATCTTAAGCATAA-GTTTAAGTCATTTAATTTTAGAACCTCGAAAATGCGCGCCGCTAACAAATAGATACATAACTATATGTATATATATGCATATTTATATATATATATATATATATATATAAATATATATGTATATATATATCTCGAATTTTGCCCAGTTTGGCAAACGTAACTCTTAAGTGTTAATTGTAATGTGTAATATGTGAGTTTTGTATATAGATTTTGTAAA-----TGTTAAATGTTAAATATTTGTAGACGGTAAGCATAGCCTAAGCCAACTAGTCTTAGTTACAAAATGCGAACGAACAAACA----GAGCAATAA--TAAAAGTTAAGACAAATATAAAAGAATAA--------------CAAACCGCGAACACA----
>CSN6 18407701 18407760|18887 chr3R 18406490 18407719 scaffold_29 388964 390210 + 59712|1238 1257
TATATGCAAACA-ATCTATT
CATATGGAGAGATATTTATT
>CG6937 18411786 18411935|18890 chr3R 18410404 18412794 scaffold_29 392267 394739 + 58739|1454 1612
TAGCTTAAAATACA---TTTACTATAGTTGTTAAGTAAGCGAAAACATTTTGT--AAGATGAATTGTGTTAAAATATGTCCTTGTA----CAAACTAAAATGGCGTTTTGGCCGAGCTGCCTTGCTGCTCCTCCAGTTTGATGCGCTTGCACTTCATGC
TAAC-TATAGTATATTTTTTACCATAATAGTTAAGTAAAC-AAAACGTTGTATAAAAAATGATTATTTTT------TTTCTTTGTAAATTTAAGCTAATGTGCTTTTGTGG---------ATTCGGACAATTCAAGTTTGATGCGCTTGCATTTCATGC
>CG31158 18432941 18433030|18911 chr3R 18429688 18433220 scaffold_29 409859 413444 + 86603|3545 3637
TTACG---TTTTATTTCGCTCTTGATTTCGATCATTTCAAAACTCGCATAACCAACACACACCTACATCACAATCCCCGCCTCTTGGCTATCG
TTACGCATTTTCGTTTCGCTATTGATTTTCATCATTTTAA------------CTATACACA---AAAAAACACT---------TTGGCAATTG
>CG31158 18433114 18434193|18911 chr3R 18429688 18433220 scaffold_29 409859 413444 + 86603|3721 3838
GCGATTGAACGAATTTGAATAGAATACTCCAA-------AATGCCAAGC----TGCCTGCGACGGGAACATAAACAGATCAGATCCACACAGAACCACTGAACCACTCACCCACTCGC
CCCAT------GTCTATGATAAAATACTCCAATTGCCACAACACAAAACACCACACACACAACTCGCACACCAATGCATCACTCACATGGAGGGGGACTAGATGA-TCACTCGATGAC
>CG31158 18433114 18434193|18912 chr3R 18433261 18438843 scaffold_29 413496 419094 + 147019|0 1084
TACACTCAAGCGTTGCGGCTGTGCCGT---------------GTCTGCCACAGAAATTCGGAATTCGTGCACTTTCAGTCAGTTAAAACCCCATCAGGGGTTGCGAGAAAGA-GATCATTTGAGACAATTAGACTACCAATGCGATAATTAACGAGGGAGAATTTTACGTTTAAAGGTCGTTCATCAGAAGACATCGGCATAATCTCGGCAACCAGAGGATTATCTCGAATTCGTGCAGTT----------------------------------GATTTTATATTTACCATGCTACTTATCCA---------GAATGAGGGTATTCGAGATCGG------------------------TTTCACCTGATTTAAAGCTACACAGTCAGATCGATTCGAA------------------TTTGAATTATCGTTCATAT-TTGCTCCGCCAAAGATTCTGCTGGACGGC----TGTTTAGGAACGAGAATGAAAACTGCTTATACACAT-----AGACTTATTATT---ACAAGAGTTGATAAACAATACTTACATCATTACCTATGCTATCATTATAAATGATAAAAATAAATTATTAATTAATGAACAATATCTCTACACAACCACAAGATGGAGAACATCGGCAGTAACAATAACGAAATGAGAATTGAGAAGAGGACAAGCGCATTAGCATTAAGCTTAAGCAATTACTACCATACCGTGTACAACTTGTTT--TTGGTCTTTTGCGATACATTATCACATTTAACTGTGTAGGAACAGTTACTCCAATATTATGTACGG--------------ATTAATATATTTATTTA---AACAACTATCGGTTGATTACGCGACATGTCCATGTAGCTAGAATATGAAATTAAA--TATCCATTACGGGGTAAAGAGAGATGGAGGAAAAAATAAAATTAAATGC----------ATCATATATTTTTGAATATATTATGAT---TATGGTATTGTGTAATTATGTAAATGCAGACTATATAAC-ATTGTTTATAATAATTTTTAACAATTCTACTGAAACGGCAATAAATTCGAAAAT---ACAAACT
AACACTCGCGCTTTGCGGCTGTGCCGTGCGGCGCCCAAAACAGTCTGCCA-ATAATAACAGAATTTATGTACATTTATTAAGCTA------CATAAAACATAATGATGATGATGATGATGATGACTATTTGTAATCGCAAGTTGTTAAGGGTCTTTGGAT-CCTGTACACAAAACGTTCGTTCAACAGAGTAC--TAAAAAGATCGAAAAAAAAAAAGATTTACAGCCCAATTATTTGGTTTTTAAATATGAAATTTAACCCACGTCGGTCTTAGAATCTAATATATAGCATATTAACTATATATCGCATTATGATTGCAGGCACTTTTGCTGAGAGCTTAACCCTGCCAGTCAAGTCCTAACCCCTAGTTTTCACCTAAATTGTTAATTGAAGTCTTAAAGAAGCCGCTTACGCTCCTAAAATTACCTTTGTTCTATTATTTGGCAATGGACTCTGCTGAACGGCAATTTGTTCTGTATC----------CCTGCTTATTCACATCAAGAATACTTATTATTTAAAAAAAAAAAAACAAAAGAAACTTACAACATTACCTATGCTATCATTATAAATGATAAAAATAAATTATTGA------AACACTTTTTCTATATGC----------AATAACATCAATAACAACAACAGCGAATTA-------------------------TGTCGCAAAGGTTACATAAATA----TATA---TATATAATTTGCTCGATTGGCCTTTTGCGATA-AGTAT----------------------GTTTCTCCAATATTTTGTACGGTTGCAAATACATATATAAATATAATTATTTATATGACAACAATTGGTTGATTACGCGACAAGTCCACGTAGTTAGAATATGAAATTAAAAGAATCGAGAATGAATCACACATA---AGAATTACAAATAAAACGAAATACAATAACTTTGACTACATACGTATGTGTATTTTTTAATATATATTATATTGTGTAATTATGTAAATGTAAACTGTATAACAATTGTTTATAATTATTTTTAACAATTCTATTGAAACGGCAATAAATTGAAATATGAAACAAAAT
>CG13843 18436397 18436419|18912 chr3R 18433261 18438843 scaffold_29 413496 419094 + 147019|3402 3425
AGTCTCATTATTATTGGT-TAATG
CGCATTTTCCTTTTTGGCAAAATG
>CG31161 18443917 18444020|18916 chr3R 18442625 18444004 scaffold_27 749628 750949 - 29791|1313 1400
AGCACCCAGAAGGCATATCTCATCTATTGTTCAGATTTTTTCAAAATTCAAGCAGCTATCTATCAAAATCTATAGTTTTATAAAATTA
A-CATGTTAATGCCGTACCAAAAATAATTTTATGTCCTGCCCAAAAT--AACCTTTCATGATTTTAAATCTGTAGTTTTAAAAAATTA
>mRpL45 18445445 18445969|18917 chr3R 18444261 18445565 scaffold_27 754882 756216 - 52757|1224 1368
TTGTACTTTTTGTGGGCCGCCTGGCGGCTCAGAAGAATGCGTGTT-------AACATTGCCTA------ATGATTTTTGAGTCGCCA-----------TTTGGTTAAATTATAATTTTTAAAACTGTTATTGTTTTTCTTTATTT
TTGTACTTTCTGTGGGCTGCCTGGCGGCTAAAAAGATTTAAAGTTGATGTACAACAGCGTTAAGAACACGCGATATGCTAGGCACAAAACACGAAAGTTCTATATACATTTTTATTTTGAAAGTTGTCTTTAGTTTGTTTTATTT
>mRpL45 18445445 18445969|18918 chr3R 18445698 18448656 scaffold_27 757358 760387 - 125119|0 297
AGATGAATGGAAAATGTAGACTCAATTTTCT---TGTAAACCACCTTAGGTAGGTAAGC------------CACCTAGGAACATATATTATTCAATAATACGTATACTTATTACTTTTGATATATTTATTCAAAATGTAGTAAAGCTAATGCTTATTGTTGCTAGTTATTATAAATACAGGCGATCACTCAGTAGATAACATACAAAA------GCTCGTCATGGAT-----TGTTTGGACATTTAGAGAATAGGGAATAGGATATAAAGTATCAATAAATAGTGCACATATATATAC
AGATGCTTTAAAAATATTTACACAAATACATATGTGTGGTCAACGT---GTGTGTAAGCACAAATTGTAATTAGCTAAGAACTTATG-------GCAATATAGATATATATAGGCATTTATTAACTCAGTTAAAAT----------TAAGATTGGGTGTAGCTA---ATTATAAATACACAAGTTTACTTCGTGGAGCAGTTGTGGACTGCCACGTTCGTCATGGTTCCTTCTGATGGGACACTTTAAAAATACAATACA--------AGTGTTAATAAATATATTAAAAGTATATAC
>CG6954 18507302 18508211|18986 chr3R 18504285 18507302 scaffold_13 1619322 1622412 - 156031|3138 3138
G
G
>CG6954 18507302 18508211|18987 chr3R 18507580 18509689 scaffold_13 1623309 1625559 - 16398|0 769
TCCACCCTGTCCAGGGCAATGATCGTTGACCAA-TTCCAGAATTAGACTGAATTACTTA----TGTATGCTGCA--ATGGCAAACTG-----------ATGAAATTGTAATTGAAATGGTATTATATTTTCAGTAGTTATACATTCAACATTACCCAGGCAAACAAACAC-----------ACACACGAATCGGATTAAA----ACAGAAAAAGATTGTTGTTAGTTGTTCTAGAGT---ATTGAAGGTTACGCCCG------TACATAAGTAGTA---TGTATGAATGTTATATAAATAT-TATGCGTGCATCA---------ATGTATTTTATTGTA-----------------------TGTATT---GTAGTTTAGTAAACAAA-TGTTTTGATTGTATTTTTGTGGCA-TTTTTTAGGGGCAC--ATTTTTTGATCTAAATGTTAAATCGGTAAATACGGAACACAAAACCAAATCAAATCGATGGCGAAACTCAAA-------------GAACAGATGTCAATACG----------------------CATTTTAAGTGTCA---CTCTTGATGTCTTTCATGTGTGTGTGTGTGTGTTCT-------TAAAAATTGCAATTCCAT-CGGATTAAACAAATAATTTAGCTGTAATCAATTGTTTGTAAACAAAAATCACCGCAACAAAAATGATAACGAAACCCGAAGATATTTTTTAAAAATATATTGGCAC-AACTGAATGTTGAAAA------AAAAAATT
TCCACTGTGCCCAG--CCAAGTTTGACGACCAAATTCCCAAATTAGACTGAATTAATTACATATGTATGTTAGAGGAGGACAAAAGATGATGTTATATATGAAATTGTAAT-GAAATGGTATTATATTTTAAATAGTTATACACACGCACACACACACACAAACACACACCATGCGCATACATACATACATATGTATATACGGCACATAAATTAATTGTTGTTAGTTGTTTTAGAAGCTGGTTAAAGCGTAAGTGCAACAAATTACACCAATATTAAAATGCATATAGATTATATATATATATATCTATGTTTTACATAATTATATGTATTTTATTGTAACATATACTATATTATATATGTATGTATTTTTGTAGTTTAGCAAACAAAATGTTTTGATTGTATTTTTGTGGCAATTTTTTAGGCGCACGCATTTTTTAAT----ATATCAAATCTGAATGT-TGAAACGAACAAGAAAATTAATTTAAAAATTATATTAAAATGTCGGTATATATGAATATATATATATATGAATATATAAATGTATGTAAATGCATTTTAAGTGAAAACTCTCTTGATGT-----ATGTGTAT-TGTATGTGTTCTCTATAAATACAATTAACAATTCCATTCGGATTATACAAAATACTTAAGCATAGTTTCTAGATTGTAAAGCTG-------GCATATAGAATGCGAA------------ATATTTTTTAAAAATATACTGGCATTAACTAAATGTAGAAGATATGTAACAAAATG
>CG6958 18520449 18520497|18992 chr3R 18516339 18521121 scaffold_13 1633592 1638460 - 185466|4241 4294
TCAAGCACC-TCACATGTCTTTCTATTAAAGTTTACGTTAAG----AATTTAAA
TCAATTTTCGGCATTTGCCAATCTATTAAAACCTAGTTTAAGATACAACTTTTT
>CG6969 18523655 18523658|18993 chr3R 18521122 18523748 scaffold_13 1638800 1641461 - 114734|2602 2605
TTAG
TTAT
>Cyp6d4 18525783 18526034|18995 chr3R 18524118 18526119 scaffold_20 2031455 2033499 - 74946|1676 1975
AAATTACAATTGCAATGATGAAATACAAT---AGTTAAGTGGCTAGC----AAATCACTCCGATTATTTGGAATGATAAGAGATTA-CCGTCAGATAAA----AAACAAAAAGTGTAC--AATAAATTCATT-ATCAAATCATTAATTAATATTTAAATTCGAAAA--------TAACTTTTATGAATTAAC---------------ATAGTTTCTTGTTATAATAATGT-TACTTTTAACTCG-CTCTCTATTTATAGGTATTA------TGTAAATTATAAAGTTGAAATGAA--TAT
AATTT---GTTGAAAAATTGCGAAACATTTCATGCCAAATGTTTTCCATTAAGATAGCGCCTAGTGATTAG-TTGATAGCAGTTAAGCCGCCTTATCAATGCCCACCAAATAATTTGCCTGATTATTTTATGAATAGAGTCAACACTTTTTATTAAATGCCTGCAATGTGCTTGTAGCCTCTCTCAGATAACTAAGCGCATACATGAATACGTTTATATATTTATTATATATATTTATGGATAGATTATTTATTTACAGGAACGATTGCATTGTATTTTATTTCGGGTATATAGACTCAT
>CG6972 18529935 18530061|18996 chr3R 18526301 18533334 scaffold_20 2045641 2052739 - 249240|4016 4153
AGG------GAGATTTCCACATAAGAGAATAACCATAACCATAGTTACCCTTTTTCTAATATATATTATAATATATTCTAGACCCTCA--CTTTTGTAAAGCATTTTAGCGGCTCAATAAACATTTGTACCCC---CT
GAGCAGCAATAGATTTTTAAA---------GACCATTATCATAGGCAAGCCTTACTTTATACACAC----ATGTACTTAGATCTTTCAATTTTTTGTAAAGCATTTTCGCGACACAATAAACATTTCTATTCTTTACT
>CG17618 18554572 18554728|19015 chr3R 18554362 18557851 scaffold_20 2066953 2070488 - 63236|224 393
ACGGGCTGCTTCCGCCAGCAATTTGAAATTGAAAACGCATTGGATAAACCTTAGCGC-------GCAAACCAA-----AAGCAATAAAACGCCAATTGAAGCATTTATATTAGATTGTTAAAGCCAACCGGCGTAGCATTTA-CTTGCCTGCCCCAAAAAAGTAAAAAAA
AAAGGCTGC---CGCCAGCATTTTGAA-TTGAAAACGCATTTGAACCATTTTGCCGCAGTCGCTGTGCGCTAAGAATTAAGCAATAAA-CGCCAATTGAATCATTTTAATTG--TTATTTATTCCAAGC----CAGAGTTTATCGTTGCTCCCTTATATACACATTTAGC
>CG6985 18568720 18568810|19022 chr3R 18564540 18573327 scaffold_20 2077107 2085893 - 218295|4451 4544
ACAAACAAAACGTTAA---CTTCAAGAATATAAATGTAAACAAAATTATTTTGTTGAACTAAATGCTTAGCAGTTGAGTTAACCTGGAAGATTT
AGATCCAGAGCTTCAAGTACTTTAAGAAACTATAT-TAAGTTAACATACTTTTTTG----------------GTTAAGGCAA------------
>HP1c 18572153 18572327|19022 chr3R 18564540 18573327 scaffold_20 2077107 2085893 - 218295|8040 8219
GGACGCGAGCAGAATCGAC-----TGTTCAGTCTTTAATCTAAGCCCCTAAGTTTAATTCATACATATGTATAGCTATCTGAAACCACTGGGTTCGTCCAGATTCATGTGACCCAACTGGCCGGAGCGAAAGAAGTGAATGAACTTTCGCGCGGCCGCCAATAAATTTGTCATCACCTCC
TTACTTGATTAGAAATTAAAACAATTTTGAAACTATATTAGAAGGAACTCCGTTTAA-------ATATG-----------GTAAGAACTTTCTTCGTCTAGATTAATAGGCCCCAGCTGTCCAGTGCGAAAGAAGCTGATAAATTTTCGCGCGGCGGCCAATAAATTTGTCATCACTTCC
>CG7023 18601951 18602098|19032 chr3R 18598959 18602560 scaffold_72 175948 179458 - 84888|3154 3339
TCCTACTA------------CGTTATCGCCCATTA--TAAGTTAAGCTGAAAGTTT-----------TCAATCTCCTGTGCAAGAT-----GAATGCCCTA-------AAAATTGTATG-TCTTTTACTATCTAACCAAGCAAAATACCACACAGCTATCAATAAAGATGATCATCAATAAAGCAA
ACCATTTAGTTTGCACTTTTAGTTGCCATCAATTAATTTGTTTCAAATGACAATTTGGCTCAGTGCGTAAAATTTAAGTAAAAAGTTTCTCGTATTGCCTATTATAGGCGAATTGTATGTTCATTCACTAATTTTATAACCCTAAC----CACATTAATAAACAATGATAAACGTTA---------
>CG7029 18618402 18618491|19041 chr3R 18612648 18619835 scaffold_72 187606 194468 - 213271|6026 6115
GCGTCCACACGAGTCCAAGCGTCCAAGTCATCCCAATTAGTCAACGGCAGACAACAGACACCACACCCAAAACAAAACAAAAAATCCATT
GAATTAGCGCGATATAAACCCTACTGGC-------GTTAGTCACCT---------------------------------AGCTATCCA--
>CG7031 18631909 18632211|19052 chr3R 18630732 18632718 scaffold_910 6 1828 + 47738|1246 1559
AATCTAGGATGTGCACTTTTATAAATCCCATCCTGCATTTCTGCATTTCTGCACCTCTCATTTGCATCCAGAGCACGCGAATTTCGTTATAGTTATAAGCACATTACGCATACGCCAC-CACGTCATCCCAGCCTTTTGTGTCAGCAAACCAAAGCGAACAACATTATGCAGTTTTGCACATTTCGTATTCCATTTTTAATGTCGAGTTTTAAAATTCATTT----------AATCCCCGTGATGTACAACAATTTTGTGACTCATTTAACATTACAACAATTTGCATTAAAATACAAACACGAACGGGAACAG
------------ACTCTTCACTGCACTCCACTCTTCACATAAGCAT------------------AATCGCGAACATTC--ATTCCAT--TAGCAATAATTACATTACTCATACGTCCCGTACACCAGCAAAGCGTTTT----------------GCAAACGCTGTCATGCAATTTTGCACAGTTCGTGTT--GTGTTTATCGTCGAGTTGTAAAATGAATTTTGTTAAGCCAAAATCCTGTGTTGTATACCAATTTTGTGACTCATTTAACATTACAACCATTTGCATTTGTAT--------------GAATAC
>klg 18785824 18787456|19205 chr3R 18785235 18785837 scaffold_73 105764 106313 + 19083|602 615
GCAGTTGATGCGGC
GCCATACATACAGC
>klg 18785824 18787456|19206 chr3R 18786061 18788800 scaffold_73 106640 108966 + 25901|0 1442
AAAAGCTGAACGAATAACCCATGTAAATAATTTTTCAAGAGTTTTGTCCACGATTAAATTAGCACACACCCACTCACACATACAGCCGGAAAATCGT---TAATGGAAATTGCAATTGGAGACTGCAAATCCGAATTCAAATCCACCATCCACCATCCCACCCCCGTTCCATTCCCATGGTAGAATAAGCAAGTCGAACTAGGTCATGTAAATAAGCATTAGATATCTGAATGTGAACTGCATTTTA----CTTCATAAATGTTGGGCTGATGCGGCCCGATGTGCAGGATGCGCAGGATGTGTATGTAAATTAAGCAAATATTATATAGTGATATTATTTAGTTTCGAGCGAAACCATAAATAACAAAATATTGAAGATGAAATAAAGCAGAGGGGGGAAAGAGAACACACACGCGGCAAAAATGTTAGTATGTAAAGTATTTGCCACATTTCCGTTTCATATTCGAGTTTATTTCATTTCTATTGCCACTTTTTCGATTGCAGTTGTAGTCTTATTTTAGCCAGTAAGCGCACCCATAACCAAAAAAGGATAACAAACGTAACAGCAATTCAATGTAATGTTTTTCGATGTAAATTAGAATTTAAGCAAACGTGTTGTACCACCAAAAAGAATGGCGAAAGGTCGAAACATAGCTACGCAAATAAGC--TAATACCCCACTCAAAATCAGAATC--GAAAGCGAAATCGGTATATTATTCAGAGTATTTGAATGTGAATCTTTGCATACATATTAGCGGCACGTGGATGTCACGCGTGTCAATCTGTAAATATACATAATAAATACGTGAATAATATTGAGTGTTACGAACCCAGCAGGCATTTTATCAGCTTTTGCACCTTTCCAATTGTACGATCCGAATCCGTACTGTTTCATTTAGGGCACACAATAGAGGTCAAGGGTCACTTGTATATTTGATAGGCCGCGGCCTACAACTCGAACTCGTACACA-ACTCCCTGTACTTAGCATGTCGATCGAACGAGGCCAAAACCGAAAACGAATTCAAAAAAATGGGAAGTGTCGAGTCGAATTGAAAACCAAGTAAAAGCGTTACAATTTATCTACATAAATGTGTATGTGTGTGTGTACCTTACA---TAGCCAGTTGAAT----GCAGGACGAATCGGAGGCATTACTACAG-ATAACATAGATGAGAGAAGGACGAGGTGACGAGGGGGATGAGGAGGGGT---CCGAAAAGGATCCAGCCTGAATCTAAATACCAGTATAATTCAGATTAAACAGATATAGCTAAGCACGTGACCGGTACGTGTTCATAAAAAGTGAATTCATTAATTACTAACTA--------CATAGTACGATGCTAATTGTATGATTAATGCGCATAAGAAACCCTA--------AAATATTCAAA-------AATA-AAATAAAGCATTAGATGTAAACTAAA
AAAAACTTAAC-AACCTCCAATGTAAATAATTTTTCAACCATTTTGTCAGCCATTAAATTAGC------TATTTCATGAGCGCAGAATAAAAAGTGCGAGTAATACAAAAACGTATTATAAAGGGCAACTGCGAATGCAA--------TATATGAGAATATGAAAGCAGCAAATCCATAGTAGGATAGTCCACTCGAACTAGGTCATGTAAATATGCATCAGATATTTGAATGTGAATTACATTTTAAGTATTTCATAAAAACT----------------------CCAATGCGTAAATAATATATGTAAATTAAGCAAGCATTATATAGTGATATTATTTAGTTTAAAATGAAATCATAAATACCTATGAATAGCAAACGAAACACCACTGT---------------------------AAAATGTTAGC-TGTAAGGTATTTTTAATATTCCTGTTT----------TTGTTTTTGTTTTTATT-----TATTTCG--------------CTCAACTTAGTT-GTAAGTGCACC---AACCA--------------------CATTAATTTAGAATAACGTTTCGAATTATAG-TTAGCATTTAAGAAAACATGTTGTACCACCAAAAACAA------------GAAA-------ACTAAAATAAACCCTAATATAAAATTCAAACACGCATTTTAGCAAACTAAA----------ATACAGATTAT----AAGTAAACCATG--------AATAACAGCTCATTAAAGT-----------ACTTGTAAATACA----------------AGGACATTGAGCGCT-------------GTATTTGATCAGCTTTTGCACCTAGC-AGTTGTACGATC-------GTACTTGTATATTTAG---CCACAAAATACGGCCAAGCTAATTTTAA----------------GCATGCAATATGAACCCATACAGATACGACTTTTGTGTAG--------TTGCAC---------------------TTGAAATAAAT------TGTCGAATTAGAG-GTAAATTAATTATGTGTGTTAATAAATTGCCACTAAGAAGTGAACTCGTAAGCATGGGTTATGGTGTAACTACTGTAATTGAAGCATTAACAACTTGACAATTTACAGTAGCATCAAGTTAATCAGACAAGTA-AAAATAATAAC----ATTAGAATGTATTTCCTGAATATATGTCAACTAAAAAGCAAACAAAA----AGTTCA--TCAAACCGAGGCAACCAAAGA------------ATATTTATAAAA------TTCACTAAATTCTAACTAGTTATATGCTAATTATGGTGGTACTTATATGATTATTGTGCATAAGAAACATTACCGATAAAAAATATCTAAATTAATCAAATACAAATAAAGCATTAGATGTAAAATAAA
>CG31281 18792672 18793183|19211 chr3R 18792605 18793184 scaffold_73 112362 112930 + 4954|70 633
TCATCATGTCACCCACTTCACTCAATCAATGCCCCCCACGCATGGCCGCCTGTCACGAGAGAATCCAATTTCGAATCAAGCTTAGCCAAGCGGTTACACAATCGCCGTAA------------GTTCCGCG----------CCCAAACACATGTATTCCATCACGCAACCAGCGGCACGAAATTTCAGAGCAACAGTATTAAAATTATAAGCAG-GAGGAGCAGGAATAGAAACAGAAACAGAACCACAATCATTCACATTTAAATTAACATTTCCCGCCGACGATTATCCTAATTG----CGAGCTGGCCTTAGCCTAGTCGCT---------CGTCCTGG---CCAAAGATGTTGA-------ATATGCGCCGCTTTCCATTCACT-ATTTACATTCATGTCGGTGACACGC-----GGCACGCGAGATTCTGCTAAAAAATGGATTCAATGTAACGCAAAACAAGCGAGGCCTCATAAAAATGAAATGCGGATAAATCAAATTAGCATTTTGTACAAATAGCAAAGCATTAGCTCGCGTACGGCGGCAATTTGTAATGTCAG
ATATATACATACACAT--------ATACATATGCCGCAATCATGCCCGCTTGGCACGAGAGAATCTAATTGGCATTAAAGCTCAACCAAACGCCTATAGACTGGTATAAAAGTCAATATACTGTTTCGCGTTATCCCAGACCCAAACACATGAAAGTC-TGTCGCAAGCAACG-CACGCAACTGTGAAGCCACG------AAAGGCTACTCAGCTATAACCTAGTATAAAGGC-----TATGAAAACCATCATTCACATTTAAATCAACATTTCCCGGCGACGTTTATCGTAATTGAGCACAAGCCAAGCTGAGTATAGTCACCTCATTTACATGTCTTGGTTACTAAAATTGCTAGGAAACTTGAATTAGGTGCATCTCATTTGTTAAAACATATTCGTGTAGTTAGCATTTTTAAGGGCACACGCGAGTAT-CTGGATAATTAATTTAGT----------------------TCCTA-------------GATTAATCAAATTACCATATTATACAAA-AATAATACATTACCT--------GCTATAATACATAATGCTAT
>CG17244 18803510 18803613|19219 chr3R 18802777 18803515 scaffold_73 119187 119902 + 10433|762 767
TTCGAT
TCTGAT
>CG13838 18868331 18868392|19280 chr3R 18868392 18868539 scaffold_73 173120 173252 + 1951|0 0
A
A
>CG6697 18888402 18888474|19293 chr3R 18887381 18889998 scaffold_15 2234209 2236835 - 125874|1026 1099
ACTTATCCTCGG-TTGCAAACATTTGTTAGATTTATGTTAGATTTATGTTTATTAAATTAAGATGCATTTTATA
AGCTGTTTTCAGCCTGATTATATGTACTA----TAAGATTCGCTTAATTTTATTCAATTAAAAT-TATTTTAAA
>CG6726 18919009 18919186|19322 chr3R 18917396 18919119 scaffold_15 2274849 2276618 - 67003|1675 1794
CGAACTCAATTCAATTATGAAATAATGCATTTAATGCTTACTTGTC---GATGTTTATTGTAATAACTTTAAACAAGCAGGCTTATAAAAACCCA------TTTAAATAAACAATGTATG
--AACGAAATACGGGTTT----TCGCGCGTTTTCTATTTGGCTGCCAATAATATAAATTTCACAAATATTAAAT--TCATGTTTTTAGATCCACAGAAATGTTCACATATGTACTATATG
>CG6726 18919009 18919186|19323 chr3R 18919120 18919373 scaffold_15 2279197 2279455 - -1245|0 71
A-ATAAATAAGCCAGTCCATAGTCC-ATACCATTAATGGTGAGCAAAAA---AAGGAAATTTAAATGAAAAT
AGACAAATTTACGATTACAAACACAGGTAGCTAAAATGGTGATAAAAAACACACACACACACAGTTACACAT
>CG17109 18922836 18922902|19329 chr3R 18921748 18925116 scaffold_15 2281508 2285074 - 67237|1147 1223
AAACTAAATCGAAA----------TAATACATGAAAACCTTATCAAAATAAAGATTGATGATTTTGTTATAAGTTA-
ATATTTAGTTTAAAGGCGATCGAATAAAAATTTTAAGCATTCTCACCA-AGAACTTTATTATTTTATTCTTACTCAC
>CG6733 18924860 18924913|19329 chr3R 18921748 18925116 scaffold_15 2281508 2285074 - 67237|3386 3439
ACAAAATGTTTGAACTACATGGATCGTGGCTATAATAAAGATGGGCTAATTACT
-----ATGTGTGACTTCAATGAATATGCGTTAT--TTATTATTTATTAATTATT
>CG6738 18926662 18926705|19331 chr3R 18925438 18926667 scaffold_15 2283608 2284843 - 38334|1241 1248
C--CAATG
CTTCAATG
>cenB1A 18949352 18949941|19352 chr3R 18946721 18952065 scaffold_15 2308730 2314220 - 178357|2729 3450
CAGTGGCAGAAGGGCCGCAAGA---GTTAGGACCTTACTGGATATTATGGAATAATTTGTTCCAATTATTAG---GATAGCGTGATATTGGATTGTTATTGGCTTTATAACGCATTAACCAGGAATGTTAAACGGTT----------TCGACCTCT-----AAGGATGTCGTTGCGGGCTTGTTTCCCTTGGTAATCTCATTTGAAAAGCGCTTCCGATTATACAAGAAAATATTATTCATTGCATTTGGCATTCGAATGGCAGGCACGATCGTTCGTTTTCTCTTAGGCGCATTTTGAATCCGTT---TTTGGCGATTAGCTTAAGTTTAAA-------------GTATTCGTAGAGCAGTTGA--GTTTA------TTAAAAA----------TACGTATATTTGCCTATA----AAATTGTACATCGTCTTATGTGG--TATTTATTA----AACGATAT---TGTAAAATGTACGT--CTAGCTATAT-----------GTATCTTGTTACAGAGCTGTTCCAAATG-TTCCGATTTGTATTTGTT-------------------TGCTAAACTG-------TTTAATGCTGCATGTT-TCTA--AATGTTTTAACGCTATCATGTTGATGATT---TTTGGTGCC---AACTGTTGTGAGCACTCT---AGGTTCGCGAATAAAGTTG------------TAAAATATTCAGATCAA
CAGTGGCAGTAGGCCTATGGGCCATGTTGACAACTTACTCGTTACAATAGA------TATTCCAATGTTTAGCTAGCTTGGGTGCCAATCGCTTATTCTTAAT---------CGCTATGCTAAATTATTAAACGGTTCATTTCGGTGCTGGCATTTTAAACAGAGCCGCCAACTCGAAACTGTTTTACTAGGCAATCTCATTT-AAAGGCGCTCTTGAT------ATTAATTGCATTGCATTGCATTTGAATTTCGTATTG---------------GTTTAATGTTATGTTGACGTTTAATTAATTAGCTAAGGCCTATAG-TTAAGTGCAAATGGCTCGTAATCCATATTTATATAAATGTTTATTGTTTACAATGTTTAAATATGTATGTATGTACATATTTTTGCCTAAAGCGTATATTGTACATTCTGTTATGTGAATTATATATTATTATAACTGTGTGTATACTAAATCTATGTAGCTAGCTATCTTATATTATATCGTATCATGTT--GAAACTGTTTCGGATGTTTCCAATTCGTATTTGTTAGTAATAAGTTTTTGCGTGTGCTAAATTGTTTTTTTTTTTTTTTTGCATGTTCTCTACGACTGTTTCAAACCAATAAAGAAAATGTTCTTGTTTAGTGCCAAAAATAATTGTGAGCACTTCAAAAAATTATCGAATAAAATTGCAAAACGTTTTTTAAAATATTTGGATTAT
>Ir 19010682 19011281|19414 chr3R 19009925 19011393 scaffold_3 5465927 5467528 + 41707|892 1575
TATT---ATTAATTGAGTTAGTCAGTTATCTGATGTTGTATTCTAGTTAAGCATAGGCTCCTCCCAATATACATAATTCTAACTCAAACTAAGCTAAGCGAAATTCCATGGAGAGCTCATCTGTCATAGCCATAGAGCTGCTGCAGCTGTGAACATCCCTCAAAAAAATCCCCCTATCCTGCTGAAGTGG--AGGCAATCTGATTGTTATCCACCTATCTACTATACTTACTACTAACCCTGAAACGATTG-TACATGTTTATGTCTAGGCTAAGCTGATGAATGATTCACGTTGTTAGCTTTAGCTTTGTGTTGAATTTAC--TATAGTTAAGTTACAAATTGATATTAACGCAAAGTAAGATGTGAGACCCA--GAAACCAAAATGCTGCAACTTAGAC--------------------------------AACTAGATAAGTCATTAAACGGCTCACTTAACATGAAATTTATGCGAAGACGCAGCG--------GAATTGAAAATTCCCTTTAAGTCGATTATTGTTTAAT------ATTACTCACT--TCAATGAGATATA-AAGAATGTACATTTTAATCCATATACTGTTTCAAAAACAA-------------------GAGCTTC-AATTATCATAAG-----GAGTGGACAATAAAATTGTATGCGTATGTGAGA
TATTCAAACCAAGCAAAATGAACC-CAAACTGATGTTGTATTC----TAAGTGTAGGCTCCT----------AGAATTCTAA-TTAGACTATACATATAGATAGTTAGTTTA-AGCAGACCCCACGCAAATGCGGCTCTGTT--AGCTGTG-ACATCCTTAAGTGACATACCCAGAAGCCGCGTGCCCGATTCGGATAACAGATGCAGATCCTTGTAGCGTCT---CTGGCTTGTATTTTGTAAACAATTGCTTGATTTTAGTGT--------------------ACTTTCTGCGTTAGTGTTAGTTTT-TAATGAATTTACTATATAAATAAGCCTCAAATTGATATTATAAACAAATACCATGAACGATATAATGAAACCAAAATGCTGCAACTTCCTCGTGTGTGCGTATATACCCTATACACTTATCCTATCTATATACGCATATGTAAAGCTC-----ACAAAAATGTTATAGTGCAAAACAACATGTTATATGAATTGTAAAGCTACCTTAAA-CGATAATTGTTCAATATCTCAATTACTCAATTATTAACTAAATATATATGTACACATATTCCAACAAAAACATAAAAAAAAAAAAAAAACAAAAATAATGCAGATTGAGCTTTGAATTGTTATTAAATACTGTGTGGACAAT-AAATGGAATGAGCATATGTGA
>CG6755 19080171 19080804|19475 chr3R 19077914 19080920 scaffold_20 625523 628567 + 78249|2453 3101
AT----GCGCTTACTCATTATAGCTACAATCTTATACTCAACTTCT-TCAGCGACAACTTAAGCAGCAGCAGTAGCAGCAACCTC-GATCTATTAGGCATTCACGGTGGGATTACCTTCCAACTTTATTGGCAAAGACTTTCAGGTCTGAATAAAGTGACATTGTGATACTAGACCTTCTACTTCCCAGTGCGCTGTGGAATCAGACTGCTGCTGTCGGCATGCGTAGCATATGCATGCTATTTATTATTTATTCATGTTCTGCCCTCTTTTATTACGCTGTATAAGTCACTATATTTAAGCCAACCGGATAA------AGATAAAGCTTTTGTTGCATCCCGCTGGGTCGTAGACAAGCTCATTTACATAAGTTATGATATTTGATTATAGTTGTTCAATTCATTGATTGCATGTAACTTACGATCAGAAGGCTGATCACTCCAACATTATTTAAAAATTAAGTTCAATGTTCTTTGTTCAAAA--GGGCTGTGCGTATGTCCAAAATCATAGAG-GTTCCAAGCTGTATATAAATGTATTTACACAATCCTAAACCTATATGAAACTACCTAAATTATTGAAGAACAGTAAAATGTCTCTTAATGCATCGCTAATTAAATTCAACCAAAAAATTCTATATTACCTTT
AGCAAGTCGATTACCAACTAATGCAAA----CTATACTCATTTGTTATGAATTACACC-----CAACATTTATTAAAGCACAGTCAGGACTATCAAACAC----------ATTATGTTCCACAATTA---------ACTTATAACAATGGATAAGGTATTAGTGTGTCAATAGA--------------ATCGACTATGACA-AAAACTCC------------GTGTACTACATACAAATT------TATTTATTCATGCTCTGCGCCCATATTTATATAAATAGAGCTTAAGTTTTTAAAGTCGAATAGTTTATCGTTTGGTTAAAGCATATAT--CATCCCAACTTCT---------GCTCATTAAAATATATT----TCTTCTATCATAA--AGTCAGCGCAAATTGTGCATACAAATTGTAAAATAATTGATTGTATAACCACAAATCGATATCATTTAAGTTAACTATGTTTTGTTCCAATATGGGCTGTGCGAGTGTCCAAAATCATTGTGAGTACGTAATTGTACATATGCTTATATATATATATATATATATATATATACATACACGCAT------------ATAATATATTTTAGCATGTGCAGCTG--TAATATCAGCTTATAATTATTAAAATGTTTCA
>CG13827 19086151 19086324|19478 chr3R 19085086 19087291 scaffold_20 632230 634657 + 44535|1114 1349
----TCGGTCCGCCGTTGTATTTGCAATCCGTGTACTCGTATTTGTTGAACAGAATTTTAAGCTAGTCGGTAATCGTTT--TTGTACGTTG---------AGTTTTTTGTACGGCACTCG---AAAGTGTGTTTAGCCAGTATGTCCTT-----TAAAGTAGCACAAAATACACGCTGAATAA---------------------------------------TTGTAAAAAACATG
AACTTGGCATCTCGGATTTAATTGT-------------GGGTCAGCGGGTCAGCATTGTTAGCCAGGCCGAAAGTGTGTGGTCATATGTAGGAAAACAGAAAACTTGTGTACAATTTTTGTCAAGCACATGTATAGTTATTAAATATTTAAGCACAAAGAAATATAAATTATAAACGTAACAACAGGGAGTGTGATTTGAAATGAACTGGACTGTTTGTTTATTGCAATAAATACG
>cdc16 19109478 19109845|19495 chr3R 19106660 19111770 scaffold_20 655055 660134 + 167567|2883 3311
AAAA------AATGTAT--------ACCAA-----CTTATGTCAATCATTAAT--GTTAGCTCCTATTG------TTAGCCAGA-----CAAACATATGC------------CATGCACTTGAACTTAATTCGTGGCCAGAACAAATACAGATGTTTATGCTTGTATATTGTCGTCTGGCTAATGAGC-----AAAGTCTTGGGATTTTTCAGCTCTGTTTTTCCCACCATCAATCGAAGTCGCCGCCATG------------TGAATAACATTAAGTATTTAAGAAAACGTAAAAGTCTCATTTGAATCATAATTGTACGGCCAGCCAAGAGTGGTCCTCTAGCCACGTTCTCTCATTCATTTTGTAACTTGAATACCATTTTATAATAATTAAAGTAAGCTTAGCATATGCAAGAAGAACTAAAGTT
AGGATCAACGAACATATTAAGTTCCACCAAACTGTTTTTTGTTAATGACTCATTAAATAGTCCCAATTACAATAATTTGATAGATGCTGCAAACAGCGGCTGCCGGCTGCCACCTGCACTTGAACCCAATTCATGCACACGGCTTATACAGCTGTTT-------------------TGGCTAATGATCCAAAAAGAGCAATGGGATTTTTTAAA-ATGTTTTTCCCATATCTATTTGAAGCTGCCGCCGTGCTGGGTTTTATTTGCATTGTACTAAGTATTTAAGTATGCGAATTGCTCCTCTCAAAATCAT---TGTATTCTCGGCAA-------TCCGCTAGAAAA----------------TGTTTTTTGAAT-------TACAAGAATTATTATG-TTTTAGGTTCTGTGAA-----------TT
>CG6763 19111627 19111759|19495 chr3R 19106660 19111770 scaffold_20 655055 660134 + 167567|5177 5316
AC---AGAATCTACTAGCTCGTACCATCCACCAACGCTCGAAAGTATTTAACGCATTCCACATACAAAA--AATCTAGCACCATTACT--TAAACATGTAGCTAATATGTTTAGTTGATAATTATTAAAATTTAGCATGA
ACCAAAGAACCTGCAAAATTCATATGTTCACAAACGCAACCAACTATTTAATGCATAACCCATACAAACTTAGTCTAGTATTAATTATCATGAATCTCTACCTGATCAAAGTATATAAGAA----TAAAAACTAGCACCA
>DNApol-epsilon 19180811 19180890|19561 chr3R 19173341 19180904 scaffold_20 730229 737980 + 397557|7719 7805
GACCTAGTTTGTTGTTGTTTTCTAGATCGTAGG--GCTTAAATATATTGTATTTA---TAATGGAATTTAATTC--GATTTTAATGA
CAATTCATCTG-----------GAAATTGTAAGTAGCTTTTAAATATTGCTTTTAGTTTGTTATCATTAAATTCGTGTTCTTAATCA
>sec13 19183904 19184254|19565 chr3R 19183018 19183949 scaffold_33 221870 222740 + 39229|888 933
GCCAGCCCCGAAATATTGTCGTGCTGAAGTCGTGGTTAAAAGTGTT
--CAGCTGTCAAA----------------------CTAAAAATGTT
>sec13 19183904 19184254|19566 chr3R 19183984 19184448 scaffold_33 222756 223135 + 403|0 274
ATGTGCCCCTTTAAACGCTGTTTAGTGTATGTTTATTTGGACTTCAT-ATGGGATCCCTATTTGAATCTTCTGAAATTATAATGAATTCTAAAGACAAGTTTTTGTCGAAATGGTATCATTTTTTTTAAGTTTTATCAAATATATTTGCAAATTGTAAGTAGTATGTATTTAAAAATAATAGTATAATAAGAT---TTAAATAATTAACCAAATTTTATTCAAACTTATTATTTTTAACCATACAGATAAATTCCAAAACTAAAATTTTTACACA
ATGGGCCGCTTCAA----TATAAAAATTATGGTCAATATATCTTGATAATGCGAAACATATTTTAA------------ATAGTGG-----AAATACAGTTTTTTTTC-AAATGG------------TGAGCGTCACCTGACAT-TTCGTCGATTTCCAGCATTCTTCACT--GCAATAATCGCGTAATGTGGTACGTTCTAAAATTAAGAAAAT----TAAAAACTTGTTTTTTACATTCTTAAAGCTTAGCGTC-----------TGTTAAACA
>RpS3 19185581 19185697|19567 chr3R 19184536 19185737 scaffold_3 6292771 6294047 + 57170|1085 1246
ACCTAGTTTTACTGTTCATCCA-------------------ATGAGCGACTAGCTGAAAGAGTTGCCCTCAAATACAAC--------AAAACAACAGAAACAAAACAAAAACACA--TAATAATTCAATAAACAAA----------------ATCAATAAGT
ATAAAGTTTTACTGTTTAACAAGAGCAACAACAACAACAACAAGAGCAACAAGTGTGCAGAGTTTGCGATAAATACAACAACAACAAAAAATCACAAAAACAAAGCTAATTCAAATGTGTGGATTTAATAAACAAATTAATTTTTAGTAAACATTTAAATGT
>CG6784 19199259 19199313|19585 chr3R 19197587 19199290 scaffold_3 6307008 6308639 + 10552|1809 1840
TTGAATATATATACTTGAATTTAACAATTAAA
TCTATTTTAT----TTGTATACAAAAAATAAA
>CG6784 19199259 19199313|19586 chr3R 19199291 19199903 scaffold_22 300544 301120 - -3051|0 22
TATACATTGTTTAAAGGAAATTA
TATGCGTTTTGTCAAATAAATAT
>beat-IV 19404529 19405286|19743 chr3R 19404286 19404707 scaffold_477 2221 2626 - 20590|243 422
CCTGGCACGGAGCCATTCCCGAC-TCCTTACTAATTCGATTCGCTGTCCTTTGGCCCCATTTCTTCCACACAGTGAAAGGTGCGGCTGGCCACTCGGAGAGCAGTTTTCTGCGAACGCTAACCATCGCCATCATCCTGGCCAGAACTGGGCAGTGGCTACTTGGCGCGGAGCTGACCTAA
ACAGCGGGTGTGCTTTATTGGGCATCCATTTTAATTGTGATTG-TGTCCTTT----------------CATAGTGCGTAGCTCGGCTGGCCAAGTTGAGAGCAATTTACTGCGCCTGCTGACTATTACCATCATCCTGGCGCGCATTGGTCAGTGGCTGCTCAAGCCCGAGCTGACCTAA
>beat-IV 19404529 19405286|19744 chr3R 19404722 19404860 scaffold_477 2648 2759 - 6117|0 139
ATGGCAGATGGCACCCCATTCGACTCGATTCAATTAACAAAGCATTCATTTCAATTCAATTCAATT-CAATTGCAATTGCAGAGCATAAATGGTGATTTTGTATACTTTAAGTGTAATATCCTTAGTTCTTAAGCGACGA
AGGGCGGATG-------------CATGATT--------------TTCAATTCAATTCAATTCAATTGCAATTGCAATTGCAAAGCATAAATGGTGATTTTGTATACTTAAAGTGTAAAATCTTTAGTTC-TAAGCGATAA
>beat-IV 19404529 19405286|19745 chr3R 19405106 19406668 scaffold_477 3202 4616 - 7886|0 203
CCCAGCTAAGGGTTCGTTGTGCGTAATTTCTGTGTAAATACTTGAATGGAACGACAAAGTCTAGGGCAAACTTTGGACTTTTGTCAAATA-----ATGTCTGAGTGGCATCAATTTCG--AATGGTAGCTGGAAACTTTCCCAT---------AACAGATGCTAAAACTACATAATTGCAAAAAACAAAAAGAA-------AAA
CACAGTAAACGGATAGTTGAGCTTAGTTTCTGTGTAAATAATTCAATGAAAC--CAAAGCGAAATTTAAGCCTCAAATTTGCCGCACACACCCTTACATACAGATAACATTTGCTTCAGAAATGTCATTTGCGTCATTTTCAGTTTGAAGAAAGACAGCATTTAAATTTACTT---TTCTAAAAATATATATATTTTTTTTAAT
>CG10157 19505563 19505604|19851 chr3R 19505445 19507862 scaffold_20 36850 39304 - 111458|128 185
ATATTGTGTTCA------TTTAACAATACA----------TTTTTTTATTAAAAAATA
TTGTGCTGTTCGGCATTCTTTATCATCCTACTAGTTAAGTTTTTTTTACTATAACAAA
>eIF-3p66 19507863 19508049|19852 chr3R 19507912 19508040 scaffold_20 39379 39507 - 1065|0 141
CCACAACCCGCTAAGAATAACCACAACTGATGTCCTCTAAAGGAAAAGGTCATGTTATAGGCCCTAGC-TTAAGCATTTGTATTCGATTT------------AAATTCAGATATTTCCTAGTAAATCACAGAGGGCGAAACA
CAACAACCGGTTAAACAATGCCAAATCACATT------------AATATTTTTGTTCTTGGCGTTAGCTTTAATCATTTGATTATAAGTTGGCTTCGTTTGCAAGTGCAACGAATTCTGAGTAAAGCACAGAATG-GAAACA
>CG16705 19513837 19513873|19860 chr3R 19513062 19513859 scaffold_20 40773 41518 - 22658|783 807
T--GAATACATACTTAAATACATGA
TCCGATTGATAACTTTAATAAATAA
>CG16705 19513837 19513873|19861 chr3R 19513860 19513889 scaffold_13 3048705 3048730 - 413|0 13
TAACCATGTGAAAA
TAACAGTGC----A
>CG31148 19528271 19528324|19870 chr3R 19526364 19528271 scaffold_20 55382 57303 - 67265|1959 1959
A
A
>CG31148 19528271 19528324|19871 chr3R 19528272 19528553 scaffold_3 230471 230788 - -1162|0 55
AACTTATTTT---TTCTAAACAAAACAAAAAATTAAATAAAGACATGTTCAACTTG
GATTGAATTCATGTTATATTTAAAATAAAAAACTCAT--AAGATAATCGCTACCCA
>CG10300 19538519 19539036|19884 chr3R 19537814 19539744 scaffold_20 64752 66775 - 59731|710 1314
GTAAGACGACTCTAGTTGCTGTTTTG-----AATTACCATTTAATTAAGTTCTAATGCTATACAAATAAT--------------------TTAAGGCCTATTCGGG------TCACTGGGTATCTCGTGTATCCT----------CTTAAAAATAGCTTTACAATTGCCTAAGGT-GCTGA---TACTTAAGTGCTAAGTGCTGCACTTCCGTTTGAAGTTCACGTGCAGAG--AAGTGGGTGCAGTTGCTCCGGATGAGGGCGGC-------GATTGGGTATCTGAAGCGGAGGGC-GTGGCCTTATTTTGAATGGGACTCGTGGTGCTCTTATTGATGCTCTGAACAATCAGATTTAGACAGTCCAAACTGGAGC------CATTGGCATTGCCATCAAAGTCTATACAAAAATATTTTAGATAAATACATCAAATA-----------------CTTTTTTTTTTTTACTTTTACCTGTAAACTGACCATATTTCTCCATATGTTTGTTGTAAAAACTAAGTTTATCTTCTAGATAAGCGCCAGCATAGGAGCTCTGCAA-------GGAAAAACATAAAT-AAATAC-AAATGGAAAAATCA
AATGTGCG-CTCGCTTGTCTGCTTTATTCTTAGTGTTTATTTAAGTAGTTGCTAAAGCTAAAAAGAAAATTACTAAACTAGTTCTACACGTTCACTGTTATTTGGTGTGTCCTTTTTGGGTATAGCTCGTATCCTTTGGCTGGCACTTAAACCTAACTTTACAATTAACTAGTTTGGCTGAATGTCACTCAGTGCTAGGTGCTACATTTTTGCTTGAAGTTCGCGTGAAGCGTCGACCCGCTGCC-TTTCGCCGGCGGCGTGCTGCTGGATGAGATTGGGGCGCTGGTTTTGCTGGCGGTGGCTTGCATTTGAACGGCGTTCGTTGTGCTCTTGTTGATGCTTTGGACAATGAGATTCAGGCAATCCAAGCTGGAGCCACTCGCACTGGCGCTGCCATCGAAATCTGC-CAAGAAT--------TGCATACATCGATTAGGGTTAAGCGAATAGCCCATTACCAGTTGATATATTACCTGCAAACTGGCCATATTTCTCCATATGTTTGTTGTAAAAGATTAGCTTATCCTCCAGATACGCGCCCGCATAGGAGCTCTGCAATTGAAATTGAAACGCATCCATGAGATACTTAGCTGCAATATTG
>CG10365 19556953 19557227|19902 chr3R 19553563 19557209 scaffold_20 78556 82106 - 57678|3686 3950
TTTCTGGTGTGCTGGCGGC--CAAGTGCTATGCAGGTCGCGTTTTTTGCTACAGCAAATTCCAAATTATTGATCGACATTTTAGCTTGTTAGGTAACCAGAGTCTATTGCCAAATTTGACGTATTTCTTTAAATTGTAAATAAT----CCTAGGCCTAATCATAAGCAGCAACTCCTCC--ATAAGTGATCTGATTTAGCCAATAAGCTAGGATTAAGCACAAAAAAACTTTTTACACGCAACTGTCAGGGAGTTAAATTACATA
TTGTGGATTTGGTCTCAGCCACAAAAAACATGCATGT---------------GGAATATTCCAAATATAATATCAATA-TTCACCAGCACAGGACACGAGAGTCTGTGACTAATATCGATGTA-TTCTTTAAATTGTAAATAATCATACATAGCCTTAACAGTAAGCAGTAACTACTCTCGATAACTGATCTGATATAGTTGTTAAGCCTTGACTAAGT--------TCTCGTAGTGCGTAA--GTCGCGTCCTCAACGCACACA
>CG10365 19556953 19557227|19903 chr3R 19557210 19559051 scaffold_42 728319 730185 - 76183|0 17
TGAAAAGAAATGAATACA
TGAAGTAAAACCAATTGT
>Hmgcr 19576222 19576868|19920 chr3R 19576119 19581866 scaffold_42 753686 759511 - 212909|115 841
GATTGGGCGCTGCAGGGGCGCCGACTTCTACCCTTTTGTACATAG--AGTCTCTTTGAACG-TGCAGGCCAGGC----GTTGCAACTCATTTCTTTAGGTGTTACCTTGT--AGTTGAATGTTTCA--CAAATTGCTTGATAGATATCCTGATTGGCCTGGCCAGGGTACCGTACAGCCAGCGTCCTCCACATCGGCAAATCGCTCCAAGCCAATGC------TGAGGGCATAGGATGGGTTGAT-----------------------------------ATTCGATATCCACTCCTGCTGCTACTTCCACTTAGATTGTA------CTTTTCGTCGTAACGCTATTTTTTTCTACCAATACATAACTGAATACTGAGTGATGATCCGCTGGAATCCACACCAGATGCCAGTCAGTGGAGCTATGACCAGGACTAGTGCAAGCGCTGAACTTGTAAAAATTATTTCCTAAGCGAAAAGTAGTACATAGGGTTTGTATAGTGATTAAA--TTAAAA--------------------CTTTTAATTAGAGCGTGTACGATCGATATCGATATCTTAATTTCGGTTTTCATTTTTAACAAAAAATTATAAACACAAAGCGTAATGGATAAATGTCTTTTGTCGACGCTGCTCACGGGTTTACAAATCAGCACTTCATTTATTTTATTTTTAATAATAATAATTATTAATAAATTATTATAATTAATTTAT
AACT------------GACGCCGCATTC--ACCTCCTGTACATAGGCGTTCGCTCGGTTCGATGTAGGCGGCGCTCAAGTTAAAATTCTTTTGTTTAAACGAATGCTTATTGAATTAATTATTGTAATTATAATAATTG-TAATTAATCCAATTGGCCAGGCCAAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCATTAAGCAATTGTTCAAAGCCAAAGCCTTTTGTGTGCGTATGCGATTGATTTGTTGTAATTGTTAAAAACTAGTTTCAAGTATAACGCAGCCTGGGATTCGTTGTTGTTGCAATTTCCATTTAGTTTATACGAATGCCTATATATATATATATATATCTATATATCAATTGATGTGTGTGTAC--GATAATGAGCCTATTTTTTCTACA-------------AACGTATTT----------CTAGTGCAAGCGCAAAACTTGTAAAAAGTATTCCTTAAGCG--AATTAGT------------TTTAGTGACTAAGATTTAAAAGAAAAAAGGGTGTTGTTTTTTTTTTTAATAGAACA-----GACAGATTGCGAAG---------CGGAATGCA-----AATGAAAGAT--TAAATACAAAATGTAATCGATAGATGTCATTTATAGACGCTGCGCCCGGGCTTACAAATCGGAACTCCATTTATTTTACTT----TAATAATAATTATTAATAAATTATTATAATTAATTTAT
>Tbp-1 19580144 19580348|19920 chr3R 19576119 19581866 scaffold_42 753686 759511 - 212909|4340 4544
ACTAAAAATTTGCAGTTTAACTTCACATTGTCAGCTCCCATTAAAATAAACCATGGAAATGTAAAATTTTTCAGTTTCGATCTGAGTTGCCCCTTGAAGATCGCCTTTAAAATAACATCGCAACGGCTCTTAAAAGTAACTAGAATGGGAGACGTACTGAAATCAATACCCAACCTTTTTAAAATAAACAAAAATATATATCAAA
GCCTAAACTTCGCAAATTAAATTTACA-TGTAATCTTGCAAACGCGTCAACAATAAAA--------------------------------------------------CAGATAATATATTAAC--------ACATTAACAAGAAAAGAAGA-ACATTGGTTTC--TGGCCAAATTTATCGTTAGGAAT-------CGTATCGCA
>Plip 19585209 19585332|19921 chr3R 19581867 19586749 scaffold_42 759897 764802 - 123489|3559 3701
CCAAACCTGGACAATAGCCCAAATTTATTGTTTACAGTAGATTACCATACGTAACAAAGGTGGTGCCTGTTAC-----------------CCAACTACT--TTAGTGCTGATTTTCTTGTTGAATATACAATTTTCTACAAAA
CCCAATCCTGATAACAGCC----------GTTGAAAGTTTATTAA-ATACGTAACGT-TATGGTGCCAGTTTCTGATTTTGATACCATTACCAAAAACTAATTAGTGCT--TTTTCAATGTAAA---ACGATGTTCTTTTAAA
>Lsd-1 19592246 19592388|19925 chr3R 19591205 19598689 scaffold_42 768806 776167 - 295346|1179 1323
--CATTGAATTCTTTATTGCTATCGTATTTTTATTTCTGTTTCTCCGTGCATATACGGAAAATACACTAAACGATATTGTACATCTATTTTTAACATAATGCATTTGTCAATAATATAAGCCTAACTTCACGCTTAACAATACAA
GAAATCGAGTTTTTTATTGCTGTCGTATTTT------TGTTTCT-----------------------------------------------------------------AATCATAGAGTTTTGCTTTTGCTTTCA---------
>CG10375 19594554 19594704|19925 chr3R 19591205 19598689 scaffold_42 768806 776167 - 295346|3564 3718
TATAGCTTCCCAGCGCGGCGCCGCTCCTTCACTATCGCCAGATCACCTCCGCCAAACCGCGTCGCGTTGC---ACATGAATATTTTTACATTTTTTTTATAAGTATCCTTTGGAATTGTAATTGACACG-TGCATAAAATATAGATGTAAGAAAC
---AGTTCGCTTGTGC---------------TTGTCGCC------------------TGCGTCGCGTTATTCTACACATATATTTTTACATTTTT---ATAAGTATCCTTTGGAATTGTAATTGACATGATTCGTAATTTATAGTTTTAGGAAAA
>mbc 19626494 19627396|19944 chr3R 19621932 19628908 scaffold_42 803516 810819 - 220980|4863 5913
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AATGGCTAAAATCCAACAAAATGC--------------GTATCCCTAACCA--TAAAAGTCGCCTTAA-TGTATGCGTGTATTTCTACTAATTGTATTCAACATAACCGAGAAAAGTATATATGTCGTAAATGTCTTATTTTATTATTTTTTTTGTTCCAAGGATTATTCCGTTACCAGCTGCAAATTTTTACACACACACACAAATGCTGTTAAACACATATTTATTCAAATGTACCCATTCAAAAACGCAAATGTAATTTGCCA-ACATTAAAACACACAAACTTTAAAAATTAACATAAACAAAAAGAAAACTAATACACATTTAACAACAAAGCCCCGTCTACAAGCCTCAAGGCGCTGGATTTTGAATAGATCGTAAAACGTCCCACATTTCATATAGATGGAACTAAAGTATGTAGTTAATGTAAACGTACTAAAAACCTGCGTGCTCAAATATATATACAAAACATATATAATATATAAAAAAACAAATAACTTATATATTTCATAGCTGCGCACAATAATGAAGCTTCATTTTTTAACTGCTGACTAAAATTTGTTACACTTAAATAAAAATTAAATTTATTTAGAAAATGTTTTCTTATTTA
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ATATGGTATAGCGAGCGTCTGATTTAACGTGCTAATTACAGC----AACCACAAGCCAG-CCACAACAATTACAATCACAACCA------------------------------CAATTACAACCACAAT------------------------------TACCAACGACAAATTCATAAACGATAGCCGCAG------------------------------ATAGAACTTAA------------------ATCAAAAACATTAATCAAAATTAACTCTTT------------------TTCTATATGTATGTGTATTAC---TATTCGTATATATGTATAGAGTATGTCTTTGTCATGTCATG-TCTGAAATAAGTACGTTAAACTCAAACAGCTCGAACTAACAACAGCCAA-CAACAACAACAACAACAACAGCAACAACAGCAACAACAACAACAACTAT------TGATACTA-------TTTAATG
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TTAGACGAAAGAAAGTATTCAAAATGATGATATCCAAATGTTTATACC----TTACACAGCAATAGTCTGGCAAATGTTGTATATCAAATTCAAGCTCAATTATGTTCCTTACCGTTTTGTTCCTATGTATGTAA-AACAAAAACAAAATGTTAATAAAAAACAAAAAACAAACAAAAAAAAAAAACAACAAAAAACAGCACAAGAGATTAGTGATACCGTTAACAAAGGCGAGAGTTCTAAAGAAGTTCTAGAGCAAAATAAAATCCCCAAGCAAAACCAGCGCAAAGAGCAAAAAAAAAAAACACAAAACAGTACAAAATTAATTGTTAATCATTTATTTGTTGAAACCAAATGAAGTCAAAGAAAAAAAAATATGTTAACCAAAATTA----------------------------------------ACCAACTTGTCAAATGCGGCACTGCTGCGTCCTCTCGCCGCTAGATGGCGCATTAGTGCTGCACAGCTAGAGGGCTAGCGGATCGCAACAGTGCTGCCCAGCGCCCTGGCGCAAAGTACTCGGCAAAGTAAACCTAAAAAAAAAAACAAAAAGAACAAAATGAAAAGCTAAATATGAATGTAAATGTTACAACAGCTGCGAGAAAATTTGTACGAAGCATT-----------------------------TGTTAAAA------------AAAATAGCTGCAAATTGCATAGCTTGTCGAACTAAAACCAATGGGGACGCAACAATTGGTATATTCACAAGGAATAGAGAGAGATTGGAACTACAAGGTC--GTGAGAATATAGGCGAGATATGGCATGGGTCAAATCAATTTGGATTGTGCAATTGGTATAAATTTTCTCCACTGTTGTG-------CAAAACAAATTATAAAATGTAAA----------------------------------------------------------CGAATGCATTTTCTTAAAAAAAAAAAAAACAAAAACAAAAACAAA
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CAATTAGACAACCAAACGTCGGGACAATGATCCTGGCTGAGGGCAGGCGTCATTTTCGTCTTGCTCCTGCTATTGGTGGCCATTGAGTTGACTCAAGGAATGGGACTATTTACGAGCGTATTTCTCTACTCCTGAGCAACTGTTCA---AGTTTAAGTTGTCCTGTTGCGTCAGCTATATTCACTGATTTAAGTTT-TTCTTACAAATATATTTTTGGTCCTTAACTGGGATGACGTGTCGT---CGCAGTAAGCGACGCGAATTTTAAAGTACTTTTTATCAAACAACAAATGCTTATCTACCTAGCTATTTTGGG-GAGGAAC--------AAAAGAAAAGA-----------------AAACACAATTCATTTACAGATTATTAGCTATTTTAAGTTCGTTATTTTTGTTCAATTGCTGGACTTTTATTACAAATTCAATAATACAAAAAAAAAAAAAAAAACAAACAAAAACTAAAAACAAATATACATATGCATATGCATATGTAATATAAAA--AATAC------AAATACAAATA-ATAATTCAATTAAATAGTTCAACAATTATATATTTCATAGTTTTAACAATTACAACAAATTACCGTA------CTAATTCTATGCGCAATAAATACAATGTCGGCTATTTTCTGCAGAGCCGCACAAAGTGAAGC-GAACTATG
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TGTAATATTATATTTTTACGGGCAGCAGCTGCGGCAACAGAATACAACGCAAAGTGCATAATTACACAATCTATATTATAAATAAAAACATAAATAATACAT--AACAGCAT-ATGAGTATAAAAAGCA---AATATGATGTACGACAGCAAG----GTTATAAGTTTAAGTAAAACAATTTCA--ATAACAGCATAG-ATATAATGA---GATAGGATGCTAAATTCTGTTT---ATCAAT----------------------------------------------------------------------CCATTAAATACATTTACATATTGTGCGCGCCC------------------------------------------TCCTAGTAATATTTTGCCT------TTAGTAAAATTATTGCTCTCAACAGATGC-AGCCGTTGCAG-AAAATAATAATAACCAGAATCACCAACAACAAA------TCGAAAACAAAAAAAATTCTTGTGATTGTAAATTTAATAAAACAAAAATATACATTTTTATTGTAACTAATTTTATATACATATATATATATATATTACTCTGCA-CATGCAATTGGCGATTGACAATTTATTGGCTTAGCTC------AGTTTCCAACTCAATACTAATCAATTTGAGCATAACTTTGATTAATTCACTTTGTTAGT------------------TGTAGAGTATT--ATAAATAATTGCTCC---ACTTTGGTAATAGATGCACAACGATTGTGTATGCTCTATACTATGTAATTTTCACGTTTTTTTTTTATTTACCATTTTCATACT-TTTGGTTTAATTTGTTTAATAAACATTGAAGAATCAACAAC
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TTTGGTC
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-----------------------------------------------------AGCTGATACAAAGAGGGCGGT-------
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AAAT-------GGGAGCCACAATTATGTA
AAATTCTCTAAAGAGGCCATAATTATATA
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ATACGTTCTATAATAAAAGTAAAACTAAGCTTAAA
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AAAACTATGAAGGTTCGTGGCTGGACTGGGCTGAGCATGAAGGCTTGCCCAAGTAAATA-----------CTCAAAACTAGGTTATT-------TTAACTATTTTTATTG-------AATTAAATTCAATTCAAACA-----------TACTTAAAGGAATATAAATAATTCTTTGGTTGTGAGATCGAACATCTTA
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AGTTCATATGTCGGATGTATATTAAGTATTAGATGTAACTTTAAAGTAAATCTCGGGATTTCCAATTAATAAAGCCAGTAAATGTGTAGACGTA
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CTAATTTACCAAAAATGCAAAAATATAATAAGCTATTTCATGACTTGTAGT-AATAATTAATAACTGTCAGTTTAATTAAACAA------------------AGGGCTAGCTAGCGACTATATGTACA----------CGCG
--------CCAAA---GTAAACATGTTCTCATTAAATACAATAGGTATATTTAATAATTAATAACTGTTAATCTAAATAAACAATTGTGCAGCATTGCAAAAAACGCTAGCTTAAG-CTATATATACATAGATAGACACATG
>CG6129 19953426 19953917|20252 chr3R 19953315 19955915 scaffold_21 1128697 1131307 - 84745|121 674
AGTGATGTGAAGTTAAGATTTGGTTAAATTTGATCCCGCCAAGAAGACGTAACGCTCACTGCCATT---------------TGCATTTATTT----AGAAAAAGGCTTC------CTGGAGTCCTCCAGACGCATCTGAGTTAATCATCACGTGCATTTCAACTCGTTTGCCTT--AGTACAATTCTAGCTGTTCATTGTCTGCCCTGTTAGACAATCGAATATAGTGCGTTCCATCCAGTCGCAGCGA--TGATGCCATC---------CTTACATCTCC------ACATAAATAT-----------CTATGCATTAATGGGTCACGAGTTCCGATTCTCCCTGA-ACGTGGGAGAACACCGAACTATATATCACACGACAATTAACATCATTTGCATTTACACATTGGCCAGAACACCGAACTAGTCAGCACGAAACAAAGCAACTATATTTAATACTTAGCATATTTAATCCTATATACAGTGCGGTTTGTCGA------CTGCATTTTTATAAAATATATACAAGCGAAACACACTCCTAATGAACACAA
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AGTCAGCAGTAGTAGGAACTTGATGCGAACAGAACAGAAAGTACACAAGGCTGTCAATTATATAAACAGAAAGATATGGTCGTTGGAAAGGACAAGCATCAACTATAAATTAAATATGCATCAAAAATAGCTGCAAATATCTCTTCTTCTTTTTTTGTCTCCACTACCAAAAATAATTAATGTCGGAATATGAAACGAATTGTTCAGGGTTTTTCGCATTCAGTTTAAAAAACTGCAACTAAAGTTTAATAGAACGCAGAGTCCGCGCAATAACTATATA---TATAACGATTATAAACGTTTGAAATTTTAACTTGTT-GGCACATTGCAATGTGTTTTGTCGTATAAAATTGTACAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAATAAAACGAAAATAGGTTTTGATATGATGAAACATTTAAATAAAAATACTTCAAGTGCATATTGATTTAACAATAAACATGTTAAAAACTAGTTTTTGTTTTTGACTAATTTAATTTGTTTAATGAATTT
>sec10 19963097 19963198|20253 chr3R 19956052 19963929 scaffold_21 1131879 1140075 - 268342|7734 7849
GGAGTTCGACGTCCAGAA---------TGATTCACATTCCAAAATTTTCCAC-----CTTCGCTGTCTACGGATTAAATTGATTTATTAAAGGGGACATTATCTAATGATGTTTAA
CACGATTGGCAGACGCGAATCCGTTGCTGAGTCACATTCCCAGATGTTTCCCAATCAATTTACTTTTTGTGTATTTATTTA---TATAAACGTAAACATGATCGAGTAACA---AA
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ATGTGTAATCACGAAAATAAAGTAATTGGTGCATGCAAAT-----CAACA
ACATATGTACACACATTCACACAAACAGACACACAAATATATATACAGTG
>kal-1 19973095 19973213|20264 chr3R 19972908 19974645 scaffold_21 1150265 1152053 - 69601|187 333
CCTT-CTCTGTA----TGGGCTCAACGCA------------CTGCTGACCATGAGATTACA--TTAGATTGTAAATAATT--GTATGTA-AAACTTAACTTTT--ACTTATCGTTAGGCCTAAGAACAA----ACAACAAGAAACTA
CCCGGCTCCGTAGTGGTGGATGCGTCGAGTAGGCAGTCAGCCAGTGGACCATGAGATTAAACTTTAGCTTGTAAATAATTTTGTATGTACGGACTTAACTTTTTTACTTACTGTTAACCCTAAGTATACGGATATAACAATGTATTG
>CG6178 19980510 19980618|20266 chr3R 19976149 19987246 scaffold_21 1152471 1163506 - 387930|4509 4687
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ACCATGTCCATCAGCCATATATATGCTATAAAGCCCAGTGAACCGTTAAAACGCGACTAAGAGAATAATATTGTACAAAGAAAAACTTTTCCATGCGTACGCTTTATTATTACTAAACTTTGTTCTTATCATTTTATTTCGTTTTATAAACTACCAACTGGTTGGATTGTGTTT-----
>CG6182 19988549 19988939|20267 chr3R 19987303 19992813 scaffold_21 1163754 1169290 - 151415|1301 1729
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GTAGCCACTAAAAAATGTATGTACTATAAGTTTAAATATATTGTAGAGCCAAGTATAAACGCATAGGTACTAAATATATTTAAAGACCACGTCCTTCTTGTCGGCCACCGTCTGAAACTCGAGAGTGACGGGGCATTGCATCCAATAGGAGAGCAGCTCTTCCGTGTAGCCAATAAGGAAGTACATTTTGCGGGGGCTAATCGCCTGTCGTATGATGGCAGCAATGCGTATTGTATTGTGTTGTCGCTTTATAATAATTTCGGAACAGACGAGCGCATGCCAGGTGCCAGTTACAAACTTGCGAATGAAGACATCCTCGATGGCTGTCTGAGACGGACGCAAGGCATCCTTAAGAGTGGCTGA-----AAAATGTTTATGAAA-------TTCTATAAAATTCAATAAAAGCAAATGTAGCGCACATAC
>Apc2 19993360 19994041|20268 chr3R 19992982 19993870 scaffold_21 1169328 1170328 - 26151|430 1061
AAGCGGATGGTTGGTTAATTGAGAAGCGCATGCATTTGTTTAGTGGCTTTT------AATCTTGTCTAC-----------------GCAATAATATTCTCACGGTCTCAATTTTCCTATAGTTCAGATTA-AAAATTTGCACTTAAATTTAAC----------------TCTCCAACACGTGTAATATTATGTTTACCCTCTCACTA------AACAATTAAGGAAACT-------AAAAAGGGTGATAA------------GAAATGGGATACAGTCGC----GGTATA---AATATAAATAAAAGTTGCGATCAACTGAGG--TCCGGGTAACTCCT------AACATGATGCT-------ACTGTGATGAACT--------------------------AGCTAGAGAGCTC--------AGTAGAAACGTTTTCGCGCGTTGCGATCCTTGAAGTAGGAGATGGCGAAGATGGCCACTGCAGCCGCCACGACAACCACGAAGAGAAGGATGAAGAAGATCTTGGCGTTGGACATTCCCGGCTTGGGATCTTCTTTGTGCTCGCGCGGGGGCTCGAATGTCTTGGCATTCGGTATGATATTGGAGCGCCGGATAATCTCATCGTGCTGC
CACTGGGT--CTAACCAATTAA--AGTGTTTGCAGTTGTTTGGTCGTTTCTTTTTTAAATCTTTTCTCTAATGTAATGTACACACTGCAATAATATTCTTACGGTCTCAATTTGTCTATAGTTCAGGATACAAAATTTTCACTTAAATTTAACAATTGCCCATTCGTCTTCCCCGTTGCGTGCGTCGTTGTTTTGCCTGATCCACAATTTTCGACAAAATAAGAACATTCTAACAAAAACCGCGTGGTAGTCTAGATAACTTAAGAACAAGTATCGTCGTAATGGGTACATTCAATATAAATTAACTTTAAGAGGACTTTAAACTTCTTGTCAGCTGCTGCTTGTAACATGATGTTTTGGTAGACTATGCCTAGGTTTGGTTGCTTTTATTGTTGCTGTTGCAGTTGGAGCTCTCGCTTTTTCAGTAGAAGCGTTTTCGCGCATTGCGATCCTTGAAATACGATATGGCGAAAATTGCCACGCCCGCCGTCACCAGCACCACAAATAGCAGTATGAAAAAGATCTTGGCATTCGACATTCCTGGCTTGGGATCATCTTTGTGCTCTCGCGGCGCTTCAAATGTTTTGGCATTTGGAATAATGTTGCTACGCTGCAAGATCTCGTCATGCTGC
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ATTCAGACAATAGTAGAACCTAGGCCATTGTTACCCACACTCACACACACTCACACACTCACACACACACACACACACACGCACACAATTAAAGCTTTATTAGTGCAAT-TGAAGTAGTGTTTAAATATGAAGTCTTTTTTTAGTTTTGTTGAATAATTGTCTTTTTTTAACGTACCCTCCACCCCACGTCCAATTCACAGGCACAATCTTTGGTTAACTGCACATA-CGCACACACACACA-------------CACACACAAGCATACACAGCCATATATACACAC---------------------ACACACACGCACACGCACACAGCTCGCACAATGCCAAACAGCGCCGGAAACGGAAATACG--CGTCACACTTAATTGCAGCCAACTTCAATTTAAG--------CACCTCAGCCCCAGCCCATCCGCTCCAAAGCCCTGCACACACAGACACACACTCCCACACACACACACACTAACATAACAGCAA-ATAACATGTAATAATAA-----AAAAAGTTTATTAGTTATTATTTAGTTTAAT-TGTTGTTATCTAATTGCAAACACATAAATTTAGTTACTTTTGCTTTTTATTCCCCTTCTTTTTTTTATTGTTTTTATTTTGCCAATTATTTTATG--TATATTTTTTATTTTCAATTGAAGAACTAGCTTAATTATAAATAAAA---AAATTTTAAAT
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CAACTTGTTTTGAG
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TAAAGAAGTTGGCATTTAATGT-----------------------------------TATATAAAATACACGAATTTGCCTTTGAGTAGTTTGACACA
TAAC-ACGCTAGCATTTTATTTGTAAAACTATAGAGAACCCATTGTGTTAGGCCATTTCTTTACAATACACAAGTATGCCTTATATGAGTTTTA----
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TATATATATATATAGATTCACGTTCAGTATCAGTATCAATGTACCCCAGAC-----TTGTTTGTAAA------TTGTCAAGTTTCTCTCTTTTTTAGCAACATTTTATAATCATTTAGGCCCACAATCGATACATATATGTATTTAATATAAAGGATTTTATTTTA-GTACATTAAAATACAA----------CTGTATTGAATGTTTCTAATCAAAATTTTAAGATTCTAAATGGATGACGCG---TACTCTGCGGGAAATTTGAATACATGCTTTCCGGTTGATTGCACCGATGGCAGCAGGCCGGCATTTGGTATAATGTTCCATGACAAAGATAGCGTTATGTTTTTGTTATCCTTCAGGCCGTTGCCATCATCCCAGAAGTAGTATTTG
>Acp95EF 20055368 20055378|20325 chr3R 20054939 20055745 scaffold_13 2970983 2971782 - 26387|456 466
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CACAACCTGAT
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TGCGCGAGCGAA
>mask 20073737 20075970|20335 chr3R 20073840 20074838 scaffold_13 2992301 2993401 - 2044|0 1200
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CAACAACAAAGCTCTCACACACACACGCACACACACACATACACA------TACATACACATACAAACACCCTCC-----CCCACCCACATCACATGCA--CACAAATCAATCGACTGACTCTCGAATGCAGTGAAA--CAAATAAC--------------------------CTTGGCCTTGTTCATTATTAGTTCACAATTTAAGTTTTCTTTACCTTGGGCAACTATTTAAATTCACAGGTAATTTGAAATTTGGCAAAAAATCTTCCGATTAGAACAGCAACAAGCTCCCAACCCCTCCTTCCCTCACGCACACATACACACACACACTAA-GAACTGCACAAC--------ACATTCGTATACTTGAATAAATACATACACACACACACACACTCGAAGACAGAAATCA------TGGAAAAATTATATATTATTTATTTT-AAATGTAATTTGAATAATTTGATATTCCTTGAAGTAAACAAATGTATAAGCTATTATTTCGTGTGATCAA--------ACGATGAATCGAAAGGAGAGAATCTAATGAAGGAAAGCACACACACGTTTA--------------------------ATTTTAAGCTAGAACTCAGTCCCTTGAATG---AAAATTATAATTAATATGAAATTAGCGAAAGCTAAAATCATTTACCAAACTTTAAACACAAACATTAAAACACA--TAACACACATATGTATATATATATATATTCATATGTATATATATATATATATATATATATATATATATGCATATTAAAAATTAATTAATAAAAATGCCACAACATGAATATTGAAACTGTAAAA-CTAGGCGCGCACTTTTTCTTCTCGAAATGTTAAAATGTCGACAGGTGGGCCTTGATGTTAAACCCTAGCTAGGATAAAAACTAAAGCTGAATAAAAGAAAGGAAATATA--GGAAGCAATAATAAATGCTTGCAGCAACAATAACAGCAGTAACAACAAACGCATGAAATTTACTTAAATATACTACTAAGCTACAACAAAAGCTTGACATTAAATTCACTAACTGTTAAAACATTATGCGAAAATCTACGAAAAGAAATTGAAGCGAATACATCAAAAAATCATTTACGTATGAAGCTAAGAAACTACACACACACACATACACACAC-ACACGCACACTCAAATCTAATACACAAAAAATTAA
>mask 20073737 20075970|20336 chr3R 20074919 20078275 scaffold_13 2993497 2996724 - 125402|0 1169
AAAAATGTAGTTAGTAGAAATTGAAATTGCTTAA--TTAACT--AAGTAAAACATCAATAACATAATGGTCGAGTAACGTTTTAATATTCCATTTACGAGAACTAAACGATATACGATACGATGATGATGATTAAGATGACGAGGCGACGAAGCGGCGCGCTTGCTTGCCATCTTT--GATGCTTTTCCGACACTGCTCATAGACGTACATAAAATATATACCTATCTAAAATATATACTAGCGAATAGCATATATGAGATACACGAACTTTTATTTC-----------GATCACCCGATGAACGCGAGCGGAACGTGAAACTAACGAAGATATGTAAAAACACTTGATAAACCTTAACAAAAACCCTTCTTGCCTGATCCTCCAGTCGGCACGAGTGAAATCCGAAGCCCGGGACACCAGTCAAAGGTGTGGGGGGGTCGTCATGCAATTGCTTTGTAAAATTCTA-GAGGAGAACGATAATGTTGCTTGAGATGATGATATATA-------------------ATGCTTAGAGAACC--------CACGCATA-----------ATCT------AATGACACACA-----------GAAACACAACAAATTCGATGGTTAT----TGCAAGATATACTTTATCGATGATAA--TGATGAATATGAAAATACGAAATAAATGATAATATAAGTGAAGCATGAAACTACTTTTTTTCTATTT-----------TTCAA----TGTTTTAGCTGCAAGCAAATAATGTAATGAGA---ATGTGGAGATGTTTGTTTAAGTTATTTGATACAACAAATTACGAGAAATATATATAC-CACATACACAAACACCTAAACCCAAACACATGCCCGATATGCCCGACAGGAAGTTTATTCGATTTTGTTGATTAACAAAAAGATACAACCGAATATCTGA----GGACATACAGCCGTTATGAGATGATTGATTATGAGATCCTTGATTGAAACGCAAACAAAACGATGGGAATAAAAATGAAAAATACAAAAGCATACTGAATAAATATAGAATTTTTTTCAAGCGAAAGAAATTAAATTCACATAGATTTATTAATTTAAAAATTAATATAAATATACTTCAAATATGAA-----AAGTAT-------GAAAACAAAAAAAAA----AAATGC
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>CG13610 20100856 20101013|20358 chr3R 20098428 20101112 scaffold_22 281513 284224 + 73847|2524 2753
TAGTTAGACGCTGGTG-------------------------TTGAACTTTAAAGTTTCAAGAAATTACAGACAGGGCATCTAGAATTCGGTCACGCCAAAGGC------AGGGCATTTACCTTTAAA--------------------------ACATA---------------GACCAAGTATTATATACAAATTTTGAAATCTCACACGTAACCAAAAAAAAAAAAAGA
TAGGAAAAGGCAAACGAACGGAAATAAAAGAAAAACAAACAATAAACTCTGCTTTGCCAGGTAACAACTAATTAAGTTTGGTAATTATACTAAACCCAAGCGCTGCCTGGGGTCATTCATCTTCTAGCTGACGAATCTTGGCACATTTTTCCTACACATTTAGTTCCATAAATGACAAAGTATTATAT-----TTCAAAAATCTCATATGCATGCCAAAAAAAAAAAAAA
>Orct 20104314 20104515|20360 chr3R 20102667 20104516 scaffold_22 286061 287916 + 91232|1675 1891
TTGGAGCCGGAATTGCGAGACGACGAGCAGTTAATCACTCAATCTACACTGATGGCCTCAATTGGTCATTTCAACGAATTTAAGCATTCAGCGCACTTCCATTT------------CTCCAGCGATGTATATTGT-ACAATTCATTCCATTTTCTCAGCTCTA--TTTGTTTAATTTTAAAAGCGATTTAATAAAAGTCACGCATATTTAAATCGTA
---------------CGAGACGCGCCGCTGATGGCGATCGTGTCT-CAAGACAGATCACAACTGGCCATTTCAGCGAATTTACGCAATTTGCATTTATTTATTCGACGAAAAAGTATTCCAACTGTACACAATATCGCACCACGTCGCATTTGTGGAACCACAATTTCATTTACATTTATTGTCCATTAAAAACAAAGCACA-ACATTCACTTCGTC
>CG13611 20107244 20107299|20362 chr3R 20106318 20107899 scaffold_22 298593 300351 + 19929|938 1051
-----------------------------------------GGGATTAC-------------CACACCTGTGTACATA-TGTATCTATAGA---AATTAAATGGTTGTTTTTGA
CTATGTTCATTTTGCTGCTCAATTGCTCGCCCAATTACTTTGACATTACTAATATCAGGGGGCACTTCCATATACCTAGTCAAATCATAGACCCACTTGGGCACTCGCTATAGC
>CG6356 20113940 20114343|20370 chr3R 20113190 20115786 scaffold_22 306964 309406 + 71076|767 1174
TGACAGCAAT-AGGTTAAGTTCCATTTCCACGACTAAACTGATTAACTACTTTTTAAGGTATACGAACATAGGTATTACGACCCAAAAACTTCTGTACCTCCAACTGACTTTCGCTATTTAAATTGTTTTACAATCCGAAACACTTTCAAAAGAAAAACAATTATTGGTTGAAATGAAAGTGTTCTAAAGAAAAGACAAAACTGATAAAAAAAAGTCGTGAAAATGGTTAGTTAGTCTAATGTAAATCTAGCTATATATACCTACAGTAATTAGGCGTAAGTTTGTTAGTTTCTGCTATTCC-TGCATTGTTTAAG--TAAATATTCATAATTGTTTTTCTGTTTGATATCGCATAATAAATATACTATTTATATGTATGTGATCGCCAGAGATCTAGGACTGCATCA
GAAAAGCAGTAAGATTGAG--------CCACAACCAAGCCG-----------TGCAGGCTGGTCGA---------------------------------------TGGGTTCCACTAGTTAAGTTAGTATACGATCGATTATCCATGCTACCTATGTATACGTATT--------CTACAATGTTACGATTGTAATACTA-------------------------------------CCAGTACTACTCTAG--------GCCTAAGTTTTCTATGCGTAATTGTTGTTATTTTTACTATTCCTTGCATTGTCGTAGCATATATATTCGTAAATG-TTTTCTGTTTGATATAGTATAATTAATA----AATTATATATATATAGCCGTTAG-----TAGTTCTGCACAA
>CG6364 20117347 20117973|20372 chr3R 20116820 20117655 scaffold_3 897095 897894 + 16279|560 893
ACGCAAAAATAAACAACTAGCTTCTGAGGCGGCCAATTCCTCGTCCTAGCGCCGCGTCTTGAGCTTGTACT---AATTGCCAAAAAA-------AAAAAACTAAAGTCCAAACGCTTAGGAATGATATAGAAACCCGTGGCGGCGCAGCACACTAAGGCAAATGTCCATTAAC---------GAGCGCGGGCATCGCTTCTCATTTGGTCTTCTCATCGTAACCGATTAACGTAGTCCTAAGATTGAAAA-GTATCTTTAGTATCTACTCTTGCATA-TGTTCAACAATACATGGTAGTGTGTA---TGTAAGCTCG-TTTCTGTTCATCAAGA
----------------------------------AACTCC----CCCAACTTTTTTTGTTAAGCTCTTAAGCAAAATTAAAAAAAAAAAGAAGGAAAAAAGCAAAAGCAAAACATTTTCTGCTCCTAACTAAAC---TGACGACGCGCCGCCCAGTGTTAAGCTTTCACTAACTGCAAATAATAGAGCGGGGGTC-CTTCCCA------------ATCCTAACCAATTAACTTAGCCTTAAGATGGAAAATTTATCTATATTA--------TGCATACCATTGTATAATGTATGCAAATGTGTATCGTGTAAGCTTGTTTTTTGTTTATTGAAA
>crb 20139602 20140165|20393 chr3R 20138688 20140354 scaffold_3 923726 925401 + 52435|927 1604
TTTTGAGTTTTGAGCATGAACGACGATTAGCAAAGCAAACAAAAGATATTTT--TAAATCCGCCCATATACACCTAGCTGTAGGAGTAACTCAATGTT-TTGTACTAAGTTGGCCCCTAGTTATGGTTTACATCTTAAGGTGCT--CAAAGCAAT-----------------AGCAGCAGCAGCAGCAGCCAGGCTTCCACCTCGACTCGTCCCTTATCCCCTGCCTACGCTTTAGTTAGTTAATAATGCCGTTGTCTATTTATT----CTAGTAGTTTAGATGACATACGTACCGCCCTATAGTCGTTATGTAGTTATGTTCCGATAGTTTAGATTCAGTATTCGATTT------------CTCGTATATGTAATCCTAAAGCTGCGAACAAAGTTGAGCTCC-------------------------GACGTCGATTTC---------------------CCCTTTGCATTCCACAAGGAAGCCCATCAAATG---TATTGTATGAGTAT-TTTTGTAAATAAGATTGTTTGCCGACTCTTAAACTAAATTAGCTGAGCTAAAATCGAAAT------------------------TAAAAACAGAAAATCCTATATGCCT--ATATATACGCGAGTATATATATCAGTAAATGTGGCCTTATAACAAAAAAAAATA
TT----------AGCACCAGTACCAAGCCTGAATATAAACAAAAGATATTTTACAAAATCCGCCCATATAAGTACAAT-------GCGATCCTGTCTTGTTGTACTAAGTTTATCTATAGTTAAGTTCGTCTTTAAAAGGTGCTCGCAAAGCAATGAATCAGGCTTCCACAGAGCAAC-TCTGCAGCAATCCTCCCCCCACAGAGACACACTTAGACTTTAATACCTACGCTTTAGTTAGTAAATAACTCAGTTTTCTATTTATTATAGCGAGTAGTTTGTATGGCA-----ATCACTTTATAGTCGTTATATAGTTACT--------GTTTAGATTCAGTATTCGATGTAAACAGAATGAACGAGTATAT---ATCTAAAAGCTGCGAACAAAGTTATGCTGCACACAGAAACAGAAACACGAAATTGAAAATAGAGTTCAAAAACAAAATAACAACAGAATTCGAAGCATTGCATGCGCAAGCCC-TTAAATACGCTAATGTACAAGAATATTTTGTAAATAGGTGTGTATGCCCGTTTTTAAACTAAATTAGCTGAGCTAAA--TAAAATCCTACATACCCTTGCATGCATACATATATATGTTTATTTATACATGCCTAAATATATATATATATATATATATCATTTATTGCGGCCTTATA-------------
>CG31132 20153912 20154348|20402 chr3R 20151118 20154725 scaffold_3 939231 942986 + 91574|2970 3477
------------------------CCGCAGACTGTTTTATGTATAAATTAAATCTAATTGCTAAATCAACAAAC--CTTTGTAACATTTGCTAGAGTCTTATTTCTTATTATTGATTAATATGTAAGAGTAAATCACGTCACTTCTCATTGTAAT--GTCAG-TGTCACCGCTACGGTCATTGTCCCACACCCA--ACCCACCCCGATCCGTCAAATCCGTAACCCCAACCGTGAAGT-GTTAGCCCATATCCATCATACACCG------TGGCAGAATATGTTCAATTAATGTTCAAGTCTTAAGTTGAATATT------GGCAT------CAGTC-------CTACA---TTCTATGTGTAGG-------GGGCATGGCCAAAGCAACGTTTTATATGTATTTCTATAATATATAGGTACTATCATACATATATATTTAAAGGTAGCACTCG-GAATCACAC--TTCATTTAAAATAGTTT-TAGAATAAAGTATCATGAAAAACA
AATTGGGCGCCCAGCTGCGCTGCGCTCAAGACTGTTTTATGTATAAATTAATTATAGTCGTATGAGCAAATAACATTTTTCTATCATTTGCT-----------TCTTATTATTGATTAATGTGTAAGAGTAATTCA------TTGTCATTGTAATACGTCAGGTGTCCTGTGTACCGCCAT----CCACACCCACTACTAAGCCCTTTTCAGGATAGGCTTAAGCA-AATTGTGTTCTCATTTAATCATATTCACTATATATAACACAGATCCCAAAAAATATTCATGCTTTGTTCAAGAATTTAAGTTCTTATTTTATGTGGCACGCTTACCAGTCTTTGCCGCTACACATTTCCATGTAGCTGCGCCTCTGGGTGCTGCC---GCAAAAAACTGTATGTATTTCTATA---TATATATAATAT-ACATATATTTAAATAAAAGTAGCATTCAAGGATCACACACTTCATTTAAAATAGATTATAAAATAAAGTATCAACAAAAACA
>Dis3 20162392 20162971|20404 chr3R 20154813 20162410 scaffold_3 943187 950928 + 293108|7923 7941
TTCTTTGGATCTTTGCTTA
ACGAACGAATATTTTGTTA
>Dis3 20162392 20162971|20405 chr3R 20162437 20162782 scaffold_3 951400 951757 + 2889|0 376
TGTAACTACAATCATTTCGTATAAATAAAATGT----AAGGTTTTTAAATTCCGCT-----------CCGTTTCGTAAACCTTTTCCACCGTTCCGGCTCTGCCGATCTCGGAGAGTTTCGAAAGCATACCTTTGATCGGGTGTTTTGTTTAAGGTTTTGGTTTCCAACTTGCGTTCTACATTCTCCAGACCCATTGCAAAGTTTCGACTACAGTGCGACGGTTGTG-CTGAGCTCG---TTTGAT---CCAAAAAATTCAAAAAGAATATATATA-----ATAAATACATATATAC---ATTAACTTGAC-TTGAATATATACAAGAACGGAAGTTATACAAAGTTACAATGGAACCCGGTCCTAGTGCAGTGAAC
TGTTTCTCTATTCGCTCATTATAAAAACATTGTTGTCATGGCTTTTTAATTGTGGTGAGAGTATTACTTAAGTCGAAAACACTTTAAAATGCTCATGTAGTG--------AGAGTGTTTCG---TTAAACCTTTGATCCAATGTTTT---TGAGTTCTGGATTTC--ACTTACTGTGCGAGCAATTAAATATCATTGCAACGTTTCGACTTTAAGGCGACGGTCGTGTCTAAGCTGGAGCTGTAATTTCCTATATAGCCTATAGAGGATCTACATATACATGTACATTAATATATACCCAATAAACTCATTGTTCAATTGACGCATTTGTGAAAAACGTACGAA---CCAATGGAGCTGGTTACCGATGCAGTGAAT
>Dis3 20162392 20162971|20406 chr3R 20162929 20165874 scaffold_3 951758 954665 + 105291|0 42
ATAAACAACTTTTAGAACATCAAATAAAGTGCTTGGAAAACTA
AAAACCAACATTGAAGGCAGTAA-------GTTTCAAGAACTA
>CG6432 20165790 20165919|20406 chr3R 20162929 20165874 scaffold_3 951758 954665 + 105291|2969 3108
TGGGTTGCAAGGACCCTCAACC-TTAACCTTAGCTTGTACGATACGAT----------------TCCCAAGAAGTAAATAAAATGT---------------------------AAGCCAGTTT-----------GGCTGG
TCTGGCCACAGTCGACTCATCCGCTGGTGTT--TTTGTGCAATATATTGTAGTTAGTTTAAATGTTCTACGAATCAAATAAAGTATCGTTTTTAAAATTATTTTAAAACTGCAAAAATAGTTTCAAACATGGGGAGCTGG
>CG6432 20165790 20165919|20407 chr3R 20165910 20166097 scaffold_3 954709 954951 + 3349|0 9
TGGCGAAAAT
TGTCAAGAAT
>Dms 20168917 20169407|20411 chr3R 20168471 20170317 scaffold_3 958360 960412 + 14883|456 1001
GGACATTTTTTTGCAAGGACATCCCGAACACCACTTGGTCCCGACATGAGACAACGACACTGGACCCTGACCACAAGCGGCGGAATCGTTTCTGTTCACCCAAAAAGCACAACACTATTTTGACGTCTTCAGCATAATTATGTAA------------ACGTAATCGATGGAAACTCAGAACTATACTCAA-TTGGAAGCTCTCTAGTTCATTAAATATCCAA--TGTCCAATGTTT--CTATGCAACAAAAAA--AAAATCGAATACATATTT------GTAAATACTCAAAGACCCTCGAA----ATGTTCTGAAAGTTAAACCCTTGGTTTTGATTT--AATTCGTACTCTTTATTTGCTGAGTGTTATAAAGAA-----CTAATAATACGTA--TTTCAACGATGTTTAAATATCTCACACATATTTCCCTAGCATGAAGCACTATTATTAAATAACCAACAAAT-----------------GTTTTCAAATCCAAACACTATTTTCCGTTGTATACTTTAATAAAGACAAACTTTTCCTCTC
AGACCTTGCCGTATA---ACCTTCTTAA-ATCATTCTCCAACGATGCTACGATACGACCCTGGATAACGATCGATAG----------GTTTTTTTTTTAGCTGAAAACTCAACACAA--ATGGCGTCTTCTCCCTATATGCATAATGTATTCTCGGCACATTGGCGTTAAACATTTAAA---ATAATCAACTTGGAAGCTCTCTAGTTCATTAATAAATCAAACAATTTAATGTATACTTACTCGTTAATATATTATATTTGTATATACATATATACACGTACATACTCAAGGACCCCCGAAGAACGTATTGTACATGTTGATCTCTTTATTTATATTTTGATTTAGAACACTTTA-TTATTCAATAATAAAAAAAAAAATGTTTATACCACATAATATTCAATAATAATTAACAGT-----ACATATTTCCCTTACACAAAGCACTTGCA-AAAATAACCTATATATAATTAAATTGTTATGACGTTTGAAAATGTAAATCTTAACTGCA--TTAATTTTTAAATAAAGTC-TCTTTTTCTTCTC
>CG6454 20181501 20181960|20418 chr3R 20180478 20183640 scaffold_3 5493159 5496458 - 111930|1066 1655
TATAAAAACTTGCGGGGCATATAGCGCATGTTTTACGCGAATCGTCCCAAAAGCGTATACT-------CTCTATTTTCTTCCGCTTAGCTAGAACTATCAGCTCT----------------------------------------------GCCCAGCAACTG------------GAGTTAAAC-TGAAGT-------TAAACTAATTCACGTTTACT-TAACAATTTTACAGCATCTGTAGATGGATTCTTTATGCAATATTTGAACTGTGAGGAATCGTTCTAATCCTAACTTAGTAGTGCTAATTTTTTCGGTCTTGTTACTTGTTTGCTGGATGTTTTTAGCGTTAAATCAATTGCAATT-------------TCTGTACATAGTTGA--TGTTTATTGAATATTGAATTTAGAACGAG-----------------------TGCGAGACACAAGT-----ATAATATCGATATATACAATTGTTGCAACCACAAACATGACA-CATATACTCGTACCAC-----TAGATATCCAATTTTGGCGCGTAAAATACAATACA---TACAATATT----ATGGAAATAC
TATACACGTTTGCGGGGCATATAGCGCCTGTTTTACGCGAATCGCCCCAAAAGTCTCTACTACTAAAACTCTCTTTTGTTGTCTCTCTCTATGGATGCTAACTCCATATCAACCCTCTGGCTCAGCGCGATATGACTTGCCCTGTTGACAGGCCCAACATATGAACATGCTTGTTGACTTAAATATGTAATACATATATAGAGTAATCGGTATTTACTATAACGACT-------ATATATAGTTGAAATCAATATGCAATATTGGAACTGTGA-------CTTGACTTTCGACAT-GTAGAATGAATTTTTCTTGTCTTGTTATTTGTTTGCTTACTGTTTAAAGC-TTAGCTCC-TTGCAATTATCATAACCATACTTTGTACATAGTCGAGATGTTTATTGAAT-TTAAATTTTGATAGATAATTTTTTTTCTTTTATTTTTGTTGTGAGCAAATAGCTCTAAGCAATA-CATTATACACAAAAAGTGTAATCA--ATTTTGGCAACACAGAATTGAACCACCAACTTATGTAACATATATCTATATAAATAATACTAAATAATATGCAATATTTGAAATTAGAATCC
>CG33340 20189686 20190012|20423 chr3R 20188850 20189712 scaffold_3 981562 982449 + 17687|878 904
AGCCGTGGCCCTGATTATATAAAGCGC
GACTA-AGTGCTGATTGGGAGAAATGC
>CG33340 20189686 20190012|20424 chr3R 20189794 20190963 scaffold_3 982559 983738 + 20356|0 223
GATGTGTGATC---ACTGAAACGGATTCTTGGCCATATTTGTCACGAGGCTCCAGAGCAGCGGATTGCAGTCACTATAGGTTCGCTCGCAGTCGGCACCTCCACGTCCTGCGTCACGGGCATGTAAATACTTACTGGCCACATTGTCCAGGGTGGGTCTGGAAATTCATTTATAATTACAATTCATAACTCAACCATTC-CAAGTAAAATGT-CACATACACCA
AATGTGTGGGTTATATCAAAAAGTCAGCTTCGTAATATGCGTTAACCAGTGCCAAACTCTTTGATTGCAATCGCTGTAGGTTTTTAAGCAATCAGCTCCACCACGACCCGCATCTCTAGCGTTCAAATACTTTTCGGCCACGTTATCCACGGTGGGTCTGCAAGTAGGATCGACATTATAAGTATTAG---AAGTATTTGCAAATAGCTCATATACTCACATCA
>CG31128 20295718 20296041|20540 chr3R 20295712 20296346 scaffold_3 1117817 1118475 + 2347|6 364
GATGC----GCTGCTTTGCATAT-CACTGGAAATTCAATAAGGTTGCCTG-------------CATGGGGGAATTCCGAGTGGCCGGGCACATACCGAAAAACAAAGTGGCCATTGCACTTAGCCAAGTCGAATACAAATCAAGGCAACAATGGGTCTGCCACTGTCCCCCAGCGACACGGGGCACATGACTCT-GGCCAAAAGGGGAGCCGTGGCATATCATATTGTTTCTGTTGATTTTATTCGGAATATGCGATAGTGGGGA--GAGATATTCATAAGTCGAA--------------AACCAATAGTGGCTTTTCAAAAAAAAAACATTGTTAATTAAAAGCAGACCAAAAAACCA
GATATCTTGGCCATTTTGCATATTCACAGCAAATTCAATAAAGTTCCATGTAAACTGCCAGTGCGAGGGGGAATTTCAAGTA-CTTGGCACAAACCAAAACA-AAAGTGCCCGTTGCATAGAGCCAAGGCGCATACAAATCAAGTAGACGA-GCATCGGCAACAA-----CAACAACAAAGG-----CGATTCTCAACCAGAGTCGCAGTCACATCACAGCAT--CGTGGGAATTGTGCTGGAACGGAGCAAACGGTGACGAGGCATGGGCCAGGCACATGTCAGGCCGACTTCATTCCCAAGGAACAACTGAACTGCAAGCGGCAAACACTTTTTGCTA---GTAAGCAAAAAAA--A
>nAcRalpha-96Ab 20316735 20316875|20564 chr3R 20316537 20317334 scaffold_3 1142324 1143105 + 14981|198 383
ATTCATGAGAACGTAGGCTTAAGAAAATTTTCCTAGTTTAATGCAGTGT----------TTCAGCAAA-------TTGATGCG------AATGAAAATTAAAATACGCTATAATAAAAACGTTGGCCCCAAAAGCAGCCAAGCAAAATGCTGAAATGCA----------------------AAGCG
ATTCA--ATAATGCAATC-CAAAATGGTTAACACTATCTAATGACATGTAATGCCTGCATTAAGCAAGCCCTAGTTTAAAGTATGTTTTAAAGAAATTAATAATAAAAAATAAAAAGAATGTTGGCCC--AAAGCTGCCAGGCAATATGCTAAAATGCATCTGTGGTTTTTGGTTTCGTGTTAGCA
>Pp1alpha-96A 20346217 20347065|20596 chr3R 20345943 20347767 scaffold_3 1177759 1179596 + 39926|282 1212
ACACTGCACACCTCGAACGAAGCACAACAACA-------ACAGCAACTACAAACGGCCACACACACAAAACACAAATAGGGAAAACAGAAAGGAGAATCCGTGTGTCCACATTCAACGGAAAGCGCAGAGAGTTTGTTTTTATCATAAACGTGTAATCGAATCGTGAGCAACGTTATATGGGGAATATGAATCTACACAAATTAGCCTATCTTTCATTTGAAAAGGAAAAAAAAACAA-AAACAAATAAGGAAAACGAAACGAATGAAATGAAATTAAGAAACCAGAAAACACAAATCGAGACACTTTAGTTCAAACTAATGGTAGTGTAAGACACTGCATAAGCAAGAATATTTTATCTCCTAATGTATTAA-----TTTTGTTATAATATTTCCTTGCGCAAAACCCACACACTCACACACACACACACACATACACATGCTCAGATCATCCGTACAGTAGGTACCATAAGTG--CACGCACCGGTTGTATTTTAATTTGCATTTCCAACTCGCACAGCATTTTAATTATGTATGCCGATCCTGGCGGCACCTTTGGCAAAGGTCTTTAACCACACTTCCCTTCTTCCTTGTTTTTTTTTTTTGCGTATCTAAGGGAATATTAGCAAATGGTAACAATGTTAAATTTTATGTTAA--TTAAACTGTACGAGAATGCTTTTAAATGTGAGTTGAGGTTACTACATATT--------ACATATGTATGTACTCGAAGCACGAT--------------------------------------------TTATTTTTGTAA-----TATTTGACATCGA--------TACATGTTTACTTAGTTTTAAAACGAGGAAAGCAATTTTAGTTGCAAGCTACAAAAGCTTGAATTGTTTACACCAAAAATATTAAAATAAACAAATATTGTGAATA
GCGGCACACA---------AAAAACAGCAACAATAATTTACATCAACAAAAAACAGCAAC-----TAAAACGGCCACACAAAAAAC---------------------------CAATTTAATACGCA-AGTGTTTGTTTTTATCGAATATGTGTAATCGAATCGTGAGCAACGTTATAAGGATATAAAAAATGCATATAAATTAGCCTAT-TTTCATTTGAAAAGTACTAAAAACCAACACACCCATACACACACACACAC--------------------------ATACACAAATTGAGACACTTTAGTTCAAACTAATTGTAGTGTTAAACACTGCATAAGCAAGAA-----TATATCTTAATGTATTAATTTTGTTTTGTTATAGTTTTTACTTGCGCGATGCGAACACAAATACTGAAACACACACACAGAAA---------------CTTACATTAGGTATGAAAAGTGCACACACACCAGTTGTATTT---ATTGCATATTTATCTCGCACAGCATTTTTCGGTTCTTTGCATAGCACAACAAC----CAAGCATAGGATTCT--------TTCCTTTATATTGTAATATTTTTTT---------------AATA-TAGCAAATGGTAA-AATGTTATTTTTTATAATTATTTTGAATTTTAATCTACACTTTTGATATGTGTG-TGAGTTGAATACATATGCATTGCAAAAGTATGTACGTATTTTTAGCGCGATATATATATATATATGTACTTAATATATATGCATATATATGTATATAATTTTTTTAAACTATTATTCATCATTAAAATTCTACTACATGTTTACTTAGTTTTAAAGC-----AAGCAAATTTAGCTCGAAAGTACATAAGTTTGAATTGTTTACACCAAAAATATTAAAATAAACAAA-AATATGTATA
>CG13618 20353173 20353261|20599 chr3R 20351984 20353303 scaffold_3 1183825 1185103 + 44700|1226 1316
GTGCTTAAACAGCTTTCAATTACGTACCTA--TTAGGTAATGCTTAATTTATGTTACTACATAGTTAATAAAGGTCTTAAACGATACAAAT
-TTTTGATGTGACTGGCAAGTATGTGTCTAACTTATGTATTTTTTAAATTA-ATTAATAAATTCTAGTAAACGGTTTTATGTTGTGAAAAA
>CG6607 20355375 20355537|20601 chr3R 20353586 20355433 scaffold_3 1185104 1186931 + 61177|1870 1930
GCATGGACAGCGGCGCGCATCCCGCCCAGCTGCTT--TACTGTATATTGTTGTAAAATAAC
ATGT-------------CTGCCTGTCGCACTGCTTTATATTGTATATTATTTAAAAATGAC
>CG6607 20355375 20355537|20602 chr3R 20355490 20356092 scaffold_3 1187154 1187804 + 21880|0 57
TGTATATAACTGAACAT-------TCTATGTGTAT---TAAATAATTCTCTAAAGTTT
TGTACATACCTGAACATATAAATTTATATCTGTATGTTTGAATATTTCGCTAAAGTTT
>CG6631 20361908 20362124|20606 chr3R 20358403 20362520 scaffold_3 1190309 1194531 + 77460|3678 3911
TCGCCGAACTTTTAATTCGTTTGTTTAGGTTTTAGATTATATTATCCATTTTATGACAATTATTTATATTTTAC---------TTACTTTGCAATTTTGTGTCAAAAAATG---ACTATCGAAAAAGATTGTATAAAATTTACTCAATAAGTTAAATGTACAATTTTATTACCAATTTGTGTGAAACTTATTTATATTTTAATAAACCCGACGATTATTTAT-----TAAATTT
T-GCAAGGCTTT---TCCAAATATTCTAG--CTAAATTACCATATACA------------TGTTTGTATTGTACCCCAAATTATTATTTATAGACCCAACGTTAAGAAATTCACGCTATTGTAAAATCGTG---ACAATGCAATTATTAAG--------ACAATT--------------------ATTTATGTATATTTTAATAAAATTTA--ATTAATTTCGCATACAGCTTT
>CG6643 20382048 20382275|20624 chr3R 20380157 20386609 scaffold_3 4715464 4722483 - 142374|2140 2409
GAAAAGCCGAGTCAAATGCCGAATGCAGAGTCTCATTACAGCACAATCAACTCAAGAAAAACTCGACACTTTTTTACCATTTGCACTTAAATCCTTTTTTATTCGTTATGTATACTTTTTTTGG--TCCCTAACCAAAAC--------------------AAAACCAAACTCTCTTAGTCGTGCC------TCTATATTTAAAACTATCAATTTATTATAGTCAATAAATCGAACT--------------GTGTTTTCAACAAACGAACA
AATCAGCTGGGGGAAAT--TGAAATTGAAATCATCAGGAATCACAGTCAGTAGAATCTGAACTGTATATTTGTCATTGTTTTGTATTTAA----TTTGTGTATAAAAGTGAATTGTATTTATGACTCTCTTAAGCAAAACTGGTTGGCCTTTCAACACTTGAACCAAAACTCTCTTAGTCGTGCCTCTGAATCTGTATTTTCTATTGTAGTTTAAGTAAAGCGGACAAATTGTGTTTACACCTGTAATTAATGTCTTTAACAAATAAAT-
>CG13620 20448895 20449621|20683 chr3R 20448431 20449885 scaffold_3 4792939 4794433 - 13932|489 1362
CCCACGGGGCCGGATTATTATTTAGTGTACAACGCTATAGTTATAAGTAATCACAAAAAACCTAGCCAAATAATATCGGCGCCTTCCTAC-ACTATTACCACACTCCGTGGGGAATAGCTTCCATTT----ATCCCATTGGAGAGCCAATCATTAAGTAACTCTTAACTCTTATTCTAAACAATATGAAAAGAAAACAAAAGAACCA--GCAGACTGCATTGAATGCA-------------ATCCCATATTGCACTAAAAACA--------------AAAGAACACCTAGCGACTAAGCCAAGGATACACTCCCTCAGACACAAATCTTA-------AGGCTACAAAATATTA-GACCTAAGCTAGTTAG-------AATCTAGACATTCATGTAATG---AAACCAACTGAAAGAAATACGCAAAGGTTAACTTTAGGCCTTAGACATATATATACATATACATACTTATTG-----CTGATTTCCGTTCCCAGTTAGATATATATATATATTTTTTTGAAGAGCGTTTAATGAAAATAATATGACTAAGGACCTAGATATAAACAATGTACC------AAGCAACACACTAAAACACATTTTGGTGTAGAATTTAAATT----------------------------------------AACTACTGAGACATGTGTGAGCAAGGCGCTCAAATCGATTTTAGTTCCATATTGTTGTACGAGGTTTCATTGAATT---------------------GAAACAAGGCAGTTGA-----------ATAGCCTAAACAA-----------ATATTTTCCTTTTATTTATAAATTATGTAATAAACAAAATATGCTTT-TAGTGCGATCAAACGAT
CGATTATCGCAGCTTTATTATTTGGT------------------------TTATCAGGAACCTGG---------AACGGAACCTTCCTATTACTATTGCTATGTCTAGCG----ATGGCTTCCATTTTGAAATACACACAGAGAGAGAA----------------AACCC-------------------AGCACAACAGCAAAACTGTTGCAGACTGCATTGAATGCACAAAACTAGTTGTAAGCCACCACACACAAAAAATACTTAGTTACACTTAAGACTAGATCTAATATCAAAAAATGGGGGATATTCAT---GGAATGAATGTTATATATGTGTACTACGAAGTACTGCGACAACAAATTGTGAACTTTTTTATTATGGAACCTCATTTCAGGTGCAAACTAGATAAAACTAACATGCG--GCACAGTTTTAAATATTACACTAATTTAAGACAAGTCTTGCTTACAGACAACCTAACTATTTTGGCTGAAGAATTGAATTGAAGAATTGATTCATAACGCATTT--TTTAAATAATGGAACTGATGACATTATGATGATGATTGAACTCTACTTAATTTAGTTTTTAAGACGCCTATTATTATTGTACTTTATTTTCAATTGGTAAATGTTTGGCTCTCTGAGTTTCATTTGAACAAATTATGAAACACAAACGATTAATTAACTCAAATATCATTTA---CAATTTAGTTAAGGCTGAGCTCACTTAATTTGTAACCTTTAGTTATAAAACGAAATAGCGCTAGTGACAACAAGAACTACTACACAAACAACATTGTTTCTAATTTTTTATTTTTAAATATAAATTACGTAATAAACAAGTTATGTTTTAGAGTGCGAT--AACAAA
>atl 20459430 20460436|20687 chr3R 20457274 20460863 scaffold_33 512779 516403 + 128006|2280 3370
GAATACGCCCAAGGAGCGCAGCACAAAACGCAGCAGCCGGTGCCGTCGCAGCCGCCGTCGGCAAGAACCAATAACAACAACAATAATAATAACAACAACAACAATGTGGCATACAAATCAAACAGGAGCAACAACATTAACGAGGCCGACGGTTTCATTCACAACATCTGGCGCAAGTTCGGCGGCAGCAACGAAGAGAAGGGCCAAGTCAGCACC---CAAAGTCCAGCGACCCCGTCCTCTTCCTCCCAGGCGC-----CAAATAGTCGCAAGAAGCGCAAAGCGAAGCGCAATTAGG--------TGTCCATGGACCAAGTAGAATGGTTCGATTTTCGAAAGGACGACTCCCCCTCTAATTTGTATAAATCTAAACCCTTCTATAGTGCGTGAGAACCGGAAACACAAACGTCTAGCTATTAATTGCCCTTAAAGGAA-GTTG--TTTTTATATTGCATTAATTGA-----------AGTGTAGATGGTCTATATTACGTATATTTAAGAGTAAGTGCATCATTAGTAAGTGGCTCGTGTCTGTTGAAAAGTGAAATTTTAAATTGTTTTTTTACAAACGATATGCGT-----------------CTGAAACGGATAT-ATGAAA-------TTTAACGCTGTAATATAAAGAAATCGCTAACGAATTT-AATTTGTTTAATTTCCATCCAAGGCGTACTCCCCCCACCTACCCGCCTCCTTTTCCATCTTATCTCA-----TCTTTGGTATAGAATTCCATAAGCAATCT----ATGTA-----TAAACAGAGTGCACATTGTTGTTGGCTGGTTTGCTAAGCGCCTCATTTTGCCACCTTTTGTTATTTAAAATTATAAAAAAAACAAAAAAACACGAAGAAAATAAAATAGAAGTCATTGCCACCCATTAAAGTTCAACGCGAAGGAGCAATGCTGGTATAGGTCATTAGTTTATCTTGTGCAGTAA---AATTTATAGAACTCTTGGT---TTTGTTTCGATTAAACAATAAATGTATTTAATGATAAC--------AGCTCACTAGCAGTTATGGCCATCGAAAAATAAATGGAAAAAACGT
GAATACGCCCAAGTCGCACAATACAAAACGCAGCCGC-----------------CTCCCGGGATACACCAGCCGCAA-ACGACTAACAACAATAACAACAACAACGTTACGTGCAAGTCAAACAAGAGAAACAGTTATAAC------------TTGTTGAACAGCATTTGGGGCAAGTTAAGCGG--------------AGTACCAACTCAGCCCCAGACATCGACCAGCTGCTCCGTCTCCAGCTCATTAACAGCTGGTTCAAACAGTCGCAAAAAGCGTAAATCAAAGCGCAATTAATGAAGTCCCTGTCCGTTGGCCGCGTTTA-----TAAACTTTTGAAATG-----TCTTCGTTTAATTTGTATAAATTTAAGCCC-----TAAATGGTTAGAA--------ACAAAAATTTAGTAATTAATTGCCCTAAAAGGAATATTGTTTTTTTATATTGCATACACTAATTTTATAGCTCAGTGCAGC---GCGAAGTAATATATAACTATACATAA---TATAATTAGTAAGTGGCTCGTATTTGTTGAAAA-TCAAATTTTAAATTGTTTTTT--------ATATGCATATTTATATGTACCTATACTGAAAAAGAAATCATGAGACCCGATCTTTAACGCTGTAATATAAAGAAATTGCTAACGAATTTAAACTTGTTTAATTTTCAT--GTTTTATCTGCCCCTCGTTTATGTGAACAATTCTAATTCTTGCCCCACGCACCTTTTGCTGTAGAAAAGTGTAAGCAATTTAGCAATGTACAAATTAAATAAAATGCACA---TTGTTGGCTCGTTTGTTAAACGT---------ACACATCATATTATTCAACTTTAGAAATTAGGCTGAA-------------------------TCATTGCCATCTACAAGAAATC------------CCATTTTGGTAAAGG----TATTTTATTTTATACGATAGTTTAATTCATTTAGTTATTGTTAAATGTAGTGTAATAACATTTTGATTATGTTTAATGATGACAAATACATAGCTTACTAGCAGATATATTT-TGATCAAATGCAAGCAAAATACAT
>ash2 20478925 20479099|20698 chr3R 20477577 20478925 scaffold_33 537555 538779 + 55045|1356 1356
T
T
>CG6695 20484102 20484133|20701 chr3R 20483959 20484572 scaffold_33 544470 545087 + 22039|150 181
GAGAAAGATGCAGAACCTTTTGAACCGGCAAT
GCGCAAGATGCAAAACCTGCTAAACAGGCAAT
>CG6695 20484221 20484326|20701 chr3R 20483959 20484572 scaffold_33 544470 545087 + 22039|276 381
ATAAAGCCGATAAGCGTGCGGAAATCGAAAAGACCGAGCGTGAACGACTGCAACAGCAGGAACGCGAGGATGAGATGCGCGAACTGGCCCTCAAGCTGCGCAGAAG
ATAAGGCCGATAAGCGTGCAGAAATTGAAAAAACCGAGAGAGAGCGTCAGTTGCAACAGGAACGCGAGGATGAGATGCGCGAGCTCGCGCTAAAGCTGCGTCGTAG
>CG6695 20484383 20485101|20701 chr3R 20483959 20484572 scaffold_33 544470 545087 + 22039|440 640
GCGCCGTGAGCTGCGTCACAAATATGGAACGCCCTCGAGTGGAAAGCTCTCGGACAGCGATGCCGAATCTGTGGCATCGGAA------AGCCAGCTGGCAAAGTCGTCGACGCGTCGCAGTCGCAGCAGATCGGAGAGTCGTAG-----GCGGTCGCCACCGCCGGAAACACAGCACAGCAGACGGAGCAGCAGCCGAACG
GCGGCGTGAGTTGCGGCACAAATATGGAACGCCGTCCAGCGGCAAACTCTCCGACAGCGATGCGGAATCGGTAGACTCGGAAGCTGCAACCCGCTTGGTCAAATCATCTGCCCGTCGCAGT------AGATCCCGTAGTCATAGTCGAAGCAGAAGGCACCGATCGCGTTCC--CACAGTCGACGTAGCAGCAGTCGCATG
>CG6695 20484383 20485101|20702 chr3R 20484600 20485284 scaffold_33 545109 545801 + 12845|0 545
AGTCCAAAGTACAATCGTAGGCAGCGTTCGCGCTCCCGAAGCGGAA---------GTCGCGTGGAGCGGAAGCGACGTTCCCACAGTCGACGGCGCAGTGGCAGCCGTGATCGGCGCCGTTCCCGCAGCCGGAGGAGTCAG------TCCAGGCGGCGGAGGCAGCGGGACCGCAGCATTGAGCGGAATCGCGAGCGGGAACAGTACAGGCAACAGCATCAGCAGCAGAACGAACGGTTGCGTGGTCGTGATCGCGACCGGGAGGCGGATTACGGCCATGGCGGCAGT---GGTTCTTCGAATCGAGGACGCGTCGTCATCTCCGCCCCGCCAAAGCTCAAGAAACTGGTTGACTATTGATCCCAAAACCGTTGT----------GAAGAAGACGTTTTTCTATTCA-CTTGATTATACATTTGATATTCGCTCGATTGTTTAT------ACATAGATGTACGATTTATTTC---------TGGAGCGTGTTTTGCGCTCACTGTTGATTCTGCCCCCAATAAAATATTTATAGCGCATAGTATTG
AGTCCAAGCCGTAACAGGAGGCAACGATCCCGTTCTCGAAGTAGAAAGAGCAGCAGCCGCACAGATCGAAAGCGGAGGTCGCACAGTCGACGACGAAGCGGCAGTCGGGAGCGGAGATGTTCTCGAAGTCGACGTAGTCAGTCGCAATCGCGGCGACGTCGTCAACGGGAGCGAAGCATGGAGAGAAATCGTGAGCGAGAGCGGTACAGGCAA---------CAGCAGTATGAGCGCTCGCACGGTGGT---------CGAGAGGAGGCACAGGCTCATAGCAGCAACTCGAGTGCCGGAAATCGGGGACGAGTGGTCATTTCCGCGCCACCCAAGCTTAAGAAGCTGGTTGACTATTAA---CATAACCAACATATACAAAGCAGTAGAAAACAGCGATATATACACCTTGATTG-----GTTATGCCCGCTC-ATCGTTTATTTATGGGCATGGGCATATGTTTTTTTTTATGGTAATATGCATCGTTAAATGTGTTTGTTTATGCTTTTGC-------------TTGATAACACA----ATTC
>slo 20533133 20533786|20728 chr3R 20526880 20534327 scaffold_33 595388 602983 + 178419|6842 7615
TTGTTACTGTGTAGCGCCTTAACTGATGGTCCTTATTCGTACATTTGAACGATGGAGAAGCTAAACGAAGGCAGAGCAGCGCATTTTTGGCAACGCATCCACAACTACATATTGGCATAAGA--TATTTGATACT-CGCGACAAGGCG-----ACAACAAATCGGCAGCG-----AAAAAAAGACATATTTGTATGTAAATCGAT----------------------------------------TGTACCGTGTAC------AAAAGT---GAAATCAAAAGC---GTTAAT---------------AAGTTAGAGATTACGACCATAACTTGCGTGCCATTAAATGCGCTGCTCTGCTCTTTTATGTGTGTGGGGGGATGCGGCTCGGTGTATTTTGTCCATCCCAACTAACAATCAAGAGACAACCGGAACCGGAACCACTGACCACCA--GATCAACGTCGACGGCAATGCCGCCTGCCTCCACACACATAAAAAGCTAATCCGGATCGGGGGACCAAGAACTTTAGCCCTGATATCCATCGTTCAACTGCCAACTGATTGCTTCCCACATCATTCCGTATGCCTTTTTAGAACCTTGAAATTATCAT----------ATTCTGTA--TATCTATAATT---------TTAGTCTTGCAACTAC--ATTGGTTGATTTTGT---------------ATCCTTGTTTATCCCTATTATTTTGTAATCAACATTGTGTGCCCCAATAAAATATTCTTATTATTATTATTTAA
TTGTTACTGTGTAGCGCCTTAACTGATGGTCCTTATTCGTACATTTGAACGATGGAGAAGTTAATTGTGTATAGAGCATCGCATTTATGGCA-------------TAAATATTGGCATAAGATCTGTTTAAAATTGCGCACCAAGAAGTATATACAA-GTATAGGCATTGGCATTAGCTATAGGTATATGTATATCTGTATCTGTACCACAGACGCGTACTATATACTAAAAAAGTACATGTGTATATACTGTGTACCTAGGGAAATGTAACAAAATCAAAAGTTAGGCCAATTGGCGTATGTAACACAACTTAAAAATTTAAAT----GCGTACATGCCGGTAAATGCGTTACTCTATACTTTTATATTTGTAGAGACAT--CGTGCAGAGTATTTTGTCCATCCTGTTTAACAATCAAGG-------------ATAGCCACACACCACAAACGACCAACGGTG--GGCAGTGTTAGATGTCTCTACAAATATAAAAGCCACATATTCATTAAAGAAAGAACAACTT---CTTTGATATCCATCGTTCAATTGTCAGCTGATTGCTTCCCACACCATTCCGTATGCC-TTTTAGAACCTTGAAATTAACATTTTACCTATAATTTTGTATCTATCCGAAGTTTTATTATACTTAGTTTTTTAATTACTGTTCAATTCCTTTTGTAATTATTTAAAGTTAATTATTATTTATTTTTGTTTTTCATTATTTTAATCTGT-----TCAAAATAAAAATGTTTTTAAAACAATCCGT
>CG13627 20543031 20543145|20733 chr3R 20540433 20547344 scaffold_33 610283 617172 + 163367|2712 2837
TTAACGCACTTT---------TAGTCTTCGACGCTGTTCAAAAATATTTATTT-ACACACTCATTTGTAAAAAACGCATTCATGTAGCGAGCAGTCGGTAGT-TAATAAAAATAACCATTAATTTA
AAATTTGTTTTTGTTATGACGTAGTCCTTAGCGACTTTCGAA--TATTTATTTTACAGACTCATTTATAAA---TTTAAACATATAGCAAG---TCGATAGTGTAATAAATAAATGTATTAATATT
>Rpb10 20543627 20543722|20733 chr3R 20540433 20547344 scaffold_33 610283 617172 + 163367|3348 3454
ACG-----------GCACAATGGAAACCATCCAAACTGGACTTGGGAATAAAAACTCTAGATTTTATTGTAAAATTACAAATTAAAGCTTGATCGATAGCCCTAGAA
ATGTGTGAGAGCTTACGCATGGGGATCAGAAATAAACCGATATTGAACTACAAACTTTATATTT-ATTGTTAAA--ACAAATTAAAGCTTAATCAAAA-----AGAA
>tok 20574203 20574855|20758 chr3R 20570804 20574578 scaffold_33 637204 640754 + 157166|3424 3844
GGCTATGGTGGAACCACTGACCGTGCGCCAAAATACATGACAATAT--ATTAAAACGGAATTTATTTAACAGATTTAGGCATATCGTCGCGTACATAAAACAGACTTTCCCGATCTTCCACGCGCACTCTTCTGGCCAAATCCAGGATATAATCAAAGATCCAATACTAGTTTTAGGCACTCGAAACACACATTGTTAGGTTCCAGTCGGCTAAGATCTGCGGTGGCAA----------------------TTACTTAGACCCCTATGTCATACATGTAATGTACT--TTGACTAGACTTCTCTAG-ACTCTGTAGCTA------AATGTGCAATTCCTCTTCCCCCCTTGCATTTGACT-----GCTTTTTTCTCTGACGCATTTTCATTTT-------TTTCGGATATCTATATTCTAT
AGACATGCTGGAAACGC----------ACAAAAATCATGACAATATCTATTCAAACGGAATTTATTTAACTT-TTTAGGCATATCGTGGCGTACATACAGCAAGATATCT-GCTCTCTTA-ACATAATCATA-GACTTCATTTTGACCGTAATCAAATATTAAGTATACAT---AGATATTCAGAACAAA--TCGTTAGGTTATAGCACGTCAGGCATATCGCTAAAAAGGGGAAGAACTCATTAGCTTTACAACTCAAATGAATATGTAACA---ATAATGAACTATTTAAGTGAAATTCATGAGTACTCAACATTTGCCATATAATATTTACTGTCGTTCTCTTTAGGGCGCTTAACGCTACGGCTCTTGTAGTAGACCGATTTACATATTAATATATTTGTGTGTATTTCTATTCTAT
>tok 20574203 20574855|20759 chr3R 20574758 20579228 scaffold_33 640957 645723 + 151092|0 103
ATATGTACAACTCTCGGATATTTGAC-TCAACTTAATACGTAATTA----TATCTATACATATTAAAAC-TTGCATAGTAACTATGTTTTAAAACCAAAACAAA
GTATGTAACATTTTTTAAAATTTGAAATCAACCTAATACGTAATTAAATATATTTACCAATAATGAAACAGCACAAATCAACGGTATTTTGAGTAAAAAAAAAG
>tld 20579143 20579234|20759 chr3R 20574758 20579228 scaffold_33 640957 645723 + 151092|4837 4922
ATAAAATGAGAGGTCCAGCGAAGGGATTTAGAGTTTAATGTTTGTTGTTGAAATTTGTAAATAGATTGTGAATAAAAGATATTTCG
TTCATATCTG-----CCTCGCAGTTAT-----GCTTAAGTTTCATTGTTGGAA-TTGTAAATAAA-TGTAAAAAGAAAATAGTGCG
>asp 20585955 20586235|20760 chr3R 20579574 20587516 scaffold_33 645865 653802 + 241013|6656 6947
ATTTAGG--------AAAATTCATCTTTAAATGTTTAATGTTAAAACCATTCT--GTGTTGTGTTTTAAAATAGTCACATAAATTCTTAGACCATGCTAGTTTTTTGGAGACAATTAGAAATAGTTTAAGATAATCTAAGACCGTCTTAACAATGTA-AAATAATTAAGTATTAAGTTAACATGTATATGCTGCAAACGAAAAATGTAACTAATATTTTAGAATGAAAACTAAGTGCATTGTTTTTATAGGAAACCACAAAAGAAACTGAAGAATAAAGACAATTGAAAGTC
CTTAAGGGTAAACATAAAATCTTTAATCGATAGTTGAATGTTATAAGCGTGTTTAATATTTATTTTCTATGTATTAATTTGTATTTTTAA--------AGTTTT-------------GAAATA----AAAATAAACGA---------TAAATTTGTATAAATAGTT---CATTGAATTGTCATA-----ACTTCGTTTGCACAATTT----------------TCAGTGCTAAGTTTGATG--TTTATTGAAATATATTCACAAAACAAATACATATATTTAATTTTAAAT-
>CG13631 20595496 20595850|20771 chr3R 20594860 20595972 scaffold_33 664724 666173 + 14863|967 1376
GAGGCTGCACGAG-GAAGGGGGCGGGGCGGGACGG---------------GGCGGGACGAACGGTCGCAG----GAGCG-GTCGAGTGCTGTGCTGTGGGTTGTCGGCGGGGGATCTCTGGCTGAT-CGGAGGAAGGATA-----ACACGGAGATATGGATTTGGATA------TGAC--ACAAAGAATTCGCGCCACTTCAAGGACCTAAAGAATTCAAGTTCGCGTAGTTCCCAAGATTCCAATGGGTAATCCAAATAGTTCGATTCGTATGACCCGAATGGG----------------TGATCCCCGGATCACGTTAGAGGCTTCAAA----GTGTTGGCAGGGGACAGGGCAATCTGTGTAACGACATTCCTTCTCAACAATAACTATCAAAAAAAAAAAAAAATA
GCGGATGTGCGGGCGCTGGTGGCTGGGCGTGGCTAATGCCATGTCCGCCTGGCAGG-TGGCCGGGCGTAGACTTGAGTGAATCGAGTGCTGTGCGGAAGTTTGAAAGTTGG----CTGCGGCCATTCCCAAGCCAGGATATATTCAATTTGTGATTTGAATTTTGATAGCTGTCTGCCCGCCAGGGGCTCCAGCCCAGCCCAGGGG----------TCATGTTAGAG--GCTTAAAAGTGTTTAAGGGACAATGCGATTGTTAAG---CGAGTGTGCAAAACGAGGTGGAAAGAGTTACAATAAGCCAAGAATCACATTCCGTATTGTAAAAATGATTTTTATCGCGAATAAG---AACGGCACAAATATCCGTATCCTCAAT-CTATATATCACATAGAACATCTAATG
>CG6879 20610203 20610284|20784 chr3R 20605152 20610238 scaffold_33 676072 681235 + 165680|5366 5402
AAATGCCAAATTAGCCCTAGATTGATTATT-TATTTA
AAATGCCAAATTAGTCTTAATTTATTTATTGTATTTA
>Ets96B 20622962 20623678|20792 chr3R 20621716 20623060 scaffold_33 377342 378682 - 50767|1324 1433
CCATATAGTCGCCATATGTGGGCGGAGCGTTCGAATGCGGCCGCGTGGGCGTGG---CCGTGTCCCGTGTACATTGTGTAATCTAGTT--------GCGTGTGGGGTTAC
-----------------GTAGGCGGAGTGTGGGAACACCACTGTATGGGTGTAACACCCATGTCTCATGTATATTGTGTAATTTAATTTTTTATGGGTGTGTGGGGTCAC
>Ets96B 20622962 20623678|20793 chr3R 20623545 20624358 scaffold_33 378999 379835 - 30065|0 147
ATATTTAAAAAAAAAATTGTTAAATCTAAAGTCCACCAAATTGCA------------TCGGTTGGAGAAACCGGAAACAGAGCTGTTTGAACCGTTTCT-GTTCGTTA-ATAAATGGCAACAGAGTGTTTTTGATTGTTTAGACCTCA
ATATATACAAAAGAAAGTGTCCA---------CTACTAAATTGTAATCGCGTTAAGGTTGAGTTGACGTATTTAAAATAAAG---TATATACCGTTTTTTGTTCGTTACACAAAC--CAGCCTATGCCACTTGTGTGTTTATA--TCA
>CG6980 20634291 20634403|20795 chr3R 20625757 20635216 scaffold_33 383347 392715 - 376631|8895 9007
CTTATTTAATTTTGCATTATATACTCACTCAGCATAAGCATGACACCCAAAAACGAGACACACGAATAAAGAAACGGCAGGTGAACACTGCCCAAATCTGTGAAGCATGAAAA
TTGAATGTAT---------TGTACTTACTCAGCATTAGCATTACGCCTAGAAATGAGACACATGAATAAAGGAACGGCAGGTGAACACTGCCCAAATCTGTGAAGCGTAAACA
>CG6995 20647889 20648095|20802 chr3R 20645098 20648101 scaffold_33 403642 406803 - 95213|3084 3299
GAAATG-TGCATTTACATAAA--ATGAGGCAATTCGAA----TTTCCAAGCATGCATCCCCACATCCAACACACCCCCCTGAGTGACTTTTCCAGCAGCGCCCAGGAGCGCTGCTCTTAATATAATGAGCTTTAGTTGTA--GTTCTAAAACTTAAAATTACATTTGGAAACCAATAAATGTATTATCAAACTATGTTGAAAATGCGCATACATTT
ATGGCGCTAAAAGCACACAACTTATGAGGCAATTGAAAACCCTTTCTAATCA-------------CCAACCCAACAAACTTGATCAATTTTCCTTTAACGCTTTTG------GCGTTTATGTTAATTTCTTTTAGTTGTATCGACTTAGCTTCTAAAACTACA-TTAAATATCATTAGATATATAATTA----ATATCGAATGTTTTAATATAAAT
>CG13636 20665426 20666217|20825 chr3R 20665029 20665430 scaffold_33 232359 232709 + 15233|403 407
AAGGC
AAGGC
>CG13636 20665426 20666217|20826 chr3R 20665462 20665515 scaffold_33 232745 232797 + 2171|0 53
TTGGCGTTTATCTACCCCAGTGATCCATCAAATGTGCCTCAGTGAAACCAACAG
TTTACGGTAATGTCTTTAGGTGATCCATCGAATGTGCCTCAAT-AAATCAACAA
>CG13636 20665426 20666217|20827 chr3R 20665620 20666226 scaffold_33 232867 233468 + 7181|0 636
AAATTAAGAAA-GTTAGATACTCGTCGCCATTAGCCTAAAAGTCGTTCTATTGTATAAGTTTCATATGTACCACCGTCAAGTTTATTCGCTTCTCACGAAAAGTTGCGTTATATACAATATACATA----ATTATATTATCTGA---TAAACGTTTTCCATAGATCCCCAATCGAACTTAGTCCGTACTCCCT----ACACTAGACAGACCGAAGTAACTTTAGATCAAATGTTAGGCA--CCATTTTATTGTAATTTTATATGAGTGTACGTGTGTGTCCAGGAATAATCACTAAAAATCGAGAGAAATTATCT--------AGTGATAGGCAACTTTTCAGCAGCACTG--TGAATTCAGATCGCTTAC----ATCGCAATTACAAATGT-----GAAACATTTTTAATTTTTGTATGTATTCAATATAAATAGCTTTAC----GAGCTCACAGCCCATAATCGAATGGAATAATAATAATAATAATAATAATAAAATATGGGAGACGATAAAAGTTAATAATATTTTCATGTCCAAGTTGCAGGTCCAGATAA--GAATTTCACCCATTAAAACCGTTTTCTTCGTAGCTGTTATCTATACTATTTAATAAAAACCTTTAAAAACCCAAACGAA
AAATGGTGAAACGCCACATTTTTGTAGTCATTAGCCTAAATGTTGTTATATTCTATAAGTTTCATAAGTACCACCGTCAAATTTATTCGCTTCTCAC-ACAAGTCGCGTTATACATCGTATACATATTATATTATATTATATTATATTAATGGTTTTTTATAAATCCCCTAACAA---TAGGCAGTACTTATTTAAAACATTA-ATGAATAAATGTTGCCTGAAATAAAATTTTATTCAATTTAATATGTAGAAAACTTA-------GCACTTATATA-AAAAAAATAATAGCAAAACAT----ATAAGTTGTCTGTATGTCCAACATAAATCAAATAAATAAAAGCACGGAATAAATTCAAAATATATTCTGTAATTGTAGGTACAAATTTCTCAATTAACTATGACAACATTAACATGTATGCACGTGGAAAACTTTTAATATGTAGTTCACAGTTCAAATCTAAAGGACATGTGAATCTCGACTTTGCTTTCAAAATACCATAGTTG----CATCCAAAAACATTTT---------------GTACTTTATAATTAAGTCTTGCCCATTAAGCAATATTTTTCCGTAGCTGT--TTAATTTTATTAAATAAAA----TTAAAA--CTAAAAAAA
>Esp 20675956 20676142|20834 chr3R 20675839 20676292 scaffold_15 667567 668017 - -1712|162 364
CTGGC---------TTATTCTCCTCAACACG-----TGATACAAATAATTTAGCCTAAGTGTTTGCTTTAATTATTTATGGCGTTGTAAATAGATTGTAAACTAATTGTGTAGTATTATCCAGAGCACACAACTATTAGAAATTGTAAGGTGAACAAATAAGTGTATTTCTTAATTACGTAA--TAATAACAAACAAAAATAA
CAAGCACCAGTACTCTATCCCTGGCCAGACTCTAGCTAACATAGATAGTGTCAGCTACTAATTAGCTTTA-----TTATGGCGC--------AATAGTAGTTCATTTGTCTAATG----CAAAATAATTAAAATATTCCCAACTAT--------------------CTTCTTATTTTTGTTGTTTGATCATCAACAAAGAAGA
>CG7006 20677031 20677107|20835 chr3R 20676306 20677186 scaffold_33 1090471 1091410 - 30709|757 868
ATCCA------------------------------TAGATGCTA-AGTTTTTACATGTTTTGTAGCAATAACCATGTTTAGGTAAAT----AATAAGTATGCTGAAAAACGG
TTTTAATGAAAATCGCATTTTAATTGTTATGATCTTAAATTCTATAAGTTTTACCAGTTTTGTAGCTTTAGCCATATTTAGTTGATTTTGAAATAATTAAGTT---AAATAT
>nct 20679960 20680024|20836 chr3R 20677384 20681825 scaffold_33 236677 241104 + 123429|2696 2769
TGT---------CACAACTGCCACAGCGACGAAATCATCGCGTTCAGCAGCTCATTCCATAGATTTCTGCATGC
TGTATTTGAAGTCGGCCCTGCAGCAAAAACCACAAGAGCGCCTTCATTACATAACTCTA---AGCTGTGCATGC
>nct 20680084 20680731|20836 chr3R 20677384 20681825 scaffold_33 236677 241104 + 123429|2858 3557
ATCGCCGCGGCCGACAGCCTGTTA-----------------AATCTTCA--------AAGAATATCTGATC------ACGTGCCGAAGATGATTGGTTG-CTGAATATGATCTA-AAACAAAAAACAGACTTAAC--AAAGACACTAAAATGATATTCTAACTCGTCTTATTTAAAACATTAAGCAAACGTTTATTTATATGTATTTTTGTATTTTAAAGTAGT------AAATTAGCTTCTATCAACTACGTTGTATCATATATAGACATTTAAC--CAATTGCGACAAAATTCTTTCCACTTGTCCGGCCCTTTTTGCATTGTACATAGGATTAACCAACCCAATTGAACCTCTGATAATGCCAAGGAAGAGATGTCTGTACAAATATTGACAAGAAACTG---CTATAA-----CTTATAAATCACTGGAAATATTTATACCTTCTGCATCTATTGCGATACTGAACTTAATGATCTGAAATCATTACTTCAT-AGAAGACAAATAATTATTATAACGACTTTAAATTATATATGTTTAATAAATTTTGATAAGGTGTAAAGCAATGTCCTGTTATCTAGTTAGGTTATTTTCAAGGCAATTATTCACAGCTCTCAGATTCCAACGATTGATGTAGTTTAATCTCAACTCTTTACCAAAGAAGTCCATTTGTACTAGTGTAAAAGATATTTTCAATA
ATTGCCACCGCCAACGGCCTGTTAGTGGCAGGACAATCGGGAAGCTCCCTAACTAATAGGAAAAGCTAATATAAGAAAAAACTCAAAAATACTTGAATAATTTTATAGGAATTATAAATAACAATTATATATAACCCATAATAACTTAAAAAA-AGTCTAACAGATACTTTAAGTGCTAGAAAATAAATATTTGTTTTTGTACACTTTTGTATTTCAAAGACGTTACAAGCAATTAGTGTATAT--------TTGTATCATAATTAGCAATTAAATGATATTTATGCAAATGTATTTGTTTCTTGTCCTGTCTTGTTTGCTTAATAC-TAGAATT----------------------------------------------TATAAATATAACCAGAAAACTGAATCTATAAGGAGGCTAATAAATAAAG-----------------CCGCAGTTAATTCA----TAATCTTTATGATT--AGTTTAATGTTTAATTATAAAAAAAAGGAGATTTAAAATGATTAAGATTTGT-----TTTTAAATATTTTGTT---------------GTTCATTTTTAACGTCCAGTCGTTCT--ATGTAATACCGCACAGTTAACAATTTCTCACAGC--ACATTGTTT--------CTCCTTAT--GAGGTATTCGTTCTTAC-AGTGTCCAATATTTGTACAGT-
>CG7016 20689792 20689938|20843 chr3R 20688471 20689795 scaffold_22 235331 236645 - 3142|1464 1467
ATCT
GCTT
>CG7016 20689792 20689938|20844 chr3R 20689926 20690185 scaffold_22 248081 248363 - 1104|0 12
ATTTTAATAAATT
ATATAAATAAATT
>Ela 20692249 20692425|20847 chr3R 20691857 20692954 scaffold_22 249799 250837 - 14086|400 579
AGCTGGCCGACATCATGGGTGGACCTCGGTGGTGGTGGTAGTGGTAATGGTGTTGGTGGGGCGTGAAGTAATCCGAGTCGTAGTCATAACTTCGCTGCTGCCTCCTTGGCCAGAGGCAGCTGTCTTTGCCTATCATCCTGTGTGTCCCTGCGAAATAAACTTGATTTCT---GCACACCC
AA-----AGACAAAA----------------ATAACATTAAGAGTATGGTCATAAGTTAGGTGTAAGCTAACC---------------------TTACCGCGTCA-GGTCTAGGAGCAGCAG-------CTGCTCGACTGTGTGTACTTT---AATAAACTTGATTTTTTGCACACACCC
>CG11089 20706836 20707200|20860 chr3R 20704587 20706840 scaffold_13 1602374 1604653 + 108653|2322 2326
GTTCA
CTCCA
>CG11089 20706836 20707200|20861 chr3R 20706841 20707154 scaffold_32 490238 490565 + 1813|0 338
ACACACTCTTGAGTATACGATTCATTCCCAGTT--TTTAAGCTCTTTCTTTGATTTCCATAAAGTTCAACTTTAAATCCCAACTTCTCAAGTCGAATACATAAGAGAATTGTAAATAATTCTCAATTCAGTTAATTTGATTTACGTTCTAAACTGAAATCTATAACCTACGTAGA-----AAGGCATTTTTAAAT----------ATGTAGCAAAATTACATAT------CTGAAATAATTGTAGTTGTATTTGAAATATTTTTGATAAC--ATTTGTAGCGTTTTAAGTATTTTTATAGAAACACCCTGTTAATCAAACCCCATCAAACTGCCTTATG
ACTCATGCGACATTATCCAACACTTTAAAAGTTGATACATGATAATTCTTAAACATTTTCAAGTGTTG---TTAAATTTCCATATATTAAGTTGA-TACATTA-----TTGTTCAATTTTGAAATTTCAATTCATTTGATCTTTGATCTAAACTGATACATATAATTTTCTTAGCACTTTAAAGTGCTGTTAAATTTCTTAGACAGTGCTGCAAAGCTTCATGTAACGCATTGGAATTTCTTTACATACATGAAACAAATGATTAATTGTTAAATTATAGGTTTTTAAGCAGTCGCATAGAAATTTCCCAATACTTAA--CGTTTCAAGCCCGCTGATG
>CG11089 20706836 20707200|20862 chr3R 20707168 20707577 scaffold_13 1604729 1605120 + 15770|0 33
CAATAAAA-CCACTTGCCTTTAGTTAGTTAAACG
CAATAAAAGACACTTGCCTT-AGTTAGTTAAACG
>CG11069 20723255 20723335|20874 chr3R 20719551 20723360 scaffold_13 1620840 1624906 + 118820|4110 4196
G------GATTCAGATATCATGTTTCCAAGTTTTCACTAGATTTAACTTTAATTTAATAAAATAAAAACTTCTCATTGTATCTATTT
GCGCCGCAATTTTAACTGCAT-TGCACACATTTTAACTA-ATTTAATTTATATGCTTTAAGATAAACTAAACTAA---AATTTATTT
>CG10845 20728337 20728770|20877 chr3R 20728367 20728579 scaffold_13 1631185 1631468 + 1544|0 285
CGCTTAAAGGT---------CAGCCAGTCAAC-CGTCTTCTTCTTCAGGTTTTGCC--AGCACCAAAGCCATCCGGCT----ATCCGGACCAGTCACGAA------------CCATTTGGAGCCATCTCACACATTCCGCAGT-------------GCATCGCATCTGACTGTGCCAC-----------------TTTGCCATTTAGCTGGC----GCGACGGAACCGA-------GCCAATGGCTGTCGGCAAGTTTGTTGCCTAAG----TCTTTCGTTTTTCC
CACTTAAAGGTCACTTTATACAGAGAGCAAATGCTGCTTTTTCTTTAACTTTGGCCTTAGCTACAACTGCAACCGGCTGACAACCTGG--CAGTCACGAAGTCTCATCAGTTCCATTGCAACCCGCTTCCCGCACCTCGCATCCACCAGCCAACCACCATCGACTACGACTGTTCGGCGCTGGAGCTGCAGAAGATTTGCCATTTAGCCGACAGCGGCAACCAAACGAAAGATTTTACAAAAAGGCGTCCGCAAGTAAACGGAATCAGACGTTTTCTCGGTTTCCC
>CG11168 20747909 20748117|20899 chr3R 20744504 20749230 scaffold_13 1650818 1655801 + 102842|3880 4092
TTCTAAGCCATGGAAGTGCCACAATTGCCACCGAGCGTGG----TTTTTTATTATTTATTTCATTGCATTTCACACGTAAAGTTATTTTTTTTACTCATTTGCTAGTCGTTGATGCCATCTCGATGCTGGCTTTGCTCCACATAAGGCAGCTCACATGTTAAGTATTTTGAGAGTTTTTTAATAAATTTACAACATTGCTTTTAAAAGCAAAA
ATC----------GTGTGCCACAAGCATTATGCATTATGAAATCATATTTAATCTTCACGCCATTTGTTTT-----------GTATTTTTTTATTTGACTTGCTAGTCGTTGATGCCATCATAAAACTGTCATTATTATTTTGAAATTGACACGTA-GTTAAATTGTATTTTTTTTTTTCAATAAAT------AACTGGTTTCAAAGCCAA--
>CG11120 20750736 20750883|20902 chr3R 20749995 20750788 scaffold_13 1656924 1657789 + 15620|836 900
TTTCTTAACTTGATTCGTTAAT------------TTTACTGCTTACTACCTATGCTTACTCATAT
TGTCCAAATTTCATTAATTCATATTTTGTAGTCGTTTATTAATAACTGTTTGTATTCACTTTTAT
>CG11771 20760105 20760637|20905 chr3R 20757753 20760154 scaffold_20 104602 106989 + 109125|2357 2414
GG-GTCGCCCTCTGTTCCGCTA-------AAACGTTATCTATTGTGTGTAGTCAACAA
AGCGTCACCCTTGCGGCTGCCATCGTGACCAGCATTCACTGTTATCTATTGTTAACCA
>CG13645 20772235 20772555|20912 chr3R 20771056 20774013 scaffold_20 120549 123631 + 85050|1237 1616
CGCGCTTTGCAC-------------GTGAAAAAGAAGCCC-------TCGTCGCCCACACGCTTTCCAAC----------CCACCAGCACCGCAAATCGCACCACTTGCCCCACCAGCACCATAAGCTGTTTGAGCCGTGGCGCCTCTTCATGGAGCGTGAGTGAGCAGA-GCAGA----TCCGAGTTCAAGTTCCTA---------TTTAGCAGTGATTCCTTTAATGCATGT---------TTATTTTTGCCCAATCTTAGCC-CTTGTAAATACCCTTGTTAAATTAGCCATA-GTTTTGCGGTGGTC-AGTGTGCGTATCATCT--ACTTACACCGAATTGTTGCCAAAATGTAGTCCCATTAAACAATA-ACCTT
CGCTGTCTGCACTGCACCTTGCACCATTTAGAAATAGCACCAACAGATCGACAAACGCAGGAGCACCACCAACATCAACACCACCATCAGCAAAAATATTACCACTATCAGCAATCAACTCAAGATCTACTCGTGCAGTGGCGCCTGTTCATGGAGTGTGAGTGTGCAAAAGCAGAGAATTCATAATAGAAATTTTTAAATTTATAGTTTGCCTATTTTCTTGCTCTTGCATGTAAATATACACTCTTTTTGTAAATACATAACAACACGTATGTACACTTCT--AATACGCCTGATGTTATATGGTGTTCCAGTGTACGTATCAGCTTAGGTTGCACCCAATTTCTTTTAAAGAATAACCCATTCATATAACACACTAT
>CG13645 20773027 20773122|20912 chr3R 20771056 20774013 scaffold_20 120549 123631 + 85050|2102 2218
GAAACTGGAAGACGAATCTCACGCGGATTAAGACAGGGGCGCTGGA-----------AGCTAT----------TTGTTGATATTATATAAATATGCAAAATAAACACGTTCGTTACC
AGTGCTCAAACGAGAAATT---ACGGAATAATACAGG----CTGGATACTTACAAAGGACTATGTTTTTGGTGTTGTAGATATCATATTGTAAAAATAAATAAAT--GTTATTTACT
>beta4GalT7 20850189 20850205|20987 chr3R 20848770 20850665 scaffold_20 201564 203455 + 69151|1496 1512
TGGGTTGTGTTAAACCA
CGAGTTTTCCGAACCTT
>Hr96 20854721 20855075|20989 chr3R 20853627 20855865 scaffold_20 205959 208212 + 72950|1141 1538
ACAACCGATGCGTGTCGGGCATTTAATGCCTATGTTGATGCCCAATGATGAATGGTCAACAAGCTGTAGTTGTTGTTGTTGTTGATGT-----------------CTGTTTTATCTTGTCGCTTGTAATGTTAGATTTTAATCGAATGTGATTGTTAGATTTGCATATACTGCATAGATTTTATATTTCTACATCAAAGAGAGCATATTTAGGATACCAAGTGCAAAGCAACACAATCTATATGTAATGTACACCGTTTACCTAGTTTCAAATAAACTAGACGATAATGCAATAACTAACTTGGAAGCGTGGGTTCTGTGCAAAAAGGAAAAAAGACAAAAAAAA--------------------------TAAACTGACTTTGAGAACCAGTGGTAA
ACAAAT--TTGGAATTGGGCATCAAATGCC--------------ATATAGGATAATCGCTGTGCCGCTGTTGTTGTTGTTGTTTCTATAGTCTATCAGCTGCAATTTGTTTTTGTTTTTCGCTTTTAAAGTTAGATTTAAATCAAATGTGATTGTTAGATTTGCATATAACACGTAGTTTTTATATTTCTACATCAAAGAGAGTATATTTTAGGTACAAAATGCAAAGCAA---AATATAAACA-AATGTACACATTTTA----GTTTTCAATAAACTATATTTAAAGCCACAAAACTACCTGAATGCATGGA--------AAAAACAAAACGAGATTTCAAGCAGATGCAAGTCAGCTTCATGGAGTTTCTAAAATATGTTTCAAAACGACTGCTGT
>bai 20866056 20866172|20995 chr3R 20865700 20866723 scaffold_98 35902 36751 - 13250|360 485
TCGTCTAGCCGTAGTCTTAATGCGTGCGTGGAACTGTGTTTAAATGCCTGGTTTAGATTTCATCCTTTCATCTTTTGAACGTTTTTCTGAAATAAATGCAAC---------TACCACGTATGTATA
TTCCATA-----------AAT-----------ACTATATTTCAA---ACAGCTCGAGTTTTACCGCTT--TTTTCTCAACGCCTTTAACAATAAAGTGTAGCAAATTAATAAATTATCTATTTTTA
>CG11791 20878358 20878799|21009 chr3R 20878181 20878554 scaffold_33 37844 38172 + 8474|180 378
CTTAAGATGTAACGACAATTGCAAGCACAAGTGTTTTCCCCACTATGTACGTATGCACCTCATCGGTTGGCGTATACATATGTGTATGTAAATGGCAGGAAACATTAGTGATAGGAAAAGCAAGATAAACT--AAGTAATCATAATACCATTCTGATTGACAATTTTAAGTATTCAGCGTATTCGTGCGTATTGTTAGG
GTTAAAAT--------AATT-----------------------TGTGTAAATATTTAT-----------GCATATACTTA-GTTTATGTGATAGATCTAAAAC--TGGAGACAGCCAAGTAAAAATGTTCTTAAACTAAACATAGAAATGTACAGATTAAC--TTTTTAATAATAAA---ATTCATACAATTCATTAAG
>CG11820 20892356 20892440|21030 chr3R 20891731 20892436 scaffold_44 414146 414830 + 15815|628 708
CACTACTAACTAGCCATTTGACTTATGAGCTGTAGATCGCTACTGTTCAAATAAAAATGAATAACTATGATAGATATTAAG
-------AATTAATCTAGGAAAGTAAAAATTGT--ACCACCAATTCTTAAAGTCAAATAAAAAGGTTTTATAAATAGAAAG
>CG11836 20898321 20898434|21039 chr3R 20898031 20898744 scaffold_20 375940 376591 + -813|302 416
TC-AATGTTGTGTGCAAATGCACGACCTTATTTATTGCCTAGCTTAGTCCGTTTTAATGCAAAGTGTCTTTGTTACTCCACCAATCCATCGAAAATAAATATAATTGTTTCATTT
TCTAATTTTATTTTTAACAGTGCGAGTTATGTTATTGATT--TTGTATACAAATAAAAACGATTTATATTTTCTACTT--------------------ACATAACTGTTGC----
>CG11920 20902050 20902104|21043 chr3R 20901240 20902275 scaffold_33 144949 146063 + 28796|865 923
ATTTAGAGATACCGAACGATTTAACAGAAATAAATTTGTTTTACT-TTTAT---AATGT
ATATGGAAATAC------ATTTTATAAGTTAGAATTTATTTTGCTAGTTGTGCGATTGA
>CG33096 20925002 20925087|21068 chr3R 20924905 20925504 scaffold_33 64611 65214 + 7776|97 182
CAATTAAAGAATAATGTGGACGGAGGCGTTAGCGACACTACATCGGGCGTAATATCTAATTCAAACCCTGCCGCCGGTAGTGCGTC
CAATTAAAGATAAATGTCGAGGGCGGCATTTGTAATATTACTTCTGAAGGAGCATCTAATTCGAATCATATGGCAGCCAGCTTAAA
>CG33095 20927469 20927870|21071 chr3R 20927363 20927872 scaffold_33 69174 69627 + 2591|106 533
AACCATTTGCTAGGAAGCCGAAAACCGAAAGCCGATATTAAAGTGTCTCTGCATAGCTCATTCATAGGTCATGAAAATATACAAAATATAAAACCACAAAAAACATACATACATATATGTCTTATATATCAATCGAATCTAAATATGAATAATAAACAAGTAATAAATAATAATTTTAGTAGTACCTTAAGTTTGAAATTTTTACAGTGATTTTGCATTTATATTAAGTAACA-------CTATA-ATGCCCTG------CCAACAATATGGG-----GCTAAGTTTTAGGCTTAACTACATTCGCAA--AGCATATATATGTGTGTAATAGTGTATTTTCTCCTCATTTTATTGTCATTTTACATATTTGTTGT-AATACATTT----TATAGTAATAAAATCTTTATAAAGAGCTAAGTAACGCAT
---CTATTGTTCAAAATTGAAATGTTAAGAATATTAATATATGTGTGTCTATATATTCGATTCATA--------------ATAAGTTATATCCGTATAAAGAA---------------------------AAGCGAG---AAATTTGTATTACAA----------------CATTTTAAT------TTAAGCCTGCAAGCTCTACAGCAAAAATGCATTTATATAAAATAATAGGAACGCTTATACATTCCTTATAAACCTAAACAATGTGTATTGTTTTTCAGTTGTTGGCTATAATATATTTGCGAACACCACCAATACTTATGT-ATAATGTATT--------ATTTTATTGTATTAATATA-ATTTCTTGTAAATTCATTTAACCCATTGTAATAAAATC-TCATAAACAACTCA--AATGTAT
>CG11844 20951079 20951348|21095 chr3R 20950921 20951368 scaffold_74 63112 63470 - 3833|158 429
GAGTTGAGAACAACAATAAGATTTAATAATTTCGCGTATTAAATAATTAGTAAGCTGGTCCTTCGGTTAACAAATAACCATTAGATTTTCGGGCGCGATCTATGAAGCTTGACGACCGATTAATAAACAGAAACAAATCAGCCACGCTTATCCATATTCCTTAGTTGTAAACAAAAATTTTTGCATTTTTCACTCTCATCATTTACGCA-TAAAAAAAACTATTACAAATAGTT-GGAATGTTGAAATAAATTTACATCAATTACAAACCAA
AAGC------CAACATCAAGCTTT------------TATTAAATA------------------------------------------TTCTTGCATATTCT----AATTT---------TTAATAAAGGTTAATCAATCTGCCTTATATTAATATGTACTTTACATAATAAAAAAAAACTATGAATTTCTCA----CGGCATTTATGCATTACATTAAACTATTGCAAATAGTTCAAAATGTTGAAACAGATATACTTAATTTAAA------
>CG11848 20961379 20962431|21107 chr3R 20961240 20961564 scaffold_74 88809 89107 - 10952|139 327
CATTTGTTACTAACGATA-AAGTAAATTTAAGTTAAGGGGTGTTGAATAAAGTTCGCGCATATATTCACGAATTGTT--GATCGATTTCCATAAATATACTCACAAGTAAATTTTTAGCAAACGGAATCTTCACACTCACAGTCACCTTCATAGCGTATTCCATTAACTTTAATTGTTTTCTAATTTTA
CATCTGTTGATATTTTTATAAATAAGTTTAAATTAAGGAG------ATAAAA---------AGATTTACAATGTATGAAAATTAAATT---TAGAATTACTAGTAAATCCATTTT------ATGGATACTTAACATACATAGGTAACTTCCACGTAGGTTTAAT--ATTTCAAATATATACAGGTGTTA
>CG11848 20961379 20962431|21108 chr3R 20961704 20961852 scaffold_1 6793684 6793824 + 1812|0 151
TATTTGCCGCCAAAGAGTTAATATTATTTATTTATTATTAAATTGATTGCATTTATTCCCATTGATGCCCCCGAATAGTTATCTCTTTTTAGTTTAAAGTTAAGA---TAAGGCATGCAGTATATATTAAGATATATACTTATATGGGTATG
TATTTATAAACATAAGATTTATTTTATT-GTTTTTTATTTA-TTTATTGGATTTA---------ACGATCCAGAAATGTAACCTATGTATATGTCAAGAATAAAAGAATAAGGTAAGAAACAAAAACCAACAAACATATATATTTGAATATA
>CG11848 20961379 20962431|21109 chr3R 20961882 20963210 scaffold_75 97156 98458 - -1552|0 580
TTAATAAGCCTTCGACTGAAACAAA----TTATGTATATAATAACAATAAAGTGTATGTACAAAATGTAAGGGCTAACTGCCAACATAGGTTATGTATATATTTAAATTTGTATGTATGTATAAATTGAGACTTAAAATAAATACCGTTTCCTCATACTTATACTGCAAATACTTATAAATCTAATGCAATTTGATTTTTCCATTAAATGTGCACT-TATTTTGACTTTATGTATCAGAAAGAGTATCTCAATGCGGTATGTCAACAAATTGTTAATTTTAATCGATAATTACG-ATTTGAGTACGCTTGCAATCGTTTATTTATTGTGTAGGTTTCATATTTA-ATTTAAAACAATCCATTCATTTTAAAATACAGTTTTGTGACAAATAAACTTGAA--------TGAAAATTGTTTAATAATAAATAATGATATAGTTATAACATA-CAGCAAA-ACGGAAATTAATCAATACAAGTAGATGTAATCTAATAAATTATAGTTAATAGAAAATTTATTT--------------AAATATGTGTAAATCAAACATAAATACTAAAGGCTACTTACTTTCT
TTCATAAAATTTCGCCTAAGTGATAATTCTTATGTACTCAAGTTCCTTGGTGATGAGGAAAAATAAATAACATTTAAATACAAACAGAAATCAAA-ATGAATTTTATTTTTTGTGTATATTGCGGTCAACGCTTTCAACA--TAATACATCCTTAAGACGACATTTAAGATGTAAACATAACATAAACAATACGA-----CAGTTGACAATACACGATATTGTGA-TTTATGT--------------------GATGTATATGTTGCAACCGTTAAATGGTCTCACCATTTACGTACTAACTTACACAAACAGTTATCTAGTGTTCATATAAATGATAACTTGAGATGTATAAGAA---GTGCATTTAAAAATC--GTATTGAAGCATACGTAATTGAAAATCCTAACAAATACTGTTTAA----ATATAACAACATTTTTCCAATTGATCAACAAACAAGTGTATGAATTACTA-----AGAGATGCTTTACAAAAGCATA-TTAATATAAAGTTTAATTTTGAACTATACTGCAATTATGTGTTAATCAAAGAAAG----TGAAGACTACT------AT
>danr 20965215 20965625|21112 chr3R 20963737 20966000 scaffold_74 93788 95980 - 29724|1578 2015
ACACCCTACATTATAGCATAGTTGTAGTTGTAGTTCATAGTGTAAATACATCCATTTTTATTGT-TATTAGCCACCTTTAGT------ATTAATGAAACTCGAATCATTTCGCAATGCAAATGCCATTTGTACTTATCAATTAACGTATTAATATCACTGCAACAGGTATTAATAGCTCAGCAT-ACTA-TAGCTAGTATTAACTAGGAATATCAACTGT--GTGACTACTTGTTTGAAAGCCAAATTCAATTCATCTACACGTATTATAACAAATACTAATTGTGTTAAGTAGCTT-AATTAGTTGGCACATTTTGTCAGCCATTCCAATCGATTTGTTTT---ATTACTGT--------GTAATCTGCGTAACTCTCAAATAAGCAT----ATAAACTAATTACTAATGAAACGAATAAATATTTATTAACAAAAC
TCATTTTGGA----AATACCACTGTGGATA-AGTCTAAAGTACTTGTA---ATACTTCTATCGTCTTTTAGGTAAATCTAATCGTATAACTTATTAAATCCGGG-------GCAAGACAGTTACAATTTA----AATCATTGAATGTATCCA------AGCAATAATCATTATGAAATAATAACAACTACTTATTAATTTTAACATCGTAACACAACTATCGTTGACTGTGTAT---AAAACCAAATGCAATTTACATAA-------GTAAAAAGTTCTAGATGTATTTATTAGCTTAAATCTTTTGGCATATT-------CCAAATTAATATATTAAGTTTTAAATTTTTGTTGTAAAAAATAAATTATATGTATTTTTAAGTATCATCGAAATAAAATATTTATTACT--------TGAAAATTTATAAATAAATT
>dan 21017698 21018530|21165 chr3R 21014248 21018529 scaffold_74 164794 169184 - 96386|3737 4698
GAAAAGCCAAAGTTGGCGCCCACGGAGCCAGCCACGGATA---CAGAGATAGAGGATAGCCCAGACGGTGCTCTGCACGATGCAGA--------------GCCAGGACCCGGTGTCCTGGCTACAGATGC-AAATGCAGATACCGCCGAGGG---------------------CTCGACGAGGTGCCATGTCTATGCGCCGGCCGTCTACCGATCGTCGGCCACCCTACTCAGCTCCCTGTTCTTCCCTCCCTACGAATTTGTACATTGTGACCTCGACGATGACCCCGACGACTGCCAGATCACGGGCGAGTACCAGCAGTACGACGAACTGAGCTCCAGCAG----------------------TTAGACCACATGGTTCCACGCATCCGGAGGACTCCACTGAATTTATCT-CCTAGCTGTGAAACCTATCGAGCATACTTTCAGTATCTTTCAATTCAATTCGAATCCACTCCATTGCATTGCATTGCATTGTATTAATTAA---TTAATCGTACGGTTAACGTGTATATATCGAGA---------AACTCTATTTGTAGCTATTATGCATTTCTTTTTGAACGGAAAGACAACCGACTC----------------TGTTTTGTTAGTTTG------------TTTTTTCACCCAATGAT----GCATTCTAGAAAAATGTTATAGCCCTTAGTTTTTGTTACGAAAAAGAAAAAATACTTTTCGAACTGCAAGGTGTGTTGGC-GCGAATGGCATGCATTTGATATCAAACGTTTTTAAATTTCGTATATTAATAACT--------------ATGGAA--ATGTGCTCAAAAGAATTTTCTTAATTCGGAATTAATGCGATATTTAAATAAAA-ACATTTACAAATTTAAA---TGTAATTTTAAATACATGTTCAATAAAAAAT---AATTAGATAATTTTTATGAAACTCTTAGA
GACAAACCGAAGTTGGCACCTCTGGAGCCAGCCACGGATATTGTTGAAACTGCGAAGGAGCACAAGAATGAAATGATCGATATAGATACCAAAGGGCATGGCCCAGACTTGGGCTGGAAGCAATCGAAGCTAGACCCAAGCTGTGCCAGCGGTATTGAATCGCCATTGTCCCTCCTTACAAGATGCCAGCAGTTTTCCCCAGCTATTTACCAATCGTCAGCAACTCTGCTCAGCTCGCTGATGTTTCCGCCATACGAATTTGTACACTGTGACCTCGATAATGACCCAGATGACTGCCAAATAACGGGCGAGTACCAACAGCCCGATGAACTCAGTTCGAGTAGTGACGAAAATGTACAGAATGACTTAGAATAAATGATTTCTTCCA-------ATCTCTATTATATCAATGTATATGTATGTTCAAATTATAGAGTACACC-----GATCCTGAGCCAAAACTCACATTTATATTG-TGAATTTTACCATTTTTTATTAGATAAGAGTAAAATGTTTTGTTTACATTTACAATTTGTAATGTCTGTCTAAATCCCCTTTAATTTATAATAC----CTTAATGATAAGTAAGATAAACCATTTGTAAAAAAAAAATTAATATTTTTTCAATTGGAACACGTTTGATCTTTTTTATTTAATGTTTTTATCAAACTAGAAAATGTTTAATTCATTCAGCTTTTTAGTTGCATATCTTAAGCTAAT-----AAAAACATAATGTGGAGACAGTCAATCATGTGGATTTGATACTATTAGTTACTTTTATTATTATAACAAATACTCATGCAAATACTGAATGAAAATATGTGCTAATAAGAATTTTATCAATTTGAAATTCGTAAAATATTTAAATAAACTGAATTTATATATGTAGAAGTTTTAATTTTAAAACCTTGTTTAATAAAACATTCGAATTAGACAATTTTTATAAAATAATTTGA
>dan 21017698 21018530|21166 chr3R 21018530 21018748 scaffold_8 4709627 4709836 - -236|0 0
A
A
>CG31103 21046482 21046482|21200 chr3R 21046308 21046811 scaffold_47 22455 22967 - 14992|184 184
A
A
>CG11851 21049463 21049843|21203 chr3R 21047332 21049846 scaffold_3 5080388 5082866 + 104727|2202 2598
AGGCAGGCCCAGATAGAAAGAGTCTGGATTCATGCCACAAAAACTCCAATGCATATGGGGTGGCTCTCTTATTCTTTCAAAACAAAAAAAACGCATTAATCTTAAAGTAATGCCAAGCAAATATGCTTAAGAAACTATAGCTTCAATTCATA----TTGAATTTATAGTGATTTCCAAGTATCTTACACCCCTGAGAGCCTCTGTCT----GTATTCCAAATAATCTTT---CGTACCCAGCATTGAATTTGTAA--TATCCTAATATCTGTTCTAAGTCAGTGAAGCGTTTTTAATTCACGTTATTTTCGTTTTGTCCATGCCAAAGTTGTGAAGATCAC-CAGAATCGAAGTAGAACATAAG--CGTCAAGAATATAAACAACGAGATTCGTATG
AAGTGG----CATTAACACGAGGCC-AATCCATGGC-CATGCAATCCAAAGC---------------------------------------------AATTTTAAAAT--------GCAGCTGTAATTAAAAAAATCAACATTTAATTTATAAAACCCAAATTAGTATTGGT-------TGTGTTCCTTTCCTG-----TTTTGTATTTGAGCAAGTGAAAAAGTCTTTTAATATTACCTGATTTTAGTTTGTAAGTTCACCAACGAAATGT------TTAACAAAATTTGCCCATTATGCGTT-TTTCTATTTTAATCAAGCCAAAGCTGTAAACATTATGCTGAATCGAACTAGAGTTTAAGATCAACGAAAATAAAAGCAATGAGATTCTTAAG
>CG11852 21064425 21064617|21221 chr3R 21064470 21064507 scaffold_3 5098956 5098993 + 1419|0 37
TAAGTGTACGAGTATTTCCTCACCTATCCAAGCTATTC
TACGTGTACGAGTATTTTTCTTCACAAACATATTATTC
>CG11854 21068737 21068984|21227 chr3R 21068395 21068872 scaffold_3 1536749 1537195 + 2693|353 490
GACCTTAGTACAA--ACACCCTAATTAGTCCAAACACAAATCGTAAATATTTATTTGACTTTCAAAATACAAATGCAAAGCAAATAAGAAAAACTGGTAAGTTCCTCATACAAATAAAACGTAGTTGCAAAATAAATT
CTGTTGCCCACAATGAAACAGTGAGCAGT--AAACACAAAGTTTAAATAAACTATAGATTT----------AATCGTAGGTAGGTAGTAAAAAC-ATTAAACTACAAGTAGCAACAAAA-ATGAATGCAAAATAAATT
>CG11854 21068737 21068984|21228 chr3R 21068878 21070803 scaffold_3 5109757 5111763 + 15289|0 137
ACTAAAGG--ATTTCTTATTTCTAAAGTTTAAGTAAAATACAGATTTATAAAAGTGAA---------AAGCAAACACATTTGT-----AGTTTTGCCAAATAAATGTAAAC------------ACAGTTAAAC---TT
ATTAAATGTAATTACATTTTCTTCTTGTTTGGCTGGCA---AAAATTAAGAATGTTAATACGACTCTTAATAATTACAATTATGGATGAGTCGTTTAAAATCAAAATAAATTCTTAATGTATAACAATTATACAGTTT
>Nup358 21084282 21084457|21240 chr3R 21082680 21084319 scaffold_35 108298 109808 + 12068|1664 1706
GCAA----ACCGGATCTAAATATATGTAGCA-TGTCTAGGATT
TAAGCCCTACTAAGTTTAAACTTATTCATTGTTGTATAAGATT
>CG11857 21085759 21086492|21241 chr3R 21084628 21086713 scaffold_35 109955 111963 + 48788|1197 1979
CAATTAGCCGCACAGACGTCGGACACGCGGGCGACGGCAGCGGGATCGGGTGATCCTTCAAATGCCTCTTCTGCAGCTGCAGCGCCACCATCACCAACCAGCGACAGC---------------GCAGCGA---CCAAGGATGTGGGGTCGCCAACAGCATCGTCCATCAAACCACCGCAGATCATTGCCATTGAGGACTACTAGAGAAAGCTACCGAAAGCAGCCCGGAATGGGAACCAGCA-------GCATAACATCAACCAGAAACAA----------------GCTTATAATATGATTTTCCTTTTCGGTTTGTGTAGCATT--TTTCGTTTC---ACTGTTGAGTTGTCGTACGGCGTCTTGTGCAAAATACCTTGTTTATTGTTTAATCTAACTGCTTGTTTAAATTTATATTTATTTACAATGCTTTCTATCTATTGTAAATCCCAAACGATACCGAAATACTGCAGATCAGCTCTAATTTAGTTTTT-CATCCTAATCCTAACAATAATTTAATAACTCTTCTATCCAAAAAGTAGACTTACTGTATTTGAATCCAATTATTTTTGATTATCGTGCTAAGATGCTATAATAATATGTCTAAATATATATACAAACATATATATATATATATTTTGCATTATGATTATACAATTTTTGTTAGCGTTAACTATACAGAATGTTAAAAAAAGGCGAATTGAAAACTGAAACTATAGGAAGTGTACACTGGGTGCGTCTTATGAATAAAGAAAGACAAAAGAAAACCAAATA--ATTTA
CAATTAGCCGCACAGACGCCTGACACACAAACGACAACATCGGTAGCA------------------------GCAGGTGCAG---------CAACAACTTGCGACAGCTCGGCTTCAATGGTAGCAGCGGGTTCAACGGCTGCGGCGGCGTCAACGG---CTACTGCTAAACCACCGCAAATCATAGCAATTGAAGAATATTAGGAAGTTATATCAAAAACTAACT--AACAGTGTCCAACAAATTCATGTAAAATAGCATTTGCAATCAATTCAGGTTCGGCCATTGTATCCAATAGCATGCAAGTTT---GTTTGTGTAACATTGATTTAGTTTTTGATTTATTACGTTGTCGTGCGGCGTTTTGTGCAAAGCATTGTTTTTGTT------TTTAATTTCTTTATTAATTTTATATTTATTTAC-ATGCAATTTTTTTCGCTCCAACAACAAAAGTT--CAATATTCTAGCTAACAATTATATTTTAATTTCCGTATTGTAATACCTTAAACTATGTAA---------AATCCAAAAAGTAGATTTACTGAATCTAAA---AATTATTTTTATTTAC-----------------ATACCTTGGCTAGATATGTAT----------------------------TTTTCTTTATATA--TTTTGTTAGTGTTAACTATACA-AATATTA---------GAATATAAAA---GACCTAAAGAAGGTTTGAGCTGGGTGCATCGTATGAATTAAATAAAAAAAAATGAAACTAAAAACCATTGG
>CG11858 21088984 21089015|21243 chr3R 21088529 21091403 scaffold_15 1708528 1711400 + 142903|458 489
ACATTGATTTTATAAATCGAATTTTAATGTGA
---TTGATTTTATAAATCCTATTT-ATTGTGA
>CG11889 21097265 21098653|21255 chr3R 21097078 21097447 scaffold_3 1681566 1681949 - -749|205 399
GAAAATGCTCCACACAATAAATAAATGCTCCTTATCAGTATAAGTCA-ATTAATCAAATTATCACTGCTATCTA------CCTAGAAATTTAGCTTAAAAATA--GTTTCGTTATTTTTAGCAATTAAT---TGTTTAGAAATTTCTAGTAGTTCGCTGGCATCAAATGGATATGTATGTAATAAGCTCAATGAC
GCCGACAAATAAAATGAGATATTAATTCACATTGTGTGTGTAATTCACATTGGTGTAAATGCAAATACCAAATAAGCTTCTCTAAAAACTTTAAATACATATATCGTGACGGTGCATCAGTCGATCAATATGGGAATAGGAATATTAAATAGTT-------ACTCAATAAATCGCTATACACAAAACTATTTGAC
>CG11889 21097265 21098653|21256 chr3R 21097551 21097821 scaffold_3 1682801 1683109 - 5695|0 308
CGAGGTATAAAAGCGGA--ACCCCACCGATGAAAAATCCGCAGTGTT-GATCACCAGGAAATCAATAGAA-------------GCGCACAA--------------GTGGTGCCCGCTTGGCTCACTCGCGACTATGTGGAGCAGAAGCTGCGTTCCTACTTTAGAAATGACTCCCTCCGCCTGGTGAACCTGGACATCAAGCTGGCCCTTGGCAACGGGGAGAACTACTCAAGCGTGATAACTCGCATCTATGTGGAGTATACG---ACGGATAAATCAAAGGATAAA-----CAATCCACCAGATTCC
CGCTGTATAAAAGTAGATGAGCTCCGCGAAGACAGCTCAGAAGTGTTTGACGGCTGTGGATGCGATCTAACAATTATGCCAGAGCAAACAATTCACGAGTTCCTTGCGGCGCCCAATTGGCTCACGCGGGATTACGTCCAGCAGAAGTTGCGCGAATATCTGAAAGATGGCAAACTGCAGCTGCAACGACTTTACATAAAGCCCGCCACGAGCAATGGGGAGAACTATGCCAGCGTGATGACGCGCATCAATGTGGAGTATATGGACAAGAATCTATTAAAGCACGAGGATACCTATTTAATAAAAACC
>CG11889 21097265 21098653|21257 chr3R 21097822 21098268 scaffold_41 615859 616327 + 2112|0 486
ACCAGATTTGCCGACGCAGGTCCGGCGGCGCAGGTTCTCCTGAGCTACGGAGTGTA----CAACAGGGAATTGGATCTGTATGAGCGCATCCTGCCCCAGATGGCGGAAGTGGTGCGAAATGAGCTGGCAGATTCCCGGAAACTATTTGCAGGCACTGTTT--------ATGTTGATCGGAAACGGGACTCGATCATCTTCGAGGATATGTCCCTGGAGAATTACAGAGTGGCCGATCGGCTCAAGAAACTGGATCTGGAGCACACTCATCTGGTACTCGAGAAGCTGGCCAATTTCCATGCTGCCGGAGCAGCCTTGGCTGAGCGCCAGCCTGGAATCTTTGCGAAGAATTTCGATCGTGGATTCTTTAACCAGCATAC--CCGCGGCTACGAGCC-CATC--------ATGAAGAATCTTTTGATGGCTTTGTCC--------------CGATCCCTGGAGCTG---GAGCCGGATCTGTGTCAG
ACCATGCTCACTGATGC-----CGCGGGCATAGGTTATATCAACACGCTCAATATATTTCCGAAGGAGAAACAAAT--GTATGAGCTGATTATACCACAGCTGGAGCAGCTTTATCAGGAGCAG--GGCAGATCTGTTAAATTTTCACCCAAGTGCCACTGGGCGGAGAATGTGAATGG---ACGCATCTCGCTGGTGCTAGAGGATCTGAAGACCAAAAAGTTTAGCAATATCAATCGGCTCAAGGGTTTCAATATGAAACAAATGCAACGAGTGCTCGAGAAACTGGCCGAGTTCCATGCAGCCAGCGCGGTCTGGCATCAGCGTAA---TGGTGCCTATCCGGAGGATTTTCAGCGT--ATCTATCTGCCTGCCAACTATCACAGATCCAAGTCGTATCAGGCGCGAATACAGAGCTATAAGACGGCCATGGCCACATGGGGCTTTAGCAATCCCGAGCTCTACACGAGTAGAAT-TGTAAGTA
>CG11889 21097265 21098653|21258 chr3R 21098269 21098927 scaffold_27 376986 377585 + 86|0 388
CGTTACCAGGCAAAGATCGATCGACTGGTGGAGAACGTAATGGAGTACGGAG----AACGATCGACGACCATTGTTCCCGGTGACTTTTTGACCCTGGCTCACGGGGATCTCTGGACCACCAATATTATGTTCCAATACGACGACAAAGGACATCCCATAAATGCCATCTTTATCGACTTTCAGTTCAGTGCTTGGAACTCGCCGGCCATCGATCTACACTACTTCTTTTCAACGGCCTTGCAGGCTGATATTCGACTGAAGAAACAGCCAGAGCTGGTCCAGTTCTACTATTACAAACTGAATGCTGCCTTGAAGAAAGTCCAGTATTCCGGAAATGTTCCGAGCCTATTCGTCTTCCATCAGCAGTTCAGGAACAGATCCTTCTATG
CATTTACAGACCAAGATCC---------TGGAGAACATGTTCCATTGGGAAGCCAAGGCAGGCATCTACGATGATACCCAAT--TTAATTG--CCTCAATCATGGCGATTGCTGGACAAATAATGTGATGTTTAAGTATGATGCACAGGGCGAAATTGTGGACACGCTCTTTGTGGACTTTCAGCGGTCGACCTTTAATTCGCCCGCCCTGGATTTGTATTACTTTCTATTGTCGTCGCCCAGTTTTGATATAAAACTCGAGAAATTCGACTACTTTGTGCGCTACTATCATACGGAATTGCAGCGCAATTTGGAACTCTTAAAGTATCCCCGACACATACCCAGCCTCAAGGAGCTGCAC--ACCATTCTGCTAAAGAATCCCCTGTG
>CG11889 21098711 21098989|21258 chr3R 21098269 21098927 scaffold_27 376986 377585 + 86|446 678
CTGCCT--TCGCATCACTGAT-----CTTTGAACCAACGATGACGTACACGGGCAAGGAAGAGGCATCAATGGATCAGATAATATCCCTTTCGGAGAAGGGAATGCGCTTTAAGGATGACGCATTTC--AGGCGGAGGAGACCAGGAAAAAGATGCGTCTCACTTTGCCCTTTCTTGATCATTTGGGTTTACTAGACGTGATGTAAAG---CGAAAATAGTAATATTA----T
CTGCTCGATCCCACCGCCAATGCGAGCATTGACACCATGTTGGC---------CAACGATGAGG---------------------------------AGGGAAAACAGTTTAAGAA-GAAGCTCTTCCAAAACGACAGGTATCGCCAACATGCTGAGGCCCTATAT-CCCTGGCTAAATCACAGAGGACTCCTGGATTTAGAGTAAGTTTCTGTAAATGTTACTGTTACAACT
>CG11889 21098711 21098989|21259 chr3R 21098928 21099423 scaffold_41 283946 284489 - -1375|0 62
TATCGTAATTATAGATTTTATATTTGCTTATAAAATATA-ATAAATACAAAATAATTTCGATT
TAATGCAGCTAAAAATATTATAGAA----ATTAAATATGTATAAATATCAAGCGATCTTGAGC
>CG11892 21108815 21108964|21270 chr3R 21107900 21108937 scaffold_27 378946 380056 + -1210|993 1132
GAAATCTTTACAATATAACTGTGTTATGTAGTA---TTAGCTAGCCAAAATGTATCCAAAGAAAAT-------TATATATTAAGTTAAGATATTTT---AGTAAAGTAATAT----AAAGCACATTCTATATACCACTTG
ACAGTCTAAAGGAAGTAAC-ATATAATTTATTGACTTTGGCTCG--AACATGCGTATATATATAATCTGAGTCTAACAACTAGGTTTATATATCATAAAAATAAAAAAAGGTTGTAAATGTATAACTAACATATCACTTG
>CG11892 21108815 21108964|21271 chr3R 21108938 21109221 scaffold_3 4785654 4785984 + -1121|0 26
TAATAAAACTAACCGTAATCATATCAA
TAGTCAAATT--TCGTAAATATAGAGA
>CG31300 21110813 21110956|21272 chr3R 21109276 21112741 scaffold_41 284490 287955 - 56912|1576 1734
CTCTCATTTATTTAC-ATAAATATGTTGCCCTTATTTTGTTTATTCCATTATTTTGTTTTCCGGTTGAAATACATATGTACAT----------AAGTACTTACGAAAGGAACATTTCTTC----CAATAAAAGATTATTACTGAAACATGAAACGGAAA
-----ATGGATTTGCTATAAATGTGCAATAAAAACTTGTTTCGCATCATTATTGTGTAGAATGTCGACAAACTTTATTTACTTCCTCTAGGTCAGGTACTTGAAATCTAAGTATCTTATCTAATCAATAAAAGGTTG-----GAACCAATTAGCTAATA
>CG11902 21165634 21165812|21333 chr3R 21160747 21165834 scaffold_41 335314 340589 - 118065|5181 5385
AATAGGCAACAAAAGTACTACCTATTCTGTTCAGTTCAGTTTTCGT-----CAGCGGTAAAATAAGACAGCACGGTATTAAT----ATATACATTTTACTTTTCATTGGATTTTTACCCCATATTATACCTTTATTT---TGTTAAT-----GTAAAGATAAAAATAAAATTACAAGGG---------TTACAAATAAACGATAA
GTTAATAGATTAACGTTCAA--------GGCAATTAAAAATTTCGCATTGACAATCATTAAATAATA-AACATTTTGTCCATTTGGGTCAACATTTTGGATTTCCTT---TTTTTGCAACATTTTTTTAATTTGCTTGAATGTCAATTGATGGTAGGGATCCGTACGCATTCAAAAAGATATAACATTTTACAATCAGACATTAT
>rha 21170439 21170566|21337 chr3R 21168972 21170522 scaffold_41 347975 349367 - 3239|1514 1605
AGA---TACGATCCATTCGATTTTACCAAATTAACTGTGTGAACATTGTTATAATTATTTAACTTTA-----TTAAGTTTGTTCGTCTTCTG
ATGCATTAGCACCGATTTCATTTGACGAAATTATCTGTG-------ATTTATGATTATTTAATTTTAAGATTGTAGGTTAATTTCTATTTTG
>rha 21170439 21170566|21338 chr3R 21170523 21172899 scaffold_41 349806 352127 - 89341|0 47
TTTTTTTTTTAAATATACACGCTAGGAAGTTTAGATATATA----AAA
TTTTTTGTTTAATTCTTTATGAAGATGTGTTTTAATTAATATTAAGAA
>CG5127 21301337 21301479|21493 chr3R 21299237 21301407 scaffold_27 465466 467688 + 81600|2198 2268
CCATGAAGTAACTAAGAATCTGTGTATCAAATGTTTTATATATTTTTATACAAAACAATGATGACAAAGCT
GTATACATCAATCAAA---------ATTGACAAGTTTATATTTTTGTA-ATAAAACGTTAATTTTAAAATT
>CG5127 21301337 21301479|21494 chr3R 21301429 21303499 scaffold_27 467953 470096 + 62750|0 50
TTTACAATTTAAACAATGCTCTTTTCGAATAAATATTACCTAAAAGTGGCA
TTTGTATTTCAGTTAACGAACTTTTATATATAACGGTGCTTAGATTTATTT
>MED28 21303394 21303467|21494 chr3R 21301429 21303499 scaffold_27 467953 470096 + 62750|2029 2172
A-----------------ACAGGAATGCATTCCTTTTA--GCTTGTAAT----------CTTGTATAGACCTGGATTAGTTA------------------------------AATAAACC-----------GATTTGATTATAT
TTATCTATTATAGCATGTAAAATAAAGCATAAGTTGTACAACTTTTAATAAACGAAACCCTTATATATAAGCAAGGAAGTTGTCTTTTGACTACACTGCGTTCATCGCATGTAATAAATCTATATGTTGAAGATTTGCAGTTAT
>CG5116 21311036 21311578|21498 chr3R 21308853 21311756 scaffold_17 804387 807343 + 85962|2256 2888
ATTTAAAGTGCCA-----------------------TGGATAAATATCT----GAGGCGCAACTGGCACCGACTAAATGTTTATTATTGCTCTCGTTTTTTTTGTTGGTTTATTAGCGGGTGTAGTTAGGACTGGTTTTCTTTTCTTGTTTTAAAT-TCTATACAAATATAAAAGTATCTGCCGAAAACTAAAACG-----AAACAATCTCTAAAAATATTT----TTTAACATAATATT----TGTATTGTATTGCACTTCTCTGAC----------ATTTTTGTGCT-----GTGGTTTTCTCTAGGAATA-------------ATCGAAACTAAACC---CTTGTGGGATCAGTTTTCGCATCAACCATTTTTGTTTATATAACTAGGGCAAGTTTTTTTT-ATTTATTTTTCTTTGTGTGGTGCTGACTTC-TCTATTGGCACAATGGAATATTTAAAAAT---AATGCAGGGTTGATG--AGCATAAACAACTTAAAATA--CAGAAACTGAAACAAACTTAACACCAGCTTAAACCTAAAGTAACTTAAAATTAAACAAAAATGCGTTCAACACTCTAGTGTACAAATTAAAAACCCATTTATGCGTGTGA---------AAATTGA
ATTTTAAAAGTCAGTTTGAGTTTTTTTTTATTTGTTTTTGTTAATCTTTCGCAAGGGCGCAACTGGCACCAATTTAATATATTTTATTTTTGCTGTTAATATAGTGTATAAATTAGT-----------ATATTGGTGTTCGGTTTCTCTAGTATACATATAAATGTATATAAATTTAGCTACAAAAAACTTATATACCATTAAATATGTTTAAAAAATATTTAAGCATAAACAAAATATTGCACTATTTGTTGCTAGACTTGTGTGCTTCAGTTTTTGATTTTTGTTCTTACAAGAAAATTCCTCTGCATATAGCATTATAAAAATATTGAGAATATATCAAACTTGAGGG-TCTCTACTTACTAGAATTA-ATTTGCTAATGAAAATA---TAAGTGCTTTTTAATTGGCACTTCTAAGCTTGTCGCTAATTACTTTTAGTAATTAAATG---TACTTAAAACCGTAAACGTGACGTTGGCTGCAGCTTGATGAAGTTTAGATACTCTGGAATTAGGGAAAATCTTACAACACCTATAAAAAAAAGTATATTCTGATT---------TCCCTGTTTCGGGCAATTGTTACAATTGAA--------TATGAGCTTGACCTGCTATGAGAGTGA
>CG5112 21318852 21318985|21502 chr3R 21317275 21318992 scaffold_17 812676 814371 + 81395|1580 1715
ATGGTTTATGATGTATGATCGATCAACTTATTGTTAGAGAACATAGGGTGTGGGTAACGCTGAAGACTGTCGCTTTTATTTATTACTTTTATTACAGGATATAAATAAATTGGCTATCTTT--TTTAACTGCTTGA
AAGGTTGTTGGT------TGTATTAACAAATACTCATACA------GGTGTTGGTAATCCCTAAGGCTGT----------------TTTCCGAACAAAATATTATTAAACGAAATGCTTTGAATTTAATTTTTGAA
>CG5111 21333931 21334001|21516 chr3R 21332071 21334190 scaffold_17 826045 828200 + 47664|1923 1993
TAAGAAAAAAATAAGATTTTTTTTAAATATTTGTAAATCAAAAAACAGGCAATAAATAAGTACGTACAAAT
-------AACATTAGAGTCTTCGTAAGCATGTTTTGGTAAAACAACAGA----------------------
>msi 21426470 21428143|21638 chr3R 21426272 21428920 scaffold_1139 13 3143 + 15730|201 2183
GACGCG------------------------------------------AGTTTTGTTTG----------GTAATTTGAATGAAACACTCTCAC-----CATGCATACACCATTCACAACCACCCCCCATACACCCACAACCACTACCACATGTGAACAGCAGCCCC---CCACATCCATTAATATTCATAGAACCACACACAAACACTCATACGAAGTTGGTTTTCCTTTGAGTTTGGCTAAGTTAGTAGTCCGATACACGGAAG---------------GCAAATTAAGTATTATATTTAAGGCGC--------CCTCGAGCGAGTTCGATAA--ATACTAACTAATAT--------ATATATATATAACAAA------TCATAAGCAATATAAGCGAGAAAAAAGAACAAAAACGGAAGCAAAGCAAAGCGAAGGAAAAACAAAATTTAAAACCAAAAAGCAAAAATTACGGAGCGTTAGAGAAGCAAAAGAAGAAAGGAAAACACATTAAAAAACCACCGATTGTGATTGCGTTTAAATGTAGCCGTTAATATATAATTTTTAGTGCATAAAAGAAAACCATTAAATCTAAATTAAAATAAACCCAAATAAAAACTAAACGTATATATAAATATACATACATATTTATAAAATGCAAGAGCAAGGAATGAATCATATAAGTT-----------AACTCACGCTCGTATAACCAAG------AATGGCGCTCACTAATTAAAAAGTTCGAAAAATTGTTCTT--------TTTTTTGGAGCCCTAAACTCAGCTGAAATGAATG-------AGAAACTCCTGCAAGGGCAGTATTAATTAATTGAATGA-----AACAGCGAAGAAAAACGTTTTGCTCAAGACAAAGAACTATTCATTATTTTTTTAATCAGCGATGAAAC---CCTATATTAGACTAT------TATTTTAGATGTTTAGTT----GAGTTCGAATTTAATTCACCCAGCATAGAAT----ACAACAACAGAGTTAACCAATCACTAACGAACATCAC-----------CAACTCACCAACACGAAA-----ACTCCAATATCCTCCTACCTTCTATCTACCCAAATCTGTTATTGTACTTAATTATATAACAATTACAAATACCACAACGAACAAACCAAAATAACGTTGTCTTTT---ATGTGTGC-----------GACTCTTT---TTTGATTTAGTTCT-ATAACTAGTTTATTCTGCACTCAATCTCAAACATTTGTAGC-AAGTAACTAAATAACCATTTGTTGAACATTTTGGCATTTGCATATTCTTATTATACTTTCGAGTGACGACAAGTTCTCAAG------GCTA---CCGGCTTCATTTATAGATCCTAAGATATTCAACCGAGAACGAGTCCTTAGGGCACTACTAATATTTTAGATC---CTTCGACCTATTTCCCAATCACCAAGTCTTTCA----------------------TTTGCATAACCATCCAAACAGCTCATGAACCAGGTAACATAACTTTACTGTAGC--TTATTGTTTTAAATGGCACAA---------------------TCTTAGTTATTAATATTATTTTGTAATTACCCTTATCTGTAGCATTTGCATTTGA-TTTTGCATTCG---GCAAATACTTCAC--------------------------CCATTGAAAC--------CAAGAAAATTATCGAATTAAGAAGAAACCCGGGGCAGATGCTCCTGGATAGT-TATG-----TATTTGTCTCATTTGAATCGCTTGCATGCTTGAAGTTTAATTTTAGTTA----------CTAGTTATCATTTGGAAAGTAATATTTTGCGTATGTAAATATCTAGTTTATATACAT----------TACACACCCACACAAACCACACATTATATGGAAAACAATGAAACATTTGAAGTAATTTTTGTGTTTAATAAAAAC
GCAGTGCACTGTATCCCACTCTTTCCCCCTTACCCCCCGACACTATCTAATTCTGTTTTATCCCTCTTTGTAATTTGCATACAATTTACACACAAACACACACATACTCTCTTCACACACACTTACACAAATCTCATCAC-ACCACAAAATTTGGTTTACCTTTTTGGTTTAACTTAGTTCTTAGTGCCACAAACACACACACACACACACACACACACAGATATACTCCTA-------TACACACACACTCCTATACACACACACACACATAATTCACAGCATATTAAGTATTATATTTAAGGCTCTAGCCACGCCCCTAACGCGCTCTATAATAATAATAATAAACATGATAAGCAATATAACAACAACAAGAGCAGCCCGCGAGGCACAGCTGCGATTAAGCAGAACAAATAAAAAAACAAG---AAGTTTATAAAAAAAATAATGAAAAAAATTAAACCAAAAACTACGAA-------AAAAACACAAAAAAAAAAAAAAACAATTTAAAAAACCACCGATTGTGATTGCGTTTATTTGTAGCAGTT--TATATAATTTGTAGTGCATAAAA--------------CTAAATATAACTAAAAC---GTAAAAAAAGAAAATATATTCTATAACAAAAACATATTTATAAAA-------GTATCAACTAAATTATATATATATATATAAAAAAAAGAAAAGCTCACTGAACAAAGCAAAGGAAAAGCGAGTAAAGAAAAAAAAACTAAGAACATTTTGCTCAAGCATCGTATTATAAAATATTAAAC--AACAAAATTATATATATATATATATATAATTGTATAATAAATATCAAACATTTAAATAACTATAAACATTTAAAACGAAAATCAAACTGAAAGGAAGCAAAAAAGCAAAAT------GAGGAAAGAAGAAATTAACATACATTAAAATACACAACATAATTTAGCTATTTAGTTTTTTGAGCTCGAATTTAATTCACCCAGCATAGTAGTTAGACAGAGACAGAGACAAGAGAACCTAACAAAACATCACACACACTAAAACCACACACACACATGCAGTACACACACACACACACACACACATTTTTGCCACCC---TCTACTTCTGTACATCATAATAAAATCGTTAAAAAAAACTGCATTTTTCCTCCTCAACCTTGTTGTACTGTGTAATACAAGCCAGAGACCACAGACTCTATATACTCTATATAACCCTCACATTTACTATAT----CATTCATTCTCTTA---TTATATCTACATGCCCCAAAAATTAAATTTAGATCGGTTTGTTCTCCCCATATA---AATGTATTTAAGACTCAACA-AAATGCTCAAGCAGCGTACTAAGCCTGGAAAAAGCTATCATTATTTCAGACTTTGCTCGAATCCAGTTTCTCAACATTTTACTAAACTCTTACATTTGACTTTATTTTATTTTTTTATTTGTAATTGCTTTAACTTAATATTATTTTTAAAATTTTTTTCTACTCATGCGCATTACTTAATGAATAGTTTA---AAATTTAAACAAGTAGTTATTGGATTAATGAAAACAAAAACAAAAATAAAAACCCCTCTCTTAGTTAT-------AGTTTGTAATTGT--TTAGTTGTAGCATTTGCATTTGAGTTTTGCATTAAAGAGAAAATACATTACACTACACTACACTAAACTACATTATGCCACACAAACACTTCATATAAAATAGTTAT-AAACAAAAACAAAAAACAGGCAGCGTGCCGTTGTGTACTCTATAAACAATAATTAATACATTTGATTCGCTTGCATGTTTCAACTTTAGTTTTAATTAATTAATTTACTTAGTTATCATTTG-AAAGTAATTATTTGCGTATGTA--TATATAGTTTATATGTATGTGTACACCACACACACACACACACACCCAACATAAT-TATAAAACA-TAAACATTTTGAAGTAATTTTTGTGTTTAATAAAACT
>CG5079 21440035 21440040|21644 chr3R 21439484 21440192 scaffold_17 972745 973449 + 11704|576 581
GAGTAG
GAAAGG
>CG5071 21445795 21446386|21650 chr3R 21445445 21447191 scaffold_17 984759 986586 + 14079|421 1078
TCGAGGTGCGATCTGATGCTGCTCCCCGGATGGCGGACAACTTTGGGGCGCTGGTGCGGCACGAGCGGGGCTATGGCTATCGTGGCTGCACTGTCTTTCAGGCCTGGGGAGGCGAGAGCATCATCACCGGCGACTTTGAATCGCAGAACGGACGCGGTGGGCACTCGGCCTTTGAGAGCAGATACTTTTTGCCAGACGAAACGGGATTGCCGGCACATCGGGGAACGGTTGGTATGCGCAGGGGACAGCGGCGACAGGACAGAAGTGGATTTGTGGGCAGCCAATTTCGGCTGGTGCTAAACGAGATGCGATCCTTCACCGCCATTTTCGGATTCATTGTCCAGGGCATTGAGCTGGTGGACCGAATTGCGGCCAGTGGCAATGCTCTAGGACGCCCGGCCCTTAGGAGCATTATCCGGAATTGTGGGGAATATC-----------ATTTAA--------------------------ACCAATAATAAGTCCGACTGATCCATTAGCTAATCCT-----ACTTATCGAACAGTATCAAACCGAAAGCTCCTAAACACTT----------TGAATGTACAACACCACCCAA-----------TATCTATTTTATTCTTGGAATGCAAATCTTGGTATAAAT---TTTGTAAAAATAAA
TCGAGGTGCGCAACGACGTAGCACCGCGCATGGCAGAGAATTTTCGCGCACTGATCCTGCACGAGCGTGGCTTTGGCTATAGAGGCTGCTCCGTATTTCAGGCCTGCGGCGATGAGAGTATTATCACTGGCGACTTTGAGCTACAGAATGGACGTGGCGGTTATGCAGCCATCGATGGTGGTTTCTTTATACCGGATAACACTGGGTTGCCGCCAAAACGCGGCGCAGTCGGCATGCGACGTGGCCAGAAGCGTTGCGATAATAGTGGATCTGTGGGCAGCCAATTTCGCATGGTGCTTTATAAGAGGCTCCCTTTTTCGGCCATATTTGGCTTCATTGTGGATGGGATCGATGTGCTGGACAAGATAGCAAGTACGGCCAGTGCAACTGGACGGCCCGCGATGTGCACCTTTATCAAGAATTGTGGCGAGTATCGCCACAACAGAATCTAAATGTTTGCTAGTGACAGCCCCTCCCCACCCCTAGAAACTCTGCTTAATCGTTTAGAAAATTATTGACAACTCAACGAGT--TCTCAGCCC---AGCTCAAAGAAACCTATTACAAAACGATATATAAAACATAACCAAAGCGACAAAGTCCAGCGAATATATATTTAAAAG--AAATCTATATATATGTGTATGTGTGTAAACGTA
>CG17383 21475770 21475972|21686 chr3R 21474317 21475771 scaffold_17 1016291 1017743 + 15917|1564 1565
AT
AT
>CG17383 21475770 21475972|21687 chr3R 21475912 21476077 scaffold_13 159868 160035 + 1106|0 60
GCAGTAACCGGGGTGGAAGATCCAAGCATTTCATTTATTAACATAATGGAAAAATACACTT
GCAGCAGCGGATGCCAGTGAAGAAATCATCTACAGGATTGATATACCGGCCAATCGCTATG
>CG5053 21490378 21491366|21700 chr3R 21488760 21491646 scaffold_17 1031544 1034716 + 76894|1755 2955
G--------TCACACATACCCA--GAACTATTTTTCTAAACGTATTTCTCCTCCAACAAAATAATGTTTTTGGGAACA----------AATTGATCAACATATCTTGAATGCATAATGGAGTTGAAACGAAATGGATTCCTTATGAATATCACAATTTTAAACAATATTCTAAAAATATTTACAATAATTAACGTGCTTGATTGTTGTTTTAGTATGTTTACATTCCAATCACACTCTATGGATCTCTCAATGCAATGATATATGTTACAAATTTGAAAT--------CACAAT-----CGTTTTATTACTCTACATTCCGCACTGTACTTTGTATTTAATAGTAGTTAATGAGTCCCATATTC-------------------------ACATGCCC-------------TAATCTT----------AATTTTGTGTGCTAT-ACTTTTGGTT--------------------------------------AATTTTTGCTGCTAGTCTACGTGTTAACAAAAACCCTTTCCAATC-TCTACAATTCGCCATTAGTTGTTAACTTGACAATGAATTTTAATTGTTGCAATAATTCGAGAGTATCGTAATTTAAAAACGCCTTTCTA-----ACGAATAAGTAGTGCCCTTAGTGATTTGTCTCCTACAGAATTATT-CATTGTAGA---ATTCACAATTCGAATTACACAAAACTTATTGTACTTAGCAATTAGCGCAGCTTT---AAAAAAACAAATTAGCAA-TGCTTTGTTGAAAA---GTTTAACTTTTAAAGTGCTTAGCCTTAGCCACCGGATATCGAAACAAAAGACCGAAGCATTAACAATTGCAAAGGTATCAAGCATTAGTAC---ATACATAATTGCTAGCGTACAATTAAAAGACAACCCACAAGTCGCTTTGATGTATTATGTTTTTAATTAGCAATATTTAATATTTACACAAACTGATGATGATAGT---------------GAACTACAAAACACCAACGGAAATGCAA----TTTATCGAATATTA------------TATATTACTATTACATTTAAACTAAAAACGA-----TTTAGAACAAATTGTAATTGCATTACATCTAATTAGCTAATA---AATACATTT-TTATGATTTT-------------------CTCG-------------AAACGAACT
AACCGCGCCTCATTTAAAAGCAACGAAATATTTTTCTATACTCA------------------AGTAACTTGGGGAACAAAAGATGAGGAAATGATTTACATATCTTGAATACGTA---------GAGCGCCA---ATCTCT-----ATATCACAATATTTGCAAAGAC-----ACAAATTTACAACGATATAATCAATGCATATTTCTTC-------TTCAGATAAACAAAAAACCTAATGGATCTCTTCAAGCAATGTTAATTGTTACAAATTTTAGACACAACCCACACAATATTAACTTATTAGTGCACAACATTTTTTCATAGATTTTA---ATAATGTTCATTAACTAGTTGCAAATTTTTTAAGAAATTTCTCAAAAACAATAACATTCCCACAAATATGTTTATAATTTGTATGTACTTAAATCTTTTGTGCTATAACTATTGATTTTTAACTTAAACTTTTAAATATGCCTAATTATTATAACATATTTTGTTGCTAGTCTAT---------AAAATGTATTTCAATCATTCACCGTGCGCCATTAG---------------AAAACGTAAATTGTTGCAATAATTGTATCTAAACGAAAATGTAAAACGCCTTTTTAATGTTACATTTAAGTTGTGCTGTTAGTGATT-------TATAAACCCATTCCATTCTAAATAGATTTATAATTATAATTAAATA--------TGTACTTAGCTCTT---GCAGCTTTAGCAAAAGAACAAATTAGCAATTGCTTTGTTGTTAACGGTTTCCGCTAGGAAAGTGTTTA-------------GAAAACGCTTCACAATAGTCGAAAATTGCAAATTGT----GTTAAAAAAAATAGTACTTAATGCATATTTTGTAGCTTTTATT-------------GCAAAATGCATT--TCTAATTTTTTTATTATTAGTAATATTTAGTAATTACGCAAACGTTTTAGCAAAGCATTTTTTTTTGCTTAGGGCTATGTCACAGCAATATACATACTATATGTTTATAAAATATAATATATACTTAAGTATATAACTATTAA--TTAAACAAAAGACACAAATTTTTAGAACAAATTCAAATCGCATTAACT---ATTAGCCAATAAATAATACATTTCTTATGATTTTATTAGTTGCTCTTTTACAACTCGCAAAGCAAAAAGTAAATGAAGT
>Lgr3 21502753 21502938|21714 chr3R 21499655 21502977 scaffold_17 1045875 1049418 + 69409|3582 3782
GTCCTAACGCTGTCGAACTGAAGGATTCTTGTGGCGCAGATCGAACTTGTATA---------------CCACCAGATTTAGCAGCATTTATTTTGTCTATGATATCGAAAATCTATATATGTATGTGAATATCTATCCCTGTCCGTGTAAGATAACCAAATGAAAGTGTGAAATAAATTGAATGTGATATTTGTAAGGCAA
GCATTGACGCTAAGCCACTGAA-----------TTGCTGGTCAACCTTACAAATTTTTTTCGTACTCTTCATTATGTCTAAATACTTTAACCATATATATGATAT-ATATGTATCTATATGTGTCTATATGTGCATCCAAGTCATTGTTAACCAATCCAACAAAAGCGTGAAATACATTTAATGTGATATTTGTAAAATAA
>CG5039 21504963 21505182|21716 chr3R 21504394 21506314 scaffold_17 1051212 1053234 + 46722|625 955
TGAATCT-----------------------------------------------------------CAAAAGTC-------------------TTCCATACAC--------TTTATTGTCCACGTTGTCTTCAAACGGTGGTTGTCATC---------GGTTTAGTTACTAC------TGCAAAC----------TACGTGCCTCTACTACAAGTACAACGAAAATAACCCTAATTTTAATGATCCGTACTGGTGGCGCCAAGGATTCGCGTCGTCAGGTCGTAGAAGCCAAAGAAGAATGCACCGCCCAGTGTGATCCACAGCACACGCG
CGTACCTAGCAGAGGGAGTTCCCACATTGCTTTAACAAAGGACAATCGCTTACAAATTAAGGAAAACAAAAGACTATTTACTGGCTTATATTGTTGTATACACACTTTCGTTTTATTGTCTACGTTATCTTT-TGCTGTTAATGTCAGCTCAAAGTGAAGCGTAACTAATACGCCTTGTCTAAACGTGCTAGACATTTGTACATTCGTTAAAAATATGTGCCTATTATTTTCACTGTTAATCAACGGTATTAGTTGCGTCTAATAGACGCGTTGTTAGATCATAAAAACCAAAGAAAAATGCACCGCCCAGTGTTATCCAGAGCACGCGTG
>CG5028 21508811 21508886|21717 chr3R 21506654 21509511 scaffold_17 1053786 1056733 + 88780|2366 2442
GCACTATCGCACTACCGAATTCAACCAACTGCTAACAAATTCAGCAAGATAAACCAAATCG-AACCAAGTCTAATAC
GCAC-----CCTTTCCGCATACGA------------AAAGTCA--AAGCCATACTAAACCGCAAACAATTTAAAAAG
>And 21638813 21638924|21878 chr3R 21638201 21639384 scaffold_17 1714750 1715815 - 18388|615 737
TACAGCTACTTTAAATGAAATAAAAATATTTGGGGT-----------CACTGCATAAAAAAAATCGTGTATTTCTCTTCAAAAAATACAATTTACACTTCTCTGCGGTCTAACTATTTTCGAA
CATGTTTCATT--------ATTAATATTTTTCCAATTCTCAATTACACACTAGTTCAAATTAAAGCTGTAACCAACTGAAAATATTGTAAAG--------TTTGTGGCC------TCTTTGAT
>CG5886 21679467 21679727|21926 chr3R 21678500 21679639 scaffold_15 2199354 2200546 + 38340|1045 1227
ACTACT-GACTGTTCGCCTATAGTCCCATCTCCAAATCTCGGGCGGCCACCAAGCCTTCCCTGCAAA-----GCATTTTGTGTCATCCATGTCTCAACTGAAAAAC--GTCATCAATTACAAACCTAC--ATGGTCCGAATTTTGTACTAGTTATTTATTGTACTTTGTATATTGTATTTATT
AGTCCTCGACTGTT--TTTGTGCTTTTA-CTTGAAAT----GAATGCCTCC------TTCCTATATATGTGTGCATTTTGTCATATTCATTTTTAAAATATATAACAAGCTAACAATTGTAAAACTATCAGTTATCCAGCT----AAATAATTATTTATTCTATTTTATAAATTCTATTTATT
>CG5886 21679467 21679727|21927 chr3R 21679695 21680214 scaffold_15 2201333 2201817 + 7874|0 32
GTGTTTCCTGCAAACAGAATAAGAATATTAAAA
GTAATTTCTTCTAATAATAATCGAAAGTTAAAA
>CG17370 21713089 21713286|21963 chr3R 21712547 21713970 scaffold_15 2237690 2239212 + 38038|551 768
GTGTACTCTATCTAAAAGC------------------AAAGAAAAACAAAAAACCAACAGCATACAATGTGAA--GAACACACACACATAAGATCTAATACTAACGTTTGTCTCTTAAATAACGTATTGAGTATGTATTTTTTAACTCAACTTAACTAAGTTTCGTTTTAAGTTAGGTGATCCTCGTTTTCATAGTGAAATAAAAGCAAAAACCGAGT
GTGTACTCTATCTTAAATCAGAATTAATGAAAAACTTAAAAAAAAAAAGAAAAACAACAACA-ACAACAAAAACGAGAAAAACAAACAGAAAACAGAATATGAA---TTCTCTCTCGATAACC--------TACGTATTGTTTACTTATACGTATCAAGGTTTTTTTTTAAGTTAGGTGATCCACTTTT---TAGTGAAGTAACAGC-AAAACCGAAT
>Lnk 21718525 21718999|21967 chr3R 21716411 21718995 scaffold_15 2241096 2243887 + 87709|2341 2920
GT--------CCGCGCGATCGATCATCAACTGCATTTCGCGGCTTAACCAGCGGAACTTTACTTTTGTGCCATTTTAATCATTGTCCTAAAGGAG-AGGAAAATTGTGTTTTTTTTCGCATCAA--------TGTGCGTTCTTTGCTTTCTTGATTCA----------------------CTTGTTTCTATTTTAGTTAGTACCTCTTTTGGAAGACATGAAGTAACTGAACATTATTA----------TGTATACATTATATAGCTAAATGTGTGTGTTCATTTTAAGTACA----TCAATGTTGTATGTATAGAAAAGAAGAACCTAAAAAAAAAAAAACGCAAAAGAAAATTGTACGATTTTTGTGGGCACCAAAGGTGCGACTCATGCGAATCCTAAAACTTCCTGCTTTAC-------AAAACAAAAATACATACATATATAC--------------------------CATACTTATAAATAT--------------AAATTATATATACATAAATA---------TATATTGAAATTGGTAAACTACAATAAATGAAGTTATGTAAAAGTAAA
GCAAATGTCGCCAGTGGATTGATTTTGAACTTC-TTGCGCGG---AATTTGTTTTTTATTTTTTGTTTTCGTTTTGTGCCATTGCATACAAGCAGCAGCGAAATTTCTTTTGTATTTGTTTATAGCCTTTTTTGTGTATCCTTACTTGTGTTTGCTAAAAGATGTGTAAGTCGTATAATTCTTGTTTCTATTAGTTTTAGAGCCT-TTTTGGAAGACATGAAGTAACTGAATATTATTACGATTATGATTGTATACATTAAATAGCTAAATATGTGTGTTCATTTTAAGTAAATATGTAAGTGTTGTATGTATAACAA----------ACAAACAAAAAATTGTAAA----------------TTTGGTGGCACCAAAGGTGCAACATTTGCGAATCCTAAAACTTCCTGCTTTACAAAAAAAAAAAAAAAAATACATACATATATACATAATATATATAGAAAAAAATATATATATATCTATATACATATACTACACTTATAAAACCATATATATATATATATATTTAAATTATATCAAAACTGATAAACTACAATAAATGAAGTTATATGAATGCAAA
>Lnk 21718525 21718999|21968 chr3R 21718996 21721914 scaffold_42 509086 511915 + 51866|0 3
CCAA
CCTA
>CG5913 21720657 21720837|21968 chr3R 21718996 21721914 scaffold_42 509086 511915 + 51866|1705 1937
TCCCTAATTCCCAAAAATGTAGACCATAAACGAC------------------------TGATCCTCTTGTAAACTACTAACATT-ACATGTCTTTA---------ATCGCACGCATACCCCAGTTTAATTTATTG--------------CGAAATTTAACGAATT----TGTTAATTATTGCAAATGGGCAGGTATTTATAAAATAAACTAAATATGCCATCTATTTGCCAGC
-CGGTGATTTCCGTTAAGCTAA---ATAGACGACCGCATTGCAGTGTCAATTTCGGCGTGCGATTATTAATAACTACCAAAATTGATATTTATTTATATTAGAACATTTCATAGTTTTTTTATTTTTATTCTTTGTTCTCCCTGCTTGTCCAACATAAATGAATCCAAATGTTGATTGTT---AATGGGAAGCAATT--AAAAATAAA--AAATGTGTCATCTA---GAACAA
>CG5959 21725313 21725313|21969 chr3R 21722206 21725314 scaffold_42 511916 514937 + 108502|3184 3184
G
A
>CG8932 21738179 21738195|21988 chr3R 21736838 21738471 scaffold_3 2766195 2767820 + 40565|1457 1475
GTTTGCGATAT--CCTTAA
GTAGCAGGCATGAGCTTAA
>CG31090 21742657 21742693|21992 chr3R 21741027 21743396 scaffold_3 2768716 2771183 + 75131|1659 1705
GCG----------TTGTCAATAAAACATGTACTCTCTGTTCTGCAAA
GAGACAGCATGTCTTGACAAAGAAA---------TCAATTAAGAAAA
>CG8966 21746265 21746289|21994 chr3R 21744735 21746632 scaffold_3 2775382 2777324 + 70078|1610 1634
TAAGTACATTTCGTGTTTCCGGTAA
TAGGTA-----------GCGAACAA
>boss 21792521 21792670|22041 chr3R 21789590 21792682 scaffold_3 2833010 2836074 + 129553|3012 3206
CCCACGAGTGTA-----------------------CAA----TGTGGCACTTCTAGTCAACGCTCCCAGTACGTGAATTCAGCTAAGAACTG---------------TCCAACATTTTGAATCACTGACGAACCAAGAACTTATTGAAGTTGATAAAATAAAT---AATAAATCGATACAAATTAATATAATCAC
TCTGAGGGTGGATCTGTATCTCTAACAGCACTTCTCAACTTCCGTTCCAACTCTAGTCAAAGCGCCAAGAACGTGCATTAAATAAATTGATGTAATCTATTTGTTAATATAACATTTT-ATTGATTGACGAACCAATAATCAAAGTCCATTTAAGACTTAAATATAAATAAATGGA---AAAATAAAATAATTAC
>Nf1 21819509 21819713|22058 chr3R 21817137 21819923 scaffold_3 2864792 2867602 + 88379|2500 2769
AC--------GTTCCACAAGTAAA-ATACGAAAATATTCAAAC------TGCAACTTAAGACAACATAAGAATAGCTGAAAACAATGC--------AACAAAATAACACCATG---ATTGGGAAACAT------------------------ATGTATTTCGT--AGTTATATAAGC----TTTGCCAAATGGAATTATTGTCCCAACACTCCAAACGATTTCACTTTTGTAATA---------TCGAACACAATATCCAATATGCAAAT
ACTGCAACTAATTTGAAAAACAAATATATAAAACAACTAAAACAAGCTTAGCAAATTATATATACACATACATAAACAAATCCATTACCGATAAAAAACAAAAC-ACATCATGTTTATTAGAAGACATTGTGGGCTATACAGCCTATTGTGCAAGCATCTAATCAAGTTAACTAAGCGCTACTTACTAAATTAAATCGT--ACCTTACAATTGAATAAGTCAAACAATTGTACTAAATAGGGGGCAGTACATATTAATGGGTATGCAAAT
>Nf1 21820297 21820876|22059 chr3R 21819924 21822224 scaffold_3 2867892 2870343 + 26946|429 1101
ATAACAACTACAAACCCGCGCACTAGACGTACCACACTTATCGCAAAAGTAATGCGTTTCCTAAATCTGCTTAAAAAGTGCTTTTAGAGAACGTGAAAACC---------------CCCACAGAATG------------TCGTACAAA------------ATCATAGAATATTTATATA--------------------TATATGTA-------TGTATGTATGTATAGAATGTCCAGAAGCGATGACCACTGAATGCGAAAGAAGGAAATGAACGCGT--GTATTGATGTATGTAAACAGAATGTATATATTTGTATGTGTAGAAGGGAGTGGATCGAGGATACTATAAGCACCGTAGAAGAAGATATCGAATGGAAATATTTTTAAACGATTACCGAT----TGTACATTTT---AATGCTTGCAACCCACAACTGCAACTAGGCACA---CCAAGTCCACCAGTTCCTCAAAGGATGACCGCGA-CCAGGCGAAACGGAGTTAACCATG---AAAGCGATTAAAGGCAAAATCAAACGAAACGAATACAAGAACAAGAATAACTTAAAGCTTTAAGAAGACGGCATGTTGCACATGT-CGTTTGCATTACTTTGTATTATAGATGAATCTCCCCGC----------AGCAAATGTATCTGATGGCATTTA
ATAACAACAACAAACCCACGCACGAGACGTACCACACTAATCGCAAAAGTTATGCGTTTTTTAAATCTGTTTAAACAATGTTTCTAAACAAAAGAAAAACCAAAAAAAAAAACACACACACAAAATGTACAAACGCGTTTCGAACGAATGTCCACTGTTGATGATCGGTTATGCGTAAAATTAAACAAATAAAACTCGTTACATGTAAAAGGACTGAATGTATGTATATAGAG----GAAGGCGAAACAGCTGGCAGAGGCGCATGGAACCCCACGAATAAATATTACAAATAATATAGCAAATACACAGATTTATACGTACATATATATATGTACTTATATTTTCACAAAGAATA-AGAAACAAACAAACACGGCAAGAATTTTTGAACAACTATCGATGCAATGTAGTTTTTTAAAATATTTATGTATGTAGTTTAGAAATAAGCACATACCTACTTACACCAGTTCCT---GCGATGACCATGGCCCAGTCGTAAGGGCCCCAAATGTACCCAAGTTGATCAATCAAAACGAAAACTGCAACAACTACAACAGCAATAA------GAAGCTTAAGAAAAGTAGTATGCGATTAAGCTGCCTTTTCATTCTTTTGTATTATATGTAAATCTCTCGATGCGAATTAAAAAAAAATGTAATTAACGGCATTTA
>HLHmdelta 21823976 21824358|22061 chr3R 21822946 21824362 scaffold_3 2871328 2872895 + 38971|1189 1613
A-----------GGGCATTCCATATATACGCAACCAATTAACATTGATAGCTTTACTACTCAGTTTC-----ATTAAGAAACAATCCAAGTTTTCCAAGGTCTAGTGTAAACATTTGCC--------TCAGAATCGTATTTAGTTGGTAGTTGATTTGATATGATGTGATGTTCCTGTGATAGTTCTTAAGTTCG-TATTTTGTATTTGATCTCCCATAG--------GCTTACTGATTCATGTATTTAATTCATTGTAATTTATTTCATCAACTTTGCAAGAGCTTCCCCACCGAGCTTCCACTTAGCCTCATTA------AGAACAAATTTTTGTGTATGTTTTAAAATTATATTTTTCGCTTTACACCATTAA-GTATAAGCCATGAAC--ATTTGAATAATAAAATGAACGTAAACTGAAA
ACTATCCACAATGCCGATCCCTTAGCTTTATTACACTTGCACATTGAGAGCTTTATTAATCTGGTTCTAGTTCATAAGTCTTAAT-CGAGTTTTCCAAGGCTTATTGTAAACATTTGCCCTCGTTTATTAGATGATTATTTGACAAGATTTTATACCTATATGATGTGATGTTCCTGTGATAGTTTTTAAGTGCGTTTTTTTGTATCTGATCTCCAGTAGCAAATAATACTTAAATATTTAAACA--TAATTAATCTTAATTTGAATACACACC-------GAGCTT-CCCAATGAGCTTCCATTTAG----ATTATACTGTAAAATGATTACTCATAGATATTTTGAAACAAATCATTTAGTTG---ATCTTTAATTTATACGCTTTTAATAAATATAAACAATTGTATATGC-CATACCACAA
>HLHmgamma 21826283 21826421|22062 chr3R 21824363 21826521 scaffold_3 2873759 2876071 + 63747|2190 2356
ATAGGATTACTTCACACCACAACTGAAAAAAAAAAAAACGAAGGAGAGA-------------------TCATAGAAAGTAAAAGTCTTCCGAGTCACTGGATTTCC----ACCAGTCGACTCCCACCTAGTTATAAGTAAACACCATAAACA-----CACAAAGCTT
--AGAACCAGCGAGAGCGACAGAGAAAAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGACTATAAGAATGAGAGTTAAGAATAGCAAATGTCTTCCAAGTCAAAGGGTTAACCAAGCCCAATTGACGCCCACTTAGCATTAAGTTTACAACAACAACAACAACAAAAAAGCTT
>m1 21841071 21841183|22073 chr3R 21840253 21841411 scaffold_3 2891906 2893046 + 17058|875 991
ACGGGATCGGTCGTAAAGTCGGAACAATGAACAGGACCA----TCTTTTGTTCGTCAAAGTCATCCTTTTGTCTTCGATGAAAATACAACCCTACGAATTTATGAGACATGCGTAAA
GCT--------------GTCAGAATAA--AACTGGAGTACATGTCCTTTGCACACAAGAGTTGCTTATTTG-------CAAAAATA------TATATATTT--------TGAACTAA
>HLHm3 21848417 21848858|22079 chr3R 21847005 21848980 scaffold_3 2899678 2901645 + 59569|1473 1996
TTGG----------GCGTGCCCAA---------------TATGGATCTTATCCCTAATATTATAATCGCAACCCAAAAAAATGGCTATTGACCGTTCT-------------------------------GCAACAAGATCCGTTGTCTTCCAAAGTAAATCATATCAACCTAAGTTAATTGAGGTCTAATCGATTTCTGAATGGTTTTGAAATACTTTTAGTTTTAGTTCCGATAATGGTAATTTGTAAATTAATTGTTTAATTTCAACTGTGATATAACTAAAGTACGTTGATCAATCAATCAGTGAATATATATTCGAGTGCGCTATTTTCCTA-----CTCCAAAAGTTCCCTA-AGTTTAATATCTCGTTGCGCT-CTCTTTATTG-------TTTAGCA-------TATATTAAGCTTTAAATAATTTATAAATGTTAATTTATGATTAGTTGAGAAAGAATAATCAAAAATACACTACCCAAATAAAATAAATG-----ATTTAAATTGAAAACACAA
TCAACTGGCTGCCTGCATTCCTGGCGACATCATCTAATTTCTAGATCTTATCTTTAGTATTCC---------------AAATGGCTATTAACCGTTCGCTGCTGCCATTATCAGCAGCAGCAAACAACAACAGCAAAATCCGTTGTCTTCCAAAGCAAATTGTCGCATCATA--TCGCATGAATTT--GTTGCACTGTGCATTGTTTTTAAATACTTTTAAGTTTA-TTTTGATAAT----ATTTGTAAATT-----TTGTATTTCAACTGTGATATAACTAAAGTACGTCGCGT---------TTCAATACAC-TTTGATTGCGCTGACTTCCTAATAATTTGCTAAAGTTTTCTAGAGTTAAATGT----TTGCAATGTTCATTATTGAAAGCGTCTTATCAAATTAACTAAATTAAGCTTTAAATAATTTATAAATGTTAAATTAGG---AACTAAATATGAATAAACAAAAGTTCTCATATTAAAGACAACTAATATATATCTTTTTATTCACAAAACAC
>m6 21858919 21859769|22088 chr3R 21857589 21858944 scaffold_3 2913778 2915211 + 24608|1533 1572
C--------------AGCAAACGGAGGAGCAGCAGCAACA
CAACAGCAACAAACAAACAAACAAACAAGCAACAACAACA
>m6 21858919 21859769|22089 chr3R 21858945 21859464 scaffold_0 6619597 6620130 - 632|0 560
CCACCTGCACGACCAATCTGAAAGGAATCATTGCTGAGAACCAAAACATCCGATTTCGAAATTGCTATCATGTCAACAGCCGCAATTAT------AGTAAAT------------AGTGGAGCAAAACCACCTTCAATGTTAGTTGCAA-CATGAGGAACGCTACAAAA-CATCAACAACTACTATTATTAGTAGCATCTTCAACGTCGATAACTATACAGCAATACAATAAGGAATACTTCAGTTGAAAGACCCAACTGCAATTATAATTGCAATGTCAACCAGCCACACCTCAAGAAGCTAAAAAACCAATTGCAACATGAGTAATGACTAACCACGAAGCAACCGCAAAAAATTGC--CAATAATATCTACAATAACTTGTCAAAAAGCGAGAACATTAACAGCCGAAACAGTAGCAGCCACATGA-------ACTATAACAATTGCAGC----------AATGTCA--ACAGTGGCAACATCTCAAGAAATCAAAGCATCGATGACAACAACAGCAGGCACCACAACAATCTCAACATTATCCAAAGCCACAACACCA
GCAACTGCATCAGCACATACAAAATGGCCAGAGCCTGACACCACAACAACAGGCGTTGCAGCGCCAGATACAGCAACAGCAGCAACTGTTGCAGCAGCAAATGCAGATGCAGCAAATGCAACAACAACAGCAACAACCGCAGCAGCAATCACCACGCATGGTGCAAAATCGTTCGCCAGTCATGCCACCCGGTACGCCTTCACCCTCGCTGCAGCAGCAGCAACACTTGGTTGCGAGCAGTAGCAACATGTTGCCGCCTCAGTCACCACGACAACTGCAATCGCCAGCGCCACAAATGACC------CCGCCTCCGCCGC--------CTTCGCCACAGAGCGCACAGCAGCACTTGCGTCAACAGCAGCAACAAT------------TGCAACAGAGTCGCCAGCAGCAACAGCAGCAG-CACATGATGGGCTCCCCGCAACAACAGCCGCCCACGGCCATGATGTCGCCACAACAGCAACCATTCCAACAACCAGTGCATCAGCAACAACGCATGCAGCTGCAGCAGCAACAACAACAGCTCGCACAACAGCAGCAGCA
>m6 21858919 21859769|22090 chr3R 21859474 21860135 scaffold_3 2915212 2915910 + -462|0 378
AACCGGTAGTTAGATGCGACCAAAGCGACTGAATGGATGGATGAATGAATAATAC----------AAGACATATCATTCGATGAATGAATGGAGCTGACGATCGATCGTGCGAATCGAATTGCGTGC----CAGCAACAAGTATCCAACTAGT--CCAAAGGA---TGCCACTCAGACATCCTCTCCAGT--------TGGAGACCCTCGATGGTTGCCAATGATCAGTAATAAATACATTTGTGATATCAACTCAAGCTAGTTAGTGTTGTA-----------------------------------------------GTATAAACGTTATTAGCTTATAA-------GAAAATAAATTAAAAAG--AAAATCCACT
AACCGGTAGATAGAAACGGTCAAA-------------TGTATGAATGAA-AATACTTCTTCAATGAAGCCATCCCATCCAGTTAGCCCGTCAGCCAGTCAGCCGGTCATGCGAAACTAGTTGCATGCAACATATGAGCAAGTGGGAAACAAGTTGCCAATGCAATCGGCCAAGCAGACATCAATGGCAACAATGTCAACGTTGTCCCGGGCTAGGTGTCAATTA--AGTATTTAATACCAACTTTATGCCAACTTTAAATACCTTGTGATATACATTTACATACTCGGAATCTATCAGAGTTTAGTTCATAGTGCCAATAGTATAAATGTTGTTAACTCTTAATCTAATAAAAAATCAATTAAAATATAAAAAAAAACT
>HLHm7 21863446 21863482|22094 chr3R 21862593 21864250 scaffold_3 2918083 2919798 + 36296|944 980
ACAAAGATCTACTTGGAAGGACTGAATTCCCGACGGG
------------TTGATGGCGCCGGGCAGTCATCGGG
>gro 21874328 21875634|22103 chr3R 21874214 21877645 scaffold_3 2929387 2932968 + 147438|114 1666
ATCCACAAAACCA--------------------------------------TGCAGTTTTTTCATTTTGTAATAAGCTCGTATAG-TTTTTATTACAACA------------------------------TGTTCGAAATCATGCAAATAACAACAACAAAAACAACAGCAGCAGCATCGGCAGTAAAACAAAAAAAGAAA-AGCAGAAAGGCGGCAGTAG--CAACGCATCAAAAAGCGAAGCAAAAATGAAAATTCTATAATATATATA--------CAAGAAAAAGGAAAACTA--------AAATTTTAAGCGTACTTGTAGCTACTAAGCCTAAGCTAAGTCCAATAAATAAAAACAAACCAACAAGTTGAACACACAAATTGCAAGTAAAGAAGAATTCAAGTAAAATGAGAACCAGAGCGAAATAAAATGATAATGCATGCGAGCAACAGAAACGAGTATGTTGTAAAATTAACAAAATGAAACCGGAAACAGAAACATAAAAAGTCGGCGATACCTACCTACGTTCATCTTAACATAAAAA--------------CAAATAGGAGGATAAGTGGAATTAGTCAGTCATTGCAATTGCAGGAGCGTTGAGATTATGATTACCAGCTGAACAAAAGGAGTTAAATACAAATACGATGCGAGTGCTTTTAGTTTGT-------------TTTATGTGAGCGG------TTTTTGTAATTTAGCTGAAAAGTCAGACA------GCGAATGCAACAACAAAT-GTAA--TTTTAAGTTGTCAGTTTCCTTACCTCC----CAACGTCCCTCCAAACACA---CACCACACACACACAAACACAACATACGA--AAAACACAAAACACATTTGCATAAAAGGTATATATATATATATATATATATAATTATAAATGAATATACTTAGTAAGCATTTTAGTTAAGAGTTTTACATTATAAATTAA----------ACACGGAAAC----------------------CACTTTCGAA-----ACACTCACTCGCATTGGGG------------------GTCAGTAGTTAGAAGC-TCAGAGCAGTCCGCTTT-GCTTGTATGTAATTTGAGAAAATGTGTAATGAGAAAATCGAGGAATTAATTGTGTGAATCAAACTCAACTCTTCAGAACCAAGTGTAAAATCCTATATTTTGAGCAGCTAAACCCAACACAGAGAGAGCCGCATCAACAACCGAAACCGAAAAGTAGAACACAGCTAAA-------TTGTTTAGTGTTTAGAGTATATATATGAAAAACAGAAA-----------ACGAATCGATTTATATATATTTACAATTATATAT-------------------ATAATGCGAGCGGCGAAA-TTGTAATAAGCAAGA-----GATAGAGTGCAGCACACGCTTCGATTTTTAATTTTACAAATATTATTATTATTGTGGTTATATATGTATATAATTATATTATAAATAATTGAAGCAAAACGAAAAA-----ATAAAAAATTATAT--GTAATCGAAAGTA
AAAAACAAAAACAAAAACAACAAAACAAAAAGAAGAACACCAGAGAGGGAATCCACACTTTTCATTTTGTAATAATCGCATATAGGTTTTTATTACAACTACAAAAAAATAATAAAAATGAATAACACATTGTTCGATAGCATGCTAATAACAACAAGCAAACAAACAA-----------ACAAACAAACAACAACAGCAACAACAAAGCAGTGGCAGCAGTACAATGCAT--GAGAGCGAAGTAAAAAT------TCTATAATATAAATAAAACAAAACAAAAAGAAAGAAAAATATATAAAAAAAAAATTAAGCGTACTTGTAGCTACTAAGCCTAGGCTAAGTCTAATGAA---------------AAGTTGAACACA--AATTGCAA--------------------AGTAAAAACC---------TAAAATAATAAT-------AACAATAATAATAA------TAAAAAATACAGAGCAGAAAACTAAAAAAAAAAGTAATAACAGTCGGCGTTACCTAC-TACGCTCATCAAAAGAATTAAATGCTGGGTCCTTTTCAATTGTGAACCCAGCATGGATTAGTCA----------TTGCTGGAGCGTTGAGATTATGCATACCAGATGAGAACACGATGTCAGA---------AATGTGAGTGCTTTTAGTTTGTCCATGTGTTTATATATATGTCGGCAGCGAAGTTTTTTGTGAACAAAATCGAACGTAAATTAATAATTGCGAATGCAACACAAAATTATAAGTTTTTAATTTGTCAATTTGTTTAAATTAGTGACTGCTACCCTGCTACCACAGTGTACTGTACCAACCCACACTTCACTTCCTCTTCGCACACGAAACACATTTGCATGCAGA------AAAAGTATATATATATATAAATATAAATGAATATAATTAGTAAGCAGTTTAGTTAAGAATTTTACATTATAAATAAACACAACAATAACAACAAAACGAAGCAGGCGCCGCCGCAACAGCACTTCCACACACACACACACACTCACACTCACACCCACACTTCGCACACACATCAATAGCCGGGGGCGCCAAAGCGGCCAGCTTTTGCTTGTATGTAATTTTGAAAAA--------AAAAAAAAACATAAGTAAATCCTTTG--TCAAAATCCA---------AACATTTGTAAAATCCTGT--TTTGTGCAGCTAAAAAAAGAAAACGGAAAACAAAAACAAAAAATAATATT-AAAACAAGCAAATAATTAAAAAAGAACTTGTTTACACATTAGTTTATATAGAAATGAATCGGATATATATATATATACTTATATATATATATATATATATAAATATATATTATATAGAATTGTGGGCACATCTCGCGCCCAGCGAAAATTGTAATAAGCAAAACAGAGAATATAGTGCAGCACACGCTTCGATTTTTAATTTTACAAATATTATTATTATTGTGGTTATATATGTATATAATTATATTATAAATAATTGAAGCAAAACGAAAAAGAAAAATAAAAAATTATATATGTAATCAAAGGTA
>CG14542 21879470 21879850|22104 chr3R 21877693 21879547 scaffold_3 2933023 2934819 + 58255|1858 1935
GCCGCTACTAAGAACCACTGCCTGTCCACTTTATGTAAGAGCCACCACCCGTTTGTATCTCCCAGAAGCGAATGTTAT
GCCCC--------GCTATCACCTG-CCGTTTTATATACTAGCCCGCTGTTGTTTTTAAGTAACAAA----AATGTTAT
>CG14543 21883031 21883072|22105 chr3R 21880151 21886044 scaffold_3 2934842 2940634 + 187598|2994 3035
ATTTCGTCGGGATGATTAAAAAGAAACCTGCTAGTTTTTTAG
ATATAG--GGGAGTATATAATAG--------------TATAG
>CG14544 21886985 21886989|22107 chr3R 21886643 21887397 scaffold_3 2941548 2942283 + 31634|349 364
-----------TGAAT
ATGTCGTTTGTTTAAT
>CG31324 21955337 21956400|22178 chr3R 21954650 21956705 scaffold_3 3013620 3015571 + 8485|812 1901
ATTGATCTGGAAAAGTCAAAACAGGCCCCATTTCTGGACGTGATAAGAGTTTTATTTGAA---AACAAATTTTAAGTCATAGCGAATTGTATTTGATTTTTTATGTATTCGCCCAGAGCATTTGTATTCTGTCGCTTAAAGATTTGACGTATTTATTCGCATTGCTCGGCATGTTGCGGCAACATTTTAGGCAACATCCAAGAAATATTGCCAGCTTCTGGGCTGAGCGTGTAAATTAC-ATGGAAAATATATGTAAAATCCGAATATCATGAATACACGTAATGTATTAAGTTGTAAATGCTTCG--CTGCCTATATTTTTGAAATTCCTTGTTACAATTTTTGGCTTTTATATGCGAT-ATGCA--TAAAAAATTTTTATTAATT-TAATACCTTTAATTTATTATTACCATAATCGAATAGATTCCTTT----TTTAAACGTATTT----TCAAATTTGTCCACAATACATACATTATACACGTCCAGAAATCCAAATTTCAATGGGCTTCGTTTTGAA-AAATTCGTACTGATTAAATATACAAACATATT--CATCAAGGTTTAATGAAGAAATCGCTATGCTAACATTTACAAAAAAAAAGAAAATATTTATACGAATCCAAAAAGTCCAAAAGTGTATCTGTAGTCGTTAAGAAATTTTATGTTTTACAGTCTCTACACTCAAGAATTAATTTATAATAAATCTATCTAATACATATATCTAGATAACCCCAGCATAATCAATGGAACCCTACTACGCTTTTCGCTTTATACAACAAATAGATATAGTGAGAATTAATTGATATGCAAAGCAATTGGTTTAAAGAAAAATACGTA---AATTTTTTTCGGTATTATTA-AACTAACTGATATATTTCAATGAATATGCCTAAGTATATCGAAACTATCAAAACGCTACAAAGCAAC-ACAAATCAAAGCAAAACCAAAATACCAACTAAAAGCAAATCTTTCCAATTCTAAATCTTTTAATAAACCTCTCTGGCATATTCCTCCTACCTAAAGGAACAAATCATCCAACTCATAACAAAAGAATTCATCAATAAAATTAGTGACCAATTAAAC
ACTTTTCGGCGGGATTCAGATAATGCCGCATTCC--GATGTATCACAGCCATCAATTCGACCCAATAGATTT----TTTCAACGCATCGTAGGATCAGTAGAATGAATTTGCCAAAAATATCTTTGTAAGGTCCATTTA-----------TTTTATTTACAATTTTAAA------GTGGAAACAACACAAACAAATTTAAATAAATTTT----TTTTCCAATTCGATTTTTGAGATTGCAATTGATGGTA---GTGACCTGCGGA---------------------ATTGAGTTAAGAGCAACTCGTACTGATTACATTTATAAA-----TTAACAAAATATTATTTGATTGTACACGATCAAGCAACAAAGAAAATATTATTACTTATCACAAAAATAATCAAAAGTCA--AGAATGAAACATTTTTTTTTAGCCATTAGGTATGTTTGCTGTCAACATTTTGTACATCAAACAATTTATTTATGACGACATATTTAGAAAAAAAGGATTTTAGTTATACCTAGGTTTGTACG------------AAACATATTTGCATAACAATTTTATAACTACAGCGCT-TGC------------AAAGCAATTGGTTTATTAAACTAAGCCAAG-----CAAACAACTATACGTA---ATTAAAAGATCTT--------CAGAACCCATTATCAAGA-------------AAATATATATCATACATATA-------------------------------------------------TAAAAAAAAAAAAAACAACTTGAAACGTAATTTATTCG------AATTGTGT--AATCAAAATGCATACCCATTTATTTTTAAGACTATTATATTTAATTTAAATTTTTGACT-----TACCTTA--ATATTAAACTTATAATTAAATTGCAAATAGACAACAAACTTAAACCATGCTACAAATTCAAATAAAATCAATTTCATTGAGCTTATAAATAAAATATAATGCTTGCTGCCTTATTT-------------------ATGGTCAATGTCAGTAGAAA---------CAATAATTTGAACAAC-----AAAC
>CG31323 22010335 22011069|22241 chr3R 22010138 22010520 scaffold_3 3088104 3088522 + 3199|201 442
CATAGTGGATATCTGTAGGTACCGCATCCGGAGCAGAAGAGGC----------------AGGCGGAAATATGGCTGCAAGGGAAGTAAGGCAGCCGGGAAGGCATTCAAG-------------TCGTCTTGGATGCACGTGGAAATCCTTTTCTTTTCCTTCGAA---------------------------TCTCTCTGTGTCTAGGATCGCAATCGCACCCAAATGTAAACGCACTCGAG
CAGTAAGAGCAGCAACTGGAGGAACAACAAAAACAAATGTTGCTTGCATCCCATGAATAATGAGGGAATTTAGCTAAACTGGATGTGAAAAAGCATTTAAGATAATCCAGCTGCGCGATATATTTGTACACAATTCATTCGATGTTCTATCTCTATCTCTTTCACCAGCTATTGTGTGTCCCGACCTCGCTCTCTCACTCTGTCAGTGTCTACAATTGCACATAATAGTAATTGCACACAAG
>CG31323 22010335 22011069|22242 chr3R 22010575 22011403 scaffold_3 3088600 3089328 + 3217|0 551
TATGGAATTCATCAAGCAATTATGTGATTTTTAAGCGAATACTTAACAACTATCAA----------ACAATAATTGATGAGCGCGAAAGGAAACTATTTA----------------------GATGCTAAGCATTCGAGTGGCGAAAATCAAAGAAAAACACTGCAAACCAAATTCAAATTCTAATTGCAATTATTTTTAGCTCCTAAGAAGGAATCTAGACTTTAAACGCTGTCGCTTAGTGAAAGGCAGGAATGGTTTACGATTTATATACGATGTGTTTTACCTTGGCATAAGTAAGCATTTTTCACCTCTCTA--GAT-GAGTATTGTACATATACAAAAACAATTTATCTATTTGTTAAACGAGTGCTGAATTTTGGGCAG--ATTATA-AATAGTTGTGTAAATGGATTAGTGA--------GTAAAATTAGCAAC----GAAAACTGCGAG------CTACAAA-GAGGGAGGAAAATTACTTTTTTTTGGGAGATTGATGTAATAACGTCATCTTTATTTAAACAGTTTTGTTTTACATTATCA
TATGGAATTCATCAAGCAATTATGTGATTTATAAATGAATATTTAACAATAATTGATGAAAAATGAACAAAATTTAAACAACTAAATTTAAAACTATTTACTATTTTTAAAAAACGCAAAGCGCTGCTAGGCAATTATCGAGTCAAAATCAAAGCTAGACAAAACGAG---AATTCAAATTC-AATTGCAATTATTTTTAGCGATTA----GGTACATAGAT-----------------------------------------ATTTACAT--------TTTTACTT--------ACAAAC-----TCACCTGTGTATTGATCGACTATTGTAAATA---------GATTTATTAATTTGTTAGA-AACTGCTGAATTTTAGGCGACAATTATTTAAAAGCTACTTA--TAAATTAGCGGCCACATAGATAGAGTTGACGAATGTAGAAAACTGCGAAAACAAACTGTAAACGAATATGAACAACTGTATTTTATTTCAA----------------------TTATTTAAACGGAGCTAATTTTTATAACTA
>CG12290 22058824 22059070|22281 chr3R 22055215 22059749 scaffold_3 1997446 2002411 + 143976|3996 4348
ACGGGGGGTTATGATAACTATACATATAGGAAGGTAAACAAACACTAA------ACTTGCTTGCTGAAGAATTCTAAGAACAGTATTCGTAA-TTTGTAAGTCTAGC-------------------AATTAACAAAGACAACTGTTTGAATTT-----GAGTTTTAAGACCAGATCATGCTGTCCTAGAAGCTTCTCATGCCAAAAA---ACAAAACCACAAAGAAAGTCAAAC---TAGAAA--------------------------------GTTTGAGATGCTTTAAATT---------AACAA---------------AAAA-------------AGAAAAGAAAAAA
A------------AAAACTATCTC----------TAAGTAACTACTAAATGTTGATTTGCTTGCTGAAGAATTCGCAGAACAGTATTCGTAACTCCGTAAGTTTAGTAAAACTAAGCCAAAAAAAAAAAAAACAAAAAAAAAAATAGAAAAATAACAAAAGAAAAAACTTAAGATAATGCTGTGCTAGAAGCTTCTCATGCCAAAAATCTACAAGAAAAAAAGGAAAAACAAACAATTATAAATATTTCACACATATGTATGTTATATGCCTGTGGCTTGTCAAACTGTAAAATGCACAGGCAAACAGCTATAAGTACCTTGTAAAACATTTGTCCAGCTAGGCAAAAAAAAA
>CG31085 22187287 22187711|22434 chr3R 22186528 22187288 scaffold_3 2178230 2178990 + 46342|759 760
GA
GA
>CG31085 22187287 22187711|22435 chr3R 22187433 22187773 scaffold_3 2179002 2179402 + 957|0 348
CCTGTGCCTATTTCTTATGATTTTACTAGGTTTTAAGGGTAGACTTACGCTATCT-------TAGCCAGTAATTA-------------GTCTTAGCCTTCCC------------TCACTGGCAAT-----AGGTTCCGGATCACCACTACTACTAAGTATGGAAATTGTTGTGCCTTGTA-------------GAATAAGCCTTCCCATTTCATTTTACTTTCATCCGCATTCAACCACAAAACAAC------------ATCAAAAAATTCTATTTATGTTGTAAGCTCGTGAACA-AAAATTTCAAAAGTTTGA-------ATAAATTGATAGAAAAACTTTGCCGAA
CCAATAGTTATTGCCTATGATTTTATTAGGTTGTAAGGGTAGTCCTTAGTTTTCTATAAGCCTAGCGAGTGTATGTCTCTTGTACAATGTGTTAGTCAACCCAATTATTTGATACAACTCTCTATATTTAAGGTTCCGGATGTCACATGTTCAT-------GGAATAATTGTGCCTTTTATTTTTAAGGTTTCATATCAGCTATCACCTCTCA-CCTACATTTTCTCATGCTCATTCACGTTACACCTTTTTCGGTATAAATACAAAAATCAATGT------TAAATTCAATAACACAAAGCGTTAAGCATTTTATCCTTGTTTAAAGAAACAGAAAACCCAAGAAAAA
>CG5432 22241071 22241111|22479 chr3R 22240957 22241806 scaffold_3 2239177 2240054 + 9406|114 163
GGAATTCTAATCAGT---------TAAATAATCAAAATCTTAAATTTAAT
GAAATGTGAATTGCTGCCCGGATATAAGTTACTGAGAAACAAGTGCCGCG
>CG31084 22253828 22253881|22493 chr3R 22253455 22253850 scaffold_3 2259321 2259749 + 2256|425 449
T--ACAGTTACACAGCGGGCCTCCT
TCCATAGTTACATAGCCAGAGCCAT
>CG31084 22253974 22254130|22494 chr3R 22253897 22253984 scaffold_3 2259791 2259868 + 3641|77 87
GAGCACCGCCA
-GCCACCGCCA
>dei 22274417 22274716|22517 chr3R 22272860 22276361 scaffold_3 2288581 2292199 + 79600|1764 2117
CGCGTATTTCTTAGCAACCCTAACTACTCTCCTTTTAAG--CCTAACCCTCGTCTTAAGTTAGAGTGCG---------------AGTTTTAACCCGACTTT-------CACTATTAGCCATTACATGCGATGCGCCATTGAGGCGGAATTCATTGTGTCATAGCAAGCAGCTGACAGGATAA-GTATATTCACATCCTGCGAAGGCAAAAGCTGCTCACCGCCACATCCACATGATAGCTC-----AACTCAACTAGTGATTTAAGCATTTCTTTGTGACGCATTTCTCGTTATC----------------------CTGTAAATAAAGCACCCAG--TGTTGATTCAAACAAT
CCAGCAC-----AGCAGGCA-GTCTGTTAGTTTATTGAATACTTAATAATTATTGATAATTAGAGTTTGTTAATTGCTGCGTTTAAGTTTAACCTAGTTTTATAGTTGCGCGATCACCTA--ACCTCACTTAAGCTATAGCCGCGGAATTCATCGTGTCATAGCAGTCAG---GCAGGCAACTGCATATTCATGCTCATGGACAGTTACAGACAGTC-----CATGTCCATTTGTT-TCTCTCAATAACCAAATTAGTCAACTAAGCATTTTTCTAAAGTATTTTTTTCACACTCTACACTTAAATACAATTTCGAACTGTAAATAAATCACAAATGTTGTTCAATCAAAAATA
>CG5447 22279432 22279630|22520 chr3R 22279269 22280286 scaffold_22 310495 311526 + 21664|165 366
CTTCCGCTTTCCCATTCAGCCAACGAGTTTTTCATGTGAGATCGAGCAGCTACAGTCGCATCAACAGGCATGTGAAGGAGAAGAGTCCGTTTCAGCAATTATCA--AGCAA-AAGTCAGCGCCATCAGAGTGCGTTTCCAAAAATATAAATCAATAAAAAGCTGTGGAAGCAGCTAAAGCTTTATAACCTATAACCATATGT
CTTCCGCTTTCGCATTCAGCAAATGAGTTTTTCATGTGAGA--------------------CGTCAGAGATCCCGGCAACTAAAATCTGTTTTATCCATAATCAACAGCAACAAATCAGAAGCCATTTCGTGTGTTCCCCCAAA--------AATCTAAAACTGT----GTCGCTAAAGCTTTAAAAAC-ATTTCAATATGT
>CG5447 22279702 22280311|22520 chr3R 22279269 22280286 scaffold_22 310495 311526 + 21664|440 1113
CTTGGCAAAAGCAGTGGCCAGAGCGTTTTCGGGGCATGCGACTTAGTCACGGGTGTGCTGGTAGATGTGCCTCCGCTGCAGCCACATACTGTATGCT----AGATTAGCCGTTAATGATTAGCCAAGGCAGTGTACGGCC------AGTTAGTT------AGTATTTATGCAATAGCAG-GCA----TAGTCATGTAAGTGAAAAGCTACCGAAACTGCATTTTGAGCCGAAGC------------------------AAGAAGCATCAACATATACACACA----------------------TTCGCATATGTTACAATTGTTTTATTAATCGGACCGAAAGGCCAGCGAGAATTGATTGTTTTGTAATTTGAAA-ATGAATAGAATTGTATACATCATGTTTGTAGTAGTTGCCAACAATTCGATTGTCTAATGTTGTAATTTCAATAT--GGCATTAACATTTGCATA-----AATACACACACACATAGTTCAAGCT-TAATCAGACATAATGCATACGCATAACTTTTTCTATACAATAC------TTACCGATTTCAAACAGCGCCAAATGAACTTACACATA-------AATCGAATCGAGAATCGTTCGATATTTAATATAAATCAGCAACATTGATTAACATAGTTATATATCTTATAAGAAAA
CTTGTTTCAATTATT----------TTTTTGGAGCACATGATTTAGTCATAAGTATGCT-GTAATTATGTCACAGCGGCAGTCATAAGCGATATGTTTAACAGTATGATGTGTAGTTGTTAGCCAAGGCAGAGTTTACCCTTAACGAGTTAGTTAGTACGAGTATTTATGCGAGTGAAGCGCGTTGCTAGTTAAATAAGTGAAAAGCTACTGAAACTGCATTTGGGCTAAAAACCATAGTTACATACAGTTACTTATACAAACTCATACACACACACACACACAACCACACAACACACACACATTTTGCATATGTTATTGT--TTTTACTAATTTAAC--AAAGTTGTGCGATTGTTAATT------TAATTTAAAATATGTAACGCAATTCACGATTGCGATTTGAACTTGATCTAAAACATTC----------TGCTTTAGTGCAAATACAAGTTTTTAATTGTAGCACATACTTACTAAACAAGAAGAAAATACAAACCATACCTTTAAATAGTTAAAATGCATAAACTTTTATATACAATACAAATCTTTAACGATTTCAAATAGCGCCAAATGAACTTAAATATATACATATAACCAAGTGAAGAATTGTTC-ATTTTTAATAAAAATCTATAAAAC---TCAAATTTCTTCTAAATGTTATAAGCAAA
>CG5455 22295125 22295732|22533 chr3R 22294956 22295346 scaffold_15 38957 39371 - 5763|178 438
GCACATGGCGAAAGTAGAAGACATTATATGTTAAAAAGTATACTGTATGT--AGGACCT-GATATATTTAAACCATAATGTGTATAG------AACCGACAATTTGATGATAATTACGCGTACC-----TATATGAGATGCCACAGCATCCA---GCTGGGGCACACTAAATGTTAGAGCGCCGCTTGTT-------AATTTAATAGTGCATAGCATAGGTGTTCATATAATT---ATATACGCCT------------ATC
GCAC-----------------------CCTTCAATTAGTCTAGAATATCTAGAGGACCTCAATGAATTGGAATCGATATGTGAATAGGCTTGCAACTAAAAGTTGACCGATATTTATGCGTACCTAAAATATATGAGGAGCGCCGTTTTTCATGTTATGGTGCATAGCATAGATTTTTTTTGTTTTTGTTTTGTTTAAATTTATAATTGAGCGCAATCAGAATTAACTTGATTTTAATATTTGCTTTTGTTTTTTGAAATT
>CG5455 22295125 22295732|22534 chr3R 22295347 22297057 scaffold_15 39503 41211 - 20500|0 426
CATAGCTCAAG-TTAGTTATACACATATTATGTTGCCTTTAGTTTAAGCTTAAAACGAGCAGAT--ATATATGCTCAGACATCCCATCTGGTGTCAATGATATTTTGGA-------ATTTTTGTGATCG---ATTGTGATCATTTTTCAAGCACTTTATTGTGATGATCCCCTAAATACCCGTGAATACGTTATTGATATTGTACCATA---CTTAGAG-----TTTGCTAGTTTCTAT-------GAATCTATCTACCTATTAATCGAAACACACACCGCTGTAAAATGTTACCAACGAAGACAC--AATTGATACATATTTGAATTTCCAGACAATTAAATAATCGATGTTTTATACCTATTTGTTAAGGATTTA--ATTACTAAA-----ACCAATAA----ATTATATTTTATAAAAACCCAA
CAAAGCGAAAGATTAGTTTTAAGCGTTTAGTTTTAGTTTTTGCTCATTTTTCAAACACACTCATTAAGATGCGTTCAAGCATGCCATTTAGCACGTAATACATGTAGGATATGAGAACTCTTGCGATTTTGTATTGTGATCAGTCGTTCAGT------TAGTTGTGATCATTTGAATAATATTGTACA-GGTATTTAGCACATACCACAGCCCATAGAAAGCTATATATTAATATGTATAATTGAAGAATATTAATACTTGTTAAT------GAACACCGCTGTTAAACGTTACCAACGAATTCATTTCGTGGCTCCTTTTATGATATTGCCCATA----------TGATATTTTATACAAACCTGTAAAGTACTGAGAACTACTAAAGATTTACGACTAAGCCAATTATAGTGTATATA-------
>scrib 22402394 22402767|22633 chr3R 22398446 22402440 scaffold_21 561701 565602 - 111268|4327 4376
AAGCGCGTACAGTCGCTGCCCAGAGTC---CAAGAGTTAATGAATCGTTG
AAACGCAAAAAACAAATACTAGAAACTTAGCAAAGCTTTACAAAGCGACG
>scrib 22402394 22402767|22634 chr3R 22402463 22403199 scaffold_21 565651 566450 - -1830|0 337
ATCCGGACACGGGCAC--------ACATTATCCTGTAGCTCAGATGACCTGAAAATATGTAAAAAACAAAAAAAAAAAAAAATCTATATAGTGTATCCAGGCACGGAATTCGAGCTTTTCTCGTTACCGCACATAAACACGCACA-------ATCCACCCGTACATG-ATGCACAACAACACACACCAAAATTGATTTAATTTAATTCTAAATTAATTTATGATTTATAGTCCC------TACAATTGGCAAACTTTGACCTATTGGCTGCGCTTCCCATCTTTAATTTGAATTTGC----------TAAATAAATATATGTGCG-TTTTGCAAACGA
ACCCGAGTGGCGGCGCCCCATGGGGCATTATTTTGCTGCTC--ATTGCTCGG------GCAATCAACCACAAGGATGAGAGCTTCTTTTCACCTACTTATGCACACCATACA-------CACACACACATACACAAACACACACACACATACACCCACACCCACATACAACCACGAAAAAACACCTTTTAAATTGTTGTATTCAAATGTAATTGGCTCTTTCTATTGTTGGCCCTCATCTTATGTTTGTATAGCCCTTA---AGCACCTACACATATAAAACTT-ATTTGGATATACATTGTAAATAAAAAAAAATTTTTGTGCGTTTTTGCAAGCGA
>scrib 22406793 22407241|22637 chr3R 22405216 22407117 scaffold_21 570294 572171 - 59414|1659 2028
TATCTGTGTGTGTGTGTACGTCTTTCAATATTTGTGCGTGTACC---ATTCGTTTGTGTAAAATACCT---------GTCTGTGTGCGAGTTTGGGTACCCAGATCCAGA-TCCAAATACAGATACACCCATGTAACAGCTAACACGAAC---CGACAGTCGCCACCCCAACAGAAAACTC----GACTCTAAACC----CGACCAATCTCTTAACTTGATTT-TTGTTTCGTATTTCGCTTGTTATGTGTTTGTGTAACTTCACTAATGCCTTTGTCCTGTCACTGACATTTCGTGTCCTGTGCTTGGAGTGCGTGCGTGTGTGTG--------------------TCAAAAATTTTAAAATGTATACA
TATTTTTATGTGTGTGTACGTGT---AGTGTGTGTTTGTGTGCCTGTGTGTGTGTGTGCGTGTTACCTTTGTTTAACGTCTCGATGTCCTTTTCATTTTTCTGTGCCGCACTCTTAACATACACGAGCGCAAGTGACTGCTCTGCTGCGCGTTCAACAA-----ACCCAAACATAAAACCCTAAAAAGTCAAAAACCCTTCGCCTGTTTTATTTACTCATTTTATTTATTTATTTTTTGCCTGTTAT---CTTCAATAACTTCACTAACGT-------------CTGACCTTTCGGGTCGCGTGTCTGT-GTGTATGCGTGTGCTTGTATCTGTGCCTGTTCGTATCTCAAATTTTATAAAATTTGTACA
>scrib 22420538 22421912|22646 chr3R 22419041 22422779 scaffold_21 585689 589281 - 55716|1665 3146
-ACTAAACTAAGCTCTGACACCCTCACTACGAC--TTGTGCGAATGTGACACGTTCATTAACCATAGCTTTAAGTGTAACC---TCCATATATAATACTATGTATGTAAAGTGTTTA-----TTTCGAACGAGACTTTTTTCGAGACTAAGCTACACCTACTGAAGCGAGCAGTAAACCAACTAATCTGGAATATAAAGTCATTTTTATACAGCGACACGAAAACTTTTTATACCCGTATACCCCGTAACATGTTAACGCTGAAACGTGAAGTTTATAGAGTGACAACTACCACGAACCCCGCCCCCACAGGCACGCCCACTTTCACCTGATATGGATAAAGGCATGGTGTTAATGCCACATGCTGTCTCTCCCTTTTGCATTTTATTAGCCTAATTATTTCTCTCTTTTCAAATTGCCC--AACTTT--------------CCGAACAACAACTGCTAGTCTGTCTGAGTTGGCTACACTTGAAATTTTTCAGTACACATCATGCACACTCACACACCTGCAGCACTTCTAGGA----CCTTCACACGCACACACGTACACGCAGATATACTACAACACACGTATACTAAACACCCGTACACAAACGAACTCCAGTGCCTTGTG---TGTTGCTTGCATAATAT---ATATGCGTTTTGCATTTTTGAAATGTT----------TGTTATTAAAAATAATGATTTTTAGAGCAGGACAAGAAGTCCAATTAGTTGTCTGTGTTCTTTTCGTAATGTCACCTTTGCCCCCCCGGGCACTTCGTTAATTGCCATAGATTAATGTGTGTAGATAAAGTCACGATTTCGAAGTCAGACACGAAGGTATTGTTGGGTTAATGTCGAC----TTATCGCATTAGCGATTTTAAATCCTCGGATTACGATGCTACGATGCATTTACCACGATTGTTATTCGTCAAACATACCAGAATCTTGAATTTAATTTATGAA-TACTCAACTAATTAACAGGGACTCGACGAG-GTGTTCTATTTGTATGCCCATACTAAGA-------AGTTA----GCGTTAATAGTTCCTGAATTTTATTTCGCAAACAAGCTTTCA--GCAAAGC------AAATGTATTCCTAAAGTCTCCAGCTGGTTAAGTTT-----------TACGATAGT-CAAACGGTGTTATAACTTTCG---ATATATTTTATAAATATTTATATGTTAATATCTGTGAACAAAGCAACCAC--ATAAATAAGAACTGCTTAACGATGTATTAAA----ATAACTACTGACTACGGTTATGGAATCACACCACTTTATCATTATCATTACCATTACCATTACTATTATTAATCATCCACATATGTACGTATTT-GTCATCGATTTGTGCCATACATATTTTATGTAACTCTGT-TATTTTT---------GCAT-ACAAAAGAAGTACAATTTATGATACTAGAAATAAAGGCGAA--TGATTTAAATTAG
TACTAAACTAAGTTCTGACACACACACACACACAGTAATGAAGATGTGACACGTTTATTGACTAAGTTCCGATATCTAGCCAAATAGATACGTAGC-CTATATGAATATACTTATTAACAATTTCTAAGCGAGAGAATTT----GACTAAACT-TAGTTACTGCCTCACACGATAAACTAACTAA-CTGCATTCTACATTTACTATGA-------ACACCCA---TTTTTATATGCAGCAAAGTTTTATATTGTTAGCGACTACGC---AACTCAAGATACTTTAATATACTATGTATTGCAGCAGAAGAAGATCGCACGC--CCACATAAT--------AAGCATAGTGTTA-------ATGTTGACCTTTTTTTTTTCAACTTTTACGATATGTTATT--TCTCTTTTCAATTCGCTCCAAACTTTTACATAAAACGAAACGAAAAAAGAACTGCAGCGTTGTTCACTTCACCAGCACTTGAAATGCTTTTACACACCTCTGCCACACTCATACACCTGCAGCGGTTTTAAAGTACTCACTCACACACACAGACATACACACAGTTATAC----ACGCCCACTTACTGACT-------CACTTGCCGCCCTTAGCGCCAGGGGCCATGTTATTAGCATATACTACCACACGCGTTTAGTATTTGAAAAAAACTGGAGAAAATATAAAATTAAAAATAATGATTTTTAGAGCAGGACAAGGAGTCTAATTA-------AAATGCTCTAGGCACGTTTAGCTGTGCACACAGAGAAA---CGGAAGTGGAGAGAGA----------AAGAGAGAGAAAGGAAAAGGAATTAAAGTGCCTAGTTATATATGAGTAATTCCTGACTATATAGTTACATTTGCGTATTCAATTGTTCAGTTCTAGAAGCCGT----CGTTTGTCATTGTTTTAATTTTAAAGACAACTCGACAAATT--------TTCATAAACTAACTAAGCAAATAATACAAACTTGTTGGGTGAAATCTAGTTGAAGTTTGAAGTTGAAACAGTTTTAGTCATGTTTCGTGTTTAACTGCAGTATTTGGTTTTATCTGCGACGATTCGATGCGCAGCTCCTGAAAAGATACTCCCGCAAAAGCATGCATGTTAAGTTTATGAAATCGAGTACGTTGTTGTAGTCAGCGTTAAATTTTTTAATTATATATTTTATAAATATTTATATGATTGTATATGT-ATCAATATAATTACAAACAGACACACACACACTCAC-ACGAATTAAGTGTTCTATATATGTACTACGTTTACGAAAT-----CCATGCATCATCATCAACAACAT--CCACAACTATTTATGCTCACACAT-TGCCAATGCATTTCCTGAATAACATGTGCCATATATCTTATATATGAATGTATGTATTTTTTGTTACTTCGCATCATAACGGAAATATG---------TCTATAAATAAATGAAAAACAAAATCAATTTCG
>CG5467 22428598 22428661|22648 chr3R 22426856 22429775 scaffold_21 594175 596991 - 97392|1814 1877
AGGATATCCGGCAGCAGCTGTAAGGAAATGGGCTGAAGTGTTGAGGTTGCATATACGCCGTGTG
GCAATA---------------AAGGAC---GGCCAA----------TTGCGCATACGACACGAG
>CG5467 22429282 22429784|22648 chr3R 22426856 22429775 scaffold_21 594175 596991 - 97392|2533 3054
CACAAAAAGTAGGAGCAATCCCAAATCCGTGCCCAGCAGCCGGCC-GAAGTATCCACGATGATTCTTCACGAGAACCATTTATAAACTTTAAGCATTCCCGACTGCCCGAGATTTTCGGGCACACTGTTTTTAGTTTTAGTCAATAAGCAAACTAAACCCGCAACTAAATCAA---ACTAGATTCGAAACGAAACAGCGAGAGCCGAGAACATAAATCAAATAATCGTAAATAATAATAATAATAATAGTTAGCAGTGTGTAAGAGCGTCCAGTTGTAATCCGTAGTATGTAACACATGGCATAAGCACAACTATGACAAATGTCCTATGGCGATTTCAGTTTCCACTTTTATACAAATGTAAAAATATTTACAAGCAATT--TTATGTA-ATACCTATATGA----TATTTAGTGTGTAAAC---TCGTCTTTTTATGAAAACGAAAGCAAATGCCGCAAAACGAATGAA--------------AATAAACAAATTGTATGCATTTTTATTTGAAAAACAA
CATTATAAATAAAGAAAAACTCG---------CCGTTAGCCGGTCAAAAGTTATTTCGATGGTCCCTCATACAAAA---TTAATAACCCCGAGCATT-CCGTCTGTCC-ATTTTATGATGGACAATATTGTTAAGGTCTAGCTCTAATCAATATAA-----CAAGTTTATTAATACATAATATTCGA---------------------AGTATGTATTTATTGGTGTTGCATTATTCTAGTTACTGCAATC----------------------TTGTGGTCAGTGTACAACAACTTACGAGATAGTCA----GTCTACAAATGCATTAACTAAACTTTAA---------TTGTAAAAA---AAAAATCAATCCGAGCAAATGATTAAATATTTACCTATATGATATGTATTTAGCGTGTAAGCAAACAAACTTTTTATAAACCGGCAAAAAAAAAAAAACAAACAAACAAACATTGTTGCAATGTAATAAACAATTCAATTTATTTTTTATTTTTAAGTCAA
>CG5467 22429282 22429784|22649 chr3R 22429776 22430044 scaffold_51 506175 506463 - 658|0 8
AAAAAAAAA
AAATGGAAC
>CG5468 22445833 22445953|22664 chr3R 22445155 22445947 scaffold_21 1562857 1563574 + 8630|681 801
GTCGCTCGTTTCACTCCTTTCGGAATCGAAAACGCCAGCGATTTTTGACTGATATTAAATCGTA------GTTTTTGTTGACTAATGCTTAAATAAATTCAATTCTTAAATTTTAAAACCA
GCCTGCCGCGTAGCAGCTTTGGCCTTTGTAAATATTAGTTGCTCTT-ATTCAGTTTACATAGTATTAGTTGTTTCCGTTGCTCTATTCT--ATTAAAATTTATTATTAAGATTTAAACACA
>CG5468 22445833 22445953|22665 chr3R 22445948 22445948 scaffold_21 1670894 1670894 + 91|0 0
A
A
>CG5476 22458583 22458680|22685 chr3R 22457668 22458684 scaffold_21 1666684 1667780 + 41015|1015 1112
GAAGTGCCATAGCTTTCAGCTGCCCTATTTGTTGACTTTTTGTGTTATCTATTGATTTGTCGAACGAACCGCTCCAATACAATACTTTTTTAAATTAA
--AGCTACGCAAGCTCCAGTGA--CTGCTTGTTAAATAATTCTATCAACTGTTA--TACATAAATGAATA--------AAAAAACTTTTCAAACTTAA
>CG31080 22460305 22460437|22689 chr3R 22460297 22463687 scaffold_21 631832 635330 - 59710|23 166
GCAGTGA----CTGACCTCAGACTGACCCATGACCCATCAACGATTCCTACGCACTCGCTGCGACCCACTTTGCTTAGTTTGTAAATCTCTCGAATTTCGATATGTGTCCCCAATAAAATATTGTTAAT-------ATAAAATA
GCAGCTAGCTTTTGACTCCAGACTGA--------CCATAACTGATTCCCACGCA--TATTTTAGCCCATTGTAAATAATTTTTGTTTAGTTCAAATTGCAA-----GTTTTTAAATAAATAATAATAACAATTATAATGAAATA
>CG14243 22466633 22466779|22692 chr3R 22465836 22466698 scaffold_21 1672142 1672914 + 11289|806 874
ATGGTCTCAAGTGAAATTTCAACGGTAACGCTTCCTATCCCAGAATATCG---CATCGAAAAAAGAAAA
ATAGGCGTTAGTTGAGTTTGAAAAATCGAATTAGTTAAATTAAAATGTTGATCAATTTATAAAATAAAA
>CG14243 22466633 22466779|22693 chr3R 22466699 22467152 scaffold_21 638527 639043 - 9169|0 81
CACCTAGCTACTCCCATCACGTGCAAGTTAACTAGCTTT-TAAGTATCCATGTAGAGGAATAAAATTTGTTTTGCTGACAAA
CACACGCACACG-CCATCAA--GCCAACTACTTAGTTTTGTAAATACCAA--TACAGGAATAAACATT-TTAAGCTGACACA
>CG5480 22483164 22483253|22702 chr3R 22481449 22483367 scaffold_21 660972 662984 - 39546|1913 2003
GAAACCTGCAAGACCACATTCTTATTTACGAATTAGCTCACACATTCTCCTTTAAGTGCTACCGTATAAAATATAAACTTAA-CTTAATGT
GCG--TGGCCAGTGCTCGCGCT--CCAGCAAATTAGCCAAATTGTAATACTT--AGTCTAACGTTATAAAATACAAATTTAATTTTAATGT
>CG5484 22545323 22545529|22763 chr3R 22544636 22545393 scaffold_22 1179303 1180055 + 38416|688 759
CCCACAGGCTTGATAGGTTAATTTGC-ATACTCCTTGAGTTAATCGTGGCCAGGGTGGCCACTCACATGTCG
-----AAAATCCATAGTATAATTTTTGAAACTCATTTAACTAACTGGGGCAATGAAAGAAAGACACACACCG
>CG5484 22545323 22545529|22764 chr3R 22545432 22545527 scaffold_22 1180225 1180332 + 2896|0 107
TGAAGTTTGTGGTTGTCTCATTTGAGACTCGAGCGAG-------AGAAGCATATTTTTGTTAGAAACAAA-----CACATTTTATAAATAAATACCAGCTATGAAAAC
TAAAGTTCGCGAAATATCCAATTGAGATTTGCAGTAGGTGATGAATAAACATATTTTTGTTAACAACAAAATGAATACATTTTATAAATAAACAACGCTTGAAAAAAC
>CG14245 22554795 22555772|22773 chr3R 22553664 22555245 scaffold_22 1190728 1192359 + 21259|1275 1763
AATTGGAGATTTGACATAAC-------------------------------AAAATAAAACAAATATGCAGTAATATTAACTATTTTCTTTTAATATTTCCTTGTCATGCATTCA----AAAATCAAAGAAATGAAGGAGAAATG-AAGTAAGCTAGCAATCTCTAGTAAAAGTAAATATTTAGTAAATATCTTTGATAAATAACTTAGTAACTGAGCGCATGTGAGATAAGCACAAAGACTTTGCACAAATAAATATTTTTGCTGTAACGTCAGGGCACGATTAATCAGTCAGATAAATAATGGAAATTTTTCTTAAGCACTTAATTCACAAAAAAAAAATAAAGAAAATTTATAAACTCTTTTAGCTTAATGGTTAACTGTGTTTTTGCGGGC--ATTAAACTAAAGCACTTAAAACAACGTAAACACATTTGTCGCCGCACTTTTCTGTTTGTTTGTTGACAATAAATAGTTTATTTTAAAAAATA
ATTTAAA----TGGCAAAACTTTTTGATTGATTTTGTGAACTGTTTCTTAAAATATACAAGAAATACACTTTTTAGTTGAGCACGTGAAATTAGTTCGTTTTTATTATGTATACGCCTCGTGATTACTGAGGCGAATTAGGAATGTCTTTCATTTATTGCTTTGTAATCACATTA---CTTTAGTAAACGTAAGTATTGCAGGCAATACTGATTAAATGC---------GAACTTAAAGATATT----------ATTTAGTTATTGTAAAG--GAGGCATATTAGTTTAGAGGAATGAATACTTGAAGTTTGTCT---GTGTTCAGGCAATATTAAAGAAATATTGCCGAATTTAAGAATATATCGTTTTAATA-----------TTCTGTAAACCTATTAAAAAGAGACATTCTGTGCAATGTCCAT---TCTGCCGTC-CTTCTGTCTGTCTGCGCGGTTCCAATTATTTTTCTACTGGAGACAACA
>CG14245 22554795 22555772|22774 chr3R 22555267 22555655 scaffold_15 659327 659655 + 1424|0 399
AAAAAATCATACTTACAT-------CGCGAACTTTTTAAATGCGCTTT-TACAAGGCTGTAAAATATTGTTAAAAATACATTTATTTATGTACAACTACGCAGCTTCAACTATATTGAGTTACACAACTGTTGGGACTAAATTATTTGGGCCCAAAGGAAATGACTTTAATATATCCGTGTTTGATAGCCAAAATTGAATGTCCTTAAATTCGTGTCCTCTCACTTTCAGCCATGTCCGG---TCGGGACTACAACGGAGAGCCAGGCTGTCGCAGTGCCGAGGAACTGGGCCAGAGCTACCGGCATTTCTGGGATCCCACCGCCTACTGGCAGTGCGGCGGAAAATCAATGGAGGAGGAGCGGGAGCGGGATAGGGATTGGGAACGGGAACGACCCGCC
AACAAATCCTATTTAGAGGTAAGCACAGAGACTTTCTAAATTTAATGCACACAAAAATGTGGCACCCAGGCAGCGAAATATTTGTACATTT---------CAATATTAAAATTATT---TTCTACAAATGTTTTTACACCACTTTTTAGA-------AAAACCAAATAAATATATATATAT---ATATATATAAAAAAATGGCCAC-------TGCCCACTTACCCATACAAAAGTACAAATACCATGAGCACAATGGCGAGCCCGGCTGTCAGGGTCTGGAGGAAGTGAATCGCATGTTCCGTAATTTCTGGGATCCCACGGCTTACTGGATGTGC---------------------------------GATAAGCA--GGGCACG-------CGCGCC
>CG14245 22554795 22555772|22775 chr3R 22555656 22556028 scaffold_22 866899 867234 - 1991|0 133
CAGCTGCAGCGTTGCCCGGCCAA--CGAGCTGTTCTAC---------------GACCGGGAGCGGCGGTGCGTAAAGTGGAAGCACTGGCAGTGGACCGAACCGCAGGATCCGCCCACAAAGCCGCGCAAATAA
CAAATGAACTGTTGCCTAACCGAACCGAGCCGTGCCGATGTGGTCGAACGATGGAGTGGGCATGGGCGTGTGCGAGATTGGGGCCC-----ATGGTCTGTCACCTAGGAGCTGACCAGAAGGCCCCATAATTAA
>Tl 22666870 22668125|22909 chr3R 22664777 22668134 scaffold_22 1335165 1338705 + 95331|2137 3640
GACTGGGAGAAGGCGGAG------------------CTGTTTCA-------GTTCGATCCCGACG--ATGAGCTATT----GTTCCGTT---------AAAGAGAAGCCTCCAAGAAGAACACTGCCACTGACGAGGCGGCGGTGAAAAGACCCAGCTGAATGTAAA---AAGTCTAGAGA-ATAT-------------------------------------------------TATCGATTTCCTCGTGTTTGGTCAAGTTACAGTCGCCCTCTTATAGGTTTA----AATCTCTTGCGCTGGTAGTGAAGCTACAGCA-AAACTAAGTGAAAATTTCAAATTTCATTATTTCATGTGGCCTTTGTTGAC----------------------------GAAAAATGAAACAAAAATGTTTAGTTTGA-----GGAAAGATGGA-AACACAAGCTAGTT-----TTA----AACACATCACTCTGTTTTAAGTGT----TATCTGTAAGCTTAGCATAGACCCTGTGCAGACTCTTGTAGA-CATAAAAATCTCATTTATTTAGTAATTAT----TTGTACATTAGGATTATTGCAAGCTGCCGCATACAAAACTGAGAATAGCTCAATGCTAAAATACCTTTTGAAATGACCACTTTTATTT-----------ATGTTTTACCTTTTAACA-GAATCTCAATGAAATGGGAATCTGAATTTTGAACAAATCGAGCTTTATTTCGAACTAACTACTTATTATTTGTTAGAACGCAGCCTACAACTAGGTGAACCACTTGCAATACACATAC----GACGTATCCAAATAGTAGTATAGACTCTGTAATTGTGTGAACAAACGCAACAAAAGCAGCCGAAATGAAATACAAATTGCCTTCTTTGTATGTATGTATG--TACGTATGCTAGATATATAGACCCCAAGG---ATTCA--TAATCGATTGCATTGCATACACACCCC--------GTCTCTGTACAT-------------AAACTGGATATTGATTTCTGTACTTTTCCAAAACTAGTATGTGTATCGCACA-GCAGATTCAAGGACCTTACACACAACTATCACTA--GTATCAACTGTAATCTCACGCCCATTTAAATGACGCTATATAAATAAGTACATAACACGCG---AATACATAATTCAGTGGACACACATTATCATGTCATCTACCAAACAATTAGGCTAGCTCTTCA----TCCATACAAAAACCAGAATGAATA----TCGTCTATGATACGT------AAATGTAATTAAGCTAAACTATGTGTATATCGTCTAAGC---TATAGATTGTCTCTGATATGTAATACCTAAGGTACCTACAGATTTA-TGCAGACACACTCATCTACTC------------TGTATGCGTATGA-GTA---CATTAAATCTAATTGTATATGAAAA--------------ACACATACAACGCAAATAAAATATATTTTAAAAATTT
AACTGGCACAAAGTGGAGCCCGACGATGAGGAGCTCCTGTTTCATTGAGCCATTCAATCCTTACGCTATGACCAATTCCGAATCCAGCTGAATGTATAAAAGAAAAAACTAAAACAAAAACAAAGTC-TAGACAACATTTTTGTGGCCAATTCAAATTGCACTCAAATTTATTTCTTTAGATATATATGTGTGTGAGTGTGTGTGTGTATGCGTGTGACTGTATGCGTGTATGTGCATCTGTATCTGTGT-TTTGGTCTAGTTCAATT--CTGTAGAATAATTTTACAAGAAACGCATCTGCTGCTCGTAATTCCAATGCACAAAATTGGTGAAAATTTCAATTTTCAATATTTCATGAGGCCTTTGTTGACATAAAAAAAGAAAGAAAATGGAAAATCTAAAAAAAAAAAAAAGGATATTAAATTTACAAATTGGAAAAATGAACAACTTGAGCTAGTTGAGAGTTAAGAGAGCTTATCATTCTGTTT--AGTGTTATGTATATGTAAGTTAAGCATA------------------GTAGAGCCTAATTATTTTGTACATTATATAATTATGATATTGTATAT--GCTATCTTTAAGTTTAACGCACGCAAAGCTAGAGGAAGCTCACAATCGAAATAATTTT-----------ATTTTATTTTGAGGATTAACACATTTAATTTGTTTGCACGAATCTC-----AAGTTTTACTTAACTTTTGAACAAACTGAGCTTTATTTTTTGTACAATCTATATTATTTGTATAAGCT---------ATTGATTAATGCACATGCAATATACATACATATGACGTATCCAAAAAGTAGCATATAAACTAT-GCCGTGT-ACTGAATGTAATTAAAACAAAAATAAAGAAATAAA-----CCATAAGAATCTATATGCATAGTTATATCATCCAACTTTGTATGTCTCGATGCCTATTTAGCTAAGCGAGTTTATTGAAAGCACCCAACAAGAAATTACCACTGTACATAAAAAAAAAAAAAAAACACGAGAACCGATTTTATATTTCCACAAAACTCTCACTCAAACTATAAATGTAAATGCAAAG-------GCATCTCTATCATGACGTTATTAGCTGAGTACTCG--------TAAATGTC-CTTCATACACG---GCATAATACATATTTACTACATACATCACTTTATCAACCTTACCCAATCATATAC------ATTTTTCTTCATTTTCACATTTCAGTAATATAGTAAAAGTACATAATACGCATAAATGGTATGTTATATAAATTGTAATTA----GCATTAAAGAAATAACGTATAAGTAGATATGTCACGTCTCTGAAATGTATTGCCTAAGGTACCTACAAATTTATTGCAGACACACTCATTTACTTATACAAAATGAATACATACATATTATGTACATCATTGAATGTATTTGTGTACAAGAGTATGTCTTGAGTATACAAGTACAA--TAAATAAAATATATTTTAAAAATCA
>CG5491 22690179 22690289|22936 chr3R 22689150 22692250 scaffold_22 1376941 1380016 + 114180|1070 1181
TTTAGCATCTCTAATAATTAAGTATAAAGTTACAATCCGCATAAAATTCTGAACGTTCATTCATAATAATAATTCAATAATTCATTTTCAATAAATG-ATTTTTAAAGATAT
-------------ACACTTGAATTTCAATATATA---------------TGCATCATTATCTTTAATATTAATATAAAAGCCAATGCACACAACATGTATACTTATAGA---
>His2Av 22694309 22694630|22939 chr3R 22693961 22694682 scaffold_42 1334 2135 + 20274|359 795
-----GCCAGTCGGCAATCGGACGCCTTCGAAACATGCAACACTAATGTTTAATTCAGATTTCAGCAGA---GACAAGCTAAAACACCGACGAGTTGTAATCATTTCTGTGCG---------------CCAGCATATATTTCTTATATACAACG-----------TAATACATAAT------------------TATGTAATTCTAGCATCTCC---------------------------------CCAACACTCACATACATACAAACA-AAAAATACAAACACACAAA-----ACGTATTTACCCGCACGCAT----CCTTG---------------GCGAGGTTGAGTATGAAACAAAAACA----AAACTTAATTTAGAGCAAAGT-AATTACACGAATAAATTTAATAAAAAAAACTATAATAAAAACGCC
TAATTGCC--TCTTCTTTTTGACTATTTCGG-------AATACAAATTTTACATCTATGTTTAAAAATATATTACAAACTAAA----TGACGCGTTGTAA-CAATTCTGTGCGAAGCTGCCAAGGCGTTCAGC--ATAATTCTAATTTACAACAATTTCTAAATCCAGCCCATCATCTCCCAGCATCTGCCCGCTACCCGACCCTAGCCTCCCTTCTATTGCCAACAGGCAACATAAACATTCAACACCCGCACTCACACACACACACACACACACACACACCCACACACACACTCACGCACTTACACATACAAATGTAAACTTAATTGTCAAGCAAAATGCAATGTTAAATGAGAAAGAGGATTAATGCAAACTTAATTTAGAGCAAAGTAAATTACACAAATAAATTTAATAAAA--------------------
>CG5500 22706068 22706181|22953 chr3R 22705804 22706132 scaffold_42 13771 14074 + 10688|264 328
TACAAATCCCCGCTCACCTAAATATCTAGTTAGGACCAAATTCGTAGTAGCTCAAATTTACTCTT
CACCAAATTGTATTCAAATACAT---TAGCAAAATTCGATTATGCCATAACCC-AATTAACTTTT
>T48 22736190 22736719|22999 chr3R 22736229 22736722 scaffold_13 1700886 1701355 + 11354|0 556
AAGTATTACCC-------CGGCTGGCGGCGCTA---GCCGTTCGAGTCTAGCGCCAGTTCAGCTGGGGGAATGGAGCATTTGCGTGCACATTCCGACAGGCCATCATCGACTTCGACAAGCTAACTGGGAGGC-CGTTTAGCCG--GAGCCGCTAAATGCCCACGCTTAG---AGCTTAGTTAGATC------------AGTTA---------------AGCAAGCAAACTAGTCACGTAAAATCACAAACAAAACCATCAACACACAACGATGCCGAGGAGAAGGAGCTAATGCAAATGCAAATGGAAATCGCGTGGAAATGAA-------TTTAGTTTTATGGATTTTACAAAAATCGCAACAATCATGTAA-CGAACAATATTCAATATACACACTATAGAAATACTATTCAGATAATAACTAAGATGATTAGCAGTATAAACGCGATACTTATAGCTATAGCTTATGTAGACAGAGATTATAAACCTTAGCGAAT---------------ACGAAATGGATAATAAAATCGTGTGCCTTAGGATTGTAAAATA
GAGTATTATCCTAGCACACAGCTGGCCACGCTACACGTCACCCAAGTGCAGCGCGAGTCCAGCCCGGAG------------TTGAGCACATTCCGCCAGGCCATC-------------AACAAACTGAGACGCACATTTAGACATCAAGGCGCTAAATGTTAACGTTTAGTTTAGTTTAGTTTAATCTAGCTTAGCTTTAGTTAGTTTATCTAGACTCTAGAGAGCGAACTAGTCACGTAAAATCACAAACACAAAAACAAA---------------------------------AAATGAAAATGAAAATCGAATT--AATGAATTTTTCTTTTAATTTTATGGATTTTACAAAAATCGCAA----CATGTAACCGAACAATATTCGAT--------------------------ATAGTGTCTACCATATAGAATGTTACATATATGATATTTATAGCACTAGCTTATGGAGACGGAGATTATAATGCTTAGTGAATAACAATCTATAATGAACATAATGAACAATAAAATCAAGTGCCTATGACTATCGGAATG
>sda 22770246 22771035|23039 chr3R 22769545 22771081 scaffold_13 1748484 1750183 + 41034|743 1737
GAGAACACATGGAAGTTGGAAATGGGGGAGAACTCAAATTGA-----------TTTCAACCAAAAAATGCGATTTAGTTATTGTAACTATTACCATTATTTGTATTCGTGCAAAGGCCTCAAATTAATTTAATC--------------AAACGAATTATTTGCGAAAAGTGATATAAACGTGTAAGTTAGCCAGCATAATTTAGGTAAACGA-----TTTACTTTTTGCAA-------TTGTATATTTATTTA-TTTGTAAGTC----------TCGCTTCTTTTGCT--------TTGCGGCATTGCTCTGCAACGTTCCTACTAAAAAATAGAAAGCAATCGGAAAATGC-------ATAGTTCGAATAACTCCCATTCATCACTTCAGGCAACAGTTTAAGTCCA----CAACACAATATCTGCCACGAAATATCT------AAAGTTTAAAACCTGTATTATCTATATCTATATCTATACTTATGATTGTCAAGTA----CTT----------TGTGTTGTTCGCACACCTT-------------------TAGATCCTAAGTGAATCAA----------------------TCTAGCACTAAGTGAACCAA--------AAATCTATT------TTGTAGTCGATCCA------------------------ATCAAGGGACTTAAT-----------------GGTCCTGGAAGG-AAACTGAGCATG-----------GGAAGATAATGAAACTGAGTGTCCTTAGTACATGGTTTAAATTGTTTGCTAAAGCAAGAGTAGTACACAACACACAACACACAAGTAATATATTTATTCATGTACGCGTGTAACTATTATGTATTTTGTAAAGCCCAACACAAAAATACTTGTATT--GCTGCTGCACAACCATGTAAATAAGTTTTAAAGCTTAC---ACTAAACACTTAAATAAACTA----TGTATTTACGT-AATTTTATTCAAAA
GCAAC-----------------------ATAACTTATACTTAGTTTTGCAGCTTTTCAACCAAAAACAGAAAGAAAGGAAAATCAAACGCGACT-TTATT-------ATTCAACAGCCTCAATATAATTTAATTTATTAAAAGAAAAAAAACGAATTATTTGCGAAAAGTGATATAAACTTGTAAGTTAGCAAACTTAGTTAAGATTAAAAACCTATTATACTTTTTGCAAGTGTATTTTGTATATTTATTTATTTTATAAGTCAGTCGTTCGTTTGCTTCATATACTGTAATTTATTTTGATTTTTTTTCGTATCGTTCCTATTTAAAAAAAAAAAAAAAACAACAAGCGCGATCACAATGGTAAAAAAAA------------GGTTAAGAATAGAGTTTATTTGCATTATCAGAACAATAGCCATCACCTCATTCCGTTTGGAAAAAGTTAAAATATTTAATTTTTAT-TTAGCACGCTTCCTAATGCTGCTTGGGTAAAATCTTAACACTTACGTATGTTACTGTCATATAATATAAAAAAGAAAAGAAAAAAAAATAAAAACAGAAACAATTGAAACTATACTACTAAGATCTTTAGCACTAAGTTACCCAAAAAAAAAGAAAAATATTCGAAACTTGTATTAAACCAATTGAACTTGAGAAAAATGCCCAAGAGCACAGATCTTAGTTTATTTTTGCTACTACAAGTGGTGGATGATAGATGGAATATGCTGCCTTAGTTGGTGGGTGCGAAAAAAGAGTGTCCTTAACGCAAGGTATAAAGTA-TTGCGAAAGTAA-----------AACCTACA---------TATTTAACTTATTAACGTAGAAGT-TATCTATTATGTATTTTGTAATGCCTAACACTAAA-----TGTATTCGCTTAGTGCACAACCATGTAAATAAGTTTTAAAGCATATTTAACTAAAAAATGAAATAAATAAAGATTGTAATTACTTAAATTTTAATTATCA
>CG14253 22810980 22811431|23078 chr3R 22810375 22811025 scaffold_29 818198 818928 + 22244|685 739
TCCTGCGGGTAGCC---------AACAGATCAGCAATCTCAGGTTTATTTTTATA
GGCTTGACTTTGTCACAAACTGAAGCACATCAGAAATCTCAGGTTTATTTTTATA
>CG14253 22810980 22811431|23079 chr3R 22811273 22813293 scaffold_29 819566 821673 + 93304|0 167
ATCTGAGCTTGAAATATGCCTGGTTAGGCCACATTGTCCAGTCGATTCCTTTGACTATAACCTCTGGTAACTTAAATCCATGAGTTTTATTTAAAATGCAA---------CATAAAACCGAAAACAAGTGCGAATAAAATACAAATATTGTGTATACGAGACAGGAAA
ATCTAAGCTTAAGTTAAGTAAACTCGTGCCTCGTT------TTAATTTAT---AATATAATCGATTTTAGTTTCCAACAAATAGTTTTAATTGAAATGCAATAGTCTAACCATAAAGCCAGAAG---GTGCAAATAAAATACAAATATTCCATATACAA-ACAAAAAT
>GCR(ich) 22876171 22876742|23156 chr3R 22874084 22876770 scaffold_29 910334 913183 + 74036|2281 3005
ATGG-ATCTTCA----------------ACCCATCGTGAACTCAAAATTGCGAACTTCGAACTCGGCCCAAGCTGCTGACTAGTCCTGTCGTTGACACGCCCCCAAACTCTCACATTTGAGTACCACATCATCCACATCACATTAACCACCTCACGATCTTCGACCACCATGTGTCCCTGAA-------------------------------TTATCTCAGATTTGCATCACTCCTTTTAATCGAGGGGGCGGCGCTTTCGCCCACGACTTTTGTACAT---AATACGTTTCC----------------------------ATTTTTCCGTTTCCA---CTCACTCTGACTATCCACCTTTTTGCATCTGTACATTTTTCACCTTCA-------ACTAAATTAGAGTCTAACCTTCAGC------CCTGCCT------------------GGAAAATTCTATTAGCTAATAGGCGACAAGTGC--GGGTTCCTTGGATGGTAACCTCACCTGGCGCCCGG---------------------AAGAGCGAATGATGAT-GATGATGATGATTTGTAGCAGAAGATGATTTAGCGGGGCCT------GACTTGCTCCATACATATAAATAC--ATATACTTTAATTA---TACTAGGCTTAAGTACGTTATGCACAA-ATAAAAAAACAACGGTGACAAAATTACGAAAAAAAAAA----CACTAA
GCAGCATCCCCGCAACAACAAGATGAACACTCACCTCGATCTAACCACAATCAGACACACACTCGGCTCAAGCTGCTGACTAGTCCTGTCTTTGACGCGCTAAC--ACTCGAATATTTCCGAAAAAAGACACGC---CCACACT--CAACCCCACAAACTGCGACTTGACCCAATCTCTGGACGGGAGAGACGTCCGACACAAGACGATTTTCTCGCCTCAGGCTCACATAACT--------------GGGCGCTACTTTCGTCCAAAACTTTTGTATATAAAAAAATGTTTCCGACTATCCTAACTACACCATCATTCGATATATCACCACTTCCATCTCTCTCTCTCGCTCTCTCTCTCTCTATCTCTGTCTCACTCACACACACACGAACACACTATCTC---GTCTGTCTTTCTCCCTCTCACTTGCCTAACCAGAAAAAAAAATGAAAAAAAATCAATTAGCTAATAGATGACAAGTGCTGAGTTCCCCGGGAAGGGAACTTCACTTGGCATCCGGGCATCAGAAAAAAAAAGAACAAGAAGCAGAAGTTAATAGATGATGATAAT-----GCGAAAGTTGAGATATAAATCCATTCATAATACATAATACATACATATAAATATAAATATACATTAATTATATTATTAGATTTAAGTACTTTATGCACAATAAAAAAAAACAACGGTGACAAAATTACAAAAAAAAAAAATCGTTCAAG
>NepYr 22883413 22883661|23162 chr3R 22882919 22883773 scaffold_29 924661 925424 + 990|512 777
CTGTCATATCAAAAAATAAAACTGATTCACCGGTGCGCCGATCAGGAAGCTCAGGTGGA-ACAGAAGCAAACATAAGAAGCACCGAGT-TTTGAGTGCGAATACAACGTGAACCAATCAACCAAAGATCGAATACCCCCATTTTGTTGAGTGTATATGTGTGC------------GTGTTT---TAGTCCGAGTCCTTTAAATTGTATTGTAAGTGTCAACTCAATGTATTTTTAATGAAAGTATATTAAAAGTAATTAATTAAAA
CAGCCACGCCAACCAACTGGTTCATTTCACCTGAACAGCG-CCAGCTACCTGAGCTCCACACAGTTTTGAAATACAGAAGCTTAAAATAAATGAGTTTGAACCAAAGATGTGCTGAATCTCCATTGATATACTA---------TATCTAGAGTACATGCATGCAAAGCTAGTTATGTGTCTACATACTTATAGTGCTAAGTGTATTATTGTAAATGTTGACTCAATGTAAATGAATAGAATATGTATTACAAATATCCAAAAATAA
>CG5815 22940217 22940862|23216 chr3R 22939985 22940392 scaffold_31 131396 131805 + 15235|238 424
CAAA----------CCGCATGACCAATAAAAACCCATAATAATGATTATATATTC-GCAGGAATGCAAGAGGATCTCGAGGACATGCGCATGGAGGCGGCGCACAAGAAACAAAAGAAGCTCGTGGCGAAAATCAGCTCACGCTCCTAGGACGGTATTTCATCTCGACGTGGGCTAATCCGTCGCCA
AAAATTTCCCTGCCCCTCCCCGCCCTCGCAAATCTAATTGTGTGTTTGTCTGTTTGGCAGGTTTACAAGAGGATCTGGAGGATATGCGCATGGAGGCGATGCATAAAAAACGCAAAATG-----GCCAAAAAGCGACCAACGCGCATCGACGACTAATTCGCCCCGCCGCCCGC----CCTCCGCCA
>CG5880 22944013 22944259|23219 chr3R 22942876 22944747 scaffold_29 797941 799867 - 65197|1211 1471
TTCCAACATAGAAGCCATTGTGATGTCAGCAAGTCAAT---ATTAAGTTAATAGTTTACGTTTAAGC-------TCAAGGTAATAGAAATCCAAAGCTCTTGATTAGTAAAATTTAGTATTATAAACCTTCTACTCAAAACTGTAATGCAG--TGAAATGCAAAGGCATGTACTTTGTTTCCATGACGACTAGGACTAGGCACAATGACGCTTTTATACTACTACTAGCT--TAATAAAAGACACAACTAGCATACAAATC
TCCGTGCA-----GCTTTTGTGATGTCATCTTGGCGAATTAGTTAAATTATTAGGCTTAAGTCAAGCATTTCCATTAGGGTGGCATG--CCAAGAATATTTATTTAGTCA--TCTATTAGTATAAGACTT--GATTAGCGTTTCCATAGAGCTTGTGAGCTAGCTATGTGTATCTTCTATCCA-AATAAACAGAACT-GCCGTAAT-------TTACAACCTTAAAACCTGTTGATTGAATACGTTGCTAGGATAT-----
>Mdh 22982097 22983328|23241 chr3R 22979886 22983517 scaffold_20 1577806 1581403 - 131016|2271 3640
AATAGC------ATTAATGCGTTCAACTGGTTGATGGCACCGTTCTGTTTTGCA-TCTAACACACTCT-------ACTACTTCCAAGCGTAC----ACCATCAGCACCAAGCAACAA--AACAACCAACCGACTACTAACTA--CCCTAGACTAGATAAATTT--CCAGTGCTCACTCTTTTTAAATGTTTGTTAATCGATCCGTTGGCATCGACAG---------TCAAACTCAGTCG---------------------------------------CAACTAAA-----AAATGATTAAAATGTTTTTGATATT--------AAATAATTAG-----------------AACACCTAACAAGCTGCGAGGTCAAGGGATCGGTTCTTAAATGTATTTTCAAATTGTTTA-ATAGTATTATGTATGTATG--CCATGTTTTTATATATGTAAAAATTATCATGTTATTAATTTTGTGATACCGAAACGTACGATACTAAATGACGACATTGACATGACGACTGTGACGGTGACTACGCCTTCGAAAAAGCAATTACGCAGTATTCTATTCTATCCTATCACTATCCTATCTGTATTTAATCTATGCTATGTTTA--TGGTTTGCTGTAACTTAAACACCCGATTGGCTTCGCAATTCCATTCCTCGCCGCTTGCCATAGCTATCCCGCATTATAAGTGTACCCCAGCTTCCGATATGATCTGCTGTGTCTACTACTACTACTAACTCTGACGGCGGCATCAAGCGAGCTCTGAAGCTATACTTA-TTTATCAAATTCACGCTTAATCACAATCCACCCGAAATTCGACAATTGATTG--ATTTATCTATTGCTATATGCTCCTTTCGTTCACACACAGAGAGCGAGGAAGTAATGTAAATTATCGATTACCCCCCTACAAACCGACCGCCTAGAACAATTGGC-----TAGACAGCAGAGCTAACTGGTGAGA------ACAACCC-AAACAAGCAAA---CAACCAAACAACTAAACAGCCAACCATCCAACCGATTCCACATGTAAAACAACTTAACTCGCTGCCGTTAACCACCACCAACTATCTAAGTTAGAACATTATGCTT-TCTATCGATTAGTTCACTTATATCTGTAGATATAT---TCGAGCGACGATTATGTTTGTTGTTTAGCCATATCTGATATTTATTAACGCAATTAAGCAGCTTTGTTATAATTTATTGTT--AAAAGGTCGAGCCTAATGTATCAGTAACTAGAAAACCT----AACCCCTTATGATCGATCGGACCGATTC---AGCCATTGTACCACTGACTAGATGATGATGATGTGCGATAAACAATAAAACGAAAACACAAGTTAAA
GAAAATCGTTCAGTTCTCTTGGTTGATCGTTTGATGGCACC--TCTGTATTGCATTCTAACCCACTCTTCGTATAACTACTACTACTACTACCACTACCACTACTTTAAAGCGACCACGAACAGC--ACCAAACACTAACCAAGCCTAGGCCTAGATAATTTCTGCAACGGCTCACACTATCTACATGTTATATGATCGATTCACTTGCCACGTCAGTTGCCAGGTTCAAGATCAGCCGGCATAAGGCTATGGGGCTACCCAGCTCTTCATTGGTGACTAATTAAACAAGCAAACTTCCACATTGTTATTAAATTTACCCATAAAAATTGTTAGTCATAGATACCAGCTGTAGTAGTTAGCCAGCGACAAGTGC----GACAGAGACTTCTATGTATTTTCAATATGTTCATATAGTATTATATATGTCTGTACAGAATGTTTTTATTTGTATTAATTATTATGTTAATTTGTATCTGAT--CGAAAT----------------TGATAATGTTACGATGAATGCGAACCTAATTA-----TCTCACAATTGTTTACTTACTA-ACTGCTTTGTTTT-TGACTTGCCTATCT---TTCACCTGAAATTAAGTTTAATTGGCTTGCTG--GTTTTAATTTCCTTCCGGCTCT----CTCTCTCCCTC-----------TATCTCTCTCTCTTTA-------ACTCTTGCTTTTCCCATTGACTGCT--------------TACTAATTTCAAAAGCGGCACTCAATGA-----AAACCTATGCTTCTTTTCTCAACTTTAAAGCAAATGA----------AAAATTCAAACATTGATTGATATTGATCTATTGCTATTT--CCCTTTCGTTGACATATAGAAAGCGAAGATATCTTATAAATAAT------CCAACCTCCACACCGACCGCATAGAACCATTGGCATATATAGACAGCAGAAC-----GGTGAGATTCTGCCCAACCCTAAACGAAAAAAGAGCAGCCGTTGACCTTAACCATTAACTCTTAAACTAAAAGTAAA--CAAAATAAGTTA-----------------------AAAGTTTTAATTTAATACAAATAGCGTATATATGTATATGTGTATATATATATATATATATATGACTATAGAAATAATTATTTTTGTCGTTGATCCATGTCTGATATTT---------ATTAAATAGCCTTGTTATAATTTATTGTTACACACAGTCAATTTTAGTTTATCATATTACTTAAACCCTAAAAAAAACATGAGAAGAAAATGGAGTGATCCTCAAGCAATTGTACTATTGACCA------GCTGATGTGCGATAAACAATAAAATATACAGAAAA------
>CG5896 22985412 22985505|23247 chr3R 22985244 22985551 scaffold_20 1583941 1584239 - 8218|168 269
G-------GAGAATCATCATTCGTTGGCAGTTCTTAGAGCGTTCCTTAGTATTAAGTCAAACCCAAAAATATATTAAATACATATTTGTAAACTCAG-TCAA
ATCTGGCCGAGAGT--TGATCCGGCTGCACACTTACACGTACATATGAGTTTT---------------ATAAATAAAATGTAGATTTCTTACCACAGCTTTA
>CG31067 22986434 22986489|23249 chr3R 22986217 22986476 scaffold_3 5605125 5605351 + 2938|226 268
TCGCCAGGGGGTTTCCTGGAATTTAATCGCTTTTCCCACGCTC
TCAATGGGGGGTTTCCTGGAATTTAATCGCTTGTCCGACGCTC
>CG5909 22988502 22988642|23251 chr3R 22987543 22988648 scaffold_3 5606270 5607330 + 23275|966 1127
TG------CCAACCGATACTCTCTTTCCTCAAGACACCAACTTATTTATATTCTTTATATTCTAGTCTTAAGAATTCTTGCCGCAG---------------GATTATCTAGATTTGTAAATTATTTTAATAAATACTATTAGCAGCAATATTTAAAATGCAA
TGAAGACCCCAATCTGACTTATGTGTTTGCAACTTATTCTCATTATTATTTATGTCTTAGTTTAGTTCTCAATGCCATTGCAATAGTCGCAATTCAAGATTGTTGACTTTAGTTTGTAATCTTGTAAAATATATAATATATGCAG----ATTGAAAAT-CAA
>spn-D 22992720 22992843|23255 chr3R 22992539 22992788 scaffold_93 6049 6356 - 3333|225 314
G---------------------GCTACATCACTTTTACTTTGTGTCGAGTTTAAGCATTAGTTAAAAATAGGTACATGCGTATTAGGATT
GTTAGCTTGCATACTATTAAAAGGTACATAAATCTTGTTTTTTATT--TTTTAATTATTTATTAAATATAAGTACATGATTATTTGAATT
>spn-D 22992720 22992843|23256 chr3R 22992808 22993144 scaffold_3 5611787 5612132 + 7375|0 36
GATAATTTTTCTATAAAATAAAAATATGTTT-AGCAA
GACCATTTGCCTGTTGAATAAATTTAACTCTGAACGA
>CG31066 23011992 23012110|23277 chr3R 23011065 23012193 scaffold_3 5628470 5629609 + 19879|1072 1214
CGCATGCCTGCTCCCCCGCCACACCGCACTGCATCCCATCCACAGTGGAACCTGCCTAATGTAAACGACGGCGCATGCGCATGCCGACGTCGATGTCA------------------------ACGGCGACTGCAAGTTCTGCT
CGCATGCGCGCCG--------------GCTGCTCCCTAGTC-----GAGAGTCGCTTAATGTAAACGACGGCGCATGCGCATGCCGACGTCGCTGTCGCTGTCGTTGTCGCAGTCGCAGTCGACGACGCCGTCAACGTTTG--
>DNApol-alpha73 23066826 23066952|23331 chr3R 23064693 23066866 scaffold_13 925447 927571 + 79447|2161 2209
CCT--------GACCACTTTGTGATGATGATAAGGAAAGGATAGTGGGA
GTTAATAAACGAACCAATTCTGATTCATTATATAGAGGCTATAATTGAA
>TfIIA-L 23081864 23082186|23348 chr3R 23080175 23082251 scaffold_3 5398066 5400310 + 60141|1840 2237
TGGATG-------GCAGTTGAGCGAACAGCGGCGGCAGTGTGAATATATAT----------ATTAACAAAAGACA------------TCAAACAAAAAGCCTCATCGAATGCGCCTTCAG----------------------CCCTGGACGACA-----ATGGCTAACCAGACCGGACTCTGCATCACTG-GGCAACATGACCAAGCAACACCGTCTGCACAGAAAGCAACGTACTCGGGC---CGACACTGTATCTTATTTTAGTTCCATCTGTTTTGTATTACGATAGCTTAAGGGTG---TGTTGCAACCAACCATCTCGAT--------TAAATGT----ATTAGAGTGCCGCATAACTTTTGTGTCAATAAACAAAAACATTTGTGAAAGTTA
TCGACGTGAAACAACAAAAGAAAAAAGAAAAGC-ATAGTGTGAAGATCCATCAGATAAGAAATAAAAAGAATACAAACAAATAAAAGACAAACGAAATGCCTCAC--AGTGCGCCTTTAAATACGTTACTAGCACCCCCCTCCCCCAATCCACACACATATACACAACATGACCAAAAGATGTCCAACGGTGGCAGCCAAACTGAT--ACATCCTTTGGAC---ACGCTGCCTGGCCGGGCATATAAAATTGTATCTAACATTAGTTTCAACTATTTTTTGTATTGCTTGCGTCAAATCGAGTTGTTTCAATTAAAAAAATTTGTAATCGTAATATATGTAATAATTACACTGCTCTGCATCTTAT-TGTCAATAAACTGAAAC-TTTGTAAAGAATC
>CG5934 23100038 23100287|23363 chr3R 23099247 23100285 scaffold_3 5419665 5420673 + 18555|819 1075
TCTTCTATAGTCAATCGACCCACCGGTACTGGAAACCAAAAACCTTCTCAAATATGCCTTCTCGTTCACGCTAGAGCTACA--------TGTATATTTTAATCTGTAACACTCGAAATTAAGCTATTGCAATGTTATTTCAGTTGCCCGATTGTCGAATTTGTATTTGTTTAGGCTTAAGCTTATGGCGCGCTATGTAT-TTTATACATAGAAGTAATTAATTTATATAGATAATTAATAAATCAATAATACCCCAC
ACGACGGACGT-----GACCCACT----CTCGAAAT---ATGCCTTGTCATTTTTACATTAATGCTTGTGTTAATGCTGCAAATTAATTGGTGTTTGCTAATCTGTCGAATTTGTGCACAATATTTTTTATTATTAGTTAGAACATACGCTTATATGTGCTATATACATATATATTTATATATATTATA-ATTATATATAATTATACACTTTAATTATTTTTAAATGTAGCTAATTAATAAATCAATATTAACCCGC
>CG5938 23102460 23103140|23366 chr3R 23102009 23103061 scaffold_3 5421994 5423240 + 22417|472 1267
GT--------------------------GCCGTCGTGGAGG-----AGGAGGGGCGTGGTATCACAGGGTCGCGGGGTTGTCGTAATGGTAATTGTAA-----------------------AATAAACACTAGCTGCTAACA---------------CTTTGCTTTAGGCGTTTACGGATCGTGCTAATCAGCAGAGAGTATAGGTACACTAATCCATAGG---------ACAGGACAGGCGCAGGCACAGCACACACAATG---GGCATTAACTAATTT---AGTGCACTCGCAGATTGTCA----------TTTTAAGCTAGCT----ACTATTTCATGTTCGGTTTATAACAAAATTTTG----------CAAGAACTCTAGGCGGTAAGTTTGATTTCTCGTAA-----CTTTAGGGCGCTCT----ACTTTTTCTGTTTTTCGTT------------TAGTTGTAAATTCTTATTTGTT--TCCCAAACTAATGCAATACTATTTAATAAATTTCGTGTTAGGAAATTTACAGTGATTTCGAAAATGTGTTTTTCTAACTGCATTC-ATA-------GTAAATGAATATTTTTCAACTAAGAATTCAAAGC-----------------CCACTTTCGATACCC-------------GAACAAA-------------TTCACACATATTCTGTTCATGTAATGTACAAGGTACATATAT------ATTTTGATAT-ATATCATATGG--TTACCTAAGTA--TTTTGTGGTTTCAATAACTTTA-CAGCACT
ATTGGATGGGTATGCAGTGTGGATCGTTGCAGTCGTTGGGGCAATTATATGGGAGGGGGAATTTTGGGGGAGC-------CTATAATCGTAATTGTAATATACAAAAACAAGAACAACAAAAACAAAAACTAGCAACTAATAAGTAATAATTAATAATTATGCTTTAGGCGTTTACT-CTTGTGC-AACAACTAAACAGAACTAGTTTAGTGAAACATACACACACACACACGTGTTAAGCTAGTGCTAGTTATATGTAGTATTTAGCTTAAACAAATTTTTGAAGGAATATATAGCTAATAAGAACAATTGATTTCATGCTAGTTTAGGGCGTTTTCATTTTTTGTTTAATTCTTAAATTTGAATATTGTTTCGAATACTGCAA-TACTAAATACAATTCTTGTTAAGAACATTTGAAATTGATTCTTGAGCTTTTACTGCATTGAGGTATGCGAAATACGGAAATGGAAGCCGATATTTGGTACTCTTAGTTTAAGATTTTGATATCTAATATCTTTACA--TAAACAATTCATATTCCTTGGATGCGAATCCCTTGATAATTGCCCCCTATATCGAGATATCATTTAATGATGTTCAACTATTCATTAAATGGTGCCTGGATAATATCTGCCATAGTTGATACGCCCTAATTGTGAGTAAACAAAAAGTACTTTTCTCTTCAATTTAAGTTTCTGAATATAATATACGGTTTCCATCTCTGATTCTATTTCGATATTGCGTAATATCGCTTTGCATGCGTACATTTTGATGTTTCAATAGCTTTAATAGCACA
>CG5938 23102460 23103140|23367 chr3R 23103082 23103580 scaffold_3 5423273 5423813 + 7397|0 59
GAACAATAAATACATTTTAATT-TACTTTAGGTTTCATTTATGTATTAATGCTTAAATAT
GAACAATAAATACATTTTATTTATCATTTTTTTTTTTTACATTTCTTAATGCTTAAATAT
>CG3368 23113038 23113170|23369 chr3R 23109577 23115412 scaffold_15 2350590 2356547 - 228704|3568 3734
CATTA--------------GCAAATCTAGT-------TTTATCTAATCTTTAATCATTAAGCCAAAAAGTTATCTT----------TCCTTGTCAA---CGCTTTTACAACTATTCAAATGACGCATTTAATGTTTGTACGCAGTAAACGTAACGAAAGTATCTACC
ATTTATGTATCTGGGTTGTGCTTATCTAGCTGTAGCATTTATCTAATCTTTAAGCA-TAAGCCAAAAAGTCAATGTTAGTCTAGAATTCTCGTAACGCTCGCTTTTACAACT----AAATGACGCATTTACTAATTGAAAGCATT----TTACCAAAAG--------
>Hmu 23116856 23117312|23370 chr3R 23115675 23118327 scaffold_15 2356577 2359218 - 68377|1202 1742
GATCGCAGACGCATCAGCTTCCTCCTGAGTTAATCGGGCATATTCCCGGACGCGAGATTAGTTTCTTCACGCAGTCAAAACCTATTAGGATTATTATCTTTTTCCCTCCAACATCTCAACCACTTTTGGGGAATTTTCAAAGGTTTCTTATTTATCATGCCCCAACTCAGGCT---GTCGAAACCAGTTAAT--TTTAGTCGAA----AGGTAGCTAAATTCAGACTAGCCGAGGGCCTTGCTCATATGATC------CTCGACGGGCAACGCTTTATATGTTGTA-GACTAACATATAATTCTGTTTTGC-----TTAGGCACTAT--------AAACATTCCATTCCTTTTTACAACCGGAAGTGCATTCCATGTAGCTAAGTTAATA------------------------------GTAAACAATGCCCCAAAATTGTT-------------------------AAACTCGAGCAACTTTTGATTTTGTACTGATTTTTTTTCTTATTTTCATTAAAAATAAAGGTATTTTGTAAAA
GA-----------------------------------GCGGCTCCACTGTCTTGAGTTCTCATTTTTGCGGCAGTT--------------CTCTTGCCTTTCTC--------------GCAAATCGCCGAAAAAAAAAAAAAAAACCTAAAGTCTCATGCCCAAACAAACACTCAGGCCAAGGCCAGTTAATAATTTAGTTTGAAACTAGTTAGTTAAATTTTAACTAGCTGCAAGCGTTAACTGAAAAATCTGTTTGTTTAAT--GCAGCTATTTATATGTCGCACAACCTGCATATAATTGAGTTTTGCTATAATCAACCGTTTTCAATTACGAAACATTC----CCAATTGTGAAAAGCATTTGCATTCC----AGTTAAATTCACATTACTTGACGACAACAAGTACGCTCACTATTTAAACAATA-TCCGAAACTGTTGAGCAATTAATAGACACTTAATTCCAAAATGAAAATACTTTTCTTATTGTACTGATCTTTTCT-GTATTTCACTTAAAGAGTAAAGTGTTTTCTAAAA
>Cyp6a18 23306012 23306190|23557 chr3R 23304355 23306022 scaffold_4 5058549 5060236 + 33386|1690 1700
AAACGACAAAC
AATTGAAAAAC
>Cyp6a18 23306012 23306190|23558 chr3R 23306163 23306256 scaffold_15 343054 343161 + 850|0 30
TGAAGCGACCCGTTTGGCA---TTGCATATG
TGATGTGATGTGTATAATACACTCGTATATG
>CG12885 23359305 23359655|23609 chr3R 23356117 23359600 scaffold_15 447998 451573 + 85472|3573 3908
AACAACGCTGAAAACATTTCGAGCTCTAATTTGTTGCCATTTGGGTTAACCAAACCGCCCAGAGCCGCCGAGCCACCCAATTCAATGTGAACGACCGTCTCGATTTATTGCCAATTCAT---------------TGGGCG------------AAAGAAAATTCGAGAAAATCCAGGAAACGCAGAGTGAAA--AATGGAAAATAAAAGA--------GAAGCGACAAATTCGTGAAAAGTAGTAGTTTTCTGGTGGCAAAAATGGCGAACCTCAAGCCGCACAAAAAAGTTTCTG---CTTACTTAGGCGACGACAAGCTAACAATGCTCGTTCAA
AACAA-GCGCAAAACACTTC-ACTTCTAATTTGCTGCCATTTGGGTTAACCATTGGAC---GACCAATCTAGCGACC--ATTCAATGAGACCGCA---TTCAATTTATGTCCATCGCATTTCCCACTTTTAGCCTGTGCGGCACCGCCCCTCAACGTATGCAGAAGAAAATC---GACACACAATGTGGAACGAAAGTATAATAAAACACGGAAACGGAAACAAAAGATT--TCAAAAGCTCTGCTATGCT-------------TTGAGCTTTAAATTGAATAAAGAGCTCTATGAAATATTTTAAGGCATTTTAAAAACATTAATCAATGTTAAA
>CG12885 23359305 23359655|23610 chr3R 23359601 23360465 scaffold_15 452427 453315 + 478|0 59
TTCAATAGTTTTAGTTGCAT-----GTCAAATAAAGCAAATAAACTCTAAAATACAACAT
TTTAATAATAATAATAATATAAGGAGACAAATAAAGCACACATCTTTTTGGCTATTATTT
>raps 23411045 23412099|23676 chr3R 23410661 23411271 scaffold_13 1759420 1759995 - 16781|399 625
AGAGTTGTAGTCCAAAAAGCTGAAGTCCAACCAAACAATCCTATAAATCCATCCCTGGCCGCAGCTCCTGACTCATTTCGTTGTAAGCCCATCTTGCGGCCATTTATTCAGTCGTTTATTTTCGGAAATTGGCTGCTAAACATTTTGTTCTTTTACAAGATTTATATATACACACGTACACGAAAAGCATTAATTTATGAATAGCAACTAACCACGTAACCAAATAT
-GTGCTG----CCAAGTAGATGCA-TCCAATTGGGCTGTCCATTTAGTCAGCTGCT-GCTGCTGCTGCTCGCTCTCTTCATT------TAATTTTTGTATCATTTGTCTG--CGCACATTTGGGCCATTTGGTCGCTTGGCTAACACATTTGTTGTAAGATTTCTGCGTA------------------ACAATTTTATTTATAGCCACTAAACAAGTAACCAAAAAT
>raps 23411045 23412099|23677 chr3R 23411316 23412171 scaffold_13 1760419 1761215 - 5334|0 840
TCCAACGGATGCACACACTCATCCACTCATGACTCATTACATACTCCACCATGAGCTGGCCATGATATTGAACGATATG--------CACTCGAGTCTTACGATATTAACGTTTTAATTGCATGTGCAAGTAGTTTAAGCCGGATAATACTAATGTACTAATCCAATTTGCTCAATAGACGGAAC--------CAAGTCTTCTCTACGAT----CAACGATCTTACATTCTCGTAGCCACATTCAGCTAAATATTA--AGTTTTAAGTCCATCGAACC--------CACTC-----TACATGTAAGCAATG-CATTTTCCAAATCAAAATCTAACTACAGA--TATATCCAATTGTAACTATGAGTATTGCATTTTTCTATCAATCTATCGATCGATCTAAACTCTGAACATATTTTAAGCCACTTACAAT--TTTTGTTAGTATATTAACAAGACACAAAGAATAGCAGCTCG------GAATTCCATTTGAGGACCGGCGCTTGTGCAAGCACTTAGCATACGATATACACAACCAATCATACTTACACATATACAAGAAACATATGAACA-ATATATATATAGTTATACCAATGTCTAACGATTTGCCTCTTCGGGTATTGTTCTACACAATATATACAATACAAGTTATATATACACAAAACAAAAACACAAAACTGAGTTCGAGTTGT--ACGAAATGAAGCCAAAATTTATTAATGTTATACTTTTTTGTAGCACG-AGATCTACGGGATCTGCGAAT------GAAAGATACCATACAGGCGGACAATTATGT-CGTGTATTATTAAATATTAAAATCAAAAAATGTTTGCTGA
TCTAGCACGCACACATATGTATACAATTATGA-TATTTAGCCATTTTCTCAAAAGCATGCT----TCTTAAACCAAAAGAAAAACAACACGAAATTTTAAAGATATTAATGTTTGAATTGCATGT------------AACTAGTTATTAAGTACAAAATAGTCCAAATAAC--AATAGATTAAACATACATTACATACATTCATTATTATTTTGCCAAAACTGTAGAGCTTAGCGCTAAACTTTTGCCAATTGTTACAAATCTTAACTATA-CGAACTTGAACAAACATTCACACGTACATATAAGCAATGGCATTTTCAAAGCGAAAAAATGAATGAAAAACCTTTTCCAATTGTAACTATGAGTATTGCATTTTTT------TCTACTAAAGAACTTACAT-----ACATAATCTTATATATATAATATCATTTTTTGATTTCATTTAAATTGTTTCTTTTTGAGCGGTTCGTTCGGTGTCTGTTCTTTAAGATCCAGAGCCGTT--------TTAGCATATAGCAGACTCTACAAAT-ATATTTATATATATAT-----ATATAAGAGTATATATATACATA-CAATACGAATA------------------CAGATATCTTTATA--------------------GTTTACACACACAGAACATTGATAAGTGTTTTA--TTGATTTATTGATAAAGTGAAGCCAAAATTTATGAATGTTA-------TTAATGCATGCATATTTATAATGATTACAAATCAGATCGAAACACATCATAATGGTGTATG--TATGTAAACGTATTATTAAATATTAAAATC--AAATTGTTTGCTGA
>Mtl 23464423 23465005|23732 chr3R 23463328 23470228 scaffold_13 1830695 1837661 - 125208|1127 1759
ATAAG--GTAGAATGTTATTGGCTTTGGCGAAGTATAGAGATTCCTCGGAAGCGACACGTACACCGGCACAATGGCCACAACAAATTGACACTCACGCAGCGC--CCTCATCG---ACAAATCAATTACATGTATTTATTTATAAAATTCTCCGTACTCTCGTAAAAGGCACCGAACCCGGAAAGAAACTCTAAACAAACGATAAATATTGTACGAAATTCTGTGAATCGAAATGTACTGCCATCAAAATTCGTATGAAATTTCTCTTTGTTTGGCTGTTTTTTTCTGCGGATCGTTGCTGTCACACATTTGGCAAAC----CACGATTCCCTCCCGC--AACAACTAAAAAAAACATTGTTAACAAAATCGGTACCACAGATAAATCATAAATCTAATGCA-CTACA--TATGTAGAAATCTAGTCAATTGAATCGAATGTATTGTACGAAT----------------AGTATCTGGCAGAAAGAGAAAATTATAACAACCGCAGCAAACATTGGTTTCGCATATC-----------------ACGAGCATCTATGCATTTCCTAGTTT-CCCATTAAATGTATTATAGTTATATATAGCCATGAGCTAAGGCAGCCAATCCGCAGCTAACC
ATAAGCAGCGGAA----ATCGGCATCAGAGAA-TACTCAGAACCAGCAGAGAGAACAAACACACAGATAAAATGG----AAC------GCCCTTACGTATCTCTACCTAAGCGTGAACAAATCAACAACA----------AATCACAACTTGCGCACTT------GATTCATTGAGC---------------------ATTATCATTTTTTTAC-----TCTGTAATTTTGAATAT----------------GTATAAGTTTAAATATTATTTG--CATAATTCACTGAGAACCGC--ATGGCACAAA---AGAAAACACAATACGACTCCCTCCCATTAGAAAACTAAAAGTAATTAACATAAAAAAAGCAGCAGCAC--TTAAACCATAATTCAAAAGCAGCTACACCCATATTGAAATCTAGTCAATTGAATCGAATGTATTGTACTAATTTTAATCAAGAGCAGCAGCAAATAACTAAAAGAAAAAACCAGA--AACCAACG-AAACATTGGTTTCGCATATCAGTGCTAAAGTATAGAGAACAATATCTAAGCAATTCCTAATTTGTTTATTAAATGTATTATAATTA---------------TAATGTAGCCCAGGCG----TTTCC
>CG12880 23517836 23518514|23785 chr3R 23517424 23517897 scaffold_13 1899095 1899587 - 24607|415 493
--TCCAACGGCATACCCTCGGTATAC---------------CCAGGGAATACCCTTGAAAGACTGCGGTGCCGGGCGTT
GTTCAACTTTCATATTTTCTTTGTATTCCGCTGTCAATTGACCTGGGCATGCATCTATAAGACTGTGGTG-TGGGCATT
>CG12880 23517836 23518514|23786 chr3R 23518416 23518510 scaffold_13 1899806 1899915 - 3791|0 109
AAGCAACTGCGGCAAGCAATAAA----------TTATGGCATAATCAAGC-----TAGGTTTAAGTGCATGAACGACTTTGTTTTGATAAATAAAAATATTGACTGATTT
AGGCAACTGTGACTAACAATCAACTGGAATTTATTATGAATTAATCAGCTACTCGTATGTTTAAGTGCATGTACGAATTTGTTTAAGCAAATAAATATGACGACTGATTT
>btz 23528656 23529174|23792 chr3R 23526082 23528862 scaffold_13 1909038 1912115 - 83290|2970 3177
GTGCAGGCGTACGCCGGCTTGCCGCCACAGCAGCAGCAGAGACGAGGCCA-ACGGATAGCGCCGCCGCCCTCCTCCGGCTACTCAATGCTGCAGCCGCACGCTGGCTACTATCGACCTCCGCCCCCGCCGCACTAGTGCGGACAGCCCAGCTCCTAACTCAACTCATACGATTTTTTTTCCCCCATTCTGTCCTTGGGTCTGCGACTC
GTGCACGTCTATGCCAATCCGCGACAGCAGCAGCACCGCGTGCGCAGCCATACGGGCGA----ACTGATGTCCAGTGGCTATGCCATGCTGCCGCCTCAGGTTGGCTATTATCG-----CGCTCACTAGGAAGTGGCTCGAAAA---------CTGACATTTTTGACGAGATTGTTTCT------TATTGCGGCAGGGTCTGTGACTC
>CG5017 23739384 23739505|24050 chr3R 23739073 23742156 scaffold_13 2188566 2191884 - 72149|341 548
AC-------------------------------------------ATTTTACACCGCTTATATAC---------AGTTTACATACATTTTTAACTCGAGTCACCGAAC---------TATTGGC------------------------CTGTCCTTACCCACTACATACCAACCAAATAAACATTTCATTA-TACATATTTACCAAAA
ACCAACGCCCCCCCCCCCCCCACCCATCAAAAAAAAAAAAAAGAAATTTTTAAACACTAGTTAACTGAGAATTGAGTTTCCACAAATTTTCCACCGACGTTTTCAAACGAAGTTTCCTAATTGCGTTTCAGAAAGCGAAACTGAACAATTGTTTTTTCCACTTTCACGGCTACCAAATAAACATTTCATCAGTTTGTCAATTCCAAAA
>mRpS22 23743906 23743970|24051 chr3R 23742689 23744770 scaffold_13 2192118 2194225 - 65653|1246 1314
GATCTATTCGCTTTATTGTTATCGATTTCTATGTACTAA----TAAATACCAGCTAGGTCAAGATTTCT
AAGCGCATATCTTTTTATTAAT--ATTGTTATGCACTAAAAATAAAATACAATTTAGGCAAATTTTT--
>RpL4 23750513 23750644|24058 chr3R 23748542 23751229 scaffold_13 576605 579281 - 111710|2006 2150
AC----TTACTTTCCCCCGAGTAG------AGCTGACACACTTTTATATTATAATAAACCACAAAAGTTGTATGAATTTTATTCATAATACATAGAGTGCGCGACAGTAATGCT--CATTAAACT-CTTAGTCTTAGGCACATCA
ACTGATTTACTTTCCACGTAATAGCCGACTACAAAACACACTCTTTTTATATAATAAATAACAAAAGTTGTATGAATTTTATTCATAATACA------GTGCGAAAGTAATATCTATATTAAACTATTTAGTCTTAGGCCA----
>CG5508 23758393 23758844|24067 chr3R 23755401 23758840 scaffold_13 583487 587027 - 112770|3141 3713
CAATGGTCGCTCGCTTT--------------------ATTTTTGGCACTCAT-------GTTTTATCCTTGTATAGTG--CATATCCACTTAAGTTTAAAGTGCGTACTCCTAGATCTTAGACT---------TAGCTATGTCTAGTTTTATAGTCATACGAGT-----TTATAT--ATGCCAAAGTGC-----------TAGCTTTACTGTAACTAAGCGACAAACAGTGAAATATGAACAAATTTCTAATGTATAATTTAAAAACCTTTTCTATATGCGGCCTCTGTGCGGCAGGACAACCGAAAACAAT--------------------------ATCAACTATA-CTGAACTGATTGATTAAACTTCA--------------TAACTTTATAATAGAACA----TCTTACATAATAATCGTCTCACTTTATTTTCACAACATCCATCTGTTCAGCACAATCTCCACTAGATTGTCTCTAAAAAACATACGTCATAACTTTTAGGA-------AATAAA-----------TACATGTGGTAGATAAAAATATT------CATTCATAATA
CAATATGCTTTTGTTTTCACATATAATTTTTTCTTTACGTTTTGGCACTAGTTTCTCTATTTCTTTCGTTACAAAGTAGTTAAATCTACTTAAGATTAAAGTGCATACTCTTAGATCTAACAGTAAGACGTAATATATATATTTAGTTCTTTAGACGTACGAATACGAGTTATGCCAATGCCAAAGAGCTTCCTACATTTTAACTGTAGGTTAGCTAAGCGAAAACCA---AAACTGGAACAAAAT----ATATATAATTGAA-----------------TGCATATATATGTTCATACAAATGTATATAATCATATTTTTTTATGGGCAGATGTTGAAGCAACTATATCTAAACTTATAAATATAATTTCAACCAAATAATGAACTGATTTGATAATGAAATAAAATTTTTGTAAAACAACGAAACTAAATTATTGTTGCAACGCCTTTTTGTTTA----------------ATTGTTTTTATTAATCAATTG--ATAAATTTTAAAATTAGTCCAATAAAATAAATGTTTTTACCCTTGTGAGATTATAATTTTTCATGACATCTTCGACA
>CG5508 23758393 23758844|24068 chr3R 23758841 23760754 scaffold_13 587547 589493 - 82389|0 3
CAAC
CAAC
>CG5514 23768165 23768205|24075 chr3R 23768033 23768887 scaffold_13 596449 597350 - 11777|135 175
AGCCACCACTAGTAGTCCTAACCAAACCGCAATGGAGCTGG
-------CATAGTTTCTCTAAA------GTGTTAAAACTGG
>CG5514 23768310 23768507|24075 chr3R 23768033 23768887 scaffold_13 596449 597350 - 11777|286 502
ACGCCCTGTCCGCCAGGCGACTCAGCAAGAAGCTCTGCCAGCAGCAGCGGTACACCAACGATGATCTCTACAAGCCCCGTCCAATCCTGTCGCAGCGCTCTCGTCGCCGGGGCCTGGACTCCATTCTCTAGCCAACGGATAACCTGTTATC-------------------GGAAACAATAAAAGGCAATTGTTGTTAATGCATTTGACATAAAACAA
GCGATTTGTCCGCTAGAAGGCTCAGCCAGAAGCTCTGCCAGCAGCAACGCTATACGAACGATGATCTCTATAAGCCCCGTCCACTTTTGTCGCAACGTTCGCGCCGTCGCGGCCTGGATTCAATCCTCTAGTTGGTGCTTAACACTTTAACCACAAATCAAATCATATATACAAATATAAAAGGGCAATTGTTGCTGTTGCATTTGACATAAAACAA
>Gp93 23777548 23777882|24085 chr3R 23776603 23778408 scaffold_13 608700 610466 - 68096|949 1341
ACTAC-----------------------TTCACCTCACCCACTGTCCAAATA--GATTGT----ACATAAGAGTGTGAAGTTCAGACTGAGTTTTAAACCGCCACCGGGTGGCCGGGCGGGCACTC------CATCAACATTACA--------------CGCTAGATTCTAAGT--AAAATAATTTCGTAGTCCTTCGCCCACGCCGTCATCACCGCCAGTCGCCCAGAGAGCACTCCACCATTTCAGCCAGCACACTTGGTTGCTCAAGCGTTTTCTTTTT--TCGAAAGCAAGTGAATTATGTATTTATACAATGTAATATGCTTAGTACACAACAGATTCCAAT-CAAAACA-AATAAAGA---CAAATGAATTTAAAACTAAAACAACT
GCTGCAGGCAGACATCACACATACCCATTCTATACCATCCCACATCCATATATGAATTGTGTAAATATACGATTGTGGCAGACAGACTGAGTACATACCCTACGCATGTGCGCAGGTGATACACTACCGTTGCATCAACAGTACATCTACCTAGGCACGTGTTTAGTTTTAAGTAAAAAAAAATTTCATAGCACATCG--------------------------CCGTAAAGCTCTCTGC-------GTCAA-------AGTCGTTCACGTGTTTGTTGTACGGCTCAAAAAAGCTACATTTTGATTTAATATATTTAAACAAATGAGATATATAAATGAATTGAATGCGTAACAGAGTAAAGATTCCAAATAAATTTAAA-----------T
>CG4849 23792633 23792688|24093 chr3R 23788424 23792711 scaffold_15 2507506 2512018 + 183030|4510 4565
ACTTCCCACAAATCAGGAATCGGGAAAACAAATAAAACATTTAGACATACTTTCCG
TCTAACGACACAATAAAATCTTGCATGGTGGACAAAATGTTTAAACGGAT------
>CG12870 23911157 23911498|24216 chr3R 23909669 23911910 scaffold_15 2650729 2653062 + 28637|1735 2104
ACGCCAAAAGCCAAAAACCGAAAA----TCCAAGCAAAATTTTTAAGTACAGCCGCAATTTTCTGAACAGAAACAAAACC-AAACTGAGCTGTAAATAAAATGCGAAGCGCAGAACACACAAATTACAAAACAATTGATGGCATCTTGAAGTTTGGCAATTTTAGAGAGCTGCACCTCAGAAACAAAATGCAAGCGCGAATGCAAAATCCGAAATC----------CCACACCCACAT----------AAATATATATATCTTTATATATATATAAAA---CTAGAGCATAATTATCTGTCAACGCCCGTTGAAAAAGCTTCGGGAGAAGCAAACAATTATTATGTATATGCAAGCAAAAAAAAAAAAAA
ACAACAGAAAAAAAAAAGAAAAAAAAATACTATCCAAATTTTTTAAGTACAGCAGAAG--TTCTGAACAGAAACATAGCCAAAAATCAGCTGTAAAT-AAATGCGAAGCGCCGAG-----AAATT----TACAATTGACGTCAATTTGGCGTCCGTCGAATGTTGAGTGCTGCACCCAAATATCAAAAGCCAAAAGC-----CAAAAACCGAAAACCAAAGTAGAACCACAACAAAATATGCTAAAGCACACACATCCATTTGCAATTGTTTATGAAGTATTTGGTTCATAAACACTTGCACGCGGCCCTTGTATAAGCCTT-----AAACAGAAAAATAAAATATTAAAAGAAACAAAAAAAAAAAATA
>CG4787 24063102 24063107|24380 chr3R 24062612 24063859 scaffold_15 2819000 2820237 + 44320|496 501
GTTTGA
------
>Mst98Ca 24118186 24118385|24431 chr3R 24117005 24118190 scaffold_1594 1325 2496 - 53668|1220 1224
CATCA
TATCA
>Mst98Cb 24119435 24119589|24434 chr3R 24119315 24119770 scaffold_50 502783 503287 + 3360|129 316
TCTGTAAAACAGCTGGAAAGATCTACTTGACGTCTGCCAAAAACATTTTGTGACAACTCCGCGTTATGGAAGTCCACATCCGCGCTCAATTATATGACA-----------GTCCAAATTAACTTTGCA---------------AGTTTTGTAAATTAAAGAAG------TGCATTGATACAATAT-TT
CCTATAC-----CTAAATACAACCAAAT------TGATAAGGCGATACTATGTTTAGCATGTAATCTGTCAATGTGCTTACATGTTTATTTATAGAATAGAAAGAATGGCGGCCAACCGAGCTTAGCATTATCAGTGATAAGCAATTTTG-ATATTAAACAAATTCTCCTTCATGATCAAAATATATT
>Moca-cyp 24170738 24170889|24492 chr3R 24170064 24170744 scaffold_15 2920814 2921425 + 18995|701 707
AAAACTA
TTACCTA
>Moca-cyp 24170738 24170889|24493 chr3R 24170745 24171005 scaffold_5 1337484 1337759 - 1039|0 159
ATCCTAGACTTTAGTTGATATACCCCAAACGGTGGCCGACCTGGTCAAGTTCCACCAGTTTCAGGTGGAACTTTCAAATTGCAATTGTAAA--AATCGCGACCCCCAATTTTGT----------AGCCAAGTCTGTTTAATAAAGG---TAAACGTCACT
A-CCTTTACTTTGGTTTATTTAT---ATACAGTTTTCCATCTG--------TCATTTATCTCTCAGAATACTTTTATATT-TATATGCAAACTAATTTCAAAATCCAATTTTGTTTTTTCTAAGATTCACATCTATTAAATCAGGAATTTGTTTGAAAAT
>beat-VI 24298750 24298931|24627 chr3R 24298360 24300542 scaffold_21 1923641 1926055 + 34218|396 607
CCGCAGCGGACCGCTTAAATCCGCCATGGAAAACGCAAATG--CAGCCGGACAAGTCACCTCCAAGGA----------------TGAAACAACAGCGCGAGCTGTGTAATTAAAAAATAACAAA------------ACAGAACGAGTGCTTGATGGCAGAAAAACAGCAAAGGATATGCAAAAATCAAAAGGAAAAAACAAAAAAAAAAACG
CCA----GGACACACTGGACATGCCACATAA---GCAAATGGTCGAGCAGACACAATAACGGCAACAACACGAAGCACAGGCTCCGGGCCAGCAGCCCGCGAAGTGTAATTAAAAAATAACAAATGCAAACAATGCACAAAAGTGCAGCTTGCAAATTATAAAAAAGCAAAAGA----CAAAACAAAAAAAAAAAAAACAACAAAAAA----
>Hrb98DE 24429404 24429420|24714 chr3R 24427228 24441888 scaffold_22 293626 308598 - 536653|2323 2339
GAGAGATTCCGGACGAG
G-GCGCCCCCAGACGAG
>Hrb98DE 24429783 24430817|24714 chr3R 24427228 24441888 scaffold_22 293626 308598 - 536653|2818 4044
GTGATAAAGTAAAAGTCGCTCAGTATAATCCCAAAATTCAAAGTCAAGTAAACGATACGCAATTCAATGATCAATATGATGAAGTATGAACGCACGTTCATAGTCCTAAGAAGTTTTCCGAGCACCACAAACCAAACATTAC--------AGATTGATTGATCAGGATCAGTGCAGTGCAGTGAAGTCGTAAGAAGTTTGGTTCAGTCT---------------TGGATTAGAACAGAAAG-----------------------------AGAGATCAGTACCAA--------------GCAAGACCAG--------------------ACCAATACAGAGT-----GCAGTGCAGTGCAGAGCAGTGTGTGAGCTAAACAGAAGAAACACA--------------GCAAGTGGCAGTACACGTACACAGAAGGTGACCAGGATTCCATTCAATTTGTCTTTGCAAGCG------------ATGATA------AATTGAATGTCAAGAGGCGCATCGAA---AACTATCCAATACCCACAGAATTGTAATCTATAATTTGCAACCCATATGTAGCAGCCC-----------ATATAAGTAACATTGTAATTAGATCCACAAAGCCGACGACAGGCCAA------------ACATTTGTATCTCCACCACACGAGCAACCAACCAACCAACCTACTTAAAACAACCAGTCATAAACGAATCAGCTATGTAAAACTTCAAGGCGGCAGCCGAGAGATATGTTTCTTTGGTTGCAGACAGCTCTCCAGTCCATCGGCTGCCGGC---AACTTTTGATAATCAGAGCAGAAA---ACACAAA---ATATATAAAAACATGTATTACATTTTACAACTTTACTAGGCTAAG--TTCTCATAGAATTAAA-TCGAGTAGAGCGTGCGG--AGCGACTTCTGCATCCATCCGCACGCTACCCTAGTCTTAATAATTTTAC-TATTCAAGT-----TCTAAGCGAACCTGACCGTGTGTGGAGGAATCTAG-ATACTTAGATTTTTGAATAAGTGTCG-ACATGGATATAACCTCTTCCGC---TGCTTAGATGTAACCGATCAACAAACAACCTTTATTGTAATTTATACCTTTTAGCAAGCAGTCTG----TCTGAGGAGTCAGCGCAATTATAC------------TTAACAAAATTTACATTTTAATGTAGCTAAAAAA--TACAAGATGC
GTGGTAAATTAGCAGTGGCTCAGTTTATTCCCAAAAGTCAAAGTCAAGTAAACGATACGCAATTCAATGAT--------------ATGAGCAACAACTCATATACCTAAGAAGTTTTCCGAGAACATCCATACCAATATCATGACAGAGAAGATAAAT--ATCAGGAACAGTGCAGTGCAGTCGTGT------GAGATTGGTTCAGTCAAAGTCAGTACAAGTACAGAGCAGAGCAGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGGTGCGTTATTCAGAGAGCAGTTGCAACAGCAGCAGCAGCAGCAACAGCAGCAGCAGAGTTAACAGAACTTACAAATGCAGAGAAGACAGAAGTGAAATGAAGAGAAGTG----AATTAAGCAGCAGCGAGACCACCCTCACACATACGCATCCAGCAGTACACGTACACAGCAGCTGGCCAGGATTCAATGAGAGTAATTTGCACAGTTACGATACGATATTATGATATACGATAATTGA--TTTAACACATACGTCAAACCTACCTATTCAATATTCAAAATAGAATAATATTTATATT--CATCATTTTGTAGCCAACCTAATAATTAAAACAAAAGGAACATTGTAA----AATAGTAATGTCGCATACAACTCGAGTTAAATTTTGTACCCTTATAGCCACAATCCTTCAGTAAGCAGTAATATTACTTAGTATATACAA--------AAACACATTAAAAACGAAAAACTTCAGGGCGACAGCCGACTAA-ATCTATATTCAAGCGACCACTTCCAAATGGTTGAATGGCTATCGCCCAAAATTTCTGATAATCAGTGCAAAAATCTACACAAATCTATATTTAAACAAATGTATTAATATTT-----TTCTTTAGGTTTAAGCTTCTCATAATTTTAAAATCGAGTAGAGCGTGCGCTCATCTTTTTCAAGAGCCGCTCGC--GCTTGTCTAGCATTAAATACTACATATATTTACATATATATCTTAGCGA--------------GGAGGAGCTTCTTATGCTCGTTTTTGTAAGTGACTATGACGCATTGAACTAAATTATCTCCCAAATGTTTAGTTGTAACCAA---AAGAACAA--TTAATTGTAACCGAAACCTTGTAGCAGTTTGTATGCAGTTCTCAAAGGTCAGCGCCATTAAGGATTTCTAATATGTTAACAAAATTTACATTTTAATGTAGCAAAGAAAGATATAAAATAC
>Hrb98DE 24431184 24431499|24714 chr3R 24427228 24441888 scaffold_22 293626 308598 - 536653|4495 4838
TTGGCTGCGAAAAGTA-TGCGAAGCGCTGAAA-GACTGCCGCCGCGCTACTGAATGCAGCCACGGA-------------AGGTGC--------CCGCGTTTGCTAGCAACTCCGGT--CGCTGGGTTTCGGTTCCCTCTGGGTAAGTAATC-CTCCGCAGATCCCAAATCCGGAAAAAGTTGTAACTTTCAGGTGGTC--TGAATCGGCTCGTCGCACCTGAGGATGGAATGGATGTTGAACGGTTTCCCCTCTGCACCATCGTAAATATACGACTTTTATTTATTACTTCATTTTATTTTCATTATTACTATCTTTGAATAAAGAAATTTCAGAATACCAAAC
TTGGCTA--AAAAGTAATGCAAAGCGCTGAAATGACGGTCGCCAAGCTA----ACTCAGCCACAAAGCGGACAATCTACACGTGCAATTGGGTCAGCACTGCCAAACATTTGCGGCAACCCTCGGAAT--GGTCGACTTGGGTAAGTTGTAGCTGCACACGT----AAACAGGGAAGTGTTGTAATTTTCAGGTAGCCATTTAAACGGAT-----------------GGATGCGCGCTG------------CCTACACAATTGAGTTTATTTGTTTTTAATACATATATAAATTTT------------------------TAAATAAATACTAAAATTTTCAAC
>CG9986 24433613 24434096|24714 chr3R 24427228 24441888 scaffold_22 293626 308598 - 536653|7049 7587
GC---CGCGAAAACATTCCTCAAACTTCACTTTGCAAATAGACTTTAAATTATTTGTATGAATATACAGTTTTATTCAGATTCAGAGTT-ATATATGTATGTATATGCTTCGTTATTCGTCGCTTCGCTCAAAAAGTTGTTTAAACTTCAA-CACACTCAGAATTTTCTGTAAATGTTCCTGTATCAATTTTTGTCAATA--------------------------ATTCATCGCAACCTTTT--CAAAACTACAACACTACAATGT-ATAAGTACATATTCTCATAT-ATATAGTTATATTTTAGGCATAGGTATCATGTGTGTATATTACTTCCAAATGTAAATGTTTATCTTTGGTTTCG---AACCCC--CATGCATTTCGTGT----TGTGTGTGTATCTCTGTGGATTGTATTTTAGTCTGT-----TCGGTTATCTATTACGATTATAATAATGATACTTTGAATAACTCTG---ACCATTAACTTGTAAATATGCTTTTG---AAATATATATTTATGTATATCTAAACAA
TTATTCGTAAACACATTCCAAGGGAAATATTTCG-------ACTCAAATTTATTTATATGAATATACA-CTTTATTAGGCTTTATAGTTTATATTTAAATGTATATGCTTCTTTTCATGTCGC-------AAACAGTTGTTTAAACAAAAAACACACTCAGAATTGT-TGTAAATGTTCCTGTATCCAATTTCGACAATATAATTATCCATAGTTTTTTAATTAAACTTCAATGCAAACGTTTTGCAAAACTACAACACTACTTTTTTATAAATACAT----TTATATTGTATAGGTAATCTGTGTGTGTATATGT-ATTTATGTATATTATTTCCAAATTTAAATGTTTATCTTTGGTTTCATTAGACCCCGTCATGCAATTTGTGTCCATTTTTTGTATA-ATGTGTGGGT-GTAATTCAGTTTGTGTTCTTCGGTTATCTATAATGGTTAATATGAATAT---TTGAATAACTCTGCTTGTTGTTAACTTGTAAATATGCGTTTTGTCAAATAAATATATATGTATATAT------
>CG9989 24497677 24497743|24781 chr3R 24497633 24497840 scaffold_29 193359 193574 + 825|50 126
GGTCAAACTAAATATTTTCTTAGATCTTGAAAAT-GTGCATATTAAAATAAATATAAAGTG---------GTATTTG
AGCCAGATTAACTATTTACATTTTTCTTGAATTTGGTACATTTTCCTGTAACTTTTGATTGCAAATATTTTTATGTG
>CG9990 24520881 24521661|24802 chr3R 24517853 24521740 scaffold_29 222782 226965 + 160760|3172 4195
GA-----------------TCTTCAGATAT---TACGCTACTTTTAGATGC--CTAACTT-------------------TAGAACACGATAAGTCGT----------------------CCTAA---TTAGTTTACACCCACTT-------------------------------CGGGTCTTCTTCTTAATTCCACTTTCGAGTTTCACTTCCCTTCGTATCTGCCCAAATGTCATAAATTATTTAAGCACATTCGCAGCT-----TTCCTTAGCT------TTCCACTCGGCACTCGTTTTTCCTTAGACTAAGTTCCGCAC---TTTCGTAGTTTAAAGCGTAAGGTTTAGGTACTCCTAAATGAAATGTTGTAAATATTTTGTGTC-----------------ACGAATTCAGTAAT-----------CCGTTG-------CTCTAGATGTCCATTATTT--GCAACCCTCTGTACTAGACCTTTTCTC---------------------------------------GACGCCGACACGGGCAGTTTATCACATACAA-----ACGCAACTAATTTTATATATTTTCAATGGACTGTGATTG--------TTTTTTCTACATAATTCACGCGAATACACGTAGGGC------------AAGCCTAAACAAAAAGAAAAC-------ACAATGAAAA----CGAACAAAAACAA-------TGGTGGGTTTTGTTATTAACATTAAGTAGCTTAAAGCATTTTTGTATGGGTTTAAGTTTTTTAAGGTAAAACATAATTAAATACAATAATG-----TACGCAACCCTAAAGAGTATGTAAA---AATATATTTC--AGGAAATATTTTGCGCAGAGCATAAATATTTCACAACGAACAAACATAAGACAATGAAC-AACGAACAAGTGAAAAACGTTCTTATTTAAGTAAA--TATTAATGTGAACGCAGTTATGTATAAATAATAATAAAGCGTGAATAAATAAATAAAGTTAAATTT
AATGCGCCGGGCGCGGGGCTCTTAAGTTTTAGAAAAACTAACTTTAAATGCGTCAAACTTAATTAGTTTGCGTTTAGACTAGGCCGCTTTTAGTAGTCATCCCTGTCTGCCCCTTCTCCCCTAAGCCCTCACCTTCACACACTTAACACACCTCTTAAAAATTCGGAGGTTCTAGCGTGTTTTCAGCTCTGCTTTATTTACT-GTCTTTTTCACTTTTCAATCTGCCTAAATGTCATAAATTATTTAAGCACACATGCAACTTATTCTTCTTCTGTTACTATGTTTCATTCCTTGCAAACTTTTCCTTAATTTAAGTTGTGCACATTTTTCGTAGTTTAATTCATAAGGTTTAGGTA--CATAAATAAATTGTTGTAAATATTTAGAATCTGCAACGTTATCACACGGCAAAACCAACAATGGAGCCCCCAATAGTTAGTGACGTCTCGGTGCGTCGAATATTTTCGCAAGAAACTTTCATGAACTTATTTTCTTAAAAAAAAAAGAAATAGAAAAAAGACAAACAGAAAAAAACACAAAAACAAGCATAAAAAAACGGGCAAAAAGCACACAACTAATTTTATATATTTTCAATGGACTGTGATTGTACTTTTTTTTTGTTTTAATATTGCACGCATATTCAACTTGGGCGCGGGCCCCAAGAAGTATACATAAACAGAAAACAAGCGAAACAAGAAAAAATATCAAACAAAAAAAAATAATATTGGTGGGGTTTGTTAGTAACATTAAGTAGCTTAAAACATTTTTGTATGGGTTTAAGTTTTTTAAGTTAAAACGTAATTAAATGCATTAATGTTAACTATACTACTTAAATGATAATATAAATGTTATATATTTCTGTGGAAATGTTATGCAAGCGGCATAAATATTTCTCAACGAACAAA------ACAACAAACAAACGAACAACACAAAATACTTCTGATGTAAGCAACATTAATTATGTGAACGCAATTATGTATAAATAATAAAAA----TGAATAAAATCCAAACATTAAAGCC
>huntingtin 24559337 24560073|24841 chr3R 24558898 24561434 scaffold_29 273529 275886 + 44909|460 1277
TATGATACGCAGATACCATACCATACGATACGATGCGATGACTAGGTATCGGGTCCCAGCCGTAGGGAAACCCAACTATTTATCTTGCGTTTAATTCCCAATCGCAGCTAAAAATAAAAAGAAAGGAACGCCGAGTTTGGCAGGCGGCTAAACTTGCTGCAAAGACAAGCGCAAGCGTGAATAACTAATTGCCCCAAGCTGC--------GGAG-----AAAGTTTAAGCGGATGTCCCTC--TTCCTTGCGTTTGTACTACTTCATCAACTCGAAGGACCCTTGCAGACCCCAGCGAATGGAAAGTTTTTTAATAGTTGGCGAATACAAAATTAATTTATGCTTTACATTATGTGTAACTAATATTTAAATTATTGCAAACGAA---TGTCCG-CCACCACGGCCCGCAATTCCTAATC------TGGTCGAAAGTTTAACGAGGCCAGCAGCGAGCGACCCGCAATTAATTCCTGCG-----GCTTTCGACAAGGACCCAGAACACGGAAATTATGTTCTTCTCAGTTTTCGGCTAAAG-TTGATCATTTATTTATTATGACGCTGCCTGCTGGGCAAGAAATAGAATACCGGCCGAAGGACGCTAGTGGGCATTAGTATGCGCCTTAGCCAATTGCCGGCTAATTCCCAATCAAAATTACTTAAAAATTCCATTATGCAAA-----CGCAAGCCCCA------------------CGCTTTGTACTCCTACTGTAA----------------------TCAAAAT-----AATAACCATATTGTTTAATGAAATAAAAATTGCTATTAAAACGA-
TA--------------------------------GCGTTAAA-----ATCGGAATAGAGC---------ACCCAAGGATT----TCGCAGCGGATTT---------GGCAAAAAAAAAAAAAACGGATAAAAAGGATGATAAAAAAGAACAACTTGCGCCCAGGACAAGCGCAAGCGTGAATAACTAATTGCTCTGCTCGGCTCGACGTTGGCGCTTGCAAAGTTCAGACGGATGTCCTCCAACTCCTTG---TCGTCCTACT----------------------------CGAGCCAGGCGAAAGTTCTTTAATAGTTTGCGAATTCAAAATTAATTTATGGTTTACATTATGTGTAACTAATATTTAAATTATTGCCAACCCGCCCCGTCTGCCCATCCCTACCCACACTCTCTATCCAACGCTAGCTCGAAACTTTAA----------------CGACCCGCAATTAATTCCTGCGATGCTGCTCTCTGCCGCATTTTAGA------AAATTGTGTTCTTGTCGGTTATTCGCGAAAGTTTTTTCATTTATGTATTG-------GCTTGTTCAG-------------GCTGAGCGGGCAGCGCACGCAGTCATTAGTATGCCGCTTAATCAATTCCTAGTT------------AAATTAATTAAAAATTCCATAATGCAAAATTGGCGTGCACCCCAAAAATTGTAACCAGCGATCAACTTATATTCCAATTGTAACTCACATGTATTGTTCAGAGTCTTAAAATACAAAAAAAAAAAAAAACATTTATGCAATAAAATTCAAGCTTAATATGAT
>CG1646 24642886 24643082|24916 chr3R 24640414 24645298 scaffold_29 355529 360488 + 174359|2609 2903
GTTCGCTGCCTAGATGTAACCCACT-CCGCCACCTGTAGCTCTAAGACGCTACGGCTTGTTTAGTTTTGCCTTGCTGCTCTGTTAAGTT---GTACACATCTAATTGTAATTTTTTA-------------------------------------------------TCAACCCCTATTTGA---------------------GCCCACAAAATAACCCC-----ACCATTGCGAA-------------------AAATAAAATATACCAGCTTTTTATCGGTCCACCATAATCGC
G---ACAGTCTAGCAGTCGGTCATTGTCATTCCCCGCATC-------CGCACAGCTTTTGTTAGTGTCAGCGTAA-GCTACGTTGAACTCTAGTGTAAAGATATTTGTAATTTTATAATTGATTCTAAAAATACATAATTAAAAGAATATGTAGCATCTAAGTGCTTAAATACATATGTGAATATTATGTGCAAACAGCCACGCCTACAAGA-AACCTCACAAAACCAATACAAATTCAAATTCTATACAATATTAATAAAGGATATTAA--TTTAATCGGTTCACTCTAA----
>CG1647 24649914 24650181|24919 chr3R 24649507 24653349 scaffold_29 364711 368901 + 86771|454 881
ACTTCGGATAACTGATTGGCCTTAGCCATATATCCAATTTACACTAGCATGCCCTCCTCATTCTATTAGGAGCTGTAAATATGTACGGAATGGTGAATTGTGCTTTTGTAATTGGATACGAGTAGAATTGGAGCTACCACGAATTGA---------------------GAATAAACTTCTTTCGGA------------------------------------------------------------------------------------TAGCATTATTTTTAAGTTAGATATACACAACTTT----------ATTACATAAATTAATGGCTTATATG-----TTAGCATATGTAAGTATA----------------------------------------ATGTATTTAAATACATACATCGCACA
GCT--AGATAATAAAT----CCTAAC---------------------------------------------------------------ATAGTTAA----------GCAAAAACATACGCTCACATTTATAGAGGCCATAAATCGACCCACTTTGTACATATGAAATGCATATATTCCATGCTGAATCCTTAACCTAAACGCATAATACTCGTATTATGTATATAAATATATACTTTACCAAAATTCGAATAAAGTAATGCATATAAAGCGGCAATTAGTTTAAGTTAGATATACACAACTTTATTTACGTAAATTACATAAATTAATGGCTTATATAATACTATAGAATATATATGTATGTAAAACTATATATATATATAGAATACATGTACGTAGATGTACTTATTTAAATACACAAATCGCACA
>CG14528 24703417 24703529|24963 chr3R 24696292 24703438 scaffold_20 1149376 1156709 + 165298|7711 7734
--TAAAGCCCTATATAGTTCATTC
GCCGCAGCTCTGAAATGTTAATCC
>CG14528 24703417 24703529|24964 chr3R 24703439 24703736 scaffold_14 386507 386720 + -2410|0 92
GTTTTTTAATTAACTAATTTTGCTTTGATGTTGCCTAACTTGGTAAGCTCAAATGAATGAATGAAAAATAAACAAACAAAT--ATAATAGCAT
GGGATTAGGTTAAAAAATCAT-------------CTAATTTAAGAAAC--------------------TAATTCAGCAAATTCCTGATGTCAT
>CG14526 24711539 24711740|24969 chr3R 24709473 24711708 scaffold_20 1160372 1162651 + 59777|2077 2293
TT---AGATTGACCCGAAATGTCATTCCTCAGTT-------------TGACCATGTTTACCCTATTTGGA-------------------TTTGCTAATATTGAGGGTATTA-----AAATTATAGTTTCGAGTAAGCGCGAAG-------AAATTTTGTTGACTTTGGTCAAGAAATTCAAATTTTAAAATCTGTGAAAGAGATAAAATGTAAAAAT
CTTTAAAGGCAAGCTCAAGAGTTTTTCTCTAGTTATAAAGGCTCTCCTACCCCTAAATATGCTATATAAAAATAAGTTTTTATTATCCCTGTGATAGCATTTCGAATGTTCATTCTAAACTGCATTCTCCGGAAAATGTTCAATATTTACAAGCTATATTAAAGTTGAATAAAACATACATTTATGCAAATCTTTGTAAAAGGCAAAAAGAAAACAT
>Doa 24747465 24748500|24994 chr3R 24745083 24748632 scaffold_20 1198239 1202073 + 122140|2623 3887
GAATTACAGCGATTTGGTTATTGTTGACAG-----ACAGCGCTAATTAAGTAC------------------TCACTCATGCAAACATACACTCAAGGCAGTCGTCCAGCAACGTCTTGCACC------------CGACTCGTAGAGTAGACCAGCAA----------------------------------------CTTTACGACGAACCCTATTTTAAGAGCAAAAGTCTTATTTTAAATTTTTG-AACTTGACTTGTAT---AGATGTTTATTATACAAA------AATCCATTGATCCCTTTTGATCCTTTGTTTCCAAATACTTCGAGCACATGTTGCTGTGCATTATATTTAGAGCTGTGTAGCGCCATGCTGCGCTTGTGCATTGTACCAT--ACCCGCCAACAGTG-TTTGTTCTGTAATGATAACCAAATCGTGTATATTATTGAAAGTGCGGTGCGTCTTCCCGACACCAG-------AACCTAATTGTAAATGTC-TTGCATTGTGCACACCCCAAGGTGGAGGAGACTAATTGAAC--------CGACTGC------------AAACCGATAATTGGAATA-----------TACAAATGTAGTTGTAA------AATAAGAAAGTCGCTTAAGCGCTAGTTGGAATGCATCCCCATGTCTACACCTGTCACTGAACCGGGAGCCGAC--TAATTTGTAATTAATGCACCA--TTTCGAGAGCGTGAACTGAAAGCTAATGCA--AGCCATTATGTACAC-CGCCCACGAATGTAC----GGATTATTGTAA-ATGTAAAGAGCAATTGTTATGCCACC----ATGTGTACACTTC-----------AGCGATCGCAGCGC---ATTTTGTGTAAATTCAGTAGCAGCCCCAGAGTCA-TCTCTCTTAGAATACGTTTTCAAATGTGTAGAACCGTTGCCGGCCTGTTTTGTTCGTTTTCGTT----TACAACCGAATATCGAAAGATCAACCCATTTACACATTGCTACACACAAA--------------------------------GTATAATTGAATATACTTATACATACTTAATTCAAATGATTGTGAGTTAGTTTAATATTACATAAATATTAATTATAAATTACATTATTTGCAAT---TTAACCCGATCAACCAGCATATAAGATA--------------------------AAAACCAATATTGTCAAGTTATTAAAAAGTGAAATAAATCTTAAATAAAAAA
GAATTACAGCGATTTGGTTATTGTTGACAGCAGCAACAACGTTAATCAAGCACACAACTACAAATATGCGTACACACACACACACATACAATGAGAACAGTCATCAATCAATGTAATCCAACATTATTGAGCAGCAGAGCGCAGCGGAGAGCAGCAAACAATAACAACTACAACTACAACTACAGTAATATTAATATATTAATGGCGAACCTTAATTTAAGTTCTAAAGTCTTATTTAGAAATTTTGTAACTTGACTTGTATGGAAGACAATTTCTACACAAATAACCCAATCGTTAAGTAAATATTGATTGTGTGCCTGC----------TGCACGCGCTGC--TCCATTAGAT--------------------------CCTGTGCATTGTCTCATCCATCAGCCAATCGTGTTTTGTTTTGTAATGATAACCAAATCGTGCATAATATTGATAATGCGTCCTCCTCTCCCGATACAGACGCCGCCAACCTAAATGTAAATGCCACAGAAATGTGCACAGTCTTACCTTGAGATAAATAATAGATCTTCAAACACGACTGCAATGTTTAAAGAAAATCTATAAAAAAGAAAAAAAAAAAAGCTACAATTGTAAATGTAATACATGTATAAGAAAATCGATAAAGCGCTAGTTGAAATGCAGCTCCATGTGCA-AGCTGTCATTTGCCATGGACTTGCTTATAATCTGTAATTAATTTACTATTTTTCGAGTGCGTGAGATGTAAGCTAATGCAAGAGCCATTATACACACACACCCATAGCTAAACCCTTAAATCGATATCATATGTAAAGATCAATTATTATGACGCCTCCGGAGGGTCCACGACAAAGAACAAAAAGCAAACGCAGCGTTTGTTTTTATATAAATTATGTAGCAG--CCAGAATCATTTTCTCTTAGGATATGTTT---AATGTCTAGAATCGGCGCT-GTTTGTTTAGTTTATTTACGTCAACATACACCCAAACACACCCACACCAACACATATACACATATATTTATATGAAAAGAACACTGGCAAGTGGGGAATGCGAGAAGTATATAGATACATATACTTA-AAATACTTAATTCAAATGATTGTGAGTTAGTTTAATATTACATAAATATTAATT----ATTACATTATTTGCAATTAATTAACCCGGTCTACCAGCATATAAGATCTACAAAAAAAAAAAATATACAAAAATACAACTATTATTGTCAAGTTATTTAAAACTGAAATAAATTTT-----AAAAA
>CG1951 24856052 24856661|25135 chr3R 24854087 24856606 scaffold_839 602 3113 + 90157|2059 2623
ACACAGCCGTAGTTAATAACAATTGATAGATATCCATGTT--CCATACATCCGATATACAAAGCAACTATATTTAGCTGTCGGCGTCGATTTATGTGGCACAAAATTCTAA--GCGTCAGTAATCATTGGTATTACCATTTTTGCTGGCAATATCACTCGA-TTACCTTTTTCGATTAGAACTTGTGTTGATACATTGGACGCTGACACATATATTTATACATAAAATCTAATCTGTGCAAGTGTATGAGTGTG--TCAGTCTTAATGTGTGCGTGTTTGTTAGTAATGTTTTAAATTATATTATGTAGACTTAAACGCAAGGCTTTTGAGC-CCTTGCTCGTTGCCACATTCCGCAATCGATATCAAATGTGAAACGAAACGACCGCATGTAGTT-AAATATAATAGTACATTAGCTAGACAAAATAGCCAACTA-ACTATGTTCTGACGTATTTTTTACAAAGCATATTTAATTCACTTTCACGCATGAGTTCTTATTGTAATTCTACGCAAATCCAATTACTAAGACACGAAATTGTACAGACATATATAGTTTTATTTATC
ACACATCATT--CCCGCGACAGCCTACCGAG---CATGTCTGCCAAATAGCCAATGTTTTAACTAACTATTCCGTACTATATATATATATATATTT------AAATTATAAATGAGTGTATGTGCAATTGTGTGTCTGTGTATGTGCGTGTGATTGTGTGAGTTAGTGTTTTTAAGCA------GTTTTGAAGTTTTGCTCGTTGTA--------TCATTCAACAAATATCAATTTTAAAAGTGAATGTGCATAATTTATTGTTAGTCTAGGCAAACAGTCAAGCAACCTATTA---TATATAGAGTACATCTAGATGTG----TATTGTGCAATTTGCTCCTTAGTGTATCTCA---------------GTGTACACAAGC---------TAGTTAAAATATACT----TATTATCAATTAAAAACAGCCAACTATAATTTATTGTAATTTATTTGT-------ATTCTCTCATTCTCTATACTTTACG------TAATATGAATCTACAACAATTTAA--AGTATAACAAAGCGCTCTTTTTACATTAATACATTCATTTGCC
>CG1957 24862715 24862789|25141 chr3R 24862566 24864604 scaffold_3194 3 2016 + 98688|149 223
TATTCAAAATGACGTTTGTGTAAGCCCCTAATGTTTTACTTGTTAAGATTAGAAAGTTTTTATATAAGAGAATCA
GGAATAAAACTAAGCTATGG-----------------ACATGTCAAGTCG-------TTTAATATA------TTA
>Pkc98E 24871947 24873018|25149 chr3R 24869901 24872158 scaffold_13 3040726 3042917 - 100606|2077 2335
G---------GCCCAACGATCGCAGTTCATGTTAACCTACCAGTTCGATGGATTGCGATGCGGTCGTCTGGAGCCCCGGTCGAATTGGGGGTGGCCCAAGTCCAGCCAGATCGCCA---TCGCGACGAGCTGTCATCCAGCGAAAGCAGTATAATATTTTCATTTCC----CGTAACTCCCCGGCGCAC--------------TCGCCGT-----------------CCCCATTGTTGTCTGTTTCCAGTCGTAGTCGT
AACGGCGACCGTTGGATTATTGGATTGGATATGCGCTTA--GTTTTGGCGGGAAATAAACCAGCAAACTGGA---TCAGTCGAA--AGAAAAAGCACAGGGCAATTC--GTTGCCAGGTTTTTAATTAGATGTAGCCCAATGCTAATCTCTTAGCCTATTCCTAGCCCTAGCTTATCTCCCTAGCACATGAACCTAAAATTTGCTTCCGTTGAACACTTTATGAACGCTTTATTGTTGTCTGTTTCCAGTTGTCGTCTT
>Pkc98E 24871947 24873018|25150 chr3R 24872159 24872371 scaffold_22 2044058 2044301 + -2081|0 259
GATGCTTGTCCTCGTTTCGTTACCGGTCCTGTG----TGTTGATCACTCATACGCATCCAACTACCAGTGCCAATTGTCGAAACTGCTGGCTTCAAATTGAATTTTGTGGCGCACAAGCCCGAAACCCT--TTTCCCC-----------GCTTCAAGCTCCACGC---CTGTTGGAATTCATTTAT-------------GTTGTTT---GCCAAGCTCCCAAAA---AAAAAAACCAAAA--------AAAAAAGGAAAG
CG-GCTCGCACACAGCCCATACCCATTCCTGAGCACCTGCTTACCACTTGT-CACAGC---GTGTCATCCACAACGGTCGAGA--GCTGATAGCATACAAAA---------GCTAAAGCCCAAACGCCTAACGTACCCACATAGCACAAACTGTAACCCATACGCACACAGTTAGCATCCAATCCTAACCCCAGCCCCAGCAGTTTGGGGCGAAGCGTACAAAGCGCAGCACAACTGAAACTCATTGCAATACACGAACA
>Pkc98E 24871947 24873018|25151 chr3R 24872372 24874184 scaffold_13 3043345 3045239 - 18721|0 710
AAAAGAAAAGAAAGAAGG---AAGAGATACCCCCACCCATCTAGTCAATGC--CCAGTG--GCTGAGTGCATTTTGTTATTAGTTATTTATTGATTGTTTGACGTGCCGAATCTCAAGTTTCGCACTCGCAGACCGACAGCATCCAACCAGAGATCTATTTACGGGAGGCGAGGCACTTGCTCC-AAGCGAATCTCAAGGGAATTCCTAACACAATAGCCGA---AATGTGCCGTCTGTACCACAAACACCACACAATACATGCGACCACACGGATCTAGTTTCATTTGTTTTACATATTCGAAATCTTGCACAACTTCCTTCTCAAGTATTAAAGCGATATTATTTTAAAGTTACCTTATTGTTAAACATGAATATTTATAAAACGAACAAAAACAAAAACAAAAAAAAAAAAAAACCAACAAAAACAAAATGAAGC--------------------CAAAAAACCCTAATACAAACGCATACAATTTA--CCAACAAAATGGAAAAAG----AAAGTAAAGCTAA----------CTAATCATAGAGGTAAAGCTAAACC-----------CACAAAGAGAATGTCTATAAAATTCATAT-TAATTTATGCTAAACAAACTATGAATACAAAAC-----GTGTTTAGTCCGTAAGCAAACGAGGAGAAGAACAAACAAATTACATATATATATATATATAAACATATAT
AAAAGAAAAGAACTATTGCCAAAAATATGCCCTGA----TCTAGTCAATGTTGCAAATGCAGCGCCATGCTTTTTGTTATTAGTTTTTTATTTATTA----ATGTGCCGGAA--------TCGCACCCAAATGCAGATAACTCGCAAC-------------------AGCGAGGCACTTGCTCCTACGCGAATCTCAAGAGAATGTC----ACAACAGCCAATACAACAAGCCGTCTGTATACACAAGAAAATACGATAAAAACATTTAAAGAACTTTA-------------TGCGTATTCGAAATGTTGCACAATTTCCTTCTCAAGTATTAAAGCGATATTATTTTAAAATTAACTTATTGTTATACAT--ATAAATATAATATTAT----AACATGAACAAATTAAAAGGAAAAACAATTAAGCCAAAATTAAACAAATACGTTAACACATACACCAAAACACACACACACACACACAAACAAACCGAGCTAAACAAATGCAGAAAATTAAACAATAAAACTAATTAAATGAAACTAAGCTTAGTCGTAAAATGAGAACAAACTTTAAAGTAAAACCAAAACATTTCTAAAGT-CATATATATTTTATGGAACACAAACTACAAATACAAAACAAAATGTGTTTAGCCTATAAGTTGGAGAATATATGTATATGTA---TATATATATATGTATATATGAACATATAT
>CG11837 24876369 24876443|25153 chr3R 24875082 24877926 scaffold_13 3046062 3048709 - 83078|1292 1366
TTGTATTTATTCTATAGATCGTTAAACTTTGTACAATTTACCAACATTAATATAAATGTTAAGCCAACGAACTTT
TGCGAACTGCTT---------TTAAGCATGGTGTA------------TAATCGTAATCATAACTTAA--GACCTT
>CG11841 24877889 24878047|25153 chr3R 24875082 24877926 scaffold_13 3046062 3048709 - 83078|2859 2896
ATGACATGATTGTTTTTAAATTCGTTTAATCTCTTACA
CTGA-ATATTTGTATTTAA-------TAAACTCTAACA
>CG11841 24877889 24878047|25154 chr3R 24877927 24878348 scaffold_13 1347466 1347878 - -1756|0 129
CTTGAGACCCTGGGCTGGGTTCTGAGAAAGCCAGAAATATACAAGTTATTAATTAATGATTGT--AAATCCACCACCGACTATAAAAATTTGCATCTGGGTTTGCTAAG-------CAAACCGGTTTGGA
TATGTG---------------------------GATCTATATAAATAATTGCACGATCATTGTTAAAATTGA-----AGCTTGGACAGTTTAAAGTCCTGTCTGCTAATGGACATCCAATTCTTTTATGG
>Sirt7 24884402 24884926|25159 chr3R 24881485 24884829 scaffold_13 3051823 3055200 - 100282|3138 3580
ATTC--CCATTTATGTACGGCCGTGATTCCTCCCTAAGATAAGAAGGTGAAATGATTACCCTTGAGTCAATGGCTTTTTGGAAACGTTTGATCTTATACTTGATATGAAGGAGCTAGCTGTTTCTTTTCTACGGAAAAGATCGACCTGCCCTCACCGAGACATATGCTCGCTTCAATAGTATTTTAGCTATAGGTTTA--TAAGTCATAGATGATAGTGGCAGCTAGAATAGAATAGGGTTCCTTTTATTTAGACGTGT--TTTTTAAAATGCTCTATTTGTCA--GTCTTTGATTATATTAATAGGTCAGCCCGTTTTTGTCTATTTTCGATATTTAGTTTAATTTTAATGGGTTTGATTGTATGTCACAATTGTGTAACTCTTGTCCTGGTATTTTGGTGCACTTGCTGC-------AGAAATCATTTGACCTTGTTTTTA
ATCCAGCCGCCAGTGCAC-ACCATGTCGCTTCAATAGTAT---------------TTGAGCATAGTCTAGTAGCTTTAGTAATAAGCATAGTATTATA------------------------------------AGTACATCGACATATATTTAT----ATATATACTTAGCTC-GTAGCGCCACTCGCATTAGTTTAGTTAAGTTAAGTATGTGCAT-CCACATAAAGCAAAGTATTTTGTTTGTCATGTAGTCGTGTAGTCCTTGGTCCAATTTAGTTTTAAGTGTCTCCGATTGCAG------------CTGCTGAAATCTATGTAAATTTGTCATTTTATTTCTA----TTTTGATTTTATG---CAATTGTGTA----TAAGTTTGGTTTTTTCAT--ACTCACTGTATTTTTGAGATACTTTTAGATTTTATTTTTG
>Sirt7 24884402 24884926|25160 chr3R 24884830 24885107 scaffold_13 3055836 3056146 - 3462|0 114
ATTATTAATATAGGTTTTT----ACTTTTAGAAC---GCTAACC--------TAACATCCGCCCCTC--TACACACGTAAGTTAAATAA-AGAAAATAAGCATTATGGTATAATG
ATTGCTACTATAATTTGTTCTATACTTTTAAAATAAAGCTAACTACCCCAAGTAAAATTTTGTTTTCAATATCTATGTAAATTAGCTATTAGAAGAAAAACAGGCGAAAATTATG
>CG11876 24941682 24941918|25209 chr3R 24938852 24944186 scaffold_3 5682123 5687598 + 160397|3094 3339
GAACTCAGGACTAGCCAGCCTCCCGATCGGAACCCCCAGCTAACTAAATTTATAGTCCAAGTCGAAA-CGCTGCCTCTGGTCTAACCGAGCTGCCCCCATAATAGTGCACCGAACTGGAAATTGAA--TGTTCTGAAAATAAAGCACTACCGCTTTCGGGTTTTGATTAGTTTTCGGACGTTCTAGTTTAATTA------TTTGGTTATAGAAATCTCTTGTGAAAAATAAACGAAAACATAAATA
GAAC---------GAAAACATACAAACCACAGGCACATGCTAACTAAATTAATTGCCCTCAACGAAATCGATAGGCATAGGTTGTCCAAAAT-----TGTAAATGCGCGGCAAATCGAAAAGTGTAATTGTTTTTA---TTGGGCCCCATCGATAGCG--TTTTGTTACCATATGCAGCATACTAGTTGAATTAATTATATTTGGTTATCGAAATCTCT-GCATCAAATAAAATGTACAACTATTT
>CG11877 24943836 24944112|25209 chr3R 24938852 24944186 scaffold_3 5682123 5687598 + 160397|5328 5667
TCGCAGACCAACAGACGTCCGATCTTTCGGCTATATCATCATGAGACACGCGTGTTATCTTTTACAAATTAGACTAAGT------------------------------AATCGTTTCTGTGACAGC------------------------------ACGTCGGTGTTTATCGGCAGTTGCTGGTTTTAGCGTTATCCTTTGGTTTACAGAACTAATTTTGTATCAATTATATATATACATATATATTCGCTGTGTGTAAAGAAAATGCGCCTTTTGGATTTAT-TTCTATTACATAACTTA-TTCGCCTTTATTTAATAAAAA-TGGTTCTCTATAAAT
--------------ACCACTTACCTGGTTGCTGCGT-----------GCGTGTGTTATATCTCTTCAATTAGGTTAGGTTGGTTTGGGCTGAAGGGGCGGTAGAGCGGGGAGCCTTCATGAGATAACCATCCATAGAAATTATGTAAAATATAACCAATGGAAATGTCTCCCCGAATGTATGAGAATTATTGTCACAGTTT--TCTTGGGTGTTATTGATGGCTGCTGTTTTTATGTGCATAGA-AGGAACTAATTTTGAGTAGACTACGCGCTTTTGTTTTATATTTTATTTCATAACTTATTTTTCTTTTATTTAATAAAAATTGATTCACTATAAAT
>CG11880 24953596 24953972|25217 chr3R 24951103 24956995 scaffold_3 5695913 5702106 + 150037|2509 3059
G---------------------------------------------------------AGACAGCAGTGCAAATTATAACTTTATTGAAGTA-----------------------------------AAACATATATATA--------------------TATATTTATTATAGCCCAAAACGAAACGATCGGGGTTGTGAGCG---ATTGCTCA-------------------------------ACCGGCTGCAATTGG-GTTTGCATTAAATGCACGCTCCTTTGCCAATACTCTTAAT-CTTTAAT----CTAGTGTATATAATACGCCAGTATCCGTATCCATATGTAAAGTTTTTTGTGCGGCTAGACATGTGATAGGCGCGG---------ACCATAAAGACCAAAAGTAATACCATA-CAATAACATGTATACAGAGACACAAAAGTACATATCTCACATTCATGAAGTTTAAGTTAACG--------ATAATTATTATAAT----TTTCGAATTTAATAAAAATGAATTCATTGAAGACACA
GAATCCATAGGCAAAGTCGGCTGGTCGCAAAACCAAAGCAATATCCCTTGATACATGTAAATGACAGTGCAAATTGTAGCCTAGACGAAGTATGTTGAAGATGCTTGCTTGGAAAGACATATCCATTATATATATATATAAATTATATTTATATATACATTATATTTATCATACGTTAACATAAGCCAC---AGGTTGTGCGCGAATATTGCTCATGCGAAATTTATTTAGATGGCAACAATTTGGGCCGGCTGCAATAGGTATTTACATGCAATGTAAA---ATTAACCAA----CTTAATGCTCCAATTTTGCCAATATATATA--------------GTATTTTAATTGAAATTATTTTTTG----TATACATATAATGTATGCAGTACTGTGCATCTATATATGTATAATGCAATTTGAAATCTATAATATGTATATATTTATGCACATATCAATATTTGTGGTTCAGCGAGTTTATTATAACGGGTGCTCAACTATTGATGTGATAAGGCGCTGAATCCTAAATAACTTAATTC--TAAACACAGA
>Vha100-1 24963409 24963704|25222 chr3R 24960012 24964276 scaffold_20 19532 23623 - 139406|3583 3901
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ACCGAATAGACGGTCGACGAGATATGAACAACAACCAAAGCATGTAGAGAGTCTCATCGCT---TATGCAGTTAAAT----AAGTACATATAATATGCCAATCTAATGGAATTTAATAGAAATCTGCTTATTAATCGTTCTATTTATATAATTAATAATCGTGAATTTA----------TGCAACGTATAGCCCTA----------------TTACATTGTCTAACGTTCTTCATAGTCGTTTATCGTGTTTACTCATTAATATAAATATATATATATATATCTAAAGCGCCCGCTTC-TGGGGTCAGCGCCAAAACA-
>CG14516 24971221 24971515|25230 chr3R 24970521 24972647 scaffold_20 30359 32619 - 73925|713 1116
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GACACAAATCCACACATCCATCAGCACGTGGCTACAGCTGCAGCAGTATTACATTTTGCAAACAAAAGTGGAGCTTTTAATTTTTAGCATGGGGCAACCAGTGCATTTATATATTTATGTGTATATTTTAGTATTTATGTCGAGTGTCATGTCAAGTCAAA---GCCAAAGAAACCTTTATAGCGCTTGATCAAACTGTTTCGTGGTCGCCCATTTGGTCGACCTTACAAAAGCTAGTAGAACCCAGTGTACATTTTTTTACTTTTAATGT-----CCTTTTTCTTAAGATCTATGAGAATCTGATCTTTTATTTCGTATATACTTGTATTGTACTTAAATGTAAAGAATAAATCGTAATTTGTTCAAATTTGTAACTACTTTTATTTTGTTCGGTTGTAAAA-
>Pglym78 24975458 24975977|25233 chr3R 24974697 24976965 scaffold_21 562042 564373 + 118507|767 1339
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--ATGAAGCTCTAATTTTGTCGAAATACA-------AAAGCACAATTGCTAGAGATTGTTAAGTCCAGATAGATGCTGGAAATATCC--TCCCGTTTATTGTTGTGGTTCTCGTAGCATTAATTGGTTCTCATACCCACTCCCCACTACAGTTAATAAATAATTTATTATAACACAAAATAATTATAAGCTCAGGTTTGGAGTGGAACATTCATTTTATTGCCCCGTGGGCTGTATTATATGCATTGTTTAGTGACTTCATCACTTGCGCTTCTTCTTGCCATCTTTGGCCAATTCGAGGCCCAATATACACTTGGGTGGCACCTTGTAGGTTTCCGTGAGTAGCGTGTATATGAAACGAATTTGATTGCCCTGCACCTGGAGCTGCTCGTGCTTCTGATGCGGCAACTTCACAATGCTTGTGCTGGCGGCGGCGCCCTGTTTGCACAGTTTTATCAGCTCGGCCATAATGATGCCATAGGCTTCGATGTTGCTGACCAGCGTCACCTTTTTGTTGCCGGACCGTGTGGCCAGGGACATTTGAATTTGCGGCTTGCCGCTGGTATCCTTGCCG
>Rpn2 24982836 24982981|25237 chr3R 24982523 24982988 scaffold_21 570325 570810 + 22961|313 479
ATGGGCATGCTGTTTGTCATTATCTAAGTGA--ATCCTGTTCGATTTTCAACCTTGC--------TTACGTTTCATGAGAACAACTAATCGGCAAGAACACGA-----------AATGCTAATCCCTAATTATAACACAATAAATGGTCATCATATTAGATGTAAAT
ATGGGCATGTTGTTTGTCATTATCTAAGTAAACATGTTTTTGGTTTTTCAATATTGCATTCAAATGTATTTTTCACCAAATTTACTAAACAACAACAAAAAAATACACAGAACTAACGCTAATCCATAATTAC-CCATAATAAATATTCATCGCTTATGATGTAAAA
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ACAGGTTCATCTGT
A-------ACCTAA
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TATAATAGTTAAAAGAACAAACTAACGAGAAAGAGGTTGTCGTCGTCGAACGCGGC-----------------------------------------------------GCGTTGGAGAAGTGCAAAACCTTTCCAATTTGAAAATAGTTTTCCTGCTATGTGTGCTCGTTCCCACAAGCGCGGCAATACCAACTCATACCAACCCACGGCTCCAACACCACCAGATGCAGCAACAACTGCATCAACAGCAACATCGGCTCAGAACAAGCACAAGCAGCGAAAGCCTGCACTT----CGCCAAGCGGTGATTGGGAAAAG-GGGCTGCAGCTGGAGTTGGAGTTGCAGCCAGAGTAGAAGCTGGAGCTGGAGCTGGAGAAGATGACAATGCAGCGATTAGAGCAATGCAG--------AACTTGAACTCTAC------------------GACGGCGGCAGCTGGAAAAATGTTTGCCCCGATCCCCGGGACACCGACTCAGTCACTCAGTCCGTCCCAATGCGCGGCATTTCCGTTCGGAAA-AAAAAGAGGATGCTGTCGAGAAGGAAGGCCCTCGATCGA--TTCGATGCTGATGCATTCTGCAGGGGTGGGGGGAACGTAGTGATCATGTTTGTAGCATCTAAATAAAGTACCTGTAATGGTTTTCATTAAGTAATGCGTC-GTCTTTGGCTTCTTGGTTTA
TATAATAGTTAAAATAACAAACTAACGAGAAAGAAGTTGCCTGTAACAACAGCAGCAGCAACAGCGGCGGCAGCGAAGCCGCAAACAAAGCGAACAAAAAGAGTTGGCTGCGTTGGCGAAGTGCAAAACCTTTCCAATTTGAAAATAGC----------TGTGTGCTCGTTCCCACAA-------------------------------------------------ACAACAACAACCAGAAGAAGAACAACAAC-------AACAAGCACTAT--------GCCTGCAATTGCAGCGTCAAATGG-----GCGAGAAGTGAGCGGACGCTCGGTCGATCGCCGCAAGCA-------------------------AGAAGATGACAATGCAGCGATTAGAGCAAAGCAGAACAACGCAACTTGAACTCTGCTCAACGAAGACTCTTCCAGGCAGCAGCAGCTGGAAAAATGCTT--------------------------------------GTTCCAATGCGCGGCATTTCCGTTTGCCCGTGTGAGGATGATGCTGCAGCG------GCCACTTGTACTATGTTCTGTGCTG-TCCAATCGGCCGGACGGACAAGAAA--ACTAATCACATTTATTAAATCAAAATAAAATATCTGCGCAATTTATTA--AAGCATTTTGTCTGTCTTTTATTTCTTGGCTTA
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TCATCTCTGCCTAGCCCAGCTCCGCTCAAAGCAGCAGCCGCCCTCATTTAGACCAACAACAACAACAGCAGCAGTAACAATAAAGTTTGAGATTTAAAATGCAGGAA-------GAGCACAATGCCCATTTCTTAAGTTCCAACTGATAAGTACAC------------------------------TAAAGATATCCAATATCTGTCGTGCTGCCTC----------CCACGTTTGGCGGAATCGTGTGTCTC-GCCTCCTGCATTT---TGTACTGGAGAATTTGTTTGTAACCGCCT---AAGCATA
---------------------------------------------ATT----------------------GCAATACAAATTC--TCCGAGATTCAAAATGCAGCAGCTGCAGCAGGCACGATGCCTATTTC-TAAGTTCCAACTGATTAGTAATTATGAATGAGAGTCGAAAACGTCGTGCTGTGTAAACACCTTAAATACATATTGTCCTGGTTTGCTCAGCACACCGAAATTTTTGGTATTTCATGTTTCAGCCTTCTGCATTTTCATTAACTGAAGAATTGTTTTGTAATTGCGTTTAAAACACA
>Ef1gamma 25047499 25047835|25298 chr3R 25047754 25049078 scaffold_21 1621613 1623067 - 17925|0 99
ACACAGCATGATATTGTCAACGGAACAGCCGCCTGCAGTCAGAA--AAT---ATTTATAAAAAAT--------AAAAGGTTTTCTAT-----TAATAACA
ATACCCCAAGATAATCTAATTGGAAAGATAGCCTGAAGGTCGAAGCAATCGAATTTGTTAAGAATGGTTCCCAAGGAGCTTTCCTACATATGTGATAGGG
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GCTCA
ACTAA
>CG14514 25051911 25052006|25302 chr3R 25051989 25052669 scaffold_21 1626735 1627394 - 32806|0 17
TCAATCGAAGAATATTAG
TTAATCAAAGTATATCAG
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AAGGTTTTTGCAACGCTGCGGCTGGCCATCAAATGTAAAACGGATGTGTCCAAAGGCA---GCATTAAGTAAGAAACTATATGCATAGAGAGCAGCTATATGGGAACTTACATTAATTAACACACACACACACACACACACACATCTATATATATATATATACAAACATATACATACGTCTCTTAGTTTAGGTCACACAAGTGTGCGCATAAGTTGAAGCAGAAGTCTGTTTGTTAAACAATGTACACGT-TTAAGCTCTATCGTTTATCTACATGCATAA
>CG15817 25059686 25060886|25308 chr3R 25059995 25061036 scaffold_21 675497 676747 + 6349|0 1126
TTCTATTATTGTATTCTAATCGTTATTAATTAAAAAACCGAAAGCG-----------------TCACATTGAAAACACGAATTTAAAACGTTGAGA--------------TTGTTT---GCCCCGTTGAATGTAAGTGACATTCGCAGAACGTTTTCGATATACTCCT---------ACATAAAT--------------------TTTGAAGTGAAAGCAATGAAATTAACAA----GTCTTTGATTCGAAATATTGCATGGCAGGTGGAGCGAGTGTTGTAATGATAGTAATTATTAATAATAGTAATGAATAATC--TCCAATATTCTCATAGGACACACCTACCCAGTTGGCTTTGTGTC-----CGGCAGGCGATGGAATCTGTA-ATAATTACAGCATCAGTTATACT---------TATAGTGACTGGAATGGTTTAT---------TGTAAACAATGAGCTATACCAACGCAAACACACAAATCTATATACGAAGTGTTGAATAGTTGTTAAA-------------CTCATGACACACCTCAAAAGTGAAGTGAGTG-------CAATGTAATATTGTAATTGATTGAATCGAAAGTGGCGGACAAACAGAAACAGATCAAGCGAACAA--------------------------------CTGAGAATTGTTATGAAAT-GGATTGCATAGTTTATAGAAACGTTTT-CATGTAAC-------------------AAGCTGCAACAG--------------AACTTCATTCACTCACAAAT---CACACACGTTTGTAATGTAATATTGATAAATAAATGTAATAAAATTATAATATATCTG----------TAATAATTGTAACAGCACACTACTTACGCAATAATTTTAGTTTAGTCGTTTAGCCTTAGTTTCTCTCTCCATGCATTACATGACTCTAGTTTAGTTCAGTTCTATTTTTTTCCAAGAGCGCTGCTATAGTGATATTAACATTTACAGA-------------GCAAAGATTTGTGTACAT------------------------TGTAATTTGTAAAGTTTACATATAA---CAATTGAA--AATAAATTTAACACTGATCAACATAA
TTATATTCATTTGTTACAAAAACAATTTAAAAAAAAAACAAAAGAGAAAAACAAGAACACAGCTAAAATTGTCAACACGAATTTAACACGTTAAGAACGCTAATCAAATATTGTTTTGCGCCTCGTTAAAAAAAACACACACACACAA---TTTCTCGATAAGCAGTTTGTAAATGAACATAAACAACAAAAAAGCTCAACTCAATATTAACTAAGAGAAAAATACTAAACAATTTTGGCTATAGCTAATAGTTCAGTTTTGTGCATAGTTTTCATATTGAAATAAGCTTAAAGGCAGTTTAAAGTAAAAAACAAACATTTCGTAATTC----AAGAAGTAGTTAAATATTTTGTTCTACATTTACATCAACAAATACATATATACGTACATATTTAAAGAATCGATATCAATGCATCCGGACATAACAACTATATATATATATATATATACATGTATATATATATATATAAGGATATAGGCCCATGCATACATATATCAAGTGTTAAATAGTTGTTACAATTTAATGCAATACCAATAAAACGCCTTTTCATTAAGGAAATTGACAACAACAACAACATATAGAGAAGAAGAAGCAGAACAACAACAAACACACACACACAACACACACACACACGCTCACGAAAGTGCATGTAATTAAAAATCAATCAGAGAATTGTTATAAAATTAAATAAAATAGTTTATATTGATGTTTTTCATATGACGAAACTAGACAAGAAGGAAAAATAGCAACAATAAAAGCCACACACAACTTCATGCATGTAAACACACACACACACACACACACACACATACACACGCATACACGTACGCTAATTGTAATAAATCAAAATAAAAAACCAATTTCAAAAATAATAAATACTTTATGCAATCAGTTTAGCTTTTTTAGTTAAC---------------------------------AATTTAGTT------TCTTGCTTTTCAGGAGCGCTGCTTTAGTGATATTAACATTTACACACACACACACACACACACAGACATGCATACATATTTATTTAGCTTGTAATTAAATTTGTAATTTATAAATTTAACA-ATAATTCCAATCAAATCAAAAAATCCAACAA----CAACAAAA
>Ptp99A 25310198 25312853|25647 chr3R 25307157 25311197 scaffold_21 1005906 1010008 + 157543|3246 4363
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ATATTGTAGCTTAGATT-----TAATGTTACAAAATAATTGAAAAAATCATTTTATAAATGCTAGCATATAAATACAACTAAATCTAAA---TATACATATAAATATATATATATAATTATTATTACAAAATTTAACATAATTAAATATATAATTATTGTAAACAT-TTGCCTAGTTTTATTAAGCGCGTCCTTAAACCTATTTTACATATTATTTAACAT------TTATTTATTGCTGTA-----------CACGTTCTTCTTTTTACCCATATATTGTTTTAAATATCTTTTCGAGTCCTTAACAAATCCTGTTTATAAT-TAAATACCCGATCAATCGATTATTAATGTTCAATTTACATTCAAATTGTATTCAAACGTAGTCGCAAGCAAGAAACATAAATTAGACAAATAAGCAAAAACTAGCAGCAAGGCACATGATTAAATATATTTAATAAATATATATACATATATCATAATAATGTTTAAATGTAGT-TAAACGCACAAAATGCAAAAATAGTTCCCAAAATGAA-------AAAAACACAAGAAAGAAAATAACACACA---CAAATTAAAGAAGACGAAAATTGCCCTCAATTTGTTAAATCGAATTAATTAGTTTTTATGTACGAGTTAATCGAAAATTTGTGCCATGCTCGAAATATTGAGTTGAAATCAGGTTCTTATATAAGGTCAGTTTACCGTTAAATATTGTCATATTGTTTGCCAAATTGATTCAATGTCCGTCATACAATCTGTTAACTGTTTTTTTCTGCTCAAAATTCTTCACAACGATTTCAAATGTTGAAACTTAAAA------AAAGAAATACAAAAAAAAAAAAAAAACGTAGCGA-AAATTA--TGCGAATTTAATAGAGAGGAAG-------AATGAACAATATTTACGACAAATTTTGCATACAT-ATAGATAATGTCATTC--GTCTAGATATAACATAT-ATATATATATATATATATATAATAT-ATGGTTATTTATATATGTATTTTCAAAGGCACAAGAAATATTTTCTCAAATTT---ATTCAAAGCACCTAAACATGCACCGCATCACTGTAAATCCCCAAAAAACAAAATTAAATTAAA
>Ptp99A 25310198 25312853|25648 chr3R 25311497 25312961 scaffold_21 1010746 1012284 + 13899|0 1609
ATTTTATATGTAAA-GTATTGGTGGAAATGAAGAACATACGAAACGATGAACAAACATGTTTTAAAGACTGGTTTTTTGTACACTTTAACTTGAATAAGCATGCATACTGATACTGATTATGTAAATGATTATTATGAACGAATGTCAAAGGTCCTTCAGTTGCCCCTCCCCGCCCCCGCAAGACCTGTCCCGAATGTAGTTTCCACTCAATCGCATGTAGTCAGACTACTTGCGGATGCAGACCGAGGATTTGGGAGCACAC-TTCAATATCCGATCGTATCAA-------TCCAATCATTTGTCAGCTGAT-------ACCAAATAG--GCGGCTCTACATGTTAAACAACCAA----------------CTAATGACCAATTTTGTGAGATTATGTTTCTTA--------------------GGCACTAGACCCGACTTAGGC---TAAGA------CTACTTAAACGCTAGAAGGGCTTGTAAATTTCTCATACC----GACACCGGCGGTGGTAACA----AATGCTTCATCTGTAATATAACGACAAGAATCATATTATTTC---GATACAATACTAAGGCAGGCAATACT--ATGCATTTTAACTGTTAAACACACATAAATAGTAGTGCGTATGATGCAACTATAGGTGGATATTTCCATGCATTATGTACATAATGTTGTAAGTGAAAAGAAAGAAAGAAAGAAAAGCTTAATCAACTGCATTGCGAATGA------AGCAAC---GAACACCTTTTGTGTGATCACACA-----------------GAGTTCTACCGAAA------------------TCTCCCAATTAAATG--------------TGCACACTCTTTTCGAGCAAATGGAATCCTTTCCGCGACTAAACTACCTTCACACATTAACTAAAGTAATTGAGAACGATAGAAACAAGGCCACAGATACAACAGATGATTATCTCTAATTGACGGTGTTATGCAATTTATAAATGTGATGAATGTCAAAGTTAAGCGTAAACAATTTAAAAGCAAGCGAAGAAAATACAAAAACACAAAAAAAAATACAAATAAAAATAAATATAAATATAAATATAAATATAAACAAACGATTCATGAGAAAGAGCTGAATGTAGCGAGAACTTAAGTATCTAAGCAT-GCCCACGATTTTAGAGCTAAGCAAATAGATGAAGATACAAATACAAATACAAATACCCAGAGGCAGACCATAGGTTTTAAAGAACGAACGAAGCATTTGCCCCACATCCTGACA--------------------------------------GGTTACCGCAGCTT---------GTAGAGGCCATTGCAGCCGGAGGAGTCGCCACAGA-------GATCGGACAA--AATCTCGCGATA---------------AACAGAATTAATGATATGAGTATATGTATGTATATGTATGTACACCTAAGCTAATCG-TAAGCCAATGAA-AGTTGAAATGGACT----------AAAGATACATGGAACAGACAACATTGAAA-----------------------------------GCGTCTAAATAAAGAACATCAAATTGC
ATTGTATATGTATATGTATTTACTGA--TAAACAACATA-----------------ATGTTTTAAAGACTGGTTTTTTGTACACTTTATCTT----AAGCGCAGAT-CTACTACTGTCTATATTAATTATT--CATTATTGTAT-----------------------------------CCAAACTTGATTTCAATCAAAATTGCTTTCGATTTCGAGTATACCAA--AACTTCAAGTTCAGTTC------TTGGCAAAATACCTTTAATAGATATCATTATTAAAATGAAATCCAATCTCTACTCTATTATTTCGCCCAAACAAAAAGCTGCATTTCTAGATGAAAAGTAAACAAAAAAAAAACCTTTAACCTAACGACCAATTTT-TGAAATTATTTTTGTTATAGAGCTATGCAAAACTCTAGACACTTGTATTAACTTAAGTGTTTAAGAAACGTTCTACTTATA----AAGAAAGCTTGTAAATT-CTCATAACTTAAAAAAAAAGAAACGGCAAAACTAGAATGCTTCATCTGTAATATA-CGAAAAGC-CCATATTATTTTCGAAAAACAAAAAAAAAAAAAACGATAACTAAAGCATTTTAACTATGAAA---ACACAAA----------------GTAGCTATTAGT---------TATACATAATGTATGTATTATTAAAACACAAAAAACGAAAATATTTAATGAATGAATGGATGAATTTGTAAATGACAGCCAAACAATCTGGACAGCATCTGGCCTGGCCATATATTCCCAGCCAATGTGAAGAAAACAGCCGAAAAAAAAAATAAATAAAAAATATTCAAAAAAAAAAAAAAAGAAAAAAACTGCACACACTTCTCGAGCAA--GGAAACCTTTCCAAGACTAA-CTACCTTCACAAATCAT-----ATAATTAATATATATATATATAAATATATATAT--------------TATCTAATTGACGGTGTTATGCAATTTATAAATGTGATGAATGTCAAACTTAAGCGTA-------TAAAAAC---------GTATACAAAAATATTAAAAAAAAACCAAAAAAA---------------------------AAAAAAACAGTTTAGTAAAAAAGCTGAAATGTAGCGAAAACCGAAG----TAAGCATAACCCACGATTTTAGAGCTAAGCATAAAGCGAAGGGT--------------TGATACCAGAAAGCAGCCCATAGTTTTTAAAGG--GAATTACAGAGTAGCAGCAAATGAGGATAAACAGTTAAGAGAGAGAAGCGTAGAAGTGCAGCAAATGGAGTAAAGCAAGTTTAAAGAGTAGCAAACGCTTCTACAAGTAAAGAAG----CAAAGAGTGGCGCGATAAGATAATGAATCTCGATATACCAGAAAATTGAAAGAAAACAAAAAAAAACACAAGCAAAAAAATATAAGTTTATGTACACCTAAGTTAACGGATAAGCTAATGAAGAGTTGATATGGATGCAAGCAAAAAAAAAAAAAAAAACAAAAACAACAACAAAAAACAAAAAGAAATCTTATAAACCTAAAGTGAATGGAAATACAAATAAAGAACATCTAATTTA
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CCCCTTGCATCACATAAACAATAAAGAGAAGCTTTAA-----TT
-----TGCAGCAGAGCGAGTTTATGAAGGAGGATTGAAGATCTT
>CG2010 25324421 25324649|25660 chr3R 25322688 25324557 scaffold_47 647134 649006 - 93126|1755 1911
GCCTCTGAGGTTCAGAGCTGAAAGCCAAGAGAGGATTGGTAGCTTGCACTTACCCGGTTGCAGAGCTCTGGATGGGATTTACCCACAACAGGGCCGGAGGAGAAGCAATGTTTCT------------GTGTGTTTTCGCTTACAA--------TAAG
-------------ATAGCGAGTGGCGCATCGA-AATAAATGTTTTACGTTAAACTGTTGTTGTATCCTTATAT----TCCATACGGAACTGGAACAGAGAGCGAGCAAATATCCCAAAAAACAATAGGTGCGCATATGTTTAGAACGCACAGTTAAG
>CG2010 25324421 25324649|25661 chr3R 25324558 25327217 scaffold_47 649325 651934 - 85268|0 95
AGTGTTTTAATGTTTT-CTGTATTTTCCGCT---TCTTTCGTTTAATTACTTTAAATCTAAATAAACGTACATAGGTAATTTAAATAAAAACAAAA
ATTGCTTCCATATTGTACTGTATTTTCTTCTCATTTTTTTCTTCATTTAATTAAATTATATATA-----------------TTAATAAGTAAGAGT
>Dr 25390213 25391007|25730 chr3R 25390064 25391086 scaffold_47 727290 728454 - 28946|149 1077
GTGGCGGCCCAGTTGGTGGGCCACGATCGCCAATTGATGCGCCACCAACGCCCACTGGGCCACAGTGCCCACGA------TCATCTTCATCCTGGTAACCAAATAGCCGCTGGCGGCGGTCCTCGAGCGGAAACCCCCAAAATTTTGCTGTGATGTTAGCGCATTTTACGTTACGATACTTCCAAATGTTGTT-TCAAATGCAC-------ACCCTGTAAATAACTATATAAGAAGCGGAGAAGAA---------------------------TTTGCACCCGATTCGAGCAATCGAACCTTGTATATAGCGAGAGCAAACAAGCAAGCAGAAAAATGTTTCCTAATTGTACATAAATCTAGCAAGTAAACCCAATCAAT------------TCAATTC-------AAAACCTTCGTTCGTTTGTT------------TCGCATAACCAATTGAC------------------AAAAGAAACGAA------------------------CGGCATTCGTTTGCACAAAATCAAGTCAATAAGCGT-------AAATTACCGATTAACTAAATTCAT--ATTTGATTGTATTGTATTGTATTTTGCAAAGTAAGTCAGTCTAGCTAATGGATCGATCGTGTATTTAAAAAATACTTCTAAGCACCTAAACTAAACTAATCTAATGCTATAACTATGCCGTTAAAAGTACTTTACG-ATAATAC--CACAGACCTATACATATAGTTCATACACGCATTAAATATTATGAATAC-ACCATATAGCGTTA-ATCCTCTGTAGTTGTTTAATCGTAAATCATAAAATCGAAATT------GTGAGAAACTGATACAAAAAAACATGCGAAAAGAGCAGAAGGAAAATCATACAAAATCATTGAAAAAAATATATAATTATACAAAAAAAAATA
GTCGCGGCCAAGTTGGTGTGCGCTAATAAATAGCTGATGCACCAGC--CGCACGAGCAGCCAGAATGACAACCAAATAACTGAGCCACG-CCCAGCCGCCAGCACGCCCACAAATGTTGTGCTCGCTTCAAAACCCCCAAAATTTTGCTGTGATGTTAGCGCATTTTAT-TTACGATACTTCCAAATGTTTTTGTAAAATGCACTCTGTAAATACTGTAAGCATAGAGAAAGAAAGCTGAGAGGGAGAAAGAGAGAGAGAGAGAAATAGCCGGTTCTCGATAGATCCGAT--ACCGAACTCTGTATATATCTAA---ACAAAAGCAAGC--GAGAATGTTTCCTAATTGTACATAAATCTAGCAAGT-AACCCAATCAATAATAATGAAGAGCCAATTTGCGTTTAAAAGTATTTGCT-GTTTGTTAAATCTAAATTGTAACATAGACTTTTAACAATATATATATATATATAAAAAGAAACAAAATAAAAACAATAAAAAAAAATTTGAATAATTTATTTGTA-AAACTCAAGTCAATAAATATACAAACAAAACGACGGA--AGCTTAAGCCGTAAATTATATTTGATTGTATTGTAATTTGCATTATA----AGTCTAGTTAAACGAACG--CATGTATTTAAAAAATACTTATAAGGAACTTAACTAAAC--------AGCTATAACTATGCCGTTAATTATACATTAAATATAATATAATACGCAACCCTATATATAGCTCATACATTCATATAA-------AATACTACCATATAGTGTTACATTCTCTGTAGTTGTTAACACTTAAATCATAAAA-CAAAATTCCCACAAAGAAAAAAAAACACAAAAAAA---GAAAGCAAAACAAAAAAAAAATCAACAAAAATCAGTG-GAAAAATATATAATTATAC---GAAAAATT
>CG1906 25423522 25423630|25765 chr3R 25423389 25424265 scaffold_47 770008 770978 - 13052|136 252
ATTTTGTAATGCTAA---TTGTTCATTTTTAAACCAAC-----CAACCAACCAACCAACAACCAACCAGCAAGAGAACAAAGATAACTAAACACCCTATGCTTCACATACTCTAAAT
ATTTTTTAATGCTAAATATTGTTCATTTCTAAATCAACAACAACAACCAA--AACAACCAACCAACCAACAAGAGAACAAATGAAACTAAA-ACCTTAAAATCCGTATGCTCTAACT
>CG1906 25423886 25424466|25765 chr3R 25423389 25424265 scaffold_47 770008 770978 - 13052|589 1003
AGTCCAACGCATTAGGTTGCAGTCGAAACACGAAACAGAACCAGTTAAACAAATGCAGAAACCAGATCAGATCAGAACCGAACAGAACAGAAAGCAGAGCCACACAACTTGAACGAAGCAAAAACATACA--------------AGAACACACACCAAA-CAGTTTTCTACTTTGATAAACACAAAAGAAAAACCTACTAATAATGATAATAATAAGAGTAACGATACATTTATAGTTTGTACGAAG--CAGTCCTAAACACAACAATACGAACAGCCACGCCCACACAACTTTAAGATATAGGAGAGATCTAGAACAGAGCGTACCTGAGCAGACCTCAGAGA-------------CTCGGAATCGGACGAAATCAAA----GGATGGCTAAAAGCCAGCACCAGGAC-CACAC
AGTCCAACGCATTAAATTGC----GAAACAGTCAACAAATGCAACAACAAAAATAATTTAAC--AATAATACCAGAAACAACAAAAAAAAAAAACACACACACACAAC----ACACACCACAAATGTACACTCCACACACACACATAAAGTACACCAAAACCGTTTTCTACTTTGATAAAAA--ACTAAAAAACCTACTAATAAT-------ATAAAA--ACCCATTATTTTATAGTTCAAATGAAAGCCAGTCCTAAACACAACTAGATGAAC--CTTGTATTACGTAGATCTTATTTAGATCGTACTTATAGAAAGGAGCGAACTTAAGCAGACCTCAGAGCTAAAAACCGATACCACAAAATAGAATCGAATCAAACAGGGTTTGGCTGAAAGCCAACACAATATTTCACAC
>CG1906 25423886 25424466|25766 chr3R 25424462 25424673 scaffold_47 771262 771472 - 6407|0 4
AGAGT
AGAAA
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A--------GCAG----CGAAATCAATTGCCCACATTCGCATGGCCCAAAG
ACACATTTGGCATATTTTTAAAATATTTGCATA-ATTCACATTGGACTTAG
>CG1906 25442777 25442879|25789 chr3R 25442560 25443025 scaffold_47 793930 794372 - -479|226 337
TTTCT---GGTGAGAAATGATGGAATGGATGGCGCCACAGCTTTTTTCTTAAATCTTTAAATAAAACTATGAACATATAAAA------GCAACAACTCGCTTCCTCTGAACC
ATGATATAAACAAGATTTACTTGTATAATTTGTGTTGA----TTGTTCCTAACTATGTTACAAGCAATGCAAATAATGATAATGTGCCGCAAAAAGTCAGTGTC-----ACA
>CG1907 25446278 25446480|25792 chr3R 25444135 25447182 scaffold_47 796426 799561 - 37595|2415 2759
A--------------------------------------------------TGACCAATATCCCATA-----------------TCCAACGATTAA-----------------------CGAAGAATGAACC------------ATGCG--------------TGTATATATACGACGTTAAGTTTAAAGAAAACTTAGGGCATTTATATGTCGGCAATTCCGGTGACAATATTACATGATAACGATTAGCTTGAATGTTGAAACAGTTTTTCT--------------------------AGCGCCATAAGTATAAAGTGGATTCTCAATAAAGCACAAAATGTT
GGGGAGGCATGCAACTATAGCAAGCTGTGTGGCCTTGTTGTTGTTAAAGATTAGCCGCAATTCTATACACTGTTAGCCAATGGGTTCAAAGTTTAAGCTGCATATTCCAAACAACTCCCCGAACGATGAACCAAATCATGGACAATACGAGAGTTATTAATTTTATATACATTTGTATTTACGATAATATCCAAAGTGAGGCATTTAAATGTCGGAAACTCCGGTGACAATATTACAAAATTATGAGTGTC-----TGTTGTGGAAGTTTTTTTTTATAAAATATATATGTAATTGATAAAACGCCTTAAGCAAAAAGTTAATTCTGAATAAAGCACAATAATGA
>Obp99a 25497935 25498057|25844 chr3R 25497237 25501033 scaffold_13 20325 24061 + 110787|722 844
TGGCTTAGGTCCTAGTTGGACGGATGTAACGATAAGCATTAGTTTAGTTAATAAAGTAATTGATTTCCCATACAAGTTCGAGCATTCCTTCTCGATTCAGTGGGGAAAAACAGAATGTAGATA
----------------------------------AGCTACAACTAAGTACATTAAGCTTCTAACTAACCA-ACAATTT-----------TCTAGTTTC-GTTAATAAAACTATGATTGGCATA
>Gycalpha99B 25511337 25511502|25850 chr3R 25511107 25512354 scaffold_13 29727 30946 + 32622|230 399
ACCCCCCGTAGCTCCAATCCCCCCGTAGACCACCCACACGCTCAGTAGTCCTAGTTCGGTGCACTTGTATTGTGGTTTTGCCTGTTGCCTGCTTAGCCT---AGAATCAATAAAATATCCCATTCGAATGGTTGCATTTCAGCAT-AGAGATGAACACATTTTATTGGTT
GCATCTTAGAGAATCAATTGCTCAGTAG-CCACTAAAACA-----------TAGTTCAATGCACATGTAGCCTAATTTTGTTGCACTCTTGCATAGCCTTTAACAATAAATAAACTTTCC--GTCAATGTTTTGCGTTCAAGCACAAAAGACAAA-----TTTATTG---
>CG15506 25547968 25548111|25895 chr3R 25547362 25550790 scaffold_13 263770 267265 + 63098|651 808
TTGCGGGCTGACCAAAATTCCACACACGTATTTATTACCATTTCGCTTAGGCATAATATCGATTCGAT-----TGTACAATGTCGCCTTAACCCGTAAGCTAA-------AGTAAGAGTTCATTCAGAGATAACGAATAAA--AAACATAAAATCGCA
-------CCTAACAAAAT---ATACGCGTATTTATTACCATTTTCTTTAAGCATT---TCGATTTGATGTATTTGTACGTTGTCGTTTAATAATATAATTAAATAAGCTTAGTAAGTGTTCAT-CAAAGATAATAAATAAATGAATAAAAAAAAAAAG
>Pcd 25549869 25549948|25895 chr3R 25547362 25550790 scaffold_13 263770 267265 + 63098|2759 2863
ACGCATTGTTATACTAGTTG-CTAAATATCT--------------------ATAATCT----TCGGTGTCCAATAAATACTCAGCTTAGCATCGATTTGCTAAAG
AA----CTTAAAACTAATTGATTAAATATATTCCGTTTGTATCGCATTTAAATAATTTGTTGTTAATAGGAAATCAAAAATTAGCCCAGCATGGACTTACTTAGT
>CG7598 25563715 25563792|25901 chr3R 25558552 25563808 scaffold_13 275584 280548 + 128527|5473 5550
CGTAACCGCCTTACGTTACGTTTGTGTTATTTAATTGTAGAAACGTACGAAGAGCAGTAAAGATTGGTTAGCAGAAAC
AG-AACAA---------------ATGTTCGTTAGTTGTAGAGTAGCAATACGAGC----------GATTTCAAAATAA
>CG1969 25567116 25567631|25904 chr3R 25565879 25567536 scaffold_13 281419 282985 + 55933|1273 1728
CAATTAGCCGCCAACGCTGCTCCAAAGTCCAAGCTTTGAGTGGGAGCACCCCATCTCAAAGTTACAAATGCGCGAAGCGCAATGCAACAAAACTAA-AATTGGATTCT--------AAGAAAACATTAAATGCAT-------------ATAGGCATTGCCAAA--ATTCCATTGCGCTGAGGGCATGATGGATTTTTGGACAGCGCTGGCTGGCGGTGGTGTCCTTGTGGACGGACGTGCTTGTCCACCCACCCGCGAGGACATACAATTAG-----ATATTTAGTTAAAGACAACCGCAACATATGTTGCTCTCTGTTTTTAATCCCTACAGAACTCTCAATTTTATAATTTTTTCTCCCCTTTCTGCTACTGAATGTGCGGC------TCGACCTCTCAACTCCAAGGTGGTTGTAATATTACCTTTTAAGAGCACCTTCATCAAGTAGCCCTA
CAATTAGCCGCCAACGCTGCTCCAAAATCCAAGCTTT-----AGATCATCCAATCTATCTAAAGCAACTGCGCGAGGCGCAATGTAAAACCAATAACAAATGGATTTTTCGCTAAACAACAACCATTTGTTGCATTTATTAAAAAACAAAAACTGTTGCAAAAACATTTCATTGCGCTTGGCGC---ATGGATTTTTGGACAGCGCTGGCAGGCGGTGGTGTCTTTGTGG-----TGCGCT-----------CCATAAAGACATACAATTAGTTAGTATATTTGGCTAAGGCAACCAGCATTTGGTTGTGCTCTATGTTTTTAATTCTTACAGAACTCACAATTTTATAACTTTTTCTCTCCCTTCTGCTACTGAATGTGCGGCGGCACGCCCATTTTAAATATGTAAGGTTGTTGTTATAATGCCCTTCAAGAGCACGTTCATCAAGTAGACATA
>CG1972 25573120 25573239|25907 chr3R 25571440 25574689 scaffold_13 286734 289967 + 161639|1685 1839
-GCAACGAAGAAGCATCC-------------CATTGAAATCCCAC---GCCTTA--------------ATTCCATAGA---TAAGCACAAAGTGTAGATACCACCAATTTCTGAAAGTTTAAAGA-GTATCAAAATATACATAAACGTTCCAATA
CGCCACAAAGAATAATTCAGGAAAGCAACAGCGGCCAGTTTCGACATGGCCTTAACGTGTCCGGCACGATTCCATAGATGTTAAGTAAAAAGTTTTGATTGTAA----TTCTGGTTTTTTGAAGACATACTAAAATAC------ATTTCTCAACT
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AAGTAATC---------AGCCGATAACAGCGA----------------------CGTGTGTTGCTTAGCTGTTATTCGCATCGTACATCTAAGCCCAAAGTGTAT---------TTTGTATATTTCCGTGCGTGTGTGTCTTGTCCCGGCCCCGATTTGTCCAATTTGTCCCATTGGTCCCATTTGCCCCATTTGGCCCATTTGGCCGCTCTGTGTGTGCTTTGTGTTTGTATTGGGTGCCAGTTTGCATTAAATGCAATCTCAGTGTCTCGAGCCTCCATTTCGATTCCGTA-----------AAATATAGCCGTTTTGTATTTCTAATGCTGGCACGATATTAGCTAA-----TATATTCAGCGTCTCTAA-CGAAAATTCCAATGTAAAGCACT-GTAATTAAACCTG---TAATTTATATTTATAAACCAACCAGTAGCTAGTAAATTACTTCAAATTTATACCCTAATTAATCGACTAAATAAGCGTGATTGTCAGAGTGA-CAGGATTGAG---------------------AGTCGGGGACTCAATCGATATCAGCGAG------GAGTGGATACGAGGTCCTTTTCCAATCCCACTATCAA----TGAGCGAATGGATA---------TGGATGTGCGTGTGTCTGATT---TCAAAACCCATTTT-------------------AGTCGCCCCTTTCCAAA--------------------GGCTAACACTTGATGGATGGATGG--ATGCCAAT-----------------CCACGCGATTTTCG-----AGGGACAGTGAATATTTA
AAGGATTTACAGAAGAAAAACAAAAACAGCAAAAGTGCTTGCAATTTCTGGCATTGTATATTTAATAGCTTTTATTCGCAACAAAAA---AAGCCTAAAGTGTATGCATGTATATTTGTATAACTCTGTGTGTATGTGCGTC---------------------------------------------------------------TCTCTATGTGTGTGC-GAGTGTTTGTG-TGTGTGCGAGTGTGCATTGAATGCCAGCTCGTCGAAT-AAATCTCCATTTCGATTTTTTGCCCCTAGGCGCAATTAAAATTCATACTTATATACAAT--TTGCACGATATTATTTAAGCATTTGTCTAAAACGTCGTTAATCTAATACATAAATGTAACACACTCCTAACTAAACGAAAACTAAACAAAAAGCAAAAACCAACCGCTAGCTAGTTAATTATTTCCAATTTATACTGC-ATTAAGCTAATAACTAAA---GGATGTAAGAGAAAGAAAGTTTGAGGAATGATATATGTGTAGGTTCATTCAAATACTTGAACGATTTAAATGTACAACTTGAATAGATTTTAATGTATTTTCGAAAT---TTGTCAAGATTTGAGCCAGCAAGCAGTTCAACCCTTCATGTATTTGAGTCTAATTAAATCAAAATTTCTTTCTATAACTCTAAATGTCATAACTCCGCCTCTTCCAAATCCGTATGGTGTGCTTGTGTGTGTAAGTGTGTGTGTGTGCATGAGTGTGCAAATGATCCTTTAATTACTCGCTAAGTCATTTTCAGAATTAAAAACAATAAGAAACAC
>kay 25618747 25619838|25966 chr3R 25617107 25618928 scaffold_13 347943 349820 + 48910|1790 1980
CCGG-ACCGGATCTGGGACGGGGATGGGGGCCG-------AGTCAGG-ATTAAGTTAAGTTTTATATAGTTGGCAGGCAAACAACGGAAGGAAACCGCGAAGCACTTTTCTAGTTGTAGGAGATGTTTTCATTTTTGTAATATGCTGTAATATGCGTAAACGTGACGAATGTGTTGTTTCGTTAACTCTAA
CCAGTGTAGGGTGCGTGGCGGTGGCGCGCGTCGCTAACAAAGTCAAACATTACATTTAGTTTT---TAATCTGTAAACAAGCAGC----ATGCACCATGCAGCATGCAGC-----GTGCGGCATGCAACAATTTATG---CATACAG--ATTTACGTTTACATAGCGAA----------CGCTAATTTAGA
>kay 25618747 25619838|25967 chr3R 25618929 25619992 scaffold_13 350023 351272 + 16275|0 1136
TGTTTTTGTATTATTATCTTTATTATGGTTAATTTATGATTTCGCTATGTC------------TTTTACATACGCCGAGGAGCTATGT-----ACATATGT-TATGTACTTGTAATTT-GTGCAATTTTCAAACCTCTTCATTGCGCGTTGTATATTTTCAAAAAATATAAGAACGCGAACGCGAACGCGAACGACCGACGATGC----------------ATGATGAGAATGATAAGGATAATGATGATAATAGGGCGTGTAGATT----------------------------TGCAGGATGCGTTGTGATATTTATTATAAAACGAATACAAAAGATGCGAGGATGAAACAAAGTAGAAAGCAAACAG----------GAGCGTCTAATGAAAGGAACTAAGCCGGTTTTAAAATTGTACATTTAAACGAATCGTAAAGCGTAAATATACTATA--AAACAAAACAAAGTGAATATATATTCAGCATACAAACTAAATACAATGCCTTGAGAGAGAATTAAGAAATGCAAACCTTTATATATAGAGATCTACATACATATATGTATGCATGTACATTTAAAGCTAAACAATAATGGCGTTGAAGCGAGTTTTATATTGAGCAAAAGCAAATGTGAAATGAGATAAATATACTTAT--TGTGTACTCTGTAAGCTGC------------------------------------AGTAGAAACCAAAATATATTTTTACTAAACGCAACAT-TGCGCTATTTTCAAATACCATTTATAAGAAATGAC-----AAAAGCAAAGCAATTATTTAATATGTAATTA--TGTATTATGT-ATACCTATATCTACCTACCCACAACCTTAAATCAAAAAACCCAAAACGATTCAACA--------AAAGCTGATCAGGTAAAGCAACT----------------------------------------CTCGCCA--------------------------GTTTCCACACTAAATTCT-----------------CAGAATATTCAAAATTTTAATCTATACAAAACCAAACCGATTGATAGCAAATAAATGCACTTAT--AAGGGCAGAAAAACACCAAAATT------------TAAA
TGCTTTTGTATTATTATCTTTATTACGTTTAATTTATCATTT-GCTGTATCAATTATTAATTACTCTATATATATATATATGCTATATGATATATATATATATATCTACTTGTATTTTTGTGCAATTTTTTAAACCATTTTTTCATTTGCGTGTGTTTTCAAAAAATATACATATAT--ATAGAAATATTTATAACAAATAATGCCTAAACATTTGCAGAAATGTTAAAAATGATTTAAGTAAAGA--ATTGTAGCACGTCGAGAGTGTGAAAGAAACGGATGAGATGTTGTAAATGATGGATGCGTTGTGATATTTATTATTAACAAGTTAAACAAAA--CAAAAATAAATTAAATTAAATGATAAACGAAACTTAAACAGAGCGTGTAATGAAAGGAACTAAGCCGGTTTTAAAATTGTACATTTAAAAAAAACAATAAAT-TAAATATTTCAAAATACACAAAACAAAAAAAA----------------AAACTAAATACGTTGCCTTGATAAAGAGAAAA--------------TAGGGAAAGAGA-----ATAAATAAATG---------------------ATATAAT---------------AGTTTCAAAATGAGAGAA---AAATGAGAATTTGAATAACTATACTTATACTATTTACTATTTAAGGCGCATAAAACAAAGAGAAAAAAAACAACAAAAAAAATCAAGAAAAAACCCAAATATATTTTTACTAAACGCAAAATGCGCTCTATTTTCAAATACAATTTATAAGAAATGACAAACAAAACGCAAAGCAATTATTTAATATGTAATTATGTGTATTATGCAATAAAAAAAACTATATACATATATATATATATATAAATGATGATGATGATACAACAAAACGAGCAAAGCAAATCAGGCAAAAATATTTGATATAGCCTTACGGTTTAATACGAGTAATTCCTTTGTCCTCGAAAAGTATATGAAAAACAAGCCCCTTTTTGCTTATGCAACAAATTTTAGGATCATAAAAATGCGCAAAATTTCTTAAATTCAAATTCACAAAATTGTAAACA----GATATGAATTAAATGCACTTTCCAAATGGGGTAAAACAACCAAAATTGTGTAAGAGAAATAAA
>Ice 25626640 25627307|25972 chr3R 25625575 25632070 scaffold_3 6266221 6272747 + 229194|1096 1770
TGGCTAATGGTATGGATCAAACGGTGGGTACGGCGAGGTGTGTGATAAACCAAGTCGCAATTAAGTTAGAACCTCATGGGCTATCGGCCTTGCAGCAT---ATTTTTTATACAACACTTTTTTAACCTGCCCAATTGCTCGACGAGATTGGTGCCACTGCCCGTTTTATTTTATTTAGGCACAAAGTATCTTTCGATTGACATTTATTAATGTCGCATTTACTCGTCTGTATTTATATTTTTTGGGGTGGGTAGAGTAGATCGATTTAACTTAGAAATCTAAGAGGTTTTTA-CTCCGGCCAAAATTTTTTGACAATTTTAACTTGCCAACTGAACAAAGACGATCTCAAAATTTTA-AATTCTCTACTAAACCTTATCATAGAACAACTTGCGCCTCTTTGATTCTCGATCAGGAATGTCGGCCCACCCTTATCTATATCTACCTTAGACCATTTACAGACAAGACCTTTTTACAATTTTATACACATAGATATCTTTATAGTATAAGCCTGTGTGTCATGGTCGTCCAAAACGAAAACAAACGATTTTAGCCTGTAGTCGAGTGTTTTATGAACAATATATACTATTTCTATGCCATTTGT-ACTCTTATATAATG-CACATTAGCAAATGTTCTCCTTTCAAGTTAACCGCTAATAAATCCGATTGAAAACA
T---TAACGATTCATTCTAATTGGTTGCTAGAGC--------TGATTAACTCCTCTG--ATGGTGTTCGTGC------AGCTGCGGGCAGTGTGATATAAAATGTTATATATGAGAC-----------GCTCAAGCTGTTGAAGAAACAAATG-----------------------AATCACAAATAACTTAATTATCCAAACTC-TAAATATTGAAATTATCTAAAGATAGTACTAT-------------TAGAGTA-----ATTT----------CCTATGAAATTGCCAGCTCCTGCCATGTCTTT------ATCTTTGTCTATTAAGTGTCCATTG------TCCATATTTTACAATTTTATATCAG--CTTTCTATA--------------TCTTTTAT----AAGCAAAAATAATG----AATTTTATCTTTTTATAC--------------------------------ATATTATATACGTACATATTTATGTATT----TACTCAATATAATTTAAGCAAAAAAAAAAAAAAATTAGTTCGATTTGGAAATAAAATATATAGAGCTAAATACAAATCATTTGACCTTCGCCTGTGACTC---GATCATGCCATATAAGAACGTGCGC------------AACCGCAAGAAA---------AGAACG
>CG7789 25630009 25630107|25972 chr3R 25625575 25632070 scaffold_3 6266221 6272747 + 229194|4670 4811
G----------ATAGCTTTGAATTCCAGCAC----------------TTTATTAGTTTA--TTTGCACTAAAAGTAAACACACATAAATTAAGCAATAACAG---GTTAGAAATTTGA------------AAATTGTTAAAA
ACAAACAATCCACAACTATAAAAT--GACACTGTAATCGTTGTTGTTTTTATTTGTTTATTTTTGCACTAAACATACACCTTTATAAGTTAAGTGATAACAGACAGTAGTAAAATTAAGATTGTGCATGTAAATTGATAAAA
>CG31037 25640154 25640782|25975 chr3R 25635595 25640271 scaffold_3 6276152 6280835 + 202094|4637 4778
CAGTGGCTGGGCCCTGGAGCTTCGT-----------------TTCCGGTTCAGATCCTGGATCCTCTGAAATTT------CGTTCAACAC-GCATCAGTTGAGGGCCCGTCTGTCTTGTTTAATATGTTTCGTTATGAGTTC
CATTGGCTTTGGCTTCGTGGTCAATGGGGTCGATCGAAGGACTTGCGGTTCTTGCTTTGAATTTTGTTAGTTATTTTTCACATTCAACTCTGCATAAGTTGAAA----GTTTATCGTGTTTTTTTTTTTTTGTTGTAATTTC
>CG31037 25640154 25640782|25976 chr3R 25640350 25642458 scaffold_3 6281705 6283886 + 72781|0 464
ATCTTCCCTTACATTTTTACGCGTAACTATATATATATACCATAATTGTTGTTTGCGGTTATTTATACAT-------CAAATGCTTTTTACAGCGCTGTTATTTAAACGAAATATTTAAGACAAACAAATTGTTTAAAGAATCCAATTTTTGTAACGCTTTGTTTGCCATTGGCCACGCCTGCTTTTATTTGTTTACTCAATAAACTACACAAAAATCTGAGACCGAAGGAAAGTAATCCAAAACTGCTCATCGAACAGATCA-ACGGAGGCTGCAGGATATACACAT---GAAACATACAAATGATACAAATTTTTGTTTTTTATTCGATATTCAGCTTGTGATTTGCAATTATTTAATAAAACCAGAGTAGTAGTA-ATATAATTATATA--------------------CACATATAAATGATTAACAATAAAATACGTTTATACAAGTAAAAGAAAGTCAA
ACCCGCCCACACATGTTTATACTTAATTA-----------CATAATTGTTGTTTGCGGTTTTCTGCGCATATTTATATAAATAGCTTTCATAGCGATGTTATTTAAGAAAAATATTTAAGGCAAACAAATTGTTTAAAGAATTTAATTTTTGTAGTGCTTTGTTTGCTATTGGCTATACACGCTTTT---TGTTTACTCAATAAAATAAAAAATAAACTTTAA-----------------AAAAATGTTTAAAGGACACAACACACCGAAATGGTAATCCTTAACCGTTTCGTGGTACACAAACA--------------CTTTTGATTGATATTCAGCTTGTGATTTGCGATTATTTAATATATATATA----TATTATATATAAATATATATTTAAAAATTTTAATAATTACATATATAAAAAGGTAATAA-AAAATACATTTATATAAACGTTCTAAGGTT--
>CG7802 25650953 25651522|25987 chr3R 25650821 25651426 scaffold_4 1342966 1343518 + 6994|132 634
GCAAATCCATAT-GCCCATTAATCTACATAGACGTCTAAGCTTCACAAGGTGCAATCAATATTTACGAATATTCACGAATATCCATCCGAATATTCACGAATATCCGAATACCCGTCGTCCTGATACAACATCCGCTATATTTGCCTTATCTAGTCAGTGCACGATTTTAGAGAAAATGAAATGAAAACGAGATTCAAATCTGCGTGTCTTGCACGGTGGAATTCAGATTGCTTGCATGGCAGCCACGGT-----------------GTTTTTGGGTTTG-AGTACTCCCCCAACGGATCACGTTCCCTACTTGCAAAGGCAGTTCGACGACAGCCCGTGGGTTCCTTGAACTCCTTTTGCGACTTCGGAAGTTGAC--------TGGTTGACATTTGTAAAAACTAATGCATATTACATTACCCTTCAAACAATCTACCATAACTACCACCCCTCATCTGTATCGAATGCGACTATCCTAATTAAGCACTATA--ATTTATT
TTCTTTCAGTTTCGCCCTCAAATCGA-----ACAAGTTAATTTCGGGAGGTGCGAACCGCAGATAACGGGAT--ACATATATCTACTTGG------------------------GCTGCCTTGG-------------AAATTTGTCTTGTCTAGTCAGTGCTCGATTTGGGTG----TAAGATAATAAATAG----AAATGT-CGCGGATTGTTTGTTGGTTAATGGA-TACTTTTATGTCAAAAATAATTAACATATATGAATTAATTTTTTGTAATTGTAATATTAAC-------ATTGATTTCCACACTTATAAAGGTAGTTCGA----GCTTCGTA------TTGAACTCCCTTTGTGACTTCGGAAATGGGCTTTTTTAGTTGCTGGCATTTG--------AAATCGAAGTAAAACAGTTTTTGATCAACTCTCTTTAATT--TATCGCTTAGCTTAGATCAATGAAGAATTTTCAACCAGACATCATATTATTTATT
>Cad99C 25680031 25680425|26007 chr3R 25674790 25680289 scaffold_41 851575 857070 + 201492|5330 5632
GGAATACACTAGGAATATTCTGGTTTCGA--------TACATTTTACAGACTTGTTAATATACTTAGCTGC-CAATTTGT--------AATTTTAATAG-TGCATTTTAACAACGA-----------------------GAGCGGTTGCCATCAATTTATGATCATAGCACGAGCAATCTGTAAATACCTGAGCGGAGATGCAGAATGGAGGAACTGATA--ACTAATATATTTAACCGTGCTTAAG-ATCAAATAATTACAGTCATTATATTTAAGCGAACGCAGAGTGCATACTTCCCACA
ATAGAAAACTAACTGCAAATTAGTGTCAAATTGGGTGTATTTATTAATGTTGTATTTATGTACATAAGTATGTCATTTGCATTAAATGAATTTAAGTAGTTGTATATTCTCAAAAATGTTATAGATAATTAAACTGAATGAGCTGTTGCCATCATATTGAG--------------AATGTGTATATA--TAATTTAAAATATAAA--GAAGAAACTGATAAGATTGAATTATTT--TTGTACATAAGCAGCCGCAAACTGCAGTCATTAGTTTTACAAAGTTAAAGTATGCAAGCATACTGCA
>Cad99C 25680031 25680425|26008 chr3R 25680290 25680609 scaffold_13 1287178 1287484 - -140|0 137
CACTTACG--AAACTGCCAGACGCAGTCGTTTTCTTTAGGAATTGTTGAAAACATGTACATGCATTAATATAAACTGTTTAAGTTGTATAAACTATGGAAAGCCAATAAATGTAAATAAATAGATTTTTAACTTAAGA
CGCATAAAGTGAGCTGTTGAAAGC-TTAGCTTTTACTAGAGCAAATCGAAGAAAATGAAATAAATTAGTAT-----------GCTATATAATGT------TACTTGCGATTTTAACAAAAAAGCTTCTTATATTCAGT
>RpS8 25689241 25689351|26018 chr3R 25688328 25689334 scaffold_13 192984 194028 + 54056|952 1052
AGGCACTAGATAAGCTTGCAA---GACA--TGATTTGCAAACAAAAACGGAATAAAACAACTTG-TTTTTTATAGGAAG-TGCATTTTTCTGATTTTGTTC
ACGCACTAGATAAGAATGCAAACTGACAACTGATTTGCAAACAAAAAC-AAATAAAACGGCTTGTTTTTTTATAAGAAGAAACATATTACACATTTTACTC
>CG7814 25700289 25700547|26027 chr3R 25700105 25700593 scaffold_13 2237612 2238285 - 11147|184 610
T----------------------------CTTTAGATAGAGGATGGGAGATATA----------------------------------GAAGAGTAAAAGTGAAA--------------------TACTATTTTATTTT-------------------------------TGTATTCGTGAC------------ATTTTGTATCG--TTAGTAACTAGCGCCATTGCTGATTTGTATGCAT--------AATCTGTAATTACTAATTCCTGTCTGTCCCCACGCCCATTTTAAGTTAATAATCCCATAATTCCC---CTTGTAAAAGTTGTTAA------------CAATTGCTGCTGGCGCGAACTGTTT---AATATTACGCAAAAT--------------ATGTTATGTATTTT-TAACGCTGA
TGGAATGTCGCCGATATGTCAATTAGTCGTTTGGGGCAAATGGTTGGGGGTGTACGGGAACGTTAACGGGTTCGGGTCGGGGCGGGGTAAGGGGTAAATGCAAAAAGGCGAAAAGCGTTGAAAACTCTTGTTTTATTTTGTGTACTTGTTTAATTCTGCTTGTATTGTACTGTATTTATGACAAATGTGTATGTATTTTGTACCGATTAATTGAATAGCATTAACGCTTATTTATGTATATTTAAACTAAAACGCTAACTAAGAACGTCAGATCGTCATGTCTTATATATACATATATATACTATATAATTACTATGATTATGTGAATTGTTAATGGATATATGAGCAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTTAAAAATCTTATGCAAAACAAATGTGTTTTCTAATGTTAATTATTTTCTAATGCCAA
>CG31038 25723401 25724533|26043 chr3R 25723680 25723954 scaffold_13 2272677 2272945 - 2440|0 315
AGCTGCATTTCGATGTGAACTTTATTG-----ACCTGCTGGGTATGCCGCAGTTCAGCCGCCTAA----TGGCAACT----TCTGCGGC---------GGGGCAAAGTCTAAA--TGTTGGCCAAACCTTTCACATTTAATTTGGTTTGGTGGCTGGCAGTGGCTGCGGTTCGATACATATAGTTAGATAGATTCCATGGCATTATGGTCGTAAGAACCTGTTTAATGCCCGCTTAGGCGTAGGTGT-------AAGCACCCCCCACAAGTGTAGTAAGCCT--------TGGGTTAGGAGCGGCCAC--TTCGGC
AATTGCAATCCGAT-TGGGCTTTGTGGGTTACACACACACATTTTGGCACAGCTGAGAGGCTTGAGGCTTGCCAATTGCCGTCTGCCGCTTTTAGCCGGGTCTAAAGTCTAAAGCTCTAGCCAAAACCTTTCACATTTTAT--------------------GCCTGTGCTTAGGC-----------GACCTTTTACA---------------AAGAACCTGTTTAATGTACACCTAGGCGTAGGTGTAAAACTAAAACAGAAATTACAATTGTGCTGCGACTGCTGCCGGTTGACTAGGCGCGGCCACGTTTCGGC
>CG31038 25723401 25724533|26044 chr3R 25724225 25724325 scaffold_13 2273804 2273907 - 3493|0 111
ATTTCACGCGGTTCAAGCGATTCTATTAGCTCGTAGATTTCGCC-----GCC--ACAAAGCCTAAAT----CCAATGACACTTTAATTGGTCATTGTATTTGCCCAACCATT
ATTTCACGCGTTCAAAG--------TCGGCTCGTAGTTAAAGCCAAAATGCCGGACAACGCCAACGCGCGCCCAATGACACAGTAATTGGTCATTGTTTTTGCCCAACCATT
>CG31038 25728314 25728953|26049 chr3R 25727895 25728463 scaffold_13 2290055 2290631 - 22468|447 600
TGTTACCTCTCGGACTTCCTCGCCGGAGTCAGGATGGTCATGTGCAAGGCGATCGTGAGCGATGTGCCCGCCTCATCCG----CGTCCGCGTCCCTTGGAGGCGATGGAGCCCCGCTTGGCCGGGACGCGCAGAGCTGTTTGGGCAACCAGACT
TGTTACCTAACCGACTTCCTAGCCGGAGTCAGGATGGTCATGTGCAAGGCGATTGTGAGCGATGTG-CCGCCGCCGCCGACGACGTCGACGTCCAC--------ATTGGGCACCAATTAAGCTG--------GAGCTGTAGCTGCAGCTGGACT
>CG31038 25728314 25728953|26050 chr3R 25728555 25728742 scaffold_13 2290698 2290919 - 1869|0 229
ACTGGCAGCAGTTCTCGAAGTGCCCCCACAAAGAATCCCGTTGCGAAGCCTAGATTATCTGCTGCTTACCTCAATATAGGAAGACCCAACATA---ATATGTATAATTGGT---------------------AGAATTCGTGAGAC---CAGCCTCTGTGGTTAGGAGTCCTT--TGTGATCTTCAGTTGTAAGTTTATTGTA-------------CATTTTTCTCTTGT
GCATGCACCATCCCTAGAATAGTTTACACAAGCGAT--------AAACGATAAACGATCAGCGACAAACGTTAATCGATAAGGGATAATCATACATATATACACTATAGCTTAGCGTTAAGAGCGCAATTTAATTAATCCTAAGCCGCATAGCCATTAAGTTTAGCAGTCCTTTGTGTGATCTTCAGTTGTAAGTTTATTGTAATTTGAGTGTGTGCGTTTTTTTCTTTT
>CG15515 25732105 25732171|26054 chr3R 25731633 25732315 scaffold_13 2295360 2296119 - 21994|495 592
GG------AGCTTGTAGATTA-----------------GAGTTGTAAATAAATGAGTCCAAAATATATGCTTGC----TTGCTAAGAA----TTTTCA
GAAATTGTAATTTTTAGAATATTTAGTAAAAAAACAACAAAGTGATAATAACAGAGTAAAATATATATGTATTTATTATTGCTGATAATATGTTTGCA
>CG31036 25738504 25738614|26059 chr3R 25736328 25738611 scaffold_13 2301300 2303771 - 75411|2409 2532
AGCCCACAACGGATGA---------TCTTAGCCATGTCATGGCAATGGCGTATCATTCATGTCCGAACCAAAACTGTTTGCAATTCATTTAGAATAAACTTT-------TCTTAATACTCCAAA
AACCAATAAAGAATAACGAGAGTGCTCTTCGTTTTATT----TAATAACGTA--ATACGCTGATAAACGTAAACTCTTTTCTATTTCATTACAATAAAATATCACAAAACTTGAATATTCCTAA
>Jon99Ciii 25748762 25748823|26070 chr3R 25747991 25748771 scaffold_13 1816510 1817303 + 1370|834 843
GCAGTTGATG
GCAGCTGCTG
>Jon99Ciii 25748762 25748823|26071 chr3R 25748791 25748839 scaffold_9 1088413 1088462 + 910|0 33
TTCTTCAATAAACGATTAT-AGCAAGCAACTCAA
TTCGAACATAAACACTTAGAAGCACACAAGACAA
>CG15522 25754298 25754491|26085 chr3R 25753648 25754473 scaffold_13 2316696 2317556 - 26966|711 887
AGCTCTAGGGCG-GATGCCAGCGATGGTTTAGCGGGCCAATGTTCGACATTTGACATTTATGTGTGTATGTGCTTTTAGGTGTGCTCAATGTGTGTGCTCCCAGCTAATTAGAAATTAGGTTTTGTAATTCATTGTGAAAGTATTAGATCACACAAGTTTTTTATACATGTCTGCAT
GCCCAATGGACATAATGGAAGTAAGCGTTAAACTGTC---------GCAGTCGTTA-----------ATGTGTTTTTAGTTTTAAATATAAATTATATTCTGTAACAGACAGAAATTATTTTAAATAATGTAGCGCAAAGAT------TTCTATGAATTTTATATATATATATATAT
>CG7866 25759628 25759811|26091 chr3R 25759081 25760481 scaffold_53 81956 83371 + 32163|602 792
GAGGATAAGCCCTCGGTTGAGC--ATTAACAAAATC-----ACAATGGAATCCACGTTCGGTAAAGTCTTCATGTTTCTCACGGACCTCGCTTGGAAAAGTCGTCTCACCATCCCTGTCATAGTCACAACTGCATTTCTCGTCATGGACATCCGCCTGCAGATCGAGATCAACATTCAGTCCGGGCAATTT
CAAGACGAGA---CGGAAAAATAAATTAACTAAACCTAATAATAATGGACTCTACGTTTGGCAATGTGTTCCTGTTCCTCACCGATTTGGCTTGGAAGAGTCGTTTGACAATACCATTGCTGGTCACAACAGCTTTCCTGGTCATGGACATACGCTTGCAGATCGAGATTAACATCCAGACGGGACAAGTG
>CG7866 25759961 25760311|26091 chr3R 25759081 25760481 scaffold_53 81956 83371 + 32163|942 1355
AATGCCAGCGATGTGGACGACGTTCAGGATGGCCTCGACGATCAGTTTAGGATGCACGAT-CACTGGTCGGACGACGAAAGCGGC-AGTGACATCTATACAGATGAG------------------GAGTACACAAACGACGATGG---CAACAGCGAAGCGTCCCACTACAGCGTGGACATCTACGATCCCTGGGGGTCAGAAGACGAGG------------TAGACGCGAGCTATTCGCGAAGGATGCGGTTCTA---AGAC-----ACAATATAAATTCTA-----CATAGGTGTAAGCGAGAGTAACTAGC-TTTATAGCTT----ATGTACATTCAGTAATGTCGAGCCCC---------TATTTATTCATCTCAA-ACAGTCATATTAAACAAAGGTATTTAAGTGCAA
AATGCCAGCGACCTTGATGAGCCGGACGACGCTTTCGAGGAACAATT---GGCGCATGGCGCAGCGTTTG--CAATGGAAGAGGAGAGCGACGTCTATACGGATGATCTCGAGGAGTATAATAGCGAGTATACCAACGGAGATGGTAACAGCAGCGACACGTCACGTTACAGCGTGGATATCGACGATGACTTGGGCTCCGAGTACGACGTCGAGAATGATCTCGATGCTTACTATGCGAGCGAAATTCACTTCTAGCTAGACTACTTCGAATATAAATTTTAAGAGTAATATATGTACATGTTAGAAGCTAATATCTGTAGATTTTAGATGTATATGCA------TATAGCCCCAATATTACGTATTTGTATATTTCGGTGTAATCACAATTTTGAAACCAGTTCAAGCCAAA
>CG15523 25773853 25773929|26095 chr3R 25765501 25773974 scaffold_53 89197 97896 + 252535|8693 8804
TAGTAAATATGCATCTGTGCGTA--------------CGTTTCGGATTAGTCCAAAGTATT-------------CCTAGAATCCTGTGTATTTTATGC--------CAAAAA
TAAAGTGGGCGACCCTGTACAGAATGTATTGTTAACTAGATGCATATTTGTACATAATATTTATTCTAATATAGTCTACGTGCATCCGTGTTTCGTGCATCATATTCCCACA
>CG7896 25816261 25816514|26138 chr3R 25812029 25816503 scaffold_53 161486 165960 + 190634|4388 4631
GCCGGCCAGCCAGCCGGCCGATCGAGGGGCTCTTCATCTTTCCCACTCCTCCATTCTGTCCATTTCAATCTTAGTCAGTCAGTCAGGCGCATCGCCGCAAACAGGTTCTACATTATATCGCCGCTCTCAGCCACGTTGTATATAGCCTTAAAGCATTCTAACCGTAACCCTAACTGTATCTATGTCTAACCATAATTAAGTGCAACCAAGTCGCTTATGCGGAATAAACAAATC-TAGTATAAT
ACACGC------------------------------TCTCTCTCGTCTCGCTGTCTCATCC----CAATCTC--TCAGTCAGTC----------------GCGGGTTCTACAT---------------------GTTGTATGTA------------------TATAGACCTAGTTCATTTCGTATTTTAACTTAATTAAGTCGA--CAAATCGCACACGCGTAATAAACAAATTATAGTATAAT
>CG15524 25822679 25822760|26144 chr3R 25820900 25823759 scaffold_53 172971 175871 + 75264|1839 1952
TTTTAC------------TTATTGT-TAATGCAT------------TTTTTCGTT-----TTTTGTACCAGTTT--AGTAAAGTTAGTTGTATTATTCAGCTCTAGTCATAATC
GCCTACATTTAGTAAGCATTATTGTGTATTGTATAAATAATTTGCATTGTTAGTTAACTGTTTTATCGTAGCTTTAATTAAACTTATTTATCTATTTGTGGGCTATTCGAAATC
>CG11504 25825302 25825485|26145 chr3R 25823815 25825343 scaffold_53 175923 177667 + 48796|1735 1793
----------ATTGATCACTTAGCTA---GAGCTATTAACTACAACT----TTAGGTTT
AAAATGGAAAAATAATCAATTATGCAGACGAGTTTTTAGCAAGAATTTATATTAAGTTT
>CG11504 25825302 25825485|26146 chr3R 25825364 25827517 scaffold_53 177710 179851 + 59986|0 146
TTTTATAGGCCTCGT-------CCCCCGTGACTTGTATTCTCATTTGA-ATTTGTACATTTAACATATATATGTATGTAACGATTTAAAT-ACTAAGCCAAATATAAAATTTAGTGGAATT----------------TCAAAAATAA
TTGTAAAGCTTTCGTGTTTTTATCTCTGTGTTTCAAACTGTAAATTGACATTAATTCACACAATATA-ATATGTATGTAACAATTTGATTAAATAAGCCAAATATAACATTTAGAAGAATCCGAATATCTGTATATATTAAAAAGAG
>Tace 25829245 25829401|26148 chr3R 25828961 25829396 scaffold_53 181783 182220 + 19572|300 453
C--ACAAAAACCCAGTGGGTTCCTTTTGTTTTAATCTTCCGTGAGCATTCTTCTTAAAACTGCCACAATTCGTTTACATTAAGTGACATATTTGAACATACGCAACACAGAATGAATAAAATTCCATATAATATAGACCAAAAACAAAAGGTCA
CATATAAAAACCGGGTGGCGGCCATT--GTTTAATCTTCCGTGAGCATTCTTCTCAAAACTGCCACAATTATTTGATATTAAGTATAACATTTAA-------TAATACATAATGAATAAAATTCCCGATAATATAGACC-AATTCAAAGGGGCA
>Tace 25829245 25829401|26149 chr3R 25829397 25831692 scaffold_53 182422 184667 + 32039|0 4
TTATA
TTTTT
>Nlp 25835703 25836074|26152 chr3R 25835397 25837786 scaffold_53 188649 190945 + 90652|309 725
ACTGCTGACCGCCAATCATCCATCGAGGTTTAAGCTATGAACGTGTAGATTTTAAAGCAAAAACAGTTTTAGGCCCTATAATACAATACGAT--------------------------GCATACT----------GAGAATACAATCTAGTTCCTTTTGAACAGCTCCTTTTACATTCAATTCAAAGACAACGTTGTGTGCTCGGTCGTGTTTCCCCAGCGAATGGTCTGTCGCTCAGCCAGGAGTTCCGCACCCGGAAGCGGGAGCGGATCGGACTGTGACTGATCCGGACACTAATCGAACACACAGATTTGTATATATATTAAAGTATAACTAAAGCTAAGCCGGACTTCCTGTACGCGCCCCTTCATATTTGCAGTATGAAAATAAAC---------TTGTCGGAATACAAAC
AAACTCAAAAAGCAATTCTC----------TAAGCTA--AATCTGTAGATTTTAAA-----AAGTGTTTTAGGCCCTATAA-ACAATACAATTATACAATATTATAACACACACAACTACATACTTACGCTATGTAAAACTACAATTTAGTTCCTTTCTCTCAGAT-CCTTGAAAC---ATTCAAA----ACTTTAAATATT-------------------GATTATATACGACTAAACC--------CCAATCCGTATGC-------------AATAAGCCAGAGATAAACCCCGATTTAGTCAGCATATTTGTATATAAGT-------------------------ACTTACAAT--GCGATTTCTCGATTTTATACAACAAAAATAAACAACAAACTGTCGTCGGTATACAACA
>Axn 25860037 25861035|26176 chr3R 25859315 25860248 scaffold_13 2604423 2605377 + 45522|776 998
TATTAAGCATTTAGCGTAGATTTTGTATTAAGGCAAATCGTGAGTGTGGCTTGGTGCACTGATGCACTCGGCAAGATACGAATACGATAACGAACGCACCAAGTGTACG---CATCTTAGAGCTAGCAACTGGAGAAGCTATTTCCGACAAATCAAAAGCTATATA--------TGTACGGGCGACCGGCTTTTGTAAGCATCACAAACTACTCTCTGCGGGG
TCTTAAGCATTAAGTGTAGATTTTTTATTAAGCTAAATTATGAATGGGG--------------------GGTAAATAATGA-----TTGATGTATGTACAATATGTATGGTACATCTTAGAGATA-CAACTCGAGAAGCTATTCCC-AGAAATCAAAACTTAAATAGAACTAACTGTACATTCAATAGGCTTTTGCAAGCATCACAAACTATTGTACGTGGGG
>Axn 25860037 25861035|26177 chr3R 25860469 25863229 scaffold_13 2605780 2608488 + 70508|0 679
ACAAAATCACATTATTAGGA-AGATTTATGGGTTTACCTCGATTGGGATTTGTTTGTTACCTTTTACTAACTACGGACTGCCTGCAATAAATTTTGTTAATATTTTTGTAATGTGCATTTTATGATGATGATATGATGATATTAACAAAGTTCTATTCAACTCGACAAAAAATCAAAAGATAATCTGTTTTATTTTTGTATA-TCTATAGCACAGCATACA-----------CACTTAACTTTATGTATTTATACA---------------------------------------------------ATGTATTGTAATTGCGTCAAT----------TGCATCTACCGATCTACCATTAGGCACA--TTTCATTTGGGGCTCGATCAGTCCAGCAGCGACCAATACTGGAATACAATGGGTGGGTGGTTTATTGGCCCTTGGCCGGAACGGACGAGGTCGATCGATTGATT--TATTCAAATAAGTTAATGCATACA---CACACACTTACTATACATATTTTTTTAAGAAAACTGAAATAACCGCAGAAATATGCAAGTAACGGATAAATTTATTATATCAAA----------CATATTTTATTTGTGAGCAAAATGCATATAGATTTAATAAAA----------------------AAGTACATGGATAGAACGTAA
AAAAAAACATAGCAAGAGAACAGTTCTATGGGTATTCCTGAATTCGGATTTGTTTGTTACTTTTTACTAACTATGGACTGCCTGCAATAAATTTTGTTAATATTTTTATAATGTGCATTTTATGAT------ATGATGATATTAACAAAGTTCTATTCAACTCGACAAAAAATCAAAATATAATCTGTTTTATTTTTGTATAATCTATTATACTACATATAGTATGTATGTACATTTGAATTTATGTATTTATATATATATACACACACGGACACAGACGCATGTATACATATATAAAAATATACATATGTATTGTGCTTTCGTCTATATTATATACATAAATATATATATTTACCATTGCACACAAATTTCATTTGA---TTTATCAAACGATGAGTGCTAATTGCT-----CCAATAGTTGCATAATTGCTTAACAC------------------ATTAATTGATTAGTTCTTACTTTCATAAGTTATCAAAAATATAACAAAACCATACAATAAATATTTTTTTAAGAAACTGATCATAACCGCAGAAATATGAAATTAATGCATACATTTATCATAGTAAAACAAACAAACCATATTTTATTTGTGAGCAAAATGCATGTAGATTTAATAAAATGAAAGAAAAAAAACAAAAACAAAGTACATAAAATTGACATTT
>Sry-alpha 25868577 25868808|26182 chr3R 25866798 25869055 scaffold_13 2611911 2614210 + 30021|1875 2135
GTGGGGCGAGCCATATTCTA-AATACGCGGGC-TTATCTGTATGAGATTTTTTTTAATACTTCATTGGCTTGAAGTGCTTA-ATTAAGATTAAACAT-ATCCTTACAAAGATTCTAATTAGCTACCTAAGTCAATTGTGTTCTTTACACTTATGTAATTACTTCAT----TAAGTTG---AAGCCATTCGCATAATTTATA-TAAAATACAATTAAAACATACCATTATAAAAA-----------------AATTATATAA
-------AATACAAATTCTGCAAGATGCGTATATTGTGTATATAAGATTTAAATAAAAATATGTTTGA---AAAATGCTTATGTCAACTCTAAAAATAATGTTAATGTATGGTTTTATTAAAAGTGTATATACGTTGTTGGATTCGAAATAAGCAGACAACTAAATATAATAAGCCACACCAGCCAACTGTTTTATTATTGTTTAAATATAA-TAACAAATATTTGTATTGCAATGGCTTGGCAGCCCTGCAACAGTGTTG
>Sry-delta 25870503 25870613|26183 chr3R 25869193 25870510 scaffold_13 2614211 2615465 + 57008|1324 1331
GCTACATT
ATAGCATT
>Sry-delta 25870503 25870613|26184 chr3R 25870511 25870768 scaffold_5 471516 471785 - 1117|0 107
GCCTACAATAAGTAATTGTTTATCTTTCCCTAGTGTATTTCCTCCTCTT-----TGTACTTGATTATTGTAGATTCCTACAAAATATAATTTACTGGTATTTCAATTA
GTCTATAAACAATAATCTCTTTTTTTTTACATATATATATTTTTTTTTTAAACATATAAACAAT--ATGCACATGCCTTTACGCTTTTA-TAAAAGGAGCCCAAATAA
>CG7946 25880028 25880068|26192 chr3R 25878519 25880077 scaffold_13 2626966 2628537 + 60468|1573 1620
ATGATC----GAGGACCAGTTCTGCTGGACCAATTACAT---GATAAG
AAGGTCAGCAAAAGGCCGCGTCAACGGTTCCAACTACATCTACTTAAG
>CG7946 25880132 25880420|26193 chr3R 25880116 25880153 scaffold_13 2628584 2628620 + 1199|16 37
TTACTCGTAAGCGTTACAAACC
GTAATTTTAAGC-TTAAAACCC
>CG7946 25880132 25880420|26194 chr3R 25880383 25880966 scaffold_13 2630310 2630868 + 20372|0 38
TTTGAATAATAT-TGAATTAAATATAGATGGTACATACA
TGTGAATGATATATGTAATTATTGTATATACTGTATATA
>CG7950 25883658 25883903|26198 chr3R 25882808 25885037 scaffold_13 2632311 2634791 + 26436|884 1154
GTGGGAGTACATAAGATAAGAGCTAGGTGTGACTTCGTACAAAATAAATAAAACTTGTCATTAACTTCAATCCATCCCCACACTATCGATCGTGACTGGGAAACATTTATCAGCCA-GATAGTCTGG---------AATTAACAGAGATATTG-----TTGAAACAGCATAGTGCTTATTTCAGAAATAAAAGATACTCGTT-------TTCTCAATTAAATTCTCGCTTTTTTTA---CAAATAGCGAAATACACAAATAAAAAAATGTA
GTGGAATAAAATAA-ATGAAACAAAG--------TAGTTTAAAATAGTAAAAGCTTGT-------TTCTATTGATTAACAGGTTAGCTCTC-TCATT---AATAACATATCAGCTGTTAGGGTTTTGTTTCATCCCACTTAACAGCTGTTTTAATACCTTGCGAC--TTTAGTTGTTTTTCTTCATTTTGTAGCT-CTCCTTGAATTTGTGTTAAAATAAACTCTCGCTTTTTTTATTTTTAATATTTAA--GCATATATTAAAACCTGTA
>sima 25946481 25947113|26278 chr3R 25945811 25947554 scaffold_13 2741754 2743550 + 23778|712 1440
ATTACCAG---------------------TACCTTAGCATGCACTGCATTTGATATGAGGCATTTG------TTGGCGGAGGACGAGAGAAAACATTGAAA-TTAAACTGAGCATCGAGAAGGAAGC-TAACCAAAAGATTGATTTT-GAGCCTTGCGTGAAAGTAGGACCCCGCACAACCAACTTGACAACTTGACAGGACCCATCCCCACCAACCATTTCCCCCTGACGATGATCCAACACTTGACCCCTGACCCCGACCCTGACCCTGGCCCCGACCCCATGCTAACCGACACATTTACAAACAGGAAGGGTTAATCACACTTGAATAGTTTTGTAGCCATGTTAACTGCCTAGAACAGAAGAATATACACGTATGTAATTTAGTCTTAATGTTTTTCTATATGCAAACCGTTTTCACAACAGATGGATGAGGAGCAAAATAGCAGAGGAGAGTGGAAAACCAGTCGAAACAT--------------------------------------------AATGATAAACCTATAGATTACAATGAGAAAATACCGATGAAAAATGTTCATAGTTTTTTGCTGGAAGGCTCAAACAAGTTTTTTGGTGATGGTTGTATTCTGGTTTATAACTTTCAAGCAAAAATGCTGTGACGAGAAAAAAAG---------------------TTTTTGAACATGTTTTAAAATAAATATTA-ACAAAAAAAAACAA
ATCATTAGGCGGAGCATTGCATTTTAATTTACGTAAGCAT-CATTTTGTTTTCTAGTTGGGTTTTGCTTATTTTAGCATTTACAGCGCGTGGGTATGGAAAATTTAAC--AGAAGTAAAATTAAAGCATAAATAAAAGATTCATTTTTGAGCCTTGCGTAAATGTGA--------------AAATTATCAATGT----------------------------------------AGCCAAC-----------------GACCGCGCTCCGAAAAACAACCGCA-------CGACACACACAAAAACAGGAATGGTAAAAATATTTTGAATAGTTTTGTAGCAACTTTAACTGCCTAGAACAGATGAATATACATGTATGTAATTTAGTCGTAATGTTTCTACATGCAACAAAAAAGTTGAGAAGAAAAACCCAAAAACCACAAAAAAAAAAAAATAAATAAAACAAATAAAAACATTACCGAAATAAGTTAAATTCGTACACAAGCAACAGGATAAAAAAAAAGAAAAAAAAAAAAAAAACAACAAAAGGGAAATTAAAAAACATTTTCATAG-TTTTTGCTTGAAGTCTCAAAATTACTTTTTGGTGTCGGTTCAAATCCGAT---CAAAATTCAGACGCAAAAGCTGTGAAAAAACAAAAAAAAAAAAAATAAAATGAAAATTATTTTGAAATAGTTTTATAAAAATTGTAACACAAGAAACATTTC
>CG15529 25978742 25978997|26303 chr3R 25978352 25978943 scaffold_13 2788534 2789190 + 26953|390 656
CTAGGGGTCAAATC-------------------------------------TTTATTG----CATAAGAGAGGGCAAGTATGTACAAATGGGGTTAGCTTAAGAC------------------------GATGCTCAGGTGGCCACCACCGCCTTGAAGGCGCACTGGTTGTTCTGCATCAGGGCGGGCCAGAGGAAGGCTTTTATCAGATCCGATCGCCGGTCCGCCTGGGGATGCCGCTCGTGTTTCTCGGGCCTCAGGAAACCT
GCAGGGAGTACATATGCATGTATATAGACGTGATTAGCGTTTAGGTTATCGTTTATTGGGTTTATGAGTAAGATAAATTATGTACAAATTGCGTAAGTTAATTATAAAGTTAGTTAATTAGATAGCCGGGATTATTAGGTGGCCACAACGGCCTTGAAGGCGCACTGGTTGTTCTGCATTAGGGCGGGCCAGAGGAAGGCTTTGATTAGGTCCGAGCGGCGATCCGACTGTGGATGGCGCTCGTGTTTCTCGGGACGCAGAAAACCT
>CG15529 25978742 25978997|26304 chr3R 25978996 25979354 scaffold_13 2789433 2789793 + 21503|0 1
AA
AA
>CG15530 26005472 26005903|26325 chr3R 26005577 26006836 scaffold_13 2237561 2238758 + 22009|0 397
AGCAGAGCTACC---------GATCGAAAGCGATTCGAAAGTTC------CCATACGT--------AGGAATACACCTGTTGAAAACCCACAAATCGAAAGCGTGGAATC-------CAGCCGTGA-----GCATGTGAATA-----ATCCAGAGGAGTATCCCTATGTTGTGGAGA--TACCCGAGCAGGAAGAAAAAAAACCG------CAGAAGGGTAGCCAATCTGCGAAATCCAAAATCAAATAAAGCGAAGAAATGGAGAAAAGAACTGCTCTCTTTTTCTATGTTATCCAAAT--TATTAATTTT-----TGTAAGATATTAAAATTCAAAATAAAAA---------CGTAACGTTTTATGGGCAGCACTTGCCACCAC-------AGCGC
AGCAGAATTACTCTCTCTTTTAATAAAAAGCGAGTTTACCGCTCTTCACACCATGCGTTTTAATTGCAAAATATAACACTTTTAAATT---AAATTGAAATCGCGAAATTTGCACAACAGCCGAGAAGTCTGCGTTTAACTATAGGCATCGATAGAAAAACATTCGATTTCCCGATAACTGCAAGCGCATGACAAGAATATATCGATTGTTCAACAAGGAAGCTAATTTGAAAAATATCGCATATACTTACCCTCACAAACACACA--------------------TTTGTTACTTAAATGATGTCAACTTTGCGTTTGTTGACTATTAAATCCTAAAAAAAACCTGATTTTTCCGTAATTCATTATTTTCAGCATTGTTCATTCCCAGTCTTGGCTA
>CG1359 26006720 26006743|26325 chr3R 26005577 26006836 scaffold_13 2237561 2238758 + 22009|1250 1273
ACAAATAAATAGCTTAAGCTCAAA
AC------------TAAGCCCACT
>CecA1 26036923 26037009|26355 chr3R 26036337 26037365 scaffold_13 2287113 2288164 + 13098|627 734
CCACGATGATTATTTATAATTATTTATTTAAAGATCTATTTATTCTGTTGC--TCCCTGTAAATAAAACAATTT-------------------TAAAAATTTAAAGAA
GATTATGGACAAATCATGCTTATTTATTATAAAAT-TATTTATTTAGCTGTAATGTTTTAAAATAAAAACATATAATATCAAATATATTTAACAAAAAACATATACAA
>CecA2 26038210 26038291|26358 chr3R 26037767 26038291 scaffold_13 2289350 2289920 + 13214|481 571
------CCACGATGACTATCTAATAAATAT---TTATACAAAATCTTATTTATTTTTTTTGATCTAAGTAAATAAAACATTGGGAAAATCA
GATTATTTACAATTCCTGTTTATTTATTTTATAATATATATATATTTATTGAGTCGTAGCGTTTTAAAATAAAATAATTTTTGGAAAAACG
>CecC 26042560 26042659|26365 chr3R 26042123 26042672 scaffold_13 2290803 2291338 + 8252|485 589
GCCTTTAATGTCCATCAAAGGACTCTACCAGGATAACGCGCGTTTAATTATACACACTTATTTATTTACCAG-----CCATAGAAATAAACTAGCTTACATCCCC
A---------------AAGGGATGCAATTTCTAGA-------TCTGCTTAAACATATTTATTTATTTATTTGTAGTTTCTTAAAAATTAAATA---TATATTAAT
>CG9682 26078475 26078557|26415 chr3R 26078438 26078528 scaffold_13 2339425 2339535 + 948|53 110
AGTTTCTCTCTACT----TTTCTACTCATTTGTCCTAATAAATGAACGAGCAAATTAA
AGTCTATATCTTCCACAGTTTTTGATTAACAGTCACAAAATATATACGAACTCATTAA
>CG18404 26079766 26079820|26418 chr3R 26079587 26080083 scaffold_13 2341325 2341798 + 12493|179 240
A-GAACTTTGGAGCAGTTCAAT------TAACAAATAAATATTCAATCGCGCAAAGAGCTTA
ATGCACTTTAAAATAAATCTATATATACGGATATATACATATTCAATC--------------
>hdc 26186263 26187891|26567 chr3R 26186065 26187622 scaffold_13 2470303 2471952 + 45336|198 1822
CATGAGGCCCCGTTGGAGTCGCCCGTGGGAACAGGTGCCACCACCACTCAGGTGCCAAATGCCCAGGGCTCTCCAACGGCCTCCGGCTGCAGCAGCAACACCATCGCCAGCAAGCAGCCACCGAAGCAGCCGCTCTACAATGCCGCCATCGATTACTCGGCACCGCTGCAGCAGCAAATTAATCCGGACTTGATTGGAGCCCATCCGCATGCCCAGCAGCATCAGCAGCAGGTGCGGCAGCAGCAACAGCAGCA-------------------------GCAGCAGCAGCAACCACAGCAG-----------------------------------------------------------------------------------CAACAACAACAGCAGCAGCAACAGACACAACAACAACAGTCACAACAACAACAGCAGCAGCAGCAGCAGCAACATCAGC-----CTGTGGTCAGCACTTTTCAGAGGGGCAACTTCCCTCAACAGTCCCATAAAACCATGAACATGATGGCCATGGCGGATGTGATGAGCAAGTACCAGCAGCAGCAGCACCAACAGCAGCAGCAACAGCGCCAGCAGCAACACAACCTGCAGCCACAGCAGCAACATGCAACGCAGAAAGGACTCGAGGGCCTTCTATTGACCAACACAAACACAAGCAAC---AACAATAGCAGCAGCAGCAGC---------------AGCAGCAGTATTAGTAACTTAATCATTAGCCATAATTC---AGCCAGCAATACAGGCAACAA----------------AATGC-------------AGCCCACTTGGGG-CCAGAGTGATGCCATCTCGGCATTGTGGGGCTG------------CTCCAGCAGCAG------CAGCGGCTGCTCCTCGGGCAGTGGATCGCAGCCCTCGTTGAGTCCGACGGCCAGCAGCAATGGCAACGATGGCTCCAAGATGATGTTGTGGGCGGCCCAAAGTTCGCCACAAAATGCTGCAAC--ACTCAGGGATGGATTCAAGGAGTTGCAGCGCCAGCAGCCACCGCAGCAGCAGGTGCCACAGCAACAGCCACATGCAGCCTCGCCCACAGCTTCGCTGACCAGTTC------CAGTTCCTCCTC---------------------------GAACGGATGGAGC---------GCCTCGCATTATGGCAAGCC------------CAACATCTGGGAGCTGCCAGGATCCACCGGGCAAAGGACACCGGCCAGCAGCCACGACATCTTCACCGATCTCCTGTGCAACCTGAGCATCAGTCAGGACAACAGCAGCCAGCAGGCCAGCAGCAAGGC---TGATGCCTCCGACGTCAGCTCGAATTCCTCCTCGTCGGCCGGGGAACTCCTGGAGGCGGCCAATATCTGGAGGT----------------TTCCAGAGTACGCCAGTAGT-----CAGCTCTA---CATGGAGGAGCCAACTGGCGGCGCAGCTGCCTGCATGCAGCTCTTCAACGACTATCTCAACATGAACTAAAACGAAGAATTGGGAGCCACAACAGCCTGCCGCATTTGTTACTCTAGCTAAATTGAAAAACAAAAATTGA
CATGAGGCCCCGTTGGAGCCACCAACGGTTGCTGGCGCAAATCCAAATTCAG---CCAGTGCCAATGGTGCTTCAACGGCCTCC---------------------------------------ATGCAGCCGCTGTATAATGCAGCCATTGACTACTCCGCCCCGCTGCAGCAGCAAATTAATCCCGATTTAATTGGTGCCCATCCGCACGCCCAGCAACATCAGCAGGTAAGACAGCAGCAGCAACAGCAGCCGGCACAACAACAGCAACAATTGGTTGCAGCAGCCGCTGCCGCAACAGTCCCCACAGCGATTGCTGCCACACAGCGTGCCACAGAAGCCGCCTATTTGGTAACAGCAGCAGCTGCTCGCGCTGCCAGCTATCAGCAGCAGCAGCAGCAACAACAGCAGCAGCAGCAACAACAACAGCAACAACATCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAACAACAGCACAAA---TTAAGCTTCTCAAATAGCTTCTCAAA--------------GGCCATGGCGGATGTTATGAGCAAGTATCAG------------CAACAACAACAGCAGCCGCTCAAGCAATTGGGCAACTTG-AGCCTGGGC--CATGATGC---------------CAACGGACTTTTATTGAACAACATAAACAACAGCAATGCAAACAATAGCAACAACAACAGCAACAACATTGGTGTTAGCAGCAGTATTAATAACTTATTGATTAGCCATAATTCACAAAACAACAACAACGGCAATAACAATGGCCTCAAAATCAACGCCTGGTCACAGCCAGGCCCACACATGGCCCAGGCGGAGGCCATATCAGCATTGTGGGGCTGTGGCAGCAATGCCTCCACCAGCGGCTCGACCAGCGGTTGCTCATCGGGCAGCGGCTCACAGCCGTCGCTCAGCCCCACCACCAGCCACAG---------------CAAGGAGCTGCTATGGGCA---CAGACCTCGCCCA-----GCTGCGCCCAGCTCAGAGACAATTTCTAT--------------GCGGCCAAAG----------------AGCTGTTGCCGCATGCTGCATCGCCCACCGCTTCCTTGACCAGCTCATCGGGCGCGTCTTCCACCGGTGGTGGTGGCAGCGGCGTCGGCGGCAGTGGCTGGGGCAATATAACTGCTGCACACTATGCCAAGCTGAGTGCGGCACAGAATATCTGGGAGCTGCCGACGGCGGCTCAAAGTAATGCAGCAACGCTCGTACCGGACATGTTCAGCGATCTCCTCTGCAACTTGCACATCAGCCAGGACGGCAACACTGGCAACAACAACCACAAGGCCAACGATGCCTCAGATGTAAGCTCCAATTCGTCCTCCACAGCGGGCGAGCTGCTGGAAGCAGCCAACATTTGGCGGCACAGCAACAACATAAATGCCACGCCCCATCAACAGCAGCAGCAGCTGCAACTCTTTGAGGAGCCGGCTGGTGGTGCA---GCCTGCATGCAGCTCTTCAACGACTATCTAAACATGAAC--AACTGAA-----------------------TCACAAATGTTACTCTAGCCAAATTTAACAGAGAATAGTAA
>hdc 26186263 26187891|26568 chr3R 26187709 26188626 scaffold_13 2472046 2473164 + 8397|0 296
TTTTTTTTATATACACACACACAACACACATCTAAAACCGAGAGAAAACAAAGCAAACTAAAAACGAATTTCTTGTTA-------TTTTTGTTGAGTT---TTTTAGTT-------------------------CTTTGTTTACA--------------------------------------------CACACCTACCTAAACGA----AAAAAAAAGCAATTTTTAGTTTTATTTTAT-------------------------------AAAGCAAATTTTTTATACATTTTACC
TTTTAGCAATATACCCAAAAACAGAAAACA--AAAAGCATAAAGAAAAACAACTATAATAAAAAACTTGCCCCTGCCAACAAACCATGTTGCTGTGTCTAATTTTAACTAACATAAAAAAAAGATGGCAAACGATTTTACTGAAAACAAAAAAAACGCGGCGTCAAAAACTGCGCGAAGGGCAGAAAACAAAACGTAACTAAGCAAAACGAAACAAAAACAATTTTCTTGTTACTTTTGTTGAGCTTAAACAGAAGATAAAAACCTAAATAAAAGCAATTCTTAGTTTTATTTTATA
>Fer2LCH 26215985 26216306|26591 chr3R 26213792 26216443 scaffold_13 2492874 2495645 + 26406|2420 2845
GGAG-------TGGAGACCACCTC--------------------CTTTTCCTCCTTCTTTTTCTAACACGCTC------------CTACACTGTCTCCTCAAAATTGCTCTCATAATTCCCT-TATAAATTT---GTTTCCTTGGATTGTTCATCAATAAATCGCAGTGCAGCAGC------AGCATTATCAAAGCAGCCACAA-------GTGAA-----TAATTTAC-ACCGCGAA--ATTCACCTTGATTT-------------------------------------ACCAGCACACCAGATTGTGATAATGTTATCATAAATAAGTTAGCAA-GTTCGCCCCAGCAAATGTATCTTTAGTATGTACGTTACC--GCTTGAACAAATAATAAACACATCAAAGAACCTAATTATCAACTAGT
GCAGTCATCTCTGCAGCGCAACTCTAAATAGCTGTTATCAAAATTCACTCATCGTTCTGTGCAAAATACAATTAATTTTCTAGTATTATAAAGATTCCAAAAAATACACCCCACGCTGCGTTCTGTAAATTTCAATTGTCATCCGAGTTGTGTTAAATAAATCGAAGCGCAGCAGCTACAAAAGCAACAAAAAAACAACAAAAACAAATACGTGAAACATCTGATTTACAATCGCTTATTATTTAATTTGATTTATTTTCCATGTACACACACACACACACTATCATATACACGCGCACACACATTTGTGATAACGTT--------TAAGTAAGCAGCGTTCGCTTGAAGAAATGTATCTTTA--AATTATGTTACCAAGCTAATAAAATAAATAAACAAAGACAACAATATACGCAGTATTTCAT
>CG15533 26256983 26257091|26619 chr3R 26255800 26257145 scaffold_578 1863 3147 - 45393|1184 1319
TAATCCTCATTTGTACCCC-------CTAAGTTATATAAAC-------CGAATGGATTCCATTCTAAAAGTAACCGCTCTCAAGTGGCAAATAGAAGTATGCGCTTATCCCTATCGAAAC-------------TAA
AGACTTTTATCTATAATATACTATTGATAAGTTATATAATCGCACATTCCATTTTATTTTTTTTTAATATT----GCGATCAAGTGCAAAATCCAAA-ATACATTCATACACACACACACACACACACACGCACAC
>CDase 26291284 26291458|26646 chr3R 26290413 26291503 scaffold_15 552719 553770 - 52185|872 1046
GATTAGATATCCGTGTGGAGTGATTTTATAAATATTCCTGGCCAGACAGTTGTAGGGCCCATCAAAAACAAAATCAACACTGAATCCATGTATTTATTTACCATTTGTAAGTGACGAAGGAAAAGCTTTATTTTTGCAAACGCGAATAAAAAAGATGCCAAATTATGTTGAAACT
TGTT-----CCCGT------TGATCT----------------------------------------------ACCAAAACTG-ATCCACGTATTTATTTACCATTCATGGATGATG-AGGAAAAGCTTTATTTTTA-AAACACAAATAAAATGAATGCCAAATT-TGTTAGAGCT
>PH4alphaEFB 26311262 26311521|26662 chr3R 26310907 26311519 scaffold_15 573818 574553 - 12781|429 763
T-------------------------------CCGGAGTCTAGT--------------ATGCGTATGCAACGAATCTTTA--------GTGCGAAATCTCATCCTTCG----TCATCGGCC-----------ATCGACTTCCTATTGTAAATAAAGCACTCAGGCCGAA---GAAGGTCGCATCTGTTCTACTTATCGGTTCATCGTACATGGGAACCA--ACTTCAACCTAGCTGTATCCTAGACTCG----TATGGAATTTATCTACTTTTGTATATTTGCCTAGTTTAAGTAGTACAAAAAAAATGCAATAAATTCGAATTGGAAATCAAAC
TGCAATGTTCGAGGAGAGAGCTTAAGCTGAAGCCGGAATCTCATTTACCAGCTGACCAATGTGCTTACTACCCACTTCTACTTACTTTGCATTCAAACATATCTTTAAGAACTTGCCGGCCGGAATACTCATATGCTTTTCCTATTGTAAAT-----ACTCAACCCAAAAATGAGGGTCCGGCTGCTGACAAAAATCATTTATTCTCAACTACATACCATGACTTGGCATTAGTTTTATTTTAGACATGCTATTATTGAATTTATTAACTTTTGTACA-------AAAATATCAAAAAAAAAAAAAATCTAGTAAAT---AATTGCAATTAAAAC
>Jon99Fi 26315514 26315625|26668 chr3R 26315303 26315518 scaffold_9 1088194 1088409 + 11408|211 215
GTGAA
ATGGA
>Jon99Fi 26315514 26315625|26669 chr3R 26315519 26315587 scaffold_9 4050453 4050534 - 85|0 81
TGAGCA---GTAACGAATTTA--GCA-----AATTTTAAAGAACACTCTGTCTGCA---GTCATTTAGATTACGGATGAGAG
CGCGCAAATAAAATAAATTGAAGGCACAAACAATTTTTCGGGGGATTCTATTTGAAAAGATCATGCGGAGTCCTCATGGGGG
>Jon99Fi 26315514 26315625|26670 chr3R 26315588 26317651 scaffold_15 575532 577608 - 30707|0 37
ACTCCAAATAAATAATTGCAATGAGAATATAACCACCT
ATTCCGCATAAATTGAGAGAAGCTGCACGGCATCAGCC
>PH4alphaSG2 26317677 26317724|26671 chr3R 26317671 26318983 scaffold_15 578075 579417 - 35266|6 67
GTGTAATTTAATATAATAAACATT--------------TAATAAATTAATATCTTATTTTAA
GTTTAATTTAGTCAAGTCAATAATCTGATTGGTACTTATAACAAATGGCAAGCAAACTAAAT
>tmod 26402933 26403280|26756 chr3R 26402689 26403311 scaffold_15 663241 663893 - 9208|267 680
AAAGACAAATACGAAATATATAGCAG-CAACCAACCAACAACAACATGCCACCACCCAAGAACAACAATCAAGCAGAAAGCCATCTATATGT--------GTGCGTGTTTCT---------TTGTCCGACTCTTGATTTGATAATTACCAATTAACAAGCAAAACCCAGCAAGAAAATCAAACCAAACCAACAACACCACCAGCAAA---------------CCAGAACAACAGCAACATGAGCAACCACGGCAACCA-----------------------------GAACAACAGATCTATGTCTATGTCCAAAACTCCCCCACCAAC--CGACCTCTGTACTCTGCTCCCCGACAACCAAT-CCAACCAACCAGCTGT-GAACTAACACCGAAGAATGATGTGCGACATGAA
AAAGACA------AAACATGCCACAACCAACCAACCAACCA-ACCAACCAACCAACCAACAACAACAGC--AACAACAACCTTTGTTTGTGTGTGAGCGCGTGTGTGTGTCTTTGTTCTTATTGTCCAACTACTTATGTACTAATTAACAA-CAACAACAACACCAGAACCGGCTGATGCAACTACAACAAGAACAACAACTGCAACAAGTATTCTCTGTGTTCAGCTCAACAACAAGTACAACAACAACAACAACCATCTTGTGATTTTCCCCTCCTGTTGACTGTTAAACACCGTCCTCTGTGTA--ACCGCAACTACAACAACAACAACAAGCACAACAC----CACCCAAACGACCCACACCCAACAACCAGCCGCAAAACTAACACCGAAGAATGATGT-TAACAAGCA
>tmod 26403839 26404627|26757 chr3R 26403622 26404325 scaffold_15 663894 664848 - 4541|322 980
TTGGACGTCAGCGTCGCATGGGCCATCTGACCAGGAACTACACCGTTGGCGTCTGGCAGTAGGATTCATCCGACTGGGACTTGGGAGTCTACACATTTTACACCGAAAGAA---------ATCAATAGCCTATCAATAGTGT---TGTCACATGCTTGTTGTTGCTCTCACGCAGAGAATTGTTTCAT--------------ATTGTTTTGTT-CAGTGTTTGTTGCGTTCT-----------TCAGATTGATGATTTCGGTT-------------CGAGTTGTG---TTTGTGTTTGG--ATCACCACCTAAGCATAATCATTTGTTTGTTACGAGTTAGGCGAATGTTCATTGTCACACACGCAGATCCA-------------------------------------GGATTAACTTTCTAT-----CTGGCA----------------------------------GCTCT----------------AAGTAGTTATTTCCTTAAGCAAATCTTCACAT----------------TTACGCTGCAGCTATACACACGTTTATTTT------ATTTTATTTTATTTACCTACCATTCTGTCCCTTGATTATTTGTAGCCCCTAGACGGGGCGATATTTCACAATTT--TTAGTTTTA
TTGGTCGCCAGCGTCGCATGGGTCACCTGACCAGGAACTATACCATTGGTGCTTGGCCGTAGGC--------ACCGGGACCTTTTGGCATCGCCATCATATACTCGATATATGTGCTTATATGAACTACATATAGTTAATATATATATATCATACTTGTTGTTGTTGTTTTACAAA-AGTTGTGCCACTCGCTGGTCGCGCAATTCTTTTGTTTCAATGTTTGTTGCGTTCTATATGATTTAATTATAATTATTATTATAATTTTTTTTTTTTTGGCCAGATATGGGCCTTGTGTTCGTTTATCTGCGTATATACCTAATCAATTGTTATTT--GAGTAATGCGATTGTTTGTTGTCAAGCACACACACACACACACATATGTACATCTACACACACACAAACAAATTGAAATTAATTTTATCTAGAAATTGACATTGTTAAAATTTACAATTACCAAATCGAATTAACGCTTTTGTCACCTTAACAAAAAAAAAATGTTTTCCTTAAGCAATTGTCAATTTCGGATTTGTCGGATTTTTACGCGGCCGCTTCACACGCGCTCTTTTTGCAAAGATTGTAATTT-TAAAACTACCTTTTG-------------TTGTTGTTTTTATATTCGGTTAAATT-CAAAATTTAATTTGTTTTA
>tmod 26403839 26404627|26758 chr3R 26404329 26404723 scaffold_15 664899 665291 - 14804|0 316
GTGTTTATATCCA--CACATGCACACATGATACAAACACATACACATA-ACATACATAA-TACTTACACACT---ATATATATATGATACATATA----TAGCCATGGTCTCTGAAAACAATTTACTGCTATTGAATTATGAAAT-GCTTAAACATAAATTTA--ACTTATGGTTAAACACACAAAACAAATGAAAAACATACAATTGTATAATGTAATGATATCT--TACTTTATATGACATAATGCAATGCTTTTAAAATACAATTTTTAAAAATCATGTAAAAACTTTAAAATTAAATAAA--AAAAAAACTAC
ATATTTACATGCATACACATACATATATAATACTTATATATACATATATATATAAATAAATATATATATATTCATATTCACATATGATACATATACATATAGCCATGGTCTCTGAAA-CAATTTACTGCTATTGAATTATAAAATTGCTTAAACATAATATTACAACCTATGTTTAACTACGCATATAAACAAAAACGGATACAATTGTATATTGTAATGATATATCATACTTTATATGATCTAATGCGATGCTTTTAAAATACAACTTTTAAAAATCATGTAAAAATTTTAAAATTAAATAAACCAAAAAAAATAA
>CG9702 26407785 26407842|26760 chr3R 26406060 26407902 scaffold_15 666033 667880 - 72579|1738 1796
TCTTACAACGCCCAAATAAAATTAGCTAAGTTATATCTATACCATTACG-AACATTAAT
-CTAACA-----TAGATAGTGTCAGCTACTAATTAGCTTTATTATGGCGCAATAGTAGT
>PH4alphaNE3 26431693 26431866|26781 chr3R 26431636 26431928 scaffold_0 5299898 5300193 - -2684|58 238
ATTTTCATTCAACCCATATACCGCGAGGGAAAGACAATGAAACACAAATAATATTA-------CAGCTAAAACTTAAGATAAAACAACAGACGTTTTATTTCATTGGGAAGTAACTAACTAAGCATAACTAACTAACCAATAAACATATCGAATTGAATGTGCAGCGCATAATACCTTTTT
AAGGTTATTTGGATATTAAACATTGAGTTCCTGTCTATGAATT-TATATGCCCTTAGTTGACTTAATTTGGATTGGACATTAAACAATCAACAGTTAGTCTTG-------GTACTGCTTTAAGCATA-TTAACTATGC------TGTGCCTAATTAAATTTAAAACACACTCACATTTCTT
>CG1342 26518424 26518490|26879 chr3R 26515660 26519450 scaffold_22 647907 652087 + 123996|2943 3094
TCTGCT------------------------AGCTTAGTAACGAATTTTCACCGA-----TCCATGCAATAAACGTAC----------------------------ACAATTCATTTTCC----------------------------AAAAC
ATCGTCTCTCCCATGGATCGCTAGCTATTAAGTTTCGTAACGAATTTTCACCGATGCGCTGCATGCAATTACCATACTCCTAAGTGCCCATAAGCAATAAAAGAGATTTTTAATTTCCCAAAAAAAAAAAAAAAAAAACGGAAAAGGAAAAT
>CG15543 26569539 26569636|26944 chr3R 26568666 26570983 scaffold_22 716852 719069 + 53328|873 1017
A-----------TTTGATTCCA--GCCACTCTGCATCCAAATT------------GAGTAACAATGTGTTCTTGGAGTC----------------CTTTCTGTGATTACTCTCGTTATTA------TTATTATTTGCTCAAGTGT
ATGGCCTGCTGCTCCGATTACAATATCCATTTCCACATAAATTATTAAATGTTACGCGCCACAAACTTGCCTCGAAGACTGAACAAAAAAAACCGTGTTCCATAATTTTGTATGTCATTGCTTTGTTTATTATTTACTCAAGTGG
>zfh1 26611926 26614205|27001 chr3R 26608399 26614694 scaffold_22 765974 773145 + 131435|4006 7052
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AACCGTTTCGTTTTTCGCTACAATACTT-TGTATTCCCCTGTATATCTGATAATTTCGATAAGTATTTTTTATACACTCGTACATTCCGAAGAGCAAAAGGGTGTGATTTCTT----TTAGCTGCTTT------------------CGATTGCGATTTGTTTTGTTTATTCGATTTATGATTATTTTTTAAAGATGTATTAAAGTTATGAGTAAAC-TGTACTATAAACTATATACCTAACGAGAGAGAAACATACAAAGTTCGATGGAG--------TCGATGATGATGCCTAAAACTTAAGCAATACCAATAAATAATGCAAAT-AA
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ACAGCTGCAAAGGCATT----------CACATGTGATCCAAGTCGTATTGTAGTTAGCTTAGACAACCTAAACCTAGATAGATAAACCTAGATAGATGTA
ACAGCTGCAGCGGCAATTCATTTCATACACATGTGATCCAAGTCGTATTGTAGTTAGCGTAG----CTTAAATTAATATAAACTAGCCTTCATTTATACA
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TGATGCTATATCGATTGATAAAAAGAACAGATTTAGTTCAAGTTCAAATTAAATAGCTTTTG-------AGACCAACACATA
TTGCG-------GGGCGTGTGCGGGGCCACAAGGAGTTCTTGTCCACCTGACTT--CTTTGGGAGACATAGACTAAAGTGTA
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GAAAACGCACTCGGTGCTCTGCTCAATCAGCATCAGCACCACTTGCAGCACTTCTCCGGCCAGCACAATGGCAATGCCATGCAGCAGCATTTGACCGGCAACGGCAGTCATAGCCACAGTCATAACAACAACAACAACATGTTGCACGGTCACCATCACAACAACAACAACAGCCTGCTGCTGGATCACACCGATTTGGGCTTGGGCGGCGGAAGTGGAGGCGGCACTGACGACGGCGGCACAGTGACCCACAACGATGATAACAACAAATCGCCGTTAGGCGCCAACGGGTTAATGTCAGCTGCCGCAGCTGCTGCTGCCGGTGGCACCTCCAGCGGCAATGACAACGGCGACGATGTCGACGAGGACGTCATCGATTAAACGATTGCCAAGTATATACATAAAACAAAAAACATAAATATATAAATAAAATATTTAAATCAACGTACTTATAACATAAATAATTCACGATTTGTTATTTGTAAAACTGCGTAAAATAGCGGGCAAAAAATACCAAAAACAAAAAAAAATGTAGCATTAAGCATATTTAATTAAATTTTAGATGGAAAATAACGCAAAAAAACAACAGCACATGAAATACAACTTTTTTGAAGAACAATAATTACATTTATAAAACAAAA
>Ptx1 26755460 26756404|27148 chr3R 26756118 26756833 scaffold_22 955359 956115 + 13296|0 322
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>bnk 27020019 27020517|27498 chr3R 27020476 27021412 scaffold_13 2748425 2749482 - 16389|0 41
TATATTCACTATGCCACCACGCACCTGTTTTGTTTGCCGAAG
TATATT---TATATTTCCAGTAACTTGTTTTGTTTG------
>CG1544 27029369 27029450|27506 chr3R 27026564 27029461 scaffold_13 2756008 2759016 - 112949|2981 3100
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TCCCCGGGACTGCCGAC-----TATATTTAGGTGACCAAACTCTAG-TTTTATAAAGCCCCCAATCCTGTATAGATTTTTTAGACCCATAAATACATAACATTTTGTGTGCACACAGCCTTACTTTCGAAATGTGGAATACTCCGTATAGAATTTTAGAATTCCATGAGCAATTTTCATAAATTACATTTTTCTAACATCGTTTATT
AC-----GAGTATCGTCTAGCTTATGATAAGTTGACCCAAAACTAGATTTTAAAAAA----TGGCTCCGT-TAGATTTATTATACC--TAAAT-----ACATTTTGTATGTACA----------------------------------------TTAAA--------AGCTATT------ATTTACGCTATTCCA--CTTGTTT---
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CCTATACTCAAGCAGCTACTGATGCACCGAAAACTGACGCT---GGAGCCACCCAAGGCACTAAATTGACCAGC--------TTGTCCGTATACGA------------AAGACATTC
CCTATACTCAAGAAACTACTGATGCGCCGCCAGTGCGCGCTAGAGGGGGCGCCTGCTTTACCAAACTAAAAAGCAAGCGCCGCTTCTTGTATACGAACAAAAAAAAGGAAAACATTT
>CG12054 27053565 27054213|27527 chr3R 27053700 27057476 scaffold_13 2784914 2789312 - 36174|0 643
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CAATACACT-GTAAAGGAACAACTTTGTTCACACTGCTTAGTTAATGTACTCAATTCTTAGTTATTATAACTTTAAGTTACGCCCCCATTTTCACTCGCTTGAGTGAGTTAAAGGCGGGGAATGGGGGCGTTGTCACTCACCAAAACCCATTGGAAAAACATTTTGTAGACTGCTTTTTAATTTTTGGCTTACTTTAGACCAGAGCATGTATAAGTTGTCTCTTAAATATTTGTATTATGTATTATGGAAACGCGAATCGTATAGATTGTGCAATATGATT-------TTGTATACAACATTTTAAGTTAGCGATTAACGGCTGATCTCCACCTTATTTAATTTAGACTAAGTTACACAA--------TATATAGACGA---------AACAATTGCAAACAACACGCAACTCAATTGTAATAAACTGCAAATGATTTGAATTTATTTTCCAA-----------------GCTAACA-----------AACACTTTTATTGTCAGACCCAGACTAAATG--TATGTGTATTATATGATATAGAACTGCAAAACAAAAGTATTATTTATGTT-TAAGCTCTAGCAAAATGAATTTCATATAGTAACACACATATTTTAATATACACATATAGATCTAGCTAATCA
>mRpL32 27079340 27079408|27547 chr3R 27077382 27080598 scaffold_33 1070804 1074084 - 55741|2211 2289
A---TACTAAGCATCCATTGTGCATTAAATCCACACG-------TTCGTTATCAAATCGATGCTATTTTATTCTCTGTG
GCTTTGCCGCTATTACGTCATGAATAAAATTCCTCTGAGCAGAATTTGTTAACAGAAGACAACTTGTTTATTTTGCGTA
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CCCAGTAGGCGCATTTATTTCGCCACCGAACTCTGAC
CCAAACAAACTTATCTACTTTGCCACGGAACTCTAAC
>gskt 27199790 27199925|27654 chr3R 27198175 27200594 scaffold_22 1942459 1944966 + 68542|1700 1843
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GTATTGTTATTGTTTGTTCACAAATTCCT-------------CAACGCAACAATTGATGA------GAGCAATAAAAATTTAACGTATA--TCGAAATCAAGGCCCGTAAA----------------------TCTCGGAAGAA
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TAAGCCTCACACGATTCCTACAGAAAATGCTCATGGTACTCGGAAAGCAGACGAAACCAGCTCAGGTGTAAA------------GGTAAAGAACGTTCTTCGG-----GGAAAATA-GCGGAGAT-------------AATATTTCAAGTTAGCCAAGAGCAGAGAAAAGCATTTAAAAGCACACACTTTGATTGCA-AGATGCATTATATAGACAACGTAAACGCTTTTGTGTAGCCAACCAATGATATAC---------ATACGAAA---------TACACAACAACTTCTGCCAGCTCCTGGGCGACTATACGATATATACCATATATATATTTTTATATACACATGTAAGTCTTAAGTTGAAGCAAGGCCCAGG------------ATTACGAGGAAGTTCCCA------------ACAGAGGTCTGGATCCAAATTTAATATAAAGACTGTGGAAAACTACAAGGAATCA----AGGAATC-------AAGGTGTCCAGAGCTGTCCGTAAATTGGGTTCGAATTTGGATTTGGCATTTTTTTAGCAGAGCTGTGCAAGCAGAACG-----AGTCTTTTAGGATTTTCAAGTA----------------------TTCTCGAAAGGTGGTTATGCA----------------AACTGTGAAGCCCCGATAAAAGCTATT--GTTTATTATTAACTGCATTTGAAAACTAATTTTTT------GAGAAATTTAGTAACCATGCTCT--AGGCTTGGCTTGATCTAGAAAGCTAGAAGAACGCTTGAACATACTCATCGGAA--GGATCTACAAAGCCCATCTTAGTACCCACAA--ATGAACATGAACATT----------TTAGAGCACG----------ATTGATTACTTTTTATTG-ATTTAAACGAATCTAGCTTAAGTGACACCGCAATTAAATTTCACTTGTCTAAGTT---------------AATACATACATTTAGGTTGCTCAGTTTAGGTTTCACATGTGC------------ATCGTAGAGGGTGCTGCCTGTACAAAGCCCAAGCCAATATAC--------------------AAAACCATCGCATAATGCACATATCCAACAAGAGAAACGATTAAAGTTGTTGAACGAGAACAGGAACATTGCCAACATACATATTAATATACTGAAAATAACACTATATGCAAATTGTTGTCTAATTACGAATCCAATCGTATCGAATCGAATTGATCTAGCATTGATTTAAACTTTCATTAGTTGT-----TGTTGCTTTGAGTGTTCGTCACTTAGTGTTAT-----------------TCATATG--AAACTAT-----------TATTGCCTATTTAGCATTCAACTAATTAACTGTTACACATTAAATATGG------------------------AGCCGCAGCT-GGGGAATCAGTTTAACTAC---TATGAAACATATTGTTGACAATAATATTG---------------------------TATTTATATATAAATGTATAT------------------------TATATTATATG---------ATGTATACCCTAC--AACC--------TCTGTATTTCTGGAAATAAGAAC--------------------------GATAACGAAATC---TAAATGGA
TAGGCCTAACACACTTCCTACAAAAGCTGCTCATGGTACTCGGCAAGCAAAAGAAACCAGCTCAGGTGTAGAGATTAGTGGATGGATAATAGCGGTTCATCTGTTGCCGGAGATTACGCAGAGATTATTAAGCACGTGGATACATCATGTTAGCCAACAGCAAATGATAGCATTTAATATTTAA------AATTGCATAAACAAATTTCAAAAAAGAAATCAA-GCTTTTGTGTATACACTAAATTCCAGAACTTGGCGCGATTTGAAAGAAAATTGGTAAACTTAAAGCGCGCCCAGCTCAGCAATAAAACTACGA--------ATAGATATATTTTTATATAT--------GTTTTAAGTTAACACTAAGCCCAGTGTAGTATGTTTCATTTCATTGCAGCTCACAAAATTAACTAACACAAAGCTTTGGACTC-----CATCGCAAAGACTGTGCAAAACTAATGGAAATTACAAGGGAAATCAAAACAGAAGTTGTCCAAAGCT-----CAATGTTAGTTGAAATTTACAGATAAGAGTACT---ACAAAACCCTATAAACAATATATTCACAGTCGGTTGAAGAGCATAAGAACTAAAAAACGGCATGAACAACCCTCTCTAAATTTAACTTCTCACAGTTATCTTGAGGGTAAATGTAATACTCTTATGTAGAATATTCAAATTGTT-TTAATAGCCAGCAAAAATCATTTGTATCATACAAAAAAATGCAGTTGCGCAGCTTTTAAGAGTTATCAATGTTT----TCTTAAAAGCGCTTTTAAAATTGTTAATTAAAATTTAGTTTAGAAATTAGTGCGACATACTCAGAAACATGAAAAAAAGCATTGCATTTTACGTTGAACTACGAAAATATTATATTTATTTTTTTTTATAGTATTTTTAGCAGTTTTTCTTAA--GATCTTTAAGTTAAGTTTCGTAAATTGAAATTGAATTTGGTTTGAGAAATACATGTGTAT---TTATTCAATGTGGTTATTAGATTTGCCAACTGCCAACAATAGTTTAAAAAACTATCAAAAACCAGATGAAATCCATTTACCTTATACCCTTACTACAATAGAGAACATCGCAAATCGCACATATCCAACTGA----------CAAATTGTTCAA----------AACATTGCCAATATGCA---AAACATATTTAACAATATACTTATTG--AATTGTTGTTTAA----------------------------AGATTTATTACCATTTTCTGCATTAATCAATTGTTTAAATGTTGCTTTGAGTGCTTTTAGCATAACAAAATGGCAGAGTACCTCAACCTCATAAGGTATACCCTGCATGTAGGCATATAATATATTTAATATCGAATTATGTAACTGTTACACATTGTATTTGGCATTTTAACTGTTTGTTAGCCTGAAGCCGCAGCTCGATAAAGCTGCTTAACTACTATTATGGAACATATTGTTGACAATAATATTGCAATTTATATAAATGTGTGTATATACATATATATATATATATATATATAAACATATAAATATGTATTTTATGTATATTATATATTATATTATATGTATACTCGTCGAAACCACAAATATTTCGTGTTTCTCATAACAAAAAAATATATATTTAACTTATATGAAATGGAATAGACAAATTCCATAAACTGA
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AGGTGATTTCTACAGCTACTATATGATGCCATGCGATACAAT----------GTTAGAACTATCTATCCTTGATTGCTTCAAATTAGTTTACGTTTAGATTTTTGATTAACTAAAGTTTCCTGCAATAGTTCTACAACTAGATTTTTTGTAAGCTGTGTTCA-----GAGGCCAATGTATACTTATTTACCAAAAATTATGTCAAGACTTCAACAAATG--TTTTATTTTGCCAACTGCGCCGAATTTTTCTTTATTGG-------CATACAAAAATATTTATTTT-CAACAATTTAATTTAGG-----AACCCTACGAAAACTGCTACAATTGAGACTATCTATTATGGCAAA-TATTAATTGAAAATT----CTGTTTCTTTCGCATATAAGTAATAACGG--GGCGAAAATTAACAATGCAAGCACCCATTTTCAACGCACCAAATGGCA---------TAAACTTTACAATGAAATGTATTTTAAAGAACTATTTTACA-----TAATTCAAAATTAAATTGA----------TTTGTTTA--------ATGTATATACATGAAATTTATAACTTAATATATAATATAATCGCAAGTCTAAAAACAGAAACAACATTTTTAA-----CAGTACAACTGC-----TTGAG-----CTATTC-------------
>Gprk2 27282189 27283499|27721 chr3R 27280676 27282343 scaffold_22 2042631 2044308 + 71405|1576 1758
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GCAAGAAGCATTTTTGAAATTGTA---------------------------------------CTTTTACATCAAATTTTCTAAT-----------------GAAAGTTGTTCAAGCTGATTTC---------------GACACACAATATATATTTATAAATGTTTCAAA----AAGACTCCTAACCGAA-ACAACAC--ACACATTGAG-----CACACATTAGAGAGTTAATT
GCGAGAAGCATTTTTAAAATTCTCTATATATATATATATGTATATATATATATATGAATGTATTTTTTACATT-AATTTTCTAATGGAAACACTGAATTGAAGAAAAAAATGCAAGCACATTTCTCTAAACTACATATAAATACACAAT-TATATTTATAAATGATTCAAAAAAGAAAAGACTTACACGAACACAACATGAATACACTGAGAGCAACGCACGTTAAGTGGACACTT
>Gprk2 27282189 27283499|27723 chr3R 27282516 27282650 scaffold_22 2044698 2044835 + 3152|0 141
AATTGTAATTGTGGTAACAAGAATACCACTTACTATA--CCACTTTGAGAGCTAAGGCCGTCAGTTTGTCACAGCACCCAAAAATAATGTTACTTAAA-----TACGAGCGCTATACAATATACACGCGTCGCCAGAAGCGG
AATAATAATTATAATAATAACAATAATAATAATTAAAAGCCGCAATCCAAATT--GGCCGTCAGTTTGTCATAGCACCTAAAG-TAATGTTACTTAAAATACATACAATTG-TATGCTATTTAAATATGTATACAGCAACTA
>Gprk2 27282189 27283499|27724 chr3R 27282679 27283661 scaffold_22 2044892 2046070 + 20265|0 1054
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TATGTAGATGGCAATCTCGGGGCGATGCCAGAGCAAAGAATGTAATATTTGTAAAGTAGTTTTTGTGCTCAACGTGTTTTTGCTAATGTGGGGGGAGCAGCGTCGGGCGGAGGATCGGACGATTGGACGGGCGAAGGGCTTATGCGTCAAGTGTTTTTAGTTAGCATTTTAAAGGCCGTTAAGCAAATGACATAAATACTCGAAAAACTTTAATGCATTTTTAATGAAATACTTAACACATACAA--ACGTACATACAACTACATATATATGGCATATATAAATCTATAAAAAAAATCTATGTAAATGTTTACACATGAAT-ATAAATGTAAATTTTTTTCTCAATTGCCGCACAATTTTCCTACGCTTTTCAA--TGCTCTTCAATCTATTCTGTTGCCTAAGTTTAAGCTGACTGCAATTTGTTCATTAAGGTTTTGAGAACGTGATTACTGATATTTTTTTATTGTTTTGTCATGCAATCATTTT----------GCATACATACTAACATATGTATGTATGTATATACATTGACATACTGCAAATGATGCCAGCTAATTTCTAATTGAGACGTCGGCTAGTGTTTAAGAGTTCCGTGTATAAATGTGTAGTGTAGGCATTTTT------GTAATTAGCAACAAAAACAAATATAAAAACACACAAATAATTTGAGAATTTATTATCTTACTCATTAAATGCAAATCATTCATGCAATGCGAA----TGCGACTGCAATTGCGAACGC-CACGCGCAACAT-TTAGTTACAATTCAATTGATTTTTTTGGCACAACTAGCTTATTGTAGGGTATACAATGGCAGCCAGCAGCAAGCAAGTTACATACATATTTCAATAAAAAGCACAGCTA-TCAGCA--CAAAACAAAAACCACAAAAAGAACAAA----AAAAAAAAAATAAAAGTAAAAATAAATAAAATAAACGCCACAAGCTCGAAAAAACGCATAATTGAATTTTAGCACAAAAGAAACAAAGCAAGCGCCTAAATATTTATCTATAGTAATTAAAGGCATATTTATAGATCATAA
>CG12063 27332041 27332720|27770 chr3R 27331476 27333176 scaffold_184 1011 2560 - 41037|619 1361
GAACGTCAACGCCAGTGAATGGCCTTTTAACAAGCCAGTTGGA-GACGGA-GATGGAGATGCAGATGCAGACGGAGCTCCGAATGCAGACCGAAGATAGAAGTGCAGACGGAGACAGAGCTGCAGGTGGAGAGGCAGAAACTAGCATGAAATTCTACTTAGCTCAAAACTTAGCACCGCTCATAATCTAGTTAGTAGATGTACG-ATCAAGACATGGAGAATGGACGC--------CCTTCCCCGGACTTTCCGC----CATAGAGCTGGACTCCTCTGT-GAAGGGATCCCCTTAGAAACG--------AAACGTAGCTTAATATTTATACCTACACCTAACTATAT-------------------TGCCTATGTAAGTGTGCGCACTTAGGCGCCCCCTCTATAAGACTTACTTACTAAGACTACTCTGGACACGTCGACATAAATACTTTCAGCTTAAGACTCGGAACTCGGAAAGTAAAGCTCCTTAGTTGTAGTGC--GAATCATTCAAACCTCTCAAGCGAGCTT-------CGAACTGACAATCATTGCTCGTTTAAGAGGTTTGACTGTCTAATAATACCTAAACACTTAACTTAACTTAACTTAACTTAATGCTTATAT-ATGCTAGGCCCAATCGATCACAGACACAGATACACAAAAAATTGTAACAAGAGGCAAAACTTCAGATGCTATAAAAGGTAAA----------TAAACGTATTAGAAAGATACTC
-----------------ACTGGC------GCAAGTTGCATGGATGAAGGATGGAGGAAACTAGCATGAAATTCTTTCTCTCTCTCTTTAGCTAAACTACAAGAACA----------------CAAAAAAAAAAGAAGAAAAAAGAAGAAA---------AACGAAAAACTTAGCAACGCTCATAATCTAGTTAGTAGCTGTACGAAATGGGTCCTCCGATGTGGCTGCAGCTGTGGCACTTCAAAGTCATTGCGCGCAACGTAGAGCTGGACTTCTCTGCAGCAAATGGCCAATTGAAAAAGTGTGGCAATGACTGAGCCAGACAGAAACTCACACGCTCACACATATGGAAAGGGCTTTGGAACTGTAGCTTAATATTTATGCTCATATATATGCTTACTCTATAAGACTTAC-TGCTAAGACTACTCTGAATATGTCGGC----AAACTATCAGCTTAAGACTTA-------------AAAGCTCCTTAGTCGTAGTGCAAAAACCATTCAAACCTCTTAACTGAGCTTACGCAACTGAGACGACGCTTGT--CTCATTTAAGAGGTTTGACTGTCT---------TAAATACTTAAA------------ATCTAAATACTTAAACAATACTAGGCCTAAT---------------------AACGCAATGTAACAAGAGAC-AAACTTCAGATGCTATAAACGAAAAAAATGAAAACGTAAACGTAAAAAGTAAATAAAC
>CG1499 27391111 27391889|27826 chr3R 27390808 27391749 scaffold_20 28423 29472 + 28376|303 1102
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GATGGGTATCGGATAGCTCTC--------------ACAATTAGCTGGGAACAAACGCAATATGCCTCGAAAGCTTCAAAAGATTCGATGAGACTTGAATAGCACATATACATACATAATCGCCAAGCAGCGATGCATGAAA--------ATCATTTGAAAAATTCA---TAGTTTAATTTTACGTAAAATTT--AGTGTAAGCTTAATTTAATTAACACTTAATTTAATCGAATACGCAATCGAATACGCAACAATTAATCGAACTGATTGCATTTCAAATGCGCGCTTTTAAATGCACTGGAACA-AATTTTCCAGCATTTTAAAACTGCGCATTGCATAGACAAAATCAACAATTTAGCAGCAAAAATTGTAGTAAATTTTTAGAATTCT--TCTCTCTAGCGCAAATTAGGCTAATTTTTTTTTGTGTGTGTAGTGA-ATATCTCTTGCATATGAGTATCTAAAATCTAAGTCTATAACTGAGGCAAATTGAAGTGCATTTATAACTTTTATTCTACCATTTTATTTATTGATTGTATTA--TTTATTGATGCT-TCGAGCTGCTTTATACGTATATGTAGGAAACGTAGCCATAATATTTCCTGCAGA-TTTGCCAAATAATTTTGTATCAAAATGTTTGTGTCAAATTTTTTGCAATCGGCTGCGTTTCACAAACTCGAATCGACTAT----TTATTGTACTTAACTACTATTTATCGCTAATT-TATTTATTGCTAATGGCTAAATGCTAATTTATTG-CCGAAACGCAGAGAGGTGCTAAGTTTTAGGTGCTT
>CG1499 27391111 27391889|27827 chr3R 27391804 27392592 scaffold_20 31366 32177 + 5248|0 87
AATTTAATAAACGAATTGTACTGATTAA-GTAATGCAATAAACTTTACGCCTAAATAAAATATTTATTAA-TAAATGTCTAAACATAA
AATCCAAAACACGAGTCGTGTTAATTAACATTCTGTAGTTGAAATT--GGCTGA-CAAATTGCTGGTTAAATAAATGTATTACCACAT
>gammaCop 27401109 27401442|27834 chr3R 27400761 27401546 scaffold_29 1003683 1004477 + 20060|349 715
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ACCTACGCGCCATGCAGAGACTTAATAGGATCTCTGCGTGCTCTGCAAATACTATGA-----TTATGAAAAGTATATTAAAGAAAAAGTTAAATGTAATCAAAAAATATATAATGTAGCTTTAAGCGGCGCCCTCAAAACCA--TTTCAATTTTCGCCCACTTTTTTGTGAGTTGTCTCCACTTAAATCATAATTTGTGGGTATTGTGTGAGTTTCTAAAAGGGTTTTTGTTGTTTTTCCATAGCAACTCATTCTAGCAATCTATATTATTATTTGTTTATTA--AAGATTTAACCTGTGCGTGTTAGTCTAAGTATTGCAAAACTGAAATACAATCACA-ATATATACAAGATAAACTAA---GAA
>rod 27413830 27413861|27840 chr3R 27410285 27416040 scaffold_29 1014753 1020922 + 199589|3798 3847
GCGTAGAG-------------ATTTGGAT-----TTTACTATTCCCATAA
ATATAGAATGTGAATTTGTTAACTTGAATACATATTGAATACTTTCCTAC
>CG1635 27415994 27416111|27840 chr3R 27410285 27416040 scaffold_29 1014753 1020922 + 199589|6185 6240
ACATGGTTC--AGCCTGTG-------ATTGTTACTCAAGATATTATGCAAGGCTAT
ACATAAATTGAGGATTGTAAACGAATAATGATAATTAA-ATACTACGCGAGGCTAT
>CG1774 27420318 27420449|27844 chr3R 27419087 27420433 scaffold_29 1022047 1023435 + 43450|1298 1413
AATTAGCGCTAATGTAAATCGAAGTTGTAGTTGATCCAAATATGTTAATCTGATGGAATTTTAACTTTATAGCTGTTATTTTATAATTTATAGGATATATCAATGAAATAAAATTG
AATTAACACTCGCTTAGTTTTTCGTTTTCCTCGTACC--------TCGACACATTTAGTTACGATTTTGTAATAGTTTATTTTCTTTTTACAAAATTTTT---TGTAATCAAAGTA
>Med 27440624 27441478|27858 chr3R 27438481 27443203 scaffold_29 1048397 1053133 + 120242|2252 3220
TCCG--------------------------------------------------------TATTTATTATTGGC-------------CCACATCTA--------TGCTAAGGACTCAGTTTTAGCGGCAGCTATCCGTCAGCTATT------TGC---------------GGATTTTGTGTTTTTCATTTGCAATTCTGATTACGATTATGTTTGCCTTTGATTATTTGATAATAATTTTTATAAAAAATTGAAACAACTTAGAAGTCTTAAGTATGCAGCTGTAAAGCACTAAG-CATCTAGTTTTATGTACTATACTTAAA--------TATACGCCCACACAACACCGGAGATACTGAACAAGCGGCCAATGTTTGTTGTCCATTTCCTGCCACGAAAATTACAAATTAAAAAAAAAAAAAACGAGAAGCATACACAGCATTACAATCATCCAAGCCACAGGGCGAAACAAAAAGAGACATCGATGCACCCATAAATACATTCATTTGATGTAAAATGCAGCATAAATAAGGCAAGCGAAACAAGTAGATGTAACATAAGTGTAATAAACAGACCGTGAAAT-------TACGATTCTAAAGGCTTCTTTTCACTGATAGCACTGCATACGCAGATCCACCTGCTGGTCCAGCCAGTTGATCCAATCTGGAGTGATAGGTCGCTCCAGGGTGACCTCGTGGAAGATCTCCACTCGACGCGTCTCCACGAACATAAAACTCTTAAACAAATGCAGCGATGCAGCGTTGTCCATGTCGATCTTGACCTCGAATTTATCCAATTTAAGCTGGGGCTGCGATTGGGCGTACTTGAGCATGAGGAGCATGGCTTCCCTGCCGAATCCCTTGCCCCGTGCATAAGGTTCGGCAATCATGATTTCCGCCTCCGCCGTTGGTATCTGGCTATCGGGATCTTGGTGCAGGAAGAGATTGGTGTCGCCCACCATGG
ACCGACCATACACACATACAGCCACACACCCACATACACACACGCACACACACAAAAGCATATTTATTATTCATAGCAAGAAGCACACCACGTCTAAATGTTAGTTTTAAGGATACAATTTGAGC---AGCTATCGTTAAGTTAAGCAAAAGTGCAAACAAGGAAAAAAAGGATATGAAATATTTAGTTTTGATTTGCAATTACAATTATGTTTGCCTTTAATTATTTAATAATAATTTTTATAAAAAATTGAAACACCAC------------------GCTGTAAAACGTTAAGTCAACTAGTTTTATGTATCATACAGACAGCCAGATATATATATTCATATAAATTTGATAACTCGAGTTGGGCTGC-ATTTTATGCAATGCCCTTCCTGCCACACACAT-ACACAC-------------------ACACACACACAGCATTACTTACGCAACGACTACAGC-CAGAGCAAAGATAGA------------------------------------AATGCAATATCTTAAAGGCAA--------AGTAGTTGTAATATAAATGTAATAAACAGAACATTAACTAAGTGTACATCATTTTGAAGCATCATC-------ATATTTCTCAATTCTTAGCTGCACCTGTTTATCCAGCCAGGAGAGCCAGTCGTCTGTTATGAGCCGCTCTAGGGTCACCTCGTGGAATACCTCCACGCGTCGCACCTCGGCAAACTGAAAGCTCTCGAAGAGGCGCAACGATATGGCATTGTCCATATCGATCTTGGCTTCGAATTTGATCAG---AGGCAGATGCTG---TTGGGCGTACTTGAACATAAGTAGCATAGCCTCGCGACCGAATCCTTTGCCGCGCGCCTCGGGTGCTGCGATCATAATTTCCGCTTCCGCCACATATTGCTGAGACTCCTTATCGTGGCGCACAAATAGATTTGTGTCGCCCACCATAG
>CG1792 27443434 27443559|27860 chr3R 27443370 27443669 scaffold_15 1735264 1735585 - -1013|65 203
GATAAACTGTACTAAAAATCAATGGAT------------CCCCGATCTGATATTCGGATTAATACTC-AATGCACTTAATATTAATCGAAAATGGAATATGTTCAAATATGGCTGTGTTGAATAAAAACTGATTTTTTC
GATTAATAATAATCATCACCGTTAAATAAGATTACAAAAAACCTATTCTATATTAGATAAAATAAACGAATGTAATTAATGCC---------TACATTTTATATACCTTAGGAATCTTTGCTTACAACCCATTCTTTTC
>pasha 27446840 27447197|27862 chr3R 27446495 27447158 scaffold_29 1059216 1059882 + 19576|345 690
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TTATAAAGCACATAATCATCATTGCCGTCATTAGGTTTTTGGTTATTCCACTTGCATGACAAACTTTTA----CACAGTTACCCAATGTGATCCATTCAAATATGACAAACAGCAATGTGAAGAATGTATATTAAGCTTAACCACGAGCTACGCATACT--CTTCAAATTACACTTACTTAATAAAGATCCTTACGAATTCAACATAATATTCTATGCCAAAATGGAATTAATAATAAATATGTGCGTTCCTTATGCATTATTCTTCCAGCATATGCTTGACTTTATT---AAAGTATAATTCGTCTAGACT-------------ATTATGCAATTAATTTCAATT
>pasha 27446840 27447197|27863 chr3R 27447159 27447292 scaffold_0 5098999 5099123 + 1635|0 46
GTATAAT--------ATAAGCTTGAATAAAATACTATTAAAAACGCA
GTATAATTTTAAGAGAAATAATTAAGAAAACTAGCATAAAAACAACA
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TCATACCCATGGATCCACGCAACACCAACGGTGGCAACAGCAACAGCGGCGTCGTCGGCGGCGGCAGTCTTGGCTGCCAACTCAACAATTCCAATTTGATGAGCATACCGGTGCCGCCACTGCGAGCTGTATCCAAGAGTACCCTGCAACAGCCCGGCAGCGCGCTGACAGCCATCACAGCTGTGCCCCTACCACCGCCTGTATT--CGGCTCATCCTCGCTGCCGCCTCCACCGCTGGCCGGACTCACCACGGCGACAACGGCAAC------------GATAAGGCCAGTGGCCGGTGGCGCGGAGCCGGTTGGTTTGCTCGCCAGTGCATTGAACGGCCTGCCCAGTGATACCCTGGTCAGTGAGTCGACGCCGGCGGAGACTATCGTGCCCGGCGTGGCCACCGCACTAAGTGAGCTGGTGTTGCGCTCAGGACCGCCTAAGTTAACGCTGCGCCCGTGCGGCCCGCTGCAGTCAGATGGCTCCAACATCTATCCGTCACAGGCGGGACCGCTATCCACCAGACTAAAGGAGAATGCGCACAAG
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ATAACCGACTACTTCATCTCCGTCATCGAGGACACGCTTAGCGACATGGCTACAGGGGACCAAAGTGTCCTGCAAGCCCGGATTGCCGGCCTGTCGCTGGAGAACGAGCGTCTGAAGCAGCACTATGACCGTCAAATAAACGACTTACATCGCACGAGCGAGCTAATGATTTCCGAAATGCGAAAGACTTTGGAGCAAGAGCACAAACGCGTGATCTCCGAACTGCGACAGCAGAACGCCATCGAGCTGATGCGGGCGGTCGAGGAGGCAAAGCGGAAGCAGTGGTGTGCGAATTGCATGCGTGAGGCGCAGTTGTACTGCTGTTGGAACACATCCTACTGTGACTATCCCTGCCAGCAGCTTCACTGGCCTGGACATTCTGCCACTTGTGGTCAGTCTGTGCCACCTACAATTCCAGTTCCACCTTCAGTTCCGACTCCGATTATAGAACCTGGACGTGCCAAAGCTA---AAGTGGCCACGCCAACGGCAACTCCGTCAATTACAAACCCAAGCCCCAGTTCGCAGATAATGCGAACAGTAGCCGCCTGTCCATCTGCACCACCTAGTGCCAACGCTTCCAGTTCCAAAAAGTGGCCGCCT------ATGATGACGTTAATGAATCAATCCAATCAGGAGGCCA------TGCTCAAGCTGCCCGCCACTACATACCTTCGGCCAGT---GGTCAGCACGACGATGACAGCTCCCGTGACTGCTCCGCAACCAGCAAACAACAACAGCACGAACGTAATAATGGCACCCACACCACCGCCAGGAAATAATCTGGCCACTATAATCTCCGCACAGCGGAATCCCCCCAACTACAACGCCAAGCACCC-CAATCCAGCGATGCCCGTGCAACGCTTTAATATTCCT
ATTACGGACTACTTCATCTCGGTGATTGAGGACACCCTGAGCGATCTGGCCGGCGGGGAGCCAAGCGTGCTGCAGGCTCGCATTGCTGGCCTAACGCTGGAGAACGAGCGGCTCAAGCAGCACTACGAACGGCAGATGGCGGAAATGCAACGTTCGACAGATGTGCTGATCGCCGAGATGCGCAAGACCATGGAGCAGGAGAACAAGCGGGTGATCAGCGAGCTGCGACAGCACAGCACTCTGGAGCGAATGCGTGCGGTGGAGGAGGCTAAGAAGAAGCAATGGTGCGCGAATTGCATGCGCGAGGCACAGCTGTATTGCTGCTGGAATACGTCGTACTGTGACTATCCCTGCCAGCAAATGCACTGGCAGCGACACTCGGCCAGCTGCGGCCAGGCGGCCACA-CTACAGACGCAATCGCA--------------------GGCGGATGCGGGGCGTGGCAAGCACAAGCAGGTGACCAGCACAGCGCCAAATCC--------CAGCCAGCAGCAGCAGCT---GAATAGAGCGAACA------------CTGTGGGCAACGCCAA-------------------CAAAAAGTGGACGCATCAGTCAATGATATCGTTGGTGAATC---CCACGCCGCCCGCCACCGAGGTGCTCAAATTGCCCAACAACACATTTCTGCGGCCGGTCTCGCTGCCCTCAACAATGCC-----------CTCTGCCAACACCGGC-AGCATTGTTAGCCCAGTCACCCTCATAGCGCCCTCCACATCCAC---ACATCTGCAGAACACCATCATGACGGGTCAGCGAAATAACATGAGCTACGGTGCCAAGCAACCGCAGCCCATTG----CCGTGCAGCGGTATAATATACCC
>CG1815 27502957 27503703|27934 chr3R 27502018 27503177 scaffold_29 1143630 1144700 + 28494|964 1190
TTGCCCATCACCGTAAATTCGAATGCACCCTTTATG---ATGGCAGAGCAGCATCAGAAGCAAGTACCAAAAGCTACTGGTCGC---TCAGGTAAAAACAATAGCCGAATGCGCCAAACTTACAGCAACAATATCAACAACAGCAACCCGCAGGGTATGCGCTGCAACAACAACCCGCAGGCTATCCGCCAGAATCAAATGAATCAACAGGTATTCCAGCCATAAAT
CTGCCCATCACAGTCAGCAGCAATGCGCCCTTCGGGCACATAACGGAGCAGCATCAGAAGCATGTGGCCAAGTCCACGGGCCGCAGTTCCCTCAAGAACAGCAGTCGTGCTCGCAATCCCAACAATCCCGTTAACAATAACAGCAA------------------CAATTCAAACGCCCAGGTCTTGCGTCACAACCAAATCAATCAC---GTTTTTCAGCAGTGAGT
>CG1815 27502957 27503703|27935 chr3R 27503449 27504379 scaffold_29 1145419 1146269 + 18237|0 259
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ACATTTATTATATTGACATATATATATATATATATTGTTAGTTTTAATCAGGCT----CACATAGCACGTAA-----ATTATGATTAACCATAAGATGGACTT--------TATAATAATTTACTGTTGCCGCAAGCGGG---CAACTACATTTTAGTTCTTA-------GTAGTTTATAAGATCATCTATCTATCAGACG--------------TCAAACCCATTCGAAAGCATGTGTACA------TTCATTCTATG-
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TCTCTGGGCAC-CTCACAC-CAAGCCCAAAAAAGCACACAC-----------------------------TCAAAGAAATAGTGAGGTTGAGGCACTCGCGAACGATTGGAGGAAGCATGTTGCAGCGCCAGGCGCT----------------CTTC------GGGATTTAGTTG----TTGTTGGGGAGGGGAGTTAAAGT---------------------------------------------------AAACTT----TTTGTTGATTTT--GTTTTTAGTTTTTTACTTGGCTTCGATGGAGCTGCAGAAATCTCCAAGC--CAGCAGACGTTTTTATGTTGTGCAATT------TACCTTTTCAGTTACAATTACACTTAT
TCTCCACACACACACACACACACACACACAAACACAAACACAGAGCCGCATATTCCAAAATGAAAACTATTAAAAGAAAGAGAAA-----AAGCAAAAGAGAATG--TAAGAAAAGCCTGAGGCAGCGCCAGGCGCTACGTGTGCCTTATGTGCTTTAAGTGGGGGGTTAGGTTGTGGCTTGCGGGGTAGGGGGGAAAGGGTGGGGATTATGTATAGACTAGGGGCGGGTTTTTTTTTTAGCAGAGGCCGTTAACATTTCAAATTTGTTAATTTTTGTTTTTTAGTTATTTACTTGGCTTTGTTAAAAGAAAAGAAAAAGAAAAACAGCATGAAGAATTTCTCTCTCTTTCTATCTACATATACATATTTATATATGAATACACATAT
>ttk 27556421 27558117|28002 chr3R 27556897 27558291 scaffold_29 1227888 1229468 + 14494|0 1497
CACCAGAGCGGCCTTATATGCGAAGTGTATCCGGGCAA------GAGTTACACTAAAAACC-------------------GAAACTAAACC---TGCACTTTTAGATAATTA--------AACTATATATACACGCGGATATGTTATACATAATGATATAAATAAT---------ATATATAAACAT-TGAA----------TGGTATGTCTAGCTGTAGTTCTATTAATTAATTTAT-------CAATATCACTATGTTCG-ATAT-------GCTAATGTTAAT-TCTATAAAATTATTACAAGCCGAAATCTGAAAACAGAAGCAGGATAATCAATGTAATGTTAATCTTGCGAGAGGGAGCGCAGATCTACCTTGTTGCCTTCAAATGAAGCTAGTTAAAAGTTAATCCCGGGTCTGGGTCAAGGTCGTTGGGCACCCAGCACCACACCCAGAATACCCAGCACGTCCACACCCTCAAAAACCAACCCGGTCACCGGTCACCCACACCGTTCCCCGTAACATCCGAGACCCGGCGAAAGATTGAAAATGTTTCGTCGGGAT--------------------CGTTGATAAAGT----------GTAAC------------TACAGATAGTAACAGCAACCATAGTTGTAATGAT-ATAACGCTAATAT----------------TAATG-AGCATAAAGTAA------ACCTAATTTATCTATCAA----------------------------------------ACGATTTATGTTGTATATCGGAGGCTTAAATTATCGCCAAAG--------------------AAAATGAAAATCAAAAACAAAAACAAAAGCAAAAGCAAAACAAAATGCAGTTG--AAATCCAACAGTAA-----------CAACAGAGCAGTCGCAGCAGACCACAA--AATATTGTTGTTAATGCGAAA------------CGATCTCC--------AAACAAAATAAAGAACTTGAAAAGTAGACAACAAGTAATTCCTCAGTCAAGTAAAACGTTCA-----------AATTTGTTGCAATTCGAGAACTAAGAGAAAACTACGAAAAAGATTCAGAAAATTACAACTGCAA---------------AAAACGTACAGAAAACCAATTGAAACAAAATTAAGCGCAATCAAATAATAAACAAGCTGCGTACGCTAACTTATTAAATA-ATTTTGTTTTTAATTCTTTATTTAGTGGTAGCTAGTGCAATTTAGTT-AGTAAGC-CGCCGTCTCCCAAACACCG----------ACTAACCAATATCGCAAATATATATTTCCACCCAATCGAACCAATCTTCCAAACATCTCTTTTGGCGTTAA-----TTTTAAACAATCAATCAAACAGGTCATGCATATTTATTTGTATGTGTTTGTTTGTACTATATTTTACTTTATTTTTAGTCTACTTTTTTATATGAATACATTTACATATATTTT
CACCGCGGCGGCCTTATA----AAGCACATCCTTGTAACGCTCCAAGTTGCAATAAAAAACTAAAAACTACAAAAAAAAAAAAACTAAACTAAACTAAATTTTAGTTAATGACAAATGCTAACTATATATATATACATATAATATACACACATATATATATATATTTATATAATAATCCATAAACATGTGCACATGTGTCTTTGGTATGCGTAGCTATAGCTCTATTAATTAATTTATATATACCCTATATATATATATTCATATATATATAAAACTAAACATAATGTTTATCATTTTGTTTTACGTTTAAATTTGTTTATAAA----------------------TATGTGTGAAAAGCGTAGCGCAGTTCTACCTTGTTGCCTTCAAATGAAGCTAGTTGAAAGAAAA------------GTTGGATTGGCTCTGATCCCAAC-CAAAATCGAAAATCGCAAGAAAA----------AAAAAAACAA-------ACAAATTGAATAAAACAT-----GCAACA--CAAATCGCAACGAGAGATTGCAAATGTTTCGTTGCGATTTGTGTGCGTCCACGTTAAATGTTAATAAACTAATTTTAAAAGCAACATTAATATATATTATATACAATATTAAATACAATAATTAACATGATAATGAATTAAATATGATTATGTTTATTATATAATGCAACAGAAAATAACTATGCAAATAATTTATCAATTTATTACATAATTACATTTAAAATGCAAAAAAAAAAAACAATTAAAATTTATATTGTATATCGGAGGCTTAAATTATCGCCAAAGAAATGAAGCAAAACAAAAGAAAAATTAATAAAAATAACAAAAAAAACAAAAAAATAAAAACAAAATGCAAACAATAAATAAAACGAAAAACATGTACATTCAACAAAGCAGCAGCAAAAATAAACAATTCAAATAAAAACAAATGCAAAATATGAATAAACGCGATCTCCAAAAACAAAAACAAAAAACAAAACTTGAAAAA-AGTTTAAAAGCAA---------AGAGTAAAAAATTGAATTTGAAATTGAATTTGTTGC-ATTCAAAAAAAAAAAAAAAAGTAAATAAACAA---ACACAAATACAGCTCCAATTTTTGTTGGCATCGGAAACAAAAACAAAACAAGAATAATCAAAACAGCTATTAATTAAACATTAA--TAATTAAATACAATAATTTATTAAATATAATTTGTTTTTAATTCTTTATTTAGTGTTAGCTAGTGCAATTTAGTTAAGTAAACGCTCTATCCACCAACAATCGCAACAGATACGATAACCCCAACAATAACTATATATATATATATGCATACATATATCTAT------TTTCTTTTGGCATTAACACAGCTATACACACACACACACACA---CACACACATATATATATATATATATATATATA-TATATATATATATATATATA-TATATATATATATATATATATATATATATATATATA
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AGACTT---------------TGAAGGAC-------------------CAGAGTTACGGAAGGACTACGAACGCACAACAACGTTTACCTTAAGCAGCGAGCTCTGAACTGTAGAATAC
AGACTTAAGCCTAGGATCAACTGAGAGACACAGTGTGAGTGAGGAAGACAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAAAGAGAGCGTGCCTTAAACA--AAACAAACAACTGTAAAATAC
>ttk 27560219 27561114|28005 chr3R 27560594 27560866 scaffold_29 1233915 1234194 + 7053|0 302
TTTTCATTTCTCTTTGTGATTTTGTTAAACCTTTTTATATAGACCTTTGTTTTTTATTT-----TTTGTTGTACATAGCTATATTTTGTTTAATACTCAAAGTCCGTAGTATAATTTTGTTCATTTCCTTGGCAACA------AGTTGGAATCAAATGTATTGGCTAATTGTGCAATCTTCAAAACGTGTTGGTGGCTTCGGAGGAACGCGACA-------------ACGCTGTTCTGCGGCCCCAC------GAAATGTTGTAAACTTAATTAACTACTAAGGCCACTTAACTAGGATCTAG
TGTTTATTTCT-TATGTGATTTTGTTAAACTGTATT----------TTGTTTTTAGTCTATCGTTTTGTTGTATATAG---TATTACGTTCAATACTCAAAGACCGTAGAATAATTG-GTGTGTTTCATTGGTAAAACAAGAAACCGGAAATCCAATGAATTGGCTATTTGTGCAATTATCAAAAAAAA--AAAAAAATGAAAAGAAAGTGAAACATTTATAACTACGTGACGTTTGGCAAGCCCAACCCATGGAAATGTTGTAAACTTAATTAACGACT------ACTTAATTATGCTCTAG
>ttk 27560219 27561114|28006 chr3R 27560903 27561043 scaffold_29 1234405 1234540 + 2677|0 143
ACAACAAAACGGACTTCCAGTGAAGAGACAACTGATATTTATACGGAATCCCAATCTGGTATTATGTATTATGATTTTTACA-GTTTACTTAACGCAACAAATACGACTTAAGACTT--GTGCGCTCAATGACTAGAAATTATA
ACCACGTAACGTACGCACAAAAAAAAAACAG--------TACTCAGCATTTGTATTATGTATTTTTTTTTTTTATTTAAATGTATTTACTTAAAGCAATCATTACGACTTAAGCTGTCAATGCGCTCAATAAATAGATTCTATA
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CTAGGGTGCCAGCAGAACAACGTCATCACTCGAAC-CCAACAACAACAAAAACAGACGGCTAGAGCAACAGCAGCAACAACACACAACAACAAT-ACACATGTCAAAATTATAATACCCAC------TCGACGATCAAAATCACACCTTG------------ACTCCATGGCAAGAGAGACAC---CAATTACTACTATTACTAGCTGCTGGGAGAAGCGGCAGATATTAACCGAAATCGAGCAGATTATACCCTATATAATAACCACACGTACGATTAGCGAGGA--------------------------------GAGGAGCAT------------------CAGGTGCA-GCGAGGATGCGAAGGAGGAGCCC------------------------TTCCAGCTCGCCGGGTCGGTTTTGGTCGCC------TTCGCCGTGGTGGTCTACTGCAGCTATCTGAACATGTATCGTCACCGCAAGTCCTTTCGTAGGAAACCACCCGCTAGCCACTCCGCAGAGTGGATAGGGGCCTCCGGAGCACTGCTG-TAGCCCGCCCCTTCGATATATAC-------TCATCTCTACAACTAACCTTACACTTGATTAGCAGCCACACATCCGGTCGCATCCACCTGTTTCGAATGGATTTTAAACACTTTTTATACTTTTGATAAGTCAAGTCGGAGGCATTCGATTTAAAATC--TATTGAAATATGTAATTTCCGAATTTAGTTTTAAACCACGTCCGCGCTCCCAAAAATCCCCCGAACCGA---AAAGACTACATTCGCGATGAATTCAAAATTTCTCTT---------GAAACCAAAAGACAAATGCTTAAGAAGTATTACAAAAAAGAAATCAACATTACACACATAATCATGCGGTTTTTGAAAACATTATAAATGTTTAATCGAGCCTCATTTGCATTTGCATATTACATAATATACGTTAGCCACATGTCATCTCATTG---------CCCATAATAACCTGCATCCTGCATATTATACACGTTAATCTCACACTCTGAATTTATACAAATCGAAGACAATTGTAACCGACACCAG--AACAATTCTTGGATACAGAACATGTTGCTTGATAAAA----------GATCTTTTAAATGAT----------GAGAAAAATAAAGGAAGCTTAACCGTAAAATACCAC
CTAGGGTGTCTGCAGAC-----TTGTAATTCAAATAACAACAAAAACAACAACA-----CTCAAACACTCG-AACAACAAATGGCAAGAGCAACAACACACTTAAAATTTATAGTATCTATTAATCATAGACGATCAAAACCGAATCAGGGGCTAAACACAAAGTCCGTGGCGTATCAATCACCATCATTAACTACAACTATTTACTGCTGCA------TTCAAATATTATATAAACTTGAGGAAATATTACAATTTATTATAAACACACATACAATTGGCGAGGGTATATGTACGCCAACAATAATGGGTCGACCTCTAGGCACATCCACCATCCACCTCACGCCAGCTGTACGTGATGACGGCGAGGAGGCGCCTGGACACATTGGTCGTCTGGAATCATTCCCGCATGCGTACTCAAAATCGGTCGCCATCATATTCATAATCATTATATACTATAACTATCTAAACTTGTTTCGCCACCGCAAATCGTTTCGCAGGAAACAGTCTCGCATTGAACATAATCAGAATATAATCGCCACTGGAGT-TTGCTGCTAGCCCAGCCCCTCACTGCGACCCCACTTGTCACTCCTTTATCCATCACTAAACATAATTTTAAATCATTAATC--ATTATTTCAATC-------AAAAGATTTTAAACACTTTTTATACTTTTGATAAGTC-AGTCGGAGGCATTCGATTTAAAATCTATATTATATAAAGCAATTTCAGAATTTAGTTATAAACCACTCTGCAACTAATAACAATACTTAAAAAAAACCCCAAGACTACATTCGCAATGAATTCAAAATTTATCCCAAAAAAGAAAAAAAAAAAAGACAAATGCTTAAGAAGTATTATAAAA---ATATTCATA----AAACATAATCATGCGG-TTTTGTAAACATTCTAAATGTTTTATCGAGTCTCATTGGCATTTCCATACT------------TTAACCAAATGTT-TCTCATAAACGATTTACCACATAACAA----AACATTACATAGTGCATTCATTGTCATTAC----------TATGAAACTT----ATTAATGTAGCCCACAACAGAAAACCATTCATGGATACAGAAAACGTTGCTTAATAAACAAACAAAAATGATCTTTTAATGTATTAATTGACAAAATAAAAATAAAGAATGCTTAACCGTAATA-ACTAC
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TAT
TAA
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TATCATAGAAACCTTTCCAAAGCTCACACTCCTTATAAAGAAGCAAGATTATATAGTAA
TGTGAATAAAACAT--------------------------ACGTATGTATATATAAG--
>CG1910 27576435 27576745|28016 chr3R 27574922 27576910 scaffold_22 453868 455883 + 30345|1661 2010
AC-------------CAATCCCACCGATG-----GACAATCAACAACTTTAATGCGTTGCAGATGTGTAAAAAAGCGTCTTCATCTCG-CCCGCCGAGTTGGTCTGATGTTGCCAACTA-CATGCAAACATTTAAGAGTTCCCCCAAA----------CAAAGCTACAATATTCTTTTTTAATTGATAACTTGATTTCGTACTCCGAAATCCCTTAAC--TTTGATAATAGTTCGC-----GTCCTCCAGTATTTGGTTGACGCGAAGGACGCCATAGGCTGCAATCGATGCTGGACTTTCAATGCTG--CGGTGTGTGCGTCAGCTGGACAGAAAAACAAAAAAAAAAA
GCAGAAGCAATATTATAATAATGATGATGATAATGAAAACCAATAACTATAGCTCGTGCCGAAAGTGTACAAGTGTAACTTCGAATCGATTCGACAAGTTG--------CCGCCAACAAATAAGCAAATAACAAGAGTTTTACCCAAAAACGGGCATGCATAGGTTTAAT--TCTGTTTCCATTGTCAAGTTTTCTTTTTATTCTCAAACCACAAAATGGTACGATTGCAATTCACTAACCATCTTCCAGTCTTTGGCTTAATTATTTTATGTCTTAGGCTGTAATCGATGCTGGATTTTAAATGCTGATCTGTGTGCGCAATATATAGTAACAAACACATACAGCAAAT
>sip3 27600442 27600519|28037 chr3R 27598199 27602988 scaffold_22 477278 482092 + 128212|2390 2468
ACGCCCTACAATCTGATGTCAACACTCCAAAACAAAAAAAACCGGCAGCGACAACTCTCAT-CCCAAAAAAAAAAAAAA
ACAGATTAGAATTTGAAG-----------AACTGAATTTAATCAGCAGCGGCAGCCTTCACGCCCACCTCGCTATCACA
>faf 27613944 27614032|28040 chr3R 27605048 27614284 scaffold_22 485070 494299 + 437503|9197 9304
GACAAGTGTCCATCTATAAGGTGTGTGTCCGTTGCCGCAATTGAAG-------AGTTCGAGACGTCT------------AAAAACAGTCCCAGAAAACTAGTAAACAC
GCTCGATGGGTATCTCCTAGAGCTGTA---GTTAGTATTGTTCAAGTCCACCTGGTTCAAGTCCTGCCTTGCCATACAAAAAAATATACCTATAGAAATA-TAAATAT
>faf 27615444 27615753|28042 chr3R 27615115 27619393 scaffold_22 495157 499505 + 126637|339 705
AATG--TATTCGCAACCTAGCTGGAGGAGAAGATGATGAGTATCCATAGTGTTAAATGTAACCAAAGCA------------------------GCCTGACAATGAGAACGGTGTGGACAGGTGTTTACTAGTGGGGATCCCCACCGTCG--AAAACGAGACTTAATGGGTAAATACGAGAAAAAGAGCAGAATCCGTAGATATTAACAAAGGATACTT----GGTTGGAGCGAT------GCGAGTCAAGGAACGAAAGTCTGGT--AGATAAGGAGATCAAAACCAGCAAAGGTGTTTATTAGCTATCGAACTTTAT---------------AATTACCTTTAATAATAAACAAATAC--ACCAAT
AATTACTAATCGCAAC----------AATAATAAAAATAATATTAATAATAATAACAACAAACAAAACACTAAGCAATTTGTGAGCATCCATCAATTGATAATGTAAATTGTTTG----GGTGGTTAA-AGTGGGGG--CAGATCGTTGTAAAAACAAAAAAAAAT---TGAAAACAAAATGAATAACAAAA-----AGATACACTAAAACGAGACTTAAACGCTAGTAGTTATTAACAAACGAATTAACAAATGAAACCTAGGCAAAAACAAGAACAAGAATACGAAAAACGATACTTAGTCGAAGTCGGATGCGAGAGGAGAGCAAGAGAAAGTAAACATTAAGAATGGGTATGTACCAACAAAT
>Acf1 27625261 27625533|28044 chr3R 27620613 27625355 scaffold_20 2057030 2061786 + 147862|4820 4925
GCCGGACGCTGATCTCCACCAGCTA--TCGTGTAAATT-AGTTAGTCTACTCTAAGCCGTAGTTGAAAACCA--------TATATATTTAAGCACAAATATTAAGT
GCCGTGTATGGACTCTTTTTAGATATTTCGTGTAAATTAAATTAATTAGCTTTAGGCCATAGACAAAGAACAAGCCAGCGTACATAATTAGACAGTATTGTTTCGT
>Acf1 27625261 27625533|28045 chr3R 27625356 27625563 scaffold_11 1302739 1302922 - 204|0 180
GTATTTAAAGATCTTTATTTTCGTGCATGTCAGTTCTAAGTTCAGCACACGCATATGCA---AAAAATCCTTATCTGTTGGTTTATGAGACTTTATGTATTTATAAATTATTGTAGACACTACGAAAATTCCACAATCAATAAATGAAGTGACCGGAAACAAACGATTCAAAATAAATAAG
CTATTTTGAGATCTTTTTTATCACGCTTTGTAGAT--------GCCTCTGGCATTTCCCCTTAAAAAT--GTATGATTTGGCCCTTAAGATTTCA------TAAAGATCTTATTCAACTCTATCATATATC----ATACAAGAATAATGTTGCCAGCTTTAGATA--CCAAAATGATTGAA
>CG1971 27632235 27632467|28048 chr3R 27631486 27632286 scaffold_20 2069042 2069816 + 8143|772 823
AAAATTGATATTGGTAAAGAGCAAGCTTTAAACACAATTAATACAAATTAGT
GGCATATTTATGGTTTAAGTTTA--TTATACACGTATATCATACCAAATAAT
>RhoGAP100F 27667492 27670981|28080 chr3R 27666914 27667495 scaffold_20 2112241 2112861 + 24239|635 638
GGTA
GTGA
>RhoGAP100F 27667492 27670981|28081 chr3R 27667799 27667889 scaffold_20 2112904 2113012 + 4314|0 108
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TGTCCGCGCACTATAGGGGACATTGGCTTAACGGCGATAGCGATATCTATAACGATATGAAACGCTGAAAGTGTTCTTTTGGAGTATTTACAGTTTACAAATTTACAAA
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ACTATGTTATACATACGAAAGAC
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TAACGAATA-----AAACATAATTTAAAATAAACAAAATATTGC
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ATTTTTTTAAGGCAAAAACGAACATAAATATTTGAGCAATTTTG
>CG14642 66855 67605|49 chr3R 66898 67429 scaffold_55 130563 131109 + 17606|0 552
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-ATTAAAT------------TTTAGTTTCCATAAAAATCACGTATAAAAATATCTAATAATGTAATGCCCTTAAATATATATTAAATTTAAATGTAATTCTAATGAAAACAA
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ATCCTAAAAACG
GCCC-----ACT
>CG9776 153527 153728|129 chr3R 153539 153754 scaffold_3 754228 754463 - 3853|0 209
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GCCTTGATTTGTCAATTTGGTCAAGAAACTGGCTACTGGAGGCGTCATCAGCTCTATCTCTGAGTTAATCGCATGCAAGGGTTGGGGCTGCAATGGAGGAGCCCACGTTTAATTCATTTTATTAGTTTTACTTTATTCCTATGTATGAATGTGTTTATCTGACGAAATGTTCTCAATAAATGCACATATATGTATGTAACATATGTATGA
>CG9776 153773 153850|130 chr3R 153834 155810 scaffold_3 754563 756678 - 56078|0 16
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ATGTTGCAACACTGCAGAAACGCTGCCCCCAGCTGCTGGAACTTGATCTTTCCGACTGCAACAGTCTGACGCCGGCAGCACTTGCGGCAATCATGAAATTCAACAGTCTTGAGTATTTGTCCGTGTCGCGTTGCTATCTCATACCCGCTGCTAGTTTTATGTAAG--TTATCCAACAGATAATCCCGCAGTATCCTATCATTCTAACACTCTACTCTGTATCTCTCTCAACGATGCAGAGAACTCAAGAAGATGACTTCACTCACCTATCTGGACATTTTCGGCATGCTGTCGGATGCCGCCATGGAGGTGCTCGAGAAGCAAATGCCCAAAATAGGCATTAACAAGTTTATACATAGTTCGGTAGGACGCCCAACTGTGGGCACGCGTCGCACCTCCATCTGGGGGCTGCGCACCCGCGACTAAAGCTCCCAACAGACACTCATCAGACAATTAAATTTCTTTAATTCTTTTTCGTTGCGTTTATAAGCCGCC--TAGCGCAGTTTTCGTAT--TTAATATAATGACAATAATTAAATGTCACGTTTAGCTTTTC-AATATCA
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ATGCAAATGGACACTCAATTGAAATTCAATTGATATATAGCTATATACTTATTGTTCAACTAGTTCAGTTTTGGTTTAAGTTCATTTTGTTAACCACT-CAAAAACACGGGGCACAGGTCACCAAC-AACTCAGAAAATCAAAAACAAAAAAAAAAAAACAAAAAAAATGCACCTGCGTACATGCGAGCCAAATTCAATGTTAAATCTTGCGAGATGAAGCCCTTCAGGAAGGAACGATTAAGTCAGCCGCATATTGGTTGGTCAAATTTTATGTTATCAATAAAATATGAGAGAAAT
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AATTTTAAATAAGCGTATGGTCTTGATTATGCAAATTATAAAAAAATAGTTATTCAAAC
AATTTTAATGAATTGCATAGTTTTGGTTAATTGTATTGTAAAACAATATTCAGTTAAAC
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CATGTATGCATTAATGAAGCATACCGAAGAGGGATCCTTTGTTGCTGGTCTTTTTGGTTGCTCAAAGTCAATGAAGTTCTTTGCCACAAAATCATC------GGGCTAT-TTTGTTATAACTTTAAATTGCTGTATGCTAAAT
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CATCTTTATTGTAATTTGCAAATGGATTTACTTTTATATTTATGATTTGCCAGCCAACATTTTC----AGTTTCAACCTAATATCCCTATTTTATTTTTATGTACATATATATGTATAGAGCA-----TGAAGTTTCTAACTGTCCAACTGA-AAGCCTGATTAACATTCATAAAAAGTTTCATTATTTATTGTAAACTAGTTGACAATAGCATTGCAAACCACATAAAACCCGTGCCACTACTGACAGTGGGCGATGTTTTCAATTTACAGCGAA------TTGATAGCAAATATGGAAATTATTAAATGGAATTGTGATAAA--------AAATACAAAGTCATTGATTGCATGTAAGTTAGCTGAAGCCACAGACAGCAATTAATATTGTAAAAAATAAAGAGGAAAATAATATAAAAATTTATGGGAAATTGAAGTTTATAGCCATAACGTAACAATCGAAGCAGCAACCACACAAAACACAGACAGCAATTAGTTAAATAAATACAACATGCAACAACTATATAAAATATACAAATAATATACAATGTATTAACTGTATAGTGCTATATAGAAAGAGAGAGCAAGGCACGCGCATGCTGCATGCGACGGTCACAAATTAAACTGTTGATAACAAAACTTTGATATTAGTTTGTAAAAGGAATATTTTGTACGTACGTAATTTTAATTTACTGGATATGATTTTTTTTTTGTATAGCAATGAACCAATCAACAAAC-CACAAACAAAATAAATGCTGCCTTGAATTATAATTATACCTGTCCATAAATATGACAGTTGATACAACAGCAGCTAAAACAACAACAACAACAACAAATTAATATTTATAATTTAGCTTACATTTGTCTAATTTCGTATAAATTAGTAATTGTTAACTATTAAAAATATTTGTATAAAATCTGGCTGGATCAGCCATAATATACAGGCGCCGGAGCCTCAGGCCTAGCTATTCTACTAATGTACTTTCTCTTCGTTAAA-TGCAACTGCCCATTCAGAGAATAAT-TAATTTGTTTGTTAGCATA-------AAACAAAATTCTTATAAAGATGAAAAATTCATTTCCTGATTAAGTCAACTCAACTATGTAATTAGGTGAAAACAAATTTTG---TTTAAGTTCTTTTCTACTACTCTTTTTGGATAA-TTAATAAATA--CGTTAGTT--GCAGCATATTGAAA
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TTATTTATATAAAAATCTTCCGCATTGTCGTAAAACACACAGCAGATTAACCTGTACCCAATTTTTTTAATATAATATATGTACACATAACGTATTCTCATTGAAACGAAATATGCGCTAATCGTCCCGATAAAATAT-----------TAATGCTTTGGGCAAATTTTTAAAA-------AGCTCTGCCCTTAAGTCTAAGCAA--TTCTTTC----AAAATATTTATATTC
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AATGAGACTCGATAAA--ACATTTAGAATGTTTACAAAACCGCATGATTATGTTTTATGAATAT
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TATGGTTATTTG
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TGTATTGACATTGAAATAACTTTTAGTGAGAATGGAAGTGAAACAATAAGGGGCATATTGTTATTGGTACTAATTATTATTACAGAAATTAATAATAGTAATAATAATAATGCATAATAATGAT-GCTTGTTTTTACAGCGAGC-CATCGCACACATTGCATACAATCTGCTGCACACATATTTTTATGTATGTATGCATGTATGTATGTATATAGCGTATGTGCGCATGTTTGTAGCAT-CTATATAAATAAAATACATTTTTGTTGCTTTTTTTCTCTTTTTAACTACTTTAGTTGTACAAAGCTTTGTATAGAAAAAACAAACAAAAACA------AAAACAAAAACAAAAACAAAAAAACAAAA--------AATCAAAAA----------------ACAAATACAATTTATAAATTGAGCCTAATGCTTATTTAACTGAATTGTGTGTGAGCATGGAATTAATCTATGTATTTAAGCATAGAATTTAATTTATATACATACTTATATATATATATATACTTATACACATATAAATAAAGTAAATGGAAAAATTTAGTTGGTTCTGCGTAAGTCAAACAAGTTTTGTAAATGTATAAAGCGAAAAAAATATCTATATTAAAATAAAATATATGTAATTTAATATTAGTCGCTATAATTGTTGAGGAATTTAAACCAAGTCAAGCAAAAACAAAACAGAAAAAAAAACAGTCACAACTATTTAAGTCAAGCAACAAATACTACAAATACCAA-----GAAATTTGTGCTTCGTTTCAATCATAAACGACCACAAATAAACAAAAAG-----------------AAGAAAACAAAAACAAGCC--CTACCCACAT---GTTTAATTAATTTATTACAAATAAATTATGCCACTAAACTGGAAAATTATAAAG------------TATGCAACTTTAGCTATTTGATAACGTTGCATGC--AACAACATACAAAATCAAGAATCCACACAAAAGAAGAAAAAAACCATCTGAAAACCACGA---GCATTGATAACAAAAGCAACATTGTTAAACGCATAAAATAAA--AGTAAAT----ATAATAAAAAAACAAA-TAGACTTTAAGTCCCACACTCTAGGTTCTATAGGTATTCAATTGCAATACGTTTTGTATGCGTAGTAGCCATTTTTGTGGAGCTGGAGCAGTATGTAAACAACACTATGTATGTAATTGTAATTATTATTATTATACAGAGATCACAAAAAAAAATACGAAAAACTAAAATTATGTGTAGAAAATTAGGCAGAAACGGAGTGGAGCATTTTTTCAATAAAA-CACTAAAAAA
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TATCGGGGCAAGGAGGGGCGGCGCCAGCGCAGAGCTTAGAACA----CGGCGAGGGCCAGTAGCGCCAGGAGCTTCCTGAAAAGGAGCGGAGCTCCAAAAGTCATTTCCATAGGCACACACAACTTCATTTAACTCACTACTACTACTTCACATCGCAGACCATCCACTTTCGAAATTC
TATCGGGATAATGCGGGTCGGCGCCAACATAGAGCTTAGGATGATAGCGGAAAGCACAGCAAGCGCCAGGAGCATCACTATATG--------CTCCAACAGTCATAAGCACACACACACACACACACAC---GCCCACATACACACCTACACAT-ACACACACTCAACAAACTGCATTC
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TTGCCCGGAAAGAAGAGAGCGCGAGAGATACAAACAGCAGCTCTTGGTTTGGGCCAACAAATAATTAACTGATAATGAGAAATTTCAATGTCAGTCAACGTCTTGGCCAGAATCAAATACACCAGAGAGTTACTCTCTTCAAATTTATCCTTTATCAATCTATGCATATGGATAGACATACACATATACATATATATAAGTATATACATATTTGTATATATTCTGTATTTGCTGAATACATTATGCCACACATTGACCCCCCAACCCCCTTCGCAAGCCGTTTCTGACAAATGTTTAGCAATTTGAATGCGCTAAAATTATGTTTCA-ACATGACATAGATA---CGACAACGTATACCCAAACGATTTTAGATATACTTATATATAGCTGC-CATA
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AACGACGGC-GTTTGTTGAAGTGGTAATATCTACTAAGGGTGGCATTGTAAACTGATTGTGTTTTTTATCAATGG-----GGGTCTACGTAATAAAGTGCTCTGATCGCC
TCGGGGTGCGGCTCCTTGGGATTTTAAATCAGATTTAAG--CGCAAAGTAAATTCTATGTATTCTCCATTTCCCGTTAATGCGTCTAAGTAATAAAGTACTCAGATCACC
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GAACTGCTCCGGCAGT------------------------------------------------------GACTACAG-GGTATT-----------------------------GTGTCCGCCGTGACACGATTTGTTAATCTCAAGTGGGAATACGCATAC-------AATATATGTATA-TAAGTGCCCATTATGCAAAAATCGTATTTAATAAAAATGTGTCTATATGTAAGGATTTCGACAATA
AGACTACCC--GCAGTAGAAATATTATATTTCCATAAAATATATTAGATTGTATGTGTGTCTTTGTAGTAAACTAAAGCGGTATTTAGAAACTCCAAAAGATGTATTAGCGATCGTGCCCGCGTT----CTATGGGCTAATCTCACGTAGATTTACCATTACTACCCCTAGCGTATTTATGCTGAGTGAGCATAATGTAAGAAAAATATTTAAT-AAATTTTGTTTATATGTA-------TGACTATG
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AC-TCATCTC--GCGGATTGT--------CCGGAATGTAATTTATATGTT--GCTGTAAAATCGCACTCACCCTCA-----------------TCACA------------------------ACACTCATT-TGGCATATGGAGCCTTTCCAGAAAGCAGCATGTCCGTAGATCTGTAACTGCGCTACCATCGTCGTCATCTCCATTTCTGTAATGGTTTAATAACCGCTCGGCTGCGTGCTCTTT---ACTGATTAAGAAAATGCTTATGCACAACTGTATCATTTACCAAATTCACTTGTGTGTTGAATTTCAAGATTTACACCTAACGTTCCG-----------ACACATA-------TACTTTTTCTAGATTTTTAGTTGACCCGAA--AACACTCAC-----TTACACAAATCACAGGCAGA---TCAATTGAGT------------TTGAGTTC----CTCTCGCCTTACGG----------GTCTGGTTGCCCGTCATATGTTACTAATTCTCTATCGTATCAAAC-CTGATTTATGTTCTATGATATT----------------------ACTTGGCGGCGATCTGC---------GCCGGAAAACTGTGGTTTAGCAATCGGCGAGAGAAGCAAAAT-AATAGTGTGCAGCGGATGCTAAAGCAGCGGACAATTGC-----------------AAATTGTAAG--------AAACAGCGTTCGCTTGAGGCGCGCTTTTATAAAATGTTTAAGTTTACACTTAGTTTA--TTTAATTGAAAATTTGTAATAGTTGTACTAAAAAT--ATCTCTGTATCACATACTAGTACTAAAACATAGAAGCGTAAAAAACAGAAAAAGAGATCATTTTAA------ATACACGAAAAAATTAATTTATGCATAATACAA
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ACTG--CCTTCAGA-----AAGCGTGCGTTGACAA------ATTAGCGGTGTGTTTGGACTTAAGATATAGAAATTTTTCTATAGCCCAGGAGT---GGAGCCTCTATGATAATAAATCATATGCTGAGGGAAAGAAGCAGATGTTCAAAAAGTTAAGATATTGCTAGATTCACAGCTATGGCCGCGATCTGGTTCACTTTGGTGGTGCTGTGACTTGTAAACTATAGTCTATACAATTTGTTAGCGGTATATACTATGCGCCCGCTTT-------ATAAGTTTATGGGCGCACTTATTGTAAGACACATTAGCTATCCTTTTTAAGAGGAAGAGTCAATATATTACTAGAATTTTCGCACACTTTTGTAGT---ACGTACATC--AACTTCAACCTAAATCGGAGTGCTCAAGTGA---GAAAGTCTCGCGCACTTGAAAACAAAATTACCTTAGGCAACACTTAAGCTAAAGCTGTGGAATAGAATCCTCGAGCAAATTATTTTAAATGGATAAATAAGCTCGCCGACAAAACCCAAACCCATACATATATTTTCCATTACCTTTAATTTTAGGGATTAGTTTATTTAGGCTATCCTCAGAAGACCTTAAATCATTCAAGTCTGGGATAAGCTTCAGCGCAGCCATAATTAGTAGTCTCATAAGAAAGTAAGTCAGATGTGGAGCACACCTTGAGAAAAAGGAGAAAGCCCAGTATTAAGC--AGTCACTATTGAACCAAATCAAAAACGTACCGAATCGAACCTCACTGCACAGACAAA-------------------------CCATCTTTAAA---------------TGGTGA-------TCCTTCTAAAGGCCT---------------GTGGTTCCACA-TTAAGTGATTGTGTTGTAAACACCTGGAGAGAATTTCATGAAAAGACATACGAG-TAGTTACACAATAATTATATATTATGGACAACTTTTATTAATTACCTTAATCTAATAATACTAATTGATTAGAACAACAATAATATTA-----ACCTACACATTGAATAATTTACATTCGTTACGTATTGTAATTATCAATTACCAAGCTAATTTAAAATAAAACAATTAGTAGTTTTCAGGCTCTACATAAATACACAAG---GCATAAATTAC------------AATACATAATATTTTTAAAGTTGCATCACCTA-GTGAATACGCTTAGCAACTT----GTTGAATGTTATCATATATTGGTTACTACATAAAAGGAAGTGTTATACATGGC-AAAAGAGCAATATTTTTCTAATAAAGCATCATCATAAAAACGAA
ACTGAACGTGCAGAAGGAGAGGCGAGCGATCAAAAAGCTGTATAAATAATTGATTCGGATTTTATATACAAACG------GACAGTCCAACAATTTGATATACTCTATAAACCAGTCTTTTGTGCTG-------TATACACATGATTTACTA-TCAAGATTTGTCTAGAATCG----------------------AACTTTTATAATGCACATAC-------CCAAACTTTTTGCTATTTGT--GCGCTATTCGCC-CGAGCACAATTTACAAAAAATAACTCAATTTGAATGCTCAAAGTAGAAAGGA--------------AAAAAATGATAACCAATAATTATCTTAAATGTCAAGATACATTTTTAATTAGACAAACTTTTAAGCTTAAAGCTAAATACAATATTTTAATTAAAAGAAAAGACGCTCTTAGCTAAAAACA---------TACAGAATGAATAGCTCTAAGGTTTAGCATATAATTT----GCAAATAATTTTGATCAATCAAATAACGTA---------------------ACGTATGCTGTTAGCCACCGAAA--------------------------------AGACGACCAGAGATA--TAGGGTCTAATAT-AGCTTCAGCATAGCCATA--TAATAGACACGTAAGTTAGTAAGTCAAATGTGGAACATGCCGAGAG----------CAGCCCAGTATTAAACTTGTCCTCGATGAAACTGTAT--AATATGTCTCAAATT---CCACAATGTAGATACGTATGTATGTAGTGTATAGCATTGTTTCCTATATATAAACTTATATCAACCAACTGATGATAATATGTACTTAAAAAGTCCTCTTGAGTACCCTAAAGCTGTTCCACATTTAAGTGATTGTGTTGAAAACACCTGGAGAGAATTACATGAAAAGACATATTTGATAGTTACAC----------------------------TTAATT--CTT----------TATTAATTAATTAAATCAATAATAATTTTAAAGCTACGTACACATT---TAATTCAAAATACTT---CATTACCATTATGTATTATCA----AATGCAGCATAAAAAAA--ATTAGTTTTTA---TCTACTTAATCACCTAGTCGCGTTTCAATTATTTAAGTAACTTATGTACCTAATTACTCAAAACAAAAATAACGTACATATATATTTTTAACAGAGTCATATTTGAATGTTATATAATTATGGTTACTATATGAAAGTA--TGTTATGCATGGCAAAAAGAGCAATATTTTTTTAATAAAGCATACCAAAACATTCTAA
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AAAGGCGATCTAATCAATT-CCTAAGCACCCCCTAAGAAAAACGTC---------------------TTAATTACATCTTCTTATGAGGATATTATTTGAATCTTAGTTGTTTTATCTCAGCCAAGTGTAAATCGACTAGGACCCGACTTGTTTGCAATACAACAACAACATCTAATATAAA---------------------TTATGTTAAAC------TGCCGATTTTATTTAAAACTATTCTGGGCAACGAACCCGAGCGCTGAGTTGAGGCGAAAATGATATTAA-ATCGAGTTAGTTCAGTTTTC
AAAAGCCATTTGGTAAATCACATTCGCACTCATTCGGGAGAACGTCCGTTCCAGTGCTTACACTGCATGAAACGCTTTACCCGGCGCGAGTATCTTGGGAAGCATAGTCGTATTCACTCACTTAAATAAGCACTGA-----ACCC-------------CAAAGCAAAAATAAATAATATAAAGATCAGTAAATAAATTTTCTGCTACATTAAACAAACATTGTTAATTTTTTTGAA----ATTGTGCACATTTATCGAAATCGAAAAGACGATTTAATAATGTGAACAGTATCTTTTGAGCTTAACATAC
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TTGGAACGAAGATGCATATATCCACTTAATTTATACCCTTTTATATCATTTTACATTGTTTGCACTTCCCC
TTG--AGGAAGTTCCAAATATCTGTTTGTTTG----TCTTTTGTGTAAAATTTTGTTGTGTATTTTGCTCT
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ATTCTAACTCATATTATTCA--TAATCAAACCA--TTATTTTATTAAGTTTTTATTTGTTATGTTG--AACTATTTCTCTGGCGTTTAACTATGAGTTTAATTATTTGTAAGCATACAATGTGCATAAACGCTTATTAGAAAGAAACGTGAATGAAAATACAATGAAGGGGAAACACTGAAGCA--TTGGAGGTGAGG------AGT-------------AACACTTATATG----------GAAAAGAAA-GAATTCATAATGTTTTACATATAACTCCCAAAATAAATGATCTGAATAAATT
GGTTTTGTTCAAATTTTTGAATTAATCAATCCAAATTATGCTATTAAGTTTTT----GTTATGTTGCGGGCGCTTCGAATGTTTTTATTTTATGTGTATA-TTCTCTATAAGCATTCAA---ATGGAAACGCTTATTTATGCTATACATACACATATATATGCTATAT----ATCACTGTGGCAATCTGATAATGCGGCAATTTAGTTTGATTTCCCCTCAAAACTTATATATACATATGTAGAAACGAAATGAATTCAAAG------------------CAAAATAAACG-TATAAATAATAA
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AAAATGTTACCTTTAAAAAATTTGAATAGTAAA---CATCGATTATTCAATAAAAGACCATTTGTCCACCCATAAACGCACAAAGCGGTATATTTGTCGATTAGGGCTTTGCATTCGTT--CTAGTTAAATTTGTTTAGTTTGC
AAAATGCTA---TTAAATAAATTAATTAGTAAAGCGCATAAATTGCAAGAAAACGAAACAAATTGTTGTTCGCAAACAAGAAAAATGGAAAATC---------GAATTTTTGTTTCGTTTTCCATCTTAATTTGTTTAGTTTGA
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ACTAAATTTCAATATA-AATATATAAGTATAATATATTTTTTATTA--CCAAGTTTTGCAAAAAAGTTAAACGGAAACACGGATAACATCGAGAAAGAAAATAATGATGGACCTCT
GCCAAATTTCGATATATCATATATATATTATATATATTTTGTAATATTCTCAAATTTGCAAAAAA---CAAAGAAAAT----GTAACA---AAAAAAAAAACACTGGCTCACTTTT
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TATTTGCATTTTTTC----TTTCGATCGTTAGTTTCGCCGCGCGCGTTTTCCCAAGCTC
TGTTTGCGCACTTCTGCAATTTCTCTCTTTCTCTTTTACACACACGCACACCCAAATAC
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GCA-AGCAACAAAC-CAAAACCCAACCGAAC--CCCGCTTTCCACAAACAACCAGATTTACAGCAACACAAATCGGAAACTACAAAAATACTACATGGAATATATTAAGGAGGGTATATTCCGG-------ATGGATTAATTGGAT
AAAGAACAACAAAAGCAAATATTAACTAAACGAAACGTTATATACACACACACACGATTACA-CTCTATATATAGT--ACTAT-------CTATCTGTAGTAT-CTGATGATAGTATATCTCTGTGAAACACTGCAGCAACCGGAC
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TGCCCTGTTTAAGACCCTTAACGTTTCACGTTTTTTACTTCTAATAAAAGGCAACAACAACCGATGCCAGCAACCACAAAGCAATCGCCATATGTTCGAGCTGCCACACGCAAAGCAAAACGCTTG----GCACACACACATGTACA---------------GTATACTCACACATCCACACGCGTGCATGAAGGCGCTTCCATTTGTGGCCTCGCTTATTATTTTTCTCGTCAG-CGCTTTTCGGTGTGAAAAACTTGTGGGGCAGAGATA
TGTACAACTCGAGGCCCTTTACATTTTTCAATTGCTGCTGATAGATAAAG----CAGCAGCATTGACAAACAACCACA-------TGCCATATGTTTGAGTTGCCACACGCAAGG-AAAATGCTCGCAGCGCACGCACACATGCATACACACATATATATATATATATATATATATATATATACATACATGACGGCGCTGCCATTTGCGGCCTCGCACAT--TTTTTCGTGTCTGTTGTTTTTTGGTGTGAAAAACTTGTGGTTGCAAGATA
>CG31529 629873 631755|604 chr3R 630391 630760 scaffold_2 790616 790967 - -1727|0 385
CGTG--TAGTTGACAAACATTTGTACATAAGCGTCTGACAGAGTTGCCCTCAGCGGCAATAGACTTTTAGCGCAGACTTAACTTATATTTTTAAACTAATA--TATTTGAG--CTCCATTTTATTAAGTATAAAACTTCGTTACAAATATAGTTTTTTAAGTATTT--ATCTAATTGAATTTGGAGCAAGCTGTTTA-GATTCAACAATGGCACCTATTTGTTTCAAACAAACTGTGTACTTGTGTTGCGGATATAGTTATCGATTTGGATAGTTCTGGACAAATATGTTGCATATCTATTGAAAATGAATTTACATTTGTATACTC-------GTAAAAAATGGGGATGCGAAATGTAATTTAACTGCACTAAAGTTGATGAGTC
GGGGGTTAATGGGCTCAATTCAGTCCA-----GTTTG--AGAATTGTTCGTGACGCAAGTGTGTGTATATGGCACGTC---ATTATATGATTGATCTATTAGCTAATTGAGACTTTTGTTTGTTTTATTGTACTACAT-------AAGCTGCTTTTCTGAAGAATTAAAGTTTGTCGAATTTTGAACAAGCATTTTATGGGTTATTTATGGC------TTAATAAACATAAATAACATCTATTTATTATATATGTAAGGCGAGATTTGCAGAAATTTGAAAAAAC-TATCAAAAAGATTTTCAAAA-GTTTTGACATAAGAATTCTTTGGTTGGGCAAAAACAGAGAGAGCGGCCT---------TTGGACTATATTACATTAGTT
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TATCAAACACATGAAAAGTTACTTTTATATTCGATTTTTTACCACTGTCTAAAGTTGGGCCATCTCCCTCACAC---------------------------ACTCAGCTGTGCGTAGGC--------AGGTTTCGTAACACGTTGAAAAGAGACAAAAAAAATGTCGACATGGCGCTGGAACGGAAAATGGGGAATACAGAAAACTCGCTAGGGCAGCACTATTGG--------------GACCAGCTTCGATATGCGCTTGACTGCTTCTTTCCAACGATATTT------------------AAATAAGTTACAAACAATACCAACAGCACAGCACGCACAATGCATAACGAACAGGGGAAATTAAGAAGGTTTTCAAAGGGGGAGGTA-GGGCACAGCCACAT-----GAGCACACGAGTTGTTATCAATTATGCTCG-GGCCAGGGTTGTCATACTGT
TGCTGCACACACACAAACTCACTAACACACAC--------CCCACTTTCGTAGCTTGTGCTCTCGCTCGCACACTCGGCGAGCGCTGCTGCGGCTGCTGCTGCTCAGCTGTGCGTAGGCCACAAAAGCAGTTTCGTAATAGAAAATAGAAAAGCAGCAAGAAATACAAAATG--------------AATAAATAAATAACAAAACTTGATGGGGCAACACTGTTAACCGTCCGTTATGTTTACTGGCATC---ATATGCTCGACTGAG--TTTACAGCAGTGTGTGTGTGTGTGTATTTATACAAATAAGTTACGAACAAT--------------ACGCACTAGATAAAGTAAGGGGTAGCTGTTGGTGGGGGTT--------GGGGGTATGGAAAAAGCTATATAGTAAGTGGGAAAGAATTCTTATCAATTATGCTTGCCATCAGGGTTGACAAAAGGT
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GTTAAATTGTTGCATGTCTAGTTCCACCAACACCCA-CTAGATAGGGTTGCCAGGT-------------------GGCATTCCTATTGCGTTCTTATGTCCGTTTA----TTCAACTACGTAATTGTTACTTTATTGGATTCGAAGTTTTACTGAGTAATAAA
GCTTAATTGTTGCAT--------------ACACTTAGCTTACCAGGGCTGCCATATAAATACATACATACATACAAATATTTCGAGTGCTTTATTGCGTTCTTTTAATGTTTCAACC---------TGGCTTTAGTTGCGTCGCAGTCGCAGCGCGACACGAA
>CG31529 629873 631755|607 chr3R 631459 632769 scaffold_17 2514422 2515936 + 5033|0 391
ATCTTAATATCG-CTCTTAGTC-------------TATGAAATCAAGTGAAATAAAATGCAAA------ATATTCAGTTAAGCGAACAATTT---TCACTTCCAA-------------------TTTCT-----GCAGTGAA--AAATGCATC-------------------AAAG--------TGTGTGTATAACTGCATATAAAAGCCGTGCACATGTGCCTAAACGTGTGTATATGCT---------CCTTTGTGCATATAAGGCGTTGTAAAAGGCTGAAAATATGTGGTATA-ATTTACTTG-GCTTTCCGTTGAAGTTATCCCCCCTCTGGCAACAATGCTTTATGCTGACCTT--------GCTTCTAAAAACTCAAGTATTTCC
TACTGGAAATCGACAGTTAGTCGTCAGCAAAGGAAGAAGAAAGAGAATTAAAGGAAAAGTAAATAAGGGAAACACAGATTGAATAAAAATTTGTGTAGCTTTTAAGAAAACTCGTATTAACCTTTTTCTCTATGGCAATGTAGCAAATTTATTGGTTCTCTGTAATATTTAGAAAGAGAACCTTTGTGTGTATAACAG--TTTACAGGGTGTGCGTGTCTGTGTGTAAGTGTGCAAATGCTTATACAGCACGTTTGTCATTGTATAGCATTTTGTTGGTGCCCATCAATGACGTATGTATATATTTACGCCTTGCAAC-AAGTTATTCTTTATATTTCAACAAAAC-TTATTAAAACTTTTAACAAGCGTTTCTCGAATATCAACTCTTGCC
>Hus1-like 634084 634144|609 chr3R 634096 635089 scaffold_17 2516779 2517806 + 27744|0 48
-CTAAGAGCTGGTATGTTTATCATAGCTGTAATAAATGCGACTTGATGT
GGTAAAAATAAACATTAATATTA-AGCGAAAATAAACTGTAATCGATAT
>CG14657 644020 644828|619 chr3R 643689 644502 scaffold_17 2525729 2526605 + 6896|440 936
AAGACTGATATAACAAAAAGCATCCGCTACGAATAAAATATGATACAAAATGATATATGCAAAAGAAATTTAACCCTCATTGAGCAAAAAGTATTAAATGTATAAAGAAACTAGTTCATTTAAGTCATTCCTGATGTCACTGTTTGTAAACGTATTGATATGCTAGTTTTGATCCTATTCTTTCAATGAATGTACAAAGTTCAACGTTTTCGGTTCGT-----TTAGTTTATGTGCTTGCCTTTGAGGCAGGTTAGTAAGGATGTATGGATAGAACAGTGGACA-------GGATGAAAAAACGCCACAACTACATTTATTTTTCCTACT-TTAATTAAGTTTGTTACATTATATGTATGGCGCAGA-TACAACGTAATCAATTCACACATACAAGTATAAATACATACATGTAATTCTAACTTTATCTAAGCATACAACTTATCTTTAAGAACAGCAATGAACAGCAACATAAAAATATAGAAAACTTTATATATA
AAAAAAAACAAAACTTAAAAAGTAAGCAACAAGTATTAAAAGGTAGTAAAAACTAAAAGCAAAACAAGTT-AAGAAAAATGTAAAAAAAAAAAACGAGTAAATAATAGAAATCGT-AATTTAAGCCATTCCTGATATTTTGTTTTAAATACATAGCTACATA-------------TATTGTTTATACGGCGATATCTAATTT---TTGTTAGGCTCTTAACAACTTTCTTTTCAGACTGCCTTTGAGGCCAAAAAAAAACAAAAAACAAAAACAAAAAAAAACACCGACATGCAGTGAAAAACGCCACAACTAATTTTAATTTTCGTACAATTAACTAAGTTTGTT----TGAATTTATAGCTTAGAATACAAATAAAACAATTCATTTGCA----TATAAATA-ATAAAAACAAATCTA----TATATATACATATAC-------------------ATAAACTATATAGTATATATATACAAATATTGAT-TATA
>CG14657 644020 644828|620 chr3R 644661 645063 scaffold_17 2527159 2527526 + 2255|0 195
GGTCTAAAAAACTTCA-----ATACTCGCTCATTGGAACGTAAGCCCATATGGC-----AAAAGCTAGAAAAGCTAG---AACAAAACAACACTAGGAAA----GAGTCGCGTAAGAGATTCGC-----------TAAGTTCTGAGTCTTTGGGTTCTAGTTACTGTTTTTGTGTACGTAATACATATTTCCGTTG
TAAGCAGCAAACCCTACCCATATACCTATCTCTCTGTCTATGTGCACGTTTGGCCATTGGAACGCCATCAAGGCTTGTTTTGTAATCCAATGCTCAAAACTGCTGTGTAACATAGAAAACAAACAAACACAAACACAAATCCTAAGTCTTT-GGTTCTAGTTACTGTTTAATTCTAAGCG--ACGCGTTTCCATTG
>UbcD6 775876 776000|769 chr3R 774956 776563 scaffold_17 2677518 2679427 + 39861|1258 1391
CCATGCGCCCACTTTAGGAACAGCAGCAGCATCAGGAGCCGGAGCCACAAAACGAGCGGCAGCAGTTTAGTAGGCGAC-CGCAGCTTAAAGCATCAGCA-----AACTACAGTAACAGAAA---TATGCAATAC
CCATGCGCCCACTTCAACACCAACAACAAAAACAACAACTGCAACAACAGAAGCAGCAGCAGCAGC------AGCGACTTGCAGCTACAAACTTCAACAACAACAACAACAACAACAAAAACAGCATGCAATAA
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GGAATTTATACAATAA-ATAGTATATTTGTGTAAACAAATATGC-ATTAA
GGAATCGACATAGGAATATTTTATATTTATCCCATGGAAAATACCGCTAA
>CG31535 776516 777388|770 chr3R 776881 777265 scaffold_17 2680509 2680936 + 2276|0 448
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AGCACTCACGACTAATTTGAATTTTTGAATTATATATACATTGTATATTAAAATGCGTT----GAAAAACAATGATCTAATAATTATGTTAATATTTAAAATAAGATAGTTAAAGCAATATTTAACAGTTTTAAAAAAATTGCTTAGGGGTCTTTAATTAAT------TAATAATAACGTGTTTCCTCTTCATA---TACAAACCTTTATTCGTGAAAAAATATATGCATCACGCGTCCATCTCTACTGCCCAGAACCACCCACCGCA--TTATAGATTTATTTATCATTCTTCA---TTGGTTATCGCTTTAGCTAGTTTCTTTGTTTATTCTTTTCTCATTTTTTTTATATTATATTTTGCATTTGTTG--TTGTTTAATCGATGATTTCATTTTGGAGCTCTGTCATATGTATTGATTTA-GCCGATTGAAGGGCGCGGTTGGTCG
>CG2016 782717 782790|775 chr3R 782721 783555 scaffold_17 2688331 2689170 + 31845|0 77
AATGTAGTTTCTCTAGTCTAAGACCTTATTTATTGC------ACACAGTTCCGC--GAAATATACCAAGTAAATCGAC
GACGTATACTATTTAG--TAAGCACTAATTTATTGCAACACAACACAAATTCACCAAAAACAAAAGAAGAAAAACAAC
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AAAGCTTTTAGAATCAAAAG-------TAATT---AACTCTAAAAATATTAAGAGATGAAACAAAATTCTGTCTAGCTGCTATGAGAAATTGTTGTCCGACGGTGAGAAAAGAGGAAATGAGCGA--------TCTTTTTTTCTTTTAGTAA----------------TGGTAGTAATT-GATAAACGATACAAAAACAAACAACAACAAAAAAA-------AAAAATGCAAACTATTGTAGTGATATTTGTTATAAAATAATTTTAGTAATTAATTTAATTTAAATTAAACAAC-----------CAACAAGAAACAACAGCAAC-CGCTCTGTGTAAGCCAACCACATAAACAATAACAACTGCAACAACGGCAAAAACAAGAACTGCAACAACAACAACAACGGCAGCAACATTAAACAAAACAATTGCTAAAAGTTACACATACGCATATTTAATTAC--------------------AAATCAGCAAAATGTTACAACAACCATTTACCGAAAGAATACGAAAATATGAAAGGAAAATTATTACCAAACGATGGAGAGAGAAGAGTAAA-----------GCAGAAAAAAGCAACACAAA---AAATACGAATAAAAATTATTCAAAATTATGCAACGTAATTTGAAGCGAGATATG------------------CAAAAATTAAGTAAA
AAAGTGTTTTGTATAAAAAGGCCCAGGCAATTGGAAAGCCGGTAAATATTTAATTATTGATTTATACTTAAATTAGCTGC---GAAAGATTGTTGCCAAAAAGCCCAAAAGAGAAAAATAATTGAAATTTACTTGTTTTTTTTTTTTATTACAAAAAGTAAAAGTAATTTGTAGTAATTCGATAAACAAACAACCAACAAACAAAAAAGAAAAAACAAACAAAAAAATGCAAACTATTGTAGTGATATTTGTTATAAAATAATTTTAGTAATTAATTTAATTTAAATTAAACAACAAGGAAACCAACAAAACAAAACAAAACAAACACATTGCGTGTAAACCAACAACA-------------------------AAAAAACAAAAACAACAACAACAACAACAACAATAATAACA---AGTAAATGAAATGCTAAAAACTAAACATATGCTTATTTAATTACTATTGCTATTCACTAAACGAAAATGAAGAAAATAT-ACAAAATCTCTTAAAGGACAGAATTGTTACGAACAAAATTATTATATTTGAAAACAGGTAGAAGCAGAAGAACACACACACACACACACACCACAACACAACATACATTTAAATGCAAATAAAATATATTCCAAATTATGCGAAGTAATTTGAAGCGAAATATGCGACAAAAAAAAAGTAAACGAAAATGTAGCAAA
>corto 909343 910094|904 chr3R 909976 913140 scaffold_17 809619 812964 - 61381|0 118
TGCAGCACCAGCAGCAACCAGGACAACGGCAACATCAGCAGCAGCAACAGCAACTTGCAACACATGAGACAGGCGCCTACCAAGTACGCGTCGATGAAATAGCCGCCTCAAGGAATAAT
TCCAACAACAACAACAACAACAATAACAGCAAAGGCAGCAACAACAGCAACAAC-AACAACTACTGAGACAGACGCTTACAAAGTAAACGTCAACGAAGAAGAAAGGAGAAAGAAAAAT
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GAAGAAGGGATCGT---TGCTTAATGCTATGTACATACA-----GACCAGAATCCACAAAGCTTA----------CACTTCA--------ATATATTGGGGGCCAAGTTGTTACGT----TAGCTCTACATA---ACAAAACACACACATAGATATATAGGTCATGTTATATATGTCGGAACACTTTAGAAACA-AATAAACCTAACGAATTTGCTTAGCAAGGCAAT-AACAATCCATA
GGATCAGCTGACGTTAATGTCCAATTCCAAATTTCCAAAAGTAGAAACAGAAACAGAAACACCTAATCACCGAATCACCTAATCAGGAGTACGAATTGGGGGCCAAGTTGTTACGTTAAATAGCTATACATATATATCAAATATA---ATATATATATTTATCAT---------------ACATAGCAGACACATGACAAACCTAACGAATTTGCTTAGCAAGGCAATAAACAATCCATA
>katanin-60 1053010 1053713|1059 chr3R 1053013 1054604 scaffold_17 937094 938695 - 54225|0 800
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TAGCGTTACACACGGATTT---TAACAAACCTAGGCATCTATCTATATATACAAATATTTTTTGATAACAACCAACACACATGGATAGTTTTTACAAAAGCTTTTAAAGTGTAGACCGGCCGGAT-------------AAATGTTGAACATATTTTATATATAATCTTTTGCCTATATATGCATATATATGATATTTGCAGATATACA------CGAAG--CGTTGGAATTC-AAAAGACTAACAGTTCTTAAAGAGGAAATATATAAAAAGAAAAAATAACAAACCTAAGCAAAAGTGAAATTGAAGGCTTAGCAACAAAATAAAAAATCATTGATTTAGAGACGGGCCATCAAATTTTTGTTATCCCTGAGATTAATCTAAAGCAATCATAGA--GCATGTGCACGATCCTTCCAATCCTTTCCAATCGAAACTAAGCCTATTATGAACATGCCTCC--TAGCCCATGGCTTCATT-------TAACGTTAGCCCCAATTTAATCATACAAAATAAG-----TTGTTTTTTTCCATTTTAATTAAAA--TTATATTTAACACACACACACACACACACACTCACTTCACTGTCTA--ATTAATGTAATTAAATTTCGCCTAATTTATA---TAAAATATA---ATATATCATAG---AGATTAGTTTTTAATATATGAAACA-----------------------TAAACCACAGCCAGAGAATTGTGAAGCTGCAA----ATGTACTTAAAATGAAATATTGAAAAATTGTAAACAATAAATCCCAAGATTTTTAACT
>CG10233 1061812 1062120|1069 chr3R 1062109 1062471 scaffold_17 945730 946059 - 16493|0 11
-CAGACACTTCA
GCAGATAACCCA
>CG12163 1063223 1063612|1071 chr3R 1063143 1063299 scaffold_0 1456201 1456362 + -138|80 166
GGTTGGATCAAGAAAAATGTTGAATTTATGTGAGATGTATTCAAATTATTCG----------ATTAAAATGGTTTGATTAAATATGG
GAATAGGTACAAAAGCAGTTTGATTTTACATTAAA-GTATTAAAAGTATTAGTTCTTTGTGCATTGAAGCGACATTCTCGTATACAA
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ATTGAA
ATTGAA
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ACACACGCCCGCCCATCTATACGTCTA--TATATATAAATATAAATATGTATCTATGTTAATGTTTGAGCTACAGCACAAATTTCTTTTTGGCTTGCAGTTGGCATTTCTGTGT--ATGTTTTTCGTTTG------------GACTTTTTGTTCCAA----------------TATAATCATGTCGCAACACTTGTAGCCCATTCCCAAAATCATATACAATCCCCTATAACAGCGCAGCGTATATATTGAAATAAACTTAAATT----ACGAATTGTGAAGAAAACACGAATAGATTCGTT
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TT
GT
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TAAGCTC-CCATCGCCCCTTGCCATCTTTACGCAATCCATGTCCCTGACAACTGTCTGTCACCTTGCACACA-----GCGCATATTAATAAGCCCTTTGGCAGCACCATAACTAATGGCCTGCCATTCGTTTTAGCCAAGCAATCGATGGCCATTAACCAGCAGGCGGCAAGC---CGTCCAAACCACTTCGAATACCACAAATACCAAATAAAAAAAAAAAA
>Tim17a2 1083039 1084192|1092 chr3R 1083278 1085209 scaffold_17 965354 967056 - 30444|0 924
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TAACTAATTTAATAACCTTTTCGGCCA---TCATATATTAGTCATAATTTACTTCAAAATTAGATGC---ATGTGCACCAGATGTTAACTAAAAAGACC---------CGAGATTTGATATTGTA-------------AACGTTGCAT----------------------------TTGCTTTTAATAC-----------------CTTGTTCGAAAGGGAAACAGTTAAAAGTAAGCTTATTTTGATG----GTGATGAGAACT----------------------------------------------------------------------CATTGTGAACTCACCTGCCGCTGCCCATGAAGCTGGCATCCGCCTGGCCAATCTGATAGCTGGAGCTCTTCTCACCGTTGTGCTGGCTATGATGATGATGCCCATGCC-----CATGGTGCTGATT----AATGTCGGCCTGTGCCGTCTGGGTAGCCAGCGAGGGCTGTCCAAAGCAATTGAACAGTTCGTCCAGTTCATTTGGCCAGCTCTGGGCCTGAGCTGCCGGCGTCATCATTTGGGCAGTCGAACAATT------GGCGCCACTCACATCCAGCGTTGTGGCAGCCACCGCCTGTTGCAGCTGCTGAATCT--TGTGGCTGTTGCTG-TTGCTGCTGTTGTTGTTGTTCTGCTTTTGTCGCGCCAGCAGGCGGCAGTCATGTCGATGGGTCGGCCAATCTAGATGCTGATGCTGTATGGAGCAATAGTAAATGCTTTTGCATTTGGCGCATCGCAGCAGCTGCTCAACTGTGCCGCATATGGCGCAGCGTGCCCGCGACGACGAC--ATTTG---------------------TGGCTT-----CTGCATGTCCTTGTCGCGTCCCCTGTTTATAGCATATTG
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AAAGATTCACTGCAAACTCCTCTCCAAATGTCAGTTTTTTTTTTTTAAACGTCAACCCGAACGCAAGCCCGTAATTCAAATGGGACATGATCATCCAATAT--ATAGCC----GTGGCAGTTCGATAGGAGCCTCCCAAAATTGAAATTTCACAAAATTTTTGTCCTCATGTTTAAAAGACATTATTCACACAAACGTTTACTGTCCCAAATTTT
>CG31538 1101394 1101626|1103 chr3R 1101621 1101784 scaffold_17 979344 979532 - 2361|0 5
GTCTCC
GCGGCC
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T------TACAGACCAGGA----TAAGATTT----TTACGATTAGTT-GATTACCTCTAATTTAGCTGAATTTATGT-----------AAAGCGAACCAGTTTGTTTGCATTAAAAAGAACAAGTAA
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G--CTGAATTTTCAAATACAATGTAATTTAAG------------------------AACCAAACAC-------------------------ATTAATAAAGCCTGTAGGCTCTTGAAAAT
>CG16708 1184585 1184879|1175 chr3R 1184535 1185307 scaffold_35 1034658 1035453 - 14602|50 375
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AAGCTTTAATTTAGTAAGAT----ACTAAAAATTGGCCGTGACACTAGCATGTAATGTAGACTATTTTACTATTGCATAATCGAGAAATTTTTATATATTATGTATGTTAAA-------------------TGTTTTTAGTAGTTAGCGAACTGTACTCTCTACAA-TGATATTCTATTCATCTGTATTATGCCATCTGTAAGATGCAAGCAAAATATTTAAACATTCCCTAAAAGGTGTGCATTATATATGTATATAAATATATATAATATATATA-TAATATAT---------ATACGTATTTGTATATTCTATTGAATTATAC
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ACACCAAGTGCTCCT
ACTTCATTTGCATCT
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ACTAC-------TCATGATCATAAAACTC--TTAAATCTTTCTAGTTTAGTGTAAAG------------CGAGCAATT-CACAAAAAAAAAATTGAGT------------TTATAGTCAATACA------TGTATTGGTTACTTGTATATATAAT-----------------GGACATT--------GCAGGA----------------GCCTTGTCAATGCACAACGAATATT-TGCTAAGCTAATCACACTGCCAGTGT-------TTTCGAATAGTGTATTGTAAA---CCCAGTG-GGCAACAACATTCATATCATATATATATATATATATATACTATATCAATAGTTAGGTTAGATTTAAGAAATTGTGATGATGGCGCCCCATTTGGGATTGTCGACTTAACCACAATACCAGTGAATGCTGACACATAATACTCATTGTAAAGCTGA-----------------------TTGAAAGTGCAGCAAGAA-AACCCTAATTAGATACATAA---------ATCTTTTAAATAACTGAATTTTTGTGAACAATAAAGATATGAGTTTGAGA
>CG2663 1226316 1226543|1209 chr3R 1226103 1227690 scaffold_35 1069004 1070585 - 59885|252 480
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GATTACA----------------------TTTATATTGAGAGTGTTTTTCATGTGTACTTA---CATTTT--------TTTAACATTAACCAATCAATTATTTAGTCCATACACAATTATATTGTTC--GCTTTA-CGCTTCATTTCCTATATATGTACCTCATG-----TTGTCTCACATCGCT-GAAAATTGCAGTAATTACAATAAAGAAAATAAAGCAAATTAAG
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ATGCGTTATCCGTTAATTGACTGCACCATAACTATATTTGGCATGCATTTATCATTT------------TTATGTGTTTGTAAGA---ATGTTTATAGAGGTGTAAGTGTGGGAG----TGTATATCCTTTGTTCTTCAAATCAATTC----CCTATGGCATAATTGTTCCAAC--------------CACACT---------AAACCGTG-AACCTTTTAGCTTATTAACGAGAGAGGGGCTAA-----GCCTTATCAAACAAAAAATC---------------AATAGCTTTTGTATTCAAAACT----------------AATTTAAACTGGTTCACTTTGATAAGGAATGGGCTATCTCTGGATTACAACTT
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>RpL35A 1291289 1291429|1250 chr3R 1291347 1292102 scaffold_15 1540761 1541444 + 34651|0 84
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GTTAATTATTAACTTTA---AATGACCTAC-------AAAAATCCGTTTTCTATAATAAATGAAACAATTTAAATTTAATTGAAA
>mRpL44 1295183 1295282|1253 chr3R 1294405 1296395 scaffold_15 1542854 1544844 + 75172|797 901
GAATCAAAACTGGCTCTGCGTCCTTGTTGAT--TATTGTAATTTGCACTAAACACATGTAC-GCATGCATTGTCAGAAAAGA--TTGCGTTTTAAAATCATTTAA
------AGCTTGGGTGT---TGCTAATCAATTCTATTTTTATTTGCTCTAAACACATGTACTTCCTGAATGGTCAAAAAAAGATTTGAGTTTGAATATCG-TTAA
>Hdac3 1298530 1298597|1256 chr3R 1298439 1300256 scaffold_15 1546628 1548370 + 82692|91 158
TATTGGATAATGTAGAATAAGGATTCGAGTTTAGCGTAAGCAGTAAAGAGTATCAGCTTATTTTGTAA
------ATTATATACAATAATGTCAC------AGTATAAGATATATAAGATATGAAC----------A
>ksr 1305871 1306458|1262 chr3R 1306358 1310303 scaffold_15 1555411 1559274 + 132857|0 101
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--AACCAGCCGATATACAAATATATACGTTTATAGACAAATATGTCATA-TATGTAAGCAGGCGCGC---ACACACTCACACACAC-ACACACACACACTCT
>CG31547 1315227 1315504|1266 chr3R 1314174 1315991 scaffold_15 1563241 1565151 + 72181|1179 1487
ACTAGCCCTCGCTTCCAGTTCGAGTACAACTTAGTATTATTAGCGTTTAGGTGGTCCAGTTCCCAGTTCCCGGTAGA--ATCGAATCAGTCCCTTGATTGGGAGTTGTGCAATGTGCCGCCGAATCAAAATGGAATTCCAGAGCCCAGACT-CTCGTTCTAAGAG--------ACCTCCACACTTCTTAC-----TTACGTACTCCTTTGTACGATCGAAC------------TCCTAAACGCTTGCAATAGATTTAAGTTAATTACGAACTACTTACTGAA---TAAACGACCCCCTAAAATAAACTG
CCAAGCCAACGTTTCCAGTTCGAGTACAACTTAGTATTATTAGCGTTTAGGCGTTCAAGTTCCGCGTAGCCAGCCACCTACGGAATATGTACTTTTTATATAAAATACGAAACAACTC------CTAAAACACAATCCCCAAACACAACTTGATAGTCCTTAGAGCGTACATTATAGCCATAGCTTTTAAGTTGATTACGAACACTACTGCGTATATGAATATTGTCTAAATATAATGAATCATAATAATAAACACAACTACAATTTGTGGTATCTAATCCAGTTTAAAGAACTTCAGCAAATCTTCAT
>Nmdar1 1334544 1335499|1287 chr3R 1334559 1336403 scaffold_15 1589134 1590986 + 52141|0 1068
GTTAACATTTT---------GCCAAAGCAGCTAGA-----------ACTTAGAATCAAGTATTATCATTG----CTCAGCCCATGGCGATAGCCAGCTAAAGA---------GAATTTAACTGTAGCAAATTGATTGTTATCGCTGAATGGA-----ATGGCCAGGACCAAAGAAAAAAGGACGATTAGCGTAATCTCACACAACATTTATGTCATTTTTGCATTGTTCCGTCGTTGGTCCTGTTATATCAGAGGTCT-TATATCTAGGTGTA---TTATTGGATGGTCTATTACGTTTTCGTAGTTTTCGACGGATTTATGTAAGGTGCTGGAGGTAGTTTCATTTCAATCTGAGTTCACGCTTTCAATGTGCATACTGTTTCCCCTAACTACTATATCTCCGCTTTAGATTTTCTCAGCGTTTTAATAGAACTTCTATGGAAAAAAAAT--ATACATATGTAGATCGA---TAAATGCATGACCAGAAACTTTCAACAACACACAATTCACCACAAAACCCACCCATTGTTGCAAGCCGTATACCAAAGTCTATTCTCATCTAAAAAAAAATCTCAAACCCGATT--TTGATCTGGGCATAAGTTTACCTCAAC-TGAAAGCTCCGAT--------AGCCTGTACAATATACAAATGTACAATTATACAAAATAAGCTTGAACAACATAAA------------TTTCATCGATT-GCAAAGTGGAT-------ACAGAATCCAAGAAAGGGCAATTCCCAGAAAGCAAT-TAACTAGACAAA---------------------------GTAAATTTAACTGAAGGAAGCTTGAACGAAATTTTTAAGCAACAAGATTATATATATACATATACATATGTATACATAACATATTGA--TAGGATTCAGTGTGAAAGTTAACAGCATA---AATGTGAAGCATAAGAAACGAAATTCAAG-AACAAACAATATTTATT----------AGTGGAATTTGAATTTTAAATGTTTTGCGTGTGTAAACCGTTTATG------CGACTAAAATAAATATTTAAAGCAAACT
GTTAACATTTTCGCCTCGGGCTCAATGAAGCCAGAGGCATAGGGATATTATTAATCAACCACGAACATTGATGTCTCAGCGGA--ACATTCATTTGCTCAATATGAAAGTCTAGACTTAATCACAGTTTATTTA-TATAAGTGCTGCATTTATGTGTGTGTCCAG--------------------CTAACATAATCAAAACCCAGAGTCAAGTTGTATTTATATATATACA-----AGCACATTTACCATATATATATATATATATATATATACATTTATTTGATGG-CAGTTAAGTTTGTGTAGTTGTCTGTAGATTAGTATAAGAATTTGTTGAT--CTCCATGTTGAATTG---TCCCCCCTTCCACATGCTTATTGCTACTGCC--------CATGTCCGCTTGAGCATATCC-------------GCACTTTTATGCCCTACCAATTGTTATATATGTCAAACGAATTGTAATTCATGAGAAGGAG-------------AAGGATCATCAGAAAGCCCACCCATTGCTGCAGAGTGTATACTAGA----------ATTTGAACACGATTTTCCGGCTATAATACTTAATTTGGG----------CCGCAACATAAAAGCTCCGATTTTCAAGCAACTTATACACTGCGAAAAGAAAAGCCTATTTATTATA----TAAACAATGTGAAACGAGTGCAGCTTTTCATTAACCGGCTGAGTCTATTAATCAGATCGATTTGAGCAAACAGCTCGTTTGAGAAACAAATACAGCTAAACAAACACATTCACAAATAGTTTTCAAAATACTTGAATTTAAGCGAACAGAAATGGAAAACAG----AAAACAGAAAACTTTAACTTGTCATTGAAAAAAAAAAAACATAAAATGTCTATCTAATGTTAAGTGTGAAAGTTAACAGCATAAATAATGTGAATCATGCCAAAC---ATTCAAATAACTGAAACGAGTTAGTCGAATCGGACAATGGAATCCGATTTTTAAGTGTTTTGAGTGTGTACGCTATTTATGCCAAGCCAAAATAAATAAATATTTAATAGAACCT
>CG2519 1365225 1366753|1310 chr3R 1362872 1365537 scaffold_15 1617945 1620934 + 80200|2611 3053
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AATCGAATGAAATCTTTACATACATGCATACAAACATACCCGACATACATAAATATCTAGTTATTAAACTTTAAACATACTGATTAAAGC---AAGAACGATAA-TCTCA--AGAGCGCATTGAACAATTTTATG-AAAATGAACCGTAGTATAATTAATATGTAATAAAAAATGTTGGATAAAAAATAAAAATTGCATGTGTTTTTACTGTACAGACTCTTACATTTCGAGGATACCCAACTGTATAAATAAGTTTTTTATTTTATAGATTTCTCTGTTGAGCTTTTAAATAGTTCAACCAAATATAATGGGTTTTTCAAATAATTTGTTACTCTCCTTTCTCTATTTGGGATTGTTCTTCAACTTTAACCCTGGCAACGGATTATGTTGCCACGCTATGATAAATTCTCATCTGGCCTGGGAAAACTACAAGACGTCTAAT
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TAAACTGCCACAAA--TCAAAGTATTACTTTTCCTTCAATCCACTCCACGCACTGCTCACGATCAATTCAACATATTATATCCCTTCGGCCGCTTCCAGTGTTATGTTTAAGCCGTTCAACTGATTTTGTAAACTTTTTATTATTTAAATGT
TTAATTGCCACACAACTTAAAGTATTAATTAAAAGTACCTTCACTTTACACAAT------------------------CATAACTTCGGCAGCTTCCAATATTATGTTAAGATTGGCGAAATAATTTTG------TTACATTCTTCAAATTT
>CG2519 1365225 1366753|1312 chr3R 1365739 1366208 scaffold_15 1621233 1621688 + 3126|0 554
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GCCATGAGATTTT-CTTTGTACCTAACAAAAGATAAAC--TTAATTTTAATAA--TCAAAAATAA---CAATATTGTAAA--TGCCACGAATTGTTCTATGAGAATTTGAACAAATATTGTTAATTAATATTAATTATGGTATGTCAACTAATTTATATAAACTAATACATAGTACTCTTACTAAACGTATACTTCTAGGTATATGCCCCTTAGTTTTTACAACTACTATTTCTGCTCTCTACTCTTCCAAACACTAATACGATTTATAAACGATAGTAATAACAATTAACAAATTAACGTACAAAAGCAGCATTAAACAAAAGGCAGTAAATTGTAATTGATAA-ACTATTCACATTTATAAATATACCAAGCTAATA----CATAGCATAAATGCTAACAATAAGA-AGAGTTGCA---ATAAATGTA------------------------------------------------------------------------------ATTCCACTCCTACCCCTAACGTATATCTAT--GCCCTCCAAGTATTT
>CG2519 1365225 1366753|1313 chr3R 1366209 1368104 scaffold_15 1622500 1624626 + 69494|0 723
AATGCTT-TATTGGTTTGGGCACACAA------------GAATATATTAACCTATCAACTCATATAGATT-----------------------------------TCTCGTGGCTGC-TCGCTGTTGAAAAAA------------------ATCCGTTCTATCGAATGA-AATCTCGAATATTGTGTTATTA--AAGCGATGTTTTAAAAAGGAATCCGATTGTTCACACAAGAGTCCGAATCTCAATTAGAAAAACAAAATTACAGACCAGGGAACAATCGTAAATACTTCAAATTTTCTTCCCTTCTCAATATGAAATCCAAGGCA-----GCTAGCTAAAGTGTAATAAGAGCAAATTTATC----------TAACTATATTTACA-----GTATATGATAT----ACATATATGATTCGGTAATCTACA---------CCGCATAGGC--------------------------------------------GAAAAATC-GAAAAGTAAA--AACTTCAATCTAGTCGCAAGCAAATTTTATGCAGCAATCTAATTCG---TTTTCGTATGCAATCTA-----TAGGCATATTCTAATCAAA-GCTTC----------------ATGACAGTTTTACATC----CGAGTTTAGTTTATTGCGATATCCGTTCTAAAAGCCAATAAAGAAACATAATTATTGATTAGGTATACAACATAA
CAGGCTTACACTGGTTTGGGCACACAATAGTATATATACAAATATATATATTTACCTTTATATACAGACTAGAGATACAATTACGATTATGTATAAACGCGTGGGCTTCTTAGCTGCATTTCTTCTAAAAAAAAAATAACACTTTAAAATTATTCGCATTATCCAGTTATGCTTTTGTATATCGCACGCATAACAAATAACATTTCGCGAATTAATAGCTTTATTTA------------AATTTGAATTATAACAAAGGCTATGAAAGGCAG------------AATATGTCTGATTGCTGTCGCTCAGCAG--------CTAAAGCAGCCATGCTAGTTAAAGTGTAATATGAACAAATCTATCCATATACATATATCTATATTTACATATATATATATGATATATACACATAAATGAGTTGTTAGTATACAAACTTATACATGCATATATACATATACATATACATTTACATACATATATACAATGGATTCACAGAACAATCTAAAAAGCAAACCAACTTAATTCTAGTCGCAAGCAAGTTTTATGCAGCAATTTAACTCAAATTTTTCATATGCAACTAATTAATTAAGAATACTAAAAGCAAACGCCTCAACACGTATGACTTCGATGACGATTTTAGACCAGTACTAGTTTTTTTAATTTTTGTTTTCATTCGAA----CAATAACAA---------ATTAACTCACAACACACTGTGG
>Pcmt 1378537 1378683|1321 chr3R 1378452 1378774 scaffold_15 1653406 1653747 + 7663|87 264
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CTGCACAATCTGTGGAAGGCGCTGGTCGTTATGCTGCTGTTTGGTTATGTGGTCTACCGATTATGGATATCTTATCATTAGCATTATATCTTCCTAATATTAACAGCAAGCGCATAAAGCTCGAATGCTTCTTCCCATGTTAAACCAAATTATTATTTACATATATATTTAATAAACG
>Pi4KII%26agr%3B 1383363 1384019|1325 chr3R 1383416 1385700 scaffold_15 1369157 1371590 - 56660|0 716
ATGACCATGGA-----GCAGCCCCTGCCGACCCCACCAAAAATCAAATCGAGCAGCCGGTTACTACAGTCTCATCTTTTTCATCATGTATATGCGCTTAGTTGTTGTCTAGTATACTTCCAAA---------TCGTAATCAC--GGAGCACGGAGCCTAGAAATGTATTTTTTGCCAAAAAACTCAAATGGTCATATTCAATAATTAATTACTTGTATTACTAGTTTCTGGGATGACTTACCCATACCATGGTTACATATTTAGGAAATATCTTATGTTTGTCAAGTGCTTGTATAGTCAATTGTTTTCGC--------ATAAAGTATGCAGAAATCAGAA-GGAGATCATTTTAAAGCAC-TCGCTCAAGTGGTT------------TATACATTTCTTTATTATTTGAATGAAATCAT---AATGCATATAGGTGAAAAA----TACAAAGCTCATTTACATTCGTTAGCACTTGAGTTAAGGTCGCC--------------------------CATTGTTATTAGCATTAGCA-----------CATATTTAATGGTTTCCTTTCCTCCAAACTA--------AAACTCAATTT----------ATTTCATTATGT--ACGGTTCGCAACT-------AAATAGTGTGGGAATATATATATATATCAACCAAAATACATATGTAAA----GTATTTAAAAGGCAAGCCTTATAT
TTGGCCGACTACATTCTGAATTCCTGTGTTACCCACC--AAATCATTTGGA----CTGGTTCCGAAGTCATTGTCTACT----------TATGCGATTTCTTGTTATGAGCTATATAGCCAAAAGTTTTTAGTTGTAATCTCCTTCAATTTGGATTTTGTTAAATTTGTTAGTTTTGGAAAACT---GTCGTTAAAATCAATTTCTATTTATTTACATTACATAT----------ATTTACATATTGTACATGTTTATAATTAAGCAAATTATTA----ATCCAACTGTTTGTATAGTCAATTGTTTAAATTGATAAAAATTGAATGAGCAGAAGTCAAAACAGTGTCCATTCCAAAATTCGTTACTCCAGCGCTTTCAATATATATATATACATTAATTACTTATTTATACCTAAACATATCAGTGTGAATTGTTTACAAACCGCTTCAAATCATGTTGTCATTC-TTACTGCTTAGAACAGGGACGCATTGAAGTTATTTATTTCAGCCCCTTGCATTGTGAATATCATCAAAAAACACAATATCAATATCCTAAAGTTTATTTATCCATGATGTATTTACGTTAAGCATAATCTTTATAAACAAGTGTTACTATGTCAACTAGTGGAAAATGAAATACAAATAATTT----ATATATATATATATAATTAAATATGCACATATAAAAAATGTAATCAAATATAATGCCTTGTAT
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-TCTGAGTGTGCAT-ATCGTGTCCTTTAGGCTAGTTTCGGTCAC--TTTGATGTAGCAAATT----------AGATTTGGATGTTGCTGCTAAAGATGAGCAATAAATT
CACTAAATCAACACAACCAACAATTTTAGGCTAGTTTTGGTCGCATTTTGATGTAACAAATTTGTATTTCGAATGTCTGGATGTGGCTGCTGCAGAATAAGCGTAAATT
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A
A
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TGGACTTAGCACATGTATACGTATAAAACCATTAAACAACCCAAAGTATTTAACTG
TCGATTTAATATGTG---ATTGATCAAATTAC-AAACAATTCCAAATATATAGA--
>eIF-5C 1421086 1421806|1352 chr3R 1421142 1422352 scaffold_3 1397136 1398348 - 10674|0 753
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TC--GTTACTGCATGCACTGCCAAATTGTCTAAACAAATAAAAGTCGCTGTACATTCCT-------AACAAAATT
ACAAATAAATTAGTACACCGACAA------CAAACTAATG--------TGTAAATGACTCAGGTGAAATAAATAT
>CG2919 1428949 1429062|1362 chr3R 1429039 1432337 scaffold_17 2404039 2407405 + 101709|0 23
GACTTAGGAAAATATATATATGTA
GACTTAAGAATAGAGATATATACA
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AATTAATAAAAATGAAAAAAATTGAAAAAG
TAATAATAAAACTGAAAAAATTTGAAAAAA
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ATATATATATATATATATATATCAACTGTTGTGCAATTTTACAAAGCTGATTTAGCATTTATATAATGTTATAAACTTTACAAAACAAAAAACTTAATGACAACAAATTGTCGCACAATCAACTTTTGAAATAAAAAACAAACCGTAATATGTATAATTTATGATATTTATAAATTTCGAATATTTGTTTACAAAGCAAAAAAGAAAAATATTGTAATT---AATTTTTGTAGATTTTTA--CAACCATATTTATAAATCCAGAAATATAGTCTATAGTTTTTGGCAGTAGAACGTGAACCTTCCCTTAAAAAAAAAAAAAAAGAAAAAAAACTTAAAGAAATTCAATGTAGTTGTAGATATAAATTGTATAAGAAAAAACGATTGTAACAAATATAAAAT----TGGGTTGAAAGCGTCATAAGTTGAACGCGCCTTAGACTAATTGTATAAAAACAAAAGATATTTAAGCAATAATTTATGGAAA---ATATATATTTAGAATAACAAACATTCGTCTGTTAAC
>CG33201 1442376 1443204|1372 chr3R 1442958 1443402 scaffold_17 2417135 2417727 + 2764|0 351
GCGGCGCACAAAGCTGGAAGTCAC----------------------GAGGAGGTGCTTAGATTAGGTTCCACATAAGAAAAAACCA--GACTGCGCGACAACGGAATGCATT-------------------CCGGCTTTTAACCGCGGACC----------------------TACTTGATTTTGGGTGATTT-GCCTTTTGTGAGTATTAGCTAAATGAAAAATCGCAAAAGAGTGCCAAGC------------------GACAAAATCAACCGACAATT--AAGCCAGTTTCAGGCAT----------------ATATATGTAT---GTAAACACAGAGTCAGTTTGAGG
GAGGCA-ACAGAAATGGATTCCACACAACAACAACAAGAACAACAAGAACAAGAAGACGAAACATGTGGAATATGAGAACGGACAATGGACTCCATGGAGAGCGAGCGTATTAGCTATAAGTCGGTACTACCCGTATATAAACCAAGAACTGTCTAGAACCCCACTCTGTAAACGCCCGATTGCAATTGTTTTTGCCTTTTGCGAGTATTATATAGATGAAAAATCGCAAAAGTTCGCAGATCTAAAGTCGAGAGCATTTAGAAGAAAATGAATAACAATTCAAAGTTAGTCTGAGGAATTATAAATTTTTTCTTTATATTTTTATTTTGGTAATACATAATGTACTTAATG
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TCTCTGCTAGGATATTCTATATGATCATCTGATCCTGTCCAGACGAATGTCTTTAATTTTCCCTTGTTTTCCGCCGATTAAGTCCATTACTACGAACTTGAAAATTTTAAGTATCAAATTAAATCTTGCGTACGTTGCCAATT
CCACAACCGA----------------ACCTGACCGAAGATAACCAAATGCATTTA-----------TGTTGTGCCTTTTGA----AATAAAGCTATGTTATATATAGGAAATGACAAGGCAAAT---------------AATC
>CG31548 1461622 1461756|1393 chr3R 1461517 1462528 scaffold_17 2430876 2431904 + 41341|116 278
TCCCA-CAGGACATGGAACTTTTAGTTTCCCCTGCA----TGGATTCTTCCATGAG---------------TAAATGCATTTAATCCGATTTTTTTAATTGTTATTTTGATTTACCTATTGTTTTGATTGTGTACATAAAACTGAT-----TGCCAT---TTA
CCACAACCAAACATTTA---TTTTGTTCCATTTGAAATAATGATGTCTTATATAGGAAATACGAGTAATTACAAAAGCATTTAAA--------TTTAAATTTAAATCTAAACTGCTCACTAATCAG-TCGCTTAC-TGAGGCTGGCAACGCTGCCAGAAGTTG
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CTTTAACTTAACGACCTAAGCAATTTTGTAAAATAAAAACACTTCAAATTAAACGATTA
TTTTAACTTTACAGTTTAAGTAATTTTGTAAAATAAAAATTCTTTAAATTAAACAAT--
>MTA1-like 1464832 1466150|1396 chr3R 1464894 1467464 scaffold_13 55582 58237 - 86693|0 1494
CCGTCGCCGGCGAGCACATTAACAGCATCAGCAGCATCGGCAACCAAGTTGTTATCGTCTTCAGCAAGTAGGTTCGAGCAGCAACA------TCCTCCATTTCCATACACCATGGATGCACTGCTCAACTAGGAGCACTC----TCTGGTTTGACTGACGGGCTTGCCATGTACATACA-----------CCCGCA-GCATAAGGCACACAGACGTGTGGACAGGCATTCGACTTAGGATCAGGATCAGTGTAG-------TTACAGCATC-ACTGTA----TGAACAGGACAAC-------------AAAACGCGATACCCGATAGCAACCA--CAAACCACTTTATTAGCGCTTAAATAGATGTCTTTTTAACAA---------------GAAATAGTAAGATAGTAAGTGTTAAGGTCTGTAGCAGCAGTAA-CAGAACGCGAGACAA-CAAAATATTTATAAATATTTTATATATATTTTA-AATTTAAA---AAATCTCAACACACCGAATGCAAG------------CTGCACTTTCCTACGAAGGTGCCAGCTGCAACGCACGA-AACTCAAATGTTCGTTAATTCGTTTAG--TACACAACGCATTTGC-AATGGTTTTT------------------------------------TAAATATACATTTGTGAATGTGTGAGTTCTGT---------------------------------CGAACTTTTAAATC---------GCGCTCTAAAGTTCCACT-------TTATTCCTTTATTTCCTAAAC--------------------------CTAGCTAAAA-CCAGATACGTAATTATGAAATTGAATGGCCTCCGTAAGTTTTAAATGTTTTTCTGTCCAGATTTGAAT-------TGTAAGCCGAAAGATATTTGAAA-TTGTTTAAGCGATTTGAATTAGGGAGTGGA----GAAATTTAACATTGTTAATGAATGTGGCGTGCAAAATTAAGTAATTAAAGCCCAATAATTTGAACTGTAACTAAAATCAAGAAGCGTCAACTACAAACAAACTGTACAGTAAATAA-CTAAAATTTAAAAGTTAAATTTCGAATAAAGCGTATTTTCATAATGTATGTAACAAACGACGAAAGTTCGGTCATTCAAAGAGCTATCCCACACACGCCTGCACACATCCCTCACCACCACCACAACCCCCACCCAAGCACAAGCCCAAACCCACATATAGCATATTATTATTTACGC--------ATATAATTAGTACGAGTCTAAGCCGCATATAATAAGTATGTACATCCGTTGTGTATGA-TTACACGGAGATAACAAA---------GAATGTCGTCTAGACTCTAGAGATAGAAGAGCAGCAGCAGGGCAAGCTGAATGCAGCAGAAGCACGCAGAGCATAAAGAGAAAACCAATAATATTAAA--------TGATTATGAA-ACGTTTCGATTGTAAGCCAAC
CCGTCTACGGCAGATACAACAGCATCAGCAGCAAAAACAGCGACAAAGTTGCTGTCATATTCAGCCAACAGATTCGAACAGCAACAGCAGCATCCGCCATTTCCATATACAATGGATGCATTGCTAAACTAGTGTGACCCAGATTCTGTCTT---TTAGTGGCTTGCCATGTACATACATACATACATCCCCTGCATGCATACAAACAAAATACATACAGACCCGCAT---ACATATACATACATCTAGTGTAGGCAACTGTTGCAGCATCCACTATACATATGAAGTTGGAAACCATTTCACTAACAGAAAACCAACAACTGACAGCAACAAGAAAAACCACTTTACTAGCGCTTAAATAGATGTCTTTTTAAAAACAAAACAAAACAAAAGAAATAGTAAGATAATAAGTGTTAAGATCTAAAGCAATAGGAAACACAACGCGAAACAAATCAAATATTTATTCATAATTTACATAATTTTTACAATCTTTATTTAAATCTCAGTATACCGTACACAAAAAATTAACTTCACTGCAATTTTGGACATGTATGAGAAACTCAAGGAATAATAAGTTCATTGTTTCTATATTAGTTTATGTTATGTAAGGCATTTTTTAATAATTCTTAATTATTATTATTTTTATTGCATTGTCTAATTTTCATAAGCATACATTTGTACATGTGCATGGTGTGTACACAATGTATGTCATTTTTATTTTAATTTGTCTAAACTATTGTATTTGCTACCATGCGCTTTCAGGTTCAAAAAAAAAAATCTTTTTTTTTTTTTTTAAATTTTGTTGAGCAAATGTTTGTTGCATACTAGCTAAAAACCAGATACGTAAATTTGACATTCAAAGGCCTCTGTAATTTTGAAATATATTTCATTTAAAATTTGAATATGCAAATAATAGACGAAAGATATTTGAAAATTGATTTAATGCTTTAAGTATAAAAACAAAAATTGGAAACTAACCTTGTTAACAAATGTGACGTGCAAGATTATTTAA---AAAATTAATTATATG--CTGTAACTTAAAGCGAAAA------ACTACCAACAAATTGTACAGTAATTGGGATAATGTTTATAA------CTTCGAATACAATTTATTTTCATAATTTATATA-CAAAT--TGAAAATGAACACTTTCAAAACGATAAAAAATAGACA---ACACACA------------------------------------ACACGAACACAAATATAGCATATTATT---TACGCCTAAAAATACATAAATAATA--AATCAAAACCACATTATATACATTTATAAATGTATTGAGCATAAATGATACC---ATAACAAACAATTTGGCAAATGACAAGTAAAATCTAAAAGTAGATCAGCATTAAAAAAAAGAAACGAA----------------AAAAAATGAAAAAATGAGCAACCACATTTATAAATATATTGATTATAAAGAAATTCTAATTGTAAGCCAAT
>CG31545 1472999 1473139|1401 chr3R 1472332 1473205 scaffold_13 62462 63492 - 14370|829 1022
GTATAAAGTTATATGGATGGATAGACCCATATGTATTTAATTGCGCTTTAGCTGGTAGTGGTGGTCGCACTTAGGTGGATGCGTGTATAGGTGTATGTG----TGCGCTTACCTGTGA-------------------------------------CGTATTAATGGAGTTGCAGCCC------------CCCAC
TCGTATAGTCAAA------GGTAACCCAATATTACTTATCTCTAGTTTCTGCTGTC-----TGCATACATTTACATGTGTGCGTGTGTGTGTGTGTGTGACTTTATGCTTGTGTGTATGTTGATATTTGTGTGTGTTTTGAATGCGTTTTACCTTCATAATGAATGATTTGCGGTCAGTTTGGGCTGTAATTAT
>CG2185 1478555 1478973|1406 chr3R 1478573 1478784 scaffold_45 748921 749107 + 1628|0 213
AATG-AAAATGAAAGTGTCGCAAAGTTTTTTAAACCTGAGTAATTTGCCCAAAGCTTATCGAAGATATTTCATTCAAGTTAAACAAAAAATGCATATGTTTGATCACGGGTGCTAGAGAAATACAGAAA-AATATAACCAATTGCTTGGTATCTAAAAGTTAAATGCGTCCGGAAATTTGATCAAATATTTATGATAAAAATATAAATAAATCT
AACGTAAAACAAATATTGAGCAAATTTTTGAAAAATCAAACGCTTTAACAAATAAATATCACA---ATTTC--TCAAAGAAAAAAAAAAACACACA----------------CAAAACAACAACAAAAACAACATAAACAATTTTTTAAAAGTTATAAAGTAAAAATGAAAAAAAAT------AAAAGAATACGCTAAAAACATATATATATAT
>CG2185 1478555 1478973|1407 chr3R 1478785 1479506 scaffold_13 69175 69900 - 36692|0 202
GCTAGCTGGATGCGGCAATCACGAGGAAAGAGCGACCTTCTTAGTCAGTGTGTACCAAATAGTTTAGGATGCAGTTAG--------TCGAGAGGCATTCCGGCGGGTTACTGA-----AAACTCTAATGATTTGAAAGCAGTGGTTGCT-ATTCTTATTATACCAGTTGTGTTTTCCAACCATTTAGAAGTTTCAATTTAATG
GCCTCAATGAT------AACAGAAACAGAAAACAAATGTCTTAGTCAGTGTGAACCAAATAGTTTAG--TCAAATTAATATCAAGTTCGAGGCATATTCACTTGTATTAGTAATTTATAAACTATATTTAATATGAAGATATTATTGTTGATTGCTTTTACGCTAATTT---------ATTGTATGGAAATTCTGGTTTATTG
>CG2182 1481952 1482074|1409 chr3R 1480892 1482305 scaffold_13 70816 72202 - 66064|1070 1203
AACGCATTAAACCGTTGTAGTTATTCAGTCGGGCGCAGCGATTTTAAAAAATCCGCCCG---CATGCATTCAAAGTACATA----TAATTTTTGTT----TTTGAAATAAATGAAGTATACAAGTTACAACTAT
AATGCATTAAACCGTTGTAGTTATTCAGTCGCGCGTTGCGATTTTTCAAAATCCACGCGGCGCATGCATTCAAAATACATACATATAATTTTTTTTGTTTTTTGAAATAAATGAAGTATAAAAGTTA-------
>Xe7 1491169 1491243|1417 chr3R 1490548 1493337 scaffold_3 4001079 4003906 + 55897|697 771
AACGTATTCACTAGTTTCGTTGTTAGTAGGAGTTCCATTAATAAAGTAAATCAAAGTTGTTCTCCAACTACACTT
CATAATTTTAC--ATTACATAAATGACACAGTTCACAATAAAATATTAAGTTAAAA-------CCATGTACA---
>Rab23 1505776 1506952|1424 chr3R 1505641 1505870 scaffold_3 4017502 4017745 + 396|138 253
AATAAATAATAAATAACCCTAAGCCCATTAATATTCTATTTATGCATGTAATGATC------CATTAATATGTTTACTTAATAAATTATTTTATGTA---------------AATT
AATATGCAAATATTAACTATAGCTACAT---TATTATAACAAGAAATGTTATTACCTAAGCTCATAAATA--TTAAACTAATAAATTATTTTGTATATTTAACAATGCATGTGTTT
>Rab23 1505776 1506952|1425 chr3R 1505944 1506454 scaffold_3 4017811 4018444 + 4828|0 674
ATTTTAACTGCAACTATTTAATACTCCTGTTTATATTTACCATATATAGAACGT-----ATATACAGACCCAATACTCACTTGGCCACACGAGCCATTAGAC---------------------------CAAAAC-------------CATAGCACCCGATCTGCACGGGT------AGATGATGAGTTCTCGAAACCATAGACAATATGCACGAGCACTG------GCAGTTTCTCAAAAATTTCCAC-AATTAGTTATAGAT----ACGAAATCAAATTTGTATGTATGTATTATGCCCGCTTTTCTATAACGGAGACTGAAGCAACTTTGCTTTCATATCGA-------------------------ATATGTTTG-------------------------------------------------------TATATAGGGGTTAGCTCCCTAACCAAGCAGAATTAAAA--GGCTATTTATCACGCTA--------------CCAAGCCCAGATCACAGG------TCCATGTGAAATCCCTTTGCCAATTCGCGTTGGCCAAATGTGCAATTAAACATTCAGCTTTTATAATTATTAACTAATTGCAAGTCATGCCAGAGCGCAATTTGACGCGATTCATGTAGACCAGTGCTGCTCGCATTCTATGCAAA
ATTTTAATAATAATAATTTTATA-TGCAGTCAATTTTGATTCAATTCAAAATTTTGCAAATTTTCAATATCAAAACTTGTTGATCTACAAAATGTTTAAGATAGGATAAAATTTGGTTTCTCTGCGTTACGAAACGCTTTTAGTTGTGTATAAGACCCG-TCTGCAAGGGTATTAACAAATAACAAGCT--------------CAAAATGCATGTGCAATAATTTATGCAACTACTCAAATTTTTAGTCTAATTAGTTATAGATAAGCATGTAACCGACTTTTCAC---TGTATAATGCCCACTTTTCTATAACGGAGACTGATGCAGCATTCAATTTATATATAGATATAATTATTTATCTAATTATATATATGTGTGTGTGTGCGCCTGTAAAATTGTGTATGTATCTATATTAATACAAGTATATATACCCTATATAGAGCTATGTATATTTTCCTACTACAGCTAAGATTGGCTTTTTGGCTCGCTAGCACCGCCCCTCCTCCAACTGCGGGTTTCGAGGGCGCCTTCGTGTGAA--TCCTTCGTCAATTAGCCCTGGCAAAATGTGCAATTAATTGCTTAACTCATTTAATTATTAACCAAGCAAGAGGCATGTCGAAACGCAATT-----------ATGTTGTCTAGTG---------TACTATGCAAA
>Rab23 1505776 1506952|1426 chr3R 1506466 1508131 scaffold_3 4018471 4020275 + 52087|0 681
GGAGTTGTCGGATTAGCTGGTTAGATGGCGGCAGGGGCGACTCGGCTGGCAATTAATATCTGGAGCATATTTAACGCCTAATTATTTTGGAGCCT--AATGATGTTGTGGCCGGGTGGCCAGCCAACCGTTGGATGCAACCAC-----------------------------AGCCATTCACTAGTCGTGCACAGACTCCGC-------------------------GTGATGTGGTTCAG---------------------------ACATGCTTACGGAACAGAAAAAATAATCGGAGG-------CAGCAAATTGGATCTTCTGGATCCCCACGAAGATGAGATACCCTTGCGGTCG-------AACTGAGGAACTAAATATTTGATT----TACACTGCA-------CAACGGAAAGTT--TTCACCATCTTTCGGGCCGGTTCCGATA----TCTCACAAAAATGTATTCATCTTTGGT-----------TTT---------TAAAACTACGATT-----TTTAATATACAGATTTAAATTCTA-------------TGCCGGATATTGT---------------TCTTG---------------------AACACGAAAA---TTATAAGAAACACCCAAATCATTTAAGACA----CCATAGAATAAGCTAACTT
GGCAGCTAAGGGTAAG--GGGTACGCGGGTATCTGTGCAGCTCTG--GCCAATTAATAACTGGAGCATATTTAACGCTTTATTATTTTAGAGCCCCAAATCAAGTTGTAGCCATGTGACCAGCCAAGCGTTGGATGCAGCCACAGCCACAGCCTCAACCAAGTCGCAGTCAGAGCCATTCACTAGTCGTGCACAGACTCCGCAATGTTGGCAGTTATTGCATGATATGTGGAGTGGAGCAGGGGAGAGATGGGAATCGGGGGGTGTGAACAGATAAAAACAAAAAAAAACATAAGCACACGAATAGTTCAGTGAACAAAAACTTAGGCAT---AACGAAGTTTAAATACCCTTGCAGTCGGCAACATAAATAAATTAAAATATTTCTGATTGTGGTCCACTCTAACTGCCTAAACTCTGAGTTAATTGACTAATATTTCAGTTAATCCTTATAGTATCAGCAGACAATTTTGGTCCACTTTGATGGCCTTAAATGTTTGTTAATGAATAAAAAGTCAATTATATATTAAATATATA---TTAAATCATAAATAACTAATAATTCACGAATATTGTCAGGAATTAGATATATTTTGGTACAATTTGACAGAAAGTAAAACACAAAACCCTTTATAAGACACAAACCAAGAATTTAAGATGAAATCTATTAAATAAGTCAACTT
>cas 1538664 1539272|1460 chr3R 1538662 1541232 scaffold_3 4057568 4060271 + 82626|2 764
GAAGG------------------------------------------ATGCGTGTCCTTAG-GGTA----TTTTGCCAGCTACTT---AGTTTGACCGA--CGGAC-----GTTGGACATTGTACATACGC---GCTTTAAGCAGGTTTAGGTGGGTTTTTTTGTGGGTTCAGGCA-------GATCCA--GGACAAGGCATCCTT----------------------------CCCTCCACAAAAACCAACTCAGCCACACTTTGAGAACCTAGAAGTCCCCTATACAAAGTGTAGCTGAATTGGCTTTTGCCAAACATTTTCCCCTTTAGCTTAGATTCTCTCAGTGCCACATTAATTTTTAAAATTTTCAGCCATTTT-----AAATAAAAAGGAAGAACTTTCTGAATTTAAGTTTGACT-AAACTGTGATGTTTTCATTAGAGTAGCCTCTTT--TAATTGATAGAGCGAGTGCAGGCTA------------TGCAGGATATGCAGGACTTAGGAGACTTGGATTGTCAATAACATAGCGTCTAAGCATTACA-----------TTGTATGTGATATACTAATAAA-----------TAATGGCTAATTGT--------TTTTGCTTTATAATTTAAGGGAATAATA-TTATAATTCTAA----TTATAAACTTTAGTAAAATCAGCATTCTTCTATAATAAATAAGTCAACATTACCTGAA--TAAATTTTATTATGCCTCAGAGCTTATTATTTAA
ATGGGAACGTCCTAGCGCTCAACATATGCCAATAGATGTATATATATATGTGTGTGTATAGAGGTAGAGGTAGTCGTAGTTATGTAGAAGACTGACTGATTCGGACGTTTTGTTAGACAGCGGCCAGGCATCAGGCTCTAAGCAGGTTT-------TCGTTTAAGGGGTACCGGTGAAATGTTGATGCAATGGCCAGGACGTTCCTTTGCCATTTTTTTTTTTTTTAGCCCATATCTTCTGCAAAAGCCAACTCAGCCACATTTTGTTGGCTCAAAAG---CCTTGACAAAATGTTGCTGAATTCGCTTTTG-TATATATTTGTTTATT--------ATTTAATTAAAGCC-TTTTTTTATCCAAAAATTTCAGCAATTCGAACAAAAACAAAAAAATAAAACT---TGAATTT-AGTTTAACTAAAACTGTGATGTTTTCCTTAGCTTAACTAATTTGCTTGTCCTTAAAATGAATGTACAAAAAATATTTGTAATTTTAGTTTAAGCGGGAATTAGGAGCTTTTCTCTG-------AATGGGGTTAAATCAATACAAAAATAAAAATTTCTTTGTGATATGTTAATGAAAATTCTTGTTTTAATTTCGGATTATCCTATGAATTTTGTTTTAAGAAATATATGTTTAATATTTAAAAATCGAAAAGTTCACAATTGTTTTTAAA------ATTTATTTATTATATATTTATCA----TAGCTGAAGCGAAGTTTTCCTTTTCGTC--CACTGATTATCTAA
>CG2100 1560429 1560483|1473 chr3R 1558969 1562284 scaffold_3 4079236 4082715 + 84927|1616 1670
TATTGATTACATTTAGATGTAATCGATGTAAATAAATATATGGGTTTCCCTTGAA
TACTATTTCTTATTAACTTTTTTTTATGATAAAA---------------------
>CG2097 1563900 1564039|1475 chr3R 1563746 1570166 scaffold_3 3715350 3721902 - 226941|158 308
TTGCAGTTTAA------TTGTTTTGTTT-GCTCATACACAT----TTTTAAATTACTTAATAAGATAAGGTCTATAATTTTATAAACTCACTGTTCTAGGCGATAATACATAAAACCAAGGTCTTGACCGCACCCACATACATTATAAAGG
CCTTAGTTTAGTTAAGTTTGTTTTGTTTAGCTTATACATTCGGTGTTTTAGTAAACCCGCTAAAAT------TAAAATTTTA--------------------ATCATGGCTGCAACTCGGCTTTCAATTGAACCTGTTTGAAC----ACGG
>CG2095 1580650 1580879|1480 chr3R 1580649 1584566 scaffold_3 3725286 3729297 - 177855|1 267
TTAGCGTGGCAGGCGGCGGGTAAAACCAA-------TTTTAA--------------TATCCATACTTTTGTTTACATCGGCTGCAG--------GTGTAAGTGCAAATTGTATGTTAGTGTTAAGCTCAAAATAATTGCGAATGTTCTGAACATGATTGGCGAGCACTTAGTGTTG-----TAGCCGTTTGTAAAGATACATATTCTAAAGATCATTAACAGTACTTCA--ATGGCCTATACACAAT-AAATGAGAATTCAACAACG
--AAAGATACAAGCAAGAGGAATAGCAAGATATATTTTTTAAATAATTGCGCCTTGTATGCCCACTCAAACAGACATCAATAATAGTTTTTAATGTGTAAGTGCAAAGAGTTTGGTAGTGTTAAGCCCAAATTGATTATAAATGTTTTGAACATG-TTGGCATGCACTTGGTGTTGCGATATAGTCCTTTATATACGT--GTATTCTAAAGTTCGTGAACATGATTGTAATATGGCTTATACACAATAAAATGAAAATGTAACAACG
>CG2082 1584992 1585859|1481 chr3R 1584989 1586149 scaffold_3 3729936 3731080 - 16443|3 987
ATTAGACGAGACCACGCCACGCCCACG-----------------------TTGGTAG----ATTAAGCTTGAT----TGCGTATTTA----AACTACTTAAACTGGTAAAATACCTTTAG-----TCTGAGCAAAACGT--ATATGTGTGAACCCAGA-GCCAAACAATCATCCCAAGTGTAACCGCTTTTCCGCGGATTTTAGGCCAAATTCTAATTAGTAATCGCTTAAAGTTTTTAAAGAGTAGCAAACCCAACAACAACACATTGACCATCCGAATCCGAATGGACGGAAATAAGCCGAAAACTGTATTTACACTGTGTACTTAGGATTAGTCTTATGTATGTAACCCCAAGAAGCCCACCTAAGAATCTGAAACAATGTTCAAACATCCATATCTAAATCTTCAACTCGACCGAACTTATCACAA-------------------CTGCTAAACACGAAC---TATAAAACGCAATCTATTTAATACCTCCGAATAGTAAACTGTACCTAAACACGTAGAAACTAGAATGGAAAAATCCCAAATGTTACTCCTCT----ACTCTGTCACCCTTCAACTTTCTAAACTTTCTATAGTGAACAGTCTC-AAATGTTGCTATTTTAGTAAATAAAAGAAAAACAGAAAAAATCATATACAAAGTTCGAACAGTCTAAGTTGAGACCAGC---------------------------TTTGCGAAA-----GATGCACACGGATTATATATACTCGTATGTATGTGTAAACAATCAAAACCAAAAGCAATTCGAAAAC---CAAAGAATATTAATTGTCATGTAGGTGTCATGCGTTTTTCAAAGCGAGTATTAAAAATTGTTTTATCGCATTGGCTTTAGCTT--AACATTTAGTGAAGACATTTAAGTCGA-------CCAAGCACTCAGATAAGTAGATGCAACTACACCGTTACACAATAAAGTTAAA---TGAAAACGCC
GACAAACTACACAACGTTACACGCAAGGGCAGGCGCAAAATGTTCAGCTTTGAGTAGTGTAACTAAGTTAAACACAACGCATATTTAAATTAATTACGTAACTTAGTAACAAAGTCGTAAGAAACTGCGACGAAAATGTTAAAATTTGTAAAACTAGAGGCCAAACAATCATTCATGATGCAATCGTATT------ATTTTTTAACCAAAT---------GAATAACATGAA--TTTTAAAG------GAACTTTTTAATTAGTTATTG---------TTTCGAATATCGAGTAA-----CAAAAACT--------------------------------TATATGTAATTTCCAACGACCCACCTGTTGAACCAAAAGAA-----ATACGATCATATCTCAAGCTTCAA-TTGTTCGAACTTTTCGACAGACTTGTCATTAACCAATTCTTATACACACGACCATGTACAAGCAATCATCTATGTAATACCTCCGATTAGT--ACTGTACCTAAGCAATTGAAAACTCAAGTGAAAAAATGCC--GTATCACTCCCATTTTAACCTTGTTTCCAGTATATTTTCTACACATGTATTTTCAAACAGTAGAGAAATGCTGT--TTTTAATAACT---------------AAAATTATATACAATTGTTATATAGCGTAAGTTCAAAGCACCACAGCATTAAGCTGAATATTTAAAGTATTTATGAAACCAATCAGGCACACAAAATATAAATAT---------AATGTCGTTAATCAAATTATAAAGCAATAAAGAAATGCACCAAAAATTGTAGTAGCTGTGCG---CTTAAGAGTTTTTCGTAGTA-----CAACGCTTGCGATATTGGCTT---TTTAGTGTGAAGCAAATGCTTAAAACATCAATTTCAAAAATAATCCAAGCACTCAA--CAATAGCTGTAGC--CACCATTCAACAATAAAGTTTAAATTTGAAATCAAA
>CG2082 1586691 1586946|1482 chr3R 1586341 1587445 scaffold_3 3731081 3732138 - 28912|363 626
TTTTCCCCTCAAGAATTGGACCCAAGCCCCTGTGCAACCAAAATTGGAAAGAAAATATTTATCCACAATCAGCTTCATTGCATATTACATATTTGTCAACTTGTTGTCCCTACTTATGTA-TTTGTTTTGTGCACGACCTTAAGTTTATAGTAGATAGTAGCCATAAATTGTAGT-TCGCTACTGAATTTA----CGCCTCATGCAAATGTTCTGCTTTCCTAAACACTGCTTCCAAAACTACTGCCGGTAAATCAC--CGAAT
TCCTCCAGCAAAGAAATCGGCC------------------AAAATGAAAATACAA---------AAAATTAACTT-------------ATATTTAGTCCACTATTATATTTATTTGCATGCTTTGTAGTTTGCATGGCTTTAGTTTT---GTAGCTGTCAGCTTAATGTTGTAGCGTTGCCACCAAGTTAAATATTTTCTAATGCAAACGTTCTGCTTACTTA--CACTGCACAACAAACAACA------CAATCATAACAAAT
>CG2051 1613922 1613929|1509 chr3R 1611927 1614750 scaffold_3 3763630 3766442 - 116436|2051 2058
GTTTTCTA
GT------
>CG2046 1619030 1619119|1512 chr3R 1617690 1620213 scaffold_3 3769014 3771549 - 73831|1346 1464
AACTACTT----TTGGCTGTGCTCAACTTCCTAGTTTTAATGCTTGTAAAAATGATACGGTTGCGGAATAAAAATCGAAC-------------------------TACTTAAGTACATC
AAATAGTTAACATAAGCTAAGGTGGCTGTTTATATTTTAATT-------AAAGGTTGCGGTTGCAAGAAAAAAACCACACAATTCATTTGTAATGAAATTTAACTTATTTTAATACTTC
>Hpr1 1644516 1644612|1535 chr3R 1643232 1647167 scaffold_20 1145262 1149144 + 134188|1356 1457
CGACGATGAGGTGCTCTCTGATTAGCATCATCCCCATGCCGATCCCACCCTAGTTATTATAATTTCGTTTCAA-----TCATAAAACTTCTTTATCACAAGT
CGATGTGGAAATACTGTCCGACTAGCACAAAGAAAA----------GCGTTATTTACTTTAATGCTGTTATAATATATTCATCAAA-TCCTTTATCACATGT
>disp 1675416 1676242|1562 chr3R 1675176 1675419 scaffold_55 15566 15806 + -1876|254 257
CAAA
CCCG
>disp 1675416 1676242|1563 chr3R 1675420 1677641 scaffold_22 1776874 1779223 + 71462|0 1072
GTTAGTTACTATTGCCGGACAACGCGTTGTTGTTGCCAAGAAGAATCAGGCAACTGCA-TTTTTATACAGGGTACGGCGGCTCTCAAGCCTGCCCGAGATAC-----ATTTATATATACATATA----------------------------------------------------------CACGCCGTGTGTCGGCATATTTAGTT--------------TTAAAATATGCTGGCGGTGGCATATGTACGTGTTGTGCGAGTTCTACA-----TTGATATACTCT------------AGATATATGTGTAATTGTACTTGGTAGGATTAGGCAAA-------------------GCTAT------------------------TTTCAAAAGACTCCAGGCTATTGCAATATGCTTTTATGCTTTTTTTTTATCTTGTGACATTTCACATTCGATGCTCCAGCCAAGTGAAAACGA-TTTGTAAACTGAAGCAATTAGCGGGAGGTACTGGGTACTCTGGGTACTGGGTCTTTGTCGGTAGGACTGTACGATGACGGTATTATTAGTTCTTAGCCAAACGTTT--CAAC------------------------GCTGTTTATGTTCTTATCTGTAATCAAAACTATTTGTACTCTGGTTTTATATTAGGTGTTAAGTTGGGCCGCAT-TGTTGGCGCCAGCA-------------------AGATGTAGTTACTTTACACGATAGTTATATGC-GCAGAG----------------------------------------ATATGTGTTGTCTATCC----TAGTTGTATGCGTTCAAAACATAAG--AACATAC-ACACGCTCACGTTTGTAATAACCATGTAACTGTGATACAGAAGGTGAGAATCTTAATG-----AAATTGGTGTTTATACAGACATAGTGTTATATCCCTAAACA-------ATGACGTATTGTAATTACCTGCAACAAAATGGCCCTGTACTTCCTTCATTGAACTT-----ATGTGTTGAAGTGATTTAATAAATGTTACTTGTAAAACCACTA
GC---TTCTTATTGCCTCA---------------GCGAAGGAGCTGCAAGCATATGCATTTTTTATACAAAGGGCAACGG--AACGAAGCTGTCCGACATATATACAATTAATATGTATATGTATTTAGCACACATTTCGCCAATGTAAGTGTACGTGTGAAGCTGTGTTGATATATCACAGCAAGTCGTATGTGCAACTACTTTGCTAGAGTTAAGCGTGATTCAAAGAGGCAAGCGGTT---TGCGTAAATGTTTGACACATTTTATACTTTGCTAATATAATATTCTAGTAGGCGGAGATTCGCAATTAATTGTAAT---TATGCTTGAGCAAACATTTGCGCCAACTATTTGGCTATTTGATTTACTATTTAGTGTGCTATTTCAAAAAGACTTTAAACAGTTGCAATGCGATT------TTTACTTTGTTATTGTAACGTTTGGCGCTC---GCTCGAGCCAAGTGAGCTCAATTTTGTAAACTGAAGCAATTGGCGGAAGGTACTGGGTAC------------GTCCATAATTGTACGACTGCATGATGTCGGTATTATTAGTTTTAAGTAAAGTATTGAACAACAGAGCGCGTCCGCGTAATTGTTTAGGTATTTACGTATTTAACTGTAATCAAAACTATTTATACTCTGAATTTTTATTAGCTGTTAAAATGGGCCAACTATGTTGATGCCGGCATTATAGTATGTATGCAGGTATATGTAGTTACCATATATGGTAGTTATATACAGCAGAAACACAAAAACATACATATATATTATGTACATTGGTGTACTATATGTGTTGTCTATCCTACTTAGTTGTAAATGTTTAAAACACACAGCAACACACAACACACTCGCGTTTGTAATAACCATGTAACTGTGATACAGAAGGTGACAA-ATTGATAAATACAAATCTATGTTTATACAGAC--AATGAGAGCTAGTTAAACAAAAAATCATGACGTATTGTACTTAACTGTAACTGAA-AAACTTGTACTTCCTTCATTGAACTTATTAAATGTGTTGAAGTGATTTAATAAATGTTACTTGTAAAACAATTA
>CG2017 1683799 1684033|1567 chr3R 1682298 1685244 scaffold_21 2210471 2213456 + 127591|1535 1825
-GAAGCGG-------------GCCAGATGGATAGTTCCAATGACATATCTATATATCTCAA--------ACAAAGAT-GACATGTACATATACTT---AATTAGCAATTAGAGGGAGGCGTTA------------------------------AATCTTAGGCAGATCTTCTGTACACTTAGTTTCGGGTTCTGTGATTTTTCGTTTAAGCTCGGCTCACAATCGGATGTTGTGAGTAATC-CTTCTCAATTAACCTTATTTCATTAAAATCCACCCCAAAATGCATACAA
CGACGCTGCACGTGGCCAGTGGACAGCTTAATAATTATTAAAGCTTATCAATATATCTCAATACGGATAACATATGTAGACATGTACATATTATTTACGACTAGAGTTTAGAGGTATCGATTAGCGTATGCAAAATATTGCGTATACGCCGCGAACTTGTAGCAGATCTTCTTTACATTTAGTTTCGAGTTCTGTGATTTTTATTTTAAGCTCAACTCCT--CCAGTTTCTAAACACAGTTACGTTACGGATAAC--TGATTCATTAGA-------------------CAA
>CG11373 1786045 1786133|1702 chr3R 1784814 1786232 scaffold_21 1839002 1840471 - 8921|1452 1557
GTCCCCAAATTGGATCCACGTTTTAAATCCTGATATTCTTTTTTTA------TAAAATGTACGGATT-----------CTTTGACGTCTAAAGCGCTGAATAAAGC
AAAACCAGACTCGTTTC--TTTTTATATGATAAAGCTTGTTGCTTAAGATACTATTAAATACGAATTGCCGTTAAAACTTGTGTCCTTTACTCTACTGAATAAAGC
>CG11373 1786185 1786203|1702 chr3R 1784814 1786232 scaffold_21 1839002 1840471 - 8921|1609 1627
TAATATCTAAAAATATTCG
CA----CTAAATACATTC-
>Pbprp3 1797870 1798019|1718 chr3R 1798003 1798356 scaffold_21 1855621 1855985 - 18054|0 16
ACACCTGGGCCACCTTT
--AGCTGCGCTGCATTT
>Os-E 1801897 1801986|1724 chr3R 1801702 1802272 scaffold_21 1855383 1855985 - 10063|220 318
AGCTTTGAGAATTAAAGATATTTGAAAACATATATTTTTGGAACTGGTGATATTATTATAGA---------TATTAAAATAAATAAATGGTATACGGAA
GTTTTTTGGAACTAA----ATTTTGTATTTTCCATTCTTAGCACTACT--TTTTACCATAAAGCTGCGCTGCATTTGGCTTAATAACTATTTGGGACTA
>Rm62 1826143 1826884|1756 chr3R 1826082 1829092 scaffold_21 1888918 1892064 - 58909|61 865
ATCGCGGACAATTAGATGAGCAGTAAAAGAAGCTATAGGAACAGGAGATTTCAGTAGCTAAACTAAACCG---CACTAGGTCCTAAGTTAAATTAAGTTCATAGCT-TAAGTTAAGATTTCGTACTACTTTCACCAAACCGCTGACGGTTATTTTTAGACTTAAATTCAGACTCCCTGATTAATGAAACACTACAAAATGCGAG-------------------------CTATTTGAACATAGCGAATTTATGTTTA-AATGATTTGTAAGTTA-TTTGACGCTGGCCGCGAGGTCGGTACAACACAATCCAATTGAGAACATCAAAAACACTTTACT--TAAACGCAAAAACCAATTTTCAAATATCATGTGATAATTTCTTAATTTAACGCAACGTATCAC-TAAACTAAAAGCAAAGGAAATCGTAGCGCGAGGAGTACGTTGATGTAGTGGAGGAAAAGGAGGAAGTAAGGATCATTCCCGTC---------TGTCCCGTTTTGATGACAATGAACAAAGGCTGACCTGACGAGCGACCTTTGTTTGATAAATAAATTCTTCAAATTACTTTTGGAAAATTAACTTTTGGATACCTTTTATGGCTCAACACGAGAACAAGAATGTGTAAAGCAAACAAAGCAAACGGGAAATCACATTAACTACTGACACTAAATACAAAAGAAAAACAAACTGTATGTACAAGATGAGAAGTTCTC-------------TTTCAATTTAATTTTTCGGAAAAAAATAAAGTTTGTGTATACCTATT-------ACAACCTAAACCAACAA
GCTAAACACAGT-----------GGAAACTAACTATAGTATCAGTTGATTTGATTAGCAAATGAGAAGCAGCTCCCTAGAACATAAGATTAATTTAAGTAATAGCTACAAATTAAGTTTTCGTAC------AACCAAACTACTCGTA-----TCATCGGTTTGTACCCGGA----CGAGCAAATAACCCACAACAAGAAGAGGGGTTAGATGTGAGCCGAAGCAAACAACTTCTTCAACATAGC-ATTTTATGTTAGCAAACACTTGTAAATTATTTTGACGCTTGCTCCAC-----ACACAACACACAACCCCCCCCCACACTACACTCACTCCCCTGCGAAATGGTAAACACAATATTATAATATCATGTGATAACTT-TTAATTTAATACAATATATCACTTTAAACAACAACAACTTAAA-CGAAGCGCG-------------TCGTGTGTAAGGCAAAGAGCA---AAGGATCATTCCCGTCTCGTTCCCTTCTCTTATTTTGATGATGATGACCAGGAGCAGA------GGGC-----------------TCGGCTCCTCG------TGATCGTCAATTAACTTTTGGATACCTTTTACGGCACAATAAG---------------------AACTAAACAAACAAAAAAT--------------ACAATACAAATGAAAAAGTATGCAATTGTATGTACAAGGAGAGAAATTCTCGCAATTAAAAATGTTTTAATTT-TTCTTTTGGAAAATAAATATGTGTGTGTGAACCTACTTACTACAACAGCCAAAAGCAACAG
>Gasp 1918721 1919272|1869 chr3R 1918708 1919555 scaffold_21 1985974 1986871 - 20813|13 602
ACATAACATCTAC-AACAAGAACCTACAACTTTAACAA-CAATAACTAAACAACA---ACAGCAACTATAACTACAAAACAATACAACAAGATCA-----ATCAACTCAGATACCCCGTTCCCATTCTGCCAAAAATCCCCCACATCACAAATCAGATTAGAATCAAAAGATAGAACCTCAAACCGAAATTCGTACCACATCAAGAACTATTTTCCTGCCATTTTCGAACTTCTCAGTTGACTCCTGTACTGTGCTTCTAATTTATGAATCTATAAATCTCTCTCGTTTCGTCTGAGTCAAACATTGCTGTCTCTTCATGTTTC-CGTTTTCAACAAGTATAAA-ACACATCGAAATTGCCACGCAAATTCAGGCTCGAAGAACTAACACAAAATTTTGT------------------AAACAAAA-TATAGAGAACATCGAGGAATGAAAGAA----ATCGTTCAATATGAAGCGTAAAATTTAGAGATTTGTACATTTAAGTGATCCTTGTTTATAAGATTATAATTTTATTTTATACATAAAAACGAAAAACA---ACAAAAATATATAAAGAAAAAAACAATACAA
ACATAACAACAACTAATAAAAAAAAAAAAAAAAAACAATTAAAAAATGAAAAAGAAATACTATAACAAGAACAAAAAGAAACTACAACAACTACAACAATATCAATTCAACTCCTTGGCCCCCAACTTTCC--TACTCTCACATATCACAAAGTCACCTCTAACAAATTGATAA------AAAACAAAAATTGAATGAAAAGAAAAGAAATACTC----------AAAATCAATCTATTTTCTACTATATATCACATC--AGTTTTCATTCTAT-----CCTTTCGTTATTTTTTTGTTTAAC--------CTATTCATGAGTCAAATTGTTGATAGATATACATATATATGTTCGGTGTCTTCCAAATT----TTTGAAAATCTTG-AGAACATGTTGTGTAATGAAATGTGCGAAAAAACAAAAGTGTAAACAACATCGAGGAGAGAGAGAAAAATATCTTTCAAATTGAAGAGTAAAATTGAGAGATTTGTACATTTAAGTGATCTTTGTTTATAAGCTTATAATTTTATTTTATACATAAAAACAAAAAATATACACAAAAAACTAAAAAACAAAAAACCA-ACAA
>Obp83g 1937392 1937464|1895 chr3R 1937209 1937446 scaffold_4 623671 623915 - -746|197 258
CACTGTACGCCTTACA-------GGATAATGTAGAAATAAACATTTTTAGTTTTCAGATATA
CGTTGTCCATCTGGCATCCCGTCGAGCAATCGAG-TATCAGCATTTGAGTGTTGCATTAATT
>Obp83g 1937392 1937464|1896 chr3R 1937447 1938076 scaffold_21 2010375 2011046 - 20928|0 17
CCTGAATGTGATATAATA
AATTAATTTCATGTGATA
>Osi4 2044040 2044254|2001 chr3R 2043717 2044349 scaffold_21 2131641 2132405 - 7498|357 683
GGCGAGAAT------------------TAGCCAATTAG-------------------CAGCTACCAAAGACCCTT---------GGGAGGAGGAGGTT-----------------------------------GCTCTGCTGCCATAGGACC--CAAAT---AGCGGACACGTTGCATCGGAAAAACAGCCTAGCGA------------GCTGGCGTATTGTTATT-------ATTTATTGAATTGTATTTAACTTAGTT-----AAACCTGGCGCACACATTTAGTCTAGTTCT-TGTCTCTGTAATTAGCAGTCGAAG-TGCTAC
AGTGGGCAAGGGATTTTCGGAGTCCAATAGCTAATTCGTGCAGCTTTGCAGTCCCTGCCGCTACCAAAGACCGTTCCAGTGCGAAGAAGGAGGAGGCGAGAAGCTGGAGGAGAGAAGGAGAAGGGAGGGAGAGGTACTGCTGCCATATGAACATCTGATGGGAGGAGGAACGAGGCGTGCTCTAAGCTGCTTATTAACATAATTAACTTATTTATTTATTGCTATTTATGTTTATTTATTGAATTGAATTGTTCTTAGTTTAGAGAGACCTAACGCACACATTTAGCCTAGTGAAATATGCCTGAAATTAGCAAGAGAAAATGCTAC
>CG1249 2170719 2171000|2145 chr3R 2170202 2170733 scaffold_55 5064 5593 - 19005|521 535
ATCAATTCTCCGAAA
ACTAGTTCTTC---A
>CG1249 2170719 2171000|2146 chr3R 2170928 2173004 scaffold_55 5614 7676 - 60094|0 75
TCTACCATAGCGATAGCGTACAGCAACCAATATCCATCAACTTCAGTTAATAAATCCG---TAAATCAACCAAATA
-------------------ACGGCAACAGAAACTCATAATAATAAAACAATAAAACCAATTCATATTAAACAAACA
>CG31367 2187386 2187506|2165 chr3R 2186554 2189273 scaffold_15 2077943 2080815 - 70657|1027 1169
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AGCCGCAAGCATACTATTCATAACTAACAACTCAAACCCAATATAAGTTAAGGATTGAAATTATGTAGCAACTAAAAAAAAAAATTTTAAACCTTTCAAGTGCATGCTGAAATGTACTATACA-ATAAACGCAAATTGAAAAG
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AAATGTACCAGAATAATAAAATTTAGCAGGG---ATCAAACTTTGA
TGACCTTAAAAAAAAAGTATGTTTTACAATGTTTATTAAATTTCGA
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AGCTCTGGCCAAAACTTGCCA------ACCCAGTGATAAACA-----GAATCTACAAGTC----TACCAACA------GGGGACACACTCACAATTAAA----------TATATATCTA-GACATATATATATATTTCTAACTTAAGTATTTA---------TAAATAGTTTATATCACT-CATTTTACATACACATTGTAATTT
>CG1024 2203969 2204191|2178 chr3R 2204172 2206019 scaffold_15 2087826 2089591 - 57111|0 19
GTATAGTCTAGTTAAAGTTA
T----ATCTAGTTAGTCTTA
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--------------------AACGACTCTCTGTTCGATTAGTAG---CGTCTTAATGTTAATAGTATTAAGTTGAAAACGTGCATACTTTGTATATAGCTTATAAATACACAA--AACGTAATAGTTTAAAGTTAAATTAGTTACCATACAAAACGCGCATCACATGAACGACTCATATACACATATACGTACTATATACATTGTACAAACAAAATGGAAAACTCGCACACATCTGCACACTCACACACACATATACATATAAATACATATACATAAATGTATACACTTAGCGAAATTCGATTAAAACAAACTCTGCTAAAAGTTTAGTCCAATAACTGCTGCATTGCTGACAAGTTTCTGTGCATTACTCAATACTATAAATTAATAAATAT-ATTTAAATAACATATACATATAGTTATCGTATACATTAAAAAAGTTTGTATTTGTACAAAAGATTATTTTATTTTTC
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>dpr11 2356021 2357389|2338 chr3R 2356871 2357419 scaffold_35 986466 987017 + 6159|0 574
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CCGATTTGACTAAGGCCAAAAATATGCTTGTATGTCTCCTGAAAATTTTG---TCGATTTCGATCGATAAAATTTCTCGTTAGCTTTTCTGGGGCAGCCACACAAAATGCA
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CTTT---GATTGATTTTGTCTTACAATTTTAATG
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AAATCGTT-----------TATTGAAATTCAG
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------ACTTGACCTGATTTAAATAGTGCTCCTGGT-------TATGACTATAAAACTATATGTGAT-T
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AAT---GTTGAATTCTTGTTTTTATTCGTATATAGAATCGTTGTTCATATTACA---GTACATTTATTTATTGACCTCGACAATAAAATTAATGCATACATGAA----------
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TTCTAGTAGAGCGAAGTTATCGCACGAGTGTAAATTAACTGCAATGTCATCCATGTAGTCCAATTATCTGACACCCCCCCCCCCCCCCCATCCACCCCCTCCCTCAAACTCCATTGTCGTAGCACATATCTGTAAATATGTTCGTATGACTATCCTCACACCATATGTGTATGTATGTATGTAAGTAGGTAGAGTGATAAATGAAATATCCATTAATATATATATATATATATGTATATAGTTATGGCTCGCTTCAGTATCTTTGAGACGGGTAAGTCGGTGCAGATTTCATTAAAATAAACATTTGGCTAAAAGCCAGCACGCGATAAAAGTAAGTTGTCTCCGTTCAAAAAAGAAAAAATTAAAAAATCAAAACAAAAAAATAAAGTAAATTAAAATTGTATATAGCTAGTAAAAATTAAAAATACTTTATCGTAAATTTC-CACCAGTCCTAATCAAAAAAAAAAATAATTAATTCAGCCTAAGCATAAGCATAAAATATATAAATTCCATCTAAAAAGAAATCAAAAATTAAATAAAAATTTGCACCAATTGTGTTTTGTAAATATTCGAATGTAGCTCAAATCGTGTGTGAACATTTTCAATATACATATATGTATGAAAAGATATTCCA
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AATATAAGTATGTGTATAAGTATACTTATGCATACATATTGCTTAT-TCAAGCAAATGCAACACCTTCCGTCTCTTTTCTTTAAGATCAAACTAAGAAACTTATGAACAACATAAA
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A
A
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CTTAGATATATATAAATATTCTCTTTTTTTTTTGTGAGCTTTATCTGTCTGTTAAGGTAGTCTAATAAGTAATCGTCCCTGGTAAAGAAAATGCCGACGCCGACGCAAAA----GGCTCAACTCAGTGA-AACAATTAAGAAAAGTCAGAAATTTAGATGC--TTCTACTACTTAGTAACTTGA-A
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ACTTGGGCAGGGCA---TCTGGAGTTCGCTTATGATAACTT-------CTTTTGAAGCCGTTGCCATTGGA--CGTCCAGTATGATAAACCTCTTTCTCTAAGCAGTATTCGAAAAGCTATTAGTTT-TAAGTGTAGCATAAATTTTAGGCCTAAGTCCGCACAGACGAACAAATTTGAAAAACAAAAATAAAAACAAAAAACAATTCAAATTGAACG----TAATATTTGCAATAATTTCAAAGTGATTTCT-ATTAAAATTA-GTTTTCGT-------------------------ATTATGATTAATTCTAAGTCGAGTGTCCCCGGGGATAATTCGCATTCTCAAATCTGTACTTAAAACCTAACAGTCATACATACTATGTACATATGTATGTGTATGTATATGTATGCATAGCTACCCATATAAGGTTTTGTTTAGTTTGTATATAGCAGAGCGCCCCACTCTCATATGGCGCCTTATTATGTTTGTGTTTCATTTTAAATATAAATTGTTTTGCTCGAGAGCTACTTAACAAACTGTGAGCCGAAATGTTCAGT----TTTATTTTAA---TATAGATTTGTGTTGTTGAAAGTGCTTTAGCAGCTTGGCAAATGCTTTACTAATTTTATTCAAAATTAATACATACTAAATACAAACTCGTTTTATTTGCACCCCCCAATCCCCACAATAATGAACAAATTCGGAGGATAAACAGGAAACTTGTGGCCCAATTGCAACTATTTAGCACAA---TTTCTATAGCAAAGCCACTGAGAATTATTTATGGCTGGTGCCCGACACCAGATGCTCTCTCAATGTTA-TTATTTCGAGTCGAATCAAGAACTTTTGTGTCTGTAAATCAAAATCCTATTACAAATACAAATACATATTGTCTCTTAGCGTAAGTGTGCATTAAAATTCAAAATATTGAGCAATGCGCAAATTGTTAAAATCTAAAATTAACACAAAATTTAAGAAAATTAAAATAATAAAAACACACAACAACAAAAACATTAAAACAAAACCTATACGTAAATTTAATGTAATTATTTATGCTGTACTTTTTGCTAAGCTAAGGTTAGTGCATTCTAGAACCTATCGGTAGTCTATGTGAACCTAGCTCCTAAGCCTAAATTATATGTATCGAATTAGCAAGACAAATTTTAGTAAAAAGTAAAATTACAAAAAAAACCAGCGCATTAAGAAACAAAAACAAAAAAAAAAAAACAACAAAACGAAATATGAAAACAAAATAATAGCAAGCAAACGCAAATAAGAAAAAAAAAATACTTAGCACAAATTAATTAATGAATTGTT------------------TTTGTTTAACCTATAAAATAGTTT------------------------TGCAATTTGTCCAAACGATA-TGATTTT-----TCAATCAAAATGCAATAAAACGTTTGTAGTTTTCAAGATAGGGGCGTACGATGTGCGCCA-----------GCGCAAAGAGTTTAACTGCATTCCATGTAAAGATAAATAACATAACTAATTTTAAATGAAATCCGTACTTATATA----ATGATATGGGTTCAACTGC----------------------------------------------------------GTAAAACCACAGAACCATACAAATATAAATAAATCAAAACAAATGAAAACATATGTAAACATGTATGACTATGACATAAAAA--TAAAACTATTTTAAAATGT
>Scr 2648842 2651103|2702 chr3R 2648933 2648990 scaffold_3 3558427 3558485 + -411|0 59
CATGGCAATTATTAAACAAAA--AATGGAATCGAAAACGAAAACAGATAGAACTTCAAGT
C-TTACAGTCATTGGAATATATTAATGGCATAAGAAGTAATTAATAAATAATGTTAAAAT
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GAGGAGCAGAGGCCAATGCAGGAGGGTTATGATTATTGTTATGGGGGAGTAGTCCAAGTCCAAGTCGAAGTCCAACTCGGAGTCCAAGTCCAAGGCCAAGTAGCGAAGCCAGCGCAAAACTAAATGAAATTTCAAGCTAAATACAATTTACA--ATTTATGAAA----AATTTTGTTTTGAACTATCCAAGAGGAC-------TAACTGTCTACTGCGTTGCA---AAAGTACATAAAAAGAAAGTACACTACACAA--------------CACTAAACACTAAAACTTAGTTAATTGTTATTATTTTCTTATTATTATTTAATTTT-TACAAAATGCAAATGGAGAAAGCGTAATAAGTTAA--------------------ATAAAAATACAATTAAAGCGTAAAACTC-AACAAAACCAACTCATGTGACCTCAGAATTAAATAAGCTATATATATATAGTATATATATATACATAAATATATTATATAAATATATTAAACTAATGCATAACAACTATAATTGTAATAATAACAATAACATAATAATAACTAAAAACTATATATGAA-ACATATATACGAGTAAATACTACATACACAATAACATTAGTTCTACGTGTCCTAACTGTAAAGCATACTTTATAAATAATATATACGATTAATTTATATAGTTTAATACTGTATACACCACA----TAAACCTATACATACTATAACAACTAAACTAAATTGAATGTTTGTAGGAATTTTAGCGCAAAATAAACTCACAACAGAAACCACAACAACAAAACCAATTGCTAAACTGCAATGCAATATGCCGAATAGTGTGTTTTATGTCGATAGAGCCAAAAGATACGACCACTATATAGAATACAAACAGAGAATAGAGAACAAAGAGAACATATGAGCAGTTAAGAGCAGACTTGAAACCTAAACCTAAACTAACAATAAGTGCTAAATGTCGCAGGATTAGACAAAGAGATACCAAAATACCGTGGAGCGTGCTGC-TAAATCTAAACAAATAATACAAATATAAGATTAACCAAGAGCAAAATGAACAACATTGGCAAA-GTTAAAAATTAGAT--AACTAACTGTCGAGAAATGTTTCGGCTAGCCGAATTTACATGGTCTTTCCTGGCTAAATAAAAATATTTTGATAC-ACGTGGAAATATTGTGAAAATAAATTCTCGATGTTTTTTTCAAATTCGTGTATAATTTCGTGTGCAATTTTTATTTGTTTATATATACATTACTTTTCAATTGAAAT---TTTGTAATTTTAAAAACGAAAATTTAAATTACGAAAATTGCAAGCACTCGAATTAGGTCGTAAAGGATATAAAGTATACCGACAAACCAATTGGCAACATTTTATGAAAGAAAAAACAAAACAAAACAAACTTATATATTGTTAA---AGAAATGTACACGTTGTTTTCAAAATACTTAAATGTAAACAAAACAATTGAAATAATCCATGTAAAGTAGAAAAATATAAAAAAAAGAAAGTAAAAATAAATTCACTATGCATATATTCA--AAATGCATTTCTGAATGCAGGCGGCGCTGCGG-CCGCCTACTATTATACCTATAACAACTATATTGA-ATGCATGTACGTAACTC-AACTCAATTTCTACGTTTTTTCAAACACAAACACACACGAGCATGCTGAAAAACGAGAAATGTAGAAATCCATATACCAAAGTTATAAAGAAAATGTAAAAGTAAATGATAAAAAAAAAATACAAATAAAAGAGCATCATACTATGTTTATATGTAGATATATATATGTATTTAAACCAACGTAATATTATGCGTGTAACTTGTAGACGACGTTTCGTTTTGTAAATTCCCC--------------CCTCCCC--CCTGAATTCAACTGTAGCAAGGCAATAGCAACAGATACGTAAGATCCCAAATACTACGAAATACTACCCAATAGAGACAACATTTGTGATTC-CATTAGAAAGCGAAAAGAGAAATGTAGGGCAGACCAACAGCCAAGTGTGGTATTCATAAAGATTGCACCATAGATTGGCGAGCGAAAATATAACACAATCCAGATACGTAACTTTCGGCCTCATTCTGTAAGAAACTAAGCAATTAAGTTTC----ACGAA----ATAAAAAAAAAAAC--ACAACAAAAAAAATATGAAACAAAATTTATTGTAGAAATTCACAAAAAACAAAATTCATATACGTATACATATATATTCAAATAAAAAAAATATATGTGTATGTACTTAGAAGAGAAAAACGCACACACGTACATTTCATGGCGAAATTTTTGAATGCAAAATTAAATGAAATGAAATGTGGAAAATGCTAAATAATTTGTTGTAAATAAACCCTAAAA-TTAGTGTAAACAAGATGAGAGAAGAGCTGCAAAATGCAAATGCTAAAAACAAAAACTAAAAAAAAAAGAAACAGAAACCAGCAGAAA--ATGCATAAAATTATAATTAAATTACAAATGAGATTTTGTTTTTATTTGTAATATTTATAAT-AAAATATAGTATTTAAAAATTT
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AAGCAGACGCGCAA---------GCAGTTCACGCAG--------------------ATCACGCAGACG------TTAAAAATTTAAAAATGTTTTTGTTTGCAGAAAGAAGTACC---CTCTTCGCT---TTTCAATTTTGTAGT-TAAAATTCGAGCAAATAT-ATTTAAATT------AAAAAGGCTCAAAC---TTAAAGTACTATGTATGTCTTGTATTTTTGAAAAAATTCTAA--------AGTTTATTATAAAATGCATT---TTAAATACATTTTTTAACCTACCTTGTCGCTTGAAATATATAAAATTTAAGTTTTAGATATGGAATAGATAAACAAAATATTTCCCTCTGTCTTA--ACTAATTTCTT----TAATTAAATGTTAAGCCCCAAAGCGACTACAGCTTCATGTCAAACTC--TTACCTTAA-ATATTTAGAGTTTGT----TTGCATTTGAACTGAGAACGTTTTGTCGACGACCT-----------------------TGACACGTCCGGGTAATTTCACTTTATTGCCTTGGCCAATTGCTTGACATCATCCGTAATCCATCTGCAAAGA------------CATCCCGATACCTGACATTTGTTCAAA-TTTGCGAATTTCCCAAATCCGAGCAAATCGATGAATGCA----------------------------GGCAGATGAAAGA------------CGAAAGAGGTGGCGGAAGAGGTGCTCCTTGGGTTCCGCTTGCCCAGAAGATCGCAGCACAGGAGGCGGTCCTGCCAGCTAATGCAAATTGACAATAGCTCGAAATCGTGCAAGAAAAAGGTTTGCCAAAACCCTAGGCGTAACTAATGAGGGCTGGAAAAT----AGAGCACACTGACTGCATGTGGTACTGCTTTAGGCTTAGAGGATGTTGCATAAGTGGGGATAGGGCTCGGCCGCCTTTCGAGCG----------AAAAAGGTGTAAGG------TCTAGGAGGCGAGTCCTT----TTCAAATATAGAATTCCAATGGCATGTCACTTTCC--TCGGAGAAAGTGAAAGTAGGCCTCAAG---TGGTCGGTGCCTTTGCCTTGCCCTCCAGCTGACCTGCTCCCTGGTCATTACGCAGT--CCAAGGAGCTCTAGCTCTCCC-----------CATACCCAGCTCTCAATGTTGTTGTGGTTTTTTGTTTGTAGCCGGCTGAATTTTTTCGCCAAAGCCAGATTGAGATGTAAAGCACAATTGATGAGCGCCATTAGTTACACGTTATGTGCAATGGATGCCATCAATTTATTAATCTCCAGAACACGCCGAGG------------------CTCCATTCATAG--------------------------------------CACCACTTCGTCGTCTTAATCCC-------------------CTCCCTCAT----CCGCCATGGCG------GTGCAAAAAATAAAAAGA------------ACT--------------C
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>Antp 2732740 2734226|2791 chr3R 2734071 2734687 scaffold_3 3006975 3007562 - 26364|0 161
TCGACAATTCCACGAAACGTATTAAGTGGAATTTTTCTTCTTCTTATCGTAGTGGGTTGAAGTAGTTAGTTCCCCGTTTAGAATTGGTCGTAGTTCCCATTAGAATCGTAACTG-TGCATACAACAGCTAGAGCTGTATTATCTTAAATTGT-----ATAAT
TCGACAATTCCACGAAACGTATTAAGTGGAATTTTTCTTCTTCTTATAGTAGTGGGTTGCTGTAGTTAGTC-----------ATTGAATGTAGTTTAACT---AGTCGTAGTAGTTGCATACAACA---AAAACAACAACATTTTAAACTATTTTTGATAAT
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TTTAATTGTG-----------GCACTGCTATATTCCAAATGTGCT-TCAAATTTGTTAAT-----CTGTCTATTATTC-----AATTTTTTTTATTACGTTTTATTCACTTCTCATTTAT---ATCTAAGCTTTCCGTCCAAAC-GAAAGCATAAAAATAATCGTCAGCCAAACACATTGTTAGTCAATTTGAAA-------ATCTCAATTAAGCCGCTCAAAATATTAATGTATATTTGTATTTGCGCGAGAGCT-------AGTCGAAACTAAGAAGT-GCTCGTTATAA-----ATTGTATCGATAT-----------------TAAACAC-CTCTATTATCACTTCTGTCTTTATGTGCTATACAAGTTTGGT
>CG1104 2897343 2897443|2990 chr3R 2897081 2900217 scaffold_3 1226683 1229893 - 113687|288 415
TGATGCTCCTATATTCC-----------AATCTTTCTTCCCATGTCATTAAATTGCGTCTATGTAAATTGGTTCTGGTCTGCAATAGA-----------TTTTGCATTTGTTAAATTTT-----CATA
TAAAACTTTCGGACTTCCAAAAAAAAAAAACAGTCCAGATTAAAGTATAAATTCATTTTCAATATAATTGGTTATGGTCTGCTCTAAAAGAAATATGTGTTTTGGAATTGTTAAGTATTGTGTAAATA
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CTTGCGCATTTATCCATTAATTGTTAGTTTTGCCAATGCGGCGG-ATGTTAA--GATAACTGAAATACATTTGATGCTGTATTTATT-GTATTTAGAAATGCGCTTTATCAAGTTCGACGATAAATTGATGGACCTTGTCAAATTAAACTGAATTGTAATAAATACTAGAATTAATTTCGTGACCAAATCGAA
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>Aly 2903618 2903974|2994 chr3R 2903807 2904142 scaffold_3503 603 926 - 7316|0 188
ATAGTGAATAGTCTGAA-TTAGTCT--AACAAGAATAGAAGAGCAGCCCAATCTATAGTTTTAAGCCTACCATATGGACACCCCCCGCATGGTACATAAATGCAAACGCATCGACAACGCCGCGCCCAGGAGCAGATCTTTG-----------AAAGCATCGGACA-------TCAAATCAATCAACCA
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AGAAATCCCCCTCG-----------ATTATCTGTCCCTGCATCCAATCTCAAGGCACTTCCGTTTATGGTCTGTTAGGCTTCTACCTTGTGAGCGCGACACCAATGTAGGTTTGTTCAGACTGTTAATTAAAGGC------------GATTGTCACGTTTCGGCAATATATTTCACTAACAA
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>Alh 2921302 2921565|3009 chr3R 2919695 2922704 scaffold_645 4599 7622 - 60138|1711 1975
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>Alh 2922238 2922604|3009 chr3R 2919695 2922704 scaffold_645 4599 7622 - 60138|2767 3134
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GTCCCTGACTGCCGAAACATATCGCA---------AAATCATTG-TTGAACCTCTCCATCAGACACGTTGCGACGTCTCATGCGTATAACAGCGCCGGCAGCAGTAACAGCAGC------------------AGCGGTAATGTTAACGCTAACAGCGC-CAGCAACAACATGCACACGCATCAACAGCAGCAGCAACA--CGCAACGT-ATTTACAAACACAGCAGCAGCAGCAACAACAGCAGCAACAACAGCCACAACATTTGCATCAAACGCATCATGCCAGTGCCGCAGTTGC---TGCGCACATGTTGGGCGTGGGCATGAGCCTGGGCACCAGCAGTGCTGCCGCTGCGGCAATTGGACGAG
>Alh 2923390 2924032|3010 chr3R 2922705 2926947 scaffold_15 1498148 1502276 - 82714|714 1443
GAGAGGGCGCCTGTTCTCTC---TTGTACTTGGTGTCGGCACTTGCTGGCTCCAACCATGTGGCACTGGAGGAGCCCACATCC---CACTTACACAGCCAC------------------TGCTCACAGACCAAATTTTGCGTTTAGTTATCTGTACATCCATATTTTGT----TTGGTATTCGTTGT----------ACATACAAATTGAATTCG--AGTCCA----------CTTCGAGTTGTAGTCTTAAGTAACTTATATTAAGTTAACAA--CTAATCTGGTTACCAATGGTCATCCGTATAAACAAATAATGTACATATATACATACACAGCT-GTAAATCAAATTAC-----------AGATTG--TTGCACAAAAGCAGTG-----ATTGAGAAATTATCCATTGCATTTATCGACTACATTGACAACTCGTCATCTTTTTAAAACGGAATGCTTCTTTACCCTTATCATCGAACC---ATACCACGACTAGATAACTTTACCCTTATTTATACTTTTAAGTTAGTTATATGTATTTACGGAAAATACGGATCTAATTATACTTACTATTGTAACGAGATATGATTTCTTTGGTCAAGTTA-----ATAGTTAAGT--TCTTTGGATAT----TTAAAAGCAAATACTTTTC-GATTTTATTTATTTACAAAATGAATAAAATGTTTAATAT-ATTAAACACAAAACCAACACAAATTCTAAA
ATGCCACTGCATCCACTCTCAGTCAGTTCTTGGTGTCGGCACATG-----------CATTTGCTGTCCACAAATCCCACACCCATACACTCACACAAACACAAATAGATGGAGGCGCCATTCACTCAG-CTACAAACTGAATTTATGTAAATGTACAGATATGTAATACAACATTAACAGTCGATGTTATGCTTGTAACGAGCAGCTTGACGTTGCCAGACTACGCATTAATGCTATGGCTGGCATTCTCGTATA----ATATCGCATTATTAATGTTAATTTAAATTTAAGTGG------GTACAAGTGATTCATGTACATACACACACACACACATAACAAAGCACATCATTAACAATAATAATATTGGATGGTACAAAACAAATGGCATAATTGTTAAATTGTACAAAACAT-----------ATTTAC-ACTTTCAATCAGTTTAATATCAATCACATACGTA--CTTAAAGCCAAAGCTTTAAGCTTCAATTAGGTAAATACA-----------ACATTTAAGATTAATTTTTTGATTAATATAACAAACAGAAACAA--GTACTTACTTT---------------TTTCTTTACTCAACCTATGATTAAAATTAAGTTATCTTTTAATGCACCAACAAACCCGAATTCTTACCTTATTTTATTTGTTTTCAAAATAAATAAAATGTGTATTGTAAACCAAAACAAAAACAA-GCAAATTCTAAA
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TCCAATCGAAACCCACATCCATGTCTGTGAAC---------CGTTCCGAT------------------GCATCTGTCTAATGACC--AATCTGTTTTAACTAACTATCCCTGAAATTAGCTAACTTAGTCTTCGTTTTGCTTCCAACGATTTTTGATCAACGATGCACTGAATGCAATTCAATTTT--CTTTAGGTTATGTGAGATTAAGTTT----------------AATATGAAAACAAGAAA--------AA
CCCAGCCACAACTTATTTAAATTACCAGCAACAGCAGCTATCGTTCCGATCATTATTTTCCGTTTTCAACTTCTAGCTGTTACCCAGAAACTAATTCAACT---TATCCACAATGCTAGCTAACTTAGTCTTCGGTT---TTCCAACGATTTTTGATGAACGAAATGCAGAAACGTCTTATGTTTTTGTCTTAGGTTATGTGAGAATAAGCTTTACAAACAGAACAAAAAAAAAAAAAACAACAAAAACTAAACAA
>Mlp84B 2939773 2939993|3028 chr3R 2939990 2941700 scaffold_550 5179 6947 - 100138|0 3
ACGA
AAAA
>CG10068 2951539 2952493|3039 chr3R 2951080 2951948 scaffold_15 1530135 1531022 - 35400|465 903
GAATGCTCAAGTCAAATC---CCGATGCTCAATAGAGCTTGCAAGCTAGTTTTTGGAGTATCCATATA------------GATAGTATTCG--------TTGGTCTAGCGATAGAACTTGACTTCCGCCTCGACACAGTCCTTGAGCAGTTCGTCCAGCTCGTCACTGGCGTGATCCTGCAGAGAGAAATAGTTATTTAGCTCGTCCACGCAGGAGAGCTCCAAGCTGCGCAAGTGCTCCAAGGCGGCCGGCTTGCGTTGCGAGTGTAGCTTGTGCAGCAACGTCAAGTCCGCTTCCGCTTGCACTTGGGTTAGCGGCGAGATCCTCGGATTTGGGGCAAAAACGAACGGCTTAAACACAGACTCGGCGGCATTGGGCGTCCCGGTGAACCAATGGCATGAGATT------CCCTTCACCGACAGCACCGAAACGGTAG
GAATGCACAAGTCAAATCGAATTGGAGCATCGTCCTGGTCGCAAGCTAATT----GATTATCAATATATCATAATAACGTGATGCGATGCGCCATTTGTTTGGTCTAGCGATAGAACTTGACCTCGGCCTCAACGCAATCCTTGAGCAGCTCGTCCAGCTCATCGCTGGCATGATCCTGGAGCGAAAAGTAGTTGTTCAATTCATCGACACAGGAGCGCTCCAAGCTCCTCAAATGCTCCAATGCAGCCGGTTTACGATTGGCATGTAGACTGTGCAGCAGCGTCTGCTCTGCGTCAGGCTGCACCTGGGTCAGCGGCGATATACGCGGCTTGGGCGCAAATACAAACGGCTTGAACACTGACTCGGCGGCATTTGGCGTGCCAGTAAACCAGTGGCACGAAATTGAGCTGCCCTTGCTGCTGAGCATTGAAACATTTG
>CG10068 2951539 2952493|3040 chr3R 2951987 2952238 scaffold_15 1531107 1531415 - 7283|0 311
CCTTTTAATTTTTGTATAAATGCAGATTTT-ATGCGTTTATTTGAGAGCCATATATAATGTATATTTGTATATGTATT-----CATATATATTTGAATGCAAGTATGTAAATCGTTAA------ACTAAGCCTGGAATGTCAC---------------------------------ACAATAATACTTTAAATTCAAGTCGGAGATTGCCCACTGAGACAGAATAAAT--------AATAATTTAAATATCACGCAAAAGCATAAAAACTAAACGAA----ATAAAATCAGTAGAG---ATTGCACAAGAAA
TCCATGGATATTTGTATAAATGCAGCTTTTTATGCGTTTATTTGAGAGC--TATATTATGCATGTTTGTATATTTAATATGTATGTATATATTTGTATGCAAGTATTTAAATCGTTAATTAGCTGCTAAATGCAAGCTGCAATTAAATTAATTTTTTTTTAATAAAAAAAAAAGGACGAATAATACTTAGAAATGAAGATCATGATTGCACATTAGGAGACAATGAATTCTATAAAAATAA-TTAAATATCACGCAAAAGCAAAAACATCAAAATAATTGCACAAAACTAACATAGAAAATTATAAAATAAA
>CG10068 2951539 2952493|3041 chr3R 2952464 2953613 scaffold_15 1531416 1532523 - 48156|0 29
AAACACGAATAGGTCAATTAATGTGAAAAT
TTGTTCGCATTGCCCGGTTGTACTTAAAAT
>gfzf 2971596 2972035|3062 chr3R 2972015 2980083 scaffold_15 1544830 1552944 - 235784|0 20
ATTGTAGTTTTAGAACTTAAG
TGCCGAATTATAGATATTAAG
>MAGE 2979960 2980087|3062 chr3R 2972015 2980083 scaffold_15 1544830 1552944 - 235784|8457 8601
CCATTCTATGAATAAT------TTACTACATTTGATCTAACAAATTGAAAACCAAACAATAT--ATATAATAATC-------------TAAAATAGAGCCAATTTCCCATTTATCAGCAAGAAAAGAATATTACGATGATCTTTT
CTGCTCCATGAATCATATTCTCTTACTCTGAACGGGCTGACGA-TTGACAACTAAAAAATATTCATCTGGAAATTGCTGAGGCGCCGATGGTGTAGTCCAAAATTCATTTTAATTCCTTCGACAAATTAATGACAACAAT-TTTT
>CG10055 3009823 3010315|3082 chr3R 3008475 3011485 scaffold_15 1584997 1588093 - 91736|1467 2136
ATTGCCA--------CTTATGTCGAGTTCGGC-------AAGTCCTG--------CTCCTGCCTTGCCCAAAACAAACAAGCAACACA---------------ACCAACTTAATGTCAAAGAACGGAGGCTAAACAGTGATTACTTTTA----AAATTAAAAC---AAAGTAAAATACGAAACTAAAAACCAAGCCAAGTAAATGATGTAAGTTTACACAAGAATACCCAAAAAAGAAGAA------------------------------------------CTTCTTATATCTTAAT-TGTACAATAATTTAACGAAAAGCAAACT-CAAAG-ATTTGTTCACGCCAAATGCGAAAAGATATTTGAATA-------------------------TTTTTTCCCC---TTTGCTCTACAATTACTTCGATTATAATTACACATACAAGTAAATCAGAA-CTTTAGCATTTAGTATGGCATTAGAGTATGAAACATTTGAATTTTGAATTCTGAAAAGCGAAATCTAGTTGTGCATTT---------GTATATACATCTATCGATA------------------------------------------------TTGTTGGTGCTGCAAGCAAA-GAAAACAAAATATGAATAAAATAAAATGGAAATGG
AGCGCCAGCACCAGCACCAAGTAGACGTAGACATTGCCAAAGTTCCATGTTGTCTCTCCTGCCATGTCTAAGCCAACCAAGCAACCAACTAACACAGCAAAATACCAACTTAATGTCAAAGAACGGAGGCTAAACAGTGATTACTTTAATGCGAAAGCGAGATACGAAAGTAAAATACAGAAACGAAAACAAAACAAAACAAATACAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACACAAAAAAAGAAACAACGCAAACTGTAAATTTTTAACACAAACTAAAAACAAACCCATTTAAATATTAATGTGTACAAGAATTT----TAAAGCAAACCACAAAGAAATTGTTCATGCCAAATGCGAAAGAATATTTGCATATACATTTACATTTATATACATATATTTTTTTCCCCCTTTTTGCTCTAATATTATTTGTTTTA-----------ACACATAAATCAAAAGCCCCAGCATTTAGCGTGGCATTAGTGTACGAAATTTTTGAATTTTGAATTCTTCAAACCAAAATCTAGTTGTGCATTTTGTATATACACACATACATATATAGATACATATATATATATATATATATATATACATACGTATTTAAGTATATATGTTGTTGGTGCTGCAAGCAAATTGAAGTAAAATATG--TAATCGAAAACTTATGAGG
>CG1288 3033095 3033413|3106 chr3R 3032481 3033228 scaffold_17 11320 12172 + 2004|786 925
AATTGTGCAATTAATAAAAGAATAGCTAT-----GCTAATTTGTTTGTTGCTCATAGAGGGTA-ATATTCTCTCATACGAAGAGAATTATTTCCCATTTAACTGAAATGTTTAATAGATCCCAACCAATTAAAGTAATCC
AATTGAATTGGCAAAAAAAGACCCGCTAAAAACAGCGACTAATTATGTGGCTTATATATAATCTATAATCTCTTC----------ACTATTTCTGGCTTAACTAAAACGTTTCCTTATTATTCAAAGAT-AAAGTGACTT
>CG14605 3043171 3043226|3117 chr3R 3042957 3044143 scaffold_2 1789796 1790971 + 508|215 270
AGAAAATGTATAAAAATTCATAATAAATGTGTAAATGCAAATAAAATCCAAATACT
TGCAGACATTTAG---CCTATAATAAAGGAG--AATAGAAGAAAAAT-----TAAT
>CG14605 3043396 3043648|3117 chr3R 3042957 3044143 scaffold_2 1789796 1790971 + 508|485 745
ATTCGCGCCCCTGGCATCTCCATCAGTATGTGCGG----ACTCAGTTTATCCGTATTCATTGCCCTCATCACTTATCCCGTCCTGATCAACGATTATGGAGTGCATGTCACAATGTTTGTGTCGGCGAGTTTCTGTCTACTAGGTTTGGTAGTTCTGGGAATATTTTTGCCTGAGACCAGGGGCAAGAGCATTACCCAATGATGGGCTAATTTCTGATAAGTGTTAAG-TAGAACCAGTACTTATAAAAATTCACGT---A
ATACGCGC----GAGAGCTGCTTCAATATCAATTGCTATATGCAGCTTGTTTGTGTTTATAATGCTCATCATTTTTCCCCTATGCATGGACCGATGGGGCGTGCCGGCCACCATGTGGTCCTGTGCGGGCATAACAGCACTCGGCTTCATATTCTTTATCTTCTTCCTAAAGGAAACCAAGGGCAAG-TCAATGCTTGAGGAT--------------TGAGCATGACGCTAGCAAAAATA-TCATATACTTTTACATTTTA
>CG14605 3043707 3044001|3117 chr3R 3042957 3044143 scaffold_2 1789796 1790971 + 508|809 1108
CAGGATGGAGCCCAATCTATGTGGCATATTTCTGGGTGTTGTGCAAATTTTTGGT--TTGATTAGCGCCGTTTTGCTGGTGGACCGCGTGGGTCGTCGCCTCCTTTTGATCCCATCGCTGGCCGGAATGGGTTT--GGCTGAGCTGGGAGTGGGTCTGCTAAAGTCCTTTGCTTCGCAGGACTTTTTACACAACAATGGTTGGATTGCACTTACCCTAATGG-GCATTGTGTCCTTCACGGCGTCAGCGGGCATAGTGGCTCTTACCTTTGTCATTATAGTTGAGCTTCTGCCCTTTAAG
CTCCATGGATCCGGATACCTGTACCATTATCATTGGCATTGTCCAGATTCTGGGTACGTGTGCGACAACGGTTCTCTGC--GATATCTGGGGACGTCGAATTCTGCTGGTGGTCTCCTCAGCCGGCGTAGCTTTCAGCCTGACCTG--CTTCGGCCTCTTCACCTACTACGCACAGTGGTACGATTTGAGCGAATGGAGCTGGGTCCCACTGTTCTTTATGTCGCTGTACATATTTTTGGGCAACATTGGACTCGTTGGCTGCT-TCTTCGTCCTACTGGTTGAGATGTTTCCGGTCAAG
>CG1234 3069896 3069970|3138 chr3R 3067903 3072676 scaffold_17 53893 58754 + 164162|2159 2241
AGAAAAATTTGAAGATTGAAG----TAGAGTTATAATGACTGCGGAATAGTGTGGAAAGAAATGCAATTTTT----AAACAAT
ACACTAAATTTATAATTCAGGAGCCCACAACCTTGA-----GCCTAACTGTCAGCAAGAAGACGAACTATTTTCTAAGGGATT
>CG1227 3073871 3074006|3139 chr3R 3072972 3075022 scaffold_17 59004 61030 + 83958|908 1057
CT-CCCACTAACTGGATTACAACTCATTTATAGACATTCCTCCAAACCAGA-TACACCGC------TTACTGTTTTTTGACTAC---TTATTGTAAAATATTTTAAACCTG--CTGATTTTATGAAATT-ATGTGTAAGCAATCAAGCTA
CCGCATTCTAATTG---TACGCCTCA---------ACCCGACTCAATCATAGTACACCGCTATATATAACTGTTTTTTGACTACCATTTGTTGTAATATA---TAAATGTGCACGTATTTTGTGAAACTGGCGCTTAAATTATTAATTTA
>Pbprp4 3076531 3076562|3141 chr3R 3075458 3076862 scaffold_17 61428 62859 + 48551|1124 1155
ATAACATCAAAGGTCACATCTCGGACTTATCA
AT---TCCAAAAATCA---CTTGGAAACACAT
>Gld 3077771 3078496|3143 chr3R 3077455 3077959 scaffold_17 63694 64242 + 5004|357 574
CATGTAAATTTCATTTTAAACTACATT---TAAAGTATATAATTCGTGTT-------------------------ACCCATTGA-CAATGTAAATTTCGTTTATCGTTTATTTCGAATTTGGACGGATGATTGATGTCCTATATTTCTGTATACGCGAATATTGCATGTATTTATTGTTCGATTAAAGTGCAACAATTTAATTTAACTACCAAACGAT
CTCATTAAGTTAACTTTACGCTATTTTAACTAATTTTCGTAAACGGTTTTCAAAAAAAAAAAAAAGAAAAAAAACACCCATTGAATTTTATAGAATTCGTTTAACATTCATTAAAATATT------ATTAGTTTTGTATTATATGAATGAGAATATTGCTGTCGCATGTATTTATTGTTCGATTAAACTGCAACTATTTAGTTAAAC---------GT
>Gld 3077771 3078496|3144 chr3R 3077960 3078279 scaffold_124 33992 34313 - -1861|0 343
AGTTAACAGGCTCCCTTAAAACTAACTACTGTTACCCACTGAATATGCCGTCAAACTTCTTGAACAGCACACTCAGCTCAAATTAAAGACAAGTAAAACTTATTAGGTATCTAGTAAAT-TTACTAAAATTCCAAATTAAATTTATGTGAATTCACCCTAAGAAGTTGAAATTTT----TCCATTAATTGCGTTTAATTTCAAAACATTATTG------ATAGCTTGAGTTAAAGAGGTTTGACTATGTAGATTTCTATTAATGCTTAATTTATATTGAGCTTTATGTTGA---CCAATCCCTACA-CTTAAA----CTATAGATTT-----CGACCTACTGGA
TATGCAAAATCCTATTAACATCGGACCACCATAACATAT---AGCTGCCATTGGAACGATTGGACGAAAACTAGGGTTTTAATTAAA--------AGTCTTTTTTATAACCTTGCAGACGCTATTATAATTA-----TGTCGTTATGTGA-TTAACGCTTAGAAGGAGAGATCTCAGACCTCATAAAGTATATATATTCTTGACCCTTTGCTTTTCAATATATCTTGATCAAA-----CTCGGCATTTATTAATTTTACTATTCTCCAATATATACTCAAAATGCTATTAAGATCGGACCACTATAACATATAGCTGCCATAGGCTCGCTGCCGATCCGTCGAA
>Gld 3077771 3078496|3145 chr3R 3078280 3078511 scaffold_17 64243 64494 + 7773|0 246
CGCGTGGATGCGACGTGGACGTTGCATAGAGTAATTTAATCAGAATCCAAGCGAAAATTACAGCGAGTAAAATTTTAAGCGAAATTACACTTATGGCACCTCAGATCCAAAACTAAACT--ATTTTACCCT-----------------AATCCAATCTTATT--------TAATCCGATCCTAT-TATGAAGGTTTCTCACTCTAGGCAC--ACCGCGTTGCGCAATTTCCATTAAAGTTATCTATA
CGTGTGGATGCAACGTGGACGCTGCATAGAGTAATTTAATGAAAATTCCATCAAGAATTACTGC------AAAATTAAGCGAAATTAATTATAAGGCAAC----AACACAAACTATACTACATATTATCTTACAATTATGTACTTGTAAATTTAAACCCTTTGGCTATACTAATTCAACTATATCTATACGTAATCCTCACTCTAAGCACTGACCTCGTTGCGCGATCTATACTAAAGTTCCCGACA
>rn 3099460 3099763|3174 chr3R 3099486 3100092 scaffold_17 86485 87233 + 22047|0 432
CTAGGGGCCTACTTCTAGATGGA------------------------------------------------------------------------AGGTAGTTCAT------CCGTTGTTTCTCCAAGCGGAGACGAGGCGTGCAT----------------------------TCCTGTACAGTATTAATTTGTAGTTAG----TCGTAGCGAGTAA--------AGGTCATTTTG--------TAATTTTTGTAGATCTTCTTGGGTTAAGTTAAGGGTGTTCGTTCTCGCGCAC---------------------TCGATAAGC-ACTATGTAAATGGCCAACGATACG-------TACTCTAATTTGACAAACACCGTCCATACCTATGTTTACACAATGTCTTGGAATACAAGCACCAGTTCAGGTCC
CTAACGTCGTATTTTTAAGTTGGCCACGCCCCATCTTCTTAAGTTATTGTACTTAGCTACATATTTGATACAGTACATATATGTATACAATTGTCAGATATTTCGTTAACCGCCGATTTGTATGCAATACGAGCTGAGGCCCGTTTAATTAGTTTCTATTAGAAGTGTCGCGTATCCTGTACAGTATTAATTTGTAGTTAGTAACTCTTAGTGCGTACTATGACCTAGGTTATATAAATATATATTTATATATATATATATATATCATTTCATATATATATATACATACACACACACACAGTTCTTTTAAGTTATATAACGATAAACAAATCTGTAAATTGCCAATTATACGTATTAATTATTCTAATTTAAC-TACACCGTCCAAATTAA-------------TTTTAGAACTCAATTACTGATTGAAGTTC
>Mst84Dc 3189975 3190083|3275 chr3R 3189652 3190243 scaffold_7 5665510 5666048 + 574|349 459
ATGCTCGCAATTGGCAGCCGAATCGATTTGTGAAACCATACCACAATCCCACCATGGTTAAACTAACACCTGAAAGTTAAAA--GCCACAAATATATATATATGTATCTTA
AAGC--------AACAGC--AAACCCTTTGTAAATTTATGTAACCATA----------TACAGTAATAGTATATAAATAAAATGGGAACAAAT---TAAAAATGTATTT--
>Mst84Db 3190880 3191002|3277 chr3R 3190762 3191025 scaffold_6 3210442 3210712 - -84|133 273
ACAACAACCACAACATGTAAAATATCTTTTTCCTGTGAACCACAAAGTGGAACTTAGGACTGAATGCGGATAAACTCTTCTT------------------AGCTCGCGGGCCTAGTCAATAAAATAAGAATTTCAAAATAC
-------------CCTGTTGCACTTCTTGCCCATGCGGCTGGTAAAGGGCA--TACATACAGTATGTCAATAAAGTGTTTTTACTAACAAAAAAAAACTAATTTTTTGGGTTTAGTTGAAAATAAATGTACCTAAAAGTG-
>MstProx 3191661 3192024|3279 chr3R 3191276 3191666 scaffold_7 5666220 5666619 + -715|415 420
GTACAT
GTATAT
>MstProx 3191661 3192024|3280 chr3R 3191667 3191766 scaffold_7 138149 138246 - -1037|0 108
GGGGCCAC---------AGCAGGGGCCCTGATAAATCATATTAAAAGTATTCACTCGACTTACGAGACCGATAAATACATACCCCAACCAAAACGTAATTCGGGTTGAC
GGGTCCGCAACACGAGTAGCAAGGGCCGCAGCACATTTTGACAGA-----------GACTGCAGAGCAGAGAAGATGGATATTAGTTAAAAAAAGTGGGCAATATTTGA
>MstProx 3191661 3192024|3281 chr3R 3191767 3191945 scaffold_7 142781 142967 - 5162|0 210
CATAGTTCCCGGAAGTATTCCGACAGGTTTCCGGGTCAACTGG--------------------TTTAGCAGCAAGGACCGCAACCGCAAAAACTGCTGGTGCCGCCGCAGCAAGGTCCACATCCTCCGCAAGGACCACAGCAGGGGCCACACCCACCACAGCAGGGGCCACA------------TCCACCACAGGGTCCGCATCCGCCGCA
CACATTTACGCGAGGCATTTTGTACTGAATGTGGTGCACCTAGATTTCGTTCTGAAGACGTTTTCTAGCAGCAGGGGCCGCA------------------GCCACCGCAGCAGGGTCCACA------GCAGGGTCCACAGCAGGGTCCACAACCCCCGCAACAGGAGCCACAGCAAGGTCCCGCTCCACAGCAAGGACCGCATCCGCCGCA
>CG1142 3298176 3298200|3418 chr3R 3298042 3298194 scaffold_8 3727259 3727459 + -956|190 208
AATATTTTAAAACCTAACT
CATCTTTTGTATCGAAACT
>CG1142 3298176 3298200|3419 chr3R 3298195 3299549 scaffold_14 675270 676693 + 29846|0 5
ATATAA
ATATAA
>CG1287 3326673 3326867|3450 chr3R 3326631 3327968 scaffold_17 2568312 2569641 - 40545|52 257
GTTGGTTTAAGGTGTAGGAAAACCTAAATTTATTCAGATACACAAAATAAACCGCCTGGGGTTTTACCACAAATTGTATAATTTAGTTAGAATTACCCATTTTCATATTTTGAAATGTATCTTTTCGAAATTGTTCGAAG-------CTAAAGCACAAATCTAAA----AAATAACATTAAATTTGAAATGGTTTTTCAAATTTCT
GTAGG-GCAAGGCG-AGGACAACAGGAG-----GCAGATATTCAAAAT----TGCTTTGG--------------TATATTATTTTATTCTGGTTG--CAGTTTC------------------TTTCAAAATTGTGCAAAAAATCGATTTAAAGTACACATGGAAATTCGGAATTGTTTTAAGTGGGATTTACTACTTGTAGTTGGA
>alpha-Est8 3335065 3335523|3460 chr3R 3334776 3336215 scaffold_17 361892 363317 + 26441|299 796
AGGCCCATCCATCGACCTTTCCCG-ACCCTCCCCATCGCATCCATTTACCATATCCATAGCAATATAGCATAAGGTTTAGATATAGCTCCTTAACTGGCCCCG---GGATGGCCTTAA-----------ACGCACATCAAATGTACACATGTAAATAGCGAAT---------TTTAAGTGCTTGTGCAGTAAGGGCAATTACAA--------------AAATCTATACACAAACATGAGTGGGTAAATATTTTGTTTGCTTGTAAGTTGGCCATCTGACT-TTAAAGGCCAAACGGAATTATTTTTGCATTGCGGCACAAAATGTGATGGGAGTTCGTTGGGTAAGCAAAAAAAAAGTGATACCTACATTTTAGAAATCAAACTTAAGTCTAAGGTACTTTTCTGTCTAGTTTGTTATTTTATCAAAAAACAAAAGCTAATAGATTGTTTATTAAAAAAATCTTTTTAAATTTCCAATAAAAATTGTCAATCAATACG
ACATATGGCTGCAGCCATCCCCTGCATCCTCTGCACCCCCTGTAGCACTGTTATTCAC--CTATATAGC-----TTTAAGCTATGGCCCTCAGTTTGGCCCCAAATGCACAGCCACAAGGCAAATCTGCGCTGGCATCAAATGTACATGTGTAAATAGAGGTTTTTTTCGTGTTTTATAGCTAGGCTATTAAAAATAAATAAAAACACATGCACATACACATACAAACACAAACGTGAGTGTGTAAATATTGAGCATATTTTTTAGAAAATCCTTTGGCTATTTATATTTTGATTGAATTAATATTAAATG--TGAACATAGTGTAAACATAAGTCGAT---TAAATATAAAAGAATAAAAATCAATATTT--------AAGCTTTAAATTCACATATATTTTCGTA----CTTTTAAATTCACATTCAACAAG-------------------GAAAAAATCTATATGAATAT-------------------------
>alpha-Est7 3345284 3345472|3471 chr3R 3344618 3345995 scaffold_17 373997 375233 + 44269|666 855
ATTTAACTTACTGTTCTGTACAGCCTAACAAAGAAGTCTCTAGAAACTGTAAATAGGTCAAAATGCTTTATAAAATATATTCTGCAATTGGATTGTTTTGCT-TTATAACTAGTTTGCCCAATGATTGCATGTGGATGAGAAATCCTAGTTTAGGTGAGATTTAAAAATATATATTTCTATTTATCTCTA
AAAAAAGTTGTTGGTATGTGTATTTGTACA---------TTAGTCAATCTATGTTGATATGAATT-----TAAAAAATATAATACAATTGG--TGGATTGTTATTATAA----------------------------------------------------TTAAAGGGAAATATTTCTATATAT-----
>alpha-Est6 3350286 3350357|3476 chr3R 3350247 3351757 scaffold_17 381543 383039 + 38757|39 118
TTGGGGGTTATATGAAGTCTATTTT------GCTATAATTTTTGTAAATA--TTCAATAAACGATACTGTTTAGAGGAAT
CTTTATGCTGGATAACAATTGCTTTGAGGTCGCTTTAAATTTCATAGGTAATTTTAATAAA---------TTTGAAAGGT
>alpha-Est5 3359948 3359985|3492 chr3R 3359767 3362151 scaffold_17 393020 395695 + 62931|269 307
GCATGCAAATAAATTTCCATGCATTAATGTTCACT-AAA
GTTTGC---------TCCAGGTTAAAAAGCTAACTCCAA
>alpha-Est4 3362392 3362473|3493 chr3R 3362152 3364284 scaffold_17 396592 398700 + 38413|257 338
AAAAAAAAAACCCTACCTTTTCGTCTTTATTGAAGTCGAAATAAATAAATATTACTTCTGATTTCACTTGCTCGACAAAGAA
CTGTGA--------ATCTGTGAGCTTTGGT--AAGTTACGATAAGGAACCA--GCTTATGTACTTA-----TAGATAAAGTA
>alpha-Est3 3364694 3364764|3495 chr3R 3364663 3366215 scaffold_17 399465 401014 + 55915|31 107
TCAAGGGTATTAAGTCT-CCTAACAATATTGGTAG--CTGAAAT---CAAACAAGTGATTAAACATTTTACAAATCT
TGAGA-----TAACTCTGCCTAAATATAATCGAAATTCTAAAATGACAAAGCCATTAAATTAACAGTGCATACA---
>alpha-Est1 3371449 3371693|3501 chr3R 3369599 3371475 scaffold_17 403958 405839 + 47256|1914 1940
AAATATATTTTAAAAAATTGTATACAT
AAGTTTAAATTTAAAAATTGCATAAAT
>alpha-Est1 3371449 3371693|3502 chr3R 3371476 3371691 scaffold_17 2530082 2530317 - -1357|0 248
GGGGGAGTTTGTATGCATGTATATTTTGTAA-----------------------ATAAATAGCAGCTGGGTATCGCCAATGAAGATTTTAAAAACA---ATTTTAATTAATAATTGAATAAAATTTGAAATATTCATGTTTGC-------TGTCAACATAGCCCTACAAATATCGCTTAACGTGCTGTAATCGAAAATGAAACTAAACTTACATTTCAACGTTGGCCATAGGCTAAACAAGGCCTAGAA
GCGTAAGGTCGTCAG-GTTAATATTGTGTAATATTTGGGTCATCACATACGAGGTTTAAGAGGTTTTAGATATCGTTGGTTAAATAAATATATATATATATATAAATATATATATATATTATATATTATATATGTATATATATATGTATATATATGTATATTCAAATATATATAGTGTAGTAAATTGTA--CAACAAGAAAACGAAAACGAAA----AACAT---CCAAAGGTTGACCAAAACT---AA
>alpha-Est1 3371449 3371693|3503 chr3R 3371692 3372145 scaffold_17 393310 393764 + 8942|0 1
GT
GT
>CG32465 3397012 3397141|3534 chr3R 3396675 3399250 scaffold_17 430656 433022 + 72494|400 543
AAAACCAAAAGAAGAAACACAAGTCCAAGGAAAATGGCAACCATGAAATCAAATCATGTACAGGTGAAAGGGAGCTGTTCCTTTAAGTT------TTCTCCGAGATTTG--TAAAATTAAAG------CTGTACAACTACCCCA
ATTTGCAAAATAAAACTAATAAATTGATATATTTTG------CTGTTTTTATATAATGTACATGT-------AACTGTTACTATGGGTTTGAACATTTTTTGGGTATTGCTTAAAATTTGAAACCCTTCTCGAAAGCCGCTTTG
>CG32465 3397848 3397965|3534 chr3R 3396675 3399250 scaffold_17 430656 433022 + 72494|1256 1377
CATTAATTGACCGTGCGTTTTAAATGTGATCTCTAAACGCACAGCCACCTCATTCCTGGAACACTAAATCCCTTCCCAATGCGTTTCAGC---TGTCTCTATATATATGAAGTACTATATG-
CATTAATTGACGGTGCGTTTCAAATGTGATCTATAGGTAAAGATCC-CTTAGCGCACAGTCCACAAAACTGTTTCAAACTGCGTGTGTGTTCGTGTGTGAGAGTGTATGAGAGTGTGTGTGA
>CG18746 3614001 3614093|3738 chr3R 3613919 3615627 scaffold_17 661762 663330 + 20728|92 192
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GAATGCGAAAGAATTGTTTAAGAAATCTTACTGAATTGTAAATAAAAACTGTTTAAGCGAAATGT--TTGACAAAAATGTGAGCTTGGTTTTAGATTTAAG
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TTGTTTTC---GCTCCTAAGAACATTTTTAAA-----------------TACACCCATTAAAAGATTATAAGAAATGTTTGGTACA----TTTATTCTTTTTTAATTACAGATTTAAGTATAAGTAATAGAAAGT-
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GCTCTTA
GTTCTTA
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AATTCTCTAGTCTTCAGCGTACATAGACTTAAGTTAAATGAATTAAATTCGAAACAATATAATTTTGTGAATT
GTGCCACA-----TCAACGGACGAGGTGT----------------------------------------AGCC
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GCTCA--------ATAAACATTCTAAACT---CTTA
TTACATTTTTATAATACATTTCCTACACTTCTCTTT
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CTATCGGACATCGTCGGCAGCTACGACAACGATGCTGCCGACGACAATGACGACGGCGACGGCGGCGGCGATGGGGCTGAACACGGGCATGGGTCAGGGGATGACGTTGGACTCGGCAATAACAGCGACGGCAGTGACTTCCACGGCTACGATGACGGCAGCCCAGGCGAACCTGCCACAATCGACAGCAGCAGCGAAGGGCAACCCACAACATCAGCAGCAGCTGC------------------TGCAAAGCGGCGCAAAAATGCCGTCGCA----GCTAAACGAGGCCGCCGCCGGCAGCAATAGTGCAACAGAGGAGCAGCAACAGCAGCAGCAGCCGCCCAGTATGAGTTACATACTGCGTAGCCAGTTGGATGAGTTGAAGCGTCTACCAGAGCCGTTGGGCAGCAATTTGCTTACGCACAATGAGCTGGATGTTTGCAAAAAGCACAACATTACGCCCACAACGTATCTATCCCTTAAAACGGTATGCCTGAGCGGTGCTCCATCTTTGGGTAGTCCCATGGAAATCTCGTTGCGCAAGTTCTTTATCAAATGCGGCTGGCTGAGCCACTGAACTAAGCGATGTTGCTGTCGTCGTTTTTGCTGTTGTTGCCATCTCCCTGAAACACACACACTGAGAATCAC-TGC---TTCAAAGACTTGAAATTAATCTTTATTTTATTATGTAGTTATATAGTTAAAATGTATGATAATAGGTCGCCCTAAACAAATTTTATATTGTTCGATATATAAATAATTTTTTTTTTTGTACAGATTTCGTTGTTGCCATTTT----GAGGT--AAACTACAAAACTCCTATTTGTATTTAAATTTAACTTGTATCAAGTCAAGCGGACAGATTCCCATAATTTCTTAGACAAAGAATACGCTTGTTTTTGTATTTTTAACGAATATGCTATAAATGTAAAATGTGAGAGCTCATACAAAAGTTCCAGTTCAGCATTGTTTGTATGGTTAAAAAACAAGATTTAAAAATGTAAGCTTAAGTAGGGCACCTTAACAATTATGTATGTGGCCACATATGTGAGTATTTAATGAAGTGTATATGAATTAATAAATGTACTGAATAAT
>CG9636 4066466 4068111|4193 chr3R 4066442 4069290 scaffold_29 1071056 1074059 - 72371|24 1851
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CTAAAGATGAACAAAACCC---ACAAGTATTTTATCAAGAAGCAACTTAACCCACAACCACCTAATAATACCGCACCAACGACACCTAGAATTGAACGATGCAGCCGCAGCCAATGCGAT-----------CAGAATGTCTC-------CGGGCACAATTTATGCACAGAGCTGCATATTCGTGTGACTCGAAACCAAGCCAACATCGCTCCCAACCCCAATCACAATCCCCGTCTGGCCATAGCGCCAGTTGTAGCCATGCTTAGCCAACGTTTAGATGCTTCCTTGCCAATACCCACACAACAGAACGTAACAGACGATACAACAGGACAACAACAAGA-GCCGAGCAATATAGCAGCCGCGGAGTGTGATCCGTTAATAATAATCAAGGAATCCCCATG-------TGAGTTAACTGGTAGTTATTTGTTGTTGCTGTTGTTAGTTTGCTTAGCCGGTTACTGTACGCCATGGAATTTTTATCATAATCAAATTGTGGCTAAAGACACAAAGACTTTACATACCAAATTAGTTAATAGTTATGTTTTAGGTAAA---GCTCTTGCATTTCTTTATGTTCGCCCCGACCAGGGCATTATAATCAACAACTACTTATGAGTTTCGTTGCGGTGACAAGG------AGGCGGCTCTAT---TTTATTTGGGGCTGTTGCCTGTCGCACATGACAACGCTTGCCGTCGCGCCTGTAAGTGTGTGGATCGTATTTCTTAGTTCCTTACGCCACAAAATCGCAATCAATATCGAATAGAGACAACTGTGAACTGTGACAAATTTTGCGACCAACTGCCAGATACTTGCTCGCCTGTGAATCTCGATAAGCATCAAACAAATATATATGATAATCAAATAAATATATTTCTAGCCGTGTGCTCTCGCACAAGCAGGCGCGACTCTCAACACGAATTTGGCGCTCAAATAGACTTATTTAGATGATTTTAGGTATTCGAATTGA-AGTGTTTATGTAAAGTGTGCGTTTTT----AAAACGCAGCTGTACAA-CATCTTGCCATAAGAATTATGTTAAAGTTCTCATATCGTGATTTTATCTTTTTTTATGTTAGTTTTTTTTTTTTTTTGTTTTTGTCTAAGCAAACTAACAACAGTAACC---------------------------AAACAGAAACTAGTCCTCGTC-----CTGAGAACCCC----CTCACACCAAAGCGGCTGCTGCTCGGAAGGACACAGCAATATTATA--------AAACATATTCAACGTATAAAACTAACCAATATTAATCAA-TCTTAATATAACCTTATCTTAGCAAGCTTC---------ATTGTAATT-------CCGACAAGACGTTAAAAGCCCAGCGCAATTCCTATTTCCTTATTTTTTTTAGATTTAAGCATCGG--------TTTATCATTCAACGCATTTGCATTACTAATTTTAATT----GCTTTTTAATCGCTATTTAAATTTGT--------ATAATTTTATAAGTGTTCCTTCCCGTAACCACCG-TTGTATTTATATTCAGCTAATTGCTTACCATTTTTACA------TTATTTTCGTTTTTAGCTTAAACACAGATTTATATCGGTATTTATATGCATATATATAAATTTGTATTTATATATTTCATTGGTTTCGGTTTGATATTATGCAACAATTTCTCATATTTTAGTTTTATATATTATTTTTGTGATATTAGCGTAACAACAAATTGATTATTACAA---GAAAAAGGC--AACTCTCGAATTAAAATTTTGA---AATTTAATAAATATATATT-ATATTGTAACCAAA
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GTTCCATGCGCAGTGCGCCAAAACACGTTTCCCATAAATTAGGAATAGGCTATACATTTA---TTCATTACATTACATAC
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CAATTCAAA
CAATCTTAT
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AATGAGTAATTAGGCTTACAAATATGTTGATCATAAATAATATCTAAG-----ATCAGTTG
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-GGACTCAAATTATGCATAAGAGATCACTTTTGGTTGTAACATACGCAAATATAAACGAC----AATTTATGCACCCAAAGGATACACACGAACAGG-----------ATGCATTGCGCTCATTGCTTATGCATGCGTATAAGTCGGCGGAAAAGGAATTGTAATCGAGCAGCATTGACATTTATTTGACAAGTTTTTGATTGATTTTACAGCTGCT
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TCAGTCATTAACGAGTACCTCTAAGTTTAGATCTAAGCATAGCAGTGGGTGTCCTCCCATTGGCTACTAAAGTACTTACCAAATATAACCATAATCAAATACCTTAAGTTATTGTCTGAGT--ATCGAATGAATTCTTG---CAAAT--GACTAACTAAAGAAAAGTTGACGAAAAAATCCTAA-------ATGAATGAACCATATTTAGCTTCTTCTTAGCAAAAATAGCTGACGTACTGATTCAGTTCAAATCAGTTGACGAAC---CCATGTTCCGTGCGGGTTTA---TAATTCATATATAAATCACTGTATTAATAGCCAAGGCGATAATGCCATTTCCGACTGTTGTGTTTATATAA---------AGCCGGTCTGCTAAGTAGCTCGAAGGCTATTGTTACACAGCATTACAGACAAAACAT
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ATGCACAAACA-ATCCATCAACAAAAATACATAGGCTTCTGTTTTAA-CT
ATGCACAAATGGATCCATTAGCATTAAAAAAGACAACAATATTTTAAACT
>Gfr 4128408 4128520|4250 chr3R 4128486 4129528 scaffold_13 3032540 3033585 - 53320|0 34
ATGCAATTAAAAGCTGCCAAAGTAAAGTAGACTGT
--GCAAATA-----TTTCAAAGCAAAATATTATGT
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TTTCTGTAACAAGTTTGGTTAAAACACTCGACAGAATAAGATTTGGATAATGTATGTATTTAATTTGTAACG---AATAAATTTAAATCAACAGTTTTCAACAA
TTCCTGTAAAATTATTTGTTAATATCTAGGGTAATATATCATTTAAATAAAGCATGCATTTCATTAATAAAGCACAATCACTTTGCGTCGATCGTTAGTTCTAA
>CG9617 4129907 4130307|4253 chr3R 4130242 4130958 scaffold_13 3033965 3034677 - 26800|0 68
GCGAAATG---GCCATACTCCTTTATTTATAGAGTCAGCGAGAGAGATTAACAGAGAATAATTACTATA
ACGATATGCAAGCAAAAGAAATTCATT------ACCATTAAGAAGCATTAAAATAAATAAAATACAACA
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AAAAGGGAGAATATAATTCAGTTTTATTAAATTC
TACAGGTAAAAGCGCTTTACTAACTATTACACTG
>CG11694 4136925 4137004|4259 chr3R 4136959 4139786 scaffold_15 668403 671352 - 68754|0 45
AGCCAATAACTTGTATATCTTATATTTTATTTTACTTTGCATTTTC
ATACAATCATATAAAATACTCCTTATTTATTTTTCAATAAATTTCC
>CG9613 4140506 4140875|4261 chr3R 4140431 4142112 scaffold_15 671997 673714 - 58943|85 476
GATGAGCCAGACGAGCGTAGATTGTAGTGTTAAATTATGTTTA---------TAGCGCGCTTTTTGATTCGC-CAAAACCAAAGTCTCTAGGTATCTGATTAGATAAAATCTTGTAAATAGGCTTA--------TGACCATTTTTAGCTCATTTGCAATAGGTTAAGTCTTAAAGAATATTACTAAGTGCACACCTCACTTAAACATCAATTAATTCTTAATTGTAAGTGCCCGCCTTGACGTAAGAACTTACGTAAATCACCCATCCCCTGAGCCCTCCTAACCCATTTGAAAAGCAAACTGGTTTCTGTATTAAATTCTTACGTGTTATTTATTATTAT-TATACAGATTTTGG---TTGTCTATTGAAATTCAAATACTCTTCAAATGT
TATGTTTTAT---------GGTTGTGATGTTAATTTAATTTTCATCTACCATTTGCGC---TTTCGCTTCGCACTAGACCAAAGTCTGTAGTTAGCTAAATAGTTTAATTATTGTATATGGTTTTATTTTGTATTAGTAATTTTAATGGTATTCAATGCAGATTG---TTGTGACAATATTAAAAA----ATACCTCGGGAAAAGACAAAGAACGTTTCATCTGTGCACGC------TGCTTTCAGGCTTAACGACCTTCAACC-----------------------TTTGCAAA-CAAACTGGTTTCTGTATT-AATGCTTAATCGTTAGTTTTAATTACAAATACAGATTATGACGTTTGTGTGTTGTAAGACAAATACTCTTCATGTGT
>CG9603 4165659 4165811|4284 chr3R 4165231 4165821 scaffold_15 696395 697130 - 15626|599 753
AGCCTTGCCCTGGATACCTGGACAACATGAAACACCCCAACCTACAACCTGGCTTATTGTT--TTGTGTTAGAATAGCTAAGATTTGATGTGTAAACTGAACATTCGCAAGAGCATTTAAAGCGTGGAAATATAAGAGATCTGGCTGTAAAGTAA
AGCC----------------GAGAGCCCACAACACCTTG-TTTACAACCAAATAGATTGCTGCTTGTGTTAATTAAGTTAAAA----GTGTGT---CTAAACATTCGCAAAAGCATTTCAAGCTTGGAAATATAAGA-ACTTGTCTGTAAAGTAA
>CG9603 4166150 4166241|4285 chr3R 4166145 4169175 scaffold_15 697183 700286 - 115584|5 118
AGT---CGCAGTA----CCGAACCCTAAGCTAAGCCATT---------------AAACCCCGCGCAAGATCCGTGATTCAGCGTAGTCGCCTTATATTTCAATGTTTTGATTGT
GGCGCAAGCAGTATAGTCTAACCTTTAAGCTAAGCCATTACCAGCAAATCCGCAAAACCATCCCCGGCACATTTGTTGCAGCAATGTTACCTTATATTTCTGTGTTTTGATAGC
>CG9601 4167382 4167592|4285 chr3R 4166145 4169175 scaffold_15 697183 700286 - 115584|1315 1532
GGAAGTAAAATAAATTGTATT-TAATCCAAAGTGAATATACGCTTAGCTATATCGGCGATCAACCAGTCCATGGAGCTAAGCAGTTTCTCGCCAGTCACTGCACTAACTCCGGCCACCAGCCAATGATGTGTGGTGATATCCTCTAGGTGTAGTATCTTTAAA-TATAAAGTATATTAAATGTGTTGTTTCAATAAAAAATCAATG----AGAGTGA-
-GCCGT----TGCCATGTATTCTAATCTAACGTAAATATTCGTTTTGCAATATCATCTATAAGCCAATCCATGGAACTTAACAGCTTCTCTCCAGTTACTGCGCTAACTCCAACTACCAACCAGTGATGTGTGGTGATATCATCCAAACATAGTATCTGTAAACCATAGTGTTAAAAAAAATTGATATCGTTAAAATAAATATATGTCGAAGTACGAG
>CG9684 4185680 4185816|4302 chr3R 4184318 4185729 scaffold_42 408414 409910 - 63542|1483 1532
TTTTATAATTTTAAAAACATTTATATATAAATAAAATTCCATTAAATAAC
TTTTTTTATTTTAAAAACAT--GTATATAAATAAAATTCAATTAGATAAC
>CG9684 4185680 4185816|4303 chr3R 4185730 4186236 scaffold_20 1283242 1283716 - 4611|0 91
ATTTTAAGTGCATCAAATGCCATTTACTTGACACCACAACTAAATCGGGTCAAACACATTACGAAGTT-----ATTGCGAATAAGCATTACG
A-----------------------AATATAAAACCACAG-------GAGAAAATTACGTTGTCAATTTACCAAATTTTGAATTAATATT--T
>PQBP-1 4204890 4204996|4330 chr3R 4204789 4205875 scaffold_3 4826217 4827329 + 9024|118 231
TCCAAATCGAAACGAATCTTGTTGGGCCCCCAATTTAGTGCAATGTATAAATGTATGCACCTTGTATTAA----TTTATTTTTATGTAC---AATAAATTTATCTTACATTAAT
TGATAAATATGACG------TTTGAATCTCAAGTGAAATGCAATG--TAAATGTGTGCACCTTGTATTTAATTTTTAATTCTTAAGTGTATAAATAAAATT-------ATTAAT
>CG31453 4385880 4386011|4551 chr3R 4385709 4389086 scaffold_3 5055244 5058355 + 72164|172 310
AGGAAGACCGAAGCACAGACTGAAAAAATGAATTTACTAAACCCACTCTATGTTCATCAAATGCGATACTTTGTAAACTTCAATTTGCTGCTATGAAAAACAA-----TCCGATGCA--GAGGCACGGGTCCAATCCCC
TGGCATGACGAGAAATTTGTTAAGCAAATGACGCCATACAAGTCCCTTT---TCCATTACATGTGATGCTTT-------------------TACTAAAAACAATGTTGTCCGATGTGTCGATGTGTTCATCATTTCATT
>mRpS18A 4387628 4387666|4551 chr3R 4385709 4389086 scaffold_3 5055244 5058355 + 72164|1969 2007
TGTTAAATACAATAAATGTTGTTAATAGAAAATATGATT
AACTAGTTTTAATA--------CCATAATAAATGTAA--
>Cyp313b1 4468782 4469227|4638 chr3R 4468609 4468838 scaffold_11 3098725 3098929 + 571|177 233
GACATTAAATATCATTCAAAGCTTTAAAAAGAGTTAAAGCAAGTCAGAAATATACAA
GGCTCCAACAATCATTTTATGTATTTTAACAAAT-AAAACAAATTA--AATGTGCCA
>Cyp313b1 4468782 4469227|4639 chr3R 4469044 4469901 scaffold_17 605191 606078 - 35887|0 212
GAAATTGAGTTTGTT-----------------TCATCTTTTGCTGTTGACCTCGTTAACGATGACCAGCCCCTCTTTCCTTGCGCAAATTG--CCAGCTTGCAAATGGCTATAATGGATTTCAGTTTGCACTTGTTCCAGCTCAC---CCACAACT--TTGCAGCA-----CACGTTGCGTATACGGAACATAATTGATTAAATTCCTTCGAA
TTAATTGAATTTGTTCAAAACTTGTACAATAATTCACTTATGCTGAGGGCCTCGTTAGC--------------CGCTTCTCATGCAAATTGCCCCAGTTAACCACGCCTTCGTCTCCGCTTCCGCTTCCGCTTTCAACTGCTAACTGTTCATGGCCAGTTATGGCATGCACCACGTTGCGTATACGTAACGCAATTGATTTAATTGCATTGAA
>Cyp313b1 4469283 4469309|4639 chr3R 4469044 4469901 scaffold_17 605191 606078 - 35887|268 306
-TGAAAGGGTCA---TATGCCC---------CACAACCG
GTGCTCGGTTCGACCTTTGCCCTCTCGAGTGCTTTCTAG
>Mkk4 4473287 4474443|4648 chr3R 4473127 4474771 scaffold_17 613242 614807 - 32020|180 1462
TCACCCTAAGCG-----AAGATGCAAGTCATAAATTAACTAAGATTCAAGAAGAACACAACAGCATGCATAACTAAGCAGAAGGAAAGCAGATAAAAAGTTT------------------------------TAATTGTTGTCTACTTTGTAGCATTCGTAGAAAACCTAGCGCATATTTTGTTAAACAGAAAAACAAACCTAAGCGAAAA-GTGTGTAAGCTGATAGTAAGCAAAATGTGTGTGTATAGTTTAAAGTCCCTAAAGCCTATTATAATTCAATAACTTTTGTATTCGCAGTTTTGTGCGTTAAGTTTTGTGTTGAAA-ATAAATTTGTGTTTACAACAGGCGAGCGGCGGGTTACAGGCGAATATATGGGCCAATAACTGACCAGCTTCGGACTCCCAGCCAAAAGCCTATTTAGCCTCAATCAAGCGAACATTTTATAATCCGGTTGATTTAT--CTATCATAAATAATGATAGCAGACTAATTGGAAATGCATTTTGCGTTAATAAGCAACCACATGCGAAACTTAAGCAATATTTGTAAAAAAAAAACAGCTTCGTGAAAACGAGAGTTGCTAGCCATGCAAACAACTAACAGAAACACCAATGCGCGTTAAGCGTAAGTAACAAGTTCAACAAAAACA--ATTTTACATTATTTAT-TGAACAGAATTTGTAATCCTATTATATTTTTTTAATTTGCATAATGAAAATGATTGTGAAAAGCTTTAAATAATTGCCAAGCGGCTGAGATGTTT---AAATGTAGTAGAAATTATTGCAGATAAATGC-AAACTAATCCCATAATATATA---AAAAAAATTAACCA--------TAACACCTACACATTCAC-------AACACACACACACGTTTTTATGCGTAGAAATTAG-TTGTAAGCGAAGCGAAAATATTTAGCAAAAAGTTACAGCTACAAAAACAAAAGTCATGTGAAAACTA--------CAAATAAAACAAAATAAATGTATTGTGCCTAAGTATAAACCGAAATGATAA--------ACACTCACCAAGAGAACTACAATTTA--AATTTAAT----CAAAACTCATAAGCCATTTATAAT------CCTTAGCCTAGCTTTTAAACCCTTAAAC-------------CCTGCTTATTAGACGTAC---------------CGCATATTTATA---CCATGCCATTCC--TGCCCAAAAATATTCACAGCCAAACAATTGCACCGTCTATGTCCCCGTCTCAAAAAAGAAAAAAAAATAG
T---CTGAAGTGCGAGTCAGACTAAAGTCATAAATTAACTAAGCAAAAAAACAGTAACAACAAAACGCA-AACTATTCAAAAACAAAACATAAAAAAACCCCAAAAAAAAATGAAAGAAAAACTTAAAACAAAAATTGTTGTCTACTTTGTAGCATTCGTAGTAAACGTAGCGCGTATTTTGTTAAA-GCAAAAACAAA---AAGCAACAGTGAGTATAAGCAAAAAAAAAAAAAAA---------------AAAAGAAGATAAAACAATTTGTAA---AATGCGTATAAAATGTTTATTTTTATG---------TTGTAGTGAAACATAAAGTAATGCCT--------------------------------------------------------------------------TTTCTTTTAAGTTAAGTGAGCTAGCATTTGA----------AATTTATGGCTTTTGTTTATAGTTGT-------------TAACTGCAACCTGC-------AAAAATTAAAAGCGAGATTT--GTAAAATTTGTACA----------CGCCAATTAAACAGAAACTGTTAACTA---AAGCAAACTACGAAA--------------TAGCCATAAACAACAAGT-----AAATACAACATTCAATATGATTTATATTTAGTTTATCCGTAAACATTCTATAAATGTTTGTTTTGCAT-ATGAAAGTTA-AGTAAAAAGCTTTAAACATTTGCCAAGTGGCTGCATTTTTTTTAAATTGTAG-AAAAATTA-TGAAAATCAACACAAAATTAATCCAATAAAATATAATTATAATAATTAAAAACAACAAATTAACACACACACATTCACTGACACTGACAACTACACACGTTTTTATGCGTAGTATTTAGATTGTAAGACCTAAAAATATATTTATAAAAAATACACAATTGCAG----------CTTGTGAAAAATAAACAAAAGTAAACAAAATAAAATAAATGTATTGTGCCTAAGTAAAAAAAAAAAAAAAAATAATGACGATATAAACTAAAATCATAATAATATAATAATTAAATAATGTAAAACGCGTCAGCTAGTTTATATAGAATATCTTAGCCAAGCTTACACACACACACACACACACACACACACACACACACAACACGCACATGTAGACACAGCTACGCTTATATACATGGCCATACCACGCCCATTTCAACACACACACACACACAAGCAATTGCACCGTCTAAAATCCCGTCTCAAAA---------------
>Dhod 4477111 4477234|4650 chr3R 4476791 4478668 scaffold_17 616832 618673 - 53383|324 447
ATCAAAGATGCCACGATTTGAAGCAAGTGCTGCATTCATTTGTGTAAAACTAAGCTGTTAACAAACATTTCTCATGCTTTTCCTTTGGTCTAACCAATAAATCATTAAATTCTTCATTGATTAA
----------------------------TCTGCCCTCATCCAAGTAATAAAA-------------------TTGTGTGTATATTTTGATT------ACAATGCGTTA--------CTTCACTAA
>bel 4481292 4481506|4653 chr3R 4480638 4481629 scaffold_17 620886 622039 - 16491|720 1079
GCAAGGCCTCAGCTTCAGGCAAAGGACCTGGGCCAGCAGCAGCAGCAGCAT---CAGCAGTCGCATCGTAGCCACTTTCGCAAATAACCAAA----------------------------------------------------CGGAGTAAAACAAAG------------------TCGATAACAACT-------------------------------------------ATATATGTGTACACACGTATAC-----------------------TATATAGGAACAGCAAATGTGAAAGAGAAACTGTCTGTGCGCAGCGCAACAC---AAATCACGAA--AATACAGA-AAAGATA
GCAAGGCCT----GTCACCCAGAG-----GGGCCGGCAGCAGCAGCAGCATCCACAGCGTCCACATAATCCCGACTAGCGTCAATAATAACAACAAAAACAACAACAACAACAGAAAGAATAACTGATAAAAACAGCAAGGAGCAGGAGCAAAGCAGAGCAACATTTGATGAACCGATCGACAACAACTTAATTATATATTTGCATATTATATGTATCATCTATATATATACATATATGTATATATATATATATATCTATATATATATATATATATATATATAGGGGCAGCAAATGTGAAAGAGAAACTGTCTGTGCGCAGCGCAACACTCACACTCACGCATTAACACACACACACACA
>CG9770 4486622 4486807|4655 chr3R 4485212 4486737 scaffold_17 625326 627011 - 21410|1670 1814
ATCTCAAGCTAAGGCCAA--TACCAAAAGCATTTATTCTATATAAACATGTAC-------------ATTCACA-ATATGTATATTCTGAAGACGAAAGTG-------------AATGAATATATTCCAGAGTTCGAAACTTCGAA
AGCTAAAGCTATAGCCAAAATACCAAAAGCATTTATTCTATATAAACGTATATTAAAACAAGATATATTTACATGTATGTATGCCTACCAGCTGTATGTGTTTGTGCGTTAATAATAAATACAT--CAACATTGTATACTTC---
>CG9770 4486622 4486807|4656 chr3R 4486753 4490705 scaffold_17 627318 631214 - 129490|0 54
ACGATATGAAAATTATTATTATATACATATATACGATACTTTATAGCCATATTTA
ATG---------TTAGTGTTGTCCCT-----TAAGCTAGTTTCTAGCTAAATTTA
>CG9773 4501005 4501102|4670 chr3R 4499657 4501667 scaffold_15 1205158 1207154 + 78997|1402 1505
TAATGCAA----TGTGCGTTGTAAATTATTCTGCGT-TTAGTTGCTAAGCCACTATACTACAATTATGACTAATAA-ACTAATTAATTTAGCGTTATCCAAACC
TGATTCAAGTGATGTGGGATGTAAATTATTTTGCTTCTTAGCTGCTAGGCGCTCC--CTACAATAATGACCTATAATACTAACTACTCTAGCATAATCCA----
>hb 4517038 4517599|4682 chr3R 4515028 4520703 scaffold_15 1220378 1226254 + 152996|2264 2947
GTTCCCCATCA----CCATCACCTTGTTATTA--------TTATTTATCACTATTATCATATAATCGTTGTCCAGAATTGTATATATTCGTAGCATAAGTTTTCCAAACATTATTTTGTTGTCGAAAATTGTACATAAGCCAATTAAG---------------CCGCTAATTCTAGACCTAAGTTTA---------------------------TCTAACT---ATCCTAACTGTAT---TGAACTGTAGCCACCTT---TCAATCTGTCTCCTATACACTCTTGTATTTTCG---------------------------AAATCGACTAAAAACCCTGAAAACGGTTTAAAAACTATCATAAATGCATGGAGAAACATAAGCCTAAGTTAAATC----TAATTTGTAAGTTGAGTCAAGCGAAACAACCAAACAATACCAACAGTCCAAAGTCAAATTAATAAAATATAGTTTATAACATATACATAATGAGTATGTTTTCTAAAATAATTAATTAGTCTTATTTA----------------------ACCTAACATATTCGTATATGCGCATAACACTCAGTTCTTTCTCTGATATTATTCTCTCAGTATTTTGTTAGTTGAAAGCGAATTCGAA----TCGAACGAAATCAAATCAAATAAATCCAA--TTATTCAATATA
GTGACGGGGGGCGGCCCGCAAATTTGTTATTAGATATTTTTTTTATATTATTATTAACATAT-TTCGTTGTCCAGAATTGTAAATACTCGTAGTTTAAGTT---------TGATTTTGTTGTCGAGAATTGTACATAAGCCAAAAACGCACAAAAAACGCTACCAACTAACTCTAGACCTAAGCCTAACTCTAGACCCAGCCAATAGATCCGTGTCTAACTCTAATTGTAGCTCTATGTAGAAACTATCCCTACTTTCTATTAGCTTTCCTTTTCTATATCTTTTAGTTACCAGCGAATGGGAACGCACAAAAGCGTCGCAAACCGAACAAAAAACCTGAAATCAGGTTTAAAAAATTCTTACTT-------------TAAGTCGACATTAACTTAAAATAATTTGTAAGCCTAGCCA-------------------GCAAAGAGTCCAAAGTCAAATTACACAGCAGCAAT---TAGTGTATTCTT-----TTATTTTCATCAAAATAAATGTTTAGTTTTTAATATATAAAAAAAAAAAAAAAAAACAAAAAACAAAAAACAACATGCGAACA-----CAATTTTCTTTAAAATATT------TCAGTATTTTGTTAGCCTAATTTCAGTTTTAAGTTGTGCCTCGACTTCGAGT-GAATAAATGGAACTTTAATCAAGAAC
>Cks85A 4540922 4541158|4706 chr3R 4539842 4541519 scaffold_15 1263177 1264878 + 70045|1094 1382
GCGGAGGATGC----CATGCCGCCGAGGAATGCTCTTCCAAGGACGCACTCGTCA--ATGCTCACGT-----AGTATTTCATAAG--------TTAGCATCAGGCAGCCTGATGTAAAATAAGAAACCA-TAGCTTTAGGGTTCA---------GCTGGGAAGTTCAAAGACACGAAACGAACTGAAGACAT---------------------CGTTTCTGTTAATTT--CATTAAGTTTATTTACCTAAAATACAAATCGAAGCGTACGCCCTGTGTACAGACAGTTT
TTTGACAACATGGTTCAAGACGCTGGCAAGAGGCTAGTGGAGAGGGCAGCGGACACAGTGTTTATGTTAGACAGTATTCAATAAGATTGGAGCTTATCATCAGTTACCTTGATGTAAAATAAGTTTGCAGTAGCTTAAGGACGCACTTTGATACATTGTTACAATTATAGCCATTAAGTCCTCTGTGGGTGTACACCCATTTGCATTTGGATACATTTCAACGAATTTTTCATTAAGTTTATTTACCTAAAATACAAA-----ACGTACGCCATGTGTACAAG----TT
>CG9797 4555512 4555657|4716 chr3R 4555027 4555848 scaffold_15 1281858 1282926 + 1017|698 860
AGCTGTCCT-TATAATATATACATAGCAATTACAGGCAATGCTAGACCGACAATGGCGCACAGCCAAGGAGCATTT--CTGCAA---ATAATTAACAAACCAATTGTAATA---TGTAGAACTTAATATTGAAT--------AATAAATCAAAACTTCAAATC
ACCTATTCTATATTAGATAAAATAAACGAATGTAATTAATGC-----CTACA-TTTTATATACCTTAGGAATCTTTGCTTACAACCCATTCTTTTCGAATCCATAGCAATAACTTATGTAAATTA-TATTGAATTATCTATAAATAAAGCAAACAACTAATTC
>CG9801 4561601 4562434|4720 chr3R 4557839 4562073 scaffold_15 1284381 1288630 + 142189|3858 4386
AATACCCATTTGGAATCATATATATATATATATTT--------ACGTAAGCATACATACACGGTGATATATCTCACATGTAACTTCGATATTCATATAGCTTTCGCTTAAGTTCGTTGATTTCAATTTGGTGTTCTCATTCGTCAGCCATAGTTTTTAGCCATTTATT----------------TGTAAATTGCAAACGACAGAAATGCCTCAAATGTTTAAAACTACC-----AAAAATAATAAGAATACACAAATG--------TACACCGTATTTTTACACTCTCATTCGTAATTCAATGTATATGCCACTTTTACAC-CAGTGCTACAATGTGAATTAATAA-GATATACTCTTTGTAATACCAGC-----TGTCTCATACAATTTCAAAT---------GTGGTAACGCATATAAATAGTTGGTAACGCACAGCTAAAGTTGCTAAATGGGCTGTG--GCAAACGGGCCTGG-GCAATAAATAATTGAGTAAACGCATTAAAAAATTGCGCTTTTACAAACACC
AACACGTATTCAGCAT-ATATAAATATACATAACCCATAAAAAACGTAGTCTTATGCAAAC----ATATAT------TATTTACTTGGTATTCATGAAGCTTTCGTTTAAGTT-GTTGATTTTATTTT-----TCGAGTTTGTCAGCCATAGGATTTAGCCATTTTTGAAATGCACACGTGTAATGCAAACGCAAAACGACA-AATTGCCTCAAATGTTTTAAACTATCTCTAAAAAAAACAGAATAATACACAAATGCAGCAATGTAAATCATATTTTTACACCTTCATAC---ATTAAA---ATATGCAACGTTTTAACGCAGAAACTTATCGTGAATTTGTAAAGATTAACAAATTGTAACAAAGGAAACCATTTTTAGCCCAAATACAAATACACGATAGGCCGCTGCGCATAAAGATCGTT----ACGCACAGCTTGAAT-GCGATAGGGGCTGTGCAAAAAACGGGCCTGAAGCAATCGTAAATGGAATAAACGAAATAAAAAA----------AAAAACA--
>CG9801 4561601 4562434|4721 chr3R 4562394 4563659 scaffold_15 1288631 1289906 + 60132|0 40
ATTGGAGGAAACGCTAGACTGCCGACTAAGCTTTTTATACA
-------------CTAAGCTGCCCAC------ACTCACACA
>CG13318 4596969 4597001|4758 chr3R 4595416 4596998 scaffold_103 62879 64454 - 39918|1607 1637
CCAATTTTAAACAATAAACTTTACT-GCTTG
CAAAAACTAAACCATTAATTGTATTTAATCG
>CG13318 4596969 4597001|4759 chr3R 4596999 4598648 scaffold_15 1336241 1337857 + 63359|0 2
AAA
ACA
>Pif1B 4599994 4600334|4761 chr3R 4599994 4600987 scaffold_41 693678 694620 - 14708|0 372
TCATGAATCATATGTATATCATTATATCGAATATCGTCGGATAT---CACCGTTATCGGAACAAAGGAGCTAAACGCTCCCTCACTTTTTAGCTTGTACATATA----GCGTATTGATATGTAGTGTTTGTT----------AAGAGTTCTTTATCTGGAGGATACCAATTGAAATCGTCTGTACGTAGTGCTTTGCATAGTGCCTTAAATCGTAATAGTATATCGTAAGCA----AATATCAATGCATTGTAATGGAATTGAAAGCAGGTGGCTTCATTCCGATGGCACGT----TTGAGTTCACCAACACCAAATTCACTT---TAAATAAATGAATCTCATTG----TTAGAGATGAAAAAAAATAAAAA
TCAAAAGTT-----TCTAT-------TCGAGTTTTGTCCGTTCTTAATACCGTTA--------------------GTTTCTGTCCCTTGTTCATTGTGCATATAAATCGATTATCGATTATTATCGATTATTTCACCTAGTGTAGAGATCGATATTTGAGGAATACAAGTGG----------------------TCCAGCATGCATTCAAGCATAGGAATTTCAAGTGGACATTTTGATCCCTTTACAATGTGCCTTAAATACAA--AATTGTACTCATCGATGTTGCACGTGTTGTTGCGTTTTAAAACGCGGAATTTACATACATACACTAATATATATTTTTGAATCTGTTATATGAACAAAACTAGAGA
>Pif1A 4600008 4600628|4761 chr3R 4599994 4600987 scaffold_41 693678 694620 - 14708|14 674
ATTTACTTGGATGGGCATTTGACGAACCGATTTTACAGTTTTCGTCACGAGGCCGGAGTTATTACCAATGCGGATGTGACCAATCCGCACCAGGTTGTGGTGCGCGCCGTAGCGGTGGGTCAGGAGTTTCCCGGCGAGGGTCCGGGTAAGGATGCGACCCAGGAATGTGGCTGCCAGGCGGTGGCACTTGCTCATCCCGAATTGAAGGCGGGAGCACAGAGGCCGTGGTCGCCCAGTCTCTACTATTATGATCCCAA--------CCAATTGCCGCCGGCGGAGGACGTGCAGCCGTGCTAGTCATGAATCATATGTATATCATTATATCGAATATCGTCGGATAT---CACCGTTATCGGAACAAAGGAGCTAAACGCTCCCTCACTTTTTAGCTTGTACATATA----GCGTATTGATATGTAGTGTTTGTT----------AAGAGTTCTTTATCTGGAGGATACCAATTGAAATCGTCTGTACGTAGTGCTTTGCATAGTGCCTTAAATCGTAATAGTATATCGTAAGCA----AATATCAATGCATTGTAATGGAATTGAAAGCAGGTGGCTTCATTCCGATGGCACGT----TTGAGTTCACCAACACCAAATTCACTT---TAAATAAATGAATCTCATTG----TTAGAGATG
ATTTATGTGGATGGCCATTTGACGAATCGTTTTTATAGTTATCGCCACGAATCTGGTGTCGTGGCCAATGTGGATGTGACTAAGCGGCATCAGATCGTTTTGCGCGCACAGGCGGTGGGTCAAGAGTTTCCTGGCGATGAAGTTGGT------------------TGCGGCCAAAATGCGATGGTACACGCCCATCCGGAGATGCTGGTGGGCGCTAGCCAACCCTGGACACCGAGCGTCTTTTTTTATGAACCTTAAGTGCGCCCAGTTTGACGCTGACGGCGCACAAA-----GTGCTAGTCAAAAGTT-----TCTAT-------TCGAGTTTTGTCCGTTCTTAATACCGTTA--------------------GTTTCTGTCCCTTGTTCATTGTGCATATAAATCGATTATCGATTATTATCGATTATTTCACCTAGTGTAGAGATCGATATTTGAGGAATACAAGTGG----------------------TCCAGCATGCATTCAAGCATAGGAATTTCAAGTGGACATTTTGATCCCTTTACAATGTGCCTTAAATACAA--AATTGTACTCATCGATGTTGCACGTGTTGTTGCGTTTTAAAACGCGGAATTTACATACATACACTAATATATATTTTTGAATCTGTTATATG
>Pif1A 4600693 4600836|4761 chr3R 4599994 4600987 scaffold_41 693678 694620 - 14708|741 884
CACCTTAAGGCTACAGACTTGACCAACAGAGGTGGACCCGGCGATAGTTTTCCCGTCAAAATTAAGAGTGTGTGGCCATTGGGTAACACCGCTCTCTACGTCCAATGGCAATTGGAGGACTGTCGCGCTGTAGCAGGATATGAG
-ACGCCCAAGCCGTCGCCTTG--TATGGGCAATGGGCCGGGGGAAAGTTTCCCTGTAACCATTACGGATGTCTCAAGTTTGGGCTGTCGTGCGCTCTATGTGCGTTGGCAATTGGATGACTGCGCCGCCGTTGGTGGATACGAG
>Pif1A 4600905 4600982|4761 chr3R 4599994 4600987 scaffold_41 693678 694620 - 14708|959 1036
AAATACTTTATAGACTCCATCATCGTTGATATGCATGCCATGGATTGTGTGCTCGGCAACAAGAAAGCGAAACCAAAG
AAATTTTTCATTGATTCCATCATTTGTGATTTGCATGCTATGAATCATGTGATGAACAAGAATAAAATTAATCCCAAG
>Pif1A 4601040 4603648|4762 chr3R 4600988 4601238 scaffold_41 694954 695197 - 3091|61 260
ATGCGAAGAGTGCGCGCTGAATTGTG-AGGAATGCCCGGAAGATTGCCCGTTGGAAAAGTGCGAGGAATGCGATGATGAGTGTCCCCCAGAACAACAAGGATGCCTATGCTGCCACTGTCGCGCTCTCATATGCGACGAGGAGTGCAAGACGGTTGCCAATACCCTGCGCTCCGGAATGTGTGATCCACTCTGCGAAATG
ATGCGTCGCATGTGCG---AATTGTGTGGGGATGAGCAAACCGTAGA-----GGAGGAGGCCACGGAAGGCGTGGACCGG------CCGGGAGAGCCA---TGTGTTTGCTGTCACTGTCGCGCGCTCGCTTGCGACAACCAATGTAAGACTGTATCCAAAACACTGGATGCCATCCGATATGATCCCGTTGCCGAAACG
>Pif1A 4601040 4603648|4763 chr3R 4601863 4602323 scaffold_41 696213 696648 - 4168|0 463
AGTGCCCAAGCGGGTACCGGCTATCAGACACCAGAGGATCTTTGTGGAAA---TAGGGCTATGGCCTGCTGTTCTCGTAAGGAACGCATCCTGATGCTGATGGAGAAACTGACCAGTCCTGGTTGCGATTGCGGTATATCTCGCCCCTGCCTGACCCAACAACTTTTCCGGGAACTAACACTACTCCTGAGATCAGAAAAAGATGATGCAGTTGCACCAGCGGATGAAGCTAGCCCACCGTGCCTAACCTTCGATGAGTGCTGTACGGCCCAACATGCTGGCAATGGGGAAGGCGATCCAGTCGAAAAACCCCCGTCAAAGAGAGAGCTCCAACGAGTCGAGTGCTTTCATCAACTGGAGGAATACCTCTGCAAGTGCTTCCTGCCGCCGGCAGAACCTCAGATTCCTGAGACCGATATCTATGCTTTTGAACTAGATCCGGACTTTCCACCAGAACCTGAGCC
AGTGTGCATCCGACAGGCAGGTGACAAGTTACAGGAGCTGTATATCGAACGATTGGGGCAATGCC----GGTTCACCAAAGGAACGCATTGTGAATATTTTGAATTTATTGAGCGATTCAAA---CGATTGCTGCATGGATCGCACTGCCACTATACAACAACTGTTTCGTGAACTAACCATGATGCTTCGCCGAGAGGAAGACGATGA---TGAAGAGGCAGCTGAACC------------CTTATCCTACGAAGATTGCATGGCAGCCGTAACGGCGGGCA-----GACTACCA-CCAAAAAAACAGCCCAAGTCGAAAGACAAGTTAGAGCGGATGCAGTGTCTTGATCAAATGGAAAAATATCTGGAGAAATGTTTTCCGCTAAAAGCGGGTCGGACTATACAACCGACGGAAATTGTCGCTTTCGAACGCGATCCAAATTTTGATCCTTATCGTAAGCC
>Pif1A 4601040 4603648|4764 chr3R 4602715 4602801 scaffold_41 697431 697512 - 2764|0 87
CTCCTTTGGGCCAGGC-GATGAGACCTCAGCAACCACACGATCCCAATCGATTGTGGGTCAGGTCACCTGCCTATGCGCATCGGAGCA
CTTCTTTGGGCTACGCTGACAAGACCTCGTCA------CGCTCGCAGTCTGTAATGGCCAAGGTCACGTGCTTGTGCTCGTCAGATCA
>Pif1A 4601040 4603648|4765 chr3R 4603570 4603674 scaffold_41 700773 700898 - 3587|0 99
TGTACATGCAGCATGAGCGACATT------------CCGA---CAGCGACCCCAACTCCCGCCATCA------ACAAACCGAGGCATCCCACATGAGAGA
TGTATATGCAGGATGAGCGACGCTGTCCAATGAACGCCGATGCCCTCGCCCCAAACTACCGCACCCAAGACATACAAACTGACCAATCCCATTTGAGAAA
>CG33191 4604098 4604127|4766 chr3R 4604097 4607643 scaffold_41 701021 704798 - 28091|1 30
AATGTGTTTGCTCACCGAATCAAATCGAAT
AATCCGT---CCCTCCCAACCGCTTCGCTT
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ATTTTG---TTACCACGCAGCA-GTGAAGAGCATGGAGATGTGTTATTGCAA--TTCGATAGCAAGCCAGAGCAACAAAAATGTGGTGAGAAGCATGGG
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AAATGGATTATCATTCGTTAAGAGGAACAAA
AAATA---TATAAATCGAAATGAAAAATAAA
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AAAGGAATA--AAAGACATCGAAGGGA
AAGGGAAAAGTAAATGCCTCGAAGGGA
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C------------GCAGGAACAACAAACGCAGCGAAATGGCAACCACAATA-----------------AACTGAACATGGA-----GGACCCAACACGGATGA-------------------------CCGTCAATGACTTGCAAATTAAA---GAGGAAAAAATGAAAGAAAGAAAAAAAAAACTACAAAAAAAAAAATCAAAAATATAAAAATTGTAAAAG
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AAGCGATGTGTGAATGTT----AATGCGAAGATGTGTG---------------TGTTTTTAAGGGTTAGCT--AACTATTAGATACCCTTTTTGTGAATAGGCA---ATATGTTGTG---------------------CGGAAGCCATTTAAATTTTTAGTTATGCAAATTTAAGCCTGTAGAATGTACATGTATATGAATAATCAATAAACTGTTAACAAATCTGAATATGTAGGTAGACTAT
>CG9836 4648983 4649145|4816 chr3R 4647019 4649890 scaffold_3 499553 502287 + 45609|2129 2296
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-------AGCCGCATACATAAATAC---------TCCAGTTAAATACAAACCAACAAACTTGATAACAGCTATAAGTTATCAATATTAGAAAACAACAATATGCGTACATATATTATTT-GCATTGGATT-----------TTATAGT---ATATAAATGTGTGAGTA
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AACGATGCTATCGCCACTTGTCATGTGCGGGCCGCAGGGCCTTGAGTTTCTGGTGCCCGTTACACTCAATATACCCCATTGTGCCGGACGTACCGCATCACTGGGTCTGGCACTCAAGGCCACCGACAGTGAGAAGAACCTCCATACCGAATGGGACAACATTGATCTGCCCAGCAATGCGGCTGCCCACACAGTGTCCGTCAAGGTGGATCACTTCTAGGCCGTAGAGCACTACAGTTACATAGTTTTAGAACGTTACTTAGACCCATATATTCCCGCCCCCAAACACACAATCCTCTCATAAAAGGAACCTAATTAAATTCATATAAACAATTGTAAATAACATCATCAAATATCATATA-----------AGCCACAATTCCACGACAAGAGAAATAAC------------ACAACTTAGATATTGATTATGAAAAAGAAAGAGCTAATTTAAATGCAAATTTTTGTTAATTGTGCCTTTAAGTGATCGATTTGCTTTTGAACCAGGTGTCGTATAAATTATATAAGCGAACGAGTTAAATTATCGAAGTGAAAGCAAAAAAAGAAATATCTGTATAAAA-------AATCTGATAACAAGCAA--------CTGTATATTTTAATGAAATTTATTAACCCTTTTTGCTATGTATTTTA----------CAACTTTAAATTAATTTAATCGA-ATATT-GATATTTCATTCTACGCAATTTGCAAATTGTTTTTATCTATGATCTATTTTA-TTGCATTGAAAATGTTCATCGTTTGCAAATGTTGTATACAAAATGTATACATATATAAACCACATAGAT----GCATTAGACTTAGG----------AAGCGTCTATATAGCCAACAAAATTAATATATATACTAATATGTATTACATATAATTA----CTTTTTTGTATGAAAAAGATATAAGCACTTAG
>pyd 4658909 4659329|4820 chr3R 4658054 4660020 scaffold_3 513184 515192 + 47214|944 1456
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>pyd 4661323 4661646|4821 chr3R 4660054 4663451 scaffold_3 515669 519006 + 78884|1379 1768
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TCATCCCGTTAAACACGCCGCATAATAATCAACAACAATTATCAAAAAAAAAAATCCTCAATACAACACCAACAATTATCAACAAATAACGAAATACTCAACAAATGTCCTCGTCCAAAACTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAT--------------------TATCTTGTGTTCGTCCAAAAAAAAACTATTTTTATATATTCAATATGCTTGACAATACAAATGAATTTCAATCGAACGTATCAACCAAACAATCAATCATACAATTTGCTATGTTTCATTTACGTTTCTTGTTGCTGTTTT-------------ACAAACAAAACAAAAAATACAAATCGTTGGTTGCT-ATTTCCCGATATATATATAACCGATAACCGATAACC
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AGCTCTCTCCCCCCTACAATGACCAGCTATTATAATGAAATAACAATATAAATTAAACGTCCGTTGGCGGTTATCATATTAAAGAATTTGCCTATAATATATAGAAAATTTTGA-TTATATGATAATTTTGGA----AAAATGAAAGAAG-------TTAAATTTATTAATTTAAATTTTTTGCACGCCC---------CCGTATCCATCGGCAGATTAAGGGTATTCGTCCGGTATTCGTGTTTTAAGAATTCCACTCTCGATTTTATTTCATCAGCTTCCCCCTGATTCCTTGATTATATTGAATGAAACTTGGCATGCAAACCGATTTTAATCGTCTTCAGTTTCTCCATCTTATTTCTTTTTATCCTTGCATTGATCTTTCTTTTCTTCCTTTTTTTGATCTTTTTTGCACTTGTCCCTATAGAATTGTAT
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TAATGCTCCTCAAGCAGCTGAAAGAACGGCCATAACTGGATAGTAAATACACACGCACACTCACACATAGCCATTGT-CATGTCATTGTTT--------------ATATACAATAGTT---------CATTTAGTTTTTCTTAAATTTGTATACATTAGC-----AGATAATTTCCTAGGAAACATAGGCTTCA------------TCATTTTGTGTTGCGGCTGCGTCGTTGATGCGATACAGTGTTCGAGGAAAGTATGTTGCTAAATTAAAGCAGCTGCTGAACTTTTATTATA
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G----CGCGGTTA----------------ATACATGTTTGTTACGTTTTTGACACTCCAGTGATATTTATAAGCAATAAAGTAATACCATATTTAGTT-----TA
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-----------------------------------------------------------------------------------GCATTTTTTTTTTTCGTAAAACATGATTGCA----AATAAAATTTGTAAGGAAA----
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TGTCTCT-----------TAACCATAA-------CAACAACAACA-TAACAGCAAAAACAACCACATGTTGTAGCTGCTGCAGACTAAGTAACAACAGCAATATGCAAACAACAAATGGAACGCAATAGCCAACCACAACAGCAACAACAACAACAAAAATAACACATCAATCAACAACACAGCAGCAACAACAATAACAACATACACAGCCGTAAGAGTAACAACAACAAC------------------------AACAAAAGTAGCC----GCAGCCGCCGTCGCAGCAGCAGCCGCAATTTCGTC-----AAACACTATATTATATGTATCGTTTATTAAATATATTAAAATTTATATAATTATAAAAAAAACAATTGAACAGAGATGTGCAGAAAGAAAAATTATTGTAATCATTGAATTAATTATAATTTAAAAAACAAAATGATAC
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-ATGCACTCTCTCTCCCTC---TCCCTCTCTCTCTCTCTCTCTC
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>neur 4846068 4847514|5018 chr3R 4847305 4847767 scaffold_27 519882 520428 + 14516|0 295
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GCA-GTCAAAGCAGTTACCCAAAAAAACAAAATACACACAAAGAAAACCCTCGTCTATTAGCACACACACACACACACACACTCAACGCATTTTCTTCGAAAGACGCAGCAATTTCCTAACTTTGAACTCGCAATCGACTTAAGCAAGAAGTATAAATTT--AATGTTTAGCAAGAGATTTGCAACAAGCGCAAAGA--AAATATTTATAACAACACAAATTCGTCAATGAATTTTTTAAAGCAACTAGTATTAGCAACTAGTTTTGATAGCAAAAAAAAAAAAAGAAAAGAAAAT
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ATTTACATTTTTATTTCTGCTGCCTAACACAGCGGGCCATAGTATTTTGTTATTTAAACCATTAACC----ATTAGACGGAAAAAATAGACTAAGCAACAAGCCA--TTCATATAAATACCATATGTTATAGTAACAGTTAAATAAACTACATTCAAATGTAATAAAAATATGAAA
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TTATATATATAAATCTATATTCTTTAAGTAAC---ACTTTACATATA
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AGCGGCGAATTGCGAGGCGCGTTATCGAATTTTAGTTTTTAGTAATTGGATGAAGGAGAAGGAATGCGAGGAGAGCATTAAAAGCAAAGCGAATGCTTACTATAAATACTATAAAAAAATATATATACATAATAATATTAAATACTAATAATAA-TACAAATAAATCTAATGTAATTTATTTATAACAAGATCTAAACTGCAGACACAGAAGAAAA----CAAAAATGATTTAAATTCAGCCCTAGAACCGGGTCTCGGAGATCGACTCCAACTTGTGGAGCAATCGATAAATTGTATATTCAATTGTAACAAAAACAGAATATGATCGTTAAACGCTTTTGTAAAGTGCGTAATACTAACACACACTGACACACACACAAGCATACACTGAGA----------GAAACACAAACTC--GATAAGAGCAACAAGTGCGCGAATAATTCTGCGCAATCCACTTTTTTTATTTGTAAATGGTGCGTCACAAAAAATGTGTGAAAAGAAAAGCT--ATCGAAAGAAAAAT----------------TCGAGCAAAGAAAATGGA--------AAAACAAAAGTAAATCA----TGTCTGCATACATATTTGATGTAACAACCTTTCAAGAAAAAAAAAAAATAAGAGAAAAACAAAATAATTTGTAAATGTTTAAGCAAGTCGACTGTAAATTTGATTATTTAAACAAAAGCGCGTGACGTTCCGTTGCG----AAACATAACAGATTGAAGGAGAAGATGATGAAAGTAAGCATAGAATTTA-----------ACTGCAACCATTTCAAGCATATACATATAAATATATATATATATAAATATTATAAAATATATACAATACAACATAATGAACAACTTAAATGTAGCATGTAGGCTAA-AGAGCAAACAAATTCAATATGTGTAAAGAACTTCGTTATATAAAAGCCAGCAGCACAC-ACACACACACCAACACATTCACGCACACCC--------ACACACACACAATTATGAACTCTTTAGCGTTGCGTTTTGCAACAATTTCACGTCGCTTTTGCGCTATGT-AAAATTTTGTACAAAAAAAAA--AAAAACAACCAACAAAAAAAAACTAAAAACGAAAACTAAAA
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TTTCATTTTGGCTTAAA--TACATAATAGA-AATACATTAA--ATATAATTGTAGTGGCTTGTGGAAACACAAGTGGAAATAATTCATTTTATTCAATATATAAAAATAAAG--AAATAGATGATAAACACAACGTTTTTCTAAGAGCCCGCTTGCCAATTATTTAAATAGTACCGCGCTTTGCATTA
>D1 5063802 5064240|5294 chr3R 5064105 5064253 scaffold_471 5875 6055 + -807|0 171
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CTGGAGCGTGTCATGCAGACAGT--CTACGTAAAGGA
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GCGCCCACTAAATAGTATTTAATTATTCAACTGTGATTAGCCTAA-TAAACTGCAATAT
------AGTAACTTATTTTAACTCTTATATCTGTGATTAGTCTAATTAAACAACAATAT
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CAATTATCTAGAATAGGATTCTAAAAAGCTGCACAAATAAATTATATTACTATAGAATGCATTAGTTTCGAAAGCCAGCCTCAGAAAAATGTTATGTGATTTCTTTTTTTATACATTTTTGGAAATAATTTACTTTAAAATAAAGCCAAAAAATGATTT--
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CGTACATAAAGGTATGTATATATGGGCTCCTATTTTTTTTTTTTTTTTTTTAATTAACCCAAAACACTTGTGTTTACACGCGTCGAAAATATATATACACCTATAGCCCAGCCTATATACAGAGTTTGACGGTGCGCGCTTGTGTATCGCATACGAAGAATGCTGCTGCAAAGAAAAACTGAACTCAAACTGAAGTTGTGGCGACGATCGAGACGACGACAACGACGACGACAGC-GATCCAAAAGGCAGCTGC-CCATAAGCCAAACGCGACTCCAACATTGCACACGCGC--------TCATCTTCAACTGTCG-------------CTGACAATAG-AAGGAAATTAAGCCGCAACGACCTGTGCTATTGTTGTTGCTGGTGCTGCTGCAAGGCAGGTATACAAAAGGAAAAGCCGACACA---CGATCCC-----GATCACGATCCTTGTTTTTATTGACACACGTACTAAACGCACTTGTCATCGCCGGCAATTGTAGAGTTTTA---TCAACTAGCTGACGCCATGAGCACCAGCTCCAATGATGAATAGCTGATGGATTCACTCAGCTGTGCCAGCTCCGAAGGAAAAACGATTTTCTATTGAAAACTCTTCCAGCGACCAACTCAACTACATATGTATGTATGTACACACACATATAAGAAAAAACAATCCCGATACGGAATAA
>Aats-trp 5089539 5091025|5323 chr3R 5090284 5092589 scaffold_13 361503 363755 + 76970|0 821
AACGGTAGCCGAATTGAGGTACCTGCATTTGCTTGACATCGATTCTTACTACCAGTTTATATGAAATTAGCTTAAATCGAACTAAGCGATATTAGTTTAGCACCGAACCGACTAAGGCACTTCTATGTAAATAGCTATACAGAATTGATCTATGCCTTGGCTCTGAGTCCGTGTGGCGCCCACTTAATGCATCGTTGTACTCGCTATTTATTTTATTTTTTACACA-------GCGTGTTTATTTTTATA----------------------AAGCAGAAAACAATAAACTTCGGCTTCGA-TTTGCAATTGCCACCACAGTGACCCACATTTGGGAAGTTGTTAGCAAGTCTATACATTTTCCTGGAAACCCGAAACGTTCAGCCAAGGAGAGA---AACAAGTCAACTCTCTAGGTTTCCCTAGAAACTACACTCTGCTCATATTCATTTCCGATTCCGGGCAAAGGTGCCTCTCTGGTTAGCCAGCTAGCAAAA----------TAACTCTCGACTTCGGAAAAATGTAAGTAATTTTCTCACTTCTAGTTGTGTGTTGTTTTTTTTTTCTGGTAACCCGAGATCTTGCACATGAATTGAATTTC----GCGGGCTATCAGTAGATATTCTTCTAGTTTTTTCCTTGCGGTTTATAGTTTCAG----GAATTCTGAATTT------TCGGAAGAAAAAAATAATT-------TGCTAGTTAATTACTATTAATTAA---AGAAGATATGTAGTAATAATGGAAACTGTGCTCA-ATATCTCAGTCTTT------------TAAGCAAGTATCTATTTCA
AA--GTAGC---ATTAATATACACAAAT-----------------------------------AAATGTATTTATATTGA----------------------------------------------------------------TTTTTGTTTGCCACAGCTGTAAG--CTTGTTGCACTCAGAAGCCTCA-CGTTGCGCTCGCTATTTATTTACTAAGCCAAGCAAAATTTTGTGTTATTATTTTTATAAGCACACATAAAAACAAAATGCAAACAACAAACAATAAA---CGGCTAGAATTTTTCAAACGCAACGAC--CGACCCAC-TTTAACTAGTTGTAAAATAGCCGTAAAACTTC----GGACTCCAAATGGGGGAGTTGGCGATCGGGCCGACACTTCGAATCTAAATGGGCTACTCGGAA----GCTCAACTTATATAC-TTGCTGATACCGGGCAAG------CATCTGGTTAAGCAGCTAAAATAATATAGTATTTTAACTTGTAGCTGCGCAAAAATGTAA-TAATTTCC------------GTGT-----------------GTAATCTGAGAGTTATTGAACGCATTCAATTTCTGTTTCGGGC---------ATAATAATGCAATATTAATAAAGCGAAAAATGAATGCAGCTACAAGCTCTGAGTTGGGTGTATCTGAAGCCTATGACGTCTCCGGGCCTACTATGCGCCTGCAACTAATATAGTTATTATATATACATATATATATATAAATATGTTCATATATCAAACTCTTTCCTATTGATACATACACATGTATGTATTTGA
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-TGATTATTTCATAGATATTAAAAATTTTTACCC-------ATATTCATTTTTTTTTTAATTGACGCCA--TTGGATACTTATTGAAAACCATGTTTTGTTGTTAATATT---TTCAAACA------------------GAAATTCTGTAAATGGGACCTACGAAAA-----AAACGTTTATCAAAGAAGAAAAAGTATTAAAGGCTACTTTAAGCATTCTGTTGCGAATTTTCAATTAATTAATTGGAAACAATTTTATGAATATGTTCTTGTGCGAACTTAATTTTTCCAAAGAAAAATTT---TTTTTATATTAATGGAATTCTTT-------------AAATTTAAGGTCAATTTTTA-----GAGAGTATAATGTTATAGCTGCTCTGCCCTTTGATTTT-------AATTTATAGCTAAGTCTCCAAAT--------AAGTCGAATTATCCGATTAGAAATAGCTTAATGTGAAAATTC-----TGAAAT
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ATCGCATTATCTGAGTGAATAGTGTATGGGCTATGCGTG-CAATAAATAAAATTG-ATATTGAATGATTAAATTG
AGCGTGTAAATTAATTTATTAATTTAT---TTATGTGGATCTATATAAATAATTGCACGATCATTGTTAAAATTG
>CG16749 5156601 5156675|5359 chr3R 5156674 5157570 scaffold_33 331823 332732 + 38727|0 1
TC
GC
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TCATTTCAGCTGGAGTTCTGGATCAAGGAGGCCGAGAGCATTAAAAGTATTTTGAGCGCCAAGCATTTGGATGAAGAGGAACAAAAGATGTCCACGGTACGCAGCTGCAGTATACAGTAG--------AAATTTGAT-------GGCG-CTGGTGCGCATATGTTGGAGTATTTTTGTAGTCCGATG-----ATAGCATCGCTTAGTAAAGTAGTGTAGTTACGTATTATATAGAGCATAGCTACAAATGTATCTAGATCTGGACTAGATAATATGGTTGCTTAAGTTATGTGTTCTGTTTGACTCACATTTTCCGACACAAAGTGCGTTTGCTAAAATCTGTTAGTTCTTCATAAATATTTAAT-ATATTCAAAATAATATTTGGTTAAAAGCAGAACGTTGATTGCGGGGGCTCAAATTCCCTTGGGACATTGTAACCTGCTTATAATTAGAGTTATCACAAATTATTTGTTACTAAAATGTATAGTAAAAATCAAA-------------TTATTTTAAGCACATT---CTGCACAGTTTCACATTCCAGCAATATTGCCAAGTTTGCTCTGGGACTTCAAGCCACACGTTTATTTGTTTTTCTGCATTGTGATTACTTTAATTAAAATGGTTTA
>Fps85D 5193321 5193962|5394 chr3R 5191614 5194122 scaffold_33 367512 370087 + 77046|1788 2551
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GCGTAGCAGCAATACAATACAATCAACAGCTGTAATTATTTCTAAAGCATACTCAATATAGTTCTTAGTAGGCGCTTTTAAAGTATGAAACTTTTTAGAACTAAGCAACGAAATGCCTGTATTTATAAAATATATAGTATACGTACATAATAAGATAATAATTACCTATATAAACATATATATTTTTAGCACATGAACGATATTTATATAAATTCGCATATATTTTATAGTCGTTTAATTGTACATTTCTACATATATGTGTGCCTGCTTGAGTGTATATGTATGTATGTATGTGTGTATGCATTTGCGTGATCCTGTCTAATTTGTCGTAACGAATCCTTATTGTGCCAAAAACAGCA-------------------------------GTAAAAGAAGCCAGAGAACTTT--------TGGAAACTCAACGTGTGCTTGATGAAC-----TCCTAGCTTATGTTCTTGAATTTATTA--TTTTAGTTGTTGGTATTTAAGTTG-------------AAACATTTGTATATTATTCAGTCTTGCTATATCCTGTTCCGTTATGGGCTCTTGGATTGGCTTTTTATCAAATTGTATATTTATTTAATGCTA-TTTACATTTCTACTAAGTTTACGACTTTATTAAT----ATACATTCAAGCTCTAAGTTTAAGCTCAAATAATTGCATTACTGCAAATTTTCTGCAATAAAAGTTAAAAAAAAAAAATGTTCAAAATAGTATATTTATAAATATAAAGTTTAT
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ACA
ATA
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--TTTTAAGAATATTTAATATT-TATATTTG-----------------------------
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>CG9362 5281234 5281309|5474 chr3R 5279097 5284743 scaffold_33 461557 467146 + 102169|2419 2537
TCAAAACTTAAGATATATTACATTGCA--------------------------TTTATAAAGATGCTTGATATTAAATGGATT---------TCCAAAGCACCC--------AGCACAA
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>CG9363 5283369 5283717|5474 chr3R 5279097 5284743 scaffold_33 461557 467146 + 102169|4782 5130
AATTTTCCGACCCCAACTGCAAAGCGCCGTAAGACGAAAAAGTGAATTGCAGTTCGTAAACCAGGCACAAGACAAACTAAGAACTTAAATCTGATCGGTGGGCACGTGGATGGCGATGGCGATGGAGAATGGATTGGATAGGATGGCAAAGCTGGCGAGGATTCCATTAAGCAGAAACAGTCGGATGTGATTTAAGAAATTGCTAACAGCATTTAAATATGCATAAATGCATAAAAATACTATCGATAACATAACGAAATTCCTCACACGAAATTCAAACGCAAACGCAAACGCAAAATTCTCAGAAAACGGAACAAAAAATCGTATAATAAATTCTTCAAATTCCCTT
AATTTTCCGACGACAACTGCAAAACGCCGTAAAACGAAGAAGTGAATTGCAGTTCGTAAAAAAAGCA---AATATATGTATAACTCGA-------CAGTGAGAA-----ATAACAATTTT--TGGAGCTAGAGTCAGATGGAGAAGAA------GCGAG-ATTTGATTGAG-AGAAACAGTCGGATGTGATTTAAAAAATTGCTAACAGCATTTAACTATGCATAAATGCATAAAAATACTATCGATAAAA--ATAAAATT--TTAACTGGCATGCTAAC--AAATCAATATTAATAATTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAA-CAAATAAAAAAATAT---ATTTTCTTT
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TTAAGTCCTATGCCTAATGTTAAATATTG---TTATGCGTAATTGTATTATGTAATTGTCTAATTCGC--GAGCATTCGATTCGCCTGTTTCACAGTG-----------TGTGTAGGAAAATGTAACGTTAAGCTCTTAT-TTTAAGTTGTAGTTGTCTGAAAAC--AATTTTCGTATGCGACCAAAGTGCATTTTTTTTTTATGTAAAAATCAAAACA--ACAAATTT
>CG9373 5331575 5331865|5511 chr3R 5331547 5333359 scaffold_3 4807903 4809767 - 52021|28 363
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GTC-----------------GTTTCCCTTAGATTTTTAATCGCAAAGGCCGTATGTCCACGCAATGAACCGT---AGGAACTTCTAGACACGATTAACGGCTTACCTTAACCCACAGCAGGCAGCAGA----GCAGCGGCTAGACTGTCCGAACCATTTTAGTTTGTAGTAACCCACA-------AACAACTAATTGTTTAATTTTTATACATACATTTACATTACTAATAACAAAAAGTATCATAAAATAATTGACTTTCCAAAATACAGAAGACGCAATTCATGTAAGTTATAAGTGATTGAAGCCAATAAATATATAAACAATATTAATATAG
>Ras85D 5336273 5337229|5514 chr3R 5336284 5336881 scaffold_3 4825235 4826032 - 8361|0 820
GTACCTCTACAT-----AAAAACTATGAATACTGTTGTAACTGCCTTGGTTCAGCTGCT-----------------ATATCCGTTTGTTTTCAACCAGCACTTAACTTGA-------TTCTATGTTGTTTGTACTTCAACAGATACTCCGTGCTTAAAACCGAAACGCGATGTAAACAAATATTGTGTATTTTTACAGCCCTGTTATCTATTGGTT------TCAACCCGACAGTCA------------------------------TACATAAATGTAAT-------------------------CTTTTTTCGCA--------CACACGCACGAGCAGAATTCCATTAGTATTCATCATTAGAGAACAAACAAGCAAA--AGCCGATAAGCTCAC-------------------AGCAACTTTCGCACAAACGAGTAAATTCGCTAGCCCCAAACTAGAT-----------------------TTATGTTCGGTTAAACACATATCTGTGGTGCTACGATGATGAAATTATAATCCGTATGAGTT---CTTGAGA----------------TTTGCCTTTCTTTCTACTTACCATACTG---------------------ACAGATC--------AATCGGAGAGAA--------------------------------AACAAACAGCCAATTAAATTTACATTATATAGTTTGCTTTAAGCTTTTTATACATACATACATACATTTAATATTTAA-TTTTTTGTATTAATTTTTGCCATACAAAAAGAAACGAAATAAATCGATTGTGTGTACTATT
GTGCCG-TACATGTATAAATAACTATGAATACTATTGTAACTGCCTTGGTTAAGCTGCTGCGACAGCGCATTTTTGATGACTATTTGCTTTCAGTAAGCACGAAACTAAAACTAACTCTGTATGTTATTTGT----------GTGTACCGTGCTTAAAACGATATTTGTATTTGATTAATTAATTCG----TTTTCGGACCTGTT-TCTTTTGGTTTACTGATTGGCCTAACAGCCAGTGTTTACAATTAATAGCATTTTTGGGAGCTGCATATATATCTTTTACCAGTCACGCTTGATTTCGTTCCCTCTCTTGCAAACACACTCACACGCACAAACAGAATTCCATTAGAATTT-CCACAAGAAAATTGAAATGAAAATTTAACGAAAAGATCACTGTTCTTATATTTTTGTGGTGCTAACTTGAAAAAATCAACTGCAAACAACAGCACAAAATCTTGTATCAGTTATTTTAAAGTAATCGATTATATTTTTTTCTACTTATCTTACTGACCGAACGATCAGTTAACTAGCTTATGCAAAGCTTTTGCCTGAAAAGAAAATCGTGTCTATTATATCTTTGATTCGAATTACTTTACTGCATCGAAATCAGTTTATTATTATAGAGCTTTGCATAAGCTAGATACAATACGTATGGAGTAGATTGATGCTGCATTAAACAATAAGCATCCAATTACATATACAT-ATTTAGTTTGCTTTAAGCTTTTTATACATACATAAAT-----TAATATTTAATTTTTTTGTATTAATTTTTGCCATACAAAAAGGGAAGTAATAAATAAATTGTGTGTACTATT
>Ras85D 5336273 5337229|5515 chr3R 5336882 5337028 scaffold_27 804641 804810 - 1139|0 169
GTAACTAGAGTTTTATGTACGTCGAAATGATTTTGT-GAATGTGTGTGTTT----------------------TGTGTCGTTTGAAAGGCTGCGAGGCGCCCTTTTAAGAGTATTAACAATAACAAGCAAACAAAAACGAACGAAGCAAATCGAAAATGAAAATGAATAT
GTAACTAGGCGCGAGTGTATGTGTGTGTGTGTGTGTTGAATGTGTGTGCGCGGGCGAGGCAGGGACAGGAGCATGGGCTGCCCAGCCGGTTTCGGTGCGCGAGTTAATTGACAAAAAAAAAAAGAAATAAGCAAAAACCAACAAACAAAATAATACAGAGAAAGAAGCAT
>Ras85D 5336273 5337229|5516 chr3R 5337029 5338550 scaffold_3 4826123 4827655 - 44004|0 249
ACGGCCACGCATTGGTTATTATTCACTTTTTATTTCTTCAAATGTCGCCTGTTTGTCTGTATGTGCGTCGGCG-------------------AATCGCCG-----------------ATCGTCCTGGGCTCGATGGTTTGTCCATTTTGGACACACA---ATGCGAAAA---------ACACACACATGTGGGAGCGTGTT-GGTCGGTGCAATTGTCAGATAAAAGAAGAGAAATTGTAATTAATTTAA
ATGGCCACGC-----TTAAGATTTATTTT---TTCATTAACGCCTGTCCGGTTTGTGTGTATGTGAGTGTGTGTTTGTTGTGTGTGCCATAAAAATGCTGTAGCTTATATATTTTTTGTGGTATTTGTCATTGCTGATTTTCGTTTACGCACAAATACACATGCGCACACACACACCCACACAGACACAAGTGCGCGTGTTAGGTTGGTGCAATTGATGGGAGGATGAACA-AAATTGTAATTAATTTAA
>Rlc1 5340538 5340590|5517 chr3R 5338830 5341594 scaffold_27 806788 809591 - 63145|1911 1963
GCAGCAAAGCTGCAGTTATTTAGTTATTAAAACAACAAAATACCATTGACATC
GAAAT---------GTTTTGCATATATTAAAATA--AACATAACCCAAACGTG
>Rlc1 5340712 5340775|5517 chr3R 5338830 5341594 scaffold_27 806788 809591 - 63145|2085 2158
ATGG----------GATATCTCAATAAAAATTGTTATTTTGCAGCCGCTCCCGCAACGAAGTCATGATGATCCT
ATCGAACGAGAATTAATTTTTCTATAAACATT----TATTTCAGTCGCTCACGCAATGAGGTCATGATGATACT
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AACGTAATAAATGTTAATTTAATACACAATATTCGACAAATAAATAAATAATAATACAAAAAAAAA--AAACAAAAACAAAATTAATTATTGCAAACGCTAAACAAGTTTGCCATACAATTTATATCTTTACGTAATATGTGTAAGTAAATGCGCATAGAAATCATTAATAAATACGTGTTTGGACTTAAGATCTACTAATTGAGTCAATATAAATAAAGTGCAATGATGTTGAAGATGAATGTATACCTAACAAAATCAAATGTATTTCTTATTTGCGAATTTATTTTAAACTCAGA
>by 5353959 5354680|5527 chr3R 5354198 5355205 scaffold_27 825167 826269 - 2071|0 564
GC------CAGTGGAATCGGAATCATGCGGAATTATGCGGAGGAGGAGCCCAGTGCTGCAAGATGTACTAACTAATCACTTTACGAAATTGTGTCTTGCGATATAATGAGCTTAACTGCGAATATGTTAACAGGAATGATGTCAGCCGTA-GTTTATTTAGACACGCACACACTCA------GAAGTCGGCGATATTTATGGCGAAGCTAA----AACATATGTACACATGGGTAC----TATCAACTTGAATTGACTAAATGCACAGT-------------GGGACAAGT-------GGATGGCCGAGTTCGATAAGATTGGTAACTATTGG---------------AAACGCCACTGATTCATATTTGTTTATATGCCCAAGT--TGTAAACAAAGCCATGAAG------ATTGTGTTAAA---ATTTTTGGAAATTCCAACTGGCATTTCAAGGAATCTCGTACCACTGTGCTGGGTGGCGAATTGAAACTGATCACCG---AAAGTTGACTGTTT------------ATTAGCAAAAACAGTATGGATGTGTATATATGGG
GCGACTTACCGTTAAGTCTGTACAGTGTTGTACAGCGCACATAAATTG-CAAATGTCACGAG--------------CATTACACGAA---GCAACAGAAAATAAAATG----TAACAACAAATATATTAACAAT-ATGATGTCACTCACACACACACCCACACACACACACACACACACATTTAAGTTGACTAGGCGCACAGTGGAGCAAATCACAGTGCATATACAAATATATATAAAAAATCAATTTGTGTGAGTAGAAAAAATAGTTTCGTTTTAAAAATTAATAAGTATATACAGTACGCCCCCGCTCAACTCGACCGCTGAAAATTGGACCAATTGGACCTTAAAATGCCTTTTATTCACAAT------AATACTAAAGTAATTTGAATAAATCTATGTGTACATTCATTTTATTTGATTTATGTTTGGAAA-----------AACTCAAAACTTATCATGC-----------GTGAATATTCCAAGTTAATTTTCTTACAGAGTTAACTTTCTAAGCGAGTCTAAAATGTTAAAAATTCTAGTGTTGCGTGTATTAGGG
>by 5356462 5356543|5528 chr3R 5355415 5359155 scaffold_27 826746 830621 - 77361|1215 1296
GAGGGAGGGGGCGTGGCACGGGTCAACAGGTCAGCAGGCTGGATTCCACTTCCATCCGTGGAGTGGAATGGCGCACAAGCAG
GTGCGCCCGGACATGGAATGCGCCACC--------------------------------------GAAAGGCAC---CGAAG
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ACCGGAAACCCTATTCCACACACCTCAA------------GCTTTCGC----TTTTCCGG--GCGATGAGTGATCGGGACAGAGGAGCATTCCGGGCGTGGAGGGCTGGTCTTGGGCAGGGGGACCCACCTCCCACCACCGCCATCACTTGATGTAACGCGCAACGAATCCAACTGCCAAACCGTCGACGCTTCCTCCTCAGCTGTATGCCCCCGCCCAACTGGCCACGAATAATGTTTCCACCCGCTCCGCCCCTCGGCCACGCCCACGCGAAACTCGCCGCCTCTTCAATAGCTTGT------------CTTAGACATTAGTTCGTATGTGAGTAATGGT----------------------AACCGTAATTAGGAGTA-------------ACCCATATACGCGTACCACCAAGAATTCAACTATAGTTAAACAGCGTAT-ATATATATATGCGCAGATATATTTGTGTGTCTGGAGAATGATAATGGCGTAAAGCAAGTGTCTGTATATAAGCCAAGATTTGCACAAAAAAATTAACAATAGAATTTCTTTGCCTT------TACAACTCGAGGATATCCTATAATCCATTCAAATAACTATATGCGAACAAATATAGTGTATTCAAATGCTTGGCAGCGGTCACTCAAAACCCAGATGGTTATGGTTATGGGGCATTCAGGAATTATTAATCCCCAGAGGGCTTTT-----CGGGACCTTTTGAGGCAT--------------------CGGTGCCAAATCGAAATGGTTTATCTTGAATTGTTGCTGTCCACACGCAT--AGCCATGCATAGCTCTATATTATATAGAATA----CATATTT-----------AAGCAAAGCGAAATATTTGTAACTTGGATTTGTGTTTTCAC--GCTTTTGAGTTAGGCTTGCGTATTTACTGCTTCCTCTACGTATTTTGTATTTACTACCATTAC-TTTTAGTTTTA----------ATAACAACAACGTACTATATTTACCCA-----------------------------------TATACGACTTACACAAAAAACAGCA-TAAATATAGTGCATTGCATTTTATACTA----------------------------ATTGTACGAACTGAACCCACTGAAGAAGTTCTTCTTC---TTGCACTAGCAAAAGAAAAAAAAACCAACAAGAAAACCAAACAGAAACAA--TGATAATGATATCCTATGAGGGGAAAAAAAAGATCGTATATATATATTTTGTTCGTTTCTACTGTTCGAAAATTAGTAACTATA-AACGGAAGCAACTAACTTTGAAACATATAAGCAATCTTTGAAATCGACTAAA
GGCGATGCTTGCAACAAAGACAACACAACCATAACCAAACGCTTTCGCCACGTCGTCCAGGTGCAGCAAGTAAT---------GGAGCACACACGCAAACAAAAACAAAAACAACAACAAAACACTCACAGATAGCCTATTTAAATAATTGATATAACGCGCAACGAATCCAACTGCCAAA------ACGCTTCCCTTTAAACCA-----------------------GAACA----------------------------------------------------CTTCAATAGCTTGTCGTAGAACTCTACTTAGGCGGTAGTT-GTATGTAAGTAACGGTTAATGGTAAATGGTTTAAAAAGTACAGTAATTTGTAACAAGAATGTAATTATAATCAAATATGCATACCACCAAGATTTCATACATACATAAGGAATACACAACACAATTATCGATAAATACAATCGATAGTTT------TGTTAAATGTGTTGAGA--------------AAACTGAGA----AACAAAAAATTCAATTCAAAATTTACTGTTTTTTATGTAGTACAGTGCAAGTTGAAACAAAAACAAAATTAAAAAACTATGT--------CAATAATGTAAT-------TCGGCTGCCGCC------------------TGTGCTTATATTTTCCTTATGCATTAC--ATTGCAACAGCTCCATTAAAAACGAGTGCATACTATACATATACATATATACAAAACATACATTATCTATACTAAATGGCGTATTTTAAAATGTTGCTGTCCACATACATGCATACACACATATATATATATTATATTAATTAACACTATATCTGCAAATTACAAAAAAAAAGTGAAGAAAATTAAAAAAAAAATTATATTTGTACTTGTTTGTGCTTTATGTTTTCTTATATACATACATGCATACATA--------ATACTTGCATTGCATTTTAATTTTATACTTACAACAAAACAAAAACA-AATATATATATCCAATTCGTATTTGTTGATTTTGAAAGTGCATGGCGGCCATGTTGTTTGCACTCGAGATAGAACTACATGGAGGCCTTCGGCTGTCAGATTCAACACGTACCCATTGGAAAGTCCTGTATATTGTACGAACTGAACCCACTGAAGAAGTTCTTCTTCTTTTTGCACTAAGCAAAGAAAAGTACA-CAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACAACTTTATAAAAAC-TCTTACTATTTTTGCGTTGCAACTGTTTAAACATTTTTATTTTATTACTAGT--------ATTAATAACTATATAAACAAAGCAACTAACTCTGAAACATATAAGCAATCTTTGAAATCGACTAAA
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TTGTATTCGTATTGTTT-CAGTATATGTATATTGTATGTAAATCAAATTTAATAAATTTT-----AACACCTTTTCAT
TTGTGTTATTTTTGCGTATTGTATTTGTATTTTATATGTAAATCAAGCT-AATAAATTTTTGAAAAACATTTTTCAAA
>AP-47 5383437 5383631|5547 chr3R 5383511 5385256 scaffold_27 1649679 1651484 - 86921|0 147
AAGGGGCAACTCCCGTTCCTGCAT-----------------CATTCCAGCCAAGCTTCAGCGAGTCATCCTG-------CAAC---AGGTAGCTTCATCTCCACCCGCGTTTTTGTCTGCGATGCGTTGCGTTAAGTCAAAAGTATAT
-------AATCCCTGTCCACACACACACACACAAACGCGCGCATTCCAGCCAAGCTTAAGCGAAAAACCTTGTTGTGTCCAATTTGAGTTAGGAGTATGTTAATTAGCTGCCTCACCTTC-ACATAGTGCGTTAAGTCGAAAGCATAT
>CG9393 5387302 5387648|5548 chr3R 5385367 5387393 scaffold_27 1651603 1653733 - 38430|2201 2295
CGTTTTTAAACTGTCTTGTA-TAAAATAGCATTTTAAAGTCATCTGAGCGTAATAAAATTGGATAACAGA-GCCCTGTTGT-CATGGAAAAGACA
CGCTGCTAACGTTAATTGTAACTAGATTGAATTATTCAGTTATTT-----TAATGATATATACCCACAGATGCAATCTTGCATATAGTATATACA
>CG9393 5387302 5387648|5549 chr3R 5387440 5389392 scaffold_27 1653796 1655937 - 51214|0 225
TCGCATCTCTGCAACGATATCTATGTGTATAGT-----ATATATATTTTAAAATAC------AATGTGGGGAT---GAAGCACAAAAACTGTCCAGCTTTAAAGGTTTACCTAAACACTGAAGGAGATCGATTTACTTGGCCATAAATCTTTGGACCGA---AAATTTCGTCAGGTAATGATCCCCTCGTCGTAGATAACGCTTCGTTCCAAGGATTTGCCAAACA
CTTCAGCTCTGTA----CATTTATAATTTTAACCAACGATGTATATTTATAAATATTTCGAAAATGAGCGAATCGGAAGGCACAGCAGAAATTTGTCTTTAAGCAATTCGTTAAAAAAGCACGCATATATATTTATGTATATACGA---TTTGAAGCTATATAAATT------AATAATGCGCCCTCCACCATTATTCATTGTTTTTTAAAACTATTTACCCTATA
>CG9396 5396133 5396204|5551 chr3R 5394971 5396308 scaffold_27 117721 119165 + 23554|1298 1369
-AGTCCAATTTGTGCATTTCAATGGATTTAGTCTAAATAAAAACAAGTTTTAAGGCTTTAACGGTCAATACA
AATTGCATTTTGTGCTTCTTTATATTTCTAGTC--ACTAAATACACTCTTTTGTCGGTCGTTTAGCAATGCA
>CG9399 5397633 5398218|5553 chr3R 5397984 5399268 scaffold_27 1662457 1663680 - 27028|0 259
ATACATATCGAATCGAATACCGGTGCTGTCCCCTTTATATAGACTTTAATCGAACTTTTATGTACATACAAATCCCACAACGCGCAACGTAAACGAAAGGATTAAGAGGAAGCTGTACTAGCAGATCGCGAAACTGCGTTTTACA------------------ACCTGTTAACCATTATT-ATTTATGGTTCA---CCGCCTTAT-CGACGTGATTCGTATTACTTAAG-TTGTAACTG-TGGAGGCTTTGCGTATAGTT
--ACTCAATGAACCACTGCACAAAGCTGACCCTTGGATGTGAAC----------------------------ACGCACACCGTATAACATAACAGA-----------------------CGCATATCGAACCACTGCGTTTTATATTAAGTTGTTTAAGTTTCAGCGACTGACCATTTTTAATCGGTGGTTTATTGTTGCCTTACAAAACGTGATTCGTATTACTTAAGTTTGTAAATGTTGGAGGCTTCGCGTATATTT
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GGTGTGTGAATGTGCAATGCAAGGACTTCTCCGATTGAAGCGACTCTGCTATAGATCATCCAAAATATAAACACAGGAATGAGAAA------CAGATTTCAAAAAGAATGTAGACCTATTTGATTTATATGAAATTATTTAAAT---ATTTACGCTTCTGATTTGTAATTGAAATTACATATGTATACATTTCTAACATG-AAAACGATAAAAGCAAAAGGCA---ACTCATCA-TTTTGTTTCCA
GGGCTGTAAAGGCGCAA---ACGAAATATTGCAACTGCAACAAATGTGCTAAAAAATAAAGCAAAAATAACAATAACAAACAAAAAATTACACAGGAATGATAAAATTTGTAGAACTATTTGATTTGTAATGAATAATTTTAATGACATGTACGCCTTTGATTTGTAATTGAAATTACA----TATACATTTCTAACATGAAAAACGATAAAAAAAAAGCGGACATATTCTCCAGTTTTATTTACA
>Kap-alpha3 5400206 5401195|5556 chr3R 5400904 5402445 scaffold_27 1665989 1667547 - 67529|0 320
CGATTTAATCAGAAAGCAGCCGCGCAGTAGCAGTGAAGTGAAAACCAAACACGTGCAACACCACATAATTTGGCGTTTATTCGTACACAATCGCTTGT--GTATGAACAAGCCCGACGAGCCGTCAACCAATTCACATAATAATAGCATTATATTTTGTCCACCACACAGCAG--CAATTA-----------------GACAGCCGGGTTCGTTT---TAGGGACGAGAATAGGAACTCTGGAGGATACACAACGGATAATCCGCTGCAG-----CCGTTTTAGCTTCTCTCAATTCTGTGTTAACAAAATTACAAAATTC
TACCAATGGCTGAGACCAGTACCGTATGCAC----ACACAAAAAACAAACACACACACACACTTCTGATTTGGTGTATACTCGATTGAAAGCATAAAGCAATACGATTTCGAGCGATACTCTGCCCATTTACCAACAAAAAAACAACAGC-CACACTGACAGCGAAAAAAAAGGATAATTATTATGCACATTCTATATGACAGCTTGGTTATATTATACAATAACAATTATACATACACACACAAACACACGAACTAAAAT-CGTTGCAGCAAAACAGTTTTTTTTTTTAAATAATTTGTGTTTTCAAACATACATAACTC
>bocksbeutel 5415192 5415495|5568 chr3R 5413707 5415281 scaffold_27 1678720 1680395 - 74800|1621 1711
CTTGTTCTCGCATATTGTTTCTT-TTTATACATAATTAGAAAAATGTACTACATTATAATTATTGTATTGTATTAAATAAACTAATTAAAT
CTTGCTTTGCTTAATCGTTTTTTATGTATATATAATTAGAAAAATGTACTACATTACAATTATAATATT-----AAATAAACTAATTAAAT
>bocksbeutel 5415192 5415495|5569 chr3R 5415451 5416903 scaffold_27 1681114 1682644 - 23842|0 44
TGCTGGCCACCATGGTGTACGTGGTATTGACACCCAACGCCTGAG
TGCTCGCCACGCTTATTTATGTGATAGTCACGCCCGCTGTCTGAG
>CG9427 5450875 5450943|5616 chr3R 5450771 5451736 scaffold_15 1381843 1382824 + 24877|106 175
ATAGATCTGC-TAAATGTCCAATGTAATTGCCTCAAGTTTGGAATGAAATTAAAATTCATAAACGCACAA
ATGTGTGTGTGTTCATATCATGTATAATTGC--CAGATTTGTTGTGCAAATAAAGATTGTGAAGAACCAA
>Crc 5454657 5454782|5625 chr3R 5454562 5455350 scaffold_54 319451 320253 - 26952|96 245
GGACGTCTAGGGAAAATTACGTCGAGAAATATTCGGTATTTTTTGTGTGTTGGTAGCTGCTTTGATGTTCTAAGCAAACGGAAACCAC-------------------AATTACAATTTGTAAGACT-----TATAATTTATAAACATACA
TTATGATAAATAGTAATTAATGCAAG-TATAAACGAATTCAATTGTCCCTATTTAAGTGGTTTGA---------CAAATACAAGTAACTTTTATATTGTTTATGTAGAATTACAATTTGCAAGACTTATAATATAATCTATAAATAAAGA
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GCAATAAGTCTCATTATGTTAACCCA-GCATCCACTTACAAATACAAAAAT---------------------------TAAATAG
GCAATATTTCTCATTATGTTTATTTACACACCCACACAAAAACTCACAGACATCTACACATAAGATATACTTATACCATACATAT
>Scm 5459081 5460059|5632 chr3R 5459138 5459670 scaffold_33 860058 860554 + -991|0 572
TTATAGGTTTATTCAAA-----TTTACCCAGTCAAAGGAGTGGAGTATTCGTACACACACAATAATTAGTTTATCCATCTATTTCGAAAAATGTGAAATAGTTCTCAATTGGACACAAAATGATTCGACTTTTTCGAAAACTGGAGCTCGGCTACCAAAATCGCAATGCACATACATTATATTTATTACACATAAAAACACGCACATTAGACACCAAAATCTATCCGACACAAAAGAAATGATAATTAACTTTAGAATAGGCGAGAAA-----ATAAAAACCA---ATATTAAATGATTGTACATATTTTACATC----TAATTTTGTAATTATGTATCAATTGCGTTTCCTAACTATAACAATATTTAATTAGTCATTAAACAGGTTGAAGATTTAATTTCTATTAAGTTATTGAAATTGAATATC---AGTTTTTAGTTAATTATTCACATGCAGTTAA--------GGTCATTTTTGCATATAAGAAACGCTTCCTTTCAAAGTTTTGCAATATA-----------TGCG-ATATATAAATGAGAGTAACATTCGGTCGTGTAAAATATT
TTATACCTATATGCATAAAGGCTTTACCCATTCA---------CGTA-TCGTGCTAACATA--------------CATATATC-------ATATAAGATAATATC--ATGGAGCGCATAATGAAT-----------GAAACCAGTGCTGAAATATTACAAG---AGTACACAAGAA-----------ACACAAAAATAAACGAAAAATACAAACAAAAATAT------TAAATAACAAACGAACATATATTATAAAATACACACATAATTCTTATACATACTACATATGTTGAAAAATAATATACAAATTAAATACTCGTATTATTGTGAAAGTATAGTAAAGAAGTAT-CTACATATATACACGCTTACTTA-----TATACATATTATGTACTTGTATGTTGTC-TGTAATTGCATATGAAAATCGAAATTTTGAAAATGAAAATTTACATGAATTGAATTAAACGTGCTCA-TTAAGCATCTACAAA----TACATTAATAACATTTGAAAGACAAACAAATTTATTGCGAATCTATATGTAAAAGCATTATTCATTTATATTCATTATT
>Scm 5459081 5460059|5633 chr3R 5459695 5459768 scaffold_33 860579 860641 + 1772|0 73
TATTAATTTTTTTCCAACTGCTCGTGATTCTTTTTTTGGAATACACATTTACAAATTGATTTATTTAGACAAAA
TATTAAATCATACTCAATTG-----------TTTTTAGAAACATTCATTTACACAATGACAAATGTAGACCAAA
>Scm 5459081 5460059|5634 chr3R 5459769 5460450 scaffold_27 1479276 1479970 - 17123|0 332
ACAGAAAAACATTAAGTTTCAGGCAGCGGA-------------CTCGGTTCGGGTTTGACTTATATAGAAATTGTTAACAAATTAGTACCTCCCTTTAACGTAAAGCAAAGC---AAACATGAACGATATTC-------------------------ATAGATGTGTTATGTGTT-GGCCATTCATGAAGAAAAAACCCCTACCCTATTTTATTATATTGATAATATAAAACACGCTATAACAAATGTAATCGCGAAGACATGAAATTCCCTATACAAAATCAATCGCATAACAAATTATACACAGTCAAGCTCCGGTTTTCAAAACCATTAT
GCATAAAAGAAACATGGATATGGCAATGGAACAAAATAAAGCGCAAGAAACGGAATATGGCCAGCGCGGAAGTGTTAACAAATTAGTACCTCCTTAAAAAGTAAAAGTAAACAAAAAAAAAGAAAGATAATCACATAATAGATAACAGATATGCAGAATATATTTGTAATGTGTTCGGGCATTGATGAAGTTGAAGAACGTTAACAATTTTATTTTA-----AATATGTAATTTTCAACCTTAAATTCTAATGCGAA-------------CTATGTTAAA-CATGCGCGAAGGAAA------------------------CCAAAACAAATGT
>eca 5510188 5510388|5679 chr3R 5509223 5511505 scaffold_3 1837248 1839571 + 59363|1085 1305
GGTGCTCCGGGGCTAGGGCATCATCAGCACCACTGGCCAACCACTGGCCTCATTGTT-CCGTGTGTTTCCCTCATTTGGCA--------GGAATTGCGAATTTCATCGATGGATCGTCATCCACCCAACCAGCCACTGGCCTCGACT----------CCAAGCACTTCTAGTTGTAATTTCTTGTGCGTAATTTAAT-AAAATCCATTGTACAAAACGAGA
GTTGA---------AGTGCA----CACCACAAGATGTCAATGGTTG--TTGGTTGTTGGCCTTCATCTCGATCTGTATGCAACCAAATTGCAAATGCGAATTTCATCGATGTATCAT------CCAGATCCGTGTTTAGTTTTAATTGTCTAGTTGGTTTCGTATGCCGAGCTAAATACTTTTCTGCCTAATTTAATAAAAATCCATTGTAAAATAAGAAA
>unc-115 5512782 5513183|5680 chr3R 5511506 5512976 scaffold_55 86905 88258 + 43811|1334 1532
GAGAAATGCATCAAAGAATAAGAAATTAATGTACCTACAGCAGAATCACACAGCAAAATGCGAAACATTAGATGTGTGGCATCAAATTTACGCTAAATCATTACGCAAATTTTATTTATTACTAAATATTTTATTTATTTATTTAAATAGAATATGTCAAAGAATAAACCAGAGATA----ATAAAACAGGACAAAAGC
GAGGAGTGCATCAAAGAAAGAGAAATAAATGTACCTACTTACAAATTCAAGAGTATAAT---------TAGCTGCATG---------------------------CAAGTTTTATTTATTAATATATATTTTATTTATTTA----AATAGAATATGTCAAAGAATAAACAAGATATATATAATAAAGCAGGACAAAA-C
>CG31352 5520448 5520831|5689 chr3R 5518519 5521291 scaffold_55 86561 89318 + 73223|2050 2507
GAGGCAAGTGGAAGGCGCAGCATGCGAGGATAGCAACCCAAGTGGAGGAGGAGGCTGTTTGCGACGAAACCAAAAGAATTCAATTTACCTTAACAGCAGAT---GGCTATAACTCACGTGGCAGGAGATGA---GAATCAATATATAAAATGAAAACGAAAC-----GGGAAACTATGCTAATTTCACAGCCAGTTTT-GAAACACGCTTTAAATA----GTTGATGCA-AGTGAAAC-----------CAACTAAACTAAATTTAAATACATAGTTACATTTACAGTGCGGAGCA-ACTAGCCGGCAGCTCCTGTTTATTTTTTTAAGAATTAGTTGCGCTAACGCAA----AATTGTAACTGAGAACAACTATATGAAAG----------------GAACATAAAATCCCAA--------------------TAAAAAACGAAGTGTA-----TAC
ATGGCTGA---------CCGCTT------------ACCCGAGCGA-----GCTCCAGCCTGCGACGAAACCAAAACAATTACCTAAACTTTTTGAGTGGTTCTTAACTATTAAACA-ATGGCAGCAAATGGCCTGAAACAATA-ACAAAAAAAAAACAAAAATATAAGAAAAACTATGCTAATTTCACAGCCAGTTTTCGAAACACGCTTTAAATATATAGTTGAAACATAAAGAAACAAAAAAACAAGCAACAAAAAAAAAAATGAA-AAATAGTTACATTTGAAGTACGGACTGCGCCACACGTCAGCTCCAGTTTATTTTTTTAAGCATTAGTTGCGCTGATACTATTTAAATTCTATAAGAAAACCAAAACTTGAAACATCATCGGCATCGGCCGAAGTTAAAATACCCTAGCAGAACTACTTAAGCATTTAAGAACCTAAGTCTGCCAATTAG
>CG9448 5531512 5532469|5706 chr3R 5531509 5531710 scaffold_55 104552 104729 + 7252|3 212
ATAATGAATTTTATTCTTATTGTATTATAAATGGAATTTTATCTCATTATTATTTTTGTTAGTAATGTTATTACAATTATTATTATTA--------ACTTCTAAGAAAGCTTATTGTGCAAATGTACACGCAAAACGCATAAAAAAAATCACTTATTTAAATAAAAGTTTTAAGTAAAGA---TTTAAACGGAAACAAAATGACTATAGT
ATTATGAATTTTATTCTAATTGTAATAG-------------------------TTTTGTTAGTAATGTTATTATTATTATTATTATTATTATTCTAATGTCTAAGAAAGCTTATTGTGCAAATGTACACGCAAAACGCATTAAAAACA----------AAATAAAACTTATAAGAAAACAGATTTTCATTTCGTTCAGAATGACCGCCTT
>CG9448 5531512 5532469|5707 chr3R 5531865 5533047 scaffold_55 104730 106073 + 35134|0 801
AGGA----TATGATGCGGCACA---------------TCCGTCACCCAGCTTCTGATTAGGATGCTGTGCATAGAATT------------------------------------------------CAATATCCTTATTTTGTACTTTTGGCGATCGTTAGCAGATTTTTGAGACAG-------GAATAACAAGTGCAGATCCTACACTCTTGCACTCGCAGCTAGCTAAAGGAAACTATAGAGA--------------------------------ATACATATGCATATATGCAAGCAGTTGAAAGT---------------TGTAGTTGTAACTA------AATTGAAAGCAAACTAAAGGTTAAGTAGCAACGTACGAAAATAGATTGATCGA-----------------------------CGTATGTATATCATATCCGTTCCCAAGTCAACGTTCGTTGATTTTAGTCAAATTTATTCACAC-------TGGGTCGTCGAGGCAATAT-------------AGACCACATTTACTACGAAATTGAAGCTATACACTGGTAGATTTAATTACACTCACATGTGAAACAATCCATTAAATGATTACGTGTACGAAAGGCAGATGCGAATT---------------------TAAGCGGTGGAATTTGTACACCTATGTACGCGGTAGTTAATGTGAATACCCAAGCTCCGGACTTAAAATATTGCAAATCTCAATGTACTATTAAATTTTAAATGGGTGGCGAACACACAACATAATTATGCAGCGGGTGAAAATGA
CGGAGTAGGAGGACGCAGTAAACAGGGCCTCGGGTCTTCTTTGATGCGATTTTCGCTT-GGTTGATGGATTTGGAAATGGATTGGTTATGAAAGAGAGCCGATACATATACGAAAAAACAAACAAACAAGAAATTTATATTTTAATTT----GGTAGCAGGCAACAATTGAAAACGGTTGATTTGAAT-GCAATAGCAGCTCCTA------TGCACATGCAATTAGCTAATGGAATCTATATAGAGAAAAACAAGATATATATTTATATATATATATATATATATATATATATATATATAGATATATGTATATATATACATAAATATAGCAGTTATTAAGTTGTAGTTGCAGGCAAACTAAAGGTTAAGCAGCAAAGTACTAAAATACATAAATTGATAATATATATATATATATATACATACAAGCATACATATTTCATATCCGTTTCCACATTAACGTTAGTGGATTTTAGTCAAATTTATTTGCGCGCCAGCGGGGGCAGACGAGGCAACATTACAAAAAACAAAAAAACAAAATCAAT---AATTCAATATTATACA---GTAGTTTAAATTGC-----TAAAAAGAAGAATATTTTAATTCAATACATGAACGTAGCGCGAATGGAAATTGAAAAACAAAAAAACAGAGTATAAACAGTAAATTATATATGTATATG-ATTCTTAAATTTACCTAAGTATGTATGTACT---TTTAAACTATGCAAAATCTCGATGTACTATTAAATTTTAACTTGTGAAAGAGCGCAC----CAAT------GTGGGTGAATATGA
>hyd 5540344 5540673|5712 chr3R 5540277 5543217 scaffold_126 4282 7285 + 105618|68 433
GC----GATTGGAAGTCTTTCCCATCTG--------------TATAAGCTTCAAATTCATTTCTTAATTAACTTTAGTTTTTTTTTGAGTTTCGACTTTCGT---------------CATATTTAACCATACCATTCCCATTTCGGATTATATATTGTTTAAAATTTATTCGAATTTGAACAATTTGTACGTAACATTATTGAACAAGATTGGCTCGGGTCATGACGGTCTTGCTTGACCCAACGTGTAGTAAAAATATGAAACTCCCCAACATCCATTGTAACCAATAAAACGGCCAAT-TAGGTAATAGGAAGCCTATGTTTTAATTATTAAACT--TTTAAATAAAATATGTTTTCTAAAGTA
GCAAATAATTACCAATCTTTGGTTTATGTTAATAATGACGGTTATTTGCTTATTATGAATTTCTTGGT--ATATGAGAAATTTTTAGATATTCCACAATTGTAACGAATCATATATGTATGTATAACCATTCCTTT---AATTTGGATCTGACTTTAT---AAAT---GTTGCAATAGTTCTGTTTTAAGATAACGTCTTTGAAGAGGAAATCATGAGGTCAT----TCCTTCCTTGATATAGTTCG-ACTGGATACACAACACT---AAGGAATTGTTAAAATGAACAAAGATTAAGATGTAGGAGTTAGGTCAAGTTTGCTTTTATTATTACATTTATTTGAATGTAGGAAATGTAATAAACTA
>alphaTub85E 5556938 5557050|5729 chr3R 5556724 5558783 scaffold_44 188686 190801 + 76903|233 345
AGAAAACGTTGTCAACAAATGATACAGCCATTACAACTTTATAAACATCACTTTCTTTCTACCAAATACCAATGCATAAAACAGTTTCGCAATAAAACAGTTTAACACAATTG
GAAGTATATTGTT-ACGCATGCTCGG-----------------------AATGACTAACTACAAAATAAAGCTCTGTAAAAA-----------AAAATGATTTTACCAAACAG
>CG12950 5560560 5560683|5735 chr3R 5560559 5561115 scaffold_44 445090 445628 + 11091|1 128
CTATAGAAATTCCACAGGGTATTCGACACGCCCCTGTGATTAGGATTTACAATTTTCTGTATTCTGCATTTCGAACTCAATAGAATAAACTTTTTATACCACTTTATTATCGAAAATA----CAACAA
CTATAGAATTTCCACGGAGCTTATGAACAGGCTCTGTGATTATAAATAATAATTCATTTTAATAAAAATACTACATTC-ATAGAGTAGATATGTTGTATCGCGAAATTTTACAATACATTTTCAAAAA
>CG31411 5569708 5570382|5756 chr3R 5568655 5569780 scaffold_15 2300174 2301337 + 24424|1156 1231
AAAAAATCTTTATTCTTACAGAAGTTTTACGATAATATTTT---CAGGCAGCAGCCGCATTAGCTTTCGCTGCTCC
AAAATAACTTGATTAATACAA---TTTCGCCATTTCACTGTACACAGCCAACAATCGCATCAGCTATCGCTGCTCC
>CG31411 5569708 5570382|5757 chr3R 5569866 5570198 scaffold_27 744572 744971 - 1651|0 405
AGTCCCAGAGCCTTGGGTCCGCGATTGTTTGG-------------TGGGGCACTCAGCCCAAAAGGTCCTCCTCCGCCT---CCACCACCGCCATTGGGAGCATTTCTGCC------TCCGGGACCACCACTACCT------------CCAGGGCCATTTCTTCCTCCAGGGCCACCACCTTTTCCTCCAGGGCCACCTCTTCCTCCA-------------GGGCCTCCCTTACCGCATTTA---TTGCACTGCTGTCC---GCCGCAA-----GGTTTG----GGGCCA----CACGTTCCACGCTTTTGGGGCGGGC----CCCCTCCACGACCACCTGGGCCGCCTCCACCGGCACCAGGGGCACCTCCACCAGCACCTGGACC---GCCCCGTGAGCCAGGA
TTTCCCAGGACCTCCATATCCAGCTTGTCCTGGCATAGGTTCTCCTCGACCACCTGGCCCTTGA---CCTTCTTGGCCTAGACCACCACTTCGACCGCCTGGACCCTGGCCCTCTTTTCCAGGACCAATATAACCTGCCTGTCCTGGTCCAGGTCCACCTCTCCCTCCTGGACCCTGGCCCTCTTGTCCCGGACCACCATATCCGGCATTGTCCTGGCATTGGTCCGCCTCGACCGCCTGGACCCTGGCCTTCTTGTCCCGGGCCACCATATCCGGCTTGTCCTGGCCCAATTCCACCTCGTCCACCTGGAGCCCTGACCCCTCCCTTCCAGGACCACCATATCCGGCCTGTCCTGGTCCAGGTCCGCCTCTCC---CTCCTGGACCCTGGCCCTCTTGTCCCGGA
>CG31411 5569708 5570382|5758 chr3R 5570199 5570281 scaffold_15 2301805 2301887 + 1757|0 82
CTGTCTGCGCTCATCCAATTTCACTGGCCACAATAACCATTTTTAATGTAAGGTAGACGCCGACGGCAAAGAGCAGAGCAGCC
TTGATTGCACTTATCCCAGCTCGTTTGCCACACCAGTCATCTTCATGGTGATTAAACAACCGGTGCCAAAAACAGCAACTGCC
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GCCAGGAACGATCGTTAAAGACAAACCAGATCGACTATAAAAAATGCCTAAT-GAGTAGTTAAGTATTTTA----------GTTGTACATCATCGGCAACTCGACATTCCACGCG-ATGCATTTCTAGTTACGTA--------AGCCAATCTCTGGGCCCGAGCCCACTTC--------------------TGGGCTAGGCCGACTAA--AAAGACTTTGTTCGCACTC----TGTAGCCCTTAGCCACGTTCATTTCATCGCCTAACTTAAGAGCATAAACTTTAAAGTAAGCGTCAATAAT---ATACATACGAAAGAGAGTTCCACATTCT
GCTTGTGGCGCTTGTTAGGAGAGCAAGCGGTCGAAATAAAAGAAGGCTTATTGGAGCAGTTGGGCACCACATACGCATAGCATTGTACGCCATCAGAATCAATACATTCCATATACACACATTTCTAGAAAGTTAGAATATATATGCATAATTTAAGCTAAAGTTCATTTCATTTCATGTGCATTTGTATTTGCGTTAAGCAGACTTACTAAATATGTTAGTAATATTTTAAGTACAACATATGATCAAAATATATTTACAAACATATTTGAGTGC---AACTATAAGGATTTGATCAAAATTTGAATTCGCCCTGAATAGGCTATCGCAGTAT
>Rpt3R 5580455 5580619|5762 chr3R 5577279 5582033 scaffold_15 2308915 2313755 + 170057|3364 3530
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ATCCTTAATATAAAA-ATTATGAAAAAAAAAAAACTAAGAATTGTTTCCATTAAATGCATCTTAA---TGCAATACTACTTAATTTTGTATATTTAATGGCGCGAAATGTCGTTTTTAAT---------------TTAACGGC--TTTTCCGCATACGTAAACA---
>Snap24 5587688 5587932|5764 chr3R 5585169 5588796 scaffold_15 2264023 2267645 + 98950|2724 2987
ATATGCACAACGGCCACGTCCCGAAACCATAGCGAACATGTTAGTCAGACACCACCTCCATTTCAATGTTGTTAGGGAAAGAAACCAATGTTGTGGGCACAAACCGTAGCTGGTGGTATTGCGTTATTGATACCATATATTATACACATATACAAGTAGTGGCA-----ACTACTCCTGGCAAACGCAAGCGTAACAAACCCATCTACTTACAAGAACTTTA--------AGCCGCCGAGCCGGATGAACTA------ACTACT
AC-TGCACAATTGTATGCACTCAAAGCGATAATGATTAACCTAATCAAAGGCTCCTCCCACTC---------------------TCCATATACTCGAAACAACT--------------------------TACTATCTCACCTAAACTTACACAACCACCACCACCACCACCACCACCAACTACTACAACAACAGGGAACACATGTTGTGGGCACAAATATACTAGCAGTAGCGGCATTATTTTTTGATTTATTTGTTGCTACT
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AACTATCTATCACC-CAATGG-----------GATTGTGACC----------AATTGCAGCTGATCATTGAAGACGTACAAATTTA-------ATTTGATATTCCTATTGTAGTCCTCTATAGT-----TCGCCAAATGTTTGCACACCCGCATCCGTATCTACGTAC------------------TGTGAGCGCACAATAAACTTTCCATTTT-------AG
----ATGGATGATCACAATGGCGTCAGCAAAAGATTGTGCCCATCGCATATAAATTGGAACCAA--ATTGGAATCGGTTCTATCTAAACGTACAATTAGCAATGCTATTAAAGCCTTTAAAAGTCAAACTAACCATCTTTATATACACATATATCCCTACCTACGTACATTTATGGGTGTGTATTACGTATGCGCACTATCAACTTTCCATTTTGATATAAAG
>CG12946 5597517 5597694|5770 chr3R 5595866 5597869 scaffold_15 2274530 2276635 + 42355|1835 2022
CGATTTGGCGGTTAAACTTTCAA--CTGCGCCGCATTTTACCACACTGAACCAAGTGGCAGGGCTGCCAGACTGAGAACAACCGCCTTAATTTTAATTTTCGCAAATGTATTTATAATTTTAATATTA--ATCACCATG--ACAAATGACCATTAGCGT----TTGTAAATAAAATTGTTATCGCCAG
AGAAACCGCGCGTAATTTTTTAAATTTATGACAAATTGGGCAACGCTTGACTCGATGGCCAGGCTG--------------ACCACCTTTCTAGTAAT------AAATCGATTT----TTTAAATAGCATGGCCACCCTGCAATCGTTATTCAAAAATGTCTTATTTTAAAGCAAATAATTTGATTCAT
>MtnA 5609487 5609580|5781 chr3R 5609056 5609745 scaffold_15 2288474 2289177 + 2862|448 568
GCTTTCCCCCA------AAAA--------AGATCTGGAGTAGAGGCGCTGCATCTTGTCTCTCTAC-----------ACACCCTGCAATAAATGTCCAATTAAAG--TAATTGATGCCTAA
ATGTGCCAGCAGTTTATAGAATTAAATTTAAATTTAAATAAGAATCTTTTTTTTTATTTTTTGCACTTGCAAAACATATATACACCAACACATGCACAAAGAAAAGTTCATGTGTGCCTAT
>CG9467 5623496 5624181|5790 chr3R 5621665 5626713 scaffold_22 908476 914118 - 153693|2076 2952
GACGTGGAAGCGGCTGCTTGATTGGCGCTTGTCGGGCGCGTTTCATCGTTTACATTTCACAGGTATAGCTTAATCTTCGACTACCAGTTTATATTCCTGCAGTTCGTGGTGTGCGCCCTCATCTACGTCTGGGTGACG---------------CGACTCAC------------CCGCGGTCCAGCCACTGG--------------------GCCGTGATGAACTGCCAGCA---GGCATTTA-CCCAATCAATTAATCTCCATTATA---------------------------------------------TGTGCTCGATGTGTTTGCAAATGCAATGTGTATCCCGTAAACCCATTTTTTGTGCTCCTCCAAACTTGG-ATCGTACAGTTA-----GTAATTTAAAAAAAAAACGTC-TGTCTTTGTTCTAGTTAAAGTTATGAAAATTAGTTAAAACCATGTAAACCAGAGTATAAGACTTCTGCAACCGATCATCTATAATTAGCACAACTCTCCTAAA----------GGGTGCTCCAT-------------------CAGGACAGATACGAAATCGTTCGGCTTGGATAAGA------TTGGTTGCCTTAAGCAAAGAAAGTTCA-------TTAAACAGCCAATCAGT------TGATTGTCAACCTTGAAG-ATGATTACTTGTGATTAAAATCGATA------GAGCGACTGCTTCAAATTCGAATCTGTCCTGTTGCATGCAATGCCACACATGAATATAATG---ATACGCCTTGTTGCAACCAGTAAACAGCTATAC-----------ATATTCAATATAAATA-------------AAGATAATTATACACAAAG------AG
AACGTGGAAGCGGCTGTT---TCGGCGCTTGTCGGGCGCGTTTCATCCTTTACATTTCATAGGTGTAGCTTGATCTTTGATTATCAATACATATTCCTACAGTTTGTGCTCTGTGCGTTCATCTAC-TATGTGTGGCGATCTCGCATGGCGAACAGCACACGAGCAACGGACACGGCGGGCACAGCATTAGATGCTGCTGCCGCTCATGCTGCCGGTAACAACTGACTGCATCCGGCATTTAGCTAAATCAAATAATCTCCCATATACACATATATATATATACATATAAAAATACATATATGCATACCTTTTGTGCTCGATGTGGTTGCAATTGCAATTTATG-CTCGTAA---TGTTACTTGTATCTATGTAAACACAGTCTCGTGTAGTTGCACGTGTAGTTTGGATTGTGCCCCTCGTGCTGCTGTAAAACGTAAA--TAAATAAATTA-TTAAATCTATAT-------AGTATA-------TACAACAGTTTTTCATTGGTTATCAACACACTGTTAGATCTAGGAACTGGGTTTTCAACAATTCCACACAAAAAGCTGCAAAATTAATGGAAAGCTGCTTTGTCTGTTTAAGATAAATGTTATCTCGCTTGTTGGAAGAAAGTTTAATTTTCCTTAAACTTATCATTCATCCTTTATCATTATCCGTATTGCAGCAATTTTCCATTCGGCTCACACAGGTAAATCTTGGGTGGAAGCCAGAAAGTTAAAATTATGT--TTGCAAAGTTTTTCGAATTGAAATTTAATGTTCATTCATTTCACTTCAA--ATTTATTTGCAATCCTCTTTTTTTTTAAATTCACTTCAAATGGTGAATAACGGGTGAAAAGGCTTTACGAAAAATAAACTAG
>CG9461 5630494 5630610|5793 chr3R 5629354 5632180 scaffold_29 429172 432080 + 104107|1260 1400
AGAACCCCCAACGGCAGCTAATCCACTA------------------TAGATATATCTTAAGTCGTTA---AGGC---CAATCTCTCAAATCTCTCGCACATCTCACGCGTTGCTGTAAATATTCAAAAGAAACCCAAACCC
GGCATCAGCAGCAGCAGCAACATCATCATCATCAGCAAGAACACACTAATGGTATTTTATGTTTTCAATTAAGCTTACAAGCTCTCAACTGTTTAGACTTTAAGACGCGCT-CGGTAAAGAACAAAAAAAAA---------
>CG16904 5641649 5641818|5805 chr3R 5641577 5641823 scaffold_11 181673 181958 + -831|87 285
ATGCACCTGCTACACTGTGATCAAAAACTGGTAATTCGTATGTACATAACTATTGGGGTGCATAGGAATGAAGAGTGTCTTTCCAACTTT-----CATACAATTTTTGTTATAAAATTCCCACCTTTGATCCTGTTTTTTTTTTGTATTATTTAATAA------GAATGTATT------------------TGTAATCA
ACAAATTGTGTTATCCGTAATTTAATGCCAGTTAGTCGAACTGAATTTATAGTTGAA----ATAAAAACGTATTGTCTTGATACAAGTATTTAACTGTACGAATTCT-TTAAAAAGTGCGCAGTCTTCATCGACCTAATGTATTTTATAGCTAAATGACTTGCTGAATGTATTTAAATGTAAATGTAAAAATGTAATAA
>CG12806 5653580 5654447|5826 chr3R 5653035 5654909 scaffold_22 1824885 1826997 - 26115|579 1636
CACAAGGACGACACTGTGGAGAGCAATTTAGGGAATCCCTCGACGAGTAGCGACTTCTAGCAGAACCTCATAGCGAGTCCTGCGGAACTAGCCAAGGATAATCTATTTGTTCTTCCAACATAGTGTCGGCCCAA-----------GACGAACTT-----CGAATGGAGATGAAA---AAACGGTGGATCGGTCGATGG---GTGATGGCCAAA------------------AAGAAGTGAAGATACGACG------------AGCGAAACTATCAGTGGTTTTAGTGCACCTA-----------GCCGAGCAGAAATGAATCAG-----------------------ATTAATGAGAAACAAAAGGACATAGACAGACACACATAAATTAATAATTGATCCAACTGAATAATTCCTAAGATTGATTAAATTTAGTTACTTTTTAGCGTAAATGATTTTTAAACCAGCCGACCGCGGAGGAGAAACCAACAGAAGTGTTAATCGGTTAATGAAATAGATCGAAGTCTAGTTTTAAGCTGTGGCAGT----------GGCAAATGTATTTGTATCTCTAGCCGCGTATGCAACATATATGTATGTACATATATG--------------------------TATGTATGTGTCTGT-ACGAATAAACCATAT----------------------------GCGAAAT-TAGGCAATG-----------TGTAAATTTAGTTA-AAAAATGTGAAGAATCATTACGGATGTAAAACAATGGCTAAATGAGACAACAAAAACACAACTAAAC------------AGAAACAGAAAATGCAATGAATAAATTTTGTACTGCTGAAA--AAGAGAAACGAGAAAGTG-GAAAACATGAGAACCTTAACGTTAAGTGTACAATTTTGCATTAGGTAATGAATAAGTTTGTAATGCATTAGTAATTAAATACAATA--------AAATGTTCAGCTAATCACATGGAAAGCAAAAGCAACCCAAACTACAAATGCAACCAACAAAAAAAAAAA---AAAAACAAAAA
CACAAAGATGACACTGTGGAGAGCAATTTAGGGAATCCATCGACGAGTAGCGATTTCTAGCAGAAGCTAATCATCA---CTGCGGAACTAACTACGGATAATCTATTTGTTCTTCCATCATAGTGTCAATCAAGTCTAGCTAACTGACTAATCTGAATGCCATTGGCAATGGCGGCCAAACAATTCCTCAGGCGCCCGAAAGCCAGGGCCAAGGCCGTCGATAACTACAGTGGGGGGGGAGGGGGCAACACTGAAAAGTTTTAGCAAAACTACCAAATAACAAAAAACACATATGTATACCCATACGAAACACAAACAAACAAACACACACACGCACACACATGAACATTGAAGTGCAACAAAAGAACAAACACATGAATAATAATAATAATAATTGATCCAACTGAATAATTCCTAAGATTGATTACATTTAGTTACTTTTTAGCGTTAATGATTTTTAAAC---CTGGCCGTGTGGCGGCAACCC----AAATGCTGCAAAAGAAGCAAAAACAAATGTAAACTAGTTCTAAGCTAGGTTATTCAATATATACTACATATATACACGTATATATGTACGGCAATGCAACAT-CGCATATTTTCTTATAAGAGTGATGAAAGGTGGCGTATAAGAATTGTGTTTGTATTTGCAACAAATTGATTATGTAATATGTAGCAGGTGTATATTAAGGCGAGAGAAATGTTTGCAATGTGTAACGAAAATGTAAATTTAGTTATGTAAATTTAAATAACAAATATGGCAACAAAAAGA-AGTTAAAGTAAAGCACACAGAAACCACAAAACCATATTTGTGAGAAGAACAAAAAATGCAATGAATAATTTTTGTACTGCTGAAAAGAATAAAGACAAGAACACATGATAATATAAAAA-TTTAACATTAGATGTAAAATTTTGCA-TAGTTTATTAATAAGTTTGTAATGCATTAGTAATTAATTACCAAACCGAATGCAAAAGTTCAGCTAAATTT------------AGCAACCAAAACATTGAAAACCTCCAACAACTGAAATTGTTTCTCAACTCGAA
>Art4 5808902 5809634|6004 chr3R 5808268 5812557 scaffold_22 2006598 2011193 - 111899|745 1688
GG--GGGCGGTGGA-----TCGAAT------AACAATACATCTTTCTG--GGAATTCCCTTTGCT-----------------CTAAGTCCGCTCACT------------------TTCTACGCTT-----------------GATCCTAATTTTGCCAATTTTTGTT-----TTGTTACAGTTTATGATTAGGTTATTTA----TTGAAA---AGTGTAAAATATTTT-TATCTATTTTCGAAAGTTAGTTCTGTTCTGTTTTGCATACCTTTTAACAACCTCTTTCCCTATCGTGCTATACTTATCCTCCCTTCTCTTACCCATTTAATCGATCGG------ACAAATCGAAGGAAATCCAGCATC-------CCAGCAAGTAACCAACATACAAACAATCAACAAATCAAGGCAGACTA----ATGTAGTTGTTTAGAACACGCAGCATATTA---ATAAGCCTAAGCTAATTTAAG----CCCATAGTAATTAGAGTTTTTAACGTATGTGAAT--TGTAATACCGATATT-----------------------TAGCCCGCACGGG---ACTGC-GCTTCAGGAAGTTTATTAGTTAATATGCCGATTGCCAATT----GCAGATTT-----TGCCGTAAGCTTTGAACAA-------------------ACCAAC----AAATTCAGATTGTA-CTGTATCTATTA-----------------TGTGTGTTATTATACTATA-------TATTGTGTGTACCTC-------------CAGCTAGTTTCAATTTTTGTACTTGTCGACCGTGTTTATGTTTAGTTCGTTTCAAAATGTAAGAAATTGCTCATAGGATTTAG-TGCTAAGCTACGATATCATTACTA-------AAGGCCGACCTGGGTCGAGAGATTATACTTATACCCCCAATACGATT
GAACAAGCGATAAAGTTTGTTGAAGAAGGCAAATACTACAACTTGCTGGCGCAATCTATTTGGCTAAAGATATGAATTGAAACTAAATTAGCACAATTATCCATTAGTGTTTTTGTTTTACGCTTCTTTTGTTATTTAATTCTGTCCAAAGTTTACCTCTTTTTTTCTCTTATTTTTATATATTTTTTTTATTCTATTTATATTTTGAAAGAGATTGTGAATTGTTTTGTATGCA---CCGAAAGTTATGAGTTTTTGATTTTAAGTACTCGAAAATTG-TTCAATCCCCGCCTAGGCATA------------TGTTGTAGATATTTTGTACATCAGTCGGCAATAACAATAAGCAAAACGAGAATCGATGAGATCTTTAAATATCGCATAGATAAAC--------AATCAAGGCAGACTAACGTATGTAGTTGTTTAGAACA-GCAGCATATAATCGATAAG-----GATAATTTTAGCCCCCCCATAGCATTTAGAGTTTTTAACGTATATGTGTTATGTAATACGAGTATCTTATATATATATATATACTATAATAATCCACGTAGATTTACTGCAGCTTCAGGAAGTTTCTTAGGTA--ATGCCGATTGCAGTTTTCAAGAAAATTTAAAAACAAAACAAGCTTTGAACAAAAACGAAACGAAACAAAACACCAACTCAATAATTAAACCTGTATCTATGTATGTTATATTATATTATTTTAAGTATATATCATTGTATTGTATTTCAATTATTTCATGTACCTCAACGAAAATGAAGAACCTAGTTTCAATTGTAAAACGGAAATTCAATGGTTATGCTTAGT---TTTGAAGTCATAACGAATTGCTCATAGATTATAGCCATTAAGTTATA--GTTATTAATATATTTATATGAATTAGTCGCGCTGAGAGATTATACGTTT-----CAATTTAATT
>CG5359 5825491 5826090|6012 chr3R 5824251 5826235 scaffold_20 291645 293673 + 77416|1298 1983
TAGGCACCGGGAACAAAGGGTT--------CATCACTTTCGATA----------GTCGACCTTCGTCGTGC--------------TTCATTGGATGCGTACGTTCAGCGGATTCAGTATGCGGCCCGACATCACAGCCACGTCCAAGTCGCGATCGACGATGAAAAACAGAAACGGATGATTCACAGAGATCTGAATGGGCTTCGATTGGGCGCCGTAGTTGCCTAGAGAGTAAAAGGAAGTGTTTATTGCACTTTGTC--TCGTGTTGCAGAGGCTGCAACTGTTGCAACACCATTAGGTTGGGC--------------------ATTCGCAATGCGTTGCGGCTCAATGCCTCCACTCCATTCCATTCAGGTGTGCTGCAATGCG----------AGACACTTACGCTTCAGCTGATTGATGGGATGCGTACGGATGGTGACGTCTATGGATTGCTCAATGTGTCGCACGTAGACGCCCTTCTCCTCAGTCATGGGCCTGAAATCGGCGCGATTTGGTTCGAATACGTCGCAGCTGCAACGAAAGTAAA--ATGAAGCCAGGAACTG-------------GAGCTATTACA----CCCA---TGCTTACATTCCCATCTGCAACAGAGAGCACAAAAACCAAAGACACCTCAATAAAAACACAAAAATGCACTCTACAAATGAA
CATGCACCAGGAAGCGAACATTGCTCCCAACTTCACTTTCAATGATGTCCATTCGTTGACCTTCGTTGTGCACCAGTGCCTGCGGCTCACTGTATGCGCACATTGAGCGGGTTGAGTATGCGGCCCGACATTACCGCCACGTCTAAGTCACGATCGATGATGAAAAACAGAAACGGATGATTAACAGAGATCTGTATGGGTTTCGTTTGGGCGCCAGAGTTGCCTGAGCA--AAAAGGAAATAGTTATTGCACATTTTTATTAGTGCTGCTGTTGCTGCAATCGAAGTTGCA------GGTGGGGCTGGCTAACACCTCGATCTCTATCTTTATTGCGTTGCGCTTCAATGCGTCGG--------------GGTGTGCTGCAATGCTGCAATACAGCAGCTACTTACGTTTAAGTTGATTGATGGGATGCGTTCGAATGTTGACATCAATCGATTGCTCAATGTGTCGCACATAGACGCCTTTCTCATCAGTCATGGGTCGGAAATCGGCTCGATTCGGCTCGAATATATCACAGCTGCAATGAGAAAGAATTATGCAGAAAGTAAAAGTCCGATCCCAAATGATCCATAAAAGCTGCCCAGTCTGCTTACATGCCCATCTGCAA-----------AACAACAAGTGAAGCAAATGAATAATCTGTTTAGGGATCCTCCA--TAGT
>CG5359 5826295 5826343|6013 chr3R 5826236 5830054 scaffold_20 293880 297648 + 86228|63 112
AACCGA-TTTCCCACAGAACTAGTTAGACTAAGGATTATACTTTAATGGG
AGCGGAGCTGGGCAAACAACTGAAGGCTTCAAGCAGTG-AGTTTGGTTTA
>MICAL 5828033 5828156|6013 chr3R 5826236 5830054 scaffold_20 293880 297648 + 86228|1894 2017
ATAGCCAACTTTCCCTGGAGATTGCTGGTCTGCGAAGTGGTGCATGGACTGTTGAGCCTAAATACTTAAGATGAAACAAGGGAACAGGGGAGAGCGTACCAAAAAGGCAGCTGAATATACAGAA
ATTTTAAACTTGCCTTGGGGCTTACTGGCTTTCGAGTTCTGGCAAGGATTTTTACGCCTAAATACTTAAGCAGAATGTACCAAAAAGCAAAAACTATAACTATAACACAAC--------AAAAA
>MICAL 5843965 5844152|6017 chr3R 5835142 5847120 scaffold_20 303631 315884 + 444774|9338 9576
GGATTGCCATCGCGTC-------------------------------ACTTAATCATCCATTCAAACAT-----------------CTTGTTAACTATATACACAAACATTGTGTATTTATATTTCATTACCATTGCTCGTTTAAAATT--GTTCGAACTCAGCTATCTCATGTACATTCAAAGAATTTAATTGTTAATCACATAT-GTAAAACGCAAGAAAACCAATATCATAAAAAC
AAAGTGATGCCATATCAAAATTTCTTGTATATATTCTTAGTTCGTAAATTTAGCAAATTATGCAAATGTGCTCGGAGAGACCATCACTTTTCAACTGTGTCAACAAATTCTCTTTCTCTCTCTTTCAT--ACAATTCTCCTTAAAATTTACGCTCATACAAAAAAAATT-------ATTAATTGTAATTTATTGTTGATCGCTTATCATACAAC----------------CATAAAAAA
>CG11722 5870320 5870348|6041 chr3R 5869122 5873702 scaffold_13 1209626 1214324 - 146305|1246 1280
-TAAATCATT------CTTGTTCTTTGTTTTAAAC
CTTAATAGTTAAAAAACTTGTTA-TTAATTTAAAA
>CG12812 5877228 5877268|6043 chr3R 5875152 5878427 scaffold_13 1215303 1218753 - 100848|2248 2316
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ACCAAATTTCCAAAATATTTAACTCATTCTCTATAAATGTATTGCGATTTGATTGTATTTATGTATTTA
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TCCAGCGCAAGCAACGAGCACGGGCCAAATGCGGAAGCCTTAACTGGAGTCGAAGCTCTCACTGACACTGAAACTGATGCCCAAGCGGAAGCGGAAGTGGAAGGCGATGGCGATGGCGATGGCAAAGGCGAGTGCGTACCCGCAAGCGGATGTTGAGCAGCACGCTGATAGCGACAAAGCCAAAATCATAGCTTAAA-CTTACTACTACATACTAAAACAGAGCAGAGGAGCCGATCAGGACGAA--ACGAGAGTGGCCAGGACCTTTAAACCGTGT----AACTTACA--ATACCGAGTGGCAATATCAGTCAAGTAATAGAGCAAAGTAATTCTGTAGTAAAATCTTAAATACAAAAGCAAAACAAACAAAAACATAAGATATTAGCTAATCGAAAG-----------GCAGGCACAACAACAGAATCACCAACATCAACATCAACAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAACAACAACAACAAA--TAACAATTTTAAGAGAAACTTCTTGTGTATACTTTAAACATAAATAACAAATACAACAAGCAA--------------CAAAAAAAGAGAAAGATATTTATGCATAAAC-AAAATGAAACGCTTAGCTCTAAGTTAAATAAACGAATCAGAACCAACAAACACCTGCACACACACACGTACACACACACATAAACAC-ACACAAGCTTGCTAATTATATATCCTTTATGCAAATTATTACTTTCAAAAAGCTACAAAAGGCAAATGCAAATGCAAATATTTCAAAGAATGAATTTAGGCGCAACCCA-AAACGAAATAGAATTTAAAAT------TGAAGCTAAAGCAATAAATATGATTTGGTGTATCAACTAGGTTTTAATTTGAA-TAACGAAATGCCCCGCTCACTAGCAGCATACCCCTGAGCAAAACGAAAAACAAAGAGATATATTGAAACGGATCCCAAGCTGCGTACAATT----ATTTAATTAACAAGTCGAAAACAAGAAAGAAGAAACGGTAAAAATAGAAAAAAAAAAACGAAAATATCACATACATAAAATTCTTTGTTAGAGCTTAGTTTATTTTTATTTGTACTTTTAACAAGTCAGTTATAGTAAACGCTTATGTTTTTTTATAGTTTATACCTTTGTTTGTACGGATACATACAAATGTACATATAAACAGAACGATAACTAATTAAACATAATTAAAACATAAAATACCTACTACTTACTTATGTATATGCTTATGTATG----------TATATCTTATGTTTAGCACTCTAATTTAAATAAATTAGAATTGTTTTCTAATTTTACGCGTTGCAAAACTTAAGAAAAGAGAAAAAAAAAGAAATTGAATTTAATTTTGAAAAAATCACACACACATATATTAATATATATACTCTTTTGAATGGAGTTTGTTTAAAATTTTTGTTCTTTTTTGTGTGTAT-TTGTAGTATTATTTCCAAGAAAATGAAATCACATGTTTGAATATGAATATACCGATCACATACACACACGTACATATACATATATTATGAAGTACACACACTTAAACCATAATATGCATACAAGTATAAAACACATACTTAAACATATACATTAACATACACATACACATACACATACACATACAGATGCAGATATAAATAATAAATTATGAATAATTTTAAATTGTACTTTTATTTATGTATTTTAATTTGTATGCGTT-ATATTTAGTT-ACTATTATCATTATTATTACATTTACTTAACTAATGATTTAATTTTAAAACAAAACAAAAGTGAAAACAAGCGCATTGTACGAATGATGATTAAATGATGAAAATAAGAGTAAAATGCATATATGA-AAAATAATTGCAAAAAT
>CG31394 6352581 6354139|6476 chr3R 6352620 6352848 scaffold_33 1089945 1090212 + 5594|0 288
GAAAAGCCAAAAACAAATTAAACCCGCTGCCATTAATCTTCC-----------CGGCCAACTCCCTTGGTGGCAGA--------------------TCGACTCCAGAGCTCGGTT---------------TTCAGGCAGTTCCTGTCCCGGTTTATTCTGGGACTCGAAAACCTGGATACGATCCACCAAAGGCAAGGTGAGATGCATTTTAACATGTCTCATGAATTCGAGCGGATTGAGTGCACA------GAAATCTTGTCTTGCCGCC--------ATTTGCATA
GAACACCCAAAAACAAATTAAACGCGTTGCCATTAATCTTCAAACTTGCGAGACGCACATCATCATATGTGACTGAGACAAACGTGGGGCAATGGGTGCACTTCAGCGGCGGGCTAGGGGCTAAAAGACACACAGGCAGCAC-------------TTTGGGGGCTCCACAGGCCGG--------CCCCATAATCAAGGTGAGATGCATTTCAACATGTCTCATAAATTCGTGCGGATTGAGCGCAAGCCGCACAAAATCTTGTCCAGACGTCGTATGTGGATTTGCATA
>CG31394 6352581 6354139|6477 chr3R 6352965 6354208 scaffold_33 1090618 1091941 + 16585|0 1415
AATTCTTGTTTCAATTT--CGGCTCCGGCGGATGGGGGCCTCTTGG-------------------------------------------------------------------------------------TTCGTAATTTAATACGCTTTCAAAATTAAGAAAAATACAC----------------------------ACATCTACCAAATACCAAATCGATATGGCCGGGTAGGCCCCAAAGGTCACAGCCAAAAAGATTCAAATTCGAAATTAGTAGGG---------AGAACATAAATAACGGCGA-----------------ACAACAAATACCGCACT-----CCCCGCCTTAGAAAAGTGTGTTTTTTGTCTATTTCTTGAGTTGGTTTCGAGTTGGAAATATTTCATTATTATTGGACAGTTGCCGAGCGG-CTCAGAG------ATTCATTTCATCTGATCTCCCATCG------------------CATCTGGGTTCTTAGGTCTTTTCTTAT---------------ATTTT-----AATTTATGC---------TGTCTGTTACTTAACTTGATTTGCATATTCTCAAGCTGGAGGGTAGAATAAAATCGACTTGTATAGTCGTTTTTTTTTTTGTTTTTTTTTG-CTTCTCGTTTTTCAATCTAATAAACCATTTTGTTGCTAAGTACAGCGGCTGAATAAATGCGAATTTTTTGCTCACCCTCACTTTGAGTTTTTGCACTTTGCTTCCCGTTTTCTCTTTCTTTATTGCACGCC-CTCTCGCTCTCTTTCCCTCGGTCCCTCTCTTTCTGGCCAGACTTTTCCCCTCCAATATGGCCG------ACAAAGCTGCACAAAATGGGGTAACACCAACATACAGAGAGAA-------------------AAAAGATTTTCACACACAGGCGGCGGAGAGTAAGGGAAAACTACAGGAAATTACCAGCAAAATAAAAAAAAAACGAAGCGAAATCGGGGAAAAAATGCAGCAAATGTTTTC----TTGTCTTCATGTTTTCGTGACTGATGCGTTATAATTTTCAGGCTGTTAAAAAAACATTTTCTGTGTGTTATTAACAAAAAATGTATGCAAAAAGCAGCGGGAGGAAGCTGAAGAAGAGGAAGCACAACAGCCCCAATGTCTGGGACCGCCTTGAATTTGG-------CGCGTTGTCTGCGCCACAACTGCAATTTTGATGTCAGAAAAACTGAACTGCAGACGTTTAATTTTTGCCTTTTTCTTTTTGCCGGGCTTGTATTTTTATTTGGTTTGGTTCGTGTGCTAAACGAAATTACACGCTTATGAATTGCTTAATATCGTGTAGCACCAGGCATAGAATAA---AAAATGTGTGGGTAATAAGCCAAAAAAAAAAAAA
AATTCTTGTTTCGACTCTGCGGCAGGGGCGGGGGCGGGCTCGTTGGCAGCTATAGAACCGTTGAGGAGCGTGCATCGTCTCTTTCTCTCTCTCTCTCGTACTCTCTCTTTTTCTCCTGTAACGTATGTGTGTGGGTAATTTAATACGCTTTCGAAATTAAGAAAAATACACTCTAATATATATACACATGCTTGTACGTACATCTACATA----CATCTCGATATGGATGG-TAGCCATGAAAGGTCACAGC--GAAAGATTTAAATTTGAAATTAGTATGGCCGCGTCGAGCAACATAAATAACAACAACGACAACAGCAACAGCAACAGCAACCGCCACATTGACAACCATGTCTTACAAA---GCCTTTGTGGCCGAGAGCTGGGGGCATCTTTT--TGGGAAATATTTCATTATTATTAGACAGTTGCTGAGCAGTCGCCGAGTGCTCGAGTCTTTTAACCGGGCAGGTCATTGATTTTTGTCTAATATTCTCATATGTGTTTTTTCTTCTGTTTTTATCAGCATAGAGGCTTTATTTTCTGGTAATTTATGCAGCAGCTGGTTCATGTTATTAACTGTAATTTGCATATTATAAAGCCGAAAAGCTGA-TATTTTCAA-----AGATTTATTTTTTATTTTGTTTGGCTTGGACTGCTTGTGTGTCTG----------CGTGTTGTTGCTTTTTTTTTCGTCTGCTGACAAACG--------------CCTCATTT------------CCTTTCTTA--ATAAACCATTTTGTTGTTACACAAAACTTTTGCAGTCGTTTTTTCCGTCCGAGTTTTCCT-----------TCCCCTACAACATGGCCGCCCAGCGCAAAGCT----AAAAAGAAGCAA----AACGTTTGGCAGAAATGTTTTGCAATTTTTTGTTCAAAGATTTTCAC-------CAGTAAAGAGTGAGAGAAAG---------------AAGAGAGTAAGAGAGTAGAAAAGGTAGATAGGGGCCAACA-GCAGCGAGAAACCTCGTTGTTGTCTCCGTGT---CGTGACTGATGCGTTATAATTTTCATGCTGTTAAAAAAGCATTTTCAGTGTGTTATTAAAATAAA------GAAAAAAACGAATG--AGAAAATACAAATGGCAATGTCTTGTTGCTCCGCTCTGCTCTGCCAGCTTG--TTCGGTGGGGTCCGCCTTGCCTTCTGT-CTGCTGCAATTTGGATGTCAAAAA---TCAACGGCAGACATTTATTTTTTA----------------------------------AGTTTG----GTGTGCTAAACGCAATTACACGCTTATGCATTGCATATTAACATGT-------TGAATATAATAATTTAAAATGTATATAAAAATCGCCAAAAACAAACACA
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TTGTTTGTTGTATATGATAAAAGTTATAAGATAAATAAACTCCTGAAAATAATGGA
TATTTGGCTGCCAATAATATAAATTTCACAAATATTAAATTCATG---TTTTTAGA
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TTAA---TACCTTGTATACGCTGTATTT
TAAAATGTTCTATTTAAAAGCTACATTT
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AACCTGTCTACATATAAAAAAAAATTCATTTATAATATCATGAAAATATATAAAAACTAAAA
AACCAGACAATATATACAT-----TTTTTTCATAAGATCCAATTATTATATACATATT----
>CG31391 6529090 6529268|6676 chr3R 6529152 6529350 scaffold_11 1740212 1740412 + -2191|0 125
AAAGTCGGCTTGAAAGTAGTCAGCAAAAATCATGCATTGTTGGTTGCGATTTTGTGCAAGAATACTACCTTACTTTTGAGGGCCAAAAATAGGT---ATTCGTGTAATTTA------TATATTTCC
AA----GGCGTTCACATTACTTTAAATGCTTTTGCACCTTAAGTTCGAATTCACTTGAAATATA-TATTTTTCTGATTTTATTCAAACGTAATTTTACTTTGTGTAGTCGACTAGGGCATACCCTT
>CG14689 6535307 6535397|6681 chr3R 6533193 6537616 scaffold_3 1782060 1786419 - 103528|2251 2348
TTTGAGGTCGTACACATCCATTAGGTTTTCA-AGAGACTTCAAATACTTCAAAATTATTTAT-TCGTGAATAAA-----ATACTTATAAATCTTGAAA
TTTGAAGAAGCGTAAA---GTTGGGTTTGAATGGAAATCTTATATAGTGCAACAGAAAGTATATCACAAATAAACGAGCATACACAAAAGT----AAT
>Takr86C 6563307 6563919|6705 chr3R 6563251 6563606 scaffold_3 1829305 1829741 - 2176|56 451
AAAGTTCTTTTGCACTT---CTGTAAATCGAGCCACCCGAA----------------TGTGAAGTCGAAGT-CGAATTTCCGGTTGTCAAAAGAAAATACTTCAGCAAGAAGGAAAAACTTACCAA-------------------TAAATTGAAT----------------TTGTATGTATTTGTATAGAAGAATCTATCGACACTTTA-ACCATCGAAG--AGCTGTAAGTTTTAACTGTTGTAAACATCTAGGCTAAGCCAAGTTTGTAAATACATTCTGTGTATAACTGATGC--AAATGTATCTGCGTATATGTTGTGCT-----------------ATTTGAGTAAAA-------------------GAATTATACGAGTCATGAAATTTC
AAAGTTCCTATAGGGTTTCGCTTTAAAAAGAGCCAATCAAAAGGAAAGGAATTTCATTGTAAATACGAAACACGAATTTGTGGCTGTCAGCAGCAG----TAAAGTAATACGCAAAAATTTATAAAATTATAAGAATTTTAGAGTTAAATGTAATACGTTCTCATGCATTCCTATATGTACTTAAATATATGTAACATTAAATAAATAATATCATCGAAGGCAGCTGTAAGTTTTAACTGTTGTATATATGTATATACGCTGCAATTTGTA-------TTTGTGTAT-CCCAATGCTTGCATGAAAATACTTATATTTAATGTTCAAATGCGCAAATTACAATTTTACTGATAATCATTTAAAAGCTTGTGCGGATAACACAAATTAT-AAATATC
>CG14691 6579052 6579119|6720 chr3R 6579003 6579119 scaffold_3 1851026 1851174 - 996|54 154
TCTTGGCTG-------------TGATTAATTGTATCCCTTTCCATTAATTCTGGGAGAATTAATA--------------------AAATTAATAACAAACA
TCTATGCCGAATGGAACATGAACAAGTAGTTGTA---AGTTTTATTTTTTCTG--AAAATTAATGCCCAAAACACACAATGGGATATATTAATCA-AGTTA
>CG31272 6582013 6582218|6724 chr3R 6581914 6582216 scaffold_2 4717217 4717516 + 1048|123 333
CAAAATAAGAAATACAAATAATAAGATAATAAAAACTAGACCTAGGAGTGCCCATTTAGAATCGGATCTTGCGACATTAGCTTTTGTTTAGTTTTACAAATTAGAGATAACGACTCAACTGGATAAGATAGGCGCTGAACAACTATTTATACATACCCTAAGTAATTAAACCAAATATATCTTTACTGTTGTACA-------AATTACGAT
CAAAAAAAAAAAAGCGGATATCAACATAACATTGAAT---CATATGTTTATTCAGCTAGAA-------------------CTTCTTTTTTATTTAAAATGTTTGAAATATCG--TTAACTGAATAAAATCGGAGTTTGAAACCTTTGTATAATAATACCAAATATTTAATACAAATATATTTTACCTATTTCATATCATTTTAAGCATTAT
>CG31272 6582013 6582218|6725 chr3R 6582218 6582705 scaffold_3 1855807 1856308 - 13841|0 0
A
A
>MED7 6585917 6585931|6728 chr3R 6585931 6586661 scaffold_3 1860276 1861000 - 36325|0 0
G
G
>TfIIFbeta 6592342 6592522|6732 chr3R 6590282 6593443 scaffold_3 5076631 5080049 + 59442|2381 2619
CATTGGGAGAATCGCCGACTTACTTTCATTAAAACACAT-------TAAGTAATTGCATGGTTCCGTTTTATTCCT-------------TAAGAACTA------------------------------CACGTTATACTTACGAAAAAAACATTATATC-------TTAAAATGATTGTAAATAGACACTAGCTTGCACTCTGGTAAATACATACG-TATATATACACTTTATCCTTAA
TCGTAGGATCTTGATTTTATTACCTGTATATATATATATATACACATATGTATGTACAACTTTCCAATGTAATCACGTACTCAGCTAAGCAAAAAGTAAATCCAGCAGACTTTCTGCACAATTTTTATCACAATTCTCGAACTATTAAAACATTCTTTCCCCGGTTTTTCAGTAATTTTAAACA---ACTAGTTTTTAGTTTCTTTGACTTTTTCATTGCATTTAGATGCTATCTTAGA
>fau 6598400 6598661|6740 chr3R 6597564 6598703 scaffold_47 31687 32900 - 18356|967 1251
AGAATCCATTTAATCAAAATAGAAATTATTCTGGGTAAATCCCACGATCCCACGTTAAATAATCTGAAAGTAGTAAGCATTTTCAAGATGCATTCTTTACTTATTATC--ATTTCATATAT---CATCATTTTTGTGATGTAAAATCGACTACTTCCATAATCATAAGGCAGACAAAACTGCC-TAAATGGAGAGATCACGAACATATGGTTTACGTTTCTGTTTCTAGT-----------------TCTTATATGTTCTTTTTTATTTTCTCTGCTTTCTCATT
TTTACTTATCTAATATATATATATAT-ATTATTGTTATTTGTTGTATTTTT---TTGCATAGATCATAGATAGTACGAGCTTCCGA------TTTTTGACAGCTTGTCGCATTTCCTGTTTATTCAGTATATCTCTGAGTTATAG-------CTCCTGTACCCATTAAATAGACAAAGTTTTTATAACTTGTATGTTGGTAGAAGAAGGTTCTGAGCTTCTGAGTCGGGCACTCCCGACTAGAGTAATCTTACTTGTTTTTTTTCTTGTTTTTTGTTTT-----T
>fau 6599254 6599419|6741 chr3R 6598704 6600825 scaffold_47 33368 35629 - 37724|621 797
GAGA-----CGCACAGCGTCAAAGGATCGGCGTTGGCTGTCCACGGCTTTGAATGTTATGGTGCCCACTAATACGTCATTGTTCTGAATTTATATATATATATAAATATATACATTTTGCAAATAATCCACTTAACCCGCTAACCT---TGAGTGCCCATATATATATATATA---T
GAAAATGATTGAAAAAAGCAATAGAATATATGGTTTATGT----GGCTCTGAAATTAACTACACTAAACGACCCG--------CTTAAATTGT---TATATATTATTA--------TTGCAACCTGTTATTTCTAACCACATACATGCATACACACTCGTGTATGTAAGTATAATGT
>fau 6600266 6600370|6741 chr3R 6598704 6600825 scaffold_47 33368 35629 - 37724|1787 1900
GGGAGCATCATCCTATTCACCCAA--CCGATAACCCGAACCCAATCGAAGCCTAGTCGAACGAACCTAGTCGTATCTAAGGACA-------CATAACCAACTAAAACAGACAAA
AAGAAAAAAAAAATGTGCAACGAAACTCAAATATTTGAAACCGAAAGAAAAGTTAACGAATTGACTGAAAAGTCTTTGATATTACAATTAGCATACACGATGTACATGGCCATA
>mRpL37 6606688 6606913|6748 chr3R 6606473 6607808 scaffold_47 47714 48984 - 29059|229 454
CCTGATCAAAGAGTCCAACCACTTGGTAGACAAACTGGAACACATCATGATTGAGAATCAAGCGCATCGCAGGTCGGTTTTGGGAAAACTAGGTAAAATACCCACCTTTCAACCGACCAAGTTTATAGCCCCATCGGAGCAGTGGTTGCCCCTCATTGAACAGCAGGAAAAGCAATTGCAAATTATTTTAAGCGGCAATGAGGCTAAGAATGCCTCCCCAGAATAG
CTTAGTGCGAGAGTCAAATAATTTGCTAGATAGGTTGCAAACAATAATGCATCAAAAGAATTTGCAACGCAAGCATGTGCATAAAACAATGGATGAAATAAGAAAGTTTCAACCAACAAATTTCAGATTTCCATCTGACTACTGGCTACCGATAATTGAGAAACAGGAAACACAGCTACAA----------------------CTATTGCTGGACCCAAAATAAAA
>Art1 6612203 6612487|6754 chr3R 6612142 6613433 scaffold_47 57010 58284 - 64959|66 366
GGGCA-GCCA--TAACCAATCCGATCTGCCATTTGGGATGGGGCTCAGAGCCCT------GCAGCGAGGATACATACAATGACTAGACGTAAGGTTTATTCCAGTGCGAAATGTGCAACGAATTCGTGTTGCGTCTTCTCCTAAGTTTAAAGTGTACCTTTGTTAGTATACATAATA-TTTTACACTCGTGCGCCTGTTTAAATTATTATTCGAACATACTTCTAAGCAAGTTGTACAGCAGCACGTCAATTCTCACAT------AATAAACAGTGCACTAAGCACGTCCCCTTTTGCTGG
AGTAACGCCATTTTACCAATGTGGCCT-----------TAAGGCTACTTGCCTTCTTTAGACAGAGGGAATTTA-ATGATGACTAGACGTAAGATATAATCCAGTGCGAAATGTGCAACGAATTTGTGTTGCGTCTTCAACTAAGTTTAAAGTGTACCTTT-TTAGTATACATTATATTTTTACAAGTGTGCGCCTGTTTAAATTATGATTCAAGAATACTTCTAAGAAAATTGTACAGTGGCACATTAAGTCTCACATAAACAAAATAAAGTGTGCGGTAAGCACA--CAATTTTACTGG
>CG14693 6637302 6637560|6771 chr3R 6637552 6638665 scaffold_47 82299 83414 - 9312|0 8
TTGTTGAAA
TTTCTGAAA
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TGCCGAGGAT--------------------------CAACCGCCAAA-------------CGGAGGAGGCAAGCCTCAGAGTGTCGTTGCTGTTAAGAAATTTTTCTACGTGTACTTTCTAACTTTCCGCAAATGTGGCCAAT--TTTAGCTCGTAGTCAA----------------------GTCAATCGCCCC----------------------------------------TCTGTTTGTGTAAATAGCTAATGTTTTGGTTCGAAATTTGTTCGTTAATTTATACAAACCCAAATACCGAATACTCTGTAAC-------CCCACACATTCA-------------ACACAGTACTAATTTTAAAGTGAGCGCGCTAAATAAACGTGTGTTTTTTACAATA---AAACG
GAGAGAAGATGCCTGCAAGGAACGACTGGGATGAAACAATCAACGAATACGAAATATGTGCGAAAGAGTCTAACCTCAA-----TGTTGCTGTTAAGAG---TTTTTACATGTATTTTCTAACTTTCCGTAAATGTGGCCAATAATTTCTAGCATAGTCTATTGATATATATTTTGACGAATGGGCAGCTGCCCATACAAATTGTTCACAAAGAAAAAATAACTATACTACTTCGTCTGTTTGTGTAAATAGCTAAACGTTTCTCTTTTACTTTGTTAT---ACATATGCGTACATACATA---AATACTTTGTAACACTCTCACTCACACACACACACACACACACACACACACAAACAATTTTAAAATGTGTGCGCT-AATAAACGTGTATTTTTTACAATATACAAAAA
>Fdh 6696627 6696718|6822 chr3R 6693250 6700381 scaffold_3 1185970 1193802 - 182421|4152 4306
GCATGAGATAACAATTCTTTGCTTTTCACTTTTTATACAAGT---TGGCAATCGCATGCGATTGCTTAAAATAATAAAC-------TCCCAGTGTATA-----------------------------------------------------TGTA
ACATGTGAACATAAATA-TTGTTATATACTTTTTTTTTTAATGCATGTACATGCCAAGCAACTGTATGAAATAATAAATATAAATACCCTAGTGCACAAAAAAACACAATACTGATAAACTTCTGGCTCCGTGCGCGGTTGTAATCTATGCTGCA
>CG6608 6705287 6705727|6828 chr3R 6705386 6706864 scaffold_3 3781356 3782910 - 56102|0 361
GTCGGACTTGGAGTCGGGGTTAATGGCGTCTGAAAGCAATTGTGCGCCCAAACGG------AATCTACACTGTATTTTCTATTTTTATATATATTT---ACCGCAGCGCGTAAATAATATTAAGACTTAGGCTAACTCTGTTGATTAGTTTTCGGTTGTGCGTATCTTTTCTGGGGGTTCTGTTTATCATAGACCAATTGACTTGGTCAGCGCTTTAGTACACACACGAATAGTTGGCGCACCAGTTAAGTTATAGATTGTATGTGCTAGGTTGTAGTTCATTATTCGGCAGAGC-----------ACCTCTATTCACAGACACATTCAAATTTTTATTTATCTTTTGTTTGATTCGCAAAC
-------TAGGCGCCG----CAACAGTTTT------CTATTTAGCACCTAAGTAGTGAAAAAGTTCACAGCACAGAATCTATTTTTATATGCAATTTACAATTTACTCTGTAAATGATACTAAG-CATAGTTT--CTCTGTTAATTAGTTATCG----------TTTTTAGTACGGGTTTGTTTTAT--------------------------GTTAATAAGTATCTGATTAAACCATGCGCC----AACCTATAAACTATATGCACAAATGCATAG---ACGATTCCGAAATGCCACTGTGGTTTAGTTTTATTTATGGACACA--CCAACATATATTTTTTCTTTTTTTTTTTTGTATAC
>CG6621 6715490 6715636|6835 chr3R 6715627 6716545 scaffold_3 3791712 3792719 - 11363|0 9
ACAGGGCCTC
GCAAGGCATC
>Ugt35b 6994219 6994309|7162 chr3R 6994067 6998921 scaffold_3 4114096 4119058 - 103741|159 254
GGCAAGATTTCTTTGAAGGACGCAATTCGTGATATTTGTAAA-----TGTAACTTTAAAACTACAGCTAAATAAAGGAATAAAATAATTGAAGTCC
AACATCACTAGTTT-----ATTCAATTTTTT---TTTATTAATTTTTTGCAAATATAAAAC---------ATAAAATTTTAAAATCATT---TTGC
>Ugt35a 6996521 6996665|7162 chr3R 6994067 6998921 scaffold_3 4114096 4119058 - 103741|2593 2800
TCAATTAAAGTCGATTAACTGTTTGAG----------------------------TTCATGCCGCCACCGACT-------------TATGTTTCCTCTTAGAGCAGTAAACATTT-------------------GCATTTTTGTTTTGTTACCAGCACCTGTGAATTAATTTTTAAATAAATAA---ATGAAAAAAAAAATATTAAAT
GTA-TTAAATTTGAAAAGATATTGGAGATTACACAATTTATTTGTACTTAAATATTTCTAACAGATACCAATTCCTTAATGATAATTATCTTTAATAATTATATGGTAAACTTTTTTTATGTGAGATTCCGTTAGAATTTTTTATTTATTAACAA-----ACAAAATAAAGAAAAAATAAATAAGCAACAAACAACAAAATTTTAAAA
>CG6666 7034856 7034948|7194 chr3R 7034369 7035739 scaffold_3 4166720 4168104 - 28398|530 646
GTCC-------AAGACCCCAGCTAAA------------CCTATTACATTTTAGTGCGAACACTGTGTGAAAATTGTTA----TATACTAAATACATGTAGTGTGTATATTTATAA-A
ATTCTCCACCAACTATCGGAGCTAAGTGTTAGTGGACCCTAATTAAATTTTAGTGCGAACA-TGTCTATTATTTGATAAATGCATACATAATACATGTATAGTT--TATTTATAATA
>CG6672 7037962 7038589|7197 chr3R 7037839 7039441 scaffold_27 1311709 1313368 - 46651|156 900
TGCCAATGG-GATCGACCCACCGGTGTCCT---TGTAC-----------------------------------------AATGATC----TGTATAGTTATCAGCGCATGTTGAATGTTTGTG---GGCAGTGCGACTCAAACATTATG------------AAATTTTAGTATACT------ACGGCGCCACAATACCCCGCCCATCACTTCCGAATGTCCCCTCCAAGAGCT-----AAGTAAAAGAAAG-TGTTTGATTTTCAGTTGTACTTTCCGAATTTTTGTTAACTTATTAACGTTTGTATTTGTTGAAATGCGTTCGGCATTCATTCCAATTCTAT----------ACATACTGAAAGCATGGCATAACTTATGCAATAGTCCATATCGAGGAGCATTAGTGTAATTGTAAGCTAAGCG-AAAGATTTTGTGC------AAAGGTAAATATAAATATTTAA---AGATTTTTTAAAATTCAGCATGAACAAAACCAGAAA---------ATAGCA----------ACTAATTCTGACTGACATTTCCATGGACATTCCGCCGTGCGGTGGAAGTGCATTTGGTGAATCGTTTTTGCCACAGTTTGAAGCATCAAAATTATGAACGAAATAAAATTTAATTTGTTATTAGCATTTTTAT--ACGTAAACCGAACTGAAAGAAGTTTTAATTCCGGTTGGATGGGTACTTATCATTCGTTTTTTGTTGGGTACAAACAAA
TG--AGCGGCGCTCCACCTGTCGATTATCTATATATACATATATATATATATATATATATATATGTGTGTGTATATATGAATGATTACTATGTATATTGAGCAGCGTGTGTTGTGTGTGTATGTATTGTAGTACGATGATAATTATGTGCTTTTTTTACCTAAATTTTAGTTTCTTAGTCTGAGTGCGCTATAAAAACAAAAACA---------AACAACCC-----AGAGCTGTAAAGTGTAAACGAAAGTTGTACGA---------ATAATTTCGGAAACTTTGTTAATTTATT---TTTTTAACATGTTGAATCG--------ACTCATTCCAATCTTATCAGAAGCGAAACAAAGTGAACGTAGTGCAACAATGCAGCAACTGCTGTTTATATATAAACTTAGTATAATTGTAATATATAAGTACCAAACTTATGCATTCAAAATAGTATATGCAATTAATTAGTCTTCTTCTTTTTAAATTC-GAAAGATCAAACCCAGAAACAAACCCACATACCATAAACATTTGATGAAATTTGACTGAAAACACAATTTCCATTT-------AAATGGATACGCTTGCAAGAGCCAGTTTTTGCTGCA-----------TAAATATCTAAACGAAATAAAATAGAATTTGTTAATCGCGTTTTTATACACACAAAAAAAATTAATGGTATATTTAAAT--GATTGGTTAG------------CTCTATTTTCAAAATGCCAACAGA
>RpS25 7040942 7041272|7200 chr3R 7041077 7042255 scaffold_27 1314493 1315688 - 39905|0 213
ATGAATGTTTTACCTTTTGCCCATCTCGCATCGCCGTAGTCGCACTCGC-CTTACAATAGAAC------TCTGTATCGATAGCACTACGATGCCGCTGTGT---GTGTAACGTTGAATAAACTTGCTTTCTTATTGATGTAAGGGACATTTGCGTGATGTTTAATTGATATAAAGATATACCCTCTTATAGAGGGA--------TGTATCACTG
ATTTTTGTTTTACC----GCACATCTAGAGT-------GTCGCACCTTCATTTACAATATTGCAATTGATTTGTATGGAAAGTACCAAGGCTCTGCTATGTGTAGTAGAATGTTGAATAAACTTGCTTT----TTGATGTAAGGAACATGGGTGTCACATTTTATTTATATTTTGTTATTGTAATTTGCAATACAACTAGTTTGTGTATTGTTG
>CG6689 7043620 7043637|7201 chr3R 7042256 7045748 scaffold_42 377094 380862 - 50768|1463 1492
AATGC------------GTGCTTCTTTTTC
AATACTCAAATTGACTAATTTTTTTCTTTT
>CG6693 7045983 7046226|7202 chr3R 7045843 7046041 scaffold_36 501874 502116 - 26|182 248
ATCAAATAAAAGAATACAACGTTA------TCACTGCGAAATGCTGCT--ATTCTGATATAAAAAAA
GAAGAAGAAAAAGAAAACACGTTAGCTTTTTCACT-CAAAATGTAGTTTAAACCTATAACAAAATAT
>CG6693 7045983 7046226|7203 chr3R 7046042 7047142 scaffold_42 546771 547890 + 45782|0 212
TGCCG-TCCTCCACTGCTCA--TCGTGCGCTCCTTAATATATATTTATCGTGTAGTTTAGGCTTAGTTACTCATAT--------------GTATTTATC---CATGTACGTATACTTGTATTTTTCGCTAGA--------TTAATACTAAGTGGACATAGAAATGCGCTACCATTATTACCCAAAAGTTTTCCTTGGTTCGCAAGAAAATCAA
TGTAGATTTAACATTGCTAAATTTGTGTAGTTTTAGTTCTAAATGTATTA-ATATGAAAAACTTAATCTCTAATATGATTATTGGGCGTCGTATTTGTTGAAAAAGAATATATATGCACATTTTTCAACATATATGCGACTTGATCATAACTAGCCCAATCAATG-----CCAGGGTTACATATACACTTTTTTTG--TCGTAAGAAAGTCAA
>CG17187 7056339 7056530|7215 chr3R 7056077 7057560 scaffold_3 1871649 1873241 - 41227|272 563
-ATAAG-----ATTTAGTTAGGCT------------------CAACATTTAATTTACTTTAATTGGACTA-----------ATATTAATGTTTGAAAATATCTCAATTTAGCAACTATGCAGC-----------TGATTTATAATACATTTACATTTAAAATAG--------TTTTTAATTTATGT-------AAATTTGGT----------TATTAATTATTT-------TTTGAAAAACCGCAAAAATA-----------------------AAAAAAAGTTTAAATCAG
CATAAGTTGTAATTTAATAAAACTAGTTGGCAGCACCACCGACAGCTGTTGACATAAATAAACGGGAAAATAAAATGGGGTATATTAGTTTTTCGAAATAAGTAAAAGCAGTTTTTGTGTTGCGAGAACTGGAATGGATTGGAAGACATTTATGTGTATAGAAAATGATTTATTTCTCATTTTTATGCCTAACAAATTTTGTCAACCCATTATATCAGATGTTTACATATGTTTTACACGTAGTAAATGTATATTTTGAATGCTTTTTTAGCGCAAAATAATTCGAAATAAC
>CG17184 7058151 7058803|7216 chr3R 7057561 7058712 scaffold_3 1873394 1874561 - 17617|629 1298
TTGCTGAACGAGCACGCTCTCTAAAAGAAAAAGGAAAAGATCGGTGGCAGAGATGATTCAGTATGCGATGCAGTGGACAGAAACACTGCATGGCGAACCATAACAATATTTTCGTGCTAAGTTTAAGTCGAATTCCTAAGCCGTAAGCAGAAAGTGAGAGTGGTAGGTGTATGTTATTTATATATTTTTCCAACCGCTTTCCATTGTATGTAACTCGCTGTACTACTCACATTTC--CACAGCTGGTACGCTGA--CGTTCCTTTAACTTGTTTGTGTTTCCAAATTTTCGTTCGATTATCATCATATTGTTGTCCTCCGCGCTTG--TAAAACATATATAACAAAGT-GTACTCGGTGCAATATGAGTGTTTTAGTTTT--------------------------------------------------------AGATATTCTAGAATGTGTG--------------------------------TATAAATCCTTTGT-------------AATTCACCCAAAACGAATAATCCATAACGAATCGAAACTGTTTTTGCGAGCTTGCATAATTTGAAATCATTGTTTTACTAGTCATCGTATTATTTACACTAAAATGAAGTCTATATATATATAAAAATATATAAATAAAAACTATTTAATTACACC
TAGCTGAAGGAGTACGCTCTCTATAAAA--------------------------------------------------------GCTGCATGAC---TTGAAACAATATCTAAAGCTTATATTTAAGTCGAACTTCTAATTGATAAGCAGAAAGTGAAGGCGAGCACAGTCCATAAGGCA--------------CGATTTCCA-TGTA-------------ACTATTTACATTTCCACACAACTCGTACTTAAAATAGTTCCTTC----------TGTTTCAAAATTT--------ATATATTCAAATTG-AACACAACGCGCTCACCTCAACCATTTCTAGCCGAATAGCGCTCAGTGCAATATATTTATTTGACTTTTATTTTAAGCTGATCAGTCAATAAGAAGAACAAGCTACGTTAAATGGAGCACAGTTAATATATCTTAAATTATCTGACCATCTGTGCGCTTATTGGCTGTCTGGCATATTTAGTTTATTTGTATATTAAAACAACAATTTATATTTAAACAAAAAAGTGTACACAAACCAAACATTTTTTTCGCTAAGGTGTACTTTAATCTAATTG-TTTACTAGTCAGCATATTATTTACAATAAAGGGAAG--TATACAAATAAAAACCTATTTAAATACAAATTAATT------ACC
>CG17184 7058151 7058803|7217 chr3R 7058750 7059328 scaffold_3 1874589 1875162 - 20336|0 55
ATCGAGTAGACGCAG--TTCGTCCCTTTCACTCGCGAAGCACTTAGGCGCGTATAT
ATTCAAGAAACAAAGTATTACCCCCTGTAGCACATGAACCACTT-TTCGCCTACAT
>scpr-B 7065756 7065859|7233 chr3R 7065588 7065799 scaffold_42 392003 392215 - 2044|170 219
TTCGGTATATATAATTAACATG----CAACTGGCAATAATGAATTC--AA
TTGGGAATTCAGAATTAATAAGTTTCCAATAGGTCGTAAATAATTATAAA
>scpr-B 7065756 7065859|7234 chr3R 7065800 7065857 scaffold_3 1865731 1865789 - -449|0 60
GATAGTAGATGCTGGGATCTTAAACATGAACGCGGAACGGAAGCTTTATTAATATC---AA
AGTGGTCTATCACATA--TATATATATATATAGAGAGAGAAGATTATATTGATATCTGAAG
>scpr-B 7065756 7065859|7235 chr3R 7065858 7066705 scaffold_42 392572 393427 - 45059|0 1
GT
AT
>CG17734 7067922 7068541|7236 chr3R 7066706 7068458 scaffold_3 5566549 5568419 - 36733|1346 1953
ATTGAATCCCCAAT------ACAATTGTTTCATATTTATGTCTATTTCCAAATGCTTTCGGTTTCCACATGTCTATTAACATTCACTGAAACGCATATTCCC---ATATTCATGACTGTCTATTTAG----TTTTCATACGTTTTGAT---------------TTATTTATTTCCCCTATTTGATTTACTCTTAATTTTAGCACAAAGTCATTGACTAACTAAAGACCATCTGATTGCTCGGCGTCCCTCTCTAAAAATCACAAGATGACATCGGCTAGATCACTTACACATAAGCAATCAGACCCTCTATTTATTGCATCATCATGGTTCATACCGATCCACTTGGATAGAATCACTGGAGGGCAGGACTCTCGCAAGTATTCCCGAGCGTTCAAGCC-----CACAACATTAGATACAGTTTTGTAAACCTGCGTAAGATTGTGATATTGTGTGTTTTAATGTACAAG-----------TTGAACATCCAAACGAAAGCTGTCGAA-----GCAGACGACAAGATGATAAATACCTCTCGCATGATATGATATACTT----AAATAAATCA-ATTTAGACTAAAAGAAA-----------------
ATTGTATTTGCCATTATTTAACAA--ATTTCATTTTTATTTTAGTTT---GAAGTCTTTGACTAATTAATACAAATTTGATTGATTTGGCCCGCACATTTCCCCGATACCCAT--CTGTCCAAAAGAAACATTGCCAGAGGCTTTGACGACACTTAATACAAATTAAATAGCATACATATTTATTACCATAATAACAATAGCAAAGATTG----------TAAAGCCC-TCT-ACAGCTGGGG-------TATAAAAACAATGAACCAGTGTTGCC-----CACGTTAAAAATAGCGTTTATAAACTCTGAAAATATCA-----ATGAATGAGA--AAACAGCTATATTGGCAACACTGG------------TCACAACTGCGAGAAATTGTTTTAGCAATTTGTAAAATGTAGGATAATGTTTTGTATACCTGTGTAAGATTGTGATAT-ACGTGTTTTAAAAAAAAAAAACCAACGATCTTAAATAT--GAATGTAAACTGTCGAATTGTCGGAACAGTCTGAAAGATAAATGCCTCCTATGTAA-ATGATATATGATTAAAAACAAAGCATACTTAAGTTAATTGAAAAGGCGCTAGTTCTTTAT
>CG17734 7067922 7068541|7237 chr3R 7068509 7068957 scaffold_3 5568475 5568911 - 11901|0 38
TGGACAGTTCCT------ACTTAGTTAATACTAGCTGTA
TGCTCGCTTCTTCGTATAATTTATTTAAATGTAGCTGTA
>CG31386 7095125 7096200|7257 chr3R 7094704 7095307 scaffold_3 5610609 5611278 - -780|483 683
AATAAAGTAAAAAAAATG------ACAAAAATTAAGCAAATAAAATGAATATATAAAATATTGATACAAACTTTGTAAACTTA--------ACTAGTTTTATTCATAATTCTTA-TTTATAATTTCAT--TTGGTTAAGGCTTATTCATAAATTATTTGTGTTAAAAATTAAATCTGATTA-ATTCAATAATAATTAATAA
AATATTCTAATAGAAATGCTGTTAAAAATGATTTATAAAGATAAATGGATATATAACCTATAACTAAAAGCTGTTGTTACTTATTCAAGATATTTTTTCTATTCTTAATTTTTACTTTATATTTACATACTTATTTAACTGGTATTT-TAAATAATATTATGCAAAATATAACTGCACTTATACGCATTACTGAGAAATAA
>CG31386 7095125 7096200|7258 chr3R 7095308 7097063 scaffold_3 5611531 5613375 - 30738|0 1065
CTACGTTTGCGAAAATTCTTTCATATCCTTTT-CAACCATCGTTACGTGCCCTCAAAGTGCCATTTTGTCACTGGGTCCTTTTTCTGCTACT-------TCCACTTCTTCTCGCACTCATTCCGCCAG----CTGTCATTTGCATTTGCCTTTCCTC--CTTCCCACTAACTG----------------------------------GCATTAATATTTGTTTTCGTTTGATAATTTTCTTTTGCTGCCTTTTATACTTTTAAGTGCACG-------------------------------------TCCTGCCATTTCCAGGACCCTTTCTC---CCCATCTCAGCTATTTTTCCAACTAGTTTCT------------------ATCTGC-GTCTCTGTCGCTCGC--------CTCCTTGCCTTG--GCCTCATCTTATTGGACTGCATAGTAAGTGGCAGCAGCCAAGTGAAAAAAGGACGACAAGGACGATGAAGAAGAGGAATGCCGGCGAAAAAAAAACCA----AGCCACATTTAAATGTGCTCCGCCCCTTTTCTATTTTAAAAATGCA--AAGCATTTGCTTGGCTTTGCTTTGCTTTGGCCTGCCTCCTGCTTCTGCTCCTGCTTCTTGCCCAGGACCTT--CTCTCTTCTTCTTCGCGGTTTCGTCCTGCTGCTGGCTCTTTCTTTTAATTTATTTTATATCGCTGCCTCCTTTTTCTGCGCGACGACGAATGCGAAGCCAAAACCGAACGCTTTTGCAAAAAAGATGGAAACGAAGGACTTGGCTTGAGGTCG----------CCTTGACTCGCCTTCACCAATAAGATTTTCGCTAGGTAACATTTGAAAAAAGGATATCGTGAAATGGT----CGGGCTATATAACAGGAGGA---GGGAGGTCAACGGGTA----------CTTTTAATTAATTGTTGCTAAGCAATTTTATGAAATTCAATCAGAGTTTT----GACTGGGAGTACCTCCCCA------------AAAGTAAGATATTATAA--AATCGGTTTCTTCA---CAATAAAGT
CTACGTTTGCGAAAATTCTTTCATATCCTTTTCCAACCGACGTTACATGCCCTCAAAGTGCCATTTTGTCACT-GGTGCTTTTCCGGCCACCCAATCCACCCCCTTCATCTAGTA--AGGGCCGCCATTTGCCTGTCATTTGCATTTCTTCTTCTTTTGCTTCCTCCTGTTTGTTTTCTTTTTATTTTTTTTTTATTTTTTTTTTTTACATTAATATTTGTTTTCGTTTGATAATTTTCCTTTGCTGCCTTTTATACTTTTAAGTGCACAGTTTCAGGCGAGCTGCTGACCCTACCTTCCTTCCCTTCCCTGCCCCTGCCACTACCCCTGCCCGCACCACTCACAGCCTTTTCACTGGTTAGTTTCTCAGTTTTCTAGAGCATACACATGCTGTCTCTTTCGGTCGCACTCAGCACGACTTCCTTTGTCGTTTCGTCTTATTGGACTGAATAG-ACGCTGCAGCAA-GAAATAAAAAGAGGATGTT--GAACGAAAAAAAAAAAAAA------ACAAAATGAAACTATGTTCGCCGCATTTAAATGTGCTCCGCCCCTTTTATAATAAAAAAAAACAGCAAGGATTTGCCT------------------------------------------TTATTCACCAAGGCCTTGGCCAACGTCTGCTCCG----TTCGCTCTGCTGTTTACTCTTTCTTTTAATTTATTTTATATCGCTACCTCCTTGTCCTGCGCGAC-----------AGCTGTAGTTGCATCCTGTCGCCATGATTGCGAATACTTCTG-CCCGGCTTGAGGTCGTGCACCGCGTCGTCGCCAAGGCTCCTTCAACACGCTTCCTGCC----------------AATAAGATCGCCAGCTGCTGCCCCGGGATTGAGAGCAGGCGGAACTGCTATTTTAATAGCCACACAGGATGTCTTTTAATTGAAAATCGCCATGCAATTTAGAAAAATGGAAAACGTGTTACAAGAAACAGGCAGCATCGACTTAGGATCCTGGGGCAAGGGAATACATGTTAACTGGTGCGCTTGTTCAGTTGAAGAGAGT
>KP78b 7172080 7172245|7337 chr3R 7170872 7172148 scaffold_3 5722166 5723396 - 8387|1346 1416
ATGTCTAAATGGTATTTTAATTAAAAC--GACTTAAATTTAGTATAACAAATAAATGTTGATGGCATATGT
ATGCCATGTTGGCATTCCAATTACAGTTTGGCATCCTTCTGGCACCAACGACAAAT-TTGCTGTCACGAAT
>KP78b 7172080 7172245|7338 chr3R 7172236 7172402 scaffold_3 5723863 5724028 - 5248|0 9
CAAGGTGTTA
CATAGTATTA
>CG6719 7234513 7234767|7377 chr3R 7233361 7235730 scaffold_3 5785787 5788415 - 58509|1290 1697
GGAGACCCACCCAAATCCCATCCCAAGATCA----------------ACATCGGTAGCAGCCACT--CGCATCTTATTTAT---TTCGACAGTACACCG----------------------------------------------------------------------------------CAAGGGCTCGGCAGGCGA---TTCCACCTGGCTTATTCTTGTTCTCCACTGATAGCAATAAAACCGCCACACA---AACGCATCAAGCTGACTCCAA--------ACGAGAT--------------------GCCTATTCCGGAGGAATGTAATATTTTAA---------------TTTGGCTACGGGCATTTAACTGCATGTAAACCGAATAAAC-GGCGAACGCA
GATAACCCGTAGAGGTTAAAACTTAAAAAAAAAAAAGCACGCAAGGTAAATCGGGTGTTGTCCCTTATATATATTATTTATTTGTTTGAAAATATATTGTTTTGATTTCCGACGCCCGATAAACATTAAACAAAACATATAATCAGCTAGCAGTGCTTTCAAAATTAAAGAAGAAAAAATCTAAGGATACGCCAATTGCATTTTGTACTTGTTTAACTCTTGTTCTC----GATAATAATAAATATGAAACACATACAATGCAGAAAATGGGCGTCAACATAACATACGAGATTGGGCCTCAAGAGTAAGCAAGCCGAT---GGAGGAACAATATATTTTGGATTAAAATATATATCTTTTTATATAGTCAGATCAGGGCTTCTTCAGCGAGAGAACTGGCTTAC-CT
>CG6723 7241940 7242079|7380 chr3R 7239819 7241985 scaffold_3 5790366 5792546 - 93169|2211 2256
TTAAAAGTTCAAAATACATAACTAAAATTTTTGATTTTTTATAACC
TCAAATGTCAGAAATATGTGGCTACCATTTAT-----CTTCCAACT
>CG6723 7241940 7242079|7381 chr3R 7242073 7243395 scaffold_3 5792865 5794220 - 53800|0 6
TCAAGCG
TTGGTCG
>ninaG 7245098 7245207|7384 chr3R 7245030 7245317 scaffold_3 5797959 5798199 - 3253|68 177
ATGAATTTCTCTGCGAGATTGATGCAAATGCGTTCAAGTTGAGGGACAACCGCACTGAACAAAACCAGGAGTTAGCAATTAAATGTATCACAATAGCTAAGTACTTTTTC
ATTAGCTTT--------GTTGATATAACT-------AGTTGACGGTTATCAACATT---------------TTTGTTATT----------------TTAATTTCCTTATT
>CG6764 7256462 7256565|7392 chr3R 7254802 7257451 scaffold_3 5808365 5810952 - 74621|1698 1816
GGACGAGTACGCTGATTTTTTCTTAGTTT-AAGTTGCTGCTAAAAAATACATTATATAAAAACCCCGTGGTACATAAATGTTGTCTTTGGTT--------------GTTATATATTTTC
GAATTC-TACCTTAATTTAGGATTAGTTTTAAGTGACTGC-GGAGAATAAATGTTA--AGAATCCCGTGGTGCATATCTGTTGACATACATTTATTACAAAAGTGAGCTAAACATTCT-
>CG6744 7259210 7259277|7393 chr3R 7257633 7259236 scaffold_35 796845 798484 - 59502|1645 1671
ATATTTCAATTTTAATAAAAATAAACT
ATATTTTCAATCGGACAGACA-AAGCG
>CG31374 7263269 7263602|7395 chr3R 7261319 7263289 scaffold_35 801198 803362 - 53104|2192 2212
AAGAGCGTGAAATTCAAATGC
AAGAAACTGCAAACACTACAC
>CG31374 7263269 7263602|7396 chr3R 7263601 7264669 scaffold_35 804079 805289 - 39818|0 1
TC
GC
>CG6783 7385612 7386514|7533 chr3R 7384140 7386185 scaffold_35 982893 984806 - 65025|1528 2108
GTGACGATCACACGAAGCCAGTGCCCAAGTTGGTGGTTGGAGTGTTTGGAGCTATCGCCGGAGCAGCCTCTGTGTTCGGTAATACGCCGCTGGATGTGGTCAAGACGAGGATGCAGGGTCTGGAAGCATCGAAATACAAGAACACTGCCCACTGTGCGGTGGAGATCTTGAAGAACGAAGGTCCCGCCGCCTTCTACAAGGGCACCGTGCCAAGATTAGGTCGTGTGTGCCTGGATGTGGCCATCACCTTTATGATCTACGACTCCTTCATGGATCTGTTCAACAAGGTGTGGGTGTAACTCGGCGATTCGGCTTGGCGACTTAGTTACTTAGTTCATCCTTCTACCCCAAAAAACCCACTCGTGCATTTTCCTCTGTTCCCATTGTTCCCTAGTCGACTGTTGCAATAGTTTCTAGTTTTGTGACATATTCCAAGAAAGCATTTTATATACACTCTATACCCGCAATGGGTAAGTGGCTATAGAAATTATACAGCTTGTTTTAAAAATTGAATTAAATCTGAA-GAGTCTATTTGAA--GTTCCCATATAAATCATAGCTAGACTGGATG-AAATAG---
GCGGTGATCATAAAAAGCCGGTGCCAAAATTGTTGGTGGGTTTGTTTGGTGCCATTGCGGGAGCCGCATCCGTGTTCGGCAACACACCCTTGGATGTGGTTAAGACCCGTATGCAGGGCCTCGAGGCAGCCAAGTACAAGAATACGGCGGATTGTGCAATGCAAATATTTAAGAACGAGGGCCTGGCGGCATTCTACAAGGGCACGGTGCCGCGTCTGGGACGCGTGTGCTTGGATGTGGCGATTACGTTCATGATCTACGACTCCTTTATGGAAATATTTAACAGCATCTGG------------------------------AAGGGCTAAATTTATGTTTAAGTGCTAGTAAACG---TCGTGCATGCTAAATTG-----------ACCTAGTCAACTATAACAATA---------CTGGATACACACACACA----------CACATACGC---ACACCCAC-----------------------------GCCCAAACGAGACATAAAGTTAATTCTGCATGAACCTATACAAATTGTGTCTGTGCAGATCACTTCGCAACGAACTGTAAATAGCCA
>CG6783 7385612 7386514|7534 chr3R 7386186 7386967 scaffold_35 985365 986152 - 33924|0 328
ATTCGGTGCTTTTGAATTCCTGAAATCGAACGCCGTGGACTCCCGAGGACAACTGAGCAACTCCGGAAAGTTGCTTTGCGGCTTAGGAGCTGGCGTATGTGAGGCCATCGTGGCAGTGACCCCGATGGAGACCATCAAGGTGAAGTTCATCAACGATCAGCGCAGCGGCAATCCCAAGTTCAGGGGATTCGCCCACGGCGTTGGCCAAATCATCAAGTCGGAGGGCATCTCTGGTATCTACAAGGGCCTAACGCCCACCATTCTGAAACAGGGCTCCAACCAGGCCATTCGCTTCTTCGTACTGGAGTCCCTTAAGGATTTGTACAAGG
ATTCGGTGCCTTTGAATTCCTGCGATCCAACTTCGTCGACTCTCAGGGCCAGCTTAGCGGCTCAGGCAAGCTGTTATGCGGCATGGGGGCTGGCGTGTGTGAGGCTATCATTGCGGTCACGCCCATGGAAACAATTAAGGTGAAGTTTATCAACGATCAGCGCAGTCCGAATCCCAAGTTCAAGGGCTTTGCCCATGGCGTCCGTGAAATAATCAAAACGGAGGGCATCAGCGGCATCTACAAGGGTCTCTCGGCAACCATCATGAAGCAGGGTTCCAATCAGGCCATTCGCTTCTTTGTCATGGAGTCGTTAAAGGATCTGTATAAGG
>CG6783 7389784 7390042|7537 chr3R 7389682 7390872 scaffold_35 988526 989823 - 28492|104 391
GAGACTGATCTAAAACTATAA--------------------TATCCATACGACTACATGCATTA-AAACTAACTCAGA---TAGCCA-ATATTCTTGTTGACTAACA-GTGAACTAAACCAAATCA--AATGGAACTGCACGCTCTGCCCAATGTTAATTTATAATCGCACCCGTACACCCGCAGTCGGTGTATGTGGGAATACTCCTCGTACTCGGGGACCAATTTCCGAATGCATTTGAAT-AAACTATTACTTGAAGTGCTTTTAAAACATTCCGACTTTCTTTT
GCAACAGCATTTCGGCTGCAAAACATGACTGAATTATCAACTGTCTAAACTAAAATTTGCATTACGAACTAATTCCCAGCTTAGTAACATAATGTTATTGAATAACATAAAAACCAAACAAAAATATGAAAAGAACTGCACTTTAATTCTAATGTTTATTTATAAACACATGCATATAT----------TGCATATGTGCATGTAAATGACAT---GTGAAAATTTTCAAAATGCATTTGAATAAAATTAATATTT----CGCTTTTA----GTTTCAAGTT--TTTT
>CG6790 7401621 7401706|7548 chr3R 7400871 7402958 scaffold_35 1007634 1009620 - 23916|772 857
TTGTCTAATCAAAGTGCTAAGAAATTATAATGTAAAACAAATTTATGGTCTATATATTTAGAACTTTATAAAACTTTCACTTCTAC
CAGCCTGGTCAAAG--CCAGGCA-------TAAAAATCGGTTTTAT---CCCTCAATTTGAATGTTTTGAAAATTTAAGTATTTAT
>CG6791 7411076 7411170|7558 chr3R 7408992 7411285 scaffold_35 1018141 1020560 - 71651|2302 2413
TAAGAAATTG--GTCTCGAAAAAGTTGGTCTATGCACG---TGAGCGTTTATGCGCT------------GTTTGATTAATGTTAATAAATAAAACATTTAAAATTCTAAATT
AGAAAAATTATAGTCTTTACAAAATCGATCTTTGTATGATTGGAGTCTCTATATATAACCATTATACAAGTTTGCTGCCTGGTAACAAAATAATCGATGGATCTTTTTAAAG
>Jupiter 7416110 7416889|7560 chr3R 7416120 7416311 scaffold_24177 469 647 - 4553|0 193
ACATATATTTATATTTATACCAACTGCAT-TCACACGAACACTCACGAAAACACATACATACATACATTATAAACATTGTATTACAT-TACATTAAATATGTAATTTAAACGGTACGACAGCACTTTCTAATGTGCACGTGCTAATTAAGTGTAAAAATACAAAATTCAAGCGCGAATATTTGTTCAATAAAAA
ACATATATATATATATATATTAATTATATATTATACACACACACACAAACACACATGCGTACATATATAAAGAAAACTGCAATATATACAAACTAAGTACACAAATCAAA-AGTAAAATG---------AAAATGCAAATGCAAATAAAACAACAAGAAACAACTTGCAATTG-----ATTTGTTTAATAGAAA
>Jupiter 7416110 7416889|7561 chr3R 7416781 7417130 scaffold_47 321158 321504 + 6596|0 109
TGACAGCCGGAATTGCTCAGAT-CCCAGCACAAGCAATTGAGGAGCCGATGGCGGGACGAGACACTATAAGAAAAAAAAAAAACCAACAAAACAAGCAAAAAAAATCATA
TTA-----AGAATTACAGAGACACCCAACAAAAACGA----------AATGGTGGATGTGCGCAGCATATGAGCAGATAATAGACAGCCTTGCAAACAAATATATTCACA
>CG6808 7447188 7447446|7577 chr3R 7446044 7447338 scaffold_42 369017 370322 - 29259|1191 1348
GAGCTGGGAATGGTTTGCTCCATTTTGTTGCGGTGGGTTAGCGTTTGCAGGTGAGCTTTCAGCTGGTGCAGCAGAGTGAATGACTTGCAACAGATACCACAGCTGAAAAGTTCAAATTATTAATAAA-------AAGTGCAAATCACTAGAAAGGATT
GAGCTGGCGAAGGCCTGCTCCTCTTTGCTTCTGTGCGTCAGCGTCTGCAGATGTGCCTTCAACTGGTGCAGCAATGTAAATGACTTGGAGCAAATGTTGCAGCTGCAAA--TAAGAATATTAAGAAATTGACATAGGCGTAAGGTGCTTGGG------
>CG6808 7447188 7447446|7578 chr3R 7447355 7448441 scaffold_42 370576 371692 - 11974|0 106
TTAATAAAAATAGCTG----GTCTATTCTGGAAAAGTGGCTTTATACTACTTATAATAGA---TAACCCT------AGTTCCTCAATTAATT--TACTATATTAGCT
TGTACAACCAGGACGAAGGCGACTATTCC-----AGCAGCTAAGTGCTGCTCGAATTAAACACTAACTCTAAATTCAGTTATTAAATAAATTGCTCCTATGGTAGCT
>Csk 7459000 7460541|7589 chr3R 7458974 7460901 scaffold_27 1321248 1323375 - 40907|26 1836
GGAGTCAGCAAGGGAGTGACGCCAGTGACGCGCGATAGGGAT-----GAACTAAAGCGAAT---TGTTTAGACCAGATGTCATTTAAGCCATGGGCAGAGCCAATCCCTGCCAGAAATGGGCCAGATCCAAAGCTGAAACT--GACTTGACACTGAACGCAACAATTTTTCGTACGA---------------------------------------TTATATACATACATGAATATATAACTACTTTACAACAATTTATTTACATATATAATTTATGAAGTAAG--TTTTGTAAGCCTAAGCGAAG-GAACCCAACACAATCAAGCAATGTTAGTGAGTTGCG--CCAGCTTCCGACATATAATTAATTGATAAC------------------------------------CAATCGAACGGAC--TACGTGAGAAGGAGAGGAGAAGGGCAGC--TGCGTAGCCTACCTACTACTACTAC---------------------CTTTAACTACCTACCACAATATTATGTTATGT-GTACACTTAACCATAGCTATT-TATTAGTTAACTTCTCGGTTCGGACTCCACTGTA---ACATTTAACTTCTGGATTCGTGACCACGTCTGTAT-CTTTATGTTATAGAATACGCATACATATGAGCGCC-----------------TTCCGTTCGGAGGGCGCCTGTCTAAAGCAATTGTTTATAGGATGTTTCCCTTTGA----TATCGTAAAAACGACAAGTTTTATTCGAGTTCCGTATACTCTTTCTGTTAACCG-TTTCTGTTTGTAGCACAAAACTGAGGGATGACCACAAAGAACTTGTCCAACAAGTCGTTGGCAA-----------------------------AGAGATCACGCTGAGAATTAGTTAAATTTCGTTACATTTATTTGTATTAAAAGAATAAAAATAAAACGAAAACAAAGCCAGCAAAAATTATGCAACATGGGCAAGCGA----AACCTAAGCATAAAT--AAACGAAGGCGGCTGATAGGCTGCGTGTCCTT--AAACTCAAGAAAACGAAAAA----GAGAAAAACACTTGTGAAAATATGCATTACATTAAAACGTCTACATATACATAATACAATACACATTA---CCTACGTATTTAGCTTATAAATC---------GATTAATAAT----ATACAAATATAAATTATTACGCGCAAAGTTCGTGGATT-----------------------------------TGTTCATTATTCGGTCCATTCTTCTAACAAGGAATCTCCTTCTCTGTACTTTAATCGAACCCATCCAATGCATCTGGCG---GCAAGGCAAA-----GGAAAATTGTAATTTATTTTTTAAAAACCTACCCCCTAATTAACTT-----AACAAATAATGTCTATTTTAAAGTTCCCTTTAAGCAAATTGTACATTTATGCGTTTTAATTTTCGTTTAAGGGCAGCCACTTTGCTT-TAACACATAATTTTAGTATACTTTATGTAAAACACACCTAATACACCAACAACACACACCCCCTCACAAACACACATCCACGTCCACATGGTATATATTTAATTAATTTTAAAGTTATTATTTTTTTACAAACACACTTCAATCCACATTGTAAACGAAAGTT-CTATGCGTTAGTGAAACCCT----------GGAGAAAGCAACAC---------AAATATGCACCAACACACAAAACTTAAACGCGGTGATTAAAGGAGGGCAGAGAGTTCTAAAACTTTTAATAAAAGTAAAGAATACAAGCATG
GAAGT-----------TCACGCCAACAACAACTGAAAACAATTCCAATAGCTAATGGAAATTTATGTTTAGAACGTCTTTAGTTTGAGGGCTGGATAAAGGAAAGGAGAACCGCCAATGG--CAGAACGAAAGCTTCATTTACACACTGACACTGAACGCAACAATTTTTCGTACCAATAATATATATATATATATATATATATATATATATATATTTATATATATATAGACGTATATAACTAATTTACAACAATTTATTTACATACATAATTTATGCGATAAGTTTTTTGTAAGCTTAAGCGAAGAAAACCCAACACAATCAAGCAATGTTAGTGAGTTGCGCCCCAGCTAACGATCTATAACTACAATATAACGATATATACATATACATATATATACATAATTACATACATACATACGTACATTACATAAACATATAAACACATATGCAGCGTTGTGTAGTTTA-CTATTACTATTACAAAATTATATATATATATTTGTGTTAACTGTAGGCTCGATATTTATATTGTTTGGCGCCCCCAACTCAACCAATTGTATACACTACTTTCTCTACTCCTTTCTCTCTCTATATATATTTA-----------TGTATACAAATCTGTACGTTTTATGTTATAGAATACGCAAACATATGAGTGCCCCGGCGGAGCTTAACTGTCTTTTTGGTGGGGCGTTAACAAACAGCTTTTGTTTATATATTGTTTTTCTCTACAGCTTATTTGTAAATC--CCAATTCCGGGCGAGTT---TGTACAATTTCTGTTAAACACTTTCTATTTGTAGCACAAAC------GACCAGCAACAAAAACTTGTACAACAAGTTGCTGAACAAAAACAACAACATTAATTATAATATAAATAAAAATAAAATCGCAAATTAGTTAAATTTAGTTACATTTATATTTGTATATCTAATCAAAAATGAGCGAAAATTATAAAAACAAAAACCAAGTAAATTAAAAATTTGACTTCAACCT-ATCAAAAACGAAAAAAAAGGCAGCT--TGGGCTGCGTGTCCTTAAAAACTACAACAAGCGAAAAACAACAAAAAAACCACTTGTGAAAATATGCATTACATTAATACTACTACATAT-TACAAAAAAAAAC-CATTAAACCCTAAATACTTAGCATATGTGGCATGTTTAATGTTTAATAATCATAATAAGAATATAAATTATTACGCGCAAGTTTCATCTACTATGTGAAATCCCCCCAAATCAATCCAAATGTGTCCTGTCTACTTATTTGTTTATTATTAT--TGTGGAATCTCTTGCAATCTTTTATATATATATATATAT-ATATATATGGTATATGCAATACATATAGTTGATATATCAGAATGT-CGCTTTAAAACCCAGCAAATGAAATACCCTGCAGCATAAGAGAATTTGTAATTTATTTATGCATATTAACAATTTATACATATAATTTACTTAACTT---TTTATGGTTTTATACGTTTCTTGTTCCATAAGAAACTTGTACAATTTTGCTTTAACAT-----TTACATTTATTTTAAACA------CACAAACACACGTACACGTCCACAT----TAACTTACATTTAATTTAAAGTTATTACTTTTTTAAAAACA---------ACAAATCCTAAAAATAATTCACAACATTTTTGTCAAACTCTAAGTTAAAAAAAAAAATGCAACATTTTACACAAAAAATCGCACGAACACGAAATACTTAAATGGAATGGAGTTGGAGATTGAGAAGGATATAAAACTTTTAATAAAAGTGACAAAT-TATAAATC
>CG18476 7500631 7500676|7627 chr3R 7500207 7500807 scaffold_27 1387534 1388036 - 19783|428 473
GGGGCTCTTGCAATAAATACAATTTGGTCTAGTATAAAAGGAATGA
-------TTGC-------TTAATTATGTTT----------------
>Taf12 7504099 7504273|7630 chr3R 7501518 7505354 scaffold_27 1389258 1393281 - 110739|2796 2982
AGGATTGGATCTAATCGGGTCGAGGCTCTGTTTC-GGTTTGCCGGATTTCGCGTATGCTAAACGTGCAC------ACGCCACAAACTAATTTAAGC---TCCAATTTAGATTA--AATAACAAATTATCGTCGCTCTATTGTAGATTTATTGTAATAAAAGTGCACTATTGATTTCACATTCAACAA
AGGGGTGGGGCGGACGGGTGCTATGCAGGGTTACTAGTTTGTCA-ATATAATTTGTATGATACTTTCATGAAAGAACACTCCAATTCATTTTAGCCACATTCAACTTAGAGTATAAGCAGCAAA--------GTTATATCACAGCTG------AACAATAGTTTACAAATGATATCATTTACTTAAA
>CG6830 7506691 7506709|7631 chr3R 7505540 7508078 scaffold_27 1393726 1396265 - 64690|1205 1224
ATACTTTACTTCAGA-CAAA
TTTATTGACTTTGGCTCGAA
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A
A
>CG6834 7510391 7510512|7636 chr3R 7510425 7511968 scaffold_41 317240 318823 - 3919|0 106
AGGAGTTAGCAAA----AATGTGTTATTATGAAGCATAAATGATTTGTTGA----------CAATTTTTAAAA-----AATTACTTTATGGAAAAGTTACAAATAAA
AGTAATTACCAAATGGTAATAAATTAT--ATAAACACAAATAATTCTTCAAATTGGTCACGCCATATTAAAAATGTATTATTATTATACG---AAATAAAAAATAAA
>CG6908 7514099 7514163|7643 chr3R 7514081 7514801 scaffold_27 1407208 1407925 - 16061|18 86
ATGTGTGTA----AACTGTTGATATTATGTTTGTAAGTAATTCAATAAAAGCGGTAGATAAATATAATT
ATGACTGAAAAGCAACTG-TGATATCGATTTCTTATTTCATACAAAAGA--------GTACAAATAAAT
>Fer3 7519132 7519294|7648 chr3R 7518792 7519383 scaffold_27 1413224 1413885 - 3270|375 600
TGACATTTCTCAGGA--AATCCAATATT-------------------------------------------------CAAATAAATGC--TAAAACTGCTTCTCGTCAGATCAGTTTTGTTAAAATATTGTAATTATAGGAATAGATAAATAATGTTTTCTTA----------AAACTTTATATATTGTTTAAAAAGCAATAGAAATATTAAAAAATATTAAAAAG
TCGAGCTTTTCGGGATTATTACAATATTGTACCGTGTTTTTTGTTGCCATATCATGTGTTTAGACTTAAGATTAACCCATATAAATGTGATAGATGTGCAAATTATGAAGTGAGTGGAGTTTGAATATGATATTAATAGATTTGGGAAGCTTAAAGCTTCTTATTAGGGAGCCGTACTTCGCATATTAAAGAGAAAGAAACAAACAACTTAACTCAT---------
>mus309 7562053 7562747|7706 chr3R 7561192 7562375 scaffold_35 1025702 1026884 - 45367|878 1204
ATCTATGTCTTGGCGGCTTGTCGCACCTTATCCTCAAATTCGTAGGCACCCATAGACCAGATCAGGTTGGCGTCCGTCTCCACCTGGACGAACTCGGTCGCATAGGTGTTTGAGGTGCTTACCATACCACCAAACTCCAGCTGTGCATGATCTAGAAAT---GAAAGCATTACTGACAGATTCGTGAAATCAGT-ATTATTTTGGTGTACGAACATAGGTTCCATTTGAGTCCCGTGGTAGTGACATTGTGGGCCGACGATCCCACGGGCATCAGAGAGCACCATCGCTGGCTGGTGACCAGGTCGACGGGCACCTGTATCGTGTGC
ATTTATTTCATGGTCG---AACGCAATTTCTCCTCAAAGCCATAAGCACCCATGGACCATATCAAATTGCTGTCCGTCTCCACCTGCACAAACTCCGTAGAATAGGTATTCGAGGTGCTGACCATGCCACCAAACTCCATTTGAGCATGATCTACAAAACAAGAGAACGTATATGA-AACTTTTTATGGTTAGTCGTCACCACGTGATACCCACATAGATTCCACTTGAGCCCCTGTGTGGTGACGTTGTGAGCCGTGCTGCCCACGGGCATTAAAGAACACCAGCGCTGGCTGGTTACCAGATCAAGTGGTACCTGAATAGTATGT
>mus309 7562053 7562747|7707 chr3R 7562739 7566351 scaffold_35 1027019 1030617 - 108500|0 8
TTTAATATG
CTTAAGAGG
>CG6923 7570204 7570660|7710 chr3R 7567782 7570410 scaffold_17 1057109 1059630 - 79986|2537 2744
ATTTCCTATACATATGTACAAAT-TGTCTACGTTTTGTGAAACAAAATTCTTGTGATAAGAATTTCATAAATATGCGTATATTGTTATAGTATAGAATTCCCACGACGGGCGTATATGATAACTTTGACCCCAGCTTGTTGTTATATTTTTAATGATCACACAAAATAATATAACATCGGACCCTAAACTTAACCGATTAGAAATCGA
ATTTCCTATAT---TATAAAATTATGTCCATGTTTTGTGAAACGAAATTCTTGTGAT-----TTACACCCACACACATATATATATGTACTACGTATTGTTAA-----AGTGTGAATGTCGCCT----CCCCA-------------TGGTTAATAATTATTCAAAATG-------------TACCAAACT------------------
>CG6923 7570204 7570660|7711 chr3R 7570631 7571997 scaffold_17 1060380 1061887 - 49511|0 29
CATTGTGTGCACGGCATCTTTATGTAAATC
CATTGTGTACATGGCATTTTCATGTAAAGC
>Lk6 7578506 7578693|7717 chr3R 7576954 7581574 scaffold_27 1574978 1580481 - 119363|2181 2415
GCGGG----------------TCCAC---------------TGTGGACAGATAAC-TCTGTTTTTTTTCACGCACATTCTCTTAAAACCAACTTTCCAG---TTCTATCATTCTTTTTG------------GTGCAACTTTTCAAAAGCTAACGTTTATTGCAAAAGTGTATGCAAACTATTTAAATTCAATTGATTCCGCCACTGCAAACAGAGTTAACAAAAACCCCAAAAAC
ACGGGCGCTGGAACCGCAACATCCACAACAACAAGAGCAGATGTGAGCAGGCGTCGGCTGCTACTGGGCA-GCACAATGTTT--GGCCCGACATTGTGGAAACTCTTGCGGCGTTTTGGCCAAAAAAAAAAAAGAAACATGTTAAATGTTTTCTTTTTTTGCCCGATTTTTTTTTTGTTTTTTTTCTTTGTATAATTCTTTTTTT----------TACATACAAATCGC-AAAAC
>CG6930 7594335 7594561|7734 chr3R 7592110 7594727 scaffold_17 1817677 1820555 + 39609|2643 2884
GGATCGTACAAGGACTTCTGGTAAACTCCCAGCCGAATTTCAAGCCATAAGGGGCGGCCAGCCTGCTGGCGGCGGTGGACAGGTGGTGTTCGTATACGGATACGACTGACTGCCGCCGGGAGCAGGCGAGCTGCCTTTGAAATTCGCTGGGGGCTTACCGGGGGTCCTGCTGAGCGTCACCCAACTCCAATTACAATAACCCTC--------------AATAAACACG-AGTTATACTTACT
GGTTCGTACAAGGACTTTTGGTAAATTCACAAATACATTTCAGGCCCCAAAAGGCGGCTAAGTTGTT------GCTAAACAAATTGAAGCCGCAAAT---TGTGCATTTTTGT--TTGGCAAAAGCTGAGCTGCTTTTGAAATGTGTTTGGAGTTTACCGAAGGTCCTGCTGAGCGTCACCCAAATC------CAATAACCCTCTCAAAAAAAAAAAAAACAAACAAGAAGTTATAC-TACA
>l(3)neo38 7603425 7603557|7746 chr3R 7602973 7603468 scaffold_17 1831767 1832321 + 16891|474 569
AAACCAAAAGG------------------------GCCCCT---------------CGAGGCCCTAGAACTACTATCCATT-------------AC
AAACCAAAAGGCAGCAATTCTACACAGGCATCGCGGCTCCTGCCTGTGTGTGTGTGTGCGTGCGTGAGACAGCGACCTGTGCGTGTATGCGTAAAT
>l(3)neo38 7603425 7603557|7747 chr3R 7603511 7603890 scaffold_17 1832362 1832823 + 1280|0 76
TTACA------------------------------AAAAAGAAAAGAAATAGAATTGCAAGTAATATTAGCGACCGA
TTACAGTTGTTATTGGTGTTGGTTAGTGCAATTTGAAAACAACCAACAAAAAAAGCGAAAGTGTTACACAAGCCCAA
>CG17360 7606851 7607541|7753 chr3R 7606758 7607092 scaffold_17 1834979 1835346 + 2476|120 382
AGGATCATATCCATATGATATACGACAAACAATATG-----TGGCTATTTATAAAATAAACAAAACAAACATTTATAAATGTGTATTAGGAAAAGTGTGCATGGTG----------GACTTAATCTTATTTTGCAATGCTGTGCCTCTCCTTTTCAATTAGCATAGATTAAATTCCCCTCCCAACGCCCGACATTTCGCTGTAAGCCTTTCAG-----CCCACTAAAAGCTCATGATAATTAATAAAACC-AATAAACGCCAT
AGTATGTCGTACCTTTAATTTGCGAAATATGATATGAAATCGGACAATATATGAATTTAAGCACGCAGCTATTTTAAAACGGCTTATGTGGGGATTTTGAACGATGTAAGCCCATCGACACAATTTGCTTATGCAGT--------------TTTCAATTAGCAAGGCTTAAAATCCACACCTCACGTAATATCTCATGCCCAGAACTGTATGAAAACATCAGATAAAAGCTCATAATAATTAATAAAATTGAATAAACATGAT
>CG17360 7606851 7607541|7754 chr3R 7607125 7613210 scaffold_17 1835711 1842261 + 185423|0 537
CGTGGCT-----------CTGGCCATATATACTCCATTTA------------CAAATAGAAAATTATATTTCCATATA---------------CATTACTCAAGCGTTAAATATTCTATCCTGAATACTCAAATAGCTAAAGAACAAAAAG-----------------------------TATTGATATTTATATA----------GTCTGTATGTATTATGTATTATGATTTTGTAATGCGTGCCTCCGCTTGACTCATTCATTCGTTTGCGCTTAGTAACATCTCATTTG-----AATAATTTTTGTGATATTAAACTTAAAGT------------CGCTGATCTTTGGTATGC----TCTTTTGTAGGATATTTAGTTTCTATTGATTTTCTACATTCGTTATTTCTTACCTTTTATAA-ATACATTGTGTACAAATATTGCACAGATAA---TAAG--------------AAACAAAATATTATACATAATCTAACTTATACGAATATTGGACA-----TGTAATCAATCGGTA
CCTCTCTAAATCGCGCAACTATACAAATATAATCAATGCAGATCTATTATATAAAATATTTAATAATTTTGCTAGATCTGAGCAAGTAAAACTCAATGCTTAATATTCTAATACTCGAGCGTATTTGCTGATATAAGAAAACCACAGACATGCTTGCTACAACATATACTTATATATCTCTGTCAATATTTATATATACACAAACGATATTCATATACCTTGTATTATGA-TTTGTAACGTGAACATTCGCTTAAACAATTCAATTATTTGCGCT--GTTAAATTCTATATATATATACTATTTTGTGTGATATTAACTTTTAAGTTGCCAAATGACACGTTTATTTCGGGTTTACAAAGTTTTCCGTATTATACCTTAATTTTGTTAATATTTTGTACTGTTTATTTTTTTAATACAACAACAAACACCGTGTAGAAATA-TGCACAAAAAAATCCAAGGCTTTACTATGTATAAACAATATTTTG---ATAACTAATCATATATATATAGTAGAAATATTTTGTAAGCATTCGTTA
>Sbf 7615013 7615650|7755 chr3R 7613280 7615571 scaffold_17 1842455 1844899 + 89055|1841 2527
TTTTGTTATAGGATAAATCAGTATGTTTCCAGTTTTACGTATTAATATTTTGAATCTG---TGGCGCTGC---CATCATATCATAGCTAAACTATCACTTTAGA-ATTCCCTTAGTTGATTTGAGAAATCG----------CTCGCAC------CCATTAACATAAATGTT-AGCAACAATTATGCCAAGCAACAAGCGAAACTTTAGTTAAACAATGAAATCCAT------------------------------TTGTAAATGTGAATGTA------AAGAAACTATAAAATTATGTGATTATATAAACAA-----ACAAAAATCAGACTATGATAAATTTACGATAAAATGGAAAAG----CCACGCCCGCAAATTTTTTGATATAATTTTTTATATATATACATA-------------------------------TATCCT-TATGCCTAAACT----------ATATAGGTTTATAGTGAATTTACCAAAGAATATTCCACCTTTGTTGCGCAATTGAAATGCATTTCTTGATTGCTTCCTTTAAACTAAACCCTATTATTAAACGCTTTCCTTTATTTATACACTACA-TGGTAATCAATATATAAT-------------ACATACTTTAAT-GCAA--TTATTTGTGGCTTACAAACGATAATATACATTTTTAAACAA
TTTTTTTATAT-ATGAGAGAGTATTTATTTGTCAACGCGTGC-ATTACTCTGGATCTGCAGTAGCTCTGTGTGTATTAT-TTATAACCGAAATATTTTTACATATATAAGTTGAATTAGTGTCAAAAGTTGTTTATTAACACTCGCATAATGCATAAATTACATGAATATTTAGCAACAATTAACGTAGGCGACAAAAGCTAAACAAATTAAATAGTAAAAAGTAAAAGTAACTAAACAAAACAAAAACAAACGTACTGTAAATGTGCATATATAAAGAAGGATACGATAATATCATGTGATTATACGTATAATGCTGACAAGAATGA----ATGAAAAGTGTATTG-GAAATGGAGAAGGAAACCACGATAGCAACTTTTTATATACATTTTTATATATATATACATAGTGCATACATATACATATATATATATATATATATGCTATATGTCTAAACTCTACATACATACATACTTATATAGTAAAAATACCAAAGATAATTCCACCTTTGTTGCGCAATTAAAATGCATTTCTTAATTTCTTCCTTTGAATTAAATTTAATTAATAAACGCCTTTCTTTATTTATACAATACAATAATGTACTATATGTGATTTATACGTATGTCATATATTTTACTTGCAAATTCATTTGTGGCTTACAAACTTTA---TACATTTTTAAACAA
>Sbf 7615013 7615650|7756 chr3R 7615643 7622286 scaffold_17 1845139 1851819 + 343349|0 7
ACAGACAA
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>CG31116 7622966 7623163|7757 chr3R 7622645 7622977 scaffold_27 201122 201433 + -1556|335 346
AATCAAGTCACC
GTGTCTTACGTC
>CG31116 7622966 7623163|7758 chr3R 7622978 7624290 scaffold_27 209350 210893 + 33455|0 218
AACAAGATGA------TCGGCCATCATAATAGTTAATACGAT-------------ACGTATACGTAAT---------ATGTTTGTAAAGAT-CAGCTAAACACATCTATCTTAAGTTACGTCTTA---CACGAGTTAG-TCATCAATGTTATTATGTATTTATATCTCGTTAGTTCATAATGTGAAAAATATCGTGATTTATATTTAAGTTGAAAAGAA
GTTAAGCGAACATCTTTCGAACCACATA--TGTTAACTCGTTAGCCACGGCAACAATGCGTGTTTAATGCCGTTGCAAAGTCTGTAAAGATACAGTTAAACA---CTAAACTAAGTTATGTCATAATTAATTAATTAGCTTATCAA-GTTGTTATGTATTTATATCTCGTTAGTGCATAAAGTCAAAGATATCGTGATCTATTTTTAAGTTACAAGCAA
>CG6946 7640922 7641487|7774 chr3R 7641104 7642091 scaffold_27 233426 234374 + 29253|0 409
TTCTTCGAACCAATCCGACCAGCTAACGTGCGGATAAACTACAACAAGAAGGGTCTGCACAGTGGCACTGCGGATGCCTACTTCGACACCTACGAGGATTCCCAGGTGGCCATGAAGCGCCACAGAGAGCAGATGGGTTCGCGATACATTGAGCTGTTCTACGACGGAAAGACGC---GTGGACTCAATGGTGGGGAACACGGCGGTGGTAACGGT---GGCGGCGGAATGGGAAACAATGGCGGCGGA---------AACTTTTCGCGGCGCATCTAAA-----GCTCTTCCATAGTTTGATTACATTGAAAT----TAATGTAGACGCAAGTATTTCGTAATATTATGATCAAGCTGATACTGCTAAACCGCTAAGGAACCCTTACAACCATGTA--AACGACTTAAC
TTCTTTGATCCCATACGCCCAGCTAACGTGCGCATTAACTATAATAAGAAAGGCCTGCACAGCGGCACCGCGGACGCCTATTTTGACACGTACGACGATTCGCAACTGGCTATGAAGCGGCACCGCGAGCAAATGGGCTCCCGCTACATTGAGCTCTTCTATGATGGCAAAACACGCGGCGGCGTTAATGTCGGTGGAGGCGGCGGCGGCGGCGGTGCCGGTGGTGGTCCTGGCAACATTGGTGGCGGCGGTGGTAGTGGCTTCTCACGTCGCATTTAAACGCTTACCTTTACATTAATTCCTTACTTTTACATACGCTAATGTAAACGCAAGTATTTTATAAGATTGCGGACCACC----ACCGC--AACCGTCGAACGCACCTTGTAAGCAGGCACGAAGGACATAAC
>CG6946 7641563 7642266|7774 chr3R 7641104 7642091 scaffold_27 233426 234374 + 29253|485 1025
TGGAAATTCCGGCAACTTTGGAAACGACAGTGGTAACAGCGGAAACTTTGGAAACTTCGGCAATAA------TGGAGGCGGAAACTTCGGCGGCAACAACAACGGCGG---CGGTGGTTTCAACAGTGGCAACAACTTCAATTCTCCAGGTGGCGTTAATAATTTCGGCAAC---AATGGCGGCTCCAATTTTGGCGGCAATGGTGGAGGAGGTTTCAATAACGGCGGAAACTTCGTATCCTCGAGTGGTGTTGGCAACTTTGGCCCGATCGGCGGCGGTCGCAACAATAACAACGGAAATTTCGGAAACTCTGGATTCGGTAACTTTGGAGGAAACAACAATGTCGGCTCGAACTTCGGAGGAGGCAACAACGGCGGTGGCGGCGGATTCAACAATGGCTCGAACTTCGGCGGCGGCAACTCAATGGGCGGTGGTGGCAATTTCGGTCCCATCGGCGGCGGTCGGGGCAACGACATCGAGTATTATACAATCCACATGCGCGGACTTCCCTACACTTCATTTGAAAACGACGTTTTTAAG
TGGAAATTTCGGCAAC------AACGGCGGCGGTGGCGGCGGAGGCTTTGGTAATTTTGGTAACAACTCTGTTGGCGGAGGAGGTAATGGCTTCAATAATGGCGGCGGTGTCGGAGGCTTCAACAACGGCGGAAATGGC---------GGTGGTTTCAATAACAGCGGCAACTCCGGCGGTGGCTTCAACAATGGCGG---TGGCGGCGGAGGCTTTGGTAACTTTGGCAACAAT---TCCGGCGGCGGTGGAGGAGGCTTTAAC---AATGGTGGCGGCTTCAACAATGGCGGCGGTGGCTTCAACAATGGTGG---CGGCGGCTT---------CAACAATGGTGGT------------GGCGGCTTCAACAATGGCGGCGGCGGCTTTAACAATGGA------------GGCGGCAATTTTGGATCGGTTGGAGGTAATTTCGGTCCCATTGGGGGCGGTCGCAACAATGATGTAGAGTATTACACCATCCACATGCGCGGTCTTCCCTACAATTCGTTTGAAAATGATGTGTTCAAG
>CG6946 7641563 7642266|7775 chr3R 7642106 7642268 scaffold_27 234789 234948 + 7461|0 160
ATTGGGGCAACAATGGCAACTTTGGCGTTGGTGCCAACAACATGCTGGGCTTCAACAATCTGCCAAGCCTGATGAACTCGGGCAACTTTGGAAACAACCAAGGTGGAAATAATGGAAATTTTGGAAATAACTCTGGACCCAGCAATTTCGGCAACTTTGGT
ACTGGGGCAACAACAGCAACTTTGGCGTGGGCGCCAATAATATGTTGGGCTTTAACAATTTGCCCAGTTTAATGAACTCGGGTAATTTTGGCAATAACTCCGGCGGCGTCGGCGGCGGTGGTGGTGGTGGCGGCGGCGGCAACAAT---GGCAATTTTGGT
>CG6946 7642334 7642441|7776 chr3R 7642319 7643177 scaffold_27 235391 236388 + 29223|15 125
AGAGGGCCACAGGCGCCGGTGGC---GGTGTCGGAGGACGCCCTGGCCCTTATGACATACGTGATCGTGGTGCCAACCGTGGTGGCAATGATTTCGGCGGAGGGCGCAATG
AGCGTGCCACGGGCGGCGGCGGCGGTGGTGGCGGTGGACGCCCTGGACCATATGATATACGTGATCGCGGCGCCAATCGTGGCGGCAACGATTTCGGTGGA---CGAAATG
>CG6950 7646103 7646129|7779 chr3R 7645315 7648340 scaffold_3 4631025 4634220 - 101476|828 914
TCGCCGGA------------------------------CAATAAACGAAT------------------------------TGCTATC
AGCGTGTATATATATAGTGCGCATTTAATTTGTTACTCCAATAAACGAATTTGTTTAGAAATATCGCATGAATATGCTGGTACGATT
>CG6959 7648417 7649351|7780 chr3R 7648341 7649092 scaffold_3 4634712 4635449 - 11846|88 827
TAGTTTTTGCCATTAGCGTTTCGCAAAACGTGTGCCATTCACAATGGAAGA-GGATGAGA--------------------TGGAGGAAA-------CAATAGGATCACACTGAAGTCCCAACCAGAATCAGAACATCAGCCTTTGTTTCGTAGTACTTAAGCCAATTGTTGCATTTAACAGCGGATGGAATGTGGCCACTTAAATTACTGCAACAAAACCAC--------------------ATTACACAGACAAGAACACAATTTCTTTA-----GATTT-AGCGGTTTTCTATCTTAACTTTAAGTCAGTTATGGGTTCTATGATTTCAAAGCAAAGAAATCGTACGAAAGGAGAAGGCAAAGCGGGCCTGTATCAACCGATTTGACCACACATATATAGTGACATATATATATATAGAAACAGACACATATATATACATGCATATATCGTAACAAACACTTTAGTGTTATCTGTGATTTAAGTTTAGTAGCTTTACTTTGTTGAAACTCTGCAGAAAGAACATTTTAAATCGAAATTGGTCTAAAACAAACTTCAATTCTTTTTATAGCATTACAGATAATTCTACAC-----TCAATGAAAC---TGTTTCGATGCTTAAT--ATGTTATTAATCAATTAATTTGTCAATTATACTAGCTGTACGATAATTTCTCCCTTGATTAACTACCAATAACAAGCATTTTTTATAAATAAACATTTGAAAAATGAAATGAA
TAATTTTTGCCATTCGCATAGCGCCAAACGTGTGCCATTCACAGGGAACGACGTCTAAGAAACTAACCAGCGCATATCCTTTGAGAAGAACCTCTTCAGTTGACTC-TACTTAAAACACACTCACAAACATA----------TTGTTTGATAGTACATAAGCGAATTGTTGCATTTAA-GGTAATAGTAGAACAACAACAACAACAACAACAACAAAATTGTGGCAAAGCTCGTTACACGCAATTACTAAAATAATGTTAGAGATTTTCTAAGTAGGATTTAAGCGGTCTT-------------------GTTATGCATTCTATGATTTC----------AATCG-------------------GCAAGCTGCCAATAATTTCGTAGCCCGTATATGTACATTCACATATACAAATATAAAAACATACTTAC-------CATACATATATTGTAACAAACACGTTAGTGTTATCTGTGATTTAAGTTTAGTAGCTTTACTTTGTTAAAACTCAAGCAAACGAATATT---GAT--------GCATATAAAGAACTTCAA---CCTGTATAACATATGACGTACTTACACATATATATCACTTACACTTATGTTTAAAATACTAATAAATGTTATTAATC-----ATTTGTCAATTGTAATATTCTAATGATTTGTACTTTCATTTTTATGTA--ATTAACATGCAGTTTTTATAAATAAAC--TTTAAACATGATTTCGA
>CG6959 7648417 7649351|7781 chr3R 7649093 7649244 scaffold_8 292543 292681 - 2518|0 155
GTATCAAGGCCAAAAAAGTTCCTGCAATTTCCAAAGGATATAACATAAAAGATTCTTCGATTGAATTTGTGAAGAATTCTTTCTTACTTTCTATTCCTGTAGAACACTATTTGTTTGAAATTGA----ATTCGAAACCGGGCCAATATCCTCAGAT
TGCCTAAAAACAAAAAA----------TTTTCGATGGTTACCATTTAAATGCTTTCTTGGTTTAATTTGTGAAGAAGGCTTTTTTATTTATAAAGCCTGT-------TTTTGGTTCGAAATTCATCCCATCTTAAATTGTACCATTCTGCCCTGAT
>CG6959 7648417 7649351|7782 chr3R 7649245 7650684 scaffold_3 4635450 4636845 - 68241|0 107
GAGCTTCACTTCACCAACAGAATCAACACAAAAAGAGAGAAGGAGAGGAATAAAGCTCGGTTTTCACTTTTCATTTCAAACAGAAAGCCATTCG-ATTCCCTGAAATT
GCAGTGC----CACAAATCCCACCCACACGTCCATATCAAACAGTAGCAACAGAACTAAGT------------------ACAGTTA--CGTTCGTATTTTTTTAAATT
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TTTGAAATTTTTAACTAGATAGATTACTAAATATGTGACATTTATATATTTATATAAAACTAAAGAGACTACGATTACAA
C---AGATTCAT-----GTTGAAGTTATAAAAAT----------TATATTTGTATAAAAATAAAAAG--TACAATTTCAC
>mthl5 7709660 7709784|7844 chr3R 7708109 7711273 scaffold_3 1215903 1219108 + 111212|1590 1789
GG-AGCCA-----------------------------------------------------CCGTCCAC---------------------ACTAATATAAGTGTTTTCGTAGTTTAGCAATGTCCAACATTGAGATTTGTACTTAATTTTAACTAATTTATGCTGTACGAGATAGTTATTAAATGAGAAGTCTGACACCT
GGCAGCCCACCCAAGCTCTAAGGAAGGTAACCCGAAGTTATATCAGAGCACGGGCCTTAGTCTGTCAACTAATTTTAAGATCTACTCGTAACTAGGCTAAGTGTTTTTGTAGATTAACAATGTTAAACATTGAGATTTGTACTTAA----AACTAATTTATA------GAAGAACAAATTAAA--GAAAGTCTGACACAT
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ACGGAAATTTATGGAGTGTG-GTCTATGCGTTTTTGATTTGTCACTTTAACT---TTGTTGGAACTTAATGAAATTAAATTATTTGAGCAA
ATG-ATGCTCATTGTGTGTGTGTCGTTG---TTTGTATTTATCGATTTTATTGAATTGTTACCAATTATTGGAATTAAATTT--------A
>Cad87A 7719225 7719969|7848 chr3R 7714214 7721964 scaffold_3 1222806 1230632 + 357031|5096 5946
GGGTCGATGGGAACTGTTGCCCAAAAA-GATGTGTAAATTATGTAGTAGCTGTGTATCTGTGTTGTAGACAAGCCCTCGCCGTGGTTAAGTTCAACCGAATCTGTTCTGTTGCACCT-TTGAGTTCGTCGTTGCGTTTTCATCAACAATATTCTAGACACGTAC-CGTACAT---------AGCACATATAAATA-CTTATATACATAGCGTAGTTGTAACTGGTAAGCCAGCGTTTATCTAGAACTCAAGTAATCAGGATAGAGAGCCAGGAGCAGAAACAGAACTA------------------------------CAAGAACCCATAGAGGAAATTCTCCCGCATAATTAATGACAATAATATATATGTA-CTATTATATATTGACAATGTCTAGCCGTA---ATGAAACGATATGA--------------------------ATATGTAAGAGTTACTAATGTACATCTACA-ATGGCATCTACACAATGCAGTCTTTACTCGAAAACTTCCGCGATATTAGTTTTAATGGCGATCCAAATCGT-CTACAGCTTAAGTTGTACCACT---AAAAAGACTAAATTATTTGCTCTTCCAATTCCGTAACACGTTTAGTTGTG--TGTTAACAATTAGTTACTTAGATTCTAGTTTAATTAGCCAAACTTGCTCATACTTATAAGTTCAGAATTTAAGTTGGA--------GTGAATTGGAAATGTGCAACGAACTAAGTTACTTTTGACCGCTGTCCGACTCCTCAC----GGGCAGAGCCAGAAACTCATTTATGTTTGCATTTACATTAAACATATA--------------CACATACATATGATAA
G---CAGTCAAAACTGCAGCTAACTGCTAACTTGTAAATTATATAGTAGCTTACTAT-------ATAGAGAACACCTTGATATGGCTTAGTTCAACTGA-TCTGATCTTTTGCATTTCTTGAGTTTGCCGTTGCGTA--AATAGAAAATATT-TATACAAGTGCATATATATGTAGACACAAGCATATATATAGAGCATATATACATAGCGTAGTAGTA--TTATATGCCAACGAATATATAAAACTCACATAATCGCGAGAAAACATAATAAAACGTAACAGTATGAATGTATTAAATTGTGCAAATAGCTACAAAGCAAAACCCCATAGTGGAATTTCTCCCGCATAAATAATGACAATAATATATATGAAGAAAACACATATATATAA-ATCTATACATACATATAAATCTATATAATGAATATATTCATAATGTCCAACTTAATGTGTAAGCGTTACACATATATGACTAGATATGGTTGCAATTACTGGTTTACTTTACTCGAATAACGCCGCGATATTAGTTTAAACGCCCACTCATTTTGTATTAC----TAAGTTATACCACTTAGAAAAGGACTAAATTATTTGCTCTTCCAATTC-GTATTACGTTAGTTTTCGGTCTTTAACTGTTAGCC-CTAAGTTTATAGTTTAATTAGCCGCGCTTGCTCATACACATTA-TTAGTAAGTTTAGTTAAATATAATATATAGAATACATATGTGCAAACAACTCTTGTGCAGTTGCCCACTGCTCTATTGCATCCATTAGAACAGAGTCATAG-CTCATTTCT--TTGCATTTACAGTATACATACGATATAATAAATGGTCAAATAAACAAGTTAT
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GGCC------------AAAGAGTCTAATTTTTGTTCATCAATGGGTTATAACA--------------------TATGGGTTATATTATAAGTTTGTTTTAAGTTTTTGAGACTGATA------AGAATGTTTCGATCGAATATTCCATAGAACAACAA--------------------TAGTATTACCTAATTACCAAGTCTTAATTTAGCAAAAATGTTATTGCTTATAGAAAAAATAAATTATTTATTGAATTT
AATAGAGGCAGTTATGAAAGAGATTTAAGTTTAATCAGTATTATAGTATAATGGGATCTCAACCAAAAATCTTTGTTGATTAAAATATGATTTATTTATGAATGTTACCTACTTATATATAATAGAAT-------TTAAATATATTAAATAAAAACAAATTTGTTAAATGTGAAATGTTAACATTAATTTATTGTTAAGCTAGGATGCTGTAATAAGTTCATATTTTAT-GCTATGTTCATTTTTTTATCCTGTTG
>CG3281 7786605 7786764|7929 chr3R 7786595 7786675 scaffold_21 1052849 1052920 - 667|10 80
AAAAGTCTACAAAACATTAAATGACAAGTTGACTTTAAATTTCAAATAAATAATTTATTTTTTCTATAAGC
AAAAATGAACATAGCATAAAATATGAACTTATTACAGCATCCTAGCTTAACAATAAATT---------AAT
>CG3281 7786605 7786764|7930 chr3R 7786718 7786998 scaffold_15 1743433 1743701 - 389|0 49
AATGTATTACTAGCTAAAGAAATCATCACTAATATA---GAATGTAGAAT
CATTTATTCTGGGCTAGGGAAAGGCTAGGAAATATAATTACATATAGAAT
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CACTTTAA
CATCTTAC
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AGTG---TGGTAGTGACAAAGTTTTGAATTTATTGTGATAAGAGAAGCGGGCTGATATATAACTATCCAGTTTTGGGATGCATCATTTAAATTTACTTATCAACTGAAAAT--------AATACGAATAAATAC-CTTCATGCGTTAATTAAACTT----AA
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GAAATTAGCACAGAATGCGACGCAGGCGCCAACGGAAGCAAATTGATGGCAATTGTGCGGCAAATGCATTAACACCACTTCATGTATTTTCATTTAAATGGTTTTTCA--------TATCCTGTGATATTTTTTAAGTTTGTGTTTAATAAAAACTTGGCAAAAGTA
TAAATTTTCACAGGA-------AAAACGTTCAGAATTCCACACTGGCGGCC---------TAAATGCA---ACCGGACATTAT---TATTCATTTAAATGCTCTTTTTAAAATCTTTATCCTGTGATAT--------------------------------------
>CG10005 7801146 7801237|7941 chr3R 7798748 7803200 scaffold_41 909279 913440 - 87902|2480 2571
GAACACCTACACTCCACGAAACGATACTTAAATAGAACACAAGATACTCAAAGACATTATCACAACACTTAAAGAAACACCACAGAGTACAG
ATATAGC-----------AAACACTACC-------ACCACAAACAATACAAAAACAT-GTCACAA-------ATAAATAATTAAAACTACAG
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GGATTTGGTGTTACCAATCCTGCAATTGCATCACGGTCACGAACTAGGCCTCAACCTAGCCAGACTGGTTAATGGTGAATCTCTATTTAATCGACACCGTACATTGGTTTCCTTTTCTGTCTTTATTTCAGCGTCTTTACCAAGTCCTACAGTT
AAATTCATTTTTA------------------------------------------------------------GGAAAAGTCCAATTTAA----------------ATTTCCAATCTTATCCT--TTGCAGTGTTTTCAAGCAATCCTACAGCT
>CG12224 7806554 7806729|7948 chr3R 7806728 7807805 scaffold_354 4308 5335 - 39237|0 1
GT
GT
>mfas 7810584 7810720|7951 chr3R 7809202 7810603 scaffold_354 4308 5675 - 41326|1432 1451
AAAATAAATAGTATTAAAAC
AAAAGATACAGCATACTTAC
>mfas 7810584 7810720|7952 chr3R 7810604 7811957 scaffold_354 6070 7463 - 64328|0 145
GCGGTGCT-----------------------------CGTCCCCATCTCATGCATATTGATATATAAAGCAGATATTTATATTTACTCTTAACGATTTGTCAACTGATTGGAAGCCGCAAAAAGCTCAGAATCTCCTCTGATAAAT
GCGGCGATATTATTAAATGTCTCTATGTGTGTATCTACTTCTTTGTCTACTACATATACATAT---------ATATTTATATTATTTTATAAAGATTCGTCAA-TGATTGAAATTTACATTAAGCAAAGAATATATGC--ATAAAT
>Tk 7819897 7820463|7961 chr3R 7819812 7820350 scaffold_512 5669 6205 - 5295|88 583
AAATGGATCACATGAGTGTTTTAAATAATCACTGGGCTGGAGATTATTTCAAACACGGACACACAAA--------AAACACACGGCTAAGAATTTGCTCTGTTTGTCGACACAAAATTTCAGCTTAATGTA----TAACGAGACTTGCGAATAATTTATTGGGAATTTATTTGAAATTGAATGAGATGCTTCGATGAGTGTGTGGATTCAATTGTACTATTTGCATATCTAAGTGTAAACTTTTAATCAAAATTATGATGAAAATTAAACTAGAAGAAG---TTCAAATGCACAAGATAAA-------------CAGAAAAGTGGGAAAGTAATTATTTATTTAAAACAAATATAT---TTAAAACGAATATACTTAAAGATACATTTCAGTTGTGGTACATCTACGTATACAAAATATATATACACCTACATTAATAGCACAAA--------TAAATATTGTAAATAATGA---ATAAATATTTATTTCAGAAAC
AACTAGGCAAAGCAAATGTTATAAATAATCACTGGGCTGGAGATTATTTAAAACATAAGCACACACACACAACCCACACACACAGAAAAG-ATTTAGTCT---------------ATTTCGTTTTAATGTAAAATTAACGAAAC------GTAAGGCGATGTAAATCTAATTAAAATCGCAT------TTTAGCCCCATGTGGTACATGAAATAAATCATTCGCATATCTACTTGTAAAC---------AAATTA--ATCCATATTAAACTTGAATAAGTACTTCATGTACCTAATATAGATTTTTCAGAATTCCACACACAGACAAAGCTACGTATGTAAGTGAAAGCGACATGTTAATTTATTTGCAATTAATTATTACAACGTTTAAACGATAACAAA-ATAAACTTAAAGTATATATATATACCTACATATATAGCGCAAATGTTCAATTGATTATTGTAAATATTGGTACATAAATAAAAACT------AC
>CG3571 7833832 7834134|7980 chr3R 7833731 7836095 scaffold_33 3785 6074 - 106519|101 419
CCCACTCGATTCGCCTGCCAAACCCGTTTCTCTAGCCACACTCGTCTTAGGTAATTTATGTGAATTGAATCGATATAGTTTAGCCTAGATATGATTGTTGAGGGT----------AACCAAGCTTTAGTGGCACCTCGTGCGGCCGCCTCGTATGCAACTCAGCTCAGCTCTTGCAGCTCTATCAAAATTGTTCATATACTACTCACAGCTCTATAGATTTTGTCATTCCAGTTATGTAATTGT-TTAGTTACTA-----CGCCTAGCCTTAAATACTCATTACAATATTAATCCTCCAAATAAAAACATGTATAACGC
CTTGC--------CTAGCCAAA--AAATTCTCACGTAGTTATTTGATTAGTTAATTTATACAATT-------ATATATTGTAATCT---TATGCATATTGCAAGTGTTAGTATGCAACTAAGCTTTAGTGGTGCCACG------------------ACCACGGTTCTATTTCT-----------AAAATTGTTCATGCGTAATTCAGGATTGTTTATTATATTACATTCCAGTTGTATATTTTTGTTAGTTTGTAATTTGTCTCTAGCCGAAAATACTCATTAAACCTTAGGTATTGAAAATCGTAAC-TCAGCAATGC
>CG3313 7840663 7840968|7981 chr3R 7836600 7842695 scaffold_33 6841 13034 - 204421|4363 4698
ATTGGCATAGGATCCGATCCGGGC--TCACAATACTGATT------AGTATTTAAGTAGTTATTCGACTTGTGATCTTTAATCTTTTGGCGCATTTCGATTCAAATCGTTCACCTGCATATGTATTCCGCCAAGACAGAATTTTTATTTAACT--TGATTACTCACTTTTGGTTTTAATGAAATTTATGTAAGATTTATGTTAATGATATTTTATATTGTGTGTAAACAATATACACCGTTTAAAAGTGTAAATGTAAGCATAAATACCGATC--------CTATTTATATATAGTACATACA------------ATACAAATAATGGAATACTAA
TTCCACA-------------GGGCTGTCACAAATCTGATTAGTACGAGTATTTAGGCAATAGTATATTTTGTG---TTTAGCCTTGTCGC----------------CGT-----CGTGGCTGCGATGTGCGAAATGTGATTTTTGATTTCTCTGCTGATT-TTGACTTTTTGTTT-----------------------AGTTATTAAAATTGTATAATCTTTGTGTTTGATTTATACAATTAATAAGTGTAAATGTATGCATAAACTTCGAATAGTTTTAGCCAATTATAGATGGTATTTATACAGTCTAATGATATATACACAATTGATTTTAAG
>CG31358 7853792 7855756|7991 chr3R 7852590 7853860 scaffold_35 328053 329315 - 5175|1336 1412
TAAACATGGTATAAAAGTTTATAAATATTT-TAATATGATTCCATATTAAAT-----TATTATTTTAAGATGTCT--
TAATAATAATAATAATAATAATAATAATTTGCAAAATGATTCGATCTTAAAAATTGACAGTATGTCAAAGCTCTTTG
>CG31358 7853792 7855756|7992 chr3R 7853861 7854822 scaffold_35 329863 330797 - 7169|0 1010
ATATATGTACTTTCCCA-ATATATATTCACCTGAGTAATAAGAATGAATCCGGCGTGCAGACTGAACCTGGAGAGCAAGGAATGCCAGGAGTGGATGAACGAGGTGTGTGCCCACTGCGCCCACCTGCTGCCCGGCGTGGAGGAGGCGGAGCTCTGGGACAAATGGTGGTCGGACGAGCTGCCCGCTCCGTTCAAGTCGCGAGTTAATCTTATGTCCGCCTACGATTGCCACAAGCTGCGCAAAGAGGTTGCCCGCCAGGTGACGAATAGCCGAGATCAGGAGTGGCACGAGG-ACGAAGGCAATCCGGTCACCTGGACGC--TCTGCCAACTGATCCTATTGATCATAGTGATGGTTTCCTCGATAATCGCCATGGTGTGTGCCCTGAAAGTGATCTGCGAAAGCCAACGTCGCTGGTCGGGCCGC----ACGAAATGTGCTCCCCCAATAAAGGTGAAACAGGAAGAGAAGCCACCGCCACCTCCAGCCGATGTGGAGACGCCGCCCCAAAAGGACTCCTGCAAGCCAGCCAAGCAGCCCAAGGCCTTCATCTCCTTTGGCCGGACCACCGACCCACGCACACGTTTCGGTCCGTACAAG--CACCAGAAGC-TACTCCAGACCGCCTCCATGCTGCCGGAATGCCAGCCGGCGGAGTCGTAGCTCCCGCCAACTCGTGACCATCGCCATCACCCGGAGCGGTGGAGCAGCACGTCGAATGGCAATTGGCGAAAAACAAATC--------GGCCA----CAAAATAACCGGCTAGGGGGAGCACTGGCCAAAAAAATCGAAAACAAATTCGAAGGCTGCCGGAGCTGTGCTCAATCGCGGATAAGATTTATGAAATGTGTTCCGCCCCGATTTGTTCA--CTTTTTCCCGGTTCGCCTCTAGTCCTTTTCGGTTTCCTTTTTT------------ATGTTGCCGCGCTGCA----CGAAACACAAAAACAAATAAATATTCAGACGTTC--------GCACAGTGGCCC
ACATATGTAAATATTTATATAAATATTCGTTAAATACACGGCAATGAATCCAATATGCAAGCAAAACATTAACAGCGCCGAGTGCCAACAGTGGATAAGCGAAGTCTTCGCCCACTGCAATCGGCTGTTGGTCGAC---AAACAGCTGGAGTTCTGGGATGATTGGTGGCTGCACGAGCCAACGGTGCCAGCCTATCAGGTGCCGCATCTAATGTCAGCCTATGACTGCCAGAAATTAAGGAAGCAGATCGAACGCGAGTTAACTGA-GGCTGCCAGC--TTGTCGCCCGAAATTCGCTTGCAATTGAATGACCTGAACTCCACCTGGCGTGTGGTT---TTGTTTGTATTTGTCGTATGCTTGGCACTGTGCATCATCGGCTCC------ATGGTCTG-----------GCTGTTGAACAGCATGCTGCAACGCGCTGCGCATCCCAGGTTTAAGGATTACGAGCGTCAAGGTCGTGGCAG----AAGAAAATGCAGAAACGCCTC-------------------------------GCCTAGATCATTTATCTCCTTTAGCAAGCCCTGCCATCCTCAGGCATACCTCGGCCCCTATCGGACCAACAGAATTATAGTTCCGGGTGGCGC----CTGCGGCGCAGCCAAACGATAGCGCCACA-CACACACACACCCTTGGCCATTGACAGCAGACACATCACAGGACGCGCGAAACAAACGT---GCGACCAAAATGGAATCCCAATCAGAGCCAAATCCAAAGAACGCAGCCAAAAATAACGACAATTAAAACAACAAAAAAATAGTAAAAAAAATAGCG--GTTGTGCTCAATCGCGGGCAAGATTTATGAAATGTGTTCCGCACCGATTTTTTAAACCCCATTTTTGATTCTCCTCTTTTTTTTTGTTGTGTTGTGTTTTGGCCCAGCAAACAAACAGGCGAACAGCAGCAGCAGTAAACTAGCGCATATAAATA-----ACGCTCCCTGTCATACACCATGGCAC
>CG31358 7853792 7855756|7993 chr3R 7855320 7855574 scaffold_35 331443 331676 - 2141|0 262
AAGTTTGCGGTGGAGCTGAGCCGAAATGGAAGGCAGA-AGAGATCATATCCAAGCTACCG--GAACATAAACTGATCACCTCCCAGGAATGCATGCAACTGAAGCGTGAGCTGGAAGCCGAGAGGCCAGATGAGTTTGAGGTTAGTCCGATG-----ATCCTGTGCCTTATGCTGACCTTGTTGCTTTTCCTGATCGGCTTCTGGATTTGGTTAATATCGCGTAGCTGCCTCTTTTCGCAAAGCGAGCCGGTTGCGTTTAAGA
AGGTGTGCGGCCGGTGT---CCAGACTGGAAATTCGATCGCGATCACAAGCAAGGCAACACCGCCTACAAGTTAATGACAAACGATGAATGCCAGCGACTGAAGCGGGAACTACAGGCTT----------CGCTCTTCAGGGTCAACCGCGGCATAAATCCCATGACCT-TGCTGCTGCTATTGTTTTTCATGGT---CTTCTGCATGTG--TATTATCGTCTGGCTGC------TGGCAA----AGGCGTTTGTGCTCAAAA
>CG4702 7947299 7947482|8088 chr3R 7946900 7947611 scaffold_35 418174 418963 - 8689|427 692
ACTTCCCAGTGGCCAC------------------------CGACTGGACTCTCCCTAAAATAATTTAAATTAATTTATG-ACTTCC------CTAGATGTTAGCTATTTATATTATTTATTTAAAAAATCTGTACTTAT---------------GGTCGC-----------------CGTAAAATGCGACTGGCTTCTA-AGTTGAC----AAAGAAAAGCGTTAAAA-ATACA----------TGCATTAAATGA---CAAAACC
GCGTGACGGGTGCTACGAATTACTTGCATTTTAGTGCGTATGACTGGAC-------AACTTAAATTAAATTAATTTATGTGCTTACTTGAAACTAGGCTTTAGCTATTTATGTTATTTATTT--AAATTCTGTATTTATTTACAATTCTTATGCAATCGCAATAACAATTTGCGTTTCTCAAAACGCGCCATTTTTCTGTAATTGACTACGAAAGATAAGAATTAAAACAAACACGAAAACTGTTGCATCAAATGAAAGCCAAATT
>dpr15 7964555 7965541|8112 chr3R 7964131 7964951 scaffold_35 458929 459894 - 167|497 1006
TTTTTATGCATAAAGGATAATGATAAACGAATACTGAATACAAGTGTAAAT-------AAAAGGGTGTTACTGCGTTCTATTCAAATAAATATCCCAAGCA--------AGCCAAAAAATTTAATGTAAACA------------TTAGTTAGTATATAAAAGACTTACTTAA-ATTTTAGACGCAGCCAAGCCACAAAAACCCAATGTGAAACCAAAACTTAATCAACTAAATAAACAGAATTGTAAGGAGTTGCTCCAA----CGTTGCGTATACTTGATTTGCAA-----------------------------CACGACATTTTAAGAAAATGCAA------ATGAAAATTAAAATTAAATGAA---------AATCAATTGAAACGAAATGAAGTGTTTGCAATAATTCATAAGCCATAAGATCTAAGTGAA-ATACAAGTAA--------------------------------ATAAAATAAAATTTCTTCAACGG----ACTC
TTTATAAAAATTTACGATCACTTCTAAGGAACTGTGTACATATGTGTGTGTGTATCGGATATGTAAGCTACAGCGTTCTTTAATAATAAATAATTGAAGCAGCTAAAATAAACAACAAATTTAAAATAAATAAACAGTAACATATTAAGTACTACATGCAAACCTTAGTTAGTGTTATAGACTTG-------CAAAAATATGAAATATGAAACTTATGCTGAA--AAATAAGTAGTAAGTGTTTCAAATGTTTGCGACAATTTCCGTTTTG-ATGTTTGCTTTAAAAATAAACAAAATATATAATAAATATATTTGCATTAAGTTTTAAGCGATTATCATAAGTGATGACAGCTAAA-TTAAATACATTTTCCCTAAATTAAATAATAAGGCTTAAGGGTTTTTCAGTATTTTTCAAAATTATGGATGTAAGTATATATATGAGTAGCTCGTGTACTGTCCACAACTATTCGACTTAGTATTAATTATTATTTATTTATTATTATTATTA
>dpr15 7964555 7965541|8113 chr3R 7964952 7967445 scaffold_35 460240 462912 - 9945|0 664
GTTGT---CCTCAGGCAATCGCCTAGTTACTTGGATCTTACGCATTAAA---GGAGGCTAC--------GACTTAAGATTTTACTCG--ATTTAATTACATATTAACAGAGAGAGA-ATAAGGAAGATACACCCTCGGCAAGGC-----AATATATACAGGACTAAGGGCATAAGT-----------------TAAAGTTATAATC----------ATACTCGATTTATGTTTGTTTCCCATCTGAGTGTAAATTGATATTGAGATTCATGCTTATGTTCCGCCATATCATATAG-TTTCATTGAAAAGTTGCAAGAATTGTGTAAATAGAATGCACAGAATTCG------------CCCTTAACAGATAAGAACATTTCCATTATTTTAATCAATTGGAATCTGCCATGGTTGTATCATATATAAGTTAAATAATCAT---AAATGATTCATAAGTCTTG---AGAGCACTAACAAATTTTCAAT--AGGATTTTTATGAAGTAAAATCAAATGTGTAGTTCAGCTCGTGTAGCACGATTGAATAAGTATCGAATGAATTTCAAATTTCTTTGGTTTCCTTAAGCTATAAATTGTAAATATGTATGTATACCTTATGATATCTGTATGAATACCCTGA-----TTTTTTAAGTCTTAAAATCCA
GCAATAAACCACCGGCAACAGCAGCAGCAGCAGGAGAAGCAGAATAACACATGGATGCTGCCCGCTGCAAACTTGAAATATGCCTAGAAATTTAAGTCCA----ACCAATGAGATACATTTGCAAAATGTAGCTACGAGTATGTTTTAACGTAGATACACTAC-AAATGCATAAGCGAGCTCATGTATTACCATAAAGTCAACATATTGCTTACAGATATTAAATATATGTGTATCTTTACAATATATACATACTTATATTTCCACTAACTTATATTTCACATTTTATCTTTTTGCTTTCGTTTAACATATTCAATCTCTACCTCTTTGGGTAACAAAAAATCAATTATATGAAAACCTCTAGTGAGTTGTGTATATATTGAAGAAAGAAATTTTTGAGAACCAACTTTCATTTCGAAATCTTTAAGATTAAGAGTCGCGTGAAATGCGTTATGGGTTGCGGTTGTAACATTATAATACTATACATAAAAGGCTACGCTGAATTAAAATAAAATAAA-----CAGCACATAAAGTAAGATTTTTCAAAAAGCGGA-----------------AGGCTACTTTCTGCCGAAAAACA-AAATATATACACTTAAAAGATAATACATATAAAATTACAAAAGAAATTTGTATTAAACAAAAAAATGCA
>Cpn 7988611 7988677|8144 chr3R 7988484 7991256 scaffold_35 494604 497735 - 7014|132 213
CTCAAGTTTAAAGCCTGGATCATGTAAAGTAAA-GCTACTAATAAA-----GCGTTATTTCACCAATT-----TTA----AA
CTAATGTTGAATATTTGAAATATGATTAATAAATGCTGTTCAAGAAAGTTTGTATTCTTTTATAAGCTGCTGCTTAACAGAG
>CG4810 8018425 8018941|8194 chr3R 8018409 8018559 scaffold_35 555956 556102 - 2676|17 158
CTCAGGATCAATAAATCACCGAACACGGCATCAATCAATGCAAATTCTGATGCTGCTGTGGTGCTTGGCGTGCGACAATTTAAGCAAAATGTTTTCGTATTCAACAGCATTTAATTAAATTCAT-------ATATGTGCTCG
CTCAACTACAATAAATCAC--AAAATGGCATCAATCAATGCAAATTTCAAAGCAATTTCATTA---GACGCAGCCCAATTTGAAAAA------TTTGTGTGCTAAAAT-TTTAATTAAATTTTTCGATTTAACATTGGCACA
>CG4810 8018425 8018941|8195 chr3R 8018657 8018853 scaffold_35 556651 556911 - 5980|0 261
CAGTGAACACAAATGCAATTTAAATTGAGTTTTTGACCAAACACA---------------ACATATGAACGGAGCCATCACTTG-------------ACATG-------------------TCAGTGAACAACGGACCGGGTGACC-----------GGGTGCAGTCACAGTTATTTTGAGGATAACATGGCCACATCAATCACTGCGGTTC-------CAAGAAATACAAAATGAAACCCGGCTAAATAAATATGCATTGT
CAATGGAAATAAATACAATTTAAATTGAGTTTTTGACCAAGCACAAAACGACACAAACCCACACACGCGCACACTCAGAACATATGTCGGCTTATGCACATGGGTATACTTCCGCCCACTCCCTGTAGATAATCCTCTGGCAGCCCCCTCGAGATCTGACAAGAGTCACAGTTA-TTTGATGATAACATGTCCGCATCAATCATTGTGGTTCGGCATGTAAAGAAATACGAAATGAAACCAAGTAAAATAAATGTACATTGT
>CG4830 8033879 8034081|8217 chr3R 8033832 8034021 scaffold_34 480560 480730 + -766|47 193
TAGGCAATCCTGCTTTTCGATTTCTTTCGTCTGAATTTGCCCGTCAAACACTTC-TGAAAAGTCGCCCACAACGTTCAATTC-TCAGAATAATGTCTCTGTGCATATTTTTAATAAACAAAATGCTGAAGTATATTCAGGAC--GAA
TTGTCGATC--------------GTTGTGTCTGAA---GCTCGGCATATAGATCACTGAAACTCTATCGAACTGAACAGTTCAGTAGAAATTTACATCTG------TTGACAATAGTCTACCTAAGGAAATATCTCCGAAACTTGAT
>CG4830 8033879 8034081|8218 chr3R 8034078 8036115 scaffold_4 2488807 2490752 + 40615|0 3
AAAC
GAGC
>CG4848 8041377 8041555|8224 chr3R 8040714 8042215 scaffold_35 582366 583951 - 13253|733 935
AGGATTCAAATCAAGTGGCC-TGTGAAGTGCAT-------------TCGAGCGGAATGCGGATGGGATGCTCTTCTATTGTTAAGCTTAACCTACATAAATATATCCGAACGTACTTGTAGTAGAAGAGGCGGGCAGCGCCCAGTAAATTGTAA--GAAAGTCACATACATTATAGAGATACTCG--------TATATACACC
ATGCGTCTAATGAAGTGGCCAAGTGAAGAGCACGAAACGCGCTCAGCCAAGCGGAAGGCCGTGCAGCAGCTGCCACTGCACTCAGCTGTGTGTGTGTATGTGTGCGTGTGCGTGAGTGT-GTTGTAATTGTGCATTCCGAGCGCTAAACTTTAAATGCAAACAATTTGCAATATGCAGCCAAATAACGTAATTTAACTACAGT
>CG4860 8045599 8045733|8226 chr3R 8044452 8047290 scaffold_35 587226 590092 - 90709|1264 1408
AAGCCATTGTTGGTTTTTC--TTTATTACTGCTGCCAAACCAATCAGAATTCTTGCTTTTACACTTGTTGTGTATGTAAATTAGTTTATCTA----TGCCAGACAAATGCATTTAA----TAAAGTATATTTAAACAAATGAAAC
AAACAAATAAGAAATTAGCAATTGAGTCGAGCTTCTATCGCCATCTGCACT-TTAAGTTGGCGGGCGATAAGTTATATAATCGATTTATATAGAACTGCCATGAATAATCATTAAACGGCTAATATACACGAAATCCACGAAGGC
>Pglym87 8057049 8057520|8237 chr3R 8057010 8057159 scaffold_35 605445 605602 + 8797|39 158
GCGTCAATTTTAATTGCTG-----CGGGATGAGTCTGAGCAGCCTCT----GGCATTCCGAACGGGTCGAATTTTAATTTGTTTAAATGAAATACTCATTTAGGGCTTATTGACAAACAA
ACGTCGATTTTAATTGTTGTTGTTCGGGTTCAGTTGGAATTTCTGTTGCGCGACATT-CAAATGGGTCGAATTTTAATTTGTTTAAATGAAATACTCATTTAGGTTTTATTGACAAACAA
>Pglym87 8057049 8057520|8238 chr3R 8057315 8058423 scaffold_35 605763 606966 + 42459|0 274
TCCGTGATTTT-----GGGTATACCCAGCAGCC--------------------TCCGAAGAAGGTCAGAGCAATCA-----GCTCAATGCACTTGTATG--CCAAACAAAAGCGG----------------CGAATCGAAAGTG-----GTGCTCACTGTGGCCAG----------------GCGAATGTCAAGAAGCAAATAAATTTATTTGATTTTAATTGACAATGAAGAGTCAACAACGATGGGCTGGCTGGCCGTTGGTCTCTTGGTCTT
TATGGGGACAGTCAAAGGTTATGCACAGCAGCCAAAATAAATTACGATAAATACAAGAAAAAGGTCAAAATAATAATTCTTACCCAATGCACTTGCCTGTCCCAATCTATAGCTGAATCTGTATCTGAATCCGAATCAGAATCGAAATCGCAATCACAATTCAGAGAGTGAGCGAAATAAACGCGAATGTCAAGCAGCAAATAAATTTATTTGATTTTAATTGACAATGAAAAGTCAACAA----AGGCTGCAAGACAGCTCCTCTGCTGGATGT
>Cyp313a5 8058575 8058575|8239 chr3R 8058425 8060457 scaffold_3 899243 901338 - 13405|153 153
-
C
>CG10038 8174706 8174801|8367 chr3R 8174234 8175489 scaffold_35 791503 792766 - 25976|535 630
CAGCCAGCATCTACTTGTTAAGGCATTTTTGTACTCCCCATTTATAGTAAATATCATGGAGATGTGAATATAAATTATGTTTTTACCGTCTGCACA
CGTCTAGTAGCAACTTGTTA---------------CTCATTTCAT----CATATTTTGAAATTCTGTGCATCA--TATGATCTTCTCTTCCATG--
>MBD-R2 8177865 8178096|8372 chr3R 8177841 8180606 scaffold_3 5811234 5814097 - 95976|24 256
CATTTCTATTGATCACGGTTATAGGGGTCTAATGAGGATTTTCTTTTAAGCTATTTTCGAACTGTTTCCATAATTTTGCAGACGTGTAGATAGTAACCGTACAAGCTTTTTCTCTTCAAAAAAAATATTGCTATACTTTATAAAGTTTGATAATATAATGGAATTTAAATGTATATTCTTTTAAAGTTAACCATGTGAGAATACAGAAAATT-ATAATTTCATGCCCAATTAT
CACACGTGTAGAAGATGATCATTTAGTTATAAGTATAACTTACCATAATAGTTTTCGTTGAATATCAATACATTTTTG----------------AACAATAAAA---------CTTCTAAAGTAGTCTCGCTTTAGAATATCAATTATGGTAGTCATTCAGTATATACA-GTATGCC------AAGAAATTCTTTTGACAAAACGAAAAATTCATATTTTCCAGGGTAATT--
>Tim17a1 8189389 8189638|8379 chr3R 8189558 8189795 scaffold_17 966016 966245 - 3178|0 80
TGTTGCCCAAAAAAAAAGGGTTTTCATTTTCATTCAATCTTTCGTTCTCAACAATCACTCATCAAAATTGTGTGCATGTAC
ACTTAACTAATTTAATAA------CCTTTTCGGCCATCATATATTAGTCATAATTTACT--TCAAAATTAGATGCATGTGC
>GstD9 8191902 8191962|8384 chr3R 8190977 8192791 scaffold_20 1546091 1547824 - 46665|983 1046
CGGGTCTGTAATAAATAATCTAATCTGTAT---CGACCTGTTTGAATAAAGAGTGAGACATTGT
TTATCCTTAGATATACCCTATTGTTGCCATGCACGCTCTATCTGAAATAGAAAAGAGTC-----
>GstD1 8193532 8193663|8387 chr3R 8193471 8194302 scaffold_20 1548397 1549239 - 48573|65 218
GCCTGA--TATTCACG-TTTTTATACCCGTACATATGATGTAGTATTTATATTCACGTTCACAAACAACAATTCCAAATTCGC-----CTGTCTCCAAA--GACAATAAATAAGTGTTC------------TTTTTTTTGAATGCACAAAATAC
GCTTAAAGCATTTGCGAGTATTATAT---TTTATATAATAATTTATTCATAATTAC--TCACAA--AACGATTTGAAATCGTCAAATGTTGTGTGCAAATTTGTATCAAGCGAGAGTTTGGTGCAAATGAATTTTTT-----TGCTTAAAATAA
>CG10035 8207373 8207452|8405 chr3R 8207278 8209493 scaffold_20 1558021 1560343 - 32371|99 192
GGA---TGGCGCAA-TGGGTGTAGGTT-TAGTGCTGGCTCGTAAATTAGGTGGAATGCAAA---------ATATACTTTTAATGATGCTATAAA
AGAACGTGATGAAATTTGATGTAAATTGTAGTATCTGCTTGCATACCAAGGAGAATTGAAATACATAAATATATATTTTTAATTTTACTCGAA-
>CG10096 8216405 8216627|8414 chr3R 8216422 8216510 scaffold_1 2785972 2786069 - 727|0 97
AACCATCATTACGTT-------TTTTGAACGTTCTTTTAGAAGGATAATTTTCATATAACACGCAAATT--AAGACAAAAAGCAACTTGTATGCAATT
TAATATCATATCAATATTATCATGTAGAACATCAATTTAAACAATTATCTTTTATTAAAATTAAAAATTCCATGATGACAAACAACTTTTATTTAGTT
>CG10096 8216405 8216627|8415 chr3R 8216511 8218297 scaffold_15 1763557 1765336 - 30744|0 123
TAATCACAAATAAAGTTAATTGGCTATGATTTACTCACTCTTTATATCTCATTTTTAA-------CATCAAAAACAGCAATTATATAGGCGTTATCATAGCTATAGCTATTTTTATAAAGCAAA
TAATTTCGCTTACAATAAA--------AACTGAATATTTTTTTATTTTTTATCATTAAATAAGTTCAATGCAAAGTGCAATATTGTAATTG-TATTCTAATTGGAACCCATTTAATATTCCAAA
>CG10097 8218181 8219836|8416 chr3R 8218298 8218301 scaffold_20 1567688 1567691 - 251|0 3
CGTT
CATT
>CG10097 8218181 8219836|8417 chr3R 8218434 8218828 scaffold_20 1568269 1568657 - 5019|0 416
GAGAGTTTGGCCAGACAATTGATATTTTGCGATCG------ACGATTCTGGGTATAAATAACTGGTGAAAAAACACCGAACACCTCTCATTCAAGCATCAGTCGCGTCTGCGCCGTTCTACGTCGGACATCGGATTACGGATAGCTGAATACGGAATACGGATTTCCGGCCTGTCTTCGC------------GAAAAGGATCGTAATAAGAGCCCATCGGAAATGGCAACGGATGTGCAATCTTTTTACAAAGACAAAACTGTCTTCCTAACAGGCGGCAGTGGATTCCTTGGAAAAGGTATTCCGTCTTCTAGTTGACAGTTGACTCAATAGATCTGCTAAAGTGTGGTGTAAATGCATTAAACGCACATAAATTTAAAGGCCAAATTCCTGTG----ATTTGGACTTTTGCAAGC
GAGTGCTTAGCTATCTGCTAGCCACTGTGCAATTGCATCTGGTAAATCTGGGTATAAATACCT--TCAACAAGTTCTAAGCGCTTCTCATTCGAACGGAAGCTGCGACTGCGC---TTAATGCCA---ACCGGACTA----TACTTGAATATACTCTAACTATTTGCTGTCGGTACTTATTGTGGGCAGTTAGAAATGGATGTTGACAAC---------GAAGAGACATCCGAAATGCAACATTTCTATAAAGACAAGACAATTTTTATAACTGGTGGCAGTGGCTTTTTAGGAAAAGGTATAC------ACACATTAAAGTGAATCAAATATATTTG-TGAAGTGCATTGAAACAATACCAAGCAACTCTTTTATAAATGATATAATTATAATGATATATTTAGAATTGTGCATGC
>CG10097 8218181 8219836|8418 chr3R 8219122 8219173 scaffold_20 1569431 1569483 - 2070|0 52
CCCTGGGATGCACTTCAACCCGGCGC-ACAACGTTTTCCAATTAGCCAAATGG
CTTTGAACTGCTCAATGACCCAAAGCTACAACGTTTTTCAATTAGCCAAACAG
>CG10097 8218181 8219836|8419 chr3R 8219564 8219803 scaffold_20 1415667 1415898 - 571|0 247
CCAGAAAATAACTGTAAGCCACATTGGTTTTTACAGGTTTTATGTATTGGACAGGATTCTTAAAACTGTATTAGTTACATTATTTGGT--GGCTCTATTTGGTTATTAATCACAAATTTAGTGCCACTACTGTAACTATTTT----TTTTTTTTTAATTCTTAAAACATGCACCGGGTTGAAG--GCTAAATAAATAATGAGTTTGTTCTTGATGGATCTCAAAACAAAAATTTTTATTAATGTGTTT
TTGAGTAAAAATTAGAAACTAAATTGTTGTTTAGGATTTTTCTGTGTTAAATA-AATTCATGGTTTTGCAATGGAAATATATTTTAATCAAATTCTA-TTGGCAATCAATTCCAA----AGTGCAAGACGTGCAATTAAATCCAGGTGTTGCCATAATTGTTAAGTGGATTATTTAAGAAAAGATACGAATAAAAGAATATATTTATTTTAACTG----------TAGATATTGTTATTTATATGGTT
>CG10097 8218181 8219836|8420 chr3R 8219804 8221705 scaffold_15 1768377 1770254 - 20205|0 32
CTATTTTTTTTTATCTCTTAAATGAAATTATCT
-TAATTTGGCTTACAATAAAAACTGAATTGTTT
>CG17227 8224736 8224930|8428 chr3R 8224832 8225173 scaffold_20 1570864 1571199 - 2740|0 98
AACGCTCTATCGTCGTAGCTGCCGGCACTTGAATGTAAGCTGGCTCCAAAGCTGTCTCGATACTCAGAGTCGTCAACCTTTTCCCCTACACGCCGTGAT
ACCTCTTTACCGTCGCAGCTGTCGTCATCTCAACATCAAATGGCTAGAGGAAACGCTAAAGATGAAGACATTACAGCCTTATCCGCTCTATGCGTTGCT
>CG17227 8224989 8224989|8428 chr3R 8224832 8225173 scaffold_20 1570864 1571199 - 2740|157 157
T
T
>Cyp9f2 8229057 8229148|8432 chr3R 8229019 8230068 scaffold_21 776112 777147 - 46885|38 133
TCTTATAAACGATCAAAATAATAATATGTTTTGTTGAATGTTATGTTTTAAAGAAGTTGACATTA----TTAAATTTAAACAATTAATGGTAATTT
------AATCGATCAAATTGTGATTTTATTCAAATG--TAACAAACTTTAAATAAATAATGATTATATTTCGTATTGAAACA--TAATGTATCTAT
>Dip-C 8237527 8237629|8440 chr3R 8235470 8237590 scaffold_20 2417118 2419120 + 54288|2150 2215
TAATCTGTATCATA-ATCAAATTATGGAATACCCAATAAATAAATAAGGTCT-CATCAGTTGACAT
TAATTTAAATCTTACGTTAAATTAT---------AATAGGAAAACGAAAACTGTTTTAGTT--TGT
>Dip-C 8237527 8237629|8441 chr3R 8237591 8239374 scaffold_20 2419615 2421410 + 79140|0 42
AGCTTTTAAACTATATTCCA----CGCGTAAACATATGTAATA
TAATGGTATACTATAATATAATTTCGTATACCTATATGTAATA
>Scgbeta 8246956 8247006|8443 chr3R 8246690 8251579 scaffold_20 2429295 2434156 + 126625|286 353
GTGCGT-TTGGAAATAAAGTGCAGCGTTACGAT----------------TATCGTATCCCTAAAACAA
GTATGCAATCAAAACAATATATACAATATCAATATACTATATACTATACTATACTATCCCTATTAAGA
>Pp1-87B 8249335 8250238|8443 chr3R 8246690 8251579 scaffold_20 2429295 2434156 + 126625|2897 3879
CCGGGGCGAGTCGAAATCCACAAGAAATTGCACCATTAATTTGGT-----ATGGAATAGC----AGCGCCACGATCAAAGGACATCCCCAGAGACATCCCTTCCAGCAGATGACTGCAGTTTTCCCCTTCCACCCCACACCCATTGAGATTTAAATCGCAATTACAAACACATTGACAAATACCATGATTAAAAGCCACAT-ATTTATTTGTAATAGCCCCCGTATATATATATATATATGTATATCTACCGACCGACCAACCATTCACCCACGCACACACATGTACACACATTTGAACACCAGCGCTTTTATA-GGTTTTGTCCAAAATTTAAACACTAGGTTAATCAACTGACCGTTCGAGCAGAGCACCAAGCGCATAACCATGCAGATTAGATGGAAACGGAGCAGCAGAGGAGCGACTGGACGCCAGTCGGTCACAAAGCATACAGATGTGGGGGCCCTGT--------AGTGCTCGTTGGCCTTAAGAGTATAGA--GCAAGTGAAAACAAAACAAGAAACAAAAAATCGAAGAGGGGAAATCGTTGAACCGAGGAGGTGGAGGCGAATGCTTGCCAAGAAGTATAAAGAGGAATTATAAGCACTAAGTTTCGACCTT---------GAATCAGTTTTTTTTTTGTTCGTCCACAATGCAGTCCGACCGAATGGACCAGCCAGCCAGCCAGCCAGAGAAATATCTGCAAGAAAATCAGCGAAATATATTAGTTTGTCCCTAA-----AACTCCTTACCATTCATCAGCTATTCAAACGTCCGCTT--------------CCCGTCATTTTAAGGATGTGTTTTTTAAA---------------------------AATTAACTATTATTAATATGTATTATCAATAATCCTTTGTATTAATAAACAAATGATATAAAACGTGTATGAATTATGAAACTGATTTCAATAAACACATTTGAAAAATCCA-TAATACG--
CAGGGGCAAATCTAATTTTACAA-ACCTAGCACCGACTATGCGGCCAGAGAGGGAAGAACCGAACGCTCTGCGTCCAGTAAAAAACTTTATAAA-ATGCAAACCAATCCTGGACAACATTTGACCTTTT------AAGAAATAAAGAGATTTGCTT--CAATTACAAA-ACATTCGCATGC------ATTCAAACAGGCATCATTTAC-----GTAGAAACCATTTATTTCGATTAACATATA-----ACCATACAACCACACCTCTATCCACA-ATAGTCGTATATCGACACATGCACACATGCATGTTCAAATAGTTTTGTCC--AATTTAAACGCGAGACTAA-------AATGTT--------------AGTACAAGATCAATTTAATTTCACATAGACATACGATCA---AGGCGACTGTA--ACAGTCGGTCAAA----ATAAACGTAGTAGGGCTTTGTAAAAAAAAAACAAATAATTAAATTAAAACTATGGCATACAAATGGAAAAATTGAAAGAAACGAGAAA--GAAAGAAAGAAATCAAAGA---------------GTGAACGCTTGCCAAGAA--------AGTAAAAGTAAACACTAAGTTTTGACCTTCGAAATACAAAATCAG-----TTTATGTTCGTCCACATTGCAG-CCAACCATTGGGTACAGCTGGTCCATGTCTTAT-------TTTATGCCCAAGTCCG-------TTTTCATTTTTCAATTATGATGAACCTCTTGTAATTCGATCCATGCTTACATGTACAATTTTATTTTTTTCATGTTTATCATTTTTAAGATGTGTTTAAAAAAAAAAAGAGATAAAAAAACAAAACAAATAACTTACTATTATTAATATGTCTTATCAATAATCCTTTGTATTAATAAGCAAATGATATACCACGTGTATGAATTATAAAATTGATTTCAATAA--ATATTTAAAAAACCCACTAATGCGAC
>Pp1-87B 8250333 8250501|8443 chr3R 8246690 8251579 scaffold_20 2429295 2434156 + 126625|3974 4154
TATCACACAACTGCAGCACCACGAGCAGTCTTTTTCTATCTAAAACAGATCAATAAGAAATCCAAACAAGATACAAAAGATAAACACG---ACAAAAACAACCACAAACCCAACCACACAATC---------AACCAGAAATAAAATCCTTTGAAACAACACATCAAATGATGCATGAAAC
TAACAC--------------------------------------------CAATAAATTTCCCATACA------CACACACACACACACCCACACACACACACACATACACATACAAACAATTTTCTTTACAAAGCAGGCAAGAAACC------AATAAGAAATTTAATAATTC----AAC
>CG5641 8253511 8253609|8445 chr3R 8252031 8255150 scaffold_20 2434322 2437453 + 101030|1525 1634
TACAGACCA-AGCTATTCATTTACAAGTGTATTTAAATTCCCAACCCA----------TGATTCAATTGATTATACTATTCCCAAGTATGGGTTCATCCTCACCAATATT
ACTAGTCAATAGGAATTTTATTAC-ATTTTATTAAGAAACGTAATCAATAAACGCCGCTGACTTATGGTATCAGCATATTCTCAGTAATGGGCTCATCTTCATAGACACT
>Aos1 8258255 8258316|8454 chr3R 8257053 8258260 scaffold_20 2437577 2438749 + 45405|1219 1224
AAATTT
AAACTT
>Aos1 8258255 8258316|8455 chr3R 8258261 8259679 scaffold_581 108 1542 + 47216|0 65
ATTTACCACAAAGGGCTTATTTATAAAAATCTGAATATCAAA---------TAACACCAGTTGT-A
CCTAACC-----GAGTTATTGCATGAATAAAGTAACATTACATCATTTATTTCATATCAAATATCA
>CG17207 8263536 8264129|8459 chr3R 8262179 8264010 scaffold_3 719285 721044 - 49807|1394 1906
TGCACACATCGCCGCCCCTCCACATCGCCCTGCACGGCATGTCGGCCCTCACCCACACGCGTTTGTCGAAGAACGCATTCGATCTCTGTCTGGAATTGATGGAGGCGGGTGTCAAGTCGAAGGCCTTGGCGGACATAGTCCTGTACATACT------GAACTGCAAGAATGATGCGAAAT-GATTTATTCTTAGACACCATAAAATTGAAACTTTCCTA-------------------------CAGACACCTGCTGATTAGTCTTATCACGTACGACCTGATCAACTCAAGCCTCAAGCCTGGTCGTGATCACTCGCAGAAATCCCTTTTTTGATAAGCAATATCAGTTATAATTCGCACACACTATTAGCAACCGTCATAAATATATGATAAGAGACCAGCTACCCATTGTGCTTGGATTTCAATTTTCAGACGGGCAAGATAAATTGGCAATAGAAGTTTCCTTTTAGAATATTACCGATCAATATAT------TTAATCTTAGCCGAAA
TGAACAAATCGCCATCCCTGCGCATTGCAGTGCACGGCATGTCCGAGCTGATCAACACGCGCCTCTCGACCGAGGCACTGGAAATTTGCCTTGAACTAATTGAGGCAGGCGTGCAGCCAAGGGCGCTGGCTGAGGTTGTGCTGCATATCCTAGATCTGAAGGTGAAGAAGTACGAGAAAGAGAACGGTCCCATGCTGCCGTAGACTTTGACGCTGCCCAAGCCCCGAAAGCAAAGCCTAGAGCGCACATGGCTAGAGATAATGCTTATCA-GCACGAC---AACACCTGCAGACCCCAGCC--GTCTAGA-----CGCAACAAT-------------AACAAT-TCCGTCACAATCCATAGAAA------GCGATTACCGCACCAACAAAAT----------CCATCAATTGCG-----ATATCA----------GAGTTAATTATATTGTTG-TATATGTTTT---------TGTTACTATCGAATATATAACCCGTTGTATTAAGTGAATA
>CG5961 8284141 8284220|8478 chr3R 8282484 8286011 scaffold_13 2011016 2014540 + 115936|1713 1803
GTTAATTAGAATTAGAATGGATTTCTGCAAGTTGGAAATAAAACAATATGTTTTGAAACCCT-----------TTTAGAGGGGGAGTGGAA
---AATTTTTCTTTGACTGGCGACC------ATGTTAATAAAACAAATTGCATAGCGTTTCTCTAATTAAAAGTTTTTAGTGTGAATGGAA
>CG5608 8288284 8288382|8480 chr3R 8288241 8290562 scaffold_55 335069 337389 - 102967|44 161
CCTTCTTTT---ATGCATACCTTAT-TTATATAGCCTGTGATTCAGTGTGCAGT--------------CCTTTCATTCGCATATGTGTGTTTA-ATAAATTTGAGTCTAATATACTTT
TATTATATTTAAAAAAAAAAATTATATTATAT---CTGTGATTAAGCTAACAATAGGCATAAAGCGTAATTTTAATTGCAAGATTCATGTCTAGACATTTTTAAGCCTA----GCCTT
>Hsp70Ba 8291026 8291353|8483 chr3R 8290901 8291036 scaffold_55 338185 338320 - 3129|138 148
TGGCATCCCTA
TGGCAACACTG
>Hsp70Ba 8291026 8291353|8484 chr3R 8291045 8291122 scaffold_471 8558 8620 + 774|0 78
TAGATCTGTCCTCGAGAAATTATTTATTTAAATGCG-ATGGAGAGTTGGCGCCGAATCGAAAACTTTACGCGCTTAAAA
CAGATTT-TCTTTG----------TATTTAAAAGTGAATGAAAAGCT-----CGAGCCGGAAAGGTCATTCGCATGGAA
>Hsp70Ba 8291026 8291353|8485 chr3R 8291148 8291193 scaffold_21 1235632 1235679 + 747|0 47
AAATAGAATATATTTATTTAAAGATAATTGCGTT--TTTATTGTCAGG
AAAACAAATTTGTTAAATGTGAAATGTTAACATTAATTTATTGTTAAG
>Hsp70Ba 8291026 8291353|8486 chr3R 8291195 8293641 scaffold_21 1046950 1049400 - 111841|0 168
AGCCAAATAGAAAATTATTCAGTTCCTGGCTTAAGTTTTTAAAAGTGATATTATTTATTTGGTTGTAACCAACCAAAAGAATGTAAATA---ACTAATACATAATTATGTTAGTTTTAAGTTAGCAA-------CAAATTGATTTTAGCTATATTAGCTACTTGGTTAA
AGC-------AAAAGCATTAAA----TAGTATTAATTGTAACAAGTTA----AGATGTTCGATCTCA--CAACCAAAGAATTATTTATATTCCTTTAAGTATGTTTGAATTGAATTTAATTCAATAAAAATAGTTAAAATAACCTAGTTTTGAGTATTTACTTGGGCAA
>Vha55 8449481 8450488|8622 chr3R 8449373 8450630 scaffold_21 2970 4403 - 36957|118 1338
ATCCTGTTT---ATTGTTTTGTTTTTGATTTTTGTCCAAAATTTTGTTTCATTCATAATTTAAGCTGGCGGCGGCGCAACGTGCGGCGCGTCTCCACCTCCTGCAAT-ATCCGCTGTGTATGCGTCTATATATACATA--------------------AACCACAAT-TAAACCACAAAATATCTA-------------ATCTACG--TTGAGAGCCTGGATGCGTGTAT-CTCGGAGCCACCCAGCGTAGCCAAAACAATAACTAGTTAAATATCGTCCAAGC-------GAGC-AAACCTACTCTAAA---GTGTGTGTTTTAGTATTGAAGTCC-------CGTCTTGCAATGTACATAAATTGAATTGCCTAATGATTGTCGT--------------------------AACTCCCGCCAACACACTGTAATTT------------------CACTTGTTAAAGTTT----ACTATTTTTGTTAGGTTTTAAGTGTGTATGCTCTTTGAATTGTTTA-TATTTTTGTCTAATCA----------------------TTTTCGCATAAAGAATCGTAGCATTCCAACAAAAATTAACAATTGCCTACCTTGTGTTAC-----------TTTCGTCTGCTC--------CCCTGGTTTTCTTTCGTTAGGCGTT----------TCACCAGTTCGCACAAGTATTAAACAATCCCCGCCCCCTGTTTTCCGTACTGCCCCCCGTCCCTGCAC-------------CGAAACCTTGTGAACAATTTGTACAGCAACT-----CAACTAAACAATGGAATATTAAGTGCAAAAAACAATGCTTTAA-TGCAA-ATAATGTTTTAAATGCGGAAATCTGCAAAAAGTATAAAAATCTATAAAAAAAAATA----------CTGTTTGTTTTTCGTCTCTAAATTAAT-GAATATTACATAAAGTTGCATAAAT---TAATATATATTGTTTGTTGTCTCTG----------GTCACAAGAGTGAATGGGGAAGTCCTCTATAATATGGCCCAATCATTTCAGCAACGACAACTTAACTTAACAAC--CATGAACAGAAGCCGAAACAATAAG--TGTTGACAT-AATATGTATTTAAAGAAACTAGTTCATGTAT-ATGTATAAACTATAGAACATTTAAACGATG----AATAAACTACACACCAAATCATGTTAAATAAA
ATTCTGTTTAAAATTGTTTTGTTTTTGATTTATGTCCAAAATTTTGTTTCATTCATAATTTAAGCT---GGCGGCGCAGCGTGCGGCGCG---CCCCCTTCTGCAATAATCCGCTGTATATGCGTCTATATATATATATACATACATATATACACATTAACTACAATATAAAGCACGAAACGGATATTAATATTGTAATATCTACGTATAAAAATATTTGATTTGTGTATACATAGAGAGTCGAAGCGCAGCCTAAACAATAACTAGTTAAATATTCTCTAATCACTAAATAAGCGGAAACTATTTTAAATATGTGTGTGTTTTAGTAATCAAAAATGTTTAAATATCCTCAAGTGTACATAAACTCAAT----TAATTGTTCTCTTCTATTCACACTTTAAAGAAAAAACAAAACATGAACATTCACCTTGAAATTTTGTTGCCGACACATCGAACATTTGTTAAAGTTTAACCATTTTATTTGTTAGGTTTTAAGTGTGTGCGCTCTGTAAATTGTTTATTATTTCTTGATCATTATTGAGTTTTGAAATTTATTTCTTTTTTGCATACTGAATCGTAGCATTCCAAACCAAATTCAACAATGCATATTTTATTTTTTATTTTATTTTATTTCGCTTGCTTCGCTTACGCTCTTATTTCGTTTCGTTGAACTTTAAGATCTTAAATATCAGTTCGCACAAGTATTATACA---CGTTCTCCCCATTTTCTGGACCCGCCCCGTTCCTCGCACTCTGTTCCCTGCACCCAACTATGTGAACGATTTGTACAGCAACTAAACAAAACTAAACAATGAAATATTAAGTGCAAA----ACTGCTTTAAGTGCAACAAAATGTTTTTAA-ACAAAAATCTATAAAAAAAAAGAATACATATATATATAATTATATTGATTATTTGTTCGTTTATTGTCCTAAAGCAAATAGAATGTTATCCAAAGTTGAAAATATGCATAGAAAATGTTGTTTGTTGTCCGTGAGAAGGGTTCGTCGGCCGTGTGAATTGGAAAGGGATCCGCAACA--GTTGCATTTTGTTACTGCCAAAAATCT-GTTTAGCAGCAGCAAGAACA-ACGCAAATTCAATAAATTTGTCAACACAAACTTATATTTAAATAA---TATTAATGAGCAAAATTTAATTAATAAATTATGCAAATGATGAGTTAATAAATTACACAAAATTGCATGTT--ATATA
>mbo 8502208 8502614|8676 chr3R 8502251 8504797 scaffold_3 896142 898714 - 79190|0 413
ATTCGGATTGGGAAGCACGCTCTTAAGATTTCACCACGTTTTCGTGATAGTAAAGCCGTTGCGTAGAACTAAAACGTATTTTTAATAAACATGTCAATTAAGTCCTATTTTCGTTAGCTGG--CTTCTGTTTTTTGTATTCGATGACACTTTAATGAGCATACGTCAGCGTTTTCTGCTA-------GACGATCCTTCATGAAGACACAAAAACATT--TGATACCCA---TGGGTATTGTGCTACAAAGTCTACTACAGTAAAATCT--ATTCTTGACGTACTGTCCCATTTTCCGGATTATAGTTCAAAAAGTA--------AAATAATAGTAATAAAATAA-------------------TAATAAGAATAA-------AATAATGAATAATAATAGTAGACTTCATACAT
A-----------------AATTCTAAACATCCAATAAGTTAATGTATGTGT---GCTTTTGTTTTAAATTAAAGCAACCTTATAGTATTTCTGTAA---AAGTTGTTTTTTTTTTTGTTGGAAAATACGTTTTTTCTAGGGTTTTGTATTTTGAACATGATGTGTCTTGGATATTGATTATAATGGTAATGAT--TTGATTTGTTCATAAGACCGTTTCTGTCACTTACTTTGTTTAATATACTATTTAATTT-TTGCAATTTGTTTTGAGTTTTTAATTTGTTG----ATTTTGCTGCGCATGCTTGAAAAAAAACTCGAGGTAAATAG-AAAAATCGAATAAACATCGGGAATGGGCTTGCTGACGAGAATGACGCCGTCAAAGAGAAATAAAAACAACTAAATTCACATAT
>Su(fu) 8515589 8515753|8684 chr3R 8515445 8515618 scaffold_3 911526 911694 - 625|148 179
TATACAAACACATACATATA--CCCGAAACCA
TGTGCGAA---ATACATAAAACTCAAAAACCA
>Su(fu) 8515589 8515753|8685 chr3R 8515657 8517150 scaffold_3 911727 913299 - 64570|0 97
TGGTGTCCATTGGTTAGCTAGTAGTTATTTAAAT-TAATCGAATTGAATCTTCCACTAACGAGTAAGTTTTACATTTATACATCTCATCTAACACAAT
CTGTTTGAAAAGCTCAATTCTTAGTATTATACTTATAACTAAAATGAATCTTCCACTAACACGTAAGTTTGAAATTTTACTTTTAAATCGAATATATT
>CG31347 8517705 8517840|8686 chr3R 8517353 8519942 scaffold_3 913322 915988 - 91805|403 559
AGGGATT------CCACGCAAGCTTTATAGACCAAATTCCCCGTTTTCGCTGTCTTCACTTCCGAATTGAACCATCTCTGGCGTTTGCGGAGCTATT-----CTCTCTGGGATTAGTCATGTTGGCCATTTGAAGACGGCTTGAAAG----------
CATTATTTTGTTACTCTAAATATTTTCGATGCTAAATT-----TTTTGGGCACTTTCAGTATATAATAGTAAAA-ATCAAGCTTTTG----GCCATTAGTCATTCTTTACAGTTGCATACATAAACAGTTGAAATGCTGTTAAAAAAAAAAAAAAAC
>Men 8538819 8539193|8701 chr3R 8538774 8540932 scaffold_27 1493197 1495498 + 92905|45 551
ATGATGGC-----CAG---------------------ATGATGAGGATCCATTCC-----------------------GCCTAAC-------------------CCCAGAAACCAAAAGGAGTGGCCATCAAAAGATATCCGGCAAGGGCGGCG-----AGCAGTAAC-----CATGTTATTTATTTTATAATGTCGCACATTTGTCGTCTAGCATAATATCCAAATTTGTATCGCGGCTAATTAACC-ACAACCACACACTATCC----------------------------------ACCAACAACCATATTATAAAAAAAAACCAACTAAAATGGAATGTCATCAGCTTGCGGCGCGCGATTTTGT-ATAATGCTAACTATGTAAATGGGATATTGATCTAATAGATA------TGTAAACAAATTTTATGTAATCTTGAACAACACAAACTATTCTAAGGA-------TATATACAAATAAAG-AAATA----AACAAAAAT
ACTACGGCACATTCAGCTACTCAACTCGTCGTGCACCAGGATATTCATCCTTTCCTCACGTTGTCGTCGTCGCGTTCAGTCTGACATTGCAGCATACTTTCCATTCCACTTGCTTCTATGAGTTGCCGTACGAATTTAGCCG---CGGGCATCAACACCAGCAACAACATGGATATGTTATTTATTTTATAGTCTCGCACACATCCTTTTTAT--TAGCATCC-----TTTAACACATGTAATAATCCTACGAGAAAGCTCTATTCAGTTTGTTTGCTGGCCCAAGTTGAAACCGAGAGAACACACCACGCTGATATATAAAAAGAACAAAAACAAAAAAGTGT-ACTAACAAAAGATAATCATTTTTATGATGCTGATATGTTTGTAAATGGGATATTAATATGATAGATATATTTGTGTATACAAATTCTATGTAAACGTG---AACACAGACTATGCTAAGTACATAAGTTATATAAAAATAAAATAAATAATACAATAATAAA
>CG10126 8681260 8681387|8896 chr3R 8681022 8682919 scaffold_27 1673512 1675274 + 35264|239 382
-TAGTGCGCAAATCTC--ACTGAACATTTTAATCTC--------------AATCACTTTACTTGCCTCGAATTTAGTCCTGCTCATGTCCTATTTATACACTATATACAGAAAATAAATAAAACGTCTGGTTGCAATTAAATAA
GGAGTCCTCCGAGCACGGGCTCAATATATAATTCTCTGTCTCGAGTATCTAACTATTAAAACAAACTAGTCTTTAGTCCTGTTCATATCTAATTTATGCAC-------------------------------------------
>granny-smith 8775764 8775917|9034 chr3R 8775762 8776272 scaffold_518 62 567 + 12601|2 163
CTCAGCCTGCCTTTTACTGTGCCACGTGCCTGACTGGATTAACATTTCCATCATTTTCTTTGCCCAATTGCAATCCGGCATCAGAAGTCAATTTGTGTA-----GCCGACAGGCATTAAAAAATCAAT---ATTATTTAGAAATACAAGAAGTATGAAATTT
C---GTGCAACAATTGCATTGCTGTGAAGTGGAGCGTTTTTGCATTTCAATCAAGTTTAATACACA--CACAAACACATATACGGA-TAAACATACACACACATGTCGAAATAAGTTAAAAAGCCAATTGAATTATCTGCCAGGCAATGAA--ATGAAATTA
>CG7381 8793490 8793904|9056 chr3R 8793522 8793806 scaffold_523 1298 1572 - 475|0 301
ATTTGGGGATCGGCGGGAGTGGCCAGTATTAGCCAAGTTACTGGCAT-------GGATGCAG-----GTCCAT---GCGCAACGTGAATATA--AATCAATTAGTTCGTAAGTTGATATTTAGGAGTCGAAGCAATATAAATTTGGAGAAAGGGTCCTCGGAACGGAACGACTCTCGCTTATCTAATACGGCTAAGTGTAATGACAAATTATCTGTAAGTTTTGAAGTTAAACCGCTTGTTGCTAGGCTAAGCGAACAGTTTTTAACCAAATTGTAATATATACATCATAATAAACTAAGGC
ATATTGACGCCATATAAACTGGATAAAACTGACCCGGTTGCAGTCTTTTAAGGCGCATGCAGTATTAATCAATAAGGCGTGGCATGCATATATTAATTAACATTATATTAAGCTAACATATAGAATTTCAAGCAATAAA-----TGATAATGCATAATCAGTGAGATATT-TGCTCGCTTCTATCAATTAACTATACCTTAAGTAAAACT-----TAAAATT--AAGGTTGATCAAATGTTGCGAAATTGA------------CAGCAAAATTGTAAAATATGCGC--TAATAAATTAAGAC
>CG7381 8793490 8793904|9057 chr3R 8793872 8794061 scaffold_523 1652 1829 - 6255|0 32
AACCAAACCAAAACCTAAATCCTTTCACCTGCG
----AAATGGAAAACTTCTCCCCCGCACCCAAA
>yellow-f 8817171 8817263|9081 chr3R 8816005 8817264 scaffold_482 4573 5950 - 33168|1274 1424
TTTGCGTGGAATTGCTTTAATGAATTTTTCGCA-------TAAGTAATA------------TGTTTATCGAAATAA---------------------------------------CACACGGAAACTTATTAATAAAATAAATCAAAAAGC
TGCATATGGAATTGCTTTAATGAACTTTTTGCAATAAAGTTACATAATAATATATTATACTTGTATGTTGTAATAATGTAATAATTGTATACTGACAAAATATTAACACAAAAATTATATGGACATATATGTCTAAAACAAATTAAAAAGC
>CG17327 8822590 8822643|9087 chr3R 8821073 8823247 scaffold_1 4152034 4154309 + 72495|1658 1728
-CTCTTAGGTTTATGC----------AACGTTACA---AATAAAGTACAAGTAATCAACAAGTGC----TC
GCATTTAAACTAATATTTGTTGTTTTAATATTGTACTTAATAAAGGA--AGGAAACAACAAACCCGATTTG
>CG8031 8834106 8834405|9094 chr3R 8833810 8834121 scaffold_13 10998 11309 - 5528|310 325
AACTTCCATTTGAGTT
GAGTTCCATTTAATTT
>CG8031 8834106 8834405|9095 chr3R 8834295 8835595 scaffold_13 11310 12642 - 53756|0 131
AAGCAC----------TCAAGTATTTTAGC------CACTCGACGGCAACTAATTCT-----TGCTATTTAAGCGTAACGTTTTTATATTTACTAGCATCAAATTGAAAATTTAACAATAAATCCAAAATCC
AAACACAATAAAAACAAAAAGTATTTTCTCTAGGCTTATTTAGTTGCGTTGGATTTTGTAGCTGAAATTCAAGTTTTATAATTCTAATTTT--TAGCAGCAAATTGTA---TGAAGAATAAAGCCGAAAATC
>CG12360 8852747 8853022|9117 chr3R 8852780 8855575 scaffold_13 30419 33172 - 83992|0 271
ATGGACCAAGTATGAGGCGACTGTGTACACTGTGTCTGCTATGTTAATGATTTTGTTATTAGTGACTAACGAATCCCTGCGCTGATTTACCATTTTGGAGT--GCGCTGCTGAAGCGAATTAGTTTTATTTTTCAATGATG-TTTTGATAG-ACTCGTT-------------TATATACG---AAATATATCCATGGATGTATATACATA------CAAACCAAACAGGAAAGACCACA---ACACATAATCTTAGTTTTTAAACACCCAAC
--------------AGTTGATTGTGGACCATGTTTCT-CGATTTTGTTGACTTTGTTTCTCGATTTTAAGTGACACGCCCGC------ATCAATTATGAATGGGCGTTGACGATATG-ATAAGTATTGTGAGTACTTGAAGCTTTTGATAGAACGTGTTTACAACACATAAATATATACATATAAATATATATATATATATATATATATATGTGTGCAAAACAAAAAAAAAAAAAGACATTCAAACATATTCCTGG-TTTTAAAAACCCAAC
>snk 8865881 8865920|9125 chr3R 8865806 8867454 scaffold_13 41672 43319 - 58239|75 114
TTTCATTTTATTTTATTTATTAAATATGCTTTTTAAAATT
---------ATACTATATAACAACTATTCAATTAGAACT-
>CG7966 8875120 8875168|9131 chr3R 8874026 8877491 scaffold_13 49981 53488 - 83720|1215 1269
TCTTGATTCCAATTTTGTAAAGATTT------AATAAACTCATTCTTTTAAAGGT
----------AATGTTATCAATATATCCAACCCATTTACCTATATTATCCAAGTT
>CG8483 9034470 9034878|9310 chr3R 9034456 9035532 scaffold_13 261011 262218 - 30206|14 545
GCTTTAAATCTTGCCAATCCATTTGCCA----------------ATCTAAAATGCCGCTCAATGTATTA--------GGCCATTAATAGCTACTATGTAGTGCCATTAGCCAACCACCAGGATCCATCGTCATCTCTAACACCTTCTGTCCATCGCCGTGAAACCCC----------------------------TAGCAAAT--------------CCTATTTAAATACCCC----AACAATTTGCCATATGAGCTGAAGTAGTTTCACTTCTTTGGAATTCCGGCTTGTTGGTGCCAGAACATAGAAGAA--------------------------GTGCTGGCGGCGGACG---------------------ATTCATGCCACAGACGAATATTTGTATCAAATGTTTGCCACCCACCAAAACTGTCATCCTGTTAAAAC----CAACCAATCGGCATTCAACATCGATCAGCTAGTTGTAGTATTGTGTTTAATAAAACAAGAATATTGATTTGTAAATT--AATGCT
ATTTGTGAATTGGTCTTTCCCACTGCCAGCCGGCACTGCCATGCACCCAATATGCCGCAGAATGTATTAGCTCACCCGCCCAGTAATTACTACTATGTAGTGTCATTA------------GAACCATCTTCGATTCTGA-ATTTCCCAACTACCATCGCATAGCTACTCGCGTACTTGTTCTATATACATATATATAGCGAATAATAGGCTCTTATACTTATTTAAACATTCCCATAAACAGATTGCCATATGATGTAACATACATT-GTTTTTTTAGCATTATGATTTGCTTGCTTTGCAATTTAATAACATATTTTTTAAATTATTTATATATATTGTATTATTGGATAACATCGAAAAGACCTCCATCGTTCAGTCAAGCAACTACCGAATGTTTGTATCAAATATTTG-----TAACAAAATTGCAAT--TTTTAAATTTTTGTTTTTAATCGGCGCCTAACAACAACTAGTTAGTTATATAATTGTGTTCAAACAAATAAAAACAGCAAGATGATATTTTAAAGGAT
>Ace 9053962 9055379|9330 chr3R 9053580 9055071 scaffold_13 283097 284701 - 8241|474 1825
CCAGAGACCACTGTAGCCACAT-GCCACACGCCACGCGCCATAGGCCAGGCCCAAACCAAATTGTTTTTTGTGAAGCACAATGCTAAATCGCTTAATTTGAAAAA-----TTGGCCAAGGGATGGGCGGAAT-----------TTTTGATAAATATTAATGCAGATAGAACTAAA----------------ATGTTTGTCATTTTGCCTTTGCGGCAGCCAAAAAGAAACAAAGTTTACAGATACTCGTTTACCGAACGGAAAA---------CTCGCTCAGATGACAGACACTTTAT----TGCCATG--CCCACATTCTTGAGCGATATTTGAGCGCATTTAATGGCACAATTTAAGCATTCAGTTCAAACCGGAAAAAAGTCCTTGTTGCCTGAAGATAGTTGGCCA--------AATTGCATTGGTTTCATGCTTAGGTTGAG---GGTTCGTTTGATTTCG--------ATTCACATTCCCAAGGAAAACTAT-----------------ACTCGAAAA------TTGTAACCACTCGATTCTTATGAGAAACCCCAA----ATGGACATTTTCGGAAAATCAACAATTGTATTGTACAAA----------------------AATTGGCATTGGTTTATTAGAAGAAAACTAAAAGTTAAAACCAAAAAAAAAAACGCGGACTAATAGCCCCAAGCCAAGCACTACCCAAGACAAATTTTATCGAAACAAATTTAACAAATTGTAATAAAGAATCGATCGAAAATGTGTTGTAAGCGTAGTACGGGGCAAAGACGAAGATGATATTTATAATGCAAAACATATCAGTATAT------------------------------------------------------------------------------TATTGTATTTGTACTAAACGTTTTACAAATTGGCTTAGTGAGAAAATTGGACGGAGGAAGATGAAATGATTTAATACTAAATAATGGTAATTATAAATTTTATACACATAGCGAAATTGGATCAATGATTAACAC------AAAACGTATTGTATGATGAGTAACGTATATGT-----------ACTTGGTATGTCTATATCTATAAATAAATATTGTTCAAA---ACGTAAATCCAACAAAATGA-----------AAGATCATTGTCAACCC------------TAGAGTTCAGTGTGTGTCGCAGACTAAATGAGAGCTAATGAGTAAAAGTAAAAGTAAAACGTAAACGTAATCGTAATTGTAACCCGTAATCGTAACCGTACTCTGTAATCGTATTAAAGGCATATCAATAT--GTATTAAC---TATGGAA
CCAGAGAGTAC------CACATAGCTACAC---ACACGCAAATACACACACCCGAACACA-------CTTTTGTAGCACGCCGC-AAATTGCTTTGTAAGAAAATGAAATTTGGCAAAAACCCAGGCCCAATAAAATAACTGATTCTAACGAGAATTCAATCAAGCGAAAACAAAGATTTTGATAAATTGAATGTTTGTCATAT-GCCAGCCAGCAGGGCATAAAACAATACAAATTGAAAATTATAAACAAACAAACAAACAAATTAACACATTCGCTTAGAGAACGCGTATTTTGCCAGCTGGCATGGGTCCAAGTCTGTGCCCAAGCCGTAATCCCA--------AACATTTTTGGAAT---GTCGAGTATGCTATAGAGTTTTTTCGATTTTTTGATAGCCCCCGACCCCTCACAATGAAACTGGTTTCAGATTTGTGTTGGGAATGGTTCAATCCTTGGCATATACAGTATTTTTTCTCTCTCGGTATTTTATTGATTTTCACTTTGGGCACACCAAAAATGTTCTTATGACAACAAAATT--TGGAAAAAACCACAACAAAATTGAAAAATTTAGTAAAT------TTGTATTATTCAAACGATGTGGGAGTTTTAACGAGAAATTGCAATTTTTTTGTAATAAGCAG---------------------------------------------------------CCCAAGAAAAAACGTTGTAAAATCGGTAAAAAAAAAAATGAATATAAATTGAAATAAAGTTTGTAGGAAACCTATT-------------GAA----ACATTTAAATGGCAAAACATATCAGTATATATTATATAAACAAATATATATACAATAAATGTAATACATCTATATATATATAGTATACATATATGTATGTACATGTATTATTGCATTTGTACTAAACGTTTTACAAATTGGCTTAGTGAGAAAAACAAA---AAAAAAATCAAGTAAATGGATA-----------TAATTAAAAGTTTTATACACTTAGCAAAATTCGAACCAGAAATAAAACTAAAGTAAAAAACAAAATAAAATAAAATACAAATGTGCTGTATATTGAAGTTTGGTATGCCTATATCTATAAATACAAATATTTCAAATAAATATAAATGAAAGAAATTAATTATAACAATCAAGGTAATTGTCAAAGCAGCACATACTTACATAGCTCAGTGTACGTA------CGTATGGGATCTTATTG-----AGTGCAATTAGAATG-------------AATTATAA----------------------------GTCTTAAGGGCATATCAGTACTCGTATTAACAACTATTGAG
>Ace 9053962 9055379|9331 chr3R 9055120 9055587 scaffold_13 284880 285403 - 5938|0 313
AAGAAGAC-----------CACTCCCGGAAA---ATACGACATATACACACAAACTGGAACACACACTCACACACCCCATCACAACCGCAACCATACACACTTAAAGTTAGAACACGTATATTAATAAAACCAAATTTTTAGTAGGCGCAGACATTTGTGTAGGAGCAGGTGATTTGTTTACAGAACTTAGTAGGATCG---------------------GTTTGAGCAATGCGATGGTA-------------ATTGCTGAACATTTGTAAATTGAAATTAGAGCTCTACGCACCCTTA------GGCAGTCAG
AAGAAAATTTTTGACAGTGCACATCTATAAGTCCACAAGACCCACACACACAGACACACCCACACACCCAAACACCCTTTAAGCAAAGCAAACA--------------CAAAACATATTTAATATGAAAATGAAATT-------GTCATAAAAGTATGTAAAGAGCTAAGAAA---GTAAAAAGGAAATAGAAAGAGGGAGAGAGAGATGGAGTTTTCGAATTTGAGCCATGCTTTTGTATACTTGGCCAAACACAACTGAACATTTGTAAA-TGAATTTAGTGTTGCATGCAACTGCAACGTGTGGCAGTAAG
>Ravus 9088454 9088580|9373 chr3R 9088517 9089791 scaffold_13 331415 332829 - 32106|0 70
ATTC-ACCTGGACTT------TGGAATCGGTTCCAAACCGTGCTCAATACGGCAATTAGAATATATGCTAG
TGGCGACGCGGGCTTAGTCAATGGAATCAGTT-CAAATCATACTC---------CTTAACATAAATGCGAG
>CG8449 9094859 9095041|9376 chr3R 9094937 9095571 scaffold_13 923360 923992 - 21914|0 120
TCGTAAGGTCCACTCCTAACGACTGAAACTGAATTTAGACT---TAAACA----GAGCAGCCACAAAGTGGATAA---ACCGGAATTAGTAAGGATTATA------ATTAAAAGACATAAA
CCGCCGG-----CTGCCAACGACTGAATATG--TTAAAACTAAGTGAACAATTTGTGAATCCTTAACCTTAATAATTCATTTTTATTTGTATGAATTACAGCAGTCATTACAGGAAATAAA
>CG15887 9113371 9113718|9393 chr3R 9113552 9114049 scaffold_13 943792 944233 - 23994|0 166
ATGATTTGTTTCGGTTTTGGCTGACCAGGATGACAATGCAAGACCAGGGATAACGGCGAGCTGGTAGCGAGTCAGGATTCAGATTTACCTCAGCCTCAGCGAGCGTTCAACCAAATAATAATTTAAGTATAGTTTAAATTATTTATTTAACTTATTTATTTATTACA
CAGATG----------------------------GAGGCGTGTCGAAGGAT-TTAGCGAGCTGGTAGCAGGCCACAAAGTATA----------CCTCAGCGAGCGTGCAACCAAATAATAATTTAAGTTTAGTTTAAATTATTTATTTACAACGTTTATTTAATACA
>Wnt8 9117774 9117930|9397 chr3R 9117614 9117785 scaffold_13 955476 955638 - 465|161 172
CATATATCATGC
CAGCTCTCATAT
>Wnt8 9117774 9117930|9398 chr3R 9117786 9119447 scaffold_13 955990 957719 - 57600|0 199
ATGGATGCTCCACTGGAAATGGAATCCAGGATTGGGGCGCTGGTCGAGTC---------------------------------CCACGAAAACTGT------------TTACCTACATTTAAGTTAATTTATTTGATTCCACCTCTAATTTATTACCACAACAAATGCTAT----------CAATAAATACGTTATTTAA
GAGAGTGCGAGACTGAGA--GAAATGTCAATTTGGGGCGCTGGTTGAGCCACGCAACAGCCACAACAACAGCAACACCAACAGCTACAACAACTATAGCTTTAATTAGTTGCCTAGACTTAAGTTAATTTATTTGTACCCAGCTCTAATTTATTACCTTGACAACAACAATAGACAAACAAAAATAAATACGTAACTGTA
>CG8795 9154787 9155059|9424 chr3R 9154958 9155690 scaffold_13 993610 994488 - 10467|0 114
AGGGGGTCAGCATATCCTCTATCTGTACTCGATAAGCGAGGTAGTCCATTCCAGTGCCACCTACGTAC--ATT-----------ACACACACACACAACTGTGATACGAGCAGCA
CGCCAAGTGGCGTTTACTGAAGGCACTTCAGCTCGTTCAGTCAGTCCATTCCAGAGATCGCGGCGCCCGGATTGGGGCCAGGGGGCAGGTACTCGTAACTGTGATAAGAGCAGCA
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AG---CGTTGCGATCGGAGCTTGTGAGCGTTATCGAAAGTATATGCATAAATATACACTAATAATCCATATTGAATATTAACTAACTAAGTTATTAGCAGCTGCATAAAACAGATTCATATAATTATTCTGTTTCAAGTTGTTAAACATAGACAGAAATGCGCTCTCTCGGAATTGGTATTGGTCCAAAATTGAACTTTCTATAAAAATGAAAACAA----CACAATTTAATTTCGCTT-----TTATC--AAGTGTAAAATAGCAAA--ATACTCTCGTGATATTTT-TGGCAAGTTAGAAAGTGCGAGAAAAGGCAAAATTTTTATATTCAAAATATATGCGAAATATGCATGAGAAAATCAACCAAGCAAAAGAGAGACTTGCGCT--------ATTTAAAAATCAAG----------TATATATATATATTTGTAGATTC---------------------TTGGTATGCTTGCTTATATTTGATATGAGTTAGTTGGCAACAC---TTAAGAGGTTGAAGTTGATGATAATGTTCTTTGTTAGCTGAGGCATCGTTTTTTGCTCCCCCTTGAATATTTAAAATGAAGCAGGAAAGGGCTTTAAGTCCGCATATATCAGTAGCAAATAGAACTGCTTATATACATAGATATATACTTTTTGTTCGATATCGTAAGTCCCCAGAT-----ATATATATATATATATATATATGCATACGTACATGTACCCTAGCAAGGAAATACATAGCTAACAAGTTGCTTATTGATTGAGAATTGTTTAATTATTTGTTGAATTACCTTCGTTTTTTTTTTTTTGGCCAATTAATTCAAATGTAAAATGTGTATGTG---TGTATGTAGAAGAGAGAAACAAAAGAATTATTGTTTCAAATATACATTCTAATAATATATATGCTGTATAT-TGTTTAAAAACA
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AGGCAATAAAATGTAGGAATTAAATAAATTGCTTATTTTCTAGTACG
ATGCAAGATACTATGTGAAT--AATAAATTACCAATTTT--------
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A
A
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TTT--GACATATTATTTCTC--TACTTTCTACCATGTTTGTAAATAAATTGGTAACACATTTAAAAACTTAAC
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TTATTGTTTAA------------------ATATAAAC---ATTTTTTATTTAATAA-----GACTATTTATATACATAAGAATATAGC------------TAT----GACAACCTTAGGCAACATTCTTTTAAGCATTCCACATAGCAGCAACATTAAA--GACAATGAGAGAGCAGGTCCAATCAAAATGAAAACATAAAGCTATATTGAAACTGAATATGTTATCTGTCCATTAAATGTGCCTTAAA---TTATATTTACA--CCATATGTACGTTATGTGTACT----CGTCAGCGTGAAA---AGTGTGCTTAACGAAACAGTGTACTTAAATCTTACATAATGTATTCAATTA--AATAATAAGTGTATAGACTGGAATTTTAACCAAGCA-----AAGTGATGT----CTTTCTGCTTAATATACAACGCTCTATATTATAGCTAAGAAATGGTGACAAATGAATATATATATTTTTTAAAATTGCAGTATTCAAATTAACAGAATGAAAAAGAAAAAAGAAAACAAAA----AAAATG-AACAACGATATTGTCGCAGATTTTA-----------------GATTGAATATTAT-ATACTTATATTGTTGCATTCAATTTTAAATCTGGAGTCAAGCTCATGACGTCTAAATGACAGCTAACTGAACAACTAC------TCATATACAAACATATACATATATACTAAAT-ATCAATTGT-TAAGTGCAAAGCGAGCATTTCCAATTTTT-----GTATACAACTTTAAAATACAAATGCATTTCTATAATTAAATGTAAAATAAAAGTGCATAT
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AT----------------CAACTTCAAAGTGCCTC-----------------------------------ATGTGCGTGCGAGCGAGTGTGCGGACTTTGATCTGCTAAATCAGTTGGTAGCTTTTTGTTTGGGCCCATAACCGAAATG---TTATGGCCGCGTGCGGCATCGCCTTTAATTATAATGTGTACACGAAT-TATGTATTAAGTGCGCCTTTCGCCAGTCTCGCC--AAGGCAACAGATGCTGGGACATAATAAAAAATAAAAAGTTTAGCCTCAATCTTGACAGCTCCTGCTCGAGTTGGTTCTTGTGTATTTAAAAGCATAAATAAATTTGAACTTGCAACACCTACTGCCTGGCGTCTGTCAGTAGTCGGGCATCGAAATAAATATTTG
ATCTGAATCTGGCCAGAGCAACTTCAAAGCACATCTGTGTATAATATATGACTTAAATATGTATCTGATTGTGTGTGTGTGTGTGAGCGCGCGTGCTTTGATCTGCATAATT--TTCACTGTCTGATGGTTTAAAGCACGACCAAAAAAAGTTTACG--TGGATGCCACATCGTATGTAATTATAATGTGAACTCATTTCTATGTACTTAGTGC----CTCGCCA-TCTCGTCCACAGCCAACAGCTGTCAGGGCA-----------ACAAAATTTGAATATGAATGTGATATTT----------TTCACTTTCCAGCAATCAAAAATAAAAACGAA---------ACAAAATAAATAAATAAAAGTTTATTAAAAACTTAACATTTTAACAAGCCCTGA
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AGTGCTTAGCAATAAACGTATCCAACTTTTAATTAA--------------------GCAAATACGAAA-------CTTGTTT---TTGCTTAAGCAGCGTCTCTTAAATTGTTATAAATACTTGTAAGTGGCCCTGGCAAAGATTATTGCTTTC--AGCGCAACGACTAAGCCATCCCATAAGATGCGCTCTTTCATGTTTCTGCGCCTGACGTTAAGTGTGCTGCTATTTGGC---TTTGTTCTGGAAGCAGCAGCGGATGCGAATGCACCGCAGCTAGCGGAAATAGGTCAATAGAATGTT-------------GAAGAGCTGCCGGACAAGTCACACCATGAGCGAGTGCGTCGTCAT------GGTTTTGGATATAGACCTGGATGCAACATACCAGG------------------------TTATTATGTAGG---------------CTGCTTTTTACGACGTCGTT------------ATTACGGTGGATACGATGGCAGCTTCTTTTCCTTTGATCCAATCTATGGTT-------AAATCTTA-----AAAGGAGCCCAATTTTGATTTTTAAATAAAGGCCAAGACAGTTAAACAAACGGACAGATATAGACGCAGCTGATGCATCAACGGGTTAAT-------GTTTGGCTGAGCTGCGGGCGCTGGT---------AGATTTTTATTTCAAATCACGTTGAGTGACA-------------CAGGACAAGAAA-CTTAATCAGTAATGTTAACGATGTCAG--TTGGAATCGCCGGATGGCGGCCTGTGGCACACAACGGGTTTGTTTCGGGTCGCGTTGCCGCATTTTGTTC-----------------------------------------------------TAATTCATATGCGTTTCAAGTTTTAATTACGTGGTGGAGACGAAGAA------------------------AAAGAATGAAAATAGACGAGAATGCGAATGTGGATGGACGTCTTCTG------TCTTGGCTTGACTGACAGCAGGGCAGGCGGCGTTGCA----------CCAACATGAAAACAACAAAATACGCCCAATCAGCGCAGCAAG-AGCGGAAGCGACACGATACACAGGACACAGATACAGATACAGACAGAGATACAGATACAAATACAGATACAGATACAGAGACAGCTACGGATACAGCCACAGAGGGCTGGCAAAAAAAGGGCGAAAAAATTAAGTAGCGAAATCAGCGGGCAAAAAA
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AATTGAAGTGTTAAGTCTATGT-------------TAAA-----------------TAAAGCCAAAGCGTAATGGGACACCCTGTAGTT
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ACAAACATTAAGAGACACACACACACACTCACACATACACATACGAAATACAGATAAAACGGCAACACAGTTTAATAGTAACAGTAAATACATTATATAAAATACAATAGTCGTTAAGTATTTGTTTAAACTTAATTAATTAATAACTGTAATATGTAATGCATAATTATCATAAT-GCAACGCTAGGCAGCTGGCGCT--CCTGCGGTGCGGGCGGGC
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ACTCAATGTAAT------TGTATTTCATTTGAACAGCATA--CTACAAATCCACACAGACACAGACACC--TACATCCACTCACACACACAGACACACACAACAACGCCTATAAAGCGACTGCAGGGCAGACCTCATATTCTCATGGCAAGTCTAGCGGCGCAGATATACAACCACAATACACACTTGTTGTGTGGCACCATTCCAACAACAACAACAAAAACAACAACCAACACCACAGCGGAAGCGGCAACTACAACCTGGCCAAGAAACAACGCATCTTTTATATATATATAAATATATATACACTAACACACACAAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGGGAAAGAAATATATACAGGATAGAGAGTTAGGCTTGGAGAAATGTAATTTTTTTTAGCAAGTGGCTAATTTTTCATAGCCACACGCTCGTTAAGCCAGCA--------------------------TTGCCCACCAACAGAAAC-----CCCACACAGTACCACAATATTA-----------------------------TGCTACACTCACT-TTGTGTGTGCGCGCATGTGTGTGTGTGTGTGTGTATGTGTGGGGCTAAACTAATTTGTTTTTTTTTCTAATGTAGTCTCATACATTATGCGAGGTAATTGTTTAACTTGTAAGCAGG---------GTCAGGCATACAGGAGATTTACCCAAA
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AAAGTGGGCAGGGGGCGTGGGCATTGGGTATCTCGCAT-TCTCCGGATAACTGCAAACTATTTGAATTTTACCTAGTTTAGTTTGTTATG
------GGCGGGGGCCGTT----TTGGAGTCCGAACACATCTACTTATAACTGCAAACTATTTGAATTTAACTTAGTTTAGTTTGTTATG
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GTGG----CGGACGATGGAACGCAGTTAA--ACCCAATTTAC----------TGCCACAGTTTAATGCTATTACTACAATAATTTGCAGGCG----------ATTCCGTTCAAGATATTTAATAA-----ATAATAAAGCATACGGGTCCTTTTGA------------------------------------------GACTTAAAATCGTAAA
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GTAAACACACATAGAGAGAGAGAGTGTGTCAGTTCAAGCTAGACGACAAACAGGCAGTCTAGGCAGGCAGATGCAGAGGGACAAGCACATTCACAGGCAGGCAATCAGTAGCATGTGTGTGTCAG--------------ACCAGGCAGACAAGATCA-GAACCAAGAAATCAAGATGCAG--AACCAAGAACCAGGCCGTGCGCAAATGCAAACGATAAATCAATCAATCAGGTTTGGGTCCGGCCGCAACCTGCAGGCTATAGCCA--TAATCCACTTGTCAAAAGCACCAAGCAAATGATTATGCGTCAAGCAAAACAGCCAAAAGCGAA-------------------ACGAAACGAAATCCAATCGACGCCACTTGTCCACAGTTTGAATGCTGCTATC---TCTCTTTTGTA---ACCATTAATAATTCGCTGATCGATTTATGTTTAGGGTCCTAAGAACCCCGAACGCTTAGTTTTAACCATAAACAAACAAAAGAAACAAACACAACAAAATATAAA--------------------TTAAAC--AATAATTTTATTGTACAAAATTGACTACCAACTGAGCG------GCGACGGATTCTCCTTGAGATTCAGTCGTT-------GTAAGGGTGTT-----------------------------------------------ATAAGGTAGAGCACTTT-------CTTTATATT-----------TATTCA-------------TGATTTTATT------------GTTTTTAGCGATCCAGCGAA---------ATGTAAGAAATCAAATAGTACCATATTTTGTAATCACTTTTTTTGTACAACTAAGA-----ACCTTTATGATTTGTGGCA----------------AGTAAGATCCCAACTCCTG--AAATGCGAATGCCACGC----ACATTTGTGTACAGGCTGCACAGTGGCCGAGAAATGGTGTCCTAGCGA--GCAAAATCCATATATG-----------CATACCAA-CTCTGTTAGTCCCTAAGAAGTAGAT----GCTACGTTAAGCCAGACTAAAAAGAAAAACGCTAAA--CAAATATCACAAA---CATTCTGTAATTAGTTCGTTACGA-GTGAAACGAAAGCGACAAAGAGATACAAGCAAAATAAAATCCTAACCAATGTTACCTACCCACCCA
GTAAACACTTACAGA------------ATCAGTTCAAGCTA---GACAAAAAGGCAGTCTAGGC--GCAG--GCAGTGAGACAGG------CAGAGGCAGGCAATCAATGACA-GTGAGAGGCAGTGAAATTTGGGAAAGGCAGGCAGACAAGATAATGATTTAAGCAAGTAATCAGCAGCTATACAGAAAATGAAGTGTATGCAGTT-----------ATCAGGCAATCGACATTGTGTGCCCTCAAGACCAGC---CTATAAGCAACTAACTAACCCCGATAAAAAACAAAGAAAGAAAATA-ATATCAAAACAAACAATACTAAACAAATTATGTTTGATATGAACCTGAGAAACTCACTTCAACCAA---CAAATATCAACAATTT-ATTGCTAATGTCTTGTCTCAATTATACATACATTTAAT--TTTTATGATCAATTCGTGTTTAGGATTTTAAGAACCTTGAACGCTTAGTTTTAACTAAATTAACACACCATACAACAACACAACAAAAAACAAAAACCTATCCGAAAAATATACTAAAACTATATAATTTTATT-TATAAAATTGACTATTGAAAATGCATCTTTTGCAAC-AATTCTCTTCGAGAATCGATTGTCCATATGGATTGAGGTGGCCGAATTGGTGGCCTGCAGTATATATATACATATATATAAAAAAAAGGAAAAGGTAGTGTACCTTAAATTCAATGTAGATTGTAGTCGACGATGCTCAGTTTATAAAGCACTGATCGTACTTTACACATATAATTTTTTAGAAAATCAGCAAACAATTTTTTAAGTAAATATATAGAAAGAAACCTATTTTGTAATAAA-TTTTTTGTATATTTAAGCTTTTTATATCTATGATTTATATTATCTGAGAAATGCCCACAAAAGGAACCAAATATCTGTTAATTCACAAAGATACGTGAAAATGATTGTGCACATTTTTTACATTCATTT-----TTATTTTCCAACAAATGCATAATATGAATATGCATTAACGTTACATACCAATTTTTGTTAGTGTATAAGACGTATATAGCAGCTATTCTGATTGATTTTTGGTACAAAAGAACTAAAAGTAAATATCATAAAATTTGTTCTGTAATTAGTACGTTACGAGGTAAAACTAA----------AAACGAAAGCTAAAAGAAAATAAATCTAATGT----TACCCACCCG
>Hrb87F 9484184 9484188|9754 chr3R 9484123 9485377 scaffold_29 221952 223201 - 57936|70 74
ACAAG
TCAAG
>CG9588 9500811 9501224|9766 chr3R 9500586 9500836 scaffold_0 4394255 4394469 - 1041|230 255
ATATAATTAAAAATATAAAAAACAAA
ATATAATATAAGATATGATTAGTGAT
>CG9588 9500811 9501224|9767 chr3R 9501002 9501901 scaffold_29 238588 239493 - 26075|0 239
TGTAGCTTT--GTGTTTAAGCTTTTTTCGA------GTTGCCTGTGCACTCCTGCCCTGCACTTTAGTTATCAGCCCATCTCTGCCAGGCCGACGAACATGGTTGCTCCAAATTGTGAAAATTGATTTTTGGACGCGATTTCAGGGCAATTTCAGCTGGAGTCATCTCGCTGAC---------TGACAGCCGGGTCAGTGGGCCAAGGAGCAGCAGTGGAGTGACCCAAGGTGCACAGGT
TATAATTTGTAGTGCTCATTTTTTATTTTACATTTTATTGCGTGTAATGTTTGGCAATGTAATTTAAT--TTAATTCCCTTAAAACATTGAAGTTGATTTGGTGGCCTGAATTTGCGAAGCATCAAT-----ATGTCATTTCAATGC----TGGCCTTAATGCATTGAAATGACAGTTTGCAACGGCTGCTGACTAACTATGCCAAGCCATGACACCAAAAT-ATCTGAGGCGCATAGGT
>CG9591 9505151 9505452|9769 chr3R 9502800 9505360 scaffold_29 240269 242833 - 83927|2508 2718
TGGAATGTGCGAAATGTGCGAACTAAATGCAGTGTTTGTATTTTGATATTCAATGGGTTCTTTTATTTTCGTTTCATTGGTTTGTAAAAATTAAAATCTCAACCTAGGCCTTGCAAA-TACTGTCCAGCAGTTATTGTACCGACGGCGCCTGAAAATCGCATCATTCGTCGTGTGTAGTTTAGAATATAACGAAGCCAACAAACAATTTCA
TGGAAAG-GAAATATGTGTGAACTAAATGCAGTTTTTATAT----ATATTTAA-ATATTCTTCAAT---AGTTTCA--AATTTGTA----TTACACTTATAAATTTTCCATTGCAAAATACTGTCCAGCAGTTTGTGTATGGTCGACGCCTGTAAATTGCAT-------------TGATTTAGAAGTTATTAAAACCAACAA-------CA
>CG9591 9505151 9505452|9770 chr3R 9505426 9508869 scaffold_29 243060 246602 - 144057|0 26
GCAAACGTAGTTAGCTAGCCTAATGTT
TAGAA-----TTAGTTAGTCAACTGTT
>CG9611 9520979 9521258|9782 chr3R 9521007 9521411 scaffold_55 262235 262771 + 7412|0 357
AAGAGC------AATTCACACCGTTTTTTG------------------------AGAAACAC---------------TTCACTAGCAATATGTTTATTTTGAGG-AATAGCGTAATGGAAATTGATAGATCCGCTCGACCATGCCCACAAACAAT-----------------------CAATCTATGGATTGGCT-GTTTGTGGACATGGATGAGGGGTGGCGTTACA-------AGTAC------------AACATACGACACACAC---------CGTGCATCAACCAAC---CAAACTAGTCTGCAT---GCCACAATACCTAATGCACGTTGTT--AATCCTGGCTGAGTATCT
AGCAGCTAAACAAAGACGCATTATTATTTATTTAACGATAACTTAGCGCACATTCGAAACGCTAATTAATTTAATCATTTATTATTGTTGTGTTGATTTTGAGACAAAAGCTTAACCAAA--TTAAAGTGGCGCCCGCACACGCACACACACACTCGCACACACTCAGCCAGACAATACAATCTGTCATGCGGCCAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGGGCGCCAGACGCGCGTAGTACCTTGTAGCATTTAACAAAGCACCCACACACACACACACACACACCTATCCACGTGAGAACTAGTCAGCATTTGGGTAACTCACAAAACGTACCTCGTTCAAACCTTGGCCAAAAAGCT
>Adgf-D 9528806 9528834|9789 chr3R 9526103 9530555 scaffold_55 269154 273840 + 181115|2940 2968
GTTCTAAGATTAAATGCTAGTCTAAATCT
-----------AAATAGTA-TCTAAATTT
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GAGCGTGGAGCCGAGGGCTTTGAGACCGCCTATCAGCAGTGCGTGGTTGCCTGTGCCGCCTTCATGAAAGAGCGCCTCCAGAAATGAATGATTTGTAAAAGTGTTGTGATTTAGATAATCTAATAAAT
CAAAGTGGCGCCGAGGGCTTCGAGACGGCCTATCAGCAGTGTGTGGTGGCTTGTGAAGCGTTTGTAAAGCAGCGACTGCAAAAATAATCTTAGTTAAATGTTGTTGT-ACATAATTAATATATAAACT
>primo-1 9535748 9535788|9795 chr3R 9535721 9536482 scaffold_55 279907 280581 + 22981|40 80
ATGATTTGTAAAAGTGTTGTGATTTAGATAATCTAATAAAT
TCTTAGTTAAATGTTGTTGT-ACATAATTAATATATAAACT
>primo-2 9535916 9536380|9795 chr3R 9535721 9536482 scaffold_55 279907 280581 + 22981|208 672
GCAACATCTGCAGGTCCCCAATTGCGGAGGTCGTGATGGTGGACACCCTGGAGAAGGCGAATGTCAAGGACGTGGAGGTCGATAGTGCAGCAATTGGTGGCTGGCACGTGGGCAACCGCGCAGATCCGCGGGCCATCAGCACGCTGCAAAAGCACGGCCTCAAGTGCACCCACATCGTTCGGCAGATCCGCAAGCAGGACTTCTCGGAATTCGACTACATCTTCGGCATGGACGAGGACAACATGAGCGAGCTAAGGCGTCTGGCGCCCAAGGGCTCCAAGGCGGAGCTCCTCATGCTGGGCGATTTCGGACTTGAGAAGAAGAACCGCATCATTGAGGATCCCTACTATGTAAGATACTTTTAGAATCCTGATTTCTCCTAACTAGAATACGAAGTTGCAGTAGAGATCAAGTAGAGAGTAGAGAACTATTCCATAGATCAATAGGATATCAAGAACTTAACTT
GCAACATCTGCCGCTCGCCCATCGCCGAGGTGGTTATGGTTGACACCTTGGCCAAGGCGAAAATTGAAGGTGTTGTTGTCGACAGCGCCGCGCTCGGATCTTGGCATGTGGGAAATCGAGCAGATCCGCGTGCCTTGAGCACACTTAAAAAGCATGGCCTTGACAGTAAGCACATTGTGCGCCAAATTAAAAAGCAGGATTTCACCGACTTCGACTACATATTTGGCATGGATGAGGACAACATGAGCCAGCTGCGCAGCCTGGCGCCGAAGGGCTCCAAGGCGGAGCTGCTTATGCTGGGCGATTTTGGGCTGAACGCAAAGGACCGCATCATTGAGGATCCCTATTATGTAAGTTAACT-----------------------------------------------------------------------------GTCAATGGCTTGC----GATTTAATTT
>primo-2 9536445 9536653|9795 chr3R 9535721 9536482 scaffold_55 279907 280581 + 22981|748 785
CTCAAAGATGGTTCGAAAAGTGCTAATGATTTGTTTGG
TTTTAATATGGTGCAAAAAATATTAATGATTTGCCTGG
>primo-2 9536445 9536653|9796 chr3R 9536483 9536780 scaffold_55 281328 281589 + 2588|0 178
-TAAGTCCCCGACACCGCCTAAGGGTTAAGCCATCCGACCAACAAGAACAGCTGATAACACGCGTTGCCAACTAACTGTTGAGGCCAGGGCTGCAGGTTGCGGAACGCTCAATTGCGAGCCGGAAAAAAAACAACACACAAAATTGTTCGTAAAA--------TTCCCGTGTAAATTGA
TCAACTGGCGGGCACCATTGCAGGGTT----------------AACAACAGCTGTT-----GCGATGTTACC------------------CGCCAGCTTGTGTA---CTTGTTCGCCAGTGTTGGCAACGACAGCTGACAATTTAAATCGCATAACATAAACTTTGGCGTACAAATTGA
>CG9602 9543172 9543254|9804 chr3R 9543251 9543869 scaffold_55 289381 290022 + 32772|0 3
ACCG
GACG
>CG14363 9613724 9615933|9871 chr3R 9612578 9613929 scaffold_55 380973 382463 + 26539|1340 1586
GCCTGCTGTGGGTTTGCCGATTGTTTGGTTTTCCTGAAACGCTGCTGACAGAGGAAAATCTGTGTGGTGTGGCAAAA----------------ACATTTCAATTCCTTTTCCAAATTCGACTGGAGTTCATAATTTAGCGTTTATTTATGAGTTGTCAAGTTGCTTGGTACGTGACTG-------------GTCGGCCTTGTTG-----GATTTTCAAGTTCAGGGCGCCGGCGCC-------TCTG
GCCTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGCATGTTGCTCGTGTGTGGTTGC--AAGGAAAATGTTTGTGGCAAAAAAAAAGAAGAAAATCACACACACATTTCG----CTTATCTCGTTT----TGTAGTTCATAATTTACAGTTAATTTATGAGTTGTCAAGGTGTGTGCGACGTGCTCGCCAAGTTCAAGGTGTTGCCGCTGTTGCCATTGTTGTTGTTGCTGTTGTTGCTGGCCTCGTCCTGGCCTG
>CG14363 9613724 9615933|9872 chr3R 9614217 9614368 scaffold_55 382737 382927 + 5051|0 201
TTTTGGGCCTTTCCTTTACTTTCATTCGCTCGGCTAGGAGTTTTCCGAATAATTTTGCCATCAAGGTGTGGGCCAGCCATACATTTTCCTCGCCAAG---------------GCTGAGGC-----------------------------------CGCGTTGATCATGAACATGACACAATATTATGGATTATGAGCCGACT
TTTTGTATCTTTCTTTTACTTTCATTTGCT-----------TTTCCAAATAATTTTGCAACCAAAACGAAAACTAACGAAATATGCCACAGGCGACGTTGGCGGCGACGTCAGCTGCGGCAGCGGCAGCGACTGCGGCAGAGGCCAAGTCCATGTCGCGCTGATCATGAACATGACACAATATTATGGATTATGAGGCGCCT
>CG14363 9613724 9615933|9873 chr3R 9614565 9614822 scaffold_55 383936 384220 + 4964|0 301
CGCTTATC-GGCCCGACCACACCTTTCGCTCAAATTGCGGGTCTTGTGACCTTTGGCAGCCTTGACAATTGTTGCCGCCTTTGCCCCTGCCCCTTCCCTTGGTGTTTGCCTCAAGTTCAAGCCTGCCGGCAAACCTGAA---ATTGCCACATGCGGTGAAAGTAAAAATTCATAATTTTACCCCCTCCTC-------------------------------------GGCAAACTCAGTTGTTAACATTTTACCCAAAGAGGC---CATAAAAATGGCAAGCCAACTGCGAGGAGGCAAGCT
CTCTTATCTGGCCGGACCACACCTCGAACTCACCTTTTGGCC-----GCCACACGGCAGCCTTGACAATCGCAA-----TTTGCCGCCGACTC-------AAGTTCAGATTCGGGCGAAATACGGAAAACAAACCTGAACAAAATGCCACATGCGGTGAAAGTAAAAATTCATAATTTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTTCGTTTTGATTGTTGTTGTTGTTGTTGCTGCTGCTTTTCACATTTAACTCGGAGAGGCGAACATAAAAATCTCGAACCAACTGCGCACAGCTTGGCT
>CG14363 9613724 9615933|9874 chr3R 9614875 9615238 scaffold_9 2316417 2316838 - 155|0 434
GAAATGAGAGGAGAGATTTTTTATCTTAACT---AAGACCCTCTTCAGGAAAATATTAAGATTGTAGATATTAACATATATAGGTTTGTTTGCATTTCGAA-ATTGTTTTTTCAGTCTAAAAATGA-----------TTTTCGTATGAATTACCTTCTTACAACATTACTGATTTGCTAAGCTTTCAACATTAATTAT-------GTTGCATTTATAAATCTTTGCTGATCATACA-------------------TATACGTTTG-------------------------CTATAATT-TGTTTAGCCATTAATTTAAG---TGAATAATTAAAGTTGTATTTACCGTTGTGTAAACCCA-ATTCAAATCCACTCTCATGAAATTTAAAATTTTGTATAAAATCTCTCTTCAAGAGTATTATTTTTCTAATCTAT
GACACGAAAGGAGGAATATATCTTC--GACTCCAAAGAGTATATATATATATATATA-----TATATATATATATATATATATCTCTGTTGCTATTGCAACTATTCTGATTATATTCGACAACTGAACTCTGCAAGGTTTTTGTTCAACTTTGATTTCTTGATTTTAATCAATTTACTTTATTCAATAAATTAATTATTTATTTAATTGATTTTTGTAGCCGTCGCTCACCCCGCAGCACCAGACGTTAGCAGGTTATCCGCTTGAGTTGCAATCTTCATTTCCAATGCCCGAAAATTCTGTAGAGCACCTGATTTACGATTTATTTGATTAAC----TATTTTCCTTTCTTACAGCTCAGACTCAGG--AATTATCATTTAATTTAAATTTCTTAACAAATTCGCTTTCTAAATGCAATATTATTTTTGTTCAT
>CG14363 9613724 9615933|9875 chr3R 9615398 9616077 scaffold_55 384303 385156 + 8217|0 709
CCCAAGTAAATTACGACTGCAAGTCAACCAGTCAAGTCAGTCAAGACGACGAGAGACGAGAGTCATCTCTGGATCGCTGTGGCTGGATGTTGGTGTGTGAGAAAAAAGT-------TAAGAAAGAAAGCAAGTTG-------CTGGCCGGG----------------------------------------------------------------------------CTTTTTCTTTTGTTGT--------ATTTACAAGCGGCC--AAAGGTTCGTTGACCGTACAAATAGTGACCCACTAACATCCGCGA-GTACGTTCACCCTAGTGACGTATTGTTGCC-----TCCATGGAGCCGAAGAT--------------CCAACCAACCGATGATGGGC-----------CCGAGCCGAACTTGGCTCAAACCTTTTGGGCCCGGCCAAGCAGCCGAGTGAGCCAGTTTGAAGCGAACCTCCGAAATCGGTTGGGGCTTAAGAGCAGCATTGTGGGCCTTAAGAGCACGTTCTTCTTCTTTCGCTCGCTCTC-----------TGTTGGCCA--------------------------------AAATGCGGAAATGCTGCTGCAACAACGCTAACGCTGTATGACTGTTCAGATTCCCGAGCCACATCTTCTTTGGCCTGCTAATCCCATCGGCGCGGACATCTTCATC
CACAAGTAAATTACGACTGCAA-----CCAGTCAAGTTAGTCAAGACAACAACAAGTTACACACACACACACACACACACACACACACACACACACGCGCACACACAGTCGTATAGTAAGAAAGAAAGCAAGTGAGCAGCAACTGGCGGCGACTGGCAACAGCATCCTCCATTTCGCCGCAGCTTTTCGCTCTCTCGCACTCTCTGCCTCTTGGTTTTTTTTCATTTTTTTTTCCTTTTTTGTCGTTTCATATTTACAAACGGGCCGAAAGGTTCGTTGACCGTACAAATAGTGACCCACTAACATCTGCGAGGTACGTTCACCCTAGTGACGTATTGCTGCCCATGATCGAAAAGCCCGAAGCTTATAGACATGCGCCCGAGCCCGAACACGACGAGCACGAACACGAACCGAGCCGAACCTGGCTCGAA--------GCCGCATTAAGC--CCGAACG---CCGTTTGATGCGAACC-------------------AAAAAGCTGCTTTGCCCGTTT-----GCCCGT--TTCTCCGTTTGCCCGTTTCCCCGCTTGCCCGTGTTCGCCGCAAAGAGCGCAGCTTAAGAGCTGCCGCGCAGCCAATGCGGAAATGTTGCATGCGCGCCCCCGTCTGTGTGTCTGTGTGTGTGTGTGCGCGCTCAATCGTGTTTATTTTGTTCAGCTTATCTGCGCTGACATCTTCATC
>Nsf2 9660195 9660401|9942 chr3R 9659826 9661257 scaffold_55 440178 441593 + 45373|392 626
CTA-CGCCTTTAAATTAATTTACA--TTCCATTATCAAACAGCAGAGTGGTT-------CGATTTGATTGATTCAAACTGGAAAAACGGTTATGTGTTTACAATTAAAAATATATATATATGTATTAAAACAAAAAACCGTTACAAAAATAC------------------TTATAACCTTTTGGGAAAAAAGTACAACGTAATATAATATAATAATATATTCCCATATTTCAAAA
CTACCGCCCGTATTGGAACTGAAAATGTCCGTCGTGGAGCTCAACGATGCTTTCTGAAGCGTGTCCAACGAATT-AGCTCGAATAGAGATT------------TTTAAAACATTTTATAGCGCAACCGACCACAAAACCAGAGCTAGAAAACAAACACAGAGCCGACCAATTATGTGAATTAAACAAAAAAACAAAAAAGAATAGAAAACAA-AGTTTATTAACATTCCGCACAG
>CG31495 9663960 9664495|9945 chr3R 9664100 9664237 scaffold_55 10142 10312 - 6048|0 170
ACCAGGCCAGACCTCTCAGTGGCCTTCGCCTGCTGTACGGAGAGCATTCCGTCCTCCAGGAGTTCGGTGACCGGTGGGCCCAA---------------------------------CATCTCCTGGGCTGCTCCAAAGGCGGGCTTGATGTCGTTGTCCAATATATATATA
ACCAGACCAGAGCTTTCCGTGGCCTTCGCTTGCTGCACATAGAGCATGCCATCCTCCAACACGCTGGTCACCGGCTGGCCCCAGTGGATGACGCCACGCGCGAGCATATTCTCGATCATTTCCTGTGCCGCACCGAATGCGGGCTTTATATCATTTTCCAAGGCATGCATA
>CG9925 9786432 9786647|10090 chr3R 9786197 9789376 scaffold_42 534116 537254 - 37996|238 471
TTTAACTTAAGAACTCGCATTCCT--TCATATGA--------CTTTAGCATTAAGTGTACAC---CAAAAGTGTATGTTCAAACATTATTTCGATATTCGATATAAGTTTC-GACCACAGTGTATTTTCGAACATGATTTTGACAATTATTCGCTTACATTTATTCCAGCACAGAGTGATTCGACTAAGAGACTTGACACCATATAAAGATGTTGATCGTT----CATACAGAA
TTTACTTTAAAAAACCTCATTTTTGACGATATGGATAACGTCCTTTTGTTATGTTTTTACATATACATATACATATATTTATA-ATTAATATATAATGCTACGTTTGTTTCTGAGAAACTTGAAACTTCGAATAAATTTTATGTTCATAATTGACTATGCGTATT--------AAATTTTTTGAATTGGATTGTTCA------AGAAGGCAGATTATTGTCGCGACTTTCAAAA
>CG9924 9793674 9794907|10093 chr3R 9790771 9796359 scaffold_53 560581 565935 - 196376|3002 4274
AACAACAATGCAACAACTACAAACACACCAACAACAATAATAATAATAATAACAACAACAACAACAAGAGCAACTACAATAACAACAGCAGCAACAATTCGTACACCAACAACAATCAACAATCAACAGCAAGAACAACCAGAACAACAACAAGTAACCCAAACTACTACAACCAACAATCGATTCAACAATCGCAACAGAAAGCAGAACTCCAGTCGATGCAGTGGCCGCCATGTGAGATATCTGATGGATCGATTGGCGGAGAACCTCAAGAATGCATACGGCGGCAATACTACAAACGCAATAGATTATGTTAAACGCAGACAGATAATGCAAATGCAGGAGCAAAAGCATAG-------CGAGCCGTA-CCGTTTATTGTTTCGATTTCAAGTAATTTAATTCACTTTGATAAACTTGATTTTAAATGTATTTTATTTGTTGATTTAATATTACCTTATGATTAATATGTTTACGAGTAATAATTATGAATTAATTTTAATCTTAAGTCAAAACACAACTTGAAACAAAAGCAGCAATTAAAGAAGAAACAACAACAACAA----AAACAAAAA-AACCTAAAAAATAATGCAAACAAAAAAAGAGCATAAAAAACAAAACGGAAAGTAAAATAAATTAAATTTAAAGTAAAGTAAAAACTAAAAGTAAAAATCGAAGGCATAAATACAAGCAGAAATAAAGAAATTCACTGAGAAAGCGTAACTATTATTATTATTATTATTATGATTACTATTATTACTATTATAATTACCGATTACTGCGTATAATTACAAAGCGTACACTTTGATTGTGATGTATATTCGATGAGTATGACTAATGAGTAACGAGTAAATGAGTAATGATACGGATATGATAATGAAGTTGATTTATATATTGTGTATATGTAAACTCGGAAAA--AATTTTCAGA-------TTCAAGGTTTAATTGCACCCACCACCCACCAAAATCGAAGAACTCCCCCATGAAATTGAGGAGAATGTAAAAATTTATTGTTTACCCGAGTTCTAAACTTTAATTTACTTTTCATCGCTGAATTCATGCCTGAACTTTTGTTTTTCGATTCCCCTCGTCTTTTCTTAAGTATCTAAAAGTATCTAAATTTCAATATCAGACGCCTGTTTCTCTTTGTTAAGCGCAAAATGTAA-----TTAATTTGTTGTACAAAACTA--------TAAAAACAAACA----AACAAAGCATTGTCGAAATAAACGCAAGCAGTAGCAATTTGTGTATAAT
AACTACAATGAAGCAGCAACCAATTCA---------------------AATGCAACAGCAACAACAA---------------CAACAGCAGCAACA-----TGCAACAACAACAAT--ACCTACAACAGCAACAATAATATTAACAACAACAA----------CAATTGTAACATACATT----TTAACAGTTGCATGCAAATTGATGACTTGA-TCAACAAATT------CATATGCGATACC------------------ACAACAACAACAACAACAACAACAGCAACA--ACAAGGGCAACTATTAATAATATTATCA-ATAATAACAACAACAACAAGAACAACACCATCAATTGGCCTAAGCCGCAGCCGTTTATTGTTTCGATATCGAGTAATTTAATT----TTGAAACACTTGAT---AAATGTAATTTTTTTATTTTGTTGATTT---------------ATGATTACGATTAATGCTTA-------ATTTTAAGATGAAATTGAAAAAAGA----AAAAAAATGCTTAAACAAAAAAGAAAACAAGAGTAAAAACCGCAAGCAAAAACAATTTGAAAACTAATAAAAAAAAAAAAA-----CAAAAAACAAATCAATAAGCGTAA------AGCTCATAAGTAAAACGCAAGGCAAATATAAAAAAAAAACATATACATAAAA----AAGTAAA--------------ATGCGTAACTATTATAATTATTATTATTATTATTAACTATATTATTAT----------GATTACCGCGTATAATTACAAAGCGTACACTTTGATTGTGATGTATATTCGATGAGTATGACTAATGCATAA---------------TGATACGGATATGATAATGAAGTTGATTTATATATTGTGTATATGTAAACTCTGCTAATTGAATTCAAGAGAGAGCATTAAAGGTTTTATT----TTTGTATTTACCGAAATCT--GCACCCCCTCGCGCC-TCTACACACACACAACAACC---------CCCG---CCGTAACACACACCCCGTTTCAATAGAACAGTAAAGGCTTAAATTGTATTCATTAAATTTCTTCTCTTTTTCGTTAAAAAT------------AAACTTGAAT-----------GTTTTTTGTTTTTAAGTATTTAATGCCAACTTCTTTATTTCTTGTACAAAAAAAAAAGAAACTAAAAAGAAACACAACAACAAAACATTGTCGAAATAAAAGAAAAATTTAGCACTCTGTGTAAAGT
>CG9922 9860738 9860901|10168 chr3R 9858982 9861405 scaffold_72 34122 36469 - 69398|1915 2078
GGTGCTCGTGGAATCCGAAGCAATCCGCCGTCTGTTTCTTTTATGTAGCGTAACAACACACTGCTTTATTTGTACATTTATAAACTCTAGCGAAGAAAACAATACAAAACAAAAAGACTTTTAAGCCCACAAATGAGTGAGAGTGCTTACATCGTCTAAACGAA
GTCGCCGGCCCACCCAGCCTGGACACGCCGTCT----CCTTTACTTAGCATAACA-----CTGCTTTATTTGTACATTTATAA---CTAGTAAAGAAAAAAA-----AAGAGAAAACCTGATTGTATCGCGTCCTTTCGACCATGTCCAAGATGTC-ATCCGGA
>CG9920 9923008 9923318|10237 chr3R 9922994 9923196 scaffold_15 2708174 2708378 - 2426|16 217
TTGCGTTCGAAACTAAATGATTATAATGAAATGTTATATTTGGTAAATGGCCAATCTACACACTCCACACACTTCATCCGACTATGAAACATGTCGCGCCTGCTCTTATAGCTACCACTCACACTGCCA-TATCGTGTAAGGACAGGCCA----AATAAACCACTGT--AGATGTGCCTTTTGTGTCT------TATCAAAA
TTGCGTTCGAAACTAAATGAT--TGATGAAATGTTGTATTTGGTAG---------CTAAACACAGAACACAGAATATTT-ACACTAAGATCTTATACATTTAAACACGCCACCAACACACAGCAGGCAACTAACCGGTACCGTCAGGACACTACAATAAACAATTGTTCAGAT-TGCGTTTTTTCTTTAAAGAGCATTAAAC
>CG9920 9923008 9923318|10238 chr3R 9923271 9923826 scaffold_15 2708441 2708994 - 21339|0 61
ATTT--GCAACACTTTCCGAAACATCAAAGCCGAT------------ATACACGATATACAT
GTTCAAGTGTTGCCTTCCGGCGTCTGCCATTCGATTGGCAGCACATATTACACGGTACAGAC
>CG9918 9926180 9926367|10244 chr3R 9926111 9927054 scaffold_15 2711878 2712856 - 15957|70 298
CTGA--TAAACTCGAACTCACTCT-------------------------CTCGTGCGGCTTCCTG-------ATGCTAATTTATTTGAATT-----CTGTTTAAGCCAGTTATTTGTCGTCTATTGCTATTGCTGCTGCTACCAAAGCGTTTTGTTTAAACTGCTTTTGCATTCATTTGCATTTGGCAATTAAA--AGTTAATCACAGTCGAGCGCACACTCTCCCTTA
TTAAAGTAACTTTGTAGTTTCTTTTTAGCGATTTTTATTACTTGTCACATTCGTGCAGCTTTCTGCATTTTTGTTTTAACTTATTTAAGCTTATAGTTTTATAAATTAGCCACTGTTTTTTTATTGTTATACCTACGTCTACCAAAGCGTTTAGT----ACAACTTTTGT-----TTTGTATAAGTTAATGAAGCTAACTAACTAAAACTTAATGTA-ACTTAAAATTA
>CG12402 9930595 9931280|10248 chr3R 9930433 9933021 scaffold_15 2717228 2719722 - 49806|176 907
CAGGAGAGGTATATCCACTGACGGAGCCGAAACACACCCCATCACAACGATTGGGGGAACCACGAGGATGATGAGTTCGACGACGATGAGACCGAGATAATCGAGATCGTAGTTTA------GTCGCTCGTAAGACGATTAGATTAAGAGGCAGCTGAGCGTCAAACGTACATTGATTTATCCGTTAGGAAATTATTTTAG-----ACCCTGAACACTTTGGGAAAAAAAACTTTAGAGGTGATACTTAGATTTTTTTAAA-GCCCCATCCGATTGCTA---TTTTAAGATCAGCCAACAACAGAAGCCAAAAAAGAAAGTACAAGTATTCATCCCACCCAAAAACCAACTTAAACATTTCAGCGAGTAACCATTAATTTTTAAGCAATCATGAAAC----------TCCATGCGATTGCCATCAATAACGATATAACCAT--------TTATTTTAAAGGTATCTTTAAACATCATACTAC-------------GGTCAGCAGAGCTTTTAATTTCAAAGAATCGAGCAATACCAACAAGTAAAGACTTTATCCTAAACTTTACTTATACGTAATCTAAGGCCATATGAAGGAGCCCAAGGAGCTTGCATTTCTATACACCTATTAATCGGGTTAATCAACGAAACAATACATCTACAAATAATACTTTGAGTGTTGTTCAAGTCAATATATTAATCAGAGTGTGTCTACAATTTTTATATCTTACGTAGC
CAGGAGAGGCTGGTTCACTGACATGATGAGGACAATCCCCAT---GCCGGATGGGGGACCGA---------------TGACGAGGACGAGCCCGAAATCATCGAAATTGTTGTTTAAGCTGGGTCAGT-GCAATATGATCAAATCAACTAATCGTTTAATACTAAACTAGTATTTCCGTAACT-TTAACTTTTTGTTCTTGATAGAACGATGACAACAGTTACAAAAAAAAA---AAACATAATTTTCGCATTTTTTTCACTGCTGCAAACTATATTTAAGTTATTGATGTTAG--AGAAACTGTTGTCTAAGTAAATTGTAAG----------CTAAAAGAAAACAAAACAAAACAAAGAGATGCGTTTGCATTAATTTGTTAACCA-CATAACACCAACTTTGAATTTGTTGAAATACGAATATTACAGGCATAACTCTAATGGTTCTCAATTCAACAATAAAGCCAAAAGTCATAATACTAACATACCTCGAAATAAACGAAACTAAACATTTCAGAAACTTGAA----ACGAACGCATAAATTCTT--TTAAAAATAACACACACACACACACGCACACCACACATATAACTATATATA---TATATATTTATATATATATTG--------------------AGTAGATCTAAAATTTCTTGTTTG-----TGATAAAG---ATATTCCGGGCATAATGTATGCATTGT---------TTGGGAAAA
>Abi 9944976 9945786|10259 chr3R 9944605 9947221 scaffold_15 2732024 2734617 - 85892|462 1384
GC-CTCGCATCGATATTCTAAACATGCCAACCATTACAATAATCTGCATCATCTGGTCTGTTCCAGTCCTCTGCTGCTTCTCAAGAGCTCCAAAAAATTTCAATTCAGTTATCGGAGAGTTAGACTGAGGACCGCAACAGACTCAGCTGACAATGACGATAAGATTTTGAGCATATTAATAAGGACAATTATACAATTACACACCTACACAAGCACAGCAGGCCAGAGAAAGCGAATTCCATTAGCAT-----------CAGCCAACCGCATTTAGTC----TAATATAAACGAGCACACAAACAC-ACAGAATCCACGGGCTAGG---------GATACCGCTTGCTGCCC--------------AACTA-AAACTATTT--ACACTTTAGTAGCCGAAAACGATGCAAG--AAGGGGAAAGT-----GAAACCGGATACCCGTGAATAACTTATGCGATATTATAAAACTGTTCCACAACCGTAGACGAATTCTGTCCTGCTCCTGCCGCCAATCCAAATACT--TTAAATATTTGCTCAC----------AGTTTTATCAAGCGATTTCTGTTTGCCTTGCGCTTTGATATGCC-----CGGCTATTATACACCAATACTACCCGAACCTATGCCCCCAGCAATACTGTAGGTTATATAAATTTCAGTTAGCATTTAATACTTAAGTATTGGCCAGTTGG------AACTTTTGTTTATAC--------------TTTTACGAACCGCAACGATGTCTT---------TTTTTTGC-------------GAACGTTTAGTTAAAATGGAATTGCCAGCAAAGGAATCAAATTAAAT---TAAACAATACAAGTACACATACGCTCTATATGGTAAAAATAATAGCTAATAAAAATTTCAATTACTAAACCGCAAGCCCTT
GCACTGCCAATGGAATT-----------AACAATAATAATAATATGCATTA------------------------------------------------------------------------------------------------TGACAAAGACGATAACGATTTCCGGATATTGATAATGATAATTATGTAACTACAGCC--------ACAGCGCAGCTCTCACAA---GTATTCCACTAGCATAAACTGAATGGCAACTAGCTGCATATAGTTGTCATCGCACACTCACACACACAAACACTCCAGCAACAATTGTCAAAGCATTTATATGAGAGCGCTCGCTATTTTCAACGTAAACGTAAACTATAAACTAATTAAATATCCTAATAGTCGAAAATAGCCCAAAGTAATGAAAAATTTGAAGAAAACTGAGTACACAT--ATAA--------ATATGACCTATTTAGTATACTGACATAGACGAATTCGGCCC-----------CCAAGTTATAAAGTGGTTCAATATTTGCCAGCGCTTACAACAATTTTTGTGTGAAGCTTATTTTTTGTATTTTGTTTGTTTGTTTCCATTGCGCTTGCAACACGCCCATACCACCCACAACT------CCCGCAGTGACGTAGGTTATACGAATTTCAGTTAGCATTTAGCTTTTAGATATTGGCCAGTTGGTTATACAGTTTTTTTATACACACATACATATACATATTTACAATACAATAATATGCATTATATAAATATTATTTGCGACAATGCATACTGAAGATTTAGTTAAAATGAAATTACAAAC-ATGAAATCAAATTAAATTTATAAAATATACAAG----CACATGCATTATATGGT----ATAATAGCTAATAAAAATTTCAATTTTCA------AAGCCCTT
>140up 9949940 9950226|10261 chr3R 9949721 9951252 scaffold_15 2736653 2738137 - 57146|219 511
GTCCTGAGGACTTAAAGAAGACGCCAGTGTGAACTTAGTTACTTTTTTTAATTTA---AATAAATTGCATATATGTCCATCTAAAGTTACATAGACAAGAATACATTTAAGGAAGCCCACTTTGGCGGCTGCTATGCGATGTTTCAGTTGATGCCTAGTGCCTCTAAAGATATCGAC-TGACGTACGGACACATATAGACACGGGATAGACACAACACAAAAGAAATAAACGATT-GGATACAATAAATTAAATGCTCTGCTAGGA-AACAGTACGTAGAAGGGCGATAAACA
ATC-----------------AACTCGATGTAAATTTAG---CTTGTTTTTATTTAAATAATAAATTGCAATAATGTCCTTTAGAAGTTATACAGAC---AATACAATTAAGGAAGCCCAAGTTGGCTGCTGCTATGCGTTGTTTCAGTTGATGCCTAGTGCAACTAAGGATACAGATATGACT--CGGATACATTTAAATA--------ACATGA---AAATGGAGCACACAATTCAAATGCAATAAATTAAATGCTCTGCGAGAAGAACAGGAAACATAAATTGTGTATA--
>CG14356 9956400 9956485|10263 chr3R 9955707 9957857 scaffold_15 2743500 2745506 - 19325|746 852
GCAGA--------GACACCGGTTGTTGGCGATAAAAAAGGAGTAAA------------ATAAGTTAT-TTTTAAGATGCTATAAATAAATACCTCAGGCGTGCCCAA
TCGGGCGACGGATAGCTCCAGCTGCT-GCACCCACGATGCAGTCCACTATTATTATTTGTATGTTATATTATAAGCCGCTATAAATAAATGCCTCAAGAG-------
>CG14355 9974216 9974305|10290 chr3R 9974214 9974598 scaffold_15 2769430 2769773 - 1179|2 97
ATGGTCTTCATTGTCTGCATTCATTTCAATATCGCTA------AAAATTTAAATGTGATATGTCTCGCATATTTTTTATAGTACGACTAACACATT
ATGGCAACCAGTGTCTCAATCCTTGTTATTACAGGTGCTAAATAAATATTGGATCTG-TGTGTTTACAATTATTTTTAGAGTATTACT--CATATT
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AACCGAAACGTGATTAGGTCTAAGATCTTCAACCCGGCACCTAAGAGAGCTTCTA------------GTTAAGTTTCTGTTTGGATAT-------TCATGGCGGTT-----------------------TGTCTCCATGCAAATGCGATTATT----------ATGGAGTGACACAT--GTCACTTGCCACATT------TCTCACTCACTCACTCACCCA-----------------TACAAACAAACAAGCAAACACACACACGCACACAACAACAAAACACTCAGAT--ACATGG-------G
AACCGAGTCGTGATTAGGTCTAAGATCCCCACACC--------AAAGAGCTTCTGAATAGTTAAACTGTTAAGTTTTTGTTACGATTTAGCCATGCTATGGCAGCTATCAGTAAATGTTATAAACAGTATAACACAATTTGAATGTGGCCAACGCTCGAACGGATTAAGTGTTCCTTTGACCCCTTGACAAGGTACAGCAGCTAAGTCAAATAATGACACACGTTAAATATATATTTCTAAAAACGGACAAT---ACACACTCACACTCACACTCTCCACACACACGGTTTGACATAGTTCCCATT
>DopR 10003005 10003641|10335 chr3R 10003274 10004322 scaffold_15 2816250 2817338 - 50745|0 392
CCAAAATGCTGTCTGAATCTCACTGGCGGTGGAGCCACATGGCTGCCCTGCGGATGCGGC------------GGTCTGCGCGTGGACGACGATGACGATGGAGCGCTGACCACGCGATATGTTCCATGAGATTCGGTCACGGCGGCCACCGCCACCATTGTGGAGACCGTGGAGGCCGCGCAGATGGAGACGGAGCTGCTGTA-----GGCCGGCAAATGGGTTCCTAAAACCAACTCGATGTCTCACAGTTTAAACCGTAAGCAATCCCAGCCCTCTACCCTACTGA-----TCCAGTGGATATG-GAAACCTGTAAGTATTATCAGCGCGTCCCCGAG-ACTAAGCAATCAACTATGCG-TATACTTAATCGCACTAGTATCTAGATGTAA
CCAAAACGCTGCT------------GCAATGCAACCAGTTGGCTCTTGTGCAGCTGCTGCTGCACCGACAGTGGCCTCAATGTGGATGATGATGATGATGGCGCATTGACCAACCGTTACGTTCCATGAGATTCGGTCGCGGCGGCCACAACAACCATCGTGGAGACCGTGGAGGCCGCACAAATGGAAACGGAGCTGGTCTAAAATTGGTCAGAAATTGGGTTCCTACA-------------CGCATCAATAAATGCGT-AGCAATCCCAGCCCAAAGCACGATTAACTAATCCCAAAGCAAGTGAAAAACCTGTAAGTATTATCAGCGCATCCTAGAATCCTAAGCAATCTACTAACCGCTATTTCTAAGAGTGTTTATACTTAACCGTAG
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TAAGTCACGTCGTTTCTTTTAAGAGATTAGTTAACTTGTGATAGAAAAGGAGAGCTTTCAAATTGTGTGCCAAA
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ACACAAAATGAAGATTGCGAACATGAAAAGCATGCCCC--------------CTTCTTGAAGAGATTCCC---------ATTGATGAAT--GTAAAAT---------CACGTAAT-------------CGGAAGATCCATGTATTACTGCCTACTATTGCGTTATGGGTAATTCTAAGTGGATCCATTAATCATTGAAATAATA
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>CG9631 10050820 10050902|10369 chr3R 10050805 10051667 scaffold_15 2854499 2855370 - 14157|15 102
GGCGCTGAA-ATAATTATAATGTGACAATACAGGAAAACACGGAAATTTATGTACAAAATTCTCAATAA----ATCTTTAAGTCGTAT
GATAATAAATAAAATTAAAAAAAAAAAAATAATCAAGACGCTG---TCCGTGTATATAATCCACGTTTATGTGTTGTTTACGCTCTAA
>Aats-met 10077212 10077245|10392 chr3R 10076668 10077769 scaffold_15 2881511 2882604 - 21892|646 679
AGTGGCCGTAATAAACTGATTCCAAAGCCAAGCA
AGCTAACATAATAAACTGTAGCCAAACTCGAGTA
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TCTTTTCTATA-TTTTGTTACGTTTCGATTTCGGTTTAATAAG--------TTTCCTATTAAAAGATAATGGTTTTATAACT
TTTTTGCTATATTTTTGTTATGTTATTTATTTGTCCAAGCATGGCTACGTTTTTGCTTATTAATCACACCATTTTTCTGATT
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AAACGAT--CAATATTA---------------------------------GCCATTATCAC--TTAAATTTTATACATATATATATATTTTT---GTAAAGTTTA----TAATGCTACTTTTTTAAAAATAATATA--------------------------------------------------TTATATCAATAT-AATAAAAAATATAC-----TGCGAGCATGT
TGGCAACAACAATTTTATTGGATTGTTTTGTTTATGCTGATGTTAATTATGCAATTATTACATTTAACATGAATATATATTTTTATATTTTTTATGTAGATTGTGACAGTCAGAGTATTTCCTACGAACTAGTCTAGATGGGCTACCGCATCGAGAGCTCAAGAGCTGCCCGAAAGCCACTTGGCCCAATCTTAATGTGAAGAAAAGGGATACAGAGATGTCAACAGGT
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TCTAAAGAACA---------CGGCACACATTAGGCAACGAAGCAAATATATCCGAGCGATCGGAGTGAAAGAACAGAAACTCGATGACGTCAGTATTCAAGGGGAGATAATTAATAATTGTAAATTAAATATGTT------ACGTACTAGCTACCTACCACATACGGATAAT------GATATGCAGATCAGTTAGCTAACTAGACTAAGGCTCCACAGATTCTATAAACAAATAC-----------------AAATAACTAAGCT------------------------------AAGCT---GATAAATAT-----------AACATTGTTGG--GCTTAGGCGAATAACAGAT-------------AAACGATGGGAGAC-ATTAAAAACAATTACTTACAGGGGCTTGTGTTAGATTGTACATATAT--------------------------------------------------------TGCATACGAATTATAAATATCTATATTATATATC-TACTGTAATGAGAAATTAACTAACCTTAAGTCACCAGGATTGTGTAAGAAGAAACTATTTTATGTAGAGCTCTGC---------------GTATTTATGTTTGTTACCAATTAACCTACTGATTA--------ATTGAT------------TGAACTAAGAATAATAT---------CCGCAACCACATGCTTATATATATACATATATATATATATTTAGAGAACGA-----AACCAAGCATCACCCTTGAAATTATTGTATTGTGAACAGGCAACCACAAC-----------------------AACAGCAG------------------------CCAATTGTAATT-------------GTACTAACTCCATTGATT----GCATATTTATTATTTTACACCTAAGTTATAAAAT-----CATGTACATTTTTGTGAACGTTTGT--------------------TTGCCTTGATTGAAGCTCA----------------------AGCGTAATCATAATTTGTAACGCCTATCTTTAGTT---------------------------------CGGCTCCCTTGTATTCTACTAGTTTAAC-----------------AATTCTTTCGCTTAAGACTAGCAATTAGTCCGCTCTGGTATTTGT-------CCAAAATTGTACACACACACACACACA-CAGCAGGCAGATATGTATATTCCTATCGGG------------GCGATCGGTCAGACT--TGTACAGGCAAAGTTCCATAGCATTTTTTGGCAGCCATTCAAGACGCGCGCACTTTTTGCACGCTGTCGAGGAATTTTATATTTTTATTCCCTAAAGAAAAAAGTTTAATAAACTACAGATTAAA--ATTCAAA
TCTAAATCATAGTTACACTCCCACACACA-----CACAAACACACACATATACACACATACATAAACATGGGA---AAACTCGATGATTTCAGTATTCA-GCGAAGATGGTT--TAACTGTATATGAAATATGTTTAAATTATGCATTGAATATGTAT-ACATATGTATTAGCTACCATATATGAAATTCAGT---------ATATTAAGGCTTGAAAGATTCTATATATATATACCCTATATATATATATTAACATAATTAACCTGGTCATGAGTATGTTGCAAATCACACGATCAAGATCAAGATATATATGTATTGTAACTAATAGCGTTAGCGGCTTGGTCGGTTTATCAACCCGTTTAGGTCCAAATCGCTGGGCAACCATTTAA--TGATTATTTACAGGGGCTTGTGTTAGATTGTAAATATATACAAAAAGTGTTAGGTAATTTAAAAGAATATGAATAAGACGTAACAAATCTCTAAGTATATAGAAAAGGAAAAAAACTAAAACATACAGCAAAATGCAAAAAAAAAAAAAAAAACAACAAAAAAC------------AGATGAAACTATTTTATGTAGAATTATGCACACATGCAAATTGAGTATTTACGTTTGTTGCAATTGAACTAACTAACTATTACAGATACTAATAATCCACTGGCCTAACCTAATACATATATTAAAACATGCCACACACACACACACACGCATACATATGTGTGTAAGTATTGGGTAACCAACAAGTAACTAAGCATCACCTTTGAAATTATT---TTGTGAACAGACAACACCAATTTAATTGTAAAAACAAGAAAGCAAACAACAAAAAAACAAATACAAATACAAATGCATAATTATAATTTATAATTAAGCACGTATTCGTGCATTTGATTTATGTAATTCTTATTAAATTGTAATTGTGCTTTGAAATGTGTCCATGTAAATTGTAAAATTCGTTTGTAATCGCAAAAAACAATATTGTGTTCTAAATTTATGATTAGTTTAAATGTGTACAATTGTTTAATATATTTTTAATGCGTAATGTCAGCCTCTTGTTGCCGGCTTTTAAAAGTAATCCTTATTTATTAAGCAGCTCCCCTGTATTCTATTAGTTTTATATATATATATATATATGAATTGATTCAGTTAAGCCTA-CAGTTAGCTCG-TATTGTATTTGTATTTTTGTCAAAATTGGATCTGAGAAATCAACCATTATCTATAAAACATACATTGTTCGATTCGGAATCACACGAAAGCTAGAAAGCATACGAATGTACAGGCAAAGTTCCACAGCA-TTTTTGGCAGCCATTC-AGACGCGGGCACTTTTTGCCCGACGTCAAGGAATTTTATATTTTTATTCCCTAAAGAAAAAAGGTTAATAAACTACAGAATAAATTATTTTAA
>trx 10089080 10090655|10402 chr3R 10090109 10090240 scaffold_15 2898074 2898224 - 5420|0 152
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GAGACATGTGTAGTTAACGGTTATTTCGATCTAAAATTTGGTCAATCGTGATACATTTTCATTTGGA--TAGCATACATTTTAATTATACGCTAGATACAACAGTTGTAAATGTAAGAGTTAAAACGTTGATATTACACATATATATCCTATA
>trx 10089080 10090655|10403 chr3R 10090241 10090531 scaffold_33 1123069 1123274 - -557|0 296
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TGAAA-----GATTTTATTTTGT------AAGATTATCGTTCGTAATGTTTTGGTT---------AATAAAGGCTATAT------TTTACACTAAGTATTT--------------------------TTCAAAAAAAAAAAAAAAAACTAATGCCTGTTTTTTTATACATTGCACTTTGCAAATATCGTATCAA--------GGATATGCAAAAACATTTTTCCGTACCGATT-----------------TTGCAATTCAAGATG--------------TCATTTTGATCAAGTTTT
>trx 10089080 10090655|10404 chr3R 10090532 10100494 scaffold_15 2898231 2908552 - 335747|0 123
TAAAAGGAAGATCAGTGTCAGAGATAAGAACTAAGTATGACGCTGGGCGTCGAAATTAATCCGTATACTCAGCAAAAGGGGTAGGTTTTACACATCTGAAAGATCCCAAGGGTGGAAATAAATC
----------------------------AACTAGGCGTTACCCTAGATAATCCAACCAATTTGGAT------------GGGTGCAGTGCGCCCATCCGAAACATACTCATCGAAGGAATACAGC
>su(Hw) 10130177 10130529|10435 chr3R 10126916 10130180 scaffold_53 323361 326741 + 73098|3645 3648
CGAT
TATT
>su(Hw) 10130177 10130529|10436 chr3R 10130181 10132105 scaffold_53 327059 328878 + 59374|0 365
TTTTCCAGCCCTTGATGC-ATG-CGTACAATTACCGCACAAAAACCATATTCTAGGAATTGATCGTTGATGATTTTTACAACATTT-GTATTTTTAAGATCGTTGGTTTTGGTACAAACACCAAGTGACCTTAAAAGAGAAACTTACCGTCTGTTGCTTGAATATTCAGACATCTTGCGCATTGACAAATTACCCAAAAACAAACAAACCAACATATTACATATCAAAGATATTT----TGATATTATTATATAGATTT------TATATATTTTTGAAT---TGAATGATGTTACCAAGCAATATATGCATGGCTATTTTTATAGTACTCTTA-TTAATTATAAAATATACAAATTCAATATTTT
TTTTTCATCATTCCAAGCGATGAAATTCAATTAATGCATGCTG--CATCCGCTGTGAAATACCCGAT-------------ACATTTAATTTTCTTAAGCATGTTGGTTTTGGTTTGAACACTAAGTGACCTTAGATAATGAAT-----------------GATAATAATGTACCAC-CCCATTGAACTGTTGTTTACAA----------------TTTACATGCTGATGATATTTCATATACTATTTTTAAACAAATTTATTAAATATACATCTTTATATATATAAGCTGTGATCCTGACTGATTTATTGATCACTA-------ATTGATCTGACCTAATTGAGAGCTGGGAAACTTCATTATGTT
>CG8538 10147101 10147507|10450 chr3R 10147101 10149085 scaffold_20 470246 472227 - 55777|0 422
CACAAGAAGCTGAGGGTGGGCGGTGGGCGGCTCCAGCAGCAGCAGCAGCGTCCGCA----TGTGGGCGCTCCT----CGCCCACTGGGTGGCGGCGAGGCCACCATCCTCACATAGGCGAAAGGATCGATCGCGCACCCGGGTAGCCAGTCAGTATTATGAATCCGTCT-GATATTCACCATAATCCGAACCGTCACACATTGTAGTTTTGAGGCAAGCTGTGTTCCATGTTGTTGTCGTTGTTGTTAACCTTGTCGTTGGCATAATTGTTGTTGTTGTTGTGCATGCATGTTGTAGTCTTAGGCGTAAAAATCAGGATTTAGAACGAAACAAACAAGTAACCATTTTGTGCTATAGTTTGATTCTAAATTTATGTTTT-------ACTTAATTTGACGAAAAAAATTATACTTTTGAAAAAT
CAAAAGCTGCGCAACGCGAAAAAGTTGCGGCCGCAACAGCAGCAGCA--ATCCTCAATGTTGTTGGTGCCGCGGGCACGCCCACT---CGTAGCCGAGGCGAGCATCTTGACGTAGGCAA------------CGCA---------TCAGTCAGTATTATGAATCCGTCTAGATATTTGCTATA--TAGGTTTAACATATATTG------TGAGAGCAACTGCGAGCAATTAGGCTCTTGTTATTGTTAATGTGCGTGTTGCTGTTGTTGTTGTCATTGTCAT-------TGTTGTTG--TTAGTCGTAGAAG--ATAACTGTAGTCAAAGCAATGAA--AATCTACTCGCGTCGAAAATGAACTCTAGTGCAATATTGTGTATAAAACTTAAATTG---------ATTATATATTTGTAAAAT
>NK7.1 10155846 10155945|10456 chr3R 10155627 10156823 scaffold_20 478551 479898 - 21666|307 415
-CAGAAGAAACCACA--------GTCAAATTAACTTGTGCCAAAAA-GTCGAATATTGCTCATCCACAAAGAGGATAAACTATCCCAATAAACAAAAGAAAAACAAAAA
CCACAACAACCTACACCTAGCCAGTCAAATTAACTTGTGCCAAAAAAGTCGAATATTGCTCA-----------------------------------------------
>CG31320 10184078 10184321|10490 chr3R 10183911 10186870 scaffold_20 508713 511640 - 95292|211 454
GATACACTTTACATATTAATTAAAAATGAATTAGATTTATTTTACCAATTTGTGTTGCAAATTAAGCTTCTTAGTAAACCAATTTAAATTTATATTGAAGATTAACAATTTTATAATCTCTTACAAACTTTAGCTTATATTCGGGTAATTGATTTAATTGACCTATATACATATATCCACTTCTCAGAACGAAGAACTGTTGTAAACAAAAGCTCCAAACTATAAAGTAAAATCTGCTCAAGCG
AACAAA---TACCTATT------------------TCTATTTT-----------TGGCAAATTAAAAGTAGTTTTTAGTGTTTTGCTAATTTTCTCTAGAATT--CAGATTTTCGGCCTGTTA-----TTTCGTTCCCATTTGCTCGATTACGTTAATTGCCTG------ATCTGTCGAATTCT--GAGTAGCAAATTATTGTAAACACACTC-------------GCAAAATGTGCACTTGCG
>CG8489 10206105 10206807|10514 chr3R 10205591 10206179 scaffold_560 1569 2101 + 6828|539 631
AAAATTCATGAAATTGACAATTAATAAACTTCAAATTG-------GAAGCCC--------CACATACGCC---ATGGATCCCATCACTCCGCC
AGACTGCATGAAATTGCCAATTAATAAACGGCAAATTGCTAAATTGAAAACTGAATAGGGCTCATACGCCCACACACCTGCTATCAGTCTGAG
>CG8489 10206105 10206807|10515 chr3R 10206801 10207423 scaffold_560 2294 2940 + 7137|0 6
TTCGCCA
GCTCCCA
>RhoGAP88C 10217096 10218496|10529 chr3R 10216828 10222633 scaffold_20 559170 564931 - 194066|331 1888
AAGATATATACATTTAAAAAAGGATTTAACCATCTGTTCGATGGTTGTTCGTCGTATTCGTTGTCTGTCGCAAAACTGACGCATTTATACGTAATTATATGATAGCTGGAGGATGATAGCCCCACTTCGAACAACCCAACGATTATGGAGAAAATCCAATTCTACCCAAGGACCACAAACATGAGCTTGCGTTTCATCCTGCAAAATGAGATGAG--AAGCTAGATCGG-------------AGAGAATATATTCTTGTAAATAC------ACTTAGTAGGTTTCTTCATTTAGTTTTCGA--CTTAGACGTAACTGTT---------TAGTTTACTGTATTATATTTATACGTGGTCCTAACTTATGCGCA----------TACGTTTACTATACGACAATAGCAATCTAACATCCAAAATACTCAACACACGTAAATATCACAAAGTATATATTTAACGATTTCTCTTGCTAAAGTTTACATCTACGTTTACGGCACTCCAA-ATCTTTAATGTTAATTAGTTTGTAGTCTTGGCAATATGTTAAAACGTATATTCGGGAAAA------CAGAAAACAG-CAAAAGCAACCTTAAAATGTGTAAAGCAAATTCAACTAGTCAAATTTTATAAATTTAAGCTAAAGTACTAACCCTAAATACACTCATCAACAATCACTTTGCCACTCAATAGTTTTGTCAGCAGATATTGATTGATTTGGCTTCAG---------------ATGTTGTTTGATTG------------ACGCCGCATTACCTGAACATGTATCTGTTAATAAACCGACACTAAGATGTACGATTGTTTCCAATATGCGGTGTGACATCAAAATGAT-------------------TATCACTATCATTAGTTTATGGATGT----------------GCCCTAAGATCCCCGATCAATATATATACATATATATATATATATATATACTATACTCTA-TAATATAGTTTTATATGTGTCTATAAATACGTTACCACATAAATCTATAATCGAGTGTGCGAGTTACCAATGAATGTCGGTAATGGCAAGAAAAAAGCAGATCAGAAACACAGCAACAAAACTAACCAATGTGAA--------GTGTATAGAAGGGAGCAGTAACTCAAATATT--CGATGCAT-------------------AAAGGAAATCGCAATAAAAGTGCATATTATGGAAATGCGAAACATATAAACCAAATACTT--TGTCTTTTAGCTTTTGGGAATTTTACTATTATGTGGGTTACGAAAAAAATCAAGATTTGTTGACATAGGTTT---TAAAGAATCTGCCGAAAAATAATTTTATATATCTACGATTCTGTAATTTTGAAATATATCTTTTATATTTTTTAATCGGGTTTAAGCTTAGTGGCGCTCCTCTCGCATTTTTTTGGAAGCAGCAAT-TTAACCGGTTCAGTTGTTGTAGA--TGGCGCCAAGTCTAGTTGCTAGTGCCCGTGTAGGTGGCGCTTGCCGGTGATGC-----CTGCATAGGTGGCGCCACTACACTGT--A
GCTGACAATACAACT--------------------------TGGCAGATCGAAATA------------CATAAGACCCACACAC-------------------------AGCCCGCTAG---CATTTCGATAACCCTAACGAGTACACAAAAATTCAA---CAACCTGGAGGAAACCACGTTGATCTTACAGTACACTACTCAAAGCAAGAGAAGTAAAGGGATATAGGTATATATTTTACTACAATATATATTTTTGTAAATACTTAACTAGTTATGATAATTCCAAACCTATTTTACGAAGCTTCAATACGTTTTTTGTTTAACTATAATTTACTGTATTATATTTATACATGGGCTTAATTTATGCATACTTTTACTTTTACTTATACTTTACAAAA--AGAAATCTAACATCCAAAATACTCAACACA--TAAATATCACAAA-TGTACTTTTA---CGCTATCTTACAAAAGCTTCAAATTATGTTTATGGCACACCAATATCTTTAATGTTAATTAGTTTGTAGTCTTCGCAATGTGTAAAACGTTAAACATGGATAAATACTTCTAGAAATCAGAAAAAAACGACCTTTTAATGTGTAAAG---------CTAGTCAAATTCTATAATTTTAAGTTAAATTACTAACCCC--ATACACTCAACAA-AATCGTTTACCAA---------GTTGTCGAAAAAT-TGCATTAATTCGGTTACGGAATGAAAAAAAAAACAAGCCAATTGATTGGATAAAATTATTAATATACAGCACATCTAAATGTATTGCCCAGGCAAATGATA--AATATATATG-----------TATATGGTGTAGTATCGGAGTTATCGCTAGTTTTAGATCTTCGTATAAATATTATTGATGTATGTATGCATACGTACATGTATGAACCTTATGATCCTTGATCAATATAT-----TGTAAATGCCCATTTTGGCACATAGTTCTATTTATATATATCTATGTATATCTATCTATATATAATACGATAAAGT----ATGGCGAGGACGAGTTATCAACTACTACAGGCAGCAATGACAAATAA------------------AACCTAACCAACCAATGTCAAGGAATGGTGTGTAGAAAGCGGAGCATATACCTATGTATTACTTATACATAATCAAATAGATACAACTGAAAAAGAAACACAATAAAATTACTTTC-----AAATGTGCAAAATA-ATTTTAAACAATTCATGTTATTTAATAT---GGAATTTTA-----AATTAACTTAATATATAAATTAGATATCGCGGGGGACAGTTCAGGCAAATAATCGGC----------TCTAATCTACAGCATATGCTACAGCC----------TCTTTTACAATCTCTCGATTGGTATAATGCCAAAGAGATTC---------------GGAAACAACATTGTCAACGTATTTAAATGTGGTCTGTTTAATATAGGAATTAAAAGCTAAAACAC-TGTTAGTGGCGC-CACCTATCATGCAGTAGCTAAATCGGCTAAATAATTAAACTGTCAA
>CG8464 10335616 10335707|10650 chr3R 10335700 10337285 scaffold_20 681566 683081 - 64308|0 7
TTTAACCT
TCCAGTTT
>CG8461 10338350 10338418|10651 chr3R 10337471 10339438 scaffold_709 4486 6458 - 67738|911 980
GACTTACGCTTTAAGTATAAATGTATTTTAAACAATTAAAAGCACAGTGCAAATA-AGCAAATCTAGCCC
GATTT----CTTAGTTATAAATGTATTTTAACAATATAAAAAT---GTTTTTATATAGTATATTTAGCCC
>Pde6 10339613 10341352|10652 chr3R 10339528 10339669 scaffold_22 314505 314651 + 3222|86 149
TGTATATTTCTTGGTCATTTCGTTGCTTGTTTTTGTTCCTTAGATTGAAAAAA-------AAAA
TGCGAAGTCCTCCTGCGTTTGATGGCCTCATCATTCTTATAAGTTTGCTGGAATTTATTGAAAT
>Pde6 10339613 10341352|10653 chr3R 10339670 10340280 scaffold_22 314894 315497 + 3198|0 653
CCACA--CGATTGTGAGCACAGCACAAATATTGATTGATCGAACCGCTCGAAAAAAAGATGGAACATA-AGGCAGCAATTGAAGATAAATGGATAATACTTTTCGTA-------------CTGTGTTTGATTGTA---TAAATATAAATATTAGCTTAAAGATACACAGCAGTCAATTTTTGAACTCGAACTCAAGCAAAATGCGAAT-ACGATAGATATT---TGGCATATAATCGCACTCGGTTAATATGAATAATCCGGTCCCACACTCTCCTAGTT----GTTGCAATCAAGTTTACTTTAAATGTGTGTACGTGTACAAAGCAAACTACTTATATACTATAGAGCATAAATATAAACTAATTATACATATACGGAACCTATATA-AAATATTTACATTTGACTAATGTATCTATAACTG--AATTGCTTAGAATTAACGTGTTTAAGGGCATTTTGATTAATTTTTTATTGGTCTGCGTGTGCTAATCAAAATTGACTATAAAAT----------GTCAACAAAAATCAAGTTTTACAACTATTTTTCTAGTTACTCTGCCGC-TCGCCTGAAAATCAAAATCCAGACAACTTTACGAGCCGATCT--AAACCCATTTCTGGATTTAGTTGTGACAATTGTATTAATTG
CAACGTTTAAATATTAAAAAAAAAAAAATAATAATAAATATAAT------AATGAAAAATTTATTGTAGAGACAAAAAT---AAACACATATAAAATGCGTTGCGTGGCGTCAATTTTGTCAATTTTTGAATTCAACTCAAATCTAAATGGCAGTTTAAGCAAAT-CGTTAGTATATTCT---ATTAGCACCTATTCAATTAGTGATTAACTATTTATATTAACTAAAAGATATGCGCACT-------TTTGTGTATCCCAATCTCTCTATCCGTCAGAGCAAAGTTGCAAAGAATCTTACTTTA--------TGTGTGTATAAAGCGGTC-AAGTATATAGCGTATTCTAAAAATATATACTCAT----------AGAAATATATATATAAATATATCTATATGTATGGGACACTTGTAATTGTTAACAACTAATTGCTAATGCTTAAATGTAAATTATAGGCACCTCATTATTTGTGTAACTGCAGCAA--AACAGTTGCAACAAAAGCAAAAAGGAAGAGAAAAAAAACGAAAT------ACTATTTTTCTAACTATTCTGTCGCGCCATTTGAGAATCAAAATCCAGACAACTTTATGAACAAACTTTAGAACTTGTTTATGAGTT---TTTTTTCAATTGCTTTGCTTG
>Pde6 10339613 10341352|10654 chr3R 10340281 10340356 scaffold_22 315631 315711 + 2475|0 80
AACTAATATACATATATTTGTATGCACAGA-GGTGTGTATTTACGTAG----CAAACTATAGCAATATTATATGATATTTC
AATTAACCTACTCATATATGTTTAGCCAAACAACCAGAACTTGTGAAGAATATAAACTATAGCAATATTATATGATATTTC
>Pde6 10339613 10341352|10655 chr3R 10340488 10340803 scaffold_22 316024 316312 + 6311|0 326
ATGAGCATTAGGCAGAAGCAAATGCAGTTGCAATATTAAGCATAAGTGAATGTCAAAATATGTGATCTATTTACGGTCCCGCAGGTGCGAAGCCC--TCGGGTTGAACCTTTGTCGGATACTATCCTCTCCCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCGACCTATCTATCTAACTATCTGTCTGTCGCTTTTAGGTGATTAAAAACCGC---------GAAACTAAACTAATTAACTAAGTAGATGGAATCCAACCAACTAGCTAAGAGTGTACGTAGCTACCCTAACCAAAATCGTGCTAGTCAAACAAACGTATGAGATACTA
ACAAACATACCCAAACAGCAGAGATAATTGCAATATTATACCTAAGTGAATGTCAAATCATGTGATCTATTTAAGGTCCTAAAGGT-CAAAGCGCATGCGCGTTATGCCTTT------TGGTATACTCTCTCCTTCTCTCTAACTCTCTAT-------TGGA---ATCTG-CGAATTACCTGTA---AGCTCTTAGGTGTTTGTACTCCGCTCTCCAGCTAAAACCAAACACTATATCTAAATAGATT-------ATCAAT--ATTAA----GTAGTTCTCTTTCGTAATCGAAACCGTGCTAGT----CAAGCGTATGAAATACCA
>Pde6 10339613 10341352|10656 chr3R 10341102 10342571 scaffold_22 316313 317727 + 60622|0 291
CGAAAGCCGTCCAATTAGAATATGGCGACTCCCTCCAGCACCACGGGCAGTGAGACTGACCACAAGTGCGGAGGGGGGATGACCGAGTTCTAATTG---GATTTTGG----------------------------AGTTTTGAAAACTCACATTAAAAATCTTGTTGTGCTCCACCTGCAT---CTACTACAGGATTTGGTACTCG---ATTTCGTTTGGTTTGAATGTTTTTGTTTGTGAAACTATG----TATTTCAATAAAATAACTTTTGCTTTAGATGTCAAGACAT
CGAAAACCCTCCAATTAGAGTTTGCTGACCCCCTCCAGTGCGGCTGGCAGTGAGACTG---ACAAAAGCGGAGGGGGGCTGACCGACTTCTAATTGCCTGAACCTGGCTGGACAGTGTGCTAAGCAACAAATGCCAGCCAGAAATCCTTAAATTCAACAACTTAAATGACATTGTCTTAACTAACTACTATAGTATCTAATTTATGTGCAGTTCAAGTTGAATGAATACCTTTTTTGGTTACTCTACGTGTATATGCCTATAAG-------------TAGAGAACAACACAC
>CG8087 10390044 10390075|10715 chr3R 10389897 10390836 scaffold_14 146963 147874 + 1980|159 190
GTACGCGGAATTCAATAAAATGCTCAACAAGA
CGTGGCGGTCGTTGGTAGAAAGATCAACACGA
>CG31313 10392302 10392529|10719 chr3R 10392461 10392504 scaffold_22 384056 384101 + 525|0 45
CAATTTGCAATACAATAAAGGTG--CAATCTCTGGTGCTTGAGAAA
TAAACAGCATTTGAATAAAATTGAACAGCTCTTTGAGCAAGAGAAA
>CG31313 10392302 10392529|10720 chr3R 10392505 10392746 scaffold_22 384105 384346 + 5004|0 24
GGCGTCATTGCTGTGTTTAACCATA
GGCTGATCCGATCTGCTCGGCTCTA
>CG8066 10393332 10394128|10722 chr3R 10393305 10393571 scaffold_1 4703584 4703871 + 1956|27 291
TAAAGTCATATATTCATTCTTATCAACCTTCATTGAATAATCATTATCTCTCGAAAAGTAGAAATGAAAACTTTAAACATTTGCTAACGACTGACTCAAATA----------AAGGTGTACTCACACAGAAT--GATTAGTCCATACAATGTTAATGCTCCTGACCTGGGCAAACAATTAAAATGATATCACAAAACGACAGGC----CTGTGC---------AAAACCAAAGTAAAATATTAACCAATAAACTGAAGATTAAGT
TAGGGTATTATATTCCTTTTTATAAGTATTTTTGTGATTTGCATAACTTACTTTAGGTTAAGTTTATAAACTTTAAACACTTACAA---ATTCAATTAAATAACTATTGTTTAAGGCGAACTCTGCTAGATTTGACTTGAACTTGACATTGACATTGACCTTGACCTTGTGACATAAGTGACTGTGTGTTAAAAATCAACAAACAAATCTGTGTACATACATAAAAACCAAACCAACA-ATAAGTTAATACAAAACAAAGTTAGT
>CG8066 10393332 10394128|10723 chr3R 10394083 10394127 scaffold_22 386871 386927 + 300|0 56
AGGTTTTACC------------TTAGACCTACATACAGTTTAACTCTTATCTTAAAT
AGATTTAAACAGCTGCTGCATGTTAAATACACATTAAGATCTAATATCGTTTTTAAT
>CG8066 10393332 10394128|10724 chr3R 10394128 10394621 scaffold_22 384132 384632 + 9110|0 0
A
A
>Cys 10394753 10394891|10725 chr3R 10394629 10394854 scaffold_5 1958338 1958620 + -753|174 286
ATAAAAAAAAAAACAAGATACACGTGA------TTTAAAAAATGATTTTTGATTAATTTTCGGGGAACTATTGTTGCA-AAGTAT----CCAATATATTGTTGGGAAAAATAA
TTGCAAAGTTCTTCTAACTACTTAAGACGTCTTTTTATTGGATTATTTTAAATTAA----CAGATCGTTATAATTGTGTAAATATAACATAAATATCTATGTGTATAAAGTAA
>Cys 10394753 10394891|10726 chr3R 10394855 10395242 scaffold_22 386882 387287 + 6773|0 36
-AGATTCTTCGTGAGAATTGCCCTGAAAGAAATAATA
CAGCTGCTGCATGTTAAATACACATTAAGATCTAATA
>CG7987 10396194 10396454|10729 chr3R 10396191 10396397 scaffold_22 387938 388127 + 5269|3 208
TATATACAAACAAAATCGGAGTAAATTACCTCAAGGTATCGTGCATCGAAAAATATCGTTGATTTATGCGTTATTTAAAATATGGAACCTAAACCTATTATAGAGAGAATAGTTCGTAAGGCTTTTAAGTTTGTACCTCAGCTTTTGTTTTGAAGAATTGGTATGCTGGAATAAATACATC--ATTAAATGGTTTTTCATTACCTT
TATATGCACATATAACTACGGTACTATAAAAAAAAAAAAAAAACAACGACAGAT--CGTTAATAAATGCGTTATTTAAATTGA----------------ATAGAGAGCTTAGCTTTAAGGCCTTTTAAATTTGTACCTCAA-TTTTGTTTTGAAGAATTCGTATGCTGAAGTAAATAAATCCAACTTGGTTATTTTTCTTTTCATT
>put 10446046 10446755|10781 chr3R 10444772 10448070 scaffold_22 444314 447778 + 75319|1547 2321
AAGCGGTACTAAGCCACAGACCAGCCAGCGGA-TCTGTGGCTCTGCAAAAAAATCAGTTGAAGCTTTTTGCTTCGTAGTGGATAGTTGATCGTCGAGGTCGTAAGACGTTTCGTTTTTAGTTTAATAGTTTGTAGTACCATTATAAGCAGCTATAGAATGGGTTGATTTATACGAAAGAAGTCGTGTAAGATGTAACTTTTCCTAAGGGAAAAGCCAA-AAGCTTAACATGCCAACGATTCTTTGTTATTATTTTC-TTTAAATT-------ATAAATCGACTCATTCGATGTTAACCCGAGTTCTTAAATCTGTTGGAAATGAGTGGAAACGTAC------ACTAAGCAACTTTGAACAAAGAGCATTAGCTATGTCCA--------GAGACGTGGTAGTTGCTAATCCGACATTGACTTCATTGACTGATAACCATATATAGTTCTATATAAATCATACATATAACGTACAATTTGTTTTGCCCTCTGGCAGTAGCCTGTGTGCATATGTAAACTGTTGAAAATTATCGTCAAGCCTTTTAAAGTATAATTTTATTTGTACGTTATCGAATGTCTTCA-----------TATAGTAGTAGTTTTATATTTAAAGTTATTTTCAA-AATAGATTTAACAATTTTA--GTTTACTTTTTAGTTGTAACGTTTTTATTTCGCGCTCAAAC------------GTGCA------------TGCGTTTTA---ATGTTGTATTTTAAATAAAAATACTTTAAACTCCATCCTAACCAT
AAGCGGTACTAAATCACAG-CCAACGTTCGTAGGCTGTGATTC-------GAATACCCCGAACGTCACGTCTTCATTTTTAATTTTTA-----------TATTCAACAATTTAGTTTTGCATAAGTATTGTG---------CATAGGCAGCTTT------------TATGTACACATACACTTGAGCGAGCTGCCATTTATACATAGATACATACAAACACACGGCGCCCGCCCGCCCACCTTAGACATTAGCTTAGTTTAAGTTAAACAGAACAAAACACATTACTGGTGGGCTACCCTAG-----AGATTATTTGGAATT--TTTGAAATGTATCTTCAGACTGGGCAATTTTGAAAATGCAAAATTCTCTAGACGCACATTGCATGCATTACGTTTGTAGCTCATCTCACATTGACTTCATCGACTGATACCTATATACA-------------CATACGTAAA---TATAATTGTTTT--------------------TGTTTATACTTAGTTTGTCT--AATTATTGCCCAGAATTTTAATTTTCTTGTAAACCTGTAAGCTGTTGAAT-TCTTTGCCAAGCCCAGCCATTGTGGTTGCTTTACTTTTCATTTAAGCCTAGACGAAACGTTTAAAAACCTAACTGTTAAGTTTTAAGT--TAACATTTTAATTCTGTACACATATCGTTTATTTTTGGTACATTTTATTTGATCTGTGCTTTAATGATGTTGTATCTTAAAT--AAATACTTTACACATTTTTTTATAAGA
>CG7886 10452395 10452731|10788 chr3R 10452012 10452456 scaffold_20 346003 346506 + 9063|445 509
CAAAAATATACTTTGGTCTTACTAATTT---CCATTAAAGATTTATTATTTGTGTGCTCCCTAAG
CAACAATAAACTCATGTAGCCCGAATTGAAATTGTTAATAAATCAGTATTTGCGCCTTCCTCAAA
>CG7832 10470391 10470656|10795 chr3R 10468080 10474368 scaffold_20 361258 367614 + 122957|2561 2899
TT-CCGGCATCAG----------------GTCGGATTTATGGCCTACAGAATTT---------ACAGATTCA--TTTAGAGAGACAGAGAGAGAGATTT------------TCAAGCTTGATTTCCCATTCACTTTTAGGCAGTTTTCGCTTAGAATTTCGGTATTTTC-----------TTTTTGGCCAT------------------TTCTTACCTGCGATTCTAGTTTGGCACAATGTTTCTATATGCAGCTTCAATGTTATGCATGCATTCACCAGCA-GATATGCATGAATAAAATAGCATTCAAAAACCATATAG---TTATGCGTTAATGTG
ATATCGGCCTTAGCCTCACTCGTACAAGCTTCTAGTGAGTCGCTTTCAAAAGTTCTTTCGAAAACAAATGAAAATTTTGAACAAAAAAAACACACACTTAGAAAACAAAAATCTAACTTAATTTCTCAACGTATGTTGAACAACTTT----TATGTTTTCTATATTTGCCAAAATTTCCTTGTTTGGCCATCAGAGAAGCTTGACAGATTCACTGGCTCCGATTTCTTCTTTAGAATACACTTCTATATACTACCTA-----TGTGTATGTAT-----AGCATGCGATGCATACATAATA----ACTGAAGCATCATATAAATACTATGTGTTATTGCA
>Rad17 10486891 10487064|10807 chr3R 10483975 10488923 scaffold_20 375259 380099 + 120249|3127 3300
TAAATCAAAACTATTTATCTGATGTTAAAACTAAAGTAGCAAGGAAGTTTTTAAAAAATGTCCCTAGGACCAAATATGATATCTAACAATCGCAAAACCCAGTTTATTATATAAATTAAATGTACTGCGCATCCCACCGTAAGAAAATGAATAGCGGTAGTTATTCGAATTCAT
TTATTTATAACTATAT-TGTAATGTTTTAGTCAAACCAAAAAATAGGTC-----GGCATATTTATAAAACAAAAAATTCCGT-----------------CAATTCAGTATTACAATTCAACGTTTT---TATTCAGTGACAA----------ATCGGTTGTT-TTCTATACAAA
>Neu3 10493569 10494064|10811 chr3R 10491530 10497864 scaffold_20 380790 387235 + 187731|2182 2713
ACCAGCACAATTAACTACAGTGAAATACGCTTGCACTGCCACAGAAATACAGCATGACTTTGCGCTTGGCCCATGGCATTTCAATATCATTGC-AGAATTTTTTATTTT----TATATTGACCTCGAAATCAAATGGGTTCAGTGTTGCAGATTACGAATTATTAGGATAGGGTTCTTTTTGTATTATTTTTCTTATATACATTAATATAGTCGTTATATTGAGAAATACACAATCCTAGATTGAGAAAAAAGAGAACACAAATAGAATATACGTGATTTAGT----GAAAGTATTTAGGATTTTTTTTTAATCTGCAATGGTATATCTATAATTTGA----AAAACCGAAGACAACTCTTCATTTTCGTTCACATTTTTGTG---TTAATGCCTCATTAACAATCAAT--TAACCCACAATCCCCACTAACATAGTCCATAATTT----GAATTTG---TTCCTAGTTTTATTTTTCCTAATT---------TTGTATGTT--CTGCAAATAAATGTGACTCTTTAACTTT
AATAACAACAACAATTACAACAGCA-ACAATTACACTGCCA---------AAAATAATTGCATACTTG-----CGGCATGTGAAGCGTGTTCCTTTTACTTTCCATTTTCAAGCACCTTTTCCCCGTTTTTATTTGTGTTCGTTTAACCTAATTTTATAACTTTAATACTGATGTGTTTGTGCCTTAATTTTAGT-TAGTTATAAGTGT--TCATTCTA--AATAAATATTTGATTTTAGTATAA-----------------------------TGGCTTGGTGTTGGAAACTATGTTAACATTTGTCATGCTCTATAATGTTATAATTCCCATATGATGCTAGAAATAATATCAAA---ATAATATCATTATAATCTTTATGTATTTTATATTTTATATACAATTGATAATTGTTGATAATTTTTTAAAAGTTAGTTGTAAATCTAGTAGCATATGGGATTTTAAGGCCTTTTGCTGTTAAGTCGCTGTTAGCTGCATGTTAACAGCGTGCGCATGTTATCTACTCTCTGT
>CG31316 10511027 10511069|10825 chr3R 10510625 10511123 scaffold_20 402617 403042 + 1640|416 459
ACTACATATAAATAAAAGAGCAAAA-CAATTAAATTCGTTCAGT
ATCGCATTTAAA-------GCAAACTCAATTAAATTCGTTCAAT
>CG7530 10550472 10550880|10872 chr3R 10550417 10551684 scaffold_22 973720 974928 + 43754|70 504
AACTTGAAGATCCGAACATCTGAGTTAAGATCCGAAGATCCGAGGAGCGGAGATGGAATCCGGGACTCTAGTAGACTAAAGCTTAGTGTAAATAGTTTATGGGGCGCTCTTTATCCGCTAA----TAACTAATATTTAGTTGTAGTTGTTGACCGATATGATTAATTTATGTTTAATTTACCAATTAGTTAGGGTTTCGTGTTAGACA---ATCCAGATCCAGATAGTTGGCATCGCATAAGCGGCAAAAAGGTTTCTCTCTTTATATCCTAATTGATTTCCTTTAATATATACAATTAAACAAT---GTCAA---TGAAATTGCATGTGTCTTGAG----CTGAAGCTGTGTTAGTCTTGTTGACTCAATTT---------TTACAATTCATAAAATGCAAATACAATATCAAACGTACAAAGCAAGCGAAATT
-------------------CTGAGTT----TCC---ACTCTGTGGACTGG--------------------------TAATGTCCATTGTAAATAGTCTA------------GATGCACTAAGTTTTAACTAATATTTAGTTGTAGCTGTTGAGAGATA---------TATTGTTAATTTATACAC----------------TTACACACACACACACACACAAACACACACAGACATATA-----CACATAGACTAATGCGTGTGTGTAATAAGGGTTTCCAGTTAGTGTACTTATTACAATAATCGAGTGAACTGTGAAGTTGGTTTTTTATTAATGGCCATGAAGAAACGTGAATCTGGTTGAAACTATTTTATATACACTTACAATTTGT-TAATGCAAATATATTAAAGTACAAAAAAGTTATAAATAATT
>eff 10558412 10559216|10882 chr3R 10558240 10560160 scaffold_22 981617 983704 + 47341|187 1083
TGCGTTCCAGATTGCAG------CAGTCCAACAGAATCAGCAAATTCAACATCAACAATAGCAGAAGTAAAAGCAGATGCAACAACAACAG---TAAAAGCAACAAAGATAACATCAACAGTTTACAATAGTCAGATTCAGAAGAGGAGGAGCTGCAGCAGCGTCATTGTAAGTGGCAATGGCCGCCGTGCTGTTGTCCACAACAATAGCCACAATATCAGCAGGAACTGCGGTCACCACCATAGCAGCAACAAACACAACACCAACACTCGCCACAGCAGCAACATCA---TCAGCAGCAGCTGCAGCAGCAACAACAGCAAGATCATCAACTGCCGCAGTCATTTTCGCCGCAGCAGCCGCTGCTACCGCCTTCGCAGCGGCATTAGCATTAGGAGCAGCAAATTTGGCGGCGGTACCAAGAGCAACGGCAGCGGC---------AAAGGCGTCCTTGGGGCCGCAGCAACATCAGCAGCTGCAGCAACATCAGCAGCAACAGCCGCTGCAGCTGTGGCAGTGGCAATTGGAGCAGCAACTGGCGGATTGGTGGCGAACATGCGATTAATTGTGTGTTTGACCG-------------AACAGAAACAG-------------------------------AACAGCATAA-ACGGAAATAATTTAATAATAATTACTGAAAA-------AATGATGTAAGCATTAAACATTAAAAGCTAGACAGCTACCAACA--ACAGCATC---AACATAATAAGTTTAAATACAAAGAAAAACAAAACTACAAATAAAAATCAGCTGGAAAAATTATTATTATTATTATTATATTATATTTAAAGAACCGGAAAAATAAAAATTGCAAAAATTCAAT--------------TTAACATCAAGC
TGCGTTCCAGATTGCAGCAACAACAGTCCAACAATAACAACAG---CAACAACAACAACAACAAAAACAACATCAGCAACAACAATAACAAAATTAGCAACAGCAAATAAAACATCAAC-------------------------------AACAGCAACAGC---------AGACACAACAG------------------CAACAACAGCAAAAACAACAACAGCAACAAAGATAACATT-----TAACAATAGTTACAACAGCTGCACACTCCCCGGCAACAGCTTCAGCTCCAGCTCCAGCTCCAGCTCCAGCTCTAGCTCTAATAAGAACGCCAACAACAATATCAAAAGGAGCTGCGGCTGCAGCAGCAACAGCAACAACAACAGCAACAAGAACAGTAA---CAGCAACAACAACAACAGCAGCAGCAGCAGCAACGAGTGGAACGGAGGCAAAGTACCAACAGCAACAATAACAGCAGCAGCAACAGTAACAGTAACAGCAACCGTAACAGTAACAGTTACTGCT--AACAGCAACTGTCAAATTG---------CCGCCATCAA--GTTTATTTGGCCGAGAAAACCGCAGTAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGTAGCAGCAGCAGCAGCATGATGAGAAAATAATTTAATAATAATTACTGAAAACAAAAAGAATTATGTAAGCA-TAAACATTTAAAGCGAGAAAGCTACCAACAACACAGCATCCCACACATAATAAGTTT----------AAAAACAAAACTACAAATAAAGATCAGCTGGAAA----ATTATTATTATTATTATATTATATTTAAAGAACCGGAAAAATAAAAATTACAAAAATTCAATTCTCTATCACGATATCGATATCGATT
>smp-30 10571623 10571877|10899 chr3R 10571728 10572853 scaffold_48 563675 564774 - 42086|0 154
ATTATAGACTACTTGTATAATAGCATTTAATTAAATAATCAAACATTTACTTGTATACTGAACTAATGCAGTT--GGTTTTTCTCTTATTTTTGGCATTTAC---TAGTTTCCAAATATCTAAAAATGTGCCGAAGCTCTGTGAAGGGCATATCT
-------AGCACACGCACAATCACA----------------------TACTTATA---ATAATTATGGCACTTCATGTTTTTCTCTTGTTTTTTACCCACACAATTATTATCGATCTAACTAAATATCAAATGACACACGGTGCACATTGTATAT
>btsz 10629811 10632901|10964 chr3R 10628462 10629870 scaffold_22 1060111 1061518 + 50665|1379 1439
TTAAAATAGTGTTATAAATTGTGAACAGCAGTGAATCAATAAAATAAA-GCAAACTTCAAA
TTAATATTATGTTGAATACTGTGACCCA----AAATCAATCAAATAAAAGCAAATTTCGCA
>btsz 10629811 10632901|10965 chr3R 10629922 10630399 scaffold_22 1061581 1062137 + 1659|0 574
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TACACAGACAGCAA-ATTTTGAGC------ATACCAC---AAATTGCATATAATGAACAAACACAGCTTGGGTTGGTTTATTAATGGCTCGCAGCGTTAGTTTTAATCAAATAAATGAGATACCTATTATTATGGCAACCAACAATTCAATATACACACACACACAAACAAATATACAAATATACATATAAATATAAGTATATATTTTCCACAAACTTTTCCCTGGATATTACACCTCTTTTAGGCTTAAGTTAAGA---CTCTGGCCCTT--ACTTTGCTATACAAGATTTTTCCACTGAGAGTTTCAAACAGGGCTAAGCGACCTCTATTTTGTAATTTATAAGACTTTCTCTAGTTCTCTAAAAAAAATGCAAAAAGGAAAAACATTAGAAAATCCCACAAAAAAAGTAAAAACTTTAAATTGAAGCCCTAACATTTATGGCATATATGAAGTTAAATATGCAAATGTTTGCATATTCCTTTACGAG-TACATGC--CCCATGTACACTTTACTTATACTTATGTAAGAAATTACTACAGGATTACAAAGTTTACACACAAATACACACACA
>btsz 10629811 10632901|10966 chr3R 10630513 10632872 scaffold_22 1062398 1065053 + 26745|0 2894
ACAAAATTGCAGTTAGAATTGCCAATGGCATCC-----TGCATTGCATTGTATTGTATTAATTATGCGATAATTATCAATTA-ACGATCACGTCGACTCTGAGAAGCATTACTAGCGGTATAAGA---CAAGAAACGATTGTAACCTTCGC----------------AATTTAGTGTTAAGAGTGTG-----GAATGATGAATACTGTATTTCTGAATACTCGAATACGTCGGAAAATGAC-----------------------------------------------------------------------------GCGATGATGATGCAA---------------------------GTAGCGCAGATACGAAAAAGCAAAAAACAAAGTAATCAAGGCAAGCGAAACTAAGCAAAAAACCTTATCAAGTTTATGGCACTAATTGTAAGCG---CAATTCTCAGCTATTCGATGCAGATAAAAGTTAAAATAAAAA-----ACTGTAAAGCGAAACGATGCGGTCCCAAGGTTTGGACCGTCTA--------TACATT-------------------------------AAGACAATTTGTATGTGTGTGTTTTTTTCCACCTCTCCCCTCTGAGAGGCAATCGCAATTG-GCATACTATATGCGCTAAAC-TACGATAA-AACTACAGATAAACACTACAGTTAAAACCTAGTTAAACCGAGGCATAAGCTTACTATGTA----TAACTATCCA-TAATACCCGAGAAATACAAATAACA---TTTTTGTAAATGCAACTTTTT-GGTTTGTTTCCATCTTTTTGTTTTC----------------------TAGACCTTAAGCGAGCAGCATTCTAAACT------------------ATATATGCATATATCTATCGTGACATCATACATATCGTGAACATTGTGCAAAT----------------CCAGCTAAGCTTCATGC---CACAACTACCAGCAAAAGG--------------------TAGATACCCACCATAGCAATCAA-TGAAT--CAATCAATTCCCATAGCAGCCAAA-----------------------TATTTCACAGCCCCCC-----------------AAATCCGATTATTGTGGACTTTATATAGGCATATACATACATAAATGAATAGCCCTTAGGTTGTAGAGGGCAGCTCTATATGATGATGAATTGTTTCA--------------------------------------------GAGAAATCACTTTTAAGAATACA-AAAACGAGTCTTATGAATGCTTTTGGTGTAAGT-------GGTAAATACCGATACCGATAATACAAAGTAATATTTAACGTTGAATGATACTTGACAAAAA--------------------------------TTTATAGA---TGTTTTTT-ATAAATGAAAATTGCTGAATCACTCGTTGCCTAAATACCGCTTGTCTTTTATACTCGATGTTTTCGAAACACACAAATAA-------TGCACATAAATA-ATGCCTGAAATTTCGTGATGATCTGGGCATAATATAGAACATACATTTACACACTTTGGTAGCACGGATCGCCACAAACGAAGCCGATGAATCAATGTGAAAATGCAGAAGCAGTTGAGTGTGGTCATAGAATACTTTCTCTAAATCAACATAA---------ATGTCAAACAATAAGCAGCAAATATTGCAA--------AAGTAATTGGTATTTAGTAGCATA------------GAATAAGCGCAAGTAGGAAACCACCATATACACAAAGATATACTTGTTCTACCCACAAATAGTTCATAATCTAAGATTAAAGCGTTTGCTGTTGGTTGGCTCCCTAATCTAGCCATAAATTTTGTTGGGAATCCAATCAAACCCACATCTAATATACATAAATATACACAAACACACGTGTAGCTATAGTTTATTCCCTCTAAGGTCTCCAAAGT---TTCAATGTTTACTACATGTATATTTTTCTACT---------ACTTACTATATATGTACTTA--------CCACC--------TAAATCAAGAATATCACTTAACCAAGGATCGCCGCAGGAGAGCAGATTGTGTTTTAACAATCGGC---------ACCCGATCCCAATCTATCCACTTACTCACTGAGATGGTGCTATATAGTCGTATATAGGATACTCGAGTACCCTCCGTACTCAGTCTCAGGTCGCGGGAGAACTATGAGAGATCTTTTTACCTTTTTACTGTGTACGTGCATTTCGGATTCAA-CTGAACTATTGTGAACTAGTGTTGATTATAC---ATGTTTATGAATGCGATGCAGACGTCACATCTATCTACTTTATACATATACATCTACTACTGAGATACGTTACTTATA---ACACCTTTACAAGCAGTGAGCACTCCG-GTCGCATTCCGTAGTATTAGGCGATTCGACGAGGAG------AGTATTTGTTATTAGTCCCAGTTCGCACAGATCGGGAAACCCTAGTGTTAGGTGA-----TTTCTATAGAACATTTTTGACGATTACGACGCATCCCC--TTGGATGCCAGGCAAATTACACAGATTAATGTTACAGATATTGATATCA-GAAGTATTTATATACCCATTGTATTTGTTAGCGTTCGCCAGAATTGCTCA-------------------TAGAAAAACCCAAAGAAGAAGATAC----------ATTTTGAATATTAACCCCGAAAAAGGATGATTTTGATTAGGGTTAGAAGCCTTTCCTCCGCCCCAAAGATACACACGTTGCGTTAATGT-------AGAAAACTTTTATTAGCGAATACACACATAAGATA
ACTGAATTTGAATTTGTATTTGTATTTGTATTTGTATTTGAATCGTATTGTGTTGTATTAATGAGGAAATGTGTAGTAATTACATAATAGGGT--ACGATGACAAGCATTACTAGGAACTTAGGAACGCATGAATGAAATTCAAGATTCGATTCGATTGATGGATTGATTCGAAAGTTAAGCACGCGATTTAGAACGATTTAGAAAGA--TTTTGAATACTCGAATATATGGCAATCAGACATACATATGTATACCTATATTTATATGTGTATATACACAGCATGTCTGGCCAGACATCAGCATTAGCATTGGTATTGGCGATGATACTGCAAATTATCTATATTGTTTATGTAGTTTAAGCAGCACA-ATGTTCAAATACGAAAAACCCAACAA-----ACAAACTTATTTAAAACAAAAGCGTTATCAAATT-ATTGCACTAATTATAAGCGGGTCATATCCCAGA----AGATAC-TACAAATTGTAAACCAAACACGCGGATTGCTCAGTAAAACGACGACGACGACAAATTAGCCCCATATGCATATATGTACATTTATGTGCATGTACGGCTATGTAGGCTAACTAAGGATCATTTGTGTGTGTGTTTTTTTTT-----GTCCAAAAATAAATGGAATTTGCAATTTTGCATACTGTATGCATTAAACCTACGATAATAACTAAGCTCCGACA-------TAAACTCTAAGCTATGTAATACATAA------TATGTACTAGTACCTATCCAATAATAATCGAGAAATACAAATAACAACATTTTTGTAAATGCATCTTTTTCGTTTTGTTTTCTACCTCTTGTTTTCGTTTTCCAACACTTATACGGTCTAGCTCTTAAGTAAAAAGCATTCTAAACTTACATACATATACATACCATATACATATATATCAATCCAGACTTCAAGCATATCGCAAGCACTGTACAACTAGATGACAAAACAAAATCAGCAAGGCTTCATATTCGCATATATACGAGTAACTGAATACTCTACTACTTCATGACTAGATACCCACCAGAAC--TCAAGTAAATTGCAGCCAAAAATAAAAGAAGATAAACAAAAGCATAAAAGATCTATTTGTATGTCACACTCCCTCCAACCTCTTGTTGCTAAAAATCTGTTTGTTGTGTAACTTTTATATACACA-AAATATAT--------------TATATACGACGAGGCAGCTCTTTAAGACGTTCGAATACTTGAAATCTATTAAAAAAAAAGAAATACATATAAAAAAATCTAAAGGGGAAAAATTATATTTAA---TATAGAAAACGAATCTTATGAATGCTTTTGGTGTAAGTTTACATTGAAAAAAACCTACGC-------GCATACAAATAAATAATGTTGAATGATACTTAAAAAAAAAAAAAACAAACAAAATAACAAAAAAAAGAAGATTTATAGAAAATGTTTTTTGATAAAAGAAAATTGCTGAATCACTCGTTGCCTAAATACCGCTTGTCTTTTATACTCAATGTTTTCGAAACACACACAAAAACACACTTACACACACACACACACGCAAAATTCGACGATGATG-----ATGATATGAGA---------ACCCACATTGATTAAAAGGATTGCTATATAATATTGGGAT--ATGTATGGAAAAGTG----GGCATTCGAAT---------------TTTCTCAACATCAATATCACATGATATAAAGTCAAACAATAAGCAGCAAATATTGCAACCACAAAAAAATAAATGGTATTTAGTAGCATATTATATAAAAATATATAAATTATAGTTGGTGAGCAATGCCAGCGAAAATACATACTGTATTTGTAAACAAAAA----AGAAAATGATAAAAACACAATTAC----------------------------AAATTTGTTG----CCTAATCATATGCATGTAGTAAATAC-----TATATGTAGACGCAAGT--------AGTTTATTTTCC-----ATCTCCCATGTACTTACAGTGCAT-CTACATATATATTTTTTTACTTTAATCCTGGCTTCCAAGGTATGCCAGCAGATCAACCCCACCCCTAACTTTAACTCTAGCATAAC-TTTAACTAACTAACTACACAA-ATTGTGAATTGTGTTTTAACAATTGACTATTCGACTATTCAACTCGTATTCA--CACTCATTCACTCGCATGGTGCTAAA-----------AAAAAACTC------TCCTCGTATTTACTCTGGAGACCCAGAA-AATCATGAGAAATCTTTTTACCTTTTTACTGTTTACGCATTTTTTGGATTTAAACTGAACTATTGTGAACTAGCGTTTATTACATGGTATATTTAT-AATACAAT----------------CCTACAATATATATACACATATGAGATT-ACATA-GTCAGTTATATACACAGTTATACAATAAATAAGTAGCAAGAGTATCATTAAGTGAACGCAAACTGTTATATGGCGAGCCCAAAAATATATGGCATTAA-------------------------CTTATCGTTTAGAGAACTCCTTTCTATAGATC--------TGATGAGGTCAGATCCCCGCTTGAATGCCAA-CAAGAAACACA------TCATATAATTATGTATATCATGAAATATTTACGTACTTATTGTATTTGACAGCAATTGCAAAAAGTGCTCAAAAATAGCATTTAAGATGCAAGGAAAATGAAAAAAAAAAAAAACAAAAATAATTATTGAGAAAATCAA-TCAGATATAGAGTTAAATATATATTATTCAATAATTGGCCATGCGCCCGAAATAT------GTTGCGTTAATATACAAAGAAGAAAAGTTTTATGAAATAAACCCGACACACGATA
>btsz 10629811 10632901|10967 chr3R 10632895 10634599 scaffold_22 1065231 1066902 + 86156|0 6
GCCAAGT
GCACAGT
>CycC 10714726 10714915|11039 chr3R 10712304 10714747 scaffold_27 1045835 1048167 + 79719|2470 2491
AATTACATAATTGCTTAAGATT
AATTGTATACTTTCTTAAGAAT
>CycC 10714726 10714915|11040 chr3R 10714887 10715062 scaffold_27 1048168 1048343 + 9601|0 28
AAGAGCTTCATAATCATTCATCATTAGCT
AAAATACAACAAAATATTTATATTTAATT
>CG7265 10718108 10718128|11041 chr3R 10715064 10719699 scaffold_27 1048345 1053062 + 195120|3169 3189
AGGCCTGAGAAACTTATATAA
ATATCAAAAAAATATATCGAA
>CG7262 10721428 10721445|11042 chr3R 10720578 10723759 scaffold_15 1631314 1634566 + 89263|925 946
AATAAATATACT----TTAAGG
GATAAATAAAATCGTATTAAAA
>RpS5b 10726154 10726248|11046 chr3R 10726246 10726448 scaffold_42 89343 89553 - 12037|0 2
GCT
ATT
>VhaPPA1-1 10728048 10728612|11048 chr3R 10726652 10728643 scaffold_42 89556 91592 - 21228|1586 2176
CCTTCGCCACTCCATTATCATCACGAAGAACAACACACATCAGAGCATTCCCCCATCCCCATGCAGACACGCACGACATCA---GTGTT------TGTGTATTTTTTTGGAAATTACGACTCGCTATACGCAGTTACTGCTTGCAGGAGACGCCCGACAAACCGAAATCCGATCAGCCGT----AACGCTTTAAACTAGGACTT-AGTTACTCATTAAGATGATAGTTGGTTAAGT-TGGCAGTTGGTTTTCACGCCTCGCACGCTCGCAGTCA----CCAGCATCACTCAATCGACTGTGGAGTGTGCACGGTGTGAAAACGACCGTGATTTGTTTATTTCATTTCTTTGCCAAACGAAAGACATCGTGTGTGTGTGTCTGTGTTTGATTTTAAGCAGTTTGTTATGTTTGTTTCTACGCTGGCTCTTCAAAGGCTAATTTAAAATGTATTATATTTACTACCGCAAAACGATAAACTTGTATATTTCAAGCTACTGTTTGAGGCAGCAGTTGTAGATGGTTGCACAGTCGCATTATTATTATTATAGAAAGTATTCCATATTAAA-------ACAAATAAAATATATAC
GCCCCATCAACCCGCAA-CAACAACAAAAACAACATTTATCAG-TCACCAAGCCATTCCGACAACTAAAAACACAACAACAACTGTGTTCCTTCGTTTTTTTTTTTTTGGAAATTACAACTCG---TACGCAGTTACAGTTT-CAGAAGAT--------------AATCCTAGCCTACGCTACGAACACGACAACATGGGACTTTAGTTACT---TAAGTTGAAAA---GTTAAATATTGCAA---ATTTTTACGCTGCGCACGTTTTTCGTTTATTTTCAGCATCA--------AACGTTGAATGTGCGCCGTGTAAAAATTACGTTAATTTGTT--TTTAATATAGTT--------------------------------------------AACAATTTGATATGCATGTGT-------------------GCAAATGACAAACGTGT-GTGTTTATGATCTAAGTAT-ATAG---TGTATAGATGTTTATATTATTTG-----------TTCAATTTTGGCACACTTGTATTTCTTAAACAACAAAAAATGTATTATATTAACTACAACTACAAATAATAAATATA-
>VhaPPA1-1 10728934 10728955|11049 chr3R 10728926 10729797 scaffold_42 91616 92500 - 49701|8 35
GCGCCGTCGCCAGCCA------TGCAGT
ACGCAGCAGACCGCTCGCAAATCGCAGT
>dpr9 10882195 10882905|11242 chr3R 10881662 10882677 scaffold_42 316341 317551 - 3691|658 1253
AGCCAAGTTGTCGCCTTTTTTTATGTACGAC-TTTGTATCATACAATGAA---------GCTATCTAAGTCTTTGGTTC---CCTTAGAAATTGG-----------------------AAATTGTGTAAATAGGCTGCTTAGCATACC--TAGAGGCGCTTTTTTCGATCGACTCTTTCCAACCTTTGTAACTTTTATAGCCAAAATTTAGCAGAAC--------GAACCCTTCG------------------GAAGGCTGCTCAACACT--------GCATTAAAGACACAAACAAAAGGCAAAGGGAAAATATTTTCCAGCAAATACCAGAACAGAAAACGCTTT--CGACTGCCACTTTGCTACTGTTTCCTCGAAGCATGGAGAAATTCTCATTTGCATTTTGCGTAATCCTAATAGAC----AGATAAATGTTCAAACGAAAGGCAATTAGCA-------------------AGACGCAAACTAAAAACATTCAACTTCAAGTACAGGCTATAGAAAAAACGAAAAAAAAACC--CTAGAAGTTAAA----------GCAAAAAA----AAAAACTGTGTAAAATATAAAA
AGCCAAGTTGTCGCC--TTTTCAAGTACAACTTTTGTATCATATGGTCAAAACGGTTCTGTTGTCTAAATTTTAGTTTCGAATCTTGTAAATAGGCCGAATTGCGCTTCTAAGCCCGCCAATTGAGTGAAGAAG-TATTTGGATTATCTTTCAAGGAATTTGCCCCAAAACACAACTTCCCAACTTTTTGATACATCAAATTAATATACAAAAGAACATTCGCAAGAACTTTGTGTAGAGACTTAACCGACACGAACACTGCTCAAAACTTTTAAACAATTTTCAGAACAAATATGAAAAACAATGGGAAAACAAGCT-----AAATGTTAAAAT-GAAAGCGCTTTTCCAGATGCCATACTGTGACTATTCCC------AATGCAAAAACT--------TATTTTATA-AACTCAAATAGGCGTAAAAATAAATGTTTAACGGCAAGCAACTCAACACACATTAAGCAACAAAAAGATAAACAAAATAATCATAATTAATTCGAAAAATA------AAAAAATTCAAATGAAAAATCTTCTAAATGTTAAACTTCAACTGCGCAGCAAAATTCAAGTACTGACTAAAGCATATAC
>dpr9 10882195 10882905|11243 chr3R 10882717 10882865 scaffold_42 317553 317690 - 5208|0 154
AACTCAATCGTAAGCTGTAACTATA-----ATAACTATAAAGTATGCATACAACATAACTCTATTGGCTATTGCGTTTTTCTATGAA-TCAGCGACGTATACGTAATATTTAGCACAAAACCGAAACGAAATGAAAAACAGAAAACGTAAATATA
AATACATACATAAGCTGTAACTATATAATAGTAACTACTATGTAT------------AATCTATTGGCTATTCCGTTTTTCTATGAACCCCGTGACGTATACGTAATAATTATCCCGA-----AAAGTAAGCAAAGAATAGAAAAACTAAATACA
>dpr9 10882195 10882905|11244 chr3R 10882902 10883423 scaffold_42 317880 318457 - 15846|0 3
GCTG
GCAG
>CG6966 10906175 10906919|11279 chr3R 10906248 10906309 scaffold_20 1872033 1872091 - 1992|0 61
AACCAGAATACCTAAAAAAAAAACAAACAAAAAATTATTACCGGCCACCATACACAACTCAC
AGCCAAAAAA---AAAAAAAAAATAAGAAAGAAATTATTGGTCTTTACTATAGACCATTCGC
>CG6966 10906175 10906919|11280 chr3R 10906319 10908668 scaffold_42 346472 348896 - 92470|0 719
AGACGAGGATCGGGACGAGGACTGGACGAGAGTCAAGCACTCA-ATTCACTCAATCACTCAATTGATCACTAGATGAAGCAATCGATCAACAGCCTGCCCGCCCGCCATCCATAACATATT----------ATCTAATACTACTATGACTACCGTCTATTTACTG----TATAATTAGAGATGGAGAGAGAGTTCGAAACTATGCTGAATGATGAATGATGATATGGACGAGATCGTTACTAACGACTGGAAACTGATTTGTGATGTTAGCAAGCGAAGTGCC------------------------TGAAT-------CGAC-----------GGATCAGGACGATAACTACTACAACT-----------GACAACGATAAC--AAAACAGAAGCCAATAAAAGGAAATCAGGC------AGACAACCGAAGCAAC-------------GCGATGAAATGT-TCTAGAAGAGATGATTTGCTGTCTTTGAATTTTGCTTGCGAAATGTTTTGAAACTTTCTTTAATATGTGTTCTTGCTACAACATTT-----------------TGTATGACTTATCATTAATAGAATATTGTATGTACTTGTACTATATGACCAAAAGCCTGGGCGTGATTGAGCAGCTTAATTTTAATTAT------------CCTGGCATCAAGCCGACTCCTCAACGCTGCAGCAATCACGCCCAAGCCACGGA
AGGCGATGCTCGT-----GGGCACATCCACACTCGGACACACACACACACACACACACTCA---------TATATACAGAGA------GACCGCCCGCCCACCCGCCATCGAAGCCATGCCACGTGGATAGACATAATATACCTACAACTAC--TATATCTACTACTATTACTATTATAAATATAGAGA--------------GCTGATCG------------------GAGAGCGTTACTAATGACTAGGAACTGATTTGTGATGTTTGCAAGCGAAGTGCCCAATCCTGGCGCCAGGATCAGGATTGAATACAATGACGACAAGGATGACAAAGATGATGATGATGACGATGACGGTTTTGTCAGTTAAAACAACAACAACAAAAAACGAAAAACAAAAAAAAAAAAAAAAACAAAGAAAAACAAAAGAAAAAACAACAACGACAACAACGACGACATCCAACTACAACTGA-AATTCGCTGTTTATT-ATTTTGCTTGCAAAATGTTT----------TTTAAT-TGTGTTCTTGCTAATCTATTTTTTTTTTTTCTTTTGTATGTATGAATTATGATAATAATAATAATAATATTATGTATACGCCACG-----------TGGCGCAGTCGGGCAGCTAAAACATATACATATGCACGCCTTCTTTGGGCTGCAGCCAAGTCCTCATAGCTGCCGCGACCCAGCCAATGCGGCGTA
>CG31304 10922776 10923349|11305 chr3R 10921690 10926366 scaffold_3 5112053 5116554 + 159421|1188 1767
CCCAGAGAGATCGATGGGAGC-GCAAATGGAGAGATGATCGAATGCGACGACAGAAGTGAAAGTGGAAGTGAAACCAGAAATAGCAATTTATCCAGTCCCGACATATCGCACGCTCGTCTGTCTATGTGTAAAACTCCTTACACCACCTACGTCTAGATGTGCATGAAGCCCAAAAAACATATGCCCGCACATATTAATCCAAAAATACATCGACTTTCGAAACTAATTTACAGGTAAAGGGCCGCGTCAGAGAATCGATGGTCTGATGGCTCTTTAGGCTTAGCCAGGCTTTATCCTCACCTGCGACTAATATCGAAACTGGAAT-GTGACAGCTCATAGGAAGACATCTTAGTCGATGTGGTGGAGTGCGTTTAAAGAGCTTAGGGATATATTTTGCTG-AAATACATATCGAAACTATTATGTGGACGCACAAATGAATGGCAAAGAA--TATTTTGAAGGGA-TAGAGCCTAAATATCTGTAACATATCTTAGACTTGCTAAACTTCAAAAGAATATTCAATTTTGTTATAGTCTTCAAAATAGCATGGAACGTACAACACTACATATCTACAAAT
------------GATGCAATCAGCAGAC-----CACGATCCTAACCAACAGCA----TGAACACG-----------------AGCACAACATGCA--CACAGCATAT----CGATCGCCCGTATATATACACAACCATCTAACTAATTAATAAATAGATAAATAT-----CCCATAAACATACTTATGCAAGTA----------------------TCTGCAACTATTTTACAGGTAAACAGCCACGTCAGAGAGTCGTTGGTCTGA-----ACTTAGGCT---------------------AGCAATTGATACGTAAACAGCTCTAGCGGAAACTC----GAACATAACCAAATCTATAT-----ATCGTGTTCAGATGCTTCAGATATACAAATACATATATATATATATATAAATATATGCATATATATACATATAAAACCAAAGGCAGCCATTTAGCAAGAATTTAAGTTTTCATGATTGAATCCTATCAGCTACCTAGCAGGTGTC------ATATTTTATTTTGTAA-------ATTAACAGCATTTAGCTTTTGATAAATCTTATTCATTAGT
>CG6912 10960860 10960906|11336 chr3R 10960790 10962041 scaffold_3 5147566 5148707 + 22341|71 117
CTAAAACAATTTGTCTCTCTGCAACTTAAATAAACATACTTTAACTT
TCGATACTACTTGTTCGTAATTATATGATACATATATACATCATTCT
>CG6904 10967562 10967924|11343 chr3R 10967331 10969594 scaffold_3 5155993 5158352 + 70053|258 638
AGTTCTCTGCCAAATGGAAGGCCCTTATATTTGTAGCGAACAAACCAATTAAAATCAACACACGCGCAATATTACCATAAGTTCCAGTTGTCTTGTTCCACCAATGTTCATCGAGATACGGGCTAAACTCTTGCCCGGATGCCTTC-----GAAACTATCTACCTGCAATTGAAATGCCAGAACAAATGTTTTCACATCTAATCAAATTATTAATATTATGTATGCCCAGATCGCAAGCGTAAG---CATTCGAGCA-----GGACGAGTCC--AGATTTTATTAAACGTTGTTTAGTCCATAAGGAGAACGAGGTCTCCCCGCCCTGTCACCCAGCTTCATACCCTGCGTATCAAATAAATCGTTATTTA---AAGTACA
A--------CCAAAC----TATTCTGATGTCAGCACTGGCTTTACGAAC---AATTCATACA-GCGCAATATTACCATAAGTT-TAGTAATTTTGTTTCAC--ACGTTCAAAGGGCGCACAGTCGAACAGACGACC--ATGCCCACAAAGAGAAACTATCTACCTACAAT---------GCTACAACTGTTTTCA----TAAACCAATT----------TCTACGCTCTTA-CGCAACAGTTAGAACAATTTGAGTATTTTTTGCCAATTGCGAAAATTCTATTTAATGTTGTTTAGTCTATAAGCAGATCAAAGT--------CCCAACAACAAAACGAATGTTATTAAAACAAATTAAATTATTATTTACCCAATTACA
>Zeelin1 10996347 10997096|11372 chr3R 10996324 10997143 scaffold_3 5186132 5187001 + 12825|23 891
CTCACCGCTCAATTTTGTAAACGAACGAAACAACGAACTACACACCAACTAAATAACATCCTGAAGAA---------CTAAAACAACGAATGCATCACACAAGGGGCCCCCAAAACAATGACAA--CCTGCTTTGGA-----------GTAGATCA------GTAGCAAAA--GGCTTTGCAAGTCTTAATATCCGTGAAAAACGTTTGAATTTTTTCAAAACTGCAAGAACTCCCCTCGGAACGAGAAAACAACCATCACTTTCGTCTGGGGTTCTCAAAATATTTGCCAAGAAGTGCGTAATTCCCGTAGAAAAAAAAAAACAACCGTATAAAACTCAAACTATCTGTTTAATTTTTA---------------------------------------------------TTATTTTCCGATTTCTTAAGAACCTTAT-CGTAAATGTTAAGTGCAAGAATATGAAAAAAA------------TCGATTTACATTTATTATAATAAAACAATAAAATCAACTTATGAGTTCCCATTTGCAACATCAACATCGCACACTCAATGGGCTTCATAAATTGTTCCTTTTTTGTATATCTTAGATGCTATATATAAAA---TATTTAT-ACAACTATTTGTATTTGTAAAAAAGTATCGTCTCTCATGCG-GAGCTCGATGACATTTAGAAAAATGTATAAGGCATATATGTATATCTG------CCACAACACAT-CCAACAT---TCGGCCTTTCCATATATACATACA-----TATGCT-----GAACATTTTCGATTTGTAATAAAACATTAAAAAAAAAAACAACAACAAAATTATGAATAATAATAAATAAAAAACTTCTAAAACCC
CTCACCGCTCAATTTTGTAAACGAACGAAA--ACGAACTTTAAA--AGATGAACAACTACAAGAAGAAGAACAACAACAACCACAACGAATGCATCA---ATGGGGTCCCCAAAACAACGACAAGCCTTGGTTTCCACAACAAGAACCGGAAATCAACGAAAGTAGCAAAAATGAATCTGTA-GTCTCAAAATCC-TCAACAACGATTGAATTTTTTCAAAACTGCCAG----CCCC----------AGAACAACCGGTGGCTGCCTCCAA----CTCAATAT---TGCCATCAAGTGCGTACTTCCCGTAGTAAAAATAAAAAAAAAGAATAATAATAATAATACAATTATAATAATAAAAAAAATAACTAAAGGAAAACATTTACAACAACAACTCTCAATAAAAAGTTTTTATTTTCAATTTCTTAG----CTCATGTCTTAGTAATAAGTGCAAGTATATGAAAAAAAAAAATCTAAAATTCGATTTACATTTATTATAAAAAAAAAAAAAACCAAATCTATTATGAGCCGCT-----CTTGAACAACTC---------GAGTGCCATAAATTGTTCCTTTTTTGTATATTTTAGACGCTATATTTGTAATTGTATTGATAACAACAAAAAAAAAAAGAAAAGAAAACTCGGATTTCAAGTATAAACGGTTTGATTTTTTGAGTACTCAATAAAA-ATATAAGGATAACTGAACGTTTCACTGCATATGAGAATATATATCTGCCATACTATACATGAATACGACAATTTTGCGGCTTAGCATATTTTCAACTTGTAAT---------AAAAACAAAACTTCCCAAAAA-----AAAAAAAGAAAATAAAAATTTCAAAAAGCCC
>Zeelin1 10997658 10997805|11374 chr3R 10997360 10998558 scaffold_3 5187002 5188041 + 24440|346 500
ACAAATTATATAGATTCAAAATCACAAAC-------AATCGTTTAGCTCTAATAACAAAGCGACGCTATACAAATCATATAGCAGTTCTGTAATTTTTTTGTACTTAATTTTACATAAATTACACGTAACGAAACGTAAAAAAAAAAACAAATTG
ACAAAAAATAAAAAAATATAAGCAAAAATCTATCAAAATCG-TTAGCTCTAATAAC-AAGCGATGCTAT----ATCATATAGCACTTCTGTAATTTTTTTGTACTTTAATTTACATAAATTACATGTAACGAAATGC---AATACAAACAAATTG
>Zeelin1 11001524 11001571|11377 chr3R 11000459 11002616 scaffold_3 5190075 5192634 + 36485|1310 1376
AACGCTGAGCGTTAG----TGAAAA-------------TAAATACTTTTGTTT--GCTTAGCTCGTA
TGTACTGAGCGTTTACATTCGAAAAAAAGCTAACTGGTTGAAAACGTTTGTTTTGGCTTAGCT----
>Zeelin1 11001789 11001879|11377 chr3R 11000459 11002616 scaffold_3 5190075 5192634 + 36485|1705 1847
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AT---ACGTCAAGAAAAAAAATCAAAAAAAAACAAACAAAAACACAAGAACATCAGCA-GAAAGTAGCCAATACAACAACAACAACAACAACATTTAAATAAAAATCTACGAAATTTGAAATTGAATGATAAACGACAACAAA
>CG6752 11016272 11017027|11392 chr3R 11016062 11021916 scaffold_3 5226311 5232380 + 203477|260 1217
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CGCAAAAACCAACAA----ACCCAACAAAAATCTAGTCACCTTAAAACAAAAAATTGCTACGCTTAACATGTGGTTATTTACACATAAGTACATACATACTATATACATAGATATATATATTTTTAACTTCAGTTTTTTTCATTTTGTATTTTATATGCTTGCAATTAT---TTCAGATGTGATATGCT-ATAGTGCAA----------TTTAAACACAGCTCTA-TGAACAGAAAACATACCAACAAAATTAAATAGTTAGCACATTAATATTAATATTGTTTGTCATTTTATGATCTCTGGTTAATGCAACTATTTCCATATTTATTTAAGAGCACACAAACTCCAAGCAAGTGCATTTATATTTATGTTTAAGCTGAAAAACTATTTCCAAAATAGTTTGCATTTAAAATTGATAACAATTAGTGGAACGTCTATTTAAGTACGATAATTTATGTCAACATTATAAGATATTACAACTATTTAATTTCATTTTGTTAAGGAGCTGGTGGTTTGGCTAAAGTATACAAATCAAACTTTATTTGTGAACCAATTCCTAAGTTATAGAATTTTAAAACCTGCCTAACAATTAAAATTAAGTAACGGAACCAATTTTAGACAATTCCCTAAACATTTTAGCGTCTCGCATTTGTTCCGTTTCAACTCTCGTGTTATATATTTAATGAAAATAACAATCTATGGCTGGCTGCGAGGTTTTGAACGTCAGCCAAATACAATTATTGTATTTCGGAAAATA-CAAATATAAACTTTTAATCAATTTTAATCACCGCACTTGTTCCGACTTTTCATTTCATTTTCAATTTAGAAAAATAAACA-AGCATTTTGATAGTACGCTGATTATATAATACAGTTAAGTCCATATAGATAAAGGTATACAGTTTATTTGGACACATTTATGTCTACATGTGTGCCTCAGGTGGTGCCAAG-------A
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TAACGATTTGATTCTAGAGT-------AACACAATCAATAAACACAAAAACTATAATGTA-CGACG
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TTGGAGCTAGTATCGGGGTATGGACAAACGGAGTGTTTAGTGTATACAACTTTTCGAGGCTCATTAACATTC--------TTTTTTATATTAAATGTAAAAGTTCTTATGAAACTAAAAACCATGCTTATCGATTTATCACAAGCACGCCCTATTATCAATAGTTCGGCGGTAGCTCGATTGTTTTCCAGCTCAAATTTAAATTATGACATTATTT-----TGTAGAATTTTCTTAGTCTTTAATT------------TTAGCTTACAACAATAGTTATTAAAATGCTTATGA
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TTAGTCATATGTTT------------------TAAGTGTTTAATGTGTTTA-TGTGATGGGTGA
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------------------------------------------------
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>Su(var)3-9 11085584 11085952|11429 chr3R 11080154 11085947 scaffold_3 1093623 1099410 - 138017|5951 6360
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ATTGAAGCATTTTGC--GAATTGCCCACTGAATTTGTACTCACTTATTTTACACGTCGT-GTATATATACATATATATATATATATATATATATATATATATATA---------TATACGCACGCCTTTATAATTATGTCTTACTTTAAAACTTACGACAACATCTAAAATAAAATATTTCAAATTTAAAAGCGAGAATATATTAATTTAGAA---CGATTTGATCTGGGAATTTAAACTAAAATCAAAGAAAACCGTATTCTTTCT-TTTATTTATTTTTCATAAAAGCACATTCATTTCATTTAAGGAAATATCCAAAATATCAA---------TTGCATTTTATTAGATACTAATA----ATTAGTTATAGTTTAAAAGATTTTTATTATTACTTTAGTATTATTA-
>Su(var)3-9 11085584 11085952|11430 chr3R 11085948 11088067 scaffold_3 1099690 1101810 - 68709|0 4
ATGGA
ATGCA
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TTACTAGATTTATTTATGTTTTAAGTTTGTTTTCGGTTGCCAGTGCTACAGTATGACAGTTGAATTTTAAATCAGCATGGGAATTGTAGCTTATGCATGATTATATATATATATATGTATAATCAATGAATATCTATGGCAAATCGATTTTCGGTTTCGATTGTAAATTAAAAACAGTTTCTTTGACATTTAGTTGGGAACTTGCATCGGATTCACGCAAATTATATAAATACTTATAAA-------CAAATAAATATAG-------TATATTATACATATGTGACGCATATATAGAAACAAAAGCTAAACTATCCCGATTTTCGTATGTCGC-----ATTCTAGATC--AGACCAAGAAATC--AAATTACGCACTTTGCGGGGGTTTTACTATTTCTGCTGCGTTATACCACCAACAATTCAACTTTAGTATGTACACACACATATATATTTATACACATACTTATATATATATATATAGAATTTGTCTATATGCATATATATATTGAAAATATTACATATATAAATATGTAGTTACAAAGATGTTGTTTTAATTGGTTTAAAACAAAATTATGAAAGCAAACTAAATGTGTACGCAATTACATTAAATCGCTTAGGATGAAGATGTTTTATGATTGATATAAACATAGTAATATGAATCA----GAAAACATGAAAACGTTATTTTGATTACC------------------ACTACATGT-----AAGTCTAACAAAATATAGATT
>MRG15 11102162 11102306|11438 chr3R 11100555 11105766 scaffold_3 1117459 1122504 - 117913|1694 1871
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ATGAATGAATAAAACCCGGCATATAATTCAAGCAGCTCTT-ATTTGCATTGCACATTTTTGCTGCAATGCTT----TAATTCGAGAGTTGCTTTGCACAACTGGCTTGTAATATATAACGAAAGTCATCCATAGAGAATTTG--CATAAACAAATAAATCATCTTCTTGGCCTCTTGT
>CG6276 11143924 11144161|11462 chr3R 11143210 11145736 scaffold_3 1164332 1167017 - 85295|818 1123
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CATTGCGGCTGCTAGTTAAGATCTCCCTGCACTTCTGTGTATACAATTTTGCCTATAGCAGGCGCAAATCGTTGTCGATGTATTGTTAACTTATTCGATCGGCTCAGCCGAAACATTTCATTTGCATTCACGT--------------AATTCCTTAAAGCTTTGCTGTCCCGAAAGAAACAACATAGTATCCTTAAATTGTAACCTAAAGGTAGCTCCTTTAAACAAAATGTGTTATAAATTATTTAATTCATATGTATATATAAATAGTTTATGTTTAAAACAAGAA---ATTCATTCAGAAT-G
>CG6236 11151039 11151260|11466 chr3R 11150653 11153319 scaffold_3 1171706 1174226 - 73070|403 651
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TCAATGCACAAGCTGCACTGAAAAAATCCAGTGGAGTATAACCCATAAGACTTTAGTTTTCCTAATTCTTTACATATATTATGTATGGAATATGAAATAACGTTTGTATT-CATGTGCCAAAGA-------CACTAAGCTCTTGTCACAAATTTAAGTTTGTAGCTCTCTTCGTACTA---GTTCCTTAGCACAACTCAACTCAAATATTATTGATAAAAACCAAATTTTGAAATAAAAACAAAAGAGA
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TGCACTATATTAACATCATATAGACTTGTAATCCTAAGTA--AGTATCCACGTCGTACAACTTGATAAAAATGTTAA
-ACGCGACTTCAACAAT---TAGGCAACTAAATATAGGCATTAGGTTTTACGAATTATAACCAAACAACAACAACAA
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ATAAATTGTGTTTGACAACCCATTCCGCAATACACTTCCCAATTGCCAAATTCGCAATCA-ATATTCCAGTT---AGTGGTACGGA------------TAGGTAGTATTATAGCTTATCAAAAAATAAATAATTTTATCCTTTGACGAAATCCGCTGGAAAGTAAAGAAGTTTCCCTTTCAATCTTGCATCAAACTCACCTACATATACTTTCTAAACTTTTTTTGTTGGGTTTGTTAGAAATACGTATGAAAATTTTATTCGATAATGTTCATTGTATTAATTGTATGTGTCTCAATTGT-------------------------TGGCTGTCGTGGCTTCTTTT---------CATGTATGTGGGCA----------------TACATGTGCG-----------------GCATCTTCTTTGTAATAC------------------------------TTTGATTGTGTTTAAAGCCAATTTGTTTTTATTTTCGCAGTGCTGTCAATTCAATTCTTTGGCTAATTTGATTCTCGAATCGGGAAGCAGAACATA-AATGTATCTGTTTGTAGCGAAGGAATACATAGGCCAAAAACATAATATCTTAGGGAGCTTAGAATAGAGTATTTGGGATAATGTACGAGTAGCTGAATCGAATGCCGTAGCAAGTGAATCAAAATTACATCTACATGTATATATATATAATTGCTTGGATAAAACATTTAACGTACTGTAAGATTGAATGCGACATACCAAAAGAGATTTTCAATAAAATCGAATTCAAATAG
AT-AATTGTATTACTCCAGGCATTCCAAAAT----TATTCAGTGAATAAA---ACAAACATATATACAAATCAAAAATGTTGTGGACTCAGCTTTGTCTAGGTGGAA--AGAAATTATTGATTAATAAATTAT-------------AAAATAC----AGATATAAATAATGTACATAGACAATTATATACCTCACGC-----CAGATAAAAACCCAGCTTAT----AAGGGTTTGTTAGAAATACGTATGAAAATTTTATTCGATAAAGTTCATTGTATTAAGTTTATGTATATATATATTTATATATATATATGTATATATAACGTATATATAGTCAATTCTGTTACATATGGAAATATGCTCGGGCATATAAAAAATTTGATTTATATGCGCGCTGGCTAATTGGCTGTATTACTTTTTATTTAATACTCTTTCGTTTTCTTTATTTTTTAAAAACTGTTTTGTCGCGTTTAAAGCCAATTTATT----------CATTGCCCATTTGTCAATTCTTTGGCTAATTTGATTCTCGCATAATTAATGGTTATTTCTCGTTTCTATTTTTGTAATTAACTGAGCTGCAGATTGGAAAAATTGTAGCGTGGA----------------ATTTTGTTAAATCTA--------TAAATCTAGAGC-------AGCGTAT--AATTTGCAT----AATTCAATATACATAA-----TGTGTAGAGTATATACCACA----AAAATAGG-------GTAATAATAAACAAATGTAATAAAATCGAATGTATATAT
>Surf4 11169389 11169985|11483 chr3R 11169314 11170573 scaffold_13 2194580 2195836 - 50318|77 711
-GGCCAGGCAACGGTCGCTCCTTGAACGAAACACTTTCAACATTTGACTTTTACCGTGTTTTACTCCTTCTGAGAAATGTTAGTTAGGAATTACCATAAAATGGGACAACAACAGGAG--CAGCATCAGCAGCACAACACCGGCACGTATAA-----------GAACTTGA---CAATTTTCAAT---AAAGGGACTTCCGCAATACCCCTCTCCAATGGCTCACTTATTGGGATCGCCCCAACCCAACTCCAAATCCATTCGCGCACATTCAACGACAAACTTCGACATTTTAAACATTTAGGACATTTTATTTTTGTACATAAAGAACAGGCAAGAAAAAAGTTTGGTCACTTTCGAGCCCACCCCAAATGAGAGACA-TAACTGATTTTATATCTATGCTTGTCAAT--ATCCATGTTTTTTGCCGATTTTTTTA--TATGATTTGTACACTCTT-ATAAATAAGTTGTAA---CCTTGGTGTTTGCCTTTTGTTGATTGCT-AGAAGTTTGAA-TATGAAAACGATGTATAAAATATGA-------TGTACCAATTGACAATGATTTGTTTCTTTCGTTTATAAGCAAAAGTGTAATAGAATTAAATTGTAACGTTTTAATAAAC-ATAAA
CGTCTAGAAATTCGCTGAAAAGTAAAC-AAACA-----AAAACTTGACTTTTATTGCGATTAACTCTTAATGAGAACATTTAGTTA-GAATTACCATAAAATGGAACAACAGGAGGAGAACAGCA-CAACAACACATAAACAGAAAACAAAATATGAGATAATAAACTTGACTTCATTGATAAATTCAAAAGGGACTTCCGCAATATCC-------AGGCTTTACCTTTACGG----------CCCACCAATAAA--CATTCGCGCACGTTCAACGACAAACTAT----TCGTATACATATAAGACATTTCG-TTTTGTACATAAAATACGG------------------CGATTTTATG----CCCCAAATGAGAGACATTAACTGATTTTATATTCATTATATTCTGTCCACGCATATATTTTGCAGTCTTTTTTATTTTTACCTTGTACGCCCTCAATTTATAAGTTGTAATATTTTTTGTGTTTG-CGTTTGTTGTTTGATAAGAAGTTCGGATTATGATAATGGTGTATAAAATATGATGATGATTGTACCAATTGACGATGATTTGTTTCTTTCGTTTATAAGCAAAAGTGTACTAGAATTAAATTGTAACGTTTTAATAAACAACTAA
>CG6196 11176061 11176115|11486 chr3R 11175217 11179220 scaffold_13 2201730 2205850 - 141879|880 948
TTAGGATGTAAGGCAATGGTTTATTACTACAATTATAGAGATAC--------------TACAGACTAGA
AT---ATATTATTCATAGTATTATAAATA-AATAATAAATATAAACAAAATTCATATGTACAGA-TAAA
>CG6194 11179433 11179991|11487 chr3R 11179454 11187450 scaffold_13 2206518 2214649 - 280925|0 646
-TCGTTGCCGCCACCACCACATAACCCT--------------GTTGCTGTGCTAGCTGTGTTA---------------------------TTTGCTCATTATTATTTGATTTAGTTGCCA-------------GCCGCTGCT-GCTTGCTTGCTCGCCCAGAAAAACCCAACAGACCCGTATCTCAAACACAAAGACTTTG---TTGTACCTTTACGCCTACGCATATAGTACATAGACGCATGCATGTATCTTGAATATTTACTGATGTCCACGTTAATCTCT------------------------------CTTTTGTTCGACCTGTCGTC--TCGCATTCTGCCAAAGTTT-TTCAGCTATTTCCATGTTCGAGCAGCCCGATCTGTTTATATGTGT----------------TATATATAAACCTATGTAATTTGCGGTATTATTATTTTAAAATCATGAATCTTTAATGGAATTGAATTATTTTACAATGGTGCCACAATTGTCACTATTCTTTGAAGTATTT-CATGTAGCGCTTA-GTTCTAGAGTTTAGTTAAATTATGTAAGTCGTCTTGTAATTGTTCGATCATTATTTAGTTTTAACATTAATTGTATATACCCTCGAGTAAATGAATAAACTAT
CCCAATGTCCTCTCTAACATATACCCCTCGTTCACAGCCTTGGTTACTGTGCAAACTGTGTTATATTATTTTCATTTCTTTATGATTATTTGTAATTATTATAATTTGTGCTAATTGCTAAGTAACTTGTCTCGCCGTTGCTCGCTGGCCAGCTCGCCTAAAACTAAACATCAGACGTGCATCTCAACAACAAAGACTTTGTTATTATACATTTACAAACACACA-----TACATATGCATATACATATAAATTGCACAGTTGCTTAT---CATATTATTTTTTTATGCATTGTGATTAGCTTACAATTTGCGACCTTTGTTCAAATTGATTTCATTCGAATTTAAATCATTTTTATTTGGTGCCTTCAGTTTGCCTGTGTTTCGCTCTGATTGTGTGTGTTTGTCAACATTATTCCTATATAT-AGTTTATGTAATTCTCGGTATTATTATTTTGTAAT--------GCGAATGGAATTG----ATTCAACAAGTTTTTCGC--------CTGCTCTCGAAAGTATTTATGTGTAGTCCTTATGTCTTAGATTGTAATTAAATTATGTTTTTCATC---TAGTTGTTCGAACATTATTTAGTTTTAATATTAATTGTAAATACCCTTACATACAAAATCAAATAAT
>ldlCp 11184190 11185004|11487 chr3R 11179454 11187450 scaffold_13 2206518 2214649 - 280925|5192 6032
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CAATTAAAAAAAATGTATTTCTAAATATATATACATTCTACAATTTATTTACTGTTAATTGATTGCTACTGTTTCTTTAGGCACAAATAGTGTTTGT--------TACATAACTGTATATAAAATATATATGTATA------------AAATATAAATGCATCAAATTTCACGCTCGTTAGAAGGGTAAATAC-----------ATGTTGGCCATGATTTAGTCGCTGTTTGGAATAGAGATAAAAGAGATTTCAGAGATTTAG----CAGGACTC-----GCTGTAA--ACATCTTGCAAAAGATAT-----------------CAGGCAGATAAAAAA--ATGCAT------GCTCAACTGAATGGTGATAAAAATTGGAAATGTTAAAGCATTGGCTTTGTAGAATGGTGCAGGATAACAGGAAGACGAAGGATAACTGAAGCAGAAACGAATTTGCGGGCTATAAACTACGCAAACTGCA----GCTACATTACAATTTGAGCTCCTCGGTGTCGGGCAGTTTGTTGAAGAACCATTGCAAATGCTCCTCGGTGACCTCGGCTAGCGTGGCTGGTTGCCATTTGGGCTTTTGATCCTTGTCGATGAGGAGTGCGCGAACACCCTCCTTGAAGTCAGCGCGCGGCTCCAAATGGCGCACAGCGAGGCGATATTCCATGATCAAGCATTGGGCCAGCGACATCTGTGCGCCAAGCTCCAGCTGGCGAAAGGTTACCTTCAGGGATGTCGGCGACACTTTGCAAAGGATCTACA-------------CATGGTATGTA------------------------AATAAATAAA--------
>CG6171 11188690 11188865|11489 chr3R 11188549 11189374 scaffold_3 1065469 1066368 - 16924|148 344
AAGGCTTGGCATACTTCGGCTTCAAATTGGCTAAAGCCCATTGTAGTCAATTCCGCGCAGAACATTCGAAATCGTCTGCGTCAACGGCGAGCCCAACGGCAGAAC---------------GACGA------TGACTCGGGGACGGATGAGGAGGATGAACCCTTTGGTGGCGACAATGACAGGGATGCGGACTACCG
GATGCAATAGATGCGCCGA----ACGGCACCTAAAGGGCAACTTAGTCAATTCCGCCCAGAACATACGCAATCGCTTACGCCAGCGTCGCGACAAGACGCAAAATTCCAATGCCCAGGCAGACGAATACTCTGATTTTGAATCAGACGAGGAGGAGGATCCATTTCACGATCAGGGTGACTCTGATTTGGACTATAA
>CG6156 11189501 11190165|11490 chr3R 11189675 11190134 scaffold_13 2580746 2581114 + 6392|0 468
GCAACTGGGCGT-GGAGCGGGCGCGCTTGTCACATATCCCGCAAAAGATCTTTCCCTCTCGATCATATCGCTTATTTTACCTTTAATGCAATG--ACCACCCGCCCAGCAGTCGCCGTGGATCCGCCATGA--CCAAGACAGTATCACGAATGTGCCATGCGACTTAATTGCAGTCGGCTGGGGCTTGGGCGGTGTCCCTGCCTCGCAGATAAGGCTGCAGTAACTACATACTCAAATACATACATATTCAGAGGTGCCATGAGCAAGGCTCCACCAACCTATCCATAGATCCGTGGGATTGGAGCATCCGTCTATGGGCCACAAGCAATTACATATACACACATACGAATAGACAAACTAAGGAGTTATTCAAGACGCATACACG-GGATCCTATATTTATACAATGTATTCGCATTTTGCTTGTTATATGATTCAATATGTATTTA---AAACTGTACAAAATATAA
GCACCGGAGTGTAGAAGCGCACACGCCTGCCACATATCCTGCTAAACGCTATGGTTCCTTTACTGTCTGCTATTTTGTAACTCAAACCCGTTGCTGCTGCTGCTCCCGCCGCCGCTCCGGGCGAACCCTAAGCCATAGATTGTATCACGAATGTGCCATACA-------------------------GGACTACAACTGAGAACAGCAAGTGAAGCTGTATTAACTAC--AATTACATACATACGTAT-------------------------ACTTGCATAT--------------------------------------ACGATTAATTGAATCTAGA-----ATAGGTGGAAAAGCTA-----CCACACAACGCGTACACACACGAATCCTATATTTATACAATGTATTCGCATTTTGCTTGTTATATGACTCAATATATATGTATTTAAATTGTACAAATTATAA
>CG6136 11195757 11196743|11492 chr3R 11196200 11196253 scaffold_13 2587659 2587712 + 2196|0 53
GGACTTGCAAGGCGACCAACATCAGAGAGGCATGTTGGACGCAATGCAAGTCTC
GGTCTTGCAGGGGGCCCAACATAGCCGATACATGCTGGACCCATTGCATGGCCC
>CG6136 11195757 11196743|11493 chr3R 11196262 11197574 scaffold_13 2588384 2589829 + 34229|0 632
AAATCATAGTACTTAACCTATCCCTAAGACTTAAATTATTCCTTAACTGTTTGTTTACATCATATATAACTAGTATATACCTTTTACTTAAGT---------------------AGTCTTATCCCTAAAATTCTAA-ATTCTA--------------AAAAATAATCCAAATTTGATTTGATTTGATTGTGCTG-----------------------------------------AAACAACAT--GATTGTGGAGATAGTAGAGAATCCTGCTGC----------------------------------------TCTAGAACATAATTCTTTTAATGATCACTTAAATAATGCAGAAAGGGTATTGCATAGAATAGAAGCATACAATGTAAAGCTAAATAATCATATGAGGAGATTGAAAGAACTGCTGGCCAACAATAGAAGATTGATTTCGGGGCTATCGTACAATGAGCACAGCATTAAATCTTTATTGGAAAACAAA------------------GCTCAA--GATAAA------CAAAT------AGAGTAAGCTAAAGAAGGAAATATGAACTCGGTTATAAACTAATATATTTTTAGGCGAAATTCAAGTAAAAGAAGGTGTCA
AGGACA----ATTACATTTATATTT---ATATCAATTATTTATGCTATGCATATTTACAATGTACATATGT-GAATTTGTCCAGTAGTTTAGTTAACAACCATAAGTTACCGCAAACCGTGTCCTTAACCTTTTAAGATTCCATTACAATTACATCCAAATATAA-CGATATTTTATTTTAATCGATTGCTTTGTATGTTCATTTATACATTTTTGAAATCATTTTTTGGCCAACAAACAAAATTAGAACGTTAAGCTGTCAAATAAAATTCGTGCGAAGCTCACCATCCGGCGTAATGAGCACAATCGCAGATTGTGTAGAGCTCGCTAGCTTTGCCCAGCAATTGGATAACGCGGAGCACATGCTGAAAAGGGCCGACGAGTATAATGACAAACTTGCTGTCCATATCGACAATCTGAAAAACGTCGTGCGCAGCAACCAAAATATACTCGAGAAATTGCAAGCCAATGAGCAGCATATGAAAGCGCTATTCGAAGACCAGAGCCAGTCTGAGCTTCATGCTCAAATGATAACAGACGTCAAACGCCTCAAAAAGAAGGTAAAGAAATCAACATCAACGTGCAGTTAAAC-AATATAGCCTGTAAC-AAGTGCAAGTGTATGTAACAGTCA
>CG6130 11207129 11207820|11504 chr3R 11206334 11207606 scaffold_20 1905170 1906369 - 28979|853 1378
TACCTGCTCAATCTTTGCCATTATGATATCAATCTCGGATCCTTGGTCCTGGTGGCTGATTGTCGGTGCCCAAGTGACGGTGGAGCTGCTGGCCGATGTAGGAATGGTCGCGCC-------------------------------GCCACCGGAGGACACGCTCCCCATTCCGGAGCAGGCCGAGCGGGATGCCTGTTTGGCCTTCAGAGCCGACGTCAGTTCGATTTGCAGCTCCTCGCAGCGCACATTTTCCAGCGCAACCTATG-------------GATTTTTAGAGTTCAATACGATTGAGTAGATATG----ATTTGAGGGCATATAGTCACCTTCTTTTCCAGTTCCCGGGCTCTCGACTGCAGATTCTCCACCGCCTCGGCATCGGGACGAGCGCTACCGCTCAGATTGCGTATTTGTGCCAGGGTTTCCTAGGATAGCATATATATATAAATACAGATAAACAAAATGTTCTATAAATCCTATAACAATACAATTGCAATATACTGTTCTTAAAATC
TACCTGTTCGATCTTGGCCATTATTATATCAATCTCGGAGCCTTGGTCCTGGTGGCTGATTGTCGGTGCCCATGTGACGGTGGAACTGCTGGCCGATGTTGGTATATTGGCGCCTTGGTATGGCCCATGTTGGGATGTTGGGGCCGATGACGAAGGACA-ACTGCCCATATGGGAAGCAGTTGAACGTGATGCCT---TGGCCTTAAGTGCGGCCGTTAGCTCAATTTGCAGCTCCTCACAGTGCACATTTTCCAGCGCCACCTAAAAGCATACACAAAAGAGTGTTAGTTGTGTGCAACATTTGTTACATTTGTCACATTTGCCATAGGTTACGCACCTTCTTCTCCAGCTCCCGAGCTCGTGATTGCAGATTCTCCACCGCCTCGGTGTCGGGACGTGCGCTGCCGCTAAGGTTGCGTATTTGTGCCAGAGTTTCCTGCCGCA------------------AGATGCACACGATATTTAA---------------------------GCATTGTTGTTATAAA-
>CG6125 11228526 11228750|11518 chr3R 11223272 11228802 scaffold_20 1922137 1928050 - 79416|6108 6357
CC-------AACTTCCTATCTGATGTCGGTTCGTTCCAGTCTGTTTGATCCGGTTATGAGCGAACGTCACAGCATTTTTATCTTCGGACTTGTTACCGCTTGACGTTCGCACGCAAATTGCGTAATTAGGCAGCGCCAGCA------GTTAGTTAGTTAAGTGCTTAGATATAG-----GTGTTTAGTTAGCGACTTTGTAAATACTTATGTGCA-------TTATAAAAATACAGTACTCCCCAACAAA
CTTAATTGTACTTTATTACTTGATTGTATTCCGTTTAAATACGCTCTATTCTGAAGTGAGCATACAAACAGTCGTAGTTCCTTTTTGTGTGGTAAACAATAAAGATAGTCACATAACTTCTAGAGTTAAACCATGCGAATTTTCCATATTAATTGCTGGATTAATCAGTTCTAACTAAAATATATAGCGGCTGTCTGCATTAAAATTCAGGCACAGGAGCGGTTCAAGCAATGCGG--CGCCCAAATCAA
>CG14869 11267965 11268960|11549 chr3R 11267814 11268332 scaffold_20 1968013 1968657 - 4118|155 659
CTAAACTA-GTGCAATGCCGGTCTGTACAATAGTTGTAT----------TAGCTTAGCTCCGCAATTAGTTAGTTA-------------AGAGAGAGAGAGAGAAGTTGGGAGCAAATGTATGTGTAACTAAAAC---GAATACTCATATT-----ATTTAGGATACCCCCCGATCGCACAA-------------------GCCAAACCAAA----------------CTATTCATCAAATCGAATTAACACTCTTGATTGATT----------------------------------------GTTATCACTG----------CCAGATTTTCAACGTTCAATCGATTGTATC-CCAAATCGCCTAAGTCCCGGTACC------AAGTATCCTCGCTGTATTTT-------CATTTAACTAGCTAGGCTAATGCAAAACCAATGTTAACAATT-----AATTTAATGTCAATTAAAAGGAATTTAAAGCTGTTACCAA-CCAAA
CTAAACAAAGTGCAATGCCGGCTTATACAATATTTGTATATCTAAAACTTACTTTAGCTAAGTAATTAACTCTATATACGATGTTCTATACATATATAAATACTAGTTACTTCTAATTGTACG-ATAGCTAAAAAAAAGAATACTCATATTTAAACATATATTCTACACCCAATCCAAAAAAAAACTCTCCAACTAATACTGCTGAAACAGAGAATATAAACGATAACTTACATATTTAAAAAAAAAAACACTGCCAATCAATTCATTTTGGGTACAATCAAAGGCCTCAAACACCAAAGTTGTGTTCTCAAAGTGAGAAGTCTCTAAATATTATACGTACAGCCATTTATATAATTTAATCGTTCAGTCCTCGCTGCCCTTATTAAATGTTAACA---TATTTTGGTATTATATATATACATATATATTAATTAATTAATTATGTTAAGCATTTCTACAAAATAATTTAACCTATAAATAAATAAAAACTGATGTAAAACCGAA
>CG14869 11267965 11268960|11550 chr3R 11268948 11271678 scaffold_20 1969575 1972272 - 81299|0 12
CTGAAACCACTGA
TGCAGGCCGCCGA
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ACATTGTGTTGTCTGCACAATAAATTAAAAACTTATCCAACGCTT
ACACCTTGTTTTATGCACAATAAATTAGAAACTTATCCAACGC-A
>CG18522 11357859 11358047|11650 chr3R 11357959 11358940 scaffold_27 899420 900466 - 45538|0 136
GTGGAGA---AGAAGAATGTGG---------------------ACTCGTATCCCTGAC-----------------------CGTGGGACATGGCACGTGGCCACGATGGGAACGCTC-CGATAAGCACGCCAAGATA
GGTCATGCCTCAACGAATTCGGCCCAACTCTACACTCCATTCCATTTTTCCCCATTACGGAAGACCAATTCAAAGACACCGCGTGAGAAGCGGCACGTGG---CGATGTGAACGCGCGCGATAAGCA---CAAGTTA
>CG6045 11368474 11368591|11664 chr3R 11368456 11371357 scaffold_27 907355 910320 - 114510|18 137
ATATGTGGTTTTGATCGGCTTCTGTCCCATTTACATATACATATGGTTCTTTCTTTATACATATATTTGAAATATTATTAAAGTTTTTATATTG--AAATGCATTTGGTTGCATTGTTAT
AGCAAAAGACATAA-----------------TGCATATATACATGCATATCACATCACATACATATACGTA----TATAAATATTTGTACACTTGCACAGACGATAGTTCGCTTTTCTTT
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GGACAGCAGAACTATATACTATATCCTTTCTAAGAGTTTGTATCGCGGGTGAAAATTTGAAATCATTTGCAATGTAACTCACTTGTGTAAAGCAATAAAAGCATATAAACTAT
GTACA--AGATTTAATGACGAAA--------AAATGTATAAATGGAATCTGTTAACCAAAAATGTTCTACAGTTT------TTGGTGT---------TTTGCTTGTCAACTGT
>CG31294 11541218 11541333|11870 chr3R 11541331 11542214 scaffold_27 1125475 1126358 - 7352|0 2
AAT
TAT
>CG5623 11591968 11592199|11930 chr3R 11591906 11595278 scaffold_27 1198667 1202173 - 27252|73 305
GGAATGCAGGATGTGCCCAGCCCACTCCGAGCCACTCCTGCTGGTAATTTCGACTTGGAACTCCATCTTGGCAAAGGAAATCAGAACTTCCTCCGTCTGTTCTTCGACTGCCGGCGTCGCTCCAGAAATCCGCAG-TTCCAATGAGTAGTTTGCGACTGGCAACACATGTGAGCCATAATTTTCGCGGTACTTGCCTCTTGGATTGCAAATAAAGTGGTTATTGGCTGTGGTG
----TGGAACATTTGCGCACATCTTT------CAACCCAGCCGGCAGT------CAGAAAACCTA-------AACTAAAATAAAAA----------------TCCGACTGTGA-----ACTTAAGAAATTTCCAGTTTCTAGCTGGCAATTT--TACTGACAACACATGTGCCACATAATTTTCGCGGTTGTTGGCT-TCCAATTGGCATTACAGTAGAGACTCTATACGTTG
>c(3)G 11615199 11615509|11953 chr3R 11615165 11615457 scaffold_23 1494010 1494312 + 1423|34 319
TTTAGTAAAATGG----AAGAATATTGAGCTTAGAAATTCATTCAGATCCATCATCATTTAAACATCTGTAC--------TTCTTTGAAAACTTGTCTGAAACTGGCAAGCTATTTTTAAGAACATGA--------TTACTTTATGTTATTTAATCCCATTTTGTATCTAATTGTTAAATTAAAACTCATATCTTGAAGTATCTTGTTCAAATA--GATCCAATCTATTT-----GATTATAGTTTTTGTAATAAAAACATTACATGTACTTTGTTGAAACACTTT
TTTGACAAAATGGCTCAAAAAATAGGTGGCC---AAATTAGTTGTACTCAATAATCTAGCAAACATTTTTACGCTTAACATATTTAGATTTTTTATATGAA-----CGAGGCTTCGGAAAGAATCGGAAATATGTCTTGAATAGAGTTTTTTACTTCAAGTTTGAAAAGGATTTTTGAAGGAAACATAAAATGTTTAAAAATTCTTTTCAAATATTAATTTGGTTTCTTTTTAGATATTTTTGATTTTTTTTTAAAATAATTATTTTTAATTTAATTACA---TTC
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ACAATTGGTTTCATATAATACTTTATT-TTCTTGTATCCATAAAATTA------------------GATATATAGTAATAAGTTTTTATAAATAAATACACAAA-----ACAGTTGTTTCCGTTAGAAGT--AATCCATCCCATCCTTCGTCATTTTATCCCTA------CGTTCTGGATA-TTTTAGAGTTTATGTCTTGCTTGCTTTGAATGC--TTTGTTTCTGA--------------------------------ATTCAGT-AGTAACTAT--------TTGAATGACTCT-------------CGTATACG----------ACAATACCAGAGCTGAGAGAGGGCTTAGCTTAAATCTATAAGTGGTATATCGGATATTAGAGCTATT-TTTACCGTGCCTGGAAATCCTATTCGACTATTTACAATA----------------------------------------TTGCTAGTGAATGTAATGTAATATTTGGCTTATACTTTTGCTACCCCACTACGTTGCTCGTTTAAAACTTATATCCTACATACACTTGTGTTTTGGTTAATTCTGGATAAGGGCTAGGAGTGAATAGATTAATTGAGATTAATATTACATGCC-----AATTTTGCAATCGTTTTAGGCTAATCAGTCTAAACAAATCGATGCGAACGCTAATCGCGCA-----AACGAAAAC----AAAAATTGATTTAATTTGCTCTCTAAATATTTCATTCTAAA-------ATCAAGCTAGTTCTTAATCTAAGCTGTTTCATTT----CCATGGT-------GCGATTTA---------------GTTCAAGTTTATTGCACAT----ATATTTTAGGGTATGAAGCTGGGAGGCTTAAGCGGAATGCATTGCTCAGGGCAGTCGAGTTGGGTATTTTGGCCT-----ATTGCATTAAGTCGAGCTGAAGGTT-TATTTGGGTGG-------------------GTCGATTTATATAAATAAAGAGTTTAAAGAATTTCTGGC-TAACATGTAGTTTGTAA--TATTATACCTTTTTGAATAAA------ATATACGTTT------TTTAGAAAAGTCAACA----------GGTAACTAGA-------------------------CGTAGCC----------------TCGTTTCTTCTTACGCTTTGATCTTTTAAACAGACGAACAGAATTCGAACTAGTCATTAACT--TTCATTCTACATGAATCAACAAAAAAAAAAAAACCTAACCACCCTATGTTTGTATGTTTATAACTATGTCGTGTGCTTTGTACTTTCAAAACTGTTGGAGACAGACATTAGACGTGACGAGAACTAAATAAAGCTGAAAACTTTGCACTTGGCGTTTACCACTAACTA------TTAGAACT-AA
ACATTTGGTTTCAATTAATACTTTATTCTTTTTGAATTCATAAAATTACATTGAATTTGTCACGCTAATATTTCCATATATATTATCAAATATAAATACATATATGTTTAAAATCCAACTCATAAAATGTCTGTTCTTGCTTAGCTTTCGTCTTTTTTCATTCAGTGTATTATCCTATGTAGTTTCATAATATAT---TTGCTTGGTTTGAATGCATTTTGTTTTCGGTACATGTGAGGCTTTACAATTGTAAATATTTTGTTTAGTTAGTAACTATGTAATATTTTGTATGTATTTTATATCAAAGATTCGTTTACGTTTATAAAGTACAGCACTACAG--GTAATGTTGCTTAGCCTAAATGGGTTAGTT-TCGGTTTTATATTAGAGCTATCGTTTACCGTGCCT--------TTTAGAACTATATACAAGAAAAATAAAAAAAAATTAGAGCGAACATAATTATAGGGTATTAGGTATTTAATGTACTTCAATATTTGGCTTA----------ACTCTTTTTCCTTTTTGTTCTGCTATCCATCCGTCCGTTAGTCAAGTGTCTTTCTTTAATTGAGATATTTGCTAAATAAGCATTGATTAATTTTTGTTTTTCTTCCTTTTTTTCTTCGTTTTGCGTATATTTTAAGCTAATCAGTCTAAATAAATAGAAGGCAACAAAAATTCAACATTTGTGGCTAAAACTGAACAAATTTTCACTAATACGCGGTCTAAATATTTTCAGCTAAATATTTATATGCTATAAGTATTATCTTTAAGCTCTACTAATTGTAACCAAGGCCAATCTGGCAAGCTACAAAAGAAAAAAAATGTTTAAATCAATTTCAAATTAGAATAAATGTAGATATTG-TCTGTTGGCCTTAAGTTAGATAAATTATGTATATAAG--AATTTGCATATTAGATCCACCAAAATTGGATTTTATCTAGTCAGAGGTTATGTCCAAGGAGCTTACAAACCAAAAGTTATGTATAATTATCTAGAAAAAATATTAGAATAGTTTGAGACATAATCTGTTGGTTTTAGCTTAACAAACTTTGCAAAATAAACAGAAGATTTAACTTTATCTAGTTTATAGAACTTAAGAATTTGTAGGAGTTAACTAAGATTATATTAGGATTATTGCACAAATTGTGGACCGCACAGTTAGAGTTATAGATTTTTATAGAGCTCGGATATGACAGTTGCTTAAACGGAATGCTGACGGGCAGTAAAATGATCTATTGCATATACATTCACATAGATAAA------------------TTTGGTATATG-ATAACAATGCTCTGGGCTTTGTACTTTGAAA--TGTGTGAGACGCGAAAGAGAGTGTACGATCTGTTAATAAAGCTAAATAACATGCACTTGTCCGTACGTAAAAGCTAAATATATAAGAACTTAA
>rec 11648709 11650198|11987 chr3R 11649847 11650097 scaffold_0 2150156 2150416 - -1700|0 281
CCGTCTAGCAATTAAT-AATAAATGCCATGGAAAACATTT-TTCTGTTTGAAACTCACACCATTA-------------CGTTCTAGTTGTGGTTA----------TATTGATTACATTTTTATAAAGTTAAATTTAATAAGCATACTTTCGGGACCATATCAATTTCACTTGATATATTCTTGCCCAGTACTTTCGTTGAAAATATTTAAAGATAAGAAGTAAATCTTCTCGGAGAATCGC---TCTTGCAATTCGTT---TCAATGACAAACGCACATTCC
CT---TGGCCATTAATGAATAAATGTC-TGAAATGCTTTGATTTGGCCTGTAATACGTGGCTTGAGCCCATGTATCATCGGGCCAGTTTTTGTTAGCCAACCGAACAATGGTAATTTATTCAT-----TAATTGCAATGA----CTTTTCAAGTTTTTATAAACTTAAACAGCTGAAGTCGT---TAATGCTTAC-----AATAGTTTATGAATTTGTTGTAGTTATGTAAGGAGAGCCAAACGTCTTGTAACTAATCAAGTCGAGAATATTGAAATATTTC
>rec 11648709 11650198|11988 chr3R 11650098 11651339 scaffold_27 76449 77499 + 13616|0 101
GCAAATGACAAACGATATAGTGCCAATATTTGGCTAACGTCTGTGGTTTTTGTTTCTGGTTAACT-ATAAGTTAAGTGGGTTCTAAAATGAGGCAAGCCAAG
GCAAATGTCTA---------TGTAAATATTGTAACAA-------------TGTTGTTGTTAAACTAATACATTAAGTTGGTTTTAAGTTTCGCGAAGTCAAG
>ND23 11661766 11661846|11998 chr3R 11661786 11662800 scaffold_27 91106 92095 + 44683|0 61
AGTTGCTTGTACCCCTAGAATTCCTTGTTTAG-AACGATTTTCCAATTAAAGATCGTTGCTG
CTCTTATTGTACATATTAGAATTTTTGTTTAGAAATGTTTTTCCAATTAAAAAACGAAGTTG
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GTTAGTTTATAAAACTTTTACATAATTAAATAACTAGCATTTTTGCGCGATGTGATCTTGTTTATCTGTTGCACATAAAATATTCATTGTATTTAAGTATGTAGGATAGGATATATAACTATA------TAGGATATAAGTTTCCTAGGCTTTGCTATTCTTATAT-AAAGAGTTGAAAAGT
CTTAGTTT-TAGTTCTTTAATAATACTTAATA--TGTCATCTATGTA--------------TCAGCTGTTATGCTTCAAA-----GTAAAACTTAGGGACACAACTTAAAGAAAACTACAATCAAGAGTTAGAATGAGAAAAGCTTAGGCACGTAGAATCCTCCACAAAAGGATTAGATAGG
>CG31150 11670188 11670245|12004 chr3R 11669840 11671611 scaffold_41 661647 663445 + 57521|374 454
ATATAATGTGTGAGTTTAATCTAAAATAAAA-----------------------AAAAGAGCCCAAAAAGGGAGAACATGC
GGATGCTCGTAAAGTATAA-CTGAAGTAAAAATAACGCTATAAAAAAACCTCCTAGAAAAGCACACGAAAACAAAGCTTGT
>CG4225 11679590 11679817|12013 chr3R 11679660 11681866 scaffold_41 677186 679452 + 98702|0 169
CCTTAAGTGACATACAGAGTAGTT------------TCTGATATTCCTGATTCCATGTGATTTGTGGTGTATTGTTATACGTATGAGAGCAGCTCGTCAAAGTCTTAGTTCGTCTATAAGTAACCTTATATGCTACTCTTATACTAATAAATAACGTAGATTTTTATAGA
GAATAGGCAGTATGAAATGTAGATCTTAGGCCGTAATTCGATTACTTTTGTTACATGTAATTTGTGGTAC-TTGTTGTGAAT----GGGCAGCATGTCTGATTCCTAGTTCTTGTCTACTT------------TATTGTAATAATAAAATATAATTATAGTTTTTATAAA
>CG31183 11683801 11684052|12016 chr3R 11683785 11684430 scaffold_41 681642 682437 + 11405|16 345
CTGTATGGGGGGGAGTCGACTCCCTCTTCACTG------------------------------------TAATCAT----ATGCATATTAAATGTACTTGTTTGTGATA-ATAAGTTAAACCCAAGTTGAACAAGTTAGTGGTTAGTCAAT-----AGTCGACCGAATCAAATTCGAAATTCGTACGGGAAAT-----CTTCTAAAATGTTTCCTAGGTTTTAATCGCCCCATCCCCTTACTCA--------------------TAAGTAGCGAATTTTATATTTAACCAAACCTCAAATTAAACAAAAATAAAAAC-------AAAAAA
CTGTAAGCATAGAGACTCATTGCCCCGTCGTCGGCAAACTATCCGGCCCAATGGCCCATCTCTAGTACCTACTCGTAATGATGCATATTAAGTGTACTTCTTTGTGATATATAAGTTAAATCCCAGTTGAACAATTTAGTTGATAGCCAATTTAAACGTGTACATTTTTAACCACGAACTATGCCCGCCATTTAAGCACACTTAATATATATTCTCAACTTTTATTGGACGGTCCTTAAACTAAATACTGTATACATTGTACTGTAACTCACGAAACCCACACTATAAGGTACTACAAAAAAATAAATAATAAAAACTCAAATTAGAAAA
>glob1 11722648 11723004|12053 chr3R 11721733 11725074 scaffold_41 728566 732096 + 31707|1124 1521
ATGAGGCAGCTGGAGGTGGAGATGCAACCGAATCCGCGGAAGGATGCAACTGATGCCAGCCGGTGGCACTTGCAACAC-ATGCACAGCTTATGTAGTTCTAAGTA-------ATTGATAAATGTTAGCTATTCTCGTTTTGTAATAATGAATGCGAATGTCCAAAACAAAAATACACACACAGTGAAAACTTATGTCTGCGTAGAGCTACTGACACACGCGCACACCC---CACACACATAC---------ACCCGCACTTGCATTGCTCTGTAAAGCTTTAACCCATTGTCAGCCTTAAGCACTTGATAGCAAACAATACATGGAATCAGCAAAGGAGAAATAAGAAAGCTTATA---------------------AATAAAATCCAGTTTGAAAGC
A-GAGAGAGATAGCGAGTGACAAAAGAGAAAGTTAGCGAGGGCGAGAGAGTAAAGCATGCAG------CTCACAATGCAAGGCACGGCTTATGTAGCTTTAAGTAAATGATTAATGATAAATGTTAGCAACTTTCATTTTGTATTTATCAGTACAA--GTCCAATACACACAAACACAGGCA-------------------------CACACACACACACACACACACAAACACAAACATATTAAGCACTAACACACACGCACATTGCTCTGTAAAGCTTTAATCCATTGTCAGCCTTAAGCACTTAATAAT-AATAATACA----------AATTAATAAAAAAGGTCGCTTGTAGCCGCAGCTTCTCGTTCTCTCAATAAGGGTTGATTT--ATCC
>CG31291 11736088 11736208|12066 chr3R 11736040 11738230 scaffold_41 739800 742117 + 62533|48 216
GGGTCAGCACCGAGTTCTCCAGC------AACAGTTTCTTCAAT--------CAACGTAC------------TTCTACTCATGTGTTCC------------ATAATTAAACGAAGAAGG---GAAATTCATGTTTTATAACTAATAAATCCATTTTAAAT-------AA
GCGTGACTATCGTGCATTCTAGTTCTAAGCACACGTTTTCCAGTTGCTAGTCCAACCTTCTGCATTATATTATTCTACTCATATGTTTCGGATTGGCTTTTACAAATATATAAACAACATTTGATATTAACATTTTGTAATTACAAA---CATTTTAAATGCAATACAA
>CG5478 11758422 11758616|12086 chr3R 11756535 11760492 scaffold_41 764723 768382 + 105072|1951 2159
ACCGTTTCTGGTGGGGAAAATAATTTATTACTCCAAGAATTAGTCTA------------CTTAGACATAGTCTACTGAACATGCTCTATG--CTACGCTAGTTCTGTCCTGCGTCAGTTTGATATATACAATTTACAATAATCTCATTTAGCTCGGGCAAAGTGGTGGCTGATTACAGAGAACAATTTAAATTATATCCAAACCAATAG
----------------GAAATAATTTATTA-TGCAAGAATTAGTCTAAAAGCCGCGCTACTTAAAT---GCTAGCTAAAAATGCTCTATGGCCTATTCTAATCCTCTCCAGCC--------ATATATACA----------------------------------GCAGCCGCTTAAGTATG-----------TATTTACAAAATAACA-
>CG31088 11775923 11775979|12104 chr3R 11775158 11776339 scaffold_41 797521 798704 + -1063|872 928
CGCGGAATAAGCAGAGGGATACGACGTCCCCTTTGAGCCTAGGATATATATGATGAT
TGC----------------CACGCCCACACGCGTAGCTTTAGCTCGTGCATG-----
>CG4287 11787883 11788259|12109 chr3R 11782373 11787916 scaffold_41 806232 811884 + 94750|6190 6228
TTGAATGCAATATGCGAAAATCG-----AAATGAAAGAG
TGACAAACAATGTTTTAAGCTTGTGAATAAAATAAAGAC
>CG4287 11787883 11788259|12110 chr3R 11787917 11791276 scaffold_41 812686 816349 + 52796|0 434
CCCGCCA--------------CTAAAAGCA-----------------------CATTAATGTCTAGCAAAGT--------------GTTCCGAGGTGTAAGGGCAACGAAAAAT---CATTG-AAATTGTGTTACTAGCCGTAAGCAAAGCGAAGCCAATCCCAATCCCCGCTTCGAGTCCGAGGGTATTTGCCCTGCAAATATG------GGGACACCTATGAGATTTACAGATTTTAGTCAATT-----GCAATATTGTAAATTATTAATTGGCGTGCCACTGGCGCACAATCGCATGCTTATTAACCCC--ACTGTTAATTCATTGTGTATTGTCCAAAAA------------------TATGTTTTATTAAATCCGTTTAGTGTTAGATCCTGTAATTTATGTATCGAAAATTA------TTGTGAATAAA
ATCGTCACATTATCGGTAATCCTAACAGAATTCTGTAGCTATATCTATGTTGTCAAAATTGTCTAGCGGAGCTGCACCTGCATTTAGTCACTGGGGGTAGGGGTTCAGGGCATTTCCCTTTGAAAATTGTGTTATTAGCATTAAAATATATATGGCA---CTCAGTCC---CTTGGATTTCGTAGATGTTTGTTCAGCAAACATTTTTAACTAGAGATTTTTAATATTTTAAGATTTTG--TAATTATTGGGCAATTCTGTATTTTGT--------------ATTGTAAACAATCGCATGCTTATTAATTTTTATATATTAATTCAATGTGTATTGTTTTCAAAATTGTATAGCCTGTCTAGTAAATTTTATTAAAT---TTTTGTGAATAAATCTGTTAAAAATG--TCTAAAACTATTTTGTTTATGAATAAA
>CG32856 11790450 11790528|12110 chr3R 11787917 11791276 scaffold_41 812686 816349 + 52796|2867 2987
AATTGTTATTAA------GGCTGGAACTTTACCAG--------------AAAAACGTACATGTT----------------GGGAGCATTAAAATATAAACAATACAGTAC------CAAAA
AGCTGTTAGTCATTTATTGGTACGAATTTAGCTAAGTTAAAAGAATTCAAAAAACAAATGCGTTCTAATTTTAAGTAACTTAGATTATTTTAAAAGAAATTAATTATGACATGTTGCAATT
>mor 11793855 11794107|12113 chr3R 11793820 11795476 scaffold_41 819652 821240 + 38642|36 305
CTCTTACTCATAAGCCAGGAAACGTTAAAGTAAA---TAGCTCTAAGTCGTACGCTCTCAGTATGTATTATGTATACTCCACTTTA--AGCCCAACTCTTGTGTGTAATCTGAAGGAGATGCACTA-----------CACATTGACGCGTCTCCAGTTTTGTGTAAGTTTCATT-TCGTGTCCGGTCGCGTTTACAAGCAATTGCACAAATATTTTGAACCAAGTTTCAAAGCCGAAAAATAGGCATTCAATAAAAATTTATTTAAACTA
-TCTTAAAACTATGTGTGTAGGCATGAGAAAAAACTTTAGTTATAAGTTGCACGCTCTCAGTATGTATTGTATACTCTCCCCTCCCGTAACCCAATTGTCTGTTCCCGCTTGAAATCCCTTCATTAGTGTACTTATGTATTTTGTTGTAGTCCCTTTGTGGCGCCTGCTCATTTGTTCTGACTAGGCGTCCTTTCATTTATTTACACA---ACTTTGAACCAAGTTTCAAA-CCGAAAACT--GCATTAAAATAAAGTCTACTCA---TA
>CG10407 11870511 11870580|12191 chr3R 11869611 11871938 scaffold_3 4924207 4926374 - 67536|927 1006
AATATCTAGTG--AAGCCCATTTTTTTTCTATCTTACTGATTTAATCGTAG--------TACAAACAGTAGCCTACAAAT
AACAGTGAGCAGTAAACACAAAGTTTAAATAAACTATAGATTTAATCGTAGGTAGGTAGTAAAAACATTAAACTACAAGT
>ird5 11872068 11872301|12192 chr3R 11871939 11874591 scaffold_3 4926706 4929456 - 18570|129 373
TGT------GCATTCTGGTCGACCATACATTTTAATTTGATTTCAATCAAACCGCATAAATATTTCTCCATTCGAAATCATACAAATGTGTATTTCGATTTTTTG----TTATTGCCCGCTTATCCAATTAATTAGCTTTATTAGTTTCATAGAATCTTTAATGT-TCTCATTTGGAAACGTTTTTTTTTTTGTTTAGAAATATGTGTTACGAACATTGAAATAAATGACAAACCTTATTTTTTA
CTTCCTTAAGCATAAAGTGCCTTCA-AGATTACTGTTTGATATTAACTAAAGT-CAGCATTATTT-----TTTAAATTTAGCTAGA---ATGCTTTAATTTGTTACATTTTATAACTGTAATCTACAGTTGATTTAGACCTTTAATTTGTTATAAT-TTGAGTGTGGCTCTTGTCCAAGC---TTTATTTTAATTTAAAAACGCATGCTCC--ACATT-----------TAAAGTTTGTTTATTA
>Mhcl 11894245 11894320|12200 chr3R 11894197 11897259 scaffold_3 4952038 4955181 - 133715|53 131
CGGGAAAGATTCATA---AAAACCTTTATAAAAACTAACAAAACGAATATAAACAAATAAATATATTGTTATAAAACTT
TCAGAAAAATACACATATAAAA----TATAAAAAACACAAAATTTGAAAATAACAAATAAACATATTGTTATAAAAACC
>Mhcl 11895392 11895532|12200 chr3R 11894197 11897259 scaffold_3 4952038 4955181 - 133715|1379 1536
AGGCCCAAGCACACAGCGTAGACTCACTCACCCTCTA-ATTATCTGACTTTTAATATGC----CTATCGCTAGTTAGC------------TAGTCTGTAAGGTCTGTTGCTATTTGCCGGCTTATCTAATTTAAATAATTAAACCATACATGCAAACC
------------GCACCGTAGTCGCATTAGCTCGATATAATACCTATATATGCATATGTATAACTATCACTAGTTAGCTAACTAGCTACTTAGCTTATAAGGTCTGTT----TTTGCCGGCTTTTCTAATTAACATAATTACTTCATACATGCAAACT
>CG5903 11971397 11971552|12266 chr3R 11970099 11972765 scaffold_3 5038680 5041439 - 55518|1435 1631
-AAGTGCCCTCCCGCTAAAGGAAACTCCTAGTCCACCTCCATCCGGGCGAAAAGTGTGCATCGATTTAAGTTGTATGAAGC----------------TTGAATTCTAT---------------CCGAAAGTAGTTATCTCTTTT----------CTTGTTGCCAGAAATAAATTGGCCTCGCGTCCCAAAAGTGAAA
TAGGCGACATGCAATTACCAGCGATACGAACCGAACGCTCAGATGTGTTATGATTTTAAACAAATTTTACTTTTTTAAACCCACATCATCTATATTTCTGATCTTTATTATTCCTCTGTATAGCATGTAGCAGTTCTCTCTATTGATTCTGTCGGCTGCTGCCTGCAATAAACTCGAGTCGCGTATCAAAAGTGAAA
>Bin1 12011880 12011973|12302 chr3R 12010633 12012539 scaffold_3 5087013 5088886 - 80733|1274 1372
TTCTTC---ACTTTCA-TCTATTCTAATCATTTTAATCTTTCACTTGACAC-TCAATGGAGTATGAACATAATTATAAGTGGAATACAAGTAAGACGAA
GTCAGCGGAACTTACAGGCTATT------GATATAATTTTTCACTTTAAATAATAATAAAGTACAGACA----GATTAGTAAAATTAAGGC--GACGAC
>CG6126 12023724 12023929|12317 chr3R 12023907 12025758 scaffold_3 5103700 5105530 - 87707|0 22
AACCTAGCCAAAGACGATTGTTT
TAATTGGC--------ATTGTTT
>mtSSB 12029912 12030035|12320 chr3R 12029127 12030311 scaffold_3 5110736 5111978 - 18061|844 991
AATTTAAGCCCAGATCACCAAACCTAA---TCTTAAGCGAAAAGTTGAACTTGCA--GCATTGTAA-----GCATTTATA-ATATTCGTTGGATATATTGTGTTA-----------TCAGATTACATGCGTAGTCGTACTCCA--CAT
AAGCCAAACCTTAGC--CTAAACTTAAGACTATTAAGAACACAGTTGAACATGCGTTGCATTTAAAAACCTACATACATACATATGTATCATATTCATTATGTTAAAAGTTATTTTTTGAAATACAT-TAAAATTATGCTGTAATCAG
>bor 12087072 12087555|12377 chr3R 12086974 12091652 scaffold_41 36552 41475 + 181941|98 632
AGCGCGGAGGAACCGATGCTGAAGTAGATG-CAACCTGCATTCAAAACTTGTTTAGTTTTCTAATCACTTAACTTTAAGTTGGT-----ACGCACAGGGCTTTATCTTACTAACGACCACCAACCAGCA-GCCGAGACACCAAAATAGTGCATATCGGTTACGTGTATGCATTTAACAGCCTGTACATAATCGTTGGCGGGAAGATGTGTTCGT-CTATAGATACAATTAAGTTTGACCCACAGATAATTGTATTATAAGCCTACATCCACTGTCTCAATAG---AATATACAATAAGAAGTATATATTTTAACTGCTGTCGTTGCATTTCGTATGTTAAAGCTTTGGACGTAG----------------------------ACTGTAAATTGAATTCGGTCGCGCCAGCACTGTGAGAGATTTATATTAAACTTCTCGCTGGCTCTTCCACCAATTTCACTTGTCCG--CAGTGTTTCCTATATGTGAGTATGAAGTAAATATATATAAATT--------ACCTGTTAA--AAA
-----GTTGGAACTGCTG--GATCTATCTGTTGACTAGCATTCAAAATTTGTTTAGTTTT---AAAAATGGACTATGAATAAGTGTAAAACGCGAAACGTTTTTTCTGGTCATTGG--ACCCTTTAGTATGTATATACATT---GCACTGCATGTGTGTAA---ACATGCATTTACTA--TTGTACAAAAACATTG------AGTCTTGCTGGGATTAGACATACAATTAAGTTTTACCTACTGATAATTGTATCGTAATATAGCATT--GCATCTTAATAGTTAATTGTACAA--------AGGTATCAGAGCT------GTTGCATTT-GCAAGTTAAAGCTTTGTATGTAGTTTTTTAAATTAATGCCAATTGCTAAGAACAGCAATTTTCAATTGGTCGCGCCCACACTGTGAGAGATTTATATTAAACTTCTCGTTGGCGCTGCCACCAGTTTGACTAATATGGCAAGTGATTCCCACACAT--GTATGCAATTGATTGATTTAAAATAAAAAGCAAATTGTTAATGGAA
>CG12785 12094051 12094184|12380 chr3R 12094184 12096570 scaffold_41 44003 46372 + 80083|0 0
T
T
>Sulf1 12136256 12136902|12427 chr3R 12136109 12139943 scaffold_41 101818 105750 + 110664|168 919
AGA-----------TTCGGCTGGACCTAGACACCA-----CACATATCCAA---TGCGTATCCTT----TGTACCTTGCTTGCCCGCTTCTAAT-------------------------------CTTTGGTTTGCCCCATTTAATGTTTTCATACATAAATAAGACTGTGTTTTAATCTATATTCG---TATGTTTAGATTTCTTT-TATCAAACTGTGTGTAGTACAGTCCTTGCTACATTTGGCTT------GCAATATTTATAGTTAGAGCTACATTTTTGACTAGCTTCTAGGCCACCTAATTTGTAAATAAATTTAG-----TACCGAAATTCTACGTAAACTAAATAAATTATTTAGCG-AATTGG-TTAAAAGTTAAAT-------TAGTTGAGCATACGTAGTAAAGATTTTATAAATT-------AAAGCGAACCCAAAT-----------GAAATTGTATTTATTGGCCAATGCTAACGGAAAAATGTTATTGCGTATTAGAGAACTAAAACCATATTTATGTCGAACTAGATACGTTCTAATTGTT-----AAGTACCCGTACCCTACCCGAATTCCCAAAGACGTTTTGTAGCAGTCCA---GCTTAAAATCGAACAAATATATTGTATTTGCCACGTTATAAATGTCATCAAATTCACTCAAGATTGATATATTAAAATAATTATTAAAAAACGATCCAATAAAACTGCAAAGAATTAACT-TTTATCACGAACAAAC
GCAGCGGCATTCCCTTCACCTTCACCCAGTACCCAGTGAGCACATATCCTGGCTTGCCACTCCGTTCAGTGCACCGCCGTGGTCTACATATGGTAGATATAGATAGATTCATGTCCATAGACGGATATAGATCTGCGTTCTGGTATATTTTC-TTCGTAAATAAGACTGTGTTT---TTTGTATTCAACTTACGTTTAGTTTCATTTATGTTGAACT-------------TCTTTGCTTC-TTTGGCTTCAACCCGCAATATAAATA-----------AACTGTAATTAGCTGTTAAGTCATTTAATTTGTACATAAATTTAGAAAGAGAGTGAACATATTTACACACTACATAAATTATTTAGCGCAATTGGTTTTACAATTAAATTATATAGTAGACGAGTACACTTAGCAAAAAGAAATCAAGTTACCATAGAGATCATATTTACATACATATTTGTAGTACTTGTATTTATTGGAAATCGCT-----AAAAACGCTA-CGCA-AATAACCAACTGTTATTGTTTTTAAATGGAAATACTAAAGCAATGGTTATTTTCTGACGTTGTGCTGCACTATTTAAATCAACTTGTTTTCTTTTTAGCAGGCAACACGCCCA----CGAACAA--ACATTGTAACTGCTATGGCAAACAT-TTAACAAACTTATTC----------TAACAAAATAA----------------AAATATATATGCATAGAAAGCCCTATTTAAAATAAAAGTAT
>SF2 12165849 12166375|12457 chr3R 12164710 12166707 scaffold_41 137590 139610 + 26533|1294 1850
ACACAACCAAGCATTATCCATTAATCTATAATATTT-TAATGAGCAGGAAA---CAGGAAAAGCAAGCTATATTAGGAAATACCAATCAATA-----TTTGTTCAAGACCCCTCAAATACCCCAATTGTAAATTGATTTGTAAAATGAAATCAACGACCAATCAAG--TTTGTTCAGTCAAGTTCCGAACTCTCA---------CCGAAGCCAACATACTTAAAAAAGAAAAACACTTGCTTTTCCAACTTATCACACGTTCTAAGAAGCAGAAATGTTCTCTTAAGTTA--TAATCCACCGGGCAAA-----ATTTGACAAAAACAGTTCTAAAATGACAACTGTAAACCAAGG-AATTCTCTTTGGCCAAAAGCACTCGGCATTCCTTGATTTGCTTTTGATTATCTTTTGAGCCTTTGCTCAGTCTGCTTCCTACATATTATATTATAACTCTTATTTTGGCTGCACGTTTTCCAAGC-TAATTTATTAGAATCTACCTTAACG-AAAACAAGAAACATCGATACAGAATAAATATGTTTGTAATGAGATAAAG
AT-TATACAATCATTATCCATTAATAT-TAATATTTCTTACGAGCAGGAAAAATTAGGAAAAGCAAGATAACTATCAAAACCCCTCCCCCTAGCTCCTATACTCACTGTTTTTCAATTATGCTGACTGTCAAACGATT-----GATCAGATCAATGTCAAGAAAAGAAACCCTTTTATCAAGACTGGAGTAATCCAATGCGAATCCCAAATTAAGATCACTAACAACAGTAAACACTTGCTTTTC---------------TCTCAGAA-CAGAAAAATTCTTTTAAATTATTTAATGCAT---ACAAATATACATTTGACAAATTAAGTTTT--AACGATAATTATAATTCAAGGAAAGTCTCTTTTTCACA----------CATTCCTTGTTTTAA------------------------------------------------------------AATTTGGTTGCA--TTCATAAAGCAAAATTTATTAGAATTTATCTTATTACCAAACAACAAACAATAAGGAGAACCCACTACTATTCAGAATAAATAA--
>CG14879 12171852 12172814|12463 chr3R 12171761 12172185 scaffold_41 145668 146117 + 69|103 487
TATATATGTCAGTCACATATCACTCACCT-CGGTGCTATCTGTCTTATG--ACGTCACTTTAGCTCTGCTATGTCCTATTGCTATCCTTTGCAGTTGCTAATTGTTTCTTT-GTTTGTAGTTGATAGCAA-ACGTATTT----------------GTAAGGCCAAAGAATTTTATGTATAATACACCTTGAGTTTCTGTTTCGCGCTTGCTAAAGTCTTCCATTCAGATTGTAAACCTACAATGTAAGTGTTAGCTTTACCTGTAATACCTACATAC--------ATATGTATACAGACCACGCCAAGTATTA----AAAATCGCATG--ACAAGTGCGTTTTCCACAAATTAAATGC----------GTAAA------CACAAA
TGCGTATGCCACGCTTTTTGCACTCATCTGCGGAACTGTTCCTTTAATGTAGAGTCCGTTTAATTGTTCCA------------GTGCCTTGCAGTAG-TATTTATGTGTTTAGAATGTAATTGCTAGCTATACGAATTTTCCTTTGTTATGTTTAATTAGGCCAAAGAATTTTATAT----------------TTTTATTTAACACT-GCTAAAGTTGTATTTATGTATGTAGCATTTATACTATAAGCGGCACACAAATTCCACAATCCTACATCCCATACAAAGTATTAATGAAAAACCCTTAAAATATAACTGCATAGTTTTATGTTACAATTCTAAATAATGCCCATTAAATGTTATTTATTTTGTTAATTTTCTCTCAAA
>CG14879 12171852 12172814|12464 chr3R 12172588 12173297 scaffold_41 146212 146866 + 15185|0 237
TCGGGAGAAGAATCCCAAAGATCCCATGATCCCCAAGGTAGCCCGCAATGTTCTCTTATTTAATGCATTCTTTCTTCAATCGCATAGATTCAAGTTCG-----GTGGCGGGCGTCCTTAGTCCTAACACCGCACGACCTTAATCCCCTCACCTGTAGTTTTAATTAGTTTG--TTGGATTCCGCACCCATCTAAATCACTTCGCTGCAGTAGCAACACGCTTTCAC----TCCTTCGC
GAGCAGCTGCAAGCCTGAAAA----ACAATCATTAAGGT---TAGCACTG-------------CACATTTTTC-----ACCACAAATTTTCACTTTTGCCCTTTTCGTCTCCCTCCTTGGTTTTGGT------TGGTTTTGTTCTGTTC-TGTTTGGTTTGGTTTGGTTTGGCTTGGCTT--GTTCTGCTCTTCATC------------TAACAATAAACTTGCACGTAGTTATTCGC
>CG10311 12176627 12176851|12468 chr3R 12176063 12178219 scaffold_41 639024 641253 + 45246|572 839
AATCTCCAGGAGCACTATTCATCAGAAATTGCATTCAAGAAGCTGAATCCACCACCCACACATCTTC------------ATCCT--AGCTTCCTATGTTCGTTTTTAGTGATTATGTCTAACTAATAATTATAATTTAGTT-------GAGGCGAGCCAGCCCT------------------TCGCT----CACATCGAATTTACGCGGCCCGTGGCATTAAGTGCAATGGAATTATGTATTTAACATTTAAATAAAACTTTAATCCA
ATTGCCCGGTCGCACCATCCAGTCACGGCTG---------------ATACACCATATGCATCTTATCTGTTAGTTGATAATACTAAAACTGCTTATGTTCGTAATTAGCTCATATGTTTAACTAATAATTTTAATTTAATTATTTAAAAATGCGTGCCCAACTTGGCATAGACGAATACATATAGCTTAAGTAAATAAAATGTATGGGGCCCGTAG---TAAGTGCAATCGAAT----TACTTAACATTTACAATTATCTAGCATC--
>CG17931 12183866 12184263|12476 chr3R 12183635 12184961 scaffold_41 649855 651233 + 11987|259 707
TCAACCCACTGGCTTGATAGAGATCTGGACTCCCGGTTGCATTTCCGGACAG---------------GTTAGGCTTATAGTCAGTCGT------------------------TCGTCAGCCAAGACCCCGATTCGCCCAAGGACCTAGGATAGTTGGTTAGAATGTACATGAAGCAACATACATAATTCACGAGAATTGTATACAACTACGCATAGATATTA---CCGGGCTGTACAGCACGCGACATAGCAATAGCAA--------TAGCAAGTGC-CACCCAAGGACTTCGATTCTGTTCCGGTTTTTGTTCATTTTCGTTTGCAGTGCTGCTGTACGATAATTAAGTAATCTTACATTTTATTTCTCCACCTACCTGACTAAATTATTTACTGTAATGTATATATATAAATTTTCAAATAAAACATAATATGCAGCCGACAGAAAG
TTAATTCCAGTACCAGCTAGAACAGCGTGCATCCG--TGCAATCTTTGTAGGTCACACAAAATTTTCGTTAGGC--ATAGTCAGTTTTAAAACAAAACAAAGCAAAGCAAAAGCAGCAGTCGCAATCCGGAGGCACC----GATCGAGGCCAGC--GATCGACTCCAGGATAGTCAATGT---CAAATCA----AATTGGTTA-AATTGCGCAAAAAAGTGAATTACAAGCTACAAAGCAGACG-TATATCAATAACTACGCATCCCTAGAGAGGACACACACAAAGAA---------GGGCTCGTTTTCTTTAATGTTA---CGCTATACTGCTAAAC---AATTAACT-ATCTTAA---TTATTTCTCTATATACCTGACTAAATTATTTACTGTA----AAATATATACATTTTCAAATAAAACATAATATACAGCCAAAATAACC
>CG14880 12186051 12186217|12478 chr3R 12185853 12186083 scaffold_15 1679937 1680186 - 1358|235 267
GCAGATTAATTATTAAACTACACAAATATGTTT
GAAGATTAATTAACAAACAATGCAAATATTTTT
>CG14880 12186051 12186217|12479 chr3R 12186132 12187900 scaffold_41 229377 231124 + 52247|0 109
TCCTGATTCCATA-TCCATTCC--------CGTCTCCGTC-------------CGTCCCATC--GCCCATTATCCGCATCCGCATCTGCTACTAGCCCTAGTATTAGCTT
TTTAAGTTCTATGTTCCATTCCACATGCCGCAACTACGCCTAGTATTAGATGACATAATATCCTACCCACTATACGCCTTCGCATCTTTCATGCATTTAAATGTTAATTT
>ss 12200150 12201947|12488 chr3R 12198103 12201123 scaffold_41 244796 247837 + 20633|2406 3494
CTCCTTGGTTGATTCTCAGAAA-ACTGCAGCAGCCGCAGCAGAAATAATTTCTATTTATTTTACTGTGATAATTTATAGATACATT-GTAT-TGTATGTGAAACTAGGTTTGCCCGTCAACAAAAAATCCAAAACAGCCGTATCCAATCTTCCAGGGAATCGGGTATGGGTACTGCAACCTTAATCAGCACAAAGTTACGAAGCCAATCCCCGTTGATCCCAAGCAATCATGATGGGTAGATGGCGGTTAGCATCGACATTTAATTTCAGTTGTAGATACAACCAAAGATTTCTCT----------AACTTATACTTATCGTTTTAGCATA--ATACGATCCA--TCCAATT---GGCTTCGGTTTGTAGCGCCAAACTTT-AGTTACATTTTAGTTACACTCGTGA------------TCGGAG----------TGAGAAATAAATGCCTAAACAG--TTGCGATTAAGAGTGCTTAAGTAGC---------------ATTTAAGTGAATAAC-------AGATGCTTGTAT------CCATATTTAATTGAACTTTAGACGTAACGAGT---------------ATTGCAAGATAAAGTAATTTTCATGATTCCTATCGTTTAGCAAGTAACTAAATTAATCCGTAAGCGGATATACCCGCATACATATATTGTATTGTATGTTTAAAGTTTTCTTGGAATTTCTAGTCGCCCGCATAAAAACATTTACT-TATAAACTAAAAAAATACA-AGAGATACCAATTGATGGTAGATTTATGTATAATATTTTGCAATTCGGCAGGCATTACTGTAGGTAGTCTGTACTACCGACTATTGGTAACCAGCAATGTATGAGCTATCCAACATTACAGCTTAAGCATTGATGATTGATCATGTATTCAAAAACATATATTTAAATTGTAGATAATCTGTCAGC-TAATAAACGAAAT--ATTTAATAAAATCTCAATTATAAATTTATAAAA------------------GAATCCCGAGTGCACGTAA----AGCGCGCCTATCCAAAACAATCAGAGCGAAATAAATCTAGAAAATAATCGAATCACTTAA
CTGTTAAGTTAATCCTGAGCAACACAACAATATTTACGAAAAACATA-TTTCTATTTATTTTACTGTGATAATTTATATTAACATTTGTACACTTATTTAACACTAGG------------CAGGCAATTTGAA----CCGTATCCGTAATACCCGTTATT----TCCGTTTATTGCAAAATCGAACGAAATTATGGCAAAAAAAGAATATCATCAAATCCTGCCCAA--------AGTACATAA--ACTAATATT---ATTCAGCTTCAGTTGTAGTTACAACCAAAGATTTTTATTTCTAATATAAAAATACAAATATCGACTAATTGTAGCATATGAACCAAACCTAATTCTTGGTTTCGGATAATTGCGCCAAATTTTTAGTTACATTTTTCAGGCACTTGTAAGACGGCATTGAATAGAAGAAGCAGAAGATGATGAAAAACCACATAAAAAGAATTGCAATTAAT--TGCTTAGGTAGTCGTAAGATTAAACATAATTAAATACATACATATATCGAAATGCTTGTATGAATAATAATAATTAATTTAACTTTAAATTCAAATAGTTGTAAAAAAAAAACGAATGCAAGTAAATGTAATTTTCATGATTCCTATCGTTTAGCATGTAA---------TCCAAGAGCGTGT----------------------TTGTATAGTTAAAAGATTTCTTGAATTTCTAGTCGCCCGCATAAAA-CATTTACTATACATACGTACATAATATATAAATAAAACAATT-ATTCAAAATACTTAAATTGTACATTTCAATTTGATGGCCGTGAGTTAAGGCAA-CAATAATAT------TTGCTAATCGAAATTTTAT------TCCAAAACTA--------ATATTATCAAATGCAGTTGTA-------ATATAATTTTAACTCGCGCCCAAGCTGTCAATGTAATTTACGAGTTTAATTCAATAAATATTAAACAATTAACTTAAAAAAAAAAACAAATAACTATTGGAAATCCAAGTTCATGTACTCGTAAAGCGCATATCCAAA-CAATCAGAGCGAAATAAAACTAGAAAATA--------------
>ss 12200150 12201947|12489 chr3R 12201136 12204541 scaffold_41 248578 252297 + 145848|0 965
AAG------------------ACGAATAGATTGCACCAGTAATGAAGCACCCGCACTCTCTGTACTCACCCACAACCACTCACCTTCTTCTGAAACCAATAGAAACCCAC-----TTCAGTGCACCCAAGTGTGCTCTCTCGCCTGACTACT--AACCATAACGATCCTCCC------TAGATCATTCTCACCACCCATCATCAGCAACA---------------GTCGCAGCAGCAGCAGCAATCGCTCGCTGGCTACCCGCTGCACCACCAGCTGGTGGGAGTTGGATCAGGATCACCGCCGCCGCAGCCGCCAGTCGCATTGTCCCGCTCGCCCACGACCTTGCCGGCGGTCAGCAGCTTGCTGAATGGATCGGCTTCAGCAGGAGGAGCATCGGATATTCCATACCAGCAATTGGCCATTGTGTCCG---------------------------------CTCCTCTGGTGATTTGCGCCGAGGAGGTGGGTGGAGGCGT-------CAGCAGCATTGGC----------CGCAAGTCATC-------CAAGCAGCAACAGTCCCTGCAACACCTGCAGCAGCAACAGTCACTGCAACAGCAGCAACATGCAATTTATCAGCAGCAACATCACCACTCGCAGCATCATCCGCATCATCAG------------------CTGCTCTATCCGGCGAACATTACGGCGCACACCGCGCTGGCTTATGCCCCGCCCACGGCCGGAGGCGCATATGCCGATGGCAGTCCGCTGCTCTCCTTCTCCGAGGTGACCAACACGCTACTGAACCAGTGAATGTGCAGGGAG--------------------------GAGGCGGGGAAGGGAACC--GTTCAACAGTTTTGCCAAAATGTGGACTATGACTATCGTATCTTCCATAATCTGAAC-----CAGCAACGAATGGATATAGCCAGCGCACGCCA
AAAGCTAGCTACAAAAAATATACAACTAGAACGCACCGTAGACGCACCACTCAAGCCACACACACACACACACACACACACACACACAC---ACACACACACACACCCTCAGACACCTAGCGCACC--ACTGAGTGCTACTGCCAGACTAACTAAACCTAAACGCTACTCCCCCTACTTAGATCCTAATCAACACCCAACTGCAGCAGCAGCAACAACAACATCTGCAGCAGCAACAGCAACAACAGCTCGTTGGCTACACGCTGCACCACCATCCGCTG------------GACTCACCGC----------------CCCATTG--CCGCACACCGCCCACGCTGCCCGCTGTGAGCAGCCTGCTGAGTGGAGCTACTTCAAC---AGATTCCTCG------CCCTATCAGCAGCTGGCAATTGTCTCCTCAGCAGCGGCAACAGCATCAGCGCCGCCGCCGCCGCCGCTCATCATTTGCGCGGATGA-ATCGCTGCAGGCGCTCAACAGCAGCAGCAACGGCAGCAGCGAGGCGCACATCAGCTCCACCTCGAGCAGC-GCGGCACGTGGCGCACGCAAATCAGCTAAGG----TGCAACAGCAGCAAC---------ATCAGCAGCAACAGCAACAGCAGCAACATCAGCCAAATTACCAACAACATCACGCACAGCATCTGCTCTATCCGGCCAACATAACGGCGCACACGGCTCTCGCCTATGCCCCGCCGCCGTCT---GGTGCCTATATCGATGGCAGTCCGCTGCTCTCCTTCTCGGAGGTGACCAACACGCTGCTGAATCAGTAGGCAACAGTAGAGCACACACACACACACACACACACACAGAAACACACACAGAAACCATGTTAAACAGTTTTGCCAAAATGTGGACTATGACTATCGTATCTTCCATAATCTCAACACAAACACCCAAAAACACAAACAATAAGAGCACACCA
>mRpS33 12261760 12261798|12570 chr3R 12258020 12263077 scaffold_41 319016 324407 + 118224|4068 4106
-AAAATAAATATTCTAACATCCACTTTTATTGAACCAAA
AAAAGTAAATGT----ACATTTATTTAT-TTGCACCAA-
>CG12753 12262602 12262744|12570 chr3R 12258020 12263077 scaffold_41 319016 324407 + 118224|5057 5290
GATAGACTAGAAGTTTTAGTATT------ACATTGGAAGCAGCCTTATGC---------TTAGATTGTTGCTAAAATTT--------------TGTTA--------------------------TTCCAGTTGACTAATAAG------------GTGGTACATACTCTAATT---------------------CCTTTTCATTTTA---AATAAAAACTAATTTGACGAATTTG
AA-------ACAATTTTAGTGTTGTGACAACATTGTAATCTACTGTGCATAATAGAGAGGTAAATTGTCGCTGCAATTTTCAATTCCATTAACTGTTACTTTTAGCTTTCATTTAGAAATAAACTTTGATTTGACGAATTCGAAATGTTAGGCTGAAGTGAATAAGTCAACTAAAATACAGGGTGTCTGCTGATTTTTTCATTTTACTCACTCAAAACAAA------ACATTTT
>Pak3 12272450 12272856|12578 chr3R 12271607 12272679 scaffold_41 333325 334648 + 12759|1110 1352
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CGCACACAGCTGATATAAAAAACTATTGAAATATAATATATGTACATTAAGTGGACATTAGATGCATAAATGTTAAAATAGTGTATACATATACATAAATGTGATTTAAGCGATTTTATCAAAGCTGCATTATGCAATTCTACATAAAATTCGTCGTAGTCTCTAAGTGC-AACAACTAATAACAAATGAAACATGCAATACTTGTTTGTAAATTACCAAAAAAAAAACAGAAAACA-AAAAA
>Pak3 12276689 12276922|12586 chr3R 12276720 12279365 scaffold_41 340536 343259 + 105138|0 217
TTGCTATGC------AATCACCGGACGGCCAGGCTGCTCTACGCGTGATCGGA--AGCGGAATCGGGTTCGGGTTCGGGATCTGCCCCGTGTGTATAA--TGAGTTTTCAATGT-----AAATTTGTTTTGTGTGGACGAAACCGGAACTGGAACTGGAATAGAATGCTGACCGTAGTCTTTGTAGTATGTACAACCGTAGAAATGGCGAAAGCAGGA
TTAATGTGTCAACAACATCATCGAGCTGGCAAATTGCTCTATGCGTGATGTGACCAAACGAATC--------------ACCCTACCCTCTATATGCTGTCTAAGCCTTCCATTTCATAGACGGTCTTCTTATGTGTATAAATTCGAAAT-----CTGGAACAAAATGCTGAT--TAGTCTTTCATGAAAACGTAGTCACAGAAACAACAACAACAAGA
>CG14896 12284002 12284320|12592 chr3R 12283883 12285950 scaffold_27 1728966 1731244 - 16401|138 505
TATCACATCTATTTTATTTATAAGC-TTTGTACTAATCTGTAT-AATTTTTTGAGTTCGTTTTTAATTTTACGTTAACTTGTGTAAAAAAAA------------------TTCATTTATGTATCAATTAATGAAGGCGTGTTATTTTTTAATTTCTCTTGTTAATCCAACCCAT------TTCGGTGGGA------TACCGTTGAATGGAATGGCTCCC-CTCGCTCAGA---ACAAAAACTAACCTTAATA------GATTTAAGGCATTTAAAAATATTAATAAATATATATACATAGTT-------TATCACTTAAGACATTATCAGAACTCCCCAAAAATAATAAAGTTTCGTAAACCAATCGG
ATCAACATATATTTTATATTTTAGCATATTTACAATTCCGTTTAAAGTTCATAAGTTTTTGTTTATTGTTTATGCCTCCTGTGTACAAAAAAAAAAAGGTTTACAGCATGGTAATATATGTATCTACGTAT-------TGTTAATTTTTAAGTTTAAAAATTCCGGAAACAGATGAGAGAGGCGGAGCGAGAGCTGTACGTTTAAGATAAAAGACACTCGCTCGCTCAAGCATACATATATGAGTTATAATAATACATAACAGAATGCATATGAATACATATATATATATATAAATATAGATATACACAAATAACTT---ACCTTGTAAGAATTCTCAGAAAGATCAAATACCTAATAAAGAAATTAA
>CG14898 12307576 12307598|12613 chr3R 12307091 12308220 scaffold_27 30593 31739 + 38695|504 526
ATCAGTGTATTATTTTATTATGA
ATAAAT-TGTAGTTTTATTATTA
>CG14899 12308416 12308750|12614 chr3R 12308372 12309757 scaffold_27 1760012 1761571 - 46066|45 468
CAAAACTA-----GAAAACTTGATTGTTAAAACGTTCTTCTGT-----TCAAAACGACGAC---------------GATGACAACAATGTTGTGT-----ACCCTCCGCCACCTTCTGTTTGGTGCTTGGTGTAATTAGGCGTATA-----------GTAGTGAGAGAAA--------------------------------GGCGTGCAATAGTTAGCCAAAGTTGGTGCAGAGCGTGTGTGTATGTCATTTATTGGTTTGTTTTCTGAAACAG-AGC-TCATTTTCCATACG-AGATGTTCTTTTATT----------TATAATTTACCCCCAAGGGATGAATC--CACGACAGATTGAACCTACACTGCACATGTGATGAT-TATATATATACAAACCATGCCACAAATAAATCATTATAT
CAAACACAATTATGTGTACCAAGTTGTTGATACATTTTTTATTATGCGCCCTAACAAAGACACGGAATTTGAAAGAGACGACGAAAATGTTAAGTTAAGACTCCTCCGCCACCTTTCACTTGGTGCTTGGTAAGATAAGGTACATATTGAACAAAATATAGCGAGAAAAAGGGGAGAGCTCAGCCATTCAACGGAGCGATGTGGCGTGCAATAGTTAGCCAAAGTTAATTCA-AGTGTGTGTATGTATTTATTACTGGTTGATTTTTTGATTCTGTAGCGGCGAGTTCTGTACTCAGTTGTACAATTATTACAATTGGCCTTAAGTTTTCCCTTCTATGTAGATTCAGCACGTGTGATTAATTATA---TACATATGTGTGTATATATATGTATACAAA------CATGAAAAAACAATAATAA
>decay 12324780 12324916|12624 chr3R 12324710 12325195 scaffold_20 990852 991347 + 17950|82 229
GCTCCGGTCACGAAATCAGC------GACAATCCA-ATCGGGACTGTGAGTCAGTCCGCGGGTCAAGAACGAGGGACGCCACAACTCTTTCATTTAATCGTA---ATGTTTGCA-ATTTGTTAATAGAAATACATATCGATGGCACTT
GGGCAAACAGCTGAGTCAGCCGAGCAGACAATACATAAACGAGTTGTGTGTTAGT----GTATCAAGTATTTTGTAT-CTGTAACTGTATC-TGTAAATGTATCCGTATCTGTGTATCTATCGATCGTGTTTCTTGTC----GCACTT
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GACCCAGCCAAATAAGAACAGCT--CCGATACTG-----------GACATACTGAACAAATGCAACAAGTGAAATTATTATTAAAATTA-----------------------ATATTATATATC--TATTGTCGACAGGGGAGGCAGATCTCAACCCTCCCGACTTGATGATCCGTCGTTGTTAGTTGAGTGTTGTTTTCTCTCCAAGAATCTCAAATTTTGCCCAATTCAATGTTCTAATTTAGTAGCGTAATCTG--------------TCTGCAAACTATTTATATTTTATATACCA-------AGGCTTCGAGTAATGTGCAAGCTGTAGTATCTCTACACAAACACATATATGCAAAAGTGTACCTTTACGAACTACGACTATATCTAGCGATGATATCAATTACGAGGTAGGATCTCCCACAGATCCGTATCAATG----TGGTGCGTAAATTAAATCAATTAAACTGTCAAATTGTTATGTGTGTGTAGTCGTCGTTTATCGTCTCGCATCTATGGCGTATAAATTTAAATGTAAATGTAAAGTGTTCCAAGAAATTACAATAATAAAATCAAAGTATCTATACAA-AACA
----CTGCTGTACGAAAATTCCTGATCGATTTTGTCTTTGCCATTGATATATTCAACAA--GAAAATATTGAAATTACATTCTAAATTAAAGCTAAATCAACAGATGGCTTCAAATTCTATTTCAATATTGACAATTTGTAGCCCAGTTAACAGTTGGCAGTCCTTAAAACTCTGACGTTGTTAATTAAATGTTGTTGTCAACT---GTAACTCAACTTTTGCTCAATTCAATGTTCTAATTTACTAGCCTAATAAGTTAAATGGAAAACATCTAGCTATTATTTATATTTTGTATTCTACTTATATAGTATACGAGTATATAACTAATTGTTGTGTGT----GCAAACTCA-ATATGAAAATG----------------------ATATCTAA----AAGCTCAATTAGAA--CAGGAT---TCGTGTAATCTGGTGAATACTGTTGATGCGTAAATTAAACCAATTAAACTGTCAAATTGTTTTGTGTGTGTAGTCGTAGTTTATCGTCCCA-ATATCTGGCGTTTAAATTTAAATGTAAATGTAAAGTGTTTCAACTAATACAAACAATAAATGCTAAACATCTAAGCAGTTGCA
>CG10345 12422795 12423021|12725 chr3R 12421523 12424795 scaffold_20 1088043 1091341 + 121716|1300 1582
CCCAGCGGAGGATCGGAATG----CATACCTCTAATTAAGATGGGGCA----------------------ACACTGTGATATTTAGGCTTA-----------AGATTCGGTGTAAAT--TATTGTGCTCATCGGAAACAACTTAGGGAACGTCCT-TGCCTACGTACTA-------GTTAACGATAA---CTATAAGCTAGGGCA------ACAGTTAGAGTGGTAACAATAAGCAATATACAGCTGAGCTTGCACTCGATAAATACAGGTCGATAGCTATGT
----GCGAATGATTCAATTGGAACAATACCTCAACCTACGATGGGCAGGCCTGGGTTGGGTGCTGTCCACACTCTGTGATATTAGGAGCTAAGCAAATAAGGAGATTTGGTGTAGATTATATTCTGCTCAACGGAAACAACTTAGGGAACATTTTATGCTTATGTAAAATTTTAAGGTTAATGGTAATTTCTTTGCACTCGATAAATATACATATGCAGCATGATAACTGTACAAGATTATCGATTAA---------CGATTAACGCGTATCGATTAATATTT
>CG10340 12439134 12439177|12740 chr3R 12439075 12440755 scaffold_20 1101782 1103376 + 37286|69 122
GCCC--------TGCGATTTTA--ATCAAAATAAATAGAACAAACACGACAAGG
GCTTAAATCAAGTTCTATCTTAAGATTGATTAAACTAAAACTAAATCGAAACGA
>CG10324 12470598 12470895|12771 chr3R 12469699 12472829 scaffold_3 3771905 3774907 - 77235|972 1282
TTGA----TCTATTTAGTTGAAATCTTTATTTAAA---------TATAGTTCATTAGACGCTTAAGTTCCTTTTTTTATCTTACTTGGGATTATCATAAATTTCAATTAACTCACAAAATAATCACAAAAATGCCTTGTCTTTTGTTGCGCGTTTTTTTCTCTCTCCGTACGCCTCGTTTCGAGAATACTTCTGTCTTACATGTTACAAACTTATAGTAGGAGATGTGATGGGGCCAGAACCACGGATTTGCTAGTTTTCCGAGTTTTTTTTTTCTGTATGCGCTGCTCTTATCTTTTAAGATATTTATAG
CTCAATTGTTGATTCACTTCAAAACTTTATTTTAAACATTTATGTATCATT-ATTAGACGCCTAAGCGTGCAT-----ACCTATGCAGGATTACATTAAATTTCAATTAACTCAC-AAATAATCACAAAAATGTCTTTTCTTT--------------------------------------GAGAAT-CTTCGAGGGCCCA---TACAAACTTAAAGTTAGAAATGC-----------AGCTATGTA-----TAGGTTTCCAAAATATCTTATGTTTAAATCATTGTTTTTAGCTATT--TATGTGAATGA
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GT
GT
>Ubx 12482098 12484493|12780 chr3R 12482314 12484102 scaffold_3 3203933 3205841 - 41084|0 2059
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CCCCTTTGTTGCTTACTGCTATGTTTAAATTATTTTGTTCGAATAAAGTTACAAATAAAAAATTAAAAAAAAAAAAATACTCATATAAAATGTTAAAAGGTAAAATTT-----AAATTCTGTTGATATGAATTTTTGTAAGGCGCGT-TTTTAAACCAATTAAAAACAAAACAAAAAAAGGAAAAAACAAAAACAAATATTACTTAAAAACAAAACTATTGAAAATTTAACTTAAATATAAATAGAATTTGTTAGCAAAGTAAAAGTATATTACAAAAACAAAAGGAGAATAATAGAAAACTAAAAAAACAAAAAACAAAAAAAAAAAGAATTATTATAATACAAAAACGTGTATAGTTCGTGCTTA------AACTTAATGCAATTTTAGTTAACTCTGTTTAATTTTAAATTAATTTGTTTAGTTTTCGTCTTAGGCTTTTTAAGCGTGCAACAAAAACAACACCACACAACATAAACAACAACTACAACAACAAAAACAACAACCAGAAACGTGAAGCTGTTTTCTTTAAGTAATTTTTAAAGT------TTTTTAAACTAAATTAA------ATCCTATTTTTATTATGTTTAGTTTAATGAAAAGCGTTTATGAGATTATCTGACAACAACATGCAGAAAA--------ACAAAAACTTTGCCTCGGCAAA-ACGAATAAATTATTGGTTTTGAAAAAATCTAAAACAAAAAAAAAAAAAAACAAACGAAAAATTAAAGAAAAACGAATGAATTAATTGTGTTATTATTTTAGTTACGAT-TTTTGTTGTTTCGTTTTGTCTTCATATAAAATAAGAGCTTAGAGTTCTTCCCGAAATCGGCGGGTCGCACTTGCGATCCGCTTTTGTTGCGCATGCGAAATTGCTTTTGATCTCGTTT-----CGTTAAATGTACGTAAGTTGAATGCTATAATAGAGATGATAACCATACCGAT-------AACGTTATCGTTATCGATA-----GCTATCGATATCTTTCGGCCAAGC-AGCGAGCTGTGCTCGATGCGATC----------TCCGAGTTGATATTCT-----------TTTCAGTTCGATT-------------CACTTAAGGGC-----TAACCAAGCAACCTTCACATGATGTATACGTAACTAGCGCATAAGGTTCAACAGATAAATATATATATATATATACATATACATAAATCTCAATATATATATACATATATATATATATTTATATTTATGTATTTTACATGAAAATCAAGTATAAATGAACAA-CAATAAGAGAATA----TTCGCAAC-----------AGACGAAAGTACGTAAG---AGATAAGTTAAATGTTATAGATTTTAAATGCAAACAAAATGAAACATATACGTAAACGAAAAAACAAAGAAGCGTGGAGTACGTGGCTAAGAGAGCTGCCCTCCCCCTAAACAAAAAAAAAGAAGCTAAAAATACAATATTTAATGATTTCAATGTGAATGATTGTCGTAGCAACGGATATACGTAAAAATGAAACGGAGCGCGTCGGCGTT--AGAATTTATTGCATTCTACAAACTTACCTACTACTTACTTATGTAATACATATGTATGTGTATATGTGCATGTGTGCGTACGTGTATTAATAAAAGGCTACATTACGATTATTGTACATTG--TTGTGGCTTTC---TTAATTTACCTTACCCCTCACAGCCTCACAAACCAATT-----GACATTAATAATGTTTTTCTATTCCTTAACACTCATGTATAAACGAAGCCCCAGAAATGA-------ACAA-----ACGTGCAAAATACTGTCATTTTG--TGTAGGGTAGACAAATCGTTTATGCTCGTATA----CTATGTAATTTTTAATTTAACGCCATGCTATGTTAGAGCCGTAAGTTGTAAATTATCAATATAAACTATACGTACTATAAACTATAAATAAAAGGCAAAACAACCAGTGAGAATGTGGTAAATAA---AAATAAAGCAAACTAAAAACTCAAAA-----CAAAAGTAGATTTT---TTTTTAAAGCGGAAT
>Ubx 12482098 12484493|12781 chr3R 12484118 12484787 scaffold_13650 66 703 + 28155|0 418
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----TTAGAATC-------------------------------AATTCAGCAAAA----------------ACAAAACAACAAAATGAAAATTATTGTAACAAATAAACCCTTTACTTAACTTAAATTAATAATTGCATATATAAATTA-------------ATAATATTGATATTGTATGGTACCATAAAAGAACTATTTCAAATTGTTTGAAAACCAACCGAAAATACGTAAAGCGAACAGCAACAAAAATTACAAATAAATTTCGTAGACTCTAAGAAAATGAAAAACTCTAAAAGTAGTTGACAGAACACAGATC---TACTTACCTAGATACATAC-----ATACATACATACGTAAATTTA--TGCATACGAATACAAAATACAAATTTTCATTTAAAGTTCCACTAGAAACG
>CG31275 12576454 12576689|12881 chr3R 12576676 12578458 scaffold_3 3318939 3320647 - 22814|0 13
AATGACAATACTGA
AAGGAAAATATCGA
>abd-A 12633344 12635408|12919 chr3R 12632830 12633614 scaffold_47 350127 351001 + 5861|638 935
CCTTTTGCCTTGTTTCACAACCGGATTGAAGGAAACTGAGTGGCTTCTGT---TCCTGTT---CCCGCTTCAGTTTTGGTTTTTGTTGCGTTTCAGTTTGATTTAAGTTAAATGCTTAGTCTTATTTGGACGGCCTAGCAAATTAGATCG-------TAAATCA------------ATATTTTGTTTGAACCCTACTGCTAAA--ACTTCTGTTAATTTTACTTTAAGTTTAGTTGTGACGAATTGTGTATTATATAATTTTATGCGATTTTAAAATGAATGCGAAAAAAATTAAAAA
CCTTTTGTTTTGTTTT--------------GAAATCTGAATGGGTTTGATTAATCTTGTTTGCCACACAATATTTATGATATTTTGATAGTTTGAAATTGAAATATGT-------------TTAGTTTAATGGCCTAGCAAATCGGCGCATTTTGTTTAACACACGCTTTTTACATACATTTTTGTTTGAGTTTAATGCTAAGATATTTCTGTTAGTTCTAGTTTAAGTTTAGTTGTGACAAGTTGTGTATTATATGAT-------GATACGAAAATAATT---AAAATATTTTAGAA
>abd-A 12633344 12635408|12920 chr3R 12633661 12636224 scaffold_47 351062 354026 + 68027|0 2142
-CTGACAACCACC--CATCGCC--------CAGCCGAGCCAACGAGCCA------ATCTTCCACCAGCCGCACCACTAGCACCACCACCGCAGCCATCGCCCGGATCAGCGTC--CGGCGTTATT-------------------------TTTCGTCTCCTCGTCTGTGTAGCGCGCGAGATAGCAAGCAGAAGATAAACTCGATAACTAAAATACGTAAAGTTTTACATAGTAAATAGTTGCATAAGTCTACAAAAAAC--------------------------------ATACATACACGCA--------------------AATGGCTGGGTGCGATGGCTTAGAGGCAAT---------------------------TAACTGGACCGGGTT---TTATTGCTGTGGATCGACGC-TTTCTGAGGTTTCCCCAATTGTAGTTGTCTATTTGATA------GAGCAACGCAT-GCGATTCCCTTCCAGATCTCCAGTGGCAATTTG-----------------------TGTATTCGACATTTCTTCCATACTTTCGCTTTTGCA-ACCCCTAAATC---GGCAATTCAACCCCCAGTGTAGAGTCTCTGGGCCAACGGGCCCAATTCGGTAATATTAATGGATAACTTGAACTACTTAGAATAGCGGCAAAGGCCTAAGGA-----------------------------AGAAGTTAGCA----GGAGACGCGATCTATATAAATGAATATTGACGAAATGAGCGATTTTTGATAGTCAGAGAACTCCGTTGCCCACCATCAACCAACTTTCAATGGAAGTGGTT---TTGGGGAAGGCAACTCGACGGATTCGAGTGTAAAATTATTTGCGACTGCTATAGGATAACCTAGTTCGATATTTAGAGCCACGTTCGACTATGTTAAACGGTATATGAATACATAAATATATGGATATGCTTACAGATTAAAGATACTTACCTATAGAGTTATAGA----GCGTACGTTTTGTATCCAC---CTATTTATTGGAAATTTATGTTTATGTTTTCAAAAGAAAAACCCCTCTTCCAATGTTTTGTTAAGTGATGTGTTTACTGTGTGTTTGCTGT-TTTCGTTGTATGC---CAACGCT------------------------TGAATACAATGATTTCTTCAATGCCATATTAATCTTAACT---------------------------------------CGAGAGCAAGTAAACA--ATTAAGCAGCTAAAGTAAAGTACGCAAAAC-------AATTGCGCAAGTATTTCCATAAATACCAG----------TTGTAA----GAACAAACGGTATGCAACATACCTAAAAGCATAATCACGATTTCAAATACGTAATATTAATAATGAGATATGAAACAGAAATGGAGTAAGACGGAGCTGAGAAATTAAATGTCG-TTTGCCAGTGACTAAAATTTTAAATTAACTACCAATAAGCAAATAACTAAATAGGCATCGATTGAAAGGCCTACAAAGCTACAAAAAAAAAAACAAACAGAAAAGAAACTCTGAAATACGTATTAGCTTAAGGTTGCAACCACA-----AACAAACTGT----CGAATGAAGGC--CAAGAAGGGAGAGTTA--------------------------------TAAAAATGGAAATATTGGC--AGAACCCATATACGTAGATTTCAAACTTCCCAAAATAAAATTTACCTAGCGTAGTCTCT----CGCGGATTGCAAGTTG---------------------AATTAAAGTCAGAAACTCTATTTATT----ATACA-AAACCGAAGTGGATGGCTTTCACAGCGCATATTTACATAAACAATTATTGAC---AAATATATATGAATATATATTACAAATATATACAACTATGATCTA-------------ACATGTGTATGTATAAACACCTAAATGTATGTGTATCTAGTATGGTTAACACAAAAAGCAGTCGAGTCAAAGTAAAAGTCACCTTTTGCCCAAAACCAGACACCACCAAAAATAAGCATCCCCAACCAGCGCTCATGTTTTTTC----------TCGATGGGATCCCTACTATCCTACTGTCCTTT
TCTCTCAACTATCATCATTACCGCTACTATCACTAGCGTCTACTATCCACCTACCATCTACGGTAATCGTCATCGTCATCGTCATCGTCAATGTCATCGTCGTCGTCGTCGTCGTCGTCGTCGTCGTCGCTTGATGCCTTGAGTTTGGCGTTTTTTCGTCTCTTCTGTGTAATACG---------AAAAACAAAACAAAGTTGATAACTCAAATACGTAAAGTTTTACATAGTAAATAGTCGTTTAAGTCTACATATAACGGATAAATATACATGAACTTATAACCAAGTAAATATGTGCATGCATACAGTGCACAAGCAAGATCAATGACTGTGCACAGTGGGTCACAGATAATTTGTTTATGAGTTGGCAAATGGACATGTAACTGCAAAGGCTTTAATTATTTTTATATATTTAAACATTTCTAA-----CCCCAA----ATTTGACTTTATTATACATTTTGATTTTCGTATCGCTACTTCCTTAGA---CACTATTGCCTATTTGATAGACAGAATTGCCTAGGAGTATGAAACCAACTTGTTTTAACTAGTTTATTATTCGAATGCCCCTAATTCAAGGGATGTCTGTCCACCAGT-TACAATTAC----CCCCTGTGCACAGCATAGTAATGTTAATGAATCCATCGATCTATATAAAATAGCGGTAAATGATAGAGTATTGCCAACGAGAGCAAAACGCTGAATCGTAGAGGTTCCCAGACTGGCAACAATGATTGGAGAAAACCATGTT----AAATGAGCGATATTTTATAGTCAAATAGTCAGATAGTCAA----AAACTTCTGCTTGATGGACATTGGCCCATTGTCAATGACCAATTAGCGAGTTAATATGTAAAATTATTTACGACTGCTGTAGGATTACATAGTATGGTA--AAGAAACTCGTTTAACTATGTT--------TATGAATACATGTATGAATT--TAAAAATATATAATACCCCTACTTACTTATAGAGATAAAGATTGTACGCACGTTCTGTACTCACATACTATTTATTGGAAATTTTTGTTTATGTTCTTAACTGAAAAA---CTCTTCCAATTTTCTTT---ATATTGTGTTGCATGT---TTTGCTGTAATTTGTTGTATGCTTTTAATGCTTTTATATTTTGCTTAGACGAATTCTAAATACATTAGTTCCGTCAATGCCATATTAATATTAATTATAATACCAGCTTAATGTAAATCATGATAAACATAAATGCAAAATGAAACGAACAACATTGAACTACAAAATACAAAAAAATAAAACTTAAACTAAAGGCGCAAACATTTCCCCATATAATAGATTAGGTGTATTCTAATGTGTAACGAACGGTATGCAACATACCCAAAAGCATAATCATGATTTCAAATACGTAATAATAATAAT---------AATAAAAACAAACAAAAAC---------AAGAGAAATGTCGTTTTGCCAGTGAATAAAA-TTAAAGTAAAATATTA--AAATAGAAAAATAAAATGTAAGTTTGTAATCGGCGTTGAATGCTACGCACTAAATATT--ACAAATAGTAAACTCTGAAATACGTATTAGCTTAAGGTTGCAACAACAACTACAACAAAATATACAACAAATTAAAATAATAAAAAAGAAAAGAAAAAACCCAACCAATAAATTTTGAGCAGGCCAAGTAAAAAGAAAAAAACGCGCTAAAAATCCATATATGTAGAGTTTTAACTTCCCAAAATTAAATTTACTTAGCGTAAACAGTGAGAGGAGAATTGCAAGTTGATTTAATATAATGAAGATACAAAGTAAAGGTAAAAAGTATATTTATTTATCGTACATAAAGTGAAGCAAAT--CTTACACA-TGCATATTTGCAAACACAAACAAAAACGTAAATTAACGACAAATATATATTACAAATATGAACTTCTATATACTATATATATATGTACATATATATATATATGAATATATCCATATACGTGTATGTAGTACGGTTAACATTCATTGCAGTCA------------------CTTTTG-----AAACGTCTATCATCAGTCCAATTCATTTTGAAACTATGCTTTTGCTTTGTTTTCCCCCATATTGGTTCAAGTGATATTATTATACTATCTCAT
>Abd-B 12752932 12755110|13047 chr3R 12752909 12755583 scaffold_47 505686 508672 + 69671|23 2639
CCCTTGGACAACAGCAGCGCTGGCGCCATGGGCTTTGCCACCTACTAGCAGTTAGCCAATCCGAGTTCGGGTAACCCCAGCTCGAATCCCAACCCCATGTCCGATCCGAAT--CACCATC-ATCTAATCAAGAACGAGCTGGCCATGGACTTTCCATGCTAGTCCAGCGATTGGAAGGGCGATTCCAGCCAGGCCGAGTTCAGTCGGTTAAATGTAC-------------AAAAACCAGAGATCTCTAGCATGCGGGATAGGAATATG----TGACCACAATGA-------GGAGCAAG--GATGTGGATGAGCA--------ACTGCCCAG-AAGTGCGCAGGCGTCGCTG--------------ATGTGTGACCAACCG----------------------ACGTTGATGCAAATGCAGTTTATTATTAAGTCAGTTCTACGGATCCCAGAGATCCAAGCCCCAACACGA-----------------TAATGCAGCTTAGTTCGGTAGTTGAATATAGATACGAGTAAGATGAAGAGTAAGCAGCAGCAGTAGCAGATGCACTTGAAATTCGCAACTGTACGAAAATATATGTATGTACGTATTTCTCTCAACGCTCTCATTAGCCTAGGCG-AGCACTATGAATTTTCCGAACTATAAATTATGAATATGAATATACTTAAACGTCAGTGAATATAACCCCGCATAAATTATGAATACACGC----GTTCGAGTAGTAGATTTTACCATACCTATCCAAT-TAAGAGCGGCCACAAGGCGGCTGAGTTAGGCTGAGCAGCAGAACACATTTTAGACCCAGATAAATGTTCTTGAAACACAAATTG-AAATTGTTTAACAATTTTCGGA------------------------------------------------------------------------------------------CCCCTCACAGCTCCGCAAACAAGAAGACACACTCCGCAG----------------------TCTAGGATAAATTTTGTCG-TATAATGTTCGTCGTGTCGTGTCCTTTGATACCTTCTAAGTTCCTGTATATAAACTAAGACATTG----------------------------------------CGCTGATTTCCGGCCGAAGCGAGCACTCGATAACTAAATTACATCAGATATATGTATATGTATATTGCGTACACGCAGAGATAT-TCAATATTTG------------TATAATA-TGAACTCGGATTCGATTTTAGCAAATGGTTAATTGTAAGTTGCAAAAATTTCAATGAGTGTGTGCATGTTTACCCCATAGTTGAAGTCGCTTTCGAATTAAATTAAC-----------TCTTAAACCAAGGAAAACACTTAAC---AAAACTACTCGTAAAGCT------AAAGCAACAAAAACTTAA-AAGATACACACT----TAACAGAAGTAAGCGAGTGTGAAAACGATGGAGGGGAGATGTCGGGGAGGAGTAATTA---------GCATACCGTAACAGCTACTTATATAACATACACATAGTACATATAGTAATC------------------------GTACATATGCATACATATATTTTCATGTGTATCGACGCCGCTTGATCCTGATATTAAGTCTAAGTTTAGTTGTGTTGTGTAATTATCGA--TTTTGTTAATGTTTTGCCCCGAGCATTATATTATATTATGCTAACCTATACCTATACCTACACCTACACCTATGCCTATCATTATATGTGTATAATTAGCCTATACATACTTGATGAAGAAATGATTTCACCCACTGCTTTATTCATGTTCTTGTATTATTATTATTTCGAGCCCTCG--ATAAGTTGTAGTCTAAAGTCGGTTATGTTTATGATTATGTTCGATTATAGTTTGTTTAGTGAATTTTAATCTAGCGTTAGCAATTCTCTTTTTTAAAAAGTTAATTATTGTGAATAAAATACAACAAGTTGCAG------AAGTGCAAAAATATACACACAATTCAA---------AATATCCCAATTACTTCGCATTACTCCGCATTCCGTACA------ACACCATTT-----TCGATATCCTTTGGATATCCTCCACAACTGTTCTATTTTTTCA-------------TTCATTATTTC------------------GGTAAGTAC-----ACCAAAGAGGAGGATGCTACCACATCG----------------------CAAG--CGACCTCTCACCATCGAATTTATTCATAGACATCCAGATACTCGTACTCGTACAAAACGTAAAGCAAAATACGTATGTACTGCACTTACTCGTAGGGGATCAGCTCGTAATCGCCACTTCCTCAGACAAAATATAAAAATCTGATACAGAACAGAACTTTCTG---------AATTATTTCATTTCGATC-----------TTTGTT----TCCTTTTATTGCGTTTCCTGATTTTTGTTACAGTATTTTTACACGGATATTGTAATACAGCGCTTAAATAAATTAAAACTAGAAT-TAATAGTCTTGTTTCGGCATATGTCTTAAGAATAAATAAATTATTATGTAA
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>Ahcy89E 12804161 12804268|13095 chr3R 12803932 12805842 scaffold_47 572742 574682 + 62224|247 381
TAATATACTT-ATTTCATTTGC------AGATATTAA----TCAGTATTTAATGCTTTATCCCGTTATT-------CTCGTTCTG-------TAATTTTG--ATATTATTTAGAAAATATATGAAAATACATTTT
TTATATATTTCATTTCTTATACAACACAAAAAACTAAGCTGCCAAAAATTAAGGTTTTTAATTGCTATGAAGCAAATTCAAACTGAAAAAAATAATTATATTATATTATCTAAGTAAAATAAGAAAA-GTTTGTT
>CG18622 12809232 12809545|13099 chr3R 12809237 12810161 scaffold_47 580018 580942 + 13802|0 322
AAAAAAAAAAAAAAACGGGCCTCAAGAGCCCGGCTTCTTGTATATAGGTACCCGGACGGTATTAAGTAGACTCTTGTACATAAGCAAGCGTAGTTTTAACTATTTGTATATAGTACGTACGTTGTATATAGGACCTGTGGTTTTTATAAGG----ATAGAGTTGGA---AAAACTCTAGGTGCAATACGAGTGCGACAG--TGACTGCTA-AAGCCGA----ACTATGGAATGTGGATTGTATTTTAGGACGTGTACATTCTCATAATTTTAGTCCTATGAAAGATCGCAAAAATAGTTAATGGAATAAACGAAATACTTGCC
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>CG3678 12816184 12816311|13108 chr3R 12815919 12816223 scaffold_47 590047 590360 + -1059|287 348
TTAAGCAAGTTAC-----------ATAGATAAACAATTAAAG-----------AAATAGGAG
TTAAAGCAGTAACCACCATACCATATACACATATAATACATGTTCATGAGTTTTAATATAAG
>CG3678 12816184 12816311|13109 chr3R 12816227 12817356 scaffold_47 590366 591454 + 35139|0 85
CCAACATAAGCACTACAAATTTGTGCAATAGATGCCAGAATGTAATGGTTCCAAATATTTTCAGATGTGGGTTTCCA-GTTTCTGT
CCTGCAGTTGCTGCTGATATAGTTAGCATAGATGCGTTACCCAACTAAACGTAAACTTTTCCAAATATGCTTTAAAACGTTACTAT
>CG17556 12820258 12820532|13116 chr3R 12820452 12822101 scaffold_47 590361 591946 + 34479|0 92
CCAATATAAGCACTAATAATTTGTGCA--ATAGATGC---------CAGAATGT-AATGGTTCCAAATATTCTCAGAAGTGGGTTTCCAGTTT
CC--TGCAGTTGCTGCTGATATAGTTAGCATAGATGCGTTACCCAACTAAACGTAAACTTTTCCAAATATGCTTTAAAACGTTACTATAATTT
>CG16941 12825101 12825212|13120 chr3R 12824472 12825545 scaffold_47 594749 595903 + 33360|701 824
GCGGATCAAAGATTAAAGGCAT----ACCAGACACAATAAGGAGTGGGCCATATATAAAAATTTATTTGTAT--ATGGTTTCGC-ATAAATTTGTA-ATAAATCGTCAATCACAGAA----TTT
ACGAAGGAAAGAAATAAGGAGTTTGCTCCTTTTAATAAAATTCATTTGTAACATGTAAAAGTTTATTTTTGTGAATGCTTTTACAATCAATCAATATAAAAATGGTTAATCACAGAATAATTTT
>CG3590 12844496 12845270|13136 chr3R 12844699 12845019 scaffold_47 620725 621014 + 2630|0 326
GAGTCGACGTTCTTGATCCGAGTA-AACATATACACATATTTGCCGCCTGTGCCTTTCCCGTTCGCCACTCGGGCTGACATATCACGACTCCAATGCTGCCACGGCACAGTGGGTCTTCGGGTCTCATGCCGCTTGCTTTACTTTTAATTATATTATACTACATATAAAACATAACAGTGCTGAGAATTTTCTTAGCGAGCGCATTTCTTAAACAGTTGC-----TACTGGCTTTAAGCAGCCGAATATCTTATGCTTTTGATCTTGTTTCCATAATTAAGATTGTTTTTAATGAAAAATGAAATATCATATCACAATAAAAGTATA
GAGTTAACATTCTAGGTCCAGGTCCAAGGTAAAGCCA----------CTCTGCAAGTGCCTTTCGCCATTCAGTCTGACATATCACGATTCCGACTCTAATACAGGCCCATG-------AAGTCAAGAGTTGCCTGCTTTACTTTTAAT----------TACCGACCATGCATAGC-GTCATGACAATTTTGGTGTC-----CGCTGTTTGTAGATTCGCAAAGATACAAAAATAAAGCCGCC-AGTACTTGACAACTTCCATGTCGATGC---AATCGAAATTATAGTTTAAGTATAATAGAAGAGGTGAGTATATCGAAGATATA
>CG3590 12844496 12845270|13137 chr3R 12845207 12846756 scaffold_0 220787 222339 + 79256|0 68
ATCTAGCCCATTATGTT----GCCCTGTTTTAATCAC-TGAATTTGATTTTGTAAAATACACACACACA
A-------AATTATTGTTCCAGCAATTTTGTAATCTTATAAACTCAAAGCTATTAAATACATTTACGCA
>CG18213 12862116 12862598|13150 chr3R 12859347 12862858 scaffold_47 630835 634502 + 61838|3009 3526
GGTGAAT------TGTCCAGAAGTCGACTCGGAGTATCCCAAAATGGTTCTTGTCAGCTCTTCCTTTATTTTAAAAAGACTTCAGATTCACGCGGAAGCTTTAATTGATAATGAAGAGGCTTCATCTTTATACATGGAATATTGTACGCATCATTATAAATGGAAGACAGTCTTTAATTCATTTTTGACGATGCCACCAGACCTTAAAAACTTTTTGGTAAAATCAAAGAAGTGAATGACTTTTTCCCATTATTTTAATGCGAATGGAGTTTTTGTTTATATTTTATAAGCATTATTTTTAATATAATCCTGTTAACTCTTGGATAAGGAAACAGAAAACCATTCCATTTAATTTATTTGTGTTGCAGCCAGCCAAACTATTTTTATAAGTTTAGAATATAA--CATATGTTACACACA---------TATCTAT--GTAAGAAGCGATCTTCGGT----------TATTCAACAAAA------ACAAAAAAAAAAAAATACAAATGAGTCAGAATTC
TTTTAGTAATTGCTGTTTGGATGTAAATCCGTACTATCCCAAAATGCTATTGGGAATAACCTGGCACATTCTAAGCAATATGGGTGCTTATTTGGACATATATAGAGATGATATCGATACGCATAATTCATTCGTGGACAATTTTACGCAGTATTATAAATGGAAGAAAATAATTAATTCTAACCTTACGATGTCAAT-GTCATTGCAAACATTTTTGAAA---------------------------ACTATTTAG--------------CTTGTTTATAAGATACAGGGTACAGTT-----AAAATTGTGGTTATTATTAATCATAGAAAGAG----------------------------CGCAGCTAAAAAAATATTAAATAGAAGTTAAGCACATAAAGCACAAAGCATACACAAAAAGTAGTCATCAATTGACAAAAAGTGGTCGCAAGTATTTTTTTCCTAATCCTCAGTAGTGCTGACGGAGGCAATCGACGACATGTGTGTGTGAACTG
>CG18213 12862660 12862801|13150 chr3R 12859347 12862858 scaffold_47 630835 634502 + 61838|3595 3749
GCTTTCTACAACATTCTACCGATAATATTGTGCACTTCGTTGAGTTAACCGAAACGGATGATATTCATTTTAAAAATATTGAAATATATCGTCAAAGCCTTTGT---GTAATCAGATGC----------ATTATAGAACAATATATTAATATCAT
ATTTCTTAAACCATGCCTGCGACATTATTTT-CGTGCTGCAAAGTT--------CTGATTACTTTTACTCCAAATACGATCAATTAAA-CAAAGATGTTTTTGTTAGGATATTAAATACTATTCAGAAAATCATGGAACGATACATTGAGACTAT
>CG18213 12862865 12862996|13151 chr3R 12862859 12863058 scaffold_47 634895 635104 + 3952|6 137
ATGTAAATCTGCAACTTAATTTGACCATCTTATACGGTACGTACAATAGTTTTCTCGCCTTGCATTGCGAAGAAAAGGACGAGACACGTTTTCTGGGAGTACTTAAGTTTTCGATGTTTTTAGCATTGAATG
TTGCAGCTACACGACGCGACTTAACAATCTTGTATGGCACATACAACAGTTATGTTACCATGCATTTTTCTGAAGGAAATGCATTTCGTCTATCGGGCGTCCTAAGTTTCATCGAGTTTCTCACATCGAATG
>CG18213 12863066 12863157|13152 chr3R 12863132 12864940 scaffold_47 636146 637876 + 10166|0 25
AAAAATGCCATCACCAGAATTTGTGC
ATAATCGCCAT-GGTATATTTTGTGC
>CG3995 12867617 12867759|13156 chr3R 12867679 12868788 scaffold_47 177279 178423 - 35862|0 111
CGGGA----------------------------TATGCACAAAATTAAGTAAT-ATCTTGGTAGTCTTAATAACCTAATCTTTAAATAATC--TAAGTTATTCAATATTTTG
CGAGATTCTATCTATCAGTTACCAATATAATTTTTTGCATATAATTAGAAAATAATTAAGGTGAATTTGATTATAC-GCCTTTAAGTAAGTAGTTTGTAATTCAACATATTG
>CG3983 12896245 12896321|13181 chr3R 12894141 12896321 scaffold_47 678952 681203 + 21748|2327 2410
ATTCTGCCTTAGTTTTAATAATTAAATCTGTAGATAGTACACTATAATATAGAAAGGTGTAATGTC-------TCTGAAAAACT
ATACAGGCATA-CATACATAAGCACATATGCATGTA-TATATGATAAATTCAAAATGACTGAAGTCCAAGCAGTTTTTAAAATT
>Keap1 12899651 12900059|13184 chr3R 12899713 12900025 scaffold_21 4449 4762 + -873|0 334
CAAAAACATCATTCATTGTACAAAGCCTGATCGTATCCCCTAG------AATTCCATGTTGAGAAGCAGCATTCCATTGTAATATTACTTACTAGT-------GTGTTCGCTAGGTGATAATTAGTCAAACCGTTTTTATGGCATCCATAACATAACTGGCGCTCGTCAGCCCATTTTAAAAAGATTGATTAGGGTTAATAGTTGATTAGTGGGAGGAAAGTTCGTATTTTACGTATTTTGTAGGTATCCAAACTGATAGATTGCGTATT-GTACTTTTTTTAACGTAGGATAAGAAGAGGAATTATG--------CGCATCCAAAATAGGTTTT
CAAAAACAGTTTTTATATTGTTCAGGTTCAGGGTACCTCCTAGTCGGGTGCTCCCATATAGAAAAACAAAACTTATTTGTTTTGTT--TTGTTAGACAACCAAATGTTGTTTCAGAGATAG---GTTAAAATGTAATTTTGCTGTACAATAT-TGACAAATAAATGGGAGCTTATGTTAAACA------------TCAAAAAATGATAAGTTGAGATTAAAATC--AGTTAAATTAATTTGCGGACAACAAATAATACAAACTCTGCATAAGAAATAAGTCCTATATATGGCCAAGACTTGATTTATATTTAATTTCACATTCCAAA-AGCTTCT
>cher 12917257 12917761|13202 chr3R 12917150 12921700 scaffold_13 1753563 1757969 + 202977|108 677
GGCGCTATATAGCCGGCCAGGCAT----ATGTGTACGTGTAGATATATGC----------------TTCGCATGTGTATGTGTGT---GGGCGCGCATGTTCCAGGGTCAAAAGTCGTGTGTTTCTTGTTTTCATCATAACGCTCTTTGTTTAATTTTAATTTCTTGATTTATCATCATATTTTAGGTA------AGTTTTTGTTATTTGTACAT---ACATGGAAGGAAGAAGCTTCTGTTTT--------TCGACGCGCCATTTTCACTCTTTAAATTGATCTTACGTTTTATTTGTTTTCTTGTGAATACATAAAATTAACAATTGCCGATATGAATTT-----------------TGATAGACTTCATGGAAACGAACT---AAAGCACAACTTCGACACACAAGAATTACTATTGCAATGCGAATAAATCTCTTAAACAATTATTTAATACTTAAGCGAAAAATTTAT---GATGATTAAAATGATTATGACGTATTATG-TTTTCTATTATCACTATCGATCATGTAATTTACGTGAAATAAATCAAAACACAAAAAAATGAA-
---GCTA---AGGCCAACAATCATAATAATACACATGCATAGATATACACCATCCCGCTCCAACCGTTCCCGAATGCAT-TGTGTACCAATCCAGTCTGTTCCAGGGTCCAAA------TCTTTTGTGTTTTCTTCATGATTGTCTTTGTTTAATTTTAATTCTTTG-CCTATCAT--TATTATAAGTGATTATTATTTTTTGTTATTTGTACATAAAAAAGGAAATATAAATGTTTTCGACTTGAACAATGTTTGCGCGCCATTTTCACATATCAA-------------TTGATTTGTTTTTGTGTGAATAATTAAACTAAATAAATACAAAAATTAAATTCATTCAACTAATTGTCATTAACGATTTGATAAAATTAAAATTACACAGCAAATGTTTGAAAAAAAAGAA--------AAAACGCGAATAAATCTCTTAAACAATTATTTAATACTTAAGC-AAACACTTATGAAGATGATTATTATGATTACGACGTATTATGTTTTTTTATTATCACTATCGA-CATGTAATTTACGT-----------AAACTCAAATAAATAAAT
>CG17475 12955130 12955238|13250 chr3R 12955017 12956190 scaffold_13 1340878 1342045 - 8840|113 229
TCCAAGGGGACGACGATATGCTGAGCAAGATAT--------ACAATTTTGATTAGGTAAGAATGTACGGTGACTAACTTGTGGAAATAAAATCAATGGCAGATTAACAATAAGAAAA
CCAAACCGAACAAAAATAATATATACAAAATATATACTGAGACAGCTTTAAAGACTTTAGACCTTAAGT---CCAAATATTGTAAATTTTATCGTAAGCACATATATCACAAAAGAA
>CG4060 12966920 12967036|13270 chr3R 12966632 12968657 scaffold_13 1819722 1821735 + 47048|301 418
GTATTCTTCATTGCTCGTCACATCCAGATC-TAGTTAGCTGTCATCAACACCACTTAGGTTTAAGTGCTTGCCAATGTTACCCAAATCCGTATTAAAATATAATTGTTAAAAAAAAAA
AGTATCTTCATTGCTCAACCGGAGCGAATCTTAGTTA---GTTAGTCACATTCCCCCAGTT----------------------GAACTCGCATTTATCT----------------AGA
>CG11896 12971174 12971361|13273 chr3R 12970466 12973495 scaffold_20 1315441 1318384 + 110021|783 976
GGAGATAGTTTAGCTGGAAAAAAAAGCTGAATCGAAGCCGGATATGTGTTTAATGTCTATGTCTTGTCTAAATTAAGGCGTTTCAACCTAGGATGCTTACCTCCTTATGGAATTTTCAAAATTTCACCAGTG-----TCGGTAACTTTGTTTCGCTCTATATATTAAATACAGATATCTATATAC-CTATTGTT
GTAGGAAACTT-------------------------------------TTGAACGCACGTCTC-TGTTAAAATT-----GTTAGAACCT---ATGTGTATATAATT-TGGCCATATCGAAATTTTACCAGTGTATCTTCTGTTACTTCTTGTCTGTCTATTCTCTATATATATCTATCTATCTCTACTATTGTT
>beat-IIa 13145721 13146507|13486 chr3R 13144910 13147255 scaffold_20 1484088 1486211 + 37714|848 1677
GCGTGTGTTACGAGTTAGTTAAAGCCCTAAGTAATTCGAAATATATTGGGGGAGTTCGCTAGACCTGGGCAATTAATAAGTATTTAGGTGATCAAAACTTGCG-ATACGAAGGGCTTGAATAAAACTTAATCACGACACATTTGAACATACTTGAAGTCATTCTAGCGGTAATAAACCATTTTAGAAGGCCAGAAGAACTCTCAGTGAGATACAAATTCATTAGCCATTAGTTCAACGTTTATTATTTAAACAGGTCTAGAGAATACCCTCATTTCGT--TGATTTCAAGTATTTTCGTTTGATGACTGCTTTTCATGTTAACTCTTATTTTACACCAAAAACCACACTTTGAGATGTGGCGTCT--ACTAGCGAGCTAAAGAGTAAAAACAAATTAAGTTTAAGCAAACATTTATAAACTAGCCTAGTCATAGACAAGAATACTGGAGGTTGGACAGCAGAACAGAAGAGTTTAAAACCTATAAAGCAGGACATACACAATTCAAATATAAATGTTTACACGAACGAGGTAAAGTGAAGGGAGAATATGCTAAGTACATGAAATTACTGATTCTACTTTTAATGTGCAAAATAACACAAAAATAAA----------CAGAGCAGCATAACAAACCAAAGCCAGAAATCAAAGGTGTGTATCCGAGGGAAGGGAAAT--GTGTGTAAAATATATTTAATGAAACATATTAAACTAATTTAATTTAAAGTAAAT----AAATCAAAGCCTTGTATGGGCATATTGTAAATGGTGGTGAAATTAAATAAAATG---------TGTGTTAATTTTAAA-------------GG
CCGTGGGCAGC-----AGCTGGAGCTC-------------------TGTGCGTGTGTTACAAATTAGTTTAATTGTCAAGTAATTAAATTACAATATATTTTGTATGCAAATGAAATTAACTAAGTATACATATAATGCATATG----TGCGTGCAGTC-------------------------------------AACACTTAGTTGG-------TTTAT------TTAGT---GCTCTCATTGTTTTGATTGTTTT----------TTAATTTTGTTCTAATTTAAA---------TTTGATAGCTTTTAATTATATCTAC----ATTTTTCA-------------------ATGTGGTGTCTAAACTAGCGAGC-------TAAAACCAAAGTATTTTTAAGCAAACCATTTGAGGTCAGCCTAGTTA------------------------------AGCCGATAAATTCAG-----ATGAAAATGGATTTCAACCATTAA---ATAAATGTTCACGT-------CTGAAATCAAAGTAAAAC------------TAAAACTACTTATTA-------AATGTGCAAACTAACAGAAAATCTAAGGTATGTGTTAAAAATAAAATGGCTAACCAGCAATAAAAAACAAAAA---AAAAGCAAAAAAAAGGAAATAAATGTGTAAAATATATTTAA-AAAATGCAGTAAACAATTATAAATGAAATCTACTCGTAAAATGATCGCCTTGTGAGGGCATATTGTAAATGGTGGTGAAATTGCATAAAAATAAAAGAAACAGTGTTAATTTTAAAAACAAATCAATCGAG
>Brf 13200555 13201365|13543 chr3R 13199879 13203154 scaffold_20 1567055 1570643 + 83622|828 1898
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GTTTAGGCATAGCATTTAGCA-TTAATACATTCTATATGGTCATTTTTATACA-TAAAACTATATTCAGC---AACTACTCATAATATAATTAAATTAAGCCTTAAATTTACAACTTTGCCGAGTGCTCTACTTCTTCTTTATCTTCTTCGTCCGGTTCTTGCTACATGCTGCACTTGTTGCAGTTTCGCCTTCTCTT----TTTTGCGCGTTAGCAGCCATTAAATCATCGCTCCCTCTTGCCATGAGGCCTTAGCGCAGCCATTTACATGTTTAAGCCGTGTTGCTGTTGCCTCCAGGCTCAAGTGGAGCAGCGCTGCGGGTTGGGGTAGCTGTTCAGCTTGAGGGGTTAGGTTTTGCTGCTGCTCTTTTGCTAGTTTGCTTCTAATTGTTGGCGCTGCCGTGGCGCGCCTCCAAGTGCTGCAAATAAATATTTCACTCTTAATCATGTTTTGCACTCGCTGTGTTGTGTGCTTGCCTTTGCGCTTGTTGTTGTAGTTGTTGCGCCCCAGGCGGCCAGT-------CGTCCAGCCGGTCAGAGATGGTGG--CAGCCAAGAACTTGACTTGGCTGCTCTGGCTCTGGCTTTGGCTTTGGCTTGCGCTTCATGGCTCGACGGCCTCGTGGACTGTTGAGTGCCAAGTGCCCGGCAATGAGCTGTTGAGTGTTTGGAGCACTTGTCTTTGCGATTTTATAGTTATTATGTTGTAATTAGTGTTAATTTAGTTGCTTGCGCACGGCAGTCGAACTAAGTTAACA-------ATTCGTAGAGTGTTGCATACTCTTAGGCCGCTGCATAATTTTCATTCTGTACTATTGGACTTTGCCACTTCGATCAACTGTTGCCTTTAAAACTGCAGCGCTCTTTAAATTGTTTAAAAAATATATAATAAATTGATGACGCCTTTAAGTTAAGGTTAGCATTGCCATCAATTGTTCTTCTCTTAGTCGAAGCTTTCTACTTTAAAAATCTATTTCTTTTCTTCTAAAATATATCATTAAAATTTTGATGACAAAC---TTTCCATTA--ATTCCAAATATTAAAAATTGTATTACTATAC
>CREG 13218990 13219244|13563 chr3R 13217557 13219963 scaffold_20 1585307 1587628 + 68387|1444 1718
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>Sur-8 13220923 13223057|13565 chr3R 13220900 13222687 scaffold_20 1588261 1590165 + 16438|25 2079
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>Sur-8 13220923 13223057|13566 chr3R 13222857 13224527 scaffold_20 1590166 1591798 + 99635|0 200
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GATGTGGATGGCGTCTGGCGCACCGTCTATGTGGGCAGCGACTGCTACTATCAGTACGAGCTGCAGACGGAGCAACAGACGCAGGGTA--------AACAGT----------------------------------------CCAGCGATCGGCGCTAACGGTGCGAGCTCAGCTAAGAATCGCTACCTAGCCCGGACCCT
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TAGTTTGTTTTTTCAGAAGACCTG-------------CCAACAAACTTGTCAAAAACCTCAAAAAGCAATTATCAAA------TAAAGCAAAGAAGGCATTCTTTGGCACAGCATGAGCTGAATTGAAGGCAGGACATACAATTCCGAGCAGAAACAAAAACGAAAACAACAGGAAATCAAAAAAACAA----AAGCAGC--------TTCGAGTCAAACACAAAATGAAAGGACATTAAACATGAACGAGCATTGTGGCACAAAGTAAATGGCAGGATTAAAACAGCTCATTCTGTCCCTGGCCGTGTGTGGGTGTATATTTGTCTGCTCGTAGAGGTTTCCATGAC---------------------CACTCACCCAACCAAAGAGCCATCCAGAAGTGCAGGGCGGACCACCGAACCACCCACCGA
TAATTTATTTCTTTCGTACACTTAAGAGCACTTCGTTCCAATAGAATTCACTTATGCCTAAAAATGCGCTTCCCGCGCTGCTTTCAAGTGAGTAATTTATGACTTGTTTTTATAT------AATTGAAATCAAAACAATTAATTTAAATCA-AGACAAGTCGAAAGGCGAAAAATCATTTGCCAAACAATGCCGAACAGCGGGCACAATTTCAGCCATGAATAAC-TAAATGAATAGCAGAAACGAATCCCTGCTCCATGTCAACGTAAATGACAGGA--AAACCAGCTCGGGTTGAGCGCGCGGGCG-GTAGACACACACTTG------CACAGAGAATACGTTAACGCACGGCCTGGCAAGGAGAGACACACAAACAACAACAG-GCCAAGCAGCTACG-AGGCCCCACCAACCAGCTGCCCCCGCA
>CG14330 13277702 13282228|13617 chr3R 13279433 13279957 scaffold_2 5454870 5455386 + 956|0 568
GCAAAGTTGAAATGTCAACGCAAAGTCACACAGATACACATACTACGACACAGACATTCATCGAGCAATATGCGAATTGTGCACTTTTCCGAC-----------TACCGTGATTGTGTTGTCATTTTGGCCATCACAGCGATATTTTGAACGTAAAATAACATGAAATATTTTAAAAAAATTTAGTTTTATTTGATAATGAAAACATTGGATGATAT-------GAAAATGCAGATTAAATTCA--------GCAGTATTAAATTCAAAGTATAATAAAATTAATTCATCGATTTTAATGAATACTTAGAATAATAAGAGAATAAAGCAACTTCACTTTTTATTAAGTATTTAAAAAATACTCCTTTA---ATATCCACTATAAG------GAAAATAAGTATGGGACTTTCACACAATACTTTGACCCACTCTTTTACATTAGTTTTATTTTAAAGACTTATTTTTTCAGACTTAATGGGTATATTTGGCCAAC-----CTGGGTTCAGCACTGTCGAC----CTGCATTTCACCGGACAGCAGGAGTCGAAAAATTTTTGAAATGCG
GCTAAAAAAAAACAACAAAACAGTGTTGCACAG-CAGACAAATTCCGA--------TTCGCGTTGC------CAAATTGTCAACTTTGGCAACACTAAACGCTTTGGTATGCTTCTTTTTTCAAATTAAATATT----CGGTATTTTCAAAATGTGAGACTACGACA------ACACAAATTTTATTAGTATTAATAACATAACCTCTTTATGCGATACTTACAGAAAATGCAGTCGAAATCCATTGTATTCACAAGGTTTTCTTTAGCTCACATTTAAAATATTTCCTTTTTTACATCGCTTCCTTATTTTGTTTA---------------TTATTGTTTGCAACGTAGTCAAAGGATTCAGCTTTATATAAATTCATCATAAAACAGTTGAAAGTTGATTAACAGTTTCCA------ATTTTGCCCGTTTTTTTTGTTTTAGTATTGTTTTCCACACTTTTTCCTTTATGTTCATTTGGTATATCCTGCAACCTTTCTTTTACTTTAACATTGTCCATGCAACAATATTTGAACTAAC------GTTTTAGAAATTTTTCAATTATG
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TTTAATCTTCATTTGCTCTCCC-CTCAGCCACAGGCTATGCAGTGGTTTATTCTTGTTGGCGGC-CCAACGCTTTGAAGTTGGCCCGCCCGAGTCCTGATTGCATTCGGCCAACGGCTTGACAATTATTATAATCTATTGCGGCACTGTAATCACAAGCCTGCACTCTCATTCGTAAAGCTCTACGGTTCGGCGTTTTGCGGAATTGCTTCTTTTGCTGTTTTGT
>CG14330 13277702 13282228|13619 chr3R 13280591 13281319 scaffold_20 1646679 1647398 + 14636|0 852
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GCAGCTTTTGCACAATTTTTCATTTCC-TTTGCATTTTTT--GCGCTCCCGCCACTTCACGTTTTTATTTCATTTATTTATTTTACAATTAGACAAAGTGAAGTGCGGCTCCAGGCAGACAGAGAGACAGGCAACAGCTGCA-----GCCGCATAG---------------------------ATACAGGGTTGCAGCTGCAGGTGCGAGT---GTGGGTGTGCGAGAGAGCGAGTGTGTGCATGAAAGGGGTTTGTCAACGCTTGATGGCAGCACGCCAAGA---------------------------------------------------TTGGGCGTCTTAAATCAAAAGCTTATTGCGAGAAATGCTTAAAATCCACATTAAGGCGCACTTA------AGACCATCTGTATACAGATACTG----------ACTCATCCAAAAAGATACCTTCATTCCAAGG------TAGCAGCGCCAGAAAGCAATAATCATAAAAGTAGCCCGCACGCTCAGCTGCCTGCCTGACAGCCTAGGCTACCTTTGGCGCAAAGTTTTCACATCGCCAGGCCACTGTTGGGTGTGTGGTGCCAAAACGAATGGCAAATGGTTCTGCCGATGGAACACTTAAGCGCAAGGTAAGTGAAAACTCAAATAAAAAT----------------------GGAAACTTTTACAATGCCGCCACGACATGGACATAGACGTCGCAACTTGGCAAAGTAACTTCAAGGCTATTTTTGGGCTAAAACGAGCGCTGGATATGTACAGCGCCAAAAAAAAAAATGGAGACAGATTCAATAAACAGTTTTTGGCCAGGCTCCTTAAAGCC
>CG14330 13277702 13282228|13620 chr3R 13281745 13282194 scaffold_20 1647521 1648014 + 8363|0 513
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ATAATTAATTCATAATGCTATGAGTATCAGCTGGAGTGCACCGGGAGTGCAGCGCAAACACTTTATTAAAATTAAAATTTATCTAAATTGCGGCGGCAAGCCATTTTGCCCGCGAAGTACTTTAACAACTTCGTCGACTCTTCTCGAGATGCTGGCCACAAAATGGATGGGGGAGGGATGCGAACACAAAACCACTGCAGGGGTTGCTTCTGATTGTTGTTGTTGTTCAAGCTTTGTAAGTGAGTCCTGCCTGTCAGCCTTCCTGTCTGTCTGTCTGTGTGTGTGTGTGTGTATCTATGTGCCTGGTCGTACTTATGTCAGCTAGTCAGCCAAGTGTCGGGATCGTCTTGTCTTGTCGGCTGCCTGTTAAGCGCTTTGCTCTAGAAATTGAAGGCTTTCTGCTCACTGCTGTCTTT-----------GGCAAAAACTGCCAAGCG---------GCAGGCAACACCTTTGCATTTTTCAATGTAACCACCATGCTGATTTATTATTTTTGACAG
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AATTA-----------------CCGACACAGCCTCTATATTTATATAAAGAAATAGTTACACATCCGTATGCGTGTGCATATCTAATCTAGTTTACTTTAAAAT----------------------AGTCTTCGTG------------------------------------------------------------------------GATTGTATACCGCTTGAGAAGTATTTACATACCCCGCTTGATTCAAAAACAACCGCACTAGACCCCCGGCATCCATTCCCACGATTCCCACGATTGCTGACTTAGTCTGAAAATTATCGGCAGCAAAATTTGAAAACACAAGAACACACAATTCAGAACTCGACTTGTGAAATTTAAAAATTGTTTTGTTATGTATTCATTACTATTAACGCCTAGTTTAATGCAACGTGAATAATGCCAGAAATATGTT-----------TGTAAATGAATAAAGAAGCCCGGCAACATATGA-GCTCGTGTACAAATTAACCAA
ACTTAAATTGTAAGCAATCAGTACTAAATAGCCTCTATATTTATATATGG----------ATATGTATATGCGTACGTATATTTAATATAGTTTATTTTAAATTAGACACGTTTTGCTCTGCTCGCAGTTGTCGTGTTCCATACATTTAAACGAGTGAATCCAACTTACCCTCCCCCTTCTGTCCCGCCCACGAAGAGCTCAAAAGAAAATTGTGCACAGCTTGAAAAGTATTTGCCGACACTGCTTA-----------------------CCCAGATAGCCGTTCC--CGACCTCCAT-----CGAAGTTAGTCTGAAAA-CATTGGCAATAACGCATAAAATT--------------TTTAAATTTCAACTTAT----TTGATAAATTGTTTTGTTATGTATTCATTAATAATAA--ACTAGCCTATAGTTG-ATAAATGAAATGATAAATACATTCAATCGGAATATGTAAATTAATAAAAAG----AGCAACACATTACACATATATACATAT------A
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CAAAATTTAACGA
CAAAATGTGTTGA
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CTGGCTGTAAGCATTATAGAGATAT-----ATATTATAGTATTTCTA--CTGACTGTCA--ATCAGTCTAGTAAGGCACGATAAATACCCC---CTAGATATAAATATTTTGATTGACTAACCAGAATTATC-AGCCTTTGTCCGATCAGAGTATT--------------TCTTGTTAAATTAAACACATGTTTTTCCTAATAGATA
>l(3)07882 13362649 13362910|13706 chr3R 13362883 13365655 scaffold_20 1717139 1719913 + 110075|0 27
-CTCGACTTTGAATTAGTTATTTTTAGC
TCTCACGTGTATAGTAAAAGTTTTAAGG
>Prx5037 13370950 13371112|13710 chr3R 13371047 13372834 scaffold_20 1725059 1726670 + 41104|0 65
AGGATCATCTGATTATTTCTTAAACACCCTAAACATTCACTACACCAAAAGACTCGCAAAATAAAG
AT----------CTCTACACTGAACACTC--AACATTCATCACA-AAAAAGACTTT---AATAAAG
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AGATGCCAAATCTTGCCACCGGGATAGTTAAG--TACTTGTGATTGACCCTTTGT-----------AGATTGTAAAATAAACGAAAAAACA
TCAGAGCAG--------AATGTGATTTTTACGTCTAGTTAGCTTTTACTTTTTGTACTGAAAATCCAGATTGTTAAATACACGAAATA---
>CG14324 13444001 13444046|13777 chr3R 13443683 13444048 scaffold_15 1862235 1862495 - 5379|320 365
GAGTATTGTTCTATGTTTACTAAATATATATTTTAGATTGTTACAT
AACTG--GTTGAATGCATACTAAATAGATATTTTCGATTTGTG---
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AAATCATATAAAACCTGACAAGCAATACGTATTCCTTAGCATCCTACATAAAATATAAATATACATTTTATACATTAAATTTTGATTTCTATTTAGTTATATTTAA--CGCGGTAAAGAAATATTCTTCAATCATATTAACCGCCAACACAATAATACAAAGCTTTAACTTAAACATTTTTAATTGTAAATACAGAAGAAAGGCTCCTAAACT-----TAAA
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ACACACACATACATAAAACTTGTTTGTAATTTTGATTATTTATATAGATACACATATATTATATTATATTATATTATGCTATATTATTTGTGTT-TACCTGCATTTAAAAACCACTAAAGAGTGCGCGCTCACATTTTTGTATATGTTTTATTATGTTAAGCAAATGAATTTACAGTCTACTTGGATCGCAACTACTTAA----TAAAATCATAAAAGCAAAACAAAAACTATTGAAAAAT
>CG18212 13499903 13500545|13840 chr3R 13500192 13501666 scaffold_15 1188268 1189935 + 44816|0 448
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GACATTTAATGTCGCCGCGACAAAGCGCCGCCCTTAATAAATAGCAGAACCACAACGATAAT----TGACAA-CAATCTTAAAGTTTGTCGAACTTCCAAAAAACAAAAAAAAAAAAACTACAACAACCACAACAATTCTAACAATCTATTAAGTTTAAAGTTTAATATTAAATATATTTGAAACATAACAAAAAAGAAAACAGCAACAAAAAAATACAAAAAAAAACTACAAAAGAGATAGAACAAAAGAGGAAAAATATACGAGCCCAACAACAGCAACATTTAACATTTTAAAGTAGCAAAAA-------------AAATGGAGTAATTAAGTAATGCTTTAAACAATTATATATATATATATATATACATATATATATACATAACTAAAGAAGGCAAACAAAACTCGTGCAATGTTGAACACTTTAATGTGAAGCGAAGGAGTGA
>CG31249 13511399 13511727|13851 chr3R 13511337 13511632 scaffold_41 745017 745255 - -623|64 310
AAAGCCAAGCAACA-ACATTTA----GCAGAAATCAATAGATAGATCAACAGCCAAGCTATGAACAAGCAAACACCTTTTTTGAAAGCTATAAAATAAGAATCCTGTTGATATTTTATAATATTATTATTAATACAAACATATGTTTATT----TATGATCCTCTTTCAAAAGATGCAATATTGTGTATGCCTATGTAATTAATTTATTTAAAATAAATCATAAA----TTCATTAAAGCAAACAAG
AAAGCAGCGCAAAATGCATTCAACTTGCCTAAAACAAAACCAACAACAACAACTAAAGGAGAAATAACTCAACGGCCTCTCTA-------------------CCTTAAGATATCATATAATACATATACACACACCCACACACTCACACTGTAGCGCCAGCCTCTCACATAATTTG------TGTGCATGTGTTTGTAG--------------------CATAAAAACTTCCATTAA----------
>CG31249 13511399 13511727|13852 chr3R 13511655 13511729 scaffold_41 745276 745364 - 86|0 86
ACGAT--TAACAGTAAAG-------GAACGCAATCGAC-----ACAATATAACATAAAAGGACATAAAGAACATAAAAGTTTTAAAA
ATAATAATGATAATAACACCCACCAAATCACAAAAGACTAATTCAAAAACAAAAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAGAAAGTAATGAAA
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GTGGACAAACTGATATGAAAAAAACAACAACACAGACACATACCTTATAAAAACAAAAAAA---TGTACATACTTAACTATTTTGTAAATTGTATCTTGTATTTTGTTTT--CGCGTTGCTATAATGCAAAGCT--------------CATTTCGTATTATGTATGTA----------TGTGTGAAGTATCGAAG------AATGATTCAAACTCATTGG--ATGCTCGTAAAACTTGTTTTATAAT-------AATTTTGGCAAGCTAACT--GCACAAAAGCAGAAATTATA-----------GAACGGGAGCACTTGATGTAATTT-----------------------------------------------------------------------------------------------TTATGTTGTTTTTTTTTATT---------ATTTACT-GAAGTGCTGCTGGAACAAGGTTTAATTTTACATTAAACATAATTTAGGCATAAATGACAAGTTTAATTAATAAGTTTTTATCTTAATCTTAATTTA------AAAATATTCAACCTTAATGAAACACAGT--------------TCATAAAAAATTAGAAAG---GAATACAAACTAATCGA----------TATAGAATCACGCAAAATTAACTTACATGCTTACTATTATA---------AAGACGT----------GAAACCAATAGAAAACATATATTGCAGATTTATTGAGCACCTGAAAATGGACATGTGCGAAATGTTGTAAGCGGTACTTTGATGCATAAACAATAAATGCCCAAAGTACATGGCAATATAACAAAATGGACTGATGTTTAAAAAAAAATTGAAGTCAAGTAGACTGGGCTGTTAGCAAGCC-----------CTGGCATAAGTATAATGTCATGTCGATCAACAGGAAC-ACAAG---------GATCAGTTGAAGCC----CTAAAGATATATA-ATTTATGTAGT--TTTCCAAAACAAAAATATGACTCAACATCTCGATATCGATATAATTACCTGTAGTTATTAGTGTATAATTTTGCTAGGATGTAAATGTATGTCCCTCAAACTTAATTTAATTATTTAATTAAT----ATAC
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CGCGGAAATATTTAAAAGCAACACGTATATAAGGCAGTTTATTGGATTCAAT
CTCGGCAACATCAAAAAGCTACAAATATCTGCGGCGGTTGCTCAAATTCAAT
>osa 13513540 13515539|13857 chr3R 13514663 13515636 scaffold_35 1130068 1130932 - 5955|0 910
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TATACAACAATGCTACCGGCAACGTCTTACTATTGGCAAAATGCT------AGTGCTGTCGAAGGAATTTGCAAAAGAAACTAAACGTATTGAGCGAACACACACATTATACAATTATATTGATAAAACTTGAGAATGCGATTTGTATTCTCTTAAAA---------ATGTTTAATCAAATAATGTAAATCAACTGAATGGGATATAA-CACGATGTGCGTAATGAAAAGCGAATTTTCTTTAAACCATAGCG--------ACAGAGACCGTGTAGGTTTAAAG--TAAAATAGGGAAAACTTGGAACAGCTT-CTAACACAACACCATGACCACTCAACCACTATGGTCACACAATAACTGTATATTTTTTCACTCAAATCT----ATAGTTAATATAAAGTC-----------------------AAAAATGGTCTGGCGTTATTATAGCC--------------CCCTTCAAATTTTAGCAATGAATTTTCAACG-TCAAACT-TAAGGCAGAAGATT-TAATTGCAT----------------------------ATATATGCATGCGTAAAAGTTAAGCACACAATATACTTA-TGTATTAAATTTAATAAAA-----------AATAATAATTAAAAACTAATACACACATATGCATACGTTATATA--------TATATATATATATATATATATATATGTGTATGTAAACATATATATATATACATGTATATATATAATAATAATAATAATAATAA--TAATAGAAACGAAT-TACGTGTGTTAAAATAAACATATATAGACGTTAGTTTTTAAATTCT--TAATTA-TACTACTTATGT-----------------CATACGAAGTCATAAAATGAACATACAACCTTACTATGTATGCATA
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ACGCGGGCTTGACT--------CGCGTAATCGTTTTGGCGGTCGGTTG--AGTTTCAATTGTCATTT--TTTGCCATTGGCACTACTCGCTCAATAAAGAAT
ATGAGACTTAGATTGCTAATGCTGCTAAATTATCTTCCGGAATGGTTAACAATTCAAAATGTTATTTGGTTTACAAAAATTGC-AGTCCTTCAATAAAATAT
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>CG7431 13577504 13577835|13910 chr3R 13577826 13578800 scaffold_35 1171707 1172585 - 34431|0 9
AGTTGGATTG
TCGTGGCGTG
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ATTAACTCGTTATAAAAGTTTTGTGTTAAACACTTAGCCATTACAATTAGACCAGGGCTCAGCACTATGTACATTATTCGCTTCTTAAAATGTAGTTAATGTAAAC------ACCCTTTCACAAACGGAACTTTAGTTTGTTTATTTGGCTTTTCGCCCCTTGTATCCACATT-------TTGCTTCAGTGGTTTTAAGGTTCGTCAATATCTGTATAAACGTTCAAGCTACATGATGTGTAAAATAAAATTTAACAAATGCTAAATAAACATTGATATTTATACT--GAATATCGCTAA----GATATACGGCAATAA--GTTGAGGGCCTAATTTTGATTGACTTACA
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ATCGTTGGTTCCTTGAGAGGATTATTTCGCATGTTCTGCTATTGACATGCAAAATGCCCCTCTGGAAACTTTCTAAAGTTGATGTCAATAAAAATTGGTTACAAATTGCTCCCTCATCCAAGCTGAGTAACGGGTATCTGATAGTCGAGGACTCGACTATCTTCCCTTGTTTCCTAATAAGATATGGC--ATAGCAGTAAATTGTGGT
ATTGATAATTTTATTAACCAATT-----GCCTGTT-TGTTATT--CAATTAATTTTCCCGCCAGTTAATCGGTTATCGGTAATTTAA--AAAAATCTATCGCATATCGATTACACACTGCAG--GGCTAGTAGTTGTTTGCCAACCCTGG-------------CACTAGGTCTGCAATGCGACGTCACAAATAAAAATAAATTATAGT
>CG17802 13628953 13629251|13949 chr3R 13628440 13629842 scaffold_15 1279925 1281436 + -5535|603 1002
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TGTATTCATATACATATGTATAATAAGCTCAAACTTTTCAACATGTATCTGCTTTTGTATGTGTAGGGTATAATTAAACAATAATAACCTTCATGAAGTGTACATTTGTGATTTTCCAGACTATATACTAGAGTTTCATTAAAGTTCTGAAATGAATGAGTTTCATTATGCTGCTTATTTCAGCAAATCTACTACTATTTCTAATACACTGAGTTTTTAATTTTTTT------TTAATTGTTACTATAATGTCAGAGAAACAGTATAAACAAATTTAAGTTGAACATGTTAAAATTGTTGTGCGATCTTTTTAAAAAGACTATAGTTCGTTTTACAACACTAACACATTAAATGGTTACAGGTTCCGCACACATGTGAATGGTAAACTCAGTAAA-----
>CG18012 13635117 13635301|13955 chr3R 13633601 13635143 scaffold_42 386632 388294 - 8993|1706 1732
AAATAAATTGCTAAAAAAAGGAGATAT
AAACAAGATACCAGCAAAGACATGCAT
>CG18012 13635117 13635301|13956 chr3R 13635284 13636761 scaffold_3 1878356 1879839 - 67461|0 17
AGCATTTTGACAAAGATT
GCAGCTTAGACAGCGTTT
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TAACCATTCGCCAGTGCTGTCAGCCCGGCAGCCAAATAGCAAAGGACCAAAGGACATCCTGC-----------------------AGCGGCGGATTCCAGAGGAG--------GCCGCCCGATCCTCATTCGGCATGTCGCTGGCCTAAGCTAAGTCCA---------------CATCTGTTGTTTTTCTATTCTACGGCGGCGAAAGACTTTGGAGTAATACAAAATATAAAACAAAGAGAAATATCTAATTTTTATAAGTCATGAAAACAAATGCATTTAAAAGAACCGAGAAACGAGAACACAAGAGCAGAGCAGTGCAGTAAAATGTTTAAAGACGTAACTACGGAATACAGCTAAATGATAAATGTAAAGGCAGTCTATATATACATATACACATATATAACGGATAA---CATTTGAC-------AAAAGGATAC-------------------------------TTGTAAATT-ATGCATATTTAAAATAATTTTTATTACACACCTAAGATCACTATTATTTTCGTAATACGATTACTACGATTATTATTACT----TAA--ACTATTACTGATA---------AAAGCATAAAAAACCAAAAAAAAAAAAAAA
TAACCCTTGCAGAGAGCTGCCAGCCAGGCAGCCAAATAGCAAAGGACC-AAGGTCAGCCCGCGGGCACTGCTCAGCTATGTTGGTAGCGGGATTCTCTGGAGGAGCTGCTGGAACCGCCAAATACCCGATCGGCATGTTGCTGGCCTAATCTATGTCCAATATGTATGTAAATTAATTTATTTTTGTTGTATTCTATGAC--CGGGAGATTTC--------------CATAAAAGTATAAGGAACTAGTTAATTTTGTAAGTCATGAAAACAAATGCATTTAAAACCA-----AACTTAGAACACA-------AGCAGAGCAGTAAATGATTTA---ACTTTACTATAAAATTCAA------GATAAAAG----------CTACATAAAATTATAAATAAATATGATTGATAATACTATTTGACATAAATGAAAAGAAAACTAAGAAGGACAAAACTAAAATGGCCAGAAGATTGTAAATTAATGCATATTTGAAAGAATTTTTATTACACACTTAAGATATCTATTATTTTCGTAATACGATTATTATTATTATTATTATTATTATAATTATTATTATTAATAACTATTATTAAAATGAAAATACACACACACACACACATA
>Rim 13702054 13702713|14023 chr3R 13698338 13702248 scaffold_3 1954926 1959251 - 61715|4443 4647
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AAATTTGCATTATGTACCGTTACAAAAATTTACAA-----AATTAATGAAAAAGAATTTAAA--AAAAAAAAGAACGTTTTATATCAAAGT--------CAAAACCTATCGTAAAGTCACCTAAAATCACCGTTACCGTTACGTTTTTGGCATAGCATACAACTTCAACGTAGTTTTT-TATAGACTCGTACAATACTCATATAG
>Rim 13702054 13702713|14024 chr3R 13702310 13703176 scaffold_3 1959323 1960215 - 31379|0 451
ATCTAAACTAAACTAAACTGAAACT-----CGACTAAAAACCAGATT---------ATTTCAAACTCAAATCGTACAAGATTACAAAAACAAAAGTATAATAGAAATTTCGCAAATCGCAAATTTGATAAACAAATAACACTTGCATATATTTATATAAGTCAACACACAGAACATATATTTATATAGTATTTAGCTCAACGTTTTGTTCATAGCAAGTTACAAA------GAACAAAAGTTGTTTAGCTTTGTAGTGTAATCAGTCTTAAAACACCTGTAAAAA----------GAAATCCCCAGCTCAAAAGATCAGTTCAAAGGTCC----AGCCAACCAATTTGAAATTAAACCGATACAATACTGAACATCAAAGCATTTGTTGTTTTTTGTTAGC--------------AATATACAATATACATACGCACTCCTGTAAATGAAAA
ACTAAAACTCAACTCAAATCTAACTATCAACTATAAAAAACTCAACTCGTGATGGAGTTGCAAGTTGAAAATACACATAATAAAAAAAAAAAAA----AACAAAAATCACAACACATGCATATT--------AAATAACA--TGCATGTATAAATACATTTATACGTGCAT-TTATGTAGCTACATATTTTTCAGTATTCAGTAACAAAAGAACAAATTTACAAACATACCAACAAAAAATACTTTAACTTTGTAGCTTAGTGAGTCACAAAACATCTGTACAAGCACAAACAACAAAATATACTAAACAAAAACTTATTTAAAAAATGCTAATAGTCAA--AAGCGAAAAACAAATTGATTGCATACATGTTTT----GCAT---TTGTTTTTAGTTAGCTAAAATACCAACTAAATATACCAAAAGCACACACACACACGCATACACACA
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TATGCGTAGTTCTAAGTTGAACTTAAGACTCGGTTGTATTTGCTGTTGTATTTCATATTGTACTGAT-CTTTGTAGTATTCGCA--GTTTTATACTC---GCTAAATTATACTCGTAGCCCATAAACATAAATGTTCTATCTTAGCGTTAGTTGCATGCCGCAGTGCCTTATGAAACAAATAAATGTTGTACACG------AATCCCAA
TATATGTAATCATAAGTT-AGTTTATAGATCGGTTGTATTCGTATTTTTATTT------GTACTGATTCTGCGTAGTATTCACATTGTTCATTGTTCAATGTTAAAGCATAT--GTTTCTTATAA---TATAAGATCTATAGCA--------TGCATGCT--AGTGCCTTATACAA-AAATAAATGTTGTACTCATAGTCTAAACCGAA
>htl 13870936 13871452|14222 chr3R 13871255 13874403 scaffold_3 2159452 2162620 - 105877|0 231
ACGAATCAGGATCCTTAGATGAGATCAGGACAAT--TCAAGCCTGGTTTTTGAACCAAAGTCAAATTGTTAACTAGAGATTATGAAGTGTCCTTTAGGGTGAATCCTAATAAATCTTCGAA----------------AGATCTAAGGCTTGCATAAAAAAATCCTACAA-------------ATCATACTACACTCGA---ATTTATGTATATAACTCTCATTTAAGTCTGT
GCTGATCGATAAC---------GATTACGATAACGATCA---CTGATCATCGATC--GAGTTCATTGAGAAACTGTACAT----ACTTCGCCTTCGGGCCAACTAACGATAAGTCTGTAAATCGCTTGAATTTTATTGCACCAAAGGCGTAAACCAAAAATTTTTACAATATTTTAGATTACAATATATTACATTATATTTATATATACATATATCTCACGTTGAAGCGTGT
>CG7215 13991163 13991617|14359 chr3R 13990443 13994747 scaffold_3 2300016 2303969 - 74308|733 1213
ACCCACTTGCCCGGCTATGTGAGCTCCGCCGATGAGCTGAAGTCCAAGCAGGGCGTGGACGAGATTGTCTGCGTTTCGGTCAACGATCCCTTTGTGATGTCCGCCTGGGGCAAGGAGCACGGAGCCGCGGGCAAGGTGCGCCTCCTAGCTGATCCCGCCGGCGGTTTCACCAAGGCCCTGGATGTGACCATCGATCTGCCACCACTTGGCGGCGTGCGCTCAAAGCGCTACTCGCTGGTGGTGGAGAACGGCAAGGTGACCGAGCTGAATGTCGAGCCCGATGGCACCGGACTCAGCTGCTCGCTGGCCAACAACATTGGCAAGAAGTAAATGGAATCCAGTCAGCCCGAAAACACTA------------GAAACTCATACATGCTAATGCTAGGCCGCA-------------ATGATATCAATTACGTCTTCAAAAG-AACTATGTAAAACGTACAATATATATGCGATTAGAGATGTTA
ACCCATCTGCCGGGCTACGTAACTTTAGCAGACTCGCTTAAAGCGGAGCAGGGCATAGACGAAATCGTCTGCGTTTCTGTAAACGATCCGTTTGTGATGTCTGCATGGGGCAAGGAGCATGGAGCAGCTGGCAAGGTTCGCATGCTAGCCGATCCCGCTGGCATTTTTGCATCCGCTTTGGATGTGAACATTGACCTGCCACCGCTAGGCGGTGTGCGCTCCAAGCGTTACTCCATGGTCGTACAAAACGGCGAGGTTAAGGAATTAAACATTGAGCCCGATGGCACTGGCTTGAGCTGCTCGCTGGCCAACAAAATTGGCAAGAAGTAAACGCGCAATGTTTATTTCCCAATATTTACTTGTAGTAAACGAATCATGTAATAATTAGTGCCGTGGCCCAGCGCCAAAATATCATGTTTTCAATTATATATTGGAGAGAAACTATGT--AGTGAATAAAAGAAATGCAATTATAAGAACTA
>CG7217 13991163 13991287|14359 chr3R 13990443 13994747 scaffold_3 2300016 2303969 - 74308|733 883
ATGGAATCCAGTCAGCCCGAAAACACTA------------GAAACTCATACATGCTAATGCTAGGCCGCA-------------ATGATATCAATTACGTCTTCAAAAG-AACTATGTAAAACGTACAATATATATGCGATTAGAGATGTTA
ACGCGCAATGTTTATTTCCCAATATTTACTTGTAGTAAACGAATCATGTAATAATTAGTGCCGTGGCCCAGCGCCAAAATATCATGTTTTCAATTATATATTGGAGAGAAACTATGT--AGTGAATAAAAGAAATGCAATTATAAGAACTA
>CG7215 13991748 13991882|14359 chr3R 13990443 13994747 scaffold_3 2300016 2303969 - 74308|1344 1478
GTAGGAGACTCCCTGCCATCGGTGGATCTGTTCGAGGACTCGCCAGCCAACAAAATCAACACCGGCGATCTCGTCAATGGCAAGAAGGTGATCATCTTCGGCGTTCCCGGCGCCTTCACTCCAGGCTGCTCAAAG
GTTGGAGACAAGCTGCCCTCGGTGGACCTCTTCGAGGACTCGCCAGCCAATAAGATAAACACCGGCGAGCTAACAAATGGCAAGAAAGTGATATTCTTTGGTGTGCCCGGTGCATTTACTCCCGGCTGTTCCAAG
>CG7215 13992077 13992448|14359 chr3R 13990443 13994747 scaffold_3 2300016 2303969 - 74308|1695 2090
CGCCATTGAAGACCCAATACCAACCACCACCACCCCCTCCAAAAATAT------GATGGAAGTCTATCCTTACAGCATAATATTTTTATTTCCCCCCTTTAAAAAAACAAACTAACTAAAAAATATGAGGTAGTAAAAATTAAGACT--TGACTGAA--------AACACACGGCCCATATTC--------TTTTTTGCGACGGTCTGGCAACGCTCCACCGGCCAGTTGCAGTCTTTGGCTGTGTGCGTGCGTGCCTGTGTGTGTGAGAAGAAGAAAGAGAGGAGAAATGCGTGTGCTGTCGTGCAAATTTCTTGGCCGAGTTGTTAACTCCGCGCTGCCCCAACAAATCATTTCACTGCGATCCCTGTCCAAAACCAGTGCAGCTATGGTGAAA
------TGACGACGCTATGCTGATAA-----AGCTTTTAACATAATATCGCAAAGAAGAAAACAGATTTTACTCGATTTATATTATTTGTTGCCC----------------------AAGCATTATT--GTAGTAAAAAAGAAGAATGCCGACCGAATTTATTTGAATACTTTGTC-ATATCCGATACAGATTATTTGCAACGGCCTGGCAACTCTATATT------TTGCA----TCGGCCAT-TGAGCAAGTGTAAGTG-GTGCCAGTGTCAGAAA-----------------TGCAGGCGTGCAATTTTTTTAACCGAGTTGTTAACTCTACGAAGACT-AACG-----------CGCGATCTTTTTCCAGAACACTTGGTGCCATGGTTAAG
>cdm 14005431 14005638|14375 chr3R 14004605 14009237 scaffold_3 2313678 2318391 - 155993|1023 1269
AATGA----GTGTATGC---AATAAGTGGCCAAATGACATCTTTATCCATCCGGATTTTGATCTAGTTTCTATAATTGTATTTAGTTTGTATTTAAATAGGCCGTCAGCTCTGTAAATTGTC--TCCAAT------TTTAACTTAAGT----TCAAAAGTT------CTCGACTTGATAAAC---TTTTATTTATA-ATTTTTACAAA---ATTACATGCTCCA-------TTTACAATTTGCACAT
ATTGAAGAGGAGATTGCTCAACTTCATGGCCAAATCTCTTATATTT---------TATCGTCCTGTTCTGTGTAATTAGATGTTAATTGTAATT---TAGGC-----GCTCTGTAAATGTTCCTTCCAATAAGTTGTTTATTTTTAATGATGTCAAATATTGCTGTGCTGGGACAGGCAAATATATTTTAAATATATGGGTTTATAAATATTTTGCCTGCCCGAACGCAGCTTTATCTTCTG-AAAT
>CG7208 14009378 14009504|14376 chr3R 14009316 14009714 scaffold_3 2318469 2318851 - 1203|63 190
GACTTTTTGGGCTTTCCAAATTCACTGTTAACTTGTTAAGATACTCCTCAATTGCAGAGAGTATTTACTAAATAGAAATAGTAAAATTTTATGAAGTGTACGAATGAATAA-ATGTTGTTATAAATTG
AATTGTTTAAGT-----------GCAGTCAA---ATTAGCATATATAGTAATTG-----AATTACGAACAAGTTGAAAT-GTAAAATTTGAATAAATATCCCGTTATTTGAGATGTTTTTATTAATTT
>CG12321 14013519 14013583|14377 chr3R 14011507 14014416 scaffold_3 2319972 2322820 - 133649|2032 2096
GCGTCTACATGTATTTTTCGGTGCTTTCAAATAAATGTTAATCTTTTGGTGTAGGATAAAAGATA
TTGTGGACAT---TATTTGGAAATTTAACAATAAAATTTAATCTTTTGGTGTGGGATAATAGAGA
>Ssdp 14020582 14020897|14382 chr3R 14020296 14023166 scaffold_3 2329347 2332255 - 121127|300 718
CAACATCAC---------------------------CAGCAACAGCAGCAGCAGCATCAGCAGCATCTCAACACGGTGGCAGCCGCTGTGGCAGCTGTGGTGGCGGCTGCGGCGTCCAACGG-ATCGGCGG-----CGGGCAGCTCCTCGGCCGCTTCCATTGCGGCTGCTGCTCTTGGGGCCGCCGCCTCCAATCTGCTCAGTAATGGCAACAACAATTTC--TGAAGGCGATGACCACA-----------CGCAAC----ACCACAACACGCA-------------------------------------GCAAA-------------TAAGAACGCGGTAGTAGAAATCCTTGATACATAAGCATAAAGTAATT---AACATTTAACGCATGTATGAGAAATAGAAAAAGCGAAGC
CAACATCATCATCATCACCACCATCATCAGCAGCAACAGCAACAGCAACAGCAGCATCAGCAACATCTCAATACGGTAGCAGCTGCAGTGGCAGCTGTCGTTGCTGCTGCCGCATCCAACAGCACCGGTGGAGGGACGAGCAGCTCAACGGCTGCATCCATAGCTGCTGCGGCGCTTGGCGCAGCAGCCTCCAATTTGCTAAGTGGCGGCAGTAGCAACAACAACAACAGCAACAACAACAACAACAGCAGCAGCAACAACAACAACAACAACCAATCTGGCAATCCGACTTTGCCCACTGGCGCGCATTTTGCAAAGGAACTCAATTTCTAAATACACGATAGTAAAAATCCTTGGTACATAAGCATAAAGTAAAGTAAAGTAATTATTATATGTAATAGTTTAAAAACAAGAAGAAG
>CG7183 14043850 14044238|14403 chr3R 14042199 14043879 scaffold_3 2358870 2360600 - 67583|1741 1770
AATATGAGAATAAATTATTCATACGGAAAA
ATTTTATGCATACA--ATTCACATTTCGAA
>CG7183 14043850 14044238|14404 chr3R 14044122 14047299 scaffold_3 2360601 2363856 - 107242|0 118
GTTAAGGAAAGGCATACCCTTCATTTATAGTTTATTACTTTGTGTAAAGAA--TACTTTAGAAAAACACAATACGACTAGACAAGCTTTCTATTGTCTGTTTTTTTTTCGGCCTAAGTT
GTT-AGTTTAGCTATTAAGTTCGATTGTAATTTATTGCTTTGTATAAAGAAATTGCTATAGAAAAACG-AGTATGCCTCGACAAGTTTTCTATTGTCTGTGTTTAAATATACCTAGATT
>CG7175 14047240 14047307|14404 chr3R 14044122 14047299 scaffold_3 2360601 2363856 - 107242|3299 3358
AATATAATTGTAAATAGCTTGTTATTAGAATTGGAAACTATACTGAAACCCAACTTACTA
AAAATAAGCTAAGTTAGTGTACAAATAGATTTGAATGCTAT-CCAAAAGCCAATACATGA
>CG7168 14050624 14050697|14406 chr3R 14048957 14051601 scaffold_42 5734 8471 - 93028|1777 1861
TACGACTCCAGAACTCATACACT---------TGTTAAAGCTAATTTAATCAGGACCAATTTATTACAACTAAAA--TTAACTAG
GAGTAAATAAGATATTAGCTGTTAAGTCACGATATTAACTATATTTTAAGCTGGACCAATTTATTGCAACTACAACCTAAACTTA
>CG7156 14065142 14065613|14419 chr3R 14064705 14068045 scaffold_42 24305 27558 - 87765|499 993
AAATAGGCACTATTTGCTTTGCTATTGAGTCCGTAAAGTATTTTCTTATTTCGTACTGTACCTGAAATCCCATTTGTGATTCCTTGCTCAGTTCTGATTGGCATTGATTTTGATTACTTTCAAAGAATCTGAAGTCGCTCCATAGCGATTAATTATGTTGTGAATCTGCTATATTATTTTCTATGCA-------TTACTTTTAATACTTGTCTTCGAAAACAAGTGTATT-AACCATCAGTTTTGTTTTTATGAGTCTTTTATGTTGTTCCTTTTTTGAATTGGAAGCTGATCAATTA-TTGGTACAAAATACGATTTATTTATACGTCTAT-TATATACATTTGCAAAGTGTCCTAGTTTATGTA-ATTGC---------TTACAATTAGAAATTA---AACTAAATTGAATGTAGTTGTAACAAAATTTGCAAGCCATTTTACAAAATTAGTAAGTAATAAAATTTGTAAAGCCAAATGAGCTAGTATACAAT
AAAT--------TTTGTCAAAGTGTCGAATTTGCA----ATTTACCAATTTTCTA-------------------------------------------------TAATTT--ATTACTTCAAGTGTGCTTTAA----------------TAATTATGTTAACAGTCTGATATGAAATGTGGAACACAAAAGAACGTACGTTCCACATAATTATCCAAAAAGAAGAGTCTCAAAATATTTGTTTTTTTTTT-TGTTTATTTTTTTCTGTTGATTGTTTCGTTT---------TCACTTGTTTGGTACAAAATATG-TTGCTTTATTCTTTAATATAAATGTATTATTATTAACTCTATGTATATATACATTGCAAATTGTAATTGTATTTAGATTCTAGGCAAACGAGCTAAACTTATATATATGAAAACTTG-AAGCAGCTACTCGAAGCTCTAAATTACAAAAGTATGCATAA--GTATTAAC-ATTATACAAA
>CG12320 14077220 14077281|14428 chr3R 14076594 14078425 scaffold_42 36159 38017 - 78326|697 759
GAGAAGGGCGCTACGCATGTGAAGTGTAATTCATATATTTGTAATACAATGGACTGAAACTG-
GCGAAGTAAGCAAAGCTT-----------TTCATATCATTTT-CTGCAATGTTCTTTATTGGT
>Rpb4 14078565 14078934|14429 chr3R 14078426 14085001 scaffold_42 38455 45143 - 142015|149 561
CTTGCTGATGCAGAAAAAGCTGCACAAATTCGAACTGGCGGCACTGGGTAATTTGTGTCCGGAGGCGCCCGAGGAGGCCAAGGCGCTGATTCCTTCACTAGAGGGTCGCTTCGAGGATGAGGAGCTGCGCCAAATACTCGACGATATCGGCACTAAACGCAGCTTACAATACTAATTACTACTACGTATAAATATAGTTTAGATATAAAGTCATGGTCCACTTACACAATAAAGTGAAGAACAGCAAGAATTTTAAGTA-AATGCAGAA---------------TATACACTGTAACAAAAATCAAC-----AAAGTCTA---------AATACAATGTAATTATATCAAACAAAAGAT-TTACTTAAAAAAAA---------GTATATATAAATTGA---ATTTGCCGCTTG
TTTGCTTATGCAAAAGAAACTGCACAAGTTCGAGCTGGCTGCACTGGGTAATCTGTGCCCGGAGGCGCCGGAGGAGGCCAAGGCATTGATACCCTCACTGGAAGGTCGCTTTGAGGATGAGGAGCTGCGCCAAATACTTGACGATATCGGCACCAAACGCAGCTTGCAATACTAATTTC-------GCTAAGTTTTGTAGAAAAAAAAAATTATT--------------TAAAATATATAAAAAC-TTAGTTTTAAGTATAATACGAAAATGTGTCCTATGGCTTATAAATT-TAACTAATATCAGCTCCGGGCAGACTATCCTAGACCTACGCGGTTTTACTGCTCCAAGGGACAAATGTTCCTTAGGAGCTATTTAATTTTTTATATATAAATTAGAATACTTGTAGCTTT
>Rpb4 14078997 14079275|14429 chr3R 14078426 14085001 scaffold_42 38455 45143 - 142015|635 924
GGCTAATTTTTTCTCCAAT----GTTTCACTTGTAAATTTCCTGAATGTCGTCAAGTAACTAATTCAAGAAAAAAAAACCCT-------TTCGTTTCTCTTTGTTTCAGAGTTCGAAAATGCCGAGACGCTGCTGATATCGGAGGTGCACATGCTTCTCGATCACCGAAAGCGACAAAACGAATCCGCCGACGAGGAGCAAGAGTTCTCCGAGGTCTTCATGAAGACGTACGCCTACACGGATAGTTTTCGAAAGTTCAAAAACAAGGAGACCATAATGTCTGCGCGAAG
GAGTTTTCCTAGCTTTACTTTTCGTTTCACTTGTAAATTGCAAAA-----GCAAATTAAATATTTTTTATATAATTTATTCTCATGAGCTCCATCTGGTTGTTTTGCAGAGTTTGAAAATGCCGAAACGCTGCTCATATCGGAGGTGCACATGCTGCTTGATCATCGCAAGCGGCAAAACGAATCCGCCGACGAGGAACAGGAGTTCTCAGAGGTCTTCATGAAAACCTACGCATACACAGACAGTTTCCGCAAGTTCAAGAACAAGGAGACCATTATGTCCGTGCGCAG
>CG7146 14096908 14097101|14447 chr3R 14096530 14096914 scaffold_42 57501 57876 - 12460|395 401
AATTAAA
AATTGAA
>CG7146 14096908 14097101|14448 chr3R 14096967 14100385 scaffold_42 58838 62284 - 109305|0 148
GTGAAATA--CTCCAATGTGATAACTGATCAAGGTA------------TAAAGTGCGAATTGAGTGTAAATGTCTGTATTATTCTGTTTTTAAATAAGCTTTTTCAGTACTCGTATGTAATGGATATACTGCAATGCTTATACAATATA
ACAAGCTCTTTTCATATGTGATAATTGCAAAAAGTAGATAAGTCTTTCTAAGTTATGATATATTTGTAAATGCTAAGCATAATTCGTACGAAATCAGACTGTTTCGGAA----TAGAAAATATGAATAGTTCTAGAATTATATAAAACA
>CG7142 14103885 14104002|14451 chr3R 14103665 14104171 scaffold_15 1313782 1314256 - 11090|246 363
GATCATGTAATAATGATCATCGGAAAGATACTATACAACTTAGGCAGATTCGCCCACAAATTAGCGCTCGAATGTGAAGATATCGAAAAACGAAATATACAAAAAAAAAGACACAAAA
AGC----GGATTATCGGCA-CGGAGAGAGTTCCTGGGACTT---CATA-GCGCACACGCA-----GCTCGAAT-TGAAAATATCGAAAGAAAAAACACA-AAAACCAAATACATCAA-
>CG7131 14112337 14112686|14457 chr3R 14109404 14113291 scaffold_15 1319539 1323403 - 178990|2979 3346
CCTGGAAATACATTATGGTTGCTC-------TGAAGAATCCGTCTCCCAAGCTCATCCCGA--GTTCTACGTTTTATGTTCAAGCTAAATCTTTCAGTCCACGTCTTCTAAAGAGATATGTTGTTTTCTGTTGTAAATGCTTGTCAAAGGGTTCGCTTTGCGAACTGCATCCATTAATCGAGCGGCGCTATCCGTTTGCTTCGCTGCACCATCGCTTTTA----TCCGATTTTGTCAATCCCATATGCATATACAGAAAATTGCCGGTGATCCAATACATGGCTTATGAATTATGGTGTATTCCTCATTGTCAAATTAAACTC-----TGTTCACAGAAATATAGAAATCCAGTAAATCACGGAATAA
ACCGGAAATATGTTTTGCTTGCTCGTGCCGACACAAGTGCCGTCGCCC-----CGTCCTAATTGTTTCATGTTATATGTCGTTTCAAAATCTTCAAGTCCAACTCTTTGGCAAGCATA--------------------------CAAGAGGTC-------------GCATATACAAAT-GAG-GACACTTTTTG--------------CCAGCAATTTTAAATGCTCGACTCTTCCACATCCACAGACACACACAACCACACACCCAAAACTCACTCAACGCGTTTATTATTGCTGCATA-----------CAAACGAAAATTGCAAGTGCTCCTCGATGT-------TTCAATAAA---------AT
>l(3)05822 14114579 14115300|14459 chr3R 14114540 14117252 scaffold_15 1327127 1329934 - 76212|39 849
CCATAATTAGCCCCCGATCTTTAACGATCTATAAATTGTATACCCGAAACAT-TGTCGATAAGCG------AGTAGATGTCGAGCGAACTGAATCATAT-----------------------------ACACACACA----CATATATAT-----------AATATTATTTTTACTATAT---------TCTTTTCGAAAAAT----CTTATGAATCGAGCATATAGTCTAAGACAACTAGTTTGTAAGCGAAAAATCGAAAAATGTTTTATATGGGTGTATTGGAAACATGCCCATCCCTC---TCCTACCCGCTTATACACGGGATCGATGTATTGATTTTATGTTCAACCCGCGAATGAAACTGTTTAGTTAACTAAATAATTCTATATAT--------------ATGTATTAGAAATGATT-----TGCTGATCCTTAAAGTATTCGCCCAGCCCCA-TAGACCCCAACACAATAGAGCAGGCAAAAAATATTGTATATAAGTTAAAATGTACGTGATTTCTATTAATGTTTAATTATTTAAATTGAGTTTAGTTAGACGCTTAGTTAGGCACATTTACAGATTCCAATTTACGATGCAAGCCGTTTGTTTATGTATGTATTAATAATTCTTTCAAATGC--TTAGGGCAATTCATCTCCGAGTGAGAAGATGAATGGTTATTTATTTGTCCCTTGCAGAGTGCTACTCTCACAATTCGTAGGACTTATCGCTAATAAAAAAATATCAGGATATCCTAGCAGTGAAGAATGTAAACCGAAATAAATGAAGATGATCACAAAAATCAA
ATATCATTAGGAAGCAGGAAATAGCAA-CTATATATTATATACAAGGAATATATGTCGATAAGAAAGAAGCAGCAGATATCGTTGGAACTGAAACATATTGTATTTCCTATTGGTAACCCACACCCGCACACACGCACCGGCACACACATCTTCACAAAGCAACACAATTAATTATATATATATATATATCTATATGATAAATGAGCGTTATGTTTCGAGC-------TTAAGAGAGTTATTTTAC-------------AAAACAGTTTTACGGCACCAAATCAAAATGCTACCGATTAATCAGTGCGCGACAACTTTTTTA--AGATCCAATAATTGTTTTTCCCTTTAA-TTGTTAATGTAATTTACATGTTGA-TAGATTATTCAAAGTATTCGATTAGGTTCTGGTGCATTGTAAATGATTTCGCGTGATGATCTATGGATCCTTATATAATTGTAATTAAAACAAAACACAA------AAGCAACAAATTTTCCAATTATACACAATAACACAGTTTTTTTTTCGTCGTCTAA--------------TTTAGTTAGCTATTTAGTTAGGCCCATTAACCATTTCCAATT---GATGCAAA--ATCTTTAAATATATATATTAAAATACGTATCAAGTGCTATTTAAAAAGCTACCATGTAAGCAATAGGA--ATTAACTAGATATCAGCC-------------------------------AACTAATC------ATAAATATGTCAAGATA------CAATG---------AACTGAAATAAATAAAAATGAT---GAAAATCGA
>CG18600 14125918 14126094|14470 chr3R 14125725 14127499 scaffold_27 1053992 1055810 + 40446|203 442
GAGT---------ATCTTCAAGGACACCGCG----------CCCGC-----------------CATCGATTTAACAAACCCTGGCGCGCCAATTACATTTATTGCATCCAGG--------------------TACTTCTG---ATTTTGTTATTTTGGGCAATGCCAGA----AGGAATATTATTATTCTAAACGATAGAAGGTTTTGATAAACTAAAATAAATAAAGAAATAAGAGAAA
CAGTGGCAAATTTAGCGTCAGGAAGACAGTAGAAAAAACACCCTGTATTGATTGCAGCAGTTGCATCGATTAAACAATTTCGGGC---CGATTTAAGTTCAAGGCCGACAAGAGGACCTACAAAACACGATTTATTTTTACATATTTTATTTGTATTTTAAATGACAAATCGTGAGAAAAATATAACGCTGCGTGCC----GTTTTTTGTATCTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACAATT
>CG7125 14128998 14129587|14473 chr3R 14129009 14129301 scaffold_27 1056954 1057201 + 3189|0 297
AACGAACTCTTCTTACCACTTACCACTTACCACTTACCACTTACAACTTACAACTCTGTGTGCTAAATTTTTCTCTAGAATCAAAATTAGTCGATAGCTTTAATTTGTTAACCACCTAAAGGCAACTCTTATGAAT---AATACACAAATACTTAATATACTTATGTGAAAATA-AAACCCAGACGTAACTGCGAAGCTCAGATC-CAGTTTAGTACCAATGGCCATAAGTTACAGGAAGAACCCAAAAACCAAACGAATGGCAGAGAAATATAGCTGAATAAACAACGCTTGACAAT
AACAAATTATATTTCTCAC--ACGCTTTGCCAAC-AACATTTGTATCTGAAATCTCTGTG--CTAAATTTTTCTTAAGCATCAAAACTAGTTTATAG-----------------CCAAAAGAAAAACCTAACGAATTACAGTACATAAAATATGCATACA---ATATGATCATATAGACCAACCCGAAAACGCTCAGCTGTACTCGTATTTTAGAACCAA----------TTATAAAAATA----AAAAAGAAAACAATT--TAGATAAATA---------AAAGAATGCTTGAAAAT
>CG7125 14128998 14129587|14474 chr3R 14129302 14129793 scaffold_27 1057427 1057896 + 16945|0 322
CCTGGCTGTGAGC----------------------CCGAGGCGATTCTCGAGAGCACCACCGAGTTA----------ATCAGCT-----GCAGCGCCAACACCACCACCGAAAGCTATCGTCGATCTCCGGCGGACTGCGCCGGATGCCATCGGCTGTCGGATTGCGGGAACTCACCCAAATCGGAGGCCATGAGCGACAGGGCGCTGAAATGGATGCGGTTCCACCTCTGCCGGCACATCAAATAGCAGTACAACCTTATTGCCTAGCCCATAAGTTTATCCTATCTCTCTAACTCGCTTCTCGATTGATATCCGCTAAACA
CCT-GCTGCAGGTGGCAAAACAACAACAGCAACAACAACAACAACAACCGAAAACGCAACAAATCCAGAACTGATGCAACCGCTGTCCGGCTGCCATAGCGCGCCCAGCGATAGCTA---TCCATCCCCATCGAACTGTGCCGGCTGCCATCGTCTGAC---------CAGCTCGCCGAAAGTGGAGGCCATTGGCGATAAGGCGTTGAAGTGGATGCGCTTTCATCTCTGCAAGCACATCAAATAGC-GTCCA--CTTAT--------CCATAGCTTTTT-----------------------------------CTAAACA
>CG31235 14142728 14142945|14495 chr3R 14142703 14143915 scaffold_27 1074405 1075532 + 19880|25 270
TCATTGGAGTGATTTATGCCTGGCACGCGGCCCGAGTTCCTTGGAGACTGCCAACTGCAACGTCTATTTGCATTCGGTTTAACAATTGCCGCATTAGGCAGCCTCCCCTCGCCCACCTCCCCCCTCCCCCCTCCCGCCATTTTATGTGGACCCCTGACTTTGTGGG---------------------------GCTTCCCCGTTTTTCGC-CGGAAATAAATGCAACTTTAATGTGCGAGCAGCCT
-----------------------------------------------CCGCAACTTTCAACATCTATTTGCATTTGGTTTAACAATTGCCGCATTAGCCAG---GCCCGTGCAATCCCGCCCCCTCCCAACT---GCCCACTTAGAAGCTGCCCCAAATTTGAGGGTCTGCGACTGAAGCTGAAGCAGAGACTGCTTCTGTGTTTTACTCATAGAAATATATGTAAATTTAATGTGCTAGCTAAC-
>CG7670 14189966 14190331|14554 chr3R 14187201 14191492 scaffold_27 1122707 1126755 + 64135|3008 3379
GCTTTTCTTTGAAGTTTCAGATAT--GCCATCTAATTCCTTTTACCTGTTTAAATATTTTCGCCTTCTTTCATTTATTTTCGGGAGTTTTTCTTAGTTTAATTTGTTACCAACGTGCTGCAAAATAATTGTTAAATTTAATATTGCTATCCAATTCGATTATTGATTACGATAACATTTATAGAATTGTTTATACCTAAATGTACAAATTATAAACACATTTTGATGCATTGACTTTGATCGGAACGAAATTTTACTAGTACT----ATACATTTTTGCATGAATTCTAGTTGGTTTATAAATTCCCTTAAAATTATATTAAGATTATACAGCTTTTTACACTTTTCAACTTGCAATAAATTTTAATTTTGT
A------GCAGATGTATGCGAAACCAGCAATCT--TTTATTACACATGTTTAAGCA---TAACCCT-----------------GAAT--------GTTCAACTAGTTAT---------------------TTAAATTTTAT-TTCCAATTGTATTGCACCTTTTATTAT----ACATGTAT----TCTTTTATACCT--ATAACCCAATTTT-------TGTTAAGGCTCTCACT---------------TATTATTTGTACTTCTGATACCACTTTATACG-------------CCACATATTATTTTA---------TATAATTTTAC-------TACAGCTCTTAACTTGCATTAAATTTTAATTTGGT
>gl 14193624 14195060|14557 chr3R 14191705 14193625 scaffold_27 1126756 1128561 + 38543|1966 1967
AA
AG
>gl 14193624 14195060|14558 chr3R 14193626 14193836 scaffold_27 1128939 1129112 + 3996|0 210
ACAACACAGCAGCACCCAAAACGAGAATATTTAAATTGGAATTGCCAAGGCATTAAACCCATAAACACCTGTATACGAATATAGAGTCCTAAGCTTAAACTAGACGTAGATGTAAGACAGGTGCTTTGATCTAAGCCAATTTTGGAGTATATAAAGAAAATAATAAATATACGAAAATTAAATACAGTAACTAATTGATTTCAACAATTGA
ACCACACAGCAGCACCCAGAA-----ATATATACTT----------AAGACATTG----------TATATTTAGATGTAGTTGTATTAGTAGGCATAAAT----AGTATATATAAGTCAGGTGCTTTGATTTAAGCCAATTTT---GCGTATACTGAA---ATTAAATGCATAAAATATACAAACAGTCGTTAACTAATTT--AAAATTGA
>gl 14193624 14195060|14559 chr3R 14193838 14194097 scaffold_27 1129358 1129647 + 4828|0 293
AAATCCGCATCCAAATGCAGTTAAAAATGCTCAAA---CAATACAAATCTGAGGAATCGCGGAGAATCGAACAAAAG-------------------TAGGCCTAAGAGCTGCACTGTACATACTTATACATACTATATTTATTATATTCGCTTAGCCTA--------ATAT-GCATTGAATCCAAGTTAGTTCATCCATTAAATAAGGTAGTT-CAAAACACGCATAAATCTATTCCAAATTAGCCAACGA--AATAGGATTTAAGACGGATATGAGTATGAATCATAAGACCA
AAAGCCCCATTGAAATGCAATTGTAAATGCTCAAAGTTTAATTGAAATCGACAAACACGAAGGAAACAAAAAAAAAAAAAAAAACAAAAACTAATCGAGGCCTAAGTGCTTAGTTGTATATAAAAAT-CATTTTGTATTTATTAT--TCACATAGCATATATACAAAATATCGCATTAGTTTAGAACTCGTATGTGTAT-GTATATGGTAGTTGAAAAACACGCATAAATCTATCCAAAATTAGCCAACTAATAATATTACCTTAAGTCTACACAAACCTAGGCAATAGAACTA
>gl 14193624 14195060|14560 chr3R 14194194 14194673 scaffold_27 1130111 1130648 + 18659|0 544
CACAGATTTTCGCAGTCGGGGAACTTGAATCGGCACATGCGCGTCCACGGCAACAACAACAGCAGCAATGGCAGCAATGGGGCAACCGGAGTTGGTGGAGAGTCCTCCACCGGCAGCGGAGTTGGTGG------------TGGCAACAGCCTGCTCACATGACAAAAGCCAAGGAGTGCAGGAGGTTTCCAGCATTACCACCCCCCGCACACCCACC-------------------------------------ACATGCAC-----------CACCAGCACCACGCCCATCACCATCACCACGCCCACATGGGTAACTACGACTACGGGAACTACAGCATCGGCGATTATACTCCACCCGGAGCCACACAAAACTATTCAGGGTATTATTTCTGCGCACTCAACAAGGCGCCCAAGTTCGAACGATTCTACTAGGGAC--TAAAATCTGGAG-GATCCCATCTGGATAAGAAACCTTAAAGGAGGACCACTC--AGTGAATTATACGGGGATAGTCACTCTATCGCTGATAAATACAATAATGT
CACAGATTCTCGCAATCGGGCAACCTGAATCGGCACATGCGCGTTCATGGCAACAACGCGAATGGAAGCGGCGCTGGCGGTGGCAGCGGCAACGGCAGCGGCAATGGCAGCGGCAGCGGTGCTAACGGCTCTGCCGGGGCTGGAAGCGGTCTTATTACATGACAAAAGCCGCGCAGTGCAGGCGGTTTTCAGCATTATCATCCCCCGCACACGCACCCGCACACGCACCCGCACACGCACCCACACACGCATCCACATGCGCATCCACATACGCACCCACACCACATGCATCACCACGCCCACGCTCATATGGCCAACTATGACTACGGGAATTACAGCATCAGCGACTATACTCCACCCGGCGCTACACAAAACTATTCAGGGTATTATTTTTGCGCACTCAACAAGCCACCCAAATTCGAGCGTTTCTATTAGAGCCCGCAGAACTTGAAGTGGTCTC-------TAAAAAAACAGATTAGAGCACTTCCTGGAGAGAATACTGTTCCAGAAAGCATTCAAAAGAAGATAAATGTATTAGTTT
>gl 14193624 14195060|14561 chr3R 14194674 14194964 scaffold_34 142227 142485 - -91|0 299
AAGATAGTTTAATAATTTCTATCGTTTCAATATAAAACTAACAACTTGAACAAAACTGAGACT--GTTGCAAGCTTAAAAAAAAG---GAAAACCAAAGATAATATGCATCATTCATTTTCATTCATGCATTTTCGTAAGA---TTTTCAACTTCAACTAAAGAACTGAAATTAAATGAAATAATAATTGTTT-ATTCAAATGTAATGCTAAAGATGAAAATTACCCCTTAAAAAAGGCTTAGGCCCCCAAAGAGCAGTCCTGGAACGTTATACATCGAGTTAATTGCTTTTTTGGTGTC
ATGTTAGTTAGAGAGCTCTTCTTGGGTAAATGAGGAGCTGAAAGCTAAGTTAAAATCATATTTGGGTTGCTATGTTAAGTAACAGCATGAAAGCCAAGTTTAATAT-----ATTAATTAACA-----GCATGTTAGTTAGAAAGCTGTTAGCTTA----ACAGAGCTCTATTT------TATATAAGTTGTTTAACATAGATAAATTGATAATAAT-----CTGCTCTTTGCA----GCT------------GAGCCGCGCGGATTCGCCATATGATGAGCCCATGGCCTCGCCGACGCC
>gl 14193624 14195060|14562 chr3R 14195057 14196585 scaffold_27 1130718 1132217 + 75232|0 3
GTCC
GTTC
>CG7675 14203842 14203958|14570 chr3R 14203848 14205348 scaffold_27 1139701 1141161 + 57443|0 134
ACGGGTGTCTGCGGCTGAGAGCCAACGC--------ACAATTTACTGATTTACTTTTCTTGTTTTTAAGGGGGAGTTTACTGT--------AGCCTAAGTTTTC--------TCAATAAAAATGATTTTGTATAA
AAGG-----CGCTCCGAAAAATTATCTCTTTTTTATATAATTTGACTAACTATATTGTGCATTATTGTGGGGGAGTATACCGTATATCGTAAGCTTAAGTTTTTCACGTAAATCAATAAAATACCTTTTATAAAA
>CG14309 14206851 14207670|14571 chr3R 14205445 14207144 scaffold_27 1141253 1142888 + 5543|1541 1899
TACCCAGATCTTTCTCTTACCGCTGGTAACTATGTATTATAGTTTGGCTC---CACTCTGTGCTCGCTCTTTCGCT--GCGAGTGAACCGTTCATGAAGACGATCCCAAAGAGGAGCCCGGAAAGCCGCTTGGC------------------TAACCTGTTACCATGGCTATAAGTGCAATAACAAAATCACCGCGACCACGGCAATACCAA-----------------ACCGGTGGAGACGATCGCG--------------CATTCTCCGCAGC------CTCGGC-TTTATAATCGGAATTCCGACTTCAGTCTCCGATTAGTCGTTCAAGGCGAAGGTTGTGGCA----CTAGCTC
TGTGTAGATTTTACACTTGACTCGGGCTGCGCTTTCTCTCTCTCTCTCTCTCACGCGCTCTGCT-GCTCTTTAAACTAACGAAAGACCAGCGCAAAGGAAAGGCAACAAATAAAAGCGAGATTCTCTCTTTGGCGGCATTCAAGCTCAGCTTCAACTTGTTTCGCCGGCCA-----GCAACAACAACAACACAGCTACAACAACAACAACAACAACAACAAGAACAATAAATAACAGCAACTATTGCGGCTCATTACAATAGCAATGTACAGAGCTGATCGCGAGACGTTTCCAGCAGCGACTCTGCAGCCAGTCGCAGAGCAAGCGTTCAAGGCGAAGGTTGTGATTGAGTCGAGTCT
>CG14309 14206851 14207670|14572 chr3R 14207206 14210908 scaffold_27 1142962 1146983 + 105898|0 526
AATGACTTATAT---TACCATATGACCTTG---TTTAAACTGCCAGCATT---ATAACCGAATGTAAATATATATTTATTTTCAAACATTACTGCATTCAAAGGAATTATATTTG---AGCGATAATTCTAAGGGAATTATATTTTTCAAATAAAGCTATATACAGGACTAAGG--------------CAACGAACTAGACGGGCTTAGACTAAGCTTGTGGTAGATTGTTGAGCATTCTTTATTGT-----ACTTGTGAATATGTCATCTCTATAATAAAATGCATTGAATTGAAAAGAATGTTGATATATTTCAGTGGTATCTCGGTTA---------ATGATATATG-AAATGAAAAATA-----AAATAGATTTTTATCTGACATGTTTATACAATTACCCGTAGTACTTCAAATAGTAA--TAAAGTCTT---GGTCATTAAAAAAGTTAATTACTATCCATTATTATTTTCTACATTATTTC-----------AAGCTCATCATTCGAGCTGCATAACTAG
AA-GATTCTCACAGCTAAAACATTAATTGGGGATTTTGGCTGCAAAAATTCGTAGGACTCAATGTAAATATGTATTTATGTATAA-------TGCAATAATATTATAAAAATATGGAAAGCACAAATTCGAATTG--TTCTATTATTCA--TGAAACTA-ATACGAATCCAATTGATTTGTTGTTTTCCAAC-AACTGAATAAAGTCAAATTTCAGTTG--GAAAATTATTGAAAATATCTAGTTTTTGTAAACTTTTGTA-GTTTCAAAGCCTTAAAAAACTAAAAT--ATTGGTAGAAGAATTTAATCTCGTCAGCAATAATAAAGTTATATTTATACATAATATATGTCAAAAAAAAATATATATAAATAGTATTTAAATTAAAAAATGTATAT--------GTAAGAGTTAATAAAATAAAACAAAATCTTTTAGCTGATTAAAAAATTAAATTAAAGTTAACTTTCAGTTGAAAAACTATTTAGTTTATATAGGAAGCT--TTATTGAAATTATATAATTAA
>CG7678 14212555 14212668|14573 chr3R 14212498 14212588 scaffold_2 3599581 3599661 + 1692|57 90
TTGTCAAATTATTTGGAAAACGCAGCAATATTAA
TTGTCAAAGCATTTGCAAAAT---------TTGT
>Vha100-2 14216039 14216346|14575 chr3R 14215940 14219245 scaffold_27 1150850 1154153 + 171550|99 425
ACCCATCCAAATGTGCTCAAACTAGGGAAACGTGTATACA---ATTATACCCCCAGCCCGAACTATTTTGATTGTTTGTTAAATGTTTTTGTTTTGTTTAATTTTTTGGATATTGTCAGTATTGTGGTGCTCTTCCCACATTTTTGTATCCTCCGTT-GTGTATTCCATTTGTAGTCAAAGTATTCCTCTTTTGAGTTGTGCCTAGTATTCTC---AAAAACCCTTTCGAAAGCAATAATTTGATATTCATTGTTATAAATAACTAATTATACAAATAC-TAATTGTAATAAATATACAGCAAAGAA-----------GAGAACGAA
--------AATTGAGCCAGAGCAATAGCCACACATATATGAATACTATACATATATATATAAATATAATTTTGTTTTGTTAAATATTTTTG----------TTTTCTCAATACTGTCAGTATTGTGGTGCTCTTCCCACATATT----CCCTCAGTCAATGTATTCCATCCGTTGTCAAAAGATTTTGTTAT-------------GTATTCTCATAAAAAACCGTTTC--AAGCAATAATTTGATATTCGTTGTTACAAATAATTG--TAAACTAATAAGTCAGTTCGGTTAATGT-CTGCTTAGAATTTATGTTGATGATGTCTGT
>CG12333 14226091 14226548|14582 chr3R 14224551 14228334 scaffold_27 1159039 1162792 + 100299|1705 2216
AGGCAACTGAAGCGGAGAGCTGCTGCACCAAAGGAATGAGGAG--------------------GCGCAGCTCTGCGAAATCCCAAACATCTCTCGAACAAAGAAGCATC---------------CCCAAAGCGATGCCCACATACTTACATATATGTAACCGTTTATCATAGATCAAGTATTATGCAGACATTGTTCAGGATGTTCTACTATCTCGTTGTCGCCCACTGAATGTAATTAACGTTGCTTTTTGCCAAATAGTCGTGGCATAGCGTGCTGCACG-----AACTACATAT-------------TATCATTGTTATAGCATACGTATG-TATATGCGTTGGGACTGGGCTAAACTCTTCGGAGTGCAGAGCTTCCGATGTCCAGACCCGATTTTATCTGTGTTTTACTACCATAATACATATTATAGACGTCTAAGGCATTAACGCTTTAGCCAACATGAATAAACATAATCAACCACCCGATTCATCGCTGGGTATATCCTAAAA
AAATTACTTAAACGTTGAGCTGCATTCCAGCCACAACCACAAACCATCTAATCCCCTTTTCTCACGTGGTTACTCAAAAG--CGGATTACTCTCGAACACATCATTGACCTTTGACTTTGTTATCTCAAATAGAAACGCGTGTATTTACTTAAAT-------CGCAACGTACATCAAGTATTTTGCGAACATAAACAACTATTTTGAATGCGTTCTTTAT---CCATTGCATGCAAC-----TTGCTTTATGCCAAATAATCGCGATA-AACATGC-GCATATATATACCTATATATATTTATATATATATATCATTGTTAT-TCCCGCATATACTAAATGTGAAATGTGTAGATAAG-------GGATCGAAAAAATCTCCATAAC---------TTTTAGCTGTGTTTTAT-----TAATATCGATCATAAACGATTTA--TAGTAA--CTTAACTCTATATGTCTAA----------------------------GGCA----------
>CG31122 14232353 14233186|14587 chr3R 14231192 14233970 scaffold_27 1163706 1166352 + 52262|1233 2149
ATCTGTA-GCCTAACTATA-----TCTATGTGTAC-TTGTACGAGAGAAAGTTTCTTAGAACCACCAGCAGCATCAGCACTTAGCTTAAGTGGAGTCACACCTACCACGTCCTATATATATTATATG----------TATGTCCAGTCCCTTCGTCCCTT---------------------------CATTTTTTGTACAT---------------------GTATTTATTTATTCCCCTTTT-TGTTCGTATTTTGTATCTTTGAT---CATCGCATTTTTGTAATTCGTCCCAAACTGAAA-GCAAAATCTCATCAGTGCAATAATATACATAATCCGAATATATATATATCTATATATTTATATATATGCGTATTTATATATATGCTGATTTTACAGACCTCTCTTATTTTATACAAACACTCCATGCTATTTATTTGTAATTGATGAAAAGATTTGTGATTTGCGCACATGATATAAAGTAAACATCGTAGAGCAAGCACTGTAATCGTAGCGTGTCTCAAGCAATTTATGTTTTAAGTACCCCAATGAATTTATACAT-CATCCGCACAGACGCATTAATCTAACCAGCCTAAAATCTAAATCACACACACCCACAAAGCCCTCTGATTAAGTATTACTTAGCGT-ACGTAAGCTAACTTTAAGTTGCAACTGGCAAAAAGCAAGCCACAACAACAAATGTACTTTACTTAGGT--TGATCCCCAGTTTCCATCGCAAACTGGGGGCAAAGTATCAAATTTGTGAGACGAGAGCGTCGATAGCAATATAGCAATCAGCTCGTCCAGGCATAGACGACGTAGTTTTCTCTGATTGTGCTGGGCAAGTCAAAGAAGAAGTACTCAATGCAAAT---------GCAAGTGAATAAAGTGAATTTTGCCAATTCAG
ACTAGTACACCTAATTATAAACTATCTATACATACATCATATGCAATTCAGTTTGTTTAAGC-----GTAGATTAAG---TTACCCTCA----ACTCAACTCTCTCTCTTTTTATACCTATTATGTAAAGCTAAGTTTAGGTTCAAATATTGTGTCAATTGTTGTGCTGAAACAGATTTTAATTGTATATTTTTTCTATAATTTATGTTTGATGTCCCAAAAATATTTATTTATTTTTTTATGATATACATTTTTTTTTTGTCTTATACATATCCCCTTCTCATA--TTGTCGAAAGCTTAAGCATAAAATCTCGTCAGTGCAATAATACATCT------------------CTTTTATAATTTCGTATATGCAATTTTTT------------------------------------------CATCACTCGTCTTATTTGGAAT---------------------GCGCACGT-ATTTAAATCATATTTGG--------ACATTTCGATTA----------AGAGGAATTTAAATGA-AAGTAA------AAATTTATCCACGCAAACATAGAGCCGCAGTA-TCCAAACAATATTCAATATAGAAAAGAAAAAC-----------TCTGATTAAGTATTACTTAGCGTTAAGTAAGAATAACTTAAGTTCCAAAAACCTTAAAACACAT-AGGCTTACAAATTCAATTAATCTTAGTAGTAATGCC-----TTTATTGTACTTT------ATTTAATGAATTTTGTAAGATTA------CAAAAACGATTTTGC----------TCTATGTATTGTGTACGTAGTTGAACTT---TGTACTACGAAATTCTTAGTAGCCCATCTCAATGAAAATAAACAATTCGAAAATAACAAAAACGTTCCTTAACAATACAA
>fru 14242315 14242498|14595 chr3R 14242214 14242805 scaffold_27 1176121 1176649 + 23711|109 294
GGGCGTGGCCGGGGCCCAAGTGCAGCCCATCACCGCCAGCTTTACCAGCAGCAGCAACAGCCGCATCATAAGCAGAAGCAGAAG--CAGCAGCAGCAGGAGCAGCAACAGCAGCAGCAGCATCAGCCGCATCAGCAGCAACAGCAACCAGCTTACTACGTCAGCAACTATAGCAACTACAGCAATA
GGGCGGGGCTGG---CCTCGTCCAG-------------GCTTCTACAGTA-----------------ATGCACAGGAAAAAAAGTTCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAACAACAACAACAACAACTACTACTACAACAACAATAGCAA--------------CAACATCTACAACATCTATAAAAACA
>fru 14251658 14251866|14600 chr3R 14251249 14253060 scaffold_27 1185898 1187886 + 31303|507 816
TCACTTCTCTAGGCAGGCAGC--------AAAACAAATCAAATC--AAAAAATCAGTAACAGATCG-AATGGTTTTCACAGCTAAGTA-ACCAAGAATC--------------------------------AAGCAA---ACGTATACGTAATCCAGAGTGAGGAGCCAACAGCC--ATCAGTTGGATGTACATC-------------------TATATCTATATCTATACATTTATAAACCC--TATCAGAAAACAGAAAAAAAA-------------------------------AACAACAAAAAAA
TCACTTCTTTAGATAGTTAGACCCCTGTGACGATATGTAAAACCCTCTACAAGCAATTGCAGACCACCCTCAGTTATATAATTACGTATACCTAGAACCCTAAGAGTTTCCGAGAGTTTCTTCAGCGCTCACCGCAATTTACTTAAAGGCAGGTAAAAGAAATTAACAAAAAAACAAATCAAATCAAATCAAATCGAATCGAATAAAAGGTTTTCAAATTTAAACTTATAAAATCACATACGTAATATTATAATGCTGAAAGATAAAGGTATTCGAGTATTCGAGCAGATTTTAGCTAATTATCAATATA
>fru 14256430 14256545|14604 chr3R 14255946 14256470 scaffold_27 1190622 1191212 + -1091|580 621
TACAAGTAAACCACACACA-AAAGAATCTTCTTCTCTCTGAG
TATATGTATAGTATATATGTGTTTTGTTATTTTCTATCTGTG
>fru 14256430 14256545|14605 chr3R 14256535 14256728 scaffold_27 1191286 1191473 + 9230|0 10
ATGAACGCTAA
-----CGCCAA
>fru 14256949 14257168|14606 chr3R 14256729 14257116 scaffold_9 3164310 3164698 - 83|227 416
ATTAGCATTAAGTTTTCGTTATCAATTAAATGTCCGAAAAGTAAAATATATTTAGTAACCTAAGAAC-----------------TTGGCAGCTACTATGAACAAAAGCAAACAGCATTTGC-ATTGGCGAAAATTGAACAATAAACTGAGAAGCATTAAT----AAAAGAATATAATTATTTTGAAATTA
ATCAGAGCTAAATAAATATTATTAAACAAATGTAATATAAGTTATAAGTAAATAGTTAATTAAGAACCTGTTTACCTGATCCTGTTGGCACCTATCATGGACGCAGTCTAAAAACATCCGCGAATGACCAGGATAATCCATTACATGGAG--GTCTTGATACTGAAATGGTTTGCACGACTTCAAAGTGG
>CG7695 14442476 14442702|14859 chr3R 14442418 14442589 scaffold_6 5890759 5890915 - -515|58 171
CACTCCCTAAGTGCGATTTAACCCACTTCTTTTTAGAGGCACCTTGACCAAAAACAGGATCTGCAAACCAACTACAGAAAAAAAGAAAATGAAAATAAAAATAAAAATAAAAGC
GATT------GTGTGCTGTATCACTTTACGCAAAACAAGGGGCT--------AATAAAATTTGAAAATTATTTGCAGTTAATAAGCTAATAAGAACACGGCTCGTACTATGCAC
>CG7695 14442476 14442702|14860 chr3R 14442590 14443214 scaffold_20 915841 916498 - 16380|0 119
GTCTAGA---TAACAGACTTGCTTATAAAATATAGAAAGAAATAC----ATGTAGAAACTTAAAAATTGTAAAAAAATAACAGCTTAAATTCGATTTTGAAGGACATAACAAGTACAATT
GACTAAAATTTAACAAAATTGGACATACAACATATAAGTATGGGCTTCAATGTCATTGCATAAAGATAATAAAGATTTACCGCTGTATAATCG-----GAATTCCATATCAAATGCGATT
>CG31224 14475843 14476862|14904 chr3R 14473481 14480858 scaffold_27 1464228 1472230 + 220652|2577 3903
GGGGGTTCGGTTCCATTGGGCTAATCGTAATCGAACTAAAGTTTAATATAATCATTACCTAGGTAGTTGTTCATGACTCTTCTATGTGTGTAC-----TGTGTGTGTCTGTGGTTAAAACAACAAAACAAAACAACAAATTAGTATTACCTATCG-AACTATATATTTAGTTA--------------------ACATATGCGATTGCCAATTCTTGTTGATTAA-ACCAACAAGAAACAA------TTATCACAA--------TAATTACATTTTACTAATCTTACATTTTGGATGTGGTTTAAGA-ACGTAGCTAAATGTGAAAGTGTT---------------------CCCCATTCTCTTCCTCCGGATTCG--------------------------------------AATCACAA-----TTCGCGTCAACCGCTTTAATCCCGTTTAGGTTTTAGATTCTAACCCACTTTAGTAAAATGTTATACCTAGTTCAGTGCAATATACATCGATTAAAT------ACTATATGCCGCGATACTTTTTCATTTCTATTTTAGT---------AGTTTAGTTCGCATTAAGTTTATTCATTTATCTTATCTATCCACG----CCTAGAAGAGCATACTAGTTAATTTAAGTTAGCCGAAATTGGTCTTAAAA------------------------CTTTCGAGTTTTTCCAGAACTTGAGCACATTCTAAGC----GAAGGGCACATACACAGAAA-------ACGAACACCCATCTA----ACAACT--------------------------TGTTATATAA----TTTGTATTTTTCTAATTGA--AGAGAAAACTCTCTGCCAGCAATCGAACGTAAGCGAACACAACTGTCATATTGGATAACAA------------------ATTTCGATGTACGTAGCATAT-----------------------------TTTTGATTTATAGTAGTTGCAACTTCTCTAGGCTATTTTAAAGGATTGTTT-CAATGGTTTAT----TGCAGC-ATTAGTTAAAATTTGTAGCTC-TAAGTGAACCCAACATTAAGTATAA-----ATAAAATTTCAC--AATACATGCGTACATGCATCATAATACGA------------------AAACAAACAAATG-AAAACAAAACAATTTTAAAATATTTACAACTTACGATAAAGATTTCAATGAGAACTAATGGAAA--------------------------GAATCCCATTCTATGAAGGAAATAAATTCAATTTATGGATAATTACAAAA-----C
ATCAATATACTAAC----GACTAATCG--ACTTATCTAAAGTTAAAT----TCATTAATTAGCTAGCTGTTCATGGCTCTTCTCTGTGCATGTATGTGGGTGTGTGTATGTTGTACGTGTGTGTTAACAAA--AACAAACTAGTATTACCTATTGAAACTATATATATATATACATACATATACGTATTGTATACATATGCGAATGCCAATTCTTGATAAACAACAACAACAAAGATGAAATCAATTTATCATAATATAATATTAATTACATTTTACTAATCGTACA-TTTGAATGTGGTTTAAGAGACTTAGCTAAATGTGAAAGTGTTAACAGCCCCTTTGATCCCACCCTCCGCTCCTTTCCATCACACACGCACACACCCACACGCACATATATACACACACACACGTTAAACACAAATATTTTAAAACAAATTGCTTTAATTTTTGTTTAGTTATAAA-CATAATTACAATTAGTGAAATGACATGCCTAGTTCAGTGCAATATTCATTATTATCATCATTTAATTTTACGCCCTAATATTAAAACATCTCAATTTTAGTTAAATAACACAATTAATTTTAATCATTTGTATTTACTTATCTTATCTATATATGTATTTATACATACATATATTTTTATGTTTAACTCGTTTGTAAAAGGCAACAAACAAATCCTATATAAATAACATTATTCTTTTGAGTTTT--CGAAGCTTGAGCACATTCTAAGCCACACAAATACACACACACACACACACACCCCTAAACACATATATAGTACACAACCAATTTGCAGGAGACCGTTTTCAAAAATGTTATATAATTATTTCGTATATTTTAAACCAAACAGACAAAACTGTCTATCAGAGATCGAAAGTAAACGAACACAACTGTCATATTGAATGAATATACCTAAACGTAATTACCATCTCGATGTTTCTAGAATATATATATATATATATATATATATATATATATTTGATTTTGTAGTAGTTGCAACTTCTCTAGGCTATTTTTAATAATTGTTTGCGATGGTTTCGATTATGAAGCGATTAGTTAAAATTTCTAGTTTGTAAGTGAACACACAACACAGCATAAGCATTATGAGAATTAATTAAATACAT-------TACCTTATAATATGGAAAACAAAAACAAACAACAAAAAAACAAACGAAAAACAAAACAATTTTCAAATATTTACAACTTAC-ATACAAATTTCAACGAGAATCAATGAAAACAACAAAACATAAACAAATACAAAATAAAATTCGTTTTGTGGAAGAAATAAATGCAATTTATGGATAATTATAAACATCGTA
>CG7698 14486839 14486880|14914 chr3R 14485344 14489791 scaffold_27 1477012 1481552 + 204919|1575 1622
AAACC------ATTCTATTCCGCTTAATAAATCTCCTTGTGTTGAAAT
AAACCGAGCCAATTTCAAGCTGCATGTGAATCCTCTTTAT-------T
>CG7705 14500398 14500850|14921 chr3R 14498128 14500549 scaffold_27 1485625 1488086 + 60502|2375 2535
TTAAACTATTTG---AATCGGCAATTCGTTTTGAC----ACTTGCGTTTAAGGAACTTAATTACACTTTTAATTAAAAATCATTGTTAAAAAAAAAACATAAGTTTGGCAATCACGTTACCGATATATGTATACTCTATGTAA--AGAACTGTAATTGAAA
CTAGACTTTTTGTTGGACTAAGGATTTCTATGGACTCAAAACTGGATTAAAAAAA------TATACAATATATTTAAAATGGTTG-------AAAAACATTAA----ACAATAAAAATACAAATATCTTTGTAAGAGAAGTAAGTAAAAATATCTCTGCAA
>CG7705 14500398 14500850|14922 chr3R 14500559 14501982 scaffold_27 1488374 1489817 + 50004|0 312
ACGGGCTGGCTGGCTGTTTGTTTTGTTGTTCACTAGCCTGTTATCTGGATATTTGCTCTGAATAGTTTAAGCTTTTATCATTTATCTAGCCAATTGGAGAGATAGACCGCTCGCCAAGCGACGCC-ACATCACCCCGAACACAACTTTC----TGCCTTTCGGTTGTTCC---TCGTTTTGATGTTCCCTA--CCATTTTTATAACTAAA-----TAAAACATAGCAAAACAAAATAAAACAAAGCAATG-AATAAATGTTATTAAGT---AGGCCAACTCTACATAAT--ACATATGTGAAAGCAATTGGAA
AC---CCAATTAGCTA------GTGTTAGTCAC------ATTATCTCAATGTTT-------ATCATTTCATC-TTTATAATGTAT-------------GAGATAAGCGGCCC----AGCTGCGTCGAAAGCGCCTTCCACAATAGTTTCTTATTAACTTCTGATCGTTTCGATTTCTATTATTGTTTTCTACTCCCCCTTTACATCCAAAGTCACTTCAAATTAATAAACCAATTT---ACAGAATATTGTACTAAGTTCTAGTATGCTCAAGTCCTACAGTAAATAATTGTCGAATCTCAAAATATTTGGGA
>CG7705 14502532 14502607|14923 chr3R 14502321 14503138 scaffold_27 1489820 1490618 + 36275|211 287
TCCAATAGATTTCAATTTAATGAATTATATATATCTAA-TCACATTTCGTTGCAGATCCCGTCAAATTGAGCGCGCT
GTGCATCAAT---AATACAAGAAGACGAATGTCCTTAACTTGGCTATCCGCGCAGATCACGTCAAATAGAGCGCGCC
>CG7709 14513308 14513535|14929 chr3R 14513287 14515090 scaffold_53 234094 235959 + 30965|21 281
-CAGCCACCG--GCATCACGCATACG------CCACGTGCCTTCGAATACTCAACCACCACATCATA----TCATCGCCGTCGCCATTGTAAATTATTCC-------------CCAAAATGACAAGCAACCAATTCGCCCATTCCTCTTATACTCCTCCATGGAAATCTAGCCTTAATTCACTGTAC--------CATTAGATGTAAAACAACGAAACAACGTTTGTGTTAAATAAACAACTTGATGAAGATCATAGAAGA
ACGGGAGTCGGAGAATCGGGTAAAAGATTCGATCCAGTGCCTTAGAATACTCGTGCCCTCATCTACAGTCTCCCTATCCGTCCCAGCTGCATTTCATCCCAATTCATCCGCTGCTCAAGAAAAAAAAAACTAAACCTCAATTGTAAATTATTCGCATCTTGAGAGAACTCGAC----CCCGCTGTACGACCCCAATATTAGTTGTAACA---------------TGCGTTAGACATAATACTT-ATCAATTGTTTAATAAA
>CG7714 14551116 14551313|14980 chr3R 14551103 14552557 scaffold_53 284487 285795 + 6461|13 256
GTCCTCGAGT---------------------TGATTCTATCCAAAA---CCCCAGATTTTGTGGCTGAATAAAGTGTT-----------GGCGCACACACACACACACATTATGAAAAGGAAATAATTTTTAGTT----TTTAACAGCACCATAATAAG--TTTGATTACAAGAAAATCTGATTGTAAGCTATCAACGATAAAAACGCATAGACATATATAACTGTTTTTTGCCAAAAA-----
TCCTACTAACCATTATCCACATGCACATGTATTAATCTATACTTAAGTGCACTTGCTTTTGGAATTGAATAAACTTTTCACAGTGCAATGATTGACATACATACACACCTTT------GCAAATATTACCCGGCCAGGGTTCAAAAATATTTCAATTGGGTTTTCTTTGCGCTTAAGTTT----------TACCAATTGTAATAA---GTAGATAT---TCTCTGTTTTTTGAGTAAAATTCTT
>CG7715 14553293 14553406|14981 chr3R 14553235 14554353 scaffold_53 287172 288280 + 26996|60 200
ATCCCAATCCCAA-----TCCTAACCAAGATCGCCAGTTCAATGCCC---------------------ATCTTTCAGCAAGCGGAATTTCATTCACTACTCTAAATAGCAATCTAAAGTAATTAAATATC-TAACTGGCAA
AGCTCGGCTTAAAGAGGCGCCGCCTTTGCAGCTCCAGTTCCATTCCCGGAGATTTAACAACTAAAATTAATGTTCAACAAGCGGAATTTCATTCAAAACTCTAAATAACACCC------AAATAAATATCTTTACTGCAAT
>Mekk1 14558755 14558999|14985 chr3R 14557717 14559350 scaffold_53 292613 294021 + 18445|1071 1318
GTGCAACGTGGTGTCTACTTAACTAGCTTGCGGTTTTTTTTAGGCGCACCCCTACATATGATGCATATGTACATCGGTGTGGATTTTGTTTAGTGTCTAATTTATGTGAATGTCGATTATTTGAATGCCCTCGTCTGGTTTTATGTTGGACAATATATAACCCGTATAAAATAATCAAATGCCTTTCCGTACCGTAACCCCCACAA---TTCATTCGATGCAAGTGAAAATTACACGTATTTTAATAT
ATCTGATCCGGCAGTTAGTTAA-------------TCCTAATATCGCACACACACATAC-ATACTTATGCTTATGTGTGTGCAAAT------GTGTGTAATTTATGAGAG----------------GTCGTCGTTT--TTGTATGTTGGACAATAAATATTCC-CAGAAATTGGACAACTTCGAATTCAAATTGCAAATTTATTAAACTTTCATACGCCGAGCGT-----------ATATCCTGACCC
>CG7718 14569786 14569972|14996 chr3R 14569832 14571575 scaffold_20 2418842 2420566 - 82362|0 143
GCTCTTCGATATAGTAGTTTAATTTTTTTCGTTC--TTTGTTAAGCCCCATATCCCAGGTAGTTAATTTAGTTTTATAATTCGTGT-TTAATCTTTGCCCTGGGCAAGTGTTTCTATTGCTGGTAATTGTTGATTTTGTACACA
G--TGTTAATATAG----TCCACATACTTAGTTCAATTTGTTGATCTTAAG-----GGTCAGTTACTATAGTCTC-CAATATGTGTATTGTTTTCAGTTCTGG----TTGTGCATATTGCTGTAAA---TTAATTTTTTACTCA
>CG14299 14580309 14580751|15002 chr3R 14579724 14584771 scaffold_21 1267909 1273066 + 164381|597 1039
GATTGCACAGAATGGAAGTCAGCACCTAAGGGATCAGCCTTAAAAGCTTTCTTCGGTGGACAGTCTGTGTCTCGCATTCCCCTAATCTCGCCCCAAAACTGCTGGTTGAATTTAGTGATACTCGAGATTGAGTTCCGTCTAGTGGACACGCGTATCTTTCCCGAGCTTTTGCGACAGATTTCCGCTCAACCTGTGGAAGCGGCTCTCAAAAAAACCATCTCATTAAGCAAAACTAGTGCCTTTCCCGCCAGCCAATTGGTGATATTTAAATACGCTCAACTGCTTGCTAGCATGGAAAGCACTCACGCTTTATTTCCCATCGTTTGCCAAAAATTTTTCGAACTCTATCTGTGGCGAGTGCCGACAGAGAACGAATCGCTTAACTTTAGTCACAATTTCGGTGTATCCGACAAGTTTTATGAATACAATGTGCCTTTGATGAA
GACTGCGCCGACTGGAAGACACCACCAAAATCTTCGGCACTAAAAGCACTATTTGGCGGTCAGGCAAACTTGCGTATACCCGTGCTCTCGCCCCAGAATTGCTGGTTAAATCTTGTGCTATTAGAGATTGAATTTAGGCTACAGGATACACGCTTTTGGCCAGAACTCTTGCGCCAGCTTCCCACACAAACGGTGGAGGCGGCGCTCAAGAAAACTCTTGCGCTCAGCAAGACGAATAGCTTCCCGGCCCAGCAGCTGGTCATCTACAAATACGCACAGCTGCTGGGCAGCATGGATGTCACACACGCGCTCTTTCCGATCTTCTGCCAGAAATTCTTTGAGCTATATCTGTGGCGAGTGCCCGCCGAATGCGATGCACAGCAGCTGAATCAAAACTTCGGTGTCGCCGAAAAGTTCTACGAGCACAACGTAACTCTAATGAA
>CG14299 14580821 14580896|15002 chr3R 14579724 14584771 scaffold_21 1267909 1273066 + 164381|1113 1188
CAGAATGCTACGTATTTCGTACCAGTTTCCCGACTGCCGTGCTCAGGCAGTTGAATTTTTCTACAATTACTACAAG
TAAGATGCTACGAATCGCCTATCAGTTCGCCGATTGTCGAGCGCAAGCCGTCGAGTACTTCTATAACTACTACAAG
>CG7720 14584956 14585189|15004 chr3R 14584923 14586696 scaffold_21 1273417 1275199 + 57796|33 356
GGGTT---------------AACTATGTTGCATACGTAGATAGTCTGACCCTAAAACTTAGTCCGTAGT------------ACGTAAGCTAAGCCGTAG------------AATAGAGCAAGTTAGTTAGCCA-----AGTGTTTCATGTCTATAAAGATGCTGTGATT--------------TTCTGTGCGCG-ACTGT----TGTTGAGCAATTGCTCGCG-------------------CATTTCA--TTCGCATGTACTTAACGCATATGTGTGTGCGT-GTCAGC--ATGCAATAAATAAAGAC--AAATAAACGT-AT
GATCTACTGAAACCCTCCGCAAATAATACATATATGTAAATG----------AAAACATAGTCTATAGTTAGTCGTATAGGTCGTAAGCTAAGCCATCGTCTAATCTAATTAATGAGGGAAGTTACTCATACACCTTCCGTGTATCAAGTCGATAAAGATGCTGTGATCATTGTACAAGAGTATACTTTGCGCATACTGCAATATTTTGAGAGATATTTTGTGATGCGTAGTGTAGAAAACCAATTTTATGTGTGTATGTACT-------TATGTGTATGTGTAGTAAGCAAATGCAATAACAGAATTTTAAACTAAATATAAT
>CG31226 14677025 14677098|15112 chr3R 14677007 14677106 scaffold_7 3745 3847 - 1176|18 104
ATCTCTTGCAAGGAAACTAAATTACCG----TCCCACATGAAGAGAGAAATGTTAATTA---------AATAAAGTGTTCAAAATAC
ATCT-----AGGGAGAAAAGCTTACGGCTACTATCATATGTAGCTCTCAAAATTATTTATGTCCATAGAATACAGCGTTCAAGATA-
>CG31226 14677152 14677213|15113 chr3R 14677139 14677391 scaffold_7 3883 4169 - 6649|13 91
TTTTTGTCATGAGCTG-----------TAGGATTGAGCTACTTTC----TCACACGGAAAAATTGGAATT--GCTGAAC
TTTTTGTCTTGGTACGTTAATTTCATATATCATTTATTTAATTTTACTATCAGTTGGTAAA--CAGAATTACACTGAAT
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TAATACCCTGGAGTCTTCCCAGGATCGCTGGCAGGCAACGAGTCT-GTTTTCTTTGCACCCAGTGCTTTCTGATGTACTTTAATTAGACAGTCAACTCGAGACCCGTCA
--ATCTGATGAACTTTTGCCCAAATTGCTGACGGGCTAAAATTTTAGCTCTGCTTGC------TGCTTT--GTTGTATTCTAATTAGACCGTCGGCT------------
>CG14292 14730655 14730746|15180 chr3R 14730475 14730695 scaffold_21 1444349 1444548 + 2109|194 234
GCAATCGACCAACATAGATGCAATAAAATTTAAATAAGCCT
GCAATATACCAGCATAGATTCGATATACTTAAATAAAGATT
>CG14292 14730655 14730746|15181 chr3R 14730740 14732325 scaffold_21 1444588 1446167 + 18745|0 6
GATTCTA
GACACCA
>CG14291 14736766 14736981|15184 chr3R 14736945 14738809 scaffold_21 1451500 1453358 + 87135|0 37
GTCTGACTAAGAGTATTCAAT-AGATTGGGTGTGTTGT
CTGAGATTAGGGGTATTCGATAAGATCAAGTATTCTAT
>CG14290 14752813 14753219|15194 chr3R 14753088 14754327 scaffold_21 1492683 1493649 + 12888|0 134
ATGTAATCCTTGCCCCGAAATCCACTTCCCCGAGACGCGACGCGCGAAGCCACTTCAAATGTTTACCCAACAGCAGC---AGCTATCGCAATTTACTGCCACCACACGCAACGAAGATCTAGCAAATTGCACTGC
ATGACAAC----------AACACGGCTCGGCCAG------CGCGCGATACCTTGACAAATACCTGAACAACAACAATGAGACCCACTGCAATCCAATCAGTCGACACGCAAC--AGCCCAATATAATTGCAGTGC
>CG12269 14803989 14804096|15247 chr3R 14803918 14806604 scaffold_15 20643 23363 - 120617|71 200
CTCGGTGTCAAAAGTAATTATGCATGCATTT------CGTTTATTATATGCGA--CAATTTAACGTTTATTGTTTATTC-------ACTTCACCCCAATAATAAATTAT----AACAAATT---AAAATA
AAC--TGAAACATTTAATAATGCATTTTTCTACAAACCATTCTCTTGGTGCGAACCAGTTTGATG-TTATAGGCATTTCAAGCTGTATTTAAAAGCAAAAATAAAATATTCTCAACATTTTTAATAAATT
>CG5451 14804697 14804784|15247 chr3R 14803918 14806604 scaffold_15 20643 23363 - 120617|851 962
ACCATATAAGCAATTGACTTTCA--CACCTAGTTAGTTTTAGTTGGTGGTCTT--ATTTGAGCTGCCGAAATATACCT----------ACTGACC----------CCAAAGC
TTTACATAAGCGTTCATCCGCTGGTCATATACTAAGTTTTATTTAGTAGCAATAGAGTATACCTATCAAAATATATGTATCTAATTGAACTGCCCTTTAATATTATCCAAGT
>CG5454 14808678 14808824|15251 chr3R 14808824 14809262 scaffold_20 2264276 2264711 - 24322|0 0
A
A
>gatA 14851890 14851923|15292 chr3R 14850835 14851908 scaffold_47 639193 640266 - 47073|1069 1087
CTGTTTAATTGTTACAAGG
CTCATTTGTTTTAATATGA
>gatA 14851890 14851923|15293 chr3R 14851909 14852952 scaffold_21 1030329 1031368 + 52839|0 14
AGCTTTTAATAAATT
----TTTTATAATTT
>Prp18 14855690 14855892|15296 chr3R 14854891 14858565 scaffold_41 857682 861219 + 126368|804 1044
ACTTGAGCT--TTATGTTAGTCATTATTGTAATAACAATATCAAGCGTTTAACTATATGTATGTGTAGAGA---------GCAAGGGGATGTTC----CGGGGGATTACATTTTCACTTCTTTCCCAGTTCAGCAGAGCGCTGTGACGACTTT-TCCACGGCGTTTATTAAAGTAGACCTGAAAG----------------------CACGAAAGAAAGCAATAAAAAAACAGTGTAATGT
ACATGAGTTGATTATATCACCGGCTTTAGTATATTTAATGG-AACTGTTTGTC---ATGTATGCCTAGGGGAGTTTACCTGTAGAGGGACACACTCAATGGGTGGGGACACTTT-ACTTTTTGCCCAGCTCAGCTGAGCGTAATGAAGAATTTCTCCACGGCATTGAATATCGTAACCTTGCCAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAAAGAAAATGCTATCTAATTGGTTTTTCTC
>cdi 14870604 14872338|15309 chr3R 14870414 14871030 scaffold_41 871800 872430 + -2174|224 666
TGTAGATAAAGTACGATATGTGTACATATAAAGAAGAT-TGTTATGAAATTTAAGTCGTCCATTTGATCATAACACGTCAACCTCATTGCATCGTCTTGTTAATGGGTTCTAAGTAAAGCCAAAC-ATTAGAAAATCATGAATTTAAAATTCATTTCCGGTTGCCAATCAATCATTTTAATGCACTTTA---CCGACCGACTTGGGTCGATGACGAATAAGTATTATATATATACATATATTATTATCAACATTGAAATCGCAGTCCATCCCAGACACAAACGAAATTAATTTCGACTTTTAATAGATGTTAAAACAACGTAAATTTAAAATCGAAG----AACGAAAACATGTCAGGCAAACAAATAATTTTGTAAAACT---GTAAACTGAATTAATG-TACTCGTATAATAAAGATACTGATATAGTAAATCCACA---G
TGTAGATACAC----ATATATGTAAGTAAGAGAAAAACATATGTTCAAGTTTTTATGTTACAT---ATATAAAAATGTTGAACAAGGTGCACGCATTTATTAA-GTGCTTTAATTATATCGATTTTATTATATGTACATATATATATG-TTCATTTTACATT--TAATAAA--GTCTTGATACAAAATAGAGCTGAACGAATGGAAGAAATGCTGCGGATTGAATATGCGAAACTTTAAGCTTTTACGAAAAGTGACGTCACTTTTAAT---------------AATTGGTAT--GCTCTGAATACACTTCCAAAATGCGCAACCTTTTCAACAAAGCGATAGTATCGATACTTTATGCTTATAAATGATACCGATAGATCATGGTAAAATTAAGTAACGATAGTTGTGAACTATCGATGACAAATTATTTAATATACATTTG
>cdi 14870604 14872338|15310 chr3R 14871040 14873218 scaffold_73 148 2271 - 32900|0 1412
CTGTGGTGGGGACCTTGTGATGAAAACCCCGACCTGATTCATATTTAATAACTT------ATTTCTTCGATT-------CTTTGAGATTTTTATCCCCATACACGATTCCTTTATACCTGGCAGTACCACTTGATAAAAATACAAAAAATAATCGCAAATAATTTTGCCCACAAAAGTTGGTTAGTTTACGATGCCTAAAGGTTTAATTTGTAAGTAAATAGTTATTTCCTTATTGTCAAGTGTATAGAGCGCAATTGTAAGTAAGCCAAAATGTTCTACTAAAAATTATGCACGCTCTTACAATAAGAAACCCAATTTCGTTTGTATAAGTTGAAAAATTATATATAA------TTACCATTTATAAGC--------ATATAGATAAACATAA---------------------TCATACGTCGTACTGGTTCCTAGTCCTTCAAATTTACTTCGCTACATACATTATGCTAAATAGCGAGTATTCAAAAACCAATCATGGAAAGTATTTATTCTTAATAATTATATCTGTCGCTGGTAAACTCCTATGAAATGGCATAGCTGTTCTTTATGAATACATTTACATATAATTTTAAGTTTATCGCGCTATTTAT-----------------TTGATTTTGTCTAAACTCTGTA-TAAAAATATTATGTTTAAAATACAATACAAC-------AAATATACACACATTTATACATAAAATGGCATATTGCAATGTATACATTTTACCTGTAACGATTAATTACCGCGTAAGGTCCAATTTAAATAATTACATAGACTTACCGACTTGAGGTTTTAAGACTTAAAGCCCCCTTTCCCTCGAAAATTGTACAGATGATCCCGGATCGATTTGAGAAGCAAGAACACTTATCATTGGCCAATCCCGTTCGGCTTAAACACGACTTATGACTTTAGTTTTAGATTCATACGTTACAAATATGTGGGTATCTGCATTACAAATAAATACATAAGTATACATTACACCCAGCAGATCAATTTCATAT--ATTAGCTGATAAATTCAGAT-TTTATAAAGAGTATTATGGGACATGATCTTTTGTTTTATTTATTTCTGTATGCCCTTTACAATCGAACTTAC------ATATATTTGGTAAATTAAATTTGGCTGCAATTAT----ACTTCAATTATAACATATATTGCAAGAGCAAGGCGAAGACTGAGCCATCATTTTTCAATTGGCTAGTAGTTTCCATTATACTGATGATAGGAAAATATATCCGTAAATTGAATATATTATCAAGAATTCTTTAGGAA-------------ATAATGGCT---CCAACTGAAGCATCTTACTTTACCAACTTAGACACTGTTGAACAGAAAATTA------------AATAATTAATTAAGATAAGTGCGAATTC
CAAGGTGGCTAGCCATATTGAGTTAAACTTAACTTTATATTTATCAAGCAATTTTAAAAATGTTTTTCGGTTTCTTTTACTTTGGGAATTGTAT---CAGGAAAAATTCTTTAACATTTGATAG-----CTTGATCAGAATACACCAGGATTGCACACGAAATGTTT--------AGTTGTATAGATTTTTGTGTTC-----TCTGCTTTCCATTTCAATTACCATATCTTTCAC-----------------CAATTAAACGTTGGCACTAAAATACTATT-----TTAGATATATTTTTATAATAG-------AATAAAGTTTATGAATATT-AAAATTTAAGTATAATAGGTCTTTCAATTCATATGTTCCCAGAAGTATGTATAAAATTAATTTGATTTCGGAACATTTATTTTATATTTTGTAATGGTTCCTAGTCCTT----TTTAATT---TAAACAAATC-TAGTAAAT------TATTTTATATTCAATCAAGAAAAGTATTTATT-TAATTATTTAATTGTATTACTTTTAAACTTCCG-AAAAAAGCATAACTA----TAATAACTATATATATCTGCATGTTTGTATTAATCATACCTTCGACACAGAAGAATGGTAATATAGGTATTATAAAGAAAATAAAGTAAACATATTATTTCAACAGAACCATGCATCAGTAACTAAACATAATCTCTATTATCATTAATACCAAAATTTT---TTTAGGCATGTCCCCTAT-----TTAATCACCGAAAATAACTTGATGTGCATATTAGTGTA----TACCATTTGCAGCTGATGCCAATTAAAAATAT-----------AAATTGT----ATCTTCCTGCCAAAAGGTTAAAAACTACAATATTAAGTA---------CATGTTCATTTTAAAAACGA--TAAGAGATTTATTTAAGA----------AGAGCAATTTGTGTTTTTG-------------TACATATGTTGTAAGTATATTTATTTGTACATTTTCATATAAATTATTTGATATATTCACATATTTGTATATATATATATATAATAATATTTATCTATATATATATAGTGACATATCC---ATAGTCGCACCCACCCTTTAACATAACTTAGCACATAAGCATAAGCACAATTATAAACATTTCTAATATTGTAAACA----AAGAGCCTGGTGATAAC---ATCGACATTGGTCAA-GATCAAACTGTCCCCCTTTTGGTAGACATA-AACAATTCACCCTAAATATCACGCCACTGTCAATGTTCCCATCAGAGTACTATCCCACGCATAATTGCTGACGCAGCTCAAACTTCACTCAATTTTGACTCAAACTCTCTCAAAGCGAAGTTTGCTAAGCGACCGCAACAGTTAGATAA-ATTAGTTCATATTC
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TAAACTTTTATTTA--ATTAAAAAAATGTTCAACTCAAG-TTGTCATACAT
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TATTTGAATGTGTATTAAACTGGAAATGAAATAGCTTTAAATGTATAGACAAA
TCTGTAGGTGAGTGCTAAAAGGGAAATGAAAAATCTCCGAAATTAGATACATA
>CG5629 14964788 14967317|15384 chr3R 14964841 14965397 scaffold_4 130355 130931 - -1196|0 622
TGAAAG-----AATTTCAATAAAACAGAAA-----ATCAAAAGTTCAACAACTCT---TCAAGTCATCTACATATATGAAATC----TATTCTCTATACATACAATACATGTACTATATTATCCAAGAGGGGAATAAAACCAAGTGAAC--CAATTCGTT--------AAAGTTTCAATATCCAATTTGGACCAACCGATAAGAACAAAATTAGAAAA-----AAATACAAACAAGCTATAATTAATGACGAATATATATATATATATATATGTATATG------TGTATATCTCGATGTATACCTTTAAATATAAAACGAAACAAAGGAATTTCCATTGAATATTTACTCTCTACAAGCATTTTGCCCTCTAAGCTAGATACATAACTATTTTATTGTTGAAAACGAAAACAACTAAATCCAATTGTACGCAATGCAGTTTTGGTCAC-TGCACCTGCCCTCTTTCTTACCGGAATCCATGAGCTGTTTAAC-TGTAAAACTGTTGTAAAATGTTTACCAAAAAATGTACCATATGCCGTACTAAGGTCTA------------------GTATCCATATACATATACATCTACAAAG--------ATACATCAATATATATA
TGTAAACCTGCATCATCAATCATATACATACATATATCAATCATATATACATTATATATCAAGTCAACGGCAGCTGCTAAATTAATATATATACTATATATACAATACATCTAACACATTGTCACGGAGGGG-TTAACAAATTGTGAATTGTATTTCGTTTCGGTTGATAATTTTCCTAATCAAATAT--ATTGAACAGTCTGACGAACCTTTGGAAAGCCTTAAATGCAATGTTGTAGAATTTTTGGACAGATTTTTGTTAACATAAAGAAAAGAGAGCCAGGTTCTATATTT---TGTATAGATGTTAATTGAGAAAGAAAGAGAACGAT---------ATGTATAC-----ACAGCTATTTTACAAGCGCCAGTAGATGA------GTTTTAGGGCAGGAAAC--AAACAAACACACATAAACACACACA-------------CACACACACCCACAAACATGCATACCTATTTTCA-----TATAAAACATACAAATCACATTTAAAATGTTGAGAGAACAAAATGAAATAAGTCATAATATTGTGTATGCACTTTAATTAATTATACACACATATAAAACTATATTTAAAGAGCTCATCTTATATATATATACATATA
>CG5629 14964788 14967317|15385 chr3R 14965398 14965738 scaffold_1 1903137 1903511 - 968|0 394
TGTGCATTAAAGTATAAACATAAAAATTCAGTTTGCCAACATGAGTTGCGTACAATAAAATATGTATAACTAGCCAAGTGTGCGAACAAGATGGCAGC-------TGCGAATGGATGGTATTTGCTTTTACTGGCAAATGGTGTTTTT----------------CTTTCTCAATGA------GTACTAAGAGAGAATACTTA-----AGCATGCCAACCATAAATAAGCTACTTAAATACCAAATAAGTT--------TTCGAAACATACATGTAAATTCGAGAAGAACC-TCTCCATATCCGTAACTTAGGACTGCATTTGATGAAAAGGTCAGTC-----------CCTGATAAATTCTTAGTGAAATTCAAGATTTATTAAACCTAAGTACA
TGTAAATTCACATTTAAATATTAAAAGT--GACTGTCAACTTTA-------ACAGGAAGTTGTATGTTGT------AGTGAGTACAAAAGCTAGCAACAATGTATTTGGTATGGATGTATTTTCAATGCACAAGCACATTGTGACCTGTAAAAGTAACTGTCAACTTTCACATTAACGTATCGATCTCAGCAATAATAATAACTAGCAGTATGTAAACTACGTACAAGCTATTCATTTTTCAATTAACATGTAACTGCTTGTTAAGGTGATTGTCAATTTTAACCGAAGCGTGTCTAAGCTAGCAAC-----ATTATATTTGTCATAGAAGCTACTAGCACATTGTAGCCTGTTAAAGTGGCAGTGAAATTTAACATGAACTAAACCTAAACATA
>CG5629 14964788 14967317|15386 chr3R 14965922 14966169 scaffold_33 20698 20927 - 3309|0 259
TGGAGTTGTAACCACTTCCGTCCCGCCCGCATTTGTGGTTTAA---TTTTTCCAGCCCACAACTATGCAGTGCTTTGTGTGTGGCCGGCAGTTTTGTTTTCGTTCGTTCTGTGGGCTGGGCAAAAAAAAAAATTCACATTTCTTTCTGACGTCGGCTTTTTGTGGGTTTTGCTGGGATGGTTGGCTGGGTCTCTGCGT---------TGTTGGTGCCTGCATCAAATTAAATTTTATTGCGCTCGCACGCACCGCAAACA
CAAAGCTGGCGCCACTTCCGG-----CCACATTTTCGGTTTCGGTTTTGTTTCAGCCCCAAACTAGGCAACATGTT---------------TTTTTTTTGCGCTCGTACAGCAGCTGTGGCGTAATATTTAACAACTTTTTCTCTTTAATG-------CTTGTGCG---CGCCAGTAAATGTGTTTGCGTATGTGTGTGCGGGTGGGTGTGTGAATGTGCAGCAAATTAGATTTTATTGCGTTCACACGTACAACACACA
>CG5629 14964788 14967317|15387 chr3R 14966195 14967207 scaffold_33 20942 21980 - 10129|0 1153
TTGCGTGACCAGCTCGCATTATTGCCGTGTTCTGAATCCGGGCACGCCAGGCTTTGCCCGCAAATATTGAGCAGGTTATAGTCCATAGTGTATACTGGCATGTGGATGACAGACATTTACATTCGATTCATCCTTGCCCTTGGACTTTGAGTTCCCGCCACAATT--TAGCTATCTATTTATGGTCGCGCCTCATAATTGAGGTGGCACCGCTCCATTAGTCCATTATCCTGTTGTTATTATTATTTTGGTATTAGTTAATGTATTGGCC--CTATTGTTGTC---CTGAGAAATGATGTCACTTGTATGTATCCGCCATTCCCTTGGCTCCTTTTCTTATCT-TCCTTTGTCTGCCGGCACGTTTATGTCATCGAGTATACGCAGCGTGTTGCGCAGA-------------------CATCAATAAGCGATTTTGATTTATGTTTGTGACAGAGCTTATGATGCTTATACATTTAATGAAGCATCGATCGATCCGGCGAACTGGAATTTAAAT---CCCACAACACGTGTGTTTTGATATCCTTA--AATCGAAATAGCGACAGA----------GTGCATGCAATCGCAATTTGCCGGACGTTGTGTCCCTGGACAACTGGTGCTGTGTGTCAGTGGCAGGCGACGCGACAATTGATTTGC-TGTTTTGCATA--------TATGGGGTGGAAAAGAGTGGCA------GCTTTGCCCGTCTAATGTCCTTGTCGGTTTAAATTTATGGCGGC-------CCAAGCCTTGGCGCCTGTCTATCCGAAGCAGGTCAAGTGCCACCGTGCCAAAGGTCAGCTTAAA-------GCACCTCAAATTGAG--TTTGAAAGCGGC--------------------------------------------------------GTAGCGAAAGCTAATTAACAT----CCCACACTCACACAGGCAC-TGAGTTATTTCTTGGCCAGGCTGAGATAG-ACTGGCGCTGGGCATGGGTTTCCACATCCGTAAC--TTCAGGGTCCTTTGCGGACGGCAGCC--TTTCCACATTTTTATTGCATGTTATGTCGTTGCCACACGC--CCGTCGGCCATAAGCTCCATGCCGCCCGCCTAAACGAACCTCTGGCGAAGGGTTG
TCGCGTGACCAGTTCACATTATTGCCACGTCCTAAATCCGGGCACGCCAAGTCTCGGACGAAAATATTGAGCAGGTTATAG--CGCCATGTCCATTTGCATAT----------TTTGTACGTTTAATTTGTAGTTGTCTATA--------------TTAACGGTTAATATCTATCTTCTTATGGTAACGCCCTA-AATGGA--------CGCATCATAA---------------------------TTGATGATGGTTGA---ATGAGCATGTTATCGTTGACTGTTTGAAAAATGATGTCACCTCT-TGTATTACATATTTCCATTTGACAGTATCTTCTCTATGCGTTCTCTGGCTCCCCATTTCTGTCATCAAGCATACGCACCGTGGTATATGGCTTTGACACAAGTCTGAGATCATCAATAATCAGTTTTG-----TTTCTCTTGCGGCTCTCGTGGC--------------CAGAGCATCGCGTGA----GCACACTCATCCACAAATTAGCCACCCGCACACTTACTTATATACTCGAACGAATGCAAACACCAACACACGTACAGGAGCTTTATAAAATTGCAATTTGCAGACCGG------CCCTGACGGC----------TGTCGGTTGCAGGCATTGCGACAATTGATTTACAAGCCGTGCATAGCAATGACTACAGCAAAAACAATAACAGCAACAACTGCGGAACCTGCCAAATGTCCTTGGCTGTTCAAATTTATGGTGGCGTATACTTAATGCCTTGACGCTTGTCTGGCTCAAGCAGGTCAAGTGGCGT----TTAAAGGTCAGTTTTGAATGCACTGCAACTCAACATGAAATTCTGACAGCTGCCACTGGCAAATTAAAATTTAATTGGGGGCAAAAGAAGAAATATAGCAGAACGACCAGCAAGAAAAACTAATTAACGCAGCGCCCGCAAAAAAAAAAGTATATAGAACAAAACAGGAACCGACGCAGACAGCACAGACCATTGACAGCGGCAGCTGCCTCTTTGGCCTCTCAGGGTCTTGGGT------CAGCCTTTTTTCACATGTTTATTGCATGTTCTGTTGCTGCCGCCTTTTATCTACGGCTTTGCCGCCTAATCTACCTGCCTTAACTGTTCCCTGGTTGTGGCCTG
>CG5629 14964788 14967317|15388 chr3R 14967260 14967375 scaffold_33 22066 22181 - 7493|0 57
CCGTTGTCGATGCGCCGGAGGCCACAGACGCAGCATCAGCAGCACCACCACCAACAAC
CCGTTGTCGATGCGCCGCCGGCAGCAGCAGCAGCACCACCACCACCACCACCAGCAGC
>CG11779 14974351 14974883|15395 chr3R 14974264 14975276 scaffold_33 27908 28870 - 17479|97 679
GCAGCGGTATGGAATGCGCGAACGACTGGTCAATCACGACTTGGAGGATGAAGCGGCTGGTGTCGACGACGTCGATTATCAGGT------------------------CTATGCGCCAACCACGACGGCAGCTACGCCTAGGGCGTAGTCCGTTTCGAAATCTGGTCCGATTCGATTCGATCCGATACGACGGTGGGCTTCAATTGGACCTGGTTTCGGTTTAAAGTGCACACTCACCACACAATTCAGACGAGACGACGACGATGGCAATTCATTGCAGCCTCAGCTAGGATGGTGGTGGAGAGACGGTGCTCAATCGTCTAATGTATGCCATAAATTTCCACGACAAGCTGAAAAGCATTCCGCTTCCCAATTACAC-TCTAATGGCGTTGCTAAAGGTCACGCCGATTTCTAACAG-----------CGCAGTTGACAAGACCAATTAGTTAGTAAGTTTCTGTGATATTGTTCTAGAGATTCTTTTGTACGTCCTTGCACTAACAATACGCATAGAACCCACGTTGCTAATCGATAATAAAAAC--TATATGTAAA------TGTAAATGAAT------
GCAGCGTTATGGCATGCGCGAGAGACTAGTGAATCGGGATGTGGATGAGGAG------GGCATTGACGATACGGATTATCATGTGACATATCCGCACACACTCAGTCCCTACGCCCCAACAACTACGGCTACCACGC---GATCGTAGTCTAGTTTAA----------GTTTCGTGTAG------------GATGAGATTCAATTACGCTTAAGCCTATTTTAAATTGCA-ATTGATAACATTGTT-ATTTGAGCGCATGCCGTGAGC--------TCACACTCGCATACCCTGGGTGTGGACA-----TGGTCAATTAACTA--------CATACACTCACACA-------------------------CACACACACGTCAAATAATAATTCTAAAGGTCA--------TTTAATAGAAGTTTCGGCCCGAAGTTGGGCATGCCAATTTAGTTTTAAGTTTCTGTGATATTGTTCTAGAGACTC-TTTGTACAACTTTAAAATAAAAACACGCTTCGAGTCAACGATTAAAATATTTTGTAAAAGCAATTTTTGTAAAGGTGCCTGTAAATGCATGAAACA
>CG5835 14974354 14974759|15395 chr3R 14974264 14975276 scaffold_33 27908 28870 - 17479|106 531
TCCGTTTCGAAATCTGGTCCGATTCGATTCGATCCGATACGACGGTGGGCTTCAATTGGACCTGGTTTCGGTTTAAAGTGCACACTCACCACACAATTCAGACGAGACGACGACGATGGCAATTCATTGCAGCCTCAGCTAGGATGGTGGTGGAGAGACGGTGCTCAATCGTCTAATGTATGCCATAAATTTCCACGACAAGCTGAAAAGCATTCCGCTTCCCAATTACAC-TCTAATGGCGTTGCTAAAGGTCACGCCGATTTCTAACAG-----------CGCAGTTGACAAGACCAATTAGTTAGTAAGTTTCTGTGATATTGTTCTAGAGATTCTTTTGTACGTCCTTGCACTAACAATACGCATAGAACCCACGTTGCTAATCGATAATAAAAAC--TATATGTAAA------TGTAAATG
TCTAGTTTAA----------GTTTCGTGTAG------------GATGAGATTCAATTACGCTTAAGCCTATTTTAAATTGCA-ATTGATAACATTGTT-ATTTGAGCGCATGCCGTGAGC--------TCACACTCGCATACCCTGGGTGTGGACA-----TGGTCAATTAACTA--------CATACACTCACACA-------------------------CACACACACGTCAAATAATAATTCTAAAGGTCA--------TTTAATAGAAGTTTCGGCCCGAAGTTGGGCATGCCAATTTAGTTTTAAGTTTCTGTGATATTGTTCTAGAGACTC-TTTGTACAACTTTAAAATAAAAACACGCTTCGAGTCAACGATTAAAATATTTTGTAAAAGCAATTTTTGTAAAGGTGCCTGTAAATG
>CG11779 14974957 14975354|15395 chr3R 14974264 14975276 scaffold_33 27908 28870 - 17479|759 1078
CAACTGAACTCGGCCACCAATTTGGTTTTGGCACAGAACTACAAGTACGATGTGGAGATCCTGGAATCCGGCGATGCCGACCAAGACGACAGTAGCATGGATGACGTGGACGATCTGGAGGAGCGTTTCAAGGGACGCGGTGTGATCTTCAGCACGGACACCGAAACCTTCGCCAACGAGAACATCGAGATGAGCCCGCTGAACGTGCAGGCGGATGCGGTTAGCCAGGGACACGTGCTGCTCGGCATCGTGGTGGTGGCACTGGCCTTGGTCTCCATCGGCCTGTACGCCGGCCTGGTCATATGGCGCTCGCACCTGGA
CAGCTAAACACGGCAACGAATTTAGTGCTCGCCGGAAATTATAAATACGATGTGGAAATACTTGAATCTGGCGA---CAACGAGGATGCAAATCG---AGACAGCAGCGAAGAGTTGGAGGAGCGTTTCAAGGGTCATGGC---ATCTACAACACAGACACCGATACTTTCGTATCCGAAAATATTGAGATGACGCCCGTGGATGTAGAGTCTAGTGCCATAAGCGAGAACCATATGCTGCTCAGCATAGTACTTGTTGTGGTGGCTCTGGTGTCAGTCTGCCTTTATGCGGGACTGGTTATATGGAGATCGCATTTAGA
>CG11779 14977211 14977308|15396 chr3R 14976744 14977751 scaffold_33 30233 31078 - 5253|498 598
ACAAACCGCAGACGAAGGAGCCAAGTGATCTGGGTG--CAGGAGCTGGAGCAGCACGAGGAGTGCCGGTGGCTGCCAAAAATAAGACAGCTGTC-GTGGAG
AGAAAGCTGATACC---GAGCTAAATGAATCGAATGGCCAGGAAC-----------------------------CCAAAAATAAAACAGCTGTCAGCGCTG
>CG5558 14985821 14985954|15401 chr3R 14984248 14987974 scaffold_33 36508 40089 - 96176|1639 1805
TTGTTTCAAACGCAAGAAGGACATTTGTTTCCTTAAATTGTAACCATTTCTTTATTTGGCACTCGAGCCATTGAATT---TTTCA--------------TTTTCAGAATATGTGTACACATT----------------TTTTAAAAAAATAAAAAAATTATATAATG
TCTTAGCGAAAAT-AGACGGATATAGGTTAAC--AAATTA---------CTTTATTTGACATTTT-GCCATTAAATTCAACTTCAATTTACATGAACATTTTTTGGTAAATGCGAACATTTTAAATACTTTCTTTGCATTTTTATAAAAAAAAATAATAATAATATT
>CG5555 15003802 15003979|15423 chr3R 15002771 15005393 scaffold_3 4714243 4717080 + 109374|1151 1386
ATCATAGCCACCGTA------------------CGCCGTCTTTATATCCAAGCTGCATTGTTTACCCGATCTTAGATGGCTA--------------------------------------TGCAAACCGAGTATATAAGGTTTATAACAGCTCTATATGTGATTTCCTTTGTATAACGAAAACCTAAGGATTAAATATAAC--TACTACTACGTAGAAAACCATATGTCCCAAAAT
AATAAAATGACCCTAGTATTTTAGTGCACATCTCAATATATTCGAATTTAGGTTGCAATGTTTGCTAAAACTAATGCGTATATATTCGAATTCCAATCCCAAAGTGAAGTGATGCCCTGCTATAATCTGAGAATGCAG---CAACAACAACTCTACATGTGATTTCCTTAGTGAAACAAAATGCTAAAGCATAATTATATTCATATATTTAAATTATCATCCATAT-TATCTAAAT
>vib 15043466 15043614|15466 chr3R 15043216 15044063 scaffold_3 4760621 4761345 + 28105|278 427
GTCTAGTAGAAAATTGTAAACAAAATATGTGTATGTAAAAATCAGGCAAAACAAGAAAACAAAACTAAAAGGCAAAGAAAAGCAAAACAAAGCAAAACAGATTAATG-AAATTGAGATAAAATTGCATAAATAAATTTACGATATAAACT
ATATAGTAGAAAATTTT----TAAATATGTACATGTAAAAAC---ACAAAACA-------AAAACTATGAT-------AAAGCAAAAACAGGC--AACTGAATAATATAAATTGAAA------TGCATAAATAAATATACAAACCTAATT
>CG5250 15053985 15054013|15475 chr3R 15053521 15054691 scaffold_15 1712354 1713501 + 9138|482 510
GATCAGCTAACTCAGCTGGATTTATTAAT
AATT-------TTAACTGAATACCCAAAG
>CG5237 15056486 15056582|15476 chr3R 15055171 15058862 scaffold_15 1714280 1718220 + 146194|1388 1610
-TATTCACAGA----GTATACACAGTATAGTTATGTATGCAGTCTTA---------------------------------------TTTGGTAATTGTTG--CCTACGCGAAT-----------------------------------------------------AAATAGTACACAA----TGTTT-------------------CTTGGAA-----ATCG
CTACTTAAAGGGCTTGTTTAGCCAACATTTTTGTGTAGTCCGTCATAGCGGACATGGATACTGCACCCTAGCAGCTAGCGAGAGAGTTGATTAATTGTTGGACATCCACGAACTTAAAACGTTTGGTAGCTGAAAAAAAAAACATATATAAAATACAGTAAACGCAGAATAACATATAAAAACTGTTTAGATCACACATTTATTTCACTTTGAAAAATTATGA
>CG5217 15072774 15072990|15483 chr3R 15072494 15072927 scaffold_15 1734259 1734717 + 4703|319 497
TTTAGAAATCAGTTAGGGAGCTGATTCAACCTTACACAATATATACTCTTCAAACACATCCCTGCTAACTGACATACATACAAGAACAAACATT-----------TTCGCTTTGATTCCA----CAAATGATAATTCCGAGCTCACGAAATAAACACATACAAG----------ACCCC
TTTAAGAGCCTGCCAG------CCTTCTGCCACACACTTCGTACACATTTTGAA-AAATCCCGACTATAT-ACATATACACAAAGACACATATTAAACACATTAGTTCATCTGCAGTTCAGCTTTAAAT--TGAGTCCAAAATGCTGAATAAAGCACATTCAAATAAAATCAATATCAT
>Dl 15128453 15130549|15552 chr3R 15127436 15129931 scaffold_15 1796998 1799511 + 47524|1122 2814
TCCATACGTTTTGACGTTTTGCATGTTACTGAAAAATCTGCTTCAATT--------------TAATCTATTTTTCATTTAGTTCGATATAAATTGTAAATATTAATGCTAGCCGTAG------CCAACGCGTATGTGTAAACTAAT-----GACAAAACGATTGAAAGAAACCTCCTCATTGACGCCGC--------CCGAGATGTCGGTGCTTTTCTAAGGCAAGGCAGTTGGCTGAATCGGGCGATTTGTATATAGTACTCATAGGT---CACATCGATATACGAAATGGATAAGAGAAAAAGATGAAA-AGCCACACAAAAAAACTACATAAATTGACACTATCTCGACTATTTAGTTTCTAACTATGTATATGTAAATGTAGTAAACGAAGACACTAAACTTAACTCGACTCTAGCTTAATGTTAATTT----AAATACCCTACACAAACAAACAAACAAACAAACAAACATGCGAAGA---CAAGCAA-AACATTTAGTGATTCTATTTTAAGTACTTCTAATTTACCCTACACCCAATTATTTTTTTCGATTTTTAAACTTATTATTTTAAATTTTATTTTTTAAATTTGTCCATCTACAAACCCTATTATATTTTTTTTGGC----------CTATTCCGATTTGGAGCATTTATCAGCGATGAAGTCAATAATATTTGTAGTTAGCGCCTAACTGTAAACGAAATGTATTGAATTTATAAATTGTAAGATACAGATACAATCAACTGTCATGAAAACTCAAAAACTGAATTGG---AAAAAAAAGAACAAAAAATTATAAGCAAAAAGTGAATGAAATATACAAACAATATACACACTACTAAAGAACAAATGAAAATTCGTGTTTTTCAAAGTCTCCAAA------TAGTCTTATTATTAT--AATCTTTTGTTA-----------------------------GTAAAGCATAAAA------GGTTTATACAATTTAATTTTGATCTCAAAACCGAAGACAACCAGACCTTGTGCAGCACGAA-----GACGCAAAAACTGTTTGCGAAATTCCAAAATGTCAAAATTAAATC---------------AATAAAACT-ACACTAAAATTGCAAATGGTTCCTCGTTAGTGTAAAGAAATGAAAACTAGTTGTAAAAGTGCTAGAAACAAACTGTGCAGCTAATTATCTGATAAATCCTACGCAGTATATAT-----TTTTATATGTTTGCT-----------------------------------CCACAGCTCTCTCATCCAATTTTGTACATA----------AAGTTCTCCG---------------------------------ATATAAGCTTTTACAGCCTATAGCCACACACA------CATATATTTTTTATAAATATCTAATTTTT-AAATAGTCGTTTTTAGTAATTTATATTTTTATTGCATATAAAAAGCCGAACAAGGAAACAAAAAAATTAGACAAACACACTCAAGAGAAAATTGTAAAAAGTTGATACGACCTTAGAAAGCAAATATTTATACCAGAAGAAACAAAAATGAAAAAACCCATAAAAATAGTAGTTACTTGCATACAATTGTAATTTAGTGTTGTACTTACGATTTAGTCTAAACAATTTTATGAAATTTTTTAGCAATTAAAGAAAAAATGAATT--
TACATATATACTGACGTTTTGCATGTTACTGAAAAATCTGCTTCAATTATTATTATTAATATTATTATTATTTTCACTTAGTT-GCGATAAATTGTAAATACTA---CTTAACGCAAAGAACTCTAGCACATAATTAGCAATTAATTTACAGACTAAGTTAAATACAAAAAATTCCTCATTGACGCTGCATGGTCGACCGACTTGTC--CACTTGTCTA-TGCAAAGTAGTGCAC------AAGCATTTTGTATATAGTATCTATAGGTAAACGCTCTGATATACGACAAACACACACACACAAAACAATATAATAATAAAAAAAAAAAACGAAAAATAATAATAAT--AATAATTGACTATCTCGCGATCTATTTTTAG-TGTCAAATATGA-----CTAAA----ATTTAACTCTAGCTTAATTACATTATCTAAAAAAGGCCTACACAAACAAACAAACAGACAAACAAACAAACGAAGAAGACAAACAACAACATTTAGTGATTCTATAATAAGTGCTTAATTTTTACACTATA----------------------TACACCTTTTATTTCA--TCTTACTTTTT-------------TTTAAACATTTTTGTATTATTTTTGGCATTTTTTTTTTTTTTTTAATTTGGAGCAACTAT-AGAAAAGAAGTCAACAATATTTATAGTTAATAACTAATTGTTAACGAAATGTATTGAATTTATAAATCTTAAG------------------------------CGTAAATTTATTTGATACAAAATGAAAGATACAAAAAAACCAGACAAAATTGAATGAAATATACAAA--ATACAAAAAACATTTAAACTAATATATGCGTGCGTATGTTTGAAAGTCTACAGAACAGTATAGTCTTATTATTATTTCCTCTGTTGTTACACAACAGTAAGAAAAATACTAACAAAAAAAAAAACACAAAAAAAAATGATTTACA---TTTAATTTTGATCTCAAAACCAT---TAAACAAACAATGTGTAGTATGCAAGTATGACGCAACATCTGTTTGCGTAATTCCAAAATATCAAAATTAAATCTTCACAAAACGAACTCATAAAACTTACAGTTAAATTGCAAATGGTTCCTCGTTAGTGTAAA---------ACTAGTTGTAAAAGTGCTAAAAAAAAA--------------AACAAAAAAAAATTAAGAATTATATATATTTTTCTTATACATTTGCTAATTAAAAAAAAAAAAAAAACCAATCAGCGCTCATCAATATTTATCTCAACTAATTTTGTGTACATATTAACTAAAAGCTCTCTTTAAAACATTTTGTTATCTACGCTCATACATTATATATATGCTTAAGCCGCCTATATACATATGCATATATACATATATTTTTTATAAATATTTAATTTTTTAAATAGTCGTTTTTAGTAATTTATATTTTTATTGCA------------AAAAAGAAAACCTAAAAAAAAAACACACACACATACG-TCAGATTGTAAAAAGTTTATAAGACATTAAGTA-CATATATTTATACAACATGAAAAAAA------------TATTAAAATAGTAGTTACATACATACAATTGTAATTTAGTGTTGTACTTACGAATTAGTCTAAACAATTTTATGAAA--TTTTAGTAATT----AAAAAATGAATTGA
>CG31212 15194717 15194884|15619 chr3R 15194624 15195159 scaffold_15 1872309 1872847 + 8285|93 273
TTACCCAAAACAGTTAAATTTGTATTTCAATGTCAAAAGATAATAAAA----CAAATCAATGTAATTATTAATATTGTATAATATTCATT-CCAAGGATTCATTCTTTAAAAAGACTGCAAGTG-CAAACATCCTGAAAT---TCGGTATAAAGCTCTAATAA----AAGGTCACCAAACG
TTAACTTTAACAATTCCA-TTGCAAGCTAATAAAAAAGGAGCATAGCCCTTTCGTGATGATGCAGTTGTTGTTA----ATAGCATTTACTGGCCGCAGCTCATATTGAAAAGTGTTAACTCATGACAAATCTAATAAAATTAATCACTTTAAAGTAATAATAATAATAAGCGCACAAAATA
>CG3581 15199479 15199618|15626 chr3R 15199018 15200636 scaffold_15 1877952 1879518 + 31749|555 700
TATCGTGTCATATAGCGCCCATAATGTTT--TTGATCTAAAGTTTGTGTTTGATGT----AATCTGTTTTCAAAATTTAATATTTTCAAAATTAATATTTTTTGAATGAAAACAAATATCTGAAGAAGACTGAATCTTCCATACTG
TATTTAAATCAATATGGCCC----TGTTTCGTTAATAAAAATTCACTGTATGTAGTTTTAGGCTTGTATTAAAAAATGTATTTTACCAACCTCAACGTTTT------------AAAT---------------CATCTTCAATTGCG
>CG31245 15201917 15201990|15629 chr3R 15201987 15202444 scaffold_15 1880249 1880700 + 10386|0 3
ATTG
TTTG
>CG3517 15249479 15249630|15676 chr3R 15249477 15250905 scaffold_15 1951284 1952680 + 62695|2 159
GTTTGAAGGATCCTGCGAATCGGCGCTTGCTAGATTTCTAAAT-TTTACT-----TTACTCTTGAGGAAAGCAGTTCTCAAAATTTTCAGTTCCAGCTGTTCTTCAACAATTTATCATTAAAGTTGTACTCAAGCTAGTTTATGTACTTTTCTGTAAA
GGGGAAGAGTAATTGTCAAT-GGAGTGTGAAACATTTCAAAACATTTACCAATTGGTATTCTTTCGACAAGCTACCCAAATCAGTAAAAATTCCAAGTTTATCTCAA---------ATTTATATCGCCTTTTAAC---TTAATACATTTTTTTGTAAA
>CG6255 15287601 15287657|15707 chr3R 15287321 15287603 scaffold_15 1984357 1984688 + -270|333 335
GCT
GCT
>CG6255 15287601 15287657|15708 chr3R 15287604 15288971 scaffold_19 1216507 1217870 - 42487|0 53
GAGTGGCGGAACAAGTTATTGATGCCAATAAACTAACTTAGTGCTCTTTAAATT
GCCTCCATGTACGAGTTA---ATACCATTCAA--GATTCGCGATTCTGGACACA
>CG15025 15315292 15315529|15736 chr3R 15313812 15315335 scaffold_15 2016350 2017943 + 8558|1683 1726
AAAACTCTATAATATAATTGAAATATATATAAAACGATTTGAAC
AAATGTCTACTTTTCCCTTCGACTATTTAATAAATATTTGAAAA
>CG6231 15441744 15442359|15850 chr3R 15442299 15442642 scaffold_15 2163583 2163935 + 15673|0 68
GGGGCGCCACCCCGTCCT-------AGTAGTTCGTAGTTTAGCTAACCAATTTCGCCTA-GATCCTAAG
-----GCCAATCTGTAATGCTAATGACTAGTTTGTAGTTTAGTTAAACAATTTTGTATAGGACCCTAAG
>CG16718 15459140 15459650|15866 chr3R 15457687 15459914 scaffold_15 2184103 2186501 + 5105|1596 2273
GTTAAAAATC----------------------ATTCAAAGTGATTATTTGTGTTACGAATGTTCCTTTCAGTCACTTAATTAGGCCTTAGCTATGACACTTTTATTATTATTTAGTAACCCTTAGAAATTTGTTTGATACTTGGTTACAAGCTTTACTCATGCTTTATTTTA---TTGTAAGAGCCCA--GTAATTGTTATTTAG-----------------GTAATCCAATTTTATGATC--TGTTAA----------------------------TTGAAAATGATTTATTAA-------GTGGCTCAAACTTATATTTATGCAG------------CCCAAGTGAG--------------------TGCCAATCTGTAAACGAGCACAAC--------TCATATACTTTTATAATTAATTGCATATTACGAAATGTTAAAAGTAATCTCTCA-TTCGTGTTAAAAAACTCAGGCTCTCAAATGACGCGTACATGAACATTTATTTTAGATAGCGTGACATATATACATGTATTTATTGCATACATTAAAC------------------------CGTATGTATGTATATTGATGTTG-ATATACTG-GAATCTCTATTCAAT------GTTGAATATATCAATAAACAAATA-----GTCAAATATT--------
GTTAAACTTCTAGTTGAATTTTTAGCTTAGGTTTTAAAAGTGCTTTATTGTGTTATGCCAGTTCCTTTAAAAAACTTAATT------------TGAATTTTTTGTTTTTTTTT-----TTTTTGCAAA--TGTTTGCAATATGGTTTTAAGCTTTACTCATTAAACATTTCGCATTTGTTGAAAACAATCGCGAGTGTGATATAAATTCAAGATACTAAAGTGCAACCTTATTTAATCACCATTATTAAAGTCCAACTAAAGTGCCAAACTTAAAGCTTGCACAAAATGTAACAAAATATGCATAATTTTAACTTAAGAATATGTCATTAATATATTCTTCTAAGGGAAATACGTTAGCTTTACGGTCTTGTCAATAATGATAAAAGCACAACAATCGGATTCAATTATTTTTG-AATCATTTTCTTAT---------TTAAATATATTTTATTGTTTCGTTGTGATTTACTTAG----TCAAGAGTTGCGTATATAA-----TATTCTAAAAAATCTTTGAAATTTTCATCTATTTGTACTAAATCTCAGGCTCTCTCGAAAGACCCATTCAAATTCTCATGTATACAAACAAACACTATATAAAATGTGAATCTATTTTAGATAAAGTAGTTATATATATATATTTATAAATATAAAGTTCGTATATTATATAATC
>Vha13 15468975 15469229|15873 chr3R 15468919 15469564 scaffold_15 2196692 2197364 + 22901|59 351
AGAGGTGGCCCCCCAAAC-TGTGCGCTGTAAATTCAATGTCCACGTTCAACTCTAATCCATAATTTAGACCCGTAATAATAGTGGTTAATCTAACTGGAAACACTGCTGTATTATTATTCCATACATTAAAGTGAAAATTCGTTGTT--------------GTTCCATGTAGAAAAAAGCGA---GCATATTAGTTTGCCTCCCACTCGCGCGG------GATTGTATTATCA----TTGTTTTG----TGTTCTGCCC------AATACACGTTGTTGTTTTATCCGAAAAG
ATTTTTGGAGCATTGCTCGTTTCTATTGTAAATTCGATGTCCAA----------AATGCATAATTTAGCCCCTTAATAATAGTGCATACTATATT---AAACACAGCTGTATTATTATTCCATATATTA-----AAAATTTGTTGTTTCGCCGAGCTAGAAACTCGGTGCAGTTAAAATCCAATTACGTGTGAA-TCACTGATCATTTTTGCGATTCCGCAATTGTAACATAATGTTTTGTTTTGTTTATGTTCTATTCCGTATAAATACAAATTGTTATATTCATTAAAA--
>CG6195 15472641 15472691|15877 chr3R 15472658 15474063 scaffold_17 1248162 1249604 + 75022|0 63
AGATTGTTGCGT------------------------------GTGAAATATATATTCTATGCTA
ACGCAGCTGCGTCTGTTAAGCCAGTTCCTGGCATCAATCGAGTTGAAATATATATTCTATGCTA
>CG6300 15596568 15597163|16008 chr3R 15595750 15597087 scaffold_17 1403647 1404783 + 15606|908 1447
TTCTTTCATTTCGTTTTGCATCATTTATTTATAAACATTTCACAAACAT---CATTATTCTG-GGGGTTTTACACAATTATTTCGTTTTTATCCTGGTTTCCATTCTAGGATTACCTTCCTTTCGGGTG---------ACAACAATTATTTCAACTATATTGTAAAATTATGCTACTAATCTTTCACTTAGGCATTTGATTTGCTGTTTTAATTTCACACCGACGGCATTGATGTGTTATTGCCGGGTCTATGTATATGTATGTACTTTTAGAATTTCTTTCGTTTGTGGTTTTTGGCGTTGCTTCTTTCTGGGCTTGGGTTATGTT----CCAGGTTTGGATTGCACTACAGAGAAATTCATGCGATCTTTCCCTACGAATCGAATCGGTCTTACTGGCTAAACGTGT---GAGTGTGGTGATCTTTGCTAGGTCTTCTCCTGCCGGGGATCGTGTCTCATTGGGCTTTTTTTTTTTCTTTTTGTTTTTGGGGTGTACGGGTGTGCATGTCCTGACTTAGCTCTATAAAGTAAGGTGAT
TTTTTTTTTTTTGTTTT------TTCATTTATAAACATTTCACAAACATTTTCATTATTCTGAGGGGTCGTACACATTTGCTTTGGGTTTTTTTTGTTTTCG-------------TTTTGTTTCGGGTTGATGGCAATACAACAATTATTTCAACTATTTTTTATAATTATTTGACTAAGTTTTTACTCATGCATTATATT--------------CTCATCTTCTGAATCATTTTATTTCTTTCCG--------------------------------TTTTATTTGCGGTTTTT--CGTTTCTTGGCGTTTGGATTTGGGCATGTTTTTACCTTCATTGGGCTGCACTACAGCAAATT------GTTCTT------------AAAT---TCTTACT--TTAAACGCGTTAAGAGTGTGTGAAT-------------------------GATTTCATTTCATGG--------TCTATGCTAATTAAT----GCGTGTATTTGTGTGTGTGTCC--ACTTAACTCTATAAAGTAAGGGGTT
>CG6300 15596568 15597163|16009 chr3R 15597088 15598980 scaffold_17 1506404 1508347 - 59360|0 111
-CATTTTATTTATATTT-------------------TTGTATATCAGTTAGTCAAATAAATAT---ATAATACCATTAGAAGTTAAAGACACTG--------------TGTA
GCACCTTAAATACATTTAGTAAAGCAATAAAAATAGTTATAAGTTTTTCCTTGAATAAAATATCCGCTAATATCATC--TATTTAAATAAACTGAGTAGAGGAGGAAATTTA
>CG4572 15688230 15688443|16102 chr3R 15688242 15688338 scaffold_4 6288350 6288439 - 1203|0 96
TGTTGATGAGAGCATTGGGTTGTTAATACTCAACTAAATTCATATAATTTGTTACAGAACTGTATATAACAACAAAGATTAAAACATCAAAAAGAAA
TATTGTCGATTGTAC-------TTAAGCTTAAATTAAATTCGAAATGGTTATTAAAGAAGTATAAAATGGAACAAAATGTAATAATATAAATAGAAA
>CG4572 15688230 15688443|16103 chr3R 15688339 15688489 scaffold_21 1707422 1707582 - 1094|0 116
GAAATGCGTACTTAAACTATTCAGTACAATTTGGAGACC--------AAATTTAAGCCTTTGTTTTTAAA-ATTAATCATGAATAATTTGGTGTGAGTTT---TGAATGCATAAATA
GTTTTGCCAGATTTAAATGCTTAATCTAATCTAGAGGCCAAACCATAAAATCAAAGCCGAACCCTATGAATTTTGACCAAGAATAA--CGTTGCCAGTTGCCATGAACAAAGAAATA
>ninaE 15711968 15712266|16121 chr3R 15711772 15714335 scaffold_17 1545221 1547788 + 99239|208 524
ATTCTTTGGCGCAACAACCAGAACAGCAACAACAACAACAAGAACATCTAACTACTTACAACAGCAACAA---------CAACAGCAACAAA--AACAACAGCAAGAACAACTGCAGCAACAGAACGAAACGCTTTCGAATAACATCAAAAACTTCAACAATAATGAAAAAATTATGCAACTTTCTTACATAACAAAAAGCAATGTAAACTCAGTTAT-TAAATTTC------CTGCAATGTCAGTTAAGGACAAAAAAAAACTCAACAAAAAAAATAAATGCAAACGAACTAGAAAAGTTATAAATTAAAATGAGC
------------AGAGACTACAGCAACAACAATAACAACAACAACGTTTTACAAC-AGCAACAGCAACAAATAGAACATCAAAACCAACAAAACAACAACAGCAAGAACAACTGCAGCAACAGAACGAAACGCTTTCGAATAAC--------------------------AATAATATCAATTTGTTACATAACATAA--CTATGTTAACTAACATATGTCAATTTCAAGCTTCTGCAATGTCAATAAAGACTAAAAAATCTATTA--AAAAAAAATAAAGGCAAACGAACTAGAAAAGTTAC--------ATAATT
>CG4538 15724548 15725317|16137 chr3R 15724548 15726430 scaffold_17 1560423 1562387 + 54664|0 952
AT----------CAAACAGAGATACCCACATCCAAAGC-----------------------------CAACCAAAACAGAAATCGAGACAACACTTGAACAAAAGAGAAAACT--------------TTCAATTCGCAACGCTTTCCGAA----TTGCTTGTTCTTTGCA-------AACTCTTTTGTCTTCTATCCACTACTGTT-CAGCTTGTT-AAACTCGTCCAGCTGCTTAATTTCGAATCGTCAGCGCTAATTTCTCGCATAAACACAATTTAATGTTGAACCCTTATGATACTTTCATTTGCCCACTCTAACATG---TATATTTTTTAGTCTGGTTTGAATGGTAAATTGATTGGTGCGTCGTAGATCCCTACCTCGAACCTATCACTCTGTAAAATATGAACCGC---TGAGGAGTGTA---------TACATTTATAAAGAATGT---------CCTCAATCCCCAAATGCATCTGTGATTCATAAACGACGAGCAGCGC-AGTCTTTTGAGCCCGAAG----------------------------------------CAATTGTAAGTGGAACAACA--------------AATCCTAAAGGGATATTTAAATAAATGCCACAGTTTCTTAAACATTATATTACACAAATATCGGAAATCTG--------CAATGT-----TGGCAATGATGTGGTCCATTGGCG---CTAGGAACCTCT---TTTGCATATAACAATTATATATACAAACGTAAACGTATATTTAGGCAAATTTTTGCATAGTCTAAATTGAGTTTCTAAATGAGTTCTTGTAGCGTTGTAAAGATGACAAGCGAGAAGCACGTTCTACCTTTAACTAATTTAAGTTG-------------AAAAAAACATTTTTAAAACAAAAAACAAATAAAAAAA------AATGAAAAAATTTAAA
ACGCTCAGTTAACAAACGCAGTAAACAAAAGCTAAAGCGACTAGCTTAACAACAGCTATAACAACAACAACAACAACAACAACCGCAGCAACAAC--AACAACACAACAAAATGCAAACGCTTTTTCTTTTGTTTTTACCCATCTCCGAAATTTGTGCCTGCGCTTTTCATTGAATTCACTTTTTAGACTTCT------TAGAGTTACATCCTGTTAAAACATTTTCTGCTTTGCAATTT----------GCTTTAATTTC------GAACTCTATTTAAT--------CTTAGTACCAATTTATATATGATCGTTAATGTGTTATATTATTTTTAGTCACGTTTAAATGATACTTTGGTCGGTA---CATAGCCCCCTACT----ACCTGTCGCAC---AATTTTTGAATGGCTCTTGCGCAATTTATATACATATTATATATATAAAAATTATATCGCTCTCCCCCTATGCCC-AATGCACCTGTGATTCAGAATTGACAAGCAGCGTAAATTGTTTATGCACGCAGCCGTTCAAAAATAGTTTGCAACATTCAATTCAAATAAGGCCAACTGTAA---AAACAACATTCACTAGAATTGTAATTCAAAAATGATAATAAAAAATACACCACTTTTTTTAAAA----ACAATCCATAAGTGCGACTAATTAGAGCAAAATAAATATGAGTACGACAACAGTCTATGCCTGTTGCGTCTTTCATAAACCCTATATCTTTATATAATATATATTTCAATAACTCTCAATACATATATAACTAG------GCAAAAGCAAAAGTGCGTTACAAATT---TTTTGGTAGCCCAATTAAAGAGA----TGAGAAGCAAATTATATTTTTAACTAATTTAAGTTGTACAAGGAAACGTAAAAAAAAA---TTAAAAAAAAAAACAATTAAAAAAAAACATTAATAAAAAAATAAAAA
>Surf6 15729384 15729481|16140 chr3R 15728557 15731246 scaffold_17 1565686 1568548 + 44788|1037 1138
CTATGCTTACTATAGCCCTTAAGTGTAAAGTAGTGTAAATGTATGCCACGTTGAAATTCAACTCAGAATGCTTTAGAAAA----AAAGTGATCTTTCTGAAA
CTCCTGTTGGCAAA-----------TAAATTAGATTAA--------CAAGTCAAATATAAAAAAAAATTGACAAAACAAAATTCAAAGTGCTTTT----AAA
>CG12378 15738929 15738945|16149 chr3R 15738009 15739577 scaffold_17 1576921 1578709 + 45735|1015 1032
TGCACAAA-GTCTCCTTA
TATACAAATATATATTTA
>CG4468 15740111 15740597|16150 chr3R 15739937 15741535 scaffold_17 1579402 1581081 + 28473|181 761
AAACCAAAGGATCTATCGAACAAATAAGTAAATCAAGTGGAAGCATACAATATGGTCGGTCCATTCATGCAGGGCCTATTCTTGATTGGCATCATCTACT---------------------------------------------------------------------GGTATTCCAAGGGGATGATGTCCATGATCAACGACTACTACAGAAGTGAGTTCCAGCGAAAGTTGCAGACGGAACCAGCAAAGACGAG-----GGCAGAGACACCCATCAATGTGGACAACTTTATGGATTATGTTAGGGAGCTGGACACTCCGGACGAGGTGGCTAGAATTCCGGCGGAAGGAACTGAA--TCTCCGCCCATGGGAAACACCTAT-----------TGCCACATCCTTCGACGATTCTTGGAGATTACCGGCACTCTACCACCATTCGATGTTTGCCTAGTTACGAGCAA---CATAAGATAGCCCATCCTATAATTAATTATATATGGTATCAATTATACTTAGTGTGTTTTATATGAGTTTCGTAGAATAAAATATCTTAC----TAACCGTATTGCAT
-AACAATAGAACTTGCGTAAGATTTAAGTAA---AAATTTGAGCGGACAAAATGGTTGGCCCATTTATGCAGGGCATGTTACTTATAGGCATCATCTATTGGTACAGCTAAGCTATATGTGTATACTTATTATTATGTAAATATTTCTTATTGAATTTCCCACCCACTAGGTATTCCAAGAGCATGATGTCCATGATTAATGATTATTATCGCAGCGAATTTCAAAGTAAGCTCCAAGCGGG--CGGCAATGCAAAGCAAGCCGCGGAGACGCCTCTGAATGTGGATAACTTTATGGAGTATGTGCGTGAGCTGGAAACTAAGGA----ACAGCCACAG---CAACGGGCAGTACAAAAAGTTTCAGAAAACGCCATAAAGCCATCAGCAGCTAACTCCCATCTGCTGCTGTACTTCCTTAACATCACAGGCGCCCATGCCTTGCCTGATTTTTGTAGCGCTGCAGACAGCTCCATAAGCTAG-----CTTACAACTAA-GAAATATAGC----ATTTTTCTTAAATTGTTTGATATCA-TAATATATACTCTATGTTCTTATACGATAAATGGATTTTAT
>CG4465 15741590 15741711|16151 chr3R 15741554 15742058 scaffold_17 1581124 1581646 + 11662|39 163
TAACGTATACTTAATATATGTCTGGGCGTATTTGATAAG--TTAGTTGTAGTG-TGTGTCAAGTATTCGCGAACAGTATTCGAATTTAGCTCATTAAACATTCGCTTATCGCGAATCGAATATGT
TATGTGATAGTTAGAACAATTTACTGAGTAATAGGTAAATTTTATTCCTAGAATTACCTTAGCTTAGCTAGGAAAAAACTTGTGATTATCTA--TAAGCCTTAACTAGCGAGGATCTAAGTTTGA
>CG4462 15747466 15747639|16159 chr3R 15747305 15747542 scaffold_17 1580906 1581129 + 342|180 256
TTAAATGCTTGCAGTTTTACTAAAGAATATTTGTGGAGTTTAGTGGGTGAAACCACTGAATAAATTTTACTTATGAT
CAAAAGAGTCTCAG-----ACAAAGAACCTCTCTTGAAATTCCTTTGGAAATCTTTCTATTAAATGCAAATAATAAT
>CG4462 15747466 15747639|16160 chr3R 15747543 15748926 scaffold_17 1587386 1588676 + 54761|0 109
CCCAAGACGACAGCCTATTT--TTGCCA------ATTAATAGTCTTTGTATTAGTCAGCTAATGAAAAAACATTCTTCTGTGATTAG-----GATAAGTGAATTGTTATT
---AAAATTAAGTACTTCTTGATTTCCAGATATTATCAATACATTATATA-TATTTAGCTAAT-AAAACTCATTTCTCTGTGATTAGTTAAAGCCAAGCAATTTATTATT
>Hs6st 15755436 15756118|16166 chr3R 15755005 15756367 scaffold_17 1597462 1598852 + 11372|463 1306
AC------TCGAAACCAAATATTACCGATTAGGAACTAGATGT--AGGACAAACC--------------AACTCATAAAT-ATGTAGCTGGGAAGGGCGGAATATGGGGGGGTGGTCACTAAGGTTACCGATACGCAGAAGCATCAGCATAAAAATCAACCGAAGGACTTTAAACTAGCGATTAAGCATAATGTTAAT---------------------------------------------------------------------------------TAAGCAGACAAAAAACATCTAGCGGACTTGGCTTGTTTCAATC--GAACGTAACACAACTAAAGGACAAACGAGCAAAATCTCAGAGCGTATAT---------TATCTCTAAACCTAAACCTA-AGCAA--AACTATAAAATCTATGACT--ATAACTATACTCCTTGCT--TAAGTCGCGCAC--CGAAAATTTTAGAAAATGTAAATACTTTGCATAAAATGTTTATTTCTTAAACGCAAGTTCCCTTTTCAAACATTGTGAGGTGCGAGCCCACTCGAATTCACTTTTCACCTTCACAACGCACCCACACTACTACACCGCCATAAATTAGATTAATTAATTAATTTGTAATACGT---AGCTTTTCGTT---TATTGTTACGCCAAGTCTCTGC-AAAGCCAAATCCACACTTAG----------------TCTAAGAGCATAGTGCTTGGAAAATGTTTTC-----------GATCCAATAACGCATTTATTTTATTTTACTACTAGACATCAC-TGTAAATACTGCAGAATAAAGTTAAACAAAACAATTGA--ATTAA
ACGGATCTTGGAAACCAAAAATTAATGTGTAGCATTTCGTTTTTAAGAGCAGACCCTTCCTTCCTCCATAAAGCATAAATGATG------------------------------------------------------------CAGTAGAAGAACAAAACAAAGGACTTTAAATTAGTGTCTAAGCATAATGTTAACGATTATTATAAACTGATAAACTGAATACTACAAAATCGAATTACTATACATATTTAAACTCAATGAAGAGCAGAAAGCTGCAAAACAAGCAACAAAAATATGGCA---TTAGCTGCGCTCTCTCATGAATGTAACA--------------------AAAATCTCTGTGCGCATATAGTATATGACATTTAGGATTGTAGTCTTAGAGCAGGTAGTTATCCTACTTATGAACTAACTACTGCACTCCTTGCTGATAAGTCGCACTCCACACAACCCTCGTATATTGTAAATA--------AAGCTACGTATCTTATAAAAAACACATACATATATACAAATACT-----------------------ATTATTTAAATGCATCCAGCGCATAGACTAC----ACGCCATAATTTAGTT---TTAATTTAATGTTAATGTATTTAACCTGTTTAATAACTTTTGTTATGTAAATTCTGTGCAAAAGCCAAATCTACATTTAGTGCATAGCTCCAGAAATCTAAAAGCAGATTGTTTTTTTTTTCGTTTCTTTCTTTCTTAGATCCAAAAACGCATTTATTTTATATAATTACTGAGCACAACATGTA----------AATAACATTAAAAGAAAAAAGGAAACATACA
>mira 15757521 15757905|16168 chr3R 15757542 15757796 scaffold_12 1499674 1499904 + 1123|0 258
TGTTTCTGAAATC---TCTTTCGAGCACTCTCCGACTAAATTCCAAATCTGATTGTTTTCTATCTTTCGCGTTTGTGTTCTGGAAATATGGGACTTACCTAATCTCATAAAAAATATCATTTTGATGCAATGCATTTTAAG-GCATGAGAAATCAAATAAAAAATCTGAAAAAGGTGTCTTGGAAAGTGAGACCTTCTTTAAAGCTATTTAAATTAAATAGACTCATCTTTGAATGTAACGAAAATAATGAGAATGCAT
TGCTGCCGATATCAAACTTTGCGAGCACGCAACGACAAA-------------TTGTTTTCT--CTTGTACATTTATAT-ATATATATATGT-ATATATATAG-CTGGTGATAAAAAT--TTTAAATGAGTTTCAGTTTAAGTGCAGCCGGCAAATTATGCACAAGCCTAA-----TGTC---AAAATCGATAAAACCAACAAAAAAATTTAAATAAAATACACAAATATATGAACGCATTCAGAATATTGAGTATATAT
>mira 15757521 15757905|16169 chr3R 15757813 15760720 scaffold_17 1600368 1603238 + 134606|0 111
GCTATTCCTTTGTAAC-------------AACTA--CTCTATCGTACTATTATAAATTA-TATACCTTAGCTAAGA---TCCGATTCGAAATATAATCAATACACGTTGCAC
GCAAACGACCAGAAACGAAATTCAAACGAAATTAGGCTAAATTTTGTTCCAATAAATTATTATAAATAAGTTAAGAACCCCCCACTCTATATATGA--AATACACGATGTGC
>CG17190 15837498 15837601|16259 chr3R 15837489 15838440 scaffold_17 1707099 1708079 + 25829|9 152
TGG-ACTTTCTCGGAGA---------------------------------TTATGTTCTGTGATTAATATAAGT------CTTGTGCAAATTCGGATTTCCCTTGATTCTTACTAATTAAATAAACGAAATGTTATGAAAATGG
TGGTGCTTCCTCGGCAAATTAAATTGCAATTTCTGGCAATGGAACTGGTCTTGTGTACTGTGATTAATATTAGCGCTTAGCTTGGGGCATTCAATGTTCCTTCTTTTTAATACTAATGAAATATACGAAAAATTAAATTATAAA
>CG31210 15840511 15840735|16261 chr3R 15839443 15841427 scaffold_17 1710583 1712582 + 14618|1119 1391
GCCATGG-------ATGGGTTCCGTCTGGGCC-------------ATGGCCGACATGGATT-TGGTGGTTTTCAGAGCAGAGTTGATAGCTGAGTTACCCACAGCGTTTTGCAGGCAACTATTGACTGCCGT-----------CTGGCGTTGCATTGGCAT-GTTGGC------ACCCTGACCCGCA----TCCAGTGCGGTTCCCACAGCGTCCGCCG-----TTGGCGTGGATGGGAAGGCCTCCCAAAATTTGCGGTCCTCGGCACTCGC
GCGCTGGCGCAGATCTGCGTTTCTTTTGGATCACCCAAGGGTATAACATTTGGCATCGGTTGTGGCATTGTGCCGGGC-GAGGTGCTGGGCGTTGTGCTTGGTGCATTCGGTGTGCTCGGAGTGAATGGCACGCTAGGTGCTATTGGCGTTACCTCCACATCGGTAGCCGCGTTGCCCAGAGCCGCAGTAGCCGCTTGCAAGTCTTGCTGC-TCCGTCGCATTTTTACTGGCGGTCGAAGTGCCTACAGCA--TCGATGCCCTTCACATACCC
>CG4433 15844300 15844707|16262 chr3R 15841429 15845527 scaffold_17 1712584 1717234 + 85108|3406 3907
CAGGAGGAGGAG------------------------GGCGAGCGATTGAATTG-----------CAAAAGACAAACTACCTTCATGATCGGATGCTCCGCTCCGAGTGGCAGAGCAAGTGGTTTTTAATTTAAACTCTGACGATTCTACTAG---TATATATATGT---------------------------------------------ATGTAACTACTACTGTTGGCCAAACGATCGATAGTAATTGGAAAGCTATATCCAAAACCACGAAGGGAACAAAGAATCAGCGAAGCGGCAGTACCATAGGCAACCGAAACCACAAAACAGTCCATTAATTAGTTCCA----CACTCACATATAAAATGGCATATCTTTA-ATTCTTATTAGTTAGCTCT--AATTATTATTTATACTCAGTCCAAGCAATGTTCCAAAGTGTGCGATGTAGTCAAGTGCTTTAAAATTAAATTAAACATG----TATGCGTTATTCTAATT
AAACAAAGCAAGCAAGAATACCATGTTTTATGAAAAGTTGAATGAATGCATTGTGAAAAAACACCAAAAGAGAAACTACCTACATGAATGAACGCTT-GACCGTAGCGCCAAGCTTAGCTATTTTT---TGAAACT--GACGATTCTACTATAATTATATATATGTGCTACCATAACTTACATTATAGCGTAAGCGCTTTGTTCTAGCCAAATTCAACTGCT--TTTTGGTACAAACACAAAAAGTGGTAAAACAAAAAGAGTCAAAACCACCCAGGGAACAA-GAATTA----------CGTATAACCAGACATAGAAACCA-GATGCAGTCCGGAAATCAGTCACAGGCACTCTTACATACCTACATACATATCTTTGCATATTGATTAGTTAGCTCTTAAAGACTTATTTATACTCA--------AATGTCCAAAAG----CGATGCAGCTAAAGTGACAGAAATGAACTGCACTATGCTATTGTTTATGTTTACGATT
>CG4424 15852209 15852348|16267 chr3R 15849071 15852942 scaffold_17 1719573 1723394 + 145723|3233 3409
TAATATAATATTTATAAGATC---------GCGACA------TTTTACCTTTGCTTAAAGCCTAAAACTTTGTATATACGACCTTT-------------GTTATATAAAGTTTGCTAGAAAGATTT---------CATGAAACTAACTAAAAAGCATTCTAAAAAAAAAAACAAACT
AAGTATCACAGGTGTCTAATCTAATAAGAAACGGCAAAGAACGTGTATCTTTGTTTGCAAC----GATTTTTTGTCTGTGGCCTTCAGTTCTGATGGGAGCTATATAATATG-GATATATCGATTGGGGTCCCCGCTTTGAATTTAATAACAAACATGTTTTAGTTAAATACATTAA
>CG4413 15855282 15855387|16269 chr3R 15853762 15857254 scaffold_17 1724327 1727850 + 54303|1674 1828
CATGTTCTTTTTAGTTCTTATGCA---------AAGTTTAGTCT--------AAGTATTTAGTAAG-----------CCGTTGTTTAAGTTCTTCCATTAAGCA--AATAAATGTAC-----------ACAGGATATA--------TTTTTTTGT
CA---TCGGCTTAGGCCTCGTACAAATAATTTTAAATTTAGCCTTTATTTGATATTATTTAATAAGTTGTGTGCTAATTGTTTTTTGATTCCTTAAAAGGAGCATTCATAATTGATCCCATTTATACAACAAAAAATAAGCCAAATTATTATTGT
>CG10889 15859598 15860017|16271 chr3R 15859360 15859761 scaffold_7 4218761 4219182 + -2052|262 433
AAAGAGAGAGAGCAAACGTGTTTTAAATTGATTAGAATCCTTGATTAATTTATGTCTTCCTTATAACTTATAATATTTAAACACTAATACTTCATTCCCTG-TTTATCTAATGTTATTTACGCCTCAGGCACCT-------AATAAACAATCAACTAAACTCAAAATATTAA
AACTTTAGAGAAAATAGCTGTGTGCTAGTTAATAAATTGCATATTTCACATTTTATTTGTTTATTATTTATTTTGTTAAATTACT--TCTTTCGTATGCGGATTTTTGTTGTATTCTTTTTGTCGCAGCTAACTTTACAGTGCTACGCTGTTAATTCGCAGCAATATGCTGA
>CG10889 15859598 15860017|16272 chr3R 15859762 15863010 scaffold_17 1729601 1733087 + 83890|0 390
GCTAGGCTTAAATTTCA-----------------------------------------------------------------------------TCAATATAATTAGATGTG------------------TAATTACACGC-GTGTTTCTGC---------------TTAAAGTGTAAA-------------GTGTCGCTTTGGGACGACGTGGAGTCCTCGCTCGAAATTTACATATCCAGGCCAACGATGTTGGCCGTGTCGTAGGACACCAGCCCGGCTACGGATTCCC---GTGCGGACTG--------GCCGCGCCTCTCGTGGATGACCCGGTGGTTACGCAGTTTGTACGCCTGCGGGAATCCCTTGCCGCACACATCGCAGCT
GCTAGACGCAAACTTCACAATAGACCGCGTTCGTAAATTATTTAAATTTTACTTGTTACAGTTAAATGTTTCATAATCAATTACGTATTTGTAATTCATATATTTATATATGCATTTATATATCTATACATAACCACACGTTGTATATATGTATATATATATTAATATTAATATATATATATATATATATATATATATATATATGTCTAAATGTTTTTATGTGTTAGCATTTACAGCTCCAGGCCGGCCTTGGCCGCCGTAT-----------AAATGGGATACAGATCCTCCATATTGGAATTGACAACACCGCTGCGACGATCATGGGTAATTCTATGATTGCGCAGCTTATACGCTTGCGGAAAGCCCTTTCCACAGATTTCGCAGCT
>CG17193 15862142 15865311|16272 chr3R 15859762 15863010 scaffold_17 1729601 1733087 + 83890|2729 3734
ACAAAAGTTAACTTGACACTCAACCACCGAAATGTAGTTAAATAGTGCATCATCAAAAAAATAGACAAGGATTCAGAGTACGGTAAGGAAAAGGACTTTACTAATTATCCGTTAAGCAGGAAAA---------------ATGCCAGCAGAAAAATCCAAACACGCTCAAAGAGCAACAATAAATTTTACGACGGCCATAATAAAAAAAGATTGGAGCACAAATTTTAGCACTTGTCGTGTGTCTGAG-TCAGGAAAAATAGAGTTTCGCAAGGACTCGCCACTCAAAATGCATCCTTA------TCCTTTAAGGGAAACTCACTTTCC-CTGCGTGCGAAGAGAATGACTCGTTGCTTTTTAAGCGGACC-------------------------------CATATAGT-ATACATATAAAGCCACCCCAAAAAGAATCCTCCCATG-----------------------------------------GCACACGTAGCAAACTTTACGTCCACTTTTATAGTTTTTTTAT-GTAGCGCTGTCCCACTAATTGCCACATGACTTGGCCAAAGATGACAGGACGCTGCAGGACGAAAGGAAATTAATGAAATTACTTTAGTGTCGCCGGAAGGAGGGGGCGTATTGCGTATTGTATATGCATTTATCCAATTGCACTTCGATCGTAGCATATAGATATCTATGTA-ACCATGATAGATGTGACCACTT---ATACCTAGTA----AATTATTGAATTTGTGGCCAACTCG--AGGCAGTGCATCCTTTTTGTCATGAAAAGGGGGACCAAA-CGTACAATGAAACAAAGAATTCAATACGAAAAACATGTACTTTATTTTAACTAATTAAATCGA---------------------ACTAAGTGAGATCTATAAATGTTGATAGTAG--AAATTGTTAAAAC------TATATTCGAAATACTTTATGTACAATAAATACAATAAAGAAATGTTTATGCATGTTACT
ACAAAACTTAACTCGA------ACAAGCAGAGTGTAACAAAA-ATTGCAACACCCAATGGA--AATATGGTATAAAAGT----CAACGCAAAA-ACTTCACTAATTACCCGTTAAAGATGAAAATCCAGCCCTGAACACGCACTTGCACACAGATACAGACACTCATAAAGAGCAACAATAAATTTTATGTTAGTCATAAGAAGCACACAGCGCACAGAGAAACCCAG-ATTGGTTGAACACGCAAGAGCAGAAATTATAGGAT------ACGACGTGTCGGG-GGAATGCATCCTTAATACTTTCATTTGGAGGAAATTTAAGTAAAGCTGCGTGCAAAATGAATGACTGGTGGAATTTGAAATGGACCATGCACAAACAAAAAACACAGGCACCAAATCCATATACTCACACACACACACACACACACACACACATACACACACGTGCATATATATTAGTAGTAGCAGCTCTATAACCGTTTTTAGACAAAAGTAGTAAACTTTACGTCCAATTTTATAGTTTTTTTTTAGTGCTGCTGTCACAGTAATTGCCACG-----------------------------AAAATGAAACGAAATTAATGAA-TTACTTTATTGTCGTTGAAATA-----------CGTGTGTTTTCTATGCATTTAATCTATTGAA------------------AATCTCTATATTTACCCGAATAGATGTGACCACTACTAATAAATAGTATTATATTTATTGTACGAGTAGTTTAATTAGAATGCAGCGCACTCTTTTT-TCATGAAAAGAGGGACCAAATCATACAACAAACAGAA---------ATAAACAATGTGTACTTTATTTAAAAAAGTGAGATCTATAAATGTTAAAAACGACTACTCTTAAATGTTATATACTTATATGGATTGTAGCGAATTTGTTAAAATAAAAATTATATGCGATATTATAT-TGTACACCA----CAATAAGAATCTATTTATGCATGG----
>CG17193 15862142 15865311|16273 chr3R 15863192 15866573 scaffold_17 1733791 1736935 + 17735|0 2396
AGGTTGTCCCCAA----------------------------------------------------GGGAATTCGAGAACAACGGAATGATGCTTTCCTTCCCTTCGTCCTGTGTTTTTGTTATCCTGTGCAGGGAGGAGGCGGTGCAAGGCCAAATGTCAACATGGTCG--------------GCGACAATGTTGACGTTGACGATTTAGTTGGCCAACAAAAAT-----------AACCCAGAGTGGCTGCGCCCAACTGCCGGCTTGCGTTTTTTCTC-CTTGCAACCCCAACCCAACTTGCAACCCGAATACCCGGCAGACACGTACCCAAATCGGAAACCAGTGGCATTTTTGTGCTGCTTAAACGTTTCGCCATCTCCGTTGGCTTTGCCACAGTTGCAGTTTCTCGAGTGCCGGGAAACATGGCTCCTTTGTTCGGATTGTTTGCCCACTGTGCACAGTGGGTGCCAGCACTCGCCACTTGCCACTTGACATTTGACCAGC-CAATTAGGCGTTTTCTATTTTCCCATTTTGTATTTTCTTTGCTGCAGTCTCGTTGCGAAAACATGGACACAACTGTAATGGCATAGCACTTTTTAAATTCTCCTGCTGCTGAAGGAAGAGGAGACTTTTTAAGACATTCATAA---ATTCGAGTT-------TTTATGCCGCATCCAGGCATTTCAATTTAAAATGCAATTCACTCGAATTCCACCATGCAGCAACCTTTTGTT--TGTCAAACCGAGCTGGAATAATAAAAAAAAGCAACCTCACACCACGGAATAATGGCAGCGAAAGAAATATAAGCGATACTCTTGCAGTGCGCTCCGTCGATATGGTTGCCCCGAACTGAATGCTGGATACATTGTGCATATGTGCACTGAGAGAAAAGTGTGATG-ATATCATTCAAAATCACAAATAAACGACACTTCTCATGGGTCGTAATTTTTAACCAACAAAAGCTTTATTTAAGAATAATTATAACAATAGC------AACCATTATTGATGATGCATAATCC--AAAAATGGATCAAGTTCCATCAATTTCCAAA------TCGGAATTTCATATGAAAT--TCATATGAACAATGAATACAAAACCAACGATACTAAAACATGAAACACCTAAAAATATATATACTAACACGTTTTATGATTTCTTATATTAATTATGTTTTATATTTCATTTAAAC------CACTTTTTTTTCAGAAATATATTTTTTTTTATTTTTTCATAACATAGT-TTTTTTTAGTGATTTCAAGATTTTTATTATTCTTATAGTTTTTAATAACTCCAATTTATG------------------GCAGACTGTGTGCTCTGTGTGGT----------CTTACACACATTCCAATTTCGAGTATTGACAGCGCGGGAGCATTTAACTATCCAATGGAGAGGGGAAAAGAAACCCACCAG------------------------------CTAGTG-AGTGACTTTTCTTATATCCTTTTTGGTTCGTCTTTTTCCCTGATGCTCTGTGGGATCTGCTTTTTTTTGGGATTGGGTTCAAGACCGTGTCCCGAGGCCGTAATAATAAAAACAGTAGCGGAAACTGGGTGCAGTGCACGCGAACAAAGCGTTGAGGAACAATAAGGGAAA---TCGCCCAGCGATTTCGTGGTAGCAAAGCGA---------------TTCCAAG---------GGAAATAGGCAGAAGATAAAGGCCAGAAAGAGTTGGCATTAAACTAGAGCAAAATGAAGCACATTTAAA---GGCCTCTAACGGCAAACGTAGCTGTGGGCATAAATTAAAGCTCTTGTCAGGCGAAAGGCTCCACAGAAATAACCATCTCACATCCTGAAATCGACAAAAAAACCAACA----CACATCCGC---CTTTTGCCAATGTGT-----CGGGAACTCATGGTTAATCAGCTTAGACAACCTCCGTCATCGGGTTCG-AGGCATTTTGTTGTTTTGCCTGCTTTTTTGGGCAC-ATCAAGAG---------GCCTAAGAGC---AAACAAATAACTCGAGTTCGGTGGCCAA--------------------------------GGGGGCTTTTTTCCCTGGAAATGCTTTTAAAAATTAAACAACTGATAAATGACAAAGTTCGTTGGACCAGAAATTATCG--TTTGACAAATTGGCAGGCCCCGATGAGAGCTCATCTATTGCCTGGCAACCACGTGGTGAGCAAGTCCTTTTAAGATCCTGCAGATGAAGAGCACTTACGGCGGAGC-CAGACGAATTACTAGTGACCAAATGGTTCTATTGACTTGGAAAATT------------AACTAAGAGAAGATTTTGCGTTGAAGGATTTA
CGGGTGCCCGCCACAGCCACAGCCACAGCAACAACAACAACAACAACAGCTGGAACTAAAAGAATAAGAACACTAAAAAAAAGGAACGACAC------------------------------------ACAAAGGGGAAAATG-GCAAGGTCAAATGTCAACTGTGCTGCTGCTGCTGCAACTGCAACAATGTTGACGTTGACGATTAAGTTGGCCAACGCGAACGCTTGTTTTCAAGCCAACCGTGTTTGGCCCCAGCTTACACTACACACACACACACACACACACACACACACACTCATACAGACCTTATACTCG-----CACGTACACTA-----AAAAATGCTGAAATTTTGCG------AAGCATTTTCCCATTTTCTT----------ACATATGCATTGT-----------------GTGTATCATTTCTTTTTTTTTTTTG-----GGTATTCATTGGAT-------TTCCCTCGATTTCGAGTGCAGCCGAAACAGCGCAAAATGGCGCGCTC------CCAAATTGGCAT-------------------------AAATATACATATAGATATATAAGTATATAGGTATATAGCTTATTCCAGTG-TGCAGCAAGCACAGTGTTGCAAAATGATTTACAATTGAGTTGAGCTAGCAAAGTTTCTAGATTATTTGATAAATTCAACTT--ATTGTATTTAATTTAAATTTTAATATTCATAATTATTTTATTCATATTAATTCATGCAAAATTGTTAAGAAAATGT----------------------------ATATATATATATGACATATTCAT--------------------------TTCTAATTAAATTAT-------TTTTGTTATTATTTATTTA-AGAAAAATGTATTGTACCTGATTTAAATTAAAATTTAAATGCTTTTTTTATTCATATGTATTCTT------GCAAAATTGTTAAGACAAATTAAATATATTAATTTCTAATTAAACTATTTTTATTATTATTTATTTAAGAAAAATGTATTTAATTTTCATAAAATGCACATTATCTTTGCAACATTATTTAAAATTGTCCACTCCACGCTGCACAACCAATTTGTGCTGCACAAAATTG---TATCTATAGTTATGGACTCAAGTGCAGCTTA-----------------TCTGCTTTTGATTTTAATTAAACTGGCTGCAATTTGGGTTCAA--------------------TTTAAGTACATAGTATTACAATGGAAAATGCAAA---------ATTCTTGAACTTTTCGATGGCTAACATTCATAGACCTTCGAGCCAAAAGCGAACGCTGCGCGTTTTCTGTGCTGTCGATATTGCTGATGCAGATGCCAATTTCAAGTATTGACAGCGAGGGAGCATTTAACCACCAAAGGAAAACAGACAAACCGACATACAGGCAGACAGACGGAAAGCCAAAACGAACGAACCGAGTGAAGTGAGTTTTCTTAT----TTGCCCGCTCTTCCT--------------------ATCTCTTTTTTTTC----------------CGCTGGCTTGAGGCTATAATAATAAAAACAGTAACGGAAACTGGTTGCAATGCACACGAACAAAGCGCGAGGAAACAATAAAAAAAAGTGTCGCATAACAATTGTCGGACAACAAAACGAGAGCTGCCGGGAGGGTTCCAGGAAGCACTCAGATAAGGGGCAGGCTGCGATGGCCAAATCAACTTGACATGAAATTAGTGGAAATTG-TGCACATTAAAGTCTGTTCTTTGACCACAAA-----------ACACAAACTAAAGTTCCGGGCGTACAATCTATTGAATATAAAT-GTGGGCTCGCATGCCAAGGTAAGCACACACACACACATAGTCACACACACACACTCACACACAGGTATCTAAACAAGGGCTAAATGTTAATCAGCTTAG--------------CAGGCTCGCATGCAATGTGGT--------TATATTTTTGGGCTCGATAAACAGGTTTTGTTTGCCTAAAAGCAAGAAATAAATGAGGAGAAACCGTTAAGCGAAAACACAAATGCTTTTGCACACGCATCAGGCTGTGGGCGTTATCATGTCG-CATGCTTTTTAAAATTAAACAACTGATTAATGACAAAGTTGGTTTATCCAAAAATTATCGGATCTAATAAATTGCTGTAGCTAGATGAGAGCTCATCAATTCTGTGGCAGCGCATAGGCAAGCTAGGC-------------ACATATGCTAAGCAATT------GAGCATATGAGAGTCCCT-----TCGAATGATTCGAGAAACTTCAAGCATTGAACTTAATGGGAAATAAAAGACAATTCTGTAAACAAAAAATTA
>Rh3 15906772 15906996|16326 chr3R 15906772 15908314 scaffold_3 5985361 5986898 - 71527|0 235
TGCAAATTCCCACCCAACAGCCACCCATCCAAAAAATGCTGACAATGATGATGAACTGAAACGGCAACGAACTCGTAATACCAAACGCCAGGGAAAATTGTATAAATATTTCACGGAGTTTCTGCTAGAGTGCAAAGAGTTGAAAATATT--------TTCTTGTTATGATTTGTAGT-CACTTTTGTGTTTATGAAAGAAATA--TAGTAAAATTACAGCAAGCTATGGAAAAAA
TGCAAAATAC-------CTGTTAAGCCTCCAGAAAGGAC-----------ACGAACT-CAACTGAACTCGACCCGTAAAAGAAAATGCCAGGAAA------ACAACTATAACAGAGACTCAAAACAAAAAGAAAATGTGCTAGCAATAATATTATAGCTTCTGATTATTATTTGTAGCATGCTCTT---------AAATAAATAGTTAATAAA-----TGCAAGCAATCAAAAGGA
>CG17199 16033923 16034057|16486 chr3R 16032348 16035633 scaffold_3 6349134 6352382 - 32633|1706 1923
TTAAAT--CTGGCCAAGTCTTGTTTAGCTTTTGTGCTTGC----------------------------------------------------GAAAAGTTTGAAGCTCGTGAAACAGCGATTTTTCTTAATTTACTTGAGATAATT-----------ATAAGTAAAGTTTAATTCAGCGAATTAAAGCGATT------------------AGCACATT
TAAAATAAATGGCTGA-----ATTTAATTTTTTAGTTCGCATTAGTTTCCTACTACGCACAGAAATCTACAAAAGTGATGTCAAAATAAAAAAAAAAAAACGATGCTGATGGAGCTACG--CATTCTAAGTCTGAGCCACGCAATCAGCTGCATCAAATAAGATAAGTCCGAGCCAAGAAATCAACGCAAGCTCCTATCAAGGGTCAGAAATCAGATC
>CG10883 16114002 16114087|16574 chr3R 16113539 16115959 scaffold_3 6442810 6445425 - 78060|591 694
GTGCGGCTGGAACAGCACATGTTGTTGCTGCTGCTGCTGTTGTTGGTGTTGCTGGTG--------------CTGCTGC----GTTGCTGTTGACTCGGCGGCTG
TTGTGGCTGAAACAAAACATGTTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGATGTTGCTGCTGTTGTGGTGTCTCGACTGCTGCTGCTGCTGCTGTAGTTGTTGCTGTCG
>CG4367 16129800 16129923|16583 chr3R 16129768 16130846 scaffold_3 6461086 6462242 - 23706|32 166
GGTGGTTAT--CATCAGCGGTGGCCAATCGAACAATACTGCT-AGTCTCAATAAATTATGTAACTTATTTATTTCTAA-----TTGTTCCAAATTGTTCATCAACAATACGATTTTGTTTTAAGAAAAGGTT---
GGAGGTGATTGCATAAGGAAACAGCAGATGCA-GATGCTCCTCATTTCCAATAGAACAAATAA-GTATTAATCTCAAAATTGTTTGTTACAATCTGTT----ATAGATGAGATTCTGTAATGAATGCATGTTTCA
>CG4360 16150802 16151350|16609 chr3R 16150790 16151029 scaffold_15 2250373 2250610 + -775|12 253
TCTATAC---------TATCCCATGATGGTTCGATTTGAGTCGGTGTGTTAAAGGTATCTTAAG---GCACTTTAAAGCCATTTAGTCTAAAACGTTTTATTATCTTTTAATACCCATCAATTTCTCGCTTTTCAAAGCTTTGTAAATGAATCATCGGCGTCTTTTTAAGTTTGGTTGCTG--TTTTCGAATGGCAAGGAAAATGACTACAATAAATTTAGATGTGACCTACTTTGCACAAT
TGTACTCCCGTTAACGTGTTAAATGCTAAGTCGAATTTA----ATGTAACAAAAATACAGTAAATGCTCTCTTAACGGCCTTCTTGCTTCTAATTTTACACTATCGCATTTAGCATTTCCATTTATGGCCTT------CTTTCTAATTTAGTTC----CGTGGTACGAAGCTTGAAAGCCGCATTTTCCATTACAGAGG--ATTGACCTCTGAAAATGAGAATAAAGCCAATGGTGAATGAT
>CG4360 16150802 16151350|16610 chr3R 16151030 16151057 scaffold_20 272534 272561 + 2132|0 27
ATATGATACAGGGTGTTTAGGCCTAAAC
ACATAATACAGGGTGTTTAAACCTAAAC
>CG4360 16150802 16151350|16611 chr3R 16151069 16153737 scaffold_20 272636 275518 + 122416|0 364
ACCCACTTC------------------AGATCCAGATCGCAACGCGATCCAGGTCCGCAGCCAGCCAGCCAGCCAGTCAAGCAGCCATTGAGGAATAGTGCAATATGCATGCCACATAGCACATACACTTAT---------AGATCGCATATACG---------------------------------GCATACGAATACGA--------------TTACATGAATAC-------TATATTTGAATATATACTCG-AAAGTGTTATTTACCTGCTGTGCAGAGCGCAATTGTATGT-AACTATATCGTAGAGAGCTGATCCACATGCGTGTCCAATTGTAAATTAAGGCTAGCCGTGTTGGCATA
ACTATCTTCGGCCAGTGAACGCGTCGTAGCCCCAAGCCCTAGCCCGAGCCCGCTCGCCCGTATGTCTGTCAGCCAGTCAAGTAGCCATTGAGGAATCGTGCAATATGCATA------AGCGCATACAGTTATACTAGATACAGATCGGATATAAACATAAGTACATAAAGTACGTACATACATTAAATACATACAAACATGCATAAAAACAAACATTTACATATATGTACACATATATATTTGAATATATACTCGAAAAGTGTTATTTACCTGCTGTGCAGAGCGCAATTGTATGTAAACTATA----GTAGAGCTGATCCACATGCATGTCCAACTGTAAGTTAAGTCTAGCCGTACTCGTACA
>CG4323 16325764 16325802|16826 chr3R 16325636 16326311 scaffold_29 115517 116169 + 14748|136 174
ACGATTTGCGTTATTTTCAAAATTTCTAGCTTTGCTATT
GCTCTCAGAGCCATTTT-----------GATTTGCTA--
>MtnB 16328960 16329059|16830 chr3R 16327978 16329572 scaffold_29 118054 119565 + 4338|1083 1182
GCGGGCCAACTATATAACTAACTGTTTAACTTCTAAACTGGAGCTTAACTCCCAACGAGTTGGCCGCAATAAATAAAGTTTATAAAGATTTTGAGCATTT
ACAAG-----------------------------AAATGGCAGC--AGTTTCT-----GTTATCCAAAAT------TGTTCATATAGGCTTGAAACA--T
>CG4288 16333112 16333295|16834 chr3R 16332940 16333980 scaffold_29 120108 121239 + 34613|202 483
GCCA--------------------------------------------------------------------TTTAGTTTGG--------CGGCTTCA-TCACATCATGAATTTTGTGCCCTAGTATTT-GTCGTTGTTACGTTTTTGTGATGCTAGCGATATGCGCACCATTGTGTCTATATTTATGTATGTTAATCCATTTAGTCTTTCACGA----------CACTCACTGTGAGTGTTTTTGCGAATAAACAAGGCATTTTATTA----------CAA
CCGATCCAGCACCGCCAGAACAATCAACGTGTTCAACTCCAAGCACAGCAGTAACCAATACCAGAGACACATTTTAGTTTAGTTTATACTCGTATTCATTCACAGTAT-CATATTGTGCCTTTGAATTTCTTCTTTGTTA------TGTGATGCTAACAA-------------GTGGAT---TTTATTCATTTTAGCCCATTGACTATTTTTAGAGCTGTTTGTGCACTCGCAGCGAGTGCAGTCGCAAATAAACAAAGT-TTATATTACTCGAGCTGGCAA
>Stat92E 16361405 16362267|16867 chr3R 16360992 16364048 scaffold_29 155032 158323 + 12291|450 1433
CTTTTTGTGAAACGCCAAAACACAAGAACAACATCAACATCAATAAGATCTAGCCGATCAATGCATGCAAATTG-AGCACCTCAACACAAACACCTTCA-------GCTCACAGCCAGAACATTGTCTATATAATATATC---GTGATTATGATTGTGTCTGACTTATGC---AAAATTTAGAATTTCTGTGTTGTATAAACCTTTGGAATGTGTCCGCACGTTGTTTTATAT----TTTTATATATATCTTTTATATATGTATACATATGATTT---CAATTTGTGCACTATGACGTGTTCGTCTGTGACAAAGCATTACGTTTAG--ATGATACTGACAAAATAATCGG-TTTAGTTAG--------TGAGTAACTAT------TTGTTGAATCTAAATTTTTGATTTTGATTTTAATTTTATGGCCTAATTTTAA------AACTTTGATATACAATTTAATTCG--CGTGCTAAGCCTATGTTAAACGAAAGTGGAAAAACAATCAACGAGAGCAGCAACGCAGGGATTGATTGCTTTAATTTTAGTTATA-------ATCTAAGTAAGATTGAATTGCTTTATGTAACCCCATCCTTTATTGGCTTCCAATGCTGAAAATGCGCAAAAATTTGAACTAATCAATGTATATTTTTTTGAAACTTGTTTGTTTGAGTCATCAGGGCAGAGTTTGCAATGCATTTCAAATGCGCCACATG------CGATTGCCTTTTTAGTCAGCTATTAG-AGACACGAGGACCATATTACGTTTGTTTGAGAGATCGTAAACATAATCAT--TTATGT-----------ATGTAAACAACAACAATAACACAATA-CTAC--------------ACTTAGCTTTGTACGTGAACCTTAAGAATTTTATAAGACTT--AAGTA---CACCCCAA----------------------------ATAAATATACAATTCAATAAACTTGAAA
CATTTGTGAAAACGCCAAAA-------ACGA-------ATCAACAAAA-CGACAAGAGCAATGCATGCAAATTGCGGCACTTCAACACACACACATACACACACACACACACACCCAGACAACAACCCACACA---TATCCAGGTCATTACATTTTAATAATTTCTATGCTTACAGATTTTGTATTTTGGT-TTAAATGTGTATTTGATTTTTGTAAACAAATTGTGGCATGCAACATTTGGCATGTGTGTGTAATACGTGCTTAGACACGACTTTGGCAATTT------TGTCAAATGTCTGT--ATTAAAGTGAATTATTTTAAGTGCTTAAGTTGAGCAGTTACTTGGATTTAGTTAGGTTTTTTTTATGTAACTATGGATATTTGTTGAATCTAAATTTGTGAGTTTTATTTTTAATTTTAAATATATTTTAAGTTATTTAGCTGGGACACA-AATGTACTTCAATTGTGCTCATTTTA-GTTATACAATA------------TGTACGTACGTATATATGTATATATCTATATCTATATCTATATATATATATATATATCTGTCTATATATGAATTGCTTTATGTATAAACCCCTTTCATTGGCTTCCA-TGTTGCAAATGC---AAAGTTTCAATTGATGTA-GTATATTTGATATGA---------TTTGAGTTAGGAAAAAAAAGTGTGCATTGCATTAAAAATGCGTTAAAAAAAGTAACTACTGCTTCTGTCGTCCACACCAAGGAAACAAAAGCACAAAAGGATAAACAAAAGAGAGATCGTGATGATGATGATGATGATGGGGAGGAGCAGGAGGAGGATAATAAAAATGATATGATAACTATTTTTTGTGTAAACAACTAAGCTTTCATTGTGAACTGTAAGAATTTTATAATACTTTTAAGTAATCCAACTTAATCAATAAATATATACATACAATATATATATATATATATATATCTATATATATATAT
>Stat92E 16362916 16363130|16867 chr3R 16360992 16364048 scaffold_29 155032 158323 + 12291|2206 2514
AACTATAACCACTATAGAAGCCTACGTATAA----ACGAAATCAGATAAACTCCTGAACGTGTGTCGCTATCTTGGAAGTCCGACGATG-ACGATTCCGCCACCTCAACGA------------------------TTGCAACGATCTGGCGC-----ATGAC-------------TCATTGTG-----------------------------CTAATCGAAAGTTTT-------ATTTA-------ATGTTATCTAGATGTAATTATTAGATTTGGGAATGCATCGTAGTGGAAGGTTTTGT----TTG
GGCTATAAGCCTATTAAGAGCATACATACATTTCTATATATATATATATATATATGCAAATATACACCTATAT-ATAAATGCGAAAATGTATAATTAAATTACGTAAACAAAAGAATCCTATATACATTGTATGTTTGCAAGAATTTGCCGCTATTAACGACGTCCATTAGATGTTTACTGTAACCAACCAAACTTCCCACACAATTCACAACGAATCGGACACTTCGACATTAATTTATAAAACTGTTTTACCTAAATGTAATTTTACATATTCGGAATGCAACATTGTGGCATGTGTTTTATTTTTG
>att-ORFA 16378111 16378630|16881 chr3R 16377958 16378326 scaffold_29 171073 171494 + 1496|177 446
CTCGTATTCAATGGTGTTGCTTTGACAATAACACTCCTAGATTAATGATTACGATTTACCCGAAC--------ATTTTGTATATTGTGTATTGCCAACTC-----------------------AATGTCAAGGCGCTGCGACTGTTAAAATA--------------GTCATGAATTTGAGGGTGTTCACAC---CAGCATATACTATGTAATTCTTGTATGTTAGTGTG-TTTTTATTATTA-----AAATTTACAAAATTGTTTAACTG
TTTGTAATTAAACGCATTACCTGGACAATAAC------TGTTTAATGTATACAACTTTATAGCTCTTAAAATAATTGTGTA-ATTGTCTTTTG-TAGCTCTTTTTTACTTTACTCAAGTGTCGAATGTCGAGTAGCAAATGCTGTAAAAATATTGTATAAAAAACTATCGTAAATTTACCAATGTTCAGTCATGAAACCAATACTTTATTA-TATGATATGTGAGTGTGTTTTTTATTAGCAAAAATAAATTTACAATGT--TTTAAATA
>att-ORFA 16378111 16378630|16882 chr3R 16378353 16379095 scaffold_29 171533 172336 + 20064|0 349
-CCAGCTCCC----TGCCCCTGCCACTCGTCACCCATAAACAC-------------CACACCA-----------------AAAACGCACTGCTTT-GATCTTAAGTCTCGCGATCGATGGATGAGCTGAGGAAATAGAAGTGAAGCACCGACATGCTCTA-----ATTGTTAGATAT----------TTTTTAGCTGTTAGTTGTGAGGGAGAGAAGCGATGAAGTGAAGACACCCGAAAGCGCTTAACTTTGTTATTAACCGTAATTGATTTATTATCGCCGTAAGCCGAAAGTATATCAGC-CAAT---------------------AAACTGTCTGAATAATGACTC
ACTGGCCTCCAAAACACACATACTCATTAGCACACACACACACACACACACACACACACACCAGCAAAACCCGAAACAAGAAAACGTACTGCTTTCGCACTTAAGTTAAATGTT---TCGATAGCTTGAAAGGAT-TTAGTGCAGCATTCTTATGCAGCATCAGCATTGTTATATATTTGATTGATATTTTTAGTTGTTAAATGTGGGAG-----AGTCATGAA--GAATACAC----AACCGCTTACTTTTGTTTTTCAATGTAAACGATTATTT---TCTTTAAGTTGAAAGTAAACAAACACAATAAAAAAAAAACAAAAACAACAAAACTATCTGTATAAAGTTTC
>att-ORFB 16378356 16378778|16882 chr3R 16378353 16379095 scaffold_29 171533 172336 + 20064|3 505
TGAGGAGGGCGTCAAGAACGGTTTCTACAAGGGACTTAGCATGAACTGGATCAAGGGACCCATCGCCGTGGGCATCAGCTTCTCCACCTACGATCTGATCAAGGCGTGGCTCACGGAGCTGGCCAACTTGA------GACGGGTTGAGAAATAGC--CCAGCTCCC----TGCCCCTGCCACTCGTCACCCATAAACAC-------------CACACCA-----------------AAAACGCACTGCTTT-GATCTTAAGTCTCGCGATCGATGGATGAGCTGAGGAAATAGAAGTGAAGCACCGACATGCTCTA-----ATTGTTAGATAT----------TTTTTAGCTGTTAGTTGTGAGGGAGAGAAGCGATGAAGTGAAGACACCCGAAAGCGCTTAACTTTGTTATTAACCGTAATTGATTTATTATCGCCGTAAGCCGAAAGTATATCAGC-CAAT---------------------AAACTGTCTGAATAATGA
TGAGGAGGGTATCAAAAACGGCTTCTATAAGGGCCTGAGTATGAACTGGATCAAGGGTCCCATTGCTGTAGGCATTAGCTTCTCCACGTATGATTTGATCAAGGCTTGGCTTATTGAGTTGTCCCACTTGAAGCGTGGTCGGGTCGAATAGTAGCAACTGGCCTCCAAAACACACATACTCATTAGCACACACACACACACACACACACACACACACCAGCAAAACCCGAAACAAGAAAACGTACTGCTTTCGCACTTAAGTTAAATGTT---TCGATAGCTTGAAAGGAT-TTAGTGCAGCATTCTTATGCAGCATCAGCATTGTTATATATTTGATTGATATTTTTAGTTGTTAAATGTGGGAG-----AGTCATGAA--GAATACAC----AACCGCTTACTTTTGTTTTTCAATGTAAACGATTATTT---TCTTTAAGTTGAAAGTAAACAAACACAATAAAAAAAAAACAAAAACAACAAAACTATCTGTATAAAGT
>att-ORFB 16378849 16379035|16882 chr3R 16378353 16379095 scaffold_29 171533 172336 + 20064|584 770
AAGTGGTCGGCAACAATAAACCCAATACTCTAGTCTCGCTGGCCTTCGGTGCTGCGGCTGGTGCCGCCGGGCAAACGGCCAGCTATCCATTGGACATTGTGCGGCGAAGAATGCAGACAATGCGGGTGAACACGGCTGGCGGAGATCGGTACCCAACCATCCTGGAGACTCTCGTCAAGATCTATCG
AAATTATTGGCAATACAAAGCCAAATGCTCTCATTTCGCTGGCCTTCGGCGCCGCGGCCGGAGCGGCCGGACAAACGGCCAGCTATCCGCTGGATATTGTGCGTCGGCGCATGCAGACGATGCGTGTTAGTGCAGACGCGCCCGAACAGTTTCCCACGATACTGGAGACGCTGGCTAAGATCTACCG
>att-ORFB 16379292 16379305|16883 chr3R 16379289 16379950 scaffold_29 172337 173001 + 34895|3 16
GCGGGAATACTATG
GCGCGAATATCATG
>CG15922 16385429 16385504|16887 chr3R 16384027 16385958 scaffold_29 176298 178251 + 52108|1447 1558
CAAACCCTCTGGTGATGAGC--------------------TTAAGACA--TACAATCTATTTATTGTATAGAA---------TAATTAAAACTACA-----TGCAAACTGTA
ACAGCCCGCCGA-AATGAACATGTCCAAAATGTTGTTTTGTTAAACTAATTAAAAGCTATTTATTGCATTCAAGTGATGCAGTAATTAGATCTACGAAAACTTTAAACTGTA
>CG10877 16388208 16388365|16890 chr3R 16387380 16388221 scaffold_41 509748 510567 - 1185|910 923
TGACAATTTCTCAT
TGAAAGCTTCAAAA
>TFAM 16401073 16401216|16901 chr3R 16400929 16401377 scaffold_29 194680 195120 + 7411|150 294
TTGTAGCTGCTCGGCCCGCCCTCTTCCATCACATAATTCA-CAAATCATGCATCATTCTGTTTTTCGTTTTTCTTTTTCGATCGCCAATTGTTAAGGTTAGGGCATTAAAGATTAAATGCTAGCCAGCCAGCATAAGTTTAACTT
T-----CTGAACCGCACATTATCTGCCATCACATGTTTCGTTTTTTTAAACACCAGTTTGATT----TCTTTAGTTTTTCATCG-----TGTGAAAATTTAATTTGTTAAGTTC-----TTTGCTCGCCTTTATAAGTATG--TC
>Elongin-B 16403780 16404399|16903 chr3R 16402861 16404538 scaffold_22 378087 379871 - 58455|1016 1730
GGATGCAGCCACAGCAGTCAGTCAGTCAATCACCCCTACGAGAACAACAA-----ACAGCAGCAAACACATCATCAAAATCAACAGCAGCAGCAAAT------------------------------------CGAGACAAAATAAATCCGCTAACTC--------TGTCGCTCGCTTGTCCCACGCA---AACGAAATGTATGAAAT-TGAAATCGAAGTTGATGGTCGGACCGGACGAAGGAGGAGGAAGATCTATTTGTCTGCGATTCTCAACTTCCCAGCGTGGTGAAGAAGCAAAAGCTGCCGTCTCAACTGCAATAGCTAAATATGCAT------TTTTCGTTGTTAATAGCAAGGAACAATTAATTTACTATGGTTCCGACACAAAATTGAACTTTGGAATGGGATT-GATAATATTCGGCTTTAATTTTACCCTAACCCCTTGATTGTTTCTTTTTAATGAAATTTATACGAATTTGTTGAGAAAA-------------TACACAAAGTCATAAAAACAATATGTGCGAACTGAGCGAACGTGCAGACATTTCAATACCCGATC-------CGCTTGATCCTTCGTGAGCAGA--GTGAATA-TTTAACTAATATTGGGATCTAATTATATTATAATTTATAATCAAATCAT------------TATTTTTGTAATAATAAGATTTAATTATTATTAAAAACGAACG
AG-TGTAAAGA-AGCATTAAAATCAACAGCAACAACAACAAGAAAAACAACAGCAATAACAACAATACCATCATCAACAATAAGAACAGCAGCTAATACTTGGATTCACAGCCGCTGCTGCTGCTGTCGTATGCGAGACAAACCTAATGCTGAGAGTCAAAATAACTATTGCTCGCTTGTCCCCCACAGTCAACTCTCTTGATGCAATGCTAAATTGAATTTGA--------------------------------ATTGTACTACAATTT----CTACTCTGCCTGGTCAAAAAACAGCAAC---------AGCAACAATAGCTAATTATGTATGCATTTTTTTCGTTGGTTATAGCAAGGAACAATTTAAATAATATGATTC------AAAATTATAATTTGAGATGGGATTTGATAATCCTA----TATATTTAAAATTAACTATTTGTTTGTTTCTT----AAGGAATTTGTACGAATTTGTTTAAGAAAAAAATAGATATACTACACAAAATTTTAATGAAAATTTATG------AAATGAAAGT-CACAC-TTGAAATAGCTTATAAAAATGGCAATTGATGATAATTGAGCAAACGGTGAATAATTTAA--AATATTGGGATTTAAATTTATTATAATTTATAATCAAATTATGATTATTATTATTATTATTGTAATAATAAGATTTAATTATTATTAAAAAGGAAAA
>CG16953 16407487 16408221|16905 chr3R 16404853 16409969 scaffold_22 380667 385613 - 78133|2831 3591
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AATT-----GAACACTTTTGCATAATTGTTATCTTTATTATTTAATCATATTAATTTAAAT------TTTGAGTTTTTAG-----------------------TTTATAGTTTTG------------------------------------------------ATTTCTTTCAATTGGTGCG------TTTCGTAAGTTTTAGTCATTTGC--ATTGTAAAGCAGCTTTTTTTGTTGTGGGCAATATCAACCCAATAT-------------------------TTGTTCGTGTCCCCATATTTTCA-----CATTTAATCATATTCGTGACCATTTTCGTCCACCAAAACG--CACACTCGCTCAGCAATTGCCAAACGACATGCAATATTTAATAGCAAATGGA-------------TAAATTTTATGAACGCAACTAATATTCTTATAAAATGTTGTAAAAGACTGTCTTTGTTCTAAAAAACAAGCAAAAGCAAGAAACAGAAAGAAGG--AAATTAACGTATGC-TACAAATTTGTT--TCGT---------TTTAAGTGAAACCATAA------TATATTGTCATGTTGGCA----GACATAACTTGATGACAAAGACACAGCACATGCATATACAAAACAAACACAAAAAATATATTATTCATTGTGATAGAACT------AACATTATATTTGTATATTTAAGACAAAATTCTGGGCGGTGATAAAACGCATCTAAAGTACCAAACATAAAGAG
>Sep2 16411844 16412067|16907 chr3R 16411809 16413262 scaffold_22 387121 388559 - 86517|35 263
AATCCGGCGCCGCCGCCTCACAA-TGTATT-GAGAATTCTGTGCGGTTCGCTTATCCCAAAGTAATTATTGCTTTCTCATCTCGTTGTCTTTCATTTGTACTATTAAGTTTACTTCAAATATTAACATATACACAACTACACGCATATGTACGCAGGCATATA-ATGATTATG--TATTTACAACTAACGAATAAATCGAACTTAGTATTTTAACAAAGTAGAAAAGAG
A--CAGACATAACATATAAGCAATTGTCTTCAAGTATTTTGTACGATTTGCGTATCCCAAAGTAATTATTGCTTTTTCATCTCGTTGTA-TTCATTTATGCTATTAAGTTT-CTTCAAATATTAACACATACACCAACGTACATACATATATGCATACATACATATAAGTATGATTATTTACAACTAACGAATAAA-CGAACTTAGTATTTTAAACAAATTGAAAGCGG
>Pi3K92E 16454694 16455468|16940 chr3R 16454637 16454817 scaffold_22 429636 429845 - 1150|57 226
AAATACAATAAAACGAAAGAAATCAAATAT---------------------AGAAACGAACGAATGTATACA-------------------------ATTAAAGCGAAACCAGAAAAATATAGATATATTATGTGCTTCTACGTTTACGATAGACCGCATTCGTCTCAAT
ATATACATGAAAAACAATTGCATCAAATATATTAATTACGCCGGGTAATTCATAAATGTATGCATGCATACACGACATATATACATATGTAAAGGTGATGTAACCGAAACATACAACAAAAATAAATAAAATGTGCTTC------TTCAATAGACTGTATGCAACACCAA
>Pi3K92E 16454694 16455468|16941 chr3R 16454818 16459192 scaffold_22 430683 434916 - 147518|0 700
AC-------------AACAGACAACTACA--TCTACATCAACAAGCTGACAACAACAACACGATTGCTTCGAAGTCAGCGACA---TCTCACAATCAAGCAAACCCACTCAC---CAAGTCTAAGTTTCTGCCTGCCCTTCCGAGCCTCTGCAACAGGCGTAGTACAATTTTGTATCCAATTCATAA-----AGTTCAAAACTATGTGTTCACTATGTTAGGCCGAGAACTACCCAATCGACAACCCCTCGATCCATAGCTGATAGTGTCGCTCCCACAAGTGCTCCAATATATACACCTTACTCTTAATTTGTACATTTCACGTTCACCCATTCTTGTAACTGTAATCATTTATCGCCCCGCCCCCTCTTATACAGTGATTTTTGATCCTAAAAATTGTTTTGTTGTCTATTATTCATTTGTTGTTTGAACACCCCCCCGCACATGCACATTGGCGCATGAACGTGCAAAAATTGTATCCTATTATGCTATA---TTAATTTAAGAGACATTAACTCT-----ATAAGTTAAAATTAACGATTTTCTATCCCTACATTACGATTAATTGTGTACTATA------ATTTGTGTGTGCTTTTGTACCAGCAACCAATCAACA----------TTATCGTGTTTCCCGGTTTCATTTTATAATGTTCTCTAATAATTGTAACGTATTTTGTAAATCGCTGGAT
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>KaiRIA 16474311 16474525|16951 chr3R 16473929 16474923 scaffold_22 449125 450139 - 25975|427 707
-TATGAGATATTCTC--------------------------------------------TCCAAAGTTTCGAAAAAGCTCTCCAT-----------------AATTTCACTCAAAA-CGTTTTCCAAATTGACATTTTGGAAGCAA-CAGTCAGTTTTCGATTTTCACTCGAAGTGTTCTGTTCGGGAAACTCAAGAATTTATTTTACTGAATAACAAATATATATATATATATAAATATATATGTCTTAAATAA---AAGCCATATAAAATGTTTTTCAA
TCATTAGATATTCTCACAGCTCTCAACAATTTCAGTTGGCATAACTTGGTATTCACTCATAAAATGCTTCAATAAAGATTTTTAAGCTCAAAGCTTTTAGAAACTTTTACTCAAAAACGTTTTCCAAACGAATATTTTGGAAATGCTCAGGCAGTTGTCGCCTTTCCCTCATCGCGTATAGAACACAAAATCCATAGCCTCTTTTCTTTTGTTTATAATTATGCATATATA-------ATAAAAGCCTTCATTAATTTATGCAATA--AAATGCTTAAGGC
>Nep4 16478289 16478506|16952 chr3R 16474964 16478457 scaffold_22 450737 454360 - 132882|3510 3708
TGGGTTTATGGCTCCCCCATCACAACAAAGATTATGTGCCAAAAAT------TAACTTGCA-------------------ATCTATATATTTTTCTTAGCCCTTAACTATTTATACTTGTAACTTGCAATAGTTTAGTTTATGATGCAATT-TATGTTTGTGATAATTCTAATTAAATGTAT----TTATATTATCAAC
TGTATTTATAGC------AATATAAAAAACTTACTGTGCCAAAAATAATGTATGATATGCTTTATTATTTTCTTTTATATATATATATATATTTCTTAGTAATTAACTATTTATATTTTTAA------ATAATTTAGTT------GAAATTATTTGTTTGTGATAAGTGTAATAAAATATAAACGATTATAATATGCAA
>Nep4 16478873 16478960|16953 chr3R 16478588 16480462 scaffold_22 454889 456718 - 79947|350 454
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TCGCTATCTATTGTTACCTATAGCCTAAGAGTATTACAGACGATCTATTCCTAAAGAAAACCAATGCAGACCGTTGGATCTATCGCTAACTGTAAGTATTATTCA
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ACGCCCGGTGACCTTTGTGCCATTTGC------CTTAAC---CCCCTTTGATGGTCATTTAAGTTAGTCCTAAAGCTAGTCAATGTTTTTGGAGCTCACATTTACCCTAAGCTAAGGCAAGCGAATATTAAAATTCGA
ACA---AATGTCC--TGTTCCATCAGCAGCCAGTTCAACGTAGCCCTTTAA-----GTTTCTGTTAGCCATAGGACTAGTCAACTATGTGAGAA------------------TCAAGCAAACGAATATTAAAATTCGA
>Oamb 16514740 16515903|16991 chr3R 16514635 16520283 scaffold_22 505229 510850 - 135308|116 1300
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CGTTCATTTGGGCCCAGCTCAAGCTCGCAGAGCAGCTTGGGCGGGTTGCGTAAGACGAGCCTGAAGGTGCCCGTCTACGAGATTTGCCATCCACTAGTCATGGAAACGCCCTCCTACTCCTATGTCGAGGCTCCCGGCGATGTCCCAACCT------------CAGCCAGCAATGGCGGGG------CCAAGCGCACGCAATTGTAGCCGCGGGAGCTGCTGGCGCTGCGCAGCCTGGCGACCAACGAGAAGAATCCCCACTCAATGCCAGGGCAGCGACCGCGGCGCACGGTGCGCATCGAATACAGCGATGCGAGGGTCTAAA-----------GAGACACCCTATAGAAGTAGGCATTAGGCCAAGTTAAAAACAGTGCTGAACAAATGTAAGCTTCTAGTTAAA--AGCTCGCAGATAAAATACGA----TGAAACTTGTTTGGTTAAACCAAAACAAATTCAGTTTTTTCCATTTGAACAAG------------CAAAATAACTATAAATTGTAAATGTGCATAGAATAGTTTCAACTACTAATTACTC--------TTTGGCTT---------AAGCGTAATCCACATAAAT--CGATTTTAAGTAGTTAGTCAAAAGACAGAGCAGT--------------AGAGTATTTCATACTAGATAAAATTCGTGTCT-------ATTTGTTATAAATT------------------------------------------------------ATGTCTACATATATACATATGCGTGAGCCTCTGAGAAGGCCAAATTGCGATAGTTGCCAGGTAGAAAGATTATCGCC-GGAAATAA-----AATTGAGAGTTGTACCTTTGAAATTCCATATAATATGCAAAAGTTAAATAATTACAGAAAACCCCATAACCAAATAGTTACACAATGCGTATTTAATATAGTA--AATCGATAAATGTTTATTGAAATGTTAATGTTGTGTGCT--GTTCAGG-------TTTTAACATAC-----TTTCCAAAATATATGTGTATAATCGCGACA-GATATGAATATACCATATG------------AAGAAAATACATATGATTCTCAAATATAATATTCCATACGATTCCAGTTAAATGTTCAGTGTGCTATAAATAAATGCTTACTTAATTTATTGAAAAAACCA
>Oamb 16518127 16518668|16991 chr3R 16514635 16520283 scaffold_22 505229 510850 - 135308|3712 4354
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CTAATCGGTAACTACGAGACGAGTCCGCTGCAGCGCACTGCCTCGCTGCCGCAGGAAGCCAGCACTAGGGATG-GCGATGTGGATACCACGGGCAGCACCAGGCGTATACGGCGCGGTGGCTTCTGCAAGGGTCGTGAGCTATAAGCAGACCAAAGCAGTAGCAGCAACAACAACTACTTACAAATACTTGACATAAGGCAATGCATTTCGCTTTT---GTACTTTTGTAAACGCCGCCAG-----------------------CCCAATT---GACATTGACAGTATTCGCATTGAACAACGTTGTAACTTTATGGCAATAATTTTCACGTATTTAACTAGGCATAAGGCATACATATACTTACACTTATACCTGTAGTCTTAAGCTTAATTAATGTGACATAACGATAACCAACACACTTTCAGTTA-AGTACGTAGAGTTAACTATATTAAGCAGGCCCCATTTGTTCAATTTTGCCGT-TGGCAAAGTGAATCAGT------------TCAGTTACATGAGTTACATGCTACTTAGTATTTAATGCATATATGTGTGTATGTGTTTATCGGCCAATAATTTGGTTAGGTCAACAGCATTTTCAATAAAAATGAAAGCATACAAAGAGCAAAAAACGAGC
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ACCTCGAATAAAGTTAAGAGAAACGCC
GCCATGCAGAAAA-TAAAACAGGCAAC
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ATTGCTACACCTACAGATCGTTGATTTTTTATGTTCATCAAATTGTTATTAGATATTCATGTTATATTGTTTTGGAGCTTTGTTTAAA-------TTTTGTTGTTTTTGTTTTGTTTTTAAATTAATTAA-TATACAGTTTTAACC----AT
A----------------------AAAAGTAATGCCAATACCATTTTAATTAGATGGGGAATTTGCACTGCGTTA-----TTCTTTAAAAAAATCGTCTTTTTAATTTCATATTTTTATAAAATTGAAAAGCTGTACAATGGAAAACAAAAAC
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GCA-CCGCACGCCAAATAACTAACGCAAACTTCCGTCCAAACAAAACTCACATCAAATCTCTCCACAAAAGATATAA------------------------CTACAAAGCAAC--------ACAGACACAAAATTGACACCCAAAAACAAAACGAGCTGCC--------------------------AGCCAGCCCAGCTCTCCATCGT-------------------------------------------------------TGCTC--------CCTTTGAACATTGTCATCATTT
ACGTCCATAAGCCAAATATCTAACTTCAATTTCCGTCCACACGAAGCTCACATCAAA-CTCTTCATAAAAAGTAAAAACAAAACAAAATCGTAAAGAAAACTGACAAAGCAACAGCAACTGAAAGACACAAAATTGACACCC-AAAACAAAACGCGCTGTTGCCCAAAAAAAAAAATATCAAAGAAAACCCAACCAAGTTGTCCGTTCCGAATTCTATATATATATATATTTACATATATGTATGTATTCTTATATATTTTATATTCTCTAGATGCGCCTTTGAACATTGTCATCATTT
>Fancd2 16636525 16636578|17082 chr3R 16634852 16640500 scaffold_22 631843 637803 - 165547|2059 2122
ATAGCGTAATACGACTAATAAGAATTTCAAATAAA----------TCAGTGACGTTGACGCAGA
AAGTATTTGTATTCTTGATAA-AATAACCAATATACATACTTTCTTTTATTATGTTTATGGAAA
>CG17270 16642163 16642799|17084 chr3R 16642152 16643317 scaffold_22 639693 640866 - 24682|11 745
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TTTGATATTTGAACAAAAACAACGAAGCAACAAACAGAAACAATTAC----AGTTTGGATTGAGAAGAGAATGAGAATGAGTTATAGAACGACACATAAATCAGATGTTGAAAGGCATATTATCCGTTATGGACTGCATCGATGTGATC--ATAAACATCA-----AACAATACTTA-ACTATATAGCAATACT--AACCGAAGCCAAATTAGTGATTTTCTAT--ATTAAG-AACAAAGGAGAAATACTCTTCGTACATACGTCAATTGCTGACATAATCACCCAAAAACAT------TTTGTACTTCCTTTTTAGAATTCATACATATAT-TATTAATCCATGT---------TAGAGTTTATTGCACTTTTAATATATAAATA-----ATTAGGTAATGCCATTATATAAATAAGTTGACAAGTTATCGTTAAGCAAATTGAACATTTGACTCAAGAAA---------AATGGCTTTAAATTTACAATCACGTTTATAATCAAAT-ATTTATA-GTATTATATGGAAGTTTTCCATTAGATTCACATGTAGTTAATTGCAATATTTGCACATTTAACAATTTATATCCAACGATCATATACACACATATGTAGCAAAGATGCTTTGTATTAAACGTACACCAATATTTATTTAAAATATTTAAAAACAATAATAGACTTAGCAACAGTACTGTTCATCCTTATATATTCAATAAAAAGTGAAGTTACTAACG
>CG17271 16645348 16645914|17087 chr3R 16644273 16646663 scaffold_22 641372 643633 - 48857|1109 1751
TAGTCACCCAGATGCGTTCAGTTTACATACATAAAACCA-------------TGTCCTCGTCCCGCGCTCTGTGACGTGCA---ACACATACTCCTGTTTCTGCCCAAA---------------ACACCCTGAAATTACGTTGACCT-----CGTCGACGATTTTAGCGCACTTCTTAGATAAATTTGAATGAAATTTACTTAACATGCTGCAAGCATTCCAATCGGAGAACTTCATTGAACAAATTGTA------ACTAAACGTCCTTCTGAGAACTCTTTTTTCAAAAGATTCGCATTTTCGAATATTATTTCTCACGAATCT-CTCGAGTGGGTTGTGCAATTCCAGCCGCCTTGTTTCGTTTTGTTTTCGATTGTCATAATTTTAGTTACTT-TTCGATATGAACTAATTTTTAAGCGCGACTTTAGAGCAGCAAAAAAAACAGACTGATTGTGTAAACGTTTGTTTTGTACAA---AAAGAAAATGAAACTATGCAAAAAAATAAGCGAA-------GAAAACCCCG-----------TCTTTTTAAACT----GAAACCTACTATATAGACGCATGCAAATCTCTGTAAGTAAAGCCGAATTAGCGAATAAAGTCAACT-------TCAAATCACAC
TATCTAGTTCAATCGATTCAGCTTGCATAAACCAATCCAGCATAGTTATGTCTGTCTAAGTGTCTTGGTCCGCATTGTGCAGCTACATGTACTCATGTTTCACCACAAACACACACACACACACACACACCACATACAAATTGAAATTTGGGCGCAAACAATTGCAGCTCAAATTGTA-ATATACTTCAAACAAATGTTTTGAACATGCTACAAGCATTCCAATCGGGCAACTTCTTTGAACAAATTGTATAATTTATTACACAAC---------------TTCTCAAAAA---------TTCGAATAATAGCACACACGAATCTCCTTTTGTGATCAGTGCAATT--AAACTGTTTGTTT--TTCTGTTTAATCTTTCCCTAATTTTAGTTATTCGTTCAATATGAAGTTAATTTTAGGCGTCACTTTAAAGCAGCGAAAAAAA-AGGCTGATTGTGTAAACATTTGTTTTGTACAAAAGAAAGAAAATAAAA----AAAAAAAAACAAGCGAAATGTTCTGAAACTATTGCATTCAATTGATCTTTAGAAATTGATAGATATATACTTTATATGCGCATGCAATTCATTATAAGAAACGTGTTTTTAGCAAATAAAAATGACCTACAAAATAAAAATAGAA
>CG17272 16649028 16649110|17089 chr3R 16647908 16650024 scaffold_22 1413564 1415766 + 78860|1171 1298
ACTGCCTTTACCAT-------------AAAAAA---------ACATTCCAGTAAAGTACTCCAATTTTCGCA---------------------CAATAAAGTTGGC--CAAATGTGTATGGAAAAAGT
ACCAAAAGCACCCTGCAGGCAGCTGGCAAACAAGCGTGCTTTACATTCCAGT-ACTTATTTCAAATCTTATACTAAAACAAGCATGCACAATGCAATAAAGTTCACAACAATTGTATTTATGAAAAGT
>CG17273 16650378 16650861|17090 chr3R 16650416 16650583 scaffold_22 646866 647029 - 7510|0 167
ATACTATAACTTCTTGTTTGATGAGGACGTACTTAGTTTTTAAGATCATCAGGTGCAGTTTCAGATTTTTTGTATGCAAAGGGAAGCAGATATTTTTTATTGTACAATAACTAAATAATGTTGTTTTAATATTTAAATACAACAGTGTGCTCTGACTTGTGTAATTGT
ACGGCTTATATTTTCGTTTGTTCA-GACGTACTTAGGTTTTAAGATCGTCGAGTGGTTTTTAA---TTTTGATATGCATAAAAGAGTAACAGATTTTTATTGTACAAAAACTAATTAACGTTGATTTAATATTTAAATACAACATTGTGCTTTGACTTGTATAATTTT
>CG17273 16650378 16650861|17091 chr3R 16650629 16652073 scaffold_22 647074 648481 - 74612|0 250
CCAGCAAAGGCAAGGGTGCCGACGACGTACTTATGCCTACCAGTTCGTGTATCTGAGACGGAAACGCTTTA------GTAGAGCCCATTGGGCAGAAACG-----------GCGCTTAAAATATCCAAACACAACTACAGACCTAACCACCCACAAATACAACTAATATTTCGACTATCTACAAC-ATTTGGACACAAATTATTAGCATATTGCTTCTTTAAGCTATACTTTCTAGTTTTGATGTTCACAA
TTAGCCA-----------TACACATTATAAATATGCGTAC--------ATATACGAGAGGGAAACGCTTTAAAATCTATTTAACCCATTAGCCAGAGTTGCGTCTGTTTTTGCGTTCAGGGCGTT------TAACTATAAACTTAACCGT---------AAAGTAATATCT---ATACCTACAACAATTTGGACACAAACTTTTAGCCTATTGCTTTATTAAGTTATATATTTTAG-TTTGATGGACACCA
>CG17274 16677430 16677565|17123 chr3R 16677565 16679392 scaffold_22 670400 672171 - 73252|0 0
C
C
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GAAAAGTCGTAAACCCGGGACGAATGGGTCTA-----------GGCCACGAATTGGTCTCGGGAGATCAACCAGAAATGAGAGCAGAGCTGGGAATGTGCAATTCGATGGAGCAAATATCAAGATCAATAGACGAAATAGTCAATATTCGACATCCCAATCATCCCAAAGTTGTGGAGTTTAGTGGAGTGGAGTTTAGCATACCGGAGCCACCAAT---GAAAGTTTGCACCAGTTTGAAGGCGGCGTGGAACCAGATATTAATATAGATTCGAGCTACATATATATACATATATACATATGTATATATGTATGTACACTGAGGCATATATAATGAATATATAAATATAAATATATATTTATACAGGTTATACTCCCTTTCGTAACTTACTCGTAATAACCATATACATAAACTATACACTGGAGGAACCACGAACCAACACTTGCAACAAATCGAAATCGTATTGCATTTATATTTGAAAGCATTTTTGGGAATTGACCTATAGTCGTAATTGTAGCTAAATTATTTATAGACATGGATATAACCCAGACGACAGG-----------------------ATCAGTGAACTGGTAACCCTAAGAAGCCGG-----------------------ACACAATTTACACAACCGAAGA-----CGATATATATTCAACGCATTTAGCCAGTAGAT--------------------------CTAACCTAAGTGAGTTGTAATTCTATCTTAGATCCATGAACGCAACTTTCTCCTGTTTCCCCCCCAATTACCCAATCTTCTGACAGTTCCCCTAAGATATAAGATTGTAAAATGTAATTACCGCTCATACAGGCCAATCTGAGAACAACACTTTCATAAAATACTTACAAACACTTACAATTAAATAAAACAAGTTAA-----CAAAAA
GAAAAGTTGTAAACCCACGACGAATGGGTTTAAAAGTCGGTCGGTCGACGATTTGGACCAGG------AACCAAAAATGCAAGCACA------------CATTATTGCAGCGCATAAATCCCAATCTGTAGTATAGCTACAAAAAATTCCATTCTGGCATACTCGTTAGGCAGCGCACTTGAAGAAGGGAAAATTTATAAAGTTAGAGACAGGAATATAGAAA-------------TAAAGGCGCCA------CAAATGATAATCT---TTTGAAAATTAGCAATGGACA---AAACATTTATATACATAAAC-------------TATTGAACGAGAACAAAAGTATATACGCACAGTT-TATATGATAGACCCTCTTTCGTAA--------TACTAATATTATAAATACAATAC-----------------AACAAGTACGGATAAC-AATCGAAATCGTA-TGCATTTATATTTG-AAGCATTTTT-GGAATTGTATAATAGTGATAAGTGTAGCTAAATTATACATACATACATTTACAACACATTACATAGATGCATATACACATATATATATACATAAGTACACCAAGCGCAATACTTGGCCAATATATCTATAATACCATTTGAATATATAATATATACTACTTAATAAAAACCCAAATATGCTCATAGAAATAAGTTAGCAAATAGCCAATAAAAAGCAAAAGCGAAAACCTAAACTAAGTGAATTGTAACTCTTAGTTAAAACCGTTCG------TTCCTTCAGTTTCCCTAC----------------------TTCCCT--AGCTGTAAGATTGTAAAATGTAATTACCTAACACGCAAT---ATTGATGAACAA---TTTCATAAA---------------TATAATTAAATAAACGAAGTTAACACCGCAAACA
>CG10830 16720165 16721111|17149 chr3R 16720138 16720807 scaffold_72 63213 63827 + 2216|31 706
CGCAGGCTTGT----TGTTGAA--TTCGCGTCATGAAATTTCACTTG---AAATTTATGGATCGAAGCGCTTGGGCGGAAATCTGAATGGAAATGCCGATGCGCAACATTGAAATAAAACACTCATGAAATTTACGAACAAATTGTAAAAAACAATAAATTCTATA---AATCGTGTGTAAAGAGGCTAGCAGCATACAAACATACATACATATGTAATCATCAGCAATAGTGTGCATT---GAAAACTATTAGGCCCCTTTACGAGTATATACTGACCCTGACTCGATGTGAGTTGACGGCTCTTACACAGATAATATAAATCGATATATATACAAATATCTATATATACCTAATTATATATTAAAAAAAATTGTCGATATTGAAAGTATCTTATAAATGTTTAGTATTA-----------TATGTAATTGAATCCAGATTGAGCGGCAATGGCAAGGCGACCGATATGTAT-TGTATTAATTAAAT-TAAACTGAAACTAATTCAAATTAACTAAAACGAAATGTAAAATGTACTTAGAGAAGCGCGAAGTAAAACTGCTAAAATAGCCAATCAATGTGCGACTAAGCAAGCATATGTATGTAAAGAGGTATAACTTGCGAAAAGCGA-----AAAGCAAACAATAAATTAATGAAATCATAAACAAAAGGATA
CGCGGAATTGTGATGCGTTGAAATTTCTGTTTATGGTTTTTTATTAGCACAAATAAATGTTTACATATGTGTGTATAAACATTTGCATGTCATACTACATATATGAACTTGGGCTAAAATGCACACGAAAT------GATAATTGTATAAAATGAAATAGTTCACATAAAATCGTAT------------------TAAAGTCAGATATGTGTATGTA-----------TAATGTACATTATAGCAAAATGTTTGG---------GATTATA------------CTTAAATCAACTTTTAAGCCCCACTATAGTTATGTTGAGGAAACCTA---GCGCGTATTCGTATACA--------TATATTTAAATCAATTGTCGATATTGAA-TTATCT-ATATATGTTTAGTATTAAGTTCAGTGAGCATATTACAAGAACAAAACAAAG----AATAAACAAGTAAATAAATTATATATGTATTAATGAGCTATAAAACGAAATTAACTTTTATCTAACAAAAGTAAACGTATTATGATCACAAATAGGCGC---------------AAACAGTCTATCAAAGTGCGACAAGCTAAATCTATGTA---AAAAAAATATACTACAAATAAAATAACTATAAAATTAAACATTTTGTTA-TAAGATGTGCAAATGCAGAACA
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AATTAAAAGCGAACAACAAGTCAAATAAAAAGTTGTCAATGGCGGACGACGTTATGAACTCGCGCGCGCGGGTCGCAGTTGGCACAAACATTTGTGCAAATAT-----TTGGGCAACAGCGACGACATCAACTAATAGCT--GAAGTATCCTTAAC--AAGCCCTTAA
>CG10830 16721341 16722171|17151 chr3R 16721487 16722016 scaffold_72 64895 65423 + 1046|0 580
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TGATTTGAGCCCACCTTT--ATATTCCGATGGGAACATTTTAAGCGTACAATTTGTGTAACAATCCCCATAGGCAAATACCCAAGCGGTTTACCTGAAAGT-----AAACAGTTTATTTACCAATTGCTAGTTCCGATTGATTAAAGCCAAAGACAAGCATAAAATTGAATATTAATAGTTTTGAATCCTAGTGAATTTTACGAATGAATA------ATTATATAAAGCAGCGG-----CTGATGAATAACTTACGGTTTGCCTT---TGGCTAAAGAAGTATTTGATGCTATTC--CGAGTGCA----------TAAAGAGAATAAGTTATGATTTTTGAATTGT-TAAATCAAGTACAGGAAATTAGAAATTATAAATTGGGAAACGCGAAATGCGAATG--TTAATGAAATAAACCAGAGCAAAACGTAAACAAAC--------------GTGATTTGAAGAAATCTAGAAATAAATTTACAAACATGTTTTTACTTATAT-AAGTA-GGGTCTCAGCTCTAGACAAACTGTAAGAATTTATCTCGGCTATCTTACCAAAAACAACTACAAGCAACTA
>CG10830 16721341 16722171|17152 chr3R 16722160 16723135 scaffold_72 65734 66809 + 47284|0 11
GAAGCTAATGGA
GCAGCTGCGGGA
>TotX 16730638 16730781|17161 chr3R 16729690 16730791 scaffold_72 72093 73117 + 27296|972 1135
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--TTGTATTATTTACCTGTGTATTATTTACCTGTCCGTAGTTCGCGATGTATACACAAAACATGCAAATTTGGGTCTGATATACAAAAAAAAA---------ATTATTCTTTGACTTAATTAAAAAAATTTTGAATTTATGTGTACTC-AATCAGCAACA----
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GCCGAGGGCACTGGAAATGGCAGGCGTCGCATGAGTGTCATTTGAGAGGGCCCAAAAACTAATAGCAATACCAATACAAGCAGCAGCATACACGGTCGCAGGACCCAGGATTAGAGTCCTGCGAAATGTGTATGCATATGTGCTGTTTTCGCATGCGAATTTTCAAGAGATTCCGAAATGATTTAGAGCTTTCCGAATAGCTTCTTCAAAACTCCTCCGCCAGTGGAGCGGGTTCCTCAAACCTCTTTCGGCCCTTCTTT-TAGCCAACACTCAA---------AGGCAAGCCAAG--ACAAACTAATCAACTAACTAACCAACTACTAACTGAGCC------CAGACCCCACCACCCACCACCA------ACTA-AACAAGGAACTATTTACACTACATTATCAGATACAAACACTTCGGCA------CTGAAGTGCCAGCAAACAAACTA---AAAGGCATTTATTTTAATGAACTTTTGAGATGAATACAGTGTTATACCTACAAAAATACAAAATGCAAAACACAAGATATTTACTGATAAAATAGTGAACGATGCGCTCAAAGATGATGAACGGAAATCAAATTGAGAATCAAACCAAACTCTGTGTAATTTGTATGTACCACTTACAACAACAAACTGAGCCTAGTATTATACACATAAATATAGAGCAAGGAACATGAAATATACATACATACATATATATGTGAAGTAACCAAAGATACTCCAAAGCAGATGACTAATGACAAATTGATAACCGTTTGATTTGGCTTGACCTTGCCACCTCTTTGAGTTTGTTTTAGATAAAGTAATGGTCGATAGCTGTTAGCTGATTATATCATACTTATTACCAAAGTGTATCAAATTGTATTGAATAAACCCCACGCCTAGATGTATTTATTACTTACCTAGTTAGACAATATAAGGGAAATATTCCCAACCGGTGCGAGCAAATACTCCTAACACCTTTT-AAGGAAACACCAAGCCC------------------CATATCCTAG-AAACTAACT---GATTGTTGATT--------TTCTCTTCGCCAGTAA-----------CTA-TTAGTGAATA-ACAAATGCTTTATGTGTGTATCGAAACGTTC-------------AGCTTTAAGTTCCCTGCAACGCGC------AGACAAACCGAAATGCAAGTGTGTATTTCAAAAGTTCGTTTGAGATGCGTGCATCCCATGGATTCGTTGTTGTACAATGTACTTGCATACACATGCATACCTTGTAGCTTTG--TAATCCCTCTGCCCAAAC----ACACACTGCAAAAACTCGAGCACAAGAGACCAAAGTAAAACCTAGACGAGCTTACAACTTTTTACG--AGAGCTAGACTCCCGCAAATGCCCTTTCCCTTTTTTTTTTTTTGTTATTTTTGCATAGAAATCCCACTCAATTTAGTGCTT--------------TAAATTTGCGCCACTAATAGCCGGCGATTGAAACTGGCAGAAGTGAGATCCCCTCTTTACCACTGACACACCCACCGATACACAGTGCATATACATACCATAAATATATCTGACATATCTGAATATAAGCAAATCAGGAACAGATTCGAAAAGCCGCAGCTATCATGAAAGTGCAATTGAGTGCATAAATTACTCGAACAATTGTTTGCTGCCCATTATATGCTTCACAGCATCTGACTGCTGGTTAATTTACCCCCACCATTAC-CGCCCGATCACCCCTAATGCATCCA-ATCGCTTTAATATATATATATA-TATACATATATGCATATAATT--TAACTGCCTCTGCCTCTCCGAGCGTTTAGTATGAAAAA-ATATTTGACAACGCTAGCCTTTCCATAGCCACAATG-----AACAGCTGCATGGGCAGAAAACATTTATTTATAATAAATAAATAAAATAGATAATTGAATGTTGGAAAAATAGCGAATCAACTATGCAAATTCATACTAT----------AGAGTGATTTAACAAATTTCATTTAGATGATTAA----GCCTAAGCGATGAGTTATGTTGTTTACGTAGTTAAATGTTGAGCATTAAATTTGAATTTGAAAATTTGAAAAATGTT-----TGCCGCCATTTGCATAAGATGCGGGGATTAAATGAAATTAAAACACGCGATATACCCATAATATG----AGAACAAATAATATACAA----------------------------------------GTATGCAATTATAGCGAAACTAATT----AAAACTAA-------------AACTGTA-------ATGATCAGGTATTAAAGTTATGAAGT------------TTAATCAAAATATATTAACAA-----------------------------------ATGTGTGCATGCGAGTGTGTGCGTGAATGTGGCCAATACAAACAAACTCATTGCAATATAGAGAATACGGAATAAAACAATTGGGCAAATATTGCTGCATACCTAAGA---AGGCAAACTTAAATACTATAGTTATATACGGCAATGGTATTCGTATTATTATACAACTTATACACGATAAACAACATATACCCGTGTACCCCACTTATACATACATACAGACCCTCATGAGGAACATGGCCGGTCGGTAGGTAGTCC-TACAAGCCCAAACTTCGTACAATTTTACCTTTTCAACGTCTCAGTGTCTAACAAAAAGCATTAAATGTATTTCCGCAAGG-AAGTTACCAATATATTGCATGTATCAGTAAAAAA---AAAATATGTGTGTCAAGACACTCGATAATATGA------------------GAAAATCGA-TAAATATATTGATATGCAAACG
GCCGAGGCATCCGGAAATGGCAGGCGTCGCATGAGTGTCATTTGAGAGGACC-----ACCCATAG----GCAAAAACACACACAAACAAATGCATCAACAGGA----------------TGTAAGTTGTGTGTGTGTGTGTGCCAATTTCACATGCG--TCTTTCTGTCATTCCGTAAATGTTTAACAATTTTAAAAGCCTTTCCTGCTAGTTCCG-GACGAGCGATGTTGACTTTTGAA---TAGTTAGATACAAATTTATAGATAAAATTTAGCCAAATAGTAGGCAAAACAAACTACAAACTACACCACAAGC---CCCACCATAAATGTAACCTACTAACAAATACAACTAACTACGACTACAACTTACTACAACCACATGCTATTTACA-GACAGTTGAGTACGGATATACTTTGGTAGTTGGGATAAGAAACCATCCAACCAACAAAAGAAACGCATTTATTTTAATGACTTTTTGAGATGAATATAA---------------------------AAAACAC------------------ATAATAAACTGAACACACGCGGATAATG--------TTAAATT-----------CAAATATTGTATGATTTGCATA-------------AACTAATCAAAGTTAACTTCATATACAT------------GGTATTAAAAACTATCAACTCACTTATA-ATGAGTGCATTA---------------------------AATATTAAACTCATAAATATTCCTTTGGCCCTAACCTTTTT-CTATTTTATAATTGATCTGGAGAAGTAAAC-----ACAACTA--AAACAACAATTTTATGCATAT------GGTATAT--------------------ACATACTTAAA-----ATATTACTTGTATAGTTAGACAATATAAGGGAAATGTTCCCA--------GAATTAAAATTCTTTACACTTTTTGAAGGAAACACCAAATTTATGCGAAAAAAGCTATTATATATTCAAGTAAAATAACTCAGGATCATTTGTTATGGTTCCTTGGCTCTCCCAACAATATGCAGCAGCCTATTTTACAAATATACAAGCGCTTTAAATGTGTAACTATATATATTTATCTAAAAAAAAGCTTTAAGTCCTTTGCAATATGTTATTAAAAATACCACGAAACAAAAAGAGTTATGTCAAAAATACAAAT----------------ATTAATAAATTGTTGCCGTTTGTATGTGCATG------------TTTTAGCTTTAGCCAAACCCACAAAAAAAAAGAGGACACAATGCAAATACTT--TTATACGAGACCAATG-ACAAACTCTACGAGCTTACAACATTAAATGGCAGAATTA---------AAAAGAAAAATATTTATTTGTAACTAATTTATTTTTACTCTAAAATACTTTTCAATCCAACACTCAATAACTTATTGCATAAATTAACAC--CTGATATCGAACTTTGAGACTTGGTGAAAGTAAGCTATC----TTATCAATTAAAT-----TTATTATTTACTTCATTTAGAGCTTGCAATTGT----------TTTACATATAAATTAACT---AAAACGTTGATACACCCACCGAAGTCACGC-----CAACTGTGCGCCCAAA-------AACACTTACCGA-----CATAAAAGACAATTCGATACCTAATTG--------------TACACAATCACTCGAACAAAAACC------ACATCAATGTCAACTTAAGATATCTACACATTAAACGCAAACCATTATAATTAAAAACAAGTACTATATC-----------AATACGAAGCATATGTCTGAACAAGTCAGGC---ACATATATACGATGGATCAAACAGTT-CGTAAAGAGAAGACATTTGATGTTCAT-------TACAGTACAT-GTTGAATTCTTGAA----AGCTATTCAACAATTCGAATTATTATTTTTTTCATTCCAACAAAAATTAATACAATTCTTTTCAAATTATAAATATTGGCACAACTGTGCATAATATAATTGAAGTATT---ATTTTGAAAGCT---TGTAAATCAGGAAAGTTGAACAA-GTCGACGATGATGCAGTTCACGTAAGACATATTAAAATAGTGTGGCATTAATTCGACAAATGCTTAAAATATGTACTACAATAAATATTGTACAACATAACTACTAAGTGTTTCTGTCGCTTTTATATTTTGTTGATACGCCACGTTTGAGTAGTTAATTTCTGGCAACTAAATTAAATATTTTGAAATATATCATTATATGGACATATATCAAATATATAAAGTAACGTACCTAAATTAATCAAAATGTATGAAGAATACTAGCAATATCTTGACGCCTCATTAGTCCTTTGTTGTGTGTGCGTGTGTGTGTTTGTGTGTGTGTCTGTT-------------------TAGCTGAAGTATGTTATCAAATAA------------------ATACATAGTAGCTAGTTAATACTAACTTCAATGGATATTTAAAGCTG------------TATTATACAATCTATAC----------ATATTTACATACACATCAAAAGCTTACATACCCACTAA-----ATGGGGTATATACC-------TACATAATTTATACGA----AAACTTCGTACAATTTTACC-TTTCAATATCTAAGTGTCTACCAGAA---ACGGAAAGTGGTTATACAAAGTAAAATACAAACATAACAAAATAAACAATTAAAGATATTATGTGTGTATGTTATTACATATGGCATTATAATCGAATATGCAAAATTATAAAAACCTATTAAATATATTGGTATTTAAAAA
>CG10827 16830881 16830970|17250 chr3R 16830757 16832905 scaffold_13 1497427 1499549 + 83493|140 229
GATGGAAACGCAGATGGTGCAAGGTTGCCATGCCGCCTGGTTGTAACAATTAAGTTTGAAGGTCATTAAATCCAGTAAGCTGCATTTGCA
GGGGCACACGCGCCCTGGTCCTGGGTG-CGTGACTGCAGCTCATCACAATTAAGTTTGTAGCTCATTAAAAGCAGCGA-TTGCACTCG-A
>CG17278 16846756 16846991|17268 chr3R 16846189 16847500 scaffold_17 1752141 1753610 + 15389|679 1029
-GCTATGGATCCATTGATCTGTAGTCC-----------------------AGCGGAAATAACTTAATCATGGAGG---------------------GGAGCGAGTTGACGC------GGTTTGGCATTCCGGAGGACTCATCTTTCCCCCGTGGTATTTGTGTGTGATATTTTTAAGTTGTACTTCAGCGGAATACAGAAAA-----------------------CACGCCCCGA-----------------------------------------ACGTAATGCATAATGATAATGTATTCTAAAATTATTAATAAT-AAATATTAAATAAAGTAATCGTAACACGCAAA
TGCTAG------ATTCAACTCTAGTTTTGACAGTGCGCAGAGATTTGGAAAGATGAAAAAACTTCAATTTGAAAAAAAAAACAAAAGAAGATTTTTGGGCCCTGTTGCCGCTTAAGTTGTTTGGCTT-------------CTTTTCTTGCGTGGTATTTGTGTGTGATATTTTTAAGTTGTGCTGCAGCAGAATACAAAAAAAAAAACCCTCGAACCATCCCAATCACAGCCCGATACCCTACACCCCTCCACCCCCTCCACCAGCCTTCACAAATATGTAATACATAATGATAATATATTTTGTAATTATTAATTTTAAAATATTTAATAAAGTAATATACATACAGTAA
>CG31207 16871753 16871767|17284 chr3R 16870562 16872718 scaffold_17 1780176 1782383 + 45431|1287 1301
AGGTGATTAAAGATA
--GCCATAAATCAGA
>Mvl 16877279 16877909|17289 chr3R 16877075 16878040 scaffold_17 1787618 1788648 + 7246|233 955
CCATTACTGTGCTGCACTGATTCTGATGGCAGTGAGGAGGTTTGTTTCACCAACAGCAACAACAACGAGCTCGGCTGCCCCAGCAGCAATCTGAACGGAACTGGGGGTCAGCACGTCGTCCTCAGCTAGCGTTGGCGTTCTAATTGGTTCCGTGAATGCCGCCGCCTTAACAAACCACTCGACAACGGACACAATGTGGCAGAGTTTTCCG-GGGCCAGGT--TAAAATTCGGTTC-----------AACCTGGCTGGCGGGGATTGGGTTGGC-----GTC-CGTTGTTGCTTCGGGT---ATACTT--------ATATAAGAGGTTCTCGGAGAGGACCTGGGATCAGTGTAACACAATAACTAAATTCTAATTGAAAAGCGTACCAAAAACGGTTCAT-------AAACTCTACTTACTGAGAAGCGCGAAGAGACAAAATAGAAAATCCATGAAAT-----------------CGTCTAAATTAT-CACTAATCGAAATCACTTTTAATTAAAGCAAATAGTTTAAAAGTCTAATAATAAGGCTGTGAAATTAACTGAGTGTAAATCGAACCACTTCAATTGTCTAATCGTATTTCAATTT-------GTCTGTAAAATGAT---------ATAATTGTATGTCTCTACATTGAACGTATGTGAGTAAT---TATTTATCAAATGTTTT---------AAAATT--------ATACTTT
CCATTACTGTTCTGCACTGATTCCGATGGCAGTGAGGAGGTTTGTTT---TAGCAGCAACAACAACGAGCTGAGTTGCCACAGTAGCAATGTGGACAATGCCAATGGC---CATGTGGTCATCAGCTAGCATTCG-GTTCCAGTCTGTTC-----------------TAACAAACCGTTTCGCAAAGAGCACAGAGTTGTCACCCCATCCGAAAGCCATGTCCCAGCACTTAGTTCATCGCGTCACAAATCTGGCT---CTGGTTTTGTTTGGCAAATTGTCGCTCTCTCTCTTCAGGCCGAATACTTGGGAATTAGTGTAATAAATGGTCATAGCATAT------TTATTTTAACATGATAAACGAAGTATACCAAAAAGTCGAAAAAAAGGTAATTCATAGGAAACAAAATTTCGTTATTTATCATATCATAAATAT-AACTGCAAAATGCCTGGGATAAAAAATAAACATGTGGCATCGAAAGTAGACATTAGTTCACTGTACTGTAATTGATAATAA------TAATAGTTTGATGCACAGACACACACATACACTCA---CACACACATACACATATTTTAACTAAACATATATATATTTCTTATAAGGCTGTGAACTGAGAAACCATAAACAATTTTTTAAATCAAAAATGTATAAATCTTAAGAACGTGTGTTTTTCAAAAATATTTCCTAAAAAAAAATCAATCGAAAATAGTTT
>Mvl 16881359 16881681|17292 chr3R 16881348 16881616 scaffold_17 1791267 1791526 + 10869|11 271
AAATCGTATCCATACTGCTCACCATTGTAGTGATTGGCGTTAATTTGTACTTTGTGGTGGTGCAAGTAGAGAATATGGAAATTAAAGGCGGCTTGCTGGCACTAGTCTGTGAGTAGTCAAT-TGCCACAATTTAAACCGAAT--CTAATGTATTTTTCCTTTTGCCAATTGCAGGTATTTTTGCCATTTTGTATATACTGTTCAACCTCTACCTTGTGATACACATGGCTGCCTGCATGGGCAATCAGCGTTTGATGAACA
AAATCGTTTCCAT-TTGCTAACCAT-GTGGTAAT-GGCGT-AATTTGTATTTTGTGGTG-CGCAAGTGGAAACGCTGCAAATTGAAGGCGGCATGCTGGCGCTCGTCTGTAAGTCTATAATATTCCCCTTATTTACTTGAGTGACTAATGCTTCTCTCTT-------GTTGTAGGCATATTTGCTGTATTATATATTCTATTTGTTATATATCTTGTGATACATATGGCCGCCTGCATGGGCAACAAGCGTCTGATGAACA
>Mvl 16881359 16881681|17293 chr3R 16881668 16882645 scaffold_17 1791719 1792683 + 47627|0 13
GTGATACAGACACT
GTGAAATAAAGATT
>Cortactin 16887402 16887947|17298 chr3R 16886612 16889562 scaffold_17 1801938 1804970 + 70652|897 1545
AAGCT-------------------------TCCAATTGAAATT-CACGATAGAACAAAATCAAATTGTATTTACATACTAACGAAAACGATAATACTGATGTTGGATTATAAACCATATAAACCA---ATTCGCAACTAACCCAGCCCATTTCCCATCCATTGTTTACCCTCTTAAC-------------CCTCCAAATTATGTGCAACGAATGGCTAGATATTGAATTATTATTGTAATTTGTTATGCT-----------AGCACTTAAAGTA-ACCGTGGTATTCCATTTTTGAT-ATATGTATCATTT----------------ATTGCATTTTACATTC-TTTGTA-TTTAACACATTTATTTTACCAAGAAAATATGCC------AAGCTATTTTAGATATCTCTCATTTCATATTTTATGCATTAGTTATGA-----TATTTGTGTCAAGTAACGATTTTGGTTTTTTTGAATTGTATAAAGTCT-----ACGAGAGTTTCCCGTGTCAG----GTGAT--CTGATCTAATGTTAAAGACGGATCTAA-------TGTTGAAGACAGTCACA-AACAAAAAGTCTGCTCTTTTGATAAAGAAATACATAATTAATAAAGTTAAATAATAACGAGTTCTCTCTT
TCGCTGGCAATGCTGGCGCAGGCGAATTCATTCATTTGAAATTATTTTCAAGAACAAAATCAAATTATAC---AATAACTACTTAAACAGCGA-AATCATGTTAAATCAAAATACTGAGTCATCGTTTATATTTATATAAC---GTGCATGCTTTATTAATGTTTTCTACTTGCAACGAAGAGACGTTGTTGTTGAAATTATTTTCTGTAAATTTCT---TTTTTAATTTCTGTTACATTTTACAACGCTCTCTCATGCCCCGCACGCAATATATTCCATTTTCTTTTATATATAATCATATATATCATTCATTATCGATTTACAAAATTGTATTTAACATTCTTTTGTATTTTTATGTGCGTATTTTTC--AAAAAATATGCCAAAACAAAACTATTT---ATA-CTCTTTTTTTATACTTAGCAGAAAGTTTTTAAAAAATTATTTGTG-CAAATTGTAATTGTATGTGTTTTGAATTGTCTGAAATGTTTTTAACAAAA------TGTGTCAAAAGTGTGCTCACTTATATATAGTTTATAAATGTTTTCATTAAGATTGTTAAAGACACTCTGACAACAAAAAGTCTGTTCTTTTGATAAAGAAAAGCG----TAATAAAGTTTCTTTGTAA------CTATATA
>r-l 16896275 16896734|17306 chr3R 16895883 16897569 scaffold_17 1811960 1813690 + 52286|449 961
AAAACCCAAACA-GCATTCCCCCTTAACGAATATTCCCCAATACCCATTCCCCCTTGGTTTCGGTTACCCTAGATAAGTGAAAAAATCTTCCAATTATTTA-----CCGCGATTTTACAG--------------TGCATTTATGAATTGAACATAGGCTATGAATCTTCCGCAAAACAGTTGGCAAACGATGC------TTGCCTTAAAGTAAGAGTTACAACAAATA---GAATGGTTAACAATCGATCCAACGAGGAAATCCTTAGTAGGAGGCCAGGCACTGCAAGACGTAGCTGTAGTCTCCGGAGAGGTCGTCCTGGAAAGGAGATCAGTGGATGGTGAATGTGAC----------CCAGCTTTG---------CCGTTGAGTGTAAGCCAACTTTATTAGTTAAT---ACAAGCACAAACTACGCATACGACTTTGATGCGCCATAATTTACAATAAAAAAAGACATGTATACAAA--ATAAAAATACGTAAAAATGTTAAATAATC
GCGTGCCTGCTACGCCCACAATTTCAAAGTTGACGCAACTGGACGTATTTCC--------TCGCACATTTTCAAATGGTCAACGGTTTTTTTTCTTACTTAAAATTAAGCGCAGCCACAGACAAAAGAATCAAAAGCATTTAAAAGACAAGTA---GTTAGGAATTTTCAAAACAACATTTTTAATATTAAGTTAAAAGTTGGCTAAAAGAAAGGAATACAACAAATAATGAAATGTATTTTGATAAATCATGTACTAAA---TTTAGTATGAAGCCAAACATTGCAGCACGTAGCTGTAATCGCCGGAAATATCATCCTGTAAATGAAACGAAAAAAATTTGGGTTTGGTTTAAAAACTGCGAATTTTGCAATTTGTTCCTTTGGCTTTTA--CTTTTTTATTTGTTAATAGCACAAGCACAAAATACCACTAGAGATGT--------ATAATATACAAATAAA------ATGTATACAAAATATAAAGAAACGTTAAAATAAT-ATTAATT
>RhoGAP93B 16908758 16909567|17323 chr3R 16908618 16909205 scaffold_17 1819157 1819695 + -248|144 600
ATGTGTGCATGCCTAGTTATGTCTCAAATTGTAGTTGAATTAATTTATTTTGCATTTTAACTGTTGTTTTTCTTTAAATGGAATTTAAATCAAAGCAAGCAAGCAAGCAAATACTCAAAGAAACTCAAACTCTTAACTCTCAAACAATGCGAAGCAAAGCAGACCTTGAATAACTTCTTGCGAAGCCTATAAATAGTTATAAAATAAAGCTAACGATAACTTAAATTAAACTCTATATATATTATTATGTATGTACACTATATGCAAAGGATGATCAGAAAGGAGAGCCGATAGAGAGAGAGATAAGTGAATCAAATGCAATAAGAGGTCAATGATGAAATGATGCTTATTAATTACTCGCAGCCAACGTAGTGCTATATACAAATATTTATTCATTTGCATAAATAAAAGAATGAAGATAAATAAA---------TATGATAATGTTCGAATCAAA
ATATATGCATAATTATATATTTCTAGTCTTATACTTTATTTCAACAATTACGAAACGCGAATGTCATGTATTTTTAA---GAATTTTTA---------------AACTTAATGTTCAAAGTGAAGCAAACACTAAACAGTCG---AATGCAATACAAG------CTCGCATCTTTGCAGGCCCAACTTCCAGTCGTCGTTTAAATCAAACTAACTATCCATTTAAGAGAA--TCAGACCGATTACAA------TACACCATAT--------TAACATACAAGTATACTCTATAGCTATAG---CCAACCTACCATGCTTACCAAAAGAATAAAAACAAAAACATAACCA-CAAATATATATATACAAC------CCATATGATATAATCGATCCA-------AAATGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAAATACCGCTCTAAAACAATATACAAAATAGA
>RhoGAP93B 16908758 16909567|17324 chr3R 16909206 16909521 scaffold_27 1610178 1610503 - 3660|0 374
ACCAATATGCAAATCGTTATGAACCTATCCTAACTTACTACCTACCAAATCTAACTTTAACTCA------------ATTTGTATTTATACAAAGGATGATGATGAAGA----TTAATCCTAACTCCT-ACTTTAACTTTAAC-----TCGTTTGCTACTCGAACTTTCTCA-CTAATTGCTATCAGGACGAAAAGTCGATGGATTTAATTTTATTTCGTAATGACTAGGAAGCTTGTTCAGAACAATGGCAACAACCCCAAATACTCGACGATCTTGTAACCCGTAGTGCTTTTTCAAACCAAAAATAACTGAAAGAT------------------------------------GAATCCAAAACTGAGAACTCA
ACAAATATGTAAAACGTTATTAACCT------------------CCTATCCTAAACTTACTTAATTACCTGCTTGTATTTGTATTTATACAAATTGAGAAGGTCAAAAGCTCCTAA--CTAACTCCTAACTTTAACTATACTAATCATTTTTTGCTACTTGAATTTTCTAATCTAATT----------CAAA-------------TAATTTTATTGT---ATGCCTAGGCTGCCTAATTTT--TAACAGCAAATACTCAGAACTTTTATCGGCATTGTAATGCGTAGTGC-TTATCAAACCAAAAAGATAAAACAGATCTAATCCAATACCGAAATTACAAAACATATGAATTTAAATTTAAAAGTGTTAACCTA
>RhoGAP93B 16908758 16909567|17325 chr3R 16909535 16912918 scaffold_27 1610562 1614139 - 151916|0 44
TGG--TCTGTTAGCCATCCAA----------AAGGGCAAACGACC
AGAGCTTTGATAGCTATTTAAATAACTAATCAAATACCAATGAGC
>CG7044 16923892 16924050|17338 chr3R 16923863 16926377 scaffold_41 749764 752233 - 78082|29 188
TTCCGAGCTAAGCCGTTTTCCAGTCAAAAAAAACCTCTCTGTGAAGTAAGCTAAAAGTTTTTTCCGTGAAATAGATAATATTTTTGATAACTACGTTTTGAACATAAAATGAGATTT-TATTTCGCCGGCGCAGATAAAATAAATAACAATACAGTAACA
TT--AAGTTAATGCTTTGTAATGCTTAA-------TTTTT------TAGGCAAAAATTGTTTCCCCAAAAATAAAT-CTATTTTC----------------ACATTTACTGGGATTTAAAATTTGGCGCCATTGATGACAT------CGATATATTGCCG
>sec15 16930943 16931186|17341 chr3R 16930536 16931152 scaffold_41 756721 757369 - 13919|452 681
TTGTTGAATTCGTGTAATCATAAACTATAGCTTTTCATCTTTA------TTGTTTAGGCTAATTTGAATTTTCACATGGAAAAAGTATTTAGTTCTCATTACATTTGATTCGATTTGTTTTTATAAAAGACAAATTTCAATTGAAACAGCTCGACCCG--TTGAACGT-GTAAAATTGTATTTTGAATTTTTGATTCT-----TATGTACA-AAAAGCGCA-----GAAC
TTGCTCTATTTATATCAAATTTAAGCACAGTTTTTTTTTTTTAACTATTTCATTTGGGATTGCGCGTTATTTCAC-TATTTAGAGAACTGGATTCACTGCATAGTTATTTCCTTTTGCTTC-ATGGAAGTTT--TTGTAGCTTGAATATATGAATTCTACTTAAATGTTGTAAAATTGTATTTGGAATTTTGAATTTCATATCTATGTACAGAAAAGCGTATTATAAAAG
>sec15 16930943 16931186|17342 chr3R 16931185 16934867 scaffold_41 757730 761248 - 157532|0 1
AA
GA
>slmb 16944973 16946441|17353 chr3R 16944950 16946948 scaffold_3 4082641 4084559 + 38607|28 1689
CATTTTGTGCAACGGCAGCTGCGCGAGTTACATCTACAATCCTCGAGCGAAGGAGAG------GAGGACGACGATGCGGACGAGGACGACGAGGATG------ATTTTGAGGAGGAGGATTCTAGAAACGATGCTGGCGCGTTTATGGGGGGATATGTTAGGCACCGGGATGCTGGTGGTTCGGGATCCGTCACCGGTTCCGGTTCGGATCCCGAATCGGATGACCTGGATTTCGATATAGATGTT-GAGAATATTAATGATTATGATGAATAATGAGTGAATGGTCGTTAACCAGCAGCATATACATACACACAGCAGACTTGTTTAAACAAAAAACGATGTTGAACCCAAGATACAGCGATCTCTAAGCGTCTATTTTAC------------------------ACACTACATCCACACACACACACACACACGAAACACAACCACATAATATGAATTAAATGAAGTTATAAAAG---------CAAACAAACAATAAATGC---AGGAGTATACCATTTATGCAGATATTTCGCA-AAACTGGCTGTTAGGTTTGTCGTGTACGAATGAAACAAAAATGAAAGATGCAAAAACGGAAGG---ACAGAAAAAGTAAAATTATATATAAGTTTATGTAGGCGCTGTAATACTAATCGAGGGTCAGTCTTTGAATCGCCCTTCGGATCAGTGGATCGATCGATTGGG-------------------CGTTATTTTAAGTGTTTCTTTAGCTCAAATACACAA---GTATCGCGTTTAG-GCAGC-----TGCCGCCTCAAGAATCGCAGCA-------------------------GGAATCTTCAGCGCGGCCAGAAGAATC----------------AGTCTTTAGCATAAATGTTAGTTAGAG---------------------------TTGCATCATTGAAATTGGCAGAGCGC-GTTGCCGTTTTGCACA-TTTGTAACCTATTTTACACGCCTTTTGCCTAATGTTT--GTGTTAATTGTAAAGTAAATCTAAGCCTAGTATCTTATTGGCAATTGTAATCTAAGTTAACCGAAATACAAATATTTTAATTGAAAAGTTAATTGTGTAAAGAAGGACACGCAGCAGT------------------GTCTGCAACTGGAA--GTTGCACA------TCTTTCGAGCGAAG--ATGAA----TTGAAAATGGATCCATTGTAC-TGCAATATATAACCGATTCTTTGATTGATTGATCTATGCTAACTATAGGTTTTAGATATACCGATGTATGTAGAAAATAGCAAATTCCCAGGCAATTTCAACAATATAATTATATGTATGTATGCCGTTCGTTGATTGTGATCAATGGATATTTTACTATGTGTATTGCTATTTGTAAGTTAAGTTCCAATGCTATAC--TTGATCTGGATCACGATCACGCCGCTTCCGCGTTAACTAATGTATGTACATAACGTTTTACTTTAA--CAAAAGTGTTAACAAAAATATGAACACATACTCCGGATTATGTAAAACTGTT-AGTGGAAAGAGGGCAGCATGTTAAACGATGGCCGAGCAACTGC-TAGTGCGCGAATGGGCTTAGTATATGTAACATAACTAGAAAT-AATAATAAATTGTGTATAAATGCTA
CATTTTGTTCAACGGCAATTACGGGAGCTTCAGCTGTATGCCTCAAGTGATGAGGAGGGACAAGAGGGCAACGATGACGACGGCGATGATGATGATGAATATAATTATGAGCTGGAGGATATTGATTATGATGTTGAT------------------------------------------------------------------------------------------GATCCCGATAATGCTGTTCAAGAAAATTAATGAATTATACAAA-------------GCCAGCAATTAGCATTG----------------AGACTCGTC----CATTAAATTATGTTGAACCCAAGATATTGCGATCTC-------CGATTTTACTGAAATGCAACAAAAAAAAAAAAAAAACTAAATAGAAACAGAAACA-AAATGCAACACACGCGTGCATAATATGAATT-AATGAAGTTATTGAAGAATACAAGATAAACGAATAATAAATACAAAAAGAGCATAACAAATAT-------TTTTGCATAAACTGGCTGTTAGGTTTG-------AGAAATATACGAAAAGAGAAAACATATATATATATAGTATACAATATAAACAGAATTATATATTAGTTAAT-TAGGCATAGAAATAAT----TAAGGTCAGTCTTTGTA----------AATCGTTGGATCTACTGTTTATGCTTGCAGCAGCGATACAAACGTTTATGTAACTGATG-TTTAGCTCAAATAACTAAAACGCATTGGGCTGAGTGCGGCTTTAATGTTATTTTGATATTTGAGGCACGTTTTTTTACATTGACATGTGTTTAGGATATACAAAATGGGCAAAACTCTCAGATCGTACACAGCATAGTCTTTAGCGTAGATGTTGGTTAAAGCTTGATTGACTTTGTGAACACATATATTTTGATTTTTCAACATTACGAATTGCTTTTGTCATACTGCACATTTTGTAGTTTAATTTACA-------TGCCTGATGTTTTAGTGTTAAAGCTGTAAAAAATTAAAGAAAGATAAATTAAAAG--ATTAGGCCTTAAGTAACACATAAAATA--------AATTGAAATGAATACTATGTATATGAAAAGACATGAAAGTCGTGCATGTTTTCACTTAGCCTGTATTTTGCAGTGTTGTTCAATACTGTTTATTAGGCAAAACTATGAAAAACTATAATATTAAGAAATATAACATGCAATAAATATACAATTCTTTAATTGA----------ACAATGGTAGATGTTATATA--------TATGTAGAAACTAGCTAATTTTCATGTCGTTTCTA-AATATA--------------------CCATTGATTGTGATCAATGCATATTTTACTA----TATTGCC-----TAACTTTAGCTTCAAAGCAATCTTATTGAATTGG-------------TACTTCCGCGCTCTAAAAT-TATGTATATAATGTTTTACTGTAAGCCTAAAAAGTTGATACAAATTGAAAT-----TTACGTAATATGTAAAACTGTTGAGTGGATACGCAGCCGC-----CAAAAAGGCAAAAGGAATTGCAAAATGAGCAAATTGG--TAACATAGGCAATATATATGATTATAAATAATAAATTGTGTATAAATGCTA
>CG7009 16958456 16958474|17365 chr3R 16958462 16959868 scaffold_42 911428 912802 + 33671|0 12
ATAAAAGCTTTAA
ATCAGTACCTTAA
>CG10824 16984955 16985111|17384 chr3R 16984928 16985525 scaffold_3 4539891 4540512 - 10677|27 198
AGTTGTTAAATATGG----CCCATTTTTTATGTGATCACTACATTTTCAAAGCTTTACAATTATATGTATACATTATAATTAATATT------TGAAGTATTTCCTAAAGCTTCTTAATTTTAAACATAAAATCTTTCGATCCA--ATAAATAAATCATTTTTTAAATT---
AATGATCCAACAGCGAGACCCTCGTATTTCCGTGTATAAGAATTTCTCA-----CTAAAATTGTATT--TACTTTATGTGTGCTATTAAATAATAAAGTAATTATTTAA--TTCAAATTGTTCAAC-TGATCTTTGACGAACTATTACAAATATATACTTTCCTAAAGTCAG
>CG3353 17042988 17043080|17423 chr3R 17043000 17044437 scaffold_3 1843967 1845383 + 62504|0 80
ACTAAGAATTAATTTTTTATTTCATTAAAAAGCTCTTATGTACGTACATATTGTAAAATATATTTATGTTAAAGATTTTGA
------AGTTGACTCCTTACTT-------AAGCT---------GTACATGTTATACCCTCTAATTGGGT---AGTTTTTAA
>e 17055552 17055763|17429 chr3R 17055541 17058746 scaffold_55 379120 382376 - 172919|11 272
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GATCAAAGGCCAAAGGTCGCCCGCAGTCCTAGCATCTAGACGATCGAATTTAAGACGCACCTGTGTTGTATGTAACCTGTAGTATGTAGCCTGTAGCCTG-TAGTATATAAGGTTTATATCAATAGATCCACCTTCTAGTATTA-TCCTAGGCATTGCCCAAT-------GAAATTTCATCAATGTATGTTGACTAGTTATAAGCTTTCAAT------GCAATTAAACAAAAACCATCAACGAATGATTCAATTTAAACAAA
>Rab1 17091748 17092926|17478 chr3R 17091878 17092338 scaffold_55 426971 427488 - 7087|0 531
TAACCGTCACTCTG-ATTTCCGCAGTTCTGTTCATAAGTAGTGCAAAGCAAGCA-----AATTCGGTGTAGCAATTAACCTAATATTACTTTAACCTACAATAAGAAGTTACCTATCACAGCAGCGCGA------------------AACCATACCGAAACTAATAT---GTACTATTAAC-----TACACAT-----------------TAATTGAGCGCAGGCGACGGCAGGAGC--------AATTGTACTTGTCCTGTGTCAG-CTACTACTTACCACTATGTATACATATGTATGTGTTTAAATTACAAATACAATTTTCTAAACATATTATCTCTAGCGAACGTGATCGTCACTTGAAATTTTATGTAAATCGAACCCAAAACCGAACGAACATT-TTTAGATTTAACGTCGAGCGATTGTGTGTTTGAATTATCGTGTGACACAAGGGATTTGTTTAGGCACATAAT-TAGTGTA----------ATAATGACGACATAGCGAT-GAAGTTTAATAAAAATTATT
TGACTTTCCTTTTGTTTTTCTATAGTTCTGTTCATAAGTAGTGCAAAGCAAACAACAACAAAATGGTGTAGTAATTAACTTAAT-CTAAATTAATCTAAACTTAAGAGTTACTTACCACAGCAGCGCGAACCGATAGCGATAACGATAGCGATACCGATACCGATACCGATTACTATTAATACTTATATGCATAAACAAAAACAAAATGAAAATGAAAAACAAACAAAAATAAAAACCAAACAAAAACTGCGTTTATTATAGCCCAGACTCAAATCCGGCACCAAACCGAATTATATATATATATATAAAACAATTTCATTCTTCAAATCATGTC-TCACTTCTGTCTGTCAT----ATTGTAATTATTATATAAATCAAAAGAGAAACC-----CCCATTATTTAGATTTAA---AGAGAAAAACGTTCAGTGAAAAAGAGAAAAACGCGTAGGATTTGTTTAGGCACATAATATAGCGTAATTTTTGATGATCGTAATAAGATAATGAGAGACGTTTAATAAAAATTACT
>Rab1 17091748 17092926|17479 chr3R 17092496 17092925 scaffold_55 427632 428099 - 24785|0 470
CCTGGGAATCATAGATGCACGTATATACTAATCTGGGTCTTT-------GTTTCCAAAATTC-------CAGGAGTACGCCGCCCAGTTAGGCATTCCATTCCTTGAAACTTCGGCCAAGAGCGCCACCAACGTTGAGCAGGCCTTCATGACGATGGCGGCGGAGATCAAGAATCGCGTCGGGCCGCCGTCCAGCGCCACTGACAACGCTAGCAAAGTGAAAATCGATCAAGGACGTCCAGTGGAAAACACCAAATCCGGTTGCTGCTGAATAACTCTGATTGTGAATCATTATTTTATTATACAATTAAACAAAATTTAAATATAATAAATTAAAACG----GAAACCACA--------CAATAATAATAAAACAAGCGAAAC--------CGATGGCGGATCCACGAAATCGTAATTATAATAA-------CTAATTCTGTAATAACAATAATGGTGAGGAATGACGAG
CCGGGAAATATTATATATATTTAT---CATAGCTTTGTCTTTAATTAATGTATTCAAACTTTGCATTTGCAGGAGTACGCACATCAGTTAGGCATTCCATTCCTTGAAACTTCGGCCAAGAGCGCCACCAACGTGGAGCAGGCATTTATGACGATGGCGGCCGAGATTAAGAATCGCGTCGGGCCGCCGTCCAGCGCCACCGATAATGCTAGCAAAGTGAAAATCGATCAGGGTCGTCCAGTGGAGAACACCAAATCTGGTTGCTGCTGAATAACTCTGATTGTGAATCATTATTTTATTATACAATTAAACAAAATTTAAATATAATAAATTAAAACGATACAAAAACACGGCAAAAGCAAAAGATGAAAAAAGAAAAGAAACATCCACAACAATAATAAAACAAGCAAATCGTAATTATAAAAAAAACAATTGAATTATATAATAACAATAATGATGCGTATTGAAAAG
>AP-2sigma 17094931 17095130|17482 chr3R 17094042 17096789 scaffold_55 429658 432539 - 86134|1071 1287
CGGCCCAATTCATACATATGTATATCGGATCTGCCA----GATGCATTCCCCCAGGCGCTACACCCGCCTATCGAATCTTCTTTCATATACTATTACGCGTATTATTATTATTATCTTTAATGTGTTCTCTATGCAAACA--------CTCAAATGTTAAAGGCCGTGTTTAGAAACAAATGATGTACCATAAGAGATTGT-----ATGCAAAAGTT
TGG--------AAACGCAGGCACATC-CACCCACTAAAATGATGCATTCCCCCATA------GCCCGCTTATCGAATC----CTCATATAATATTATG--------TACTATTTATCTACATGTGTTCTATATGCAAGCAAAACAACTCTCAAATGTTAAATGATGTGTTTAGAATCAAATAATTTATGATAAGAGATTATTGCAAATGCAAGTATT
>CG3308 17096644 17097676|17482 chr3R 17094042 17096789 scaffold_55 429658 432539 - 86134|2858 3003
GTGTATTTTTGGTTGGTTAGCACACTTAAAAGCGCTGAATATTACTCAAGTCCTCAAATTGCTCCAGCTGGTGCAAATTGTCCCACCAGAGTTTCAATCGATGCTGCAGAATCAGAGAGAACCAGGGTGTCAGCGGGGCACTAAAC
GTGTATTGT-----GCTTTGAGTTCTCAGAAGCGTTGTATATTTTGCAAGTCTTCGAACTGTTTTAGTCTATGCAAATTGTCCCACCATTGTTTGAGCCGATGACGCAATATTAGAGCAAACCAGGGGGTCAAGGGTGCACTAAAT
>CG3308 17096644 17097676|17483 chr3R 17096790 17097823 scaffold_55 432969 433993 - 25608|0 991
AAAATGGTAAAGGAGCCACATGGAACTGAACGACAAAGTGTGCCACCCAGCAGCTTTAAACCCGTAACTCTATAGATTCAACGAGCCTGAGATTCACGATAGACTCATACCTATGTGCCTTAACCACTAATCGAATTCAGGATG----AAGCGCTTATCCTGATCCCCACACATACACA---------CATCCACAAATACGACCCCCATTGCATGCGAAAAGTACGTATACGTATATAACTATATATTCACCCCCTGCCGTAAAGGTGCAAACCATCG----ATCGAAGTTTGCAGGGTCTAGCTTTAAGTTGTTGGAATTTC-CGAGCAATTGCTTTATTTACTCGAGTACCCAGAGAAA---CGGTGCCAAGGTGGTGCCTCGTGAACGTCGACTCCGGATTCGCCCGG--GGTCTGCAC----------TTCACGCCTCGAAGCGCGCGCTTCGAACTCGCTC------CCGAAGCGATATATGTTAATGTTAAGT-----GCTGCAGCTTGTCTTTTGTTTGTTTCTTCTG--TATTTAGGCTAGAATCAATACTTT-----------TAGTTTGTGTCTCTGTTAG-CCTGTAGT-CGTACTTTTGTACATATTTATTCTTGTTGC--------------GACGATGACGATGATGATGATGATTATGGGAAACGTAATGTGATCATTTTAAAAGC------TAATTAGTTATTTGATATTCAACATACAAACACATTAGTTAG-GCTATGAAACATATTGAATATCGTGCGCCTATACAAACTATATATGTATTGTTATATTTACATAT-------ACAAAAG------------CGTTGTACTGAACTGATCGACCCGCGGAGGTTGCATAAAATCCGCTTTGTGCCCATTGTCCGCACACAGACACACACTATTTTCCATTTG------AATAAAGCGAATTTGAAACCCAAACGAACAAAAGCCCCTTTTAGACGTCATTAC
A---------------------------------------TGGTGCCCAGCA-CTTTAAGC------------AATTTAACCAAGCCTGAGATTCACGACAGACTCACATA-ATGTGCCTTATAACCTAATCGAATTCAGGATGTGCTAAACCCTGACCCAAAAACACATACACACACGAGCTATACCCACATACAACTACGACGCAT-TCGCATGCGACTTGCAAG---------AAAAACCTCCATCCTATTTATACTGTTA--GTGCGAATTTTTGTTCTGTCTTAATTTGCAAAGG-TAGCTTTAAGTTGTTGGTATTTCGTAAGCAAAGCCTTTGTTTACTTT-GTACTAAAAAACAAATCGGTGCCAAGGTGGTGCCAAGTGAAGCGCGGTGGCGGGTACGCAAAATCAATTTGCACTTGCTGCCGTTTCACACTGCGAAGTGCGCGCTTCGTGACTGTTAAAAAAGCTGCAGCTATATACATTATTGTTTAATTTTCAGATACAGA-TATTTTTTCTTTAGTTCTAAGGTTTATTTTAGCTAGGGCACCTTTTTTGTATACCAACCTATTAAGTCTCTCGTTTAGTTTTGTAGTGCATACTTTTGTAAATATTTATTCTTGTTGTTCGTTGCGGAAGAGATTGATGATGATAATTATGATTATTATGGTAAACGTGATGTGATCATTTTATGAGCTATATATATATATTTATATAATATTCAACA-ACACACAT-TTAGCTAGTGCTAT---------------------GCTAATACATACACTCTATT--TTGTTATATTTACATATTATTCAAACATATGTGATGCTCTATACGTTGTACTGAACTGATCAACAAAACGGAGGTGCATGAAAAC--------------------CCCAAACACACACACTATTTTCCATTTGAATACAAATAAAGCGAATTT-AAATAAAAACTATAAAGAACCATAAGTATACATTCTTCC
>CG3301 17099965 17100163|17485 chr3R 17100078 17100293 scaffold_41 8389 8630 - 2670|0 96
ATACGTAAATAATCAGTGGCATGGAACACC-----------GGCATACACAAGCTGAGAATAGAGGATTGAGCCGGTGCAATATCATATTACACTCA
ATACCGAAATTAT---TGACAAGGACAAATTATCCGCCTTGGGTTTTCCCATGTTGCGCTCCGAGGATATCGCCGATGCAATCACCTACTGCATTCA
>CG3301 17100225 17100312|17485 chr3R 17100078 17100293 scaffold_41 8389 8630 - 2670|169 244
ACATTGCA------GAAGTCTTCCGACAAGAGTTTATCAACAGGGGAACTCAATATAATATGCCTGTTGG-AAGTA
TCACCGCACTGACCGAGGTCCTGCGCCAGGAGTTTCTCAACAAGGGCACCAAAACAAAGATAACAGTAAGTGAGGA
>CG3301 17100225 17100312|17486 chr3R 17100294 17100567 scaffold_28 1336482 1336783 - 2082|0 18
ATACCATTGCACCAGGAGT
ACACCAACGTGCTGGGCGT
>CG3301 17101100 17101122|17487 chr3R 17101074 17101938 scaffold_55 436063 436932 - 28340|33 58
AGTGACCACTTCCAAGTG---ACCAA
A---AATTCTTCCAAAAATATACCAA
>CG10823 17102557 17105673|17488 chr3R 17102235 17104329 scaffold_55 437771 440073 - 19668|339 2476
GATCGCTTAGCTAGGAACAGACACGCCACACGGGGCACGGGAAACAGGACTTCCCCGCACACACACACACCACAGAAAACAGAAGACAGAGTACACAGAAGACACTCCCCACAGACCTAATAGGTAATAGATGTTTTATACGTGTTTCAGAGGTACTACACAAAATATGAACTACTCCTTGGCTATGGCTATATAATACCTATATGTACCGT-----TACGCAGTTTT-AAGATTGTTTGTACTCGCAAT--TTGCTATAT----CGAAA---AGTTTGGTTAAGAG--------------TGGGCGGAACAACG--------TGGGAATCGAAGGGG---------TTATAATAGCTTAG-------------CTAAACTTTTTGTACGACGGCGAACGTGAGTGAAACGGGCAAGTCCAGTATCATAGTTGAGAAACGAAAACAAAACAAAATGAGATAACACCGAGGTCTAAAGTAACGTACCTACTAAATTTTTGTATGGA-AATTCTTACAATTTATAC-------------------------------------------ATATATATTTATATTGATTTTGGAATAAGCAATATGCAATACAAGCGTATGTCTGCGCGTACGCCGTGTATCTATCAAACAACAATAATCAATTTTATTAGAATTTTACACAA-CTGAGTCGCGGCAGCGGAAATGGGTTA-GAAAACGCAATGCACCGGAAGGCGAGTGAAAGCGAAAACA---ATTGACACACCATCCAAGCTTTGTTATCGCTCAATCGC-CGACTATTTCGATACTTCGATACTTCGATATAGGTGGGCAGAGGC--ACCAGAGACA-----GCAGAGATAGTGAGGGCATCGAACGCGCACAAAGTAACACTTGACCATGCTGGGACAGAGTAGATTA----GGGGGGAATGGAATAGTCTAGGGATTAGGGCTAGATTAGGATTAGAACAGGACGAAGGAGTA----------------------------GGTTGTCCGCTA---------------AGTGAGCACA----------------AAGCAGTCAAAGATTTCGCACT-AAACGTATCACTACAAACTAACAAAGAAGCAAACAATAATCGAACTCAAATTCGTTAAACACTAAACACCAATAAACTTT----AAACTATACGAAATAAAATTTTAACGGAT---------------------------AGCGCAAGGAGGCAGAATCA-----------------------ATG-GTAAAACTATGAAACTAAACGTAACGATTAACTATGCAATTTTATTGTTAGCCAAAATTTTATAACTGTCAAGTAACGAAC---AAGTAAATATTTATATGTATACAGAATATATCAAGTATAAA---GCAT-ACGTTATATAT-CTTTATATACTTCGATTGCATTAGGCGCTGATC--------------------------GGTAGAGTTTTAATT-GGCTTTTGTGTAACCGAGAACGATCTGATCAGA----GATTTAGTCTAGTCGT------------ACTCATTGCTCTCTG-------------TTCAGGCACTTGGGGGGGAGCTACATATGTGTAAACCCGATCCGAAATCGAAAAGTAGAAGACATGCACAGCCCGTTCAAAACTCCAGCGCTTAGTGTAAGGCAAGCATCTACAATGAGGAATATCAATAATATATTTCAAATATACAAATATATAT-TTATATAGGCCTAGCGACTCACAAGCTGGCAATATGTGGCAAGCAGCCACAGAAGCGAACAACAACGTCTA-------GTAAACA--AGAGATTA----------CATTTATACAAATA--------------CATACATATTATATGCTGCAAGTACG--------------AAGGGCGCGCAATAGAATGTCCTT--TCCCGCTTTCGATTC---CACTTAAAGAAGAACCCGAAAGTTGCGAGCAG-GCTGATTTAAGCAAAGTAATATTTATCGAATACCCCAATTTGAACTTTAGGTTTTAAAGT---------TTTAAAACGTAGAGCATACCCATACTCA--CATGCATGTGC-ATTATGTTCGTTATTTACCGATGCGGAAT
GATCGCTTAGTTAGGCACACACACAC-ACACG-----------------------CGCACACACACACACAAGAGAGAG-----------GTACACGCAATGCAC-CTAAACTAAC---ATAGTTATTAGATGTTTTATACGTGTTCCAATAGTTGTACACA---TACACACACATACTCACACACACACACACA-TGCATACAACTACCCTGTATATTCGCAGTTTTTAAGATTGTTTGTACTCGTCATATTTGCTATATATACCGAAACGCAGCCTGCTTAAAAGAAATACTTGAGTCTTGAGCGAGGGAATGCAATTTTTTACTAGCCAAGGGAGAACCCAGCCCAAAAAAAACTTGGGACTTGGGCCCGGCTAAAAATTTTCTACGAAAGCGAA---GAGTGAAAAAGGAATGTCCAGTATCATAG-----------------AACAAATTTGAGAAACACCGAGGTCTAAAGTAACGTACCTACTAAATTTTTGTATGAACAATTCTTACAATTTATATATATACAATGCATGCATATATATATTTAAAAAAAAAATATATAATATATATTTGTATTGATTTTGGAATAAGCAATAT-----------ATATGTAT----------TACGTATCTATCAAACAACAATAATCAATTTTATTAGAGTTTTACACAAGCCGAAAAGAGAAACGAGAAACGAGAAACGAAATCGAATTGCGACATTAGAGATATAGAAATATAGAGATATAGGGGTTGATCAGCCGGACATAGTTATGGCTAATTCTTGGGGGGATGTAGGCATTACGAAGC----GCACAAAGCGGCAACAGTCGACCATGGAAATGTTTACGGGGCAGTTGACAAAATAATATATATATAAATATATATTTATTTGTGCTTGGTTGGGATTAATTACTCTTAGGAGAGCGGCACTGGTTGGCAGGTGGAAGAAGAGTTGAAATAATAATAAATATAAAAATATATATTTGTAATTTATTTTTCTTGGTTGGGGTAATTACTATTATGGGAGGGGAGGGGTAGGCACAGGTAGGCAGGTGGAACAAGCTGTCCGAGCATTCGCACTAAAACGTATCACTA------ATAAAAACAATAATCGAAAATCGAAACATAATTCGTTAAGTTCTAAACACCAAAAGAAATTAGGAAAACGTTAACGATAACAATTTTAATAAATGACTAACAACTAAGCTATATATAAACAAACATATGGAACTACAAACATATATATACACACACGTATAAATATGTATAGAAATATGGA--TATACATAATGA-CAACTATGCAATTTTATTGTTAGCCAAAATTTTATAAATGTCAAGTAATAACTGTAAACGAAACATTTATATATTATATAAATATATATACTATATATTCGTATCAAGTTACAAATAAATTATAT------ATAGCATTAGGCGCTGTTTTTGGCACGCTTTGAAAACAAAAAAAAGCCACAATTTTAACCAGGATTTAGTTTAAACAAAAAAGAATTGAGACCAACCCGAGTTGGCCCAGCTTCAAGCTTCAATAAACCCAATATTATGAGATATACTAACAATTCCCAGCGTCTAGAGCGTGGCTAC-CAAATGCAAACTAA----------GAAAAAAAGAA---------AGCCCA--CAAAAAATTAACAGATAATAT----CAATAAATTATGAAAATATATATAAA-AATACATAACATATATAT---TATATATATTATATAGATGTATTAATACAAATGATT----CATGCAGTACACCTCTCCATTCATTATTTACAATTTTTATTTTATTTTAAACATTAACTATTATTGCTATTATTATTCTTATAAATATTTTGTATTTATATTATACAT-TTATATACTCATACTACACATTTATATATGGTAATAGATACTAATAGAAGTTTTTTAATTTCACATACAATTTATATATATAAAAAAGAAT-----ATTTACAATTGGTAATGATATA---TAAGTAATATTTATCGAATAAACGAA-TTGAACTATAAGTTTTAAAATTACAATAAATTCAAATATTAGATAAAAACGATAGAAAACAATGCAAGCGAGATTATGTTTAATATTATTGTGTG------
>CG10823 17102557 17105673|17489 chr3R 17104468 17104497 scaffold_55 441008 441037 - 1938|0 29
GCCTACGATTGTGATACAAGTCGGCAGTTC
GCCTGCGACTGTGATAGAGGTCGGAAGCTC
>CG10823 17102557 17105673|17490 chr3R 17104829 17105592 scaffold_55 441127 441939 - 40128|0 813
AACCCTTTTTCCAC-CTTAACCACCTAGGTACTACGACAACGTGGCCATCGCCTCCAGCACCACCAGCACCCGGAAGTCATCGCACTACCACCAGAACAGCTCGAGGAAGAGTCCGAGCAGC------------AAGGGCAACGCGGTGTCCTACATCTACGAGCACAACTCGCTGCGGCGCCACAACATGATGCTCAAGCAGGACAGCAACCTGTCGCAGCAGATGCTGCTTAAGCAGGACTCTCACGGATCGCGTCAGTTCCTCATCAAGCAGGAGAGCTCCTGCAGTGATGCTTCTGGGATCCGGCGACCCCTCTGCCAGCAGGACAGCAATGGCTCCAAGGTCTCCCTGTCCAAGCAGGACTCAATTGTGTCCTACATGGAGGCACGCAGGTCGGCAGGACACGGTCTCAACGACACACTGGTGGAC---------------AGGGATAGCGTTTCCATGGATGTGGGCCGGCGACAGGGC----GCCACACCGAGCTCTCTGCTCGATAAGCGGCAGAAGTTCGTAAAGCAGGACTCGGTGATCTCGTTTGTGGACCAGCGACCAGAGCAAAGGCGCCATCAACTGGTGAAGCAGGACTCGGTCATCTCCTTCGCCGACCAGCGACGCGGCCTGCTCCACAAACAGGACTCGCTGATGGCCAACCGGACGGGTGATGCACCCACCCACCACGTTTCCATTCTGAAGAAGACCGACTCGCAGCTCAGCTACGGCA---------------GTTCGACTTCTCCTCGCAGGAATGCGGATCTCTACGAATAGG---CAATATTGGGTTAAA
AACCCTTTCATAACTCTTCCATTTCCAGATACTATGACAATGTGGCCATTGCTTCGTCTACGACCAGCACCAGGAAGTCCTCGCACTATCATCCAAACGGTTCGCGCAAGAGTCCCAGCAGCCCAGGTCTGAGGAAGACCAATGCCGTCTCGTACATTTACGAGCACAACTCGCTGCGTCGCCACAATCTGATGATGAAGCAGGACAGCAATTTGTCTCAGCAGATGCTGCTCAAGCAGGACTCGCACGGCTCACGGCAGTTCCTCATCAAGCAGGAGAGCTCCTGCAGCGACGCCTCCGGCACGCGGCGTCTGCTCTGCCAGCAGGACAGCAACGGCAGCAAGGTGTCGCTCTCCAAGCAGGACTCGATTGTCTCCTACATGGAGTCGCGCCGCGTGGCCGCACTCGCTGCCCAGGAGCGCTCCGTGGACTCGGCGTTGACCCAACAGGACACCATATCGATCGAGTCGCGTC-GCGGCGGCGCCCAAGCCACGCCCGCATCCCTGCTGGACAAGCGGCAGAAGTTCGTCAAGCAGGATTCGGTCATAAGCTTTGTGGACCAGCGACCGGAGCCGCGCCGCCATCAGCTGGTGAAGCAGGACTCGGTCATCTCGTTTGCCGACCAGCGACGCGGCCTGCTCCACAAGCAGGACTCGTTGATGACCAACCGTTCCGGCGATGCGCCCACACACCATGTCTCCATACTGAAGAAGACCGACTCGCAGCTCAGCTACGGCACCTCCTCCTCCTCCTCCTCCGCCTCTCCCCGCCGCAACGTCGAGCTGTATGAGTAGACCCCAACTTGGGAATAAA
>CG10823 17102557 17105673|17491 chr3R 17105653 17106864 scaffold_55 442349 443418 - 55904|0 20
CCTCAAATATATTGATAAAAT
TGTC--CTGCATCGATGAACT
>CG16791 17146476 17146775|17546 chr3R 17146397 17146610 scaffold_12013 409 645 + 3232|83 243
TATGTGTAAGGCGAAATCGAAC-----CACTTCGCGCTGGTTTGGCTGTATATAATGTA-----TTGTTTTTTTCTTTAGTAATGATACACACTTTTGTTTAGTTCTAAGTGCTTAAAATAAAC----------------GAGATTTTGATAATTAAGACA
TATATGCAAAGTCTAAGCAAACGTAGACAATTCAAATAGTTTGTGCTGTATATATCTTAATTATTTATTGCTTTATTTGATCAATTTAAATCATTTTCTTTAGTTTTAAGTGCTATATATAAATATATGTATCATATAAGGAAATGTTTATAAGTATTATT
>CG31182 17152158 17153008|17553 chr3R 17151964 17153389 scaffold_53 4744 6028 - 20079|195 1166
ATTTTGT----------------------------------------GCTCCTTTGCACATGCCTGTGAGAAAGAAAAATTGAGAAGAAGAAAGATAACGAAGCACGGCAA------AGTGATGATATGATATGTACATATCTAGCCACGATTATACAATATCGATTACATCTT-TGTATGATGATATGATGATGAAATGTTGGGATGGGCTGCCCGGTGACCGCTAGTATAATTGTCTCATTTATCAATTACTTATTGTACTTTCTTCTTA--CTACATTCT-ACCTAACCT-AACAACCTACTACTACT-------TTACCTTACTACT-----TACC----------CTACTACTACTATTCGTACTACTATTTGCTCTATGGGTTCACCATTCTGTGTTGTTCTTTCCTTTCTGTG---TGTCCGTGT--TTGTGTCCTTTTCAGTTCGGTTCCCCAGCTTTGGT---TGTTTCGATTTTTTGGTTTCCTCAGTTGCTTTGTTGCTGTTTAATTAGTTTCCATTCAGCTTCGTTCTGTTATGTTCTGTTCTGTTCGGTTGAGTTCAGTGCAGTCGGTACTCCCCTACTCTGTACTCTGTAC-ATACATGTGTGTAATTTAATTAATGTAATTTTAACATGAAACTCAACAATTTCTGCTCTCGGTTAC-TCATAAGTTACAATTGTGTCGTTTGTTCGTTCGTTCGTTCGTTCGTTAGTTCGTTGGTTGGTTCAATCCTTTGTTGTTCCTACTCCTAGCTGTGTGTGTCTCTCGTTTATCATT------GTTGTTCGTGTTGTGCGTGTGCGTTAGATTGTTTTTTGGGCCACCATACTCTGCTGTA-TACTGCAATTTAGCCCGGCTATCTAATATAACTC----TGCGCTTAAC----------------------GGTCCGTCTGACCGCA-----ATACAAAAACAAAAAAAAAAAAAAACAAA
ATTTTGTAAAAAAAAAAACCAAAAACAATTATTTACTCGTGCTGTGCGCTTTTTGGCACATGCC-------AAAGAAAATTGTAAAGAAAAAAAAAAAATAGCAAAAGAAACCTATGAAAAACGAAATAGTAGCAATTTATATATTTATGTATATATATT-TTGCATACATATTGTACATGATGATAAAA-----ATATGTTGGGATGGGCTGCCCGGTGACCGCTAGTATAATTGTCTCATTTATCAATTACTTGTTGTACTTTCTTCTTACTCTACATTCTAACCTAACCTAAAAAACCTACTACTATTTAACTACTTACCCTACTACTATTTGTACTACTTCTACTACTACTACTACTACTTCTACTACTATTCGCTCTATGAGTTCACACTT-----TTCCTCTTCCCATCCCACACCTCATCCGTGTTGTTGTTTCCTTTTTTTTTTCGAACATATGTGTGTGTCCGTGTTTGTACCTTTTAGTT----------AGTTGTTACTGTCTTCTACGTTTTTTTTTTCTTACTTTTAGTTAC------TTTTGTTTTTTTGCGTTTTGT----------------TAATTTGTACATAATACTAAATGTGTGTGTTATTTAATTAATGTAATTTTAACATGAAACTCAACAATTTCTGCTCTCGGTTCTATCATAATTTATATTTGT---ACTTTTCCGTACG----------------------------------------------AAACTCCTAACTAGATGTG--TGTCATTTTTCATTCCGTTCGTTCTAAGTGTTGTTTGTGCGTGTGTGTTTGTTTGTTTGTTCGT--TTGTGTATTATATTATCGTATTATAGTCCAGCTATA-AATATTACACACATTACATTTAACCATTTACATACATATGTGTGTGGGCGTGTGTGTGTGCGTGTGTGCGCGCCAACAAAAGGAATTAAAACC---
>mod(mdg4) 17177331 17177387|17580 chr3R 17177196 17177653 scaffold_53 36710 37150 - 10195|136 214
CCTAAGAAAA---------CATACAAATACCTGT----------TGAATAAATCTTAAAGCAT---TTTTATACAATAA
GGCAAAGCAAACGGAAGGGCAAAGGAAAAAGTGTAGCCGAAAAACGGGAAACTGTGAAAGCGTCGGCCACATCCTCTAG
>mod(mdg4) 17177761 17178555|17581 chr3R 17178125 17179484 scaffold_53 37832 39173 - 43525|0 433
GGATACTGTAGTTGGAATAAGGTGTACTTTAGAGACGAGCGACAGTGGAGCATTCAATCATTATAAATAAAAAGAAAATACATTGATTGGCAAAACTTTTTTATTAGCTTCTTTGCCATTTGCCATTTGCCATTTGCCATTGCTTGTGTCTACATTAGGTAACCCATACTAACCTTTTACATTTCCACTCTTTTTAGAAAAAC---AATTCGAGTACGTTGTCAGCCAGAAGGGCCACGTGCTGCTGTTGCACAAGAAGTTCCCCTTCATCCGAGAGAAGTGCATAAATGGAAAAACCTACTGGCGCTGCACACAGTACACCACAAAGACCAAGTGCCATGGTCGGCTCCATGTGCTAAACGGAAAAATAGTGCACATCAAAACGCACAATCATTCACCACTCGACCAGGAGCGAAAGCAGTACATGAAGCTGC
ACATATTAGAATTAGCAATGTGTATAGTTGAGAATAAAG-------------TTCAAAAAGTGTACAAATATGGGAAATAGCTGAACTAGAA------------------CTTTACCAACTAGC-TTTACAGATTCTCATGACTAGAATGTAACTAAAGTTGTTT-------CCTCTTCCATATATATGTATTCCAGATCTGCCCAACTTCTGCTATGTGATCAGCCAAAAGGGCCGCATCCTGCTCCTGCACGAGGGCTTCTACTATGTCCGCGAGAAGGCCTTGAATAATAAGACCTATTGGCGCTGCACTCAGTACACGACAGTGCTCAAGTGTCACGGACGGATGCACACGCTCAATGGACGGATTGTGCACTTTTGCAAGCACAATCACAGGCAGGAGGAATACGGACGCAAGCTGAAGGCCGCGCTGC
>mod(mdg4) 17179071 17179100|17581 chr3R 17178125 17179484 scaffold_53 37832 39173 - 43525|996 1029
TTTAAGAGTCTTTCGCAGAA----ACATGTTAAT
TTTAAGTGATTTTTTTCGAACTTGGCTTGTAAAT
>mod(mdg4) 17180160 17180416|17582 chr3R 17179538 17180563 scaffold_53 39237 40303 - 17700|660 940
GATGTGACGGTCTGCAGGGCTCGTGTCGTGACCGCGGTGGACAAAAACTCACAGGAGCGAATCATCAAATGCACCTACGAGCATGATCACAGCCGGAAATTCCCTAGCAATAACGTAAACCTGCCTG------TGCTCATAAAAAGGGAGAAGGCCCTATCTCTG-GATGCGTCATAGGCTTACATTTAAGTGCACATTGTCAAAACCATAAGACATCTAA--------CAATCCACTTTTAA--------ATAAATGACTG-CTTTTAATTTTAAACGAA
GACGTGACCGTGTGTCGTGCCCGTGTGGTGACCGCACTGGATGCCTCCGGGCAGGCGCGCATTATTAAGCGCAACTTTGAGCACAATCACAAGCCCAAGTTTCTGCACAGGGGCGTCAGCCTGTCGCAGCAGCTGTCCATAAT--TGAGGGCGCCACGACCGCCGCGCTGCTGAAGAAGGGCAAGATGAAGGGCAGCCTGTTG---CCGCTGGCCAGCAAATAGAGGAGCAGCCTAGGCTTAAGCTAGGCTAGAAAAAACTGTCTGTTGAATGCAAACAAA
>mod(mdg4) 17180696 17180941|17583 chr3R 17180564 17182450 scaffold_53 40573 42576 - 35709|135 406
ACGTGTATACATTGCTGTATTAC-CAATAAA----CTTACAATTCTTCGTTTAAAACCTAGTTTAGTAGTTA---------------TACACAAGTGATAAGACACTCCCAAGTTTAT-GGTTATTCTAATTATCTGCTT-----AATCCTTTTAGAACTGGCTGTCTTCGGCACTGGACAGCGGGGAAGAACCGTGCTGCTCTTCCAAAACGAGAAGTTCGTTAAGAACCGATGTTCCGCCTCTCGTACTTATTGGATATGCTCGAAAAAG
ACAATTATGCTCTTCTGTTATACTCAATAAATGTTCGCACAATCCTTAACAT-AAGCCTAGCCTTATAATTGCCATAGCACTCTTCTTACACAGAATAT------CTATTAATTTTGTAAACTGTGCTAATTGTTAATCTTTTCAAATTCTTTCAGAGCTGGCGGTCTTTGGCACGGGCCAGCGCGGACGCACAGTTCTGCTGCACAACGAACAGAAGTTTGTCAAGAATCGCAGCTCCGCCTCACGCACCTATTGGATATGCTCCCGCAAG
>mod(mdg4) 17180942 17181279|17583 chr3R 17180564 17182450 scaffold_53 40573 42576 - 35709|407 761
ATTTAGGTGAACTCAATCCTAGCAACCTGGCTGACTTTGGTAACGAGAGCTTCTTGCCCAAAACCAAGGGTAAACGGCCACAGAATGTTCGCTGTGGACTGGCGCCCGATCAGAAGTGCGTCCGCACCCTGGACGACTGGGATCGCATCCGGTATGATCGGACCAGGAGCGGCGATGTTCTGGTCTACGACGGATATCGTTATGATCGACGAGCCAACTACAACGATATCATATATTGGGGGTGTGCCAAAAAGCGACTAAGCTGCAACGTCTACATGATTACCCACAAAAACAAACCCACATATGTAGCCATTTCAGGCGTGCACAACCATTTGTAG-----------------
CCTTGCGCCCGCTGGATCCCAACAATCTGGGCGACTATGGCAATGAGAGTTTTCTGCCCAAGTCGCGGGGCATTGTGCCGCAGTCCATACGCTGCGGTCTCTCTGCCAAGCGCAGCTGCACCCGCACCCTGGACGACTGGGATCGTGTGCGTTATATGCGCACGCTCGGCGGCGATGTGCTCATCTATGATGGGCAGCGCTTTACGCGGCGCGGCGCCTACGAGGACACAATTTATTGGATGTGCAGTCGCAAGCGACTGAATTGTAAGGTGTACATGATCACCAACCGAAACAAGCCCACCTATGTGGCCATATCGGGCGTGCATAATCACATCTAGAACTAGGAACTAGGAAC
>mod(mdg4) 17181480 17181683|17583 chr3R 17180564 17182450 scaffold_53 40573 42576 - 35709|989 1284
ATCAAAGAGCATT--CAGAAGTCTGAATCGGGACACATACATAGCTGTATAGATTAGGCAGCTTTTTGTACAGAATGATGTAGTAAACGAAAT---------------------------TGAACCG----------------------AAATCCATTTCTAGTTTTGC----------------GCAATAACACCTTTTA------ATTTGTC--------AGATCTTAAGCTTGAT-----------ATATAAACAGGCTTAGGATTATTTTGCAGAAGATAGTATTTATTAAG
ACGGAAGGGCAGCGACTGCCAGCTAAATGAGGCCAATTAAACTA------AGACTAGGCTAGTTACTTATTAAGTCGATGCATTAAATCAATTGCCTATAAGTTCGCCAGGCCAGCCAGGTGAGTTGTGCTTAATTTTTTAATTGCTTTAAATTAATTT-TATTTTTGCTATTTTTTAGCCGCTTGACGTCTCAGCTTTTGTTTATTATTTGTCCGGCAGCTAAAATATAAGCTTCATGCAAACAACTAATAGAAAATGTTTTAATTTTTATTTGTA------------TTTTAAG
>mod(mdg4) 17182072 17182165|17583 chr3R 17180564 17182450 scaffold_53 40573 42576 - 35709|1689 1794
ATCGAGACTCAAAATCTAGCCATA-----------GCTTGCGAACTA-GAAGTAGACTATTTATATGTGAATCTAAAATAAACTCTTTGTCTTGTTTATTTAAGCA
ATTAGGATTAGATAAGAAACTAAATAATAAAATAAACTGGCCTGCTACGCAGCGCATAAGTAATATAAAACCCGCCAACTAAGTATATTTATTGTT-----AAGCA
>mod(mdg4) 17182777 17182871|17584 chr3R 17182528 17183480 scaffold_53 42785 43736 - 25363|271 365
AGAATCATATTAAAACCGGCCGACTTTGGATCATTGTATAGAATCAATTTATAGCTTATTTATTGTAGAATACAAATCTTGAAAATCGAAAAACC
TCAA----------------CGTTTTTTTATAGTCTTTTAGCGTTAA--------CAATTTAGCAAAAAATAAAATTGATTTCATTTAAAATGTT
>mod(mdg4) 17183243 17183267|17584 chr3R 17182528 17183480 scaffold_53 42785 43736 - 25363|778 802
CGCACTAGTCTTAAGTCCAAGTGTA
CATGTTAGCCTTAAG-CCAATTGTA
>mod(mdg4) 17184012 17184465|17585 chr3R 17183727 17184365 scaffold_53 43737 44400 - 16158|317 683
TCATTTCATCATC--------ATACCATCTTCATCT-TCGTCTTCATCCTCTTCAGCAAAAGACCAGAACAAGGGCGTCCTCTTGAAGCGCACCGCTCAGGGCGAGTTCCTGGTGGTCAACGGGAAGTCTTACAAAAAAACCCGCGCCATGCAGTACCGCACCTACTTCCATTGCTTGACCAGGAACTGCCCGACCTACTACGTCCTCGTGGAGCTGAGCCGACGACCTCGACTCACCAGGCATCATGAGCACGCCCAGCACTGTCTGCAGTGCTATTAGGATGTAGGATGTGTATGTAGTCATAGGCCGAATCCGCAATGTACAATATACC--GAATACCATTTTACCATTAAAGCA--ATCCCAA
TCTTCTCATCACCCATCAAACACATAATTTGCATTTATCATCCCGATACCACGCAGCAGCAG-CCGCATC-----CGTCAAGTTCCAGCGCACAGCTCGGGGCGAGTTCCTGGTGATCGATGGGCGCAGCTATAAGAAAACCCGGGCCATGCAGTATCGCACATATTACCACTGCCAGACGCCCAATTGCGGGGCGCACTATGTGCACGTCGAGCTGAGCCGCCGGCCGCGTCTGACCAAGTACAATGGACATGCGATGCACTGCGTCCAG----AATGAATTATAGCCAATAGCCTTAGT-GTAAGCT---TCTGTAACTGATTAGTTAACTTAAATGAAAAGCAACAATCGAAACATGAAGCCTT
>mod(mdg4) 17184012 17184465|17586 chr3R 17184399 17184792 scaffold_53 44917 45310 - 16966|0 66
-TGAGATTACATAAACCCGAAAGAATGTCATTTGTCCAAAAGATTATACCCAGTTGCATGCATTACC
CCAAAACAACAACAACAACAACAAATCTC--TCGTCTTGTAGTTTAT--TTAGTTGTGTGCGTCATC
>mod(mdg4) 17187910 17188285|17587 chr3R 17185900 17188737 scaffold_53 46206 49185 - 42223|2276 2662
GGCCAAAAAGGGTCCTGTTCTCATCGT-CAAGTACATTCCAACCCCTGCACTGCAT-AGGTAATA-GACACAGCTTCTTCTAATTGTTCGTAGATATTTACCAGCGAACGAGATATATAGAGAACAAGAATATTATTG---ATTATTTAGAAGTACACCAAAATTAGCATATAGTTTATATGGATAT---CTTGAAAAAGTCAGATAGTTTCTGAAACATAATAACGCAACGTGAAATATCAAAATACTCATGCATAGCTAAACTCTAAACTTAAATTTATATGGACCCACGAGAATTGATTAATTCATAAAACTTTCAAAAAACGGGATAAGATCTCTTAACGCAAATAC-GTTTAGTGCACAAAATAAACACTAT-TTAGAACGC
GAATAAAA------CAATTATCAAAGTATAAATACACTCCAA-------ACTAGATGAGATAGTATGCCGAAAGTTGATGGAATTATTCTCAAA-ATTTGGCAGCTTGTTGTATCTAAGTTTTACCAAGTTTTTTTTGGAAAGTCCTACGAAACAAATAAGAACTCAAAAACAACTGCTTTCTATATAAGCTAGACGAGATATTGGAGTTT-TGAAGGGGATTGGAGCATAGTCAAAGTTCAC--------TAGATCTCTGAGATCGAAACGCTCAAACATACGAACAGATCCGGACTGAGCAAAT-ATATAGCTTATAGA-----GGATTCGTCGTCT----GCAGATATTGTCTA----AAAATATATACTCTATATTTTATGGG
>mod(mdg4) 17188689 17189001|17587 chr3R 17185900 17188737 scaffold_53 46206 49185 - 42223|3083 3132
ATTAGCTTAAGCAATTTACAAACCGAAATAAAGATAATGGAAACAT-CTA
ATTGAAATAAACATGTTACAAACATATAAAAAAGTCTTAAAATAATTCTA
>mod(mdg4) 17188689 17189001|17588 chr3R 17188987 17190956 scaffold_53 50307 52352 - 39334|0 14
CCCCGTCGGTTGTGG
AGCGACCGGGTGTGG
>mod(mdg4) 17190174 17190248|17588 chr3R 17188987 17190956 scaffold_53 50307 52352 - 39334|1326 1406
TTTAA---ATTGATTGTTGCAT-TCGTAAACCGAAA--TAAATGCCTGTACTAGAACTTCCCTTTAAACCTATTGTGCACT
TTTGCCTCATTGTATGTCGAGTGTTGATAACTGAAAAATAAAATGTTGTAGAACAATTTGTTAATACCCCCGCCCCGCCCT
>mod(mdg4) 17195822 17196050|17592 chr3R 17195935 17196290 scaffold_53 57992 58342 - 10437|0 120
GTGGATGAGGAAAGGATGA-----TATTACCCAAAAAAAAAGTGGTCGACTTAATCAAGGTATAAGTTCAAATTCAAAGACACAAGTTAGAAAAGATCTATATTATTTTGATTTCTGCACT
ATATACAGGTCAAATATAAAGGTGTACTTTCCGATAGGAAAGTGTTC--------CAATATTTTTTATCAGAGTTAAAG-----TGTCGAGAAATATATATCTATATTTTATTTCCAAATT
>mod(mdg4) 17197045 17197358|17594 chr3R 17196730 17197930 scaffold_53 58994 60133 - 17351|318 634
ATTGGCTATCCAACTGGTCTTGGCAGTGCAATGTAGTTACTAAGTAACAGCTATTAAAAGTACATATCTAGGAAATGGACTATGTACACTTATTTTCGATATTTTCATCCTAGTTACCCGAATATGCATTTTGAAGTGTCGAAT---CGAGTTTAATTTGAAGTTTAATGAATAAGATTGTGAATATAGCTGTAAGACCCCTGAGTTCGATTAACCAATGAAGGTTTTTTTAAGTTCGCATATGCTTTGCAAATCCAATTGTTCCATTCCCTTGACGGCTATGTGATCATGTGAAATAAAGATCTGAACTCATGAAA
A-AGGTGGCACATTTAGTT-------TATATTGGAGCAGCT--GCAGCGGTTATT-------------------------------------TTTTTTTTTTTTTCCTACCAG--ACTCGAATCAGCCGATGCAGGGCTCTAGTTTCCATGTTGACAGTGCAATTTAGTTACTAA----GTAAATA-----------------AGTCCGAATAAAGGCCAAAA------CTAAGCTAACAAGTTGTAGTCAAATATATCTGTATCTGCTCTCGATCAGTTGTAAGTACCTATA----TAAGATATATGTTCAACAAA
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GTGTCGTGAGAATTTTGTAAATACATACATGCATATGTATATGTATATGTATATGTAGCAATTAGTATAAAATATGTAG-AAATATTAAACGGGGTGGGGCCGGGATACTCAAAGCCTGCAGCTTATAATTGCTTACAACTCGAATGGTATAAGAGAGCAATGCGCAGCATGAGCAGAGCTGATGCTA-ACATTAAGTATGCATGTTAGCTAACACTCTGTCCGATTAGTGCTAATG-TTACCCCTAACATATGTAAATCATGCTTAACATTAAGGCCGCCAGC-----AAACTTTTGCCCACAGC-CAAGCCTCCTTACA
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>E2f 17446026 17447290|17887 chr3R 17446635 17449847 scaffold_3 2632081 2635245 - 71222|0 734
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G---------------------CCACACACACACACACACACACACACAC---TCTGCGAATTGGGGGTTTGGGAATTGGGAGGGGGTGTTTATAATTTTAAATTATATACAAGAGAAGCAGCGCATATTATGTTAGAGA-TGATCTATTATTATTATTATTATTATTATTATCATTATTATTAATATTA----TTACAAATTATCAAGTAAAGCAAAACCGTTTCAAGAGAACATCAGCAACAACAACAACAAAACAATGTAAAAAACTTAATGAAACTAAGTTGTGTGTACAATTTTAAGCATAAAA--ACCTACATTTAAATTTATAATCCAAACACGTATTTTAAGTAAAAAAACAAAAACAAAAACAAAAAA--------ACAAGAAAAATGCCCCACAAAAT------------------GCAAAAAA---CACATTTTATAAGCATATTTCAATTTTTAGCCTTAAACAATACAAAAAATAAAAACAGAAACCAAGCAAAAGCAAACAAAACAAAAACAACAAAAAAAACGAATAAATGAGAACAAAAGAAATCCTCATTAAAAAATATTTTGCGCCAGAACTGTCTGTAAATTAGTG-----------AACACAAACACACACACACACACACGGATAATTTTTAATTAGAAAAACCAAATAGTTATAAA---AACTAATATTAAATGAAAATAAATCACAACAAACAACAAATTTGAAATTGAAAA
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GCG---------ATAATGACAATGCTGCAATCGATCGACAAATGCAGTTTTTAGCCCCTAGGACAAAAT--TCCTTATACTCTTTCGTATTGCATA-----------ATAATGTGAAGAAAGTGAATGCACAATTTCATAAATTGCTAGCACAAATAATATTGAGAAAATTAGTTGAAAAATATAAGATAATTAATGTAAGTAATTAC
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GAGTGCGAATGATGATGGCTAATTGCTCGATGTCGGTGGTTCCCGCAAACAGGGGCACTCCGCGTAGCATCTCCGCCACAACACAACCTG
ACGTACGTATTATAATCGCCAATTGCTCGATATCTGTTGTGCCTGCAAAGAGCGGTACGCCGCGTAGCATTTCGGCCAACACATTACC--
>RpI12 17602558 17603010|18047 chr3R 17602648 17602822 scaffold_21 2089894 2090057 + 1433|0 182
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CTGCCTCGATGCAGCCACAAAACAGCTTTGAATGCCTCAGTGTGTACATCCGAA------AAACACACCACATTCAGAGATACACGGAT-AGATGGGCACTGGCATTGGGAGGACCCGCA------------CAGCCGGCTGAGAAGTCATTGCAGGACAATGGAAAAGTCGTTGGCTGTCTA
>RpI12 17602558 17603010|18048 chr3R 17602823 17603539 scaffold_22 290472 291193 - 23011|0 203
TTGCTAGCAA--TGTCCGTGTAAATA-----GTCCTAGATTAATGAAAATAATCATGCTCGACGGCCTGAGAAATATAGA---------ATTTACCAATTATAATACCTAACCGGTGTCAAACTTGAAGCAGAACCCACCTCGCTGGCCTTGAGTCGGTTTTTGGGATTGTAGACCACCAGATTCGAGACCAGATTGATTTCCA
CTGTTAGTCAACCAATTGTGTAAATACAAGTATCTTAAATTAATGAAAATAACTGTGCTCGACAGCCTGA-AAATATAGATGGAAAGAGATTTGTGGATGGTAAT----------TGCGTCACTTATTATTCACCTCACCTCGGTGGCCTTAAGACGATTCTTTGGATTATATACGACTAGGTTCGATACCAAATCAATTTCAA
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CCGGATTGGGCATTGGACCGGACCAACAATAGGTTACTTTCAAGTTCCTAAATGCAAGTTGTGCAAACTGGCGCGCTTCCAGCTGCTATCCATAGGTAGCATATATATCTATATATATATATATATATATACATATATATATCTACTCGTGGTAGTTGAGTAGTTGTAGTTTAG-TTCTCTAGTGCGTAATTACTGTTCTGCCTGTGATAGCTTTTAGATAGTTTAATTAAACCTATGTAACTATGTATTTTGCAT----GTGAACTTTAGCATAGTTCCGAATAATAATTACTTGCATTTATGCAGTAAACATTTGT--------AATATGAAAG-
>Caki 17611467 17612404|18057 chr3R 17610888 17613003 scaffold_21 2104160 2106338 + 62885|658 1722
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CAAGACAGTGAGCTGGAATGCCCCGACTGTCTCGATGGCTGCGATTGCGAGTGGGATGCATACACAAAGGCGTCCAATGTGGCGCTATACTGAG-------------------------------TACACA--------------TACACACACCATTAAAGTATTAACAAGGCACAAATA----------------CAACACAGCAAACAAGCATCTACAAGAAACATACACACGCAGTCA-AATTGGA---------GCGCATGGCGCCCATTTATTTACATAAAAACAAAACACACACACACATACATCTATAGAGAATGGGTATTATGGGAATTGCAGTCGCAACGCAAAGACAA-----TTTGTAAAGCTTAAAAATACTTATTTAAATTTGAGTTTCTGTTTTATTGTTTATATTTGATGTTTTTTTAGTCAACATAAGTTAAATATTAATTGTATTTGCCATTCCAGCAAGCTGCGCACTGCGGCCTGTTAATTGTTTGTGTTATTGTTTTATTTAATATTGCTCTTAGTATTCTTTTG--CCAGACAGCATTAATCGCTTATGTAATTCCTTGCACTTGTTAGTGGTTAAGTTA-----AGTTGAACAGATAACAACAGAAGCACTCCAGCAACAAAATACAAAATTTAAAAGTTATACAATTTTTTGTTTTGTTTGCAACTTAATTAAAAGTCTTTTGAGAAG--CGAGCGTGAAACGAGTTAGTAAATTATAG-CGAACTACGTAATTAAATTTAACT-AACATAGAACAAAATGAAAAGCATGAAGAGTCATAACGAGCAACTGCAACAATATGAGTATAAAATATAG------TATGATGTGAGCAATTTCAAGTGTTTCAAACAAATTAAAAAC-AATTAAATACACATTGCAAAACAA---AAAACA-----AAAACAAAAAAAAAATTAAAAACAAAATAAAATACAAACATTTAAAAAATATATTGTGCACGGTTTTAAATGCAATAAAGAAAATACATCATGCAAATGATTTACACGTACATACACAAAGTAAAACTGCGAAAATGTC
>glec 17676627 17677431|18135 chr3R 17676031 17676987 scaffold_21 2175256 2176081 + 9396|667 1034
CCCCAACCCAAACCAATTCAA-GCGTTCTCAGCGTGTTTTCGGGTCCAGATGCACGCGTGTGCCAAAAGTATTTACAATTTACTTTGTGTCATGATCTCAATTATTAAAAACAATTT-TATTATTTTGTTTATCTAAATGTAATTATAATTGAAATTATTTAAAAATTCTTCTTAGCCCACAAACAAACACACACACACACCCTCGCCCCTCTCATTCACACACCACCCACGCACACTTTTACACACACGCACACACACACACTGTACTCATATTTATTGTATGTACATTATCGATGTGACATTTTAAATTGTATGTACTGTCTAT-----GTATAAAAACTTCGTATCTATGGCAAAATTATTTCCC
CCCCTCCCCTCACAATTTCAAAGCGTTCTCAGCGTGTTTCCGGCTTCTGCAGCACGCGTGTGCCGAAAGTATTTACAATT-------TGTCATGATCTCAATAA--AAAAACAATTTAAATTATTTTG----TCTAAATGTAA-TATAATTGAAATTATTTAAAA----------------------------------------------CGAACTTACAAATTACACAGGAGTTCTTGAAGTTCCACAATTAA---------GTTCTTGTATTTATTA-----ACAATTTCGAT----CAATATTACTTGTGTATAATTATTACTATTATTATTATTAATTCGCA-ATACGGTAAA----------
>glec 17676627 17677431|18136 chr3R 17677114 17677742 scaffold_21 2176092 2176604 + 3814|0 323
CTTTGGATCAGAATGACGATGACAAATAGCCCCTGGCGGAGCAATAATTGCAATATATGATATTAATTGTAAATGTAATTTTAATTTCTAAAATAATTTGTTTATTTTTTTGTACCCCCGCCATACACAGATACTTTTGTGTATGGATTGTACGTTTGTTTTAAACCAAGACTTGACGGTCCAAAAATGTTGTTGCATAACAAATGATT---AAGTGAATGGAT---AAAAGCCAACCAGAAACAACAACAAAAGCAACCCCAGAAAAGATCGGCGCGCGTGCACGGCCAAAAACAGGCAAAAAAAATATATGATTAATAATTA
-------------------------------------GGGGCAATAATTG----ATATTATAATAATATTATAACAAATTTTTATTATTTAAATAATTTATGTTTTTTTT------------------------TTATATGTGTATATTTTTTGTTTAAACAAATCCAAGACTTGACAGTTCAAA----TTGTTGTTTAAGCTTTTGTTGCCAAGCCGTTTGCTTTGAAAAGAAAAATATAATTGA----AGAAGTAGCAGAAGAAGGAGCCCACACACACGCACACTCAAAATAAAAAAAAAAAATTAGATACTAATTAGATA
>CG6569 17691892 17691964|18149 chr3R 17690708 17694548 scaffold_22 1783488 1787136 + 74491|1226 1305
TTTTACGGTTGTACAAATATATATTTTATGATAACTCTCGTACATA-------ATAAATTAGTTCTACGAGATCACACTA
TGTAGCATGTATATGCAATTATATTTTATAGTAGAT-TGTTAAATAGTTTTATATAAATTTATT-TACAAGT---AACTA
>CG31174 17694403 17694511|18149 chr3R 17690708 17694548 scaffold_22 1783488 1787136 + 74491|3796 3949
TCATCGCTTAGGAATTTTTAAGATTTTAGCATTTTATTAGTGAAATCAAAAC----------GTATTTATGTAG-----------TTTCTTGGGTTTTAAC---------------ATTTGA---------CAATAAAAAATATTCAGTATATC
-----ACTTAGGA--TTGAGAGTTCTTTGAACTATCTTATCGGAATTTAAATATCACAGTTTGTGTTTGTATAAAAAACCCACTCTTTATTGGACTTCAATGTAGACACGCGGGCAATTTTAAGTTTAGCTCTATAAGAAAAATTCAATATAT-
>fit 17709640 17709787|18164 chr3R 17707890 17710134 scaffold_22 1798896 1800892 + 29455|1777 1926
GCTCACGACTTGGTGATCAGTTG--ATATAATTTAAGGACATTCCTTTAGCCACCTTTTTTTTGCAAAATGCATTTTAATAATCAAATCCTTTCAAACGAACTAATTAGTAACAAATTATCAAAATAAATTAAGTTTAAATAATAATTAA
-----------------CAGCTGTAATGTTATTTAAAAA---------------------------AGAAACGTCTTATATATCAAA---------ATAAATGAATACATAACATAGAACCAAAAAAAAAAAAACTGCAAT--TAATAAA
>CG17819 17710433 17710519|18165 chr3R 17710505 17712144 scaffold_3 203407 205124 - 37111|0 14
TTTATCACATTTTTA
TTTAGTAAACTTTTA
>CG6560 17711398 17711480|18165 chr3R 17710505 17712144 scaffold_3 203407 205124 - 37111|1010 1096
TCTAAATTATAGTAATCGTCGC--CTGTTAAGTTGTCCCTAAGAACTAAATATACGTACCTACATTTCAACTCACC--AAAAGTATC
TTTAGAGTTCATTAATTTGTGCTACTGTAAGATT-------AAAGCTATTCA-----ACCTACACT---ACTTACTTGAAAAGTGTT
>CG6439 17842264 17842709|18308 chr3R 17837475 17843831 scaffold_3 331286 337411 - 119329|5292 5739
ATGGGCACCACTGTCATCGCCGGCATCGCGATCAGCAAGTCTACAACATCATGGGCAACAACGTTGGCGCTTATATAATCGACATTAGACAGTTTCTGTTGTTGCCACAGCTAAATTTTGAATTGTTGAAAGAAACACCTTGAAAGTTCTTAGTTATCCTATTACGTCCAATTTTTTTTATTTGTCCCGATGT-CTTCAGTGCATTCATTTGAGTATTATTTCCGGCGAATATTTAAGTTTAGTCCAATTGAAACGCCTGCAGACCCGCCCCGAATCCAAAAGTTGCGAATTCTTTAGTTTTACCAATTGGCAGTAATACATCGATCCTTGATTATGTTGTAATTATTTACGTATTATTTCCCCCCCCCCCCCTTTTTGATTTCGCAAAGATGCTAATTTACGGTCGAATTATATT-TTATGTTTAACCCGTTGAAAAGCAAAACAAA
ACAG-----------ATTTCAAGAAT-----TCAGCGA--CAACAATA--GTTGGCCCCAAGGATCACGCATGCTTA---GACAAGAAACAGTT----GTGTTGCC------------TAAATTATTG-----------TTTCAAATTTTTAGTTGTC---TTTCATTCATTCAGTATGATTTCCTTCCATATAATTCAATGCATTC-TTTGAGTATTATTTCTGGCGAATATTTATGTTTAGTGCAATTACCTCGCCTCC--CCCCGCCTC---CCTAAAAA---------CTTTAGTTATACAAATTGGCCGTTATGC---------TTATTATTTTGTGATTAT----GTATTATT---------------------TTGTGCAAAA--TCCAAATTGGATTCGAATTTTGCCATCAACATTAAATTTATGACAAGCAAAAAGAA
>CG6455 17845227 17845581|18310 chr3R 17845384 17846461 scaffold_3 339755 340762 - 37935|0 200
ACTACGTCCCGTGTCCCCTTCCTTCAGAAACAAGATGATACACTTACTATTTGTTATTAGTCCAGGAGAAGATGGTACGATTACCAACAATATGTAATTTGTCCAATTAGCGATCACAGTTGAAACGAAATAGCACTTATATACATATATTTGTAACATTTTG-TTTAGCTTCAATTATACAAAT--TAAACATAGAAACC
ATTATGTTCCCTATCACGTCGCCC-------------ATTTAGTTATCAATTTGTTTTAATT------------------TTAC--------TCTAAAAAGTCTA--------------TCAAAAAAAAAAATCAC-TACTTAAAAAACATTGTGAAATTTTGTTTTAGAAGCAATTATACAAATTATAAATATAGAGGCC
>CG6028 17849978 17850087|18312 chr3R 17849231 17851142 scaffold_3 343739 345519 - 56463|787 896
GATTGTCAACTCATTTGGCTTGTTGTGTTTGTAAAGTTTGTGTTATTAGTGAAACAATGGCATTTAATAGATGATTTTGTAGTTTTCAATAGATAAACTATAATCAGATA
-ATAGCAAACTAATT------------GTTACAAA--------TGTTATTTAAAC-----CAAATAATCGCTGTGCATGT------------------------------
>CG6022 17851687 17851856|18313 chr3R 17851805 17853034 scaffold_3 346041 347250 - 53294|0 53
ATGGAATGCATATTTAGATGATCGCTATAG--GTACAAAATCGGCTTAAGTTAT
----------------GACATTTTCTAGAACTGTACAAAATTGATCTAAGTTAT
>CG6015 17857865 17857947|18317 chr3R 17856662 17860017 scaffold_3 351132 354469 - 154107|1276 1362
TGGTCCGCACAAAATAACATAG-ATAGATGTAAGCCAAACTGATGTGTAA---ATTGATTGATTATATTGCTTACCCATTATGTTCC
-----AGTAAACAACTAGCTAGTGCAGTTGTAAGCTCAA-----GTGTAACATATTAATTGA-----------------------CT
>CG5778 17911093 17911324|18364 chr3R 17911322 17911640 scaffold_3 406153 406460 - 10261|0 2
GAT
AAT
>CG5391 18158807 18158907|18644 chr3R 18158712 18159489 scaffold_3 664426 665203 - 22933|95 209
AT------GGATTCGG-----TTCCCTACTAAAT--CGACTGTATATGTTTATGTTTTTGTTTTCCGTTGGTTTAAGCTCACAAATAAATTATTTATTTA-TTGTTAACTGCAAT
ATCTGGCAGCGTTCGGGGCAAGTTTCTAGTTATTTCCGAATTTGTTCATTTATG--TTTGTTTTC------GTTAAGCACTGAAATAAATTATTTATTTATTTGTAAATTGCAA-
>PSR 18186498 18186790|18682 chr3R 18185513 18188036 scaffold_3 692795 695289 - 88923|1027 1395
TCCAGGGAGCGGGCCAAGCGCAAGGGCTTGCTCATGCGCCTCTTTCAACGCCAACTGATGCTGCTGAGAGGACTGCCCCGCCGC---------------------TGCCGGCTCAGTTAGCACTGAGGTCGCGATCATA-----CTCTGCAGAGTTTTGT-GTATTTTTCTACTTGGACCAGCATGTTTGCAGCTCCTGG---------------ATCCCGTGCTCGCCC------TCATCGAATGCCTGCTCC----------------------CTGATTTCAA-TAGATGCTCCGGACGTGACTCATTAGCGTAAACCCTAAATGCAAATAAATAAATGAATCCAATATGTTTGTACA-----TCG
TGTCAACAGAAAGCGAAAAGGAATAGCCTGCTTTTGCGGCTGTTTCATCGTCAACTGTTGTTCTGCGGTCGCGTGCCGCGCTGTCAACGTTCGTCCGACCGCACATCCCGCCCAAGCTAGCAGCGCAATCCTGACCCTGATCATTTCTGCATGTTTTAGTAATATTTTTCTACATAGACAAGTAAACGTGTTGCTGTAAAAATAAACTATGAATTATCCCCGGCTAGACCAAACAGCCGCTTAATATTAGCTCTAAATAGTCAATTTGATGTTTAATTAATTTCAAGTTGATCCGCCAAGGATAATTCGCCAACG----ACTTAAATGCA---ACATAAATAAATTCAATATATTTGTAAAAATCTGCA
>CG5382 18190261 18190389|18683 chr3R 18188616 18192441 scaffold_3 695629 699446 - 123530|1681 1810
GGTGTGCATTCACGGTCGAAATAAGCATACGTAGCATATAATCGATATCCAAGTCCCCGATTCCGAAAGAATAAAACTTTTACAGCTATTTATATAACCT-AACATTGCAAAGCGAAATAATACAACGAC
AATGTATGTGTATTGTCAACATA----------------TATCGAAAAGCCCTTCCCTTCCTCTGTTAAAATCAAAACT-------TATTTATCTAACCCAAATATTGCAAA--AAAAAAACTTAACGCT
>CG5380 18191802 18191936|18683 chr3R 18188616 18192441 scaffold_3 695629 699446 - 123530|3314 3468
GGATTAGCTCGAAAACTCTGGATTTTATTTTATATTAAGTATTACAAATTGAACTTATTGTTTATTAAG-----CTTTTTGTAGCACAAA----CATTATTAACTCTTAAATGTT-ATGGTTACC----------ATAAAAAAAAGGAAAATTTG
-----------AAAAATGCAAACATTGTTTTATATT--GTTACGCTAATTTAA-GTAGTGTTTATTCAGAAGTTATTTTGACAGCATTCGAGTTCATTATACATATTCATACATTAATGGGTGCCAAACTTACATATTAAGCGAAAAACATTTCC
>CG13850 18234285 18234572|18718 chr3R 18230162 18236639 scaffold_20 1272385 1279064 + 185856|4529 4818
CATTTGCCACGGAACGCATCGCAGTGGCAGCGGCGTTACGAATCTGACATTTGATCTGCTAGAGAAGAGTGGTTACCACGTTATTCCCGTGCCCTATAATGAGTTCAGCACCAGTGACAAACTACTGAAACGCGTTCAGTATTTGGAGTCAAAGTTCAAGGCGATTGCAAGTAGCAAATAATTGCAGTTATAGTTTATTTAATTTTTCTTGTAATGATTGATCAATATTTGAATTGTTAAAATTTTGTAAATGTTAAATTAGGCGCTGAATTACAAGCTAA--ACCCAAA
CATATGCCATGGAACGCATCGCAGTGCAAGTGGCACAACGAACCTAGCGTTCGATCTGCTGGAAAAGAGTGGCTATCAAATCATACCTGTGCCCTACAATGAGTTTAGCACCAGTGACAAATTACTGAAACGTGTTCAGTATTTGGAGGCGAAGTTTAAGGCCATTGTTAGTAGCAAATAGTTTCAGTTATA-----------------------------TCAAAATTTGAATTGTTTGATTATTGTAATTTTATAATTAGGCGCTGAATTA-AAGTAAACTATTCAAA
>Nop56 18244817 18244959|18721 chr3R 18243335 18246764 scaffold_20 1286012 1289555 + 127754|1708 1873
ATGTCTCTG-------------------TTACATT-CAACTTAG-TTTAAGTCCACAC--TATTATCTTTTACTTACATGCTTCTTTTGTATTTCCTTTGACCCCCTGATGGATCGCATTTCAAATAATAATAAACATATACTTTGGAGGGTATTCCCACCGGAAT
AAACTTTTGTGTGGAGAATGTACACATTTTACATTGCTGCTTAGTTTTAAGTTCAAACTTTATTAT-TTTAACTTACTATTCTTTTCTGTATTT----------TATGATACACCGCAAATTAAATAAACATAAATACA---------------------------
>CG13848 18249027 18249317|18722 chr3R 18247625 18249825 scaffold_20 1290130 1292414 + 84065|1490 1874
TTGGGGTTAGTGTGGC--GGCAGTGATAACAA-GGCGATTAGCCGAATGTTATAGATTAGTCGAAAACATTTACAATGCGCAAATGCACAAAGGCGCATATCAGTT----------------GTCATATTTTATGGAAGG--------GTACTACAAATACTCCCTAATTCCCCACTTAACCATATTTGTATATATTATAAGTCATTACGTT-AAACCTTTTTAAAAAAGGTTA-------TTTTCGTTGTGTTA-----ATCATCAATGTT--------------------ATCTTTTT-------TTTTTTGCTTAATAAAG------------------TGTCAATACACGATAAACCAAACAAAAAA---------GAGAC
TAAGCGTCTGATTAACCAAAAAATGATTAGAACTGCAAGCAGACATAC-TTATAAATATTATACGAATATTTTCAACGTGCGGATTATCATCGGTA---ATCGGTTAATGTCTACAAATGGCGTTGCCTAGTATTTAAGGTTTCGTTTGTGCTAAAAACAATGCTCATTTTA-----TAATGATAAGTATTTATAATGCACATTTCAATGTTTGCATCATTTTAACAATAGATAAGTGTACTCTTTGTTGCCTTGCTGTTATCGTCCACATTTTTCCAACGACCATAGACTCATTTTATTACCAGAGCTCTTTACTTAAAAAAAAAAGAAATCAATTCGACTTTGTAAAATAGCATAAACGGGTTATTAAAAGTATATCTGATAC
>CG13847 18250934 18251255|18725 chr3R 18250875 18255046 scaffold_13 814559 818896 + 109807|72 436
GCAC------TTGCACCACCAAAAAGCACCACCAACCAGCACCACCATCCCGCTCCACAACCAGCACGAAC-TCCAAACACCTCCTGC--TCCTCTGAGTCCTTTTTACCCAGAAACAAGTATCTACCGCCCTACA------CGTTGACTTAAGTTTTGCGTACAACATCTTTGTAAATATACAATCTATTTTAAAGCGTAAGCATCGACCTAAGAAA------------------------AACATATAAAAATGAGCAGGATGAGTAATGCGGAGGATATGAGAATTA--TGGT--AAAGCAATGTGTTGAAATGTAACAATTATTTATTTTCTATGTGAATAAAGTTTATCTTAAAGTACAA
GCACCACCAACTGCACCACC----AGCACCACC-ACCAGAACCAACACCATTCCAAACAAAATATATGCACATCCTAATATCACCACCAATCCAAACAATCCCTTC-------AGCCGGATGTCTGCCGTTCCATATTTGCCCGTTAA-TTAAGTTCTTCTTGCAACATCTTTGTAAATACGC-----ACTTTAAAGCATAAGCATTATAATAATGAATGCGCGACAAGGAACAACCGAAGCAACAGGAAGTTTTGAACAGGAT--GTGCCGTGGCGTCTTTAAGCTCTGCTTGGCTAAAAGCTGAATATCGAAATGTAATAATTATTTATTTT-TATGTGAATAAAGTTTATGATAAAGTACAA
>Rpn7 18286380 18286474|18749 chr3R 18281636 18287971 scaffold_53 519421 526013 - 161577|5354 5483
TGTAGTTCATATA-----------------------AAAAGATTTATTCAAATTCAACATTTATTACAGTGTAAAGCTA--------ATGCAACG-TACAA--TAATAAAAACGATATAAAAC-TCATGG
TGTAGCATAGATATACTCATACACACCCAAGAACATATAAATTTTATTAAAAAATTCAAGTTATTACAATGTAAAACTATAATTAATGTGAAACGATACAGCTTAATGTAGACAGCAGAAAATGTTTCTT
>CG5377 18292627 18292867|18753 chr3R 18292404 18292758 scaffold_2 4179211 4179565 - -1112|233 387
GAGCATGCAGGTGTTCAAAGTTCGAATTTTAAAAGGAAACTGATAGTTTTGATGAATCAAATTCATAT-------CTAAGTTAAAGAATATTGTTATCTAT------TCAATGAATCATTTCGAAATAAATTGAA-------AAATAACC---AT
GAGCTTGTGGCAGCTCTAGGTAAG-----TAAAAGTTAGTTAA--ATTTCGATTAGGCGACTGTATCTAAAGCTCTTAGCTTGAAGTTTCTTTTACTTTATGAGCTGTTTATAAGATGGTTCGAATTGGCTTGAGTCAGGTTAAATGAACTAAAT
>CG5377 18292627 18292867|18754 chr3R 18292865 18293712 scaffold_53 529999 530869 - 42371|0 2
ATT
ATT
>CG5376 18313753 18313803|18779 chr3R 18312963 18317349 scaffold_53 555742 560243 - 200166|807 861
CTGAACAATTTAATAAACTAC----GTTAATTAAATGCACACATCTCGTTAATAA
TTGAACAATTTAATAAACTACATATGTCAATTAAATGCACAAATTC--TTTATAA
>T-cp1 18314807 18315024|18779 chr3R 18312963 18317349 scaffold_53 555742 560243 - 200166|1909 2143
ACATTCTTCACCGCGAGCGAAGC-----ACATTTCTTCTATCTTGTTTAGGCATTTAATTTTAATCAAATCACTCACTTTCAATTGTCGCCCCA--TTGATTGTAACAACAATTTAATTGTGT--TGCCCTTCGCGATCTGTATTAACACCGCACATC---CGCAATCCTTTCTCATCCATGCTTCAATGTATAATAAACTGATCTTCAGAATATGCTGAGGCGT-----AAACT
AGCGAC----CCGCAAACCTTGCTCTTGGCATTTCTAAAAT-TTGTTTAGGCACTTAATCTTATGTTAA--ACTCACTGCAAACTTTCGCTCCCATTTAATTGTAATAACAATTTAATTGTTTTCTGCTAACTGCGATTTGTATTAACCCCGCACATCATTTATAGGCCCGCCTCATTCACGTAAC-ATACATAATAAATGAAACTTCAGAATATGCTGCGGCGTATGCAAAACT
>CG5346 18345804 18346038|18820 chr3R 18344541 18346437 scaffold_42 572150 573950 - 18798|1348 1630
-CAGTAACAACCATAGACCATAGTCGGTCG---AGCCATCCATCGCATCTCTACCTAAGCTGGGATGAAGTTCGTTGTGGGAACGGATGGGGAAAAT---------------GAAAAG-CAGCAACTCATATGATGATGTTTTGAACCTTTTTATTATTACCTTTACTTTTATTCCATACGATTGTAATTGCTTCATTTCATTAATTT-----ATATGTA-TCGAGATAC------------------TATATACAATACATG-----CATACACCGTAAACA
CCCTTCACAACCCCTGTTCAT--CCGGTCATACGGCCATGCAGCCATCCGTCATCCAGACTGAGGAGAG---------AGAGAGAGAGAGAGAGAGTTTCCGTCGTATTTGAGAAAAGTCAACAACACGCATGTTG----TTTGTAACTTTTTATTTTTAA---TATTATTATAATATACGATTGTAATTGCTTCATTTCTTTAGTTTGTATCATATGTATTTGATATACATACTGAATATTTATATACAAATACAATACATACAATTCATACAACATACAAA
>CG5326 18357894 18358436|18841 chr3R 18357870 18357969 scaffold_42 585420 585510 - 1355|24 99
TGCCCAACTCGATGATGAAATGTAATTTTGTATATTTTATTTGCAAACAATAAACAAACGATTCGTATGTATGTAA
TAAAAAAATAAACAATAATATGTAAATTGTAAAATATATTTTGAAAATCACAAATAAATAATACG---------AA
>CG5326 18357894 18358436|18842 chr3R 18358006 18359711 scaffold_42 585540 587204 - 59551|0 471
GAAGCGACGTTAGTTGGCGCTACCTTAAGCTATGCACACTTATTTTTATGGTCCTTCCTTATCC------CTGATATCCTTCCCTCCTCCATCCACAAA--------TCCCAGCCCACATTCCCATGCTCCCATCCCAAGCCACATCCCATATCCTCCCCCTAGGTATACATAGGTCAAGATGGATATTATACAATCTG--TAGTCGCGTAAGCTTGTTTCGTAGTATTTT--GTTAGTTCGAGGAAAGCGGCCCCATTTGTACTTGTTTGGATCAGTCGCCATTGCAGAGGGCAAGAGATTGTTGCACCTACTGTATTGGGATAGTGT-AATAGTACCAAATATTATAGTTTAGTGATTAGA------------CTTTATCCTATGGACTG--------TGAAAGTCGAAGACAAGTTAGGGCAGGCGAATGGCGAGCCA--AAATCGGTGAACTCTGAACTTTTGCCTGT
GAGCCGACGTTTCAT-ATATTGCCTTAAGATCGATAGCCAAATGCGAATGCGGCGTTTTTTTTAGTTAGGTTTATAGCCTGTACACGTCTACTGTGAAGATACACTTTCTTAACCCATTTAGGTATATACATAGATGAAG--------------------CTGGGTGTATGTACAT-----TGGATATTACATTTTCTAGCTAGGTTTCTAGGTTCGTTGCGTAGTATTTGAAGTCAGGTATGAGAATGTGGCCGCAAAGGAA---------AAAAGTCGCCGTTGCGCAGTGCCCCCAAACATTGCACTTGACGCGATGGCAAAGTATAAATAGAACCAAATATTTTAGTTTAGTTGTTCGATACGTGTGTAGTTTTTATTTTATTGATTGGCGTGCAATAAAATTCTAAGACA---TAAAGCAG----ATGGCAATACACCAAATTGTCATTAGCAGCAATTTTATTTGC
>CG5315 18369414 18370144|18849 chr3R 18369310 18370422 scaffold_42 599589 600764 - 15862|113 949
ATGCTGAAGTGGATGC--------------------CAAGAAACAATCATCGTAAAAGCACATACAATCCCATTCATA---------GTACGAGTA---AAACATATATTAATGCGAA----CTAGCGCAGTTTTACAATGCAACCTTTTTAGCGTTTGGGGAGCATTTGTACCTTGTTAT-------ACAAAATCAACGGAACCATATAGAAGACAAAAACACACACTTAACACACAATTACACGCATTTATCATC-AAAATCTTGCATAGAAAAAAAAAAATTGCAAAACCAGTTGATT---GTCGAATGAAATCTGCAGTAGAGAAATTAATATATGTACAATTATTTATAAAATTCCAATTTGTCTACTTAATGTTGTCGTAAGTTGATTTACATTTCGAGTAGTGCAGAATT----------GCTTGCATCTGAAATTGGCA--------------AAACGAGATGACTTC-----------CGCTCAAGGGTTCCATTGCTAAAACAGGATCTAAAGGAGCTACCATGTCAGCCAAGCAAT----TACTTTAAGTTATGCAATTAGATGATCCCCTTGTGGCATTAGTATT-----------TACCTTACCGCTTAGAGTTGTTAGGGTTGTATGGAGTAATGAACATACGTTTCATCGTTAAATGAGGTCTGA-TTTTATATTCACACATATACACAGCACATCACAAATTCCGCATCCCTGCACCCACACGGCAGAGCATCGCGCATGGA-GCCTAAGATATTATATCACCATATACATTATAAATGCAGATCTATCACAAAACATAAA---GCGAATCAAAA----CA
ATGCTCCCGCAAATTCAAATCTTACATTAGGCACATCAAATCATATGCACACTCCATACACACACACACACATACACAAACACCAACATACACACACACACACATCTATCTATATGGAAAATCTATCGCAGTTTGACAATGCGGCCATTTTAGTGTTTGGCCCGCATTCGTTCATTGTTGTTTGGCTAAAATAAGAAAAATACCTACATTCAGGATGAATACA-------AGGACATCTGTTTTCGGATTGATTATTAAAAAGCTCGCGT--TAAAAATTACTTAGCAATACCCGTTTATTATGATCGAATGAAATCTGTAGTAGTTTAATTAATAT------AATAATTTATAAAAGTTTAATT--TTTACCTAATTTTATTTTAGATTA--TTGATCTTTAAATAGTACATATTTAGCCGATGACATTCTCGTTTAAATGTGGCGTAATCGTAAAACTCAAATGAAAGCATTTCAACAATCGTTGCGCTCAGGGGCTTAATT--TAAAACC-AATTTACTAAGGCCAC--------TCAAGCAATTTTATACTTTAAGCTTTTCAGTTGA--GAACGTTTTG----ATAAATATTAAAAAAAGAAGTACATTTCAGT-------------GAATCAAAATAATAATAAATACAAA----ATCGTTAGCATAGATCTGATTTTTATTATTTCTCAAATATA-AATATATTTCAAAGATATAACCGGTGCA---AGACTTTATTATAGCACGTATATATGTATATTATAATATAAAGCGAATCAAGACAGAACTTTAAATCAA--ATAAAATGTCAAATTGCGAATCAAAAGGGGCT
>CG5278 18384583 18384729|18864 chr3R 18384116 18384621 scaffold_29 1085202 1085727 - 9788|547 585
GCCACCCATGTTCTATGTGCAACCTTGTTGACTAATTTC
GCGGGCGTTGTTCTATGCACAACTTTGTTGACTAATTTG
>CG5278 18384583 18384729|18865 chr3R 18384622 18385009 scaffold_29 1085975 1086351 - 13337|0 107
GAGGGAGGAGCACAAACACCCACCGCCACCCACCCACACACACCACCCTCAACACACAAAACCCCTTCAATACTCGTACAAAAGGGCGGGTAGAAACACCCACTGAGA
----GAGCAGC-----TAACCGCTCCAACCCCTCCAAAAATACCAC---AAACACACACACAC------ACACACACACAAACACAC------AAATACGTAATGGGA
>Dph5 18407749 18407926|18888 chr3R 18407775 18408846 scaffold_29 390672 391817 + 56139|0 167
TTCCGCTGCGAAA---TTACCTAATTTAGTGTCTAGGAAATGTTGTCTGTGCATCTGAATTGAATTTACGAAGCAAGAGGAGCT-----GGAAGCTCAGGA--AGAAAGTGATATCGCTTGATGCCACCCGTATACGTATGTAG------CCTGCCCAGCGGCAGCTG
GCCCACCGCATGAACTTTATGTATTTAAGTGTTTAGGACACAT------------TGAATTGAATTTAAGTAGCTTGAAGCTCTATGAAGGATGAGTAAGATGAGAAAGTGATAT---------------GCATACGTATGTGGTTTCCCCCTGCTTAGTTCCAACTG
>btn 18411787 18411870|18890 chr3R 18410404 18412794 scaffold_29 392267 394739 + 58739|1455 1547
TTTG----TACAAGGACATATTTTAACACAATTCATCTT--ACAAAATGTTTTCGCTTACTTAACAACTATAGTAAA---TGTATTTTAAGCT
CTTAAATTTACAAAGAAA------AAAAATAATCATTTTTTATACAACGTTTT-GTTTACTTAACTATTATGGTAAAAAATATACTATA-GTT
>CG31156 18434382 18434581|18912 chr3R 18433261 18438843 scaffold_29 413496 419094 + 147019|1282 1493
ACAAAC--------TGCAGGGATTTAATGCTTTCGGAAGTATTTAATGATTCATATCGTAATTGTTTGGTTGCTCACACGAGCATTCATATATACTATATATAGTTCATATATATATTTATATATATGTGTATATGCATAGTATAACGGCTTTCCTAA--GTTTAATCAAA--GCTTATCAGTTAGTAATAAATGTTCACATAAAAATCACC
CGAAACACATTTGGCGCATAGTTTT--TGTTTT---AAGTTTTTAATGAATTTCATTTTAGGTGAATGGTTGTTACCTTAACCATACAT----------TCTTGTTTGTCTAAATA---ATATGTATGTCTATATAATTAGCA----------CTTAATTGTCTCATCGAGCGGCTT----------------TGTTTAACGAAAA------
>loco 18445690 18446014|18918 chr3R 18445698 18448656 scaffold_27 757358 760387 - 125119|0 342
TATAAGTGCGCCCACGTACTTGAAATGGCTTTACTGATCTTGCTTGTATATATATGTGCACTATTTATTGATACTTTATATCCTATTCCCTATTCTCTAAATGTCCAAACA-----ATCCATGACGAGC------TTTTGTATGTTATCTACTGAGTGATCGCCTGTATTTATAATAACTAGCAACAATAAGCATTAGCTTTACTACATTTTGAATAAATATATCAAAAGTAATAAGTATACGTATTATTGAATAATATATGTTCCTAGGTG------------GCTTACCTACCTAAGGTGGTTTACA---AGAAAATTGAGTCTACATTTTCCATTCATCT
TCC---TAAGCCCACTTACC---GATCTACTGTCTGATCT---TTGTATATACTTTTAATATATTTATTAACACT--------TGTATTGTATTTTTAAAGTGTCCCATCAGAAGGAACCATGACGAACGTGGCAGTCCACAACTGCTCCACGAAGTAAACTTGTGTATTTATAAT---TAGCTACACCCAATCTTA----------ATTTTAACTGAGTTAATAAATGCCTATATATATCTATATTGC-------CATAAGTTCTTAGCTAATTACAATTTGTGCTTACACAC---ACGTTGACCACACATATGTATTTGTGTAAATATTTTTAAAGCATCT
>Gclm 18510728 18511214|18988 chr3R 18510479 18511932 scaffold_13 1626888 1628515 - 33291|269 924
TTTTAAG-TAACTCCCACATACAGATGCTAGGCTATAGTTTTAA---------------------------------------------------TGTTTGTA-----------ATGTATGC-TGTGTACAGTGGTGTACTTATTGTTTGTTATACAAAACCCAAATTGATGATTCGA-------------AGCCGATCGATTCACT--TTGCTGTAAACGATTTTA----AAATACTTAT----------------TCTGAACATAAAGCGTTTCAAAAACGACAA--------------TTGGCAATTGGCTATTGTGTGTCACTGGCTTCCAGCTGCTGG---------GGGTTTAGCGATTTG-AGCCCCAACCGGTTTGAATGCC-------TCGGCTACAAA-----TTAAGTGTACGTCCAGCTG------------GTGTA-----------ATTTATATGCTCTGGTCGCAGACGAGTACTCTTGGTGATT-TCCTTGTTGTGGCTTGTTATTTGCCCCAACTAAT---CGCTGTCTAGGCCTCCGCTTCTGTTGGAC----TCAAATCTAATTAAAGGCAGA---CGCGTCTCGCCCGACGACCCATCTAGATCACGTGGCTGACCCGCTCGCCTGTCGATACAAC
AATTGAGCTTAGCGGCATAGTTCGAAGCTAAGCTGAATTTTTGATATAGTATATATATATATATATATATGTATATATATATATATGTATATGTGTGTGTGTATGTATATGTATATGTATGTATACATGTAGTACTGTACTTATTGTTTGTTATACAAAACCCAAGATCGAGATGAGAACAGAAAAGTGAGAGCCATTCGACTGAGTGCGCGCTTCAAACGATTTGATTGTGAACAGTTTTGCTGATTTTTTTTCTCTTTGAATATAAACAGTTACTGAAACCACTAAATTACCGTTTTGTTTTTCATCTAACAATTATTTGCTACAATTTTTT--TTTCTGGCCCAATACACAATCCAGCGAGTGGTATTGGCAACCGGTTTGCGGGCTCACAAAATCAAGTATAGAGGTATGTAATTGTAATACCATATAAACATATACTGTGTGTAAATATACATAGATGTATTCGCTAAAATAACAAACAATCGTTATCGTTAATCGTTATCGTAATCACTGAGGGACAGCGCCTCGTAATGCGAGCTGTTGGGTACATCGCTTCATTTGACCCTTTCCGCATCTGACTCTTGTCTGGGTTTATGTCTGGCCTTAGGCCCCGCACAAATCACGTGGCTGCGCTGCTAGCCGTTATTT-----
>CG4907 18533508 18533627|18997 chr3R 18533493 18533710 scaffold_11 2034317 2034501 - -364|17 136
ATCGGTCCGGATTATGTGCCAGAATATCAATTTGCATTTCTATCTTAGCTGAAATATGCTGGCCCTGTATCAATGATACACCTATAACTCCACAATAAAATAATATTTTTATACCAGTAT
ATCAATTAGAATGATGT-----------AAATTACTGTTGTATCTTGGTTTATAC---CTGGCTATATATCTAT-ATATATATATATAT-TATATTATACTGATATTTTCGAAATAGTGG
>CG31151 18537264 18537437|19000 chr3R 18536558 18538219 scaffold_20 2052853 2054504 - 77793|760 951
GCGAAAAGTGGATAGCCGTGG--TTAGGCAT------AGTGCATACAGATC---------TATATATATACAATATATATACATTATACATATATTTTACTATACGT-GAACAGATGAAGCAGATATATACCTATATGTATACAAATATTATTTCTATATATTTTAAAATGCATTACGTATTTCGTGAACTC
GCGAGGCGTGGATAGGCTTAGACATAGACATAGCAGAAGTGCATACAAAATCTATATAAATATATATATATACAATATATACGTTATACATATATTTTACACTACGTGGAACAGATGAAGC--ATATATACCTATATGTATACACATATTATTTC--TATATTTTAAAGTGACTAATGTA--TCGTAAAC-A
>Irp-1A 18547042 18547151|19008 chr3R 18546667 18547117 scaffold_20 2062980 2063397 - 1225|408 487
ATTTCTAGGCGACTTTTAA--TTGTTATTATGTGCTGGGAAATA--AAATTTGACATTCATCTGTGAGATGATAATTATT
ATTCTTAAACATCTTTTGAGTTTGTAAATGTTTTCCGGAGATTTTTAAAAGTGACAGCT----------TAATGCGCGCC
>Irp-1A 18547042 18547151|19009 chr3R 18547118 18548698 scaffold_33 961148 962784 + 80692|0 33
TTAGTGCGTTCGTTGACTTTTATATTCCATATGC
ACC-TTCCCTCTTTTATTTTCTTATTCCACTTGC
>CG4813 18550606 18550794|19012 chr3R 18550618 18551991 scaffold_20 2063410 2064810 - 47155|0 201
ACGTCCATCACAGACTTGTTATCCCCGCTGCCAAAT-----------------TGCTTGCGCCATAAAACAGGCTTTGCATCCCGACGCAGCTTTAGATGATAATCCCCTATACATATTATTTATATAGATTACAAATACCA--------ATTATACTACGTGACATTACAATAAGCCTACCATGTAACTATTGCAATAAAC
ATGGGATTCA---AGTTGTAGACTCTGCCAGCAACTATGATAATTTGTTATAATGTTTGC------AAAGTAGCTTATTAT--AAACATGAATTTAGGTT-TATTTCACAATATATATAATTTATACAGATAACAAGGAATACAGCTATGATTATCATACGTGACGTAACAATAAGC--ATTATGTAAC--TTAAAATAAAC
>Dcr-1 18559727 18559830|19020 chr3R 18559699 18564415 scaffold_20 2071959 2076801 - 218332|32 159
GAAGTCATCGCTGCAATCGTG------TTTCATTAGATTTAATGATTATTT-----TTTTAGACATAAGAACTT------TAATTGTACAAATCTTAAATAGATTGTCTATGG-------TCGAATAA
AGATGTGGCGCTGT-GTTGTGAATAACTTTAGTTGTAGGTACCCACAATGTACATATTTACTACATAAATGCTCCAATAATAATAATAATAATAATAATTATATCGATAATAATATTATTTCAAATAA
>CG4771 18568675 18568870|19022 chr3R 18564540 18573327 scaffold_20 2077107 2085893 - 218295|4406 4604
GTTCTCAAAAGGTTGATTCCGCGAAATAGTTCAGAACTAATTATGGCCAAAAAAAAGCACAAATCTTCCAGGTTAACTCAACTGCTAAGCATTTAGTTCAACAAAATAATTTTGTTTACATTTATATTCTTGAAG---TTAACGTTTTGTTTGTTTAAGTTTTTACTCTCACTTTTCTTGAATAAACCAGTTGAATACA
GCTTGCATAAA-----------TAAATCTCTCTTTAATAAGTTTTGCCATA---------------------TTGCCTTAAC----------------CAAAAAAGTATGTTAACTTA-ATATAGTTTCTTAAAGTACTTGAAGCTCTGGATCTTTATG----------CAGCTTGC-TGAAGACGCATCTTAGGCTTG
>CG17141 18571786 18572221|19022 chr3R 18564540 18573327 scaffold_20 2077107 2085893 - 218295|7642 8113
CTATACATATGTATGAATTAAACTTAGGGGCTTAGATTAAAGACTGAACA-----GTCGATTCTGCTCGCGTCCTT-------ATTGATTTTCCGCCATGGGCACATCGATGGCAATGTCGCCAACGCCGGGCACGGGAATCGAGTACGAAACACTAGCCAAATCGTCGGTATCATT------------------------GGCTAGATCCATGGGTGCATGGTGCTGCGGCGCCTGGTCCACCTGTGGCGCGATTCCACCAAGATGTCCAGCCAACTCAGCGGACTGATCCACCTCCGGCGGCACTTCGACGGGCGCACTGCTAATGTGCGGATAACTGGTGCGCGAGGCCGCCAAACGCAGCTCCTCCGGCACGCCCTTCATTCGCATCGCAATGTGACGGGAGTAAGGTGCCATCTTCTGGAAATAGTCAATCAGCATTTGCGGATCCTTCTCCACGATCTGTGCCGAT
-----CATAT-------TTAAACGGAGTTCCTTCTAATATAGTTTCAAAATTGTTTTAATTTCTAATCAAGTAAATCTCTAAAATCAATTATCGACCATGGGCACATCAATGGCAATGTTACCCACGCCCGGTACGGGTATAGAGTAGGAAACACCAAC---ATTGTCCATATCAGTATCAGCCGCTTCTTCCTGCGGCACGGCCAACTCTATGGGCACTTGTTTGTTTGGTTCCACGGCCGGCATCTGTTCGGGCTCAACGTTGCATACGGTTGGCTCTACTG---------------------CATCCGTGGGTGCACTGCTGACA---GCGTAGCCAGTTTGTGCCGCTACTGCGCGCAATTCCTCTGGAACGCCTTGCATGCGCTTACTGATGTTGCCAGTGTAGGGTGCTATCTTCTGATAATATTCGATAAGCATCTGCGGATCCTTCTCCGACACCTGGCTGCTT
>CG31139 18573455 18573464|19023 chr3R 18573424 18574627 scaffold_72 158649 159897 - 16549|39 48
ACTTAGTATT
TCTTAATCTT
>CG31152 18574736 18574960|19024 chr3R 18574739 18577267 scaffold_72 158473 161044 - 52380|0 255
CGAA---ATGAAATGTTATTGTGTTTAAGCATTTCTCATTTTGTATTAAGTTGCTTAGAGCAGCGTGAATCTCTC-TGTCCGCATTCCATG---CATTTTTGATGTCCAAGATTTAGAGAACAACTCGAATATTTTCCTATTTATATATATAGCATTTATACAATC----------TTTATAACAATCG-----------------AAAGCCATTTGTTTTAAGACTCAAAGTTTAAAATATATTTGGAAGAAATA
TTAGATTATTAAGTCTTATCTTAATCTTTAATGTTAATTTTTGTAAGAATTACTGAACAATAAAAGAAATATTTCACGTTCGGCGTGCATGAAACATCTTTTATAT--AAGCTTCAG--------TCGTTTGTTATTTTGTTTTAATATAGCATTTTTTTTTAATTGCATTGTTCATTAATTACATTCGATAATGAACAAAATAACAAATGCATCAATTTT----CTTATAG-CTAAAATATCTCAGAATGAAGTA
>CG4721 18589680 18589763|19030 chr3R 18584521 18594036 scaffold_72 165635 175007 - 243901|5293 5377
GATGAGAATTTTGCCA-TCCATATACCTAATATGTATCTATTCTACGAGATTTCGAAATAAAAGCATTTGTTGCACTTGTCATAC
ATGGCTATTCACAACATTTTGTATTCGCGACACATATCTATTACACAAGTCC----AATAAAG-----CTTTGCACAT-------
>CG13841 18592596 18592891|19030 chr3R 18584521 18594036 scaffold_72 165635 175007 - 243901|8281 8581
GCGACACATCGAGTATTAAACTAGTGACTAAGT---CGTAGCTGTAGTCAATACTACATTATTTATTCGAACTTTAAAGTGACACGTTCTCAAAGCACCATTGCAAATAATAAAAGGAACTTTGAAAGCGAGTTTGGGGCTAACATTAAGTGGTTC--CCAAACGGATGACAGTGCAGTAAGTTATGGCACTTTGTTTTGGCTTTGTTCCAAAGCTGCCACTTTGGCATTTTAATTTACGAGTGCGAAATACATACTTAAACTATGATACACGATCTACAGATGCGGTCAATTTGTTTTAG
-CTGCGGAACCAGTATTATTTTATTG--TAAGTGAAAGTGATAGTAGCCAACA-----------------ATTTTAAA----CCCATCCTCAGAGTAGTAT-------------------------------------------ATTAATTAATTTATTTAAATAAATAATATAGAGAC-------------------TGGATCTGTTC----------------------TAAGCAATGAG-----AATAGATTTCCATCAAATGATCATCGATTT---------------TGATTATCG
>CG31052 18807179 18807312|19223 chr3R 18807081 18807771 scaffold_73 122524 123230 + 6387|98 260
CTTCAGGTTGATCTG-----GAGCCGAAACTTTTAATCCA-TGCCGTAC---------------------TTATGTAGCCATT--TCATTCGTACTTATACTTACGTGTACTTAGGTATTACGCTGTTCAAATAAAAGTAAATGCGAAAAGTTAGCAACATAT
TATTAAGTAGAGTAGCGAGAGCGCCGAAAATTT--ATCAAGTGAGATACCAATGAGTAAAATCACAACCTTTCTGTAGTTTTTTATCTTTTGTAGTTAAACATA---ACCATTAGTTATTA--GTACTAACATATTGCCAAGAGCGTAAGGTGAGGGGTAGAC
>lmd 18846944 18847621|19260 chr3R 18847260 18848268 scaffold_73 159596 160577 + 17682|0 375
GCGTTTGCAGCGGTGGCGGCAGCAGTAACAGTAACAGCAACAATAACCGTT---ACAATGCGAATATTAATCAATTAAGCGAACTCGAGCAATTGCTGA---CGACGGCGAAGCCCACAGGTACGCCAGCCGCATCTGCTAATGGAATTAGCCTGGCCAACAATAATGGCCGCGCCAATGGTGACAGCAAATGCCACTTGAGCGAGTTTGTGTCGTTCGAGTACGTGACAAAGTATCTGACGGATGTCTACGAG--CCGCAATGC-AAAAGCCCACAGCCCCCGGCT---AATTTCCATTTG--CAGCCCGAATTTGACAACAGCTTCGACATGCTGGACTTCCCGCAGTTCATTTAAGTTAGCTTAGTCCTTAGA
GCACTTGCAGCATTAACAGCAATAATTACATAGCCAACAACTATAATTGCTGCAACAACGAAAATATTAATAAATTTAACGATCTTGAACAATTGCTAAATTCTACAGCGGTACCTA-------GCGAACTGCA--AAATGTTGGGACTGTTTT---------TAATTCAGGTGCAAAT---------AAATGTCAATTAAATGAGTTCGTATCGTTTGAATATGTGCGAAAGTATCTAACAGATGCATTTGAGTCCCCCAGTGCGAAGAGGCCGAAGAGTCCTGTTACAAATTTTCAAGAGAATATTCCGATTCTA--AATGATTTCGAAAATTATGATATT---CAGTTTATTTGAGT--ATTTAATCTTTAAA
>CG17119 18880132 18880446|19287 chr3R 18880207 18881720 scaffold_73 183048 184580 + 27230|0 281
TTGAA----------------ACATTGTGTGAATATGATACTTAATCTACGATTATGT--------------CATCT-------CCACTGTACACTTATCATTATTGCTGTGCTGTTTTCCATT-----TCTCCCCAGGCATTCGAGGGAATCCTCGAGCTCTGACCTCACCACCGTGACCGATGTTCAAAATCGAACAAATGAGTCGCCGCCGCCGAGCGAAGTGACGACTGAGAAATATTAGAGCTGCATTATCATATGTCTGCTGTAGAGAAAGACTTT
ATAAATGTATATATGTGTTTTAACTAGTATGCATTTCAGTCACAAGATATTATTATTTTCAATACGCTTTTACATTTTTAGAAGCTGTTGTTAGCTTTCCTTTATTGATAAACTATTTATGTTTTTCGGTTTTTTCAGACAGGCAAATAAGTCTTCAATTTCTTCTCTTACGACGGACACCGAGGTTCAAAGT------AATGGGCAACCG---------AACAGGAGAATTGAAAAATAGT---GCTAAGCTAACTTAAATATATTGTTGACAACAATCTT
>CG4656 18939734 18940394|19346 chr3R 18939640 18940499 scaffold_15 2300731 2301541 - 15476|96 804
AACGTAAATGAAACCTCTGGCATAAGAGCAATTTTTTAT-TAGCCATAACATGAATGCGGCCAAAAAAGAAGTGTCGGCAGCAGCACAGCTAATAGTATTCACGTTTTTATACGAGATATATATTTTTATGTAGAATCTAGAGAAAATTACGAA----CTAGCAAACATTAGGCG-CCCAGTGAACAAAAAGCAGCTGCTGCTCGTCGCAAAATACATATACATACATTACGTTTAGGGTTCGATTCTTCCCAGCCGAAACTAACAATCAATTCCAGGCATTTCCATTCGTTTAGAAAGCGTTTAAGACTTGTAACTAACCAAAAAATAATTATTAATCCACA---------ACATTACCATACAGTTTT-----TTGTTTTATGTTAATAATCAATGTATGTGC-TTTAT-------------GCAGTCACGTTAAAAGCGTTGTCATTCA-----------TGTATCTATTGTACA-ATGTTTAGCTTTTAAGCCGTGACATGAAGCACAGGTCCTGCTAGTAGCGTGTAGTTGAAAGCCATTTTATCGAGTCATTGAACAAATGTGTGAAAATCAATTTGATTAGAAATCGCAATGCCTGCGAAACAATAAGAATAACTGTGCACATACTTCATATTGCATAACATGGACTTGTTGATTGAAAATCATTTGGAAATCCAATAAAATG--AAAATTTTACAACAGAA
AATGCCAACGGAATCTCCAAC--TGCATCAAGTTTTTATATAGCCATAATGTTAATGCGGCCAAAAAAAG-----CGACAGCAGCAAAGCAAATAGTATTC-----CTTACATT---TATTAATTTTCATATAGCATTTAGGCAAAATAACGCATAATTTAGTAAACATTTGGCGCCCCAGTGAAC--AAAGCAGCCGCTGTCTTGAGC------------CGCAGTTAATTTTTTGTTGTTGAT-----AAAAATGTAACTAACAACCACAATCAGGCATTTCCA---ATTTAGAAAGCGATTAAGACTTGTAACTAACCAAAAAATAATTATTAATCTGCGTACACACACAGACTACCAAACTATTATACTAATTTCTTTGTGTTGAATATCAAAAGATGTGTGTTTATCTATTGTTTATTGATAACAAGTTTAAGAGCCATGGTAAACAAAAACAGCAAGAATATGAATTATATGTATGTATAGTTTTTA-----TAGCATCAAG---------TGCGTGAAATATTTAGCGCAA---CTTTTTTACAGGCCATTCGATAAAGTT----------AATTGATTGAAA--------------GCAACAGTAACAATAACTATATGTAAAC-----------TAAGATGGACTTGTTGATTGAAAATCATTTGAATATCAAATTAAATGTAAAGATTTAACAAACATG
>CG31365 18949676 18950018|19352 chr3R 18946721 18952065 scaffold_15 2308730 2314220 - 178357|3090 3551
AAT-----AGTCCCTGGACATGTTTTACCAATACACCGCAGATTGGACCACCATGTTTTACA--------CCTGAA-----------GAGACCAACTTTGATTGATCTGAATATTTTA------------CAACTTTATTCGCGAACCT---AGAGTGCTCACAACAGTT---GGCACCAAA---AATCATCAACATGATAGCGTTAAAACATT--TAGA-AACATGCAGCATTAAA-------CAGTTTAGCA-------------------AACAAATACAAATCGGAA-CATTTGGAACAGCTCTGTAACAAGATAC-----------ATATAGCTAG--ACGTACATTTTACA---ATATCGTT----TAATAAATA--CCACATAAGACGATGTACAATTT----TATAGGCAAATATACGTA----------TTTTTAA------TAAAC--TCAA
TATGTTCAAGTTCCAAATTAT-TTAGGCAAAGGAGCATCTAATTGTATTACAAATTTTAACAGTACCAATTTTGAATTTGTAGTTCGAAAATCATTTTAGCATAATCCAAATATTTTAAAAAACGTTTTGCAATTTTATTCGATAATTTTTTGAAGTGCTCACAATTATTTTTGGCACTAAACAAGAACATTTTCTTTATTGGTTTGAAACAGTCGTAGAGAACATGCAAAAAAAAAAAAAAAACAATTTAGCACACGCAAAAACTTATTACTAACAAATACGAATTGGAAACATCCGAAACAGTTTC--AACATGATACGATATAATATAAGATAGCTAGCTACATAGATTTAGTATACACACAGTTATAATAATATATAATTCACATAACAGAATGTACAATATACGCTTTAGGCAAAAATATGTACATACATACATATTTAAACATTGTAAACAATAAA
>CG31457 18952226 18952429|19353 chr3R 18952392 18953246 scaffold_15 2314801 2315769 - 3281|0 37
CCACGTAACAACGAATTTAGTTTAATCCTCTATATTAT
----TTAAAAATAATTTT--CTTATTCCTGTGCACCAT
>hh 18953425 18954459|19354 chr3R 18953282 18953639 scaffold_15 2315808 2316167 - 5183|152 384
AGTTATTTGTCTT----CAAATGTTTTTTTGTTTCATATTCTAAACTGG-----TTGCTTGGAAAGATTGCTAGATTGTCCATCATTCCGAATCGTGCCTAATCAGGTGTCCGGCTGCCACGCTCCGAATTGCCTTGAAATTCAACA--------TGAATGTTTGTCGCCTGTGCTTGTCGAAGGAACCCAATTTCCCCGTTTTCGGTGCAAATGGATCGACTGCTC-TGCAG
AGTTGCTGGTATTTTTACAAATGTAGCTTCTGGTCACACTGTAAATAGGCGTCCTTTCGCGAAATTGTTGTTTGTTTTTTTGTCATACTAATACGAATATA-------------------TATTTAAAATATATTCAATTTTAAACAAATAATGTTGACTGTTTGCCGTCTGTGTCTAGCGAAGGATGCCAACTTCGTCATATTC------AATGGCCAGGCAGCCAGTGAGA
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GATGGAATC-----------------CTGGAAGAGC---------------------------------------GATCCTGATCCCAAC----------GATCCTGT--------------------------------ATTGTATTATATCCTGTAGT----TATGTATATGCCT-AATGATTGATGTATTTCAATGTTGAATATCGTTAATAATCGATCGATACTATTTATTTACCACCACAAATCAAAAACCCACACACAAAACACCCCACCCAAGCGATAAAGCAAAGAGCAAATGAGTATGAAATCAAAACGATGCGAAACGAAATGAAAACACTGTT--AAATGTCCTTGACTTATTGTTTTTGCAAACATTTTAGCTGTAAGTAGGCAATCCTCGGCGCAGATCCTAAATCATCCTGAGAAAATCAATCGGCAAACTCCCGGAGAACACAGACGACTGTTACTGTATATTATCATGGAATTGAATTGCATAATTTATTGAGGTGCGGCGGCGAGTTCAAGCCCTTTGATATAATATATATCGTAC-----------TTTGTATATAGA----------------------------------------------AGAAGCATTATAGTGACTGAATATCTTATTGTAATTGTGTATATA--ATACTTAATAGTTAACTGCGTATTTATACTTAATATTTAATGAAATATAAAGAAATTGTTTGATAAATGAATGTGTGTTATTGCT
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AA
GA
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T
T
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CAGTCAAGCAGCACGGAAGCTGCTTGAAGTGCGA-CAGCTGATAAGATTTGATCTGCAGTGCGATCGAAAGCCCACAAATTATAGTACTCAATGGG--AAAAGATACTTTTGAGAATTATTGTTT-CCAAGCGTGATGTTAAATTTTAAGCAGCAGCAAT--ACCTGCGATCTTGCTACGAGATTAATGTGTGTGT---------------------------------------------------------------------------------
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AGATCGCTCTTCGCGAATGAGTTAGTCTAATTGCTTTAAGTT
ACAACACT--------ATAAATTCGTTAAATTGTTTTAAGTT
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TCAGGGGCTCCGGCTCTAACTGAAATTCCACCATCAACTACAAATCCGATTCCGAATCCGCATCCATGCACCCACCATCTGATGGGTATGATGATGATAAATGT--CGTCTGG-CCATGGCAGTTCACATGAAAAACACATTACGCGCCATCGTTTCTTAATGCTAAATAATGATGGCAAAATCATGACACAAAACCTCATAATAATGTTGGTAAATCAAAGCAAATATAG----TCAGAC---TCGAACAACCTT
TCA-------TGACTTAGCCCAGCATCCAGCAAGCAACTGC---------TCCAA--CATCATCAGTGGCAGCAGCAGC------ATCTGATGATGATAAATGTGTCGTCTGGTCCCTGGCAGTTCACATGAAAAACACATTACGCGCCAGCGTTTCTTAATGTACAATAATGATGGAAAAATCATGACAC-AAGCCTCACAATAATGTTGATAAATCAAAGCAAATATATAAGCACAGACGGGCCGCAGAGCTCA
>CG17380 19228333 19228992|19608 chr3R 19228633 19231020 scaffold_3 6336715 6339161 + 30447|0 371
GAGGTTATTAATTAAGTA---ATGATTTACAACTTACCATAAAATCTTGAGCAATGGCCACGACCTTAAGTAGCT---GATGGTGCCAACACCATTCCAACAACGAATTTACTCGAATTGTCGATTTCCTTATAACCAACAGCACTGGTTGTGTGTTTAGCATACGTAGATTGCGGTATAAAATTTCCAGTATGTCTTCCGGTGAA------TCGTTAACAAAAGCTATTGTAAGGACATTATGTGACGGATTTTCAAGCAAGCTATAGGTTTCCCTAGAGTGCTCTTTAATTTGAAGTACGGAAACAGGAAGTTGCCACAAAATATCTAACCAAGTCGTATCGAAGTTGCCCAAAAGCAGAACATATTCAA
AAGCTTGATATTTAATAATATATTTCTTATAAA-TACCTGAAAGTCTTCGAGAATCGCCAAAACATGCAACAACTGCAGCTGTTGCCAGCACCATTTCAAGATCACTTGCACTTGCTCAGT---TTTTTTGAAGACCAGTAGTAAGGGTTGTGTATTCCATAATCTCAAATTGAAAGTCAGAAACTCAAGAAG---TTCATGTGTATCATGTTCATCAACGTATGCAATGCTAAGCAAGTGATTAGAGTGATATCTATCTAGATGATAGCTGATGTTCAATTTGTCTTTAATCTTAATAGAGGACAAGGGCAGCTTCCACACCAATTGTGACCAATCGGAGCTGGAGCTTCCAACCAGCAGCACATAGTCAA
>Irk2 19339690 19339867|19685 chr3R 19334212 19341427 scaffold_3 6438080 6445767 + 177170|6455 6675
CTTCCCCATCGACCCAA-------------TCGAGGTGCTCCTGCAGTTCCGGCTAT--------------CAGACACCTGGAAGGCAAAGCCGCCTGCGTTGGCAGCTCTCGGTGCCCTTGTAATGGTCCTCGACTATCAACGCACTTAAATGTACGAGTTAC---------------CCTACGAAAATAAGTTAATAAACGCTTTAG-TCAGAGACTAC
TTCTACTGCTCACCCAATCCCTCGACGACTTCCACGCACTCTAACAGCTCCGGCTACAATTCGTGGTGCGGCAGTCACCAGCA--GCCACGTCGGCAGCGCTGGCAGCTGTCGTTGCCCTTGCAAAGAGGCTGTTCTATCGACACG-TGAAACTTACGAGTTAATTTCATTACTTACTGCTTACGAAAATAAGTTAATAAATGCTTGAACTTTTAGTTTAC
>Irk2 19339931 19339989|19685 chr3R 19334212 19341427 scaffold_3 6438080 6445767 + 177170|6766 6880
GC------GCAGATTCCAGTGTT-TCGTCCCTTGTGTTGCTA------------------TAGTTGTAATCG-------------------------------TGTTTGTCCTAT
GCTTTTGTGTCGTCCAAAGTATTGTCTTCCTATTTGTTGCTATATATAGATAGTTCTTAGTAGTTGTAGTTGTTGGCCCCGCTTATGCACCAGCCTACTTTGTTTTCTCTCCCAA
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-GTTGTTCAAAATTTCCAGTATTATCGGATTTTTTA-----------GAATTTCAATAAATTTAAATA-GGTTCAA
GATTCTTTATAAGTTTAGATGCTGTCAAATAATTTAATTCACTTACTGACTTTAAATTATTATCTACACGCCTCAA
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AAAGACAT--CCAAATACC---CTCACAAAACCACACACACACACACCACACACACTCACCCTCACACACTCTATTTTCGTATTGCCATTTTGTGAAAGATCGCACGAAACCCAGAATATTTAAATGCAAAATTCATTGTACAATTTTCGTAGCTCGTAGAAATTGT---TAGCTATATTTTTAGCTATATTGTTAGCAACTATTTTG----TAAGTGTTCCAGCATTTATTCACACCAACACCTATTCACTTTCATAACCCAACGTTGAGATGCCTTTCCTTACTACACGTGTATCCACAATAACCAGGTGTAAATAGTCAGAG---TCTATCTAATGCAAACATCCAAAACACGATGTTAATGTAAATTAAACATATTATATTTTAG
ATAGGCATCACCAAGCGCATTGCTCACCCAACCACACCCACACAC-TTACATACACATA----TACACATTTTGTAAGCATTTTGCCATTTTGTGAAAGAGTGAGCAGAA---AAAATATTT-AATGCAAATTTCATTGTAAAATTATCGTAGATTGTAGTAGTAGTCAGTAGAGATACATATA---ATATTTTTAGCAGTTAGTTTGTATATAAGTGTTGCAGCATTTA--CACACTATTACACAAGCA--TACACCCCCCCACATGCCCATGTCCATATCAATTTTA---ATACCCACAGAACACACAGACACGTAGCTTAAGCATTCTACATATAGCATAC--CCAAA-------------GCCAACAAACTTTTCCTTACTTCAT
>CG10184 19428224 19428320|19774 chr3R 19427305 19428849 scaffold_470 3584 5148 - 28350|1020 1128
ACATTTGTAATTCTT------------TTGAATATTACTGGAAAGACAAACACAATTAGATTTTGCATTTTGTCGTTTAATTAAAGACATAGAGGGAGCAAAAGAAGAT
AAATTTGTATTAACTGATAACAGAAACTAGAATAAAGCCGGGAACACAAA-ATAATTAGATTTTAC-TTTGGTCATTTAATTAAAAAC--CAAAGCTGCAAACTGACA-
>CG31145 19432458 19432572|19780 chr3R 19432146 19432773 scaffold_29 19 649 - 13959|380 495
CGATAAGGAGGCGACCGGAGTGAGCCCACACAACATCCTAGAGCATTAGATTAAATCCCCTAGCTGTTAG-TCGCGTGTCCTGTGTGTTGAAACTGAAACAAAAAAAAAAAAAAAA
CGCTAAG------------------CCTCAAAAA-----AGAGTTAGAGTCTAAA---CTTAGCTGTAAGTTTGCGTGTCTTGTGTACTG--TCTAGATTTAAGAGTTGAAA----
>CG10254 19514727 19515250|19862 chr3R 19514490 19514737 scaffold_13 3049906 3050147 - 2992|240 250
TATGCCTCCAA
TATATTTGCAA
>CG10254 19514727 19515250|19863 chr3R 19515026 19520237 scaffold_20 41954 47319 - 120052|0 264
TTGCCACTCATCCTGGC------CAGCGTATGC--------CTATGAAAATGGTGCCTATCAGAAGAACCACAAGACTTTTGCCGCCTGCGTTTTGGGAGTCTGATCTGGCCCTCGGCAAGTGTCAGCGTTTTATA---------GCCCCTATCTCGAAT-CTCGAATTTCTATCCGCTCGTATT----GCTGGCAGACAGCCTTT-TAGTTAAACAAAA-----------TTTTCTACGATTATTGGTTATTAGTTTAAAAAAC
TTGACGCGAATGTTCGCAATGCTCAATGTTTGTCAGCCTTGCCTTCGTTGTGGTGCCTATTATAAAAAACACAAGACTATCGCCGCCTGCTCTT---GAAATTGA----GCCCTTCACAGG-GTTTATTTCTTATATATTTAAGTAATCACAGCTCGAATACTCTCTACCTTATTAACTTGGCTTATCAATCGGCTAACAAACTTTATAACCAAAAAAAAAAGATGATATTTTTCCTAAATTTGTCGCTTATTATTTGTAAAAAC
>CG10252 19520936 19521002|19865 chr3R 19520981 19522082 scaffold_20 49055 50119 - 31519|0 21
ACCAAGTGCAATATTGGAAGAA
ATT---TGCAATATTAGAAAAA
>nau 19538534 19538667|19884 chr3R 19537814 19539744 scaffold_20 64752 66775 - 59731|725 903
CACTTAAGTA---TCAGC-ACCTTAGGCAATTGTAAAGCTATTTTTAAG----------AGGATACACGAGATACCCAGTGA------CCCGAATAGGCCTTAA--------------------ATTATTTGTATAGCATTAGAACTTAATTAAATGGTAATT-----CAAAACAGCAA
CACTGAGTGACATTCAGCCAAACTAGTTAATTGTAAAGTTAGGTTTAAGTGCCAGCCAAAGGATACGAGCTATACCCAAAAAGGACACACCAAATAACAGTGAACGTGTAGAACTAGTTTAGTAATTTTCTTTTTAGCTTTAGCAACTACTTAAATAAACACTAAGAATAAAGCAGACA
>Rpn9 19557225 19557309|19903 chr3R 19557210 19559051 scaffold_42 728319 730185 - 76183|15 111
TTTTAGTTTCGCCTGATCTAGACGATCCCACATATTCACATTTTGCGCGAATGC-TTTTGTATTTAATTAA-----------AAACCCAAATACTGT
TTATAGGTTTTCTT------------------TAATTTCCATTTGCGTATATCCGTTTTGTATTAAACCAACACGCATGCCGAATGCCAACTACACA
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CTGGCGTATGTTTCGTTCTTTTTTTTCCCACTTTTTATTTTATTTTAGTTTTTGTTTGAAAACACACACACACACACACACACACACAAATGAAAAACCACTTCACAACAAAC-----TAAATAAAACGCATTGTGAATTATTATAAATTAATTATAATAATTTATTAATAATTATTATTA----AAGTAAAATAAATGGAGTTCCGATTTGTAAGCCCGGGCGCAGCGTCTATAAATGACATCTATCGATTACATTTTGTATTTA--ATCTTTCATT-----TGCATTCCG---------CTTCGCAATCTGTC-----TGTTCTATTAAAAAAAAAAACAACACCCTTTTTTCTTTTAAATCTTAGTCACTAAA------
>CG10221 19580343 19580527|19920 chr3R 19576119 19581866 scaffold_42 753686 759511 - 212909|4539 4734
TCTTAGTAACTTGGTAAATCATCCCTCTAGGTTAATTAGTGTGCGTGTAAATATTTATCATCTAATTTCGCCCGATGTAATATTTTTTATTAATTCTAAAACCGACCTTTTTAGATATTTAAAA------AATATCGTACTCAGAA-----TGTAAATGTTGTACTGATAAACCAATGAATCGCTCGACATTTGAT
TCTTAACGAATTGGTTAATCATCCCT--AGTTTAATTAGTGACCATGTAAATATTTATCATCTA------------------TTTTTTATTATTTCTGAATTGAA--TTTTTAGATATTTAAAAGTCAGAAATATCTTACTCAAAAAAATATATATGTGTTGTACTGATAAAACTGCTTATC------CATGCGAT
>CG10219 19585207 19585443|19921 chr3R 19581867 19586749 scaffold_42 759897 764802 - 123489|3557 3825
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TTGCCTAGCGGAGTAGGGCCAACCCGTTAACTAAATTGTGTACAGCGACTCGACGATTGCTTTATAGTC-----ATTAGCAATAAATAAAAGTAACTTGTAACTCGTATATTAACAAAATTGTATTTAAAAGAACATCGT---TTTACATTGAAAA--AGCACTAATTAGTTTTTGGTAATGGTATCAAAATCAGAAACTGGCACCATA-ACGTTACGTAT-TTAATAAACTTTCAAC----------GGCTGTTATCAGGATTGGGTC
>CG10217 19586459 19586702|19921 chr3R 19581867 19586749 scaffold_42 759897 764802 - 123489|4873 5149
TAATATCAAAAGTATTTTTTAACTATTCCATCCAACGAAATTTACAAAAATTTTACAACCAACATAAAGTCACTTTTAGGAG----CAATTGCGTGCCTTAGAA----TGCGAATTTTAGAAAGTTTTAAGCAAAT-TTTAAACTTAGTTTGTAAG-------ATCATCACAATTTTTAC-----------GTGTAACAGC----CATTCCGTCC-CAAACGAATCTCAAATG-TATTGTGCAAATAATTAAAGCAGTTAAATAAATGCCTTGAACT
GAAGTTTAGAATAATTTTTTCAGTA--CCATCCATC-------------ATATCCGAGCCGA---AAAGTGCCTTCTAGAAATATCTAATAATGTGCCTCAAAAATTCAATGAAATTAACGGAATTTGTTCAAAATATCTATGATTAGTTTATAAGTGCACACATAATTGGAGCTTTTACAACTCATTATTATGCATCAATTTTGCATTCCGTCCACAAAAGAATCTCAAATGTTTTTGTACAAACGCCTA---CAGCTAAATAAATATT----ACT
>CG10214 19592241 19592484|19925 chr3R 19591205 19598689 scaffold_42 768806 776167 - 295346|1174 1419
ATTAAAGCAAGAATTTAAAGCACCCTAGGAATTCTTTCAATACCTAATGCTTTATTGGCAATATGAGTCTATAATAATTTTGGATAAAAGTCCGCGTTGTATTGTTAAGCGTGAAGTTAGGCTTATATTATTGACAAATGCATTATGTTAAAAATAGATGTACAATATCGTTTAGTGTATTTTCCGTATATGCACGGAGAAACAGAAATAAAAATACGATAGCAATAAAGAATTCAATG--CTAGT
ATTTAATCTTAGATTTA------------------TGCACTATGTAACA----------AATAAAACTGTTTAACTAGTACGAATA-------------------TGAAAGCAAAAGCAAAACTCTATGATT-----------------------------------------------------------------AGAAACA------AAAATACGACAGCAATAAAAAACTCGATTTCTCAAT
>tst 19594121 19594761|19925 chr3R 19591205 19598689 scaffold_42 768806 776167 - 295346|3131 3775
TCGAAGGAGATGGTCCAAGCCATCCATTGTAGAAGGAAAGAGGCAAGACGGAAATGTGTTTCTTACATCTATATTTTATGCA-CGTGTCAATTACAATTCCAAAGGATACTTATAAAAAAAATGTAAAAATATTCATGT---GCAACGCGACGCGGTTTGGCGGAGGTGATCTGGCGATAGTGAAGGAGCGGCGCCGCGCTGGGAAGCTATATTATCGCGACTCGGGCTTAAATTTTGGTGGAACCATCATGCCGGTCATATGTTTTTGTTTCTTGGCTTTCTTGGACTTGCCGGCACCCGACTGAAAGTCATGCCAGCTGTTTACTCGGCTCTGGCGCGACTCTTCGAAGTTCTGCTGCCATTCGCGGTCCGCCTTTATCCGCTCCTCCTCCTCGATTTCCGTTTCGCGCTTTCGCTTTCGCTCCTCCTGGTCGCGTTGGTCGAGCTTTTGCCGTCGACGCTCCATGTCGGCAAACAGTTTCATGACCATAACGTAGATGGCGTGCTTGTACTTGGTGGGATCGTCCTCGGGTATTGGCTCAGTGGGCCGACCCTCTTTTTTAAGCTTTTTACGCTTTTCTGCAATCTGAAAGGTAACGAACAAATTAATATAATACAGTACAATAAAGAAAATGTGCCATTGC
TCTAAAATGTAGGCCACAAAAAGAAATTG--GGTGAACAGATGAAACACAGGATTGTTTTTCCTAAAACTATAAATTACGAATCATGTCAATTACAATTCCAAAGGATACTTAT---AAAAATGTAAAAATATATGTGTAGAATAACGCGACGCA------------------GGCGACAA---------------GCACAAGCGAACT---TCATCGTGTCTCCGGCTTAAACTTTGGCGGTACCATCATGCCCGTCATATGTTTCTGTTTCTTTGTTTTCTTTGATTTGCCAGCGCCGGATTGAAAGTCGTGCCAGCTATTTACGCGGCTTTGACGAGATTCCTCAAAGTTTTGCTGCCACTCGCGATCCGCTTTGACACGCTCCTCCTCCTCGATTTCCGTTTCCCGCTTTCGCTTGCGTTCCTCCTGGTCGCGCTGATCAAGCTTTTGCCTTCGACGTTCCATGTCGGCAAACAGTTTCATAACCATAACATATATGGCATGTTTATATTTGACAGGATCGTCTTCTGGTATGGGCTCAAAGGATCTGCCCTCCTTTTTGAGTTTTTTACGCTTTTCGGCAATCT--------ATAAACAAAATGATATGCT-----------------------------
>CG10208 19598715 19598857|19926 chr3R 19598690 19599709 scaffold_42 776877 777851 - 45710|25 168
ACAGAACCATTTTCATTCCGTGTGCGGAAATCTGGTTCTAACAGCGTGCCATTTATGTAAACAGTGCCATAGAGATGTGCAAGATCATCTTCCGTATTGATGACGAATTATCAATACAAATATATTACTGCAATAATTAT-TGA
ATATATCTAATCTAAATATGTGTGAG-----------------------CATACATATATGCAAT----TAAAGGTG-----GATC---------CTTGAAGACGAATC----AAATAAATATAGTATTTTGATATGTATATAA
>Nup98 19599950 19600735|19927 chr3R 19599761 19599954 scaffold_42 777892 778091 - 203|210 214
CTAAC
CTAAA
>Nup98 19599950 19600735|19928 chr3R 19599955 19606978 scaffold_42 778362 785700 - 213181|0 887
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TTTATACGATTGTTAATTTGTTTTAGGCAAACTGGAATACTTATACAATTTGCTGAGTCAGTTTGAGTGTACGGACGGCAGCAATGTCAAGGTGCCAAATTGGACAAATCAGGGTCAGATATTTCTGGATTACATTGACATCAATGAAAAGTTCAGGCATATACACAACGTCAGCTGCGTGGAGGATATACATGCGCGCTGGGAAAACCTAAAGCCTCAGCTAAGTGAGATATGCTCGCGCATCAGCCTGCTGCCATGCCCCACATCGAAGCATCGTCTATGCCAGAGTGAAATAGCCAAGAGCTTGAGCTGCCTGGTGAATGGCATGTGCATAGTTTGTCCGGAACTCGAGCCGTGTGTCGTTTTAAAAATGGCTTTGGAACGCTTGCCCATGCCCCAGGAGTTCTCCACCAAAGAGCTAAGCAATCTGCTCGACGAGCTGATGCACAAAATACAGAACCAGCGGCCATTCTCAGACTCAGAACCCGCGCCACTGCACACCACCGAGCGCATAATGATGCAAACTTAAGCAAATAGGAAAACATCCATAGATAACTAAGCAGGGAAAAAGTGAAAAACAAAAGATTTGTAGTTTAGCAAACAGTTTCATTTAGATTTATCAATATATCTATATATAAATATGTGTATTGCACTTAGATGTTAGGTCCTATCGCACACAAAAACA-----AGCATTAGTAATTATTTAAAACAAACAAAAAATCTATAAATACTTGTATAATAT----GCAACGTTTCGTTACAAAGACAAACTTTCAATTATATGATGCGATTATTGTTAATTTGTTTACCATCTAAAAAATTGATCCAATGTTTATAATAATCTGCAACGTATTCTTCAGAAACAATAAAATTAATATAGTTGTTT
>CG33111 19627422 19627778|19944 chr3R 19621932 19628908 scaffold_42 803516 810819 - 220980|5958 6369
TCCTGTTCCTGACACCTTTCACGCCCACTCTCTTACACCTTGGTCTCAAATCTCAGGACCCTGCTGTC--CCTGAACAACGAA-CATTCCGTGCATTTTCA---------------------------------AACCGTATTATTGTGTGC------CTTTTCAAGGATGAAACTGAAGCCATTTTAAAATTTACTAAACTTAAGCTCCAACTTCAGGATTGATTTTTTCTATACAAATCTGACATCTTATATTTTATATACTTGACAATATTTATTTATAACCAACTTTTAACCGGCCTGGCTAATGTGTTCATTTTTGACAGGTCTCGCGTTTTACTAATCAAAACAACCCCAAACAAAAAATTTAATAAACTTTTTTAACCAAAAAAAAAAAG-------------AA
TTCTTATCCT--------------------------ACTTTGGTCTCAAATCGAAAGCCTATGCTCTCTGCTTCAACATCGAAACATTCCGTGCATTTTAATATTTATACGTAATCCCTCCTATTTAATACACTAATTTTGCCTTTGTGTGCGCCTTTCTTTTGAAGGAGAAAAC--AAGCCATTTTTAAACTAATT---------------------TATATAATATCCCTATGTGAAATTAAC--------TAACATGTATTTGA---TTTTGACTTCTAACAATGTGTTCATGTTACTCATTAATATTATTATTTATG------------CTTTATTATACAATCGAAACCCAACGAAATATTTTGAATAAACTTTATAACCAAATATATAAACTTAATTATTATTCAA
>CG10192 19635550 19636015|19950 chr3R 19632862 19639549 scaffold_42 816993 823700 - 177499|3042 3519
CTGACAAAACATTAACCAGCCCATCG-------GATTGCAGAGAAACAAATAACCACAACGAAGCAAACAACCAACCACAAACTGATCCATACGGCAACATCGTTTGAAACCATTCCTTAGACTAGGCGCGGTCGTAGGTGTCGAAGTCAA---AAACAATACCCAAACGATCATTTTAAAATTTCACATGTCAATCTTACAACACATGGGGT-GTCTCTCTA-ACACATTTGTTTGTTAGATACGAGGAATATATCTGGCAAAATTAAGATTTGCAAACACATAGTTTGCACGATGACTAGATCAGACGTGATGAAAATTTTTTGTTTTTATACACAGATTTCTTTGGGAACCTAAAACTTATCCATTTCATTTGTATCACAACACGTTCCTTAAAAAACTCTAAAGATTATTCCCTTTGTATGACTTGGTCATAATTCAGATAAACATATTTACACATTACTCGTATCAAAAGAAT
--AAGACAGCTCCCCCACACCCAATGCAGGAACAACTACAACTACAACAAAAACCACAACGAAGCAAATCGCAGGCAAAAAAAAAATATATA---------TATATAAAAACA-----------AAACACATATTTATATGTATATGACAATTGAAACAGCGCC-----------------ATTTGGCCTTTAAATCATACACCACGCGCGGTCGTATATGCATACACACCT------------------ATATATACACCTATATACAAACAGACAGAAACCACTTTTACATTGCAATTGAAACAAAC-------------------------------------TGAGAAACAAACA------------------AACAGACGAC-------AAACAACGGCAAATATTATAAAC-----------------TATTGCAATAAAAAATAT----------------ACAAAAAAAC
>Pli 19685876 19687100|19991 chr3R 19685873 19688393 scaffold_42 866516 868863 - 80604|3 1283
ATATAAATTTAATGGATTAACAAATGTATTTACGTCTATATAGATACTGTAGTAATTGAAAGATGTCCAAGTTTGAAGCAGGCATTAAAACTAGGCTTTATTTATTATCATTAATTAACATTTAACGGCAACAGAAAACGGAAACAATTTCTGAATACTGAATTAAACAAACACAAGAGGAGAACAAATTTAATTG-AAGAAAATGTTGTATTTGTTGTGTCTCTGGCTGCTATAGTT--TTGCATTATTCGATTGCTACTATATAATTACTGCATTATGTTTATCAAATCAATGCGATTAATTACGAAATGAGCAATGCCGCTTTCATCGCTCCATTATACACCCCATTCCCCGATCGAAATTGCATGTTA---ATGTTTCA----TGTTTGGTTTCCCCCAC----TGTATAATGTAAAAATGATTTGAAATTATGAAAGCGAGGCATACAAACGCAAT--GATCAGCAAGCAGCACACATCAACCATACGAATTAATTGAAATTGCATAATTGTAAAAGTTGAGACCGAATGTAAATCCCAGATATATTTATTGTGTA----TAATTGTGTAAAAACAAAAACAAAAGATTGAAATGTAATCGTTGAACCTAATTATTCGCAATCAATTGCAAATACCCAACATTTGCTATGGAACGGGCAACCAAACCATGAGCAGCAACATCATTTACGTATTTCT--CACCAAATCTAGAGCTTACATTTAGATCGTTTAGTGATCGAGGAGAACCTAACACAATTATAAACAACAATTAAACTTCAGCAATTGAAAACATGGTAAAGCATTATTCTAAATAACAAATAATAATGAAAAGTAAATATACAAAAACCGTATAAACAACATGTACAGTTTCGAAACTCTGTCAACAAATACGTATAAAAAGCGAAATCACGAAATCGAACAGATTAAGTATGTAGCAGCATACAAACGGCTAGATCTATATAGGTTTAAATATATCTGCAGCGATCTATGTATGTTGATATTCATTTTCTGCCCAAATCGCATTATACATTACTAAGTTAGTTAATATTACACCTTATTATTATACATTACGATTATGTGTATTATTATTTTGTATGCA-------------------------------TTAAACACA---TTTGTGTGTTCATTCAATTTTGCGTTGCGGTGTGTTAACAAATCACAACATTGCAAAACAAAAACAAAACAACAAAATAGTTCATAATAAATACAAAATGTAAAATAAAAACTTTCTAGCAATACATAAACTAAA
ATATATGTAT-ATGTATGTGCACATCT-TTAAAGTAGATATGTAT-TTGTAGTAATTGAACAATGTCGAAGTTTGAAGCAGGCATTAAAACTAGGCTTTATTTATTATAATTAATTAA------------------------------TTATACATGTATTAATGGAGAAATACAAGAAAAATATTATTTAAAACGAAAGTAAATTACATATGTATTTTGTA----------AAAGTTAATTGCTTTAATTG-------CTATATTACAACTGTTTAGTAATTATTCATCAAACGCAAACATTTACAATA----------------------TCAATTACATGCAACAGACCCC-----AAATTGCATGTCATACATAGTTTAATGTTATTTTCTTTCCTATACATTTTGTCTGTTGTATAAATTATTT-------TCAAAGCAAAGATTGCATAACAAATTCAATAAGCATGCAAAAAAAAAC-GCAGTAACAATTAATTGA------TTGATTTAATTAAATCGCACTGATTTAAGCTGCCAGCTGCCTAAACTGTGTATATGTAATTCTGT------ATAAACATAAGATTGAATCATAAT--------TTAAATATT-------------AAATGCGTATCTGTAGCAACATTAACAACAATATCAAGAAGAGCAGCAACTATGTTTTCCCATTTGTACTGGCAAACAATCAATCAACATTTATGTATTTTTTT--------------TACCAAATCTAGAGCTTACAAACTAATTTTAATACTACAAAATACTACAA-----------AAACAAAAAATGAAAACAAATTCTAAA--------------------AATATGTTTAGTTTCACATGTTTGTC-GCAATTA-----AGAAAATG---TTACGCATTTACACAAAATTCATATA-------ATTCATATGCAAATTTCTATA-------AATTATCTCAGC---------CTTTCGTACATATTACATTTCTGTCTGTA-CACATTATGGATTATTACGTTAATTACTATTAC--------ATTACATCAAAAAATTATTCGTATTATTATTTTGTATGCAAAGAAAAAAAAAACAAAAAAAAATAGGAAAGTTCAACAAAAACACTCTGTGTTCATAAAATGTTGCGACACGATAATGTTACCAATTACAACATTACAAA------------------------TTAAAATAAATATAAACTGTAAAATAAAAA---TCTAGC-GTACACATAC-AAA
>TfIIA-S 19716109 19716300|20024 chr3R 19716267 19716555 scaffold_42 898101 898390 - 17474|0 34
ACACCACCGACCCGATCTGA-ACACCCAATGTAAC
TAACAACTAAGCGAAACCGGCGCACAAATTGCAAC
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GCACTTGTCGCACC--CCACGCATCCCTCTGCACTCTGCTTTTGTTGTGTGATTTCTGTTCTGTTTCGTCTACCGTCGGGAATCGGGTATCGGGTGTTGGGTACTGGGTATCGTGTATCGTGTATTGAGTATTGAGTATCGGCTAC-ATTAACCAAGCCGCTGCATCCAAATCTCTAT---------------------GTAGAGTCGCCCACCACGACGCAGCTGCCGACCATTTCGGATGCACCAG-CACTCAATGAAGCTGCACCACTC---AAAACCACCTGCCGCACGCCCACCAAACGGGCACGTCGACAACACCG------CGCGTTGGCAAGAAACTCGCCAACTGGCACTGTGGCACTGTTGCCACCGCGAACATTTGCCATTGGCGAGCTGATCTGGGGGCCGGCACGTGGACACCCCGCCTGGCCAGGCAAGATAGTTAAGATGCCCGACGGTGTCTGTACACCGTCGCAACAGTTCGATCACGTGTGGGTGCAATGGTTCGGTGGCAACGGCCGTTCCAGCTCCGAGCTAATTCCGGTCAACTTGTTGCAGAGCCTATCCGAAGGCTTGGAGGCGCATCACAAGGCGCAAAAGGATACCAGAAA
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CGAACTCTGGAAGTGGAGCAAGACTTGGCACTGCTCATGTATGCCATGTCACTGGGAGAGCAATA-----GTTCGCTG---------CATCATGCTG--CACCAAATCACTGCTTGATTTAAACAAAATGAGTGTTAACTTTACATATATATATATAGATAGGTAAAAAGTCAAGTGTATATATCGAGCATATGTACATTGTAATTGTATTTATTAATTTTTATTGTTACCGAAGA-GAACTACTAAAGAGA----GATGTTTAA
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TAAAATAAATATATATTTAAT-ATTTGTTTATAGGCAAGCAAAAAGTGACCAGAACCAAAATGATTTACATAAACAAAAACAAGAGGAACTAAA----------------TATGCGAATATTTTCATTAAAAAATCTGCTCGACTGGCAGGAAAAAGAGATTAAAATAATGCATCAGCATTTAGACGAATACTAAGGAGAGAATAATTGCGTTTTAAAAATCTAAACTTTAGTATTGTTTGTTCAATAACTCGTAAATACTTTTCA----
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GTCGCGCGAAGATATACTTTCAAGTTAATTTTGATAATTCCCAA--ACACATGCATTAAACCACATTAACACTAGAATCGCTCC----CCGATGTGAATAAATTCGTAGTTGCCGGGA
GTC------AAATCAACTTTCAGTTAATATATTATAATTCCTAAACACACACGCATTAAATCAGGTTAACACATAAATCATTTCGCTTGCGACTTGAATAAATTTGTTGTCTTTTGCA
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AATGCCGTTTGGTTCAACAAGTGGAGGGTTCATTTTAGAGA----TGACACTTGCAAACA-----AACAATTTGAAATGTATTTAATTTAAGTAAATGCATTATTTA---ATTTAAATTTCTCAAATTTGCAAAGGTAAA
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GCCCGCTGAGTGTGCTGATTAGCCCCCAGACTCTTAACTAGTTAATTAAGCAATCGA---ACTCAAGAGCATAACTATTGCTATTGCTC---CATGCACCGCCGTCTTAGATGAAAA--GTCACAAAACCGAAAT-----GCAAGAATCG-TAATTTATATCTATGGCAATTGGAGCTGGCCAAA-----------ATAAC-TCTTTTAAA---AAACAAAGCAAAA-CAAAAGCGAACTTTCGCCCGTGTTTCGTATTAAGTTGAACAAGTTGCGAGCTTATTATTGTTGATTTTCTGTAATTTTTAAGTT---AATGAGCGTCAAAGTGAAGCAATTGCATTTT-CAATTATGTATCGCAACGTCTCGTACCGTCAAGTCACGTTTATCGTACGAT-CGCTCCGTTGCCGTAACATT-AAAATAATCAAATATACACA-AAACTAAACT-CTAAACAA
GC--GCTGCAGCTGCTAA------------AACTTAACTAGTTTATTAATCAACCGATGAACTCAAAAGCAAACATAAACATATTGCATACGCGCGCACCTCTGTTTTTGGTAGAAAATGTCACAAAAGCAAATTCATTTATATGAAGCAACAAATTATTAGTTTAGCTAAAAGATTTGTTCAACTTTCTAACGTCATAACGTGTTTTAAATTAAGCTAAAGCAAAAACAAGAGCGAGCTT------------------AAATTGC-----TTTTACAATGATTGTTGTTGATTTTCTGTAAGTTTTTAATTTTTAATGAGCGTAAAAGTGAAGCAATTGCATTTTTCAATTATGTATCG---------------------------TATCGTACGAAACGCTCCGTTGCCGCAACTTTTAAAGTAATTAAATACACACATAAACTAAATAACTAAACAA
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ACTCTTCTTTAATTATGTA---CTTCAAATA--------TAGTCCACAAGATTTTGTTTCTTTTTAAGTAAG
ACTGTTATTATATTATTAAAAGCCTTAAATAAAACAAATTGCCAAACAAGAGCATTTATTTTTTAATTCAAA
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CTCTAAAACATATTTTTCCAAAATGAACTCGATTGGTTAGGA---TCGATTGACCTATATGTACTCTGATTTT-CACAAAAGCT----TACTATTCATTTTAAAT---TGATTAAATGTTTAAAT-TGAAAACC
CTCTAA--------TTTTCAAAAATAGTTTTAGCTGTTAAAACTTTTAATCTACTTGCATGAATTTTGATTCGATAAAAATGCTCTAATTTAATTCGTTGCGAATTTCTGTTTTGTTTTTAAAATATACATACC
>Aats-glupro 19777852 19778011|20097 chr3R 19778008 19780597 scaffold_42 197219 199777 + 132392|0 3
ACGA
ACGA
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TTGATGCTTCAGTCGAGT---CAGCAATTTGTTATTCTTTATGTATTTGTCATGATGTGCTCGATTATTATTATTTGTCATTTAATC---------ATAATTGCGATTGAAACGCGGCAGCTGGAATTCGCAATCTAGTGCA-------ATTTATATTAGTGCACTGT-----------------------TATTGGATATAAATATAAATGTATTATAGCTATAAGTTATTCGCGTGATATCAATAT--TTAAACAATTTACTC
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TGCCCGTGCTTGGAGCAGTTTCTGTGCACGCATTGAGACTGATAAAGACAATTCAAAAAAAAAAAAAACAACAGACGACCAAACACAGAACCGCACACATATGCAAACATACGTAAATTGTTAAGTTTATGGAATTGGCTGCCAAAGCGTTTGTAAAATTGTTTGCTCTTAATGATATATATATATATATATATTCACTGATGACAATTGTATAACTGCCAATCATATAAATTGAAAGCCCATGTCTAAAATTTAAGCATACAAAAATTTATGTGCATATATTTACGCATTACTACGCTATAAGAGGTGACAGTTGCTGAAATTGA--GCCAATCGGCTCAGTGTTTTCGTACG--TTTTTTATAAGATGCTGCAATG----TATACGCTATCTACAATAATTGTAA-------ACAATACGTAGTTATAAATGGGCACTTTTAGCCTTATCATCAGTAATCCT-----------------TTGCTGCTTTGATCTAGCTTTAGCATGGCCCGTTG---GCTCAATTATGCTTAATATTGATTAGCTTTA--GCGTAGCGCAGTTTTATTTAGCTATATCTGACAAAATCAAGCAAACCCCAGAGAGGCA---TGTTCTTA------TATTTGGACAGAGACATATAGATCACCTATACTAGCTTATAGATATTG--AATTTGTTTTAGAAGTTAACAGAAAATATATATATGTAATATCGACCAGTA-ATTAAAACAATAAAAAAAGTATATCATATGAAAACTGTTGTTGCCTTGGG
>KrT95D 19824159 19824359|20133 chr3R 19821294 19826506 scaffold_42 247661 252861 + 164430|3155 3361
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TCA----------------AACA----ATATACCCAATGCCCCCATTC-TCATGCAGACTCGCACACGCAGAC--AGATACAGTTAGAGCAGGGTCAGCCGGACAGATGCGCGGCAATTCAATTTAT-TAACTAAGAAGAATGCTAATTTATTTTATAATTAATATTTGTAAATTTTTAGTTAATAAATTACTTTTAGCTTGTAAAT
>Miro 19860083 19860615|20174 chr3R 19857418 19862579 scaffold_42 291982 297239 + 177894|2799 3426
GGG------------------------AATTCACTAGGATAAGGGGACGGGCTTA---------ACACACGATTACC-------------------------ACGGACACGTTGAAGTTTGACAAATTCATGTATCTTA-------------------TTAATTATTTAATTGCTTGGTACTGTAA-ATCCAAATTTATTGTTACGAAAACTAAAGCAAACTATGAACGGA----CACATGCCGATGCTCTCATTCCTGACTTGTAAA-TACACTCA-TCAAGTACACTAGCAGGAATTGGGCTGGAGCAGTGGCCAGTCGAG---------CACATTGTGTACGCTGCATTTCTAATCGTATATTAACTTACATAAACCATGTTCTCTCTGATAAGTCAAATAAGCTATTGTTACCAGCATATTCGAGTAACGAAACAACCAATATCGTGCATAGCTGATAGTGATATGTACACGTACTGCGTTCTATATAAACCAATATATACGACATCTAGAGAATCACCGGGTTCGGTGATATCGCACTTTTGTAAATACGCGCAAATCC--CCTAGTATGAGCAATAAACCTATCTATATGTGTGGATTAACATATAGTGATATTTAATGGCA
GGATTTGGATAGATGACACCAACTCGTAACTGCCCAGGCAAACAGTGCGCACACACACACACACACACACAAACACACATATATACATATATATATATATAGATATACACACCAAATGTTCAGAAATTGATGTAACCTTCGTGTATTTTCGTTTGACTTTTTTCCCTTCATTTCTGATCTTTATAATATCAAAATTTCTTGTTTAAAATACCACGCGAAACTATTGGCAGATTTTCAAAAGG-GACTTTTTCGTGTCCAAATGAAAAACTAAACCGAGTCATGTACATAAGAAGCTACCCA-CAGGCATAGGAAACACTTGAGTGAGGGTATCACAATGCAGGGGGGGATTGCACAGACACACACACACACACACACACAA-----------ACACTTCATACGTTGCATTTCTACAAGCATATACATATA----------------TATATATACATG-TGTCTAAATATATATGTA--------TGTATGTATATATATGTATAATATAAACCTTAACGCTGTACTCTCCGATAAGTCTTATTAGTT--TACGTCCTATTTATGCCCATTATTAGCTATCA-CGCATTTA-ATGCCGTGATTATCATC-----GTATCTAAC--TA
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GTGCGTGGAGCTCAACTTCAAGTGATCCACGCCGGCGACAACTGAAAGAACATCAATTGAA------------AAGCTCCGGGCGATGGGCGGGTAGCTGTAACAATCTAATCCAATCTAAGTACGTGTTAAATTAATTTAATGATTTCTAATTTAA-GCAGATATAGGCGTATAAACGAAACGGAAATAAAATAAACCGAATGAGAAATTCAACAAAAACAAACAAATAAAAACTGAAAAGAGAAAATGCTAATTACGCGCGACAGAGTTAAAACAAAAAGAA--AACAATCGAAACAA--AAACGTGACAAAGCAAATTGTAATTGTAACTATGTGGAACATGTGTCAACGAAAACTGAAGACGGAAAGAGGGTAGTTTCAGTGGGATGAAAGGATAGCCGCAAGCAAGCAAGCCGAATGCAAAAACAAG
GTGCGTTTAGC-AAAAGTAAAATGCAGCTGGTCGGAGCAAAGCGTTGAACTAAAAGTTGAATCGTGCGCAGCGAAGCTCTGGGCGACGGGCGGGTAGCTGTAACAATCTAATCCAATCTAAGTACATGTTAAAATAATTTAATAATTTGTAATTTAAGGCAGATATAGGCGTATACAAGAAACGAAAACAAA--------------------CACAAAAACAA--AAACAAAACAAGTAACGTTTAAACAACATCAACAATTGAATAAAATAAAACAAACAAAAGCAAAAACAAAAACAATCGATCGTGACAAAGCAAATTGTAATTGTGGATTTG------------CAATTAACGTTTAA-----ATATTGTGCGTCTCAACTGAGAAGGCAAACAAATGCAAATTAAACAGGCCG------AAAATAAA
>Rox8 19868924 19869685|20183 chr3R 19869432 19869856 scaffold_21 1035334 1035755 - 13237|0 271
GCTGAGATGTGACGCCAGCTTCGACGCCGTTTGCAGCATCCGGGAAGTCGCCCCCAGCCGCAGCCACAACCACCTCTGCTGCATCAGCTTCCGCACCTGC---AGCAGTTGCAAGCGCATTACGCACGTTTAGGTTACGTACAATACCGAGTAGTAGCAAAGTCGGAGCCGCTCCTGGCCATGCCGTTGAC--------------CAGCGGCAGCAGCCACATTGACGGTGGCAA-TGTATCTGGAGATTATTAAGGATGCGCGAGTGTCCA
GCGGAGACGTGACGCCTGCTTCGACGCCGTCTGCAATATCCAGACAGCCGCTGCAACCAACGACCACATCC---------GCATCAGCGTCCGCAACAGCAAAAACAACAACAATTACAACAAAAACAACAACAACA---ACAGACCAAAAACGTGTTCGAGTCTGAGTCAACAGCAGGCA--CCGATGACAACAACAACAATAATAACCGAAGCAGCAGAACAAACTGCGACAACTGAATCTTAACTT-------AATGTTTGAGTTCCAA
>Atg6 19874893 19874980|20186 chr3R 19872883 19876728 scaffold_21 1039439 1043320 - 113569|2222 2309
TTTTTCTTTCTCTTTTAAATGTATATTTATAAATTACTTAATTATCCCCATAGTATTAAATCTAAATCTTTCAAATTTTAAATGAGAA
ATTTTGTCATAATTTTAATTATAT-TATACAAATTACTG---------CTTAGAATTACAAATAAATTCCTTAACATTTA--------
>Hsp68 19880802 19880918|20192 chr3R 19880309 19883172 scaffold_21 1046589 1049424 - 132016|493 614
TTCAAACGAAGTCCCCCTATATTGATCTCATAACCAAAAATACTCAAATATCTAAAAATATAGTTCCAATATGCTATTAAATAGTATTAAT-----AAATATTATATATAACTTGCCAAAGC
AGCAAAAG------------------------------------------------------------------CATTAAATAGTATTAATTGTAACAAGTTAAGATGTTCGATCTCACAAC
>CG33100 19889511 19889528|20198 chr3R 19888620 19892738 scaffold_21 1058806 1063499 - 54777|1132 1149
AATTCAGTGAATAACTAT
AATTCAGTGAATAATTAC
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ATCTCGAATGCAATTACTTACACGC-CACATTCACTC---CACACACACACCTCTCCACACACACACACAT-TATATATCTCATCCAGACCCGATCTATATACATAGGATGTTGCGCAACCCACCCAGAGAAATTGCAGAAGACAAAATCGAAACTTAAACTGTAAGAGACCGCAACCAGTGAACCCCCGATACAAAAAAAAAAAAGAAATG
------AATGCAATTACTTAAACACACACACACACACACACACACATACACTTAGACACACATAGATACACACACACA-CACACACACACTCGATGTCTGT--TTAGGATGTTGTGCAACCCACCCAGAAATGATTC---------------AATACAAAGTTTAAGCGACCCTTGCCAGTGAGCTACACACCCACACACACAC---ACACA
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CTGCGCCACCAAAGAAATTTCCACGGATTTCGCG----------TGTACATATAGTCGCTAGCTAGCCCT------------------TTGTTTAATTAAACTGACAGTTATTAATTATT-ACTACA
CGGCCGGACTAACTAATTATTCATTCTATTCATGTGTCTATCTATGTATATATAG-CTTAAGCTAGCGTTTTTTGCAATGCTGCACAATTGTTTATTTAGATTAACAGTTATTAATTATTAAATATA
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ACGGAG---------------CGGCCGGAGCTGGAGCCACTGCATCGGCTTTAAGCATCGAACAGCAGCATCTAGCCTCTAGCATCCAGCATCAGGCGTTTCTTTAGCGAGAGAGATTACACAGACTGATCAATAATGGAATATATAGAAATCTATATAGCATATATATGTACATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATTTTTGCATTCTATACTATTTCTTTTTTTTTGTTTACGCCATTGGGGTTCAACATCCATCTAAGAAGATTAGGCCGTTAAAAAACAAACGTGTACCGCTCACACACACAC-------ACACACACACCACATACACACATGCACGAATATAGCTTTTATACCACAATATATTGTACAATAAA---TAATATTTATATTTT
ACGACGACGACGCAGTGCACCCGGCCGGGACGGGCG----------GGCGGTCAGCTAGAAACAGCAGCGAC---------------------------------AGCGAGAGAGATTGCACAGACTGAACAATAATAATACACACACACACACACACA-CACACACACACACACACACACACACACACACACATACATATATGCACATAAATATGTATG---------TATGCTGATTTTGTTTACTTGTCCAC------GGGGTTCAACATCTATCTAAGAAGATTAGGCTAGCATAGAGCACAT-TATA-TGATTATATGTATATTGTAGTAGCATTTGGATCTGGCACGCACACACAGGCCTATAGTTTATTGACT--------CTGCGTAATAAAGCTTATAATTTATATGT-
>CG5463 19953773 19953933|20252 chr3R 19953315 19955915 scaffold_21 1128697 1131307 - 84745|524 690
GAGATCTGGTCGATAGTTGTGTTCATTAGGAGTGTGTTTCGCTTGTATATATTTTATAAAAATGCAG------TCGACAAACCGCACTGTATATAGGATTAAATATGCTAAGTATTAAATATAGTTGCTTTGTTTCGTGCTGACTAGTTCGGTGTTCTGGCCAATGT
AGGA-CTGCTAAAGTGTT------ACTGGACGTAT-TTATTTTTGTATATATAATA-AATGATGCTGTAAGGTTCTTGAACACATGCTGTAT-TCAGTTTGGGTATGTAAAAAGTTAAATGTGCATG-TCAATGTTATATAAATTATTATG------TGATCGATTT
>CG31133 19973157 19973228|20264 chr3R 19972908 19974645 scaffold_21 1150265 1152053 - 69601|270 350
-AAACGATCGG--TGTTTAGTTTCTTGTTGT----TTGTTCTTAGGCCTAACGATAAGT--AAAAGTTAAGTTT-TACATA
GATTCGACCAGGCGAAACAATACATTGTTATATCCGTATACTTAGGGTTAACAGTAAGTAAAAAAGTTAAGTCCGTACATA
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ACACAAACCAT----CAAGAATT-TAAAGTATTACATAGGCCAAT--TTATTTGTTATAGCCTTTA-----------------TGTTCCAACCATGTCTTTTGTACTCAAATTTATCAATTCTTAGTGTT-----AACTTTTTATTTTGTTTTTTTGCTGCTTACTGCTTATTTAACAAAAAATTTGTTT-TATAAAAACATCAA
AGCCGGACAATGCGACAACAACTACAAAGTATTAGTTACAAAAATAATTAAGTTTAACGTCTTTTGAAAGCTAACAAAGAACTTGTTAAAAAATTGCCTTATTTACTTATATGTGATTCATATTATTGTTGTGAAATATTTGTATTGTATTTTTATACTGTTTATGCTGTTGTTACTTGAAAATTTGTTTATATTAATAAATAAA
>Myo95E 19980549 19981861|20266 chr3R 19976149 19987246 scaffold_21 1152471 1163506 - 387930|4599 6099
ATTTGAAGCGAACTTCGGCCAGCAGACTGTCATCTTTTCGTTCAAATACGGCGGCATGTCGGACTTAGCACAAGGCCCACCCAAGGTCACACGCAAGGCGAACCGCATGGAGATAATTGTGTGATCCGCGACAGAATCGAAACCTGATCGTGGCAGC-TCTTCGAGTCCGCTGCTATCATCTTCTTCGCCTTAGGCAGAACTCGTGTTCGGCGGAACGTATCCAAAAATTGTCGCCAGTCATCATG-CAATTGCA---ATTACCATTGCTTTTTGCGGTGGCCGGGGTCAGTCGACTTTTATATGGTCCCAGGGATCAAAATACAATTTTAGCAATATATTCATACA----GTCACACTTACAATTTAGTTTCGTTCACAAGTGACAATCAGAGTAACCAATTTGTTGTCAGGATTGTGCCAAAAGCAGAAAACTAGAATTGTACCAATGGTAAAAGAAAAAAGAGCGAGCTAATTTTAAAATGCACCGTTTTT---ATTTAACTATGTAAAGTTAAACGAAAAGAAACTAACGAAGTGAACAACTGAATTTATTCATCTAATTTGTCGAACTAGGTTTAAGTGTAAATCGTGCACCAAGTCGATTAGCATTGCAACAATAAGTATGTACTGCAAATAAGCACTGGTAGCAGCGCAGCTCGAAAAGATTGGAAGCAGGATTTTGACGGGGGTGCGCCTGTGCTGGATGAGCAGTATTTAGGATTTTACACAAAC----TATGATATTTCCGTTATAGAAACCAAGGCATTTCTCTTACATTTAAGGTTTCATACACAATAATTAGTAAACTAATGCTAGAGA---------------------CAGACATATAAACCTCTTTATATACTGGAAACACAA-ATGAACCCAATATATGCAATTTGCTGCGACAAAGCAAGATA----------GAAACTTTTCCCAAGCAAAACAAAAAATGTTAA-----ACAACTATTTACAAAGCAGAGCAGATGAGTAGTTAAATATTTCAAATAAATATATAAATATATGTATACACCATACGAAATTAATAATGAGTCTATATAAAAGCGACAA-------------------CAATATGGAA-------AAAATACAT---------GTTTGTTACAA--GTTGA------------GAACGAATGTATGTAGTTGTTTATATATAA--CTTGTTATTGATAGTTCAGGCA-----TCTACGTAATTAAAGCTGG-------AGTTGAGTTCTA-GAGCTTCAGCG-------------ATGTCAC--------------------------ATGC----TATCTGCG-----ACATGGAAATCCATCAGTTTTTATTTGTATTTAAGTTTTA--AGCGAATACTTCGAAAGAA--AAGCCAAATATGAGTAAATCGAAACCCAACCAGTTGGTAGTTTATAAAAC-------------------AAAGTTTAGCAATAATAAAACATACACATAG
ATTTGAGGCAAACTTTGGACAGCAGACGGTCATCTTCTCATTCAAATACGGCGGCTTATCGGATTTGGCACAAGGGCCGCCAAAAGTCACGCGCAAGGCAAATCGCATGGAGATAATTGTCTGATTAGTGAA-----------------TTTGCAGCGTCTTTG----------------------CGCCTTGGTTTTGGTTAGTGT---GCGGGTCATTTATAGGA----TCTCAAGTTTTTATATCAATTATATTCATTTCCAA-GCAATCCGCA-TGCACTTATTAGATCTATGTTGACTTGGTCCCGGGGACCAAAGCATAATTTTAACAATATTTACACACACACTGACTCAAATATAATATTATTTTGCTCACAACTGACAATCAGTCTCACAAGTTCGTTGTCAAAATTGTGCCAAAATGAAAGAG---GGGGTGGGTTGGGGGATAAATAA-----------CTAATTTAAATCAGCACCATTTCTTTGATATACTTAAGTAAT--------------AACTAACGAAATGAACAACTGAATTTATTTAACTAATTTTTCGAGCTAGGTTTAATTGTAAGTCAAGCACCAAGTCGATTAACATTGCAACAAAGAG---------------AACTACGTTAGGAACGTGGCACA----------------------------------------------GTGAAGCGTTAGATATTTTACACACACAAAATACGATATTTCCGTTATAGAAACCAAAGCATTTCTCTTACATTTAAGGTTTCATACACAATAATTAGTGAACTAATGCTATAGAACTCATACAAGCATATATATATATATATATATAGCTCTATATTTACT--AAACACAATATGAATCTGCGCCTCAGAACCCAGTGAGAGATAGAAGAATAAAACTCTTGTGAAACTTTTTTCCA---------AAAAGGTTAATTAGGAAAACTATTTACAAGCCAGAAAACATG--TAGTTAAATATTTAAAAAATATATATACATACATATATA---------AAGTGGATAATTCAATTATACATAAATGACAAAAGGCAACCGGAACCGAAACAATATGAAACCAGACGAAAACAAATTTTACGAATGTTTGTTACAACAGTTGGTCGTACTTACATAAACTATATGATGTAGTTGTTTATATACAAAACTTGTTATTGATAGCTCAGACAGAGATCAAATGTAACTAACACTTGCATATATAGTTGAATTTCATGAACATAACTGGATCAGAGTGTGTATATTACCGACTAATTAAATGGGTAGCAACACGATGCCGAATATCTGTGTGTATGTATGAAAAT-----AGTTTTTATTTAGATTTAAATTACATCATACAATACTCTAAAAAAGCCAAGATAAATAT-----AAACACAATCCAACCAGTTGGTAGTTTATAAAACGAAATAAAATGATAAGAACAAAGTTTAGTAATAATAAAGCGTACGCATGG
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TCTGAATTTGGACGGAAGAAGGGTGATTTCGTTTTTCAAACGGGTCATGTGATTGAAATTGTTACCAAAATGTTTCTGGTCATACAAAATGCCACAGGCAAACCCCCGGAGATACACATAAGCACTGA
TCGGAATTTGGTCGCAAAAAGGGTGATTTTGTGTTTCAAACGGGCCATGTCATCGAAATTGTTACCAAAATGTTTCTGGTCATACAAAATGCGACGGGCAAACCGCCAGAGATACATATAAGCACCGA
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TTTGTGCCCATTTTGCTGGTGCTATCCACGTCATCGCTTTTGCTGTTGGACCAACGAACGCTGCAAATTAAGTACAGAGTGCCTGCATCGGAGATTTACCGAATGTCTCTGAGCCCCTACCTAGATGACATTGCTGTGTTTCACGTAAAAGCG
TTTGTGCCCATTTTGCTGGTGCTGTCCACATCATCGCTGCTTCTGCTGGACCAGCGCACGCTTCAAATCAAGTATCGAGTGCCTGCCTCGGAGATTTATCGCATGTCCCTGAGCCCCTATCTGGATGACATTGCCGTGTTTCATGTGAAAGCG
>Myo95E 19982369 19982504|20266 chr3R 19976149 19987246 scaffold_21 1152471 1163506 - 387930|6716 6851
TGTGGGTCATCCTTTTGTGGGGGACTACGTGCGACTGCGACACAACCAGCAGTGGAAAAAGATCTGCGCCGAGACCAACGATCAGTATGTTGTATTCGCAGACATAATCAACAAGATAGCGCGCTCCAGTGGCAAG
CGTGGCTCATCCCTTTGTGGGCGACTATGTGCGGCTGCGCCACAATCAGCAGTGGAAGAAGATTTGTGCGGAGACCAATGATCAGTATGTCGTATTTGCAGACATCATTAACAAGATAGCGCGCTCCAGCGGCAAG
>Myo95E 19982566 19982897|20266 chr3R 19976149 19987246 scaffold_21 1152471 1163506 - 387930|6923 7254
GCCCGCGAGGAGTATCGGTCCTTGAAGTACAAACGACAGGTGAGATGGGCCATCGATATTATAGGCCGCTACTACCGCCAGTGGAAGATCAGACAGTTCCTTCTGACAATTCCCTTGCGACTGCCACCGAACACGCTAAGCCCGCTCTCCACCGAATGGCCAGTGGCTCCCGCATTTCTGGCAGATGCCTCTCGTCATCTTAGGTCCATATACCATCGTTGGAAGTGCTACATCTACCGAAACTCCTTTGATCAAACGGCGCGTAATCGAATGCGGGAGAAGGTCACAGCCAGCATTATCTTCAAGGATCGAAAAGCTTCATATGGACGAAG
GCACGCGAGGAATATCGTTCTCTGAAGTACAAGCGTCAGGTCAAATGGGCCGTCGATGTCATTGCGCGTAACTATCATCAGTGGAAGATCCGACAGTATCTGCTCACCATTCCCTTACGTCTGCCGCCGAACACGCTGAGTCCGCTTTCCTTGGAATGGCCAGCGGCGCCTGGTTTTCTGGCGGATGCATCGCGTCTGCTGCGCGCCATCTACCATCGCTGGAAGTGCTACATTTATCGCAATTCGTTCGATCAAACGGCTCGCAATCGCATGAGGGAAAAAGTGACTGCCAGCATTATATTCAAGGATCGCAAGGCATCCTATGCGCGCAG
>Myo95E 19982980 19983039|20266 chr3R 19976149 19987246 scaffold_21 1152471 1163506 - 387930|7350 7409
GAATGCCGATTTGGCATTCCCTTCACTGGTCGTAGGCATTTGTGGAGTTTATATCGTGTC
GAGTGCCGTTTCGGCATTCCCTTCACGGGCCGTAGGCATTTGTGGAGTTTATATCGTGTC
>Myo95E 19983113 19983809|20266 chr3R 19976149 19987246 scaffold_21 1152471 1163506 - 387930|7504 8200
GATTCGTCATTATGCAAGTGTAGTGAACTACTCAATACATCGGTTTCTCGAAAAGAACTCCGACATGCTGCCGAAGTACATAAGCGCTGCCTTTTATCAGAGCAAACTTTCTTTGGTGCAAAGCCTATTCCCCGAGGGGAATCCCCGTCGACAGGTTACCAAAAAGCCCAGCACGTTGAGTTCGAATATCCGCACCCAATTGCAGACGCTGCTGGCCATCGTTAAGCATCGCCGCTCCCACTATGTGTTCTGTATTAAGCCCAACGAGGGCAAGCAGCCGCACCAGTTCGATATGGCTCTAGTGCAACATCAGGTGCGCTACATGTCGCTCATGCCGCTGGTCCACCTGTGTCGCACTGGCCATTGCTACCACCTGTTGCACGTTAAGTTTTTTCATCGCTATAAGTTGCTCAACAGCCTGACGTGGCCCCACTTTCATGGCGGCAGTCAGGTAGAGGGTATCGCCCTCATAATCCGTAACCTACCGCTGCCCTCAGCGGAGTTCACGATCGGCACCAAAAATGTGTTCGTGCGTAGTCCCCGCACCGTATATGAGTTGGAACAGTTTCGCCGCCTGCGTATTAGCGAGCTGGCCGTGCTTATTCAAACCATGTTCCGAATGTATCACGCAAGGAAGCGCTTTCAGCGCATGCGACACAGCCAGATGATCATATCGAGTGCCTGGCGCACGTGGCGG
AATTCGCCACTTTGCCAATGTTGTTAACTATTCTGTACATCGATTTTTGGAAAAGAACTCGGACATGCTGCCGAAATATATAAGCGCTGCCTTCTATCAGAGCCAACTGTCGCTGGTGCAGAGCCTATTCCCGGAGGGAAATCCGCGCCGGCAGGCCAGCAAAAAGCCAACAACGCTCAGCACCAATATACGCACGCAGCTTCAAACTTTGTTGTCCATCGTGAAGCATCGTCGCGCCCATTATGTGTTCTGCATAAAGCCCAACGAATGCAAGCAGTCGCATCAGTTCGATTTGGCCTTGGTGCAGCATCAGGTGCGCTACATGTCGCTGATGCCGCTGGTGCATCTCTGTCGCACTGGACACTGTTACCATTTGCCGCACGTCAAGTTCTTTCAACGCTACAAGCTGCTCAACAGTTTGACCTGGCCGCATTTCCATGGCGGCAGCCAGGTGGAGGGCATAGCTCTGATCATACGCAATCTGCCGCTGCCGTCGGCTGAGTTTACGCTCGGCACCAAGAATGTGTTCGTGCGCAGTCCGCGCACCGTCTACGAGCTGGAACAGTTTCGCCGGCTGCGCATCTCCGAGCTGGCTGTGCTCATACAGAAAATGTTTCGTATGTATCATGCCAGAAAGCGTTATAGGCGCATGCGCCACAGCCAAATGGTCATCTCGAGTGCGTGGCGCACGTGGCGT
>Myo95E 19983869 19984116|20266 chr3R 19976149 19987246 scaffold_21 1152471 1163506 - 387930|8265 8512
AATTTTGTGTTTCATGTGCTGCGTTCGGAGCAAGAGCTCTATATTCGCGAGGGATTGGAATGGTCTCGCATTGACTATTTCGACAACGAGTCTATTTGCGAGTTAATAGACAAACCCAGCTATGGTATATTGAGCTTGATTAATGAACCCCATTTAAATAGCAACGACGCTTTGCTTTTGCGAGTTCAGCAATGTTGTGCGGGGCATCCCAACTTTATGACCACCGGCAGCAATTCCATGTGCTTTCA
AATTTTGTGTTCAATGTGTTGCGCTCAGAGCAGGAGCTGTATTTGCGAGAGGGCCTGGATTGGTCGCGCATCGATTACTTTGACAACGAGTCCATATGCGAACTGATTGATAAGCCCAGCTATGGCATTTTAAGTCTAATTAACGAACCCCATCTGAACAACAACGAGTCACTGTTGCTGCGCATACAGCAATGCTGCGCCGGCCATCCCAATTTCATGACCAGCGGCAGCAATTCCATGTGCTTTCA
>Myo95E 19984214 19984536|20266 chr3R 19976149 19987246 scaffold_21 1152471 1163506 - 387930|8613 8935
AAGTTCAAGAAACAGCACAGCTTCTTAATATGGAAGCCCAAATTCTCATAAATTGCTTAACCAGAGCGAATAGCACGAACAGCGCTCAAGAGGATGTGGGTTGCGAAATGGATGCACGACAAGCAGCTACCAACCGAAACACGCTGTGTCGCACTCTTTATAGCCGTCTCTTCACGTGGCTGGTGAACAAAATTAATGAGTCCCTGAAGTCAACACAGCGCGAAAAGAACCTAGCATTGCTAGATTTTTATGGATTCGAAGCGCTGGACCACAACTCATTTGAGCAATTTGCCATTAACTACAGCGCGGAAAAGATCCACCAG
AAGTGCAAGAGACTGCGCAGCTGCTCAATTTAGAAGCTCAAATTTTAATCAATTGCCTGACGCGAGCGAACAGCACGAGCAGCACACAGGAGGATGTTGGCTGTGAAATGGATGCCAGGCAGGCTGCCAGCAATCGGAACACGCTCTGTCGTACACTCTACAGTCGCCTATTTACCTGGCTGGTGAATAAGATCAATGAGACAATGAAGTCCACGCAGCGCGAAAAGAATCTTGCCCTGCTCGACTTTTACGGCTTTGAGGTGCTGGATCATAATTCCTTCGAGCAGTTTGCCATTAACTACAGTGCCGAAAAGATACATCAG
>Myo95E 19984598 19984745|20266 chr3R 19976149 19987246 scaffold_21 1152471 1163506 - 387930|8997 9144
CGATCCTTGGATGTGCTGGGACTTAGTTGTGAAGAGAGCAACTCCATCTTTCGGGTCATCGCAGTGGTTCTAAAGTTGGGTAACTTTATTTTCGTACCCATTACTAACATTGATGGAACTGAGGGTTGTCAGGTGTCCAATGTATACG
CGTTCACTAGACGTGCTTGGTTTGAGCTGTGATGAGACCAACTCTATTTTTCGAGTTATTGCCGTGGTCCTGAAGCTGGGCAACTTCATGTTTGTGCCCGTGACCAACATTGATGGCACCGAAGGCTGTCAGGTTTCGAATGTCTATG
>Myo95E 19984811 19984905|20266 chr3R 19976149 19987246 scaffold_21 1152471 1163506 - 387930|9210 9304
AATCGCTCAAGCTGTATCGAAATGTGGAAAAGTACGAGCTGCTCCGCAACACAACTGCCATGGAGGAGGACCGCATGAATTTTCATTATACGAAG
AATCTCTGAAGTTGTTTCGCAATGTGGAAAAGTATGAACTGCTGCGGAATACAACTGCCATGGAAGAGGATCGTGCCAACTTTCATTACACAAAG
>Myo95E 19984964 19984977|20266 chr3R 19976149 19987246 scaffold_21 1152471 1163506 - 387930|9363 9376
TCTCCAGTTGCTAA
TCTTCAGTTACTAA
>mRpS24 19988529 19988592|20267 chr3R 19987303 19992813 scaffold_21 1163754 1169290 - 151415|1281 1369
TTCATTCTGCTATATACATGTC----CAATATA---------AAAGTGTAGAT------------TTACTTAGTGCGTGTACTCGACTT
TACCTATGCGTTTATACTTGGCTCTACAATATATTTAAACTTATAGTACATACATTTTTTAGTGGCTACTCAATGCGCGTATTCCACCT
>CG5510 19993395 19993659|20268 chr3R 19992982 19993870 scaffold_21 1169328 1170328 - 26151|465 842
GCTCTCTAGCT--------------------------AGTTCATCACAGT-------AGCATCATGTT------AGGAGTTACCCGGA--CCTCAGTTGATCGCAACTTTTATTTATATT---TATACC----GCGACTGTATCCCATTTC------------TTATCACCCTTTTT-------AGTTTCCTTAATTGTT------TAGTGAGAGGGTAAACATAATATTACACGTGTTGGAGA----------------GTTAAATTTAAGTGCAAATTTT-TAATCTGAACTATAGGAAAATTGAGACCGTGAGAATATTATTGC-----------------GTAGACAAGATT------AAAAGCCACTAAACAA
GAGCTCCAACTGCAACAGCAACAATAAAAGCAACCAAACCTAGGCATAGTCTACCAAAACATCATGTTACAAGCAGCAGCTGACAAGAAGTTTAAAGTCCTCTTAAAGTTAATTTATATTGAATGTACCCATTACGACGATACTTGTTCTTAAGTTATCTAGACTACCACGCGGTTTTTGTTAGAATGTTCTTATTTTGTCGAAAATTGTGGATCAGGCAAAACAACGACGCACGCAACGGGGAAGACGAATGGGCAATTGTTAAATTTAAGTGAAAATTTTGTATCCTGAACTATAGACAAATTGAGACCGTAAGAATATTATTGCAGTGTGTACATTACATTAGAGAAAAGATTTAAAAAAGAAACGACCAAACAA
>CG5515 20013444 20013524|20293 chr3R 20012158 20014426 scaffold_21 1190809 1193221 - 87012|1399 1527
GC-------------TACAAACTGTGTCAAACTACTCAAAGGCAAATTCGTGTATTTTATATA-----------------------------------ACATTAAATGCCAACTTCTTTATTAATCTAA
GCAGTGCTGCGATATTACAAA-----TAAAACTCATATAAGGCATACTTGTGTATTGTAAAGAAATGGCCTAACACAATGGGTTCTCTATAGTTTTACAAATAAAATGCTAGCGT-GTTATCAATCTAA
>CCR4 20023310 20024157|20296 chr3R 20019619 20025501 scaffold_21 1211937 1217736 - 129968|3930 4857
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CAATAGACACGGCGCGCTAGGCCAACGATAACGGTGACAACAACAACAACAACAACCAACATTCGGACGGCCTCTGGCAGCGGCGGAACGCTGCCGCAGTTCAGCTATC----GGGGACGCAGCAGCAGCGGCAATAGCAACAGAAACAAC--AGCAACAACAA----------------------CATTAATCAAAGCAACAACAACAATAACAACAACAACAACAACAGCAGCAGCCTCCGCCCAGCTACACATGGATCATTTCGCAAACCTCCAAACAATCCAACATTAT--------GAGGAGCCCAAAAGCATATATATTTTTCCCATCAATCACCAATGTGG-GCGCCGCTCAT-TATTAATTCAGTTTA---TAG------------TTTAGTTCTGATTCTG-------GCTTGATTTCCAAC--------------CCATGAGTTCTAAGATGACGATGTTGTAGAGAGGATCCGCTACTTTGTGCGCTGGCTCAAACCCCAATCCGTGAAACCATCCCCAAGTTCAACTTCCAGCGATTATGCCATGGAATAGGGAGAGGATCTATAGACGCGCACGAAGCAGCGGATAGGATTTACATACACACACATACAATTAACTTGCTGCTCTTACACGCCGCGTTTCTCGTTCTATTTTATCATTTTTAATTTCAGTTTTAGCATCGAATAAAC------TATATAA-ATACACAT------AATTAAA---TTACGTTCTTGTAGACGACAACATTATGA------------TACATGTAG-CATA-TTTCATAAGCTCTGACTAAAACACAATACAACAAAAACAAATACA--------AAAAACCAAGCTACTTTTAAGTAAAAAATGCAAGAATATAACTATTTTGTAAAGAATAAGCAAAAAACACACACACACAAA
>CG17786 20040345 20042426|20310 chr3R 20040302 20041247 scaffold_21 1232801 1233698 - 8479|43 1052
TTTTCAACAAGCCTCGTTTGAATAAAGAAACCAAAACGTTCAGAAGATTCGCTTTGAGCTTATAACTCATTCTTTCCAATTGAATATTCATAAGCCTAAAGTGAGAGTTTCATTCTCTGAGGCGATCATTCAGTTTATTCATAGAGGCGACCAGTATCCATATCTTCGATTTAAAATTCGCATTTTCGACT--TGTCTGCAATTTGAGGGAACA--TAAAACATCCGAACGAAGATCTGGTGCACAATTAATTCCGACTGCGATCGCCTCGTCAAGCATAAAATCTAAATCTGAAAATCGAGAGCAG---CCCTAGTTACCTGCTTACTGCTTATTGCTTACCTGTGCTGCAGTTAGTCGGCGAGTAAAAGTTTTCGCCTTATTTTTAATTAAAAGAAACTCACGAACGCGCAGCGCGCACTGAAATTGCTTG----AAGTTTTCCGCTCTGCTCGACGTCTCCTCCGGCTCAAACTTGGCTCAACTTGGCTTGGATTGGCTTGGCTGAAA----------TTAACTTGGCTCGAATCGTGTTGGCTGGGAGTAGCAATCGGAGTTGTCTCAGCATCTCGGCGCTGGAAAATGTCACAGATTTTCCATTGGCAGGTTCCGGGCAGACAGTTTGTGTTACCATTCCCCAGATAGAAATTACCACTCGAAGCTAATTTATTTAATTAATATTTTCACTAGTTCGTA-TTGTGTGCGCTCCCGCATTCTTATTGTAATGCTTGTGTGTTTTGTTCGTAAGCATCGTTTTTGCACAAATAACAA--------------------------------------------TCCCAT---AGTTAACCCGACCCATCATCAATACACCGCATTTGTAACCCACACACAATAATAAATATGGCCAACTTATTTATTTTGATTAAGCCCGAACGACGAGAACCCAATAAAAAGTGTAAACAAA--AATGTCAAACAAAAAGAA------------------------------------
TTTTCTATTCGAATCATTCGAATGCATTCATAACAATATGCCGGGACTTAAGCTTGATATT-TATTGTATTCACTTCGACTGAACTCTGGCACTCATATAT-----ATTTCGCTCGCT-----------TCGATTGATT--TCGATGCAGCATTTAGTTTTATTTTTTGGGTCAGCTTATAGTTTGCGGCTGTTGGCTGAAGGTTAAGGTCGCCGCTTATTAATTTGTAAGAAACCTT--TTTCTAATTATGCCAAGCTCTGATCA-----TTGAGCATAAAATCTAAGAC--AACAGCAGTAGCAGAAGCCCTAGTTACCTGCTTATT------------------TAGCAGTTGG-CGCCGAGTAAAAGTTTTCGCCTT--TTTTAATTAAAAGAAACTCACGAGCGCGCAAAGAA-ATTGCATTTGCTGGTCTCAAGTTTTTCACAGTGGCTGCTG-CTGCTGCTGCTGCTACT------------GCT---ACTGGCATGATGGAAAAATGTCACAGTTTTCCACGATCGAGTCGAGTCG------------------AGTT-----------------CCGGCCAATGGTGGGG--------CCGCCCAGTATGGAGCCGGCTGCTTTTGTTACCATTCCCCACATAAA---------------CTAATTTATTTAATTAAGATTTTCACTAGTTTGTAATTGTA-----------ATTGTCATTGTA-----CATGTATTTCTTTC--AATATGTGTTATTGCACAAATAACAAAACGGAGGCGCGTTTTAATATCACACACATATACTTCACATAATTCTCATTCCATTTAGCTTTAAGTATCTCCATTAAGTTTTATTCTTGTTTCGCGCACAATACCGCAATTA------TTATTTATTTTGATTAAGCGTGAACGA---GAGCTCAATAAAATACATAAATAAACGAATGAAAAAGAAAAAAAATAAACCAACCGATTGTTTGGAAATGAAAAAGAAAAA
>CG17786 20040345 20042426|20311 chr3R 20041370 20041541 scaffold_21 1234204 1234354 - 2821|0 171
TAATTTTTATCGTAGAGCTTAGGCAACGTTCCTACATGTTAGTTTTGTATTTTTATGTATTTTTTGGGTTCTATTTTATTTTAACTGATTAGTTGGTTTGGTTTTTTATACTTAGTCCGTAATCGAAGCGCTACAACGTGAACTTTTATAGCCGATAAGTTATATGTATATT
TAATTTGT-TTGTAGTTCCTAATTAACACTT-----GGTTCGTTTTATTTTTTTAAACAAAATTTGGGTT---TATCGTTTT-----------CGGTTGGGTTTTAGGTAAC-AGTTAGTTTTTAGAGCGCTACGAAGTGAACTTTTTTAGTTATTTAAGTTTATTTATGTT
>CG17786 20040345 20042426|20312 chr3R 20041557 20042102 scaffold_21 1234523 1235105 - -1307|0 687
GAAAAACAAAAGGCCAACGAGTTGACCAAAT-----------GGGCGCA---------GGCAGAGGAAGGCTGGCAAGCAGGCTGT-TGGATACGATCCCCGGCTAAATGGAAACTTATATAGACAGGCCGGGACTGGAAACCATGTACATACGAATCCCAGTCCGACTTCCATTTCAACTTTCACTTTCACTGCGGCGGCGGCGGCGTTTTGTATATCTGTATTTTTTAAGACATTTTTCTTTTCCTTTTCTTTTTGCCAAGAC-----------------CACAGATCCACAGATGACGGAGCTGCGGGTGGGGGTTACGGGAAGGGTGCGACTCTTATGCAGATTTTGTGGCGCAAAAAGAAGAAGAA-----ACTGTAGAAATCGTGTAGATGTAC-----GATGTGAACTCTAGAGATACTTTAACTATACCCTCATACATATCTCCATCTACCT---TACACATACAA-------------------------------------------------------------------------------------------TTAGTTGTTGTTGTTATTTGTGCATTAACGTTATTCCATAGGGCCAAAAAGCCAAGGAACCTGTCCCCAATTGTACTCCCAAAAATCTAGGAATTATATAGGGTTACATATACAGTGGGTCGG
GAAAAAAAAAAAGAGCACGAGACATTGAAATTAATGCGCCATGGGCGCAACAGCAATTGAGAGAAGACGCCTGCTCTGCAGACTTTGTAGAT-------CTGTATGTGTGTATGTGTATATATATATGTGTGTATATGTATGTGTGTGTATGTACAGGCTA---------------CAGCTTTCACTTTCGCTGCGGCGAAGTCG------------------------------------------CTTTGTTTTTGCCCAGACAAGCGGCGAGATTCAAACACAAAAACAAAAACAACG------------------ACGAAAAG--------TCGTATGCAGATTTTTAAACGCAAAAGTAATAGAAATCGTGACTAGACAAGAGGCCCAGCTAAAATTGTGGATGCGAATACCCACACAACCCTATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATGTAAATTGCTATAAATACAACTTATATATATATTTGTACTTTTATATCAAGAGCGATGACGCATTTGTAACATTTGTAAAAATTGGTTTAGTTTATTTATTTTTTTTGTTATTTGTGCATTAACGTTTTGTATTTGAGT-----AGC-------TTTGAGCTTAGTT---TTCCCCATAAGTTTTGAATAGTTGATAATGCTATATTTAGTTGGACAG
>CG17786 20040345 20042426|20313 chr3R 20042385 20046198 scaffold_21 1235243 1239070 - 72562|0 41
CGATGCCAGTGGAAAACTAATCAAATCCAAAGCCAAGAAAAT
CGAC-------GAAATCCAAACCAAAATGAAGCCCACGCAAT
>CG5669 20049167 20049470|20317 chr3R 20049417 20049912 scaffold_21 1244312 1244789 - 22127|0 53
CATTCGGAGTCGCTGTTCATGGAACAGTTCTTGTTTGACCACTTCCCGTAGCAC
CATTCGGAATCGCTGTTCATGGAACAGTTCATCTTCGACCACTTCCCATAGCCC
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TGATATCCGCTAAAGAAATCGAAAACTATACTAAAAATGTGTAAAAGATCTCCAATATATATATGACTGGTATTCAAGGCCGCATCGAATGGGTTCGTTTCAAAATTTAAAAC
TAATATATGCTAAATTATTGACAAATTATGATAACATTTCG-AATATGTGTCAAATACATTGCTGAATTGTGTGGGGGGGAGCATCGAATACATTTGGGTCAAACGACAAAAC
>CG5677 20054044 20055139|20325 chr3R 20054939 20055745 scaffold_13 2970983 2971782 - 26387|0 227
AG-CTTAGGGCTAATGCTAAATACAGCTGGTTCCGCCCGGGTTCCCTAGCTTGTAGTGTCTATCTAATAAAACCC--CAAATAAAATATCTTTGT------------------AAAGATTTCGAACTGTATCC-CAAACGAAAGAAACTTAAGAGAAATTCGTTGAAAATAATTTATTTTTGGTCCATTTTTATAATGACAAT-----TTTATCTATAGCTTTCTATA
AATCTTAAAATTTTGATTAGAAACATTCAATACAG----------TTGTATTTTAATGTAC-TAAAATAAAATCCTTTATATTAAATACATATATGTATCGATTGTGGGCCTAAATGATTATAAAATGTTGCTAAAAAAGAGAGAAACTTGACAA------TTTACAAACAA-----GTCTGGGGTACATTGATACTGATACTGAACGTGAATCTATATATATATATA
>CG5706 20076174 20076245|20336 chr3R 20074919 20078275 scaffold_13 2993497 2996724 - 125402|1380 1451
-AGATTTGCAAAATGTTCAACATTGTCTAAAAGTTCACAAATAAATTATCACAAATTAATAAATAATGCCAA
CAGTTTAACAAGACA------ATTGTTCAACAATTCACCAAGAGTC---------TTAATAAATGGT-----
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ACCCCCA------------------ATACGACAAACAGGCACTGCATTGATCAAATACGTT-GCCGTTT---------CGATGGTCAATAGGTCAAAATTGGTAACTA--ACGAAACTCGAAAATAAGTTTTTGTCAGTCAAATTTTACGGAAAGCGACCACGTCCATAAA-ACATTTTTAGTAAATATAACTATATTTGATTAGAAATGTG---------TATCCTTTAATT---TGGATTCCGATCCCAT-----TTGC---CCAATCATTTTGTGCGCGCC--CGGACTGTTTTTGGGGGCCTTATACACTTAGCTATACAAATATATATCT------CTAATTAAGTGAATCT----TATGATGT-AAAAGGAAACGGCAAGTTGTATTTAGTATTTAACTAATTACCATTTAAATTGTGTATTTAGTTCACTGCGATGTATTTACATAATTGAATATATATATATATATATTTTACAGTATTTTAAAAATAAATATTTGAAGT---GAATATTT
ACATTCATTAATTGTGAACGTGACGAAACGATAGAAACAAATGCAGATAAACAAACAAATTCGCCGTTTGATCATTGGTCCTGGACGACGGGTCAAAATTAGCAGTCGGTACAAAATTCCATAAATATTTTT------TCAAAACTTTTGATAAA-AACCACGTCCAAAAATTTATGCTTAAAAAAAGATAATACA-TAAATTATAAATGTGAACAATTTTTTTTCTTCAACTATATACATTTCAATAGCATACGGATTGCGTTTTAATCGCCCATTGAGCGCCAGCTGAACGCGTTC---ATCTATATGTATT---CCATATATATGCGTATTTTTTCAATTAGTTAAGTAAATGTGTAATACGATTTAAAAAGGAAACGGCAAGTTGTATTTAGTGTTTAATGAAATTCTATTAAAAT--------------------ATGTATTTAA----------ATATAACTGCGTATATTTTACAGTATTTT-AAATTAAACATTCAATGCTCGAAATATTT
>jar 20080252 20080273|20337 chr3R 20078588 20084313 scaffold_22 258647 264518 + 255485|1791 1812
TTGGATAATGAATGAATACCAT
TTGGATTCTAAAT-----CTTA
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TGTGGACTG--------------CACTTTCGTTCAAA---TGATATTTAGCAAA-TGTACTCTATTTCGAGT---------------------GTATGATTAGGCGAGCTTGGAGTTTTT------TCTATCTATATACACCGAGTTGTATACCTTACCTA--TTTAATCTTCATTATTATTTGCATTCATCCTACTGCTT--ATAATTATAAACATGTGTATTAGTCATTAGAAGCTCGCTCACATACATGATAAACATAAC---------TTAACTTTGTTG---------GTCCTGCG---------------AATTTGGTTGCATTCAAACCATAAGATACACGTCATGGTAAAGCTGACGAAT-AAATTTAGCAATAG--TTGCTACAAATGAAAAAAAGAAAA
GAACAACCACTCGAACTAGCGCTCATTTTCATTAGCATTTTTTTATTTAACGGATTGCACACTTTTTTGGATTCTCTTCTATTCACATCAGAAATATTGATAGTAGCGCAAAAACTTCACGAACAATTTTACTTTGCAAACTGTGTTTTGTATTTTGGTTAATTTCATTTGTGAACTTTATTTG-------GCTACTCATTGCATATTTAATATTTTATATTCTAAACATTAG-----CTCGCGAAAACATCAACAACAAAACATTGAAATATTAAAACTGTTGTCAATAGATTTGTTGCGTTATGTTTAAAGGAAGACTCGTCTACATCTTAACTGTAA-----ACGTCATATATAAGTCGGTGAATAAAATTTAGCAATCTTCTTGCTACAAATTGGATATCAAAAT
>CG5728 20154175 20154410|20402 chr3R 20151118 20154725 scaffold_3 939231 942986 + 91574|3271 3607
TTTCATCA-------TGCCCCACCTT---------------------------TTTAGTTTGTAGGATTAGGAGTAAGATCAAGAGTTAC----------------------------ATACAG------TGTTTTTCATGATACTTTATTCTA-AAACTATTTTAAATGAA--GTGTGATTC-CGAGTGCTACCTTTAAATATATATGTATGATAGTACCTATATATTATAGAAATACATATAAAACGTTGCTTTGGCCATGCCC-------CCTACACATAGAA---TGTAG-------GACTG------ATGCC------AATATTCAACTTAA
TTTTGAAAACGAGGTTAATCCGCTTTTGATTGTATCTATCCGTACAGAGATAATTTAATTTGAGTAAATTGGAA-AATATATAGAGTTACTGGATCATCGCCCTCACATTAACGACAATTAAAGTAGATCTGTTTTTGTTGATACTTTATTTTATAATCTATTTTAAATGAAGTGTGTGATCCTTGAATGCTACTTTTATTTAAATATATGT-ATATTATATATA---TATAGAAATACATACAGTTTTTTGC---GGCAGCACCCAGAGGCGCAGCTACATGGAAATGTGTAGCGGCAAAGACTGGTAAGCGTGCCACATAAAATAAGAACTTAAA
>CG5746 20171507 20172432|20412 chr3R 20170318 20173121 scaffold_3 961002 963805 + 46674|1313 2318
ACAACCACTTCCCAC-TCCCACCCCTGACGGCACACTAGAGAACAGAACGCTGCGCGTGCTTCGATAGGC---CAAAAAACCAAATAAGAAGGGACTAGGGCAGAGTAACATGGAAGGGAATATATGTTTAATGCAACAATTAACTTGCTATACATA---------ACACGCAAACACACACATACGCGGTCACTCAAAGCATACAATT--TTAGTTTTAAGTATAAAGTTCTCTTTTTCTTAGCATTTAAGCAAACTAGTGTTTCGACGTCTTTCTACATAAACCCCCACC---CCAAATTAACATCCC----CCTTTGTTTCCGTTTCGTCTCCCCATGAGTACTGAACAGATATATTGAAATAATCCGCCTTGCCTGTTGTTTAATGTTCTCTAAATAGACAAACGGAGCTAGACTGCACT----GAGCTCCAGCCTAAGAA---AATTAAATGTGCTCCTCCTTAGTTCCATTTACAATTACAAGTCAACTGTGACCAAAGTATGCTACAATCATATTTTTTATATGACGGAAAAATGAGAGTACGTAACATGATCTTTTGAATGAACTAAATTTAAAC--ATTTTGTGAATCATGTAAAATTGTATACAAATGAATGCAATGTAT--ATTTTAGTTTTTAAGCTGAAAACCGC---------AATCCACTCTCGACA----------------------CAATTATTTT-CTATCCCACATGCATCTGAAAGCGTT---TATGATTTTGCAAGATTGTGTTTTTTTCTTTATGAATGACAAAAACGTGACAAAAGCGTGACTTATTACTTTTTTGTTTTACAAAAACCTCTTATAGTGACAATTTAAGCAAAAAAAAAAGTTCGTAATAATGTAACTCCTTAAATTTAAGCTG----------AAAAAAAAAACAAGTAACGAAATACACAA-AGTATATTAG-AAAAAGATGCAAAAACCATAACCATAATCAAAGTCAATAAAATAATGTTCAAAAATG
ACTAGAGTCTGCCGCATCCCTCGAATGGCGATACCCATCAGTGAAGAACGCTGCGCGTGCTCCAACACGTATGCCAAAAACCAA--AACAAGGGATTAGGGCTAACGAGCAT--AACCATATGAATGTTTAATGCAAAAATTTGCTTGCTATATAAATTAATACGTACACGTAGACACACATACCCACAAACATTGAAAACACACACACAATTAGTCTTAAGCATAAAGTTCTC-TTTTCCTAGCGTTTAAGTTGAAACGTGTTGCTACGTCTTGCTTTTCATCTCCCTATCTATCCTATCCAATTTTCCGAAACCTTTGTGTTTGTTT-GTCTTTGCAATACCCTATCACTGTGACTGGCAAGAAGATTGTATCGCCTGTTGTTAAATGTTTTGTTAGTGGACAAATGGAGCCTTGCATCGCTTTAAGTGCTCCCGCCAATAAATCGGATTATGTATATTTCTTTATAT-----TTTACAAATATTTTTCAA------------------------------TTTATCTACTTGATGAATG-------------------------CGATCCAAAAGTAAATCAATATTGTGAATCATGTCATATTGTATAC-AACAATTGCAATGTGTAAATTTTAGTTTTAAATC---AATCTGCTATTAGGCAAAACATCTCTTTACAAATTGAAACTTTTGTTTATTTCTAATTTTTTTAATATATCTTAAATAACTGAAAAAATTAACTAAGATTTCCCAA-ATATTATTTGTTTCTT----AAATCTACTGACGTGAAAAAGAACGCAATTATAATTTCTTTTCCTAATA----------ATAGCAACAATTTAAGCTACAAAA-----TCGTAATTATGTAACTTTTATTCATTAAGCTGAGCAAAACAAAAGGAAAAAAAAAACAAAGAAATACACAACAATTTATTAGCAAAACAAAGCAAAAATCTTAAAATTTATCAAAGTCAATAAAATAATGTTCAAAAATG
>Golgin84 20181790 20181992|20418 chr3R 20180478 20183640 scaffold_3 5493159 5496458 - 111930|1429 1690
TCG---AATCAAATACATTTAGTTGAGCAATTGTTGTATTTCCAT----AATATTGTA---TGTATTGTATTTTACGCGCCAAAATTGGATATCTA-----GTGGTACGAGTATATG-TGTCATGTTTGTGGTTGCAACAATTGTATATATCGATATTAT-----ACTTGTGTCTCGCA-----------------------CTCGTTCTAAATTCAATATTCAATAAACA--TCAACTATGTACAGA-------------A
ATGGTAAAACAAACA---TCCGTTACACATTTTTCGGATTCTAATTTCAAATATTGCATATTATTTAGTATTATTTATATAGATATATGTTACATAAGTTGGTGGTTCAATTCTGTGTTGCCAAAAT--TGATTACACTTTTTGTGTATAATG-TATTGCTTAGAGCTATTTGCTCACAACAAAAATAAAAGAAAAAAAATTATCTATCAAAATTTAA-ATTCAATAAACATCTCGACTATGTACAAAGTATGGTTATGATA
>CG18528 20183815 20183932|20419 chr3R 20183717 20185278 scaffold_3 976243 977834 + 62127|108 249
AGAG----ATAGTTTATAGTTGTGAG--TTGCGA-----AGATTAC----ACTGCCCATGTTGAGTATTGAATAAAATATTC-----ATTTGTACCCT-AGAGTTTTGATAAGCATAA---TAAATTAACATTTCTGCACGG
TTCGTATTTTAGTTTTTAAGTATTAAGCTTGCAATGTACAGAATATATGGACTGCCAATATGATTAATTCATCCTAATATCAGTTAGATTTACATTTTCAACAATTTGGTAGGAACAAAGTTATCTGAATATTTC--AACCA
>CG5762 20186427 20186612|20420 chr3R 20185601 20186535 scaffold_3 977839 978758 + 5986|874 995
GTGTCGAAGGCATCAGATTTTAAAGCGTCCAAATCCGAAAATGTAACTGTAA----AAATGTAACACATCTGCACTAGAT---------GTGATATTTGTTACTAATAAAATATTTAAGTGT
GTTTCGTATGCATTTGAACT-AAAGATTTATATTCAGAACCTGTGTTGGTAATCGAAAAAATTATATCTCTGCTCTTGACAAATTCCTGGTAACATATGTTCGTCATATG----TCAAATTT
>CG17780 20208635 20209068|20443 chr3R 20209056 20209814 scaffold_3 1006770 1007575 + 23399|0 12
CACTAAGCAATTG
CAATAAATATGTG
>CG5768 20211825 20211847|20447 chr3R 20211787 20212051 scaffold_3 1012181 1012444 + 9974|38 60
TAAATTTCCGATTCCTAAAAGTA
TAAATTGC--AATACTAAAAAT-
>nAcRalpha-96Aa 20226948 20227460|20460 chr3R 20226119 20227718 scaffold_3 1027556 1029215 + 49956|920 1518
CGACCACTTGGGTTCGCGGCTGGCTGGTGGAATCTAATCATCAGCTCGCTGCGGACCCTGTTCGCCGCTCGCGACGATGATCGTGGATAATATACGATGAGCCAAACCATGAGTATTTCCTCGGCGTTGTACAACACTAACAGCAGCAGCAGCAGCATCAGTATGAGCAACGCCAGTGACAGTGGCAGTGTCATCGGCAGTGCTGTAAAGGTTATTGTGAGTAGTGTTGGCAGCACCAACGAAACGGATGACTCGTGGAGCCCATCGTAAATGTGCGCGAGGCGAGTGAAGTGAACATTGCGA------AATGAATTGAGATACAATCGAATGGAGGCAAGTTTTTGGAGCAGTTGATCAAAATATGTATGTAATGTAATTTGAT---GGGGTTGTAGTGTTGATTAAC-----------CGTGACAGTGCTG------------------------------GACAGCGACGCAAGC--CACAAGATCGCT-GCGGAGCGGAGATTAGTTTGTAAGTTTTT----------TGATG----------------TAC-------TTGATGTATGATTGTGTGGTCGAAGATGTTTAGGTG
CGTCCACTTGGGTTCGCAGCAGGCTGGTGGAATTTAATCATCAGCTCGTTGCGAACCCTGTTCGCCGCACGCGACGATGATCGTGGATAATATACAACGAGCCAAACCATGAGCGTCTCATCGGCGTTATACAACACTAAGAGTATCAGCACCAGTATCAATATCAGCGTTGACAGTGTTAATCCCA---TAATCGATATAGATAGAA-----ATCGCGA-----------------AACG--ATGACCAACTCATGGAGCCCATTGTAAGC-------AGCGGAGCGAAGCGAACATTGGAAATTGTGAAAGAAGAAAGAAACAAAC-AACGGTTGCGAG-TTTTGGAGCAGTTGATCAAAATATGTATGTAAAGTAATGCAACACAAGCACTGTAGAGTTGGATAACGCTACGACGAAAATAACTGGGTTGGAACAACAACTATAACATATATATTTATATGACACTGACACGACCAGTGCAACTCCGCCAACGGCATAGAATCTAGTTAGTAAGTTTTTGATGGATGCATGATGATTGTGTGAATAAACATACGTATATATTAACGTATG--TGAGTGTTGGACGGTTGTGCAGTG
>nAcRbeta-96A 20334936 20335361|20589 chr3R 20334892 20336398 scaffold_3 1163822 1165573 + 28130|44 506
ATTGTGGAGGACTGGAAGTTCGTATCGATGGTGCTGGACCGCTTCTTTCTCTGGCTCTTCACGCTGTCCTGTGTGTTCGGGACCTTGGCCATAATATGTCAGTCGCCATCGCTATATGACACCCGGTCGCCCATTGACCGCCAGCTGAGCGAGATTCCTTTGCGCAAAAACAATTTCATGCTGCCGCCGGACATTGTCCGTCAGGTCCTAACCTAATTGGGGTC-CCGAGGTCTT---------------CCCGTCTGAGTTAACAA-TGCTTCCGAGGCTCGGAACTGTGTTTTTTATGATGCGCAATCAAATCAGTTG--------------TTTGCTGGGAATGCGGCAACGATTTATGTCTAAGTGTTTATCATCCTGCAATGCTGTAAAACCGAATTAGCTATAAAACATGG------AAACTAAATAAAAAAAATTCTGTTTTAACTCATAACTTCA
ATTGTCGAAGATTGGAAATTTGTGTCCATGGTCCTGGATCGCTTCTTCCTCTGGTTGTTTACGCTGTCGTGTGTATTCGGTACTTGCGCCATCATCTGCCAGTCGCCCTCACTTTATGACACCCGCTCACCCGTCGACAGGCTGTACAGTGAGATTCCATTGCGTAAAAGCAATTTCATGCTGCCGCCGGACATTGTCAGGCAGGT----AGTTAATTAGAATCGGAAAGGTCTTCAAAAGGCAAGAGACCTCAAAAAAGTTAACAATTACAAAAGGGGCTTGTA-----GCCCCCTATAA-ATGGAATCCATAAAATTGAAATTTCAAAACGTATTTCTTGAAATCTACCAAAG--CAATGTCCGCTTACAAATATCTCAGCATTATTATAATTCTTTAATAATAATAAAATATAATTTATTAACCCAAATACTGAATATT---TATTGTTTAATAAGTGCG
>nAcRbeta-96A 20335863 20335969|20589 chr3R 20334892 20336398 scaffold_3 1163822 1165573 + 28130|1198 1304
ATTCCGACAATGTGATACCGCGCAACTTAACACCCGAAGTGCTGCAGGCGTTGCGTGCGGTCAGATTTATTGCGCAGCATATCAAGGATGCCGACAAGGATAACGAG
ATTCTGACAATGTGATACCGCGCAACTTAACACCCGAAGTGCTGCAGGCATTGCGTGCGGTCAGATTTATTGCGCAGCATATCAAGGATGCCGACAAGGATAACGAG
>nAcRbeta-96A 20336620 20336947|20590 chr3R 20336494 20336951 scaffold_3 1166505 1167001 + 19515|156 511
ATCTCCATCTACGCACAATATGTCGCCGCTGGTGCGGAAACTCTTCCTGCACTTCATGCCCAAGCTGATGATGATGCGGCGGACGCAGTACACTCTGCCCGACTACGATGACTCCACTCCGAGCAATGGGTACACCAACGAGATCGATGTGCGGTAAGTGGCAACCAACTCGCGAAATTGAAAGTAAAC--------------ACTTGACTTTGGCCTGCCTGTTTGTGT-TGTG-------------GCATGGGCTGGTTTTCCCCTGCAGTGACAGCATCAGCGATTTTCCCAGCGAGTTTAAGGACAGCCAGGATGGCGCTTACGATAATGGCATGCAGAACTCTGTGGGTGA
GTCCCCATCGACCCACAACATGTCGCCGCTAGTTCGCAAATTGTTCCTGCACTTCATGCCCAAGCTGATGATGATGCGACGCACTCAGTACACTCTGCCCGACTACGACGATTCGACGCCCAGCAATGGCTATACCAACGAGATCGATGTACGGTAAGTATTTCC---CTTTCCATATCGAGGGTTCACCTTTCACCTAACTAACCTTACCATTGCCTATTTGTGTGTGTCTGTGTTTTTGTTTGTGTGTATGTGGGTGCTTTTTATTTCAGCGACAGCATCAGCGACTTTCCCAGCGAGTTTAAAGACAGCCAGGACGGCGCTTACGATAATGGCATACAGCACTCAGTGGGTGA
>nAcRbeta-96A 20337206 20339329|20592 chr3R 20337183 20337427 scaffold_3 1167395 1167641 + 16463|25 246
CGAGAGATATCGACAGGTGGAAATTGTGTAAACATTTCGTTGACAGGTTACGTTATGTATTTCGATACTCGTGTCGTTGACCGTGTTTTTCCTGCTCTTGGCCGAAATTATCCCCCCAACCTCGTTGGCCGTGCCCCTGCTGGGCAAGTACCTTCTCTTTACCATGATACTCGTCTCGCTATCCGTTTGGACGACGGTCTGCGTGCTGAACATCCATTTCAG
CAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAAACTGTGTAAATATTTCGTTGACAGGTTACGTTATGTATTTCAATACTCGTGTCTTTGACTGTGTTCTTCTTGCTATTGGCCGAAATAATACCGCCCACATCGTTGGCGGTGCCCCTGCTGGGCAAGTACCTACTCTTTACCATGATACTCGTCTCTCTGTCTGTTTGGACAACGGTCTGCGTGCTCAACATACACTTCAG
>nAcRbeta-96A 20337206 20339329|20593 chr3R 20337508 20339786 scaffold_3 1167708 1169988 + 20606|0 2000
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CCCAAGTATGTAGA--TGGAATTATTTTTGGATGGAAATCT----------TTCATTATCTAAGGTATCTGCCTATTCTTAAAATATATGTAGATGACTATTCATTTTTTGCATTTGTATTATATATTGTAAATTTATTC-----TTTTACCTACATACAACTAACTAAGAACACTAAAAAA---TCACTCT-----GAATATATCAATAAGTTTCTATATATTCTT------------------TTCCCTCATGCACTTTAGAGATTGTATCATTAACAAAC--TCCTATTCAAGCTACGACTAATTCTTATAAAGCTGAGCTCTTTAGTTAGTTTGCTAATGA-----------AAATTGGCTTTAATCGAATGTTGGTAGAAACGCTCTGAGTTGAAATTGTTAAAGACCTACCATAAGAGCTCAACTTACTTTCCACAAGAGTTGTCTACTTCTTTGCTATCG------CTCTCCATTTTAGCCTACTTTATTATCGAATATCCTCCATTAAGTAATTGCAATAAACATTT---GTCTTCAGATCACAGAGTTCCAGGTGCATTTTGATTCGTGGCATTA-CAAGCAGAACAATTGCCCTCAATCGTGCAGCACACATATATTCACGTC-------ATATATTTCCAAAAAGGATTCAAATTCAAAT---------------TTGCGTCGAATATCATTTGTGCTGTTTTGAGTATTGAAATCTCATAACGTAAATTT-CATCGAATGCATACAAA------------------------CCGAGTTCGAATCGA-----AATCAAATTG-----------------AATTTTCCCATATCAAGTGTCCCGTAATTA-----CACACTATTTCACACATTGACCTACATATAAAGGCACTTAATTACACGCACCTACAACAC-----------------ACAACTACGCACTACACACACACACAC---ACACACACACACACACACACACACAATC-ATACGTGATGTTTGCTGTTGTTGTTATTTTTGTTTATTGGCTCGTTTGAATCAAT-CATTTGCTTGGAGTATTAAATTAGCAAAACATTATAGTAAATAATTGCGATCATCACAAGAATAATTGAAAATTAACAAAATAAATAAATTTGATGGGGTAATGACAGATAAAATATTCCAATAG---GAATAAAATGT--------TGTGATTATGAAAAAAGTAAATAAGAGCAAGTTTTTTGAAAATCAAATTTCAAGTCATAGTAAAAGTAATATTATTTTATTTTTTGAAAAGTTAAAGTATTTTATACTTAGTATCA---TTAATAGAATGACTTGGGATGAAACGTAAATGTAAAAGCTATTTTTAATTCAAAAAAATTATGTTTACAATACCATCGAATTTATTTCTAGTTTTTT---GATAATATTGTGTGCTAGAAAATATTTAAAGATCAACACAGACTTATTACAGCAAAAGCTCTGTGTCAAATAAAAAAAGAATCAG--ACTGGTTGGGTTTGGATATTTGAA---ATATATAGGAGGGGTATAT-TAATTTAACCAAATTGGGATGTATTAATAAGAAACTGTTTGCCAAGGTTTCTGTC----ACACTT---ATAGCTATTTGA-----------GAAGAATATCGCCTCATTGAAGGTATTTTAAAAGAAATAGAAATGTCGACGAGGTTGTTGGTCGGAGTAAAGAAATTGTGTGAGTGTTTTGCCTGATTCCACGATTTGCGATG---TCTTTAA---TGTAACT-TATTATTATTT----TTAATTATTATTTATGTTAATCCTAATATTGTTTACTAATGTGAATTAAATTGAATTAATTATGAAAAATCAATTGTTGAA--GTCGAGTTATTGTTTTACGTGGCGTAATTGATATGTAATTGGCTATAATTAATAATGATTGGTAAATCGTT-CGTCCATGTTATTATTTTGTTTATGCTGTGTTCT---TGTCATTGTTG
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-CTTTAAACTTTAGAGAATTATTTA---ATACACATAGA-------ATGTTCAGTT
TTGTTAAACTTTAGCGAAATATTCAAACATACAGATATAAATTTATATGTTCAGGT
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AAACGTACCAAAATGATTTACTTGT--------ATATACTTAGTTAACAATGTCCCAGATTTATAAGCTTTGTTGGATTTGTACTTTTTTGTTTTCGTTCTATGTCAGTCACTTATTTCCCGTATCGGTTACTACTTAAAAAAATCTAGA---TGTACTGCCTTATATGTAAGTTGAAAAAATGCAAATGTACTTGGGAGCAATTTTACACTAAGTTTGAAGATCATAATAATGGATCAAAGATTTAAGTGTAAAGTTCTTAGATTTAAGTATATCAGAAATACCCAACGATTTTGAAAGAAATCAATATAAATAATTAATTTGTATATACTCATACATGTGTTGGGTTGTTTGCAACAGACAGGATTACAAAATGTAATTG---TTTGAGATAAATCTCCTATCTGATATA---ATGTACTCTAAGAATTTGCCCTTTACCCACATTACACGTTAGTTAGCATTTCAAATATATTTAGTGTATAAGAAATCTACACATCAAGGCCGGATATAATCCAATAAACAGAAAAACAATCACACTGTGAACTCCTGTACTTGAAACATTAGCTGGAAAGCTGTATGCGAAATTAAT--TAAATTTTATTAAAATATACATAAAT--------------------AATTGT-----
>CG5789 20362050 20362640|20607 chr3R 20362521 20364707 scaffold_3 1194634 1196820 + 89052|0 136
GAAACGGTGGCCCAAAAAAATATCCATC-------GGAAATCGCATTTAACCAAATCTGGTGCTTATAATGGCTCAAGGTTACAACTCT---TGGGCTCCCAATGGAAGAG-------GAATCTTGTCCAAAACAAA
GAACTGTTCG---------ATATGCATTTAACGCAGGACTTGGCGTTTAATTTAAAC---TATTTAAAAACCAACAAGATTACAGCCCTTTATGTAGGCCCAGTTGATGCATTCATTTGAATTTTATGAAAAGCTAA
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CGGGCATACGCATTGCGGGCGGCTCTACAGACTTTGTGAATAAAGTCTTGGAAAATATGCGAGGCGGCATGCCCAACGGTGGGCTCGAGGATCTGCGTAAATCAT---AGACCAAAT---------AATCCAAAGCATAAACGAACCGCCCATCAAGTTTAGACTTAAGCATTGATTAGCATGTAGCCACAGCCCCCGCCAACTAGATCCCCAGCCCAGCCATCCACAACGCTAAGAATGTAACCCAGAAACTAGACTAACCAAACATCA------ATTTTC-------------------AAAAAATGTTCTG-----------------CTTGAGTGCGTGATAATATGTGAATGATAACCTGATAAGAG---CGAAAGTGAGAAATA-GTTGTAACTGTGATTTAA-GAGCCTGG--------CTTCGTGTGCAACAGATAAGTGCAA---------------CCTGTGCAAC-------AAGCTATTTGGCCAGCGCAAAA---------ATTAAAGAGAAAAGAATTCCCCGAGGTAAATGTAAAAGAAATACAAAAATTGCTAAAAAACGAAACAAAC-TGTAAAGAAAGAGGCAACTACAAACACAAAAA-----------CACTACAAAATTTTGTTTAGTTTATAAGAAA---AAGAACGAAAGAAAAAATTATGGAGGTAATGCAAAGAAAACGAGTCT---AGGAATTAGCTACCAGTTTTACCTGCTTACGACATAAGTTTTTGATTTTGTTAAAACATT--------TGAATTGCGAGACAAATTTGGGCTACGCTCTAACTAAACAAGCACTTACATATTTAATTACATATATACATATATAACTATATATATATACAACTGCGATTTATTTGTTTAAGTTTTGA-TGCTATATAAAACAAGATGTATAAATT-GGTTCAATGTCT-AGCTTTAAGTTTTTCTATATCTATTCGCTAAAACGGAGAGCTTTTACTTTTTTTTAATTAATAG-TTATATCCATATATATAAAGCAATTAT-GTTCATTATGTTTGTT--GGCCCCACCCGCCCCCACATACATTTTAATTGGTCCTAGGTTGTCAGTCTTTAAGTTTTTGTTTGATCCTAAGTTAAACTGAAAATAATTTTGCTTTATT
>CG13624 20386104 20386229|20624 chr3R 20380157 20386609 scaffold_3 4715464 4722483 - 142374|6923 7048
AGCGCCTCATGAATGGTATAGCCGAGCTAAAGCAGGCCTTGGTCGTCAAGCATCGCACCAAGAACCTGGGCGAATCCACCGAGGAGGTGGACCAACAAATTGCACGCATTTACGCTACCGCCTCTT
AGCGTTTGATCAATGGCATTGCCGAGCTGAAACAGGCGCTGGCGCTGAAGCATCGCACAAAGAGTCAGGGCGAGTCGACCGAGGAGGTGGACCAGCAAATACAACACATTTATGCAACGGCTACAT
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-TGTTGCAAGCGTTGTTTGCTTTCGTGTTGCAATAAAGATGTAGGCACTGCCTGTAAAAAAGAA--AAGAGCAA
TTATTGCATTTAGTTAATAAATAAATATTTTAATTAAAA-ACATTTGTTATCGATAAACATTAACTATGTTTAA
>Syx18 20449516 20449688|20683 chr3R 20448431 20449885 scaffold_3 4792939 4794433 - 13932|1213 1436
GTGAAGTCCCCAAAT--TTATGTGTAACCCACCCAATTTAGGGAATG-ATAAATGCAAAAATGTT----TTGTTATCGTTTGATCGCACTA-AAAGCATATTTTGTTTATTACATAATTTATAAATAAAAGGAAAATAT-----------TTGTTTAGGCTAT-----------TCAACTGCCTTGTTTC---------------------AATTCAATGAAAC
AATA------CAAATTGTTTCGTGTAAAAAAATTAATTAAGAAAACACGTGAACGTGAAAAACTCATGATTGTTTTTGTT--ATCGCACTCTAAAACATAACTTGTTTATTACGTAATTTATATTTAAAAATAAAAAATTAGAAACAATGTTGTTTGTGTAGTAGTTCTTGTTGTCACTAGCGCTATTTCGTTTTATAACTAAAGGTTACAAATTAAGTGAGCT
>CG5794 20466030 20466141|20691 chr3R 20464424 20466946 scaffold_33 521925 524416 + 124356|1637 1749
TCAATCAAA-CAACCATTCAAGCATGCCATATCCAATACCAATCACCTAACCAATCCATCCAGCATTAACCCGTGACAAAATTTCCAAAAAAACAAAAAATCAAGATAAAAAA
TCCATCTAATCAAACATCCAAGCA--------CCACTAC--ATCGTCTAACCA-----TCAATTATCAATCCAT----AAATCCAC-------CAACAAACCAATCCAATG--
>CG31125 20479089 20479115|20699 chr3R 20479114 20480519 scaffold_33 539279 540785 + 35938|0 1
CC
CC
>Ppox 20485772 20486019|20703 chr3R 20485285 20485985 scaffold_33 546024 546732 + 20080|503 735
ATTGGTGATTCTGTTGTATTTGCGTAAGCTGGTTTTGTGAATA---GTAAAGTAGGT---CCTTTGTACATAGAAT----TTGAGTTCTGTTCCTTCTGTGTT---------TTTACTTGCCGTGGCCTCCCAGGCACGGCGGACTCTTCTCCGGCTCCTGCTCCGGTTCCCACTGCTTGGGTGTCTTGGCCTCAATGGACAGGGCGTGCATAAACTCGAAGCCTGCTTCCTT
ATTATTTATTCATTTGTAT-------ATTTTCTTTTGTAACTATGGTTTGAGTAATTTTCCGTTTGTACATTAAATTCCGTTGATTTC---CCCTTCTAGATCGAGCCGCCATTTATTTACCAAATCCACCCAGACATGGTGGACTTTTTTCCGGCTCGTGCTCGGGCGCCCATTGCTTTGGTGTTTTCGCCTCAATAGAGAGTGCGTGCATGAATTCGAATCCGGCCGCCTT
>Ppox 20485772 20486019|20704 chr3R 20486019 20488445 scaffold_33 546771 549372 + 62806|0 0
A
A
>CG31117 20493447 20493669|20711 chr3R 20493620 20495626 scaffold_33 555620 557385 + 34781|0 49
CCGCGAAAAGTGTCAGTACGGGCGACAAACTTGAATTTAATTAAAAGGCA
CCGCGAAAATTGTCAACGCAGGCGACAAAATTGAATTGAATTAACAGGCA
>CG13630 20543657 20543751|20733 chr3R 20540433 20547344 scaffold_33 610283 617172 + 163367|3389 3483
GGGTCGACCAACTTGGGCTAATACATAACTTCTAGGGCTATCGATCAAGCTTTAATTTGTAATTTTACAATAAAATCTAGAGTTTTTATTCCCAA
-----AGTCCACTTGG--------AGATTTTCT-----TTTTGATTAAGCTTTAATTTGT--TTTAACAAT-AAATATAAAGTTTGTAGTTCAAT
>Ast 20586252 20586979|20760 chr3R 20579574 20587516 scaffold_33 645865 653802 + 241013|6964 7730
GTCAATGCTGGCCACCACTCTCCCCGGATGGCGCAC-----TTATTCAAATC-CAGCCGTGCGCCATTTGACTAGGAGCTCA------TCCTAACTAATGTTATCGAAAAAGCACTTGCAAAAGCTCTCAGACTCTTCT-----CCAAACTTAAGTCACACATTCGGGAGGCAATCTAAATCTAAATGTCTGCGAATCCAAACGAATTCTTTGCACGCCCCTCGTCCCACAAATATTTATTGTATGAATCGCTAGAGCCAATGGTATTTATGTTAAGTTCTTCAAATCGATGCGTTTAACGGCACCC---------TCTAAATTATATACTATGACAAATGGCGAAAAAATCAAAAAAAAAAAAAAAAACTGAATGAGAATGAAACTGGCGTGTGCAATT---ATCAAGGAAGAAATACATATAATGTTATACGAATCTATTATATATGCATATTCAATCCAATTTAC--------AGTACTCCATATATGTACATTTTAAAGGGGCATTAATTAATATACACGCGGATTTAAACTTATATACTTG--GGGCAATCTCTCTCAGAAAGAGCGACACGAGTGGCATTCGTTGTGGTCGTCGGCGGAGGAGCACGAATAGTGGGTAAACTACTGCATACTAATATCGGTGTAACTAAGTGTTTGACAAAGTGATTACTAATTTAACTATATAATTACAAATATGTAATTGTTTTGTGAATACATGCATACCTACCCGAATAAACATAGGCGCAGCAAGTCTGCGTTAGC
G------------ACCGCCCACCCTAAAGAGTGCACGGCTGTCATCCCACTTTCAGTCGGGTGCTAGTTG-TGAGCTGCTAAAATAACTTTTAACTATTAT-ATC-AAATTGCTGTTACATGG---CTCAGACTTTCACAAAAGTCAAACTTAAATAACA--TTCGAAAACTAATCTAAAGCT--------------------GAGAACTTGGCGTGGACTTCGTTC-------ACTTATAA-ATAAAAAGTTAAC--------TTTTAAATTTTAGTTCTTCAA-TTGAGGCGTTAAACTGCAGCAACATTTTAGTTTAAACTATATTATAT---AAATGC--AAAAAATAAAATGGAAAAAATA----TGAAGAAAAAAAAAAATGGCGTGTGCAATTGAAATATGAACAGAAATACAAAGAATAT------ATTCAATTATATATACATATTCGATCTAATCAAATTTAAATAAATATATTATACATGTACATTTTAATGGGGTATTATT--ATAAAAATATTTATTTATATGTATATGTATACTGGGCACTCTGTCTCCAACATCGAG----GAGGATCAATCGTTGTAACCG---------AAACGCGTA--------AAACCAA--------AACATTAGT---ACCAAGTATATT---------------------CTATATAAGAACGTATAC--------------AATATATA-ACACATACTTGAATATGTATATG----GCAAATTTATGT-AGC
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AGAACGCACAATCCCCAGCCAAACGGAAACCAACTCAAAACTGCATTTACGCGACGTACTGA-GAACCACCAG-----------------AACTGGAGGAGAT----TCGCCCCCGATTGTAAATAAC--AAGAGCTAGAGAATGAATTAGAGGAGCACAAGTTAATTAGTTGAATTGCCGACGATAGCGAATTATAAATCATCGATGGCGGACGCATCGAGGATGTATTGTAGTAGAATGTTGCAACATACT-TGCGGCTAGGATGTTCAAGTAACGCAATTCAATATGCAAATACCCCAAAGTGTTGTAGCTTAAAGTGTACATTATTTTTGTTATACTTAGTCGTTTTATACCTAACACGCGAAGAGGCCG------ATCGGTGACAAGCATAATTTAT--------TATACACCTAACTAAACTTGTACG---------TGTACGTGTAATTGATGATGATGTTGATAATACTGTTGATTACATTGGTAGCCCAATTACTTTTACACAACTAAGCACAGCAATGTTTGCGCCAAACAAAATACCACAAACTGGACATGCCGAATTAGAAATTAATATCGAAACAGGGTCGCCCCTCCCCAGAGGTCGGGAGGCACTACACTTAGCTAAGCATTCG-TGTGTGTGTGTTCTCTGAGTGGATAAACTAGTTTTAGTCTGCATTATAATAAAGTACAAACCAAGAATT
GGAACGCACAACTCTAAAGAAAAC-CAAATAAAATCGCATTTGCATTTACGCAACGTACTGAGGAACCACCAGAGATTTGTTGCTGAACCAGCTGGAGCGCATCATGTGCTCCACTTTTGTAAATAACTGACGAGATGAATAGTAAA------AAGCACAGGTTAATTAGCTAAATTAATAACAATGATAATTTTT--GTTAGGGCGTTTAAATGTATC--TTACAAATAGTAAAAAAAAATTGTTACGCTCTGCAATGTTTACGTACATAACTAATGCAATTTAACTTAAAAATA-CTTAAAGTGTTATAGCTTAAAGTGTACAT--TTTTTGTTATAGTGA-----TTTTTACATTATACTACCAGAGGCAATGGAACGCAGCTTAAAAGCAGAAAATATAGCTCGCGTATACATAATAACAGACTTGTACATTATTAATTTAAGTATGTAATTGATGATGATGTTGATAATAATGTT---------------------------------------ACAATAATACTTTTTTAAAGC---------CAAACTGGACATTCTAATT------CTAGTACTTACCTAGCTGTGTCCTTTTTATCACAACAGGGCGCCCT--ATTTAGGCACTTATTGGATGTATGTGTGTTC-----GAAAGAAATGTAGTTTTAGCATGCATTGTAATAAAGTACAAACCAAGAATT
>CG18410 20623179 20623675|20793 chr3R 20623545 20624358 scaffold_33 378999 379835 - 30065|0 144
GGTCTAAACAATCAAAAACACTCTGTTGCCATTTAT-TAACGAAC-AGAAACGGTTCAAACAGCTCTGTTTCCGGTTTCTCCAACCGA------------TGCAATTTGGTGGACTTTAGATTTAACAATTTTTTTTTTAAATAT
--TATAAACACACAAGTGGCATAGGCTG--GTTTGTGTAACGAACAAAAAACGGTATATA---CTTTATTTTAAATACGTCAACTCAACCTTAACGCGATTACAATTTAGTAG---------TGGACACTTTCTTTTGTATATAT
>CG5807 20631387 20632132|20795 chr3R 20625757 20635216 scaffold_33 383347 392715 - 376631|5757 6691
TATTGGCGCAAGCGACACGACAATGCGTTT---TGTATAAACCGAC------------AGGAGGTGAGGCGCCTTGTCGAGTCGCCGCTAAAGAGCCTAACAAGTTTCTATACCAAGTATCGTAACCTTAGTCGTAAGAGCAGTCGCAATACCACCGCTAGTCGCAAGGCAAACGAAATGAACTGTTAAGACACGAGAAAAACATGGGAGATGGGCAGCTGAAACTATATAATATACCTTTACA-TATGTTATATGATCACGTATAGTTGTGCAGAACTGATACTAATATTTAAATTTTGCAATGTTAACTGTTGTGCTTAATTGTTGTACTTTATACAGACAGAGTCCTCACAGTGC---ACCAGCATATCACTGTGGTGCCAGTAAACAC----------------------------------AGAACAATGG------CACTCGTGTACCATGAT----ATTCGCAGAAATCTCGCCAATAACTAGCATGTAAATAGAAGATGTAATTGTGCAACATAAGCCGCAGTCAA----TTTGCAGTAGGC------GTAG-----TTTAGAATTTCGTTTCTTGTCGTTCAGAGTGAAT--------------------TCCATTTCATACATGTTTTT-CGCTATTTATC--------------------------------CACGTATATTTCA--GTTATTTTTA-----------------------TAAGATTTT---------------AACAATGTTCCTTAAGCAGCGAA-ACGATGAGGCGTGTTCATTTCATTTTACGGCATACTCAAATCTGTAACCCAATATTCACACAATCACACACTAACAAGCGTCTAAAACTTATGTGATAAAAAATAATAATAAACAAAGCATTTTA--CTAAATTAAT---------------CGAA
TATTTAAGACAGCGACGCGACAAAGCCTTGCCATGCCAGCGCCAACGTTACGCTGACCAGCTGCTCAGGCGCTTTGTCGAGTCGCCCTTTACGAGTCTAACTAGTTTATATGCCAAGTACTACGATCTTAGTCGTAAGAGTAGTCGAAATACCACCGCTAGTCGTCAGGCAGACAAGATGGACTGTTAAGA--------------GAGGAATGTGGAGGTGCAGCT-TCCGACATGAATTTAAACTACTTTATA------------------CAGAACTGATATTGATATTTAAATGTTGCGCTGTTTATTGTTGTGCTTAATTGTTGTAGTTTATA------GTGTACGCACAGCATTTAAACTGCATTTCCGCTTTGTGCGTGTAGACACCCCCACCCCCACACCCACACACACACACACTCACAGGCAAATGGAAGCTACAGTTACGTTCTAAGATTTACATTTGTGAACATCTATCAAAT--CTATTTTGTATACAAACATTGT----GTGCAACATAAACTGCTGTCAACAGATTAGGTTTAGGCTAAATTGTAGGTGTTTTTAAAATTTTATTAGTCTGAGTCTATAGTCAATGTCGATATGTTTATTCGATATCCATTTCATGCATATTTTTACAATAATTCTCGTATTTGTACTAATTTAAAGCAAGAATTTTAACGCATGCGTCTCATTGTCATTCTTAATCATAAACAAAATAATTTATTTTAATATATTCATATGTATGTCAACAATAATGTTCCTTAAATGGCGCATACGCTAACGCGCCTTTCATCATCTTTATTGCACACTAAAAACAATAAAACAACAAACGTACATATACATAT------GCATCTAAAAGTTATGTGATATAA--TAAAAATAAA--AATCGTTTAAATTTAAATTAATACAGCTTCTTTCATTTGGC
>CG5808 20640617 20640650|20799 chr3R 20639854 20641276 scaffold_33 398201 399616 - 22920|812 846
AG-ATAAACGACGTAATTAATCAGAACAAAACCAT
TGTATTGACATTACAAATAATTTAAACTA------
>CG31119 20680823 20680824|20836 chr3R 20677384 20681825 scaffold_33 236677 241104 + 123429|3649 3650
AG
TG
>CG10899 20682104 20682289|20837 chr3R 20682060 20683187 scaffold_33 241470 242609 + 13385|44 238
TGGAAGCACTTTTGGCAACTGAGGGACTCTCGTGACCAGCGCGTCCTTAACACCTACAGGGAACTGCAAGATGGCCATGACCGACCAGT---TTATAGAAGTAAAGCAAAATAAGTGTTTTAGCCAAGTGAATATCATGTAA--TATGTATTGTCCAAGTCACATAGTGTATTA----AAATTATTTTAAGTGCA
TTGCAAAACCTGTGGCTGTTGACAGACGAGCGCGGCAAGCCTCTGGTCAACAATTATCGCAATTTACAACGTCTATGCAATCGTACTGTGTATTATCGAAATGCAAGCAAATGAATACT---GCACAATAATTGAGATGCAACTTACGGCTACTCTAATGCTCATCGCTTGTTGCAGCAAGTTGCATCAA---CA
>CG10899 20682339 20682418|20837 chr3R 20682060 20683187 scaffold_33 241470 242609 + 13385|297 376
GTTCGCTTACTACTCCTCCCTGTGCCGAGGCAGTCATCTGGTTTGTTTTCCCGACTCCTCTCGATGTTCCCAAGGAGCTG
GCTCGCTTACAACACCACCTTGCTCTGAGGTCGTCAATTGGTTTGTCTTCCCAAAACATATTGAAATTTCAAAAAA----
>CG10899 20682471 20682580|20837 chr3R 20682060 20683187 scaffold_33 241470 242609 + 13385|448 557
ACAGGTATCCAGCATAACTAAGTTGGATGATTCGTGTCCTCTGGAGGACAGCATGGCTTTGCAGGACCTTTTTGCTAGCATAGACAGCCAAAAATACTTCACCTACCAAG
TGAGGCGGCAATGGTTAGGGATTTTAATAAAGCTTCAACATTCGTTGCTAATTTTACCTTAAGGGATGTTTTAACTGGCATAGAAAGGCAAGAGTTTTTTACCTATATGG
>CG13640 20687373 20687454|20842 chr3R 20687290 20688190 scaffold_22 234388 235322 - 7235|86 167
CGATTCGACCGTCTGAACTCGCATTGTTGTCAGCAGTATTAGCCATTAAAATAAAATCAGCGAAAGTTACATCTAACCACAA
CA--TCTATAGTTAAAATTTGTGTAATATACTCAAGTTAGGGCAAAT------AAATCAGTGAAAGTTTTGTTT--------
>CycB3 20694075 20694522|20849 chr3R 20694000 20695972 scaffold_22 251386 253357 - 73622|81 555
GACAGCCTCAAAGT---TTAGCCAAATTCAACATGAT------ACGATACGCTTCACTTAGGCTCTAAGACGCTTCTATTCCCAATATT-------AGCCCCATCCCGACGAAACAGCGGATCCCCGCCTTAATCTAAAAACCCCTGATTTTACCCCTTACCTAGTGTTCCCG--------TCAAGTCCTCGCAATTTATTATATTTTAATTATTATTGTGACCTTCGCATTATTGACATGTTTTTTGCATAAATATTATGTTAAGAGTGC-TTTTGTTTCTTTTTGCCATGTATTATTGTTTAATTTTCCCACATACCGCATACGTAGCCGAACACAATCAATCTAAACTCGAAAGGCGACATTATCTTTAGCACCCCCACCCAAAAAATCCCAAAACGATT--CATGTTTTAATATGTACGTTAGTCTTAAGAGATGCCAGCATTAAATAAACCTAACTCGTAAGCCACCAAA
CACTGCTGTAACGCCAATTAGCCAAATTGATAATGAGCAACAACTGTTACGCTTCAC-TAGACATTAAGACGCTTCAATCCATAACATCTCTAAAGAACCCTAT-CAGTCCAAATAGCAA-----CCCCTTAACCAAGATATTCATATATTT-----TTATTTAATTTTTTCGATTTATTTTGTACTTTTTGCGTGTTGCTAATGATGTTCTATTATTGG----TTTACATTTATGAC----TTTTTCTATAAATTTTATGTTCAGCATTCAGATTGTTTCCATTT---ATGT-TTATTGTTTACTCTTCTTTTAT----------TAAAAAAAAAAAGGCAAT-TATGCAGGGTAGCCAGCACAACTGTCACCCAACCCGACCACAAGAACT---AACCATTTACATATATAAATATAT-------------------------TTAAATGTATACTATTTATAATC------A
>CG3744 20697503 20697673|20853 chr3R 20697245 20698312 scaffold_247 2584 3488 - 23811|273 443
GATTCGTAAATGTCAACAGCCGAAACAAGATCGCCTGCTTAGGCAGTAAAACTAGACCCGCCCCACGCCCTCGTCCCTTTGCAATAGTTTTTTACATCATTGTCTTTGTTTTTATTTGAATTTTTGTTGTTCGAACTATTGTTTTTATTCGATAAAGAAAATGAGAGAAAA
GATTCATCAA----------------------------CCAGACAGTAATA--------------------CACCCTATTCTAATTACCTGCTGTATCGTAGTTGTTGTTT-------AGTT-------------CTCTTTTTTTTATT--ACAAAGTCAACGTCAATATT
>CG31121 20707180 20707323|20862 chr3R 20707168 20707577 scaffold_13 1604729 1605120 + 15770|13 168
GCAGATACCGTGACTGGGAGGGGAGCTGGCCAGGATCTGGAGTTTAGATGGCACAGGCTACCGAACTGTACATTCCATAGAAACTAATTCTTGAAATAAATAGT------------GTTTAGTCGAGGCAGTGTTCGTTTAACTAACTAAAGGCAA
--------CGCTACT-----AGGCACTCACTTGTAGCCGGATT---------------CATCCAACTGTACATTAGTTAGCAACTAAATTTCTTTATAAACAATAACAAACAAAAAATGTAGTCGAGGCAGCGAACGTTTAACTAACT-AAGGCAA
>CG31120 20741562 20741675|20898 chr3R 20740882 20744503 scaffold_13 1646614 1650349 + 93916|839 985
CATGTGATCCTGTTTCACAACATGC---------------GCACAATTACTCGTCAAGGACTATTAACATTCATACCGTTCTCCTG-----------TACAGA-------AACTAATTTACATAATAAACTTTATAAAACACAAATC
TTACAAGCAAATTTTCCCAAAATGCCGCCGCACATACAAGCCACAATTTGTTGTTTA-GACTGGCAATGCACAAATGTTTTTTCTGCTTAAGTTTACTAAAGACTTGCGTGAATGTTGTTTGTACTCAAGTGAGAAAAGCACTAAGA
>Osbp 20760589 20761120|20906 chr3R 20760885 20768288 scaffold_20 109879 117628 + 246037|0 247
ACAGCAGTAGCCAACGGAGCAGCCAAGGGAGCAACTGCAGCCACTACCACACATAGCAGCCTTAGCGAATATTCTAAAGTTTTCAG---ATATCCAGCCTCCACACACAACTAACACACCACAGCGGGACACGCTCCGACTGATTT-CGGAGCAGCACATACGCATATTGTAGTACCACACTTTGATCT-----AGAGCATATTTATATATATATA---TATATATAAATTAATTCCTGTAAACTAAC
ATAGCTGAACTCTATGTG--------------------AATTATTTCAATACGCA--AGCCT---CGAAACTTC----GCTCTCAATCCCTAAACAAACAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATAAAAGAAACAACGCCCCAAGACACTCACAGTCAAGCATAAATAACTTTTACTGAACTATAAACTAATCGATGTAATAACATTTTTTCAACTACTTAGTGCATATATAAATTAATTACTGTAAAGTAGC
>ssh 20764425 20765150|20906 chr3R 20760885 20768288 scaffold_20 109879 117628 + 246037|3735 4773
AGGCCATGCTCTGCTTAACAACATGCTAACT---------------------------------------GCAAACTGCAACATTCACATACCACTTGCAACTTGCAATCCATA------------------CCCTGTAGCCACTA--------------AGGATCGTCCTCATCCTATCGCCTGCTTTACTTATTTATATACTCGCCCGCTTTC---GACCATTTTGTGTT----TTTTGTCCAACAATCGAACACCACCACCCCATCCATCCCCTCCATCATGCCTCGTGTTTGTT----GTCTTGT-----------------------TGTGTAAGGCGT------------------CCATGAAAGCT-------TCTAAAGATCTTGTGTCTGCAATGT---GTGAATGGAACTATTAAGATGACAAGAGAGGGCAAACAAAACAACCTATGGAAATGAAACTGTATTT-GTACTTTTAAATTACTTGTAACTGTATACATAT--TTATTTTATATTATGCAAGAACTGCCTACGAATAAACGATTTATTGTATATACGTCATCGTCT---------------------------TGTCTTGTGAGTGTCC----------------------CTGTGCC-GTCCATGTGCC-------------ATTCACACCACAACTCCC------------------------------------------ATGTGTTGCCCAACAAACACTGCCCTCCGTTTTTAC---CAGATTTGTATTTGCAGCCTTATCCACATGATCCGCTCCTTCCGCTACTCTTGGGCGGAGTACAAGAAGTGATCCGGCACATGGAGCACCGACTGCCGAGGCCGCGGCCCAAAAGTTC----------CCACCTTGAACACTTGTATTTTTTGCCA-TTTATCAGACCACATATTT---------------------ATAAATAAAAATGTGTAATCCA----------------------ATTTCGAGCGC---------------AA
AGGA-ATGCTCTTTCTTACTACACACAATTTCTCTTTCTCTCTCTATTACTCTCTCTCGCGGACACACAGACACACACACACATACAGACACCCATATTGACACAGAACTCATAAAAATAGTAACTAAGCAGTCCTAAAGCTATTATTATTTTTGCTTTTCAGCTCGACACTTGCCTATTATTTGTATTAATTATATGTATTTTTGCTTTTATTCACTGTTCACGTTGCGTTACATTTGTGTCTCTCTCGCCGACGCGCCTCCCCACCCCATTCTCTCACTCACTGTCTGTCTTTATTCAAAGCTCTGTACGATCCATCATTAAATTGTTTATTTGTGAAGCGTTTGTTTTAGTGATCCTATCCACAGAACCCACATCCATTTCAACATCCAATATCTG-AATGTTTTGTGAAAAGTGCCGTCAGG--GACGAAAAAAGAAAACAAAAACAAACTATGAAAATGAAACTGTATTTTGTATTTTTAAATTACTTGTAACTATATACATATATTTATTTTATATTATGCAAGAACTGCCTACGAATAAATGATTTATTGTATATATATGTATGTATGTGTATACACATATGTATTTCATGTGGTGACTTGTGTTTGTTCATTCGTTCGCTTCTGACTCCACCTGTGCCTGTGCCTTTGCCCGTTAACTGACTCAGTCGCATTATATTTGTCTGTCTATATGTGTGTGTGTGTGTGTATGTATGTATTTATTATGTGTGCCGTCCAATGAACTTTGCCATCAGCTTTTACGACCAAGTTTGTATTTGCAGCCTTTACCGCATGATAGCCACGTTTCGCTACTCCTGGGCCGAGTGCAAGAAGTGAGCC------------ACCGAACCTTGATGTCACCCCACCTATGTTCTTTTAACGAGCTATCCACGAAACATATTTAATTAATTAATTTATAAAACTTGATATGTTAGTAAATTCGCGATACCAATATTAATAAATATATTTATTTTATTGCCACCAAGAGAAATGAGTCATTGTGAGTGTGTGCGTGTATGTGTGAG
>CG11781 20850193 20850256|20987 chr3R 20848770 20850665 scaffold_20 201564 203455 + 69151|1500 1563
-GCATTTATACAATACAACACACTATAATAGCGAAATAAACATAGGATCTTTGGTTTAACACAA
TGCATTTCCTCCATGCAA---------ATAGACAAATAAACATAG---TTTAAGGTTCGGAAAA
>Smg6 20855145 20855500|20989 chr3R 20853627 20855865 scaffold_20 205959 208212 + 72950|1608 1994
AAGCCGAT-TTGCGCGGCGAGTGG-ACCG-GATAACAATTGGAATGGACTTGCACG---ACGCACATTGGTGGTGCGGAGCGAGCTCGAGCTATT-ATATTACCTACATTATACATAAATGACTATGTAAGACGGGGTCGGCAGATGCGG---ACACATACGCTGGCTGCGGATACGTACACGACGTGG----ATTTCTGAGGACTGGTCGCGGGTACACATGCGCGGTTGCTGTGGTGTTTCCCCGGGTTGATGC-TTTAACGAA---GCACATCTCTCGTTGGTTTCCAAACATCT-----TATTTGTTTTTTCCT-----ACTTCGAATTTTTATTTTGTGACTTTCGGAATTAAATTATTTTGGATTGT---TGTTCAAAATC
GCGCCAACATTGAAGGAATTGCGATACCGTGCTGACAATTGTATCAGGTTCATCCACCTGCGCATGCATGCTGTGAAGAGCGAGCTTGTACTTTCAATATTACCATCATTAGACATATTTGACTATGTATGTTGCGGCCAACAGCCGTAGCACACGTAAACATGGGACGTGGCTCTGCGCTTGAAGTTGGAGCATAGTTATGTGCTGGTTTTG----TTCGCGTGAGGCTTTTGCCAAATCGATTCGGCTTGAAATATTTGGCCAACAGACATATCAACATTTGCTTTCCAAATTTTTACATACATTTGTGATTTGCGTTAAAACAATAAAATAAAAATTGAAGGGTTGTATAATTAAATTTGTTGTTAATATATCGGCTCAAGTTG
>CG6422 20859866 20860303|20991 chr3R 20859741 20862288 scaffold_98 2170 4700 - 63234|125 600
ATTTACTGAGCTGCTGCGGTAGAATTCTTTTTTAAATG----------ATATTGAATGGACTCCCACAATCCGTTGAATTGCTTAGAGACGTTAAATTATAATTTTTAGATTTTTTAACCATTGCGTGTAC---------------AAGATAAAATCCCGATTCATGGCGAGCATATATAACGAACATGTGGGATCTAGGATTAACGATTAAAGTATGATAACATTTTTACGTAATTATTTATTACAATATTTATATAAATCTATTGACGCTCACATTGAACAGTTCATAAAAAAATTAATGATCGATTTTGCCGATATATATACAACATTTATAAACACCAAGGAGTCTGCTTCAGCCATTCCTTGTAGTTGCACTGTAACAATTTATACAACTTATTTGA---ATCTAAAGTGTACACGACTTATGTATGTATAATATAATTAAAGTAACCA----------ATCCATCAATTA
----ACTGAGCTGCGGAAACAAA----CAATTGAAATGCGTCTGATGAACGTTATATAGAATCCT-CATGCCAATGTGCACCTAAGATTCGCT-GATTTCATGTTTAAGATTTTTTAA-AATTCTGTGTACAAGCAGTTAACCAGAAAGATAAAATTAAGCT---------GAAAATAAAGCCAACAACCGGTAATTAGGTATAAATACAATAATATGATAACATTTTTATGTAATTTATTATTA------TTATATAAATCGATCGACGCTTTCATTGAACGGTTCATTCGAA--------TTTAATTCAATCGATTTGTACACA--ATTTAAAGTC----AAGAGTTTACTTGATTCATTCCTTGTAGCTGCACTGCTAATATTTATTTAACCTATTTCATCTATATAAAGTCTAAAC------TGAGTATGTGAAATAATTACAGTTTCAATTTTCATTATACCCATTGTTGC
>CG31110 20866149 20866540|20995 chr3R 20865700 20866723 scaffold_98 35902 36751 - 13250|453 862
ACCAGGCGCTGAACGACGAAAGCCTGTGGATGGAGCAGTC---CGTGGTGGACGATTCGAGTGCATCGAACAGCTCCGCGGCCAAGTCGCGCTATATCTTGATGAAGAAGGGAACCACAAGTC----CGTGC--AAGGAAGACACCGACGAGGCAGGCGCTTTGGCCGCCAAAAGCGACGGACTGGATACAGAGAGTGCAATGTTGCTGAAGGAAACAACCGTCTAAGGGAATCGCAATTTTTAACTTATGCCAGCTGAGCCAATAACTTGTACCGTGTGGTTTTGTGTTATGTACCTGTTATGTTAAACGCGTCCAATACGAGCTATTTATTTGTCACACCGCCAAGAAATGTGGAGAGCAGTCGCAGTAATAAAATATACATACGTGGTA---------GTTGCATTT
ATGAAACCTTGGTAAACGAAAGTCTCTGGATGACACAATCGAATGTCGCAGACGGT---AGTATTCCGGGGAAACCGATATCCAATTCCCACTATGTTATAGTTAAGGCAATATCTTCAAATCTGAACGTGCCTAATGAAGACACTTGCGTGG------------------------GCAAGCTAGAAACTGATGGAGGTGTGCTGCTTAAAGAGACAACCGTTTAGAGAT------------------TGTCAGC------------------AGTATGG----ATATTACCAAATGAATATATACACCAAATCCCAAGTATTATACCTATTCTTAATAACA--------------------TTGTGTGAATAAAATAAAAATAGATAATTTATTAATTTGCTACACTT
>CG31112 20884800 20884996|21017 chr3R 20884518 20885553 scaffold_300 11741 12660 - 6994|287 487
CTCATGATCGAACCCAGCCACTAACCGATCACTCCACTTTTTCAATGTTTTTCTCTAGGTGCAAGCGAAATTGAAATTTTTGGCAAATACTCTCTGGCAAATATACAATTCGAT---ATAGACGCACATATTATCGAGCACGATCGG-ATGCGCTGGTGGACAGATCGTGGACACCCACGGACTCAGGAACACCGACTGGA
CTCATTTTTAAA------CACCAAGTTGTCAATCTCTGTGTAAATAATTTTTTACAATTCGCACTTTAGTGTGTACATGATTATCATAATTTTTCTGTAAATATTTGTTTTTATGTCACAGTTGATTTTGGTATCGAACTAAATCAGTATGCTCTTTT------------------------CTCATGTATCTTTACATTT
>veli 20890134 20890368|21026 chr3R 20890110 20890524 scaffold_49 600269 600669 - 10103|24 269
GGCACATCGGCAAAAACTTGTGCCATAGTAGTTTTTGCCATTAGACCATGCTGATATGCACGTATCAAGCCCTTTACGAATAATATAATTTAA-CACAAATACCATTTATA-----TATTATTTATTACAAAGAAACTCTGGAAAATTACTCTTTAATCGTAAAAAGTGAGTGTTATGTATTTG---TAACTAATTACCGCGTTGGTTTTTGTTCCAATAAATGTAA--TTAAAACTGTCAGACAA
AGC----TAACAAAAATGTATCTTACAATTGCAACAAACATTTTAACATGCT------------TTAAAAATCTCAATAATAACATAATGCGCTCTTTAGTTGCAGTTAAAAGGGTTGCTGCCTTATATTATAAAAATATAAAAAACTAGAGTAAACTCG-----ACCAAATATTATACATTTGTTTTAACTAA-AATTACGTATGGATATATT---ATACTTTTAAGCTTATGTCGGCTGAACGA
>OstStt3 20892434 20892728|21030 chr3R 20891731 20892436 scaffold_44 414146 414830 + 15815|706 708
CTT
CTT
>CG13650 20934945 20935091|21078 chr3R 20934500 20934946 scaffold_74 31392 31839 - 5845|478 479
AA
AG
>CG13650 20934945 20935091|21079 chr3R 20934947 20935241 scaffold_74 154577 154891 + 6006|0 170
ATA--------------TTATTTCGACGTCAACTTGGACTATCTA------CTTTGTCTACGATCCCAATTGAGTTTAAAATTAGTAGCTCTAGTGACTTACCTACTAGTATTGTTTTCTATTTTAA------ATGTAAAATGTATATTTTAAATAAATATACTGTTAATA
ATGAAAAATAAGAGTATTTACTAAAAATGAAAATTAGTTTTTCAAAAGAACCTTTGTAAACAACACAAATAAAG----AAAAGAACAACCGTATTAAGTTAATTGCTGAAAACGTTTTAATTCGTGGGTAATCATTCAAAAACGGAATATTATATTAATGTTGTGTAACCA
>CG31108 20938587 20938929|21085 chr3R 20938557 20940926 scaffold_74 42249 44602 - 90428|31 396
AGCCCGAAATCGATGGG----AGAGGTTTTTAATCTAAATAGCTAATTTGTCAAGCTTTTGTCCAGTCATCCTATTGTAGTAAGTCT----AATTATTTTTGTATTCAAATTTT---CGCATCAAGGCAGAGGCTTACACAAATAAATATTTATCGATAAACAACGATTACTTGAATGTAATTTTTGAAACGCTTTATTAAAAATGAAATAGCTTTTATATA--------TTACAAAAAAAAAATGGTCAAATTTTTCTGCCTACACAACTCATAGCTTT----AAAAACTTAATATACATTCTACGCCAAAGATATATGAAATCGATACTTCGAAAATAAACGTGAAATGCACAAAACTATGTAA
AG------ATCAAGGAGCACAAGAGATTTCAAATA-----AGGAAATCTGCAATTTATTTATCTAAATATTCT-TTCTAAAATCTTTGAAAAATCTCTTTTCGATTTGAAAATTAAATACATTAAGGCTG-GTCTTATAAAAA---------ATATGAAAAAAAC----------ATGCCGTTT---AAATTTTATATAGTTAATTATATGCATTTTACGTATATTTAAGTCGCATAAGAAAATTAACCAAAACATTTAG----TATAATCCTTAAATTTAAGCAAAAAATGATTGAAAATTGCAAACATACGGTTTAGTAAATTTACATGACGCGAA-----GCAGAACTGACAA---TATGTGA
>CG31510 20943147 20943298|21087 chr3R 20942953 20943421 scaffold_74 50214 50688 - -499|198 355
TAGATAGTTCGTAATGCGGTTAGATTGATAAAGAGAACATACATTAAACCCACAATAATGTATTACATTTTCGAATTAGCTACATTCTTCAAAAA------TTTGTACAACATTTGAGAAATGGAATGTAAATAAATCGATTTTATAACGGCAGCCAA
TTAAGATGAGATATTGATATTATTTTAATGTTATGGATTGCCATTATTTTTAAACTACTGTTTTATAATATATATTTAACCATGTACATAAAATAACGTGTTATGTTTAAC-TATAATATATAAAAAAACAAAAAATTAATGTTTTTATGTTAAACA-
>CG10238 20951354 20951373|21095 chr3R 20950921 20951368 scaffold_74 63112 63470 - 3833|435 449
ACCTAATTAATTATT
AGCTGATCAAAAATA
>CG10238 20951354 20951373|21096 chr3R 20951369 20952616 scaffold_74 66167 67374 - 22828|0 4
TAAAA
TAAAA
>Cad96Ca 21023289 21023700|21171 chr3R 21023238 21023645 scaffold_27 1322417 1322842 - -2629|51 446
CGACTTTGGGACATCTGGTTCCAGTAAGTTGATACTCTTACTTGAATTTGCATACAGAGAGAAGGTTTACACTGCCATTACGAGTCGCACTGCAAATAAATGT-----ATCTTTTGGATATTTGACACGTCGAAATGCCAA-AGTGTTTAGCACTATCTTTGAGTTTCGGTTGAG----CGATAT---ACTCCAATGCAAAGGCCGTTGTAATTCCTCTTAAACTCTAAGTTGATTGCATTGTTTGCGTTCACGTTTTATTTATTTGAC-------------TTGTATTATGTAC--TTAATTTATCAACCGTGTATAGA---AGTTATACTATATGTA--------ATTTATATTATTGTTAAACCGAAAATAAACCATAAATATACACCTAAAA
ATATATATATATATATATAT---ATATATATATATATTTATATATATATAGACGTATATAACTAATTTACA--ACAATT--TATTTACATACATAATTTATGCGATAAGTTTTTTGTAAGCTTAA-GCGAAGAAAACCCAACACAATCAAGCAATGTTAGTGAGTTGCGCCCCAGCTAACGATCTATAACTACAATATAACGATATATACATATACATATATATACATAATTACATACA-TACATACGTACATTACATAAACATATAAACACATATGCAGCGTTGTGTAGTTTACTATTACTATTACAAAATTATATATATATATTTGTGTTAACTGTAGGCTCGATATTTATATTGTTTGGCGCCCCCAACTCAACCAATTGTATACAC------
>Cad96Ca 21023289 21023700|21172 chr3R 21023646 21024140 scaffold_74 180881 181390 - 21468|0 64
-AGGGTGGCCCCCAATGCACTGA----------ACCCGAACCCCAAGAGCTTTATTACCTCCAAA
CCGGTTGGTTATTTATGCGTCGGGAACGGCTTTGCACTGCCACAAAGAGCTTTATTACGTATAAA
>CG10420 21059356 21059766|21215 chr3R 21058488 21059506 scaffold_3 5092912 5094111 + 8722|1135 1287
AGCACATCAAAATAATTATGTTGTTACACGTCATTAAACTAGCAAAAATTTGTATGCTACAGAATTGTTCTCCAAACAGATTATGAATCCTTAAAGCCTTAAGTTCTTGTTTATTGTAGCTACAATAATAAAG--CAATGACCTAATGTTTAA
AGCACATGAAGTTTAGTATATAAATTAAAGT-ATTGAACTGATTCTAATGCATAAGCTG------------------AAATTAGTACCAATTTAAGCCAAAA----TCCTTTAATAAAACCCCCGTAGCAAGTGCCAAAAAACTACTCTTAAA
>bam 21068761 21069244|21227 chr3R 21068395 21068872 scaffold_3 1536749 1537195 + 2693|379 490
AATTTATTTTGCAACTACGTTTTATTTGTATGAGGAACTTACCAGTTTTTCTTATTTGCTTTGCATTTGTATTTTGAAAGTCAAATAAATATTTACGATTTGTGTTTGGACT
AATTTATTTTGCATTCAT-TTTTGTTGCTACTTGTAGTTTAAT-GTTTTTACTACCTACCTACGATT----------AAATCTATAGTTTATTTAAACTTTGTGTTT--ACT
>bam 21068761 21069244|21228 chr3R 21068878 21070803 scaffold_3 5109757 5111763 + 15289|0 429
ACTAATGCTGTGCACATCGATAAAAGAATGACAGCAAATATGCAATTTAAAAAAGCTACTCTTCTCATGGGAAGCAATAATT-TCGTAAAGTA-------AACATATCTATAGTGTAAGATATATTTGTCCAATAGTGCGGACTCCATATTTGTATTCGTGAATA--AGCTTATATA-AGCTTTTTAAAAA-----TATTTATCAAATCGATACAAACAA--AATCAAAATGAAA-------------ACGATTTATTACCCCTG-TTTTGAGATTGATAACAAATTTATATAA---GTTTAACTGT------------GTTTACATTTATTTGGCAAAACT-----ACAAATGTGTTTGCTT---------TTCACTTTTATAAATCTGTATTTTACTTAAACTTTAGAAATAAGAAAT--CCTTTAGT
ACAGAGGTT----AGAGCGTTGGGGAATTGAGACGAACTATTCAAATTAA-----CTAATCAAAACAAACAAAACGACAGTTATCGTCTAATATATACAGAAAATACAAATAAT-TGATAGACATTT---TAATGGATTGCA-TCAATATTTATAATTATCACTATTAAATTATCGACAACTTATTGGAAAATTTATACGTATCAAATGTAAATGTACTATTAACCAAAAGAAAATATCTTGTATTGAAGAAATAATTATACATAATTTTCGCATTTTGAACATATTTACAGAAACTGTATAATTGTTATACATTAAGAATTTATTTTGATTTTAAACGACTCATCCATAATTGTAATTATTAAGAGTCGTATTAACATTCTTAATTTT---TGCCAGCCAAACAAGAAGAAAATGTAATTACATTTAAT
>RpS27 21071674 21072074|21229 chr3R 21071916 21072232 scaffold_42 366326 366672 - 10808|0 188
AATGGGAC---TCGCGATGAACCACAAATTATTAATTTTTTAATAAAAACTCT-AAAACGTAAAGAAACCACAGAACC--------------CATAC-------GAGAGAAAGCTTGTAATTCAATTGCTGCGGTCCTTTGGTTCATTGTGCTTTGTGAATTA-----AAGAATTAACGATGTTGTGGT
TTTGGGGCGCTTCTCGATGAACCACAAATTATTAATTTTTTAATAAACACTCTAAAAACGTAAAGAAACCACAAATCCGTTGAGCCCTTTTTCATTCAAACACTGACAAATTGCTGTCAATTTATTAGGCGTCGCATATTTGCCAATTGGATTGTGGATACAAGTGACAAGCAACAACAACATTTCGGC
>CG10425 21086678 21086977|21241 chr3R 21084628 21086713 scaffold_35 109955 111963 + 48788|2179 2214
AACAAAAATAAAATGTATTTACTGTTCAGAAAATGA
AACAAAAACAACA---GTTTAAAAAGACAAAAATTA
>CG10425 21086678 21086977|21242 chr3R 21086724 21088125 scaffold_17 2131970 2133399 - 51823|0 275
AATCTCTCTTGTCCCGCTGCCCTTAAAGTATTCC---CAAGTGCCCA---TAATTAAATCACTTTTTTATAA---TTAATCAAAATGTGCGATTGTTTTGCATGG-----------TTAGCCTATTCATATATTACAATTCCCGTATTATCATTCATTTTTATATATATATTTGTATGTGCATTTGAACTTTTTTATTATTGCCGTGCTAGGGTTTTAACTATTTGT--ATCGTGTTTTCTAGACTAGATGACGTGTGCTCGTTTTGTTGGTGTGT
GAGGAC-AATGACATTCAGGAATAGAAGCAACCCACATTAGTGCCCAATCCATTTGGCACACTTATTGACTAGCCGCATTTAATATTCCATGTTGATCAGTACAGAAAAATCGCTTTTTATCTAAACGTATATTCCAAAAGCCTTA-AATCAAACAATTATAGCT---------TACGCATATTTCCATTTAATTGTTATT-------TACGATTATTACTTTATGTTAATTTTTTTAAATAAACTATATG--GTTTGCTTTCCATGTCAATGTTT
>Aats-gln 21088988 21089059|21243 chr3R 21088529 21091403 scaffold_15 1708528 1711400 + 142903|462 541
ACGGGATTTCGGGAACCCACAAATGAA--------AAGAAACAAAATCCGTATCACATTAAAATTCGATTTATAAAATCA
-------------AATAAACACTTGAATTTTTTTTACAAAACAAAAATATGCTCACAAT-AAATAGGATTTATAAAATCA
>CG10513 21101514 21101582|21264 chr3R 21101319 21101582 scaffold_3 1671832 1672119 - -496|212 315
ATGGAAGCCATCATATACTACGAGTATTTGATAAAAAA----------------------TAAAAACA--AATTTTATTTTG-------AAGTTAAA----ACC
A--------AATATATAATACATATTTTTATAAAAATAAATTGAAGCGACCCTATTATGTTAAAGGCATTGATGTTATTTTGTTTTATTAAGTTTAATTGTAGC
>CG10514 21104149 21104226|21266 chr3R 21103956 21104225 scaffold_3 4777783 4778064 + -167|211 291
AGATTATTAGGATATGTTTTATTGGGCTTCCACGTTTTATGTCTATAAGTTTAAATAATAATAAACAAT----CTCATTTT
ATGTAAATGGAATTAACGTTTTTAG--TTGCATAATTTGTA-----AAGTTTAAGAAATACTTAACAATAAAATACATCTT
>CG10514 21104149 21104226|21267 chr3R 21104226 21105238 scaffold_3 4780504 4781520 + 46350|0 0
G
G
>CG31102 21119180 21119379|21279 chr3R 21118870 21120561 scaffold_41 304701 306315 - 44646|314 522
AGCGGTTCAAGTCATTACTGTTAAAACCGAAATTAAGTATATGAATTTGTATTAAAGACTAAAAATGTATACAAGTAGATCGAT-ATATATATATATTTTACATACTTTATCCCGTTTGGACTGTAACTTCTTTTACATCATAATTTAATATGTTTTCAACTATCAAAACAAATATAGTA--------AACAGCATAGTTTCAGCAGAT
GAAATTTATATTTATATTT------ACTTACCCTTGTTGGACGAATTTCTCCTA-------------TCTGTAAATATAGCAGTCACTTTTGGCTATCTTGGAAGATTTATCT--TTTG---TTTAGCTGCGACAAAGTC--GGTTGAATATTTTATCAAA-ATCAACCGAAATAGAAAACAATTGATAATAATGCACTTGGGGCCAAT
>CG10550 21132128 21132226|21299 chr3R 21132031 21134115 scaffold_41 312786 314790 - 46586|108 211
CTTTAATCCCGGATCCCAATTGTGGTGTAGCCAATTTGCTGTGATATTA----TATATCATAGGCGCAAGCAATAAATACGAATTTGATTTAATTTACAC-GTA
CTTTATATATGTTTAATCATTG-----------------TGTGATACTAATATTACATCATA----TAAATGAAATAAAACAATTTCCTGTACTTTGTACTGAA
>CG31099 21135148 21135257|21301 chr3R 21135129 21135228 scaffold_1 6817428 6817521 + 1320|19 102
TG---AATGAAAGAGATATTCATAGACTGATAATTGATTCAAGTACAATGCTCAATAAACTTGATTAGCCGCCTTATCAATTTT
TGGCAAATATTTTGAATATGCATTGGCCAAC--TTTATT-------AATGCTTAGTACATTTTATTGTCCACATTATTTATTTA
>CG31099 21135148 21135257|21302 chr3R 21135229 21135735 scaffold_41 317311 317764 - 4585|0 28
TCATGAATTAAGGGTTCTCGACCATTTAA
TAATTACCAAATGGTAATAAATTATATAA
>CG10560 21144272 21144348|21318 chr3R 21144034 21144475 scaffold_41 326525 326983 - 10|243 331
AATATCAAATGATCTCTTAAAATTAGTCTA---------TTTGCAGATATCATTTTTAC-TTAGAAATAAAT--TAAACGATACAAAAT
AACATAAGTGTTATTAAGAAAGTTACGCCAACATTTTATTTTACAAAATTTGTTTTTCTATTAGACATATATACTGTTAGATGCATGGA
>CG10562 21146774 21147004|21322 chr3R 21146745 21148393 scaffold_41 323949 325629 - 43723|31 292
TGCCGCCAACGAAGTGATTTCAATTTTTCACGATAAACAATCGAAATTGAGTCAGAACAATGTG-------GGGCACTATGATAGTGCTATCAGTATCTGTGCGCGATAATGGCAACGAGTATAAATAAACCTTTAACAATAAAAGACTTC---------AAACATTTCACCAAACTTGTCATGAA------TTTCGCATT----TTTAGAAGGAATGTGGTCATGATAATGGGAA-CCAATGT---TTAAAGTTAAC-TTA
T-----------ATGCATTTCTATCTATTA--ATATGTAATATATATAGAACACATATCAAGTGATCGATAGGTGATTTT--TCGCGCTACCAGTTTCCATGAGTCACAACT----------TAAAAAATACGTGACCATTAAATGTTTTCTACGTTGATAAGAAATTTACTCAAGTTATAATAAAATGATGTTTTGTGTTGGGATATAAAAACTGTTTTTTTATCATTGTGGAAATTCAATATCCATCAAATTTTGCATTA
>CG10675 21155246 21155414|21329 chr3R 21155122 21155361 scaffold_11 2983532 2983792 + 334|138 263
TATTGTATTGCATTCATACAAACATGTTGTTCACAAACTATCTCAAAATGCTAGGTGTTAGTATAAGCTAATACGAGAGGGTTTTTTTAAATAAATG--------TGCATAGTTTTACAA--AAAA
TATTGTATTATTTATTTATTTTTATTTTCTTTATTTCCTATATTGCA--TCTATGCATTGGAATATGATACC-CGAGCTGTATTTATTGTGTTCATACTGTTGTTTACATACGTTTTAAGTCAAAA
>CG10675 21155246 21155414|21330 chr3R 21155362 21158451 scaffold_41 330117 333210 - 71077|0 57
ACGGAGGATGCAATGATAAACAAG-----TTTCTAGAGAACGAATAGTGTAATAATAA
ACAAAGGGTCCAACTATGAATCGACCTTTTATCCAAAGCACATATTCTATACCAATAA
>CG10669 21157379 21157496|21330 chr3R 21155362 21158451 scaffold_41 330117 333210 - 71077|2149 2291
ACTCAT------------------GATTTTGAAATGGGTCATTTGTATATTGATTTTATTT---CTATGTAATACGTACGTAAGTAATGACGAATTTTCTATTCATCAGCCAAAAATTAAAA----ATTATTTTTAAAATAAT
ATAAATTTAAACCAAAACTGAACAAATTACCAAATAAAACA-TTGAATGTTTAAATTAATTAAATTAAGTAATGTACAAAAAATAATTCTCAAAAAATATTTTC-----TCGCAAATTCAAGGCATATCCTCTTGAGAAAGTT
>Fur1 21173090 21173324|21339 chr3R 21173275 21174193 scaffold_41 353299 354196 - 9657|0 49
ATAATCAAAACAAGTTATTAGTTAGGTCATGCATTTAGCCATCCTCATAA
CCAGCCAGCATCC-TTCTTAATTAAAAGGTGCATTTTGAATAGCTCATGA
>Fur1 21177466 21177728|21343 chr3R 21175960 21177927 scaffold_41 356015 357834 - 23658|1609 1934
TTTAGTA----------------------------ACAAATGACGGTAAAAAAAAAGAAAAGAAAATC--GGCAACAGCAAAGA----AACAAAATTGAACT---GTGTAAA----GAACGAAAAACCGAAATGAGATGAAAAGC-----------GAACAAAGAATTTCCA----TTTAAAAAATTTGATGGCAACATTGCGAGAAAAAATACAAGTAAAAATAAACAAAAATACAAGTAACTTAGATTAGGCGAGCTGATGAGAAGGAATCACTACAAGTCCAAAAAAATATACATACTAAAAA-------TTTTGTAGTTAAA
TTCAAGAAAAACTATTTTGCAAAGCTGACAACAACATAAACAATTGTAAAAACAAAAAAACAAAAAACAAAACAAAAACAAAGATGTGAACAAACTTCAATTCCAATTTAAAGTTTGATCAAAAAACAAACATTAAC--AAGAGCATTTTGTGCTTAATTTAAGCATTTTCAAAGCTGGCAAAAAATCAATTGAACAATAGCAAAGTAAGCAACAAAAACAAACATG-ATAAATAAGCGTAGAAAACAGAAAACAAAC--ATAAAAATAAAACTCTGCAAGTCC-AAAAAATAAATATACTAATAAATATACTTTTTGTAGTTCAA
>CG11910 21206785 21206978|21382 chr3R 21206684 21206836 scaffold_41 399317 399451 - 1488|102 153
GACAAATTACTAGAACCAATAAAGCACTTTTTGGAACTCTAGGGAAAACCAA
GATCATTTATCAAACTCAATCAA-CACATAAAAGAATGTTATAGAAA-----
>CG11910 21206785 21206978|21383 chr3R 21206837 21207457 scaffold_41 400209 400871 - 28079|0 179
CCGGAATTGGATTAAATTCCTTGCAATATTATTCAAATCATA-----TTTAATCCC---------CTTATTTAATCAACTATTTAATCAAACAT--------CAAGCAATGT--------TAATCGTACTTTAAGGAAT--------TTGACACACAAAAGCAACATATTGATATTTTAA
CTAGAGCTGAAAGATAATATCTATAAAACCATTAACAAGACGCGCCTTTTATTCCCAGGCGTGCGCATATCTAATCAATTACAATATCATGGATATATTATCTATTTAATATCCTATATATAATCGTCTTTTAAGAAATTTTAATAATTGACACAAGCAAGCCACTGACTAACATTTAAA
>XNP 21303584 21303977|21495 chr3R 21303523 21306062 scaffold_27 470130 472820 + 108576|91 589
AATACCCGAATC-------------------GAACCAATGC---CGTGGTTACACCCTTTAATTTA----ATCGTAGGTAATTCGTCGACTTTGTCGATATTTCCTGTGGACTAAAGTTACAAATGTGGTTTATCCT-------ATCTAATTACAATT------------------------------ACCAATTACCC----------------------ATAACCGAGCGCATAAGATTATTT--TTTCGTCAACTCAGTTAAGTTCGAAACTGTCCTAATTCATGTGTAGACTTACATTAGATACAAGTAAAAACAACAAAATATACAGCATATGATTTAAATACATATTTACACG-ATATAGATCATG-GCTATATACAAACAATTCT--------------GCGTATCCGGCTAGGACAAGCAGAATTACAATTATTTAACACGCGACATAAAGATAACAAA-AATAAATGGCACAG-ATATTATAATAAATGC
A----TCGGATCTATTTATGTATAAGAAGATGAACTTATGCGCACATAGCGACTCACGCTAGAGAGAGGCAGAATTGGGATTGCGATTACTTGGC--ATGTTGCC--TCATTCAACATTACATATGTGTTTTATTTTTTTTTCAATTGAATGTTAGTTAATTGACGCTTTTATTTTCATTGGAAACAAAACAAATAGCTTTGTTTTCATACATTCATGAAAATAGCCCAA-GCATAAGTTTATATAGTTTCTATCTCTGAATTAAGTTTAAAACTGTCCTAATACA--TTTAGAATTATATTAGATAT------TGATACCAATACACAC------TCACACAAACACACATTAGCGTGCAAACATATAATGAGTTATATATACATAGATATAATAGCTATTAAACGCGATCTTTACTAAGGTCTACAAAATT----TAACTACACACGCAGC---AAAATAACAAACAATAAATGGCACAGAATACGAATACGAATAC
>Dhap-at 21311335 21312325|21498 chr3R 21308853 21311756 scaffold_17 804387 807343 + 85962|2627 3096
AAAAGTGGATTTTTCATTCA------AAAATGTTGTA---TAGACAAGCCGGTTAGTGTTAGATCCCATCGAAATATATATCACATATATT-----TTTAGCCGAGGAATTCATAGAAATGTTGCCAA------CAAAATGTAACATTGAAAGCACATTC----ACTTTTTTTAACGA------AAATAGTTTAGCACAATTTTTAAGTCAATTT---------TCACACGCATAAATGGGTTTTTAATTTGTACACTAGAGTGTTGAACGCATTTTTGTTTAATTTTAAGTTACTTTAGGTTTAAGCTGGTGTTAAGTTTGTTTCAGTTTCTG--TATTTTAAGTTGTTTATGCT--CATCAACCCTGCATT---ATTTTTAAATATTCCATTGTGCCAATAGA-GAAGTCAGCACCACACAAAGAAAAATAAAT-AAAAAAAACTTGCCCTAGTTATATAAACAAAAA
AAAAGAGCAATTTTAATTAATATGAAAAACAGTTTTAACTTAAATAATTAAGTT--TAGTAAACATTGCAGAAAAATGTAATCAATAACTCAACAATGTAACCGAAAGGGTCAAATATTTGGTGTTAAGGATTTTACTAGGCAACATTTGACACACTTTCGTAAACATTTTTTAAAAATCCCTTGCAGAAATTAGAGACATCTACAACTCACTCTCATAGCAGGTCAAGCTCATA--------TTCAATTGTAACAATTGCCCGAAACAGGGA---------AATCAGAATATACTTTTTTTTATAGGTGTTGTAAGATTTTCCCTAATTCCAGAGTATCTAAACTTCATCAAGCTGCAGCCAACGTCACGTTTACGGTTTTAAGTA---CATTTAATTACTAAAAGTAATTAGCGACAAGCTTAGAAGTGCCAATTAAAAAGCACTTA---TATTTTCATTAGCAAAT-
>Dhap-at 21311335 21312325|21499 chr3R 21311885 21313995 scaffold_17 807990 810072 + 92851|0 454
CTGGCAAACGGAAATGGGCCGGCGAGGGAGGCGACAAGGGAGAGGGACACCGATTCGAGTACCGATACCCAGTCGGGTCCCAATCAGTGTAGTACAATTACCATTTCATTGCCCATGCAGTTCATCCAGTTTGTTGTCGGCCTGCTCAAGAATTGTCGCATCATCTGCATACTTTTCATCATCGTGGTGTTGTCGCCGCTGTGGCAGCTGCTCCACTGGATCATCGTATCCACCCACTCATTCACGTAGGTTAACGGGGTGT----CTGGTTAGGATGGGTCGATACTAATAGTATCCTATTTATATTG-----GCATA-ATTAACATTCCCTATTTTCCACCTGCCATTTAAGAGTTTTTGATAATGTACATAGCGACACCCATTTGTTAGGAAGACAAAAGAGC-TATGCTAGAATAAGATTGAACTACA---ATTTTGTGACTAGCGAAATC
CTGACAAATGGCAAGCGGTTGGCCAACAGCTCACT---------GCCCACCGCCTTGGCAAC---------GTCCGCATCCAAACAGCATTTCACAATATC---------------ACAATTCATACAATTCATTGTCAGCCTGCTCAAGAATTGCCGCATTATATGCATACTCATTGTGTTTGTACTTGTGGCGCCGTTGTGGCAATTACTACTGTGGCTGATCGCAACCCTGTGCTCAGCGGCATAGTGTGTGCGTGTGTGCGAGTGTGTGTGAAGTATTTGGGCTAATGGCATGATGGGTTTGTCGTTTGTGTATACGAGAATACGTTTTATTAGTCCTTAAGTATTTAATAATAATTGATATTTTG-------------ATTTGTT-GCCATACACAAAAGCTTAACCCAAAACCATTTTGGATGACAGTCATTGTAGGTCTAG-GAAGTC
>CG33494 21319281 21319736|21503 chr3R 21318993 21319659 scaffold_29 429102 429722 + -388|301 727
AAATACATAGCATGATATACATACATATATAGCATGAGTAACGAAATATGTATATGTGCAACAAGTTCTGATTGTTAAAGCTACTCGATTCTAATTTAAAATCAAGGTCAATACAAAATGCTCTTATCAACATATATGAATCACATATGTATTAAGATGTAAAA------------TCTCATTTT---TAATTAAGCATTAATGTGAAATGAAA------------GTGCCTTTTTGCCGTGTGTATTTTTTATATGTAAGGCCCCTTTAAAGTCGGCAGTCAACTGTTTGTTTACTGAGTCAGAATCTTGGAGTCGCCATGATCAGTCGCATTG------------AAATATTTATTTTTATTCATATAAATTCCATAATAATCAAAACTGGAAA-----TTAAAAAAAAAAAAAAAATTAA----
AAATATATAG----ATATATATACACATTTAT-----ATAACTAACTATACATAAATACA----GTTTACAGAATCAAAAGCGTTTAATAAGCATCAAAAATAATGAGCAATAT------TTCATGTCTAAATGT------CAAATTTATAGCGAAAAGCATAACGAATATATTTGTGTCATTTTAGCCACTTAAGCTTCAACAAAAAAAAAAAAAAAACAGCACTGTTTCGGTTTGCGGCAAGTATTCAGAGTAT-----------TCGAATAATGCA---AACTCATTATTT--TAACTATAAACGTTA--------ATACTAAGTAGCATTATACTATATGGGTAAATATATATATGTATTTATATATATATATATATATACAAATATCGCGTATGTTTTGTAGCAATACAAAGCATTTAGTTT
>CG4673 21436735 21437011|21642 chr3R 21436699 21437680 scaffold_17 967826 968748 + 42028|36 317
GAATCCCAGACACGAAAATTTCCACAATTTGCAGCC--TAGATGAACCATTCGAAATTCCGGTGTAAAAC-AAACTAAAGATTCAATCATACTTACTTACTAGCAGCGACTGGAAAACATGGGTGTCCTGCGAACACACGTACACATGCACACTTAGAGGCGGTTCGTGCGAATGTCGCGCATTCTCTAT--ATGTAATCCTTGTGTAAGAATTTTATAAAATAAAACGAAATGATGGAAGGAAAATTTAATTTATTTTTAAATAAATTTCAATTGTTGTGC
GGAT-----ACAAATAGTTTACAGCGTGCTCCAGCCGTCAGCTTAGCGCGACGAAATTCTGGTGTTAAATGAAACTAAAGATTCAATCATACTTACT-----------------ATATATAG------------CAAAGGGGCAGGAGGACA---GGATGCAATTGGCGCATGCCGCACGCGTTCTCTATAAATGTAAT--GTGTATAAGAATTTTATAAA---------------------AAAATTTAATTTATTTTTAAATAAATTTAAATTGTTGAGT
>CG4685 21450525 21450653|21655 chr3R 21450430 21452904 scaffold_17 991209 993497 + 76625|110 241
AGT-CCGATGGAGGGATCACCCCCACTGCTTTCATACGCTGTCTTCCACTAGAATGCGATTGGTTTATTGTTG--TCTAATTGTAGAATAACACGCCGCTATATTAATAAATGTGCACAAAGTCTACCTGAA
AATACCCATTGCCGCA----CGCTATAGCTTTAAGTAGCAGTCTTCCACTAGCAAAATGCTTGTTTGTTGTAAATTCTAATTAAAA--------------ATATAACTAAATGTGCACAAAAAGTACTTT--
>tankyrase 21478807 21480253|21690 chr3R 21478804 21479555 scaffold_17 1018868 1019637 + 24401|3 832
GAATTACAATCCCTACTTGCATCACAGTCGCCAGCATTTGCTATCGAAAGGTGG------TAATGGTGGTGGCGGCGGTGCTAGT---CGTCACTTCTACGCCTTCACCTCGTCGTGGCGCTGGTGCAGTCTTCTGTGCGCCGCCATGCGCTGCTTTGGGGCCGGGGGAGCCGGGCACGGGAAT---GCTCCGTACAGCAGCTCGCTGCAACATCATCGACTAAGACGCTGTTCGTCGTACAATGCGGAGAATGCC------TACGAGCACTTTGCGGCCCCCTTCAAGGCGCGCAAGACGCGCGACCACATGAATAACATCACCTACGAGTTGTGACGGTG------GTACGACATGCTGGTGGTTATTGATCTCTATGTCTCCGTTGGCCT--CCCGTCTA-------------------------TTTTATTACA----ATTACTAGCTATAGATGTCGTGTCCTGTGTGTCTCTCTCTCTCTCGTTGTTTATTATA-TTACTCTATAATATATCACGTAAGGGCGAGCTAGCGAGATGGATTCGTTCGGTTTGGATCGAATTGGATTGGATTCGATTGGGTTAATCAAAAGTGAAGCACAGTTTTTGAGTGATTTTAATTCGA--------------AATACGGAAAATGCGATTCGATTATACGAGGTTACAAGTTCTTTGCCGATGAATGCATTA-CATTACATTACATTACGCTCGCGCGTTTATTTAAGTGTTTAAGCTTAG----TTAATTTAA------ACAATAATTAAAACTCCAATTAAATTTAAATATACAAATACATATACATCAATCGAAAAAT
CAATTACAATCCCTATTTGCATCACAGTCGCCAGCATTTGCTGGCCAAAAAGGGCCACAATAATGGAGGCGGCAGCGGTGCTGGTGCACATCAATTTTATGCCTTCTCC---TCCTGGCGCTGGTGCACGTTGCTGTGCGCTGCAATGCGTTGCTTT---------GGCGCCGGGCATGGTAATCAGGCCCCCTACAGCAGCTCATTTGTGCATCATCGTTTACGTCGCTGCTCCTCCTACAATGCGGACATCGCCTATGATTATGAGCATTTCGCAGCGCCGTTTAAAGCTCGGAAGACACGCGATCATATGAATAATATTACGTATGAGTTGTGACGGTGGCCGCTGCCTGAAATCGTTATGCATTTTGATCTCTTTCTCGCCGTTGTATTTGTTGGTCTAATCCTAAAATTTCAGCTCCTTAGACTTTTATTACAAATTATTATTAGCTATAAATGTCGTGTACTGTG------------TCTCGTCGTATATTCTAGCTACTTTACAA-------------------------------ATCTGATTG--TCAAATCAAAAAAAAAGAAAAACAA------AAACTAAAAGAGCAGCACATTTTTTGAGTGATTTTAATTCGAACTTACGAGTAATTAATATTAAAAAAACAATACGATTATACGAAAAAAAAACGAGAATTGAAAAGAATACATAAGTATGAGTATGCAATATGCACGCGCGTTTACTTAAGTGTTTAAATTTAGCTAATTAATTTAACAAATGACAACAATTCAAACTCCAATTAAATTTAAATATACATAAATATATACATACATAAAAATAA
>tankyrase 21478807 21480253|21691 chr3R 21479566 21479803 scaffold_13 1663002 1663223 - 3807|0 242
CGACAGCCACAGAATCATCATCATCAGCAGCAGCAGCAGGCGAA---TCGCAGCCAAAAGTATAGTCAATTTATGATCATCACACCCGCCGTTTCCATAGATCGCGACT--TCGAGTACGAGTCGCATTTGGACTTTGAGGATTTCGCCAATGCGGCCCACAACAATGGCAATCTGTTTCGACTTGGATTGCGGCGGAGTGATAGCAGCAGCGACGACAGCGGCCACAGCAGCGATAGCAGCA
CGGCAGCAACAACAACATCAACATCAGCGGCAATAGCTGGAAAACACTTGCTAATGAAAACTCACTCAAGCC-CGCCCCCGACACGCCCTG-ACCCATAGTTGTCGACTTGTCGAGTGAAAATCACATTTG----TTAA------CGGCAACGCTGGGTGCAAGTACTTCAA----GTGCCACTTGGTTGACGGC-----AACAGCAGCAGCAACAACAGCAACAACAGCAACTACTGCTGCA
>tankyrase 21478807 21480253|21692 chr3R 21479804 21480260 scaffold_3 2490535 2491016 + -221|0 502
TG-GATGCCCTCTGTCGGGTCCACGCCCACAACCACGTCGCCCGC----GCTGCACCAGCCGCAAACGCAACAACAACCGCAG--CAGCAACAGCAGCAGCAGCCGCAACCACAACAACAGCAGAAGGCACCA-CTGCCGTTGCCACC--GCCACAACAGCAGACCTCAGCTCCAGT-TGC-CAAGAGGCGGCCGAAACATGCCAAACCATCGCTGCAGTTGCAGTATCAGCCCTATCAGCCCCAGCACCACCCGGTTGTTGCAACCGCCGC----TGCTGTGACCACCACCCAACCTTCGCCCG------CTGGCGTTTTTGCGCACAGCAATAACAACAATAATACGAGCAGCGGAAATGTGAATA--------ATAACAACAATGACATGTCGCCGGTGTCGAAC-------AGCAATAGCTACTCCTCGGTGGACACCA-----------ACCAGACGCTGCTCAACT-----CGCTGGCCAACCAGCAGCGCAACCAT
TGAGCTACACTATGCCGAGCTTTCGCTGA--ACAGCGCCACTTGCAGCAGCTCCAAGAAGAACCAACCCAGCCAGAAC-ACAGTCCAGCAGCAGTCGCAGCAGCCGCAGCCGCAGCAGTCGCAGTCGCAGCCAGCCATGGGTGGCACCCTGCCACA-----------TGGCTCGAGTATGCGCAAGCTGTTGCC-CAACATACCGG--CAACGGCGACGCTGCAGCGCCA-------CAAGCCAAATGCGGGCGGTCTGCAGCATCCGCATCAACATGCTCCGCCGCCCACATACGATTATTTCGAGGAGCCCACGATATATGCGCAGATTGATGCATATAA-GACACGAGC--TGGCGCTGCGGCTGCCATGCAGGTGGACACAGTGGC-TGGAGCCGCCTTCGGACCATGCGCATCATCGCCAGGATCGCAAGGGACGCCCTCAACCGTGTCGCCGGGCACGGTGCAAATGTATACGTTACCCCCCCATCCGGGCGGCTAT
>CG4730 21502793 21503019|21714 chr3R 21499655 21502977 scaffold_17 1045875 1049418 + 69409|3622 3821
TCTTACACTAACTCGCATCCCATTTTAAATTCCGTAAAATTGCCTTACAAATATCACATTCAATTTATTTCACACTTTCATTTGGTTATCTTACACGGACAGGGATAGATATTCACATACATATATAGATTTTCGATATCATAGACAAAATAAATGCTGCTAAATCTGGTGG---------------TATACAAGTTCGA
TCTAAAGTTAAGCCCAGTCCCAACAAATAAGTTAAAAAGTTATTTTACAAATATCACATTAAATGTATTTCACGCTTTTGTTGGATTGGTTAACAATGACTTGGATGCACATATAGACACATATAGATACATAT-ATATCATATATATGGTTAAAGTATTTAGACATAATGAAGAGTACGAAAAAAATTTGTAAGGTTGA
>CG4743 21504956 21505087|21716 chr3R 21504394 21506314 scaffold_17 1051212 1053234 + 46722|618 860
AATTAGGGTTATTTTCGTTGTACTTGTAGTAGAGGCACGTA----------GTTTGCA------GTAGTAACTAAACC---------GATGACAACCACCGTTTGAAGACAACGTGGACAATAAA--------GTGTATGGAA-------------------GACTTTTG-----------------------------------------------------------AGATTCACTAGGCA
CAGTGAAAATAATAGGCACATATTTTTAACGAATGTACAAATGTCTAGCACGTTTAGACAAGGCGTATTAGTTACGCTTCACTTTGAGCTGACATTAACAGCA-AAAGATAACGTAGACAATAAAACGAAAGTGTGTATACAACAATATAAGCCAGTAAATAGTCTTTTGTTTTCCTTAATTTGTAAGCGATTGTCCTTTGTTAAAGCAATGTGGGAACTCCCTCTGCTAGGTACGCAAGGCG
>RpL27 21509460 21509816|21717 chr3R 21506654 21509511 scaffold_17 1053786 1056733 + 88780|3099 3156
ATAATAGTTACAGTGTC------TTTTTTACTTTTTCCTTTACTAATAAATATTCGAA
ATAAAAGTCACAAATTTGAGAAATTTGTTA--TTTTCGTTATTTAATAAATATTCGAA
>RpL27 21509460 21509816|21718 chr3R 21509727 21510245 scaffold_17 1057130 1057653 + 35881|0 96
GCTGCCCATTCGCTACTTGTGGTTACTGGATTTGTCGCTC------TTTTTTAAGGTTTAATAAACAAAGAAGTAATTCTGATA-AAACTGACCGAA
GCGGCTACTATATCTGTGGAGGTCTCTTGATTTATTTGTCGACGTTTTTTTTAAGGTTAAATAAAAACAAAATT--TTCTGATATAAAGTGACCGAA
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ATTAA
GTTGA
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CAATTAAACATAGAATTAATTTCAGTTTTTTAT
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>HLHmbeta 21830648 21831027|22066 chr3R 21830831 21831681 scaffold_3 2880749 2881612 + 34271|0 210
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>Dak1 21879959 21880296|22105 chr3R 21880151 21886044 scaffold_3 2934842 2940634 + 187598|0 154
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>dys 21903144 21903188|22124 chr3R 21901944 21904954 scaffold_3 2958506 2961510 + 62875|1473 1517
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------------------------TGCAAATATGAATAGACT--TAGTTAAGCACGTATAAAATATTGAAATTTCAATATATATATATATATATATATATATATATATATGCGGATTTATTTGGAAATCTTTGTAGTTCACATGTATTTGTATTTTCTATCTTAAT-TAGCGCTAGAAAAAGTTGTACGCCTGCATTTAAATGCAAAAGAAACAA-------------TTTTATTTCAATTTGATTAGTTTTAGTAGCTGCGTTATTTAGT---------------------GTTCCGCTTGCGCTTAAAT---ATAAATATAAA---CTTCTTAGGTGCTAAATACATTTGCATTCAAAAATGTTTAGCAAT-ATTTTGCCATGAAACTTTCAAG
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>Ald 22081712 22082029|22306 chr3R 22079757 22082172 scaffold_3 2037698 2040469 + 13108|2405 2841
GCCAATTCCCAGGCCTGTCAGGGTATTTACGTGCCCGGCTCAATTCCGTCGTTTGCCGGCAATGCCAACCTCTTTGTCGCCCAGCA---------------------------------CAAATACTAAGTCCTAAATGCCACGCACTAATCCCGA--GTCACAATCGAGCGAAGCTATATCCCAAGCCGAATCCAGATAATCCGCA-------AGAGTTACTGATCGAGGCCCAGCTGGAGTGAGACGGGCAACATTTATATTCCTCCAACA-ATGGAACTGCAAATAT-ATTCCTTTTA---------TACATTTTTACATTTT------------------ACCGAATAAACTG-------------ACTAGACCTT-----------------------------------AAAGAAAATATTTTTGGCGAAC
GCCAATGGACTGGCCTGCCAAGGCAAATACGTGGCCGGTTCGATTCCCTCATTCGCGGGCAATACCAGCTTGTTTGTTGCCCAGCACAAGTACTAAACAAAATTAAAGACAAGTTCCAGCAAATGC-AATTCCTAACGGCCGCTGTCTTAACCCAATTGGCTTACCTGTGCTGAGAGCAAACCCGAACACATTCC-GCCCACCAGCACAGACATGGAATTACAAACCTAAAACCTTATATAGATGTACAACTAGAGTTCTAATTATGACAAAATATAATATTACAATTATTATTTTTTTTGACATGAGCCTACACTTATAATTTTTGAATGTCAGGAAAACAAAAACGAATAAATTATGTTTACGAATGTATTCGACTTTGTGGCCTTTGATAATTAAATCAAGTTTTAATTAAGAAAAAAAGTAACGTTTGGAAAT
>Ald 22082196 22082249|22307 chr3R 22082234 22082390 scaffold_3 2041350 2041509 + 2538|0 15
TCAAAGGATTGAAGAA
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---ACTGTTCGATGGGATGCCCCAGAT---ATTTTGATTAATATAATTCTTACTATTACTATTT----------TGTGCACAAAGTTTATTTCAACAATTAATTGTCTAA
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TATTATTAAGCT--GTTGTGCACGCCAAGGGCTTTGA--------ATTGATCTTTATAT-------------------------ATAATGCAGTACTGAAATAAGAGAGGTCTAGTCCACAATTTGCAAGATTCGTTATGCTGCATTATCGAGATACAATTTATCACTTAACCG---------------AACTCTATGAAAACCCA---TACGCATATTTATTTTAAATAAATA--CAAATT----AAAAACAA
TATGTTTAAGTTTTGTAGCGCACGCCAAAGGCTTTAACGTTTACGATTTCAGTTTATATTTTAACTATATGATATATGTATTAGGTAATGCCAGGCCTAACTAAGAGAG------TCCCTAATTTGCCAGTTTAATATAGCTCTA----CACAATATAACTTACTATATTATTATTATTATATATATATAAATTTATGAAAAACAAGTTTCAATATATTTATTTTTAAATAATAAATAAATTCTTAACAACCCA
>Rb97D 22698303 22699683|22944 chr3R 22698509 22701496 scaffold_42 6926 10108 + 56502|0 1437
TGGAAGCGTTCCGCCGCCAACTGGGGCCAAGGCTGTTGGCGTATCCAATGGCTCCGTGGCCACTGGAGGCAGTGCCAACAGCAAATATCGCCGCTAGATTGGGTGAGTA---------------------GCCGTACCCGCCATTAGTCGTTTCTTTTGAATGTGGTCTATGCATAAGAGCTACCTCAAATACGTCTT---GCCACGAATATATCCATATACGCATATATTACTCGCCATTGATGCACTACGTCTGAAGTACTTGTTTATGTGTAATTACTAATGTCTAAAATTCTCTTTGATTTAGATGCTCTTT--------------GGGCGG--CTAAAGCTCAAGAATCAA------------------GACACTCTTTAGTAAGCTCGTTCATAAGCTAGG--CCACACTCGCTTAG-AGTTACTAAGCAGGA----------AACTTAAC-GCATTGTCTCTCTATC---------------ATAGG-----------------------------------ACAACTAACTACGATTTTACTGTAC---ACTTAAGCTATACCATTGATTACCCTACGATTG------------------ACCTAAGCTATG-GCAGACTAT-----ATATAACTATTTTATACAACGTATTGCGA---GGAGCGAGCACTTCTCCAGTTCGAATTACTCTAGACAT---AATTATGAAACTCTGTATCGTAGAAGAATGCCCAAAATACGATACGAAATTACAACAGGCTCTCTATTTAAATCTAAACCT------------CTCTCTCT--------------------------------------------------ATCTGTAAAACAAGAAGAAGGATTGTGC------------------------AATGGTGGAGGATGGAAGAAC---AATTGCCAATCAAGATCAATTAATTAGACATAAATCACGGAGCTGTAGC--CTGAGCTTATTGGCCCAAAACAAGTAGTTTAATCGTAGATGCCTATGTATTACCTAAACCATTCAAATAAGAAGATACGTCCAAACAAAAAAAACACA---------AGAAACAAGAAACAAGAATATAAGAATCCGGAGCGAAGTCGGATCCCAAATCAAATCAAATCATA-CGCAGGGCTGGCGGGCGTGGCCTTAACTATTAATGTACACAAGAGATGATATCAAAACAAATGTCAATTTTTACAAGAAGCAAGAATCGGACACTTATATACTGTATTAATGTTAAAGGTTTCTTATCTCGTCGCCCACGATGTTAATTCATATAC-TACATATATCTCTTCTTATTTGTATATCATGACGAACTCAAAGAAGTGTATATACCCGAAAAAAATGCGAAGAAAATGTATATGCTT---TCGGATT---AACTAGACTTACGATTTATTCT
TGGCGGTGGCCCACCCTCG---GGGCCCGTACCTAAGAATATTTCAAATGGATCGGTGGCCACCGGGGGTAGCGCGAACAGCAAATATCGTCGTTAGTCGGGGTAAGTAAAGCGAGAGACATGCAACTCTGTCCCTCACGCATTGCGCTGTCATTGTTGTGGTACGTTTATGGCTAGTA-CAATTTAAAGCAAAGTTTAAGGTACCAAATA---CTGACTCCAATTGTGTCGCTCTCTAT-----AAGTATGTC-AAAGTACTAATCCTT----------TAATCCTTATAATTCTCTTTGATTTAGATGCCTTTTTGTGTGTGCCTTAAGTGCAGCACAAAAGCTCAGAATTCAAGATACAAATACAGATACTGATACTGATAAATAGGCTCG-TAGTAAGCTAGGACACACACTCGCTTAGTAACTTAAAAACAGGATAAATATAATATATTAACTGCGTTGTCTCTCTTTCTATATATATATATATATATGTATCTATACGTTTATATCTAACTGAGCGTACGGCAACAACTAACTAAAGTTTTTAACTCCTTAACTTAAGCTCTAATGTTATTTATTGAACGATTGATATCCAACTATGTTTGTATTTAAGCGATACTCGGCCTATTAATAAGACAAATATTTGATACAAC----TGTGAGTTGTAGCGAAAATCGTTTCATTTC-ATTTACTGTTAACTTGCCATGCATAATTTTCTCTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACTAAGTTATTTTAATACAAATTGTAAACCCAAATTAGAACTTAATCAACTAGTGCTCTCTCTTATTCTCTCTTCATACTATAATTATTTATGCCTAAAATGTAATTCCTCCAGTCTATAAATACAAATGAAGTACAGTGCCCGTGCCCGTGCCCCGTGCCCGTGCGTAGCTCAGCATTAGAACACCGTAAACGTGTATTTTTGTAAACGAATTAGATCTTAAATA-GAACCTTTAGCAGTCGAGCTTAT-----ATATAGAGCTAGTTTGCTC------TCGTATATACTA--TAATTAATAGACGCCTTAATACTCGTATAACCAAAAAGAAATCATATTGGCCGACGAGCAAAATACCA-AATGAAAAAATTATAAGATACGTCCAGTAATATATAACATTCAATCAAATCGAAAGGCTGTTGAGCAACGC----ACGGCT-GCGCACATCACAAGTAATAATATATGAAATATCA------------------AATAGAAAAGTTTAATACTGTAGCCATA-TAAATAATTCAATCCAAATTACTGTCAATTTGTATAAACATACATGTATATAAATATATTTATCTATATATATATATGCATATATGACTGTACGCTCTACTTAAATGAATATGATTAAGTTGTAAACGGTTTCCTCACACTCAAAACTCAATTTGCAATTGCTGCT
>ro 22702493 22702614|22946 chr3R 22702311 22703093 scaffold_42 10109 10977 + 9653|231 372
TACTTGCTAATT--GATTACATTTATTTGAGCTTTAAACTGTTTAGATTAAGATCGAATAAAAGTCATTGTGAAAACATAACAGATTGCAGGAATTGCACTTTTCGAAG---AAATCACTCACTGCT---------------
CGCTTATTAATTCGTGTTAAGTGAATTCTTGTTTTAAGCTGATTTAAATGCG-TCAAATAAAC-TAAGTTAAATGAAACAAAACGTTTTTAGCTTTTAAATAGTCAAAACTTGCATCACTGACGGCTGCTTATAACTATCTA
>Ets97D 22736496 22736833|22999 chr3R 22736229 22736722 scaffold_13 1700886 1701355 + 11354|310 559
ACATATTTTACAATCCTAAGGCACACGATTTTATTATCCATTTCGT---------------ATTCGCTAAGGTTTATAATCTCTGTCTACATAAGCTATAGCTATAAGTATCGCGTTTATACTGCTAATCATCTTAGTTATTATCTGAATAGTATTTCTATAGTGTGTATATTGAATATTGTTCG-TTACATGATTGTTGCGATTTTTGTAAAATCCATAAAACTAAA-------TTCATTTCCACGCGA
ATGCATTCCGATAGTCATAGGCACTTGATTTTATTGTTCATTATGTTCATTATAGATTGTTATTCACTAAGCATTATAATCTCCGTCTCCATAAGCTAGTGCTATAAATATCATATATGTAACATTCTATATGGTAGACACTAT--------------------------ATCGAATATTGTTCGGTTACATG----TTGCGATTTTTGTAAAATCCATAAAATTAAAAGAAAAATTCATT--AATTCGA
>Ets97D 22736496 22736833|23000 chr3R 22736723 22738187 scaffold_13 1701899 1703353 + 58944|0 118
CATGGCGAGCTGAAGC-----TCAAGGAGGAACCCGACATACTCTGGAAGTACGAGGAGCCTTAGCGTTGGCTGACTTGGTCGGATGACGGCGCCTGGTTAATA---ATACAAATTGTT
CATGACAGCCGGATATCGGTATCAAGGAAGAGCCCTACATCCTGTGGAAGTACGAGGCGCCATAACGTTGGCTTAAACTGTTAGTAATTAGT------TTAATGGCCAGATTAACTGTT
>CG6330 22775845 22776146|23045 chr3R 22775425 22776124 scaffold_20 2466005 2466695 - 7626|438 766
ATCTCATTTCACCTTCTTACATTATATGT--GCGCATCTCTCCAGTATACAATGATG--TTTCAACATTCCCTAGTTTAGCTCTGATTAAGTTCCTAGCTTTATTTC----TGTGTATATC------------------GCCCACAACCTCATCGGATAATTTAAAACCGATCATATTGTACGTGCATATGTTCATATGTTACCACAATTTAATATATATATGTATATCAA----TAATATA-TAAAAATAGTATC--ACTGAGTGTGACGTT-----------CAAAGGTTATCAGA-----AATAAACGCTTTTGAGATCACAAAAC
ATTTCAAGTTACCTTTTGAC-TCATATGTCAAACCAACTCTCATGTATACAAATATTCCTTTAAACACTCCATAGTTTAATTCACTTTAAGTTCTTA-TTTTATTTCCCCATATGTGTATCTATGTACTATATACGTATATCCACTTCCTCATTAGCTTATTTAAAGACAAGCATATTGCAGGTATTGGCGTATTAACGCT--TAAAGCTGAAAGAACTTATCCAAACTAAATATTAACATATTATAAATAATAACAAACTCAATGTGACGTTGTGTTTCAATATAAACTAAATCAAATTGTTGTTAATCGCATCGCTAATTGCAACTT
>CG6330 22775845 22776146|23046 chr3R 22776145 22777668 scaffold_20 2466742 2468271 - 58946|0 1
AT
AG
>Tsp97E 22787446 22788077|23058 chr3R 22787063 22789365 scaffold_20 2480221 2482841 - 40218|472 1202
-CAGGCTGAAAATACA-------------ACAAGGAAGTGAAACATTTTAGTCAAAGGGACGAAGGCTGAATTTTAATTCT-TACAATCGCGTTTCCTAACCAGAATCGAATCCAAACTGGAACAAAAGATTAC-TCTTAATAGAAGGAGAAGGAGATGGTGGAGGAGTTATACATGTGCTCAAC-----GCTGCTGCTATTAAGGATAATTTTATTTTACCATTCTACATGCTATAA-ATGCACAATGTTATTTAATTACAAAACCTCCATTGAGATTATGTTTAGATGTAATAATGTAATCTAAGTTTAACCGTTTAAAAGTCCTTAGTTAGCTCTTAATGCCTTTCTTTGCAACTCGCAACAATCATGAACGACTCGACGTGACTCGACCTCCACTCAAAACTACTGTACCACTACGAGACAAA--------------------------------------CATTTCAACAACCTGATCTTACTGTAGAACTAA--CAACC--AGTCAACAATTGTAAC-------TAGCAACGTAATAAGTATACAT----CAACCTATATAC-----------AAACGTAATTGCAT---------TATTGCCCTCAAGGCGTATAAACAATAC----TCTAAATGTTAGCTGTGTGTT-AAACTTTAAACTAGCGAGAAAAAATGCCCACAAAATAACAAAAAAAGAGTAATCCTCTATACATACATGTCAACA
CCACATTGGAGCTGCATGAGATCGAAGAGCCAAGGCGCTGGCAATTTTTAGTCAAAGGGACGAAGGCTGATTTATAAATGTGTACA--CAAATTTCCTAGCATGAACTGAGACAAAGCAAAATGCAGAGACCTCGTCTAAATGTCCTTTGAA--------TATATGCATTACGCGCTTGATCAGTTTCTAGTTTTAATTTTTATAAAGTGTTTTAGTTACCCAATTGAGAT--TATAATATGTGTTTCGT--TTTCACTATATAATATTTG-------TATATTTTATTATAATTGTACAATTTTTTCTTAGTTTCTTAAGTTAGCTTATTATAAGTATTTTATTTTTGTTTGCAACTGGCAACAATCAGAAAA-------------------------CACAACTGCTGTACCACTAACGAACAAAAAAAAAATAATAATAATAATGAAAAATAGCTTAAAAACCATTTCG--AACCTGATATAAGCGTAGAACCAAGTCAAATGAAACTAGCAACTGTAACTGTGTTTTAACAAAGCGTAACATATACATAAAGCAACTTATATACATCTACATACTATACATATATATATATATATACATATACATATAAATATACATAAATAATTCAAGATATAGATGTTAGATGTGTGTTAAAACTTTGAGATTAGTACTTATATTGCATATAAAAAGAAAAAA-------------CCAACAATACATGTCAAGA
>CG31075 22811344 22811447|23079 chr3R 22811273 22813293 scaffold_29 819566 821673 + 93304|71 194
GCTGGAA-----------CTTGAAGTGTTTCCTGTCTCGTATACACAATATTTGTATTTTATTCGCACTTGTTTTCGGTTTTATG---------TTGCATTTTAAATAAAACTCATGGATTTAA
GGTGGAGAGCATCTGGTCCTTTA--TGATTTTTGT-TTGTATATGGAATATTTGTATTTTATTTGCAC---CTTCTGGCTTTATGGTTAGACTATTGCATTTCAATTAAAACTATTTGTTGGAA
>CG6295 22831621 22831669|23111 chr3R 22831280 22831641 scaffold_29 860579 860959 + -2966|382 402
GAAAGCTCTGTGAGCGAAAGC
AAAGAATTTATTA-CAAAAAC
>CG6295 22831621 22831669|23112 chr3R 22831642 22832882 scaffold_29 850564 851801 + 61297|0 32
GTCCAGTCTATAATCTAA-----TAAATTGTGT
ACTGAATATGTTTATTAAACATTAAAATTGTAT
>CG17191 22844330 22844381|23117 chr3R 22844314 22844381 scaffold_29 859321 859379 + 598|16 67
AGGGGAACTATTATATTGAACATCTTATCAAAATACAAAAAATTAGTACTCC
AACGCAATTAAAAAATTAAAGAATTTTTA-----ACAAAAAAATATGA----
>CG6283 22845954 22845997|23121 chr3R 22845861 22845975 scaffold_29 855735 855836 + 242|95 117
ACATTACTG-AATACTCAAAAAA
ATTTTTGTGAAACACTTCGAATA
>CG6283 22845954 22845997|23122 chr3R 22845976 22846251 scaffold_29 857124 857397 + 9254|0 25
AAC----CATGTTCTCTGAATAAAAT
ATCATTATATACTATCAGATCAAACT
>CG6277 22847791 22847821|23127 chr3R 22847245 22848909 scaffold_29 858797 860475 + 40185|605 639
TAGAAACTCAATAAACTT----CAAAAAACTGTAA
TAAAAAATTAAAGAATTTTTAACAAAAAAATATGA
>CG6271 22850683 22850714|23131 chr3R 22850668 22851429 scaffold_29 860920 861691 + 44255|15 52
TTGCTGTGCAATAAAAACGATGCTTAAAAAA------T
CTATGACGCAATTAAAGAATTTATTACAAAAACAATCA
>Nep5 22883617 22884304|23162 chr3R 22882919 22883773 scaffold_29 924661 925424 + 990|733 894
TTCGTTTTAAGTGGAATAGTTTAGATAGTTCATT-----GTTCATTGCATCATTTTGGGCTTTACGGAAACTTGCTAATTACGATCAAAAATACTTGCATGTGAATATTGTATATACTTTTAATTAATTACTTTTAATATACTTTCATTAAAAATACATTGA
TTTGTTTTATATT------TTTACATATTTCTTTTATATATTTATTATATAAT---AAAATTAGATTAAAATTTTTTATTTCGAACGTCAAT---TGTATTT-----CTATGCACATTTATTTTTGGATATTTGTAATACATATTCTATTCATTTACATTGA
>Nep5 22883617 22884304|23163 chr3R 22883817 22883948 scaffold_29 925725 925858 + 1213|0 146
GACGAATAAGCAATTGCAACAGGAACAGTCAAGTGATTTTTCTAC--CCGTTTGTACTTAAGCTAGCCA---TATGATTAGATCGAATATAC------AGGTGTCTTTTGCACGTTTCTGGATGCTGG----CGCAATAAACTTAAT
GATGATAAAACCA-------------AGTTAAGTGATTTTTCTACGTACATTTTTATTTGTATTAATTAGTCTAGAAATTGATGAAGCATACCTTTAAAACTGCTTTCGGTGCGTATTTTTATAATAGTATATGCAATAAATGGAAT
>Nep5 22883617 22884304|23164 chr3R 22883960 22884626 scaffold_3 3978638 3979302 + 4217|0 422
ATTGATGGCGAACTGACGCTGGGCGAGAATATCGCAGACAACGGCGGAATGCGGGAGGCCTTCTATGCGTACCGCCTTTACGTGAAGGAA-GTGGGCCGGGAGCGGTCCAAGTTGCCCGGCTTGGAGCACTATTCCCATGAGCAGCTCTTCTTCATCTCGTTTGGGAATCTATGGTGTG----------------------------------------------------------AGACCTATA---CGCCGGCAGCATC----------------GCGATACGCGCTCACCGATTCTCATTGCCCGGGACAGATGCGTTTGCGGGGAGTGCTCTCGAACTCGGAGGAGTTTGCCAGGACCTTCAAATGCGCCCGAGGAACGCCCATGAATCCCGACCAGCCCAAGTGCCGCATTTGGTAG
TTGAATGGCATCAACACTCAAGGCGAAAATATTGCCGATAATGGTGGCGTGAAGGAGTCGTATATTGCCTATCAACGCTGGGTAGAGAAGCATGGGCCGG----AGCCAAAGTTGCCTGGCCTAA---ACTATACGCCTCAGCAAATGTTCTGGATCTCGGCTGGTCAGACTTGGTGTGCCAAATATCGTAAAGGTAAACGTTGAAGAATATTATGTTAACTAAATATTTTTAAAAACAACATATATTTCACTTGCAGAATCCCTTAAGATGAGAATTACAACAGGCGTGCACTCGCCCTCAG----------AGTTCCGTGTGCTAGGCTCGCTGGCCAATATGAAGGACTTTGCCAAGGACTTCCAATGTCCAGAAGGCTCCCCCATGAATCCTGTGCAA---AAGTGTGAAGTGTGGTAG
>Nep5 22884435 22884788|23164 chr3R 22883960 22884626 scaffold_3 3978638 3979302 + 4217|555 746
AATTACGGCTCGATTGGAACCATCCTGGGCCACGAACTCACACATGGCTTCGACGACAGCGGCAGGAGATTCGACCGGGCAGGGAACATGGTCGAGTGGTGGTCAAATAGGACCATTGACGAGTATGTCAATCGCACCGAGTGCTTTGTGGAACAATATAGCCGCTACCACCTCGCAGACATTGATGAATAT
AATTTCGGAGCTATTGGCTATGTGATTGGACATGAAATCACACACGGCTTCGATGATCAAGGTCGTCAGTTTGACGTGAAAGGCAACTTGCGGGACTGGTGGCAGCCGGACACCCAGAAGGCCTATCTTAAGAAGGCACAGTGTATTATCGAACAGTATGGAAACTA------TACGGACAACGCAACTGGC
>Nep5 22884435 22884788|23165 chr3R 22884627 22884977 scaffold_29 926465 926803 + 3145|0 172
GTTCACCCAGGAATAGCACTAAGCACTAAAAA-CCGAGCACTGAGCACACAGATAGCCGAGCAAACAGACACCCAGGCACGCACCC--------GCACCCGAACCTAGCACT--AATCCTCTCCTGGAATGGCCATAACCCGTGTGCTGCTCTGTGTCCTCGGCAGGGCGCTC
GTT--------ACTACTACAAAAAAGAAACAATCCAAGCACATAGCACCGAGACACATTTGTCTGCA--CTCCGCACCTTGCACTCCACGCTATGCACTCAATCTTGGCGCTTTAAGCCCTTAAGACAGCAACTCAATTACATTTGTTCGAACGCATCTTTATTAGAGCCCTG
>spz 22890792 22891044|23171 chr3R 22890709 22892311 scaffold_29 934465 936281 + 19710|87 453
CAAGAAGTTTCACCCACCACAGAATGGCAGGCCAAACTGATCAGTGGTCATTGATTTATTCTATAATCTGCTGA-----------ATCCACACATAGACC---------AATGTGCATATTAATTTAGAGCTTTA----------------AGTCG-----AGTCATT--TTAACCATATTCGTGTCAT-------------------ATATTCATTTTTGAC-------------------------------------TTCCA--------------CGTCTAATGCCTAAGCTAGAAATGCAAGTAATTAGTCCTAG-AATAAAAACAAAACAAAACACAAAACACAAAAAAAAAAACAAGAAA
CAACAAGTTTCACCCACCACAGAATGGCAGGCCAAACTGTCTAG-GGTC--TTATTGTTTTTATAATCTGTAGACTAGTTGTTTTATATGCACATAAAACGTATCTTAAAATAAGTATAAATAATCAGTACTATATCTAATGCCTAATAATAATTGCAAACACTCATTGATTAGCCATAAATTTATTATAAGGTTTAGTATTTACAAAATATTACTTATTGACGCTGCGCCTATGCTAAAAACAAATTCATGTCGTACTTTTCCACTCGGCTTAATTTCCGTGTAAAGTCTAGA--ATAAATGCATGTTATGAGTATTAGTTATATAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACAGAAAAAATAAATCTAAATA
>spz 22891525 22891575|23171 chr3R 22890709 22892311 scaffold_29 934465 936281 + 19710|1051 1120
TTCTGGAAAA-------------------TGGGATTCTCCAGTCGATGGCTGCGACAATGTGATATTGAG
CTAAGCAAAAACCAATCTGAATGTTGATTTTAGAATGTCGAGCCAATTTCTGCAC--ATGTGATTTTGAT
>CG6131 22908854 22908994|23182 chr3R 22906951 22909967 scaffold_29 956663 959965 + 80840|2211 2441
GCTGGAGTTTGG----CAGGCGGT---------------------------------------------TGCAGTGCCCATCATCCTGA---------------------------------ATAACCCAGAGATTCCTTGCTTCTAGGTCCTA--------ATCGCACAGGTGTACCCTGTCCTCAGATTTTCTAAGCGATATTAAAAATTCCCTGTAATAAATTTAACT
ACTGGTATTGGGTAGTTAGGCGGCGCATTTGCCGCTCCTTTGAGTCAGGTGCATATACAACGATAATCGTGTAGTTCCCCTCCTTCCCCTACCCAAGCTCCTTTTACATTTCTGTTCCAACTATTCGCCAGTGATTCCTTGCTTCTAGGTTCTAGAATCTTTAATCTATATGTATATTCCATTC----GTTTTATACTTAATA--AAAAAT------CAAACAAGTTGTGT
>CG15884 22915417 22915632|23188 chr3R 22915459 22916312 scaffold_29 968443 969325 + 42846|0 206
GAAGGAGGACCTTTTGATGGGGGGATCACCTCTGAGTTGGG----------------------CCAGAGAGTCAGGGACTGAAGTGTCCGAGGACAATGTCAA-CTTGTTACTGCCAAATAAATCAGTCACTCC---GCACACCCCACACATGTATC--TATTACTGTACCTGTTTATATATGTTCTTGAAT-----GTGTGTAATA
GACGTTGGACCCT----------GGTCAATATTGTGTTGGATGGCAGGCGATTCGCCCCCTCCCAAGAGAGATAGCGACTGA--TGTCCGTGGACAATGTCAATTTTGTTACTGCCAAATAAATCAGTCACTCCCGATAACAATCTATATATATATCTATATGTCTGTAATTATGAGTATGTGTGTATGTATATATAATGCGTAATA
>CG6070 22934196 22934718|23208 chr3R 22932590 22935642 scaffold_29 992098 995238 + 23128|1829 2447
ACTGCCATCGAAATGAAATGGAATCA--TTTTTCAAAACG------------ATCTA-GCTATTTGGCCCTCCAAATA------------------------------ACTACCTATTAAATCTCT----ATATTGATGTGAAAGCTT----GAGAACGAGAAAGCTTG------------GCTCGTTAAACCTGAATACCAAAAA-ACGAAAATACCTAAAAAAGCGGAAA----------ACATGACCTGTACATC-ACAAGGACTGGAGAACGAAGTCAATACTATCATATTTCTAT-ATTTATATTTATAAACCATGACAAAAACTTTTACCTAAAGTGCAAATTCTTCGAATAGTAGTTTAGTATTGAGTTCTAGTTTAGCATTTATTTTGCACTCATTAAATTCGAAATCTAAACCAAAGTAAGCCAAAACTGTTTGCCAAAG------GTGCGATATTCAGGTCGATATTTGCCA------TATAAAGCAGTTTCATATAATCTTCTGTTGCTTATTGTTTAAAAATTCGGTTATTGTTTTTGTCCCTCATTTTACTACCTAAGTGCATTGCATTGCAGTTTGT--AATAAAGATTTTTGTAC----GTTTC
CCGAATCCCGGATGTAACTGAATTTAGCCTTATCAACATGGGAACTCATCACATATATACTATAAATCACACACAATACATCACAGAAAGAAAAACAGGTGCAAAGACATCGAATATTAGGTTTCTACTAATTTTGTTTTGACGCATTTGTGGATTACGCGAATTGTTACGAGTATCTGCCACATGTGCCACTTATCTGACAAAAATGTTGATCCACTTCACAAAGAGAGAATAACTTGTTTACATAACCAACAATTTGACCATTATTGAAAATCAATCTTAAAACTATGAGCTTTTCATCATTTATCT---TAGGATATAATTAAATATTTTGC------------------------TAGATCGCCAACATGTGTGAACTTAGC------TTTATATTAATTATATTAG------TTACCAAAGTACGCCAGTAATA--TGCCAAAGTCCACAATACATTATT-AAATTATTAATTACAGACTTATTATTATTTATTTTCTTTGAAATATTTGCTGCGT-TTGATATTAAGTTGCGTTATTTAATTAATTTTTT-TATAATTACTCAAACTTGTTAATTTGAGATAAATTAATAAAAAAATTTTATACGGGAGTATT
>CG6059 22947338 22947457|23221 chr3R 22947023 22949079 scaffold_29 802414 804444 - 45131|328 450
TCTCCACAAGCTGGATGACAGTATCCACATATATCTACATATGGAGGCCCGCCTCCAACTTTGAAAGGGTATCTTTTACACTTTTCGAATATTAAAAAAACATTGTG--TTTTGTTCAT-TAC
GCTCCAATAGCAGCGTGCAATGCGGCGAATTTGCATAC---------TCTGCCGC-----TTGAAAGGAAACCCC----------------------AACGATTGTGGCTTTTACTGGTATAC
>CG6051 22950474 22951364|23223 chr3R 22950392 22954521 scaffold_29 806870 811349 - 152386|92 1218
GACTGGCCAATGGCGCTAGAAGGCGCAGCTGACGACCAAAAATGTG------------------GCCGCGAT-GGAGGAAAAGC-AAACTGTGAATCGCAATTGTTCCGCAAACATTGTTTTC----TTTATTTTAT------ACGTAA-----------------TCCTAATCCCATGCGATGGGGCCACATGACCACAGCCAGGGCCCGCGTATATAGATCATATATATCTTAAATATATATATTACCCTAGCTATATATTTT-TTATTTCCAAACCAATGACCAA-CTGAGCGTC-TATCAAACGAGTCTACAATAAAGCTTCGAACTAAACTAAACTAGACTAAACTAAAAGATATTTGTTCATATCAGAAGATAGCGCCAGCTTTAAGTTCGGCTCG--CATTTTATAAATATCACATT--------ATGTTTTCTGTTCTTCGTTT-----------------------TGTTTCGGGACGTAGGGAAGCACCTTTTAGAGTGGACAAGAGTTTTTTATCCGTAAGCTTTAACTTTGCA-AGATC--------CTTTGTCACTAGCCAAGGCCTTACTAAATGGCA----------------GTTAGAGGTGTAGAT---------AAATGTGTGTATATTTTTCTAGCGTCGAGTATCATTGCGCGATCAAGCTGATT----TAGTAGGCGTTAACTGTAGCAGAAATTTTTGCGAAACATTTTTTGTGATTTATCGTAATTT-TATA---TGTATTAATTC---GCTTATGTT-------------------------------------------AATTCGTTTCTATTTGACCTAGCTGGAATAAATAAGTGCGTAGATGTATGT----------GGCA--------------------------AGATGAAATCC---TTAAATTGA--ATTTC-------------AACAATAATAACAACTATATA---------TTAACACTAAAGATAAACACATATATACATATATATTTTCTGATTCAAACTTGTAAAAAGAATGTAACAAACGAAAAATCTGTAAATTGAGTTTAAGAAATATACGCA--ATTTTATGCTTAAATAAAAACCAAACAAA
GAGTGGCCATTGGCGCT----GCCAACGCCGA-GACCAAATATGTGCCCAGCTCCACTGGCGCCGCCCCAATGGGGGGAAAAGCAAAACTGTGAAACGCAATCGTTCGTCAAA-ATTGTTTTCGTTTTTTATTATATTTTGTAACATAAAAGAAAAGAGAAAGATTTTCAATTCCTAGACAACAAGTCCGCATATAC----------CCCATAAATATATAT-ATATATATATAAGATATATATATAGATATACCGCTAAATTCTATTATTTTTAACGAATTGACCAATCCGAGTGTCGTATCAAA--ACTGTACAATAAAGCTTCGATCTA--------TGTATTATACGCAACTATCCATGTTACTATATATAGATATATTTA--TATATGTACCATTCGGTAAACCTATAAATATGTAACTGCAAACAAATGCTTTCAGCTCATATCATATGTATCAATGCAACATATAGAATATATATATACATACAGACACACCCATTTCTCTATATATGTCTACATCAGATGATGGCCTGCATTTCAAATAGATCATTTTCGGTTTTGGGACTGGGGTAG---CTATTAAATTGAAATTGTTCTCGTGTCACGTTTAAGATCTAGACTTTAGTACATAATGTATATATATTTTTGTAGCA-----------TGTGC-AGCAAACTGAGCAGAATAATAGACATAAATTCTAGCGAAAA--TTTGCATAACA-TTATTGTGATTTATTGTTATTTATATACCCTGTATTAGTCCCAAGATTATTTTTCCGCAAAAAGCACCAACAATACGCGTTAACAATTAAATTTAAAAATAACATTTACTTTATGTACAGGGCATATAAATATATACAGATATATATATATATAGTCGGCATGAACCGACTATTGTGTTCTTACTTTATACGAAATCCATTTTATGTTTAACATTTCTTTAAGCTAGCGGAAAATTGATTTCAACTTTATAAAACACAGTTTTACACATAATATACATATATGCCTACATATATATTT-----TTCTGACTTGAAATAAAAAC-TAATAAAAAAAAAACT----------GTTTAATAAATACATATATCATATTTTGCTTAAATCAATA--AAACGAA
>Ser 22997818 22998712|23260 chr3R 22997170 22998105 scaffold_3 5615439 5616513 + 15324|822 1168
TAAGCTGTAAAT-ACTGTAAATTAGCAGTTACCGTTATTGTATTTTGTCTATAGTTAGATTGGTAGTATTAAACTAAGAACCAGCCGCAACGCGTTAGACTTTA-------AAAGTTGTTTGCAATTGTACGCAATAATATA-GTTTTAT-----GCTCGTAGTTAGGTAGCTGTGTAACCGGGTAAGATTCAAACGATTTTGTACTGTATTATATACCTATCTGTGTAGTA-ATATTTATTTATTAT-------------------------------ATTAATTTTGATCTAGACGCAATAAAGTAATATCAATAAAGATAGTAAAA-------------GACAT
TAAGTTGTAAATAATTGTAAAATTGTAGTTACCGTTATTGTATTTTGTCTAAACTTA-------------------------AGCCGCAACAAGTTAGACCTAACAACAGCAACAACAACAGCAGCAGCAT-CAACAACAAATGGTTTATATAACGTTCGCAATAAATAATGTGTATATTCTTAAGTTATTCAC---ATACTGTA-TGTATTATATA----------TAGTATATATTTATTTATTATTTTACTATAGCGCCAATGCACTCTGTAAGCAGTTACTTTTGATCTAGCAGCAATAAAGCAATATCAACAATAATGATAAAACATAATTGACATCGACTT
>Ser 22997818 22998712|23261 chr3R 22998126 22998291 scaffold_3 5616574 5616720 + 6511|0 169
TAGTGTAATTCCGAACTCTTCTCTTC---GCTAAGCAACATCCTACACAGTGTGATATTTAGTGTAACCCAGGCGCGCATTTACATTCATTTAAAGGTAATGATATATATATATAAACGAAATCAACTCCTTGGCTAGCACAAG-CTGTATATAGTTCTCATTTAGGATC
TAGTGTAATTTCAAATTCTTCTCTTCAACGCTAAGCAACATCCTACACAGTGTGATATTTAGTATAACCCAGACGCGCATATAC--TCGTATATAGTTTAT---------------------CCAGTTTTTGGCCAAGCACAAGCCTGTACATAGCATAGCTCTAGGGTC
>Ser 22997818 22998712|23262 chr3R 22998397 23001603 scaffold_3 5616721 5619629 + 115739|0 365
CCGTGATCTCACCAACCAACCAATCAAGAAACCAACCAGCC----GCCCACAGC------CAGCTCAAAGTTC----------------------------------------CAATTGCCACAGCACGGGCGCTATTTCCAAGTGCATTAGTAGCGTAATTAAAACTAGGATATTGTTAAGGATACCAAGGTAGGCCACAACGGAGTGGCTCTGTTGAAAACGTACAGTTCTAAAAATCCAGGTCTCTCAGACAAAGATGAGGTACACAAATAAATTAGCTAGTTAATCAAGCATGTTATGGCCACGGGTTGGGCAAATTTATTTGTATACCTGATCTTATCTTAATACTAAACCAGTTCTCTAT
C---GATCTCAGCAAACA----------AAGCCCACAGGCCCAAGGCCCTAGGCTCATTTCCGCTTAAAGTTCCTGGCATTCAGCCTGGCATTTCCGCTTGATGTGCAGCCAGCCATTGCCACAGCACGGGCGCGATTTCCAAGTGCATTAGTAGTGTAAATTAGCC-----------TAAGGTTAGTTAGTTAGTTAGCTACT------------------TGCATAGTT-------------------------AGTTAGTGT------GTAAGTTAGTTAGTTAGTT----------TGGCTGCGTAGTTAGCATTTTGTGTTGCA-----------------------------TTCTCTGT
>CG31063 23053160 23053428|23322 chr3R 23052798 23055134 scaffold_3 5679791 5681962 + 57403|397 732
AGGCGAACGCTG----TTGCTGTTGATTCACCCAGATAAGCGGCGGCCGTGATAA-GATGATAAGATGATAAGATGCGTCCGCATCCGCAGCGTTGCCTTATACACATCTTTTAGTCAACACCAACCATTTCGAATGCTTTCCAACCGAGCGCATTGTGAGTGCGCCTAGCGCACACGATATAATACTGAAATTCCCGTGCCTGTCGAG-------------------------------GCTTACCT-----TATGATATGTATACCGTGTAATATGTA----------------ATAAACCCTGGC---------CAGCTGTCCGCTCAT-GAA
----GCCCGCTGCCCCCTGCCGTATAATCGCGTATTTCTGTTATCTAACTGATAACTACTTCACAACGATA------------ATCCGCTGGGCAGCTGCAGACGATTAATGTACGCA--AACAAGAACTTCACATGCTTTCCATCACATCG----GTTAACACGCGTAGCG------------TAACTAAATTTCGATGCCTTTCGAGTCTACACATATAGTACATACATATAAGCATTGCTTGTCTGTATATATTATAGATATTTCGTTTATCATTTGTTTGAGAATAAAGAGCATGAGCTCTAGCTGCGAGACGCAATCTCTGGCTTGTGGAA
>CG31064 23056483 23057381|23324 chr3R 23056283 23057044 scaffold_13 2943602 2944342 - 8820|213 804
TGGATCGCCACTCAAAGTCCGGATCCAGGTGCCGAAGGGAAATCAAACTGCTTAACAAGACTCTCAATTCGGGAGA-CCACAACTAAATGAACACCATAGACAGTGTGTACCATATATAGGATGCCTTTACTCCGT---AGACCAGATCCTTTTAG-------AGGAAAGTATACCAGATACCAGAATTGTTTTGAATAACTTATGTATGCAACCTGTTAGCTAAATTATCTACCCAGAGTCC-CCGTAAA-----CAAAGATTATATAT---GTACGATTATATTGTAACCATACGTCGTTGTAT-ATATGTATAGTGTGATTAAGAGGCTTCAGATGTTTATTATACATATGTATGTACGTATGGGATACCCACGCAATCGCTTATATTGTAATTATACACTCAGTCTAGTCAAATACAAATAATAATATTATTGTAATTATATACTATGAATAAATATCGAGACTATATGAATCTACAAATCCATGCAATGTACTATACGCGTTGGAACTTCTGCATATATTC----TAATCCACGTACT-----CCTCCAAATCGAACCCAGAGAAATAAAACTTATCCGAACCTCAA
TGGTCCGCCAATAGAGCTGTAAACCTAACCTGTAACTGAAAGTGCAACTGCTTAACAATA-TGTCAATATTTGAGATCCGATATTAAAAATACGTTGCCTTCAGT----ACTATCTATATAGTACCATAGTCATGTGTTATATAATACTCGTATAGCTCCTTAACAAAAGGCTATTACACG------TTGTTGAAGATTCTCCAAAT-TATAAGCTGTTAGCTGAATTTCCTTTCCCTACCCCATCGTGAAGGCCCCAAGTATTCCAAATTGCATTCTGATGTACTATAGAGCTAATTTATTATATTATATTCAAATCGATACGCATATGTACTCACAACTTGCTTTATATATATATATAT------------------ATCATTTATAT-ATATATATGGACTTAAACTAGTCAAATGACAAT------------GTAATTATATA-----AATATGTAT-------GTATGTATGTTTGTATCTAT--------CTATACATGTTAAAGGGCGTACATATACACACGGTAATACATATATAAATAACTCTCAAAACCAAACCAAAGAAATAAATCTTATCCTAAC-TCTA
>CG31064 23056483 23057381|23325 chr3R 23057045 23057334 scaffold_21 1844336 1844660 - 1671|0 325
GCCAGTTTCGGT--TTTCACAGAATGAGT---TCTACATAAATGTATTAACTTGTTCGTTTTTT------TTTTTAATTGAAATCTAATCTGAAACTAGTTTAATATATTTACTCAATGTATTTAGTGCCTGACTGCATTTAAACCTAAGCAT---AAATTCATTTGTTCAACTATTATTTGGC----------TTTCTAAAGAGATCCTCTTTGAAA---TAATGATCTATGTAATGTCTGATCCAAAGATCAGTCCACTA--AAGTTAGCATG-------TGAAAATCGGAACGGCCTGCATTGCTCTCAACATTCCAAGGACC
ACTTCTTTCGGTCGTTTTGCGGAAAATCTCTATATATATAAATATATATACACAACCGCTTTTTGTGACCTTTTTGATTAAATACGAATATGAAACTGGTTAAACATACAGAGTAAATGGAGTTTGGGTGGGCTTGC-TTTGCAGCTGAACATTCAATATTTGTTTGAACAACAAGTTGAAAGCAACACGAAAACATGTAAGAAGATGTTCTCTGGCATTTTCAAAATTATTATAATTTTTTATGTGAAGAAAATTGCAGTATTTATTTTGCAAGAAAGTAACAAAAATCCTCAAGGGTTATTTTATGCTTGGTATTTGCAAGATT
>CG31064 23056483 23057381|23326 chr3R 23057335 23058082 scaffold_13 2944875 2945595 - 27407|0 50
GCTAAGCTAAGGCT-AAATAAGAATA-CTTAAG--ATACTTAATTTATAAG
---CGGCGACGTCTAAAATAGCAATAGCTTTAGTTTTATTTAATTGCTAAG
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CAATACAAGCAGGAGCCCAACAACTGAAC---------------------------------GAGTTGTTGGACGAC--------------------GCAGCTCCA-GGAACCAGGCACA----GAAGCCGAACGAAGTGAGACGTTAGGCGAGGATTACTTAAG-----GTGGCGCGCAGTTACTTAA--------------------CCGCATCTG--AGTTG------CGGCCAAGTTCATTGGACACACAC--------ACGGCATACAGTATTTTTTGTATAGTTAAAATATACATTGGAG-TTTTAGTTCTCGACGATCGCGCCCTCGATACA----GAGTTGACTTCCGTAAAGAGGGGGCTGGATCGATCAATCGTGCATAG-----AGATCCTAGGGAGTAC---------------ATTACATTTAGACACCATTTCCTACTGTTAGCTGTAAACTAT-TATGCATAAATTAATAAATGCTTTAA
CAATACAAGCAGGAGCCCAACAACTAAACGCAGGTCGCTTAGGAATGGAGCGCAGCCGGCGGGAGTTGTTGGACGGCCGCCGTGGCGGTCGTAGTTGGCAGCTCCACGAAACCAAGACCAGGGCGGGGGCGACGCAATCAAAACGGCGGCCAGAATTTACTTAAACAAATGTGGCGCGCAGTTACTTAAAACAAAATAAAACAGGAATTATATATCTGCAAACTGAGAGATCGGTCAGTTTTGCTTAGATCATATTGTAAACGATTTCATGCAGTATTTTTTGTATAGTTAAAATATACAATAAAGTTTTTAGTTTTATGTCAAAGTA-TTTCGGTACGTTTCGAATTGAGTTCGATATGGTGAAA--TACATAGA-CACCCACACATGATTTGTAGAGTATAGAGAGTACAATACGATTATATGTAATACGTTTAGAAATCATTTCCTACTTTTAGCTGTAAACGACAAAAACCTAAATGAATAAACGCTTTAA
>CG5987 23073949 23074089|23341 chr3R 23073894 23074091 scaffold_22 1166066 1166264 + 768|57 199
TCAGTCATTTCGCCCAACTCCAGCCACACAGACTACTTACACACATCCACGATGTGT--TATTCAAATTCGTTATTTAAATTTAAATTGCTGCTCGTCACAAAAAATGTAATAAAATTCTTTCGAATCTTTAAAATAAATATT
TCATACTTTAAGCCCAGACCACGTCACGAGTTCTATTAATACTGGTTAATTTTTTGTCGTAGAGAAACTCTTAA---AAACTGGTCCAGTTTTTAGTTTTAAGATAAACAACGAAATTCTTGGAAAGTTTGGCTTGAAATCCT
>pll 23076853 23077052|23346 chr3R 23076723 23079169 scaffold_13 938065 940553 + 52211|172 375
ATGGGCCTTATTATGTTACCATTTTATTGACGAACTTGAAAAGCTCGAAGGACCATTTGTAAACCATTTCCACATTTTGTGATCAATCGCAATATATATTTTTAACTTTAACATTCCAACGAAAATTTCCCTAAAGACTTATTGTTATGCTTAAATTGTAAATGCTTACCCTATTGTTT---ATTAAATATTTTTGT-ACACTT
------CTTAATATAT------------GTTTAGCGCAAAAAGCA-----------TTCCAATATATTTT---ATTTTTTACACGTATGTCACG-ACTTTTGTTATTGTAATATTATATACATACACTCCTTAATAATATATA---AAACCAAAACTTTAAAA---TACCCTATAATTCTGGACTATATATGTATATCAAACAC
>woc 23082315 23083027|23349 chr3R 23082252 23082800 scaffold_3 5400441 5401044 + 2706|67 612
TATAAAATGTGAACGCCAACCAAGCACATCTCACTTTCGATTGACTAAACTTAATCTAGGAATCAAAAAAATCCAAGCAGCAATATACACAACTAAACTTAACACCCACTCACAT---------ACAAACGCACACTCATGTAGACACGCGAGACATTTTCATT----AGTTTTAGGATGGTAAGAT-CGTAAG-CCAGA-CAACCAGGCATC---TTTAGTCA-TTACTTAGATTGTTTAGGCGATAAGACATAAGCCAAGTGCG-------------ATGTGGTGCCCGACCGGATAAGCGGATGCGGATGCGGA---------TAAGTGCATGTAT---GTATGTACATAGATTG-ACGATGGATGACCAGATTCCCGTGTACAATG----TGGGCTGTACATAGGATGCGAACCTTAACAATTAGC------CGCGCTGTTGTTGTAAGTG-TTGAATTGTAAAATGCTGTACACTTTAACTGCAAGATCGAAGTGCATGTACATGTCTATATATAAATACATACA---TACTTTCAATGAA
TATTAAATGTTTTTACAAATTACATAAATGT-GCTGCGTCGTGAGTAGCGCAAAGTTAGG-ATCTGTATAGACTATGAATTTAAATTTGAACTTCATCTCAACATCAATTAATCTTTTTCTAAAGCAAGTCAACAATCATTTAACAGTTCGGCAACTGATTATTTCGCATATTTTGTTTAGTTAGATACGTAAGACCAGAGCAATGACGATTTCAATTAAGTCATTTAATAAGATTGTTTAGAGTTAAACTGTTAGGGAGAGTGTGCTTAATTAAGCAAATGCAGTCCCTGAGGCAGCGTTTAGATTTGAGTGCGCGAGTCGTTTTTAGGCGCGCGTACGTGGTATGTACATTGAATATATAATCTATAAACATTTAAACAAATACTATGCAGTTGCAATGTACATAGAGCATATACATAAACAATTAGCTATTGTCGCGCTGTTGTTTTAAGTGTTTTAATTGTAAAATGCTGTACTCCTTAATTAAAAAAATTAATTTTAAATATACG-----ATACATATACATATATTTTACAATCTATAAA
>woc 23082315 23083027|23350 chr3R 23082825 23082950 scaffold_3 5401064 5401246 + 1455|0 182
TTGGTGCTTAGCACATGTTTGTTTGCGGGCAAAACC-----------AAATTGGACTAACCAAGGAGCGAG----------------------------------AGTTGTGCT-----------ATATTATAAATTGTTTTAAACTTATTTGTACGCATATTTCGAT-TGTCTCTAGTTGCG
TTGGTGCTTAGCACAAAATTGTTTGCGGGCAAAATCACCAAAAAACAAAATCAGCTAAATTAAGAGATGAGCGCCTATTAACGACTCCAATCGCTTAAAAACCATAGTTGTGTTTCATAAGTAAGATTTTACATATACACCCACACATACACACACACACATATATATATATATATACATGTG
>woc 23082315 23083027|23351 chr3R 23082972 23084239 scaffold_3 5401265 5402536 + 63607|0 67
TGTTTAGTTAG------------GCAGTTATATCATTGTGTACGTGCACGGCTTGTCCTGCAATGACA
TATTTAGTTAGACACACGCGGACACACATACAATTTGTCGTATGTGAAAGGCTCATTTTTCAATGACA
>CG14262 23090049 23090136|23357 chr3R 23090003 23090418 scaffold_3 5409238 5409716 + 4897|47 134
AAAACTACTTGGAATTCCCAAAAGCTTCGCGCATAAAACCCAAAAATTTAAAAAAAATAAGCCAATAAAATATCAGTTCTCATTAGCA
AAATTTGATCGCAATGGTTAACAAGTTTGATTGT-----TCGATTATTTACATTAACTGA-CGACCAGAGTATGCGTTAACATAGCTA
>l(3)mbt 23091952 23092224|23359 chr3R 23091184 23092003 scaffold_3 5410618 5411449 + 26617|789 840
TTCCTCCGGCGAAGGTTTTTCTTCTTCGGGCACAACTATGGTGCCATCCACT
TGCTTCTGGTTCATTTTCGTCATTGTCGCTTATGGCCAAAGTGCCGTCCGCC
>l(3)mbt 23091952 23092224|23360 chr3R 23092170 23096030 scaffold_3 5412203 5416148 + 92465|0 54
GACTCCGGATACCAGGCATCCGCTTCCGTTGATTGATTTATAAGATTATTTTGTT
GGCGCC---------ACATCCGCCGCCAGCCATTATGTTTCAAGAACGTTTAGTT
>mrt 23102971 23103311|23366 chr3R 23102009 23103061 scaffold_3 5421994 5423240 + 22417|1165 1267
AGTGCTG-TAAAGTTATTGAAACCACAAAA--TACTTAGGTAA--CCATATGATAT-ATATCAAAAT------ATATATGTACCTTGTACATTACATGAACAG
TGTGCTATTAAAGCTATTGAAACATCAAAATGTACGCATGCAAAGCGATATTACGCAATATCGAAATAGAATCAGAGATGGAAACCGTATATTATATTCAGAA
>mrt 23102971 23103311|23367 chr3R 23103082 23103580 scaffold_3 5423273 5423813 + 7397|0 278
AT--GGCTATCTCCTAACTTCCTAACACATC---------GCCAAGTATTACCCCAAAAAGACAAACACCATTGTTAATACCGATT--------------CATTCC-AATCGCATTCCTTAAGCT-------ATATATACTAAC---------------CATATATATATATATATATATTCCTAGAGCCAGACCCGCGCATTGTTAAAAGACTTGATTATATTTAAGCATTAATACATAAATGAAACCTAAAGTA-AATTAAAATGTATTTATTGTTC
CCCGAGCGAAGCACAAATATGTTAAAATATTATCCCTAGAATCAAGTATTATCACAAGAAGTC-TACAATTTTGTTATTCCTAATGCCTGAAACAATTAACATTCCAAAATACATTCCTTAATTTTGAAAAAATACGTAATTATGTAAATAAAAATATATATATATATATGTATACATATTCCTAGAGCAAAGCC--CACATTGTTAAAAGACTTGATTATATTTAAGCATTAAGAAATGTAAAAAAAAAAAATGATAAATAAAATGTATTTATTGTTC
>bigmax 23113087 23113219|23369 chr3R 23109577 23115412 scaffold_15 2350590 2356547 - 228704|3638 3783
TCGCGCGGTTAGTTCATATTCTCATTGGTTATTTTAGAAATCCCTGTTTGGTAGATACTTTCGTTACGTTTACTGCGTACAAACATTAAATGCGTCATTTGAATAGTTGTAAAAGCG---TTGACAAGGA----------AAGATA
AGGC-CTTTTAGTTAA-GTTTTCTGTTTTTGTTTT-----TCTCTGTTT--------CTTTTGGTAA----AATGCTTTCAATTAGTAAATGCGTCATTT----AGTTGTAAAAGCGAGCGTTACGAGAATTCTAGACTAACATTG
>CG3348 23117253 23117381|23370 chr3R 23115675 23118327 scaffold_15 2356577 2359218 - 68377|1683 1811
TGATATCTTACGGCTAAACTTAATTTAATGCTAGTCTAAGACAACCAACCTCATTAGGCTTACGTCTATTTTTACAAAATACCTTTATTTTTAATGAAAATAAGAAAAAAAATCAGTACAAAATCAAAA
CACTATTT-------ATACTTAATTTTATAATATTTACATATGCATAAT----TTATACTTAAGTC-GTTTTTAGAAAACACTTTACTCTTTAAGTGAAATAC-AGAAAAGATCAGTACAATAAGAAAA
>CG3330 23155407 23155536|23406 chr3R 23155406 23156572 scaffold_15 2401379 2402461 - 18502|1 144
-GGAAAAGATGACCGGCG----ATCGGCAGATTGTCCTAAAATCCAATGC--GTCCAGCCCAAATCTCTCA--TTTGTCAAAATTTTTTTAAGTGATCTTTGCATGAATAAACTGAAGAAGACA------TAGTTTAATAAAAA
TGCAATACTTAAACCGAGTGGCATAAACAGACTTGACTTATTTTGAACGCCTGACAAATATCGAACTCTTAGCTTCGTCAAAATTTTC--------------CGTAAATATACTGTAAAGCACACGCATTTAGGTTATTAAAAA
>Klp98A 23373496 23374455|23639 chr3R 23373489 23378885 scaffold_15 2680205 2685430 - 235720|7 1090
TAGTTAACCTACTGCTGAATTATCTCCTGCCTACAGTGTGTCTTTTTATTTACTTGTACTACCTGTTAAGCTATATGAACGACAACATGGACCTGTTTTGATTAGCTAGCCGAAGC------TACTGTGTAGATTAAATTAGT--------TTTAAGCCC----------------CGTAGCTATGTAAGACCACCAGTGTCCTTTC------------------TAACACTCG-AACATATGTGCGACATTTTTTATACCCATTGTTATCTACTGAATCGGAGCTTTATATTGAAATCACTTTAAATGTAACTGCCAGTGGCGACGTTGCAATCTCTGATTTGTACTACACCAAGTGCAAATATATATTCTATCTATTAGTATCGATATCGCGTTGGAGGTTTGTTTAGATGGTTTGTTGGTGTTTTTACGGCCAG-----------------------------TTTTAATTAGTTAATTATTTACCTTTACTAGTTAA-----TTATAC-------GCATAGGTGTACGACTTCCAAAAAGTTATTCCAGTTATTTAGTCTGTGATTGCCAACTG-AAGTTATA-GATCAGAATCAGAATCCAAACAAATGAGCGTAACTGAACATTTCACGAGCGAGTAATAGT--AATCCAATCC---------TAGGCGTAAGCTACTTGTACA---AATCGAACACTGAAGGGTC-TAGGTGGGCAGATGTTTAGCAGTAGGTATTAGGT--TCACTAGCTACTAAGTTCTAGAACTAAGTCGATGCGTCGCAATTAAACTACACTAATTATGAGTACAATTCCCGAAGATGTAACAACATGAAATGTTCAATGTAAAAAGCATAGACTAAGTTTACTTATAGCAATATGCTAGTTGATATTGAATGGTGAAATTGATCGATCGGCGGATCGATGGCAATAAGTGAAACAATA--ATAGCCTAGATGTAGTAAAACCT-------------GATGGTTCCGGCCACTCAAATGGAAGTCCCTCAGGGACAGGCCAATTCCACAGAGCGGCTGCTATCGTAAAAAAATAAATACGTAATATATACATA
TAGTTAACCTACTGCTGAATTATCTCCTGCCTACAGTGTGTCTATTTATTTATTTGTATTATCTGCTTAGCTATATGAACGACAACCTGGACCTGTTTTAAGTAGCTAGCCCAAGTAATCCATAGAATGTAAACTCAATTATGTATCTATATATAAGACCATGTTTGTACTATTTATGTATGTATATAAGACCACCAGTGTCCTTCCAATATGTTATTACTTTTATACCAATTGTAATATATACATACATAACTGTATAAACATTTATAATCACTGTAT-GGAGCTTTACCTTAAACCGATTGTAAATCTAACTGCCAATGGCATTCTTGTATTGTAT-ATATATAC--------GTGCACATATTGACT-----------TCCCAAT-----GGTTGAGATTTATTTATACGTTTTGTTGGTTTGTTTACAAACAGCTTGCGCCAGAAATTGATATGTGGCGTATTTTAAAATAGCTAATTTTTTGCT----CTAGTTAAATATTTTATACTTGTATTGTGTGTGTGTGAAACTTCC-ATAAGTTATTCCAGTTATTCAGTCTGTGATTATCTAATGAAAGTTATATGACAAAAATCTAAATCCAAACAAA-GTACGTAACTGAACATTTCACGAGAATATAAAAGTCCAATTAAAACCTGTATTTGTTAACCGTAAGCTAGATATAAAAATAATTGAACACTGATGGGTCATGGGTAGGCAGATGTTTAGCAGTAGGTGATAAGCAATATATAGTTTCTAAG---TAACCATAAGCTGAT-CGTCGCAATTACAATACACTAATTATGAGTACAACT-----AACCGCAAAAACATTAAATGTTAATTATATAAGGCTTAGAATAAACAC-------------------------TTGATCGTTAAAGTTGCTCGATT------------GCAATTACGGAAACAATAATATAGTCTAAATGTTACAATAAATTCGTATATATATATATATTTAAAATATTTCAAATGGCAGCACTT------GGCGCCAACTCTAAA-----------ATGTTAAGCTAACAGACTGTTAATTCCAGCATA
>wdb 23390760 23391290|23654 chr3R 23388815 23392798 scaffold_13 1735074 1739544 - 93235|2365 3075
GCAACGCGAGGCGCGCCGGAAACTAACAATAAA----ACCAAGATCAGTAAGAGC-----------------GTAAG-------------------CGTAACGCGTTATCCGATATCCGTAAAC-------------------------GGCAGAGAGACA-----------------------GCAAGCAAGCAACCACATCTAAA---------GGAGAAATAA-------------------------------ATAGTTAT--ACTAAACCACACATATGCTAAACCTTAAAACCAGAAAACAT-AAAACTGAAACGTATACTCGATTGACAAGACACCAACCAAGCTGGCCAGACCCACAGCTCGCTTGGGCGGCTGTTGAAGGAGGTAGAACCGAAATCTGGATCGGGATCAGGATCGGGAGCTGGATCATCAGATCCCAGGGCGTGTGTGTGTCCGCGTTAATTAAGAAGCTTGAGTGCGGCATTAAAGAAATCTTTATAAATAATGTATCTTACGA------------------CTACAGCAACACACACACACACACCACACACACGTGCGCGACACGTATAA------ATATATATTACAA-AGGAAGAAAATA------ATTATTAATTACGTTTAAGC-------------GAAAAGATGTTGAATAAAGAGAAATCATGTTAGTAAGTGAA-----AA
GCAACGCAAAGCGCGCTGGAAACTAACAATAAACAACAGAAACAACAGCAACAGCAACCACAACAGTTAAATGCAAGAAGAACACGAACAACAACACATAAAATGTCAGCCGGCTCACGTACACACCCAAACCCACACACACACAAATGAACACAAACACACACACACACACACACACACACACACACACATTCATCTATATATAAAATTAAAATCAAAGAAATAAATAAGAATGAAATTTGTTGAGCTGGCGATAAATAGTTATAAACAAAATGCAGCTTATGCTAAAACTTAA------TAAATATGAAAACTAAATTGTATACTCGTTTAACAAGACACCAA--AAGC----------------------AAGTGGCTGCTGGAGTGG-------------------CAGGATCAGCAT----------------------CAGGGCGTG-----------GCTAAACTAAATGCTTGAGGAGCGCAGCAAGAAAATTCTATAAAATATAATATCTAAAAAACACTACTTACACACAACCAACACCAACACACACACACA---CACACACATATTATAAATACATATAAATATATATATATATTACAAGAGCAAGAAGATAAAATATATTATTAATTAGGTTTAAGTTAAAGAAACAAAAGAAAAGAAATTGAATAAAGCGTAAAAGTGTTAGTAAGTGAAACAAGAA
>CG5639 23412095 23412407|23677 chr3R 23411316 23412171 scaffold_13 1760419 1761215 - 5334|836 912
TGTCACATACTGATATGATCTTTAAGTATCTGAATCTAAAACCCTTATCTTGGAATAAAAATCACGAACGTGTCAGC
AACCATACACATTCCTCATCTATAATTGTCTAAG-----------------GAAATAAAGATCGC--ACATGTCAGC
>CG5639 23412095 23412407|23678 chr3R 23412172 23415417 scaffold_13 1761678 1764950 - 143460|0 253
GCATTCCGTTGTTGAG-TTATCTAAATCAATTTGTAAATAAAACAGAGCAAATTTAAGATCTACTTTTAGGGGGGAGAAGAGATCAGAGGC--CTTGATTCTGCCCCAACTAAGCCAAA---------AGGGGAGTGCGACTAGA-----GGGAACCCACTTTCGAATACTTAT-CGCATATGTTCTAGCAACCTAAGACGATTAATTTATGAATAAAGCTTTAAAGTCGAATAAATAGTCTTTTTTTTTTTTT
GCGTAGTTGTGTTTAGTTTAGTGAAATCAATTTGTAAATAA---------------------ATTTTTTGG------------CTAGACGCCGCTTGGCGCCGCCTCGAGTGGTCCATGCCCCACATCCAGAAAATGCTGACAGATGGCGGGGCACCTA---TCATATATGTATGTATGTACTTTCTAGACGCATAAGACGACTAATTTATGAATAAAGCTTTAAAAACGAACTAACTGATTTGCACCTCTCTT
>dsd 23423481 23424756|23688 chr3R 23423270 23424960 scaffold_13 1777431 1779215 - 28669|289 1736
TAACCGTAACACTATGCTTACCTACATAAAGAAATAATGATAACGATAATGATAATAATTATGATAATATGTAACTAGCGAATAGGTACGAGTATATAGAATATTTGCCTCGACTTTCTTCTACTAAC-----CACACACAAAAGTCAAGCTAGCAAGTTGATAATCCGCAGTTATTATTACTTTAATGC-ATTAGACTAGT-------------AACGAAACGAGA-----ATGCAAGAAAGAAGGAAAGAAAGA----------------AACAAACAAATA---------------ATAATAATTTTTAGCAAAAGGACATATTTATATACG-GTTATATACAATTTGATATAGTTGATAGGTC--GAGTAGCGTTGCAA-TAGTTATAAATGTTTAATTTATTATTTATACCGGGTACCGCGTGCGCTAAGCCCGGTGGCAACAACAGCTGTA---TTCAAATTATTAATGTAT-------TTTTTTTACTTAACCAC------------ATAGCCTAAGCGTGTTGTTAGAATTTATTTATGCA---AATTTTGTGAGCTGCCCCGGCAGCAGTTGCACCATATGCCGCGACAGAAACAGAGTTAAAAACAAAAGACATTCAATTGATCTTAGCAAA--------AAAAAAAGTGA-----TGAACCAAACCAGAGGACAGGCAGACATGTACAAGGAGAAGGAGAAG---GAGAAGGAGCGAGGTGACGGAGAAATGCAATACTGTGTTCAATAATAGAA-------------------------ATATTTCTGTTTTTAATATCCGTGCAAATATTTACAACGCAAGACATAAGTGGATCAAGA-CATAGAC-------------------CGACAAAAAAATAGAAAAACAATGCAAGTGTAAATAATATACGTAAATTACTAACGCTATTTAGATAGTAGTTATACATATACAAATACAAATAGCTCTTGATATGAGAACGCGCCCAAAACAAATCAAACGATTATATTGTACATGCAATCTAG---ATGAGAGATCCAACATTTACCAACAAAATTCCAATTAAATCACAAACTAATCGTAAGGTTTCCTCTTGGCAGCAGCAAACAAACAAAAAACAACAGAAAGAACTCACGCAGTTAATTAACTCTATAATTCAAACTAAG---ACAAGTCTCACCAACTA----ACTAGATGCACTCTCTGATATACAAATCCAGAAATGGAACAACCTCTAGAATCAAAAGGCACTCGTCGCAAACTTTAACTAACACCTAGAGATCTCTTAAGAAACACACCTTTTAAAGTACAC---------AATCTCCAGTCG----AGATGTTGACG----ATCCGATCGCTTTGGGTTAGTAGGCAGACAATTGTACATCTGTTTAATTTTTTAAACGATCTAATAAAGTCCATTTACGAAATTTAA
TGA----AATAC--AGTTTGCACGCGATAATAATTATGATGAATGATAGTGTGTACAATTA-GATGATAGAACCCTAGCGAATATGCTCCAG----------ATTTTCTCTATCTATATAACACACACACACACACACAGACACACACAGCTAGCAAGTTGATAATCCGCAGCTATTAATACTTTAATGCAATTAGTCTAATATACCCTTAAACGAGCGATACGAGAGTACGATGCAAATAATAATAATAATAATAATATTATTAAAATTATAATAATTGAATGATTATTAATAATAACATGATAATTTTTAGCAAAAGGACATATTTATATACGAGTTATATACAATTTGATATAGTTGATAGGTCGTGCGTAGCGTTGCAATTAGTTGTAAATGTTTTATTTATTATTTATAC--AGTAAAATGTAAACTAATTTT--TAGCAGCTACAGCTCCAACTTTTAGTTTATAAATATATATACATATATATATATATAAATACATCCATTCATATATGGCTTAAGTGTGTTGTTAGAATTTATTTATGCAATTAATTATGTG-TTTTTTTTTATTGTGTTTTTGCTAGTTACCACAA-------------------AAAAGACATTTTACTAATTTTAGCAAAAGCCGTATAGAAAAAGTGATCTTTTAACACACTTGAGAGAGCAACAACAAATTAATGAATGTGTGCAAAAATCTGCTAAATACTGTGTTCATACAAAATAACAATAC---ACTCAAAAGAAAAAAAAAAAAAGAAGAAAAAACGACAACAAATAAAAGTATTTTGTTTCTGTGCAAATATTTACAACAAAGAGCAAAGAACGAACAAGAGCATGAACATGTGTCTGTAAATATATACGATAAATAAATATATATAT-ATATATACATATATACTATACGTAAATTATGCAGCCTA-------------TATATGTAT---AGTACATAGAGC----------AAAACGCGCCCAAAACAAATCAG-------------TTATGTAATTTAGTGTATG-----------------CAACACAATTGTATTAATAATAAAAAATAACAACAA--TTTCCTTT---------------------GAACAACATAAAAAACTCA-------AATTAAGCCTAAGGTTTCCACTTGGATAACAAATTTGAACAGCAACAACAATGTATGCACCTTGTAAC-TAGAAA--CAACAATGAAAC-------AGAATCAAACGGCACTTGTCAACCACTTT---TAATATATATATATATATATAAATATATATATACATAATTATATGCTATAAAGAAACCCCAAGCATTTCAGATGTTAATGAAATAACAAAATACTTCAGGCTAG--ACCAGCTAATTGTATAGTTCTTCAAGTCTGCAAGTGATGCAACA--------TTTTAAAATTGAA
>CG5612 23449081 23449203|23722 chr3R 23448747 23449910 scaffold_13 1812153 1813327 - 14417|390 550
GTAGCCCGCCAGGGGGG---GGAATCATTAGTTAATCCA------TGGAAAGCTTT--ATGAGTAGTCTTTAGTCCAACAT-TCTGTCTATTGTA----TTTTACGAAATAAA--CTTTTGGCCTAAGC--------------------CAAGGCACACAC
GTGTCATGGAGCGGGGGCAAGGTATAATTAATTTAGTCAACCGATTGAAAAGCTTTAAATGAGTAGTGTTTAGGGGCGCATATTTGCATATTGTAATATTTTTATCAAATAAAACCAATTGTCGAAAGCCGAGCTAACAGTCTTAAGAACAAGGCACGCAC
>tau 23466512 23467156|23732 chr3R 23463328 23470228 scaffold_13 1830695 1837661 - 125208|3444 4187
ATGCCG-----AAATGCATGTCGAGCTGTATCTGAAACTGAATCTGAAACTGACT---------CTTTCTTTGCAAGCTAAGA-------------------------TCAACAAAAGTGAAATATGAGCA--GCTAATTTGAAACGTACTATCT-AAGCAAAATCCACACAATGCAAAACGAGAGTTATGCGATAATTTCCACACACCCAGATAATTCACAAGCCAGTAAATGCGATCAGATCAATTCGATAGAGGTGCAAGCACGCAATGAGATGCAGATACTCGTACATCTACACAACCACCCCACATAGAAGCGGTATTTGGTATACAATCGAAAGTATATTTGACTAGTTGAGCAATGCACTCTTTATCA-TCAGATAGCAGA-------CATGAATTATATA--TCTCAATGTATTACCAG------AACTTCATATATACATACAAATCTATATATATATATATATACATA---TATAAATAAAAGTATCTAAATATTTAAGCAAATTATACAAGAAACGTACGAATAAAGTGTATGCTTAGTTGAAAATGT-----TACCA--------CTTGACGTCTAAATGTTAAACGACTAAGATAATGCAACCATTTAGATACTTTTGCGACCAGTGAAAACCAAAAAC---CAAACCCAACTGAACAG-----ATACGAAACAAAAAAC---------------AAAACG-AACCGAACCGAACAGAA-GAGATAATAAC
ATCCAGTCCAAATATGCATGTTGAGCTGAAGTTTTACTTTCGTTTGATGCAAATTTGCAAATTACATAAATTGCAAAAGAAGAAAAAAACTAAATTGAAAATAACAAATAAAAAAAAAAGAATTTTGAACAAAGCTTATTTGAAAAATGTAATCTTAAGCAAAAGTTACACAA-----ATTGAAATATATGCAATAATTACCACACAATACGAGTATTTACTCAAAATTAAATT----------------------GTGCAAGCACACAA-------CACACACTC-----------------CGTTACAAAAA---------TAAAATAAAAT--AAATTATAT--GATTAGTTGATCTATGCACTATTTATCAATCAGATACCAAGGCAAATGCATAAACTATATAAATCTTTATATACAAACAATAAGCAAATTTCATATACTACAACAAACATATATATTGAAAAAAATAATTAAAATAAAAAAGAAAGTATCTAAAGTAATAAG-AAATTATACAAAGCATAAAC-AGTTAGTTATTTGCATATATATATATATATATATATCAACTGTGTGCTTTACGTGTA---GTTAAATGTGTTGAAAAATAAAAT-----------------GAAAAGTGAAACATGAAAACTATCAGATACAAGTTCGCAATTCATATACAAATTTAGATACTTTTACTTTTTGCAAAAACCGCAACCGATTCGAGTACCACAATTTAAGCAT
>Mlc1 23483285 23483677|23753 chr3R 23483100 23485007 scaffold_13 1857129 1859054 - 62547|234 655
CATTCCTCGCCAGAATGTGTGACAGACCAGATCAGCTA-AAATAGTTGAAAACAACAGCTTCAACAACAACCAACAAACAACAACAACAACAACAACAAC-ACCAACAAACTTTTAGC-GACAACCATTCTCCATAGATGTTATATTCATCGCTAACTCTCTCTA--TCTCTCTCGTATATTATTTTAATTAAAAATTACTTCTGCTACTACAACTGCAAAATTGAACTTCAAGATAATATTATTTTTTAAAAAAT--AAAAAAATTTAAATTAT-AAAATAACGAAAAC---------AAAAAAACTGAAAAATATTCAAAGTTTTGTGCACATTATTTT-------GTTATGAATTAT---TTTGTTGGTTCAGCCAAAAGCAAAGCAATAGTTAATGATTATTTTATATG--AGACGTG
CATTCCTTGCAAGAATGTGTGACAGACCAGATGCGCTATAAATAAATAAA-----------TAACAACAAC-----AACAACAACAACAACAAGAACACCAAACAACAAATTTATAGCAAACAGCCATTCTCCATAGATGTTATATTCATCGCTAACTCTCTCTATCTCTCTCTCGTATATTATTTTAATTAAATTTTACTTCTGCTACTACAACTGCAAAATTGAACTTCAAGATAATATTATTTTTTAAAAAATAAAAAAAAATTTAAATTATAAAAATAACGAAAACAAAAGAAAAAAAAAAACTGAAAAAAAT---AAGTTTCGTGCCAATTATTTTTGTTTTGTTCATGAATTTTTCATTTTTAAGTT---TTAAGTGCAATCCCAAAATTTATT-TTATTTATTTTGAAAGACGCA
>Mlc1 23483789 23483791|23753 chr3R 23483100 23485007 scaffold_13 1857129 1859054 - 62547|772 774
ACA
ACA
>Sce 23506126 23506272|23766 chr3R 23506150 23507800 scaffold_13 1886730 1888396 - 74861|0 125
-CTGTACGAAGCGTTTTAGTATTAGGCCGTTTATTTCTGAAATGGAAATATGTCTAGCTGTAGAGCTTAACACACGTATATAAAGCATTCATGTAC--CACAA-AATATATTTAATTGTAAGTAAA
CTAGTTCAAGGCATTTTAGTTTTTAA-CATTTATTTCCATCATCGAAATATATATGTTTATAGGTTT----ACCCTTACA------ATTTATGTGCTTCACAAGAATATATATACATATATAGAAA
>CG31055 23511352 23512016|23775 chr3R 23511225 23511497 scaffold_10 578723 579002 - 1793|143 296
TTTAGTTGCTATGCAAATATGTATTTCCTGCTTTCTAAGATAGAATTTTACATCCATTCATTAGTCTTATTATATTA--TTAAGTTTTTA------AATTAGACTGTAACGTCTTAAGTTTTTAAATTTAAAGTTTTTATGACATACTTTTTAA
TTTAGCTGGCTTTAAGATA-ATATTGTCAATTTCTTATAATAACGTTTAAAAGGCG--CATTAATGCTCTTCATTTGAGTTTAGTTATTATAAAAAAACTAAACTCAAATTTGTTAA------ACATCTAAAACTTGCTGAACCAGCATTTGGA
>CG31055 23511352 23512016|23776 chr3R 23511660 23512226 scaffold_13 1892149 1892746 - 789|0 406
AGCGGATCCACGATGTCCTGGCAACTTACCCCAGCAGCCAGGCCGCCGTTCCCATCCAGCTTG--GACGCATGTTGATGAACTTGTGCTTGCCGACTGACACTTTTAGCATGTGGCAAGCAACGATTTCGAGTAAACGCAATCGAATTAGAGTTTCT-----AAGTCTTTTGCTTGTGGCGCCAAA-------TGCTGAGAAAGT------GCATCTAAAAATTCGCGTCAACTAC-----GAGCACGGTTTTCAGTTCGAAATTC----GGTATCTTTGCCACTCGGATTT--------------GGATTTTCAAGTTCCGCAATTC----GACCGCAGATACGTCCGCACACGATAAAATCTCGCCAAAGACTGAATGA--AGCGGGC-CGGTCGTCGTCGCAGT
AGCTGAAACTGTATTCAGTATTTACTTACCATAGCCAGCG---------------CCAGCTTGTTGCCGCAT----ATGCTCTTGTTACCATTG-TTGTCATTGTTATTGTTCTTGTTGCACTCATTTTCATTAA-CATAAGCTGTTACGTGTTTTTTTTATATTTTTTTTGCTTTTGTTGCTCAAATTTGTATGCTTAGCGCATCGTTTGGTGGCGCCAAAGTTGCAGCAGGCATTTAATGCGCAAGCTGTTAAATTAACGTATCTGATGGTCGCTATGTTAACTGAATGTCTGTTATGAATCACAGTTTTAGAATATATGCACTTCTGTTAGCCGCAGACACGTCCGCACGCGATAAAATCTCGCCAAACACTGAATGGGCAGCGGCCACGGCCAGGGCCAAAGT
>CG12876 23522187 23522437|23790 chr3R 23520959 23524468 scaffold_13 1901953 1905435 - 153003|1248 1521
ATGGCGCTGTAGCTGTAATCAAGTTCATGTCCACATGTG------CGCAGTCCGTTCCGCCCAAGGGTCAATCGCATGGCAGAGCCTCAGATGAGTCTGGATGGTGGGCAGACAAGATGGGTGGTATTCGGCATTTAATGCTC------------CGTGTTCTGGTTCTGTTTGGAAATTGTATCATACAT-----GTTGATGGCTTATTGGATTTTAATCTCATATATGAAAACATTATTATCACGTATCACAGTAAACGTTCTTACCCTAGA
ATT--------------AACGAGCTCTATTCCACATCAGTTATATCGCACTGTGTTTAGCCTGCGGCTCTAT---ATGTTA------TTCGTGAATTTAGATTCGATCTAAAC---CTGGATTGGTTATGGCATTTAATGCGCGCACCCCGGCCACCCTTTTTGGTTCCGTTT-CAAATTGTATCAAATATAAGAAAATGAATGCTTATTGGATTTTAATCTCATAT-----------------ACGTATCACAATAAACGTTCCGTC------
>CG12428 23529099 23529445|23793 chr3R 23529264 23531121 scaffold_13 1913233 1915061 - 63786|0 184
-AAGCTCATCTAGTATTAAGAAAAGATCTAATCTTACTTTATGTCGTCATTGAAATTCAGTTCTCATTTTTAGT---TCCAATCAGAAAGTAGATTTTTGGTTTTTCTTTCCATTTTGTTTCAATTAGCACAATTACCTAGATTTTAACGAACAGTCGAATTTAAATATTTTTTATTTGAAATTG
TGTGCTCA-----------------ATCTCAAGTTTGCGCATTACGATAT---AAATCGATACCCAATTTTAATGCATTCCATCTGGAATTGGA--TCAGATTTTTCTTGCCTTCTGCCATATATCAGGAGCTGCCCATAGACTTAATC--ACGTTTATATTGATTAACTTTATCGTTTAATTTG
>CG5003 23739491 23739759|24050 chr3R 23739073 23742156 scaffold_13 2188566 2191884 - 72149|534 829
AATATTGTTTGTAAAGATTCCGTCGAAGTGGGCCGTGCTGGATTATTTTATTTTTTTTTAA--------GAAAAAAGACGACATGGCCAAGCCGATGGATCCACAAC---GCTGGCTACAAGCGAGTG--------------CTGTAGCTCAGCCATCTAGTATTACGTTT-GACTATTCGAGTCCTTGTA-ATATATACACGCCAGGCTAAACGCACTGTATAAATCAAAACCACAATTCAATTCCTTTAGCTAGGCATTAAAAAGAGCGCGCGAGATCCTTTTGGTAAATATGT
-ATTTTGTATCTATGCAT------GATAAAGACCCACCCTTATTCCTGTAATCCTTTTGAATGTTCCATGCTTGATGGCGCCTTGATC-GGCCAACGGCATCGCCATTTGGGTAGCTATATGTGTCTGTGGCACCTGCTGCTCTGGCGCTGAGTTATTTAGTATTATGTTTGGAACATATATATTTACATATATATATATATGGTCGCTTAACCG-AATGTATAAACCTA------------------CTTGTTAAGCAATTAAA------CGATAAACCATTTTGGAATTGACAA
>CG33213 23743899 23743979|24051 chr3R 23742689 23744770 scaffold_13 2192118 2194225 - 65653|1239 1323
ACAGCGTATAGAAATCTTGACCTAGCTGGTATTTA----TTAGTACATAGAAATCGATAACAATAAAGCGAATAGATCCTACGAA
TTAACC-----AAAAATTTGCCTAAATTGTATTTTATTTTTAGTGCATAACAAT--ATTAATAAAAAGATATGCGCTTTTATGAC
>CG12259 23745552 23745636|24054 chr3R 23745500 23745598 scaffold_55 234390 234477 + 2092|52 98
AATAATGATTGATTTAATACATCAAAACAAACGAAAAATAACTACAA
AAAATTGATTAATTTAATAAACGTTACCAAATATAGAATAGCTTTAA
>CG4980 23746995 23747091|24055 chr3R 23745638 23747049 scaffold_55 238409 239808 + 73477|1418 1472
ACTTACGACTGTAACTAAATATAAAGGATATTAAAAAAAACAGCTAAAAATCTAA
ACTTAAATCTGTAATTAAAAAAGAATAAATGTACCAAACATTTCTTATAATCTT-
>Mes-4 23758704 23758904|24067 chr3R 23755401 23758840 scaffold_13 583487 587027 - 112770|3553 3713
TATTATGAATG------AATATTTTTATCTACCACATGTA-----------TTTATT-------TCCTAAAAGTTATGACGTATGTTTTTTAGAGACAATCTAGTGGAGATTGTGCTGAACAGATGGATGTTGTGAAAATAAAGTGAGACGATTATTATGT
TGTCGAAGATGTCATGAAAAATTATAATCTCACAAGGGTAAAAACATTTATTTTATTGGACTAATTTTAAAATTTAT--CAATTGATTAATAAAAACAAT----------------TAAACAAAAAGGCGTTGCAACAATAATTTAGTTTCGTTGTTTTAC
>Mes-4 23758704 23758904|24068 chr3R 23758841 23760754 scaffold_13 587547 589493 - 82389|0 79
TGGATGC--------CAATTATATAGAAATCGCTTAAACTCAAGAAAA--------TTTTTTAACATTACATTTTTGTTG
TGGATGCTGCTCCTGCTAGCAAAGAGCCGTAGTTTAA--TTGAGAAGAATATAGTGTATTTTTTTGTGGCATTTCTGTTG
>CG4963 23768511 23769703|24075 chr3R 23768033 23768887 scaffold_13 596449 597350 - 11777|506 953
ATGTAGAGAGCCGTAGCCTAGCTATGTCCATTGTCCTTGCTCCACGCACTCGACTG-------TTTCGATCTATCATCACACATTATCCTCGTCTCAGTGCTAGAGTT--CCACATCCTTGAGTAGCAGACGCAGTTGAGTGCCGGGGATCAAGGCTAGTGGATCGCCCAAAATATACAATAATGCAT------------------------CATA-TTATTACGTTCACTGTT----ATTTTTGTTTATATATATGCATA--------------------ATATATATGGATATGCTGCACCGGCGACTATTAAACTGTAAGGTGTAGCGCT--AAATTACAATT--TTATTGTTAAAGAATTCAAACGAAAAAAAAACAAGCGGAAGCAAAA---------CCATTGGCAAGCGAAATGGCCCATTAAACGGATGAAAGAAACGAA
ATCGATGTACCAGCTAATCAGACATGATAACTATAATTGATATATGCTCTTAAGTACCAAAGTTTTTAGGCTATAA--ACAAAACAAAAAAGGTTCAATTCTGTAGATGACGTCACAATCAAGTGCACGGTGCAGGCACATAGCTGCAGCCTCGGATTATATATC-CCATATATACACACAAATACATACACACACACACACACACACCACACATAATTATTACGTTTATTGTTTGTTATTTTTATTTATATACATGCTTATATATCTATTACGAAATTATATATGTATATAAATATTGCACTTGCTATTTGTAA-CTGTGAACTGTAGCCCCTAAAATTAATACGCATTATTGTTAAACAATTCAAGAGACAAGCAACAAAAAGAGAGAAACAATGAATTTCCCCCTCCCTCAAAAAATA----ATTAAACGGC---GATAAAAAAA
>CG4963 23768511 23769703|24076 chr3R 23768961 23770439 scaffold_13 597496 598948 - 43756|0 873
GCGTCGCCGGTGGGCG------TGGCCGCGAGCGGGGCCGGCGTTCG---AAACGTTTGCAGCAGCAGCGACAGCTAAACCTAAGCGTAGCTATTAGTT-----GGCGGTAGGAAATGGG------------------------------------------------------ATGATGGCTGGGGTGGATCCAGGGCAGGGGCCACCTGGGCAGGCGGGGACGACACGGTGTTCGAAATACCTGCCGTTCCGCCAAACCACCGCCTGGCCACTGCCCCACCACCGGCCCGCCCGGACCCAGCTGCTTGTATGAATACTCTGCGAGGAGTCGGTGAGAGAGTTTTATCACTCCATAGTCGGAGGTTAAATCGTAGTTGTTGTTCTGCACAAAACTCTCGCTCTCACACACAACACGCAAACACACACACACACACACCC------------------TATACACACACAATATGACATTTTTAGGCAAAGTGCGAAATTCTTGTTAAAAGTATATGCTAATGATGATACTGTATCTATGTTACTTTGAAA------TGAGATAACCTTCTTGTAAAATACTATTACCTATGTATTACAACCTTTGATTTACAACAATTATATATATATTTTTTTTAAACAATTTTCAAATGATATACGCATATACATAC--ATATATTTATGTTGATCGTTGTAAAGT-------AATCAAGAGCAAAAATGTAAAG----------CACACGCTCGCGCGGCAGAA---------------GGAAAAATTCAATAATTTGTAATCAAATTACAGCCGAAATCTTCAAACTGAGATGTTACAAA-ATATAAGGAACAGCAGATA----CAGCAGAAAACAGCT
GCTGGGCGCGTGTGTGGGCGAACGGCCGTGAGCGGGGCCAGCGTTCGTTAGCACGTTAACAGCAGCGACTA-----AAAAATAAGCGTAGCTTTTAGTTAAGAGAGCAGCCGAAACGGAGAACTAGTTTAATATATATATATATATGTATTTATATTTGTATATGTATATGTATATATTTATTGTGGAGGATGAGGAGAAGA------CTGCGATGGTGTCG--GACACGGCGTTTGAAACGCCTGGCGACT------GCCATTGCCCGTCCTCTGCCCTCC--------------GTTCTGGCTGCATGTTTGAATACTCGGCGCGGAGTCGGTGAGAGAGTTTTATCACTCCATAGTCGGAGGTTAAATTGTAGTTGTTGTTGTGCACAAAACTCTCGCTCTCACACAC-ACACACACACCTAAACACCCCCCTCCCCCAACAACAAAAAAACAAACACACACACACGATAC----------AGTCATCTGCGAAATTCTTGTTAAAA----ATACTGCTAATAATATTGTATCTATGTTAATTGAAAAATGATGAGAGGAAACCCACTTGTAAAATACTATTACCTA--------AAATTATGTATTACTGCGAT------GATTTTTTTAAAAAACAAATTTAAAAGTATATATACATATACATATGAATATATTTATGTTTATGTTGTTAAAGTAAAACAAAATACAAAACAAACGCGCAATGCAACTACACACACACACACACACATAAACAAATAAAACAATTTGGAAAAAAAATAATTAATTTGTAATCGAATTACAATTTACACAAACAAATTATGCTGTTACAAACAAACAAAAAAAATCAATTAGTTTCGATAAACAACTGCT
>CG4951 23778424 23778474|24086 chr3R 23778474 23779782 scaffold_13 610851 612158 - 8429|0 0
G
G
>%26bgr%3BTub97EF 23792730 23792827|24094 chr3R 23792729 23794172 scaffold_15 2512455 2514002 + 62573|1 110
AGTCCTAGAAACTATCACAACTGTAGCTGTTTTCTGTAT-ACTATTTTGTAAATTATTTGTCC-----------CGAAAAGGCTTCAAATAAATATTTAGTAAATATAGT
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>larp 24143896 24146303|24472 chr3R 24143885 24145833 scaffold_15 2893290 2895364 + 38168|11 2271
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-----------------CTAAGAGCGCCTCAACTTGCTGCAAATCTGTAAATTTGTTTTATTCTTAGCTCCAGACACGTTTACTATTTACGCGAAAACAACAATAGTAATAATAATTGCCA--ATAAATTGTAAAACCAAAAGCAA-----TTAGAGTGAACCGATTAAA-
>WASp 24650228 24651171|24919 chr3R 24649507 24653349 scaffold_29 364711 368901 + 86771|930 2138
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ATAGATTAACAACTAGGCGGCCATTAGAGATGATTGTTGGCAAACACATTATTCCAAATATAAGCAATAATTTTATTTGTGCTTTGGCATTTTGATTTATCGCCAGATAAATCACTGTAAATACTGTTTAGTGAATTTTTCATACCTCTTTAATTTAATTTTTCTAAAAACTGTTAAACAACAAACAAAATACGCAAATTTATTAACACAAGTTAAAAAACTAAAGAAAAAATAACGAAAATAATTATGATTGCATAAGAACTATTTGTTTT--TCACTACCAATTCACATATGCATATAATTCCTTTTAATTGCTCAAAAAGAAACGAAATTCATAATCAAAAATGACTTAAAATTATCAAAAACAAAACAACAATATTTATGTACATACATATGAATATGTATCCACAACAATAAACCTAAAATATATATCTGCATGTGCTT-----AACTTGTTCAGA--GATGTGCCAAAAA-----GAAAAACAACTATTAATATGCCCCTGTCAAAAAACAAAAAAAAACC------CGAAGCAAAAGTCTGTATATAAGACCTAAGATATATTTTCTGAAAATATGCTTAATTAAACTAGTTAGTCGCGGCCCATTTGGAGTTGTCTTATAGAACTTGAACTAAGCCTAGACAAATGCGCGAACTGAGGATTTTTTCAAATCAGCGTTATAATAACTAAATGTGAATGAATATGTATGTTTTATTCAATTTAATAACAATACTAATAAACATAAAATTGTAATTCAAAAAATTGAAATATTGCAATTGCAACCCCAAACTGACTAATCGAAATTGCAAATTTATTAACATTTATTAAACAAATTTTTTGCTCAAAACAATAAAAAATTCAATAATTAGCAAAATTGTTTGAATAAGTAACAAGATTATAATAATGGTGTATAATACCCCCA---ATATAACCAGACCATAAGGCTTCCTAATCTTCTTCGAAAGATAATAATCCC----CAGTTGTTT--TTCTGAACCCACAACTAAGGGAATTTCGAACTATTAACTAAACTAATTCCAAGTATTAATGCTTTTAGTTAAAGTGCATTAAATGCAAATTTTTGTAGTCATTTCA-----------------TTAAACAATACACACATGTGTTGAAATTAGAATAATTTTTTTTTGGACACTTGAGAGGTCGATGGTCATGTTGTATTAATGAATC---G
>Apc 24658022 24658956|24927 chr3R 24658056 24662364 scaffold_29 375637 380100 + 132089|0 987
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A----------------------AACGAACGCA------------CAAAGCGAATCC-----------------------------------CGTCTTGCATTTTCGCGTGAATAGCAGATAAACGG------------------------------------AATCAAGGAATGTTTAT------------TATATATATTCAATAATATATATATCTTACAAACCTATATAGTCTTGATATATATATATATATACATATATCTCCTTCTTCATTTAGCGGGTAGCTAGATTTGTTAAGCG--------------TAGAAACTATATCTAATCCAATTCACAGTCAGA-AACGAAGAGCCTAAAACACATTGAAATCAGCTCCAAGTTCGTGTGTAGCCAAATGTATTGCATTAAAATAATAAATTAGATATTACTTCGGGCCTTTTCAGATGTGTACAACCTATATAGAGCATATCTATATCCTATATACCTACGAAACATATATCAGATAATACGATATTCAAAGTTGTAATATTTATCAAT------ATTATTTATAGCAGGTATATAAGGTCT-ATGTATGTTGGGGCTT-------------CTTATTCAAATGGGCCA-----AAATTAATCAAAAAATAAAAACAAAAAAAAAAACAAAAACAAATTTTATACACATAGTGAGCGTATTAGCCGG--------------TCGGCTTTCTTTCTGCAA--ACCAAATATTATTTTGAGAATGATTATTGTAACACATTTGTAGTCATTGCTTTTTAATTATCATAATTTTATAAATCTTTATTTGATAAGCGTATTTGTATCTCGTTTTTAGCCGCT--TTCATGGCGTTCTTTAGTTTAGCTTTGATTTAAGCCGATTTAAATTTCTAATAA-TATATTAAATATTAATAAAAACGAAATG-----TTTTCCAACAAAAAA--AAAGCATTAAAAATTCAATTTATTATA
>inx3 24679837 24680182|24949 chr3R 24679298 24681134 scaffold_29 1122615 1124574 - 67120|647 1046
GC-CCGTGGCCAGGGTTTGGCTTCAAAACAATGATTTCAATGATTTCTCAATAATATTTGTAGGGGGGAGATA----------GAGAGAGTT---------------GTGTGTCATGAGGTTAGG----------------------CATTTCCATTTCTACCACTAAGACTGCAAGAGAACGAATCAGCAATTGCACTTTCGGAGAT-CCAACTCAGTAATGTTCTGTGCGAAATATATTTAGCAAAATTATAAGGAAACAATCTTTGAATATGGTCCTAG-GCAGGCGAAAGACAGGTGCAGTTCGTCATTGACACGAGGTGAGCCACAGAG----TGAGAAGATACAAATAAAAAATAAATCAAATAAAAATGTGAAAAAAAAAATATCATAAAAAA
GCGCTATAGCAACTATTTGGCGCTAATAT-ACAATTTCAATGATTTCTCAATAATATTTTGTAGCCAGAGATGTGACCAATTCGAAGGTGTTTTTTTTTCGTCGTAGGTGTTCTAGGCTTTTAGGCTTTCTAATATAATATATACAACATATGTATGTACATCTCTAAGACTGTTTTTAAGTGG---AAACATGGAATTCGAGGAAACGTCAGATAAAAGAAAAACAAAACGAAACAAACATAAAAAAAAAAAACAAAAAGAATTCTTTAGCAAAATTTTAACGCCTATATAAAACAAAAGCCCTTAGACACACACTTAAAGAGAGAGAGAGAGAGTTTGAGAAAGTGCAAGTTAAATGAGAAAAAGAGAGAGATAGAGAGAGGGAGAGACACTCAAACA
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GCCACAATCAAGGACTTTGAGTGGATGTCTACTCAGACCTGCAATTCGCTGGCCAATGCTACCGAACCATCGCTGACCCATATGGAACTATGACCCGCTTACTGGCTGCTACTGCTCCTGCTCCTGACACTGCTGCTCTTGATAAAGCCTCAACCACGACGCGCACC---AATCAACTGGCAAATG----GAGAAGGAGCATTCGCGGGCTGA-----CTAGACAAAAGCCACAGCCAAAAAAGGAGGGATTAAGAACAAAGCAAAG---------TAAATGCTTCTCGAAATATACCGTGTATAAATGAGCGCGTGCTGTAACAGTAACAATATGAATAAGT-----TAATAGTGAATA------GTGAATATATGTAC---ATATGTATATGTATAATTAGTACATACTTCGACTGTGGTATTTAGCATTAAGGT--------------GACTATGAAATATGAATGAAGTGA---------------ATTACAAAGCG----------------------CTTTCAATTATAACT----TCTTTGCGCTACTCTCATGCAAA-GCCTCTGAGTACTATATG-----------------------------------------------AACGATAATTTCAATGATGTTGATACATATGTACCTCAATATGCTTACAACCAAAAAACAAAACAAAAACAAAAAAAAAACAAACAAACAAAACAGAAACATCTAATTTTCAAATACT----TATATAACTTTGTACCTCGTCGACTATAAAAGAAAAACGAAAGTTAGGCATTAAGAAACTTTAAAAAAAAAACTTCCTAGTTGAATTACAATGATATGAAATGTCTTTATTTGAGAAA---------------------------------------------------------AAAAAAACCTCTAATGCGTATTTTATG------------CAATTAGTTAGATGTAACC---------ATTGGACAAGTGTGAACA----------AAATCTTCAGGCTAATCGCTGCTGAATCGAAT--------------------TAGTAAAACTTC----------------------------------------------CTAATTTTCAGCA---------CTCCTTATGTAGCAAAAAATA----AAACTCCGAAAATGA-----------TATTCCCTAGGTTTTAAGAGGCAG------------------------ATGTAGAATAATAAAATTAAAATACGGCAAAGTATTTGAATCCAAAAGATG-AAACAATTATGAGTAATTAGCGTTTAGTAGTTCCAATAATTTACACCACACAGTTTAAAGAGAAAGTAAATATAATTAATGAAACCAAAGCTAACAA---TATTAGATGAACAAAAGCAATAA-AACATGAAAATTAAATGCTTGTAACAAGTTGAAAATCTAT------TGTAAGGCGCAATTATAGCATTAATATTATAGATACATATATATGATTTCCCGAGAACGTTAATAAACAGTAAACGCGTACAAAAAGGAGAATTTAATT
>CG33203 24697874 24697983|24963 chr3R 24696292 24703438 scaffold_20 1149376 1156709 + 165298|1687 1796
GAGCGATGCGAATCCCGGAGAAGTGGTTTCCCGGAGTGGTGGACTTCTATTTGAACTCCCACAATATAATGCATGTGCTGGTCGTCGTGGCCGTTTACTCCATGCACAAG
GTGCCATGCGCATACCCGAAAAGTGGTTCCCAGGTCTGGTCGACTTCTATCTGAACTCGCACAACATTATGCATGTGCTGGTCGTGGTGGCTGTCTACTCCATGCACAAG
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A
A
>CG14523 24703736 24703802|24965 chr3R 24703737 24705894 scaffold_20 1156710 1158863 + 59966|0 65
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TAAAGCCAGCTGGTCAGAAGCGTTCGAATGCA------TCATTTCATTATAAAACTTAAAGCTAAA
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ATATCATTCACATACGTATCGCGCAAATTGTTGTTCAACGCCCCGCCC---CCCCTCAAGATAATGAAATGCAAAAATAGCGTT---------------AAAACAAAAAAAAGA--AAATGTGGCTCTAATAAATGT-AAGCCACAAAATAAATGCCCGATTCCCGAAAAATATGTCGCATAATGTTACATTGCATATAAATTAAACACGAATACTATAAAATAGTGCATAAA--------------TATAATTAACGACAAA-TTATTGAATAAATTATCGCAAAAACTTATGCAAAT--GTTTTTCTA
>CG14521 24750717 24751208|24997 chr3R 24751032 24752116 scaffold_15 2925921 2926823 - 31162|0 181
TATCAAAACTGAGAGAAGAAGAGCCGGCAATCAAGTATTCCTACAGAT-TCCCTCGGACACCGA----CATCGACATCTCTTTCTCTCTTGCCTGCGTTCTTGTTGTTCGTTTCCGTTTCCGGTTCCGTGGTCCCATCTCCAATGTATTGGACCCCAGCCGCCCACGCACGCATACATATTG
TATCAAAACTGAGCG----AGAGCCGGCAAACAAGTATTCCTACAGGTGTTACCCAGCCCGTGAGACGCACCCGCACCCCATCCATAATCGAATGTGTT----------GCTTACGCTCCCGCTCAAGCACCCCCAACACC----------CCCTCCACCGTCCACACATCCACGC-TATTG
>CG1443 24818699 24819006|25086 chr3R 24818598 24819988 scaffold_15 2995650 2997068 - 48794|112 465
GA--TCCTT----TAACTATATCTATCTTTCGTATCCATTGTAGGGCATATC--TTGAACTC----------CCCAATCTTTCGGTCAAGCTC-GTAACACTTTCGTTTC-CAGTAGTTGTTAGTTATAGTT---GTATGTATCGTATATATCGTTTGTATGTTTGTACCATAACCATATGCCCATAGTCATATGTTTGAAACGCTTTATCCGAATCTTGTATAGCTTAGTTCGTACGTCTCTAAATGTAA----ATTTGCAAAAGTTGATGGCGTAA-------------------TGTGGATGTAGATGATCGATTACAAGTACAATAAAAACTGCTTCACATTTTGTTTGG
GATTTCCTTAATGTAGATATATATATATAT-ATATATATGTGTGTGTATATCGTTTAAAATCGAGGTTAACTTTTGTCTTTTCGTATTGGCACTGTAACATTTCAGTCTCGGAGTAGTT-CTAGTTTTAGTTTAAGTGCGTCTC-TATACATTGAT--TATGTT---------------------TAGTCCTACGGTTAAAGCGTTCTATCCGATATCTGTATAGTCTAGTTTG--------TAAATGTAATACTATTGCTAAAAATTGATTATGTAACACATACTGTGTATATATTTATGTACGAAGCTAATCG-----AATTGCAATAAAAATCGCTTCATATT---TTTGG
>CG1442 24852161 24852201|25131 chr3R 24852092 24852174 scaffold_45 55650 55729 + 362|70 83
ATTGCACATCCCTC
ATCGCACG-CAGTC
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GCAATAAAGTACAACTGATTCTCTTATATAAAAA
ACAATTGGATATACCTAA------TATATTAAA-
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TGGAATGCCTAATCACACACAAACACTCACACGGGATCGCAAAACTATAACTAAAATAGCAATACTTTATGTTTAAGTTAATGA-------------ATAAATTTGGTTCTACACATAATGAAAGCGAA
TTGAATCCCTGCAAAGACACCGAAACATAC----GAAAGCAAAACTAAAACTAGAATAGCAATATTATATGTTTAAGTTAATGAAATTATAAAGCATATAAATTGTATTTTAAATAAATTAAGTATAAA
>cul-5 24884992 24885674|25161 chr3R 24885149 24886884 scaffold_13 3056190 3057975 - 67262|0 581
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GCCTTTGCGTCCTTGCCGAGTTACCATTCCCACTCCTGACCTACAACCTAGCCACAGTCAGCCTCCAATCCTTACACT---------AATGATCATCATT----TCTCAATTGGTTGCGTGCTCTAAGCGCGCGCTCTCTCTCCCTCTCTCTCTCTCTTATACATATATATATCTCAGTCACCCATTTTTATGGGATCCTAGTTTGTTATGTTGACATTACGTCCTGGGCAGCGTTT-------TCAAAATTGAAAAAATTGCTTTTCTCCTATTTGTATGTTTTTTGTTTTGTGTAAAAGCGTAATTATTTTTTTTATATTCGCCTATTGGCAGCTCTGTTTAACGTCATAGGTATTATATAT-----ACTGCATGT----------------AGCCGCCCTCAGATAACGATTACAATTAACACTAATCTATAGAGCAGAAAAAAAACCTTTTGATGTTTTCTACGTTTGTATGTAGTCATTGTATAT----GTTGTGC-ATTTTGAGTTATTGCTTAGGTAATTTTGTAAAGTCTCCTTACGTGTGGCAAACACTCACAATCACACACGCCCCGCAACC
>CG11874 24934771 24935602|25208 chr3R 24933017 24938058 scaffold_13 3118764 3123879 - 99321|2223 3088
CTACCGCCTAAGTGAAGCAATTAGAGGGCAGAGCAACTTAGTTGCGTCCGCGACACTAACT--GAAAGCCGAATGGAGTTGGTGCATTC------ATGCCGCAACTATCGTTTAACTCGTATTCGCAATTTAGCGTAAATGCCAAATACTATGCTAAGCTTAG------AGATACGCAGAGCAGAGTTGGCTTATCGGATGAAGCAATGCCCAACATCGGGATGGATCGATTGAGACAGAAATTGTAGCCCCTGGGGCAACAAATTAGGGTGCAATAT---CACTTG-TTTAACGCCAGACCTCTACTAACAAAATTCAGTTAAAATATTTACTAAGTCTATCTATAGAAGGCCAGCAATCTTAATCCATTATCTGTGGAAGGTGTTAGATTTGAGGTTGCACCAAGAA----AAAGCTGCATTTGTCGCCCCAGGAATTTTTGCGAAATCATCCCATCTTCCTATTAAACATGTCATTTGAAAATCGTTAGCAATCGATTGTATAATATTCTGTGTACTGATAATTG-TTATTTTGTAATTATTTATTTCCTATTATAAGCACGAA-CTGTAACACGATATTGGGGCATTGCAAACCCATTTTTTAGACAGTAGCATCAATCGAATCCGCCAGCAGGTTTTAACCTTGTAATCTATGGTAGTTAAACGTGTATGT-----TTATGTTAGCATGATATTAGGAATCAGTTGCACTACTCAGCACAAAGTCGATTTGTGTGTAATCTTAAAGGTAGCGAATAAATGAAT-----CTCAATGAAAATGAGCAGAACATTTTCGATCCCACGGCAACCTGTGAATGTATGTAAAACGGAGCCAATAATAAAATGCAAGTGTTTTTAAAA
ATAC----------------------------GCAACCGAATTGCTTCATCAATACCAACTAAGATAGTTTATAAGGTTAGTTGAACCCCAGGAAGTGTGGAAATTTGGCGTTACCCCTTAGTCGTAGCTTAGCACAAATGCCAAATACAACGCCAAGCTTTGGATGCAAAATATATA-AGTGCACTTGGCCAAAAAAAATTAATAATAATCAAAAAT-----------ATGCAAAAAGAAAGCAT---------GTCAATGATTT---GTATAATATTCGTACTGATTTTAGCGCATTATTATTATTACTATTATTCATT-----TATTTACTATTTATAAGTACCGAAAAC-----------------------------------------ATGTTGCACCCAAAACTCTAGTACTCTAACTGCCGC------AATGTTGATAA------------TTATAATTAGGAAT--------AATATCGTATATAACATATAGCAATATAT------AACTGGTAGGTACTTAGTACATGTGTATGTAATTTCCAATATGATATTGAATTTGTAAAACCC------AGCAC----AACGCATTGTTTAG---------TAAATTAAA--CATTAGCCTGTTTTTA----------------AAATAAAGATATATATAAAAAGTCTATTA--ATAGTATTGAAAA----TTGTAATATT--GGATAAGGT----------------------GAAGTGAAGGAAGGTATGTTTGTTCACAGATACTGAGCTGAAAATTTT-AATTAATCAGAAATTCG----CCTCTATAAAATG--TCAGATAATAAAAGAC--GCGTATTTAAAA
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GTTTCTCATT------GAGTC--GTTTACCTACTAAGTCAGTGTACTATGCAAGCATTAATAA--AGCAAATTTATATATATTTATTTATAGAGAACCA-TTTTTATTAAATAAAGGCGAA-TAAGTTATGTAATAGAA-ATAAATCCAAAA
GTTTCTCATTTTTGAAGAATCAAGTCCACCAACTTAAAGTATGTACTTTGAAAGAATTAAGAATCAATCGAGTTGTATCAGGTTATTTATAGTGAATCAATTTTTATTAAATAAAAGAAAAATAAGTTATGAAATAAAATATAAAACAAAAG
>yemalpha 24944048 24944603|25210 chr3R 24944187 24945334 scaffold_3 5687781 5689131 + 15234|0 511
CATTCGGGATCGGCCGCACAGCAGCCCCTTCCGGCTGCTGTGACGGCCTTTTACAACC---AGGAGGCGATGGCCGCCGCCATCGTGCTCTCCACGATGAGCCACGCCTCGCCGCGCTACGACCTGC----TGGCCAAC--GGCTC------CGTCTCCATGTCCGCCGCCCAGGTGG---GAGCCTCTGCCAAC---------------------------------ACACTGCCACAAGTATTCGTTAAACCCAGCCTGCCGCAGCCCAGCGCTGGCGGCGATGTGGTGACCACGACTGGAGCTGCTCGCCCATCCACGCAACAACTGCCCACAAAGTTCATTTAGCTA---GGGTCACTCA-GCTCGTTCCCT-TGCGATTCTAA-----------------------TCTAAGATTCTAG-----TGCTGATTCTAG---GTAGGTTTCATTCGCAGCTGT--------GTCTGCCGATTTTCCAATTATTGCACCAGTTTAATTATT
CATACGGGGAATGCCACA---CAGCCCCAATCGGTGTCGGTGTCGGCATTCTATAATCACGAGCAGGCAGTAGCTGCGGCACTGGTGCTCTCCTCGATGAG---CGCCTCCGCCCGTTATGATGCGTACGATGCGCAATTGGGTTTACTGAATGGGTCCCTGGCTGCCGCTCAGGTGGCCAGCTCCTCAACTCACACTGCAACAGCAAATACAATAACAACAACACCAACACTGCCACAAGTATTTCTGAAGCCTTCCCCGCCGTCCGCAACCGCT---GTCGATGGGATTACCGATATGGCAGCAAACACGGCGCAAGCGGCGCAACTGCCGACAAAGTTTGTTTAGGTATATGGATTGCACACACACGCTCCCTAAGCGATTCTAAGTTGACCATTATAAATATCTATCTCCCAGAGTTAAGGGAATTAATACGTTTAGTTTGTAGGTTTCATAAGCATTAGTCATTTACCCCCCGCCCCTTTCCTTGTCACTACTCGGCATTAATTACT
>CG11881 24954299 24954455|25217 chr3R 24951103 24956995 scaffold_3 5695913 5702106 + 150037|3447 3621
TCCACGGGAATCGCGAATGGCCAATATTGTTT--AGGTAATAGATTTTGTATTCTTTTTCTAATTGGTTATGAGGTTTTTAAACGAAAT-----------ATACTTTTTACTTTAGTTTTTA-----ATATTACCCATATGAAATTAAAACTAAAATCTTTCAGCTTGAAAGCAA
TTTTC---ATTCTTATATGGTTTATTTTTTTTGAAAATCTTAAAACTTAGCTACTGGTTAAATACTCACATAATGCATGTAGAAAAAATTCCTTATTGTTGCGCTGTTTCATTTAATTTCTATTGAAACAATTTACATATG---TTTAAAGTAAGACATTT--GCTTG---GCAA
>CG14512 24963692 24963732|25222 chr3R 24960012 24964276 scaffold_20 19532 23623 - 139406|3889 3929
CTCCCAATAAGCATTCCCAAATGCAAGCTTCTTTTGGTGCC
TATTTAAACGGTTTT--------------TGTTTTGGCGCT
>ligatin 24975609 24975661|25233 chr3R 24974697 24976965 scaffold_21 562042 564373 + 118507|929 993
GCCGGACAAT-AAATGAAGCCTCCTCC----GCCTGTCCTCTTGA-------GTGTAATAATAAA
ACGGGGCAATAAAATGAATGTTCCACTCCAAACCTGAGCTTATAATTATTTTGTGTTATAATAAA
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GATCGAA----TCTTGTTACCGGGCCGGGCTATGTTTTTCAAATATCGGGGGTTTAACTACTAATTTTTATTTCAAGTACAAAGTTAAAACTATGAATCAAACACGCAT----------------CTTCGAGTCACAAGGCCGTGTACGGGGAA-------TTGTTACGC------------AGATGTTTTGTTGAATAAAATGGCGTCTTACAAG
GATTAGAGATGTTTTATTAAAACACGGGGC-GCGTTTCTCGGGGGACAATAATTGAAACGATGGTACAAACTC---GGGCAAAGTTGAAGTAAAGAA-CATATACATATATATATATACCATTAAATTAGCCTTAAAATACTGCTCGCAGGCAAAGTATTTATGTTATGTTATGTTAACATAAAATGAAATGTTTAATAAAATGGCGTCGT-TTTG
>CG14509 24998986 24999456|25247 chr3R 24998830 24999520 scaffold_21 588309 588986 + 9681|207 719
GGGAACAGGATGGCTACTTCGAGCACAAAGCTTGATTTTGCATTGGAAAGATTAACTGGCTAACTCTCTGACACACGACAACAGGATACGAAATGCAGCACA------------AACTATAGGAAGATTTAGTCACGGTATATGCACGCGATAATAAGGCGGGCACGCTCCCAAAAGGGGCGTGGCACCGGTGAACAAAACACAAAAAAAAAATCGAATTACACATGGAGGCCATTGTTCGACTCTTTTTGACAAAGAACATTTTTGCGATTAATGGAAA-------TTTTTTAACCAAAACAAT---------TATATACTTACTATATGAATATGGA-GCGTGTAAAACAAAACACACACACGCACACATACACCCA------------GAACAATGCTAAATGCTAAATAATTACGTACGACTACACCGTA-AAAAAAATAATTGAAAAAAACCTTGCATAACAAATTCATACTACTCTTTTTTTCAACCAAAAAAAAAAAACACAAAAA
GCATACAGTCTA-----------TGCAAAAAATAATAAAATATAACAAAAATT------------------TACAAAAAAATAAAATAAAAATGCAAACACATATAAACGAGTCAACAAATCGTCGATATCGTCGTTTAATATGCACGCGATAGTAAGCCGAACATAAT-------------------------------------------------------------GCCATTGTTAGAACCTTTTTTAAAAGAGATTTTTTTCCAATTTTTCGAAAAACACAACTTTTTG--CAAAACCATACACAACAACAAATGCTAATTAATTGCTTACATATACATACAAAAATAAATATATATATATAAATATATATATATATATATCTAGCAATCGATG-TGTATATTGAATGGATATATACGATTACACTGTGGAAAAAAATGTTCGAAAAAAACCTTGCATAACAAATTCATACTAATCTTTTTTTCAA---AAAAAAAAACGAGCAAAAA
>CG14508 25028387 25028422|25278 chr3R 25026371 25030435 scaffold_21 636772 641045 + 119479|2204 2239
GTTTGGTGAACTGTTTAAATAAAGGTTTTTGAATTT
AATCGTTTTTCCGGTTGGCGGGCGAATTTTGAAATA
>CG1458 25047938 25048122|25298 chr3R 25047754 25049078 scaffold_21 1621613 1623067 - 17925|218 424
ATTGCGGCGGTGCATCGATACACAAACG---TTCTAGCATTTCC----------TCTCGCTGAGCTCCAGTTTGCTTTTA-----AAACCAATAGTAGTGGCCGAAGCTGTTTGAACCCTTGTAATTGTAAGCAATAATTGATGATATTGATGGATTAAGTTAAAAGGAGCCAATAA-AATTGCCCAAACA---TAAATTCAAATCG
CGTGCCTGGCTCCCGCGATGGTCCATCGCATTTCTAGCATTTCCTTGTTGATATTCATGTAGAGCTGCAGCTAATTTGCAATCGTAAATTGTTTAAATTCTAACATTTTGTTCAATCTATTCGTACTGTAAGCAATAATTGAT--------CGCATTAACTCAAGATATGCCAATAAGGATTGCCTAAATGAATCAAATTCACACAG
>CG14507 25050422 25051988|25301 chr3R 25049939 25051915 scaffold_21 1624285 1626379 - 53505|534 2169
TGAGCCTAGTGATGCCTTTGGCTCTTTCGGGAGCCGCTCCTGGCCTTGCTTCC---------GCTCGATTTATCCGCTCGCAAGCTTCCCGTGTTGCT-----CACCGGCGTGGCCGTGATC--------CCTGCCTGCACGTCCGGCAATTGGGAGAACTCTTTGATCGCCTGACAGTCCTGCACGAACAAACGCGCCGTTTTGTGCTGAGCCGTGTGTGGTTTGTAGGCCACCAAAACGTTGTGGGCCATGAGCAGGACATCCCTGTGCAGCTCGCTCAAGCTGCGAATGAATCCCGAGTCGATGTTCCGCTTGATGGTGGGGAAATCCATGGGGCGTAGGCATAGATCCGCATGTCGCTGGGCGTGCTCGTCGTGGAAGGGACGCTTAAAGGGAGCCGCATGCTTGCTGTCCAGCAACATGGCATAAATGGACAGGAAGAGCTTCTTGGAGGCGGCTCGCGTTTCTCTCCGATCGTCGGTGTGCTCGCTGGAGGCGGGAGAATTGGGTATGCTGTCGATAACGGGCGTGGAGGAGCAGCGGCGACGTG---TGGACCTAGCAGTG---GAATGATCGCTGGCTGTTGTGGCGTCATCGTCCACCATTGGACTTTCGGACCGATCCCGATGCGGCAGTTTTCGTAGCAAAGGCGTTCGAGCTGGCGCCGACGGTGGCTGA------GGTGTGCCACTCA-GCTCCAGTTCCGACTTGGAGTCATCC-------AGAGCCAGCTTCAATGCCGGGGGCTTAGCTTT---TGCACTCCTTGGATGG----------------------TCATCGTGCTTGCTGCTGTCCGTCAACGAAGACGACTCCTCGTCTGTGTCGTGCAGATCCACAGGAACCGGAGCGGACTGAGTGGTCGTCTTTTCTTGCATTGTTACTGGCTTTCCCGCTGTGTCCTTGCCTGACT--TGCTTTGTGCTTCCCTAGTG------------GCTTGGTGATCTATTAGT------TCCGGCTCGTCCGTGCT-------TCCTCCTGCCTTATTTTGTCCTTGGG---------------AGCTACTTTCCTGTTCGGATTTGTCTTCCGCGGCATCCTCCTTCTTCGGAAGGGAATCAGTGGCCCCATCTTCCTCCATTTTCG----------------------TGGGTGGCGATCCTGCA--GTATCCTCACTTGAAGTGCTGATAATGGTAATGGTCTCACCAATC---TCCTCCACCGCCACCTCGCTGGTCAACGGCTCGGACTCTGCGTCCTCGGTGCCCCTAGTAGATTCACCACCGGACTGACCACGATCCTTACTCTCCTGGGAGGCCACGGCAGCCAGGGGTATATTGTCGTTGGAGTCATCGCTGGATCCAATTACTAGCTCCACAGATTTTGGTTTATCACTGGCTGGGGAACTTTTACTTTGCTCCCGCTTCAAAGCGTCCAGCTTGTCCTCAAAGTCAATAACTTCGGCTTTATCGTTTGATGGCGAGGC------TACGACGTCATCCACATTTTTCAGAATCTCATCGTCAATGACACTGGCCATATCAATGTCGATGTCATCTATTATTTGATCAATGTTTTTGAAGACTTCCAGCAGCTGCGCTTCGTTG
TTAGTCTAATGATGCCTTTGGCTCTTGCGTGAACCGCTGCGCGCCTTGTTGCCAGCAGGCGTGCGCTCCTTGTCCTTCTCCTTGTCCGCCCTGCCGCTGGTGCTGCTGGCGGAACTATTGTCGGATGTGGTTTGGCTGCACGT----------GGCAAACTCCTTGAGGCAGCGGCTCTCCTGCATGAACAACAGCGCCATTTTGTGCTGCGTGGTCTGTGGCTTGTAGATGAGCAACAGGTTCTGGCACATGAGCACCACATCCCGCTGCAGTTCGCTGATGCTGCGCAGATGGCCGGAGTCGATGTTGCGCTTGATGGTGGGCAGGTCCATGGGTCGCAGGCACAGATCCGTCTGCTTGTGCGGATGCTCGTCGTGAAAGGCGCGCCGAAAGGGCGACGCATACTTGCTCTCCAGCAGTGTGCTGTAAATGGCCAGGAAGTGCTTCTTGGAGGCGCCGCGCGTCTCGCGACGATCATCGGTGTGCTCACTGGACGCCGGAGAATTGGGTATGCTGTCTATAAGCGGCGTAGAGGAGCAGCGCCTGCGCGTACTGGACCTGGCCGTTAGCGACTGATCGCTGGCCGTTGTCGTGTCATCATCCACCATGGGACTCTCGGAGCGATCGCGATGCGGCAACTTGCGCAGCAAGGGCGCTCGTGCCGGCACCGGCGCTGGTGCGGGTGCCGGTGTGCTGTTTATACCCGAGCCGCGGGGCGGCGTCTGTCGCGTCATGTGGCTGGACTCGGCATCGGG---TTTGCTATCAGTGTGTTGCTTGGATGATTTGGCGCTGTGGCGTGTGGGCTCATCCGCTTTGCTGCTGTCTGTCAGCGAGGAGGATTCCTCATCTGTGTCGTGCACCGAACTGGCAGCCGTGGCTCCAGGCGTTTTTAGCTCTGCGTTTGCCTCGACTGCCGCTTTCTCTGCCTCCTTGCTGGGCTCCTGC-TTGGGCGCTGCAAGTAATACATAAGCTTGAGTGGGTATCTTTGAATCTATACTTGGGCTTACCTTCGCTAATGGCCTCTGCTTGCCCAGCTTTGGCATCTGGCTCCGCCAACTGAGCAGTTTCTTCGGTTTTTCTGCTAGTC-TCGACTGTGTCGCTGGCAACCGCAGGCGACTTGACGGCTGCCGTTTCCACTGCCTCCACCGGATCGGCCACTGCCACAGCTGAGGTCTGTTCCCGAACTGCATCCTCACTGGAGCTGCTGGCAATTGTAATGGTCTCGGTCAGCTCGTCCTCGACAGCCGCTTC----ATCAGGAGCT--GTCTCTGTGCTCTCG---------ACAGACT---------GCTGATTGCGGTCTTTGCTTTCCTGCGAAGCCACGGCTGCCAGCGGTATATTATCATTGGAGTCATCACTGGAACCAATAACCACTTCCTGTGCTTTCTGCTGGGTA--GGCGATGGAAC----AAACTCGTCACTCTTTAACGCATCCAGCTTGCCCTCAAAGTCAACTACCTCAGCTTT---GGCTGACGGCGCAACGGGTGAGACCACGTTGTCCACATCCTTTAGTATTTCTTCATCAATGACGCCGGCGATATCAATGTCTATATCATTTATAATGTCGTCCATGTTCTTGAACACCTCAAGCAGTTGTTGTGTCTCG
>CG31445 25066301 25066492|25319 chr3R 25065806 25066479 scaffold_21 676842 677550 + -797|532 762
GTTTAGATCCTCCCAGGAAGCCTACTTTATTTTATAGT--ATTCTAAGTGAA------------GATTGAA---------AATACAAAACAAG-----ATTACCCGTTTCTCAGATAGTGACGATAGA---ACGACGAAGAAATTTC--GAAAT-----------TCT----TTTTGCTAATTTTTTCCAAAAAAATAATA----AATATATTTATTAATCTGCATGCTTA
GTTTAATTACACGCAT--ATCCTTAATTAAAATATAATTAGTTCTCAGCCAGCCCTCAACAGCTCATTGAAATCTCTCTGAATTTAAAACAAGTTCCAAATAAATTATATTAAAATAATTATGTTAAACATATTACGGGGCATTTTCTTGAAATGGGATAGCAGATCTGAGCTCTTGCTGGATTTTTTTTAAATAACTTTAATGGAATTTAAATATAGTTTATTATGGCTT
>CG31445 25066301 25066492|25320 chr3R 25066480 25067300 scaffold_21 677582 678414 + 24452|0 12
TGCTCACGAATGA
GGCTAAAAAAGAA
>stg 25077540 25078299|25332 chr3R 25077498 25078814 scaffold_21 688837 690171 + 43500|42 906
GTTGTGGGATGATCGTGCAGTTCGTTATCTAAGTTTGGGTGTTATCG---------------TATTGTATATATAGACGTATAG-------------GGGTATTTATTTCATGCT--------GCTTTTAAGTTGATTTTTGTTGATTTTCATTTGTTAATCC--GTAGAC---------TAAGTTTCTCGCACACGACGCAGACACACACCCG-----------ACACTCGCATTCATGCAAAACAG--ACAATTTC--------ATTTGGAATTTAA---CGCTTTTGTTTAGTTATTATTGTTTTTATGGTTTCG-------------GCTTTAGTTCAATTATTTAAGCACTCTAGTTCAAA-TTTTAAAGATAACCAACGAACAAGCAAACGAAAAATGTGCATTATAATCTAAAAACGTGAGGAACCATGTCATTTAAATTTAAGAGGCCGATC-CCGAAATCAGACCCCTTAATCATTTGTAGATGATAAGC--AGAACAAAAAATGGCTAAAAACAAAAAAAAAAAAAGAAAACAAATATCACACAAAAACAAACACGCTCATTAATTTCATCCATAAAACTTTATTTATAAGATCTATCGTTTAAGAGTTGAAAGTTGTAAACTTCTGCTAGGTACAATTTACGCTTATTATTTGTTTATTTTTATGTAATCCGTAA-------------CCGAACAACAAGGCACCGAAACGCAAATGCAAACAAGAAAACAAATAT---TTTACCATGTAATGATTATTATTTAAGCAAAGCTTATTTTTGCATC-AAAAAAGGCAATATTATTGAACAAAGACCATCAATTTTAAATATACATTAATACACGACGAAAAAGAA
ATTCCCTATTTTTTTCGCGGGAGGGTGGCAACGCCAAAACAACACTGAAAAAAAAAACAAACCATTATTTGTACATAAGAAAAGAAAAACAAAAGCTGGGTATTTATTTCATTTTAATGAGAAAATTTTAAGTTGA-TTTTGTTGATTTTCGTTTGTTAATTTTAGTAGACCCTAAGACTTAATTCTAATACACAC-ACACACACACACACCTACACACACTCACACACACGTGTACATTTATAACTGTAACATTTTTTTCCCTTGACTTTTTCTTTAAGTTCGTTTTTCTTTGATCAATTTTTGTTTAATTGTTTTATGTAAAAATTTTCGATTTAGTTCAATT-TATTAGAGCTTTAGTTTGAATTTTTTAACGTAAC-----------------AAAAATGTGCATTATAATCTAAA-------------ATGTCATACAAATTTAAGCGGCCCCCCTCCGTAGTTAACCCGC---GCCCATACTAGTTCGTAAGCTTAAAACAGAAAATGGCTAAAACA-------------------------CACACACACACACACACATACATTAAT-----------ATCTTAATT------ATTTTAAGCATAAGAGTTGAAAGTTGAAAACTTGTGTTAGGTACAATTTACGCTTATTATTTGTTTATTTTTATGTAAAACAAAGCTCTTCGCCCACCCTTGACCCCTTGACCCCTTGACCCCAC--AAAACAAAACAAAAAACATCCACTTATTGTATAATGATTAT--TTTAAGCAAAGCTTATTTTTGCATCAAAAAAAGGCAATATTATTGAACAAAGA-CGTACATTTTAAATATAAATCACGAACCCTGAACTGAAAA
>Cnx99A 25140965 25141556|25410 chr3R 25140974 25141451 scaffold_21 773537 774119 + 7296|0 597
CAAAATGTTTGTTCG-----CCAAGGCAGCCGACATCTCCCACAA--------ACTACACACACACACCACACACACACTCGT----TTCGGTTTAGTCAAC--TCTGTACGTACTTT---TGCCGTATTAT-CGTTGCATTTCTGTC----------------GTGTTCGACCCTCTGTCGTCCCCATATCTCCTATACATATATAGCACCCTTACACA---GAGCCAGCCGCGATGGCAC-CGCTTTATAGTGTTTAGTTGGAGTGATGATCCTCCTTTTGATTTGTGTAAAAATGGAAAACACCA----ACTAGACAATTGAGGGAAACAAA--TCAACTACAACTGAAACTAA------------AGCA-GCAAACAAAGA---------------GGGAACTAAAGCAGATAAAT------------------------------CTAATGGCAAGCATCTAGTTTAATATTATGTAATTTAAACGAAATTGAAT-AGTATGTTAGTTATACTC------------AAGTTTCCATTTTCATTTGTACCGATGAAAATTTACAGCGAAAAATAAAACTAAATGTCAAAACCAA
CAAAACTTTTGGTGGTAGTTCCATAGTTAGCGCGATCGCATGCAACTGTGTTAATTAAAAAAAAAAACAACACTAGTTTTTATATGGTTTGGTTTAGTCATCGTTCTGTACGTACGGCACGTTCTGTATTATTCATTGTATTTATGTTCGTATACTCTTCACATATATATGACCCACTATCCCTCCTACCCCCCCGCCACCACAAAAACTGTCTCATACACATGTTCAAGTTCTGTTCTCACACAATTTAT----TTTAGT----------ATTTCCATGTAAGCACACACAAAAATAACATAAAATAGAAAACTAGACAAATGAGGGAATCAAAGATTATATATCACGAAAACCAATAAGCGATACGTAGCATGCAGACACAGAAAAACGCCAGTTAATGAGAGAGAAAGCGGATAGAGAGAGAGCGAGAGAGAGAAAAAGCGAGAGAGCAATGGGGAAATATCTAGTTTAATATTATGTAATTTAAACGAAATTTTATGAATACGCTAGTTATACTCCGAGTTTAAACAAATTTCATTTTTTCATTTGTAACAATGAAAATTTACAGCG-AAAATAAAACTGAATGTCAAAACCAA
>Cnx99A 25140965 25141556|25411 chr3R 25141452 25143257 scaffold_21 774284 776144 + 73517|0 104
GCGGGCATCCCCACATGCCGAATCCGAAAACAAACACTGCAACTCTAAAGAAAAAAAAAAACTTAATCCAATTCCAAAAGCCAGCGGTTGCGAAGCAGCAACAAC
GAGGGCGTGGCACAATCCAGCAT---------GTCTCTCGGATTCACAAAATACTTGAAAACTTAAACTAATTCCAAAAAA-------TGTATAACTGCAACAAC
>CG2321 25312733 25312862|25648 chr3R 25311497 25312961 scaffold_21 1010746 1012284 + 13899|1442 1632
GGTGAGC--------------TTGCAATTTGATGTTCTTTATTTAGACGC-----------------------------------TTTCAATGTTGTCTGTTCCATGTATCTTT----------AGTCCATTTCAACT-TTCATTGGCTTA-CGATTAGCTTAGGTGTACATACATATACATACATATACT
TGTGAGTCCGATTCTAAACAATTTAAATTAGATGTTCTTTATTTGTATTTCCATTCACTTTAGGTTTATAAGATTTCTTTTTGTTTTTTGTTGTTGTTTTTGTTTTTTTTTTTTTTTTTGCTTGCATCCATATCAACTCTTCATTAGCTTATCCGTTAACTTAGGTGTACATAAACTTATATTTTTTTGCT
>CG11500 25316265 25316349|25652 chr3R 25315206 25318612 scaffold_47 640643 643916 - 92871|1067 1151
AATCAGTGGGATCAGTAGTTAGTTAGGCCAGCAGTTACGTGTACTTCTCACTACATCCAATATAATATATATATATACATATGTA
AA-----GATATTAA-----AATGAAACTAAC---TTCAAGTAATTATTACTCTTTTTAATAAATAATA-----ACACCTCATTT
>CG2310 25317246 25317469|25652 chr3R 25315206 25318612 scaffold_47 640643 643916 - 92871|2091 2314
GTCCTGCCATGAATCGGGAGGCGCGAGGTCCTCTACACTTTACATTCCACCTGTTCGCCTTTTAACTTATTTAGTTAGTTATAGTGACACACAAGCCAGAACGTCCACGTTATGAACGCATTGTACAAATAATATACATATGTATGAACAACGAGCGATTATTCACATCGCAAGCCTTTTCAATAAAATGACTATAATTGCATTAAAGATATGCATGCATACAT
AATGCGAACAAAATGAAAACGAAACAAATGTATTCCACTGCACATTC-ACCTTATCA-------------TTAATCATAGACAGCACAATACACGCCA-------CTTATTTTTAAGTTCTT----AAATAATA---ACGTCCACGG----------------CATATTTTGCGCCTTTTACAAGTTGTACAAATAAATGTATGAACAATTTACATT--TAAAT
>Trc8 25324562 25325363|25661 chr3R 25324558 25327217 scaffold_47 649325 651934 - 85268|4 851
TCGCATATAGGGTAGGCTAGGACCGAATCGAACGGAACGGGAGCGCTCGGCGTACCTTGCGTTTCTTATATATA-TATATATCTTACGACTTGGAAAC-GTTCTGTGCGTTAGTGTACTTATGTATAAATGCAAATCTTTGTAGCGACCCAAGGCTTCTCTATTCCCCCTGCCCAAA------GAGCAATCTATTCGTAACACACCAGCACACCAATGCCCAG------CACTCGACCACAGCACCCACCTTCGATCC---TATATCGTCATAGGCACAGACAT-----------TACGTATGTATAACTCACGCAGCTATGCTTAACTAAATTATATACCATGCATATAA---------TAGCTGAACGCTGATCGGC----AATGAGACGATAATTCAAACGGAGATGATCTACATATGTACGTTAAGTTTATGGTAAAAAGTCGATTCAAAAATGTTGAAACATACACACACAAAAAAAAAATTAAATTAGCATTAAGTTTGCAATGGATGAAAGCAGTG-TAAAAATCATCAGCAAAACGCTAAAACGCAAAAACGATAAACATTTTATGTGGTGAAGTCTGAAAATGATTTAATCAAGTTACCAAGTAAATCTAGTTAAAAACAAAACACGAATCAACGCGGATTGAAATGATTAAAAAAAAAAAAAAAATGATTTAAAAACGAGAGCAAGGCGAAAAGTTGCGTTGTATAATTTTGTAATGTAAAAATAACTTGTATAAGCAAATCCTTGTTTTGTTTTTATTTAAATTACCTATGTACGTTTATTTAGATTTAAAGTAATTAAACGAAAGA---AGCGGAAAATACAG-AAAACATTAAAA
------------------------GAATTGTACCG------------------------------CTATATTTAATCTTAATCAAACCAGATGTAAACTGTTCTATGTGTTAGTGTACTTATGTAAAAATGCGAAACTCCTAAGCAA---AATTATTATCTG-----CCTATTCGAACGTTTCGGGAGACCCATTCCTATAA-------ACGCCAATACCTGATTCATTCATGTGCACGCACTCCCCAACTCACATTCATACGTATTCATATACACGCAGACATCCAAAAGCACGTTCAGTTGTTTGGCTT-CGATTCCACACTAAATTAAATTATAT--CATGCATATAAGTACATACCTAACTATATATGTGAGGGCGCTGAACGAAACGTGAATTCAATCAGAGAT-------CTTTGTACATTAAGCTTACGGTAAAAAGTTGACCCAAAAATGTTGAAAA----------------------AGGTTAGTTTTAAGTTTACAGTG-----AAATGGTGTTACAAAACAACAACAAAA----AAAACCATTAGCAGAAAAATA---AATGCGGTGAAGTCTGAAAATGATTTAATCAAG-TACCAAG-----------------------------------------------TAAAAAAACAAACAAAACTAGTTAACAA--ATCGCAAG-----------------ATAATTTTGTAATTTACAAGAAATTAAAATTAGCAAATCTTACACTCTTACTTATTAA-----------------TATATATAATTTAATTAAATGAAGAAAAAAATGAGAAGAAAATACAGTACAATATGGAAG
>CG7567 25412958 25413054|25756 chr3R 25412700 25412988 scaffold_47 759395 759699 - -520|289 325
GCTTTCATGCTTTACAAA------CACACAAAAGTGA
ACATCAATTATTTTCAAAAAATTGTATAGAAAGCTGA
>CG7567 25412958 25413054|25757 chr3R 25412989 25413630 scaffold_47 757742 758356 - 3758|0 73
AACCTGATAAGGTTTATTCTAAAAACTAAA--------CAAAAAGAAATATGATTATGCCAAATTAAAATGTGT
CATATGATGAATAGAATTCAATATAATAAATATGCATTCAATAATAAAAATTCATATGTCTAATGCAAAGATGT
>CG11470 25414715 25414791|25760 chr3R 25414707 25415344 scaffold_47 755285 755968 - 1448|8 99
AAGAAAGTCAATCAATAAATATA----------TCAGGCAATTGAATTCTCTGTT-TTATATAAATAAA-TAATATA--GGAATGCAAGCT-
CTGAAAATTGTCAAATATCTATGATGTGAATTTTTAAAATGTTGAATGCACGTTTATCTTAAAAATAAAGTAATATGTCGTAATACAATCTC
>DopR2 25456023 25458582|25801 chr3R 25454849 25456155 scaffold_47 808445 809636 - 6480|1247 1391
GCCATGCATACTAGGCTAAGCTGCAACTGCAAACGGCAAACGGCAAACCTAGATTTATATATTGAGTGTACTATACTGTAACTAC-------CATATACAAACTAC-----GCAAGGAGATTAAAAAGCGACAACTAAGACGGAA
GCCAGGCATATAATTGAAAGATCCAACCATTAA-GTTAAGCAGCAAAAC-AGATTTGTACTCCATATATATGTAATTACGACTACGTTTGTATGTATATGTGTCACTATGTGTATTAAGATTAAAACAT----ATTGAAACAGTA
>DopR2 25456023 25458582|25802 chr3R 25456263 25456445 scaffold_47 810269 810415 - 4022|0 183
CAAAATGTTGCTCATTGTTTTCAAAAAACAAACAAAGCGAAATGGATGGTCCAAGGGATGGTTAGGTGGGGAGGGAACAGAGATGGGGGAATTTCAAACAAATGGCAATTATTAATATTGAATATG-GTAGCGCATAAGTGACATACATAGCTCATAGAGTCCTCGTTGTGTCTGTATCCGTGT
CAAAATCATGCTCATTGTTT--AGAAAACAAACAAATCTG---GGAAGGAGAAAGAAAACTTTA-----------AACCAAAATGAT---------AACAAATGGCAATTATTAATATTCAGTACGTATAGCACATA------------AGCTCATAGAGTAATTTGTATGTATGTGTGCGCGT
>DopR2 25456023 25458582|25803 chr3R 25456867 25457212 scaffold_47 811482 811850 - 4663|0 386
GTAGTTGCATAGTGGGATTAGT-GTAACTGTTAGCTCTCATATCTTAGATCTTCCATTATGTAGTTGTTCGTTCCG-TTTCGTTCCGT--TCCGTTCTGTAAATGTCTCAAACGTCTAGCAATTGAATT---CAAAAAGCTACGTCTTCAACCTGTCCAAGTACCTGA----------------------CTCTCTGAAATCCAAGAAGATACTATGCATGTATATAGCTTAACTTTGACTCCTCTGTCGCTCAAAACTAGCTTTCTGTTACTCGAAACTCGTTTGTTCGTTTGTTATCAACTGAAATTCTACGGGTGCAATATGAATTTATACCAACTTAAGGACTCGAACAATCA------------GGCAAACAGGCTTCAAGA
GTATTAATATATTAATATAAGTAGTTACAATTAGACGTCATATCTTAGATCTTCCATTAATAGATTATATACCCTAAGTTCTTTATGCCATGCATCCTGTAAATGTC-AACCCATCTCTAAATTATATTTAACAGAAAGCTACGTCTTCAACCTGTCCACGTACCTGACACGCCTCCCTTACTCTATTTGCCCTCTTTAAGCAATGCTCCTCTAATGGGTATTTA-AACTTAACTTAAA---------TGCTTATAACGAG-TTTCTGAAGCT----ATTCGTTT-TTCCTAACTCCTACTATATAATATGACGGGTGCAA-AAGAATTTAAACCTACCTTAGCCTTAAAATAATAATATCAATTTAATAGCAAAATGCCCTCAAGA
>DopR2 25456023 25458582|25804 chr3R 25457473 25457612 scaffold_24 524193 524335 + 502|0 147
GAAGCGGTGATCGATGGAAAGGCAATAC-----TTTGGACAGTTCTAAGCCAATCAGATTTTGAATTCACTTTGTTGTCTATTTATTTTTTTACTAGCTCTTCAGGTTTCAATAAGG---ATATGAACTGAATTTTATTATCATTTTG
GAAATGTTTCTCGGCAAGAAATTAGTGCAAATACTTGAAGA-----AAGCACGGGAAAATTTGACTTGAGTTTAACAAAAACTTGATTTTTAAGCAGCAGAGCAGGTTTTAATATTGCATATATAAGCCTACCGATGTGCTTATTATG
>DopR2 25456023 25458582|25805 chr3R 25457613 25458617 scaffold_47 811909 812956 - 34138|0 1045
TGTCACGTGGCCGCTGCAATGGTGGCCGCCTCCACCTCCTTCGGCTACCACTCGGTGAACCAGATCGACCGGACGCTCATGTGACGGCAGCTGAGCAGTTGCAGCACCTGCAGCGGGGGCAGCAACTGCGGCGGA-----TCACGGT----CCGCCCA------TCACCAGCACCACTCCTCGGGCACGGCCACGCCCTCGTCCTCGCAGCGATCCTGCACTAGATGCCAGAGCTTCCACCGCCACCACCACCGCTCCAGGCGCCGCAGCTCGGGGATGCAGATGCGCGGGGACTACAACTCCACCACGGCGGTGAACAGCGCTCTAGCCAAGACCATAGTCACCATCAGTGCTCCTCCGGTGGCGGCTGCCTCGGCCAGTTCGCTGCACCTGGGC---GTCGGAGGACGTCCTTCCTCGGTGTCCACCCTGACGATCGCTTCGGTGCCGCCCACCTTG------------------AGTGGCAGTGGCAGTCCAGGAGGCTCTGTGAGCGGGGCCACTACTCCGCTGGCACCCAGTCTCAAG------------GCCCTGACCCC---------GGGACCCTCCAACTCGTCGGG------TCACCACGTGTCCTTCA------------TGCCCATGACGGGCATGAAGCGGTTGCGCAGCTCGAACGCCTCGCTGGGATCGCCCAATGGAATCATCAGCACTGTGGCCGGAGCGGACACCACCTCGGCGCCCTCGCTGATCGACGCCAGCGAGGATCAGGTGCAGATGCGGAACCAACACCGAATCCTGGAGCAGTGCCAGAGTGTCCAGAGCCAAATAACTACGCTGGGCGACGTGGAGGACGACGACGAGGAGGTCAGCGACAGTGAGAGCGAGAGCGTCGGACTCGCCCTGGTGGTGACCACGCCCCAACTGGAGAGCCAGCCCGTGGAGGCATCGAGTTCCTCCAGCTCCTCGGTCAAGTAAACTCAGCAACAGAAC-CACGGAAACAAGCCCAGACATTAGCTTTAAGATTCAACCATATACATATGTGTGTTTATCA
TGCCATGTTGCCGCTGCTATGGTGGCCGCCTCAACATCCTTTGGCTACCATTCCGTCAATCAGCTGGACCGCACCCTGATGTGACGTCAGCCGAGCAGCTGCAGCACTTGCAGTGGTAGCAGCAACTGCGGCGGCGGCGCTGGCGGTGGCGTCGCCCGCAACTCTCATCAATATCATTCATCGGCGGCACACACGCCTTCGTCCTCGCAGCGCTCTTGCACGCGCTGCCAGAGCTTTCACCGGCATCATCATCGCGCCAGGCGTCGCAGCTCAGGCATGCAGCTGCGGGGCGACTACAGTTCGACGTCGGCGGTGAATAGCGC---AGCTAAGACTATTGTGACAATTACGGCGCCGCCAGCAGCGGCAGCCTCGGTCAGCACATTGCATCTCGGCAGTGGCAGTGGCAGACCCTCATCGGTGTCCACGCTCACGCTCGCTTCGGTGCCGCGCACGCTGTTGCTAGAAGCCTCTATTGGTGGCGGTGGGATGAAAGGTGAATCCGTTAGTGCGGCCAATACTCCAATTACGCCAGCCATGAAACACACCAGCTTTGCGCTGACGCCCAACGATATAGGAGCATCGGGCTCATCGGGTTCGACTCATCATGTATCGTTTATGCCCATGCCGCTGCCCATGATGGGCATCAAGCATTTGCGCGACTCCAACTCATCGC---------------------TCGCCGCTACGGCC---GTGGCCACCAGCTCGGCACCTTCATTGATAGAGGCTGCGGAGTCGCCGACTGAGGTGCAG------CATGCAGCGCTCGAAATGCGCCAGAGCGTGCAGAGTCAGATCACAACGCTGGAGGATGTGGACGATGTGCATGACAGCGATGAAAACAGCGACAGCGAGAGCGTAGGTCTGGCCCTGGTGCAGACAACGCCACAGCTGGAGTACCAGGCGGGCATGGCGTCAAGCTCTTCAAGCGCTTCGGTTAAGTAAACTCTCCCAAAGCACTCAACCATATTAGTAATAATATATGCATTGATATTTGTATATAGCGATATAATTCTTGATTA
>DopR2 25464654 25464737|25811 chr3R 25464332 25464864 scaffold_47 817965 818535 - 11873|388 490
TTTAGCGTAGATTTAGTTG-------------------ACAATGATTAAGGCGCCGAGCCACGCCCCCTAGCGCCCTCCATTTGTCCGTAAGTCAATGGCAAG
TTTTGCCTAGGTTTAGTTACCATTCAACAGGCCCGCTCGCAATGATTGAGGCGCTTCCCCAAGCTATTAAGTTTC-------------TAAGTCAATGGCAAG
>Bub3 25499855 25499996|25844 chr3R 25497237 25501033 scaffold_13 20325 24061 + 110787|2692 2839
TGTTATATATACTTGTTTACGGCAAAGTTTTACATCATTTTTTAAAGTAAGCTACTTAGTATAC------TCTTTCAATTTTATGCGCGCATCTCTGATGAAACCCCACATCAGTTTTCCCAGCACAAATAAAAGCTCTATAAAACTC
------ATGCGCTTCCTTTTTATTGACTATTA----ATCTAATGATGAAATATATTTTGCTTATAACTTAGATTTTAATTTAACGTATACATCCTTAAGCAGCGACCACAAAAGTTGGCCAACAGCATAGCCCAGCTCGGCAAAGCTC
>CG7582 25505983 25506212|25846 chr3R 25506105 25506563 scaffold_13 24317 24765 + 15041|0 120
AGCCAGTGCCCAGTGCTCATCTGTCGGAGGCCCAGAGACAACATGAACGCAACCACCAAACTTAGTACTTCCAAAGCGT-------------CTAGAGTATTGCCATTTACGTGTGTTGGT
TGCA---GCTAATTGCTCAATT----AATGTCCA----------TAACGCAACCACCAAAATATGTACTTCCAAAATATTAGTGTAATAGTGTAATAATAATGCCATTTAGTTGTGATAGT
>Obp99c 25511456 25511520|25850 chr3R 25511107 25512354 scaffold_13 29727 30946 + 32622|352 417
GTCTGAATTTTCGGTCTCAACCAATAAAATGTGTTCATCTCT-ATGCTGAAATGCAACCATTCGAA
GCTTAAGTT------------CAATAAA-----TTTGTCTTTTGTGCTTGAACGCAAAACATTGAC
>Obp99b 25541973 25542059|25890 chr3R 25542042 25542803 scaffold_13 257073 257850 + 17438|0 17
AGGGAGCATGGATCCAGC
---GAGC-TGAGTCCAAC
>CG7593 25549877 25549923|25895 chr3R 25547362 25550790 scaffold_13 263770 267265 + 63098|2767 2838
GTATTTATTGGACACCGA----AGATTAT--------------------AGATATTTAG-CAACTAGTATAA
TTTTTGATTTCCTATTAACAACAAATTATTTAAATGCGATACAAACGGAATATATTTAATCAATTAGTTTTA
>CG7601 25560990 25561165|25901 chr3R 25558552 25563808 scaffold_13 275584 280548 + 128527|2683 2881
GCTTAGAGTATGTTAAGTCACACGTCCTTAAGTATTAGTTTCA-------TTTTTATTGTTAATTGAATTTCGCTTAAAATGAGGAAATTAT-AAAGTATCGCATATGTGTGTGTTTGGGTTAAAAATTAGTTACACTC---------------GTGTTATTGCCTAACGATAAGATTAATAAATAATGTATTGTAGTA
AC---AAATATGTTGCTTT---CGT--GTAAGTTTTAGTTTTGTTTTTTTTTTTTATTGTTATTTAAATTTTGCTTAAAATGAGGAAATTATAAAAATATTGCA-ATGCGTGTGCAGTGTTAAAAAGTTAGTTACATTTCGCATAATCTTGGTAATGATAATGTTTTAAAATAAATTAAATAATTACTGTAT--TCATA
>CG7609 25567688 25568631|25905 chr3R 25567715 25571134 scaffold_13 282986 286433 + 118467|0 929
GATTATTGAGAACTCGATGTATTTACAGCTTAACTA-ACTTATTCATC-CTCTTTTTAGCCACCGCATGTTCCCACTGTCCTAAAAGTCAGCCATGTCCCGCCCATACCCATGTGGGAACCGCATAAGTTCGTCTCCGATGCCCTCATGCTAATGAACGATGTGGGCGATGTGCAAACAGCTCTGACAGTCCTTATAGCGCTGGGAGAAGCTCGGAAGCTCCTGCCCATTGACGATGCATTGGTGGTGAGTTCAAAGACAAAGTTGGGATCAGAA--CGGAGTTATTCATCCGGTTTTCTTCCTTTTC---AGGAGCACTGGTTTTACACCTACGTGGACCAGCTGCATCGCTATGAGCTGTGGAACGAGGCCTGCGAGGTTATCAACCGCTCCTGGCTGAGATCGGTGCAGCAGCTCAACCAGCACTCGACCGCCATGCACACGAACTGTGGAGAGTGTGGACGTCCAATGGGCGGCAAGGTGGGATGGTACTGCGACAAGTGCAAGTCCATGCAGTCCGCCAAGTGCTGCGTCTGCGGTCTGATCGTCCGGGGAGTCTACGCCTGGTGCCAAGGATGCTCCCACGGCGGTCACATAGAGCACCTGCAGAAGTACTTTGCCAAACACTCCAAGTGCCCCAAGTGCGGACACCTTTGCGCGTACTCATGAGACGCGGAGGAGGCTGGGTTTGCCCAGCTTTTGCCCCCCATTTGAGAGCCTTGTAAATAGAGAAGACTTAAGCCCAATAAGTACCTTGCACTAGACACTAAACAGATTTTTATATAAATGTAGCTCGAAGATGTAAACTTGTAAAATAAG------CTCAACGTTTGTGAAGTAAATTAACAGACAGGTTTAATCGATCTTCTGCAACTTTAAATAGCACAAATGTTTGTTACTTAACTTTTTTTGAAATATTGGAAAAT
ACGATTTGTTACATAGAAATATTAACTTATAAAATATATATTTTCAACACATTTTTTAGCCACCTCATGTGCCCAGTATATTGAAGGTCAGTCATGTGCCGCCCATACCCATGTGGGAGCCACATCAATTTGTGGCAGATGCGCTAATGCTGCAGAATGATGTGGGCGATGTGCAAACCGCTTTGACTATACTCATTGTTATGGGCGAGGCGCGCCAGATGCTGCCCATTGAGGATGCCGTGGTGGTATGTGTCTTTATAA----GGCATCCGAATTCGGAATAATAATTCACGTTTGATTCTTTCGCAATAGGAACACTGGTTTCATACCTATGTGGATCAGCTGCATCGTTATGAGCTGTGGAATGAGGCCTGTGAGGTGATCAATCGTGCCTGGGTGCGCTCTGTGCGCCAATTAAATCAACACTCGACGGTTATGCACACCAATTGCGGTGAATGTGGTCGACCGTTGGGCGGCAATGTGGGCTGGTACTGTGACAAATGCAAGTCCATGCAGTCAGCCAAGTGCTGTGTTTGTGGTCTGATTGTGCGTGGCGTCTATGCGTGGTGTCAGGGCTGCTCCCATGGCGGCCATATCGAGCATTTGCAGCAATACTTTGCAAAGCACTCTAAATGTCCAAAATGTGGTCATTTATGTGCGTTCTCCTGACACCCAGAGGA----------GCCCTACGCTTATGCCTAAACTGATAGC-----AACTGGACTGGCAGCGAGTCCAA-----ATGTGATGCCAAA-ATTAGAAAAACATTTGTTTTGG--------GAATATAAAAATACGAGAAGCACATGCGCCCTCAACCATTCAAAAAGAAACTGTAAATAAAATCTTGTTGGTATTGTTAATTCTTAATTACTTTATATGTATATATTTCAGATATTTAT--ATTTTTAGAAAAT
>ATPsyn-gamma 25573424 25573575|25907 chr3R 25571440 25574689 scaffold_13 286734 289967 + 161639|2029 2220
GCGAATGGAATGTGTTCGAACA-----------------------------GCTCTAACGATT-CATACAG--CTAATTGCATATGGTGCC-------AGGCACCTGGAGCTACGCCTGGAGC-CCTAGTAATGTTACTCTTTCAGAAAAACCCCAGAATAAATAGCGTGGAACGAACGAAAATAACTTTAA
GC------AGTGTCCTCGAACACACACACTCCAGTTCGAGTCGCAGCTTTAGCCTCAACGATTTCATCCAAGCCTAATTATAAAAGATTACGATTCGAAGACGCCAGAAGCTGCGTATTAAATGATTTAAAACATAATTATCTGAGATAAAACCGA-AATAAATAGCGTGGAACGAATACATTTAACTTT--
>fig 25605018 25605133|25948 chr3R 25604954 25605139 scaffold_9 3756395 3756598 - -63|71 199
TCATGTCGGGTG------TCTGCGGCAAATATTAGTCC-GTGTCCATCAGCA------GTTGGCGATAGAAACCCAAATATACTTTGTTTATACAGATATAGGTTTTGAAATACATACATAAACTGGCA
TTATTAAATGTAATTAATTTTGTAGCTTGTACTCGTTTAGTGTTTAGGAGTGAGTTTTGTCTATGTTTAAGCTGCATGTTGAGATTGTGAGGACAGACACAGACACACAAACAGACAGACAGACAAACA
>CG7837 25621419 25621563|25968 chr3R 25620195 25622515 scaffold_13 352163 354567 + 82961|1263 1467
ACA-------CCACCACCCA---------------------------------------------GTTGCGT-TCTGTGATCACATTTTGGCGTTTTCCATTCCCTGGATTCAGCTCGTTTTATTTGCCACAGCCCTTAGCCAAGT--ATTCCAATGTGCTACAATG--TATATTTAAAATG---TATAGACTACGGATTAATCT
CTAATTTAGTTCCCTGCCCAATCTGCCAACTGTATATGTGATTATGTGTGTCTCCCTGTGTGTATGTTGCGTGTGCGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCTTGTGCCAAATCCAAACACAATGTATTTA--AAAACCCCAGGCCAAGTTTATATCACTGCACTACAATAATGGTAATCATAATAAACTGCATACTATAGTAAAATGT
>CG7834 25627448 25627670|25972 chr3R 25625575 25632070 scaffold_3 6266221 6272747 + 229194|1911 2152
ATGTTCCTCAACTAGAAAATTGTGAGCGCATATTCTACGTTTTTAATTAGTCGAAAG-----TTATCAGAAACGTGCATTTATCTAGCCG--GAGAGTCGGATTTGCTGACAGGCTTTAAATTTCTCTGAATTCAACCCATACCCGTGTGCTTTAAGTGAACTATAAAT---------TGGAATTTATTCTCGTTGTGTCCAGCTCTAA-GAATAAAGTGATTGTAAGC--TCTGAAATCGT
GTCAACATCCAATC-AAAATTGTGAGCAAA-ATTCTACGTTCT--ATTTTTTGTACTACTTTCTATCAGAAACGTGCATTTATCTAGCCACTAAAGATTGATTCCCCATGTGCGCGCCGAGTGTC------------CCATA-----GTGCTTTAAGTGAAAATTAAATGTCTGTTTTTGGAATCT------GTCGTGTCAAGCCTTAACGAATAAATTGAAGTGAAGCAACTACAAAACAT
>ncd 25630009 25630127|25972 chr3R 25625575 25632070 scaffold_3 6266221 6272747 + 229194|4670 4831
AGAATGCATTCTGAGCCCAGTTTTAACAATTT------------TCAAATTTCTAAC---CTGTTATTGCTTAATTTATGTGTGTTTACTTTTAGTGCAAA--TAAACTAATAAA----------------GTGCTGGAATTCAAAGCTAT----------C
ACAGTTTTTTGTAAATCTCTTTTTATCAATTTACATGCACAATCTTAATTTTACTACTGTCTGTTATCACTTAACTTATAAAGGTGTATGTTTAGTGCAAAAATAAACAAATAAAAACAACAACGATTACAGTGTC--ATTTTATAGTTGTGGATTGTTTGT
>Vps16B 25640642 25640784|25976 chr3R 25640350 25642458 scaffold_3 6281705 6283886 + 72781|303 466
AATTGACTTTCTTTTACTTGTATAAACGTATTTTATTGTTAATCATTTATATGTG--------------------TATATAATTATAT-TACTACTACTCTGGTTTTATTAAATAATTGCAAATCACAAGCTGAATATCGAATAAAAAACAAAAATTTGTATCA
GA--AACCTTAGAACGTTTATATAAATGTATTTT-TTATTACCTTTTTATATATGTAATTATTAAAATTTTTAAATATATATTTATATATAATA----TATATATATATTAAATAATCGCAAATCACAAGCTGAATATCAATCAAAAG--------------TG
>CG7829 25642450 25642637|25976 chr3R 25640350 25642458 scaffold_3 6281705 6283886 + 72781|2263 2271
AAGCGAAAA
AAGCAAAGC
>CG7829 25642450 25642637|25977 chr3R 25642459 25642973 scaffold_13 1808638 1809203 + -693|0 199
TGCAACATACTTGATT---CGGGCAGTTTCACTATTTTAGCAGTTGGCACCCATGAAAGAC--GCATAAAAACGTGCACGTAAATGCTT-----TCTCGCTTAAAGTGAAAAAATCTACGC--GGATTTAATCGTAC----AAAATAATAAAAACTTTAAGGTT-----CATTAAAAGCCAACTATTTGTGAATAAAAGA
ATCTATATAAATAATTGCACGATCATTGTTAAAATT---GAAGCTTGGACAGTTTAAAGTCCTGTCTGCTAATGGACATCCAATTCTTTTATGGTTTTGTTTTTATCGGAAAATTTGGTGCTTAAATTGAGTATTATTCAGAGGCTAATAAAAGTTATTGCGCTCGACGCATTAATTGATATCTGCTTCGCTTTTACAGG
>CG7829 25642843 25643057|25977 chr3R 25642459 25642973 scaffold_13 1808638 1809203 + -693|446 583
GGCACCTATGCCACCATTGCCGGCTGGGG---ATTTAAGTCCATGAATGGTCCTCCCTCGGACAGT--CTGAGATATGCCCGAGTGCCGATCGTGAATCAGACCGCCTGCAGGAACCTACTGGG--CAAAACTGTGAC
GGTGCCACGGTCATCCTGACCGGCTGGGGTGCACCCGAACTCA--ACTGGCCAGCC---GAGCAGCTGCTGCGGACGATCAATCTGACGATCATCGATCGTGCCGAGTGTAGGG-CCGCCTGGGATTACACCGATGGC
>CG7829 25642843 25643057|25978 chr3R 25642974 25643243 scaffold_1 5312623 5312838 + -221|0 83
AATACTCTCAGCTAAAATGAGTTAGTTCAGCAATTTGCTCTGTAGGTAAAGGCCATTCCCATAAACCCAGAGAGAGTAGCCGAA
--------------------TTCAGCTCGACCATCAAGGCTATTGGTCTGG---CTACTTATAATCCT----------GCCAAT
>CG31033 25653000 25653281|25990 chr3R 25653276 25654317 scaffold_4 1348451 1349405 + 37883|0 5
CCCTAA
CCCAAA
>CG18041 25680412 25680579|26008 chr3R 25680290 25680609 scaffold_13 1287178 1287484 - -140|124 307
ACTAATTTTTAAGCCCTCGTAGATTAAATGTTTACTGTTGC---AATCATAGAAACCTAGATAT---AAATCTCCGACACGAAAATGTCAGTTGGTTTTGTACT---------CAGCCATTGTAGTTTTTGGTGCATTCG-GGTGTAAGGAACCCCTAATAAATAGGCACTCTTAAGTTAAAAA
AGTAA-----AAGCTCTGCTA-AGTGGACAGTTATTTTTTCTTAAATTGTACATACATAGATATCAGAAGTCTCAAATCTAAAAGT---AATGGATTTTTTACTTTGGATATTCGTTTGTTGTAGAATCCGGCATGTTCGCAGTAAAAGGAGCTGCTTTTGGA-ACTTTCACTGAATATAAGAA
>CG31032 25684830 25685049|26012 chr3R 25685034 25685204 scaffold_20 1546103 1546283 - 1108|0 15
ACGGGCGGCGGTGCCT
ACAAACGCAAGCGCTT
>CG15514 25685776 25686075|26013 chr3R 25685984 25686373 scaffold_13 191098 191507 + 13184|0 101
CCCATCGACGATTGGAACG--GCTTGTGTTTGTAGGTGGATAA--------GGCGGGCAATATGATTATTTACACTTAGGTATGATTATACTTTAAACGATT
TGCATACACAATTATTTTGTTATTTATGATTAAACAATAATGATAGTAGATGGCGGTCTATGTAACAACTTGAATTACAATTACATTACACTT--AACGATT
>CG7816 25689421 25689679|26019 chr3R 25689445 25691430 scaffold_13 195352 197486 + 65212|0 306
-AACTTTAGCTGACAGCAGTATAAGAAGAAAATTGAAAGCAGTTT------TTAGTTTGTTCTA---------------------AGATTGTCATTGGCAGTTTTAAATTAACATGAA--TTTGTTGTACT----------------TTATGGGATTCGACA----------TCCTGTCTGCGTTATGTAATTATAGCC----AATATGAATGATATTTAAACTATTATTAATGATTACGTAT-------------TACTGTATCATACTTATGAAACGAAAATTCAATAGACATTTAAGGGAGAGT
CGCCTCCAAGCAGCAGTAACAGCAGCAGCAAATTAAACGCTGCTTTAAAAATTATTTTGTTATATTTTCGGCCACCACAAATCCCAAATTGTCATTGGCAG-TACAAATTTCTAGGAATTTTTGTTGTAATTGTATTTGTACATTAATTACGCATTACGACAATATGACCCGCCCTATTTGTGTTATATAATTATAGCCAATTAATACGAATGATATTTGAACTATTGTTATTAATTACGTATATATATATATCTATTTTATATCGTACTGTGTGAAGTCAGATTGCATAGTGAAACAAGTGAAAAT
>capa 25738707 25738862|26060 chr3R 25738649 25739444 scaffold_13 2305089 2305952 - 13561|72 312
AC----------ACACTGACTCCC--------CCTTTTGACACTCTGAATGTCG-----------------------TAGATACTTTTGTATA-----------------------------------TCAAAGAGAACG--CTTCTAATTGAATATTGTAACGGGTATACAGCAAATATGTTTTTCGGTCAAATATATATTATGAATAAGGGCTGGTGAGAGCTTGTAAT-------TAA
ATGATAAAGAAGGCAAAGGCACCCGAAGGAAACCACAAAACGCTCGAAAAGGCTTTCCAATATATTTATTATGAATCTACAAATTTTAGTACACTATTTACGACCACTTGAACCACTTGATTATAGCTTGAAAGAGATCAACATTGCAACGGAATAATATAATGGGTATATAATAAACAAGT---------AAATATAGCATATATAAATGGGCTGGTGAGGGCATACTATGTCGGTGTAA
>trp 25740242 25740317|26062 chr3R 25740238 25741928 scaffold_13 2306842 2308469 - 47937|4 95
GCCGCGGAATCCACTTTCATAGCAATT----------------AAATAGTTAAGTCCTTTGTTTGTGTGAATAATAAAAAAAAAGAATCTCA
GCCAAAAGATAATTTTTCAATAAAATTTTCGTTGATTTCCCTAGCCGAACTAAGTACTTAAAATGTGTGTG-AACAAATAAACGAAATTTAA
>Jon99Ci 25750947 25751020|26081 chr3R 25750914 25751904 scaffold_9 1096933 1097817 + 18646|33 111
AAAAAAACTTTACTAATTTCAAAGCAAAAAGGTGCTTAAACAAGTTTTAAAT-----AAATGAAGAACATATGCTGTTA
TAAG-----CTACTGCTTCCGATATGA-------CCTAAATAAAGCATACATATAAAAAATGAATACATTATACTCTTT
>CG31040 25756268 25756354|26088 chr3R 25756268 25757874 scaffold_53 78992 80547 + 71585|0 86
TTTTCAAATAGTTACATTCAATATCCAAACTTATATGTAATTTTAAGTATGTATTTATATAAACTATTTTGTTGGCCTACAGTTAAA
TCATAGAATCCTTATAT----------AAATTGTATTTAA-------TATATCCT---------TAGCTCTTTGTCCTCCAGTCAAA
>eIF2B-alpha 25760304 25760326|26091 chr3R 25759081 25760481 scaffold_53 81956 83371 + 32163|1348 1382
GGGCGAATAAAGATA------------TTGCACTT
GG-CTAATAAAACTAAAAGACAAGCATTTTGGCTT
>Takr99D 25776513 25777224|26099 chr3R 25776502 25776601 scaffold_53 102093 102204 + 2001|11 114
ATAAATGACTATGAATGTGAGTGTACGTGTAAATATAAATGTCTGAATATAAACGTT---------------ATTGTGAATAAAGCGACTTGCTCCATCACCAA
ATCAAAGATTAT---TGTGTAAATATATAAAAATATTTATGTATATATTTAAGTATGTCTCAGCCTCTGTGAATTGTGAATAAAGCGTCTTACTCAAAATCCAA
>Takr99D 25776513 25777224|26100 chr3R 25777062 25778015 scaffold_53 103201 104107 + 17377|0 169
CAACCGGCCATCCAGGTGGTGCCGCCGGAGATGCAGACCCAGATCGTCTGCTCCTCGCCGTACAACAACAACTATCGGCGGGCCAATCCTGGCCTCTCCGACCGCGACTCGTCCGACGACAAAACCTGGCTCTAAGCTACTT-------TAAGGTCTCGAATTTACACTA
CAGGCCGCATCCC---CGGAGAACGTGGAGCTCCAGATGCAACTCGTCTGCAGCTC------CAACAACGACTATCGACGAGGCA-------TCAATACATCTGCAGCT-----GATGACAAGACCTGGCTGTAGGTTTCCTCTTCTCACTATCTCTCGAATTTAGACTA
>Acph-1 25816861 25817305|26139 chr3R 25816781 25817754 scaffold_53 166832 167898 + 14545|80 606
GAGGCTTACCCA-------TGCCATGCAGTTGAAGGCCCTACTTAAA---TCTGAATTAAGAGC-----CTTGCCCGCTCTCTAGTTGC-CAAAGTGATTTGCCTTTCTTGGTGTTTTCTATATTGATTTTGGAAGTCATTGGAGTCTCAG-GCGACAGTTGTTGTTATTCGTGGTTACTACTTAGTTAAGCCGTGCATTTCACACAAAGTCAGTTTGTATTGA----------------TTAGTTTTGTTA-------------------GTTTAA------------------------------GTTTGTGCATTTGAAATTGAAAAACACAAGCTCGATAGCATTTAAATGGAGTAATAACTGGTTTTGTTGTTATTCAGTGAAAGATATGGAATACAAAGACTGTGAATAGCGATCTTGAAGTTGCATACATATTATACATAACATATTTATACACATATACATTTTTATGAAATTATCATGAATGATAAATTTATTGTATTAAAATCGCTCAAATCAAAGA
AGGGCATGGCTAGGATGGCTGGGATGCTTATTGAAAGACTACGCCAACTTCCTGAATTAAGATCGAGTTATTGCTCA-GCTTTAGCCACTTATTTTTATATATCTCCCCTTGTCTTTGATTGAATGCCATT---AATTATTT--GTTTAAGTACGACTATTGTTTGTGCTCCATATATGTACGTATTTGGTGCAACAATTGTA---AATGTAAATTTAGATTGAGTTATTGCGCTCGGCTTCAGATCTATTATAAATCTCCCCATGTCTTTGTTTAAATGCCATTAATTCTTTAATTAATGTTAATTGTTTGTGTAC---GCATTGTGTGCGACAATTGTAAATGTATATTGTTAAGCTCATA--TGATCTTGT--TTCTTTTGTTAAACGACGACAAAACAAAGACTGTGAATGGTTACCCTGAAAGT---------------------TTCTTGTACACATTTACATGTGTCCCATATTAT-ATATATCATAGATT---------------AGTAAAAATATATA
>CG7903 25819196 25819483|26141 chr3R 25819259 25819870 scaffold_53 170971 171633 + 8538|0 260
GCAAGTGCAATGCAGCA-----------ACGATGTTTGCCAGTC-CACGTGTACTCCAC-----TTAATAATGTAATAGCCGAATTTTGTTTTTC-ATTGTTCCGCGCGCAGAATCTTTT-AGTTAAGCCAACGACGACGACTTTTAAT--TTGTCCTATAGC----CGTGTACTTTTAAGACCAAC--ATCAACAGTATATTTGTTATTCGTAGTC---------TAAGATTGTTTCGATATTTATGCAATACTTAAATA
GCCAACAACATGCTGTATGTAACATTTTATCATGGACCCTAGACGCCGGTGTAATCTATGTAGATTGCTGACCTAATAGCCGAATTTTGTTTTCCAATAATTGCGCCCATGCAACATCTTAAGTTAAGGCAA-----ACAGTTTGAAACAAATGTTCAATAACAATACGCGTTATATTAAGCCCAACCAATCAACAGTATATTTGTTAATTGTATTCATTAAGTATGAAAAGTATTTATCCATTTGAGCAATGTGCAAATA
>CG15525 25822682 25822748|26144 chr3R 25820900 25823759 scaffold_53 172971 175871 + 75264|1842 1940
AGCTGAATAATACAACTAACTTTACT--AAACTGGTACAAAA-----AACGAAAAA------------ATGCATTA-ACAATAA------------GTA
CCCACAAATAGATAAATAAGTTTAATTAAAGCTACGATAAAACAGTTAACTAACAATGCAAATTATTTATACAATACACAATAATGCTTACTAAATGTA
>CG7911 25829434 25829491|26149 chr3R 25829397 25831692 scaffold_53 182422 184667 + 32039|45 102
AAACACATTACACTCCAGTAAGCTAACTAAATGATCCGAAAAAAATAAAAACTTCAAT
AAACACAC--ACCTCCAGTAAGCTAATC-----------TACAAACAGAAAAATCAAT
>CG7912 25831758 25831778|26150 chr3R 25831734 25832030 scaffold_53 184715 185017 + 7902|29 51
AGAGTGCTCTTTTGTCTT--GCC
A-ACTGTTTTGCTAACTACAGTT
>CG7920 25836189 25836384|26152 chr3R 25835397 25837786 scaffold_53 188649 190945 + 90652|840 1038
GCAAGCACTGAAGAAGCA---CTAGAGATCACTATTTACTAGCAGCGACCCGCAATCTTTGAAGGCATTCCCGATATCGCTTTGATCCACTTCATAGAACTGCAATCATGATAGCCCTTTAGCATTACCAAATCTGAAATTTCAATTGATGAGTAACGAATTGATGGGAGAAATAAAACTGAAATTGATTAAATGCCTG
------ACTCAACAACCCATTTTAAAGAGT-----------GCAACGAATCGAG-----CAAAGAAATTTTAAATATGTTTTATATGCATTCCCGCAAAATGGTTTC------TCCCTGT-------------------TTTCGATCGG-----AATGAAATTCAGTAGAAAATGTAAC---AATT-------------
>CG7920 25840264 25840402|26156 chr3R 25840204 25841733 scaffold_53 192934 194631 + 9163|67 278
TGGGCT-------------------------------TGCTTATGAAAACAGA-----ATGAAAACGAGAACACCGGGTTGTGGGGCC-----------------ATGCAAATGTAAGCC---------CATGTGT-----------GCCCGCAATCCAAACTACTTTGGAGCACATATGCATGTACATACGTACATATGTACGTAAATAGG
CGTGATTGCCCCCCTCAGCCCTTTGCCCTAAATTGTGTGCTTAGCAAAGCAAAGGTTGAAGATAGCCAAAGGGACGCGTGGAGGGGGCCGACGACCGCTCAAAGAATGCAAATGAAAGGCGCGCCAGTGCGTGTGTTTTTGTGGCGCGTTTGTAAATCAAACTATT----AACACACATGCATGTGCCTGTGTGTGTGCGCACACATAAACA
>Mgat2 25841227 25842093|26156 chr3R 25840204 25841733 scaffold_53 192934 194631 + 9163|1257 1823
AGTGTTTAGGCTCCGTCCAGATCCAAAGATCGACAGAGTTCCAAGCGACGGGGCGGCAATCCTTCAAACTGAAACCAGAAACTAAACCTACGAATACTAGCGATAGACCATACACATACA----TACATATGT------ACTAACTCGTATCCCCAGATTGTGCCGAAGCCGTTTCGCAAGCGGCCAATTAATTTGAGTCTAGATCTAGAGGCAGCAAATCGCATAAACTAGTCATAGCAATGTATTACAGCACATGCGCTAT---------------AATACATCATAGATCAAACTTTTGATA-----TATCTACGAGCCTACGTTTTAAGCCTGTACATAG--AGGAATTGCGTTGTATACAT--CACATAAGGTCTTTTTATGATATTAACGCGGAACTAATGTA----ATTTGTTATTTTTTAATCGTTAGTCCAAAGCGCTTTTATGTATTAGGAATTTTGAT-TAATCGAACGAATAATCCTAGTGAATAAACGCCAAGTAAATGCTCTACCAGTATAGACTTTA------AAAACCAA---------------AACAAT
ATTGTTTAGGTTCCGTCCAATGTTAAAGACCGA-ACTGTTCCCA-------------------TTAAACTA----------------TCACGAACATT-----TCTACTATATATCTATACCTTTACATATTTTGAGCAAAAAAAAAGAAACCCCAGATTGTGCCGAAACA-------------------AAGTCAAGTTTAGTAACAGAC----CATAACGCATAAACTAGTCATAATAA-ATATAAAACTAAATCCGACATGCATGGAAATCAGATAATATAACATGGTAAAACTCTTCAATAGATATTGTCTATGA-TATATGGGTAAAGCATGTAAATAGTAAAAACCTTTGTTGTATAGATTTCACATAAGTTCTCTTTATG-TATAAGTATTACGATTATGTACGTAATTTGTTATTTT--AACTGTTAGTCCAAGGCGCTTTTATCTATTAGGTTTTCAACTATAACTGAACGAAAAATAATATATATTAAACGCTAATTAAATACAATCAAAGAGTCTTTTTGATTCGATAAAACCAACGAGAAATCTTAACTAAATAT
>Mgat2 25841227 25842093|26157 chr3R 25841914 25842718 scaffold_53 194961 195756 + 32978|0 198
GGCCGGGGAGCCCACGGAATGGAAACCAA---TCAGTCAGCAGCAAGGAAGCCTAGCTAATAGCGTTAT----------CTAAGTAGGAT----TATTAAGCAGTAGTCTTAGT--CACTGTAAACGAACATTCAGCAAGTACTCTGCATTAGCTAACTAACCGAAAATAATCAAAGGCCAGAAGGCAGAAGCCGGAAG
AGCTGATAAAACCAAAAAAAAAAAAAAAAAACTAAGCCAAAAAATGGCTAAACTAGTTAATATATATATTAGCTTGTAGTTGCGTAGAACATCATTTTAAGTAGCTGCCCGAATTATACTCTAAAGTACTCTTTAGGCTAAATGCAACATCTGA-AAGTACTCGAAAGTACTCTAAG--CTAAAAGCAGCATCTGAAAG
>CG7928 25860762 25861149|26177 chr3R 25860469 25863229 scaffold_13 2605780 2608488 + 70508|369 796
-CCACTATATTGAATATATATAATAGATAAT---TATATATTGTGTAAGGCCCAACCCATCATCGACCATCATCGTGATCACCACCCAACCGAATGCAAGCGAAATCATTTGGATCATTACGTTCTATCCATGTACTT----------------------TTTTATTAAATCTATATGCATTTTGCTCACAAATAAAATATG----------TTTGATATAATAAATTTATCCGTTACTTGCATATTTCTGCGGTTATTTCAGTTTTCTTAAAAAAATATGTATAGTAAGTGTGTG---TGTATGCATTAACTTATTTGAATA--AATCAATCGATCGACCTCGTCCGTTCCGGCCAAGGGCCAATAAACCACCCACCCATTGTATTCCAGTATTGGTCGCTGCTGGACTGATCGAGCCCCAAATGAA
GCCAGTTCGTCAATTAAGCTTAACTAAGATTGTACATATATTTTGTATGGGCTAGGAAAT----GACAGTCTTCAC-ATTATTA-ATAATTGAATAAAA--------ATTCGGTTTTAAATGTCAATTTTATGTACTTTGTTTTTGTTTTTTTTCTTTCATTTTATTAAATCTACATGCATTTTGCTCACAAATAAAATATGGTTTGTTTGTTTTACTATGATAAATGTATGCATTAATTTCATATTTCTGCGGTTATGATCAGTTTCTTAAAAAAATATTTATTGTATGGTTTTGTTATATTTTTGATAACTTATGAAAGTAAGAACTAATCAATTAAT------------------GTGTTAAGCAATTATGCAACTATTGG-----AGCAATTAGCACTCATCGTTTGATAAA---TCAAATGAA
>ocn 25862717 25862811|26177 chr3R 25860469 25863229 scaffold_13 2605780 2608488 + 70508|2386 2480
AGGCGTTTGAAAGCTTGTTTTATTTTTCCTAACTGCCCTGTTGGCAATTTATAATACAACAAAAAATTAGTAAATACATGGCTACATATCGATTT
AGCTGACCGAATACAAATTTTGGTTTTTTT------------------------TGCAATAAAAA-----TGAGAACAGAAGTATTTTTTATTTA
>janA 25864339 25864584|26179 chr3R 25864168 25864466 scaffold_13 2608489 2608794 + 1552|179 326
AAAGGCAGTTAGTCTGTAGCTTTGCAACTGCTCGCACTAAACCTTTTCGGATCTAAATTAATCAGTTTGTACACAAATTTCGTTTCTTTTCCTTTGG--------------------TTAAATAAAATGAAAATGTTCAAGTCATTGC
AAAGTTAGTCAAGCTGTAGATTTTC-----TTCACAACAGACCTTTT------------AATAAACTCGTCTAAATTTTCCATTTTACTTTTTTTGGCGTTAAAATAGTTTACCTACTCAATAAAAATGAAATTATTAAAGCTCGCGC
>janA 25864339 25864584|26180 chr3R 25864467 25865130 scaffold_13 2609049 2609702 + 9283|0 130
CTGCAATCAACGA------GAGAAGACTCCACATAAGCACACTGACATGAATTTATA-------CCATTGGCTTTGATCCTGTGTGCCATGATTTTATTGGAAATGGCATTTAAAATTGAGAAATGCTCTG
TTTATGTTTATAATTATTTGAGCATACTTGAAGTTAATTTATTAAT-TCAAATTATATGTACTTCTACTGAGCACAAACCAGCCTGTATTCAGTTTATTTG-TATATTATGTAGGATCGAAATATGTCTTG
>RpL32 25870868 25871034|26185 chr3R 25870977 25871761 scaffold_13 2616327 2617119 + 34213|0 70
GCTTAAGATT--------CTTGA--GAGTTCTT--GTAACGTGGTCGGAATAC-ACATTTGTAAACGTTAA
GCTTAAGTTTGGAATTCGCTTAAACGAGTTTTTTATAAACGTAGTCGGAATACAACAATTTGAAACGTTAA
>spn-A 25880412 25880587|26194 chr3R 25880383 25880966 scaffold_13 2630310 2630868 + 20372|30 213
TTGTGCTCACTTATAGGTTAATTAATGCTAGGAATAGAGCTCCCTAACTTTCTAATGATTACTTATCCCTAGACTAAGAATTAAACTTCGTAGATTGTTTTTTTT--------TTTGTTTTAATGTTTACTTAGAATGTTTAGGATAACGACGAAATAAAACAGCCGTTGCGAATTGTATGTAC
---------------GATTAATTAATTTGATGA----------TTGAATTTATGAAATATATGCAAAGCTAAGCTCATATTTGATATTTGACGATTGATTTGTTTAACTATACTATGAACATATATTTTTATAAGAATTTTAGGATATGAATAAAAATAAATA------------TATATACAG
>CG31025 25951118 25951486|26282 chr3R 25951271 25951538 scaffold_23 1428643 1428933 + 1735|0 230
TTTCATTGATCCGGGTCGCCTATGCATTTACATCCCAGCCCCATATCCTCATACTTACATT--TTAGCCTAGCCATGTTCTGATTGAAGTAA--ACAACCGCTTAAAATT--------ATAAGTTTTAATAAACTCAAAATTACAATTAATGTGTTTTCCTAATGATAGTTCTAACCTAAGGTGAATACTTTAAATATTTAATCAAATAGCAATTAA---TTCATCTGAAT
TTTA--TTATTTTGATTTCTTTTCTATTT-TATTTTATATAAATATATATATATTTATATTATTTATGATGTACATGTCCGAATTTATGACGTTGCAATTGTTGAAAAATGCTTTTATATAATTTTTATCAAACTTACAA-----ATTACTTTGATTTCCTAATATTTTTTTAAAATTCAAATAAGTACTTTACAATTTTAATCCCAAAAAAACTGACCTCTTATCATTAA
>CG31029 25955011 25955102|26284 chr3R 25954095 25955086 scaffold_13 2751901 2752862 + 6954|986 1062
AAATGCATTGATGTTAGCAATCACAAGTATACATAGC-CTTTACATTTTAAATAAATGACGGTTTCGGCATTCCAAG
AAATGCATTAACATTA---AACATAAGCTTAAAGAATTCTTTAAGTTTCATATTTTCTATTTAGTAAGCAATTTAAG
>Tpi 25958698 25958963|26287 chr3R 25958548 25960161 scaffold_13 2762708 2764307 + 59973|162 463
GCAACGCGATCTCAAGCATCAGATCGCTTT-----CGGCCAGCGAACTGCCCGCGAA------------GGAGGCACTGGAGGGCAGGACTCCATACTCCTGCGCGCGA--ATGCATTACGCACA----CACCTAGTTGTTGTCACC-----------ACCAAGTGCAGTTCCAAATTCATAGTTACCTTGCGAGAATGCTACTCACA--TCCTTGTTGTTGAACGTATAGTAGTCCATTGTGTAAATCTTAAATTATTCAGGCAATAATTATGCGCTACTCATTTACTTATATACCAAACC
--AATGCGGCCT--------GGACCGCACTTGCAGCAGCTCGCAAACTGCCCCCACAAAAACAAAAGTCGTAAAAAAAAAACAACAAAAAACCAAACTTATTCGATTAATTATGCATTACGCATAACTTCAAAGAACTGTTGTCAATCGCTTCGAGAAACCTGATGGCGCTGGATGATTATAATC---------GAATGTAATTCAAAATTCCTTGTTCTCAAAAGTCGATGTTTCCTTT---TAAACGCTAA------CAATTCATAATT------TATTCACACCTTGGCAT---AGATC
>CG31030 25990411 25990871|26317 chr3R 25990433 25992198 scaffold_13 2806247 2808061 + 48428|0 459
GAAGGTCATAAATCTCTCATAACC-CAATAGATCTCGGGCAGCCATGTTCATCCAGATCACCTACGTGGCTTTCAAGCCCCTGGCTCTGTTCACCTTGGCCATCGAGTTCTTTCTCATTCACTTGCTATTCGTGTTGATCGTGTTGTACGTGTATGTGCTATGGTACTACTG----------AGTAATCCAAAGTGGAGATGAAGAAATATAACATATA-----TCAGAAGAGAAAGATAATGCAGTTTTTCTGAAATAGTACTTGTTATGAACAAGTGTTTAACTGCCTGTCATGTTCTTCAAAATTCAGATGATTTCCTCCAATTGAGTTAATATTATCAATATTAATCGAAGCAAAATAAACTAAAATACTTAAAGGACTCTTGTTATTAACTATATAC-ATATA-CAAATGGAATATAACT---TAATGAGATCTAAAAAGAATAAAGCATGCTTT
GAGTGTTCCGCAGCTTGTAGCATCGCTTTGGACCCTGCTGCAATATGTTTGTCCTGATCACTTTTACGCCTGTTAATCCGCTGGCATTATTAACGTTGGCCATCGAATTGTTTCTCATACATTTGCTGTTTGTGCTGATTGTGCTCTATGTTTATGTGCTCTGGTACTACTAATATAATGGCAGCCATTCAAATTACCTACAAGCATATAT-ACATATAAATACTCACTACAATTAAGCAATTTAATTCAACCCAAGTTTGGCTTAGTTCGAAA----TTTCAAGCGTATGTCTTG---------ATTCGGCTTACTCACTT--ATCGAATT----TTCACACATTTTATCG----AAAATATACCAAAA---GTTGGAATTTTTAGTCACTAATTTAATAAGAAATACCAAACCAAATCTAACGATATATCGATACTTCGATACTATAAAACAATTTTT
>Mlc2 25997160 25998711|26319 chr3R 25997151 25997556 scaffold_13 2813900 2814286 + 8172|9 447
GTTTTAGTTTGAATAAGGTGCCCATAACCACTAGTACCTAGGCTG------ATCGGAGGAAGCA-CAATATATTGCCTTATTTATCTAATACTACTATTACTCAGAACTCAACACTTGACACTCGACACGAGCACACACCACACTCACACGCACACTGCAATCCATTTCAAAGTGCAACATGCAACAAGTTGTTAAATGCAAATCGAATCTTTACTTCAGTATATTTTAAGCTACACACGGCAAGATGAAAAAATTCAGAAAA------------------------------CTTTTAACCCGGTCAGGAATATTAACAAGAGTAAAACAAAAAACATCTAAAAATAGAAAACAAGTAACTGTTTTTATACAACATAACTAGATGATGAT-ACGATGACGAAGTCTT----GGAATAAAGCAAAAGAGAGTCGTCTTG
GTTTTGACTTGAACAATA----CACAATCATTAATACTAAGGCTATATTCAAGCAAAAGCAGTAGCATCACTTCACACTAATTACCTACTA--AAGGAAATTACAAACACAATAACTAATAC----AACAAACACAATCTATAATTAAAC--------CAATTCAATTCAA-------TATGCCACGAGTTGTTAAGTGCGAA---AATCTTTACTTCAGTATAAATTAAGTTACTTG-GCAAAAAAGAAAATATACAAAAAAAAAAATATAAGTAAAATAATAATAATTACTTTTTTAACCCGGTCAGAAATATTACCAA----------------------------AAAAAAAAGAACTGTTTTTATATAACAAT----GATGATGATGATGATGATGATGACTTTAATAGAATAAATCAAAAGCGAGTCGTCTAA
>Mlc2 25997160 25998711|26320 chr3R 25997607 25999566 scaffold_13 2814605 2816652 + 74069|0 1245
GGCACA------TCCGATCACATCCTAACTTCTAACTCAACATCCATTTTACAGCC--------------------------AGAATCAGAACGTTAAATC------AATCAGTCAAATCAGTAATAATAAACGTAATTAAAAGAAACGCTCG-TTTACATATGTAGATTCTCAGTATCT-TGTAATCTC-TTTTGTTAACCATCACCAAGTACCTTGTACCAAGAACAACACCACCAACCAGAT-CAGCAACATCCGATCAAACTGAACCTCAAAAGAACTTCTTCAGCAA--CATTTGGTAGCGATCAGAACCATTT-ACCATGTATC-TGTCCATCATA----GTTAGGGATACTTACGATCACGTTCACTGTCACGGCAAGAAC-TGACGCGTAGTTTTCTAGTTGATTTACTGTTAAATTTTACACGTAAAATTTATAAAACATATGCTATCTATTTTATTT-----AAAACACCTATAAAATCAACAAAAAAAACTTAAAAACAACAAACAAGC---CGTGTCTATTTTTATATCGCTGTCCGTTGAAGAACTAAAGAGAAGAACCCCCAGAGAGAGATGATTACCAGATCGAGATCGAGATCGGAATCGAAATGAGGATGTATGATGTATGATTTATGATGTAGGGAGGACGAAGACGATGTTGATGGGTAGCCGGGCTGTATTCGTTAGCCCTGCACCCGCGAGTTCAATTTGATTATGAATATGAA---TTTTAGCCAGTTTTGTGAGTTACAATGTTTTTCGTTCAAGAAATCTCGCAGGACCAGGAGAGAGAGAGGTAAACCCATAACAAACTATTGTTAGGGATCATTTAACTGAGAGCCAAATAT-------------ATATCCTACTATCACAAAATATTTATCGTTATACATATCTATCGTTCGT-------TACTTACTTATTTATCAGT---------TATGAGTTATCAATAT------TATTGC--AAGTTATCGAGAGTTAGGCTAAT---AACAGAGAAACATT----AAGTTCATTCACTCAAATTG---------TTTAATGCGAATTTATATAACTTAACCATCGCCACCA------------------CCAC-AACTTTCTGCTTATGAACTATCAGCGATATAAACCACCCAAACGAACAAACAACCCAAAATGA------TATCTGAAATAT-GAAGAAACATTCAAATAACAAACCCAGTGTTTCTAGTTAATGCGTT
GCAGTAGCTGGCCCCGTACACATCCTAAC-TCTAACTCAGCATCCATATTACAACCAACAACAACAACAACAACAACAAAAAAAAAACAAAACTTAAAAACTTTTAAAATCGTCTAAA--AAAAATAATAAACGTAATTAAAAGAAATGCTCGTTTTACATATGTAAATTTTAAATATTTATATAATCTCTTTTTGTTAACCAACACCA-----CCACCAACAAGAACAACAACAACAACAAATTACAACAACA------CAAATTAATACTC---TTAACTTCTTCAACAAACAATTTGATATGAACTAAGAACATTTAACCATGTACCAAGTTCCACATATCATTTTAGGGATACTTTAAATC----CAAATGTCGAAGCGCCATCTTGACAGCTAGTTTTCTAGTTGATTTATTATTAAATTTTACACGTAAAATTTATAAATAACTGAAAGTCTATTTTATTTCAAAAAACACACAAAGAAAATACTTAAAAAAAAAGAAGAAAAAACAAAGAAATTCACATGTTTATTTT--AATTGCTGTTCGTTGAAGAATCACAGAGAA------------------AGTTACAA-----------------AAATAAAGATGAGCAAGCGCCGTGGGTAGCTTATGATATAGATATATACATAAGTATATATGTATATCATCGATATCTATACGAAATATATATAC-------------------AGAAATAGGTAGGCCTTGGCCCACATTTGTTAGTT-----------------AATCATTTTACAGGTTAAGGAGAGAGAGACATATAC----AATTCGTTATCGTTAGGTTACTTTCATCTGAGAGCCAAATATTCTATATAACTAAACACTTGAATACTATAATATATTATGC---ATATATCTCAATCGTTCGTTTAACAATATTTCAATATTTACCAATATCTATAAATATATATTTTCGAAATATATCAAATTACAAAAGTTATTGAGAGTTAGCTTAATGAAAAGAACAAAACATTTTAAATGTTCATTCACTCAAATTGTTTTTTTTTTTTTGTGCCAATTTATTTAATTTACCCAAATGAAAAAAAAAAATGAGAAGAATATTCACAAACTTTCTGCTTATGAACTACTTACTAT----------CATGAAAAAAAGTGTTTCAAGTTTATGCGTTTAACAAAAGTATCGAAAAGTTATTAAAATGCAAAAGTTAATATTTATTTTTGATGAGTT
>CG9747 26011142 26011565|26327 chr3R 26011144 26011471 scaffold_13 2244727 2245020 + 4446|0 357
TGCGTCTGTCTATGCG-AGGGCGGGACATAGTCGATAATCGTTTTT----TAAATTAAACCCTATTCT-----ATTCTATAATTATCTATATCTTCACACCAGACCAACACACCTGCACCGCAATGGTTAACACTCACACAACCACCCAACACCTAACACCCACATCCCCTCATTTTCGTATCTTCATTTGTGTAGGTTTAGGTAT-----------TTAGCACGGTACGACATAAGTTATAAGTCACACACAAATTTACGTATAGACGACAACTACAAAAT-ATGCTCTCAGTCCGAGACA--------AATAAAAAGAAAATAAATATTTGCAAATAAAAACAATTCAAAAATCCA
TGCGTCT---TGGGCGTGGGGCGGGTGATGGTCAATAATCGTTTTTCTATTAAATTAATTAATATTCTTATTAATTTTATTGTTATTCCTATTCGTA-------------------------------TCACCCTTACAGAACC--CATATATTCGATATCCATATATACAC-----CATATATTCATTTGCGTAGGTTTAGGTATTCTCTAGCATATTAGCTTGGTACGTCATAGTT--TAAGCTAAACAT---------------------TTACAAAATAATGTTTGTAATTCAATAAATTGCAGGCAACAAAAAAAAAAATAATAAATGTAAAATAAATTATTTACAAAATACA
>CG9747 26011142 26011565|26328 chr3R 26011560 26012549 scaffold_13 2245332 2246242 + 46435|0 5
GGAGCT
GTAACT
>CG9743 26022087 26022358|26339 chr3R 26021452 26023244 scaffold_13 2260341 2262174 + 53684|675 1000
GCTAGGCCGTGTATTATGTTTTCAGCCTGTGGTTTTCCTAGTATTAAGTTGTAGCACCAAGCCATGCCTTATGCTCTGTTTTTTATCGGGACCTGAGTCTTCATATGTGACTCAGATCC----TCTAAACTAGGCTATGACCCATCACCCAACGCCCATCCACCATCCCATGCCATCCCGGACCACCAGGATCTCTGGGATCGCCGTTTAGGCAAGCTAATCTCCCA--TCGTTGCTTTCGTTACTTACC----------------------------------------TGCGGTTCAATAAACTA--------TGTTTTGTATT
GT---GCTGTGTGTTAGATCGCAGTGCTGCTATAGTATTAGCAGTTAATCG-----------------------CCTGTGTTTTTGTTAATCCTAAGT-TTAAGATAAGCGTCCGCTCCCACTCCCAAAATACCTAATATCCAGACACAACATGACCAACCGCCCTACC---CCCTACCTGCTCCCA--------------TGCCACATATGTACACTACTCGCCTATGTCGTTGCTTTTGTTACTTACCAAAAAAAAAAAAAAAGAAAAAGAAAAATGAAAGGGCATTAAACTGTTGCATAAACCAGTCTTGAGTGTTTCGCA-T
>RpS7 26032240 26032359|26347 chr3R 26032081 26032646 scaffold_429 7689 8331 + 11013|193 360
AGCGGCG------------GGTTCTCGTTCGAGAGTAGCACTGGTTCGCCGGTTCATCTGGGAAT---------------ATGAGTTTTTT------ACATGAGCT-AGAGAACG----------TGAAT-AAACATTAAACAATCT---AAAACTAAGCAAACTTCC
AGAGGTGTTCCACTGGCAATGTCGTCGTC-----GTCGCGCTGGTT---CAGTTCAACAAGAAATTCTGTCGTACAGAAGATGCGTTTTGTTTTTTAACATGAGCTGAAAGAACGCAACGTCAACTAAATAAAACAGTAAACATTTTTAAAAATTTAATTAAATTATT
>CecB 26039056 26039197|26360 chr3R 26038938 26039157 scaffold_13 2289921 2290209 + -153|171 289
TTTATTATTAATGCATTAGGAAGA----TTAACATAATGAAAATAGATACTCAATGCCAATGT------CAAATTATTAAAATAT-------AAGCAAGCAGATATTAATAAAAACAAA
TTTATTATAAATTTAGCAGTAAAACAGCTCCTAGTAATATAATTTCGTAAGTAATTACAATTTTTCGTGCATGTTTCTAAAATGTTTCGCAAAAAATATAAGATTTTTTCATACTCAGT
>CecB 26039056 26039197|26361 chr3R 26039158 26039797 scaffold_13 2281853 2282522 + 9495|0 39
AATCAAGTCTCGAAGATCCTCGACCCGCTCATTTCTCTTA
AATTGAAACATGCGG---TTTTATTTATTTATTTATAACA
>CG9737 26066985 26067237|26401 chr3R 26066986 26067639 scaffold_13 2321451 2322100 + 23508|0 266
CGTCAGATTTCTTTATTCTGCGAA--------------AGGAACAATTGGCGCCTAATTGAAGCGGGCGGGATTCCGATTCAGATATGTTTACCTCTAACATACTTGTATCTACCGTATTTGTACATATTTTGCTAATTATCTAACAGCCATCAACTATTTGGTTAAGCGTGTGAGTGAATGAGTGCGGAATGTGGAGTGCCTGTGCGAGTTAACAAAAGTCTGAAAAACATGTTTCTATTTAAATAAACTACT-GAATATTTACCC
CGTCA---TTTTTGGTTTTGGAGACATTTCAGATAACCAATAACAGTTGGCGCCTAGTTGAAG-GGGCTGGGCGCCG--------GGGCGTGCAATCCACGGAAATGTCTCTA-AATATTTGTACATATTTTGCTAATTATCTAACAGTAAATTACTGTGTGTGTGCGTGTATGTGTGAGTGTGT-----AGGTGTA-TGCCTGTCTGAAATAACAAAAGTCTGAAAAACATGTTTCTATTTAAATAAGCTATTAAAATATTTACAC
>CG9733 26069698 26069827|26405 chr3R 26069433 26070721 scaffold_13 2326138 2327368 + 33512|284 417
GTCCCGAATTCAAACTGAATGTTCA----AAACAAAAATTGTGATCTTTAGCACTCTTAGATTAATATAGTAACTAACTTAGATTTTAGTAGACATAAATATTTATTAATGCAAATACAAGTTTTAAATCTGAT
GCGCAGCTCTTTAGCCTAGCTTTAAACTGAAGCTCGAATTGTGATCTT------------GCCTATATACTCGTTTATATGAATATCAATA-ACATATTAATTTAACAAC-TAGACATAAGTGTTAG--CCAAT
>Fer1HCH 26211290 26212019|26588 chr3R 26211257 26211425 scaffold_13 2489616 2489779 + 2183|33 171
TTAAGTGGAATCGCTCATTCGCATA-GTAAGACACTCAG-CACAACCCATT-CAATACATCCTATATCTTTATATTTTTCTGTCAATTAGACGAGCAAGTTCTTAAATAAATAACAATATATATGTAACGAAATAAACT
TGAAATTGAAAAATCCATCTACATAAGGCATACATTTAGATATAAACAAGTACAATATAT---ACATATAAATATTTTTCTGTCAATTAGTCAATAGAGCTATTAACTTAATAAACAT-----TACGATCAAACTAAAT
>Fer1HCH 26211290 26212019|26589 chr3R 26211704 26211999 scaffold_13 2490294 2490598 + 12332|0 307
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ATTTTAATGGCCCCGTTATAGTCTGTTAAGGTGACCAACTGGAC---TGGTCTGTCGGCTCTGGAGGATGCTTTCAAGCTAGAAACCGAGGTGACCAAGTCTATTCGCGAGCTGATCAAGACCTGTGAGGGTACTTCCAAGAAGGCTGATGATAACGATTATCATTTGGTCGACTATCTGACTGGCGTCTATCTGGAGGAGCAGCTGACTGGCCAGCGCGATCTGGCTGGCAAGATCACCACACTGGAGAAGATGATGTCCTCCCATGGCCAATTGGGCGAGTTCCTGTTCGACAAGAACTTGTAAGG
>Fer1HCH 26211290 26212019|26590 chr3R 26212017 26213791 scaffold_13 2490625 2492642 + 24437|0 2
AAA
AAA
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CAATATGTCTCG---------------CTTCCAAA
TCATATGCCACAATTTGTGGCTCTAGCCTTGAAAA
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ATATTAAGATCGGCTAAAATTTGGATTTGTGT---AATTGCATCTTAGCGTATTTGTTGTTGAATAA--AATTACATTATCGTAGTTATATGTTTCGCCATTGTATGGTTGCATTAAAAAATAACCTATTAAACTTACTTAAAACATATTTATACATACCACTATACACATTTTGGTTGTTATAAGAACGATTTGAGACCTATGTAGATTTTTTGTTATTCTATGTTAAA--AATAAAAACAATTTA
ATATTCACATTGGTTAA-------GTTTGTGTGAAAATAGAA----AACATAGTTGAAGTTATATAATTAATTATAAT----TAACTACA-----AGCAAGTTTAAACCTACAATAGA--------TATTAAAATTGTATGAAAC-TATTTATGCAT---AGTTTATTGATTT--ATTGATATCAAA---ATTCGATA-------AGTTATCTTTATAATAAATATTAAAACAATAAAATGAATTTA
>CG2217 26244816 26247075|26610 chr3R 26244506 26244960 scaffold_13 2536030 2536437 + 5831|317 464
ATCACAATGATATACTTTAAATTCTGCTGGCTTCTAGTCGCCGTTCTACTCTTCATTTCCTCGCAAAATGTCTGCGCAGCTCCAAAACGAAGAGGAAAACCG---AAAATTAAGTTTCCTAAAATCAACATAAATATCCATCATAACA
ATTTCAATGAAGTACTTCAAGCTTGAGTGGCTTTTGCTTGTCGCCTTATTATTA--TGCCTCG-GCGATGTATTTGCGGCACCAAAACGCAAAGCGAAACCGTTTCCCATCAGGCTGCCAAAGATTAACATAAACATTCATCATAATA
>CG2217 26244816 26247075|26611 chr3R 26245492 26246112 scaffold_13 2536647 2537474 + 16328|0 835
CCACCCCTCACTTC-AGATTGACAATCAGCATGCGGTCTCATATCCGCTGGATGGCAAACAAAACCGGGGAAA---ACTTTCACTTAGGC-----GAATATTGCGAAACTATTGGGCT----------------------------------GCACAACCCGTTGACACAAA--TCGCACTAAATCAAAAATTATGCTTTGCACAAATAAAGCGAAAGGACGC------------------------CGGCGAGGACGAGGTTGC--CACGCAGGAAA---------TCGCTACACCCTGTGGCCATAAATCTCATCTAGTCAAATATTGAATTACGCCGGATGAAGA----GGCA------GGGGATGCGAAGGGCAGGGAAAGGGTTCTCCG------GCGATTCGCAGATCCACTTTAGTGGGTCAGAAGGATG------------------------------------TGGCACATCCCTGCAGATTCGCTATATTCTCATTCCCTATATATGGTGTGTGACATTTTTCCGGCACATCGCTTTGTCCTGTTTATTTAATAAAAAT-TGAAGTTATGAGTGCT----CAAGGGT--------CGTTTATGCGTCGATAATGAATAGTTATGGCTGTTT------GAAGGGTTCAGATTCATAATGC------------------------------------------TTTGTTTGGGTCGCTTATGATGCAATTTATTCATGTTTAT-----------------GTAGTTATTGGGTG-----TTGGGGTGACAATGGGTTAAGGGATTTTCCTTCTTTATATTCCGATTT
CCGCCCGGCACTGGGACAATAACAATCAGCATGTGGTCTCATATCCGCC--ATCAAAGGCCAATGCAAACAAACGTATTTTCACTTTGGCATATTGGATATTGCAAAACTATTGCGTTAACCCTTTGCTGAACATCCCGGGTCCCAGGATACGCGCAATGCGTTGACACAAAAATCGCACTAAATCAAAAATTATACTTTATACAAATAAAACGA--TGCCGTTGTTCTCATCCTCGTCCTCGTGCTCGGCCTGCTCCTGGTTGTGTCGCGCAAGAACCGGAAGTCCTCGCTAGACCCTGTGGCCATAAATCTCATATAGTTAAATATTGAATTACGCAGGATATAGAATGTAGCATATAGTAGGTCTTTGGATGGCACGAAAAAAGGGTTCAGCCACATGCATTTCATATATTCAATTTTGTGGGTCAAAAGGATGCTCGTGCATATGTGCCACTGTCTGCCCCCCCTCCCCTCACACACTCGTCCGGATTCCCT---TTTATTTTCCCACTAGTATGTGTGTGACATTTTGCCTGGGT-TTGTTTTGTTCCGTTTATTTAATAAAAATCTGAAGTTATGAGCACTTCGACAGGGGCCGTAACAACGTTTATATGTCGATAATGAATAGTTATGGTTATTTAACGCAGAGGGGCGAACAGCCTCAACGCTTGTTTTCGGGCATTGAGTGCACATTTGAGCACTTAAATCTTTTTGTTTAGGTCGCTTATAATGCAATTTATGCATGTTTATATTAGTCCATGCATTGCGTAGTTGACAAACGAACCCTTGGGTGCTCAATGGGTTAAGACACTGGGTTTTTTGCCGGTCTGCTTT
>CG2217 26244816 26247075|26612 chr3R 26246167 26246528 scaffold_13 2537984 2538439 + 4580|0 475
ATAACTTCATCTCGA----GCGTTGAAGTATTAGCTTTTCCGCGCACGCTCCTCTCGCTAATTAAATCTAATGCAACCTGTAATAAATTCGCTTGTCGCGCTT---TTCCGGTCGTGCGAATCAACCCTTT-------------TTCGCGCGTTGT---------------------------------GTGTATGCAAATTCTG------GCGGCAAATTGCCCTGGCGCCATTGAGCCTTA-----TCATCTATGGCATCCTGAGTCCTGTAG--------CCTGAGTGCCGTACCTGCCGGAGTCACCCTCGTAGATCCTCGGATTCCCTCGCGATTT-----------GGCGTACAAAGTAATTTTCTGGCAGCCACGCG---ATTCAATTTTCGGC----------------------AAAATATTCGGCATAATAGTAAAG------TTTTATGCGAATTCCGCTGGCAG
ATAGCTTCGTATCGAACAGGCGTTACATT-TTGAAATTTCCGCGCACGCTTCA------AATTAAATTTAATGCAACCTGTAATAAATTTTCC--TCGCCCTTTGCTTCCGGCCGTGCG---CAACCCTTTGATTACACACTTCTTTGAGCAGCTTCCCAGCTCCCAGCATAGGAAACATATAGCACACTCATATGCAAATTCTGTTTGGCTCTGCAAATTGGCTT-TTGCCAAACATTTTTAACGCCTTATCGACGGCAT-TTGCATCCTGTCGCTGGCAACCCCTCGTGATAAGCGCGTGGGCGCGACCTC------TCAACTAATTCCCGCGCGTATTCAATGGAGGTCGACAAACAAAGCAATTTGTTGCCAACTTTGCATCTATTGAATTTTTGACTTTTCACCGTCTGCTCCTGTCGGATATATTTTACATAATAATAAAAATAAATTTTTACGTGCAAGCCGCTATCAG
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TAAATATAAATAAAACAAAATAGTG----
TAAATAAAATTAAAAAAAAAAAATGTATT
>CG2218 26251116 26251780|26615 chr3R 26251413 26251675 scaffold_15 512935 513198 - 3536|0 291
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CATAGAATT-----------ATTTCTAATCATATCAGCGTCGATTTTAGCAAGTGCTGAGATTTTTATTCGAAGCCAAAATACACTTGGAATGGTG-GAATCAATACTTATTCCCCAAT---TATCAGTATCAGGTCACATTTAGTCGGCATTGCGATTAAACTTACATATAGTACATGTATAATCATAGGGCAG--ATAAAGA----GCGCATAATTTTTGTAGAC----TTTATACAACCCCAATTGGAAGGACGAGATGA---AGCGCGCAGTTTATATATTCATAACA
>CG2218 26251116 26251780|26616 chr3R 26251676 26252557 scaffold_15 513354 514243 - 29471|0 105
GAGCTTCCCCGTACATCTCCCAATCGACCGCCTTCCGTCGATTGCCGCAATG-AGTTTGGTTCTCCCCATCCGGTTCAGTTTGTAAGCCAGTCAATCGCTTTAGCC
GTGCCTGCCCATACA------AAATAGTCGTATTCT----AGTGCTTCAATATACTTAGGTTC---------------GTTTGTAAG------AATTTTTGTTGCC
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TTATATTGGCGCCACCGCCTGCCAAGCGCCA--------------CGTAGTCTACGGAATGCAGA-----------------------AGGGATTGGCGGGA--TTGGGCTCCGGTGGAATTAGATATGGGATA------TATTTTTTGCTAGGACGCGTTTACAC-----AAAATACACAAACACACAGAAGCACTGAGTATA--------------TTTTTAACGAGGATCAGG---GAGGAGCAGC------GCCGTATCTATAGTACTATTGTATCTG----------------AACAGCCGGGTTCCTGGGCACCCAGCTCTGAGCAACTGTTTTTACCACACACAGGAAAAACCTAGAGAAAAGTAAAGAAAAGCCCATTTGAGAGTATAGAATATCGATTTTGGCCATGGTGCGTATATATTTAGGCAAGTGTAGAACTGTTTTTGTAAACTTTGTTAAC--------TAGTTTAAAGTCTAGAGCAT------------------CAACCAATCACTGAACGTCAAC-TTTTGCACTCAATGTAACTATTAAAGCGATAAAACCTTTTAATCTTAGTACGAATTTGTTCAAAACAATTATCAAGCAAAGGAAATGCAATGAATGACCTCTTAGCTAAT-AATGAATAATTAAATAAAAGTCA-ATATTAAAAACAA
TTATATTGGCGGCATCGCCTGCCATGCACAAGCTAGTTGGTCAGTTGTAGCCACAGAAATATATATATATATATATATATATATGTATATGTATAGCCAGAAAGTTAATGTCGGTTTAGATCAGTTATAGAGTATATGTCTATTTTTTGCTAGTATGCGTTTATACCTATACAACTACAATCAGTCGAGGATGCATCTGGTCTATGCTAGAGTAATCTTTTCTAACCATCAACAGGTTTTAAAGCCAACTTTTGAAACATATATAAAATAGAAATTTACATGTATGTATATATGAAACTATAGCAGACATTTATGGCACACAATTGAAAGCAACTGTTTTATCTGCAC------------------------AGGAAACGAGCATATATTTATATATAATAGAAA-------------------------AAGATACTGTAACTGTTTTTTGTAAAACATTTTTAACTAGATGCATAGTTTAAAGTTTAAAGCGTAACGTAACGAAAACAAAAAAGGAAATCACTGAACGTCTACTTTTTGCACTCAAT-CAACTATTTAAGCG-TAAAATCTTTTTATTTTAGTACGAATTTGTTC--AACAGTTATAAAGCAA---AAATGCAATGAATTACCTCTTAGCTAATAAATGTAAAACTGAATATAATTAATATATGTACAAAAA
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T
T
>PH4alphaMP 26317531 26317743|26670 chr3R 26315588 26317651 scaffold_15 575532 577608 - 30707|2019 2139
TAGCTATCTGAGGTGAGGTTGCAGGGACGACGGAACTCCTGGTATCCCGAGTGCATCCAGATGTTGCCAACTGTAATATGAACATGAAGTGATAAATACAGTTTTTAGATACTTATGAAAA
TACTCGTTTGCATTAAGCGTGCATGGACGACGGAACTCCTGGCGGGTGGAATGAATCCAAATGTTGCCAACTGTAA----AATATATTACGATATTTACAAGTTC-GGAGGCTTT----AA
>PH4alphaMP 26317531 26317743|26671 chr3R 26317671 26318983 scaffold_15 578075 579417 - 35266|0 88
AA--AATTCACTCAACGCCAATTAAAATAAGATATTAATTTATTA--------------AATGTTTATTATATTAAATTACACCTAATC
CAATAATTCATTTAAAATTCAATTTAGTTTGCTTGCCATTTGTTATAAGTACCAATCAGATTATTGACTTGACTAAATTAAACTTAATC
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AGATCGTGATAGTCAGGTT
AC----TAATTGCGGATTT
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GAGGGTCGTCGGCCAC-----------------------------ATATAGATGTT-----------------------------TCAATTTTAAAAATATTTCAAGTCAAACCGATGAGCGAGCAGGAGGAGTTGGGTGTCTATCCCGAAAGTTATGCAATTATATCAAAATATTCTGAAAGGGAAACAAA--------GTTTATTATCGATGTGTAACTTA--AGCGTTGCGAA--------------------------------------------------------------------------------CCACAGAGCACAGATACTCT-------------------------TATATAGATGTTTATAGGTGTACAAATAAAAAATATATAGAAAAATGGTAATTAACTAACGTATATTTAAGTGAAAGAAACTGTAATTTCAATAAACTCCCCCGATGAAAAATCCCAGGCGGAGCGGCAAGA-----ATTTTAAGTTGAAGT---------------AATTAGTCAAATTT--------TATCGCAGTCATGCATATATGA-------ATATACACAC-CATATACTA---TATATATATTTATGTAATCAGTGTATTTGTATATCGATGTTTCAAGTACCATGAATGTACC-------------AAGACAATCCC-TTGGCAGCAAACAAAACTAAACTAAAGCTAA--------TGCTAAAGCTGTAACTGAAACTAAACTATTACTTAACTGGTGACAGTCTAGCGATTCACCCACCACGAG--------------------------CCAGAAAATGAGAACATATTGAAAGACATGG----------CAAAGCGAATTTAAACCTCTATACACACGA-CACATTTGCATAGTCAAA-----------AAAAGTAAATCTCACTCGGTGTCCTTTTTAAATGCAACA-------TTGCGA--AAAGCT---CCACTGAACTGTTTTCCCTACCTGAAAAATCATTTTCGCAGAAAATCA---ACAAAAAAAAAAAAAAATGTGACAAAATATCAAAGAAAAAT--------CAAACAAAAAAAAAGTGCAGAGTTTATATAAATGTTTTGATGGATAGAGCGGTGAACTTTTCAACTTATACATATAGCAGAGATTATTGTCATTATTATTGTACTATTATGCGCAGCGCAGAG-------AAATAATTACTACATAAATGTTGTTGCTGGATTTAAATGCATTACTTATACAACTACAT-ATGAAAAT---TGTTTTAAGACATACTCTATTGAATTTATTCAAATACACACATATTGCGGA-----------------------------------------------------TAGAGCA-GACCAGATCCAGATCA-------AATCGGAACAGA----AAGGGAGGAA----CAGCTGCAAGCCAAAGGCG--TGACCCCGCGACCCCCGACCCCTTAGAAGGGGCGGTGGGCGGGGCTCCAGCTAGTACTAGCAATTACAC----ATTAATTAGTGTTGGTTCTAACTTAGCTG----GCGAATGTTACACGCAGCGAGCGATCAGATCACAAATAAATCAAATTTTTGAAAGGGGTTCCCACTCCTGGCGGAACCTCAGGTATTCAATCACG
GCGGCATTTCAGCAATGCTAAAAGAGTGTGCGGTGCCCGTGATGAGTATCGATGTTATGAGATAAAATAGAAGCGAGTCGAAACGTAAATTTTATGCATATTTATAGCCCATCGAAGGGCAGTATATCTCGATGTGAGTTTC-------AAGAATACATATTCCAATTAATATATTAAAAATACCAAACAAAAGAAATACATTTAAAATACATATATATCAAAGCAGCATTGAAAATCTAAATTACACAATATGCAAAATATTAATCAATTCTATAAAAATATTACTACATATATATTTATAAAGGAAATACAACTCCACAGAGTACATATATATTGATGTGAACTTATAGCGTTGCGAATTATATAAATGTTTATAGGTGTATACA------------AAAAAATTGGTAATTAAGTA-------------TTGAAGAAACTGTAATTTCAATAAAC-------ATAAGGTATGC------AAGCGGCAAGAGGTTTAATTTAAGTTAAAGTGCAACATTTAAATGAAATTAGTCAAATTTTAAATGTGTATATCAATGGTAAATGTCTAACTGAACTATATATACAAGCATATACTATATTATATATATTTATCTA--CAATATATTTATCTACAACTATTTATATATTGATGTATGTAACATGTGCCCCCTATAAGACAATCCCTTTGGAAGTGTTTACTTGTGCACTAGAAAAAAACATTGATTATTCAAGCTGAAACTAGCATCAAA------------------------------ATGCCCACCACAAAGAACGTTGCATATGCGATCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACAAACAAACACACATATGACCTACCACAAAAGCGAATTT-ATCAACTATATACACGAGTAAAACTGCATAGTCAAAAAAACTACAAGAAAAATAACTTTCACTTGGTGTCC-TTTCAAATGCAAAACTCAAATTTGCAAACAAAACTAAGCAACTAGACTATTTTATTTA--TGAAGAAAAATG-----AGACGGCCACTTACAGGCTTGAAAAAAATGACAAAAAAATATATAAAAAAAATTAAAAATATAAACAAAAAAAAAATG----------ATAAATGTCTTGATGCGT---------------------------------------TGTTGTTTTCAATATCGATGTGTGATGCAAATCGTAAATGTTATACAAATGAATATCAAAAGAAATATGA-GCGAAAATTAAATTATGCCAACATAAAGGTACATTATATAAATGTTTGTTTTAAGTCATA-----TTGAATTTACTCAAATACACACATATTATTGAACTATACAAATACACATACATATTTATGAAAACATATATATATTAATTGAAATCAAAGCACTAGCAAAGTTTTGTCAGTTTTGTAACTGAAGCAGATTTTAAAACAGACACTTGCAGCTGCAAGCCAAAGGCAATTATTTTTGTTGGCCCACGTGGCGTATGGAAGGCGTAAGTCAAAG---TAACTA--ACTAGCAATTATGCAAATACATATTAATGTTGAATTGAATGTAATTGAATTATGAATG-TATAAGTGGCAA---AAAAAAATAAAACCAAATAAAAT------------------CAGCTGAAGAATCTTCAGCGATTGAACAAAG
>CG2241 26407920 26407990|26761 chr3R 26407951 26409457 scaffold_22 520583 522096 + 64029|0 39
CTTATATAACTAATTTTAAAACATTTGAAAGCTCCATTAT
TTCACG--------TTTAAATCAATT---AGCTTTATTAT
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GGGATCCAAAGAAGTCCGAAGGGGGAACAACGCTGCAACCTCGTTATGCGATAGTCTTAGCCCAAGTCTAGTTCGTAGCTTAGTCTCTGTCCTAGACCTAGTACTAGCTTAGTCTTGC------CACCGAGGCCAGCGACT---------------------------------------------------------------AAATCTAGATGTGGGCTGCCCACGC-----TCATCGCCTTAGTTGAAGGTACCATTACCATTCCACGGCTAGCCCAGCTCACCTTAATTAGCATTTAAGATGTGGCAATCTTCGCAGATATCTGCACAATATTATTTATTTGGCCTCTAACGGCGAAACGCTGTGAATTC-------CAGAGTCAGGGCTCCTCCCACCCGCGAT--------TTTGCCGCTGAACATAGTATTATTTTCGGGTAGCGAACGGCGAGTTTTAGCATAAGTACTTAAATAAATCAAGTAAATATAAAATAGTTAAGTGGCGTTAAGAGTTTTACTTGATTGGCCAAGAAAGTGGAAATAAAACACTCTCATTAGGTATTATACGTTGTTACCAACTACTGGCTTTATTAAAGATTTATTCCAAGATTGATAGACTT----TATATCTAAACAACA----TCATGATTTCTGGGTGTCTTTAATCTCAAACTA--TGCTGTGATTTTATTTGGTGCTTCGTGTGGGAAGTAAATTTTTTGGTTCGAAGGCATCAATAAC---AAGAAAGCATTA
-----------------------------ACGACATAACCTCGAT------TAGTCTTAGATTAATTTAAGTCTTTGTATTTATTTC---ACAAAAACTCG-GCTAGCTTAATTTTGCATGCTTTGGCAAGGCCAGCGACTTGTTTCGCTCCTTATAGGCAAAAAATTATTATAATGAAAAGAAGCGGAGAAAAACACGAATGAAAACCCACGCATAAGTCACCAACATCATTATCAACAGTCCAGCCAAATAGTCAAATATTATTTTCCGTATA-----------TTTAATTAGCATTTAAGTTGAAGCAATCCATCATTATTTATTCGC----TTGTGAATTTGATTTCT---GGCAAAATGCTGTGAATTTTGTTGAGCAAAATACAAATTTTTGCACCTCATTGTTATCTGTCTTGATTGCTGTGCATAGTATTAAAT-----------------AATTATA-CCTAAG--CCTTAATATAACACGCAAATATTGGAACACTTAAAGTTGTTATTTGCTTT------------------------------CACTAGCATTTGGT------TGCTGTTTCCA----------------------TATTTAAACATCGCCTGGCTTTTAATATATCTTATCAACAAATTGCACAGATTTAAGACTTTCCCAATAATAATTGACGCGCCGTGATTTCATATTG------ATCCAGCCAGAAGATTTATTGAC---GAACCATGAAAAGCCCGAGCAATGCATTA
>CG2246 26418734 26418983|26768 chr3R 26418812 26420281 scaffold_22 534032 535534 + 35400|0 225
-GGACCCACTCACTCATATAACCACTCACAAGTCACAAAAATAGTGTTGCA---------ACCGACCCGT-----------------TTTGGGTCGTTTT----TTGTTTGTTTA------------TCGCTTT------------TAGACATCAATTCAACGAGCGCCCAGCGCACGTTTGCTCAAATAAAATTGATTGATCCCACATAATGTAGCACACTTTTA
CGCACCTTCATGCCCACTCATCCACACACACATCACTCATGTACTGTGTCACAAATGGTCACTAGCCAGTGTAGTAGCTTCATGGAAGTTGCATCTTCTTTATATTGTTTGTTTACCACGCCCTACCCCGCTTTAATTTTATTAAATAGAAACTATTATAAACCGTGCTCCAGGTGCGGCTGCTCAAATAAAACGAAAT-ATGCTTTAAAAT-TGGCGAACTCTTA
>PH4alphaPV 26471828 26472143|26832 chr3R 26470117 26473087 scaffold_22 600372 603363 + 26919|1838 2181
TTCTCAGCGAAACTGTTTTTAGACAAGTGA---------------TACTATACGACCACTATAAAACTCAATAAAGTCATATTAGAATCGATAATGCTGTCAATTAAACATTCCCAGCGATAAGAACAATTGCAAATCAAGTCGCGACATTCCGAAGAGGAATAGGTGTTTTCCCCAGAGTCGTT------CATCAAAATCAAGAAATGGAAATTCCT-------GCTAAATATCGTTTAATGGTCGTGAACCAACCATTAATTGACATTTTGCATTAAAAGCACAAGATAAGAAAGCGGGTTTCTATTTTTAAAAACATGAAAATAAATGCACATCGATCTAG
TTT--------ATTTTTGTCGGACAATTAAGCCATCTTCTACATTTACCGAACCTTAACAAAAAAATAAAACAAAATGTTTTAAGAACT--CAATACTCAAAATAGAA------AAACGATAAGA-----TTTAAATCCAATGAGTACATTCGTTATACAAAAAGGTTTACGCATTACAATGCTTGCAGCGCTACAAACAGAAAAAGTGATAAGGTCTTATCTGAACTATAGCTCTTTTTGAATCTGTGATTT--CTATTAATCTAATTTTCTAGTTAATAAC-TGATACCAACAAGC-------------TTAAGATATATGACCCAACGCTTATTAACAGCA
>Pka-C2 26521250 26521372|26882 chr3R 26521337 26522837 scaffold_22 655219 656692 + 47482|0 35
ATGTCAATGTGTCCTTCGAAATCGTCGTTTTCTTTA
ACGTTG----GTCCTCCTTAATTTTATTCGTTTATA
>CG31010 26530481 26530863|26894 chr3R 26529414 26532115 scaffold_22 671042 674003 + 23930|1288 1926
AGTGAG---------AAGTGCGTTT------------------TCCATTTCCATTACCATTTCG--ATTTTATACGAACCAGATGTTG-----------CGTGGCCAGTCTATTTTGGTGCTGAGCCTCAAA-------------------------------------------------------------------ATTCGCAGCTCTTTTCCT-------TCGACTTTTGCTCTTGAACCACATTTGTCGAGA-------------------------ATAATGGATCCCCTACT--TTTGGC--------CAAGGTCGCCCGCTGACATGGCATTG---------------------GCACTCGATTAACA---------------------------ATTAAAGCCGCAGCTCTCAAGGTCGC-GCAGAATTAAGATGGAAAATCTCAAATGAA--TCAGGGTC---------------------CCCCTGAGTAAAAGTT-----------------------GGACTGGGTGCGAA-----------TCAATTTCGC-ATGCGCATACATTAGCAATAAAAATTTGTAGTACCCCCTGAAACCGAAATAAATAAAACAAACGAGAAGCAAA
CTTGCGGCCGCATTAAAGTGTCTGTCAGGCAGCTGAAGAAAATTTGATTTTGATTTTAATTTCGCAATTTTATACAAAACAGATGCTGGACAATATAACCATATGCGATCTATTTTTATGCAGAGTTTCCACTTTTCACTTTGCCCGACTGAAGTGATAGCCCTCCCTCTTACCCTAGATAATCACATGTACGCTGACTCTTTTCAGCTGTTTTCATGAACTGTTCCATTTTTGCACTTGAACCACAATTGGGGAAATGTTACAAATCGAGGCGCCAAAATTATAATGGATCTCGAGCTCATTTCGCACATGTTTCAAGGCCGTCATTTGACATGACCTTGAGCTCTGTGTATAACGTATACGCCGTGGATTATCGTGTATTTATTGACATGTGGCATTGGACATGAAAG--GCAGCTCAATAAATGGCTGCAG---TTACTCAGAAAAATACAGCTGGAGATCAGCATCAGGCAATATGCGCTTACCAAATCTCTGGGCAGCAATTTTGATGGTCAATTTTGATGGTTCGCACTTGCCGCCAACCTTCGATAATTCAATTTTACCATGCGCATAAATTAACAATAAAAA-----AATACTGTGTAGCCGTACAAGAACTATTTAAAATGTAATTTGGA
>CG11314 26570326 26570475|26944 chr3R 26568666 26570983 scaffold_22 716852 719069 + 53328|1831 1981
TTTGTGCCCACGCTGCATGAGCACTAAATTAAATAGTGAAATATACCTTTTTTCCCAAATAAAATAAATTACCGTGATGTTTAAATGATGTGCAAGTTTCTTAAAATACAAGGAGCTATATTGGCTGCTCCCCTGATTGTGGCGA-ATGCA
T---------------------GCTAA-------------------------TCCCAG-----------TGCCATG-TGGTGCAATAAAATGCAGTTTTTTTG---------------------------CTCTGAACGTTTCAACGTGCG
>wts 26615379 26616696|27004 chr3R 26615285 26616246 scaffold_22 777807 778796 + 11673|104 1120
AAACTAAACGAGACGCGAATTTACCCAACCACTTCACTCCTCTCCTTTCTCCACCTCCGATCGGTGGCCGGATTCGAACTCAGCAGGCTGG-------TTGCATCCGGCCATCCCATTTACTTCCCATTCAGAATTGAGATTGCGAGGTGTGCG-----ATGGAGAACGAACGGAGACCAAAA----GTCGCACGGCAGCGATATAAGCGGGTCTTATAAGCCTAATCTA----AATCTAAACTGGGAGAACAGGACCCATGTATGTGTAATTAGTGTCCTGCTATCCAATTCGTC-TATCACTGCTC-TTCAAC------TGAGTGT-----------------GCCCCCCCTCCCTCCCTCCTCATCCC---------ATCCAAAAGAACAAACTTAGACGTAGC---------------------------------------------------------------------------------CTATGTGAAAAGCTAGCAATGTTAGACCAACTTGTTGAATGCCAAATGAAATTGTTTAGCCCCACGAGGAAAACGCGGGGGAAATTCAACACTTATTCTCTGATAGCAAACGGAA-------AAGAAA-GAAAAAAAAAACAGAAACAGTACGAGAAAATTGTAATCTTCTTAA-TGTAATATTGTAAAGAACAC--GTTAAT--TGTAATCTATGCTAGAGTTGTGTAGCGCCCTAAGATGTTTTTTAGTTTATAGACCGCTAACCGTAATCTAGTTTAATTCCTAACACTAAGCGAGAGTACAGTACATTGGTTTTTTTGTTTGTCGTAGGTTCGTTGGAAAATGCTTAACGGGAAACGATTTGTTTTTCTCTTTAATTAGCTTCAGTTTGTATGTGCGTGTGTTTTTATTATGACTTATATATAGTCCATCTGAATATTCGTGGATGGAGCCTATTTTAAATGTGAGATCGAGCTAATTGAAGGAAATACAAACAA-ACTCTGTGTGCCTTGGCCAATTAGTTTAC
AACTCATAGGAGAAGCGAATTTAACTAAGC-CTGGAC------CAATTTACAGCGTTCAGTCGATGGCAA----CTATTTCAGCAGGCTGGAAAGTTGTTGCCATTGACGGTAACTTTGAAACTTTAGCTTGACAACAAATTATTTTGTGCGTGGATCCATCGAGAACCGATCCAGAGCACAGCATCGCAACAAGTTAGCGATATAAGCGGGTCTTATAAGCCTAATCTATACAACTCTACTCTTAAATAATATGCCC---GCGGGCGCGCTCTAAACTCAACTATCTATCACTTTGTATCACTGCTCATTCTACAATCTTTGAATGTATTAAGCGCACCCCCTCGCCCCCCCCCCCCCCCTCTTCCCCCATAAAATATAATATAAAAGAACAAACTATAATGTATCTATCGTGTAGACTCTATGCATATTCTATACATAAATTTTATATATATATATATATATTGATATATTTAAATATTATTAAAACTAGCTGCATATATAGCAATGTTAGACGAACTTGTTGAATGCCAAATGAAATTGTTTT---------------------------------TTTTTTTTATAATATTCAACAGAACTTCTATAAGAAATGAAAGGAGAAACAACAACAAAAATCAATATCTATATACAGATTAAATGTAACGTGTAAAAGAAAATTAATTAATAGTTTTATATATGCAATACATTTTTAGCGC--TAAGATGTTTTTTAGTTTATAATTCGCTAACAATAATTTAGTGTAATTTTCATGTCTAAGCAAAGGTACATAAAAC---ATTTTTTGTTTGTTGTAAGCTCGTTGGTAAA-----------ATGCGATTTGTTCACCTATTT----------------------------TTTTTCTTAT-----------------------------TGGCCCGAGTTTGTTTTTACTGAAAGG-----------AAAGAAGATGAATATAACACTACGCGTGCCTTGGCCAATCGATTTAC
>wts 26615379 26616696|27005 chr3R 26616321 26616390 scaffold_22 778865 778936 + 701|0 74
CTTCGACCTTTAACTGAACATAGTATATCCTTGTGCACTACTACTCCACA-----ACAAATATATATTTTTAAAT
CTTGGACAACCAATTGAACCAATT---TCCTGGTGCTCAAAAGCTATACATACTTACACACACACACTTACACAC
>wts 26615379 26616696|27006 chr3R 26616407 26616517 scaffold_22 778977 779086 + 2615|0 112
TACGTATATACATACAAATA-ATATACATATATTTGATATATATATATATATATATGCCGTAGGGC-ATGAACTGAATAAATATAAAACGGAGCCGAGTAGAGATGAAACGAG
TATATACATACATACAAATACATATATAAATAT---ATATATACATATGCATATAAAACAAATAGTTATGTACGATATTTATGTTGATTAACGTTGAGTGTCAATGAAATGAA
>wts 26615379 26616696|27007 chr3R 26616626 26617685 scaffold_22 779595 780635 + 54252|0 70
AATGGATGCTCTCCATGTGCCCAACACCAACACCCCGCCCCCGAATCATTGTTAGTCAAATAGTCACAAAA
----GATGCCGTCAATCAAGCAATCA--AACATTT----------TCGTTGTTAGTCAAATAGTCACAAAA
>CG12071 26702806 26703719|27102 chr3R 26702772 26703421 scaffold_22 885655 886447 + -748|34 838
AAGCACCATCGAAGAGAAAGGCTAACTGACTGGCCAATCAGCTATAAATACGAATTGTAAATAAAGTCTTAAGCAGCCGAGAGCAA----------------------------------------------------CCCTAAGTATATGTTTAAC---------------------------------------------AACACTACCCAGCAAAACTAAAAACTAAAAACAAAGAAAAAAACAAAGTTTGTAAATGTCAGGTTATAAAG---CAT--------AGATCCCCGTGTCAGCGATGTC------AACTCAAAATCAAACG------------------------------TAGTCTAAGCAACCTAACATATCC--------CCCCGCAGAACGTATATGGTACCCATC-TACATGAGCAGCCACCACACTGAGATA-------------TATAGATATGCCACTTCGCCGTT--TCGCAATTTCAGACCCTCCAGAGTAGTATCC--------------CCACATAGACCCGTATGCAAACCGAACGTGTATGATATTGTATGTGTTTCTATGGCATTGTTTGTACATTAAGCTTATTAC-GTACTCCAAATACGTCTTCGACTAAAACGCAGCCTGGGAGGTAAACCAAATAAAATGAAT-TAATGGAAGCAAAACATAAGTAGCAGTAGTAGTGTCCATCAGCAAAGCTCCCCACACATCTCCCCACTCCATTCCAATGGCAAACCATGTAAAGATCAAGAGAAAATAAATTTAATTTAATTAAAT-----
ATCCGTCTTCAAGTTTGCAATTAGCCTCAGCTCGCAAGCAGCTATAAATACAAACTGTAAATAAAGTTTTTAAAAAACAACAACAAAATTAAATTAAAAGAAAAAAAAACTATGAAACCAAAAAATGATTTTAAGAACACCTAAGTATATGTTTAATTCTAAGAGGTAACCCATACAATATGCCGGCCGAGAGATGTTTTCAAATACTTTTCGCATGAAATGCTTCTTAAATTCAAACACAAAATC--GTTTTTCAAATGGTTCGTTTTAAAAGCCCATAACTAAGCAAATACAAATATGAATAATGTTTATGTGAATTGAAAACAAAAAGGAAAAACAAATGTAAACAACATTAACTATGTAGTATAAGTCATTTTACATATCCATTGAAAATCTCAAAAAAAAACCAGCATACAAATCATACCCATACAGCCATAAAACTGAGATATTATTTGCTTATTTTTGAACATTCCAAGTTTTTGTTAAACACATCTTCAGTTCAGCATTTAAAGTATCTATGAAAATGGGCTACCAAATCGATGTGCAT---CAATGTATTTGTATAATA--GTTCGCGTTTAAATCA-ATTGTTTATA-ATTATGCTAACGGCAATACAATATCTATGTCT-----TAAAA-----------AGGAAAAACAAAAAATACCTATGTAAT--------AATGTAAGTAGT-TCAGTAGTGTCCGTCAATGATACT-----CACATT------CAGAATTACTACAGC-AACAGTGTGGAAAACGATGGTAAATATATTAAATACAATAAAATCTAAC
>CG12071 26702806 26703719|27103 chr3R 26703422 26705644 scaffold_22 886703 889078 + 108839|0 345
GTGTCGGTGCCGGTGTCGCACATCATTGCCAATTCGCCGACGGCCGCCACGTATATGCAGGCCCAGCTGA---GCGAGCACGCCAGCAACAT-----------------------------------GCAGCACG-GCATGCCCATTGTCACGTACAATGGGAACCAGTACTGCGTGATTACCCGTGCCCCGGATCTGGATGTGGAGGCGATGCAGAAGCCG---------CTGGACTATGGCCACGCAGCCGGAGGAGCCACCAACATAATAGTAATGTCGCCGATGCAACTGCTGCCCCCCCAGCAGCAGCAGCAGCAGCCGCAACAGCAACAGCAGCAGCAGT
GTGTCAGTGCCCGTCTCGCACATAATTGCCAACTCACCAACAGCAGCCACTTACATGCAGGCCCAGCTGACTGGCCTGCACACCGGCAACACCATCGGCGTCGGCGTTGGCGTTGGCGATGCTGGCGGCAACATGAACATGCCCATCGTCACCTACAATGGGAATCAGTATTGCGTTATAACCCGTGCACCAGAGTCGGATGCGATTGCCATGCAGAAGCAGTCGCTGCCCCTGGACTATGGCCAGGCCACCACAG------CCAATATTATTGTAATGTCGCCAATGCTGCCCCCGCAACAACAACAACAACAACAGCAGCAGCAACAACAACAGCAGCAGCAGC
>CG12071 26703869 26704303|27103 chr3R 26703422 26705644 scaffold_22 886703 889078 + 108839|561 1091
TATTGACAGCCGGAACGGCTAGTCGCAGAGTCAACAAAACCAGCAG-------------------CAGCGGCGGCAGGAGTCATTGC--------------TAAGACCACCAGCAGCAACAACAGTCGCAACTATCAAATGGATGCTAATCAAAACCAAAT---------------TCAGATGGAGGCCCAAGCACGAAAACAGAAGATAATCATTCAAAACCAGATGATACTCAATGCCAGCCACCAGCAGCAGCAGCAGCCGCAGCAACATCCGCAACAGCAGCAGCACCAACAGCAGCAGCAGCAACACGTGGCCCACGGAAAGAAGGCAGCCAGAAAACACCAGCAACATCTGCAGCAACAGCAGCAGCAACAGCAACAG--------------------------------------CAACAGCAACAGCAACAGCAGCAGCAGCAACAG----------ACCAGTGCGCCTATGTACAATAACAATAGTAGTAGCAACCACAACGGCAACAACCAAAGCCAAGAA
TATTGACAACAGGAACGGTTAGTCGTAGAGTCCACAAAAACAGCAGCCGCCATCGCTAAGAGCAACAGCAACAACAGCAGCACTAGCGGCAGTGGCAACAACAATAGCAGCAGCAACAACCATAATCGCGGCTATCAAATTGATGCAAACCGAAACCAAATACTCAACAACAGCCCGCAATTGGAGGCACATGCACGCACCCAGAAGATAATCATACAAAATCAGATGATCCTCAATGCCAGCCATCAGCAGCAGCAGCA---------------GCAGCAGCAGCAGCAGCAGTCGCAGCAGCATCAACATGTTGCTGGCGGCAAGAAAGCGGCCAGAAAGCACCACCAACAACATCAGCAGCAGCAACAGCAGCAGCAACAACAAGCACAGACCAGCGCGCCTATGTACAATAATAACACCAACAGCAATAACAACAACAGTAACAACAACAGCAATAACAACAGCAATAACAACATCAGCAATACCAGCAACAACACCAGCAACAACGGCAATAATCAGGGACATGAA
>CG12071 26704414 26704848|27103 chr3R 26703422 26705644 scaffold_22 886703 889078 + 108839|1202 1648
GCTGCCCTCGAGCC------------CCGCACCTCTAGCCTCGATCATCTAATCTAACCCTCGCTCTCGAATCCTTCATTTCAGGTGTGCAATAAGGCGTTCGCAAGGCGGGACAAGCTGGTGATTCACATGAACAAGTTCAAGCACGTGACGCCCACGAACATTGCACCACTCGGAAAGCGGCTGAACAACATGGTGAAGAAGAAGGAGCAGCCGGATCCGCCGCCGGAGGACAACAAGCAGAGCCTGGAGCTGCAGCTGCAGCAGCAGGCGGTCCAGGTGGCCGCCCAGAACATAATAGTGCAATCTGCTCAAGGAGCGCCGACGTCGATTCCCGGTATCATCATACCGCACCATCAGCAGCAATTGTCGTGGACGTGCGAGCTGTGCGGCAGGATGTTCTCGAGTCGGGACGAGTGGTCCATTCACGCCAAGAGTCATCTGGAG
GCAGCCCTTGAATCGGCGGCTCAATGCCCCAGCGCTTGCTGACAGCCACTAATCTGTTGCAATCTC------CATCCATTTCAGGTGTGTAACAAGGCATTCGCACGCCGGGACAAGCTCGTCATCCACATGAACAAGTTCAAGCACGTGACGCCCACAAATATTGCGCCGCTCGGCAAGCGGCTAAACAATATGGTCAAGAAGAAGGAGCAACCAGATCCGCCGCCAGAGGACAATAAGCAGAGCCTGGAACTGCAGCTACAGCAGCAGGCCGTACAGGTGGCCGCCCAAAACATTATAGTGCAGTCGGCGCAGGGGGCGCCGACGGCAATTCCGGGAATCATCATACCACATCACCAGCAGCAATTGTCCTGGACGTGTGAGCTGTGTGGGCGCATGTTCTCGAGCCGGGACGAGTGGTCCATTCATGCCAAGAGTCATCTGGAG
>Sap-r 26709186 26709634|27106 chr3R 26707796 26714867 scaffold_22 891741 898808 + 154597|1466 2018
GTGATGCGTTGTGATGTACGAACCAGGCG-------CGGAGGATTTGAAGGAGAAGGGACCCGATCCCACGCTTTATATATGCA-----TATACCTTTACATATATCTGTTTACATTCTATAACGATTT---ACTGTAAATGAAACATAATT-ACTTACTTTT-----CGTTTTGTACCCCGGTTTT--------------------TGGCTCTAAATTTGTTAGGTGAATTTGTGATGAAACTGAATTTATAAACGCA-------------------CTCAAACGCCGGCTGAAAAAAGTTAAACTTAAC-TAAACTA-----------ACACTTACACTAAGCA-GTACCCTTATCGTAATTTCAACATAAAAATT------------AGCGAAATTCACGAGCCGCAAACTTTGTATCGATATC--CCCATGTGTCCGAAGTCATT--TGAGCA----GTGTGTGTAGTTTAAGATATCAAGCAAAACTGTGTAAAATACGAACATTGATCTTATAAATCATACAGAAAACT--------TAAACCG---
G----ATGTTGCGTGTTGCGAACTAAACGCAATCGCCAAATGATGTGTCGCAAAGGGG------CGTCACGATATATATATATATAAATTATATCTTTAC----TTTTGTTTACATTCTGTACTTGATTGGGACTGTAAATGATCGAAAATTGACTTATTGTTTTGCACGTTTTATATGTTTATTTCCTTTTCTTACTTACTTTATATTGCGCTTAATTTGAGAAAGAAATTGTGGGTGATAGTTAAAATACGGATGCAACTGAAACTGATTGATTTTTGTAAGCGTATGCGAAAAGGGCTTAAATTAAACATAAATTGTAATAGTAGACACGCTCATTCCGGTCATGTACTTTT----TAAAAACCACTTAAAACTTGAAACCACTTTAAACTGGTTTTAAAACCCGGAACAGGCTGAGAGAAATCAACCAAATTCCCCGAACTAAATAATAAACAAAGTGTGTGTGTAGCATAAGACGCCAA--------GTGTAAAACATGAGAACGAGAATCAAATCTGATAAATAAATCTTTTAAAAGTAAACAGCGC
>CG15549 26761118 26761766|27156 chr3R 26760987 26761196 scaffold_9 4038710 4038941 + 1614|139 231
GTGTATATTTTGTCA-CAGCTTCTTTCTGTTTTAAGTG----------AATGAGAGACTATTAAAATCGGGAAACTAAATATTTTA---TTTC
GTACCCATTTTGTTTTCTGTTTCTCTCTTTTTTTAATGTTTATCAACTATTTATTTATCATTATGTTTATAAAATTTAAAAATTTACCTTTGC
>CG15549 26761118 26761766|27157 chr3R 26761206 26762479 scaffold_22 961528 962940 + 15819|0 692
AGCACGTGTGAGCATGAGG---------------TCCTTGGACTAAGGGGCTGGGAATCAGGAAGGAAGTGCCGAGGGATTTACCATAATCTGCAATACATTAGCGGCAGCTTTGCTCTGGATTCCAATTCAATTCTTTGGGTATCTCCGGCCAAAGCCATGTAAATTACGATTCGCCACCTCG------------------------------------------------------------------------------GAAATCCTAT----TAGTAGTTAAAACCTGATTAGGAAATACTTGCGGCCG-----AGCCTCG-GGCTCACATTTGCTGAAAGCAAATAATAATAAATGGCTCTCACATGCGAGATG----------------------CTTTGT--GGATACATGCCCTCCAGGGTGACACCTCCTCCGGAGCAAGTCGAAGGTGGCGTGGAATTCAGA-----TGGCTGTGGAGTCGAGTCAAAGGTGCAATAACCCAACCGAGCGGGGCACATAAAACTAAATGGCTGCGGGTTGCGTTGCCAGTCCTCGAAGTCCTTCCCAGACCCCGGACCCCGGTCCCGGATCACCAGCTCGCTCCTCTGCGGATTCAGTAGCTATTGCGGTGGAGATAACAACCATAAGGGTACACCCGAGGGCACTCAGAGAGGAGCGTTGCA
AGGACGGCTACGACAGCGGCGGCGGCGGCATCAATCCAGATGTTAATGCACATGCGTGCGGCATAAAAACTGTGCGGGATTTGGCATAATCTACAATACATTAGCGGTAGCTTTGCTCTGGCTTTCAATTCAATTCGTTGGGTATCT-CAACGAAATCCATGTAAATTACGATTTGGCACCTTGCTACCACGCACAGACACACACACACAAACACACACGCAGTCACAAGAACACAAGCACTCAGAACGATGCCAAAGTCTCAGAATCCCATTACATAGTAGTTAAAACCTGATTAGGAAATACTTGCGGCTGCTTTCAGCTTTGCCACTCGC-TTGGTTAAAAAGAAATAACAATAAATGG----CACATGTGAAATGGTTGCTTAGGTTCTTCTGTGTCCTTTGCAGGGGTCTGTGGTCGTCAGGGTAG----TCCTGGGTGACAACAAAAACGTGGCCCAAAAAAAAAAGTTATTCGCAACAACTCAAAGTCAAAGGTGCAATAACCCAA-------AGGCACATAAAAGCAAATGGCTGAGGGTTGTCTCTATATAC----AAGTATATATATGTATGTATAGGTGTGTATATGAATATGTATGTGCGCTGCTGTATGTAATGCTGCTATTGCGGTAAAGATAAC------------ACACACACACACACACAAAGA-GAGCGACGCA
>Ctr1C 26789011 26789169|27200 chr3R 26788826 26789892 scaffold_13 2400006 2401121 - 10736|257 462
CACAGGA----------------------------ATGGACCGAGACGAGCTGTCTAGGAGCCCTGCTAATGTGTTTTTCTAATTAACGCAAGCTGTAAAA--ATCATAAC------GGCT--TGGGTACCCGGCCTAATTGTTAATGTTTATGGCTCGTAAAACAATGAATGCAGCATCTTCCGCTGCCGAAATG---------A
GCTAACACTCTGTTCACCTTTCCTGTGCTTCCCATGTGCCCCTCTTTGTGTTGTCTGTGCTTTGTGCTAATGTATTTTTCTAATTAAACCTAGTTATAAAAATATCAGAACAAAAGTGGCTGCCAGCCGCCCAGCCTAATTGTTCATTTTTATGGCTAATAAAACAATGACT---GCATCTACCAAAAGATAAAAGCAACAGTAAA
>5-HT7 26794864 26795605|27212 chr3R 26794432 26794956 scaffold_13 2414351 2414944 - 6245|546 655
ACTGT--------GACAGGTTTC--TACGGTTCCTT-TTATG------TTTCGAAAACAATCAGCACCGGATATGAGACACAATCGTTATCGAATCTATTGATACCTCCC
ACTGTTAACCCAGAACAGGTTTTCACACAGTTCCTTCTTATGTTGTTATTTCCAAAATGAAAAGAC---GATTACAATCACAATCGATATCGAATCTATT----------
>5-HT7 26794864 26795605|27213 chr3R 26794957 26795160 scaffold_13 2415152 2415374 - 4057|0 223
TTTGTATGTAGTAGTGCTA-GTAGTGCGTATCTC-------TGTATATGTGCACCCCCTGAAACTTGCA--------GCAATGTGCGAATTGTAGACGACTCCTCTAAATGTAACTTGTTGTTGTAA-TTTTAAATGTAGAACTAAGCAATCGA-CGTGGTGCGTGCCACGCACACA-ATCACACTCA-CCAACCAATCATACACACACACACACACGGTTGTA
TTTGTATGTAGTAGTGATGCATAACGCAAACCCCAAAGTACGATATATG-ATAAACGATAAATCATAAATGATAACTGATAAATGCTACTTGTAGATGGCTCTTTTAAATGTAACTGATCGTTGTAGTTTTTAAATGTAACGCTAAGCAATTAAGTGGGCTAAAAGCAACAACCACACACCACATACACCCACCCAACCATTCACAACCAAAGCAACAATTGCA
>5-HT7 26794864 26795605|27214 chr3R 26795401 26797302 scaffold_13 2415388 2417320 - 80581|0 249
GCCATCCACGAGGACCTCCATTCCGG-------------AGAAAGGAGCCTATCCAAGCGAATCTGAGCTGCTCGA----------------------AGGGTCTTCC-CTAGGTTTCC---------GGAAGAAGCGAACTCCTCTGCTCGACACACTCACACACTTAGGTATAAACACTGGGGTGTACATCTTAAACAATTAGGAAATGTAAAGTTTTAAGTGGGAAAATCAGGCTCTGGGCTGTTTA
A--GTCAATGGATCCCTGTATACTTGGCTCCTTAAATTTATATAAATGTTAATGTATGTATATGTGTTGTTCTCTATACGGATAGGCCAAAACTAACTAGTGTCTACAGCTTGGTTTCCCCTTCCACACAAATACACACACACC-CGCCCCCACACACACACACACTGAAACACACACA--------TACATAT---------------------ATTCTATGTATGAGTGTAA---------CTGTTTA
>CG31008 26815199 26815293|27238 chr3R 26815293 26815584 scaffold_13 2440554 2440875 - 7990|0 0
G
G
>l(3)03670 26878333 26878484|27330 chr3R 26878341 26879417 scaffold_13 2534485 2535432 - 29402|0 163
GATCCTGGC------------AAATCCTTTTGTCCTAATTTGTTGACTTTTCTTT--------GAGGCCCCTTATGGGTTTTGTATAAACGATTGAGCGATCGATGGGGATGTACTCAAAACTTAAGCAAAAGTGTCATTGCGAGCGATAGTAAACTAACTTAA
AGGACTTGTTTGCCCTGTTTAACAACGTTTCCTTCTTGTTTGTTTGCTTCTGCGTCTACCACAAAAAGCCTTCAAATGATCTGTTTAAACGAGGGAGCATTCTATT------------AAACGCGAG-----GTGTCATTGTAAACGATAGTAAATTAATTTAA
>dco 26880905 26882250|27331 chr3R 26879829 26881104 scaffold_13 2536435 2537934 - 9635|1354 1575
AGATAGAGAGCATATAAATTGCGTTAGACATACACAACAAAACAAT-TGCATTAACGTTTCGATTTAACAATGTAAGTAATGGCCCTG-----------CGGAGGAAAGTTACACAACGCTAGCTAATAAACTATAGCTATAATATGAAATTTGTTTATAAGTAATACCAAACC-GTAAAATAAAAAAGGAAAATGCAA---------AAAAAAAACTTAAA
ATATAAAAAATATGTACTTTGCATTATATATATATATATATATATTATATATTTTCAATTAGTTT--GTAAAGTCGTTAAGGGGCGTGAGCTGCGAGCACGCATTAAAATTATA--ACGCTAGCTAATAAATTGTAGCTATAATATGAAATTTGTTTATAAGTAATACCAAACCAATAAAACAAAATAAAAACAAATGAGTAAACGCGAAAAATAACTACAA
>dco 26880905 26882250|27332 chr3R 26881199 26881421 scaffold_13 2538025 2538219 - 1239|0 223
TAGCTTTAAGCAACGCTCTGACTTATAAGGCCCTCCTATGTTATATTATGTAACCTTCTGTACCGCCTACTCCCCTATCTATATATATAT-ATTTATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATACTTTCGTGGTCTGCACTTTGCTGCCTGTGTTCATATATATCTTTCCGATTTTTAAACACTTAAG
TAGCTTTAAGCAACTCTCTAATTTGTAAAGCCT--CGATGTTAAACAACAGGAATTCATA----------------ATCTATAAATCTATTAATAATTCAATAACCCATTTTTGTTCTCTTTTGTTTATCATCTTTAATATA-ATATATGTATGTGTTCAATATTAT----------TTGCGAGCTCTGTTTCAGTGTATTTCTCAGTAATCTAACTAAATGAA
>dco 26880905 26882250|27333 chr3R 26881594 26881751 scaffold_6 2159146 2159329 + 1877|0 183
GTTAGCAGGACACGCA--GGCATT---TAATTCTGTTTTGCATTTGACTATTT------GCTCTTGGCCG----------GCTCAACTTTTTCTTTGTTAACTTGAAGTCCCAGACCAAATCAGGCAGAACATGCAGAACC-----GATCATGAACACATAATAACTCGATTGTAAGTGTAATA
GTACGCAGGCCGTGCACCGACGTTAAGTAATTTGGATTTGCCGGCGACTGTTTTGTCCCGTACTCGACCAATGCACAGCTGCAAAATGTTACCGTTGTTAACTTGAAGGACTTGGCCAAGCCAAGGCAGGCCCCCAGACCCATCTGGGACATAAGAAAAATACCACAGACTTGAAAGTATAATA
>dco 26880905 26882250|27334 chr3R 26881834 26883605 scaffold_13 2539100 2541061 - 80585|0 610
TATTTTATCGTTTAG-------------GTTGCGA------CGCTGGACACG-----------------------------------ACACAGTAGACAAACA---ACAACAGAACTCAACAAAC---TATACATGTAGTAT--------------------ATATAGTTATATATACCTA-----ATATATATA-ATACTTGCTTTATATATGCG-GTAAAACACGTTGAATGTATCCAAGCGGCAGGATGACCAGGTCCCTGCCAG--------------------AAACGGAGG-ACAAGAGCAGTGAGAGAAGAAGAGCAGAGCAT-------------------------AGCAAAGCGCAGCGCTTTTCTTTTTTTGTGTGTACATTTTCGTTTGTTTT------------------------TTGACATTTTGGTTT----CTGCTCCCA--GATG-TTAGAACGTTGAGCGCGCTTATTATTAAT------------------------------TAACTAGCCTATGATTAATTTAATTTATACTATTAGAACATAAACGATTGCAACCTGGCTGCAAGAAACTGCAACAAACCGCACTGTT
TATTTTATTGTTTAGAATGTTGTGCGACGATGCGAATTAAGCGCTGGACACACACACACACACACACACTCACACACACACACGTCCACACAGAGAACACGTACATACAGCAGATGCAGCCACACATACACACATTTAGTATATTACGCTCCATATGTATAAATATATACATATATATCTGTGTGTATATATATATATATATATTTGATGTACGCATACATAACATGTTATATGTATAGAACAGTCAG--CGACCTGGTCGCTGGCAACGTGTTGCAGTAACACACACACACACAGACACACACGCACGCATACAAGCATACCCAAGCACACACACACACACACACGCAACGAGAAACAAACAGCTGCGCTTTCCTTT-------TGTACATTTTTGTTTGTTTTTATTATTTTTTTTTCGCTTAAATATTTGCGTTTTGCTTTGATGCTTTTTCTAATGATGATGATGATGATGATTACTATTATTATTATTATTATTATTAGTATTGTGTGGCAACGCTTATGATTAACATATGCTAAGTTTAACTTATAATTTTAGTTGATAAACAATTGCAAGTCGGCCGCAAAAAG--GCGAAAGTATGCACTACT
>CG11317 26916429 26917088|27364 chr3R 26915013 26916957 scaffold_13 2582209 2584243 - 6651|1659 2256
TGCGGCGCCAAGTGAAAGGGATGAACTTGGGAGGACATCCAACTTGGAATTGGGCGCTCATCTTTTGATGAAGATTGACACACGGGGCGGACCGCTTGTCACCCTAATGAAAATGAATTAAACCCCAATCCGGCCGAACGCAAAGCCGCAAGCCAAACAATGAAAACTGTTGGCCAGGA--CCCAATAGCAAAAACCAAAAAACCAAAAAACCGATAAACAAAAACAAAAAGAGACGCCAGGACAAGATATAAAATACTTGTGGA-CTGTGTGTTGTCTGTACTTTTAGAGTTCAACTACAAGAGACCCC--GCTGGGGGTCTAAAAACCAAGTTATAAAT-ATAAATGTAAATGTATATCTATGTATGTG-TGTGTATAATGAGCTAGTCG--------------------------AATACGAAACTCCATAAATG--GAAATCATATCATTAACAACATATGTGT--------------------AAGCCCCAGGACAAATGCAAAACTATTTACCAAATGAAAAACCAAAGAAAAACCCAA--TGTATTTTTCAA-----TAAATAAAACTGTGCGAA-------ACCGAAGCA
TGCGGCGTCGATTGTAAGGACTAAAAGCTGGGTTAAGAGCGCACCAGAAATGGCCGTGAGTATTGCGA---------GCAAATGTGGCCGA-------------TAATGAAAATAAATTAAAGCAG----CTGACAAACG-GAGTCCGCGA-----ACAATGAGAAATGT--GCCGGCAACCTCTGCAGCAGAAATTGGCAAAC----AAGTCGA----------------------------------ATAAATTCTTTTCGAAACAGCATATTGTAT-TATTTTAAGAGTTTAACTGCA---GACCTTAAGCAAATGGTCTTAAAACAAATATGTACATGATATATATATATATATATTTATGTATATGGTATGTATATCGAACAGGTAGTTGCTTGTATGCAGTGTGTTAAGATACATTTAAAAGCCCCCAAATAATGAAATCATATCATATAATGCATATGTGTCTACAAAACTGAAACTATTTATGTGCGAGTACATATGTGCATGTGTATAATATATATATAAAAAAAAAAGAAACAAACATGTATTTTTAAAAATCCCAAATAAATATGTGTAAATCGTAAAACCGAACCG
>CG11317 26916429 26917088|27365 chr3R 26917084 26917505 scaffold_13 2584939 2585305 - 18239|0 4
ATACC
ACATC
>CG11318 26932088 26932326|27385 chr3R 26932156 26935038 scaffold_13 531833 534713 + 84703|0 175
ATATACTAAAATACGTATTCCCCGACGAACAAAGGTCCAGGACCAATGTATTAATAACGTTATATTTTATGCTAATTGATTGCCATTATGTATAGGTCCCTAAATTAAAATTTAAAAATTCTAATATAAAATAA--GACAATACTTCCCAGCGAGTCGATT---TAATTAATACTA
ATGGCTTTAAATTAATA------AGCGAACAAAGTTTTATTAGAAGTATTTTAGAAGTATTTTATTAT-CACTCATTAAATATTAT--TTTATTAATCATTACCCGAGACCTTAGAAAT----GTGTAAGAGCGTTGACAATATACATAAGCTTATAGAATGGGTGACTAACACTA
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TCCGTGTATAAATATGTATAGTCTATGTGCTGATATATGCAAATGTTGTT-----CACTCATTTTGACGCAGCTCCCAAGGGCCACGTTAATGCGGCATTTGTTGCCGCGGGCTAAAAGCACTCAGTTGGCTTTTAGCGACTCCTGACTGTCGGGTTATGCATAAA-TACATGAAATATGCAAATCCCGATGCAGGTTGCTTCAAC----------GGCAATAACCTGCTCCCTATA
>Prosalpha3T 26947855 26948347|27405 chr3R 26948219 26949149 scaffold_11 941965 942942 + 26852|0 131
AGAGAAAATTTTTTAGTCATTAGTT--ACTTTTATAATGTTTATATATGTT-ATATGTTACATTTTAAAAACTAAAAATTGTTTCCTAAAACTATGATCCAGAAAGCCAAACCTCATATATTCAAAAAACTT
AGAGAAGCAAGCTCAG-CAACAGTCGAAATCCTAAGCAGTCTGTGTTGCTTGAGATGGTACAT------------GAATAACTTCT---AATTATAATGGAAAAAGTT-AATTTTGTATATGAAATAAAATT
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AAACCTAAGTTAAGTTAC--CATTAGTA---CAACAAAATGTAAATAAATTC-----------TACATAGTACCT
GCAGCT---CTAGGCTACTGCATGAGTAAGCCATAAAAATAAAACTGTATTTGACCTTCCCATTACAGAATAGCT
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CAAAAAACACCCAGTACAAACAC-CAGCACTCACCGATAGGTTTCTTCGCTGACGTTGATGCGCCCCGGAACGCCAGTGGTCTCCGTCCGGCTGGTGAGATTGACAGTATTTCCGAACAGACAGTAGCGTGGCACTCGGTTGCCGATCACTCCAGTCACCACTTCGCCGGAATGGATGCCTATGGTGATTTGCTGAAAAAACAAGGACCAAAACAAAGA-ATTTAGAAT------TGTAGAATTTGTAAGG-------------AGTTTATCTAGCAAATAAATGTATAATCTGA
CTAA-------CTATAAAGTTATGTTACACTCACCGATAGGTCTCCTCGCTAATGTTTATGCGACCGGGCACGCCGGTGGTTTCGGTGCGACTCGTCAGGTTGACGGTGTTGCCAAAGAGGCAATAGCGGGGCACACGATTCCCGATGACGCCGGTGACCACCTCGCCCGAATGGATGCCAATGGTGATTTGCTGTGTTGGCGTTGAAAAAAATAAAAATATTTAAGACATTATATATAGGACAAGCGAAGCTCTTTATTTTCTAATTGATTTACTGAATAAA-ATGTAACTTAA
>CG31004 27005305 27005641|27482 chr3R 27005123 27007215 scaffold_13 2725777 2727939 - 67921|241 697
GG-------------------------------ATCGGCACTCA------------------------ACCCGATC--CTTAAGCTGCAAAGTTCAAAT-------------------------AAGAGCCACCCAATA------ATAACTAATCTTAAGTACCTTTCATTGCCGCCGACATGAAAACGCCCACCTG-------------------ACCATCAGTTTTCTTTAACTTTACTTATTGTTAC--ACCGCTGTTTTCTACCCACGGCCATGACCACATCCA-ATAACACACACCCAATAAGCATTTATTAATAGTCCGAATCCGTGAACCGAATCCTTGTACA-----TTAAGCATAATCAGAACGGC--AAATTCATTACGTATTACTTTGGCCCAGGTAAA--CAATCATCATTTTA-TATTGAATAAAACCAAAAACACTTGTTTAT
GACTGCAACACACGAACACAGGCATACGAACATACCAACACACACACACAAACAACACACACACATTCGCCTGACCTGCACAGGCTATAAAGTTCAAATTTTGTAAAACTAATTTCATTTATCGCACATATACCTAATATATCTTATAATTATTATTGTATAACTTTGTTAAACTCTGCTAATTGA---CCCACCTGTTGTTCATTTTGTCAACCCATGACCATTTTTTTTTGCAAATACCTCCTATTACTAAACAATTTACTCGTACTATAGAAATAGCCCAGTCCACATATTATTATTTAAATATATTTTTATATTTCATTTGTATTTTT--ACCAAATCCATGAATACCGCTCTTCGCATTATC---ACGGCTAAAACTAGTTAACAATTTGTTTGTCAATTGTAAAGTTTTTCATCATTTTATTAATAAATTACCTTGTTAATAATCATATAT
>chp 27029904 27030358|27507 chr3R 27029836 27031017 scaffold_13 2760049 2761356 - 36135|72 580
CTTCTGCACTTTACAT--------------------ATAAGACGTCCACCGACTTTTATACCATTCTTGAGCAAGTCTACGGCAGACAGGTCATATGAGTCCTGC---------CGTCTAGAGTTTAAGCGTGATGATGAGACTTTGGCCACTTTGATACC---TTTTGCAGTTAGTT--GATTCTCTTCCGACAACCTTCTCTCACCGATCCGCTG-GTCCTTGGTAACGCCTTATATGTAGTACTCCTCA------CAATTCACCACCGAAGCACTCCA-TTCTTCGCCTCGCCTCACTGTCTATCTCCATGTATGTATATTCTCGTAGGCCTTAACTAA------TCCAGCTAATCCAGCTATCTAGTAAACCGCCTGAC------CTGACCCACGAATACTTTCTGTACTTCTTCTATAAGTTAGGTCACTGCGCTGCTTAAACAATTCAAAATGAAAGTCTGTAAAATGTTTCATAAACATATAATAAATATTTACGGTAGGTT
CATTTGTGTTCTGGATGTGACTTCTGTACTTTGCAAATAAGACGTCCACCGACTTTTACGATATTCTAGAGCAAATCTATGGCAGGCAGGTCATATAGGTTTTGCGAAACTGAACATCTAGAAATTAAGCGTGATGA-GAGACTTTTTCC---TAAAAACCTGGTTTTTATGTTCTTTCAAATCCAATTCTGAATTCCT--TTAAACCAATCTTTAGAGTCCTTGGTAACGCCTTATATGTAGCTAACCTCAACTCGCCCATACA-CACCTCTGCACTCCATTTCTGTGGCACTCATCTCAATTTAT-----GGTAGATATTATTATATACACGTTATTTAATTTTTTTCTATATAATCCAGCTATATACTTAATCCTCCGATTTATTACTAACATAGAAATACT----------------TAAGTTAGGTCACTTCGCTGCTTAAACAATTCCAATTGAAAGTCTGTAAAATGTTTCATAAAC--ATAATAAATATTTACGGTAGGTT
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CTTTTGGTTATAACTTTTCAAA
CATGTGCCTGTGGAATTGC---
>zwilch 27036685 27036906|27512 chr3R 27036906 27039043 scaffold_13 2768053 2770261 - 74491|0 0
G
G
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GCGCG--CCTGCTGCACATCGATTGCTCGTCC--TTGTTTCCTGCGATCGGGCGCGTGCGC---------------------------------CAGTCGCATGCGAACGAGAAT-------AGCAACCAAACAACACTTCAAACAAACAAACAACAAC-AACAACCAGAACAAGCAACACCTACGTTCGTTTT-CGATTATTAATGATAAAATGATTGATTGATTGATTGATAGCAAACAAGAACATCCTGTACAACTATCTAATTATAAA-TACCAACAACAACCACATAATACATGTAATTTTGTTTTTAAAAAACATGCGA---------------------------------------------GCGAGGAGAAGACCACACCTAC-TTTAAGTTGAAC---------------------------------------AACCGAAATATCAGGAGGAAGGAGGATTG--GATTCAATCGGATTGGA----CTAGCCAACGCTCACGCCCATACCCAGACGACAGACATTAAAATTAGATTTTACTTAAAGCAAGCTTCCGGCTCACCGAAAACACAACCCAATCGATGGCCCGAACGAACTCCAGCCATCCTCGTGCACTCGGCCCATTCGGCGGAGGATCTCCATGCGCGCCCACCAAGGCTCTCTCTCTCCCCGAAGTTCTTGGACA----------------TGCGGCAGGCATCTCGTGGAGATCACCT---CTGCGACTAACATCTTGGATG--GGCGAGTGTGTGGGCGTGGCTGGGCGGAGATGCGGTGGATCGTTGAGCTCAGCAACTTTTCGATTTTATTGTGGCGCGTACTGAAAGTCTACGTTTTTTCAAGTATTTTGTATTCGAAAAAATCAGTTTCTTTATGTAAAAGCTGTCTTTGTTCATTGCCACTTAATATTTAT---------GAAGAAACTTGTACTAAGAGTAGTTGCAAACGAAATGAGCCGAAGAGCGCAGCTGAAA---TCTGAAATAAAGGAGAAATGAATGTGT------------AATGGAAT
GCGCCGCTCTACTCGTCCTTAGTTTTTCGTGCAATTGTTTGCAGTGTGTGTGTGCGTGGGCGATATTGGGATTGGATATTCCTATCTCGATGGCAAACCGCATTCTAACGGCAATCAGCGGCAGCGAGAAAGCAACGTATAGAAGAAACACATAACAACCAACAACCA---------------ACGTTCGTTTTTCGATTATTATTGATAAA-------------TGATTGATAGCCAACAA---CATCTTGTAC---TATCTAATTATAAAATAACAACAACAACCACATAATATATGTAATTTTGTTTTTAAAAAACATTCGAAACTGTAGTAGTCGCCTAAAAAAAAAAGCCTAGCAAAACATCATCGCGCAGA-AAGAACACACTTTTATTTAAGTTGAAACCAAGAAGAAAAAAAAAGAAACAATACACTGCTAATAAAAAAGAAAACATTGGAAAAAAGATCAGTTAAAGAGACAAACAGAACGAAGACACGATTTAAACGAAAAGTTGAGATTGAAATTGTAAACATTAAAATTAAATTTTAATCAACGCAAGCTTCAAATTCACACAGCATTAGCCCCACACACAGA----AAACGACACTTGCATCTCCGCTGCGCCTTTTCCATACAGCGAGAAGGTT--GAGCCAGCTACCCAGCTCTCTCTCTCTCCCCCAATTGCCTTGACAAGAACATCCGTTGAGGTGGCGTGGGCAGCACGTGCAACTTTCTTGTTCCTCAATTGAGATCCTGAGTGTTGGCGAAGGCGTGG-TGTGGTT------ACTTTCGTGTCGTTGTTAA-----------TTTTGAATTTAT-GTGGCGCGTACTGATA----ACGTTTCTTTAAGTTTATTGTATTT-AGAACTTGTTTTTCTTTTTGTTTAAAC---ATTTATTAATTGCCACTTAATCATTGTCATATAGTCGAATAAAGTGGGGTTTGTTCTATTGGCTAGAACAACAAA--AAAATAGGTATTTGAACGATTGTGAAATAAAGGAAAAATGAATGCGTTAAAGAACTAAGAATTGTAT
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GATTGATAAAATATATACAAATTAATATATA-CACATATGAAATTAAGTTATAAGCAGGCAGGCAACACGTAATGCTAGTTAAGTCAACAAATGAGAGAAACAAGCAAAAATTTGTAGGAAGAAAACTAGAAAATGGTAAAGACAACATTTATTATTTAGTTTTTAAGCA-TTGTTGTTGACACTGTAAATAATTGCATAAAATGTAAACAAAATTTTGTAAGAAATTAACTGGCGGAAATACGATTCACGTACGTTGTATAT-ACAAACATGAACAATTCAAAAAGAATTTTTATTAAACTTGATATGCAATGTTTTT--GAAAATCTATATGTATTT-TAAAAAACCACATACGATTATTTGTGAAGCACAGCAAATATTACATAAATAAT-AAGTTGTAAAAACTGATGAAATCTAAGATTTGCAAATAGAAAAATTTGTAAAT---TTGCTTAGTTAAAAGTAATATCAGTTTTTACAGTTTGAGATTTTTGATAAATTTTAATGGCTCCTATGTTATTAGTCAA---AGCAAAAACAAGCAGTGCTTAATGAGTTA-----------AGACAATACCATTATAATTGTTTTTTATTTTATT-----TTTTTTTACGACATTTCATGCTTAAATGGTTCAATCATCACTTTATGCACTTCGCC----ACCAATTCAGCCAGCACAAACTT----CTGAAATT----------TTTCTTATCTATTTTATTGTAAACTTTTGAGTTTTGAACCGCTCGTGCATGAAATGCACAAAATTTTTATATTATCAACAATTTTTACTAGTTAAAACCTTTTGGGTAATAAAAAAGAAAAATTACTCTTTAAAAATTGCTACCCAGTCTTAATTTAAAAACATGAACAAACATGGTTTATTTTTGGTCCAACACCAA---AAGAACAATTT-------TTGTAAAACGAATTAAA----------TTAAATGTTTAATGGATGT--AAATTTATTTAAGAACCATTTGTAATAATAATAATAATTAATAGTGCAGCCCTA------------AACTGATTTCAGTCCCTTGTGCGGT---TTTCGAAGTAGTCTCGTTAAGCCAAAGGCACCTTTATAAACG--TGTAAAATGAAACAACTTTA--------ATATATCGCTATATTTGGATAGCTAGAAAAT-----CACATGGGTGCT--------------CGGGTAATT-----------------GGTCATAATAAATGACTTTGTTTTGATA---------ATTATAGTTATATTACGAGAAACATGAAT-AAAATACAATTTTGTAAGACATGCCG
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TAACGAA-------C
TAACAAATTCTGCTC
>CG31204 27217613 27217698|27666 chr3R 27212158 27219347 scaffold_22 1967467 1975146 + 114637|6263 6358
AAGTTTGACTAAATAATC---ATCCAGCACTTG--TGATGTCTAGTGAAACTCCTTTTCCCAAGTGAACAAATAAA--TGCAGTCCATTTA---GA
ATATTTACCCAAATTATTTCTATGCAGCAATCAGTCAAAAACCTGTGAA---CCCTGCGCAAAATTTAGAAATAACATTGAAATCAGTTTATGGAA
>CG31002 27219304 27219350|27666 chr3R 27212158 27219347 scaffold_22 1967467 1975146 + 114637|8077 8126
TTTTTTTAATGTTAATCCAATAAACTTTTCAAGTTTAATGT------TGT
TTTATTTCGCGTGAATC---TCTAGTTTGAAACTTTGATGTAAACCTTGT
>CG31002 27219304 27219350|27667 chr3R 27219348 27219928 scaffold_30 1351128 1351720 - 6668|0 2
AGT
TAT
>CG11337 27227557 27227775|27674 chr3R 27226912 27230363 scaffold_22 1982658 1986035 + 127964|682 907
GTTCCAAGATGCAAATT--AACTTGTACAGTGAGCTTTCCTTATGTTTCGTCTGCGAAAAGACGCCTTCAAAACTTGAAATTTTATTGTAGGCTAAAAAATGTTGT-----CCTTAAAAGTTGTACGTATATAAAATATTGGATGAAGATTCACCTATTTGACCGTCAGCTGTATAAATAAATTGTTATTGCTCGATTCAACCCCGAGATGCTATTTATAAAACAA
GGT---AGCTGGAGATTGGAACTTG------------------------------GAATAG-----CTCAA-----GCAGTTGTACTG-----TTAAAAATGTTGTTTCTGTTTTTAGACTTGCGATTATATTATATATTAAGTTATAAATTTCATGTATATACAT--------TAAACAAA----------TCAATTTAATTTTGAATTA-----TGTAAAATAG
>CG11334 27285546 27285733|27726 chr3R 27284264 27286888 scaffold_22 2046294 2048967 + 92692|1312 1542
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CAGCCGCACAATTTTTTGCTGCTGTTGTTGTTAATATTTGCGTTAAACGAATGCACTCCAGTTGC-----AAAGAGCACCACACAGACACACACACGGAACCACAAAAATATGGGCGACCAGCCAACTGGCTTTTGTATATGTAAAT--------------AGGCGCTGAACGTAAATACA-----AAGCACACTATCTTTACACAATAAGGCTCCAGAGTTTATCCACAT
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AG-----------------------------------AACCACCAACAACAACAAGAACAACAACGATGATAACAACAACAATCACCACCAGCTAGCACTCATTCACT--CTGTATAAATATATCCAAGCATTAA--CTATTTTAATTGTAGGGTTTAAGCAGTTTAAGGTAACCCCCCACATACATCATACCGCATGCGCTCAGAATAGTCAAAGGTCCCCAAC---------GAAACCCTCAATTTAAATGCAAAGACTCACTATATATATGTATATACTATATATATATGTGTGTGGCCGGAGCAGTGTTGTGATTTTTCGCTTCGG----CCAGG----CTCAATGCGCGCATCCTTAACAA--AAGCAAAATCAAACCTTAAGCGACACTGAAAACACAAGATATGTATGCTAATTGTAATATAGTATAGCATAGTATACATATATATATATATATATATATATAAATCTATATCTGTATCGCATGTGAGACGATTCGTTGTTGTCAGCCTAGAAAGCATGATAAGCAGAAAGTAACGGAAATGGCAGAAAACAAAAGCAACAGAAATCTGAAATACACACTGAAAAAGGCGAAACGTCGATAACGAAAGCCAATATCAATCTACTCTAGTGTGTATTAAAAACAAAAAAAAAAAGGCAAAATTATGAATTAAAAAAAAAAAATCGGGAAATTCAAGAATGAATATAACGTTAAATTCTTAAGCAAAATGAT-------AAGGAAAAGCAGTTTAGAAGCGAACACAAAACGTTATTTTTACAATTTGTTTTCGAATTATTAGAGTTTTAAGTGTGTGTGTGTGGAGTGCATGCAAATACTATACATATATATATATATATAATATACACACATAAGATATCTTTAAAATTAAATATCGATCTGACAATGAGCATACAAATTGTAACGTAAACAAAATTTAGCCGTGTGTGTGTGAAATTGTTTTCAACAAAAAGTCTTTCGTGTGGTGTTTTTTACTCTTGCGTCAATTTTGCATAAACTTTTTAAACAAAAAAAAAAAAACTAAAGAAAGAATACTTAATATGTATGCTAAGCGAAAGAGTATTGACGTATCGATTGAACTGATAAGGCGATTGGGTATTTACAAA-----TTATTAAAGTTCGATAAGCAATATATAGAACACGGAATGCGAGTGAAATCGATTGCGAACAAAAGAAAGCACAAGAAATTATTAAATAAATGCAGCGAAACAGAAT---TAATTTAA----------------GCATTAAAAGTTAACGCGTGAATTCAAAATGAGAAAATTGTATAAAT---------------------------TGCAACT-TAAGTTATTTATAATTAAATAAAAAAAAAAATATACATACGAAGTAA
>RpL6 27420509 27420645|27845 chr3R 27420604 27421329 scaffold_29 1023436 1024160 + 47929|0 41
GCGAGGGGATGGATTTGGTTCTTCAGTTTAAGGATTTCTAAA
GCGTGCGGCC-CAGACAAAACTTCAATTTAAGGATTTTTAAA
>CycG 27424172 27424994|27847 chr3R 27422335 27425128 scaffold_29 1024630 1027970 + 26220|2392 3350
TATCCAGCGACAGCCAGCAGCAGTAGAGCAGCAG------------GGTCAACAGCTGGGCAAA--ACTGGAGCAGCGG--ACAAAAGGACCATCAACCAGACGTAATC---------GCGGGACACACCTGACACCTCA-CACCTCCTGCTTTCCTGGCACTAGGCATATCCCATAGCAGCAGCAGGAGGGTGGAAATCTCCGCAGAGGATGTGTG---------------------TCCGTGAGAGCGTTCCGCGTGCGAGTGTAGTAGTGCTGGTTGAGGTAGAGTGTGTATATTTTGCTAAAG-----------------TGCATCATAATTCTTTTGGCATACACACAAATGTGTATTTGGTAGC-----GCGCTGGTTCTAACATTTAAGAAACTATTGAGATACGGAAATGTGGGCGCCAAGGTGACGCAGCCAC--GCCCACCC----CTTTTGAAAAGTTACCCGAGAGTAGCGCCCCCACAT--TTTTTCGATT--TATTTGCGGCA-GACAAAA----AAATACGTGAAAAAAAAACAAAAGCAAAAAAAAATA--------TAAAAAAAAAATTAAAAAGAA----------------------TGCTGCGGACCATCATACAAAAGATTGATGCCGTTCCGGATCATTATTCGAGATCAGTGAGAAAGAGAATACGATTTGAGAATTG----CGAACC-CACGCC-----------GAAATCCCGAACATCTGGAATGGGACAGCAGTTTTTTGTTGGTTGCGCTTGAAAGCGTAAAAAAAAAATTCAAAACCCCGAAAGGAAAACTTCCAACAAAAAGAAAATACTTTCTACAAACCCCTAAATAAGTT---GTCACTCTATGTTCTCTATGTTTGTCCCGATTCTATCTGTTAATGTAGAAGCCCCGAATAATCAATGGACCCAAAAAC---ATCAACAAAAAT
TA-------GCACCCAGCAGCAGCAAAGCAGCAGCCCCCAATAATAGGACAACAG--GGGCAAGGGATTAAAACAGCAGCAGCAGCAGCAGCGGCAGGCAGGAATCATCATCATCTATGCGCACAACATTAGCAACAACAGCAGCAACAGCAGAAGCAGCAGCGGCAGCAACAAATTGTGGCAGCAGTAGAAAAGACATATCTACAGCTAAAACGAGAACTGAGTAACTGCTCCACAATTCGTGTGCGTGTGC-GTGTGCTAGTGTGTGTGTGCATGGAGTGTGCGTGTGTGTATATATTGCTAAAAACAAACAAACAAAATGATGCATCATAATTCGTTTAGCATACGCATATATATATATATATATATTATTTACGCTGGTTCTACCATTTAAGAAACTATTGAAAAATG-------------CGAGGTCAGCCAGTCGTCAGCCCAGCCAGAGCTT-----GATTTGCTTTAGGCGACAGGCAGCATATAATTTTTCAATTAACATTTGCGGCAAGACAAAACAAAAAATACGTTAGAAAACAACAGAAAAAAAAAAACACAAATGAAATGAAAAAAAAAACCAACAAAAAAAAAACAACTATTATATAGAAATGATGCGGACCATCATACAAAAGATTGATGTCGTTCCGGACCATT--TTGAGATCGGTGAAA----GAAAACGATATGAGAATTGATAACGAACCGCACGCCCACTAAAAAGGGCGGGCACAGGCATACGGAATATGACAGCAATTTTTTGTT--------TAAACAATTCGAAAAAAAAACACAAAAAAACAAAAAAAAAACAATCTACCA--------CCCGCGCCACAA---TTGAAATTAGTTTTAATAACTCTTTGTTCTCCATGTTTGTT----TTGTAAACACTTAAAAACTGGACCTAAAAAAAAAACTAAAACAAAAACGAAAGAAAAAAAAAT
>CstF-50 27561225 27561645|28007 chr3R 27561192 27562644 scaffold_29 1235037 1236537 + 77691|33 460
TGGCTGTGCAAGATTTTA-ACTTATTCATTT------TAGTACCTCCTATCTTCCGGTATGGATTCACTGGTTTATCTGTGGGAGCTGTGTACCAGTCGTCCCATTCAGACGTACACGGGCGCTGGAACCACCGGCAAGCAGGAGCACCAGACAGAGGCTGTATTCAACCACACAGAGGATTACGTGCTTTTCCCCGACGAGGCCACCACTTCGCTTTGCTCGTGGAACTCCCGTAACGGCTGCCGCCTGACCCTTAACTCGCTTGGACACAACGGACCTGTCCGCTATATTACGCATTCGCCCAATGGTCCTGCTTTCCTCACCTGCTCCGACGACTTTCGGGCACGTTTCTGGTACCGAAGAGCAAATAATCAGTAAACGGATGAAGCTACACCAATCGAATAAAACTTTAAGGAATAAAATATGT
TATGATTACCAGTTCTAATACGTACCCATTTTTGTTGTAGTACTTGCTTTCATCTGGCATGGACTCGATTGTTTACCTGTGGGAGCTATGCACCAGTCGACCCATACAGACATATACGGGCGCCGGCACCACCGGCAAACAGGAGCATCAAGCGGAAGCTGTATTTAATCACACCGAAGACTATGTACTGTTCCCAGATGAGGCGACCACGTCTTTATGTTCCTGGAACTCGCGTAATGGCTGTCGCTTGACACTGAACTCTCTGGGTCACAACGGACCTGTCCGCTACATAACCCATTCGCCCAATGCGCCCGCTTTTCTCACCTGTTCCGATGATTTCCGAGCACGTTTTTGGTATCGCCGTGCTAATAATCAATA-------GTTGCTAGG--ATTCTAATAAAACTTAAAACTATTTTAC-TGT
>awd 27570894 27570979|28013 chr3R 27569968 27571668 scaffold_29 1244218 1245900 + 38481|979 1066
-CGGCTACTTTAA-CTGTCTGCC-CTCGTCTAAGCTGAATACAGATTGATTCTTCTAAAGAAATAAAATTCCACAATAATTACTATAT
GCAAGTGCATGAATCTGTACGCCACTCACATAAGTCTAAC----AGCGATTCTTCTAAAGAATAAAAATTCCAC-------CTTATAT
>l(3)s1921 27572167 27572288|28015 chr3R 27572165 27574381 scaffold_22 451349 453746 + 63815|2 136
TTTTCGCCGAACATTTGCATCTACCAGCTG-TGTATATATTAGTCGTAAACTTGTATTGTTTTGTCACTTCTGTGATCAC---ATGGACCTA-ATCTTATCGAGACA---TAAAAAGAAATT-----TGAACGTG
TCCTAGTTAGA----GGAAATTACTCATTGTTGTATATAAAATTTGTAAGTTAATATTGTATTTGTATTATTATTAACATGCAATGCGCTGACATCTAATCAGTGCATTGTTAAGATAAACTATCGCAGAACGTG
>CG2196 27577531 27577704|28018 chr3R 27577442 27577633 scaffold_7 4761258 4761449 - -1119|99 205
GAAATGCTTACAGTTCTA----ATAAGATTGCTTTAATATTTAGTAACGACTATTTCTGAAATAAAATGACATGTTTATGAATTAGACTTTATCCAAACAAAAAAAA
ACAGTGTATACA--TCTAGGGTATACAGTAGGTACCTCATTTAATAGCAGCA------GATATACATATTTATTTTTATAACTTAACTTAACTTATAACTTAAATAA
>CG2196 27577531 27577704|28019 chr3R 27577634 27579273 scaffold_22 456507 458197 + 55687|0 70
TATTACCACATCTGTACATTTGCATTCGAATTTTTAAGTTTGAATAGGAATTGGCGAATAAGCATAATAAT
--------------------------CAAATTTTGTACTTAAAACTATTTGTAGTTAATACACAATGTTAT
>CG2187 27581078 27581155|28021 chr3R 27581134 27582358 scaffold_22 460479 461710 + 34646|0 21
TTCTTGTTAAATGTGTTTTTTA
CTCATCTTAGTATTATTTCTTA
>CG2150 27589026 27589521|28028 chr3R 27588998 27589195 scaffold_22 470308 470485 + 8926|28 199
CCGAAAACGAAAGCCACACAACAACACCCACAACACCAAGATGGAAAACACCCCACAAAGTGTTATAACGCATTACTAGCTCGTAAGTGTTTTTATTTTATATGAAACAAACAAAGAAACAAC--AAAAAAATATGAAAACAATAAAAAAAATAGTAAATTTTGTCACCGTT
TCAAACAACAAAAACACACATTCTCTTCCCCA--------------------CAAAACAGTGTTATAACGCATTATTAGCATGTAAGTGTTTTTATTTT-TATGAAACAAACAAAGAAACAACAAAAAAAAATATGAAAATAATAAAAAAAATAGTAAATTTTGTCACCGTT
>CG2150 27589026 27589521|28029 chr3R 27589221 27590124 scaffold_22 470505 471569 + 30995|0 480
ATCTTCGCACAGGTCTCACATCCGAAAGACACACCT-CTGCC-AAAAATGAATACCGACGGACACGAA-------------------------ACCGACAAAGACGACACCAACACTATACAAATTTGGGCAACCTGGATCTAATAATGGAACTACCGATCACCGATCC---------GCTCTGATCCCGAGAGAACTGGAGATCGCTTCCCCTTCTCAAGCCCTCTTC-----------------------------------------CCGAACTCAGCGACTG--------------------TACCCCAACA-------CTCTGAAACGTCCGTTCCCCGGAAACCCCAAA---------------------------------------------CAATTCGGGACTTCGTCTCGGGCCTT-------------------------------TTTGTAACCCTTGTAAATAGTTTC
GC-----CAAGTGACTCACATCTAAAACAAATTTTTGCTGCCAAAAAATGAATACCGACGGAAAGGACGACATCAATCGACACAGCCTGACCTAACGACAACAACAACAACAACATTAACTGAAATCAACAAGAATTTATGAAAGTATGGGCTCACCAACAACCAGTACTTGAACTTGGCTCAAAGTTCGTGCGCGCC-ACGCCCCCTCCTCCCTATTGAAACACCTTCTGAGTGAAAACGTAGTTCGACTAGTGATGTAGAGTGAACGATCGAATCCATCCACCGTTTCATTCACCTACCATCCATCCCCCATCAAATCTCGCGCTATCTCACCTTTCCTCCAGAAGACCCAGACTCAGTGACTGTATAATTTCTCAAAACTATCTTTCTATTTGAACTCAAAATGCGATTTCGCCTTGGCATTTGAGAGGTAACCGAATTTCGGGGTGAAATTCGTTTTTGTTTTTTGTAAATAGTTTT
>CG2126 27600767 27601072|28037 chr3R 27598199 27602988 scaffold_22 477278 482092 + 128212|2743 3050
TGCGGCGACGTCCAGATGCAAATTTTTCACGCCCGGGGAACTCGTCGATCGACTGTTGTTATCTATGTGTAGTGT-ACGCG-TCAATTAATTTATTTACATTTAGTATGTAGCTCAGACTCAGACCTGTTCCGAGTATAATTGCGGCTCTAAAAGCCGTTGAGAAACAAATTTAGGAGCAGGTCTATTTAGTGTTTTCGTCGCACAAGCTTAATTCATTCTTCGTTCTTTTCGTTTTAATTATATTTCACATTAATTATACACATATAGTAATATTAAATACAAATCATCAGTTTCCCATCTCTAAAA
TCCGGAAACTTGCAAATGCAGATCTTTCATGCGAGGGGCGCTAGGCGTTCCACAGTTGTTATTTATGTGTAGTTTTACGTGCTTAAATTATTTCTTACTATTATATATGTA-----------------------------------CTCTTAAAAT-----AGCATCCAACTCA-----------------------TGTCG-----------------------TCTTTTCGTTTTAATTATATTTCACATTAATTATACACATATAATAATATTAATTATAAATCATCAGTTTCCCCTTTTCTAAA
>CG2118 27616668 27616847|28042 chr3R 27615115 27619393 scaffold_22 495157 499505 + 126637|1779 2005
CGGAATATGTTTCGA--------AACGTACCAGAGAGTTGTTGCATTTACAAACAAAATTATATTTTAAATATTAACTAGCCTGCTTTTGG------------------TTCAGGGATCACGAAGTGCATTTATTATCGTTAAGTAAAAAAGTGTCCATCTAATGGAATTTTCTTATCTTTAACCCATTAAACGTCTAAA---------------------ACTGTT
AGAAAATTGATTTGGTTTGCCTGGGCATACCAGGAAATTGTTGCATTTATGCGTAGAATTTGACTTGTTGCATTTATTTCTGTGCTTTTGAATCGATTCTTAAGCAGTTTTTAGCTTTACCCACGTGCATTTATTAGATTTAAGCGTAAATATTTCCATCTAATGGATCATTGTTGTAACTAATCCCGTGACAGTAAAAATAATGGGTGTTTCTTTTATAAAGTATA
>CG11576 27632588 27632837|28049 chr3R 27632685 27634280 scaffold_20 2069823 2071448 + 56920|0 159
CCTCGCCAGAAACTCGACGCGGCCAGGATTTCCAGGGATGCATCGTGATTTTAAAATTGCTATTACTGTAGTTTAGTG-------TGATATTTTAATGTGTATTTTCACCTCAAGTCACAATGAAGACAATACCTACCTGAACTCGCGCTTTTTTATACA
------------------GCAGCCCGGTTT--------CATATCCTCAACT---AGATGATTTTAACATAGTTTAGTAAATATATAGATATTTTATTTTTTACTTGCGCCTT--GTCATAAC-AATAGAATATTTA---AAACACATACCATGTTAGGCA
>ferrochelatase 27636176 27636715|28051 chr3R 27636214 27637205 scaffold_20 2074344 2075336 + 41391|0 512
CTTT----AATGCCGGATTTCCATTCCCATCCACTAAAACCAATCCCATCT---TTACAGGGCTATGTTAAGCAAGGCCTGAAGAACTTCATCCTTGTGCCCATTGCCTTCGTGAACGAGCACATCGAGACGCTGCATGAGCTCGACATCGAGTACTGCGACGAACTGGCCAAGGAGGTAGGCGTAGAGGAAATCCGTCGAGCTGCAACCCCCAACGACCACCCGCTGTTCATCGACGCCCTGACAAACGTTGTGGCAGACCACCTGAAGTCCCAGCAGGCAGTCAACCCCAAGTTCCTCATGCGTTGTCCCATGTGCTCCAATCCAAAGTGCAGGGAGAGCAAAAGCTGGTACCGCCAGCTCTGCTCGAACTAAGCAACCAAGTCAACTTGCGGGGGTGGGTA----GCACTGCGTGACAAGCGTTTCAAGTGCTGCAGCTGGAGGAGAACATTTATGCATTCATTTGGGTTTCTGGGGGATTGGTTTTCACATACTGGTGTTTATTTCTTT
GATTTCCGGAAACCATGCTTTCATGC---TTCCATGACTACAATCTCAATTAACTTGCAGGGCTATGTTAAACAGGGCCTGAAGAACTTCATACTGGTGCCTATTGCATTTGTTAACGAGCACATTGAAACACTGCACGAGCTGGACATTGAGTACTGCGATGAGCTGGCCAAGGAGGTGGGCGTGGAGGAGATACGTCGCGCTGCCGCTCCCAATGATCATCCGTTGTTTATTGAGGCACTGAGCAGCATTGTGGCAGATCATCTGAAGTCGGATCAGCCCGTGAATCCAAAGTTCTTGATGCGCTGCCCCATGTGCACCAACAAGCGCTGTCGTGAAAGTAAAAAATGGTATCAACAGCTATGCGCACACTAAAATGCCATTTTATTTATATGAGACTCACATAATGCACCATCTGTAGTGCATTTTAAGTTAGTTAGCTTCAAGCTATCATTACAATGTTCATCATGCTATC-----AATCGGTTCGCTTATA--GGTATTTCATTCATT
>heph 27676731 27677576|28085 chr3R 27675482 27678550 scaffold_20 2131339 2134752 + 76665|1597 2595
AATCCGATGCGAAGTCAGGTTTACTGAACCTGACTAGGTACCTCCGGCGGGTACAGCTACATACAGATGCATCAGCAGCAACACCTTCAGATCCATTGGCAGCAACAAATACAAACTATAATCCGTAGTACAAGAAAAATG---------------CACGCAAACTTCTACTGAAATGGCAGACTCCAGAAGCACTACCCACCCAATCCAACATAATAATCAGCAGAAACAATCGATGCAAGAGCTATA-CCAATTTTAAACAATTCAACTCACTCTAAGAACTGTTTTCTGTTCATACACTACCCCTTAGTGGGAAAGACACAAACA--------ATTAAGGAATCTTACTGAATTGATAAAGAAAAAACTACAAATAA-----ATATACATGAAAATTACCACGAA-AATAGCATTTTAAGTT-------------------------------ATGGCACGCGCAGACAACAAAACAAACAAACAACCCACAAACTAACAATCAGCAACATCGT---AACTTAAGCTTAACTTTAAACC-----TATAGTTCGTAAGAAACCTGCATTGCATAAAAAAAACAAAACAAAAAATATATGATGAGTAGAGAGGAGTTAAGTATGTTTAAAGTAAAAAGAGAAAGATCGTAACTTAAAATATTTTTAGTGCACTGTACTGTGTTTTGGTTTTAAAAAACGACAGAAAGTCAAAA-ACATACGAAGGAAGAAA----------TTATGTTAAA-AATGAATTAAG-----------------GCAATGTTTTATTATGTACATG---ATGCTGTTATTATATTTTAAATGAATGCAACTT--------AACTTTAGTTTTTTACAAGTGC--------GCAATTTCAATTGAAGAAATA--------------GCATACCCGTAGCTAA--------TAGATGTTTTAATTT--------------AAAAAAGTAAAAAGTAAGAAAGTATTTAGAAAAA
AATCCGACCCGTGGTCAGGTTCACTGAACTTGACTGAGTGCCAACAG------CAGCTATGCAC---TACGGCAGCAGT------------TCTTTTGGCAGCAACAGATACAATCTATTATTCGTAGTACAAGCGGCGTGCTGGGCAATCGCCATCACATCCACTTCAACTGAGAAAGCGAGCCCAACCAACCCAATACAACCCAACCCATCAAACAA-CAGCAGCAACAATCGATGCAAGAGCTATAGCTACTTATATACA----AACAAAATCTAAAATCTAATTTCTGTTTTTATTATAAC----AATGCGCAAAACTCTATCATAACACTTACTACAGAAATTCTAAAAACTAATAAACAAAACTATACAATTAATTAATATATATATATATATTTAAATGAAGAATACAATTTCAAATTTCAATTGTAAGACAAGCATTAAGAGAAACAAATACAACAAATAGAAAGGGAAACACAAAAGCAGCCCACTA---AACAATCAGCGACGTCGTATAATCATAAGCTTAAAGTTAAAACTTAAATTTAGTCCATAAGTAAGTTGCATTGCATAGA-------------------------GAGAAAGAAGAAGCAAAGCAAATTTAGAAC----------------TAACTTA----------AGTGCACTGTACTGTGTTTTGGTTTTAAGAAACAGCAGAAAGTCAAAACAAAAACAAAAAAAAAAAACAAATCAATTTATGTTAAACAATGGAGTAAGCAAAAAAAAAAAACAAAACAAATTTTTATTGTGTACGAGTATTTACTGTTATTATATTTTAAGTGATTGAAACTTTGATTGAAAACCCTTATTTTTTACAAAAACAACAAAAAACAAAAGAAAAAGAAAAAACATATGAACTTAAAGTGCATGCGCGCATTTAAGCAGTTTTTAAACGTTTTTCATTTTGTTAGCCGTACCAGTAATGTTAAAAGTAAAGTTAATCTCAAAAAAA
>krz 27873827 27874749|28295 chr3R 27871552 27875607 scaffold_20 2378665 2382831 + 40303|2509 3677
ATGAAAA--------------------------------------------------------AGGAATAGATCGAACTATTAATTCATATGAAGAAAATAC------------------------TACTATTATTTTCGGCATTTGTATAATATAAAAAGTATGAGAAAATTGGGCAACCTCTAAATGTAAAGTTTTATACCAATAGCCATGGTAAACAGTTGGATTTAAGCTATTTTATATGTGTAGGCCATATATTGTAGTATCTATAGGGTTTAAGCTGAAAGTGTACGAATTTT--AAAATGTGAAATTGATAAACCAGTCAACACAC-------CAGATCTACACAAAATGCCCACGCATAAGTTAACTACACGAGCGAAGTATTTCGGCCACACCTGTAAAAGTTGAAAGAATTCACAAAATTTGAT----------ATGTAAATGTTGTA--TAATATTTTTTATTAA-----------ATGCCCTCTCCCATTATAAAAAC-------------GCATAAAACAAAAATTCATTTACAAATTCTAATGATCTTTTTATTATGCCTCTTCTTTTTGGGACATTGTTATTGCTTTGCAATGC----ATTGATAATTTGTTCGCAACTAATTT---------AAAATAAGTTTTTTGAGTAGAGTACGTTACTAAAAATGTTTCTAGATTT---------------CTTTTCTGCAATTAAA-----------AAGAAATGTTTTAGGATGGCT-------------------TGAGGTTTGGATGTTGTTTTATAAATATTCTTCCAATATTTCAAAAATAATTTGTTT-----TCAAAATTTATTACTAAAAAATAATAATATTAGAAATATCCATACCCATACCTTGAAACAATGATTTGTTATTTGTCATTAAAGTCGTGCATGCAAAAAA--------ACTATTCTTGA-----AAAAGCTTTAAA------------ATAGTTTTTAAATTTAATTTTAGCACAAATTTAAT--TTAATTTAAGACGGCATTCT-----TGATTCATTACAA---ACTTTGTAACCCTAGAAGCGAGTCCGACC-------------------CTATAAGGTACATT-TATTATTTGTTA---GGATACCCAACCAAGTCGATCTGA
ACGCTGACAGTCGACGTCTGTCAATGTCCGTGAGTTGTTTGTGGTGTTGCTTCGAGCAACTGCAGTTTTCGATCAGCCCATAGACATGCGTGCGCGCAATATTTATTGTCCAACTCTACGTATATATACATATATATATGGCATTTGTATCATACGATGTTTATGCGCAG----------CCCTGATTGTAAACTTTGA-ATACATAGCCACGGTACATAGTTTTATAT-TGCTA-TTGATATGTGTAGGCCATACGTTCTAGTATCTATAGTATTTAAGCTGAAAGTGTACGAATTTTTGAAAATGTGAAATTGTTTAACAAATACACACACCCACACACATACACATACAAAGAACCC---------TCAAATACACCGACCAA---------CAAAAAAGCCAGAAGTTGAAATTATGCACAAAGCTTAAGCAATTTATAACTGTAATTGTTTTAGCCATTGTTGTTTAACAATACCCAAAAACACGCACAATTCCTTGTTAAGAGCCACGCCATTTATGACAGTATGCAGACAATTATTT--AGTTTGTTTCGCTCTGTTTGTTGT---TGTTCCGTTTAAGCGGGTGTCGCAACGTTTAAAAGCTTTAAATGAGAATTATTTTGAACTTAGTTTTCAAGCACAAGAACATTTTATTTAAAAAAAAACCCAGAACAAATATGCATACACATGTACATTAATCTAAATACGTTTTTGTAATTTAACAATAAAATATAAACAATAATTTGTTATAACCAACAACAAAAACCCAATTGCAAGCAATGTATAGTGTTC----AAAGCTTTCCAAATAATTCAGATATGCATTCTTTAACGCAAATAATTGATTTCTTAACAATTAAGTTAC-----ACTTACAAATCTGTAATTTAAA---------TATTTCGTTTAACTGAGACTGAACCTCTATAAAACCTGAGACACTGCTCTCCAAGGATAGAAATTTTAAACAATATAAACGCATATATATTGTGTTTACTAGCAACAGATAGATCATTCTTGCTTTAATACCATATTATATCAGTTCCGCATTACAATATAATTTGTATGTATTGAAGTGCACCGAACAATAGATAAGAGAGATAGAGCTATAAGGTAAATCGCAATATTTGATAACTGGAAATCGTATCATAAAAAACTGA
>Map205 27882314 27883043|28307 chr3R 27881330 27882348 scaffold_20 2391307 2392569 + 1496|1280 1315
ACATTTACAAAT-TGTCCTTTATCAAAAAGAATTAT
AAAGTTATAAATGTAGCTTGTAGTTGGAATTCTAAC
>Map205 27882314 27883043|28308 chr3R 27882376 27882425 scaffold_20 2392601 2392650 + 698|0 49
AAAAATATAACAATTACATTTAAAATGTTTTTAATACATTTTTTGATCAC
AAAAAAACAACAACAACTTATAAACTTATACAAGAAAATGTGGTGAACGT
>Map205 27882314 27883043|28309 chr3R 27882565 27882872 scaffold_20 2392737 2393075 + 387|0 349
CTTATTTATATACGATTATACCCTCGATTTCTTGCTACATATTATTAAATCATTTTATTTCAAAAAATAATGAACTACTGTAATGAACGCAGAG-CGAATAAATGTTTGTGCTAT--TTTGTAACGAAAACGAAAGATAAATG-TCACCAAGTGTTCTGTTATTTAAAAATTAAATATTTACTTTTGAAATGCTTTAAAAAA---AATTTTTGCTCACGTTCTTAAATTCTT-------------AAATTAAATTTCGTA-----CAACTTTTAAACTT----TTAACAGCAGAAAACTTCGA-------------AAACGTTAAAAGAAAAATGAAGAATACAGTAGCA
TTTTTTTTTTTACATGTATGCCTTC-----CTTTCCAAATATTAACGCCACCACTCGAACAGCACAATTACGATCT----TTCCAAGCCCAAAGTCGATTAGAGTTTTGTGCTATATTTTGTAAAGGATTTTCCATTTGTGTGCTCGCTTCATTTTCTCATTTACATACTTTTAGTTCATTCTTTTTTAAT--TTTAAATATTATAATTGTTCCTCACGCTCTGTTATTTTTGCTCTCATGTATTAAACGAAATTTTTAATGTGTCTATTTCTAAGTTGAAAACCAGCAAGAGAATCTTTGGAGCGCAACAAAACGAAACGAAACAAGAAAAGTAAAAAAAAAAAAAACA
>Map205 27882314 27883043|28310 chr3R 27882951 27884412 scaffold_20 2393181 2394793 + 7264|0 126
TATGTATCCTAAATTCCAG-----------------ATCACACA--------AACCTAAAATTACTTTATTAATACTGAAAACATATTGAGAAAAAGTGTTT---------AAAACGAACAGAAAAA
GCGGGCACCAAAACTGCAGCCGAAGATGAGTTGATGATCATATATGGAGAAAAATAAATAACTACTTTACTAATATTATAAACATATTATGAAAAAGTATTTTGCGCATGAAAAGCGAACTGCGAAA
>SP71 86883 87173|83 chrX 84464 87026 scaffold_28 1330336 1332957 + 134908|2487 2666
GTTGAAG---------------------------------GATCAAGAAAAAGTAGGAAAAAAAAGAAAGAAAACAAAAAGAAAGTACACAACACGA--TTGTCACC-ACATACGCTCCCTCCGTTCTCTCCGACACACACACACACACACACACATATTTCAATGTCTTTGGCGCACAC
GTTTAGGCGCACACAACACTGAAAAAAAAAACAATAACAAAATGAAAACAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGGAAAACAAAAACCATACACAACACAAATTTGTCACCAACACAGACACCCACGCATACATCCATAATACACCCACACACACACACA---------------GGCACACAC
>SP71 86883 87173|84 chrX 87027 87722 scaffold_28 1333196 1334119 + 13899|0 187
GCAAATTACTGACAAACGTATAATTTTTGTTTTTTTTTTTTCGATATTCATATAAATTATTAAATTAAAATACAATTTATTTTTTAATATTTATTTAGACTTAAAGCATAAAATA-------------------------------------TAA----AATTCTTAGAGAGCAAAGAAAAGAAAAAA
GCAGCTGCCTGACAAGCGTATATTTTTTGTTTTTTTTTTTTTTTTA-----ATTAATTACTATAT----ATACAATTTATTTATTTATATTTATTTAGATTTAGAGCGTGAGTTAATTCCAGCAATTGGTTTGGCGATGCGTTCGCCTGCCCTAAGCCTATTTTTTTATAAACAAAAAAAAAAAAAAC
>CG2995 110084 110847|93 chrX 110183 110961 scaffold_2 6179308 6180054 + 132|0 696
ATAAAATCGCAGCAACCCCAA--ATTCGATAACAATATTTGTAATATAAACATTGAATCGTTATCGAAGCCCGGTCGGCTTTCTTTCTTTTTTGACTGCCAAATGTTTCGTGGTTAACCACTTTTTATCTATTTTTACGTATACAAATAGTGTTTGTTTATTATTAATTTTGTTTGATTTGTATTAATGTTTTACGCCTTATTAATAATGTTTTTATTCTTAGTACCTGTAAAAACAAATT---AGTTTATACTTTCT-GCGCGAAA---CAAACTAATGACATAAGAAGGGCATATCAAAATTGTTTCCCGATATTGTGGGTGTGCGTGTTTCCGGAACGTAAATGTTTTAAACTTAAAATTAGACTTGGACATTACCAGGCATAAAATAG-AATTGTAATGGAGGAAAGACCATCTAGTCATAAGAA-TGAAGGAGACAAAGTATTTCCA----TAGAAAAGAGAAAAA--AAATTTTTTTTAATAGAAGTA--GTCGGTTTTTTTTTTTAATTTGTATGAGCTCTGGAG-----CATACATATGTAAATACGTGATACGAAAAAGTAATACGTTTGATTTTACCGTTAACCATGA-AAATTAGACCGTTTAAATTGACCTGTAATGGGCAACTAAATGTTAC-------TCGCAACCAAAAGTAAAGGAGGAATTATTTAGCAAAAAAAAAAAA
ACAAAATAGAAAAAGTCGTAATAATAAAATGAAAATATTCATAA----ATTATTAAACTGATTGCAAA-----------TTTTCTTCATTTTTTTTTGCAAAAT-TAAGGAAGTACATGCTGTTCTGTACACTTTAACA-ATAAAAGACGTGTTTTTTTTTTTTTAATTTTGATTTACATTTCCTGTTGTTTTTTTATTTTTTGTTAATACTTACACTGTTCCAGCCAGTAAATGGTATCTCTGACCATATAGTAGCTAGCTCGATAGCTCAGATTAATGTCAAAAGTGGAAATTAGCGAAAGCGT-----GAAATCAAAGCCCTCCGTAGAGATGACATATAAAATGGTAATGCTTTTAATCTGTAATGAATACCATTAGGAATTGAGAAGTCGCTGGTTCAAAGCCAGCAGCATTTGTTACCAACAGCCCAAAGAAAAGAGGTATATCAAATGCGAGAAAAAAAAAAAACGAAATTGAAATGAAAACGAGCAACGCCGCTTAATTTCTTCTAGTTAACTATGTCTTTGAGCTTAACAAACCAATGCAAACGCG-----CTTATCAGAATCACGCCCAGTCGAACCGAGGCGCAGAACAGATAGGACTCCATAAACAGCATTTCGGCCAGGCACTGAGCATTTCGTCCTTGTCGCATTGCGAGGCGAACGCCAGGACGTTCAGCTGGCATATGAAA
>cin 115108 115292|95 chrX 114720 115340 scaffold_26 1489311 1490050 + 7727|405 707
GAACT-------------------------------------------------ACACAAACGTAAAATG---TAAAACAAAGGTATAAATTCCAGAAGTTGGACAGACATATATAGACA-GCACATATAT-----TATCTT----TATTTTTTTATGTATGATAACAT-------------TAAATATAACG--------TTCAACAAT-------------TACACCGTTAGCAGTGTGAGCAAA-----AACGATTAAAAAGTA-----------------AATATTATAAAAGCCCTCA
CTATTTGCTCCGCCCGGAAGCAGTTCCCAGCACACTCCAAAATAAAACAATAAAACACACACGCAACAAGGAACAAAACTAAAATGTAAA-CCAACAAGTATCATATATATATATATATATGTATATATATTCGTGTATATTCTGATATGTTTGTATGTATTATTGCATATATATATGTATATATATATAAAGAGATAAATCGCATTAATATATATATATATATACATATGCAAAAATATGCACAAATTGTCTACAAATCAAATGCAGCAAATTGTCAATTTACAACTTTATAAAAGAAAAGG
>CG12470 165618 165764|160 chrX 165033 165765 scaffold_10 3284790 3285528 + 33250|594 751
ATAGGTCCCATATGATTTCTAACAAAAGAGGGC------AACGCATACACAACGAGGATAATAC--TGGACGACAAGCTTTGC-TCTAAACATTTAACATATTTTGGCACAATCTTTATCAATAAA--TAATAATCTCTTTGAAAGCAACTAAAACAA
A-------------ATACACGGCAGAAGAAGACAAACTTAACGACTAC-TAACTATACTCATGCATTTGCCAACGGTCTTGATATTTTGGCACCTCCCGGAATCCGGCACAATCTCGGCTAACCAGATCAACGCTCTATTCTAAATCAAAAAAATTAA
>CG3777 206496 207026|218 chrX 206542 206845 scaffold_25 454051 454456 - 2568|0 420
GCCCAGATTTGCTGCAGCATACTCCTAGAGTTGGGCTGGGTGGCCCACACA----AGCGATAATAACATTTAACAATTGTT-----TGATATATGT--------ACTTTTTTT-----------TAAGTTTT------------------TTTCTCCTCGTACT-----------TGCCTTCCAAAAACTCG-TTAGCTTTGTACACATACGCC--TTTAATTAAAATACTGATAGA-----TGCGTACCACTTACGTC----ATTAGAAAAAGTCACCAAAAGGAAAAATATGGACGACACAAGAACGAGGAGA------------------------------------------------TCTAAGCCACTCGTAGACCACTAAGCACAAAATACCCGAAAAATATAACTGATATGAT
GCCTCCATTTGCTGC--TATTCTCCTAA--TTGGATGGTTCCGCCCATCCAGCCCAGCGATAATAATTTTTACGATTTGCTCTTCCTTGTAAATTTTGGGTTTTACTTTCTTTCTTATTTCTCATAAGTTTCGCAGCCCGCGCTACGCCCCCTTCCCCCCTACTCAATCTTTTTGTCTGTTCTTAAAACGCGATTAGCTTTTTACACATACAATAATTAAAATAAAATATTGAAATAATATTTAAGTCTCCCTTGCGAACAAAACAAAAAGAAGTCACCAAAACAAAAGAAAAAAAAAAAACAAAAAGGAGAAGAATATGCGAATAAATCGAAAAAGAGAAGAAAATCAATTTGTGAGCAAAAGCGAAGCCTTCTGTAGAACCCTAAGC-----------TGAGTATAAAAATGATATGAT
>CG3777 206496 207026|219 chrX 206912 207151 scaffold_25 454531 454832 - 1958|0 169
CGCGTGTGTAG-AAGATACACT------------------------------------TATTATATTTTTTTTCTGAGATACAATTATAAACACAAAAACGACTTTTAACTATA---TATTAAATAAAAACAAAAG---------------GAAAAACATAATAATTTAA
TGCGTGAATAGCAAGATTTATTATAAAATTCTTTCCTGTTTCTCTTTATCTCAAACACCATTCTTTTTTTTTTTTTTGATACAAT-ATAAACA----AACGACTTTTAATTATACGTTTTTAAATAAAAAAACAAAAAATAAGTAAAAACTAAAAAAGGGAATATTTCAA
>ac 227522 227813|246 chrX 226735 227823 scaffold_25 520252 521650 - 23502|991 1421
A---------AAAACAGATCAAATCT-------------------TCAGCTATTGCTAGTCGCACCCAACCATAACACACATCAAACCATTGATTGGCCAACAAGTATTACCTCAGCCAC---AAAGTATTTATATTCCCTAGAAC-----------------------------TACCTTTTTGCCTTATAAATTAGTATTTAAGG-----------------TTTTATATAGTTTCTAAGGATAGTT---TCTA----------------ATGGAAGACAATTTATATT---TAAGTTTTTTTTTATAGC----------------ATACATTGAGGACATTAAACTGATATATATAA--------AATTTTAA----------------ATGAGTTTTTATTGTAAACAAAATTAAACGGTAATTAAA
GTGCAGTCCCCAAGCCAATCCAACCCAACCGAAACCAATTCCAGGGCAGCCA--ACTAGTCAGACCCAAACGCAACACACGCC-----------TGGCCTCAAAGTATTACCTCAGCAAAAAGAAAGTATTTATTCTAGTTTAAGCGCATTTTTTTTCTACTCTCGTAATCCTATTATTTTTTTTTTGTACAAATTAGTTTTAAGAGCGCTGAATGTGCCTGCTTTTTATATAGTTTATAAGACTGCCTAAATCTAAGAACTAGCTAAGAACATGGAAGACAATTACTTTTAAACAACTTTTTTTTTTTAACAAAAAAAAAAACAATAAAACATGGAGGACACTAAACTGATAAATATAGTCAAAACTAATTTTAAAAACAAATCAACAAACATATTTTATTATTGGAAGAAAACGAAAATGGGAATTGCG
>sc 254037 254303|292 chrX 252840 254332 scaffold_25 569632 571264 - 38252|1353 1655
CTTAATCCCCAAA------------------------ATTTACCACCACGCC--CTATTTTC-TTCTAGTCA----ATGTTGAGTTGAACCAAGTGCCTCAAATTGTAAATAACACTAATACAAAAACAACATACCCCCAATTTTTTTTTCTTACTTTAAGCTATTTTTTTACATTGTTAAGAACCA---CGAGACCAGTTTCAAATTTATATATTTATGAAATAACTATAGCATGGAAACGAAAACATATTTTTTTGCTAATACAATTTTATGTT--AATTAGTTTTTGGTGGAAAAATAAA
--GGCCCCCCAAAAAAACACATAAAAAAAAAACAAACATCAATCATAATTCCTGCTGTTTGCTTTCTAGTCAAAATATTTTGAGTTGAACCAAGTGCCTCAAATTGTAAATAGACTCAGTTTCTAGCCTTAAAA----CAATTTTTTTTTTGCACTCTAAATATTAATTAAATATTTTTAAAAATTATTTTAATACTTTTTTTTTGTCTAAGAATTTATTATTTTTTTTTTTTGCATAATTTAAGTGAATTTTTTTTTTTAGTTTAAGTTGAACTTGAGACCAGTTTATAATATATAAAAAAT
>l(1)sc 267392 267641|311 chrX 265991 267664 scaffold_25 592211 594027 - 33816|1606 1932
AGGGGTCTTACTAAAAGTCCCAAACAAACAAATATTGTACAAACTGTAAATACCC------------------------------------------TAAATTGTTGCCTTAGTGAGTGTA--------------AAACCAAGTCTCAAATTTCACATTAGCCTCTAAGTT---ACCCCATATTTTTTTTTATTATATTTTAACGCAATGGAAG----------------ACATATTTTTTTCATAGTTATAAG--TTTGTTATAAGCATGGAAGACACTAAACTAACTACTTTTAAGCCAAAATAAAAACATATTGATAAATTTAA
GCGAG----------ATGCGTGCAAAAACAAAGCCTGTACAAACTGTATATAACCAGCAAAAAACAAAACAAAACAAAACAAAAACAACAACAACAAAAAACTGTTGCCTTAGTGAAAACAAAAAACACAAAAACAAACCAAGTCCCAGATTCTAGA--AGTTTCCTAGTTTTAACAACAACTTTTTTTTTTTCATAGTTTAA--GCATGGAAGACAATGATATAAAACCACAATTTTTTTTCATAGTTTTAAGTTTTTGTTATAAGCATGGAAGACACTAAACTAGCTAAT---------AAGTATTATTATTATTATTATTATTA
>ase 319239 320008|382 chrX 319349 320161 scaffold_7 2734989 2735747 + 402|0 695
AAAGTTTTTTTTAATCAAGCCATGACTGAGTCATTGTGT----AAATATCAATTTAAGCCGAGAAAGGAGGA-TAACTTCGGCCAGCCGAAGCTTATATACCTTTGCTGTTAAAACCAT---GTATTTAATATGAAAGTTCGCACAATTTCGATGAAGTTTATCACAAATTTACGATTTCATCAAGATTTGTATATTCTCCAAATTCTATAAAATATATGTACATTTTTGATTCTTGCTATGGTACTTGTACGTATGATATTGTTGATCGATCCTGCCCGAGTCACCTTTTATATCACCAGACATGCCGATCATGAATATTTATTGA---TGTGGGGTCGGAAATGCCTCACTGCTACCTTCAGACAT-----------ATTATAATATCCTCTGAAAGAGTGTGACAAAATGAA---TGTATGAACACTACATATTTAAAGTCATCTAGTGATATAAACCAAATGGAAATAACCTTGTAAGACCCAACCACAAAATAGTTATCCTGATAAACGGCTTAATGTTGAGCCGGACTAACAGAGTGTCTAGTATATAACAAAAATTAATGTATTTGTGTAACCATATTT--------TTTTTTTATAGATTTAATTGTAGGAACGTTAAAATGACAAGCAGATAATATATGCTTTTGAATAAATGCAAATAAAT---ATGAACATTTCCAAAAACTTAA
AAAACTTTTTCTGACCAATTTCAATCTTAGATAATACCACCCAAAATAGTAATTAAA--CAAGAAAGAAGGGCTATCTTCGGCACTCCGAAGATTCAATACCCTTGCAAATTCAACCTTTTCATAATGGTCATGGAAACTTGC--------------GTGCAACAGAAAGATA-GACGTCAGCAGAGT----------------TTCATTAAGATAGCTTTAAAATTGAGAGACTAGTTCGCATAGAAACAGACAGACGGGTATGGGGAGAT------CGACTCGGCTGTTG-----------ATACTGATCAAGGATATATAAATACTTTATGAGATCGGAGATGT----CTGCTTCTATTACACATTTCACGACAAAATTATAATACACTCTGAAAGTTTATATAAAAAAGAAATCTGACCGATTCTTACACTTATAAAATT------------------------TATAACATTTT---GCTTATATAAAAGTCGGATTTTCTAACTAA----TAAATGTTGGGTTGG----TCAATATATCT-TTATAAATAAAAAAGTTTTCTTTCCCAGAACCTACGTTTCGGCCGAACTTTCCTATGG---CAATTATATAATAAGTAGATTGACAGACCGACAGAAAAT-TTTAAGACTGACACTGATTATATTGGCTGTAAATTGTTGAATAGATAT
>CG13373 334899 335005|398 chrX 334523 334929 scaffold_25 1370904 1371316 - 10464|388 425
---GGCTT----TACACAATCCAGCACTTATAAAGTCG
AAGGGCTCATCACACACACACACCCACCCATACACTCG
>CG13373 334899 335005|399 chrX 334996 335375 scaffold_25 1372892 1373312 - 7893|0 9
ACCAACCAGC
ACCATCCAGC
>CG32817 336916 336996|402 chrX 336849 336917 scaffold_25 1371212 1371280 - 2723|67 68
GG
AA
>CG3176 339404 339485|405 chrX 339337 339418 scaffold_25 1371212 1371298 - 2973|67 86
GG-----CATCAAACAATCA
AAGGGCTCATCACACACACA
>CG3156 347394 347556|413 chrX 345654 347445 scaffold_25 1379294 1381120 - 65680|1785 1841
AAGAGGG-----TGTGGAATTTAAGATAAGTTGGACTAAACGGCTTAGAAGTGGCCC
AACAAGGACCACTGGGGCAGCTAGGATTAGCT-TATAAGCCGGCTCGAATGCGGCTC
>CG3156 347394 347556|414 chrX 347462 347598 scaffold_35 1008195 1008329 - 1325|0 94
TGGACCAGCTAGTGCTATTGTTACCGGGATATGTGTTCATAAATCAAATGTTTTTAACTCTTTGTAAAATATACACCGTTGACCATAAAGGAACC
TAAACCAATTAAAG-TATTATCTTCAAGAT-TACTTTAATAAATCCCAGAATATTTATAGTACATGAAATGTTTCAATTTAATGATAATCCAACC
>CG17778 352627 353191|423 chrX 352782 353088 scaffold_23 401332 401641 - 804|0 317
ATCCTATACTTTATATACATGTATACACATTAAGAAAACCACACCCATTGTATGCGAATTAAGGTTTTTTTT----TGGTGTTTTATTCCAGTGATA-------GGCAGGAATAACGAAAACTCACTGCTCTAAGAACACAAAAACACAATGCTTAACACAGAGTAAACAACATTTACGATGATATGCGTTCTTTAGGACGAACCGGAATGTCTGAATGCACTTTTCCAAATTTTGCCTTAACATAATAGTATTTTGAGGTAGTTTTTGATACGACACGTTTTAAAAGATAATATATAACAGACCGTACATATTTAGG
ATCCTCTATCTTATATATATTCAGGTATCGTTCAAAAACAAGTCCTGCTTGACGAAAATTAAATCATTTTTTAACCTAATTGTTCTTTCTAATGATACGGCCCCCGCAAAAATGTCACACACATAC--ATAGACATACACATACACATATAGATATAGATATATATATATATATATACACATGTATGGGTTGAACAGGAGCAGCTCTTTGGCCGTAATCTACTTGGCC-TACTTGGGCTAAGTGCGCTTTTAGATAAAAGTCGCTGGCGAGGCGGCACG-----GCACGCATTACAGGCCAAAGCGTACATGTTCAGG
>svr 359794 361154|426 chrX 358803 360537 scaffold_28 1369674 1371503 + 41136|1024 1885
AGAGGGATG--------------CAACGGAAATACCTATATATATGCGCATATATATTATATTGGGCAGTTCCAAAATGCTATACATATATCCACATTTAGCGATGCATAGTATTCTCTGCTCTCCTGCC-----------------CTCTCCGCACTATC-CTTGTACTATATAT------------GTTATCTCCGCCATTCCCGAATCCAGATATACA-----ACCATTTTGCATGTTCATTTGCTCCCTCTCATTTAGA-ACCTTTATTTGTTTACCGCGAGAGCTAGCAGAAAATAAACAATGTTGGCTGTCGTGTGGATGAATTGGTTTGGTTTTGTCTC------GAATCTTTTGTACATACACTTTTTTAATTTATCTTTTAAAAACTTCTGTTTCATTTTTATGTTTTTTTCGCATTTTCATACGCTTATATGCCAGCCTATGTTCCTTCCACGCCATTACTTCAGACGCGCACATATTTAGTGGATGC---TTGATTTGTATATAGAGAACGTATTAAGAACAAACACGAAGAAATAGCAAACCAAATAACGAAATGAAATAAATTAAGGAAATAAGCGAATTGTAC------------------------TTAGGCAATATGCAG--AAATTGGCCCACTTATGGT---------CATCGAATG------ACACATTCCCAATACGAATCGGTTATAGCTTTATCAATATTCCCCTTATCTTCCGCACACCCTAAAACATATTGTCAAGTATTTTAG---------CAACGATGCAAAAAAACTATGATAAATCCAA------AGCCCACTACATGAACCTACTGC---TAAATATACTGTATACTAAATA
CATTAAATGCGGCCCCCCCTCCCCAACTGCAACTGCAACTGCAACGGCAATGGCAATGGCAATGGCAATGGCAACAATGAT-TCCACATCTTCTTACTGCATACTGCACCAGCTGCATCGGTCAATTGCCTAACACTAGTTGAAGCATTGTTAACACTAACATTTGTAACATTTGTCACGCCCACAAACTAATGCACGCCCATCGCACACACACACACACATAGACACCGTCTAACACACACATT-------TTTCTTTTGTATATTTTTATTTTTTT---------TTTTGCTGCATTTACATAAAGTTATCGTCTTTGTTTTTGATTTCGCTTACATTTTTTTCATTTCAATATCTTATTTTCATTCAATTTT----TGTCTCTTTTATCTACTGCCA-GCCGCGTTTAAGTTCTCTTAAA-----CACACGCTC-TCTCCCACGCTCTCTCCCTCTCTCTCTCTCTCTC--------TTCCTTTTTATTGAGTGCATATCAATTTGTTGACAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGGGAGAGGGACAACAATATTTGATTTGTATATATGAATAGGATATGACAACCCCCCTACCCCCCGCCCCCTTCCCCTCCTTCAGCCCGCCTGCAATCAAACGAGCCATAAAATGGCCAGAACGCACACCGAATACCCTGCCCACACTCTCAATCATAATTATATATATATATATATATGT-----ATATCTGTCT-----------ATATATTATCATATTATTTAGAAGCAAGTAAAACCATGTGTAAAAATTAT-ATAAACCCAACTAAATATCTAACCAAAATAACCTTATATACATAAACATA-TAAACCCTAAATA
>svr 364700 365902|428 chrX 363078 365930 scaffold_28 1375130 1378022 + 62564|1650 3035
CCATACAGCCGTACTTTGATGAGGAGCAGCTGGAGCGGATCCTGCACACGGATGACGATGACGACGAC--------------------------------GGACCGCACAT-------------------GGAGCCAGAACTTGATGTGGCTGACGATAGCGAAGACGACATAGTGATGTTGCATAACAACGGGAACAAGAGACGGCACTAGATGTTCTGATAGATGTTCCCAATCAAACACAATCTCGAGTGACACAACCACCAGGGATCACCTAATCCCCGATCGACTTTAACCACACACAACATAACTGTGATTCAAAACGTTTTCAAGAGAAACCAACGCTCTCCTTT---TTTGTTATTTTTGTGTAATATCTACCCTTAAAAGGTGAAACACTTTATTTTTGAGTTTTAGTGTTACTGAGCTTGCACCTAGAATGCATCACAATCGTCAGCTTTAAATAGAAAATCCTACTACCCACTCGGCAAATCTCTCGTTCATGACCGTTTATATAGAGATATACATTTTTATGTTCAGCCAAAAGAACTGTATGCGTAAATGTAACT--TAAACTAAAGACTGAGAGCCTCATAATTCTAGCAAAAAAAAAACCATAACAATTTGTGAAAAAATAT-TAAATCTA-ATCTAGCTAAAAA------------------------------------------GAAACCGAAAATCACAGCCAACAACAGCAGAA--GATTGAGTTTGTTTTAATGAAAAAATTAACTAACAATGAATCAAAAACAATGTCAATATTAAATTATACTAATTTATTAAGCATTGTCTTCAGAA--------------------AGCTAAATTAC------TTAGCAGC----TCATTATACAGAAAATTGATTCTTAAAGATTAATTTTAAGCTTACTGTTTTACAATTTATTAAACCATATTTAGTAGCTTTTATCGGAAATTGAATGGTTACTCCCATGAACTCTAACCCTCTGTATGCTGAAATCAGGCTTTCTAAAAATGATTTTAAATGCTGGAAAA----------AAATGTGCAAGATCATAACAAAAACAGTTAACAGCTTTTGTA---ATATTTTGAATATGCCCA-ACATATAAAATTCAAACGTAAAATCAAATCGATTTACATAAACAATGAATACATATAAAAGTGTACTGCACGATTTTA-------TCTAAATAGAGCACAAAAAGACA---AAGCGGTAGAAAATAACTTGAAAGTAA-----------AATAA-TATATATATCATATACATATATATATATCATATACATATCCTAATATATGG---------CAATTTAAACTAAGTAAGCAACTGAATCTAA------ATAAAAAAAA
CCATACAGCCCTACTTCGATGAGGAGCAGCTGGAGCATATACTGCACACGGATGATGACGATGACGACGATGAGGATGTGGTTGGCGTTGGGATTGGGGTGGAGCGCGAGCGGGAGCGGGAGCGGGAACAGGAGCCGCAGCTGGATGCGGCCGATGAGAGCGGCGATGAGATTGTCATGTTGCATCAACAC---AATCGGCGCAGGCAATAGA------AAGGGACAGCAACACACACACACAC---------ACACACACAC-----------------------------ACACACACACAACATAACTGTGATTCAAAA-GTTTTCA--AAAATCAAGCGCTCTACGATAAACTAAATATTTTTTTTTAATTTGTA---------------------TATTTTT---TTTTTGTCAATTTAATCATGTACATACA------CACA----------------------------CACACACACA--------------CACACATATATATATATATATATATATATATATATATAGAC-ATATAGCTATATCCATATCGACATCCGATGTCTTGCCGTTAAATTGCCGCGAATCTCTGCATAAACAAAAACCTTAAAAAAGTCTAATAAGAAATATATATATATATATATATATATATGTGTGTGTGTGTATATTTATATGCATGTATGTGTGCTGTCCGGTGTTGCCAAT-GCAGCCGTTTTCCGCTAAACGGATTTAGCGTATTTTGACG--ACAATCAACAAACTTTGC-------------TCAAATTCGAATTAAGCTATTTTATATATTTTTTTTTTCAAAGCCCTTTTCAACACTGGCTTTAGCTACCTTTTTTTTTGTTGGCAACACTGGCGCTGTCCAAGAACCTAACTGT----AACTAATCTTAAGACTGA-GCTCCAGCAAATAGAAAATCAAAACAAAAAGC---AAAGAAGAAGAAGAAAGTTAAACACACACACACACACACAC---ATACAGCAAGAATGTGTACT-TAAGCAATTGAAAACTTTGAAAAAATAACATTCCACATGCCCGGCCTTACAATAATACCAGACCAAAATCCTTATATCTATATATATAATATATATATATATATAGAAT--AAAAATAAAGCATATCCAATTTAC--CAGCTGGCAATATATATAATTATAAATGAAACATTTTTAACATATTTCTAACGAACATTCAATCAAATGTGCAGGCTTTTGATATTATACAGAGCGTAAGCGCCCGATTGAATAACTATATATAT-ATATATATATGCATATATC-TATAGCTATAAGAATGCACGATTTGAATACCAATTTATATATATTTCGCACTTTATGCTTATGAATTATATTCGAAA
>arg 384741 384859|453 chrX 384373 385339 scaffold_28 1402567 1403635 + 36742|374 594
AGAATGCAACACCCCCAGTTTTGAA-------------CTTATTCATATTTATGTA--------------------CAGCATTCGTG------------------------ACATATTAGTGTGTG-----------TTTTTTTTTCGTATCTTAATG-------------------AGAGAA---------------TACAATATTTGCGTAAAAAAGAA
TGATCGCAATGTGCATAAATCTAAATGTTTATATATATCTCATATATATATATGTATATGTATATATATATATATGTAACATTTATGTATATTTTGTATGTACAGGTCTTTGCATATTTGCGTGTGTGTGTTGTTTTTTTTTTTTTTTTGGCTTAATATTATTAATTATGTTTAAACAGCAAATGGATAAATTTAATTTATAGCATTATAATAAAAAAGAA
>Appl 432400 434960|497 chrX 432255 432769 scaffold_10 3529735 3530258 + 12852|162 557
GCGAGATG-GCAAGATGGCAGCATGGGCGCGGCTGGCAAGAGCGAGCGAGTGGCACACATCAACAACAACAGTAAACGCAACTGCAGCCACC--------GCGATTTCAAAATGGAAAAACTTAAGCGTATTATTAAAGCAGATGGGAAGAGAAATGATTTTTTTTCGTGAAATGAGCGCAGTTTCAATAAGAAAGAA------------TGAAAGGGTAGAAG--AAGAAAGATAAATTCAATAAATGGTAATATATCTATATATTAAATTAAAGCAAGCAGAAAGGCAACAATATAAAGCAAGCAATTAAATTTAAGTATTTGAATGTTTAACAAAACGCCGTAA---ACATCCTTTCCAGCTCTCTCTTTCTCTTCCCCTGTCTCTGTCTCTG
GCAAGAAGAGAAAAATAATAATAAAAAT-------AAAAAAGAATACAATAATAACGCGACAACAACAACA--------AAATGCATGCACCTAAAAAAGGCAACAACAATCAGCAAAAAGCATGGCACATCACTAAAAAAAAAAAACAAACAAACAAAAATT-------AAATGATATTAATATAAACAAAATAAAAATTTTTTTTTGTCTAAAGGACCGCAGTTCCGCAATGTACGTGAAAT-----GTAATGCATCTATATATTAAATTAA-------TGAAAGGCAGAAATATAATGCAAGCAATTAAATTTAAGTATTTAAATGTTTAACAAAATGCAGTAAAACAAAAAAAAAACATCTCTCTCTAGCTCTTTCCCTTTCTCACATTCTG
>Appl 432400 434960|498 chrX 432957 433932 scaffold_10 3530687 3531622 + 7043|0 1105
GAGCAAAACAAAAGATATTCCTAGTAAATAAATTGTCGA-CACACACATCACATCCACATTCAAACACCGAGTCACCCGCAGAACAGTCACACCCACACTCACACATACA-----GTGTCA-GGAATGCGCAAAAAAGACACAAACGCATTCATGCCTGCTTCGTAGCATATTTTTGAGCGTTTCGTGGCATTAGAAC------GCTTGCAAGCCGATCGCAATTCTTACCAAAAACCTACGC-CATTAATTAGAGCGGCAGCGAGAGCTAAAAGATAAGAGCAGGAGGCAGAAACACCAACACACAGACACGGAATCTCGCACA-----------CTGAGACACTTGTGAACCTAAGAGCTACCTACGCGTACTAATCCCTATACGATCGTGCATATGCGCTTGTGTATATGTCGA-----------ACTTTCTCTCTCTGTAAGC-----------------------CACACACACTCAC-----CAG--------------AGAAGGGAATAGAACACACAAAC--------------------------CATACACAAACCACACACGCATACACGCA-----AAATATATACAAAATATTTACAGCAAAGCCAGAA----------------GAAATGTCCATAAATGTATTTATGTATCTATACACGAGCCACACAAAGCAAAGGTCGAAGGTCAGCCAGCTAGGGAAGAATGACGACGCTTGGCGGGCTTTGAATAT-AATATACGAATCAGCTATGTAACAGAAACAATGCAAAACGCTAAGCTAATTGCAGACAGAAACAAAAGAAGGAAAACCAAATATTAAAATGAAAGCGAACAAATTTTAGAACTTTTTCTGCATATTTTGTGTGTAAGTCGATGGTCGAACAAAAACAACAAGAACAAAAAGAATTTCTCTCTTTTTTACGTACATTTTCACCGAAAAGACAGCACAAAACAAGACAGCAGTTACAACTCACAACTCACAGCTCACACCCACACAGCACACACACACACACACACACG----CTGCACACACACACACACACACACACTGAACGGAGCCCTTGAGCCAAGTAGAGTTGAGTTGTTGCATTT
GAATAATATGAAATATATTCCTAGTCAATAAATTGTCAAACACCCTCACCGCG--CACGCTCACAC-------CAACAAAAGCACACACACATACACAGT-ACACAGGCAACAAAGTGTTGCATACTTTGCAGCAAAGA---AAACGAACT------------ATACAAAATTATTGAGCATAGCAAAAGCTAAAACCTGCGCAGCATGCAAATTAGTAG------TTGCTAAAAATTTAAATGCATTAAGCAAAAGCAAAGCGAATAC-GTAAGCAAACAACAAAACACACACATAAACACACATAAGCATATACACACTTGCAAAACAGAGCGACACAGACACATGTGAACCTAAGAGCTACCTACGCGTACTAATCTCTATATGAACATATATATAAATATATATCTATATATATATACATATACATTTACTTTATATGTATGTACATATATATATGTATTTAAGCATATATATACTCACATATACAGCTATATAAATGGTAAAAGGCAAATTATATATACATATATATAATAAATATGTATATGTATATATATACACTATATATATATGTATACATATATATATATATATATACAATATATTTAAAGAAAAACAAAAACGCAAAACGCAAACGCAAAATGTCCATAAATGTATTTATGTATCTATACACAACACCCAGAAAATAAATAAATATATAAAAGAATTAAATGAAGAAAAAACTCAGCTATTAAGCCAAGCAAATAAATTTAACAAGCAACAAATTATGCAACAAAATGCAAAACTCATAAC-------------------AAAAAGCAAAGCTAATTGCAAAAGCT-----------CTTTTAGAACATTTTCTCCAGATTTT---TGTAACTGGCT-------------------------------TTTGTTTCTTT-------------------------CAGCACA-------------------------------------------------CACACACACACACACACTCACGGCACCTCCACACACACCCGCACCAACACACAGACATGTGGATTTGGCGCATGCAGCTTGAATTTGGTATGTTT
>Appl 432400 434960|499 chrX 434079 434184 scaffold_10 3531913 3532022 + 3278|0 110
AGGCCCAGAGATAAACCAATTTGAAACGGCTAGTTCA-TTTCACGGCTCGATTGCTTGGCAAATATTTGGCCTGTTTTG--TTCGAGCATCGAGATAC--TGTTACTCAAT
AGGGTTACAGATAAACCGACA-GAAATTGCTAGTTTAATTTTTCAGCTCGATTGCTTGGCAAATATTGGACAAGTGCCGAATGCTTGATTCGAGACGCTTTGTTATTTAAT
>Appl 432400 434960|500 chrX 434203 434752 scaffold_4 2633445 2633990 + -992|0 591
TGCTTTCCCCGCTGAAAGCCGACAAGTGGCTGCCCTTCTCAGTTCGTTTTCCATTTACGATTTACGTTTAATTTCCATTGCCAAATTGGCCATTTTCTTGGTGTGACTCACTTCGGCTGAGATTAAGTGAAAGCACACACTAACACATCACAGCTGAAATTCATGTTCAGATCAAA--------------GCTAAATCAAAAGTGCAGCGAAAGTCGATATTTTTCAAATGT-----ACAAAAACAAAACTGGAAACTGAGAAAACAACACCTAAATTCAAACCA-AAATATTTGCTGTACCTCAAAATATATATATTCTGTTTCATACATTAATTTGTGACTAGCCAGCTTTCGATCGGTTTAAGCTTAGGCATTATTCGTGGCCCCATT--------TTCAGCATAAGTTCTCATTCGAATTAAACTAAATTGTATTGGCAATTGGCAATTGGCAATTTGAACGGCATGAATCTTGGGATTGTTTAGATCACTTG----GCTCTATTGAAAAGATCCGGGCTAAGATTGTTACCACGTTT------TAAA----AGCATGGCAATCAAGGCAAATCAACGGCGCTCCGCG
TCCTTTCTTTGTTGGCAGCAAACAAATTGTTGT-------------TTTATAATTTAGGATTCAATCTTATCATATATGAT--AATTACAAATTTATAGTATATGAAAAATAT--GTTGAGTTAAACTAAAATTAAATATCTAAATATTTAATATAACAATAA-ATTTATATTAAATTACTGTTTTTCCTGCTAATGCAA--GTAAAAGTAAAGCCGGTTAACGCGAAATGTCAGCTAGAAAAGTAAAACTG---ACTTATTAATTAGAG---AAATGCTAACCGGAAACATTGGATAATCTGCATAAAATAAACACTGCTACTTGTACATTCATATCTATTGATATGGCATGTATCTGAATATAACTGA----TTGATCGCAGCTGAATCAGAACAAACTCAAGAGAGTTTCCTGTTTTGGGCAGACT----------GGCAATTGACAATTGGCGATTGGCAATACATGAACTTTTACTTAGTCATGGCTATGGGAGCTGCACAATTGTCGCAATCTGGTCCAACTTTG---CCATATTTGTATGCTAAATTTGAATATTGCA--CAAAGCCCACACACAGCAA-CTGTC
>Appl 432400 434960|501 chrX 434753 435912 scaffold_10 3532880 3533996 + 34670|0 212
ACACACACATAAACAGACGCGTTATAT-AATGTATTACAA-ACATATATATATTTCAAGAGGAAAACCCAAATGGCAAATCAACTACACAAAAAGCAAATAAGAAGAAATCTTACTAGTCAAAGCTTGAATATTTTTTATTTTATTCATTAATGCAACAAGAACAACAACAAAAATGAAAAAA-GTATACATATATATAA--ATAAAAAAAAA
ACGCGCACATACACGGACACATGGCATTAGAGTATTACAAGAAAAATATATATTTCAAGA---------------CACACTCACAGGAAAAAATAAATATAAAAGAAAATCTAACTAGTCAAAGCTTGAATATTTTTTAATTTATTCATTAATATT-------------TAAAAATGACAAAATATATACATATATATAAGAATGCGAGAATG
>vnd 454133 454643|523 chrX 452708 455050 scaffold_10 3560146 3562782 + 44966|1574 2280
TATTGCTAG------------GAACTGGCATTCACGGGACTGGGGGCGGATAGGTGGATAGTCAGGCCCGTG--GAGCGATGAGCCAGAAGACCACGCCTC------------------CAGATT----CCCAGTGAAGCCAAGTAAAAGAATATACAATAATAATTGA------AACACATACAAA-----CCCCTACTAGC-----GCTCAGTCTCCCGGACTT---ATCCTTGAGTCGTTTCTGTACATAG------TTCATATATATAATCATATATATACCTAAATGACATAAATTTATCCATTCCTGGATATCAGACCAATGCCCATGACA-AAAGAAAGCTAC-------ATTTCCTTCTAAATAAAAATCAAT-TTGCATAATACTAGTGT-CTCTTGTCAAGCGCAT--------------TTAAGTCG---------CATAAAATTT----------------------------------AGAAGTAGATTCATTTTTTTTATTTTTTTTTTTTAGCCCTAAGTC--CAATCCC----AAAGATAAAATGTGTAAATA--------------TAATATAAAAATGAAGTAAATCTG-------------------------AAAAATAGATTATTTC-----------------AAAAGAGAAATAAAT------AATAGGAAATATGCAACTAAA
TATTGCTAGCTGCCTAGATTCGAGTTGGCAGAGCCGG--CTGGGAGCGGCCAGATGACTGGTAACTCGAATACTGGACAATAAACTCGCTGTCAAAGTCGCAGCTGTGTGACTCTGCCACAAATTGTGGCACATTTCGGTTGGGAATTCGAACAAACAAACAAAATTGGTGCAATAATATATAACAATGGGTCGACAACAAGCAATTGACGCACTCTCCTCTACTCCAACTCCCCGTCTCCCCTCTCAAAAAAATAAAATTTAAAAAAAGCAAGCAAAAAAAAGCGGAA--GGCGTCAGCTGCCACAAGCTTG--TGGCAAGGCCAAGCCGGGAGCAGAAAGTGCTCTACTTGAAGAATTCTTCGCCAAGCAAAAGTTGTTGTTGCATGTTGCATGTGCAATAATGTCAACAACATATATCATTCGTGTAATAAATCGCTATAAATACAAAAAATTTTTTTTTCCTGCAGCTCTAAAGCTGCAGGCCATTTAGCAATAAGTTTTTTTTTTACCTTTTTTTTTTTTAACAA-AAGTCGTTAATACCTATAAAATACTAGATATATAGACAAGTTTTTTTTTCGCCTAGACCTAAATAAATTAAATCTTATTTTTATTCAAATATAAAATATACAAAAATTTATAAATTCGTTTTGTACATACTGAAAAGAGGGAAATAAATTCATGAAAATGACATTATATATATATA
>mod(r) 479450 479869|550 chrX 478761 479450 scaffold_10 2602468 2603136 + 27733|692 692
G
G
>mod(r) 479450 479869|551 chrX 479782 480045 scaffold_41 747664 747920 + 1197|0 91
CCTATTTACTTTTTTTCCTTTTGGTTAATCGTGAGCCCCATCCATATATTCTCTCCATATA-TACATA---TATATTAAAAAAAAACTATGC
CCTAGTTCTTTTTTTTTTTTTCTTGCCATTGCAGAGCGTATCAGCATATTTTTTTTAGAAAATACGTAACACATTTGAAAAATCCATGACAT
>CG13369 481541 481586|553 chrX 480514 481543 scaffold_36 891185 892301 - 33524|1117 1119
AGG
GAG
>CG13369 481541 481586|554 chrX 481556 481630 scaffold_36 892595 892670 - 1850|0 32
AGAATGCAACGCAACAATAA--ATCTCTATCCT
AGAATG-AATGCGGCATTTGTTGTTTTTATGAC
>l(1)1Bi 490290 490454|563 chrX 490392 490667 scaffold_67 194404 194690 - 2989|0 72
TGACGAAAAG----------TACTAAATTAGTATTGAAGTCATTGAAAAAATAGCAAAAGTACACTAAACTTT
TGACAAAAAGCGTAACTACTTGTCAAATTAACATGAATTTTA------AGACAATGGAAATTAATTTATATTG
>CG13367 503020 503207|578 chrX 502016 503196 scaffold_25 993782 994914 + 30658|1030 1213
CAGAAGAGGTGGCTCAAGGGCAGGATGGC-------CGGAGCCCTGAATTTGAAAAATCTAATTTATTGCAACTTTTACTCTTCGTAAACGGGCTACTTGCCGAACAGAAAATAATTCAAAAAGTACTTGATGTACTGTAGTACCAACTGAACTCAATCAGCAATTAATGAATAAAATACAATT
CGCGACAGGGAACGGGAACGCAAGGCGGCTGCCTAGCAGAGGCCTAGGCTTAGGAGG----------CGCAACCTTAAACCT-------AGGCTTACTTTTTAGATGGCAAC------------AGCTTAATTTATTGAAGTATGCGTTTAGCAC-ATAAGAAACTGATAAAAACACAAAAACT
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---GCGGCACTCC
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CGCT
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TGTAGAGAGTATGAAGGAATGAA-AATGCATGCATGATTAATGAAAATCTTAAAACTTCT
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GTTTAGTAATTGTATTTAGTAGGTATATTAGTTAATTGGACATATCTAAAGTTATATACACATATTTATACATTAAGATTCAGGAGTTGAACTAGCTTTTAAGGGAGAACAAAAATTACGAGATGCCATAAACGAACTAACCGATCGGTCGATCGGTGGATCGGTGGATCGATCGATCCATTCAGTTTAGATATTGCGAAAATGCCGTATAGCCAAATCCACGGGCAAATCGAAATCAAACTTGGACAGCGCATCAATAGAGCGCAGCGAGTCGCGGAATCCCGTGCACGCCACATAGCTATTGGACGTATAGTATGTATCAATAAGCTCGTTGCAGCTGAGTATCAGATTAAGCCACTCCACCAGAAGATGTGCGCTGC---GAACAAGAAACATAGATTATGAACTAATTTCAATAGAAGTGCATAAGTTAACTGCTTAAGCAAGGGGTTGGGTTCTGGGCGGGAGTGTCCGTCCGCATGTTATCCTGCACATGATTTCAAGTTTTGCCTTAGCAACTAGATTTTTTGGTTTATTTAAGCTAACAGGGTTAGATATTGATACTTCTCGATCTCCACTAAATATCTGAAACATACCTG-ATCTAGCTACCAAATCCATATATATACATATACATATATATATATATTGCCCGCACTACCATATAAATATATGTATATATATATATCGATTACCCAGAAATTGGGTTGTTATCGA--TTATTACACCTACACTTTATCTGCATTCCAAATTTATCTACATTCAAATTAGGTATCTATTTAATTGATTATGTTAAAAACATATTAATTCTAAGTTTTAAGCAACCCAGCGCTTATGTGCTGC--GATATATAAGCCTC
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AAGTT
AAGTT
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GGTAAACACATGTATTGTATATTTAA------AGTCTGCTTTACACAATTTCAAATCGAATGCAACAA
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C---TGAGGGAATGTTGTGAG--------ATTTAGTTGAAATGTAACTGTG--AATTAAATGGTTTTTTTTT-------------------------ACAC
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CGCCCCCCAAAATTGCCACACCCACTGACAATGCTTCTCCCTCCTCTCTGTTTATATTTCTCTGCTTGCTTTCTTTCGGCTCCGCAAACACCATTGCCATTGCGATTACCGTGACC
CGCCACGCGAAGTATGCGCACACGCTCATAACCATTGGCATTGCGGTAAATGCAGATTTCTTTGGCCTGAGGCGGCCAGTGACGCACACACTGCTGCGATTGCAGCAGCTGCAGCT
>su(w[a]) 898463 900242|1037 chrX 899077 901928 scaffold_19 1161573 1164480 - 59311|0 1314
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ACAGATATGACGTGCGTGGAGCGCTGTGCGAACTTTCCACCTATGAGGCACCACCTGGTGGCTATGGAAATCGTCTTGAATATCTCAGCGCCGAGGAGCAGCGGGCGGAGCAGCTGTGCGAAGAGGAGCGCTATCTGTTCCTATACAATAACGAAGAAGAGCTACGGCTGCAGCAAGGTAAGTGCAGTTGCCGGCATGCCGTAT-------------GCACCG-------------------CCTACTCAATGC--GAATTGTATGTACTACTATTTAAATTCTAAGTGCCAAGAAATACCGATTT------CATAATGAAAAATCAAGCTCAAATT-----GAACAAAAAC----AAATCTA---AATATCAA---------GGCCAA----TATTCAAGACAAATTATTAACGAGAACAGA---AACAAGAATACAAGAAACAAG---CACAAATAGAAGCGTAGAAATCAAGTCAAATGCAAGTAGCAGCAAACAAAAAAAAAAAACAAATACAAA--AAAAACCAAAAAAACCACAAATAAGATCAAAAACCAACCAAA---AGCCAAACCAACAACAGCAGCAACAACAACAATGATAATGAACGTAAGTTTCATCCAATGCCTTGTGGTGGGTGCCGCCGTGGTTCAGGTAAATAACAACCACTTGACATTTAACAAATTCAACAATTTTTTGCAGATGCTGCT-GCTGCGGCACTTTGGGGAGTCCTTGCTCTCTGTAACTCTTCCAAAAAAAATCTCTTGAAGACTGCACATAGAACTGAGCTCCAGCGAAAGTTAAAAATGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAAACAGAAATTGAAGCTTTTAACAAACCAAAACC-----CAATGTC-------AAGAATATTTATTCTACGATCTTTAATGTGCATTCCTTTTGTGTGCCGTG--CGGCATTTGTTGCTGTTGTT----------TTTTGTACTAAAGTCGCGC-----CGTTTGTCTTGTTCTCTTATTTTTGCCAACACTACATACGCACATACTTTCACACACCCACACACACACACTCACACGCACACGCACACGCACATATATAAACGTACAGAGGAGGATCTGAAGCGTCTGCAACAGGAGACATCCGGTGGCAACTATAGCCAAGTAGATTTCCAATACGATGGCCAATCAACATGTGGTTCATCTGGTGCAGATGCTGCCACCTCACCAACGTCAGAATCATCGACGCTGGCCGAGGAATCGGAGCTACCCTATACACTGCCACCCAGTCTTCTCGTGGCGCCCGCACCGGGCATGCAGTTG
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CCCGAAACGATGAAGCAGCACGCTATCATAGAGAAGACTGCTCGCTTTATCGCAACCCAGGGCGCCCAAATGGAAATTCTTATCAAGGCAAAGCAGGCGAACAACACGCAGTTCGATTTCCTGACCCAAGGTGGACATCTGCAGCCTTACTACCGTCACCTTTTGGCTGCTATCAAGGCGGCCAAGTTCCCGCCCGCACCACAAACTCCGTTGGATCAGCAGAATACAGACAAGGAAGCACCCTCAGCGGACGACCACAGCGAGGAAGTCGCGGGTGGAAGGAG---GAACCCCAACCAAGTGGTCATCACGGTGCCCACCATCAAGTACAAGCCCTCGGCCAACTGCGCCTACACCCAGCTAATTAGCAAGATCAAGGGCGTGCCCCTCCAAGCGGTCTTGCAGGAGGACGAGTCAAGCAATCCGGGCAACTCGCAGCACTCGGGCGGCACGGCCTCGCCCGCACTTAGCTGTCGATCCGAAGGTCA-----------------------CAACAGCCAGGGAGGTGAGTTCACACCCGTATTGCTGCAGTACAACGGGAGCACCTTCACACACGAGGAGGAATCGTCGAACCGGGAGCAGCAGGATGATAACGATGTCAACGGTGGCGAGCCGCCCCAGGTGGAGCTGCTTAAGAACACGAGTGCGCTGGCGTTGGCCCAAAACTATAGTTCAGAAAGTGAGGAGGAGGAAGATCAAGTT--------CAGCCAGAAAAGGAAGAGGAAAAG
CCGGAGACAATGAAGCAGCATGCAATTATTGAAAAGACGGCACGTTTCATTGCCACCCAGGGCGCCCAGATGGAGATCCTTATCAAAGCCAAGCAAGCCAACAATGCACAGTTTGATTTTCTGTCGCAGGGCAGCCAGTTACAACCATATTATCGCCATCTGCTGTCCGCCATCAAGCAGGGCAAGTTTGCGGCCTCAGTGCCGGCGGCG-------------------ACAACGGACCAGGCCAATGTGACAG-----GCGAGAACAGCGCGTCTTCAAGCAGTCCGAAGCGGAGCCAGCAGATCATAACGGTGCCCACCATCAAGTACAAACCGTCGGCCAATTGCGCCTACACGCAGCTCATCAGCAAAATCAAAGGTGTTCCGCTGCAGACAGTATTGGACGATGA---------------GAACGCTTCACAGCATTCCGCCGGAACCGCCTCGCCCACGCCCAGCTGCAAGTCCGAGGGCCAGAGTCAAAGCAGCATTGCCGCCCCAGCATCCAA--CGGCGAGTTTACGCCCGTTCTGTTGCAGTACAATGGCAGCACATTTGCCCACGAGGCGGA---------------GGAGGACAACGCTAACGATGC------------ACCGCCTAAGGTTGAGCTATTAAAAAACACCAGTGCCCTGGCGCTTGCCCAAAATTATAGCTCCGATAGCGATGACGAGCAGGACGCGGACGATGACAACAGTCAACAACGGACCCA-AGAAG
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GCACCACCACCGCTTTTAACTTTTCCACTGCCCGAGGAGACGCTGCGCCACATTATCGACAAGACGGCCACGTATGTTATCAAGAACGGTCGCCAGTTTGAGGAGACGCTGCGCACCAAAAGCGTCGAACGTTTCAATTTTTTGCTGCCGGACCACAAATTCTATGCGTATTACATGTACAAAATAACCGGCGATGTGGACGCCGCTTCTAAGGAGGAGAAGACGCGCAAAGCGGCTGCCGTTGCCGCTGCACTGATAAGCAAAAAGGGTCTTGGTGGCGCTAATGCAACTGCTGCAGCTGGTGCAACTACAGCCAGCGCGTCTGAAAAGG
>su(w[a]) 901471 901722|1037 chrX 899077 901928 scaffold_19 1161573 1164480 - 59311|2607 2870
CTCCTGTAAGTTTCTCCATTCGGGCTCGCGATGACCAATGTCCATTGCAACACACTTTACCGCAGGAGGCCAGC---GACGAGGAGACTAGTTCGAATGCTGCTGGGGTGGAGCATGTGCGACCAGGTATGCCAGATAGTGTGCAACGGGCCATCAAACAGGTTGAGACGCAGTTGTTGGCCAGGACCGCCGGGCAGAA---------GGGAAACATCACGGCTTCCCCATCCTGTTCCTCACCACAAAAAGAGCAGCGGCAAG
CGCACGTGTGCTTCGCCATACGCGCACGCGATGAGAACGCGACGCTGCAACCGGCACTGCCACAGGAGGCCAGCGATGATGATGAGCTCAAGGCAAAATCAACT---GTAGAGCAAGCGCGTCCTGGCATGCCAGATAGCGTGCAACGCGCCATCAAGCAAGTGGAGACGCAGCTGCTGGCTAGAACTGGCGCCCCAAAAGCCACTTTGGCAACGACAGCGACTTCCCCACTC---------------AAAGAGCAACGACAGG
>su(w[a]) 901792 901920|1037 chrX 899077 901928 scaffold_19 1161573 1164480 - 59311|2977 3105
CTGAGGAGCGTGTTAAGGATAAGCTGGCGCAGATTGCCCGCGAGAAGCTGAACGGAATGATTTCACGCGAAAAACAATTGCAGTTGGAACGAAAGCGAAAGGCCTTGGCCTTTCTAAATCAGATAAAAG
CCGAGGAGCGTGTTAAGGATAAACTGGCACAGATCGCACGTGATAAGCTAAATGGCATAATGTCGCGCGAGAAGCAATTGCAGCTGGAGCGCAAGCGCAAGGCTATGGCCTTTCTCAATCAAATCAAAT
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GTGAGGGTGCCATTGTGGGCTCTGCTGTGCCTGTTGTTGGTCCGAATCCTCCAGAGTCAGCGGCCG---------------GAGCTGCGACCGCCGACAGTGGTGACGAGTCTGGTGATTCTGTACGTTCCATACCAATTACCTACTTTGGCCCCGACGACGATGACGAAGTCGGTGAACAGAGGCCTGAGATGAGGCTCAT--AGGGAGCACGCAGA--------------------------AGGACG----AGGAGGACGACGATGAAGAGGATGGCGGCGATCTGGAGAAGTACAACTTGCTCAACGACGATAGCACGAACACCTTCACCAGCAAACCCGTGCTTCCTCCCACCGCTGCTCCACCTCCTGCTGCTGTTCTGCTTTCTGACGACGACGACGTCCAGCTTGTGGCCA---CTACCTCAACGCGGTC-----------CTCCAGC----TCGCGCCATCTCAAAACCCACCGCCGGAGCAGAAGTCGCAGTAAGAATGTCCGAAGCAGTGACAGCAGCCCTTC--TAGTCGAGAGTCCTCGCGCCGACGCCGCCAGAAGAGCAGCAGGCTTTCCAGGGAGCCATCATCGAACCCGCCACGTAAGTCCCAGCATTCGTCAACGCAGCGAAAAAAGACCC----------CCAAAAAGAGGAGGCGCAGCAAAAGTAGAAGTCGCTCTAAAAGCATCCGGCGGAGTAGGAGCATAAGCATATTGAGAAACAACCGGCGGAGCAGATCGCGTAGCCCCAGCTGTC-----GAAATGCAGAACA----GCGACGCCAGCAGGACCGACGGCGCACTCCCACTAAAAAGTCCCACAAGCGGCACAAGCGACGCAGGCGCAGCAGCTCCCCCTGAGAATCTTCCTAGAGCTCCGCAACCACCTCCACATTTCAAAGTTTTT---TTGTAGG-TTACAAGTTGTA
GTGAAGGTACGGCTATTGGCTCAACTG---CTGGATCGGATGCGATAATTACAGAAACAGCTACTGCGAATGCGGATTCGGGAGCGGAGGCAGCAAACATGAATGGTGACTCAAATGATTCGGTGCGCTCCATACCCATCACTTACTTTGGACCTGATGAGGATGAGGATGACGATGAT--GATGACGACGAAGAGGACAATGAAGTGGGCGTGCGGACGGCATCAGCAGCTCCACCGCCGCTCAGAACGGCTAATGCAGAGGATGATGAGGATGAAGACGGCGATCTGGAAAAGTACAATTTACTTAATGATGATAGTACCAATACATTTACCAGCAA------GGTGGCAGCAGCGGCAGCAGCAGCAGCAGCGCCCGTCCTGCTCTCCGATGACGACGATGTACAGTTGGTATCCACCGCTGCCGCACCACAGTCAGTGTCGTCCGCTTCAGCAGCTGTGCGCCATCGCAAGACTGGGCGTC------GAAGTCGCAGT---------CACAGCAGCAGCAGCTGCTGCTCCATAGCGCAAGATGCTTCCGTGACCTCATCTAGCAGTAGTCCTAGTTGCCGACGCAGTCGTAGTCGGAGTCGCAGTG-----CCCA----TCGGCAGCGCCGTAAGCGCAAGTCCAGTGCCATTGCCAAGCATAGACGCCGACGTCGCAGTCGCAGTACATCGCGCAGTTCGCGTCACAAGCAGCGCAGTCGCAGTCGTAGCAGCAGCCATTCTAGCTTACGCCGTCATCGCGACCATCATCGGGATAAGGAGGAGACCTTGTCGCGCAGAAGAAATCACCAGCGCCAGCCGAGCAAAAAGAGTCACAAGCGTCACAAGCGACGTCGACGCAGCAG------CGGAGGATCCGCCTCGCAATGAGCCG-TGTCTTTGTATCTAAAGCATTTTAGATTTTAGGTTTAAGAATTGTA
>su(w[a]) 901976 903381|1039 chrX 903116 903650 scaffold_19 1193557 1194101 - 7020|0 315
TTTATAATTTTATGTATTTTGTGTAAAAGTAACCTATGTATAAATCCGTGTAAGTAGCTTTACG------------ATCTGGAAATTCCGTATTACGCCAGTGTTCAGATTCTTCC----TGCCCACTGCGCACAGTGGGTATAAAAGCGCGGTGGCAGTGAGCTCATCGATTCAGTTTAATTTGGATGCTCCGCA----------CGACTC---------------GACGATGCTT-CACTCAAACTATCTTTTTCTGATCGGCGGTTGCTGCCTGGTTTTCGCT--------GTCTCAGCGCAGATTCCCATCA
TTAATAATTGTACGCAATATGACGATATTTAGGGTTGTTGTAATTCCGT--AACATACTTTGCGGCTGCCCGTAATATTTGATAATTGCGT-----------GTGCAGGTGCTTCCCCAGTGATAATCGGGCACA-----CATAAAAACACGCTTGATTCATGCAAATCAATTTAGT--AGTCGACAAGTTCTACAACTGGAACCACAACTTAAATATCAAATAGTTGAAGATGTTTGCTTGCAAATTGTTTT------ATTTGTGGCTGTTGCTTGGCTGTCTTTTGGCCTTGGCGTCTGCCCAGCCACCCATAA
>su(w[a]) 903457 903762|1039 chrX 903116 903650 scaffold_19 1193557 1194101 - 7020|391 584
CGCCGCGACGTTGCCCGGCGAACGAGACTTTCCTGGCCTGTGGTCCCGATTGTCAAACGGAGTGCGCCACGCTAGGAAAGCCCTGTCTGGTCAGGCACATCCGATGTCCAGATGGATGCTACTGCAACAAGGGCTTCGCGAGGAACGCCGCGGGCACGTGCATCCCCCTTCGGCGGTGCAACGAAGGCGGCTAC
CGCCACGCGACTGTCCACGAAATGAGGTGTTTCTGCCGTGCGGTCCCAGCTGCCAGTCGGAGTGCGCCACCTTGGGTCAGCCCTGTCTTATAAGGCACATTCGCTGCCCCGATGGCTGCTATTGCGTCGAGGGCTATGCCCGTAACGCGGCTGGCTCGTGCATACCCAAGGCTCAGTGCCGCAGACGTGGCTCC
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CATTCCCCGCTCTCTCTCTCTCTTTTTTT---------TTTGGTTGATATTTTATAATTATGTTTAATAAACTTTGCAAAGTCGGGAACGGAGTCTGTGCACCGGACGGACGGACGGACTGCTGCCCGGCGTAAGCCG
TTTTCTGTTTTTTGTTTTTTTTTTTTTTTGCCCTTTAGTTTTGTGTGTATTTTATAATTATGTTTAATAAAGTCCAC----------GCTGCGTATGCGCAATG---------------TGTT------TTTAAGCCG
>CG11378 1029401 1029563|1209 chrX 1028158 1029560 scaffold_19 1389167 1390667 - 41020|1332 1563
ATG----------AAAAGCATAGTGAGGTAATCTTTTTTTTTTTT------------------CGATAACAAACG--------------CCTGTGTATTGCGGACA---------------------------TTTTTTTTGTTTGTGTGTGTATAGTGGGCACCGAGTATCGGTGCCGTAGTATTTAATGTCT-CCTAAGGAATTGCCAATAATAAAC--GTGATTACGAT
ATGCGTTATTTCCATTATCATATATACATTTTTTTTTTTGTTTTTTTTTTTTCTCCCTATCTGCAATAATGAGAGTAGTGATACCATTTCCTGCATATTGTGCAAGTATTCGTATGTATTTTATCATTATTATTTTTTTTTTTTCGTTTTTGTTTA---AACACTTATGTACGGTACTTTGTAATTTAATGACTACTTTATTTATTGCTTATAATAAACAAACGATTACGAT
>CG14626 1045330 1045411|1223 chrX 1044360 1045377 scaffold_19 1410860 1412026 - 11644|1137 1191
AGTTCGAGTT-------CGGGCTTAGCGTACGATTTAATTTTTTGTTTCTTAATT
AATCTTCGTTAGACAGCCAAATTGGGCAAATGGATTTAGTTTGTACTTAGTGATT
>CG11380 1052776 1053493|1235 chrX 1051469 1052776 scaffold_19 1424736 1426145 - 39128|1506 1506
G
G
>CG11380 1052776 1053493|1236 chrX 1052777 1053018 scaffold_10 4527594 4527827 - -289|0 256
GTCTGGATAAATGTTCAGAT-----------GTTCGAAGGCATGGAAACTCATT--TGACCGAACGCACTATCTCTGCCTGGATGAACTAAACCAATTTTTAAACTTGGCAATCTTCAAACGATTTTATCAAAGGTTTTTTCGGATGCCTTA--GAATTCTAGAATTAAATTTTAAATCGCTTACGCACGTTTTCTATGTATATATCCAGGCAAGCCATCTTTAAAACAAATTCAAACATCCGTACATTATGAATAT
GCTTGCCT--ATTATCAGATTCGACTTAACAATTCGAA------AAGGCTAGTTTATAACTTAAGTCG--ACTTTTGTCTCCTTGAGTT--ATTAAATTCTAAAATAGGTAATTTACTCAAAATTTCGTT-----TTTATTTGATTTCCTTACTGAAATTTGTATATCAATTTATAGACAATTTAGAACGAATAAGGTGCGAATA---ATTCAAG-TACTTTTAGACTAAACTCAAGAATTTGAAAGT--CGAATAT
>CG11380 1052776 1053493|1237 chrX 1053310 1053355 scaffold_19 1430577 1430622 + 1933|0 45
ACATTCGCTTTTCATTATTTTGTACGACGTTTTTTTTTATGTTGTT
ACATTCGTTTTTCTGCACTTTTCGTTTCTTTTCTTTTTTTGTTGTT
>CG11380 1052776 1053493|1238 chrX 1053356 1053525 scaffold_4 5851165 5851352 - 2642|0 155
TATATTGTTAACCAAGA---AAATGTGCTGCTGA---TCATGTGTGCAATATTTAGTCTTAATGTGCTTCTTGATTTACCTATATTATGTAC-----------TTGTATTTTTGTATGATTAAACCGAAAAGAAATTAATTTGAAAA-CCAAATAA
CATATTGTTAACGAAAATAAAGATGCCTTTCTAAAACTTATTTCTCGAAATTTTTGTTTCCGTTTCCGTCAGTTTTCAATTACATTTCATAGGTTATTTTGGGTCGTAATAGTTTCTAATTAAAGTGAAAAGAATTTAATTTTAAAATCCAAATAT
>CG11381 1062048 1062256|1247 chrX 1061686 1062066 scaffold_914 2235 2689 + 2532|452 470
GGCCCTTGAACAGACTTAA
GTCCCCGCCCCCAACTCAA
>CG11382 1068436 1068534|1253 chrX 1066923 1068491 scaffold_25 266751 268194 + 19218|1642 1701
ATTATTAAACTAGTTTTAAGCT----CTAGCGTCCAATGTATTTTTTTATCCCTATCTAT
ATTATTGCATAGTCCATAAACTATTCTTATCATTATTTGTTTTTTTTTTTTTTCATATAT
>fs(1)N 1186097 1186275|1385 chrX 1184115 1186398 scaffold_5 3019214 3021619 + 39934|2141 2338
TTGTTAAATTAAAATGTATATGTAAACTTGTT-TAGATGGATGAT--AGTGAGTTGC--TTAT-----AAGATGTAGTTAGTTATCTTTAGTGTGCTGTTT--------GTTAACTGTGTAATATTATTGTAATTATTCTTCTTGTTGTGAATAAACATTGGTTTGGTGATGTTTAAA-AAGTATATAAACGATAAGA
GTTTAAGAAT-AAATGTGTAATTTGATTTGTTGTTTATGTATTTTTAAGTGTACTGCAATTATTAATCAATATATATTTATATATGTTCCGAAATCCAATTCATGCGTAGCCAACTTAATAAGGTAAATTCATAAATGCGCACCCAACTTAACAAGCTGCCATTCAGTCAAGCACAGACAACTTTACAAGCGAAAGAT
>CG11412 1200765 1201597|1401 chrX 1200594 1201063 scaffold_5 3044989 3045562 + 10098|171 584
GTGGACCCGGC---GGCTGCCGTTGAAATTGTTGTCTAAGTAGCCGCCGAAGATGTCGAGATCTGCGCTCTGCGGAGGAC--------------------------CAGGGCGCTCCCCTCGTCCTGGGTCCTGGCCAGCTGGCA--------GCTTGTATCGGCGCCCTCTTTTTTGTACCTATTTA------------------------ACTAGGAAGCATCGTA-GCATCAGTTTAT-------TTTCTCCCCAACT---------CACACCGTCCCTTGT----------------------------CTCTCTTTCATT------TGTAAATTATTTT-ATTATGTAGCAGCA--GCAGTACGAGCAACATCTGCTACATATGCAGGAGCAGCACGAGCAGCACACAA
GCCGAAGCATCTTTAAATGATGTTGAAATTATTGTCT-AGTGGCCGCCAAG-----CGAGA-----GCTCTAAAAAGGATGCCTTGTTTCAACTATATAGTTAAAACCCAATGTTTTCCTTGGGCTGGCTTCCATACTGTCCACAAGAACGGGACTCTTGTTTGTTTTTTTTTTTTAATATATATATATATATATATTTATACATATATATGAATATTAATTTTATTAGGCATTTGTTTGTCGTTTGATTTCTTCTCACGTGGCGCATGACAAACAATCTTTTGTACCTATTAACTAGGCTTTACAATTTTTATTTTCTTTAATTAATGTATGTAAATTATTTTAATAATTTAAGCGTATGGCAACAAAAGAAACAACTATAACAGCAGCAGCCGTAAAAATAACAACAAATAA
>CG11412 1200765 1201597|1402 chrX 1201100 1201438 scaffold_5 3045587 3045897 + 2238|0 364
TTTGTATGCAATACGTGATTTACATGCATA-----------------------AAATTAAGCATTAAAGTCGTAAGCAAGCAATTAGTTATGTACATTAAACAATCTACAAAAACCAATCTAGGGAATAGACAACAACATGAAGCAGCAGCGCAGCACACGCTCATCGACGCCCATTTACAAAGCTATAAACATAGTATCAAATTTTGTAAAAAGATCAATCAAAGCGATGATCGCGCAAGTCGAACGATAAACTCGAT---CATGTATATCAAAATAAACGCAATTGGAACCAAGAGCTGAGAACAGACACACAAAAATGCAGCCTCATATGCATACTTGTATACAAACCTTCAATGGGTGGAT
TACACATGCAATACGTGATTTACATACTTACATAATTGCCTAATTGCGAGTGCAGAAAAACGAAGAAAATCAGAAGCAATAACCGATTGCAATATATTGTACATTAAACACAAAC------------GATATTACAATCTAAAGCG-----------------CATAAACAAACACACATAAACAAATAAACAAAATATTCATATTTAT-----------TTAGAACTATGTT---ATAAAAGCAACAACAAACGCAATACATATGTATAT-GAAATAAAC---ATTGAAACCGACAAC-----ACACACACACAAGACCGCAAA--CATTTACATAAGTAAATAATTACAATTAATATATGCAT
>CG11417 1213232 1213301|1412 chrX 1210871 1214354 scaffold_19 1414697 1418242 + 125072|2443 2518
AGGATTAATG--TTAC----TGTACAATAGGTGAACAAATGTAAATTAAAGACTACGTTAATGACATTGAGCGAGA
A--ATTTATGGCTTACATCGTGTATAATAT-------------AACTAGAAATAAAGCTAACAATGTTTAGGATGA
>CG3056 1229937 1231561|1418 chrX 1229230 1230078 scaffold_25 1813492 1814254 - 28533|711 856
ACGCCATTAATTTCTTTACACGATATTAGCTGCATCTCACAGGTGAAGTGTTCATGCTGCCATTGCCGATTTGCA----GCCGATTCCCCAGCCAGCCGCATCCCGTAGGCAATGGCATTTGCCACAGCCCCAACAAGAACAGCAG
ACAAAATTAATTTCTTTACACAATATTAGCTGCATCTCACAGGTGAAGTGTTCATGCTGCCATTGCCTATCAGAATATTGCCAATGCCCCGACCACAAGCACTGCAGCGGCAGCAGCAGCAGCCGCAGCAGCACCGCCGTCAGCAG
>CG3056 1229937 1231561|1419 chrX 1230475 1231653 scaffold_25 1817071 1818165 - -1723|0 1203
TCTATGTGTATGTATGTATCTTGCTATCCATATATGTATATCCATATCAGAGAGCCAGGATTGGTTGAGACCATACGATATAACCCGAAACCACACTGGCCAGGAATAGCAAATCCAAGCATTGGCAGCAAGAGGCAAAGCAAAGGTGCACGGCAGACATAGGCAGTACCACAAGAACACTATCACAGAATTAAGCAGAGCAAATTAAAGATGCATAGCGTGTATTAAGATGTACGAAATAATGTTCCAAAGTTAACCAGCCTACACAATCCCCAACA-ACACACACACACACACACATAAAGACGGTCG----------------------GAGTCGAATCCTTGATCG--------AACCACATAAGAAAAAATTCCAATGAGTTTGTATGAGCA-----ACATACAAAGCCCCAAACGCAAACCATCAGCCACTCAAGACGAGACGAGAACGCAACCAAAACTCAAATATAACTTTCCTGCACTCAT-CTCCAGTT--CACGAAACAATCTTCGCTCTTGGTGGATTGCGAATTGTAAATGAATTGAGTAACTGCACGGATGCAAAGCCCCAAGATGTGGCGACTATTCCGGCCGGACACTGTGAGACGGACGTTACACACACGGATATATAGAGAGACGAACCTTATGACAACAGACAGAAGACGCTTGCTCTGAATAGATGGTTAATTTGTAGACTTATAAGGAACGTCGACAGCGAGGGTTCGTTCGCGTCACTTGCTTTTTACTACATTATAAATAAATTATTGATGTACTACCAACAAACCAAGA-------------------ACAAGAACACCACACTATACAAACACCTATATATTAGATAATATATATGAATGATGTATAAATACCCGAACTTCGGGTAAACTTCCAACAGAAACCCGACAAGAAGATGGCTGAATATGAAATAAACTTGAAATT---TTCCAACCAGCATACCCGTGAGACCCAGAGGTCCGAAATTTTTTTTTTTTAGTATTGATAATCTCTAAACGTAAATCCTAGTCTCGTAGCAATATCATAGTTAAGGTGACTTTTTTTTCAGAA-------------------TAAACTTAAAGCACGAAA--------GAAATACATGTATTTA-----------------------------AACCTTAAATCCTAAAGTTTATAATAAACGAACACAAATTG
TTTATATATATATATATATATATATATATATTAATATATATTTTTAACAAGAAACTG------------------------AACTCGAAA--GCAATTGGCAGCAAGAAGAATTC------------GAAAAATGCAAAATGAAAGCGAATCGAACACAAAAGAAACAACAAGAGAA---------------------AACAACTTGCAAATATGTAACAC------------------------------------------ACACACTCACACACACACACACACACACATATATGCACACACACTTGTATTTGTTTAGCAATAATTATTGATTTAAATTTTTAATTGTTCAATTTGACCAACTAAAACGAATTTT--ATTATTTTGCCTGTGCCCAGGCACACACACACACACACACACAACCTCTAAGGCAC----------ACACACGCCCAGACACAACACACATACA---------CACTCACACTCCAATTGCTATGAATTTGTAT-------------------AAAAGAAAACAAAAAGGCAAAATAAACATTGATAAAATGCAAAAAATTGTAGACTAC----GCGCAATTCAATGAATTTAAAAATATATATATATATATTTAAGTGTATATAATATAT----ATATATAGATATTCATAAATCGGATTACATTATATATATATATAC---------ATGCTGATAAT-----------------ATTTGTATTGATGTAAAGATCTATTGATGTATTGATGTACAGCAAACAAACTATGTGTCGTGTGTGAGTGTGTTTACAAATGTGTCAATC-------AAAGCTGATTGATGGAAACTACGAATTTGTTATGTGAGAAAACGCAAAC--AGAGCGAACGAAAAACAAAG----TGAAAAAGCGTAGCTAAAAAGCAAAAGAGAGTAAAATTACCTTTAAAGCAGAATCGATTTGATATACGGA-----------CTTTTTTTTGAATA--------------ACTTAAAAACTAGTCTTATAGCATTATAATAGTTAAGACATTTTTTTGCGCAACAAAAAAGAAAACAAAAGATCTAAATTTAAAGAAATGAAAAATATATAAAATACATGTACTAAAAATAATAATAAAACAAACTACAAAACAGAACACTAAATATTAGAGAATATGCTAAAAATTTGTATATAG
>SNF1A 1234987 1235678|1426 chrX 1234045 1234987 scaffold_25 1823229 1824204 - 56297|990 990
G
G
>CG32813 1248387 1249672|1442 chrX 1247070 1248761 scaffold_5 3563567 3565516 - 35384|1486 2030
TCCGCAGCCAAGG--GGCGGT----------------------------------------------------------------------------------------TCGAACTAGTCGGGGGTCCTGCG---GGCGAAAGCGAAAG------------------CGACAGCGACATCATCTCGATAGTGGACATAGATGATGGGCGGTCTAGGGAGGACGAGCAGTCGGAGGAC--------------------GATGGCGAGAACCGTGACCAGGCCATAACGGACCTGACGCTACCCGACGAAGACGAGGAAGACGATGTAGACGAAGATGACTCACAGGATGCCTTGGTCAGGGATGTTGGCGTGGTGGGCGGCCTGTCGTCGCCAGATACACCGCCCCACTCCTCTCC---------------------GCCGCCAGCGAAGCGCTCGAAGCGCCA------------------GGAAGTCACCTCCGAGCTCCTGAGGCAGCTGGCCCTGCAGCAGAATCAGGATCCCCAGGAGGGG
TCCGAAGCGAACGATGGCGGTGACGACGATGACGACGACGACGACGACGACGGTGGCGGCGGCGATAATGATGACGACGACGATCAAGGCGCCACTGGCCTGCTGAAAATCGATGTCGATGATGAGCCTGGGCGTGTCGACAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCGGTGGCGACAGCGACATCATTTCCATCGTAGACATTGACGATGATGAGGACGAGGACGAGAATCAGGAGGAGGATGTGATGGAACTGCAAGTGGAGCTGGAGCAAAGCAAGACCAG--CATAACGGACCTAACGCTGCAC------------------------GAAGAGTATGACTCACAGGATGCCTTGGTCAAGGATGTGGGCGTTGTGGGCGGCCTATCGCCA------ACACCGTCACAATCCGCGCCGTCGCCACCGCCATTATCGCAGCCGCCAGCGAAGCGCGTCAAGCGCCACATTGCGGTGCTGCCGCCAGCAGCTGCCTCAGCGCTGCTGCTGCAGTTGGCGCAGCAGCAGCAGCAGCAACAGCAGCAACAG
>CG32813 1248387 1249672|1443 chrX 1248762 1249671 scaffold_5 3565681 3566746 - 9762|0 1115
TGCTAGTATTTTGT----CTAGTTTGCTAATTTTATAC------TTGCTACCATGGATTGACGCAACCACTTTGTAACATTAATTTTACCATATATATTTATTTACGCCCAGTTT-GAGTGCCAAA-ACAGAAACCAAGAT------------------TGGG---------------------------------GCCTTGCCATCGAAAA--TGCTTGCCA-------AAGGACCTGCTGAAATAACCGGTCATAACCACTCGCGACCCACTATTTATTTGCCAGCCTAACTGAAACATAGCGATTCATCTCATTTTAAAATGTCTTGCGTCGCCTATTTTTTTATTGCCTTTTTTTT--TCTATACATGTA-ACGTGTTTATTTTTAAGTTTTCCTACGAGCTGCTACCAAAAAGAATAAGAAGAAGAAGG----------TGACTATCT-TGAATGTACATTT-----------ACTTTACAAAACTAGACCTTACTTACTTACTTAATTAGAGATCGAGCAGCTAAGAACGCATGAAAATGAAATGTACAAATGTGGTTCCTAATCTAGTCCCTAAAGTCAAAAGTGAAGAA------CGAAAGAGCTACAGAAAAGAAATCGAA--------ATTGTTACGCCTAGCCGAGAACTTGTGTATTATTTTTTTATATCGCTTAGATTGTTC------------------CCCCGAG----GAAAGCATTGAAGGAACTGTAGCTAATTT--ATGTACTT--------AATGAACCAGTGAAACCAAACCAATGATTTGAAATGGTGTAA---AGAGAAGAAACTTGCTAGTCGCCGCTGCATAACTGTGT------------------------AAATGTGGCACACAAA-------------CCATTTAGTTA-GTGTT-------AGTGCTACTGTACGTGTAAAATACAATTAAT----------TGCCTATCCAGACCCAGTAACCACAATTTACAAGGAAGCACACACCAAACGAAACTGAAAACCAAGAAAACAAAACTATTTATACAA-TTTTGTAAACAAGAACTTATTAATAAAA----CAATGAATTTACTTTGTGGCCCAG
TGCCATTTTTATGTTAACCAAATTAGCAACTAATATACAATTAATTATTATTATGATT-------ACCTATTATTAACGT-AATGCTATTATTTATATTTATTTATGTCTAGTTTTGTGTGCCAAACAAAGAAGCCAAGATGCAAGTGACTGAAGTGCATGTGCATTCATTTAATTTTTTTATTATTATAATATTAGTTTTGCAAACCAAATCTTATTTGCCATTTAACGAAATGCTTGCCAAAAT--TTAATTTTAAGCATT---AATTTATTGCTTAAAGCCAAGCCTATCCCCGCCT--GCTATT-ATTTATTATTTATATGTTTTGTTAAACATACATTTTATTTTTTTTTTTTTTAGTTTATACAAGTATATAAATTTATCGTTTAAGTTTTTTTTTAGCTGCAAACCAAAAGAAAATGCAACGAAAGGCCCAAAAAACTGTTCATTTGTCACTGTAAATTTTACCTTAAATTACATAACATAATAAGTTGTCATGTAAAAA---AAAAAAAAAACAAACACAAACAAACAAATTACAA-AAACTGTACAAATGTGGTTCCTAATCTAGTCCTTAAAAACAAAACAAAACAAAAAAATCTAAGAAACTGTTTAAAAAAAAAGAAAAAAATTTTATTGTTATGCATATAGCACAACTTGTGTATTTATTTTTTTTTTTCTAAAAAATATACTTATATATAAACGCAAAGCCCCCAGTCCCTAAACCATCCAAAGAACTGTAGCTAATTTTAATGTACTTAAAAAAAAAAAAAACTGAGGCACCCAAATCCA-GATACAGAAATATATAGTTTTGGATAGCAATTTGCTAGTCGCCGCTGCGTAACTGTATTCTTTAGTCTAGCATACACAAGAAAAGTTTAAAATACAAAATGTTTAAAAATGCTATTAAGTTATGTATTTGCATACTGTAGTAATATATATACAAAAAAAAATATGTGTAAAAATTATGCCTAACT-------GTAACCACAATTT------------ACATAAAAAGAAA---------AAAAAAAGAAGAACATTTATACAATTTTTGTAAACAA-AACAAATTAATAAAAACCCCAGTGAATTTATTTGGTGGCCTAG
>CG11448 1252197 1254159|1446 chrX 1251875 1252216 scaffold_19 1448184 1448550 - 15028|359 378
GCGCCCCTTAAAGCATCCGA
ATGCCTTTTAGCCTAAGCGA
>CG11448 1252197 1254159|1447 chrX 1252274 1252526 scaffold_19 1448584 1448791 - 3984|0 258
GTTCCGTTCCGTTTGCACTGCCCCCCGCACCCCTGCATCTTGCATCCTAATTTATTATTTATTTTTTACTTTTACGTCTTACGATTACGTTTACATTTAGTTTAGGCAACAGCCTGTATCTGACCCTGTCC------CTCGCCATTCACCTGCTCCGCCTGAGCTGTACATACATAGTTTACACACTCGATTGCTGTGCCCTCATAATTCTAAGTTGTTATGCAATTTTGTTTACGTAATACGCGTTTTATTCGTAACT
GTTTGATTTTGTTTT----------------------------------ATGTATTA-TTATTTTTTGTTCTTTCTTTTTA----------TTTATTTATTTTTAGTCCCTGTCTGTCCCTTGCTATGTTTTATATGCTCGCTAAGTATTTACCATTTTCTTATTTTATGTACATAATTTACATATTTGATTGCTGTGCTCTCATAATCTTAAGTTGTTATT---TCTTTTTTACGTGAT---TGCTTAATATGTAATT
>CG11448 1252197 1254159|1448 chrX 1252939 1253217 scaffold_19 1449668 1449944 - 3729|0 298
TATCTAGATCTTCGGCTATCGCCAGCCCGTATGAGT-ATTTTAGCACTCTCATAGCAGTTGCCCCAAGCGGCCTTATAAATATATTACAAATTTATCAAAATACGCAAACCTTAGAGCGAAAGAAACCTAAAAGTATATATAATTGATATATAATTAGCAAACGTTACAACCTTAGCGCATTGTTTGTTGAC---TTGAATTGAACT--------AACTAACGAAACC------AATCTCAGCATAGT--AGATTCCATTGATAGCATTCGATTGCACAAAGATGCCAAAAAGCGAAAA
TATCTCGCTCTAACCCTGTAGCCAACTTTTAATAGCGAATTGAGCCTTTTTGTAGCAGTTGCCCCAAGCGGCCT------TATATTAGAAA------AAAATATGAACAC----GATCAAAATA-----TAAAGTAAATGCATATTATTATTAATTAGCCAGCGTTG-AATTGTAGCTGATGGTTTGTTGACAAATTAACTATAATTAGAGATAAAACGAACAAAAATTAACAAAATTGAAGCAAAATCAAAATCATATAAACGTTTTTTAGCCGCAAATTTTAACCAAAAAGAGAAAA
>CG14777 1325439 1325513|1519 chrX 1324540 1326346 scaffold_58 289276 291242 - 51799|998 1090
TTACCTGAGTCGTATTTGTTACCTTT-------------TGTGACTCCCAATTGT-TAGGCCAATTGTTG--AATT--AGATAGCGGTAGCGT
ATCCCAATTTTATATTCAATTGATTTGCAGCATTATTCATTTGACGCCCGGCAATGCCGACCAATTTCTGCTAGTTGTAAATAATTGT-GTAT
>CG14780 1330420 1330548|1524 chrX 1330415 1330597 scaffold_16 174747 174933 - -414|5 145
CC---ACCATTTCGGCATCCATGCCAGTGCTTTAGTCTATGTAGTAACTATGTTCTAAACAAAA----TATTCATAATACACATTCACGTACAATGTAGCGACAGCTCTGAATCT-----AAGAGCTACCGTATGCAAACC
CTGAGACCAGTCAGG-GTCCAGA--AGTGCCTGAGGC----------CGATGTTCTTGCTTAAAATTTGATTTATAAGA-AAATTTATTTCAAATAAAGGCAACGCCCTCAATATGTTTGATAACCTTCCTTTTGTAATCG
>CG14782 1337829 1338243|1535 chrX 1337774 1337920 scaffold_58 147959 148104 + 7039|55 146
CAAGACGAACAACGGAAGCGATGCGAGCAGGAGGAGATTAAGGAGCTGCGCAAGATGACGGCATTCAAGGCTCGTCCGAATCCATTTAAATA
CAAGACGAACAACGCAAGCAACGCGAGCTGGAGGAAACAAAGGAATTACGCAGAATGATGGAATTCAAAGCTCGTCCAAACCCATTTAAATA
>CG14782 1337829 1338243|1536 chrX 1338026 1338237 scaffold_58 148583 148756 + 3286|0 216
TACCAGATTAACACAATTTTTGTCTCTTAACATTAACATTACTTTTACGCATATATCGTTCCCGTTTTTGGCGGATAAGAACCACTAAAATCGTATGTTTGGCGAGAGGATAAACTATATGGATATGTATACAACATAAGCAATTTGCAATTGCGATCATTAACTGTTTTCTATTTGTACAAAGCCCAA-AAAACAATAA----ATTAATACTGTAA
TATCATGTTTATATAATATATGAAT--TAACACCAATTTTTTTTTT-------TATTGTTCATTTTATG----------------TATAACCGATCGTCTAGCATGAG----AGGTTCATAAATATCTATACGCC-TAAGCAATT-------------ATTAATTGTTTTCTATTTGTATAAAGCAAAACAAAAAAATAAATCTATTAATATTGTAA
>CG32810 1372212 1374441|1575 chrX 1372079 1372457 scaffold_58 207760 208089 + 2239|133 382
TCGCGCTATATATTCACACACAACCCTTGAAAATTTAAATACCGAACTTCATCAACATACAACTCATTCCCAATCAGTAACACAATCAGCCACTCAGCCACACCGACCCAACACCAATTGGATGCAGCCAAGGAAGCCCGAGCCACAGCCACAGCCACATCAAACACCACAAACCACACGCGATCAGATCAGACTCAGCCACAGGCACAGATCACCCACCAAGATC----AGCCGGAATCACCAAAGCAG
GCA--------ATGCTTATAGAGCGTGTGTA------------------------------------TGCCATCCAAAAACAAAAACAAAAAGTAACTCCCATC-ATCCAACACCAAGCTTAAATAATACACCACAACCAAG-CACAACATCATGAACAACAAAAACAACAAG-CAAACGAAAACAAACAAAAATAAAAT-TAAACAAAAAAATATAACCAAAATCATAAAACAAAAACCAACAAAACAG
>CG32810 1372212 1374441|1576 chrX 1373140 1373612 scaffold_58 211149 211635 + 11502|0 536
GTTTTGTGTAG-GCCCGGTTT----TACTACCTTGAGCTTTATTT---TAGAAAACGAGCAAGGCGAAGATCAA----CTTTAGGAAATCAATT-GAATCACGACTGAATTTATGTGAACTTGCACTCAAAGAAAATACATACATGCGAATACATTATAGTGAGGATATACATGTGTGAAAAAGAAAATGATTAACGAAAATGAAAACCTATCCGGCGACGTTTTGTACAGACAGGCATGATATCTATAATATGATAAGTACTACATGAATGTATATAATTTTAAA-TAGTTACTAATTTATACACGAAAAAGAAAACAAGCGAAAATTGAAGATG-------------ATCCAGAACGTCGCCACCTACTCGTACCCA-TTTTGTATCCATTTTGACTTATTTTACGAGCACAGCTGGTGCAGATTATATAGAGTATAACTTATGCTTAC-------------------------GAGGAT-----TATTTCGACGAAGAACCTTTACACTAGCAAGTAGT------AGAACCGCA
GTTGTGTGTAGCGCCCGGTTTGCATTATAACCTTGAGCTTTATTTAACTAGCAAA--AGCAAAGGCAAAAACAAAAAACAACAAAAAACCATTTTAAATCACGACTGAATTTATGTGAACTTGCACTAAAACAAAAT---------CAACTAAATAGAAATCAAGA------------------AATATGAAACATGAAAAAAAAAAACAATACGGCGACGTTTATTAGATATACGCAT--TATTAATGATACT----------TATGTATGTATATAATTTTAAAGTAA--ACTAATTTATACACTAAAAAAAGAAGAGAAGAAAA--GAAGAAGAAGAGAACAAAGAAGAGAGAACGTCGCCACCTACTCGTACCCATTTTTGTATCCATTTTGAATTATTTTATGTGCATC-TAAATGCAAGT----TAGAATAATGCTTACAATTATTTGGTAGAAGCCCAAGCTGAAGCCAGAGCATATATATATATATATGGAACACCTTTACATTAGCTTGTAATGTGTAAAAAACCACA
>br 1499922 1501321|1743 chrX 1500019 1500249 scaffold_48 242424 242629 + -759|0 236
ACGGGGGGTTCTCCAGTTGAGGGGAAGCAAGTTTTTGTTAAGTTTGAATGAACCGAATGTCAAGCATATGTAGGAACACATATACACACTCATACTCACTCACTCACACACCCAGAC----CAACACCCACACACTCAAGACGGTGCTTTTTGTACACATTAACTATTAAAGACCAGGACGA--AGGAAGCGAATGTGCACATACATACACACAGTCTAGGCTAGTTACAATTAGTT
GCTGCG------------GCAGCAAAGAAAGCTGCTATAAA----TAACGAAAGTAATGTTTAATAAGTG--------CATATATAAGTAAGTACCTAAGCAAACGCAAACGCAAATGCAACCGCAACCGAACATTTATTCTAGTTTTTGCGTTATGCACCGAAAAAAAAAGTAAAAAATAAATAGAGATCGAATAGCAACA-------AAGCAACAAAAGCTAAAAACAATTAACT
>br 1499922 1501321|1744 chrX 1500513 1500664 scaffold_10 823477 823622 - 99|0 155
AAATGGCTTTAACTAAATACA----ATTTATCCGATGGACAGCATATTATTCTGTATACACCTCATGATAGGCGGCAATCGCGCACATCGATTAGAAGAGGGAAATGTGAAGCGTTAGACGTATGAATAATCTCTCTCTTAAAGTTAGACTAAACT
AAATCGATTAACCTTAACTCACGATATTTTTCCGGTGA----CATAT-ATTTTCATTGCTTTCGATAAAAGTATACAATTTCAAA-----ATTATGAAATCAAATTGCTTAGCAATATTTATGTAGATTAGCTCTTGCATTTAGTGAATGCTAATT
>br 1504870 1505553|1745 chrX 1502027 1505286 scaffold_58 397132 400492 + 76520|3306 3808
GATCAGCAGCAACTCTTGCAGCAGCTGTTCCACGTGGCGCTCAACAACTCCGCGGCGGCAGCGGCGGCTGCAGCGGCAGC-AGCTGCGGCGGGTGGATCGGGAGGAGGCCCAGGTGGAGTGGGAGCTGGGCCGGAGTCAATCAACGGAGGCGGACAGGAGTACGGAGGAGTGCAGGGGCCGAGTGGCACGCCCACTGTCGATCTCACCCAGCTGGAGC---------------ACGCGGCCG-----------GGGGCGGTGGATTCTCAGCCGCCGCCGCCCTGCAGCACCACCTGC-----------------------------------------------------------CACACCACCTAGCACATCAGCATCCGATGTCCCACCAGCATCCCCACCAGCTGACGCACCAGCACCCGCATCCCCATCCGCACCAGCATCCATATGAACGCATGAATTTACTAGACCAATAAGCAAGGCGCCAGAAAGTATGCTAC
GATCAGCATCAACTCTTGCAGCAGCTGTTCCATGTTGCACTCAACAACTCAGCAGCAGCGGCGGCGGCGGCAACGGTGGCGGGCGGCAGTGCGT-CACCGGCAGGTGGCCCCAGTG---------------------------------------------ACTACGGGGGGCAGGTGGGTGGAGTCACGCCAACAGTCGATCTCACGCAAATTGATCAGGGCAGCGGCGTTTATGCGGCGGCAGCGGCGGAAGGGGTGGCAGATTTGCGA--------GCCCTCCATCTCCATCAGCAGCATCACGGCGGGCATCTGTCACATTTAACGGCGCATGCCCACGGACACGCACATCCACACACCCACCCGCACACCCACA--------CACACCCACACACACACACACATACACACAGCCACAGCCACGCCCACCCCCATCATCATCGCTATGAACGAATGAATTTATTAGACCAATAAGCGGATCGCTGAAATGTATGCTAC
>br 1504870 1505553|1746 chrX 1505291 1505413 scaffold_58 400668 400808 + 1376|0 141
GATGATCGGGCAACAGACACACGCACACGCGCACACAAAGGCA-------------------CACACACACACACAAAGGAGGAGAAGGACGAGGAGGAGGAAGCGAGGAGGAGGAAGCGAGGAGGAGAACAAGGAGGAGGA
GCTGATTTGGCAACACTGAGACACACACGCACACAGGAAGGTATGCAGCGATCGATCCGAACCAAACACACACACACACACGCACACGCA-ACGAAGGAATGATCAAAACGGAGGATTAACGGCATAGCCCGGGGCTAAGCT
>br 1504870 1505553|1747 chrX 1505483 1505692 scaffold_58 400872 401033 + 1988|0 70
ATTTCAATTTCGGATCTCACAGAACGGAAAATTCAAAGACTTTTTCGGCCAGAAAAAAAAACGAAAGAAAA
GTATGCACTTTGGATCTCAACCTGGCGAAAACTGAATGGACTGTTTTGGCAAACAACTGAATGCGAAAAAA
>CG11509 1509043 1509237|1751 chrX 1508781 1509193 scaffold_19 2658330 2658698 + -1667|263 436
AAACTATTAAGTTTTCCACTCTAGCCTAGTAAGAAATGTACATTTTTGTCTCCTGTACGTTCACTTGTACATATTATAAGCAAGGTGCCAGCACTAGAACTAACCCAAGCGGCAAGC---CACTCCTACACACACATATATATGCAAAGCAAA--------------------G
TAGCGCGAGAGCCGCGCACGGCTGTC--GGAGACGACGACCATTTTGGGCGGCCAGGCGTTTTTTAGTAGTTTTT----GAATAGCTGCAAAATTTGGGATGGCGCGTGGCGCACACACACACCCACACACACGCGCACACACACAGAGGAAGAGAGACGAAAGACACGCGTTG
>br 1511189 1511525|1752 chrX 1510482 1512181 scaffold_58 415289 417020 + 30658|748 1166
ATATCGGCTAGAACTAAGCTCAAACTTAAAGCAATGCCATTATGTAGTGATATA------TATACATACCTACCAATCTATTATACACGACGAACAAAAA----------ATGTTTAGGCCCCATCTTTATTATTA--CGAGGTGGCGACGATTACAAACAATACAATTAATAGCGTATTATAACT---------AAAGACATTAGA-TGTAAG---ATAGTTATATGGGGACATTTGAAACACTT-------------TTAGATTAGACCTAGATTAGTCGGATCAATCTATACATCGACTTGCTGACTTTTTCACAACTC--ACGCCTATGGACCAGT-------------------------ATATAGAATAC----------GGATATAC-ACTGTTTACACTCTGTGGCCTTCT
A----------AACTTAACTTAAACTTAAAGCAATGCCATTCTGTAGTGATACAAAACTTTACAATTAAAAAAAAAAAAAATTAACAAAAAAAAAAAAAACTAAAAAATCATGATTTACATACATTTACATAAATATTTAACTATGCGTACCTAGCATACTATATATACATTAACTTATAATGAATAAAAAACAAAAAGACATTAGGCTCTAAGTTTAGAATTCTTT----ACAGTAGATACACATAGTATGTAGTTACTATGAATTGACATAAA--AGTTGACCCAAC---TGAGCTAACTTGCTGAC-ATCTAACGACTCATATGCCTATGGACCATTTACACACATACTTATACATAAGTACATATACAGTACATTATTTACTGTATATGCAACTGTTTATACTCTGTGGCCTTCT
>br 1515759 1516087|1755 chrX 1514731 1516381 scaffold_58 420212 421611 + 37008|1035 1370
GAGCTAAGTTGGAACGCCA-TCTTTTAGAGAACGAAGGAGAGCTGGTCAGTCAGCCAGTCAGTCCATCCATCGGTTGGATGACCAGTGAGAAGCAGCAGCCAAGACCAGCTACAAATACTTTGCCCATTG----TTTTCGCACTGGACCGACGATCCCCCATCGCTCATCGCTCAACGCCCATCCGCCAGGAGGGGGGATCTAGATCTCCAGCGTGAACTAGGTCTTAGCTAATTAATG-ATTAAGCATATTAGGCA-TATTTTGGCGTCAACTGTTTTATTACTCTTATCCCTATGTTAGGTAATTATTACGATTATTTTTTTGTGTATCCTTAA
GATTTACGTTGGAATGCTATTTTTTTAGAGAAT---------------------------------TTCTGTGGCCAAATG--CAGTCAG------------AGACCAGCTACAAATACTTTGCCCGTGGTTAATTTTTACACCTTG-TGACGACTAGCCATAG------GCTC----------------------------------------TTAATTAGACCTATTCCAGTCACTGTGCTCACAATTTTAGTTATTAGTTTGTTTTTTTTTTTTTTTTCGTTTGTAATTGTATTTCGTTTAGGGTTTAATTTAATTTTGTCGT-CGTCGTCAA
>br 1517001 1517698|1756 chrX 1516417 1518144 scaffold_58 421658 423277 + -451|594 1370
TGTTTAAAGTCGGCGGGGCACGGAGAAGACAAACGTGCAGAAGCGAAACACA-----AGAGACAAACAAAATCAACCAACAAACAAAAGAAAAACGTTATCAGGGATAAA-ATATCAAGTATGCAGTAGGAAA-GTAATTTTTTCTACTTATTCACGAATACGACGAATAAAGTAACAGAAATT--AAAATCACTTTTTTATATACACATACATATACACACGCGAGCGTATAAACGATAAATGTGCATATGCGTATGCGCAAGCTAAGCGAAACAACTAAACTAATGTCTATGTATACATGTATATAC------TTTACACCATTTACCATATACAATTTATAAGCCGATATGCCGATGATATACACATATACAATGTTAGTTTGGTGTATAGAAGACAGATGAGCTGTAAACGTTTTTGCAAATCAAGAAAATAACGTATTTAACAAAACCGCAAAGTAACTCAGTGATTTT-TACCAGCGAAGTACAAATGTTCTGAAATTAAATTAACTAACAAGTAA-----------------------TAAGCGCCGACGAGCAGATCAGCAAATCGAAG-------TAGCTAGCGACGGGAGTATTCA--------GAGCAGAATCATAAAGGGAATAGGGCCGCAGTTAGCACT-----GCCCCAAAATAGTGTCTGATCATGTTGCATGCAACCAGGAGGGGCAGGCA-AACATGCA-------------------ACAACCACCAAGCCCAGACTGGAAGTGAAAAAAAAAAAAAC
--ATTAATATAACTAACACCAGGAAATGTTTTAGGT----ATGCTAAACATAAAGGGAGAGAGAAAAATTATGTAACGAAAACACAAATTAAAACGTTATCAGGGGAAAATATATCAAGTATGTAGTCGTAAGTTTTTTTTTTTTTACATATAC-CATATAAGAAGAATAAAAGATAAGAATTGGAAAAATAACAATTTTAAAC------------------------------ACGATATGTGCATATTTACATACATGCAAGA-AAACAAAAAAA--AAGCT--TTCCAACATATGTATATTTATACGAGCCACTCACATTTTTTGCGAAACAAAAAACAACAGCAGCAAAAACAACAACAAATACAT---------------------TACACAACA----------------------AAATGAAACAAACA-----------AAAACCGCAAAGTAACTCAGTGATTTTCTACCAGTGAAGTACAAATATTCAGAAATTAAAATAAACAACAAAAAAATTTAATAATAACAATGTCAGCGTAAATGACAAAGAGTAACAAAAAAAAACAAAGTTTTTGTTTGGTCGCCAC-AAAGTACTAACTTTATTGAAACAGCACAAGCAAAGAATTTAACTCACACTT-GTACTTTGACGGCATCATATTTTGTATGTTTATAGTATATACTTCAACACAACGTATATATAACATATATATCAACATTTTACAACATATAACTATGAAAACATATTTTCAAACGGACACAACACAAAA
>dor 1524527 1524610|1762 chrX 1522329 1524565 scaffold_93 8465 10720 - 78387|2248 2286
TTCGCTACCACCGTCGTTCAGACCCAAATATTTATGTAC
--CAGAGCCTTAGTTATTGCAACGGATACATGTATATAC
>dor 1524527 1524610|1763 chrX 1524566 1525170 scaffold_93 11293 11864 - 22223|0 44
ATATAAAGTATTTATTATTATAAATAAACCTACACTGATCACAAA
ATCTAAGGAAATTATTATTAAAATTATATTTTCATATGT------
>hfw 1528913 1529267|1765 chrX 1527932 1529086 scaffold_93 15044 16212 - 45401|982 1178
------------------AGCCAGAGTGGAGAGTAAGATGGCCAGTTGGTCAAACAGACGGCCA-----GACTGTGACACAATCACATGACAGAGCGTATTCTCATACGTGTCCTACCTTTATATGTATCCGACTGTATCTGCGGAACCGTGTGCCTTCTATATTCATACATATGTGAACGATTTTTGTGGTGTGTA
ATTAACTAACCGATAAATAGCCAGACTGAACGTGGACATAGCATATCCGCTTAACACTTCACCATGAGCGACTATAACGAATATCGATTTTGATGTGCCTTCTTACATATG-CCTATATATACATATTTATTTATATAACAATAGATCTATCTATTTGCTGCAATGAAATGT-TGTGTATAAGCTAAACGATATGTA
>hfw 1528913 1529267|1766 chrX 1529087 1529868 scaffold_93 16370 17063 - 2664|0 190
GCCTTAAGAACAGTGTGCATGCACTTGACGATTTGTAGTGGGTGCGGTGGATCTGGAAGTATAAAATGGAGG------AGTAACGTTGATCAG----CACCATTGCTTAGGGTCGTGAGCTTAGTCAGCCTACTTACATGTGGCAATAAATCAATAGAGAAACTCGTGTTCGGAGTTCATTTTACGAATGA
GTCGTGA-AATATCTAGAATTTACTGCGCTATATAAAGAAATTATGA-ATATCCAAAAACATATAGTCTTAGTTACTTAGTAAGGTTTTGCAGGATTCGCTTTTGTGTATGTACATG---TAAGTACGCCTTCT----------AAAAATTC--TATTAAAATTAGTAC-CGATGGCTACTTTGCGTATGA
>b6 1546035 1546344|1787 chrX 1545055 1546043 scaffold_93 42250 43294 - 42560|1039 1047
TTGTTCCCA
CTGCCTCTA
>CG14798 1549854 1549999|1792 chrX 1549925 1551659 scaffold_93 47772 49459 - 34862|0 74
GTACATATACATAGTATATCTTAAGCTAGCTACTTGTACTTTATAAATATTGGGCTCACCTTTCTCACTCGCTTC
GTATACAAATATAATTCTACTTTTTGTCTATAATTATATTACATAAATATTGTG------TATCCCGTTTGCATA
>Adar 1639911 1640157|1908 chrX 1639073 1640230 scaffold_100 21240 22392 - 52831|839 1120
CTGCACTCAGCACTATTAT---------------------------ATAATTTTAAAAAAGACAACAGCAACGGCAAGCAATTAATAGAATTAGACGACATAGATTTTATGACAAATTCTGATATAGAATGCAAATTATATTGGGTGCAAGCACATCGCTATGATATACCACTTCATATGATTGACAACCTGCCAACTTTGCGTACCCATTGCAATAGCAAGCACAAAGATGCTTATGCTCGAAAT--------ATAAAGAACAGCTCTAGAATATTTATAG
CTGCGTTCAGCGTTACTATCAACCGGATACATTTGTAACACAGTACATTTTTTAAAAAAAGACAGCAACAACGGCAAGCAATTAATAGAATTAGATAATATAGCTTATAAAAAAACTTGCGATGTAGACTGCACTTTTAGTTTTGTCCAATCAAATC------AAACTCAATTAAATTTGATTGATAACCTGCCGAT------AAACCATCGGAACAACAACGACAGACATA--TAGGTTCAAAATTTGGAACAATGAGAATTCTCAGTAGAATATTTCTAG
>CG14801 1708617 1709093|1966 chrX 1706747 1708621 scaffold_5 6109857 6111968 + 57518|2138 2142
AGGAC
CGTGC
>CG14801 1708617 1709093|1967 chrX 1708661 1708715 scaffold_5 6112005 6112063 + 1298|0 58
GGCATTGGGGGATGGG-CAGCAAGTAC-TTTTAGTTGTTAAGCCA--GCTCGTAATAGT
AGAACTGTGGGCGGGGCCACCAAGTACTTTTTAGTCTGTAAGACGTTGCTAGTTATAGT
>CG14801 1708617 1709093|1968 chrX 1708716 1709566 scaffold_5 6112384 6113310 + 9898|0 442
ACTGTATTCAAAAAGAAAAACACAATCGTAAAATCTCAGCTGGGTATCTCTCCTGGCAATCGGTTTCTATAGCACAGACTAACTGATTTATCTCGGTTAAACGTATAGGTGCCCATTGCCAGGGGTTGGGTCAGCATATACATATACATATAGAATATATCAAGTAAATCGCAAAATTGAAATGACAAAAATGGCAAAAGGAAGCAAGCGAAGGAGGAGGAGGACAAGCCCATAATTATATG-CGGTACATA---AGGCACATTT-----------TGTAAGCGTATATTTATAGATAAATATTACTTTAATCTA----CATATGT-------------ATATACACATATTGTTTTTTTTTTTTCTT----------------------GATTAATTTCG----------AGCCACGAGAAAA-TGTACTGAAGTTTTAACT
ACAAAAAAAAAAAAAAACAAAATAACTAAAAAAAATTAACAAAAAA---------ACAAACAACAACAATATGACAAA-----------ATGTCGTTTATATAGAGCGAAGCCTATTTTTAGTTATACGATATATATAATTACATACATACA-AATACA-CACATATATATGTATATGTATATGA-----ATTATACATACACACA------------------TACATCCATACATATATATCTATATATATATATACACATATATCTTTGTATATATATGTATATATTTATATATACGCACAACTATAAATTGTAAGCATATATTTATAAAGAAATTATATACACATTTTGTTCTTTTTTTTTTTTTGTTTTTTTTTTCTAATTAATTAATTAATTTTGTTTTCGAAGTAACCACAAGAAAAATGTACTGAAGTTTTAGCT
>MED18 1722961 1723040|1973 chrX 1722155 1723021 scaffold_26 636464 637304 + 35359|815 875
TTTACAATAAAAGTGCACATCGCATTTATCCAACAGTTATTTAATTTCTTAAATGTAAGAA
AT--CTATTCAAATGAATCCTCTAGCAACAAAACA-TAGAATATTTTATTAGATATAATAA
>CG14804 1731810 1732637|1980 chrX 1731771 1731875 scaffold_5 5244606 5244706 + 1812|39 104
GTGGGAAGCTGGAGAGGATTTCCATCTTCAGGGGGATAAGTAGTAACAGCCAGAGCTAGGGCAACA
CACGCAAATTGGACAAG----CCGGCGACGATCGGTCCATGGCTAACAGGCAGAGCCAATGCCATA
>CG14804 1731810 1732637|1981 chrX 1731876 1732667 scaffold_26 329682 330530 - 853|0 860
ACAGAAGGCGGAACTATTACGCATA---------TATTCGTATTCGTATACAGCAGCAGGAAGGCAGTTCAGCAGCAGCAACAAATAT--------GCATATATCTATTTTTTTA-AAGTTAATTTAAAATTGTTACA----AATGTTTTATTGAGGTTATGCGCATCATT--AACCAAAAGCAGGCAAAT---------CGCAAATGATAGTAACAAAAAAACAAAACGAAACTTAGGACAAATGAGA---AGAGGCAACCTCGTAGCTACAACCAATCTCTTGGCGTTTCCATTGGTATTATT-GCTATAACAAGTCG-----------AGAAGCTGTCGAG--AGGCGCGCGACTCGGACA------CGAAAGCAAACCCTAATCCCCTGCGCCCCAAAA----CTAGTTAAACTCCCTAGTATTCCGATGAC-CATTCCCTATCCTTGTGGCGTTTGGAAAATATGATTTTTCAATTTGAAA----------------AATGTTGA--AATTGCTTTCTAAAAGTGAGACCCCTGAATTGA--AATTTAAGTGTGCATTAAACTAAACCAACTCCAATACA-AATGAAGATGAAGCAGCAAACAGCAGACAAAACATCCATTAAATAATAAAGTTTTAGTCTATAGCGTACTAACGAATTGATGCTGGGAGCGTTCTGATA-ATGGCGATTTGTCCGAGCGATCGGAAGTGGAAACGACGAAACGTGTTACATGCCTTGCATATGTACATAAC--AGTTCATATACATA-------------ACATACAAGAATTATTG-ATATATACACTTAGACACGCAATTTAACAAATAAAAGCGATATGAGCGCCAAACACG
AT-TAACGTATATCCAAAACGTATACACGAAAAATATGCATATATATATACACACACACACACACA-TACACACGCATATATATATATATATATGTGTGTATATCTATTTTTTTAGAAATTAATTTGAAATTGTTAAAGAAAAATGTTTTATTGAAGTTATGCGCGCAACTTGATCCACTTGCACACACACACACACACACGCACACCCTTTCGGCAAAAATAATATTCAATATGTAC-ACAGACGCTATTAATACCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGCCTCTCTCTGTCTCTATCCATGCTCTTAGCTCTAGTAACTTGTATTCAAAAACAAAAATCATTGCATAAGGCAAACGAATGTTATAAATTTTTGTAAGCCAGACCACGCCCACTTTGCAAAGGAAACGCCCAACTAAA------AGCAATATAAGAACTCATTCCC------------ATTTGGAAAATTTGATTTTTCAATTAGCAACAAACAACAAACAGAGAATACAAAACAAATGCTTTTTAAAAGTAAATTC---AAATTGAACAATTCAAAT---CAATACAAAAAACCGATGCGTAAGCATAACTAAGTTAAATATAAAGTTTAGAGAATATATATACATATATGTATAAATATATAAATCGAAGCACGCCTA-GAAAACATGTTACATGCATCCGCATATATATAAATCTATATATATATATATGTATGGGCACGA----------TATATG-CTTGCATATGTACATAACATATTTCATATTAATATATGCATATATATATATATATATATCTTTATATATATATATATATACATGTATATTATAAATTACAATTTATGAAATTAATAAAAACG
>CG14805 1735161 1735237|1983 chrX 1733580 1735654 scaffold_24 585856 587904 + 58269|1611 1694
TGAACCTTAAGCTTGCTTTCAATTACGTTTAC-TTAGGA------CTTAGGACAAAAATACATGATAATAGAAAAAAAACAGCA
---GCCTTAAAGATATTTTGGTTAACAATTATATTATGATGTTTTTTTTTTTAAACAATAAATGTGTAAAGAAACAAATTGCTA
>CG14806 1737392 1737590|1985 chrX 1737148 1737484 scaffold_5 5251073 5251365 + 6482|244 336
GTGCAATATCTGTCGTCCCCATTTCGTAATTTCCAGTTTGCCGTTTGCAATAAGTTGGAATAAAAGATCACGTGCGTAAAATGGTGGCATAAA
--CCAACAT--------------------------------------CAATAAATGTACATATA----TATATGTTCAAATATGTATGAAGAA
>CG14806 1737392 1737590|1986 chrX 1737485 1739536 scaffold_5 5251539 5253680 + 64276|0 105
ATTTACTTAGCTACTATTTAAGGGGATGAAAAATACACGTTGTTCGGAGTTAGTTAATGTACTTAAAAGTAATCGCAAACTATTTAAATAAAATAAAATAGAAGTA
ATTTACTTAACAACTA---------AAGATAGATACACATTGATTGATATTTGT--ATGT---TAAAAAT--TAGAAAAGAAATTAAGTAAAAAAAAAAA------
>mRpL16 1747386 1747436|1992 chrX 1746241 1747703 scaffold_5 5261250 5262750 + 35368|1183 1259
ATGTATAGC--------------------------TTCAATTAATAAAGCCATCCTTCGTTAATCTGTTACGAAACT
-TTTATAGCGAACCAATAATTAACGTAGTAAATGTTTTAATAAATCAGCCAATTGTTATTCAATTTTT---GTGCCT
>CG17766 1771491 1772177|2009 chrX 1766611 1771506 scaffold_31 1341221 1346169 + 287089|4984 5002
GGT---GAAGGAGCAATGA
AATTTCGAGCGAGCGATTA
>CG17766 1771491 1772177|2010 chrX 1771732 1772557 scaffold_31 1346809 1347745 + 4286|0 496
GAAACGAAAAAAAGCTTAGCAAAATTAAGACAAAACGAAAATGAAAGCATAGCTAGGGCAAACGGGAAGCTAAGCGAAGTTAGTTCAAGCGAAAA-----TTCACAACACATTTTGT------TATTTATTTATATACTTACCCTATATATCTGTATCTGTAT-CTGTATCTAATCCGTATCTGTATGTATTTTAATGTATTACACGATTTTAATATGTCTCTTATTCGCCCCTCTGCGTTCTTTTTAATTTTTAGTGCCTAACTTTTACCC------ATACTCTTAGAACACGTAT-TTCTGTTTCTGT-------------TTCTGTTTCTGTTTGTCGTTAATTTCCAATGCGGAAAAACTAATAACTAAATCCAAATCCAAATATTAACAAATTAAACAACAATTAACCAGATATGCAAGCAAACACAACTACACGAGAA-----------------AAGCAAA--GGAAATGAAAAACGAAAAAAAAAAACA
GAAACCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACAAAAAACAAAATAGAAGAAAAACTAATTCAAACAGCGCCCGAAAACAGACTTTCGATAACCAAAACGATTTGCCCAAAGCATATTATAGAGGGTATTCCCTTCGACATTTTTTTTTTTTTTTTGTTTTAGTAAATTTTCTTTTATCATTAACCATACTTTTTTTTTAATATTA------TTTGATATG----------------CGGAAATTGTTTTGGTTTTCGGCAGTTGAGAACTTCGCTGTAAAATATTTATGTAATGCGTGTATTCTGTAGATCTAAGAGAAGCTAAATGCTATTTGTTTTGTTAAAGAAAAATATATACATATAAAAAAAAAAAAAACTATAAATTATTAAAAGAGGAAAGCAAAAAAAAACTAA---AAAATGCGACCGAAAACAACTTAACAAAAACACAACTACATTTGTTTAAACAAAATGGAATTGAAAACTAAAGCAAAAAGAAA
>CG3573 1783323 1783678|2022 chrX 1782596 1783437 scaffold_31 1362602 1363474 + 23921|767 884
TCGCCGCAGCTGTGCCGCCGAATCGGAAGCGAGCGATAGATGTACTACTCTGTTGATAGTTACGCATAGTGTTAAGCTATTTATTTTATTTG---TTGGTACTTTGTTGGCACTTAGC
TTCTCGCGCAGTTGCACTAGTACATGTATATACAGATATATGTATCA-GCTAAAGATATGAATGTAAATTAGTTAATTATTTATTTTAAATGTAATTTGAAGTGTATTTGCGCTTAGC
>CG11596 1786350 1786675|2026 chrX 1785174 1786437 scaffold_46 250725 251882 - 44810|1198 1288
TAGCCATTGAACCAAACTCAACAACACATCCAAACACCACAATCAAGTCCAAGTGCAAACCCACCTACAG---ATGGCATCACGAACATCT
TATC-------GCACACACACACACACATCTTGACCATAAAACAACACCAGACCCCCCACCCACCCACCGCTCCTGCTAGCACAAATATAT
>CG3587 1797568 1797697|2031 chrX 1797263 1797603 scaffold_46 255847 256183 - 15336|305 340
CACTGTGATTGCGACAAGACAAATGCTAAAATAAAG
---TGCAATTGAGCAAGGTTATTTAAAGAATTAAAG
>east 1878621 1878814|2113 chrX 1874859 1879045 scaffold_28 1555949 1560444 + 109339|4251 4465
TGACGG---CGAAGGAGGGCGCCATGGCCATTAG----CCGTAGCGCCGGAGGTAACCCGGCGAAGTAGTAGGATCAACAAGCAGGCG-ACGTGCAGCTTAAGCGGCGATCTTCAGAACAAGAGGTGAC-CAGCGGCGGCTCCATGGATATCACAAACTCCA-CAATTCCAT--------GGCTGCAGTAGAATAAGTGATACA---CTAAAAAA
TGATTGGCCCGATGCCTGAAGCAACTACAGTTAGAACTCAATCCTGCCAGTGAGAGAAAAGCGAATCAACCAGA--AACTAATAAGCATAAGCGAAACCACAACGAGG-----CGGAACAGGAGCAGAAGAAGAAGCAGGAGCAGGAGAATAACAAGCAAAAGCAAATGCATTTTAAAAGATATATAATAATATAAGCGAGAAAGAGCGAGATAG
>CG4313 1911102 1911570|2154 chrX 1910657 1911199 scaffold_26 1473776 1474288 - 22007|445 543
CTCCGACAGATGCCTTAACACCTTCATCGTCCTCCGTCCTAGCGG-GATATGATATATGTGTGCCATATGGTAGTAATACGATGGGAGAAGTACCCAAA
-TCCATGTGGGGAGTCGAGACGCATCCCGAGTTCCGTCCCAGCAGTGACTATCCATATACATAC------------ATACGAAGGGAGGTTTTCCAGAA
>CG4313 1911102 1911570|2155 chrX 1911374 1911938 scaffold_26 1474950 1475690 - 14995|0 253
AGAAGTATATTGCATTTTATACCAAATGACTTT-AATATCTGGTTTACATTTGAATTCCATGTTTAAGAACAATCGATGTTTGTTTAAATTTTGTTTTTTTTTTCTTTGCTTGTCGCTAATTATTGTACCAATACATA-----------------------------------------------------ATAGATATATCCTTATAT---GGATACGCCCTTTCTATGCCCCCAATAAATGCTTCGAATAAT
AAAAGTATATTGCATTTTATACCAAATGTCTTTTAATATCTGGTTTACATTTGAATTCCATGTTTAAGAACAATCGATGTTT-----------------TATTTATTTGCTTGCCGCTAATTATTGTACCAATACATATACATATACAATATATATGCATATATATATATATATATATGTGTGGTATATATATATATATATATTTATATAATGTATACACC------ATGCCATCAATAAATGCTTCGAATAAT
>CG4194 1925558 1925848|2165 chrX 1924749 1925592 scaffold_26 1727409 1728276 + 11982|906 940
AATATGTGGAAAATCTAAGTAAATCAAACACTTAA
----TCTAGTTATTTAACTCAAATTAGAAACCTAA
>CG4061 1930953 1931050|2167 chrX 1929862 1930959 scaffold_24 1348496 1349593 - 39553|1097 1103
CAATCGA
GGGCGGA
>CG4061 1930953 1931050|2168 chrX 1930960 1931130 scaffold_24 1349723 1349897 - 7476|0 97
TAGATCTCTTTACTCTAAGGAAACCTTAAATTAATGTCTACATATATAGAGAATATACGTGT-------CCTAAAGGCGCCGGAAAATGGCCAGAAAA
TAAAT-TATTTATGTTAA--AAAATATATATTAATATATATATTTGTCAAATAAATATATATAAATGCGCCTAGATGCGGCGGAATATAGCCAAGAAG
>CG4025 1934230 1934611|2171 chrX 1933231 1934230 scaffold_24 654694 655697 + 37520|1033 1033
A
A
>CG4025 1934230 1934611|2172 chrX 1934451 1936457 scaffold_24 656280 658430 + 83648|0 198
TTTCCCAAAGACTGGGATCGGGTAGTTCGA--AGTGACAGAATGCTTTTTGATTGAAGAGTTACATT---TATTGTTTACCCGCGT---TCGTTTTTTCAATACACATTAGCATTACTAAATCGGTAGAAATAAT---------------------CTGTAAATTTGT---------AAAATAAAGAGCAATTAAATAT
TTTCGTAGACACTTCAAT---ATAGTTCGACTGCAGACAGAACCTGACTCTACTTAAAACATGCATTATATATTGTGCACATTTACATATTGTTTATAAATTTCACTTTATTTTTACAATGACGTTCAAAATTATGTTTGGAATTTACAACTTAAACCGCATATGTGTGTTGCAATCAAAATAAATAGAAAAAAAATAT
>Unc-76 1948201 1949252|2187 chrX 1948099 1949102 scaffold_24 1381069 1382215 + 1568|102 1162
GCGCCGCAAGCGGTAGTCGCCG-------------AGGAGCAGGAACCCCAGCTGT------------------------CGCTCCATCTCTCTGTCTGTGTTTATACAATTATACAAC-------------------TTGCATATACACACCGAACACACCACACATAATTT-----------AATGATT---AGTTCGTACT---TTAAAT--------TATTGTTTAAATGCAATCCGTGTACTCTCCGCGGAGAAGA---AGAT---TTGCCGCATAAAGAGAGGACTCTAG-----------TGATTCGTCTGTCGAATATGAGGCACCCAAAGTGGGGTCTTCTTCTCAACGGAGTGCTTTTCCCGGCCGATTC---GACCGACAGAACAAAATATGCAACAAAACATACATGCAATACACATACATATATAGACACATATATATATATATAAACCGAAAAATTTAC------------CGAGAGCGCGCTCTACGAACTCAGCCAGTCCTCCCATGGCAATAATACTCAATTC----TCTCCGCCGCCTCTCTTTCTCTTTAAGGAGCATTCGTAT-TGTTAAAGAGCCGACTCCAACTAAG-----------CTTAAAATACATACATACATATATG-GTAAATGCATGTGGGCCAGT-TGCAAGTCCGCCTGCCGGTGCAGCTTCAATTTTTTCGTCTATATGTGAAA--TATGCAGATCTAAATCGAT----ACACGCTTGCATTATGTTCGCCCAGCTATCTGCGATCGAACGGACAGCCAATCACTAGGTTTTACAATA-------AGGATCTTATCTTGTATGTA-ATATATA---ATCTGATTATAAGAGGTGTGTGGCCTGCAGTCCCTGGAAAATCCGCCGTTTCGAAATGTGTTCCGAGTGCAATTTACAAAAATATGATTTGAGATGGCATCAGAATCAGACTCAGAATCG-GAAAATCAGAATTA---------GTTGCAGCAATTGTTTT-CGCATCGCTTTAAGTTTACGACGCCTAATTTACTCATTTTTTTATTGTTT
ATGACGGCAACAGCAACAACAAAAACAACAACAACAAGAACAGCAACAACAACAGCAACAATAGCTACAGCAACAATATACGCTCTATCTCTTTGTCTGTGTTTAAACGAGTATATATTATTTAATAATTAGTTTATATTACTTATAAATGTGTAACACA-TACGAATAATATATTCGATATGAAATGAGCAAAAATACGCGCTAACACAAATCCAAACTCTATTTGTCATATGCAAACGCTTCAAACTAAACGAGCTAAACCCAGATATCTAGCCTGTTAAAGCTATATCTTCAGCTAGACAGAAATAGCTAGATTATTAAGAAAGAGAAAGTGAATGTGAG---TGTGTTTAAGCAAAGTACGTATTGCACGCAATACTCAAACCTATATGCAAAATTCTTAACTAAAGAAAAAATACAAAAATAACAAAAAAAAAAAAAAGTATATACAAAAAATAA--AAACAATTTACCATATTTAAACACAATGTCGCATAGTCGAAATGTTGTTAAGCTTCA---AGAAATAATAAATAAAACAAAAATTCGAATAGCTAGCATACATATAGATGGGCATGCGTATGTATTGTAATGCCATAAACATTTAAATAATTGTCTGTCTATATATATATTTATATATATATATATACATATATATGTGCATGTGTATGTATATATATATCAGATTCTTTGTCATGTGTTCGTCGCTGTTTCAAAACTGTCTTAAAACCAATCGATTTGGAAACAGTTTCAGCATAAGTAAATATC-GTGTGTGTGTGTGTGCATAGTCAAACAAAAGTTGTTAAACTATACATATATAATCACACCATATATATATATATATATATATATGCATACTAACTGAATGTTGGCT------CCTTGCTCGACTTTTGCTTCAAGCTGTGCTCCCAACGAGTTTTGCATTTTTGCTAAATCAACTCAACTCAGCATCAGGTTTATTATTATTATTATTAATATTATTGTATAATGTCTAAACAATTGTTTTCCATTTTGTTGCAATTTTATTACTATTATTATTATTATTATTATAATTTTT
>Unc-76 1948201 1949252|2188 chrX 1949113 1951360 scaffold_24 1382379 1384920 + 32515|0 148
AAAACGCGTTCTATTTTGTTCAAAACAATTGTTTAATGTAAATGGAGGAAACACAAATTTAATTTTAATT-----TGCATAGAAAACGCTGTGTTATTTACTTTT----ACCAAACAAGCATAAATAAAACGCTAATGATAATGCTAAC
ACAGCGCACTTTGCTCTGTTTACAACAAA-ATTCATTAAAAATGTA----------ATTTTATTTTAATTATTTTTGCATGCAAAACGCTGTGTTATCTACTTTTTATCAATAAATATGCTTGAATGCAAATTCAAATACAATTTAAAA
>csw 1967890 1969821|2201 chrX 1966997 1968400 scaffold_24 1406718 1408326 + 36175|1037 1631
TCGGCTTGCGACCGCCAAGC---------------CATGCGCCTGCGTTGCCGCCGCCACCGACACCGCCGCGCAAAACATGACAAATGAATTTCTAAGT---CGCGACGCCCCCTT-GACACGCC----CCCTTGACACGCCCCCCTG-ACACCCACCTCCCTCCACACGCACACAGAC-CACATATGGTTTTC--------ATTTTAAATGTCACCCAGCCGCCGCCCCAAACCCAAAA---------CCCAATCCCTCGACTATGTTTTACTGTTGTA---CCACGT---TCTACGTTTTTTTTT-----------TTTTTTTATAATTGTAATCTATATACTTTTTTGTAATTGTGTGTA-ATGTA-----ATGTTTAGTTTTATGTTATTGTCTCGCTTTATGTTGTAAGTGTTCCCTGCACACGAAAAGCAGTAA---CCCCACCACCACCCCAAAACCCAAAACCCAGCA------TATTTATGTAGTAGTATTGTAAGAATCCCCGAACCGGTAGT---------TGAGGATACAATCTG-GGCGGAACTGCAGCAGATCCGCCAAAAAACAAAAACACATTTTTAA
ACAGTCTGAGGCAGCCGCACGCTGCCTATGTTGCTGCTGCGCCAGCGCTGCCGCCGCCGCCGACGCCGCCGCGCAAGACATGACAAATGAATTTCTAAATATGCGCGCTGTCATATTCGATATGCAGCTGCATTTGACATACACACATACGCACGCACGCACGCACGCACGCACGCACGCACGCATTCAGTCTTCTCCTTCTTCTCCTACTTCTTACCCAACCTGTTTCTGAAGAGCGCAAATAACGATTTCTAAACTCTTGATTTTTTTTTTATATTAAAAACCCACACATATATACCTATATTTTTAAATGTCCCAATTGTTTGTCCGTTGTTGTGTGTCCTATTGTTCTTAAATGCGTCTATATATATATATATATTTAATTTAATTTTATTGTTTTTTTTTTTTTTGT--GTGTTTATGTCTCGCTTTAATTTGTAAGTGCCCCCCTACCACCACCACTTCCCACCCCCCTCAGCCATGTTTGTATGTAGT--TGTTAAAACAAAAACAAAAGCAAAAGCAAAAGAAAATGAAAATGAAATTTGTAACTGGGCTGCAGCAGCACC-----AGACTAAAAGCTGATCTATAA
>csw 1967890 1969821|2202 chrX 1968401 1968813 scaffold_19 1678127 1678571 - -1081|0 463
GCAGAATCGCAGCAACAAAATATAACACCCGTTCCCTGTTCCAAACCGC--TTGAA----TTTGGTGGAATCGGC-CTTGATAGTATTTCACTTTCTTGAAAATATTCGC----------TTTAGATAAGAAAATTGACTTGTGACAAATATTTACATGTATTGCGCTGGTTACAAACCACAAAAGTTGCTTAACTTTAAATTTT------ACGAATCGACATTTATGATATTTCGCATGCTTGAAAATAGTTGTAGTTTCCTAT--TTGGGAATCATTGAAAAATCCATTTATAAA---GCGAAATCCAGTTCTGGCACGTTCAATTTGAATCGGTTAATTTCTAATCTAGTTGGCGAAAA-----------AGTGAAGAAAAGTGAAGTCCACCTCCTCCAA--ATTCAACTTGAAACGGAAACGGGTTACCGGTTGGAGTGCAAATAAA----------GT
ATCAAATA--ATTTATATACTAGAACTTTCGTCTTCTTTTTCAATCAGACATTGAAGACATTGAGGGAAATTAGTATTTAAAAATAAAAAAAAGGCCAAAAAATATTCTCACACATGCCTTCTGGAGATCGAACCTGACATCGGCCAACTAGTT---TTCATCAACTTAGTGTCAAA--AAAAAAGTGGACTTAATTTAAATTTTTTTTTTAGGTATCAACATTTATTGTAGGCTTTTTGCTTTCAG-TACTTTTAACTAGATAAAATTAGGAATAAATTCAAAATGGAATTTAAAATCTGTGAAAACTAGCTCT-----------TTGTGATAAATAAATCGAGAATTAAAATTGGAAAAATAGATCAATCGATGGAAAAAACGGAAAACAAACCTAATTAAAGAATGCAAATGGACGTGATGTCTTGTGCTGGGCCGTAATGCAAATTGAAGACGCGATTGT
>csw 1967890 1969821|2203 chrX 1968814 1969090 scaffold_24 1408406 1408630 + 4917|0 282
TTTTAGTGTAGTAAGTGTTGACAAA---ATCGATAGAGAAGAAATTAGAGGAGTAACTGAGGCAGTAAGCACGTAACGATAATGATACAAAAAGCGTTGATTGTGATTCGAGTGACAGCGAGAACAGAAACTGAAACAGTAACAGTAACAGTAACAGATGAGAACAGATGCGAATGGGATCAGTACAG--AACAGAACAGAACAGCGGAGACGCCAACCGAACAGAACAGAAAT-GAACAGAAGAGAAGAGAACAGATTAGAGGTAAAAGAAAAAGCTAAGAA
TTTTAGTGTTGTAAGTGTTGATAAACGAAAAGAAAAAGAAAAAATTTAAAGAAAAA--------------------------------AAAAAGCGTTGATTGTGATTCAAATAACGGCGTCAAACGGAACAGAATGAG-AACA---------------GAGAACAGA---GAACCGAAATAGAACAGAAAATAGAACAGATTAGC-------CTAGTATAACAGACCATGCATAGAACAGAATAGCGGCAAGCGCATAAGAAATCAATTTGAAGGCAATGAA
>csw 1967890 1969821|2204 chrX 1969150 1969823 scaffold_24 1410017 1410675 + 3684|0 743
ATTCAGATCCAGATCTATATCTCTAGCAGCCAATTTCTGATTTCCCCTTCCCTCTTAGTT---TTCCCATTAATTTAGTGA--------------------TTGTGTGTATATTTTTAATTGTATATTGAA-----GATTATTTATAGCGATTGTCCATTGTGTTA-----------------------CATTTCAAATGTTCGAAAGAATTGTATTTAGAAAGTTTGTACTTTAGA----AATTATGCATTA-ATTGTGTGTCTGTGTCTCTCTACCCAGTCTCCCTATCTCTGTCTCTCTCTCTCTCTCTCCCTCACTGTCTATGCACGAGTGTTTTCTTAACTAAGTTTATTATTTCAACGCTGAAGCGTAATCAAAC-TATATATGCAATATTTAAGCACAGTACCTTGGGCGCTGCAAAGAAATTAAAAAATTTT---------------AAAATAAAAACAAACTGCTAAATCATAAATACAAAATATATACAGGAAGGAATAATAGCAGCGAAATGTAAATCAATTAGATTATTGTGCAAATTTGAGTAATATATTTAAAACATACCCTTATTTTATCTTATTTAACTTTATGCTTTTGTAAGTGCTTTAAATTGTTATTCATCTTGATCTTGCAAAAAAATGAAAAAACCACAAAACTGAAAAACGAATACAAAACTAAAAAACAACACAAATTATATTTGTATTTATACAGAAAAATAAAACATTTTATATGCGA
ATCCAGATACTGGTTCAATTTTGGAGTGACCCTTT----ATCTCCGCCTCTCTCTGAGTTCACTTTTTTTTAAGACAGCAAGAACTTCTTTATATACTATATTATCTGTCTCTCTTCAACTTTGCTTTGATCATATGGTTATCTTT-TCAGTGCTCCGCTTTGCTATCTTTATTCGCCTTCTTTATTCACATGCCATATGCTCT------TTGTTTTTGCAGCTTACTGTCTCAAGATACCAATTATGCTTTGTGCTTTGTATTCGTAAACGTTGTGACATTTTTGCCAACTGTTTCACTCTCTCTCTCTCACTCTCTCTTTCT--------GTATTTCTTTCGCACA------CAATTATGCACAGAA-CACACACACACACACGCACGCATGATTGTCTTAAATTTGTTTGATTTTTGTAAACATTCGACAAACTTTTTGCGATTTTTTACTCGCAAGCAACACACACTCATA---CATACATACAGAGAAAACATTTTGAGCAATCAATTTACATAAATGAAACCCGA---------------AATTTG--TAATTTAATTTAAACAT---------------TATTTGATTGC---TTTTTGTAAGCGCTTTAA-TTGTTATT------GATTTTGCAGAACGA-AAAAAAAAAACAAAA---------------AAAACCAAGCGAAAACACAAATTACATATGTATTTATACACAGAAATAAACTATTTTTTATGAAA
>CG3835 2001017 2001095|2240 chrX 2000427 2001103 scaffold_24 1330397 1331088 + 39886|590 683
AGGC--TTCTACCTAATAGATTCTATTTTTTTTG---TTTGTGTGTA----------ATTTTCATAACCTTATAATACAGAAATGGCATTAGAA
ATCCAGCACCGCCTCATTTTTTTTTTTTTTTTTGTACTTTGTGTCTCTTATAATCATATTGTTACAAATATAAAGTGTAAAGCTTATAATAAAT
>Pgd 2004545 2004722|2243 chrX 2003273 2005029 scaffold_24 1332841 1334673 + 77201|1275 1531
GTTCCACCTGCTCCACTTTCCCGTTCACACATTCCATGTCATTG-------GCGCCGGTGTCTTAG--------------------------------ATGTTTCTTTTTTTTC-----------TGGAGTACTTT-----AGTACTTATTTATAC-------CATTAATATATATGTATGTATATAGAATTTCATAATTGTTGTTAAACATAACATTAAATTGGTGTTTTT-----------------TTGCTAGC
ATGTCATATACAACA-TTCCATATCTACAATTTGTATGCTCTTATATCAATAGGCTGGCCTCTTAGTGTATTTCTATGCTATTCATTTCATTTTTCAATTGCTTTTTTTTTTTCGTTTTTTTGTTTCAAGTACTTTTGGGCAGTACTTAATTATACAATATGTAATTAAAGTATATGTACACGTATATAATTTCATTGTAATT----AATATATTATTAAACTGGTGTTTTTGTTTTTATCTTCTACAATCTCCAGT
>CG3630 2028085 2028437|2271 chrX 2026791 2028249 scaffold_26 1401518 1403002 - 42629|1427 1591
GGCGGAACAGGGAGCTTGTTAGCTGGGAAGGAAGGAAGGAACATCCCCTTAAATCGTTTAAAAGGAACTCTCGCAACTACTAAAGCGGCAGCTTTAAATTGCAGTAGTTTAGTTTACGGCGTACTTAGTTTAATTTACAATTAGAGCAACACAACACTGAAGACA
GCCAGAGCAGG---------ACTTTGAAAGG---------------------GTTTTTTGAAAG---CACTCGCAACTACTAAAGCGGCAGCTTTAAATTGCAGTAGTCTAGTTTAAAGCA----TAGTTTAACTTATAATTAGTGTTA-ACAGCACTGAAGACA
>CG3621 2029211 2029296|2272 chrX 2028764 2029239 scaffold_26 1819734 1820196 - 14030|455 483
TGGGCCGCATCACCGCGGGAATCGCCTTT
--------AGCACTGAGAGGATCAACTGT
>Cyp4d2 2034825 2034890|2278 chrX 2033710 2035132 scaffold_24 472297 473701 - 33315|1167 1232
GGAATTCATTCTTGTGGGTCTATCCAGCTCTATTTGCATAGAATAAACGTGTATACAAGTATTTAA
ATAGTGAAGCATCATTAGTCTA----------------------ACACGTGCATGCAGTTAATTGG
>pn 2038742 2039095|2281 chrX 2038998 2041035 scaffold_36 703830 705839 + 86658|0 109
ATATGGATTAAGCGATTATGTACAGG-GTATACATGGGTAAAAGAAAGCGTTATGATTAATAAAAAAAAGGA--------CTACAACTGTGGCTC-GGTA--TCGTCAGC
ATATATATATAGAAATTATGTACATGTAAATACAT-----AAATAAAATGTAATAAA-AATAAAGAAAAAGCTAAACTTTCTATAGCTGCGGCTCCGGCAGCTCGTTGGC
>pcx 2092752 2094212|2322 chrX 2092647 2092912 scaffold_36 799845 800068 + -851|109 269
GTAGATCACATATATTTGCATTTGTTTGCCAAGCAAACACCCCAATGGCAGGGACTGACACCAAGGCGGACATGGACACAACCTTGTAATACATATCAGCAAAGAGCAGAAATATGGATATTGAAATCGCAGAGGAGACAACCTTGCCCCGGGCTTCCGCA
---AACCACA-------------GTTTA--AAGCACACACACACA---CACACACACAGACGGAGGGAGAGAGGGGTGTGCGTGTGTGTTGTATATCATTTG-----------ATGAACAATTTAGCC-CAACTGAAACGAATT-----CGGATCTAAGCA
>pcx 2092752 2094212|2323 chrX 2092959 2092962 scaffold_36 800092 800095 + -94|0 3
TGGT
TAAA
>pcx 2092752 2094212|2324 chrX 2092963 2093221 scaffold_26 163510 163767 - 1245|0 266
CAGAAAAACAAACAAACAAACAAACAACAACAAATGAGAACACTTCCAAGAAATCAAAGTA-ATGTTTATAAAACGAC----TGCGTTTAGT-GTATGC-ATAGGAATTAGGAGCAAACTACAATAATTCAGACAAAAACAAACAAAAAAACAAAGAATTCAATTTTAGTATTAATAAAAGTTATAGGTTATACTCGGTATATAGGAAAAAGAGCGCAAATCGAGAGCAGGATATTGGAAAGATCATA-AAAAATATATTTAACTAA
CAGCAACAATTACAAATAATATAACAATAATAAATATATATATAT---ATATATCGATTTATATATATATAATACAAAAGCATGCGTGTAGCAGCACCCGAAAATAAACAACAACAAATTAATATAACTAAAGGAAAACAAAACAAAAAAAAAGAAA---CAGCATCAGAAATTTTCCAACTGCT--GCTGTAATAATTTTGTACTCAAACGTAATCAATTCAAGCA-AAAACAACAACAACACCACATAATAATAAATTTAACAAA
>pcx 2092752 2094212|2325 chrX 2093222 2093441 scaffold_36 801106 801343 + -99|0 254
TTGTTGTAACTTGCGAATTGTATA-ATATGGAAACGGAAAACCAAATGCTTCTCAAACATTACCTATTTTGTTCTTTCTCCTCTCGCTAGCCAATACAGAAATATTAAGCAAACCTAAAGAATTTATAAATGTAT---ATTTAACGGAAA---------------------TTAGTTTAAAGTTAAAGTTAATGAACCCCACACACAGACACAAAACAT----------ACCAAATTCGATTGTTAAAGAGTACA
ATAT-----------ACATGTATGTATATATAAATGTATGTACAAGTATTTAACTTAAACCCCCTTTTTAGCCCATGCTCCC------AATGGGTACAGGGTATACAAACAACAACAAAATATATATATATATATGAAATATAACAAAAAAAAAAAAAAAATAAACTAACTGAAATTTTAAATTAAATTAAATGTAATTTAAATGTAAAACCTAAACAATTAAGTGAAAGTCAAGAACAATTGCTGACGACTATA
>pcx 2092752 2094212|2326 chrX 2093530 2093651 scaffold_36 801419 801522 + 4219|0 121
AATTCCTAGATGATTAAGAGGATGAGGATGAGGACGAGGATCAAGTGGAATGACGACATGTAAAGCTCTCACGTTGCCTTAATATATTAGACTGATTTTTTCTACACACATTTGTAGACGTA
ATTTACTGACATTTTGAGATAATGTTTATGAATATGA------------------AAATGTAAAGCTCTCACGTTGCCTTAATACATTAGACTGATTTTTTCTACACACACACACACACACA
>fs(1)K10 2100709 2102202|2330 chrX 2100602 2101217 scaffold_26 171341 172085 - 5579|111 767
GCAGCCAATGCAACCGAATCCGAATACCGAATC-AATCGAATCGAACCGACTAAAGAAGAGGTCGGTCGACT---------------------CACAGAACTAAATGTAAACTTAAACTTTA---AACCAAT--------------------------------GAGCAATTCAAAACTAAAACTAACAGCGAGCAACAGC-AAGAGTCTGACAATTGAAGACGAATATAACTCAAA-ACCCCGACTCCTATATCGGATATACGTATACACAATCGTAATCCGAGGAG-----GCGCCGCCTTTGTCACACGTTGCTTTTGCGACTGAGAACTGAGCTTAGAACGATAA--------TGTAGCAACAAAT-----------------ACAAACCCAGCGATAAT----AATGTGGG---CGAAACTCTAGTAATAGCGAT-------------AAAAATTTAGATTGCGAATCGATTCACTTGTCTAACGTAACCTAG--------------CGTAACGTAAAGTAGAGTATTGAAATGTAACCGTAACGTAACGTAACGTACCAGTTTCCTATTCGAAAACTATTTGTTGTTCAATTCTAAGTTGCAGC-------------------------CATTTCAAGTATGTGTACACAA
ACCAAAATCAAAATCAAAAACAAAAACAAAATCAAAGCGAATTAAATGCAATAGAGCAAGAGCCGGGCAAGCAGGCGGCTGACAACTAAAAAACAAAAAACAAAAAAAAAATTAAAATATCAATTAACTAATTTATTATAATTAACTTTCCCATTTGCCTTGAAAAGCAGCTCAAGACCCTTTCCAAAAAAAAAAAAAAACTAATAGTTTAACAACAATCAACTAAACAAACAAAAATATTTAAAAACTAAAAAAAAAAACAAAAACAAATAATCATTTTCTACATAAATTTTGTGTTGCATTCTTCA--------TTTGGCGAGCGAGAACTGAGCTTAATTCAATAAATGGAATGCAAATCAACAAATTTCAATAAAAAAACAAAACAAAACAAAAAACAATATAAACTATAGAATTCGAATAGCTGTTAATTGCATTCGATTGTACAATAACATATTTAAATTG---ATTGCTTTTTGCGCCAAACTCAACTTAAAAATATTTGTTGATTGTAACGTAACGTAACGTAATGTAACGCAA-CGTAAAGTAACGTAACGCA------TTGTATTTGTTAATTGTTAA--GTTAAATCACAAAAAAAAACAACCAAAAAAAAAAAAAAATTAATTTATTTAAAATATTTATAATCGA
>fs(1)K10 2100709 2102202|2331 chrX 2101355 2101495 scaffold_26 172256 172433 - 5023|0 178
CATAAATCACAC--TGTAGGC----------------CTTAGATTACACCACTTGATTGTATTTTTAAATTAATTCTTAAAAACTACAAATTAAGATCACTCTGTGA--------------------ACGTGTGCTCGATGGTGTGCATCTACGGATTTGTTTTTGTGTTCTTTTTCCC
AATGAATTACACTTTGTAAGCAATTTAGTTGCTAATATTTACGTATTTTTGCTTAATTGTATTTTTAAATTAATTCTTAAAAATTACAAATTAAGATTGCGTTTAAAAACCGAAAGAAAACAACAACATTTATTGTCTATTGTGTGCATCTAC-GATTTGTTTTTGTGTTTTTTTCTCC
>Or2a 2103651 2103732|2332 chrX 2102240 2103651 scaffold_26 173125 174545 - 39486|1459 1459
G
G
>CG3071 2120728 2120977|2350 chrX 2119814 2121429 scaffold_26 212773 214408 - 35244|918 1187
CCCAGGCCGACGTAGAACAACGATATAGCCACATAGCTTTGATATTAA------GTATATAAGTAGTAGTAGTTTAAGTATAAAGCAGTTTCAATACCCATTACGCATGTATATATCTTTCTTTATTAAATACATACTTAAAATGAACGTTTCGTCGTGCATGCCAATTTCAGTT----TTGAAATGTACAATGAAATTTT--------GTCTGCCGTTTTACGCATAATAAA-AAAAAAAAAACAATGTTAATG-GGGCAGCAAAACAG
CCCGGAGCCAATTCTATAGAC----TTGGCGCAT-GCTTAAACCTCAGCCCGTCGCACATA---AGCATTATTCTAATTGCTTTTCACTTTCGA-------TTCGCATACATAATTATGCACATGCCAAATGGGCGGGGGGATTGTACAAAGCTAAATTCACGTTCGTTTTAATTATTGTTAGAAAAATCATCAAAATATTAATAATAAAACAATTATGTTATAAAAAAAAAACAAAAAAAAAAGAAGAAAAATGAAAGAAGGAAAACGT
>EG:BACH48C10.2 2185010 2185097|2431 chrX 2184092 2185030 scaffold_9 1050028 1050946 + 14965|919 939
CGCATCCTGCTGGGTTGTGTC
CTAATACTCCTCTCATGTGCC
>phl 2199588 2200027|2448 chrX 2198980 2199978 scaffold_37 678316 679358 - 35876|630 1068
ACAGCGAC----------CTGTACCTGTACTTA---------------------CATATATCCTGCGTGATCAACGTGATCCTACATCTATAT-ACTTTTTGTTCTTGTCCCTCTGTACATAAGCGATTCGCGAAGGGGACGGCTTTGGTTGTCCACCAAAGTGAAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAAAGAGAGAGAG----ATGGGTTGCCTGCCGACCCGGGAGCGAAACTTGCTTCTTTCCT------------TGGAACTGACAAAGTGCATTTCTGTTACCACACACAAAACGACTACAAACTGTAAACTAAACTGCAACGCCCATGTGTACATAACTGCATCATAACTTATATACGTTAGGCAAGACTACTGAAACTAAACTAAACTAAACTAAACTAGCTGATCGCAATTACATTATACACATTATACTTATAC
AGAACGACAAGAAGGCGGCTGTACCTGTACTTACTACCCAAGCGATTGGGCAGGCATGCAACAAATGCTTGCATATTGTTTTTATATATATATAAAAATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATGTATATGGTCAAGCTTAAATGCGAGCAGGCCAGCGAGAGAGAGAGAGAGACAGAGTTGCACGAAATGCGCGAGACTCTGGCTGTTGCGCTCTCGCTCTCGCTCCCGCACACACCTGGACCTGTTCGGCTGTGTTTCCTGTATCTT--------TGACCTCAGCCTGAA---------GCAACTCTAATGTG--CATTTCTG--TTAAAACGTATAAACACAAAGTAGA--CGCTGCAATGAGAAGCAACTA---TTAACTATATTATTGTAAACTAACTAAAACTGAAACGCGCATAC
>z 2306364 2306706|2572 chrX 2304452 2306429 scaffold_31 1037730 1039788 + 74724|2073 2138
GGTCTGGAGGACATAAGCGACGCCGACGGTGACGATGATGAGGAGGATGCGGATGCCTATTTGGAT
GATCTGGAGGATATAAGCGATGCGGAGGCGGAAGCGGAC---GCCGATCCGGATGCCGATCCGGAT
>z 2306364 2306706|2573 chrX 2306430 2306787 scaffold_31 1039892 1040310 + -596|0 351
CGCTTCAACC---ATGGGGGCTTTTAATTCGTTAGTTTTA---GGTATACAACTACC----ATCAACCTATCCCTAT-------------------------------------CCCAATTCCACTTTCCACACACATTTTTTTGTTT---------AGGTTTTTTTTC----------TAGTTGTCGCGGGGCGGG------GGACAGCGGTGCGACTTTAGTCCATCGCTGGCCAGGATTACCGACTAAGCCATCATAAATTGTAAATCGCAATCAATCAATTATACAGACACGCAATTATACTGT---GGGCGTGGCCAGCTAATCCACGATGAAAACTTAGGCAAGTT
TGCTCTAACCCGGATGCAGCTGGTTACCACATAGTCTCTATATAGTCTATAACTATCTTTAATTAACATATATATATATATATATATATTAATTTTTTTTTTTTTTAAGTTTTTTTCAATTC-ATTTTTCAAATTTTTATTTTTACTTTTATATTCTATTTTTTTTTTCGTATTTACTTTAATTGTTTTCGGGTGGGCGGGACGGCCAGACGTGCGG------------GCTGGCCGTGATTAACGATTAC-CGATTAACAATTACCGATTACCGTTTACTATTTAC---------CGATTGTCGTGTATCGATTATTGATTACCGATCATCGTTTACC-CTTAAGCCAATT
>CG13759 2439883 2439981|2750 chrX 2439196 2440246 scaffold_31 1286287 1287362 + 23474|693 794
GGAGTCACCCGGCTGGCTCACATTTGGAACAATAATCTCAT---TTATTTTCTACATATACATACATTGCATAATCGTTATTGGAATGTTTTCGTACTACAA
-----CAACAG------TAAAGTTCAAAACACAATTTTTATAGACCATTTTTTTTTTATATATATTCTATATAGATAT-------ATATATATATATTTC--
>wds 2443786 2444049|2755 chrX 2442859 2444319 scaffold_24 1549576 1550924 + 58322|947 1222
AG-TGGCTGGTATCCAGCTG------GAGGACGTTCGATCGGA-----ACACACACATACATTTCTTGGATAATATTATTTTAAAGCGAACAGCCTAATCGTAATTGTAACACCCCCACACCCCCCCACCACGAGCCCCCTTTTTTTTTTGTACGCATAATTTAAAAAAGAAAAGGAACTCTAAAATTCTACGTTTAAATCACACTTTAAACCTCACATTCTACGGCAAAACGGAAAAATTACAAACAAACAAACAAAAACAAAAAAAAAAAACAA
AGCTGGTTGCAATCGCATTGTGCAACAACGACACACACACAAAATCACACACACACACACATTTCTTTAATAATCTTATTTTAAA---AACCAATTACGTTTAATTA------------------------------ACCTTTTTTTTTTTTA---ATCGATTAAAACAAAAAAAGTACTCGTAAA-----------------------------ACATTATTCAGGCTCGCAGCAGTAGCAAAAAGAAACATTCTAAGTTACAATTGCAAAACAA
>egh 2454056 2454761|2760 chrX 2453240 2454057 scaffold_24 572366 573147 - 38691|825 826
AC
GC
>egh 2454056 2454761|2761 chrX 2454124 2454168 scaffold_24 573187 573234 - 1573|0 48
ACAGAAACCAAAAACCAAATTAAGCAAG--GCAAAAA--CAAACGAAAT
ACACAAATCGAAAATC-AATTAATCAAAATGCAAAAAACCAAATGAAAC
>egh 2454056 2454761|2762 chrX 2454217 2454389 scaffold_24 573291 573469 - 3535|0 193
TGATTTACTTTATTTGTACATTTTATAAGCATAAGAGTCACTCAACAATCACACCCACACCCACACATACACCTGCACACACGCACATATAATTGTTGTTTCGTTCTAAAGTCATGG---------------------TCATTCACAACTTTGCCAAAAAGAAAAAGCAAATCAGATCAGATCAGATCATAGAA
TGATCTTTTTTATTCG---------TAAGCTTAAGTTGCACACA-----CACACGCACACACTCACACACACATACACACACACACAC-TTATTGTTGTTACGTTCTAAACACACTGAGAAAAATTTACTTTGGCCGCCCTTTTGCAACACTGTTAAATTGCCAAAACAAAAAAAAACGTTTATAATGCTAGAA
>egh 2454056 2454761|2763 chrX 2454434 2454892 scaffold_24 573526 574089 - 2249|0 432
ACAAATGCAATAGACAACGTCTTGGAGCGAGATCTATG-AAGTGCAT-CACTCACTAGAAAATACAACTATTGCGGCAATAACAACAATTGGGGC----AATAACAATGATCCAAGAGGACCACACGCGAAAACTCTCCATTAAGTGTAATTTCATTATATATATATATTTTTTTTTTTTGTATAGTCTGTAG----------------------------------------TGAAAGAATGCGCTATATTTATATAAACGTAAATAT-------------------------TGTATGTACAT------------------TGTAGATT--TATTATTATAATTACGATTATTTA-----AAAATGTGTACATTGATGTATTGAAAAT-------CTGTTAAATGTCATTCACACCGAA--ACCAAGGTTA
ACATGTGCTATACAC-TTGTCTT-------AATACATGCACGCACACACACACACTAACACACACACACACACACACAAACTTAAAAGGAAAAGCTAAAAAAAAAAAAATTCTAAGTTAATAAT------AAATTTTGCATTAAGTGTAATTTTTTTTTATAGTCATTAGTAGCGAGTTAGAAGAAGAAGCAGCAGCAGCAGCAACAACAACAACAACAACAGTAAAACGCTATAAAAAAAAGATATATATATGTATATATATATATATATATATATATATATATATGTATGTGTGTATGTTTATATTGTATGTACTATATTATGTAGATTTATATGATTATCATTATTATTATTTAAATTTAAACTGTGTACATTAATGTATTGTAAATTGATGAACTGTTAAATATCATTCACACCAAATCACCAAAACAA
>mit(1)15 2462686 2462984|2771 chrX 2462982 2463896 scaffold_46 240437 241415 - 41716|0 2
TTA
TTA
>CG9904 2477876 2478301|2778 chrX 2476974 2478007 scaffold_5 3881461 3882450 + 44927|924 1055
AAAGTGGATGGAGGCGGAGATGATATGAGATGATATGGAACGAAAGAGGGACCACCATTAACCACCGAAGGCTAGACCAACGCCCGTGCGACGCTTGAGCCAAAGACTAAATAGATTTAGGACTAAGTTAGT
A--------------------GCTATCCGAGCATTTTAAATG----------------CAATCGCTAAA----ATTCCACCGCTCTAG----GCTTACGCCAAAGACT-TATAGGCTTAGGATTATTTTAGT
>CG10260 2489454 2489509|2786 chrX 2488159 2489454 scaffold_530 1753 3067 - 77822|1327 1327
A
A
>sgg 2530761 2531790|2832 chrX 2530557 2530831 scaffold_39 398579 398838 - 1042|208 282
GGGAAATAGTAACATACATACACACACTA-AATATATATCCAAGCATATATATATAGTAATCAT---TATATATA
AGGGTATTATAACTTATTTAAGCAATTTATAATGTA-ATAGACGTAGACGTATG-AGACATCATAGGTATATATA
>sgg 2530761 2531790|2833 chrX 2531173 2531375 scaffold_10 3933279 3933486 + -861|0 215
GAGCGAG--------CGCTGATCGATTGTCATTTTATTGCTGCCGCGCGTGGCGATATATATATATATATATATATATATCTTTTAATTAATATTTTAAGTGATCCTCTCCGCAACTCTCTTCGTTAATTAATGTA-----TCCCTCCTATTTTTTTTGACGCCTTGAAAAAGAAATGAACCAATGTATATGTATATTTAAAAGAGTCACTGCATA
TCTCGAGTTTAAAGTCGCTGACCAATTAAATTTTTTTT-------TGATTTCCAATAAGTTTTAACATTTAAAT-TTTCCCTTGCAGTAGTTGGTTTAAGAGAACATACACATATATACTTGCATTTGTACATGCAAACATATCTTAGCACATTTGTTCATACATGCGATCATACATACGTGCATGCACATACATACATACATACATACCTACATA
>sgg 2530761 2531790|2834 chrX 2531490 2531769 scaffold_583 212 413 + 296|0 279
GTTTGCGTAGGTTAAACAAGGCATGGTCTTGCAACAACGTGCAGCATGCAGCATGCAACACACTCACACACACACACACACCACCCTAAGAAAGCAAGAGGAAGGCAGAAGAGGACAGAAGAGGAGGCGAAGATGAAGTAAAGTGGAACAGATTGAGAAAGAGAAGGAGAATGAGAAGGAGGAACAGAAACAAAGCAAAGCCCCGAGCATAATGTTAATGTTATGTTAAAACCTAAATTTAATGCAAATTATTAACGCAGAAAAGAACGAAAGAGAAAAG
GTTGGCATATGCTAAGC-------GGCTTAGAAAAAAC-------ACGCGCTAAGCACCTTATGCAAATAGGCCCAAAGAACAGAA-AATAAAGTAAGAAGAGAAGAGAAGAAAACTTAA---------AAGATGAAGTAAACC-------------------AAGTAAAA----AATTATAAACAAAACGCACGCGAAA---------------------TTTGTTACAGTC-AATTTTGAAGC---------ATGCGGAAAATGAAAATAGAAACAAA
>sgg 2530761 2531790|2835 chrX 2531770 2532128 scaffold_10 3433571 3433950 - 762|0 20
GAAAAAACAAAAAAAAAAAAA
GAAGAAACAGAGGCATTATAA
>sgg 2533448 2534013|2837 chrX 2533550 2533590 scaffold_10 3435730 3435770 - 2091|0 40
CACACCACACACACACATACACACACGCAGCTACACTCGAA
CACCCAACTCACACACACACACACACTTAAACACACTTAAA
>sgg 2533448 2534013|2838 chrX 2533690 2534390 scaffold_10 3435867 3436675 - 6775|0 381
CACAACAATAAACCCATCCACACACACACACACACACTAACACAAACACACACACACACACATGTATGTATGTATATCTAGC-----------------TATATG----------CATTGGGCGCAA-GCAAATATTTAGCATAA----AATCGAAATAAAACCAAAAA---TCCACTTTAAACTATGCA---TAAATAATTAA----------AATAATTATCTGT-ACTATTAAAGAGAAAGAGAAATCCCCGAAGGAATG-----TTGAGAAATAATCGGAAAACCCCTCGC----CCGCGTCCCAAACCTTCAATATAGTAAATAACACTTAACAACCAGATCGCGGAACGTAATATAAATTAAGTCAAAAAAAAAAA
CGCAAATGCATGTTTGTTTACACACACATGCATATGC-------AGCGTGCGTAAGCG-ATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGGCCTTGTATTGTGTATGTGTGTATGATTGCTTGTACATTGGGCGCAATGCAAAATCTTAGCATAATCGAAAACAAAATAAAATAAAAAAAAACACACAAAATACAAAGCAAAGCAAATGCCTAACTGCATATGTAACAAATATGTATTATTATTAAAAAAAAAAGAAAAAAGTAAAAACAAAAATTAATTCAGACCTAATAACAGACACGCACGCAATACGGTGTCACAAATCAAAAAGGCAAAAGGGAAAAGCAAACAAATAAAAAACCTAACGCATTA--GATTGAATAAAAAAAAAAAA
>per 2548436 2548936|2852 chrX 2548388 2548437 scaffold_31 1533961 1534010 - 3847|48 49
TA
CA
>per 2548436 2548936|2853 chrX 2548868 2549254 scaffold_31 1535056 1535426 - 5844|0 72
TAAGGTTTATATATCCGAATCTTTTTTAGTTATTTATTGTACAATAAATATCGAAAAGCCAACGC----CAAC
TAATATATATATTTATAAATCAATTATCCTTAGTTTTTGTTTGAGAAA---AGAAAAAGCATAGCAATTCAAG
>CG2662 2556852 2557074|2857 chrX 2555938 2556857 scaffold_5 5106716 5107660 + 8832|978 983
CGTCCC
CTTTTC
>CG2662 2556852 2557074|2858 chrX 2556858 2557431 scaffold_1 5523367 5523979 + -621|0 235
CACCCACCTCCTTAGCACCTAATGTCATGTACCACACTTAATTTAAATCAATACTCTCTT-----CTGTAGCCAT-------CGCAACCGCATCACTTCGCAGCCAATAAAGC-------TTATATTAAGTCTTCTGGCGGATGGCTAAGATTTTGCTTTAGTTTTAAAAATGTTCCGTAATCCCACACTCGCAAATGCACATACTTTTGAATGGTATCTGCTGAATTTGCAACAC
CCCCCTTTTTTTTCGCTGCCTGCTCCAT-TGTCGTATTTTATTGAAATTCATGTATTTTTAAAAGCCTTGGCCATTTGGTAGCTGAGCCGCATTGGCTCTAAATCGTTTAAGCATTTGTTCTGTATTTTGTCGTTTTTCGGCTGGCTTTATTTTTGCTTGATTTTTACAGATATTTCGTTGTTGTTCGGTTTCG---GTGTTTATCTGTGCATAAAAGTTAATG-CTTTGCATCAT
>CG2694 2573265 2573811|2869 chrX 2572531 2573316 scaffold_48 607922 608697 - 12692|751 804
CTGGCAGCTGTCTAGCG--GCTAGCACACAACTTGAAGAATATATTTTATAAGT
CAGGCGGCTTCCAATTGATGCTGAAATACAAAGCTTTAAATTTTTTGTTTAATT
>CG2694 2573265 2573811|2870 chrX 2573488 2573660 scaffold_10 2598559 2598720 - 1695|0 183
AAGGCGTTCGTCAGCTAGTCTACGTGTTAACTAGTATATACTTTTATGT-----------TTAACTAACAAATTACATGTGAATACTACTACAGTAAGTCTCGTCGGAACGCTGGTGGCTATTGAAATAGCATGTCGCTGTTTTTTTTCTACGGAATCAAATGAGAAATCAAAACAATTTAATA
AATGCGCTT-TCAACAACTTTATGTTATATGTA-TATATACATTTATATATGTACGCAATTTGTTTGTCACATTAAAAATAAATAATTATA-------------------ACGAACAGCATATAAAATAAAAATTTACC-TTTTTTTTTTGCGAAAAAAAACAAAAAAAAAAAACAATTTATTA
>fs(1)Yb 2580042 2580315|2877 chrX 2580212 2582722 scaffold_10 2608611 2611268 - 52269|0 103
CGTTCGACATCATCGGATTCAAAATATTTGAGCAAGCTAAGATCTTGCCATGTGCTATTCTTAAACTTGAACTTGAAAGTGAAATAAAGGGCATGCGCTCAAGA
CATACAAAAGTACCAGTTTTGGTACATTTGTACCACATGGACTTGTACCACTTGTA--CCACACGCCTAAGCTTTGAGGTACAT--ATGTACATACATTTAAGC
>fs(1)Ya 2582648 2582737|2877 chrX 2580212 2582722 scaffold_10 2608611 2611268 - 52269|2760 2834
GTTTTAAGCTTTTGCCTGCGAATCTGTGTTTTAATTGTGAAATTCTTCTTTTTTTTTATCGTTTAATAAATGTTT
TTGT--ATTCTTTCTTTTCAAA----TATTTAAGTTGTG-------TCATTTTTGTTTCCCATTAATAAATAATT
>CG2709 2583641 2583645|2878 chrX 2582836 2584407 scaffold_5 1984203 1985774 + 19415|894 898
GCTAG
ATAAA
>dwg 2586110 2586215|2881 chrX 2586180 2586452 scaffold_48 636328 636606 - 362|0 35
AAACTGATTTTTGTTCCAGAAAAAACTGAAAGAAAA
AATCAGATACGTGTTAGAAGATAAGTTATGACCATG
>CG2712 2590357 2590565|2886 chrX 2590423 2590551 scaffold_5 4636257 4636389 - 1775|0 136
TTTATTTTCGGTA----CTTTCCTTCGCACAAT----AACAAGTTTTAAGTGTGTTCCTATTGTTAGGATAAATTTGATTGGTTTTCCCACCCAAAATAATGCGTGTTTCATACATACATATATATTATATATGGTC
TTTGTTTTTGCTATAAACCTTAGTTTGGTCGATGTAAAACAAATGTTAA---TGAAACAATT-TTATTTTTAATTTGATTGCCTGTTCTACTGAAAATATTGCAAGCCGTAGACATTTTCATATAGTTCGTGTGGGC
>CG3588 2779537 2779626|3167 chrX 2779550 2779628 scaffold_19 120360 120454 + 2155|0 93
TTTTCTAAAGACTCACCCAA----------CTTTTTTTTGTCACCCCACGAA-------AAGCACAAGAATAAAAATGCATTTTGTTAATTTAA
TTTTCTATATGCTCACTCAAATATTTTGTTCTATTTTTTTTTTTACAACGAATCACTTTAAGCACTCGAAT-AAAATGTATTTGTTAATTTTAA
>CG14420 2796623 2796697|3186 chrX 2795079 2796654 scaffold_19 140935 142616 + 20511|1732 1763
GGAGTTGATCCCAGATCCCCAACCGATCCCAG
AGACGCG-TCTTGGTTGCCTAAACCGTACCGG
>CG14423 2802606 2802752|3191 chrX 2801424 2802771 scaffold_19 151702 153138 + 25440|1331 1501
G--------GATCTAGGATTCAAGGTCAGGATCCAACGATCCGACACATTCC----GGCAAGATAA----------TTTTTTTTTCTAATTTATTGTAGCCTAACTT--GCTACTGCCACACTTCCTGCGGCAGGATAAACGATAAATAAAGCCCTTCAAGAATAACAAAA
GCAAGTCACAAATCGCGATCCGAG--CGAGAGCCCGGGGATCGACAATCCCCAACGAGCAAGACAACACAATTCATTTTTTTTTTCTAATTTATTATAGCTAATCCTAAATTAAAGACGCACTTCTTTTGGTCAAACAGA--ATAAATGAAATCTTTCGAAGAGTACTCGA
>CG3603 2805081 2805106|3193 chrX 2804260 2805416 scaffold_19 154755 155841 + 39839|826 851
TCGTGAAATGCATATATGCAATATAA
--GTGAA----------GCACTAAAA
>kirre 2988582 2988959|3451 chrX 2988079 2988587 scaffold_19 413983 414467 + 21345|527 532
ACTACA
GCAGTA
>kirre 2988582 2988959|3452 chrX 2988699 2988843 scaffold_19 414588 414697 + -351|0 144
TTTTGTCCATCGATATTAGCGTAATATTCTGATTCAAGCGGTGTGCTGAACTTTCGAAAAGATCTTGGGTTGTAAATGCAACTGACTTGGATTTATCTGATATGGCTGAAATTCGAGCACTAAGAATGTGACTGCTTTCGTTTGT
TTTATTCAATTCGTATTCG-----TATTCGTATTCGTATTGT---CTAGACTCTAGATA----CTAGGG----------AACTAAGCGAGATAGAGAGAGTGTGGCG-------------TGTGTGTGTGTGTGCTTTTTTTTTT
>N 3027138 3028418|3508 chrX 3025851 3027678 scaffold_19 465463 467372 + 63972|1356 2036
C-----CGTGATCTGGATGATTTGGTATGTTGAATATCGC---GCAAGGATAATTGGAT------------GGCTTGCCAAG------GATAACAGCAAAAGGG---GACTCTTAAAGAGTCCGCGGCTAAG--TTCGATCTAAAATATGCTATATATTGTAATTCTCTAATCTCTACGGATTATGTA--------TTTTTTCCAACGACTCTT--TTTTTTTTTTTTTGAGTGTGTCTATAAGTTTTAGATGTTAGTGCGAAATACGCAATTCTAGCGGAAGAAGCGTCATA------------------AATTGTAGTAACTTAAATTTT---ATTTAATGCTTGTTGTACAGTGC------GCGCCGATCGCATATAT-ATATATATATAT---AGATATTGATATAGATATATGTATATCTACTCATAGATATACC-AGTTAAGAGCTCGTCTTGT-----------GGCGCATTTTATTTTATTGTCGTAACGTC-ATCGTAGCTTCC-AGTAAA--AAAAAAAACAAAAAACAAAAGAATCAACATAAAAAGATGAGC-----------------------AACTAAACTTAGCGCAAATT-CTGATTGGATCGATTA---AACGTTTGTGGG-------------------------ACAATTTGTAGTTGTAA
CATAAGCGC-ACCTAGAC------GCAGGCGGAGCACAGCATGGCGACGACAAGCAGACGTTAAAGGTGTGGGCACTCAAAGTGCGCAGGCACCAGCCAGCCAGCCAGACAGCCAACTAGCTGGCGAGCTAGTTTTTGACTTTTAGCAAGCCCTCC-------TCCCCTACCCTTTGCGCAAAAAAGAAAAAGACCTCACCCACAACAGCTTCTAATATTTTTTTTTTTGACTA-GCCCTTAAGCTTTA-ATTTAAACGAGAAAAACAAAA------CAAAAAAAAACACATAATTATTGTATTATTGTATAATTGTAGTAATTTAAATGTTTAATTCTAATATTTGTTGTACAGTGCGACAGTGTAGACATCGCATATATCGCGTGTATATGCCCGATATATAAACACACATATCTATATATAAATTTATATAGAGATTAAGTTAGGTATTTTTTTTTTTTCGGCATGCATGCATAACCCATACCCAAATCTTAAAGTTGAACGCAGTTTTCGAGCAAAGTAAATGAAATAAATAATTTGATATTTATTTGTAAACGTCGCGCACCAATCGCTGCTTCCAGTAATTAATTAAAATTAGCGCAAATTACTTTTTTAATCAACTATTTAACATGTACGCGTATTTTGTAATTGTAATATCTAATTGTAATTTGTATTTGTAA
>N 3027138 3028418|3509 chrX 3027679 3028534 scaffold_19 467477 468358 + 10232|0 823
GTGACCATTATATCACTAGGCCATAAGACTACGCTAAGTTTTT---TTTATCGAATTCTACATTATTAATTATGGCCC---CACATGCTATATA-TAAATACATAAATTTCGTAGTT----CTGTAGGTTTTGAAACTGAAGTGCTTATATAAACAAAATTGTTAGAC---CGTACACCGC-ATCGAACCTTTTTTTTTACACCAAGTTTTTTTTTTTTATTATTATTATTATTATTATGACTATTATGTATTATTACATA------TTGACTAAG-CTAAACTGTAAAAAGATTCTCATAACTGTTTGATTTAAGT---TGACACATACAAAATACAAAAGGATTTGCA---AAAAAAATTACACAAAAATCACCAATGGAAACGTATAAGTCTA-ATTGAAAGAAAGAAAGAAAAGAAGAAAAAAAAGGAAAAAACCACGAAAAAGACAGTAACCAGCCAAGTTTACTATATATATAA----GGACACTCGACGATCTA-----------------CGATCTAAGTTGATGAAAAGATA--------------TTTTCAAAAAATATGCAACAGAAAGAAAAAAAACGCACACACTTAGAGAAAACTGCAAAATACGAATT---TTCTCGTTCGATTTGCATTAATTTTAATTTGAACGGTATTGCTTTCTTTCGTCTATATTTTGTGTGTAAGT--------------TTTTAATGTGTAAATTGTAAAATTATTTGTTTTCCTAACTTAAACAGCCAGACAGCAAAACGAAACTGCAAA-CTTTTTGACATA--AATAATAAATATTAAATAATTATTTT
ATCATCAATAGCTC-TTAGCATTTACGACTACGTTTAATTATTAAGTTTAAAAAACGAGAAACTAAAAAAAAAAACACAAACAAAATCTTTAAACTAATTGCATTATTATTAAATGTTTAGCTGTTAGTTTGGAAACTGAAGTGCTTATATAAACAAAATTGTTAGCTATATATACAATACGAACGAAACATTCTG-------CAAGCCTATATCATATATTATTTTTTTTTTTTTTAT-ATAATTATGTAATTCTACATAAAACGCTATATTAAGTTTAAATTGTAAAAAGATTCTCATAATTGTTTGAATTAAGTCGATGACGCA-ACAAATTACAA----CTTTCCGCTCAAAAACTTTATAATATATATATAGATATATGTGTATATCTATATATTG-------------------------------ATAAACGATTA----------AATGCGCCAAGTTTATTTTTTTTTTAAATTTAGACAAAGTACGGCCTAAGTTTTTAACGATAAACCGATTTATATAAATAAATATATATATATATATGTATTTTTTCAAAAAATATGCAACA------------------ACATTTTTGTAATCGCGTTAATCACGAATCACATTTTCATCTATTTTAAATTTACTTTATTTTTTAT-TTAGTGTTTTTTTTTTATTATTTTAATTGTTTTGCTGCGCTTTTTCTTAATCTTAATGTGTAAATTGTACAATTTTTTGTTGTCCTAACTTAAACAGC--GAACGAAACATGCAAATGCAAATTTTTTTGACATAATAAAAATATATATAAAATAATTATTTT
>CG3939 3032353 3032380|3516 chrX 3032329 3032491 scaffold_48 358616 358814 + 2064|35 87
AACGC--------------GATTTG-----------GCTTTGGCTTAAACTCA
GCAGCCAGTGTGCCAAATTAATTTGTCGCCAGCCGCACTCCGCCAAAAAATCC
>dnc 3195330 3195502|3738 chrX 3193814 3196205 scaffold_19 670979 673292 + 87433|1568 1740
CGGAGAGTCGTGGGAATTTATCGCAAATTACAGGAAAAGGCTCACAACTTTTTCCTATTACGTTAGTGACTACTATTAACACAGAAAAAACCAAAACAAAAACCTAAAACGAAAAGCAAAAAAAAAAACAAAGAAAAACTCTTGGAAAAAATGCAAAAAAAAATCCACAAAAA
CGGAGAGTCGTGGGAATTTACCGCAAATTTACGGAAAAGGCGCACAGCTTCTTCCTAATACGTTAGTGACTATAATTA--AAAAAAAAAACAAAAACAAAAACCAAA----------CAACCAAAAACTTAAGAAAAACTC-------------------AAATCTATAAAAA
>dm 3241469 3242172|3815 chrX 3241747 3242019 scaffold_10 3754388 3754659 - 1602|0 299
AGTGATTTAACAAATTTGATTTCTTCAATGTGATATATATATGATTTTCTTTC------CGCGCGATTTGATTTGGTAGGGAAAGGTTAACGAAAGCGGTTTTATGAAATCAATTTGAAGTGTTTTTTTTTCGCTGCATATATTACAATATACACGTATGGATTAGATTTAATTAA-----------------CAATTAGCGGTCTGTATATAACATATGAAGTAGAATATCTTAA----TTATTTTTTTGAATTAGTTACTTAACCATGAAGTAAACAAAAAGGAAAACATTTAAAAAA
AGTGATTTAA---ATTGGATTTCTTTAATGTGATAT-TTTTTGATTTGATTTTGAAGCAAGCAAAATGCAAGTTGGAAGCAAA-----AACTAAAAC-----TATAAA-------CGAAATGTTGATAATTAAGAATAGA-ATTAGGAGGGAAACGCCGGAAATGGTTTTGTTCAATCCATTTTTGCCCCAAGCAAATCCTCTTTTCTCTTTATCCTATTTTGTACATATGCTTAGGATCTTAGTTT------CTATTTACTTAACCATGAATTGAATAACAACAAAAAAAAAAAAAAGA
>dm 3241469 3242172|3816 chrX 3242022 3242368 scaffold_10 3754957 3755353 - 4564|0 188
CAAAAAATGAGGACAAAGAACCAAACATTGAAAAGTGAAA-------GGAATAGTTAGAAATGACAGACCTAGCGGAGAAACGAAACACAAAAAAAAAAAAAAAAGAAACTGAAGGGAAAAACACAAAAGGAG-------------------------------AGAACAAAAACAAAAAAAAGAAAAA
CGAGAGAGAAGGAAAGAAGAGCGAATAT--AAGAGTCAAAACACGCAGCGATAGCTTAAGAAGATAG--CTAGCGAGAGCACGAGAAAGAAGAAGAGTAGAAAGAGAAG--GAAGAGAAAGA-AGAGAAGGAGTAGAATTGAGCGCGATTTTTGAAGCAGCGCCAAAATGAGAGCAAATGAAATGCAAA
>CG10802 3340631 3340716|3954 chrX 3338455 3341525 scaffold_10 3914364 3917272 - 73015|2272 2357
AGTATTTTTGTAGTGTTCGAATATACAATATTTGTATGCGCTACGAAAATTCATAAAATAAATATTGCCTAGTTTTATAACAAATA
AATA------------TCGCATTACTTATATTAATTTGTACTA--------------------ATTGGTTTGTTTTCTCTTGAAAT
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ACGGTGAGCTGCATTGCGA----------ATATCGGACGACC--------CATT---------TCATC----GCACAACTGCAGGCACAAAGCA-GTTCCATTTGTTGA--------------AGGACGATGGCCATCGGTTAGT-TGCCATCG-----------GCCATCTCTCTCGCTTTC
ACCTTTAGCTACACAACTAAATAGATAACATCTCCGGTAACCAAAGAAATCATTAGCTGCTGCTCATCTAGGGCGCTGTGGTGGCAATCAAACAGGCTGGATCTGTTGATGCCTGTCACTGGGAATACACCGTGCATCTACTCGCATGCCACAGCAAACTTTCTTGCGCTCTCTATCTCTTTC
>CG10803 3344373 3345064|3956 chrX 3344529 3344592 scaffold_19 1584566 1584638 - 968|0 75
CATTTTCGAATAGCTTTTGTGTA-----------ACATATTCATAG-GCCCTTGGTGTGTAATCGTTGTAGAACCA
CATTCT---ATGGTGCATGTGTGCTCTATTTCGCACACACTCACAGCACCCTTGATGTTTACTAATTATATAAGTA
>CG10803 3344373 3345064|3957 chrX 3344606 3345896 scaffold_19 1584665 1586031 - 9834|0 544
ATGCTACATT------------CATATTTACATACTACTAATTGTA-ATAGTTGCATCCCGGAATCCAGAATTTAAAATTCCTATCGGGCTAGTA-----AGATATTATCGCTCGTTTTGTGTAA---TGAAATTG--------TGTATTAGCATT-TGTAATTTTTACTCGATTTGGTGTATTCATTTTGTTAA--AATTAAACCG-------AATC---AACTGAACTGAACTTAATCTAAATTCAATTTGGATTTAAAACAATCTCAATGAAATCGCAAGCGCAAACAACAACAAAAGAACCGACAAAAAAAAAAAAAAAGAAAAACAAATTGCCTTACAAACAAAAATGTTAGTAAAACTTTCATTTTAGTTTA---------------------GACTTTTTCAAAAATTGAATACTGGAACTG---AAACACAATTTATGGCATTTAGATAAA--GTTAAAGTTAAATA----TAAACTAATTG--TATGGCCTATGTATTGAATATTAATCTAACGT------------AACATTAAA
AAGCTACATTCGTAAACAAGCACGTACATTCACACT-CAAATCACACACACACACACCCACACATCCACAAAC--ACATACCACTTACATTAGTACATACAGGTAAT-TTTTTCAATCTATACAACGCTGATATTGTAACGATCTGTACTATTGTTGTACGCATTTGACTTGAATTGGTAATTAGGCGTAGTTAAAGAATTTAATTGCTATTTTAATTTCGAAAACGATGGAACTGAATCTAAATTTAATTTGGATTAAAAATA----CAAT----------------------ACAAGTGAATC--TGAGCAAAGCGAAAAAGATAAACAAATTGCCTTACCAAC-AAAATGTTAGTCAATCTTTAATTTTAACTAAACATACATATTAAATACAAGGAATTTCTTCGTAAA---AGTACTGAAACAATACAAAAACAAAACAACGCATTTAGATAAAATATTGAAACGAAACGAAACGAAACTGATTGAAAATAGTCCA---AACTAACAATAAGTTAACACACGAACAACTTAAACAACAAA
>AlstR 3510390 3510393|4190 chrX 3510278 3510911 scaffold_5 6227762 6228335 - 4872|112 115
GCGG
GCTG
>AlstR 3510535 3510945|4190 chrX 3510278 3510911 scaffold_5 6227762 6228335 - 4872|258 669
CTCTTGAAAGTAAACTAATTGAGATGGTCACAACATTTTTGAAGGCGACTTACAAACTCGAAACAGAAAATATGAATTTAAAACTGACAAAGAAAACATAAAAACGCGGCGCATATAAGTTAACTATAGTGTATATATAGTAAACAATGTATGTCTATGAGGAGA----------ATATAATTTTCC----GAATTATGAAATG-TGATTGTTTTGATAGTTTAAAATGTGTACGCATTATTTCACTAAGAATAAGACA--------------ACCGAAAAGGTATATTAT--AAACACGCATATATTCTA----TGTTAAATTTTAATACGATTGGTTTCTTTTTAAACATTGAGCGCCGTGTAAGTTGCATTTGTGGCCTAGAACTTAAGTATTTAACATAATAAAATTT
TTCTGGAAATTATA-TAGTGTATTTGGCCATAGTGTATGTGG-------CCACAGAATTCCATTAGACGATTTTTAACTAAAATT-----------------ATTGCAGCTATTA------------AATGCAAATATTACAAACATTGTAACTTCATATGAATACATAACCATTATATTATTTCACACAAGATTTTTTCGGTGTTGCCTAACTAGATAGTTAAGAGTGTTT-----TTTTTTTTCGAATAAATAGTTAAGGTTTAATCCGAGACCCGAAAAATCTGTTGTGCGAATACGAAAATGGCGTCAGTTTGTTAAAT---------ATTTGTTTGTTTTTAACAAATATTTAC---ATGAGCAAAATTGGTATAATACAGCTTCTGAATTTGGTGCAACAAAATGT
>AlstR 3510535 3510945|4191 chrX 3510912 3511180 scaffold_5 6229925 6230129 - -709|0 33
AATTTTTCCAAAATAATAAAAAAAAAAGAAAAAA
AATGTAGTCCAGCTAGTTGTAAAACTAACAAAAA
>Mnt 3546468 3546512|4256 chrX 3545653 3546859 scaffold_5 6295669 6296828 - 15367|912 961
CC-----CAACCAGTAACCCAAGCAAACAACAAACAACCACAACAATAAC
ATTGCAACAACTAATGAGGCAA--CAACAACAATAAATCAATTTTTTTAA
>tlk 3631640 3633912|4368 chrX 3631375 3632537 scaffold_5 6432660 6433937 - 33149|265 1353
CTGCCAACCAAGCGCAATTCGAACTCATAATTCGCCGCCGCCGCAGTAG--------CAGCAGCTACATTAGCTGCCAGTAGTCAACAGCAACTTCAACACCAGCAA---------------------------------CAGCAACTCCAAATCCAGCAATACCAGCAGAATCAG------CAACTTCATTTGCAA----------------------AACAGCAGTAGCAATTATGCGGCCACGCTTCTAGATGCAGCGGCCTTTTGCTACGAAACCGTGATGGATGCAGCCCACTTCCAA--------------------------AACAACAATAATAACAGCACCATCATCAAGAACAA-------------------------TATGCAGACAATGCCGGCAAACGCTGCCAATGCTG-------CTGCAGCTGCAGGGGGAGGGGGAACACCG------------------------------------------------ACCTATCAGGGGAAATACAAGCGCTGGCAGCAGCAACAGTTACAACAGCAGGCGCAACTCCAACAGCAGCAGCACAAGCTGCTGTTGCAGCAAGAGCTGCTCTAAAATATGAAGGGAATGATGACAAGCGAGTTTA-----AGAGAACGAGGAGCTGCCTGCCAC----ACTGCCGCCGTCAGCAATAACAACATCCCAAGAAAATTCACAGCGAGTCGCAA---AAGCATCAACAAACAAAGCAAAAAACGCAAAAAAGGATTACAAAGACGCAGAGAATAGGGGACATTTGCAATGGGAAATAACAAATTATTGCATTATCTGCTGGATTGTGATTGTGGTTCAAACATTAAAAATACACTTACTCATACACACAAGGTAGACACTGCAGACTAATTTTGCCTTAAAAGAAACAAAACGAATAATGTTAACTGTAAATTTTCACTTTGTGTCCATGCATAGTTACTAGTA-ATGATGATATAAATATATAAATATATATAAAATATAAAAAT-TATATAAATGTATAAATTTATATTTATA-TATATATATATATATATA-TATATATATCTGCATAAA
CTGCCAACTAAACGCAATTCCAATTCATAATTCGCCGCCGCAGCAGCAGCTGCTAGCCAACAGCAACG-TACCAACCACAA--CAACAACAACAACAACAACAGCAACAATAATAATATTAATATTAATATGAACAACTGCAGCAACAACAACAATAACAATAGCAGCAGCAGCAGCATAAACAACCACATTAACAACATCTACAGCAGTCGTAGGCTGCACAGCAGCAGCTATTATGCCACAACATTGCTTGATGCGGCCGCCTATTGCTACGAGACTGTAATGGATGCCACGCACTACAAGTTGCAGCCGCCAGTAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCGGCAGCAGCAGCATCATCAACAACAACCACAACATTTAACAGCAACAACATTGCACTCGCAACAGCAGCTGCAGCTGCCTGTATTGGCCATGCCCACAGCAGCGGCAGGAGCAACAACAACGATTAGCGGCAGCGGCACCGGCACCGGCACCACAACAACAACCACACGCACCTATCTGGGCATGTACAAGCGCTGGCAGCAGCAGCAGCTGCAGCAACAGGCGCAACTGCAACAGCAACAGCAGCTATTGCTGCTGCAGCAGGAGCTGCTCTAGC-----TGTGCACTGACGTTAAGCAACACTGCCAACAGTTAACGA-ACGCTTACTGCTGCTGCTACTGCTGCTG-CAGCTGCAGCTGCA--------------ACTGCAACTGCCAATGGATGCAACAGCAGCAAAGGAAAAACAGATGCAACAGCAACAGCAACAGCAACGGTAACAGCAACAACCACAAAAACAACCAGCAA------GAACAACCCGAAGAATTTCCATAGGCGCCT---CCCAAGCAAAGCGCGT-CGCAAATGCATAAAATAAAAACAAAAAACTAAATT-----------AAACAAAAC----------------------------TATATACATGTATAAATAAATATATATGTATATTTATGTATATATATATATATAACATATATATATATATATATGTGTATATATATATATTTATAGTATATATATGCATATATATTATATTAAATGTGATAAA
>tlk 3631640 3633912|4369 chrX 3632538 3632593 scaffold_5 6434728 6434783 - 2200|0 55
CATTGAAGCATACTAGTAAATCTTTATAAATATATTTATATATATATTTATCTCTT
CATTTACACACACTGCAGATTGTTCATATATATATAGATATATATATATATATCTT
>tlk 3631640 3633912|4370 chrX 3632601 3633487 scaffold_5 6434991 6436130 - 10875|0 1186
ACGCTTTTAATCGGAAAAAACATCCCAATTATAT-------TTTAATTCAATTTGAAATATAAAAGTCATTTTTG-------------TTTGTTTTGTATCAAAATCC---------------------AAAAAAAATTGATTTAAATATAA---AAATACCATAAACATTAA-CACCACACACACACACACACACACATATATATATATATATATATATATATATATATATATACATATATATATACATTTGTATATAGTCGTATCTGAACCACAA-ACAAATCCAC----AGATAAAAAAAACTGAAAAATTCAT--AGAATCAAACC-------------------ATTTTTTTATATGCCACAAAGA---------------AAAGAAAATAAGTAGAAATGCAAGA-------AAAATCG--------------AGAAAAAGCGTA--------------------------ATTCATGAGATCAGATCGGATCAGAAAAATCAACA-------GAAAATAAACCTATTTGAAGTAAAATACTTCTAAATACATAGTAAACTAATGTAATAGTTTTTATTAAAATTACA---------CATATATGTATCGATATATATACATGTTT--------------------------------------------------------------------------TTTTTTTTTTAATTTTAAAATTATAATTGTAATGCACTAT-GCGTAA-ATTGTATTAAATATTAATATCCAAGGCATATTAATAGAAATATATATACATATATAAAACCTG-----------------------------------CAAAAAAAAAACATGAACTACCAAGCTAAATGTTTCAATAATATAT--AGATCTATATGTATGTAAAACCGATAT---GAAATCTGCCTACAGCCAGACAAAAAAAACCTTAA--------------AGAGAAAGATCAGAAGAGG------AACAGAAGAGTATGAGCGGGGAGTGAAAGATGC-----------AAGATTCAT----CCAAAAGCGAAAAACATTTTTTTCTTAAGTCTACGCAAAACAAAATGAATGAAAAGTAACCCGAAATTAGTTTTTAGAGTATAAGTATAAAAAATGGAAAATATCGCGATAGAAAGAAACAAAAAT
ACACACTCGCACACAATTGAAATTTCAACAATATGAAATTTTTTAAATGAGAATCGAATTTAAAA-TCGTTTTTGCATTTAAATCATATTTATTTTGTATCAAAATTCTGTTGCATCGTTCACATCCGAAAAGCCAATTGTTTGTAATTTATTTTGGAAGCGATAAACCTGAAGCCCCCCTCCCACACACACACACACACACACACATGCGCGGAACAACAACAACA-------ACAACAACCCAAACAATTGAATACACTAGCAAAGCAGACAAAATATGAGTACACTGTACGAAAGAAATAGTTGAAATGTTTATCAAAAGTAAAACTCATAAACAATAAAAAGCAAACATTTTTATATGCCACACAAATACAGCAACAGCAACAACAACAACAACAAAATATGCAAAATTTTCAACAAGTTGTACCAACTCTTAAAAGTAAATTTATATATATATATACATGACTATATATAATATATATAATATAATATAAAAACGTAAGAACACACACATCTGAGAAAACAAAACAA---------AAAAACTTCTTATTAAATAATAA-CTAATGTAATAGTTTTTATTAAATATATAATATATATGCATATATGTATATATATACATATATATTGGTATATGTGTATGTATATATATATATATGTATATATGTATGTATGTATGTATTACTTATATTGCATAATATATATTTTTTTTTTAATTTTAAA-CCATAATTGTAATGAACTATTGCGTAACAATGTATTAAATATTAATATCAAAGGCATATTAATAGAAATATATAAAAAAAAAAAAAAACAAAACAAAACAAAACAATTTAAAAATATGATAAAAAACAACAAAAAAAAAAAAACTACCACGCTAAATGTTTCAATAATATATAGAGATCTATATGTATGTAAAACCCATATATAAAAATTTGCCCAAAGCAAAGTAAACGAAACTAAAATGTTGAGAAACCGCTGAGAGATACCAGCAAAAGTTGATATACACATAGGGGTTAGGGTGGGGTTGGGGACTCTTTTCGTCGGGCACTTTCATGCCCCCAAATTCCAA----GCTTTTTTACAAGTCCCATTCAAAAGTAAAGCAA--AAAAATAACC---AACTAAT-------------------GGAAGGGAAAAAATTGGTAAAGAGGAAAAAAAAAAT
>tlk 3631640 3633912|4371 chrX 3633488 3635031 scaffold_630 211 1919 + 23023|0 633
GGACGC------------------------------------AGATAAGGACGGCAAGCAG--------AACAAGAGTAATAAAGCAGCGGCAAG-------------------AACTCCCTAA-------AAATAGCAAAGAGCATTGTAAATATT---TATA---------------------------------TAAATAATTTATGCCTAATTAAAGTT---TAAATT-----------------------------------------------------AATGAAGAAAACCAGCAAAAAAACATAAAAAACCAG---------------------------------------AAGAACCATTTCA-GATTTGTATGCAAA-TTTGTATAT----GTACGTACTTTCCTTTAATTTTAGCCAATCAGTTTGTAAGATTAAATTTTTTTTTTGCATCTCTATAAAGAATAATGATATGAGGATAATGATTCCGATTTTTTTTTCCGTTTAATGTAACCGTTAGAATTAGC-CCATAATGGTCGATATCTAAATGTGTGTGT-ATATCGATGTGATGTCATCGATTGTCGATAACGATTGGATGCGAGTGTGTGTTAATTTAATTTGAT
AGGCAACAGAGACAGATATACACGAGACAGAGACGGAAATAGAGATAGAGACAGAGAGATGCATGATGCAACAGGAAGCAAGAGGCAACAACAAGTTGCAACTGAAGAACAAGCAACCCCATAAAACAAACAAGTAGCAAAGAA-ACTGTAAATATTAAATATACATATATATGTAATAATAAAAATAAAATAATACTAATTAATTTATGCCTAATTAAAATTTAATAAATTCGATGCAACAGCCACAAAAGCAAGAGCAAAAGCAAAAGCAAAGCAAAAAATACAGTAAAAAACAAAAACAAAGAAACAAAAAAAAAAAACGAAAAGAAAAGAAATGAAAAGAAAAACAAGCAAAAATCAAGAACCATTTCATGAGACGCGTACAAAGCTTGTGCATGTGCGTGCGTACTTTCCTTTAATTTTAGCC-ATCAGTCT-TAAGTGTGTTTTTTTTTTTTTTATTGTCAGCGTCAATAAATATATG-------TAATTTAAATCTATT------ATTAATGCAACTATGATTATTATTATTATTATTATTATTGTATAATTATAATTATGATTTTTTTTTTGTAACTTTAAT--TCAAT--CGATTGAATGC--GTGTGTGTTGATTTAATTTTAA
>CG2947 3636906 3637715|4373 chrX 3636710 3637724 scaffold_10 2076545 2077452 + 4291|232 1066
GGTTTAGAAATGGGGCAGTAGTAAGACTGAAACATGCGTCGATAAAAAGAAGTTAACAACCAATTACACGAAATCGAGCGAGATTACAAAACAACAAAGAAAGAGAAAGCAACAGAGTGCGGTGAAGAAGATGGACTACACGAAAAACAAAAGGGAAAGCGGCTGCCTTACACATTTTTGCAGCTGAGAAAAAACAAACATTTCCTAAGCTTTAACTTAACCAACACGTAAAAGAACGGGCGACAATGGAGAAAATTCAAATATTCAAAATACTACAAGCAGTCAGAAGAATAAGCAACATTTATTTAAATC-GAGAAGAAAGAGATGTTGGAGATGCTGGAGA--CGCTTCTTCACATATTATTGAAAAGCATACTTGCGGCCATTAAAGTGGCAAATGAAACTATACAAAGGAGCTAGAATATGCTTAAAAACTTAT-CACATTTGCAGTTCACAGGTAAATCAAAAGATTGTCCTGTGACGAACAAAACATAAATGTTTAGACGTCAAGTCAGATTCAAGGGTGCCGATCGATCTAGTTGAACTAAAGCTCG-----AGAAACAACCAAAAGAAAATAAAAAATATATATATGTTCAATAATATTAGCCTAAATT---ACCGAGAACGAAGAAACGGATAAAACTAATCGCATCATTTGGTCAAACA--------AAATTGTACTGA--GTAGGATTTAAATCATATTG---TAAGCAAATGCATTTAGCCCCCCAACATGAAAGCAATCGCCCATTCATTCACACACTCATTCACACACTCATTCAACCAGTGATCAATGGAAATAAATAAACGAATCAACAAGAACCCGA
ATT--------------------AGCTGGAAACAGCC---------AACAGCCTCAGCAGCAACATAATTAATGCAAACAAAATTACCAAAAAAAAAAAACAAAAAAAAAAAAAA----------------------ACAAGAAAAAGAAACA-------------CATACACATGATTTAGAGCGAGAAAA-----------------------------CAACACAAAAGATA-------AGAAAGGAGA--------------------------------AGAAGAATAGATTATCTCTCCTTAACTCTTATTATAAAG------TTAAGGTTCTTAAGAGTTGCTGCTGCATAAAAT-TCGTAACGTATCTTTGCCATAACAAAGAATGCAAGCAAAA------AAAAGAAAT---GTTTCCTTATTAACATATATAAATTTATCGATGATATCT-AGTTGAACTAAAGCTCGATAAGAGAAAAAACGAAAGTAAAAAAATGAAAAAAAAAAAACAAAGCT-------AATATAAATGCACACACACACACATATATACACATACACATACACATACAA---GCATACACATTCA--AAGATTAGCCTTAATTCTAACCCAATGCTGAAGATGAGAAAACACAA---GCAGCAAGCACGAAAACATAAATTATAAATTGTACTGATCACAGGATTTGAATTATATTGTAATAAGCAAATGCATTTATCAGC----CATCATCACACACACACACACATGCACACACACACAATGACACCTAGCTTGCCAAATTCCAATCAATATTGAGATGCGGCTCAGCATGTCCTTAA
>Crg-1 3642105 3642576|4380 chrX 3642071 3642530 scaffold_5 1277637 1278009 - -376|34 463
ATGTTTCAATAATATATAATAAACCGATATGAAATCTGCCTACAGCCAGACAAAAAAAACCT-TAAAGAGAAAGATCAGAAGAGGAACAGAAGAGT-TTGAGCGGGGAGTGAAGATTCATCCAAAAGCGAAAAACATTTTTTTCTTAAGTCTACGCAAAACAAAATGAATGAAAAGTAACCCGAAATTAGTTTTTAGAGTATAAGTATAAAAAATGGAAAATATCGCGATAGAAAGAAACAAAAATGGACGCAGATAAGGACGGCAAGCAAAACAAGAGTAAAAAAGCAGCGGCAACAACTCCCTAATAATCGCAAA-GAGCATTGTAAAT-ATTTATATAAATAATCTATGCTTCATTTAAGTTTAAAATAATGAAAAAAATCAGCAAAAAAACATAATTCTAGAATAAAAATCAAGAAAACCAAAGAC
GAGTT---ATAATCCAAAGCAAACACA-------------------CACACACACACACTCTGCAAATTGAGAGGTAACCGAAGCAGCGGAATATCATTAGGCGTACTGCAAAAATGCATTTTAAAGGAAACAGGAATTT-----------------AAATAATATATATATA---TATACATATAT-----------GTATAAATATATATATATATATATATACATATATATATATACATATATACATACATATA-------CAATACATACAATAATAATATA--------------TTTCGAATAGCCAGAAGTAAGCAAAGCAAGTTATTTATATATG-AATCTAT----------------ATATAACAAAAACAAAAAACAAAAAAACATAAGAAATTCATATAAACACACACACACACAGTC
>Crg-1 3642105 3642576|4381 chrX 3642531 3642643 scaffold_13 2193119 2193227 - 1061|0 45
AAAAGCAAACAAAAAACTTGACGAAACATTGAATATAAAAAAATAC
AAAAGCCAGCGGAAAATGCCATTGAGCATGAAATCCAAACGGCCAT
>CG32789 3645989 3646811|4385 chrX 3645793 3646817 scaffold_10 2076545 2077452 + 4556|232 1079
GGTTTAGAAATGGGGCAGTAGTAAGACTGAAACATGCGTCGATAAAAAGAAGTTAACAAACAATTACACGAAATCGAGCGAGATTACAAAACAACAAAGAAAGAGAAAGCAACAGAGTGCGGGGAAGAAGATGGACTACACGAAAAACAAAAGGGAAAGCAACTGCCTTACACATT-TTTGCAGCTGGGAAAAAACAAACATTTCCTAAGCTTTAACTTAACCAACACGTAAAAGAACGGGCGACAATGGAGAAAATTCAAATATTCAAAATACTACAAGCAGTCAGAAGAATAAGCAACATTTATTTAAATC-GAGAAGAAAGAGATGTTGGAGATGCTGGAGA--CGCTTCTTCACATATTATTGAAAAGCATACTTGCGGCCATTAAAGTGGCAAATGAAACTATACAAAGGAGCTAGAATATGCTTAAAAACTTCACATTTGCAGTTCACAGGTAAATCAAAAGATTGTCCTGTAACGAACAAAACATGAATGTTTAGACGTCAAGTCAGATTCAAGGGTGCCGATCGATCTAGTTGAACTAAAGCTCG-----AGAAACAACCAAAAGAAAATAAAAAATATATATATGTTCAATAATATTAGCCTAAATT---ACCGAGAACGAAGAAACGGATAAAACTAATCGCATCATTTGGTCAAACA--------AAATTGTACTGA--GTAGGATTTAAATCATATTG---TATGCAAATGCATTTAGCCCCCCAACATGAAAGCAATCGCCCATTCATTCACACACTCATTCACACACTCATTCACACACTCATTCAACCAGTGATCAATGGAAATAAATAAACGAATCAACAAGAACCCGAATT
ATT--------------------AGCTGGAAACAGCC---------AACAGCCTCAGCAGCAACATAATTAATGCAAACAAAATTACCAAAAAAAAAAAACAAAAAAA---------------------------------AAAAAAAACAAGAAAAAGAAAC--ACATACACATGATTTAGAGCGAGAAAACAACA-------------------------CAAAAGATAAGAAA------------GGAGA--------------------------------AGAAGAATAGATTATCTCTCCTTAACTCTTATTATAAAG------TTAAGGTTCTTAAGAGTTGCTGCTGCATAAAAT-TCGTAACGTATCTTTGCCATAACAAAGAATGCAAGCAAAA------AAAAGAAATGTTTCCTTATTAACATATATAAATTTATCGATGATATCT-AGTTGAACTAAAGCTCGATAAGAGAAAAAACGAAAGTAAAAAAATGAAAAAAAAAAAACAAAGCT-------AATATAAATGCACACACACACACATATATACACATACACATACACATACAA---GCATACACATTCA--AAGATTAGCCTTAATTCTAACCCAATGCTGAAGATGAGAAAACACAA---GCAGCAAGCACGAAAACATAAATTATAAATTGTACTGATCACAGGATTTGAATTATATTGTAATAAGCAAATGCATTTATC-------------AGCCATCATCA---CACACACACACACATGCACACACACACAATGACACCTAGCTTGCCAAATTCCAATCAATATTGAGATGCGGCTCAGCATGTCCTTAAACA
>ec 3701823 3702862|4447 chrX 3696750 3701827 scaffold_25 1102784 1107888 + 212765|5490 5494
TGATG
TGATG
>ec 3701823 3702862|4448 chrX 3701982 3702851 scaffold_25 1107889 1108631 + 3197|0 890
ATAAAGTGGTGCCAGCTAACAGGCGAATTGCATGGACCCGGACTCAAGGATCAGGCGGAATGCGGAAACGGAGGGGAAACACAGTC-CTTCTATGGTTCTACATGAGAAGTTCCCGCTGTGACACATAACCCACCCACTAACCCACCCATCACCACCCACATCAATGCCAATGTTCCCAAGCACACGCACACAAGCATATTGTACACGCCCATTCATACCTACACATATACTTGCCCAGGAATCGTGCTAAAGCTTAGCGATGCAGCGGCACCACCGAATGGGATTGCAGTGAAGTCCAGCCGCTGCAACGCTTACGAACTGCACAGTGCCACCCGTCGCCCCATTGGACATCGATCGCTTGACTAACTCCACATTTTTTAAACACCCAAAGCCTGACCAGTCGTCCGCCTCCATAAACCACATTAGTGCTTTTTGTTTCGACATCGAATTTTATTTACATTTTTTTACCTAAGCT---AACTAAATACGATTTATTTCTCTGTGTGAGACGCCAGCA-GTTTGAAACTTGGTCGTTGAGCTTCCTTGTGCGTGCTGTTGTCCAACGACACTCGCACTTCCATTTTTTTTACAT-ATTTTTTTTTTGTATAATTTTTAATTTTACTCTAAATCAGTTAAGGCATTTATTTTTGTATTGTCGTACTTAATTA-TGTTAAGA---ATATTTTTTGTGTCT-------TGCATTTAAACGAATACGTGTATTTTTAGTGTTAA--TATAGCTCTTACATATAACATAA--ATTTTTTACGATTTTATTTTGCTATAACATTATTAAAAGATACTTTGCAGCATATGAACAACGAAATAAGAGATGTCGAGCATCCACAAGAATGGGAAGAAAGTAATATTTCTAAATAAATGCA
ATGATGCAGTGCATCCTGAGGAGAAGTGTAAATAGAGCCAAAAGGAAGCAGCAGCAG--CTGCGGA----TGGCGGAGCAACAGTCTCTTTTATGTTAGCGCAT-AGATGTCCGAACTGTTACA---GCCACGCCTACGGCCACGCCTACTGC-----------------ACGCACGCACACACACACACACACACATGTT--------CCCAGCACACACACATATATGCTTACCT-------GTCCATATATATAAC-ACACGTCGCTCGCAACGAA--------CATTAA----CATTAGCTGCAAGAACAAC-AACAACACA----------------------------------TGACTAACTCCAT--------------------CCAGCCAG------GCTTCCGCAAACCTCTTATATATTATTTTTATGCATAT------TTGCTGATTTTTTTTAATATAACATTTAAGTTAAGATCGTCTTTTTTTTTTTTGCTAGCCCTACGCAAGTTTGAAACTCAGCCGCTGAGCTTCCGCCGCCGGAAAGTTGTCGAACGACTACCGGAAGAGTTTTTTTTTTATACAATATGCCTTTTATATA--------------TCGTAAGCATTTATTTTATTTTACTTTTTTTTTTTTTACTTAATAAGCATTTAGACATATATTTTTTTTTTTTTTTGAAATGCATTTTATTCGATTGATTATTTAATAGTGTTAAATGTTTATTTTTACATACTTTATAACGATTTTTTAAGATTTTTCTTTACAGAAAACCCA---------ATTGCACAAATGATGCGCGAAAAGATAAGAAA---CGAATGGTAAAAATGATTTGAATAAAGTAAAATAAATAAATAAATTCA
>CG2930 3723855 3724061|4463 chrX 3721022 3723906 scaffold_58 22007 24849 + 107428|2898 2960
ACCTCAAACCGATTCGTCCTG-----------CTTGCTCCCGCGTTGTGTATTATATATATAT
GCTGGTACACGCCTCCTCCTGGGACACGCCGCCCCCCTCAAATGTTGTGTATTATATATAAAT
>CG2930 3723855 3724061|4464 chrX 3723918 3724140 scaffold_58 24877 25131 + 2118|0 178
TGTAGATGTGTATATGTATGTAAATCCTTAGTGGCCTTTGTCCATTTCCAAGCTAAGTGTAAG--------TGAAGCTGCGAC---------------------CGGGCATTGTTGCATATGAAAAGACATCC-----AACT-AGTTAATCTAATAAAAGAAAATTAATAATATAATCC
TGATAATTCATATATGTACTT---------------TGTGTCCATTTACAATGTAAGTGTAAAACCCTGCCCGGGTCAACGATCGGACCCAGAGATCGACGGGACGGGCCTTGTTGAATATGCCAAGACATACGTTTTAACTAAACTAATCTTATACAAATAAATCAAAAATTGTAATC
>CG2930 3725511 3725533|4466 chrX 3724748 3726438 scaffold_58 26780 28484 + 42456|771 793
GAATACGGATGCCTGATTGTCAT
-AACATGCATATAAGATAGCATC
>VhaAC39 3727707 3728208|4468 chrX 3726625 3727997 scaffold_58 28614 30061 + 70589|1182 1501
GCGCGCT---AGATGATCGCTAAGCATTTGGCATACAAATAATATTACACGTTTTTTTTTCCTGCCTTTCGATATGCGTTTTTTTTTGTTGTCCCTC--------TACCCTTGTTATTGAATTGTTTA-----ATGTATATTA----TATTATGATAC----CGAGTCTGTATGT-TTGTATGTAGCGAGTATTATTGCCGGTCCAGGCAAATTTTTGTCAAGTGTTCAGACCCAAGCCTAGATTTCTCAGTTTC--CGCGGCTCCTCCTCCAATTGTTAT--CAGCATTGGCCCAATAGATAACTATATAATATGTATT
GCCACCTTTCACGTGATCGGC-GGCCCCCACAACACATATAATA------ATTTTTCTTTCGTGTCGTTTAGCATCCAATATTTTTTTTTGTTTTTTTTTTTTCGTTTCCCTGTTATGCAATTGTTAATGTGTATGTATATTATTATTATTATAATATGATACTATTGTATATGTATTTTTTGTTTCGAGTATTATT----------CCAACTATCTGT----TGCTCTGCACGAA----AGTCTTGTTAGGTGCAACGCAGCTCCCTTTTCCATTCCGATTCCGATTTCGGTTTAACAT-TAATTATAAAACAATTGTT
>VhaAC39 3727707 3728208|4469 chrX 3728024 3728420 scaffold_58 30080 30423 + -836|0 192
GCTTCGTGTT---TGTGTACATATGTATAATTATCGAACGGAACGAAAACAGTTCAAATTGAATGTAGAGAAAAGAAAC--ATCAG---CACCATATGTTAACTACTATATAGAAAATGCATACTTATACAAGAACTACATATGTGAATGATAAATCAATTATTAAAACATGTTTTCAAACATTCCCTTAAAC
GCTGCGCATTAAATATAAATATAAATACAAATATATA---------------TCCATATATCATATTGTGAAAATAAACCAATCTGTTTTACTGTATTTCAGTGCATATATAAGCAATGAATGTTCTTTCTGAGATCGACTGTCCCAGTATGGAATCTATCTTGA----------TGAAACA-------GAAT
>CG15239 3735530 3735724|4477 chrX 3735417 3735593 scaffold_58 38238 38432 + 10388|131 194
GCGGCCAGCGCGAGTTTGCCAACATGCTGGGCAATAGTGTAAATACCTTGTACCGCCGCAGCTG
GCGGCCAGCGCGAATTCGCCAACATGCTTGGCAACACTGTAAATACCTTCTATCGATGACGTTG
>Vap-33-1 3798160 3799342|4560 chrX 3797849 3798309 scaffold_58 121690 122122 + 14227|325 474
ATGCCATAAACGAACGCCAGCAACATGCTACATGCAACGTGCAGCAACAGTAACAGCAAGAACAGCGGCAACACCATCATACAGCAACAGCAACAACAAAAGCAAAAGCAGCAGCAGCAGCAGCAACTAACAATAGCAACAACAACGAAA
ATGCCATAAAT--------ACAACA---------------ACAGCAACATCAACATCAGCAACAACAACAACAACAACAAATAGCAACAACAACGAACACAGCAACAGCAACAACAACAACAACAACTAA----AGCAGCAGCCACAAAA
>Vap-33-1 3798160 3799342|4561 chrX 3798310 3798683 scaffold_37 807832 808219 + -1769|0 412
GAAGAACAGCAGCAGC----------AGGAGCATTAAAATAAATTTAATTG---------GCAGAAGAAACAAACCACAGAGACGAATGTAAAGCTGACTAAACCGGGGACCGTATACATTTAAACGGTTGT--ATTGAAAATCAAAAATAATCATTG------TTTGTTAGCGAAAC----AAGTATCGCTCAGAATAGTATGGATTATGATGTGAGAAATATTGTTTGGTTCCAACATATTGCTCAAAGACAGATTGGCAGTTCTTGTTTTTAATACGAATCTTAACGAGACTTAAGTGTAAAGCATTCGAAACAATTTTAAGCTGTAT-----TGACGCT---TCGTGTATTTCAACCAAAAATATTTAAGTTTTTGCAAGATCTCGCTTGAATTAGTCGCAACCGGACT
TGCGAAGAGCAGAAATGCCTTCATATAAAAGC-TTACAGTCCATTTAATTATAGCTTGGCACAGAAAAAGGTATCGGCCTTAACAGTTGGCTAGCTTAATAAA-----GAAAATAAAGCTGTGAATTTTTGAGAATTGTTTAACAAGAACAATTTTTACGGATATTCCTTTGCCAAACCTCAAAACATGGCGCATAACAGTGTGGCCTTTTACACATGTAATATTTAACAGAGCACTGTTAACTCTCAACAGATGCTCGTTAGCTTATGATAATAGTTTGCAGTTCAATGCGGATTA----TTAAGGCCTAGAAACA-TTTTAGCTTCTCTAAGAACAACGCTCTTTTGTTAACGTTTGCGTTAAACATTTAA--------------CAGCTAAGCGCAGGCGCTGCGCTGCT
>Vap-33-1 3798160 3799342|4562 chrX 3798782 3799349 scaffold_5 5217398 5217884 + 3767|0 582
GCTAAACAAAACAAAAAAAAAAAAAAAAAACAAAAAAAAAACCGCAGAGAAAGGGAAAAATAGAAGAGACGTAAAATCGTATTTTCGCAAGGGGGAACATCTCTCAAGAAC--TCTTTAAAATCCGCTAAGATCCATACGT--------ATATTTGCT--CAGATTTTCGATTGCATTTTTTCGCTATTATTAATTTGTAAGAACTTAAGTTTAAAATGCCTCACAATTCGTTTTAATAATTTTTCGATGCATTTGCAA---ACGGGAAAAGTCAAGT--ATTTCAAAGAATAACAAAAATTATCATTAATCATACCTTCTCGACGAAACTAAAAGAAAAACCAATTTGTTACTTGAGTGCGAGAATAAACTTCAGTTTTATCAATTTTTTTTATTATTTGCTTTCTTTTTGTTAATTAATTTTTTGCAGCCACATAGACCTAGATGTAAAATTTAAATCGAAAACAGAAACGCAAATGTCAAGAAAAAAACATTTAGCAAAATGCAACAAAAATTAAGAAGAAACACTTGTATGGAA---AACCAATCAAT--GAAAAGCTTCAAAAAATAAAAAAATAAAA
GCTAAACAAAATAAAATATAACAAAAAAAATACACCAAAAA--ATTGAAAAACGAAAAAA----AAAAACATAACAAAAAGAACCCTCAAAAACAAAC------CAAGAATCTTTTTTTAGGTACACTTAAATCAAAGCGTGAAATATTATATTAGTTAATAAATATATAAATGCTTTTTTGTCGAATCACTA----TAGAAAAATTAAATGAACAACAACTTTAGCTTTATACTCGTACATTT-----ACATTTGTAATATATTACATAAGTCTAGTTAATTACATTAAATACAAATAATAATAATAAA--ATAC----------AAAATAAAACAAAAAC--------------AATATAAGAATGAAAATCAAACGAAGCA-------------------------TAGCAAATTAATTC--------------GAAGAAAATATAAATAATACAACAAAAAAAGAAA---ATAAACAAAGAAAAAAAAGTGTA--------------AAAACAAAAAGAAACATTTATATGTAATGCAGCCAGTTAATATGCATAGCTAAAAATAATAATAAAACAAAA
>brn 3950701 3951034|4792 chrX 3948401 3950701 scaffold_26 905196 907546 - 77382|2418 2418
C
C
>cib 3955444 3956218|4798 chrX 3954876 3955537 scaffold_26 911461 912184 - 27880|644 737
TGCGAAAAAGTTGAAGCACACCGAGACCAATGAGAAGAACGTGCTGCCCACCAAGGAGGTGATCGAGGCCGAGAAGCAGGCTTAAAATGGGGGC
TGCGAAAAAATTGAAGCACACCGAAACTAACGAGAAGAACGTGCTGCCAACCAAGGAGGTCATCGAGGCCGAGAAGCAGGCCTAAAGCAGCAGC
>cib 3955444 3956218|4799 chrX 3955721 3955991 scaffold_28 1102189 1102427 + 1236|0 281
AAGTATTTTACTATTATCGTATTTCGGTTGTCCGTTTTTTTTTTTTTTGCAATATTTTTAC----ACATATATATATATATTTTTTGTATTAACAAGCAAGAGAGCCAGTCTCATTCCTACAGCGTAATTAACATAAAATAAACATTCGTCTATCCCATATATATTTGTGCATAAATGTTTCCAAAACA-CACGACAAACACACACATCATCATCGGA----GGAAGAATAAAACGCAGATAC--AAAGCAATACGACAGCCAACTCACTCAGAACATTTAC
AACTATTTAAATATCATTTGATTTT---------TTTTCTTATTATTTTCATTATTTTTATTTTAACAGCAACACAAAC-------GGAGCAACAAGAAAGTGAAAAAGATC----------------TTCACAGAAAATAAAAAATAGCTGCAAATATATATATATATATAT---TATATAAAGAACAGCCCAGCAAACTAAAAAACTATCATAAAACATTAGAAAATTTAATTGTAGCTATTTAAACAAAAATGAAA--------ACTCAAGAAATTTAT
>cib 3955444 3956218|4800 chrX 3955992 3956239 scaffold_26 912952 913213 - 9840|0 252
ACAAGAAAAGACAGC------AAATATATGAGAAATACTTTTTAAAAGAC-ACGCAAAACGTATGAAGCGTATAAAACAGAAAAACAAAAAGAAATAC--GGTAGAAAAGCATCTATA-----TAAAGAGTATGTGTAATTTTTTAATGAACTTTTTTTTATATACTTTACATACGATATATTTATACTGGGAAAAATAAAAAAA------------AAACATAAATGTAACATTTTATAACAAAAACGTACT
AAAAAAAAAGAAAACGTTTTAAAACAAATGAAATTAACTATGCAAAAAATTATATAAAAAAAAAAAA----AAAAAACTAAAAACTAAAAACAAATGCAAGCGAAAAAAGCAAAAACAAACCATAAAGAGTATGTGTAATTTTTTAATGAACTTTTTTTTATATACTTTATATATGATATATTTATACTGGGAAAAAAAAAAAAACTAAATAATAAAAAGCATAAATGTAACATTTTATAACAAAATTGTATA
>CG4865 3960032 3960107|4802 chrX 3959097 3960089 scaffold_26 922224 923219 - 3791|991 1048
CCGGTCGTCTCAAAAGTATATATAATATTGTATGATATAAACTAGTTTATAACATTAA
-----CATTGTATAAATATCTTTAGTAC--TATTAAAAAAAAAAATTTATAATTATAA
>CG4865 3960032 3960107|4803 chrX 3960090 3960233 scaffold_31 239495 239635 - -1152|0 17
AAACGGAAACTGTAAATG
A--------TTGT-----
>CG4857 3971232 3971984|4815 chrX 3971118 3971332 scaffold_26 940036 940231 - 4211|117 221
AAACCACACAAACAGCAATCGCTGCAGCGTCAGCGAAATCGAAATCAGCAACA----TCGGCGTCAATCACAATAGCAACGTCAGCAATATCGGCAGCAATCTAA
-------------AGGAATGGATTCAACATGTTCGGCATTCAAACCCCCGATGCCGCTCGTCGTCCTCTGCCGTTGCACT----------TCTGCTGCAATTTAA
>CG4857 3971232 3971984|4816 chrX 3971400 3971439 scaffold_0 6647891 6647930 - 1807|0 39
AAATTTTTTTTTTTTTTGCTGGGCTATTGTTTATATATCT
AATTTGTTGTTTTTTTCTTTGGGTTATTCTTTATGTACAT
>BcDNA:GH05057 3977507 3978084|4825 chrX 3976193 3977769 scaffold_26 945384 946957 - 43223|1372 1643
CCCGGGACCTAATTGTATATATAGCAAACTATCATCCTAGTGAATTTACTTAATGTGTTCCGTCTCCTCATAGTTTAGCCCCAATTTA-TTTAATACTTTTTAC-TTCATATTTTCTAT-----ATATTTTATAAAAACATGGTGT--AGGCAAACATTTTGATGATTTAAGTTCAGACTAAGTCACTCTTTTTTTTTTTTAACCAGACATTTTCGGATTGAAATCAAATGAGATTTTTTCTAACTACACCGCGTACTTGCGCAAATTTTAA
---GGCATCGGAT------------------CCATCCAA--GAATTTATGT-ATGTTTTCTATT---------TTTTGCCTCAACTTAGTCTATTGCGTATTATATTTGTAGTCTCGTTGGCCAGTGTCCAATTAAAA-ATGATGTCAAGTAACATATCATAAGCAACTAAATGTGTTCATAGCTGGTCTATTGCTAGTCGAAC---ACATTTACAAATATATTTTATTCGAGTTACTTTTAAGAAATGCCAATTACT-------ATTTTAA
>BcDNA:GH05057 3977507 3978084|4826 chrX 3977770 3978253 scaffold_7 4107832 4108305 + -1435|0 335
ATATGAAAACACTACTAGTTGTATAATGCTCAAAGAAAAGTTGTATAATATCTTCGTAAGATAGTACCTAGTCTATCTGCACGAAGGTTATTTATTTTACCTCGAAAGGTA-AACCCAAATGAACTAATTCTCTGTCTTTGTTGTAC-CTAAGCTATAAGAACGCTTTAAGTTGCCCCATTGTATTATATATAGGCCTATAGGTTT----TGCAAATTGTTGGAGATTAGTTACATTAGATATA--------CATAAGCTTCCCCTGTGTGCCTCCCAATTGACGCAAATAAAATT-------GGTAGTGTTATCGAAACCTATTTAAAAAAAAAA
GTCTAAGAATACTCCTGAC-------------AAAACACGATATGTTGGATTTCCTTAA-ATGGAAACT------------CTAGAGTTTCTGA--TCATCTCAAAAGGCACAAGTTATGAAAACTTGTTTTAAATCTTTTTTGCATATTAAATTGTGATTA-ATTACAATATGCCTATCCGCAGTTCTCATATTTATATTAATGTTAAATGCGAATTGTAGTAACATTGTTA-ATTAGTTTTAATTATTCGTATATGTTTGTGTTGTGATAAGCTCGCTTATGTTTATCAAAATTCCTTATAGACTACGTCATTTAACCATATAAGAAGGAAAGA
>CG15572 4115726 4116322|4989 chrX 4115206 4115729 scaffold_26 893384 893915 + 10605|541 544
TGTA
CGCA
>CG2982 4166827 4166986|5060 chrX 4165341 4166856 scaffold_26 1233832 1235364 - 51499|1503 1537
-----ACGGCAATCGAAAGCGAGTTGCTGTTGATA
CCCACACATCTATCATATATCAATTGTTATTAGTA
>norpA 4207272 4207691|5115 chrX 4206132 4207820 scaffold_26 1302498 1304068 - 7063|1304 1760
GATTCCCAGATCAATGGTCAAAAGGGGAAAGAGCACCGCGATACCAAACAGAATAATAAATAAAAAAAACACACTAAAAAACAAAAAAAAAGAATGCTGATTTAGCTGAAGATGCTAACATATATACTT-TTCCTTATATACTACATTTACACACTCATCACTCGAAAACACACACT-------------CGCCCACATCTTGAAAACTTAACTTTACTTACAAATATTTAT--------GTATATGTCTTATGCCGGAAGCATAAGCTTATATTCTTAATACCTAGAATT------CAAAAACACTTTGTGCTTTATATTTATTTAAGATTCTGATGAAGATAAAAGGATAAGGAAAAAAAGAGT---------CAATGAGAGGGCCACGCAGTAATGTGTGCAGTTTATTGGGGACGTGCTCCTCTCGAATTCATTGTAATTTATTTTGAAAAAC
-------ACAACAACGGTAACAACGGTAACAACAACAACAACAGCAAA------AATATTTAAAGCGAAT---CTTTTAAACAAAAAAAAAGAA--------------AAGAAGTTTAGTTCTACGCCTATTATTTAGAAATTGTAAATCTACGCTGAAGAAAAGAATTCAAAAACTGTAATGAAAAGAAAGTCAACACTTTG-TGCTTTATACTTATTT--AAGTCGTTATAACACGAGGCATATATAACTATCCAAAAATATCTATATGCATAGATAATACATCTAATTGTTGGAAAAAAAAAATATATA---TATATATATTTCA---------------AAAAACAAAAAGAATGCAAAATTTTCTCCAAACACTTGGAAAACCACATTTAATTATTTGCTGTAAAACCGCAAAAAATACTAATCAAA-TCATATTTACTTACCAAGAAAAAC
>CG3626 4215580 4216373|5125 chrX 4214687 4215697 scaffold_24 1830214 1831239 + 45607|927 1056
GGATCGA--CGGAGCTGGGCTCCCGACCAATATCATCTGCCATCTGGACGTGCCAAGCAATGAAGAACTTCGT-TCATTT------CTGGTTCAACTCG---AGAGTCTCAAAAGCAAAGCGATATTATT
CTTCTAACCCAAATCTGTGTGCCCCTTCTCCATTCTTTTATATTT-GATATACAGCCAAGCGAAAATGTTTGTCTCATTTCGTTCGCTCGTTCGTCTCACTTCGAGTCTCAATTGCAAAGCGATATTAGT
>CG3626 4215580 4216373|5126 chrX 4215911 4216138 scaffold_8 2962040 2962232 + -585|0 230
CAAATCGTGTTCGTTTAAGCATCGAAGCCTAAGTACCAAAATGCCAGAAGATTTCGGGTGATTTTGATTGTTTGTCAAAAGTGGTGTCAATTAAACGTGTATGTACAATAAGCTCCACATGCGATGTATATATAAGATATATCGCAGT---ATATATAAGAATCTTCCGTGATATTGGAATAATTGAGGTTTTTGCACATTGTTAAAAAAATGACACAAAAAGGTTACACA
CAAAAAATGTTCGTTT---CGTCCAA-CAGAAACAAAAACAAATGAAAAAGTT---GTTGGCTTTGATT-CCTGATGCAAGTTGAACTGGTTAAATGAGCAGTGGCAGAGTACAGCACAGGCAA------------ACAGGTGGCAGTGACATTTGTTCGAGTGTAGCTTAATACCAAAAT------GCATTTTCCATGT-ATTAAGAGATGGACAAG-----------CA
>CG3626 4215580 4216373|5127 chrX 4216139 4216249 scaffold_26 1314079 1314186 - 1435|0 110
TTTTGCTCATGAAGAAAAATAATCAATAATAAATTTGTTAATGAATATATGAGCTGAAAACTAATAGAAAATATTTCTGAGCAGTTTTTCAGAAAGTTTTGATTAATCTTT
TTTGGCGCTTG--GAAAGGCGACCG-TAAGACATTTATTGAATGCCACATGAGCTGAATGCTGCCCAGGGTGGTGTCTCACTCGATTTTGAAAGATCTTTGCTGAACCTCT
>CG3626 4215580 4216373|5128 chrX 4216250 4216420 scaffold_8 2962330 2962504 + 1447|0 134
TTTTTTTACTAACCCAGACGATTGA-----------CTTTGTAATTTATGGTGTGCTACTGTGTGAATCACACCTCATATTATAAATTATATTGTACTATATTTATACAAATACATTTACTGTTTACAAATGCCT
TAATATTATTAAATCTGACAATTGCGCAACAGAACTCTTTTTTATATATTTTTCTTTATAGAAAGAATCACATTTAATACTACAAATTATTGTCAACTATAGCAATAAAACTATTTCTATTTTTTCTCAATTTAT
>bi 4328863 4329701|5325 chrX 4327323 4329149 scaffold_24 2000529 2002374 + 74186|1664 1991
CAATTACTGGACGGCCGCTCCGATTGTGAGGATGCCGGTCTCGAATTGGAACTAGAGTTGGAGGAGGATGTCGAGGATCTGGATCAGGATCCGGATGAGCAGGACGAG---GATCGCAGCTCGGTCATCGATCTTGATCTGGACGTCGACGTCTGACCGCGAACGGATCAGCGACATTGCCTCTAGCCTCTGAACTACA---------------------------------CGGCC---ACCGTCTTTGTGGTTTAGCGTAGTGTATATGTACATATATATATCG--GACGATTTGGACCCTAGACTATAGGCATTTGTAGCATATA
CAATTACAGGACGGCCGCTCCGACTGCGAGGAGGGCGGCCCC------------------------GATGCCGATGAC---------------GATGACGACGACGAGCACGATCGCAGCTCTGTCATC------GATCTGGATGTCGATGTCTGACCGCAAACGGTGCAGCTGCAGCAGCTTTAGCTCGCGCCCAACAGCAGCAGCTGGGGCCCAGCATTGGCCCGCGCTCCGGCCCTGGCCAGCGGTGGCAGTTAACCAACACTGCGCTTCAGTGTAAATAGCGCCAGCGAT-------CTACATTAGGCATATTTGTAGCATATA
>bi 4328863 4329701|5326 chrX 4329168 4329424 scaffold_24 2002449 2002699 + 1528|0 265
CGTTGCGAACTCACTCTGCCCGTTTATCGCCAGTGTTAAGTA-----ACATCTTTTTTTTTTTTTGTCTCGTT--TCTAAGCAAAGCCTAGCCCCTAGAAATCGCTGGCGATTCGCTGGCAAAGT--GATGGAGAGGTCTAATTGAAGACAGAAGGTAGCAAAAACAGAAGAAAAAAAAAAAATAACACAAAAAGGAAACAAAAAACAGGAAAAAGTTAAGGCGACGTGGCAAGAGAATCGTCGTAACTTTTAGCGCCTTGAAGGT
CGTTGCGGG-TCGCTTTG--CGTATAGCTGTAATCCGATATATATATATGTGTTTTTTTTCTTGTGTGTAATCGATATAAGCAACGCCTAGCCTGTAAAGTT--TTTGTGATGCGCAGGACCCGCCAGCTTTGTAAACCTAGTTTAA---AGAGAGAGAGAGAGAGAGAAAGAGCGAGAAACATAGTAGAAGAAAGCGAGGCGAGAGAGAGAGA-------GAGAGAAAGAAAGAGAGAGATATTTGCTTTCGTTTCCTTAAACGT
>bi 4328863 4329701|5327 chrX 4329425 4329780 scaffold_6 345559 345863 - -361|0 296
TCCAGACTTCAAGATCAAACAGACGGAATAAAATGAGAAGTAAGGGCAAGGGGCTATCCTCAGACAAATTTATGT------ATCACCCATATATGTATATTGATTGGATT---GAAAATAGCAACATCAAAGATGGCGCCTCTTTATATACATCTAGAACACGCATATATATATATATAAATATATATATATAGTATATATAGAAGCTGGTATATATACAGAATGTAACCTTAGTAAAACATACAAGAAAAAACAAA-----------GAAAAACAAAAACCCACAAAAAAAAAATA
CAAAGAATTAAA----AAATAAATAAAATACAGTTTAAA-------TAAACAAATATATTAAAAATAAATAATAATATTAAATAACCAAGCTATCTACGGCAACTGAACTCAATAAAATATCAACTT----------ATTTCTTTAAATTAAATTCAGCTACACTCAAAAACA-----AAAGATTTGTATTTTTTTTTCAT-----------------TTGAGTGTAGCGCAATTAA--TATACAAATATATACAAATGCAGCTGATGGAATTATGCAAAGCCAAAAAACAAACA-A
>CG3556 4378824 4379076|5397 chrX 4378172 4379059 scaffold_26 67975 68876 - 21384|679 1038
GCACG---------------CGGCCTTAGACG-----------------------------------------------------------------------GAGCTGC-AGTTTAACCCACTAAGCAAAGTCGATAAATAC--------------CCGGTGCTATTGGACTATATTTAT---TATATATATGGCCATAGTCACGT---------CTCACACACACACAACACACACGCA-ACAAGCAAAAAGGCACTTACACTCGCACAGGA------ATAGCTGTATGC-TACACAGTACAGC---TATTCCTGAGTAAGTGCATATATAACTGCATAATAATGGCGTAATCAAAAA
GCACGCACACAAGGATTTGCCGGCCTTAGTCACTAAACTAAAGTTAAGCCACGCGGAGAGGAGGGTAGAGGAGTGTTGAGGAGAGGTGAGGATGTGGCAGCCCGAGCTGCAAGGATAACACAGATAGCAAGGATAACAACTACAAGAGCAACTGTAACAGATGCAACT--ACTACAACTGCGCGCATGCATATGTATATGTCTACGTGGTTTTCAATATACGTATACAC-ACACACACGCACACACACACACACACACACACACACACACAGTATCGCACACATATACATGCGTACATATTGCATTATATATATATATATATATATATATACAACTGAATAATAATGGCGTAATCAAAAA
>CG3564 4387294 4387679|5407 chrX 4387115 4387790 scaffold_28 20641 21283 + 9904|179 578
TCCCGAGCGGAAAACCAGGATGGAAGTAGCAAAGGAAGGCGGCACACGAAGCTCTGGGGGAAATGTGTGCGCAATGCGTTGCA--GTCTCAGATTTAATTTAAATGATTAACATCCTTTTGTAATTTAAATAAAATACCTTGTAAAAAG--TAATTAGTGCTTGAAAGTATGTCGATCATGTTTCTGTTTCGAGAATTATTAACAGAGATT---GCTATATTAGAGAAATTAATATATATATTTTTTTTTAATTACCAAATATCTCTTAATGGAAACAGAACAGCAAATATTTTCAGACACACATTCAAGGGGGGAAGAGACACTTGTGAACTTTCGAACTAAATTGA---TAAGA----ACCATTTGTTTTCTAATAAATGTAGGTTGACAAGAGAAAA
TCCC---TGTGCAACTTGTGCGTGCGCGTGTACAGAGAGCG-------------------------------AATGTGTTGCAGTGTCTCAGCCTAATTTTAAATGATTTA--------------TTAAAT-ACTTTTTTTGTAACAAATTTAAGCAACAGCTAAACAT-------TCATTTTTCACTTCCGCCCCTGTTCCCCCCAAATTTGGACTGTCTAGCACGATTTAAGCAGCATCTCCTTGATTATTTGCCATGTCTTACCTG--GCTAGCTGCTTCTATAATATGCCCAAGTCCATATGCAATT--------AACATTTTTGGACATTTTTAC--AATCGACCCCAAGATGTGGCTATGTATTTTAACATACATATATATTTAT-ATATAAAA
>CG3568 4389642 4389747|5408 chrX 4388079 4389756 scaffold_28 24166 25816 + 29704|1611 1716
ACACAATGTATCTAAGCACTATGTAATCCTTAAAATATATTACAATAAAGAGATCAGCTTTTTTGCTGATACATATGTACATATGTACATATGTACATATGAACAT
AACAGCCGCAAATA--------GTTGTCGTCCATATCTTTCAAAATAA-------------------TCCCCATATGTATATA-ATACACGTGTTAATATAATTGC
>peb 4471207 4471460|5533 chrX 4471091 4471643 scaffold_2 4701953 4702557 - -3261|120 456
ACGCAACTCGAGTGACAATCGAGCGACACCAAGAGCCATAAATACTGGAGTAGCAGCAGTTTTACACCGCCTTACGTATAC--------------------CAAAGCTTAAATAGT---TTTCATTAATGGTAGTCTACTT------------AAAAAATACAAAATAACAAA-----GAAAAGAAAAAAAACGAAAATGAAAAC-------CTGATTAGAATGTA------AAACAGGAGTGCGCTAAACAGCTCGATT---------------------------ATATTTTAGGAGTCACAGGCTCAAG---CTATAGAGCAAAAGTAAAAAAA
ACTAACTTTAAACATAACCCACACCACACTAACACACACGCATGCACACACACACACACACACACACAAACACACACACACAGGTACACAACTGCAGTATTTGATGTTTAAATAATGAATTTTATGGACA--AATTTAATTTCTGACAACAACAACAAAAACAACACAACAAATTAGCAAAAAAGAAAAAAACAAAAACATAAATATTTTAATTTATTAAAGAGTATACAACAAATTGCAGTCCGGCTGAAAAATCGTTTTCAGGGTGCTAATTAATTAATAAATAAATAACTAACAAGAAACATGAGCAAGAAACTTGAAAGTAAAAGCAAGAAAA
>pon 4483897 4484349|5548 chrX 4483299 4483899 scaffold_46 222131 222719 - 23778|617 619
GCA
ACA
>mRpL30 4493827 4493886|5565 chrX 4492878 4494929 scaffold_46 235308 237311 - 54959|980 1040
TTAAAATTTGTTTTCTTTATTCCGAAAAAATAGTTTTTTAAATACAAACCGAAACCCA-AA
ATTCATTCAGTTTTAAT-------ATAAAATAGAATTGTGCATATATATATATATACATAA
>Cbp80 4502944 4503496|5573 chrX 4503325 4503781 scaffold_26 1497361 1497871 - 8455|0 208
TATGCTATGAAAACCATTTGAAGAAGCCCCATCAAGT----------------------GAATACTTTTGGGCGCTAGAAAAACACTTTAT---TGTCA-----TGGTAAATATATTTA----TTTATATGTAC---GTTTTTGTGTGTATACATATATATACATTTATATAGATCTGTTTTGTATGCATTCAATATATGAAAATATAT
TGTGCTAGCCAAAACAGTTGTAGTAGCACTGTGACATTGTGGAACATAAAAAAAATGCAGCATACATTTAGGC--TGGCAGGGAAATTTAAATATGCCAACTTCTGATAAGTAAGCTTGAAGTTTTATTCGCACTCAGATCCTGGATATATATATATATATATATATATATATAG-TATATTGTATGTTTTTATTATATGAAAATATAT
>ctp 4543696 4544702|5628 chrX 4543516 4544187 scaffold_4148 555 1338 + 24304|181 797
AGTATTGTCGAGTCGGATGAAGTGGTGGTGAGGAGGCTGATGGAGATGCAGCAGCTGCCCCGCCAGCAGCA---------------------------------------------ACAACAGCAGGGGCAGCAGTCGC---------------ATTT-----------------CGGAGCAT----CAGAGGATGAGGATCTAGAGCAGAAACAGCAACAACCACAACAATCACAGCAACTACAGAGCCAGCAGCAACA-ACAACAACAACAAC----AACAACAAC----AACTACAAAAAGAACAAGAACGAAAACAGCAAACACTACAACCACCAGTAGAACAT------CTCAAGGATGCGGAAATGATGACCGATAGGGCAAGCGAGAAGCAAC------------------AGCAGCA--AAAACGATCAGAAGATTCGCAAATACAACTAACCAACGATCAAGACGTGGACGATGGGGAC---------GAAGACGAAGACGAGGACGAGGACGATGAAGATGGCACCATTGTGGAGGACAGCGATGCCACCAGCTGCAGCAGTTGTCGACGAGCCGAACTGGAGGATAATCAGCAAGAACAACCGCCG
AGTATTGTCGAGTCGGATGAAGTGGTGGTCAGGAGGCTGGAGGAGCAACAGCAGCAGCAGCAGCAGCAACGTTTACAACAAGAGGAAGCGTCAGCTGCAGCTGCAGCTGCTGTTACGCAGCGGGAGGGGCAGCAGCAGCAACAACAGACAGGGGATTTAGATGTGCAGATGGAAGTGGAGCATGGAGAGGAGGAGGAGGAGGTGGAGCAGGAGCAGGAGCAGCAGCAGCA---GCAGCAGCTGCAACTGCAACTGCAACAGGCAACAACATCAGCGGTTGACAACGATGAGGAGTTAATGGAACAGCAGCAGCAACAACAGCTAGAACAACAAGAATCATTTGAAGATATGGAACTGGATCTTGAGGAACTGGCGTT------ACCAAACGTGATGCAACATTACGTTGAGTATGCGGAGGAGCAGGAACACGAGCACGAG---CACGAAGACGAACA--CGAAGACGAACATGAGCAGGATCCAGATCCAGATCCAGAGCAAGATGATAATGTTGAAGAAGATGATAATGACACCATAGTGGAGGACAGCGACGCAACCAGTTGCAGCAGCTGCCTGCGTGCCGAAATGGAGGAGGCTGAGTATCAGCAGCAGCTG
>l(1)G0334 4550008 4550360|5635 chrX 4548790 4550165 scaffold_5 3107235 3108582 + 72991|1230 1391
GTCATCGGGC--CAACGAATCTGATTCGGGAACTCACAAGA-ACCTTAAACGAAACAAGAAAACCGAACAGCAAACACAAATCACTGACAGACAGACAAGAAGACACAATAACTCAGAAACTTGGAC-ACAAGCGAAATCTCTAGATCATAAGCCGAAAGTT
ACAGTTTAAATGCAACGATTCT-------------ATAAGATACATATACCCATGCACACACACATATATACACACACA---CACACACAGACACACACG-AGCCAGACCTACACACACGCATGCATAACAAGCGAAATCTCTAGATCTTAAGCCCAAAGTT
>l(1)G0334 4550008 4550360|5636 chrX 4550166 4550346 scaffold_5 3108772 3108921 + 3447|0 181
GAACGATGAGAACCCCGTAGAACGGAACGGATCCGAAGAGACCCACAAAAAGCTTAGCTAATCGGAGCACTCCAACCACACATCGTAGCGCACCACATAACTCTGGGGTA-CTGCATTGGATATTATATTGCGAACGTGTTCAATAAGGATAAAGCGAGGTGTAAATTGTTGAAAATATAAA
GAATTATGCACACCCTGCCCTAC-----------------CCCCCCAAGAAACACA-----------CACTTTAGACCCAAAGTCAATCACTCAACCTGGGCCAGTGGCAACAGCAACGGATATTATAT---GAACGTGTTCAATATGGTTAAAGCGAGGTGTAAATTGTTG-AAATATAAA
>l(1)G0334 4550008 4550360|5637 chrX 4550347 4550759 scaffold_47 32675 33075 + 1113|0 13
AATCTAGAAAAATT
TATCCAAAAAGAAT
>CG7024 4552559 4552741|5638 chrX 4551199 4552585 scaffold_5 3110626 3112040 + 48219|1419 1445
TATGCCCCCACGGAATGGAACACCATC
-----CACCACCAGCTGCAGCACCACC
>CG6986 4573289 4574731|5673 chrX 4572591 4573633 scaffold_5 3141544 3142551 + 27968|745 1105
ATAGTGAATATTTATAATAAAATATTTATGGTTTTAAACTCCATGAGAGGAGTGATAGATGA----TATCATGAAACTTCTCATGAAACACGAGAAGAGGGCTTTAAATTTGCCAGCAAATCACGCGGAATCACAAGTGAGATGATTGAATCAAAAGTGATTCAGTTGAAGCGTGCGGTTAGCTGAAAATTTAATTTGTTATATCA-----ATCGATATCTATGTATATCAGTCTCTCTATATATACGATATATATATACTACATAACATACA-TTGTGCCATAATGTGATGATTATAGATT------TATGCTAGTTAACCTAAACGTAATTGTTATCCTAAGTACTAAACGCATCAAAT
G------------------------TCACGGTTTAAG----TGTGTGATGCCTGATCATCAATAACTATTATGACATTTTTT------------------GTTTTTGTCTTATAGCTAAATCATGTCTCATTCTTA----------CAATTCGAAAGCTGTACAATC---------------CTAAAAACT--GTGTGTTAGACTAAGCTGAGCAGTGCATACATATTTTAACTTTTTACTATTTACGAC-----------------CATACATTTGTGCCATAATGTGATGATTATAGTTTGTATGATATG-TAGTTATCCTAATCGTAATTGTTGTT----GTCCTAAGCGTCATAAAT
>CG6986 4573289 4574731|5674 chrX 4574550 4574611 scaffold_5 3144490 3144555 + 3907|0 65
CATCCACACACGGAAAGCCACA----CACAAACGTAATGGAGTAACAAACATTTGCGGTTTACTGC
CACACACACACACACATCCAGAATGTTACAAACGTAATGGAGTAACAAACATTTGCGGTTTACTGC
>CG6927 4753845 4754058|5905 chrX 4752200 4753896 scaffold_31 885716 887517 + 77566|1770 1826
AAAAAGGT----CCATTTC-ATTTTATTATTAGATTACACAGTAGATTTAATATTGT
GGCGCTGTGTCGCCATTTTAATTTTATCATTGAATTCTAT----GTTTTAATCGTGT
>CG6927 4753845 4754058|5906 chrX 4753897 4754113 scaffold_8 138873 139079 + 140|0 164
GAAAAGTATCCAAT--TTAAAGTGTTTATTATTTGTACCCATCGTTTA-GCATAGTTTGTTTAATTATTGTGAAAGTTTTGTATTATGTTTGTTTCACTTTGTTCTGTAAAATGATTTTATATTTATTCTGTTGTAAAATAAAGTTCATGATTCTATGGCTGCCT
CGCACGCACACAATTGTTGCCATACATGTGATTT---CTTGTCGCTTGTGTTTGTTTTCTCTTAATATTACG--CTTATTGTAATATGTATTAATTAATT--GTAAGTAACATCATCTCATAGTCAT--AGTTGTACAA-----------ATGTCACGCATATCT
>CG32772 4759382 4760225|5918 chrX 4759078 4759389 scaffold_31 893753 894036 + 16990|307 316
--GCTAGTTA
AAGTTAGTTA
>CG6903 4766771 4766885|5923 chrX 4765320 4766773 scaffold_25 1786892 1788367 - 67624|1481 1483
GGC
AAC
>CG6903 4766771 4766885|5924 chrX 4766774 4767014 scaffold_41 344208 344488 - 807|0 139
CAC-ACGAGAGTAACCATATGCACAATCAATTCAATTGCCAAATAAATTAGATACTATCGTTGTACGATCGCAAA---------------TCAAAATCAACAAAAGTA------------ATTATAAATCAGACAAAGAT
CACTGCAAAATTGACCATCGCTTCAATCGATAAAGTCGTCAATTATCAGCGATAGTATCGTTGAATTAAAGCAAAGTACCGTTGTTATGGTTACATTCATAAAAACTAAGCAAGCGTTTTATTATTGGCCTGACAAAATC
>Ptp4E 4798970 4799341|5954 chrX 4798675 4800034 scaffold_36 970315 971688 - 16671|314 750
ATATTACTTGCT-----------------GATTGATTAACTTAATCTGTATCTA--GTTGAACACACAATCTGGA-TAACGGGCTATAATAATTTGTA-ATTTGGTGGTGCTTCATATTTTTTTTTATTTA----------------------ATATTGAGTTTCTGTGGCTGCGGTTGACCTAGAGGTTCTACATTAATTTATCTGAGATTGTAACTAACCAA--AAATGTTCAATAATTT----ATTTTCTTCTTTCTTTTCACAATCATTCACAAACACCCAT---CACACAATTAAAACACGATTGTAAATCACACAAAAAATCGCCT-------AACCTACACATTTTCATATGCTTCTACTCCTGCAAACGAATTGAAATTGAAAAACTCGAATCCGATCAAAAACACCGCAAAAAAAAAA------AAAA
TTGTCGTTTGGTTTGGTGAACGTCGCTGCGGCTGCTAATTTTAATCTCTAACTACCATTGACTA-ATGCTCTGTACTAAAGCCCCATGCTAAGCTATATATGTGTATATATGTAGTATATATATATATAGACAACAACAACAACAACAAGAACACACACAACTTTTGGGTTTGCAGCTGTTTTTTTTTTTAAATGTTTTCTTTTTTTTATTTGTGACTAACCAAACAAATTTGTTATAATTTAATGAATTTCTTCTTTCTCTTCACACAAACAAACAAACACACACGCGCACACATTGTA--------TATCAAACACACACACACACACCTGTCTAACAACCCACACACACACACACACACACACACATACA---------------------------CTGCTCTCAACTGCTGCCTTCACCAAATTGTTTGCAA
>Ptp4E 4799842 4799861|5954 chrX 4798675 4800034 scaffold_36 970315 971688 - 16671|1304 1323
TAGAAAAGTCAACTTTTTAG
T--AAGAGTCCGC-TTTTAG
>Ptp4E 4800208 4800662|5955 chrX 4800205 4800240 scaffold_36 971936 971971 - 2430|3 35
ATGACGAAGGCATAGCTGAGACGGGAATCTGAG
ATGACGAAGGTATTGCCGAGACAGGCATATGAG
>Ptp4E 4800208 4800662|5956 chrX 4800256 4800358 scaffold_36 972144 972276 - 3168|0 132
AACATCTACATATGATATATA----------GTACCTATAGTTATTTTTTTTTTTTTTACATAT-----------------ACTATACGTAAAA---TCTGCCTGTGATGTGCTGGATGTGATTTGTCTACGA
AGCACATATATATTATATATACACACATCGTATATGTATAGCTATATATATATAGTTAATATAACAAACAACAAAAACAAAAAAACACGAAAAAAATTCTGCCTGTGATGTGCTGGATGTGATTTGTCTAGAA
>Ptp4E 4800208 4800662|5957 chrX 4800490 4802614 scaffold_36 972391 974519 - 539|0 267
CGCCTGTTTGCCATAGAGCTAAGCTAGCTAGCCCGCTTATTTAATGTAATGCCGCCAAACTCTAGACCAAACCAACA-AGAGCGTAAACTTAAGCTTCAGGTTTAA-----------------------------------CAATCTGCTACCT--ATTTTTGTAT----------------------------CTGTACCTACCTGTATCCCTGTACCTACTG--------------------TATAAC---------TACCTAAAC
CTCTCGTTTGCCATA--------------CGCGCCTCCAGCCAAGTTAATGCCGCCAA---TTAGACCAAAACAACAGAGCGTTTAATCTTAAGTTTCAGGTATAATTAGCTATTCTTTAATACTTTTAAAAACAAAAACACAATACAATACTTCGATTTTTGTATGCGACTATTATTGTAAGCTTAAAGAACAATATATGCTCCTATATATGTATAGATACTAATATGTTTTATACCATATGTTATACCATGAGCTAGTATTTAAAA
>ovo 4914318 4914941|6134 chrX 4914041 4914507 scaffold_36 1149802 1150246 - 15072|282 483
TTGATGGATTTTAGTTATATAGAATAGGAACCATTCGATCGATTCGAATCATTCGAAT--AACTCGAATCACTCGAA--TCACTCGAATCACTTAA-------GCAAA-CCAACATTGTGACTTTGAAGTTTTTTGAAAACTGCCCCCCCCTCCTTTTGCGGAGGATACGGAATTATTGGAGATTATGCTTATTATGTATAT
-AACTGGAAACTAGCTATA------GCAAAGCCTTAGATTAAGCCTAAACAAACTAACTAAACTTAAACTAAATGAAACTAACTGAATTAATGTAAAGTTAATGCAAATTCAACTCTAAG---CTGAAGTTTTATGAAAACTGCCCCC-------------------ACGAAAATGGC-GAGATTATGTTTTGTACATGTAT
>ovo 4914318 4914941|6135 chrX 4914882 4915620 scaffold_36 1150956 1151837 - 1996|0 59
TTCAACAAAACAGAACACAAATCAAAAAACAAAAACTTCGAAAAAAAAGAAAAAAAAAAA
TTCATTGTAAAGAGGCATAAAAAAAAAAACAAAA----CAAAAAACAAGAACAAAAAAAA
>rg 5096057 5096387|6422 chrX 5093266 5096591 scaffold_66 66864 70171 + 152659|2864 3238
GTTTGGACACTTGAACATTGCAGTAATCCACGACTCGCCAGTTAACAACGGCCAAGGAAGCGGAAGTGAAA-AGTGAAACAGAAACGGA--------AATAAAATATAAAAAACGATCGCAAAGCA-ACTACAAAGTACTTACAAAAACAAAAAAAAAACGGCGCAAGGAACG-----GCGAATCGGTTTTTTTCTAT------------------ACAGACCTTTACAACTCTAGGCTAGT----AAGCAAAAC--TATGTTTTTTTTTGTCTAGTATTAATTG----TGCATTAGTGTGT-GTTTGGCCAATGAAAGCCAGTCAAAAAAAAAAAATTGACAAAAAAAAATAGAGAACGGAACAGAACAGAAGA
GCGAGTGCGTTCCACATTCGACACATTCCACG--TTCCCAATACACAAACACACGGACAGCTGAATCAAAATGGCGAGAGAGCCGCGTGCGTTGTTCAGGCAAGTTCAAATAAGAGCCGAAGAGAGCGCAACGATGTACTT-------------AAGAGCGTTGAAGAGAGCGCGGATGTTAATTTGTTTCTTTCTACTTTTCATTTTTATTATCGATAGACATTTACAATTCTAGGCTAGTATGCAAACAAAACTATATATTTTTTTTTGTCTAGTATTACTTAAAATAGCAATATTATCTAGTATGTTCGGTGTGAGCCAGTCGGAAAAACAAAAC-------------------------------------
>CG15786 5147863 5148134|6506 chrX 5147592 5148331 scaffold_66 162288 163042 + 5277|295 636
ACAGCTTACCCGAT---ACCTGCTT------AAAACCGCT---TACCCGCTTACCCGCTACCCGATCGCAAACCGATTTGATTACGTTTTTCTAGCCCTAGTCGAAACAGCTATGCACCCGCGTTCGGATGGAATCCCGCCCGAATCGGGTCAGAGTTCAAACGAGTAACGGGTAAAGGTAAATTTCTCCACCGCCTACATTTAAGATTTTAAAC--GGTTATGGT-----------------------------ACACACACGCACAGGCAC-----------------TGCTGTACATAAAG-AAATGCTT-GAATAAACT--------TAAAACCTATA
ACCGCTTACCCGCTAAAAACAATTTAAAAAAAAAAACGCTAAAAATCCGCTTACCCGATACACAA------------------AAGTTTTTCTAGC------TAAAGCAGCGCAGCA----------------------------------CAAGGTCTACACGA--AACGGGTAAAGGTCAACTG-TAAACTG--TAGATGTAAGATGCAAAAACGGGTTATGGTTGCACTCGCACACACTCGCACACACACGCACACACACACACAGACACACTTAAATATATATATAAGCTGTATATAAAGAAAATGCTTAAAATAAATTTAAATATCTAAAACTTATA
>snf 5155667 5155737|6512 chrX 5155348 5155668 scaffold_66 175290 175613 + 22125|322 323
AC
AC
>dhd 5158021 5158359|6514 chrX 5157692 5159644 scaffold_66 177223 179021 + 26047|348 740
GCAGCAAT-CCTGCCCAGCAATT----------------------------AGCAATCAGCAGCGCATCTTTTTTTTT---------------------TTACTTATTTAACTCATCTTTTAAACATGTTCGCCTCATTTGTGTTCGTTTATGTATTCGATGTTATGTGTATGCTCATGTGATGTTTAGCTTGTAAGCGCGAGATGTGGGTAGCAGGAGATGCAGTGCAGCCAACAGCAGTGACCAGATGATATATGCTATGCTACTACTACTACTTATATGCTATGATTTGTGGCGCGGAGG----CGTGTCTGCGACACATAATCCCGCCCATTTAGCTTTAAGATTCAGGCACTAAGAAGCAATTCGATCAATAAATTATTGTAACCACT
GCGTCGCTACCTAACCGTAAATTTAACATTTTAATATATGTATTGCTTAACTGTAACTGTAAGTGTAACTGTAACTGTAACTGTAACTGTGACGGCAAACAATTTATGTAATTTCCAATGCAAAAATAACC-TCAAATTTGAATATGTTTTTTTTTTTGCCCTTAGAAGCATGCTTCTGTGA----TAGGTTTTAAG-GTTAGAAACGATTATAAACTGAT-----------AATAAAAATGACAAAGAGAAATAAGAGA----ATTGTTTGGCTTCATCTG-TGTAATCTGTGTAACGGCGGCAATCGCAGCAGGCGAATGGCGTTCCTGGCGTTTGACTTCAATTCACAGATTTTAAT-ATCGTCCAGAGGAATCAA--ATAAAAATCATT
>Sas10 5164028 5164309|6518 chrX 5162662 5164028 scaffold_66 186644 188010 + 60319|1401 1401
T
T
>Mcm3 5171831 5171965|6525 chrX 5168885 5171973 scaffold_28 1585473 1588611 - 155729|3047 3191
TCGC--GCATTCCAAGGAGCAACAATCGAACGAACGATTGCATCCATCAATCCATCCTTTATCCATCAACCA--------TTCTAGCGCTTAAGTTGTCATTTTTGTTTTGTATTTATATAAAAAAAAAAATAAACACTTTGGAA
TCCTTATCATTTTCAG----------CTAACCTATA--TACATCTGATTGTCTCGCCCTTAAATAACGTACAAATTCTATGTTTAGCCATTAAGTCTTTCGATTTTTTTTTTGTTCATTTTATATTTATAATAAAAAC-TTGGAA
>XRCC1 5177425 5177668|6527 chrX 5175178 5177592 scaffold_28 1603003 1605400 - 48496|2442 2618
GTGCCATTTCTAACCTCATCTCATATTTTGTATACGACTTTATTACTTAAATTGCTTGTAATGTGCAAGTATCATATTTTTGTACTTTGTTAATCGA---------ATATGCTCGTTATCAAAAATTCGACAAATTCAAAATAAGTGATTAGTTTGGACCATTTTGAAAAAAGAGCC
GCGCAAATGTCAA---------GTATTGTGTTT-------------TTAAATTGTATGTACAGTTAAGCTAAAATTTCTATATATTACATTAGTAAAGTGATATATATATATGTAATATTAACGATTTAAATAATT-----TTCTTGGTAGCTTTCAAAGATTTCAAAATGCGCGCC
>CanB 5179155 5179772|6528 chrX 5178611 5179359 scaffold_28 1606714 1607468 - 36467|549 772
ATTGAGCCACATAATGAGTAC-------TATATATATACAATTGTAGATATGATACAATATGTATAGCCGATTTTCCGTAATGAGTGTGTGTGTGTGTG----------TGTGTACCTTCACTTCCC--TTGAAACATGTTCAGCTTTATAATAAACGGTCTGTCTGTGAGTCTGTGAGGGCGTTTGAGGCGTGCCAAAAACGAAGCAGTTTACTCAATTTATT
ATCTAAGCGGCCAATAGATACGCACACACACACACACACACCAGCACACAC------ACACACATAACTATTTATCGACTAACGGTATACATATACATGGAAATCAAACTCTTTTTTTTTGTTTTCTAATTCCAATTCGTTGACATTTCAAACAAACGCTATGCATATGTGCGTGCTAA------------ATGGCAACAACTAACTAACTAAACCAAGTAACT
>SK 5241842 5242375|6616 chrX 5241558 5242380 scaffold_1357 3954 4732 - 14657|287 850
GTATTTTTAGAGATCTATCAACAAACAATCAACCAAACAACCAACCAACCAACCAAC--CAACCAACAACTAAGAACAAATACCAATCGAAAAGATAATGACTAAAACAAAAAAAAAAACAAAAAAAGAGTGCCTAAGAAC---------------AACTAAAGCAAACTTAAAGCCAAATTGATATCAGAT--CGGTATAGAAGTTTTCGGGTCTTTGGAATGGGGAAATATCATTGGTCGTCTCTGTTTGTTTATGTTCTGTCTCTTTTTTGTCTCTCAGTCTACATTTTCGTGAAACTAACTATCATT------TGTCCACATAAATCCCTCTGTACGTACTAT-----GTTTGTCAGATTAGCTAACAAAATAACAATGAAAATCACTGTCAGTTCGCAAAAGTAACCCTGTACTGCTGTTGCCCCCTTCATTATTAGACTCATCATTGTGCCCATCAATAAACGTAGAAAAGCTTTGGGAAAGCCATCCATCAGAATCTGTACATACATCCGTACGAAAAGAAAGTAAAACCTAAACGCAAAAAAAAAAAAAAACGAAA
GTATTTTTAGAGATCTATCAAC-----ATCAACTAACTGTCAGAACCACCAAAAAGTTACGAAAATCCCCAAAAAAGAAATAACAAAAAAAAAACAAATAAGTATATATACATATATATATATATATATGTACATATATACATATATATACTATATAAACAAATTAAACTGAAACTAAATCTGAGATTTGATAAAAGAATAGAAA-----------AAGAGATCAAACAATAACATATATCGTATATATCTATATA-GTTATACAGCTTTACAGTTAATAGATCTGTTGTATAATACAACCATATAGCCTGAACGAATCCCCAAGTAAAGCTTTCAAAATGAACAACTCAGAACGTGTGAGGCCAACTGAAAAAACCATTCATAAAATCAC-----ATTTAAAAAACTTTTGTTTTAC-GTTCTTGTCTTTTGTCCTGTC---CACACATGTGCGTCTATTCATAAA------------------------------AAAATATATACATATAT--------AAAAAAAATA----TTAAAAACGAAAAAACGATAAAACGTGC
>SK 5244935 5246379|6619 chrX 5244289 5245901 scaffold_28 1702867 1704428 - 39557|723 1739
ATATCAGAAAGAGAGCGCTCCAACTCCGTGATTAACATCGAGATGCTAACAATAAGGCCGGATCGATTCTGGCCAACCTCATTCGCACCCCAAAAACCAACATCAACATTTACATCAACATCAATGTCTACGTCAAAGTGTAAACC-CGAATTCGAAGTGGCCGAGACAGCGCTGAGGCAACGCGTGCTATCGCCGTCGTTATCGGAGTTTCAATCGAAATCGC------AATCGAGACCATCGTC-ACAAACGCAAGAGCACATTTTGCAAAGGGAGATCATACCGATGGTACCGATCATACCG---------ATCATACCAGTGATACCGGAGGACGCCGAATCGTTGGGAAACACCAATACGAACAGCAACAGTTCGCCCGATC------AGCAGAATGTGCCCATGACTATAAGTA----CAGTACCGCCATCGAGTT--CAGCGCCCGCATTCACAGCG--ACCGGAAGCGGAGGTTCGGTGACCGGAACTAGCGGTGGCATTGTGAA---ATCGATAACGATGAACGAACCGATTACGACGGGGAGCGGCAAGCCGATTGCCTC------------GAATAAGTTTACTAGGAAAAGAGAACGTGTATGCAATAATAGTAGTTAATAGTAGTAGTCATAGTTATAGTAATAATAGAGGTAAAAGTAATATTAGTAATTCTACAAGTCGAATTTCGAACTCGGCCTTTTGTAAATAAGCCTCTTCGAGAT----GAGAAAAAAGTCAAATGTTAGCATATACATATTAATATACAGAATACACACACTATGTATCCTATATCTGTATACGGATATATATAGGCCTCCCCACAAAACATCCAAAAAGAAAGCAAAAAAACAATAAGCGAAAACCGAACAGAATATATGTATACATATATATGTCATTGTGTAACTTTTTTTTTTTGTCTAAGTTTTAGGCTAAACGTATTTGTAATATTTCACCTTGGGCCAAGGCAGCCTGTACATGCATACTAAAATACTTAACATAATAT
ATATCCGAAAGAGAGCGCTCCAACTCCGTGATTAACATCGAGATGCATATATTAAAACCAGCTAGAGC---AACTACGTCAACAATATCATCCACATCAACAACAACATTTACGTCAATACCAATGCCCATGTCAAAGTCCATGTCACCAACTC----TGATGGAGACAGCGCTAAGGCAGCGTCTGCATTCGCCATCGTTGTCCG---TCGAACCGGAACAGCTCTTCGAACTGAG-CCATTATCAACAGACATATTCGCATTCACAGCA----GCATTCGTATCCGCATCAGCG--CACCCTGGAGAACATCAGCATACCAGCCATACCGGAGGATGTCGAAACCATG------ACCAATGCGAATAGCAAAGGTTCACCCGATCCAAGTGCGCAGCTGCAGCCCATTCAGGCGGGCAACGCTGGCATCTCCATAGAGATGGCAGCGGACATATCGATAGCGCAACCGATAACAA-----CACAAATCGA---TAGCGATGCCAGAACGAATGCAACGATGACGACGA------CGACGACGACGACGAATGTCACATCGATTGCCACAAAGATCACTGAGAATAAGTTTACTAGGAAAAGAGAACGTGTATGCAATAATAGTAG-TAATAG---------------TAATAATAATACAAATAATAGTAATATTAGTAATTCTACAAGTCGAATTTCGAACTCGGCCTTTTGTAAATAAGCCTCTTCGAAATTAGAGAAACAAAAGTCAAACGTTAGCATATACAAACATATATA---------------------TCTATATGTGTATATATATATATATATGTAT---------ACAT----------------------------------------GTATATATATGTATATATATATTCATATAGGAAAGGTGTATTTTTTTTCTAAG-CCTAGGATA---TTATTGGTATTTTCACA---------ATAGTATCTAGTAATTGAAT--TAAATTACATAGCATAGCAT
>SK 5244935 5246379|6620 chrX 5245902 5246200 scaffold_37 969031 969383 + -2792|0 364
AGCATGTAGGGGGGAGTGTATGTGTGTGTATGTGCATGGGAGT----GTGCGAATGCGAG-TGTACAGGACCAGATTGGTAAGGAAGTTAGGTCATATGTA--GGACATAGATCGTAGGGCACCAGCATGTAGAATC---------------------------------------------CACGTATATAAACGCTCAGAAATAGCAACAGAAATAGCAATAGCAAACCTTAAAGATCTGGCACCAAAAGTCCATAACAGTAAATTCGTATATCCCTTAAAGAACTGC--AACCCCCAGCACTTCCGCT------------TCCGGTGCAGCGCCAACCAACTGCAAAACATCCACGAACATG
ACAAAGCAGAAACGCAAAAGTGAATTGGCACGCGCAAGCGAGCTACGAAGCAAATTCAAACTGTTAAATATCATGTCCGTAAATGTTTTCAATTATATATATTGAAATTAATTAGTGCCCGATTGGCAATTAATATTGATTCCTTAAGGAGATGAGGGCGAGTCCAAACTAATTCGTACTCACACACACACACACGCACACACACACACACACAAACACACACACAAACCCACAGACA--------CACACACACACACAGAGAAACACATATG----TTATAAAAATGCTAAAACATCAAAACTGCCGTTAATTTAAAAATATTGAGTATAAAAAACACAAAGAATTATACATATATATACATG
>SK 5244935 5246379|6621 chrX 5246201 5246540 scaffold_28 1705081 1705401 - 1248|0 179
GCAAATTCTCGTGTCCGTCTGTC-TCGAATTTGTGTGCATATATAAATTGTATCCGAAGGATGTGTGTCTGACCTGACTGTGTGTGCGAGGCAAGTGAAAGCATAAGCATACGAGGAACCCATTAAAGCCCCCAACAATTATACACAAAACGACGCATAACAACAAAAAAAAAAAAAGAA
GCGTGTTTTTGTGTATGTGTGTGGTTGTATTCTGGTGCATAAA--AATAACTTAATGAAGATGTTAATATGAGTATTCAAATTGTTCTATGTA-------TTACGAACATAGGAGAAATTCATCTAAGTTC-----AACTA---AAAAAATGTTGCTGGTTATGGAAAAAACAAAAACAA
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GGATTAGCTCGAGCTTTAAGCGGAACTGAGGATGCGAGGC
-----AACTGGAGC----AGTTGCACCGGGGCGAAGTGGC
>CG4165 5271585 5272145|6652 chrX 5272068 5272456 scaffold_5 630990 631425 - 4208|0 86
AAGCACAAATGAAATGGAGGCGGTTAACCAAGAGAGAAACTATTTGCAGATGTTCATAAGTTATAATAACGA---------ATACAA
AAGCTAACAAAAAATTGTTTCAGTTATATAATTATTATTACATTTACATATTTTAAATAACAATAACAATGATGGAGGATTATAGAA
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ATGTAATTAATTTAATGATTTCAATTTGTAACAAATAAATAT-TATATAT
----ACTTATTTAACTGCTCTAAGAATCTCCTAAATACATATACATACAT
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GCAA---TCGCAGCCAGCGTTTAAGA----TGCATTAAGATTCCTTCAATACAACCTCCCACACATATAACCTTCAAT---ATTACTA--TACATTTAACACCCA---GAAGCTTCTATTCTATTATTCTAT
GAAGGTTTCGCACACGACGAATTTGGTCCTTGGAATAGGTTTTATTAAATTAACTATGCCCTTAATTGGGCATTGAATACAATTTCTATTTACATTTCGCATATATCTACAATTTATCTTCAATCTATTCCC
>CG16752 5337499 5338794|6728 chrX 5336755 5339102 scaffold_10 1350678 1353125 - 43895|744 2289
TAATTGGTGATGTTGGTGCCGCGGCGGGGCAGCAGCGACCATCGTCGCAGCTCCACTAGCACCACCACCACCACCA------CCACCAAGACCATTGGTGGGTCAATGATCATCGGTGGTGAGGCCTCGGCGCAGCACCAGCATCTGGTAACGCACCATCTGCAGACCCACTCACAGCCCAGTCAGCAGCGGCGGGTCAGCACCATGGACATCATCACCGAGGAGCGGATTT----------------------------------------------------------------------------TGTAAACTGGATGCGAGAATCGGATGGGTTCGGAA---------------TCGATTGGGTGCG--------------GCTATCGGAAATCAGAGATCCCAA------------------TATACTGTTGAAAACTATC-----GGCTGCCTGC---CGAGGAGCGCAATTTACAA------------------TACAGTTCTTTATTCGTCAATGGTCTCAG--CATGAAATTTTAACAGAATTTGCAATTGCAACTAATCCAGCAAAAATCAAAAGA--ACTCCACTACACAAATGGTTTTT-----------TTTCGAACAGAGCTAAGAAGTAAGGTTTCAGGAGAAAACTACAATACATAGGTACACAGGAACTTGTTT--AATTA-AAAACACTAATATATCAATATCAAA-ATAAC------CAAAAATGCGTAGAGTATTTGGAATGATGCAGTCTGAATTTTGATGGATTTTGCAAATGAGCGATTTTCACTTTTAAATAACTTAAGGCAGTTTAAAAACGTTAAGAAATACATAGATATCCCCGGGTAGACCGAATAACACCCAAACCGAACATTAAGTGTCTGTTCTATTCCCGCGAATAAGACACAAATTTCTCCATTCGAATCTGTGTGTATTTCTCTGTGCGTTGGTGTCATATTCAGATTAAATATTCAGATTAGTACT---TAAGCTCATATATGTATATGCTATTTTTATGGCTAAGGGTGTACGTCTAAGTCT-----AAGAGATGCGGTGAAACTTTCAAGAAGTGATAGTGGTAGGGTGAAAGTGCTGGGTGAAGATTTTGGGTAACAACAATAACATAATACTACAGTAAAGTTAGGAAAAATACTTACAGGAAACTCACAA------GTCATAACTATCGGATTGAAAAGCGAAACTGAATTAATCGAAATAATCGATAGTATTGACGATTAGTTTTAGCTTCTAGGGTATTTACGAAATT---TTGAAACAATGCCTGGGTAAATATGTTTATTTGAGAGCAACTTTTTGTGCGCCCATTTGTAAAATATTTTTGTA------------------TTTTAAC--TAGGGTTCTTTAGCGTAG-------TTAGTTGTAGGATGGA--------------------------AAACTCGTTTAAATTCGTAAACCTTTTGAGCCCCAGTGTTTACCGATTTAAATGAAAGTTAAGAATACACAAAAACAAAAAAAAA
TAATTGGTGATGTTGGTGCCGCGGCGCGGCAGCAGCGACCAGCGTCGTGGCACCGCCGTATGCACCGCCGTTGCCGAGGGCTCCGCCGTGACCACGTCGGAGGCACAGGGCAAAG------------CGCCGCAGCATCAGCATCTGCAGTTGCATCAT---------TACCATCATCATCATCATCATCGTCGGACAAGCAACATGGACATCATAACCGAGGAGCGCAATGTCTAAGGTTTACCCACATTAATTTGGCTCCGTGGGCGCAGGCGGTGCTCTCCATGGTAAAGATCATTTGGTAACTATATAAAAAAAATGTGCGAATTCTCTGGTTTCAAACCAACTAATTAAATGTTCCACTGAGTACGAAAAAAATTGAATAGCTAT--GAATTTCGATTTCTTAACCCTTTTGCCAAATAGAATATTTCATTGGCTAACACCTTTATGTCTGTGTGTGTACGTGTGATGGAATATACGACTTGATATCCAAATGCTATATACACTACTATTAATCTTTGATCCCAGATTATCAAACTT--ACGGTATTCATA-TACTAACCAAAATAAAAATAACTAAAAAATAAATCTAAAAACCATACAGATTTTAGATGTTCAATGTTTGTTCAAGTTCACTGATTAAAATGTTAAATACCTATTGAAATATGT--GTATTTATGAATGTGTACCAAACTATAAAATATATATTACTAAATATTAAATATAATGAATCACAAGAATACGTTTGAAATTAGCATTAAAGTCTACTGAAACTTCA-AGTTTATGGAGAGAAAC-----------TTGATTGGCTTA--------CAATAAAAGAAAGAGATAAAAATGAATTAAATGGTTAAAGAATTGGCA---------AATTTGAAGTGATAGCTAACTT-----GAATAAATTATAAA-------------------ATATACTTCT-TATAAAATGATGTAGAAATAAAAGGGATGTTTAAAACTACAACTAAGCAAGCTCTGATAACCATATACAAGAATTAGTTATGTACGAATATATCTATACCTTATCAAAACAATTTTGAAATTCTTTTTAAAACTAAAAGA---AAAATAAAATATATAAATAAAAATTT---------------ATTGAATAC---------------AAAATTAATTACAGGAACCGCATGGAATAGTGTAGTATGTATCCAACTAATAAATAAAGTAAAAATAA----AAAGAAAGAAAGCAGAAAC---------TGGCCTAAAAAATATTTATATAAATAAATATAGAAGATGC-TAATCCAAAAAGTTTATTTTTGTGTGA-TTTTTGTGCGGC-ATTCGTAAAA-GTTATTGTAAACAAAAAACCAATTAAACTTTAGCAATAAGCTGATTTTGTTTAAGTAAAAACTAATCGTAAGCTAAACAACAGACACCCAACGAAAATATATGAAACTCATTTAAATTTGTAAACCTTTTGAGCCCCAAAGTTTACGGATTTAAATGACAGGCAAATATTTTCAATAAGTAAAATCAA
>CG4151 5347660 5347812|6734 chrX 5346914 5347836 scaffold_5 3927109 3928055 - 4850|791 971
GAGTTCTGGCGAGGAAG---CCCCCATACGCGGATCCCAACTTGAATCCTGGCACTGACCTCCTTTCGCATACAGTTTTTTTTTGTCCAACTTCT--TTAAATT---------------TTTTTGCCTATGTTAGTCCCGTACAAATATAAATAATTCAATCACA--------TTTAAATC
GCACGCTGACAACAACGATATCCGCACATGCATAT-ATATTTTATATTTTATTATATACCAACTTGTCCCTTCTTTTTATTTCTTGGTTGCTTCGCATCAAATTCAAAGCGCTCGTAAATATTTCATAATGTTGCGACAATAAAAATAAATATCATTTTATGGCAGGCTCTTCTTTGTTCT
>CG12730 5363377 5364007|6757 chrX 5363228 5363481 scaffold_10 1386136 1386414 - 6046|157 278
ACTTG-GTTTCAGGTGCACGAACCC-------AGCTTTTGGTGGC---------TCTTACTACGTTAGGCTTACTCTGTGTGTGTATCTGTGTGAGAGCGAGTATCTGTGTGCGAACGAGTA
ACCCACGCCTCCCACCGACCGCCCCTATCCAGAGGCTGTTGTGGCAGGCGCTATTTGTACTATCTTAGGCTAGTCTCACTTGAATGTGTGTGTGTGTGTGCGTGTATGTTTTTAGTTGAATA
>CG12730 5363377 5364007|6758 chrX 5363502 5363805 scaffold_9 3656240 3656575 + -1252|0 350
TGCGCGTGTGTGTGAGTTTGT-TTTGAGAGAGCGAGTATCGCTTGCGTTTGCTTGAAGCA----TTTAAGTCTGAAGTTTGAAATTGTGGCAAGCTTTTGTCGCGGGAACAGTTACC--GTATGTGTTATCTAATAGTCGCTAGATATAGGTCAAGAAGTGAAGAAGATAAA---GCCAGTCGATCGCAGCAATAACGTAGATATAATAGCGAACAGAAAGCGAGAGAAAACCA-------------------CTAACAAGAGAGCAAATTC----------CAAAGAGATAAGTTGTATTGTGCCTTCTGGCTCTGCTTCTTCCCTTCTTCTGATAAC--------TGGT
TGCACATGCATCTGCATCTGCATCTGCATCAGCAACT---GCATCTGTTTGCTGCAAGCAACATTTACAGGCCACAGGCACAGATTGCAGC------TGTTCGCTGGACTCGCTAACTGGTTTAAGCGGCCTTTTATCTTGTGGATATCTAT--AAAATTTATCAAGATAAACCGGCCAACAGAGCGCAGATAATAAATAAAACAAATATGAAAATCGAAACTATGGAATACTAGATATTTTCACCAGATATTCTAGCATTACCGCCAATTAGTAACTCTAGCTAAAATATAAATTATTATTCAAGTTTT----CAATATTTTCACTTATTAACATAACATAGAAATTTGC
>CG12730 5363377 5364007|6759 chrX 5363806 5364222 scaffold_14 3074222 3074702 + 305|0 242
TAACAATGCGTGAATATATATGTACATATATATACCCGATTTTTTTTTTACTTTTATTAAGTACATAGTAT---TTGTGTGTCTCAA---------GTGAATATACATTGAA---GTAGTTAGTTTTTAGCACAATGCTT--------TTCATGACCACTG----------AATTGTTGTATTTATAAACAAAT---AAATCGTTT-----GCAATGGAAGAATAAAACAAAAATACATAAA-
TACCAATATATATATATATATATATATATATATTTAC-ATCTTTATTGAACATTTGTTAA--ACATAATACGCGTAGTATGAGACAACGTAAACATTTAAATAAACACAAAACTCGTCGTCAAAAGCAGGAACAAAAATTACCAGAAATTGATGAGAATTGTTGTAAACGCCCTCGTTGTAATTATGAACATATCTGGCAACATTTTCGACGCAATGTAAGCTAACCACAAGTATTTATAAAA
>CG4136 5457276 5457470|6926 chrX 5456755 5457839 scaffold_24 1701067 1702134 + 18136|551 769
AACATGTACATCGATGTGTTGTTCTAA---GGACAACGATAAACCTAC---AGGATTCGAAACACATCCGGCTAAATGCAATGAACCATTTTGTATGCGCAAACGGG---------------CGAAATTTCACGGCCCACGATAGAAATCGAATAAATTAATAGCA---TTACATATATGACAGAAAATTAAGCAAAAAACAAAAAAAAAACAAAAAAA
AACATGTACATCGATGTGTTGTTCTAGGCTGGACACACAAGTACTTATTGAAGGGGTAGGAGCACGAGAAGA-AGAAGAAGTGAAGGAGGAGGAGAACGAGATGGGGGCGGCGCTGCAACTCGGCAATGTTAATTTTCTAAGCATAAATCTAATAAATTAATTAAATATTTAAATCGATAACAATTTTTTTTCATATACCTAAGGCACACACACACACC
>l(1)G0045 5470602 5471289|6942 chrX 5467933 5470705 scaffold_5 4019828 4022612 + 72123|2743 2869
TCGACTTTAGTTAGTAGTCA-GTAGTTACTTAGTTGTAA---------GTTAAATCCAATCGT-----GTCTTTGAAAAAAGTTCGAT-----TTAATCTGCTTTTAACTGTT---TTAACCCGTCA
GTACGCATTGTAGATGTTCATGTATATAGATAGATGTAGTTCATTTATGTTAAGTACAAATGTTATAAATATCGAATAAATATTTTATATTAATTAATTAGCTCTTCGATTCGAGATAAACACGCCT
>l(1)G0045 5470602 5471289|6943 chrX 5470706 5472330 scaffold_5 2566727 2568389 + 14809|0 628
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ATGAAACACATTAGGCATT-GTTGTACATATTTAATACTAATTTT-ATTCAATTTAAAATTACTTTTATGCTTTTTTTTTTTTTTGTGTACCATCAATGTTTT-------------------------CGTTCGT-ATGTAATTTATTCA----TGTGTGTGTATTTGGGTAAAGATG-TGAGTGTGGTTGTGTGTGCGTGTGTGTGTGTGTTACACTCAAAGCGATCTGCTGCGCGTTG---AACATAGAGCATTGAGCCTAGTGAATGAGTGGGTGTGTGTATTCGTGTTTGAACGAAAGTTGTTCGCGCTCGGAAAGAATTTGGTATCTAAAATGCGACAATAATTTAAAAATTGCTTACAAC-----------ATTTGTTG-----GGTCATAGCTCCGCAAAATTCATTTTCGTTCGTTTTCATTTTGTTTGTTG-AGTTGATATTATT-ATAAATATTTGTTGTATCAT--------------------------TTTGTAATTATGTATTTACTT----------CTAGTTAATG--GTTATGGGAAAATGTATATTAAATGCATGTAAATTTCGCTTAATGCTTCCATTTTGTTTTTGTATATATATGTATATATATATAT
>CG4119 5515384 5515790|6991 chrX 5514510 5515559 scaffold_31 30277 31298 + 40356|911 1115
TAAGGAGATG--------------------GGAGAGATGCCCGTCGTGCGCATCACTGGGGAACTGGGCGGGAGCAGGTGCGGATCCGAGGTATCGATGGAGGAGCAACAGCGTGAAGTTAGATTCTAAGTTACTCTTACGG------AACCTATGCGATTACA-AAAATGTACATAAGGGGCGTGCTC--CGGGAATTGTTGCG
CAACGTGGTGTATAACAGCGACCGATCTGCAGAGAGGTTGCAATACTTTAAGTTACATTTGTAATGCCTAGACAC-TATACAGAAACGAAACAAAAACAGAAAAGAAAAAAAAAAAAACTAAAAAGTAA--TAATAATACGATAAACCAAACACTATGATTATAGAAAGTGTACATACATAGCGTGTGCGGCTGGAATTGTTTCG
>CG4119 5515384 5515790|6992 chrX 5515606 5515844 scaffold_31 31338 31549 + 839|0 190
ATTTACAAGAAATTGATGAATAGCGAGCGAGCCAATCGTGAAGAACAGCTTCATTGATTTCTAAATCCACCTTGTTAGCGTTAATTAATAAATATTAATCATCGATAATTGTAAATATAAAC-CGAACTCACTTATAAATTTACA-CCACCAGATGCAATAGAAATAAAAAAAATCGCA----TAGCCCAT
TTTTAGAGATAATTGCAAAACAGAGAAACA---------GAAAAGAAGATTCATCGATATGTAAATACAC----------------------TCACACACACACACACCCACACACACACACACACGCACACAAACAAACCAACAGCAATCAAATTGAATGAAAAGCAAATGAATAACAATCGTGCTCCAT
>RpL35 5518686 5518793|6996 chrX 5518211 5518686 scaffold_31 33461 33918 + 28772|475 475
A
A
>cv 5537810 5538321|7023 chrX 5537122 5538045 scaffold_31 64731 65580 + 30193|697 932
GCGCGGTGCGATCAGGATGCCATTCAAGGATTCAAGAAACAGAACAAAACAGAAGCCCACATCTAACAAATTTAGCTACTCAATTCAGTGACATTATTATTATTATTATGTAGTACGAAGTAATATTTGTATAGCACTATTATTATTATTTTTATTTACAACAAATGATTAGGCGCTTTGAATTGTTTTACTTATGAACCGGCCAAGATATATATATATATATATATTATATTACA
TAACA--GCGAACA-AATGCCATTTAAAGA----------ACAACAAA------------ATTTAACAAA-TTAGTTACTCAATTCAGTGAC------ATTATTATTGTGTAGTACGAAGTAAT-TTTGTATAGCATTATTATTATTATT-------------------------------ATTTTTTTTTATATAAATATATATATATATATATATAAATATATAAAATATTAAA
>cv 5537810 5538321|7024 chrX 5538046 5540303 scaffold_5 1519124 1521437 - 89563|0 289
CATTTTTTTTTGGACTAAAAAATTTATTTT------TTGTCAATGTTTTTGAGAGTTTTGATATTCTGGGGCGGGGTAAAGTGCAATTA--CTTAGTTGACCACACTTTGCTAACTTCTTCTTGTAAATAAAAATTTCATATGTAAACAGTAATCGTTGTCTTTTAATGCATGTCTTAAGGTTAAATAAGCAATCAAGGCTCTACAAACACTCAATAAGTACATAACTTAATTTT-----GGAATTAATTTACAAATGTCAACTATGTATAAATATGCCAT-TATTACTC
CTTTTATTATT------ACGAGTTCATTTTGATTAATCATCAATTTTTTAATGAAATT--ATGCCCTTGCTCTTAG-AAACTGAAAATATGCTTACTTTCTTTTATTTCGATGTCTTTTGTGCGTCTTTAACAATTTGCTGCGAAAA-----------GCATTATAAT----------AAGGCAATTCAATAATTTTAAACGTACAATAACTTAACTAGAATTTAATTTATTTTCAACTAGACATATATATATATATATATA-TATGTATAAATAGACGGTATGTCCAAC
>CG4078 5596791 5597018|7086 chrX 5596969 5597525 scaffold_4 1546960 1547570 - -1757|0 49
ATTTTGAATTTCTCTGTACGGATGTTTATTACTATTAAAAATTATACGTT
ATCTTTAATTTCTTAGTGTAGATTTTTATGAAATATCAGAGTTATACTTT
>CG15772 5598885 5599277|7089 chrX 5599058 5601447 scaffold_26 692781 694884 - 5130|0 278
CATCCAATCCCACATA-GACAGAGTTATTTGTTGCGTTAATGTCCCTGCATAGCGAAATCTA----CTGTGCCTT----------------CTCCAAAAACTCCAGATCCTTCTGCATTCCTTTCCC----------TCCAATCCGTCAACTTCATCTCTCCTCCGACTCCTC------------------------AAATGTATCTGTA-ATACAAGCG-ACGTGTAGGACCCAA-AATGCTTTAATGGAAA-TAAACGTTAGTTACTGTTCAAACGC
CACACACTCTCACACACAACTGAGTTAGTTGTTGGGTTA-------TGCATAGAGGAATTTATATACTGTGCCTTGCCTCACTCTCTTCTTCTCGCAGATCTCTTCACCATGATCCATGTCGAGCTCAACCCGAGCATCTGGTACCACATCCTAACCTCAAATCGATTTCCTTTTGTTTACATTTAGACTATACAGAAGATATATATATATATATATACGCATGTGTATGCCATATTGATGCTTTATTGGAAAATAAATGTTATTTATTGTTGACTAGC
>CG15771 5604073 5604987|7091 chrX 5603623 5604491 scaffold_26 697467 698347 - 13483|472 940
GCAGTGCGGAGGAT--GTGTTGAGTATCGAATGAATCGATACGAATGACGAGA-GATTGTTGAAAAATGTACCTTCAGTT-TACAAAACTATAGCTAAAGAGGATTGAGGATTGATGATCGTAGAACGGGAGTAATATTCACGGATGGATCACGAA-----GAAGGACAGCCAG-----GAGAATTGGAAACGAGTGCAGGAATTTAAAGTTCAACTATTAGCGGGAGGAGCCCGGAAGCACGGTGAATCTCGCTATCTGCCATTAAACTAAAATTAAGGCTAGCAAACA-------GCATCGGAGCACACAAACTACTACGGCCAACAAGTACATGGAACAAAAG------AAAACAAATATGAAATCAGAGGACAGGAA-------------GCAAAGCAAAGCAAAGCAACC----AAATGTATTTTTCTA------AGCGAATTTTCTGTCACATATTTTGTAAA
GCAATCCAGCTGACCACTTTTGGATTTGTTCAGAATCGACTCCAAAGGGGCCACGCCCAGCAAGACGTGTGCCATTTGTTAAACAAGATGGAAGCGAAAGA----TGAGGAGTAGCAAGC---GAATGG----AATGTGCAAGAAAAGCAAACGAAATAATGATGTACCTTCAGTTTACAAAACCCAAACACACGCACACACAAACAAA---CAAACA--AACAAACGCACCCTGGAAG------GAATCAC-CCACCCACAGACACACACACACCCACACACACACACACACCCATACACTCACACACACATACCACTAAGCTTAACATACGCAGGAATCTAAAGTTCAAAAAAACAAATTGGAATTGAAGCAGCAGTAATATTTAAAGCCTGGCTGAATCTCGCAAATCTGCCATAAAAATATATATATATATAATATAGTATATTTTTAAGCACAAATACAGCAAA
>CG15771 5604073 5604987|7092 chrX 5604629 5604715 scaffold_28 1385846 1385928 - 2128|0 86
TAAAAAAAAAAAAAAACAACACCACACACAAGAAATACAAAAGAAACGACACGAATAACCGAATCACAAGTACAAGTACGTGAATGT
TGAAAAAAAAAAAAAATAACCAAAATCAAAAGAACAAC-AAATAAACAAAACGCAG---CGCAGCGCAGGTGTGCGTGTGTGTGTGT
>CG15767 5635995 5636161|7129 chrX 5635428 5636007 scaffold_1 1270744 1271290 + 6617|570 582
GAAATTTTTTGGG
-AAATTTTATGTG
>CG15767 5635995 5636161|7130 chrX 5636132 5637115 scaffold_31 106839 107975 - 3865|0 37
ATAAATATTTCCTTGTAACT--------TTTTAAAACT
ATAGAAAATCCCATGCAAATAAAACAATTTTTATAAAT
>CG12239 5639492 5639784|7132 chrX 5639202 5640230 scaffold_31 113426 114401 - 7590|312 606
GATGCACAAAGGAAA-TCGATGACCCTTCCCAAATTTGAAAGCACCGAATGAGTAAACGGATATGGATCAAGGAAAATAGGCATTACTACCCCCAGAAAAAGCAAACGGACCCGACAGCAAGCGACGAGCAGAGGAATGGGATGGGTTAC-TCCGCCGGAGCATTGTACAATTTAATCCAACTGTTACTGTAACCAAAAACCTTCCCCCTTTCCTGTTGTAGCCAACAAAAGCATAACGAAAATATATGATGGGATGCTCGAGTAGCCGAGCATCTGCAAACTGCATTGCAATTC
GATACTAAACGAAGGCTTAACGAT-------AAACCTGATATACTGAAACGCATAAA-------GTACCTAGGAA------CCCTATGTCCCCCAATACCGTACAACCTAATGAGCAACGAGTTTAAGGCCGAGAGTGGATCTGAGATGTATCTGTAAACGCATTGTACAATTTATTCCAACTGTTACTGAAAC-----------------------TGTAATCTACACT-GAACTACAAACAAATATAA-GTTATAC----ATAGTTGAGCATATGCAAA-------GCGAGGA
>CG4052 5650468 5650470|7149 chrX 5649887 5650604 scaffold_3 3725387 3726194 + 23477|678 684
----GCC
TGCCGCC
>CG15765 5684437 5684809|7195 chrX 5684195 5685247 scaffold_31 203688 204783 - 9593|245 676
AGAC---------------GCCCGGAGCCGCGTTGCTG-------------------CAACCGTAATCCGCACTAGTAACCGTAAACGTAAACGTAATCGTGACAGTAACCAACTGTTAAACCATAAATAAGAAAAATGATGATGAAGTAAGACGTAAGAAGTACACTCCCTGCACAGCCACGTAATTGGTCTTCAAAATCAGAGCAAATTGAAACAGTTGTTGGCATTGCCCCGCTGGCCATTTCCTTTCCTTCCTTTTAAAAGTCTCCCCAGGAACCCAGACCCCACAACATCATC--CCGCATCCATATTCCTGGCCAAAAGTTTGCGGAGCT--------ACCGCTTCCCAAAGACTTGTGTCACCGGCA----GAAATGCCGG--AAATCCAAGCGGAAAC---------CCAAAAGAAAACTCAAC
GAGCAGCAGCAGCAACTGTAACTGAAGCGACTTTGCAGTTAACACATATTTCCGACACAACACCCATCCGCAC-AGCCCCCCTGATCCC---CCTGACCCTTGCAATG--TAATTGGTGTGCAACAAAAAAAAAAA-----GAAAATATCAAAAATCAAAGCTGCATTGCC--------------------------------AGCAAATTGAATCAGTTGATGTCGTTGCC-------TGATTCCAGCCACCAACAACAACAAAATCAACAACAAAATCAACAACAACAACAACAACAACCATATCCACATT-CTGGCC-AAAGTTTGTAAAACTTGGCTATGTCCGCCCCCGCACGGCT--CCACACCGGAAACTTAAGCTGTTAGTCAACGCCAAGCGGAAACGCAAAGCAGCCAAAAGAAAACTCAAG
>CG16721 5728026 5728636|7239 chrX 5728297 5728495 scaffold_2 6309870 6310082 - 1416|0 228
AGTGGGATCCGAGG--CATCTGAAAGGAATCAAAAATGTGCTGGAGCGTCTGTGATAACAAG--AATATTCAACACAAAAT-------------------------TCAAATTTTTGGGGGTTAAGAAAAGTGAACTCGTGAATTATGTGTGCTCCTCAATT-TTCGTAATGTAAACCCCCTCTTTATAGTACATACATATATATATATATTATGATTATACACGTGTA
AGTAGGATACAAGTTCCAGCTTAGATGGAT-----AGGTGTTGGA-----TGTGATCATAAGTAAATATTTAAAGTAAAACAACGGCTCGGTAAACAGCAGTGTTGCAAAAGTTTATGTGCTTAACACGACCCAACACTTATTTTATTAATTTACTAAAATTGTTCAGAAAGCAAGCA-----TGTTTAAGAC-TGAATATATATATATATTGTGTGTATATATATGTA
>Act5C 5749065 5750026|7266 chrX 5747910 5749826 scaffold_28 1103176 1105091 - 105705|1155 2021
GAAGGATCGCTTGTCTGGGCAAGAGGATCAGGATCGGGATGGTCTTGATTCTGCTGGAGGAGGAGGAGGAGAAGTCGAGGAAGCAGCAGCGAAAGTGCAAGTGCGAGTGGTGGAAGTTTGGAGTGCAGCACAACAAAATCAACAACAACACCAACTACAAGATGAAAAGAGCGGAACCACCTGCACACCATCATCATTATCATCATCGTTTTGGGCGCATGTTGTGTGGTTCCAGCGTATTAATATAATTAATTTATTCCACATGAG--ATATGATATGA---TATACTATGTATTTTTTGTTTTTTTTTTATTTGTAAACCTTTAATATAACAAGAACTACAAAAAATGAAAATG--AGCGAAAAT-GCATAT----TCTGCCATTCCAC-ACACACACCAACAACACCCAACACACGCACACCCACAAGCTTACACACACACATTCGCGGCATGACAAGGACATCAAGATAAAGAAGAACTTAAAGAAGATATTTCCCAAAGCGCAAAAAGAACACACACACA----------TTGCAAAACACAAACAAC-------------ACACT-AGCGTTTTGTACAATTCGTCA--GCAACCTTATGTATTATTTTTTAATTATGATGTAATTATA---AACAAAGTGAAACAAAAATATGAAAACAAAAAGGAA----AATCAAATCTGTCTTCTCTTTCT----------------------------------------CCCGCTCTCCTCGCTCTCTGCTGC----------------TAACCTCGCCCTCTCCTCTCTCATCTTTTTGTCTGTCTCTCTTCCACATT--TTTGCCGGCCGGCAAA-ATAATAACCCACACACA
G--------------------------------------TGCTCCAGCCTCCAACCGGGTAGCAAGTGGAGTGGCAACAACAACAACAACAACA--ACAACATCAAGAAGAAGAAG------------------AAAAACAGCAACAGCA--------AACGGGAGCTGCGCAATGTTATCCACACATCATCATCGTCGTCGTCGT-----------CATGTTGT---GTTCTAGC--ATTAAT----TTAATTTATTTCACATGAGATATATGATATAAATGCATAATATTTTTTTTTTGTTTTTTTTTTATAT---ACCTTTTAATAT------AACTACAAAAATTGAGAACAACAACAACAACAACATATTCTCTCTGCCATTCCACTTCTTAAAAAAAAAATCTATACCACA-ACACACACACATGCGTACAC--------TCCCGGCATGACATGAAAAGAAGAGAAAAGAAAAGC--GAGTAAAATATTCCCCAAAAAGCAAGTAAAAGACACACAAAACACAAAAATATGCAAAACACAAACAACAACAACAACAACAACACTAAGAGTTTTGTAAAATTTTCAAACGCAACCTTATGTATTATTTTTTAATTATGATGTAATTATAAACAACAAAGTGAAACAAAAATATGATGGAAAAAAAAAAACTTAACCAAATCTGTTTTCTGTTACTCTTTAAACTGTCTACTCTTTTTAACTGATAACGCCAAACCCCCGCCACCCACGCCCTCTGCTCCATTGTGACCGCTTTTACAGACTTTGCCTAAACTTTCTGCTCATTTTATTTCCTGCTCTAACCTTTTGATTTGCCGGCCGGCAAATGCAGTAACACGCACACA
>Act5C 5749065 5750026|7267 chrX 5749827 5750171 scaffold_28 1105213 1105542 - 5314|0 219
CTCACACTTGGCTGCAGTTTCGCGTGCGATA-------------TTCACACACATTCAAGCATACAAGCATACAT---ACATATGTATTTTTTTT-TTATTTGTACACTTTTCTAATTGCATGCGTATCGATTGATAA---GTTTACGCCTGAAAATGTTAATTAAAATGTGAAAATGCAACTGAAAAACTGATGAAATGAAACAACAACAAGCGAACAA
CTCTCACTCTGTGTGTGTTCGCTGTGCTGTAAACTCCTTGAAATTTTATACATACATATGTATTTAAGCTGAAATTTTATATGTGTATTTAGTTCATTTTTTGTAT-TTTTTCTAATTGCATGCGTATTGAATGATGATATGTTTACGCCTCAAAATGTTAATTAAAATGTGAA------------------ATGCAAAAAAATAATAATAATTGTTCAA
>CG12236 5755878 5757044|7274 chrX 5755415 5755909 scaffold_28 1113070 1113668 - 17585|536 602
T------------------------GCGTC--TTCATAAGTCTCGGTCGC---------CTGCGAGC
TGGACGATCTTTCAGGTGCAGCACGGCGTCAATTGAATATTCCAGGCGGCACGGAACCAATGCGAGC
>CG12236 5755878 5757044|7275 chrX 5755931 5756116 scaffold_28 1113702 1113893 - 1238|0 193
ATCTGGATTGAGATCGA-TAGGATATACGGATAG-GGGAGAGAGATATAGTTAATTACGTCCAGCTTAGCGAGCAGCCAGCAAAACCAATCAACCCAACCAGCCCATTCCCTCGTGTTTCGATCAAAGGCCCCA------AAACGAAAACTAGCCAAATTTGTCAACTTAAATGCAAAGCAGATAGGAGTACGA
ACACGGAGACAGAGCGAGTACAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGATATAGAACATTACGTCCAACAAAAAAAAAAAACAACAAATGCTGCAAATGCTAAAAACC--TCAGCTAGTGGCAAGACAAAACAACACAAAAAATAAATGTAAAGCAAACAAAACTGAAAGAAGAAACAAAAAAAAAAAAAGAGCAGGA
>CG12236 5758000 5758315|7277 chrX 5757679 5758005 scaffold_28 1116116 1116438 - 12810|326 331
GACAGC
CTCAAC
>CG3726 5786600 5786906|7316 chrX 5786203 5787150 scaffold_28 1145080 1146206 - 14526|417 864
AGAAGGATCTGAGCGAGCTATGGACACGTCCGCAGATTTGAGGACCAACCAATGCCACAACCATAACGAAACTGCAGAAAAGCCTCAAACGTCGCCACAGGCTGATCTAGGATT-----------------------------------------------------------------------------------ACAACAGAAGGATGAAAGACAGCTAGA--------------------------CGAGGCTAGTTTTGGATCCTGAGTAATGCTTTCCTGAATCCTGAATTCCCACATTAATGTGTTGTTCCCATCGGTGGGTCACAACTATA-----------ACTGATCTACACATTTAGGATCTTATTATTACATAATATATAATATAA-TATAA----------ATACATGTCTATAAATACA----------ACCAC
AGAAGGATCTCAGTGAGCTCTGGACACGTCCGCAGATATGAAAACCAACGAA----------------AAACTTT--CAAAATCTCAAACGTCGCCCGAGATTAATCTAGGCGTTGTGTCTAAGCTTATGTTTTAAGCACAATTTGTTAGGCTAACATATTTATGGCACTTGACCGCACTTTAAAAAACAAAAAAAAAAAAAAAAAGGAAAAAAAAAAACAAAAAGCAAAAAAGACAGTAAAGTTAAGCGCGAGGCTAGTTTAAGATAATCGGCGTTAACCTAATGAA----------ACGCGTTACAAAACCTTTCC------TGAACCAAAACAAAAAAAGAAAATACAATGAAAAAAAAAATTCAGATTTCCTCATAAATTTCTGCATGTTACAACTACAACTGTTTTACTATATATATATATACACACATATTACTATTATTAT
>CG6041 5795352 5795444|7324 chrX 5795340 5796694 scaffold_3 4527277 4528504 + 15853|12 106
ATCTAGTCATCGCATAGGTCCGCCAAATAGTCAAAGACTAGATTATAACCTAATTTAAACTGCAATTAATTTATTAAATTAACTTACAAT--TCT
ATTT-GTTGTCAAATTAAAAATCCAAATCTTAAAATAATT--TTAAAGTCTAAATTATAGAGCAAACAATATTTTTA-CAAATTTGGAATATTTC
>CG6067 5803206 5803520|7330 chrX 5802222 5803303 scaffold_28 1158872 1159928 - 20519|1023 1127
GATGCCTTGAGATCTG-AAACATGGGGGAAACTAGCCAA------GTAAGATATCCAAGGCCTTTCAGTAGTGTAATGCCGAGGAGTGTGATAATCTCGATCCGA
GATTTGTTTGGGTTTGTGGACATGAAAACTGATATCAAAGCTTTCGTTAGCCACTTTATTTGTTTTCAAAAAACAAATACTTGAAATGTGATAATCGCTATTAGG
>CG6067 5803206 5803520|7331 chrX 5803304 5804592 scaffold_28 1161090 1162343 - 17271|0 216
TCCAATGAGTGGAATAATCTTCTTAAGCCATATTAGCACCTGACATTTTTAAACTATGCTGTAAAGATGTGCTAGTAAGATATAAGTCCAATGATATATGTTAACTTTGCGTTCCCAAAGAAATAATACAATTTTGATTCAACAAAAATAAACAATTTATTAAGATACATAGAATAAACATAATTATGTACAGTACAAATACACATAGATTACAATA
TTCAATGTTTAACAAATATTTAACAAATTTCATTAACAATTAACAATTTAA-----TGCAGTTAGGAAATGC-------AGAAAAATTTAACAACATTT------------TTCACAACAAGCTGTCA-------AATTGAACAGAAG--AATAACTAAACAAG---CAAAGACTAATCAAAATTATTTACCATAGCGTAAGAACTAGATTAAACT-
>Grip 5831636 5831932|7360 chrX 5829437 5832037 scaffold_28 1190706 1193318 - 91536|2292 2668
TGC-----------TTTTGCCCGAGA----------------------------------------------TCCTTATGTTAAACTAGTTGTATGCTAAG----CTAATCCTAAGTGCCATT-----------GCTAGCCCATAATATTATATACTACATATATCCCTGTATTCTTTACCGAGCGAAACCTGCACACAAACAAACAGAAAAACCCTTACCG---TCAAGGACAATTGGAGCAAAACAGTCTGGCATAACCAAATAATGTCCTCTTTAA-GATAGATCTGCCATAATTCTACGT-TAATTCTATGC---TAAAATTTGTTTTCTAGCAAATAAACAATCGTACCGAAAGTTTGTTCCAAACTAAACA
-GCGACGATCCATGTTTCGCTCGAGAGGCCCAAAGTTTCTGTCTATCTTTTCTTTTCTTTACTATTTTTTTTTTTTAATCTTTAACTAGTTGTATCTTAAGTATCTTAAAGCTAAGTGCCATTTTTTTTTTGTATCTAACCGCCGAGTTCCCTTTCCGGATGCAAAACTGATCTGATCATCGACCCAAACCCACCCACCCACTTTCTGATATGCCTTGACTAATTTTAGCGACAATAAGTGCCAAGT-GCCTG-------CAAGTTTTTTTTTTTATAATAATATATATA-TATATATATACACATAATTATATATATATACATCTATATATATAGCGAGAGATTAAT-ATACCAACGATT--GTCTAACGTAACCA
>CG5966 5837330 5837880|7364 chrX 5837587 5837733 scaffold_28 1200488 1200656 - 2046|0 171
TTGTTTGCACAACCAGAA-----GTGGCACAGATG----------CAGATGCGTGTCTGCGCTGTGGGAACAGATCGAAAAAGT-------GTTCCCAGTTTGACTTTTA---TAGCAACTCGCTGAGAAGGAACAGTTTGTATTTTATTATAGTATTTTAATAGTTCGAAA
TTCTCTGCGCAGCCAAAAAGGCGGCAACACAGTCGAGTCATCCGGCCGCAGTGTTGCTGGGTTGGTGGCTTGGCTGAGAACAGTTGCGGCTGTTCCCCCTATTGCTTTTAGCCTGGGCACACACCGAAAAG---CCTTTTGTATTTTATTATAGTATTCGTTTAATTCATAA
>CG5941 5884194 5884814|7430 chrX 5884076 5884360 scaffold_24 509671 510025 - 5938|118 355
GCGAAATAGGAA------------------------------------------------------TCTGCACTTGCACTTTTTAGTCTTCTATGTCATGAGAGCAAAGAATGGTTTTTGATATACGCAACTGAGTCCTGATT--ATTATTTTT------TTCTACTAATTTTACTCTGTCAGTTAAACTATTTAAAA-CATTGCGAAATA--------TAATTAATGGCATTTCAAG
ACAGCATAGCACAGCACAGCACAGCACGCCGGGCATGGCTAGCTTTGGAGCTGCAGCAGCGTTCGCCATGCACTCGTCCTACTTAGTCTTCGAGAGCAAAAGAATGTCGGTTTTTTTTTTTTTTATTGCAGCATATGCAAATTCGATTGTATTTAAATAATTTTTGTAATTTAAAAAGGTCAGTTAAACTATTTTAAATCAATTCGAAATACATACAATTAACTAATTGCACTTAAAA
>CG5941 5884194 5884814|7431 chrX 5884398 5886243 scaffold_24 510063 512152 - 7054|0 459
GAAAACCAACCACCTGTGGAGAC------------CAGTGGTCCAGGTGAAAGGTGTCCA-GTGGATCTAAATTTGAGCATTTTAATCGGATTCGGCAGGTATGACTGAACATTGAGTCTTCTGTTTGGCGGTCTTCATTCTGTTAGCT------CTTATTTTAAGAGT---GACTGAATAACTGTGAC---------TCCTTTTGTTTATTGATTAGTCTAAAGAGCAACGAAACAAGGCCTGTAGCTTAAAG--TTTGCCAGGGCTGCGAACAACTCATACAAACATTTCAAGGTTATAGTTGATATCCGGGCACTTGTGAATACACGA----------AAAGATTGTATACAAAAAAGAGCTTATAACTAAATGTACACAATTTATTATTTGTAATATTATAATTTTTAGTAGTTTTACTTCAAAATTATTGAAATAAAGCTTCGCAATACGTGGAA
GCAAAGCAACCACCTGTGGCAAGTGCCACAACGTGCAGCGCATCAGGGCACGAGCGTGGGCGTGGGACTTAAT--GCACAATTTCAAACTATCCGATTTGTAATAATAATTACCTTATTTCCTG----GCGATTTTCGT---ATTAGCCTTGTGACTTATTCGGTGTGCACAGGATGCGTACTTTTAACGTGTGAATATCGATTTTTCAAATAATTGGTC---AGCGCAAATAAATCAGCTGTTGAAGGTAAAACATTTGGCA---TTGCAAATAAC--------ATAATGCGCTGCTCCTGCTGAAA--CAAGCAAACGTGACGTCACAATTCCTATTGCCATGCTGGGACAAAGCTAAAAGTTTATGCTTAAGCAAGCAAA----------CGTGACGTCACAATTCCTATT-GCTATGCTGGGACAATGCTAAAAGTATACAT-GTATGTTATGTAT
>CG5928 5914377 5914502|7460 chrX 5914275 5914772 scaffold_31 1295500 1296027 - 7371|102 292
----GAAGGCGTGTAA-------------------------------------------TTTAAATAAATACTTTAATTTATTTTGTAACTTA-ACACGAACATGT-----------------TGTTTAGGAATGCATTTCGATATAAATATTTGTATGTATGAATAAAATAATCATACGCATAGTAGTAA
AGATGAAGACGGGGAACATAAGTAAAACCATTTTTTTTTATTTGATTGTATAACTTTTATTTAAATAAATAGTTTAATTTATTTTGTAACCTATGCACAATTTTGTAATTGTTATTTTGTTTTTGTTTAGGAATGTGCTTGT---TAAAC---TTTATGTATAAATATA-TATATATATATATATATGCTA
>Nep1 5948836 5949209|7504 chrX 5946887 5948837 scaffold_31 1343219 1345193 - 111020|1975 1976
TC
TC
>Nep1 5948836 5949209|7505 chrX 5948845 5948963 scaffold_22 1604857 1604978 + 62|0 128
GCCGTCGATGTTTTTTTTTTATATATTTATATCGCATACTATATAGTATTTA--CATATCGATATACACCATACGAGTACTGTAGATCACCTGCGGCAA--------CAGCAAACCAACCTACCAACCA
GCTATCTATTGTTACCTATAGCCTAAGAGTATTACAGACGATCTATTCCTAAAGAAAACCAATGCAGACCGTTGGA------TCTATCGCTAACTGTAAGTATTATTCAGTAAACCTAACCA-CAACCA
>Spx 6102323 6102655|7701 chrX 6101085 6102877 scaffold_25 1580805 1582727 - 63069|1274 1740
GT------------CTAGCGTGTAGTGTATACCAATTTGGACGAGACGAGAAA------------------------TAAACATCAATAGGATTC--------ATCAATGAAGCCTGCTCTGGGATA-TGTTAAGATTTCC------------------------------ATTCTTCTTTCTAA--------------TATGCATTTAACAACCGGGAAACCACTGGGAGACATTTAGATCA-----TCATTGTATTTCCATTTAG-TAGTCGCAATACAATCT--------TCGAATTCTTACAAGACGAAATTAAATAACTTTGAATAGAATTT------TGAAATGAACGAAATGATTTGATATAAATTGACTCTCG--ATTCTTGATTTTT-----TTTTAAACGG---AACTATTTTCAAT---------------AAACATAAAACGTTTACATTAACAA
GTCCGGCTCTGCCGCTAGCAACTAGT-TACACAATCTTAGACGAACCAATAAAACCGTATCACGCATTTTTCACAAGTTACAATTAACGAGTTTCTTAATTATATAAACGAA-CGTGCTGTAGAAAAGCGAAAAGAATGCCCAAAAGATGAGCCAAAGGCAGGAAGTGAGGCTTCTTCTGCCTGAATGGAAACCAGCTTTAAGCGTTCCGCAGCC---AAAGCATTTGGCAAAAATAAAAGCGGAAACTAAGCGTAAAGCTCCTGAGATTATCAGAATATGCTTTGCTACAGCCCAAATCCTTTGGA---------CAATGATTATGAACGGGATATAATTAATGCGACAGACAGAAAAAGGCAGGACGTGTTGAATCTTGCCATCTCTGTCTGTTTGAAGTCTTAAAAAGTATATCTACATTCATTTTCATGTCGTTTTCAAAACGAAACACGAATATTTTAAGAG
>Spt6 6119661 6120222|7718 chrX 6114762 6119661 scaffold_25 162882 167877 - 267286|5074 5074
G
G
>CG15897 6134665 6134794|7740 chrX 6133604 6134727 scaffold_36 576754 577849 - 41000|1075 1140
TCCCCGGGCG---CCCACATACCCAAAGGAAATTAAATGAACCTAATCTTTACATAGCATTTAATT
AATCCTGACAACTTCCATGCACGCAATTCACACTTAGCCTAGCCA--CTTTCTATTGTAATCAATT
>CG15896 6138344 6138401|7744 chrX 6137967 6140294 scaffold_28 1347404 1349783 + 79674|395 459
CCA-TGTGAGCAAGACTTCTTATGCGAATAAATAG------TAGCCAAATGTTAACACGAATACA
CAAATGTGTGCTAGATCG---ATGGAAAAATGTAAATGTTTTTGTTGTTTGTGTTCGCTTCTGCC
>CG3815 6143729 6144209|7746 chrX 6143519 6143860 scaffold_28 1354358 1354675 + 9237|210 343
AACCAGTACCCAGACTCCATCAGCAGAAGCAGCAGCCTTTAGTTTAAGCATTAAGACACAGAAACATATACGCGCTCAACCGCAGCCAACTCCAGTGGA--GCAGCACCAATCTCAGTGGGGCAGCTAGCAGCC
AGCCGGC-CCTAGAGAGGATCACACCAAACAATA-----TACTCCAAGCGGCGCAGCTAGCAACCATGCA---AATCAATCTCAGTGATCGGCGATCGATCGCAACAC-------------ACAGCCAGCAGCC
>CG3823 6151734 6151981|7755 chrX 6151593 6152072 scaffold_24 470395 470864 - 1280|152 418
TC---GCCGTGCGCACAACTGTACCTTAATTTTTTGAGCCTTCAGCGATTTTTACATATCTTAAACTTTTTACCCTTCAAGTGTACT------------GCAAGTGTTATCCAATTGTGGTCAAGACACTTTGGCCAAATTGTGGTGAATGTGAAAATCGGATTAGGCTCGTCTATCTAT---TGTATTTTTG-CTTTGTTCCCGTTTGTTTTCCCAGCTGGGCTTGGGTCTATGTAAATATATATATATTATATTATATTCTTAAC
TTTTAGCCGTATTCA------TACCTTATTTACCTGTACAAT-ATATATATCTATATATCGACA----TTTATACCACAGCTGGGCTTGGATTTAGTTCATAATTGTTCTCTAATAAAAATGCACACAACATGCCAACAT----ATCTATATCTATATCTATATCTATATCTATATCTATATCTATATCTATATCTATATCTATATCTATATCTATATCTATATCTATATCTATATCTATATCTATATCTATATCTATATCTATA--
>CG15893 6177224 6178003|7780 chrX 6176263 6177716 scaffold_26 1857963 1859650 - 27929|1040 1775
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CCGCCAGCAGTCCGTATACAATACGTCGCAGTCGTCGTCGCTGCAGCAGCGGCGGCAGCGGCAGCATTAATCGCCTAAAGCTGCGACTGCGCCGCTCCACCTCGTCGCCGGGCTAAGCGCGCAGCGTTCTGCATACGGGCAATG---GAAACGATCAAATTCGAAAACGATATTCGAATGCTGGAAATGCTAGGAATGCTTGGAATGCAGTTGCGGCGGCGACCGCACTGGCGTGCAGTGGCGTTGCCAGATGTGCCAAATAATCAAATTGGGTGGCGACAGCCAAAGGCATT-------------------------GGAAAACAGGTAGCGAGAAGGCCTTGGCGTGTTGAATGAGTTGCCAGCTGTTTGCAAATGTTTTGTTAAACTATTTTTTTTTTTTCAACTTTATTTTTTTTTTTTGAGTTTTATTTAAAAAAAAAAAAAAAAACAAAAGAAAAAACCAAACAAAAAGTAAAGATGGATTTTAGACAAGTTTTCCTTCAATATAAATATACATAAACAAATTGATTTATATATATATATATATATATATATATCTTAGTTAACTAATTATATTTACATGCATATATACACAAATATATTTATATGTATTTACATGTGCTTAAAGTTCGTGAAACAGTGAAAAAAAAGGCTTCCACACAAACAGACATGCACACACACACAGAGAGACAAACACGCGCATACACACACCGACACACACACACACAACCTA
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GAAAGA
CAACGA
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TGCAAATACAACAAATTCGAATGTACAA
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GGCCACTTCTAATCTTTCTCTTTTG-----TTTTATGTAGTTTCGATTTGCAATTTTTCCTTTTT----------TTTGTTTGGCGAACTTTTA--GTAACTA-ATACTTTAC-ACACACACACACACACACACACACATACATGCATGCATACATATATTCATTATACATACATATATCTATGT---------ATACTATTATATATTCGCACACATTATATATATATATATAGTTTTTTTTTTCAATTGTTGCTTTCATATTGATATCATCTCGACGACATTCTCGAACATACGATACGATATATACTATATATATATATATGTGTATCTATATATGTATGCATAT-GTATATATATGGGTATATAGATAGCTATATACTATATAGAGAGACAGC-TATTGGGCATGCCCGGTT-TATAATATAACTAAGTTGTATTTAGCACTGATTAGTTGTTAGTTAAACACATTGCGTAAACTGC-------ATTCAGTATGGCATTCACTTAGCTATTAACTATAAAAGATTCTATACAAATTTATTCCTTATTGTATACCTAGTTTAAATAAAAAAACCAGCAAAAATGTT
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GTAGGG
TCAAAG
>Pat1 6440904 6441870|8096 chrX 6440910 6441098 scaffold_25 953552 953747 + 2442|0 197
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CGGCACGCGCGGACGCCTAGCGTCCGGCCCAGGGGCATGCCCAAGACAAGACCACAGTCGACGGCCAATATATAGCTACATCCATATGGGATGTGTGGC---TGAATCGGTTTG-------ATGGGCTCCATACAAATGGGCGCTTGGACCTTAGGTAAATGTTAGGCAAAAGCTCGAATTGTCCG-------TCTGTCTGGTTTGGGGGCGTGTCCGGCCAAATTGAAGCGAACGGAACCGTTCCAAAAGACCTCAATACACACATATATGCAATTGAAAC----ATACTCGTCTATACGAAACGTTAATCAATAATAATGATAAT
>CG3973 6495650 6497334|8166 chrX 6495961 6496003 scaffold_10 160701 160741 - 122|0 42
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GTGTGCGCGCCAAATC--CCGCACAGCTGATCGCAGGTCGCGA
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GCGAAACACCAAAAATGCCA------CAAAGATGGCCACA----AAAGTAGGACACAGCCTAGAGCCGGAGCCGGAGTCAGAGTCACAGCCGGCAGCAGAGACTCGTGGTGGTTAGGTAAGAGGCAAGAGGAAGCAGCAGGCAAAACCACATCCGCCTCAATGTCAACGAGCGC
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CTTAGAACCCAGTTACTGGTTCAAACCTTTTGAAATTTAAAAGAAACAATACAACTTTTTAATAAAAATATTGCAAACCT-CATTGATTCTCATAAGATTTCTGAACAATTTG-----ATATCTAAACAATATTCG----TATCTACATAATTT---GTATCC--CAACTT-GTCTGGATTTGGAACTGAGTCTCTT-TTAATTTGAATCAAACTAATATGAA--TATAAATTGATAAATTGGCCTTGATTGAATACCAATTTTTAGGATTTGCGTAGAG
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AAAAGAAGCGACAATA--------CTAAGCGCTAAACCCTCG---------------AATGTTGTGTGTAG---------CGGAATTCTA----TTTACTGCACAAT-GCACACACTCA----CACACACACAACACACACACACACACACACA-----ACACACACACAACACACGCGT----------TAAAATATCTTTACTGTGCATTCGGCATCGAAG
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TTTTCCAGCATAGTCTTAAAAAGAAAAAGGAAG---ATTTATTTTTATATGCAAGCAAACGCCATCAATGTGAAAACATAAAATAAAGGTAAGAGGGAAAGCTTTTAACAAAAACTCAATTTTACACATAACACGAGATGCGATACGATGATGATGATAATGAGATGGAAATACAAATAGATAAAAAATATATGCAACTATATATATTCATATAAAGAAATGTAG-----TTAGGATTGTTTGAGCAAGCC--------AAACAGAGCGA-------------AAGAATAAGAAATCAACTAAACGAATTT--TGGTGCTTTACCAAAGCCAATTTCAATAT-ACTACCCCCAACCCCCTAC---TGAACCCCT-------------CTTACACAAGGATCCAACTATATCTATAAAGT-----TAAGAGCCATAATCTGAACAGCGGTCACAAATGTTCGAATGTTAAGT---AATTCGTCTAATTGATTAATTAA--TACTCCATATATAACCCATAAATACACATATTGAAGCCCCAAAACT-----TATTAACTATATATATATATATATATATATATATATATATATATGTATATACATATATATAT
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AACTAGTCGAAAACCCTTTGATAACCTCTAGAGCTTAGGATATATATA-CATATATATATACATACATTTTTTTTTTGCCAGT--GTCGAGCATAGTATATATGTATTTACAAACACACACACACACAAAAACACACAATCGTGCCTGTA---------------------------------CATACATACGCACTTC---CTTAATACACACAACAGCACACACACACACAC-ACACACACACACACTGCCCAGTTATCATCCTAGTTCCATGCATATCTTTACGGAGA-ATTACGCGAGAGGATCACAAAGTAAAGGGACATATAAAACTCAAAAATTGCCGCTCCCGGACGCAAATACTTAAAAAAATA----AAACCAAAAAAAAAAAAAAGAAATATAGAAAACCGACACAAAAAAAAAAGTAACAAACACACAAAGATCATATACCTCAGC-----ATTGTTTTGAGCGCTCGTTCTTATACTCAAAGTCTAAATCAAATCCGTTTGGTTTTCGGATAACCCATTTTA----------TGTACACCAAAAAA------AAAAAAATACATACATACATTAAATTTATACACATATTTATACAACA
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CAG
CAG
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TCTTTGTC--------GTCTTTGTCTCTACGCTCATTTTTGCATTTCATTTCAGTTTAAGTTTGTGCGATTTTTTTTTTCCTACCAATTTTTAGGTTAGGTTTCATCTAGTTAATAAGCATATCGTAGATCTTAACTTATATTTAAGAATTAATTTTAGTTTTTAAAT-TATTCTGAAAATTAATTCAATTTCTTATATTTGAATATACTCTTCAGCTTTTTTATG----CGATTAAAAGTAATTTTAAAAGATATTTTCAAT
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CGCGCAACAACCGTTTGGGTAACAAGTCGGCCCTGCCTAAACCGTCTGGCTATCCAGTCTAGCTGATAACTATGTATCAAATTTGTTGTTCAGTTGAAAATAGCTGCCACAATAAAAAGCAACTCTTTGGAAATTAACTTTTCGTTCGAATCTCAAAATACGCGACAAAATTCGTTATTCTATTTTGTAGCAATAGGAATAAGCACTTGGTGAAGATGCTATGCACCCAGCAACCGTTAATGTTCCAGCCGTGCCAGATCCTG
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TAGACCGACCATGCAAATGTTACGAGTGGACAGTTCTGGAGGGGGGCGTTTGGGCGTTGTTAACATCTTGTTATTCTGAGAGATAAAAGAAAAAAAAAAAAATGAAAATA
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TCTTGCGGTGCTGTGTATGCTTCCAGTTTTCTGATTAGATATCATCTGATTAGATTCCGTGTGTTGTATTGTTATGGGCGTGTGTGTCAGTGTATTGTATTGGTCTGTACCTTTGTTGTTACTGTGTGTGTG---TGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGTGTG---TGTGGATGCACTTTACTTGCTGAAGCCCGCTTCAGAAGCTTCCAATTGCGCTCTGATTGGATTCGGCTCAAGGCGTGCACATGTAAATGGCCTGTCGTCCGTCTGTCTGTCTATCCGTGCGTGTGTATGGGTGTTGTCTGATTGGATTCCGCCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGGTGCTGCTGCTGCTCCTTAGTAACCCTTGAGGCGATCCTCGAGCGGCGGCTTGATCACCTTGGGAGCACTCGCCCGCGAGACGCGCATCCGCTCGGCCGCCTTGGCCAGTCGCTTTTTGCGCTCATCGTTCGATTCGCTGGCGCGTCGCAGTCGCTGGCGGGCGGCGTTCTTCATCAGTCTTAGGGTTCTTTGTACTTCGTTTTCGTTTTGGCGTCGGACGCGGTTCGCCTCGGCGTTTTTGGCCAGCCGCAGACGATACTCGGCCTCCGATTCTTTGCTGCGCTTATCTCGCATTCTCGCCGCGTTCCGTTCCAGACGTCGTTCCCGTGCCTCGACAGATTC
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GCTGAAACAGTTGGGCCCCCTGTATATATCAAAATCAAAT-----------TATCTGTTCCGCTAAGCTAACCGTGTTAAGCATTAAAGA--------------------------------TAGAGCTAAATGTCC
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CAGTATAGCCAAC
C------GCCAAC
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AACTGCAGTTGCTCAATAATTGCCAAATTAATCTTCGTAAGCCAG----------TTTTGTTCGTTTTGTTAAACGTTTTTATATTTGTGTATGTCCTTTTTTTTATTTTGTTTAATTGTGTGTGTTTTAACTTTTGATTTACCCATACATATATGTTCGTGTTTTTTGTGTGCTATTTAAGTAGTTAGTCCAAAATTAGTTTAGCCTATTT---AGGTGTTTACACTTACGAATAA-TTTCACCGGTTCTCCTATGTCCTTCAGTTTATGTGGCCATATAGG--------AAAAGTGAGGAGAAGGAC
AACTGCAGTTGCTCAATAATTGCCAAATTACAAATGTTAAGGCAGATTCGTTTAATTTTGTTCGTTTT--------TTTTTGTATTTGTA-------TTGTATTTATCT-------TTGTGTTTGTTTTCATTTT--------------ATATATCTATATTTTTTTTGTGTTC-ATTTAAGTAGTTAGT-CGAAATTAGTTAAGCGTATTTTACATGAAACAATTTTTATGTATAATTTTTACACATTATATGATTTTCGCATAAGTTTGTGGCCATATATGCTGTTGATAATGTTGATAAAGAGGAC
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ATATATATATACAAGGCATATATATGTATACATAAATGTAT-ATGTAATTAAAGCAGAAATAAAATAAAGATTTTGTAAACGCGATCTTCACAAAAAAATACG-----TTG---CAAATAATTTAAAAATA-CGTTTAG-AAATCAAAACGAAAGAGCAAAGAAAAACAAGAGCAGAAAGAGAGAGAGAAAAAAAAAAACAAAAT-----------AAATAAAATCAACCAAGGCATGCATACATTATACAATTTATTTTACAGTATATCCGATATCAATACTCTAGCCATAAGTGACAAAAAAAAAAACAAATATATTTATATACATAATAAAATAAAAACCAGAAA---ATTCAATACAAAAACAACCCTATTTATCATTTAGCAGCCATCAAATATGCAGGGTATATGGCCTAGATTGACTCAATTATACCCTGCACGCAATAGAAAACGTGTTCAATGGGTATCATCGTTTGCTGCAAACGTATGTGACGGGCAGAAGGAAGCATCTGTGTTCGAAATCGAT--AAATATCGATATTGAG---------ACATGACTCTTTAAGCATAGCTTGAAACGAGCTGATCATTTTCATCTAA--TCAATC-----------GATATGCTGTC-----------------------------CAATTTTCA------------TGATATCGATAAATATCGATTTTGAGGCAACGCTCTCAAAGCATAGCTCGGAACGAGCTGATCACCT
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ATATG----TATGTACATTCTTGTTAAAA-
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TGCAATTATTATTATCGTATAGTATAGAATACTATACTATGATATGT-CCATACCTGGAAAGGCACTTGCCCAACGCGTGTTACCCTCCACTTTGAAGTTTTGAGTATTGTTCATACTCA-----------AGATGTCTGGCCGGATGAGGCACATATTATGCATAGAGGAAGTCATATA-ATTTATGCATTTATAGCAGAAGAATTCTTATGGTACGAAAACATTTCTAAATTGGGCTATTATAAATTAAC
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AACACAATGCTGAATATAAATATAAATGTTCGTTTCCTT---CGAGTGTAA-----GTGAGCTAAGACTTTTGTGGTATATAATCACTCATTTTATTTTCTAAAGTTC---------ATCTCGATTG-------CGCATCCGTT-----TTTACTT
AATAAAATGATGCAGTTCGTTAAAAATGATCGATTAATTGAAAAAGTGCCATCAGCGTGAATAAATGTATTTAT---ATATAATCACTCATTT-ATTTCCTAAATTTTTTTGTTTTTATCTCAATTAGCTTTTTCCCATCGGTTGTCATTTTACTT
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ATTCATTTATTCTCACCTGCTTTCTTGCAGTTACCTACAATTGGCTGTACTGGAAACCGATATCGGCGCCCGATCCCATATCGGAGAGCATGTCCATTAGCCTCATCGGCTCCTACTGTTAAACTGGAAGAGTCCGTGCCACAATTGCCCACACATCATCATCATCATCATCAGAGT-CATTCTTGTCATTGTCAACCTTCACAATTCTCAGTCAACATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATTTTTTTGTTAAATGCCATGCCAAAATTTTTCCAACAAATTTATGTCGCTCTCAATTTGGAAAGAAAAAGAAAAGAAAAAAA---AAAAAAAAAAAACAAGAA----TATTTGTAGAAAATTCGAAAGAAACCCATTTGAAATGGGCAACAGCTCGATTAGCC-------CTAAGCTCCATGTTCTATCCTATAATGCCTGTCCCAATATTATATAGTCTATAAGTTTGTGCCCGGCGAACGACCGAACATTGTTCCACATTCTGTGTTCTAATCTGGGGAAAAGTTGTAATCATTTTTCGTCAACAATTGCATTTATATTCAGCTCTAAGTT
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GAATTAAGCTGGGGAGCACAACATTTGCCACAAACATCAACAGCAAAAACAATAGCAACAACAAAAACAGCCACAGTCACAGACAACAGTAACA-TGTTAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAACAACAACAGCAGCAACATCTTCATCAACAACAACAACAACAACAACAGACAAAACACATAAAACAACACCCGCATCTCACATGGCTCATTTGGCACCGCCGCCAGCACCACAACAGCAACAGCAACATCAGCAGCAGCAAAAACACATTCAGCAACAACAGCAACAACAACATCATCATCATCAACAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAAAAGCAACAGCAACT------CTATCAACA--AACAGCACACAGAAACAGCAACACATACGAAATGTTGTACTCCCACAACCAACACCCGCAATCGCAATCGCACTCGCACACGCTGCCCCTGGCGCTGCATACAACGCAACCAGCAGCAGCAGCAGCGGCAGCAGCAGCAGCAACACGCCAGCAACAGGAGCAACAGCGCCAGCAAAAGAAGCGGCAACATGCCGAACATCAGCAACATGCCAGCAGCAGCAGCAGCGCCAATAAAACCAGCAGCAGCAGCAACAGCAGCAACAGCAGATCCGCTGCACAGCACATGGCAGAGGCGGAGCACGCCTATTTGTCCAATATGTATAGCAAGGCGGCTGTCAATATGCTCAGCCCGCCGCTGG---CTGCCGCGCACGAGCCGCGTC-GCAGCAGCAGCAA----------CAGCAGCAACACCTTCGACTGGAGCCTGGCACAGCAGGAGGCGGCCTCGCAGCAGCAGCAGCAGCGCGTCGTGCGACGCGCTGCGCCTGTGGCGGCTGCTGTTGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGATGCGGCAGCTGTGCGTCAGCAGCGGCAGGCGATAATGCATCGCAGGCACAGCATTTGTGCGGCCGGCATTGCCAGCCTGTCGCCGGCCTCGTCCACCAACTCCTCGTCGGCGGCATCGCCAACGACATCGGCAGCGGCGGGCGCTGCGCTGGCAGCGGCCTCCTATTATGGC------------------------GCCTTTACGGCGCCCTATCATCAT---------------------ATGAGCGCTGCGGCGGCA---------------------------------GCGGCAGCGGCTGCCCATCATCAGCATGGCCAGCCCTCGCCGACGATATATCCGCCGACGCCGCCGCCGTCGGCGCCCTGGGTGCATCCCTGGTATGCGGGCGAT---CCCTTTTAAGCGAAATCAAAAGCAAAAACAAAACAAAAAGTGAAAGAAAAAGAAGAGGAAGAGGAAGAAGAGGACGAAGTAGAAGAAGATGATAAACAAAACTAAAACTAAAATGCGCTTCTCCCATGTACATTTGTAGTCTATGCCTAAGTTAATTTATATATACATATTTGTTTATCTGATAATATCACAACACACAATTAATTTTTTTTTTTTTTGATAAATTTAAATTTTTTTTTTTTTTTTTTGATCGTGTTCTTGT----------TTAGCTTGTAAGTAGGTTAACTA----ATTATCGGGGCATCACATGCCGCAAAGTAATTGGTTATCGATAGTTACACGTAGCGAACGTATATCGATAACACAGACACAGCGCCAACTGGACTAAAAGAAACTATCGTACATTTTGCTAAAACTACAACCGTTTTCTTGTTTGAACGCAAATTTTTTGTTGTTTTTTAAAACTGAGAACTCAAAGAACTGATTACATTAAAAAAAAAA--AAAGAAAAAAAAAGCCAACAGCAACTGATACAAAAAAGAAAGAAACAAACGAAAGAAACAAAACTGAATAATAACTTAAATATTTTTCAAGGTCAGGCACACACACACACACACACACACATTTATTTATTTATTTTTAATTTGTTT----TTTTTTTTC------------TGTTTGTTCGAATTAACAAGAAGAACAATAAGATTTACAGCTCGTTCGCTGGCGTAAAAACCCGACTGCATAGTTAATAAATTAATTTCATTTTTCATGCGCATTCAACTCGGCATGCATATAAATAAGTTATATAAAGTCATTAAATTGTAATTCTAAGCAAGAAATA-CAATTTCTTGCAAAACT----------ACTCAAACAAACAA------
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>CG4586 6817396 6817505|8557 chrX 6815227 6817405 scaffold_37 295941 298138 + 76272|2240 2249
TGTGGGGCTG
GGCGCCACAG
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CTTTTGTTTTCTACATACGTATATGTTATTCACTAATTTTTGTATTGAAGTTGAATCATAACATTTTTTTTTAATAAAGGAAATAGGATTTCG-CAATT
CGTGCACTTTTTTAAGGGGTAT------TTCGTTAACTGTTGTAGGCCTGTTATGTCGCCGTATTTGTATATATCATTAAAGCT---TTTTCGTTAATT
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CAGCATCGGGCGGATAGATATAAGTGACGAAAGAGCTGCATCGCTACATTAATTTTTT
CAGC--CAGCCAGCCAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGCCCTCACAAACATAGCTTTGT
>inx2 6848008 6848750|8592 chrX 6848155 6848810 scaffold_358 1001 1722 + 4609|0 677
TAATGAACACATATCAACGAATTCCATGGTAAAGGACAAGATCGCAAGCAATAGCCGATTTTACTGTTTACTGTTTTGCATCAACAACAAGACACGTACAA-------------TTGCAAT-----TAAAAATACAATTACAATAATGTAACCAACAACAATAATATAACAAATAACAGATACTAGCCGCAGCCAGAAACGTTAGCTAAAAGAGTGGATTGGTTTTTTTTG---------------------------GATTGGATTGGTTCAACGGTTTCAAGACAATCAAATTTTCCATTTGCCAAAATTAAGAAT--TTCCCGACTGGACCGAAAATCCC---ATTGCCAATCCATTTTAAAACATTCCTGGTAATCTTGAAAGACAGAAGAAAAGACATTT---ACAAACTATATATTTTTTGTGCAGCAGCAAACAAATTGAGATATGAT-------AGATCTATATACATCCATATATATTTTTAATAAGCAATTACATATATATTTATACATAAATATACAGACGGACCGAAAAGAAATCTATATATTTATGA-----ATGCCAC-ATGCGAGTAACATTTATGCTAAGAGTTGTGATCATTGATTAAGACATCTAAAAA----------------AAAAATGCGAAAATACAAAAAAAAAAAAGAAGACA
TATTTAAGACATATCAACGAATT------------GCAATGCCGCAA-----AGGCGCTTGTGTTTCACA-TGTTTTG-ACCGATTGCAAAACACTTGAAAACCCGAAGAAGTAGTGCAAAATATATAAATATATATTAAAAATGATAAAAGCAAACACGACACGCCCACATACGATGACCGCCCACACCCCCCTCAAGCCACAGAACAGGCAGCTGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAAGCCAAGGACAATCTTGAATGGGCTGCTATAAGAATT--AAAACGGTAAAACTATAGAAACTCTAGAGATAATAACGATAAAAGACAACGCAGAAAAGACACAAGTTGACAAATGTTTCGAAGACAACAACAACAAAGTTCAAGCATTTTTTTAACAACAATTTAAATACATTTTTTTTTTTTCGTATTCTAAAAACTATTTTGGTAAATATTTTTGAAAAGAAACACACACACACACATATATATACATTATACTACTAGATATATAGATATTAATAT-TATATATAT---CTTTATATATATATATATATTTATGATGCGAATGCCACGATGCGATGAATATTTATGCTAAGAGTTGTGATCATTGATTAAGCAGTTTATAAAATTTATAAACAATTTGAATAATAAACAAAAACAAAAAGCAAGCAGCAAACA
>CG32736 6857140 6857372|8602 chrX 6856814 6857407 scaffold_36 1244173 1244788 - 19930|356 610
GCAAAATGCCCGCCGGAGTTTCCTGGGGCCAGTACCTGAAATTCCTCGGCTGTGCCCTGGCATCCATGATGGCCGGATCGCAGGCTGTTCACCTTTACTATAAGCCTCTGGAGGACTTGCGCGTCTACATCGAACAGGAGCAACACAGCACACAGGTGGATCCCACCGC-----------AAAGCCACCGG---AATCTGCATAACAC-TGTGTAC-TAGACAAGTTATTG-----GTGACTAA-AGCTATTTAA
GC---ATGCCCGCGGGCGTTTCATGGGGCCAGTACATGAAGTTTCTGGGCAGCGCCATGCTGGCCATGATGGCCGGCTCCCAGGCGGTGCATCTGTACTACAAGCCGCTCGAGGATTTGCCCGTCTACATAGAACGCGAGCGACAT------CAGCTGGAG-CCACCGTCAGGTGACACAAAAGCGAACAGTTAGATTTAAGTGTCATATATATATATATATATATATTTGGAAATGCAACTAACAACTATGTAA
>CG4593 6859843 6860248|8605 chrX 6859507 6859890 scaffold_11079 3 394 + 23640|338 392
TCCCCGGGTGGGCAGGACCAAGTCCT-------GGTGCACCCTCGCATTTACCCA
TAGCGATAGCGATTCGCCCATATCCTAACCGCGGGCGCTTCCT-GCATTTCTCCA
>CG14427 6886685 6887005|8620 chrX 6886323 6886817 scaffold_36 12930 13453 + 16220|368 542
G-----GCGTGAAG----------ACCCAACCAATC-------------------GCACC-------ATCTCCGCCTGGTTCGGAGTGGTTCGGCGATTGGTGTAGCCCATCG-ATGTAATACCCGGCGAGGACTGGCAACAGGTGTGCCAGCTGTCAAACAGTTGGGCAATTAA
GTGGGAGCAGGCAGTGGTAGCTGAGCTGAGCTAATCAGAGGCTGATGCGTGCTCGGCAACTGGACTGGGCTCCGCTTGGTACGGAGTTGTC--GCAGTTGCCCT--CACATCACGTGCGTCGACTGCTGGCTACTGGCAACAGGTTGTCAGTCAGTCGATCCATCTGGCAGTCAA
>nullo 6895464 6895620|8626 chrX 6895001 6895735 scaffold_36 27361 28141 + 14771|508 669
GATAAGATAAAAAGATTAACATAGAGCCATTTGTATAGCCAATATTGTGATAGCTCGTAAGCCCAAAAAAAAGT-----TCTGAATAAAATTCATATTGAAAATCAAACTGAAAAAAGTAGCCCACTTTATTATTTATTCGTTTATTCATATTTATTAGTTA
GTAACGAAATGGAATCCGTAATGTGATAGCTTTTAAAATTCGTATT-------TAAGTAAATCAAAAAAAATGTTTTAGTTTGAATACAATTCGAACTGAAATGTATGTAGGACAGTACAATCAAAGCACTCAATCAATCAATCACTTGAAAGAGGCAGTCT
>CG4607 6917441 6917925|8648 chrX 6917621 6917820 scaffold_67 39595 39815 + 3859|0 229
AGAAATCGGGTCGGGTTTTTCAATCTGTGATGTGTTAAGTACTTAGCCTTGGCAGCCATGGAATGCGGCAATTT-----------GATAATCAATAAAAACCATTTACCAAGTAAACA----------AAAGTCAATTGAAGTGCATGTCGCGTTGAAAATGGTGCAG---------TGCATATTGGTGAGGTGACAAAGAAGCTTCTGACATCTTTATATACATATATC
AGAAACCACGCGTGAGAATGCAATCTGTGATGTGTTAAGTACTTAGCCTTAGCCA-AATGGAATGCGGCATTTTCTATGGCAACAGCAAAACAACAAAAACAAGTTAACAAATAAATATATATATACTATAACTAACTAAA---TATGTCTGCTTGTACTTGTTACAAAATCACAACTTCAAATTGATTGGG-----AAAGTGCCTTCAAAATAAATATATTTATTTATC
>CG8300 6951351 6951581|8696 chrX 6950973 6952281 scaffold_26 626585 627730 + 12326|401 631
GCGCCCACTGGGCCACCCACTTGCCAGGTGGGTTGTGCAAGGTGGCGATTTTCTTGGCAGGAAGGCGAAACAAAATGCTCATGGAGTACTGGCGACACTTGGAGACTCTTTTACTTGGTAAAAACCATGCGAAACGAAATGAATCAAAACAGATATTAACTTTTCGACACTTTATTCGCTAGCAAATAAGTTATACATATACATATATGATAATAAAAAAAATACACATAT
TAATTAATTGGGCAATGAACTCAAC----------TGTAAGAATACAAT----------AGAAAATGCCAT-AAATGCTCATCAGGT-------AAAATTGTAAAC------ATTTTATAGACTACGTACATAAAAATATGTATTAAAAATCAAATCA--TTTTCGACACTTTATTCGCTA-TAAATAAGTTACAAA-ATACAAATTACATATCTATAAACA-----ATTT
>CG9650 7085139 7085656|8895 chrX 7081831 7085874 scaffold_28 1095956 1100786 + 135947|3871 4788
CTTTTCAGTGGTTT---------------TCCCGTGCCGCTGGCGCCACCA---------CCGCCAC------------TGCAACAGCATCAGCCGCATCTGCAGCAGCCGCAGCAGCAACAGAC---------------------------------CAGTCGCAGTCGCATCATGTCGCGCATCTTCTAAAGGTGTTAAAACGATTTAGAAAGCAAAAAATATACCAAGCCCCC--------TGTAAATAT--------------------------------------------------------------------------GACTTTTTTGAAAA------------------------------------------------AAGCCCCCATCC--------AGCTCCTTCCAGGCGACGAAAAAAAAACGACCAGAGGCATTTAATACCAAAGCAATAACCGTTATGTAATATAATTTTAAAGA-------TTCGAACCTTTTTT-----------------------------------------------------------TTGTAACGAAAACAAAACCACAC-------CACATTTTTTTCCAACATTTTT-----------------------------------------TTTTCGTGCTTGTA-------------ATTTATATATATAGTATATAAATATACGTAAATGTAATAATATAATCAATTAGTGA--------------GTACTTGTG-TGGACACACATTTTCCAGTGTATTTTC----------------TAGGACTAAGTAAGAAA---------------------------ATGAGAAAGGATTTGTATAAAATGAAAAA--------GAAACCTACTAAACCTAAACGT
CTTTTTAGCAGCTGGAGCAGCAGCGCCCACCCGCCGCCGCCGGCATCAACACATGGTTTGCCGCCCCCCGTTCCACATGTGCTGCAGCCGCATCCACATGCGCTGCTGCCGCCGCCTGGACATCCGCATCATCATTCGCATTCACAGTTGGCCGCCAGCAGCCGCAGCCGCCTCATGTCGCGCATCTTCTAAAGATGCCAAACCCCCT--------------CGCCCCTCGCCCCTCGTCCCTGTGTATATATCAGTTATCGCACGGTTATGATACAGCCACCCGACACCCGACCCCCGACCCCCGCCCGTCAACTACCCTCACAGCAACTTTTTAAAAGATTGCGCCGCGAACTTCTGCAGCAGTTGTTGCCTCTCCCAGCCACGGCCACGCCCCCGCCCCTGACATCAGCTGCACCTTGAAGGCGACTTAAACACGACCAGAGGCATTTAATACCAAAGCAATAACCGTTATGTAATATAATTTTAAACAATTTTTTTTCCAATTTTTTTTTTTTTATTTTTTTAAATAAGATATATATATATATACATATATAACATATATCATACGTGTTGTATTTAAAATGATTTTTCACAATTACGCATATTTTTTTTTAATATTTTTAAAATAATTTATACGAAACACAAAAGAAAAAACATTGAGTATATATATGTATATACCAATATATATATATTTATATATATA-TATATATATATATATATAT-TAGAAATGTAAACAATTTATGGCAGGAGCCGCAGCCACAGCTGCGCCAGTGACACAATTTCCAGTGTATTTCTAGCGGATAAGAGTTAATAATACTTTGTAAAAAGGCAAAACTAACAACCACAAAAAATACTATAAAAGAAAACCTACAAAAAAAAAAAAAAATACTACAAAACCAACTAAAAGTAAATCT
>CG1958 7112973 7113117|8931 chrX 7112185 7113091 scaffold_28 1147594 1148451 + 858|828 949
CTTAGGTAGCCTGTACTTCAAACTTTCGTAGATACTTCTTCATATTTCT---CGTCAACTCGTCAACTCAATTTTCAAAGTGAGCGTGTATATATACCATTAAAACAATGGATTCGGTAAAA
CTGAGATATATTAATATATATATATATATATATATATATATATATATTTATACGTTTA-TATTCATTCTAATGTTCTTA-TGATCATAAGTATA-ATCATTTGCCCAGACGATTCTATTAAA
>brk 7155824 7156848|8995 chrX 7153758 7155940 scaffold_28 1204885 1207267 + 45987|2400 2516
GAACACACACACACACACACACACACACACACACAACAAACAACACACACAATAGAAACTAAGGAAGCAGCAATCCCACCAATCGGATGTTATAATGGCAGTCACTGGGCCTGGCCT
GCAAACGCA-----GCGGAAACAGTTGCTAATCGAAGCGACAACAATCACAACAACAACAACAACAA----AAACCCACCTAAGGAGCGGGCGGCTGGAGGGAAGGAGGCGTGGCCT
>brk 7155824 7156848|8996 chrX 7155958 7156239 scaffold_28 1207507 1207865 + 797|0 420
TATTTAAGCTTAATAACGTTTTTTTTAGCCCTACCACCTAAGTTTACCTTAATAAAAAATTGTATATCTAAGCGCAAACATATATCTTCCAAGCATATCAGCAAAAAAAACCCCAAACCCTAGGTATAAACCCTTCTTTTTTTTTTGGTTACACACTAAGAACAAATTAA----GCTTAAGTTCAG---------------------------------------------------------------------------ATTTTTCTTTTTT------------TTTTTCTTGTATTAGCTTG-----TGTAAATAA---------TTGTGTACAAAAAGTGAAACAAGGCGAA----------------------------------ACAATTGAATTTGCTTAAGAATTTCAACGCT
TATTGCAGCGTAGAATTATTTT-------CATATTAATTAA-TTAATTGTAATTAAAAATT------------------------------------------------------AAATTTAGTTATGCGCCATCTATTTTTTTTTTGCTAAATTCTAGCTACAAATTAATTGTAATTAATTTTAGTTGCCTTTTTTTTTTGTTTAATTATAATTAATTATCTATAGATTGTAATTAGTTTAATTATTTTAAGTGTCCCCCATTTTTTTTTTTTGCTATATTTTACTTTTTATTGCGTAAGTTTTGTTTTTGTAAATAACTAATTTTATTGTGTACAAAAAAAAAAAGAAAACGAAGAAGAAGCAAATTGGCATAAAAATAATCAAGCAGAAAATTGAATTAACTAAAGAATTTTAACGCT
>brk 7155824 7156848|8997 chrX 7156240 7156920 scaffold_28 1208420 1209145 + 9953|0 713
TCATTTCATTTGTATAACTTGTGGGAGAGTATTTTAAGAGAGAAAATGT-------GAAAAATGCAACTGGAAAAACTGAGAAAATTGTTAAGAGTAAAGCTTTAAAAACGAA---ACAAATACACACCTTTACA-ATACACACT---TTTTTTATTTGGAAATTGAAAATTGAAAATTCTTGTGATATGACAACAACAAAACAAAATTTTAATAAAATTGTTGAAAACTGAAGCTT-----------ATTGA------ATATACAGCTATAT---TATACATAAATATATATTTACAAACACAAAAGAGAGCAAGAAATTTAACGTAATATTAAGGGTTACATTTAAAAGTTAATTATAATGATATACAATATACATATATACAATATATTTATATACAAACAAGAGGAGAACGTTTTTTTTTTTTTTTC-----ATTGCCAAGGGAAATAT--------------------------------------------------------TAAATGCGCCTATACATAGAGAAAGAGATATATATATCTAAATGTATGTATATATATA-----AAATCAGTATTTTTATATATTACATTTGACAACAACAATAATAATAATAATAATTGTGTGACCATACAACAAACAAACAACAAAATCAAAAGGAAAACGAATTGATTAAATTAACAACAGAAAA-----CTAAAAAAACTTT
TAATTCTTTTTATATAC-----------ATATATTTAGCTCATAAATCTTATGCCTAAAACATTTAATCGTATAAACT-----AGTTATAGCAATTAA----TTACACACACACACACACACACACACACGTATATATACATAATGGTTTTTTTTTTTTTTTTTGGGAAATTGAAAATTCTTGTGATATG------AAATAACAAAATTTTAAT-AAATTGTTAAAAACTGCTGATCGCATATAAAGAATTAAATATATATATATAGCTATATAGATATGCATATATATATATATATATATACAAA-------TATATATTATATAGTATATTTACAAGAACAACAACAA--CAATTATATCTATACACAATATACATATATACAATATATTTATATACAA-------GAGATGTTTTTTTTTCTTCGTGCAAACGATTTGCAAGCAAAACTTTACAGATATATATACATATATATATATATATGTATGCACGAGCCCCCAAATATGTATACATATGCATATATGTGCAGATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAAAGCAGTATTTTTATATATTGAA----AGAAAAGAAATAATGAAAAAAAAAAAT---------TAAAAAAAATAAA-AACAAAA-CAAAAGAAAAAC--------TGAACAAGAAATAAAAAATGTATTCAATTAACATGA
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AA
GA
>l(1)G0331 7172800 7174051|9021 chrX 7173100 7173959 scaffold_35 964988 965778 + -583|0 893
AAAAACAAAATTGAAAACAGTAACGTGCCAGTAACTTTTTACATAA------TTTCATACATTTTGAGTATAAGTGAAAAAGAAGAGACTGCCGAGTGCCTTACAGTTCTACAAAAAGAAAGAAATTCCTGGCTGGAAATCGAGGGA-----AGGAAGTGCGTCGAATCTCTAA----ATCCCAGAATTTGTCCTTCCCTTTGCCAAGCCAAAAACAAATACCATTCGAATCGTTCAATTTTTTTTTTTTT--TGTAATTGTTTTTCGTTAATTATGTTAAATTCGTAATCTGTGATTGTATTGTTAATTGTGAAACTGTTACATTTTTAGCAAGCACTGCCCGCCACTTGATGATCGCACTCGAAAAATTCCCCCGGCTCTTACTTAAAATGTAGTGTTAAATTA--AAGCAAGAGAAAAATGAAACTCAATCGAATCATGGACGTAACGAAAATTTACAAAATGTGTATGCGATTTATGCTAAATATATGTGTTTTTGTATATTTAAAGGAACTAGATTTTAAATACACTGCAATTGTACTTGTTTCCGTTTATCCGTCCGTCTTCTCAAGGTTTTGATGCCATATAAATCGGTTATTCGAATTGTTATTCCTATACGTTTTTGTATGATAGATCATATAGCTGCCATAGGAACAAACGGT-----GTAATGCCATTATCTCAAAAATCA--------CCCAAAATAGTTGACTCTTATTTTTTTTTTTTTTGCTCAATCTTAGACTGTAAATATACAATAGGTTTCTTAAGTGTTGTTTTCGATTGCACCTCCTCTCA--ATAACCCAAATAAGAAACCCGCCCCATCGTTACCCCATGCACGTTCGAGTTCTCAAGCCAGGATTGTTGTAAACGACAGTTTTGAGTATTA
AATGGCTAAAGAGAAGATAATAAAAGGCTACTAACTTTTCACTTAAATGTTTTTTCATCCGTATTAAGCAAAATATTACCTAAAGAGATTTTCAACTGAGTTTTCTTTACATAATATTCATAAAACTCCTGTATTAAGATTTAAGAATCAATAGGCAATTTAATAAAGTTTTAATTTTATTTATATATTTACCCAAACGTTTCTCGATTTAATAAGCCCTTACATGCCAATC-CCAAATTTATTGATAGTTAATATAATAGTT--------AACATTTTATTTTC-TAATTTTTTATACCCTTGCA------GAGGTGATTATAATTTTGTCGTGAAATGTGTAACGCATAG----------AAGGAGACATCTCCGACCC---CATAAAATATATACATATATTCTTGATCAGTATCAACAGCCGAGTCGATACAACCATGTCCGT--------CTAACCATCTGTCTGTT---TCTATGCGAACTA-----GTCTCTCAGTCTTAAAA----CTATCTTTATGAAACTTTGCAGAAGTCCCTCTTTCTGTTG-------------CACGCAGCACATATGCCA---AGATCAGCT----GGATCG------------------GACCCATATATCATATAGCTGCCATAGGAACGATCGATCGAAAGTTAAGTTGTTGTATGAAAAAACATTTTATTTTTCAAGATACCTTAACCCCACTTGGCATTTATTAGTTT--TACTATACTCCTAATATATA-------TGCAAAATCTTG-TTAAGATCGCATGACTATACAATATAACTGACATAGGAAAAGTG------AGTTGTATGAAACACATTTTGTTTATCAAGATAACTTGACCAAAATCGGCATTTATTAGTTTTA
>CBP 7187044 7187971|9035 chrX 7185502 7187776 scaffold_5 2759836 2761923 - 57380|1586 2420
CGGGTTGCAGTCACTGCTGTAGATTACAATA-CAACCAAATCAACAATAACCCAACAAAAAAATCCTTACTACAATCAAGATTATCAGAACCATCAACACAACAACGTCCGATGCCATAACATCGGCAACAATAACACCAATGAGCCAATGCTACATTATACATTGAATACGACAACGATGTTGGCCAATAACAATTACAATAAGATAGTGGCCACTTCGTTGCCAACTCGCGTGCAGGCGGCAGGCGGCAGTTGGCTAAATCTACAGCATGTGGCGCCTCATAAATCGGGACCGTT------------AATAAACATTAGCAACACCACCAC------------------------------------GATCGTTATAAGGAACATGAGCATTTACGATTATTTTCGGCAACACTTGTCCAGTTCGAAGCGCCAGCGCTCGACCTTTGAGCCCCATCCATCGCCCACTACG--------TATCCCGCCTCCAAGTTGCGCAAGCACAACTTTAGTAATTATCAAAAGGAA---CGGGAACGGGAAAGGGAAGACCGACAG----------------AAAGATAATAATAATAATAAT-----CATCGAACCAAGG-GCAAACCATCA--------------------TTAGATGACTACGATATAAGATTTTTTGTCTACCTTAACTCGCTAATAATATTCACAATGTCGTGCAGTCGTCAATCGGCCGCCGAGGGCGATGACCTCAAGCATTTCATTTGCGACCGGATCCGGAAATTCGATCGCCTACGACGAAAGGCAAGAAAACGCCGCAAGAGAAGGCCCAAAAAGCTGG
CGCGTTGCAGTCACAGCTGTAGATCAAAATGTTCGCGATGTAAACAACAA---AACGAAGAAGCCAATGCTGCCAGCAA-----------------------------------------------CAACAACAACAACAAC--------------------------TACAACAACTA-------CAACAACAACTAACTTAAA--------------GATTCCAACTCGCACGCAGACGGCGTGCGGCAGTTGGCGGTATCTACAGCATGTGGCGCTGCATAAATCGAGACCATTCAACAGGCAAACGACAATCGCAAGCAACAACATCACCAGCAACGGCTGCAACAGCAGCAACAGCATCAACTTGATCACAATTAGAAATATGAGCATTTACGATTATTTACATCAACATTT---CAGTGCGGCCGGCAAACG--CAATCGCCGACGCTATTCGGACGGCGATGACGATCTGCCTCTGCCCTCGCCCAAGGTGCGCAAACACAACTTCACCAATTACCAGCGGCAACAGCAGCAGCAGCAACAGCAGCAGCAACAGCAGCAGCAGCAGCATCAACAACAGCAACAGCAGCAACAAGGAAATCGGAGCGAGGAGCAGAGCAGCAAGCATGGGCCAAATTCTACTATGCATAATTATGATCTAAGATTTTTTTTTTATATTAATTCGCTTATATTATTCACAATGTCGTGC---CGTCAAT------ATGAGGGCGATGATTTCAAGCATTTTATTGTTTATCACATACGCGAATTTGATCGCATACGGCGCAAGGCGCGAAAGCGACGCAAGCGCAAAATGAAAACGCCAG
>CG1999 7205001 7205304|9062 chrX 7204812 7205003 scaffold_5 5763634 5763818 - 777|193 195
TAC
TGC
>CG9657 7266759 7266876|9166 chrX 7265301 7267112 scaffold_5 2874414 2876317 - 71447|1547 1673
----AGGGGATTTGCATGGCGGTTCAAGGGGAAGGAGTAGTAGAAGGCTGACCGGCATCATCCTGGCAAAGTTCCTTTCGGTAGCTTAGCAAATATTTA-----AAATAAAACACAATTCATAATTA
GCGGAGGGGGTTCGGACAGTGGGTC-----------GTAGTAT-CTGCTGCCGGCCA----------AAATGTTCCTTTGGTAGCTTAGTAAATATTTAAAATTAAATAAAATACAATTCATAATTA
>CG11368 7297745 7297899|9214 chrX 7297314 7297879 scaffold_5 3713473 3714044 + 8092|472 610
ATTTGTCCACCTCTGCGATTCCCGACTCCAATTTCCCTCATAAGGCTTACTGAAATGT----CACCTAGAAAATCCTTTTGTTAAGTCCCTTTTTTTTTTGACAAACAAATTAAATGAAAAGTATATGTATGTGTGTAT
----GCGGACCCCAGCGA--ACCGATTCCCGTTTGTCCAAACTGGCGCTCCCACATATTCTGCATGCAACAATGGCTCGGGACTCGTCCTGTTTGCTTATTATAAGTACATATATCTATATGTTTTTTTTTGTCTCTAT
>ct 7492231 7493401|9506 chrX 7492434 7493134 scaffold_5 3185936 3186591 - 10071|0 809
TTTTAACCCCTCGTCAGTCCAAAGTACTAGGGATTAAACACAACCCTATTAACATAAAACTTCTCCGGTCTGCTCAGTGAGAAAAGACCAACTTTAAGTGACTTTTTAATTTAATAAACTGTAGCGGACTAAGGTCGAATATCCTTAAAATTCACTCAAACCACCGACAGACAATTACCCGGCGCAATGAAATGTAAAACCGTTAA-GATTAGACAAACGTCGCCGCCCACACCGGAATTTCGGAATGTGCAAGTGTGTATTTGGGGGGAAAAGCGGTTGGGAAAGGATGCCGTGGGC---TGCCAAAAGGAGTGAAAGAAGCGTAAAAAAGTTAACCGGAGTACCAAGGAGAGGAATTTCAACCGCAGACGACGACGC-ACGACTGACCGACCGCCGTCCCCTCAAACCA------------------------GTACGCACAATTGAGAAAACACTTGCACAAATAAACAAAACCCCC----CATCACTTTTCCAACCACTCGGCC---------------------------ACTTTTCTTGTAATTTTCTAGCCAAACAGAAAAAATGTTGCCCGAGTACGACGAAACCGAAACCGGGAAAAATAGAAAACAAAAAAAAAAAAGTATACAAGGCAAACAAATGAGCGGC---------------------------------------------GGGACTTTTGACTTCTTCTTTACA---CGCCCAAGAACAAGAAGAAGCAGCAAAA-AGGGACAAACTGGGTAAAAAATAAGCAAAAAAAAACTAACATACAGCCAGGGATTT
TTTGAATACTCCGCC-----------CTAGAGTTT-------------------------------TGTTTGCTTATTTTTAGAAATTC--CTCCA--------CTTAATTTAATAAACTGTCT---ATGAAAACC--ACACCACGTACCGCCCCTCAGACCCCC---AGACAATTACCCAGCGCAATGAAATGTAAAACCGTTAAAGATTAGACAAATGTTGCCACCC------------CAAAGCATAAAAT---------------AAAGGAGTTTAAGTTGCAAAACCCTGAACCCCTTCCCAAAAAAGGAAAA--------AAAATTTCAACCGGCAGACGATGG--------------CGACGACGTCGACGCCACGACTGACCAGGC-CCTTCCCCACACGCCCCCCTTGCGCATGTCCTGACTGTCCGCACGCACAATTGAGAAAACACTTGCATAAGTAAACAAAACACCCACAGCGCCACGCCCCCAGCCGCCTAGCCGGCCAGCCTCGCAGCCAGTTTTAGCGCACTTTTCTTGTAATTTTCTAGCCAAACA--------------CAAGTGCAAAAAAA------------ATAACAGAGAAAAAAAACAGAAGGAAATACAAGGCAAACAAATGAGCGTCCCGGCACACAAAACAACAACAACGAAAAAAGGCAGAAAAAATAAAAGGACTTTTGACTTCTTCTTTACAGAGCGCT-----ACAAGAAAGGGCATCGCAGCAGCTACAAA------AAAAAATATGATAAAAAAAATATGCA-------AGGGATTT
>ct 7492231 7493401|9507 chrX 7493183 7493331 scaffold_5 3186663 3186848 - 5461|0 187
GAAAAAGTTAGAAGGAAACTTTTGCGGCAGGCAAACAA---GGACGGGGT----CCCAAGGACAAGGACCAA-------AAACAGGG-------------------------GGTGTAAAGTGATATCATTAAAATATTGACAAGACAATTTTTACGCCTACAAATTTGTTGAATGCCTTTGTTTACA
GAAAAAGTTAAAATGAAACTTT-GCGGAAGACACTTTGATTGGGTGGAGTTGAACTGCAGACTATAGACTAACTGGCTGAGGCGAGGCATCGGGCGGGCGAGCGGTTGGTTTGGTGTAAAGTGATATCATTAAAATATTGACATGACAATTTTAACGCCTAC-AATTTGTTGTCTGCCTTTGTTTACA
>ct 7492231 7493401|9508 chrX 7493332 7493492 scaffold_24 1310484 1310650 + 1486|0 75
CAGTACCAAATGGAAACGGAAGA------AAGATGTCGCGTCAAGAAATGGGATGAGATAGATACAAAAAAAAAAA
CAGTTTTTAATTTATTTATTAAATACCATGATACGTCATGTCATATAATTTTGTAATAAATGTACAAAAAAAAAAA
>ct 7519854 7521259|9548 chrX 7515855 7519957 scaffold_5 3216049 3220297 - 174320|4373 4491
AGTAAAAAAATTAACAGAACTAAATATAAATTCAGTGCAATGTGTAGAGAAGCGGAGATGGTTAACGCGTTTACTTGTGATTAAGTTTG---------------AATGTTTAGACGATG
AGCCAGCGAACTGGCAGAGGAACCAGCAGCTCCGGAG--------AGTGCAATGCAGACG------ACGTTTACTTGTGATTAAGTTTGGCAGCGGCCCCACAAAATGTTTAGCCACTG
>ct 7519854 7521259|9549 chrX 7519973 7520143 scaffold_5 3220330 3220515 - 2503|0 185
CATACATACATATATATATTAATAGCACTTAGGCTCTAGAAAACTATATTTTTTTGTTT-----TTTTTTTATTAAACATTAACTAC-TAAATATAGGCGTTAGTTGTAGCC-GTTAAGGTAGCCTTAGGTTGAGGAGTTGT------AATAGTTGTAGCT--AAAAGTTTAGAGACGCTATGCGA
CATGCATATATATATATATTTATATACATATATATAGAGACAAATATAACGTTATATATAACGATATATACATAGCACATAACATACATATATATACACATCATATATAACTAGTTGATAAAACTCTACATTTTTTTTTTTTTTTTTACGTAGTTGTAGCTAAAAAAGTTTAGAGACGCTATGCGA
>ct 7519854 7521259|9550 chrX 7520295 7522162 scaffold_1643 31 2276 + 29746|0 1249
TTTTTCGATTTGTTTCTACTTGAAGACTGTAAGCAAA-GGCGGTAGGATTGATAACTACAAACGTAATTCTATTCT-ACATACATTTTTTTTTTAAGAAACTATTATATGATTATTAGCAGTTTAGCTG------GTTAAGTGTAAATAAATAATTAAATGAATGATGAT---------GACGATTGA-----TAGTGTACATAG------------ATTTCTCGCGAGGCATGATCTTGCTATCGTTCTTCCTAAAAAAAAA-----------------------------------------------TCCTACCTTCTACCACCCTCAGCAACCGACTTGTTTAACTATCTTTTGATCTCAAGCAAAA-------------AAACAAAAAAAAACTAATACGAAACG--AAACAAAACAATGCAGAAATTGAAAGGGAAATGTGGAAGGC--ATGGAGTGAA-------------AATCCAAAGTAAAAGATAGTTAAAAGC-----------AAAGCTGAA------------TTGCAGCGAGCAGAAAAGTTTTCCCCTATTTTGTTGCCCAAATAAAATAAAAATATGTCGATGAGAAAAGGAAAGGCAAATTGAGAAAAAAAATATATAA--------------CAATAATCTTTGTAAATTCTGAATTTACATAAAAAATCACACACATAAAATACACCTACACAACAAAAACAC----ACACACAAATTGAGTAATTCATAATTATAGCAAAAATAAACATGCAAAATGCACTAAATTATTT---------ATAATCTAATTAT---------------------------------------TCTATACATAATTATATATAATTATACATATGCATATAAAGCGAAAAATGAAAA-----------------------------GTTTATCAACTTAGCCTAACGGTAATTTAAATTTGCATTAAACCGTAGCATAAATAACAAAAATTTTTTTCTGTGAATCTAAAATATTTAAAGGTA----------------------------AAAATAGAAAACACAA------------------ACCGCATATCGTACTAAAGAAATTACACAAAAGAAAAAATATAA------AAAAATAAGAAAACAGTA----ATCTAAGACAGCCAATTTTTTTTTTGCCTAGATCTTAAGTTTACAACGTAATCGTAATATTAAATAAATTACAAAATAAACAAAC
TTTTTTGATTTCTGCAGTCGGATAGCCTGTAAGCAAATGGCGGTAG-------------------AATTTTATTATGATATTTGTTAAACTTTGTAGGATATA----AGGAATATTACCAATTTTTTTTCGCATTGTTAAGGGTAAATAGATAAACAATAAATTTACAATATAAACCTAGAAGCTTGGGGCCGTTTTGTAAATAGCAAAATGTAGATGTTGACGGCAAGACAAAAGTTTTTTTAATTTCCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACATAGCAAGAAAACTATATTATTATAATATTACTTCTTTTTTTTTTTTGTTGCACACAAAAGTTTTAACTATCTTTTGATCTCAAGCAGCACCAACTCACACATACACACACGCACACACATACACAACTGTAAAAACAAAAATACATAACTTTAAACAAAACACCTGAAAACTGAAGAAACGAACAACAACAAGGCGAACCCAAAGTAAAAGATAGTTAAAAAATTAACCTTAAAAAATCTAAAAGCGCGTTTTTTTTGCATC------AATTTTGTTTTCTTGTTTTCCTTTTCATAAGAAACAAACCACCCTCCAAAAAAAAAAAACAAACAAAAAAAAAAAACAAATATTCAATGAATAACTAAACACAATAAATTTTGTAAATTTTAAATTTACGTAAAACA--------AAAAAATGATAATGCATATTAAAAATTATGTAAAACACAATGTAA--ACTTTATAAACAATATAGCAAAATAAATGCAAAATGCACTAAATTATTATTTATAATAATAATAAAAATATATTTAAAAAAAAATATATATATATGCATATATAAATATATATATACATCAATTTATATATTTATATATATATATATATAGATATATATATAAATATATAGATTATACAGTAAGCATTATGCCGTTTATTAACATAATCTAAAAGTAATTTAAATTTGCATTA----------CAAATAGCATAA---TTTTTTTGTGAA-CTAAAATATTGGAAAATACAAAAACAAAAAAGCAGAAAGAAAAAAGAAAAAAGAAAACAAAAGAAAATAAAAAGTAGACAACCGCATATCGTACTAAAGAAATTTCACAAATTAAAGCATAAAACTAATAATAAATTAAAATAAAATACTATATTTAAGTGAGCCAATTTTTTT---GCCTAAAAGATAAGTTAAAATCGTAAC---------------------------------
>Rab39 7581549 7581713|9643 chrX 7580655 7581826 scaffold_46 919480 920785 - 38209|931 1186
TTCACCCCGACCTCA------------------------TTGTCTATTATTTTCAATAC------------TGTTTATGTACATTGATTTGT--------------------------------ATCGTA--------TGACC---CACCAG--TACTCCTTTTCCCCCCTAAACACCAATTTGTTGAC--TCTTTAATCTTGTTTAATCGTCTAG-TTTAGCTAAAAAACCAAA-------ACAGTTACGTATAT
TTAAATTAAACCGAATGCGAGTGTTTAATTTGATTTGTTTTGTTTCCAATTTTCCAGACATATACATTATATGTGTATATACATATATTTTTTATTTAATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGTAATCGGAATTTTAATTGATCGTGCACCAAGTTGATCTTTGACCTCATATAAAGTGCATTGATTGGCGATTTGTAACATTTTTTTGTTGACTCGTTTTTAATAACGCACCAAAAATAACTAAAGTAATAGAAAT
>Tom40 7584277 7584825|9649 chrX 7584131 7584464 scaffold_46 923788 924155 - 7045|146 374
GCCGGATCTTTGGACGGCCATTATCTACTTCAGCCTCA--GACCCCAAGCACACACCCATCCATTGTAACTTTTTCACATCATCCGCTA--------ACAACAAGAAGAAGAACAACAACAAACAA----------AGAGATATATAAATCTGC---------------------TAACAAACTTTTTTTTATGATAATCTGTCTGTCGCTTGTGTGTATAAAAAATGC
GCCTCAACAC--AACAACAACACAACACAACAACCACAACAACAACAACAACAACAACAAGAATAGCAAC-----AACAGCACCAGCAACAAAATCTACAATAACAACAACAGCAACAAGAAACAGTAACAGAATCAGAGAAATTCAGATATGCAGATCGTAGACATGGAATTATCAACAAAATCATTATTGTAGTCGTTTATCACACACACACACATACACCTCATAC
>Tom40 7584277 7584825|9650 chrX 7584535 7584855 scaffold_46 924225 924622 - -175|0 372
TATGTACCAGTGTGCCA-CTGTTTGTCGTCCG---------TTGTTAATCGATCAATTTAACCC---ACTGACAGAGTCATAAA---------TGCGGAGTTC-----AAAATACAAGAATGAAAACTATTCCACAATTAGTATACATTTCTTCACTGAATACACACACACACACACACATC----------------------CAAAAGAAACATA----CAACAAGAAACTATCAC--TGTACATTTTATGTTG---------CTTCCTAAACGTACGCATTT----ATTTAGA----ACAACCAGCTAT--------TTCCTCCAGACAAACAAAAATGAAT--TAAATAATTAAAAAAAAAAAAGAAAA
TATATGCATTTGTTCAATTTGTTTTTATTCCGAAAAGGTTTTTGATAATTTGACACTCAAAACTGAAATTGCAATCGTCAAAAAAAAAATTTGTGCTAAATTCCAAAAAGAAAACAACAAAACAACAAATGCCACAACAATTCAACAACCAACAACCAACAACAACAACGACAATGAACAACAACAACAACTGGCAGCAGGCAATAATAGAAACAAAAAATCAGCAAGTAAATATTCCTTTGTACACAAAAAGCGGGGAGCATAAGCTGCAAAACAAGCACGTTGTTAAATGTAAAATACACAATCAGCTGTATTTGGTATTAGTTTACACAATAATAATATAATAATAAATAATAAAAAAAAAAAAACAAAA
>p115 7741874 7742023|9878 chrX 7739288 7742249 scaffold_25 774344 777331 - 134779|2635 2798
AAATCGT-AACGCGGAT---------GAGTTGCTAGCCACGTACATGTTACAAC-TGGAAATTGCTCGACTGCCCTAAAAACGTTAA--AATATCTTATATACACACATTCTACTTGTTT-TACATTTATTTAACTTACGTATAGAATATATGTCTAGATCAGA
ACATGGCGGATATGGATTGTATTAAGGCGCAGCCAGCCAACTGCTCGAGAGGCTGTGCGAAAAGCTCGACT-------CAACGCCAACTGCCCCCTGCTCCTTATACATTCTGATTGTTTATTCAACAATTTA-------TATAG---ATATACCTA---CTGC
>bys 7748785 7748882|9885 chrX 7747167 7748858 scaffold_25 779796 781494 - 78756|1646 1726
GGCGGTGTAAATTAAGGAT--AACTTTAAGATGATATTGTTTTACTATTTAATATCGGATAGTCGTTAAA-----TATGTA
A-------CAATTACTGTTTGTAATTTTAGTTTAGAGTTTTGAATTATTTAACTTTTGAAAAAAATCAAAAACATTATGTT
>bys 7748785 7748882|9886 chrX 7748859 7749561 scaffold_46 185863 186558 + 12817|0 23
AATATACCTACATATGCAGTGAAA
AATTTAACGACTATTTGAATACAA
>CG1444 7756824 7757121|9897 chrX 7756069 7756900 scaffold_46 194879 195748 + 38287|792 869
AT-TATTGAGGATGAATACGGCGGAGGAGGCATTTAATGGGAATCGGTTGGGATGATGAGTGGGTCAGTTGGGTTGTG
CTATCTTAATATCAAATCCAAAAGTGTGCAAACTTGTTGATGCCATTTAGAGTCTGTGAACGGTTTGATTGGGTTGGG
>CG1444 7756824 7757121|9898 chrX 7757003 7757513 scaffold_2 917855 918276 - 293|0 118
TAAACTAAGTTTAGTTAGTTTTTGTCATTAATTAGCATTGAAGATTCGCAAACAGCCATGTCATGTAAACAATAAAAAATGTGTTACTAGATATATGTATATATCTAGTTTCCAATGAT
TAAACTAATTTTAGGGTATTTTTTTTATTACTTGTTATAAAAGTT----AGATAAACATTTTTTTTTAACAAT----TATTTTCTACTTTTTTTTTGCAT------------TAATGTT
>CG1514 7762560 7762681|9903 chrX 7762167 7762679 scaffold_46 201586 202096 + 9137|410 536
AGTGAACTTAAGAAGAACCACTTCGTTTTAGATTTTACTTTAACCTAAACCCTTTTTTTTATTTATGTTATGTT-TTGTTTGATTT-----TATGTTCAATGTTTAAT-GCTCTCCCTCTTTCTAAC
CGCCAAGTAGAGACGAGCCA-TCTGTTTTTAATTGTA--TTAAC--AAATTGTTTTTTTTTTTTATTTTTTCTTATCGTATAAGTTGCAAATGTTTATAATGCTCTCTAGCGCTCTCTCGCTCTAAC
>l(1)G0155 7766601 7767209|9909 chrX 7765586 7766850 scaffold_5 4675457 4676715 + 41218|1096 1349
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ACTA------------------------ACCAAAGGGCGCAGATATCGAAAAAAAAACACCACATAAAACAC--------ACAAACACAAAAAAAAAAAAGGAAAGA-------------AACACCAACAAACTGGACACGAAACAAGCAGCGA-----CGGCGCGGCATTGGCTTAGAATTTGTATGCTTTTTATAACATAATTAGTTAATTTTATATTTAATATATACATATATGAAACTAAACTATACTAA
>RpS14a 7779785 7779916|9939 chrX 7778921 7779930 scaffold_24 1275206 1276210 - 33305|923 1054
ATGGCAGTATCTGGAAAGCAGTAGTCTATGTTTGCGGTCGAAATACAATACTGCATTTGTGTATGCGATAAGAAAGCTTTTCTGTTCGTGTGCATAGGTGCACTGTAATAAACCAGGAAAATACGATGTAAA
-------------------AGCTCTCCA-GTGTACGGC--ACATTTCGTGCTGTTTTGGTTTGT----TATGGATGCCACACTCGCTGTGTGCGTTGATG---TATAAACGAAAAGAAAAATACAAAAGCGC
>RpS14b 7780954 7781035|9941 chrX 7780253 7780959 scaffold_10 1777238 1778032 - 31449|798 803
AAATGG
ATTTGG
>RpS14b 7780954 7781035|9942 chrX 7780960 7780998 scaffold_24 1276100 1276138 - 441|0 38
ATCGTGCCACCCGCTTTTGACGCTGCTTTATATTCTTAT
CCAGTGTACGGCACATTTCGTGCTGTTTTGGTTTGTTAT
>CG1530 7786837 7787169|9949 chrX 7786707 7788524 scaffold_24 1283548 1285449 - 70883|146 498
ACTATGCGACAGTTAAACGCAAGTGTGTATTGATAGGTAG--------TGTACAACTAAA---AAAAAGCTATGACAT---------ATGTGCGGGATGGAAACAGCACCGCTTCTCTCCGCTTTAGAATCTATTCTTTGGCACCTGAACGTGGGGCATGAAGTCGTAGGTGATGATCTTGGGGCCCAGGAAGCCGCCGTAGCCGTTGCGGCCCTTGTAGTAAATGCCAATGCCGGCTAGTGGTACTGGTGGATTCGAGACCACGTCCTGGATGTCCATAAACGGCACTGTGCTCTGGGCGGCATCCTTGTCCAGTCCAGTGTTAGTGAAGTCGATGTACTGATTGTGGCGCG
AAAATGTGCTGGTTTTTTGTATTTA-ATATCGATAAGAAGAAATTAGATGTACGCCTACATATAGAAAGCTATTATATTATCTTGAGATGTCCATGCCGAAAACCAGGCCAGGCCACC------TAGTTAATGCTCTTTGGCAGCTGGACGTGTGGCGTAAAATCATAGGTAATGATTTTGGGCGCTAAAAAGCCTCCATAGCCGGGACGACCCTTATAATAGATGCCAATGCCGGCTAGCGGCACTGGCGGTTGAGAAACCACATCCTGTATATCCAGAAACGGTACAGTGCTCTGCGCTGCATCCTTGTCCATGCCCGAATTGACGAAGTCAATGTACTGATTGTGCTTGG
>sn 7830764 7831337|10003 chrX 7830609 7831597 scaffold_24 1332881 1334132 - 17605|165 994
GGCGTGACCACGACCATCCCGAATGGGTTGCTGCACGCGT----------------------------------CATCAGTATC----ACAATCACACACATACTTCCCAACCAAGCGGGGATTCCCTAATTATTGA-----TCCACGCAGCTGAAGC---------------------------------------------------GCCAAGAAGAGTCGCACAAGAATTTGA--TATATCCTAAACAATTGCAAAATGAACGAAATTAAAATGATAGGAAGGAAACGTTGATAGACCCAAGGAGATACGAGTGAATG-------AAAAATGAAGA-----------AACAAACTTATATATTTATATATAAAGATCTACGTATACATAGAGA------GAGATTTTTTT--TAAACAACCTATTTAGCTTTTTATACGTTTTATACGATGAGAATATCTACAAACGAGAACAAGA--AATCTTTTAGCGTAGACAACAAAACAAAACTTCTGTCGCGAGTCCTTCCGTTTT-----------------ATCAAATATATCA--------------------------GCAACT--AGGCCAGCAAAAATGAAGAAAGACGTAATGGTTATACAAGCACAT------------------------------------CATATATACACCAATATATACA------------------TATTCGATTCGTAAAGCTTC---------------------------ACGGAAAAGAAACTAAAAAAA------AAGCGAAGGGAAATAAGAGCAAAAAAAAAAAAAAAA
GTTG------CAGCGCTTCCAA---GGATGCGGCACGTGTTTGGCAAATGCAACAATAATTACAACAACAACAACAACAATAACAACTACAACTACAACCACACGTATCAATTTTTAGAGTTTTAGCAACGTGTCGACTATGTCCAAAAAACAAAAACATAAACAAAATCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACAATTTCGAACGCAACAAAAAAAAGTCGCACAAAACTGTAAACTACATGCAAATTAATGGCGAACAACAAGGATGCATGTTTAT-GCAGATATATATATATATATATATGTATATATATATATATATATATATATATACAAAGATTATGTACATCAGCACATATATATATATATATATATGTATATATATATATATAGAGAGCGAGCGAGATTTTTTGAAAAAACAACCTATTTAGCTTTTTATACGTTTT-TACAAGAACAAAAAAAAAAAACAAAAACAAAAACAAAAATCTAGCGTAGGAAGTGAAACAA----TTTGTCGCGAATCCTTCCGTTTTCCAATATCAGCAACAAAAGAAAATATATTAAATAATAATACAATTATAAATGAATTGCAAATGAAGACATGCAAAAAAACGAAAAAAAAAAATAATTATATATATATATATATATATATATATATAAATAGATACACATCATATACATATATACACACATACGTACACGCATACGTACATATATTTATTCGATTTGTAATGCTTTTAAAAAGGGCCGCTTAACTTAAAAACAGCAAAAAAAAAACAACAAAAATTTAATAAACAAAACAAAAAACAACAAAAAAAAAACAACAAC
>Tbh 7871086 7871770|10062 chrX 7870767 7871206 scaffold_66 274670 275140 + 21379|319 473
GGGCGCCGTACATT--------AGGCATTAG----------GCGAATAGGCGAATG----------GGGGCGTGGCAT-AGCAC-ACACTCACACCCACACCCACACACACACACACACATACAGCACATACAACACACG----CGCACGGCATG
GCGAGTTATGCAAGGATACGAAATGCATTTGTTTTTTTGTTTCTTGTATTCGATTGCATTTTCGTCGGGGCGGGACAGAAACACGGCACACACACACACACACACACACACGCACACACATATTGAATATACGGCACGGGATTACAAATGGCATG
>Tbh 7871086 7871770|10063 chrX 7871536 7871857 scaffold_15 211099 211395 - 4904|0 243
ATGGTCATTAGCATTATCAACGCGTTTGTATGTG--TGCGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTAAGGGCA-ACAGGGCAAAACAAATGTTTTCACTCTTTAAATAACTAATGCATTTACCAATCCTGCCCATGTTGTTCACCCTTTTTACTTTCACTTTCACTTTGCTTTCGCCTTTGACTTTGTTTGTGCCCTTTGCCCTTGTTGTTTTGGCCAGCCTTT------GAAATTTGCCGACTGAC
ATGTGCATAAGCAGGACCTGTGCATCTGTCTGTGCGTGCGTGTATGTATGTGTGTGTGTGTGTCTGGGCATGCAGCTCAGGCCAA--------------TCAATATCT----TTTTTACAAATATTGGCAAAAGT----------TTTGCGTTTGCTTTTACTTTGGCTTTGGCTTTGGCTTCGGTCCTGCTGTTGGCTC----TGTTTCTGGCTGCAGCTCGAAAATAAATTTCCAAAAAAAT
>mys 7914172 7915473|10121 chrX 7912988 7914179 scaffold_26 670640 671805 - 55539|1187 1194
ATTCGCTA
ATTCGCAA
>mys 7914172 7915473|10122 chrX 7914210 7915062 scaffold_26 671854 672879 - 3159|0 1076
TGTCGTTCCACGACC-ACTGTCTGTGCTTGAACCGGAAATCAGAAGGAACCCCAAC-CAGTCAAACTTAAACACCAGCAACAAATCCGCACCACCAACCAACCAACCA-ACCAACCAATCAATCTTCAGTAC--------------------CGACTCCGACTCCGAACCACTGAATACATCGACGAAGCTGCTTTGCCCGGGTGCAAAACCACTGAAGTC-AACTGCCATTGAAACGCGTTCTAAACTAAGTC--------------------AGCCCTATATATACAT----------------------ATATATGCATATTTATATATACATTTACACAAGAAACCCC------------------------GCCATGGGGCAGCCTTTAT-------------------------ACATTGCGTATACTTAACGAGCAAACGATTTGTGCCTTGCGAC--------ATATTTTAGACTAAATCTATACGTATGTATATGTGTATACAAACAAGTAAGCAGACAACGCACAG-------------------------------CAACAACGCGGAGCG--AAGAATCGGAAAAAAAATTGGAAAAACAAAAAAATTAAACCAGCCAAGAAATGAACTACGAACGATAGTTAAGATTAATGATTTTTGTATTCTTTTTTTCGTACCAATAGTATCCAAGCCAGCGCCAGAATTTGTATT-TTATTTTACTCCTAATATGTAATTGCTGTTTT-------GTGTTTTTTATCGACCTAATTCTAATTATTTTCATTGAGCCC-------CATTTATTA--TTAACGA---GAAGAGC----CACTGCAATATAGCTGTATGTATTC-----------AAAAGTCAGAATTGGGATACTTAACTAA-TCTGCTACCCTCCCAAAACGGTCGTCC--------TTCGCAATGCCAAACCCCCC-----------------------AACGTCTTAATGTTTTTCTATTGTTTTTTTAAAGCTAACTTTACAATTAATATTTAAGCA-ATTAACATTTAAGCTTGTAATTGTTAATTT
TGCCATTTAACAACCGACTGCCCCTGCT----------ATCAACACGCCCCCAAACACACACACACACACACACC-----CCTACCCGCCTCACC-CCTTCCGAGCCACACAAATGAAGCAGCTTCAAATAAGAAAAAAAAAAAAAACGGTGCGCGTGCCACATTTAACAA--GAAACAAACAACAAAAACAAAATGCTTGGA---------ACTAAAGTCAAACTGCCATTGAAACGCGTTCGTAACTAAGTCAAAGTTTTATAAAAAAAAAAAACTCTATATACACATAGCAAACGAATTGTGCCTTGCAATACATATATATATTTATATATATATATACCATAAATTTTAGATTTTATATATGTACTTGTGTGAACGTGGAAAAGCTTCCATTGCTGAACAGCCAAAACAAGCAACAAAATTTGGAACGCACAAACAACAATTGATCCATACGCATCAACTAATCAAACGATCTACAAACAAATCTTAACAACTATTTACTTATATGAAATCAACTGA--AATCAACGAACGATCCGCTTTTAAAATATATGTAAAATGTATTTCATCTGTGCAGAGTTTCCAAAATCGCAAATA----TTCAAAAGCGAAACAATAACAATTGTTAAGAAAGTCAC-ATGAAATGCTTTTGGAATGCAAGACTTGCGTGTGCAGCACATTATACAAATTGTA--------------ATACTTAATATTATTATTTCATTTAAAATTTGTAACTTAAGTATTTGGCAAAGCCTTTTCGGATCGCCTAATT-TATTAATGTCCATGCAAGCTAGCAATGTATTTATTAGCTAAACGATCCAAAAAGCTAAACAAAACAACAAAACTGAATTTATGCCAATTTCAAAACAAAAACAAAACTAAAAAAACAAACTGATTTTGTTAACTTTTATGGACTTACGCCCAATTTTTGTTTGC--CGTCAATTCTTTCGTGTTTTTCTTATATGTATGTTTATTATTTTTTTTTTTATATATTATTATTTTAAATCTAACTTTACAATTAATATTTAAGCGTATTAACATTTAAGCTTGTAATTGTTAATTT
>mys 7914172 7915473|10123 chrX 7915105 7915487 scaffold_26 672912 673287 - 7255|0 398
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AAATTGTGGCACGTTTTTTTTT-----TTTTATTTATG--------AACCGTCGAGAGGTTCCAGTTTCTTTTTAGGAAACGTGCCTTTTTCAACT---TTCTGATCATTAATAGTATAATTAAACATAAAACAAGATGAAGAAAGAACAACATATTTTTGCAATTTGTACTGATTACTGATTAACA---ACAACAAAATAAAACGTAGTTGAGTGTATAAAAAAATAAAACAT---TAAATAAAAAAAAGTAAA------GAGTA---------AATAATTAATTGAAAAAAAAACAGTGTGGAAACACTGGCAATTTTATTGAAATATCAAATAATAAACATATAATAAAAACTGTTTGATGCTAATTTTAATGAAATAAAAAAGAAACGGAAAAAT
>CG1575 7964274 7964369|10175 chrX 7964253 7967271 scaffold_10 1125173 1128119 + 105672|21 139
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>CG10958 7979980 7980207|10191 chrX 7977744 7979986 scaffold_10 1138484 1140762 + 80206|2285 2291
GTGCGAT
CCACAAT
>CG2129 7992583 7993095|10201 chrX 7991185 7993734 scaffold_10 1153925 1156531 + 62363|1490 2089
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TATCGCTAATATCTCTTATCTATGCTGCAATTATGTGCTAAATCATATCTTCCACTATTGTTCTATTTTATGTGTAATTTGTAATTTGTAATTTGTTGTTGTTTTTATATTTAAGAACTCAGGCATAGGTTAGGCGGAAACATCATTTTCTATATGTATGTATGTACATATGTATGTATGTATGTATGCATCACATGCAGTATACATAAATAGTCTAAGCTATTAAATTCTTATCAGCTCGTTTTTCATAAATTCCGTTCTCAGTT-TTTGA---------TGAGCGAAATTCAAATTTACCAATCGA-TAAGACTTTGTATATCGGTTTTACAATCGATCGAGCTTCTGTTGCAGAGCATCGAAATATTTCAATTGTGCTAAGCGATGGGGGAGAGGGAGCGGTTAGATGTCTTGT---------------------TATTTAATTTTAGCT--GCTTTTGACAACA-ATTAATCGAGCCA------CAAATGCCAAATCGCGCGTT----------TAACCTAATG-----------CCAACGATTAAATTTAGCATACACTGCGTGAAAATGTCCGACGAGGCTTTGGT-----AAG
>CG10959 7995534 7995923|10203 chrX 7994043 7997665 scaffold_10 1156540 1160021 + 115457|1543 1940
CCGAACTGAGTGGAAACCT--CCTGTCGCCTTAAGCTCTATTTCCATATAA---CTCAAGATATTCAAGATACACCACAAACAATGTTCACTGTTCTAGATTTTATAGATAGCTTATCAATGTTTATGGACACCCGACTCTTTCGTTCCAA--CTTTTCACATATATATATATATC-TGTAAATAGTATTAGACATTTTCCAATCTAAGGCCGCAAATGTTCTTTTTTAATTTAAGTGATGAAGCCTTCCATTTCTGTGTCTCAAAAATTAGTACCTACATATCAGTAGAAGTCGTGTGTAAGCTGTTATATCTGTTAGTTTAGCTAGTTTTAAGCCAAGACCTTGCTTCCGACTAGGACAAACCACGTATGTACAATAAATGTTCTGATACACGTTA
GTATACGAAGCGG---CCTGGCTTAGAGCATAAAGCTTAGTTATCATATTAATTTTCATTAGATTTA-GTCGAACAATAAGCAAT------TGTGCGATAATTAAAACAAA----ATCAA-GTCTGGCAAAATCTGTCGATTACGTATCGAGACCCTGCAGGGTATTACAATTATTGTATAAAATGTGCAACACATTT--------------GAAAAAGGTGTCTTTGACCTTA-----TAAAGTATTATTTTTTT------------------------TATAAGTAACAATTG--------------------------------ATTTGAAGCTTAAAGGCCGTCGCCCACGTTAAGCATTCAATCATATTCTGTGAAA---CTGAAGTTGTTTA
>CG1583 8003614 8003622|10207 chrX 8000757 8004190 scaffold_10 1162806 1166346 + 77798|3090 3098
GAGACCTAG
ACGCCGTCG
>CG1583 8003801 8004275|10207 chrX 8000757 8004190 scaffold_10 1162806 1166346 + 77798|3283 3740
TTGGCCCACGACGACCGGCAGGAATTTGTGTATCCCAAAGTCGC--CTGCCCGCAAAAGGAGCTAACCAAACATACCGCCACATAGTGCTGCAATTGGGTTTGAAACTCAATGGGAGAGCA----------------TGGCAAAACACCATCATCAT---------------CCGTACTTAGATGAACAGATTGTGAGAGGAGGAGGAGGAGAGACAGCCAGAGACACCACGTCTATGTATTAGGC---------------TAAAT---------------TACCAACATATTTATATGACTGTCAAGTGCTATTATAATGCGTA--GTAGTCGATACGATGTACTAACACACCTAG---TTGTAGTCACTCAATCTAGTTTAGGCCAACGAATCGATAACAGGCTGCCAGAAAACCAAGTTTTTTTTAAACTAGCTGTAGACCCCATAGATACCCTA
TTACC---------------------------TGCCAAATGCACCTCTGTTCGCAAAATA-------------------CATCTAATTC-GCCATTAAGTTTGAAACCTATTGGTAAACTAATCTCACAGCACAGATGGGCGAAACAACTTAAGCATTGCTTAACTTTAATCTCGTACTT--ACGAACAGCTTATTACTAAACTATACTCTACCATACCAATACACAGT---TTTACGTATTAAGCCGTCAACTTCTTGGATACATACACATATACACACATACATATATATATATATATATTACGAGTGCTGTTATAGTGCGTAACGTAATAG----------CCAATACACATATAACTTTTACGTATTCG---TAGTTTAAGCATACGAAC-----ATAGGCTGCCTGTGAAACAAA---GTTTTAAATAGTTTGTAGCTAACATAGTTGATCTA
>sdt 8083158 8083177|10311 chrX 8082792 8083439 scaffold_10 1257730 1258473 + 22684|473 492
ATATGAGAAGGCCTACTACG
GTATGAGAAGGCGTACTACG
>sdt 8083243 8083424|10311 chrX 8082792 8083439 scaffold_10 1257730 1258473 + 22684|582 763
GCACATCACTGGAGGCCATACGCACGGTGGTGGCCAGCGGCAAGATCTGTGTGCTCAACCTGCATCCGCAGAGCCTTAAGCTGCTGCGCGCCTCTGACCTCAAGCCGTACGTGGTGCTGGTGGCGCCGCCCAGCTTGGACAAGCTGCGCCAAAAGAAGCTGCGCAACGGCGAACCCTTCAAG
GAACCTCACTTGAGGCCATTCGCACAGTCGTTGCCAGTGGCAAGATTTGTGTGCTGAACCTGCATCCGCAGAGCTTGAAACTGTTACGCGCCTCCGACCTCAAGCCCTATGTGGTGCTGGTGGCGCCGCCAAGCCTCGATAAGCTGCGGCAGAAGAAGCTGCGCAATGGCGAACCGTTTAAG
>sdt 8083488 8084690|10312 chrX 8083447 8084359 scaffold_10 1258691 1259639 + 14660|54 1034
GAGGAAGAGCTCAAAGACATCATTGCCACGGCCAGGGATATGGAGGCCCGTTGGGGTCACCTATTCGACATGATCATAATCAACAACGACACGGAGCGCGCCTACCACCAACTGCTGGCCGAGATCAACTCGCTGGAACGCGAGCCCCAATGGGTGCCCGCCCAGTGGGTGCACAACAATCGCGACGAGTCATAATGGGTTCTAAAGCACCCGCAAC----------CACCA-CACTACCATCTTCCCTAG---------------------------------------------------GATCCATCAACACCCAAGAAATGAATAGCAAACCCAAACTCTTTGTAAATACAATTTTCAATTGAGCCATGAAGCGG-AGAGCAGGATCGATT-CCAGTCCAGTAGTTCGGTTTGCCTGCCGATGCGATTAATCCCAACCCCTCCAATATTATATATAAATATATATATATTTATACTATTCGTTGCATATGTGCATTTTAGTCTTAGAGAGAGATCGAGTTTTAATTGT----GTGTACTCCTGTTTTAAAAGCATTCCAACCTCTTTATGTATGTTCACAAAATTTGTTGTTCGATTAATCGATTTCGGGAATGCCACAGAGGAAATGGTGATGCTGAAATCAGTGATTTCAAAAACCATATTGCTTCTTGTGGCACTTCCGTTTTCCTCTTTTTTTTTACCACTACCACT----AACTTATATACTG--------TAAAAGAATGTTTTTTT------TTTTTTTG--TATTTAAATTAAGCTTG---GACACTTCCTTAATTTCAAAGGGCAAATTGAAATTGTAAAATAACGAATCAGCAAAGGAAGGCCAGAATCGATATGATAGTACCCCTAGTACCCAATAAAATGTGTAATA---ATACCCATAAGCGACTCCGAATG--------TTAACAGAGCCAGAACAATCCGT-------AGGCAGCTGTGCGA
GAAGAGGAACTTAAGGACATCATCGCAACCGCGCGGGACATGGAGGCGCGCTGGGGTCATCTGTTCGACATGATCATCATCAACAATGATACGGAGCGCGCCTACCATCAACTGCTGGCGGAGATCAATTCGCTGGAGCGCGAACCGCAATGGGTGCCGGCCCAGTGGGTGCACAACAATCGTGACGAATCATAATAGCCTCGGAACCGGACGCAGCGCATCTTCATCGCCATCACCATCTCCTGCCCCAGCCACAGCCCCAGCCCCAGCCACAGCCCCTGCCCCTGCCTCAGCCCCGCATCGAGCCATTTACCACTTACCGACGATGAGCCAGCGC--CCGCTTTGTAAATACG--TTTCAACTCAACCATTTGGAGATGGAGCAGCTGCTGTCACCGGATCGGGAGACAGGGCATCCTTCCG-------------CAATTTGTATAATTGAGCATATATGTACTTGCATATGTAGTTTGCCTATT---TACCTACTTTTTAAC------------TCGAACTTAGCCCGTTCCCATATACTCGTGTTATTTATG------AATGTATCTATGTAAATT------GTTTGTTTGTGGACAAAC---TTTTCCTAAT---------------------------------ATTTCAAGCATTCCAATTTTTTTTTTAA-ACTTCCTTTTACTTAAGTATGTTCACAAAAATTGTTATTCAACTTTTAAATTGATTTTTTTTTAAATATTTTTTTTTCACCCAATTTTTATGATTATTTGATAAGAATTTGTTTAGCACTTCCTTAATTTC-AAGGGCGAATTGAAATTGTAAAAAAAAAAAATA--AAAAGAGTTTCAGTTTTTGTAACGCTGGCCAGTCTGTACTC--TAAATCGCTAAATATCGAAATCGAACTCCAACTCGGAACACCCATCCTTTAACAGAACAAAAACAATCCGTTAAGAGAAAGCAAATGTTGAA
>sdt 8083488 8084690|10313 chrX 8084401 8085229 scaffold_10 1259696 1260577 + 14142|0 312
AGATTCAAATTCAAAAGCAGAATCAGA---AACATACAGAGAAACCGAATCAGAAGCGCAGATACAGATGCAGATGCAAGTGTTGCAATTACGTAATCTATTTACTTTATA-AAATATATAC------TATACGGATATACATACACATAAATTATAAATCGAAGCGTACTTAATACAATTAATTTTTAACAAAACGA-ATGCAAGAGCAAAGTGAAAACTAAGA------------AATAAAACCGTTCATAAGAGAGAAACAACAAAATCAGTAAGTCATTGCCAAAAAAAAAAAAAACAAGAAAAACGAG
GGAGACAGAGAGAAAGGGAGAGAGAGAGAGAAGATGGCGAGCAGCCAA--TGGAAGTGCAAGGGCAGAAGCAA--GCGAATGTTACAATTACGTAATCTATTTACTTTATATAAATATATACATAAATTATACATATAAATATACACATAAATTATATGCAG---------TAATACGATTAATTTTTAATAAAAAGCTACGTGAGAGCAGCGAAAGCAGGAAGAGTTGTAAACAAGAATAAAAC----GATGAAGGAGAAACAACAGAATCAGTACGTCATTGCCAAATAAAACAGAAGAAAGAAATACGAA
>Trxr-1 8092931 8093275|10319 chrX 8091313 8092936 scaffold_31 632847 634458 - 93688|1620 1625
AGCGGG
ATGGAG
>Trxr-1 8092931 8093275|10320 chrX 8092945 8092995 scaffold_0 7366556 7366605 + 352|0 52
TCAGCCGCCTGGGACGTGTCGAAGCCGCT--TGCTCCACCCGAAATCCCGTAG
TGAAACGGCTTGGA---GCCGAAACCGTTACCGTTCGAGTTGAAATATATTAT
>Trxr-1 8092931 8093275|10321 chrX 8092996 8093229 scaffold_31 634542 634805 - 3094|0 270
ATGAAT-----GGTTGTTGTCGCGGCCCAGCGATCGATGAGTTCAA----TAGTTCCGTTTCGTTTCCACAATTAACACCCA---ACACAATAGCTCTGC----GCAAGGGAGGGGCACTGGGCAGCGATGGCGGGTGGAAC----GACACCAGTGGAACTACCCGCGCG---ACCAGCCCAACCCACGACTGCTGCGCCG--------------CCGACATGCACTCAAAATTTTGAATTTGTTTGAACCTATGAAATTAACTATGAAAT
ACGAATTTGAGAGTTGTTGCCGCTTCAAAGCGATAAA--AGTTCAAGTTTTAATTTAGTTTCGATAGTAGCACACACACACACACACACAATAGCTCAGCCGTGTCACAGAGGGGGCACTTTTCC-CGGGGGGGGAAGGAACTCTTGACTTCAGTCGAACTG-GAGCGCGAAAACAAGCCCCCCCCCCTAAGCATGCCCTGGCAGCGGCCTCTGTGCGGCACGCATCCAAAATTACGAAATTATGTTA---TATGAAAATGATGATTAAAT
>CG1632 8117356 8117705|10348 chrX 8117096 8117505 scaffold_5 1540057 1540458 - 10109|264 430
TCGGGA-----TAGT---TCACCAGGGGGCG---GCGGCACGCCCCTCAGC--GCATTTGTGTAGAAAACGGAACCGAAACTCACTGGGTATTATGTGTGTGTGTAGCA-AAGCAAGT---AAGGCAATTAAGCATATGTACTATGTAACTAACCTGCTCTAATGTT
CCAGTAGCCTGTAGCCTGTCGCCTGAAGCCGTCAGCGGTACATTTATTACTCGGGCTTTCTGTAAAAA-------------CTAACGTGTATTATGTAAAAAGCTAGAAGAAGCAACCTTAAACGTAATTTACCGCATGT----TTTAAC---------CTAATATT
>CG1632 8117356 8117705|10349 chrX 8117506 8118727 scaffold_5 1540977 1542217 - 18638|0 251
ACTCGAACCTATGTAACTCTATGCTAACTGTATTCTTTAAACGTCCTTTTTTTTGCTGTTTTGTGTAATATTTATTAACTATGTTGTAATTGTATGTTAAACATGTCGAAAAGGAAGCAAATTTAGT---TGTTAGTCTGTACGTTTAGCTG-------------------------TTTGTAGAAAGATATTGTT---------------------GAATAAAATGAAA---TCGTCCAAAATCAAGATAA
ACTAGAGCCTAC---------TACTTGTTTTATCTTTT-----TTTTTTTTTTAACTGTTTTGTGTAATATTTATTAACTATTTT--AATTGTATGCTAATCAAA-AAAAAAAAAAGTGAAAAAAGGATATATTAGTGT-TACATTTAGCTGCTGTATAACTGCAATTTTGTTTGTATTTGTTGATAACGATTGTTTTGCTTTTGCAAATGCTAGTTGAATAAAAATAAAAATGAGTAAAAAAAAAAAACGG
>CG1636 8120599 8120656|10351 chrX 8119496 8120693 scaffold_5 1542879 1544124 - 47967|1173 1232
TCGCGTCCT--ACCGCACGGACGCAGCACACTTTTACACAGTAGAAAACCACATTTCCTT
TTTGATTATTGACTGCAAAAACGGATAAAA-----ACCAAAAAAAAAAAAACACTTTGTT
>CG1387 8234591 8234740|10534 chrX 8234658 8234735 scaffold_1 6571883 6571997 + -1099|0 117
GAGCCAGACAGAGATAAATCCAATGTAACGGTCAACTTAATAGTACAAT-AAAATCTC--------------------ACGAAATCAATGT-------------------CTTTAAAA
GAGGCCGACAGCGAT---CTCAATGCCGAAGCTTTCCTGCTGTCACGTTTAAGCTCTCTTCGAGCTTTGCTCGCCGCTGCGTGCTCAACGTGTGCTCTCTCCCGAGGGCCCCTTATCA
>CG1387 8234591 8234740|10535 chrX 8234736 8234994 scaffold_5 1668473 1668682 - 4952|0 4
ACAGC
AAAGC
>CG10555 8247801 8249181|10559 chrX 8246118 8247825 scaffold_10 756963 758861 + 48310|2003 2027
GGAAGGGACAGCCTATTACCGCCGC
ACAAACGACATTCAACGATTTGCGC
>CG10555 8247801 8249181|10560 chrX 8247826 8248034 scaffold_14 2800655 2800876 - -533|0 229
TGCCACCTGGCTGTCTCCACAACAA---------GTAATTCT-----------CGACTGAGATTCGCTGGTTGAAGGTGGAGAGGAGATTGGGATCTACAGGCCGATCATCGATGGAGAAGGAGGTGATGCAGCGCGAGTAATAGCATAACTGGACG-ACAACAAAGGAGCAGACGAAGCAGATTGCGTTACACTAGGCATATGATTAAGAATTGTATCGGCACAGCAGC
GGGCGACTCGTTGTTGCATCAGCAATTCAGTGCCATGAATCTGTCAGCCAATACATCTGCGTCCACGTCTTCCATGTTCAACTCCACGCTGGATACCACCGGCTCCTCGTCGGCCAGCAAAGATGTGAAGCGTCGCCGGCGCTGGAACATTCTGTCGCGCAGCAAAACGCCCGATAAACAAAAGTCTGCCACGCTCGGCAGA-----GAGAA---GGCCAGCACAGCCGC
>CG10555 8247801 8249181|10561 chrX 8248682 8249043 scaffold_4 1788266 1788638 - -53|0 381
GCAATCGATCCATCCTATTATACATATATATATTTATATATTATTAATTCTCTCT--TTTAAGTAGGTTCCGCTCCCCTTTGAAAACGATTATTCTAAACGATTTATACATATACATATATTAATATACTTAAGTGTAGGGAAGAGGACGATGGAGCAGCAGAATAATAGTGCGTGTTTTAAACCCTAAATTAATGACCTA--------AATATTTTAACTATATATATGTGTATTTTGTATTTTTGCGT-TTGTCTTTTTGTCTGTCTGTTTTAGTCTGTTATTTTAATGTTTGTGCATTTTTTTTTGTGTAGCAATTTTACA-TTTAATTATCCTCGGTATCCA--------TTTTCCCGATTTCTTCCAAAAGTTTATT
GCAACTAAGATATTTTGTTTAAAAAATATGTTGTTTTATAGAAA-AGTTCTATTCAATTCGAAGAAATTTCGCTTAAAGTCGAAA-TATTCATTCAGAAAAATAAGTTCATTTTTAT-TGTTGAAATTCCTATTTAAATGCTAGCACATTTCCTTTCAATTATTTATGACTACATTCTCTTAGCTTTGGGGAAATTACTTTTGCTTTGTAATATTTTAAGTGTTCATGTATATAAATAATATTTTTGAGGATTGTCTACCT-TCATTATTTTTCTGACTTATACTTTATTGCAAAAACCTCCCTATTT-----ACAATTTCGTACTTTCAGTAAAATTGTTATTTACTCAACTCTTATTCCAATTGATTTTAACAATCAATT
>CG10555 8247801 8249181|10562 chrX 8249051 8249611 scaffold_7 3470819 3471385 + -1836|0 143
CAGCGAAAGATTGTAAT--TTGTAAAAGCCAATATATATTTATACGATAAGCTTACATTTACTATTTAAAGTTAAACTAAAAACTATAAATAGCAAGCGCAAATCATGAAT-AAATCTT----------AAATTTAAAGTTAAA
CAACAAATGATTTAAATAATTGTTCAAAATAAAAGCACTAAATGCGTGGAGCCGAAATT-ACAAAGCATATTTAAACCGAGGTTTTTAT-TAACACCAACTAAACAAGAACGAAAACTTTTCATTGCGGAAATTGTAGATGGAT
>Trf2 8274352 8274651|10600 chrX 8273491 8274352 scaffold_10 782472 783338 + 17003|923 923
G
G
>Trf2 8274352 8274651|10601 chrX 8274571 8274664 scaffold_9 3156700 3156790 + 2817|0 81
CACAGCGAAGCAACAACAACAAACAACAAACAAAACACCGCAGCAACAACAAAATCAAGAGCCAAATATTTA-AAATATAAG
CAAAATGAAAAAACAACAACAAACAACAAACAAAAAAAAAAACCAACCACACAAT-AGGGGC---ATATTTATATATATTAT
>Trf2 8274712 8275436|10602 chrX 8274703 8275182 scaffold_9 3156859 3157335 + -2947|9 507
ATTTACGTTTAAACTACTTTGTAAGTTAAGCGAGCACACCAGAAACAA-ACAAGCAGAGATAGCGAATAGATGATTTCGATCCCGAAGTATCCCAGAAACCTCAATAACATCTAGATGGTAAGCAAGGGAGCTTACCACACGGTAAACATAAGTTTAGACTTAAAGAAAATACGTATGCGACAGCGTTTTACGTATATAACCGAAATCTGTGGATAGCCTGGATGAGTCACCATCAATCATCGCAATTGCA---ATCAATTGTGGTGAAAGTAAGAG--AACACACATGTAGAACTAATCACCAGGACAGGAAGAGGACGATACGAGCAAGGTGCCCAGGCGGATCGGATCTCGCAGCTTCCTATCTTAT-------------------TTTAAATTTTTTTTTGAAGCTGAACTCCAATTCAGTTCTGGCCAAGCAAACTACAATTCTCAAGTAAAAATCCGTGG---AGAGGAGGTGGGGCCAGAGAAAAGCCCACT
ATTTACAACCAATTTGC--CGTAAGC--AGTAAGAACAACAACAACAACAACAACAATAATTATAAACACACCAACAACAACAACAACAATATAAGAGAAAAAAATTATAATTATACAATTAGTAG-------CAACAAAAAGCGAAAACCCAATTAAAACTAAATTAAATTAATAAA----------TTGTGTAAAT------TTTTTGTGCAAAGCGAGAATTAGTTTAAATT-ATTATAAAAAAAACACATACAATTTAATGTTAAAGCGAAAACTCACACACATACACACACACACACACACACAGAGACAGACAGACACACATA---TACAAAAGGAAACGGTATACTGTACATGCATATATAACAATTATATATATATATATATATATATATATATATAGAGCGATATACACATACATATATCTGGACGCAAAGCGCAGATGTTGAGCGGAGTGCGGGGGTGTAGGAGGGTTGGGGGGGGGGGGGGGTGCGTT
>Trf2 8274712 8275436|10603 chrX 8275203 8275204 scaffold_9 3157349 3157350 + 191|0 1
GA
GA
>Trf2 8274712 8275436|10604 chrX 8275205 8275896 scaffold_10 784574 785282 + 1438|0 340
AGAACAACTGATTAATTTCTTGTATATTCATAGGAAATTTTTTTTGTTTTCGCTAT-------------------AAGTCCTACATAAT-------------AAATGCTATACATAAGTGCTGCGTGTGGGCGCATAACAAACGAAACGAAATGCGTTTGAATGCGATTATAAT--ATTAATATTATTATGCATATATACAACACACACAAAT-------------------------------------------------------------------------ACCTATATCTGGTCACTTCTAACCAATTATAAACAAAACTGGAA--AAGCAGAAA
AGCACATTTTATTAGTATCTTGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCTTTCATTTTGTTTATTTTTGACTTTTGGATTTCTTATTTAATGATAACATCAATTAATTTAAATATATAGATGGTTCGAGTTCGAGACCAACAACAG---------TCGCTTGAACTTTAATGTAGTGCATTATTATTACTGTA-----AGGGATTAAACTTAAATTTTGTTTGTTTTAAAACTATTTTAAGTGCTTTAAAAATTCAGATCTAAGAAATTATATTTACATGCATACTACACTTATATCTGGTCACTTGTAAACCAATAACAAAAATACGCAAAATATGCTAAAA
>CG1440 8285997 8286172|10615 chrX 8284318 8287351 scaffold_10 824294 827400 - 113806|1745 1943
GTCCAGGTT--GCCATCAAGACACACCCAACACACCTAACACACACCCAACACACACACACA------CACCCAACACACACACACACACCCAACA---CACACCCAA---CACACACACACACATATAAAA----AAACATATATTAAAATACAAT-----ATATATAAAGCTTTACGAGCAGCAATCTTCGAGCAGC
ATTAATGATCAGCCAAATGGGAAAGCTTTACA-----AGAACAAAATTAACAATAACTAACAGTACTGCAAGCAATA-ATCCACAAATACTTAAAATTGTATGTTCAATTTCAGAGATAATTTAATTTAAAGTCTTAGCCAGATTTCTATATACTTTTTCTCATGTATGTATGTATATGTGCATGCACTTT--AGCTTG
>Es2 8308455 8308621|10653 chrX 8306744 8308499 scaffold_10 882455 884094 - 53888|1753 1797
TACATAACATTACCCATAACCCAGCTACATTATTCATGTTTAATT
CAATCTAAACTA-TTGTAA-CGAGTTGT-TTATTTGTATTTAATT
>CG32714 8354891 8355335|10700 chrX 8354542 8355194 scaffold_3953 1043 1726 + 5264|425 739
AATGTAAACCAAACGATTCTCCGGATTCTTTCAAT----TCTTGTTCCGATTTGTATTCTTCATTCATTCCTTAAACAAAAAACCGAAAAAAAAACGTAAGCCTACGTAATACTGAACAGCAATCAATGCACTT-TCCATAATTC-TTAACTTATTATATATATTATTTATCGAAA-----AATAAAACCATCTTGTGATATCTTTTTTTGTGTTTAGTCATAGGTTGAAAAAAAAAATAGAAAGAAAAAAACCAAAACAAAAAGTATGCAAAACCCATAGACAAGTAATTCTTAAAAAAAAAAATAAAACAAAA
AATGTAAACCAAAGGGCATT---GGTTTTTTCAATAACATTTTTATTCAATTTATATTCCTTAAACATTTTCCAAAAAAAAAATAAAAAAATAAA-------CTCCATAAT-CACAATAG--ACTCGCGCATTCATCAATAATTTATTAATTTATT-TATTTAACCTTTGTAAAGGAAGTCAATAAAA--ATTGTGTGATATTTTCAATTTTGTTTAGTGATAGTTCCAATCGAGAACCTTTTGCA-------CAATGCAAA---TATGCCAAAACGCTAAAGAAGCA-----TAAAGAAAGAAAGAAGAAAAAA
>CG32714 8354891 8355335|10701 chrX 8355195 8355435 scaffold_27 1772302 1772540 - -2652|0 150
AACTATATTTATTAGAGCACAGTTTATAATTTGTGTTGAATGTTTAGTTTCCGTTGATTTTAAGC-CAATTTATAGTTTCAAAGCCTAGACACTCAGGAT-----TTAGTTCAAATATTAGTAGTTTAGTCGATG----AGTTGTATTTGC
CGCAAAACTCATTAAA--------------TTTTCTTG-----TGGGCTTGCATTTATCATATGCTCTATCCATA---TAAAAATCCACA-ACTGTGTATGTCTCTTTGTGTAAATGTCTGC--CTCAAACGGTGCACTGGCTATATCTCA
>Nrg 8395372 8395629|10751 chrX 8395133 8395788 scaffold_5 76551 77255 + 12551|316 593
TTTAATTAGTAAGCAGCGCA----CCGCAACAGCAACTCAAAAATAATATCGA----AACCGAGCCCTTAACCCCAAAAATCAAAAAATCAACAAGACCAAACA-CCATCACAGCAGAAAAATGAA--------AAAATT---AATGAAAATAATAGTAGCCTACATTTTATTCGACTATAAGTGCAAACACCACGACTAATTTAAAGTATATATAAAAATAGAGGTTTTATATATAACTATTAAAATCTTAAAATGTGTAAAAAAAAAAACAAACAA
TTTAATTTGTAAGCAGCGCGGCTTCCACAGCAGCAACAAATAAACCGAACCGATTCGAACCGAGCCCCT--CCACTACAACAACAACAACAACAACAACAAACATCCACAACAACAATTACATCAACAGCGCCCAAAATTCTAATTGAAAATCAAAGTTTTTT---TTTAAGTTAATTTTTAGTG---------CGACGAGTTCATTTTCAACATGAAAGCGAATATTTTTTATAAAGTAACTAAAA-CTAGAACTAAACAAAACAAAATTAAAAAAA
>Nrg 8397228 8397353|10754 chrX 8396973 8397674 scaffold_5 79141 79901 + 11473|267 444
GAGGCGTGGCTGGGATTCACTTGCCCC----ATTGTTCTCCT---GATTTTCTAC-----CAAACGATTCAAACGCCTCTTAAACAA----------------AAAAGAAACTGTGTAATTCTATGTGT------------------------AAAACGAAAACTGCTTTAAGTGTCT
GAGGCGTGGCAG--------TTGGCCCAAAGATTGCTTTCATTCAGTTTGTGTGCATTCAAAAACTACGCCCAAGTTTATTAACTAATTCCGTGTGCGTGTGTGTGTGTATCTGTGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCGTGTGTAAATGAACAAAAATTAAACTGCTTTAAGTGTCT
>CG11265 8412175 8412872|10773 chrX 8410607 8412175 scaffold_10 2411381 2412824 - 27855|1685 1685
G
G
>CG11265 8412175 8412872|10774 chrX 8412489 8412779 scaffold_393 595 937 + 1416|0 343
ACTTTGCCTCTGAT-CGCGCTAAATG-TATTTCAGTTTGTTTCTAAAATAAACATGAAAGCAAA-----GAATATATATATATATATATATATATATTTATATATATAGATATATATTAAAT--TAAATTAAATTGTACCATAAGCATAA-----------CTGTTAGCTCAT---AAGTAGATTGTAAGGGTTTAAA--AGATCGATAAACTGAAGTAT-------------------GAAATTATGCTAATCTCTTTTCCCATACCCCCCCC-----CCCCCCTTTTTATCC----ATCATCATGCGCATTCAAGCTTCTAAAGTATTTTGTAGTTTCTGAA
ACTTTGCCCTACTTGTGCGCTAGTTGGTATTTCATTTTGTTTTTAAAATAAATATGAAAGAAAACTGAAAAAAAAAAACTAATTTAAAAAATTATATAAATATATATAGTTAATAATTGATTAACAAAATAAACAGCGTTTAAGGCAAAAACAAAGTTAGTCATTTAAGTTATGTAAAGCGAAATGTGAAGTACGAAATTAAGTACATATA-TGAAATATTATTTGAATAAGAATACTAGAGTTTGTATAAAATTGTATAGCTATAAGGCAACTAGGTTTTCTTGTTTTTATTTCATTATAATTATTATAATTAATACTTCTATTTTTTTTTTTTTTTTTTTAA
>CG11265 8412175 8412872|10775 chrX 8412863 8413649 scaffold_393 1029 1895 + 14260|0 9
AAAAAAAAAA
AAAAAGGAAG
>CG12065 8433404 8433763|10798 chrX 8432482 8433925 scaffold_10 2437884 2439417 - 54975|940 1378
GAGGCGG--GGCTTCGAATACCCCATTTCCTCCATTACACCCCAACCCCCCCGCCCACCCCTTCCCTGCAATCGTAGCATTTGATTTGCCTCCAATTTTCGTACCAATCCCGCTGCGGCGTCCCTTTATTTTTTTGTGGCCAGACACA---------------------TGGGGACCACTATTCGTAAACCAAAATGTGCATAGATTGCATCATATATAA-------TGTATGTTCGCGTAATATTGTATTAAATGATTTCTTGTTATTTATTTTGTTATAACTTTTGTACTACA-------------------------------------ATCAATCTAATTTAC------------ACACAAACACTTGACGTATATAAAAACACATATATACAACAGTAAATAAATATCGCAACTAAGCTTGCAAAAACTAAGAA
GGCTCGGCCAACATCTAGCACTCAATGCATTAAGCTATGATTTTACACATTTTTAAATCTTTTTTTTTTTTTAATATTGTTTAAATT-CCTGCAATGTATTTATCAAACGTTTTATTTTGT-TCTCTGTGCGTTATTAACCAAAATCGGAGCCTACATCGGCTATTAGCTGGCGGCCCCTCAAAGTAGACCAAAATGTATGC-GTTTTCCTAATACCTTATTACATGTATATGTAAAAGTAATA-TGTATTGAATAATTTCTTGTTATTTA-TTTGTTAT-GCTTTTGTACTACATACATATACATAAATAATAATAAACATATATATATATATCATTTACATTTACACAAAATGTATGACACAGGCACATAACGTATATACCAAAATATATATTTATTTGTGTATATACAT----ACAAATATATTAAAATTAATAAA
>CG12081 8435599 8435946|10799 chrX 8434383 8435599 scaffold_5 1784697 1785964 + 71185|1268 1268
C
C
>Crag 8445865 8446452|10809 chrX 8445536 8445985 scaffold_5 540836 541276 + 22386|329 456
C--GCAGTGGCTCCCAGCTGGAGGCAGGAGCAGCTTCAAG-----CGATGCCGAAGTGGACACATGAGTGGAGCAGCCGAAGCCTAAAAGACAAGACGACCAAATAACTTGATAACAAAATGGAAACG
CGTGCGCTCGATAAAGACCAGGATCAGGATCGGGATCAGGGTGTCTAGTGTGGATGGGGAAACA-AAGTGAAAC--------CCTAAAAGACATGGCGACCAAAAACA-----AACAACAAGAAAACG
>Crag 8445865 8446452|10810 chrX 8446366 8446508 scaffold_5 541334 541547 + 2791|0 153
AAAACATGCAAATGATTTTGTAAATGACTTGATCTTAACATTTAAGTACTTAA------CGATTTTTCGCTGTTTAAA----------------ACTAATCA---------------------------------------------AAAATAT
AAAACAAAAATTTTGACTTGTAAATGACTTAAACTTAAATCTTAGGTACTTAAATTTTTTGTTTTTTTTTTTTTTAAATTCTTTTTTTATTTGTATTGAGCATTTTTGTTTCGCTCGCTCGCACAACGCAGAGCTCGTACACACACTCACACAC
>CG12772 8525499 8525954|10930 chrX 8525591 8525863 scaffold_8 3153080 3153380 - 2715|0 309
TTGGTTTTGGCGATAGGAA---TTTGTTTTTTTTTTTTTTTGTTTTTTGTTTT---TTGTAATT-----CGCATAGTTTTTAGA-------------------GTTAGGCCTTTTTTTTTTTGTAA-ATCCAAAGTTGCTTATTCGTAAAGGTATTGCTGAATATA--TAACATGTTGCTTTCCGTAAGTAATTTGTTTATAAAAAATCT-CTTTTAGGATCCATTTGCTTCTAAACG-AAACTAGAACCAAATTGAAACATCACTTATTTGCCTGGAAAAAGA--CGAATTTTTATTTAAGAAAGTATT
TTGCTTTTAGCAAAAAAAAATATTTGTTTTCTTTTTAGTTTATTTCTCATTTTAGTGTTTAATTTTTTGCTTGCAGTTTTTCGATTCATTGCCAAATTCAAATGTTTGTTTTTTTTTTTTTTGTAACATTCAAACTGGCTT-CCCGTATTTGTATTAGAGAATATATTTTATAAATTGTATTC--TTATTTACGTGTATATAACAATTATACATTTATG------TAATTTATAAACGTTGGTTTTAGTAAAATTAAAAAAAAAGCCATGCGCATAAAAACAGATTTTTGTTGTTGTTTAAGTTTAAACT
>CG12772 8525499 8525954|10931 chrX 8525864 8526295 scaffold_10 1652976 1653396 - 1472|0 92
ATTTAAAA--AAAGCTTGCTTATTATTAAATAACAAATAACATGTCACATACACACTAAATATTCTAAAAATATGTTAAAAAAAAAAAAACAA
ATCTAAAGGCAAACCCTGCTAAAATGTTGATAACAAAGAAATTTAAACATAAAGTAAAATTTTTGTGAACATGTGAAAAAAAAAACAAAAAAC
>CG11284 8533414 8533996|10941 chrX 8532504 8535185 scaffold_5 4704889 4707582 - 89007|924 1596
TGTGCTTGCCA----TATGACTTGG----------------------------------------ATACAATTCTACAATTCCCGCTCCCGCTGA-------------------CTTTCCTTTTTCCAACCTTTCGCGCAATTTTCTCCGCCCAATCGCCTATCTAAACTATAGCTATGTGTAAACATTTATCTGTCTATGGTTGTCTGTAAGCTGCTTTTGTTATTTGCCTCATGTACATAGCGTTATATACCTAACAAAACATACATATACATACATACATATATATATATATATATATATATATATATATACGGAGTATTTACGATACGGATACGTGTATGGAATTTTAGTCGGAGCACGCGGTTGCCTTGCATTGAATATTTCAGAGAAATATCGGGCACAACTA------------------CTTAAGACATCTACAAGAGACGTAATCCTAACG-TTTAAGTTATTAAGATAAACAGTGAAAGCGAGAAAAAGAGGAAAATAAGAACAGTAAATCAACACATTTTGTATGTCCAAACTGAATTTATTAAACATCTAATTAAACATGTATAAAAGTATCAAAAAGTCATTATTA-ATATTAAAATGCT------TATGTTAAT-AGGAAGAATGGATTAAACCTATGCAAACATTTTTGTCACAATAC
TGTGATTGCTAATGCCATGACGTGGTGCATCTACCAAAAAACGAAGAAGTCCTACTCCGAAACACCTATAACAATAATAATTCCGCACCCATAGGAATCTGTGCTGCACTGGATCTGTGCTGGTTGTGGTTATCCACTTGTTTTGCTATAATCAATTGAATGTCAAA------------TGTAAAT-CTTATAATTCTATGGTTGTCAATAA---GCTTTTGTTAGTTGCCCCGTGTACATAGCTATATATACATA-------ATATATATTCCTATATATATATATATAAACATAAATATATGTATGTGGACGTCAAGTTCGTAATATAT-------------GAATCATAGTCGGAACACGCGACTGCCTTGCATTGAATATTTCCCAGAAATGTTTATTAATATTAATAATAATAACTTACAACCTTAACACAGCTAATAAATATGTATGTATAATATTTTAAATAAGGCCAATCCACTTTGTATGC----AAAACTGAACTTCGAAATTACTAATTTTATATATAATATATATAT-------ATATATATATAATCAAATCAAGTATATATAAAATGTACATATGTTCTATATCGTGCGTTACTCGGCTATAAAATATGCTAGTAAAGCTCCATTGTTTGCCCTCATG-AGCCATCAAAGTCATCATGC
>Ogg1 8536934 8537040|10942 chrX 8535767 8536939 scaffold_46 924895 926094 + 28352|1228 1233
TCTTAT
TTTAAT
>Ogg1 8536934 8537040|10943 chrX 8536961 8537464 scaffold_37 656522 657053 + -2815|0 86
TATTCCTA-CTTGTAATATTTGAATATTAAAATATAATAGAAATGTATATACTAA------TGTATATATAAATATATATCTAAACA
TATTCCTAGTTTATAATATATGAGTAGTC---TATGCTATATATATCTATATTATGGGCATTATAGATCGGAAAACAAATTATATCG
>Hexo2 8557601 8557718|10976 chrX 8555805 8557649 scaffold_5 1914700 1916556 + 88614|1816 1871
ATCGGTCGTTCCGAACCTAGTT----TTAGCACCAGCACATAC---CATGTACATA
ACCAGTCGCCTTCTGTTCAATTGTTATTTGTACCATAATAAACACACATATACATA
>CG1785 8561947 8562301|10983 chrX 8561774 8562276 scaffold_19 2450306 2450764 + 5463|177 513
TTCAGTTATTAGGTCTCTTTATTTTTAACGGAGCTTACAACAATATGTACTTTTCTATAGAATTAAAATCCACATTCTTTTTCCCCCCAAACGAAAAAAATTATGAACTCTAGATCAGGGACTTGCCCTGACTGCGTCTCTGTTTCGGATTGTTCTT---CTTTTTCTTCTTGGACAGCGGAGCTGCCAGGTCGCCATCCTCACGCGTCTCGATTGGTCCATCCAGTCGCTTTACGCCACTGAAACGAAAGAGAGGCAAATACGAAAT--AAGTTATATTTTTTTTAAC-TGAGTGATGTTTATA-ATAAAACGAAACTGGAGACAAATAAATAAAC
ATTA--CGTCAAAGCCCTCCAATTTTATTGAAG-----------AAACACTTATAAATATAGATTGTACCC-----CATTTTGTGCCCACATAAGA-------------TCAGATTAGCGATTTGCCAGAGCCCTTTTTCAATTTCGGATTTTTCTTACTCTTTTTGTTCTT------TGGTGGTCCCAAATTTGGTTCC------GGCTCCACAACAGCATCCAACCTCTTGACACCGCTGCA-----------GAAAATAGCAAAGGGAATTGGCATTTGTTTTGACATGAACAAGAGCGAGAGAGATAAAGAGAGAGGAGAGAAAGGGAGAGAC
>CG1789 8566680 8566737|10984 chrX 8562314 8566708 scaffold_19 2450820 2455288 + 184092|4567 4607
AATATTTC------------CCCTCTAGTTAATAAAGCAAT
AATCTGCCAAATCGAAAGAGCCTCTTAGTTCATACATCTAT
>CG1789 8566680 8566737|10985 chrX 8566709 8567257 scaffold_6 4079457 4079979 + -396|0 28
TAAGTGTTAGTTGAAGACTTTTGACAAAA
AAAATG--------GGGCCGCCGACGCAC
>CG10648 8748594 8748714|11260 chrX 8748190 8748611 scaffold_19 2685893 2686406 + 2386|501 523
CCAGGTCCAC-----AATATATA
TGAGGTAGACTAAAGAACATATA
>CG10648 8748594 8748714|11261 chrX 8748612 8748857 scaffold_9 1670994 1671289 + -817|0 133
TTTCTCC----------CCCCCCCCCATGCTCAATCCACTTAGCTGTTAACGCTTATTGTTT--------AGCCGGTTAAGAATA-------------GTATTTTACATAAAAAAGAAAGAAAAAAAAACAAAA
ATACTACAGAGCATCATATATCATCTATGCCAGATCAATATAAAAACTCACGATTTTTTTTTTCGATTCGATTCGATTCGTAATATTTCAAGTTGAGTGTTGTTTACCTGAAATGAAATAGAGAAACGTTGGCA
>CG12660 8758182 8758184|11277 chrX 8757745 8758232 scaffold_19 2696774 2697308 + 9481|494 496
TGA
TAA
>rdgA 8870053 8870175|11425 chrX 8869812 8870430 scaffold_19 2856306 2856872 + 12185|242 388
ACGAATCGACGATCA------------------TCTCACAAAATGCCG------CAGTTCCCCGCCAAGTAGAGCAATCGCTAGACAAGCTTACTACTTATTCAACATTCAGACATTTAAATGAAAAACAAAACAAACAAAAAAAAA
CCAAATAGCCAGCCGCCAAATTCCATGTAGTGCTCGCATAGAACATCATCATTTTAATTCCCAGCTGCAGAAACATGTCCCGAATCCTTGTGGTTACTTAGCTAATGTGCACGATTTT-----------------------------
>CG32709 8872511 8872856|11428 chrX 8872605 8875656 scaffold_5 4553451 4556303 + -12087|0 267
TAAAAAGTTT---ACTTTTTATTTTTTTTTTTTTTATTGAAAATTGTAATATTCTTTTAAATACCCGCCCCAATGGCGATCGCAGCTGGAAATCCATATGCAGTAGAGCAGAATTGAGTAAGGAATATTTAGCAATTGACAATCTAGAGATTTTATAGCAAATGAGCCGAGCATGAAGGCCGATGAAGCGTTTGCTATCCCCCCTAAACCATTCACTATGA-------ACC----GAAACTTAAAGAA--ATAAAAAAAAAAACAAAA
TATAAAATTTTAAACGTTTTTTTTTTTTTTAACTAATTGTATATTGCAATACATAATTAAATGC-----------------ATAGTTTGTAAGC-ATATGT----GAACTGTATTGAGAAGCG------TAACAGTTTAGTCTATTTAAATTTTACGT-----------------------------GTATTTCATGCCCCCCCCCCCCTGCGTATTTTGATTAAGATACCATGTGAAAATAACAAAACGATAAAAATAGAAATGAAG
>CG4040 8898499 8898557|11451 chrX 8896350 8898499 scaffold_5 4581716 4583826 + 96676|2254 2254
T
C
>CG4040 8898499 8898557|11452 chrX 8898557 8898631 scaffold_5 4583890 4583952 + 2388|0 0
A
A
>HP1b 8927303 8927582|11484 chrX 8925700 8927614 scaffold_5 4615532 4617299 + 44505|1641 1952
TTGAG-TGGCAGATACAG--------ATGACTGTTTCGGATTCACTCGCTTATGTGGATACATACACACCG------GCTTTATACGATATATGTACATACATATTTCGTAG-CGTAGCCCTTAAGATA-AAAAAATTGGACAAACTGAAG------TTCTGGCGTCAGTCAGCGGTAGTATATACATAT-----ACATATATACATATACATATATATACATACTTA-ATCTATAAGTTCAATTGTAAAATTGTTT-TTAACATCTACCTTTATTTTTG--ACCCACATAAATGTTTTATAAGCATATAAC
TTAAGCCAGCAAAAACAATGCCATGCAAAACTGCAT-GGATACACACAGATACACACACACACACACACAGGCACATGCTCGCTCCTACATTTTTACATACAAATAACATAGACATAATCATACATACATACATAGATATACATACAGGCATGTTCTTTTTTGCGCCAACAAAC-ACAAAACAAAAAAATTGAGCGTATTTCTAAAATAAAGTAAGCATACATTTTAATATGTATAACGAAAATAATAGCAATGTTTCTTTATCTTAAGCCTGGTTTGCGTAGATTTCCTAAATCCTTTTTACGAACATAAC
>CG32707 8930923 8931093|11486 chrX 8928169 8930939 scaffold_5 4617324 4620116 + 114427|2868 2886
TCTTGA--ATCTATTGAAT
TATTAACCAGCCAATGAAT
>CG7033 8937618 8938054|11495 chrX 8936589 8938233 scaffold_10 2108824 2110470 + 68585|1037 1532
GCGCT----------TAAGTATTCTTGTTCTAGGATCATATTTTTTTTAA----TTATGAACTCTCGTTTAACATCATCGCTAACCTTACACGTTCTGTTTACTACACTAATAATCCACACACA-ACACATTAGCAATTATATCACACGTCCCACTCTCAAAGTCGCA-------CAATT---TCTCGCTAAATTTGTCCCTGTCGTGTAATCCT----TCTACTTAATTGTGAAACAAATTGATATGATGTTGCAAGCTGAGCTTTTGATTCGAGGATGAGTGCTGCGATCAAAC---------------------------CAAAACATTTCAAAAATGTCTAAAACTCCATCAAACCGACAACTAAACGA---ACTTGTAAATGAATACAATTGTTGTAAACATTTGATGTGCGCAAATTGAAGACCATTAAACAGAAAAAAAAAAGGAATAAATGATAAATCATATATTTATGCTTAACAAAACTAAACAAA
ACATCAATTCTTATATAAGTATTTTTGT-CTAGGAT----TTTTTTTTAAAACCTTAC-AACTCTCGTTTAACATCATCGCTAATTTTATGT-TTCTGTTTAA---ACTAATAACACACACATGTATACACACGCACGCACACAAC----CACACTCGCCTGGGCACAGCCAACGCAATTAACTTTCTCTAAATTGTTT------GTGAAAATTTCAAATCTGTTT--TTGTTACGCGAATTACCACTGTTGCGCAAGCTCAGCTT---ATACTAAAGAGAG------GACCGAACAAAAACATCTAAAAAACAAAGCAAAAAAAAAACATTTGAAAAATGTCTAAAAC-CCACATAAACAACACATACACAAGCAACTTGTAAATGAATACAATTTTTGTAAACATTTTATGTGCGCGAATTGAAACAAACTACACAGCAAAAAATAAAATAATAATAAAAGAAATGATATTTATGCATAACCAAACTAA--AAG
>AP-1gamma 8961484 8961737|11519 chrX 8961308 8961703 scaffold_28 1746333 1746698 + 8343|184 405
AACTGCGATTGTATTAAAGCGAAACCAGATTAGCCTAATATCGGAAATAATTCAATACACGGAGCAGCAGCAACAAGAACAGCAGCAACACTAAGGAAACACACACACACACACTGTGGTTGTCACA--CATTTATTGTAAAATAAGTTATCACACACACACACACACACACGGTGAAACACAGAGACACCCACGCAATCGCATCTAGATCAGAGCATTTTC
A------TGTGTTTTAAAGC--AAGCGTCTAAGCTTAAAGTCTAAAG----ACAACACACACAGACACACCCACACACATACCGA---------------GCACAGCTAAATACAGAGGTTGCCACACGCATATACTGTAAAATAAAATGAAAAACACCTACAAACACACAC----AAACACACAAACACACACATACATACACTCATATAAAAAGAGACCC
>CG7065 8992845 8992951|11559 chrX 8991503 8992845 scaffold_28 1784109 1785313 + 27541|1400 1400
A
A
>CG7065 8992845 8992951|11560 chrX 8992911 8993250 scaffold_5 1200317 1200662 - 1938|0 40
ATAACGCCCTTTGAAGTGCCCGTGTATCTGCTAGCTGGCAA
AAAATATGTTTACA---------GCAGCTGCTAAGCGGCCA
>dalao 8996894 8997199|11564 chrX 8994572 8997377 scaffold_28 1788661 1791549 + 72041|2604 2951
GA---CAAGGAATCCCAC-----CACCCAGATCCTAGT--------TGTGGTCCC--TAACTTATATATGAATCGATCCCTGGT----GTTGTAACATAGCTGTCCCCT------------CCCGGAACTTCCGGAAGGCAAACAACCGGAATGCTCTTAACTTGAAATCCCTATTTAGGCGCCACACCTAAGAA--------CTCCACATCAATCCCATTCTCAAATTAAGTTTATATCACTTTTTTTTCGCGAAGCCTAATTTTAATATTTTAATAACTGAGTGTGCGTCGCATTCTGGACTGTATGCTAAATATGCAAATAAATTAAATGTACGATTATATGTAA
GACCGCAAGGAATTCCACATGTGCAGGAATATCAGGGTATTCCCCATGTGGACACATTCGCTCCAATATCAAGCACTTCGGTGTGCGCGTTGTAA-ATTGAGCTCCACTGACTGCACAGCGCACCGCAATGAAGAAAGGCAAAAATAAAAAATAAAAATAACAT--CATTTAGTCTTAAGCACAAAAACTATTAAATAATTATATTTACATTTTTTTTTTTCTC---TTATTTTTATTACTTTTTTTTTTTGCATTTACCCAAATCAAT-TTTGACTATTTTTGTGTGAGCCACAGAC------ACATATTATATTTATAATTAATATACCTTTATAAATATGTGCGA
>mei-P26 9016037 9016898|11587 chrX 9015927 9016530 scaffold_19 1832078 1832640 - 21146|110 643
TTGCAAATCAAAGCGCGCAACAATCGTCCATCAGTCGATATGAACAAATATAACTACAAATACTCGTCGGGCAAGATATACGGATGTCGACGGCAGCAGCAATCAACA--AACACCAGCAATAGCAACACCATCTGCAACAGCAACAGCAACAGCAACAGCAACAGCAACAGTAAT-----AGCAATAGCAATAGCAACCTCAACATAAATATCTTGGCAAGGAGTCAACACACCGTACACTGCAATAACAACAGTCAACTGGACAAGATAAGCAGGATAAGTAGCATGAGCAACATTTGCCTCATCGACAGCAACAGCAACAGCAACATCAATCAACAACCATTGACTACAACAGCGTCAATCATCTAATAGAACCGAGAAGCAAGAATTAGA-ACAAACTAAGACATTGAC--------------------------------ACCATCAACAGATGCAGATAGCAGATGCAACTATACCAAATGGGCATATATGTATGAATCAAAATGTATATGTATATATATGAGTGGGG
TTGCAAATCAAAGCGCGCAACAATCGTCCAGCTGTCGATATGAACAAATACAACTACAAATACTCGTCGGGCAAGATATACGGATGCCGCAGACAGCAACAG-CAGCATCTACAACAGCAATTACAACAGAAACTACAACAGCAGCAGCAGCAACTACAACTACAACAGCAACAATCAACAAGCAACAGCGACAGTAACAGCAACAGTAACA------------------------------GGAACAACAATAGCATAATCAACAGCAACAGCAACATCACCAGCAGTAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAACAACAGCAACACCGACATGGAGCAACA-----------------------------------------TAGCAACAATATGATTCGAGCTAAGCCGTCGCCTTCCATATAGAAAAGCTCGAGAAAAGCTCAGTACCGTTAAGCACTGCAA-----CAATGCAACACAATAATATGTATATATATATATATAT----ATGTATATATATATATATATATGGGG
>mei-P26 9016037 9016898|11588 chrX 9016531 9017034 scaffold_48 518286 518693 + -2353|0 373
AATGCTAATAGACTAAATACGAATGATTAACTACGAATACGTGAAAATGAAAAGGTCGAGCTCCTATTTTTTTTTCCCCGTTTATCTGTATAGTCCCCTATCAACGTTCGAATTCTTAAAGCTGATCAAATCTGCGGCTGCACAGACTCGCTCTATATATATGGAGTACAGCTGGAGGCAAATGCAATGCGTTGAATGCGACTTGAA--ACACATTTTGTTTAATGCGAAACACGAGAAACGTTGCCGCTGCAACCGTATGAAACACATAAACAAACCAATAACAG----ATGATAAACAAAATGCAACAAATACTATTTTTGATCTCTAATTTAAAAACAATTAGCGCTACTACTAAAAAAAAACAAAAACAA
CGATCTAGAAATCTA---------------------------------------------------------------CGCTTATT-------ACATCAACTAACCCGGGAACACTTA------GTCAAACCAGAG-----AGAAAAACACAATTCTCATTTGACACAGAGAAACAGTTTAATA-AATATATTCAATACAACGTGCAATACACATAACATTGAACATAAAGCAAAAAAAATA----------------ACAAAAAAAAATAACAAAAAAAAAACAGCACTATTGAAAAAAAAAAAAAACGAAAGC---------CCGATAAATTAATAACAAT------TACAACCAAATACACACACACACAC
>CG12057 9037566 9037770|11623 chrX 9036650 9037612 scaffold_19 1855210 1856170 - 26626|950 996
GTGAACACAAACTTATTTACCTGGATTCTGCAAATAAAAATTATGCA
------ACACTCCGATTATCC---ATTTAGTTAATAAAACTTGTGTA
>CG12056 9038777 9038848|11624 chrX 9037906 9039053 scaffold_5 4640963 4642093 - 27707|883 957
CAGCAGGGCCGGGATTTGTAAATA---GTAATTAGTGCATTTGGATCAATAAATTATTAGGTGGAGTTAACATGG
ATATTGTGTGCATATATGTATATCAATGTTATTATAGCTTATGGGTT--CAAGTT-----GTGAACTAAATA---
>CG12106 9039957 9040570|11625 chrX 9039069 9040506 scaffold_5 1980104 1981644 + 35865|916 1598
GGAAACAAGCTCTTCAAATTCTTATCGAT-TATATTTCGCA-----------------GCATATAACACCAGCA-----TTGTCGGCTATATACAGTGTCGGAACAG-------------------------------GAAACCTAAACAGTTAACACAGTCATCATCGCTTAAAAGGCTACGGCT---------TCATCATTTGGAGTCCAACTCCAATGGCA------------------------------------------ACCACTTCGTTGATCATCCGCGTCAATGGGCAACCTTGTGCGGC----------------------GGCGGCACAAGCAGCTTCATCAGCTGCCCATAGTGATTCGGCGCTGTGCTATAGATGGTGCCCGAGAAGCGGGTGCTGTCGTTCTTCTCGGCGGAAATCACTGTGCAACGGTTCTGTTCCGAAAGCCGCATGTTTAGACCACGGAAGCGTGAGTCCAGCCTGTATAGATTAGCCCCTTCCCGTGGTAGAAAGAATGGACGTCCGCTAAACGGATTCATGAAGTCCGCCCAGTAGCCGTACGATAGCAGGCGATCGCACATCTCCCGCGCTGCCAGGACAAACTGCAAAGGTAGTTGGCATTAGTTATGTATGTAG-----ATATACTCGTTTAGATA-ATAGGTAAATACC
GGAAATCAGTTCAATATATATACATATATATATATTACATATACATATACATACATATGCGTGTAATTTAAATATGTGTTTTACAAACTTATAGAGTGTGAAAATAGTTTGTACACAATGTTTATGACAAGTCCGAACAAAAACTTGGCAATTAACACAGTTGTCATCAC-TAAACGGCTACGTCTTGTCTTTCGTTATCTTCTGCTGACCAGCCAAGGTCGCATGTTGCGCTATTGTTGAGTGTTGGTTACATGGAAATTGTACTACGAAATTGTTGTTGACGGTTATCCACTGTCATTCCGGTACATCCTCAATTCGCATTTTAAATTCTGTAGGGGCGAGCAGCTCTACCAGCAGACTATAGTTATTTGGCGCTGTACAGAAGATGGTGCCTGAGAAGTAAATGCTATCGTTTTCTTCGGCAGCGATAAGCACGCACTCGTTGTGATTGGACAGACGCATATTGAGTCCGCGAAAGCGGCAGTCCTGTTTATACAATATAGACCCGTCTCTGGGTAAAAAATATGGACGTCCACTAAATGGATTTAAAAAGTCTGCCCAATAGCCCAACGAAAGCAAACGATCGCTTATTTCTCTGGCAGCGAGCACAAACTGTAA---TAAATTATAAAAGCGTTATTTGCAGTGAATGCATCCGTGTTTATATGTGTAGGGGCATGCG
>CG12106 9039957 9040570|11626 chrX 9040542 9040766 scaffold_5 1981684 1981923 + -979|0 46
CCAAATCTAAAACTTATTA------------------CAAATGATTG
CTGAGTGTAAGAAGTGTTATGGCATAGTCCCTTTGTCCAATTGCGCG
>mxc 9090945 9091149|11692 chrX 9088128 9091073 scaffold_10 345536 348612 + 64777|3094 3226
GTCACTTTCAGTTGAGGGGTGAGTTTGGATTTCATTT-CAGGAAACTCTATAATATAAGCTATATAAATTTATAAATGT---AAGCAAAAGATACATTTAGATCTAGCACAAGATTTCGTAATATTAGAGTAA
ATCCCATCCGAT----------------ATCTAATGTACAAAGAAC----TGAAAAAACCTATGTATGTTTGTATGCATATAAATTAAAAGAAATATAT-------GTACA-----TTATAAAATTAAAGCAA
>mxc 9090945 9091149|11693 chrX 9091102 9091406 scaffold_547 4790 5094 + 1117|0 52
AAAGAAACTTCCT-----AGTGAAATTGAAATAAATCTTCTGAATGAAACAAA
AAAACAATTTCTTGACATACTGTATTTAAGACGGTTTTTTTGGATTGGATAGC
>Dsor1 9095108 9095256|11697 chrX 9094484 9095179 scaffold_5 741276 741966 + 27294|648 719
ACGCCTCTGCGTTCCGGCCCCCATTTTCTCTATCCTCCCATATCCACACTTGCTCTTTGTTCAATAGAGCGT
-----TTAGCATTCC--------TTTATTTCACGCTCGCGCA--CGCACATACACGTTATTTATTTGTATGT
>CG17754 9099577 9100270|11700 chrX 9097717 9099588 scaffold_5 745391 747283 + 112967|1895 1906
TCCAAACCCAAT
TTACGCTTCAAT
>CG17754 9099577 9100270|11701 chrX 9100012 9101603 scaffold_5 747321 749011 + 19944|0 284
TATAGTAGTTGTTGT-TACTGTTGCTGTGAGCTGCTCGTGGTTGTTGCT----CGTGTTTCCTAACCCGGCAAGTTTGAAACTGCAGCTCA--CCTTCGCCTCGCCTCGCTCTCGTCTGTGTTCTGACATGATTCCCTGTGGTATGGCATACACC---CAGAACTCACC-------------CACTTTCCG---CACCGCACACCCCAACCCAGTATTTTCCCCATAACTCTGCTCTTTTCGGCTTGAATCTAAAAATAAGTAAATCAAAAAAAAAATAAAAAAA
TGTATGAGCTGTTGTGTACTGCTACTGCACAATGACCACTGCTATTCCTATTACCTTTTACCTATAACTGTTATTCTTACACCTACATTCATGCCTATGTACTACGCAACACGCGTTTGCGTTCTGGTCCGCTCCGTTCGGGTCTGGTCAGCTCCGTTCGGATCTGGCCTGATCTGGTCTGGCATTTGTTGGTACTTGGTACACACACTCGCTTTATTTTACCCGCTATTATTCAAACGTAATCTCATGCCAAGTGATACAAGAAATTGAAAAAAAATAAAACAA
>CG17754 9100942 9101041|11701 chrX 9100012 9101603 scaffold_5 747321 749011 + 19944|1096 1195
ATGCTAGACAGACAAGACAACAAACAAAGCAAACTATAAACATTTAAGCCAAGCTAAAAGAAAAAACACAAGAAAACTTGTCAAAAAAAAAAAAAAACAA
TT-----------------ACGAAAAAACAAAACTATAAATATTTAAG-------------AAAAACAAAAGTAAG---ATCAAGCAAAAGCCAACACAA
>ric8a 9103305 9103896|11704 chrX 9102056 9103600 scaffold_5 749386 750997 + 59026|1267 1631
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GCAACGTAACGCATCGATTCGCGTACAACATGCAAAACAATCGTCGTTGGGGTCTTCCAAATTGTGGCCACATCGCCTCCCAGT--CTGCCAGATCTGGATCACTGCAACCCCTTT-CTCACCTTATACATACACAATTCTCGGCCGTAGCACTACGAATGCCGTTTCAATCTAATAGTCAAATTTAACTTAGTTTTTTATTTTTCTGTGTAATATTTAAGCGCATTGTTATTCCAGTATTTACATTTGCTAACAGGCAGTGCTAGATAGATACACGGT-TGGCTTTTATATAAATATATATATATATATGTATATATATATATTCCACTTTTATT-GTATCTGCAAGTGAATTTTTCATTTATC
>CG16892 9120489 9120575|11727 chrX 9119167 9120669 scaffold_10 805896 807438 + 48325|1375 1467
TCTTAAAGCTTAGTGATTTTCATAGTAATACATTTTTTGATTTGGTTTTTGTAAGCGTTAA------TACACAGTTAAACAGGTTAACCTTAA
AC--GATTCTATGTGAATAGGATTTATTTATTTTTATGTATTTGGTTTTTATAAGCGTTAATAAAGGTACACAAATAACATGTTGGAATTAAA
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CCCAACCGGATCATTCAGCGATCAGCGCCGACCGGTATCCACCTGCACCCACATCTGAATCTGAATCCGAATCCAAATCTGAATCCCAGCCACCCACCGCTGCACCTGCACATCGAACTGAACTAGGAGAGCAGCAGGATCACCACAAGAACTGTACAATTTTTTGTATCTTTTTTTTTTTTGTAGCAAATAACGTATGTCTAAGTAATCCCAAAATATCTGCAAGTTGTACATAA
CCCAACCTTATTCTAGCGCCACTCCAAAGAACACGCGCCTTTCTGCACATAGAACTGAACTAAAA--CTAAACGAAATTTGTG-CGTGTCCTCTTTTTCTTGCCCCTTTCAAT----------------ATTAATATAATATATATTAGAA-TGTAGTGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGCATTCTGTGT------GTAACTTTTACAACTTTAAGAACTGTAAATAA
>lz 9148093 9148858|11753 chrX 9148661 9148883 scaffold_10 3341293 3341457 - 3123|0 197
TTTTTTTTTACTAGCCCTAAGTCTTGAAGGATACTCGATAAAGCCGCACAACTATCTATAAATATATATAAATACATACGTATTTATACATTTTTTTTCTGTTACTTTATGTGTGGGAATCTGCCAAAGGATTCGAAGATGACAGTAAAAAACTGAACGATGAAGAAGAGAAGACTATAAATAAAGTTATCGTATTTA
TTTTTTTTTAATAGGCTTAAGTCTAGATT------------AGTTGCGTCA-----TATAAAAATATGCCGCGA---------------------TTTTTGTTATTTTGTTTG---------------AAATTCGAATAT-------CAAAATCGTTATAGGAAAGAATGAAGACTATTAATAAAGTTATTGTATTTA
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CCAAACATTCGCAGGCACAGCGTCTACAGCAGC
CTAGACATGCACATTCACACCACATATATCAGC
>BCL7-like 9202903 9203823|11825 chrX 9203228 9203708 scaffold_1 900420 900876 + -1625|0 514
ATAGCTG-CTTAAGATACAAAACAGCCAGTCTGAATGTTGTAAACCGTGTAAAGTTTTTTGACTTTCGATTTCTAGACGTTTTGACAACAACTAGTTTATAACTTAGCGTACTAACATAAAGGCTACTTTTTTTTGTTCACTATAAAACTGGCTTGAAAACAATTGATGTACTCGTTCATAAGTTG---ATTTTCCTTGTAAATTTCGCTTG--TAAACGCTTTTCTACGCATTCAGTGAATGCAACAGACTTGAAATCGAAGCGTTTACAAGCTAAAGCTTATAGTTTGTTAACGAATTGATCAAAGCAAGTCAAACCGAAAACGAATATGAACCCGCGATAGATGCACAAAGAT--TAACCGAAATCGAAAATTGAACCAGTAAACC----------------TCTTTATAGTACACTTACCAACATAAATGTGACATTAACATTTAACTGCCAGCAGGGCGCGAAAAATATGCAA---ATGTTCGCT-------GAAGATTTACTTATTGTT
ATAGCTATCGTTGAATAAAAAACAATACAAGTTAAAGTTATAAATACTGCACA---TTTTGTATTTTAAATATAACATTTTTTAGGCCTAAGTTGTTT---------TGTAATTACAA---------------TTATACTCAGTAAAAATTAACTATAAACATGTTATATATT---GCGAAAATTACATATATATTTTTTAGTTTTATCATGGTTTAAAAATTGTGTAAAAAATCAAACAATAAAACACACATATTACTGAGGCACTT----TTTGGTGTTTATAAC-----AATGAA------GAAGAAAATCAAAT--AAAATGAATATTTCTTTAATATTGCTATTAAAATTTGCTATTTACAATTAAAAATAATTACAACAAACCAAAATAATGCGTATCTTAATTATATTATATGTAGGTATATTTGTGTATTTTAGAAATTT-----------TGGCACGCGGAATAAGTAATGTGTGTTTGCATCGTGTAAAAAAATAGGTTATTGTA
>BCL7-like 9202903 9203823|11826 chrX 9203709 9205034 scaffold_5 5273646 5274913 - 8375|0 114
TTTTTTTTACATTTTTTTATGATTTTTCTTTATTGAATGTTTTAGTTTTCTTCATCTTACAATTTTCCCCCCGTATGTATAATAATAAAAAAAAGTTTTATTCTTTCAACAAATA
TTTTTTTTACATTTTTCTTTTATTATTTTTTATT-------TTAGTTTTTTTTTTAGT----TTTTCTTTTTGTAT-------AATAAAAAAAAATTAATTTCATTCAACAAATA
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TTGGCGACCAAACTCGAGAAG
GAGCGTAACTCGCTTGGGATT
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ACCT---TTTTACACACACATACACAAAACTGTTTTTCGCACGCGCCTTGTTTTTTTCGCGGAGAAGAAGAAGCGGATGGCAAGAAATCCGAACGAGGCTGCTGCATATTCGTTATAAACAAATGAAAATACACACCTAATTCGCCAGAAAATCAGCAAAAATGTGTTTTAAATAAATCTCGAGAGCATTGGACCGCCTTTGTACGAAAAGAAAACCAATCAAGCCTGT
ATCTTACTTTTGCGCTTTCAGGTGT-------TGTTTTGCACTTGGCAATTTCTTGC-------------AAGAGGATGATATAAAAACC------------------------ATAAACATACAGAAAGA-----ATAACACAACACCAAAT---TAAAAATGTTTT---AATAAATTTC--AAGTATTGCAGTGCT----TAAAACAACAATTCAAAGAAAGT---T
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ATTGGCAAGCGCAAAAGCAAAAGCAAAAGCAAACGCAATCGCAATCGTAATTGTAATTGTAATTGTAATTGTAATTGTAATCGTTATCGGAAT-------CGTAATCGTAATCGGAATCAGCGTCGCAGTTGCTAACGAAGCAAACCTAATCAA--------------------TTCAATTCGAATTCAAACCAGGTTCGACTTCGAAAATTCTTAAGGCGAAA
>Hex-A 9433066 9433625|12125 chrX 9433372 9435056 scaffold_5 1843219 1845075 - 5137|0 351
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CTTAGTATTTAAATTAGGCAACA--------TCTTAGAAAAAAGTTGAGCTAAAAAAAAACAACAACAACAACAATTAATAACGGAATGTGTATGCTTCGGCAATTGTTACTTTTCTTTTCATTTCATTTCCTTTCGTTTTTTTTTCTATTCTTTTCACTTGTTCGTTTTATAATCTATCTCTTTCTATCAAGCTATCTCTTAATTAAATAAATTATTTG--------------TATGTCTAATTTATTTGGTTAAATTATCTATTCTCGATTTT-GTAAAAAAAAAAAAAAAACAACAATTGTTAATATATTTTACACACACACACA-CACACACACACACATACACTTAT
>CG3002 9449235 9449503|12136 chrX 9447296 9449522 scaffold_10 2583133 2585387 + 79618|1994 2307
AATACCCCGACATATAAGTATCACCCG-CTCCCGTCCACTGAA----------AGCGCAGGAGGAAAATGAAAAGAACGAAAGACAGTCAATTTTCCCGCATCTATG-----TTGTGCTCC--CCATTATCTTAAAGATACTTTTGGTTTTTCAATTTCTGTATTGTATGTGTATGTACGCTGATAAGATTTTTATTCAAATTGCATTT-----TGCATACA-------AACGATTTAGTCGTA-----ATATAATTATGTATCAAAGGTTTAT---------AAATTATGAAAAA-GTCGCTACAAAAGCCAA
AATCGTCGCGAATGTCAATTGAATTTGATTTTTATTCTTTGTATCATCTTGTTTTCTTTTGTGAAACAAAAGACGGGCCAGTCACTATTAATTTCTTTGTAGCACTGGATTATTGAGCTCCTTCCAAATTATTATTATTATTATTGTGTATT---TGTGTGTACTTATATTGAATGTATGCCTATAAGGATTTTTATTAAATTGCATTCCCTTATACATATATATTTCTAAATATATATATGCATATATATATATATATATATTAGCAGTATATTTTATAAAAAATGTATGAAAAATGTCGCTACAAAAG-CAA
>CG3003 9457674 9457826|12141 chrX 9457475 9457707 scaffold_5 4697253 4697480 + 10002|199 232
GTGATCTGATTGCAATAGAAACTACTAGATCACT
G-----TGTCTATCATAATAAATACCAGATGATT
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GA-------TGTCCCCGATCCTTCCCAAAA-------TTGTTACAGTTGAAAGTTGATGAAACAAATGCCATAATGTCCCAAAACCCAGAACGGCAACAAAGCAAGCGTAGAACGAAAATCTAG-------TGTGTGTTTTTTTTTCAGTGTTTATTGTTGATATAAAAATATAATG-----------------------------TGAAAATC--------AAAAAAAAATTTGAAT---TCACAAAATACCGTATAAGG----CATTATAT--------------------------------------AATATTATATAAATATATATATATATATATACATACACATATATTAACTATACATGTAGAGACTAGAACTTGAATTTTTTTCATTTTTTTTCCCCCAATCTAGTAGCTAAGGCATTTTTTTTTGCATGTCTGTAC--------ATACAAACATATATAGCG--------TTCTTTTTAAGCCATACCATATAGAATGAGAGAAACCATCTAGTTGTGTACCATAATAATTGTTAATTGTCTTTAAGATAAATTATATACAACAACAAAAAGTGAAAAATCCAAGGCGACAAAATCCCCACACTGAAATGAAATCCTAACAATAAAAAAAA
ACTTAGCATTAGTCCGGATTAGTACCTAAATAAATCCTTGTTGCTGTTGGATAATTATGAAAAAATT----------------------AAAATCGACAGGTTATTATTAGCTCTTGATTTTAATTATTTTTTTTTTTTTTTTTTACTGTGTGAAGTATTAAAATACAGCCATAATACTGCATATATATGCAGACTTAATACATATTGTATATCAATACCCTAAGAAAACATTCTAATCAATCCCGAAATGTAAGTTGATGTCCTCTTTATATATTTTTGACTCGTTAGTGACCTAATTGTTGTTGTTAAGAACATAATATACATATATAAATATCCAAAAAAAAAAAAAAAATTCAATAATACATGTAAGA---------TGATTATTTCGAAATTTTTTTTC--------ATAGGCTAAGCAATTTTTTTTTGCATGTATGTACATATTCATATATAAACGTATATTGTAAATTATTTTTTTTTTTTAACTTTCCT--------TAAGGCAA-------AGTAACGTAATAAAAAAATT-----TTGT-TTTAATCTGGAATTTATTCTTGTGCTACAAACCAAAAAT-CAAGTATACCAAATCCC-------------AATCCCTACACCAGAAGAAA
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TACCGTTTGGCCATGATCATCGCCATGTCCACCGTTTTGTACATTAACTTGATCTTGTACTCCCAGATGTTTCGCTTCGCCAGAGGCTAGCTCCTCATTATCACATCCCTCACTCTCATGTTCGAGGCCTGAAAATGCATTT
TATCGTATGGCCACCTAGACAATCATGTTGACTATCTCGTACAT----TTAATTTTATATTCACAACTGTTT-GCTTTTCCTGATGCCAGATGCCCGAT-TCACAT-----ACATATATGTCCCAAG--TAAAAATGCATTT
>CG32698 9694145 9694451|12423 chrX 9693944 9694720 scaffold_10 2858556 2859254 - 6202|210 520
AAGTCAGCGACGTGATGTCGTAACGTAACGTATCGTAAGCGTAAGCGTATGACGTAAGTAGCGAGCGGCATGCAACAGGAGCTTCCACTAAACATACATATAAACAAGGCGATGCCGAGGGAAAAGGACACGGACCGAAAGGATTAAGATGGAAGAGGAATGGGACAAGGAGTGGGATAGAGGATCACAAAGGAATCAGTGC-AGCAGCGGCCAA-AGAATGGCGATT-GGAATTACACACAT-CTATAAATATAAATAGGCAAAAGAATAATATGGATAGCGATTACGATTACGATAATTAGCATTAAAT
AAGTCA--------ATGCCATAACGTTCAGTTTA--------AAGCGTGAGACGTTAGTAACGTGTGGCTTGCAAAAGGAGCTTCCAATAAATATACATATATA-------------ATAAAAAAG---------CGGAAGAGTCAAAGAGGA--AAGGACAGGAAAAAAAGGGAGCGAGTAAAGCAAAATAAATTTAAAACTGGCAACGCATAACCAAATGGCAATTAAAAAATATACATATACTACATATATAGATATAC---------ATATGAAAAGACCCTATAA--AACATAATAAGAGTTAATG
>Ser7 9712177 9712291|12450 chrX 9712174 9712388 scaffold_4 3806142 3806338 - -895|3 118
GCGACTCTCGACTTTCGTTTCCGTTTTCGGCTATTTTTGGGCACCCATAACGCAAAGTCAAGCTCATTGTGACCTTCAATGACATTAAAAGCAATTTTTTTGAAATACATACA-AT
GGCATATACGTTCTTAATCT--------GGATCTGTCCTTCTGCCCGTTGCGCA----------TACTAGTATCT------AAGCTGAAAAGATATATATATATATATATATATAT
>CG9686 9725660 9725756|12456 chrX 9725208 9725735 scaffold_10 2903888 2904415 - 25681|455 530
TCCCCAAAGAGTCCTACCCCCTCCCGTTAACACTTAAGTTTTTTTATGAGTTTTTTTTTTTTATGTGTAAATAAAA
TGCAGCTGAGTTGATATGTAATCCTTTT-TTTTTTTTGTGTGTTTATTATTTCGTTTATCTGCTATGTAAATAAAA
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GGTCAGCCC---GCCCATTCG--------ATCCGAACCAAAAGCCCAGTTTATTGACAGCCCA----------------TTAATCTTATGATTACAGGGATTTTG---CAATCGCTTGAAGGTCCCCTCCGTCTCGTTGCATAAGTTTTCTTTGTT-----TTTTTTTTTTTTCTTTGTGATCTATATTAATAAAAAC
GGGCAGTCCCCAACCCGTTGGTGAGTTTTATTTGTA--AAATAGCAAGCTCCTTGTTGCTCCAAAAATGAACTATTCTTTTTTTTTTTTAGCTGGATAAATATTGTGCCGCCCATTTACAGGACTTACGTGTTTTTTGGCTTACTTTTTTTTTTTTTGGCATTCTTTTTTCATTTTTATATTTTTGCCCAACAAATAC
>CG9691 9730089 9730267|12460 chrX 9730252 9730571 scaffold_6 5105508 5105813 + -506|0 20
T-----AAAGTGATGTTGGAA
TTAAAGAAGTTAAAGTTAAAG
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ATAAGTA--ACTTTATTGACTACACCAGTCGCATATTAAACAAACGCCCAACAAGTTAAGAGATAAAAAAAAACAAATGTAATACAAAAGATTAATTAAAAATTAAATTCTATTTAG
ATAGGTATAATGATAGTTATTCCGGCATTTACGTACAGAGTATAGAACCTAACACTTAA-ACACAAAGCAAAA-AAATGTA---TAAGTGACTTATT----------TCCATTCTAG
>CG32694 9850960 9852106|12605 chrX 9850161 9852172 scaffold_10 3082225 3083953 - 25480|835 2029
GGTCAAGGGTCAGCACCGGCCACGCCCTC----GCCCGAATTAGTCAAGTC-ACCAACCTGTACAGAGTCAAATGCAGCAGATCATTCTCTCTAACTCGCTAGCCCCAAACGCCCCGAAAGTCTGTCTCTATCTCCCTCTGTCTCACCCCAGAAATAACCCCCTTTCCAATGCCCCACACACCCACTCACAACAACCCCACACACACACACACACACACAAACACGGCCACTCATTCACACGGAGAGAATTTTGTTCGATCAAAGAAATTTCCCGGCAATGTCAACATCTTTTTTTTAAATTCATAGCAAATTTTTTTATAACATAAACGAAATTAGTTAAAACAAACTAA---ACACAAAAAAAAAATTATAAAA--------CCATAAGCAAAATTGGCAGAAAAAAAAACACGAATCAAAG--AATTTTATTTATATGTATCAATAAAAGAAACAAAATCGAATCGAAAGTATGGAAACAACATTCATATGAATATGTTTAGA--AGAAGAAACGCCTGATACAATTATTCCTGCCCTAGTACTATATCTCTATTTTCCCTGACCCGTCTATCCATATCTTTAAAATTTTCAACGGCTTTTGTAAATATTTTGCT----ATTTGCAAATTTTCCCCCACCACTTTTCCTAAACCCAATTTCCCTAATTTGTAATTGACCTCTTCTCTCCTTTTTGTGTATATTTTGTGTTCTATTAAAAAAAATCATGACTGTGGTGTTTTATTTACTATTATTTTTAA----TTATTTTAAACGAAAACGAAACGAAGAAGATGAATGTGAAGATAATGATGATGATGATGATGATGAAGAAGAAAGCTAAGTGGATGCAGAAGACACGTCAAGTTTCTATTAGATGAAATGTAGCCGAGCTTAATGTTTTTTTTTATTTGCTGTTGTTGGTCAAAGAGCCCCAAAAACACCCATACACAAACACGCACATTCACTGAAGCATACTCAATATA--------TAAAACCGATTCGATATGCCTAT-TATATATATAGAACCGTTCTTGTTCGACTTCCCTGTGTCCCCTGGATTTGTTTGTAACTCCCCATAATCCTAAGCGAATTGTGTTTTTCTAACTATGATTTTTTTCTAGCTAGCTAAGTGAAACTTTCGAAAAATGTGTATAAAATAAA-----------ATAAAATGATTATAAA
TCTC---------CCTTGGCCACATCCTCACGTGCCCGTTTTAGTCAAGTCAACCCAATTGTACAGAGTC-AACGCAGCCAA-----------------------CTGCACGCCC-------------------------------------ACATAAGC------------ACGCGCACAAACACTTGATACTCTTCCACCCAT-TACATACACTCTATAATGTTGTGTTTTTTT-------------TTTTTTTTGATAATTGAA----------------AAAATCCACTTTTTAGCAAAATTTCTAATCTTTATA-AATATATACTCAACTAA-AAACTCTAACTAGCGCAGGTAGAAAAAAATTTACATCAGAAATTTGCAATACAAAAAAGCGAAAGAAACAAAAAAAACACTTGATATTTATTTTTTTTTTTTTTACGAATA--------AAAATCGA--TGAAAATACCCAGACA-----TATAAAAACACGATCAAATCAAAACAAACGACTAATGCAAAACTATTTTGCTTTATATTTTTCTCTTACTTTTACTGTGGCTTCT--------------------------CTTTTGTAAATATTTTGCTTAAACTCTACGAACATTT-----GCAATTTTCCAAA----AATGTCCCTA----------------------------CATACAAATGTTTTTGTTCACTTATAAAAATCATGACTGTGGTGTTTTATTTACTATTATTTTTAAAATCTTATATTATAT--AGTCGAAGTAAAAAA---AAATATACAAATTTTTATAAT----------------------------------------ACACAT------------------------GTCTTGCTTTATTTCATTCCTTATGACAACTTGTTGCTCAAAAAAGCGCCAATCCA-TCATACAAAAACATACACAAAATTAAAAGAAATCAAAATTTATTGACTATTGAAAACAGTTC---ATGTTTATCCATATACATACAATTATTTTTA--AAAACAAACTGTTTATAACGAATGCCTTTTTATTTACCCTTAAG-------AAAATGTGTTT------CTATGATTTT----TAACAACTTAAGTAAATTTTT----ACATGTATATATAATAAAAATGTTCACTTAAAAAACACATTAAAT
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GTAATTGCTATATTTATTACTTTTTTTTTAATTATTATTATTATTATTTACTTGGCTTGTTGAAGAAATTATTCTAAATGGGATTTAGTGAGATATGCATT---ATTGTAGCATTTAATGTTTA---CAATATATACTGATTAAATTAGATTTATTTAA---TAATTTGAAAGTGAGAAGTTTAACACATTCTTGCTACTACAAATTTAAGAATAATTGTTTATTTTTGAGAATCTTTACTCACTAAATCCTCACTTAAGACCCCTCAATAAAATC--TTTAACACATTGTTATTA----ACCGC
GTGA---ATATATTCATTTATTTGTATTAA-------------------ACATGGGTT----AGGAAATTTTT--------AATTCTGTAATTAATTCATCGTAACTAAAGCTTCTTAGATTTGAGTCAAC--------ATTAGATCACGTATATTTGGCTCTTGTCTGAAGATTAT--GTTCATCGAAATATCTGTACCAAAACTT--------GGCATTTATTT--------------------AATCCCCACCTA-------CAAACAAATTCTTTTTAATATCCAGCCACTATATCATCCA
>Yp1 9900535 9901037|12654 chrX 9900713 9901175 scaffold_32 90022 90509 - -2641|0 363
TAAAAATATCTATTTTGTTTATCTTAAATCATTTAGGAACTATAATAGTCTAATAGATCATCCCAAAAAAAAGGGA---------ACAAAA---TCAAAAGTAAATATCGTAGTTTGGTTTTGTAAACTTAGATTTATTTTATTGTTGTCGGTGTTTTTGTG-------GTGTTGAGGTCTAATCTTCTCCAC----TTATGGCTTGGGC---TCAGATTAGAAAATAATTT------GTTTACGGTA----ATTTGGGGGGAGTATTGCTCATGGGAGGCTGGCGTTATAACAATAAACCTCAACATGAAGCGATAACAATTAGAAATACAGCC---AAGAGTTTAGGATCAGGGCTTAGGCG
TTGCAATGCATCATTTG------TTAAATA--TTAGCAACAATAA-AATATAATAACTGGCAGCCAGAACAACTGAGCGTCAGTCACTAAACGCTCTGGTGCGCAAATAGCAGGCCCTGTATGTCAAATTAACTGCGGAAATGTGTTGTC-ATATATTTGGGACGCAGAGTCTAGAGGTCAAAACATGATCAAAAAGGTATCGTTTATGCAAATCGCTTTAGGGTATGACTTTGGATGTCTTAAGACAACATATTTGACAGGAGCTTTGACAAAAAAAATAGGGCTTTACAATTTTAATGTTGATCTTGGGGTCA----AACCGCAAATCTATCCTCTATGAAAATCGGATCAG---TTAAATG
>CG2972 9929947 9930271|12686 chrX 9928404 9930017 scaffold_10 213474 215113 - 70210|1576 1650
ATTACTCTGGGCAGTAAGGGGCTAGTTGTTCATTAGCTTTCCAATCGTAGACTTTAT-ATAAAT---TTATATAA
-------TACGGAATGTTATACTACATGTGTATATGC--CACAAACATATATGTTATAATAAATAAATAATAAAA
>CG2972 9929947 9930271|12687 chrX 9930018 9930168 scaffold_5 1620809 1620960 + 1336|0 156
TATATAAAATAAAACACAAGGGAGAACCTGAAACTTTGTAAAATGTAAACAGAGAAGCTTTTCAAGTA----GTTACAAGC--GTTATTTTTAAACGAAATAAATCTTTTTTTTTTGTATGTAAGGTATGGAGTTTTTCTTGGATTCTAATTCCAAT
TACATACATAGATATGTTTGGGGAAATTTTGAATATTATAATCTCTACACAG-----CTTTATGTGCATAGGATTAGGAATAGGATAATTACAAATAAGGAACAGCTTTTTTTTTTGTTTGCAGACTTTTACGTTTTTATTATATTTCTTATCAAAT
>CG2972 9929947 9930271|12688 chrX 9930169 9930305 scaffold_12 1306300 1306429 + 701|0 106
ATTTATT----TACAAAGTTAAAAGCTAGAAAATCTTTTTTTTTGTTATGAACTAGCATTAAGTTTCATTTTTTTAACGTAATTAAATCTGTTTTTAATTGAACATT
CTTAAATCGCATACAAATATTTGTGGCAAAATATTTGTTTTTTTTTT-----------TTTAGTTTA---TTTCTTATTCATTTAGCTCGTATTATAATTTA--GTT
>l(1)G0230 10059383 10059462|12876 chrX 10059308 10061344 scaffold_10 1048021 1050435 + 22016|75 193
A----------------------------------CGTAATCACCACACAACCGCCACCAATAAACCACAATCGATGCTTTGTGTCTGAAAT-----AAATAAAAAACATAACGATCAC
ATTGCAAAACTTGTAAACAACAAATATTTAACAACCGAAACCACAACAACAACAACAACAACAACAAACAGCTTACAA-TTGTGTTTAAAATAATTAAAACAAAACAAATTTGAATCCG
>CG2967 10074919 10075136|12890 chrX 10072009 10074939 scaffold_70 122846 125659 + 109429|3018 3038
CCGGCTATCGGAAGTATTATT
CCTTAAATCATA--TATTATT
>CG2909 10173822 10174170|13003 chrX 10174124 10174628 scaffold_74 175664 176140 + 9076|0 46
CAGTGTAAATACATGTGTATAAATGCAGAGCAGTTCCTTATGCCAAA
CATTGCAATTACTTTTTTAGTAATGTATATCATTTTTTCATTCTAAT
>CG17841 10227908 10228452|13065 chrX 10227759 10228266 scaffold_28 85494 86085 + 5480|157 612
TGCAAAT---------------TGTATTTATTTT----------GAGGCAGAGTTCCAGCCGC--ATCCGTTTT--------------------------GCGGAGATCTTGC-TATTGTTTATACATTTTTAATTATACAACAAGAACGACCCACTACTAACCGGAAAACTGAAAACCGGAAACAGAAAACCATGACGGACGGAGGAT--GAAAAAGGCAGCGGAAACGATGGCGACCTACAAATGAACCGAAGACCA--------------TGGACAGACCCTTAGTGTTAAA-------------------TAAAGACATTATTTACTAAAA---AAAAAACAAAAAAAAGAACGATAAAGATGAAAGTGAAGAACTAA-----GAACAAGAACAAAACTAAAACCAAATGCAGATAAAGCGAATAAACTATGTTGCTTATTTTTTGAAGCAA
TGCAAATTTGTTAAAGCTTATATATATATATCTTTCCATATATATATATATATATCTATCTGTTAATTTTTTTTTTTTCTTTATTTTTGTTGCATGCCCAGCGCAAGTCTTGCTTATTGTTTATACATTTTTAACAACCCAA----AACAACCAACTAAT----TTAACACTGTTAGCCCGCTTCGAGCTAGCTGGGCAGCTGAACAATCCAACAATGTTTGCACTTTCACGGGCTCCTAACAATTTAAACATAAACCAACATGCAGTCAGCCCGGCCAGACATTTATTTTTTAGTTATTTAATTGCTTACTTTTAAAGACA----TTACTAAAACCGAAAACAGAAAACAAAAAACAAAAATGAAAAATGAAAACAACTAAAAATTGAAAAAATGGAACACGACAAACAAAACCAAATAAA---AATATA-TATGTTGCTTA-CTTTTAAAGCAA
>flw 10252701 10253307|13093 chrX 10251936 10252751 scaffold_28 128584 129400 + 48254|773 828
TATATCCATCCGCTTCCATTTCCTTAAAGGTTCAAC-----AAACAACAGAAATAA
TATATCCATCCGCTTCCATTTCCTTAAAGGTTTAACCTCAAACTCAACAGCAACAA
>flw 10252701 10253307|13094 chrX 10252784 10253481 scaffold_28 129695 130510 + 4090|0 696
AAATATAACGAAACGATAGAAAAGGAGAGCGTTAGGCGATA-GTAGAGAAAGG--------GCAAATGATAAATTAAATGTGTGAGC----TATTAAAGCAAGCAAA---ATCG----AAGTGCATGA-------ATATCAACATCTATGTGAATCCGTCAT-----------TATCTGTTATCTG-----ATGTGTCAT------CTGTATCCAA-------------CTTGATTACCTTATCCGTGTACCTGCTAGTTGCAGCAGCAACATCAGGAGCA--------------------------ACAACACCAGCAGCAGCAGCAGCAGAAACATCAGTGAAACACTCAGAGGCCCATAGTTAAGTCGATTCCTGCATTTGAT------GATTATCTGTTGAATGGAAA---------TTGTGACAACGTCCCCGTAACAGCAGCTCCCAGATCCAAAACTCCCGAAACATG--------CAGATAAATAAATACATTAAA------------AGTACAGCGATGTTAAGCAATGAATTTATATATAGGCTTATTAATGTAAACTATATAC----TATATACTTATATATTC-ATAACTACAAAAGAGAAACG---------------------------------------------AAAACAAACCTAAACAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA
AAATACAAAAAAAAAAGAAGAAAATACAGCCCCACAAAATAAGCAAAGAATGTCGTTTGATACGAAAGATGGATAAAACGTGTTGACAGATTAATAAAATAAACAAACAGATCGTCTTATATACATGATATATATATATATATATATATATAAATATAATATATGTATATAAATATATTGTATATGTAACTGCATGTTATTAATAACTGTATACAAAACTTCTATATTATTTATTTACTTTA--CATGTACATACATGTTGCTAAATGCATATTGACAACACTACACTACCGACTACACTACACTATACTACACTAAAAACTACAATAATAACAACATCAATTACACAT--------ACACATTTAAGT----TCTTGCATTTGTTTTTAAAGATTACCGATTGGCCCGACAAAAAAGTGTTTATAAAGATCGCAACGAGCTAACCTCCCGCAAATTCCTAGATCCCAAAAGATAATTAATAACCGTTAACTAAACACGCGATATATAGAAAAATGAGTACAGCGAT-TAAAGCAATGAATTTATA--TAGACATATTATTGTAAACTCTATATACGATATTTACTTATATGTACTACAACAACAACCAAAATACATACAAATTGCAAATCTATAACTAGGCCACAATGTGCAGTGTTTCCAAGCAAAAACAAAACAAAACAAAACAACAAAAAAAA
>CG15304 10306375 10306523|13151 chrX 10306251 10306418 scaffold_34 162333 162489 + 757|129 172
AGGGATGCAACTGCTCCAACGCGGCTACAACTCATCCGCCACAA
CCGGATGTAGCTGCTCCCAAGCGCATACACACCATCTTCTACGA
>CG15304 10306375 10306523|13152 chrX 10306419 10306536 scaffold_43 809527 809635 - 598|0 105
TCGATGTCTTGGATCCGGGGCCATCGCTGGACTGCG-GATCAGTTTATTTTATGTGTAGTGCAAGACCTTGAAGGAATAAATAAGCTGAGAATGTAACACACTGTA
AAGGCGACTTG---CTGTCGCAATTGCT---CTCCGAGCTCAAACTGCGCGAGGCCTGAAAGAAAAC----AAGGAATAAAAACGTTTGGAAAGTGACAAACTGGA
>CG2889 10322370 10322420|13170 chrX 10320095 10324396 scaffold_28 1740004 1744099 - 89879|2407 2457
ACCTGACCCCTCACAATTGTGTTTAATCATTATACGTATAATTAAACTGTA
GCATGGACCTTAGCTATTATGTT--GTTATAATA-----------------
>CG2124 10443624 10444385|13333 chrX 10443334 10444224 scaffold_10 4413657 4414582 - 15146|316 986
CAGGAAATAAAAACGGCAATAGAATTGATATTAGTCAGTCATTAGCATTATCTGAACATTGTACAGGCACAACACTACGATCTATTAATTAT-CTAGAAAAAAAAGCAATAATTATCGAATATTTAATAATGAC---------------CGCCCGCGGCCGACAACTACTAGCACAGCG-----------------------------TCTTGCTCCCGGATC-------------------------CCCGCAATCGGACCGCAGCGGACCGTTCGTCGCGATCCATTGTATGGTTGATGCCGTCGTCAGAGGGTGGCGCTCAACGCTCGCTTGGTGTACTCGTAGACCACGAACAGGGTGGCCGTGGCTGGAATGGTGCGCAGGACAGATGGCAGCAGGCCGCGATAGAGTGCCAGGACACCTTCGCGACGGACTATGTCCGCTCCCACGGCGAACATGCTTTCGTTGAGGTTCTTCACCTGTATGCGACTCTTAATTACGTCTGCAGGAAACGTCGACGTCCAGAGGCAGACGCCTCCAATGGCGCCGGCGATCATCGTACGCAGTGGTCCAATATCATCTTTGGATTGATCATCCCTGCAAAGGAAAATAAGAATTATGCCAATGTAAATAACTATTTAACTTTGTCCAACATCTTTCATTTGAATA
-----------AATGACCGCAGCGACGAGTGCAGCTGGGCAGCA----CATATGGATATGG----AGCTCAGCAATATCAT--ACTAATGATATTAGTAATTATAGCGATAATAATAATAATAATAACAAAGGCAACAGAATCGGAAATCGTTTGCAATGGAGCACTGGCAGCAGCGTGAGCGTAAATTTTTTTTTTTTTGTTTTTTTTTTTTTTTTTGGTTTTTTTTTTTTTTTTTAATGATAACCGCCCGCGGTCACGCCCACGCCCAC-GCCAGTCTCAA--------ATGTCACAGGTCACAGTCACATCGCCCCATGGAGAGCCTTCTTGGTATACTCGTAGACAACGAACAGGGTGGCCGTGGCCGGAATGGTGCGTAGTACTGATGGCAATAGTCCGCGATATAGGGCCAATACGCCCTCTCGTCGAACAATTTCCGCACCGACACTGAACATGCCCTCATTGAGGTTCTTCACCTGAATGCGACTCTTTATGACATCTGCTGGGAATGTTGATGTCCACAGACAAACACCGCCAATGGCCCCGGCAACCATTGTCTTAAACGGCCCAATTTCATCCTTTGTCTGATCCTTACTGTCATTGA--------------TCAATTTATAT-ATTAATTAACGCATTCACGCATCCCACAAT---ATA
>CG32677 10554378 10554897|13474 chrX 10554061 10554953 scaffold_10 4538392 4539532 - 18501|331 1096
GCCTGCGGGAGAGTAATAAATGGCGATTATTGTTAACTATAAAAAAAACACAACCTTACAAGG--GTATTACGATATTTAGTATATATACCTATACATATAGAGAAAGAAAGTGGAAGAAAGAGTAAATATATGTATGTATATGCGTGTGTACCTATATATATAT---GCTAA-ACATATACTACACACAG----------------------------GTGTATCG----ATTTTTTTTGTGAGTAATACTAGACAAAGTTCGATCGGA---GGCAAGTTAAGATCAGC-------TACTACGACAAATA-------------------------------------------------AGAGGAAGCGATAACTAACACACACACAAAC-------------------------ACATAGCACGCCTTTTTGCAAAGCTTAGTAATAATAGTTAATAATGTG------------TGTGAGTTTG-GGCCATCGGCCAGG-----ACATACATATATAC-------------------------ATACATAAATATATATGAACAGA------------------------------------------------------ATGACCTTTTTGCGAAAACGTCCTTAGCTTAGTTGAACCGC-----GACATTAGTCAGAGAGTACA---GCAGCTATAGTAACAG------------------AACCCCCATATATGC-TTACCCATACTTATTGTAAAAAACC
GC------GATATCTATCAATA--GACGATAGGCAAT-----GAAGAGCGCGTGCGTAGTAGGCAGAATTCTAATGATATATATATATG-ATATATATATATATAAATATA-TGCATATATTAATGTGTATGAATATGCGTATCTGTATAGACTTAGTTTGATATAACGCTGATACTTATATAAAGCATAGAAAACGTTCTAATTTAGCTATCTATTGTGTGTGTTGTTTTTTTTTTTTTGTGACTACTATAGAATAAAGATATAACAGAACGGAAGAGTATAGAAGAGTATGTGGAAGCTATGACAAATAACAAGCGTAAAACTTTTGTTCCAAACTGCAACCAAAAGAAAAATATAACAAAGAAAACTATAAACAAAATGAAGAGAAACCAAAAGTAAAGAAAAGAAATGACAGAAATTGCACGCCTTTTTGCAAAGCTTAGAACTAATAGTTAATAATGTGAGGGGAGAGCGCTGCGACTCCGTTGCGATTGTTCGGGTAAAAACATATATATACACATATTATATATCTATACATACGCATATATATAAATATATATATATAGATATATATATTGATATATCTATATATATATATCTTTATATATCTAAATATACACGATGACCTTTTTGCGAAAACGTCCTTAGCTTAGTTGAACAGCGTACAGACA-CAATTAGTGAATATAAAGATAGTTACGATTACAATGCCTTTGCCAACTACGCACTCCCCAACTACGCACTTCCTTTCCTCCTCTTCAAATACC
>ras 10593422 10594025|13530 chrX 10593259 10593539 scaffold_28 538169 538458 - 11710|163 301
CATACGACGATGGCTGCGACGGAAACGGGCAGTGG--------------AGGAGTGCCTGCCCCTGTCCA-------GCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAACACCATCAGCAGCAACAGCATCGCCACCGATCTGCAGCAG
CATACAAACAATGCTGCGGCGTCGTCCGCTGGTGGCAGCCACTATCAACAGCAACACCAGCTGCAGCACACAACAACGCAGCATCAACATCAGCAGCACCAGCACCAGCAGCAGCAGCAGCGGCAGCAA-CAGCAACAG
>CG1826 10616291 10616921|13553 chrX 10613888 10616677 scaffold_46 245233 247916 - 97065|2468 2866
GCTGATCGCCGCTGCGGCCGATAATGTTTTGTACTTGAAATACTCCTGTG-GTCTGTTAGCTGTTAGTCTCCGCGCTTAGTTATATTTTGCAGACCGTGCTGCTCTTGTTATCTAGTCCTTCCCAGTGC-CCCAATGCTTGGTGGTTCCAAAACCTGTGCATTGCATATTGGTTTTGCGTTATTACCTTCGTTATATACTATATGTATATACATATATATATATATAGATATATGTTTTTATAATTTTATTGTGATCCAAAAATAATTCCTTATGTTTGCAAGGCAGCAGAGTTATTTATATAAGCAATATAACTGAATTCTATGCACACAC-------ACACCCACCCACACACACACCACACACACACAC---CACACACACACACACATGTTTAAC
GCAG-CCGCCGC--CGGCTGATGG----------CTGAA-------TGTGTGTGTGTGAGAGATTTGTACTCACCCTC-----CAACTTGC--CCCCCGCCCCCTACGCAATTTAGACATTTTGAACGCGGTCTATGTTTTATTTTT-------ATATATGTCGCA------ACTCGAAATACTCCTGTGGTCAAATGCGCTGT-TATTTACTTAAATTTGTACAAGCGAACA---CTGTACAATTGT-------------------------TTTTTACA------CACACATATGCCCAGCAGCGATACAATTTAATTCTAAGTATTAACTTTAATTACACTAAATTATACTACAAGTATGTACATACACACACACACACACATACACATGTCCAGC
>CG15209 10687908 10688221|13635 chrX 10688043 10688256 scaffold_9 699819 700001 - -660|0 178
GATGACCCATGCAGATATACATACTATGGCAACTATATGATATTCTCCGACCTGACTTTCTTTAGAACATTATAAGGAGCATTGTAATTCCAGCAGCAATTCTTTCAAATAATAGTTTGCCTCATTTTTAGACTCGTATAGAAATGCAAATAAACTAAACCGTATTATTGTACAGCAAA
GCTTACCAAT-CACAGATTCAT-------TAAGCAAATGCTCT-------CTTAGCGATGCTTAAAGCTTTACGCTTAGCTTT----TTCCACAACCACAAATTGCGAGC--TTTTAAGTCGCGCTTCTAATACCGTGTAAAAATGCAATCTAATAAA-------TAGGGTATATTAAA
>CG2202 10696991 10697356|13641 chrX 10692698 10697027 scaffold_10 3153405 3157662 + 98910|4579 4627
CTATCGATGC----TGAAGTGCG--------TGATTCTGCTACTGCTCC
CCGAAGTTTCCCTATGAAATTCGCAAGCCGATTATTCAGTTGCTATTCC
>CG2202 10696991 10697356|13642 chrX 10697347 10697503 scaffold_9 2548243 2548397 + 289|0 9
CCTCAAACAA
CTTCCGACTT
>CG2186 10708002 10708798|13656 chrX 10706957 10708167 scaffold_26 1338563 1339769 - 32863|1113 1280
TAAGAATATTTAGTTTAAGAATATATAGTTTTCTATAACTATTATCGATTATAGATGTACGACGATGATGGGGAGTAGTGCAGTAAGCAGTACTTTAGCTTTAAG--GTAAAAAGTTATAAATAGTTGAGCTTTCTTTATAAATAGCGGATTATACATATATCTAGAT
GCCGCAGCCGCAGCAACAGTAGCAGCAGCAGTCTAC--------TTGGCGGCAGGCG-ACGACGCCGCGAGGAACTAATCCGTAAAGCG--CCCTAAGCGCCAATCCGTATTAAG-CATATATAGATAGACGACATATATATAAAAGATGTTATGTGTATGTTAAGAT
>CG2186 10708002 10708798|13657 chrX 10708168 10708777 scaffold_0 2480119 2480718 - -1858|0 656
GT-------CATGTAATTGGTGGGTGTGCGTGAGGGTCTCTACCCCGTGCTCCATGCGGTATGCAAATTCATTTAGCTTTAAGTGTACAAATCTTATCAATGACTAAAACGTGCTTCGTTTTCTTAATCGCTATTTGTATTTAAACGTAG-GATAAAGTGGAATGCTTAAAGCTTGACCTGGACAACAAAACAATTACCGTATATAACTTTAGCAACACAAACTAGGACCCAAATGTGCATACTATGTGCATGCTCATAGCCCTTAGCCTATGTAATCAAGTGAAAAATATTTACACCTCTACATACATTTATATATATATACATAAAGTGTATATATTTATTTATAAATACTTCAATTTAGTTTT-------------------AAGCACAAAAGC---TGAGCGTCTATTTTT---TATGATGACAATTCTACAAAGATTTTATTGAAAGAAAGAGAAGTTAAGAAGTGCAAATGCTTCTTAGGAATTTACTTTAAATTTACCTTTA---GTTATTTGAAT-------TATTTTATAC-ATTGTGCCCCGTTGATTGTAAATGAAATTTATTGTCTGTCCTGTTGTGTTCTTTGTAACTACTATAAA---CCACATACGAAACTATGTTAGCTTGTGAACTAGTTTAACTAATAA
GCATGTACGCATGTAA---GTATGTATGCATGTGTATCGAAAACAATTACTAAATGC-ATATACATATTAGAGTAGCCATTAAATAACAAATATAAAAAGAACCGTCTAGTCACAAGGTCTTCAGACTAGTTATTGATTTATAATAATAATGATAATAATAAATATT--------------------ATAATACTTA-TATGCATACCTATTGAAGCATA-----------AAGCGCGCACAC-ACACACACACACACAGCCCATA-CCAGAAAAATCAAA--------ATTTAATTCTCCA---ACTTGCGCAGCTAAAAAAAAAAAAAATTACCAACAATTTAAGCATAACTGAAATTAGTTATTTATATTTGCACAAGTAAAAAACAAAAAAACAATTAACAATATATATCTAAATAT-ATAAAAGAAATGAAAATGTGTTTTTGCTAGTATGTAAATT----AAGTGCGTGTGATTGTACGTAATT--CTTAAGTCTAAACTATATACAATATTTAAATACACATATATATTATATAAATGTATATATGTGTGTGTTGATGCAA-ATATTGCATATATTGTTATATACTTATATACAAATATATATGTCTATGTATGTATGTGCATAATTTTATTAGCTATTTTAATTGATAA
>CG2157 10715760 10715895|13667 chrX 10714951 10716072 scaffold_26 1351183 1352343 - 36413|918 1092
--------ACACCGCACGGTCCAACGTTCAAGATCTAAGCTAGTGGAATTTATTTTTTTT-------------------------------CATCGATATATTTTTTTCTAACTTTATTTTTATTAAAAGATGCTACAAAAAAATACATTATCATAATCGTCATTTAACTAGAAA
GATGCGGCGCATAGCATGGAAC-ACATTTAAGTT------TAGTGCAATTTATTATTTTTTTTTTTTTTTTGTCTCCCATTCTATCATAAACATAAATATATTTTTTTCTAACTTAATAT---TTGAAATATGTTAAACAAA-----------ATAAGCG------AAGCAGAAA
>CG15208 10746845 10746956|13697 chrX 10746828 10747164 scaffold_7 3331812 3332172 + 2259|17 142
TTTTCAAAATTAATTTTTGTAACGTGATCTTAAAACCCTAATGATTATTGATTA--------ATGCTCCACAATATATCCA------TTATATGAAATATATATTTAAAATATATCCAAATAAACA
TTTTT----TTTATTTTCAAAAGATGA-CTTAACATCCGCATGATC--TAATCACAAGAAACATCTATCTCTAAAAATCAAATTTAGTCAAAGAGAACATATATTGGCATTAAGTCGATATATACC
>v 10770741 10770856|13731 chrX 10770129 10770835 scaffold_31 121606 122289 + 28842|633 727
CAATCGGCAGGGTATCCAATTGGTCAATGTTTGGCTATGCGTTGTTTGTTCTGCCTACTGTTTTGTCGTTTTGGTGTAATAAAATTACTTGTTTA
TCATC-TCACGAT---CAATT-ACAAATTTTCAACTA------GTTTATCTTGT---TTTTTTTTTTTTTTTGTTGTATCTCATTTTATTTTTTA
>v 10770741 10770856|13732 chrX 10770836 10771018 scaffold_6 5498918 5499102 - -765|0 20
GTCTTTGTTATCACATTTGAT
CCATGTAAAAACTTAATTGAT
>CG2145 10774844 10774930|13736 chrX 10772677 10774897 scaffold_31 126127 128356 + 74064|2345 2399
GGCAGCGATTAACGTTTGTGCCTCTCGTAG-TCATCGTAGAATTTTTTTTCTGTC
GCC----------------GCATGCCACAGCTCACCACAACGTTTTTTTTTTGCC
>Myo10A 10808686 10809264|13779 chrX 10808509 10808999 scaffold_25 1102445 1102851 - 16190|178 494
GGCAACCAGGATTGCTTAGCTACTCGCTCTTGCAATACCCATTATTATTATTATAATTATTATTATTATTATTCGTATCGATATTGTATTGAGTCATTCTCTCTCTCTCCCATACTTCTACATATTTTTTTGTCGATTCGTAAGTCTCCCATACCAGTTACTACATATATTTATTAACGCCCATATGCAAGAGTCCATATGTATGTTTA-GATGTCTATGATGTGCTGGTTTCCATATTCCAATTTTCGATACCC--AATCCAATCGTACTACCCCCAACTCGGTGGCGCTAAGATGGCCATATAGATCCCCATTCA
TGCAACGAATATTACGCAT---------------ATGTTTATTATTATTATTATAACTATTATTATTATTATTA----TGATATT----------------------CCCCACACTTTT---TTTTTTTGTGTCGAGTTTTAAGTC-----------------CTTATATTTACAATTG------TGCCTAAGCCCATACGGGGGCGCAGGATCTTTCCTAATACCCAGCCTCCTTCTCCCACACTTTGTCGGCCATATTCCAATTATTCCCCCTCT---------------------CCATACAGATGCCCATACG
>Myo10A 10808686 10809264|13780 chrX 10809022 10809243 scaffold_25 1102874 1103088 - 3040|0 235
TTTGTCTTAAGTTTAAGCGAACCAAGTGCAATCCGAGTGCAGGAATTGAACTCCCACAGGCTCTGAGTCCAATCCTCTGGTCCCCTATTCATATTTCGATTCAACGATTTCTTGTAGCACTTAA--GATTAGCAAACTTTAATAATATCATTTTTTTTTTTTGAC-ATTTGTTAAATCGAA--------AATTGCTTA---GCTTAATCCCTAAAATTATCATAAATAAATACAAT
TGTGTCCTAATTTTAAGC-AACAATGTGCAATCGCAATCCGAGTATTTGGCCC---CAGCCTT---GTTCATTCC-----------ATTCCTGCTCTGAATTATATTCCCTCTGCTAATCTTAAGCGAATCTTAAATATATATAAACTATTTTTTTTTTTCTGACAATATGTTAAACGAAATTCGTTGCAGTTGTTTGTGTGTTTAGTCT---AAATTACCGTAAATAAATACAAT
>Myo10A 10808686 10809264|13781 chrX 10809244 10811075 scaffold_25 1103670 1105185 - 31908|0 20
TTATATATGTATATCTATCGC
TCAATTCTGATTTCTGATCAA
>CG11160 10893845 10894353|13895 chrX 10892308 10894061 scaffold_25 1216865 1218482 - 49548|1554 1786
GCATACTTCTAATATACATACATATATTTAAAAATATCTTCACATACATATCTAAATG-----CTTTAA----------CTAATTTGAAGAATCATTTTAGCCCAATTCGGTCGATCGATCAGTAACAAAATGGAAAAAAAAATATGGCTACCTCTAATGCGAGTGCGACAGTTTTAATATTTTGCATTATAATTCTGAATTATTCTTTCCT-TTCATTTTATTATTTATTCA
AAAAATATCTAAAAATTATGTGATCA--TAAAGAAGTCTGGA---ATATAGCTGGAAGATACTCTCTAATGATCATATTCCAAATTTCAAAACCATCTTTCATTGGTTCTCTGAGTTCCTTAATAACCATGTGATCATAAAGAAAT---TTCGTATATAGCTGG-GAAATACTCCTATCTAATTGTATACCACATTTG-ATTATTCTGTTTTAAACATTCTCTGAGTTATCCA
>CG11160 10893845 10894353|13896 chrX 10894153 10894625 scaffold_25 1219013 1219483 - 21366|0 200
CCTGCAGATATCGGGATGTCCTGCGACCGAATCACTACCTCCTGCTCTCGGCCAAATATTCCTTGTGCCAGATTTACGGTCGAACTGAAGGATACTTACTGCCACAGATGTCCCCAGAGGACATTGCCCGCAAGGAGAGCTACTGCCGCGAGTTTCTGGAAATCGTAGATGTACTCGATCCGGGTCTGACCCGTCTGCGAG
CATGTAGGTACCGCGAGGTGCTGCGTCCGAATCATTATCTGCTGCTGTCGGCCAAGTACTCGCTGTGCCAGACCTATGGCCGGATCGAGGGCTATCTGCTGCCGGAGTTGTCGCCGCAGGATATTGCGCGCAAGGAGCGCTATTGTCGCGAATTTCTGGCCGTCATCGATCTACTGGAGCCGGGTCTGACCCGTCTGCGCG
>CG11160 10894409 10894763|13896 chrX 10894153 10894625 scaffold_25 1219013 1219483 - 21366|261 477
GACTCATCATGTACGAGCTGCATGCCCCCGTAATGGTTTTGGCTCAGTCGGCATTCCAGAGCGGACAGATCTCACGACAGGAGTTCCAGCGGCGACTCAAAGAGGTCGTCAAGCTGCTCCAAGTCAGCAGGGATATCCTGCTAATGGAACCCGAAGGATCTACGGAAAATGCAATGGGACAGGCTGCAGCCGATGCGCTAAGCAAAATGGGTTGCTA
GTGTCATCATGTACGAGCTGCATGCTCCGATTATGGTGCTCGCCCAGCTGGGCATGCAGACGGGCCAGATGTCGCGCCAGGAGTTCCAGAAGCGCATCAACGAGGTCGTCAAGCTGCTCACGGAGAGCGCACACATTCTACAGCTGGAACCAGCCGGTTCCAGCGAGCACGAAATGGGTCGAGCTGCCGCCGATGCGCTCATCAAAATGGGCTGCTA
>CG15203 10913145 10913299|13924 chrX 10912984 10913310 scaffold_25 1253610 1253912 - 8295|161 326
TGGGATTAGCTGGGATTATGCAGGATTAGCCACCGGGAGAAGA-GGACCACCGAAGCCAAGGATGCAATGAATCT-TTCTTAGTTGCAACGTACATATAAT-CAACAATTTGCTAATTTAT--------TTGTCATCTTGTACTTCTCAATAAGCACCATGTTTTG
AAAGG-----------------------------GGGCGGCGATGTACCGCTGTCCCCGATGGAGCACGGGATCGACTGGCAGCTGACCAGCGCCTAAAACGCAAAGCTATGCTAATTTATTTTGTACATTTCCATTTTGTATGTCGAATCAAGCAAC------TG
>CG2081 10935206 10935328|13947 chrX 10934316 10935472 scaffold_25 1289549 1290873 - 13700|1006 1206
-----------------------------------------------------GAAGTGAACTGGTACTCTGTTC-------CTAGGAC-TACTTAGTCTTTAGTGCAGATCTAATG------------TGTACAAATACAAATGGA-GTTTATTGCGGAATACTTGAATATGTTAAATAAATTTAAATT----TCACATT
GCGCAGCCGTTACATCCCGTTATATTGGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCAGCGCATTTTAAGTGTGATTGTATCAATTAGGCCATAATTAGTCGTTAAT-CAGCTGTAACGCAATGTATTCTTTGTGTCCTTAATATTGTATGTGTGATGCGCATTATTAAATTGCACTTAACAAAATTAAATTAAACGCACTTT
>CG2076 10937221 10937312|13950 chrX 10936923 10937792 scaffold_25 1293231 1294162 - 6546|309 402
GCACTGGAGACGAACATGTGATGCGAGGATTATACCCTCTAAAATATACATACATATTTATACTGTTATTAAAATAAACCGATCGAG--TTAGG
----TACCAAAACAGTTGTGATGC----AGTAAAACTAATAACTTATGA---------TATACAAACATTAAAATAAAGCTATATAGGCTTAAA
>CG2061 10939523 10939882|13951 chrX 10937885 10940061 scaffold_25 1294251 1296538 - 96141|1714 2229
AC------------CCGTAG-----GCGGCGACCCA--------------------------CTCCACCTATTCAGC-------------CCGACCAATGC-----TCAACACAACATACTT-------TCGAATCAGGGAGAGTTATCATCATTTCTAGTC--ACTTGTTT---------GCCGAT-TTTTCTCTCATTGTTGCCTTTG-CGTTCACCC---AGCGA---ACTGGGACGTTGGAGTGAAAGATGGAGAAGGATGCTAG-------------------------------------GTGCTGCATAGATCCCAGGTC-----------------------------CCGATGGAGCCCGTA--TCCGATCTCTGAGCGCACCGCTTGCTGGAATGTTCTCAGTCATTCTCATATCAAAATTCTCTGTGCTTTACGCTAAGCAATTAACTTAATACATTGATACTTATACACAGACATATTACATATACATT-ATATTTATATACAA
ACACACCACACACACCGCAGACACTACGGCAGCCCAGTATCCGAAACCGATTCACAAAATCTTTACACCCGTTCAGCAAATGTATTCTCACCGACTTTTGCGAATTTCGACAC-ACACACATAAACACAACAAATCAGG--GAGTTGATTTTTTTTCTAGTCAAATTTGTGTTACGTCCCCGCCGTTAATTTGTTTTGTTATTCTCGTTGCCGTTCGGACGCGAACGAATCACTGACGGTTAGGATCATAAGATCTCAGTGCATGGTAAAACCTTACCCCCCCTCCCCCCACCCACACACACACACACACCGCCCCCATCCCCGCTCTTGGGCCCATTTGAAAGAGGGGCAGCTAATCAATTGAGTGCGTGGCGCCAATCACCGAACGCA----------GAATGTTATTAATCATTCTCATATCAAAATTCTCTGTGCTTTAAGCTAAGCAATTA----AATAAAATAATAATAATACGCA-------TACATAAATATTCAGATATATATACAA
>Hsp60 10957044 10957526|13962 chrX 10955153 10957540 scaffold_25 1302984 1305362 - 136495|1896 2484
GCGACTGCCACTGACTGGTCGACAGCCGGAGAGGGGGAGGGAGATGTGATGAGAACCGAAACCAGCATAC----------TGTTTAAG-TCACGATGTGGAACGATGACGTCGCGTGGTCGGCGGCGAAAGCAGCTCATCAGTTATCAGTCATCAGCAGTCGGAGCGAGACCCACCAATA-TCTCTTACATCGGTGCATCCAG-----CCGGAGACACATCACCCACCATTTG---------------------------------------ACACGCATTCTAATCCTTGATG---------GAACTTT--GTTTTGCTTCGCATTTAT---CCTTTGGCAAGAGCAGCGCAACATCAGCACACAAATCCAACACAACCGGCTGGGTGTGAGCTCGTCGAGACTGCAGCGTTCGCTCCGCCACACGCCGTCGCCTC--CATTGTGCTCCACGTTTTTTT-----------------------AACTATTCCTTAACTCTATTTTTTTTTACATGTTATATATGTAA-------AGATACCGCTAGTTGTAAAAT-ATATTAAATAAATCCG---AAGTTAAATTGAGG
ACG-CAGCCAC--ACACACACACACCCAAACA-------------------CACACCAACACACACACACACCATTCATATGTTTAGGCCCACGATGCATAAAGGCCAGGCAATGGGAT--GCGGCG----------------------------GCAATCCGCGCAGG---CACCCACATTCTCTTACTTGGGTGCAGTCAGCTACCCCCGCGCCACGCCTCCCACAGCTTACACACACACACGACCGCCCGCCCGCTCGCACACACACACACACACACACATGTATTCGATGGTTCCGCGTGAACATCGAGTTTTGTTTCGCATTTATCTCCTTTTTGAACAAGTTG-----------------------------TCGGCTGGGATTG--------------GCCGCATTC------CCAGGCGCTGGCGTTTCTGCATTGTGTTTGACGTTTCTTCTTTTACTTTTTTTTTTTTTAAAAAACTATTCCTAAATACTA---TTTTTTACATGTTATATATGTAAATGCAAGAAATACCGTTAGTTGTAAAATAACAATAAAAAAACATAAACAAATTATATGAAAG
>Rpt3 10971905 10972025|13975 chrX 10970372 10971986 scaffold_25 119763 121440 - 89574|1629 1710
ATTATATTAATTCATACACACTACTCCCGCCCCATTTTTTCCCCCAACACACTAAACTCTTCTTTGTACGCATAAAGTTATA
ACGGAATAGCTTTA-ACATTTTCATTTCGCCC------TTCTCTAAACCTAC--AACTTAAATATATATACATATATCTATA
>CG18292 10984121 10984911|13994 chrX 10983886 10984180 scaffold_25 864549 864830 - 986|243 302
GAGGAGGAGTCGCTGGCGCCGCAGCTGGCGACCCCGGAGTGAAATGGACCAGGAGGCGAG
CGCGATGAGAACCTAAAGGCCGAGCTG----CGTCGCATGGAGCTGGAGAAGGAGGCGCG
>CG18292 10984121 10984911|13995 chrX 10984336 10984983 scaffold_24 653943 654671 - 5761|0 683
GCCGCCGGACCATAGTTAAAGAATGTTTAGACTAGCTCAGGTTACAATCGGTTAAATCGACAATGC---------------------------------TACAAGTATAGCTGCAGCCCAAG-------------TTATTGGACT------TGTGTATCTCTACCGTATACCCATTAATTTGTATCCGTTAATGCA-AGACCCAGTTGCTCCTGTGTCTGCGTTAGTGAATGCAATCAATTACGAGTATCTAATG---GCAACCGCCGTCGAGGATTTGCAGATACAAATGCAGATGCAGATACGGATGTATCTGGACAGGATTTGTGCGAGTTTGTCAC--------TGCCGGATAAAGCTGCTCCTCGTTATTTTAGAGAACTATACAA-------ATGCAG------ATATGTAGATGTAGTTAAGCAGAGATATATGTATACATATAT----------------------ACTTGTTATGCAAGCGAACAGTG----TGCATGTCCAAGTGAATGGTGAATTAGTGGCAATTGACACGAGAATATTTATATATGTATACACAT-----TATTTACTATATGTATGAGAGCAAATACGACTAAGTTCAAGCATGTATACCAAACCGAAACCGAAATCGAAATCGAAATAAATGCGCTATTTTGGTTTTTGTAAACGCAGAA
GCCGCCGGACCATAGTTAAAAAATGTTTAGACTAGCTCAGGTTAT-ACAAGTTATATATAATATGCATATATATTATATATAATGCATACGAGTATGTATACAAATATGAAGCGAGCCAGAGACAGCTTCAGATTTTATAGAAGTAAACAATATATATATATA-TATATATATATACAAACATATATGTGTATGTATATACATAAGTGCTTATGGATAAGTCTAGGCTAAGTTG--CACCTGCGTATTTTTTGTGTGTGTTCCAAACGTTGATGTTGTACAGCTTTAAGTA-------GGACACGGCT---TCCAAACACTCACTGTGCATGCTATATACACTCTATATGTCAGGGCAAATTGAGC--AGTTATTTTAGATAACTATACAATACATATATACAGACCTATATATGTATATATATATATATATATATATATGTATATATATATATATATATATATATGTATATGCATTTGTTATAAACGAGGTTAGTTAAGCCAAATAATTAAGCGACCTTCCTTTTAATCTAACTTCCTACAGATATATATACATATATATATATATATATCTATATAC-ATATATATGCGAGC--ATATGGCTAAGTTCAAGCGTGTATACCGAAC------------CGAAATTGGAATAAAGACA-TATTTTGGTTTTTATAAAGCAATTA
>CG15201 10989914 10990030|14003 chrX 10989312 10989915 scaffold_24 662603 663132 - 14215|608 609
AT
AT
>CG15201 10989914 10990030|14004 chrX 10990002 10990429 scaffold_32 346765 347174 + 421|0 28
TCAATTACAGGGTATGCGATAACTATAAT
TCCATTTCACAATAT----TGTCGAAAAT
>CG1908 10997599 10997810|14012 chrX 10997775 10997889 scaffold_24 667751 667855 - 1997|0 35
TACTAATTAAAACGAATGGATATTCTATTTGCAAAC
TACAACTTTAGGTGCGTGGGTATTGTG---------
>Dlic2 11008004 11008430|14021 chrX 11006267 11008126 scaffold_10 3929164 3931053 + 97105|1781 1938
GC-----CGTAGTCAACCAGGAGCAGCAACA----------CACACACCACAGCAGAACAGCAACAAGAGAACCACAACAACATGAGAACGT---------------TATTTAAGCATCAAGTGAAGGGTAGAGA-----CTCGTAGAGACTCGTTGA
ATGCGTACATAGAACAACAACAACAACAACAACAACAACAGCATCAACAATAGCA-AACAGCAACAACAG---CGCAGCAGCAGCAGCACACACACACACACACACATACACTAATATAAATCGAAAGAAAGAAAAACCTCATGCACAGACTCGTTAA
>Dlic2 11008004 11008430|14022 chrX 11008371 11008484 scaffold_5 1277104 1277235 - 1539|0 69
AGCCTTCTGCTT-------TATACTCAAACAC---TTTCGATAAGAAATTTAACAAAAAAAAAAAACCAA
AACGTACTGCTTCAAGTAGTACACGCTAATACAAATTTTTAGTCAAAATTTTATGAAAATCACTTTTTAG
>CG1657 11178747 11179292|14230 chrX 11178399 11179280 scaffold_10 4130996 4131848 + 19300|348 953
--CGATATTTGTTAAGG------GCTTAGGCGGATGTATCTGT----AGATTTCTTTATCGCTTTGTTGT------AGGCATTACACCAATCTCCCAT---------------------------------------------------CCCACTCTCTCCTCCAGTCGATATTTTCCATATTTATATATGTATATGTATGTCTGTGTCTG---ATATTTGTGTAAAAATTTGTTAAAACCATAGTCTAAGTGCAAAAACTGCGGCAGATGTGCGAAGCGATCCAAGTCAAATCGAAGTGGAAACGGAACACCAATCAGTGGGAGATGCCGATGCTGAAGCTGAAGTGGAGATATCTAGGTTAAGCTTAACATTGAACGCTAGAAGGCCTCGCCTTACGGATATCCACGATATATATATATATATATATATATATATATAAAGTGAACTAGAGAGCATATTCTTCTATTTATATATACACGTACCATACATACATACCTAGATATATGCATGTTTATCGGATCGGTCTAGCCACTGTCATAAGTATGTTTCGGAAACGAACTGCAACTTAATATTCCTTATTGTGTAACACAAAATTAAAAGCCAA
ATCAGTCTTCGCCGAGGTCGTTAGATCAAGTTGTTATATATATTCAGATATTTGTTTAGTATGATATAGTTAAGTATGGCATCGTATCGAGTTCCGGTTTATGTGTTTCTATTTTCTTTTCTTGGTGTCCAGGCAGCGATTGATATATATCTACTTTCTATACAAATAGATGATATACATATACATATATATATATTTATACATATATATATATATATATATGTATATATTCGT----------------GTGCGACAGTTAC-ATATATGT--------------ATAAAATTGTTATGAATATTGA-----AATCAAAGGCAGCTATAAAAAGATAAGCTACA--GGCGGCAGCT-------GCTCAGCAATTTCAACTA-----------TTTTTCGATGGCCGCATTATATATTTGTATACCCGTACATACTTAGTAGGTACATGATGTAGC----CATTGTACACACATGCATACATAA---ATACATATACTTAGCTACATACATATT------------------------ATAAGCATGCAAGTAACATGAAAATCAACTTAATATTCCTTATTGTGTAACACAAAATAAAAACTTAA
>CG1738 11194939 11195066|14254 chrX 11194383 11195643 scaffold_19 1694893 1696059 - 27036|572 699
TTGTTTATATAGCTCTTAGTTAAATACTAAAACTAGCTTAGTCAAAGGATGGCACTGTTTAAAAATCAATTTATCTATTCTAGCCCTAACGTCAGGCTTAAATTATATAATATATAACTATACCAGCA
----TTAAACTAGCCTAAACTAAATCGTATTTGCATTTCAATGGGTTGGTGG-------------GTAATTGTTTAATGCTA----------------TAAACAACATAATACAC-ACGAATCTAGTT
>CG11752 11195644 11195712|14255 chrX 11195646 11195684 scaffold_19 1696399 1696444 - 593|0 46
GTAGCCCAATTGTTGATGTTAAAT--------AAAATAAATGCCATT
GTAGAATAA-TGTTAACGTGCGATCAGCCCTAAAAAGAAATGTAATT
>CG1737 11199754 11200516|14259 chrX 11199008 11200063 scaffold_19 1700208 1701280 - 31841|770 1108
GCGTGGA-GGCCTGGTCCATGGTGGCCACAGG----AAGAGCACGTA----TCACA-----TTGTAAAAAATAATTCACACACAGCACTCCCCTCCCCATCCCCATCC---CCCTCCCCCATACACATACACAAACAAACAAAGCGGACACTCGATAATTCGTTTTATGC---TGTAGTTGTAATAAAACAGATACAAGTTTTTTTTTGTAAAACCA-TTAACTTAGTTGTAATAGCTAGTGTAGCGTAA-ATTTATATATATTTATATGTATATATATATATGTATGTATAT-------AAATATATATTAATATATATACACGTATATATAATTATA
GCTTGGCTGGCTGGGTATGTAGGGATGTAAGGATCCATGGGTACATACTCTTCATAAGTATGTATACAAAGTAGGGCACTTGAGCGAATTGCTTACATACCTACACACAAACACACACACACACACATACACACATAGACA---CACGCATGCATATATATATTATATGTATATTTTTTTGGATTACCTATAATCTATTTTTTTTTTTTTTATTCGATTTAAATTAGTTGTAATAGTTACTTTAGCGTAATAGTTAT-TTTAGCTGTTCGT-TATATCTACATTAATGTA-ATAAAAACAAAACAAAAACTAAAAGATTTAAAGGTAAACTTCACTATA
>CG1737 11199754 11200516|14260 chrX 11200227 11201054 scaffold_19 1701281 1702039 - -3696|0 308
CCCAACTCTCGAAGGGATTGCGAAGTTCCGGGCGGT------CGAGGTATATCAAT----AATGATTTTTATTTTAAATGCGTTGGAATACATAGCCCCCCTCCGCCTTCCCCGCGAGTCCCGCCCCCTTCGAAATCCTTTTTTTTTAAATTGCTATTATCGTAGTCGATTCAATAATATAAAACCGGGCGTACATGTGCCTACGCCCGCGTGGAGGACTAGCCAGTAAGTTAGTCGAGTGTATATCTAAGTGATCCCAATTCAA--AGCATACAAATAAAAGAGAAAACTGATT-------TAAATAA
CCCAATCAT------GGGTCCAAATCCCCGAACTTTATATACTAAATTATGGCTATTGCAAATTGTTTACAAACTGGATGTGTGGAAAAAAAACGTTGCATGCCGCTCGGACGAAGACTTTTG----ATGTGAAATCTATAATTTTAAAATAATT--------------TTACATGATATATTA-------TATATGTG--------------------TAGGCATAAAGAGAGTT--TTGAAAAACAAAAATATCACTTTTTAATTTGCAAACGAAAATAATGTTTAGTTGATTTATACAATAAATAA
>dsh 11203444 11203944|14262 chrX 11201529 11204770 scaffold_19 1702829 1705994 - 124530|1924 2504
AAACCTTTCTTTTTGCAATCAAATTGTGTTTTTA--ATTAATTAAATTAAATATGTACGATTATTCTTTTT---TATATACGAGTATACAAAGCAAGCAAACAGCAAAC---CACAATATAATAATTATAATTATAATAATAATAATAATAATAATTATA---------ATAATAATAATAATACTTA-----------------TGTATATGTATGGTATGTGTAAGTCATAGAAAAGAACGCTAAACACCCAGCCGCAACGAG-----TCAAGGATCAGCGAGGGCTCGTGAGGCAGCAGGAGGATCAGCACAGGGATATCCGTGTCCGGCAGCAATCGGTTGTGGACCCGATCAGATCAGATCAACTGAGATATATGATATATGATATATATAT--------------------------------ATATATATATATATATATATATATGGATGATGCGGAGCGGAGCGGA--GGAGCAGGAACGGCAGCATGACGGGCGAGAATGATTTTGAATAAA-------GTTCTAAGAATTTAGTAATCACAAAGTAAATAAATACAAATAAAATGAATAA
AAA-----TTTTTTGCAATGAAATTGTGTGTTTATTATTAATTAA--TTAATTAATATAATTATTCTTTTTATACATATACGAGTATACAA--CAAACAAAAGAAAAATACAAACAATATAACATGTATATTTATAA-GTTGATCATGCTGATAATTATGCAGATGGATGTAATGGACACAGTGTCTACTAAAATTAGCTCGCATTGCGTTTGTGGCGTTTGTGTGC-TCTGCGACCAGATCACACGGCCCGCAAGCTCGACGAGAACGTTGCATGATGGATGAATGTAAGCCAGTTAAAATGAGTATAAGAATGAGAATGATAATTTTGAATAAAGTTC--------------TAAGAATTTAGTAATCAAAAAATAAAATATATAACAAACATTTTGTTGTCAATGTTTCTGTGCAATAACAATGTAAAATATAGGCATAAGTCCAGTTATGTAAGCTTCATATATCCATAGATTTGGGCAGGAACTGGACTTTTGTGGCCCGGCCCGACCCAGAATCGGAGAACTCGTGCCTAAGATTTCG-AGTTCCTGTCTGGAT---------TTGAGTCGATAG
>CG11750 11204982 11206154|14263 chrX 11204798 11204983 scaffold_19 1706022 1706209 - 11088|186 187
CA
CA
>CG11750 11204982 11206154|14264 chrX 11204990 11205125 scaffold_12 944071 944191 + 1655|0 135
GAAATTCTGATGCTGATCCGGTCCAGGCAATCGGCTGCAGATCGTACTCTATCGCCATGCGGACTAGTCTATAAGCATCAGTCGTTTTACAACCATCGACAGGATGGGCTGTGGAGCTCTGCTGCAAATCGCATTA
GCCAAACTGAAGTACATACAGGCCTGGCAATCGCTGCCCGACTTTGGCGTCTCGCTGTTC-------------ATCATCAA--GTTCGATGGCCATCGTAAGGAGGAGCTGCTGGGCGTGGCTCACAATCGCATTA
>CG11750 11204982 11206154|14265 chrX 11206115 11206222 scaffold_38 1103413 1103514 + 1835|0 39
TCGCAGTTAATAAAAGTTAGCATTTAAACACGTAAGAAAA
TTGCATTGTAAAAATGCGAAAATATAAA-----AAGAAAA
>dlg1 11233393 11234509|14301 chrX 11234159 11235050 scaffold_2 6036713 6037582 + -1148|0 381
CCGGTGCGCTGTTGT-TGTTGCTCGTTGTAGCTAAACTGGCCAGAAGGAGAAAGTACATATAGCAACGAGAACGGGAAAACTGCCAACGGGCGTAACACATTTTCTTTATATTAAA---GCTAACGATATTTATACTAAGTTTTTAGTGCACGATTTTGTTTGATTAGTGCTTACTAGCGAATAAGGTACATTGTGAAAGACATTAAATCAAGCTTATTTATA-ATTTTAGCTTAAGTTTGGTGCATGTTTTGGTTAT--TAATAATGTTTTAAGTTGCCAAATTAAA--TTTGATTTTGATTTAAGAAAC------------ATACCATGTGAACCCCATTTAA----------AAAATATACATACATTTTGCGCTTCTT
CCGTTTTGTTGTTAAATGTGGCACATTGTTTAAAAACAAAACAGAAAAAAAAA-CGCGTGGAGCGGGTAACAGCAGCAAA-----AACTAACGATAAATATTTATT----ATTAAATGCATTAAAAATTTTTGCTCACATTTTTAATTATCTATTATTGTTCAGTT---GTCTGCCAGTGGCCATGCCATATAGCAAAAG-----------------TTTATGGATTTTTTTTTTTTTTTTTTGCTTTTTTTGTTTTTGCCAATAGTTTTCAAGGTTGGGCAGCTGATGTTTTGGGTCTAATGTCAGCAGCGGTCAGGGCTGTATAGTTTTTGCGGCCAAAATAATGGCTACAAGAATTTATGAATGAATTTGG---TTGTT
>dlg1 11248023 11248097|14320 chrX 11247393 11248539 scaffold_3751 302 1573 - 12369|776 874
ACAACCAACAATC----------------ACAAAAAATATAAATT--AAAACAACCACAAGAATCAACA------GCAAACAAAAAAAAAAAAAAAAAA
ATAAGCAACAATTTTTGTAAAAGAACCAAACAAACCATATAAATGCAACAACAGCTATAAAGGCCTTCAAATATTACAAACCAAAAAAAAAAAAAA---
>dlg1 11251397 11254214|14323 chrX 11250696 11251761 scaffold_19 1764986 1766116 - 39983|732 1138
CCAACAGCCACCACAACTTGGACACTGCCGCCTCGAGTTCGATGTCGACCAGTCTCGAG------AACAACAATAGGAGCAACAGCAGCAGCAACAA-ATCAGCAGCCGCAGCAGAAGACGCCGCACTGATGATGCATCA-CAGTAACAACAG-----ATACTAATACAACTACAACAACAACAAGAACAACAACAACAACAGCAACCACAGCAGCAGCCACAGCGACAACAACAAAAACA-ACAACACTGACAACGACAGGAAACGGAAATGAAAACGGATACGG-------------AAACGTAACCACAGACCTGAACTAACCAATTTGACCGCAGACAGAACAAATTTATTACGACGCAGCCGCAG------------CAGCCAACTTAATGT---AGCAAAT
CCAACAGCCACAACAACATGGACACTGCCGCCTCGAGTACGTTGTCGACCTGTCTCGAGAACACCAACAACAACAGCAGCAACAACAGCAGCAGCAGCAACAACAGCAGCAGCAGCAACAGCAGCAACAACAACAAATCAGCCGCAACAAAAAACGTCACATTGATGCAACAAC-ACAACGACAATGCAAACATCAACAACAGCAACAGCAACAACATCAACATCAGCAGCAGCAACAATGCGCAGCAGTCAAATCGATGTTGTTCAT-GATTAGATTGGTTATTGTTTTTTCTTTATAAACAATTAACATTTGCCGGCGCAGTTCAATACGAGCCCAAATCAAGAAAACACACTAAAACAAGATTTTTGGATATTAGCTCTTAGCTCTCTTGCTGTGAGGACAAAC
>dlg1 11251397 11254214|14324 chrX 11251922 11252214 scaffold_19 1766117 1766351 - 7070|0 292
TGTTCAAACGGTAGCGGACAAAGGTGTATAGTTTTTAGTTAGAACAAAGTTGGATATAAACAAAAGAAGCGAAATATAATATAAAATATGTATATATATATATATCAATATATATATATATATATAGATATATACACCCACTTATATAGGTTAAGATCCGATTATAAAAACATAGAGAAGAGCGAAAATGAGGGCTTTCTGGAGTTCGTTAAGCGCTAGAGTGTTGTTTGTTTATGTTGATGTTTATATACGAGAGCCAAGAGTTATAGCGAGTTAGTTATGTTGACGATAAT
TGTTCAAACTGAAGCGGC---GGCTGTTTAGTTTA-AGTTAGAACAAAATTG---ATAAAAAAAAAAA-------AAAAAAACAAACACACACATACATGCAAACTGAAA-GCATATTAATCGTAAGATCTACATA-------ATATG-----------------AAGCAAATGAGGAAGATCCGAAAGGAGAAC--------GTTCGTTAAGCGCTAG--TGTTGTTTGTTTATGTTGATGTTTATA---------CGAGAGTTATAGCGAGCTAGTTATATTGACGCTAAT
>dlg1 11251397 11254214|14325 chrX 11252400 11253205 scaffold_19 1766352 1767217 - 4816|0 933
GATGACGGGACGCAGATGCAGATGCAGATGCAGATGCGG-ATGTGAATGCG--------------------ATTGCGAACGGTTGCGGATCTA----GCGGAAAGTCAGACAATGACGATAA--CGATTTACGATTACGATCTAATGATAATGATAAATATATATTGATGAATATTGACGCTAATAACGATGGAGATGATGAAAAACGTTGGTGCATTTGTTGTTAGATGTATGTAATTTTT---CCCACTCGCCTTTGCCTAAAAGCAACACAAAATTAAAACAAACAAGAACGATATATAAA---ACGTATAAACACTAGTAACTAGCGGAAAAGTTGCATATAGAACCACGGAAATTCATTCACACAACCACTTACTATACTATATCTGTACCATTTAGCCCATAGTCCGCAGAAGATCGTCGAAACAAAGTCATTTTACTATATAAACA-AAACATCCGCATAATA-----ATGTAAACTACGACAG--AAATTGATTGGAAAAAAGGAGAAATTGAATTTGTT-----------GTCGCGTTG--ATTTAA------ACCTATATAATGAGTAAAATATTGTATATTTAACAATCTA---------TAAAACAAATATAGTATGTAGATAATACACACA----AACACACGAACCCATAAATAACACACACACACACACACACACAAATGGAC-------------------TACCGTTGCGGTCTAATTTTATACACACCAGACAAATCGAAT-TGCAAATAAATAAATAATTAA--GAAAGTGACA-----ATGGAGAAGCAGAGCTGGAGATGAGATCAACTCAAACTAGATAACTATACATATATTTGCT-------------------GATTAATTTATGT---------AAACCAATATACGATTTATAGCCAACGCACAGAA
GATAATATGGTACATTATTGTATACATATGCATATATTGCATATGTATGCATAATAGGTATAAAAAGTTTAAGTGCGACAAGCGTCAGATATGCTACGTTGAAGGATAGCAATTGAAAATGAATCAGTTTGCGAATACGACTATAT-------AGGTATATATATGGGTAAATA--------GATAACGACGACGACGACGATAA--GTTGGTGCATTTGTTGTTAGATGTATTGTATTTTTTCCCCCACGCGCCTTTGCCT-AATGCAACACAAATCACACGATAAGAATCATGCTGCATAAGCACACCTACACACAC--------------ACACACACACACTGAATCACACACATCTATGTACACAA--------------------ATACCATGTAGCCTA---ACTAAAGAAACGCGTCAGCAACGAGCTATATATTTATATGTATATAGATATATGCGCTATATATATATATTTATTAAAATGAGTATATAGAGAGGGAGAGAGGGCAATATCACTTCTTTCAATACAAAAAGTCATTTTACTATTTAACATACGATTTATATGTTAGACAGCATTAACTAATTCTGAAAGCGTCATGTTGACTTCAAACACATACA-CATACGCATATTACGATCAATACAACATATACACCCATATATATTATATACTTATATATATATAGAAATATATATGGTATATAAATAATATACACCGATACGGTTTAATTTTAC------------AATTGAATATGCAACAACATAAATACCTTGTTGGTATTGACATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATACATATATTTTTTTTTTGTATTGACAGCAAACAATTAGCTAATGTTCAACAAACAAACAAATTTATAAATTATAGACAACGCACATAA
>dlg1 11251397 11254214|14326 chrX 11253239 11253289 scaffold_19 1767259 1767303 - 2234|0 50
TTTGTTCGAAAAAATTTAGCTAAATTCAAGTTGAGTGTTAACATTATAATT
TTTTTTCTAAGAAATTTAGTAAAATTCAAGT------TTAATATGATGATT
>dlg1 11251397 11254214|14327 chrX 11253290 11253418 scaffold_19 1767434 1767529 - 1111|0 129
CATGCGAAT-ATGCATATATTCAATTTTTTTTTTTAACTCTCCATCTCTCCTGCTCGCCATTATACGAACTACTTAAAACATTTTTTTTTAATTAAATTTTTTGTATATTGCAAAAACGTCGACGACGCC
CATATTAATAATATATATATATATTTTTTTTTTTCGTCTC----TGTCCCTTACT------------------TTGTAACATC------------AATATTTTGTAAATTATAATACCTTCGATCCCTGC
>dlg1 11251397 11254214|14328 chrX 11253453 11253606 scaffold_19 1767532 1767753 - 783|0 224
TATATACATATAACTATTATACGAATAAAGAGAAAACAAATTCATTA-TAATTTTCACAATGTATGCGCCGAGAGCATTGTTATATTTAATAAAC----------------------------------------------------------------AACCT--AAAACAAAAAGGACAAACAATGGAAAACAAAA----TAAAAACTATGCGAATAATTTCC
TATAAACATTGAAC-AGTATATGTACGTGCAGACAATGCATACAAAATTCGTTTTCACATAGTA--CGCAAAATGCATTGTTGTATTTAATAAACACAAACCTAAGCGAATTATATTAATTTAAATTTAAACAAAAAAAGCAGTAAATGTAATAAAAATAAACTACAAAAAAAAAATGACAACACATATTTCATCAAAGCCGTAACAACTTTTTAATCAATTTCC
>dlg1 11251397 11254214|14329 chrX 11253607 11254289 scaffold_19 1768411 1769227 - 707|0 774
ACTCTAAACAAAATGCAAAACAAAGCAAA-ACAAAAAAAAAAAAAAACGAAGAAGCTGAGGAACTCTAAGTGTAATAAACTAATTAAAAATCGAACTTCTTAATCAATTTGATACATCCA-----ACTAGCATACG-----GAAAGCATTGCATTAACTAACA-TTAAACGATGTGCAGAGGAGTTAACT-ATAGATAACCGCT----TAAACAGGGTGACTA---TTCGTAGCAAGTGATTTTTTTTCGCTCAAACAAAAATACTTAAATCACTGGTTAAGGCCCTATTTTCCATGCGGT-------TCTTCCGAAAGCGAGGCAGCCAGTGAACGAAAAAACCTATAC------------CAAATTCAAA-TCACTTTTCCAACTAGCCTTAGATTTTACTAACAAAC----------------------------------------------ATGAAACCCTCGAGAACTAACTATCAAGC----AATTATCAACTAGATAAAGAAAATATATATTTAAATTAGA---GGCCCCAGGAGCGGCTGAGAAGGGCGACTTTCTTTTCTCAAAAAAACATAAAAAA--AAAAAACGCAAAAATAAGTATGATACAAAATGTATAACCCTTTCGTCCCAGATGATATATATATATATATATATATAT--------------ATATGTATGTA--TATCCTATC----------------CACTACA-------------------------------CACAC---------GCGC
AATTTAAACGGAAAGCAATTTAAAGTACATACAACATACAAAAGAAATGGAA-------------TTAAATTGAATGAA--AATTGAAAATCAA------TGGCAAATTTTACACATGCATGGTTGGAAACGTATGTGTGGGGACATGTTTAAATAGTTGATAGTTAAATAATACAGAGAGTGTATATCTTATAAGTATATACTATAACAAATGAAATGAATAGATTTAATAACGACTTACTGTATGTAGCTCATATAGAAGAATTTCACATACTTATGGGGTTTTAAGCCCAAATGCGGTAAACTTTCTTTTCTAATAGAACATAGTATATATATATATATATATGTATATATATATATTTCAAAGTCAAGGTAACTGTTCCAA--AGCCTTAAATGCAATTAATTAACGCATTTACGAGTATATCCAAGTTACATACACATACATTGCTTATCTATGAAATGCCCTATTTCTAATGATGAAAACAAAAATGAAAAACAAAAAAAAAAAAACAAATGACAATTTTTGATGTAGCCTTAGAAAATGTATGCAAGAA---------TTTACCAAAACGAAAAAAAAAATGAAAAAAACAAAAAACATTTATTAGATAAATTAAATAATACCATAACACAGAAAACAATACATATTTATA-ATGTGTATTAAAACTAATACTGAAAGGCATTTAACGATCCCATTGTTCAAAACAATTTTGTGCTACATCATCTAAATGATGAACAAAACGATGAATATCGTACATTTTGTCAGCGT
>Gs2 11274850 11275413|14352 chrX 11273582 11275487 scaffold_19 1787056 1788907 - 64163|1284 1927
GACGGGA-TGGGATATGCCT----ATCTCCCGAATT-GTTGTTATCGATTTATAGCTTGTTGTTAAACCACCTTTTGATCCACTG--ATCCAATG--------ACCCACGAACAACCCGAT-CAACTGAACACCGAACGCGAAGTTATTTGCATAACGTAGGCTTAGTTTTTACCTAACGTATTTC-CCATAAACCAGAACTAGAAACCTAAGGCAGCCCCCTCCTCTTGCTGATATTTTCAAAGTTTTTT--------TTTTCTTTTTTTTGTAGCTGCTGTTACTTAGGTTTTAGTATGAGTTTTTTTTTTTTGTTTGTTGACCAATCAAATATATAGTAA-----TGTGGTCAGCGTAATG----ACGATGAAATGAAGAGGAGCAAGA-------ACCCAAAAAAGACATCCCCACGAAGAAGAAGA-AAAAAAAAGATAACATAAAGCTCTAGTATCAAACAATTCCTTGAGACCCCGCAAAAAAAAGAAAACCCAGCCCCCTACTTGTTAATGAT-----------ATTAAATAATTAACTTTAAT-------CCTAAAC-------------------TACATACATATACTCTCTAGTTAAGTAAATGCACTAAAAAATAAAAAAAAATACACAAT
AACACCAGCCGCATCTGCATCTGCATCTCCAAATCTAGCGGAGCTCGA---------TGTTGTTCACCTGAC-CCGGACCCGCCGCAATCCCAGGCGGAGTAAGCATAGGCGTAGCCAGACACAATCAAAACATTTACTATACAATGTGTACCCAACGTAGATTTTTTTTTTTTTTTTTATTGTTCGGTCCAGTTCTAAACGAGACCATTTAAGCAG-------ATGTTAAAGATATATATATATATATGCATAAAGAGCTTTTTTTTGTTGTTAAACATTGTTG-TTAGGTTATAGAG-------ATTAACGGAGCACGTTGAAGAAGTAGGTTTAAAGCGATCGATTGTTGCCCATTGAAGGGTCCACAACAACATTAACAAGTACACCACCCACCCACCCACCAAA-----CCCCACCAAGCTGAACATGATGAACCGAGAACCGATGGGTAGCAAAACAGAGAAGACA--ACGTTCCGGCTACCGGAGGGAAACATAAC--------TATTAATGATATTATTTAAACATTAATTAATTACCTAAAATATCAATACCTATATATACGCATACAAACATACGTACATACATATACTCCTTAGTTAAGTAAATGCAC--------GAAAAAAAATTCA----
>Sk1 11290777 11291230|14362 chrX 11288414 11290782 scaffold_19 1804555 1807067 - 73069|2533 2538
TGAAAT
GTAGAT
>CG1745 11301732 11301841|14375 chrX 11300710 11302252 scaffold_5 1708547 1709947 - 6537|1129 1238
CATCAAACTCGATGTAATCGCATTAATCATGTCTCATTTTGTATTAAATGATTTCGTTATTTTTATGACAGGATTTGACCAAATCAAATTAAAGAAGAATTGAGCTAAAA
--------------TAGTC-----AAAGATGCCTGATT---------------------------------------ACTGAACTAAATAAA------------------
>CG1756 11321293 11321486|14397 chrX 11320974 11321586 scaffold_5 1739721 1740376 - 17087|340 585
ACGGAAAGGAGGGATAGAAACCAGACAGCGAGATTGAGCTTCCATCGATGAAAAAAGTGCTGCATAGTTTTGGGCGAGC-AGGCAGAAAAGCAAAAAAAAAATATATATATACATATATCAAGCGAAATATCAATTGTAGTTAGGCTGC---------------------------------------CGATCGTAAACCACATGTTACAGTGGACACTGGCTAC------------TGTAGCACT
-----AAGGAGCTTCCACTTTTGGCCGACAAAAATGAG-TGAGGCGGAAGGAAAACTCATAGCATACTTCTA---GAGCTAGGCACAAAACCAAATATCATATA---------ATAGATGAAATCTTGTACTTATTTTAGTTAGGCTTCACACAATATCTAGTTGTTGTATTTCCCATAATTGTTCATCGATTTATATGTATGTATATCAATGGGAATCGGATGCCCTGTTGTCCAGTGTTGTCCA
>Cyp4g15 11328080 11328323|14405 chrX 11326324 11328370 scaffold_5 1746428 1748168 - 71204|1756 2031
ACCCCGGTGGCCGCGACGAACATCAGCTAGGCGAACCAGGTGGACCAGGTGGAGCGGGTGGGGCAGGCGGAACAGGCGGGCAGCACACCATACACCGTACACCGCAAACAATAAGCTACACAGAACGGACACTTATCCATACATATAACTCCACTTGTTGGCAAGTGATAGTCACCGGTTTATACAGTAATATT--------GATAATATTAAATAATAATAAACGTGCTCCC------------------------ACACTCGATTTATTGAATA
------------------------------------------------------CAGCCGGGACAGGCGACCACAACTGGCAGCACGGCA--------GCATCATAAAC-----------------------TTATGCATATCT----------TTATTTGCAAGTGATAGTC-CCGGTCTATACAGTAATATTCCATGCATAATACAAGCAAGAAACAAAACACACACTCTCCCCCCTCCCCCTACACACACACATACACACACACTACTAAAGA
>CG1749 11330198 11330282|14406 chrX 11328404 11330577 scaffold_5 1748213 1750312 - 59586|1905 2002
---------ATTGATTCCGT---ACTCCG-TATTTATAGACACTTTTTGTAAAACACACACTTTTTTTTTGATAAACTCAGCTTCGATTTGTGTAAAA
GACTGCAAGACAAATTCCATACAACTCTGTTATTTATAAATATATT---TACAATTTTCCCTTTTTTTTTTACTACAAAAG-----------ATAAAA
>CG32666 11398590 11400264|14504 chrX 11398480 11398807 scaffold_14 83211 83572 + 240|132 370
GCTTAGTTT--AGATAATTTTTTTACGGCCTTAGCATCTGAAAGGAGTGCCACACTATATCACGGT------TGC---CACATGAGAACATCTTCTTATTCAACGGAAAATTGAAA----------GTTTTCATATTCATACCAAACTTTACAGTTTTATAAGTTAAAGAAATGTATGTTTTTTTTTTTAATATTTGTTAAAACGAATGTTGTGTTAGACTACACTATTGGACCTTTTC
GGTGAGTTCTACAATCATCTTACTTTGAACTTAACTGGGGAAAAGAATATATGCTTAAATTCAAGTGAATAATGCATTCAACTGAATTTTATTTTATATTTAACCAAAAATCGGAGTTGATAAATTGTTGGCATATTAAGAAAATAATTTA------TGTATGACAAATATATTAAACTTAAGGTTTCTAAAGGTTCTAAAGACCA--TTTTTATCAGATT-CATTTTTAAAACTTTGC
>CG32666 11398590 11400264|14505 chrX 11399774 11400148 scaffold_1 1992846 1993184 - -283|0 390
TGTAATTCTTTTTTTTTTCGATAATCATATCTTAATGCTTGATATACGAGTTGTATTTATTAGG-----------CGAAACGTTTGTGTGGTCGGCGATCGAAGGAGGGTCAGTTAATTGTTAAAGAA-AAATGCTTA-ATTTATCGTAATCGATTACCCTTTTCTTTTATATTTAATACTTGCGTGTACTTCTCTTAATTACTATGATTTTTTTTTTTAATACACCTAAACCACTTATTTGTGTTTACTGTATATG--TAAATTAGTAGTTAAAGGCGAGGGCTTTATGCCCATCAACAGATAATAAAAACTGCGCCAGAGGGAGCGAGAAGTGTGTTTTAATTATTATTAGTAATTAGTAATTTCAATTGATTTT-TTGTGTTTAGAGA
TGTTATTTGTTTGTTGTT--GTTGTTGTATATGAAT--TTTGTATGCAAATCATAAATATGACAAAAGAACAACACAAAACATGAACACAACGGGCGAACAAAAATTGTTGAGAAAAATGAAAAAGAACAAATATTTGGATTTAAAACAAT-----------TTTATTAGCATTT------------TGCTTCT------------GGTTTTTTTTTTT--TAAATCTAATTTAAGGATTTTTTCTTTCTCTTTTTTACTTGATTAGTA-TTAGAGTTTTAGTTGTTGGG---GTTAGTAAATCATAAAATATGCAT--GTATGAATGGGCATGTTGGATGTGTTGTTATGTACAATTAATGG-----ATGGATTTTGTTGTGAGTAACCA
>CG32666 11398590 11400264|14506 chrX 11400149 11400473 scaffold_13 3043970 3044306 - 465|0 139
ATCTATTTCTATGAGAAGACAAACAAAGATGCAAATTCTATTATATATTATATTATATAGTAATTATTTTATAGATAACTAATTTAAAATATATTCA-------------ATAAAAACCAT-----------AAAAATTA
ATATATGTATATATGAACATATATATGTATATACATGCATATATATAATTAACAATACATTA------CTACAAATAATTAAATACATATATATACATGTATATATGTGCATAGAATTAATCTAGTATATGGAAAATATA
>PGRP-SA 11407922 11407998|14511 chrX 11407245 11408055 scaffold_25 1026656 1027464 + 24002|690 766
ATCAACTACAAGTAATTGCAGTAGTCTGCCAGAATGAGCATATCAGTTTAGTAAAGTAAATAAACCAATGTTGTTG-
TCCGGATGCCCG--GTTGAA-------TCTAGAATTAGGATTTGCATT--------TAAATATATTTTTTTTTTTAT
>CG11699 11416519 11416630|14514 chrX 11415868 11416657 scaffold_25 1065309 1066073 - 25674|680 791
GCAGCTCACAAATATACACACAATTTAAAGTAGACCTAACGCCTGAGTAGACCAGAACATAAAACGAAACCTTTGTTAACTTCAGTTTACATACAGACAATGTTTTCAAGAC
ACTGCCACCACCCACACACACACTC---------CCTCACAC------------ACACACAAACACAAACAGCTGTTGGCT--AGCCTATAGA--------GCTCATAAAAT
>CG11696 11421258 11421368|14518 chrX 11419243 11421696 scaffold_37 953826 956172 - 83285|2092 2202
ATCTGTGTGTTGTGTGTCTGTGTTTGGTGTCTGTCCCTGCGACTTTGTGTACACGTTCCCTGGTCGGGATTTATGTATAAAATCGTACAAATAAACTTTATTAATATACAA
ATCCGGCGATTGTACATATGTAATTAGTTTATTG------GCATCTATAAAAATGTTGCA-AATTGTGAATTGTAGACTTAAACGT-------AACTTTTGTAGTATAAAA
>nod 11430673 11430972|14525 chrX 11429542 11430970 scaffold_10 1567944 1569438 + -1159|1270 1581
TACAATTACTAATTAAA--TAGCATTTTAATTCGAATATAGTATAGTGATTGTTATTTATGTGGCATATACTTTGAT----TTTACAACTATAGTAGGAGTAAAAAAAGGAGCCGGATATCCTAAAACAAACAGTTATATATGTGTATGTGTAATATTTCTCAAGATGTTTACTTATTTTTTGTTTTCGACTATAATTTATTTG-ATGATAGCTTAGACTACCTATTAAATAAGCGCTATGTAATCTAATATTTAATTGCATTTTTTGATTTAAAGTAAAATAAC-------TTTTAGGTCAATAACAATAA
---AAATTTTAATTTAATTTAGTGTTTAGTTACTAAGAGTGTGTTCTAATTTTTTTTAA---GGCCTTTTTTTTATTTATCTTTACTTTTAACGCAATAATACAA-------------ATTATAATCCATTC---TATACAAATGTGATCGGAACATTTT----GGTTTTGTCTGAGTTTTAGGATTTAAAGTCAATTTGTCGGAATGCTTGCT--GATTCCCTGCTTTAAAAATCTTTTAAAGTCCACGCCCTAGTT---TGTTTCCATTTGAAAGACAACAATGCACCGATTTTGAGTCACTGGTAGGAA
>rho-4 11443199 11443753|14537 chrX 11442018 11443307 scaffold_10 1271449 1272792 + 65378|1204 1348
CC-CCATCACTAGCTC-------------------------------TAGCCCTAGCCCTA----ACCCTTAACCATGTCCAAAGTGCACTTCGATATTGAGCCGAGGTTGCAGTACGCACAGTACTATATATAGGATTTCTTCT
TCGCCATTGCGATCCCGACCAATGACAAATTAGCTTTAAGTCGCGCATAGCCTTAGCCTCAGGTTGTCCATGTACATGTCCAAAGTGCACTT-GATGTTGGCCATCTATTGGCTAGAGCAC-GTGTCATTTTAAGGCTTTATTCT
>rho-4 11443199 11443753|14538 chrX 11443308 11443450 scaffold_9 1431634 1431786 + 1563|0 152
GACCATGTGCCTATGCCAGCTGCAAA---AATAATTT----ATTTTTTTACAACTTGCCATGTCAGCTTCATTCCCA-ATCCGAAAGTGGTGCAAGCAT--GTCGTACGTATTTTTATATATTTATATACATACATACATATATAGTAACGTA
TAGTTTATTTGTTTGCCAACTGGACAGTGAATAAGTTTATAGTTTCTATTCAATTGTTTTTGTAAGTTCATTTACTGCGTGCAATATACGTACAGACATACGACATATATATATCTATATATATATATATATATATATATGTGCATTTGTATA
>CG1703 11452708 11452906|14547 chrX 11451150 11453801 scaffold_10 1569272 1571794 - 112396|1558 1761
CCCTCAAGTTGCATACGGACTTGGAGTCCATGCAACTGGTCATCACTCGTCAGCTGGCTCGCCCTATGTTAATTGTTCAACTGTTGAATTGATTATCTGCTAGTTAGTCTTTTTATACCAACATATAT-----ACAATAACAAATTGTGGAAGTAAATGTTATTACACAAGAGCGTTTAAGAATGTGTTGTTTATGTTATTAAA
CCAACGAAT--------GAATT--------------------------------TGTCTCGTTCTCT-TTAATTGTTGAA------AATCACTT---CACTAGATAGCCTTTTT-------TATATGTGGGCCACAGATCCCAATAAAGCAAGTACATAATGTTGAACTA----------------------------------
>Ptp10D 11513134 11514024|14617 chrX 11513325 11513486 scaffold_25 427139 427335 + 1473|0 202
TATACTTGGATATATGTGTACTACACTGGATACTACTGGATATATATATATATATATACTCTACACCGCGATCTATCGAATGGGAAT----------------------------------------GCAGCAATCTCGCCAAACAGAACGAACACGCATCAATTTATACATTT-TATATATATATAAAGATATATATATCTA
TATACATATATATATATCTA------TATATATACCTATACATATATATATATATATCAATCCAATCCTGTATTGTCTAATGGATACTACCGATATTATTATAACTGACAACATATTTTTATTGCTAGCCACAATTTTTTGTAATGTTATATATATACATACATATATACGGGCATATAGACATATATATATATATATACCTA
>Ptp10D 11513134 11514024|14618 chrX 11513601 11514026 scaffold_25 427336 427841 + 4581|0 545
TATATATCTTCCAATTTTTTTGTACACCTAATG---TTAGTTGAAATATGTGAGCGAGACGAGCAAATTTTTGTAGCAAACTAAAA--------GCGCTAAATGTTTACTTTTTTATATTATT--------------------------------------------------------------------------------ATATATATAAATACTTGATAAACATATACCTAATATTAGATCTAAACTAAACTAACTATAAATCGCACACACTCATACACTCACACAAAA-------ACACAATGCAATAATTGAGTTACATAGTTTTAAACAAATGTTAAAACATTTTGCTGCAACCGTCGGAGATGTAGTGTACAATTTTTAGT-TTCTCGTATTATTTTTTTTTTTATGTCTGT-------TTTGTGTTTAAATTTTTTGTAACTTTTTACAAA--------------GCGTAAACT--GTGTATGTATGTGCTACATTGATTTTTGTTTAATTATATCAAGTTTTTATTTAAAAAATCG
TATGTAACTTCCAATTTTT--GTACACTAAATGAGTTTAGTTGAGGAAAGGAAAAAAGAAAAACACAA------AAGAAACAAAAAAGTAAGGAGCGCTAAAAGGTTTTTTTTTTATATACATATACTATAAACTATAAATAAGCTAAACATTAAATAACTCAAAGAAAAAAGAAAATCAAGAAATAAGCACTGCTTGATCACATACATATATATATCCGA-GTATATATATGTA------------------------TATA---CACATACATGTGTACATATACGTAAAATGTATGTAAAAATTGCAATAATTCAGTTACATAGTTTTAAACAGAAAAC-AAACATGTTGCAGCA----TCTAATTTGTAGTCTATTGCTATTATTATTATTATTTTATTTTGTTTTTTTTTTTTATCGTAAACTATATGATATTATCTACTATATATATTAACAAAATCTTTGTATATGTGTGTAATTTTGATGTATGTATGTGCTAC-TTTATAATTGTTTAATTATATAGAAACGTATTTAAAAAAGAAG
>bif 11530581 11530948|14636 chrX 11530452 11532623 scaffold_209 6824 8583 + 9218|130 508
ATGTAA---CAGAATACATAAGCAAAGCGTTGAAATAATATCTATT--GTATACCAAAACCAAAAATATCTATGATAACAAACAAGCAAAGGCAATTAAACCGATCCGTAAACTGAATAACCGATTAATAACTGCAGCCGCTCAACCCGAACCGCAATAAATAACTA---TCAAGTAAAGAATAGAACAACTTAACAATGAAAAATGCAATATTCAATATGCGAAATGACAAATGCCTAATGCCAAATGCCAATCCAAATAACCCAATAACCGATTCAAGTGCGAGAACAGAAATGCCACACCTCTAACCCAGTGCACTTGCTCTGTCTGCTCCGCTG---GGCAATCAAACTAATCGCCAATTCATATTATTATTAAG
AACTAATCACAGAATAC-----------TTTGAAATAATATCTATATAATATACAAAAACTATAA----CTATAATATCATATATATACATATATATATATATATATATA-------TATATGTTTAT----------------------------ATATATAACGAAATCAAAGTAAAAAAAAAAATAACTTAAC--TGAAAAAGGC-------------------GGCAA-----------CAAGTGCAAAGCAACGTCTCTCTCT------CTCTCGCGCTCGAACAG------CCCACCTCTAACCAAAATC-----CTCTCTATGCACCGCTGCCATGCGTTGACAACACTGGCAAATACTT------------
>bif 11531318 11532512|14636 chrX 11530452 11532623 scaffold_209 6824 8583 + 9218|889 2185
GCTCCACGGCTCTGGGCTTCTACACGCCCATGAAGGGCACGGCGATGGACAACCTATTCCAGCTGGGTGTCACCCGATACGCCCTGCCCGAGAGCAGCAGCAGTGGGAG--CAGCAATGGCAGCCACAGTCCAGGCAGCAACGGGAGCAGTCCAGCCGGAGCTGCGGGCAGCCGGTTGATGTTCAACGGGAATGGCAGCATTATGGGCATCGGCGAGGGACTGATCAAGGAGGGCGACTTGGCGGCAACGGAAGCAGGACCTGGAACTGCAGATGGAGCAGGTGCCTCCAAGAA-----GGGTTCAGCTGTGGACGAGGATGATTACCATCTGACGGCGACGCCGGGCGCCGAAGTTGTGTACAGCGAGGGTACACAGAAAACGGATTTGCTATATTAGGTCGTCCTGCCAGCCAAAAAACCGGAGCGTCTAGCTCTTTTTCTA-CCGGTTTCCACCAAACTCCAAACCTTCCGAGCATAACAACCTACCACATCCTGATCGTTCCCCTAATTGAAAAGCGTGCACTTAGGTGAAATATCAACTTCGGTTAGACGCGAAAACAGTAACGAAGGAAAGAAAAATAAAAACAACAAGGCAACGTAAACCAAGTATGGCAAGAAATCCATAAAGATACGTATATAAATAGATATTATTTGTAAGTTTGTAAGCCTAGAGATCCGATGTGTATGTGTACAACAGCAAGCGTGTGTGTCTGTCTTCTTTATAAATATATATATATGGTTTTTTTTTTTTGATA-----AATTAATAATTATATTATTGTAATGTATCTACATACGGCACTGAATGAACA-ACTTTGCTGCT--------GCAATTGTATTTGTATTTGTATTGTG------------TATTCCATTTACGGCATTTTG-----------ATAGTAAATATACA-ACAACAACAAATCAACGTATTTCCGACTGCATCCCGAAGGTTACTGAAACCTTAATCCACGAAGTACGCGACGAGCGGTTAGTCCCGCCCGAGTATTAACTTAATGGATTCTAACGATCCGATCTTGTGACCCAT------------CATC--ATCCCTTTTCGCGACCCTTCCAAAACGAAAATGAAGAACA----------------TTC--TAAGCTCCGCTTGCCCATTCAGCGGAAGAAAGCA-----------------------AAGGAAAATGT-AACATTTGCCTCATAATTATTATATACATTTAGCGCTTATTGAATATTTTTTACAATTGTATTCCGTAAATAAATATAAAATACATCAACATCTA
GCTCTACGGCCCTGGGCTTCTACACCCCCCTCAAGGCCTCGCCCATGGACAGCCTCTTCCAGCTGGGCGTCACGCGCTATGCCACGCCCGACAGCAGCAGCAACGGCAGCCCAGCGCCTGCTGCCACA-----------AACGGCGGCAGC------------------------------TACAACGGCAACGGCAG------------CGGAGAGGGACACAGCAAGGAGGAGAGC--GGCGGCAA--------------GGAGCTG--------GCGGCTGCGCCCGAGGATGTCGAGGACTATCTGACGACCTCGGTGGCGGC-----GTCGTCGGCGCCGGCGGGCGGCATTGTTTACAGCGAGGGCGCCCAAAAGACCGATCTATTGTACTG----------------AACGAATC---------AGTTCCGTTTCGAGCCGG----AATCAGATTCAGAACCGG--AAGCGGAACCGGA-ATCGGATCCGGAACCAGTAGTAGATCCTGAAACGCGC--------------TGAGCTTCGTTTAAATACG-----------------------------------------------------------------TATATATATATACATA--------GATATTATTGATAAGTTTGTAGGCCTA-AAATGCG-TTTGCAAAAACAGAAAAAAAAACAT---------TTTTTTTTATATATATATATAAATATTAAAATATACATAATACTACTATTATATATATATATTATTGTAATGTATC----TTTGGCACTGAGCAACCGTAATTTGTTTTTTTTTTTTGGCAAGTGTATTTGTATTTGTATTTCGAGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTATTGTATTACGTCTATACCTATATATTATATATACATGTAACGATATATT----TACTTTCGATTGTGTA--------TGTTAAAACCGAA----ACAAAACAAGAGAAAAGCAA------------AAAAAGAAAAAGAAAATATTGTAAACA-CCGAGGTTGAGCCACGTATTTAACAACCACATCAAAGCCCGTTGTGGAGTATTAATAAACCGTAAGCAATAAGCAAAAAACGAAATGTTTTTTCCATAAACTTTGC-------TTCAATCGTAGAAAACAACAACAATAACAAGAACAAGAACAACAAAATTGTAAACATTTGCC---CAATTATTATAAA--------GTCTATTTCATATTCTTTGCAATTGTATTCCAT---------TCAACAACAACAACAACAA
>PhKgamma 11541177 11541219|14648 chrX 11539994 11541423 scaffold_25 454939 456484 + 29211|1333 1375
GGAGGCCATCCGGGATCCGTATCGCGTCAAGGTTCTGCGCAAG
GGATGCCATACGCGATCCTTATCGCGTCAAGGTGCTGCGCAAG
>PhKgamma 11541280 11542182|14648 chrX 11539994 11541423 scaffold_25 454939 456484 + 29211|1472 1615
GTCATCGATGGCTGTGCCTTCCGTGTCTACGGGCATTGGGTCAAGAAGGGTGAGGGCCAGAATCGGGCCGCCCTCTTCGAGAATACTCCCCGCACGGAGCTCCACGCGCTCTACATCAACAATCTCAGCCGATAGAAGGCGGTC
GTTATCGATGGCTGCGCCTTCCGCGTCTACGGCCATTGGGTAAAGAAGGGCGAGGGCCAGAATCGTGCCGCCCTGTTCGAGAATACTCCGCGCACCGAGCTCCATGCGCTCTACATAAACAATCTCAGTCGATAGGAGACGGCC
>PhKgamma 11541280 11542182|14649 chrX 11541519 11541595 scaffold_25 456564 456640 + 2197|0 76
AAGAAAAAAGAAAATAAGAGGAAACACAGTAAGCAAGAAACCAAGAAACAAACCAACAAACGAATTAGCAAAAGCTA
AAGAAGAGAAAAAAAAAAACAAAACAAAACAAACAAGAGACACCAAAACAACGTGCAGAACTTATCAAAAAAAAGTA
>CG1837 11557260 11557669|14661 chrX 11556095 11557789 scaffold_28 1297081 1298735 - 57860|1181 1642
AGCATCTGCCGGTTCACAGGGAATCAGCAGTAGTCGAATGATCAAATAATCGCCCGCCAAATTAATTGTAATCGT--AATTTTTCTTTCTCCAGCATAAACCTCTGTGAGG-------------AGTCCG----------CATTT------------------AATCAATATATCCAACAACACCCAAACGACAACGCGCTAGCTGAAATTGATAAATTCAATCTGAGTTCCTTTTACTTTTTTTTCGTTTTTGTCCCTCTTCCTTAGCTGTTTTTGTAGAATTTTTTTTATACTTATTTGTTTAGTGTTTACGTAAATGGGGCACGGGACTGTGTGCGCGATGATAAGCCATTTAGC---GAACTTACATTTC----AATTTTAAAGTC--ATTTTGAGTAGCCTACGTTTTAGGAAAATTTGTCAACACAAAGCTAATAAATATCAATTGGAAAACAATA
-------GCTGATGAACTGATGAACCG--------------------AATCACACACCAATACGAATGTCATCGCCAAAGTAAACTAATTTCTGC---AGCCTCTATGAGGGCATTGGTTGATAGGACCGAATAGTCATCCATTTAGACAAACAAACAAAAAAAAACAACAAATTTAATAATAGTCGAAACAAAACAAACAAATTTACACTGAAAATGTGAATC--AGTT--TTGTGATTGTTCCTTGTGTTG-------TCCATTAGCGGCTTTTTC----TTTTCTTTGCATTCAGTTCAGTTTTGTTCAC-------------------------------ATGTGCCAATTATCTAGGAATATATTTTTCTTGAAATTTTGCTATTAAATCTTGAATGA---AGTTTATATCGAAACTTTTAGAAAAAGCGAAAGTATATATAAAT------ATATTA
>CG1841 11560560 11561629|14663 chrX 11558427 11560570 scaffold_28 1299220 1301298 - 91002|2230 2240
AAAAAAAAAAC
GCTGATCAAAC
>m 11602524 11603451|14707 chrX 11600907 11602530 scaffold_28 1343738 1345340 - 81312|1693 1699
TCGTTCG
GGGATCG
>m 11602524 11603451|14708 chrX 11602531 11602825 scaffold_0 1687922 1688304 - -1539|0 382
GGATCAAGATATA-GATAGCAAGCAGAATCATAATCAGAATCAGAA-------TCGGAATAGCAATCGAAAGCGAATTCAAAATCGAAATGGAAACCAGCAGAAAGCAAAATCA------------------AAACACGTTGCCCACATCT------ACGCCTTCC------ATTATTATTTATTTATT---ATGATTATTGT------TTTTTTTTTTTTGAAGAAACGTATTATTGGGTTGTTTGTT----CGGAATCCTGATCCAAACGAAAAA---------------------AAGAGATATATATG---GTGCAGATATC-------------AGATATCAGAGATCGGGCAACAATGCAATACTCAAACTGCTCGA
GCAACACGGGAAACAACAATAACAAAAATCGAAAGCCAGAGCATGAAATTCTCTTTAAAGAAAAAAAAAAACCTAAAACAAAAAGAAAATACAAATTAACAAAAACAATGATTAGATATTATAAATAATTATAAACATATATCGCATAAGTTTACAAACAAATTTCGAAATGATTATAATTTTATTGTTTTAATGTTAAATGTGTAAAGCTGCTTATTTCTAAAAGAATTCAAAAATATGTTGTATTTTATTTCGGAGTAACAAAAAAAAAAAAAAATTAAAGTTTTTTTTTGTTTTTAAGCAACAAATATGCCTTTGCATATAGCCCTTAGGCGTTACAGTTAATAATTTTTATGCAAACATGCCAAATGCAAAGTAATTCA
>m 11602524 11603451|14709 chrX 11602826 11603158 scaffold_28 1346221 1346497 - 1111|0 340
TTCGGTGCTGAATGTTCTAAAAGTTTTTTTTTTTTTGCAATTTGTTTTTTTGGATGCATTTAGTCGTTAAAT-TGCATAGAGGAAATCATAGAAAATTAATGGAAATAATACACAAAGAGAGAGAGAGATGCACAAACAAAATGAAATGAAATGAAGACTCCGGAAAGGTGCTCCAGGCTTAAGGAGACGGATGTTATGCAACGCATCC-ACTAGGCATAAGGGA-ACTTATTTATTTAT--ATATAAATATATATATATCTATAAAGTATACATACGAGATTTAGCTTGTAAGTTTGTGTGGTAT---GGAAATTTTTAATTTTATTTTGCTTTCGGACA
TTTGGTGCTGCATAATAT----TTATTTATTTATGTGTATTTTTTTTTACTGGGTGCATTTAGTCGTAAAATCTGCA------ATAACATAAACGAAGAATACAAATAACA-------ATAGAGTTTGCCCAATATATACAAT---------------------AAACGTATTTC-----TAAATAGAT----------CAACGCACATGACTAAAATTAGGGGACACTTATTTATTTATTGACCTTACACTCTATAAGAATCTAAACTATGCTACAGAG-----------AGAATCGCATAATATTTGAAAAATGTTCGAAAATATTTCAAAATCCATCA
>m 11602524 11603451|14710 chrX 11603194 11603513 scaffold_28 1346514 1346839 - 365|0 270
CGGCATCCAAAACATAATTAGGGGAATTTTAGTTAAATTTTAGTACATTCTCACTCTCACACACACACACACA-CACTCATAAAACTCACAGA---CTTACTGACGCACACATACAAAACCGACTACC---------ATTTTCCATTGATAGTATGAACAAAAGCAAATGCAACTCCTTGCATGCATATTAAAATTTAAATTTAAGTGCAAATTTTATAACTGAAAAATTGACAATTGAATAAAGATTAGTTAAGATGAAAAATAAATAAC
CGGCGTTTAGCGAATTTTAAGCGAAATTTTAGATAAAATTTTCAACTTTTTCATACATCTAAATTCACATAGATCAGCAATAGGGCATATATAGTGCATATATATATATATATATATGTACGCATACTTTTGGCATGATTTTCTTTTGTCTGAAATTTGAAAACCATA---------TTTCTAATCTATGTGAATTTGGCCTTATGTACTTATTACCTATTTAAACAATT----AGTAAATTATTATTAGAGAAATTGAATCA-ACAAAAC
>Karl 11625668 11626190|14742 chrX 11625835 11625896 scaffold_25 2021174 2021233 + 2270|0 61
ATGAAAAAGGCGAATTCAATAATTTATATAAAAGGTTATTTACAGAATGGAACAAGACAAAA
ATGAAATGGTCAAACAAAATA--TTGGGTAAAAGGTTATTTACAGCATTGATGAAGGCAACA
>Karl 11625668 11626190|14743 chrX 11626125 11626373 scaffold_3 1815514 1815737 - 1396|0 67
AAAATATTATACGAAAACCCGATTTATTTTG--TCAATAATACAAATTTAAATAAGCACTTTCAAACA
AAAATATTTAACATATAACTGTTAGGGTCAGATTCAATAACATATTATAAAACAA-------TAAACG
>CkIIbeta 11629546 11631864|14750 chrX 11629456 11629656 scaffold_3 5374351 5374608 + 1402|118 259
TAAAATAAATACACCACCAACAACAACAAATACTACAACACAA------------------ACACATACGCACGAATACAACAACAAACAATC-------------CATTTAACTGCATGTAAACGAAACAAAAACATAAAT
CAAAATACA-ATGACAACAACAACAACATTAACTTAATCGCAATATCAAGTTCGCAGGGTTAAACAATGACATAAATAACACAAGTGGATATCTAGTACTCAAAGGCATTCAACTAGATATAAACAAAACAAAAATTTAGAT
>CkIIbeta 11629546 11631864|14751 chrX 11629781 11630991 scaffold_31 295524 296813 - -1435|0 1394
TCATTTATATAAATATAAAAACTAAAAAAA-----CAACACAAAAAACAAAAACCAACTGCGTTTGTATTTCAAAATGAAAAGAAACAGAAACAGAAGAAATTGTATAACAAAACAAAATAGTTAAAAGGACACACAGCAACACGCATATTTATTTAGAGCCCATAAACATTCAAAACATGAGAAACTTCATGCGATGTTGATTTTTATTTAAAACACTGCAACTTCTTATTAATCTAAACTTCATTCAGAAACATGTATTTATGTTAAATTTGAATGTTACCGCTGAGCAGAATATCCTTCGCATTGAAGTTTAAGTTCAAGGACTACAA-----GCATAACTCTCAAATACACACACACCCACAAACGCCTACACACACACGCTTATATATATATATATTATTTTCTTCAGTCAATTAACCAATTATGTATGTGTTTTTATATGTTCGTTTCCTCACATTTTATGTATGTATGTATGTTTTGTGTAACATTTTAAGACACAGGCAGTGCAACACTTGACCAAAAAAAGATAAAA-----------AGAAGGAAATAAA-----------ACAAACAA-----------------------------------------------AAAGGATACTCGAATTAGACAGAAAAAGAGAGTGTGTGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGTTAG--AAGTAGAG------CGATAGGTAAAAAGAAAC--TAATTTA-----AAGTAGAGAAAACAACGATATAAGCAACATAGTACTTCCA-AATAATAAAGAACACAAAT--------------AACGATCAGCATTTATGTA---------------AACGACAACGCAAATAAAAACCCTGTATAAATTCCATAGCCC--------GAAGCGCCAG-------TCAAACGCGCGAAGATT--CCCAAAGTAGTGGCCGGCAAGAAGATCCCTACTTAAGGAAAGAAGTTACCGGAACCCCAACTCCCAAAGAAGTAGACGAA-----AATTAATGAAACCAACAAAAACATACA----------------GTACAGTCA-TCCCCATCCAACCGAACACC---------------CACTCACTCACCCACTGATTTACACACACACATCGACGCGCTCACACACATAGATACCGCATGACCCCCCTAATACCAACACCCACCCATACACAGAATGAATGCAAATGAAC-GGAAGCAAAAGCAACCACTTGGAACATAAGGATGTGGATCGAAGAAGAGGATGAAGATTGGCAGCAGGACACGAGCAACGAACCGAACGAATCAAGCCCCAAAATTCCAACAGACACACACACAATG-----AAACAAGTACACATACACACCCACACACACACTCATGAGCATGCAC
TCATTTATGTTG-TACAACAGTTCACAAAAGGTGGCAACACTAGACCAAAACACA------GTTCGAGTTTCAAAATGGAGCAACACT----CTTAAACAACTCAATAGATACACAAA-----CATACGCACGCACACGAACACACACACACAC---GCGCACACACACACCCGCAA----AGAAACTG-ATAAGACAGTGGGTATGAGA-AAGAGAGCGAAAATAATTAACGATTTAG--TTAGTCCACATACAACGATATATGCAACAT------AGTACTTCCAAAAAGA---------TCATAAAAAAAAAAAAAAAAAAACAACAACAGCCACATACTGCTACAAAATATATATACACACAAAC--------ATACATATATATATATATAGATACTATAT-----AAATAGTAACATAATTATGTATATGCAAATGCAA---CGTTT----ATAATTTATGTGTAGTAATATTTATAAAAAAACG----AAAAAAAAAACGCTGCTCCACAGAAACCAGAATCAATAACTGATTCCAACTTAGAAAGCAATAAACTTTAAAGTCAACAATCAAGTATCCCCCCCTTCCCGCTCCACTATGCGATGAATTGAGTGAAAAGCAAATGAAAATTAAATCAAATACAAAAATAAAAAAAAAAATAAAAAAAAGCGAAAAAAGATAATAAAGTAAATGCCATTCGATGTGGAAACAGAAGCAATAATTCACTCATGCATACACAACACAACAACAACAACAACAACACACCCACACAAGCATCGACAACACACATTCATGCATGCACACACATATATACATATATGTGTGTGTGTGTGTGTGTAACATCAACGAAGA----AATCGTAAAGGAGTTTCAAATTCAAGACAAGGGCAGCGACAGCGGCGGCTTGAATGCATAACAACCGATCCGAGACAGAGCGAGACAACAAGATACAAACAAAAGCAGCAAAGC-ACTGAG----CAACAGCGGAAGAGGAAGACGTATCATCAAGCATAAAAACTCACAAACACACACACACAAGGATAAACCACATTTAGTCAATGTTAATCAAGTCAAAGATGACGAAGTAGTGGCAGCACTTGCATATACACACACACACAAACACAGACAAACACACTTACACACATACAAACAGAA-------CTGTATGCAAACGCTTGCGCAAGTGCTGCCCAGCCTTAACCAAACCATTCGCAAAAGCAATAGAGTAGCGCACAAG------------AGAAGAGTAC----ATTGGTTTTTGGAGTTGA------AATGTAACAAGAATGCGCATAAAAATAACACAGCCAGCCACAGATTGGTTTTATACAA-TACATGCATGCATTTATATATATATCTATATATATGTAC
>CkIIbeta 11629546 11631864|14752 chrX 11631038 11631474 scaffold_31 296864 297364 - -1726|0 514
ATGTGCACAC-----ACTGTTATCCAACCGATAGTTACGGCAAGTGTTGCCCTATCGTTCCCAGA----------AGCAATAACAAACTTGTAGCAGTGTT--------CAACAATCAATCAAAAGCGCAATAAGAAAACGAATGATA---AATAAATTGATA-----TGTGAAG----------CCAGCATTAAATTTCGTTGCGGATTGTTTGTGTTCGTTCAGTAAAGTAAAGAATACAAAAAAAAAAGAAAATAACGAAACGTACATAATACA---TATATAGCTTTGGCTTTGTTCCAGTT--GTAGCGGCATTAATCGGTATAGTTTAGTTTTTTAAGGGTCCAAAATTGGAAACTTTTC---CATTTCTAATTCTACTGAATTCAAATCGCCCTCCCCTTGT-----------TGTTCTTTTCTTTTTCTAATTCTT--------------AACTCTAAACGTA----TTGTATGTAGTGCGCAAAAGCATTTTCACCCATTTGTAAT
ATGTGTATATTATTGACTTATAAACGAGCAACAATTATGTTAAACAATTGCAAATAATTAATAAATAACAAGAAAATAAAAAACGAACGCATCTTAAGTTTAAGACACACAGCAGTTAGTAGAAACAGAAAACAGAGAACAAAAAACACAAAACAAATAAATAATTAATGCAAAGTTCGGCTTGCCGAACTTCGAATACCCTTGCAGAATGATAAAGTTCATAGATTT--GTACGAACTAGAAGTAAATGTATTTTCAAAGACAAGCACATTTTAGAGTCTTTATAGATT-------GTTAAGGTTCAGCAAGGATATTCCCATATGAAGTTCTGTGTTT-----ATTTCGAAGCAAATAGTTTGCAAACACTTTTAGTTTTTAAGGGTCCAAATTGAACATAACCTATACATATATATGTATATTTTTTTTTTATTAGTTATTTTATTGGGGGCAATGATATCAAACGCAAGTTTTTTTCGCAATATCTATAAATATTACTACTTTTTTTTTTT
>CkIIbeta 11629546 11631864|14753 chrX 11631485 11632308 scaffold_31 297396 298284 - 10139|0 507
ATAGAAATTCTTCTGCCAAAACGAATTAATTGAATT--TGATTTTTTTTTTTTTTTT----------------------TTGTTAAGATCAATATGAATAT-------------------TTGCGTA----ATTAGGAGAACGCAAAACAAAAA-ACACACA-AACAATAAGTCGTGAAGTGAAGAACGTTTTTTAAGAAAATTAGAAATAAAGTA-------TAAATAAATATATATATATATATATATATGAAAATCTATATAGAGATCGATAGAAAGGCCGAGGAC--------CGTTGATAAGTTAATCTGGCGTGTGC------AGAAAACTGTTTACAATTAATT----------------------------------------------GATGAGAAAATAAAACGAAACGAGAAATGAAAATAA------------TGGAGAACAAAAGTAATAATAACAATAACTAAAATAAAAACGAAACTGATATTTAATACAAAA
ATAAAAACTCATGTGT---GACAAATTGTTTATATTAATGATTGTTTTTTTTTTTTTGTCCATTTCTTTGAGAGATAAATTTTTGTATGCAGTATGTATATGAGAAATGTTGTAATAGATTTGCATACCGAATCAAAAGAAAGGAACACAAAAACAAGTACATAACAATAA------AAGTGAAAGACAA-----AAAAAAAGAAGAAACAGAAAACATTTTTTAAGCAAATTTAGCAATAAA---------GAATATATATATAGAAATCAATACAAAGGCCAAGTGCGTAAGAAACGTTGATAAGTTGA-CGAGTGCATACCGAAAAAAAAAACTGTTTACAATTGATATAAAACTGACTTAATTTAAACAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACAAGAAAAAAGAAAAAACGAAAATGAAATTGAAGAAGTTGAAGAACAGAAGTAATAATAACAAAAACTAAATAAAAAACAAAA-TGATATTTAATACAAAT
>CkIIbeta 11633998 11634000|14757 chrX 11633925 11634223 scaffold_31 301070 301375 - 7600|76 78
GCG
A--
>CG32662 11666861 11667439|14801 chrX 11665512 11667023 scaffold_28 1066529 1068214 - 36165|1602 1779
GAATTAGCGATATGTTTGCTGTGCGTCTTTAGCCTGGTGGTGCTGTGGCATCTGTACGC-----------CGCCA---ATCGACAGGATGGAGCACCCACTGC-CCATGCGCTCCAACAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCCGGAACAGCCGCTGCAGCCGCCGCCACCGGATCATCCAC
GAATTAGCAATATGTTTGTTGTGCGTGTTCAGTCTCGTGGTGCTCTGGCATTTATACGCCGATCCGGCAACGCCAAATACGGCCAGGCAACAACAACAACAGCAACAACAACAACAACAGCAACAACAACAAGAACAGCAGCAACAGCAGCTGATGTCGCTGCCGCAGGAGGAGCAAC
>CG32662 11666861 11667439|14802 chrX 11667267 11668448 scaffold_28 1068485 1069757 - 5766|0 208
AAGAAAAGTATATCATTTCAGTAAC---CACGAAACAAAAACAAAACGATTC-------------AAAAAGAAAACCAACAAAAAACAA---------AACAAAACACAAAACTCTGCAAAAAAATTGTGATTTATCGAAAAGAAAAACAACAAGTT-----------AGTTATAATGCATAATTTAAAGCAAAACAAAACATAAACAC
AAAAAAATTTTAAAATACTAAAAACATACATAAAAAAAAAACAATGTGATTATTGACAAAAAAAAAAAAACAAAAACAACAAAAAACAACGCGTTTGTAGCAATTCGTTTAAATTTACAAAGAAAAAAAAGCTTAAAAAAAATAATGCTAACAATTTCTAAGTGCAAAAGTTATATTATTAGCAATAAAAAAAAACTCAATATATATAT
>CG32663 11669200 11669662|14806 chrX 11669214 11669502 scaffold_22 877728 878055 - -1887|0 332
GGCGGGCCTGTTGGGTGGCCAGCTGCACCAGATGCGACGTATGTGCGCCC-AGCTCTTTAGTGCGCGCG---CTGGCGAGGATTCCTAGACGAAGGTTT----TGGTGCCGTTGGCTACACACTGTATTCTCTGTATCTG-CAACTGCAGCTG----CATTTGCATCTGC--------AACTG-------CATCTGCATTCTTCTG-TAACTGCATCTGCCTCGGTATTTGTATC----TGTATCTGTGTCTCCGACGAGCTATCGTAGTTTAATTTTTT-----------GCTTTTTTTTTAGTTTAGTCCAAGTAGTCGATAGTCGATATA
GGAGTGCCCGCTGCTGGAGCCACT----CGTCTGCAAGAAGATTGCGCACGAGCGCCTCACGGCGCTTATATTTCGCGAGGATTGCTTTTTGACGGCATGCCAGGATGGTTTTATCTACACATGGGCGCGACCGGGTCAGACAACGGTAAGTGGAAACGCTTGACTCGGCCTGTGACAAGCTGTTCTAATCGTTTTCTTTCTTTGGCCCACAGCACGTTGCTCAGCACTTGTCGCCCAGTCAAGCAGCGCCTCCGG-GCGGCACGGTAATATAGTTCGTTAAAATGTATGCGATTAACTATCAGCGTAATCTTGTCAAGCAGCAGGAGGCGGC
>CG32663 11669200 11669662|14807 chrX 11669560 11670602 scaffold_2433 897 1946 - 2653|0 120
CA-----------TTCTGATTGGATTCTGTTTTTTGATT----TCTACGAAAGAG--AAGAATACGTACTTTCCCCGAGAAAACTAAAATGTGAAATGCC-AATGCAATAAAAGTGAAAAC
AAATTAGTTTTTTTTTTGATTATTCTCAACTATTTTATCAGCCTCTAAATAATTGTTAACAAAACGCA-TAGCAAAAAGAAAGCCATAA---AAAATGCAGAAAGCATAAAATGTAAAAAA
>CG1847 11704370 11705103|14843 chrX 11703161 11704568 scaffold_5 5837216 5838630 - 59387|1234 1458
AACATAAGTTGCGTCAACGTGCTGCTCATGCTGCTTGTCTATTGGAGCAGCTACCTGCAGCGCTAGCAGTACTTGTCACTACCTTCTTTTCTT-----------------------TCGCTGGCCGTCAGCTTCGCTCATGGTCTCGTGCTGCTCTGCTCGATGGCGAACCTATTCCTCTGCTGCTGGACCCT---CAAGAAGCTGCTGCGAGCAATGCAGGGGC
AATATAAGTTGCGCTAACATACTGCTCATGCTCCTCGTTTATTGGAGCAGCTATGCGCAGCGTTAACAGT--TAGCCAATGCTTTTCTCTTCTGGCTAAAGGGTAGCTACGTCTACTCTTTGGCCATGCACTGCTCCAAAGGGTTTATTATGCTCTGTTTGATTTTTAATCAGCTGCTCTGCTGCTGGACCCTATATAAAACACTGTTCGTGGCTATCCAGAAAC
>CG15739 11708864 11709290|14848 chrX 11707784 11710555 scaffold_48 121071 123687 + 64700|1093 1548
--------ACGGCGTCCGGCGGAGGAGATCGAAAAACG---ATATATCCATTGGCTATAGCTGTACCTGGGTAC--CTGGGTAGCTGATATAGTGTCGTATTCCTAACCAGATCA-CATTCTG---TCTGCGAAATTTGAATCATAGTAAGCAAACAGAGTTGACGAACTTGGGAGTTCCAGGAAAACAAAACCACTGCAACCATTTGGTCGTAAAAGATCCATAGATGTACAGTGCATATAAACAAATAAACAATATATATGTATATAGTCTAGCTGAAACAATGCACT-ATATTTTATTAGCTAAAATATATGTACACAATTACTAATGACATTAGAGACA--AGCGATCGAACTTTGGGATACCCCGCAATTCACAGTGTAAAGAGATTTAAGGTTGTGAACAA--------ATAAAAAGTTTAGTT-TTATTTATAAATTTCGCCAAAAAAA
GGCCCACTACACCATACACCATAAGCATTCGGGATTGGGGCACGTATCTGTAATCTGTAAACGGTTAAGGGTTCTATTGTGTCATAGGTATATAGGTGGATTCGGAACGTGACCATCATTGTGGTCTCTGCAACTATTGCATTCT------------------------------GTTCCAG-------AAACCA--ACAATAATTCTGCCAAGAAA-----------------TGCA---AATCAAACTAAAAA-----------------TAACCGCAATAATACTCCAAGATTTGAATACGAAATGGTTTCGAATCGAACCATTTTTGAAAGCGAAAATATTTACAATTAAAATTCGGTTTGCTGC-----------CTTATAGAAATTATTTGTTATAGTTAAGTTAGATCATTGAATGTTTGGTTCTTGCTTCTGCAATTC----------
>SelG 11721797 11722181|14858 chrX 11721401 11721961 scaffold_48 135391 135937 + 11750|409 581
TAGCGACATCCG-GTTCCCAAGACTCTTGGGAGGATGTCGCGCCGACAGAAGGCTGGTCGTGTATAGCAGCACCC-TGAATGACCCAGATATCACGGTTT---ATCCCGCCCA---TGTGGCGCTTATGACGCAGTTGTCTTAAACTCGAACTCGAGCGGGCAATTGCTGATT
CAGCGGCGTCCATGAGTCAAAAACGCTCGGT----CGTCGC-TGAACTACAGCGTAGTCG-----AATGGCATTCATAAATACTCCATAT----CGGTATTAGATCTCGCAAGATTTTTTGCGCATATGACGCAGCATTCATAAACTCAACGCTGAGTGGAATGTTGCTGAAT
>CG1840 11722906 11723126|14861 chrX 11723118 11723425 scaffold_48 135938 136238 + 487|0 8
GAACTTACA
GGATCTATG
>CG15738 11727609 11727686|14864 chrX 11727486 11729796 scaffold_31 270515 272796 - 18624|131 211
TAGCGATTAT-GTTAGTATGTAGTACGAAATAAATTCTTCATTGTTGACTTC--TTTAATAAAAATCACTTTAAAATAAGA
TTGAAATTATCATTAGTGTACGGGCTGTTGAAATTTGTTAATTATTAAAATCAATTAGCTAAAAAGCGTTC----ATTGAA
>CG15737 11733409 11733847|14868 chrX 11733350 11733412 scaffold_31 279049 279111 - 1000|59 62
TTGT
GCGT
>CG1806 11843723 11843844|14975 chrX 11842280 11844046 scaffold_10 1547315 1549142 + 31842|1587 1719
GGATATATTGTA-ACTTAAATTCA---ACATACTACTTAAATTATTTTTAGCAACTGATACAAAT-TACAAATAAATTATTT--TTTATATCTAAGTACCATTAAAGTAACACA----ACGTTTAAAAACAAA
-GATAAACTTTGTACCTACATACATGCACATGCATCGACAATTACAT------ATGTATGTGTATGTACAATTATAATATTTAATACAAATACAATTGTCACTAGAAGAACACATTTCAATTTGGCTCAGCAA
>regucalcin 11850909 11850995|14982 chrX 11849937 11850909 scaffold_48 191915 192890 + 60618|978 978
G
G
>CG15735 11854601 11854668|14986 chrX 11854467 11856632 scaffold_48 195948 198143 + 89104|152 220
TAATAAGCAGAAAAAAAACACAAACAAAACAAAACAAAAAAACAGAAATGTGCTTCAAAAAAGAAC-AA
AAATAA---------------AAAAGAATGAAAAAAAAAAAAACCATATTTGCTTCAGAAATGAATGAA
>CG1796 11856605 11856685|14986 chrX 11854467 11856632 scaffold_48 195948 198143 + 89104|2255 2285
---ACTCCTAGTTTGTAAGCCTATCCATAAT
GACACCTCTAGTTTGTA----TATCCATAGC
>CG1796 11856605 11856685|14987 chrX 11856633 11857197 scaffold_48 198295 198883 + 4893|0 52
AGAATACGATTTTCCAAACGATTTCATTAAAAACAACTTTAAATGCGCTCGAA
CGAAGACGAT----AATAAGATTTGATTACAAACAACGTTCA-----------
>CG32656 11898927 11899084|15051 chrX 11897562 11899056 scaffold_988 929 2596 + 26331|1597 1755
A----ACTGGCGTGGGATGCCACAATCAACTGCACTTAAATATTGGCAATGATATTC---------TATCTC----------------CATTTCCTGGGTCCTATCTAATTTATTGCACTTAAACTTAAATATCTATCATTTTTTGTTTTCCTTAATAA
AGACGACTTATACACAATGCCA-AACCAAATAGACGGAAACGAAAACTGTAGCATTCACACTATATAATCTCACAATAAATTCAATGATATTAGCAACGATATATTTACAATAATGTACTTAAATTTTTTTTTTTTTTTTTGTTTATTTATTTTAACAA
>Ten-a 12165121 12166113|15454 chrX 12160577 12165810 scaffold_24 367417 372801 + 255912|4683 5491
CTTCGTAGGAAACCCGTAAAAACCAGCCACTAAAACGCGAGGAGCGCAGTGAAAACCGAAGAACAGGAGACATAAT----TATTTATATTTATACATATATA-------TATATAAACATATATATATATATATAGT-------ACATAAATCTA--------------------------TGTTATCGAACCAGTTTTTTGATGTCAAG------GAACATTATATATATATATATACACGT------------------------ATACATAAAATATTTTTTTTTATTGTTAGCCACTAGAGAAAAGTAAAGAAAGAAAATTAATGAAAATAAAGAAAGCG-----------ACATGCCAACATA----------ATCCCATGTAGCTGCATGTACGTTTATATATGTGTGTGTGTGTG----------ACGTCAGCTAAGCCGCAGATACATTTACAGTACAGATACAGATTACAGATACAG-----CCGCGTATATAGACGAAGT-TATAGATATACAGATACATATATATATACAT---CATATATATATACTCATCATATATATATATATGTATATATA-ATATATATATATAAAGATAATGGATAGTATAGTGTAGTAGTCATACGAGCATAAAGC----GTACCATACATACAGAACATATGTACATGCATACTCACCACAATAAGGGGCGCAGGAGGAAAATTAGCGGGGCGGGAAATTTATGGGAATGGGCGTATCAAATTTTTTTTTGTGGTACTCGAGCTTTTTGAGACTGGCATAGTTTTAAACAAAACCAATTG
CTCC-TAGAAACCCC--AAAAACAACAAAACAATACGAAA----------CAAAACAAAAGCCCACTAAATATAATTAAATATTTATAATTAT-CATAATTACGAGTATTATAGCCACTGGGTTAGAAAGAGATAGCAAGAGAAACATAAATTGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGTCGAAGGCGCAACTGTACTAAATACTAAATAATAGGCCTACAGAAAATGATGAAGGTAAATATATATGTTACTCAATTCTTTTTTTTAAGTCAAAGCTTAAAACAATTTTTTTT-TTAATAATCGTTAGAAATTAGAAATGCGACAAAGCAAATGCATAAAAAATAAACGATAAATATTATATATGACAAAGCACTAGAGCTATACCATATATATGTGTATGTATATGTGTATATGTGTGTCTGTGTATGTGCTCTATATACCATATAA-----AGATAAACTTACGGTAGA-ATATACGTTAGTTATATGAGAAGCCCAAGAGCTAAAACTAAGCGCCCAAAAACACACACACACATATATATGCATGTACATATATATGT-------ATATATAAATACATATATAAATACATATATGTGCATGCATATACATGCACACAAACAATAAGAATTTGGCGATAAAAAAGCAGCGGCAGCATG-ATATATAATATAGG---GCACAGGCCTATGATAATATAACAAGCAGCAAAAAGAAGAGAAGG------AATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGTTATTTAATCGTGGTACTCGAGCTTTTTGAGACTGGCATAGTTTTAAACAAAATCAACCA
>Ten-a 12165121 12166113|15455 chrX 12165811 12165974 scaffold_24 373177 373328 + -636|0 163
AACGGCAACTGACCGACGGACCTTCAGGAGGTGATCCCTTGGATCTTCCATTTGATACCAACCATCCAATGTACATAAGCAGAAATGGAGAGAGAGGTGGCGGGAACGGAAACGAAAGTGGACATTTTGAGGGACAGGCCCAGACCAAAACTCACACACACACA
AACACACAGAGACAGACGCAG-GCAAGAAAGAGACAGAGACAAGCTCATGCTATATAGCCAACTTTATAGGTATACAAGTAAAAACAGAAGCAAAAATAAAGTAAATT--ATCAAAAATATTCAACTAAAAGAACG---------TAAAATTTACAAAAAAAAA
>Ten-a 12165121 12166113|15456 chrX 12166088 12169195 scaffold_24 373411 376501 + 32348|0 26
AATTAAATGGATAACAAAAAAAAA-AA
AGCTAAATTGTTAAAAAAAAAAAGGAA
>CG2577 12208217 12208388|15514 chrX 12206990 12209698 scaffold_24 446420 449158 + 30208|1258 1464
AAAATCCATAGAAATCGTCGAGTTTCGAG-TAAATTAATAGTC----GAACTAAATTAATTAGTAGCCTGTAACTAGAATTACTCCCCTCACAACTAATCAT------------------------------TATAAATTGCATGCATAAATAATTAGTGGGAGTATAAATTATAACGAAAAGTTAAATAAAGTATTAAAATATAAA
CGAA--------------CTAGTTTCAAACCGGACTAACAGACTGGAAAACGGAGTAAACAAATAGC----AAAGAGCAAGACTCCCATAGCAGCTCTTCAGACGAGCCTTGAAGGAGTTGAGAAAGCTGCATGTGATCTGGATCCCTAAAATATTCTTG---GTATTGAATATA---AAACGTAGATTGCAATCTGTGTATGTA--
>CG2574 12243681 12243768|15563 chrX 12243582 12244170 scaffold_24 1518713 1519390 - 2614|120 240
CAGTGT----------------AACCAGAGTAACCAATCAAATGTAACCTAATAACCTTAAATACCATTA----TAA----------AATAAAC---AAAAACAATCGCATTATGAAATGA
CAGAGCCCGGCGCCACAGCAGGAGCAGGAGCCAGCGCTCAGTAGTGCGACGAGCAGCTCAATTGCCGTTAGCGTTAACCACAGTCGTAGCGAACTTTAGATAGATTCCCATAATAAACAGT
>CG15926 12310511 12311447|15671 chrX 12310234 12310538 scaffold_31 619962 620279 + 12238|300 327
TTGGGGCAAATAGCGGGGGACGCGATGA
T-----CAACGAGAGCGAGAAGCGACAA
>CG15926 12310511 12311447|15672 chrX 12310887 12310966 scaffold_9 605771 605850 - 1287|0 79
ATATGTTTATATATATATATATTTATATATATATATGATATATATATATCTGTTTGTCTGCAGGCGATGCTATATTGCAA
ATATAAATAAATATATATATATAAATAAATGAAAACGAAACTTAAATTAAAATCTATAAACACGACACACTATATAAGAA
>CG15926 12310511 12311447|15673 chrX 12311044 12311963 scaffold_9 605944 606746 - -3554|0 413
TTATAAAAATTATTGTATGCATATATGTGAATTTATTTTTTTTTTTTTTGTAATTGTAAAAT---TTAGTGCGGCTTTTTTAAAAAATGAAAAGGATGTAGGGACGTTTAACAAGTAAAAACTAAAAGAACAA------AAAAATAACGAAAAACGTTTTGCTTGCATGCATAATGGATACAAAATCGAAAAAAAAAATTTAACATAAAGAATAATGTATTTATTTTTATTTATATGATGACGATGAAGCAGATGAAAGTAAATTAAATGTTAAACCTTAAAACAAATATACACACACACACACGTACATATACAAATACACACACACACATACGCATATATACTA-TACGATATATGAGATGAAATGAATGACGCAATAAAGCAAAACGAGATGAACCGGAAATAGTAGAAAA
TTATAATAAATATATTGTACGTATGTAATATTGCATATAGGTATTATT-ATGATTACAAGATGACTGAAAGTTACTGTTTCAAAACGCAAAAA------------------CAAACGAAAACGAAAATAAAAATTTAGCAAAAATAATAA--------TTACTTATACATATA-TATATATACATTCATATATATATATTCA-TATATATATATATATATATATGTGTATATACA-AAGGATAGTTAAGCTGACGAACGAAAAGTAAAA--TAAA-----AAATAAATATATACAAAATATATTTTGCGTATGTTAA-ACAAAAATTTAAATTTAAAACAATCCCAGCAAAACATTTTATACGAACTCAA---AACAAAAACTAAATACAAATCTATACTTGAGCAACAAAAAT
>CG2560 12322985 12323388|15693 chrX 12322047 12323380 scaffold_31 638117 639280 + 32787|957 1384
GGCGATTATTATTTAGATATACCCTTATCCAACACCCTTCTCCCGCAAGATTTATGCCCCACCCGATTC------CCGATTCCTGATTCCCGATTCCCGATTCCCGATCCTCGA--TTTTCCCCCCAGCTGCAAGTATTTAGTTTTTAAGTGCAA--CTCCAACAGGCAAATGAAGAGTAAAACAGAGCTAGCGAAA---TTTTTTTTTATCATTTTTTAGTGTTATACACGGAGCACAATTTTATATGATATTATACACTGATATATGTTATATATCTAGCCTACACAAAAACACGCACACACACACACA---AAAAAAACAAACACACACACAAATCCCGAGCAAAGACACAAACGAATC----------------TATGTATATACACTGAGTGATATTAGTAGTAAATAAAATGGCTAAACTAA
G--------TGTCCAG-CCCAGCCCAGCCCAGCTCCGCCCCGCCCC---------GCCCCGTCCTGTTCTGCCAACCGGCAACCACCCCCCTACCCCT--CCCCCAAAAATAAACCCTTTGACCCTAAGCCCAAGTATTTAG-TTTTAAGCGCAACCCTCCAACAGGCAATTAACAAG-----------TAGCGAAATTTTTTTTTTTTATCATCTTTTAGTGTTATGC---GTATACAA---TATATCCCCTGAAACCCTAATA----------ATCC--CCTACACACACACACACACACACAAACACACTTACACAAAGACAAGCCCAGACAAGACACAAATGAACATGACAATGAATCTATATATGAATATATATATGTATATACACTGAGTGATATTAGTAGTAAATAAAATGGCTAAACTAA
>CG2560 12322985 12323388|15694 chrX 12323381 12326916 scaffold_42 861936 865374 - 152594|0 7
CGATCAAA
CGACTCGA
>CG2556 12349997 12350484|15727 chrX 12349758 12350593 scaffold_31 667519 668329 + 12615|260 796
AGAATGTGGGTCGGGTACCCTTGCAGAAAACGGCAAAACAAAAAAGATGAAATACAAAAACATACACACCAACGACCTGGTGCAGAGCAGACCAAATTATTTAATATATAGTGTCCACACTAACACACTTGATC---CTCTCACTTCTCCGAGTCCACGTCC----ACGTCCAC-----GTCAACGTCCAGGTCCTTCTCCTTCTTCT----CCCTCTTCACCTGCGA---AAGCTGCTTATCAACGAATTAATCTTAATGC---------CAATCAATGGGAATTGAAATTATAACGAAATTGAATTGCCTGTACTTAAAGCGATT-TATATGTGTTATTTGTA-----ATGTGTACGTGAACTGTTCGAGAAATCTATTGTATATAAATAATTCTTCGTGTTTCCAGTGCGAGTACAG---TCGACTTGCT--TATAATTTATTACAAATCAACTT---TATATATACCATATATGAAAGTATATAAACAA-AATACTAT----ATGTACGAAAT--CAATATGAGAAAACGATT
AGAG---------------CTGGCGG----------------------------------------------CGAC------CAAAGCACACCAAATTATT---ATTGTAATGTCCCAAGCACTAAACAAAATCCAGCCCCCCCCTCCTCAACCCTACAATCCTGAAAGTCCTTTAACAAACAACAATAATTTTTTTTTTTTTTTTGTAAAGCCAAGTTGGGCTGATATATAACGTATATAGCATTGGATCGAGCGGGATCCATTCGTATACGATCAAC--GAATTAGTATT--------TTTAAAAGGCATGTACTTAAAACAATTGTGTTTCTGTAATTTATGCAAACATGTGTGTAAAAACTCTT---GAGATCTATTG----TAAATAATTTTTCGTGTTTCAAGTGCAAGTTTCGGCCCCGACTTGTCTATATAATTTATTGAATATAACCTTACCTACATATA-TACGCGTTCATATATGTAAACAATAATACCATACAAACATACGTATTTACGATATGCGATGCCACTT
>CG2555 12388073 12388178|15796 chrX 12387954 12388476 scaffold_31 736773 737234 + 1066|123 233
GTGATATAATCGATGAGATGGACAGGAGCGCCTACGAGCCAGTAATCTGCTATTAACACTGTAAATTTCAATAAATTGACACTT-----CTTTTGGTAATTTTGGAAAACA
A-------------------------------TCCCAATTGGAAACACGATCTGAACACTCAATATATACACACACATACGAATGTACACCTTTGGCAG---CACACAAAT
>CG32654 12442695 12442802|15865 chrX 12441720 12444281 scaffold_31 807913 810530 + 24530|998 1107
GTAATCAGGGGAGGGACTGGCCGGAGCACTACTCCCGAGATATGGAGCA--TTTGACGGAGGAGGAGAGTGTGAGGGTGTGAAAAGGATTGCCCCAAATGCCAACGAGAT
-------------------GCCCGCACAACAACAACAACAGCAGCAGCAGCCCCAATAGGAGTAGCGAATGTGCGTGCTTGAAACTCGTTTT----------------AC
>CG32654 12442872 12443862|15865 chrX 12441720 12444281 scaffold_31 807913 810530 + 24530|1177 2345
CAGCAGCACTTCGAA-ACTACGTAAAAAAGAAAGGCTTTTGCAACCGATGACCGCTCACACACACACACACGCACACACACACACTACAAACACACACAGTCATGC-----------ATTAAATTTACACACACATCCACACGAGAAAAGTCAACTTTCCAGCAGGGGAAAAGTTGGTCCTACGATATTTTCAAGATT--CTACAGTTTGTTCAACTTCTGTCTGTCTGTGCTATCTTTGTGCGTGTCCTTCTACTAAATTAACTCACCCAATTTAATTGCAAAGAAAATAAAAACCTAATTTTACCAATTTGTGCGCATGTGTGCGTGTGTGTGTTTGTGTGCGATCGATGTC---TTAACGTTTA---GTAAATGATTTAATTGAGGGAA--CGATGAAGAAAGCGATTTATGTACGACTAGCGAATTA----TATATGTAAATTTTCT------CTATGTAAACTATACGCCACCTTGATTCCTAAAAAATCCCTCAATCCCCC------------ACCCTTTA----TATATCCACACACGACCTCTTCCCCGATTTCTGTTTATATACATGTTTCTTTTGTATGTTGCATAGTTTTTATGATTATTTTTTGTTTAGCTGT---ATGAATTTGTATTCG----AAGGGAGGTCCAGACAC-----------------------TAATTCGGAATTC---------ACTTTGAATA-----TGCATTGCTGTATTTTCCACA-------------------TCTAAATACTATATAACTGATCTATCTGTCTATATAACTACGAAAGCTGATATTCGATTGATT-----TAAGCGTTTAAGAAGCAAATGAATTGTTCTCCCTGGTTTCTC--TTATCAATGTATTCTCCTCTGTGTTTCTTTTTTACAATTGGTGTGAAATATGCAAATGATTCCAATTATATATATATATA----AATGTATCTTTAGAACAATTAAAATGGTTTATTCTGTTTTTTTTTTTACTATTCGTTT----------GAATTGAAAATGCATTTTGAAAATGTTTA-TTTGTTAGAACT----------------------------------TGTTTGTTTATGCTTTAATTTTAAATTTAAATAG----------TAAACAAAA-AAAAAAAATAA
TTGCAGCATTTCGAGTAATACGTAAACTTAAAA------TATAACTACGTGGCGCGCACA-ACGACCGCAACAATCAACAGCAACAGCAACAACACTTAAGCGAGCGGACAACGACAACGACAACTACA---ACAATCACAATAACAACAACAACAACCAA------CAACAACAAGTGCTACTTTCTATTAATTATTGCATGCTGCTGCTGCAAAACATGTTGGGCAGCTC---CTCTGCGTGTGTTTCGTTGTTGTTATTATT-------TTTCGTTAT-----ATATATATACATA--------TATATATATATATATATATATATTTGTTTTTTTTTTCTATCTCTGTCTGTTCAAACTGTAATTGTAAATGTGCGCGTTTAGCGAAATTGAT-----AAGAAATTTATGTACGATTAGTAAAATATATGTATATGTAAATTTTTTCTTCTCCTATATAAATGATTAGCCCCGCAGCCCCCTCTATAAACCCTC--TCCCCCATTGCGCAACAAACCCAATATGATTAAAGCAACAAGTTTTTAGTTCAACTATGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGTCTATGTTGCATCGTTTTTAGTTGTATATTTCATAAAGACAGGCAATAATATTGTTTTTGATTTAAATTAAATACACACACATATATATATATATATATTATTATTATTTAAAAATCTTCGATTAGTCTGTGAAAAGAAGGCGAAAAGCTGAAAGTGCAAAATTGGCAAATTGAAAAATGGTTTAAGCACCAAAAAAAAAATATATATATATATCTATCTATTTATACACATAGTTAATTAAACAAAAGCAAGAATTTGAAAGCAAAACTAGTTTTTC------GTTTCACAAGTGTCGATGTACTACTTTCTATATCTAATCTGT---GTTGATTTTTGTTGTGCGTACAATCACAAATATTTACATAAATATTCCATTTAATTTGTAGAGCAA----------ATGTTTCAATGTTTTCTTTGTAATGCATTTCAAAAAAACAAAAACAAAAACAAAAGCAAACAATGTTAATTTTGTTAGAGTTGTGTCAATGTGTTTATTATTATTATTATTATTAATTTTTTTTTACGCGTTAATTTAATTTTTATTTAGCCTAAAAACATAAACAAAACAAAAAAAAAAA
>CG2540 12464832 12465056|15896 chrX 12462494 12465420 scaffold_31 835469 838655 + 55076|2605 2863
C------ACCACAACATTTTGCAATAGAAGACTACTG-TTTATTGTAAATACCAAGAAGCTTGGGATATTTCTTTTTAGATGCACCATTCCAAATAGACCAATTGCAACGACGTGT-TATAGAGGCTTCTG--ACGAATCACAATTACGATTGTGATTTCC------------------------TGTCATGAACATTATTATTTATTCATTATTATATATGAAAACATATTTTAAATATAAATTTAAAACAAACATTT
CCGACCGACTGCAATTCCGTGGGACGAGCTCCTTCTGATTTGCTTCTTATTTC------TTCAGTATCAATCCTTTAGTGTACATGATTT---GTAAAATATTTAAATATACATATACATAGAAAATGGGGGTACAGATTGTTAATCAAATCTTAACTTCTTAATCGATGGGTAAATGGGAAGTGTATTATAAATTTTGTTTTTTGTTTTTTTTTTTTGAT-AGCACATTATTTACAACCGTAGTAACATCTTTTATTT
>tomosyn 12487141 12487281|15927 chrX 12486172 12487385 scaffold_25 330014 331208 + 67792|1003 1146
AATATCTATTTTAGGAGCCAATTCTACCACAGTTATTGTAATATTGCTTTTATAACACTTTCTACTACATTACGAGTAAAGTACACTTATTTAATTTCTGTTTTCAAGTCGTCACGTTATTTACAAA---AACCGAAAACCAAC
AATATCTATTTTAGGAGCCAATTCTACCACAGTTATTGTAATATTGCTTTTATAACACTTTCTACTACATTACGAGTAAAGTACACTTATTTAATTTCTGTTTTCAAGTCGTCACGTTATTTACAAAAACAACCAAAAACAAAC
>CkIalpha 12490431 12491222|15931 chrX 12490255 12491759 scaffold_25 337175 338699 + 15005|200 1118
--------GAGCTGCAGCGC-----------------------------------------------ATTCAGA--------------CGAATGGGGGGAGTGCAT-------CAGAGAAGGAGAACGTGGATGCGTGGAT-----------------GTAAATGACGTTGATGTGGGCGAAAGG--------CCCGGCAAGGAGCGGAGCAAATATGAAACAGACGCAACCGTAAAATTGAGTAACACCAGCGGT-----CGTCCGAATGTTTCTTAATATTAATTTAAATTCAATACTAAACAAATAAGGAACCACAAACAAGCAAGCAACGGCATCA--TCAGCAGGGCATATAAAATGATACCCCAGCAAATGT--------GATTCACGAGTGAATCACTGCGATCGATAATAACATAAACCGAAATTATTGCAAATCAATACGATTTAAACTAAT--TTGCAATCCA------TACACAAATCAACATACTTGCATA-ACACACCCACACACACACATACATACACACACTCACCCACTCTCATCCACCCACTCAAAAAGCAAACATCATTGCCCAAAAGGGGGAGAAAAAAGAAAAGAAGAGAGAAGAAGAAAAGAAGAGGAAAGAAATCAACA-ACACTTAGCCTAATAAATTACAAGAAATAATATTGGTAGAGTTGGAGGAACAAAATGAAGTAATGCTGAGGAAACTAAACCTATATATATATGTATATGTATATATGTAAGCGAATAAACACAACACCATATATGTATGCATATACCCATTTGATTCACGTCAAATCGAATCCAATGCTTAATTATGAATCGAGCGAAACAAAACTCAATAACTAATTAAAATGGAATAAATAAGAAACAAAACAGCA-ACAAGCAAACAACAACACAAAAAAACAA
TTCAGCTGAAGAAGCAGCACGCAAAAAAACAAAAACAAAAAGAAAAACAAAATAAAACAAAACAGAAAATCAGAAAAAAAAAAAAAACTGAAAGAAGAAAAGAAATGAGAAGGCAAATAAGAAGAGCATGAAGAAAATGATAACTAAGGGTGGCAAGCGTTAAAAACAAAAACAAAAACAAAAAGCAGCAAAACACAGAGAGAAGCAGAGAGAAGTAAAGAGAAGGAGAACAAGAAGAGGAAGAAGAAGCAAAAGTATGGAAGTTAGGATGTTTCTTAATATTAATTTAAATACAATACTAAACATTTAAGAAAGATGAAGAAGAAAAACAACAACAAAAACTCAAC------TACAAAAGAAGAAAGAAGCAAATATCTAAATGGAATTCACA-------CACACACACACACACCCACACACACCACACACA---CACAACAGCAACATTTAGCATAATAAAAGCAAGCAAAAATGGTATAAAAAACAGCATATATTCACACATATACACACACATATATATATATATATATATTTAGATATATATGTATATATAT---AAATGCAAATAT------------------------------------------ATAATGTATATGTACACACACTCACACACACACACACACACACA-CACATTCAAGAATGTCGCTCGCGT-----------------GTA---------AAAGCATGCATATATATGTATATACATATATATGTATTAAAGTATATATATATATATATATATATATATATATATCTACTGAACACACTAAAATGCGAAATTAAT-----AAAATTAAACAACAACAACAAAA---AACGACGCAATAAAATCTAATTAATTAATAAACAAACAGCATGCGAGCAA--GGCCAAGCGTGGAAGGAG
>Tis11 12513178 12513640|15968 chrX 12513473 12513893 scaffold_27 1232348 1232799 + -2067|0 197
GCTGTGACAGTCAAACGTAATCGTTA-----TACAATAATCGTTATATGAGAAGGACCGA--ATTACGGACTACTACGGGACAATTAGTTAGATAGATACGTAAATGACAAAC----AAACAATCCAAGCAAACGATGATCTTAAACTATAACTAAATACTAAAAACTAAAAA-------------------CTAACA
GCTGCCATATTTGCGCACAATCTGTACTTATTTTAATCATGAGGATAAAAAAGGGCCTGATAACTAAAATGAATAAACGGACAAGC--TCAGAATGGTGCGTACTTAATAAATTGATAAATTACCTGCGCACGCGATGATTTTGGAAAATACTTAAATACTTAATCGGATCAATTTTTTGTGGTTGATGCTTCTCTCA
>CG4004 12581373 12583722|16080 chrX 12581364 12581492 scaffold_7 1185592 1185737 + 142|9 150
GTGAAACTAAAC--TAAAACTCATTTCGCATATGAAAATGCGATTGAA-AACGTATGAACGACAATTTAATTATTTCAAATTCTATCTTTA-------------------ACGATCATTTCATTTGGCATTACGGTTTAAAA
TTAAAAGCAAATGATGAAACTTTTTCCTAAAAACTAGTTGCATTTAAATGAATTTTAAAAAACAATATACATA----AAAGTATATATTTATTAAAAGAACAAAAATGAAATGCTCCTTTC-TCTACTAATACAACATAAAT
>CG4004 12581373 12583722|16081 chrX 12581659 12582163 scaffold_685 5523 6110 + 2743|0 596
TAGCCGCCTGCAACGCTAAGCAAAAAAAAAACCAAAAAAAAAAATGCAGAAATGGCAAATGTAAAGCGAAAACGGCTAAA----------------------AGCGAAAATGCGATGCAAAAG-----------------GGAAGGAGAA--GAAAAGGGCAAAAACAAAAAGGATGAAAGCA-AATAAAGGAACTGGTTGTTATTCATTTAAAATTTGACTA-----AGTGGTTCTGCATGCGGATCCCTTCCCCTCTT----------CATCCCCGCCCCCTTTCCCCGACAAGC-----------AGCCAGCACATCTTGTTTTGTCAGCCTGCCTTCTTCTTTCTTCTACTTCTTCATCTCCTCCGCCTTCTTCCCGT---TTTGCTAATTTTCTGCT----------GCTGTGCTGCGATTCTTTTATTTCAGGTTTCTTTGCCTTGCCGCTGTGTTCTCTTTTCCTTCTTTACTCCTTTTCTTTTCTACACACTCCCAATCTTTTCCTTTGCCGTT-------TCCTTTGCTTTAGTAACTTTAATTTGTTGGCATTGCCATTG----CCGTTATACTGGCGTTCGTCTCT
TAGATGCCTACAACTTTA-GCAGGGAATAAGCCAAAGAGAA---TGTATCCAAGCAGAAGGTATAATGTATACAGCCCAGTTCGTTTGCACACATTTCGTACAGCGGATATCGCATGCGACATTTTTGTCGCCAGGCTGCGGCTTGAGTATTGAAAAAGAGAACAAAACAAAAAATAACCGTATAGTCCGCGAACCGGTTTTCAATCATTTCAGTTTTGTGTGCAGGCAGCGACGCTGCTCTCTTCTCTCTGTCGCACTTGTGCCAACTACTGCCCCAGCCCCTACCCCTGCGCCGCGACGTGGCCAAAGCCAACAACAACCACCGACTAAGCCATTCTTCTTGTTATTCTTGTTGTTGTTGTTCTTTTTCCATGTCGCTGTGCATTGGCACAGTCTCAGCGCGCCGCAGCGGCTCTGCTTCCATGCTGTGCAAGAAATTTCGCTCGTTTTGCTTGTCTGTTATTTTTTTTTTTCTTTTGGTTTTTTTGTCTTACTTATTTT--ATTTTGCGCTTTGTGCTTCTTTTGTTACTTTGCTTTAGTAACTTTAATTTGCTGCCATTGCCGTTGGGGTCCGTTA---TGGCGAGACTCTCT
>CG4004 12581373 12583722|16082 chrX 12582280 12582733 scaffold_2 1241173 1241589 - 1672|0 478
TTATATAACAATAAAGCTCATTTGGAAAAAGAATAGTTCTCACATTATACACAATGT--ATTATTGTTTTCTATCAATTAAAATTAA------------TTAAAATAATTAAATTAATACTACTTAAAATACATACATATAGAGAGAAATATCGTTCTGTGTAATTTTCGGTTAGGTCGGTTCTATTTTCTTTTGATTTTCTTTATGATTCTCTTTATGATTCTCTGTTTTCGCCAGTAAGATG-----GTAAATGACAGAAGGGCGGAAAACTACAGAAAGGGCTTGTCCTGTGGGATTTTCTATGCAACCGCCATTCACCAAGTTTTCACACGTTAATC-ACCATAAGAAGTTTTCGCACTGTGTAGCCACATTGCCGTTGGGGTTTCTTTTCTGGATTT-----TTTTCCTTTTCATCGTTTTATTTTTGGGATTTTCGCTTCTGACGTCGTTACAGTTGTTGTTGTAGCCGGCAT
TTTTATGCTAATCGAACTCA-------AAGAAATATTGATAAAATTTAAGAAAATATGAAAGATGCAATTCCATATAATAGAATTAAACATTTGACCAGTTTTAACCTTCAAAGTAATATTTTTCAAAAATTGTACA-----AGAAAAAGAG----------AACTTTTGTTTAGAGCATTTATGTTTTCTTGTCCATTTCAATGCTAATCGAGC------------------CCAAAGAAATGTTTAAATAATTGAAGAAAATGTGGAAAACTCTTGAATTTGCTTTGCCTTTTCAATTTTCTATGCAATTCCATATGATTA---TTTAACATGCTAATTGAAAGTAACAAAAAT-----CTATGTAAATGCAT----------ATTTTATTTATGAATTTGAAAATTTGTGTTCTTATTG--TTGTTGTTGCTGTTGTCGGTGGCAACG--ATAAAAGTTGTTGCTATCGCAGCGAT
>CG4004 12581373 12583722|16083 chrX 12582836 12582951 scaffold_2 1241696 1241800 - -624|0 115
TGTACGTTTGTCAAGATATACAAGATTGCTTTAATGAAAATATGCACGAGTAGTACATCGAGTTTTTGAGAAGTGCATGAAAAAATGAAACTTGTAGTTTCTGGAAAATTCGCATG
TGTATGT------AAATATGTCAAATGTGTGTCGTCAACACCTGCATGCGTGGGCGTCTGTGTGTGTG---TGTGTGTGTGTGGGTGTGTGTTG-AGTGTGTTGAGTGTGCG-GTG
>CG4004 12581373 12583722|16084 chrX 12582952 12583357 scaffold_37 399216 399645 + 7758|0 469
TTTCCAAGTTTTGATGTCCTTTGTGTGTGAGCGTATGCGTGTGTGTGTGTGTCGCCATTTGCCTTTC--TCAGCGTCTTTGGTTTTGACATTTTGCCTCCTTTACTAAAC-----CACACCAACCCCCCCCCCCCACACAATTGCCTTTACCTACCCCACCACACCCCTTAGTCATACTTCTCCTACGGCAAACAGTTTTTGGTCGTAGTCAACCGCATTAATCCATCCC-CATCTCAGCGTGTGTGC------------------GTGTGTGTGTGTGTGTT-TGTGGCACAAAATGAAAATGGCAAAACAAGGTCAAGTGTAGGGAGCAAAGTTTGTTTGAGTGGCACACACACGCACACACAAGCTACATACAAATAAGCAAATA--------------------------------ACACAAAAATAAGAAACA-----TTAAGTTCACATCACTTTTTCATCAAG
TTTTCGCTTTTTG------CTTTTGCTTGCATGTATGTGTGTATGTATTTGTTGTAGCCGGCATTTAAGCCGGCG-CACAATTTTAGGCAAATTACTGCGTTGGCTCAGCGTGGTCTTGGCTTTTGCTTTGTCATACAAAGTTGCCGATGC-TGCCCCGCCTC------------TGCTTCC-----------------TAGGCCGCAATCAACCACAATCAGCCAGCCCATCTGTAAGCGTGCGTGTCTCTCTCTCCCTCTCTCTGTGTGTATGTGTGTGGTGCATGGCACAAAACGAAAATGGCAAAACAAGGTCAAGTGTAGGGAGCAAAGTTTGTTTGAGAG---CACACACACACATACAATACGTATACACACACGCACATACATGTGTATGTATGTGTGTGTGTGTGTATGCTGACTAAAAATAAAAAACGAAAGCTTCTACTCACATAACTTTTTCATTAAG
>CG4004 12581373 12583722|16085 chrX 12583371 12583962 scaffold_26 1108385 1108964 + -774|0 388
ATTCATAATTTAATACATTTTAAATGAATTAACATTATAATTTATATATACTATATACTTCTTAAGAAATCGA------AATGGAATTGTTTTTGCCTTTTTTTGTAATATTG-TTAGGCTATAAAAATCCAACAACGCGTCATTATTTTTTTTTATTTTT--------------CTAATAAATAAACAAGTTGTTTCGATTTTAATCAGCTGGTGTATCGAGACTAAGTACATGTGTCAC------------ATGTATGTATG--TACATAAGTATGTA--CATATGTATATTAGATTATATAAGTTAGAACAAGTGAAATCGTTCGATAAGGCTTAGAAAAATGATTTCTTATTAACAAAACGCCAAAAATAAATGAATTGATTAAC
ATTTATATATGTATAT-TTATAAAAAAAAAAGTATTTTAATA---ATATAGT---TGCTTCTTAAAGTGCCTATGCTTTGATTTATGTGTTTTTTTGTTTTTGTTTTGTTTTGCTTTGACCTGTAAACTATGTTTATATTTAAATTTTTTTACTGATTTTTATCCCATTTCTGGGCTGAGGGTTCGGGTAGTTGGCTTTACTTCGTTCAAGTACGGGTTCAAGCATA-GTACACGCGTCTCCTCTTTAGGCTTATGGCTGCCTGCTTACATAGCTATGTAAACATATTTCTGTTTATATATATATATT-GTATATATAAATTCATAT----AGATATATATATAT-ATTTCTTTTATACACAT-------ATCAAATTCTTTAAATACA
>CG3812 12604559 12604920|16124 chrX 12604495 12605290 scaffold_6 1466449 1467164 + -1905|65 464
GCTATGCAGCAATTCAATTCAATCCAAACACACACACACACACAGC-CAGCCACACACACTCATATCCAAAAAATACGAAACACC----------TCATGGCGTAGCTGAA--------------GTGTC-ACGTTTTGGGGGCTTTTAGTTG-GACACGTTAACTGGCAA----TCAGCTTTATTTGGGCCTAT-TTGGGAATTCTATAGTCCACA-----GTTGTGCAATTATCGTACACGTG-CAGTATTTGTTTTGATATTATTGTTTAAAGTCCAAACTATGTTTTGTCATCATTTTATTGCATACTTTTCGTAATTTATTTCTCTCAAAAATGACTTTATGTAAGAATATTTGTCATTAGAGTATTCATTTTGAGGCGTGTGAAAAATTAATAA
GCGGCACGCCATTGAAGCACCATAAACGCACGAGCATATCGACGACATCGCCACAGGCG-----GTCCGGGAGCGACGTGGCACCAACACGAGCATCGTTGTGGAGCTGGATGACAGGGTTGGTGGCGTCAATGCGGCGGGCGCATCGGGCAGCGGCACCGCATCCAGCAAAAGTTCACGGGAACTTTCGCCCACACCGAAAAACCAACAGCCCAGAAAAATGTCACAGGATTATCGTTCGCGTGCCGGCAGGTG-------------------AGGCTTACATA--------CATCATTTC------CACGTATTGCAAATAA-------CAAGAAATACTATAAATAAAAATATT-----------------------------TAAAAAAAGAAGAA
>CG3775 12637613 12638171|16165 chrX 12638165 12638535 scaffold_3 5186343 5186663 + 227|0 6
AATGTAA
CTTG-AA
>CG4645 12745647 12745852|16343 chrX 12745343 12745722 scaffold_24 922936 923296 - 12046|307 382
GATGCATTCCGCGAGAAACCAGTTCGTCAACGTCGCTGAACTAAGCTGTAAATTAAGTTGTCCCTATTTTTATATT
GCAATAATACCGGATAGACCAGAGCGACCA---TTCCAAGCTAAGC--AAATTTCGTTTGTTTCTTTTTTTTTTTT
>CG4645 12745647 12745852|16344 chrX 12745836 12746118 scaffold_23 38043 38357 - 1038|0 16
AAAAAAAAAAGAAAACA
AAAAAAAAAAAACAACA
>fne 12779428 12779740|16391 chrX 12778481 12779877 scaffold_24 960377 961975 - 24167|1062 1504
GCG------------AACCAGCCAAT-----------------CTGGACTAGACCTTTCCAATACTCCACGATCTGTTTGATTTAACAACAACCTAGACTATAGATTGATCTGATCT-------GATAAGATATGATGATATGATACGATGATATGATGTGACAAAGACAGTGTAGTCGAAATTGCG------------------------AAATTTAGCGCGAGTTTATGATATGTCTATCAT--------TTGATTTGTACGCTAAACGAAATTATTATGATTG--TAATT------------CTAATGAAATCTTAGTGAAAATTGATTTATTT------------------------------------------CCATCTCTATAATTTAATTTTATTAACTAATC------CAAGAAATGAAAAAATGCAAAAAAAA
GGGCAATCTCTGGACAGCCAACCAATTTCTGTTCGTGAAACAACCAAACTGAATGTATCTATTATTTTTGGATCGAAT---CTCCCTTTCACTCTATGCGATGAACGAGTATAATATATATAGCACAAAAATATGATGAAGGAAAGTAACTATGGCATTTGACAGCGA-GTTGTAGTCATAATTGAAATGCACACACATACCATAACACACACACTCTGTGTGTGTGTGTG-TGTGTGTGCTTTTACCTATATTGATTTGTATGCTAAACGAAATTATTATGATTGATTGATTGATTGATAATGATTAATGAAATCTTAGCGAAAATTTAAATATTCTATTATGTTTACTTTTGTGGGAAATTACACGCAGCACTTACATCATTTAACCAATTTAAGTTTATTGAACAAACAACAAACAACAAAAAAAAAAACAAAAAACAAA
>CG32643 12818854 12819142|16436 chrX 12818548 12818910 scaffold_24 1041445 1041859 - 3423|363 429
CGAAGGAACGAG-GAACCATGCCAGTGTACA---------CAACAAATGAATTAACTGTTTCAATTA
--AATCAACGTGTGAACCAT---CGTGCACCACCAAAATTCCACAATCAAATTTGCAGTTTCAATCA
>CG18646 12909736 12910072|16557 chrX 12908656 12910562 scaffold_24 1186388 1188321 - 62447|1152 1503
TTGGATGGATGTGTTCCCGTATGACTGGTCCTAAGACTTATGGCTAACACACATAGAAATTCGCCATTAACTATATAAGAAAACTACAAATTGTGAAAAATTTTTTCTCAGCCATAACCTTTTGGAAATTGTAATGATAATTCGGAAGAAAATTTTGAAAATATTTGGATAAATTATATAGAATTGCAGTGG---------------CGAATTTCTTTAATTTGAGCGTACTTTCATTATGATTGTGGCGAATAATTCTGAGCAGTGATTGCGAAAATACCGATTTTATTTACAAATAAACTCAGTTAAGTTCAAGGCAGTTCGCTAGATTAGCTATTGCAAAAAAAAAAAA
AT---TGGAAAAG-------------------AACAATTACGAAAAACAAAAAACTAAATTCAAAACTAAATTGCACAGAGAAC----------AGACAAACTTTGGCCAGCC-----------GAAGTTGCAATACTCTTGCAGCTCTCATTAATATATATATATATATAAATCTTTCAATATTGTTGTAAATTAATGCTTAATACCGAATTCCAACCTTTTGTACATATTCCAAAGATATATGT------TATTTCCAAACAATCCGCATGATATCGTGTTCCGTTTCCACAAATTCCACCCAATAAATGAGCTGCAG---------CCAGCTCTTACAACGTTCGAATG
>lic 12927316 12927930|16588 chrX 12927081 12927960 scaffold_24 1211353 1212257 - 12733|235 931
G----------------------TTAATGGCCGGGT-------------AGCAGGTTAATGGTTAACCCATGGCGCCGCCCCCTTAACCCCTT----AAGCCGTGCCCGTGCCCGTGTAAATTGCCGC------------CGTCTTCTTCTAGCATGCATTTCGTACATGT-TGTGTGTGTGTCCCCCGTCTGTGTG------------ACAGCAAAAGGAATAAAACTTTATTTGAATG--GAGTCCAAGGAAACCCCAAAAACAAACCCAACAGCAATCAGC-------AATAAGCGTCAGCTAATCTAAAGATACAAAATGGAAAGTGCATAATTATT--AATTTAAGTGAGAGAAGCAACAGCAACATAACCGTTACTAGCAAACCTGCAATATGCATAATGCAACAATCGCCTTGCAACGCTCAAAAATGGATAACCGAACCGTGCCT----CCCAGCTGGCGATGCTGCTGATGTCTTGAAGCATAATACCATTTTAATATATATTTTTAAATGAGAATAGCTTAGTCAACGAAAAACAAGAACAGAAGCAAGCAAAGCATTGAATG---TAAAAACGTACTAAACTTAAATGATAATTTGTGAACTTTTGAACACCAAAATAGTCGAAAAGAAAGTGTTTATAATTATAATTGTTTAACAAATATATATTACGTAAAATAGCTAAATCCT
GAGCCAAATACGATGATCAACGTTTTGTGTACGGATTCAATGAGAAACAAACAAAACAACTGTAAAT---TGCCGCCGTCTTCTACATGCATTTTTGTATGTGTGTGCGTGTGCGTGTGCATGCGCGCGTGTGTGTGTGTCTCTTTCTTCCACTGTGCAT---GTGTGTGTGTGTGTGTGTGT---ATGTATGTATGTGGAGCAAGAGAACTGCAAGAGAAACAAATTGTTAGGTTAAGTACGAAATCAAATCAATCACGCATACATACATA----CAATCTACTCTATTATATATATATATACATATATATATATATATACTGCAAGG----TAATTTTTCGCATTTGCGGCGCTCAAGTGAAAATGAAATGA--AATAAAATTAAA--TGCGATTCGCAATAAGCAAAAGT------------CTATAGAAACAAAAACCAAACTGTGCCTCAGCCTGGGCAGCCCAGCCAGTTGCTGTCAAACTGTACTATGTTAAACTTCTAGATCTACATATATAACACAAG---AATCCACTTACTGTATCTACTGCAGCGTGCCACGTGCAACATGCCACAAAAATATAAAAAAAAAAAAAAAAAAACCAAAAAAAAAAACGCATCAGA--AATCGCCAAGCAA------ATTATGTAAATTG-TTAACAAATA-----TACGTGAAATAGCTAATTAAT
>CG2200 12929443 12929674|16589 chrX 12928481 12929589 scaffold_24 1213475 1214481 - 37159|966 1112
CCAAGCAAAACGATCGAATTAAAGAGAACATTGATGTTTATTGTACATATGCACATTCATAATTTGTTTTATTCTGCAATAACAACAATTCCTACACGTAAGCAGTACACATACAGTAGTTGTACACTATGACTAAATGTATAAAAA
------AGACTGATCTATATATATATAGTAATACGAAATATTGTGCA-----ACATTTAAGCATTGTTTTAT-----ACTAACAATTATATATAAAAAAAACAAACAAGAATATA-CATAAGCATATTAAAGAAAAATCAATAAAAA
>rad 12956786 12957004|16619 chrX 12956383 12956890 scaffold_31 246592 247083 + 24370|406 510
AGCAGGCGATCGGGGGGTTTTCTTTTTGTACAGGAGGTGGGGACGAGACGAGAGATGGGAGTCGCTCTATTTATTGTTTTACAAACGATGACGCCCGCTTTTTAT
GAGCGGCTCGGGGCGGCTTTACTGTGTGTGTCTTATAT---------ATTATATATATATATATATATATTTTTTTTTTTTTTGTTGCTGTTGTCTAAGTTTTGT
>rad 12956786 12957004|16620 chrX 12956891 12957811 scaffold_31 247300 248221 + 16431|0 127
TTTTCGAATATTCTGTTGGGTTTACA-------------GTTAGCGTTAACGTTATCTAGGATAAGTATATAAAGTAG-AATTGCAATCTTTGTTATACAAATACGAATATAAATATATATATATATA
TTTGTTTGCATGATGTTAGGTTTACATAGTTTAGTAGTAGTAGGCGTTATATTCTTATATATATTATGCATAAGGCAGCAAATGCTGCGCGCTTGTTATAAATACATATCAATATATATATATACACA
>CG4330 12968374 12968502|16631 chrX 12966877 12968430 scaffold_31 257266 258873 + 87233|1559 1619
AGCAAGCCTA-ACT--ATACGCTAT-TTTAGCTAGATCATAAGCATTTGTGATAATTCCGA
CACAAGCCCAGACTTAAAACGTAATATCCATTTAGAGCATAAGCATGTGTGATAATTCCGA
>CG4332 12990801 12991306|16662 chrX 12989032 12990843 scaffold_31 1210957 1212767 - 85759|1792 1834
TCCTATATCAGCAAAAGGAGTAAAGGTTGCACATTCCGCCTAT
GCTCATGACATCACAATGCTAAGTAGCTGCATATTCCGTCGAT
>CG12096 12995397 12995506|16664 chrX 12993725 12996302 scaffold_31 1216009 1218498 - 70663|1695 1806
AAAGCCGGATGGCAGGCATTTGCGGCCTTCGATTGCAAG--TCCTATGTTCAAAAGCTTCAATTAACATCTGAATATGTATTTATAAAATTAAAATTTGATTTAACTATTAG
CCA---------CAGGCGCTATCACACCTGGTCAGCCGGACACCCACATTCACACCCACACACTCACACATACACCCTAAGCAATACAAGT-AGCTGTGAATGCACT-----
>REG 13047461 13047918|16732 chrX 13047474 13047634 scaffold_37 301408 301562 + 140|0 166
GAAGCCCGAGCCTCAACTTTTTTTTTTCCTTTCCATCATCTTACTTTTCAA-TCAATAATCAGCCCGTAGAGCGGACGGTCAGCAATTCTTGTCGCTACTCAA-----AAAGCTAAGATTTTCCAATTCGGTTTACAAACATCAAAATTCTTTAATTGAAGAGCAGT
GACGCCC--------ATTTATTATTATTATTATTATTATTTGTTTCTTAAAGTTAACAAACAGACCGGAAA---CGCCTCCTTCTCCTCCTCTTGCTCCTCAATACTGGAAGCCAACAGCGTCCGCATCCCGTTCCAGAGCCCGCGTATCCGT-ATTGAAGCGGGGT
>REG 13047461 13047918|16733 chrX 13047691 13047781 scaffold_37 301731 301819 + 2585|0 95
TCTAGAATGTAATGTTGAGATTGGCGTACAATACAAG---AAACCGATGCTG--TATAGATTCCACTAATAGCTATAGCTATGCATAAAAAGAATA
TCTAGATAATAATCT--AGATTAAAGTAATATACAAGCGAAAGTCGATGCTAATTTTAGATTCCA-----AGCAATAGTTACACGTAAATAAAATA
>REG 13047461 13047918|16734 chrX 13047785 13047974 scaffold_5 5792404 5792586 - 693|0 147
GAGCTCCATTGACACATTTT-------------TTCAACATTTCCTAATGTAAATTTATAACACGGGCGCCCCTCATACGGAAAATGTCCTTAAAAATGTGTGAAATATAAATCTTTATAAGT-AATTCGCTCCGAATAGGTAACACT
AAATTTCATACATACATTTGGATTTTGCACAAATACAATATACCCTTATACCAATTTTTA--ATGGGCTCAGAGTATAACAAAAAAAATAAAATAACACTGCAAAATA-AAATCAAAATAAATAAAATAACTTAAAATAAATAA-ATT
>comt 13095802 13096431|16789 chrX 13095623 13096421 scaffold_46 366379 367298 - 9690|179 951
GGCATCTTAAACTGCATGTG---CCCAAATGGAGTCTCAATTATTAGCTTCTAAGTGCTAAGGACGGGCGATGAATA---GCGATGAAACCAAAT---CAGAATCTCAATGTACACGTACATATACA------------CCGCTAAACATATACACAGATATATAGA---------GTTATATATATATATACGATCCAGGCTTCGCGATGTTTGTTCG----------------GTCCCAAAGCCCAGATAAAAATCACAATCCA---------CATCCCGGAGGAGTTTCGTGTGCT---TCTGAGTTCCCCCACAGAGCTCAATC-AAATCAGACAGATATGTGAGACCCGTGACCTGA--------AGATGATGGCAT----ATAAATGACATA-----ATATATGGCTTAAATGGACAGATACTCAATTACATTTATAAATAATTAACACGCGTAGCCACTAACTCGTTAAAGGCATGATAATCTTTCTCGTTACCTTT-------TAATTTT-----AGGACTTTTGCT--TCAGTAAATTCTC---------------AATAGGAAACGAAAAA------------------------------ACGGGAGAAAACACCAAAG-----TATTTGCCTTTGGGCATTGTGAACGTTGTTTATCGGTAACTAAACTAATTAAATATTT--ATTAAATCAA-----------ATATTGTTAACCGCCAATGTTATAATTATATCTTGAATAAAGTAAAACAAACTTAAA
GATGTT---AAGTGAAAGAGAAACTCAAGT-AAATCTCAATTATTAGCGTTTAAGTAAAGAGTATGTCCGATATACGAGCGCGCTGTTAACATATATATATATATTCTATATATAT-TATATATTCGAAAATAATCCCCCCATTAACCGACTTTGAAAACGCGTTAACTGCTTTGCATTGTGTGTGTTGGTCCAGTCCA-GTTTCCCGTTCTTCCCACGTTTCAAATTCCAAAACGTTCCTAACCTAAAATCGAACCCAAAACCAAGTGCAAACTTTTCCCCAAAATATTTCCTGTGCTATAACTGAAAGCAC-------GTTCGATCTGTAACAAACAGAAATGTGAGACCTGTGACCTGATTTGGCATTGCGGCTGGTATTACGAAAACTAACATAATCCTATATATAGAT---ATATACATATATATTATTAAAATCGATACTAATCTCAACGATAAACGATTA---CGATATACGCGTATAAATATTATACATTATATTTGTTAGTATAATTTTTTTTCAACATTTTTTTTTCTCGTCATATTGTTATTAACTTAAAAAAAAAAAAAAAACGAAAAACTTTTGTCTTGTTAGTCTTAAGAATTTGTCGCGGAATAGAACACCAAAAATTGTTAGGAGAATTTAATCGGAAGAAACGTTGTTTAGCTTGCAAAGAGTTTATAACATAATTACATAAAAACAAATACTCAAAATATATTGTTAATCACCAATGTTATGA----AGCCT-AATAAAGAAAATCCATCTTGAA
>CG15743 13121432 13121678|16833 chrX 13120137 13121532 scaffold_26 1944264 1945652 + 54948|1324 1427
GGTCTGGTCAGCTCCCCTACATTCTAACCCTTCCCGAGGAAATCCCCTCGC--CCACATCGTTTAGGCAGCATTCA-AAAATAGCTTTAAGTTAAAAGAAGGAA
TGAAGGGTTTGCCAATCTGC-TAATGCCCAATCTCTGGAATCTCTGCCGGCAGCTGATGCACACATGCAACGTCGACAGCCTAGGCTTAAGTTAAATGATAGAA
>CG15744 13127816 13128373|16835 chrX 13122853 13128191 scaffold_25 1290792 1296444 + 183673|5462 5921
CTCGGCTCACTCAGCCCAACCCTAGTTAGTTGTATATAGATTATA-GATATATATATATATAGATATACACAAG----------------------ATGTATAACCTTACCATCCCGCAACAACCCC-----GCTTGGCCGGCAATCCAAAAGATTAAACGTGCCAGTCCCAAAGTATT-----------TTAGTACCAAGATGTGT-------ACCCAACCCACTGACCCTCGCCAATATGCATATGTATGT------------------ATATATATATATATATGTATATATATGGGCAGTGGGCTTATATCTTAAGTTTCGCCCACTTAAAACCTAGCCAGCTAACTGAACTTGTA-ATTATAGTAAGGACTCCCTATTTATTATGACT-------------------AGTATTACTCCACAAAAGATCAACAAATCTCACACTCACCGGAGAAAA
CACAGCGCTCGCAA--CAATCCTAGTTAGCT---TATAGAATATATAATGCATATATAAAACAAAAAAAAAAAAAAAGAAAAGAACATCTAGACTTAGGCATAGTTATAGAGACATACGATAAACCCTCCGTGCTTGGCTGG--------ATGCTTGCAGGTGCCAATGCCAAAGTAATCCTGTCCTCAACTAGAACCTAAGCATTTTTATATAGACCTATTTACTGTATATTGTAATTGTACTTTTTTATGCTTGACAGGTGTATGTCAGATATATGCCTATATATATATATATATAGTTGTCTAGCCTAAGTC----ATTTCG--CATTT--ACTCTACCCAATTCACTCGACTCCTATATCAT------------CTATTTATTATGTCTATATAGATATCCTGTAAGAAATGCTATACAAAAAGAGATTATGACATTTCGCAAAAGCAAAAAAAAA
>CG1622 13133511 13133847|16839 chrX 13132600 13133511 scaffold_37 536839 537829 + 31111|1021 1021
A
A
>CG1622 13133511 13133847|16840 chrX 13133634 13133853 scaffold_37 538124 538376 + 4192|0 252
TGGAAGCCACGAACGTCAGTTGCGCTTCTTACTCAGGTTAAA---------------------CACTCTCCGAAACCCCGAAATGTTCCATAACTAACACTAAATCTAGACACAATCACATGCGGACACAG-----CAGC--AAGGCTATATTTTGTAATTTGTGACT-----ACACTTACGCTGATAAAATAGTTTTCAAGTTGTG-TTTATGA-AAATAAAGTCAAAACTTATTTGTTTAA----AACGTT
TGCAAGCCCCGC-TATCAGCTG-GACTCTTACTCAGGTTAAAACAGACACATCCATGCAAACACACACACACACACACAGTCACACTCACACACACACACTAA-TACATACACGAGCAAACGTGCATACAGACAAACAGCGTATGGCTATATTTTGTAATTCGTAACTCTTAAATATAAATGCTGATTGTACATTTTTCAAGTTGTGTTTTATGCTAAATAAA---AAATAACATTTGTTTAAGCCCAACGTT
>CG15745 13140936 13141331|16845 chrX 13139232 13140986 scaffold_37 542721 544416 + 41756|1850 1907
AG-------AATTCGGGTTGGCAAAACGGACAAGTAACAAAGTGGAGCAGCCTAGTAA
AAGCCACACAACGTAGGTTGCGCAGAGGGGCAGGGGGTGCTGGGGGCTGGCCACGCAA
>IP3K2 13162703 13163254|16881 chrX 13162298 13163282 scaffold_37 577748 578944 + 17598|453 1206
TGGGAAATC------------------------------CATACATTTCCACACGGAGGT------------------------------------------TTGGGGCTGGGCCCCGGAGACAAAGACATTTC----CAATTTCCG-----------------------------------------AATCGATTAATCCCCAATT-CCTAGGCTTAGT----------------------------TATACATTTTT---TTTTTG--------------TTTTTTTCTAACAGTTTGCGTAC-----ATTTAACCCCTTAAGTTTAAAATCAAAGACTGAAATCACAATATGCATACACATATTTTTTAATATATACG-------------ATATACGCGTACATATACATATATAGAAGATATATAGCCTGGCCTATATGTGCTGCTGCTGCTGCTGTAGTGTAATTTATTTATCCAAAACAAAAAAAAAAACAAAAAAATTCACGTTTGGCGAATCCTAGAGATACCCGAATGGCTGGAGATAATACCCACAAGGCAGTTGCAACTGTCGATCGTAACGATACGAAAA-------GTAACTAAGAAATGAACACACCCAACACGCAACAAGAGCTTAGACTAA----GTTTTTAATATAATGGTTATGCGACTACCTACTAAATAC----TACTAAT--TGTGCACTATT-AAATTCAGTTAAAACA---AAACGAAAAAACGAAAGTA
CAAGAAAATAAAAATCGATAAAATATATATATATATAAACATATATATACATATCGAGATATATAGAAAACTATATAGTTAACGATAATACTGAAGCGTTCCATGGGGCTGCGCCCC---GCCAAGGAAATTTCCTAGCACATTCCGCAGAAATGTGTTAAAAAAAAGCAACAAAATGAAATATGAAAAATCAATTAATTAACCATTACCCAAACTTAGTCTAGTTGTCAATCATATATATATATATATATGCATATATACCTACTTGCGTATGTATGCAATTTTTTTTTTGTTTTTTTTCCCACTCTCTCTTTAACCCGTTAAGATTAAAAGCAAAGACTG-AACAACAATATGCGTATACCTATACACAGATATACATATATATCTACACACACACACACACACACACACATATACATATTATATATATATATATATATATATAC-------------------ACATATATCTAT-----------ATATATGTATATATAGTTAAATTCGTTGTGCTCCTGCGTTGCTATTGTAGTTGTAATTTAT-----TAATGCAATTCGCAC-------AGAAACAATGCGCAGCAAATACTGTAACAACAACAAAAACAAGTTCAA---GTACTATTTACTTATAAAAATAATGTTATTAATATTATGTGTATTTGATTATCTTCTAATAACTACATACTAATTATGTGCACTATTAAAACTCATGTAAACCGTTTAACAAACAAAACTCGATCA
>CG15747 13173542 13174956|16887 chrX 13172302 13173886 scaffold_36 550962 552545 - 41495|1320 1701
AATGCATCCAATTAAAGTTCGAGTTGAGGGAA---AAACA--AACCAGTGATTTCTGTATTGTCTGCTTAT--------TATGCTAATTTCAAT-----TTGTCCCATGCTCATAAATA-----ATTTATGTGCACGCCAACGC---------TCTTAGCAGACCCTTTTCGGTGCAAATATTTTGCATAAGTTGCAACAGACTCCCCAGCCAGCCCGTTTGCACTTTTCATCTAAAACAGAGAACAACAGCAAAAAAAAAATGGGTAAGAAGTACAAGGCATGACGGATGGAACC--GCAGGAAAAGTTGGGTGGGAAAAACCACTGGAGGATGAGGAAGTGCCTGAAGGAGCA---GAACGCGAAGATATTCCATTTATT
GACGTGCCTGATCCCGACTCAATTTGTGACAACTTAAACATTAAACGGCGCCT--CGCACTCAATGTTAATTTTAAATATATACTTATGTACATAGATATTCACACACACACACACATATATATATATATATATATATAAATGTATATCTAAATTATGCGAGTGCTTCCTTTGCGCAAATATTTTGC--------CAACAGG--------------CATTTGCATAGGCCGGAAAAAAAAGACAATAATGATACAGTAAAAAC--------------ACGCTTGACGGAACAAAGCTAGTATCAAGATTGGGCTGGTAAATA----------------AAATGTCTGAAAGGAAACTTGTATTCGAGTGTGTTTTTTTTTTT
>CG15747 13173542 13174956|16888 chrX 13174024 13174354 scaffold_21 2236528 2236800 + 2553|0 330
ATGTTAAAGAATTTACACCAGAAATCATTGGGCTGGGTGCCCAATTCGAATTATGATAAAGGTAGACACACAGCATATTTGGGCTATAATGACATATTGATCCAAACATATGTATTGTACATACATACCTTGCTAAATCCAACACAATGTAAATAAGACGATGGTAGGCAAAAAATTCATCCCTATTGATTTTATAGTGTCCCGAACAAATCCGCGTTGAGGCAGACAGCTTATGCAGAAATGACTTTTTAGGTTTAGGTTCACAAATATCTCGTTCACTGAGCCGGAAACTCCTAATCCAAGTTCTAATACCCACTGCAAGGGTATAAGG
ACGTCGAAGAATTAATACCC------------TTGCAGGCACAACT----TTTTCATAAGGGTAAATA----GTTAATGCCGATCATAACGATATCTTGAT--AAACAAAAAAGTTGTTCATACAAG--------AACCCACTAGAAACTA--CAATATAGCTGTAGG-----------TTCTTGTAGAATATATAGTGGTCCGATCCGACTCGGCTAGAAGAA---------TATATAAATGCTTTTATGGGCTCGG------AGAAGTCTGCTTCTATGCGTTACACAATTCACGACAAAATCATAATACCCTCTGGAAGGGTATGAAG
>CG15747 13173542 13174956|16889 chrX 13174399 13174653 scaffold_36 552709 552942 - 3758|0 259
TAACAAAGAGCCAACTTGGCGTTAGTTTATTTTTTTTTCTTTTTCTTTTTCTTTAGCCATCCCTTTTTTTGTTTTTGCAACATTGTTGTTGCTTCATTTTGCCGCAAATGCTGGGAAATCCTTTTGGAAAATAGGTGTGCCCGCCGCCATAAAAGCGAAAACCAATGGACCAGGAGGG---TGGAGCGAAGCGGAGG--CATCGCGAAAGGAGAACGGAAAGCAGCGAAAGCGCGGCGAGCACGGCTGACATGGTTAGGA
TAACAAAGA-CCAAGTTGGCGTTAGTTA-------TTTCATTTTTTTTTTGGGGGGGTAT---TTTTTTTATTTTTATA--------TTTGCTTTAGC---CGGCAAATGATGTAAATCCATTTTATAAAATAGGTGTGT---CAGCCATAAAAGTGAAAGCCGGCAACGTTGAGATGACATGGTTTGGAGCGGTTGTCTGTCGCTGCAGCGCATTGCAGACAAACACAAGTACAG-GTACAAGAAAGACATAGATAGAA
>CG10617 13199899 13202118|16909 chrX 13199036 13199941 scaffold_36 568269 569174 - 43687|887 933
ATAGAAGTCTCGCGAAGATCA----CAGACGGCGACGACGGCGGCGG
AGGG-----TTGAGAAGATCGAGCTAAGGCGGCAGCGAAGGTGGCAG
>CG10617 13199899 13202118|16910 chrX 13200058 13200177 scaffold_28 504742 504854 + 2074|0 119
AAAGAAGAGAACGACGAAAAAAACAGAAGAAAACCTTGTGGAAAATTGCATTTACCACACTCTAGCCATGAGACTTTCTTACTTTTCTACTGCTTACGAACACACACACAACCAGAAGTA
AAAGAAAAGGGGGAAAAAAAAAACAACAAAAAACCAGTTGGGAGC---CGTCCGCTATGCACAAGCGACGCA----TCGTACGATCCACACACACACAGACACACACACAGACACACGCA
>CG10617 13199899 13202118|16911 chrX 13200812 13201009 scaffold_5 1856642 1856812 + 1617|0 199
AGAACAAAACT--CGATAACCGATAATCGATAATCGAGAATCGAGAAGCGGCGAGCCCTTTAAGCATTGTGATATGATATAATAGCAAACGAAGTGAATTCAGAGTGCGTCTGTGTCAAGAGCGGAGAATCGTATCGAAGGAAATCAAAGTATTTACGATAGCTACAATCCATAGTCGATATAAAATATTAATAATAATA
AGCACCCAACTACCGATAAACGATAACCGATAATCGATAACCAATAACCGAT------------------------ACATGATAACAAAAATATTGCATCAAATCAGCAGCAGCAACAGGAGATGCAGATGA----AGAAGAAACAGAAGCAGAAACAGAAGAAATTATTGAGGATTAAAATAATG-ATCAAAAATAATA
>CG10617 13199899 13202118|16912 chrX 13201215 13202113 scaffold_36 572013 572658 - 477|0 911
ACAGTAAAGGACAATAACTTTGCAAGCATTTACCA--TATGATTCCATGTTAAACACAAGTAATTATAATTACCAAACATTAAACAAAAGTTCGTTGTTGGTCCCGTTTTAACATGAACCGATTGTCCGCTACAACCTTATAATATATGATGATCATA---ATGTATATGATCCTGAGACCATAATAGAACGCACTCGAATACACGAATAGTACTTTCCTAGTCGCACCTGCATTTTGACCAACCAACCAATCGAATCGAAAACCTGGCACATTTCTAGCTCAAGCTTTAATCAATGTAATCCTCTAATAGAACTCAGTAACGTTTTTGAATCACACTTACTAAATGGATATAAAATACATATATGTATGCAGAGGGACAGTGCGTTTCACAATTGTATGAAGTGAGATAATAGCATTTATTCATTCGGTTCGAAGAACACAATTTCCCATTTGACAACTTTTTGCGGTAAGTTCGATTACATATCCTAATTAAAAACAGCTGGCTGAATTCGAAATTATTTGACAATCGCCAACAGTTGGCCATCATTTGTTCCGAAATTTAAAAGATTGTTACTTGTG-AAACGCGC-TGCACCGTATATATAAGCATATATGTATATATTTACACAAAAAATATATAAAGAAGGCATTTAAAAGGCATTAAATGGAAAGTCCTTTCACCTAAAAACTTCTAGTATATAAATCGCTGAGAATTTTTTTTTCTTTTTTTTACGTACTATTAGCTAATGAAACGATATGGCTAAACTCGAGTTGAATTTGTATTTATACGGAAATATATATATACATATATATATATGTGTGTACGTGCTATATAAGATAATGAATGCTACAAATTGTTATACACGT--AAACCGAAATTGACTCAAATAAACGAA----TAAAGATATTAA
AAAGCAAAAGACAATAACTTTGCAAGCATTTAAGAACAAAGATTCCA----AAAAAC---------CAATTATTAAACATAAAATAA----------------------TAGCTTGAAACACCTTTTGTTTACCAGGTTA-ATTACCTGACGCGCACCTGTATGCATATT-TCTTCGATCTATAGCTAGACATATTCCAAAAAAAAAA----ACT------GAGAAATCTGAGAACTTTATAAATGACCAATC-AATCCAAAACCTGGCACA---------CAACCTTTAGCAGCTTTAATATTCCAA-----------------------------CTAACAAGTAAATATAAAACGAAGAAAGATTTAAAT-----------------TAATTATAAAAACTAAGA-AATA-----------------------AATGTAATTGCTTAT---AAAATTAATTATTGAAACATCAGTTTTGTACTTTAACTAAGA------GTCTCAAGCATAAAATAGCTACAAATTGTTAAAAAC---------TTAGTTCAATAATTCTCGTGTTGAATATTTGTATTAACATGCATGCATTTGCTATACACACACACACACACACACACACACATTACACATA-------------------------------------------CTATATATACCTTATATATACATA-------------------------TACATA--------------------------------------------TACATATATCTATATATATATCTATAT---TGGATAGATGTAAACGATCTATAT------GCGAATGCTACAAATTGTTATACAAATAAAAATCGAATTGAAATAAAACAAAAGTACATTCAAATAGATTAA
>CG1640 13213519 13214097|16923 chrX 13213354 13213977 scaffold_28 516100 516723 + 7618|165 689
ATCAGCTGCCAACTTCCCCGTCCTCGATCCCTGTGTTAAGTGTCAATCCTCCGGCTTAGGATTAAAAATTTAAATTACCCTAATTGTTTTTTTTTTTTCCTCTTTGT------TACTGTGTCATAGCTGAATGCTTCTAAGCTCTTCTTTATATGCATATATAGATATATATGAGAAATATATAAAAACATTTTTAAAACCCTATGATTTGTGAACCCAACCCGCGCAGGTTTTATCGCCACGATAACGTTTCCAGTTAGCAATTA-----------ACCCACTTAACCATGTA----------GTCTTTGATTCT----TAATTGAACGAAAACTCCTGGCGGAGATTTGACAATAATTTTTGTTAGAACCAAA-AGTAGTTTACCATCTTTTGGTCGGCGCATAAT-------TGAAAATTCTGATAT---------------------TGTTCTAAACGAAAGTTATTTGCATTGTGTATATTT------ATATTTATCTACACATAAATATATATAGCCCT
A-----TGCCAAC-------------AGCATTGCGCTCCCCACCCATCCAGCAACCAA--ATTGAGACGTGAAACAGCTTTTAATTTTTTTTTCATCCCAAAATTATAAAGTGTATTTAATAAAACATAAAAGTAGTGAACCACTTATTTAT-----------GATAGTTGCGCGA------------------------------GTTCCTCTACTCA---CGCTCGAGTTCGACCGTGTCTATTCGCATTATATACAACAAATATATATATATATACATATACAAATATATATGTGCCATATGTTTATGGTTTTTAAATAATAGAATTGAGGCACATTACCAAAA-TTGACAATAATGTTTGTTTGAGCAAAATAGTTACTTGTTGCTTTGTTGCCATCGTTTGAGATTGTTATGAAAATATATATATATATATATATTGTACATTTGATGTTCCCGCTAAATGTTATATATATTGTACTTTTGTTATAGAAAAATTATGTAT-CACAAATACAATTGGCATT
>CG1640 13213519 13214097|16924 chrX 13214009 13214277 scaffold_28 516754 517012 + -616|0 99
AAAATCATATGATGTG---TGTGCGTTCAAGTCATTACTAATTGTTATAGACAAGAAGAA--------ACTTTGAAAATAAATAAATAATTATTATTGTT
AAAAGTGTGCAATGCGCATTGCAATTGCTTGTTTTTCTTATTCGTTCTAATCAAGCACACTAGCAGTTACCCTGTA---AAATGTCTATATATTATAAAT
>Tim9a 13219730 13219819|16933 chrX 13219067 13219862 scaffold_28 523342 524111 + 17714|692 786
GTGTTATAGCT---GTTACAAACAATCTTAACTAGTTTAGACAACTGAGATGATGCATTTTCCTGCATTTGTCAAAAT--AGCTGAGTAAAGAAA
AGCACACAGTTCGAGTTAC---------TAAGTAGTTTAGTTAAC------AATACAAATTCACACCGATAGCGAAGCTGAGCTAAATAAAAATG
>CG1662 13222687 13222783|16935 chrX 13221213 13222699 scaffold_28 525836 527227 + 25485|1549 1561
CCCAGCGCCAGCC
CACATCGTCGACC
>CG1673 13234356 13235166|16943 chrX 13233938 13234358 scaffold_28 542464 542891 + 21546|429 431
GTC
GCC
>CG1673 13234356 13235166|16944 chrX 13234446 13234876 scaffold_28 542966 543484 + 4712|0 520
GTGTATTAGTAGGATTTAGTGCCAAGTGTTTTGTGGGTCGCCAATGTGCTCGAA-------TTTGTTTCGTTTATTGTGCATGTG------------TCTATATGC---TTGCATATATCGGA-------------TATGTACAATATATATATATATATATATAT-TATATAATATAGTAGGATA--TAAGTCGAGGGCCG--------ATTCGTTAAGTTGCATTTAAATGTATATTTATTTATTTATGTCAGG--------------------AATTCGAATTGTACATAATTCCAACTGGTTCAATGTTATTTATAGTTT----------------CCCTAATTATTTT------CATATTTTTAGTTGTGCGCCTTTAGAT-ATATATATATATATTTTTTTTTTTTTTACTTTATCTAAAGCTATGAATCGTCTTTTTGCGCTTTTACTTCCAAGCAGCATCGAAAGC-AAGGTAAAATTACCAACTACAAATTTTAGGACTAGTATAAAGAGAT
GTGTATTAGTAGGTTATAGTTCCAACAGTTTC-TGGGTTGCCGATGTGCTCGAATTTTTTGTTTGTTGCATTTAGTGAGTGTTTGCACAACACTCGATCTATACGTAAAACGCATATATAATACAGAATACATATCTATATACAATATATGTACATATATATATATATATATAA-ATACTTCTATAGCTAAGTTAAGGGCCGGGCTTTGCACCCATGCTATATAGTTACTATATATATATATCACTTTGTATAAGACGCACTTTTTTTTAGTTTTTAATTCATAATTTATTTATGCCCAATTTATTTTTTTTTTTTTGTTTTTGTTTTTGCTTGTCCACACCATTATTATTTTACCAAAACTACTTTATACTGTTCGGAATCAGATCAGAGACAAAGCAATTTTGCTAGAATGAAATTTCATAAGATTTATGAATGCCTTTTGCATGCTTTTACTTCCAAATCAAACGAAAATCGAACGAAAAAACGTAAAAAAAAAAGATAACCACAAAAAGAAAAAAAT
>CG1673 13234356 13235166|16945 chrX 13234904 13235168 scaffold_28 543639 543944 + 2823|0 324
AATTAATT--GAAAACGTACCGGAGGCGAAATGCATTTATTAGTGAGTAAGTGATCGAAG--------------------------------CGTTCTTGGAG------------------------GTAAAAGCGGC----ACGAGAGGCACGAGGGCAGCAGCCGAGCTGAGCTGTGACTAAAGCTAATCTGAACCTGAACCCGTCAGTAGAACCTAGGCCTAGGCTGTAGATACTAAACCCGAATCAAGCTGTATACTATATCTGTAACACCTAGTTGATAAGCGAACCAAGCGATGAATAAACGATGACAAAAATCAAGAA
AATTAATTTTGGAAACGTACCGGAGGC-AAATGCATTTATTAGTCAGTAAGTTGCCAGAGTCGAGTCCAAGTTGAACAAAAGCTCTAAGACACATTTCTGGAATGTATTTTATAAAGTTATCTGTTTGTAAAAATGTTGGAGGTAAAAGCAGCCAGGTGTGCTGCAGAGC-AAGCTGTGACTAAA-CTA--TTGTATCT--AGCTGTTAGTCAAACT----------ATCTATACACAAAACCTATATGTATACGAAAACTA-AACTTTATCATATTATTA--AAGCAAATCAAAGCAT-AATAAAAAATCAAAAAAAAAAAAAA
>CG1681 13242973 13243153|16952 chrX 13242559 13242975 scaffold_10 1582072 1582484 + 16124|423 425
CTA
CGA
>CG1681 13242973 13243153|16953 chrX 13242976 13243123 scaffold_1 5351940 5352085 + -181|0 153
GGACCGTCCGCCGCC----AATATTGTTTAGTTCCCTAAGGCAATCGACTATTTAACCAGATTATTTTTTTTTTTTTTGCGCTACAACTATTGCATTTT-TGTGATTATACTTGCTCTTCCTA-TCCAATAAGTCTTAGCCTTTCCATCACACT
TGCTTGGCCTTTGCCCCTTACGACTGCGTA-TGCATTATATATACTGCCCAGTTAATATTATTTTGGTTTTTTTTTTTGT-------CTGTCTTATTTTAAATTAACCTACTTGTTGTTTGTGCTTTAATCGATTTTTCTTTTGCTACGACATT
>CG1716 13254693 13254965|16965 chrX 13254518 13254697 scaffold_12 1255233 1255415 - 8914|178 182
AAAAT
TGAAT
>CG1716 13254693 13254965|16966 chrX 13254698 13254975 scaffold_5 4633906 4634205 + -1725|0 301
CA-AGAAATTGTGTTCTTCTGCGGCACCAGAAATC-GAACCTGAACCAAATCCCACACGGAACTAGAACTTTAACTTTAGATA----CGAATTTAGTTAAGCACATTCGACCC----CTAGGATGCGATCTA-----CCCCTCGTAGTGGGTAGCGTTTTAAGTGGGGGCAGCCAAATTGTACAGTTAATGAAATGGCGTAAGATGTAAGTGGAAAAATTCACAATACTTTTTGTTTCTTAAAATT-------------------GTCTAAAATTTCTAATAAATTCGCATTTTCATTATTA
AACAGTATCCGCCGTATTCGGTCAAGCCAATGATCAGCAAATGAATCAGATATTTATCATAGTTTTGTTTTTATTTTTGTTTCTTTTTAATTATTATTATTAATATTCTACCCAGTGTTTGGGTATAAACTCAGTTTTTCATTCTCATTTTTATCAGTTTATTCGTGG------CAATTTGACA------AAAATAATGCAAAAAAAAAATACCTACGTTAACAAATTTCCTCGTTGCTCAAAATGCATGAAATAAAAACATCTATTTTAAAATTTTACGTGATTTTAAATTGCAATTATTA
>CG32635 13352832 13353567|17106 chrX 13351917 13352832 scaffold_10 1140566 1141705 - 15772|1186 1186
A
A
>CG32635 13352832 13353567|17107 chrX 13353229 13353987 scaffold_10 1143493 1144331 - 1996|0 366
CTTACAGTTTATAGAAAGTATTATGCGAAAAATGATGGCAACCAA--GGTGGATCAAATAT-AAATAAAACGATTTAT-GCATTGAGTCTTGGCGCAATTGAATAATTTTACAGAGCCCTGTGATCCACGTTTCTTAA----CCCTAAGTAGCTATTGAAATTTTAATAA---TTTAAT---GTTCTCATTGGACGGACAATCGTGC------AATGCAAAGCTAAGTAAATAGTTAACTGTTGGCTAAACGAATGGCTGCCAAAA--------CTAATACCGCACAAGGGCTATATACGAGTATATAACTATATATATATATAAATATATATATAAATGAAAAATAAATATCTTACAAAATTAAAT
CTTGCAGACTACTAAACGTA-------AAAATAGATGTCCATTGAATGATAAATCATTCTTGAAATATGATAAATTATTGCTTAGTTTCTTATCGTATCTGGAAAATTCCACAAAA---TATTAGACGATTATATTAAAATACCCTCTGCAAGGGTATAAGACACAGTAAACCTTAAACCAAGTTGTGACCGTAAGAAAAAATACGTTGCGAAAGCGCAAGGGTAATCAAAAAAC----------CCATACCAATTACTCAAAAAAGACAAACTTTAAAAGTCCATAAAGGTAATATATATATATATACATATATATATATATAAATATATATATATA--------AAATA----GCGAGATT---T
>CG15757 13378640 13378856|17137 chrX 13378406 13379096 scaffold_10 3713643 3714357 + 15553|247 486
GAGTTCGTAATTGCACACCATGCCCATTATTATTATTGGCTCCCTACATCGTTTTTTATACCTTATTTTATTATTTTTTTTTTTTAATTTTGTGCCCCCGACTACTCGTATTATATTATTATGAATT-----------------------TAATTTCTGTCCACATTTTTGTTGTGTTCAATGAAATGGGATTAAAAAATAATAAAAATTTATTAAGGCAAAGCAGCGAAAAATTATGAA
GAGTTTGG-------------TTCCGGCGTTATTACGGGCACTCT-----GTTTTTCTTTCCTT------------------------------CTCTGGACTACTTATATTGTATTATTATGGTTTAAAAAGTGATTTCAATTTTTTTTTAATTTATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGCAATCAAAAGGAATTAAAAAATAATAAAAATTTATTAAGGCAAAGCG----AATATTATGAA
>CG32631 13391531 13391808|17162 chrX 13390457 13391600 scaffold_10 3731859 3732820 + 12557|1092 1161
AAATTGGTCAAAGGGATTTCCCTTTACTTACCTACAGTTTTTTTTTCTATACTTAATACTTAACTAGCCA
AAATGG-------------CGTTATCCTTAAATACACTTTTTTTTT-----CTTAGCCTTTAACTTGCCA
>CG32629 13409930 13410038|17188 chrX 13409699 13410522 scaffold_1108 306 1198 + 9519|262 370
GTCGCTGGGCTGGCAGCTCTTCGTCAACAACTGAGCAAACATCTGGACCCGAAACTGTAGCTCAAGCTGAAGCTGAAGCTGAAGCAACATATATCTGTGGCACAAACTG
GTTTTTGGGCTGGCAGTTATTTGTGAACAACTGAGCAAATAGTCAAACACAA---TCCAGCACCAGCTCCAGCAACAACGACAACAGAACAGACT----GCACAGACCA
>CG15758 13410987 13410992|17189 chrX 13410580 13411289 scaffold_1108 1248 1824 + 2832|414 419
GCACAT
GCACAA
>CG32632 13424312 13424528|17210 chrX 13423822 13424508 scaffold_10 3762413 3763103 + 18190|513 726
TATCCGCACATACCCATAAGACTGCCGCGTGGCAAGCATTGAATCTGGCTAACTCTCTTGGCTGCCGATAAGGACAACGATAATGATAACTGTTGCTGCTGCTGCTGTTGCAAGAAACCAATTTTAAATTGTATTAGCCGAG--------ACCTTTACATGC------TTGATACATATATGTACGTGTATTAATGCTT---CGTGAAGTTACA
TATCCGCATATACCCATAAGATTACCGCGCGGCAAACATTGAGACGA-------CACACGGC-----AAAATGACAGCAACAACAACAACAGACAAC-CATCAAATGTT--AGCAAACCAATTTCAAATTGTATTATCAAGAGTGTAAGCACATGTATGTGCATCATTTCCATATAAATACGTAGATGTATGTATGTTCATATATAAAGTTATA
>CG11178 13442849 13443469|17234 chrX 13440382 13442930 scaffold_10 3782456 3785004 + 101526|2569 2704
G----------------------GACGTTAGCACTATCGGGGTCA---------------------------TTGTATAGAATTGAACTAAGCTAAATG----ATATTTATTTATTAC-ACAACATATTGTCTCAG
GCAACAATCTCACAAAAGCAACAGACACAACCACCACCAACAACACACACACACACACACACACACCAAATTCTGTATA-AATTTACCTAAGCTAAACTATACATACTTATTTATTACAACAAAATGTTGTTTCAG
>CG11178 13442849 13443469|17235 chrX 13442935 13443204 scaffold_0 2064293 2064533 + 1308|0 275
AATGTTGAATTTATAACTACTACTCGAACTTCC-CCCCTATTTTTTTGTATACCCATACATATTCTGTAGTTGGTTGACTTGTGGTACACAG-AAACCTAGGATTTATGATCG----AGCGACAATATACTATGAGATACATCACTACTAATTGAAATAATACCTCATTTTCGTTTATTTTAAGCCCAAAAATGACAAAATATATATCTACGAATACGAAAAAAGCGCACACAAATGAAATATCCAAATTAATTAATTTAATAGCAATAAATGCAA
AATCTTGCATTTATATATGCTCTTCCTACTCCCTCCCTTCTTTTCCCCTGTACCCCT---TGCACCGCACTTG--CGGCTCTTATCAGCCGGCAAAGCTCGCATCTGAAATCGTTCAAGTGGCACAAGAGTTGTGGGAATATCAAAACTGGTT--------------------TCTCTGTAGGGCACAAATACGTAACAATGCATATAT---AATACGTACA---TCCATATATGTGATAAATACAAA--AATTGA--CAACAACAAAAAATGAAA
>CG11178 13442849 13443469|17236 chrX 13443214 13443492 scaffold_10 3785005 3785280 + 3132|0 293
TGCAACTTTTTTGTGGCACAAGTCAATCGCACGCTAAACTACACAAAATTGGCCAAATGATA-ATATTATTTAATATTTATAGATACCTACGC--TTAAGTTACCCTTGCCGTATTTACCCACCACTCA------------------GTGTATACATATGTATA----ACCATGTAAAGC------TAAACCGTTCCAAGTGCAATTTGTAATCCCAAAAAAGGCAGCGGAGATCCGTAATGAAATCCGTAATACGTGTGGCAATAA-------AGAACTTAAGAAATCTGATA
TGCATTTTTGTTCCGTTTCGCATTACTC-----------------AAATTGGCCAAAAATTATATATTATATTATGTATGTGTATTCGTATGTATGTAAGCCACCCA-ATGATCCTCACCCACTCCCCAAAAGGCCCAACCCCACACGTGCTCGTATATGTAAACAGTACAATGTAAAGCAAAACCTAAACCGTACCAAGTGCAATTTATAA---CAATATA----------ATCC------AAATATTTAATCTGTGTGGCAATAACTAGGCGAGAATCCAAAGCAAGCGAT-
>BthD 13446980 13447165|17240 chrX 13446999 13447723 scaffold_5 1998912 1999898 - -301|0 269
TTCAGCAATAGAGCCCTATGATCGATGATTGGCAAATCCTCTCGAGGAACCGATCGTTGAGAACCCCTTTGCCT-----------------------------------------TTGTTGATCGC----------------------------------TCAATTTTGGAT----------CAAAAACTACATACATGAAAA----------ATACTCGAGCATTGTTATTACA--------AAATATATTAAAACATCTTAGAAACC-
TTCAGCAATAGCGCCATATGATCATTAAACGGTAAAACCCTAACGGGAGCCGTTCACTGTGAA-ACTTTTGCCTGTAAGCTGAAGAATTTCTGACGTCATCTCTCTCTCTCTCTCTCACTGCTCACTTCAACACGTTACGGTAAATAAAGGAAATGATCATTAATTGTTGATTCTGTTGTCGCATAAAATTTATACATAAAAATATATATTGTGTTCTCAAATAATGTTTGTATGTGGGATTCGAATAGA-CAAAACAATATAGAGATCG
>NFAT 13496697 13497594|17305 chrX 13496629 13496752 scaffold_5 1862425 1862548 + 3432|76 131
ACGGCTTCAGATCAACAAATTAAACTATGTGGACTTGCTTTTTTTTTTATCAACTA
ACGGCGACAGATCAACAAATTAAACTATTGGG--------TTATTTTAATCAACTA
>NFAT 13496697 13497594|17306 chrX 13496765 13497668 scaffold_5 1862557 1863525 + 7066|0 982
CTACACAGGCTTAGGCTTAAGTATATATGTAGTATATAGAGACATACACAAACAAACGA--------------TAAGACGGAATAAA-----GGTTTCATGTGG--------ACCAACTTTTTGACCAA-GAGAAAGGAGTAA---------------------AAACGGGATCAGAGAATAAAAAC-----CACAAACACAAACAGATTTGTAGCTTTAGATTTGCTTACGTTTAGGCATAAACCCTATTTAATATAATTACCTAAATTTAATGTTTTTTTTTTTTTTGATTTTTTTTGCTATTTTAATATTGATTTAAAAAACAAATGATGAACTTATCTCAAAAGGTTAAATTA---AAACAATGATAACGACTGCCATATACCT------ATGAAATATGAAGTGAAATCCCGAA------AGTGAAGAATGAAAACCGAAAATGAAAAATT-CAGTT-ATCAACCTTGAAAATCGATAATTATAGAAAGAACCAACTTTCATAAAACAAATGTTGATTACGCT------------CTTTGCTGGA----------AGACCTATTTTTATAATTAAGTCTGATTTGA---------------AAACTTCCTTTTTATTTGTTTGAGAATTTTAGGTATATTTTACAATTAAAGCCTA-ACTAAATGTT----TTGGCAGTAAAATTAAGCTTATTTAATTTTGGGTCAAAAG------AAAACCACGA-AAAGAAATTATTATTATACAGTTAATAATTTATAAAAAAAAAATACATATTATGTGTAGCTACGAATATAATGAATATGCGAGAAATTCCAAAAGACTTTTGATTTAAAGA--------------------------------AAATGCAATTATTATTTTGTTTATGGTTTAATCATTTTTATTTTCAATTATATTG-AAGGAACGACGAACACACACAAATAAAGTTGTAACTGATGTTATTACTATT
CCACACAGGCCTAATCCTAAGCGT-----TAACATATAAAAACACACCCACACACACACACACGCACACAGCTTAATGTGGACCAAATTGTTTGTTTCATTCGGTTAGCAGAACTAATTTTACCACCAATGAGAAAAGTGCAATGAAAATCACCTCTCTCTTTCACACCCACACACAACACACAGACAGACACACACACACACACACATTTGTATCGTTTTAAGCACACTTGTTAAGCTGTAGACCCTA--------------------TAGATATACCTTTTTTTTTTG----TTTTTGTTAAATTTAAATTGATTT-----------------TTTGTCAACAAAAGTCAAATTATCTCAAAAATGATAACGACTGCCATATAAATACATGAATAAAACA-GAAGCAATCGCCCCAACTAAATAATAATACATGAAAAC---AAATCAACAATTGCAGTTAATCAA--TTAAATATACATA--TTAAAACAGATTTTACTTATTTAATCAATATTTTTTTTCTATTTACGTATTATTATTTTGTTGCGTTTATGTCCCGAAACTTTCTGAAAGTTCAAGTCTGATTTGATATACATACATATATAAAACAACTATATATAATTATAACTATTTGTTTTTTTTTTTTTTTGCAAAATATATATTTCATATTTTTATTATTATTAATATTATTATTATTTTGTCTTCTGTTAAGGGGTTTGCAAAATCAAAACAAAAAAATTATCTACATAC--------ATGTATAAA--------------TATTTATAGCTACGAAT---ATGAATATGCGA-AAATTCCAAAAGACTTTTTATTTAAAAACAAACAACAAAAACAAAACAAAAAAAAAAAACAAACAAACAAACTTTTTTTCATACTGTTCAAGTTTTAAATGTTTAAACTATATCGCAAAGAACGAGAAAACAGCACGCACACAAATATAACAAACATTTTT--TATG
>CG11164 13503119 13503232|17310 chrX 13502038 13503268 scaffold_4 2630369 2631564 - 34536|1093 1243
AT---------TAACGTTTCACAGATCTTAAGAATAGGTTT-----TAACTCCTTATTTTATATATATACTCTATTTAATACAA------ATGTACAC-----------TTTTTTTTACAATGAATATAGTACTTTAAA------GAATTA
TCTTAAGCATATAATAAGTTGCATTTTTTAGAAGCATTGTTCACAATATCAACTCATTTTATTTATATAAACGATGAACAACAATGATTGAAGTTCACTGACTTCTCTGTTTATGTCGCAGCGCACGCACATCTTCAGATTGGGCGCATAA
>CG11158 13518005 13518561|17329 chrX 13518540 13519698 scaffold_1 3619065 3620178 + -2010|0 21
ACAATTCAGAAAGGAAATACAA
ACAATGAGAAAAAGCAACACAA
>CG32627 13547589 13548378|17358 chrX 13547135 13547610 scaffold_91 54335 54799 - 28125|458 479
GAAGGTTTTATCCCATCAATAC
GAATGTCTTTTACTCACTACAC
>CG32627 13547589 13548378|17359 chrX 13547646 13547765 scaffold_12 1562847 1562967 - 1856|0 124
AAATCCAAACAACAAAAACCACACATCGACTTGTGCCGTTTCTT-----TTTTTTTTTATCGTTCTTGAACTATACTCGTAAATCGTTAATCGTCAATTGTCAATCGTATATCGTTTATCGCATA
AAATCAGGTTTACTTAAAACTATCGACAGCTTGTCACGTTTTTACGAGATTGACTAATATCGATTGTCAGC----CTAGATAAACGTTAATCATAAATCGAATATCGTATATTGTATATCGTATA
>CG32627 13547589 13548378|17360 chrX 13548025 13548744 scaffold_91 55004 55618 - 13570|0 356
TATGAATTTTAATGCTCTCTATTTGCGCGTATCGCAGTTTTTCTAATGTTTTTGAGCACTCAGTTGCGTGGCTAGTATATCTCTATCCACGCAATGGGTTCTTAGATTACTTCTGTAGATCTATTTATATATAATTTCATATATACATACACCCACCTGAATCCGCACAATCCTAACTATATAGTGA-CACACAGCACAGCATCGCCAGGCACAATAGGTCTTTTATCT--TATCCTAGTCGCTCTAACTATAATTCGCGTTTCTTTCGATGTTGCTAGTCGTAAGCGTAACCGTATTATTATAACCGGAAAATATTATTTTTTGAAATAAATACCATATCTATTCATATGATTTAC
TATGAATTTGAATGCTATCTAT---CGCCAATCGCCGTTTTT--AATATTTTATAGAACT--GTTTAAAAGTTA-TATATATATATATATATA---------TACTTTACTTATATA--------TATATATACTTATATATATATATATACT--------------------TTACTTTATTATAAGCACACAGCACAGA-----CAGGCACATAAGTAATACTACTCAATGTTTTATTTCTTTTA--TATAAGTAGTATT------GTTGTAGCT---------CGCAAATAAATTGCGGTACACTGTAAAAAT-ATTTGTCTAAATAAA----------------ACAATTGAC
>CG32628 13551544 13551859|17363 chrX 13549550 13551751 scaffold_91 59816 62019 - 26628|2153 2392
TTGAC------------CCAGAATCTCCGCCAGGTGCATCACCGAGTT--TTTTCATTCAAAATTTTAGTCAAATTT-AATCCGTTTTA---------------GACCCGTCCGTTTTTGTTACGTAAAAAAGCGATAAGAAAATGA--TTAGCAAAATTAACTAAATAATTGATAACACCTATAGGCGTATTTTATGCATATGTAAACCCGATCTCTGTACCTACAGTTAATCCCTAAA
CCGACAACATCCCCTTATCAAAATCTTTCATGTATTTGTATGTGAATTTGTTTTTAAACCAAATTTTAGTCAAATTTGAATTTGTTATAGAAATAATGCACTACGATGTGCGCAATTTTGACCAATTAGGAAAATGTGAAAACATAAATGTAGCAAAATTTATGGAGTACTACAGTTCCCCTTTA-GTGTAGGCATTGTGTATAATAACCATAT-TTTGTATCCAGTATTGAATATTGAA
>mus101 13560569 13561049|17368 chrX 13559439 13561636 scaffold_10 601314 603549 - 29843|1145 1736
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----------CCTACAGGCATAAGCATTAAGCTCAC--TTTAA---TATTAAC--ATGTACATAATAAATATAATACTATG-----TACAAAAATGTATTTTTCAACAA
>CG11151 13574830 13575042|17380 chrX 13574612 13575066 scaffold_10 801006 801495 + 18635|218 472
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ACAGACACATTTTAGTGATTTCACAATCTAACGCACACCAACGTACATACATATATCCCACATATGTATGA-CCAGTTTGTATCGCATTTGTTTTTGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGTTTTTGGTTTGTTTAACTTTGCAGCATCGTAATTGCGATATTTTCGCGTGTGTTTGCACAATGTGTATGTGTGTTTTTTTTGTATGTTAATAC---TATGTGTAATTAGAAAATAATACATAAGCCTAGAAGG---A
>Rtc1 13592482 13592538|17407 chrX 13591140 13593153 scaffold_5 776459 778505 + 59318|1360 1425
ACGGTT-----CTCTAGGCTAAA----ACTTGTAAGAATAAACATTATATATTTTTTTTGTATAAC
ATTTGTTATAGCTTTAATCTAGATACGACTAAATAAACCAATCAATTTATAAATATATTAAATGAA
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----------------------TGTTTAAAACGTTTAC---CAACACTGTAGTTGATATGCAAACGCGTA-ACGCATTAGTTTAAAAACCGTTACA----AAAGAGTTGAGAGTTTGAATAATTTCTTTAGT
>rdgB 13610671 13610686|17429 chrX 13610125 13610920 scaffold_5 2008952 2009937 + 12199|661 700
A------------------------ACAAACAAAAAAAAA
AGAAAATTACAAATCACACAAAAACAAAAACGAAAAAAAA
>CG11103 13617111 13617323|17437 chrX 13616390 13617162 scaffold_5 4608540 4609299 - 30934|721 786
ACGTGTGTGATATGCCTCTGTGTCATAGCTTTAAGTAGT--------------TAAATAAGATTAA
AC-TAAAGAATACGCCCTTGTGATAATACT---AGTAGTGCAAGATACATATGTAAATAAAGTTAA
>CG11103 13617111 13617323|17438 chrX 13617178 13617492 scaffold_23 1654141 1654463 - 1469|0 150
AATTCGTAGTGTTAGGAAATTAAATTAACTTGCCCCTTATTTCATTATAAATACCTTTGTTATAAAATCATTGAAATTAATAATTTCATACA----TATCTATTAGATGTAAAGTAAGGATAAATA-AATATTTAGAAGTACAGTTAAATA
AACACATTCTGTTAGTTATTTA---TAAATTACGCTGCATTCCAT---AGATACCTTCGTTATGAAAACATATCAATTTACAA-GTAATACAATGGCATCTAT------CAATGTGGGGCCAATTATAATATTT-----TATATTGAATTA
>CG33174 13639417 13639580|17469 chrX 13639243 13645534 scaffold_48 236513 242974 + 77400|186 350
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GCCCGCTGCACAGAT------------------GAAAAACAATAATTTCAAGAAAAGAAACTAA---------------AGAAAAAGAAAAGCAAAGAAAAGAAAAGAAAAACGAAGCGAAATCAACGAAAC-----------------------CAACGCGCTC
>CG33174 13642457 13645438|17469 chrX 13639243 13645534 scaffold_48 236513 242974 + 77400|3690 7022
ATTTGTTATCATTAAACAAAAGACTAAACCAACTTTCCATTTTGCTCTCGTTAAAACCAAACAAA-----------ATTTTTAAATATGTCAACCGAATTACAAGTCTCTCTCTCTATCTCTCTCT------------------------------------------------------ATGTATATTTCTCTCTCCCGCTCTCAACCTAACCTCAAACAATAAAAAAAAAAACCAACAACCTATCCAATTTTGTAAACTAAACTCTCTAAATGTAATCGTACTCGCTG--TGTATGTACAAC----GAAAACCAATATCGATATTGTGTCTCGCACCCGTAAGCTCCCACCCACCC-----------------------------TCAAAC-------CACACCTCACCACAGCGAACTATCGAACCATTA-GCAATTCTACCCACATCCTACTCGCTTAACTTTGACGTAACTGTACTTAGTCA---CTCCACTTCACTCG-----------CTAACTGCATCT--GCTACTGTCTCT---------TTCCACTC--TCGCTCATCTGTGAAACTGTACATACATGCATCC-----CACTCTCGCTCGCAACATCTACTCGTCTCTTTCT---------GCATTTATATGTAACCACCAGTTGTGAAGATCAGGATTAATTGATTGCTTGATCTGTTTCGATTATAGATTAGAGAAAATAACTGCAGTCGAAAAAAAAGGGTATAAATGCCAACCAAGAAGAAAACAAAATATATATATATTACGAAATCAGACCTATCAATCAATCAATCGGTTTAACATTTCAGTAGGACCACAACATAGATCTAAGTTAAATGATCAAGTACAATCAAACACTGATCCCCACCACTCTCGCTAC---TCGCCTTTAGGTTGTAACAACGAGTGGGCCACGCAAGCCGCAGCGCCAGACCTCGAATGCATTCTCCACCGGATCGAACGAAGCAGCGCACGATATGGACCTTGAACCGCCGCATTGTAGCGGCCACAGT--GCGCCGACGGATGCCATGAGATTCGAGACGCGAACCGATCCCGGCCAGATGCAGAACTCGATGTCGCAGTCGCAACACTGCAAGCGACTCTCGCAAAGTTCCTACACGAACCTGAGCAACTGCCTCGTCCTGACGCCGACCGCCCAGCACAAGCTTTGTTTGGAGACGTCATTCACCAACGGATCGACACCAC--------------------------ACCAGTCCGGTGTACAGCCAAATCCGCGGCTCACGTCGGCGGCCTCGTCGCTC--------CTGAGCTCGGCAACCACGCCGTATGACATATCAAGTGCTCTGGACGACAGCCTGGCCACAGTGGCGCTGCGGCAAAGCCCCTCGCTGATTAGCGCTGAGACGACGGCTACAGTGATTGTTAATCCGGAACCGGATGCTGAGGAGATTGCCATACCACAACGGCTCAAGGCGGTGGCCTTCGATATGGCGCTCACT---CCGCCGCCAACGCTGCCGGAGAGGTCCATGC---------TCGGTCGTCAACACTCCGAGAAAAAGCCACGTTCTCTGCCGCTGGCCCAAGTCCAGGCCCTTCGTAGAGCTTCGGATGCTGGTGCGGTACCTGGAGTGGATTTACTGCACGACGACTGGTATGGCCTGGCCCCACTGGCCAGTCCCGAAACGCTGTCCGAGATCTCGAGCGTCTCCTCGCGAACCAGCGTACCCATTAGCCTGGCCAACAGCATTGAGCGCTATCTGCAGCACATGGGCGTGGGCGTTGG--------------------CGGT-CCGAAGGTGCCACTCGAGGACATCTTCGAGTCGCAGCTGCATACGCCCAAGGTTATGAGGCGGGCGCCCAAGTTCAGCGAGAATCTTGCTGGCTGTGCAGAGGACACCAGAAATCTGGATCAGTACAAACGGCTGGGTCGTGTGTTCATCACCTTTCCGCGCATCTTTCCGGA--------TCAATCGCCAGCGGC-------GCATAGTCTGG------------ACTCCAGCGACGATAGCTTTGAGTCTGCGTCGGCCCACAGCCTACAGAGATTGCAGCTGCCGC--ACGGTGCCAATGCGGTGCAGAGTTCCAAGTCCGCCGATCCGCTGGACGGGGATCCCGATGCGACGAGGCAAACGCAGCCCGCCAAGAAGTTGACATTCAGCGATAGCGATATCCTGACGGACGCGGACTGCCTGCGACTGTGTCCACACTGTCCCTGCGATCGGGATGTCCAGCGTGGCTGCTGTACTCGCTCGGAGCACGG------GAAGTGCGGCACAGAGATTTC--CGGGGGTTGTGGTGG----TGCCGCCATGGGATTGGGCTCCACAGATACTAGTTTCTACAGTGCCAGCTC------ATCGCTGGAACAGTTTGCCACACCGGCTCGGCAG----AACGGTGG--CACTGGGGCGTCTGGCAACCACCTGGAGGAGATACTCATACGGCCCGGCGTGTTGGAATCGCATTTTCCCGTTCTTGGCGGTGGCAGCGCGATAGAGACACCGGCTTTGGTGGCCCCAGCCTCACCATCGCCGCTCAGCAATGGC------AAACGACCGGATGTGGTTGGTGGCCGGGTGAGGAAACGGCTCTCGTCCGAGGAGTTCGTCTTCTCCCGGAGCGAGGATCTGCCTAGCCTAGTACAAATCGGTGATAGGTGTA---CCGGCTCTCCGGCGGGACG---ACGTCGGGCCAAGGGCTGCGTCTATCCGGCCGGGAATAGTCTCCGTTTGGACGCTGC---------TGCCGCTGTCGCCTCCGCTTCCGCATCGCCCACGTCCATTAGTAAATTTACCCGCACGCGCGTGGCCGCCGGAGGATTGGCAGCCAAACAGGCTGCCGGCAATAACGAAAGTAACGTTTAATAGTTGTAAGTTGCAAGCAGTACCTTCACCTGGACACACAGATGCGATTTCAGCCCAAAGTCGACAATTATGCCGTTGCCATTGCTTT-CACACAAGCGATACATACACAAAACCAGTTGATTACAAATTAAAGGAACTCACAAGGAATCTAACATTTTGCATACCGATTACCTAAGGAACAACATTTAGCATTAACACACAAGCGTTTACTATTAACTAAATGCAATAT-GTATATTTATATACAGATATATAAATATATATTTTTTTGTGCAGCCAAGCCCCAAGCGACGAGAAATTTTAATAAAACGTTTTAAAAAATGAA------------------------------------------------------TACTCT
CTATGT----------------ACTTAAGCAACTTTCCATTTTGCTCTCGTTAAAAAAAAAAAAACAAAAAAAAACAAATTTAAAT---TCAA------TACAAGTCTCTATCTCTAATTCTCTCTCTGTCTCTTTATAAATATATTTATATATGTATGTATATATATATATATATATGTATATACATATCTTTCTCCTACGCTCAACCTAACCTATAGTTTTGTACAATT----------TTTGTTTCATTGCCTCTCCAAAACTGTCTAAATGTAATTGTACTCGATACTTGTATGTACAACTTCGAAAATGTGTTATGCATATTGCCACCAGAGTCACCACCCCCTTCCCCATCCATTTACACAAATTCTGATATTCTTTACCGTTAAACGGGCATACACACATACCTATAATGCATTGTAGTTTTTTCATGTAAGCAAACCAAGATAGCACCAAAAGAATTTCTAAACGGTTTCAGGCACCCAAAGCTTCCCCTCCCTCTACAGACAATGTTTAAATGCAACTTCGCCATCAGCTTTGACATAGTCTCCCGCTCGCTCGCTCGCTCTCTCACTCGCTCACTCACGCACTCGTTTTCGCTCTCGCTCTCGCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCGCTCGCTCATTTGCTTCACAACAACATTTCCTATTGTACATACAAACATACATATGTAGCTGTT--AATTATCGTCT-GTGTATGTAACTGTGATAGTGTATGTAGATATGTAGTACTCTACCTGCATATACATACATACATACATA---------CATACATACAAATTGATAAA-----------------------CACGCCTTGAAATGAATT--AACGATTTGTAACATTTGCCTTCTCGTTGTCATTGCTCTCGTTACCATTCGCTGGCAGGTTGTAACGACGAGTGGGCCACGAAAGCCCCAGCGCCAGACCTCGAACGCATTCTCCAGCACATC------------------CTTGGAGCAGGAGCAGGAGCA--GGAGCAGCTGGAGCTGGCGCCAACGAATGCC---------------------------GAACAGATGCAG---------------------CATTGCAAGCGCGCAACGAACAGTTCCTATACAAACTTGAGCAACTGCATCATGCTGACGCCAACGGCACAGCATAAGCTCTGCCTGGAAACGTCCTTCACCAA----TCTGCAGCACCAGCTGGAGCTGCGGGCAACGGTGCAGCCGGGCGGCAGCAAGGCCTCATCCATAGCT------GGCAGCATCTTTGGCCGCAGCCAACTTAGCTCCACAACAACTCCGTACGACATATCAAGCGTCCTGGACGACAGCATCACAACGGTGACAATGCGCAGGAGCCCCTGCTCCATGCTCAGCGAGACGACA---ACAGTCCTGATGAATGCCGAACC---TGGCGAGG------------CGCCACGCCTGCGTGCGGTCGCATTCAACATGGCAGCAACGACGCCGCCGCCATCGCCTCTGCCACTGCCTCTGCCTCTGCCGCTGGCGCGTCAGCATTCGGAGAAGAAGCCGCGTTCGCTGCCCTTGACGCAAG------CGTTGCGTCGCGCCTCGGTGGCGGGT------CAGGGTGTGGACCTGCTGCACGACGACTGGTACGGTCTGGCGCCGTTGGCCAGCCCGGAGACACTGTCGGAAATCTCGAGCGTATCGTCGCGGAGCAGCGTGCCCGTCAGCCTGGCCAACAGCATTGAGCGATATCTGCAACACATGGGCGTCGGTGTGGGTGCGGGTGCGGTTGCGGGCGCGGTGCCCAAGGTGCCGCTGGAGGATATATTCGAGTCACAGTTGCACACGCCGAAGGTGATGCGACGTGCGCCCAAGTTCAGCGAGAACCTGTCCGGCTGTGCCGAAGACAACCGCAATCTGGACCAGTATAAGCGTTTGGGACGCGTGTTTATCACATTTCCGCGCATCTTTCCCGAGCCAGCTGCCGGCCACCAGCTGCAGTACAAGCACAGCCAGGGCCTGGACTCCAACTCCAGCGATGACAGCTTCGAGTCGGCG------CACAGCCTGCACCGACTGCAGCTGCCAGCGACTGTGGCC-TGCGGTGCC-AGCTCCAAGTCAGCCGATCAACTGGATGAG---------------ACACGCTCGCCGCCGGCCAAGAAGCTGACGTTCAGCGACAGCAACATCCTGGCCGAGGAGCACTGCCTGCGCCAGTGCCCGCACTGTCCGTGCCGGCGCGATG---GACGCGATTGTTGCACGCGCTCCGAGCACGATCATCAGCAGTGCGCCTCAATGGAGGCGACGGCGATGGCGACGGCAACTGCCACCGTCGGCTCGACGGATACGAACAGCAGCTTCTACAGCGCCAACTCGCAATCATCGCTGGAACAGTTTGCGACGCCGAACCGACAGCTCCAATTGAAGATCAATGGCGGGCATGCGCACAAC------GAGATACTCATACGTCCAGGTGTCCTTGAGTCACATTTTCCCGTTTACGGCGGCGGCGGCCAGCCGGAAACGCCGGCCATTGTGGCGCCGGCATCGCCCTCGCCCATAAGCAACGGCGGCACCAAGCGGCCAGATGTGGTCGGTGGGCGTGTGCGCAAACGCCTATCCTCCGAGGAGTTTGTATTCGCGCGCAGCGAAGATCTTCCCATTTTAGTACAAATCGGTGATAGAAGCGGCCACGGCTCGCCGTCGACACGCAAACAGCGGCGGGGCTGCTGCGTGTATCCCGTTGGCAATAATATACGGATTGCCGGTGCCGATGTGGATGCAGCTGCAGCTGCTGCCGTCGCCTCCCCCACGTCCATTAGCAAATACTCCCGCACTCGCGTCGCTGC---------GGCAGCAAAGAAAGCTGCTATAAATAACGAAAGTAATGTTTAATAAGTGCATATATAAGTAAGTACCTAAGC----AAACGCAAACGCAAATGCAACCGCAACCGAACATTTATTC--TAGTTTTTGCGTTATGCACCGAAAAAAAAAGTAAAAAATAAATAGAGATCGAATAGCAACAAAGCA-ACAAAAGCTAAAA--------ACAATTAACTTAAACAAGAACAAATACATTTA--------GCGGTTAACATTGAACAAATACAAAATAGTACATATATTTTT---TGTGCAGTTAGCTGACCAACTGAGTAGC-AGCCCCAAAGCGA--ACAAGTTTTAATAAAATGTTTTAAATAAAAAAACGTTACAAAAATCCAACAAACACTTGCAAATTAATCGGCTCTTGGTAGCAGGGTAATCG
>CG11095 13646614 13646815|17471 chrX 13646707 13647948 scaffold_5 5292257 5293575 + 27736|0 124
AATTGGCCAATTCTGATGGTGTTCTTTGTTTTAGTGTACGCGTTAATTGTTAATTCTCGGAGAGATTTATAATAAAACTG----------TTGACCATTATGTTGAAA--TCGAAG----AGGAG
AATTTGATAAATGAAATGTTACTTTTTTATTTGGTTT----GTTAAT----AACATGTATTGCTGTCTATAATAAATCTGACGAAGAGTATTTATCAGTCTTTTAAAGCGTCAAATTTTTATTTG
>CG11092 13659635 13659851|17483 chrX 13657345 13659643 scaffold_5 5300563 5302985 + 68090|2426 2434
CATTAGCCA
GCTTCATCA
>CG11092 13659635 13659851|17484 chrX 13659729 13659846 scaffold_10 4216618 4216747 - 1688|0 129
TTTTATTGGAATTT---TTCTGTTAAGCGCAACGCATTTAAAGCA----TTAAGCATTCGAAAAATTTAAAAGAAAATATTTTGTATGTATGTGTTATAAGAAAACTAAACAAAATTC-----AAAATGT
TTTAAATAGAATTTGCCTTTTCTTTGAATAAAAATATCTAAAACCCATTTGTAAAATTTGAAATATGTAGAAGAAAATATCTAAGTCAAAAGTTTTTCCAAAAAAAAAAGAAAAGTTCTTTCTAAAATGT
>CG11068 13790327 13790528|17683 chrX 13790506 13790771 scaffold_14 79144 79399 - 1147|0 22
TAACTCAAGATCTAAACAATCTA
TAAATTAAAAGAAAAAAATTATC
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A-CGCC--------CGAGGTCAGGAGGAAAGTCAGAAAGCGGATCCGTCAGTTGTATCGGCGTTTTTCCAGAAAGTGGGTGCG-------------------------TGACATGAACGGGCGGG-TGGGTAAAT-TGAATACTTTAAAAGCAACCAG---------------------AAAAACCTAAAACATACGAAAGAAAACATAAAATAAGAAAAAAGTAAG-GAAGCAAACATAAAAAAAAACGATTTAAGAACACATTTTTTTTTCGAACCTTCTGGGGCGGGATATACATATAAAATATTAATATATATATTTTTTTCAACCAATCGATCGGGGCGATCGGCGAAA-------------------TGGAGGAGA----GATAGCGAAAGCATTCTTTATGTAAGACGTAT-ACATGTATCCGAAACAAACTAAAAACGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACAGTAATTGGTTTTAG
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>ben 13832554 13833745|17750 chrX 13832748 13832785 scaffold_3 5959486 5959546 - -492|0 60
TT---AAGAACACATTTTTT--------------------TTTCGAACCTTCTGGGGCGGG
TTTTATAACACACAATTTTTTGTATATTTAAATAAGTCGATGTCGAGGATATGGAGATGGA
>ben 13832554 13833745|17751 chrX 13833029 13833846 scaffold_5 5526134 5527036 + -2841|0 860
GAAATAACCAACCCATAACCATTAACACA----------------------TGTAGCATCAG----ATATGATAAATCAATTGGAAAGGCAAACAAGAAGGGATTTTGAT-------TTCCTTTAAC--TCGTCATTTGA---AAACTCGGCTTAAATGTCAATTCAAAATAGAGAATTTT---GATTGTA-----TCATTTTCAGTGTTTCAGAAAATTTAA------GATGTGATC-----GTCCAACTTGTA-------------GACTTTACTTTTCTTAACTAAGAG---------TTCACCATTTCGATTGATACTTGAGCTTTGCCTGGGTTGTG-----TCAGAGTCCCTTTGATAAACGATAAATAGTTTTTACTCGAAAACAATTTTTTTTAACCAAACAATGAAGCCTTTAAGCTATTAGTAATTTTTGAAAAAAAAAAAAATAAAAAATATATATATAAAAAATATACAAAAATATGATACATGATCAAAATACAATGAATGCATACACTATATATTTATACAAAA--------------AAAATACAAAAAGAAAAACAAAAGTA-GTGGCTTGATTGCGTGAAAATTTCAAGTGCAGTTCTCAAC------------------------AAAAATTGTGTACAGTAATTAAAT---GTTTGTCACCGAAATCACTAAAGGATAATCCAAAAAACAA-----TAGCAACCGAAA--AGCAACCATAAATCAAAGAGTAAGCGAAAATAAAAATTCAGTTTTCTTTAATTTTAATT-----------AATTTTTTTCTAAGAAAAATAAATAAAAACGAAAAATTCAAATAAAAATTATAAAAAATAAA
GAAACTTCAAACACACACACACACACACACACACACACACACAAATAGTTCTGCAAGAAGAGAACAATATACTACATTAAAAATAAAAAAAAAAAAAACAATATATATATACATATATATATATAACTATTGACATTTGATATTAACGTTGTTCGTACATATGTGAGTAATAGTGCCGTTTATAGAGTATAAACATTTGCTTTAAGGGAACCAAACCAATTGGCGAATCGAGTTGTTCGCAATGTCAAAGTTGCATTTTGTGTCGTCTTGCATTTCTTTTATTTGTCATGCGAAGTTTCCTTTTGATATTTCGATTAGT-CTGCAGCCAAGATTGGGCTCCGGTTCCTCAG----CTTTTTATCAATG----------TGTACGAGACATCAAT--------AATAAGAAACGAGCCTTTTATGGAATTAGTACTTT---------ACACACGTAAATAATAAATGAATAAAAATAACTAAAAAA--------------AAAACACAATTAAATTGTTGGCTTTATTTTTAAGTTAAGTGGTAACGGATCTTTAAATTCAAAGCTTAAAGCAAGTGTCTGCCTTTTGAGCTTGAGGCGTCTTCAAATGGGGTCCACGTCCAGCTGGACAGAGGCGGCATTTCGAACAAACTTGGAAAACTATTAAATCAAATTTTTTCCTTTAAATATTAAAGCTTGAAACGATGAGTACATATTTTATAACCAAAAGTAGCAACTGG-----AAGGGCTCTGATAAATTCGGAAAGTATTTCTTTCAGATTGGAAATCAAGCACAGAAAATGTTTCACATTGGGAAATTAAAAGAGAAAAAAAATGCAATCTTAAATTCGAAAAAATAA-
>CG12480 14005386 14005492|17990 chrX 14005158 14005533 scaffold_5 5705376 5705766 + 10521|237 350
GAC----AAATAACTGAGAGCCACAGAGTCTAATATAATCTTAAATTTA---TAACTTTTTTTTATTTTGGAACTATAGATCATTAAAATTTCCATAAGTGTAGAGAAAACCAA
ACTTTTGAATTCTCTGGCCACAATAAAGTATGAAATAAAATTTAAGTTCAATTGATTTGTGTTGCGCATGGACACCAAGCTCTGCAGAGTATTCATGTTTGCAGCAACCGCAGC
>CG1368 14009466 14009607|17996 chrX 14009244 14011149 scaffold_5 5708285 5710339 + 8572|303 477
GGATCTTCAACGAAGAGGCCTGCAACTGAACACGAAACAGTGTC--CATAACTACATACTGCCCAAATTAACCATATATTTTTTT----------------TTTTTGTTTTGTAAACTTTTGT-----------TTACAACGAAATAAACCGAAACA----TCAATAATCCAAAT
-----------TAAGACGCTGGAAACTGTTCACCAAATCGAATCAACATAATTGTA----ATTAACATTTGACATGTTTTTTGCTCCGCGTATTCTATTCATTTGTTTTTTTTTAACCTGTGTGTATATGATAATTAAAACAAAATA---CAAAACATATCTTAAATATTTTAAT
>CG11584 14017115 14017258|18003 chrX 14015988 14017649 scaffold_5 5714511 5716067 + 16984|1271 1429
-----------GATGCCTGTGAACGGACCCCAGCGGAGGTCCGAAC-TCGCAT-CAAGTTGGGTGT--TCAACGATTTAGCTGAACTTAGTGTTACGTAGCCAATTTCTAGCACCTTATAATTTTGTTAATCAATAAATTGTTTTTGTTTTATAAAAAA
CGGACAAAGTAAATGCAAATGAATGGG--CTGGCACAAAGCCGGACGCCGGATGCATGCTCGATGTCATTAGTTGTTTCATTAA--TGAACTTTACTTAGCCAAATTGTAGCCC----TAGTCCTGTTAAT-------TTGTTTTTTTTTTCT------
>yl 14033524 14033900|18015 chrX 14033540 14033888 scaffold_5 5737523 5737872 + 6582|0 387
ACTATCGTCTGCTCAACAGGA---AAGCAAACTACATGCGCTGGACGGAGGTGGGGCCGGAGGCGATGGCGATGGCGGACGCGGAGTTGGGCGGCAGGTGCCGGACATCCTGGTGGCTGACATGGACGACGATGCCGCCAAATCAGCCGGACAGTTCGGGGGAAATTACGCAGGCAATGATGCGAATGCACGATTTGTGTCGTAAATG-----------------AGTGGCAGTGGTTATTTATTTATTT---------TATTATTGCTGCTGTTTGCTGTTTATTATATCTATGTATTT--ATTGTAGCGTTAAAATG-------ATATTGTATTTAAATGT-TAATCGGTGATTGGAGTTTATATAGCTAGCAAAATATTAAAAAC
AACATTTTCTATCCAACAGCAGTCAAGCGAAATACAGTCGCTGGTCAATGGACGGA---GAGGTTGTGG---------------------------AATGCCGAACGTCCTGGTATCAGGCCCTGGCGATGATGCCGCC---TCAGCCGGACACTACGGGGGAGATTACGCAAGCGATGATGTGCATGCACGGCTTGTACCATAGGTGATCAGAATTGATCCAACAATAGCAATGTTAACTAATTCATTTGTAAATTTGTGTGCGTGTTATGTATTTCTACTTGTAATATTTATATTTTTGCATTGT-GCATTGGGGTGCATTTTCATGTTATAGTTAAATGTATAGCATACGTTTAGGG----TGGCGCCAAAAAAAAAAAAAAAAC
>yl 14033524 14033900|18016 chrX 14033889 14034909 scaffold_28 1791371 1792395 + 15927|0 11
TAAATCGAACAC
ATGTGCGAGAAT
>CG11590 14034795 14034844|18016 chrX 14033889 14034909 scaffold_28 1791371 1792395 + 15927|998 1048
ATTCAATTTGCAGTCCATTTAATGGAAATAAAACGG-TTATCTGGAAAATT
TCT---------GTTATATAAATGCAAATTAAATAAACGATTTAGATCATT
>l(1)G0007 14058560 14058665|18045 chrX 14057759 14059737 scaffold_28 1816884 1818923 + 57372|837 942
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CCTGGC-------------CAAAGCCCAGAGCAATGTGTAT-TTCAATGTGTGTGTTTATTTTTCTTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTATA-CATAATAATAAA
>mRpL38 14061790 14061887|18047 chrX 14061487 14063227 scaffold_5 1857497 1859380 - 64712|303 423
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TTTTATGGCTTAAATATTTTATTATAATGCACAAAAATCAAGCGTGAGAAATTGGTGCTTAATAAATTTATAAA
>mud 14092168 14092537|18075 chrX 14092248 14092328 scaffold_5 6290244 6290324 + 5330|0 80
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AATCAACTTCCGTTGTCCTTTTTCAGAACTCGCCTCCCAAGCGACGCCTCAGTAACATGTTTAAACGCAAGTAGGTGTGTT
>CG1461 14098676 14098783|18080 chrX 14096931 14098965 scaffold_5 6296657 6298589 + 57729|1786 1894
GCTGGGAGCA-AAACATTTATTAGATATTCTAGACTACAATTTTTATCAAGTGTACATAAGTGTATGTATGTATATATACTATATATATATATATATCAATCATTTTAA
TCAGGCAACATGTATATTTATTAAATAGTCTAGGTTAAAGTTGCT----------------TGCATG---GTATACATGC---ATATACATATATAATAATAATAT---
>dpr8 14293402 14296308|18237 chrX 14293806 14293943 scaffold_19 48404 48527 - 854|0 137
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TGGCTAAGGAAAGCAGCCAATTCACGCAATGGAAAAAATTAGAGA-------------GAATTAAAAAAAAAAAAAATAACAAGCAAAGGCAAACAAATCGTCGAAACGA-ATTTCTATTGAGTTGGCTGCAATTCGG
>dpr8 14293402 14296308|18238 chrX 14293944 14294482 scaffold_9 2792609 2793112 - 1439|0 562
TAAACGGAAACGGCGAGTTTATGAATTCTCATCTACTTAACTTCTTTCGGTTGGTAACAACTTTTACACACACACACACACATACAAACCACATTCTCTAGTACAAGAATAAGCTATAGGTGTCTAAACATATTATAAATAAACTGCAAGTGGA---AGTTTCGATGGAAAACCCCGTGCGATTTG-----CGGAGTGTC---TAAGTACGATAAAGATAATGAATTTTTTTTAAATAACTAGCATAAGTTCAAGACTATAGTAAAATGTAAGCAAACTGAGTGGAGTAACCGAAAAATAGCTAAAACGGATGGCAGATTAGCTAAGATTAGCAATGGATTGTTGAATTAAATGTGTACATATTAAACAAGTCAGCATAATTAGTCTATGGATATTTTTT-------TTGTTTTTTTTTTTTGGCT--ACTCAGATCAGAATAATCTCTACCT-ATATAT---AGGGCATTTTGATGTGTTTAGGGCTTAAGCGATATTAATTATTGTTGTATGTTGAAAAAAAAAAAACGAAACGAATGGATAAAACCAAATGCCATTGAGA
TAAATAGATACTACGAATATGT-----CACATTTGCATATCTCC----GCCAATTGCCATTTGTTATACATACTTATATACATACGTTTTGTTTTTTCTT---------CAAGCTAGCTGTTGCCC-------------TGGTCTGCAGCTGGCGTTAGTCCTGATGGATCGTCTGGTGGCAATTGTATCCCTCACTGTCGCTTACATAATATTGCAGTTAGCAAACGCTTATGAATAATGATTGTTATTTT-----TATAGTG---CGCGTGCGATGGAAATAAATTTACTATGAAATTGGCCAGATG--CGGCTGATTATATATTCTAAGGGCCTGTTTGTTGATTTTTGTGTGTACACGTTATATGAGTCACAATACTTAA--GATGGAAATTTTTCAGTATTATTTTTTTTTTTTTTTGGATAAACCCCTTTCAAATTAACTGTTGGCTGATATATATAAGAACAAATAAACGGTTTCACAAATTG------------TATTGTCGACCTTCGCGAAAATAA----TAAATAAATAAATAAAAACAATTTCAAGTGAAA
>dpr8 14293402 14296308|18239 chrX 14296131 14296346 scaffold_5 2757217 2757526 - 2984|0 273
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ATTAAGTTTTTGTATGAAAAACATTTTGTTTATCAAGATATCGTGACC----------AAACTCGACAT-------------TTATTAGTTTTACTGTGCTCCTCATATATATGCATAATCCTATTAAGAT---CGGACCACTATATCATATAGCTGCCATAGGATCGATCGTTCGA--------AAATTAATTT------TTTGTATGAAAAAACA-
>CG14414 14415971 14416111|18304 chrX 14415516 14416121 scaffold_60 285921 286485 - 13704|485 633
GCTCAATCGACCCACACTCGACTTTGCCACCGTCTCACGCATTAGTCTGTAAAAATCATTAGTACTTAGGGCGCTACCTCAGCAGACGAGCCTTGCAGGTGTAATTTACAATTAATTTA--------TTAAAAAAAAAGGTACAATCAG
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>CG14411 14669723 14670207|18621 chrX 14667136 14670179 scaffold_26 737599 740946 + 132329|2781 3396
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>CG14411 14669723 14670207|18622 chrX 14670180 14670343 scaffold_25 1547045 1547176 - -1717|0 27
TAAATCAAATGTGTAAAATCAACAAAAT
TAATACATCCACACACACACACACACAT
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AACCTAATCGAATGGGATGTGCAGCAAATGGCATTGACGACGTAACCCC---CAAAGGAATTGCAACTG-----GAAATGAGAGAGGGAGCTGAGGGAGAACGAGAGAGGAGTTAACAGAAAGCG--AGAATAAGAACGAAAGAG------AGAGCGAACGAGCGAATCTGAGAGAAAGAGAAAGAGAG-----AGCGAAAGAGA----GAGAACGCATTTGTTAGAGCGAGCTGGCGAGCGCATCAGAAATCAAAGGAATCGAACGATA-------ATCTTACATATATAGATATATATATACATATATATGTCTACATATAGCAAAATGTACTCCGATATT----------ATATATATATATATATGT------------GTGTGTCAGTGTGTGTATGTGCCACACGACGACAAAAGGCCTGGCCCGGGCATAGTTGGATAAATCAGTTAACGAATCAGATATCCAGCTAAAGCTAAAGCTTATATCTAAAATTAATGCATTTCGCACGCATTCGCAAACGCATTTTGTGGCCTTTTCTCGATAAATAAGCAGAAATTACCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATCCAAAAAAAAAACACAAAAAATACCAACAAACAAATTTTGTAAACAAAAGTTAATT--GTGGCGTGTGTGCTAGTTACTTAC----ATATAGATACACTTATATACACATACGTACACAC-ACACACACA--------TACACAAACATGTGTATTTGTAT------TTGCATTCGCAACTGTATTTGTATTTGT----------------ATTTGTATTTGTCGTCTTCGCTGTCCATTTAGTCCATA----------AGCTG-GACTACAATCGCACAAAACCATCAAAAAAAAACAAAACGTTTCTTTA---CCATGAGCATCAACTGAAACAGTGCTG--------------------------------CGAATTGCAACAATTTGTTGCTTTGCAACACTGTCAAACTACAA
>Flo-2 14766165 14767520|18741 chrX 14767216 14767632 scaffold_37 1128254 1128649 - 4154|0 336
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CACTTTACAACACTATTTTTTACTATGACGCTACTGTCGCCGCCGCTCTTCCACCTATTAACACACACACACGTACACACACACAAACACTCTCACAACATGCGTTCGAATTTTTAAAAATTCTTTTGA----------------TAATGTTTACTTTTTATTACGCA---CATTCAT-TAATATTGTTTA-------TAATTATTATTAT-TATTTTTTTGTTTTGTAACAAC-------------------TTCTCTCACCATTTTTGAA--TACATTTCACAAATTGTTTCTTAGTTTTTAGCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATACAAAGCA
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CCCAAAATATTGGTGCGCCATCAGTCGGCGGATAGCAGCAGCTTCGAACAGTAACAATTGCGCCGACT
>CG32594 14866621 14867284|18863 chrX 14866665 14868114 scaffold_31 15669 17160 - 3120|0 719
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>CG32594 14867543 14868077|18863 chrX 14866665 14868114 scaffold_31 15669 17160 - 3120|1013 1588
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ATGCGAGCGATATGCCACAAGATCAGGAGGCTTTGCCGCAGTACGCCCAGTTGCAGCGCCAACCCACAGCTCAGGAGCGCGCCGTCCGAAGTGTGAGCAAT-GTTAGCAATG-CCAGCTATGCCACGCCCGTTTGGCGTCAGACTGCCGATGCCACGCCCATACTGTTAACAACAACATTTTCCGCC-------------CAGCCGCCAACGCAACGCCA-----TGCACGCGACATGCGTCCAGATCTCGAGATGTC---ACAATTGCATCCCA----------------------TCAATCATCAATCCAGC----TCCACCTCCG--GCAGCCCGGCCCGCTTTCCCAGCAATCACAACACC-----------ATGCGAAGCTTTCAGTACTTGGACGGAGCCGCCAGCCTGGCCGCCATGGAGGATATGGCTGCGTTGCCGCCAGATTCTGGCTCAAATCATTCGGGGGGGAGCGATGAGACTGTCAAAATCGACGA---AATTGAATACGTTGATGCCTAAAACTAACCA--------------ATATTATAACAAAAACACTTGTGATAA
>CG5541 14885047 14885437|18872 chrX 14884087 14885322 scaffold_31 26557 27762 - 42136|990 1294
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AGCTACAAGCCACACACACACA-CACACACAC----------------------------ACACACAAATTACACAC-----ACACACAGCTGACAGACGCTAGCTAAAGCAGAGCGACGCGGCG---------------------------CACCACCA-------AGAACCACCAA-GAGTGACCTTTCGTTGTACCAAATTCATAGTCTACGCTTAGTTTGTATCGTGTAACATTATGCTATCCATCCTATCTATATAATATCGCAACTATTTTAAACCCAAAACCTATATAAGCTGTAAAT
>CG5548 14898341 14898501|18880 chrX 14897298 14898556 scaffold_31 41018 42272 - 23402|1132 1295
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GCTTAAACGTTCAGTACAGTTCGGCCGGCAAGCGGAGCAGCTGCGTCAACTGTGGGCAAC-TTCGCAAGCAAGCACACACTGCC---------CGTCGCA-----------AGCGGAAATTTCAATAAATA---CTATGCCTAGTAATAATATGGATCTGTT--
>CG33178 14917678 14917716|18905 chrX 14917130 14918206 scaffold_46 405712 406770 - 19952|550 588
ATAAATTCAAGTCCCTTTCGGCTTAACCCTCAAATATAA
GTGCTTTAAACAATTGTTGGATTTAA------------G
>CG5599 14922186 14922569|18912 chrX 14921929 14922648 scaffold_46 412383 413133 - 16354|257 723
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GACAGAGGCCGGCGCC----AGCGCTTCACTGATCAACCGTTAAGGCT-GTTCTCATGCATTTATTT--ACAAAACAAAAAAAAAAGAAACAAAGAAAATCAACTAGGAAAATAGGAAAAACCTCTACAACAACAACAACAACAACAAGAACAACAAGAACAGGAACTCAGATGCCTTCTTGGCCGCCATGTGACGCACTTTTCCTAAACCCCCTCAGAATGTGCATTTATAGCGG--ACGCCGCCCATGCGGTCTCCCCTCTAGCTTTAAGCTCGTCGCGCACATGGCCGGGCCATGCCCCCATTAAAAACAACAAAAACAAATAGATTTCTTAATTCAATTGTTTTAGTTTCTAATGCAGTCCAACTGCAA-TTCTGTGTATATTTCTAATATA--TATATCTATTTTTTATGTACTCATGTTGTAAATGGTTGTCCAATAAACATC--CAAGGATTTAAGCCAA
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CGAAGGAGTTCGTTCTTTAAGTTTGGAGGCGGCGGAGGCGGAGGTGGTGGCGGCGGACCAGGGGGCGGGGCCAATCCAGGGGCAGGAGGCGGTGGCGGCGGACAGATGGGCGAGGAGCCACACCCACATGCCCATCGACGTGACGTCTGCCGCACCATCTGTATCCCCTGGCTGTGATC
CGAAGGAGTTCCTTCTTCAAGTTTAGTTCAGGTGGGGGCGGAGGCGGGGGCGGC---------------CCCAAT---------------------------------GGCGAGGAGCCGCATCCGCAGCCGCACAGACGCGACGTCTGTCGCACCATTTGCATACCCTGGCTATGAGC
>rab3-GEF 14945980 14947699|18940 chrX 14946248 14946461 scaffold_5 4867485 4867692 + 926|0 219
CTAGCTCCTTCGAACACAACATATTTCATAAAATATCAATTG----TTTTCAAAATTGTTAAAACATTT--GTAAGTCCTTTAACATGAAATCCGTTAAATAATTATGTATATCTTTATGGAGGGAAAAAGTATAAGCGGTCAAAGTAGGGAACATTTATAAAAAAAAGGAAAATTAAGTAATGAAGCTTAAGAGACGTTTAAAAATAAATAATAACATT
CTAGAAACTTCAAATGAAACAAA----AAATGATATTATTTAACCATATCCAATATTTCGATAGCAATCACGTAGGT--------AAGGAATCACATACATATGTATGTATGTATGTACAGAAATGTACAAGGTACAATGTTAGTAAAAACAACAACAACAACAAACGCGAAGATAAGCTTTTTTAGTTTATGGTAAGTATGACCAGAAATTATTACTTT
>rab3-GEF 14945980 14947699|18941 chrX 14946462 14946813 scaffold_1 1413044 1413443 - -3052|0 414
AAAGAAGATTTTGTCAAAAACAATGCTTCTAA--TCATTCC----------TGTTCATAATTTCA----------AAAAACTTTCACATGTGCAATATT-------------------TTAGTAAGTCAAGCTTTAA------TTGAAATAAAAGTTCTT----------CTTAGAGAAGTAGACATATGCTTAAAGACAAAACAATCAACTCTATGAATATATATATTTAAACATAGTGGTGAACAAAT-TATGTTACAAAATTGCAAAGTTTTGCTGTCTGTAAA-TACACGAA----GTATCAATATGGATCTTAAACTTAAGCGTGCGCATAAACGTGGTATTGTCCTTGGTCTCTAGAGCCAAAGTTACAGTATTCTCCAATCTTCCTCTTCCGCACGGATCGCGAAAGC
TATAAATATATACATATACACTATATGTACTATTTCATTTTTTATATGGTATGTTTTTAATTTCATTTATTATAGAGCAGCTTTTG-ATATGCGATTTTGTGCACACTTGACAGGAACTTTTTATATTGAGTTTTCACTCGTTTTTATACAAAATTTGTTACTTTGAAGCATTTGATATATATAAATATATATAATTTTAAAACAAGAGCTTTTA-----ATAAGTATCTATTCTGTTTTATGTAGAAATGTATGATTAAGTACTTTTAACTTTTGC--ACAATAAATTACAAGAATGTGTTTTTATTATGTAGCTAAAAT----GGGTTCGCATTTCTTTTTTGGAAGTCTAAGATTTTAAAG---AATTGTTATTAATTTAAAGTATTTTTGTTAATTATGGCTTTAAATATA
>rab3-GEF 14945980 14947699|18942 chrX 14946814 14947695 scaffold_46 448384 449347 - 6848|0 1065
CCCGCGATCCATCAGTTATGCTATATACATATATATATATATATATATGTACCGTAATCGATTATACTT----------TAGCCAAATCATATCATTAGCCGCCTCTCACTAAT-CCCATAGACAAATTGTTTCCTGCTAAGCTTTAAGGCAGAAAGCGCCAAACAAAAACAAAAACTCGCTTACGACTACCTAAAACATAGATAATGACAAAT-ATATATATACATACATACATACATATATATACACTCAGATCGGGACTTGACTTCACTGTGGGGCCCTTTGAGAGGGCACAACAAACGAAACACAAACGGAAATTGAAGGCAATCTAGTTAGGG--ATATAGTATACT-----------ATACC---------------AACTAAATT-----CAAACTAA-----------------------CAAAC--AAAATATTAAAATATTATGT----GAATATCTACCAGACAACTACGATCATACATAAAGTA-------------------AATATATATATATATAAATATATATTTATG---GTAAAGGAATTTAACTAGTTCGTACAGAAAATATTAAGAGATTGTATGACAGCAAGAAGTGGTCCTAAGTTCAGATCTATTGGGATCGGTAGTTTAAGGAATTGTCAGGGAACACG--AGCACGGACGACGGAG--AGTTTTGGATTAACGGGGACTCTGGAGAGCAATAAGTATGTGTATGTGTATGTAGTTTGTAAAAGGAGATCGGC----GTACATCCAAA---ATACACACATACACACACATATATATATA---------------------------TATATAT-------------------CTGAAAATATATATAAAAAATATAACTATTTTTTTGTTA--GCTGGCTCTGGATGTTAAC-----CACAA-ATAA----AGCCCAGCACCCATATATATATAT--------ATATACATACCTCTTTAGCC-----------GTGTATATATGTATATGATCGATTGTATTTTTCAAAGTTCAAAGCGAGAAATAAAAAAAAATAAAA
CACATGCTATATATGATACGATATATATACATACATATATATATATAACTACGATATTTTATGTTACCCAATGCTAGCCTAGACGCATCATATCATTAGCTCACACACGCACACACTCACACACACAT-------------------------------ACATACATATACCACATTTAACTAGAGGATTACGATATATAGGAGAGTAACAGGCGATGTATATAGATGGAT-------TATATAT---CGAATATGGGCACAAAATTAAAC-------------AAGAAAAAACAACACA--------AAAAGGTAATTGAAGGCAATCTAGATAGGGAAATGTAACATACCAAATATGATAGATACCATAAAACCTAAATGAAACCAAATTATTCCCAGGCTAATGTCAAGGAATTTAACTAGTTGTTAAACCAAAAATTTTTAAAAATTACCTACAAAAATATATATAAAACATAAACGAATTGAAAAGAACCAGATGCGACGCGCGCGGAATAATATATACTTATATATATATATATATATGTATATATATATATATAAATA----------AATATATATAGATAT----------------------ATATGTATATATATGTGAAGGTTTTTAGCTTAAGGAATTGTCAGGGAACATAACATAACAGCCAGCAGAGTTAACAGAGCTTTAACAGAG---TTGAGCAGCAATATGTGGGTGTGCGCGTA-ACAGAGATTTAACAGAGTTCGGCATAGGTATATCTATATCTATATATATATATATAC-CATATATCGATAACTTATCCATACCTACGACTTACTGTCTATATATGGGGCATACAATAACTGCCCCAAGCATATATAT-ACATATATATATTTTTTTTTGTTGTTGTTGGCTTTGGATGTTAACAGGAGCACAATATTATGCTAACCAAACGTTCATATATATGTATATACAAGAATATATATGACGTCTTATCCTACAAATAATATTACATATATCTATATAA--AATTGTATTTTCCAAAGTTCAAAAACGTGTGCAAATAAACACAAAA
>CG5652 14970733 14970821|18971 chrX 14970479 14971232 scaffold_46 488667 489403 - 13433|304 397
TCTGGATGCACACACTCTTTCTTAGCTATGTATAACTTGTAAA--TGTCTTAGCATTTAGTGGCAATATGTTTAGTGATCCC---CAGCGAAAT
CCTGAA---------GCTCTCTTTG-TATTTGTATTTTGTAAATTTGTCTTAGCATTTAGTGGCAATGTATTTAATTACCCCGGATAGCCTACC
>CG5662 15045272 15045317|19082 chrX 15044554 15045272 scaffold_46 294852 295588 + 18090|748 748
A
A
>Top1 15159856 15161966|19247 chrX 15157972 15160548 scaffold_24 662812 665474 + 102722|1946 2764
ATGGGTTCTCCTCACAGCCACGCCTAGACACAAACACACAAGTACGCCGACCCTTCCTCCAC----------------------CCACCACCACCCCTTCAGACACACACACAAACACACACTCGCACCCGATCGA-AGAAGATGTAACAACAA-ACCACACCCACCACAAGGCCGGTTTATAAATAGATTCCATGCCAATCCCGCCATTGTTTGGTCCACAGTTTATGCAATTGATAGTGCATATGTCCAGCTTTCGGCCAACGCAATGGGGGATTGTTAGCCAAAATGAGCGG-------GACGGAATGCTGCACTACATCGTAGTCGTGGAACCGCTTGTACGCGTC------CGTTTTGTCTGCTTTGAATGGGATTAATGGGATCAAGTGCATACTACGCCGAAGTCTAACTTGCGAAATGTGCACACCCAAACACAAGCTAATCCAATATATGTCAGTTTTATTCATTAAAGGCAAGAGGAGATGTGAAACCTGGGCAAGACGTCGCCGCCACCTAAAAACAAATCAGGAGCATAATTTTCTATGTCTCTACAAAAGAACTTTTTTGTCAA----GATACCCTTA-----------------------------------------TACTTCATAATT-------------------------TTACATATAAAACATATATACAT-----------------ATATATATTTATATTTATGTATATAATAATATTTGTGTATATATTTTTATTTTTAATAT--AATACATACATTTACATAAATATATATATATAGATATATATATATATAT
ATTGTTTTTTAACACAACCAAGGAAATATATATACACACACACACTCACACGCACACAGCGCGGGAGGAGGCAGCAGTTAAAAGCGGCGAAGACCAACTCAATCAAACACACACACACAAACACACACCCCACCAACAGCAAAAACAACAATAACAACATCATCAGTACCAA-------CATAAATAAACTCAA--CCA---------------GATACACAG---ACACA--------CACACATACACACACGGCGACCAAT-CAGTG---------CAGCCAAAAGGCGCCACCTTGTCGTCGGAATGATG---------ATGATCAAGTAACATCTTCCTCGGATCGGCAAACCTCTTGAACGGTTTATGCAAAACTATTATGCATACACACACACCACACA-----CACACACACAAAACA-ACACA-GCGAATGAGAGAGAATTATATATATATATACATAATTCATGTGAATTAATGGTAGCTTTTGTTTTTGGGTGGCA------CACAATATATAAATATAT-----GTATATATATATATGTATATGTATTATATATTTTTAATAAATTTTAATAATTTCAAGTGTTGCGCACTACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTAACCTCTTGATTGGTTTTTGTAAACTGTTATGCGTACTCACACACCACACACACACACACTAGCAACACGGCGAATGAAAGAGAATTATATATATATATAC-ATAATTCATGTGAAT-TATTGGTAGCTTTTGTTTTGGTTGCACACA-ATATATAATTATATGTATATATATATATGTATATGTAT
>Top1 15159856 15161966|19248 chrX 15160549 15160806 scaffold_4 4265678 4265879 + -455|0 258
AAAAATATAGATGTATATATATATCTATATATATATATATATATTTAATAGCAAAAGCAAACGAAAATTATACAATT-TAAAACGCAATTTTTTTTATGTTTACCTATAGTTGATTTTGTTTAGCGAAAACAAAAAACAAAAACAAAAACAGGCATTTGTACATAACAAGCCAGCAATTAGTTACCAAATTAGATATTAACTAAATTAAGATATAATAACATTGTAAATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGC
CAAAAAAAAAATAT-----------TAT-TACAAACAAATATTGTCTGGATTGGAGGCTTATCGTATTCATAAAGTTGTCACATG---TTGTTTTTACAGTTCACAAAAAATGATT-----------AAATAAATAAAAAAAAAAAATACAA-----------------------AAGTAGTGAAAAAAAAATATTTTACATAAAAT----TGACGCAAAATTTTGAACAACAACAA----AAACCCTTTAACTATTGA
>Top1 15159856 15161966|19249 chrX 15160807 15160953 scaffold_24 665920 666066 + 4313|0 157
TATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATT--------CTATCTATCATAATAATAATAATAATTTGTATA---AGTGCAAACTGAACAGAGAAACCTTGTAGCCCAACTTTTAGCATAGCATAATTTATTCAATTCAACTCTGAAGCAGCG
TATACT-TATAGTTGATCTTCGTTTAGCAAAAAGTTTATACCTACAATTTATAATAAAATTTATAAAAACATACATATTAAGTGCTAAGTGAA--GAGAAACCTTGTAGCCCA-CTTTTAGCATAGAATAATTTATTCGAT-------TAGAGCAGCG
>Top1 15159856 15161966|19250 chrX 15161182 15161365 scaffold_24 666497 666728 + 2178|0 238
AGATACAAATCAAACGAGCAATTCAAATAACTCGATGAACCAAAACAGAAACACAGCCAGCAAACCAGTCGCAGCGAAAGAAAGAACT------TTAATCTGAAAGAAAGGAA---------------------------------CTTTATACATATAGAATCTATAGAA-----GTATGTGCAATTAAGTGAGCTAAAA----------CTATACCT-TAAACCTTGTAAAAATCGA
AAAGAAAAAGGAAACGATCAA---AATCAAAAAGATGAAAGAAAACGAGAACAACGCAACAAAGAGCATTATAACAAGA-AAAGCATTACATGATGAATTTAAAAAAAAAAAAACATCATGCACACTAAGTTTAAAGCGAAAACCCCTTTATAAAT-TAGGATTTATACGAATATAGTACGTGCAATTAAGTTAACTAAAAACCGTTTGATCAATAACTATAAA--TTGTAAAAAACAA
>Top1 15159856 15161966|19251 chrX 15161781 15161952 scaffold_24 667315 667426 + 5408|0 171
CACTCACATATAAACTTGGCATATTATAATATTGATATAAGCAAACAAAAAACAACAAGCGAAATGATAAGAAACCCACTATTTTAAATCGAAAGCAAAGTAAATGAAAAACAAAATAGCATAAGTGAATGTAATTGCAATGGAATGATGCAAATATACATAAAATATATAT
CACTCACACATAAACTTGGCATATTACAATAT-GATATAAGCAATGAAAAAACA------GAAATTGTAAG-----------------------------------------------------TTTAATGTAATTGTAATGGAACGATGCAAATATACATACAACATATAT
>dah 15164639 15164939|19255 chrX 15164759 15166898 scaffold_66 95222 97421 - 33679|0 184
TATATCCTTCTTCCTTTTCCCATGTGCTTTAACATTCGCGTAAATGCTT---TAATTTGTAAACTTACAACTCTGACAAGAATGCAATACAACAAAATGTTTTTATAAAAATATACAATGCAAAAAACACATTGTTAACAAAGCATTTACATACAAAAT-ATCAACTTTGTAGATTTTCCAATGC
TATCTCTCTCTCTCTCTCTCCTGGCACAATATCATTTATACATGAGCTTAATTGAGTTCAAGGATAACAGCCCAAATCATGTTAGAAGGAAATAATATTTGCTTATACAGATATGCA-CGGAATAACCGTAGTAATAACAAT---TTTCAATACAAAATTAATGGTTTTCATTACTTACTA--GC
>HDAC6 15173953 15174292|19263 chrX 15173313 15174279 scaffold_26 1542011 1543036 - 20829|713 1050
CCCTTAGCCATCCGCGTGCTGGACGCCCTCACGGACTACTTGTGCGCGCTCTGCCCGCCACTAAGGCACCTAATCCATTTCCTGGCCGAGCACCTCTGGCCGCTGCTGGAGCGCATTTACCTTAACCTGTTGCACTACTTCCTGGCCCACTGAGCACCCCATATCCAATCCTCTAGCCCGCACCCA-CAACTGATCTGAAAACTGCTGCAAC------TGGCAGCCGGT----CGGTCATCCCCTGGAGATCCTGGCACCAGTCACCATACCATTTATACAAATGCAAATTGTTAAAGTTATCAACTAATGATCTAATAAATAATTCAAGTGTTTTTT
CATTTGGTGGTGCGTGTGCTGGATGCCATTACGGATTACATGTGCACGCTGTGTCCGCCGCTGAGGCACATACTCCAGCTGCTTGTGGAGCACATGTGGCCGCTGCTGGAACGCATTTACCTCAAGCTGATTCAATATTTTCTGGCCCATTGAGGCACACACGGC----------ACACGCACACACCGACCGACCAGGCACACCACGCACCGCATCTTCGCATCCTGTTAACCTGTTGTACCTTGGC-ATCCAG--AATATTCTCCATCCAATATCCA-AAATTCACACCGCTGAAGCTG--AAGAAATGTTGCCGC-ATTAAATTAATTGTTTTTT
>CG6227 15183620 15183958|19272 chrX 15182074 15183637 scaffold_26 1551429 1552975 - 84893|1552 1569
ACCTAGATCTAGATCCCC
AGTTTGTTGTAAATGCCC
>Ahcy13 15286415 15286587|19413 chrX 15285000 15286693 scaffold_66 193235 194975 + 68241|1515 1693
GCACCCGATTCGCCAACCGGTTCCACA--CCCGAATCCATAACCGAATCGGGACGCGGCGCCGGAGACGACGGACCCACAC---TAGTTATCTAT-TGTCTGCGCATTTCACTGTTCACCTAAGCAGCTCCAATAAAAACCCATCTCACGTACTCTCAGCGAGAGAAAACCCCACATAG
A-----GATTCCCATAA----TACACAACCACAAGCCCCTAA---AATCTTTGTGC---------GATCACGTTTTTATATACGTAACCATCTATAAGAACGTCAGTTTCGCAGTTTATCGTA--AGCTTCAATAAAATCAAAACT-------------TGAAATTTACTCACATACAC
>CG11655 15289241 15289492|19417 chrX 15289372 15289634 scaffold_0 1993266 1993543 + -1305|0 130
GGAATGCCGCAAATCTCAAGCGTATTATACTCCAGAATTTCACCTAACACCTAAGACGAACCCAAACT----------TATTGGGATAATTATTTTTTTTACAATAAAATTAACCTATTAATTTTGCAAGC
GGCAGGCCGAAGATCTAATACTAAAGAAAGTCCTTAATTTTTC-----ACCTATGATAACGACGTACTACGCGCGCACTAGTAAGATCTGTGCTTGACTTATTA-GCCGTTATCACTTTAAGATTGATAGA
>CG6299 15300648 15300750|19422 chrX 15300462 15301516 scaffold_26 1953041 1953995 + 19601|186 302
TC------------GTTCCTTAGCCTAGC-CTAGCCTAGCTTAGCTTAAATAGCTTATCCTACTTTATTATTTATGCCCATGTCCAAGTAAAACGCAGAGCCTTACTTATAA-ACCA
TCAGATGAGTTGGTGCTGCCAAGCCTTTCGCCCGCTTCCTTTAGCCT---TAGTGTAGCCTATTTAG-----TATGGATATATGCTA-TGATATATAATGTTTAAGTTCTAATTTCA
>CG6340 15317613 15318317|19441 chrX 15318286 15318490 scaffold_5 3875316 3875489 + 4285|0 31
TTGCGATTTACACACACATTGTTGTTGTTGTT
TTCTAATTTGTACTCGTATT----TTGTTATT
>CG6340 15320379 15320546|19446 chrX 15320094 15320554 scaffold_5 3877393 3877948 + 11411|336 550
AA----GGGATCGGAACGGAGGAGGATCGGCTCCCTGCCAG--GCTGTAAATACCATGC-----------CACTCACTCAACTCA------------TTAGTCAGTCAATATGT-TTCTCCTCAACAACTTTT---------TGTTTGTGTTGAGAA--------AATTTTTTGTTTTTTTGATTTCAAATAAACGTTGCAACAGAATTTATGAA
AGCGCTTGGGTCGAGGCCAACAAAAAACCGTTTACGAGTGGAAGCTGTAAATAGAATGTGCCCGCATCAACACTCGCTTAAGTCACCTAAAACTGATCTAATTTCGCAATATTTATTTGTTTTAACAACTTTTTTCTCCAACTATTATTATTAATAATTACTTTTTATTTTATTTTTTGATTATTTCAAATAAATTTTGCGAGGAAATGTTCCAA
>l(1)G0168 15344339 15344726|19477 chrX 15342270 15345451 scaffold_5 1399913 1403366 - 39088|2426 2901
TTGTTGTAGAATA-GTCGCGTCTTTATGTTGT-CGTGTGTTTTTTTTATTGGATAATTTTAGCATATTTT----------------------------AAACCCACTTGT---------AAACGTGCAATC----------------GTGTCGCCCGTATTCGGAAACATATGT-CCCGCATATATCTCGCTATATATATATATATTTATATATATATTTAACTATATATA------TCTCCAAAACTGTAAA-ATGTCTGTATGTGTATATGTGCAACACTAGCAACTTGTAAATATGTAATATGCAACTTG---AACATGTCGAGGGCAGCAGAAAATAGTAGAACCCAATGGTTTTGGCCAGTTTTGCTTGCCTGTGACACGCCTTCACAGCGGCCTTGCTAATGAGTAGC-CGCCAAATAATAAAAAT---------AATTAAATAACTAAA------------CGAACCAA
TTGTTATAGAATACCTTGGAACTGTGTCTTCTGCGTGTGATGATTGCCTTTAATTATTTTACTATTTTTTTGTTTTTTGATTAAAATAAGTTCTGATAAAATTGATTAGTTGTATATTGAAACGTGCAATTAAAGTACCATTCGGTAGCACTATCTATATCGTTTAACCCATGTACTCGTATTTACTACTCCAAATACACATCTATGATTGTATAC-TCTAACTATATATATGCCCTTTCCCAATTTTATAAACACACCT-------TGTACGTGCAGCAAGCGC-ACCTGTAAATATGTAATATGCTATTTATACAAAATGCCAACGA-AGCGGACACCAATAGGGTATCCTG-------------TCGCCTGTCATTGATGCGCCTTAATAGCAG-CTCGCCAAACAGCAGCACATAGAATTATATAAACAAAAGCCGGAAATAAATATTTAAAAATCAATAAACTAAAATCGA
>CG7860 15404181 15404378|19533 chrX 15402819 15405603 scaffold_5 2991812 2994455 + 66738|1380 1585
CTAAATTCGGAGTACCTA--------CCTATCCAAGGATTTATCAAAATCCCAGTAGAATAGTAAACAAATTAAAGAATCTTCTTTCATTTCAAAAAGTTACATAAATAAATTTGACTTGTTTTAATAAGAAGCACACGCATTTGTTTTAAATAGTTAGTTCATTTGATCAAGAGACTATATAAATAAATTAATGTTGACCACACT
GAATAATCCAATCACTTAAAAGCTATTTTACACAGGTATCAAGCGTACCCTCAAT-GTTTTCTGTATTATTTGAATAAATTACTATTGTT--AAAGCACAACATTATAAAGCCTAA--------AATATAAATGATAAGTGTGTATGT-ACATCATTA-TGAATATCACAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATACCCTAACA
>CG7872 15413373 15413800|19541 chrX 15412263 15413634 scaffold_5 2996360 2997735 + 61106|1135 1419
CCGCTGCTCTGCGATGTTCAAGTTTCATTGTTCCATCTAAAAGTCTGTTGTGTGCGTGTTGTAAAACCGATCCCAAATTCCTCGCCCTCGGCATC-----CCCATACCGTCTAAATTTTGATACATTTATATATATATATTTAGA------------AATTTTTTGTACACCAACTATATCAATATGAATTATGTTAATGTCCCGGTGTTGTCCG------CCAAAGGGCGAAACGTTGACCCCGCCGGAGCGATCCGCCAAAACCGGTTCAAGAACGTGGCCAC
ACGACGCCTGTTGATGTTCAAGTTTTATTGTTCCATCTTG----TCGCCATCGGCATACTGTAA--------TTTATTATTTTATGTTCAATATCTAAAGTTCATGTGTTTTTTTTTTTTATACATATTTTTTTCTGTGTGTAGGGCGAAGTTTTGCAATAGTTTAAAAATAAATTATGTTAAT---AATTCTGTTAGCCATTGGATACTGCCCGCCGGCACCGATGGCCAAAACGTTGACCTCGCCG------------CAAACCGGTTCAA-AACGTGCTTAC
>CG7872 15413373 15413800|19542 chrX 15413749 15414119 scaffold_105 1362 1687 + -1191|0 53
AACTAACTTGACTAAACCGATTACTGTAATAAA--CTAGATAAAATTCAAACGT
AGCTGATTTCAATTGAGTGATTTTTGGAATAAATACTATATACATGTT---TGT
>CG8097 15418928 15418981|19551 chrX 15417501 15419885 scaffold_5 3001443 3003721 + 22846|1472 1527
AGATATGTTGAGCATATCTTCTATAAACAAAA--AACAAAAAAAAAAAACACAAAA
GGGC----------------CTACGAACGGGCTTAACACCAAACGAAAATACAACC
>CG8105 15423242 15423303|19555 chrX 15421039 15423685 scaffold_5 3005323 3007931 + 73595|2305 2371
TTTTGCGAAGTTTTTCGGAT--AAATTTTTGTTTTCTGTT---CTAAATAAATGTTCTTGTAGTGCA
GTTAGTTTAACTTTTACAATGTAAATTGTTGTTTCGTGTTAATTCAAATAAAACGTTTTGAAA-GCA
>CG12708 15511562 15511674|19667 chrX 15510244 15511903 scaffold_46 175034 176883 - 37616|1515 1639
TCCTCAAGGATATTCCTATACCATAGGCATAAGACATTTTTTTCATAGCCCTAAGAACGTTTTTTTTTTTTTTAATTT-----TTTGGCC-------AGAATAAATCATTTGGAATGCAGAATGT
TCA-CATGAATGTTT---TAAAATAGCTTAAATATTTTTTTTTCAAA------------TATTTTTTTTGATTAATTTAAGAGTTTTTCCTGCTAAAAGAGTAAATAA-TTGAATTATGAAAATT
>CG8128 15533803 15533977|19690 chrX 15533019 15534209 scaffold_46 208560 209658 - 32863|789 970
GACTTGTCGGTGCAATGGCCAAATCCTTAGTGCAATTTT-------TATAAAGTCCTTTCTTCCAAAAGCCAGCAGCATCACAACTGCGCATTCAAATGTTCACAATGTAGTCAATAAATGAATTTTTTTGTATATAATTATATGCATATATCAATTAAAGCTCACACAGCCTTTTACAAAA
-----------------GCCAAAAAAATAGTGCAATTTTGTAACTGTGTCTAGTTTTAATTTGTACATACCCTCTGCGT---AAATCTGTAGCTAAATTTTAATCAAATGTCCCAAGGACAAACT---------------------ACATATCGATCAATTGTTA-------TTTCA-----
>CG8134 15539389 15539678|19694 chrX 15538162 15542912 scaffold_46 213560 218599 - 169809|1246 1693
A-------------------------------TTTTAGACCTAAGATCGTACTGTACATTATTTACTACTGGATCATTACCACTGAATGAGAA--------------------------TGACACATGCAACTATCGCTTAAGTGTAACCAAGTCTACCAACTAACCTTTGAACGTGCCTACACG-------------------------------------------CATAAAAATTGAATTA-------------------------------------AATTAA---CAAACGAATGAC-CAGGTGAATGCAGCAATAAACAGAAGGTGCGAAG------CGCAATGAAAT--------GTAATAGGATTTGTGATTTGTACAATAAATGAAGA-GGAATGCGCATGATAGTGCGAAG--ATAAAGATGACTAACAAACCACCAA
AGCAGCTCGATCCGTTGCACGGAGCTCGACAGCTCTCTACTAAAAAAAAAACAATATAT-ATATATATATAAAAAAAAAATACAAAACACAAAAAACTCTGTACAATATAGCATATTTTTAGCATATGAAA-TATCGCTTAAGTGTAAACAAGTCTACCAACTAACCTTTCAACGTGCCTACACGATGCAACTCACAAGCGAAATACGCATACGCATTTAAGCATATGTATAACTATAGAATTATGAATATATATATATACATATATGCATATATATATATAATTAATTACGTATGTATGAAGCTCGAAAGTACAATAAAAAACGAAAGAAAACAAAAACGGACACAATAAAACTTCCTTTCATAAATGTACTTTGGCTTCTTATTATAATTAAAGACAGAATGTG-------ATCCTAAGCCATGTCAATTTTTGTAAATCAACCAA
>CG8184 15565085 15565425|19709 chrX 15562008 15566004 scaffold_24 756749 760900 + 140680|3258 3700
GGTG--------------------------CGACAACTGTGACGGCAGCTTCAAGCACCAGCCGGCAGAGCCACCAGTAAC--CAACAAAC-CATGGACGCAACACTATTCCTACAACGCCCTCAAATACACGGGTGCA-ACGATGAGAAATGCATAATTGATTTGAATTGAACAGAACAGAAGA--GAACAGAACAGCCACTGCAAATTTGCGATAGCGGCAACAG---AAACTGCATACATAAACAGTACATATAGTTATATAGTATATATAAAA-----ATGTTGAATTAATTATTAATTTTCGCGC--------------------------CTATATATATATACA-----------------------------------ATATATATTTTCTTAAATTTTCAAAAGAAAACGGAAGAAAACTAAGG-AAACCTAAC
GCTGTGCCGTCCGATCACACCCAACAAAAACAACAACAATAACAACAACTAAAATAA-------GAATAACCAACAGCTACAGCAACACACACAAAGACACACACACATACACACACCACACCACACCACACCACACCACACCACACAATTTCAAGAATTCCTACAAAAAAAACAGCGAAGAAAAATAATTAGAACAGCCACAGCAAATGTGCGATAGCAACAACAGCGACAACAACATATACATATAGTACATATAGTTATATAGTATATATAAAGAAAACATGTTGAATTAATTATTAATTTTCGCGCGTATATTATATACAATACATATATATCTATATATATATATACATGCATATATATGTATATATATATATTTACATATATATATATTTTCATAAATTTTCAAAAAGAGGAAGGAAAAACCGAAGATTAACAGTAA
>CG8191 15567166 15567600|19710 chrX 15566128 15568549 scaffold_24 761227 763660 + 36838|1106 1540
CTACACTACGAGTTTAATCATGTTTCGGCAAAAACTCGCAGTTGCCATCGGTCAGGCGAACCACCTTCTCGCCCTTCTCGGCCAGGATCTCCTCGATGTTGCGCTTGCCGTCCAGATCTGTGAACCAGTTCAGATTGTCGGCGATCAGGTGGTGATTGGAGCAGCCCTCGCAGGTCACGATAACAACGCCGCGTTGGTATGCCAGCTTCGAAATGGTCTTCATGTTCCGGGTCTGGCACACCTTGCAGGTGTAGATCAGCTGCATCTTGGCCTCCAGTTTCGCCAGAGGAATGCTATTCGTGGCCACCGTCTTGTCCGCATCGTCCTGGGAGCAGAGCAAAATAATTATACTTAACTTTTTTGTTATACATAATTTTAAATATTGCATTCCATTTATAATATTTTAAATTACAAATGTAAATAACATTATTTAAT
TAACAT---GGGTTT--TAATTGCTTGACAAATATTCATGTTTATCACTGACAATTTTCACAACTTGTTCCCCCTTTTCGGCCAATATTTCCTCAATGTTGCGCTTGCCATTGAGATCCGTGAACCAATTTAAATTGTCGGCAATTAGATGATGATTGGCACAGCCTTTGCATGTGACAATAACAACGCCCCGGTTGTAGGCCACCTTCGATATGGTCTCCATGTTCCTGCTCTGGCACACCTTGCACGTATAGATGAGCTGCATTTTGGTCTGCAGCTCCGCCAAGGGTATGCTCTTGCTGGCCACCCGATGGCTTTCATCTTGCTG-------------------------------------------------------------CAATTGATAGTA-TGTAGATTA-AAATGTTATTCACCT--------
>l(1)G0136 15569430 15569718|19711 chrX 15568978 15569789 scaffold_24 763664 764630 + 15165|484 910
ACC------GATGGAGATCCGGAGGAGA-------TCCGCCGGC---------------------ACCCGCCTCGCAGACAGACCTAAATTAACTAAGTT----------AAATGCAGTACGCGGCCCGACCTTGTATCTCATTAC-------GTTGTTG-----------------GCAAAAGCACCGCATCCTTTG--------------TAAATTTTACTTCGC------------------AAACGA----------ATTCTAAA------TATTAAGTTGTGTTCTATAGTTAAATTTTAGTTGT-AGCGCTAGGTAAGTGACGC------ACCCGCTTCCTTG-----CCGCAGGCTGGCAGTT-----TGTCCTCTTTAGCCC-----TAGTTCAATATATAGACAAGGAATGTTCTAGA
TGCGTTTGTGATGGAGAAGGGGGAGGGAGGGGTGGCCAAGCGGCATGCTCTCTCTACAGAATCGGACCCGCCTCGCAA--AAACCTAAATTATCTAAGTTTATTTAGAGATATTACAGCTTGTGTTATG----TATATTTCATTACAAATTCAATTGTTATTTTGCTAACGCTCGTTGCGAAAGCATCTACTCAATTGTCTCGATACGTTTCTAGAATCTACCACATTAAGGTGCTCCACAGCAAAAACGAAAGAAAGTATATTATGAAAATATGCATAAGATTGTTTTCTATAGTTACATATTAATCATAAGCGCGCGGCAAATGAGCCCAATTGACACTGTTCTTAGGTTATCCTTCAAATAACAATTATACGTATGTACATTAGCATGTATGTAGTTCAAATTATAAACAAATAGAATACGAAA
>CG8206 15573916 15574179|19714 chrX 15573331 15573991 scaffold_28 624704 625327 - 28897|598 676
G---AACTCTAGTCAAAGGGGCATCAGTAGAGGTGAGAACCTGGTGCCGTCAACCTGCGAATCGTGTCTGAGGAGGACA
TTCCAGTTCCAGCCA---GGACAGCGATGCAG-------TGTCGTCGTGTCAACACTCGGAACGAACGAAAGGGTGACA
>l(1)G0022 15582710 15582910|19724 chrX 15581216 15582990 scaffold_28 634011 635784 - 104176|1494 1713
-TCCCCATCA-----------TTTCATCCGACCCATTCAAT---TTAACCAAGTTAATGCACCGCATGCTACTCAACCCGCGTCTCTCAAAGCCACACACAACCAAAAGAAAACTAAACACGTAAATAATTTGGAAACACATGAAATCGGAA----TGGTTGCGGCTGCAAGTATTCACATTTAAAATACAATTCTAATAAATACAAAAACCAAACACAG
TTCCTCACCAGCTGGTGTAGCGTCTATGAGTTTCATCTAATTAATTAACCAGGCTAACTTAAAATATACAAATACACACA-------CACACACACATGCACCCGCAACAGCAACTAGAACTCAAATAATGACGAGTTGCCTTAAATGGGAAATCGTTATCGCTGCTTCGATAACTTA---TCGAACTTCTACCAGAGAGGATAAAAAAAATA-------
>CG8239 15584873 15585159|19727 chrX 15583770 15585103 scaffold_4 1575322 1576602 + 40523|1110 1371
TG--------------AGAGT-------GATTTTGAGAGTGAATTGCATAGGGAAAGGCACAGAAATTCTATAAAGGA-------AATATTTTTTAGAATATATTTATGCGAAAATACATTTATCAAAATGTACAATGGGGCACAATGTATAAACATTTAAAATGCGCACGATTATTCATTATTACGTGACTAAATTTGAATA---TCTCAATTGCAACAACTTAATTTATTCTCTTTATTTATTTTTACCTTATTTATTTA
TATTCCTAACTAACTTAGACTCTTCCTAGATTCCGGGCTCAAATTGCACACTTGAAAT------AAGTTGCTAAAGGCTTAACTTAATTTATTTTTGACTATAACTA---GAAAA-------ATCTAGATATAC-----------TTACATAACATTTTTCTTTATACCCATTTGTGCATTGTTTATTTCTTTATTGTTGGCACATTTTCAATT--AACACTTCATTTTTTTCTCCAT-TCTTTTCTGGCTTTTGTTATTCA
>CG8239 15584873 15585159|19728 chrX 15585142 15585241 scaffold_4 1576638 1576736 + 822|0 17
AAATTATGAAAAACGGAA
GAATTTTAAAACTTGTAA
>mRpL3 15596533 15596604|19741 chrX 15595240 15596544 scaffold_46 919970 921311 + 47201|1352 1363
CTTTAGTGCTTA
--TCAGTGCCTA
>CG17209 15603310 15603452|19747 chrX 15602285 15603540 scaffold_25 246869 248121 - 54671|1032 1203
GAAGCGGGCCTTCTTGACGTTATACTTTTATAACTTCATTATTGTAAA--------TAAATAGT------------ATATACATATTTGTTCTGTCTAGCTATG---------TTAAGCAAATTTACCTAGATTGTACTTAGCTGCGGAAATTAAAGATGGTATTTCTTATA
GCAGCCTGCCCGCCCGCCATCATCT-------ACTCAGTTCCTGTGAAATGCCAGCTAGTTAGTCCTTAGTCCTTAGTCAATCTAGTTGGGATGTGTCGCCATGTTCCCAGTTTTAAGTTAATTCCCGTCG-CTACGCTGACCTCCAACAATTACCAAGCGTTATTCTTAAA
>mRpS30 15621947 15621985|19772 chrX 15621748 15622406 scaffold_48 39036 39792 - 9063|202 248
ATGAATAAATATAAAACACTTCCTAAGGTTACACT--------TGTT
CTG-CTATACGTTGGCCCATTACGGATGCTCCATTATCTTTAATTTC
>Rhp 15627450 15627684|19778 chrX 15626640 15627505 scaffold_10 351473 352363 - 35233|836 909
GTAGCCATCAGTTTTATT------------------TTGTGTTTTATTTTTTTGCTCTTAAGGCAATGGCCATT
GT-GCTGTCAAATTCATTTGCACTGGGGATTTCTTATTTTAAGTTATGCTTTAATTTCCGCAGCAGTGGCCATT
>Rhp 15627450 15627684|19779 chrX 15627506 15627689 scaffold_10 1549562 1549761 - 2055|0 196
TCAAGTTAAAAAGAATGTTGTGCAGTTTAAGTTA----AGCAATAAACTTAATGATTTTTTAAAAGCCCCTCT-----------ATTATACCCATAATTTATTTTATTCCTATTGATTCAATCGCTCCCAATCACCCATCGATAATAATCTACACGGAAAATGAATTGAAATAAATGTT---TTTAATGTTTTATCG
TCAAGTGTAAAAAAAAAAACTGCA-TTAATGCCATAATATCAACAGTTCTTATG-TTTTGTAAGTTCTCATTTTCGATTTAAGCATTATATGTACATTGTATATTCCCACTGTTCGTCAAACCGCTACCGATCATGCAATACTACCAATCAAAACGATTAATGTATCGATTTAAATGTTGTATTCGATACGTAACCT
>sd 15658386 15659673|19812 chrX 15657964 15659323 scaffold_10 4497582 4499020 + 35774|454 1514
CAAAAGCTGCATGGAGCAGAACCCAACCTGTCTGCGAATCCCATCATCAACACACAAGTTCACAAATATACCGACAACAACAACAGCAGCAGCATCAACAATAATAGTAT------CATCAATACGGCTAAGAATTGCGATAATAAGACGAGTAATGAAATTGCCAACACAATATCCAACACCAAGAGTGCCAGAATCATCAGCAGTATCAACAGTATCAACAGCATCAGCAACACCAGCAACATCGGCAACATCAGCAACATCAGCAACATCGGCAGCAGCA-ATAGCAACACTATCGCACTAAAATGTGGCGACGGCAATATGAAAACCAGGAACCTATCCGTTGCTGGCGCCACAATTATCAAGCAATCACTCACCTCACCG---------------------CAACATCATACGGATATCGATGCCTTGACAGCACTTCAAGTGGAGGAGGTTATTTATACACA---GTCACAAGGGAATACCAGTTAT---CAATTA-------GACACCGA-AACAAGCATTGC-------------TCCCAACGTACAAGAGC--------CAACACTC----------------CAGCAGCAACATACCGCCTATGAGGATCGTACAGTGACAGTCCTGCCACCGTATAATCTATGTATCGGCAACA------------------------------------AGCAACCACAACCATTCGAGGCTGAGCAACACGAACACGAACACGACCAGGAACAGGAACTGGAACTGGAACTGGATCAGGAACAGCAGAAGCAACTGGGGAACACGGGCTATGAGCAGTTCCTGAAGTTGTCCGCTCATGAATATTCAGAAACTGA---CAGACGCTCCGCG-GCTGCTCTAAATCTCAGCAGTATTGGCGAAAAAGAAGCGGCATTGGTCGGTGAATCCAAGACGGATCTTGAAGATCCGCC---AGAGTTTCGGATGCTTCGAGAGGTCAGTGCGACAGCGGCGGAGGAT-CCACGACGAGGACCCAACGCCGATGGAATCAGTAACAAAGGCCGTGAGCCGTGAGC
CATGAGCTGCATGAAGCAGCGCCCAATCTGTCCGCGTTACC---CACCAATGCACAAATCAGCGAATACAGCAACAACAACAGCAACAGTAACAGCAACAATACGAGTAGAAACCACAACAGCACAACTAATAACAGCAACAAC------AGCAACGG------CAACACAA---CCAACAGCAA---TGGCAACAGCAACAGCAACGGCAACGGCAACGGCAATAATAATAATGCCATCAAGAGCAACAACAACAGCAACG-CAGCAGCACCCGC--CAGCACAGAGGAGGCCTGCAGCTCAACAACT------CTGCAAGGCACAGGACAGGAAA----CAGTTGCGGCCGC------TATCAAACAATCGCCGACATCGCCGCAGCAGCAGCAACAGCAGCAACAACAACAGCAGCAATTGGGTGGCATTTCAGCTCTGCAAGTGGATGAGGTGCTGTATGCGCAGGTGCTGCCAGAGAATAACTATCATTTGCAACAACAGCAGCAACAACAACAACAACAATTGCAGCAACAATTACGTCAAAACACACACATGTTGCTGCAGCAACACTCAACGCAACAGCAACAGCAGCAGCAACTTGTGAATTACCAGGACCGTCCACCG------CCGCCGCCCTACAGCGCCTGTCTCGCCAACAACAGCGGTAAACAGCAACAGCAGCAACAAAGGCAACAACAACAGCAATCGTTTGAAGTGGAGCAACATCAAC---------AGCAGCAGCAGCAACAACAACAAACACAACAACAACAACAACAACAACATCT------TACCACCTATGAACAGTTTCTGAAACTGTCCGCCCAGGAGTACAC-GCAACTGAACGCGGCCGCTGAGAATGCGGCGCTCAATTTGAGCAGCATGGGCGTCAGCAAAGC------TGGCGAGGATAACGAGGTAAACGACGAGGCGACGTCTCATGAACTGCGCATGCTGCGGCAGGTGAATGTGGCCGCCGTTGCCGTTGCCGCCGTAAG----CAATGCGAATGACAAC-GTGGCCGATGCCG---ACTGTGAGC
>CG32582 15670675 15670860|19824 chrX 15670625 15670948 scaffold_9 669143 669478 - 2236|50 267
TATATACAGACGTTCTTACGACTCGGTTTTGGGATCTAGGAAGCCCAGGATAAATGGCAGAATGCTGCGGACTCTGAGCTTTGTCAATCATATTCATTTTG---------------------ATAACATAAAGATACCACTAAATTCTGTTTTTATTTTTCTTCGTTTTCATGTTTA-----------CCTAGATTATTTTAATATATATTTACATTG
TATTTACGAACATTTGGATG--TCATATTTAAATTTCATACAGATC-GGACAATAAGCACCGAACGACTGACTTTGGGTTCAGGACAAGAGCTTCCTTTTGTCCTTAAAATATGCTCTCTGTATAACA-AAAAATAATAAGAAATTT--ATTTCGTTTTTCTAGAATTTTAGGTTAAGAAATTAAACCCTGAGAAGAGTTAAGAATATATTT------
>CG8578 15681251 15681564|19840 chrX 15681131 15681472 scaffold_16715 565 892 + 5958|120 374
TCTAAGATGGGAAATGCAATCTCGCCAACCATTGAAGGATCGCACCCGATGACATAGGAAACGCAAGTACACGACATCATCAACACACAAATCAACATGCTGCAATTG---AAATAGCACTTCGGTAG------CAATTTAATCGGTCTTAGTGGTAGCAAATCGATAATTTTTGAAGGAT------------------AATCCAAAATACTCTA------CCTTAAAAATATATATATATATATATTTAAATTA
TCAATGAT--GACATGGAAT---------------------------AACAATATTTCAACAGCACGCACATG-------CAAAACATTAATCGAAGC----TAATTGCATAGATAATATATCTGTAAAATAGTCAACTAGTTAGGCCCTA----TAGCAAATATTTAAATTTGAAAATATTTAAATTACTTTTTTATATACCTGCGCTACTTTATGTAATCCTTCAAAA---ATTGGTACATGTATTTAAATTA
>CG8578 15681251 15681564|19841 chrX 15681475 15681706 scaffold_2 969195 969427 + -1683|0 89
ATATAAACTAACTGGATAATAATTAACATAAATAATGTCTATATGTGTATATTTAAAGCGCAAAATATAAGTAACAATTCAATTGGTTCA
GTATATTTCCGCTTTGTATT--TTCGCACAAATATTTCACATTTTATTTTATTT-------CAAATATATACAACAATTTATTACATTAA
>Gbeta13F 15696734 15696823|19859 chrX 15694909 15696746 scaffold_69 78416 80250 + 60880|1889 1901
AAATAAAACAGAA
AGATCGTGCACAA
>Gapdh2 15703272 15703599|19870 chrX 15702253 15703273 scaffold_11 2689822 2690913 + 71669|1090 1091
AT
AT
>Gapdh2 15703272 15703599|19871 chrX 15703558 15703758 scaffold_11 2697306 2697552 + 2045|0 41
TGTAGTTTTAAAAATGCCGACTCATAAGCATTTAAATATTTA
TGAAGCTGTAACAA---CAACTCATAAAAGTTTCATTATTTG
>CG16952 15709349 15709471|19879 chrX 15706127 15709449 scaffold_69 207304 210560 - 135491|3269 3370
AGATTTCGAGTGGCACCCGATCACGGGCATTATTTTAGCATGCCTTTCTGAATAAACAAAATCCGATACAATTAAAACTAAAA-ATCTAGATAAATAAAACA
AGGTGGCAAGTGGCTCCCAACATGGCGCTTGATTTAAGCACTCCATTCTAAAGAA--------------AATTAACATAAAAATATCGAGGGAAATATGATA
>shi 15737737 15738433|19912 chrX 15737919 15738153 scaffold_31 497130 497332 - -1677|0 247
AAACAAACCATGAAAATGATCCTTAAATCCTAGAAATCCAGAAATCAACAACGATGGGAAATCGATACATTTGAATCGCTTGCGTATT-----ATTGTA-GTCATATATATATATAATCTGAAG--CGTTGAAACTGATATAAATTCTTAATATGTGAAAAGCAACTAGTCGAGATGCACATGATTTCTTTAAT---TCCATAAGATGTTTTT--CGTAATGTCTACTTCCCTGTGTAGATATAAACA
AAAAACTGCTTGAATAAAATACTT--------------------------GCCACGGGAGATTTAGATTTGTATTTAGCTCAAATACTCTACACTTGTAGGGCATATGAAAATATTGTCTGAGGAAAGTCAAGCCCTACATCCA-------------------AACTAAATCATATTGACATTATTGTACTAACATATCATTAAGCTACCATTGGCATAATTTCTCGCGAACTGAACACAGTTCCTCA
>shi 15737737 15738433|19913 chrX 15738154 15738190 scaffold_5 2237132 2237168 - 1934|0 36
ATATATACATATGTGTACAAATGTCTGTGCATTTGTT
ATACATATGTATGTGTACACACATATGTACATATATT
>shi 15737737 15738433|19914 chrX 15738343 15738969 scaffold_5 2238851 2239452 - -1031|0 104
CAATGATCTTAATTATATAGCTAACTATTAATAAATAGCTTTCGTTAACTGCATTGTGTTGTTG------------TTGATGTTAAACTATAAAAAA--AAAAAA
CAATAATTTCATTTAAA-----AGCAACTAATATATAAATTTTTTTAATAATATTAAGATGCAGGGCTGGGCTCCTTTCCTTTCGAGAAATGATAAATGCACAAA
>shi 15739862 15740189|19916 chrX 15739693 15739941 scaffold_25 193452 193673 - 9926|169 248
TGGCCGCGTAATTGAGTGCACAGCATGCCAGAGTATGCTTAATTATTAACAGAAACAGAAACTTAGAGAGCCAGCACGCG
AGA------------------AACTCACCAG---------CATTGCAAACGAAGCAAGAGAGCAAGAGAGCCAGCCAGCG
>shi 15739862 15740189|19917 chrX 15740089 15740869 scaffold_17 1779482 1780184 - -1449|0 102
CAACATTCAAATTAGTGCTTTCGAATTAAGTTTATCGGGGATACCATTTACTTTTTAAAGTATATTTGAACGTGAAATA--AAAAAAAAAAAATTTATTTTCC
CACAATTGAGTTCACAGCTTGGAAATTGACTTTA-CACGCATTTCGAGGACCCCGAGCAATGTGATCAAGTGTTAACTATTAAGGAAAATACGCGCATTAATA
>CG8909 15753819 15754512|19930 chrX 15753818 15754150 scaffold_17 1253515 1253833 + 736|1 352
TTGGCATAAATAGTTAATGGCCCACAAAGGGGATCCTCTGAAACCATTTACCGATTCATGCCATCAACGTGA---TTGATTTGATTGTAAATGTAAAAAAAA------TAACAACTGTTTTTAATTTGATCTTGAAACCCCAGTAGAATAT-TCTGCGATTTTTTTTTGTTTTTTTTTTTTTTTTGTTTTTGTGAAAGTGCAAACGTGTCCTGTTAAAGCTCAAAACAAAAAAAAGTGGGGGT---TTTAAGATAATACAAAATGAATATATTATATATGTAATATGATATATGATATTCAATTATGTAATC-------ACTAAATTATTTTCCTATTTTGTAATAATAAGT
TTCACGTAAAAATTCTCTGATGTCCTAAGTAG-TTTTCTGGAACTA-CCACCGA-AAGTGAAATAAAAGTGAAAGTATATTTAAGCGCAATTCTAAAGAAAGTATATTTAAACACAATGATAAAAATGAAATAGAAATGCAAGTGAAAAGTCTCTGAAAAATTCTTTAGCGTTTCAGTTTTCTGGAACT-------AGCACGGA------------------AAGAGAAAAAAAAGCGAAAGTAAATTTGAGA----ACAATTTTTATATAATAAAATAATTTTCTTGCACATAATATTCACTCATCTGATATAAATAGTATATATTATTTACCCACCT--TAATAGTAAAT
>CG8909 15753819 15754512|19931 chrX 15754151 15755360 scaffold_0 1414571 1415713 + -4379|0 393
AATAACTATTAAGTAATTCGG------------GTGCTTCGACTTTGAAACAAAAAAAATATCCTACTGTTGGGCGCGTTTTTTGTTTGCTGATCACGAAATTGATA----TTGAAAATTGTAATGACCATACATACCATGGTTTATGTTT-ATGTCTGATTGCCAATGATAAAATCATTGTCAAGTCCAATCATAAACAACACAGTGCAAACGGAAGTTCTT------CAGCGATTTCCGTTTCCGCGTCGCGATTAAGTGCAAATGT---------CGAAAAACTTCCAATTCTCTTATTTTATACATGTATGTATGTATGTGCTAGACTGTTGATTTAAGTCTGTATGCAAAATTGTACAACGTAATTAAACGAAGAAGTGTTAACAAAAA
AAATAATATGAAAAAATTCTGCGAATCCAAAAATTGGTTAAGCAGAAAAATAAAAAAAAAAT--------------------TTGTTTG---------AAATTTGTAAGCATTAAAAAACGTAGCGG------ATCTCTTTAATTATTTTGGATTTGTAATTCTTAAACATTAAATTA--GTTACGACATATT--------CACAGGGTTAGGTGACTTTCTTATTTTGCTGGTATTTC----TCGAAGACAACCTTGAGTTAAATTGTTTATAAAAACGAGAAAATAATAAATC----AATCCATAAATAAGAAAGTATATTTTCT----------TTTAAGGGTTTCTGAAGTTTTATATGAAATATCTGTGCTGGGAGTGGTGGAAAGGGA
>CG8924 15777993 15778391|19964 chrX 15777282 15778005 scaffold_10 1758465 1759335 - 21889|866 878
CCACGCAATTTGC
CCATGAGGTTGGC
>CG8924 15777993 15778391|19965 chrX 15778335 15778916 scaffold_1 47817 48455 + -377|0 56
AAGGAATTACTGTATTGTTAATAAGATAAATAAAATCGACCTGGAAACTTTTACTGG
AATGCCTCAGTTTATTGTTAAATGAATATATA---TCGTCATG-------CCACATA
>CG8928 15779541 15779826|19967 chrX 15779394 15779785 scaffold_44 368195 368594 + -262|163 422
TTAAAATCACAAAGTGTTGATTCTATAGTATAGCAGCCTAAAAGGATCATTTGCC-TTTGTTTCGTCGTTACGCTAGACAATGACAGTTGTATTAA------AAAATGTATAGAAAACACGATAT--------TTTCTTACTGAACCATCCAAAACACAAGCGTCACAAGCAATCGACTCATCAAAGAAGTCAAGTTAGTACACCTTAATGAAACTGGGTTTACAAACTGAAACTGTTTGTTTTTTAAATGAATATCAAC
T---GAGCCGAAGTTATTG--TTAAAAATATCCACATTTAAATGGCTAACGTGTCAAATAATCGGTCAATAATATATATACGCATATATGTATGTATAGGTTAATATATATAGTATATATAACATGTGAATTGTTGTATATCGCAGCATTGTACACACAA-------CAAAAATTGA---GTTGAATCATTTGTATTAGTTC-TCGCAACAAAACCGGTTTTGAATCTTTAATGTACTTAAAAAGTAAATTAACATTAAC
>CG8931 15819303 15819344|20006 chrX 15818159 15819509 scaffold_46 23267 24623 - 56544|1179 1221
TTAATGGC-TAGTCAAATTATATTGCATATGTAAATTATACAA
CTTTAGGCTTGGTTTGATTTT------CAAGTTTATTCCCAAA
>exd 15828910 15829944|20021 chrX 15828281 15828925 scaffold_25 350933 351557 + 39268|629 644
GGATCAGGGCTGTGAA
GGAT--AGGCTGCCAA
>exd 15828910 15829944|20022 chrX 15829229 15829649 scaffold_4 5134946 5135366 + 954|0 455
AAATCAAAAAAGAAAGTAAATAAGCTG-ATATGGTT----TTTTAATTGACACAGTCTCCTGCTTTTTAACAATATATGCATGCAGGATGTATTAAGAAGTCGACAATTGAATAATGGCCTAATTAAGAATATTTTTTGCCCGAACATAAAACGAAAAGTTTGCTCGCTTTTTTTTTTTAATTCACAATCAATTGAAATGGAAAGCATGTTGTTTGTGGCATGTCAACTGT-----AAAATACATAAATACGTAATAATTCGCTTAAG---CGATTATAATTTGATCAACGTTCTTTAAAAAGGGTT--AATA-ACCAATGCAGTGACTTTTT----CTGCATAGCCCCATTT-----AGCTTATATATTAACCATCGAAAACATATGC----------AAAGAAACTCGATTAAACTGGTAGTATACGAATATTTTCACAACGAGTGGAGGAGGC
AAATAAAAGAAAAACTCAAGCAAAATGTATTTTGTTAAAGTTTTTATTAACTC---------TTTTTAAATGAACTATTTATACATTATGTA--------------ATTAATTAATGGAATAAACAAGAACATTTTTTGTAAAACTGTAAAGCGAAAAGCAAAAAAATTGTAAATTT----CATACGAAGAAACAAAATCAAAATTAGGTTCTTTTTATATACTTAAGCGTTCGCACAAATACAAAAAAAAAAAAAAAGATAATTATGTTTTGGTTGTTTTTTGTTGAAAG--CATTAAAAATGATTTCATTACACACAAGCGGTTCTTATTCTCAGCTATATAAACAGATTTGTCGCAATTTATGTA-CAACCATAAAAGATTTTTGCATTATTTTTGAACACAATTTATTCACATTGTCAGC---CAAATGTTT--GCAATTAATTAACGCGGT
>exd 15828910 15829944|20023 chrX 15829655 15830661 scaffold_25 352299 353187 + -2189|0 311
TTTCAGAGCTATTATT-------------TTGACCGCAGCTGTGTATAAATATATTTTAATACATTTACCTACATT---TGCGGGTATATACAAATATTGCATGTAAATCATACTATGACGATTCTTTTTTGGCTACAGTACGTATACGACAGCAAAATAGTG-TTTACTGAATTTA-----AAACTGTACGAAATTTTTAAAAACTTGAACAATACGAAAATACGAAACTAAACCATGTATACGATGTATATCAAATAAATAAATAATACATGTTGTTGTTATCCGCACACACGTCAACTAATTACAAAAA
TTTCATAGCTACTTTTAACTTTGCGACAGTTGGCAACA-CTGTACATACATGCCGCATAATTCATTAATTGATAATAAATGAAAGCAAACGAGAAAAATGAACGTAAAT-------------TTCCTTT-------------------GAAACGAAAATTGTAATTTGCACAATTAATAAACAAATTGTATACCATAATTAAG--TTTAAACAAAACGAATAGAAGAAAC------ATGTATACGATGTAAATCAAAT---TTAATATAACAAGATTTTCCTGCC-----------------ACTCCCAAAA
>CG8939 15833576 15833636|20025 chrX 15832933 15833756 scaffold_46 29612 30465 - 35123|652 762
ATGTAAATCTAAAAAATA-----------------------------AATATGTAAT---ATTTTATAGATACTA--------AATATATATATAA----------AACGA
AAGTAGACCAAGAAAATGCTCTACGTTCCGTCTCCAGCCCCGATTATAGCTTGTAGTCAGCTTATGTAAATGCTAATGTATAGAATAAATATATAATCTAGTGCATAATAG
>CG12698 15842576 15842662|20038 chrX 15842037 15842813 scaffold_47 742109 742887 + 9766|581 675
GTTCGTCTTCAATTTACTTGCCACTTGAATATATTTATACATTTCCAACTTT----AAAGCATTATTAAATCATTA----GTATTGTTTTCAAAA
TTTC--------------TGAAATGTCTAAAAAATTATAAATGTCTAGTTTTATGCAAATTAGTCTTAAATCAATACAATGTATCATATTTAAAA
>dpr18 15903632 15904241|20065 chrX 15903683 15904283 scaffold_8144 95 660 + -464|0 598
ACAAACAATTAACCAATAATATTAGGTATAAACGAGATTGGCTGGTTCTAAACAACGGTTTTAGTTTTAAAGTTGAGAATCAGAAGGTGATTTCATTACATATTTTTGTTATAGTGCCTACGGTGTATAAGACTTTAAATTTGT---TTGGACAAATATTCTTAAAAATTTGTTTAG----------AATTGAATTAATTAGGCAAAAAGATGACATAATAACAATTC-------------CAGATTCCTAAGA----GCCAAAAACCCAATGGTTTAAAAAAAAAAGTTTCTCGAACTTTTTTTCTAGTTAATTTAGTGATGATGTTGAAATATCGCACACATGTTATATGATGCCTCTTAAAGAGTTAAGAAACTGGCGGGGATAGCAAAATATTTCGTTTAATTTTCTGTGACTTTTAAAAGTTCATAGAATATGTGCATTAATTAAGTTTGAGCAACTAAGCAGGCAAATCAAATGTATCATACGTTATTATTATGTTATACCACTAATTCACAGGATAACAAG---------TTTTTTCAAGAAAACAACGATCTGAT-TAAAACTTTATGCGGTATACTACTTTTTCATCACC
AAAAATGACTGGATAATAAAATAAAATAATAACCAA---------TTCTAATTAA-------ATATCGAAATGTAAATAATAAAATAAAACTCAATAAAATATTTCATATATAGAAAA-ATTGTTCAATATATTTTGGAGTTATACATCTTATAAATATGTTTAAAAAATTGTTTTGCTTATTTTTTAAATATATTGATT--TCCACAATACATCATAATATATATGCACATTATTATATATATATTTCTAAGCATATGGAAATAGCTACATATATTTAAAAAAGA-----------------TTATAATTATTTTA---------TTTTAATAT-------------TATGAT--------------TATGGAACCAA-----ATAAAATAATATTTTTTTCATTATTTTTTG---TTTAATAGTT--TTAAAGATCTACATTTTTCAATTTTAAGAATTCAATTGGGTTGCTAAAAGATTTCATTTTTTTTCTTTCTATTATTATACTAATTCAAAGAATTTCAAATTTCAATCCTTTTTCCAAG----------TTTGATATCGCGCTTTTGGGTCTAAAATTGTCTTTCATCA--
>CG8958 15919600 15919696|20083 chrX 15917791 15919676 scaffold_48 240497 242425 - 20609|1953 2029
TTAGGTGGAGAACGTAGGTTCTAATCAAAATTCTCCGTTTCTTGATTGCTTTAACTAAATAAAGCTGACCTTTAAAT
AAACGCGTGCAACAAAG---CCCATCGAAATTAT-AATGTGTAGAACGAAATAGCAAAAC-AAGCTAACCAAAAAAT
>CG3415 16107550 16107762|20346 chrX 16106407 16107857 scaffold_48 481516 483006 - 49895|1159 1407
GCGCGG-ATCACCTAGAGACACATAGTCTGCCTTAG---------TCGCAATGGATTATCAT-------------TGACTTTATAATTCGTTTCGCGTCCGTTTTTTTTTGTACATACACTATAACAA-ATATGCCTATACATATGC---AATTGTTTAAACGCCCG------TGGTGGTAGAAGTATTTTTTTGTAACACTTTTATAAAACTCCCAATAAAACATCACATAACTGAAAATGC---AAT
ATACGATTTCAGCTTGAAAAGTTAAATCTAATTAAGAAAATGCAAACATTATGAACTACATTTATAGCAAAAATATAACTACATAACCAG----GCGGTGGT------------ATAAAATATTGCAATATAAATTTAATAATATGTTAAAATTGTTTGTCCATTTGTTTATTTTTTAATAAATGACTTTTTACTTCTTTTTTATATACTGCTTTTATATGAATTTGATTTAAATGAACATTTTTGGAC
>Pros28.1 16111247 16111525|20351 chrX 16110307 16111252 scaffold_48 485486 486438 - 42213|957 962
CACCCA
TGCCAA
>Pros28.1 16111247 16111525|20352 chrX 16111496 16111777 scaffold_64 196269 196529 + 919|0 30
TCATCATACATTAGGCGGAGCTCCT-GTTGA
TCACCGCTCGATAGACTGAACTTTTTAACAA
>eas 16119041 16119558|20360 chrX 16118954 16119232 scaffold_48 492133 492450 - 8895|87 338
TTTCTCTCTCCCGGCCACTC-------AGCGCATTGGGAGTTACTACATTATG--TGCCCAGTG------------------------ATATATGTATAAACTAAGGCTGGAACGGGTCTCAATGTTATACATAT-GTATA--------------------------TATATAACGTGTGTTCAGAAATCAGAAACAAAAACCGAAACAAACTTAAATTAGTGTCGTGTTCGTGCCAGCCTTAGTGTATGTA
TTT---TTTCCCAGAAATTTGAAAATAAATGAAACGAAATACACAATTTTGTGACCCCCCAGTGATGTACTTATATATGTATATATACATATATGTATAAACTATGGCTAGCATTGATATATGTACAATATACATAGTATATATACATTCGTATCTGTATACATATGTATATAAAATGTGTTCA------------------CAAAATATCCTTAAATTAGTGCCGCGTCCATACCAGCCGTAGTCTATGCA
>eas 16119041 16119558|20361 chrX 16119472 16119554 scaffold_48 492451 492531 - 5066|0 82
TGTATATATAAAGAATTTGTATATGTTCTTTAATTTGTATAAATTGATATTTTGTAGTCATAATAAAGCGAAGGTATGTACTT
TATATATATAATGAATTTGTATATGTTCTTTAATTTGTAT--ATTGATATTTTGTAGTCATAAATAAATAAACATAAATATTT
>CG3560 16120861 16120940|20362 chrX 16119835 16120972 scaffold_48 493104 494263 - 24948|1109 1223
ACGCGCCACTAAATCCCTCTACT--TTGGACTTGTAAATGTTG-AAATACATAGCTTAGATAAATACCAAA----------------------------ATTGGCTAT----GAA
AT-----------TCTTCTTACTGGGCGGATTTGTAAATGTTGAAAATACATAGCTTAGATTCAAATTAAAATTTCTCTGAAGAATTCATTTTTAAGGTATTGGATATTTAAGAA
>caz 16127133 16127451|20367 chrX 16125852 16127415 scaffold_48 499535 501008 - 38190|1342 1689
---GCGCATGGTAGCCAGCCGAACGCGGCACCTATTTTTTTCACTTTTACTTATTAATT-------GTAGCGAGAGTACGCTTTTAAATGTACTTTTAAAAT--------TAACAGTCAGAGCAACTTTTAAATGATAATT---GCCAGCACACGACTTCATTTGAACCGATTTT----TATCCCAACACA-------------------------CACACG---------GTTATCGCTCGTTTTGACTGAATTATATTATATAATTATGTAATCTAATTT------AACAACTGTAACTGTAACATGGTACATACGAATAAACATATATATATGTATACATATATA
AGTGGGCATGCCATCAA------------AACTATTTTTTCTAA-CTTACGTATTAATTATACTACATAGCAAGTACTCACTTTTAAATGTACTTTTATATTACACCCTCCACCAGTCAAAACAAACACCCAAAATGCATTCAATCATGCATTCGAGTCATTATCTATTGATTTTACGATCCACTAATACAAAAGAAAAACAACAACAGAATTTGTTACACGTTGTAACATTTTATTACTCGTTTTGACTTTAGCATATTATATGTATATGTAATCTAATTTTACAAAAACAAACATAATTGTAATA-GATACATACAAATAAAAAATTAATAAAAAAAATATATATA
>CG3632 16137062 16137255|20372 chrX 16136837 16137277 scaffold_48 511756 512219 - 14957|227 460
GTCTCCTCTGTTGTATCAATTTGTACATATTAT-TACTCAAAAATATTTATTGCATAT------GTGTTAGCACCATAATAGCAAAAAGTTCATCTGTGCGTTTATATAGA---ACACGAAATTATAC-AATTTTGTTAGAAATATATATGTGGATATA---------------------------TGGAAACAATTGTAAATTAAAATACAATCTTTAAACA--AACGTCAAA
GGTTCTGACGTTGACACAATATGTACATATAATATACTC--AAATATTTATTGCATATATATAAATGTTAACACTGTAATAGCGAAAAAT--ATTTGTGCGTACTTGTAGAAACACTTGAAATTATACAAATTTTGTTAGACATATATATATATATATATACATATATATATATATATATACAATCTGAACGCAATTGTAAATTAAAATACCAAACTAAAAAAATAAAAACAAA
>CG3679 16140152 16140861|20375 chrX 16140639 16140865 scaffold_1 1750179 1750406 - -99|0 246
TTTAATAGTAAGCCAAGCATATCAGAAGAGAAT-----AAAAATAGCATTTAAGAGGCAGGTGAAGCCGTTTGACCACAAGTATCCTACG-------------TTTTAA--GGATTTGTCCATTGATGTAAT----ACCTAGAACTAGTAGCTTGCAAAGCACACTCCCTATTAATTTCGCTTTTCGCAGCTGTCTTGAAAGACCAGCGAGGAATAATTCAATAAAAAGAGATTATCAGTTAAGCAA
TTTAACATTAAGCCAAGCAATTCAGAAGAAAAGATTTAAATAACAGATTTTAATAATAGCAAGAATACCCCTAATAGAAACTATTTTGTGAACATCGAGTTATTCTCAAATAAACTTTTAGTTTCATTTAATGATCATTTAAATCTCAGGGATTTAAAAG---ATTCTATGTT--TTTTCAATATCTAGGCTGTCCCG---GATTAAAGGGCGATGGATTGA---------------AATTAAAGGG
>CG32579 16159003 16159057|20399 chrX 16158375 16159210 scaffold_10 2133532 2134337 + 12918|638 692
AATTCTAGCATAATTAGTAGCATTTTGTATATTTGCAATAAACGTTGTTATGCCC
---------ATAGTTAATACAG-----------TGCAAAAAAAG--AAAATGCAA
>CalpC 16161991 16162464|20400 chrX 16159704 16161994 scaffold_10 2134361 2136594 + 102805|2319 2322
AAAC
ACAC
>Dsp1 16171745 16172830|20406 chrX 16170745 16171954 scaffold_10 2145984 2147181 + 52762|1064 1276
GTTTAGCAGT-AAATACTCTTCACTATTTATACAC--ACGATCGTTGTCGCGATGGAGGAAAGAAACATGATAACGTTGGTTGATCTATTATCAGGTTGGCCAATGTGTGTTGAATATAAATTTATATATATAAGGGTGTGCCCGCTTTAGAGGTTTCGCTTTCCGGTAACAGAACACCGTCACAATTTGTTCAGAAATTTGTCTGGAAAAGT
GTCTAGCAGTAAAATACTCTTCACTATTTATACACTATCGTTGGTCATCGCGAACAAGGAAAG---------AACGTTAGTTAATCCCTAGCCAGATTAACTAATGTGTGTTGCATATATATACACAAGTATATATTGATATAATATATATATGTATATATATATATAAATAT------------ATATATATATATATACATCTATATATAT
>Dsp1 16171745 16172830|20407 chrX 16171997 16172247 scaffold_26 1239069 1239262 + 432|0 250
TGGTGGAATGGTTAATCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGTATTCTTTTTAAGCAGTGCGCATAGAGCTCTTTTGAATCTCTTTTTTCCTTTTTTTTTTTGCATTCATATTTAGCATCTCCGTATGAGCGGTGTAACTCTTTTGTATTAGAAATATTTGTGTACCAATCAATGTCCAACTAAAAATCCAACTATCACAGAAATCTCTTGAACTTTCAGTAGAGGTTTTCATAGTTAATCGAAGAGAAGAGAAAC
TAGTGTAGTGTTT----TTTGTTTCTTTTTTTTTTTGCATATTTTTAG-----------------TATTTTATGTTTGTTTTTCTCTGTTGTTTTGTGTTTTC----TTTGTATGTATGTATGTACG----------TGTGTAT-----ATATATGTGTATTTATGCATG--CATGCATGCATGCATGTA---CATAAGTATGTGTGCATATCTGTAGGGATCCGTACATGTACGC------------ATG
>Dsp1 16171745 16172830|20408 chrX 16172469 16172979 scaffold_10 2147182 2147722 + 20739|0 407
TTATGTATATGTAAATGCATATATATAAATAATATATAATT-----TTTTTTTTTAACA-TAAGTAATCAAATTTCCATGAATTA-TGAAGAT--AAATCACAAAGAAACCTTTTATAAGTTCTATGTTAAGATGAATACGATTAAGTAT--GGTTAGATTAAAATGACACTCAACTGTCTGCGAACCTTA--TTTGTGCTTCAGTGCTAAGTTTCTCCCTAAAGTAATAAGAAAGAACTATTTTATAAATTGAAGAAATTCATCATGATGTCATTCGTTCTCAGCAACTATGAAGGTTACCACTACAT----------------------------TTATAAATATTGGTACATATTT-CCCATTTATTAAAGTTA---GATTCACC-ATAATGAAACTACAATTAA
TTATATATAAATATATATTTATATATAATTAATATAAAATTAATTTTTTTTTTTTAATAATAAGTAATCAAATTTCCATGAATTACTGAAGGAGAAAATCACAAAGAAACCTTTTATAAGTTTTATTTTAAGAATATAATATATAAGTATATGGTTAGATTAAAATGACATACATCTGTCTGCAAATCTTATTTTTGTGCTTCAATGATAAGTTTCT-CCTAAAACACTAAGAACGAATTATTTTATAACTTGAAGAAATTCATCC--ATGTCA----TTCTCAGCAATC------GTTACCACTAAACAAACATACAAAACATATGTATATACATATTACGTATATTGGTACATATTTCCCCATTTATTAAATTTAGATGATTCACCAATAATGAAACTAAA---CA
>sl 16188724 16190424|20416 chrX 16186706 16188930 scaffold_10 4306261 4308489 - 115177|2034 2258
GAGGATTGCTGAGTTAGCTGGATCAATATCAATGATTCCAAATCGAGTGTTTGCGAAAACAATTGCGCTAGATCA-AAAGGAAAGCGAACTTAA------TTCGCAAAAGCAATTTATCAACAACTTGTACATAAGAACATTT-----------CATCGAACTATGAACCTGATTCTCTCACTTGTAATTTGTCTAAAAAGCTTAGGATCTGAAACGTATGATTT
----ATCGGGAATCTACTTAGTGCAATAAC-ACAGCCCGAATTCAAGTATTTTTAAACACAATGCATACATATCACAAAACACCACGTACATACATATCTTACCCAACCACATATTAACTATATCATATACATACATACATATATCGCAGCTAGCATTACTTAACAAAACTACATTCTGCATGTGTAAGATTTTTACAA---TCTGCACTTGCGACAAATGATTT
>sl 16188724 16190424|20417 chrX 16189345 16189553 scaffold_21 2269290 2269484 - 1756|0 216
TTTGATATTCAGTTTCAGGATCAGCTTTTCATAAGTATTATATTACAATCTTCTTA-----AAGACTTTTAACTGAAGAAAATAGACCACTTTCATATGTTATCTGGAAAACTATTTTAGACCTTTCTCTTAGCACAAATACTCAAACAGCATTTCAATCATTTAGCATTTACCTTTTTTATTTTCTCTTTTAAAGCTTAAAGTAATAA---TACAA
TTTGCTAATTTAATTTAATATC----TCTCTAAGCTATTAGA----AATATTCCTAGGCGAAAGACTT--AAATAAAGGCAACATATTAATT--GACTTTTGTCTAGTCAA---TTTTCAACATTTCTTTTAATGTAAATATTTA-----CATTTCAGT--TTGGACATTTCTCATTTTCATTTTGTCCTTATAGGTTTCCACGAAAACCCTTGCGA
>sl 16188724 16190424|20418 chrX 16189554 16190235 scaffold_13 1113469 1114213 + -929|0 774
TTTATAAAAAAAAAAGGGCAAAGGAAATTTAAACCACTTTGATTACATATGTCTTCCAGTTGTTTAACAATTACGATATACCACATAATTGTGTCTATGTTATTTAACCACGATTGTTGTAGCTA-ATGTTACAAA------AACTAAAAGTTTGCAAAC-AATATTAAAATAAAATGTAATTATTCAATTACATTTAAATGAACGTGCCTTAAAATTCGAAATGATCGAAATTTTAAATGTTTGAACGTTAACTATTGAAGTACACCTGTTGCTAAAATAACAAATATTTGAAAAATAATAATATAGCTCAAAGATATCTATTTTTTATAAAATCAAAGTT--------CTAACTTAGCTTCTTCT-----CTAAACTGCGAAATCTAAATATCTAAAGCCTAAGTTCAATAGACGTATTA--------TTACTAAATGCATTATATAATTTATATATCTAGATATTCATAA-------AATGCACTAGTCGATTTAAGAAGTGGAAATTGTGCTCCCTATGCGAATCATTTA-------------------GGATTTTAATCTGAAACTATTT--------GCATTCCATACGAATGCCC-----CACTGAAACGATCGATATC-ATTTGTCT--------------TGCACTCGCATTTAATTATTTAACAAACATTCTGCTGTTTCCATTCGCAC--AATAGTTCTAATTTG---GACATTTTGCGCGTTTGAGCGCATTAGCAAATCATGCTTAGTATA-----TATGTA
TTTATGAAAAAA----GACAAAATTAGTTTAAATTGATATAATCACTTAAGGCTTTGATTTATTTCATAATAACTAAATACATCACAGATTTTAGAATGATTATTATTTA----TTTTGTACTTACATATTACGTACTATTTATCTTCTGCTTTGTAAATGAAGAGTACGACGAGGCATAAGCAATCAA-------------AACGCG--TAAGGATGTGAAACATTATTGCTTTCAAA---TCAAAAAATCCCTAAAGGTATAGATTTTTAGATATAAAAGCAAATATGTTGAACAAATGAAAGTAAAGTAAAAAATCTGAATTTAAATTTAATCAAAGCTTATCCAAGCAAGGCTGGCTTATGCTTAAGCCTTAACTCCATAACTCAAATAATTCCATAAGAATACAAAAACAGGCATTGGAGTTGTTTAACTAAATTCCCTAATTACTCCATCAAATTTTGTTTTCAAGAGTTTCTGAATTTGCTAACAGATGGTAAAGATGATAAAGTTGTTTCTTGCGGCACACATTTGTTTAAGCAAATTTCTTGTTGTTGTTTATTTAATAATTATTTCTTCTAACAAATTTAAAAAGTACTCACACATTTACTTAAAGGCTTATAATCAACTTGTCTTTCGCACAGACACATGCACACACGCTCAATTCCTTAG-GTATATTTGAATATTTGCGCTCTCATCAAATATATCAAATATAAATGGCAAGTGCTGCTGTTGAAAGGCTTGTCAA---GTGCGTGGTAGAAGCTTTGTGTG
>sl 16188724 16190424|20419 chrX 16190236 16191389 scaffold_10 4309662 4310812 - 39008|0 208
TGTGTATATGTACCCAAAATGTATTTCATTTGTACGTTCCGTT--TTTAAGTGATTT--------GTATCTGTACGTCTAATAGATATTTTCAACTGT----------TTTTGTAATTGCCTTATAATTCAGTAAACACACACCATACGTATACATTCATAATTATTTAATGCCAAATAAATGTTTATCCGGCGTTAGCTGTCTATATA
TGCACATAACTGACTAAATTTTGCTTCATTT------TCTGTTATTTTAAGTTATTTTTTCGCATATATATTTATATATTATACAAATTAGAAATTGTATGTTAATACTGTTATGAATGTTTTACCCATATGTGTATATATACATAAATTATACTGTTTTA-TTCGTCAATGCCAAATAAA-GTTTTTACGGCGTAAGTGATATTTA--
>Gpi1 16195152 16195212|20422 chrX 16193217 16196725 scaffold_10 4315476 4318803 - 43324|2008 2071
TCCTTGCCATATATGTAGAATATATTTAG---AAGTAAACATAACATGTTTTAAAAGTACATTT
TTTTTG---TATATAAACTCCGAGTTTAAACTAAATTAATGTACCATATTCAACAAGTTAAGCT
>nonA 16199682 16202465|20427 chrX 16199600 16199696 scaffold_18 2181980 2182078 + 352|84 98
CCCAATACATATACT
AAAAATGCGAATATT
>nonA 16199682 16202465|20428 chrX 16200756 16201954 scaffold_10 4324892 4326133 - 6996|0 1355
TGTTCTTTTTTTTTTTTTTTTGAATTGGGTTCCTCA---CGGCTAAT----GCAACAC-TCAATTGAACAATTGTA-TTTCCTTGCTTGAATAGGACTCCTTCGCT---TTTGAATTTGGGGTTAACAATATGAACCAAGGCGGCAATCAACGTGGAAATAATGGCGGAGGAAATAATGTCCCATGGGGACGTCGACGTTTTTAGACACTGGATCG-----ATCGAACAATATA---CATACATATAAGGATGAGAT-------TTGACGTACTCTCAAATATTTGATTGCGTTTCAC--ATTTTAACTTGGCTCGCTAGTGC------GCGCGATCAGAA-----------------------------TGAACTTGCTTAAAAGGATCCCTTTTTATCGCATGCACCCAAA-----TATGTTTTGATTTAATATTTGGTCAATTATTATCAATCGTCTATCGATCCTAAAATTTTAAGAGTAATGACACGCAAAGGATGAACCTTACAAAAATAATAGTATACAATCTGAATCCCAAAATGAATGTGCAACAATGCTGC--ACCGAAAAGAAAAACGAAATCATTGC----GTACATATACTTAATCATAACGATA------ATTT-----AAGATTATGTATGCGGCGAACTACATTCTCCAGTAATTTAATTCTTTTT-----TGTCCACCATACAAATTAAATATACATA------------------AAGATATATTCCAAATCGATTTATTTGAACATGAAAAACGCAATATTAATTCAAAAGAAAAGAAAAGAAAAAGAAAGTTAAGAACACTTCGAGAATCTGGTGAGTATTCCGGATGAGCGCATGGACTTGATCTGGATCTTGGTCTGGATATCTCATCTCATTCGATGTCCACTAATGGATG-ATCCTTCTGTTGTGCAGAACTATTCTAAGCTTTCCCACTATTTTGTTAATGATTAACAAATAAAATGATTAACAACTTTTTTTTCTGGCTGTAGTCGAATCGCAACTCAATTTTTTTTTTTATTCAGTCTAAATAATGTTTT---TATTTTTCTTCATATGTTTTAGTATCTATTTCAAGTATTTATCG-------------GAAGAATTAAATTAATTTCGGTAATATGACATGTGTAAAATTTTGTGTAATTTTCATTTTTTTTTTTTACATTTTGTCTTTTACCCCTTTGTTT-------TTTGTAAAATATTCTTGCTATTTTGT--ATTTGATAGTAATATTTAACGGAATTGCATA------TCTTATCTAATATG---------GAATTTTC-------GGGAAATGATATTCGATTTTGGGAAAAATGCAAGG
TTTTTATTAATTTTTGGTTTATAATTGGGTTCCTCTACTCAGTCAAAAACAGTAACAAATCAATTGAACAATTGTACTTTCCTTGCTCGAATAGGACTCCTTCGCTGCTTTTGAATTTGGGGTTAACAATATGAACCAAGGCGGCAATCAACGTGGAAATAATGGC---GGAAATAATGTTCCATGGGGACGACGTCGTTTTTAGACAGCCGATATAATGCATGGACCAGTATGGATAATACGTAAATCGACAGAATGCATCGATTTACGTAGT-----ACACTCGA-CACGTTTCACTTATTTTTAGTGAATTATTCATTGCAAAACAATACAAACAAAAAGAGAGAAAAACAAAACAAGAAAACTTATGGAACATACTTA-----ATCTATAATCAACTGATGCACCCAAAACTTTTATGATTTGATTTAATTATTTGTCAAATAT--GTCATCGTCAA--GTCCTTATAAT-----AAAGAATCATACATAAAAGTAAAACCGAGAGTGCAAGATAAAACATTGCCATAAATGGAAAGCAATATTAAAATACTTTTGTTATCCGGGCGGCAATTTTTAACCACCCCCGCGGTACATAGAATCTAACATTTGAATATGAAACATTTTTGAGTAGCTTCTATATGTAAAGCA-TAATTTCTTTAGTACATTTTTTTTTTTTATCTCTTTGTATTATACATAAAATGCATTCATGTCTTGATCATGTTTACCTAAAATATAAGTATATGCGATGTATATATACATAGATAATCTAATCTTCTCC----------------------AATGTTATGTACATCAATCAATTATGGTGAGTAT------GGAACG---GGAC----TCTGGATCTTAACAGGTATATAT-----------ATATATATATATATATATATCTGTAAGATCTGAAGATGCA---TAATCTT------GATTTGGCTGGGGCT---------------CCAATTTCTTTTCTTTATGTCTTCTGGTTTATTCCAATGTGGATTTGATATCTCT---ATTACAATTATGTTTCGTATATTTTGTTT------GTTTATTATTAAATCGCAGCAATTGGCGATCCTTGTGCTTAAAAACAATAAGTAAAT--------AATAACATAATCCGAATTATGTTGA---TACATGCTTTACGTACATATATTTTCTTTGGGGGGCTAGTTTTGAAAAGTCTGTAAATTGATTCGGGTAATTTACCAAATCGATGGTAATTTTTCTCTAAATAGAATAAATGTTTATTAACTGAAATATTCTTTCATAAATTTTCTCTGGCAGCAAAGCGCCATCGACTTTTTGGAACAATTTATGG
>nonA 16199682 16202465|20429 chrX 16201955 16202130 scaffold_1 2671435 2671606 + 89|0 181
GAAAATCATTCAAACGCTAG--TGTATTT-TGGATATACATTTCTCACCGATT---TTGGATATTATCTCAAGTACAACATTATTTAGGATAGATTTTGATAGTTTTACGCCGTTTTCTTGCAATGAAACCGACAATCTCAGACTTTGACCAAAATTTGATGAATAATACTTTGTGTTTTAT
TTATTATATTGAATGTCTAGATTGAATTTGTGTAGATACAGTGAT-ACCAATTCAGCTATTTTTTAGCTAAAGTAAA----TATAGTAAAATGATTTGGCTATTTTTGAGAATTTCCCTTGCTCAGAAAGCTA-AATCTTAACATTTAAGCTAACT----TAAATATTGTTGTCAGCTCTAT
>nonA 16199682 16202465|20430 chrX 16202131 16202688 scaffold_53 305843 306538 - 446|0 461
ACCCGTATACCTTTC---------ATGTTGCATAAATAT-----ACATTGGCATACCTACAAAGCAACAAATTTAAATGTAGTTGTAATTAATTGTCATGCTAATA-ATTTAATTATACTTATATAAATATATATATATTAGTATGTTCA-AAATACT---ACTACTTTAATCAAA------------------------------------------------------------------------------------------CAAATATGGCACTTTGAAAGCAAACATAAAATATTT----------------ACATTTTGATCAGTTCTGGGTGTTGGCACCGAAAATTA-ATTTTAGTAAATTAATAAACAATTCGAAGTGTATAGAATATCTTTAATTTTT-TTCAATTTTGATGCAAATGAAAAATAAACGGAAATTGACTTCCAAATGCGAA
AATTATATAATATTACAAGTACTAGTTTAACACAAACGTCTATAACATTAGCAGAAACAAATTGTGAAAAATTTCAATTTAATC-TAGCACACTTTAGTACTTAAATATATATGTATATGTATATGTATATGTATATGTATGTGTGTATATACGTACTTGAAATATTTTGATCAAAACTTAGTGTTAGATATATTACACAAAACTGAACTGTGGCGGCATTTCTTGAGGGCTTTCGAATACAATTTCCTATAAATATAACTCATATTAAATGTATAACATTTAAAACAAAAACAGAATGTTACGCATTTAATTTTCAAATATTATAAAACATTTTAGGGGTT--CACCATAACTCACATTTTATAATGTTTGTTAGTT-TTCCAAATGAAAATAATAATATTAATTTGTATGCATTTGTAATTATAATAATATATAATATGCTATTGAACATTTAACACTTT
>Fur2 16215205 16215720|20443 chrX 16212631 16217219 scaffold_10 4337408 4341861 - 123093|2635 3170
TTGATTGATCAATGGACGACGCGACAGCGAACGTAATTGAACCAACCAACCAACCAACCAACAAACCAACAAACCAACCAACCATCAAGAACTTTGATCTTGGCTTTCTTGCTCTGGACTAGTAAATTGTAACCTTGCTTTGAAGGAATATAGCGAATCGAAATATTTAACATCTGAAAATGATAAAAATTTATATGTGATTGTGAATTGTTTT----TATATATATATTTGTAAATTTAATGTTTGTATTAAATTTTTATGAAAAATGTTATGTCAAGTTGAATGATGACAGTGTCTTTTTTTTATTGTTCCCAGCCATATCTTTTCTATTCAAATAGGGAAGATAAAAATGGTTAAGAGAGAAAAAAACCAAAATAAATTTTGATCGATTTATTGGCAAACATCCGAGAACAAGAGAAAATATCGCTTTCGAT-ACAACAAAATTAG-----------TCTTAGGATTTATTGTTTTTAGTTTAATAAATTTTTTAATAAATGTAAACAATTTTTAAGT----ATCTGAACCCA
TTCATTGATAAAT--------------TGAATGTGAATGCACCAAT------AGCAACAATTGCAACAACAGCAACAGCAA-CACCAACAACTTTGATCCTGAATTTCTTGCTCTGGACTAGTAAATTTTAACCTTACTT--GAGGAATATAGCGAATCGAAATATTTAACATCCG-AAATGATAAAAATTTATATGTGATTGTGAATTGTTTTTATATATATATATATTTGTAAATTTAATGTTTGTATTAAATTTTTATGAAAAATGTTATGTCAAGTTGAACAAAAATA-TGTTTTTTTTCTCTTTTTTTTTGTTGTACTTATCCTGTGCA----------ACAGGATCCGTTTTGAAAGGAA---------------CTTGGTATGGTTGCATGTATGCATGTGCATATGCATAAGTATGTAGATTATGATGATGATGATGTTAGAGTATGCAAATGCTAATGAGTGACAATTGCTTATGATATTCACTTTATTTTGAAT----ATTATTTTTAAGTATAAATAGAAAACAA
>CG4239 16221898 16222640|20450 chrX 16220724 16222658 scaffold_10 4344685 4346601 - 58176|1212 2046
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ATCATTTGTAAATTAGCTC----------------AAAATTAGTAAACGCTGCCAACCAAAGCTACAATTTATTAATATCGAACGAACAATTATTCAATTGACCCATAAGTAA-AATATGTACTGATATCCGTA------------TTTGTACAAGATTCGATGTACAAAATCAAA-------------------------------------TTTAATGATAAGCAA---CAAGTGGGTGTGT---CTGCTTATCCTTGACTCTGATTTT-----------------CCATTTATATTTTTAGTTATGTTTTTTAATTTGTAGTATATTTGG--GGACTTTCAAACTATGTAAACCTAATTTATTGTTTTGCTTTTAATGACGACTGAAAAACTCAGAATAGGACGAC-GACTAATTAAATGTACGATTTGTGTCTGCAGTATAATGAAATCTGGGCAATTGCACAGGTTTTGTAGCACAGTCTTCGGCATGTCGAAGCTAATTCATATTTATAAACAAAGTATCTAAAAGTCATAGACGTGGCATATTCTATTTTTTTTT---------TTTGTCAAACCCATTAGATGT---------AAATATTTAAGTCATTTTTTGAACAATGAAATTTTGTTAAATATTACATTTGTTTGGGAGTATATCCAAGAAAGTCATACATTTAAAGAG-TTCATCACAGACGAGTATATATACAATAATCGGACTATT-TAGTGTATATTTATA----TGTAAACACGCGTTCATAC--AATTGAACGCCTTTGTATGAGATTCTAATGATCATTGGTTACAATAAATCTATGTGATTTGAA
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TACTTAGTATTAGGCCATAATTTTTATACGGTTTATTTATTTATTTTTTTTCTTATACCTATGTACATATAGTTTTTTTTTTTTTTTTTTGCTTATAAGTAAAGTCGATTGTTTGTTAAA-
>Traf3 16251041 16251526|20470 chrX 16250502 16253011 scaffold_10 4376288 4378857 - 77906|546 1096
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TGTCCTTGCTTGTTCTGTAT-----------------ATGACAAGAGCCAAGCCAAACAACGCGT----GTGCAGCTAAGCAATAGCTTGTTTTAATAAGCCTCGGCCAGATGCTAAGAACTATTGATAAATGTTTGCAGTTCCT-GCATATGCAATTCCATTATGCTTAACTAATTACTTAACGTATAGATATAATTTCGATGTGTTTGAATGAACCTGTTGTCGAATTAAAGCCAAAGTTCAGGCAAAACACCTGCCCCCATACCAAAAATGAAAAGCAGCAGTCATTTAAGGGCTGTGCACCTTTAATAAAATACATCAATACATAT-AGGTATATTTAAAATTCGAACAGT------GTCAACTGGGTCAGACGTAAGGAGTCAAGACCATATTTCAATCCAATACAATGATAATATATATAAAGAGCAAAATTTGAACAAGTTTCAATATACGATCATAGGCAACATCTTTTAAATGATTAATT-------GCGCCTTT-AATATAAGTGTAAATGCATAAGCTCTAGGGTTTTCTTTTCTTATTT
>hang 16270750 16271435|20494 chrX 16270373 16271645 scaffold_48 584259 585680 - 11214|428 1312
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>Rbp2 16286023 16287010|20509 chrX 16286908 16287167 scaffold_8 3272492 3272767 + 823|0 118
CAGACATACCTTATGAA--------ATTAAAACACCAACAGCAGATCTTACAAAACAA-------ATCGCAGAGAAGCAGAACATCCACTAAGTA-CGTAAAATAAAAAAAAAAAATAC
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A
A
>crl 16428747 16429357|20660 chrX 16428748 16429140 scaffold_55 162297 162653 - -1221|0 406
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AAATGGAAAGTGGCGCCGCCGCTGCCGCCGCCGCCGCCGCTGCCGCCAACAATGACAGAACCGAACAACAATG-GACAACACTGGGACACGGACTGGGACGTGGATGCGAATT---GGGGGCGGCGG----AGCAGCAGCAGCTGAGGCACAACGACAGCCAAACAACGACGACAATTCGTGACAGCGGGCAGCTACAGCAGCAGCAGAAGCAGCAG-------CAGCAGCAACAGCAGCAGTGGGAAGGAGAAAATGAAACACACAGGACGGCGACGAGGACAAGGACGACACTGAGCTGCCCCTCCGAACAGCAAACACCAACGGCGACGGCCATGTTACAGCGCCGCAGCAGTCGG----CTG----CACGAACGCCATCAGCA--AATACAGAATGAACTGCAACAATTGCAGCAGCAGCAACAGCAGCAGCGACGTCGACGC-----CAGCAGCAACAGAAGCAACAAAAACAACGGCTCAACA
>Nup153 16443036 16444399|20681 chrX 16443727 16444406 scaffold_28 396382 397075 + 1577|0 778
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---GAAGTGGTTGGGACACTTTGCTGATCTTGAG----GATGACCGCAATGATGCACTGCAGCCATTTGGGACACGCTTGCTGCTGCTTTAGTTTTCAAACTCCACTTAAATGTAGTATTATTCACACTTTGGCTACGCTTTTAGTACTTGGCAATTGCTACTTAAACCCCTCGTAACCCTTCCCCCACGCACTATGCATTGTTAAGTCATTATGCCACGCCCTAAAGTACACACACACACA
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TTCTTATGTGTATAAATTCGAAATCTGGAACAAAATGCTGATTAGTCTTTCA-------------TGAAAACGTAGTCACAGAA-ACAACAACAACAAGAACAACAACAACATAAAACGTAACAAGTCACGGAACACATACATATACATATGTATGTCTGT
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CATTTTGTTAT-TGTTTCGTGTAATTTGTAACATATTTTATATGATATATGTCTACACATAAGATCGAACGCAAAATGTGCCTTTCTCTCGCGAAACAGACTAGGAAACATTTCAACGAATATTTAATGTGACCATGGAGGACAGCACTCGATTGTTATTGCCGTTTTGAGCCAAGGCGCAGAGCCATTGCAAAATGTTATTCTTTATAGACAAATATATATTCTCTTCAAGCG----CCATTT---GGTAACAGCTAATACTCGATCGAACGTGTTCTATATAGATCCAAACCAAAATCAATCCTAAGCTCT---GTTCTATGCAAATGCA---ACATTTTCAACATTTTCAATATGTTTTTTAAA-ATTGAATATTTT---------------GTTTGCAACTGTCTCAAAAGCGCAAGCGGGCACAGTTCTTGTCAATATAATGGTTTTACTCTATTATTAATATATATATTAATTATTATGATTATATTTTTTGTGTGGTTATGTTGA---GAGCTGCATTAACATTGTTCGAATATATAAACAAATATAAAACTGAATATATAGTA
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TC--------------------------ACACGGCGCCCCTTCGAATTC----------TAAAAAACGCATTTTTAGA--CTTCTATTGTAAGCG---CTTTTTGTTTGCACG-AGAGAGAT---GAGAAAATAAAA-------------------CCAACCACAATTTGTAAAAGTCTACGAAACATGC
ATTGATTGTGTTGTACCCGCGTGCCTGGACACCGCACCGAACCAATTCCCCAAGTCTATTAAAAAAATTAATTTAAGAACTTTCTACTGTAAGGAAGTTTTTTTGTTTGCACACAAAAAGATTACGAGAATATAAAAACCAATTCACTAAAGTTCTACAAAAACAAGCGGTAAATATGCACAAAATTCGT
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ACAACTGAGACGACGAGCGACAATGCGAAAGT----CAGGCCCGGATACAAAAGTCCAGACCTCG-----------AGCGAGCGAAATAATGGCAATGGGC--------------AGCT----CAGAAATAAGAAAGA----AAGAATGGAAAAAACACGAAAAAAAAACGCTGCCA-AAGCTGGAGTTTCGAG-ACGAGC---------GCGGCACACACTTGCGCAATCGCAG---CAACAAAACCAAGCT-------GACCAGCTAATTGTGC-------------GAGTGTA-CGAGCGAATGAGTGTGTGTGTGGTTGTGTGTGTGTGCAAGCGACTTGCGCGTGATTTTGAAATCGGCCAACAACCGCTGGGGAACAAA
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ACGTACTCAGTAT--------GCCAGTATTCAACTTCAATT-----TAAGCCAGCGCACAAAAG-------------AAACGTATTATTTTATTCATCATCATCA---TCATAATCGCATAGCATCGCATCGCATCGCATCGCATCGTATCGCAGAATAACGGTAAAGCAGTTCGGGTCACATTAACACGTTCTAATTGGACACTC
AGCAACGCGAAATGTTTTATAGCGTGTGTTTGCCGTGAGTTATGTGTGAGCTACAACACGAAATTTACATTACGAACGAACGTCTTGTTTGAGAAATTAGCGCCAAACTCTCAATCTCTTGGCCCCGCAACCACTGGCAGCCCCTCCTGTCCAAAAATCGCAAAAGATTTTGCCCAAACGAACTTTCGCATTTAAAAAAGAAACTC
>mthl1 16481706 16483634|20733 chrX 16482369 16482649 scaffold_28 1280485 1280793 - 3808|0 338
CACAAGGAATTTTCTGTTGAGGCACTTTTGTT--GTTTAGTTTAGATCGCGTTGCTCTGGTTTTTTTTTTTTTACTCAAATCTCAAGTGTGAGAAAAACAGCAGGCGC-----------------ACCACACACAAACACACACACACATGCATGC-ACATATCGGATGTTTAACATTTAAATTAGCTGCTTCTGATTGGCATTTTCGTAT-GACACTGCTTGCAT-----------------TCAGTTCTTTATGTG------------------TGGGTGTGTGTGTGTGTGTGCCTTTGACGTTTTTATTGCCTAATCACTTT--TTTTTATTTGC
CACAAGGAATTTATTGTTGAGGCATTTTCTCTCAGTTTGGTTT-----------------TTTTTTTTTTGTTTCTCCCATTTCCCGC--------CGCCGCAGCTGCTGTGTTTGCTTTCAAGTGGCTCGCGCAGCCACAAAAATGTTTGAGTGTGAGAAAACGG-----CAACGTTTAAATTAGCTGATTCTGATTTGGATTTGGATTTGGATTGCGTTTGCGTTTGCGCTGCATTTCACGTCAACATCTCACGTACAAAGCCATAAAAAAATCTATGCGCATGTGTGTGTGTGTTTCTGTCATTTCGATTGCTCAATCAGTTTGGTATTTGTTTTC
>mthl1 16481706 16483634|20734 chrX 16482804 16482926 scaffold_28 1285455 1285596 - 3122|0 147
ATACACACACATTGATAGGCGGAAACAAT-----------------------CAAATTGATCATCGAAAGTTCAACG--ATACGCAGCGATCAAGGTTAAATGGTTCAAAATGAAAGCGCGCTAAAATAAAAAAAAAAGGATAAAACG
ACACACACACACTGAAACACAAGAATAACAAACAGGCACGCTCACACACAGACACACATATTATCAAAAGTTCAACGTAATGAAAACTGATCAAGGTTAAATGGCTCAAAGCAACAAC------AAATATAAATAGAAGCAATAACCG
>mthl1 16481706 16483634|20735 chrX 16482937 16484093 scaffold_28 1286192 1287608 - 5809|0 943
GCACACACACACA---CACACGCATGT-GCATTTGTCAATGCAAGCAGTGCAGTTGTCCTGCATCCTGTTTAGAAACTCCAAG----TTTGAGATGTATTCCCCCTCCCAATTACA-AACGTATTTTTATGTATTTTAGCTCTTGAAAACGCAGAAA-CTACAATGCAGTACAATTA------------------TTATTTCTCATA----AGATTTATTTAATTTT--------TTTTTTTGTAATTA-----------------------------------------------------------------ACTAATATTAATTTATTGCTCAAGTT-------ACGATGGCACGTTCAACG----------------TGCTTGAGTGACAATTGTATTATG-TAG--------------TAGAACTTCCAAAGTGTTCAGGCCAAAAGTAA---TTCTCCCCGAACTAAAGAGCGATCATACTG-AGAATGAGTGATTACATTTATATATATATATATATATATGATTGACTAACATATATGTATATATATATTTATTTACATATGTGTACATATTACTGCGTATTTTCTATGTAGCTTATTTAGTTATCTTGATCTAAGCAACGA-ATCGAATATGAAATTATCGAATGACTGAGACAAAGGCAGCGAATACTTTATACCAACATAGATTTTACATTTT-------------------GATACTAACTAACTATTA-----------ACTATT--------------------------------GACTATTGTATATAAACGTATTTTGTACACAC---CATATTG--GCTAAGCAATTGATATAAAAA-----------ATATATATATAT----------------ATGTACATTTAAATGAAAATGTGCATAAACAACGATTGT----TAACTCG
GCACACACACACATTGCACTTGTATGCAGCGTTTGCCA------------CACTTGGCGTGCCTTGATCTGAGCAGCTCTTAGCGACTTGCGAATGCACTTCCCTCCCACACAACACAATGTATTTTCAT----TACAATTTACAAAAACGCAGAAAACTAAAAACAAGTACAATTAATCTCTGTTTGATTTTTTTTTTTTTTAATATATTAAATTTATTTATTTTTAAATTTTTTTTTTATATAATTATAGTGCGTTTAACGCATGCCGTAAACAAAAAGAAAGAGAAAAAAAATGCGTTTCGAAAACCAACAAAAAAAAGAAAATCATGGCAAAATTTGTCTGAGAAAATGAATGGTTTAATAAAACATCAATTATAGATGTTTAAGCAC--ATTGTATTATGATAGCTCTTATGTAAGTATAGTACTTCCAAAGTGTTCAGGCCAAAAGTAATTTTTCCCCTCTAATCAAATCCCGTTTGTTATGTAGCATATGT-CCTAAATTTGCATATA-ATGAAAGCAAATTGTTTAACTAGATTTAAGTGTAAATGTAATT-----------------TATTATTAC-TATTTTATTT----CTTGTTTTGTATAATTTTTCAAAGCAACTACAACGAATATGAAATT-TCAACTGACTGAGGCAAAGGCAGCGAATACATTTTACATACATATATGTTTTATTTTTTTTTTGTAATATTTTTTATAGAGTATTTAATTATAAGTAGCAGGCATACTATTTTTGATAATACTACATACAAGAACAGTCAACGTATAATTGTATATAACTATATTATATATATATATAAATATTGTAATTGAACAATTGAAATTGATATATGACATTTCATAGCTATAGACTTTTACCACAGCTCTAATATACACCTTGAATCGAACAAACATATATGATATATATCATATGGATCT
>CG32573 16487105 16487967|20741 chrX 16487551 16488773 scaffold_10 1045643 1046795 + 41381|0 416
TCCTCCTCGGGCGCCGCATCCATGGACTCCTCGATGGTGCGCGAGTGGTCCTCGATCTCTTCGTCGTCCAGATGCGGTGCTCCATTGGCGAACGAGGCGAAGCGCAAAGGATCACGCAGTTTGCCCATCACCGCCCACTGCTTGCACTCCGGACTGTTGACGTACTTGCGCAGGTCCGCCAGCGATTTCGAGGTCTCCACGGCCGTCTGCTGTTCGTACTCCTCCTGGGTGAGCATGCGCCTCTTTAGCGGAAAACGGCGGCGATACATGAACTTGATCTGGTTCGTCCACGAAATGGGGAAGTAGTGGGCCACAAAGACCAGCACCATGATGAAGATCACGGCGCTGGTGTGCCAGCTGCTGAAGTAAGCCATAACGGCGCCAATGGCCTGCAGCACCCACATGACGATGGTTTGC
TCATCCTCGTCAGCGCCTTCCAGGGAGTCCTCAATGGTCCGCGAGTAATCCTCGATCTCTTCATCATACAAATGAGGTGCACCATTTGCAAAGGATGCAAAGCGCATCGGATCGCGTAACGAGCTTATAATACTCCATTGACGACAGTGCGGACTATTGACATGGTCACGCAGTTCAGCCAGAGACCGTGCCGTCTCATTGACAGCCTGTTCATAGTATTCCTCCTGTGTAAGCAGGCGTCGTTTGGGTGGAAAGCGGCGTCTATAAATGCTGTGTGCGTATTTCTGCACCGACTCCGGACAATAATGGGCTATAAAGGTGAGCACCAGCAGCACCACGCAGGCACTAGTATGCCAGCTGCTGAAATAAACGATTGCAGCGCCAACTGCCTGTAGCACCCACATGATAATGTTCTGC
>r 16502532 16503014|20747 chrX 16502295 16503473 scaffold_10 2456110 2457267 - 24773|237 795
AGGATTTACCCAT---GGAAAACCCACAATCTTTGACTCTCTACTATTATTTTTGTATACTATCTTTTTTATACCACACATGTACG-----------------CAGCTGC-------ATACGAATATATTTGATCCATTT---------------------------------CGGTTAATT--GTTTGTGTCT-------TTATGGATGA-------ACATATAATACTTGTATCTGCATCCAAAACATGCAAAAATCATATCTTTCTCTGGAAAATGTGAAACAGTTTTACGGTTTTCCCTTTAATTCTAACAAATATATATTTTCACATATTTCATAGTATAGCAGTATAATATTTTAACAAGCAAAAAAAAAAAAATAAGGTGTCATATGTTATATAGATTAATTATAAGATGGTGATGGAAATCCTTATTCTAAGTGTCAGTCTCAAACGTTTACAATAAACATCACGTGCCCATGTGCCGCTGGTTGACGGTGGTGCTTGGTGCTTCCTGCTTCCACTAGTACCGCTCCACCACCACGGCTGTGGGTCGCCAT
ACTTTTTCACAGTTTCAATAAAACTGCATTTTT----TTTTTTCTTCTATTTTTGTA------CTTTTTATTAGCATATAAGCATAAATACAAGCGGCAGAACCAGTTGTTGCCTTAACACAAATAGTTTTATTTGATTTTATTTTTATTCAAATGATAACGGGCCAAAGAGGCAGCTAATTGGGTTGCTGTCTTGGCTAGTTACCGATAACTTAGCTATCGATAACA-TTGAAGCGTTGCTCAACACGCACAATATTC------------GAGAAAAGTGTGGCAGCTGCGCAATCATTTC--AAATTATAAAAAACAAA---------------CATAGAATCATATTAATATATTACACAACGAGGGTAAGAAAAAAAAATGTTTTCCATAATATGTAGTATAATT--------GGCTTAAAAATC--TATTC-----GTCAGTCTTTTATGTTCAC---AAACATCACGTGCT-----------------------TTCCCAGCGCTATTTGTT-----TAATAGCGCTCGACAACAATCTCTGTGG---GCCAT
>CG4678 16544093 16545084|20800 chrX 16543321 16544183 scaffold_28 1373644 1374401 + 5601|814 906
CCCTTTTGTGTGTTTTGAATCCACTTAATATCTGCCAACGACAA--TCAGTATCTGGTGGCTACGGGCACATCCACCACCACAAAATCCTCAA
TCGACTTGCCGAGTTCGAA---AATCAGAATCCGCAAATCGCCAGCTTCGGCTACGCGGACAACGAGTTCAGTCGCCACTTCAACTACCTCAA
>CG4678 16544093 16545084|20801 chrX 16544184 16544924 scaffold_10 2105355 2106061 + 3510|0 820
CGGTGAAT------CGCCG---CGTCAATGGAAAGCTGCAGCT--------------GTCACCAGAATAATGGCGATCCGATTTCTTTGAGTGTGTAAATAATAGCTAAATTGGTTTAGACCTAGAAAATGATACGCAACTAACCCACTAAAACACCATT-GAAGTAATCTGTTTTGGTTTTTGCTTTAGTTCC------------------CATTGCGATTAAGTTTATGAAACAAAATAACGTTAACTTT----CCAAATTATTATAGTTTAAACACTTTTAGTTTGAAAAATCTATATAAAAAAAATTAAATTGAGTAAAATTAAAATATTGATTACATTTTTGTTATTACTTTTTGTTTATCTAAAGCTTAT-TCTTTAAAAAAAAAACTGATTTTCTTTGTGCTTTAACAAATCTTACCAAAAAGTTGACAAATAATACCCTTAAATACAATGACCTTTGCTGGCAAAAGGTTTATTATTAAAAAT-ATAATGGTT----GCTTGT----------AACAATAATGTAGAAAGGGAATCAAATCCTAATCTCTGTGCACCTACGTATAACATCTTGTTGAC---------------TTCGCAGCGCTTGGAGGGCATTGGGCCCATGGGTCCCGGCGGAGTGCCAGTGGGTGGTGTAGTGGGTCCCGGTGGGCTATACCGCCCCATTCCGTCGCCGCAGCATTACCGCCCACCTG---TACCGCCCTACGCGGGCGCCGCCTCCAGCGATAGTGGCATATTCTCGACCATCAGCAATGGTTTAAACAGCCTGTACTCAAATATATTCGGCTAAGGA
CGCCGCGTACCCAGCGCCGGTTGGTGAAAGATAAACTACACTTACCAACCGAGTAGAATCACCAAAACGCAGGAGCAACAGCAGCCCC--GCGTGTAAATATTCGC-AGAGTGCTTTAGTCTTAA------------GGCTTGCCCACTTAGCCCCAACTAGGAATAACA------AATTCTTTCGCTAGTGTCGAGGGAAATGAATGAATGCATTGCACTTGAA-TGATG-GATATGACAATTTTAAATTTTTGACCAAA--GCTTAGGATTAAAGTCTCACAACTAGCCAAATT------------ATTATATTACTCTCCTATAATATAGTGTATTTTTTATTCTGTTTGGTTTTGGTGTGAGTAAAATGTATGTATTTACGTAAAAAATTCACTT------------------GTTCAACATAAA----ACTCATAATATAATTAAGC---GTTGTTCTTGTTGTCAA------TATTATTAAATCTAATACTGGTTTTTGGCTTTTTAATGAGGACAATAAACATGGAGTTAGAATATCAA----------CTGCTTACAGACCCAAAACAGTGCATTAACCACATTCGCCTACTATTCACAGCGCGTTGAGGGAGTTGGAGC--------------------------------TGGCGGGCCCTCGTA----CTACCGGCCCATGCAAGCACCCCAGCATTATAGGCCAGGCGGCCCCCCGCCCTACGCCGCAGCCGCATCCACTGAGAATGGCATCTTTTCGACCATCAGCAATGGGCTGAACAGCTTGTACTCAAATATTTTTGGTTGAGTA
>CG13008 16547805 16548059|20806 chrX 16547791 16548119 scaffold_5 5722062 5722373 - 1064|18 289
GCATGCTAATGGACAGATAGAACAGCCCTGTGACATGGATATGCAATCCCTTGGACCCGACGATATGCAAACCCAGATTCAG-------ATGACCGCCGATGTTGGCACCAGCAGTTCGGTGAGCCTAAT-----GCCCACTGTGACTTATCAGCGT--GCTCACCCTTTCGAGGACGGCCAGGTGGAGAGATCAAAGCCACCGTCCCGAGATGAGC---AACTGCGTCGCGTTTTGCTGGATGCCTTTCACATGGTATCCCGTTCGCAGGT
GCCAGCCGAAATGCAGCCGGAGCAGCCC---------------------------ACCGAGGATGTGCCCACCCATATCGAGTGCGTCCAGTGCGGCGACTATCGCGGCGAGCCATCCAGCGAGCTCGACGAGGAGCCCAGCGAAGGCCAAAAGCATCAGTTGAC-----------CAACATATTGGCGCTGCTGCAGCAACCCGGACGGGAGAAGCGAGAGCTACACCAACAGCTCCTGGAGGCCATGGAGCATGTGACCAAGTCGCAAGT
>CG32574 16578192 16578304|20847 chrX 16576522 16579448 scaffold_5 5782442 5785490 - 73868|1823 1996
ATGTTGTTCATCAGAATAGTGATAAATAGCCACCAATTTTACTG-TACAGTCATGCAATAGTC---AAAGGTTTTTTTTTTAAAC------ATACATAAATACACCGAAATACAAGAAT---------------------------------------------------ATAA
ATAGGCTTCAGCAGCA-----GCTAACAATTATTTTTTTTACTACTTTAGT--TGCAATAGTCTATACAGTGTTTTTTTTTATGCTCCCTAATAAAATAACTCTCTGATGAACAAGCATTGTAACGTGGAAGTGTCCATATATGGCATATCTCAGTTGTAATTGAGAAAACTTA
>mRpL22 16618901 16619031|20903 chrX 16617913 16618905 scaffold_5 6593597 6594518 - 37220|1021 1025
CCACC
AAACC
>CG4756 16622633 16623579|20906 chrX 16621711 16623466 scaffold_5 16094 17894 + 31272|954 1973
AGGCGCGTCGGCGGGCGGAGGGAGGAGGAGGACGCCGACGACGTC--TACTCCTTTTAACGCTG--GCCAACTGCCGATCAAAAGAAAT-----------TAACAACCAAAC-------TTCTCACATTG---------TTGCTGCATTTGCTGGACGTCGGC------------ATTGTTGACCA-------GAATAGGGATGA---------------------------ACGAGAATATTGATAGTGCAATGGCTCATCCTCATCCGTGT-GACCCCCAAGAAA---------CCCAATC--------CTATAC----CCATAAGCCACCACTGCCCAAA--CCCTTA-AGCCTTTCCCCCGACTCCCCGGAACACA-------AGTAATATGCGAAAAGTAAAACAGCAAT-------------------------GAAAGAACGTAAGGAAGAAGGCAACTGGTGCTCCCACGAAAAACAAAACAAACAAAA--ATTAAAAATAAATAAACTAGTATGTTGCGAAAGTGAGTCTAATATTAAAAAAGAAATTTACAAAA------ACTATTTGTAGCCTTGGTCCGTTGTTAATAGCTCTTTAT-------------ACACGCACTACA-----TTAAATAAACTATGTAAATTTACAAGAGAATTAACAGAAAACACAACACACTCAATCAAATAGCAATTCGTATT---CTTAGGCTTAAAGACATGTTTATTTGATCGTTTGTATTATACATCATGTTAAGTGAAGTGGGGCTCTGGCTAGACATCAGTTAGTAGTAACCAGAT---ACTTTAAGCGAATCAAAACACAATTAGACTTCAATGTGAAAGCAAAT---TGAATCC--GGAAGCCAATACCAATTATCGCTACAAACAGAGAAATAACGAACGA---AATAATTTGCAATATTTAAACTAA----------AACATCGTGTCGTTTGCCCCGGCGGTTTGGAGATAT--ATTTAGAGCTCTAGTTTAAGCCTAA
ACGCAACTCTGACGGCTGCCG-----------CGCTATCGTTATCGTTATCGCTATCGTTATTGATGCCGGCTGCTGAATACTAGCGCTAGCTGTCCTGCTCACACACACACACACACACACACACAGTGAAATCGAATTAGCCGCATTTGCAGTCAGTTTTCTCTTTTAACTTAATTTTTGGCTATTTTTTGGAATATGAATAGTATGCTTTTCATGGTTTTCGCTTTTATAGAAAACTTGTGCTAATACGTAAATTAAATTTAATACATGTAAATTCTCAAGATATTTTTTACGCCTAATTCGGCTTCACTGTACTACGTCAGCGGTGTCCACTTACCAAATGCCCTAATAGCCCACACATCGACAAGCACACACACACAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGCAACACCACGATCATATGAATTGTAGAAGCGGTCGCAGCAACAACAACAACAAAAACACAACTGGTGCTCCC----AAAATAGTATAAACGAGAATATTGCAAATGAAGGAA-------------AAAAGGAAAATAATAATAACAGCAGCAACAGCAAAATTGAATAGTAATTGTAGC----GTTCATTGTTAATAGATCTTTATAGAAAAAGAAGAAATACAAATTAAACATAGTTAATCAAACTATGTGAATGAAACAAATTGATGACCCAAACAAATTTGGGGCCAAACGATAAGCAACTAACATTTACCTTAGCCTT----TCATTATTAAATGCTGTTTTGT----CACCTC-------------------------------TTAGCCAAAAGCAATCAAATAAAATTCTAAATCTGCCAACGTGAAATGAATGAATAATGAGAACAACAATCAATGAATTCATAAAATTCGACGTAAATTA-----AAAATCAAATAAATAACAAACTGTTTAATAATATGTAATTATTAAATTAATAATTAAATTAACAT----TTAATTGTACATGTAATTTTTAAATCTGAATTTTAAGAACTTATTTAAAACGAA
>CG4756 16622633 16623579|20907 chrX 16623508 16625150 scaffold_0 6681401 6682994 - 38144|0 71
ATTAAACGATTTATGTTAAAGCCTAGACTGATTTTAGCCATACATATAAGCCTAAATAAAACTTAATAGAAA
ACTAAATTATCTAAAGTTATACTTATACTAAACTTTGTCTTA------AGCGTATATAAAGTATAA------
>CG4768 16629256 16629960|20917 chrX 16629119 16629258 scaffold_5 22710 22849 + 10605|137 139
TCC
TCC
>CG4789 16635851 16635934|20926 chrX 16634898 16637256 scaffold_10 4382432 4384729 - 48308|995 1078
CTAATGCACTCAATTCAGTAGTTCTAAGTTGTAGTTATCGTACGGGAAGCATTACAAAAAGAAACGATTAATTCCCATTATAAA
CCAATAATTAAGGTTTAAAAGTT-TAAATTTAAGTAAATATATAACAACTTATATACTTTTACACTAAAAACTA-------AAC
>CG4829 16660076 16660433|20956 chrX 16659571 16660418 scaffold_5 5913776 5914581 - 28938|505 857
GGTGAAGAGTTTAGGAGGTCACCCAACCAACCAATCAACCAACCAACCATCCACCCATCCACCCACTCACTCATACACGCATACGTCACACACACA-AAAAACACACACACGCACGGAAACATTGCATTG-AGATTAGAGTAGAACTGCCCGAAAATGAGAGCAATTT---CCATGGAACAAGAGAGTATAAATGGGCAGATCTGGTTTAGAGAGTGGTAAAACAGATCGATCGCAT-CAAGTGAAAGTATTTAAGCTAGCTATGTC-TTTTTTACATAC---TATGTATATCGTACGTTATATAAATTTATATGCTACTACCTAACTACTACCTTATACAATAAAAATAAAA
G--------------------------------CGCAATCGCGCACGCATACACACAAACACACACACACACACACACACACACA-CACACAAACACAAAAGCACACACTCTCATACACACACATAACCACACACTAGCGTA------TCGTCAAGTGAGATTAGTTTGAGAGATGAAGCGAGAAGCAAGAAGCGTGAAG---------CGAGAAGGGAAGGCGAAATCGAATGTTTGCAAGTGAAAGTATTTAAGCTAGCTATGTCTTTTTTTACATATATGTATGTATATCGTATGTTAAATAAATTTATATGCTA----CCTACTACTACCTTATACAATAAAAAAAAAA
>CG4872 16716621 16716735|21031 chrX 16716234 16716644 scaffold_630 6135 6533 - 7580|401 424
TTGCTGTCCAGCTGGCAAAGCGAT
CTCCGATTCGGGCTGCTGAGAGAT
>CG4872 16716621 16716735|21032 chrX 16716675 16718253 scaffold_10 2472615 2474164 - 67482|0 60
TTCTTAAACTTTAATGTGTATATGCGCGTATATAAAAAAGCATTTGGAAACATAACAATCG
TTTTTGGTTTTCAATATTTAACAAACATTTTATAAAGAA-----TGGAAACATAATAAT--
>CG4875 16719454 16719801|21034 chrX 16719485 16720394 scaffold_10 2259553 2260340 + 31996|0 345
GTTTAACGTTTCATATATTTATGTTGATGGA----GCGTATAAAATAAGC-------TAAAAAAAAAGGTAAATTATTTATGTT------------------CGCTTCTGATCGCCCAAATCCTCGATGACGTCCTCATCGATCTCGGCCCATTTTTCGGGTATGACATCGAACAAGTCATCCTTGACGTCACCCTGAATGACGATCTCGTCGTCTCCGGTAACCGAGGAGCCGCAGGCAAATTTCGTGCCAAAGAACTTGGCGGCCACCTTGAGATCAATATCTGGAACAGACAGGGAATGTATTATGCTTAGTTAACAATAAAGCTCATAAGTATATCTAATAT
GTTTAAATCTTTTTATATTT-----GATGTAACTTGCGTATAAAATAAGCACATTTCTTAAACAGGACGAAAATGGCTATTGGTTCTATGATTTTAGATTAACGCTTCTGATCGCCCAAATCCTCGATGACGTCTTCATCAATTTCGGCCCATTTATCGGGAATGACATCAAATAAGTCATCCTTTACATCGCCCTGTATGACAATTTCATCATCGCCAGTTACTGATGATCCGCAAGCGAACTTCGTTCCAAAAAACTTGGCAGCCACTTTGAGATCAATATCTG---TAGGCGGG-----------------TGAACAAAA----TCATGAGTGGATCCATT--
>CG4880 16722172 16722666|21037 chrX 16721557 16722715 scaffold_5 706893 708130 + 5503|690 1220
TAGGTTTTTAA--AGTTTACGTTTTAGACAATTCTGCAAACCAGTCGTGATAAATTTAAAAGCAGGTTGGCAAAAACTATTAGGCTAGCATCCGTGGAATATCAGCAAAC--AAAGTTTAATGTTGTAAATCAAAAACCAATGTTTTATTCCTGTGTATCGTACATGTACA--TACATATATGGCCAA--TACTTTGCTATT-TTTGTACTACCATATGTGTAAATGAA-ATTAAGACGACAAATGACAAAATTTTTGTAAAA----GAAAACCAATGGTATC---------ATATAAGAATAAATTTAAATGAACGAATTATATTTAAATTGTAAGTTGACAGCATTCAACCACGATATTAAGTAAATGTGATTAAAATTGCCATATGTGTATAAGAGTCTAGAATCAAGT--------TCTTATAAATATACTATTTTTTTATTTTAAAAATAAGAAAAAAATTATTGTTCTGCTATCTTAAACAATT-----ATATATTTCGAAGAATGGGAATTACTATACTACTA-
TGGGTTTTCAACGAGTTCATATTTCTTTC-TTTCGGCATTTAAGTT-TGTTAAACAAAAAGCAAGGTT-----ACACT-----TCTAGCATTTTTCAAGGGGGGGAAAATGGGAAGTAGAATCCTGTAAAATTGAAG---------TGTTACTAAGAATC-TATATGTACACTTGCATATTAAAATAATCTACATTCCAATTATATATAAAAATATTTATTTAAGTTAATGCCAAAACTAGGGAACATAAAGCTCATATTGAGCTTCGAAAATGACTGACAATTTCTCTTAGATATGTAATTAGCTTTAAGATTCCTAAATGTAGTC--TTGATAAATTGGC-TTACTTAGCCA--ATATTCTCTGATTGTGATTATATGTG-CATAAATGTCCAAGTAGCCATAATTAAATATAATTAATTGTCCAAATATGTCGTGATTGTATGCCCTCA--CAGAGGAACTCTATTTGGTCAAAATGTAAAAGACTTTCTAAAAATATTTT---GAACGTGTATTAATATAAGACAAA
>CG4928 16770615 16771348|21094 chrX 16770636 16770831 scaffold_58 421961 422132 + 1442|0 199
ACACCCCAAAAACAAAAAACAAAAAAAAAAAACACCGCACAAGCCCCTCACACCCCACATTCCATCAAGATATCGATAGAAGGAAGCAGAATTGATTGGATGCTTTATCGATTTAAATGCAAAAA----AGACAAGATTGAAAAACAAGACGAAGAGCTCTATCGATAAAATGAAAACTAGCATAACTATCGATAGACAA
ATATTCCAAAAACGAAAGAAAACAAAAAAAAACCAAGAACAA------------CCATATGTCGTCAAGCTGCAAACATATG------CATTTTTTTATATACGT-----ATATAAACATAGTTATTTCAAACCAGTTTTTAAAAAAAAAAAATAATCGT-----ATTAAAACTAAATTAATATAACTAACACCAGGAAA
>CG4928 16770615 16771348|21095 chrX 16770857 16771896 scaffold_5 698652 699632 + 11607|0 497
CGGCGCCGATTGAAAGTCGCGACGCGTTGCATACTTTTGTGGTTGTAGTTTTGTAGTAGAACATTTGTACCCCTCACCCACGAAAACCCGATCCTGCAAGAGAAAAACCATTTAGCTCAAAGTCCAACGGAGTTTGGCTTAACTTTAGTTTGTACATACAGAGAAGAGATCGAAAAGAGCGAAATGCTATTGAATGCAAAGGCA-GTGAGAAGCCCCGGAAATGCAAATCCTTTGTGTGTTAGTCTAGGTGTAAGCACACTCGTACTCGGTTGAAACGGACTTCCTGTTTTCAAATATAAATCAATCGAGACCTATCGAAAAAATCGATATAATCGATCGACTTAAATTCGCAAGTGTTTTTTATTTGCTGAATGCAAGTCAAACAAATAGTTTCTGAAA---TATGCATTTCGAAATTCAAGAGCAGTTTACAATCGATACATT--TATATTTGAAAAATGGGGCGTTCTTAAAAACTTGGTATCACACAATCATAC
CGGCGCCAATCG------GCGACGCGTC-CGAACTTTTGTCGTTGTAGTT--GTCGTAGTAC-TTAGTACATTCCCTCTTCCCAATCCATTTAACACAAAAGGCCAATAAGCAAGCGCAAGCGC--ACACACCTGCGCTTATATATA---TATATATATATATAA-ATATACATATGTGTG---TGTGTGTTTATGTATAAGCATGTGTG---------------------TGTGTGTTTGCGTATAGGTGTGTGTTTGTGTGTGTTTG-------------TGCTCATGTCACGCACAAATTTGTACATACATATGCAAGAAAT-GTTAACAGCGAGT--------TTTGCAAGTTTATAGCAATTGACGC------------CAGATGGCGCCTTTAACTTTACGTAGTGTGAATTACAAGC----------ATCGGTGTGTTAGTTTAGCTGTAAGACAG-----------------------ACACGAC---AC
>RhoGAP15B 16789402 16789935|21119 chrX 16788465 16789568 scaffold_5 638875 639935 + 50241|946 1112
AAGTGCCCTCTCCCAGCTGCCAAACATAGATTTAACCGCCGTCTTGTGCATTTTTCTGTAGATATTCTGAATTTATTCGCAATATTAGGGAATATATACGTTTAGCAATATTTTTACGAACAATTTCGGGAATTTTCCAATATTTCAAATTAGTCAAGAAAAAAATA
AGCGACAACAACTGAATAGCCAAACATTCACTTGTTTGCCAATTTAT---TCTGCCTGCATTAGCATTTAATTTATATTCAATCATG----------------ATCACAATTTCTATT-----TTTCGAAAACATTCTA------CACATGTGT---GTATAGCATA
>RhoGAP15B 16789402 16789935|21120 chrX 16789569 16790522 scaffold_5 6519007 6519963 - 3654|0 424
TTTTTTTTTTACACTTTTTCT----------GTAAATAATC--ACGTTTGATCAAATACCAAATTGTACATAAGCTTAAG----------AAAAATCGATTGTATATCTAAGTATATGC-------CCTTTGTCTTCAACATAGCTCGATATCTGACATATCTAGTGTTTA--------------TCTACATATGTAGATAGATATGTATACTAAC-TATTAGTTAGGCACAGCCACACCGAGCAGCAAATTTTAGGCTAATTAAAGGTTTCGTTAAAAGCCTAATGTAATTTTTATACGTACATATGTATATGTTTCTAATTGGATTCGCATTTATTCAATGTTTGCTTACATTTGAAACCATTTAATTAATAAAATTCATTTGCTAATGAAT--------------ATTTCTATATAATTAAA
TTTTTTTTTTTTACTTGGTCTATGCAGCATTGTAAATATTCCTAAACAGCATCTAGTCCAAAATTGTACATAACCTAAAACACAAAAAAAAAACAAGAACTAGGGATCTAGAGAAATGCGAAATACATTTTGTATTTA------CTAGTTATTTAA-ATGCCGAGATTGTAATGGGAGGAAGGGGGCGACAGATGGCAGGGGGGTTGCATAGTTGCATAGCAGTTATCAATTACCACAT--------AGTCTGTAGTTTTATAATTTATATACTTAAAAACATACTA-AATATATACAATTACCTATGCACATG------AATATGTATGTGCCTATCGAGAATTTGTACGCATTA--------CTTATTGAAAAAGTTTACTTTTTAGCTAATTTCCAAAATAAAGAATTCCTATTAATATTAA
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ACGAAGGACAGAAGTTTGGAGCCACTACAGTGCCTTGGTAACCAGTTCCTGA--GTTTAATCATAGCTGGCAGTATTGTAGTTATTCGCCGTATGCTCTTGCTTTTCAAAC
ATTATGTATATAGGTGTAA-------ATAGTGCCTTTATATATAATTAAATAATGTTTAATTGT--------------TAAATAATGGCCCCA-GTTCCTGCCTTTGAAGT
>CG4949 16913524 16914848|21299 chrX 16913633 16913931 scaffold_9 4571164 4571456 - -341|0 318
AATACTTACTTAGAACGTTTACCTTATGCATTATTAAAACATGCATTTTGTCAGGTTA---GACGAATATTTTCAAAGCTGGAACGAATTTTCCAATCTCGAACGAATTTCG---AGTTATTAAGACTGCATTTCCATTTTAT--TGACTTAAAGCTATTCATATTGCCTTCCCAAAAGATATCCAAATGGGGAACGGTCGAATATTTAAGAAAATGAATTTATAAAAGGCAAGGCAC---------GCTATATTATATCCGCATATAATACTAAGACAGTGCGTACATTT---GGCAAGAACTTAAGAAATACTGTAC
AAAACGTTTTTAG--CCTTTAATTAGT---TTGATAAAACGTTCAATGTGTGACATTATTGAATTGAGAACCTGAGAGAGGGGCTGGGTTACCTGAAATACTAGAAATATCGGTCAGGGAAAAAGACATCAAATGCATTTTATATTAGAACAAACTTTTTAAACTAGCCTTCTCAA----TTACCTCAT------------AAAATAAATGAAAGTAAATTCTTTCAAGTCAAGAATCAAATTCTCAGTTAAAATATATT---AAATAAAATAAAGCCAAGAAT--CATTTAGGGGCAAGAAACTGGAAGAAATCGTAA
>CG4949 16913524 16914848|21300 chrX 16913932 16914854 scaffold_10 2506722 2507664 + 21920|0 1012
GTTGAAAATATCTCCCT-ACATGGCATCCATGCAAAATGTTATACGA--AAGCGAAGCAATCGAATGCTCGATCAAATATAAGACTTTATT-------ATAGTATACTATTTAGTCTAAAAGGGATTAAAACTACCAAAAAAAAATTGCTGA--TAATTAAT-------TATAATATACATACATAT---------------------------AACAATAATATTTATTATG----CTAAAC------GGAAATCTCAA-----------CTTAAGGGAATTTATATGAAATAAAAAAAAAATTTCGAATGCATA--AGATACGTAAATGCAGCTAAAAGTATTGGAGAATGTA-------TTCCG---------GAAATACGGCTAGTGATCTCCGGAACGCAAGCCACCAAAGCCCGTTTAAAAGGAACTAAAACTCA----------TTCACATGTAGCCCCACCCCAAATCCCTGCTGCCTTCGTCTTCGATTGGAATCCGATCTCCGCATCCCAGCCTCATATGTAGTCCAGCATGCCGCTTATGATCTCAAAGGCATCCCGAGCCGTGGGCTCAATGGCGCTGCTGGGCAGCAGATAACCGTGCACTCCGTTGTCCGCCAGCTGGAGCGTGTAGCTGAAGGGAATTCCGATCTCGTAGGCGGCAAAAGCGTCCGCACAGCCTGGATAAATCAAGGAAGCCAAAGGATTGGCAAG-GTCGGATAAAGATCTCTATTATATTCTACTTCGAAGCAAATAATATAAATATTACGCACCCGATCGCTGTTCAATTAGATCGTTGGATGCGTCGACCTTATATCGGGACTTACTACCCTTTTTGCGCAATCCATCGGTACCCACCATCGCCACGTCCAGAAAATCATCCAATCTTTCTGAATTGAAAGTGGAATTGGCCTTGACCGGATAGGATATCACCTGACCATAGGCCTGTAGGGAAATGTAAAGCTGCAAAAATAATGAATAAAGTTAATAAATCAAAAAATATAT
GTTCCAAGTTTCTCCCTGATAAAGGATCTTTACCTAATATATCAAGATTAGAGCAAACCGTTGGATGAT-AATTATATATAAGTATATATTTGTAGAGGCAATATATAATTCACTCTAAT-GTTATTCACGCAATTAAAATTTAAGTGTTGAAATAATTAAAAGCGGCATTTAAGTTAGATAAATATCAACTTTTTTTTTTTATTGTTTACGTTAATGATAAAATAAGTTATATGCACTAAGTTTGTTTATAAATATTAAGACTAAAAATATCCAAAAATATTTATATAAAAAAAAAAAGAAAAAAAAAATTACTACCAAGTAT-TAAATGTATC-----GTATTGAGTTATATAGCGTTGGTTTCGTCCTTAATTGTAAGAGCAGAAGTGCGAACCTGATCGCTGATGAAAAAAA-------AAAAGGAACTAACATTTGAGTTTTGCTGTGCACTTGCATTCCCACGTC---------CTGCCTTCTAC--CAACTGG----------------------CTCAGATGTAGTCCAGCATGCCGCTTACTATCTCAAAGGCGTCCCGCGCTGTTGTCTCAATGGCGCCGCTGGGCAACAGATAGCCATGTACACCGTTATCCGCCAGCTGGAACGTAAAGCTGAACGGTATGCCAATCTCATAGGCGGCAAAGGCATCAGAACAGCCT---------ACGGAAG---GACAATGGGCATGAGTAGCATTGAGATCAAACTTTGAGTGCATCTCTGA----------------CTACATACCCGAACGCTGCTCAATCAAATCATTGGCCGAGTCAACCTTGTAGCGCGCCTTGCTGCTCTTTTTGCGCAGCACATCGGTGCCCACCATGGCCACGTCCAGAAAGTCATCCATGCGCTCCGAATTGAAGGTGGAATTGGCCTTCACCGGATACGACAACACCTGTCCATAGGCCTGCAGTGATATATACAGCTGCAAAAGCAATGCACAAAATTGGATAAGCGTCAGATTAAG
>CG4955 16917147 16917297|21303 chrX 16916658 16917252 scaffold_10 2511209 2511865 + 10203|558 665
CCACCAACGAAGCCCCACGTTGGGCGCCAATAAT--ACTTAAACTGACTTAAGACTGCGAAACTATACGTATTGCCTGGAAACACGAACCATTCGATCATTTGCAAAA
TCGAGGATAAATAGTTACGTACCGGATCAACAATTCGCTCGCACAAAATTCAACGTTTGACATTCTG-ATATTAACTAGAAAC-CGTATAATTAAACTAATTACCATA
>CG4955 16917147 16917297|21304 chrX 16917253 16918490 scaffold_10 2512108 2513269 + 40962|0 44
ATTTCAATTTGAATAAACTTTAAGAGAAAACTTTTGTAGGTATT-
ATTTTAACTTGGATGGACCTTCGGCTACAGCCAGACCCCAGATTT
>CG16700 16931666 16932424|21319 chrX 16931743 16931887 scaffold_1 5810532 5810683 + 1159|0 151
AATAGCCGAAGTCTTCCAAGAGCAGACCAATACAAGAT-CAAGCAATATAAAACTCAAAGGATCAACCAAACCAACATAGTTACAAAAAGAT--TTTAGCGGAACTAC-TGATTTTTATAAACGCCAAAATTCCCATAT---CATATAAACA
AATTGCACAACTCTTCCTAAAGGAAATAAAATTGAGCCACAATTAACAAATATGCAAAAAGAAAAAACAAACCAACAAAATTCCAAAGGACTAACTCCAAGCAATTATATACGTTTAATAACCTACCAAAATATTATGTGTATATATATGCA
>CG16700 16931666 16932424|21320 chrX 16931938 16932392 scaffold_1 5810757 5811196 + 748|0 490
GACTTCCAAAAAATGGATTTTAGGAGAAACACAA--CTATTAA--CGATCTCCGAGTTTTTGAGATGCCAAATCAGTTGGGATGCCTTACACGAAGAAAACAGGAATGGCA-GAGGATCATATTTATCGAAACGAAATGATATAC---CAAACCTCAA------------TGATATAAAGCTTTAAAGATAATGAGAAA---AATAACGGCAACCATTTAACAGCCATCATTTTAGCCATATGATCACAAAAACATTTTAAAACAATTTAAAATGTACCCACT--CTTAATCCTTAATTATTTACATGAAAACCCAATATGCTTGCGAATTTACCACAAACAACAA-AACAAACACAACCATTTATATATATTTA--TTTATACCTAAGTGCCTTCTTTTGTGTCTTAGTAAGCGTGTAGCGCATTTTACC--TACTATAATTGATTAT------TTTTTTAATAGATATTAAGTGAGAATAAACAATGCG
GACCCACAAAAAACAAAAACAAAAAAACAAACCACGCCCCTAACCCAGGCCCACAGTTGTCGTAGTGTT---CCAATTAAGATT-------CAAAGACAAAAATAATAACATAAAAATATTATTTAAAAACAAAAAACAAAAAGCAAATAAACCTTAGCTGAAATTGGATTAGCAAAAATCTTGAAAAGAAAAAAAAAAGAGAAGAACGAAAACAAATAAAGTACTCGTAAATTAAAGGCATG-----AAAAGTATCGTCAGA-AGCTTACAAATTACATAATTATGTAATACTTAATTATATATCTG--------ATATCTGTGCAGATCCACTCGAAAGATCAACAAAAAACCCAATCAAACACTTACTTTAAAGTTGAAACCAAAATGCC--------------------------GGGTAATTAATCAATAACATAATTAATTATTAATTATTATTTAAGCGA-ATTGAGCAAAAATACATTATTCG
>CG4991 16938023 16938501|21323 chrX 16936877 16938930 scaffold_10 2538247 2540075 + 60464|1177 1695
GCTTA--------GAGAGCTAGCAAGTATATTTTGTACATAAATAATGCTGTCATTCCGCGGAA----CTATGTGAATGCGTTGTCCTGTTCTGATGTAAGATTAATTTGT-------GTATTTTTCCACTCTTTTTTTTATTATTAT--TTTGTTGATAGTTTTAAGCTGTGCATATTTTTTTTTTGTTTGTATGTATAAAAA--------------AAATGTTTATTTG---GCACAAAAACGAAAGGAGGCATAAAGGAAAAACATGATCTGCAGCTATAACCCATTTTAATAATTGATTACCATAGCAATAGGGCTTTGATTGTGTGAGAGCCTGCAAATGATCGTTAAAGCCATATGTATGTAATAAATGCTATTCATCGATTTTATAAATATATATGTATAAAGTATTAACTAGCCTTCAGCCAACAATGTTTAACACTAAGTTCTTTTACAAAGTGAAAAATATGCGCTTTTGAGAGCGTATAAATCAATA--AACATAAATCAACAACGAA
GCTTAATGGGCCCGAGTGCTTGCCAA-GTATTTTGTAAAT-----ATGCTGTAAACGTGTGAAATACCTTATAACGTTTCATTGTCCTTCTATGC--TAAGTCTTATATATATATATAGTATTTTTTTTTTTTTTTTGTTTGTGCTATTATATGTTATTAATTTTAAGTTGTGCCTG--CCGTGCCTGTTTATATGTGGCCCGATTGATTTAATCGTCAACTGTTAATTGGCTTTCAAAGAAACGAAACTAG--ATAAAACAAAAATAT------------------ATTTTAATAAATGATAATAATA-----------------------------------------------CAT-TGTCTTTTATAAGT--------TTGATTTTA-----------------------AACTTGGCGCCATAC-----------------------------ATGTGAATACTTTGGGCATTT------------ATCAACACTGCCGCAGGGCTGCAACAAC
>CG5010 16984237 16984584|21371 chrX 16983759 16984755 scaffold_28 1819693 1820705 + 21874|484 893
AGGGCCCAGCTCCGGTAGAATATCATCTGGCCAAGCACCGGCGGA--TGAACGCAG--------CCGGATGA---ACCCATCG------GATGAACACCTCCGGATGA----ACTCTGTCCTATCCCTTCGTTTAGTTCTTAATTGT------------------TTAATTGCAAGCATCTGAAAGAAAGCATTGTTTAATTGTAGTGCAAAATG------------AAATGTTAAATAGAAAATCCCGT---------TGGCAGCCCAAAACCCTTTCCAAAAAAAAACACAAACAAACAAAACAAAAAAGAAACCAAACCCCACGGGTTGTCAATGTGGGCCAAAACAAAACGAAGTTTCCAAGAGTTTTTATTGTTTAAAATATAAATATATGCATAAGTTAATATC
ATGA-------CAACTAGAACATCAACAACAACAATAACAACAAAATCGAACACAAAAAACAACACAAATAATCTTCTCATCGATTGATGGCGAAAATGTTGAGCTGACGTTGTTTTTTCTTTCCTTTGTGTTTTTTTTTTTTTTGTTTTTTTTGTTCGTTTCAATTAGTTTTACATATATTATCAATGGATATTGTTAATCAGACGGCAAATTGTTTAATTTAGTCAATTGTTCAATAGAAATGCGTGCAACGGCGTGCGCCAGCCCAACTCCTTGGTAAAAAAAAAAAAGTCCCAAAAAAAAAAAAAA-----------CCCGCTGG-CGGCGTCGCTCGACACAACAAAAAGAAAATTTC-----CTTGTGTTTTTCGTACTGTAAAT---TGTAAAATTCCCTATT
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CTATAGGTGTTGGCGCAAGCGCGCGCCACTCGCGATGTGCTGGCCGAAAATCGG-------GTCGTTCTCAGCGAGGTCAACGAGGAGGTGGAAGTATTCTACTTCGCCACCGAGTGCTGAACACATTGCA-----------------TAATCGAGGGAATTATTTGTTTA------AGTTAGA--TAAAGTGTAATTTGCACTAAACCACATGCATAAG----------------GGGTGGGTTGGTTAATGTAATCTTGTCTATTCAACATGCAATTAATATGAGACAAGAGGAAATTTATTTT----ATATTATGAGGTTTAAAT---------------------------TTGATTTGTAACTAGCTCCA--------------AGCCAAGGAATGGTTGCTATATAATT-----------------TAAATTCTATCCTG-ATTAAACAATATATGTATATATATATATA----TATATTTATCCGTGATATATGATT---------AAGCAAACAA-----------------AACCTAGACGTTT---TCTTGCTAAGCGGAAAG---AACCAGGATAATATTTACATTAGTATTCCATCATAATTTCATGGTCCAAGTGGAAAGGAT-AAACTTGATTTTATATT----TGTAAATTGCTAAGA-------ATACTACTTGGTTTCATTGGATTTCCAACCTA-TTGACCCACCCTGACACACGTCTATATTAAGTTCACAATTCACAATATATAAACTAAAAAATTGCATATTTGGCGAAACAGAAACCAAGAGAGT----AACGATTAAGGAAA-------------GTATTCCCGTAAAGCGCTATCAATTTGTCGAGTGCTTAGATTTAATTTAAATGAT-----------CGTATT
CTATAGGTGCTGGCGCATGCGCGCGCCACACGCGACGTCCTCGTGGAGGGCCAGCACAGTCGCCATTCGGAGCTGAGC-------GAGGTGGAGGTCTTCTACTATGCCACCGAGTGCTG-ACTCATTCCACCAGGCGGCTGAATGGGTGGGCGAGGGCACCGATGGTTGACGGGGGGGTTAGAGGTCGCGTGTGAGTCGC---AAGCGGCCGGCAAAAGCAAGCAATCAACTGGAAAGCAGTTTGTTTATTTTTTTTTTGTTTTATAAATAT--AAATAAAATAAAATGAAATATAATTTTTTTTCATCATTTGACAAGGGCAACATACCCACACACACACACACCCACACACATATGCTTATAGTTAAGCTCATTAAAAAATACATTACACAATGAAAGTATTCCACGTGAAGCGCATATTGAAGAGCAATAAATGTTACTTTATAATAAACAGAATAATTATACAAATATCAAATATTAAATTAAAGCAAGACAAAGTGTTAATTTAAAGAAGAAACCAATGCACTGCGCTTAAATTAAGCTAAACATTTATATTGTATTAATCGCTAAGTCTAAGTCAAAGACCATGTAAATAATTATTAAATGTAGTTTTTATTGTGCGCGCACTTAGGATGAGAGTTAATTGAATAACGAAATATCATTTCATATGACAGCTACATACAAATAGGCTGCATTCGAGTCGCAAAAAACTTCATTTGTTCAGACATTTGTTAATATTATATACATA------TACATATAGCATATACAAATATATAT---GCTAGATTAAAAGCTATTGGCTTGTATACGATCATAAAAATACACTTTCAATTGTATTTTTG----GCGCTTTAACTAAGCCAAAATCATGCTGTAAATATATATAACTGGCATACACACGTATA
>baz 17028332 17029254|21430 chrX 17029054 17029279 scaffold_2471 2047 2288 + 1959|0 222
AAGCTTT-----------AGCTCTAAGTCCAAGTCAAACGCCTTTGT-----ACATAACTAG-TTTACCCAAAAGCCAACAAGAAAACAGAACAACATCAAATCCCAAAAGTTTTGGACCTACACTGCGAAAG--GTCTTAACAATTTCCATTGTCAT--TTATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAA-TTATTAGTTTAATTCTAAAT
CAGTTTACAACATCAATAAACGCTATGTTTAGCTAACATTTGATTATCGGTTACACATTTAAATTCATTTGAAATTCAACAACAAAACACGACAACAACAAAGCAGAAAAGCATAAATCATATAATGTCACCTTCATCTTATCACACCCCAGTTTCCTAAGTATATTACAATATTGATTATTTTCATATATTTTTCATTTCATTTGTTCGTTTACTTTT----
>CG32564 17041642 17041791|21443 chrX 17041307 17041934 scaffold_28 1887636 1888347 + 5987|378 654
GTGCTCATGTAACCATAACTCAAAGCCACTC--------------------------------AAGGACT--CCAAA--ATCTAACCTA----------ACCTAACCGTACTCAACTA--------------------TTTTTTTTCTAGTTCTAAA--------ACGAATACCTTT-------ATTTTTTTG----------TTCGATCGATG---------TGTACAT------------AAAATAAA---------------TCAATATACCCG
G-----------------CTTGGCGTCAATCCCTGAACTCTCCTTCCCCAATCTCCCTCCCAAACGGACTTGTTAAACTATCTAGCCTGCGATCTGTGCACCTAAACTTACTCAACTGTTTTTAATTTTTTTTGTTTTTTTTTTGTTTAGTTTTAAATACAAACGACGCATAATTTTTCTCCCAATTTGTTTGCTTTCCTGATTTCGATCTACAATCTAATGCTGTGCTTTTTTTTTTGGCCAGAATAAAAAGTCAGCTTATTGTGTAATATCCTCA
>CG5162 17051035 17051153|21456 chrX 17050346 17051219 scaffold_5 779606 780480 + 4701|735 859
GGGGCATATCCTCCAAATCACCATTCCCAT------AATCTATCCTAAGCTAGCAATAAGCCTTGTTTTTTTTTTTTGGCTCAAACCGATTGCGGTCGATAAGCAATACACAACTTGCCTTCTAA
AGAGCATATTTTCTAAATTGTTGTGCACCCGGTGTGAATATGAGCTGATGTAGCATTAA--------TTATCAAGCTGGCTTG-------------TGATAATCAACAAAAACCTAAATCGAAAA
>CG12998 17053260 17053431|21461 chrX 17052467 17053286 scaffold_28 1901961 1902970 + 14765|1045 1071
AGAATCGAAGAGCTACCATCTCTAGGA
GCAAC------GCTGGCAACTCTGGGA
>CG12998 17053260 17053431|21462 chrX 17053340 17053482 scaffold_28 1903014 1903185 + 758|0 123
TCACAATCCACCCGATTTTATAACATAGTTTTT--------------------AAGTACCATTTTTTTTTGTGTAACAAATAAA------------TAAATGAATAAATCAAAGGCATAAAGTT
TTATATTACGTATATGTATATAAGACAGTTTTTTTTTTCTTCCCATTTTTATAAAGAAATATTTTTTTTTA---AACAAATACAAATTGCAAATTGTAAATTAAGCAACAAATCGCATGATTT-
>CG5172 17056304 17056586|21469 chrX 17056242 17056570 scaffold_28 1905488 1905957 + 9246|62 469
TTCCGTGTCCTGGCAGGGCGGAAATGGAGGCAACAAGAACGGAGGCGGCGGA---------------------GGAGGTGGTGGTGGCCTGTACGGTGGTGGTGGCGGTGGAGGTGGCAAACAACATGGCGGTGGCTGGT------------------AATCAAACCA-----------CCAGGAGCA--------------------------------GCTAATCCACCG------TCTGATGCTGACTTGTGTTCCATGGCATAGAGATAGAG---------------ACAATCCCTAGATTCTTCTATTTTTCTTCTA----------TCGAAAGCCCAA--------------------------TTTTTCCTGC--TTTTAATGTTTTTTATACTAATAAAT
CTCCGTATCCTGGCAAGGCGGTAACGGCGGTGGAAAGCATGGCGGCGGCGGCGGTGGCGGCGGCGGTGGCTATGGAGGTGGTGGCGGCAAGCACGGCGGCGGCGGTGGAGGCGGTGGCAAGCACGGTGGTGGCGGCTGGTAAAAACAACCAACCAACCAACCAAACCAAACGCTCAACTCCCGAACCACACACAACGAGAACTGCAAGACGAAACGAAATGTAAATACTCCGGCTACTCCTGCGGCTGACATGTGTTCCACGGCATAGATATAGAGCTAGAGGCATTACCCACAAGTGCTATACTTTAACTTTTTTTTTTGAATTTTTTTGTTCGCTTACCCAACTAGTTACACCCAAAGTTTCTCAAGTCTTTTCCTTCCTCTCTACTTTTAATTGTACTAATAAAT
>f 17114338 17114901|21529 chrX 17113292 17114576 scaffold_697 3362 4665 - 46896|1111 1368
TCTG--CATCCACGTACACATACCCAAAAAATTAAATCCATTTTTCAATCGACTCCTAAGCGGTGTATTTTTTTTTTTTTTTTTTT-TGTGGA-----TTAACTTAAAGCATGTGCAATTATA----ATGAGAAAAACCCTAAATAT---AAAGCATAAAACCTAAGCCTAAGGTCTAGCTACTTACAT-TGTAC-TATATGCATA--ATCATTTTTGCACCTCCATATTTTTTTTTTTTTTCGCCAAAACGAATATT
ATTGGCCGTCTCCGCGCTTAAGTCTCTTGTAGTGCATTTTTTTTT-----------------GTTTATTTTTTTTTTTTTTCTTTCATACGAATATATTTAACTTAACGAATGTGCAATTATATCACATGATATATA-TTTCGATATGCGATTGAATTACACATATACATA-----TATACACATATATATATACATACATACATATTATAATCTTAAGTAATCCATATTTGTATTGTGTTTAACGCACACGCGTGCT
>f 17114338 17114901|21530 chrX 17114577 17114858 scaffold_19 1015937 1016205 + 1203|0 302
GT-TATTCCTAGTGGGCAGTACAGTATCTCAAGGCGAATCAAACG--TATATATCTAATCTTAGCTGCTG-----TGCTT-AAGTTCTATTTCGGTTTTGTATTTTAATCACTT------ATACTCTCTATTTTTTGACATTTTTTTTTGTGACTTGGCTTGAATTTATTTAGTACTGGAATTAATTTAATTGATTGGTTAAGCAT-TTTTTATTGTTATTTGTTTTTATATACGCGGCTCAAACA---ATATTACTTTTAATA-ATATAAATACACGAATACATACA-ACACATCTATGAAT
GTGTGTTTTTTTTTTTTCATTCAGTA----AAATTGATTTAAATTGTTTTTTCTTTCCTCTCAGCTACTGCTTCTTGCTTTAAGTTGAATTTCAGTTTGCCGTTAAGTTCACTTTAGTTAATTTTCCTTGTTTT------TTTGTTTTTGTTATTAATCTCTAATGTAT-----------ATTAA-TTAGTTGCCAAGCCATGCATATATTTATGG---------CCTATATACACA---CAGACATGTGCATCCATTCACATACATATACATAGACATATGCATACATATATATATATGTAT
>CG5445 17138775 17139415|21564 chrX 17138582 17138775 scaffold_5 909311 909499 + 9596|193 193
G
G
>CG5445 17138775 17139415|21565 chrX 17139250 17139569 scaffold_5 909738 910025 + 2275|0 165
GTGTGCGTGCGATTGTTTAAATCATAATTGAAATTTTTTTTTTCCAATAATTTAAATTCCTATGTTTTGAGTAATCGAGAAGCATGAAAGCTAAGAAACGTGTAACAAAATTAGATCTAAGTGTTTTATTGAGAAAAAATAAGAATGAAGCAGAAGGATTAAGAAA
GTATGCGCGAAATGGTTCTATGTTTAAGCGACATGGTTTTTTTT---TTTTTTGCCCCCCCTCCTTTTG---------------TCAAACCTAT----CCTGTAACAAATGTAGATTTAAGTGTTTTATTGAGCGAAAGAAAGAGAAACGAAGAAG--------AA
>B-H2 17157238 17158099|21604 chrX 17157399 17157746 scaffold_50 544831 545126 + -905|0 355
CATAAAATTTAAATACACATAGGCATAGATACGATTTTTAAGCATATACAGCTGCGTTAAAAGTAAAGGTTTTAAAATATATCTATGTGGTTTCTCAAGAATTGCAAACGTTTTAAGATATTATGTGAAAACATTTTTCCCTCATTCAAAATGCCAGCAAGACTACAAATAAATTAACACT--ATAAATAAATACAACTTTAACGACCAATCAAAAATCCATTACTTATAAAATGTTCCACTATAGTTACCAATATTTTTGACACAGCTGTAGATAAGACGTGCTTGCTAAAAAAAAACACTAAAAATCATGTCTGTAC-TGCCACTGAAAATGTATTTGAAAAGATGT-----GT
CATAATAACCAACCACACACACACACACACACC---------CACATACTATATATGTAATAACACTTCTCTATATATATATATATATTTATTCGCAACCAGCTAAAACG----AAAA---------AAAACAA------------CAAAAAGC-AACAAAAAAAAGAAAAAATTAACCTTCAACAAAGAAAAAAAAA---AAAAAACAAACAAAAGGGCAAAAAGAACAAGAAG-----AAAAAAATATCAACATT---AATACAT---TATCTAAAAC-----------AAGATGAAAGTTGAAATCGCGGTTGCAAATGTTAGTCAAATTATAGTAGAAAAAAAGCTACAAGT
>B-H2 17157238 17158099|21605 chrX 17157747 17158468 scaffold_5 933715 934475 + 13185|0 383
GTGGTAAACTAAATAAAATTTGTATAAATTCCACGAAAAGATTAACATAGAATAACCCAAAATGTAACAGTATTAGACACTCCCCATGTTCATCTGTTTCCAAGAATAACCCCCAAGTAATTGT--------GAACAAAAAACAAAT-----CTAAATATAAAT-----CTTTTTTTTTTTCTATATTTAATTAAACCTAGCTATAGA---------TGCAATTTTGTAAATTTTTGTAAATGATTTTTGTACATACGCAGCAGACCAACAACATAAGCAACACGATTTTTTTTCCAAACAATATAGTATTTTTTTTTTTACAATTTTTTTTTGTGCCTAGTCCTAAGACGTCTATTGTGTGTAGT----AATAATAAAGCGAA
GCGCTAGGCTCAA--------GGCTGGATCTCAGACGGCGATTACAACGGGACAGCTCAAAGTCACCCAG-----------CTGCATGCTCAGTTG--------------CCCCACGTAAATGTCTCACATTAAACAAATAAAAAATATATATTAAATATATATATATACTTTTTTTTTTTATATATATAAATCTAACTATTTAAAAAGTAGCTTAATGAATTTTTGTAAATTTTTGTAAATG--TTTTGTACATAAGCAGGGAA---------------------TTTTTTTTTGAAACCAGATTTTTTTTTTCTTATCTTTAATCTTTTTTGTGCCTAGTCTTAAGACGTCTATTGTGTGTTGTAATGAATAATAAAAGAAA
>B-H1 17236348 17237216|21731 chrX 17236710 17238401 scaffold_5 1030512 1032337 + 18761|0 621
AAAGCAGCACAAATG-----AGTTCAGTATTCAAAACAAAATCATGGAACCGAAAATTTGAATGGAACATGCATATTAAAAAAAAAAACATTTGTCAAAGATCAATATCCA-----CAAGAATTCGCGTTTTTGAATCTCCCCTTAAGCCCCGCTTGTGTGTGTGTGTGCCTGCGTGTGTATATATATATTAATATCCCTGTGAATCTGTGTGTGTGCTTAATTTATTTGATTTGCTCTTAGTAACTTATTCGAAA-----------TGTTT-----TTTAAAGAGTTTTTTTTTTTCAATATAAGATAATGAAGTAAAATTAAGCAAATATTTATTTAAATGTTGTAAAAACTAGCAGCCAAAAAAGCAA-----AATAATTT--------------------TGTATAGTTAAGCCTAACCACGAAATGTATTATCGAATAAACAA------------------------------------------------------TTTTTTTTTTGTCGGTAGCCT-------AGACCTATAAACGTTGTAACTGTAAAATGTAAAGTACATTTAACCGCATATTTTTTTGTCTAAATAAAAAATAACAGAATGTGAGAA---TA
AAAGCGGCCCAGGTGCAAGCGGTTGAACAAAGAAAAAAAAATAACGAAATCCAG-------------------CAACAAAATTGAAACCATTT-TCAAGTATTTGTTTCCAAAACACAAAATGGCAAATGGTTGAGT-------------------GTGTGTGCGTGTGTATGAGTGTATATATATATAT----------GTGTGTCTG-------GCTTAACTTATTTG-TTTGCTTTTAGTAATTTATTATAAAAATAATAATAATATTTACCGATATATACAATTTTTTTTTTTGAGGTTAGGCTTAGGAAATACGAAGCATAAAATATTTATTTAAATGTTGTAAAAATTAGCAGCCAAAACAATTACATTTAATAAATTAACAAATAGAAGCAACAATGTGCATAATTAAGC-TAGCCACAAGATGTATTAACGTGAAAACAAAAACAAAACAAAAACAAAACTTTTAATAGAATTGCATTTTGTTTTTATTTACAATTTTTTTTTTCTTATTATAATTATTAGAATAAATGTGCTCGTTGTATTTGTAA--TGTAAA-TGTAATTCAACACA-ATTTTTTTGTCTAAATAAAAATAATAATAATAAGAGAAACATA
>CG5613 17262537 17262671|21759 chrX 17261345 17262572 scaffold_5 1061544 1062790 + 27180|1229 1264
AGCCCAAGTTGCTTGTGTAAATAAGAACTTAATTTT
GGCCTCGGCCGCT----TAAAAATAAAATACATTTT
>CG12991 17432316 17432899|21977 chrX 17430515 17433252 scaffold_5 5074783 5077688 - 50660|1928 2739
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TTTCTGACGT---CTGTTGCGGATGCATTCCAACTAACCCCCTGTTATTTAACCATATGTTCAGTATTCCTTCCATATACTATATTGACTAGCACACCCCCTCCCACAACAACTAACATTTTGCCCAGCCCAACAGACAACACACACAGAAACAACAAACAAACACATCATAATTATTAAGTAGGCGCCAGAGTGCGCAGTTTAGCATTTAAGTGGGGGGCCCCTCAGTGGGGCCAGTTGTATGTATTTACTAATTGATAGGCATTCGTGCAGCTCAAAGGGCTTGTATGCAACCAAGCGAGCAACTAGTTTAAGCC---AACTACCAAAATTATGTTTAGTCTATTTTAAGGTCGCA-------AATTTATTTGCTAGATTTAAATGTTCAGCATGTTTCAGTTCTACAAAACTTCTTCAACAGAACTACATACGTACATATATAGGTGTATCCGAATTGATGTGTGCAGCTTTTCATATATTCCATTCTCTTGAACTCAGTTTTATTTGAATTTCTCTATGTGACTCGTTTTTGTAGCAACTTAACTTATATTTATGTTTTACTATTTATGCAATTATATATTTAATGTTGTTGAGTATTTTTTCAGATAATTTCGTTTCGTTC--GTTCGTTTTTTCGTGATTAATATTTAATATTTATACAATGATTAGATTTGTGTCTGTCCAACAATTAAACGCAATCATTCCTTCCAGTTTAGCATATAGTGCAACTTTATA-TGAAATTATTGTATTACAA---AATAAATTAAACAAT-ACCACTAAAGATTCTAACACAATATTGACTGTTT
>X11L 17439247 17440045|21983 chrX 17438955 17439681 scaffold_5 1585339 1586049 + 13729|329 775
ATATA--TATGCAACTGTTCACACGCCTACGCTGGAATCGAAAAACTA--TAAATTCGT-CAACTGCAACTTGACCAGCTTAAAGTTACATCGATTCGCAAAGAGACCTTAAATTGGAATTTGTTTAGTCTTAAATTGTTC--ATTGATTATTTGTCTTTATGTATTCACATTGCAAGCATAATTGTAGTTAATTTAAATGAATTGCAAATGTATTAAGTCTACAATGAGATTAATTGTTCGTCGTCAAATCGTTCAGGTGTCCACAGCGACCACAACTGCAATAGAGAG--ATTACTATTACTGGAGTTACAGAAAATGCTACTTTTTGGTTCATTTTGTCCATCTGTGTACATGAAAAAGACTGAATTTAAAGCC---AGTGCGAGTGTATGTGAGCAGTCATTGTAAAGTATTTAAAAAATTGTAAACGCATTGTCCCGAAAAT
ATATGCTCATGCACCTCCCAGCACACACACACACACACACAAACACTAAGAAAATTCGTATGTCTGTTGTTAATGCAGCCCCAGCATACCTGGA------------------------------------TTAAATTATACAAATGGAGGACTTTCATTTAGGCAAGCAAAATACACTCAAA--------CAAATGAAACTTTTTGAAATTACGATAAAGGAAAGGAAAAAGAAACTACTCATACTTATAAC---TAATTAAACTAAGCACTCACAG----AATAGAGCGTACTTACTACAGCT----TTGCTTTATTTACTTTTGTTCAATTGTTTATTTTC-TCTATGTACATGAAAAAGACTGAATTTTATGTTTTGCGTACACGTGTGTGTGCATGGGTG----AGAGTGGGTGCGAATGTGCAGCTGACTTTTAGCGAAAAT
>X11L 17439247 17440045|21984 chrX 17439717 17440997 scaffold_5 1586254 1587515 + 9984|0 388
TAAGCATTCGATTGAATTTACTTGCA------------AGCAAATTTTTATGATATGATCTAATCCATTATTTGTCATGTAAATTAACCGTATTTTAGTTCATTAACTACATTTATAATTTTCGATAAAAAGAAACAAAAAGCAACACACCTTATGCCAAAAA--AGATTAGATTTCGTTAAACT----------------------TATTATTGTATAGAGCCAT-------TGCGGATAATTATTGCAATACCATTACCG-ATATTTAT----TATTAAAAATAGCCTTAGAAAAACG---------AAGCCATGCCTGCAAAAACCAACAAAACAACAAACAAAAT-AAATGCATTTAA--AAGCGTCAGAAAAACATAAAACGAA
TAAGAATTTAATTTCAGTTGCCAACGCGTTAGACAGACAGCAATAATTTATGATATA--------------TGACTGTATAATTTAA----AATTAATTTTATTAACTACATTTATAATTTGCAGTTATGCCAAAAATCAAATATT-CGTTTTACGATTAAGATGCGATGAGATTTCGTTGAATTGTTTCTTAATTCATTCTTTTTTTTTTTTTTGATAAATTTATATATATGTATGTATAGTTA-----ATACTATTAACGCATTATTGTACTGTATTTAAATGAATGTCAAATACTTATTATAGTTTAAGTGATGCCTGTTATAAGCGA----ACAGTAAACAAAACGAAATGCATTTAAGTAAACGTCGTCAAAATA-------AT
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A
A
>CG5800 17472862 17472942|22013 chrX 17470305 17472862 scaffold_25 84172 86649 - 115244|2612 2612
G
G
>beta-Spec 17502875 17503174|22054 chrX 17501862 17503321 scaffold_25 1322245 1323723 - 54303|1133 1441
AGTAACAGCCGTAACGCAACCATAAGCAAGAGCAGCTAATTAAAACAAATAACAAATAACATGAAATGATATAATACAAATGCAAAACGACAACAAATTATACAGCAAAAATTAAGAAGAAGCAAATATATATATTTTTTTTTCATATATTTAAAAC----TTATTTCGTAATGAGAAAAAAACAAAAACCGACAAAAACTTGCAAGAGAAGAACGAGCA----AAACATAAACAATTATTATGCTTATCAAATTTGCACGATAAATACTGCTATTA-TGATTAAACGTATGTATCTTATTTATTTAAA
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GA
AA
>par-6 17539357 17541033|22108 chrX 17539865 17541424 scaffold_36 697480 699003 + -4004|0 1278
TTGCACGTTTTTGAATGCAGTCTCTTGTTTTTATCTTTTTTCCTGGCATATATATATATGTGTATTTAAATTTGTAAGATTTACGTCTTGTTATTATTCTTGCTTGTTGTATTAGACTAGAGTGAGACAGCTAGAG-GAGAGAGTGAAATAGAGAGAGGGCATCAAATGCTGAAGGCAGATCAATTTATTTAA-----------------CTTAACCATTTGAAACGGC--------AATAATTGTA----------------------ACAAAATCACATATACGAGCACGAATA---ATTTATAAAAAAAAAAAACATTCCATTTTATGTACTGTGACAA----GTCGGAAAAGCCTAACAAAATTATATTTCCTGATT---TGTAAGCCTTGTTTTTAATTTGAGCCGATCATTTTGCGTATATCTGCTATGTTTTGTTT---AGCTCAA--------TTTCTTATTTTTTCGGCATTACTCATTATATCT-GTTTATTTTAAAAACCATTTGTAAT----TTTTAACTTTTGTTTTTTCGTCATTGTGTCCAATACTCGTCCAAGTTCTTTGTTGTCATTGTCATCACTTAGAGTTATGGAGAAAGGATAGAAAAACGAGGAGATAAAGTTAACAAAACGTTAAGATACAAACGAAACACCAACAGCGCCTTCGCCTTCA-AGAGAGCAATT--------CGATACTTTTTATATA------------TATACAAGAGAATATATAAACGAATACA-ATCTATGT-TATGTACGTACCCCTGTACACACAATTGAATT-----GAAGTCTGTGTATTCGCTTTAGTAAAATTGAGAAAACGCCACTCACGGCAGATGGGATGCAATGCGATCTGCTCGACTTGAAGTTAACAATATTAATATTTATGGGTCGCAAC--GGGCATAACTAACCCCATACGAACGTGTACCCTGGGTAG---ATAGC--AAGATCTAGGATAGACAGCAGCGAATCTGAAACTATAACTAAATGCGTATCGCCGCCCAACCACTCCCCTCATATACCCATTTCACATATACCCTTGCATTATCGAGAAATCTGAACTTACATCGAACAAAAGTCGCCAGAATATCCCGATTTCCAAGCAAACGCATGTATATATATATATATACAAAAGCTAATGTGTATTCCCGCTAAGCAACTGAAAAGACCGAAAAGCAAATCACGAAAGAAAACCTTATATTTTGATGTATGTATTATTATTTTTTAATAAA-CCTAAGAGAACTTGTAACCG
TTTCCAGTTCCCAGGCATATTGTTTATTTTTTAAATTAATTTTTCACACATACATGCACACACATACAGATAT-----------------TCCTTGTTAGAGTGAGCAGGAATATAGAAGAGCGAGCGAAAGAGAGAGAGGGAGGGAGAGAGAGAGAGAGAGCGAGAGGCTGCTTTCAGTTGTAATTGTTTAATTGCAATGCGAGCCACGCCCACGCCTTAGACACGCCTCAAACTTAAACATTGCATTCCATTTATGTACTTTGCGGCACACACACACACGCACACCCACCCACACACACACACACAACAATTAAACATT---TTGTATGTACTT--ACAACCTTAGCTAAAAATTTAAGCAAAA--ATGTTTGTTTGTTCCGTCTAATTTCAATTTATATATATATACAATTTTTTTTTTTAAATATGTT-TGTAACGTGTGCGAGCTTAAGAAAAGTGTTACTTAATATTCT--TAATATATATTATATTTTATTTTATTTAATATTTTATTGTATTCCGCTTTTAAACTGTGTTTTCTT-TTGTTGT-CCCAAT-------CAAGTTTTGTGTT--TATTTTTTTGTATTTGTATTTTGTACG-----TCTAAAGTTGAGAA-------TTAAGAGAAAAACAAAAAAAAAAAAGAACACCAACAGCGCCTTTAAAAAAAGAAAGAACAATTAGCAAACGCATAACGTTTTATACGATATACCTAGACTATACTATACTATACATACATACACACACACATATATATATATATATATATATATATATATATTTATATATTATAGATGTTTTTATACACGTTTCTATGCAA---AGTATATATATCTCTATATATATATAA-ACAATTAAAACTGC-AGACTTGAAGTTAACAAAAAACACATATGAAAGACATATTTTAGACATATATACACACACACACACACACACACCGAATAACCTATACCCTATACTCTAAAAAAG-CAGCAGCTAAGC-------ATTGTTAAA-------------------GCGACGCGTATATA---ATTTAACTAATAC---------------------------AAATCGAACAACTATTA--AGATTATGCTAA-----AAAGAAAGACA-----------------ACAACAGC--------------------------AAGAAGAAGAAGAGAACAACATCTAAGAACAATTAATATTATTGTGCATGTATT-------TTGAATAAATCCTTAGTGAACTTTTTAGTG
>CG32560 17585190 17585632|22168 chrX 17584487 17585657 scaffold_37 645619 646850 + 36330|740 1330
GCGGATGGGGGGCAG--AGAGGAAG-------GGCAGAGATGGAAGGAGACTAAG-------------GAGGATTAGGAGGTGACCGCGACC-GAACCCGAA---------ACCGAAACCGATACCTAG-CATACCTAGCATACTGACGGTGGCATCTTTGTTGCGCTGGACACCGTCGCGGTCCCGTCTTAGAGATACCTTTTTGTTTA-----TTTTTTTTTTTAGATATTTTTTTTG------TATGCTACATAAATTATA------------------------ATATATATAC---------------TACATGTTTA-------ATATATAACTATGCATA-----------ACATACATACAT-------------ACATTATACATAATTTCTCAATCTATGTTTAAAACCAACAAATTGTGAAAACGCTAAACGCAGCTGCAAAGGCAGCAAGATAAACCCCAGAAGATC-----------------------------GGAGCATGGAA----GTGAAGAAGAAC-CAGAACAAGTTAAGATAATGAATAAAATTATAACCAAAGTTAGACAAAAATGCAC
GCGGTTGGAGCGGAGCCGGCGGAAGCAGGCGCGACAGAAGCGGCAAGCGGTCAGGGTTGAGGTTGCATGTAGATTAGCTACAGCCTGCACCCAGCACATGGATACACACACACACACACACACACACAGACACACATAGAA-GTTGAAGCTGCCGCCGTTGTCGTCGTGTAATTTTTTTTCGTCAGATT---AAGATACATTTTTGTTTAAAAACCTTTTTTTTTGCGCCAATTTTTTTTTAATGCTATGCTATATAAATTATACTACATGTTTAATATAATACATACATATATATATATGTATGCATATATATATATATTTATATATATATATATATATATGTATATATATTTATATATATATATACATAAATAATACATACATATTATACATAATTTCTCAAGCTATGTTTAAACAAAATGATGTACAACAA----AAACGCAACTGTTGCTGCAGCAGCGGCAACGGCAGAAGATTGTAAAAGTTAATATAAAAAATAAACAAAAGAAGCAGAGAACAGGACGAAGAAGTGTGCAGAACAAGTTAAGTTAATGAATAAAATTATAACCAAAGTTAGACAA--------
>unc-4 17611780 17614820|22207 chrX 17611011 17612932 scaffold_37 505571 507584 - 23980|824 2247
GGCAACCACGC------------GATGGCCAC-GATCCGG--CCGAATCCCCTCGAGACCT-------------------CTTTGATTTCCGCGTTC-------------------------CTAGAA--TGTTTTGCTCAA-------------------CTTATTTCCACGTC--TCCCACTCTAAGTTTCCCCATTTGTATG-TATCTTCGGTTCAGAGCTTAAATAT--TCCCTAAGTGATTTATTT----------------ATTCAAATGTAATGTGTAGTGCATTT-------TTTTTTAAATTTTTTTTTTAATTTTTTTTATCGT---------------AGACCTTGTTCC----CCGAG---AGAGACTAAAT-TAGTGTTGTAAATGAATTTATT---ATTTGTACTGCGTATATATACTATAAATAATCT--------------TTTTTTTTGGAGTGGCTGCTGCCCA----------AAGCAATGCTTGAAATA--------TGAATAATAT-------AATTATG---------TAATAGAAGTCTATTGACTAAGGACATTTTTTTTCAAAGTGTGA-------ATGCGTGTGAATGTGTGTGCTGTGTGTGTG------------TGTGTGCTATGTAAGAGAGCCTGTGTAAAAATGT-------------------------AATTTAATT-----TAGCAAAACAAG-----AGAAAACCAATTGACGATG-GGAAACACAAAGAATTGCATAGAAATCCACGAGTTAAGTAAGCGAATTTTTTTTTTGTGTCGAAAAAAGCAGGCTAGAATATTACAAATATGAG--AGAACCCACACAATATTACATAT---AGACATGCAAAGAACGGCGAAATGGCTGCTAAAAAT-TATATTGTATCTAAAAACTGATTGTCAAACAAGAATAAAATGCGAATCTGTAAAGAGAGAAAAACCACATAAACAACAAATTACGATTATTATTTACCCATTTTCGTTTCGAGTCGAGCTTAACCACAATAAACAAAACACACAAAATAAAAACTGCGCAAGCCCCGAAAGGCCCCTCTGAAAATTACCCAATTCCCAATGAAATGGAATTCAATAAATGGCAATTTAAATGGCATCAAAAACACACACTTAAATCTGATGTTTGAAAAGTGTTTTCCTTGAGCAATGGCGTGCAAATCCGAGCGAGTGCGCCAAGTGGTTGCAAAGGATCTCCCAATGGCACGGACATCATCTTTATACGGCCCGTTAATA----TTATGGACCTCCAACATTAAGAAATAT------ATCGATGGAATTGATATCAGCTTGAAATACATCAATGGAATGGGATTATGGT------------------TAAATGCAGCTGCTAAAAGAGTCCATTTCTCAT
GGCAGTCCAGCTCGTCAAATACAGTTGGATACTGATCTGGATCTGAACTGGGTCGGAGTCTGGCTCTGGACTGGGTCTGGGTCTGGTGTTTGGGCTCGCTTCAACCTAACCCGAAAGGTCTGCTGGGAGCTGTTTGGCTCAGGGTTGGGTTGTCTTTAACTATAATTTCCTTGTCATTTGAATTATGAGTTCCTAAATGTTTTTGCTCATTTCGTGTTTGTGTTTTTTTTTTCTCTCTCTTTGTTTTCTTTTCGGCTCTTATCCTTAATCTAAATATAATCTATCGT-CATTTAAAAGGGTTCTCTATGACTTTTTCCCACTGGCTTTTACTATTAGCTTATATTTTTCACACATTATTCCAGTTCTGGGCTCCGAGCTTAAATCTAGCTAAGTGATTTTATTTATTCCAGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAATGTTCCAAGAGAGACTAAAATTAGCTTCGTAGTG--CGCAGTTTATATTATTTTTAAGATATGCTTAAAACATTTTTTTTTAAACAATTTTTTTCCCAGTTTTGTCGTGTGGCTAAGCAATGCTTATAAGAAATGGTAATATTAACGATAAATATGATATATATATATATATAAATATATATATAATAAATATGAGAATAAGTTTTTTTTTGCTGCCTGAGTGTGTGTGTGTGTGAATGTGCATGTGCGCGTGCGTGTCTGTAAAAATGTAATTAAAACTAGCAAAAAAATAAAACAAAAAACCGAAAAACGATGAAGAAATATGAGTAAATTTTTTTTTGTCC------TGTTCAAACGACTTTGCTGTAAAAATCAACAGAAAGTGCGCAGAAAGTGAACAAGAAGAAGCAGTACATATAAAATATAACACATATGAGACACACAGAATATTAAAAATAGAATGCAAAGTACATATATTGTATTTAAAAATAAAT----AAACAAAAATATTGTCCAA-----CAAAAATAAAAAAAAAACAAAAACA------------TATTGTAAAAACA---------------------AGCAAAAACAAAAAAAA---ACGACACTAAAATAATGTTTTTTTTTTTGTGGTCATATAAAATTGGCGAAGAATTCAATAAAATAAAATGAAAACAATA-----TAAAACGGCATGAAAAATACGCA--TAAA--TGAAGC---AAACGTGTTTTTTTTTATCGG--------------AAGCGAATGTGCA--------GTTAATGGACTCGCG--------------GTTTTTATGCAGCGTATTAAAAATCGGTTTGTCATTTTGGCACATAAAAATATGGCATAAACAAATCAATTGACAGCTGTAAAAAATACA--AATAGAACACGAGAAAAATTCTGCGATGGCGAACCAATAGATGCACATGATATATGATTCCTACTCTCAT
>unc-4 17611780 17614820|22208 chrX 17612933 17613435 scaffold_9 1352599 1353078 + -2120|0 538
GGAAAGCTCTGAGGAAATTATATTGTTAACATGAGCATACTCA----TGTCTTTGGTTTT-TAAAGATACATTTAAATCTGAAGATACATATTGTATTCAGAGAATTACAGGTTTCCGATTTGGTTCGTTTAATGTTAAATATCTACTCTTTTGAAGTATGTAAACCTTTGCGAATAGGCAATTCTTTTGATAATAGGATTCAAACATAATTGCAGATCTCAAATGCTTTACTT---TTCAAGTTTCGCCAGGAATCGTATTGAAATGTACAACAGAACAGTAATGATTTCATCCCTTACTTATAGATTCGAGTTACCTGATCAATTACAGACTGACCAAAAACCAAAGCACTTGAAATTGGAACAAGTTTTCGAGTTGAGCCCATTAATCAGGCTGCAACTCA--------GGCCTCAAAT--CGGTCGGTGTGTTCATAACCGATTTGCGGTTGGGCAGAGGCATCG----------GTTTAAT-----TTTTTTTTAGGTTTTTTTTTTTTTTCTTAT---GAGAGGAAGAAGAGA
TAATTTTACGGTTGAAGCTTTGATTTAAATGTAAA-ATATCCCGCCCTATCGATAGTTTTGTAATGCTCAACTTGTATGCATCGATAAAT-TCTTATCGATATAACTA----TTTCACAGT--ACTTGCCCGACGCTGAAC--CTGCTTATTTGCGCCGTTTGCGATAGTGTTGTTATGCAGCCCTCTTA----------TTAAAGACATTGACGGAGCCCTTTTGCTGCTGTTGAATTTAAATTTC------AACCTTACTGGACCTCTCGACAGAACGTGAATA---------------TATAGATATAAGCAACTC---CCATTATATTC-GACTAAAAATGTTATCACTTTTGATT----------TTGTACTTGTGTC-ATAAAACAAACAATGGCATATATTGGCTGGTATAAAATAATGCTCGCTGTG--AATAGCATAACCGCAAATGG-TAATGTTATTGTCGCTGTTATGTTAAATAACATTTCTGTTTGGCATTCGTTCTTTTTTTTCATAAAGAAAAGAAGAAGAGA
>unc-4 17611780 17614820|22209 chrX 17613588 17614313 scaffold_37 509161 509993 - 13512|0 925
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CTGCTGCTGCACAGCGTGACGTCGACGTCGACGTCAACG-----TTGACTGCGGCC-----------GCTTTCATGGGAATTTGTGG------AGTTCATTTCATGGCAATTTTATTGCTTATTAATTTTTCAGTGTTCGCGCTTTGATTGTTGTTGTTGTTG-----TTGTTGTTGTTGCTGCT-----------------GATGCTGCTGATGCTGCTGCTGCATGCTGTTAATGATTCCGCGTATTGCTGCCACACACAACCCTCTCCCCGCCTTCCCACCTGCTCCACACACTGTTTGCGTCTGTCGATGCTGCCCCTGTTGATATGATTATTACGTTTATGTATTTTAATAATTGTGCATGATTTGAAAGATTTTCACTCCCAATGTGTGTGCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGAGTGTGTGTGTGCTGCCCGATCTTCAGTTTGA-GCTCCGATCAAGCTCCACTCCATGCGATCCTCCAGTTTGGTTTCGGGTCTTTTTGTGGTCGTGTGCCCCCGTCGCGCGTCCATAACTT---------------------------------TTGTGGCTCAATTACTTTTCGATGCAAATCAAATTGGTCGCCTTTTAACTATTCTTCACACGTTTTTCATTAAATATTTTCCACCTT--AAACTCTTTGGCATGCAACAAACAAGAAAGAAAACAAAAATACTCTGCTTTGCCTCA----TAATTTTACGGATTCACCTTTTCCTCGATCTGAATCTGCTTTGCCCGTGTATCTGAGCATTGTAAATGAG-TTTTTATCGAGCTGAATAGCTATTTTTGTTTGCCGCATTTTTTTTTTTTTTTGTTTTGTTCATGATTTGTTGTTTATTGGCCTCATAGCTGACGGCTCGGGCAC--ACTCGACA------GATCCGATGTGC
>unc-4 17611780 17614820|22210 chrX 17614601 17614763 scaffold_37 510577 510732 - 9491|0 164
ATGATGATCACCCTACGTTATAGCGCTTAATCGAAATCAATAAAGTTATTAAAGCGACGCTTTTAAGTTTTCTGTAACAGATTCTTAAGCCAACAACAAGGGGCCCCAAACAAAGGTGC--CCACAATGGCGATTAGCGCTCCATCGTAAAGCGGCCAAACAGCA
ATGCTGTACACCCTACGTTATAGCGCTTAATCGAAATCAATAAAGTTATTAAAACGACGCTTTTAAGTTTTCTGTAACAGATTCTTAAGCCAACAA---------CTGAATAACAGCGCAGCAACAATGCGGATTAACGCTTCATCATAAACAGCAACAACAGCA
>OdsH 17647866 17647925|22257 chrX 17647166 17647895 scaffold_37 551826 552567 - 17528|750 780
CGAATATCGA-ATGTTGTACTATAATTCTAC
CACCCATCCAGAAGCAATACAACAACTATAC
>CG6398 17675037 17675534|22303 chrX 17674070 17675903 scaffold_734 3961 5993 - 59371|1011 1686
AGGCACACCCGAAGGGGCCAGC----------------------------------------------------CAGCTTCAGCCAG-----CAGCTGCAATTGAGTTATAGAGACATAGAGATCACAAATCA-----------------------TGACCAGGAGGGAACCTGGTAGCCCTCCCCAGTAAT-------------CAAAATAGAGCAAG-------------CGCTAACGAAATCTTA------------AAACGCATACATTCTGA--CAATGAA----AATATTACTTA-------AAGCATCAATTTTTTTTTTCGACAAGAATCTAGTTTGTAGTCTATATAGAGCTATATAGTATATATATATATGCTTGTATGTATAACTGATCGTGGGACTTGAGTCAAAGTTGCGTC-CAAGTTTTTGGTGCGCGAATTGTTTGCGCGTTATTTTGCAAATATCTAAGAGAGACGAATGGAT---------------GGATGGTTTTATATGTTGACCACGGCGAGATGGCG-ATTTAAAGACGGAACAATAAAGAGTTAATTTATTGTAGCACGTAACGTACATGTAGCGTAT-----------------CTAAAATAATAATAAAGA-------------AATATGTGTATGTATCTAAGCTAAAA
ACGAACTGCATAACGAATCAGCGAATGAAAGCGGAATGAAAAACAAGAAACAGCAGCAACAACAACAACAGCAACAACTACAGCAAAACAATCAAATGAAACCGCTTGAAAACGCTTTTGAAATCACAAATCGAAATGTGGGATTAGGTTGAATTTCGCCCAGTTTCAAATCTGTCAGCCTTAACTGTAAATGGCAAAGAGTTTGCGAAGAAAGGCTCGATTCTTTTTTTTTCGCTATCTAAAGCTAAACATATTTACACAGATGCATACATACGCATGTAATACAATTCAATATAACATATATATATATATACAAATTTTTTTTTT--ACATAAATTTAGTTTGTAGGTTCTATCTATTTGTATAGAA----------------------------ATCGTGGGTCTTCAGTCAATA-TGCGTCGAAAGTATTTGGTGCGCAA----TTTTCGCAAAAACACAAAAAGACAAAAAAAAGAAAAATAAATAAAATAAATAGAGAAAAATAATGCAAAATGAAAAGTACTTACAGCAGGCGAATATAAAGAGAGAACAATAAAGATTTAATTTATTGTAGCATGTAACGTACATGTAGCTTATAATTATATATATATATACATACATAATAATAATTACAATGATAATGATAATAATAATGTGTATCTAAGCATAAA
>e(y)1 17677097 17677288|22304 chrX 17676161 17677139 scaffold_3 1663884 1664761 + 38379|946 989
CGAAACGACATCATTTACCT-TAAATTAATATTCTTAAACCAGA
CGAACTGAGAATATATATGTCTAAACTAATGTACATTAAGCATA
>CG6506 17685679 17685827|22313 chrX 17685822 17686921 scaffold_46 772864 773947 - 13435|0 5
TTATTA
TTACAA
>CG6769 17696562 17696639|22322 chrX 17692709 17696571 scaffold_46 779424 783279 - 148349|4103 4112
TCATCGCTTG
TCATAGATCG
>CG6769 17696562 17696639|22323 chrX 17696587 17697330 scaffold_46 783306 783942 - 5359|0 52
GCTATTGGCCTCCCCCCTACTTGTACAATAAAAAGTTTTTGAGTTTTGCTTAA
GCAATTGTTTTTTTTTTTTTTTTT----------GTTTTTTTGTTGCTTTTAA
>CG6788 17723281 17723341|22366 chrX 17722597 17723304 scaffold_7 5396994 5397663 + 6668|691 714
CTATTACAGTAAGAATAAAAAAAT
TTGCTTCAATAAAAACTTAAAAAT
>GS 17726401 17726546|22372 chrX 17726266 17726467 scaffold_58 235650 235828 - 1734|137 203
AGTTTTCATTTGCTGACGCTGCTGTCGCCTGTCGCCCGTTGCCTCCTGCCTGCCTGCTCTGCTCCTG
---TTTCATTTTCTGCTGCTGCTGTTGTGTGTTTCTCTTTGCTCGCTACCT------TCTGCCCCCG
>GS 17726401 17726546|22373 chrX 17726468 17726524 scaffold_25 698729 698785 + 1736|0 56
CCTCCTGGCATCCCGCATCCTGCATCCTGGCACCTGCCAACCGACACCTGCTCCTCC
CCTCCTCGTCCAGCGCAAACCGCCCTCCGCCTACCGCCTACCGCCGCCTGCTCGTCC
>CG6842 17744117 17744661|22390 chrX 17742513 17744449 scaffold_37 209113 211100 - 94126|1609 2080
ACACGAACCCCGCCAGATATCGTCAGCA-------------CCACCAGCTAATTC-TAATTGTTGCCTATTGCATAAATT--CAAACACGTTTTACTTCTGGCTCT------------CCTTAAACAT-----TTTTTTTATTTTATATATATATATAATGTATACATACGATATATGGTTAAAATTTAATTCAAATTTG-TCGTTCGATTGCAAC--------------------CGGAGATGAAGGACATGCA---GTGAGC---------------------GTGAAGCGGGTGGATC-----------------TGTGG--------------------------ATTGTTGTAATCACAA----------------AGTCAATGTA--TTTTTGTACTCTTAATGTTAAGCGACGGAAGAAACCCGATATCCAGCCTGAAGTTTGAAACCTAATGTAATATGAGTGT
GCCGCAAAAGATAATGATACCGCCGCCATTAAGTCTACCACCCATCAGCTAATTCTTAATTGTTGCCTATTGCATAAAACGATAAACACG-----CCCCTGGCTCTATGGATCCACACACTCACACACACACACCCACATACACTATATATATATATAATA-----ATATATTATATATATAGAATTTTTTTCTCTTCTGCTTTTTCTTTTACCACAAATTGTACACACACACACACACACACAAACGCTATGCATATGTGGGCTGCAGATCGTTCGTCTATATGGTTAAAATAGTTTATCAAGTTTTGCCGCCCCCTTGTGGCGGCTGCCGCCGCTGCTGCTGCTGCTGCTGTTGTAATCACGAAATGAAGAGAAAAAGTAGTCGATGTATTTTTTTATACACTTAATGTTAAGCTA------AAACCCGAAA--------------TGAAACCAATTGTAATTTATGCGT
>CG6847 17757649 17758103|22405 chrX 17756144 17757928 scaffold_37 231447 233197 - 56212|1564 1898
TATTCAGACATGCAGCTGGCT--AAGCTGTCCCGCCATCGGGGATGAACACTTTGTGATATGCACACCAGATCGTGGCTATGGCACGGCTC--------------CAGAACCCCC---------------ATCCCATTTCGATCCTAATCCCAATTCAGATCACTCATACGCATTACACCCA--------TCCTCACACTGTAAATATTCGAACGAGCAAGCAAAGTTACATAGACAATGAAATGGAATTTCAAATCGTTGGATGTTGCATCGTAGAATAAGA----------TATTGAACGTAAGAATTTA------AATGTGAGAAATTTAGT
GGTTTCTGGGCGCTAGGGGTCGGGAGATGGGACGCAGCTATAAGTGAACACTATGTGATATGATAAACAGAGAGCAGCTCTGCTGCAGCGCACAGTGGGGCTGCTCAGCGTTTTCGTCGAGTAAAAAAATGTCCTGGCCAGAACTCAAACGCATTTTGGGGC-CCCAGACTCGTCGTACCAAAAAGCTTCACCTTGCACTGTAAATA---------------AAAGTTAAATGGAATTTGAATTGAATTCGCACAACAT----CGTTTCGCTGTTGACAAAGAGTTCTCTATGCATTAAGTTTAGGCGTTAAGTTTATAATGTGAACAATTAAAT
>CG6847 17757649 17758103|22406 chrX 17757929 17758038 scaffold_34 868995 869121 + -919|0 130
TGGTAAGATAAA----AGC-----CTACGGTCGA----GGGTCTCGACCTTAA-----GATATCAGAATATAATGGTTGTATTTTAATTTTTTCGGG---GCTATTATATTGCCTTCTTAAGTGGGTAAGC
TGTCAAGTCAAACTAGAGCTCCAACCATGAACGAAGTCAGTTCTCATTCAAAATCGGGGAAGTTTGAACCAAGTTATGATAATTTCAAATTTTGGAACACCCCACAAAAATACTTTTTTA----GACAAGT
>CG6847 17757649 17758103|22407 chrX 17758039 17758235 scaffold_34 869444 869627 + 109|0 71
TATATATCCACATACATGTACCTTATTTTCCAAATAAATATTTAAATTAATATG-------TGTAACCGAAA
TATATATATACATATATATAATATATAT---ATATAAATATATATATTATTATGGTATGCATGTATATAGAA
>CG6867 17862097 17862207|22553 chrX 17860156 17862097 scaffold_37 377884 379880 - 82683|2037 2037
G
G
>Dhc16F 17912333 17912409|22605 chrX 17905471 17915353 scaffold_37 443666 453731 - 448307|7029 7126
GTCTAGATACAAATTG----GAACTTATTGTTTTACTTTTTATGCTGCATACTTAAA-------------GCCGTCTTTATTTCGT----TTCATGTT
CGTTTGATGCGGGATACTATACATATATTTATGTATATATTCATCTATATACATATACATATATATATTAGGCGTCTTTATTTCGTACAATTCGTTTC
>dik 17921520 17922358|22614 chrX 17919210 17921616 scaffold_37 457148 459403 - 70596|2417 2513
GACAGGAGCCTGGCCTGGGGCTGGTGCCAGCTAATGGCCATGCATCAGGCAAAGAGGCAGGTCCGCGACGCTAGCCTCAAGCTGCAGTGCGTCTGAA
GACAGGAGCTTGGCCTGGGGCTGGCGCCAGTTAATGGCACTGCATCGGGC-----GGCGCTGCTGTGGCAGCAG-TGGGAGCGGCATAGCGTTTGGA
>dik 17921520 17922358|22615 chrX 17921617 17922148 scaffold_24 914437 914964 - -2034|0 580
GGAGCTGCTCCTCCTTACTCGCCACTCCTTTCATTTCGCCAGACTGTAAATTAGCCACGCTATTCGACAC-GTACACGTA--------GCCTCTAGTGTCCGCAATCCAAGTTGTGGACGTTTTGGGAAGATGCGCTCATGGTGGCGGAAAATGTTTTGCATAAGTTTTCCTCGAGTTTTGGCATTCGTTTTCCCCAAATCGAACGCCACTTTTGAGTCGT------TTTCGACTAGCTTCCA-AACCCGTATTCTTATCTTCGTCACCAGACTGTACATTAACAA-------------------AGATACATTAGCTCAT-AGAATGTAGTGTTCAAGATTAAAGTG------AAATTAATTATTTAGATAAGATCTTCAAGTGGCGGAGAGTAGCGTTTGCGTA-------TTTTAAACTGTTCTTTTACAAAATCATAATTTCCCTTTCCTTGCTTAGTAACGTATTCCGTATTCTGTAAGCCTACAGTTTTTTGCCAATTTGTTTGTAATTGCCTGAAAATTAAATGGATATCCGTAGATTTTACATGCTAAATGCTAAATTTGATTTTGTGTACAT
GAAACGG-------------GCCATACAGTTCGGCTC-TCGGATTGCCGACAAGCGGCAGCAGGCGGCACAGCAATCGGACTATTTGCGCTTCGAGTCCTTGCAACTGAATTAATGTACATAGAGTTAAGAACTG---------------AATGCCATCCATGAGAAATTC---GTTTTTAAAATACATTTT-----ATTAGAATGCCATTTACAAATCACAAACTGTGTCAACTAACTTACATAACTAGCA--CTTAAATCCGTTTTAAAGCTGTTCTCAAGCAATATTCGTTGCATTCTGATTGGTTACGATTGCATATAAAAATGTTAACTGCCCGCTAAATTTGTTTTGTATATCATTTAAATGGGCTGGCTATTCAAAC-GCTAAGGGCA--CTCGGCATAAAGCTACTTGTAAACATTTGTCATGC-ATGTTATAAATCTTGTTGTATTGCTT----ATGTTAACTTGATGACATAA-CTGTTACTGTTGTGCCTGTTAAACTTTACATGATTGATAACT-----GTTACCCGTATGTTATGACATTTAGTTGCTAAATGTGTTCGTGTGTTCGT
>scu 17926648 17926792|22620 chrX 17925876 17926803 scaffold_37 463373 464315 - 56958|772 935
A------------TCCGGCTGAGCACTGTCTTGGACCTGTGGAAGTGGCTCGATCAGTTTGCATTT-----ATCTATTGTCTAGTGGTTAAGCTGAAAAGTTTTATTATCTGTCCCGAAATTATGTAATAATTGCTATTAAACACACAATG--TCACATTTCAA
ACGGAAAATGGATTGTACTCGAGATCAGTTTTGCATTTAACGGAGC-GCTTGCTGTGTGTGTGTTTTATCCTTTTTCTCTCTAGTACATAAGCTCAAAATTTTTGTT-TTTGTATTCAA--TTTGTAGTTTTACAGAATAAAAATGCTGGGATTTGAATTTTAA
>RhoGAP16F 17930815 17931354|22622 chrX 17929176 17931465 scaffold_26 1745525 1747818 - 70909|1736 2327
GT---GCGAGCCCCGCT-------------------------------GAGGAGGAACAGCCCCAGTCTCCCAGGTGATGGTCCATTTGGTGTCCGGGCGCCCGCCGCTACTGTTACCCACAAAACCCGAATCCCAGCCGCTTACGTCTCATCCAAACCGCTCACCTACTGTGCCGTTGTGTCGAACGC-TTTGCTAACCACTCGAAATCCGAAATCCTCAACCCGAAACCGAACACCCCACTGTACCTGCCACACCTCTATACCCATTCCCGATTCGCTCCCGAATCTGTTTCCAATCCCGATCACATCGTCT----ACAGATGCACCGCCGATCGCCGC------CGCCTGAGCATGCGCAACCTAAAGAAGACTCTGTCGCAGCCGGACCTGCTCTTTCACAATCTATTCTGAGCTGGCCCAATGACATCCAATGGATC--CTTCATCCCAGAGAGAGCACTGTACATATATGGAATGACTTTACGCCCCGC--TAGCAATTGTGTCCTAAGATTACTTTTTATATTCTTACTTTATCAACTAACTTT---TGTACTTATGTTTACTAATATAAACACTAAAACTAATT
GTGGAGCGAGCGCCCCCCACCCCCACCCCCCTTCAATCACGCAAAAAAAAAAAAAAGAAGCTTTTGTACCTGTGGTGCTGGTATCATTGGTGTT----GGCTCGTAAAGATCGTTGTTT------CCCGGCTCTAAGATGCTTCCGATATGTATAAA------------------GTTGTCTCGAACTTGTTTGCTAATTATTC--ACTTCGAA-----CAATACCAAA---AATTCCCCAATG----------------AAATCAAATCCCAA-------CCGTATCCAATCCGTACTGCTCCCACATCATCTTCACACAGATGCACGGCCGATCGTCGACTGAAGCGTCTGAGTGTGCGCAACTTGAAGAAGACGCTTTCCCAACCGGATTTACTATTTCATAACTTATTCTGA--TAACGCGATGACA--CAAGAGCTTAACGTGACCCGATA-----CGCTATACGTAT-TAGGATTATTGTACATATTGCATTAACGA------------------TTTTATA----TACTGTACATACTACCTATGAATACACTTATGCATAAATATTCTGATATTTGA--TAATC
>Taf8 17937156 17937421|22630 chrX 17935966 17937232 scaffold_26 1755029 1756301 - 56943|1239 1315
GAGTAGCAGGCGTTTTTAATTATGGTTTGAAAATGTAAACACTCCTGTTTTCTTTAAATTTAAAAAATTAAAAAATT
-------------TTATAATTAT-------AAATAGATGCATTGTAATTGTGTATAGTTTTTTAAAAAAAAAATATT
>CG7135 17939095 17939330|22631 chrX 17937447 17939149 scaffold_14 2782199 2783851 - 64264|1727 1784
GCGGTATATACATAGTTCGTAAACACATTTTTTTTTTGTCTATTT---TCAAATAAAT
GCAGTG-AGAAACAATT-----GCACATTGTTGCTCCAACGGTTCATACCGAATAAAT
>CG7135 17939095 17939330|22632 chrX 17939162 17939474 scaffold_14 2787333 2787658 - -1321|0 185
GTTGAATTTGTACATGTTGCAAA-GCATGTTCCAATCAAACCAAAACCCATTCTATTATAAACAAAAAAGCACGATGT----AGATTAGTGTCGTGACTATCAGATACCCCTTAAAAATGCACGATAATACCATTACAATACAATATGC------------AATAAACTTTTTGGCATACATTTTC
GCTTAGTTTACAGATATTGCACATATATTTACACATTAAAATAAAGT--------TTTTAAAGAATTACGCGCACTTTTCACTGACTTGTTGCTTTACTTTCGCATTAACCGTTGCAATG--CGGCGTTGCCA-GACTGTCCGAAATGTCTAAGCATGAGGAGCATTCTGTTAACTACGCAATGTT
>Frq 18035397 18035550|22789 chrX 18035214 18036388 scaffold_5 2156556 2157896 - 18438|183 336
CCGCGGGACCTGTAGTCGTGCGAAGGAGGGGTGGGAAGGGAGCGATAGTGACGATGATGGGATGGAACGACGAATCAAGGATCAAAGGTCGCCCCACAAGCACGTCCACACCACGCCCGTGTACCATATGCCATTTGACCTTTTGGGGGGGGGG
CCGCAAGAATTGTAATTGCGC------------TTAAATTCGAGATTGTCACA-----GAGTTGGAAGCATGAAGCAAAGA------------CAACGAATTCGTGCACAATA---------AATAAATATGGTTTGATATAATGGTTAAGTAA
>Him 18044445 18044681|22797 chrX 18044094 18046200 scaffold_5 2171382 2173267 - 10792|384 624
CCGGATTCCCCCAAAACAAGGAGAAAAAGAGGGAGATAGCTAGAAAGTTAGAAAGAGAGAGAGAGAGAAATCCGGGAACTGAGACTAGTCTAAGGGTTAGCTTTAAG-GACGCATTCGGTATTATTCCTGCTGCTGTGTGATGATCGCGCTGCTCTTCCATTTTCCCACGCCTCTGCAAACCGACTTTATTTTTTTTCCTGTTAA---TAAATAGTTAAGTAATAAAGATTTTTTTTGAAA
TCGGCC----------------------------------------------------------------------AACTAAAGATTGCCCAC-AGTTATTTGTAGGCAATGCTCACTGTA-TATTCCT-CTGCCGTGTGATGTTCACGTTGCTCTTCCATTTTCTAA-----TCACAAATTACTTTTATTCATTTTTTTTTTAAATTTTTTTGCTTAGATAATAAATTTTTTTACTGGAA
>CG6106 18195502 18195899|22974 chrX 18195162 18195503 scaffold_784 5562 5904 - 16927|343 344
GG
AG
>CG6179 18215171 18215426|22999 chrX 18214080 18215183 scaffold_8 3732664 3733772 + 50463|1120 1132
GACGAATTTATAT
ATTGACTATGAAT
>Tsf1 18224219 18224281|23004 chrX 18222470 18224293 scaffold_19 2036655 2038501 + 86770|1804 1866
TCACATTTTATACTACTAGATCCCACTATCTGCATCAATAAAATTTAATTCGAATATAAACAG
TAAGTGGGCGTGGCATTTGCATCGGCAGCCCCCATTATTAA---------CGAATAGATATGC
>CG6290 18272089 18272173|23050 chrX 18270958 18272227 scaffold_19 2136306 2137637 + 4781|1301 1387
AATCACCGAGCTCCCTGACGACCACCATCGAGTGTATT--TTTTTTGTTTGTTTATAAGTGCAATAAAATCAACTGAAAACCGGAAA
AAGCTACTGGCGGCATGTAAGCCACTTAAAAATCAATTAGCTTCCTTTTTTTTTTTGAATACCA-AAAATATACCAAATA---GATA
>Aats-his 18354136 18354384|23147 chrX 18352666 18354405 scaffold_19 2242605 2244393 + 71721|1510 1794
GCTC--TTTTCACGACACT--GATATTAGCGACACTTAAACGCTCCCGCTCCTAATTTA------------TGAACCATCCAGCATCGAAGTATATGAATT---TTTTTTTCCTATTTGTACGTTTTGTATT--------CTTGGTGTCC---TGGCCGGAGGCG-CCGCGTGCTACTATGCT---TAGGTCTACAGTGTAACCATAGGAATAAGTGCGGACAACT-TATACCAAAA-TGAACACTAAAAAGAAACAAATAAACGCAGAAGCGACTCGCATTTAA
GGCCAATCCTCGCAACGTTTCGATATTACAACTATGCTGATGCTTTTTTTTTTTTTTTGTTTTTTTTTCTTTGTTCTGCCTAATTTATCAATGCATTCACTGTGTTTTTTTTTTATTTA-ACGTTTTGTATTAGCTCCCGTCTGCTGCGCCGTCGACCGGACACATCCAAGTGCTACTATATTATATGAACCTACCCTTTAGTTGTAGGAATAAGTTATAGCAAATGTATACCAAAACTGGAGACTACAAATAAAC-------TGCAAACGC-ATTCGCATTTAA
>Bx 18404874 18405653|23225 chrX 18404496 18405094 scaffold_1053 5936 6549 + 28195|420 652
AATAAAGCCCTGGGCATGGGTGCCGCTGGGGCTGTTGTGCCGGGATCTGGAGTCGGCGCTGGAGTTGGAGTTGGAGTTGGAGCGGCGAGTCAGCAATTCTA------CTCGGGCTTCGGGCTGCAGCATCAG------CACCAGCATCAGCAGCATCACCAACAGCAGCAGCAACAGCAACAGCTCATGGGATTGGGCCTAGGAATGGGCGGCGGTGGAGGAGTAGGAGGAGG
AATAAAGCCATGGGCATGAGCG--GCAGCGGCGGCGGCAGCGGCAGCGGCAGTT-------------------------------CTGGTCAGCAGTTCTATGGAGCTGCTGGCTTTGGGCTGCATCAGCAGCAACATCAACATCAACAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCTCATGAGCTTGGGTTTGGGCATAGGCATGGGCATGGGCATGGGCATGGG
>Bx 18404874 18405653|23226 chrX 18405101 18405693 scaffold_19 2307016 2307771 + 6139|0 741
AGGATCCGCCGGTGGACCAGGCGGAGGGGCAGGAGG-----AGGAGGAGGCGTTGGCAGCATCGGAAGCGGCTGCAAGCGCTACCAAAGAAAGTTTTACAACCGCAACTGAGGAAATCGACGGGCGAGAAAACGCTAGCGGAAAGGATGCAGA-------------------------------------------------------AATCCAGAATCGATATTCAAATC--------TTCGTTT-GCTTTGACTGAGTTCAAGTTTTATAGTTTTAAAGGCCTAGTTT-----------------AGTTAGCCTACAGAAAAGTACTTG----CTGAATTTGCAGACATTTT------------------------------TAGATCCT------------------------------------------AACATTTAAGAGACAA------TATGTTTACTTAGTTCTATTCGAGAATAACCGCCCCATTTGTTTTTAAAC--------TAGTTTTATTTTCGTTTCCACTACATACTGTACATATTTTCCTTGTAAACTGTTGACGTATTAGC---GGGATCCTTTTTTTTTTTTTACATACTCCATATAGATATATTCGTATTTATCTATGTATATGCATAAATA----------ATTTTATTTTCACGCTCGAAGCGTGCGGTGCCAAAAGAAATTCAAAGCAGTGCCAAAAAGTTAAAAAAAAAAAAAAATAA
AGAATTTGCTTGGG---CGGGTGGAGGGGGATGTGGTTTTCCGGTGGGAGCTTTGGCAGCAAGGGAAGCAGCTGCGGG-GTTAACAAAGGAATTTTT-CTATTGCAACT-----AATCGGCCCATGCGCAATTGCCCGCTACAAATATGCAAACGCATATATCGATATATATATATATGTATATTTATATATATATCAATATGTTTAAAAACAAAAAACTACGTTTAAACCATAAAATGTTCGTTTTGCTTTGACTGAGTTAAAGTTTTTTAGCTTTAGTTATTTAACTTCTTCTTTTTTTTTTTTAATTTAAAATATATATATATATATAAAAACAGAACCCGCAACTATTTTGACTCTGATTTACTGTTCCTCCAAGCTCTGTAAATACTTTGCGTGCAATTTTTGCGAGAAAAAAAAACAAAAAAAAACAAAACATACAAAAAAAAAACAAATTATGTGTATTAAATAACAATGTATAAGAAGAAAACTGTTAAATTTTAAATATGATGAATACTTTTTTTTTTTTTT-------------------TTTAACTTTTGTTTTGTTGATTTTTAAGCCCCAGCACCGCTTTCTATGCGCGATATACCATATGCATGCATAATTATATATACATATAGATATATATAAATATATATATATACTTTTTTTTGAACGCTCGAAGCGTGCGGTGCCAAAAT-AATTCAAAGCAGTGCCAAAA----AAAAAATAAAAAAAAAGA
>CG6540 18483298 18483427|23342 chrX 18481790 18483449 scaffold_5 4750314 4752035 - 29923|1638 1797
GAAGGGCTGATGGCAAGTCGGATGGATGGATAGATGGAGTGATGGAGTTTCCGGCTACTTATTTAATAATTCACTG--CCTACATCCAGCAT---------------------ACATA-------CATATACATACTTATTAAATGGAGATATATTAGCA
-------TGATCGTTGAATAGATTAATCAATAATAAAAATAAAAACCGATCCATTCGTTTGTCTAATTGTTCTTCGAAACCAGATTCAGCTTCAGACATTTTTAATCTTTGCAACATAAAATCCTAATGCATACATTTATAAAATATATATATAT-----
>fu 18494394 18495167|23347 chrX 18490643 18494607 scaffold_10 4561246 4565096 + 126376|3898 4141
CCGGCACTTT--------------------CTTTTATTGGCCTCAGGCGTTTT----------TATCCGAGCAGATCCTGAATGTTGCCCTGGAAGTAGTCGAGCAGTTCGTCGATGTAGTTCCCGAAGCGGTCGAAGTTGAGCAGGTAGTCCTCGCTGCAGTCCTGTTCGTACATCTCGTTTAGCTTGGACACATCCTTGTCGGAGAGGCCGCGTCTCTGGCCCAGCGAGGCGTACGGATCCT
GCAACTGCTTAGTCTTTATTAATAATTGTACTTGTATTTGTTTAATAAATCTTAATCCTTGTCTAGCCGAACAGACCTTCCAAATTGCCTTGAAAGTAGTCGAGCAGCTCGTCCAGATAGCTGCTAAAGCCATCAAAGCCCAAAAGGTAGCTACCATTACAGTCCTGCTCGTACATCTCGTTTAGTTTCGAAATATCCTTATCCGACAGGCCGCGCCGCTGGCCCAGTGAGGCATACGGATCCT
>fu 18494394 18495167|23348 chrX 18495041 18495168 scaffold_20 1861579 1861695 - 514|0 128
GTATGTCCATACAATAGTCCATTAATTCGCAGTATTA--CTATTGAATGTTAAACTGAACTCCTTTACAGTGTAAGCGATTTAAAATAATACTCAATTACATGAATAACTGGTAACCATTTGGGTTGGC
GTTTATCCACATCGAAGTCGGAGAATCCGTTGCGCTGACCCATTTTAG---AAGCACCATTCGATTGCTGTGT----GTTATAAAATAG-AATTGATTACATGA-----TGCTAAACATCTTGGTGTAC
>phm 18522089 18522161|23384 chrX 18520877 18522839 scaffold_10 4611491 4613409 + 42329|1218 1290
GTTGTGCATCCTGAGTGCATCTTATTGTATCCGATTTTTTTTTGTATCCCTTACAATTACATTATACTTTTTA
ATTTTG------GGCTACTTCTCTTTG-----AATTTTCATTTAT-----------TTGCATTTCATTTTCTT
>CG6891 18615132 18615282|23482 chrX 18614989 18616710 scaffold_48 24234 26189 - 37962|143 327
GCGG-----CCTCCAAGT-------TACTTTACATATACATTTTTTTT-TGCAACTCTT-AACTGCTTACCAAA--CTGCTCCTTTCTCTTTAATTATTATGAATTAATTTTATGAAATTTAAAA------ACTGTACATTT------------TATGAAATATTATACAAGCAATTGTAACATT
AGAGCCGCTCCTCACGGTGAATCAATAATCTACTTCTTAATTTTTTTTGTGCACCTCTTCAATTGCTGACTTAATCCTGCT-TTTTTTACTTAATTATTATGAATTAATTTTATGCGATCTTAAAATATTTACTGTACATTTTTATGTAATATGTAATAAATATTAAACAAGAAAC--AAACATT
>CG7053 18626492 18627452|23490 chrX 18625014 18626498 scaffold_128 22990 24428 - 46494|1540 1546
CGGGCTG
TTGGCTG
>CG7058 18644879 18645939|23498 chrX 18645910 18646148 scaffold_8 1599190 1599430 - 833|0 29
TATAAAAATGTACGTATGTAAGTAACACAC
TATCAAATGTTCTATATATAATACGTATAT
>Pvf1 18676248 18676838|23539 chrX 18675901 18676267 scaffold_5 1944238 1944621 + 5100|374 393
GGACAGTTGGTTCGCCACGG
GCGAGATT------CTACGG
>Pvf1 18676248 18676838|23540 chrX 18676346 18676993 scaffold_5 1944680 1945238 + -969|0 526
GTACTTTATAATATTTATAGTTATCGATTAAATGTAGGCTAAAACTTCAATATCCCTAAACTTAACACACAG---TATTTACCCCACTCTGCATCTGCGGCACAAGAAAAACTTTAAGTGGTTGCGCAGAAATCTCTGACGATTCGATATTTGCCTAAAAGTTTATGGTTGGCCAGTAAAAATCCACAGAGAAGTGTACTTTCAGATACATTTT-------CGAAGTATTTTAGACCTTTGGAGATTTCTGCA------CAAATCCTGTACATTACTTTTTATGAATTTGTTTATATAACTTTTTAAGCGCCTTTCACTTTGTAGCGGCTTTGTACACATTTGTTGATTTCCGTTTGTTTAAGTTTTAAGTCATCCAAA------AATAGTTGTCCACAATTTAAAGACTT-TCAATTATCCGCCGTACTTCAT--TTGTATGTAACTTTTTT---------TTTTTTTGTAAAAAAAATGTTAGATTTAAGTTTGCGTAAAGAAAATACAGACAATGTATTGAATT
GTACTTTATATTATTTATAA-------------------------------------------AACACATAGCTTTACTTATCTTA-TCTAGCTATACAGCCCGTTCATATATTTCAGTATTT------CATCTTTTGTTTTTTCTTTGTTTGTCCGTTAATTT------------TAAA---------AGCGATTTTCATTCAATTGCTTTTTTTCTCAATGGGATTTTGTGTAGCTCCCAGAATTCGTGCATTCCATTTAATTATGTGTATGGTTTTTTTTCATTTGCTTTGTTTAAGTTTTAAA---TTTTTCGCAT---------TTTACACAACATTTCTGTCAATCGTAGCTCTAAGACTTAAATAACAAACACAGTTCAATTGTCGTCTTTATACGAAACAATTGTAGGCGAGTTACTATAATTCATAATAATATGTATCATTATTCCGCGTCCGTTACATAAAAAAAAAAAAAAGAAAATCAATTAATAATGAAGAAAA----------------AAAT
>CG7282 18689547 18689796|23546 chrX 18689698 18690410 scaffold_5 846292 846963 - 21887|0 98
ATTTTTTTCCAACTCTAGTTTTAAGCGCAAAACTTAAGGTTTAAGCACAAAATTGTCTTTTTAAATACATTTCAAAGATGTATGTATTCGTAAGCAAC-
GTCTCTTTCTCTCGCTAGTTTGTAGCTTGAAA-GTAAGAGCTATGCAGCA----------TTTGATGGCCCTCAATG------GGAGTTGCAAGCCATT
>CG7288 18693892 18694015|23549 chrX 18691756 18693987 scaffold_5 847611 849849 - 93804|2216 2312
TCCACCTGACTTTTAATA-ACTCCTAACTATATTTCGGTTAACAAACTCCATGATAAAAAATAAAATATGCTGTAGTCGAGTGTAGCGACTATGAGT
-----TTAATTGTACATATACAAATAATTGTATGCAGGCT--------------TAAATATTAAAATGTG-TGT-GTCTCATGT--CAGCTGTGTGT
>CG32542 18712059 18714576|23564 chrX 18711948 18713293 scaffold_5 867855 869480 - 20629|113 1635
CAAAGACTTGACTCCTGCAATCTGATGACGGCAGTGGCAACAGCAACATTGG------------CGACAACGACGGCGGCGGCAGGGACA---------TCGGCCACAGCTGAGTGCAAGACAACAACGGTG-----------GCTGCGAGTAGCAGCAGCAACAACAGCG-CTGGTAATCACAA---------------------CAACATCGGCAATAGCAGCAGCAGCGGCGTCATTACCAACAACAACAGCAGCAGC------------AACGGCGGCAACATCAACATCGCCATCAGCGACTCAGTGAACGGACACAAC------------------------CATCATCATCACCACCATCACCACAGGCATCATCATTTGCTGGACACGCCGGCTAGCA--------------GCT----------------------CTGTGGGATTAGCAACAGCTACAGCAGCAGGAGGAGGAGGGACAGCAGCAGCAAT---CCCAGT-----AGCAGCCACACCGGT---------TAGCAATACACCAGCAACAGCATCGTCATCAGCATCAGCTGCAGTTGCAGCTGCGGCTGCAGCTGCTGCAGCTTCAGCAGCACCAAGCAGCGTGGCCAGCTACGAGCGATCGGAGCGAAGACCC-----CCACTACTGGGAGCACCACCTGCGCTGTCCACGGT----CAGCAATAACAACGGCCGATCGGGCGCAGCGATCGCGTATCACTCGCTGATGCCGA-ACTTTTATCCCAGCACGCGGCAGCT-----GCACATGCATGGCCATGCCCGGGGTCATGCGCACCC---ACCACAGCACGGTCAACCCCATCCCCACCAGCAACCCCAGCCACACTCG------CATCCCCACGCGCATCCGCATCCGCACCCACATCCCCAT------CAGTACCAACTGCAGTCGCTAAGCCACTACCATCAGCAACTTTAACAACGTGTCGCTGGCACTGCCCATGGGTACGGGCTACCAGCGGCTGGTGCGCCTGCTGCTCCTGCTGCAGCG----TCGTCGCTTTGGCGGCCGCAAGAACAA--AACGGCGGCGGCGAACGAAGTGGAAGAGGAGATGGACGCGCAACTGCAGCAGCCAGCGGTGGCTGTGCCTGTCGGCGATGAGGC-------------------------TGGGAACCAGGGAAC------------------------CATCGCCACTTGGCTCTGG-CTGTGGCTGTGGCTGCTAGTGTTGCTGGTGCTGCTGTTGGTCCTGGGCCTGC-----------------------------------------------CGCTGCTTTTGATGATGCTC---CTCTGATCCGCCTCCACATCCGGAGCCAGTCCCCT---------CCCGAGAACCACCGCACTTAGTTCATGTTAAACATAGTTCTTATTTGTATCTTCAGTTTTCGTTAGCCATTTTTTTTTTTTCGTATTTAGCTACACTTAGATACACG
CAAAGACTTGACTCCTGCAATCTGATGACGGCAACGGCGGCTGCAGCTGCGGTTGCGGCGGCTACGACAACAACGACAACAGCAACAACAATTGGTGGGGTCGCTGCAGTTGCCGGCAGCATTGAAACGGCGCCGCCGCCGCCGCCGCCAATACCGCTGGTAAGGGCAACGCCTGGTAATGGTAGCACCAACATCAACGGCAGCGTCAACATAGGCAACAACGCCAGCAGCAGTAACAACAACAACAACAACAGCAACGGCAGCAACAACAATAACGGCAGCAACATTGGCAACAACAACAGCAGCAATGGCACCAGCAACAACGATCAGACAACAGCGCAGGCGCATCATCATCATCACCATCATCATCATCGGCATCATCATTTGCTGGATACGCCCTCGAGCAATGCAGCCGTTGCCGCTGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCAGCCGCCGCAGCAACCACAACAACATCCGCAACAGCAACATTAACAGCGCCAGCAACGGGCCAAGTGTACGAGCGCCTATGCCGGCCCAGCCATGTTGTGACCCACCCAGCGGAGCAACAACAACAGCAGCAACAGCAACTACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAA-CAGCAACAACAACAACGCGCACCCCTGCCGACTGCACAACAGCGTCCAGCGGTGCCGCCGCCGGTGCCGTTGCCGGTGCCGATGCCGGTGCAGCAGCTG-CCAGCGGCAGCGAGTTCGGTGCCGGTGCCAGTGACGATGCCGTTGCCGTTGCCCGCACATGCTTATCAGACAATGCCCGGCTATTATCAGGCGGCAGCGCGACCGATGCCGCATCACGCGCATCCTCACGCGCATCCACATGCGCATACACATTCGCATACACATCCCCATCCGCATCCGCATCCGCATGTACATCCACATGCGGCCTACCACCAGCTGCAGCCGCTGAGCCACTACCATCAGCAGCTTTAACAACGTATCGCAGGCGCTGCCCGCGGCTGC------TTTGCGACTCGCGCGTCTCATGCAGCAGCTGCAACGCATCCAGCCAGTGGAACAGCAACAGCAACAAGCAGCTGCTGCTGC-AGCGTTGCCACCGTCGCCACTGTCGC-CACCTCCGGCAACGTCAGGTGCTGCTGCCTTGAATCGATCAAGCAGCCGCCGGCGCCGCTCCTTTGAGGTGCGCACCATGACGCTGCTCATGATCCTGCTGCTTCTGGTATTATCGCTGGGCATTGGCCTGCCGCTGGTGCTGCTGCTGCTGCTGTTGCCGCCGCCGTCCATGTGGCAGCTATAGGGCGCAATCTGGCTAGCTAAATGCAGTGCGATCTCAGCGCTGCGCCACATTTTAACACCCCCACACACAAACACACACACACACACACAGACACACACACACACACAGACACAGACACCACCGCACTTAGTTCATGTTATAGGTTATCTCTTGCTCTATATACATGCATATATACATACATATATATATATATATATATATATATATATATATATA
>CG32542 18712059 18714576|23565 chrX 18713360 18714333 scaffold_5 869560 870680 - 920|0 1184
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CAACAACAACAAATGCAGTTGATGTGTGTGCATTTTTAGACTGAGATTTCTGCCAACACACAAAGCAAGCATTCAACACACACACACACACACACACACGCATCCACAACACACAACACACATTACACAGATACATACACACACACAGCTACAGCAAAACTCACTTCAAAATGTGTTCAGTTAAACTAACGTTATTTTAGACATCTACTTATCAAATAGTTATACAAATTTATATAT-TATGAAGCTATATGCACATATATATATATATATAATTTTTTTATTATTTCTATTCTCTCTTATGTTCTAACCTTTCATCTTTATTGACCGCCTCCTCCTCCCTTTAGCTATAACATTTTCCACT--TATCATACATTATATAATTTAAGGCAAATATTTTTTTTTTATATATACATATGCAAACATATTTATATATATATATGTATATGTATATATATATATATATATATATATAATATATCATACTATAGAAATTGAAATGTAGCTAAGCAA-ATTTTAGGAGTTTTAAATTTGTTTAAGCCAGACCACTCACCGATCAACTTAAATCGAAAAATCGCTAAAAAACAAAAAAAAAAAAAAACAATATTATAATTTATCTATTATGATGACAAATTTTAAAATGCAAATTGTTTATTTTCCTTTTTTTTTTTTTTTAATATAAGCTAAATATTTGTCTAAGATTTCTAAGTTGTAATTGTGCCGAAATGTTGGCGATTCTAGACAACGATT--ATATGAT-TATGTGATCTTATGGCCATGCAATTGTTGAAT---TTGTGAGAATTCGAATATTTATTTGTTAGTAAATAAAACATTTGCTTAAGCGGCGCCCGCCCACACAGGACTCTCACGCGGGCGTGGCGCCTCTTCAGACAAATGTTTGCTTAACAAATTGAGTGTGTGTACTTGTTCGCAAGACATTTAATAAAATTATTGTAGCCA-AAACTCTCGGCCAGAAACAAAAGCTTGCACAAATATTTAGCAATTTAC-------GAAAGAAAA--------------------------------AAAATGAAAAGGAAAAACACATTTCTCTCATGATGCGAAACGAAC-------AGAACGAAACGGAACAGAACATAAACACAAT-ACAAAATACATATT------TTTACATAATTATTTATAGTTT
>CG32542 18712059 18714576|23566 chrX 18714375 18714385 scaffold_5 870736 870746 - 784|0 10
GCATATAAAAC
GCACATAAAGC
>CG32542 18712059 18714576|23567 chrX 18714386 18714958 scaffold_5 871222 871964 - 4819|0 206
ATTCTTATTATTAA--ACCATTAATACACAAAAGATACAAAAAGCAAACGAAAAAAAAGATCAAACAATTTTTTTTTAT-TATATACAAAC-------AGTGCTGTTTTGAATAAATATGGTTTTTTGGATTTATTTCAAAACACGCAGTGAAAAGCGAAAAAAAAAACGAAACAAAAAACAAAAAACAAAAAC------ACACAAA
ATTCTTTTTATTTATACACATTTTCTTGCAAAAGAAACAAAAAT---ACAAAAAAAAA--------------TTTTTATATACATACAAAAGAAATCAAATGCAGTTTTGAATAAATATGGTTTTTTGGATTTATTTCAAAACGCAGCTTGAAAAAAAAAAAAACAACAAAAAAAAGAAGAAAAGAACAAAAACCGCAAGACACAAA
>CG7332 18721384 18721559|23580 chrX 18721227 18721919 scaffold_5 4696565 4697328 - 11097|157 404
CGCC---------------------GTCAAGG--GATCCACAGAAAATCGCTGCAGAAGGTGTGCCAGAATCGCATGGAACGGCATGGACA--TACTGTGATGGAGGAAACACTGATGTAAACAGAAGAAGACGCG--------------------------------TTTGCACGTTTCTATTTCACAC-----TAAATTGT---------ATTTATTTGAAAATATTTAAAAAA-AAAAAAAAAAA
CGTCCTTATTGAAAAGATGAAAGATGTTAAAGCAAAGGCAAAGTCAACCACAACAAAAATAACAACAACAACACACAAAACAACAACAACAACAACAACTAGAGAGCAAAAGTAGCAGCAAAAAAAAAAAAACAAAAACTAAAACTAAAAAAAAAAACAAAATGATGCCATGCACATCTTTATTTCAAACACCTTTCAATTGTTTATTGATAATTTATTGAAAAACGTTTAAAAAACAACCAAAAAAA
>CG7378 18743027 18743234|23611 chrX 18742781 18743074 scaffold_19 733516 733797 + 14239|250 297
TACGATTTTTGTGGGACTTGACGGGGAGCCTAAGAGACAACCAAAGAT
GGCAAT--------------ACCAAAACCCCA--ACACAACCAAAGAT
>CG7378 18743027 18743234|23612 chrX 18743205 18744047 scaffold_19 734367 735427 + 7329|0 29
GAAAAATCGTTGTTCTAAACAAAAATGGAA
GACAAAGCGTTGTTCTAAACTATT-TATAA
>CG32541 18847286 18847336|23753 chrX 18845638 18848574 scaffold_19 842279 845314 + 78689|1892 1942
TGCTACAAAAAGGCGCTGCGTCACATTTGCAAGAAATGGACTATTGTTATG
TGCTACAAAAAGGCCCTGCGTCACATATGCAAGAAATGGAGCATTGTTATG
>CG32541 18859552 18860814|23772 chrX 18858796 18859604 scaffold_5515 459 1272 - -407|811 863
GAATACAATACAAAGACTGCCTCATGCCATGCCATCCACTATTACCACCAACC
GAATACAATACAAAGACTGCCTCATGCCATGCCATCCACTACTACCA-----A
>CG32541 18859552 18860814|23773 chrX 18859605 18859713 scaffold_9 3998449 3998564 + 3174|0 115
CAACAGCGGCAGCAGCTATAGCAACTACAGTAGCCGTCGTCACCA---TCAGCATCAGC----AGCTGACGTCATCAGCGTCAACGTCATCGTCCACATCATCACTGCAGCCGCCC
CAGCTGGGGCAGCGTCGGCAGCAATTGTTGTTGCCACGCCCACAACACTGGGCACAAGCTCATCGTTGGCATCGTCAGCGTCCATGTCATCGTCCGCCTCATCGCTGGCCTCGTCC
>CG32541 18859552 18860814|23774 chrX 18859849 18860260 scaffold_9 3998691 3999143 + -2199|0 479
GAGGAGGAAGAGGAGGAGCCAGGGAGAAGTTACTACCA-GAGGAGTCAGATGAACCGGAGGCGCCACTACAAGTACGACGCCGTGGAGGAGTGCTGTCGTCCGATTTG-CCAGGAGCAGCACTACGGCTCCA-----------------TAGCGGATATGTTGTAAGGGGGGAGGGGATACGAATATATGCAAAAGGGGAAACGAAAGAGGATACGGACTCGGAATCACTTTAAAGCGAAACGCAAGGTACCTACAACAAAGTA------------------------------------------------ACTAAAAGAGAAATGCATGAAATAAGAAAAGAGCATGAAGCAAAGAGAATTAGCACATATATGAAGAGAAAGAAGGAGAAATCCCCTCGAATGCAGAAAATAAACGATTATAGCGTTTGGCGATA-AACGATAGGCGATAAGCGATCATCGATATCCGAGGAACGAGT
GCGGCGGCGTCGGCGGGGACGGGGAGCCCCGCCGAGCAGGAACAGCAGGATGAGACAACGCAATAATTCCATGTTGGGAGCCGTAACAGATT-------CACGATCTGTCCAAGAACTTCGCGCTGGCACGAAAAGACTGTTTATTAGTCAGAATTTAATTTGTAAACGATGAGAGGAGATACACACACACACACACACACACACTCGCACACACACACTCACACACAC---ACAAAGACACGCAGAGACACAGACACAATTTAGTTTTGTACTAAGCCCTCGGTTGGAGAGATCATTTCCATATGTCGCATGCTAAAATATTTATACATAAAAGAAGGA---------AAACAAACAAAATTGAGACATCTATATATATATAGAGAGAGAGAACATAACG-GTACATATTGTATTTTGTTTTA--GTTGGAATATATAACAAT-----ATAGTTTTTAACACACACACACACAACAAAT
>CG32541 18859552 18860814|23775 chrX 18860273 18862116 scaffold_19 856489 858609 + 7314|0 726
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ATATATATATATATATATATATATACCTAT------ATTGATGTATTTGAGTAATCTTTGA-GAGCACAGAATTAAATGTTGAATATATATATTTAAAATATATGTATTAACCATGGATATCTGGCAAAACTGGCGCACGCTATTAA-----TGTTAGGTATATGTGTCTATA---TATAT-------------------------ACAAACATACATACATACATA---ATATATAGAGTTTACACACACATATTTATTCATGTACATAAACAATTGATATCCATTCTATAAGCTAACTATGTGAAAAGCAGTTTTTTTTTGGGGGTTAAGAATTAGCATTGAGAATTGTTGTTGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGTATTAGACTAGATCTGGGACTGGCCTGGCCTGGCCAAGAAGTTGTCTAAGGGCG----TTTATTTGAAAAATAAAAAC--AAATAAAACCTAGAAGAAAACAAAAAAAAAAACGAAACAAAAAATATTTAAAACATGGCAAATATATTATCATACACATAAATACAAATCTATAAACTTAAATATATATATAAATGTATACTATATATACGATAACAATTTTTTTTTGTATTTATAAACTAGCATTGCTTGTATATAGACATAAAATATATATTGATGGAAAATGCCGCTGGCAAAATTTTAATAAAACAATATAATATTTACAAATATATATATGTATTAAAAT
>CG7406 18912311 18912531|23840 chrX 18911590 18912741 scaffold_48 195324 196607 - 17012|865 1114
GCAGTTC----CTCGGAGATG------------CTCGGACATTCCAACAGA-TGCCAGGCAACCCAGTGCGCTGATGTCAACTCTTTTGTTCCTGTTGTCGGAGTTGTGCGGCGATATTGGCCTTTTTCGATGCTCGAAGTTA------GTTTAGGACAGCGCACGCGTTTTGTGT--GTGCGCTTAGAAACCAT---TAATTTTTTTTGCTAATTTTTAAA-GAAATACACAGAAAATGAAAAAGATAA
GCGGACCAATGCCCAACAATGGCTCAACACAGACTCCCATCTTCCCATACACCGCCATGTGAT---ATGCCAGGCACTCGACTCATTTGTTTCTGTTGTCCGAGTTGAGCAACGGCATTAGCC-TTGTAGATGTT----GTTACTATATCTTTAAGACATCTTTTTTTTTTCGTGTTAAATAGTTTATAAATTGTACAAAACGTGTTCAACTATGTTGGAAACCAAAAATAAAAAATATTAAAAAAAAAT
>CG14191 18916378 18916510|23847 chrX 18916333 18916378 scaffold_48 200903 200948 - 3156|45 45
A
A
>CG14191 18916378 18916510|23848 chrX 18916426 18916465 scaffold_48 201110 201150 - 1488|0 41
ACCTTAATTGTAAATACTTCCCAACATTAAC--CAATAAAAC
ACTCGAATTGTAAATAC-TCATTACATTAACAATAATAAAGC
>CG7453 19015131 19015939|23975 chrX 19014070 19015231 scaffold_10 4371190 4372533 + 7883|1237 1405
CGAAGACGCGGACGACAG------------------GCTGGCGGCAAGGGCGGC--------------------CACTTCACCGGGTGCTCCAACGCCTCCTCCGGCGCAC------------------------------TCGGATGATTATTAGTTGTTTAAGTTAT
CGAAGGCGCCAGCAGCAGCAGCGGCACGGCAACGGAGCTGCCAGCGGTGGTGGAGGAGCTATTGACGGTGTGGGCTGTTTATCAATTGCTGCCACGCGGCTGCCGTAGCGCAAAAGAATTTGATAAAGCAAAGCAAATGATTGGAAAGATTATTAGTTGTTAAGTTTAT
>CG7453 19015131 19015939|23976 chrX 19015246 19016401 scaffold_10 4372566 4373691 + -4479|0 744
GCTTGCATTCAATGCAA-------------GATCGCCGGATCGAAAGCAGAGTGAG-------AGTAGCGGAGAGCAGAGGAGGCGGTGGGAAAACGAAACGA-----AACTATG-ATATTGCTCAGTCAATTAGAGGAGGAGGAGAAAGGGATTCGCTTTGCAGCGTGGCTAGGATACCCTTCCGAGCGGCCAAATTGAATTTAAAGCCAACTGATTTTCAACACTAAATTCGAGTGGACTCTTAAGTT-TAAGCATTTGGATTATTGTCAAGCATTTGTTAGCAAT---CAAAAATTGATACCGGCACTTATATGTACCCTATATATACATATATCTACTTAGGCTG-----------CTGCTGTACATCGAAGGCTGCG--GACTCTCAACCATCAACCATCAACATCAACATCAGCGCAATTAGCAATCACTTG-ATGCATCCACAATCTAGCCGTAATGTGCCTTACGAACCAGCTCTATATACACCTTTACACATGATATTCTCCATCGCCGGGTCTTCGAGGTGATTTCTTCGCATTTACTTTACGCAACCAAGCAGCAGCACTCACTCAAAAAAAAAA---ACCAGCAGAAACCAAAAACACAAGCAATCGGCCTGAAACAAGCAAATTTATTGCATACCATGTGTATATACATAAATATGAATATATATATATATATATATACATATTTCTTATTGTTATTA-ATTTAACAACTACA---ATAAAGCAACAAGGCT
TTTTGCATGGAATGCAAACAGAACAATTGCGCGAGCAGGATAGCTAGAGGAATGTGTGCAAGCGGTTGGAGAAAGCGAAAGCGAGAGGGAGAGAAAGAGGCACTGGCTAAATATACACATTGCTCAGTCAATTAAAACATTGAGAAAAA----------------------------------------CACTAGATGAAATGTTTATGTAGGTGTGTGTACGCGC-----GCGTGTGTACACACATGCTGCACAAATATGTGTTAGCTTTAAA-ACGCAATAGTAATTTCTAAGAATATATACATACACACATTTACA---TATATATATATATATTCGTAGCGGCCAAATTGCATAATTTGATAAGATTCGAACGTAGCGCAAAAACTGAAAAGTTAAAAACTGATTTTTATGAAAATATTGCTAGCATTTGATTACATGGGTTCAAATTATGTT-----TATGCATTTCGATTAATGTGTGTCTATATCTAAAGAAA-AAAAAACTGCATA------------------------TACATTTATACCTTTCAACCAAGTTGTAGATACTATTGAAAAAAAAAAAAGAAAAGAAGGAACTTGAGGC----GCAATTAGCAATCAATCATTAAAATTACTATACAAAATATTTGTACACTATACTATAACCATA-ATGTGCCT-TACCAACTCAGCTCTTAATAATGCTGTATCAAACATACATATATATTATGTACACATGTA
>CG33253 19020711 19021216|23985 chrX 19020651 19020832 scaffold_40 184044 184200 + 2042|60 190
CGCTCGATG---------TCGGTGCTGCAACCATATCTGGAGGCACTGCATCGCTGCGAGCTGCAGCGTCAGCAGAAGCAACAGCGAAGCGGAGCGGCTGCAGCGGGAGCGGCGGATGACGATGACGACAT
CCCCAGATGCTGCAGGAACCGGCGCTGCAGCTTCAAATGCAGCCACAGCCAC------AGCTACAGCAGCCGCAGCAGCAGCAACAATAC----------CAGCAGACGCAGCAGATCTCGTCGGCCATGT
>Mec2 19024026 19024130|23991 chrX 19023977 19024144 scaffold_31 417757 417913 - 1486|63 167
TTTGAATCTAGGGCGTTGCCAGAGTTTGAAAATATTAATGTCTTATTCATTTTTTTTTTTTTTTTAATAAATGCAATTCGCACTAGCTGGCAGCTTCAGCAATCG
TTTATTTCCTGTGTGTT-----AGTGCG----TATCGCAGTTTCAGCTCTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGCTGCT-------GCTGGCAACAATA-------
>CG14193 19024753 19024970|23992 chrX 19024772 19025136 scaffold_10 449082 449414 + 1234|0 209
GGATTTATAATATAACTGGAGCAGATCTCCAAA--TTGACTTTA----TCCATTATCATTATCCATCCATGAAGAAAATGTTAAAAGATCTTGAATCA--ACTCACAGTATTTAAGTTAAATTACTTTATTTTTTTTTTCGTTTTTGTCTTGTAACAATAAGTTTGCTTCAAAATAAAATTATCCTTTTTATTGTTTGTAAGT---AATT
GAGTTTATAGT----TTGGATTTGATCTCTAAAGATTAAATAGAAATTTCCATT-TAGTTAAATACTTTAAAAGGGAATTCTCAGAAAACCAAAAGAATTGCTTGCTGAAGTTAGTTTAATATAATTTTTGTTTTTTTTTTCTCTTAAATCGCAACAATAAAATTGTGAAAAAA---------CCTGTCTA------GAAAACTCAAACT
>CG14194 19029389 19029984|23995 chrX 19028378 19030936 scaffold_10 4295099 4297680 - 57222|1025 1814
ATATAGACGGCCAG----------------------TACAGCACAGGAGCAGTACAGGAGC----AACAGTAAAACAGCAACATTTACAATA-AATCGCAAGAACCGCGTAGACTTAAGGACAGCCTCTTTGCACGCGCACAAGGAGACGCCGCACACCTTTGTTCAGGTGTTTATGTTAGGCATTGTTAAGCATACCCATACCCACTTACACACTCACGTCTCCGTCGTAGCTTTTAGACTTGTACTGAATTTTAATTGTA---------------AGACAAACGCTAACACCGCCCACGAAC-------CATGTCCAACCAACCAACCAACCAACCAAGCACATCGCACCCA--CCATGCTCCCTTCCACGCATCCGCCTGCATATGATA---GCACATATAGC-------------------------------ACATACATGCATACAGGACCTGACCAC--------CACACGCTTTTGTCCAGACCCGAAT---------------------CGGACTCCAACT----------------TGACCAC--------AAATTGAACAGCGCCGCATTC---GGAATTTTGACTCG-------------TGTGCTAGTATTATA----TGTAAAACATCTCTCACACCTTGAGAAGCCCACTTATGTGTAATGACCTACTATAAAGTGTAAATAATTAACAGAGTACGTGAAAACGAGAAATATACTTAAGTGCTTCCATC------------------------------AAAAT------GAAAA
AGAGAGAAAAAGAGAGAGAGAAAGGGAGATATGCGATGCAACGCCGCACATATACAATAACTAAAAACAATAATA-AGCATTGCTTGCAATGTTATCACACTAAACACACACACATA-------CATATATATATATATATATTTATATA-TGTACACCTATTCTTAGGTGATTAGCT---------TTAGGCACTAGCATACATGCATACAAACT------TTGGCCGTAACT----AATTCGTACTGAATTTCATCTGTAAGCCTCCTCGCTCTCAGCCGATCGTCCGCGTTACACACACACACACAGACACACGCACACACACACACAAACACCCGCGCA-ATCTAGCCCAGGTAGTGTGCTCTTTAATATACAAGCATGCATATAATATCTGTACATATATTCGGCCTGTATTTTTTAAGCAGTTTTCTCTTAACTTAAAATCACA-AAAACTTGAATATATACTATATACATATTTATATATAAATACGCATATATATTTTTAGCTTTTCGAACAAATTGTAACTCATACCGAGTGAATTGTGAATTCTTTTAGCAATATTTTATAATGCATCATTCGTTGGGGTTCAGATTCGTTTACCTTATATATGTGCAAGTATTATATTGGTGTATGCATATTTTTATGTTTTTAAGGGTTTGTACATTT---------TAAAAGAAATTGTAAATAATTAAC--AATAC---AAAATTAAAAATCT-CTTAAGTGCTTCCAACTTATGTCCATTATTTGGGTGTTGTTGTTATAAAAGGGTTTAGAAAC
>CG7874 19048746 19048875|24006 chrX 19046854 19048878 scaffold_10 2163415 2165301 + 36487|2014 2166
CTTGCTCCAAGCTGCGAGCTCCACGCTCCTTTTCTACAGATAAACCCTTCCATTTATGTTGGTCCCTTGCTCTAGTCTAGCGAAATTATCTATACT-------------------AATTTTTTTTTGCTTTGTG----GCGTAAATAAATATT
------CCAAGCTTCGAATTCTAAGTCCAATCGGCCCAGATTCCACTCACAATCTATGTTGGT-----------GTATAGCGTAGTCTCATATGGTTATGGTTCTTAAATTCTACAATTTTTTTTTTCTTTCTGTATTGCATAAATAAAGACT
>CG7876 19050427 19050527|24010 chrX 19050228 19050926 scaffold_10 2166611 2167234 + 3364|202 302
TTTTGGGATGCCAGAGGGAATCGAGAATGGATGGATGGTGTGTCCTTTGAGTGGGCTGCAAACGAAGCGGAGTAATAAAAGCAGTCCAAACCCAAATTTAA
CTCCG----------GAGCAGTGAGCATAAGTGAA----------------------------GAATTTTAGAGATGAAATAAAT----------ATCCCA
>CG7884 19069104 19069850|24027 chrX 19068939 19070056 scaffold_10 2188430 2189460 + 14093|174 971
TCG-AGCTTCTCTCTTGTCTTCACCA----CACACTGA-ACACTGATTCATCCACACTGATCCAT-----CCATAAAATTGCACCACCACACACCATGCACAACC-CATCAACAAACACGCACCACCACCCACCACCCGCCATACATCGCACACCGCAGGTCAACACGATAGTGACAGCAGCGCCGACGGCGGCGGCACTTCAGCGACCCACAGCGAGGCCCACGATGTCCCCCTCGCCCAGATAGA----------GGTCGAAGCAAGGTCAAGGCGCCCG-GAGCCGCACAGCCCCCCATCCTGTTGTAATATATTTCACCCCAGCCGCCCCTCCAGGCCCCCCGATCGCAATGTGGAGCGAGGATACGGCCTAGATATAGAGCAAAGTCCTTGGAAGCGCTATGACGATGAGTGGAGATCCCGAATCAAAGTTAGAGTATTTTCGCATTTGGTAGCTTTATGAACAAATGAGGAGGATCAGAGAACCAAAGGAGTGGAGCTACGCGTAGTATATATATATATTTGAAAAAGGATTTGTATTCACAATTCTCTTTTTTGCTTTTTTTTTTTTTTAGTAACCTCTGTGTTTTTTTCGTTCTGGCTCTTCCTTTGCTAGTTGTAGTTCTATGTATAAA---ATACCTAT-TATATCTATTTCAATCTATCCGAAGAATGGGTTGTCAG-GCGATTGACAACGTTATAA--------------TCGATGTGCAACC------AAAATATAGCAAATATGAACAAACAAACGATCGAATAAAATTAAACCAAGCA---AA
TCGTTATTTTTGTTTTGTCTCAAACACTTTCACACACACACACACATTACTACACACTCATCATTTATGACCACATTA-TGCAACACTGCACTGCACCCACATCCGCATCCGCTCACACACACATGCACACAC--------------------ACGTAGGTTATCACGATTGTGACGTCGGCGCCAGCTGCGGCTGCGCTACAGCGACCAACACCAAGGTCCACGATATCGCCCAGGCCCAGATAGAGCTACTCCCGGGACGCAGCCGACTCAGCAGATCCGAGTGACCAGCAACCGGCGCATCTATTGTAATATATTTC-CCCAGGCCGATTGGATGGATACATTGATT-TATCGTGTTGCGAATTTATTTCTTA--------------------------------------------AGCCTAAACCAATTTTAGAGTATTCTTGCATTTGGTAGCTTTAC------------------------------------ACGTACAGTTAGT-TTTATATGTATTGGTAA-------TGTGCTTA-ACTTTTTTTTTTTGGTTTTTTTTT----------------TGCTTGCGATGATATGACGCGTCCT---CTAATATTAAATATGTATACACACATGTATGTATGTACATATGTAGCAA--TATGGAAAGTCTAGTTTGGCAGCGTGTCTGATGGCATGACCACGCCCTCCCATTTTCGGGTGTGTGGGCGGCAGAACAATGTGAAAAGTGTGTAGCTGCGTTTGTTTGTTATTAATTAAGCAACGAAAACAA
>CG7889 19078763 19079159|24034 chrX 19078645 19078820 scaffold_19 707463 707638 + 6373|124 181
TTTTAGTCCTAAAATAAACCTACACCACGTAAACAAACACCCACTATCTGGAACCCAC
CTTTAAT--TAAACTAAACGAAAACAAC---AACGAAAATGAAATACCAGAAAACAAC
>CG7890 19085199 19085983|24042 chrX 19084658 19085231 scaffold_19 712819 713389 + 36663|541 579
GATCCACG------GCTGGGTGAGTAGACGGAACTGGGA
AATGAGTGAGAGATAGTGGCAGAGGGGGAGAGAGAGGGA
>CG7890 19085199 19085983|24043 chrX 19085411 19086110 scaffold_19 713390 714103 + 3876|0 651
GAGAATAGGAGATATTGTTGTTGCTGGCCACGGCAACGGACTGATATTGTTGATTGCATTTTTGATACATATAATTGTACTTATATATAGTATATACACACACACATAAAGTTAGTGCTCAAT------------TAATTGTAGCTTTATCAGGAGACAAATTCAACGA-AGTGCGCAAC--CTGAAAA------GTCCGCACTCAAACAAT--ACGGTTCCTCACTCCAATTCA--------ATTCAAATGAA----ATGAAATGAAATGAAACTCACTTTTCCCACTATACTCGAATGTCAGGCAGTTGGACGTGGAGGAGCCACG-----TTCGATCCGAG-ATGGACATGGTTCCCCCGTCCGCTGGGCACACACATTGCTATGTACTACCACTACCTAAGATCATTA------------TACCTAAGATC----------------ATTATGTGCATTTATATACAAGAATAGTGAAAAAATAGAGCTTACTACGAAATTCCTACAGTCTCCTAAAC-TAAACATATACA-AAATAT---TGTATGCATAGTTCCAACAATTTCAATTGCATGACTCAACCAATACGATTGCTTAGCC---AATTTCAATTA--AAAAACAAACTAAATAAATCGACCTTAAATCTA
GAGAGATAGAGATGTTGTTGCAGCGGAATTTAGCAACAGACTGATATTGTTGATTGCATTTTTTATACATACCATTGTACTTATACATAGAAGATATATATACAAACAAATATGGTATTTGCTATCGATGTGATGCAATTGCTGTATGTTTGAAAGATACGCTACGTAATATTGCTCAATTATTGAAAACAATATGATAACAACAAAATAATAAACGGTTCCTTCTCTCAATACACAACGCACAGACACACGAAAACTACTATATATAATGCCTAAAAAATATATATCTATATATATATATAAACGCATAGAACAAGTAGAGCTTACGACGTATTCCTACAGAGTATGAGCATGA--------------AGACAAACAGAGAGCTACGCAT--CCAGATCCTAAATCAATTACTTAAAAGACACTATATAAAAACGTACTGATAGCATGCGATTAGGCACACGCGCACACACGCACACTCTCTATATAAAATTCA-TATGCAATT--TATGGATACCTACATATATACATATACATACATATATATATATACATAGCTC--AACATCTAAATTGCATGTTACAA-------AATGGCCTAGCTAAAAACTTCAATTATTACAATTTAATAAAATAATT---TCATAAATATG
>vav 19105516 19107216|24064 chrX 19105423 19106039 scaffold_5 4552985 4553582 + 10896|96 643
TATTACAACTACGAGGTTTACTTTGCACCCAAGGCCATTACGCCCACAGCGGCAGCCATTGCTGAATTGCCAGGAGCAGGAAATGGAGCTGCAACTGGAAGTGGAAGTGGATGTGGAACTGGAACTGGAACTGGAGAAGCTGTAGCTGCAGGCGGAGC--CATTCGAGGAGCCGCCATCGAGGAGGCCGTGGCCGATGTCGCCAGTCACAGCAACAACAATTGCAGCTAGATCGTAGCCTAGTTAAATGTATACCTTAAAATGTAACTTGTTTTTATTCGTGATTAAGCCTATTTTGTTTGCCTTCCTTTTATTTTCTTTTCTTTTTTTCTTTTTTTTTTTTGCGTCGTC--TGCTCGAAACATTTGTGCCAATCACCGGAAAATTACAAAATCCACAGCAAGCAGCAATGTTTGTGTGAGAATGTTTAACGTTTCAATTGTTTACAACTA----TATATTGCAA---ATATATAAA-------TCTGAGTGTACATGCTTACATTTCTAAGAAACTTTATAG------CCACTTAAGTTGTATATGT
TATTACAACTATGAGGTTTACTTCGCACCTAAAGCGAGCACTC---CAACGGCGGCCATTTCTGAAACACCTGTAGCTCTACA---AGCGACAAACG-----AGGAGACGATTCCCAACTACAGCAATAACAACAACAACCACAACAACAACAATAACATCTGTTAGACAGGCAACAACAAGATGAACAT----GATGCTGAGAA----AGCAATATCTGTTGCACTTAGTTC-----------AAATATACATATACAAAATCATTTTAAATTAATTAATT-----GTATAATCTGTTTGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTATATATATATTTTTTGTGTGTAAATTTTCGTCGCTCGAAACATTAGTGCCAACAACAGAACAATTATGAAATGCATCACAA-----AATGTTC-TAT-AAAATTTTAAACGTTTTTTTTTTTTTTAACTAATTGTATATTGCAATACATAATTAAATGCATAGTTTGTAAGCATATGTGAACTGTATTGAGAAGCGTAACAGTTTAGTCTATTTAAATTTTACGTGT
>vav 19105516 19107216|24065 chrX 19106040 19106203 scaffold_28 584104 584293 + 639|0 191
GCGTTTCTTTTATTTGTTTTATTTTTTTTTTTCTTTCTCGTTCTTAACTTGTAATCGTCCCACGTCGAGTGAGGGTTGTGCGAATGA--------------------------AATGAAA--TGGAAGGGAATGCGTATTTCCATAGAAACAAAGCTTTAAGATTTATATTCATATTATTGTACTTGTACTG
GCGTTTTGTTTATTTGTTGTTCTTTTGATTTTGGTTATTTTTTTTTTTTTTCAAT--TTACAGTTTGGACGAAAATTTTGCACCCGACTGCCGACGTTGCCGCCGTCTCACTTAATTTAGTCTTTACAGCAATGCGTTATAAAAAAAAAGCAAAAAAAAAGAATATATATATACATATATATATTTATTTTT
>vav 19105516 19107216|24066 chrX 19106204 19106472 scaffold_5 4553866 4554132 + 2583|0 291
GTAGATATTTAACCC-----TAGTT-GAAACGCAAATGTTAACATAACGAAAGCAACGCAGCCACAA------AATGTTCGAACAGAGAATAAGAATACCACAATGAAGTAGTAACGACGATAAGGAAGTAAAAGCTTTAGAAATAACGATAGCCGTCATATTTACACGATGATCAACATTTTAGGCCAGCCAATTTATAGATATCTATACCTA----------TAACTATAACTATACCTAATAACTATAACTAACTATAATGTACCTATTT-ATATAGCCAACGAATCAC
GTGTATATTAAACTTATGAATAGTTCGAAACGCAAATGTTAACAAGTCAAAAGCAACAGAGCAACAATTCTGCGACAACGGCAAAAAGCTTTAGCAAATCACGATATAACGTTAAAGA-AACAATGAAACAAACAA---ACAAACAAAGAAA-----CATATGCATAAGAGTAT---------------GCCAACTTATATAAATTCGTAATTAAATATTAACCTTATTGTACCTAGAGCCAACGAATGTAGCAGACT-TAACAAGTATATTCGAGGTGTTCAACGATTTAC
>vav 19105516 19107216|24067 chrX 19106827 19106917 scaffold_2 6252019 6252135 + 1835|0 116
TAGATTTAAAAATG----CATACTAAAATGCTAGGCTAGAGTGT---------------------CGGTTTCAAAATCT-TTTCATGTGCTAAGTGTTCAAGTTGTGTGTGTGTTTG
TAAATTTGAAAACAGTCCCAGACCCAGTGGCTGGGATAAAGAGTTGCATGTTGGCTCAAAGCAAACGATTTCTGCAGCTGTTTTGTGTGCTGACTGCTTTATTTGTGTGCGGGTTTG
>vav 19105516 19107216|24068 chrX 19107096 19107303 scaffold_5 4554752 4554978 + 3826|0 151
TTAAGTAAATGTT-GTTCGTTTC---AATTGCAAATTGTCGCATCCAGTTTAATGCCAATGTAAT-----------------GATGTTTGTGGTTTTTACAAATAAATGAAATGGTTGGGAAA----------TCGACGAGAGCGCTCCCCT
TTAAGTAGTTTTTTGTTTGTTTCTTTAATTGAAATTTGTCGCTTCCAGTTCAATGCCAATGTAACAAATGTATTCAATTCAAAATGATTTTGCTTAACACACACACATGCACACGCCAAGAAAAACAAAAACCAAAACAAAAACACGC----
>CG32827 19247292 19250521|24249 chrX 19247143 19247504 scaffold_36 262214 262540 - 6400|150 374
GATTGGGATTGGGC-TTTGGGGAGTAAGTCAGGGTAGTCAGTCGGTAGATGGCAAAAACTTGTATAATTTTACTCGGCTCACTCTTTGTGGCCGC-----------CTGTCTATAGTTGCCACTTTTGCTGCTGCTACTCGTTGTTGGCAAAAGTTGCATTCAAAATTGCAATTTTATATGCACAACGCTCACCAGCAACTTTGGAAACAATTTGTGACAGCCTT
CACTGGGCCAGGGTATATGGGGTATATGGATGCATTAGCAG-CGAGCGTCAGCAAAAACTTTTATAATTTTACTTAGTT--CTCTTTATGGCAGCTTATAGCAGAGCTCTTTCTGGCTGTTGTTTTTG-TGTTTGTTTTCGTTGTTGTTGGG----------AAAATCGCAATTTGATATGCACTGCA---------------GAAAAGAATTTTCATCAGCTTT
>CG32827 19247292 19250521|24250 chrX 19248209 19248598 scaffold_36 266022 266391 - 5332|0 414
CTCTAATTGTTTTTTAAATACGTCTCTCAAATGCTCTCTA---------TTTCAAGACGAGAAATGAACAAAGAGC--AGCGCCAGCAAACAACAACGAACA-ACAAATGCAAA-GCACAACTTCTACGACAGCCGCCGAATCA-TTGAAAGAGCCGCGTCTTTGCTTTTGCTTCTGCTTCAGTTTCTTGCTTTTGCTATGCTTGCGCCATGCTTTTTTCGCCATGCTTTTTTTGCCGCTTGCCTCGAAAATGGGGCGTGACAGAAATGAGCACATA-------AGTGTCATAATCACACACACACATAGCTACACATAGCTACACATGCATTTGCTTACTTGAGCTAGAGATTTACCTTCAAGTGAGCAGCTCAGCTTTTTAACACTTTTACTTT--CAGC--AATACTCAGCA
CTTTAATTGTTTTTTAAACACATTTT--AAGCACTTTTTGAATACGCGTTGCCAAGTCG-GCAATAAACAAAACGTCAAGCATCAGCAAACACACACACACACACACGGACACACGCACAACAATCTTGG-----GCCCAACAACTTGAAGCAGCAGCA-----GCAGCAGCAACAGCAGCAGCA----ACATTTAACGCAAGTGTCCCAAGTCTTT------------------------GCCTTGGAAATGGAGCGTGCACAAAATGAGCGCGCACAACAACAACAACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACAGGCACTAGTTAGTGTGCGAGCTTTACCTTGAAGTGAGCAGCT----TTTTCAACACTTTTACTTTTTCAGCCCAACATTCAACG
>CG32827 19247292 19250521|24251 chrX 19248617 19248942 scaffold_36 266417 266719 - 7986|0 353
TGACTAGAGAAGCGCCAAC----TCATTTAATTTGATGCCCCAATCCAACCAGCCATGCCACTTCCCCACTGAAAGCCCATCTTCCACCCAGCAGCACCTTCTTCTCGCGAAGCCGTTGCCTAATTGTCGTCTATCTCTAGTCGACAG----TCGTGGCCCATAACCTCCCACCTGC--CACCCACTTGCCATC----ACCCACTTGCCACCACCCACTTGCCACCACCCACTGCT-------------GTTTGCTGTCTCAGCGCAAAATGTTGCTGCTCTAATTAGAATGAAACAATTTTCATTTCATTCTACATTTTCATGTTGTCGTCGTTGGCATTGCCTTA-CTGCTT
CGGCAACGGCAACGGCAACACATTCATTTAATTTGACGTCTCG--------------------------------------CGCCCTCGCAGCAGCAACAGC------AGCAGCAACAGCCTAATTGTCGTCTATCTCAAGTCGACAGCAGGTCTCCCCCTGCTACGCCCAACCAGTTGCACCCCGCCCCAATCTTATATGTATATACACACAGCCTCTAGCCGCTGCCCTCTGCTCTGTTTGACGTCTGTTTGCTGTCTCAGCGCAAAATGTTGCTGCTCTAATTAGAATGAAACGATTTTCATTT-----TGCATTTTCATGTTGTCGT--TTGCTTTTGCCTCAGCCGCTT
>CG32827 19247292 19250521|24252 chrX 19249531 19249952 scaffold_36 266740 267115 - 4013|0 466
TTGTCGCTTGCTTGGCCCAAAATAAATAATTTAC------------------------------------GCCAGTGTTGCTACTTTCGCTGAGCCAAGCGAATCTCATAGAAATTATGCCATGCCAAAGAGTAGGACGTTCCTTCCTTCCATTTTAATTTCAATCTACTCGCTGGCAACTACGTACATATATACATACATGCGTGTGTATATATGTATATATATTAATATATATACATCTCTCTATCCGTATCCACAATAATGTATGGCAAAGATGCGGTATCCTGATGTAATTCCCGCCTCCTCGCCGTCTGAACTGCATCATATTGCAGCGGCAACAACCGC----ATAAAGACATTAAGCGCATTTA---ATTTGAAGTGGCAGGATGAATGGAAATTTGCAACGAGGCAAAATGAACACCC--ACCCACCAACCAACCGAGCAATATGACCTGCATTATATG
TTGGCTCTTGCTTGGCCCAAAATGAATAATTTACGCTGCCGTCGCCGAAGCTGCTACTGCTGCTGCTGTTGCTGCTGTTGTTGCTGTTGCTGATGCATGCAAAATTCATAGAAAT--TTCCAT------------------------TTCCATTTTAATTTTAATC-------------------GCAAGTGTAATGCCAGGCCTGCCCAC-------------TTTATATATAAGCA-----CTATATAGACTTGCGAT-------------------GCCTACAGATTTAATT---GCTAGCCAGCAATC--AACAGCAGCA-ACAACAGCAGCAACAACAGCAGCAACAACGGCAGCAGCAACATTAACACATTTCGAGTGGCAGCA--AAGTGAATTTTGTGCTGA-GCCAAGTGCACAGCTTAGCTGAGCGACCCACTGAGCCATATCAGCTGCATTATCTG
>kek5 19303488 19304001|24296 chrX 19302217 19303822 scaffold_36 338326 339869 - 65170|1338 1681
TTTGGCACCCACGGCGATCTCCGCCATCGCCGGCAGCTGGCGATGTGATGCAATGTAGCGATGCAATGCATGCGATGGAATGGAATGGAATAGAATATGATGGGATGGGATGCATTGTGATGTCGTTGCCGACAGCG--AGCAGCAGCAGATGCGGATCCAGTTGGATGATGAGGAATGGGGAATCCATGGCGGGCTGAAGCTGATGCTGATAACTTTATTGCGCGTATGGGATGTGGGATGCAGCCCCCCAGTCGACAACAGAATACAA-------CATCAACATCAACATCAACATGAACGTCAACACATCCCCTGTTGCGGCTTGTAAAAATAGCCGGCGG
TTTACCA--------AATATGCGCC-----------------------------------AAACACCCCACTCAA--------AATGCAATTGCAAATTA-------------ATTCAAATTGCCTTTTTAGCAGCAACAGCAGCAGCAGCAGCAGAAC-------GTGAAGATAAAGTTGAAA-----AGCAGATTGATAAAGAAGATGAGGA-------GCACGGGCAAACAGTAGTA-GCAGCAGCAAAGGGGAAAGCAGATGATAAAGAGAAGCAATAACAACAACAATAACAGTAACAGCAACACACAACAGAGTGCAGTT------AACAGCTGGCAG
>kek5 19303488 19304001|24297 chrX 19303829 19304036 scaffold_36 340408 340641 - 3792|0 182
TCTGTTCCGTGGTTCACGCCACT-GCGTGACTTGTGTGCCAAA-CGACTGATGTAGGTTTTAGTAATTAAATCGATGAAC-ATGCAACACACCAGTTCTTCTT---CTGGTCTGGAAAATGCGACGGGAAAT----ATGTAATCTTCGGCGAGTTGGATGAAAAAAGAAAAAAAAAAAAAAAA
TCTGTGTC-TCGCCCGCGCAATTCGCGTGACTTGTGTGCCAAACCGACTGATGTAGAATTTAG-AATTAAAACGAGGAACGATACGAAATGAAAACTCCAACTGAAACAGTAAGGGAAACAGAAAGAGAAACGGAAACGGAAACAAAAGCAAACAGAAACAGAAAACAAAAAATCAAACAAGA
>Nat1 19317879 19318580|24313 chrX 19317609 19318089 scaffold_36 930926 931419 + 18841|297 516
GACCAAACAAGACTACTA-ACTAATACCCGGGCCCGAGAAGTTAGTAACAGCAACAAC-AGATCTGCGGCCACCACACCAACAAACACAACAAAAGCAACAATAACGAAAAGTGAA------GCGAAGAACCTAACTA-ACAACCAACAATATGAACAGGAATAAGCTTAGCTCTATAAACAACGGCAACCACAATAAAATTCACTATTAACAACAACAA
AAGCAATCAGGCATAAAAGACTGCTAC-------------------AACAACAACAACTACAACTACAACAACAATAATAATAATAACAACAACAACAACAATAATAACAACAGCAAGAACTGCAACAAACCTTACAACACCAACAAGAAGAAGAATAGCAATATGCTTAACTCTATAAAGAACTTCAACAAAAACAA----CAACAAGAACAACAACAA
>CG12203 19327175 19327277|24321 chrX 19325410 19327244 scaffold_2110 703 2522 - 43366|1895 1974
ACGCTCCCCGCAGCTAGCCAGGATTATAGACCACA----------ATTATCTGATTTTTTTTTTGCTTTGTTCATTATCT
ATGCCAGGCGTCGCCATCGCCGCCAAATGGCCGCAGAAAATTGCGACTTTCTAATAATTTAATTGCTTTTTTTTTCGCCT
>Pfrx 19342465 19343294|24339 chrX 19339829 19342556 scaffold_36 404687 407456 - 107832|2839 2930
CGGCGTCGCCTGCACCCCGTGCATCCACATCCACCTCCGAAATCCAAGACAATCTAAGCACGGCTGCTGGAACGGCTACGGCTGCCCCAACC
---CATTGCCAACGCCCC---------CACAAGCCAACCAAATCCAAGACATTATAAG---AGCCACAACATCCCGTACACCCAACCCAACC
>CG33525 19359146 19359778|24360 chrX 19359092 19360184 scaffold_392 8198 9462 + 5198|55 892
CATTTTCAATCAC-----------------------------------------------TATCCACACACACACACACAAACGA------------------ATACCAAAAACAATA-TTTGACCAGCATCCATAAGACTTAAACGCAGTAATGATACGATTTTCGTTCACACACCGCAAAGATTGCGCCACACACACTTGAGAATTAATATGTATTCCGCGAAGGTTGGCCTGATTTGGTTGATTTGGTTGCCTGCAGAAGTCCTTTGCATCGCGTTGGATCGCCAAATCAGGTTGACTGGCACTCGACTAAGGCATAGCAACAAAAAGAATTGTTCTTTGTTCATACACGGA-CACGTACACCTTTATATAAATA-GTATATACAACTTAAAATATTTTTTT-------------------TTAAATTATTAT-------AAATAGAATCGTAAATTAT-TATACTTAAAATAGTAACTTA------------TATAACGAGATTGATTAATTTAAAG--AAAGCAAAGTCCAAA----------AAAATTGTACATTCATACATACA-------TACATACATTACATAGTTGTATACCGTGAGT----------GGAAAGAAAGGAGAAAAGCAAGCAC------TCGTTTCT-----------------------------------ATTCCCAAACTCATCCTGCCACAGACGATAATCATAATG--------------------------GATCACCAC--ACCTAATGCTAATCCTAAGAAATGCATATCTTGTTTGCGAAGAGATTAAACAACAACCCAAAAACCAAC
CAACTTACAACACACACACACACGAACACACACACACTCACATATACACACACACATATATATACACACACACACACCCATTCAGCTAATTTGTATGTGTCTTATGCCAAAACCAAAACTTTGACCAGCATCTTTTAGACTTACAATCAATTCTA--------------CACAAAGAGAAAAGAATGCGCATATTTCTCATGCAGAAATATTTGTTTTTTTTTTTTTTTAAATTAAATT------TTTTTTTTTTTTTAATGATTTTTTGTATTAATTTCTATAAAGAAATCAATGCGCGCGACTCTAGAC----GTAAGGCAAATAGACTTTTTGTTCTCTATTTATATATAGATTATATATATATGGATATATATATATATATGCA----TACATATTTTTTTACGAAAAGCGAGTATTAAACTAAATTATTATGTAGTAGATATATGCTAGTAATTTATAAATAAATCAAGTACTAATTTAATGCTTTTATGTCTTAAAGAAAATGAGAAAAAACAAATCGAAACAAAGCACAAACAGTATATCCAAAATTATACCTATACACTTATAGTTATGCTACATATA-TAGAAAGATATAAATAGAAAATAGAGAAAAAAGAAAAGAAAAAAAAAAACCAAACATAACATGTTGATTATAATGATATATTATGATGAGAACGATGATAACGATGATAACGATATTGATGATGCTGATGATAATGATAATAATGCTGATGATAATGATAATAATGCTGATGATAATCACAGACGTAATGCTAAT-----AAATTTCATATCTTGTTTGCAAGAAGATTAAACAAAAA--AAAATACCAAC
>car 19402255 19403344|24421 chrX 19401829 19402754 scaffold_26 1882906 1883843 + 27592|432 966
GGCCGGCGGCTAAGCCGACTGGAAGCCTATCGCCTGTCCAACGCCCACGGCCTGGCACGTGGATGAAACGCGTCCGTTCCGCTGAAGCCGAGATCAAAGAGAAAGGGCAAGC----GGCGCAGCGCGGCAATCGGGACTGCAGATGAGAATCCAGGATGCTAGGGGCGTTGTGAATGACACGATTACTAAGG------ACTCGCCGGCAAGCGGAAACCATAAAATATTTATTTTTCGAACGCGGCATTTATTATTTATTCTTGTAACCTA-------AAGAGCATGTATGTATATAGATAGATTCAAGCATA-ATATGTATATTTATGTATACCG---AAGTATGTAGTCTTAAGC--AAAAAAAAAAAACAAAAAAAT-----TGCAAATCCCATTTATTCAA----GCTTGGCAATTGTAG---TTTTAAGTGCAAATAATTCCAACTTTCAATCATACATACGTGTGCAAGACAAATATTTTCAAAATAAAAAGTTTAGTCAATGTTATGCCGCCACATACATATATATAT
AGGCAGCGCCTGAGCCGCTTGGAGGCACATCGTCTATCCATCGCCTGTGGCTTGACACGCGGACGGAACGCCTCCATTCCAATGAGGCCATGACCAAAGCATCGCCACCAGCCGAAGCAGCAGCGCAGCGTTCT---CTTTAGATCGGAG----------CAGCCGCCGCCCAAGCAACCCAATTAGAAAAGTTTACATCTTATATACAACTACAAACATACATATATTAATATGCAGAGCTTATCA-ATGTTATTTTTCTACATAATTTACACACCTACAAGCACACACACACACACACACACACACACACAGAGACACACACGCCTGCAAACCTTTCAAGTATATTAGAATATGCCTGCATATAATAACCGTTAATGTATTTATGTATAACCCACTTGTATACATATACTTTATATGTGTAGAGTTTGTGAGTGCAAAAGCTTTTGA-----AATCCTTTATATGTCAACTATATATGCAT-------ATATATATGTCTGT--ATGTACGTATGCCATATGCATACACATAT
>car 19402255 19403344|24422 chrX 19402755 19403002 scaffold_16 2240951 2241214 + -447|0 292
TCCCCAGCGCCATATACAGATTACAAACCGCATATTTAACCGCATATCGATGTTTTATGAGCCC---GTAAATTGCCCGTATTGCTTGTAAATGGTT---ATGAATTTCTAAATGATGTGAATTTGATGTAACTTTGTGTATGTTCGTTCAACAGCAGCAAGTGCA-----------TTGAATGTTCCTCA-------AGGCTTATCCTTAAGCATGTATATCATATCCGGAAAGTATT------GGATCCAATGGATGGCGGA---------------AATCCAAATATGTT
TTGCC-------TAAAAAAGTTTTGACGTCTACAATTG-----ATTTTGTTGTTTTGAAAACTTTAGGAAAATTCCTCTTAC--ATTAAAAATCATTCTCATGAATTCA--------------TTGCTGTCACTACGTTTTTTTTTTTTTACAATTAAAAGGTGCATACTAAATTTGTTCAGTGTTCATCAGTTACGTAGGTATGTACGTATGTATGTATGT-ATGTAAATGATGTACTATGTTAGGCTTTAATTGATTGCTTGTTATTATTTTCGTTTAATCAAAATATGTT
>CG14205 19429328 19429485|24453 chrX 19429188 19430098 scaffold_29 527433 528360 - -4416|173 343
GGATCTCGAAACTATTT------------ATGAGCAAAGATATC-AATTATAGGTTAAGGACCTTTTTTTACTAATGTTAGTTCATTTAAGACATACATATATTCTTTAAAACTACAAAGGTAGATCATAAATATGAATATACCAAAGAAATACAATATTATCGACAATTC
TCATTCCTAAACTTTTTACTCACTATTCAATTAGAATAGGTTTCTATTTATAAAACAATTTACTTTTATTTTTCTTATCAACTTGTTATAAAATTGTATTTCGGC-CTAATTCTGCACTTGTG------AGCTGTCAAAAAACTCAAGAGATAGTGTATCGT------TTT
>RpS10b 19432854 19433015|24454 chrX 19432332 19433185 scaffold_25 1259825 1260699 + 36490|529 716
ACAACCCAGGCGCTTCAGTTTTTTTTTCTAATGTATAAAAAATTACTCAGTAAAATGTTCAACTGAAGATCCATACCCTTAACAATAGAAGAAACCAACATCTGAAAAATGTGTGTGTGTTTTATGATATG-------------------------ACGATCAATTATAAAGCAAACGC-AAGTGAAA
ACA------GCGTTTTTTTTTATTCAACTTAAATTTAAACGAGTTCCCAACTCTGGAACTAACCCAACAACAACAACAAAAAACTAAGAAAAAACAAAC-----AAAATTGTGTGAATGTTTTGTATTATGAAGCAGAAGATTGCAGCAATGCAATACGACAAATTATAAAGCAAGCGCAAAGTGAAA
>CG14207 19444828 19445130|24470 chrX 19444614 19445188 scaffold_25 1273022 1273686 + 18880|214 608
A-GGCCAGCCCAGTTGTCCAGTTGTCC-----------AGCTATCCAGTCACCATGGTCCCAAGCCGGTTGAGGAGCAATAGGCGCAGGA---------------GGAGCAGGAGGAGTGCGAGCTGCTGCCGATCAGATTAAA------------------------------TCCATACACACATTGAGTTTAATCCAATCCTAT-----------CTAAATGATTA------ATTTTTTTGGTTCTGACTTAAAGCTAAACTATGT---TACTGACGTACTACTCAT------------TAACTTAAATATAATTGAAATTATTATTAAATTTGATTAATTTAATTCATATTTATAATTTTCGC-ATTAAACGTAATCAATT--TTGCCGTA
ACAGCCAGAGACGT--TCCCGCCACCCCCATCCCTGAGAGCAGCACGGGCAGCATCTTCTCCAGCAATAAAGCCCGCAATAAACACACAATATATCAACCTATCCGCAACAGATGCCCAGCGTATTTCTAGC-ACCATACTAAAAAAAAAAAAGAAGAAAATCACCGCAGTTTCCCAAAGTTGACTTTGGGCTCAACAAAATAGAATTCAGAATTGGCCTAAATAATTACACTATGTTTTTTTTTTTTTTCGTTTTTGCTAAAATATATAAATACTGACTTACTACTCATACTTAACTGTAATAACTTAAGTGTAATGCAAATTATTATTAAATTTGATTAATTTAATTCATATTTATAAATCACGCAATTAAATGTTATTATTTTCTTGTCGTA
>Tyler 19446858 19447244|24471 chrX 19445762 19447256 scaffold_25 1275090 1276487 + 42117|1114 1503
CTTTGCCTCGAGTGTAATCGAGTTCTGGAAACGTCATCCCGCAGGTGGCTACCTTTGTGACCATGCCCTTTGACCTGATCACCACGCACACGCAGATTGAGCTGGGTCAGGACGTTCTGTAC---GAGGAGATTGGAGCGGGAACAGGAGCGGGAACGGGAACAGGAGCAGGAGCACGACCAAAGACACCGCAAAGTGCCGTCGCCAATTCCAGGCCATCGGTGCTCTCGCGAATGCGTCAAATTTACAGGCTGCAGGGAGTGCGGGGCCTCTATGTCGGGGTGATGCCGCGCATGCTACGTGTGGTGCCCGCCTGTGCCATCATGATCTCCACCTTCGAATACAGCAAGTCGTTCTTCTTCCACTACAATCTGGATCTCCAGGAGGCAG
-TTTATCTGCAATACAATTTGATTTT----ATTTGATTTC-CAGTTGGCCACCTTGGTGACAATGCCCTTCGATTTAATTACCACACATACGCAAATTGAACTGGGACAGGATGTGCTATACTCCGATTCATCTGGATCGGGCAAAGGCG-----------GCACTGGTGGTTCCGCAACCACGGCTGCCACC--GCATCGGCTCCGG--CCAAACAGTCGGTGTTTACACGCTTAAGCATGATATATCGCCAGCAGGGTATACGGGGGCTCTATGTTGGCGTTATACCAAGGATGCTACGAGTTGTGCCAGCCTGTGCCATTATGATATCGGCATTTGAGTACAGTAAATCGTTCTTCTTTCGCTATAATCTTGATTTAAAGGATACCG
>Tyler 19447850 19448080|24473 chrX 19447698 19448093 scaffold_25 1276899 1277233 + 3325|152 386
CTTACCGGCGCTCCCAGTGAAGC----AACCGCCAATCGCGTGGAAGAGGAGCAAGTGCATCTGTCATGGCTACGAGGGAGGCCTGCGGCCAGTTTGCTGCTGCCAGTGCGGCAATGGCGGCTGCTTCCAGTCAAAATCCGTCGAAGGCCACGATGACGGACCCCCGTTTTCGGATCCGACCCCTGCAGCAAGTGGCATCCGCCTGTACCGGCGCCATGGTGACGGCCTGCTTTA
GTTACGGACGTGCTAATTAAAGCGTCAAACAGAAAGTTCCAGAGTACAAGATGAAACCCAGC-------GCAACCATG----CCGGAGGCCAAAT-----------ATGAGACCCCGGCGAA-----CCAGACAACA-CAGGCCAAGTATACAATGATAGATCCCAGATTTCGCATACGTCCTATGCAGCAGGTAGTGTCCGCCTGCACGGGTGCCATGATAACAGCCTGCTTTA
>Tyler 19448150 19448319|24474 chrX 19448144 19449443 scaffold_25 1277296 1278586 + 49033|6 217
TGACCCCTCTGGATGTGATCAAGACCCGCTTGCAGGCACAGCAGCAGGCGCTGCTCTCAAACAAGTGTTTCCTCTACTGCAACGGCCTCATGGACCACATCTGCCCCTGCGGCCCGGACACGCCC------------AACCCAGCAGCCGCCAAGC------------------------------CCGCTCCCCGTTTTTCTGGCACCATT
TGACGCCTTTGGACGTAATCAAGACCCGTTTGCAGGCACAACAATCGGCACTGCTGTCCAATAAATGTTTCCTATATTGCAACGGCCTCATGGATCACATATGTCCTTGCGGTCCGAACACGCCCCCGCCCACTTCTAGTCATGCATTTACCAAGCTCTCGCCTGCTTCTGCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCCACTTTACGGGCACCATT
>Tyler 19448379 19448888|24474 chrX 19448144 19449443 scaffold_25 1277296 1278586 + 49033|287 796
GACGCATTCATCAAAATCAGCCGCACTGAGGGCATCGGCTCCCTGTGGTCGGGGCTCAGCCCAACGCTAATCTCGGCCCTGCCCTCGACCATCATATACTTCGTGGCTTATGAGCAGTTCAAGGCCCGTTTCACCGATATCCACTACAAATACACGCGACGCCCGGATACCATTGCCCACGACATTCCACACCCGATTCCATTTCTGGTGCCGCTGCTGGCCGGCGTGTCGGGCCGCATTCTGGCCGTAACCTGTGTAAGTCCCGTCGAGCTAATCCGCACCAAGATGCAATCGCAGCGCATGACGCACGCCGAGATGTTTGGCACCATTCGCCAAGTGGTGCAGTCGCAGGGCGTGCTGGGCTTGTGGCGCGGTCTGCCGCCAACCATCCTGCGCGACGTGCCCTTCTCCGGCATCTACTGGACCTGCTACGAGTACCTCAAGAGCTCCTTTGGCGTTGTGGAGCCAACGTTTAGCTTCAGCTTTGCGGCGGGAGCGATATCCGGATCG
GATGCATTCATTAAAATTAGCCGCACTGAAGGCATCGGGTCACTCTGGTCTGGCTTGAGTCCGACGCTCATCTCGGCCTTGCCCTCAACCATTATATACTTTGTGGCCTACGAACAGTTCAAGGCACGTTTCACCGATCTGCACTACAAGTACCTG--GCGCCAGTACAGAGTTCACCAT-ATAGTCGGGAC---ATTCCAATGCTGGTGCCATTACTGGCGGGCGTTACGGCCCGCATACTGGCTGTGACCTTTGTTAGCCCCATTGAGATGATACGCACCAAAATGCAATCGCAAAGGATGACTAACGCCGAAATGATCGGCTCCATACGACAGGTGATGCAGTCGCAGGGTATTTTGGGTCTATGGCGCGGCCTGCCGCCCACCATACTCCGCGATGTGCCCTTCTCTGGTATTTATTGGACCTGTTACGAATATCTCAAGAGCAGCTTTAATGTCGTCGAGCCCACGTTTGGCTTTAGTTTTGTCGCCGGTGCCATTTCAGGCTCT
>Tyler 19448961 19449042|24474 chrX 19448144 19449443 scaffold_25 1277296 1278586 + 49033|874 955
GTGGCCGCCACCATCACCACGCCCTTCGATGTGGTGAAAACGCACGAGCAGATCGAATTCGGCGAGAAGTTCATATTCTCAG
GTGGCTGCATCGATAACCACGCCATTTGATGTAATTAAGACGCATGAGCAAATCGAGTTCGGTGAGAAATTCATATTTACAG
>Tyler 19449121 19449551|24474 chrX 19448144 19449443 scaffold_25 1277296 1278586 + 49033|1034 1357
ATAATCCACCCAAGCAAGTGGCCACCAAGTCGGTGGCGATGCGCCTGGCCAGCATTTACCGCATGGGCGGTGTGCCCGCCATTTTCTCTGGACTGGGGCCCCGACTCTTCAAGGTAGCGCCCGCATGTGCGATAATGATTTCGTCCTTCGAGTACGGCAAGTCATTCTTCTATCACTACAACATCGACCAGCACAATCGGAGCAATCAGGCGACAAAGGGGCCCGGCTCCTGAACGCGCTCCCAATGCGGTGACCACAGCATGT-CGACGTGAATCTTTGTACATATGTAGATTAATGCCAAAGTTGCCAGGAAATCGGTGGGC
ATAATCCGCCCAAGAGTACGCCGACCAGGTCAGTCATGGATCGTATGGCAAGCATTTATCGCTTGAATGGGCTGCGGGGCGTATTTTCAGGACTCGGACCGCGTTTGTTTAAAGTGGCGCCAGCCTGCGCGATCATGATATCAACATTCGAGCATAGCAAGGCTTTCTTCTATCATTACAATGTTGACCAGCATA---------ATCAGGC--------------GCTGTTG-----GCCATAAATAGTGCAACAAAAGCGAATACGACCTCAACATATG---ATACGAGGGCAAAGGACTAGATGGACTGGAAGTGGCTCGAC
>Tyler 19449121 19449551|24475 chrX 19449533 19450764 scaffold_25 1278662 1279885 + 18639|0 21
GAAAACAAACATGA---GCTTA
AAAAACAAACCAAAATCGCTGG
>CG14211 19458569 19459666|24484 chrX 19458443 19458596 scaffold_25 479762 479909 + 8312|126 153
GTGCAGCGTGCTGGAAATAGAGCGAGAT
AAGT--CGCACTCCACACAGATATATAT
>CG14211 19458569 19459666|24485 chrX 19458681 19458771 scaffold_25 480001 480106 + 1409|0 107
GCTTGGATTGATTGATCAGTGCTT--ATCAGTGCTGGCCAACATTG---------------ATGTCCTACATATATACATATATGGGCATTAAGTTATGTTTCTATGG
GCTGATGCTGATTTATTTATAGTTTAATTTAACCTGGTCAACCTGGCCAGACCAAGCATATATGTACTATATATATATGTATATGTGTATGTA--TATGTATATATAG
>CG14211 19458569 19459666|24486 chrX 19459193 19460591 scaffold_25 1917356 1918882 + 19828|0 561
AATTATACACTTACTTATGTACGTGCGATATAGTGCACC--CATATTTGTTGGAAGCCATACAAGTATGTATATTGATCTTTGCTGTTCCATATGCATTTGCATAGCTTTTTGCATGT---TACCAACACACACACACACACACAAACTATGAATGTATTTTAGATATTTAAACCTTTTTGGAAAATATTTTATGCAACGGAAAACGAAACAACATTTTTCAATGACAATATCTAAAA----CTTATGC--GATATACATACATATAATACACACATTATATTATAATTACAACATTGTCGGCCAA----------ACGGACACGTCGGTCGCATGGTCGATGGA----------------------------------ACGAAGAT--------CCCCCCCAGCTTCCATGGGACTTCGTGCA-----------CCTTCGGATATTGGCGCTACCTTATCGATATTGATGTGCTT-TGTTCACCCATATCTACTGTACT----GTTT------AAACGAGTGTGTGCATTGATATT---AAAGTCAAATTGTTTGTTTTCC
AAATACACATATACATACCTACATACATAATAACATACCTGCATATATACATACAAGCATACATACATACATACAAACATATATAATTACATACTTACATACATAGATACGTACATACATACACAAATACATACATACATACACAA-CTACATAC-------AGACATATACACATACATACA--------TACATAAGTAGAATCGAA---------------GAAGATATCAAAAAGCGTATTAAGTTAGACATACATACATATG-TACATACGAGAGTCTGCTATTTAAATAAAAGTGGTCAATTTCCTTTCTGCGGACAACCCTGTTGCCTGTTGCATGCATTTGTACAGGGTAGAAACACATTGGTGTTGCCAGACGGAGACAGGAAATGCCCGAAAAGAATGCGCGAGAGCGAGCGAAAGAGAGCGATGCTCTGCGCTCTTCTCTCTTGTATGTGAATATATATATATATATATATATATATATAAATTGAACTTAACATTTGCTAAGAAAAGAAAATTTGCTGTTATTTTTAAAAAATTCAATAAACACATACAT
>CG14212 19460464 19460542|24486 chrX 19459193 19460591 scaffold_25 1917356 1918882 + 19828|1399 1503
AGTTTG--------------------------TGGTAAGGCCAGGTTATTAATGCTGCTGTTTTATTCGACTTAAAAATAAATCTTTCAGTATGTATACATAAGA
GGTTGGGGTGGGGCAGCCAAAAAGAAATTTATTGGTAAGGCAAAATTATTAATGCTGCTGTTTTATTCGACTTATTAATTAATTTTCTGCTTTGTATACATATAT
>CG14213 19474408 19474688|24494 chrX 19473246 19474408 scaffold_25 126001 127105 - 53334|1210 1210
G
G
>CG14213 19474408 19474688|24495 chrX 19474610 19474748 scaffold_42 829187 829322 - 1371|0 78
TACAAATAAATTAATGTTAATACTAAGATTGTCACTGACACCCAATAAAGAACCTCGAGCAGACGATACGATATAAATA
TACAGACGCGTTGTTGCCGTTGCTG---TTGTTGCAGGGTCCCCACGACGAGTTTCGAAAAAAAAAAAAAAAAAACAAA
>CG14214 19478031 19478432|24500 chrX 19477663 19478265 scaffold_25 1938377 1939086 + 18072|431 726
AT-GCGCTGAGTGGC------------------AAGGAAACCACCAATCATCCAATCATCCATTATA--------------------GCATACATCAGATCAACGTCTTTTTTTTTCGTTTAGTTAACATGCATTATATGTATGGACCATGTGCATTCAGCGAATGCC-------TTTCTAACAAAATTCTACACAAACGTACGAAAACGTATTGTAATG--TTTCGATATTCCATT-------CATGAACAAGTTAGTTAATAAGATTC------AAATGTAAAAAGGAATCACC
ATCTTGGCGATTGGCAATTGGTCAGGAGGAGAGAAGGAGATGAACAATAAT--AATCATCAATTTTACGTAGAATATTTCTTTTCGCGCCTAAACAACATAAATATACTTTAATTTTTTTTCCTGTATA---GTTACAC-CAAGCACTATGTACATTCAACGAATGTCCTCTTTTTTTGTAACAAAATTTT-CATGTATGT---GAAATGTATTGCAATAATGTTCAAATTCCCATTCACAACACATGAAC--GTTAGTTAATAAGCGTCAGTAATAAACGAAAAAAAAAACAATC
>CG14216 19499291 19500812|24518 chrX 19498506 19499342 scaffold_25 1158438 1159328 + 34485|852 911
CG--ACCGACG---TCTGCTAACAGTTCGTGTCCA---GCTCCAGCACCAACACCAGACT
CAGTGCCGAGGAGCTCTGTTAACGGTACATGTCCAAACAATCAATCACCTGCGCTCCACT
>CG14216 19499291 19500812|24519 chrX 19499343 19499798 scaffold_9 1967266 1967713 + -1855|0 481
CCCGTAGCC-CCGACGCGCTCCAGCCGAGTCACTCGATCTTGTACCCCAGGGGCTGCGATCGCAGAGCATAGGACGTCGGGCATTGC----------GCGCAGCGCGTGCGGATCCTGGGTTCCGGATTGGTAGCCTAGCATATAAGAATACTGTAAATAGAGAGGGGCCATCGCTGCAGCGAAAGCACATCCAACAACGACCAGCACCCACACACTCGCATACTCCAAACACCTGATTCGTAATCCACATCAACACCACACATGCAAGCAACTGGCTAATGAATTGGAATATA---ACACACAACCAATGACGACC-----ATTTCCACACGGCTGCCCCCCAAAACCCCTGTAG---TAGTATGTGTACGTGTCCGTATTCCTTGTAATTTCGCCCGTCGACTGGGGGTCTTATCACAGGCTCTCGCTTCCCTCAGCTGGCGAAGGC----GCCGACCATCTGACTCCGACCCGTTCTCC
CCCGTGTCCACCAGCGTGCATCAGTAA--------GATTTCATAAATGTGGAGCGTAAAACGTAAATTGATAAATGTCAACCCTTGCAGATGCATCAGCGCCGCCAATCCG--CCCGTGATTGTGCACTGTTCGGCGGGCAT------------TGGACGCACCGGCGTGCTCATACTAATGGACACGGCTCTGGCACTGATGGAGGCGCGCGAGCCCGTCTATCCGCTGGACATTGTGCGCACCATGCGCGATCAACGCGCATGCA------TGGTAAAGAATGTGGTAAGTGTCTATGCATGATTAATCATGACTGATTAATCTTTAGCTAGCTTTTCTCTAAATCCCTTTCAGAGTCAATATCGCTTTGTATGTGAATGC------ATTTGCGCGGCCTACATGAAGATATCTCGCAGCAGCGCGGCCATCAACGATGATGACGACTAGAGCCGGCCAGCTGCCCTTTCCAAGTTCTAC
>Zw 19506124 19506289|24523 chrX 19505360 19506300 scaffold_565 12 1004 - 47872|771 981
--GCGTTTGGAGCACACCAATCCCCGGGCTGGGTTCG-------CAGGA---TACTCCTCTCTGTCCGCACGTACATGTACATACATACATATATATGTATATATACATATA----------------TGCATTCTTT------------GGTTATTT-GTAATTCGGTCTGTACAAGA----TTTTTTTTTATTAAATATACAAAATAGT
GTGCGCCCCCAGCCCGGCCCGGCCCGGCCCGGATTCGACTTGGTCATGGACTTACCTTACACTTACTATAGCTACATATATTTTTATATATACATCTTTATATATATATATATTTCATTGTAGATAAGTGCTTTTTTTTTCTTTGCTTTCGGTTATTTCTTATTTTGGTTTTTACAACAGTTGTGTTTTTTTTTTTATTTTATTAAATTTA
>CG14224 19520004 19521182|24538 chrX 19519906 19520079 scaffold_25 1182843 1183019 + 5820|98 179
CAAGGCTAAGCCATAGCCATAAC---CAAACTGTACACAA--CCTGTCTATATATCTACGAACTACAACTAC-TATATATAC
CACTGTTAAGGCGCACGCCTTACGTACACGCCAAACGCAAATATCGTCTATATATATATA---TATATATACATATATATAC
>CG14224 19520004 19521182|24539 chrX 19521036 19521238 scaffold_15 2672460 2672686 + 2388|0 173
TTGTTGCACACAAGCGATTTGCATGCTAACGATATC-TACTGTAAGTTAATGTGTGT-----ATATAGGTATATATATATGTATATACATATATATATATATATCAAAA-----TATTC-----CAAGGTGTTAAC-----------AAAAGACGTAAAACTATAAAACAAAAA
GTGTTGCGTACAAACGATGTTGACGATGACGAAAACAAAAGGCAATTAAATTTGTGGCCAAAATAAAGGCGCCGGCACACGCAAGTCGTTGGGAAGACTTGGGGCAACAACAGGTGTTCAGGCTTACGGGGTTGGCTTGCCAATCAAAAGAAACGAAAAGCTAAAACACAACAA
>Cdc42 19532532 19533189|24548 chrX 19531869 19532611 scaffold_25 1192423 1193207 + 42044|687 787
TTCTGCTTTCCTCACACGCGGTATCCCTTTCATTCTGGCTTTCTAC---------------------TATCGCAATGACTCCTTCCCAGCCTCCCGTCGTC
TTATTTTTGTTTCTTTGTTGTTTTTCGGTTGTTTTTTTTTTTCTGCATCGCTCCCAACAACAAAAATTAATGCAGCCACCCCCCCCCCCCCTTCCACCCTT
>Cdc42 19532532 19533189|24549 chrX 19532632 19532789 scaffold_25 1193215 1193332 + 177|0 160
CCGTATATATATATATATAACATATATATATATATATGTATATATATTGGTCTTGATTTACGTTATTCTGCATTAGCCCAGTACTCCATGAGCTATTTCTCCTCGCCGCCATCCGCCTGTGTCCCCACTCCCACTCTACTCTTTT---TGTCTCACACACC
CCACAAATAC-TATATATAACCTATACACG-ATATAT-----TGTATTG-TATAAATTTGCTGT----------------------------CTATATCTCTTT-------TTAAATTGTTCTCTCAATCTTTATACACGCTTTTAAATGTCCAACCCCCC
>Cdc42 19532532 19533189|24550 chrX 19532954 19534154 scaffold_25 1193477 1194688 + 8942|0 238
CCACAAGCTT-CAGCTCCAATCCCCGCCAGGATCCAATCGCAGCCAATCGAATCGAAACCCAGCCGACTTCATTTCTGCTCCCAAACATGTTTTTGGCGCAATTTTCGAATTAAGTAAA-AAGAGGAACCACAATATCAATATAGCGAAAACAAATGATTTATATATAAATATATATATATATATATGTATAT-ATATATATATTTCTTTATATATATATACAAAGATTAAGGAGAGGC
CTACATTTTTGCAAATCAAAATTCCGCTTGCGCCC------------------CGAGACCC-------TTCAGAGCCGCTCTT---TATACTTTTGGCGCGATTTCTTA--TAAGAAAATAAAAGCAAAAACAAAAAAAATA-AGCAAAAA-AAACAAACCAAGAACAACAATAACAATATAGCAAAACAAATTATTTATATATTCATATATATATATATACAAA-ATTAAGAAAAGAA
>Bap 19568168 19568524|24590 chrX 19565269 19568447 scaffold_36 519546 522683 - 194686|2918 3246
GCGTTCCATGGCGCACATCCGATGGCATAGGATAAGCACAAAGCAA------------------TTGGAGCTATCGATTTGCGTGTG-----TTGAAGATTA---GCTCAACAATAAGTTGTAAATT-------------TACGTATTATTATT-ATATTGTGTATTGGCCGAATCGCCACCTACATATATTATTTATGCATATGCACACATATAAAATCCAATCGGGTTCGTCGAGAGATCTGTTAATTGT-----TAATCGGAGCTGCTTGTCACTCAGTGTACTAACGTGTA----ATAGCAACGTTGCATAACCGCATTCCAAAA
-------ATGG---ACACAAGAGGCAACAGGAGCAACA-ACAACAACAACAACAACAATTCGGGTTGAAATTATAAAACTTTATGTAGTTATTTGAATATTACGCGTTAAATGAAAAATCCTCAAGTACGCAAACCTTGAGGTGTATTATTATTAATATTATCTATTTTACAATT----------ATATATACATAATACATACACACATATATA-------------------TATATATATATTATATGTGTGCATAACTGGAGCACATTATAAAACGCTGCCCGAATCCAAAAACCAAATCGACGTTGGA----CGCATTCCAAAA
>Bap 19568168 19568524|24591 chrX 19568448 19568540 scaffold_5 1943867 1943958 + 1384|0 76
CTCTGTAACCCCATATGTCCTATGGTCGGCATCTATGTATATGTTTGTGTCCTAGTAAAATGCGAAACACTAAATAA
CACTGAAAACACATAGATCCTATGCTCGTTGTTGTTGTTTGTTTGTTTGTTTCAAATACGTGATAAACAA-AAAGAA
>CG14234 19572321 19574393|24597 chrX 19572069 19572434 scaffold_36 527673 528040 - 16475|264 379
CAAACAAGCAATAGCTACATGTAACTATACCCGTAGGGGGGCTACGGGCTGCGGTACTTGGGCGCG-GATGTGGTCAT-GGTCGGGGGACACAACTGTATGGTTGGATAGTTAAAC
CAAACAAGCAATAGCTACATGTAACTATATCCGTAAGGGGGGCAGAGAGAGAGAGA---GAGAGAGAGAGCTGGACATGGGTCGGGGG---CGATTACAGGACTAGAGAGCTGGAC
>CG14234 19572321 19574393|24598 chrX 19573430 19573467 scaffold_36 530144 530181 - 2323|0 37
AGACATTAGATCCATGCAAACAGCGGTACAAACTTCAG
AAGTATAAGATCCATGCAAACTGCAGTACAAACTCAAG
>CG14234 19572321 19574393|24599 chrX 19573784 19574575 scaffold_36 530197 530923 - 1075|0 643
CAAAGAAGGATTGGACATTGCCGGGCAGG--AACTTCCATGTCGAATCGGTTGGTTTCCAAGTCGCAAACACCTATACTAAATACAACTCGAGTTTCCTGTTAAGTTGATTAGCAATTAGTTTCTAGGAATGGCTGCCGTCCGCAATTGTTGATTT---------ATTACTATCGAAGACTATAGACTTTATATTTCCGAAT----------------TTTGTTCTCAAACTCAAGTGC----TTATACTTTGATTCCTATTAGTTGTTCACTCTATCCTCCTGTCGTTCTAATGTTCAACAGCAATGTCTAATGCAGCACGATAATGCATTTAACTTCGGCAAACAGTAGACGTTTTGTACGACACACTCAATTCGGTTTAATA--AAATATATATATAAAAAAAAAGGATAATAACTGCAAACTAAAGTAGTGAAAATCATAAAAAGAGTTGCACACATGTATACACCACTAATGAAATCCAATTAAAAACTAATATAACAAAAAGGCCAAAAGCGATTATAACCAGAAAGAATCCGATTTCCGAATGAAATCAAGTCT-TGAGACGACGGGCTGCCAAAGATTAAACAACTTGTAATGAGCAAACAGAAAAGTAATATTAAATAAACGATGCAGGCCACAT
CAAAGCCCGATTAGACATTGCCAAGCAAATAAGCACGCACATTTAA-CATTAGGTTTACAA--------------TGCATGTTAAAACCTCAGACTAATTTCAAGCTAAACAACAA--AACAAAACCGAATTGCTGCCGTCCGCAATTGTTAATTTTGGAAATTGTTTGTTTTCGAAAAAAAAAAAATATATGAAAACCAATCGGACAAACAATTCAACTTGTTTATCGTTTCAAACGCCGTACTATATATTTATGTTAATTAG--GTTTATTTAAT-------------TTATAGCCAAAAACAATGTCTAATCAGG-----------GTTTACTGCCAG--AGTAGAAAACCTTACAAGCTCTGCATTTAA--AAGTTTAATATGAAATTTCCAGCTAGAAATAGAAAGAAATAAGTAGAAACAAAAACCCGAAAAGCTAT-------GTAGCAAAACTTTGCAT----------AAATTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA---AAAAATGAT--------AAAATAAATCAATACACGTATTCAGCTAAGTTTATAATAATACG------------TATAACAAATTGTA------AGAAAAATAAATAATGCGAGCCAAAACAAATATGACAAAT
>Rpp20 19579043 19579684|24602 chrX 19577233 19579790 scaffold_36 535752 538481 - 51913|2120 2810
CA-----------------------------------------TGTTCAAACTCTCGGAGCTGGTGCGCTGGCTGGGGCTCACCGAGTTCGAGATTCTGGTCAATCTGTGCGGCCTGCTGGTGTTCACCATCACGCTGACCGTCAAGCTCCATCTGCAGGCCAGGGCCGGACCCGGTGGCATACTCCCGGAGCCCATGGGCGACTGGTTCACCGTCTTCAGCCCCCTGTTCTTCATCGACATCTGCAACGCGTACTTTTGCGTCATTGTGGGCATCCGCATGTACCTGGACTCTAACAACAAGCGCAAAGCCCTGCATCGCTTCATGTGGAGCACGTATTTCCTGGTGCTCATCGCCATCTTCAAGTACCTGCTCTGCCTGAAGCTATCCAGCAAGACGGGCCTCGAGTATTCGGAGGTCTTCTCGCCGATCTTCGTTCTGTTGCAGCTCGTGGCTGTGCGCGCCTGCCAGTTGCCCAACTCCATCTAAACCATAGACGTAGTATAGCCCTAGTTCCGTATTATACATATATGTAACTATTCTGAAAGCCTTTAAATCATTGGATTGGTAGTTATCTGTATACGCAATGTGGTACAATAATTTTTAAGCGGTACGAAATTTATCTTTCTGGATATAGCATATCTAATATATACGAA-----TTATATCTGATCTGATTCGGTA---TGAAG
CAACAACAACAACATAAGAAACCGAAACATAAGTAAAAGAAAATGTTCAAATTATCGGAGCTGGTGCGCTGGCTGGGGCTAACCGAGTTCGAGATATTGGTTAATCTGTGCGGCCTGCTCGTGTTTACCATAACGCTGGTCTTTAAGAT--ATC----------GGGCACATTTAACAATATAATGCCGGAGCTAATGTGCGACTGGTTTAGCATATTCAGTCCATTGTTCTTCATCGATATATGCAATGCATATTTTTGCGTTATTGTTGGCATACGCATGTACCTGGACTCGGATAACAAACGGAAGGCGCTGCATCGTTTCATGTGGAGCACATATTTCCTTGTACTTATCGCCATCTTCAAGTATTTGCTGTGCCTCAAGCTATCCGGCAAAACGGGCCTCGAGTACAGCGAAGTTTTCTCGCCCATTTTCGTGCTGCTGCAGCTTGTTGCGGTTCGTGCCTGCCAGCTGCCCAACTCTATTTAA----------------------AATCATCTAATCTACAT---TGTAAACCCCCT-----CCTGAAATGCCTACGATTAGTTATTATATATATGTGTGTATATATATAATA--TTGTAAGCGA-------------GTTATGAACATA------CAAATACATACAAAAGTTTTTGTACACGCACTTAGCCAGCCCATTGCAA
>CG33932 19579491 19579684|24602 chrX 19577233 19579790 scaffold_36 535752 538481 - 51913|2609 2810
ACCATAGACGTAGTATAGCCCTAGTTCCGTATTATACATATATGTAACTATTCTGAAAGCCTTTAAATCATTGGATTGGTAGTTATCTGTATACGCAATGTGGTACAATAATTTTTAAGCGGTACGAAATTTATCTTTCTGGATATAGCATATCTAATATATACGAA-----TTATATCTGATCTGATTCGGTA---TGAAG
----------------------AATCATCTAATCTACAT---TGTAAACCCCCT-----CCTGAAATGCCTACGATTAGTTATTATATATATGTGTGTATATATATAATA--TTGTAAGCGA-------------GTTATGAACATA------CAAATACATACAAAAGTTTTTGTACACGCACTTAGCCAGCCCATTGCAA
>CG32528 19581808 19582395|24606 chrX 19581137 19581814 scaffold_36 540181 540933 - 43699|749 755
GTGAAAC
GCTAAAT
>CG32528 19581808 19582395|24607 chrX 19581861 19582251 scaffold_36 540964 541256 - 2244|0 390
ATTTTACATTTTATATTAACTTTTTGATAGTGTTTACACGCCTAATTTATGTGCGTTCTCGAAACTGATTGTAGGCGATGCAGCGGTTAAAGCTTACTGATCCTAACTCTCAAAACCACAACTAAATGCTGCGTCGCGTATAATCAGCCCAAGGAATGTTTATATATATATATATATATTTATGTGTCGTACGTCTAACCACTGCGATCTGCTCCAGATTCAGATTGCTCGGAACAGGAAGGAGCAGAGCAGAGCAGAGCTAACCCAAACCCAAAATCCGGCGGCCAGTTGTTAACTTGTCTTACTCACGTGCCAGACGTTGTAGTTGTTACTAAGTGAATTTATTGTATTAATACATTATTTGAACACAATAACCGAGATTGTGCCTTTA
ATTTTATTTTTTTTTTTTTATTTTTGTTA-----TAAATTAATAATTTATGCATGCTTAAATCGTAAATCGGAAATGAAATTGAAATTGAAAAT-----GTCCTAACTGTTTA---TATATTCAAGTGTTCT---------------------AACTGTTTATATAT-TGTATGTATATGTATGTGT-GCATGTGTGTGTGC----ATCTAATCCCGTTGTAAGCTGTTGGCCGCCGCAACGA------------AAAGCTAACC----------------CGCCCGATTGTTAAGTTGCTT--------------------TAGTTGTTACTAAATGAATTTAT-------ATACATTTTATAATTGTATTAATAAA---TGTGCCTTGA
>CG12534 19583789 19584108|24608 chrX 19582991 19583789 scaffold_36 541753 542556 - 29150|830 830
G
G
>CG12703 19592695 19593227|24614 chrX 19592252 19593223 scaffold_28 1473781 1474911 - 29041|443 1167
AACTAGCAATTTCCAT---------------------------------------------------------------------------TCTTCA-------AGCCCAAGCCCGA-----TGATGATCATACCGCTCTGGCTTCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCATGCGGTGCA-------CTGTATATACCGAGAT-------------TGTATATATTGCAAGTTGGAAA--TGCTTCCTTGTTTCGA------------------------------TTGTGATTGTTTCTTTTGTACGCTATTCCACACTATA---TTCCGTTTTATATAATTCCCTCGCTGGGATTTAAGATGTGTAACTCTGAGAATCGAGCTGGTGTTAGTGATGTAAGCGTAAAGTAGTCGGCGCACAGCCACAAGCGATGGATGAGCGTTTAGAAAAGCTTTTAGTGAATAACACACCCATACCTGTAGTAGACCTGCATAC-CGCACAAGTCCCAAATCGCGCATAGAGAACTTATAGTAATTTGTAAAATACGCTTGGCTTATT--------------------CAAATGTTTTGTATTTTTGGTTGAATTGGAA-TTGGAATGGAAC-----------------------------CTTGCA---CGGCAATAATGTATTGCATTATACAGTGCAAGACGCAATAAATGTATATAAATATGAAAAAA
GAGCCGCAGTCGCCACATGGGGCATACACACACACACGCACACTACAAACTACACACTTTTGGATACCTAAACTTTTATACCTTATCGAAATCTACACAGTCTTAGTTCAAGTTTGCCAATTTGTTGTTGTTAAAGCTCCTGCTTCGCTTGCGACTCCATTCCCACGTAAATGCTGTACATAGTGCTCTATATACACTTATATATATATACGATTATATATATCTTTTAATTTCGTGACTTTCTTTTTTGTTTTACACTGTTTTCTTTATTTGGGCTTTTGTAATTTTGTTCTTCTTTCTGCTGCGCGCT-TTCCACTCTTGAGATTTTCACTTCATGTACTTTTC----------CTCAACTATCCTGTTCGAGTAAAGAAGCTGGTGTTAGTTATTTAAGAGCCTA-TCGTCGATTGATCGAATTAACTAATTAGCGAACATTTAGTAAATCT-----------ACACACACACA-----AACACACACACACACACACGCAACTCCCA-----TGTATAT-GCACTTGTAAT--CTTGTAATTTATATTTAATATATTATTTCTGTTTCCCCCCACCCCATATACATT-TCTTTTCGGTTTAATTGGAATTTGTAATACAATGTACTTGATGTTTCTTATTTTTTTTTTCACTTGCACTTCAGCAACAAACAATTGCATTGTATTGTTAATGCTTGCATTAAAATGTATATATAAAAAAAAA
>skpD 19647215 19647325|24689 chrX 19646747 19647680 scaffold_5 1925813 1926802 + 14571|474 683
GGCACAGAGAAGAAGAGGAAACTTCAC----------------------------------------CGGAACCTTACTTTG------------------------------TTGAGAACT-----------------TTTTT---------GTTTCGCCTAGATAAATATACTAATATTATATAATATATATATA---TATATATACCA
TGTGAGGAGAAGTAAGCGGCACTCCAATACCCATACAGGGCACATGTCGCCAGATGGTAAATGGCTGCGATACCCATCTGCGAAACTTCTGAAGAAAATAATAAACAAACATTTGAAAACTAGGATAATGAAATACGCTTTTTCAAACTGAACCATTGCTTGAACGAACACATGCGTATTAAATAACTTTTATCTAGTTTATATATAAGA
>CG32529 19738896 19740624|24800 chrX 19738428 19738972 scaffold_10 1837231 1837771 - 22365|479 558
CGCAAGGCATGAGCCATTGCGATCGAGCTCC---CGTCAACCCAGGCAATGGATGAACTGCGGAGTGTAGGAACAATAGC
CGCCGGGT-----CACTTAGGGTCTTGCCCTAAACGAAAATCAAAGCAAATTTAAGAATGCGCTGAGGAGAGACAAGTGC
>CG32529 19738896 19740624|24801 chrX 19739259 19739735 scaffold_10 1837824 1838294 - 5643|0 530
CGGGGCAGGATAAGGGACACA-CAGATACACCCGGGACCCCAAGTATACCCAGGACACACACACACACACACACACACACAA------ACATACACCAGACCAAAATGTAGGCGAAGGCTTTTCACTTAGACGTGAGAATTTCGAGAGATGCGAGGAGAAGAGGGAAAATGTTGGGAGACAACTGCTAGGCGAAAGCA--------TTAAATACTTTACATTGTATTACATAATTTATT---TATTCTG-----------ACTACACACCCCACCCCCTGCCAACCCTCACACACATGCGGATAT---TTTTGTTATTAAGTTGTATGTATTTATTATCATTAATATCGAGTAAGTCAGCATTCTGTGTACAGTTTTCCGCTCGCTTTTGCTCTAATCGCTCAAGGAAT-------TGGTTTAACCACCTACCGAAAACCACATCCATTAGCTAAGACCCTT--TCGATGGCCAAAAAGTTATTTGGTG-------TGCCACA------GAAATCTCTGCAAATCGACTTG
CGGGCCAAGACAAAACACATAACACACACACGCAAACACCCAAACAAAC-----ACACACACATACACACGCGCACACTCAAGCAAACACATACACACGACCAAAATGGGGA-------------------------------GAGCAAAATGAATGGAAAATAGAAAATGT--------AACTGGAAAAACTACGCAGTTTTTTTTCAAGTAATTT---TTGTATTACCCAACTTATTATTTATTATGTGCCCAACAACAACACACACACACTCACACACACACTCTCACACACACACACACACACACCTTGTTATTAAGTTAAATGTATTTATTACTCTTAA-----GTTTAGTCAGCAATCTTT------TTTTCCGCT--CCTTTACCCTATATGTATATGTTTTTTTTCGATAATATATATATATATATATTACTGACTCTACTCTCCAAAAAACTTAATTAATGCTCAGGCAAACACTTTGCGCACACTCTGCTCCAACTGGCAAAATCTTTGTAAAACGACTTG
>CG32529 19738896 19740624|24802 chrX 19740263 19740791 scaffold_10 1838499 1839017 - 6079|0 379
ATATATTTTTATTTGTTGTTAGTTTTTGTAAGCG------ATTGAACACACATTTTGTACTCTTGATTTGACATTTATCTTTTGTGTTCGCCTTAGTTTGGAAATTTGATTTCAGAGACATGATTTTCTTTCGGTTAACTATATTATTCAGCTGCAA--ACAGTTAACGAGAATCTTTAG------GGAAAATAACAACAGAAACAACAACAAGTCACATTATTA----TATTATATATACATAAATATATCTACGTAGTTCTATATAAACAAATATCCTTATCCATAAAACATTTTTTTGTAATCTTAATTTAATTTAGCAGTAGCGTTTTTAGTTGCTAAGTTGATATTGCAAATAGTTTGTTTTATACCAAATACAC
ATATATTTATATATATATTTAGTTTTTATATACATGCATAATGTAGACCAAATTAAGTAC-----ATATACTATTTTTTTTTTAAATATTTTATAAATGGAAAAACTTAAGCTACGTGCATAATTTA--TACATTTGATGAAAGCATT-AACTTTAAGTACGAGTTACACAAATCCTTAATGAACAGAAAAAAAAAAACAAAAACAAAAACAAAACAAAATAACAACAACAAGTCACATACATTAACAAATGTACTTTA------AAAAATATATATATATATATATTAAATATTATTT---AATTTTAAT--------GCCTAAGC--TCTTAGTTTGAAAGCA---ATTGAAAATCATTTGTTTTATACCAAATAC--
>Nep3 19801398 19802432|24824 chrX 19800111 19801468 scaffold_10 1857876 1859259 - 75971|1311 1393
GGG-GATAGTG--CAATTTCGATCTCAGAAC---------GAGCCAAAGATGGAGCCAAAGCCAAAGCCGAGCAACTAGACAA
AAACAATAATAACCAATACAGATCTCATAACCTCTGCGAAATACCAAATAT--AACAAATTCTTAAGCCAAATAATTTATCAA
>Nep3 19801398 19802432|24825 chrX 19801632 19802251 scaffold_10 1860230 1860941 - 1645|0 739
AAAGACCGTCAGTCATTGTGCCTATGAAAATGATAGAAA----CTGACGATAAATTCACTTTCGAACTCCAAGGGGTCTGGAGTACCGATCTATATATAATAGGTCCTGGAGCAGGATCAAGGGACCCTTAACTACATTTGAATGTGAACGCACGAGCTACCAACTTTATGGGATGGGTGTGTGCAATTAAACGAAATGCGGCACACGCCCAGCGGGTCTGATATATATATATATATACAAAGTTATATATATATATATATATATATATATAAATAGATATGATAACGATAAACGA----TAATTGTA-----------------------------------------ACTTAGCTTTTTGTAGAACTATGAATGTATATTGTA---TTATAAAGATACAAAGTTCG---CGGCTCGTGTCCGAAAGA---------AGAAGGTTTTCTCCCAACTTAGATATACCTTCGAAAGAGTTTGAAAA-ATCTCATTTTTTTTTTCTTATA-AAATACGATTGTGT--CGAAGTT--------------------CCTGAGTATGAGATAGGAATAAAATG-----------GTGGGCTAGTGGGTGTGAAAGTGAAAGA--------GATAGAGATAGAGA---------TATAGATTGAGAGGCAAACAGTTTTGAAGCTTT----TCAGTTGCGAAAGTGAACAGGAAATAACTGAGTGATTTAGTTTATCTTTATTATA
AAAAAACGTCAGTCATTGTGCCTAAGGAAAAGTGAAAAACTATCTGACGATAAACCTA-TTGCATACTTTTGGGAAAC--GGGCATTGATCGACTTTAAGCCGCGCCTGCACCAAAGCCGAGA---CTTAAACAACA-------GCAAAAACAACAACAAAAAAACAATTTGGAAAACTGCGAACTAAGAAAATGAACGCATTACA-------CGAATTAAATAAAGATAAAAAACTTCGATCGTCTTAAGATATATATATATATATATGTATATGTATGTAGTAGTTATTAACAATTTGTAATTGTAAACAGCGGATCGGCGTCGAGATCCGCTCTAGATAAACGTGGAACTAGCTATTTGTATAACGATTTATGTTCTTGGTACATTTGTACTGGAACTACTTTGGAATCGG--------CAAAAGAAATAGGCGTAGAGAGTGTGTTTGCGAGTGATTGATGCGAACAAAATATCTAAAAAATATCTACTATCTTAACACGGATATATATGTAAGTGTGCAACAAAGTCTCCCCTAACTATAGTGTGTATCTGTGTACGAGAGTGAATTTGTGTGCGTGCGTGTCTATGTGCGAGTGTGTGACGAGATGAGCGATACTTTGCGAGCGAGATAGAGAACATATTCGTGTAGTATTTGATGCAGTTGCTTCTGCCGTTTCGTTGCCAAACTCCAAAGTGCGAACAAAATAGCAAAACGAATCAATTTTTGTATTTTGTA
>Nep3 19801398 19802432|24826 chrX 19802252 19802390 scaffold_45 26694 26848 + 227|0 158
AGTTAA---AAATTAAAGAAATTTTGTTTCG-------ACCGGAAAAGGCTCCGTCTG---------ATATATTTGTTCTTTTTTTTTTCCTTAAATTCCCTAAATTTGCAAATTGTTGTCGAT-TTTAATTTGTGTTATTACCTTGTCATGCCGAATA
AATTTAGTTAATCTTAAGAAAATATATATCTGATAATTATGGGAAAATATTTCATTTAGCTAGACGTACATAAATATACCTATACCTCTCTCGAAATTTCTT----TTTCAATCTATTACTGATATCTAAATTTTGTTCTAGCATTTGTTTGGGAATTA
>Nep3 19801398 19802432|24827 chrX 19802410 19802430 scaffold_45 26871 26893 + 78|0 22
GAATTGGAATGAAAAAAA--AAA
AAATGGGAATGCACTGCATCAGA
>Nep3 19801398 19802432|24828 chrX 19802431 19803225 scaffold_10 1861465 1862155 - 1544|0 1
AA
AC
>CG9570 19886026 19886459|24928 chrX 19886074 19886488 scaffold_352 10577 11006 + 5288|0 432
GCAAAGCGGCCTC-AATTAGACGAACGATCATGCCGGGA---CCAGACCAGACGAAGC--AAATGTATTTATTCCAGCCAGATGGACTCGAAAGGCTCTAAAAG--------------------------------------ACCGTGCCAAAGGATACTGGGAATGGGGAACGGGGCGAAATGATG-GACTGCAGTAAAATGTCTATGAAAATTGACTTGGTGTCCTGGCATTGAGAGGCAGTCGGGCGGAAGGAGCTGCCAGCGCCTGGATGCGCGTCAATTGACAAATTGTCGGCTCGACTGGCCCATT--CGTCCTGGTTTTGCCTTGCTCCCCGTGCTAGGCTTGCTCTCAACTTCCCAAAACCAATACGAATGCCAAAATGCCAAAAATACAATCCCGGGCAATTTTAGACCCAAACAGAGCAGAAA
GCCAAGCAGTTGCTGATTCGATCAGTGGCCGCGCAGGGAATGCTCAGCAAATTGATGCTGAAATGTATTTATTCCAGCCAGATGATTTCAAAAAGCGATAAAGACTCCGGCAGCAGCATCCAGCAGCCAGCAGCTAGTGGCAGCCGCAACACAATAAGCCGAGGCACAGACGCGCGGTGAGACGAGGCAACTGCAGCTAAAT-TCTATGAAA-TATACTGCCTGTCC----ATTCACAGTCAGCCGGGCGGAAGCAGCT-TCAGCGCCTGGCTGGGCGTCAATTGACAAATTGTCGGC-CGGCAGCTCCAGCAACGTTTCAGCTACGCTCCGCATTGCCAGCCAGAGTTGC---------CACCAGGCCAACGGCGTTGTC-----GTCAACGTT----------GGCGTCGTCGTCGCCATCGTTGGCGAAA
>CG9577 20001663 20001768|25063 chrX 20000871 20002665 scaffold_36 413055 414893 + 76300|806 937
TCGGTAACCTGTAATATGTAATCTGCAATCTGACAGAATTTAAAATGTATT---TGCCATGTGTGCATTTATAAATACAGCATCTGCCTTTAC-----------------------TTTAGGACCCAAATCA
GGGAT-----------TCTAATTTATGAACTTGAACAATT--AAATGTATTTTGTTCTTTACGTTTCTTTCGTACTACCTATCGTGTATGTACATGGGCCCTGGGCGATCGGAGGAGTTATGCGCGTGATCT
>CG9578 20005061 20005211|25067 chrX 20004810 20005345 scaffold_36 417626 418371 + 10649|325 600
TCC--------------------------------------------CGATGTCCGATGCTAG-----------------------------------------ATGCCAGATCCCAG------ATCTCTAGGTTTATGTCAGTCGTCGCATTGGTTACAACT--GCTGCTATATGCGT-----------TTATTTATTGCCAAC------AGTGT---GCGCATG--------CGCAGACGACATTAAAAGCGATTTTCCT----AAAAGGCAC-
TTCGAGTTTTTGGGCTTCCATTTCGCTTCTTTTTTTTCATTTCACTGCGTCGTCTGTTGCTTGTGTTTTTTTTTTTGTATCACCTTTTTTGTAGTAGTATTAACCTTCCAGAAGGCATGTGGGCATCAGCCGATCCTTGTCAGCCAGTGTATTGAAAGCAAATTGATTGTTAAATGTTTAAGTTGATAAATTTTGTAGTAGCAACTGGTTTAGTGTTTAGCGTGTGTAATTTATTGCCACAAACATTAAAAGCGAGCATCCTGCGCAAAGGACACC
>CG17052 20052865 20053903|25105 chrX 20052571 20053080 scaffold_36 434246 434852 + 20671|299 607
GCCA--------------------CTTCCGGT-------------------------------------------------CGCTTCTACTTCTCCT------CATCACATCCACACTCACAACTCATGCACATGCACACGCACACACAAGCACACTGAAAGAAATTATCA-ATCAAATCAAATCGAAACAATT-CGAAAC--AAATCAACAC-------------ACAGATTCGCGTCTTAGTCACTTAAATTTAGTAG-TTCTAGCCCATTTCCTATAGAGCGTATGTGTAGCAGTTAAACTTCAAT
GCCAGCCGTTAAGCCGCGTGCCACCCGCCGATAAGAAATATATCAACAAAACAAAAAAAAAAAAACAAACAAACAAACACGCACTGCCACCCATCCTTGCGCGCGTCTACTGCAGATACCCAAAATACACCCACGCACACACACGCACACACACACTCACACGCACAGTTACACTTGGACAGACCGAAGGACTTACGGAGCTGGAGCCGGCGCTTTCGGGCACTGGCTGGACGCGCGTTGTAGTCACTTAAACATAGTAGTTTCTAGCTTA-TTCCTATAGCGCCTTTGAGTAGCACTTCAATTTCAAA
>CG17052 20052865 20053903|25106 chrX 20053081 20053777 scaffold_36 435056 435741 + 3398|0 733
ACTCTGACCTATCTATTTCTTAA-------CTATCTTTCTCTATATCTGACTACTTCTAACTACTTTTCTAACTACCCAAA---------TCTCCATTTCTGTGCCCAACCAAACGCTGCCAAATTGTTGTGTATATATTTCCCGCTTTCAGACTTTCGCC---TTATTATTATACAAAAAGAATAAACTGAA--------TTTTTTATAAACTATCTATATCTATCTATCTACTATAAACTATCTTCCC--AATCCCAAGACTACTACTATTCCATATACTGTTTCAGCTATCCTATGTGATCTTCGCCTAAAATTTCAATTTCCCTCATCTCTACGTTACTCTACTTAACTTCTTATCATATTCCAAAACCAATTTTCTGTCTATAAGGAAACCCACTCTTTACAAACTT-TTGTCCTCCTAAAATTTTCAAACTTGAATCTTTTCCGTTCTCTTTTCTTGATTTCTTTCTTTCTATCTTTAAAATTTCAATTTAGTTCGTGTTTTATTGTTTTGCGAACTGTTACGCTACAGTTTATTATTCCTAAAATGCTCCTTTTTTAAGCATTTCAATCCTGTAATCTTGTATTTCACTTCTACCTCAAGTTTCAAATCTAAATCTTTTCTATACATTCTATCTTCCTCATAAATATTTCCTTGTATTTCGATTATACCTA-------CTGTATAAATACTCTTTTAGACTATGCTATATGTTATTTATTAATAAAC
ACTCTA--CTATCTCTCTCTTCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGTCTCTCTCTCTCTCTGTCTCTTACTTCCCACACTTCATCTGTGTCTATCTGTGCTCTTAACTATTCTAT---AAAACGTTGTGTATATATTTCCTCTTTTTTTTTTTCTACCTTTTTATTAATATACAAAAACAAAAGAATAAAAAAAACTGTTTTCGATAAACTATCTGATTTGCTATCTTTTCTATTTTTCGTCTTTTCTAATTACTTTATCTATTTATGAAATACATACTATT----ATTCTTTTTATAATCTACATTAATTCTGTTCTTTTTTTTCATCATCTTTTGCTTTGGGCTTATTTCTTCT-ATATTTCTGATCAACTTTCATGT--------------ATTCTTTCTAAACTTGTTGGATATATAATGTCTT---ATGTATAGTATTTCCTTTCTGATTAACATTTTCTATTATGAATATCCTTTAAATTTGATCAAAGTT----TTTCCTTGATTTATTCCCTAATAAATGGTATTTTATAACTTATTAAAGTCCCTCCTTTCACACATTTTGCTATTGAAAAATCCTACGAAAGT------CCAAGTATTTCCTTAACAAGCCTTATATATCTGTTCTCTTCTTC--------TTCCTCATAGATTAATTTCATCTGGAAAGATCTTTATAGCGAGTTTTTT--TTTTTGCTAAGT-TTATTTTCTTATAAAC
>Peritrophin-A 20058502 20058922|25113 chrX 20058424 20058911 scaffold_36 441993 442430 + 4295|78 503
GGATCGCCGAGCGATCTGTACATGCACACGAACAAACAAACTGCAACAGTGCAATCTCGATAATGTGAACGTTCAAATTAAAGGAGATACATATGTACATATGTATGTAC--TTGCT--GGCTGCAAATTTGGAGTTATGTTGTTTTGCAGACAACCCCCCCCTCCTAGGTTTACACTGGTTCGCTGCTTCGAGTGCGCACT-----GTAGGCTCCGACTAACCAACTACTTTCGTCCCTTCATCTCCGCACC---TTCGCTGCACTGTAAAAAATGTCCTAGCCCA-GTTAGCTTGTTAACCTTTTTGCTTTCTAACCAACCAACCGTC--TGTATCTTGCTCTTCTTTCTGTATTATTAACTTGTTTTGTTGTTTGGTCTCTTTTGTATATGAATCGCAATAAAGTT-AATTTTATTTATTGTA
TG----------TGACCGTATCTCCAAAAAAACAAACAA---------------------TAAAAAAAACACACAAACTCAA----------CTGTACATATGTATGTAAAGCTGCTTGAGCCGCGCTCTCGCTCTC----TCTTGTGCTCTCTATCTCTCTCTCT--------CGCTCGCTCTCCCTTTCTGTTTGTCACTCGTTCATGCACACGGCCTA------TATGTCTGTCCCGCTCGCACTGCACCCATTTCCTAGCATC--AAATATTGCAATAACTAACGATAATATTCCACACTCTTCTTTTTTTTTTTGCTCAAATATAAACATATATTGTTAATCATCATTTGTA--TATTTTTTTTTGCTGTTT---TCAAAATGAGCACTAAATGCAATAAACTTGAAATTTATTTATTGTA
>Rab10 20063987 20065366|25125 chrX 20064179 20064333 scaffold_36 448497 448616 + 2726|0 154
AAAACAAAGCAATAGAGCCGGGGTCATTCGCACGTAGGAAACTTACTTATTACGAGGATACGCAAAATGGAACAAGCAACAGAAACAACCTACCTAAAGTTTAACAACAAGCAACAGATATTGTAATACGAACATTTGGAAGCAACTTTACAAAA
AAACGAAAGCAATAAACATAGACTCACACACATGCAT---ACACATTTATGGCA--------------GTAACAACCAA--GAAACAACCTACCTAAAGTTTAAT------------ATTTTATAATGTTA----TTTGGAGTAAATTTACAAAA
>Rab10 20063987 20065366|25126 chrX 20064929 20065095 scaffold_5 3502594 3502718 - 3197|0 166
GCATATATATATAGATATTTAGATATAAATATATATTTATATATATATATACATATATGAAATTACACACCGTATATCGCATCGTTTTTATGTGCATTCGCGCCCGCACACCCAATTTATATATAATATATATGTATGTATCTGTGTACACTTAAGGGGGCTTGGGT
GTATTCATATATGTGTATGTAGGTATATATATATATATATATATATATATATATATATGCA---------TGCATATAG--TCGAGATTATGCCT-------------------------------TATATATGTATGTATGCGTATATAGGTGGGCATGTTTGTGG
>Rab10 20063987 20065366|25127 chrX 20065236 20065706 scaffold_36 449500 449894 + 9168|0 130
TAATTTTATTCTACTCTTTTTTTTTTGTCGTGTAAACCTATTATTTGTAACTGTATATGGATTTAGTTTAGTTGTCCACACCAAATGATTTACCGATTAAAATATAAAGAACAACCTAAACCATGTCATAT
TAACTATAAACTATTATTTTTTTTTT-TCGTA-ATACTTATTATTTGTAAATGTATATGGATTTAGCGTAGTTGTCCACACCAAATGATTTAATGATTAAA-TATAAAGAACAATTTAAAGC--GTCATCT
>CG1631 20138891 20139357|25238 chrX 20138819 20139134 scaffold_6 5280225 5280529 - 760|77 329
GGCTGGGGTTGGTTGAATCGGCATCTCTGCAGGCGGTTTTTTTTTGGTTTTTACAG-ATATTCACA----TTCGATGATC---ATGGATCTAATATTTATG-GAGGGCAAGATATGAGATGGATCCTTACCAGCAAACTCAATTTTCAGGATAAGGCTTAGAGTAATTAGAAACGTACTATCCGAGTATATTTCTTTTTTAGCCAGATATCAACATTTATGTATTCGCGCAAATTAACATACATACATTGTTT
AAATAGAG-------------------------AGGTCTTGCTTTGCCCTGTAAAGTATAGGCAAAGAGGTTGTATGAGCTGTATGGATGCTTTATTTATTCGATATTGATATGTTTGAAAAGTTGTTAGGTTGATATCTAAGTATCCGCATTAAAAATAGATTATTTAGAGACTAAAATATCATGTATATTTCTTTATCAGCTACATTAAGTAATTTCTCCACACAGGGTATTTAAGAGTCGTTCATTATCT
>l(1)G0004 20202935 20203077|25313 chrX 20202151 20203009 scaffold_36 641040 641905 + 44594|797 876
TTGG----GAGAGCGGACTG-GAGTGGACTGGACTGGAGTGGAGTTCGACTTGAGAGGGAGTAGTTGCGGTTTTTTTTTT
TTGGCTGTGATCTTGGTCTGCGTGGGGGCTGGGATGGGCCCAGACTACAATTAAGTTTAGATGTCTCCTTCCTTTTTTTT
>l(1)G0004 20202935 20203077|25314 chrX 20203010 20204359 scaffold_36 642757 644168 + 61327|0 70
AGCATTAGCAATAAATAATAAATATAATAACATGTATTCAAACATTTACAATATACACA---AACACACAC
ATCGTTATAAATAAATAAAACATATA-TATTTTACATT-AGACAATTACAATATACACACGGAAACTACAC
>HERC2 20222231 20222924|25322 chrX 20221828 20222278 scaffold_25 1343039 1343490 - 22943|403 460
ACCGAAC---------CCACTGTCCATC-CTGCCCGAAATGAACAATTAAATTAACGA
ACGCAATTATCGATAACAACCATTAATCGCAAATCGAAATGAAAACAAAAACCAAAAA
>HERC2 20222231 20222924|25323 chrX 20222417 20222705 scaffold_25 1343639 1343892 - 2204|0 297
CATATATACACGTATAAACATATATTTTAAATTAGCACTTGAATCGGAGCAAGACGACGAATCGAGCGAGAGAGAGAGAGAGACGGCAAGCGAGGGAGAATGAGGAGAGAGAGAATGAGAGAGCGAGAGAGAGAGAGAGACGGCGAGAGAGCGAAAGAATCGGTCGATCGCATAATGAAACCAAAAAGCA--------AAACGTTAAA-GTTATTTCCATATTATATTATATATACATATAAATTTAAATATAAATGTTAGTTGAAGTCCACTCATAATTAAACACAAGGCTTAAACG
CACACACACACACAGAGACAGACTTGCCAGATCTGCA--------GCACATAGACACACAAACACAC-ACACAGAGACAAAGAC----AGCTTGGTAGAGAGCGGAAGGAGAATATTGAAAAG-----GATACTGGAAACTGTTGATAGAGCAGAGA----------------CACGAAACCAAAAAGCAAATTAAGCAAACGTTAAATGTTATTTCCATAT-------TGCATAAATGTTAGTTTAAA---AAGTCCAAACACACACCCATACACATATAAATAATATATATAAATG
>Obp19b 20228348 20228485|25328 chrX 20228260 20228406 scaffold_25 1351415 1351569 - 5135|88 154
--------GGCCATGGAGCTGCTCGCTGGCCCACCATTGCATGTTCTCCCTCCCTTTTTTTTTTGTT
ACGCGTCCAACCCTAATCCTTACACCTGGCCAGCATGTTTGTGTTTTTGTTTTTTTTTTTTTTTTTT
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GAACAGATTTGAGACCCATGACGACCCCCCGTTACTGTATCACAAGCGCCCTTCTGGAATA-------------------TAACCATCTTTTTTTTTTATG-TGTATACTATGAAT--------------TAAGTACTTG---ATAAACTGAG-AAACTGCAGG
AAGCAGCACCACGCCTCACCA----CCTCGGCAGGAATGTTGCAAGCGTCCCT-TGATATATGTGATCCGCAATTGTCTTTAATTTTTTTTTTTTTCTATGACCTATGCTATATATATGCGTCTAGTTCCTAAGTGCATGCGAATAAACTGCGCCAACTGCAGA
>cactin 20236993 20237088|25337 chrX 20234581 20237012 scaffold_5 4128859 4131402 + 105394|2574 2593
AGGATTGTCACCGTCTGGCC
ATGCGCTTTATTGTGTTGTC
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---ACTCCAACGTTCACA------AAGCCATTCTGTACATAGATCATTATCATTGCTGGGTACTTATATGTAGTTGATAAACAAAACGATAATAAAACAGAGCTTGTCGCTGGTTTA-TACTTGTACAATTTATTCGTAAT
GGCATTCCATAAATCAGACGATGTAATACTTTCTGTAAATA-------------TCTGTGTACTTGCATGCC----ATACACATATTTATGTTAACAC-------GTCAGAGATTAAGTATTTATAGATCTTAAATAT-AT
>CG1812 20325491 20326508|25442 chrX 20325423 20326043 scaffold_5 4026344 4026939 + 1191|68 678
CTCTCTGCAAGTCTCTGCAAGCCTCCGCCTCCATCTCCATCTCCATCCTATCCGTATCGAATTTAGCGATTCTCATGATAT--TTTTATATATACTATGTGTAGCTAGCGTAGA------CCTATGTACATGCGAGATTT----------TGTGATGACTG--CAGTAACGAAAATGTGCCAAGCACGG-AAATGAAACATGTAAAGACCGCATATGCCTTAATTTCGCTCTCGAACGAATACACAGACAATGGTAAA---TTATTAAATAACTTTTAATTAAC-------TTGTATAAACCGCATATGCCTTCATTTCTCACTTGA-------TTGA--TAAGTCAGA----GCTCGAA---AAATAGGATTTATTTGTGTG-------GCTGAGACCCTTCTTTAATTGCCATGCATAGTTC-ATCCATAAGCAAACATAATGTATAAAAATGGCAGATACTTGTCATTCATGTGTTTGAAAATG--CAGTCACT-TTTTTGAAGAATGAAAAAGCAAACATTTTAGAGCTATGTTGTGATAAAATTAAGTAAATTTAACGAAGCATAATGTTTATAAAGAATTAGCATTCACTGCGTCGAAAGGCATA
----CAGCGTGTCCCAAACAGC--GCGCCT--------------------TCTGCAACGAATTTA------CTCGAGATCTGATTTGATAACAACGCAATGCAATTA-TATAGAAATGACCCCAAACCCATGCTGAAAATGCTGTTCCCATGTTACTACTGTACAGTGAAG-CAATGTGCCAAGCAAGGCCAACAAAACGATTGTTAATAGCAGGT------------CAACCGTTCGAATATTTAACTATTAGTAGAAATCTAGAAAACGATTTAAAATAAACATTTTCTTCTTGTTAGTAATATATGAACTGTTTTGTAAATCAAAATCATCTTGAAGTAATTTAGATATTGCTTGTGCCTAAAGAGTTTTAAGTTGTGTGAAAATCTGATGATACTTTTCTGCTATTCC---ACAAGATTCGATTTCCAAACCAAAATA------------GATCGATAATTG---TTTGTTGGTTCGAAAATGGACAATCAAGATTCATCAATAACCGGTTGTTAAACAC----AAGCTATG-------AAAATCCAGCATAGCTGGCGGAA-ATTGGGT-------GAATCCATATTAACAAAATCGAGGGGTATA
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AGCAGCACACGCACACACACGCGCACTGAGCACACACACACACACACACACACACACACACAG-AGTGATATGGAGCAGCAAGCAGGCAGAAAGCAGGCGCAGAGCGGCAGCAACATTGTGATATAGTCATATAAGTTAGACACGTCCACAGCAGAGCACAGCACAAAAAAGAAGAAGAACACACACGACTCCGGCCGGCAAACGGAGCGG----AGCA--GGAATAAGAGGAGGAGGAGACGGAGGCGGGGGCGGGACAGAAGGCGCAGGAGGACTGCCAGGAGCTG-GGCTAAAGGATATACGCATGCTTGGTTTTGGGGCAAGG---CAAGGGCCGTGCGGCGAGCTCACTCGAAGTTTTATGCTC-GATTCATAAAATCGTGCGTTGAGTTCGTTACGCACAC------------------------ACACACACACGCACACACACACACAGACACACACACTCCAATCCCCCTGGAAGAAAAGTATATGCCAAAAAGCCCTCCTGGATTTTCGCTCGATCGCCACGCGGCGAACGTCAAGGAAACTATTTAGACCTAAACGCCTCGCCCCCCCAC
>run 20507311 20508002|25697 chrX 20507800 20508043 scaffold_5 4274891 4275104 - 5651|0 207
TCATAACTTTTTTTTTTTGAGAACCTATTTTTTTCGATGGATAATATGCGAATTTAGCTATTTTTAATCATTATGTTTAACTAGTCGTCTAAGCGAG-----AAATCAATTTTTTTGTCTAGCCATAAGTTTTAGCGCGAAAAGAGATCTAACACAAAAATCGAATTTGAAACAAAACCAAATAAAAAACAAAAATCACACACAAAAA
TCGAGATTTTTTTTTTTT-----------TTTTT-------TAACATTCGAATTTAGCTATTGATAATGTTTAAGTTT--TTAGCCATGTAAGAAAAGAGCAAAACAATTTTTTTTGTATAGCTTTAAGTTTTAGCGCGAAAAAATG------AAAACAAACGAATTTCA---GAAACCAAATAAAAAGAAAAAACAAATGAACAAAA
>Ntf-2 20849536 20849912|26119 chrX 20848180 20849772 scaffold_10 221505 223179 - 9002|1591 1827
GAGCACTCCACTTACCTACGTATGCACACCACTCAGCACCACACATAATCGACATCCAAAGATGCCCAGCGCCAGATGATAACAACAAGCTCGGCAGTGGAACTCAGAAAAAAAAAATATAACAAAGCCAGCCAGCGGTCTCACGATTATCAGCAAATACAAAAGTTAGAAAAAGAAAAAAAAAAAAAAAACAATAAAAAAATAAGAAAATAACGCTAACTACTATTACGATGTCAA
GAAAGCCACAACAACAGCCA-----ACAGCAACCAGCAGCAA-------CAACATCCAAAGATG--CAGCCCTAGATCAACACAACAACTACGACGAC--AACTT--AAAAAGACGGTGTTGCATATTT---------TCTCACGTCAAT---CAAGCATAAAAATCATA-----CAAAAAAAAAAAAACACAATAAAAATTTAAA--------TCTAACTACTTTAAACATGTAAA
>Mgstl 20854683 20854790|26125 chrX 20854343 20854721 scaffold_10 226946 227331 - 19515|340 386
GC--------ACATAGGTCTAGTCCTTCTTGTTTTTTTTTTTAAGCA
GCGGCTGTTAATATACGTAT-GAGTTACTCATTTTTTTATTATAGTA
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ACTGGAGCGTTCTCCAGTTCC--TGATCTGTGTCCTAA-AAATCCAACCACCTACAGACTATGTTACGCATTTTTAACTTATACCCGCATGCATTTTGATTATATCAAATAAAGTTTTATCCTAAAGTATCAAAG
ATCGAAACCTCTTTCGCTTGCAATAATATGTAACTTAATATACTTAAACCCCAACA----ATTGTGTGCATTTAATATTTG---------ATATTTTATCTATTAAAAATAAGG-TCTACTCGAAGCCTTTGTGT
>bves 20887784 20889621|26152 chrX 20887386 20888051 scaffold_10 477559 478243 + 3600|460 744
ATTTATGCAACCGCCCGCTGCTGCTCAACTTGCCACGAACAGAAATCAGAGCACCCAT--CCGTCCCTTCACCTTTG-ACCTGCACAAGAACTACCAGAAAAACAACCCCACCCACACATGCA-AACAGCCATCAGCCATCAGTCATCA----------GTCAG--TCAGTCATCAATCATGCGCAGCCACACCAACAGCAACATCGATCACGATCATCAGAA-AAGAGCGAAAAGAGCTGTCGAAGATATCTGGAAGCTATCCATCTAAATCCGCATCCTAAGT
-------------GCCGCTGCAGGTGCAGGTGCCACTGGCAGCACTCAAAGAAACTGTAACTGAATCCTGATATAAGCAACTGCACAC-ACTTCTTACACACACACACACACCCACACTTACACAGCATCAATGTGTTGTGTGTATGCATGCCCTTTGTGGCAGCTTCAGTCAGCGA-CACCAGCGGCAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAAGAACAAGAACAA----CAACGATAACTGCCAGCACAGCTCGAGAAGCCACATTTGAAGT
>bves 20887784 20889621|26153 chrX 20889204 20889456 scaffold_10 479020 479412 + 2694|0 395
CCGCTTGGCATTTACTGGAAA---TTTACTGTGCTGGCACAT---CAATCAAGTCTCTAAAT------------CTTCCATTAACACATT------ATTATT-TTATTTGTA-TTTCTATATGCAT----------------------------------ACGTATTTTGCGTTGATTCGTTGATTGATTTGCATACAAATTGAGCTTGAA------------------------------------------------GAAAGCGTGAAAACTAATTAGAATTAATATCGA-----ATA---ATATTTG---------------------ATAATGTTAAGCA------ATACATAGCCTAAGTTGTTGTACATACGCTATATATATATATTTGC
CCGTTCCACATAAAATGGAAAATTTTTACTGTGCAGGCACATAGCCAATTTTAGTTATAAATATATACGTTTGCCTATCATTATCACATTTGTTTTATTATTATTATTAATAATTTCTTTTTGGATTTTGCACATTGTGTTTTTTTTTTTTTTGTTGTTAATGAGTTTGTTTTTGAATCGCTGATTGATTTGCATATTAATACGATTTGAATTGCAAAAAAAAAAAAATTGACAGAAAGAGAAGATATGAAGAGTAAATAAAAGCGT--AAATTAATTGTAATTAATATCTATATCTATATCTATATCTACACGCATACATATACACACGTAATATACTAAGCGATATGCATATACATATTTAGTCGTTGTACATACA-TATACATATACATATAC
>bves 20887784 20889621|26154 chrX 20889549 20889618 scaffold_10 479495 479566 + 3384|0 73
GTGGAATCAATGTGAATGTAAACAAGCCAAAAACCGAAAGCTAATAAAACAAA----AAAAAAACACACATAAT
GCGTAATCAATGTGAATGTAAACAAGCCAAAAAAAAAAAA--AACAAAACAAAACATAACAAAACAATAATAAT
>CG33670 20919213 20919946|26191 chrX 20919486 20919716 scaffold_10 508714 508960 + 4614|0 246
GGGATTAGCTGCATCTTCTGCT----GCGCTCTCTGTGTTCTTCACATACTT---TATTTCCATACGTACATTTCCCTCCAGCGCTTGCCCTGTTTTAGTGTGGCAAACATCCACGCCAAGTTAAAGGAGGGCC------AGCATCCGTTGAGTGATTCCTACAAGCGGTACAAGCAGCCCGGCATCACCACAGCCA---GCCAGGAAGGACTTAGTAGCGCGGGTCAAGGTCAACAGGGTCACCAG
GAGATTAGTCGATTTGTCTTCTCGTAATACTTAATTCATTATTCAGATTTTTGTGTAACTCACACTGGTCGATTTTCAACAGCGTCTGCCGTGCTTCAGTGTGGCCAACATACAAGCCAGGTTCAAGGAGGGGCAAGCGGAGCATGTCCTCAGCCATTCGTATAAGCGCTATAAGCAGCCGGGCACTGCAGCTGCTGCATCCCAGGAGACACCTGCGATGCCATTGCATGGCCAACGGGAGCAACAG
>CG33670 20921144 20922093|26192 chrX 20921072 20922218 scaffold_10 517568 518700 + 14895|87 1121
ACCATGCCCAATTGGTGGTGCCGCGTCGCACGTCCATGTGCGTGGACTCCATG------------------GGACAGCCGCTGCGCAGACTGAACTCGAATCTGTCCCTGCACACGGATCTCAGCTTCCCCGGAACGGGTGGCTATCCGGGCATGCGAATGTCCCTGCCACAGCCGGCTGATCTCGGCCAGAGTCGCACCTTGCCGCGCTGCTTTCTGCGACAGTCGTCCGATTCGCTGGCTTCCCAGGGCTATCCATTG---------GGCTCCAGTCAGCAGCGTTTCTCCCAGCTGATG---CTGAATCAG------------CAGCAGAATCGCTTCGTGTCCTCCACGTTGACACTGCC----CCAGGTGGTGG-----CGCCCAAGAGTCA------AGTGCAGTGGCCCACGGCGATTCCCTCCTCGCCGTCGAACTACTCGAATGGCTATCAACAGCATCCGCAGCCCATTTACCCAGCTCCAACATCCGGAAGTGGAGCACCTGGGACAACGGCTTCGGTCTCCGGA------CCACCGAAATTCCAGCGCGGCTACGCATTCGACGATCAACAGCGTAGGTCCAGTTTT---GTGAGCGATGCATTCGACCTGGACGAGATCGAGCGGGAGCGACGGCGATCCCATGCCAGTCTATT---------TGGAATGGGTCAGGTGAGGGATCCCTACGATCTCATCAATGGCACCGCCGTCTAAGATACCCGCAACCACATACTCGTAATCAATAATGCCAAAGAAACGAAGAGCTAGCATTTTT----------TTTCGGAAGTAAGGTGACAAAAGAATAAGTATATGTCTATTGCAAAAATAAACTATTTAATGATTATATACAATATATATAATAGATGGTCCCAGCAGGTCTTAAAAAATTGATAAACTAAGCGCACAATCAGGCCCACAAAATCTATCAAAAGTATACATACACAAGTGAAAAAAGAGTAGTAAAATTCGAAATAGGTCTTTAAAAATTAATAAATGCGCACAATTTTGGCC
ATCAAGCGCAGCTTGTGCTTCCCCGCCGCGTGTCCATGTGTGTTGATCCAATGCTGCCACCGTTGATGCAAACGCAGCAATTGCGCAAACTCAATTCAAATCTGTCGCTGCACACA------------CCACAATCGGATGCTTGGCCCTG---GCCGATGCAGCAGCGCCTGGCGTCAGAGCATGGCCAGAGCCGGACGCTGCCGCGCTGCTTCCTGCGTCAGCCGGCAGGCAGCCAGGATAGCCTGGGCTCACTGCAGAGCAGCTACAGCGCCAGCCAACAGCGCTTCTCGCAGCTGATGCACCAGCACCAGCAGCAGCTGCATCAGCAGAACCGCTATCTA---TCCACGCTGACCCTGCCACGACCATGCGACGAGTCACAGCTCAAGCCGCAGCCGGCGGTGCACTGGCCAACGGCCATACCTTCCTCGCCATCCAATTACGCCACCGGCTACCCA---CTTCCGCAGCCGGTATAC---------GCACCCGCTCTTGCTGTGCC---GGTATCGAGTAGTGTCGCTGCACCTCATCCGCCCAAATTCCAGCGCGCCTACGCCTTCGACGACGCTCAACGCCGTGCCAGCTTTGCCGTCAACGAGGGTTATGATCTGGACGAAATTGAGCGCGAACGCAGACGCTCCCATGCGAGTCTCTTCGGTGGTCCTGGCGTGCCGCAGACGAGGGAGCAGTATGATCTCATCAATGGCACCGCAGTTTA------------------------GAGCCAGAATG----AGTTCAGGACAACTGGCATATGTAGATTGTAGATTGCAGATTGAAGACGATTGGAG----AGCATCTATCTGTTAT-------GACTGCTTGACAATTA------------ACAATCGTTCACTCCA------CTCAAATAAATGTTGCCCTAAGCTTTAGAGGATCCCCATAA-----ATTGAAAAGATTCA----------GAAAAAAAGTCTT--------------GTTTTTCA----TATTAAAAACAAACATTTTCTGCT
>CG11566 20921800 20922093|26192 chrX 20921072 20922218 scaffold_10 517568 518700 + 14895|818 1121
GATACCCGCAACCACATACTCGTAATCAATAATGCCAAAGAAACGAAGAGCTAGCATTTTT----------TTTCGGAAGTAAGGTGACAAAAGAATAAGTATATGTCTATTGCAAAAATAAACTATTTAATGATTATATACAATATATATAATAGATGGTCCCAGCAGGTCTTAAAAAATTGATAAACTAAGCGCACAATCAGGCCCACAAAATCTATCAAAAGTATACATACACAAGTGAAAAAAGAGTAGTAAAATTCGAAATAGGTCTTTAAAAATTAATAAATGCGCACAATTTTGGCC
-----------------------GAGCCAGAATG----AGTTCAGGACAACTGGCATATGTAGATTGTAGATTGCAGATTGAAGACGATTGGAG----AGCATCTATCTGTTAT-------GACTGCTTGACAATTA------------ACAATCGTTCACTCCA------CTCAAATAAATGTTGCCCTAAGCTTTAGAGGATCCCCATAA-----ATTGAAAAGATTCA----------GAAAAAAAGTCTT--------------GTTTTTCA----TATTAAAAACAAACATTTTCTGCT
>CG15445 20930935 20931011|26202 chrX 20929509 20931094 scaffold_10 525435 526981 + 38266|1441 1555
CT---TGTATTTGACTTGCCTTTTTTATATCTATACAAAAAAATATAGAAAC-----------------------------CCGAAACCGGTT------GTCAAGATAACTGTAA
CTAGCTGCGTTAGCTGTTTGTTTTTAGCATTTAAGCCATTAAATTTAATTACGTTCGTTACGGCGGCTACGGCACGCTATATAAAAACAGGTTTATCACATGTGGATAACTGTAA
>Pros45 21128280 21128339|26442 chrX 21128279 21128501 scaffold_22 1539564 1539777 - -1024|1 65
-----GCGTTGATCGGCCATTGCAAAAGAACCCTTATATTATTTTCAATAAATACATCAGTTAGT
TTCACGTTTAAATC-----------AATTAGCTTTATTATGTATTCCATAATTATCCCAATAAAC
>CG1486 21138080 21138825|26453 chrX 21136550 21138819 scaffold_5 1686927 1689264 - 72295|1593 2431
C--AATAACACAAGTAC----------GAGTATATTTCAAAATTAACTATAACTGA--ACGGCAGAGGAAAACAC-TTAGATCAAGGC-------------AGAGCCAGCA-------------ATATGGATTCCAC-------AGTGGGAGAGGCCTTAAAACGCAGCAATATCAAACAAGGCTTGAACTGAACAGAA--ACGCGTAGACAAAAACT-GGACAGATTACCATAT---ATATG------GACGGCTTCATTTCCAC---TTTCCCTACTTAAACGAAAAGAATTCCAA-AGAGGATGATTGTTCGCCCGAAAAGATGAAAAGATGATGATGATATGATCCAATTGA--ATTGCTTTTATGTATTTATATGTATATGGCTATTTCTATGATCTTTTATATATCTCCATTATATATTATATTATTTTACCTTATACTTTACTCC------CACCATTATTGTTGATTATGATCAGAGGGA-------AATGTGC-------GTAACTTCGTCCTCTTTA--CGCTTTTATTT----TTTTGTTTTTATAATTATTCAGATGCAAGTACCTTTGAGAGACATAATATATATACATTTATATATATATAGGCAATTCTTCAATGTTCAAT--TGTGCGAAGCAATAAATTGCGCTATTCTTATTCGTTAAGCTAAG----TGACAGTAAACTAAAGAAATTAAAGAAAACGCGGAGAAAGAAAATAATTAAATGACAAAAATATATTTATTATACAAAAATTGCTGCTATAAGAAAATAT-CTGCACAAAATATGATAAAAGGAAACTATACAAAATAAAATGTGAAATCATT
CTAAATGACTTTGGTCCAGCGCACAGAGCGAATGCTCTGTGAAGAGCAACGTCCGACTCTAGCGGAGCCACACACATTTGACACACGCCCCCCTTTTCCAAACAGACAGCAGACACAATAAAGCATAAGCATTAAACGTAAACTAACTAAAAGAACCTTAAAACTC--CAA----AAGCAATTCTGTAATTCCAAAGAACTCTTCTTAGACGAGAGCCGGGACAGCATTTGATGTTCCACATGCTAAAAAGCACGTTTGCTTCAATGTATTCTTTTACTTATAT-------ATTCAACTATTGTATTATCATTTATTCTTATATATACAAATATG----TATTCTTAACCAATTTATTATTCATGTGCTGTGTATACACATATACACACACACATA----CACATACACATATGCA-TATGTATTTTTATTTTTTATTTTCATTTTTGTTTTCTATTGCATCGTTGTTGTTG-TTCTGCTCTGTGGAACGCATTGAATATCCTTTGACTGGAATTCCATTGTCCTTATTCGATTTTGTTGCACATTTTGGTTTTGTTTGTCCGTGCATGCAAGTACCTTTAATTAAATTAA---ATAGAC-----------TAAGGACAATTGGACAATGTTCGATTGTGTGCGTAGCAATAATTTGCACCTTTCTAATCTAATTTGTTTAGGCGCTAAGAGAAATCAAAAACAATATATATATATATTGTATGCGAACATATAAAAATGAT--AAATATATTTATTATACAA--------GTTGAAATAAAGTATGCTGCTGCGAATGTGCACAATGATAATGATAATAGCTATGAT-TAATATTATT
>CG1486 21138080 21138825|26454 chrX 21138820 21139080 scaffold_6 1503966 1504220 + 2154|0 5
TAGAAA
TAGAAT
>fliI 21154862 21155766|26472 chrX 21155240 21155270 scaffold_5 1706619 1706648 - 1900|0 30
GCTGGGCAGCTGCCGTGACAGAGTAGCTGCC
GCCGTGCGG-TGCCGTGACAGAGTAGCCGCC
>fliI 21154862 21155766|26473 chrX 21155359 21155772 scaffold_5 1706739 1707210 - 1256|0 524
CGTGTGTTTGTACTTTTATA----------------------------------------AAATG-----------------TATTTAATTGTTTTGTATAA--TTAATTTAAA--------TTTTTTTATTAGCTCACTTGCTCCCGCCCCTAACTAAATAATTAGCTAACTCCAAGAACGCCAAGTATTCGCCCACTCCCTGCGAGAAAACCACATGAGTATATTGAATGCAAATATACATACATATGTATGTATATCACATATGCCTACAAATACGCAATATATATATATATATATATATATACATACGCTGAGCTGAGAGGATTACTCCCCTGTGCTAGTCCTTTTAAAATGTTAACCT----ACTTAAAGCTAGCCTGTAATAAAGTCAAGGAAGCACTAA----------------------------------AACTAATTGTACAAATGCCCACGTATTTATTTTATTT--TTATTAATCCCCTGAATAAACATTAGA----------AAAATTGAA
TGTATATATATATATGTATATATATATATGTATATATAAACACGACACAGAAACGCCAGCAAATGTTTGTACTTTTATAATGTATTTAATTGTTTATTATTATTTTTATTTAGAGCCGTTGTTTATTTTTTTTTTTTATATATTTCGCCGCCCAATTAATTAATTAACTCAC---------------CACTCGCCC-CTGTCTACGCAA----------AGTATTCT-----------TTTATCTATATATGTTTACATAGCTTTTG--------TATGTACTACTTATAT---TTTATACATATTTATATGCTGAGCCGGCGAAGTT-----TTTGTGCTAGTC--TTGAAGGTGTTATCCTCAGAAATCGAAATGTAAACGAAACAAATCCAAACAATTGCTAATTGCACAATGTCTTGCTGCCTGCAAAAATTCGCCAACTAATTGTACAAA----ATCATATTTATTGCAATTAACCAATTATACAATGAAAGTGAATAAAAATGCCAATTGAAAACTGAA
>dod 21157108 21157813|26475 chrX 21156971 21157226 scaffold_19 1811483 1811760 - 6052|140 278
ACTCAT-CGAGCACCGACCCACAGCACAACTCGCGTCCCTTCACATGAATAAAACGGAAT--GCCCAGCCATTTCAATATAGAAT----TATTTATTGTATT-------------TTAAAATGTTAGGTCTTGTCTAGG
ACCTAGACGGATGAAAAGATATAG-GCAACTGCATTAACTCATTAGAAATAAAACAAAATTAAAAAAGGCGCTTGAATTTAAGATTCTGTGTTTATTATCTCCCAGCATGATGCATTTAAATGTTACAAAATGTTTAAG
>dod 21157108 21157813|26476 chrX 21157227 21157452 scaffold_19 1812284 1812499 - 5696|0 227
CTAGAAGCGTTTCTCATTTGCCAATGTC--CAGTTTGGCGGCCAGTAGCTTGGCTCCGGGCGTCTTACGGTCCGCGAGTATCTGGCTAAGGCTCCTCTCCGCCGCGATGGCTTTCTTGCAGTCGTCCAGCAGTGCGGGACACTCCTCCACCAGCTTGAGCAGGACAAAACAGGCCCGGTTGACGCCCAGCCAGGCTTTCAGCTGAAAAGGGAAAGGGAATCGCAATTA
CTAGAAGTTATTAGCATGTTTCTATTTCTTCAGTTTGCTGGCCAACATCTTGGCACCCGACGACTTTTCGCTGAGCAGCACTTCGCCCAGTTCGTGCTCCTC---GATAAGCGCACGGCAGCTGTTCAGCTGGGCTGGCGAATCCTCCACCAGCTTGACGAGCACATAGCATGCCCGATTGATGCCCAGCCAGGATTTAAGCTGCGAGAAAAA---------CAATTA
>dod 21157108 21157813|26477 chrX 21157615 21158630 scaffold_19 1812518 1813446 - 28151|0 198
TGATTTTTGGGTACTTACCACATCGGAGGACAAGTTTTGGAGTAGCTGTTGGCTGAACGGGGTGCCCTCTCGCTTGCCATCGTTCTTGAGTATCTTCTTCAATACAATGTGCATGCCGGCCTCCTCGATTCCGGAGACCAACGGAGCCGCCGGCTCCTCCTCCTTTGCCTTTGGCTTTTTGGGCTCCTTTTTGGCTTTC
TGATTGTTAGCCAATTACCACATCGCTGGACAAATGCTGCAGCAGCTGAGTGCCAAATGGAGCTGCTTCGTGTTTCTGGTCATTTTTAATAATCTTTTTGAGCACATGATGCATGCCGGCATCCTCAATGCCAACGAC------AGTGGGCAACTCCAACGC----AGCTTTGGCTTCGT-----CCTCTTTTGGTTTT
>sol 21164779 21165089|26487 chrX 21164677 21165048 scaffold_25 1984716 1985036 + 7196|102 379
TCCAGGGAGCAGCAGCCGCCTATCAGGAGCCGCATCCGCAGCAGCAGGGACCGCGTCAGCTGGAGCTATAGCTGCAGCCGTAGGAGCAG--CTGCTGCCTCGCGGCACGACAATAAGACACA------GCTTGGCAACGGCAGCCGCAGTAAGATGTGGATATGCATCAAATGTTCCTATGCCTACAACCGACTCTGGCTCCAGACTTGCGAGATGTGCGAGGCCAAAGCCGAACAGCAGCAACAGCAGTTGCAGCTGCAACAGCAGCAGCAGCAGCA
CGCATGAGGCAGCAGCTGTTT--------------------TGGCACCGATCACGGC-----------------CAGCAATCGGCTCATTCCTCCAGCGGCACGCAACGACAATAAACCGCAATCGATGCTGCTGCACGGCAGCCGCA---AGATGTGGACATGCGGCAAATGTTCCTATGCCTACAATCGTCTCTGGTCCGAGTCCTGTGAGATGTGCGAGACACTATCCAAGCA-----AACAGCAGAGTCATCTCCAGCATCAGCAGCAGCAGCA
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AAGCACCCCGCGACGAGCCATGGACCTGCAAGAAGTGCACCCTGGTTAACTACTCGACAGCAATGGCCTGCGTGGTGTGCGGCGGCTCCAAGCTGAAAAGCATCTCTTCCATCGAGGACATGACGTTGCGAAAGGGCGAGTTCTGGACCTGCAGCCACTGTACGCTCAAGAACTCGCTGCACTCGCCGGTC---TGCAGTGCCTGCAAGTCCCACCGCCAGCCGCAGCTCTCGATGGCCATGGAGGCGGTACGGGAGCGACCGGATGGTCAGTCGTACGAGGAGCAGGATGC------TGCAGCCGTCGGGGGCGGAGG--AGGCAGTGCCCACCAATCGGGCGCCAATGAGGTCAAGGCGCCTACAGCCTTGAACCTACCGCTAACTTCGGTGGCGTTGCCCATGCCCATGCTGCAGCTTCCAACG-TCAACAGCGGCTGGTCTGCGCGGCTCACGCAGTCCCTCGCCCAGGATGCAGCTGCTGCCATCACTCCAGCAGCAGAGGAACTC---------CAGCTCATCGGGCGCTATACCTAAACGTCACAGCACCGGCGGCTCCATTGTGCCACGGAACATTTCCATCGCTGGTCTGGCCAATTACAATTTGCAGCAGGGCCAGGGAGTCGGCTCCGCATCGGTAGTGTCTGCTTCTGGAGCTGGATCTGGAGCTGGAGCTG-TCGGAGCCAGTACCAGCACAAAGAAGTGGCAGTGTCCCGCGTGCACGTACGATAACTGTGCCGCTTCCGTCGTTTGTGACATCTGCTCGAGTCCGCGCGGCCTGGCGAGCGCAGTTTTGGGCGAGGCGTTGGGCAGAAAGTCCGTTCGAGTTGCCCTCACACCGGCAGATATTCGGCAGGAGAGCAAGCTGATGGAGAACCTTCGCCAGCTGGAGGAGACCGAAGCGTTGACCAAGTGGCAAAACATCATACAGTACTGTCGCGACAATAGCGAGCTTTTCGTGGACGATTCGTTTCCGCCGGCGCCGAAGAGTCTGTACTACAATCCGGCGAGCGG---AGCAGGCGAGGGAAATCCTGTGGTGCAGTGGCGACGGCCGCACGAGATTAACTGCGACGGCGGAGCGTATCCACCGTGGGCTGTGTTCCGCACCCCGCTGCCCTCGGACATCTGCCAGGGCGTCTTGGGCAACTGCTGGCTACTCAGTGCGCTGGCGGTGCTGGCGGAGCGCGAAGATCTGGTCAAGGAGGTGCTGGTCACGAAGGAGATATGTGGCCAGGGCGCATACCAGGTGCGCCTCTGCAAAGACGGCAAGTGGACGACGGTGCTGGTGGATGATCTGCTGCCATGCGACAAGCGTGGCCATCTGGTTTATTCGCAGGCCAAGCGCAAGCAGCTATGGGTGCCGCTGATCGAGAAGGCTGTGGCCAAGATCCACGGCTGCTACGAGGCGCTGGTCTCGGGCCGGGCGATCGAGGGACTGGCCACGCTGACAGGAGCGCCTTGCGAGAGCATTCCACTACAGGCCAGTAGCTTGCCCATGCCCAGCGAGGACGAACTGGACAAGGACCTGATATGGGCCCAGCTGCTGAGCTCTCGATGCGTACGATTCCTCATGGGCGCCAGCTGTGGCGGTGGCAACATGAAG
AGCCGCGCAGCGATGAGCCCTGGACATGCAAGAAGTGCACCCTGGTCAACTACTCAACGGCGATGGCGTGCATTGTGTGCGGCGGCTCGAAGCTGAAGAGCATCTCCTCCATTGAGGACATGACGCTGCGCAAGGGCGAGTTCTGGACCTGCAGCCATTGCACGCTCAAGAATTCGCTG---TCGGTGGGCCTGTGCAGTGCCTGCAAATCGATGCGTCTGCTGC------CGGTGGC---GGACACGGTGCGCGAACGACCCGATGGCCAGTCGTACGAGGAACAGGACACAACGACGGCGACCGTCGGCGGCGGCAGTCAGACGTTGGGTGAACACAATACGCCAACGC-----CGACGCCAACGGCTCAGCTGCAGTTGCTGCCGCCGTTGGCGCATCGCA-ATTCACGCAGTCCCTCGCCCCGATCAACGGCGGTGG-----CACCGGTCCTGACGGCCATCCAACAG-CTGCAGCTGCAGCAGACACAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCGCAGCTCATCGGGCGCCATACCGAAGCGTCATAGCACCGGCGGCTCGATAGTGCCGCGCAATATATCAATGGCTATGCCCACC--------TCTGC-----GGCCAG-------------------------CTCCTCCTATA-----ATCTGCAGCAGCAGCTAATCCTGCCCAGCGGCTCGGTTAAGAAATGGCAGTGCCCGGCATGCACATACGAGAACTGTGCCGCCTCCGTTGTCTGTGACATTTGCTCGAGTCCGCGCGGTTTGGTCCATACGGTGCTGACGGATGCCCTGGCCCGCAAATCGATGCGTGTCGCT---ACGCTCAACGAAATCCGGCAGGAGAGCAAACTAATGGAGAATCTGCGCCAGCTGGAGGAGACAGAAGCGCTGACCAAATGGCAAAATATCATACAATATTGTCGCGATAATAGCGAGCTGTTCGTGGATGATTCATTTCCGCCGGCGCCCAAGAGCTTGTACTATAATCCCGCCAGCAGTGCAGCGGATGGCGGCAATCCGGTGGTGCAGTGGCGCCGACCCCACGAGATCAACTGCGATGGCGGCGCCTATCCCCCATGGGCGGTATTCCGTACGCCGTTGCCCTCGGACATCTGTCAGGGTGTGCTGGGCAATTGTTGGCTGCTCAGCGCATTGGCCGTGCTGGCCGAACGGGAGGATCTCGTCAAAGAGGTGCTGGTCACCAAGGAGATATGCGCCCAGGGCGCCTATCAGGTGCGTCTGTGCAAGGATGGCAAATGGACGACCGTCCTTGTCGATGATCTGTTGCCGTGCGATAAGCGCGGACATCTGGTCTACTCGCAGGCCAAGCGCAAACAGCTCTGGGTGCCGCTCATCGAGAAGGCGGTGGCCAAAATCCATGGCTGCTACGAGGCGCTCGTCTCGGGCCGTGCCATCGAGGGCCTGGCCACGCTCACGGGTGCACCATGCGAGAGCATACCGTTGCAGGCCAGCTCGTTGCCCATGCCCAGCGAGGATGAGCTGGACAAGGATCTGATCTGGGCACAGCTGTTGAGTTCGCGCTGTGTACGCTTCCTGATGGGCGCCAGCTGTGGCGGCGGCAACATG---
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GTGGACGAGGAGGAGTACCAGCAGAAGGGGCTGCGCCCGCGACACGCCTACTCGGTGCTGGACGTGAAGGACATCCAGGGACATCGCCTGCTCAAGCTACGCAATCCGTGGGGTCACTATTCGTGGCGTGGCGATTGGTCGGATGACTCCTCGCTGTGGACGGACGATCTTCGGGATGCTCTGATGCCGCACGGCGCCAGCGAGGGCGTCTTCTGGATCTCGTTCGAGGATGTGCTTAACTACTTCGACTGCATCGATATCTGCAAGGTGCGCTCCGGCTGGAACGAGGTGCGTCTGCAGGGGACATTGCAGCCCCTGTGCTCCATCTCCTGTGTGCTGCTCACCGTGCTGGAGCCGACGGAGGCGGAGTTTACCCTATTCCAGGAGGGGCAGCGCAACTCGGAGAAGTCGCAGCGATCGCAGCTGGACCTGTGCGTTGTGATATTCCGCACCCGGTCTCCGGCGGCGCCGGAAATCGGTCGATTAGTGGAGCACAGCAAGCGTCAG
GTCGACGAGGAGGAGTACCAGCACAAGGGTCTACGGCCGCGGCATGCCTACTCGGTGCTGGATGTCAAGGATATACAGGGACATCGTTTGCTCAAGCTGCGCAATCCGTGGGGACATTATTCGTGGCGCGGCGATTGGTCAGATGATTCGGCCCTGTGGACAGATGATTTGCGTGATGCTCTAATGCCGCACGGCGCCTCTGAGGGCGTCTTTTGGATCTCCTTTGAGGATGTGCTCAACTATTTTGATTGTATCGATATCTGTAAGGTGCGTTCCGGTTGGAATGAGGTGCGTCTACAGGGCACACTCCAGCCGTTGTGCTCCATTTCGTGCGTGCTGCTCACGGTGCTTGAGCCCACCGAGGCCGAATTTACGCTCTTCCAGGAGGGTCAACGCAACTCGGAGAAATCGCAACGCTCACAGCTCGATCTCTGCGTTGTGATATTTCGCACACGTTCGCCGGCAGCGCCGGAGATTGGGCGCCTCGTCGAGCATAGCAAGCGGCAG
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GTGCGAGGCTTTGTGGGATGCCACAAGATGCTGGAGCGGGACATTTACCTGCTTGTGTGTCTGGCCTTCAACCATTGGCACACGGGCATCGAGGATCCCCACCAGTATCCTCAATGCATCCTAGCGATACACAGCTCCAAGCGTCTGCTGGTGGAGCAGATAAGTCCCTCGCCGCATCTCCTGGCCGACGCTATCATTAGCCTGACCCTAACCAAGGGACAGCGGCACGAGGGGCGCGAGGGGATGACCGCCTACTATCTGACCAAG
GTGCGCGGCTTTGTTGGCTGCCACAAGATGCTGGAGCGTGACATCTATTTGCTCGTCTGTTTGGCCTTCAATCATTGGCACACCGGCATCGAGGATCCGCATCAGTATCCGCAGTGCATACTGGCCATACACAGCTCCAAGCGGCTGCTGGTCGAGCAAATAACGCCCTCGCCCCATCTGCTCGCCGATGCCATCATCAGCCTGACACTGACCAAGGGCCAGCGGCATGAGGGACGCGAAGGCATGACCGCCTACTATTTGACAAAG
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GGCTGGGCGGGTCTGGTTGTGATGGTGGAAAATAGACATGAGAATAAGTGGATCCATGTGAAATGTGATTGCCAGGAGAGCTACAATGTGGTGTCGACACGCGGCGAACTCAAGACAGTGGACTCTGTGCCCCCGCTGCAGAG
GGCTGGGCTGGACTGGTGGTTATGGTTGAGAATCGACATGAGAATAAATGGATTCATGTGAAGTGCGATTGCCAGGAGAGCTACAATGTGGTCTCGACGCGCGGCGAGCTCAAAACAGTTGATTCTGTGCCGCCGCTGCAAAG
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ACAAGTAATCATCGTTCTCACCCAACTAGAGGGCAGTGGCGGCTTCAGCATCGCCCACCGGCTGACCCATCGTCTGGCGAATTCCCGCGGCCTGCACGACTGGGGGCCACCCGGCGCCACCCACTGCCCGCCCATCGAGAATGTCCATGGACTGCACGCTCCGCGGCTAATCACCTAGAATGGGATAGGGATAGGGATGGATGGCAGTGACGCAATTTCGATGC--------------TACCCCGCGATATGT------------------------------CGC-------TGTTCGAATCCTGATTTGCA-------TGCGTCTCCTCTC--------------------------------AATTCTACCCGTCTTCTAGTCGATGTTCTGTTAACGAATCACACAT-----TACAGCGAAAAACCCAAAGTTGAAACCAATCAGCATGCGAAACAATTCATATATATGTGTA--TAGAGCCGTGCAGATATGATATATGTATGTGTTTATGCACTAAGGCGTATCGGAAAGTGGGAGCAGATCCCCGGTGGGGATACGGCAGAGCCCAGAAGCCCCAGTCCGGAGTCCTAAGGCTAAGGCTCGGCACGATTCGCTTGAGATCCAATGATCTGTGTTTTGATTAGAGCGGCTATGATTGTGGATTATATAGATATGTATTGTGAATTTAAGTGCATCCAATATTAATATGTGTATTGTTTTAAAAATAAAG-ACTACAAGTTATAAAA
GCAGGTGATCATTGTGCTCACCCAGCTGGAGGGCAGCGGCGGCTTCAGCATTGCCCATCGGCTGACGCATCGTTTGGCCAATTCGCGCGGCCTCCACGATTGGGGTCCGCCGGGCGCCACCCACTGTCCGCCCATCGAGAATGTGCACGGTCTGCATGCGCCGCGCTTGATAACATAATTGATCAAACCGACTTGGAAGGATGG-AGGGGCATTAGTTCAAAGCAAAATATATATATATATATATAGATATGTATATATATGTATCTATGTGTATTCCTTTAACGCCATAACGTTTTTGAACTATGATTTTGATTTCGGTTGCATTTTCTTTAGTTTTGTTTTGTTTTTATATTTTAATTTTTTGAGATTTTTGCATATTCTAGTCGATGTTTTGTCAACG--TCATACGTACACACACACACACACACACACACAT-ATATAGATATACACGAATATAAATGTATGTATATGTGTAATTCGAAATAGTTAACGATGCGAT-TGCGGGCGCATAAATACATACATATATTGAGAAAAGAAATGAAATAAATGTGAATTATATAGTTAAACATCG--GCCTGATACCCGAACCCTA---TCAAAACT-------------TTGAATTTCATCGATGTATGTATTGTATTGAATTAAAGTGCATGTGCGTCAT----------------GATCCAGCAGCAT---ACATAAATATGTCTATTGTTTTAAAAATAAAATACTACCAGTTATAAAA
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ACATTTAATATTAAAAATAAGGAGTTCAAAGCTCAGTAGTGTTGC
TCAGCTAAAACAAAACAAAACAA----------------------
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GCAGGCGGGTATATCTTTTATATACGCGCTTGG---------CGGAGGCG----------------GCAATCTCTAGTTATACACA-------------------------------AGTCGTATATATACACATATACA-----AAACATATATTTTGTACGCAGATTTTGGTTGCGATCGCGCTTTAATTCTACTCTCAATTGTGAAACGACGGGCGCTAAGTATTCTGTATTAATTTCGCATTCTCCATATATATATATCCGTA-----------GTATCTAGATATACAC-------------------ACCACATACATTTATACACACATCTAACT
ACAAAC-------------ATCTACGGGCTCGGGCGGCAGGTTGGCGGCAGTTAGCGCACGTTTGTGCAATTTACATATATATACACCTATATATATACAACTATATATATATATAGAGATAGATATATAGACGTATATATATATATATATATATATTGTACGCAGTTTTTAAG-----------TTAAGTTC----------------ACGATGGGCGCTAAATTATCTGT-TTATTTTTGCACTCTAAACACACACACACACAAACACACACTCGTGTATATACATATACACATATATGCACGTGTGTGTAACCATATATGTATGCGTACATATTTAGCT
>Sep1 21171515 21172363|26493 chrX 21171766 21172009 scaffold_25 1993010 1993278 + 2766|0 304
TACACCTGC-CGCGTATGCAAATGCCTGCAATGCAATTGCTTCATCAGAAAAACAAAGAACATAAGGAACACCAACCATCAGCGAACTCATATCACTTCTATCAAGCGAAACCACACACGAAAACAATTGTATTCCTATTATGTATTTAGACGCG-----------ATTAACAA-TGAATTA----------------------TTATTGTAAT----------------ACGCATCTAGGCTAAGC----------GAATCCAATCCGATTTATATTGTATGTTAATTCATTTTTGTCTGTTTA
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GATCAATCCCGACCAGAACATCGCTTCTCAAAGCTATTTGTGGACAATTTAG
ACGCATATCCG-CCGGACACCCGTCACGCATGTCAACT-----GCATTTTGG
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GATCGAGAACGGGAACGAGATCAACATCATCATTATCATCACCATCGACGGCGTCATAAGCATGCGTC-----TGAGACAGACGAGCACTGCGAGGACAC-------------CAACAACAATAACAACAACGAGCAAAGCAACAACAGCAGCAGCAGCA-CAACAGTTGC---------TCGCAGCCACAAGCGA-------------CGCCACAGTC-----GCCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAACAGCAGCAGCCGCAGCAGCAGCAACAAC-AGCTGGAACCGAGCCCAGAGACGC--------ACGAGCCGCAGCTGCTGCACGCCGCGTCGCTGA---------------------------------GTCCCGAGGATAAGGAGAACTTTTGCCGACAGCTGCAATTGCTGGATTCAAATTCG------GCGGCCATTGCGGTCGCCACAAGCATTGCGAACCTGAG-CCTG
>waw 21180368 21181398|26506 chrX 21180992 21181560 scaffold_25 2010632 2011331 + 16857|0 534
GACCAAGAAAATGCCTTTCGGCGCATCGAGGATGTGCACAACTATGCCAAGTTGCAGGA----------------------------CTGCAGCAGCGACACT-----------------------------------------GACGACGAGGACGACGAAGAGGAAGATCTCGATGAAGAGGAGGATGATGAGGAGGAGGCGGAGATCCAAGTGCAGTTGCCTGTGCAGCAGGAGGTCACGCGCATTCGTC-----------------GCGAGGCCGCCGAAGAGCATGTGGACGTGGACGTGGTCACAGTGCCGC-------AGCAGGAGCAGGATCAGTATAGCCATCAAGTAGAGCCGCGACAGCTTCAGCA----------------GGATGAGACAGCGGATA-------------------ACACACGGCCGGAGCATCATGCCCGCCGACCCATGAATGCCTTCCTCATATTCTGCAAGAGACATCGCGGTATCGTCAAGGAGCGTTACAAAACTTTGGAGAACCG
GACCAAGAAAATGCCTTTCGCCAAATCGAAGATGTACACAATTATGCCAAACTGCAGCATCATCATCAGCAGCAACAACAACAACAGCAGCAGCAGCAACAACATCAACATCAGCACAGCAGCAGCAGCGAACTGGGCGAGGAGGATGAAGAGGACGACGACGACGATGACGACGAGGAGGATGAGGATGATGATGAGGAAGAGGAG---CGGGGGCGGGAGCCAACAAAGAA--AACCCATCTAAATGTGCCCATCAACACAAACAATGATGATGATTCCGAGGAGCATGTCGAGGTGGATGTGGTCACTGTGACGCCAACGGCAACAACTGTAGCAACAGCGGCGGCGGCGGCGGCGGCAGCGGCAGCTACAGCACCACAACTACAACTGCAGCAGGAGCAGCTGATGTCCAAGGTGGATCAGGAGCATATGCGGCCGGAGCATCATGCACGGCGTCCCATGAACGCATTTCTCATATTCTGTAAAAGGCATCGCGCCATTGTCAAAGAGCGCTACAAATCGCTGGAGAATCG
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TGCCATTACAAAGATACTTGGCGACTGGTGGGCCGCTCTCGACGAGCAGGAGAAACACTGCTTCACGGATCTGGCACAGCAG
AGCCATCACAAAAATACTCGGCGACTGGTGGGCCGCACTGGATGAGCAGGAGAAGCAGTGCTTCACCGATCTGGCGCAGCAG
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AACAAGGACGCCTTCTTCAATGCTAATCCAAACTTCAAGTGGTACAAACTGCCAGCTCCGCCGCTGCGAACGCTAGCTACCCGTCCCAGCAACGCGTCTGCTGGCTTGCTCATACCCAGTGAAGATCAGCCACAGCAGCAGGTGCCGACTTCACTGCAAGTGCAGTGGGCAGAGCGAGGGGAGATGCCGCGTGCTATGCTGCGCCCCAACTACTTTAAACTGGCAGACGAAACGCAGATGGGCGAGCTAAGCTCCCTACT----GCAAGTTCAA-----GTACAAGAAAAGGACTTCGCCCTACAGCAGGTGCTCAGCGAGACCAGCCAGTTTCTATCTGCCCATATG-CCAGC--------------------TGGCAATACAAATGGGAATGGCAATAAGCGCTCCTTGCAGGACAACAACTCGAGCAACTCCAGCGAGGAGGAGGCGGCCAGTGGTAGCTCGCCAAACAAGAAGGTCAAGTCATCACGCTCCTGCAAGGGCAAGATTTACCAGGAATTGGTCAATTCCGGTCAATTGGCGGCCATAGCTAAGAAGAGCAAAGCTCGCTTGCCGCCGGCAGGTAACATGGGTGGAAACTTTGTGGACATCCCCTTGGATGCGGGACCCAATACACCGCCCGTTTCGCCACCGG--AACGTCAGGGTAGCAGTCCG--GATTCCATGCAAAAACATATAAGA-AGCGTTTCCGAGTCAAGCAGCAGTGGTTTCTTTGATCTCGAGGAGAAAATCAAAGAGCTGCCAGCCCTCAGCTTGGACGCTTACCTGCAGCGCAAACGTAGCACCAAAAAGAAGAAGAAGTTTAGCGGCACCAAGAAACAGAGGAATTCGAACAGCACAAGTGGTGCATCAGCAACTTCGAATGTGGCAGCAGCAGATGCTGCGGCGAAAGGTGCTGTCCCATTATCTAGCGAGCAACACGTGAGGATCAAGCAGCAGCAACTGCAG--GCTGTGGGAAGCCAGCGACGAAAGGCGCGCAAGGAAAGTATCACCCGGCGCGATGTTAGTGCCATTGAACAGGAGGTGGCCTCAATTCTGCCCCTGACCATCAATGGCAGCTACTACTTTAACCAGA---GCGGTGCTCCCAAGGCGGTGAATGCCCCTGTAACCTCGTCGTCG------------GCCTCGCCACCGCTCTCTTCGAACTCCTCGTCGTCATCCTCCTCGCTCTCCTCGCAGGCGGCCTTCGACGTGACCTCCTCTACCTCAGATCTACTCATTCTGGCCGAAGTGGCCGCCAACCGCACTGAGCTGACCAAGTCCAACTAGCGCCTGCAACACCAATAACATCAGCAGCACCA
AACAAAGATGCCTTCTTCAATGCCAATCCCAATTTCAAATGGTACAAACTGCCCGCACCGCCGCTGCGCACGCTCGCCACCCGTCCCAGCAACGCGTCCACCGGAC------AAATTAATGAGGAGCCGCTGCAGCCGCATGCACCA---CAGCAGCACCTACAGTGGGC---GCCCAATGATGTGGCGCA---TATGCTGCGCAGCAACTATTTCAAGTTTGCGGACGAGACGCAAATGGGTGAGCTGAGCGCATTGCTCAGCGCCAATGCGGGCAGTGTGCCGGACAAGGATTATGCGTTGCAGCAGGTGCTCAGCGAGACGACACAGTTCCTGAGCACGCACATGCCCAGCAACAACAACAACAATAATAATAACAATAATAATTGTAATAATAATAAGCG---ACTGCTGGACAGCGGC---AGCAATTCGAGCGAGGAGGAGGAG------CGCGGCACGCCCAGCAAAAAGCTAAAGACCGCGCGCAGCTGCAAGGGCAAAATCTATCAGGAACTAATCAATTCTGGCCAACTGGCGGCCATTGTCAAGAAGTCCAAATGTCGCCT------------CAACAGTGGCGGCAGC------AACAAC------GATGCCAACAGCAACACGCCGCCAATTTCGCCAACAAACAACGTTGTCGCCTCAGTCGGACAGCTGCTGCCGGAGCCGGAGACGACAGCGGT---GCGTGTGGCGGCAAACG--AATTCGATTTGGAGGAGAAGATCAGGGAGCTGCCGGCGCTCAGTTTGGATGCCTATTTGCAGCGCAAGCGCAGCACCAAAAAGAAGAAGAAATTCAGCAGCAGCAAAAAGCAACGGAACCCCAAC-----------TGCAACACTAAC----AGCACACCAGCAGCAACTGTTGC-------------------------------CAACGTGTCAACAGCAA-CAGCAGCAACTGTTGCTGCCGTGGGCAGCCAGAAGCGCAAGGCGCGCAAGGAGAGCATCACGCGTCGCGATGTCAGCGCCATCGAGCAGGAGGTGGCCTCCATATTGCCGCTGACCATAAATGGTTGCTACTATTTCAATGAGACGCGCGCAGCGGCAGCAGCAGCAACAGTTGCCGCAACAACAGCAACAGCAACTGTTGCCGCATCGCCGCCGCTGTCGTCG---TCATCGTCCTCGACGCTGTCCGTCTACGAGCCGGCCGGCTATGATGTGA---CCACTACCTCAGATCTGCTCATTCTCGCCGAGGTGGCCGCCAATCGCACCGAGCTGACCAAGTCCAACTAGCAGCAGCAGCAGCATCAGCAGCAGCAGCAGCA
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AAATAGACATTCGTTGGATCTACAATTTAGTCAATAATATTATGTAAACACACACACACACACACACACA
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ATTTGTTTTTTTTTTTTCAATCAACATTTATGTTTTTTTTTTTTGTTATTTGTTAACAACGGCGCCGCATAGTTTCAATTTCTGTTTTGCTAGATTTGTTAAGTTTTTTTTTTGTTTTTTCTTGGAAAAGCAAACAATATTACAAAAAATATGCACATGTGCTGCGCTTATTAACTGTTAATTAATATTATTATTATTTCTAATACAACTAGTAGCTATAATTTATTATCTATTATCTATTGTGAAAGTGGAAACATGCAAAACATATACATATACCTAATATAATAT-----
>slgA 21194582 21195837|26521 chrX 21193703 21194593 scaffold_25 2026670 2027652 + 43312|981 992
GCTGGCCTAGAT
ACAGCTCCGGCT
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TATATCTATATATTTGTATATATATATATGTATACATATATATATATATATATATATATATATAGAT---GTATGTATGCGTATATATGTTATCGAACG---TTGAAAGA--------------AAACAAACTCAA-----------AGCAAAGAGAAGCATATTATTTAATTTAATCAAACTGTTGCTTGCATATGTATTTCAATATAAGTCATTAATAATTGTATCTCTTGTTGCAAGTTAAATGCGTGTGTTTTGAAAAAAAAAAACGAATATATATATATATATATATATATATAAAAACAACTATGTAATAAA----AGCCGTAAACCAAAATAGGTTTGTAAAATTCTAGCGCGAGTTAAACAAAAACAAAAAAAAGCACATTTTTAGCAAAAAACTTAAAAGTAAGAGCATATAAAATATA-TATATATATATATATATAGATATATATGTGCATGAGAACAAAATATTTATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATTTACTTGGCTGCATTTTAGACTAGTTTCTCGAGTAAATTC-----------TATTTCT-------ATTTCAATTGTTGTCAACTGCTGCTGCTGCTTATTTGCTCGATATGTGTGATCTTATATATTGTTTCCTTAAGC-ATAACAACTGTAGTTTAGACCTCTATATATATCTATATGTGTATATATATGGAGAGATCGGTAGAACGCCTGCATTTGTTTCTTTTCACAGCAAGCATC------AATATATATATATATATATATATATATATG-------TTGCCGCCCAGGGATTAACCTAAACCTAAACTGAATGTTTTATTATAATAATTTTACTAAATTATATACATATATATATATATAAAAAAATAGCAAACATA-----ATTTCAATTGTTATTTTTATT-TAGTC------TCACCCCCCTCCCCCAACCCACTCCCCTAGTTTGTTGCTTTCAGTGTGCTTGATGTAATTGAGTCGAAAAGTTCTCCTTTTTTTTCTCGAAATATTCATAGTTATTCAATATACATTCATATTTATGGTATGTGTGTTATTCAATATGCGAAACTATATACATTGCATATAT---------------------ATAAATATA--TATATGTAATAAACAATAATAAATAATTGAAAAATCAATAATTGTATGAATGTTAACTATTTCAATGACAATAATAAAATGTTAAAAACTAT
>CG32822 21331497 21331513|26713 chrX 21331292 21331876 scaffold_45 681820 682449 + -979|234 265
A------------AAGAACGTG---AACTACG
ACTATTTATTATAAAGGACTTGGCAAACAAAG
>CG14621 21650389 21650580|26868 chrX 21649917 21651537 scaffold_5 1958639 1960376 - 22478|529 820
TGT--GTAGTTAGTGAA--TGTATCCAATAAGCGGGTTAGC---TAAATAGTATTAACC----------TGTGACGACCA-----------CCATC----CAAATTCCGACTCTCCC---CTCTTTTATATATATAAATAT---------------------------------ATATATGTATTTATATTAT-------TATATTATATTTATATTTATATATTTATATATATATATATATAGTG-----------------------TATATATTAAAT--ATGTTTGAC
TTTTAATAATTAGTGAAATTGTATTACAACATCAGGCCCACACACAAATTGTTTTACCCGCGTTCGTTTCGTCTCGATCGTCTCTGATAACCCATCTTATCAGAGTCCACCATTTACGGGCATTCTTGAATTGAATAGTATTTCGCATTCAAAGCAACAATTCAAACAATTCAAACATTCGTCTTTGTGCTCTCTGCTCGTATGTCATTTTTGTTTTTGTATATTTCCAATGTTTTTTGTTTTATGCTCCCATCAGCTCCTATCCTAATTATATTGTAAATTATTGTATGA-
>tilB 21654827 21654866|26870 chrX 21653121 21655591 scaffold_5 1961725 1964221 - 46634|1775 1827
G-------------ACTGTGTTCATTATTTAAAAATGGTTTATTTAAATATTT
GTGGCGAGACAACAAATGT-----TTATTTAAAAATTGTTTATTTAAATATTT
>CG14619 21671584 21671890|26883 chrX 21668610 21671912 scaffold_5 1978095 1981618 - 54575|3393 3730
GG------CCCAATCGGTGCTCTACGTGCAG-------CACTCTGCATATAGCGATGGAAATCAAGATGACCATGGGGTAGGATGAAAGCAGAAGGAAATGAATCAAACGAACTTTTAGAAACGCTTCGTAGAATTGCATACAAACAATTTACTTAATTTAACT-CAACTTAAAAGCAAAACAAACTAACTCCTAACTTAAAGCAGAAACCAAAACAAAAACGGAAAAGCTGAAGAAAAGTGCATAAAAAAACCAGAACAAATG-------------TACATAAACAAAAACGAACTTCGAT----GGCTAAACTATACAACAAAAGGAACAAGAATA
AGCTAACTCCCCACCAATTACCTA---GCAGTTGAATCCAATAAGCAT-TAACAACAGCAACAACAGCAACAACAG----CAGCAACAGCAGCAACAACAATACCAAAAGCAA---CAGCAACACCATCTTAAGCGGCA-ACAATAACAGCAGCTA---CAACTGCAACATAAACAGAAAAAAAAATGAATAC-AACAAAAAACATAAGAAGAAAAAGAAGTGCAATAACAACAGCAAAG----TCACAACACCTTAGTAAATGTTTCGTAGAACTTTGCAATAATGCAAACGTGCGTAAATTAAAATTAAAACTTAACTATAAACTAATTCTTAACA
>CG14618 21678260 21678400|26893 chrX 21678221 21678686 scaffold_14 633987 634446 - 64|39 182
CGG-CAGTCGACATCG-GATCTCGAGGTCTTTTTG-ATTTTTATTTCAGTTTTTGTTTTTACAAAATCACATTTCGTTTTGTTTCGCAATTTAAATGATAACTTATGTATTTTAAGCGCAAATAATAATAAGAATACAAAGAAA
TGATCAATTAATATAGTAATCCCCAATCCCCAATGTAATTTCCATGCAGTTTTTCTATTTGGCGACAC---------------TCGCGTTTCAATTAAAAAGCAATTATTTTCAAACCGAAG-----AGAAGATTACACAAATA
>CG14617 21688651 21689034|26903 chrX 21688646 21689039 scaffold_5 1946354 1946727 - 9493|5 393
CAATTCGGGTAGTCAGTTATGCAAGTGCCT--TAACAAAGACTGCGAGGAAATCGAGGGACCAAGCCTCTAGCACCAGTAGCTAACCTAATTACTAACCCAACTAGCAAGTGCCTTCGTTCCCTGTTTAATTTCGCCTCTAATCCCTGCCAGAAATAT---GTCGAGCTGAAACAGGAAGAGCGCCAGTGGGCGGCCACACGTATTAATGCCGGTGTGCGAGGATTTTTGGTCCGCCGGCTTTTTGCAACCGAGCAAGTGCAGCGCATTGTCCAAACCATCAGAGACACCCTGATCTTCGTGTTGAACCTGCACCTGGAAACTTGTGGACATGGCCTGGATGCAGAGGAGCCTGCAAACTTGCGCCTCAAGGCGCGATTGCTTCAACAG
GAATTCGAAACGTTTCCCATTCGATTGCTTAATAAAAAAGAGCAAGAGCAAACTAACCA--TAACCCACTAATACAAGTCACAAT----ATTGCCACGCCCTCACTCACATGCCTCA-------------------CTCTGATCATCACTAGCTGTCCACGGACGAGCTGAAGACGCAGCGACGTCACATAGCCGCCACAGTTGTGAATGCCGCTGCGCGCGGCTATTTGGTGCGCCGTCTATTCCGGACCGAGCAAGTGCAGCGCATTGTTCAGACTATACGCGATACGCTCATCTTTGTGCTCAATCTGCATCTGGAGACGTACGGCAACAGTCTCGACCAGGAGGAGCCGGCAAATATACGCCTTAAGGCGCGCCTCTTGCAGCAG
>l(1)G0196 21707181 21707328|26928 chrX 21706669 21707768 scaffold_10 4612753 4613970 - 4669|632 789
---ACGGTCTCAGATCTGTGTTTTTCTCATTCTT----ATACGCTTCAAAAGCACTCAAAATTTGAAATTTTATATTGTGTGATTCGTTTTTTATTCA---AAATTAGAAGAGTTTACAATTTGTATAAAATAAAATTGTTGCACTGTTGTTATGAAC
GATATTGACTGTATTCAAGAATCATCTGATGATTAAGCATGCTCATTGGATTCTCTAAAGATTTCGATTCAAATGATTTATTCAAAATTTCCTATTCGTATAATTTTCGAGAGTTACCCATTTTTTCATTATACATATAT----ATTTTCTTATCCTG
>l(1)G0196 21707654 21707825|26928 chrX 21706669 21707768 scaffold_10 4612753 4613970 - 4669|1141 1265
AAC--------AAATGCAGCAATCACTTTCTTTTACCAGTTTCTGTATAAATATAACCAATAT--AATTTGATATTTATGCATATATATGTATGTATGTATGGATATGAATGAAAATTGTGTATT
AACTGGGTTTAAATAATTGTAATTAATTCACTTAAGACGCAAATAGATAAATA-----AATATTGAATTAAACACCTTAGCATATAGA--CATGTATGTATGTATAT-AGTAAATACTTTCTCTT
>l(1)G0196 21707654 21707825|26929 chrX 21707769 21707954 scaffold_6 4732799 4733023 - 1055|0 71
AAATTCCTCTAGTTTTTAA--------------GCCTTTCGTTCAGAATTGGAATAAATATT-GCTAGAAGT
AATCTCTTCTAATATTTGAAATACTTTTGAATCGACCCTCGTTCGTATTTGGGGTATGCATTCTCTCGGGTG
>S6kII 21736839 21737492|26957 chrX 21736239 21737695 scaffold_10 4642076 4643708 - 34865|618 1446
TCCTGGGC--GGCTGCATGGTGTCCGCGGCGCCAGGCCAAGCGGCAGATAGTCCGACTACTTTTCCGAATCTATAGTATTCTAATCCAATGCTGCTGTGCCAATCCGCGTCGTCT------------TGTCAAGGACAATGCG---CAGAAGCTTGGTTCACATCCACAAACGCTGGGCAATCCTCGCCAACGCTGCCGCAGCGCCAAGCTGCGTGTGGTTTA-------------GGTTTTGGGGG-------------------------------------------AATCG-----------------------GCCTAACCTAAAGTATTTGAC----------AAGTGTTAATTATTTATTTTATATGAAAGCATGCCAATATGCCA-AGGCCATAACGCA--------------CTGTGCGGGGCATCTATATACACATATATATAACTATACAAATACTGATATACA----------TCTATATATA-GCT----ATTTATATAACGAATCCTAAAGCA-AGGGCCTAGAGAGCGCGTGTGAATGTGGCGCCAGGATCATCCCAGATGATTCCTGAAACCACATTATTTATCCCAAACTGGAAATT-----------AAAAAAAAGCCTCTCGCCCAAGTTTACATATTTTTAATTAAATT----------------AATCGTAGCTAAATTTTTCAACATCACCGTGTTAT---------TGTTGCTTAATTAAATTAATTAAAATGAAAAAAAAAATGGAAAAAAGTATTAGCAAAACAAACAAAAA--TTAAGAATAAAAGCCGCAATCCTTTTATAT
TTGTTGGCAGGGCT-----GTGCCCGAGACGCCTAGCCAAGCGGCAGCTAATTCAATTAATATATAAACTCTATAGTATTCTAATGCA---TTGCTGTGCATTTCCGCAACGCCTTTGGGAGTGGCATGTCGCCCTCAATCCGTACCAGCGGCAGGGGCCAAA-CAACAAATGCCGTTTAA--AGCGACAGCGCTGCCCCAGCGCCAAGCTGCGCCTGGTCTGAGGATATGGATATGGACGTGGAGGCAATACAACGCGCTCTCGCTCCCACCCCCACTCCCTCTTTTTCAATCGCTCGCGTTTCTTGCATGCAGCGCGGCTAATTTCTAGTATTTGGACGAGTATTTGAAGTGTTAGTTATTTATTTTATA-AAAAACATCC----ATGCCAGATGCGATAATATAAACGATACATGTGTCTGTTCACACTGCATGCGTGTATGCATGTGTAACTGTGCCCATGCCCAGGTGCACGCAGCGGCTTTTAAGCATATGCTTTACATATATACAAGATATATACATGTATATATTATATAATGCCTATGCAAAAGTA----TGCGTTCTTCCT---CGAGCCCTTAAGCCCAGTTGCCGAGTCTCAGCTGGTTTTTCAGCCGGGCCCAAACGGAGGCTACACTCAAAACTAAATCAATCTTAAATTAACTTCAAATGTTGGCCAAAAAATCGT-GCTAAAAATTTCAAAAATGATATAATATATATATACATTATATATATATATATATATATATATATAAAACAAAAAGTAAAAGCG----AGCAAAGAACGTGAATATTTTAATTATCTTAGCTAAATTTTTCACATCA
>CG17600 21745218 21745423|26968 chrX 21744746 21745407 scaffold_10 4650207 4650897 - 20726|496 715
CGGGAAAAGCATCCGCTCTCTAGTTCCCAGT-----TTCCCAGACTTTTGTATATATTTTTTTTACGGAGCCACAACGAAATCCCATCTATGTGGGG---------------CTTTGTCTGATAA--------ATTACCCCTTTTATATCCATTACTCTATCAATGTACTTACATATGCGTATAGCTCTTAAGACACATTAAAAT--TAATCGAATAAAG
-------AGCCCCAATCCCTGTGGCCCCGATTGATGTTCAGCAACTTTTGTAAATAGCTTCCC--CCAAGCAACTGCCAG--CCCGCCCATTTAGCGGCTGTCCAAGAGCCCGTTTCTCTCATTATTAATATTATTATTTTTTTTATATGCA-CATTTTTTGCATACACAAATAAATACATCTAGTTGTAGGCATGTGTTTGCATAATAAACGAATAAAG
>CG3038 100872 101260|85 chrX 100278 101216 scaffold_3 3017439 3018336 + -912|617 992
ATGTAAGGAC---TTTTTAAAAGGGGGTGATGAAGGAAGAGACAAATATTGGAAAAGGGATATGATACTCATCCTTGCATATATATATATATGCATTACAATAAAT----GTTTGCCAGAAA--TCGACTTTACATG------------AATTACTATACACCAGTTTTTTAATTATATATAATTTCGGTTGCCATAGTAACAGTCGGAAAATTAAATGAAAAATAATAGGACATGAAAACATACT-TTCATTGTTTTTTTTTTAATCATCAATTTTAAAAATAAAACTGTTCTAATGTGTTTTTTGTTTTACACTGCATTTTTACG--AAATAAATAATAAT-------AATAAGATTAAAAACAGAACAAGACA
ATATAAGTACAAATTTGTAGAAGGGCTTTGCACAAGCCAAAGCCAATA-----ACAGGGAT----TCCCCAAAATGGTTTGTTAATATGTA--CCTAACAATAAAATGTAGTTAACTTTAAAGTTCAATTGTAAATGCTCTTTCTGGCAAGTGAATATATAATATTTAGTTAACTTTAAA-GATCTCTCTT---------AAATTCTGACAACTTTATCCAAAACGG-AGCCCATTTCGAAGTCCAATTCAAGGTTTGTTCTTCAAACGTATTTTTAAATGTTGACAATTTTCTTTCATTTTTTTCGTTTTATATTGTAGTTTTAAGTCACATATTTTACAATTAAACTAAATAAAAATAATAAGAATACTGAAAA
>CG3038 100872 101260|86 chrX 101257 102560 scaffold_26 1466023 1467373 + 44011|0 3
CATC
CCTC
>CG13377 115155 115426|95 chrX 114720 115340 scaffold_26 1489311 1490050 + 7727|504 759
TTTAATATTTTTACAATATATTTCGATT-GATGTTTCTTTTTTCT---GTTCTGAGGGCTTTTATAATATT-----------------TACTTTTTAATCGTT-----TTTGCTCACACTGCTAACGGTGTA-------------ATTGTTGAA--------CGTTATATTTA-------------ATGTTATCATACATAAAAAAATA----AAGATA-----ATATATGTGC-TGTCTATATATGTCTGTCCAA
TTTAACATTTTTTTTAAATGTTTATATTTGATATTTGTTTTTTTTTGTGTCCCCTTTTCTTTTATAAAGTTGTAAATTGACAATTTGCTGCATTTGATTTGTAGACAATTTGTGCATATTTTTGCATATGTATATATATATATATATTAATGCGATTTATCTCTTTATATATATATACATATATATATGCAATAATACATACAAACATATCAGAATATACACGAATATATATACATATATATATATATATATGATA
>CG13377 115155 115426|96 chrX 115426 116547 scaffold_26 1490300 1491437 + 50501|0 0
A
A
>ewg 125343 126188|110 chrX 125262 126486 scaffold_10 3174167 3175749 + 7199|89 1186
GTGGAGAATGGCGACCAGCTGGAGACCATCACCATGTCGCCTGGAATGCACCAGATGATGATCCAAGGAGGTCCTGGCCAAGAGCCGCAGCTGGTCCAGGTGGTCAGCTTAAAGGATGCCACTCTGCTAAGCAAGGCTATGGAGGCCATTAATTCCGGCAACGTAAAGTCCGAAGACACGATTATTATGGAACAATAG----------------------------CTGGAGCCCA---------------------TAGAAGGCATGATTTCGCCTG----------------------------------------------GATTAAGCGATTG-ACGTGCCATGTTTTCTGGGCAT-CGTAGCTCTCCTGACTGACTACCCGTCT-ATAACTTAGGGTTCCTTTTGCCCCAC-----AAAAAAAATGTTTTCCAAGTACCTGAAAGGTGTTGCT-------AACGGAGACAGAAGCAATAGG--------------------------------AACCCCA--------------TGGTCCCGTCTACCCAAAT--ATAAACCA-TCTAGTCATCGCATGTATAGT-----TAAGAGTGCTTTCCACCAGGAAAGGACTTTAGACTT---------TGCATATATAAATATCTTTAACTA------CTCGTAAAACCCTAATT------CCTACTATTTTTTGTGAG----TTTTTTTTTGCTCTAAAATAA-TATAAATCTAAATTTTATTAGC-TATAAAATTGTAACAAACGTATGCCGAGGTGTAAACATT-------ATAAGCGTT----------------ACTTGTAGGTGGGACTTTACATA----TATGGTAA--ACTTGTGCAACATTCGCTATGTCTAACCAACTGA---ATAAAAAATTAAGAGAAAGATAAGAGTTTATAACTTATACA--------------------ATTAACTTAGGACAA------CTCATAAAGA---ACGCAATGCAATGTAACCAGAGAGCATCACATTAAACATAACGTATTATATAATAGCTAACGATTATCGTTACTACTCATAATTATTAAATAAACAAA
GTGGAAAATGGGGATCAGCTGGAAACCATTACCGTTTCGCCAGGCATGCACCAAATGATGATCCAGGGCGGACCTGGCCAGGAGCCGCAGCTAGTGCAGGTGGTCAGCCTGAAGGATGCCACGCTGCTTAGCAAGGCCATGGAGGCCATCAATTCGGGCAATGTCAAGGCCGAGGACACAATCATAATGGAGCAATAGACAAATTGAAATGGAACTAGCAGCGCAATTGGAACTCAACACGAGCTTCAATCATAATCTAGATTGATCCATCACGCATGTAAATGCTTGACTACACACTCATAGATTTAATGCATTTTTTGATATGATTACGCGAATATATATTCTATATAATATATATATATATATATATAATAAATAGTTACTCAAATGATTATATATAGTACATAATCCACGACGCATAAACGAAAATATTTTAGAAGTACCTGAAAGGTGTTGCTAAAACAAAACAAAAAGAGAAGCAATTTATAATTTGATTATTTGTTATATTTTCATACCCCAAACCCAAGTTATTTGTGTATTGATCTAGTCTATGCAAACAAATGAACAATTCTAGTCATCAAATATCCAGTCGTAATAAAAATAT-----------AAAAAATTATATATTTCCGTTTCTGTATTTGTACAAACAGTTTTAAATATGTCTTCGCATAGAATAATATTTGAAGAACAAGTTATCTTTGGTATACATTTTTTTTTTTAATCTTATTTCGTTTTAAATCAAATTTTCGTCGGCTTAACAAATAGT--TAAATTAATATCAATGGAAAACTCTTAATTGAAATAACAGTTTTTGGGGACCCTCCCCACTAGCAAAGGGTACTGTACTTAACGTTTCTGCAAGTACTCATATACCTATACATATACCTAAACAATTTATATATATTAAATATAAATAAAAACTATGCAGAGTTACTTGTACGTATGTTATGGGCTTTATCACATAAACTCACTACAATAAATTCTCATTTGCATTCATGCATTAACATCTAGTCATAAAG--TTAAATTAAATATA---TATTA-AAACCAAATTATAATTCATCTTAGGCCAAACAAAAATTAAACAGGAAAG
>ewg 126431 127390|110 chrX 125262 126486 scaffold_10 3174167 3175749 + 7199|1543 1607
TGTACATTTTGTAAA--------CTGAAATGCTAAATAAAGCCAACAATTTAACTTCAAAT-TAA
TGTATATTATGAAAGTCATGTGGCCAAAAATGTACGTGCATACAATAATTTTATGTTTATTACAA
>ewg 126431 127390|111 chrX 126503 126867 scaffold_10 3175949 3176233 + 674|0 372
ATCTTTTAA--TGTAGTCATTCGCATAAAAAATGCACAAACGCGGAGAAATGAGTTTACGAGATATAAATGTGCTATATATGTGGAGGGATATTTAATATATTCTCCTGAAAGTGGATCCAAATTTTATTTTATGTTGATCTATTACTATTTTCTTTATTGTTCTTGTGTTTCAATGAAATCAATATTGATTTTACCGTTATTATTGTGTTTACATGTTTGATTTTCATATCGCATTATCGCAATTTG--AATTGTTTTAGCCCAAATTTTAATTTAATCAAGCCAAGTCAATTGCAAAAGAGGGA----GAATGAAAAAGCAACAAATTTTATTTAAAAAAAAGCGATTGTTGTGATTTTAATATAATTTTA
GTTTTTTAATTTGTAGTCGCGTTCGTGCTTCAATCCAAAATGTATAAAAATAAAAT--CGAAACACAA----GCCAAATA-------------TTAACGTATT----------GAGTTCAACAATTGATTTCAT----AATTATTTTAATTATTTTTATTGCCTTTTTTTTT--GTGCAATCCATGGAAA-------------ATGCTATGCAAATATTTGATTT-----------------AGTTTGTTAATAATTATAA--------GTAGTTGGATTTAGC-------------AAACAGGGAATTTGAATGCTATAGTTTTTAATTGTGTTAAAAAAAAAATGAT--TTGTGACGTAATCAAAATTTTA
>ewg 126431 127390|112 chrX 127036 127275 scaffold_10 3176262 3176498 + 401|0 251
TTGTGAATGCCAAAAAATCTAAATAGTTATAGCCAAAGGAAATCCCTCAGTTACTAA--CTATACAAATTGAATTTAGTGCCGGGAATAGAAAACCAAAAATTTTT----TTGAAA-ATTTAAACCAAAAATC----AATTCTAAATTAAAAACTAAAGTTGTTCCTAGTTTCCAGAACTACAAAACATAATATAGTTTTAGCC-ATTTGTTTAGTTGTTAAAGTGTGGAGTACATATATTTATGCACGTAA
TAATTGATAAGAATAAAACAAAATATATATTT--------AACACCGTACTAACAAAAGCCCCCCACACTGAATTTAAAGT---GAGCCAAAAATCAAACATGTTTAATATTGAAACACTGAAACCAAAAAGTTAAAAAGTTAAAAAAAAGAAAAACAATCAAAAATGTTGAAAAGAAAAAGAAAAAAAAGTATGCATAAAATTGAATTGCCAAGTTCCTAAAACACA----ACAAATAATTATGCAAGAAA
>ewg 126431 127390|113 chrX 127276 127880 scaffold_10 3176666 3177388 + 1309|0 203
AGTT------------------------------------------------------------------------TCCCATTTAATAATTCA-----------TATT----ATCTCGAATCTAGTCAATTACGGCTTTCC--TCAAATAGAAAAATAAAAAAAATGAAAAAATGCACTTGCCATTTAAACTTAGACGCGCACA
ACTTACATTAGCCACTGTAGCAACACGCACGCACACACACGCACGCACACACACACGCACGCACTTGCCACATACATCCCCTTCCTCAACCCAAAGCTAGCTACTATTGCACATATCTAATCTAGTCAA-AGCGGCGCTGCATGCACACACACAAACACACACACACACAAGAACCACTTGCCATTTTTACTTACATTTAAACA
>ewg 127910 128031|114 chrX 127881 128951 scaffold_10 3177569 3178751 + 23060|35 156
GATATCCCGTTTCGGTGAGCAATGTGATCTCAGTTCCCGTCTCTATGTACCAGTCGGTAATGGCCAACGTGCAGCAGATCCAGACGAACAGCGATGGAACAGTGTGCCTCGCGCCGATGCAG
GATATCCGGTCTCAGTGAGCAATGTCATATCGGTGCCCGTCTCCATGTACCAGTCAGTGATGGCCAACATGCAGCAGTTACAGACGAATAGTGATGGCACCGTGTGCTTGGCTCCCATGCAG
>ewg 128112 128247|114 chrX 127881 128951 scaffold_10 3177569 3178751 + 23060|243 378
CTCCACCAAGGTGAAGGCGGTGCTACCATTCAAACCGTTCAGAGTCTCACTGATGTAAATGGTCATGAGAACATGACCGTAGATCTCACCGAGACACAGGATGGGCAAATATATATTACAACGGAGGATGGCCAAG
CTGCATCAGGGCGAAGGTGGTGCCACAATACAAACGGTGCAAAGCCTTGCCGATGTGAATGGCCATGAGAATATGACCGTGGATCTAACCGAGGCGCAGGATGGTCAAATCTTTATCACCACCGAGGATGGGCAAG
>ewg 128310 128383|114 chrX 127881 128951 scaffold_10 3177569 3178751 + 23060|456 529
TCCAGGTAGACCCAAATAATCCAATTATCACACTGCCGGATGGTACAACTGCCCAGGTTCAAGGTGTTGCCACG
TTCAGGTGGATCCTAACAATCCGATCATAACGTTACCGGATGGCACAACGGCACAGGTACAGGGCGTGGCAACG
>Cyp4g1 323871 324379|385 chrX 323793 324104 scaffold_25 704007 704347 - 4667|82 357
CGTATATACTATATATCCTTTTAACCAACTATTC---------AACGCAACTGTTTGTGCTCTTCACCTTTTTAGTAC------------TCCT-------------------ACTTTTACCACTATCTATACTTTTTTTTCGTAGCCATGTAGTGTGATTTTTTTTCTTTATTCTAGTATTTATTAAGTCAAATGGTTTAAACGAAACCCAAAAAATATGAAAAATACACGTATGCGAGGC--ACGTAGCCGATAGAGCTGCAAAACAATTGTAA
CGTAAAAAAAAAATAACACGTAGAAAAACATTTCTTAGAGGAAATCACAAATATTTGTTCGTTT---CTTTTTGGTATAAGCGGTTGGTGTCCTTATATCTTACATAATATACACATTTATATACATATATATTTTTTTTTTATTATTAT----TATTATTATTATTTTTTTTTGAAATATTTATTAAGTCACATGGTTTATATGAAACCCAAAAATTATGAAAAATATATA-AAGCAACGCAAAAGTAGCCAAAAGAGCTGCAAAAACATATAGA
>Cyp4g1 323871 324379|386 chrX 324154 326163 scaffold_25 704374 706388 - 95932|0 248
AATCCAGAAATCTAGGACCCCGACTACACACACGCAACCCCG-AACCCGA-----AACCGGAATCCAGCCCTGTATATAGATG-----ATGAATACCGATGAATATCCCA-AACCGAAAACTTGATGACGAACTTATAAATCTA---------AAACACCGAATAAGAACCCAACGCAC--AAGCCAGCCAGAGAGTCAATTAATTTTTCTTTCGTTTTTTAACTCGTTACTTTTATATTTGATTAATA
A-----------TAGATACCCTGTAAAAC-----CAGCTCCGTGACCCGCTATATATCCTGTATCTATATATATATATATATATATATATATATATGTATGCATGTCCCGTAATGGAGAACC---------ATTTATAACCCCGCCCCCACCCAACCACCCACT---TCCCCACTCCACCACAGTCAGCCAGAGAGTCAA---------ACTTTGTGTGTGAGCTAAGCGCAT-----TTTGATAAAAA
>Exp6 327874 328655|389 chrX 327762 328374 scaffold_3 1142403 1142965 - -1087|120 650
TCTGTTTAGAAAGCTCAGCATTCGTCCCGATTGAAAAAGACATTA------AATGTTAAC---TTAAAAC--AAGCTTCGTACATAGATTTAAGTGCATTATTATCTTTA----------GTTTTATGTCTACCACGTAACGAATATACGATTACTCTGCTTTCTGTGCTGTCACCGCA-ACTCGATA-AAAGTCATACTACATATACATACCTACATATATCTTAGTAGCATATACATTTATATCCATAAATTAATTAGCATATCTCAACATGTAAATC-AGTTACGTTGTAAGCAAGTATAAAGTATCAAGTAAGAAAATAGCTGGAAGGGCCGAAAAACCCAGGTACGAAATTATGTATGTAATTTATTTCGGGAAAACCTAACACCACCACCAACCAAAAGTAAATTCAAGGCGTTTAAAGTCCGTTGTAATGATTTGAACTATGTATGAATGTATGTATGTATGTATAATTGCTTAAGTCCTGCAATCAAAAGTCCAATAAAACTATTTTTACCATTTT------A
TCTTTTTATAATGTACAACA---GCTTCGAGTGTAAAAGCAATTACTGCACAACTCCAACGTGTCAGAACTAAATGTTTATAAGTAGTTTT-----CATTGTTAACTTTATTGCAAAAATGTTATAATTCAATTAAATGTTATATGTGTTACATATTTGCTTTGTATGCCATATTTGTGGACTTGTTTTAGAATCAGCTTACGCTT-------TACACA------------------ATTCCCATTCATAATTTTTACATCAAAATTCAA-ATATAAACCCAACCAAATTTTCG--AAATATCAAATATATAATAGAAAAA-----------------------ATGTATAAA--TATATATTGAATTTATATT-----AATTTAACGG----GCCAATTTAAAATGA----------TTTGCAAACTGTTTTACCAATTGGGA-TATGTTTACATATATAGATATATATATATATAGATATATAT--CAATCGTTATTTCATTG---CTTTCTAGCACATTTTGAGTACA
>Exp6 327874 328655|390 chrX 328654 328736 scaffold_25 714551 714633 - 7020|0 1
GC
GC
>CG18166 336685 337730|401 chrX 336546 336780 scaffold_25 1370904 1371147 - 8606|150 245
GGACTTAACTCACAATAAAGTCACGCAGTTGCGGCAAATAAACTTGGCGCACTCGCCGCAGGAGTAGCCACACTCCTCGCAGAGATCCATCACGCA
GGGCAGCACTTACAACAGGGTCACACAGGTGCGGCAAATAAATTGGCTGCACTCGACGCACGAATAGCCGCATTCCTCGCACAAATCGAACGTACA
>CG18166 336685 337730|402 chrX 336849 336917 scaffold_25 1371212 1371280 - 2723|0 68
CCCTAGCTGAGGAACATCTGGCAGTGCTCGCACAGCGGAGCCTCCTCTTCTTCAATTCGATTACCACTG
TTTTAGGCGACAAACATTTGGCAGACCTCGCACAACGGATGTTCAGCTTCCTCCGGACGATTGCCGCTG
>CG18166 336685 337730|403 chrX 337080 338006 scaffold_25 1372737 1373733 - 26683|0 728
GTGGCACGCCCTGCGTCGCAAACGCAGCACATGGCGCTCCAAAATGTGCTAACCCTTTTGGCTCTCTTTGCCAAATGCTCGTTGAGCAGCGTGAAGGGAGCGGTGAGTC------TTCCCCAGTA----CCTTATTCTCGT-TCCATAATGTTCTCTTTAGATGCTTAATGACCATTTCAACCGGAAC-------------------------------CCAAAGACTTGGCATATTCTGGTCATGCCCTATGACTCCTAGAGGCCCAGCGCAATCTGGCTGGGAATCGTACGGTCCCTCTCACAGGAGAGTCCCTGGATTGCCTTTTTGGCAGCATGTTGGATGTAGACATCAAGCACTTGATCAGCCACGGCGGCAGTTGG---------CAGCACAGACAACCTG----------------------ATTGTAACAGCACAACACAGTAACCTGATGTCACCCCGATCAGCCTAGCTCAGTGTCCTGTGGCAGGATCTAATCCAGGCCATCATTAGCTATCGCGCGGAAAGAAAGCTGACACAGGACATAAGTGAAACGGAGGTGGATGGTTTGGCGGACTTGGGTCTGAAACTGGCCACTGTAATGGCCACAGTGCGCGCCA---CGCAGGCACTGGCCGTGAAAA--GTCGCACCCTTCCTGCTTATCTTCACCATTCGCCAAATGGTAGCAACCGAAAGGCCCACGACGCTGTTCGAAAAGGT
ATGCGTCGGCCGGAGACAAAAGCCGAGCACACCAGCCTGCAGAACGTGCTCGTCCTGCTCACGCTGATCGCCAAATGCTCACTGAGCAGCATCAAGGGAGCGGTTAGTTAATGTATACTCCAATGTAGCTCTTACACTGATATTCGCCCACTTCGTTGCAGATGCTCAACGAGCACTTCGAGCTGATCAGCGGCAATGTGTCGCTGCGTCTGCCGCCGGCAAGCGACGCCGCCTACTGCGGCCATGTGCTGCGCCTGCTGGAGGCACAGCGCGCCCTGGCCGGCAACCGGACCGTGCCGCTGACCGGCGAGACGCTCGACTCGCTGCTGGCCAGCATGCTGGACGTGAATATCAAACGCTTCATTGTGGCCGGCGGCAGCTGGTCAAACTTTCGGCAGCTGCATTCGGCGCTTGCCGAGAATTGTCTGTTGCTGTTGCGTCAGCAGGCAGCG--CTCATGTCGGATCGTGCACCGCAGCTGGCGGCGCTCTGCCAGGATCTGGTGCAGTCGATTGTCTGTTATCGCAGCGAACGCAAGCAGGCCCAGAGTCTGACCGATGAGGAGCTGGATGGTTTGTCGGAGCTGGCGCTCAAATTGGTCACACTCATGGCTGGCATTGCCGCCGGGCCTCAGGCGCTGGCCATGAAGCGTGTGGCGCCCTTTTTGCTCATCTTTACCATCAAGCAAATGATTGCCACCGAGCGGCCCACCACGCTCTTCGAGAAGGT
>CG18273 339620 339705|406 chrX 339697 339869 scaffold_25 1372503 1372675 - 9249|0 8
GTAGAGACA
GCAGCAACA
>CG17896 347609 347917|415 chrX 347720 347817 scaffold_25 1381839 1381934 - 2377|0 104
AGAAATTATTGCATTTATTTG-TGTGCCTGTTTATTAGATTTAAGACGATTTG------AGACGAAACGTGTATCTTGAAAATAATTGTATGTAAATGATAACAA
GGAAATTGCTGCATTTATTTTCTGTGCC----TATTAGAATTAAG-CTATATGTAAAACTGATAAAACGTGTAT----AAAGAAATTGTTATAAAAAAAAAACAA
>CG17896 347609 347917|416 chrX 347910 349453 scaffold_25 1382001 1383544 - 100248|0 7
GCAGAACC
ACACACCC
>elav 374043 374613|438 chrX 373084 374106 scaffold_28 1389222 1390391 + 15672|1176 1239
AAACAAACACAAAACACACAAAAACGAAAACAAATTTAACTTTATTAGCAAAAAAGAAAATGAG
AAAAAAAAAAAAAACAAACTAAGATTTAATTAAAAGAAATTAACCTAGCAAAA--GGAGATAAA
>elav 374043 374613|439 chrX 374107 374276 scaffold_24 1041002 1041160 + -150|0 182
AGAAGAAGTTATAAGATCGGGAGAAGCGAATAGGTAGGGGGTTGAGAAAGAACAATGAGATTTTAAGAAATAATATTGCAAAATGAAAACACACTGTGGCAGTGGCAGCTGTGAAAGGTCAAAGGTTGGCAC-----------AGTCGATCTAG--TCACAAAGCAAAACAAAGAAATCAACC
AAACGAAATTATTA------------TGATTGATTGATTGATTGATAATGATTAATGAAATCTTAGCG-----------AAAATTTAAATATTCTATTATGTTTACTTTTGTGGGAAATTACACG-CAGCACTTACATCATTTAACCAATTTAAGTTTATTGAACAAACAACAAACAACAAAA
>elav 374043 374613|440 chrX 374277 374370 scaffold_8260 718 836 + 2569|0 121
TCTCCTCCCCAAAAC----CGCCGGCCAAAAG-------CGTTGCAATAGAAAAATTCTTCTTGTTTAGCATTTAAGTAAAA--------------AACCTTAACTAAACGAAG---CGAGC
TCGCGTCTAAACAACGAAACGACGGCCCAAAATGCCGGCCGTTGCAATAGCAAAA---TTCTTGTTTAGCATTTAAGTAAAACTCGAAAGAAAGCTAAACTTAACTAAACTAAAATTTAAAA
>elav 374043 374613|441 chrX 374438 374994 scaffold_24 1041275 1041775 + 11950|0 184
AGCGGCCCAAATGGAAGTGGACAAGGACGCAGCGGGAGCACCAGCAACCACAACCCATTATCTTGAATCTAAACCTGACCACACAACACACATATATAAATATGCATGG------TATAACGGTAACTAAGCGCAACAAAACAGT---ATGTGTACAACACACAAGAAAAAAACAAGAAAGTAGC
AACTACTTAAGGGCAA-------------TCTCTGGACAGCCAAC-----CAATTTCTGTTCGTGAAAC-------AACCAAACTGAATGTATCTAT---TATTTTTGGATCGAATCTCCCTTTCACTCTATGCGATGAACGAGTATAATATATATAGCACAAAAATATGATGAAGGAAAGTAAC
>CG4293 384759 384907|453 chrX 384373 385339 scaffold_28 1402567 1403635 + 36742|392 650
-CGGCATTTCTGTGCAACAGG-------GAATCTC-ATTCTGCAAACTACTAACCCTTCTTTTTTACGCAAATATTGTA---------------TTCTCT-------------------CATTAAGATACGAAAAAAAAA-----------CACACACTAATATGT------------------------CACGAATGCTG--------------------TACATAAATATGAATAAG-------------TTCAAAA
CTGGCCTCGGGCCACAACAGGCCAAACCTAATCTCCGTTCAATAAATT--TCACAATTCTTTTTTATTATAATGCTATAAATTAAATTTATCCATTTGCTGTTTAAACATAATTAATAATATTAAGCCAAAAAAAAAAAAAAAACAACACACACACGCAAATATGCAAAGACCTGTACATACAAAATATACATAAATGTTACATATATATATATATACATATACATATATATATATGAGATATATATAAACATTTAGAT
>CG13365 477536 477621|548 chrX 477614 478010 scaffold_10 2601228 2601615 + 18784|0 7
CTGTAGTT
GCATGTTT
>CG13364 481579 481716|554 chrX 481556 481630 scaffold_36 892595 892670 - 1850|25 76
TCTTTTTATACTTACGATTACCATTAAATAGATCATTGTACGTCAGGATAGA
TCGTTTTATACTTACGATTAAACACAAATAGCGCATTAAATATTGTCATAAA
>RpL36 485138 485282|557 chrX 485241 485719 scaffold_28 236168 236638 + 25892|0 41
ACGGACGGAATCTGATTCGACATCTCGGCATCGGAAGGCAAC
AACGCTGGCAGC-------------CAACAACGGAAAGCAGC
>Dredd 490341 490659|563 chrX 490392 490667 scaffold_67 194404 194690 - 2989|0 286
TGAACACATCGCCGATATCCTGACGATTGTCACCAACGAAGTGTCTAAAAAGCGAGGCAGTAATGACGAGTCCATGGTGCCGAATGTTAAAAGCACATTTCGCCAGCACGTGTACTTT----CCACCTCGTCTGTGATT-----TTGGTTTTTAACGTTAGCGCAGTTGTACGTCCACTCAAATTGCTCTATAAAGGTAAAAATACATTTTTATAAAGTTTAGTGTACTTTTGCTATTTTTTCAATGACTTCAATACTAATTTAGTA----------CTTTTCGTCA
CGAACATGTGCTAGACATTCTGACCATTGCCATTGGACAGGTGAGCGAGAAGCGCGGCGACAAGGATCAGAAAATGGTGCCTCTTGTTACGAGCACGCTGCGACAGAATGTTTATTTTCCGGCCATTTGACCGGCAATTAGTACTTAGCTTTGCTCTCGAATCGAGCTCAATGTTAACAATATTTG--ATGCAATATTGAAAACAGACTTTAGTCAATATAAATTAATTTCCATTGTCT------TAAAATTCATGTTAATTTGACAAGTAGTTACGCTTTTTGTCA
>Dredd 490723 490877|564 chrX 490668 491318 scaffold_67 195143 195772 - 16290|55 209
TTTAGGATAGACGTGACCACCGTGTCGCCGGACCAGCACATCGACATGCTGCGGGCCATGTCCACGGTAAATGGATATGCTGCTCTGCGCCACACCCAAACAGGTAGCTGGTTTATCGGGAGCCTGTGCGATGCCATCGATCGCCGTTCCGCCAG
CGCGATGTGAATGCCACCACGCAGTCGCCCAGCCAGCATGCCAACATGGTGGTGGCCATGTCCACGGTGCCGCGCTTCGTTGCGCTGCGTCACAGCGTCCAGGGCAGCTGGTTTATCCAGACGTTATGCGATACGGTCAAACGGCATGCGGCCAG
>Dredd 490946 491345|564 chrX 490668 491318 scaffold_67 195143 195772 - 16290|278 659
TTCTCCACAGAAATTTCTGTCGCC-CGACCCACTGCGTAG--------ACGGGATGGCACGGATGTGGATAAAGAACGACTAATCGAGGTGTTTTCCTCGATGGGATACAATGTGGAGGCGTACGACAACGTGGATCACATGGGCATCATAGAGCGCATTCGCAGTGCGTGCGATAGATCGCTCGTGCGCGATTCCCTAGTGGTCTTCATCCTGAGCCACGGCTTCGAGGAGGCCGTCTACGCATCCAACAGCATCGCCATGAAGATCACGGATATCGAGGACTTGCTCTGCAGCTACGACACCCTGTACTACAAACCGAAGTTGCTAATCATACAAGCCTGCCAGGAGAAGCTTGTCCATAAAAAGAAGCCAAATGAGCTC
TTTTTTATACAATTTGCAGTCGCTGCTGCCCGCCGTGAAGCTGAGCGCACGCGAGGGCACCGACGTGGACAAAAAGCGGCTCAGCGAAGTCTTCTCGGAGCTGGGCTACAGCGTGGAGGCTCACGACAACGTGGACCATTTGGAGCTGCTCAGCCATATGCGCACAGCCTGCGCCCGTTCGATTCTGCGCGATTCATTGATTGTGTGCATCTTGTCGCACGGATTTGAGGGCGCCGTCTATGGCGCCGACAGCATTCCATTGAGCATCACGGACATACAGAACGTGCTCTGCGCCAACGAGGAGCTGCACGACAAGCCCAAGCTCCTCATCATTCAGGCCTGCCAGCAGAA-------CGCGAAAGAGTTGCAAACG-----
>Suv4-20 505310 506870|580 chrX 505673 506122 scaffold_2927 28 539 + 2279|0 534
ACGCAATTAGCAGAGGTTTTAGACGCCTTGCATCCGAAACCCAACTT------AGCTTTACACCAAGCAA------------------GCCCCTCTGTTTGTTGCAAGATAATGA-----AACAACCACATATTCGAGGATACTTGGGACTCCCACCCCACAATAGCCAACAAGAAAACAATAGCGCAGCAGCGGCAACCAGA-------------------ACAGCAATATATAAATA-ATA-----ACATATATGCATG---------------------GTGTATATACAAGATATACGAGACAAACTTAATGTTAATTACTACAAAGCGAGCTGGTTGAAGAGACCGAAAGGAGGAGGAGCTTACACTTTCACATACATATAACAATAACAATGTATATA------AACCAAAAAGCGGGAAATTTAATTATAAAGCAAGCGAAAACAATTGAACAGAAGATTCAAATAAAACGCTAAATACAACTCGATACAAGTGGTGGTTC----AAGTGGTTCGACGGACCATGCAA
ACGCAATTAGCAGCGGTTTTAGAAGCCTTACGACTAAAGTTAAATTTATGAACAATATTAAAATAATAAATATAACAAATTATATATGATATGTGTATATGAAACGAGAGAAGAAAAACCAACAACAACAACAACAAATATA----------TAAGCCAACAGGAG-CAGCAAGATAACAACAACAAAATAGCAGCAAACAAATAACAAAAACAATAGCAACAAAGCAACATATATATATATACATACACATATATATATGTATGTATATGTATGTATGTATGTATATTTGCAAG-CATAGCAAACCAAATTCATTTCA--CACAAACAAATAAAATGTATATAAAAACGGGAAATTAAAACAAACAACAAAATTTAATACATATAA-------AACCTATTTAAATTATAACTAAAAAGAAAAACATATATTTAAAACACAA--TACTTAAAATGAAAAATAAATAAAAATAAAAGAAAAAAAAAACGGGGCTGCAAGAAATGAAACAAAAAAATTGTTTGACGATTTGTGTAA
>Suv4-20 505310 506870|581 chrX 506453 506632 scaffold_10 3589544 3589692 - 2243|0 179
ATCCCTGATATACCCGCCCTGGGTTTTCATATTCGGGAAGCAAAGCAACAGGCTGACCAATTTGTTAATGCGAATCCGGATATATACCAGATTGTAACTTGTTTTGTTTTTGCTTTCTTTTCCATTTCTCTCTTTCTCTTTGTGATCACTTCCCGTTTCTCCCAACCCTTTTACTTTGTG
ATCCCTTTGCTACTCGTC----GTATAAACACACTGGGAACAGAGTATCCGGCAGTC---------------------GGTATCTTCC-GACTGCAACTTCTTGT---TTACCTTTCTTTTCACTTTTTGTTTGTTTTTTTGTTCTCACTTCTTGTGTTT--TAATTGCTCCGCTTTGTG
>Suv4-20 505310 506870|582 chrX 506814 506855 scaffold_36 709753 709792 + 1267|0 41
CAAGCAAATTGACTAAGCACAGTTGCCATTTCCATGAGAAGA
TATGCGGATTGACT--GCGCTGCTGCCATGCCAACAACAAGA
>Suv4-20 505310 506870|583 chrX 506856 507709 scaffold_5 5781964 5782849 + -2551|0 14
CCAACGACTGATCTC
TAAGCTGCTCCCCTC
>CG13362 606056 606646|686 chrX 605290 606351 scaffold_5 5976524 5977815 + 3864|996 1357
ACGGTATTACAAAAAAAATGCCGATAA---TGGGATTCCATTGATTTCATGTTCTTTTATTGATTCATATTCGGATGCTCGATCAATTACATTTACACATTTAAATTGTATTTATCAATATTTTAATACTTTGCGCTTGTTGCACGAATTTCAACTAGCAACGAGCGAAGATCCCTAAGCTCCACCTTTTTC-------------------------------ATCTCC----ATAGTTCCTCCACATCAA------------------------ACGTGCCTCCTCAATTAGTGGAGAACTATCCTTTAATC----ATCAATTCAACAATTACAAATACATTTACTTAACTAGATGAACTT
ATAGGGTTAGATGAAAAATATCAATTACCCTTGCGTTTTATACACTT-ATGTTTTGTTTTTTATT--GGATCAAATGATTCTTCAATTACATTTACACAT--AAAT-----------ATAGGCTAATACTTAGCGCTTTCTGCGCGA-TTTCAACTAACTTC--------CTTCCTCAGCTCCTCTTGCCTCTCGCACTGCACTGACTGCGGTTCCAAATGCGATCTGTTAGAATCGTTCCTATGCCTTAATACATATAAAGTACTCGTACTTAAACATTTCATTTCATTTTGTTTTTTTTTTTTTTTCAGTTGCTGACCAATT-AACAATTAGAGTTACAT--ACATATCTAGATGAAATT
>CG13362 606056 606646|687 chrX 606587 607302 scaffold_5 5978578 5979298 + 8274|0 71
TTCAATTGGATGGTGCAGCAACAGCCT------------TTCTGGTATAAAGCCAATCCACGACTGACTTGT
TCCAACAGTGTGGTCTAGCCACGCCCGCCGCCCCGCCCATTATAGTATTAA-CAACGCCTAGACTGATTTGT
>CG13361 608831 608959|691 chrX 608942 610660 scaffold_5 5982774 5984632 + 27083|0 17
CACAAATAATTATATGTT
CACAAGCTGCTGGATGCT
>RpL22 619377 619545|703 chrX 619244 619872 scaffold_28 1408812 1409413 + 20660|148 318
AGATGTAGCTGATCCCTTCAGTGGAATCACTAGGTTTACATTGGTTTTTATTATACATTTCACGCCCTCAAGCGGCGTGTTTTTATAAGCTAACAGAAAGAT-GTGAACTCATGAAAAAAAGAAAACTTCGGGCTAGCCTCAATAAAACAATTGTGTGTGAACCTT-ACGA
AGATCTATCAAAACTAAATGATAAAACCATCAAATT--------------TTGTA-------------CAAGCTCTGTTTTTTTAAACGAAGACAAACACATGGTTTACCTTTAAAGAAAAAATAA--------------TAATAAAGT-----TGTATAAACTTTAACGA
>CG13360 644670 644937|741 chrX 644396 645756 scaffold_5 6045477 6046747 + 52686|277 545
TGGGTAGCGCAGGACCGTGGGACACGGATCCCCAGATCCTTTAATACTTAGGCT-TATCGAGAATTTTGCTACTTTTACCAATGGTTTTTTTTTTGTTTTTGTTTGTAAACAGTACGTAGAGTTAAGCGTATTCTATAAATTAATCATTATACCTACTCATAAATAATAAATAGTTGCCTATTTGGGGTTTTCATTTTCACAAAGATGCATATGAGTTATGTTCTGGAGCTTTAAAGGATTATTAAAACACTTATTGAACCACAAAATG
TGCG--------------------------------------AATGCTTAATTTATATTTATAACTTGCATGTGGTTATCTATATTTTTTATTTT--------------------CGTACGGCTAGG--------ATATGTTGATTTTTTTTTTTATT------TAAAAAATATTTTTTTTTTTATGTATTTAATTTAAGCGCATTTGTCTAT--------TTTTATATATATAAAATAT---------GCTTCTTTCTATACAAGCCG
>Rbf 653909 654297|746 chrX 653793 653954 scaffold_41 96809 96961 - 1497|118 163
ATTATATATAAAAGCTTATATACAAATATACTTTTTACAAATTGAT
ATTTTGTATATTCTTTTATATACATACAAATTTTTGTTACATTAAA
>Rbf 653909 654297|747 chrX 654020 655837 scaffold_10 1667521 1669534 - 45497|0 334
ACACGGG--------------------------------------GCTTATGGGGGCAGACTAGACTTAAGGCA---AGAACTAAAAATTCGGCGCAGAAGGCCACACACTGGCCCCTC---------CGGCGCACGTTCGACTATTTTATGATTGTTTTTTTTTAAA------TATTAAAACTTAAATTGACATTTTAACTTAATTTCAACAAACTATTTTAGCACATCTTTTAAT-TTTGCTCAACGCCAGCCAACCATATAATTCATATGCTAACCCAATACTTTGAAATAGTTGTACTAAATACTTGATCACCACACACACACACATCCAT
GGATGGGGGGTTGAGTTTTCATTCTGATATGCCGCAACAGTCGATGCGCATCCGGGTCGAC----ATGAAGGCACACAGAATATAAAATTCATGCTGGAGGCATATGCAATGTTATTTTAATTGACAGCGGCGAGCGCTTATCATTTTACTTATTGTTTAATTTTCCCTTGTTTTTTTTATCATTAGCCTGCCATTTTAATTTAAT------AACCT------GTGCATCTTTTTATATTTTTTTAATGCAAGTCAACCATGTA---TGCATACT-ACCTTATACCTATATATATATATA-TATATATAT-------ACATATACATATATTTAT
>CG12467 666352 666518|757 chrX 666503 667781 scaffold_19 836224 837602 - 69404|0 15
AGAAGAGTGGGATTGG
CTGCAAGCAGGATCAG
>CG3713 703461 703672|792 chrX 703157 703711 scaffold_19 877125 877615 - 2695|319 558
TTCAAAAAAAGCTTGCCACTCACTGGCAT---TCCGCACTCCGCTTCATTTGG--------TTTAATTAAAACTCTTTTTGCCATAATCCAATTAAG-ACCAAAGGCAAAAACCAAATGACAA----------------CAAATGGCATAATGGCCAGACAACAAAACAGACGGCAAAAAATAGAAAAACTCGACAAACTCAAACAAAGCTCCGCACAAAGCAAAAAAAAAAAAACTGAA
TTTAAAGACAATTCATTATGTAGATGTATTTATTTATATATTAAGCAATTTAGCTGTGGACTTCAATTAAAGCACT-----CAATTATCCAATTGCGTTTTATTGACAATAACCAAATGGCCAAATATTAATCAGAGCCCAAATGTCATTATGGCCAGACTACGA---------------------------------------------------------------------------
>CG3711 780426 781034|918 chrX 780942 781803 scaffold_19 1008168 1008965 - 41764|0 92
AAACTGGTGCTGCTCCAGCCGGCATTGCAGTTGTTGCTCGCCTGGTTGCAAATCGGACGTAGCACGTAATGCGGCAGTAGCGGTTGGCAGCGC
AAAATAGTGCTGCTACAGCCGGCTTTGCAGTTGTTGCTCGCCTGGTTGCAAATCGGACGTAGCACGTAGAGCAGCAGTAGCGGTTGGTAGCGC
>CG3708 785613 785716|923 chrX 785643 786676 scaffold_19 1014800 1015873 - 33583|0 91
GTGCGACGCGACTAGCTGTTTG----CTAAACAAAATTTACAAG--------------TGAATGTGGTAATGATTTCTTATTAAATTCTACA
ACGCCCCAGCATTAGCAGTGTTAATCCTAAATAGAAGTTTTAAGATTTTCATTAATCATGCATGCATT-TTCATTCCTTCATACTCTCTACA
>CG3706 787751 787848|924 chrX 787696 789182 scaffold_19 1017330 1018815 - 53291|61 158
GACGCCGACGAATTGTTTTTGTTTTCAGTTTAAGATAGCATGTAAAAGTATGGGGGAGACCCATCCTATCAAAATAAAGAGATTTTGTTTGAATGACA
GACATC-CTAAATTGGATATATATATATAT---------ATATACAACT-TGATGCATACCTATGTGAT--AAATAATGTTACTC--TTTAACAGAAA
>CG3704 795990 796284|928 chrX 795775 797545 scaffold_19 1027201 1029188 - 63134|238 725
ATGGGCGGATTGTGATCC---------------------TCGATGGCTATGGATT-------TCGTGAT----------------------TTCGAGTTTTCATTTTTA--TTATTTACTTTAACAAGCAAAAACATTCAATATAGTGTGTG---------------TTCGTCACTTGCACCTCCGATATTTGGTTT-------------------------------------------------------------------GTATATATGGACTTA---GTTTAGCTTTGCAAATTAGTGATAACATATAC------ATATGGAGGATATAT--CCCGCT------------------------------------CGTAAATGTAAATGCAAGCC------------TCATACTTTGCGTAACTTACTCTGTATATATATATATGTATGCAGATAAATATATATATATTTACATTTATGCTGTA
AT---CTAGTTTTAAGCTAAAAGATAAACAAAAAAAAAATTGATAGCTATACACTGTGAAAATCGTAATGAAATCCTTATAATTTATGCAGTTAGTTTGTTCTTTATTATTTTATTCACTTTAACAAGCAAAAACATTCAATATAGTGTTTGTGTTTCTTTTTTTTTTTTTTTATTTTTTTTTAATATATTTTGTTTTGTATATGCATGTGTGTATATTTATAATTGTGTGTGTATGTATATAATGTTTGCGTAGTTCTCTGGAATATATATGGACTTAAGTGTTTAGCTTTGCAAATTATTTGTAACAATTACAATGATATATGACGGATATATTATCCATTTGGGAATCTTTGATTTGATTTATTGGATAATGCTTGTGTATATGTAAATGCAAGCCGTCATCGATTTGTCCTATATTATAGCAAATACTCTTTATATGTAC---------CACACAAATATATATATATATGTATATATG-TATA
>CG3703 799287 799427|929 chrX 797959 799952 scaffold_19 1030804 1033010 - 53286|1364 1534
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GCAGAAACGCCAAGAGAAGAATAAGCGCTTTAAGGCCAAAGCACGCACGCAGGCACAGAGCTCCAATAAACCCGTGCAGCTGCCTACCAATACTGCAACGGCACAAAAC----TTTGACTATAAGAATGTGGACTTTCGA--------CAATTTCAAGGCGGCGCTAAACGT--------GCACAGAGC
>A3-3 1102074 1103335|1287 chrX 1102567 1102651 scaffold_651 1631 1726 - 2304|0 95
GTCCGCCTGGAGCCGGCATCCAGCCTGTGGCTTGACTACCTCATGAAGCAA-----GAAGCAGAAACAA------TTAACAAGTAACTATCATTAA
GTGTGTCTGGAGCGGCGCTCCGAAACGTGGCTTGACTACCTCATAAAACAACCTTTAAAGTTTAAAGCACTTTGTTTAAAATATAAATATAACTAA
>A3-3 1102074 1103335|1288 chrX 1102886 1103093 scaffold_47 343930 344128 + 965|0 214
CATCACATACTAATGTTAATCT--TAAACGCCACTCGACTAAGCAGGAGTACAGAAAAATAAGCCGCAGTTCCCCCTTTAAACCCCAACA---ACCAATCCGTAGCGAAGATCCCATTTCATGCAATGCGATCCCTGTTATCAGTTATAT--AACTAAAGCATTCTTTCTTTCAAAATCAAAGCCACACATTTCTTCCTAGCCTACAACTTTCTT
CATCACAGACGCGTGTTAACCGAGTAGAGCTCTTTCATTTGAAAAATGCTGCTGAAGAA----------------CTTTAAGAACTTAAATTTATCCAACCCTATAGAAGCCCCTATTTCATGCATTGCTTACTTTGTCGTCGGTAAACTTAAGCTGAATTGTATATTTTATGAATGTCCCTGAATCCCTGAACCTCTTATCAAACAATTTCTTT
>A3-3 1102074 1103335|1289 chrX 1103108 1104849 scaffold_651 2089 3908 - 51630|0 228
GGAAGGGC-GCCGGACAGGGAGCGGGATCGAGACCGCGACCTGCTGCTTCCAGCCTTCGAACAGCCAAACACTCAGCAACAGCAAGCAGTCCAATACCCGGCCGGGAAGGAAGAGCCACCGGCCAGTCCACAGCTTGATGGGCAGGTGCAACTCGAACTCGAAATGGAGCTGCAACTCGGAGAGGATCAGGATCCGGCTTGGACTCATGTAGACTACTGGTGCTAGGGC
GATCGGGCTGCC-------CAGCGTGCTGCCGATCACGAGCTGTTGCT---AGCCTACGAACAGCAGCAGGAGCAGCAGCAGCAA-------------CAGC--AGCAGCAACAGCAACAG---------CAGC------AGCAACAGCAGCAGGCGGTGGAGGATGAGCTGCAG------------CAGGAACAGGCTTGGACACATGTGGACTACTGGTGTTAGGGC
>CG14622 1146528 1147266|1351 chrX 1146922 1148842 scaffold_46 811133 813173 + 86503|0 378
AAACGGGGTGGAGATACCGATCAACTGGACCTGGCCCCG----GTGTATATGTTTCCAGATGGCGTGAAAGTATTTTTTTTTCTTACATAGTAAAGACACTACCTTCTTTTGTAATTATTTATATACTACCCGTACGCGTACACTACGATTTATGTATACCTACACATACATATATAGCACATAGTCTAAACGTAAAGCTCGGCTAATGCAAGCGTGAAACCAAATTATTTACAA-------------AATCGAAAT-GTAATTGTAATTT-----------AAAGTCTAAAAATGTTATG----AACGAATCGAAATCGAATCGCAGCGAAGCGAACACGGATCGTCATGTGTAGCGTACCTTGA-AAATTGTTTTTG
AAGCGG--------CCACGCCCAGCCAAAGCAAGCAGCGCGTAGTCAAAGTTTTCCTTTTTTTTTTTAAATTTCTTTATTTGCTCTTTTCTTAAA-----TATCATATATTGTTATTATATATATGCTACATATACATACCTATACCTAAACATATATATATATATATATATATAT---ACATAGCTTAAA-------ATCAGTTTCTGCAAGCATTAAACCAAATTTTTTACAACCAGCAAAAATACAATGAAAATCATAAATGTAATTTGTAAACTAAAGAAAACTGAAAAATGTTATGCAAAAGGGAAAAAAATTCAAA----AATCAAATCAAAAAGAAAGACAATTTGTAGCGTAAATTTACAAATTGTATTTG
>CG11409 1186335 1186611|1385 chrX 1184115 1186398 scaffold_5 3019214 3021619 + 39934|2401 2464
GTCGTGGTTAATGCTATGTATATGTGTAACTAAGTTCTTGAAATAAATATATATCTATATAGTT
CTTTGGGTTAA--ATATCTAAATTTGTATTTATTTTATTTAAATACATTTCAGCTTCTTAAGGC
>CG11409 1186335 1186611|1386 chrX 1186399 1190502 scaffold_5 3025102 3029477 + 135238|0 223
GAGGATCCTTCGGACAGGCTAACTGTACATATGTTTCCTCCCAACTTCGTCGTCCTCTTCCAAGCGTTATCGTA-ATGTGTG---TGTATTTATTGTAGTCACTGTCCTCTCAATCTGCGTGCCCCGCGGATAAGGGATCCGCAATCCGTGGGCTCATAGTCGTAAGTCCG-------GCCTAGGATGTAAGAGTCAATCACTGAGTGCGAGGGCAAGCAAAAA
--TGGTCCCCCTGATTGGCCAA-TGTAAATAGTATCATTTACCATAACAAAATC-----CCTATCGTTACTGCGTGTGTGTGTGTTGTATTTATTTTAGTCACTGGTTTTTTTTTC------CTCCGCCGCCTAGGGGCCCGGGCTGACCGGG-TCGTAGTCATAAGTTGGGGCCTAAGCCTAAGTTCTAAGAGTCAATAACAGAAAATAAATAAAAATAAAAA
>CG11418 1201695 1202061|1403 chrX 1201843 1202947 scaffold_5 3046981 3048059 + 44754|0 245
TG-----------TTTCCGAGACTGACACCGCCCATGTACATACATACTTAGGATAAGCCA-CAACTTCACATTCATGGTGAGTCCAGCTTAAGGTTAGGGCAGCCGCCGTTGGCTGAATTGAATGTTGTTCATACTTTAAAACCT------CCTGCTAGT--------TAGGATAAGTCCATGATCGATCCGACTTTGAGTAT-TGAAACCGATTGTTGTTGACGAATGCGACCAAGTGTGGCAG
TAACCGGCAGCATTTCACTAGACAAATCCCGGATTAGTGTATATATCTTAATAACTAGAAAGTAACTCAACTCTGACTACAAATTTAGCT---------------------------AACTAAATGTTGTTCATATTGTTAAGCGTTACGGCCCCCCAAATGCAGCGTACAAGGTACGAGCATGTTGCAGCTGTGTCTAGGTATGTGCAACAGTCCGTGG--------TGCAGCTCAATGTGGCAG
>CG12773 1206708 1207698|1406 chrX 1205037 1207170 scaffold_5 3051667 3054049 + 39602|1936 2466
GACACTCACACAAC-AACTCAGAGCACTTT----------CTAATTATTAATT-CTAATGTATTAATTCTT-----------------AAGCTTCGCATTCTTTCGATGTGTTCCTTGCTCTCGTA--GTTCTTCAACGATT-----ACTCCTTAGTT-----GAGAGCGAATAAG-TTGTTGCTAAATGGATATGTTTCCA-GTGTTCCGCACACAAAACAGAACGCAT----------TTCGAGGAGACATATGTGATACTGAGATAATAAGTGAAACCA----AAACCAGAAATCAAACTCGATGATTTGGCGCCTTGCATTTAAGACGACAACA-CACACAGCACACAGAGCACAATGAAATTGTTACAGAAC----ACAAGAATGAGCCACATAACACAAACAACACCTAAGCTAAGCTATAATCCTGTATTACCATGTCGGTGGACAATAACAGTCCTAATTGATA---ATATATATAAACCTGTACCCGCGTACACTCACTCGGCATACG---ATATCAGCAAT
GACACTCAAAAATCTAACCCAGCGCACATTGCAGCTTTAGCTAAATTTAAATTACTTGTGTACTAATTATTTAATAATGTAAGTTGAAGAATTTAACCTGCTTTTAATATGTTCCTTTCTTGTGTAAAGTCTTTTTGCTATTTTGCCATTGTTTAGTTCTATGGAAAGCCTGTAAAATTGTTGCTTAATAGATATGTTTCCGTACATTTTGTAC-CGTCTCAAAGCACATACATAGTTTATTTGAGGAAACATATGTGATACTGAGATAATAAGTAAAACAATCAAAAAAAAAAAAAAAAACAAAACAAA----------ACAAGAAAACCAACCACAGCCCAAAACAAAACGAACACAA---AAGAGTTTTGGAAATTTGGCGCGTTTGCATTCTATGATACCATAAAGAAATAAATTACGAATGAAACTTAT-------------TTGATTTAAATACCTTTGGTTAAAATATATGTATGTAAACTCACACACCCACACACATACTCCAAAACCGCAAAAAGCCACAAA
>CG12773 1206708 1207698|1407 chrX 1207514 1208748 scaffold_5 3054065 3055288 + 48544|0 189
ACCGAGTCCAGGGTCTAGAGCACAGGTTCACCTGTATGCGGGCCGGGCAACGGGGCAGGCGGCGTGGCTGTGGAAAGCAATA-GTCGAGTGCATTTCTCTACCGCTAAGCAGTACTACGTTTAACTAAA----GTGAAGTAGAGCCGGCGAGGCAGCCGAACTAAACTTAACCCTATGTGTGTTTGTAAA
AC-----------TTTTGGCCATGGG-----CCGTAAACAG---TGGGAACATGGGTTATGGGGAGAC-GCGGCGAGCAATATTTTGAGTGCATTTTGCTAATACTAAACCATATAAATTATAACGTACATTTGTAAAGTGCAAC--GCTAAGGA---TAATTATGTTTAATCCAGCACATGTATTTAGA
>png 1213309 1213478|1412 chrX 1210871 1214354 scaffold_19 1414697 1418242 + 125072|2526 2712
CGGAAGCCAATGGTCAGCTCACCAGCACGAGGAGACCTCAACAAATATTTCATTGTACTTAAGAACTAGGCTAGCTTAAGCGATAAATTAAGGTGTGTGCTGT--GCTTTG----------TGTGCGCCTGTGCTTTTGCCAGGGGATCTGTCA-----GCTATAAACAGTATATAATGTATATTCC
TGAGAAATAATTATTTGTT-----------GTAAACTGT--CAACTCCTTCAT-GTGCTC-----CTTTTCCTCCTTTTGCAATTTGTAACTGTGCGCCTTATTAGCCTTGGCCGATTCGATCTGCCTTGATGCTTTACTATGACCATTTGTGATTAATGCTATAATTGTTGGATTGT---CAGCCC
>CG3719 1235529 1235896|1427 chrX 1235860 1236195 scaffold_25 1825654 1825994 - 19593|0 41
TG-----AGCTGGAGCGGCGATGCGATGCACAGGTGGATTAG
CTCCAACAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCGGGATGAG
>CG14785 1312036 1312227|1515 chrX 1312221 1313488 scaffold_19 1574291 1575562 - 39349|0 6
ACTCAGC
ACACAGC
>CG14786 1313996 1314099|1516 chrX 1314006 1317544 scaffold_19 1578085 1581682 - 112075|0 106
CCGGGCG-----------ACGAGATAGATAGATCGTCGCTCTTATCCTTAGTTATACACTTGGTATGTATGTACACACATAAATTAGTGC--AGTAAATACGAGACG
--GGACACATTGCTTTATACATAATATAAACTTGATAACTGTTATTGTT-----TATCTCTTGTATGCA---ACATAAGTAAATTAACACTTAATATTTATAAGATG
>l(1)G0431 1318801 1318914|1518 chrX 1318911 1323347 scaffold_5 4015083 4019677 + 159217|0 3
TTGT
TTGT
>O-fut2 1321176 1321327|1518 chrX 1318911 1323347 scaffold_5 4015083 4019677 + 159217|2434 2643
-CCATCTGTAGCTCCCACCTGACATCTCAAGACCTAGTTTTAAGTCCAAAGCCAACGTAAG---------AGAGCAAACGGGATTCCGAACCACCTGCGATTGTGTACCAAAAATAAA-------------------TCTAAA-----------------------------GCCAACAGAAAAGTGCTAGCA-GAAAAGTCAATTATAA
GTCATCAATGAATTTC-TCTAATATATCACCATGTAGTTAAGTGT----ATTTTATGTAGGTTTATTTTTAAATATTGTGAATCTTTGAACAAACTGCGATGCCATACCAAAAAGAAAAACCAAAAATTAAACACTTTTTAAACAGACATTGCCACACACTTATGATACAGGGAAAACTGAACGATATTGGTATGCAAAGTTATTTTAAT
>Rab27 1330697 1330797|1525 chrX 1330693 1331661 scaffold_58 298849 299769 - 37534|4 153
GT--GCCATG------------------------------CCCGTGGCCAAGTCA---CCCTGCTTTGTTCCTTGA---CTCGTGTTTCCGAATCTAAGTGTGTTTCGCTGTAAATAAATGTTGATTGTTGAGTG-----------GAAA
GTCGACCACGGAACCGGAAGTCGGTAGCTGGGAGCCGGAAGCCGTAGCCTACCCAAATCCATATCAAATTCAATTATATCCAGTTTTATTGCGTTTATCTATGTGTGTCTGTAAATAAATGTTGCTTGTTAATTGTTAATTCCAACGAAA
>sta 1338609 1338707|1537 chrX 1338601 1339742 scaffold_58 149941 151193 + 64311|8 116
GGAATCGTC-----CGGGCCACAGATGGCACTACATCAGCACAGCGTTTTGTCAGGAGCCTTTTCAACGGCATAAATAAACAGCTGTTTATAT-----CTAAACACCTC
G--ATCATCAGACGCAGGCCGAAAGCTGC----------------------TTAAGCGACTGT---ACAGCATAAATAAATACCATCTTTTATGTTTCCCAAATCACGT
>Nmdar2 1343043 1343369|1543 chrX 1342908 1343414 scaffold_58 155649 156196 + 1350|160 528
AGCGTTTGGAGCACTTGGAGCAT----TTGGAGCTGCCCACGGAGGAGGGACTCTTACTCACACTAGA---------CAAACATTCGCAATCGAGCCGGAGTGCCATCCTACAGCGAGTACGTCTAATCA---AAATCAACGTTTCAAACAATATGTGAACTAAAAG--------------------CTTTCGAAAGTTAGGG--ACGAGATAGCGAAAGAGAAATTGAACCCAAAGCGCCTC---ACGAAAACCGCACACAACTCGATAGTCAGTAGTAGATAGTCGAGGATAGAGAATCCAGAATCCAGAATCCAGA-ATCCACAATCCAGAATAAAGAACTAAGGCCAGATATGCAGCCCAGAAAA
AGCGATTGGAA----TGAATCATATTGTTGGCATTGGCATTGGCATTGGCTTTGCCGCTAATCTTGCATCCTAATATTAAATATTTAAGTCCTGCCCACAGCATCCTCC-ACAACG-------TCAACCACGCGCATTTGCATTTCAATCAATCTGTAATTGAAGAAATGATTCTTTAATTTTTTTTTTTTTGGAAATAAGGGCTACGATTTAAAAAAAAAAAAACGAAGGCAAATTTACACCAAAACAAAAACTAAGTAAAAGGAACAACTCTCCAAAAACTCTTCATATATATACTATATATATATATGTATACAAATATATATA------TATATACAAATATAGGTGTATATTTAATCAAAACAA
>CG3740 1524156 1524679|1762 chrX 1522329 1524565 scaffold_93 8465 10720 - 78387|1873 2286
GTACATAAATATTTGGGTCTGAACGACGGTGGTAGCGAACTACTCCCACTCGACATTCACCTGCTCCCAGTCGTCAACGAACGGCTGGTCGATGGTGCTGATTAGCAGCCCGCAGAATAGGCAATCCGCAGCAAGAATATCCTCGATCTCGGTTTTCAGTGCCGCCCTCTTCCGCTGCAGCTCCATCGCCTGCTGTTTGCTCAGGGCACCTGACTGCGGTTGCGCCTGC-GTTTGCACCTCCG---CCTCCAGTTGCTGCTTTAGAGTGCCGAGGCGCCGACATTGCTCCTTGGTGAGCAAGGGCACAACGTGCTTCTCCAGGCAATCGCTGTGGAACTTGTGGCCGCAGATGAAGATGAAAAAGGGCTTAACCAGCAGCATCATCTCGCAAATTTCGCAAGTATCCTGAGACT
GTATATACATGTATCCGTTGCAATAACTAAGGCTCTG--CTATTCCCACTCGACGTTCACCTGATCCCAATCGTCGAAGAAAGGCTGGTCTATGGTCTCAATCAACAGGCCACAGTAGAGGCAATCGGACGCAAGTATGTCCTCGATTTCTGTTTTGAGATCAACGCGTTTCGCCTGTTGCTCGGTTGTGTGAT----------------------TGGTCGAGCCTATTGTTTGTGCCATTAAATTTTCCATTTGTTGCTTCAACATCGTAAGTCGGCGACTGCGTTCCTTACTGAGCATTGGTAAAACCTGTTTTTCTAGGCAGTCGCTATGGAATTTATGCCCACAAATAAACACAAAAAACGGCTTTACCAGCAGTATAAGATCACAGATGTCGCACACGTCTTGCGCCT
>CG3740 1524156 1524679|1763 chrX 1524566 1525170 scaffold_93 11293 11864 - 22223|0 113
CCTGCTCTGCGGGCAAGTGGGCGATGGCCAGGTAACTGTAGAATTTGGACGGCTATCTCAGTCGAAACCTTTGTGATCAGTGTAGGTTTATTTATAATAATAAATACTTTATAT
TAAGCT-GATTTGTAAATGCGCCCTGGTC---CAATTACCGATTTT--ACTGATGT-------------------ACATATGAAAATATAATTTTAATAATAATTTCCTTAGAT
>CG32809 1531475 1532036|1768 chrX 1531464 1533238 scaffold_93 18286 19905 - 47627|11 615
CACAACTGGAAATTGGCGTGGAACGAAGCTAAAATTGACATTTAATCGGAGCAGTTGAGATTTTTATATCTGAGATTGCGGACCAGACTAGTCGAGGCCCATCA-ACACCCATACCCATAATATGTGGGGACTACGATTCCGAATCCAAATCCAAATC----CAATTCCGATATAGAAACGTTGGAGGCATTGACAAATGAGAACGAAACGAGACGATAGTA---------ATGATTGA-ATATGAATGGCAAACACCTTTTCGTTTGTTAGGATGAGCACGGACTAACTCACAGCGTACTTGTATTTAATATCATCTAATTGTCGTACACAAATATGTGTTTGCACAAATCCAGCATCCGCATCCGATGTAC---------------TTTATGTG---TTGTCTGTGAGAACGCAGGGCAAATTATCGGAAGCAAAA--CTAAACGAAAGCATACAGTATCGAATCGAAACACAAATCAAAAGACGT------ATAAGTAA--CTTGTGCACCCCCATATAAAAAACATAAAGCAAAAAACCAAAAAACGGGCAACCGTACACCCCATGCACCAGAGTAAAAATGCCCAGATGAATGTATTTAT
CACAACTGGAAATTGGCATGGAGCGAAACCAAAATTGATATTTAATCTG--------------TTGTAGC-----------GCCCGGTTAATTGAAG--CATTATATGTCTATCTCTGTCATTTGCACGAGTTTCAGCTCTATCCGTATATCACTATCTTTGTCACTCTTGTTAACAGACAT------CATTAACATACGAAGACTTAGACAGGCCTTCGGACTCTGTAATATCATTAATACATGAATAATAGAA----------TTGTTAAGA--AATGTTAAGTAACTAAACTCGTAATTATACGGGTTA-CATCTAAATGTCGTACATACATATATATATATATATATATA-TATATATATATAATGAATATAAATTCATCTACGTTTATATGCTATTGTATGTATGTACCCAATGCCAA--ATGAAAATCAAAAACTTTGAAACATGCACCCAACATAG---CGGCACATAGCTGTATGTATGTATGCACATAAGTACATCTTATATATGTCCATATTCAAAAGATTTTGGATAATATC-CATAACAAGCATGAGTAGAAT------------ATAAAAGAACCCTAACGCATGAATCCAT
>CG32809 1536167 1536216|1774 chrX 1535982 1536271 scaffold_3 5318998 5319373 + -1014|225 316
TGACTGAAAATTCA--------------------AATATA---AAAGAACATTTACGAAAAAAAAAAA-------------------CCAAA
AGAGCGCATATTCAATGAATTTAGGTCTCAACAGAACATATTTATAGATCGTTTATAAAGAAATGCAATGATAAGTCCTGAACTTGGCAAAA
>a6 1549768 1550398|1791 chrX 1549773 1549818 scaffold_14 2449842 2449890 + 2483|0 48
CATTGTATA---TATATATATATATACATGTACACCAGCTGTGAGAAAA
CACTGCATAAAACATATGTATGTATGCATGTACACAAGCTGCGAAGAAA
>a6 1549768 1550398|1792 chrX 1549925 1551659 scaffold_93 47772 49459 - 34862|0 496
GCT-----GGATGACTGATGACCGATGACCCGCCAGAACCGAGTCCCCATCGCCATAATATCATTCCCCG-AGCCGGAAGCA------CGGCATAGACTTTAACTAGCAGTGGCTAGAAGTGCAAATATGAACGTAGGTTTAGCGACAACACATCACTATTTCCCAGTTATCCTTGAATCCAGGACTAGTCCTTGTCCGGTCGATTTTTGTATCCTTCCCCTTTCCCAAGCAC-----------CTTCTCTCCATCTCACTCAGTTGCCCATTAATCTCCCTGTCTCTGTCATTCTCATATTTTAAGCTTTAAATGAAACGAGACGACAACGTACAAATGAAAGTAGAAAAGCATCAACCCATATACATTGTTGAGCAAAAAACACAAATTTCAAAAGATTATAAGAGGGAGTAGAAAATTTGAAGCGAGTGAGAAAGGTGAGCCCAATATTTATAAAGTACAAGTAGCTAGCTTAAGATATACTATGTATATGTAC
AGTTCTTGGAACGCCACAAGATCATTCCCCGACCCGAA---AACTTGCATCACCA-------ACCCCCCACATACAAAAGAAATGTAGCGGTCCAGAATTTTTCTCTTACTAGCCTCTAGTGCAAATAT----------------ATAACATAT-----TTACATAGATAT--------------GTAGTTC---------CGATTCTTTACAGTTTCAGCAGTTCCGAGCATGGTGCCGATTGTGTTTCTCTTTCGTACTCGCTTGT------GTCTGCCATCTCTCATCTCTCTCATACTTTAAGCCTT-------------TTTGAACGTACAAAATCAGGCAGAAAAA---------GTCTGCAAAGCTTAGAAAAAACAGTAAACTTATAAAGAAT---AATGGAAATATA----TTTATGCAAACGGGATA------CACAATATTTATGTAATATAATTATAGACAAAAAGTAGAATTATATTTGTATAC
>CG3795 1565094 1565244|1812 chrX 1565087 1566172 scaffold_93 68539 69662 - 14016|7 160
CGCCCGCCTGCTCCGCGATTCGTTCCACGGGCGGTGCTGGTCGG---TTAGCCGGCTGGTACAACTAGTTAACCTGCCAGCCTGCAAACCTCCGAGCCTGCATACGACAAACCAAAATTGACTAAAACCAGCGGGCATGACCTGTCATCCATGG
AGTCAATCAGTTTTATGGATCTCTTCAGATCCGATTTTGAGTTGTACTTTATGCACTTCAACAGGTAGGTGGCCTG-CGGCTTGCGGCAGGC--ATCCTGCATATGACAAGCCAAAATTGAGTAAAACCATGGCACTGAA---GTCTTCTGGAA
>CG14812 1714126 1714474|1971 chrX 1714474 1715116 scaffold_5 6122937 6123487 + 10645|0 0
C
C
>deltaCOP 1715299 1715674|1972 chrX 1715206 1721924 scaffold_5 6123846 6130842 + 159888|111 588
GCCGCGC---CGCTGGCC----------ACGCCCACCTAAGTAGTACATAAATATACATAATTTCCCGGGGTCATCCGATGCGATGC------AATTAATTCAACTGCTGCA---------GCATGTTGAGAATTATTTTTCCATGTGCGAAC-----TTTACATATTTATG-GCGCAGACAGCT-----------------TCTCAGAGCGAGTAAT--TGATTCCAAAAAAAA-------AAAAAAAAACACCAT---------------CAAAGCCAATTAATTAAACTAATTTTGTGCACTCCGCTG--CGCTGCATATAACGGTATCAAATAAATTAATTGCAATTAGTTGTAACTGGCGATTGCAGTGTTTTGTTTTGTGTGCTTCG-TCGCACCCCTTCGATTTG--------------AGTAATTTG----------TATGTAGATTGCTATGAATAAACCATATACAAT
ACTATATACACACATGCAGAGAGGACAGATACACACATAAATA-TACACACACATACACAGTTACAC--TATTAGCAGACGTAGTATACCTAGAATCGAAACAATTTATGTACGATTATATATATGTT-AAAACTATGTTTACATACATACATATATATTTCCACATAAATGTACGCATCAAGCCGCGATGCACTTGTGAAGTCGCAATACGGCCAACAATAATTCCAAATGGCATGTGCTCCACAGCAATCATCATAGAGTATATATAACACAATATAAAAAAACATAAATATTTTTATTACCTGCGCGGAATGCAGCATATAA---TTTGAGTTAAAAAAATTG---TTAATTATAGTTGGC-ATTGTAATAGTGAATTTTGTTTATTGTGTTCACAGGCAAGCAAATTGCAGGAAAATATTGCAATAATTTGCGTATTTTTTTATGTTAAATGCTATAAACAAAATACATACA--
>CG14814 1718134 1718483|1972 chrX 1715206 1721924 scaffold_5 6123846 6130842 + 159888|3240 3599
CTGGGTTCTCTTTTGAGTTTTGTTAAATTATGTGCTCCAAGCCCTAAACCATTTTTGGTATATCATAGACAATTTGAAAAACTTAACTGAGATCTCAGTTCGTGCGAAGTAGTAGAAGTAGTATATTTTGT-TTAATGTATTATATATTTTCTTAACCAGAAACATGGTTTCCATTAAAATTAAACGGACATTTAAAAGCTAGTGCTGTAAAGCTCGATTTTGCATAGCCGGTGTCGGCCGGCGGTG-------TTGGTAAAGGCGATGCTTGGACTCATTACTTACAGTGAAAGAGTATGTCTGTTTATGTATG-TTAATATATGCCTAAT-ACAACCTATTAAATAATTGCTTTGCAC
CTAAGCCTC-------GTACAGCTAAAATGAGTACGACATTCTGCA------TTTTAATATATCGT------TTTATATATTTTAAT----ATCT------------------ATATATTTTATATTTGACGTTGATTTAATGTAAATTACCGT---TTAAAACATTGCTTTCAATTAAA--AAACACCCACTCTAGATTGAGT----TGGCATTTGATTTGTTATCTCAGCTTTCAGT--GCTGTGCAATTAATCGGCATAACGATTGCTGAG---TGTTATCGATGTTGCTGGGCATTGTCGATGTGTGCACGACTGGCATCTGTGACGTCACAATTAGTT---TAAGTATTAAGGAC
>CG14815 1722979 1723163|1973 chrX 1722155 1723021 scaffold_26 636464 637304 + 35359|833 875
TTCTTACATTTAAGAAATTAAATAACTGTTGGATAAATGCGAT
TTATTATATCTAATAAAATATTCTA-TGTTTTGTTGCTAGAGG
>CG14815 1722979 1723163|1974 chrX 1723163 1724990 scaffold_26 637677 639519 + 79914|0 0
C
C
>CG14817 1732861 1732917|1982 chrX 1732849 1733304 scaffold_26 331067 331520 - 19288|12 68
CCGTCGTCGCAGCTGCTAAACCGGCGTTATTTGTTAAATAAATCTAGATGTTATGGA
C--------TAATAAGTAACTAAGTTTAATTCATTTCA-AAACACACATGTTCTGCA
>CG14818 1735167 1735294|1983 chrX 1733580 1735654 scaffold_24 585856 587904 + 58269|1617 1751
ATCCCTCTACGAGAAGTTATTGTTTTGTTCATCCAAATCGTTTTTAGGCACAATCAGTGCTGTTTTTTTTCTATTATCATGTATTTTTGTCCTAAG------TCCTAA-GTAAACGTAATTGAAAGCAAGCTTAA
ATGCAA--ATTAAAATGCACAGTTTGGACGTTTTTTCTCCTTTT-----GCTATGAATAGCAATTTGTTTCTTTACACATTTATTGTTTAAAAAAAAAAACATCATAATATAATTGTTAACCAAAATATCTTTAA
>trr 1737463 1738311|1985 chrX 1737148 1737484 scaffold_5 5251073 5251365 + 6482|315 336
TTTATGCCACCATTTTACGCAC
TTCTTCATACATATTTGAACAT
>trr 1737463 1738311|1986 chrX 1737485 1739536 scaffold_5 5251539 5253680 + 64276|0 987
AG-TCGGGAGGAG--CCTCTAGCG----------------GAGGACCAAAGGAAGC------------------GCAAGAAGCGGCGGCGAGCACG----------------TCGCTCCCAGTGAACAGGAACAGGAGTAGAGACAGGAACAGGAACAGGACTTGTATCTGATC---------AAGTAGC-TAGATTCGCTAAGCATTATAGTTCGTGTACATTTATATAT---ATATATATATATATATATAT------------------------ATATTTATATATATATAGTTTATATGCTATATGCAGATATGCTCG----TGGAGAGCAT-ATGACCTTGTAAGTTTTGTATATGTGCCCAC---------------------TGTAGCCAATTCGTATCCTTTATATCGCTCTTAAGTGCAAAAGTGGAGAGTGTCTTCATAGTTTAAATTGAATAATTGCTATCGTTTCTACATAGAAAGAATATAAATGTTACTGCTAGGACACGACCA---------------CCCCTGTAATGTATTTCGGACCCCCTCTCCTCACACAGTCGCTGGAGCACCTAATTTTATTTGTTTTAGCACCATCTCCACATTCATCAC-----TACCACCATTGCAAT-TATCGCGAGGAAACTGACCGCCCCGATGGCCAAC-----------CCAAAACTTGACTTTATGCGTGTGTGCCTTC--CCCTCTGTTTACCATTATTATTATTATCATAATTGTAGCGGTTATCTTTCAATATTCGGCCACTTTACATGG-----------GGAGCGATCCTTCTTTCGCTGCGTGTATCGTGCGCAACCTTCTTTGAATATATACACTGATAAGGATATGAACACCTACTTCTATTTTATTTTATTTAAATAGTTTGCGATTACTTTTAAGTACATTAACTAACTCCGAACAACGTGTATTTTTCATCCCCTTAAATAGTAGCTAAGTAAAT
AGCCCAGCAGCAGCACCTCCAACACCACCACCACCATCATCACCACCACAACAAACACCAGCTCCTACGCTCATGCAACAAACACCAGCAGCTACAAAAAGAGTTCGGGTGCTCCTTCCCAGTGAACACGATTTGAATTGTTGTTATTCACATG--------TTGTATACAACCACATCATCAAAATAGTATATATTCTTTAAGCAGTATA---TGTGTACATATATTTATTAGATATATATGCATGTATCTACACACACACACACACACACACACAAATATATATATATATATAAAT------ATATATGTATTTATGCACGAGTATAAATGGCATAAAAATCTTCTAAGTTATCTGTGTGTGCCCACGAATGCGCCACTCGTGTATATTGTAGCTAATTTGTATCC----TATTGCTCATAAGC-CAAACGTG--------TTTTGTAGTATAA--TTAAAAAGAAAAAACAAACAAACAAACAAACAAAAAAAAAACAACAACAAGAAAAGAAAAACAAATAAGAAAATTTCACGCATAAAATATTTGTAGTTACAACTTTT-------------AAGCATGTATTTTATGTTACTTGATGATTA--TTCGTATGTATTACGTGCGTACATATATAATACTATATATATATGTATCTGTACATCCTTCTACCCAATATCTGTAAACATCAATAGCAGACCT-----GGGTGTGCCTTCGTTCGTTTTTTTTTTATTATTATTATTATTAT--------TCATTTTTTTTAGCTGTTACGAGACTGTATAGGAAGAAAACAAATGAAACAATCTCTTCCCAGGTG-GTGTA------GTAATTTATTTTATGTACATCCAAAATTGAATGTAT-------------TTTTTTTTTTTACTTAATTTCTTTTCTA--ATTTTTA---ACAT--ACAAATATCAATCAATGTGTATCTATCTT---------TAGTTGTTAAGTAAAT
>arm 1747557 1748254|1992 chrX 1746241 1747703 scaffold_5 5261250 5262750 + 35368|1415 1594
ATACATGCATAATATTATACATTTATTATAATGCGAACGAAACGGCAAGAAAAACATATTATATGATGCATTACATATTACCCACGTAAACGAAATGGAAAATTAAACAAATGTTTGCAATAGAACTCGTACATT---------------------------------TCCCTTCATATG
ATACACACATTACATTATATATTAAACATAA----------------------ACATAATCT---------TACATATTACCCATATACACAGAAATGGAAATTAAACGAATGTTTGTGGTGGAA-TCATAAATTAAAAACGTTTTTCAACTTGAAACCCAGAAGTATTCCCAGTATTTG
>arm 1747557 1748254|1993 chrX 1747983 1748158 scaffold_5 5263439 5263614 + 12070|0 175
GCGGTGGTAACATCGGCGCCATTCCGCCTAGCGGCGCACCAACTTCGCCCTATTCCATGGACATGGACGTTGGCGAGATTGATGCCGGTGCATTGAACTTTGACTTGGACGCCATGCCGACGCCACCCAATGACAACAACAACCTGGCTGCCTGGTACGATACCGATTGTTAGACA
GTGCTGGCGCCGGTGGCGCTGCACCACCCGGCGGGGCACCCACATCGCCCTACTCCATGGACATGGATGTCGGCGAGATTGATGCGGGCGCTTTGAATTTTGATTTGGATGCCATGCCGACGCCACCCAATGACAACAATAACTTGGCTGCCTGGTACGATACCGACTGTTAAGCA
>arm 1747557 1748254|1994 chrX 1748196 1748308 scaffold_5 5264002 5264111 + 5818|0 58
ATTCGATGCAGGGTCTGGAGATCAGCAGCCCAGTGGGCGGCGGCGGTGCTGGCGGTGCT
ATTCAATGCAAGGTCTCGAAATCAGCAGTCCAGTA---GGTGGTGGTGCTGGCGCTGCT
>CG32803 1756844 1756921|2001 chrX 1756541 1757461 scaffold_5 5276038 5276991 + 8804|325 442
ACCAATATTGCTTGCCCAACTTAAATATGT---------ATTAAGAAATTAAAGACCAGTGTTTGAATACTTTT------GGAAAT-------------------------TTAAAAA
CCTAAGTTAGCTTCCAAAGAGAAAATATGTCGAATTCCCAGTAATAAA---AAGACTGTAATATGATTTTTTTTTGCCAAAGAAATATTCCTACTGTTCATCAACGTCATTTTGATTT
>CG3810 1760477 1760696|2005 chrX 1760623 1763932 scaffold_5 5280412 5283675 + 119552|0 77
GCTCGCAATCACCTCACCGACCAACACGACTGATCTGTAGA----TAGATATGTATGTATTTAGTTACTTAGGGGTAT
GCTGG----------------CCGCATGACTGATCTGTAGATATTTAGATATATATACATATATATATATATATATAT
>CG4406 1864060 1864133|2103 chrX 1863294 1865374 scaffold_28 1542403 1544762 + 68402|981 1106
TCTGGAT------------------AACTTAAT---------------ATGATTCATGTGATAATATTAATTTTATTCGTAAATACA--TCATTTC----------------ATTATTAATAC-AT
TCTGGATAGTTGGCAGCAAGCAACAAATTTAATGAGTTCAAAATGTACACATTTCATGTGATAATATTAACTTTATTCGTAAATACATTTCATTTCATTAATTTATATTATTATTATTAATACAAT
>Actn 1881250 1881696|2118 chrX 1881039 1883245 scaffold_26 1433512 1435851 - 101659|211 819
GA-------------------------------GCGCAAGGCACCACCCGCA--------------------TCCGAAGGAC--------------------------------------TGCATCGGCGAA--------CCCGAGCAGAGCCAGA-----TCATATAATAA-TGATAAACTTT-AATAATAATAATATTAATAAACATAGATTTATTATAC--CTACACTCGTAA----CAGTAGCTGCAGAAGAA-----------------CTTCAGATCAT-------------CATGTGAGGATGAATATATTTATTAATTTCCGTCTCGA---GCCGATGTATGCG-ACCCACACATACA---AAACACACAAAAAACAAATGAAAAACAAACATATTATGAAATGAAACACACA-TACATTTAAAACAT--------------TTGTAAAACAGCAAGGCAACCATAAACTGCATATCGAATATTTAAATCTAATTACAAAAACCAAGTCCAAAAAACGCTAAAAAAAAGCTAAAACTTATTTTTTGAAATTTATGTTAATAAAAACAAAATCCATACATAAAAACCAAAAACAAATAGAAA
ACCCCACGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACACACACCAACACACACACACACACACACACACTCAACTCCCACACACACTCAACTCTCACACACACACACACACTCGGCCCTATGTGCAGCGGGCGACACTTAGCCCCAAACAAAAAGAAAAAATATCATATAATAATTGATAAACTTTAAATAATAATAATTTTAATAAACATAGATTTATTATTATGCTACACTCGTAAAGCTTAAAAAATTCAAGAGAAACGCAATTATAATCTCTTTGCAAATTATATATTGTACTTACTATGTATGTATATATATATATATATATATATATATATATATATATATGTGTGTGTGTTTGCATATATGTGTATATATATA----------GATATATATATATGTCTCGATGTATATCATACATTACATTAAATACATCTTATTCAAGCCGATTGTCAAACAGAGAATGGAAAACAAAATGCATATCGAATATCCAA--------AAGAAAACAACATACAACAACATCTAAAAACA---------TTATTTTTTGAAATTTATGTTAATAAAA--------CAAACAAAAAAAAAAAAAA-----ACAAA
>usp 1894952 1895542|2137 chrX 1895046 1897563 scaffold_26 1451084 1453607 - 90839|0 605
GGTCC------CGACTCTAAAGTCTCCCCCGTTCTCCATCCGAA------------------------------AAATGTTTCATTGTGATTGCGTTTGTTTGCATTTCTC-----------CTCTCTATCCCTTATACCCTACAAAAGCCCCCTAATAT-TACGCA-------------------------------------AAATGTGTATGTAATTGTTTATTTTTTTTTTATTACCTAATATTATTATTATTATTGATA-------------------TAGAAAATGTTTTCCTTAAGATGAAGATTAGCCTCCTCGACGTTTATGTCCCAGTAAACGAAAAACAAACAAAATCCAAAACTTGAAAAGAACACAAAACACGAACGAGAAAATGCACACAAGCAAAGTAAAAGTAAAAGTTAAACTAAAGCTAAACGAGTAAAGATATTAAAATAACGGTTAAAATTAATGCATAGTTATGATCTACAGACGTATGTAAACATACAAATTCAGCATAA--ATATATATGTCAGCAGGCGCATATCTGCGGTGCTGGCCCCGTTCTAAATCAAT---TGTAATTACTTTTTAACATAAATTTA
ATTTCGATAAGTTATCGGAAACTGTTGCCTGTTATCGATAGAACGTATCGATTGCCGTTTATCGTTGATCGATTGATTGTTTCATTGTGATTGAGTTTGTTTGCATTTCTCTGCCAACCCTGCTCCCTACCGCCCCCCCCCCCC-----CCCCCTAACACACACACACACACACACCAAGTTCTTTGATAATTTTTAAACTGATAAATACATTTATTATTATTTTTTTTTCTGTAATAATTATATATAAATATATATATATATATACATTTTTTTTTTGCAACTAGAAAATGTTTTCCTTAAGATTGAGA-----------ACCGTTTATTGCTGTGTAAACGAAAAA-AAACAAAAAC--------------AAAACAAAACATG-ACATACATATGTATACA-------TATATATAAATATATATATATATATATATACATAAACAAATTGTAATTATTTCTTAAAATAAT-TGTACCCACAAGTTATAAA-------ATACATGCGAATT----ATAATTATATATACAAAAGTGTACACAGATCTCCCTCTCTCTCCC---TCTATATATATATATATATATATATATAGATATAGATATA
>CG4322 1900447 1901290|2142 chrX 1900356 1901102 scaffold_26 1456018 1456768 - -1395|98 829
TTCCATATCGTAAGAAATTTTTCTATACAAAT-----------TAGTTTATTCCA-AGAATTCGCCAAATAGCACAGAGAATGCGTTAAAATTGTGCCATCGATTACCTTTA-------------GTTTCCGTTTTATTGCTAATTTCAAAGTTAATTGTACACTA-----AACATAAACTGTAAATCG-----------TATACCAAATTGTAATTTTTACCCAACTAT----ACTGATCGCTAGAATATTTTGATTATAATCAAACCATTTTACTTTTGAGTGCCCCTCTACTTTTCGCCCTAATATTCTTATTCCGCCCTATATTGCATAAGCCTAAGCCTGGATTTTTAATAAGCCCCCAAAATCCAT----ACACATGTTACAC-TACTTAGTAATAGTTTAGT--TCGTAAATATTTATGGTCGCTCACGCTTAGTATTAACCCCTTTTCTTTCT----------------ACCTTATATGCTAACTTCTACCCCTTAAAGACACCAGATCGTGGCTCTGCACGACTGTAATTCTACTTGGAACCGAAGTCATTCCTTAATTGTTTATCCACTACTCTCAGCACAAACATTCCATTCCAACGTAGGCCTGTGTAAATGAACCTATTGTTAGTCCCATCACGA-CCATTTGAAAGAACATAAAAGCAAATCGAATATGAAGATAAATAA-------AAATATAATTGTTTACATAAATACAAATGCA
CTCAATATCGTTTACGGTATGTGTATACAAATATCTATGTGTGTCGTCAATTCCATATCGTGCTTACAATAACGTTTACGATAAGCCAAGTACTCAATATTGATTGCGTTTATATAAATATGTATATCGACGTATCGTATTTACCTATATCGTAAATTGTAGAATATCCCCAACATCGTTTACGAAGTGAACATATACGTTATCGTAAAAAGTATATCGTACTCAA-TATCGTAAATGGTGGCTGGCACACGTTATATATCGTAAA-----TGTTATAACAAGTACTCAGTTCCGTTT-------ATATCGTAAAT----CGTAAATCGTA-AATCGTAAA--TGG---TTTATTGTGCTCCCAATATCAATTGTGGCACAT-TCATACATATATCGTAATCGTAACATACTTATAGATATTTATCGCTGTCTGCACTTAGTATTAACCAGTCTATCTCCGAATTCCCCAAGCTCAAACTGTATATGCTG--TTCAATTTTTAAAA-----TATGTTGTCGATATACATAACCATCGTT------------AAAG----TCCGTATCCGTATGTCTGACATAAGCAAGGCAACAAACCCATTTAAA-----------------AAACAAAAAATGCCTCCAATTATGATTCATTTGTAAAAACATCTATTCGAATCTAAAAAAAAACTATTCAATTTGGCTTAATATGAAC-TTTATATTTGTACA---GCA
>CG4322 1900447 1901290|2143 chrX 1901187 1901238 scaffold_26 1456848 1456896 - 428|0 52
CCTTCGTTATGAACACAAAATTGCCAGGAATTGTAGATCGGG-ATATAGTAAA
CCTCCACTACGTACGTTATAT----ATATCTTGTATATCGTACATATCGTTAA
>CG4322 1900447 1901290|2144 chrX 1901263 1903141 scaffold_26 1456932 1458734 - 79187|0 28
CGCAATGCTTTAATTCCAAA-ATCAAAAC
CGAAATGCTTTAATTCCAAATATCGTAAC
>CG4281 1918473 1918890|2161 chrX 1918694 1920366 scaffold_26 1482817 1484634 - 40573|0 245
CCCCAG-------------AAAGCAACACTA----TAATCCAA--ACAAGACCAATCCCTAGCAAATGCAAACGTACAGCCATCAGCA---------CTCGAGGTG----AAACTCTTGGCATACGCTTGCATTTCTAGGGTGGAA-----GAAACCC---TTAATCTATGAAT---GCTTTTAGCTTGTTTT------TGTGAAATCTGTTCCATGTACATAAGTTGCATCGGTCCGTGTATATA
CCGAAGAAGTGAAGTTATAAAATCAAAACTGAATTTAATCCAATTACCAGACCAAGGC---GAAAATCACGTCGCTCGGCAAGCGACAACTGGAAACCACAAGGTGCTCCAAACTGAAGGC---TGCTCACATTTTGTGCTGGGCACCTGTGCAGCTCGTTTTAGCCTATTCATTAAGCTTTTAATGCGTTTCGTATAGTGTCGAGTTTTGTCTG-----------TACATCGGTCTATGTATATA
>CG4199 1922582 1922864|2163 chrX 1922400 1922647 scaffold_36 658057 658306 + 959|195 260
ACACAATGGCGTATTGGTTTACTTTTGCTAAATAAAGAATTTTAACGTTTCGTATTTAAAACAATA
ACACACAGTTGGAGCTGTGTGTTTTGTCTACAAAATATTTGTTGGAATTTCGAATTTGAATTTTTA
>CG4199 1922582 1922864|2164 chrX 1922851 1924664 scaffold_26 1724931 1726730 + 78064|0 13
ATAATCAACTTAAT
TTCGACAATTTGAT
>CG4045 1930954 1931022|2167 chrX 1929862 1930959 scaffold_24 1348496 1349593 - 39553|1098 1103
TCGATT
TCCGCC
>CG4045 1930954 1931022|2168 chrX 1930960 1931130 scaffold_24 1349723 1349897 - 7476|0 62
-ACACGTATATTCTCTATATATGTAGACATTAATTTAAGGTTTCCTTAGAGTAAAGAGATCTA
TATATATATTTATTTGACAAATATATATATTAATATATATTTT--TTAACATAAATA-ATTTA
>CG16903 1934494 1934644|2172 chrX 1934451 1936457 scaffold_24 656280 658430 + 83648|45 248
TGATTGATAGACA--------AGCGAGACAAAC---------ACTCCCTTATATTTAATTGCTCTTTATTTT---------ACAAATTTACAG---------------------ATTATTTCTACCGATTTAGTAATGCTAATGTGTATTGAAAAAACGA---ACGCGGGTAAACAATA---AATGTAACTCTTCAATCAAAAA
TGAAAACTCTATACTAATTGTACCGGAAAATGCTTTTTGATTTTTTCATCATATTTTTTTTCTATTTATTTTGATTGCAACACACATATGCGGTTTAAGTTGTAAATTCCAAACATAATTTTGAACGTCATTGTAAAAATAAAGTGAAATTTATAAACAATATGTAAATGTGCACAATATATAATGCATGTTTTAAGTAGAGTC
>ph-p 1982360 1982964|2219 chrX 1982054 1982513 scaffold_7 4049781 4050193 + 489|312 486
CTATGAATAATAATTGATATCTAAATGTGAATTTGAACTTT--TTACTAAA---------TAATATTTGAATGCCTAGACCTAAGCTTTTTTTTCAAGAT----------TTTTTTTTTGCAATTGCTGAAGAAATTAAAATGGCACTGAATAGTGTTTAATAAATGTGAAAAAG
CCAGAGATGTTAACTGGTA---AGTTGTAGATCCAAACATTACGTATTAAACATATCCTATAACTTATGCATTTAAGAAACCAAACTATTTTTTCAAGTTATAACGTGCCCTTTTCTTTGACGTTG--GAATTATTCGCTTAGGCATTCAAT-----TTGCGAATTGCGATAGAG
>bcn92 2004603 2004921|2243 chrX 2003273 2005029 scaffold_24 1332841 1334673 + 77201|1340 1764
GG-----------------------GAAATACGGAGCGAAAAACGCGCTAGCTGAAGAGAGTACAATAGCAGGGAA----GGAGCGGTAGAAGGAGCAGGAGGCGTCTCCAGATGAAGACACAACTCGAAAGACTCGACCCACACACAACACAACACACCAAACCACACGCATTGTTGATTTTA-------AATGGCACTTGCATTCATGAAACTAAGGAATCAAAATCATTTGCTAGCAA-----------------AAAAACACCAATTTAATGTTATGTTTAACAACAATTATGAAATTCTATATACATACATATATATTAATG-------GTATAAATAAGTACT-----AAAGTACTCCA-----------GAAAAAAAAGAAACAT--------------------------------C
AAAGTTGCATCACTATCATCCACTCGAAACACACACAAATACACACACACACACACACACACACAAAGGCAAATGGCACCTGGACAATAGCCGGCGCGGGCGGCCT--------------AAAACTCGAAAGACTCGTTAAAT---------------TTGAATGTTGCTTTTTGCTGTTTTTGTTATGTTCACGTTAAATGCCGCCAAAAAAAAACCAAATCAAA-TCAATCACTGGAGATTGTAGAAGATAAAAACAAAAACACCAGTTTAATAATATATT----AATTACAATGAAATTATATACGTGTACATATACTTTAATTACATATTGTATAATTAAGTACTGCCCAAAAGTACTTGAAACAAAAAAACGAAAAAAAAAAAGCAATTGAAAAATGAAATGAATAGCATAGAAATACAC
>wapl 2006258 2007032|2246 chrX 2006079 2006422 scaffold_28 584800 585099 + 4745|187 360
ATAGACATGTGTAAAGAGAGAGTTAGAGAGGAAAATTCT---------AGATTAGATGTGGGAAATAAAGTTATTTTATTGCCTAAACGTAAGCTAAAGAAACTCTACTTATAAAACTAACACTGATAAATAAATATATATATGTATATGGATATATGTGTACGTTTACAACCA
ACATACTTGTACATGTATAAAGTAGAAGATGTAATGTTTTGCAAACAAAAACAAACCAGAAAAAATATAGTTATTTTA------------AGCAGGAAAGAACTCTATCCAT--AATTAA-----------AAATGTATGTATGTGTATGTTTAAATG----------------
>wapl 2006258 2007032|2247 chrX 2006469 2007621 scaffold_28 585138 586477 + 24451|0 674
TCG---------GACCTGGGATCTGAATCGGAATCGAAGAGCCATCGCAATTGTCGTTA-----ACCA--CACCGAAAGCCTGCCACCAAAATAA-----AATTCTGTTGTTTGTGATTA--------TGTAATTTGTTTATGTGTTGATATAACAATCACTACATGTATGTGTATAGCCTGTAATGCACCTAGTTTCAGTCAGCTATATATATATAGATATATATATATATAGAAGTATATAGCTAAGA-------------GCGATAGGATACAA---------TGCGATCTGTTTTTGCGTTTGTATTAACCC----AAAGTGATAGCGAATTCCTGAGCATGGTCTGCGTTTTAACTAAAGAAA-------------------ATGATTAAGATTGACGAAACGAAAGCGACACCCCGAACAACACAAAGATCCAAATC-CCCACTAAT-ATGAGTACGTTATATAGTCATAAGCAATATTAGCAGCTA--AATGTCGGCTTACCCTCGAAA-----------------GCACACACCCA----------TGTAAATATTCTTTAATCAGCGATTTTATCGGACGCGTCTTAGGTTTATTTCGAATGTGTTTTTTTTTTACCTATTCATACTTTATATATT------AAACCTTTTTTTTATTGATTGTAA
TCAATGCCGGACGAGCAGTAAGCCAGATCTGTGGAAGACAGACGTCGCCGTTGCCGCCGCCGCCGCCAGTCACTGAAAGCCTGCCACCAAAATAATAATTATTTATGTTGTTTGTAATTGCTGACAATTGCAGCCTATATACATAATTATTTATTTCCTATTACGTATATGTGAACACACACACACACACACA-CCCAACACACTTTGATATATATATATATGTGTATATTTTATAATATTTCGCTGTGCTCTGCTTGGCTCTGCCTTGGGTTTTCAGCTTAGCTTCGCAATATTTAATTGTATTGTATTTAAAACAAAAAAAGTGATAGCAAA----TGAGCATGGTCAGCGTTTTAACTACAAACACACCCACACACACATCCGCATACACACAACAACCACAACCACACCCACACAGACACACACTCAAAGATCCAAATTAAATACTGATAATGTGTACGTTATATAGTCATAAGCAATATTAGCAACTATTATTATATATTTACACACAACACACACACACACACACGCGCACACACACAGATAATCGATTGTACATATTGTTTATTCAACGATTTTATTCAATGCTATCTAGATTTTATTTAA-----TGTTTCTATGCTCTATTACTATTTTAATTATTATTACAAATTCTTTTTTTTTTTTTTTTTAA
>Cyp4d1 2015298 2015370|2252 chrX 2015327 2015475 scaffold_26 1387277 1387417 - 4967|0 43
ACCACAACATCGCATTATATCTTTACGCTTGTCAATTAAAATAT
AAGACGCCTTCATGTTGTTTTTGT-------TCCGTTAAAATAT
>Nmd3 2038974 2039068|2281 chrX 2038998 2041035 scaffold_36 703830 705839 + 86658|0 71
TCCTTTTTTTTATTAATCATAACGCTTTCTTTTACCCATGTATAC-CCTGTACATAATCGCTTAATCCATAT
GCTTTTTCTTTATT-TTTATTACATTTTATTT-----ATGTATTTACATGTACATAATTTCTATATATATAT
>CG18031 2057975 2058070|2299 chrX 2057919 2058312 scaffold_26 125712 126134 - 3681|56 153
-CTACAATGTTTCAATGTTACCTTTTTTCCCTTTTTTTTTTTTAATCTAGTAGAATTGAATTTTAAGTCAGCTC--AAATAAATCGAACGTCATTCTA
TCAACCAAGTTAGACTTAAATATTTTTGTTTTTTTTTTTTTTTTTTCT--TAGATTAGAGCATTAGCTATTCCTGGAAACGGACAACTTGGCATTTAA
>msta 2062006 2062181|2303 chrX 2062018 2062637 scaffold_26 132328 132981 - 27723|0 197
TTCATATT----------------TAGCTTCAAAACTTCATTTTTT---------TTTTTTTAGGTGTGAATGAGTGAGTGCTTTTGTGAATGCGTACTTTTCGG-------GGTGGCGTGAATCGCATCCGAGCCCTTTGTTGCTATTTTA-TTCGTAGTCAC-TTAAGAATCCAATAAACACCGAATCCTTTCGAA
GACGGACGCAACAGTGCCAGCTGACAGTTCTTGGACCCCGCTTTGTCTGTGTGTATTTATGTGTGTGTGCGTGTGTGTGTGTGTTTGAGCTGGGGCAGCTGTCGGCCATGGAACTGTTGTAGCTCGTAGAAAGTGTATTTTTTTTTCTTCTATTTTGTAAACACTTTAGGAATACAATAAAAGTCCAGTTCTTTAAAA
>Vinc 2070442 2071170|2307 chrX 2070956 2071282 scaffold_26 143632 143951 - 9749|0 242
GCGATTGTCAGTGCCTACGGGGATGCTGGAGGAAGGCACCTGACCATCTGCCCACCGCCCTCAACCCACCTGACCGAATGCCGCCAGCCG--CGTGCCTTGTGTAACATACAAAGCTAAACACTAATCTTAATGATTTCTATTTTA----AATGTTAATCCCTA----ATCGGTTCCATCTGAACGCCAGTTATGT------------------AAGTGCCTGCAACTATTTATTATGTGCTC
----------ATGTCCA---------------AAAACACACACACACACACACACGTGTGGCAAGAAACGCGGCCAAAAGCTATCCAATGTTCGTGCCTTGTGTAACATAAAAACCTAA--ACTAATCTTAAAACATTTGATGCTACTTTAATATTAATACCTGCAATACCTGTT--------ATGCCCGTTATCTACTTCTCCTAACTCTTCCAAACACACACATTTATTTATTATGTGCTC
>CG3191 2106295 2106461|2333 chrX 2103887 2108385 scaffold_26 175775 180306 - 172988|2569 2755
TTACCTAGAACATCTTCCACGGTAGCAAGGAGTCTCCTTCAACTGAAGACGGTTA-----------AAAGTGTTTCAA---GTGTATTGGGATAAACAGTTCCTGTGGCTTTT-CATCTCTTAAATATCCATTTTTTTTTTAAATTTGTGT----TGAAATTGCTCAAAAATAAATAAGTAAA-AAA
G-----------------GCGGCTGCACGAAGAC-----CAATTGACAATTTTTTTTTTCATAGATGTAGTATTTGAATTTGTTTACTTTTGTTCATAATTG-TGTAGCTTTTGCATTTGCAGTGTATTTATGTTTGTATATAATATTTGAAATATGGGTTTGTTCCTTTGAGGGTTATTAAACAGA
>CG3091 2108488 2108751|2334 chrX 2108386 2108674 scaffold_1 5357576 5357844 + 1576|102 295
TGGGAAAGTCCCAGAAACA---CTTACAGGTTCTAGAGCTCAGTGAAGCTGGCCCTCCATTAAGAA--TTCTTATTTTCATATTTTATTATTTTCTTACCAATTTCTCTATTATCAAATAAGGGGCTATTGTCGATTGATTGACAGCAATGGGAACAATATACTTGACAAAACAAT--AAATTATATTAATTAC
TAAGAAATTTAAAAAAAGAAATTTTAAAGATTCTTAAATCCTG-AAAATTGGTCCCTAAAAAAGAAAATTCAAGTTATCAAGTTCAAACATTTT--TATTAATTTTCGTTTTCCAAAATTTGAGTACATT-----TTATATAATTATAAGGTGTATTACATATTATACATAAATATGCATATTAAACAAATTCA
>CG3091 2108488 2108751|2335 chrX 2108749 2108873 scaffold_26 181456 181567 - 3667|0 2
TAT
TAT
>CG3078 2110555 2111895|2339 chrX 2110872 2111091 scaffold_26 189535 189744 - 3217|0 236
GTTAAAGCATGTTATGTATGTATGTGTTGTCGGTGTTATGTGCGTTATAT--------AGGTTTCG----AGACCCTCCACTTTTGCCTACCCCCATAGATGCATCCCGATTCAGATCCAGAACCAGATCCAGATCCAGAAC-CAGATTCAGAT--AAAACTAGCTGCAAACT-GTTATGATAACAA-GGTGAAATCCTAAGGTCTAAGGTCTAAAAGCAACAATGTTAACATTTTA
GTCAAATCGTGCTAAGTATATGTATGTCAT-AATGTTGCTCTTGATGTATTTGGGAATAGGTTTCGTTGGAGGCATGTCCAGTTGGTCGAACAGTTTA-------CCCAATCCA-ATGAAGAACAAAAT--------AGAATACGAATTCCAATTGAAAAATAAACGTATATTCGCTAGGATAGCAAAGGTGAAATCCTAAGGTCTAAG----------AACAATGTTAACATTTTA
>CG3078 2110555 2111895|2340 chrX 2111488 2111645 scaffold_26 190475 190629 - 1916|0 158
AACTGGGGGCAAAGCCGGCTATTGACCTCTGTCCACGAGCCTAGAGGATAAGACTAGTTAATAGGTTTGATCTACACTCATGGGGGGTTCCCTTCTCAGTGGGTGCATTC-TCAATTTATAGCATTTGCCAGTGCCAGTAATGTTGTTCCATGTCTATA
AGCTAGACCCCAAGTCCATAACTGTTAACTGTCTATATACCTATATATATATGTTATTATATATATGTATTGTATATCCATAATATATA----TCTTATTGTATCTATTAATCTAATCAAAACATGTGCCAGTGCCAACAATGTTGTTCCAAATCCTTA
>CG3078 2110555 2111895|2341 chrX 2111832 2112260 scaffold_26 190902 191333 - 25553|0 63
CGCAGCATCTTCAGCTAGTCCCGACGAATGCGACGGGATGTCGTGGCCCGGACGCACACCATGT
CGCAGCTACTTCAGCTAGTCCAGGGG---GGGGCGGGGCACTGTGGCACGTACGCACACCATGT
>l(1)G0144 2116359 2116849|2347 chrX 2116845 2117356 scaffold_26 209314 209829 - 14030|0 4
ACAGC
GCGGC
>CG2924 2121556 2121940|2351 chrX 2121430 2121588 scaffold_38 79516 79662 - -760|128 161
GCATATATTG-GTGTAAAAGTGTCAAAAAAAAAA
GTATATATTTTATGTAACAGAATAAACAAATAAA
>CG2918 2127423 2127646|2358 chrX 2127168 2127585 scaffold_26 223041 223613 - -1137|286 578
GATTCGAAGGAGGATTCACA--TCGGGGG-------------------TTACAC---------AGGGGGAAAAAGACGGCAAA--TGGTCGCGAAACGG---------------------------------------------GGCGTC--------------------------------------TTTATTTCTATGATTTTTTT---------TAGCTAAAGTCGGGGTTAAATTATGCTAC------TTCTAATCGAAAACAAAACACACAAAAAAAAAAACACAAAA
GGTTCGGATGAAGGATGACGGGTTGGGGGACCTGTGAAATTGATTGATTTGCATGCGGCGGGGAGGGGGGGAAAGTTGGCTAACTTGGATCCGTAGCGCCCAAAGCATTTCGTGTACACATAAAGAAAAGAAAGAAAAAACAACAGCGTTCAATGTATTTTGTTTTTTTTTTTTTTTTTAATTTTTATTTTATTTAAATTATTATTTTGTTCAAAACTAGCTAATGGCGGGGTTAAATTATGCTATCGTAAACTTAAATCTAAAACTAAAGAAATTTAATGAAATGTATAAAT
>CG2918 2127423 2127646|2359 chrX 2127586 2130164 scaffold_26 223740 226353 - 124213|0 60
GGAGCCAAACTAGAGGGATTACGAGCATCCGTAGCAGCAGGAAGCCAAGTGCCTGTCTTAG
AGCATGACATCACTAG----ACTATCACCAGTAGGAGCAGGCGAAAGAGAGCGCGAGAGAG
>CG2865 2137668 2137733|2373 chrX 2137722 2138184 scaffold_26 240709 241110 - 11409|0 11
AAGTACCAGTGA
AAGTATCAGTAA
>mRpL14 2200151 2200205|2449 chrX 2200134 2201142 scaffold_37 679522 680554 - 26199|17 71
GATCCTCCGGATCACGCCTTTCTGTTGCTAAATGAATAAAGTTTATCCAACTGAA
TA-----CTGACCAATTCATGCGGTTTCTCA-TGTGTGTCGTGCTTAATAATAAA
>ptr 2201289 2201689|2450 chrX 2201180 2201504 scaffold_37 681257 681608 - 11524|109 368
TTTTTTTAACTAATCTTAGTTTTTGTTATGAACTATGTAGTTT-----------------TTTAAA---AGTTTGTTTTAGTCATTAGGTCACAAGAGAACCCAAAAAAT------------------------TAACAAGAAAACGAAAAGCGCAAAATTTATCTATATAAATATATATCTATATATATATATGTATGTTATTATGCCGATATAATATTTCTTACGTCATAGTGAAATATAGTAACCAATTTTCTAACC
TTTTTTTAACTATTCTTAATATTTGTTATGAACTATGTAATTTAATGGCTCTTTTTTTTTTTTAAACACACTTTGTTTTAGTTCTAAGGTCACAAGA--ACCCAAAAAACGAAAACCAACAACAACAACAACAACAACAGCAACACACAAAGCGAAAGA-----AAACAAAAAAAAAAGCAAGCAAATTTATATATACGTTAT-ATGCCTATATAATATCTTGTATGTCATAGTGAATTATAGTAACCAATTTTCTAACC
>ptr 2201289 2201689|2451 chrX 2201628 2202722 scaffold_37 681988 683157 - 25002|0 67
GTTTTTGAAAGTGAACTGAGGAGAGTCGG--GCAAAAATTATTGAAGCAGC----GCACAAGTTATAT
G----CGAAGGAGA----AGCAGAAGCAGAAGCAGAAGCAGAAGCAGAAGCGGGAGCGTAAGCGAAAT
>CG14045 2234274 2234285|2497 chrX 2234118 2235396 scaffold_37 731714 733120 - 43856|223 234
TTTGACTTCTGG
TTTGACTTTTGG
>CG12496 2265513 2265890|2527 chrX 2265484 2267198 scaffold_37 768103 769812 - 46157|29 419
GCAGAGGTAATTTCAAACAGATCCTCGGAAAGCCACAAAAATGAGAAGAGAAACTAAATGCGAGATGGAGATGAAGATGGAGACGAG---AAAGCGAG-CAACGCTGACAAACGGGGGGAAAACGCTTAACTATGACGCTTAACTAGTTCCTAAGTCGTAAACTAATCATCTTTCAATTACTGTACATAATTTCTTAGGCCACCTTAATCACTATTTATTCCAATTACTAATATAACCATTTTTTTTTTTGCTGCTGTTATGTAGTTTTCG-----AATATACCTTTTTTTTCATTATTTAATTTTAAACAAATATGAATATTTATTGCTACTTTAAGTTACCCAAATAATTATTTTTTCAAAATAAAA----GCATTAAATCAAAAACAA
CCAGAG------------------TGAGAGAGAGAGGGAGAGAAAGTGAGAAAGTAA--GAGAGAGAGAGAGAAAGTGAGAGACAAGGCAAGAGCTAGCCAACGCTGACAAAC-GGGGGAAAACGCTTAACTATGACGCTTATTTAGTTCTTAAGTTGCAA------------TTAATTACTTT------TTTTTT-------TTTAATGTACATATATTAGAATT--TAAGTTAA----TTTTTTTTACACTGCTGTTATGTAGTTTTTGTAAAAAAAAAACTTTTTTTTTAAATATTTATTT------ACTTATGCTTAAGTAAAACAATTT----TTTTTAAAACCTTTTTTTTCTATTAATAAAATGCTGCATCAAA-CACAAAATA
>gt 2283263 2283586|2546 chrX 2283267 2283491 scaffold_26 269400 269589 + 3154|0 228
CTTTCTTTTTTTTTTACACGCTCGCATTTAAGTACTTTAAGTCCTTGGAGTATACGTTATATTTGGAAAATGTATTAGCTGTAGTGCATCTCGCAATCCCACCAGTTAACTATCAATGGAATCATCT-ATAGTTGTAGAAGTCCCAGCTAGCTATTA-ATGTTTAACTTATAAGTGAA--TTTTTTTCATAGCCCTAAGGAATGAATTTCAATAAATTATCGAAAATAA
CTATTATTTTTTTTTTTATGTCTCAATTCAAGTATTTTAAGTACTTTAAGT--------TCTTGGGC-----------TTTTAGCGCA-----AAATCTCACCAGTTAATTAATATACAAAATATCTAATAATT-----AGT-----CTGTATAGTACAAGGTTAATTTATAAGCGACATTTTTTTGCATATCTTTAAGTAATAA-----AATATCTTTTTAAAAATAA
>tko 2298463 2298517|2567 chrX 2298310 2299339 scaffold_26 291146 292287 + 24912|186 240
TTAATAACCACTTCCTAATCACGTTGTTCAAATGCATTGCTTCACAATCAACAGA
CAACCAACTACCATGTAATTCTCTTCCATAAAAAAACAAAAAAAAAATAAGAAAA
>CG32796 2300320 2301206|2569 chrX 2300433 2300647 scaffold_1 4694063 4694260 + 1287|0 218
ACTAATGTTAAGTTTTTTTTTTTATTATTGATAGAACTATTTCGGGGGCCAAATTTTATCTCGAATAAGCCCTGTAGCATAGCGTTATTTATTTATTGCAGTGTAAACGTCAGGCGTCAGCAACTCAAATTGATTAGTTCAATTAACAAGCA---ACCTAATGTACGTTTAAGTCAAACCAACTATATA-GCATTAAGTTAATACATTTCTAGATGTGA
ATTAATGTTAAGCCGCTGTTATTGTTGTTGTTTTACTGTGTTCGGGAGCAGGGTCTTAACTTTGATGAGGTTTCT-GCTTAAGGGTTTCTGTTTTTC----CGTTTATGTT-GCCCTTAATA---------------TTCAGATAACAAGCAAACATCTAAAAGGCACACACATACATACAAACATATGCATGTTATATGAATATATTTGTTAATGTTA
>CG32796 2300320 2301206|2570 chrX 2301202 2302382 scaffold_31 1033155 1034430 + 21580|0 4
TGGCT
TTTCT
>trol 2327139 2327307|2609 chrX 2326602 2328153 scaffold_31 1078194 1079806 + -260|696 937
GG--ACACAACCAACAGCCG-----AAACTAGCTTTTTAATTAAACATTAACAAATGAAACAAAACGAACAACAA------------------------------TTTTTATATATACAACATATGCATAAGCCCAAGAAAATCCACAAAAAT-TGAATAT---TATATCAC-------------TTACACATAAT-------------------ATAAAAAAAACAAAAACAAAAGAGAAA
GGCAACACACAGAAGAGAAGAAAGAAAACAAACTAAAAAAAAAAACACAAACAAAAAAACACAATCCCACAACAGAAGTTAGCTTTTTTTTTTTAAATACACTTTTTTTTATATATATATACTATGT-TAGACTATGGAATATCTATATATATATATATATATATATAGAACAAGAGGGACAATTTAACACACAATGCGCTAATTTTTGATATCGAAAGGAAAATCATCGATAAAAACGAAA
>trol 2336714 2336881|2624 chrX 2336239 2336823 scaffold_31 1092211 1092866 + 1575|525 676
GTCGGGTCCGCCGGTTCGCAG-------------------------TCAGA---AGATGTCGAGTCCGACAAGCCACCTTACTTCCAT--------------TTCGCCCCTGAAAAGAAAGAAAAGAAAAAAAGAAAAGAAACGAAACGAAA
GTCAGATCCGACAATGCGAAAGAAATACTGAAATATCTCTCTTATCTCACACACAAATACAAACACACACACACACACACACTCACATGATCCCAAACTATATACGTTTCTTAGGCCAGAGAATTTCAATTGCAAAATAATACCAGAAAAAA
>CG8310 2435439 2435444|2748 chrX 2435443 2436734 scaffold_31 1281639 1283089 + 47976|0 1
AC
AC
>Klp3A 2455313 2455828|2764 chrX 2455155 2455462 scaffold_1 6610718 6611038 - 2425|174 334
AGAGATGGGTATATTTTT---TGAAAAAGGATTTCCCAAAAAAAAAGCAGGCATTTTTTTTTCCA------AGGTATAAAATTAGAACCTTACTAGTTTTTGTTTTGTTTGTTTTCGAAATTTTCAGCCCAAGCTCCGAATATAAAAGACATGC--ACATA
AAAAAACGGTTTATTTCCGACTGAATCAATAACGGCAAAAGAGAACACCTGCATCTAGGTTTCTACGCACTAGACACTGGGTCCGAGCAACAACACTTTTCGTTCTATTTTTTCGCACATGTTCTTGCTCGACCACTGAACAGAAAAAGCATGCCAAAGTG
>Tsp3A 2474497 2474591|2775 chrX 2474535 2474916 scaffold_5 3879357 3879715 + 20545|0 56
GATCCGGGACAGCCCAAGTTCTACGGGCCCTACAACCGCACCTGAACATACATACTC
------GGACA-----------------CACACACACACACACGTACATATATAGTC
>HLH3B 2536430 2536586|2841 chrX 2536244 2536503 scaffold_0 1687662 1687947 - 82|228 307
TTTGCTATTTTTTTTATCTAC----CAATAAATTACAAAGTTAATAGTGCAAATTGCAGATGCAGAATCAATAGTTAT--
TTTGTTATTGTTGTTTCCCGTGTTGCAGGTAGTTGCTTGGATAGTTACTTAAACTTTAAACAAAAAATGTACAAGTATTA
>CG2650 2548887 2549051|2853 chrX 2548868 2549254 scaffold_31 1535056 1535426 - 5844|19 190
ACGCATATGT-ATCTAACAAAGTCCGGTCTAACTAGCCACTCTAGCTAATTACTGATTAAACTACCTAATTGCAGCTAAATCCAATCCATCTTCGATTAAA-ACAACTACT-ACAAGTGTTG----GCGTTGGCTTTTCGATATTTATTGTACAATAAATAACTAAAAAAGA
GT-CAAATGTAATTTAATAACATT---TTTAAACA-------TAGATATATTGTGATCTGTATATGTGTTTGCTTT---------TCCACTGTGAATAAAAGATAACACCTGGCCAGTCTTGAATTGCTATGCTTTTTCT---TTTCTCAAACAAAAACTAAGGATAATTGA
>CG2658 2550878 2551381|2855 chrX 2551083 2554267 scaffold_31 1538413 1541567 - 119025|0 370
CTGGCCGAAGCTCTGCTGGAGAAGGAAACGCTGGACTACGACCAGGTGGTGCAGCTAATCGGACCCCCGCCATACGATCTGGGCAAGCGGCAGGTAGAGAGCGTGGAGTTTGAGCAGTCACTGAAGAACCTAAGCACCGACACGGATGCCACAAAAGCCT-----GAGGCCATGGGTCCAACT----CAGATCGCAAGTCATAGCCATAGTCTTCGTACGC---------------------CACGTGCCCCTAGTCGCTCACCTTTTCGC------------------------------CCGCCCCT------------GGCTCATGTGCGTTGAATGTAAATAAAGTTGTTTACCTTTCTACATGACT
CTGGCAGAAGCTCTGCTCGATAAGGAGACGCTTGACTATGATGAGGTGGTCAATCTGATTGGACCGCCACCATTTGATCCAGCCAAACGTCAGGTGGACTCTGTTGAGTTTGAGCAGTCGCTGAGGAATCTTGGCACC------GATGAGCCAAAAGCTTAGTTGGAACACCTTAATATAGCTGTGGCTGACCCCAACACA---CTTTAATCCACTTACACACACACACACACACACACACACACACACACACAAACACACACCCTCCCTCATACATTGTCACACAACACCCGCGCTCCTGCCACCTCTCTATAGACAGCCGGTTCATGTTCAATAAATGTAAATAAAGTTGTTTACCTTTTTAATTGATT
>CG2658 2551549 2552084|2855 chrX 2551083 2554267 scaffold_31 1538413 1541567 - 119025|539 1074
GCGGAACTGAGAAACGTTCGCATGCCCTATCGCTGGCGGAGCGCAAGGTGATCGCTTACCACGAATCGGGACACGCGCTGGTGGGCTGGATGTTGCCCAACTCGGACATCCTGCTTAAGGTGACCATTGTGCCGCGCACAAGTCTGGCGCTCGGCTTCGCCCAATATACGCCCAGCGAACAGCATTTGTACAGCAAGGAGGAACTGTTCGACAAGATGTGCATGGCGCTCGGCGGGCGCGCTGCCGAGAATCTAGTCTTTAACCGCATAACGACGGGAGCTCAAAACGATCTGGAAAAGGTGACGAAGATCGCGTACTCGCAGATCAAGAAGTTCGGCATGAACGACACCCTCGGTCCCATCTACGTACGCGACGCGGATGAGACCGAGGGCGGCGGTGCGATGGGCAGCGGTGGCAAAAAGCCCTTCTCGCGTGCCATGGAGAGCATGATTGACAACGAGGCGCGGCATGTGGTGGCGAGTGCTTACCAAACCACCGAGGGCATACTCACTACGCATCGCGATAAGCTGGAGAAG
GTGGCACCGAGAAGCGTTCTCATGCGCTTTCGCTGACCGAACGCAAGGTGATTGCCTATCACGAGTCTGGCCATGCGTTGGTCGGCTGGATGCTGCCCAATTCGGATATTCTGCTCAAGGTGACCATTGTGCCGCGCACAAGTCTGGCCCTGGGCTTTGCCCAATACACGCCCAGTGAACAGCATTTGTATTCCAAGGAGGAGCTATTCGATAAGATGTGCATGGCACTGGGCGGTCGTGCGGCAGAGAATTTGATATTTAATCGCATCACAACTGGCGCACAAAACGATTTAGAGAAGGTCACCAAGATTGCCTATTCGCAGATCAAGAAATTTGGCATGAACGAACGGCTAGGTCCCATCTATGTGCGTGATTCGAATGAGACTGGTGGCG---------------GCGGTGGCACCAAGCCCTTCTCCCGTGCTATGGATAGCATTATCGATCACGAGGCGCGCAACGTCGTCTCCCAAGCGTATCAAACAACCGAAGATCTACTGAACAAGCATCGCGACAAGCTGGAGAAG
>CG2658 2552144 2552452|2855 chrX 2551083 2554267 scaffold_31 1538413 1541567 - 119025|1136 1445
CATTACCATACCATACCATACTTG-TTACATTTTTTAAGGCGCTGCTGCGACCCGGTCGCTTTGATCGCCACATTCTCATCGATTTGCCCACGCTGGCGGAGCGCAAGGAGATCTTTGAGAAGCACTTGTCATCGGTGAAACTGGAGTCGCCGCCCACGACCTTCTCACAACGCTTGGCCCGCCTGACACCGGGTTTTTCGGGTGCTGACATCGCCAACGTATGCAATGAGGCCGCCCTGCATGCGGCGCGCAACACACAGATGGAGGTCAGCAGCAAGAATCTTGAGTACGCCGTTGAGCGTCTAGTTG
CTTTCAGCTACTAATTAATTTTTGCTCAAATTTCTGCAGGCTCTGTTACGTCCCGGTCGCTTTGATCGTCACATACTCATTGATTTGCCGACACTTCAGGAGCGCAAAGAAATATTCGAGAAGCATTTGTCATCAGTTAAATTGGCCGAGGCGCCCAGCAGCTATTCACAGCGTTTGGCACGCCTAACGCCCGGCTTCTCCGGCGCCGATATTGCGAACGTATGCAACGAGGCGGCGCTCCATGCGGCGCGCAACGTACAGCCAGAGGTCACCAGCAAAAATCTAGAGTATGCCGTCGAGCGTTTAGTTG
>Csat 2557273 2557993|2858 chrX 2556858 2557431 scaffold_1 5523367 5523979 + -621|470 656
TTGCCAATTACTTTATTTTTGAGAAATCCTA-----------GGTTGAGCCAGCCCAGACTTATATATTTGTATTTGAACTAAAGTCGCATTACTCGCACAGTGTTTTAAGAGTGATTCCATATCGATATGTTTCATTTCCTTTGAATAAAT--------ATTAGACGAATAAAAG---------GC
TAGTCAATCTTTTTAACATTGTGATAAGCTAAGGTCAAGGTCGGTCGTGAAAGCACAAACGTAAGGTTGAGTATGTGAATGAAAATCAGACAACC--------------------ATTTTATGT--ATATGTCAAATTACATTCTACTAAATTAAGGCGGGTCAATCAACTAAAAATTCATAAAAGT
>Csat 2557273 2557993|2859 chrX 2557436 2557835 scaffold_11 3265694 3266096 + 316|0 436
TAGCACTTTCTGTTGAGACGATAATTGTAATGTAAAGCAGCGATAAGAATACTTAATGATTTATGTAATTTAAATGTATTTAGGGTATTCACTAGCGAAACTAAAGTGTAGTT--AATGAAATGATGCAGCTTGAATGCACGTTTT-ATTGATCATTTT----AATTGT----TACTTTGCGAATGCTGAGGAATGCCAGCAGTATTTACTGGACAACAC----CACACATACCGTGCCTATCCTTTTGTAAATATCCACTTGCACTCAAGTTT----------AGACTAAGATTTGTAACGATTTATAGTTTTCAAGTTACACTTGATGTT----------CGGCCAATTC-ACAGCCACAACTACTTTTGTTCGAATTTTTTTTTTAGAAGATCATATATATGTATATATATTTACTTGAATG-TGCATTATTTA
TAGAACTTGCTATTGAGCC---AACTTTCTTTAAAAACTCCAACGTGCA--------GCTTTAAGCAGTTGAAAAATATTTTAGGTTAAAAGTCATGAAGA-AAAGAGTTGTTGTAAAGAAGGTACGTAACCCCATAACATATTTTTGATAATAATTTGTAAGAATGGCGGCATAAATTAACATTATTTAGCAATAACAGC--TATTTTCAGAATAACTTTGTGCCTATATGTAGTGCCTGTGATCC----AATCCCCA---GCATTCAGACTTTGCCTGCCCCAAAGTAACCTTTGTA----TTCTATGTCTCCAAACCATGAGTGAAGTTGATTTTGTTGTGGTAGGTTTGATAAAGCTGAATATCTGTGTGCATGTGTGATTCTC---------TATATATATATATATATCTCTTTAAATGTTGCTTTATATA
>Csat 2557273 2557993|2860 chrX 2557836 2559005 scaffold_5 5108365 5109535 + 47936|0 160
CTCTGGAGGAATCCGGATCTGCCAACAGTATTTGTCCGTAACCCGGAGGCCGCCGTTCGGTAATTGCTCTGGTGTATCCGGTGCATCC---GGTGTCCTTGATATTCCCCACGTTTTGTGTGTATATATATTAGGATGGATATTAACGTCTGGACAATTCG
ACAATAATGCATCCGACTCCAGACCTAATCCATGGCAACAACATATTGCCAACAGTATTGTATTGTCGTTTGTTTAGCTATCTCTTTCCTTTGGGCACCTCCTGCCGCCCATGTGATGATCGTTCGTGTACTTCAAT-----TTGATATTTGTACTGCTTT
>CG2685 2567904 2567985|2867 chrX 2567983 2569999 scaffold_48 603108 605209 - 67941|0 2
CAC
CAC
>CG2701 2573796 2573858|2871 chrX 2573852 2576178 scaffold_48 608922 611252 - 80391|0 6
GCGCAGC
TTGCGGC
>CG2713 2586375 2586671|2881 chrX 2586180 2586452 scaffold_48 636328 636606 - 362|204 284
TTGAATAACTAAACTTGCTTGTTTTTGTTTTTTGGCAATTTAATCGTAATATTATTATTATAAAG---AGACGACTTAACC
TTGAACGCATATATGTATATATTTTTTCTTTTCGTTATTTCTTAAGTAGCTTGTATATTTTAAGTCTTGGGCAGCCTGA--
>crm 2590400 2591158|2886 chrX 2590423 2590551 scaffold_5 4636257 4636389 - 1775|0 136
GACCATATATAATATATATGTATGTATGAAACACGCATTATTTTGGGTGGGAAAACCAATCAAATTTATCCTAACAATAGGAACACACTTAAAACTTGTT----ATTGTGCGAAGGAAAG----TACCGAAAATAAA
GCCCACACGAACTATATGAAAATGTCTACGGCTTGCAATATTTTCAGTAGAACAGGCAATCAAATTAAAAATAA-AATTGTTTCA---TTAACATTTGTTTTACATCGACCAAACTAAGGTTTATAGCAAAAACAAA
>crm 2590400 2591158|2887 chrX 2591157 2591503 scaffold_48 637530 637868 - 15848|0 1
CA
CA
>Syx4 2595243 2595316|2890 chrX 2595212 2595735 scaffold_48 642180 642705 - 18313|31 108
TGCAC----GCGAGAAACTTTATTTTTTTGGCCTATTTTTAAAATTTATACGTAAGAAAATAAACTTTAAAACCTCAA
TGCACATAAGCGCAAAACTATTTTTTTTTTTGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTG------AATTGCCCTTAAGCCAAATA
>CG32795 2639062 2639467|2980 chrX 2639060 2639692 scaffold_48 711744 712545 - 2796|2 541
ACGAATCAGTGCGATGATTCTGATTAGCCTGGCATTTCAATTGAACATATATT-----TACTGTTTTTACTACGTTTTTTTTTT------------CCTATTTATTAAATTTTCCCTTGGTT------------------------TTGTTCCTCTCCCCTTCCCAGCCACCA---------------AAACGACTTTGAATTGTGTTTTTTTCCCCCATTTCATACACATAATGT----------AAAACTGTTGTACATTTGAAGCAAACACTATATAAGCAAAGAAAAAACAA-------CAATATGTAGTCACAGTACACA-----------------------------------------TTTTTTTTTTTCGCCTAATTGTAAGTATGAAAAGTGAGAAGATGAAATATTAAATGGAATTGAAGTGACCCGTTTTT-----------GTTTATTTTTTATGTTTAGAC----TAAGATTGAAATGGAAGCTAAAAAAGACAAATA-----AATGAGAACGAATGGTTAATAAT
AGCAATAGCAGCATTTGTGAGGTGTAGC--------GCACTCAGTCATATATTTTATATAATTCTTCTTCTCCGTTTTGTTTTCTTAGTTTGTGCACTAATTTATTGATTTTGCTTTAAGCTGAAGTTTCTGGCGACTTCTCTTTATTATTCCTATTCGGTTTATTGCATTCATTGATTTTTCTGCATGTTCGACTTTGAACGGCA----ACTAAGCCAAGGCATTCACCTACTGTGGGGCAAAGCAAAACATAAACAACACAAAAACAAAAACGAAACTAAAAAGAGAAAAGCAAATGCTGTAAATTTATACCAACTATGTACATTATTATATTATTATTTTTTTTTTTTTTGTATTTAAGTAATTTTTTTTTTTTCGCTTGCTTGCAA--AGAAAAAGTTAGAAGAGAAAACGTGAAGTGAAATTGCAAAGTTCTGTGTGCAGAAGAAGCGAATTGATATTGAATGAAAAGAAACTGCAAAATAAACAGTGAAAATAAAAAAGAAAAAAAAAAACAACAAAAACAAATTGCAAGAAAA
>w 2646755 2646884|2990 chrX 2646657 2646885 scaffold_70 28556 28815 - -781|113 268
CCGACATATATCCGAAATAACTGCT------------------TGTTTTTTTTTTTACCA--------TTATTACCATCGTGTTTACTGTTTATTGCCCCCTCAAAAAGCTAATGTAATTATATTTGTGCCAATAAAAACAAGATATGACCTATAG
TCGCTAACTATTTTAATATATTGCTGTGTTTGGGTTTAAAAGCTTTCTGTGTATGTACCCCGATGTATCTATTAATATATCACTATTTGTTTTTAGATCCCCGAAACGTTAAGTTTCTGTATAATTGTTTAAATTACACTAAAA----------AA
>CG14419 2741337 2741439|3112 chrX 2741309 2742400 scaffold_19 74939 76120 + 9972|28 151
TGTGCCAA---------------TAAATCTTTTTTTTTACATTTTTTTTCTTTGTTTTTAGTGTACTTTATAATATTTA---TCAAAAAGTATGCCAATAAAATGGATCTTTAA---ATAAAAA
TGTACTAAAATGAACACCAATTTTTAATATTTTAATTTGTTGTTATTTTTTTTTTTTTTTTTGTTTTTGTAAGTTTTTAATGACAATAAACATGACAACA------ATTTTTAACGCAAAAAAC
>rst 2808363 2809970|3197 chrX 2808133 2809356 scaffold_19 177886 179322 + 10421|316 1530
TATTATTTCCGTGTCTCTTATTCT------CAAAACTTAATGCTCTTCTATTTTTAAAAAATTTGATTGCTATTTTTTGTACAGTGTACATGTGTACATGAAACTTTAGAACTATTTCGTAACGCGTAACTCTCCCAGAGATTTTGAAATCCCAAGAATATTCCTTCGTCAAAAACAGCTGCCCCTATATAATCCGCAAAAAATATATAGAATGGTAATTGAAAGAATTCAATTTTA-----TGTATACACAGCTATAGTATATGCTAAATGTTAATGATATATATATATACAACAAGCATGAAGACATTCAGTTG----AATGGATAGCGAGTAAGCGAACGAAATGCCAAAGTACCTGATAGTATTTAAGTAGGGGGTGGGAAAGTCTTTGGATCGGTACCGCCCGCCATTAACTTCTTCTGAATTATGTAGCATTATCTTTTCTCGCCGGAATTCTAAGCTATGACTTGGGATTCGATAGTGTGTTTTACGATTAAATAAA---TATAGAAGCTAGATCTTGA---------CAGTCGCCTTAACTTATGACACGCCCATAC--------------ATCTCAAAACGCCCATGCAAATAT----------------------------------------AGGAAAAG-----AAAACAAAAATGAGAGCGTAAACGTATTCAATTCGTCAGTTCAATTGTGCTAAGTGTACTTCTAAGTGTATAACGGT--CTAAT-------------TATCCTAGTTGTAGCCTAACTAATGATAGACACGCATATTTA------AAGTATAGAACCTAGCCCTAGATATACATACATGCATTTTTTTTCAT--------------AGGCCTAAGCATTAT-----ATTTTGATAAGCCAGCGTATTTCGTCTAAGGAGCCCCTG----------AAAAGTAA-------------------------------------ACATTACT---------------------------------------------ATTTCATT---TTGCTATATTTATTAGCTGTGGGTATTTTATTAGTGTCGCCAATTAAGCGCGAAACGAACAAATGTTTTTTGTTTACAAAATGCAAATGATAAAAGCAAATAAGCAGCATGAAACACACACAAAGTTAAACACGAAAACAAAAAGCAAAAAAAAAACTGAATAAAAATTTATTGA
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TCGAAATGTTCCAAATATTGTAATTTAACACATAGTACATTTTTTTT-----TTTTTGTTATGTTTT
TCCAAGAAACTTAACTAAATTTCTGTAGAATTTAGATTCTTTTTTTTTCGCATTTTTTTTGTGTTCT
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GCACTGTGCAAATGAAATAAATATATGATATGAC
ACTTTG----AATGAATTCAACAATTTATTTCAC
>ng2 3096181 3096351|3587 chrX 3096085 3096297 scaffold_14 1266408 1266597 + 1262|97 218
CCAATTGTTTTCTTTTTTTTT--TATTTCTTAGTCCATAAGCTTAACTAACACTACAATAATTCTTTTACAAGTCAATTAAGAAATCATAAAAAAATATACAT---ATTTTGTGACATGTCA
CTAGTTCATTCCTTTCTTCTTAGTTTTTTTTATTCGATCAGCTTAAAAATCTTTTCCAAAGATCTTTT---------TCAAAAGTTCGTTAAAGACGAACTACTCGATCTAGTGAAAAATC-
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GACGCCTTTGAAAATGTAGTTTTTCTTTTTGGTTTTCTTTTTTCCGTTCAAAACACTTAAGGCAAATAAAATGAATATTTCGATATT
GATTCCTTATAAAATATAGTTTTTGTTTTCATTTTTTTTTTTTATAGTTATCACA---AAATCAAAGAAATTATATGTT---ATATT
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GAATAGGTCAACA--------------AAACCTTAAGACTATTTATTCAGAAATA-TAAATAAA
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AGCGAAAATG-----GTTGAAACAACAACTACATGTGGACTATATGCATAATAAATATTTTTTTTGTTCATGATTCAATAATTGATTGGTGCATTGGTCTGATTCGAAAACACACACACGAAAAA
AACAACAATGTTCGCGCTGTAAGGAACAGAAGACGCGG-CTAAAC---TAATACACCGAACTGCTGGATTATATTGAACGATTGTGTCAT------ATCCGATTTGAAATTAT--------CAAA
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G
G
>CG12535 3248785 3248819|3824 chrX 3248737 3249527 scaffold_10 3764043 3764872 - 1758|51 85
GGAACGGAACGACGCCGAATGTCATCATTAAGTAA
GCAAGGAATCGATATT---TAGCATTTCGGACTAA
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TTTGGCAATAAAATA-----GTGTATACATTTAAAACTTTTAGAAAACTGCAACTTGGAGATATACA-ATACATAGATGACGCATCATCTATTAAACAGTATATTGTTATATCTTTTAATTTAAATACATTGAATTCAAATTTTTGCAAACTGTAAGCACTATAAAATTG
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>CG12206 3321893 3322189|3920 chrX 3321842 3322174 scaffold_10 3887927 3888272 - 2183|52 366
GCTTTTTTCTAGCTATAGTGCTTTTTTTTTCTATCTATAT-CGAAGACATATTTTTTTTTTTTGT----------------GCGCAACTTTTGTAGTCGCTTATTATTAACAGTTGTGATATTTGAGAGCAGTTAGAGCCGA----------------TAAGGAGCGGCCGAAACGGATGCGAAACGAAAAGGAACGGAACGGAACGAAACGGAACGGAAACGACACACACACACACACACACACACACACACACACACATAAAACATGTTCACGTATGTGAATCGAACAAATAAAAAACGAATTAGGCATTATG
GCTTTTTTTTTCAAATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTATATATGTATATGTATGTATTTTGTATATCTACTTATGCTACGAAGTGCAAATGTTGT---CGTTTGTTATTAACAGTTGTGATATTTGAG-TCAGTTGGCTGCAAGTCTCGCATTTGGGACTTGGGAACAGCTCCAGAGCTGGCGATGTCCCTGGGATAGTTGTGCGAAGAACTGCAG-------AATATATATACATATATGTATATATGTATTTATATACATAG-------TTTCTTATGTAAATCAAAGA---CAAAAATATATAAATAAAAATA
>CG12206 3321893 3322189|3921 chrX 3322175 3322791 scaffold_21 2053682 2054169 - 22056|0 14
GGAAAACGCTACAAA
CTG----GGCGAAGA
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AATGGTCGCGTGAATTCGTTTTGAAACACAATTCTGGACACTTCTGGGCATTTTTAAAATCGATCAAAAATTAAAAACCCTTGAAAAAGAAATTCACTCCTCCATGTAGCAATGGATTGCACTGTATTATAAGTTATC---AATTTCATTATGGTATACTTATACATATATATACATCGATATATATTATACACA-----TCTATTTAGA---------TCGAAAGGAAAACATATATTATAC-----------ATGTATTTAATGTTATTGATGTTGACAATAAAGGAACCCTTACG-AAACGAGTTTTAAACCAAAACGAAAGAGACGCGATATATGGGCGACCTTCTATTACCCGCAAAGAATACGCAGATGGAACACACGC--AGTTTGCAAAAACTTGAAAATGAATAGTAATATATTTACGATAAACAA----TTAAAATCATATTGCTAAAAAAAAAAAAA
AATATATGCGAGTATATATTT----ACACAACTAACCAAAAAAACAAACA---ACAAAAACTATCTAAATTTAAAA--CGTTAAATTCAAAAGCATTTTGTGTATTTGTTAGAGTTATACACAATATAAAAAGTAGCCCGAAATTCCATTTTGAAATATATAAAACTGACAAGATAAATTTAAGCACTAGCCAAACGAGGCCTAGTAAGAGTTCCCTAGTCCAAATAGAAAGATGTCCTGTACCCAAATACTAAATATATATATACATATATATATCAACAAGTCACACATTCATATATAAGCAAGCTTTTCCCTCAGCCTTGATCAATAAAATTGTTAATAAATAATGCAATTTTAGCAAGAGAT-----GAGGGTACAAACTTTAAGTGTGCCAAAAA-TAAAAATCTATCCTAAAATGCCGAC--TAAACAAGAGCTCGAATTCAAAG---TAAAATATTGAGAG
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CGGCTGTGCATAAAAACAGAAAGAGCGCAAAATAAAGACACACACATACACAAAGCGAAATGGTAGACAAAAA----------------TGTACATATGTACAAATACTCTCAACAATTTGTAGTACATCT
>CG10804 3332832 3334506|3948 chrX 3333435 3334039 scaffold_1471 2389 2946 - -107|0 663
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>CG10804 3332832 3334506|3949 chrX 3334091 3334709 scaffold_1471 3034 3612 - 13427|0 467
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AAATGCGGCAGTTGCTGCAATT----GCTGACAATAACGAAACTAAA-----------------------------CAATTATG-----------------------------------TGTAAATATGGACAATAACTAAGCCAAAAGCTCGCTCACCGATGGAAG--TCAGCGTCAATATCGACA----ACTATCTGTATCTCCCATGTATGTTATGTATCTATA------------------TGTTCCCAAAGACTGC-TCGAAAGACAACAACAATGCTAGGAACCCCAATGGCCACAGACAAAAACAACGGTGAACTCAGCGCCTGGTGCGCGGTTTCAGTAACAAAAAATACAAAAAAAAACCAAACAAAAAAAAAAATCAAAATTAATAAAACAAATACTAATAAAAAAACAAAACGACTTAAATCTATAAAATGTTTCCGCATAACTTCATAAATATGTT
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TCCCACACCACAAAGCTTAACGCTTTCGTTATCCTTAAGACCGTGTTTGCTGCTTAAGTCAATCGAGGGAGAATATACCAATATATGTATGTTTTTAGTACATGAACAT
TAGTGTTTGAATAGGCTCACCAC----AGTGTGCTTCATCTAGTGATCGCG----AAATCAACT---------------------TGTCTGTT------------ACCT
>Gas8 3347165 3347668|3960 chrX 3347562 3348974 scaffold_19 1587123 1588566 - 63615|0 115
GACCTGCTGAAGAAAAGTCATATTCACAAGTCGGATTAAGAAAATATATCGAGGC---------GGGGAAGGAATTCAAAACCAGAAGAAACAAAACTTACTCCAGAACAAAAAGA
T-CCGCCTTGGGGCGGATTATATAGATAGTATAGCATGGGCTATACTATATGGGCCACTGGCCAGAGATACCCATGCGAATCCGGAGGCAGTTCAAATTAGCCAAAAACAACAAGA
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TGCTTGCTTTCATTGAGCTGTCAGTCCGTTAGTTTTGCC-TTGTGCGCGTGTGTGTGTACGTGT-CTGTATTCGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT----GTGTGTGTGTGGTGACTG--------------------------------------------------AATTTGGTTTGATGAATTGCTTCCCTGCCAGCAAACGACACACACAT---ACACACGCAGACAC-TTTTTAATGAAATAAAAACTTTTTGGCAAAGTGAATTTTACTGT
>CG32791 3367477 3369158|3972 chrX 3367846 3368199 scaffold_6 2644276 2644570 - -664|0 377
GCTACTTCCAACTGCCTTTTGTTGATTTGTACAACTTTGATTGACACTTGTGAGGTTCCGCGAACAGGGTGTGAGTTTATGATAAATAGACCCAGAACTTTTTTCTAATTTATTTTTTTTTTTGTCAGCAGATTTGTTAATTGTGTTGCTGCTGTACCTTAAAATATAAAGACATTTCTTATTTTGATGCAAATGTTTTACACACAAACTGTGATGCCCTTTAACCCCATCATGCACAGCTTGTAACCCCTTCTTACC--AACTATTTCTTGGTGTTTGCCAAAAGTTTTTCTTTCCTTTTGCTTTATTTC---CCAAGTCTTTGCAGAGGAGT-------------------GTTTTTTTCTTTATTTATTTTATTT
ACAAATTCCAAAT------------TCTATTGAACTTGAGCAAAAACTTCTTGATTTCCTCT--CTAAGTCTTAAAGTATCAGAGATA-------AGGTTTCTATTTATTTATTTCTATTTT--------GATTT-----TTCTATTCCTGC-GAATAATTATATAGGAATACAT------------AGTATATATTCCATAGGCATAGGG---------------------TATATAGCTTGCTAAATTCTTTAACTAGAACTATT------------CTAATATTTTTTTTTTGTTTTTTTTTTAGCTCATTCCGAGTTTG---AGATGCGTTAATGCGCGTCGTGTTTCAGTTTTTGGCTTGATTTACATTTGTT
>CG32791 3367477 3369158|3973 chrX 3368488 3368934 scaffold_8 5149998 5150387 - -958|0 448
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ATTGATTTGTTAAGCA---------------AACAATTTAACGTAATTTATAAAGTTAAAATTGTATCATAATTTATTGCGCAGCAGCAGAAAAGTATGCAACCAAAGTT----GTTCTTTTGAATTTGCTTTACAATTTAAACTTTAATTAAATGCCATTATTTATTTATTG---TTTTGCCAGCCG---------CTCAGTTAAGAAGCTAAGCTATTGTAATATAAA----CAAATTAACTACAAAGTAAAGAAAAGAAAAGAAAAAACATAAATAATA--------GCAAACACACAAAAT--ATGTATTT------AAGATTGACACTAATTGTAAGCAGTTATTA------TTACGCGA--AAATAAGCATAATAAAACTTAGGTTGATTGATACCAAAGCAAAGGGGCGAGTAAACGGGAAATGCAAAGCAGAAAAACCAAA
>CG32791 3367477 3369158|3974 chrX 3368935 3369901 scaffold_19 1602388 1603343 - 19359|0 234
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TACACGCT--------GGCAGCAGTACACTAGGCTAACACACACATACGCAAACAC----ACACATAAAAAAAAGCATGACATGGCT-----------ACCTTCTTCGCATTGCTCACATTTGGATAGGATAAAAAG--GCTTGCGTTGTGTAACTGCATATCTGTACACAAATATAGACACACACACGCAC-------ACACACATGCACACTCAGACGTACAAACATATATAA
>CG2875 3427877 3427978|4090 chrX 3427697 3428133 scaffold_19 1691582 1692120 - 7051|254 384
ATTAGTGTTAC--------TATTGCTAAGTTTAAGCAGGATTAAAGTGC---TGCCTGTTAT----------------TGGGCTG--CTGATGTGCCAATTCGGCCTGAAACCAATCGGCTGCTGAAATGT
---AGTATAACAAAATATATATAATTAAATT--AATATAACAAAAGTGTATGTGCCTGTTATGTGTATACTTCAAAGACGGACTGTATTCCTGGACCGGTTCCGTTTTGAAACAATTGCCTGGTGAAATGC
>Parg 3514445 3514852|4197 chrX 3513962 3514729 scaffold_5 6236280 6237011 - 18844|503 816
GAAATTTTTTTTTTTTTTTTAATTATACTATTC---TAATCTGCAAAGACAATTTTACTGTTAAATTTGTATAACATTGATTGATTAATATAATTTGTTATATCATGCA-----------AATCTAGCTTTTATTATGC-------GAAATTTGTA-----GTTAAAGCCAGTAAAGTTTCTTTTTATTTAACCGAAACCTTTTGTTTATTTTATTTGACCACAACAAGAACATCAACAACAACAACCACGAAAAAAAAAGCGAATATATATTTGTTTGTTCGTATATATATATATATATCTAAGCAGAT---C
GATATTTTTTTCAATTTTGAGATTTGGTTTTTTAGGCAATTCTCGAAGACCAT---AGCGCTAGATC-------CACCAAATGGT--ATGCAGGTTTTCATATGATGTACGCAGATAGAGAATATTTCATTTTTTATACTTCCCCCATATTTTGTACTATTGTTTAATGAAACAATGTTTTTCTGTGGCTAAA---------------ATTTTATTTAACTGCAA-----------------ACACACAAAAAAAAAAGAGTGGAGCTATAT---------CGTGTATATAGTTATATAGGCAATATTATGGGC
>Parg 3514445 3514852|4198 chrX 3514833 3517007 scaffold_5 6238035 6240220 - 57474|0 19
GTGATATTGCACTACAGGAT
CCAATATTCTCCTGTACGCT
>Rala 3550710 3551985|4260 chrX 3550478 3551396 scaffold_1031 114 1088 + 7685|241 1031
AAGCTAACGCTTAAACATAT-TAAATATA-------ATCATCAATCGTAGACAACTAAAGAAGCCCATAATAATTATGCAA-TTTAAAACTTGCTACAGATATTTCTCTTGTTTAATTATATATACGCATACATTTTTTTGTAATATTTTTAAAGTTTAATAGCAAAATGCAAACCA------------CACAAACCAACAAGAAACCACACAGAAAAGCTTTTTATAAATATATCTAAATA-------TATATTTAAATATATATAAAATAGTATAAAACACTTAAAATCCTAGC-----GAAGAAACAACAGA--GGAAAGCGGGGAGAAAGAAAAAACAGAAAAA---CAACAAAT--ATCTCCAATTATTAATTGTAAACGA------------AGTG----AATCGAAACAAATTTTTAATGCAATTTTTGTAATTTTCTAA-----------------ACCGAAAGCAAATGTGTAGGGATTTATAAACAACAACAAAACCAATGAGTAATAATGGTACAC-ACTAATGT---TTCTGACAAG---CTTTGGAGACTTTCCGTTACAA---ATAGTT---------------ATTTTCTTTGCCCTGGAACACATCCAAT-ATATGTATATGTATGTATGTATGTATGTTTAGCAATTACTCCCGATTGATTTGCTTCTTTGTTTACTTTTGTATAACTGCATTCTGTATTGTAATATTTAAGCTATTATTATTATGATAATTATTATTATTATTA-----AATATATAAGTTATATATGCAATC
AAACAAATATATATATATATATAAATACACACATATGTTATCAAAT-TAGCGAGCTAAAGCAACAACAAATAAT---GCAAATTTATAAACATCTGCA---CTTTATTATATACAATTTGATTTAAATAT-CATTTTTATTTGTTGTGTATAAAGT--AATAGCAAAATGTCAAACAATTAATTAAAAACAAATACACACACACACACGTACAGAAAAGCTTTTTATAAATATATATACACACAATTCATATATATATATATATATATATATATATATATAGTTTAAAAATATAATTGTAAAATGCAGCTGCAGGTTGAAAAGAAATAAGAAAAAAACAAAACAAAAAACTCAACAACTCCATCTCTAATCATGATATTAATACAACTAATTAATGAGAGTACTCTAATTAAAGCAAAACTATTATGCGATTTATGTAATTTTCTAACTAGCCACAAAAGAAAAACAAAAAAAAAAAAAAAACAAATAAAAAAAAGAAAATAAAACAAA--AATCTTAATGTTAAATTACAAATATGAATTATGTCAAATAACTTTTGTAACTGTTTGTTTCAAGAAATGGTTTGTTAAAAATCTTCCCTTTTTTTTTGCTTCAACTGCAGCAAATTATAAACTTTATTTTAAAAATATTAATAATT-GCAA--ACTTTCGTTCTAATTTTTTTTTTTTTGTTTCTTGTG-AACTGCATTCTGTATTTTAGGGTTTAAGCTATTATTATGATTATTATTATGATTATAAATATTATTATTATAATGGTAATGCCTACATCT
>Rala 3550710 3551985|4261 chrX 3551762 3551942 scaffold_1031 1427 1607 + 5222|0 186
AACGTCAGACGGACGTGAAACAGCCGCCGAAGCCCAACTCTCATTGCTGCCAACTGCTGTAGGATGATGAAGAACAACAACGGACAACAACCATACGATGAACAACAA-AACAACTGCAGCA-GCAACAAATTGGAAAATAACA----CAACGGCCACACGGATGATAACACCAACACACAGGATAT
AACGTCAGATGGACGTGAAAGAGCCGCCGAAGC---ATTCTCCTTGCTGCCAATTGTTGTA-AACACTCAACTGCGACTA-GAACAACAGCAACACGAC-AACAACAACAACAACAACAACATGGGCCACACGGATAAACAGCAAAAGCAACAGCAACGGACATGGAAACGGAAACAAACAACAAAT
>Rala 3553102 3553108|4263 chrX 3552809 3553617 scaffold_1031 2787 3708 + 12231|351 357
GCATTAG
GCATTAG
>CG33221 3642734 3642818|4382 chrX 3642693 3642935 scaffold_13 2193305 2193536 - 2407|41 129
ACAGCGTATACAAATCTTGACCTAGCTGGTAT----TTATTAGTATATAGAAATCGATAACAATAAAGCGAATAGATCCTTCGAAAAAA
TTAAC-----CAAAAATTTGCCTAAATTGTATTTTATTTTTAGTGCATAA----CAATATTAATAAAAAGATATGCGCTTTTATGACGC
>yin 3708200 3708410|4453 chrX 3708117 3710556 scaffold_58 6951 9540 + 75699|90 346
-TGTCCGATTTTCGTAC----TTAAA---GTCCATACCCATATCGACAGCGTCGCCCGCATTCGCATTTAGTCG-TAGCTAGCCCTTTTATTTAT---TTTATTTGTTCGCATTT------------ATTTATATATGTAGTT--GGCTG------TAAA-----TACGTTCGTTTGTACGAGTATTCTGTAGATGCATTTT---TTACCCA-----ATTGTTTTGTAAATACATTTTATACG-TTTTATTA-CAAA
CTATCCACCTGTCCACCTGTGTTAAATATGTAAGTACGTTTATC----------TCTGCAATACCATTTATTCATTTGCAAACTATTTTAATTGCACACTCAGTCATTTGAATTTCCCACGTAAACCATTTTAATTTCCCGTTCAGACTGATTCCTTAAAATTTCCAATTCAGTCTTGTTGAATTTTCCGCGCAAGCTATTCAAAATACCCATTCAGACTTTTTGAAATTTGCGCGCAAAACGATTTTATTAGCAAC
>CG32776 3740264 3741918|4486 chrX 3739574 3740397 scaffold_4 272614 273527 + -3356|803 939
AAATTTTACAAAATCGAAAATCCAAAATCGAAAAAAAAGGATTAAGCAAGTTATATGCAAATACAAATCGAATCGTATCCGCTTAAAAACAAAATGAAAAA---TGCAGCTAAAATGAAAAAAAAAAAAAACATAAA
AAACAATACAAAAACAAACTTTAGCTAGACAGCAAAAACCACTCAATAA---ATACTCAACTATAAAATCCTCTTCCTCCACAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATACGAAAATAAAAATAACTATAAAAAAAACCCGAA
>CG32776 3740264 3741918|4487 chrX 3740438 3740833 scaffold_31 721041 721464 - -174|0 442
ACTTATGAGGAAGTTTCCAGTTGCATATTCCATAAAAACTACAGGGACAATTTCTGTTTGATTGGCCAACGGACGTTTGCAGATTCAGTGCTATAGTTTATGCACAGATTTT--GATGGCAACTGCGACTCGTCGGGCGATGGCAAGCAATATGAAGT--------TCTGGGCCAACAAATTTCTAGAA-ACTTATA-ATCACTTGAAATGGCATTTAAAAGT------------GTGGTCTAGTTATCCGTGCCCGTGCGACTTGCGGACTGAAAATATATTGTAGACAAACTTTGGAAACATATGTAAGCGATATTAAGCAT--CTAGAAAGTTTTGAACAGGCTAATAGCATAACA------------TTCAAAATAAAAAGCAAAAG---------ACATACCCTTTTACCACGAACCCAACCGGTAGGTGGCGCTGCA
ATCCACGATTGAATTTCCGA---CATGTGTCACCCAAACGCCTGCAGCCCATTTTGGGTGAACAGCAGCTGCGCGATTCC----------CTGTGGCTGCCCCACATCTTTTTGGCCAACGAGCGCGACTCCAGCATCTTGGGTAAGTGTCGTTAAATCTATCAGATCTGAGCCAACAAATTTCTGGAATACTTAGGCACCACGGAGAAGGATATTCTGACATCTGTTTCGCCGGATGGCACGGTCAT-TGTCTCGACGCGCATTAAGGCC--ACGCTCTATTGCTGGCTTAATTTGAAGAAATTTCCATTTGATGAGCAGCACTGCTCCACGGTCTTGGAGAGCTGGAT-GTATAACACATCCGAGCTGGTGCTGCATTGGGAGCAAAAGCGTCCCATCACATACGATCCGGCACTGCATCTGACCG--AGTTTCTGCTGCA
>CG32776 3740264 3741918|4488 chrX 3740868 3742316 scaffold_58 47353 48628 + 29053|0 1104
TGGGTCGCAAGGTGGCCAAGGAAATAGCGTGCAAGTTTATCGAGACGTCCTCGGGACTGGATCACAATGTGGACGAGCTGCTGGTCGGCATTGTGGCCCAGGTGAAACTCAATCCGCAGCGTTTGCGATTGCTAACGGAATTGGAACTGCAGCGCCTGAATCTGCAGAGTACCATCCAGAAGCACCGTGGAATGCACCTGCAGACGCGTCGGATGGTCCGCCAAATGAGCGTTTGCCAGGGCGACGAGGAGATCTTCGATGGCGGATTGCCGGAGGGGCTGCAGAACGGCGAGGCCAACGATGATCCGGACGGAGTGCCTAGCACATCGAAGGC------CAGCCGGT-CGCGGATCGAGAATCCCAACCGCAAGCCCTTAAACCTGGAAAGCATATTGAAGATGGGCGAAAGCGAGGTGGACGAGGATGAGGATGTGGTCAAGTCG-----------------TCGCAG----CTGAGCAAATTCAATATGCTGGCGGCCTCCATACGTCATCGTCGTCCATTCCGCAAGCGTCG---CTCGTTCGACGGCGGCGTTACCACGTCTGCAGCCGCGGATGCAGCCGCCGAACTGCAGC--GGCGCTATCAACTCCGGGCCATGGATG--ATCTGCAGCTGGAGGGACGACTGGCAGGAGCGACGGAGGAGCGGTTCGGGGAGAGAAGTGGACTGGCCGACAGCGATGACGAGGAGGACGGTGAGGAC-ATAGTGA----ACGGAGGACACCGGAATGCCTGCAACCGCAAGGTGGTCAAGAAACTAACCGCCCGCACCAAGGTATTCATCTCGTCGGTGCTGCGCTTCAAGAAGGCCATCAGCCTCAAGCGGCGCAACTCATCCAGCTGCAGTGATCTCTTCGTGATCTAAACGTTTGGCGGCGGCAGCATAGGAAGTAGGAAGCATAGACTGAATGTACAT------AAATGGAGTATAGATGGAGGCGAAGTAGGAGCATAGATATGGAAGCGAAAACGGAAACGC----AACCGAAACCGGAAC----CGGAACCATCCAGACCAGTAGATCCAGAGATCAAAACAAGCACAACGAAACAGCAGCGCAAACCGAAGTGGAGT
TCGGGCGCAAGCTGGCCAAGGAAATTGCCTGCAAATTTATTGAGACCTCCTCGGGACTGGACCATAACGTGGACGAGCTGCTGGTGGGCATTGTGGCCCAGGTGAAGCTCAATCCGCAGCGCATCCGGCTGCTCAGTGACTCGGAACGGCAGCGCCTCAATATGCAGAGCACAATACAGAATCATCGGCACATGCATTTGCCGGCCCGCCGCATGGTGCGCCAGATGAGCATGTGCCGCAGTGGAGATGA------CGACGGCAG------------------------------CGATGAGGATCTGGGCATGGAGCCGAGCACCTCCGCCGCGGCACGCAGCCAGCAAGTGCGCCGGG----CAAACCGACGCGCCCTCAATCTGGAGAACATCCTACGGATGGGCGAGAGCGAGATG---GAGGATGAGGACAGCAGCGACTCGCATCGACCGCGTGCCTCTGGCAGCACACTCAGCAAATTCGAGCAGCTTGCCGCAGGCA------------------TCCGCAAGCGTCGAGCCCGGTCCAACTTCAACGAGAATGGGCCATCCACTTCGGCGGCGGCCG-----CTGCAGCTAGGCGCCACTCGAGCGCAGCTCTCGATGGAGTCCTCGACTACGAGGACGAC-------GACGACGAC----------------------------GTCGACGACGATGATGCTGATGACGATGATGACGATGATGACTCTAACGGGGTCACCGA-----TTGCAACCGGAAGGTGGTCACTAAGCTGACGACTCGGACGCGGATCTTTCTGGCCACCGTGTTGCGCTTCAAGAGG------AACTTGAAGAGGCGCAACTCCTCCAGCTGCAGCAATTTGTTTGTCATCTAAAAGGAGTGAGTGTCCAAC----------TGAGGTATAGACTGATTGTATATTGGGGAAACCAAACCATAGAGCAGGGC--AGCTGGAGCAGATCGGAGGAAACATCGATGAGGCCGTGTCAAATAAAAATCAGAATGTGGCTTAGCCACGCAAATAAGTAAATATGACTTGCAAAAT-------ACTAAATACTAGATTAAGCTAAGCTAGAAT
>CG32776 3742079 3742271|4488 chrX 3740868 3742316 scaffold_58 47353 48628 + 29053|1265 1457
ACGGAGGCCTTCTGCGCCACCTACAACATCGACCTCTTCGTGGTGGTCTACTCTGTGATAGATCGAAACACTTTCGCAGCAGCCGAGCGTGTCCTGCAGTATCTCAAGGAGAACGAGATGCTCTTGTCCCGCGGAGCCATCCTGGTGGCCAACAAAACGGATCTGCAGCGACACCGAGTTGTCACCCGTCAGA
ACTGAGGCTTTCTGCGCCACATACAACATTGATTTGTTTGTGGTGGTCTATTCGGTTGTGGATCGGGGCACCTTCAAGGCAGCCGAAAAGGTGCTGACCTACCTGAAGGAGAACGACATGCTTTTGACTCGCGGCGCCATTCTGGTTGGCAACAAGACGGACCTGGAGCGTCATCGCGAGGTATCGCGCCAAG
>CG32776 3742793 3742884|4491 chrX 3742785 3743046 scaffold_4 2319966 2320232 + 2327|8 99
ATGATGACTACGGACAGAAGACGGTGTCGGTGCTGGTCGATAACATTGAGACGGATTTGGAGATTATTGATCATCCCGCATGCGAGATGTCG
ATGATGAATCTGGCGAAAAAGCCGTATCAGTATTACTCAGCGGCGAGGAGTCCGAATTAATATTCATAGATCATGGATACACCGAGATGACT
>CG32776 3746345 3746499|4494 chrX 3746339 3746452 scaffold_58 56685 56798 + 7363|6 113
TTCCAGCCTACAAAATTGCCATGCTCGGCGCCTCCGGAGTGGGCAAGACCACACTGACTTACCAGTTCACCACTTCCGATTACATATGCGCCTACGACCTGAGTCTCG
TTCCGGCATATAAAATCGCCATGCTAGGCGGATCCGGCGTAGGCAAGACAACGCTAACATATCAGTTCACAACCTCGGACTACATATGCGCCTACGATTTGAGTCTGG
>CG2938 3777393 3777590|4534 chrX 3777556 3777815 scaffold_58 108669 108935 + 1278|0 34
GCACACACATGATATATGTATGTGTATATCGGAAT
GAACAAATACAAGTTAAATAAATAAATAACATAAT
>CG2938 3777901 3778192|4535 chrX 3777859 3780451 scaffold_58 108980 111606 + 125209|50 358
TC----CTGAGCGATTCGCAATCCAATTG-CCGCCCAGGTATTGACCCAAAGTATTCGATAGATAGCATAGCCTATTCGGCAAATATGGAACGAACTTAATTGTTTAACGTCAGGGTGGAACGGTTCTGTATT-TAAGCTTATGACCTTAAAATCCATTTGCCATATCTCGATATTTTTTTAA-AAGATACTTAACTCTAAGGCCATGGGTCAAATATTTGTTTTC----------GTTTTGCCTAAGAAACCCCGGGATCTGGCATTTTTGCTAAGATTCAGACAAGACAATAATTTAATTTGTTAAT
TTGCTGGTCAGGTGTCGGCAATCAAATTGCCCGCCACACCCTTCGCGCAACACGTTC--------GCATACCCTGCTTTAAAAATGGAGAATGCGCATCTTGGT---GCGTCTGTCTGGAGGCTGCCTATGTTCCAGGTTTATG---------TCCCATAATCACAGTTTGAAAGTCACTTAACAACATTTTTTAATCT-----------TCATTTTTTTTCTTTCTGTGAGCAGGGTATTGCGTGGTCGACTACAACGTTTGCGCTTTTTTTTTTGTTGCTTTCCAAA-GGTATTTCAATACACACAC
>lva 3800782 3801111|4565 chrX 3800685 3801511 scaffold_46 206814 207598 + 13274|98 469
CCAATTTC--------CATTTCGCGGCAAG-AACGACCACACGTCCAGAAGCCCGTACTCCTACGACTAGCACTTTAATAACAAATCATTACACTAACTTCGATCCTGGCCTTCCTTGTGCGGACAATGGCAATAGCATTAGAGTTCTTTATACGATATTATGTACCTTGGCT-----------------------------AGCTAAAAAAAAAAGCTCATCCCCTTGGCCGTTCGAGCCGTATTCCCGATTT---GTTCCAAACGCGTACGTTTTATGTTGTAGATATGTAAA-AATTGTATAAAACAAAACGAATTGTGAAACGAAGCTGAAGAAAAACCAGAAAACTTAACTAAAGAGAATTTAAGAA
CCAGCCGCAGCCGTCGCATCCTCCGGCGAGCAACTAGCAGCTCGCCAAGCGTCGCCAGCGTTGCGCCCAGTTGACTGCCGCGAAATAATTA--------TCGATT---------------TAAACAAC-----TAGCATTAGAGTTCT-------ATATTGTGTACCTTGGCTGAATGTAAACAAAGAAAGGCAGAAAAGAAAAACAGAAAAAGAAAAACAACAACAAAATATGATAAAC--TATTCCCGAATTGAGGCTCGCCACGCCCACGTTTTATGTTGTAGATATGTAAACAATTGTAAAAAAAAAAAAAAAAAATAACAAGAAGCATATAAA--------------AACGAACGAAAA--TAATAT
>CG6428 3810663 3811056|4578 chrX 3810662 3812877 scaffold_46 217373 219488 + 88067|1 402
AAATCTCTTCCGAACCATACATACCTCGTTCCTTGTTCCTGCAGCATGAAGAAAAAAACAAACACTGGAGGCTAGGGTTATTTCTTTTG-------TACTTAAGTGTTGCATCTAGTCTAATGGTTCCTTATTATCA-GTTTTGCATAACTCGCATATTAACGATGTTGTCGTGGTAGTTTTTATTATTAAGTGTCGAATCCCTGACCTGTTTTTAAGTAGTCCTTATTTACTAATGTATCCATTGTATGCAATAATATTATTAGCCAAAACCAAAAATTAACCAATCATGTCTAAAATTAAGCATCAGACATATTAAACGGTTGTATAACAAGTTATATACACAAACTAGTATAATTTGTTGTATGAAAATAAATAAAATCAATTTGAAATTAATGCAAAA
CA--------------------------------------GCCGGATGCCTAAAATGCCGGACA--GCAGCCT-------TTCCATTCGGCCGGTTTACTTAAATTT---ACCTCATCTAGCTATCTCTTTCTCTCACATTGTGCGTACCTGG------AGCTGTCTAGTC-CAGTTTTTGTTGTTCCTACATGTGCAA----TAGCTTTTTTTTATGTGCATTTTAT------ATATATTCATCGTGTGT----ATATTTATATTTTAA--CGGGAATT-----CTCATGT---------------ACTCGAAATAAACGGTTATTAATAAAGTGCGATATATATGCCGAT-----------TATCAGTTCGATTACGATCTATTTTCAAATAATGCAAAG
>CG6414 3814235 3814318|4581 chrX 3814230 3815332 scaffold_26 707080 708181 - 37290|5 91
TCGTCCATCAAGTCGTTGTTCAAATTCAATTCACATTTTGTCTCATTCAATTGTTGTATTTCACCACAAATT---ATAAATTTTACT
TTGTT------GTTGTTGTTCCA---------------TGTTTTCTTAATTTTTTTAGTTTTGCAATGTATTTACATAACTTTTATT
>CG6379 3943152 3943410|4790 chrX 3942975 3945888 scaffold_26 902012 904880 - 108604|190 457
GCCAACACAACTTAGCCATAACTATACATTAACTATACATAAGGAT-ACATATGTGAATTTCCTTTTTTTTTTTGTTT-------TTTGTAACTTACCCCGCACGCCTAGGATTCATCGGGAAGTTTTACAACGGATCCCTGCATTTTACTTATTCGACTTAAGTATTCGACGATCCGCATGACCTAAATCATACATACAAA-ATTTATTTCGACCATCACTACGAACTATTATATATTCATAGAACATCATACACACGTATGTGAAA
ACTAG-AAACCTAAGTCA-ATTCAAATGCAAAGCACACATCGGACCGACAATTGGCCAATTACAATTTTAAACGATTTCAACAAATTCGTTTTCTAAGCTGCAGACCGAAAA--------AAAAAACAACAACTAAAACAAATATTACAAATATTTTTTTT-----TTGTAAAATCCGCA-----TCAATTATACATATACATATATAT----------------AATTA-TATATATATATATATTAGCATGCTTGCATCTAGATAA
>CG6121 3960028 3960166|4802 chrX 3959097 3960089 scaffold_26 922224 923219 - 3791|987 1048
TTAATGTTATAAACTAGTTTATATCATACAATATTATATATACTTTTGAGACGACCGGCTAG
TTATAATTATAAATTTTTTTTTTTAATA--GTACTAAAGATATTTATACAATG---------
>CG6121 3960028 3960166|4803 chrX 3960090 3960233 scaffold_31 239495 239635 - -1152|0 86
ATTTCCGCTACCAA---------TATTCTTCATCGGATGATCCTGGCTTCGTTGTAGC-TTGTAGTTTTCATTTACAGTTTCCGTTT
TTTTGCATTGCCAAAATATCGCGTATTGTTGCCGATATGATCATGATGTGAGTGTACTATTGTAG---------ACAA--------T
>Fas2 3979609 3980016|4828 chrX 3978829 3981058 scaffold_26 949313 951624 - 19966|936 1535
GGAGGTTATCCTCCGTGTCC--TGGAACTCCAGAGTCCAACCGCAATGTGCACAAAACGATGAGGAGGGAAACATA--------------------------------------------TATGGAAATA---------------CACATATATG---------------------------TATGATGATCTAGCGA---GAACAAG---------------------CCAAAGCCAAAGCTGGGGGAAGAGCACT-TGAATATCGATCG---ATTGGCACACTAAGTTGGTTTT-------AATTTACTTTCGTACACAGCGTAAATCTT-ACTAAATGTCTTACTATAACGCATACGATATCTTAACAACATCTAACT----TCTAAAACATAGCACATTAAGCTCG-----------------------------------------------------------AAAAACCAGCAAGCAAGCATACGAAGAAGTAAGAAATA-----ATAACTCAATGTCGCTTCATTTTCTAGTTTAAACAAGTATTTTATATCGCTGCATTTGCTTTGTTTTTCCTTAGTCCAAAAAAAAAAA
G---------CGACGCAACCAAGGGAGCTGCAA----CAAAAACGACGTGCACAAAACTTGCAACAGAGAAAAGTATTGAAAAGTCGCCCAAACACAAACCCTCACACTTTCGCAAATAGTAGAGAAAGAACCGCAGCACCAAACCACAAACATGACTAACCCAATTACCTGTCTACCCACAAATGCCGAATAAACGACACGAACAAGTTGCGAATTACAGCAGCAAAACCAAAGCCAAAGCTGTGGGAACAGCGTTAAGAATACTGTTTTTTCATTGGCATA-TGAGTTGGTGTTCAGTTAAAATTTAAGTTC-TATAC------AATCTTAACTAAATGTCTTACTATA---TATACGATATCTAAAGCATACATAAATAATATTTTAAGCTCAGTACAACATACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACATACACATGCACACACACAAAATACACTCATATGTCCATGTTGCTTCACTTTGTATTT-------------------GCTGCA-TTGCTTTTTTTTT--TTGATT------------
>Fas2 3984290 3984441|4833 chrX 3983944 3984841 scaffold_26 956524 957535 - 8951|383 548
ACGACCTTACCTGCCGATGCTTC------TGCTTCCAGCCATCATGAAGCAGTGTTTGGAGGATCCTCCCGCTGACAAATTATCAT---GGGTTTCTTTCTCTTGT----TTCCGTTTTGGTGTGTCAATGTGTAAATAATAAGAAAACTA-AATGAAAAAAACAC
GCGCTTGTAACAAGCAGTACACCAAGCAGTGCACGGAACAACCGGAGGATGATGCTTCAAG---CCTACCGCTGCAAAATTTTCGTTTCGTTTTGTTTTATTTTATGTTATTTTATTTTTGTTCATCAATCTGTCGACAATTTGTATATAATAATAAGGAAAATAC
>Fas2 3986761 3986780|4836 chrX 3986129 3987216 scaffold_726 1629 2724 + 29929|723 742
AAAATCAAAAAAAAAAAAAA
-----------AAGGCAAAA
>Femcoat 4087203 4087293|4954 chrX 4086914 4088523 scaffold_26 1117196 1118560 - 12352|289 379
ACCAAGAACCCGGCTAATTGGCTCGGATGGATGGATGGACGTATATTTATTTATTGCATTTTCTCTGCCTGTCACATCGACGTGTCTGTCT
---------------GAGTGGATGGCGTGGAGAGTGGGGC-----TGTGCATAGAGAGTGGGCCTCGCATGTTGCATAATTACATA-----
>CG15576 4097112 4097503|4963 chrX 4097005 4097213 scaffold_26 1129779 1130028 - 5631|147 252
AAAATTGATGGGCTTTGGAATTGGAGGACATGCCGAGCCC----CGGACGCATATAATAATTTCCTGTTCAATGAGCAATTATCGTAATAAAGATACAATTCCGCT
AAAACTGGCTGGCGGCGAA--CGGAGCGGACGGCGAGCGCAGAGCGCACGCATATAATAATTTCCTGTTCAATGAGCAATTACCGTAATAAAGATACATCTCGGCT
>CG15576 4097112 4097503|4964 chrX 4097494 4097909 scaffold_26 1130495 1130915 - 2342|0 9
GATCTGTACC
CACTAGCACC
>mRpL33 4166990 4167054|5061 chrX 4167050 4167467 scaffold_26 1236094 1236527 - 13982|0 4
GATAA
GGTAA
>rb 4380866 4381880|5400 chrX 4380958 4381132 scaffold_26 72717 72905 - 4143|0 192
ATCCATCCTACTTAGCTAGGCGTGTGTGTA-ATGTGTGTATGAGTAATCGAAAC-------------GTATTTGTAAAGTGTTTGATGTTGTAAATCTGTTGCCTT--CGTGCTCTATGCGGCCTTCTTCAAAACGTAGCAAAGACAAACGAATATCGAATCTATATAT-TATATAT-TATATTCATACAATA
ATTCGTACTATTAAGTCATATATATTTATATATATATATATAAATATGTGTAACTATGTGTGCGTGTGTATGTGTGT-GTTTTTGATGTTGTAACTCTGTTGCCTTTGTGTGCTCTATGCGGCCTTTTTCAAACTCTCTAACAGAACTATATATAT---ATATATAGATATATATATATATATATAAACCATA
>rb 4380866 4381880|5401 chrX 4381355 4381525 scaffold_32 297405 297564 + 3530|0 171
GAATGAAAAGTGATGCAAACTATTGTGTAAATGCTACAAAACTATATTTATTGTTATACACATTCGCAAATTCTTAATGAAACTTATTGAAATGGGAAACACACAACTTCCTATATATTTGTATCCGCTTATACTGAGATATTTTGCATAAA-AGAGTCACCATTTCCTTTT
GAAAGAAAAGTAATCTAACACAAAGCTTAAATGCTTAAAATCGATATTTATCGGTGCGTGCTATCGATAATTTTAAATAAACCTAAGCTACGTGGG---CATACAATAGCCTATGCCTCCAAAT---------TTGAGGTCTCTTACATAAATAGACTCACCAATTATTCTT
>rb 4380866 4381880|5402 chrX 4381872 4382670 scaffold_26 73311 74106 - 42614|0 8
GCGATGGAC
GAGTTGGAC
>Usf 4391757 4392618|5414 chrX 4391781 4392080 scaffold_26 634215 634518 + 9871|0 309
TATCCCCACCAATAAA---CAGGCTGCGCGACTGTCTA-AGGGAGACGGATAGCCTAAGGGCCAGCAACCA-GGCGCTGCGC--GAGGAACTTGATCG-CCTGAAGCGTCAGCAGCAG--CTCCAGGAACGCTTCCACACGGCCGGCGGAAGATCGACGTTTAATGTTACCCTAAATTCGCTGAACAGTTCCGCGACCAGTGATCTATTCGAGGGAATCGATACGACACCCAATCTGGCCGCCGTCTCGTCGCTGGGATTCGGCAAGCGTGGCCTGCTGATCAGCGATTTTGATGAGTAAACAAAATCTG
TATCCATATTAATATTATTTAGCTTGCGCGACTGCCTGCAGGGAGGCGGAGAGTCTGCGTCTGACCAATCAAGGCGCTGCGCCGAATGAATTGGAGAAACCTAAAGCAGCAACAGGGAGCCTGCAGGAGCGTTTCAATACCGCTGGCGGCT------CATTCAATGTAACGCTTAATTCCCTGAACAGCTCAGCTACTAGTGACCTCTTCGATGGCATCGATGCGGCACCAAATCTCTCAACGGTCTCATCGATAAACTTCACCAAACGGGGCCTCATGATTACCGACTACGATGAGTAAACGTAATATG
>Usf 4391757 4392618|5415 chrX 4392600 4393671 scaffold_26 634579 635614 + 15367|0 24
GTGGA------GACGGGTTTGTAGG
GTATAGGATAGGGCGGGGCTATAAG
>CG11436 4395122 4395646|5416 chrX 4393930 4397050 scaffold_36 580173 583447 - 93761|1282 1954
TAATGATTGCCATTACAAACAGATGGACTGGCACATTCCCTTCACAAAGCAACCAAATATTTTTGGTCACAAAATAGCTTGTACG------------ATTAATCTGTTCTTAATTAGTATTTAGGTATGTGTGCAAGAGACGTGTGCG---------------------AGTGTGTGT-------GTGTGTGTGTATAGGATAAGTTTTCAGGTATAGTTTTA--------TCAGGCTTTATACAC-------------------------------------------GGAAATGTTCGAAAGGAGGAGGTTC----------------TTTCGATGCATAATACAGCATCGT-----------------TATGTCACTTTAATTAATAATAT-CTTTTAATGAATATTTAAACAACGACTTTTTCACATTCGATAAGAAATAAGCTTTGAATTGTATTCAACTAAGAACTCTTTTGTTTATTTCTGTTTTCAGACAGCTTATTTTTATATTTGTTATATTATGTTTTATATTTGTCCAAAACCTCCT------ACCTCGAATTTCCCAAAAAAAT--ATCATTAAGATCGCGTATTTATATTTACCACTAGTTTTACATTCAG-------------TTATG--TTATCTTAATGCAAAAAAAAAAGGAAAT
------------------------GAGCTCAAATATGCATTCCCAAAAGCA---AAACATTTCGGGTCACAAATTACCTTTTAAATTGTTTCTTTATTTTATTTTTTTTTTAATTATAATTAATGTTTTTTTTTTAACTATATGTACATATAATTAATTAGTCATTAATAATTAGTCTTAATTCAGTTGATGTTTTGTTTCTAAGCCTTTGGCATTAGCTTTAAATAGCATTTAGTTTTTACACAAAGTTGAGCTAAGGATAACTTTTGCCCAAATCCCTGCTCAATGGAGGAATGCCCAAGGTTAGGGTATTCTCGAAACTAAAACAATTTTCGATATTTAAGCAATAATCGTATACACTCTACCAAAAATATAATAATATAA-TAATAATATACTCTTAAAG----CTAAAACTAAAACATTTTCATATTT--------ACAAACTTTCTTTTGTTTTT--TTTATAAATATTTTGTTTTTAATTGTTTGGAGA------ATTCAAGTACTTTTTGAATTGTATTCAAAATTGATTCG----TTCATTTAAGAACCTAGATTATTATCAATTAATTAATTATTAATAT----TATATACAGTGAAATCTCGTCTAACGTAAAGTTTGTCGAATAGTTTATGGTTCATTTTTACGC--------ATGAAATT
>CG11444 4398349 4398571|5417 chrX 4397279 4398395 scaffold_26 230597 231701 + 47314|1097 1143
AACTGCAATTAACATAAATAAACCAACTAATTGTAAAAACAGAGAAA
AATTGCAAAGCTTATCCATATAGAAACTTATTGTAATTGCCGAGCGA
>CG11444 4398349 4398571|5418 chrX 4398566 4398715 scaffold_26 232930 233079 + 8303|0 5
ATAATC
TTAACC
>CG12184 4472617 4472909|5537 chrX 4472408 4472846 scaffold_22 771797 772249 + -1688|222 473
AGTTTTAGTTTTTCATTATTATGCTTTTGCCACTGCCAAGCTTTGTTATTT----TTCTATATATTTTAATCGATCACAATTGTTTAAGTCCAGTCCATACGTAATGTTAAAATTTAATGTAGCCGGCCAATTAACTTTAAACATAGAA-------AATTATGTTGATCTAGCATTTGACTAAATTTGTAATGTTTTT---AAAAGAAATAAATTGAGAACGGGTCGACGATCGATTT--------AAATCT
ATTTTTTTTTTTGTTTTCGTATTTTATTGCTGTTGTTTGATTTAATTATTTAATTTTTTGGGTATG-----CGATTAAATTATTTTAAATTGAATTAATTTGGA--GTAAAAATTTGAA--AGCATTCTAATTATTTAGAAATTTATTGTCCTTGTAAACATTTCAATAGTTAATGTTAATAGATTTTTT-TGTTTTTCTGAGAAGGATTTTTTTTACATCAATACGCACATTGAAATTTGCTAATAGTTTT
>CG12179 4476289 4477038|5541 chrX 4476547 4477207 scaffold_46 368108 368748 - 5371|0 523
ACACCCATTCAACCCGATTTGTCCATATA---TTTAAAATCTCATAAATTCCTAAA--TCCCATTTATCCAAACAGCGCCTCAAAAGTCGCGTGGCCAGCGGACAGATATCCCTGAATCACAGCATGGCAATCATGTAGAGAAGATCGAATCAGGATTTTTCCACAGCCACCGAAATGACAC--CCACCAGTTATAGTTTTTCATTATTATGCTATTGCCAGTGCTAGGCTTTGTATTTTTCTATAGCTTTTAATTGAT------CACAATTGTTTAAATCCCGAAGCACG--TATGGTTTAGTCC-ATACGTA-ATGTTTAAATTTAATGTAGACGGCCAGTTAACTCCAAACATAGAAAACTATGTTGATTTAGCATTTGACTAAATTTGTAATGTTTTTAAAAGAAATAAATTGAGCACGGGTT-----GACGATCGATATATATTATATATTATATTTTTATTGATATTTT--------ATTGATTATCATCTCAATATG--TACTTTAGGAAAATGTAA
CCACCCAGC-------AGTGTCCCATACAGATTGTTAAATCTCTTAACTAAACGAACTTTTCACTTTTC----TAGCGTCTGCAGCGTCGCGTGCGCCGTGGCAAGCTCTCGCTCAACCACAGTCGCACCGTCATCTAGTGGAG-------CGAGGCGTCGCGGCAGCTCAACAAGTGCCACTTCAACATGTTCTATATATATATATATATATATGTATCACAAGCATGGATCGAATGTTTGGACAGTTATTAACTGGTTTTACGCATGCCAATGTAGGCTCCAACTCAAATCTATTTTCTAGCCCTATATATATACATCTATATTTTTTTTTGCTGTTTTGTCAACTT-----------ATCTATTT---ATTAGCATTTTAC---------ACTGTTTGACCAATAAATGATT---GCATTTGTCATTTAAGAGATCGTTAAAAA--ATCAATGATAATTATCTTGATTCTTTAAAGTTCAACTGAAAAACAATTTAAAATGCTTTGTTTATAAAACTATAA
>CG3062 4486504 4486604|5550 chrX 4485191 4486519 scaffold_46 225358 226732 - 44585|1411 1426
ATTGCACTCAACACAA
ACTGCACAGAGAACAT
>HLH4C 4490364 4491100|5560 chrX 4490323 4490435 scaffold_46 232363 232473 - 2661|41 113
TTTTTTGTCTAGCCTTTAAGTCGTGATATTTGTTTATACTCAAA-CGATTAATATATACAGCATTGTAATCGC
TTTTTTGAATAGCATCTAATACGTGATATTTGTTTATATCCAAGTCCAAGAATAAATCGATTATTTATATAAA
>HLH4C 4490364 4491100|5561 chrX 4490436 4490836 scaffold_5 5343742 5344217 + -38|0 500
CGATTTGCTAACCTATTTAACCTATGGTTAAATACATACATTTTTTTGTTTTTTGTTTTTTTTTTTCCTTGC----CACTGTTGAAAGACAAATGCCCGTCGTTTCGTTTCGATTCGTTTTTTTTTTTAGGCTTA---------GGTTTGTTTTCGTAGAAACAATTGT----------AAAGCCACGATTTAACCT--AAGGTTAAAATATGCCCGT---------------------------ACTAAA--TGTAGAA--------GATATAAGCTATTAG----------------TTTGTGTAATTTAA-----TTGAAAAGTAGA----------------AATATCGAAGGAAATAACAAAACTAAATATGCCAGTAGT-ACATACAATTAAATTTATGGGAAAGCAGTGCTTAATCCTCGGAGTAAACCTTGATCATGGTTTATATAATATAAATAACCAAGAAAAAAAAAACAGAACCTTAAACTAAGATCCA
CGATTTGTTTGTCCCCTATATCTATATATACATACGTACTTGCTTCTGTTTGTTTTTTTTTTTTTTTTTTGTATTATTCTTCTGA----------CCCTTTGTTCTCTATTTAAATAATTGTTAATGCAGAATTAATTATAATGAGCTAGCATTAAAATATACAATTGTTTCTTTGTGCAAAATAACTTCTTTTCTTACAATATAAAAATATGCCTTTTTGTGTTCGTTAGTTACTTTTGAATAAGCGAAACTTGTAGAAACTCAGCCGATAAATGATAATAGAGAGCCGTTAACAGGATGTGAGCAGTTAAAAGAACCCCAAAAACCGATCAACGATAACCGATTAATAGATAAACATATGAAAAATCGAAATAACTATGCAGTGAAATACAATAAAAC-----AGAAATTGGT--TTCATCGGCGTATAAAACAAGCAATATGTACTATGGAATATAAAT--------AAAACAAAACACCCCCTATAACTAAATATGT
>HLH4C 4490364 4491100|5562 chrX 4491064 4491645 scaffold_46 232582 233180 - 32682|0 36
GATAGCGCCGGCGCCTCCAGTTTCGCCACCAGCTGCC
GACGCCGCCAACGCCTCCAGCT--GCAGCCAGTTGCC
>torp4a 4493827 4493921|5565 chrX 4492878 4494929 scaffold_46 235308 237311 - 54959|980 1118
GAAAGGACCGACCGACTCCAC-----------------------------------------ATTTTAA--TGCTTAGTT-TGGGTTTCGGTTTGTATTTAAAAAACTATTTTTTCGGAATAAAGAAAACAAATTTTAA
GCTGAGAGCACCTTAATCTGCCGCAGTCATCCGTGTGATAAGCTCTCATTGGGCCTTATATACTTTTAATTTGTTTAATTATGTATATATATATATATGCACAATTCTATTTTAT-------ATTAAAACTGAATGAAT
>CG3009 4503389 4504562|5573 chrX 4503325 4503781 scaffold_26 1497361 1497871 - 8455|86 517
TCGATTAGAGCCGGATACAATCAAACGGAACAGGAGGCCATCTGCGCCCAGTGGCAGTATCAGCCGTCGGAGAAGTATGTGCCCAGCCAGCCGAGAACCTCAT---------CCTAAATGGGCAACGTTGA-----------CGACCTGGACCAGCTGATGGACTCATGGAATCGGTT----ACAAATCTACACGGCATTAGCTTATCGCCTAGCTATAGTTATCCTCGATTGCAATTCTTAAACCTGAACGAAAGCCAAAGATCAAAACAGTCGCTCGAAACTAGATGGGGAAAATATATATACACATATATATTTTCATATATTGAATGCATACAAAACAGATCTATATAAATGTATATATATGTATACACACAAAAAC---GTACATATAAA----TAAATATATTTACCA-----TGACA---ATAAA
TCACCCAGAGCCGGCTACAATCAGACGGAGCAGGAGGCCATCTGCGCCCAGTGGCAGTATCAGCCCTCGGAGAAGTATGTGCCCAGCCAGCCGCGCACCTCGTAGATGTCGCCATAGCTGACCGACCTGCAAGTCTACAAATCTACCAAGCAAAGCAATTTGGCTATAGCAATCAGTTTAACCCGAATCCCAATGCAAGCAGCTGTTTACCTGACAAAAAAAA---AAAAAACCAAAACCTAAAACAAAACAGAAACCGGTGCCAAAAAAAATGGGCTAAAGTGAAGCCGCAGCGCTGAGCGCAGAAA-ATATATTTTCATATAATAAAAACATACAATATA-CTATATATATATATATATATATATATATATCCAGGATCTGAGTGCGAATAAAACTTCAAGCTTACTTATCAGAAGTTGGCATATTTAAA
>rap 4512519 4513229|5579 chrX 4512535 4512991 scaffold_26 1507125 1507569 - 1464|0 483
GACCCCA----CAGCAGCAATAGATTAAATAAATTTAAGTTAAGCAATCTGTATAGAACGGTAATTAGCAACATTTACGTAGGTAAACACATGCAATTTATGAAGGAATAACATCAAGAGAGATGGCTG--------------AAACAAGAACTGAAAATGAAACTAAGTCTATGGAAATTGTAAGTAATTGGAAAATCAACAACACCACACTCACACACTATCTTTAATCGACATTTTTTGTTGCTGCTTTTTTAAATGTATTGTTTTTTTTTTGTGGTACACCTACACTACACCTAAGAAAATTGGATACCCCTACAT------ATACATTTATACGTTTA---TATATATATATTTTTTTGCTAGCCTCTAAGTAACTAACTTTATTTCAAGCAAACATTTATACACATATTTCGCTCACTAGAAACACTCATACCCCCGAAAACACAATGTATATTAAATAAACTTATACAATTTCAAAA
GACTCCGGATGCATCCGGAATACCTACAATAAGTCCAAAATATTGTTTATATTTAAGTATGTAACTA-TAGCGTTTATTTAG--------ACGCACTGCATTAAGTAATTCGGTACATTGATGTAATTGTACTTCTAATCCAAGAACCAGAACTGAAAAACGGTTTAAGT-TAAGCCAAATGCTAAAAATCCTAAACTTAAC-------TAATTGAAATCTATATATACTATATGCTATACATACATACATGTATACATACCGATTTTTTTTCTCTTTGTATACTAAAA--------AAAAAAAAAAAATAACCCAAACTTAATCAATTTTTTTTTGTGCTTAGCTTGTAAGCATTTATTATTTGCAATTGCAATATTATTATATTTGTTT----------TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGTAACACACACACGTACACGC---AACACA-TGTATATTAAATAAATTTATACAATTTCAAAA
>rap 4512519 4513229|5580 chrX 4513047 4513164 scaffold_26 1507640 1507753 - 2643|0 121
CAAAACAAAACAAAGCAAAGTATAATATAAATAAAATGGATACTTGAAACCGAAAAACAAAGCCAACCAA---CCAATCAGCAAAA-ACCAAGCTGAAGCTAACAAACTAATCGAGCCTATA
CAAAGCAAAAGAAAAAAAAGAAAAAGAAAAAGAAAAAA--------AAAACGAACAACAAATACAACAAAATTTTAGTCAGTGCAGCGCTAAACCATATTTAAAAGAATAATCAAGCTTATA
>rap 4512519 4513229|5581 chrX 4513171 4513922 scaffold_26 1508033 1508769 - 50048|0 58
GGACAATAACTCCAAGCGAGCGAAGACTGAGCGAGCGCCAAAGGCAAACACAACACAAC
ATTTGATGGCGACATCCG----------------GCTACAGATGGGGGCACGCCCCAAC
>Pp2C1 4525637 4525868|5603 chrX 4524887 4526821 scaffold_5 3081013 3083060 + 11275|786 1106
GCTAGATTGTAACGAAACATGCGAGCAAC-------------------------------TTGCAAGTACAAATCCTAA---GCAACGGAAAATTTTAGATCCTAGTATACTACTTTACTGAAAAC-----GCAAAATTGCATAATT---TAACCAATTT---TTTTATGTGCACA-ACACACACACACACACA--------------CACATCTTTTAAATGTATATATAAAAAA------------CTGTATAAGC---------------CGCCGCATAAAAAAAAATATATATATTGATATATATACATTTA--TAC
GTTGAGTAAAAGTGAAGAGAGTAAATAATTAGTGAGTGGCGCTGCCAATGCGTTTCAAAATTACAAGTACAAATGCTAAAATGAAACCTAAATAATTAGTTAGAAG-ATGTGAC-AAAGTGAAAGTAATTGGTAAAATTATGTTACTTTGTAACAAACCGAAATTGTAGGTGCACACACACACACACACACACACAGACGACACATCGCACATACTTAGATGTTGTACATAACAAACAAATACTTAAGCTATATAAACACATGCATATACATACACAACATTTACACATATGTATACATGGATATATATATATATATTTAT
>Bteb2 4615793 4615818|5728 chrX 4615325 4616797 scaffold_5 3378724 3380163 - 30682|499 524
CCACATTCCAAGGACACGATGGATGA
---------------ACGCTAATTGG
>SIP3 4805163 4805273|5963 chrX 4805036 4805348 scaffold_2174 193 583 - 2060|171 326
CAATTTCAAGGGCACATAGAGA---AAGCACATTATCAT-------------TAGGAAATAAAATAGGAAAATCATTAAGTTATAATAAGAG-------CAAAGAA----------------------AAATAAATACAAAAATGTAAAATGCAAA
AAATT----GGGAATATAAAAAGAAAAGCAAACAACCACAAAAGGCTGCGAACAAAAAATGGTATGGGGGAGAGAGAGAGCGAGAGCGAGAGAGAGAGACAGAGAACAATGGCGGCGGGCTACTAATAAAATAAACGAAAAGCTTTTGTAAGCAAA
>CG32767 4919871 4922373|6143 chrX 4919588 4920040 scaffold_28 1495836 1496317 - -1982|308 508
GGGGAATCGGATACAAT-------------------------AAAGAAGGAGAAAAAGAATCCA--CATAACAAAAACTTCTATCAAAGCA--TTTAATGTTAACAACATAATTGAATAAAATCTATATAAATTAA--TTAATTAAATTATAAATGTATAACAAACAAGTTAGCCAACAATTGTAAAACGTAGCTGAAAAA
TATTATTAATTTCTAATTTATGCATTTCTTTTGTAAGCCACAAAAATAAACGAAAAATAATCCATTTATATTTATATATTTTTTCGTTTTAATTTTTTTATAAGCTACAAAATTG-ATCATTTTTGTATAATTTTGCCTTAAAGTAATACTCAAAACAAAACAAAAAAATAACCGAA-----ACAAAAAGAAATACAAAAT
>CG32767 4919871 4922373|6144 chrX 4920041 4920485 scaffold_36 1159229 1159655 - 5566|0 489
CTTTCTCACCTTCGCTCGAACACCTTGTGGTTTCCTTAATTAGTTGCTAAGTATCCACG--------------ATAAACACACGAATACATTAAACACCCACACG---------------ATACTTGATTATGATTTGCAT-----TACTAT-ATACTATAGATAATCTGTAGCTAAGTGTAA--GCCTAATTTCAGTGTAGTCTTTAAGCTGAAAGAGCATGCTTTAGCTTTAGCTTTACCCTAACATACGAAACTGCATAAGCATACGAATATATA-ATATAT---TATATATAGCCGCTGTACAATTACTTGATCTTTAGCATTA-ACACTTGAAATCTTTTAATTTGCATTTACATCAACAAT---TGTTTGTGTATATTCTTTTCGTTGGTTTTTTTTGTCGAAAATTAAAAAATATATATATATATAGCCATCAAATATATATATATATATATAGATATAGATATAGATGATATATATCTGGAT
CTTTAAAACTTAAAATTGAAATTATTGTGGTTTCCTTAATTAGCTGCTAAGTTTTAATTTTAATTAATTTCGCATAAACACACACACACAT---ACACCTACATATACATATATACACACATATTTATATGCTACTTATATATGTCTAATATAATATTATATGTAGAGCG-AGTTATATTTAAGCGCCTATTTTTTTCATAGTC-ATAAGCT-CGAGAGCATGCTTTA----TATATACACACCCACACGCGCACACACACACACACACATATATATATATATATATATATATATAGC----------TTATATAATATTTATAGCTACGTTCTTGA----TTTTAACATATA-TAATACCTACAATATATGTTTATATATAT-----------------------------------ATATATATATATATATATAT---ATATGTATGTATGTATATAGAAATATATACAAATTGATTTTCTTTGCAT
>CG32767 4919871 4922373|6145 chrX 4920627 4921069 scaffold_28 1496954 1497431 - 1231|0 503
TTTATTATAAGTTTTAATTTTTACATATCATTTATTCTTATTGTGTACTCAAATATCTGTTTTAAATTTCCGCATGGCCCAGCAGCACATTGTATTTT--CTATTGCGAACCCTAATTTTAGTTGTATAGTTTTGCATTTGATCTCTC-------GGCTTTAGTTTTTGCATTCAAAGCGAAAGAAAATTCAGTTCCTGTGTAATTGCAAAGATAACTT-----------------GAGAAATTGTATTATAATTTAATGGACTAGGCAATCAATGTGCTGCTTTCATGCGGAAAGATATGCATATATGTATG-----AACCATATCTTTCTGTCACTCGAGGATCCTACAGTATTGGCTCCAAAAACCTAATCAAAACAAAAAAAAAAAGATACAAATAAGTGAAAACCGCTTTAATTATG------------------------------CTTTTCGTTGTTTATTTTTTTTTTTACTTTTGATTAACACTTTGTTTTCAAT
TTTGTGACATTTTTGAAAGTTTTCTTAT--TTTACTTGTGTTGTGTA---ACAAATTTGTATTGCACTTGC---------AGCAATAAATTGTTGTTCGCCTGTTTTTTTTTTTATTTTTTTTTTTTTTGGTTTTTGCATTATTTCATAATCAAAGCCTTTAGCCTTTGCAGACACGCC-------CACTCAGCACAGCTGTAATT---AACAGAACTTTTGCCATATATGAGAAGGAAACACAAAACAAAAAATAAAAACACTATGAAAT-ATTCAACTATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAGATATATATTTTTTGTATTCGAAATTCCTA-ATTGTTGTAGCAGCAAATTTAATTTAATGACAAACAAATCTATGTTAAATTGTATTATTATTATTAATTATGAATTAATTATTGTATTATTTCTTGTCCTAGTATTTTGTAGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGTTTGTATAATTTAGTTTTTAAG
>CG32767 4919871 4922373|6146 chrX 4921329 4921495 scaffold_36 1160703 1160863 - 5709|0 168
ATATTTATACATATATATTGCTTATATATACAGA-ACACATACTTATCC-TATATGTCCACCATATAGACAATTTGCTATCTCTGTTGCGCTCGTGATGATCTTATAACGTGATCTTAAGTCTAAATCAATGTGTAAAATGTAATGTTTGTTTATTTTTTTTTTTGTTT
ATATATACACGTATCTAATATATATATATATATATGCATATGCATATATGTATATGTATAT-GTATAG-TAATTTGCTATCTCTGTCGCGCTCGTGA-----TCTTAACGTGATCTTAAA-CTAAATCAATGTGTAAAACGTATTTGTAACTGTATTTTGTAGTTGTTT
>CG32767 4919871 4922373|6147 chrX 4921621 4921887 scaffold_105 28599 28810 - -321|0 266
AGGCATCAGGAAAATATTAAAACTTTATGGGGGCAAACGAAATTGTAATTATGTAACAGGTTTTTGCAATGCGCTTTAAAAACATAGATTCTTAGGAAAATTAGTTGTGAGTGATTTATCAGCTGGTTTTAAAATATCTGGTATTCGAAGGAAAAGAATGTAATTTTTTTTTTTTGTAAATCTCCAAATTATAGTTCTAAGCTGACATTTTGGACCTTCCCAAAGGAAAGAAAAAGTTTGGGTGGTTTTTTTTTTTTTTTGATTAAG
AGCCATCAGCAAATGAGATCAAGTTCAATGACACCAATTAAATTTTAATTATACAAA-------TGAGATATTTTATAAAATGATA----------AAAACCA-------------------------TTAAAATA---AATATAAAAAAAAAACGTAAATATATATATAGATATATATATATATATATTA-ATTTATATATTAATATATTAGAGATGC---------AAAAAGACTTGAACCAGTTATATATACATTTAAATTGAA
>CG32767 4919871 4922373|6148 chrX 4922288 4923275 scaffold_36 1161071 1162218 - 52467|0 86
GTGCAGGCAGCA-GCCGCTGCCGTTGTGGTGGATCATCATCGTCATGGTCATTGTCATTGGAAACGGAGGAGGCATCCGCGTCATCA
GT-CGAACGGCATGACGCGGCCATCTTCACATGTCTACGCCAACA-----AACGGGAGCAGCAGCTGGGGATGCACCTGCAGCAACA
>CG5062 5025418 5025607|6310 chrX 5025329 5026728 scaffold_37 1154501 1156007 + 26161|95 341
ATAGTTATATTTT------------------CTAAAAATCCATCCA--------TAGACAGACAGC-ATCAAACACGCGCACACACTCACTCCCACACACACACACACACACACACA-------CAGACACACACATGAACTCAAGTTGACAATGGCATAGATGATGACTTTTCGAGCTTGGCGGAATTAAAACTTGCAGCACA--------------------TATAAAATGTACATA---ATGTA
ATGTTTCCATTGTTGTGGGGTGTTATTGTAGTTGAGATTTGATTTGATTGTTGCTGGAGTGGCAGCTCTTAAACACATGCTCCCCATCAAGCACACACTCACACACACGCACACGCAGCGATGGCAGCGGCACGTATGCATACACACACGCACACACACA------------CCAGGCTGCGCGGCATTAAAACTTGAAGCATACTTTGCGGCGACTTTTCATTTTTCACATATATATATATATATA
>CG3323 5148220 5148455|6506 chrX 5147592 5148331 scaffold_66 162288 163042 + 5277|731 844
ATAACCGGATTCGGTGTTTGATTTCAC--ATTATTTTTCGAATTTATTGTTTTCTTACTCGGGCCCAAGCGAAGCCACGTCAAAGTTAATAAAATTTCATGTGTATTGCAAACC
ATAACCG-ATTCG---TTTAATTAAACTAATTATATGGAATATTTATTAAGCACTTAACCGTTTCGGTGCAAAACCAAATTTGTGTTTAAGCAACCCAA---------CAAACT
>CG3323 5148220 5148455|6507 chrX 5148442 5150225 scaffold_66 163938 165672 + 18200|0 15
GCTAC--ACAACCATC
GGCACAGACGACCAGC
>CG17764 5151498 5151630|6510 chrX 5151614 5152442 scaffold_66 170861 171563 + 9222|0 16
GTAAGGCTTGCGGTGAC
AAATAGAATGTGGCGAC
>TrxT 5156431 5156474|6513 chrX 5156405 5156958 scaffold_66 176008 176578 + 16291|26 71
GCAAAAGTACCATTACACTCCGAACATAACG--ACAACATATGTAT
TTGAATA-ACCTGTATTTAACTAAGAAAGCGGAAAAACTCATGCAA
>Rnp4F 5164159 5164372|6519 chrX 5164364 5166753 scaffold_66 188710 191033 + 25915|0 8
GCGACAAAT
GCTAAACAT
>CG3252 5250469 5250750|6627 chrX 5250362 5250712 scaffold_1 781939 782309 - -950|117 392
TCGTGGGGATATCAGAGATTACGACTAACCA-----TAACCACTTGTTATTTATATACGCCATTGTCAGCCTCTATGAAGCCATCACAAATGCGAAGCACAATCCTTCGACCGA---ATATATCGCA--TGTATCAATAAATAAATAGCCGTTTT-----------------TTTTTTTTAATTATATTTTTGTTATTCTACGTACAAACTTCATTTATGAATGTGATAATATTGAGCAGAAAAAAAAAAT-----AAATTATTATTATCAAAGAA
TTCTTGAAATAACCGAAAATACAAACCGCAAAAATTTAATTGATTTTCGTTTGCTTAGAGCGTTTTTAGCTTTTAAGTTATGAAAAGAATTAAAAACTAACATTTTTAGGCAGATTTCTGTTTTGCAATCGTTTAATTATGTTAATATTAGGCTTTAGCTATTTAGCAGCAATTTTCAACTATTTTATCTTAGTAAATTTAAGTACAAAATAAAATTAT-AATATAATCAAATAAAATACATAAGCATATTGCTTCAAATCAAACAAAAAAAAAAA
>CG3252 5250469 5250750|6628 chrX 5250744 5251372 scaffold_28 1710792 1711411 - 17626|0 6
ACAAAGT
GCGAAAT
>CG3249 5259044 5260209|6636 chrX 5258589 5259675 scaffold_28 1723659 1724825 - -3203|483 1270
CACATGGCAACACATGGGCGGGCGGGCATGCAACGGATCGACTGGA-GCTGCAGATATTACTATACTCAGTTTATAAGTAGGCATTACTAAATAATGTACATAGATTTTATAACG---------------AGAACGAGATGCGAAAAAAAAACAAAGAACATACTAAATAGACCCAACTAAAATACCATGCGT--------TCATCAGATATACAGAAA----------AACAGAAACA-CAGAAA-CATAGAAA-------CTCTGGATAAG-------AATGGAGAAAAACCTGACAAAACTTTAGTTTTATGCTGC-------------TATTTGCTGAGATCTGTAAATATTAT--ATTAGGCCTTTTTAAACAAC------------------------TGATAATATCTAATCGACG---AGTTCATACATTTACATGCATTATACATTTTTTTTTTTTTGTTAATTTGTATTCAAACTGTAATCAGAAAATGTATTCAAA---------------------------ATTCCCAACCCAAAAATAACTCACACCCGCACTAAAGCCACAGAATGCCTAACAAA--GAAAGAAACCATTTAAAAG----CAGAGACAGAGTGACGTTACGAATTCTTCATAATTATATATGCGTGTGTGCCATTGTTAGACAACAA--------------ACCAACATTAAACATAACCAACATAACAAGC-----------------AAAACAACAAACACAATAATTAACAAAAAAAAAAGAAAAAAAAA
CACACTCAAACCCACATACATACACACACACACACAACCAACGAAACGCTTAAGATATTACCATACTCAGATAATAAGTAA-------TACTTAGTGTAAATAGTTTTTTTTTTGTTTTGGTTTTTTCTAATACATATATATATATAAAGAAAAAAGTCAAAATT--------TCAACAAAAATACTTTATATAAAGTATATTATATTATATATTAAAAGTAACTCGCCAACCCAAATAGCATAAAGCGCAGAAAGTTTTTCATTTGAACAAATCTTGTCAATTGTATATAATTCAACAGTTATTTCTTTCTATCTCTCCCCCCCAAAAGTATATTCACTCAAAAATAGAATTATTTTTGGCTCAGTCATATATAGCAATAATTTTATTTATGATTTTGATTTATTATATTACTCAATCCACGAATAGTACAAGCATATTTCAAGAATGTGTATTATTTTTTAAACAAAAAGTGACAAAAAAAATATAAAAGAGAAAGAAAAACAAAAAAAAAAAGGTTAGATAAAAGACGGACACGCCCCTTGCAAAAGAAAC-AATAACTGAACTAACACAACAG--------ACAAATCGGCAGATATTCGTTAAAGGATACCAGATATATATGTATATATATATATATGCATATATATGTATATATATGTAGGGTATATACATATTAATGTAAATGATAATTGCTTATCTTCAACTCTGCTCTCTGCGCAAGCCAAAGGGTTTTTTTTATAAAAAAATAAATACTA----AAACAAAAAGAAATGAAAAAAAAA
>CG3249 5259044 5260209|6637 chrX 5259709 5261162 scaffold_28 1725127 1726547 - 34322|0 512
CAGCCTTAGTGAACAACTCAACTAGCAACCAAGAACTATATGAAAACTTAAAAGCAAACTTAAACAACAATCACTCAAACCCAAATCAAGCAACTTGGCGGTGCAACAAAAAAGGAATGCTTGAGTATTGCGCAACAG--GCTCCAAGATGCGGATTCGGATTAAGGATTTCGTTAGCAGCTTTTGCAGTTAGCATGTAGCATGTAGCACACAGCAAATAGCAATTGCCCGATTCCAAAAGAACTGGCAAGTGCAGAGGCCTCAAAACAAAGAAAATGAAACGTTTGTTACGTTGTTTAGATTGCGACTGAGCCCAGAGAGAGCCCCTTAATCATTACATAACAAACAACACACACTCGCCAAATACACACACAC---ACACACACACACACACACGCATATATGAGTAAGAGCACCTAACACCACACTAACCCATACACAT-TACACAACA-AGACAAACGTTTGTTTGTTGA-----CTGTCCAGAATTGGATACCAAAATGGAGGGGGAA
CAGCCTTCATGAACAACAA------------------------------AAAAGGAAATTTTAACATAAATTATAGTAGCTACAA------------------CAATAACAACAGCAT--------------CAACAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAACAACAACAACAACAACAGCAACTTTAATCAGCAGCTAAAAGTTAAAGTCCCAAAATGCAGAAATGC-----TCCCAACAAATGGAAAA---CAAAAAACACAAAACAAAACAAAACAAAAAGTTG----------TAGAACGCGACTGAGCCTAGAG-----CCCGTATTTATATATAAATACGAAACATACACATGC---ATATACAGACCTGTAACACACACACACTCACACACACCTCTACACACGCCCACGTAA-AATACATGCATATATATATATATATATAATATATATAAATGTGTGTGTGTAGGACATCTTATCGATGATCATATACAAAAAAAAAAAAAGAA
>CG3239 5339277 5339382|6729 chrX 5339244 5341210 scaffold_10 1354017 1355947 - 9291|34 139
CAAATGCCTGGATCAACGAACTTTTAGAACGATTGATGAATAAATTGCAATTTATTCTCCTAATATACTTACGAATGTTTACACACCAAAAAAAAAAAAAAAAACA
CTGATG----------AAGGCTCTAAGCACA--------------TGCCGTTTAT-------------------------------CGAACAACAAAAAAAAAATA
>CG32762 5345502 5345629|6733 chrX 5345588 5346335 scaffold_5 3925328 3926046 - 9101|0 41
GCGCAGCACCACTCGACGCAGCACCACTAGGCGCAGCAACTC
GC-CAGTGCTGCCCCCGCCACCACCTCGGATCACGACCACCC
>RhoGAP5A 5461807 5462261|6934 chrX 5461570 5461951 scaffold_0 4757370 4757750 - -332|281 426
CAAACATTTATATGAAAAAAAAAACAAATCAACCAGTAGAAAAAAACGAATTTAGCGATTTTTCGAAATATTTTTGCGCTAATTAAATATGCGTCACAATAAAAAA-AAGGATATTTATTATACATATATACAAATACAAATTCAA
CATATCTTGATCTAAATAGATAAATAAAT----------AAAAAATGGAACT------------GAAAAACTGAAAAGCCAAAGTAAAA-GTGAAATAATAAGAACTAAGGATTTTTCTTATATTTTTTTTAAAACAATTTTTC--
>RhoGAP5A 5461807 5462261|6935 chrX 5462131 5462303 scaffold_24 446120 446292 - 10879|0 130
ACGAGCACAATCTGGCCACCGTATTTGCGCCGACCCTGATTGCCACGCCCCAGCACATGACCAACCTGACGGAGGAGATCTTTATGCTCTCCTCGCTCATCACCCACTGCAAGACTATATTCGCCACATCC
ATGAGCACAATCTAGCCACTGTGTTTGCGCCCACGCTGATTGCCACGCCACAGCACATGACGAATCTCACGGAGGAGATATTTATGCTCTCCTCGTTGATAACCCACTGCGAGACCATCTTTGTCAGCTCC
>Mlc-c 5464371 5465110|6936 chrX 5462345 5464744 scaffold_24 446339 448681 - 72955|2203 2589
CGCGTCTGTGAATGTGCGTATTATTCTAAAATTGACACTAGAAGGTTAATCAGTAATTATCAACTAGTGCAGTCGTTCTTTTGTACCAATCACACTCGATACATTTATATATATATATATATGAATTACCATAGTATACTTCAATGGAAGGAAGGAAAGCCAGAGTATCACG-AAAAAGTATTTCTAAATTAAAGCT------GATATGCGTCGGTGGCGTGTGTCCGTATTTAAATGCGCATTTTGAAGTTTTACATGTTTATTTTTT---TTTAAATAATTTAATATTTGTATTTAATAAATAATGAAATGAGATCCAATGAATGTGTAGGTCTTTTTACAAAAGAAACGTACTTAAA-CTATT--AAACCAATTGAAACCTTAG
CGCATCGTTAACATTGCGTATTATTCTAA-------------------------ATGTATCGA---------------GTTTATA--------ATCCAACAGATTTTTATATAC-TATATAC------CCATAATGGAACTCAACGTCTTCAA--------CGAGTATCTAGTAACAAGTATTTCTTAATTAATGATTTGATATATATGCGAGGGTAGCGTATAATTGAACTTTAATGCGCATTTCAAAGTTTTACATGTTTTTTTTTTTTATTTGAATAATTTAATA-ATATATTTAATAATTGA---------AACGAATGAA--AGTAGATCTTTTTACAAAAGAAACGTACTTAAAGTTATTAAAAAACATATGAAACTTACA
>Mlc-c 5464371 5465110|6937 chrX 5464945 5465529 scaffold_24 448870 449464 - 34841|0 188
-ATCAGACCGATTCTAGCTGTTCAACTGTCCAGCGACACGACAATAGAAGCAACGCTATATCCAACACAATACAACACACCAACACTAA-ACACACCTGCCAAGCTACACATAGATGAGCC--GTTCATTCCGCCAGAAGTTCCAACTCCGTGATTCCAA--------------------CTTAGCCAT
CCCCAAAGCAGATCTA-----TCAA------AACAGAGCAGCAGCAGCAGCAACAACATCAACAACAACAACAGTTACAATAACAATAACACACACCTGCCATGTT--AGCTAGCCTAGCCGAGTTCATTCCGCCA-AAACTCAACTCCCAAGATTCCAAGATTCCACTTTTAATTCACGCTTAGCCAT
>CG11473 5472890 5474120|6944 chrX 5472331 5473819 scaffold_5 2568628 2570058 + 10004|609 1676
CCGATAACGATTGCAGGTCGCTTGTT-CATTTCCCCCCACCACAAAAACACTTTCCTTTTTTACTTTGTTAACTCGTGGAGAACTTAAGAACCTT------------------AAGATCTAAGTCATAGCGTTTACAGTTTAACGAAAAACTTAGAACCAAGAACCACGGCACATGTTTTTAATCTGATTTACGTATTTAATTTAGTTTTAGT-TTAGTTTCGCCTCTAACACGCTGCAATATCTTGTTACTAAATCGAAACTACAAGTT--------AATATTAATTTCATAATTGTTTAACCATTAT--CCGCTTCGGCAACCGAAACCAAAACGAAATCGATTAAAAAAATTCACATTACAAATAAGATGGAAAATATTCTGAAAACACAAAACAAATGGTTGTTTACTTTTCGCGTGTTTTTCGCGACTGCGAATGAGGGGAAATCCCCGTGACTATACACTGAAACACAA---AACAGGGACACACAATGATGCAATGCCATGAAGAACGCGGC----CACAGGAAACGGAA---ATGA-----------AACGAAAC-------------------------------GGTAACACAGCCCGGAAAC----GGAA----ACGAAATTCGATCTGATCTGAC-------------------------------------------TTTTCCACCAATCGAGAACAACAACAACAAGAACAACAGTAACAGCCGAACAACAACAAACTGTGATGAATTCATATGATTTACTGGTATAATTTGCAATTCGATTACATTTCTGTTCCCGACTTGATTTAAGCCTTTAAGCCCTTTCGTTTTTTTATTCTCAGCCACAAGTCACTAACTGAGTCGACAAAACTTTTGTAAGAATTTAGAAACAATGGCGCTAAGACAACTTCATGGCCAATTGTAAAAACAAATTGCCCGAAACACCA-----TTACTAAAAACAAAATAATACAAAAAAAAAAACCCAAAGAAAACAAAGAAAATTGTGGCATTTAATGGCCAGAAATACAAAAAACCACAAAATAAAAAAAAAAA
CCGAAAGCGAATGCAAACCAGTTGCAACATTTTTCTCCTCG----------CTTTTTTCCCCATTTTAAAGAATAGGCGAAAAACTAAAAGTATTTTAAAAAATTCAGCACATGATATGTTAATTATTAATTTAATGGCTTCTCTAAATGCATACAGACACATATTA----ATATTATTTCTGTCTAATTTGTGCATTATTATTATTATTATTATTATTATTGCTT--AACTCGCTGCAATGTGTT----------TGTAACTAAAAGTTTTACTTTAAATATTTATATTTAAATGTTTTTGTTTTTATTTCCGCTGC--------AAATCTATTGAAAATCATGTAAAAA----TTAAGCAAAAAAAAAAAGGAAAAAAAATTAAACTTATAAACAAAAAGGTTGTTTACTTTTCGC------TTTGCAGC--CGAGTACACGAGTGCTCAAACAAAAATATACTTTAACACAGCTCGACAATTAATTCAAAAGCTGCCGCGCCGCAAAGTATGCAGCGCTCTTCAGGCAGCAGAACAAATGATCACATACACAAACTGATCAGGTGTGTACCTATATATTTATAGATATATGGGTCACAATACCTGTAGATATTTGGAATGCCACGAAATGTGTTGTTGTAAGACGCGAATGCATTATTCATAAAACACATTTTGTGCAGGTTTTCGATTTCCCTTCATCCCAAAACAACAGCCG-AAGACAAACACTAACA-----ACAACAACAAACTGTGATGAATT-ATATTGTTTATTG----ACTTTGGATACCAATTA-------------------ATTTA--------------TCAGTTGCATTA--------CATAATTTACTACATTTTACCACAGAAATTC---------------ACAAAAGTCACAAAATGCGTTCGTGGCCAATTGTAAAA------CACCACAAAGGCCAACAGATCAACAAGAAAATTATGTTGTGGCAGCAAAAAGCCAAACAAGG--AAGAAAATCATT---TTTAATATTTATATATATACATACATACATATATATATAAATAT
>CG11473 5472890 5474120|6945 chrX 5473860 5474265 scaffold_5 2570543 2570975 + 12603|0 301
GGCGATGC----------------------------CTGGATCCCGATGTCTATATAGGCCGATGATGGGTGGGAGTTATGAAAATGCACCAAAACCAAAA-------------TGTAGCGAGCCGAGAACGCGAACGGAAATCAAGTGAAGAGTTAGGTTCTAATTACGTACTAAACATATATGCATACTACATATAATATATACATTAGTGCAGATATGTACGAGAGCATATTATGACGTTTTTTTTTTTGTTTGAGGAAACCAAAGCGAAACGAAATGAGTAACGAAACGAACGAAACA
GCTGTTGCAGCAATGCAAAACGAACGAGGTTATAAAATGCACCAAAACATAAACAAAAAGTAATAAGAAAAAAAAAATACGAAATGAAAGTAAAAGAAAAACAGCAACAAAAATTATAGCGAACCGA-AACGCAAA--GAACGTAAATTTAATGTTAGTTTCTTATTGCATATATAATATATATACATAT--------ATATATATATGTATATATATATGTATATTTATATATAA--ATGTGTGTTTTTAGTTACGCGTACGTAAAGGTTAACTAAGTTCAAAAACCAAAT-AACGAAACA
>Sirt4 5509865 5509965|6984 chrX 5509944 5510726 scaffold_31 24082 24870 + 41814|0 21
TACTCACAGTTGTTATATGTTG
TTTTTATTGTTTATTTTTATTG
>Rab-RP4 5516059 5516151|6993 chrX 5515847 5516076 scaffold_4 2340157 2340404 - -1298|238 255
GTCAATCAACCTTAACGT
CACACACTCCCATAACAC
>Rab-RP4 5516059 5516151|6994 chrX 5516077 5517164 scaffold_31 31995 33253 + 34947|0 79
-TTCGAATGTTATGCG-----TGCTTTTGTCAAATTTATATCGTGTATTTATTTAATCGTTTCAATATCACTAGCATAAA
CTTTTATCGCTATTCGATAACTAATTTTGATAAATTTCTAGCGTGTATTTATTTAAACGTTTCAACTTCATTAGCATAAA
>Tre1 5519073 5519202|6997 chrX 5518979 5520113 scaffold_31 36459 37624 + 53242|97 244
TCGAGCTCGCAGT----CGAGAGCTTGTAATTCATATCAATTAC------------CTACTTATTACTTGTTAGTTCATAATTATTTACGATGTATGGCCGTGCTTACATCA-AAGACAATCGAAT-TAAATACATATACGTAGACCA
TCGAATTTGCAATACGACATTAACTACTTATTAAAATATACCATATATGGTATACACTCTTTTTTTTTCTTTAATTTATGTTTATTTAC-ACGAAAAACAAATCAAACAGCATAAGAAAATAATATATAGATATATACATATAGACT-
>CG3160 5530674 5531148|7015 chrX 5531094 5531365 scaffold_31 57398 57694 + 7361|0 58
TTTCAGTTATGGTTCTC----CATGTGTTAATTTGTTATTTATTGCTGCGTTAGTTAAT
TACTGTTTGATGTGCTTAAGGCGTATTTTGATTTGTTATTTATTTGTGGCTTATATAGT
>CG3149 5538182 5538390|7024 chrX 5538046 5540303 scaffold_5 1519124 1521437 - 89563|144 400
GGACCATGCTG-TTGGAATTGTTATCCT-----------------------------------------CGCTTCCCTCGCACCGATGAACCGCAATGAAACGCACAGTTTGAGTAATA-ATGGCATATTTATACATAGTTGACATTTGTAAATTAATTCC-----AAAATTAAGTTATGTACTTATTGAGTGTTTGTAGAGCCTTGATTGCTTATTTAACCTTAAGACATGCATTAAAAGACAACGATTACTGTTT
AGCCAAAGCTGAATTAGTTTGTTTTCCTCTGTTGCTGATGTTACTTGAGCTCTTCTTCCTGACTTGGGGCACTACCTTTGCTTCCAGTGACCACA---AATCGCACATCATGTTGGACATACCGTCTATTTATACATA-TATATATATATATATATATGTCTAGTTGAAAATAAATTAAATTCTAGTTAAGTTATTGTACGTTTAAAATTATTGAATTGCCTT----------ATTATAATGC-----------TTT
>CG33080 5553798 5554143|7042 chrX 5554138 5556217 scaffold_31 661711 663780 - 129318|0 5
GAGCAC
GCGCCC
>CG32758 5564972 5566864|7052 chrX 5564885 5565100 scaffold_45 590204 590476 + -543|87 274
TATTATTACTCTCTCGTTTTCCTTCTTATTTTTT-----------------------------------TTTTGTTCTCT--------TTTTTTTTTGGCCATTTACATGTAGCAAGCGC--------------TTAGTTTAGATTTGTGTGTATTCCATATAATAATTAATAATACTAT--GCAACT
GATT--TCCATTTGGGGTTTCGTTATTTGTTTTTAGACTTAAGTAAATCGCATCGACCGTGGCCAAGTGTTGTGTTTTTTAAGGGGGATTCTTTACGAAAAGTTTACTCTTAGGCTGCTCAGTTTTATTTTATTTTATTTTTTTTTTGGTTTTAATTTGGTTTATAGTTAAAGTTTCTTTTTATAATT
>CG32758 5564972 5566864|7053 chrX 5565101 5565950 scaffold_31 678669 679599 - 3467|0 946
ATATACATCATATATATATACACATATATACATAAATGTTTAGCAAACAAATCAACAG--ACATTGATCATTTAT----TTATTTATATGTACGTAGGAAGGCCCAGATCGAAATCAA---ATGAAACGCTTGAAATCAGACAT-CAGAGATCA-GTAAACAGAGATCA-------GAAATCAGAAATCGGAAATCAGAAATCAAAG------ATGATCAGCAATGAGCAAAAGAAAAGCGGGT-------TGGCACCAAGCAAATGCTAAACGAAACA--------ACAATATAACTAATGCGATG-AAATGT---TGAAAATATTGTACTCATTCGAAACTTTCTATAGAAATTGTTAGTTAAATATAAGG--TAACGTTAATAGTTATTGAACAAATGCAAAAGCGAGACTCAAAACTCAAAACTAATGAAGCA-ACTCAACTA---ATGCCAACTCAAAGGCGAACTCAAAAGTAACGTAGAAAGAGACGGCAGGCGGGCGCCAGAAAG----AGAGGCACAACACAAATAGCAAAAGCGCTGAGCTTTCCTTCACGCCGGAAAAC-----CACAAGGAAAATCACAT-TAGAAAAATCCCCAGACCTAAGCAACC-TAAACAATTTCACACGATTTAAGGCAGAACATA---ATTACACATCCGCATA-----ATTATAGAATGGCATATAGGCATACATTTATCAACGATGCAAGTGACGTCTGCTTGTGATATTTACAATTTACACGATTATTATGATTAATTTTATATAT-----ATATATTTAATTTAAT--TGATTCCATATCTCTTTCGTATCTGTATTG-------GATTTGT--------TAATCTCTCGATGTGCGTAG------ACCACGTAATGTATT-TATTATGTTTAGTTATAGTCCTATGATAATGTGAATTTACAATTATGTTTAT
ATATATAT-ATATATATATATATATATATATATAC-TATATAGTATATATAATAAAAACTGTACGAATTGTCTGAAGTATCATTTGTATGT--GTAGTAAAAACAAGAAACAAATTAAGAAACAAAACAAACAAAACGAAACATGTTGAAATTATGTACTCAATTTTAATTTTTTTAGTAGCAAAAAATGTTAGTTACACTTAAGAGCTGTTTATAACTAGTTATTGAAACTAAATATGCAAATACAACAACAACAACAAAAATACAACAAACAAAACATTTTGGTTAAATTGCGATAAATGTAAAGCAAATGTGTGCGTGTGTGTTGCGTGTGCGTGTAAAAGTTAACAGAAAATGTT-GTTCAAAATAAAGCTTTATTGTAACAAGCGGCAAATATAACAAAAATCG---CTTAATTTAAGCAATGAATGTAATACACACAGGCATACACACACACACACAGCCACACTAGATTGTA---TGGAAAACAAGAACAAACA--CTTTAGAAAGCAGTACAACAAAAACACACACAACTATATTTATATGTACTCACACACACTCACACACAATTATACACACATATTTACATGTAAACAAATATTTGTATATATATATCTATGTACATATATATGTTATATATTGAAATACATATATAATATATATATGCATATATCTCATATATATATAAATATATCTATATATTTATCAACGATGCAAGTGACGTCTGCTTGTGATATTTACAATTTACACAATTATTATTAT---GCTTATATATTACCAATATGATTATTATTATTATGTATGTATGTCTATTTCTTTTTTTTTTTGTCCAATTGTTTTGTCATAATTATATTTATTCAATGTATGTAATTTAATATAACGCGCTATATTGTCTCATATATATATATATCTATATAAAATTATGTATATATATATATATATAT
>CG32758 5564972 5566864|7054 chrX 5565951 5566160 scaffold_3 6130385 6130574 + 1405|0 212
CAAAACAAAAGAAAACAAAACC---AACAAACAAACAAACAAAAATATATAAAAGAGTATATTTAAGCCAACCTCAGCGTAATATTTAATTCGTACTTTTCCAAATACCCTTTGTTCCGTTTGTGTTTGTATATTTTTTGCTCATAGGAAAGCAGCGGCTAAGGGAGATCTTTGAAAAATGAATTGTAAAAAGTCAATTTTAATTATACACAA
CAAAACTGATGCAAGTACAATACAAAACAAAATAATAAACAACAAAATAAAAAAGTACATTTTAACGCAAACAACAACTTAGCAAACTGAGCAAAATTCTTTCTATTTTCTTTTATTTTTTTTTTTTTGTGCATTTATCAATCACAGCAAA-----------------------AAGATTTACATGTGTAAAACATAATGAAGTTGAAAACTG
>CG32758 5564972 5566864|7055 chrX 5566161 5566235 scaffold_462 1517 1601 + 1982|0 85
TTATACA---ATATAGATATATATATATATATATAAATATATAT-------TACACAC-CACTCACAGACATGCGTACATTATAAA
TTATACATGCATGCATATATATACACATGCAGACAACCACACATACATACATACATACATACACACAAACATACATACAT-ATATA
>CG32758 5564972 5566864|7056 chrX 5566852 5566948 scaffold_934 1387 1483 - 6135|0 12
GGAAGGCGGAAGG
GAAGCAAGAAAGG
>l(1)G0060 5583897 5585217|7074 chrX 5584091 5584518 scaffold_31 697518 697910 - 581|0 442
AAGAACACTTTGCTTTGATTTTAGCCAAAACGAATAGAGAACGTAAAAAACAAAAGCGATGACCCTTCAAAAACAGATATATATGTGTATGTTTATATACATATATGTATATAGAGGATATTACATAAATCGGGTCAGCGTTTTATTATTAAAAAGAATTGTATTACCTTGTATTTCCTTGAATCCTCCAATATATTATTTGCTATTATGTTATGTTTATTTTATAAAATATTTATGCGAATTGTAATGTGAGCAT------------AGCCTGTAGAAA--GGCAGACAAAACGATAAGCGAAAACGTACAGTTTGTTATATACATATAGAAAAACAAGAAAAAAGTAATACATTTTTGCACTATTTTTTTACGTGTATGTTTGTATGCATGGCCTGTGAGTAATTGAGATAT-AACAAAAACGAAAAACACAAAGAGAAAA
GAAAATAACTAATTTTAAGTCAACGCAAAAAAAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAGAAAAAAAAAATTAATATTAAAT---TAAACGAAAAATTAGTTACAT-TACGTGTAAAG----------TTAAAGCAAAT--GTATGCAAGAATTAAAAACAAT---------TTGTAGCGCATTAGAT-------TATGTAATTAGTTGTTA--GTCGATTTAGTCTATAGCCTAATAACTGTATTAGCCAAGTAAGCATAAAAACCAATTCAGTTCGTAAAAGCCTGCTAACAACAACAACAACAACAACA-ACAAC------AAAAAAACCACAAAAACAACAAAAAAACAAAACA---------AATCATATATCTTATATATTATTATAAAGGCTTTAGGCTTAAGCGAAAAACAAACAGCAACAACAACAACAAAAAGAAAA
>l(1)G0060 5583897 5585217|7075 chrX 5584586 5585552 scaffold_31 697960 698831 - 10016|0 668
CGATGGCTCATGTGGCACCACTGAGCCCGC----GGGGTCATCCAATCCATCTGTCTGTGATGTCAACAAAATCGAAATCGAAATCTAAACCGAAACTGGGAAGGGGAAGAGCAGCCGCGGAAGCCAAGAATTCTCGTCAATTTCCATATACTGTAAATAATTGCCAGGACAGGTAGCCCACAGGATCTGGATGGGGATCAACGCATACCAAACAAGCAACAATAATATTAACAATTTCCATATACTGTAAATAATTGCCAGGACAGGTAGCCCACAGGATCTGGATGGGGATCAACGCATACCAAACAAGCAACAATAATATTAACAACAAAACCAACAAGCAGCCACAATTCTAAATGAGAGAAAACAC-------------CACATTTTTAG---GGCAAGCTAGCTACATGTAATTATAA-----CATATATATAAATAAATACTTAAGCTAGCCGTTAGTTAGCAATAGAATATAAA-----GTATAAAGCGAAGGGATTTTGTAGCAGCCGTTTCAGTTGTAGTTTTT----TTTTTAC---TTAGTATAAATATGTAAGCGTAAATTAAAATTTACTCTTGAGCTTAGGAATAATTTTAAATAGACTTAGATAAATTAAGATAAATCTAAGTGTAGTGTATGTGTATAAAAAAAAAGGGAAA
CGTTGGCTGCTATGG---AACTGAGCGTGCAACAAGTAGCAGCAACACCAGCAG----------CAACAACAACAACAACAACATGCAA--CATGTCTGTGATG-------TCAACAACAACAACCAACAA-------CAGCAGCCGTTAACTGAACCGCAGTGTTAGGTCTAG----CCAC---ATATATATATATATATATATATATATATCAATCTATAGATATCTATCCAATTTATATATA-TATATATATATATATGTGTGTGT-GTGTGCGTGACCTATGT-------AAAGTCTATTAGGAAAGC----TTAAGATAAAGCACGAAACAGCGCGCCTGGCCCAATTAGAAATTATCTAATATATATATATATGCATATATATATTTAGTGTGTCAATTT--CCAAATTCGAGTGCAAACAGCAAAATACACACACACACACACACACACAC---------ACAACACAACACACACATTTGTATATAGTGAAATTGTCGTGAGCAAATTAACTGTGTCGTGGGGTTTACGATTATTACCGATTTCTACATATACATATATATATATTATATTTTTTTTT----CTTAGGG-----TTTGTATAG-------------GGGCTGTATTTA--TGTAGTTGTTAAGCTTAAAAACAAAAACAAA
>MAPk-Ak2 5605144 5605951|7093 chrX 5605126 5606066 scaffold_26 700014 701024 - 5150|18 954
ACAA--------CGAGGAATCCAGAGCGA---CTAACACGGCCAACCCGGGAGTGAGATGAGATGAGATGAGGAGAGATGGGCGTAGGATGTAGGATGGGCGAACCATCGGTTTAACACTTAAGCGGATAACAAT-----GTTGTACAATGCTTTACAAAAACGATAAATACTACTATACTACGACGGCGGCAAGATCTGCTATTAAC--------TAATATACTACGATGACAGCAACCTTTGCA-----------AAACAACTACTCCATGTTATTGTTACGTTACGTTTTCTTATTCATTTTGTCCCATTAT----------------------CTATCTATCCATTTCCAGTCAAGGGTTCTTAGGGTATTTTGTAGTCTGAAAAGTGCTCTTTTGTAAAAGAAACTATAAAGCGTA---ATGCGCAAATAACGAACTTAAGTAAAGCCAAGTGCAAGCCTAGC-TAGCCAGCCAGCCCAGCCGAATATTCAAAATGTCTCGGTATCGCGTGAAAGTGTTTCG---------------------------------TTTTTCGATTCCCTTTTTTTTTTTAAAT---ATTATTTTCCAAAAACGTGTCATTTGTAACCGAACCGTTTTTTACGTGTACGTGACTT---TGATTATAATTATATATATA----TATGTATATGTATAACCGTCTGTGTATGTATGGCATATGTGTGGAGAAACAATTATACAGCCAGTTCACGTTAGCATTAA-TCTGCGCAAGATTCAGTGTTGTTTATA---ACTTTTATT------TGCTGAT--------TCTGCAAGCGATATACCATTTTACCGT----ATAGCATATTTGTAGTCCATAAACAACAAGATCATCCCCCAAATTAATAAAAACAAATCAAGCTTATTTTACTATGATTA---AAACAT
AAAAACAACAACCAAGGATTAAAGGACAAACGCCAAACCTTCCTCCCTCTATAAAAGATAAAATATAATATAATAAGATGTGCCCCAATATCGGGCTGTTCTTATTATA----TTACGCTTTATCGCCTAATACTTAAGAGTTGTACAATGCTATA----------GAACACGACAAAAGTTTTACAACTTCTATATCTGCATACAACAGGGATGGTAGCCCACTCCCCCACCCCCACCCCCCGCCTCTTTCCCATTATCCGCGCACTTCTTGACTATGTTACATTAATTTTTGTTTGTCTTTATGT-GCATTATTCATATCCTGTATATGTATGTATTGTATATCCATTTCCAGT-AAAGGTTTTAAGGGTATTCT-TAGTGTGAGAAAAGTGCTCTTTCAAATTGAAATATAACTTATATAGAAGCG-ACATAAC-------AGAAAACCTACGCATATACCTACTATACTTAATATATATATATAAACATATATTATATATATATATATGCTTATAGTATGTCGCTAGCTACAGCCCCGACTTATAACAACCTGAATTTTATTGAGTTAATATTTGTTTTATCATTTAATTATTTTTGTGACTTGTGT-ACTTGTGA-------ATTTTTGTTTTGCATGCGAAATGAATGACAAAAATCATGTTTATAATTTAATTTTTAATTAAAAACAAAAGTGCATGTATGTCCC----------AAACAGCT-----GTCGATTAACTTAAGCATTAGCCCTGCTCCAGTTGACATGTCGAACACGTCTACGTTTATCATCTTGTGCTGATCACAGCTCTATGCAAGCTATA---CAATTTATCATATAAATAAAGTATTTGTAGTTTATAAA-ATCGAGACAAAACCCGTGTTT------------------TTATTTAACAATGGCTAGGCAAATCT
>CG3097 5611089 5611326|7098 chrX 5611179 5611295 scaffold_28 1400682 1400784 - 128|0 116
TGTAATTTGTAAACTCTGTCGCTTTTTTTACACCCCCCCTCCACCTTGTATAATGTGAAAACTCTGTGTGTGCATGAAGGATTATTTATGTTGGTTTGGATGTCTGATTTGGTGACT
TTTAATATG--------GCTTTTTTTTTTGCGTCCAATCATTATTTTTTTTTTTTTTAATGTTATTTATACGAA------ACTATTTATTTATTTATTTATGTGTAACTAGACAAAT
>CG3108 5622431 5622571|7112 chrX 5622246 5623986 scaffold_28 1400515 1402215 - 71522|190 344
TC-------CTGACACTTAGCTCAATGCGATTTTTTGTAAATCAGCC--TAATGATTTTTTTTTTT-----TACTACTTATATGAATACTATTTATTTATTTATTTATTCTACTTGTAACTAGACAAATTGAACACACAAAAAAGAACACACAAG
TTGCCTGAACTTAGACTTAGTTTAATATGGCTTTTTTTTTTGCGTCCAATCATTATTTTTTTTTTTTTTAATGTTATTTATACGAA-ACTATTTATTTATTTATTTAT-----GTGTAACTAGACAAATTGAACATTTGA---------------
>CG11462 5683401 5685665|7193 chrX 5683334 5683485 scaffold_31 202873 203033 - 3620|67 160
AGCGGATGTTGCTACTGTTGTTGTGCCAGTTGCTGCTGCTGCTGC-----TGCTGCT----GCTGCTGCCGCTTCGATTGCTGATGTTTTTGTT
ATCCGTTGCTGCGGCTGGAGTTGCTCCCGTTGCTGCTGTTGTTGTCATAATGTTGTTTTCGGTTGTTGTAGCTCGCGTTGCTATTGCTGTTGTT
>CG11462 5683401 5685665|7194 chrX 5683486 5684192 scaffold_31 824813 825537 - 561|0 764
GATGTTGTTGTTGTTGCTGCTGCTGTTGTTGTTG--CTGCAGCTGCTGTGGCATTCGATTTGATTTCATTAGCTGCGGCTGCT---------CTGGTAGCAGTAGTGGTTGCTGCTGCTGCT--GGTGGCGCTTCACTGGCAATTACCGTTGCTGCTGATGTTGCTGCGGTGTCTTCAGTTACTTTCACGCTTGTTGTCACCTCCACAGCTGCACCTGTTGTCGCTGTCACGGTTGATG--TTGCCAC-----AGTGTCAGCGACTGTT--GCAGCTGATGTTGTTGCTGCTGCTGTTGCTGCTGTCAGTTCCTTCGATGACGTGACTGTTGATGGCTGCACTTCCACTTTGGTCGATGTTTCTGCTGCTGCTGCTGCTGGTGTTGTTGCTGTTGCTGCTGCTGTTGTCGTACTGGACGTTGTTGTCGCTCGTGTTGTTGTGGTCGCATGCT-----CGCTGGCATGTTTGGCCGGCGGCACGTAGTGCGACTTCACCAGCAGCATT-----GGCGGTATAAAGCGCGTATTGTCGGCGGACT-------CGTTGACGTGC-----------GTTGCATGTTGCTGCTGCAACGTGGCGCCTTCGTGCA-GTATCTGCTGTTGTTGG-TGGTGTTGCTGCTGCGAGGGATGT-ATGGGATGTGCCATGTTGTTGCTGTTGCTCTTGTCCGTGGG-----CGTGGCATGGCTAGTTGTTGTTGCTGTCGCTGCTGCTGCTGTGCTCGTTGTTGTTGTTGGTGTTTC
GACGCAGCCGGCGCCGCCGCTCCCATTGGCTGTGGTCTTCAGCGGCTTGGCCTTGCTGGGCGCCTGTACAGGACGTCGCTGCTGCGTGCTGGCGGCCAACGGCAGCGTCAGCTTGTGCTTCTTGGGCAGGCAATCGCTGGCAGTTGCTGTTGCCGCTGGCGCTGCTTGGGCG---GCAGCTGGCATAGCCGTTGCTGTGGCATGCGGCTCGGCAATGGCAGCGGCAATGCTGGCGGCCGCTTTGCTGCGTTTGGGCGCCGGCGTCTGCTTGGCCGCTGTCGGCGTTGTTGCTGTTGCTGCTGTTACCAGATGCTCCAGCGATTCCGCCTGCTGCAGCTGCGTCTGTGGCGCGGGCAGC-TGTCTGCGTCCAAAGATGGGCGTCTGATTGATG-CGCTGC-GCGGTCGCC----------TTGTTGCCGTTC-----AGCGAGGCCTCGTGCTCGAGACGCTGAAACATTTTGAGGGC-----------------CACCGGCGGCGTTTTAAAGAAGTTGCGCATCGAGTGCTG-CGATTGACTAAAGTTGCGTCGATTCGCCTCCTCCAGATGCTCGAATTTGCTGCGGCATTGATGCAGACGCGTGCGCATATCCTCAAACGCTAGCCGATGCTCCGGCGGCGGCAAAGGTGGCGGCGTGGGCGGCGCCACCGGCGGCGGCGTCGGCGTTGGGGCATTCACCTCATGA-TAATTGAGGCTCGTATCGCAGCTGGAGTCCACGTCCGAATAGTTGTTCAGGTCGC
>CG11462 5683401 5685665|7195 chrX 5684195 5685247 scaffold_31 203688 204783 - 9593|0 1255
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GAGTATTGTGCAGTCGGTGCGTTACTTTTTTTTGCTAAGTATTTTTTGCCAGCTTTGCTTTTG-----------CTGTCTTGGGCTAGAGTAAACGAAATTTGACGAAACAGACGCTCGCAATGGTTGTGTATCTTATGTGTATATTACGAATAGCTCTGTAAACA--TTTATAATAGTATTTATCATACTTAAGATTTGGCCTTTGGTATGCAACCACCTTTCCCTCTGCTCCTTGAATTGTTTTTCA---TTTTTATTTTTGTATATTTTTATTTCTCTTCCTGCCTTTAACTGCGACAGACTTTGC------------------------CGGTGCCTAAATTTGTCACTGTGTGCGTGTGTATGTCCGAGTGTGTGT----------GTGTGTGTGTGTGTGTATTGGTGGTGCATTACTTTGTGG--TTGGTGCTGCAAAGAATTGACATATTT-GGTGCTCCCAACTGGAACCTGCTGCTGCCACTCGCCCGCACACTCTCCCTCTGCCTCGCTCTATATCTATCTCTCCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGTGTGCTTGAGTTTTCTTTTGGCTGCTTTGCGTTTCCGCTTGGCGTTGACTAACAGCTTAAGTTTCCGGTGTGG--AGCCGTGCGGGGGCGGACATAGCCAAGTTTTACAAACTTT-GGCCAG-AATGTGGATATGGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGATTTTGTTGTTGATTTTGTTGTTGTTGGTGGCTGGAATCA-------GGCAACGACATCAACTGATTCAATTTGCT--------------------------------GGCAATGCAGCTTTGATTTTTGATATTTTC-----TTTTTTTTTTTGTTGCACACCAATTA--CATTGCAAGGGTCAGG---GGGATCAGGGGGGCT-GTGCGGATGGGTGTTGTGTCGGAAATATGTGTTAACTGCAAAGTCGCTTCAGTTACAGTTGCTGCTGCTGCTCTTAGCCCAAGATCTTCTTGAAATAGCTGACGGTTTCCGGCTTTGTTAGCGAACGGTGTCGATTTGGCTTGAATGGCGCTTCGGTTTCCACGTGCAGGAAGTTGCGCCGTGTTGTGGC------GCTCGTTAACT---CCAGCTCATCCTCATCCCTATCTCCA---TCTCCATTGCCATCCTCGGTCACACT-----------------------------------------CTCGCTTTCCAA
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TTGATTTACAAGAAAGTAATTACTATTTTAATGGAAGCACTTAAAATGCAATTCAATAAAAGGTGTCGATAAAGTGAATAAAGCAAATAGAAACATTAAATATAATCAACTAT------CAAGCGTTTAAATATTTTCAG---------------AACGTTTAAAAACGAGCCAATGCAATCGGAAATCGAAACAAGTGAGATCGAAAAAAAAA
TTAATTTGAAAATAAATAAACATTGTATTGAT-----TTTCTATAAGATTGTTTCAT--------CCAAAAGATTAAATAAAGAAAATAGAAACAAAAAATATATTGTTTTATTATTTACACACGCATATCTTTTTATGGCATAGACGTCGCTTTGACGTTTGAAAACGACATAGCTC-ACCGGAAATCGAAATCATGATCATGGAAAACGAAA
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CAAACTCCTTAATTCGCTTACAA--AAATTGTATTTGACTATTTCCATACACCGAAAAAAAAAAAAACAACATCTATTACATATGTTCATAATTAATTGGTAAA-TATGTAATTTGCATGGCGTTTGCTGTTTTGGATTTTCATAAGCCTATTTTGGAAAACTGAGTTGAGGATCAACTGGCACGTATTTTTA-AGCGGCAAGTGAAACCTTCTG
TGCAGCTCGAGAGTCTCTCGAAACGAAATAGCCCTGGAATGTGCC-----GCCGATAAGAG------------CTGTAAAATTTGATT----TCAAGTCTTAAACTATGCAAATTAGCTGGCGTA-ACTATTT--------------CCCAGTCTCGCATATTAAAAAAAAAAAACATTAACAAGTATTTAAACAACGCTTCGCGAGTTCTTCTT
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AAGAGATTGCACATGCAGAGAAAATTCCATTTAAATGTTATGCATTTGATTAAAT---GTCTAAATAAAAGAAGCCTATTTATTAGTTGGAATAACTAAGTGTAAATGTAATCCAAAAAATATTAAATATACCAC
AAAATATCGCACA-------ACGATTATCTTAAATTGTTTACTACTTTGTTAAATTACGTATGTATATTATAAATCTATACACA---TATGACAGCTAGCTGTAAATCAATATCAAAAAGTATTAAATACATAAC
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AATAGCTAGACGG------------------CAGCACTTACATTTAAATTTATCTATACCCTTTAATTTTTTTTTTTTTTGTTTAATATATTTTTTTTTTTTTGCATTGCCAAAATATCGCGTATTGTTGC-----------CGA------TATGATCATG-ATGTGAGTGT-ACTATTGTAGA---CAATTTAATGCATAAGTAATTTTTTTTAAAACAATTTTTTTTTTTTTCGTAGT-------CTTTAC--ATTAATTGAGGTTAACAAGCATGAAAAACCAAAACATCTTA-----TAGAGTCTTGATTTGAGGTACATCTATTGAAATCGCGATTATGGTAATT-----AAGTTTTGAATCC---GAATCGAT---TTTAAGCAATTAAT----AAAAA---------TAATAAAAAAAAAGCAAATTGACA----AACTGTAAT-
>CG3016 5722232 5722665|7230 chrX 5721034 5722382 scaffold_31 241642 242988 - 869|1390 1546
ATGCATTTAAGATTTTTTAAGAATTCCAAATTCATGCCGTGCTTTTAGCTGTCTGTATTTAGCAATGTACACAAATCAACTACCAATAATTGTTTGCGCGTTAATTCTGTAGGATA------GATGTTCAATAAAAATTTCGAAATCAGTTCCAATT
ATGCGTTTGACATTGATCAACACT-----------GTTCTGGTTATTGCTGTT---------CAAAGGTCGCATGTCAAATGCAAAT-----TTTGCGCAATAGAAATGAAAATTACTTTCAAAATTTAAACAAAAATTATG-------TTTCAATT
>CG3016 5722232 5722665|7231 chrX 5722383 5722392 scaffold_46 374180 374191 - 254|0 11
TTTGTTA--TCT
TTTGTTACATCA
>CG3016 5722232 5722665|7232 chrX 5722663 5722821 scaffold_46 374607 374771 - 6834|0 2
TCA
GCA
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GTGCTGCCTGCTTTGTTTGTCC
ATCTAGCTTGCAT--TTTGTCC
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AATCTGTATCATATTGTAATCTATGTGTATTTGTACTGTACATAATTATGTTTATTCTATGTATCTTAATAAATTGTTTATTTTT
AGCC--------AGTTTAATCTAGTTCTTACGCTATGGTAAATAATTTTGATTAGTCTTTG---CTTGTTTAGTTATT--CTTCT
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ATACAAAAAATATATAATATATACATATAGCGCTAGAACAGAGGGAGATACAGATTCCATTGATCGTTCCAAGTCCAACTTAACATTGTTTTAC-TACTTACATATACATATACACATATTT-----ATGTATGTCGATGTC----TATTATGCGATGCCTAACATTTACCACGATTATCCGCAGTTT----GTTTTAAGTACAACATAATCCTAGATTGCTAATGTAAAAAATGCTTGAAT------------------------AAATTCAAGGATAGCCAAAGGCAACA
GTACTCGCTGTAAGTAATATATGTATGTA-CACCCATACATACGCAGCTGTATACGATAAGAACCTACTTAAATTACACATA-------TGTACATACATACATATATGTATATAAATATATATACAATGGATTTAGATATCAAGATATTCGTTTATCCCCATGTCTGACTGAAAAAATAAGAAAGTTAAAAGTTACAAGTA-AAAAGAACAGAGAAATATTCGCATCGAACATGCATTAATATTTGTCTTCCCCTTTAAATTATAATATTTAATGTAAGCCATATTCTTTC
>CG4766 5842740 5843708|7373 chrX 5843032 5843422 scaffold_422 5085 5569 + 4667|0 498
CTCCTTGGCGGCCATTTTGTGCCATGTCTGT--------GTATATGTGACTGTCTGCGTGCGTGCGCGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCG---------------------------------AAAGTGTTAATGCGAAGATGCGAGATAAGTC---CACTCCCCATTC----GACTCGACTCGACTCGACT--CAACTCGACTCGATGCGATT-----------CGAGATATATATCTGCCCATC-CAAGCGATCCGGCTAAGCCT-CGAATATTGTTTTTAATAACTCGCCCCTCGACGCTCACGACACATCCTTTGTTTG--------GCCGGCG--------------AACAATGGACTCGC--------------CGGTTCGCA---AGTCCGGATGGAAAAATCG--AAAAATCGAGAGAAT----GAAAAAAGAGCATTTGTCCAGGCGGCTCCTTTTACACGGTGGCTATACACACTCGACGTATACGATTGT
CTCAGTGGCTGCCATTTTGTGCCATGTCTGTCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTGCGTGCGTGCCTGTGTGTGTGTGCGCATAGCAACAACAATAGCAAGCGGCGAAAAGCCGAAGTGTTAATGCAAAGATGAGAGATAAGCCGCACATTGCCCACTCCTCAAACCAAATTCGACTCTTTTGCCGCCTGTTACCGTTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGATGCTTCTTTATGCCCATTGCACGCCTGGCTGCTTATCCGGCGAATATTGTTTTTAATAACTCGCCGCTTTAAG--CATGTTTCGCCTTATGGCCAAACACAATGCCAGCAACAGCAACAGCAGCAACAGCGAAACAACAAAACAAAACAAAGCGATACACAAACAGTCACAACAACAACAACAACAACAACAAAAGGAATAGAGAAAAAAAGAGCATTTGTC--GGC-------TTTGCTTTGCAAGTGTGCTCA---AGTGTAAGCGAATGC
>CG4766 5842740 5843708|7374 chrX 5843708 5844743 scaffold_422 5716 6716 + 60124|0 0
G
G
>mab-2 5851096 5854043|7384 chrX 5851351 5851635 scaffold_28 1219623 1220024 - 4539|0 425
TAAATCTGGCGCTGAACTCGATGAGGACCTGCTGTCCCAATCTTCTGACCGCCTGTCAGCCAGCATGTTGGCCACATCCCCACCGATCCCCGCCAGCCGCCAGCAAATCCGCACCTCATCCACCTCTGGCA------------------------AATCAAAACAAATGTTTTATTTAAATGGTTAATTTGATCGG------------GCCAGAGC---------------------------------------ATCTGTG---------CCGG----CCGGCTTGTTGGCGATGGCCAAATGAGCAGCTTACAAGGAGATGATGAGG-------------------------------CCCGAGG----TACACAAATGG------------------CTGCCAAATCGTGAGAATTGCATTTG
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>mab-2 5851096 5854043|7385 chrX 5851738 5852416 scaffold_28 1220557 1221346 - 9522|0 829
ATTTATTCAGGTGGGCGAT---TTGGTTATGGCCATTTATGACGGCGATGATTTTGGATCAACTCGATTGGGCTAAATTCGATTCAAATGTCTTTTATTTTTCG-----------ATCGGGTTGTTAACCGCCTAGTTGCGCTTTT--AATGAGTTGTGTTTTATTGGATTTGATTTGCATTTTAATGCGGTTTCATTCTCAAATTTATTATTTGTTGTCGAC-GCAGACGCAGTGCGTCTGTGTGTTTCCTTTTTATATTTTT--CTAAACATTTGCTTATTCCATTGAGCGGCAGACACTGTTTGATCCGCCGCTTCCCACACAAATTAAACCATAATAATAATTAATAAATGATAATTTCGGCAA---------------TCGGCTGGTC--------------CTCCTCTGGTTCCCATC-----------------TTCCTGTTTGCTGTCACCATCGC------------ACTGGG---------------AGATTTCCAT------------------------------------------TTCCATGCAATTTATATACGTTTTAATGGCCGCAAGAGCAAATTTT-ATGAACATCTCATAATCGCATTTTAAACACACAATTTGTCACAGCCCCTT------CGCATGTCACCCA---CTCGAAATGATCGCCTGCATATGGCATAGCAATTAAGGAATATTCATTTTTATTTCCACACCCATTTGCAGGCAATAA-----TTAAAATTTTATAA--CCGCTTCATTTTGGGTGTTCTTTTTTTTTGTTAAGTTTAAAACAAAGTTTGGTTCAAAATCAA
ACTAATTTTTGTGGGCGGTCAATCGTTTTTAGCCAATTATG-CGGCAAGCGTTTGGCTTGGCTTGGCTTGGCTTGGATTTGGTTGGGGGGCGTCAAGATTGGTGGCGTCTGGCGGATCGGGTCGTCAGCCGGCTGGTTGCGTTTTTTTAATGAGTTGTTGTTTATTGGATTCCATTTGCATTTAAACATGA---CCAACAAATATTTATTATTTGTTGTTGTTTGCGGTCGCTGGGCATTT---TATTTTCTTCTTAATTTTTTGATTTTTTTTTTGGCTGTTGGATTTTTGGGCCGCTGCTG------CTGCCGCTTCCCACACAAATTAAA------GAACAATTAATAAATGATAATTTCGGCAGCCCACAGCCCATCCCTCAGCTCGCCAGTCCGGCAGCTGACTCCTTTAGGCCCCAGCAGAACCATTCGAGCTGTCGCCTGTCCATTGGCATCATCATCACCAGATGTCAGTTGGGGCCAATTTGTTAGCCAGCTTTGCCTCGTCTTCTTCTTGTTGCCCTTGTTTTTTGGCGTCTTAATGAATTCGATGCAATTTATATTCATTT-AATGGCC--AGAAGCAAATTTTTATGACCATCTCATAATCACATTTTGAACACACAATTTGTTATTCCCCGATACGTAACGCGTATTACGCATCTCGCAAAATG-TTATTTACATGT-------TTGTTGTGGAATGTTTAACTCATTTATGTCGCTTTTCTGCTTTCAATGAGTAGTTCAAGTGTTTATTATGTTGTTTCCCGTTTAACAATCTATTTATTACTTTACTC----------ATTTGCTCAAAATCGA
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GCACCTCTGAATACCCTTTAATGATCATAATAATTTGCTTGAGATACAT----ACTGCACAAAAAAAAAAAAAAACAAAGTACAAATATTG
GCGCCTCTAG---CACTTTGCCAGTCTCAACA------TTGGAATGCATTTCTACCATACACAAAAAAAAAAAACCAAAATAAACAAATTG
>mab-2 5851096 5854043|7387 chrX 5852768 5853365 scaffold_28 1222964 1223594 - 5715|0 666
AAACCAAGGAAAAGTCTTAACAATTTAAGAGTATTTTTACGTAAGAACAATTTATGTGATATTAATGATTTGCCCAGTTA---TCGGGTTTTGAATAGTTCTGACATAGCAATTTTTTGGTA--TGCGGAATATCTGTCCGAACTGCCAACTTCTCGAGGGTCTCGTCCGTCGATCATCGGATGGCCTTTTGATGTTCTGCCGGCATT---ATTGATAGGCCACGATTTCGATGGATTTCGATG-----GACTGTGGAAAATGTCAGAGGCTGACATTTCG----TTGGCTGTCGACAGGTTGCGCATTTTAATTGCGAATTAACAGCGATTCCGCGGAC---AGCTAACAA--TCCCAATAAAC---------------------TAAACACACACACGCACGCACAAT------TTGTGTGTGCCGCATCTGCCACGCCC-----ACCCACGCCCACCGCTCGCGAGAGTGACTCAGAAAGTAAAGATACATTTGTGCT----TTCCCGTCGAATCG------ATGAAACATTTTGGTCACGTGTCTGTTTCGATTTCGAGCGACAGACATAACATTCAAATTAAACTTTATGTCATTCATAAATTAAATAATTTAATTTTTCCCCCATTG-----TTTCGTGTTGTTACCTTCTTCTGTTTTTA
AATCCATGTAATAGCCATAATATATACATAATATATT--------AGAAGCTGCTCTCATAACTATAACATGCCCAGTTAACATTGCCATTTGAATAATAAT-------CGAGCTCCGGGTGGCTCCGGGGCGCTACTTTGAAGTGCTGCGTTT-----GGCGACGTGCGCCAATTTCGGCAATCGATATAAATTTCAGGTCGATATTGCAAATGAAAAGAAACAAACAAAAAATATTGCTAGGCTTTCAATTGTCGAACATGTCTGCGGCTGACAGCCAGAGGTTCGTTTGTCAACACGTTGCGCATTTTAATGGCGCATTAAAGAAATTTTCGCAGACCGAAGCAAACAAATGCCCAATAAACCTTAAATCAATTGTCGCAAAATGATCGCCAACATGGCCATAATATGCAATATTGTATATACAGAGGCGGCGGCCCACTTTGAGCCCGGCCCAAACAGCCATCCGAGTGG----------------ACAATTGGACTGAGACTGACGGCGACTGACAGCGCATACAGCATTTGGATCACGTGTGAGTTTCGTTCTCAGGCAACAGACATAACAGTCAAATTAAATTGAATGCCATTCATAAATTAAATTACTTAACTTCTCCAACGTTGATTCTCTTCATGCCTTTGGTTCCCTGTACTTATA
>mab-2 5851096 5854043|7388 chrX 5853390 5853944 scaffold_28 1224143 1224829 - 8780|0 703
CACTGGGACTTCTTTTTTTTCATACGCCTTTTGTTTTTTTAGTGATTTTTTTTTTCTAC---------AACTAAAGACAAAGGAT-CGCAA---GGATCAAGGGCGCTGGGAGG-----GTCGAAGCTGGAGA-----------AGGAGAAATGTG-TGAGAAAGATAGAGAGAAAGCAGTGAAATTGTAACCCAAATACTATTTGATATTTCGCTAGATCGTAACTT-----AAGTTTAGGTGCTTTCGAAAAGTATACGCCGCTTACAGAGTTTCCTA----TAATTAGAGCATACTTA---------------------------GTGTTATCCATTTAGATCGTCATCGT-----------------CGCAAA---ACGCACAAAAGT---------TACCAACT-AGTTACATTT------------GTATGTACGACATTTTTTTTTTTTTATTGGTCCATTTGCTATTAGCAAAGTGCAGAGCAAAATTAGCTAAATTA-------------------------------GCTGTAAGTCCT----AATGAA-ACTGAGACAGCCGAGTGAAGGAATA---TTTCCCCGTCGGTCCTAAATTATTTATTCTATGTTTTTGCCTTCTTCTTGTGAGTTTAGTCAATAAAACGT--AAGTTTTTTCAATGAAAATTAGCAGGGTTATTACTTTCTTTTG
CTTTATGATTTTGTCATTTTTAT-TTTTTTTTATTTTTTTCGTTCTTTGTTTGTTTGTCGGGGAAACGAGCTAGAAACAAAAGCCGCACAATGTGGCCCAATACAATTAGTTGGTAGTTGTCGTAGTTCGGGGGCTAGCGAACTAGGGGGTATACGCTCAGAGAGGTACATAATTCG----GAAATTTTAACCCAAATACTATTTGATATTTTTATAGATAGTAAGTTGTTTAGTTTTTAGGTGCTTTCGAAAAGTATACGCCGCTTACAGAGTTTCCTATATTTAATTGAACCACACACACATATATATATATATATATACATATATATAATACCTAAATAGATC-TTATCGTATAATACAAATAACAGCAGCAAAAATACGCACAAACCTAAGTACTTATATCAACTGAACTACACTTAAATATATCTAGATATATATGA-ATATTTTTTTTTTCGCAAATAATTTTGCC-------AAGCGGCAAATAAAATTAGCTAAAGTACTTAGCTTAAGCTGAGCAACAATTAAATAGCGCTGCAAATTATGTAAAATGAAGACGTAGAAGACGAAGTGAAAACATATATTTTTTTTTTCTGT-TTAAATTATTTATT-TGTGTTTTTTGCTT-TTCTTGTGAGTTTAGTCAATAAAAAATTAAGTTTTTTTCAACAAACTGCAATTGAGTTTTAATTGTTGGTTG
>mab-2 5851096 5854043|7389 chrX 5854022 5854539 scaffold_28 1224900 1225419 - 26744|0 21
AGCTGCAGAGCTGCAGAGCTGT
GGATCCCAA----CAAATTTGT
>rux 5880981 5881228|7428 chrX 5881136 5882372 scaffold_58 285286 286412 - 4303|0 94
ACCGGACAGATATTTAAACAGCT--ATAGTCCCTAGTTGCTTTTCCAAATTTACGTAGCACAATTATTTTCTTTGGCTTTCGAGGATACCCGACA
AGGTATCAGCCTTTTGGCCAAATGAATCAACCGGATTCGTTTTAGCTCAATATTGTACCAAACTAAAT---TATAGATTTCAAGCAAAGCCCATA
>Tsp5D 5914362 5915197|7460 chrX 5914275 5914772 scaffold_31 1295500 1296027 - 7371|87 574
ACACATATATACAGCTAGTGTGAGTCGGAATCCTTGGACCTGGATATGCTTATGCTCG---TAACCCTTCAACTAAACCAATATATCAACTACAATATATATTTATATATAAT-TATATAATACTTATGTTACTTTATGGAAATCTGTAGTATTCGAAATAG-----CAGAAACCGCAACTGCCCGAAAAGCGCGAGGAAAGCGAGAAGAG---AAGAGAAAAGAAAAGAAGAGAAGACGAAGTGGAGAAAGAGGGAGCAAATAGTTAAAGCAAATATTACATTACTACTATGCGTATGATTATTTTATTCATACATACAAATATTTATATCGAAATGCATTCCTAAACA-----------------ACATGTTCGTGT-TAAGTTACAAAATAAATTAAAGTATTTATTTAAA-------------------------------------------TTACACGCCTTC----TCAAAGGCCCACCAA
ATATATATATATGATGAATATCAAAAAAAATACCAAGAGTTTGGTAT-TTTATGCGCAATCGAGTGCGAAGAGCGCGCCTCTAGATAGACATCGAAAGCTATATACATGTACCATATCCAATCTGCATGTTATTGTACGGCAATT--GAGTATTGGAAGAAGACAAACGACAACAACAACTGCCCGCAATGCAATCAACAAATGAAATTAGCTAAAGAGAAAAGTAAATA-------------------------------------AAAACACCATTTATATAGCATATATATATATATATA-TATATTTATACATAAA---GTTTA---ACAAGCACATTCCTAAACAAAAACAAAATAACAATTACAAAATTGTGCATAGGTTACAAAATAAATTAAACTATTTATTTAAATAAAAGTTATACAATCAAATAAAAAAAAATGGTTTTACTTATGTTCCCCGTCTTCATCTTTAGAGTCCCACGAG
>Tsp5D 5914362 5915197|7461 chrX 5914805 5915741 scaffold_31 1296043 1296943 - 24521|0 489
ACGCGCCTGTGACG--------------GTGGTA-GGCGGACTTCTAAATTGGGGGGTTG----------------------CAGTCGGCCTCCCGAACTCCCTGTCGCTATCTCTATTCCTTTTGTTAACTCTCTTA-GTTTCTAATTTATTCTGCGAAATGTGCCAAAAATTAATTTAATTCAAAGTGTATTTTTTTTTGTTTTTTTGTTTGTAATCTGTAGGCGGAGACAAGTCGAAACAAAATTGAACTGGCAGCAAAATGACAAATT-CGCACTGGGCACAGTGTGAACATGTC--ATATTGCTGCCG------------------------------------------GTGAAACAA------------TCACATAT-TTAGTTAGCAGTGTATCCATATTGTGATGTGCTC-TCTAGTAGTATAGTATAAGGCCCAAGGCCCGAAACGCACCTGGAACAGGGTATAGTGCGTTCCATACTTA
ACTCGTCTCTAGCTAGATCCGATCCTCCGCGACATGGAGAATTTCTAAAGCAAGGCGCCGGGACACAGGCTATTGCATATATTATTCCCCCCCCCCACACCACCATCACCCTGTACCCCCATTTTTTTAGTATTATTATATTTTTTTTTTCTTCTGCGAAATGTGCCAAAAATTAATTT------AAATATCTTCATTTTTTTTCTGAACTTTGTATTATTAGAAAAATGCTAAGGCGAAAAAATATCTGAAGCGAGGCGAAAAAGCAAGCTGAGCCCAAAGCTGAGTTCACACAAGTTTAGTATTTTTTCTGTTGCTTGTCTCTTTTCCAGCAGTATTTAGTGGTATTTTTTTTGTGAAGTCAGCTTTGCGAGCCTCTAATCTATTAGTTAGCGGTATATCCATATTGTGATGTGCTCATCTAGT-TTATA--------------------------------------CATAGATCTATCCATATATA
>CG4666 5921303 5921605|7472 chrX 5921145 5921420 scaffold_50 377852 378147 - -123|174 305
GCCCATAGCAACTTAAAGACTTTATTTGCTATTATTTTTTCACTGTGCCTTAGTTATAGGAATA--------------TTGCATTAATGGAATGGCTGAAGATTTTAAATATAATTTTTTACAAACCAAAAA
GCATGTAACATTTAAACAACATAATTTTCT----TTTTTTATTCATACAATTATAATAGAAATAGGATTTTTTGTTTTTTACTTTTGTTTCATGTTTATGACTTTTGTACTTAGTTTCTAACAAA---AATT
>CG4660 5923947 5924309|7476 chrX 5923923 5924306 scaffold_26 1359716 1360180 - 417|24 468
GAATCGTTGGAGTCGCCGGAAGCGGATGCGCA------ACCGGAAACGGAAACGCCCATTATTA-----------CATGTTTTTTTTTTCTTGTCTCGCGTGC----------TTGTGTGTGTGAGTGTGCGTGCTAAAGTGTGCTAATGTTTAATGTCTAAGTGTGCACG---TGAAATGTTTGT---ATTGTAAGCTATGT--AAGGGTCTGTAAAACAAATAA--------------GAAAAGCCCGCCCTCTTTTG------------------GCCTTAACTAAT--GTATTGTATAATTACCCAGAGATCAGACACGCCCCC----CCGAATAATGAACTAGA------AATACAAACAAAACTCCTTGGTAGTCCACAGTGTGTAAGCTATGATGTACAATGATTGTTTA------GTAAATGAACAAACCTAATGTG
GAAGCGGTGGTGCAACCGGAAGCGGAAGTGGTAGCGGAACCGGAAACGGAAATGCCAACGATAAATAGTTGCCAGCAAGTCTCTCAAGTGTTTTCTAGTTTGTAGATCAATTATTCTTTCCACCAATTTGCCTATTTA--TAAATTAACATTCCATTATAATATATTTTCGATCCGAAATGTTTGTCTAACTTTAGATAATGCCAAGAGAGAGAGAGAAAAAATGATGTTAGTGTCCATCGAAAAGGTTGCCTATGTTTACGTTTGTTATATACTATTATCCCAATTAATTGTTATACTATTATTTACAATAATTTAGAAATGTTGCTATTATAGATTAAGAGATTATACGAGCGAGCATGAACAAAATTCCGT-ATCATAACTAATGCATATGTCA-ATTATACAATTATCAATCAAAAAATATAGATAAATAAATGAAATATA
>CG4660 5923947 5924309|7477 chrX 5924307 5925063 scaffold_31 1311711 1312420 - 28128|0 2
CTG
CCG
>Mipp2 5927943 5928863|7481 chrX 5927757 5928189 scaffold_31 1315342 1315742 - 360|201 450
CCTTCGCCCCCAAAAGGAAACGTTCGTTGTGCTAACTTGTGTTGTATACCTATAAACGAGACAGAATATATATATTTGATAAGGCAAGGATATGGAACAAATGTTGGGTTCCTACATAACTTTGTACATAACACTTACGACCTTAATTACTTTTGTCTAATTTTGTTTGTCC-TGTCGGAAAGCCCAACAACAAAACCAACCGCAGTAACAACCAATAAACTAACGAAATTTCTAGTTTAAAGCTT--AA
CTTTGGAGCTCAAACAGAAACACGTTTTGTACATAGCACTTGCATATGCCTATA------------TACCTATATGGAATCACATACTTATGT---ACACACA-------CCTATATATATATATATATA-TATATATGTATTTGGTCGCTTTAAT---GTTATATTTGTCCCTATCGAAG----CAACAATAGACTCAGTCG-------------------AACCGGATTTGAGTTCTGAACCTTTCAA
>Mipp2 5927943 5928863|7482 chrX 5928472 5929929 scaffold_31 1317103 1318623 - 35385|0 581
GTCGGCTAAGCATG---------GAGCACATTCGGAATGG----------------AGCT-GCTGG-ATGGATTGTTTGATTGTATTTTGTGGCTTTGCTGCC----CTGCCACT-----------------AATTGACCTCGGGAAAAGGGATTCGTCGGA-----------------------AAGTTTAGGATACAACT------------------------GATATAGAGATAATGTTAGGAATGGAAA---AGATTCGAAGGAACTGGAGTTCAACAATGATCAGATTAGGAT--------------------------------TAGGACTAGTTTTGTAAGT-----------------------------GATGAGCGGCGGAGAGC-------GGAAATTTATGTGTTGAC-----------------------CAAGTGGCGAGTCGAATTCTGTGTGTTTTGTATGCCTTATTAATCAATGTGGACCATCCACTCCAGCACTAAAGAACT-TCGAACAGGAGCGCATGATATAGAGCGAGACGGAGATGGAGAGTGGAAAGAGAAAGGGA
GCCAACTGAGAGAGAAAGAAAGCGAGAACGACCGAAAGAGACAGAGAAACAGAGAAAGCTGGCTGGCATGGAATG-GGAATTGGAATTGGAATTGTTGCTGCTGCTGCTGCCGCTACCGTAAAACTATGTGAAATTTAACATGAAACAAGGGATTCATCGGAATTTGTAAACAAAATTTGAATTGATGTCGAGGATAAAACGAACAGAGAGCGCGAGAACGAAAAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGGGAAAGTGAGAGCAGTGCTAAAAGGAGTTGAAAAATGAGATGATATTGATGCTGCATACATATATATATATATATATATATATATATCTAGATATATATATATATGTATAGGGATAGAGAATAGCCATTAAGTGAGAGTTGAAGAGCAAGCGAAAGAAATTT-TGTATAAGCAAAAAAAAAAAAGAAAGAAAATTTAATTGGAAAGTCGTTATGTATGTATTTTGTATGCCTTA-TAATCAATGTGGACCATCCAATCCAAATTTAAAAAAAGAAAAAAAAAAAAAACAAGAAATACTGT-ATACGCAACCGAAAGCAGAAATGAGAAAGTGA
>vanin-like 6045423 6045593|7638 chrX 6045318 6045814 scaffold_31 553076 553558 + 1468|106 290
GATCAAAGTG-ACACGGGTGTCTTAGGCATTTTAAGTCAAATGTCGTAGGGTTCACATGACGTTGGAT-TCTTATTT----------TTTATTTTTTTTTTTACTTACTTCTAATGCTCGATATTAACAGTATTTATATTAAGCAGTCAAAAATAAAAAATGCTCT--CGACTTGTTGATAATTA
GTTCATATCATGCACAGG---CACAGGC-------GACAAATG-CGTCAAATTCGCA-----TTGAATCTTTTATTTAACTATTTGCTTTTCTTTTCTTTTTGCTTAATGCCATTTCTCGAGCTCGAC--------TTTGAAAAAATGAATAGCAAAGTCGGCTTCGATAACTTCTAGACCATAA
>sqh 6068297 6068642|7670 chrX 6068307 6070346 scaffold_31 602841 604963 + 41217|0 395
GATCGCCAGCAGTCGATTCACTAGCCA-----GCTGCCTCTCCAAT--CAGCC-------TGTCCAAACTATC-----CATCATGAGTTT------CGTTTTGATA----ATTTAATA----------TATACAAGTATAAAT-------------------ATTTTTTTTTTTTGGTTTCGCGCCTTCTGTTCTTTGATTCCTGATAATCCTGTACTTATCCGTGCATTTGAATTAAACAAAAAGTAGCCAACACCAGCGATTGTTATGTACGACAGTGTAGTGTGTGAGATGTTGGTGCCAGATAACACGA--TTTCCCGAAAAACTCCTTTCATAAGTATTAACTCATTGAATATACATATATATTACCTATATACAAATACATACTTATACA
GATTGTTGTACTTAAATTTGCCAACCGTTTTTGCGGCTGTTATAATTCCAGCTATATTCATGTCC-AACTGTCAAACGAATCGTGTATTTTATACCTATTTAGATATGCTATATAATATCCCCTCTTTTATATATATATATATCTGATATATATTTTATTTAATTTTTTTTTTTTTTTGCCACTCGTTTTGTTCTCTGTT---------CTCTGTGCCTATCTGAGCATTTAAATTTTACA------TGTTAACAT---------TTTTGTGCG-------AATGTGTGAACT----------GATAACACGATTTTTTCCGA------TTTCCCATAAGTATTAACTCAT---ATATATATATATACAAAC-ACATACACAGACACACATACACA
>CG3585 6086637 6086699|7694 chrX 6086699 6087254 scaffold_25 1562241 1562800 - 32673|0 0
A
A
>Lag1 6102894 6103550|7702 chrX 6102878 6103198 scaffold_25 148773 149123 - 3337|16 361
ACAGTTTTTTTTTTGTTGTTGTTTGTCTTGCTTAACCAAAAAAAAAAAA----------AACAAAAGCAAAAGCAA-----AGAGACGAAGGAGA-------AAATAACGTTAAATATAACCATTTAAACGTAAAGCTAAAGTTAAGTTATTTTACCAAACGAAATGGAAGTTAG--CACAGTGGGACTAAAC--CAAAATCGCTTAGGCAAGAATTCAATAGACGAAGAGTAAAAAATGAATA------GTAGTCAAA-ACTATTGTAAATACTGTACTTGTATGTTTCCCATATTAATAA--------ATTTATGCTAAACAAATTACAAGACCAAAAAACAAA
ACAGTTATTTATTTTTTTTTATATGCATAGTTTAGGCAAGGGCAAATAATGGTTATATTAATTACCGTTATTGTAAATGACAGAAACAACCGAAATAACAACAAACAGCTTGGAACGAAGAACTTGAAACACACAGCAAAA-----------TCAGCAAAAGAAATATAATACAATTTATAATAAAAATTCGCTACGAATTCGCTTAAACAAGAAAAAACAAAGAAACAATTTAAAACCGAATAAGAAATACATTCAAATGCTATTGTAAATATTTTAACTGTACGTTTTCCCAAATAATAAATAAATGTATGTACGCCAAGAAAATAACCAAACCTAAGACTTTT
>Lag1 6102894 6103550|7703 chrX 6103223 6103753 scaffold_25 149155 149789 - 9840|0 430
CTGAGACACCAGT-ACCACTAGTAGGGG----CCACACTTCCCGGG--------------------------AGCAGGCGCAGCAA--------------CAACAGCAAACAAACAAAAT-CCACACACACCCCAAAAAAG-----------CACACACCACGAACACACACACCACACACACT--CACGCACACAGACGCATACAAAAAAACCAAACCAGTTCAGAATGTTTTTATGTT-ATTATTTTTTTTTATA-------------------TATACATCTTTTTTAAGGTAAACAAAAAAGAAAGAAACAAATCGAAAA-----------------CCAAAAGAAATTTAAATAAAT----GCGAG-AAAATTGATGCGTAACGAT--TCGCTTGTACATCGTTATTGATTAAAACTATTACTATT
CCGATGCAGCAACGACCAACAGCAGCAGCTAACTAAACTTGTTGCGCAGCTGTTGTTTGGCTGGAAGTCGTCGGCGGGTATGGGGAATTGGATTGGAAGGCAATGCCGAAGAACTAACATGCCGCCGACAACTGTAAAATGAGGATTCAAGAAAAACAATACAAACAAAAACAAAAACAGCAACAGCAACAAAACAAACACAAACACAAAAACCAAACCAGTTCAGAACGTTTTTATGTTAATTATTATTTTTTATATTTTATAAAAAGAAAAAATTATTTTTTTTTTTAACTGAAAAAAAAAAACAAAGAAAATATTTGAATAAAATGCGAGTAACTGCGCAGCTAGAAATTCAAATAAATTAACACGTGTCTAACCAGCGCGCGACAATTATTATTTATACAAAGTTTTGTGTTAAACCAAAAACAAAC
>CG3566 6120206 6121459|7719 chrX 6120305 6121881 scaffold_25 168630 170271 - 4576|0 1298
GAATCCTGTCCAGCAAGTGCATGCAAAGACCCAACCAAGCCAAAATGCCATATCATCATGTAAATAAAGAAAGCCCTGCGGATTTCCCTTCTCCGCTCCCACACGGATTGATCTCCTTATCTCGCTAGAACACCAGTATTCCTGATAAGGCATTTCATCATC--ATCATTTCGTACGCTC-CACTTTCCTTAATGCATG-AAGCTCCTATTCCGACCACAACCGGTTTCGCATGAGCATGGCCTGCGTTTCAATCAATAAGTACAATTAGCCAACTCTTATGTAATCCATT--AATTGCCTCGAAGCCCCCAAAGTTTCACGCTTCACGTGTCCTGAAAGTCTCTATTT----------CGTACACTTTTTGGTGTACTACT-------TTGATACCCTTTGATA----CGATTGGATACCCTGAAGAAGATAAT-GATGATACAGAAGTGTTCCTTAAATTATATCAATTATTTATATTCCCATATAGAGTATCAACTTTTTCTTTACCAACCGCTAACAAAGCCACAATACTTAATATTTAATGAATCTAATGAATCTCAACTTGCATGTATGATATTTGCTCCATTCA-AGATTTAATT--CCTTCTCAAGCACGAAAAT---------AAGGTTCTACAAAAGCTAGTTGGACTTGTAAGTTCTAAC-CACT--------------GACCTGTGTACATATATTACCCATCAT------------GATTAACCCAAAGCAC--ACGTCAA-------GCAACTGGAAT----------------------------TATGTACATATATAAATGTG---------------ATAATCTAGAATACCAACAATTTGCACGCTGTAATT-----------GGTCACTCTTTGGTTTTGTGAATGGCACCCCACCTTGACTTGCGTTTTTATTTTGATTCTTGGTTCTGTGCCTTGGTAAA---GTGCCACGCCTACTG---ATGCCGCCGCCACCCCCAA-GCAATGCTGCATCCTAAGTTAAATCAACCCCTCTAGAAATGC--CTGCAAAACCGTGTAATCCTAGCTAGCTAACCAAAGTGCACCCAGTTTTGTTGTTGTGACACCCAGTCGGTCGGAGTGCC---TTATCCTGACCATGATACTCCCATTGAT-TTAAACCGCCTTTCATATTCTCTATTCCATGCAACAGCTGCCGTCATGTGGCACTGGCCCTGGGCGCCGCCTTCATCGGCATCTCGCTGGTCTATGTGATCCGACGCGGTGTGGCCAGAAACTAGTC-TGCGGCCGGACT
GTTTGGCGATTAACAGGAAAATTGAAACAATCAA-CAGAAGAAATTGGCGT-CCGTTTTGT-GGCAAACAGAGC---GTGATATGATATTGTGTGCATGCA-ACAGCATGATCAT---------CAAGAACATCA-------TCATGAGCAACAACATTATCGAATTAACCCGCACGCGCATACATTCTAAAAGGCATGCCCGAGTCAGCTGCAACTGGAACCGGTTTCCAATTAGAGCG----------CGATCAGCAA----------CAGAATCCAATTGAATCCATTTGAATTAACAGTTCGTCCTTAACCTAGCATAATTCTCGTATACTCTGCATGCTGATTTGCTAATCGGGTATATATCTATATATATTCTATTTGCAAGCTTCAAATTCTTCGCCAGCACCAAAGTGAAATTCTACAAAAGCTGATCAACCACTCAATTCAGCATGTAAATTTATAATAATTTGTGAAAT--CGAAATTAAATGTGCACATTAACACAGGCACACGCACACAAA--CGCACCAATATACATTTAGGCA---TCATGTATGT-AGATAACATTTATGTTACAGCTCGTGTTGACAGACTCTGTTAGCCTGCCTAACAGCGCAATTTCACCTGCAAAGGTGAAAAACGGGCGAAT--GTTCTGTTATTTCAAATGCACTCACAGAGCAAGCGAGAGTTTTAATTTGATGTTATCCATTATATTAAAGTGAAAAATAGACGGAAAGCTCTGCCGTCAAATTGACTGCATTTCCAATGCTTTGAGCGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATATGTATATATGTATGTATTAGTGGCTGCATCTTATCAATGCTCGACATCTAGCACGAAGCACATCATGCCAGCACGACACCTCTCTCGCTCTCTG-TCGCTCTCTCTCTCTCACTCTCTGATCAGTTTTTATT-TTGATATTCTTTTTGGTTTAATTAGTGCCACGCCCACTGCCAATGCCGATGCCACTGACAATGCGAATGCGAATGCTAG-------CGCCAGTTTTGAGACTGCCACGCCCAAACAATGTTGCATCTTGCATTAATCCAAATCGAACACAATCTCCCC------CCACCCCTCTACTAATATTGCCCCGTTATCTT--TTATGATGTATATATGTATACTATATATGATTATGTGCTTTGTTTTTGTCGCAACAGTTGCCGGGAAATCGGACTGGCCGTGGGCGGCATTCTGCTGGGCGTGGCCCTCATCTATGCCTTCAAGTATGCAACGGCCAAGAAATAGTTGTGCAGCAGGATT
>CG32744 6122213 6122379|7720 chrX 6121882 6122330 scaffold_25 170422 170857 - -218|358 490
ATAACTCAAGAATTCATACTAAGTTTTAGTAAATTGGTTTATTCAAAGGCACAAAATAA------------TCAATCACAATAATTATTGGTATTCGAAGAATAAAATTTTCA---ATTTGTGTGTTCAATGT
ATAAATC---------------TTTCAAATAACTAAATGTACTCAAATAGACAACATAAATGTATTCCCTGTAGTTCATGTTAATTGGCAGTAAATTATGGTCAAAATTCCAAAATATTTAAATATTCAATAA
>CG32744 6122213 6122379|7721 chrX 6122344 6122569 scaffold_25 170858 171081 - 14753|0 35
ATTTTTTCACCCTTATAAAAATTGAAGTTAGTTAGT
ATCTTCGTAACACTATTAAAAGCCAAGTCAATCACT
>Top3beta 6129374 6129782|7734 chrX 6129370 6129580 scaffold_7 5131162 5131401 - -117|4 250
TCTTAATATAAAGCAACTTAATGAAATCTCGTGTA------ACTTGGAACTATTTTATGGTA----AGAAGCTACCAATTCCAAAAAATCTTCAATT-----------------TTTTA--------TAGGAAAAACTTTATTTTGTTTAGTTTTAAGAGTTTTTAAAGTATAAATAAAAAAAATGTTCATATGTAGGGGTAAACTATACAGAAATAAATAAAAA-----TTGAGTAAATACATTTG
AAATAGT-TAGGTTTACGTTAAGAGCATTTAAGTATCAATTACTTGTGATTATTATAAAATATTGAAGTAGTTAAAAACGATAAGAGAAATGCATTTGACAGTTTTAAAACACATTTTAGAACACATTAAAAAACAGTTTGACAAGTTTTTGTTAGGAAATGCTCAAAGTTTTTATAAACCCAACGTTCATATATAG--------TTTAAAAAGTTTATCAAGAACAGTTTTTAGT--ATACATTTA
>Top3beta 6129374 6129782|7735 chrX 6129581 6130315 scaffold_25 353692 354456 + 17953|0 283
GGACACTGAATT----GCATTTAG---AAGAACAA------------------------TAACTAAACAAGAAA-------AAAAAAGCCTAAT------------------AAAAACGAAA-TTGTATAAATAAAATTTCCATTTCATTCTGTCTTTA---------------AGGGGCT----TTGGACATAAATAAATATTAGGGTAGCATTTTTTTAAATTCCA------TAATTGTAAAACATTTCTTATATTTGTATCCATAAATACATTAATTTATT
TGCCACTGGCTTCCAAGCATATCGCTAACGACCAGCTCTAATTCTATATATATTGCATTTAACTATGTAAGACGTAACGCTAAATTAGTCTAGTCTGCGAGACTTGGCAGTAATAAACGAAATTTGTATAAATCTAATTTGGTTAACGTTTTTTCTTCACCCAAGCGACAGCATAAGGGTTAAAATGGGAGAACATTAAATAGCCATCAAATGTTGTATTAAACGCTGGACAATTGATTAAAAGGCATTACAT-TCTTTTAATCCAAATAAACGCCATTTGATT
>Rpt4 6134704 6134854|7740 chrX 6133604 6134727 scaffold_36 576754 577849 - 41000|1117 1140
AATTAAATGCTATGTAAAGATTAG
AATTGATTACAATAGAAAG--TGG
>Rpt4 6134704 6134854|7741 chrX 6134852 6136013 scaffold_36 578363 579466 - 65600|0 2
GAG
AAG
>CG15891 6138340 6138980|7744 chrX 6137967 6140294 scaffold_28 1347404 1349783 + 79674|391 1045
ACAGCTGGAGCAGATCCTTAAGAGCAACAAGACCAAGGAGCGAAAGAAGGAGGATTTCCTGAAGCGCAAGCAGGAACTGTACTACAACATGCTGACCAAGCTGGAGCGCCAGTGCCGCACCCAGTACCTGAACGTGCTCATCAAGAAGTTCGCCAAATTCATTTCCCATCTGGCCACAACGATGCGCATTCCGCCGCAGCTGGTGGATCCGTATGCGCGCATGCAGCGCGGCATCTTCTGCAACATCCTGTTGGCCATTGGTGTGCAGCCCACCTCACAGTCGGCCATCTACTACACCAGCCAGGATGCCATCGAGTACGATGTGTGCCATCGCCTCGCGCACGCGCTGCTCAGTTTGATCATTAAGGCGCTGGACTCGGCAGCCACAAGGGATCCCAACGAGCTGGCCAAGCCG---GCCGACTTGGACTTCGAGATGGACAATCACATCAAGCGTCGGCTCATGTGCGCCGCCGAGAAGAAGCTGCTGTACGAGCGCCGTCGCAAG----AAGCCCCAGCCGCAGGGTCTTGGAGCCTTTGAGAAGTGCACCCGCTATGACTGCGACTAGGACGGCTCCTTCAGTGTATTCGTGTTAACATTTGGCTA------CTATTTATTCGCATAAGAAGTCTTGCTCACA-TGGTCAC
GCAGCTCGAGGATGTACTGAAGAATACCAAGAAGAAGGAGCGACGCAAGGAGGATTTCCTGAAGCGCAAACAGGAGATGTACTACAACATGCTATCCAAGATGGAGCGTCAGTGCCGTTCACAATATCTCAATGTGCTGATCAAGAAGTTTGCCAAATTTATTGCACATCTGGCGACGACAATGCGCATACCGCCACAGCTGGTCGATCCCTATGCCCGGATGCAGCGCGGCATATTCTGTAACATACTGCTGGCAATTGGTGTGCAGCCGACCTCGCAGTCGGCCATCTATTATACCAGCCAGGATGCCATTGAGTATGATGTGTGCCATCGTCTGGCACATGCGCTACTCAGTCTGATCATCAAGGCGTTGGATACGGCGGCCACACGCGAACCGAATGAGGTGCCCAAGCCGCCAGCGGACATGGACTTTAAGATGGACAACTATATTAAGGAACGGCTAATGTGTGCCGCCAAAAAGAAGATCCGGAATGAGCAGCGCCGCAAGCGTCAATCCACATTC----AATTATGGCGCCTTTCACAAATGCTCCCGCCTCGACTGCGATTAGATCGATATCTGCCGGGCAGAAGCGAACACAAACAACAAAAACATTTACATTTTTCCAT---CGATCTAGCACACATTTGTCA-
>CG15892 6138340 6138415|7744 chrX 6137967 6140294 scaffold_28 1347404 1349783 + 79674|391 473
GACGGCTCCTTCAGTGTATTCGTGTTAACATTTGGCTA------CTATTTATTCGCATAAGAAGTCTTGCTCACA-TGGTCAC
ATCGATATCTGCCGGGCAGAAGCGAACACAAACAACAAAAACATTTACATTTTTCCAT---CGATCTAGCACACATTTGTCA-
>CG15891 6139046 6139839|7744 chrX 6137967 6140294 scaffold_28 1347404 1349783 + 79674|1118 2020
CTTTAG--ATCCATAGATCCACTGGTTAATATTCATACATTACATTACAT-------------------------------TACATATAATAAAACGTT----------------GCTTATTT----AATTG--TAAAC-------------CACATATGCAGTGCTCTTTTGCTTGTTAGTGGTGTGAG------TCATTGGAATTCCTTAATCTTG---------TTGCCATAC-----AATTAATGTTCCATTTCTTTGAAAACATGTAGAACTTTTCTGACTATCAAGTAGTCCTTTGGTTTTACCTCGCTCACATTTCAACTGGGACTGCT----------------CATAAGGTGATCCACTATCG-CAGCGTGAATACATAAAATTGTTAGTGCTCCCGTTTACCCAAATTTTTCGTACACAAAAAAGA----TTTCGAAACATTATTTTGTGTTTATAAGTAACCAAGTTCAAAGCTAAATTTCCAATACGTACAAATTTACCAAGCCGAGACGAGCCGTTCCGTTTCGTTTCGTTTAGTTCAGTTCCGTGTAGTACTCTTCAGCCATGGCCAGCTCCAATGTCTCGGATTGGGATGAGCCGATGCCCACGTCGACGGAGTCGCTGCCCGAGGAGGAGGATCCGGATGTGTGCGCAGAGGAGAACGTAAAGAAGCGGCGGGAGGAGGAACTGGACAAGCTGGAGTTGTATGTGCGGCGCATGGCCTACCAGCCGACACTGCCGCCCAAGGTAAAGCCCTACGACGTGGCCCTGTCCAAGCCCAAGTTGCACACGCTCATCGACAACTACGAGCAGTTCAAGGATGTATACGATCCGAAGCTGCGGGCCAAGCGGATCAAGCGCATGCTGGGCAAATACAAAGCCATTACCACGGA
ATATGGCGAGCAATGAAACTAATGCTAATTGTATACATAATTTAATATATATGTAAATGTGTAGAATAATTATAGATTTGTTGCGTGTGAGAGAGCGTTAGAAATTGTAATATAAGTTAATTTGGCGAATTGATTAAACGGTCGAACAAATACAAATATGCGTTGGCTTGTCTCTTATTTTCGATTTGTGAATCCCCCACAGAAAGCTTACAATTTCGAGCAAAAGATGGCGACACTCGCCAATAAATATTTCGCTT-----AAACCAGAAAAAGCTGTT--GGCAATCAAAG------TTGGCTTTG--------ACATTTGAACTGGTTGTGCTTTGGGTCCAGCTTCAACACAATTCATTTCATGTTCGATAGCGTAA---CATTAAATTGCCAGTTCTCTCGATGTTATAAAAGG---AAAAGCAAAACAAACTATTTTTGTTACTTTTTTTTTTCTTCTGTTTTCGTTTTTTTCAA--CAAAATTTTGTGTCTATTCAAATTTAGCGAAATA--------------------------TTAAATCAAATACG------------CAATTATGGCCAGCTCAAATGTATCTGATTGGGATGAGGCTCTGCCGACATCGTCTACGGAGGAGGCCGAAGAGGAGGATACAGACTACTGCAGCCCGGAGAATCGGAAGAAACGGCAGGAGGAGAATGTCTCCAAGCTGCAGTCGTATGTGCGACGCATGGCCTATCAGCCGGCGCTGCCGCCCAAGGCTCGGGCCTACGATGTTGCCCTTTCAAAGCCCAAAAAACACACGCTCATGGATAACTATGAGCAGTTCAAGGAAGTCTACGATCCCAAGCTGCGGGCCAAGCGCATCAAGCGCATGTTGGGCAAATACAATGCCATCACCACAGA
>CG12219 6144287 6144532|7747 chrX 6144357 6145639 scaffold_28 1355610 1356971 + 25186|0 188
GATGGCAGCCGGCACCTGGACGCGGTGCATGCGTAGTCTTAGATCTTTACAA-------TTACAAATATATACATAT-----ATATTTTTTGCATATTA-GCCATACCGAATGTACTTATCCGACGTTTCGTGTACTCCACAAAGTCAAGGCGTCCCGCCGCCTGGCACCTATTGTGTATACTCTTCTC
GACGG-AGTAGTCAC-----------AAATTCCTAATGCGAGATCATCTAAAGCAGCCCCCATATATATATACATATAATCAATAGTTACTGTTTAGTGTGTCTAGCCGTATGTACTTA------------TGTACT--------TTAACATATTCCG--GGCTGGCATAGACTGTCTATCCGCTGTTC
>CG3446 6194559 6194931|7798 chrX 6194393 6194583 scaffold_26 1882108 1882332 - 647|196 224
AATAATAAATTCACA----ACATAAAACA
AATAAAAAGTACACAGTACACATTTGACA
>CG3446 6194559 6194931|7799 chrX 6194835 6195694 scaffold_26 1883090 1884070 - 32804|0 118
-TCGGC---------------------CTAGTTAATGGATTAGTTAATGCCTAAGCACGCACCTTTTTGTTTGTAGATCATCCGCCTAAGCGCCAAAAAAAGAAAGT-ATCGACCAATT
TCCGGCTGCTGCTGCCGACTGCTTCCACTCTTCAGCTAATTAGTTAATGCAC---------CTTTTTTGTTTGTAG---CTGCGCCTAAGCGCTATTTAAAATGAGTAATAAACCAATT
>swa 6208655 6208916|7813 chrX 6208762 6210428 scaffold_26 1613400 1615017 + 13515|0 161
TCCAGCCTTCCACCATCCACTTTTATTTATTTATTGTATGTATTATCATATCCTGTTATTTTATGTCGCGTTATGTCGATTCAATTAGTCCAAATTTTTAATGCCATAGCATTCA-------GTTAACCAATATGTGCATGTATAACCAAATTTGAAATTCG
----------CATAATTTACGTTGATTTGCAT-TTGAATTTTTTTTTTTCTTTTTTTGTTCT------CATTATTTATATTGTATTTATTTAGTGTTTACACGCTGGCGTTTTCAATGGTTCGCGAACGAACGTTTCTATTTTTAACCATATCCAATAATTG
>PpV 6216295 6216964|7817 chrX 6216292 6217267 scaffold_26 1901037 1901889 - 21329|3 685
AACGTTCTGATGTGATGCGATGTGAAGTGATGCAACGCAATACTATACCACATACCATACCACATACCGATCCAATACGATCCGCCCACTGTTCCGGCATCGTGGCTAATAATCATATACGCTTGTGGAGAGCAGAGCGGAGTGCAGCCTTCGACTGACTGATCCGTTTCATTTGACCACCCATGAACTCAACGCCTTAAACTCAAAACGTGCGCAA-CGAGCACCCCAAGCATAGCAAACACTCAGAACAGCAAACACAAGCCACACACAC-CACACACACACCTGTAACTTGTAATTTTCGTCTCTTTTTTTGTATGGCAAAAACACATATCTAATTCTTAAGAGCACAGTTAAAAAAAAACTTTGTTATTAGTTTCCGGCAAGTCCAAAGAGAGGGGAACACGTGAATTGATTTCTTTAAG----TTGTATATCCAAGTATTGTATTTACTGATA-ACGGATGCTAATGGAAGCAAGAAGTATATAGAGATTCACTTTGTTATTTTGTATTCCAAAC----CTACATATTTATTTCTGTGAACAAACACAAAAATCATATACTTTGTACATTTTGTATTAGTAATGCTTTGAAGGAAATAAGAATAACTAAGAATAACCCAATT-GTGTGATCCCGATCAAAACGATATGATTAAAACAAAAAAGACAATTCG-AAATGC
AGCTCGC-----------------AAGCATCACAAT-CAAAACCATGCAACAAATTA--------------CCGCCACG-TCCGCCCGCCGCTGC----------------------------------------------------CAGTCGACTGA-----------CATTCGCACTGCCAGCGACCAAATAGATTCAATTCAATAGCCGCGAAATCGGCCGACGCCAGCAGAGAAACCAA-AACAATAACACACACA---CACACACACACACACACACACATACA---------------CAATACCTATGCAC-ACACACACACATACACAATACCTATGCACACACAAGCTTGTAAACACCATAATT------CAGCACTTAGAGAGAGAGAGGATTGTATTCATAATTATGCTCAAAAGATTTGTTCAACCTTGTATTTTGTTTCCGGTTATACAGCCGTTATTTATATATATATATATATATACATATATATTAACTATTCGTTTAACAAATATCACTTAATATACATATATATATATATATATATA---TATATATTTTAATTATTTTCCATCTTT--TTGCTTGTGTGGCACAAGAGCA---------AACCGAATCAGCAGCGTCCCGTTCAAAAGGAAAACCCATAAAAGCAAAAGACAACTTGTAAATGC
>RpL7A 6376250 6376361|8031 chrX 6376000 6376769 scaffold_31 160771 161554 + 24316|265 388
TTCAATCTGAAGCCGGTCCGGTCCGATGGTGGAGACTTTTAAGTACACATGGATG------AAATTAGTTGGGCCATGCT------CACTGAATTTGATAACTAATAAACTTTTAAGTGTACAA
TTTTAGCCAGATGCGCGCAGCAACTATTGT----ATGCCTAAAAGCAAATGGACGTCGATTCAAGTAGAGAGTTGATCCCATACAACAACAACAACAACAACAAATAAACATTTAAGTGTACAA
>CG3226 6498342 6498461|8171 chrX 6498348 6499469 scaffold_26 433577 434621 - 30580|0 127
ATATGA-----TAATAACCACACCCATTCGCGAATTAGCTAACTACCTAAGGCACTGCTTCGAT--TCCA-------GCACAATTTGTATATGTGGATAAATAAACTCCCAGCTAGGGCATTAAGTTA
TTATTAGTTAGTTTTAAATGAGTCCAACAACGAAATA---CATTATATAAAATATATATTTGATACTCCATACACATGCCTAAGCTTCTCATGT--ATGAACAGAGTGCAGTACAGTGCATTAAGATA
>CG3198 6516433 6517218|8183 chrX 6517184 6517365 scaffold_6 4207997 4208170 - 3709|0 36
AGAC--CAAAAAAAAAAAAGAAAAAGAAAAAGAAAAG
CGACAGCGAAACAGCCGAGGACGAAGAGGAAGAAGAG
>CG3192 6522497 6522598|8188 chrX 6522482 6523893 scaffold_26 472491 473911 - 34049|15 119
GATTGTATCTATCACGCTCTCGATCGCACTG---CGCGCCTCGTTTTTATTTCATAGGCAATTAATCAACGCATCTATACAATTAAAATGAATGGAAACCAAGCT
GATTGTTTGTACACTTTTTTCTTTCTTTCTGTTTTGCTCCGCTCAATGCTTGATTGGGCAATTTACCAGCGCATATGTACCATTAAAGGAA----AAACTAAATT
>CG3184 6532830 6532905|8196 chrX 6532894 6534010 scaffold_26 486216 487308 - 36534|0 11
ATTCGATATCTG
ATTCGAGGTGTG
>CG14442 6534424 6535039|8198 chrX 6534928 6536624 scaffold_26 488711 490448 - 54309|0 111
GGTTCGCGGAGGCGTCACAGTCGCAGCACCAATCGCTAGAAGGGATATGTGTGGATGACGTGCTAGCCAGGCCTCCATTTCCGCCGGAATATCAGGCGTTGGACGCACAAAC
GTATCGCGAAAGCGCCACGGTGGGCCCACAAATAGCTAGAC--TACATGCATATATGTCTCCATATCTATGCATATAT--------AGATATCGCTCTATACACACACACAC
>CG14440 6541939 6542564|8206 chrX 6541527 6541985 scaffold_26 497343 497771 - -1118|447 494
CGGAGGGAAAATCGCCAACGACTGGAGGTACACCTC-CCAAGCTTAAC
CAAAGAGTAA------AATGATAAAACATAAACAACAACAACAATAAC
>CG14440 6541939 6542564|8207 chrX 6541986 6542287 scaffold_26 497250 497631 - 5183|0 395
GGCAATTTTTTTTTTTAAGTTAAAAATTAACAAGATGAAGTAA--------CGTAATGTAATCATAAA---------------------GTAAAGTATTTTTATAATGCATGCATTATATTCGTACG------------------------------ATATGTATACACACACGACACAAAAACCAAT---------CACACACACACAGACACACACACACCCCCAAC--------------------CCCCACACACACATGCACTAGCATAGTCATTGCCACACATATA-----GAGCCCCCAAAAAAGGGCAGTAATATCCCCCACTCCCCCAGGAAAAAGGAAGCTTACAGCGCCAG-GGTGCCTCACTGTAAATAAAAAAAAAAAAAAAA
CGAGAATTTTTTTTTTAAGTTAACATTAACAAAGATGAAGTAAAAGAAAAACAAAAAGAAAACACAAACAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGTATTTTTATAATGCATGCATTATATTCTTACAATATATAAATATATATATATGTAGTTATATATATATATATATATACAACACGCAGAATAATATATAGATACACACACACACACACATACACGCGCGCGCAGTCATGTGTAAATGTATGCACGCCTCACACGCACACGCACACACA----CACATGCACACATACACGCGCGCGCACTCACACACGAG-----ATACACACATGTGGCGCAAGAAGAAGAA-----GCAGCAGCAGCAGCACAGCGCGAGAAACCCCAAAAAGCAAAAAA
>CG14440 6541939 6542564|8208 chrX 6542288 6543747 scaffold_26 498003 499705 - 34695|0 363
TGGAGGATCGTATAATCGGT--------------TAGCCTGGATTCAGGCAAAT-ACGCCCATTTG---GAGCTGGCTCTCCGGCAGA----------GCAGCTTGGCCGAGCA-GCCCTAA---------AAGCTGGCCAGGATCGGCAG-----------------AGGAACACAGACACATCTACAAATTATATATATATATAAACATATATATATATTGTATACAGCCTATAAGAAAAAAGTTTGAGATAAGGAAACCAGTCCGAAAC--------------------CAGAAGGATTCT-------TGAGGACTTGCAAATGAATGGGCAGCA-----GGCACTCTAGGATTAAAGCCA
GGAGCAGCAGCAGCACCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGGCGGAATCCAATCAGACAACACCCATACACACGCACGGATAGACAGACAGACGGACGACAGGCCATTTACATGTGCACGCCTTGAGCCGAATCCAATCAGAGCGCAATTGGAAGCTTCTGAAGCGGGCTTCAGCAAGTAAAGTGCATCCACA---CACACTCACACACACACACACACACACA---CACACACACAGTAACAACAAAGGTACAGACCAATACAATACACTGACACACACGCCCATAACAATACAACACACGGAATCTAATCAGATGATATCTAATCAGAAAACTGGAAGCATACACAGCACCGCAAGAAGAAAGCCA
>RpL17 6586773 6587012|8262 chrX 6586949 6588397 scaffold_37 199845 201471 + 50479|0 100
AATGTGTTCTGG--------------------------------GCCAGCCGCCCAAGCCGGTGAC-AACTACTG----AAGCTCCATTCTTTTTTTTTTT
AATGTGTTCTGGAACGTGGGCAGTGGCGGTGTACGTCGCCAGCCGCCAGACGCCCAGGCCGGTGTTAAACAACTGAAACAAACGTCATTTTTTTTTTTTTT
>shf 6616680 6616851|8288 chrX 6616353 6617339 scaffold_24 588232 589235 + 16419|372 555
GGCTACCGGCGCACACGATCCAAAATATTCAATCAACTTTT-----------CACTTTTCTACTAAACCAGCACGACAAGAACAACAGCAACAGCGACAAAAGGAAGAAACGAAAATAATTCTAATTGTGATAC-ATTTTTTTTGTAATTTAACATAACATTTTTAAATAAAAACAAAATCTAA
GGACAC--GCAACTGAAATGTGAAATGTGTAGCATACACATGGAAATGAAGCAACAATTGGGCTCTACCATCA--ACAATTATACTATTTAAAATG--AAATGGACAAAAATAAAATAATACTAATTGTGATACAAATTTTTTTGTAATT-----TAAAATTCTTATATAAAAAAGAAATATAT
>C3G 6626633 6627589|8305 chrX 6626791 6626833 scaffold_5 3519027 3519069 + 1898|0 42
TCAAATTGAAATTGAACTCAAAATCAAAATCAGAGATTTCAGA
TAAAGCTGAAATTGAAGTTGAAGCTAAAGCCAGAAAATACAGA
>C3G 6626633 6627589|8306 chrX 6626834 6626955 scaffold_30 879039 879173 + 1074|0 140
AATCGATGCAATCCACGAGCAG-----AACACCAAGCGAACCCTAGCACAAAGCGCGTTATATGCAATTCTCTCTCCAAACAACCAAT----------ATTAAA----TACCCGTGTGTGTGTATGTGTGTTAGAAGTTAT
AATTCGCGCAGTCCAGGCCCAGCCCCAGGCCCCGGGCAAAGCCCGGTTGCAGACGGGC------CGCTGCCTTATTAAAAGAACCCATGGGTGTACTCATTAGAGTTGTGCACGTGTGTGTGTGTGTTGGTGTGAAATTAA
>C3G 6626633 6627589|8307 chrX 6627282 6629975 scaffold_24 602825 605595 + 99875|0 367
TCTTCAAGCAGCAACAGCAAAACACCAATATTATATATGATAAAGT------------ATATACACCGTATTAATTAAACAGTTCAAAACGGTTGCCACGTCTAGGAG--------------------------GAGGATCAGCAT-----------------CGGGAGCAGCCAACAACTATTCTAA-TGGGTCTGAGCAATAATGTTCGCTATTCTCTGTCTATATATATACAATTATACAAGATATTTAGCTGTAATTACCAGCCGATGC-CGAATCGGAAATACATATACATACTTACTTA---AGATGTAGCGATTCAGATACGGATACGGATACATGTAGCCGCGTACAAATAACGAGCCGA
TCTTTATGCAGCAACAAC--AGCAACTACATTTTAAAGTGCAATGTTTACATACACACACACACACACACACACTCGCACACATACACACCTTCTGCATGTGTGTGTGTGGGTGTGGGTGTGGGTGCGCGCGCCGTGGATGTGCATAGCTCCCTTAGACATAACACACGCCGTCGTCAACTTATCTAACTGGGTCTGAGTACAATCGATCATTCACACTACTCTATAC-TAAATACGTATATAAGCTATATGTATATATATATATATATATACACGACTTTTATGTATATATATATATATATATATGTATATATAGCAAT--------AGATGCAGCTGCATATGTGCATGCACATAAAATGTACCTA
>CG3075 6663411 6663936|8345 chrX 6663935 6663971 scaffold_24 649412 649448 + 2277|0 1
AA
AA
>CG3044 6693112 6693343|8364 chrX 6692063 6693222 scaffold_24 1446886 1448086 - 33677|1158 1271
AACTTTATGTATATATAAATATAAATTAAA-TTATCACAATCGATCAAT--TTATAATATAACTAGAAGGTGTCAGCATACGCAAATCATAGGTAATATATATACTCGCATGTA
TAATATCTATATGCATAAGTATAAATAAAAATTATCACAATCGATCCATATTCATAATATAACTAGAAATTTTAA---CACGCAAAT---------TATATTTACTTGTATGTT
>CG3044 6693112 6693343|8365 chrX 6693223 6694509 scaffold_24 1448482 1449736 - 44413|0 121
TTACTTTGTATTAAATGATATTTGATGTATTTGGAAGAGGCTGTTGCTTCTGCTGGCTGCTTCACAACCGCCTGGCAAACTGCTCGGAACAGAAACAGTTTTGTACATAGTCA-TAGACGAT
---------------TGAAAATTGGTG---ATAAGAAAGGTTATTAAGTTG--TGGGTG--------CCAACTAGGAAACTGTTTTAATGTATTATAGCTATATTCAGAATCGTTTAACGAT
>CG14434 6697145 6697281|8370 chrX 6697086 6698000 scaffold_26 1391167 1392070 + 24312|68 219
TCATTCATTTTGTACATCCTCGTTAGGATTAGTTCTGTACCCAAAAAATG---------------GGACTCTGTCTTGTATCATAGAATTACCAACATTTGTTATCCATAAAACATTCTGTGAGGCAAACAAAAAATGTATGTATGTAAATG
TGAATTGCAGCCAACATCCAAG-------------TGTACCCAATAAATGATGTCTACATTTTATGCAAACTGTTCTGATTGATCGATTGACTGACTGTT----TCCACAACGCAAGCTGTG---------GAAAATGGGTGTA-------A
>CG32732 6803247 6803684|8546 chrX 6803164 6804552 scaffold_67 171670 173050 - 23619|84 545
GGATTTAAGCA---GACAACCCACAAAATTCGAGTGGCCATCGA----------AAGCGAAATCAATAACTCAGTCTAGCATTAGCAATTAGCTATCTATTTTTTTTTTTC---TACCATTACTTAA---CTTATTTTAACTGAAAGTTTAAGTCAACAGGTTTTGAAGTTGGATACCAAAATAACTTATAATTCTACAACGATGGATTTGTTGTACATTGAGTAACGGAATATTCTGCTAGATTTTA-AACTCGTGTTCGTCTAGTGTGCTACGCGCATTCTAGGATATAGCGTTTTATTGTTT---TATGTTTGTTTATTTTATTAATTACAATCATGACAGTTTTAGTATTTTGGAATTAAAAATGAAGTCTAACAGCGCAATGTAACCTTTTATAATTTTGTCAAGAAGTTTTTATGACTAAATATAAGATAGGTCAAAAAAAAAAAACA-AAAACTA
ACGAAAAGGCGCTCGCCCAATCAACGAACTCAAGTGGCCATTAACCAACAGTTGCAGCGTGTTCCCAAATCAAATATA-TATATATATATATATATATATTTTTTTTTTCCTAGTACCCATACAAAGACTCCGATCCTAGCGAGAAGCCTAAGAAATC--------AATATCGATACGATAAAAACCCACCA-------------AATTTGTGGGCT------------AACATT----TAGATTCTATGTCTGGCGGTTTTCTATAGC-CGTCGCATAGTTTCCCAGACAGTGTGTATTTTTTTTAATATTTTTTTTTAATTTA--------------------TTTATTTTGCTAAGCTCAAAAATA--------------TCTGCAAATTCTTAAAATATTG-----------------CTTGACAAAAAAAAAACCAAAAAAAAAAAACATGAAACTA
>CG3040 6817560 6817694|8558 chrX 6817408 6817593 scaffold_4 2646994 2647140 - -245|153 186
AAACGATACGAATAAATCGGAAAAAGACAACTTT
AAGTGCTTCGAGTACC------AAACACAACTTC
>CG3040 6817560 6817694|8559 chrX 6817594 6818411 scaffold_37 298171 298968 + 46693|0 100
ACTCGATTCAGATCAAATCCCTTTTTTTTTTGTGTGTACCCCAGCCTTTATTTATCCGAGTAAACTAATTTAATAGCTTAATTCAATATGTGTAATGTGTA
ATGTTATTTATGT---GTCTACTTCTTCTTTCCATATACCATA-----TATT----------ATTTAATTTATTAGCTTAATTC--TATGCTTTCTGTGCA
>ogre 6819252 6819665|8562 chrX 6819072 6819375 scaffold_36 1171088 1171377 - 3417|186 347
TTAATCAATGATCACAACTCGAATCGCTT----------GGCAG----------AAAAGACAATTCTTT---TATTTTA--------ATT-------TTTTTTTTATTTTTGATTTTCCATCAATGATAACAAGACAAACAAACAAAACAAAAAAAAAAAAA
TTAATCAATGATCACAACTCGAATCATTTCAAATCGCAAGGCAGCCTAAAATGAATGAAATAATTGTTCAAATATTTTGTGAGAAATATTTGTTCAGTTTTTTTAATTATTGAATTTCTTTT-------------------GACAAAACGAAGCAAAAA---
>ogre 6819252 6819665|8563 chrX 6819427 6819564 scaffold_36 1171380 1171537 - 2116|0 157
CTGTTTTGGAT--------------TTTTTATTTTTATTTAGCACAAATCATACTACTTAGTTGAAACTCGAGACCAGGACAGGGCCACGCCCCCAACGCCCCGTTG--GTAGTTCTGTGATTAAGCCCTGACCT----TTTAACCCCTTCCAAAAAC
CTGCTCTGGATTATATTCATAATTATTATTATTATTATTTAGCACAAATCATGACAATTAGTTGAAAACCACACACCGAATGCAAAAAGGCAAATGACAATCTTTAGCAATAGCTCTTTGCTACATGCCTACCTTTCCGTTTATCACCCGCCCAAAAC
>ogre 6819252 6819665|8564 chrX 6819648 6819898 scaffold_36 1171604 1171870 - 16338|0 17
ACCAGATGTACGAGATGA
AGCACACGAAAGAGACAA
>inx7 6836847 6836965|8580 chrX 6836660 6837372 scaffold_36 1204852 1205547 - 15034|208 326
TTTATGCATTTCAATTAACGCTAGGCAATTAATTATTGGAGCTTTGTCTTGTTTACACCTGTTTTTTTTTTATATATATATATGATCATTTCATTATAAATATATTTATTATTAAGAGA
TTTATGTACCTTAATTAAAGCTATGTTATTAATTGTTA----------TCGATTTCAGATGTTTTTTTTTTTTAT-------------TATTATTTTGAATATATTTATTGTCAAGTTC
>cm 6854536 6854713|8601 chrX 6854672 6856365 scaffold_36 1241640 1243324 - 82294|0 42
ACAAAAT-CATCATCCGGATTCCAATTCCAGCTTTAATTAATA
ACAACACGCCGCGCACGGCCCTCTACT-CAGCTTTAATTAAGA
>CG14425 6920901 6923470|8651 chrX 6920544 6921440 scaffold_67 44696 45519 + 4193|404 989
ATTAAGTCAATGCAAACCAAAAGTAAATATTAATTATTTTTTTTTTCTTGGATAGCGAAATGAGAAAATATTTTTTGTGACTATTTTTTGAGCATGTGACGTAAGGCAAATCATAAACGAACTTGATTTTTTTTTTAATGAGACAGTTTTTTTCTTGTAATTCTTTTT--------------AGAACATTTTTTTCTTTACT---CATAAGAAGCCAAGCTAATTTTGTTGTAATACCGAGACCGAAATGTAGGCGCAGCAACTGAATAGAATTTTTTTTTGGTAATTTTAATAACTAACG-----TTGTAGAACAAGGTAACCTCACAGAAAACCTAATCGCAAATACATTTAAAATGTTGTTCAATAATAACTTAAAGCATGAAAAGTGTTAAGTAACGGAATATATAT-TATACATTTTTTTATATCGAAGTAAATGTGTCTAGAAGGTAAAATA------ATCTTTTTATAAAGAAAAAAACAAAATACCAGAAATATGCATACAATTTTTTTTTCTAGCATAAGACAAAGCG-----------------TTTTTTATATAAACATATTATACAAGAAAACC
ATAAAGGAAATGAAAA--AAAAAAAACAAATGTGTGTTTTTTTTTTCT-------------AACCAAATATGTTTT----------TTTGAGCATGTG--------TAAATT---------CTTATTTTTTTTGTAGAGATGATAATTTTTTTTTTAAACTTATATTTTATATAAAAATGAAAGAACATATTTTTTGTTGTTAAACATAAGCAGCCAAGCTAATTTTGTTGTA------------------------------TATGTTTTTTTTTTTTTTTGTGAAGGAATAATCGAATGCGCAATTAAAAGATATATAAACCTCACAAAAA--CTAATTAC--ACACATTTTAAATGTTGTTCAAGG-------AATATATGTATATTAATACATACCTATATATATATATATGTATATATATATATATATATATATGAACCTACAAATATATACATACATTTTTTTTTTATAAATAAAAAATAAAGAAAGTAAAAAG--------AATCTTTTTATAATGCATAA-ATAAATCGCGAGAAGCATACACAACTTTTTTTTTTGAGTTTAGCATAAGTGAAAATC
>CG14425 6920901 6923470|8652 chrX 6921441 6921662 scaffold_22 1288457 1288653 - -1869|0 224
AAGCGAATATTTGAATCACTATGTAAGCGACATTCATTC--TAAAGCCATCCAGTCGGGAAGGCGGCGTCGAACTCACTTAAATCGAATGCAAATAGTCTCAACCAAAGTAGCCTTAGTGAGTAAGCGGATATATACATAACGAATATCGGATTAATCGGAAGGAGAACTCATACAATGCATATGGCACCT-TAGCATGCTGTGTCGATTGTCTCGTGTAACTAG
CAGAGATGAAGTATATC----TAAAGGAGACAACTATACGATCATTCCATTTAGCTAGAGTTGCG--CTCGAA------------GAAGGTGCCCCGCCCCAAGCCACATGCCCCATGCCA-----CATGCATTTAAATGAAGAACCTTCGGCTACTTGAGCGAAAAACTAAAACTCGATGTTTTGTAAATGTAATATGCTTATGTAAGTGCTATG-----CTAG
>CG14425 6920901 6923470|8653 chrX 6921663 6922673 scaffold_67 46507 47695 + 2206|0 1255
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ACAAACGAG--------------------CGCCACAAAGC----AGTTGTGGTAACAT-----------------------GCAGCGAATT------TAGA--------ACTTAGAGTACTTAACGACAGGGATTCGATGTTGTC------------------------------AGCCATGTGTAACGTATTCCTATGATATACCCGATGTACCCGAGTCTCTGCTCCACAATTAGCCAAATTTTAAGCGAGCGAGG-----------------ACGCCTAGCTTG--------------------------TAGTC-TAGTTGTAG--CATTACGAACT---------------AAC-------------------TAAATCGAAACGATTCTTGTGATCAGTATGTGCGGTCTTGCCAAAGATTCAAAT----TGTGCGAGTGCTCATCTCTC------CCTCTCCC--------------------TCTCAACTTTAACTTGATATTATTAGCGATATTCATATA----TTTAGTATCCATAACGACCCGTTTTG----GCCATGTGTTTCTCAAAAGACTTTGAACCGTACTCAAAAGGCAAAGGA---CACGAATATT--AAACTTGTACAAATATCCGAGAGTTAACGACCTGAA------------CCTTTTGAA-CACTAGAAGCCCGCCTATCCCGCATTGCATTATGCATGTTTATACAGATTATACAGATATAT-TATATACCCATATATACCCATATACACAAGTAGATAGAATTAAGAGGCCA
ACAAACTAGTAGCTAAGTATAGCCCAAGTCGTCGCGAAGCTTATGGCTGTAAGAACATTATCGTTTAACGTACTTAACTGAGCCACGGATTCATCAATAGATAATTGTGACCCACAGAAATTTAAGTTAGTGATTTTAAGTTTTCAGTGTTTTGATTTTTTATTGTTAAATTTTGAGCCAGCCAGAATGTATTCCT-TCCTACCTACCACCCATATATATAACTGCTCCAGAATTAGCCAAATTTTGTACAAAGTATATAGATTTATTTATTTTTATGTTTTACTTGACTTCATCAAACGGATTTATGTACGATAGTTATAGTTGTAGAATATTAGAAAATTTGTTAGAATAAGGCAACGGATTCTTAAGATAATCGATAAAAGGAAACGTTTCTTGTGATCAATATCTGCGGTCTTGCCAACGATTCAAACAGAATGTATGAATTCTCAATTCTCAATTCGCCTATACCATGGGCGGTGTGTAGTGCGTTCCTTGTTTTAGGTAGAC-CAAGCAGGTATATACATATATATTTTCTGTAACCAATATAGAATATTTTATAATACGATACGCTATACTAACG--TATGACAAGCTCACAGTAGGCAAAGTGTTTCTTAAAGACTAAAAAATTGTACAAA-ATCGAATAGTAGAGCATGTCGATTAAATTCAACGCCTTTCAAATTACTGGAAGCCCGCCTA----AAATAACA-TATACACG-------------CATAGGTATATGTATGAATATGTATGTAAACATATATATGATTAGTTATAAGAAAAAAGCTA
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CACAAATCATCGAAACATTGGTAGAATTAGGCAACATTAAATATCCTATAATCCTTAAGTGAAATAAATGTGAATCACAAGATTCTTATTTCAGCTTCAAATTAAGCAGGCACTTTTTATAATAAACGTAATAAATAAAGATAAATATAAAA
CACTAATTA-CGATACGC--ATTGAATTTTTCAAATTTGTA---CCTACAATC----------------GTGCGTAACGACATTCTCTTTCTTGCGTC-AATTCAACATTGAACTGTAACAAGAAATATAGCTAGTGGTGGCACATATAAAA
>CG4617 6948071 6948255|8691 chrX 6948190 6948247 scaffold_10 3082413 3082470 + 1641|0 57
CCGGATTGCAACTGCAAATGCATACATATATATATATATATAATCATACCAGGCCGCT
CCAAACTACCTATGTACATACCTACATACATATATAAATTCAAGCATATGAGTAAACT
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AGTAAATT
AGTTAACT
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CTCCAATGCATGTGTAAT------AAACAG----------TTATTTTACTATATTATTATTATTATTATTATTATTTAG----------CGCTGC----------TGTAGGCGTAACCAAAGT--ACAATTGATTAAATGCTTGCCCCACATATATT-----TTTTTATCTGGCTTCTT-------ATATATTATATATACATATATATTTGAATTGTTTTTTGCTCATTTTTGTTTGTTTA---------------------CGCAGCAAG-AAATACTGTGATACTGTGATTCATTTTTTTTATTTGAAAGATTTGAACAATTCAACAAAAACCCCA---TGCAATTCGATTGAATAACGCATTTTGCGAACCGAAAGTGTACTTAACTT----------AGAACGGAATTCGAA------CTATAAATTGTAATTGTATTCAATGTGCCATTAGCTTAAGAAAAT--ACTAAGAAGAAAAAAAAAACTGAAACTTCC------AAGTACTT-------AACATATTT----ATAATTA-TATATATGTATGTGTGGCCTATGCAAATATATTTGTTAAGAGAGCTCTATATACAAAATGACTATACACTTAATATCTAATATATGTATATTTTTCTAAGATATATTTGGCCAAATTTGATTGTGCTGTCCCC----CTTTTTTTTTTTGTCTAATAAAACAATGTCTTACAAAT-----TGTTTATAGATATGTAATTTGTAT-TTTGTAACTTATTTA-TAGCGAATAAAGTGTCGAAAA--T
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TTTTCCTACCCTGACTATTGCCAACTGAAGAGCATCAATACTATGTTTATAATAGAATATAAATAAATGCCAACACTAAAAACA
TTTTTCCAATTTAACT-----CAATTTTA-AGCATTAGTTTTATAAATCGTATTCATTCAACGTAATTTTTTTTATTAAGTTTA
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TAACAGACGCACATCCTCCCCTCAAATTCCCCTCAACGCATCCGCAGCCACACTTGCA-GCACGCCCCACTGCCCCGCCGTGTCGCACACGCACACACATTTGTGTGCTCGCCGCGTCTCTGTCCGGGTCTGGGCAACTGCAACGGCAGCTGCAACTGCAACT--GCAACTGCAACTGTAACTGGAGTAGCATTAGCATTCAGTCTGCGGCAATTAGCATCCGTATATATATAAACACTTATGTGGTTTTACCTTACATTCGCATCGCTTGTCGATATT------------GTGTCGATTGTCAGTTGAAAACAAACAATTCAATGCATTTAGTTTTAATAACCTCATCATTATTTA
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CAGCTAAACTATGACTAAA----AACTAGAGCAAAACTAAATAGCTAAAACTAAAACTCAAAACTA---AAACTAAAAGAAAA------------GGCAGACACAAGACGAAGACGAA------AACCAAAGCAAGCAA-------CAAAAACAAAACAATTTAATTAAAGGAATA-----AAAACCATTTTAGCCTTAGCA---CCATGTTTTACCCACCATTCCTGTTTAATGTATTTATTATGATAAACAAATACACACACACGCACACACACACGCGCGCACACACAC-------GCACACATCCACACGCAAACTGTGTTCATTTATAAGCAAAAACTGTAAAACATTAAGAAAACAAAAATATTTGACTTAATAACGAAAACAATTTAATTTATAAGTGCAATGTGATTT-TCTTGCAACACACCTCCCTCCCTCCCAAGCAACCCTCAACTAATTTAACTAATTTGTATTTATTTAATTGTACTTTAAGCGACAAAAGCCACACACATACATATTT
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AAATTATGTCATATCATTATAGTTTTTATTCTATTCAGAGATG-GTTGATATTATATCACAATAGATATTAAATTTTCATGGATAGTTCATAATTATGATAAACTAAACACATTAAATCGGTCGGAATATGTATATATAGCA----TATAACAAAA
>Atg5 7159851 7160367|9002 chrX 7160091 7160513 scaffold_28 1215750 1216143 + 7963|0 282
CCTTATCCCTATATGTATATAGCCCTATGTTTTGCCCAGTTCGCGTGCGTGTATATTTATGTTTGTGTTCGTGTCAATGTGTGCTTGTGAG-----AGTGTGTGCAGTTCTATTTTTCGATTCCAGCAAATCCCAGGGCGATCCTCTGCGATCGATTTACATACATATATACGGATCCATGTATATATCCAAATATATGTCTAG-TTAAGCTAATCTGTATGCTATATTTATGATATATGCCAGCATTTAAAAGAAGCGAGCAGCGCAAACCAAACGATTAAT
----AGAGCTCACAGTGAGCGATTCCATGCTTT----AATCCAGGGCCGT-----------TCTATACACGGATCGATATACACTTATCGATAACTATAGCCTATAATT-TATTTATTAAGTTCAATGTA---CAATACATATTTATGCAAT-AATATATATAGCTATATA------TATATATATATATATATGTATATCTAGCTTGACTTAGCTCTTGTACTACGTAACGCAAATAGATTTGCACGTCAATTCATCGATCATTTCGATTCGTACTATTTAT
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AATAGATGCCCACGATGATTATGAATATACAGTCAGTACAGTTATTCACACAAGACCCCATAACAAACCCACCTG
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GATATTGTAAATATATGGTTAGCATTTTAAATT
>CG32726 7270460 7270713|9177 chrX 7270640 7271029 scaffold_5 2881817 2882277 - 1557|0 81
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AATATTGTTATAGTCAATGTACATCAAGTTATATAACTGAGCAAAGCTAAAATGCGCGACTTTCGCAGCCTGTCTTATTGTGAAAGGCCCCACTCCACTCTCTCACCATCCTTATACCTCTATTGCTTACATACATATTACGCATTAAGATACTAAAACATATGACGTACGATTTAATATGATATGATATATTATATCATCGCCTACTATGATCAGCAACCAGTTTGTTAATGTTTTTTTTTTTTTATTACTAT-TACAATTATCATATATATA------TATATGATTATGA---TTTCTTTGCGTACCAAATACAC
>CHES-1-like 7528694 7531150|9559 chrX 7528966 7529217 scaffold_5 3229689 3229900 - 1040|0 254
ACAACAAAATAATTGTATGCCTAGCTTTAACTTAAGGTCCTAAAAGCAAGAAAAAAAAACCAAAATACAAACCTTTTTCATAAAATCCTTGGCACGACACACAGTGAAAGACAATCGCCGCCCGTGTTGTTGTCGTTGTCGCTTAAGTTTAAAGTTTAAACAAATTCTATGTAGCTATAGTACGAGTAAAATATATATATATATATAGAT---TACACACACACACACACACAGCAATAGCAAAGTACATATACA
ACATTAAAGTAATT--------------------------TAATAACAAAAAAAAACAACAGATATATAA------TAGAAAAAAAATATGCAGAAATGTGCAG----AACCTATTGCCA-----GTTGTTAAACTT-TAATTTAAATGCAAATGTTGAACGTTTACTTTTTGTTTGT-GTATATGTGCATTCTATATATGTCTATATATGTGTATGTACGTATATATACATATTCATACATATATATGTATGCA
>CHES-1-like 7528694 7531150|9560 chrX 7529218 7529532 scaffold_2 2115423 2115798 + -352|0 381
GCAAAAAACGCAAAA-GCAAAGATCGCAT-TAAAATTGTATACATACATTATATTTAAACTACC---AATTACGA----AACTAAACTAAATGTTGATGTCAAAGAGAAACCAATTTGC-------TAGTTGTTACCAATCAGAAAAGAACACATAAAACAAAAAACAAAAAACAAAAAAACAGAAAAACAATGTTAAAACTAT---TTTGTTCCCTCAACAACTTAT-------------------------------------------TATTAAGATTATGGT--TTTTGTTTTTTTTTTTTAGTTTAATTACATAAAAATATTGCCTTGATGCATATTTTGGGGAAAGA---ATGTGACTAAAATACCAGAAGCGAGA
ACAAACAACAAAAATTATGAACATTTAATGTAAAGTTACAATCTTTGGCTATACT--AACTAACTAGAACTATGACTAAAATTTTAATATGTATATGTGTCTAAGCAAAAACAATGTGTATACATACAATTTCGGCAAAGCAACTGA-AAGAGGCAAAACAAAACAAAAACAAAAACAAAACAAAAAACAAAC---AAAACTCTACATTTATTAACTAAAAAATATGTAAACAACACACGAGAAAAAAATACAAAGAAATTATTTTAAGGCTATTAAAATTATGAAAACTTAAAATTTCAACACACACACACTCACAAAGAAATGCTAAATAACAGTATACTTTTGGTAGAGCTACGCGTAACTGTCAAAAAAAAAGGAATA
>CHES-1-like 7528694 7531150|9561 chrX 7529533 7529746 scaffold_5 3229901 3230072 - 2754|0 214
TTTTAGTTGAATGAACCTCCTGCAATTTTCCTACCCAAGGTGTACATATATACAAAATGGATTAAGCTGTTGAAATGATGCTGCACATC-TTTACATAGGCATATTGTGGAAACCAAGAAATACTTATTAATTAAATAATTAAATAGGCGAAAGGAAAAAAACTTGACAAAGAACGCCCTAAGTGTTTACACTTCATGTACCTTTTTAGCAAAAA
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ATATGGCGACAGGCTGGCGGCA---AATGGAC----GTAATACAG-CCGTTCAAAGATC-GCCACCCTAAC---------CACGCCCCCGCCCATA--------CGCCCTCCCGCCCATGCGATCTGTTGTTGTCTCTTTCTAAAGCAAAAATTGTTCAAATCACAGAGCATTTAGACTAAATTTTGTAATCTTAGCAAGTTCATAGTTTCTTCAGAT---TTTTTTTATTGCTCTACCTTTTACAAATTCTTGTGTGTTTTCGTTTTTGTTATAGAAGTTTTTTTTTTGACTACCATTTTTTTTTGATTATTAATTTTAAACCTTAGACCTTATGTTTTTAGGATTTTTTTTCTGTGACTTTACTGTGCCCCGCAATTAAATGTTGGCCATTTAATTATTACTTGA------TTAACTATTACAATATG--------ATTTAAAGGCCATCCTAGCTGCAATTTCTTACAACTCCTAGATGTTAAGTGACTTCTTCATATTGTAGCTTGTAATTT-TAAATTGTGCAAATAT--TTTACAGACCA--------------ATCGCA------AAACGAAATTACTTTTAATGGCAACCAGTTGAAATCGTAACC---------------------------------------AGAGTTATAATGAAAAAGTATCTGGTTATTCAGGGCCCACAATTCGTTGTTAACTTTTAATACATACAAAACT---CTAGTTTATTTGTT--------TTTTTT-------TTCAACTCGCGACACGAGGGACACAAGCAAAGTGAACTTTTCCAG---CGTATCAGTGACAAGGTTTATATCAAAAGAGAACATACACATAAAACACC----AACAAATTGAGCTAAGTAGGAATGAGTAGCTAAGTAAAAGAAAATAAGAAAAAAAATTGTAAAAA-----GCGCAAGAAAAAGGAAAAAATGTAGAAAGCAA---ACGCAACGTTTGTACAAATAGCAAACCAGAGTTAAGATTCTTTTTTATTTCGGTTTTGTGCCGCAAGAAAAAGGTTTTTCCTACACTTATAAGATCCAAAACACCCTACTTACATGATCTAAAAACAAGCGATATAAAAATATATACATATATATATATACATATACATATAGAGAAAAGTAAGATAAGCCAAGCAAAAAAAAAAAACCCACAAAGAAACACACATTTAGCGCCTTATATATGGAGTCCTTAGCTAAAAACGAAAGAGAGAAAATGTTGAATTGTTTGAACTGCTTTGTTATACGAATGCATGAG-TACATATATATATATATATATATAAATTCTATATATATTTAAGACCCCATCCCTATTTTGACCTGCCCAGTA-------ACCCCTTCCCTCCGCTCCCCTTCCCATCACGACACTCAAGAAAATGTTAAATCAAAGATATTTAGTTAATAAGCC-AGGGAGTAAACCGAAAATCCTAATTGTAAGCTTCATTTAGATGGTTACACGTACATAGTTGAAATATGCTAAACATTTGTTAACACGAATCCAATCGTAAGCTAGCCGA
ATATGGCGCAAAGCTGGCGGCAGACAGTAGACACTTGTAGGTCGGACTGTTTGTTGAACTGGCACACACACACACACACACACACTAGCACCCACAACCTCAGTCGCCATCCTGCTCGCACCAC---TTGTTGTCTCTTTCTAAAGCGAACTCTGTACAA--TGCGGCGCATTTAGTC-AAATGTTTTGGT-TTCCCTTCTTTTTCTTTTATATATATATATATATATATATATTTTATTTTTATTAATTCTC-TGTGTTTTTGTTATCG----AGCGACAATTTTCTTTATTATAATATACTATTTAATATTA----------------------TTATTATTATTTTTTTT------TATAACTATTTTTCATAGTTTAATTTTAGCTGTTAACTTTTTATTGGACTTGATTTAGTGGCAACCATACGTGCCTGTTAATTGTTGGCCATTATATATATAATTTTTTTTTAAT-----------AGTTGCAATTTTCTTTGTTAGCTTTTAATTTACAATTTGTGCATATATAATTTACAAAACATTTAAAACATTTTTATCTCACCTTAGAAACAAAAGAAAACCCAA-AACAACCAACCCACACCACCACAAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAAACAAAAACAAACAAACAACAA------CAACAACAAAAATCAACCAAAAAC---TAATAAACACAAAAATGTCCTAAGGTGCTAGCTGGGCACGATTTTTTAAAAAAATATAATTGTTTACATACGATTTATGAAGTAAGAAAAATGTACAAGAAACTTAAGAAGGAGAAGGCAAAAACTAAAAACAACAAAAAAAAAAAAAAAACAAAAAACAAATCAAAACAAATTGTGCTGACAAACAAAACAAAAGAAAACAA-AAAAAAAATGGCAAAAATGTAGAAACAAGTGAAAGAGTAAAATGTTTAAAACAAAATAAGCAACAATTGCGT---TATCAAAGCA-----------CTTTTATATGTTTGTT---TGCTGTGAGTTGAAA---------ACATATATAAGTC---------------------------AAATGTGTAACACACACATAAATATATACACCTCTATACATATATGTAT---GTAAAGTA------------CTAAAAAAAACA----------------ACATTTAGCGCCTTAT-TATTGAGTCCTTAGCAAAAAAGAGAAAAAAGAAAA------------------------ACAAACAGATGCAGCAGATGCTGTTAAAAATTTGAATTGTTTAATTCGCTACATGTTATATACTAT-TTACTATATTATTATTACAATTATGATTACAACTATTATTACTATTACTATTATAATTATCATATGTTATATATTATTAA--CGTAAGTGCTAACAAAATCAACCAAAAGAAAAAAACAAACAACAAAACTAACACGGGCCAATAAAGCGTAGCA---------TAGCAATCCGCATACCCTATACTAAAACAAACAAACCAACAAACAAACAAA
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-GCTACTTATTTAA--ATAAT-------ACGAATAAAGTTAATGTGTCC
CGCATCATCATCAAGCATAATCATGTTAACGAACAATGTT---------
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CTAGAGGCACCGGCAGTCGCACCACCTGCGGCTGTCGTCG
CCCGAGGCAGCGGCAGCGGCTGCCAATGCAACAGTTGCTG
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TCTCTG-----------------CGAG--AGTGCATATGTGTATATTTAAC-GAGCCTAACCTTCAGCCGAAC
TCTGCGTCTAAATCAGGCCTATTCGAGTCAGTCCACATACGAACATGAACCTGAACCCAGCCTTCAGACAACC
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---TTCATCTATTTAAATCAATCCAAAATTTACCATTAACTTTAGCATTAACTTTACCATTAACTTTAACATGAACATAACTAATGTTGCCTCATTCATGCTATTCACTCTCATTGCATATGTTGACATCCAATCAGTCAGTCATCAGCA---ACCGCACCCGCATCAGCA-----TCAGCATCAGCATCCACATCAGCATCAACAACCGCATCCATAGCCGACGTCGACGAGGCCAATGTGGGCGCTCCACTTGGCCTGAAAGAGGGCCTGCTGCGGCCCTACATGGGCCTTCTGCCGATCGAGCAGCCGAACGATCCCTGGACACAGAAAGCCTATAATCCGCATTATCCTTTGTATAGCGGCGGTGGCAGCTATGAGACGTATCTGAGG---------CCGCGCCGGGACACGCACATTATGGCGCGCAGCCAGCCGC------TGCTGACGCCCGGCATGCTGGAGCGCCTGCTGCGCATCAAGGCGGAGTTTCAGAAACGTTTTCCCCATCTCTACCAGAGCATGCTCAATCATCATACGAATCAGACGCGTGTCGTGGTTAAGCCGCCGCTGCTGGTC----CGTCTATCCAGCAATC--------GGGCTAGGCATAGCGACGAGCCGATCCTTGAGCTGGGCGCCGCCGAGCGCGGTCTCTTTGATGAGGAG-------------------------CCGGACGAGGA--GGAGGAGCAGGCAGACAGTGTCGAGCAGCCGACCACCGAGAAGAACGAGTCCAGCGAGCTTTTCAATAAAAAGGATGACCTTGATGGCGATGTCGACTATTTCCATTTCGAGGATAACGATGACAACGTTGATAACGATAACGATAA----CGATAACGATGCTGATATTATTGA
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ACCCGAA-----------GCAACCAGGCGAAGTCGGTGGATCGGAGAGCCAGAAGAGCAACTCTAA------TCCTCCAACGACGTTGACACCAGCTCCACAAGAGCAACCGCAAGAGCATCGAGTCCACAAAAG
AATCCAACAACAACGACAACAACAAGGATGAGCAGCTGACC-----AGCGGGAACAGCAGCTCCTCCGCATCTCCCCCAACCCCGTCCGCGCC-------------CAGCAGTCATCACATTGAG-----AAAAG
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G------CTGGCGGAAACAGCATGAAAACCAACAACTACAACAAGAGCAACAATTAAAGCCAGAACTGCATTTATTCAAATTATTAATCGATGACGCCAGCTATCGTTATCGTTATCGTTATCGAACATTAAAACTGTTTTTTTACTCTCATTTTCTCTGAAAAGATGAATTTTT--GTCTATTATTTGTGTA-----GCATTTAATCGAAAACTTTGTGATTTGCAAAATAAACT----------TTAAGAA
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T---ATTCCCATTAAGAGAT-----TGCCAAGAGTTTTTGAGGGGGCGCTCAAAGTGGCC---CACCTTATGAAGTGGATAAAGTTCCGAAAACTAGTTTTAAAATCCTTTTTTTTTAAACCGACTTCTTTGTTCCTATCAAATGTGCATATCATTTATTATTTGTAGTTGTAAGCAATTTTTTTTTGTCAAAATACTTGCGCTTCGTGCAATTTACAATTGATTAAAAATA
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TTAGGCATTAAGGTTGCATACTATCACAACAATTTTTTTTTCCCCC---TCACTGTCGTTAAAATAAACTGTAACATGGCTATGTGAAATGC
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TATAGACAATGTCTGATGGCTAAACCAGAGCCAATGCTTTATGGCTATTAAATATGTATTATGGATGATATGAGGCACACATTCTTTTTTTTATTTAAGAAACAAAACCTTTAAAGTGCGATATTTGTATTGTA-TTACCTATAAGTTGTTGTGAACACACACACACACACACACACA-CACACATGCACAGACACACCAAGACACAAGAACA
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TTTTATGCAACCGAATTGTGATGATGTGATAGACTTATA-----------------AAAAATACTAATTAATAAACAATTTAAAACGTTGAAGAAAAAAAAA-------ATGAAAAACAAGCGAAAAACAAAAAAAAAAAAACAAAAAACAAATGAAGTAACAGCCCAAGCC---CCGACACAGG---CTGAAT----------------ATATATGTTATGTATTTGTATTATTGTCAT
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AAAGTTACCA-GTGAATTAA
AATGTTACTAAGTGAAAAAA
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GAAAACTACAACTAAAAAATGTTTTTTTTTTTATCTACTCAAGGGGTATACAC
GAAAACTAAAGCAATAAAATGTTGCTTTGTTGATGGGTTCGGGGAGCAGGCAC
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TATCGAATTATTTCATATTTTTTTTTTAGCGTAGTTGCCAGAGGTTTCATTTTCATTGATCATCATTCTTACATCATATTAGTATGTATCATATGTATGCAACTTTTC---ATATTGTTAGCCAACAAGTTTTCATCGAGAAGCCCCCTCCCCTCCGCCTATCCCCTCCCCTTGATATTCCAACATAGAAGCTAATTAGTTAGGCCATGTTGGTCCGAAAGTTGTTGCCCAAAAACGAAAAACCTGTTGGAACCGCAATATGTTTGCTTTACCTTCTGCCCGAATCGCAGGTAAAATCTTTAGTATTAAACAATTTTCTAAGTTCATCCTCAAAACGGAAAAGCAGTACAAAGCTAGCGAAAGCAGAGAAAATAGCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATAATAAATAAATAAATAAAAATATCAGTTGAAGAAAGGAAACAAGTTAAGCAGTAAAGAGAGACAGGACACAAGGGAAAAGTACGTAGAGT-ATGTTGTTGTTGTAACACAGCGAAATTTCTTTCTTTATATATATATATATATATAACATATGTAT--ATATATATGCAATGATTTATATACATATATGTGTATGTCTTAGGAATATAGAAGAAATATAAGACAACAAAAGTATATATCAGACCACATGG---ATCTCCTTGTAACAAAAACTACATTTAAAAGAAGAGAAAATACATACATATTTACGCACAGACACACACATACGTATATATATATATTTATGTGTGTGTGAGCGAATACCATAAGTGGAAGACATTGTTTATTATAATTATGATAATTATTTTGTTTCATTTTGTTCTGTTTATAATTCTAATTTTGTATTTTTATTTTTTAGTTTTTCTATTGAACTCTCATACGC
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TAAAATGAAAA---ATGTTCACGCTGATATATTCACATTCGTAAAAAGCC---AATGCTAATATTATTTTTA----------TTTTTTCAAAAGTTCTATGCAAATACTGAGAGAAATGAAAAGTGAAAGAAAAGAAAAATGTTGAAAATTGAATTAATTTAAAGGCAATAAGAATAT-------TTACAACAAAATGCAAGAATTATAAGAAAAA-GAAAATACGCCACATTCATCC
>CG10777 7769354 7771935|9923 chrX 7771149 7771642 scaffold_10 1767880 1768459 - 4294|0 599
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ATTTTAGTAATTTGTTAAAGACACACACACACACACACACACACGCACACACACATGAACAAACACACATACGAAAAT----TAACAGAAAATTGTATCAAAAATGAGAAAAGAACATTTTTAAAA----CCTTTTCACTAACTTGGTTGGTATGAAATTAACGGTTTGCTTATA-TAATATATACAAAAATGATAAACACAAAATATTTCCATAATAACAAATTAAGCTAATAATACTCAACAAGCTGAAAACATATAAATTCTGAT-TAAATATTAATATACAGACACACATGCAAGAACATTCACACACACACGACACACACACACACACACGTCACATACACACATACGACACACACACACATACCGCACACAAAGAGAGAAATGCAGCTAATCGTTTTTCGATGAAAGTAAAATTGCGAAAGCGCACCGGAAATTCAAAATGGAATATTTAGAAATT------CGTAAATGTTCAAA---AACATAAAATCCCAGCAAAGGGCAAAAAAGCAGCGCTGCTTTGGTAG-AAGTATGTAAACGAATCTAAACAACAACAAATACAATGAAATATGTATTGGAAAAAAAAAAACACTT
>CG10777 7769354 7771935|9924 chrX 7771643 7772299 scaffold_10 1769092 1769760 - -1953|0 308
-CAACGCACGAACATCGCCTTCGAAACCCTTTTATGTTTTCCAAAC-ACAAGGTAAACCGAATCAAAACTCAAGAAAATCCAAA----------AAGGGAACGATTTTTGTAGTTTTTA---AGCTCTTTCACACACAAATCACACACACACACACCCCGACAGTTGCATGTTCTTCGAATGTTTAAAAAGAATTGGGTAGATTATGTTACCAATGTTATGTTATATTTTTTCTTAGTATAGCCATTTGGTATATGTTATACTAAGAAAAAAAAAATGATCCAGGGACAGACACTGTT--AATTAATTG
ACAACGCGGACACA----AATGGCAACAATTTACGAGTTTGAAAACAACAACAACAACAAAACCAACAATGAAAAAAATTAACAACAAATTTGCAGAAGCACAAGTTACTCCCTTTTTACTTAGAACTTTCGTATATA---TGCATATACATATATCCTAACTAT--------------ACATATATAGATACGTGGAT---TTTCATTTCCATTGATAT-TTATTATTATTATTATTATTATTATTTTTTTTTTTTTGTGCAACACAAACACATACAA-ACAAACACACAGACTGCTTGAGTTATTCG
>CG10777 7772001 7772463|9924 chrX 7771643 7772299 scaffold_10 1769092 1769760 - -1953|385 703
AAATGAATCAACAGTTATCCACATA-ACACA-TATAAAATCCAAATGCATATG-ATGATAAATGAACGAATGGATATAATTTTGCCAACATAACAGAGCATAGCAGCTCTTTAACTTTTGACCAAAATCGTTGC-CTTTTTGTTTCTATATTTATTCACAC----------CTCACTACTAATATT---AGTAGAACATTTGTGTTCTCTTTCGCTTATTTAAGCATTCGCAATTTTTTGTTTGCGATATTGACAACTAACCTTAAATTCGTTAATGTTCTCTGGA--CAAACTGCCGTTAACCATCAATA-ACAAGGG
AAAAGAAAACACAGACACACACACATGCACACCCCAAAACACACTTGAACACGCATAACGAATTAATAAACAGTCATAATTGTGAATCGACTAGAGAGTGACTCGACTCGAGTCGTTCGAATCATACAAGTTATACATATTCTATATGCATATATTTAAATGAATTATTTAATGAGCATTCATATGTGATGTAGAGGATGTCTATTTGCTTGTGTCTGCTCGATAAT-----GATGTATATATGCAGTGTATACA--TAATGTAAACT--GGTACGATTCAATCGATTCAATTTTACATCAACTGTTATTACACCACTG
>CG10777 7772001 7772463|9925 chrX 7772300 7772919 scaffold_46 210150 210812 + -190|0 186
GCGGGACAACA------ATACGCTA------------ACGCGCTCATGGGACGAAATGGAAGTGGATCGTGGAAAGCTACAACAACAAAAACAACAAGAACAGCAGCAGCAGCTTTAATAAAATCAACCACATTGCAAGCAACAACAACTCAAACA-----ACTATAACAACACCAACGACATGGAC
GCCGAGCAGCAGCTGACAGATGCCACCGCAGCGCTGCACGCGCGCATCGAGC-AGCTGGAGGCGCAGAAGGCGAAGCTGCA--GACGAAGACCGCGA----------AGCTGATGAAGTGCGTTAAGGAGTATCGCAGCAAGGAGCAGCAGGAGCAGGCGCGCAAGGACAACAACAACGATCTGGAC
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GTCCCTTCTGAAGTCCCGCCTGAAGTCCCTTCGATTTCCACATGA--TGATGATGTTTGTGATATCAGTGGGGAATAAAAT-CGTGTAAATAG--------CGTATACCTGT
-----------------------------------TGCCAGGCGAATTGTTTATTGTTGTGATA-----GGGGAATAAATTAAATGTAAATAATTTAAATTCGTGTACCTGT
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AGCGGAGAGAAGCGGTGCTGTTTCCATCCCGCACAT---------ATGTCATAGCTTTTT---TTTAGTTGTACA--------CTACCTATCAATACACACTTGCGTTTAACTGTCGCATAGTCTAAGTGAGA------TCAGAGGA-------GAACGAACCGCAGGAGATGCAGAATCCGGCAAGACAAGAATATAAAAACAAATTA--TATTGAAAATAACAAA-AGAAATAAAAACGAATGTGAATCTGAGAAACCAGA
-----GGTGGCCTGGCCTGGTTTTCGGCATGGACATCTCAAGATAATATAATAGCTTTCTATATGTAGGCGTACATCTAATTTCTTCTTATCGATAT-TAAATACAAAAAACCAGCACATTTTTGTGACGAACAAAACTTCAAAAGAATAATTTGAAAAAAAAAAAAGAAATACTTTAATTGAAAAATTAGCCATAAAGAAACGCGTTACCTATCGGAATACACAAATATACATAGACACAAATATGTATATTTAAAAAAAGA
>sws 7802055 7802653|9960 chrX 7802254 7803061 scaffold_24 1302905 1303813 - 7307|0 423
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CTATAAATGGAAGGGCGTCTGTCTAAGATAAATATATATACA--------------------TATATATATATATATTAGCAT-----AGCAGGAGTCGGAG-------CAGCAGCCGGAACCCGAACTGGAGCTGGAGCTGGAGCGGCT----------------GGAGCAAACG-GACCATTCAACTGGCCAACAAAATCTCCATTGATTATGTAGT------TAATAATGACAATG-AAATCGTTATCGTTTA-GTTAAATAAGTGTACATCATATTTAGGCTTAGCTTTAGCTAATCACACA---CACACACACACACACACACACACACACACACACACTTGGAATCCCTATCCACACGAAAAGACACCGAATTGCAGCAGCTGCTCTCAACTCCATGTATGTACGCATGCGTGCATGT
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TGA
TGA
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TCAACTGGTAAAAATTCAACACA-TACTCACAAACGGACACACACACACACACACACACACTAACAGATATACACCCACACATAGAGCTGCAAAATTGATATAT---TCTCTTTCGAGAAAAATATACATACATATATATAGATATA-TATATACATATTTATAT----------AAATACCTATAAATACTATTTAGG-----GTCAG--TTAACCGAA--AAATGTATAAA
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GACGCGTTTTGTTTGCTTAATTGTTTGGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTATATA-AGACCCCCAAAAACATTTATGTATATATATATACATATATCTATATATGAAACGAAATGCTTAATTGATTGAAAAAGCGGAAAG
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GGATTATTGGATACGTATACCAAAACAACAACAAAAGCCCAAACCAAAAAAAAAAAGAACAAAAAA
TCAGC--------CCCCCAACAAAACGAAAGCAAAAAGCAAAAATAGACAAACCACACACTAAAAA
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CATTTTACAAACTGTGGCCCAATGTTATTAAGTTTTTACATTTATATGATAAAAACAAGCAACAAAAAAAAAAAGCAAAAAACGAGAGAGAAACTTGTGCTATTATAATTTATTATTGTCTGTGTGTAATTGTATCACGA--ACACTATTATTATTATTATTATTGCTATTATTATTATTATTATTATTGCTATTATTATTATTACT
>Gclc 7947816 7948767|10159 chrX 7947991 7948277 scaffold_3855 261 562 + 1701|0 324
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ATCGTTATTGCAAAGACAATATTCTAGAATATGGAAATCGCA----CAATAAATAAACCAACTATATATATCT----TTAGTGTGATAATCCAAAAAGTGCTGATGTTGGAGCAGATATGGCCAAAAACTGGGGCGCATAGGGTAAGGATAAATATTTAATTAAACTTATATTTGTTTTTTTCATACATATCTGTTATA--AGTATTATTT-------------TACAACGAATATTTTCTCTTTTTCTTCAATAGGCGCTGGTCAAAATAGTCTGGATGCAAAAGCAGATATGCAAACTGATTTCAGCGTACAGAGTGAGTGCA
>Gclc 7947816 7948767|10160 chrX 7948763 7949266 scaffold_31 1514241 1514748 + 24587|0 4
TCGAG
TTGCG
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ACAGAGTTCGTCTTAAGCAGAAGGAATATAATGTATACATTAAACTTAGAAGCTA------------AACAAAA
ACTAATTGAATATCTGATAGTAG---TTTCTTTTATATAATAAATTGTTAAGTTATAATTTCTAAATAACAAAA
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TTGATTGCGTGGCGGAGTTATTTAGTGGAGGCGCCTCCCAGAGACTGACG---------------------GAATCGTCTAACGAGTGGT--------ACACCAAAATAAGGTCTAACTTTAGCAATATTATGCGTAGTTCTGTAACTTTTCGGTTGGTTGGAAAGGATCTTGAAAGCGTTTTGCAAGCGGTTTGGGGCCAAAATGCGTTTTGATATCCTTTCGCTGTAGCTGTATGTAATATCTACATAGATCTAAGAGTAAAAACCTAACATAGTTGCATCCAAATCAAACTTAAGGAACTTTGAGTCTTTAAAGGTATTTTTTATATATTTTGTTTACCTTTTTTATTTCCTGAACAAGTTTTAATTTGGAATAAACATACTTCTAATATACAA
TTGTTTCCATTTTGGGCATGTTTTGATACAACAATTCT-ATAGACTGATGTGGCTTCAATCTCAAACATGAAATTCGTTTAACGAATACTCAACGAAAATACCAAAATAAGTTATAACTGCACCA----TATGATTAGTT---------------------GAAAGCGTCTTGAAAGCATTTTAC----TTTTTGTCGCTAAAATGCGTTTTGATGCGCTTTCATTGTAT-------------------------------------------TAATTGTAGC---ATTAATTTCAAGCACATTCAATTTTTT-------TTTTTGGCTTAGTATACTTAACAGTGCAATTG--TAATAAAATTTAAATTTAAAAACTATCGAGTCTTTTCGCGGCT
>Smox 7983608 7984457|10195 chrX 7982639 7983990 scaffold_10 1144181 1145486 + 1687|1055 1480
ACCCGAGATTCATCAGTGTTACTAGTCAGCA---GCTCCGCGGGATATCAAAATGAGAATCGGAATTGGTTTC----------AAAGAGAAAACCAAGA--AAAATTCTGAGAGCACAT---ATGAAATA-AGTTCAGGCAAATTATATACGAGTACATAAATGAGTAATTGAAAAACAAATGGTAGATG-CAAACCAGATGCAGATATATCTATATACAAAGAGCACACACTTACATGTGGGATATATATCTTTACAAGCATATATGAGAGAGAACATGTATTTGGCGTTACAAGTTTAGGACTATATATTGT---------------------GTAGGTGGAAACGTGGAGAGAGTTA--CAGTTTTCGATAAGAAGCAACAATTTTTTTAAACATTTTACATACAAAAAAAAAAAAAAAAAAA
ACCAAACATATAAGAGTGTCAGCAGACGTCACGGGCATTGTACGAAATCATTATTGAAATTTTTGTTTTTTCCTTTGGGAGCAGAGTACAAAATCAAAATTACAATTTTGAGAGCACATTAAATTAGATGTAGCCCATGCAGTTTGCACAGCGCTACAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACAAAAAACAAAAAAAATAAGAGAACTACTATATTC------TATCTATCTACAT-----ACATACATATACACAAATAC--------GAGATCATGTATTTTGCGTTACATGCTTAGGGTTTTAGTGCGTAGGAATAGGCCAGATGGGTTGGGAGGATGGGACGTTGGGACGTTTGATTTTTTTTTGATAAGAATGGGCGGCTCC-----AAATTTTA-----AAACAAAAAAAAAAACATT
>Smox 7983608 7984457|10196 chrX 7984455 7986306 scaffold_10 1145923 1147939 + 91617|0 2
GCG
GTG
>CG2263 7989137 7989234|10200 chrX 7989093 7990774 scaffold_10 1150742 1152418 + 86336|44 160
TACCTTAAAAAATCAATAGGACCTGCGA-TCAAATTGCATTTTTT----TTCACACATGAATGTTCCAAA----ACATATTTATAAATAAAA----------GTTCCGCCACAGAAA
T--------------GTTGCATTTGCTATTTAAATCATAATTTTTGAAATTCATATTTGAACAGTAACAAGTTCGCGCGTTCGTAAACAATAAACCAACACTGTTTTGCAACA----
>Gbeta5 7995954 7996302|10203 chrX 7994043 7997665 scaffold_10 1156540 1160021 + 115457|1971 2356
GCCATGTGGCAC------CTTATTGTTGGGGGATG--CATTTGTCCAGGACAGATGC--------------CGTCTCGCTTTGTTTTCCCTCTCTTC---------------TGATTTGTTTTTTTTTTTTTTTTTTGTGTTGTGCATCGCATCTCTAGGATAGTTAAGTTACGGATTCGGTGATCCCCCAAGTGTGTACATATGTCTCATGTCGGGATTGCCAGCATGGATGTCTTGGTTACCGCAGTGTTATGCTTACTACCAGCTGCTGTACCAAATTGAATCTAAATATATACATGTATATGCATCCAAGTGTAACCAATATGCGACTAGTTATAAGTTCCTGTTCGAAATAAATGTTGAGCTATAGACAAACTGGCTTCTT
ATTCTCCGACATGCATAGTATATTATATATGTATGTACATATGTATATGTAAATTGAATCTGTTGAGCACGCTCCTAGGACTGCTCCCGCTGCTTTCAAAATGTATGTAGAACAATTTGTTGTTGTTGTTCAATTTTTTTTTTTGTGTAATAT---TAGAAGTGTTACGCTAAATACT----------------------ATATACTTTAAGT-------------------------ATTATGAAAGGCAAATGCACGCAACCAA-------ACCAAAGAGAAAGCTCGTGTATTTCTGTGTAAACAT------------ATTATGCGCCTAGTTCTAAGTTCCTGTTCGAAATAAATGTTAAAACGAATCCAAA--------TT
>Traf2 7999826 8001069|10205 chrX 7998200 8000150 scaffold_10 1160145 1162233 + 37682|1822 2179
AAAATATGTACCTTTTTTGAAAACAACGAAGGGGCGGGAATATATTTTTTTAACCTTTAACGCA--AAAGCCTCCGTTTATGATCATCAATTTCGTTTGGAAAA------AAAAAAAAAAAAACAACAAAGGCTGTATGTATTATTTTATCCCAATACTTAACTTAGTCCATAGCGATACGAACTACATGTTTAG-----------AGCTAAGAATCCCGGGTAGAATGCACACGCTGGCAAGGATTAGAGC--------------CCAGACTCATCTGGACTTGGATCGCTGACAGCTTGGAACCCTCTCCGTTTAGGAAACCCCAATAAAGGACACTTTTGTACCGCAAATCAATC
ATAATATGTTCCCATTCAAAATACAAATCGGTTG-----ACCTCTTACTCAAAGACTTTACGAAGTAGAGACTTTAAATTTGGTATCCTGGCTCATATATGAGATTTTTCAAAAATATAAACCTGAAATTTAAAATATACATTCTTTTATACT-ATACGCAGCGACATGCGTA-CGAGAAGGCTAGAATGTTTGGCAGAGTAGCTCGGCGAGGGATACAGGGTGT--CTCCCAGGCGGGCACAGCCGCGAGCTTTCTCTTTAGCAATCGCTGTCATGATTATTTGGGTATAATACAACCTGGATCTCTCTATCTTCTCCCTCTTTTTATATA-GACAATTATGTTAGGAAAAATATTT
>Traf2 7999826 8001069|10206 chrX 8000222 8000690 scaffold_10 1162305 1162733 + -2377|0 496
CAACAATATGCAATACCCGATAGCTGACACACACGTATATATATTTTATATAGACCTATATATATATAGTATACGAGAGACCGCTAATAGTCACCGTCTAGCAAGCATCACATTA--------AGCAATCTTGATGATATTCA-AATACTAATCGATATTAGCCTAGTATCCTAGAACTATCTCTTATTCTCTATTTGTATTTCTA-GTGCTAT----------------ACTATTACTTACTATTGGTTCTAGTGAACAAAAGTCAATGCAGATCACGTAAATACATAGGTCTATAATTGGAAAACTTAGTTGGTCTTGGGTTTACCCGTGATACCTTATCAATGCATTTTCAGTGCTTAATTAAT--CTTTAGTTTTCAAAACATTCTCGTCAATTTGATTGATTTTAACTATATTTGTAACTGAGTACGTCCATTTGGCAGAAATGTCAGCCCTATTTTAAACTAGTTTACTTAATATTGCATCTAGAATTATG
CAACGAAATGTCAAAGACGTTGGCAGAAGACCTCAGATGGTAATCAATTAGAG---------TATCCAGT-CATGCTATACCTGTCCTTATATCCGTCTATATATTATTATATTATTATTATTATTATTTTGAATGAGGTTTATACTTTTAATTAA-------CTAGTTTTATGTATTTTTTTTTTTTTTTAATTTGTTATTTTTATATGCTGTTTATAAAACACTTCCAGTCATTCTTTTTCATTGATTTTA-----------TCAATTGCAAACACAAAAAC------GTCCATTATATTATAAGTTGTTCGA----------------------TTATTTATA---TTTC--TGCCTAGGTGACTATTTTACTCTTGGCAATATTCATGGCAGC---ATAGAT----ACTACAAATATAAATATTTATATACATAATATAGACACTTAGGCAATATATTGCATACACCTAGGTAAGCAAAAAAAAATAATTATG
>Traf2 7999826 8001069|10207 chrX 8000757 8004190 scaffold_10 1162806 1166346 + 77798|0 315
ATTGGCAATGGAAAAGGAAATGGAAACGCGGCGGCACCGATGTCTTCCGATTGCGTTAAGTTTGCACCAAGGTGGAT-CGTGAATCATAGGGACCCAAAGGTAAACCGTGCAAGTAGAGAAAAATAGCCAGGTATTAGAAATACATAAGTACGCATGGTAGCAATCATAATTGTCATCTTTTTGAAGCGAATTCATTCCTCTAGCAG-TGTGAATTCGTTCCCTAGATAGACA-ATAATCCCATCTCCAAGGAGTGCTAGCCTAATGCTTGACCTGTTATCACCGTGGCAATATAGTTTAGAACTACTGATAACAA
ATC-TCAACCTGAACTCAAGTAACCACATCCCG------------------TGTGCTCAATATACAAACATACGCACACACATTTTATAAAGACCT-----TATACCCTGTA-----CGAATATTAGTCACAC----GGAAGGCAAAACATCACAGCAAAGCAATTTTTA-TACCGTAGTTTAGAGGCGACTTTAT---CCTAACTGATATATGTACAATGCATATATGCATATATGATAGCAATTT------GAGCAAGCCAATTTTTGTATACATTTACAC----ACATTTTATTGTTAAACAATTGAGAGCAA
>CG10761 8006771 8006892|10210 chrX 8006877 8007828 scaffold_10 1168291 1169208 + 28877|0 15
CGCTGAAGGCATCTAG
CGCCAGAAACATCTAG
>slpr 8015897 8016817|10219 chrX 8015745 8016302 scaffold_10 1177011 1177467 + 7632|160 566
AAATATAT-TGAACTAAACCATATACATAAATGTGTAACAATTGGATTAACATTAAGCTATATTTATACCGATGCGTAAGTGCGTCCTTACACATTACACATTACACACATCTTAGTTGAACTAAGTTCTAGTTTTGTAGGAACTCGAACATTTTTTTGGAGTCCTTCCTCCTTTTTTTTCACCCCCTCAATCTTTGTAAGAGATATTTTCCAAAATTTCCATCGCTTGCGGCATTTCGTTTGGCTTAAGTACACTTAACGAAAAGTTGCGGTGCACATTAATTTTAATTTGATATTCGACTTTTTTGGTATTTTGAGCACAGTTTTATTTACATACATTTATTATGCAATCGGGTTTTCCATTTTATTTATTTATGATTTATTTCTACAAAAAAAAAAAAAAAAAA
AAACATATCTAAAATATACAATATAAATATATATATA----------------TAAACTATTTATATACATACGCG--------------------AAACATTACAAACATCTTAGTTCAGCTTAGCCTTAGTCGTATGG---------CATTTTTTTG-------TTTTTTTTTTTTTTGAGTTCGTCA-----------AGAAATTAGCC--AGTTTTAGTCGATTTCAGC--TTCTTTTCGCT---GTTCATTTCCCA--------------TCCTTAAGGTTTG-TAGATTTTCG---TTTTGTGTGTTT---GTGCAGTTTTATTAACATGCATTGATT-TGCAATTGGCCTTTGTCTACTTTTAGTATTTGATTTG-------AGAGAAAACAAAACGAAA
>slpr 8015897 8016817|10220 chrX 8016711 8016753 scaffold_10 1178494 1178536 + 2751|0 42
AATTAGCTCATTGTTTTATATTAAAACTGTAGACTAAGTCAGA
AACAAGCCCATTGTTTTATATTAAAACCATAGATTAAGGCATA
>slpr 8015897 8016817|10221 chrX 8016801 8018823 scaffold_10 1178784 1180994 + 43531|0 16
AGTCCCAGTTGTGCGCC
A--------TGTGCGTC
>sni 8086734 8086813|10317 chrX 8086755 8089410 scaffold_31 627549 630561 - 25385|0 59
ACGATGACAGCGGT-TAGTTTACCTGCATTTTGTTTCTGTCTGTTAATTGTTGTTGAATA
GCGAACACAACACCATGAGCTACATATATCATGTATATATATATATATATATGTTATATA
>CG32715 8091000 8091367|10319 chrX 8091313 8092936 scaffold_31 632847 634458 - 93688|0 54
GCCGCCTCCAATCACAATAAGGTCGTAGTCGTAGGATCCTGCAGGAGAAAAAAGG
GCCGCCACCAATCACAACCAGATCATAATCGTAGTTACCTGCAAATAAAAGGAGG
>ND75 8093887 8094165|10322 chrX 8093884 8095689 scaffold_31 635755 637667 - 84889|3 318
GCGCCC-------ACTCTCGCGTCTGATCTA--------AACTAATAACTAATTAATGTTTTTTTTTAAACTCTGCCCTTCGTCCTTTCGCGCCGCACT-CGCCCACTAATTAACGGACACAAAGACACCAG-----GACGAGCCGCGGGAAGAGCCAGC----GCAGTAGCGGGATGAGGAGCACGATCGGC-----GGCTGCAGAGGCGCCAGCGCTGCGTCAGTTGTAAATGAAAAAGTCTTACG--TTGTTCAAAACAAAGGAGTTATTCAATACGAAAAATAGGAAAA-----CCAAAATAAAAATGTAAT
GCGACCCAATTCTGATCTTGATACTGGCCTGTAGCACATAAATCTTAAATAATTAATGCTGTTTT---ATTTTTTTTTTCCATTTTTTTTTGTCTAAATGCAAACACTTTTTGCTGTATACTCAAATCCTGGCCAGCGGCGAGCAGCGGGAGGCGACTGCAAAAACAAGAATGAAAGAAAAAGAGAAAATGTCAAAAAGTGTGCAGAGT-----GCGGAGCGCGCCTTGTAAAT------GTCTTTGGGTTTGTTGA----AAAGAAGCTAAACAATACG-CAAATAGGAAAACGAATCCAAAATAAACGTGAAAT
>Corp 8115266 8115560|10345 chrX 8114003 8115333 scaffold_5 1536421 1537736 - 52656|1308 1386
TATTATGATTTGAGATTTAATTA----ATCGCCGTAATAAACTTTTTT------TTCAAATAAACTA-GTTATAAATAT
TATTCAAATTTAAAATTAAATTTTAATATCGCCCTACTATGCGATTCTCATGAATTCAAATAACATGTGTTGGCAACCT
>Corp 8115266 8115560|10346 chrX 8115368 8116109 scaffold_5 1538597 1539366 - 6948|0 205
GTCGCCAATCATGGATTGTACATAGCTCTACTACGTATACGATACTCCAATTAGATGTATTCAT--------AAGCTAAAAGGTTGAACCATTGTTCCTAAGACTTACACTGCAGTAATCGCACCAAACAAACGTCC-----AAACCAAATGTTATATTATGTAAAAAATAACCATTTTTGTTAATAATTTTAAGCTATGTGAATG
G-CGTAAGGAGCACCTAGTCTGTCCCTAAACCAGG---ACGATATTGTATATAGAACCTTTTTTTTTGCGTCTAGCATTAAGGTTGAACCACAGTCCCTACCAGATAAGC--AAATAAACCCAACAATAAAAACTACGTTATAATCCAAAAAGTCAATAAGACTCGAGATTCCCAAACTGATCAATAATATATGTGTATGTATGTG
>CG15345 8242392 8242693|10550 chrX 8241885 8242423 scaffold_0 1073467 1073939 - 2028|526 557
TTTTCGAGGAATAAAACTGAGTGAAACTGCTG
TTTGCCAAGCACAATACCGGGAAAACCCACAG
>CG11190 8249773 8250095|10563 chrX 8249612 8251842 scaffold_10 760257 762573 + 69164|178 545
GAGGTGATACAAAAAAACAG--CCATCGGGAGTCGTGATAAGCTCCCA--CTGATAGTATACCCTTACA-ATTCCAATAAAGTATATTCACAAGGATACCAAACTGGGTT-----------GCAATTCTCGATTTTTAAGTTATTTCAATTTATTTCGGGGGTTTTCAAAAACAGTATTTTCAGTTATTTTGCTAAGAAAAATCAAA-----------------GAAATCG-----CCATGGGATTTCTATATATATTGTAGATG---AAATA--TGTATAAACAATGTAAGAATGAGAATTGCAAAGTATACTTTTAGCTTTTTAGAAAGCTAACCAAATTTGTAACGA--AATAAACAAAGTGAAA
CAGGGGATATAGGGAAAGTGGACAAGAGATACTCGTAAGCAGCACCTATTTTGGCAGCTGTTTCAAACATATTCCAAAGTACGCCAGTCATTTTGATACATCAGTTAGTTAAAGAACTTTGGCATGTCCTGATCATC-GGTTACACAAATAAAACGC-TCCATGTTCATGAACATTTTTTTTTATGGATTTGTTCTCAATCATTAAATAAGATATTCAATCTGTGAAAGCAGTAGTCCATCTGGTTTCCGC---TATTTTAGATGCTAAAATAATTCTGTATACATTGATTTTATAAAAAATGC----CATATTCCAAATCATTTTGAA--------TAATTCTTAGCAATCCTTGATCAGGTTGA--
>CG32711 8253243 8253560|10568 chrX 8253236 8253537 scaffold_5 4005698 4006023 - 1169|7 343
TCAAGGAGAAGATGTTTTTG------TGGTCAAAAACGTGCAGATGACTTCTAA----GAAGTTGGAAAATCATGTATTTACTCGGAAAGAAGCCAGAACTGAAGTAGCATAC----TTATTAGT--------------------ATTATCAAATGATGAGTTTTTTCATCATAGT------TTTAGTTCTATATTTATAGAAAAAAAAAACTTTCCTTGTTACTTTTAGTTTTTTCATTTGAAAGACTGCCGTTGACTT-TTTCAT-TTTATTCGCGTGCATATTAAATATGTGTGTTAAATATACATAATAATAAATGATCGCTGTGTTTATGCA
TTAATGAGAGGCTTTATTTACACGGATGTTTATAGGTATGTATATATTTTGTTATTTTGGGGTTGTTAAAACTTGTAGCTAATC------AAACTATACCTGACTTTGTATACCTGCTTATCAGTGGGTTAAACTAGCTCAGTTGATTATGATACAACATTATCTTTCATACCTGTGCGCCATAAAGTTCTACATGTATGGTATAGATAAATATA------------TAAATTTAATATGTCTTCGACTGTTATTAGTTTAGCTCATCTTTAGTCTGTAGTATATATACTTTGGTAGTTAGGTATAGAAAATAATAGTTAATAACTAAATCCAAATA
>CG32711 8253755 8254014|10569 chrX 8254007 8254092 scaffold_5 2614650 2614730 + 2128|0 7
ATTCTCCA
ATCTACTA
>CG32711 8254899 8254988|10573 chrX 8254690 8254969 scaffold_10 764027 764361 + 373|285 355
TCTCATGTGCATTTATGAAGATATACATATATATATATATACATATATCTGCATATATGACTGACCAAAAG
TCCCATATATATGTACATTAATATATATATATATATATAAGTATATATTTATATATACGTATATGTAAAAT
>CG12125 8279153 8279880|10610 chrX 8279268 8279397 scaffold_57 103459 103605 - 2471|0 146
TAGTTTAATAATCTGAGATTATTGATATAGACATGTACTCTTAATGTT---------------TCGATATTTTTCAAAACGATAACAAAATATTGCAGATAGGGAATCAGTTAAAATACTTCAG--TTTTCCGACTAACGACCAATT
TCGTATAAATACTTGAAGTTATGAATATATTTTTTTTTTTTTAATATTAATTTTAAATACTTACCGATATTTTTCGATTTGATAGCTCCGTATTGCCGAGAAAAACGTAAGCAGAACGCCACAGCCTTTTTCGTTTAACGTCGAATT
>CG12125 8279153 8279880|10611 chrX 8279580 8280248 scaffold_10 2084504 2085284 + 22387|0 427
CTGGCGTTCACTTTAG----------------------CTAGCCTTCTATCCATACTT------------------CTTGGACTCCC--------CTTCTATATATTTTTTACAAAAACCATTTGGTTCGG--TAGTTTCCCTAAGAAATGCTCCACAAGTTGACTAATTTTAAAGCC--------------------ACATACATCCAGCCACACGTACAC---------------------CAAATCCACGCATCGTCATTGTATGAATAAG--CTGCATTTAAGTCACC-AAAACATTTGTAAAATAAAACTGTTTACCGCCCGCTC--CGAGCGAGAATCCAGC---------------------------TGAAATACCTCCGATTGCA----TGGGTAAAGTGGATCCAGGTGACAGACGCG
AAAGAGGACCAGAGAGGGAGAGAGAGAGGGGCAGAGAACGAGCATACGAGAGATATTCATGCAGGATGTTGATGAAATTGGGGACCCGGCCAAAGCTTCTGTTTATGTTTT--GATGGCAATCAAATTTGAACTACTTTATGCCACATACG-TGCATACGTTGACTAATTTTAAAGCCATTCACACGCACCCATACAGACATACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACATGCACATT-TATGATTAAGAATCGCATTAAAGTCGCCAAAAACATTTGTAAAATAAAACTGTTTACTGCCAGCAAAGCAAACCAGCTGCTGGCTAGTTGGCTCTGCCTCTTCTCCGACAATGGGGCATCTCCGATTGCAACAGCAGGTGGAGTGTATCCTCTTGCTTGGCGCG
>CG12123 8286478 8286646|10615 chrX 8284318 8287351 scaffold_10 824294 827400 - 113806|2295 2490
GTTGGACTTGGAACCGCAGATTATTTCGATCAAAAAACTAAAAATTGTAAATTGCATTAGGTGGTCACGATTCGAGCGTCGATCGTGTTTTTTTTCCTCTTTTGTTAAGCAAAAGTCAAATATA---------------------GTTTTCAATTTATTTATTTA-ATATGTAATTGTATATACGTA-----AAAA
-------------CTGCGGAT-----------AACAATTCATAACTGTTA---GCCTTAAA--GTCTAGATATAAAA--CGATTTTGTGGTTTACTGCTAGTTTTTAAGATACA---AAATATACAATTTACAAATTCTATGTTTGTATTCAATATATTTATTTATATATGTGTATATACTCATGTATGTATATAT
>CG15347 8303719 8303932|10650 chrX 8303692 8304580 scaffold_10 3904700 3905563 + 21336|27 246
GATGTA--ACGACGGCCAGAGTCGAATGATGGACGAAAGTCAATCATGCCACAGACCCAGTTCTTTTAGAAATTCCCGTCTTATTATTTTCTACATTCTAAAACATCATTATACATACATACATACACTGGGATGTTACATTTATACTCGTTTATTTCATTACTTTGAACAAA----ACGTTAATAAAGATAACTAAACTAAAGAAGACAAAAATAGAAA
GACGCACTGCAGCAGCTGGCTGCGAGT-ATTGTTGAGCGTTGAACG---------------ACATTTAAAAAT----------TTGTATTGCCCATTTT------TTTTTTTACATATTTACA---ATTTACATTTTGCATATG---CCGTATATTT------TTTAAATAAAGTAGAAATTAACAAAAAAAAAAACAACAACAAGTAATCAAAACTAAA
>CG12116 8312679 8313168|10662 chrX 8312451 8312975 scaffold_3 2551266 2551718 - -1357|228 541
GGGTGGGTGGGTAGAATTTTAGATTTCTATAGGTTTGCCATTCACAAT--ATTAACATATATTGTTGATTTGCTACTTTCAACTGAATTTGAAATTGAGTCTATTTTTAATTAGAATAGACAGGAATCACCGAAGCACACT-CCTTATATTTTACC----------TATAATATATTTAAAACTGATGTTCAAAAAAAGAGTACTGCAGAATATACTTAGTAATTAGTTACTAT----TGGTAAATTTGTATGTGCAGGCGTGAGTTTATGAGTCAGCAATGCACAACAGATTAAACAAATATACAGAATATAC
GCTTAAATTGGTTGATTTTCGTTTTTCTATCAGATAACATTTCACAATCAATTTATTTATTTTTCAGTTTACCCATTTTCTTACGAGTGTG---TGGAATTTA--------GAAAACACGTTAAAAATAATTTTGCACATTGTTTTGAATTTTGTCGTCTTGAGAGTTTCATCTATTT-CCACTTTTGTT-----GGTGGATTATGC------TACTTATGCATAAATTAATATACTCTGAAAAATTCAAATTTATAAGTGTCTGTGTAATAATGAATAATGATGAATTAACCAATCAGTCAGTCAGTTTAATC
>CG12116 8312679 8313168|10663 chrX 8312976 8314135 scaffold_10 887019 888246 - 28747|0 242
GTAGCACCGTGGCGGTGGGCTGCGTCCCCGA--------TGGACTCGGTTC-------------------------------TAATCTTGGTTGACGATTTAAATGCTGTACATGACTTGATCGCCTTGGAAATTAATAAAATCTGGCCAATGTCCCAGATTTCAGACC----------TGCAAGTGC-ACGAAAATCAAGCACACGAACAGGAAAACGAACGAAAAATTATATTTTTATTTT
GTAGCAATGCAGTCGTGGTCTGTGCATCCACTTGGGCATTGGAGGTGGTTCGCACTGGCACGCACTGCTGCAGACAAGCATGTTAACATGGCTGACGATATTGATCAAGATTTTGTGCTAATGAAAACGGAATTGAATAAAATTTGGCTGATGACCCTCGTGC--GACTAACGGTACAATGTGCGTGCTACGCAAACGAAACACACGAAAACG-AAACACAAAAAACATCATCTATTTTTTCT
>otu 8330229 8330739|10677 chrX 8330268 8330651 scaffold_10 906506 906924 - 2043|0 444
TTGCAATTAA-CGGCTTTTAAAATTTAATCTCAC--------------------------TTTTAAATTTGTAGT-----TAACTTTTTATAGGCCATAA-GCGTTGGCGCTCTATC--ATAAACCATTCAGCTTCTGTACAACAATCG-ATTGCATAACCT--------AACGCAAATGTCAACCCAACTTCATTTTAAAAATGTAATTTAACGTAATTTTATGCGAATTTTTTTAAAGTTAGCC---GTCACGAAATCA-----AAGAACCACCTATTTATATGATTTATTTAAAACCCTTCTAACCAAAAATATCTACATACTATCTACTATATATATACATATATATATATATATATATTTATGTGCTCGCTGTTCGGCTAGAGACTCACCTATGTAAAGTGT---------ACCATCAAAAATTAACCATAAATAAAACA
TTGCATTTCATCGACTTTTAAAACTTGCTCGAACAACAATAACTAAATAACCATTCGCCGTTTTAAATTTGTATTAAATATAATTTTAAAAATATCACAGTAAACCAGTTTAATATCAGATCAAACATATAAAATCCATAGAACTATCGCATTATTTAACACGCAACATAAACAAAAACATCAAC-------AATTTTAAATATGTCATTT-ATGCAATTTTATGCGATTTTATTAGCAAACAACTTCAATTTCGAGAGCAACAACAAGAAACGC---------------ATTTACAATCAATTTATTTATACATTTTTAAAAATTATTAGCTA-ACATATATATCTAAAATTAAAAGCGGGTTGCTTTCTTTTTTGTTTTATAACAAATT--ACAATGTTAAACCTCTTCACGCAACAATTTAAAGTTTACAACAAACAATACA
>PIP82 8370753 8370950|10722 chrX 8370457 8373353 scaffold_5 49159 51988 + 47578|347 551
GCGGATGAGGATTAT-GTATAGAGGTTAAGGATCTTGAAACTCTATATAGTGC---TTCTAACACAAACATAAACGTGTATTCAATTGAAATCAATTCTAAATTATTGTAATGTTTTTTTTTTTCTTTTGTATTTTCAAAATTGT---AGTTTCGGTAACCAACTTGCGTTTTTCGTATGCCCAAATATAAATTTTCGAACACTA
TACGAAAACTCTTACAGCAAATACCAAAGAAATAATGAAAAACCA-AAAGAACAAAAGCTACTACGAACTTAGGTCAAAAATCTATAAAACTTAAAATAATATAATAATATTTTTTTTTTTTTTTTTAGAAATATGCAAAGAAGCGCGAAATTCTTT----AACTTGAGAATTGTGTTGAACTAGTTGTAAGTCTTTGAACATTG
>l(1)G0095 8400479 8400788|10757 chrX 8400787 8401776 scaffold_5 6536377 6537368 - 52606|0 1
CC
CC
>CG12111 8415483 8415525|10778 chrX 8414130 8416137 scaffold_393 1896 3709 + 39439|1407 1449
TTTTCGATTGGTTCTAAAATAAAACCAGCATTACATACATATA
-----AACGGGACAATACCTATAATTATATATACATACATATA
>CG2056 8416335 8416573|10779 chrX 8416572 8416655 scaffold_393 5264 5320 + 116|0 1
GT
GT
>oc 8476576 8477583|10855 chrX 8476333 8476637 scaffold_5 571618 571987 + 4236|323 392
GCTAAAACTTAATTCCAATTTCAAGTTCTTTAAACCAAACTAAGACATAACA--TTATGAAAAC------
ATCAAAACTAAA--CTAATTCACTGTTCTTAAAACAAAAACATTATTTCATAGCTAACAAAAACAAAGGA
>oc 8476576 8477583|10856 chrX 8476748 8476965 scaffold_5 572149 572414 + 3590|0 278
TAGCTTAAGCCGCCAGGATCAACGAAGTAAATGAGTGATAAATCAAGGAAAA----------------------------------------AAAACCGATGACAAACATTTGTTAAAATCCAGAGAGTAAATG-CATGCGAGGATTGCGAAAAGTGGGGCGTTAATTGTAAGTTGGCAGGAGAGTTTTTAAATGCAAT-------------ACGTAGACCATTACGTGGTACAGCCAG-------GGGGGCGTTGGGTGGCAATCAACCCAAAAAAAA
TAACTTAAGCCGCCAGGATCAACGAAGTAAATGAGTGATAAACTAAGTAAAAACGAAAAACAAAAAGCAAAAGAAAACAAAAAAAAAAAATTAAAACATTTAACAAAGATTTGTTGAAACTC-----GTAGTTGATATGCGATAATTTCTAAGTGAGCGAAATCGAAAG-AAGTTG------CAATATTTATAGACAATTTCGCGGAAGGGGGCAAGGACGAGGGCGTGGTTCTGCCAATATATGCTGGCTCCTTGGCTGG-GGTAAACTCTGAAAATA
>oc 8476576 8477583|10857 chrX 8476974 8477400 scaffold_5 4613917 4614285 - 2081|0 440
TTGGAAAT-----AGGAAATTCAAGTTCTCATTGATTTCGAAAGACTCTTCTTGACTCGTATAAATTCAGAGTGATAGATATATAGATTTCTCACATTATTGATTGTTAGATTAATTATTAAATTTCATATTGAGGCATTTAGATTTCAATATCAAT-ATCGTACATGGTTATTTATAGATTCA---AGAAAATTCTTTTAAGTCTCAAACTTTCGAAC----ATCCAATTTAGCAATGCCAACTATGATCGCGAAATGGAATGCACCGCGTTGGAGGTCTATTTCCATTCTTTTTTTTTTTTTTTTTGTGTAGTTAACAAGAATTTTTTTTTAAATATATATATATATATATGTAT-TAGAAGCGTGTGTAAAAAGCGGGGGGAGTTACAAGTTTATACAGCCCAAACATAAACGTAAATCTATAACTAAACATAGGTAT
TTGGAAAATATCAAGAAAATTAAAATTTTCATTAAATTCAAAACAATTTTCTTGTCTCCAAAAA----AGAACGAAAAATGT---------TCATTTTATGGCTATACATTTTTCTTGT----TTTTTTTTTCAAATTTTTAGCACACATTTTCTTTGAGTGTACATA-------AAAGAAAGAAAGAGAAAATCATATAAAATGTTAAAAATTCAACTTGTAATCAAATTTTGTAATGC------------------GACATGCA------TACATATACATATACATAAATATATATATATATAT----------ACATAAATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATACATATACATAAA-----------TATATATATATACA---TAAATATATATATATATATATATATATATATATACAT
>Ppt1 8533859 8534015|10941 chrX 8532504 8535185 scaffold_5 4704889 4707582 - 89007|1451 1615
GATGGTGCCCAAAAAGCACGTATTGTGACAAAAATGTTTGCATAGGTTTAATCCATTCTTCCT-ATTAACATA------AGCATTTTAATAT-TAATAATGACTTTTTGATACTTTTATACATGTTTAATTAGATGTTTAATAAATTCAGTTTGGACATACAAAA
GATTACGCCAA--------GCATGATGACTTTGATGGCT-CATGAGGGCAAACAATGGAGCTTTACTAGCATATTTTATAGCCGAGTAACGCACGATATAGAACATATGTACATTTTATATATACTTGATTTGATTATATATATAT-------ATATATATATTA
>CG2004 8557700 8557833|10977 chrX 8557832 8558699 scaffold_19 2446318 2447163 + 46707|0 1
GC
TC
>l(1)G0020 8561950 8562055|10983 chrX 8561774 8562276 scaffold_19 2450306 2450764 + 5463|180 285
AGTTCATAATTTTTTTCGTTTGGGGGGAAAAAGAATGTGGATTTTAATTCTATAGAAAAGTACATATTGTTGTAAGCTCCGTTAAAAATAAAGAGACCTAATAACT
-------------TCTTATGTGGGCACAAAATG-----GGGTACAATCTATATTTATAAGTGTTT-----------CTTCAATAAAATTGGAGGGCTTTGACG--T
>Lim1 8602471 8603260|11038 chrX 8601541 8603125 scaffold_19 2493721 2495516 + 23199|1102 1974
GGCTAAGCCCCACCCCCTCTGCTACGTTTTGTTTTTGTTATACTTTTATTATTATTATTATTATTAAAACTGTGCTATTTTTTTGTATTTCAATTCGGCGCCAAAATATTTGTAAATTAT-----AAAACAAAAAACACAAAAAAAAAAACA----AATAGACAAAGGAAATCTCTCTTAAATGTATAAAAATCAAATAATGGGCGCTGCACATA---------------------------------------------------GTAAACAATTTTTTTT----------------AACAAACAAAAACATAAAAAACACAAAA----GAAAAGCTCTAAAAAAATTAAATTAAACCCAAACACTAAACGTCTTGTCTGTAATTAAAACAAAAATACTATTTATGTGTATCAGTGTA-----------------------------TAAAAACAAAATGAAAAACTGTAGTCTTAAAA--------------------------AAAGGATCTGCATAAAGAGATTTTTTTTTTTGTAAATTAGCACATTTTATTCGTATATCTAAAATTTGTTTATTT---TTGCCTGCATTTTTTGACGAAAAACGTTTTTTTTTTTTTATATTATTACACGTAACATATGGATATATATTATAATCGTTGTCTAACAACATAAACGTAACTAGGCATGTAC-------------TAGCTCCTAAGTCTACATAAACCAGATAT---------------------TATATATACA---------AGAGCTACATACGGCAGCACACACGTACACGGCAAAAAAAAAGA---------AAAGA----------------------------AAAAAGAAA
GGCCAAAAAACAGCTGCTCAGCTTGGTTTTGTTGTTTTTAT-----TATTATTCTGTTTATTGTTTTAGTCTTCTTTTTTTTTTATGACT-------GCGCCAAAATATTTGTAAATTATTTTTAAAAATTCATAGCAAAAAAGAAAGAACATCAACATAAACAAAACAAAAATCTCT-AAATGTACATTAA------AATGGGCGCTGCACATAAAAAGCTAAATATATATTTATACATACATACATATATATAAATAAATATATGTACATGTTTTTTTTTTTTTGTTTTTAAATCTAACTAATGAAAATTAAGAAGAAAGAAAACAGTGTATAACTTTAAAAAAAT---ATTA----CATAAACTAAACGTCTTGTCTGTAATAAACA----------ATTTATGTGTATGTGTGTAAAAAAAAAAACAAAAAAAAAACAAATTGATAAAAACAAAACACAAAAAGATAGCCTAAAAATCGTGTTAGCAAGCAAATAAAAATATAAAAAAATGGTAAACACAATATTATTTTGTTGTATATTAGCACATTTTTTTATAATTCGAAAAACCAATTTGTTTGCCTAACCAATTTTTTTTTTTATTAAACTTTTTTTTTTTATTATATAAATATAT-----AAATAAACATATTTTATAATCGTTGTCTAACAACATAAACGTAACTAGGCATGTACTTGTGTAGTTTTTTAGCTGCTAAGTTTAT---AACTATATATATATATATATATATATATATATATATATACATATATATATATATATATATACATTTATATATATATATATAAAATATATAAAAATATATACTGAAAGGCGCATGCATATATAATGTAAAGCTATATACAACAGCA
>Lim1 8602471 8603260|11039 chrX 8603179 8603642 scaffold_19 2495860 2496310 + 25210|0 89
TATACGAAACAGTTGGCAACGCGGCTGCTGCTCTTCG------GCAGAGAGCGAGAGCGAGAGCG--AGAGAGAGCGGCGCGAGTGGAAG
TATACAAAACAGTTGGCAACGCGCCTGCTGTTTCTCAAGACCTACACGCAGCGGCAGCAGCAGCAGCAGCAACAACAACACGAGCAGGAG
>Moe 8718839 8719182|11215 chrX 8718596 8718882 scaffold_105 30945 31203 - -935|254 300
TGTATAGAAGAATCAA-GAATAAGCAAAAAGAAAAAAAGAAAAAA--
TATATACAAGAAGCAATGAAAAAGAACAAACAAACAAACAAAAAAGG
>Moe 8718839 8719182|11216 chrX 8718883 8719119 scaffold_32 777445 777650 + -1114|0 239
AAAGAAAAAGAAAAAGATATAACTACAGCAAGAGCAGATAATAATAATGATGATTGATAATGATGA---AGATGATGATGAAGAATAAGCAACAAATATAATTCCGGTCGCTGGCAAAAGCCTATTGCTAACTATCCCACCAGCGACGACCCTTTTCCACCCATAAGAACACTTCCTGCCTCCTAAAGTGAATTGAAATGAAATATACTTTGTTTGACCGTCGTTTTGTCTCGCAGCTTT
AAATAAAAGAAAGTTAAAACAAGTGAAACAAACATAAAAAGTAAAAACAAAAATAAAAAATGCTACCTCAGACGGACTTGAAAA-----CAATAATTTAAAT-------------AAATGAATTTATATAACAATATGAACATTTATG-CTTATAAACAAACAAAAAAAAAAAACCTA-----TAGAGCAGAAGTAAATGAAAT--------TTTTA--GTGAATTTACCTCATGATACC
>Moe 8718839 8719182|11217 chrX 8719182 8719349 scaffold_19 2651824 2651991 + 13291|0 0
A
A
>CG1885 8744268 8744462|11257 chrX 8744038 8744270 scaffold_9 3209799 3210017 + 766|237 239
TTG
TTG
>e(r) 8749964 8750299|11263 chrX 8749807 8750614 scaffold_19 2688148 2688894 + 22178|176 515
AGGGACGGCGATGCGACAAGATACATACATATAAAACCAAATAACACGATGATGCATGCATCAATGCGTGCAACACTAACGACAACAACACGTTGATGTATGCAACAATGCGTGCAATAGCAACTACAACAACAACAACAATACGAGGATACATGCAACAGCGCTTGGAACAGCATCCGCAACGGCCACAACACCATAACACCAATAACACCAACAAGATGAGGAAGAAGAAGAAGATGATGATGGAGTGGTGGGGCATCGATTCCATTGGAGACTTGCTGCTACCGACTAG----ATCGCCAAATGACAGCAACTTTTTTTTGCAACATAACGCAATGC
AT--------------CAAAAT-----CAGCCCAAACCAAATAC--------------------------CAACAACAACAACAACACCA-----------ACAACAA------CAACAGCAGCTGCAACAACAAAATATCGAAATAGAGAAGCAAATCCGCAAATGAATCAAGTTGTTTTAAACTTATTTCTTTGCATAGAAAATAGAAAAAACGAAACGAATAAGAAAAGCCTAATAATAATTAATTAATA----ATTAAT---AATTAATAATTGCAACAAACAACTCGAAACATTGCGCATTTGCGG--ATTTTCTTTTCCAATTTTCCAAACTAA
>CG10962 8818129 8818425|11344 chrX 8818124 8818371 scaffold_19 2780471 2780704 + 2992|5 257
CAGTAAAAATCAAATAAAGGCGAACGACCCGATCCGACATG-----GCGCACATGACACACGGCGAGATACTCACATA-CCCCCCCACATTTGGTTTGCCACAAACTGTTGGCACTCA---CCTCGTTTCGTTTTATTTTTATTATTGTGTTCAGTTACTACGTAGTATATACATATATGTATCTATATATGGCATATGT-GTTCAGCACCTTTCCTCAAGCCAAATAAATAATTCAGTTTTGTGAACTAACA
TAATAACAATCAAATGAACGC-AACGACTCGACGC-ACACGCACCCACACACAC-ACACACAGC-ACACACACACACAGCACACACACATGCAGTTTATT-TGTACTGTGGGCCTTTGGTCTTTATTCTCATTTCATTTT--TTATTGTAAT-----------TGTTATGATTATTGTTGTTGTTATGATTGACCGTTACAATTTAACAAC------AAAGCTAAATAAATAATTCAGTTTTATAAATTAATA
>CG10962 8818129 8818425|11345 chrX 8818406 8818651 scaffold_19 2780781 2781021 + 9964|0 19
-AGCCCGACAACACAACGCA
AAGCGCTATGA-AGTACGCA
>CG10970 8914820 8914974|11475 chrX 8914840 8915882 scaffold_5 4603442 4604305 + 13506|0 144
TTAAAGGATCAAACAAAATAAAATATTTCCAATGCATAATTTTGTTTAAAACGGCT-ATCAAAAGTTTTAT-----CCATTATG----ATTTGTCTAATATTTTTGTTGTATGGATATAACAAGGTATTTTCCAAATAAAAATTA
TCACAGGATCACATATCCTTAATGTGCTGTTATG-ATAACTGTGTCTTTTGTGGCTAATTAAAAGCGTCTTAAGTACTATTATGTGACACTTGCTGAATATCTACAAACAATGGATTAGGTAAG---TATTCCAATGAATAAGTA
>CG7267 8916669 8916804|11476 chrX 8915919 8917230 scaffold_5 4604328 4605770 + 18741|891 1060
AGATTCCGTTTCGTCGTATATGTACTCCATATCCGTTTATTTTTTTTTTTCGCAAATCGAATAACTCGTG---TTGATAAGCATAATGAAACAA-----GAATCTATTGTAAATGTTA--------------------------ACGTAACATTTTTTTTTGTAGCTGTG
AAACAAAACCAAGGGGTCCACTTATTTTTTTTTTTGTTAATTTTTTTTTTGTGAAACCGAAATTCTCATGGCTTCTGTGTGGGTCATAAAGCGAACAATGAATCTTCTGTAAACTATACGAATATCATGTACACCCATCTATATACATATAATACTTATATGCAACTTTT
>CG7246 8924042 8924167|11483 chrX 8923998 8925681 scaffold_5 4613840 4615506 + 50630|45 172
TTGGCTAAATAGTTTATTTGTGCTTCTGTTTTTTTCATTAACTTAATTTCTAAGTCGATCTTTCGGACTGTCTATAGTGATTCGATTCTAAAATAAGGAC--TTGTGAATATACAGCTTATAAGATAA
CTAGATAATTAAGCTA-----GCTGGTAATTAGTTATTGAATTT--TGTTTAAGTC-ATGTTT----ATGTTTATTTTCTTTTGTTTTATCAACAAATTCCATCGAGAAAGGATAGAAAATAAAATAA
>CG7766 8938827 8939463|11497 chrX 8938607 8942119 scaffold_10 2110670 2114183 + 91260|225 953
-CCGGTGGCCA-----TTCACCTAAT------------------------------CACTTAATTGTAATGCCAAAATCTCTGCAACACTGGATACGTCCGTTCTCGTTCTCGTTCCCGCTCGCTC-GCACACAGCTTAGCGCCCTCGCTCCGTCTCTCTCTACATCG--ATCGATCCTGCCTCTTTCTGATGTCTCTTTCTTTGTGACCTCTGACCCCCA---------------AGCCCAACGATAATTTTAGTCAGCAGACGCA----------------TGTATATAT---TTTTTTTGACCACCCAAAAAAAAAAAAAGCTTTGTTAACGTATTCGTTTTGTTTCGATTGAAAATGAAATGCAAGCC-----------AATTT-------AAAATGGTATTAGCCCACAT--ATGTACATTATGTATGTATGGATGTACGTATGTGTTGAGACCTTGGAAAGATACTCCAAAACTGCACCCAAAAAACCGATCCTAACCCCGCCACACCACCCAGCCAATCCATTTAGTAAGCCAACCCATGCTGCTCGGATACAGATTTGTTTTTTGTACTGGCAGCTATTTTACAGCGACAACACTTTCGATTGTTTTAACTTTTGTATATTTAAAATGACCCTATTTTATATATTACTATTATACGTTTGAATTGTAAAGTTGAACGCGCAGCAAGTTTTACAATAAAAATGTGTTTGCAATGTTTGACAA
GCTAATGTGCAAACGCTACACTCGACCTGGAAACAAGCAAAGCGTCTGTAGGACGACGCTCACT--TAATGCCATG--TACTGTACTACCGACGGCTTCTATTTTATCTATCTCTCGCTTTCTCTCTGTATCCTGTATCTCTCTCTCTCTCTCTTTCTAACTATCTCGCTGTAGACACAGTCTCATTC-----TCTCTTGCTCGCTCGCCTCGTGCTTGCGTCTGGCCGTGTATTTAGCCCAACGATATGTTAAGTCTG-AGATCCGCCCGCCCCGGCAATGCTGTATATATGTATTTTGTAGACCATCCGCCTACTAAGCCTCAATTGTTAATGTGTTTTATTTGTTGTTTATAATCTTGAGCGGCAATCCCGGGAGCTATACATTTTACTCCCAATATACTATCTACGTACATGCGCGTACATTAACTATGTATTATCATAC----------AAAATTTGATTTTATACATCAAA---------AAAATATATATATAGA--------------------AATTGATTTATACACGCAAC---TGGCAATTGCATATTCAATTGATTC-----CTCGCCGGAATTTTG----AACGACACTTTT--TTGTTTTAGCTTCAATAAGCTGCAA-----------------ATTATTATTGTAAAAAAGAAGTTAAAAG----------AGTACATTTT--------------TTTCCAATGT------G
>Bx42 8949539 8949692|11507 chrX 8949566 8951208 scaffold_10 2121815 2123459 + 87373|0 137
ACAAAAGCTTTAGCGTGAGGATTAC------CAATCATCGTTGTATCGTCATCATCATCATTGCAAACACTATTCACCATT-----CACCAACCAAACAAACGTTTTTTTTAACTACTCCAACAACTTGGCGAGAATT
----AATGTCAGACTCAAGGATCATTTAAAGCAATCCCAAAAATATGGCAAATACATACATAATACATACATATTATAAATATAAACAACAGACATTGAAACATTTATTTTATTCACTCTCAAAATTTCTTAGGAATT
>ld14 8970353 8970464|11533 chrX 8970346 8970877 scaffold_28 1763999 1764620 + 15387|7 187
GGCGG-----------------------------------------------------------------AGGTTGCCCGGAGAACTTGTAGTCGTATATATATAGATGTCTGACTATGTGATATTCTGCACCCCAA----AAACAAAAAAAAAAAAACAAACAAACAAAAACAAAAACAA
GGCGGTTAAAAAGCAAAGAAAATACAAAACTGAAAAGTAACTAAACAAAACAAAACAAAAAAAAAAAAATAGGAAGAAAAGAGAACTTGTAGTCGTAT--------ATGTCTGACTATGTGATATTCTGCACCCAAATTGTACATAGCATAGACAACACACCCACACACACACACACACAC
>His3.3B 8998459 8999332|11565 chrX 8997472 8998583 scaffold_19 2154937 2155982 - 4914|1111 1236
AGACCGAATCGAGTACACTTAACTTTACACTTACGTATATGCATATATATACATAAATACATATATATATAAATATATATA-TATATATAAATATAAATATAAACCTATGCGGAAGGAAAAGAACT
GGGCTGAATGAACAACAATCCAATTTG-GTCAGCAAACATACATATAT---CAGAAATGAGTACACATAATATTGCAACTACTTTATATAATAATACTTTTACATC--------------------
>His3.3B 8998459 8999332|11566 chrX 8998607 8999845 scaffold_19 2156004 2157312 - 23087|0 867
-GTGGATCAGCAGGAACGCCAGATTCGA-----------------------------TCACTGTCGTCCATTCCCGAACAGTAGACCATT---------CACGTACCGTTGTAGGAGAGGTGCA--------CGCCAA--GGAGCT--ATACCAGCGACACATTGATCCAATCTAT----------------CATTCATATTTACATGTATACATTTATCATCCTTTTGTTGTTCAATCGAATCGTCAGCATGACGTTGTCGATAAGAAAAACACCACACACAAAACAACACACA----------ACATTACTGTAATGCTTAAAAAT------------------TATTTTA-----------TAACTCTTATTATTACTATTATCA-----ATTAGTTTTTAAGTTTTT-------TTTCTCGCCTGTGCGTCGTCGGTGTCACCGTGTACGTTGCGCCGTGCTCCTTCTTCTCCAAATCC--GGGTCCACCTCTTCGTTTTGGAAGGAGGGAATACCACCGGGCGGCCGTTGTCGCCTGTCCGCCTGCAACATCCGCCACCAACCACTCCAACAACTGTCCAGCTGGCGGGCTTCG-GTTTCCA-GGTAATCCGTGATCTTTAAGGCGCCTGCCTCGCCTTTATCGCTTCGATCGAGGAGAGGTT--------------CACCATCTGGCTGCCGGGATGTGCGGAGCCTGGAGATCGGGGCCAATCTAACGTCGGCTGGACGTGGCAAGGCGGACAGACGGTTGCGGACCGCCTGGCGGTGATTCCCGGATCTCTGGATGGGCGGCGAG-----GGCATG--GCCGTCTGGCGATGCCACTGACGGCACGCGGCTTTTATGAAG
CAGAAAACATCAACAACAACAAAAACAACAAACAAACAAAATACACAAAATTCACATTCATATTATTATATACACAAACAGCAGCATAGTAATTTGTTAAACGAACCGAAACAAAATCAGTTCACAAATATTCGTCAATTGGAGCTTGATTTCATTTATATCTTACGCAAACATATACATAAATATAAATACCATATATATATATATATGTAGCATTATAATTGTATAACCACACAAAACAAAGCAAAGCAAAACAAATATGAAAAAAAAAAAAAGA-ATTCAGAATAACGTGCATACTTATGCTTCGTTTCTATTATACATACATATATAAACATAATCTATGAATATTTTAATTAATAACTGTAACTCTTATTATTATTATTATTATTGCTATTA--TTATAAATTTGTATATTAGTTTTAAGTTTGTGGCTCGCCCGCTGCACGCATTGCGTTGGTCGACGCCATCGAATCCCAAGATCCCAAGATAGATGCCGTTGC-------------AGTGCCAGCCGTTGGC----ATCGTGTTGCCGTCTCCAACATC--GCCCCATGAACTCCAACAGC----------GCATGCAGCGTGTTGCCACAGGAAGCGCTGCACTCTGAATGGCATCGCGCACAGCGGTCCCTTTAAAAAAAAAAAAAACAACAACAACAACAACACCATCCAAGATACAGAACCGAAAGAAGCCGCTGTGCGTCGCCAGCC--------GCCGGACAAGATCA-TTGGGCGAGTGGGTGCAACGCTTCCTTTGGCAG--CCTGATGCGTTGCATGTGCGGCAAGTCGGCGGCATGATGCCAACGGTTGTTGCAACAG-CATCGCGTTGCCGTTCAGGCG
>Ost48 9002143 9002228|11571 chrX 9001071 9002163 scaffold_19 2159009 2160093 - 503|1165 1185
AACCCACAATCCATAAAAGAA
AACATGCTATTCACAAAATAG
>CG9034 9004729 9004826|11575 chrX 9004694 9005374 scaffold_5 2017211 2017901 + 15054|35 138
AGGAGTTGGACCCTTCGGAAAAATCCTGTCGGCTTTCATCTTTGATTTTTTTTTG---TTTACTCTAA--AGCTAAGTAAAAC-AAACATCCAAATGTACAAAA
GAAAACTGTGCGAT-----------CTGATTGTTTTCAACCATCTTTTTTTTTTGCGCCGCAATATAAATAGCTAAGTAAAACAAAACAATCAAGTGTATAGAA
>Zpr1 9005338 9005707|11575 chrX 9004694 9005374 scaffold_5 2017211 2017901 + 15054|695 733
AGCAAATA--AACAAAATTCGAACAAATTTCCACATAAC
AGCAAATATTACCTAAATCCATGTACATTTCCATAT---
>Zpr1 9005338 9005707|11576 chrX 9005662 9007218 scaffold_19 1820481 1822020 - 70825|0 56
TGAAG-----TCTGCATTCGCAAAAATA------TAGCAATTAATTCATAATCAGAT
TAATATGCCTTTTACCTCTTAAACAATATGCATTTACTAAACAATTCATAATTCAAT
>CG12115 9034544 9034599|11620 chrX 9034510 9034659 scaffold_5 4640773 4640908 - 1349|34 91
ATGTGAAAAGTGACAAAATAAAAAT--ATAAAAAATGCATCCAAGTTATATGAAGAAA
TTGGGC---GCGCCAGGCCACCGATTTGTGCAAAATGCAAGCAAATCAAATGCGCAAA
>CG12118 9039963 9040139|11625 chrX 9039069 9040506 scaffold_5 1980104 1981644 + 35865|922 1203
CGCGGATGATCAACGAAGTGGT------------------------------------------TGCCATTGGAGTTGGACTCCAAATGATGA---------AGCCGTAGCCTTTTAAGCGATGATGACTGTGTTAACTGTTTAGGTTTC-------------------------------CTGTTCCGACACTGTATATAGCCGACAA-----TGCTGGTGTTATATGC-----------------TGCGAAATATA-ATCGATAAGAATTTGAAGAGCTT
TAACCGTCAACAACAATTTCGTAGTACAATTTCCATGTAACCAACACTCAACAATAGCGCAACATGCGACCTTGGCTGGTCAGCAGAAGATAACGAAAGACAAGACGTAGCCGTTTA-GTGATGACAACTGTGTTAATTGCCAAGTTTTTGTTCGGACTTGTCATAAACATTGTGTACAAACTATTTTCACACTCTATAAGTTTGTAAAACACATATTTAAATTACACGCATATGTATGTATATGTATATGTAATATATATATATGTATATATATTGAACTG
>Reg-3 9042027 9042111|11628 chrX 9041740 9042252 scaffold_5 4644864 4645338 - 2944|314 399
AAGTCCCTAGTTCTACGCGAAATACCGATAGTAAATTCCAATCTATGTAATTCAATTAAATACAAAACATGTTT-CAAAAGCAGAA
----------------TCAAAATAT------TATATTCGTATATGTAT------GTATAATAATGTATGTGTTTGTTAAAACAAAA
>CG12119 9051341 9051641|11637 chrX 9051269 9051448 scaffold_5 4655635 4655828 - 2133|72 194
ACTAAATAATCGTATCTGTATCTGTATTTGTATTTTTATTTATTTATAATAAATTAAAAACCATACTCGAC-GAGTGCTGCTAATTCCCAGCGAGAGTGTG--------CCAA------TGAA
TTTAAATATACATATATATATATATATTCATATATACATATATGTAC-TTACATAGAAAACGGTTTTCATTAAAGTTTTGCCAAGAACAATCCGAAAAATGACGCATCTCCAAATGCCGGGAC
>CG12119 9051341 9051641|11638 chrX 9051545 9052300 scaffold_5 4655896 4656686 - 30264|0 101
ATAGCCGCCGTATACAGTC---ATCTATTTCAGGACTCGAGTAACTGGCTGAGTGGATT--TCTGGGATTTCTCCCAAATGGATGTTGTTGAATATGCAACT
GTGGCGGGTGTCCCCATGCAAAATCCATGTCGTG--TCCAATGACACACAACTTTCGTTCGTTTATTGTCTATTCTAAATACATATATCTATATATATATAT
>CG12120 9062876 9063455|11655 chrX 9062562 9062979 scaffold_10 317511 317847 + 787|317 421
AAAGTATATA-ATTATATACTACGGAATCTGATATAAATATATATATATATATATATATATATTAAAATGTTTTTAATAAATAAAAAATATTGTTTTATAAACAT
AAACTACACACATTTTATTTTACTCAATGTACTATTTATGTATGAAGGTATGTAAATATATATT----------TTATAAGTATATA-CATTTCTCCATGAGCAC
>CG12120 9062876 9063455|11656 chrX 9062980 9063248 scaffold_5 4666485 4666774 - -72|0 296
TCTACTTTTGATTTCGC-CATATATGCGCATATATATATATTTTTTTGTATACA-ATATTCATACAAATTATCAGTATATTAATATTTTAAAAGATTTTTTAAATCAAAA--ATAGTTGAAATGTTTTTTTTTCTTACCTTAACTCAAAAGAAGTTCACTTTCCGTT---CTTTGGCTCATTCT-AAATTTAAAATTGTAACAAAAGTACATATATTTATATTGATATTTTACCTACTC---ATTACTTTGTGTCATC----------GAATGTTTCTTTTT-------ATGGTTGA
TATACTTATACTTATACTCATACTTATACTTATACTTATACTTATACTTATACTTATACTTATAC---TTATACTTATACTTATACTTATACTTATACTTATACTTATACTTACACTTGCACTTACACTTACACTTACACTTACACTTAC-ACTTACACTTACACTTACACTTACACTTACACTTACACTTATACTTATACTTA---TACTTATACTTATACTTTTACTTTAACGAATTTCAATTGTTATATGTTGGCATTTATTGAGGACAGTTTATTTATTGTTATAATGGTTTT
>CG12120 9062876 9063455|11657 chrX 9063322 9064601 scaffold_28 236285 237554 - 50968|0 150
ATGCGTAATCCGTATCGGTAGCCATGGCATTCATCGCGTCTTTACTTAATCATTCTCAA---------ATGACTATAACATAA-----TATCAATCTATGATCTATATAACATAACTATAACATAATATCAATCTATG---ATCTATATAT
TTGTACAATTAACATCGCT---------------------TGTACTTATTTGTTGTGAAAAAAAAGGCAGAACTAAAACTTAAACCATTGGGGATCAGTTAT---TATTAAACAATTACAA---------AATCTATGTATATCTATATAT
>CG12121 9074008 9074488|11672 chrX 9073889 9074177 scaffold_46 36161 36460 - 1130|145 322
AACCCTTGTAAATAAATAATGAATCCGCTTAACGGAATACTGAACGCTTGTGACACCCAGGCCCTATCCTTGGTTTAAGATATACATATACATATAAATAAATACACTTATGTAATTACCTATAATTTTATGAATATAACAAA--------GCTTTAATATGTAAACCCAAGATTCAA
AAACCTTAGAAAAAAGGAATCAAGCCTGTCAACTGGTT-------------------CAAACTCATTTTGCAGCTCATTTTAAATGTATGCTAATCAGTCAATGTAAATATGTA----TCGATAAATATCGATAGACAACAAATTTAATCGATTTTAATATATAATCCAAAGCTTCAA
>CG12121 9074008 9074488|11673 chrX 9074477 9074632 scaffold_10 329923 330072 + 7797|0 11
GCCCCATAATGG
ATCGCTTAGTAG
>CG12124 9082022 9082481|11683 chrX 9082341 9082672 scaffold_10 339359 339693 + 2621|0 174
TT----CCAGCTCC--ATTGAAGTTGTTA-----------TCGTTTACATACTACATC------------TAGAACCATTTGTTGGCATCTCTAAGTTTTTTTT-----TAAGGAGACAGTTTTGAAGTGAATTTAATTACTATGTGCACCAAGGATCGTTATTATTAAAGTATT
GTAACATAAGTTTCTACGTGGAATTATTAGAAAACCCCATTCGTTTTCCTTATACACTTGCATATATAAATATAATTTTTTGTTTACATCTATTCATTTGCGTTAGAACTCAGAAAAATGT----AAACGATCTTGATTAATA-ATTAACTAGATGTATGTAGTAATCACGTATT
>amx 9091132 9091427|11693 chrX 9091102 9091406 scaffold_547 4790 5094 + 1117|35 324
AGGTCATAAGCTAACTTTTCCAT---TACAGTGTACATAATAACGAATGCAAATATGCAACCATTA-----GGAATAGCAAGATCTTCTCAAAAACGTGTACATAATTAATTAGGAAATGTATTTTATTAATAATGCCAAAAGTTCTTTTTTGTATCTTTTATCTAGCACAATTCTT-------TGATCGTATCAATAAATAAGTGAAAGAGAAAATATAACCATCTCTTTCTCGTTCCTGTAAGATCAGACAAATTTGTAAAAATAAATGGTTTGTTTCATTCAGAAGA
ACAATGTACCCCA--TTTTTAATGGGTTCAGGGTA--TAAAAACAATGGCAACTCTCCAACAACTATACGAGGACAAAAACCAACTTCCAGGAATCGTAAATATAATAAATACACAAA--------AACAAAAAT----AAAATACATGTAT-TAATATTAATCACGCCCATTTCTCGCCTCTATACTTAAAACAATAAATAAGGAAAAAGAAAAAAATAAACAGCTAGTTTCTATTTTTGCAAACCCACCTCAA---GCAACCACCTATAGGCTATCCAATCCAAAAAA
>amx 9091132 9091427|11694 chrX 9091407 9092296 scaffold_10 349424 350282 + 41212|0 20
TTTAGTTTTACAGGGGTTAAT
TTTTTTTTTTTCGGCGTTAAT
>CG17440 9113653 9113726|11718 chrX 9113612 9113672 scaffold_5 760286 760343 + -251|41 60
TATTTTTCTACGACAATCCA
CCGTTACCATCAGCAACCCG
>CG17440 9113653 9113726|11719 chrX 9113673 9114044 scaffold_5 760587 760937 + 10327|0 53
ATTTGTAATCCCCTAATCATAGCAAGAAATAACAATAAACTGATGTCCAAGAAA
------AAACCGCAAACAACAACAACGAAAAAAAAGAAACAAACACACAAGAAA
>c11.1 9120871 9121345|11728 chrX 9121114 9123421 scaffold_10 807623 809919 + 89747|0 302
AGCATCCAA-----------------------GGGACCAACTCGA--------------TTAATTAGATGT------------GCAGTTATGTTGTGTGTGTTTGTAAATTATGACTTAGTATTGCTCCAAGTGTGATCCCTT-TGC-CTCAGCA---------ATCGTTC------CCTTATTATGTTTGATA----TTTAACTCTTTGTTTTGTTATGTAATCGAAAGTCACGTTATATACTATCTGTATACACATAGCATTATTTATATATTTATAT-TTCCATGTTAATGCGGAGCGTT
AGCATCTAGTGCGCCTTCAGGCTACATGCACTGGGACCAATATAAACGCAAATCTGATCTTAACTTAGTATAAACACACACCAGCAGTCGTATTTTATG---ATACACATTA-AATTTAGTATTTCTCCAAGTGTGATCCCGCATGCGCTTAGCATGGACGTCTAACCTTCATGTATCCTTATTATGTTTGATAATCGTTTAACTGTTTGTTCTGTTAT---------------------TCGTATGTGTGTAAGCATATATGTATATATATATGCGTATATTACATGT--ATGGAAATCGTT
>c12.1 9163135 9163500|11776 chrX 9163498 9164348 scaffold_10 3360892 3361724 - 44142|0 2
GCA
ATA
>CG32705 9171879 9172479|11787 chrX 9172189 9172624 scaffold_50 207259 207632 - 1591|0 295
CCCGTGGTGGTGCCTGTGCTCCTGATGCCACCCGCCAGCCAAGCTCCGGGGACAGCAGTCGCTGCTCCAACCGCTGCCGTTGCTCCAGCTGCCATCGCCGGTCCACAGCCGCAGGGGCAGTTTTACAATGCCCAACTGGAGCCGGCTGCCTATGCCTGTGTTCCTGTCTTGCCCCTCAAACCGATAAGCAATGGAGTGGGAACCAATAGTCATCAGCACCATCATCATCATCACCAACAGCAGCAGCAT-CATCATCACCAACGTCCGCACCAG----AACATCCACAATCACAAC
ATCGTGGTAGTCGC------------AACAACTATCACACAAGCTCCGATGGCGTCA------GCTACAATCGCAATCTAAACACCAACT--------CGAGCAGCAGCTATCGCGGCAG----------------------CGGCGG----------------------GCGCTACGAGACGGT---CAATGGCAATGGCAACAGTAG----CAGCAACATCAACAACAGCAGCAGCAGCAGCAGCGGACAGCAGCAACAACAGCAGCAGCAACAACAACAGCAACAACAACAAC
>CG12139 9205052 9205534|11827 chrX 9205035 9205254 scaffold_7 983092 983255 - -1252|17 223
CCCAACAGAAAACACACACCACCCACAGAGAGTAGCAACACGATCAGGAGGAGAAGATGCAGGAGGAGGAGGAGAAGGATCAGCAGAAGGAGGA----GTAGCAAGTCCTCGGGGACTGGGGACGCCAATAAGCAAACATATCCAAAAATTGATAAACATATGCAACCCCCCACAGGAGAAACCAACTAAAAACAAAAAAAAAAAAA
TCCAGCATCA-----GCAGCAGCAGCAGCAACT-GCAACACCATCAACATCAGCA---GCAGCAGCAGCAGCAACAGCATCAGCTGTATCATTATCATGCCACGCATTCGCAGCAGCTGCACGCG-CACGAGGCAAGCGC-----TGGTTTGTTGGATATAT--------CCACA--------------------------------
>CG12139 9205052 9205534|11828 chrX 9205255 9216782 scaffold_5 5275599 5287194 - 681329|0 322
TATCAAGCCCGTCAATCGGCTGTCGTTGCGGCGGCAGTTGCGATGGCCAGTTGCCGCCAACAG-CGCCGGCAGCATCAGCAGCAGCAGCATCCCGAGAACAGCTATCCGCTGCAGACATAACACATACTGGTC------------------AAGCAGAGGAGGGAGCAGCAT------------------------CAGAAGCAGCAGCATCAGCAACAGCAGCAACATCAGCAGCAGGGACAGGGACGTTCTAGTAGTAAACATCACAAATCCTGGCAGGTAGCCACCGCTGGCAAGGTCACCACCAAGGTCTAGCCGTGAC
TATAAAGCAAATCAGGCAG----CGGTATCGCGACCGTT------------------CAACTGTCGCCGTCAGCAGCGGGCGCAGACGCGGCCC---AACAGTTATCCGCTGCACGCATAGCACCGACCCAACCAACATCAACAACAGCAGAAGCAACAAAGGCAACAACAGCGACAACAACGACAACAAACACAACAACAACACCAGCAACAACAACAACAACAACAACAGAAGCAACAACAGGGAC------ACAGCAAACATCACAAATCTTGGCAT---GCCACCGCCAGCGAGGGCACCACAAAA--CTAACCACAAC
>CG15316 9266954 9269202|11912 chrX 9266935 9267674 scaffold_5 5345386 5346026 - 11009|19 779
GTCCCATCATCCTGGAGCTGGTCGTTTTTATTCCTATACT-------ATTCCCAACCCATTCCCAACCCATT--CCCATCTCGCATTTCAATTGTTCGCCGGGCGATT---CACTCGCCTGTGGCCGTG---AGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCGGTTTAAGCCTCATTTCCTTGCACTTCCGTTTCTGGCATATGAGCACTGAGATAGTGGCTTAACCCATGCCAAC---------------CAAGCCCAAACCTTAAC-----CCCGCACATTCAGAATGGCAATGGTAAACTGCTCTTTGGGTTGTTTGGCTCTTTTGGCCTGCTGAAAAATGCAAAACTTTCATTTGCACTCGGTGCTTGTTAGCAAAAGAGACGGA-GCTAGAGTACAAGCGGCTAGAAC---GAGATGGCAACATTGGGCAGGAGTAGGAGGATAGATAGAGAAGGCCTCTGGTCGTAGTCCTGGCCTTTAACTCGGTTAGAGCCTGGTTAGAAGCTTGGCCATCCCGTTTAGCATTGCCCAGCAATTTATTAGAGTTTTGTTTTGTTTTCCTGCCTGTGTACAGCATATATACGTATTGTAGGTAGGTTAGGTATGTCTGTCTGTCTGTCTGTATATGTATATATTCTTGGCCCCCCCTTTGCCATCCCTTTTCCCTCTTCTAATTCCGTCTTCTTTTTTGTTAAACTCTCTC-GAATTGCATAAGTAAATAACGCACGTAAATGCATTTCTGCAGAACAAAAAAAAAAAAAAAA
GTCCCTTTTTTTAACAGTTGCCTGTTTCATCTGTCATACCCCGCCTGGCCCCTTACCCAATTACAAACCTCTAACTCAGCTCACATTTCAATTGTCTCCATGTTGGTTGCCCGCTGCCCGCTGCCCGTTTCCAGTTCCCAGTTGC-TATATGCGGTTTAAGCCTCATTTCCTTGCACTTCCGCTTTTGGAATATGAGCATATATAGAGCGGTACACACAACACCGCCGCATACATACGCACACACACACACACATCCACAAACACGTGCACACATGGATAGACAATGGC-AACTGCTTTTTGGAAGTTTTGG----------CTACTGAAAAATGCAAAACTTTCATTTGCACTCGGTGCTCGTTATGGAGGGGTATGCACGCCCAAGG--AAATTGCTGGAATGTGGAGAGAGGGTCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCGCAGAGTGTA---CTGGTTGTA----CGGCCTTTAACTCGGTTATCCCCTG----------------------TTAGCACTGCCATACAATTTATTAGAGTTTCGTTTCG-------------------------------------------------------------------------------TTCTTTACTTCTATTTTAGTATTTTTTCTCTCTC--------------TCTCTCTCGCT---CGCTCTCGGAATTGCATAAGTAAATAACGCACGTAAATGCATTTTTGTGCGAAACCCCAAACTGCAAAT
>CG15316 9266954 9269202|11913 chrX 9269143 9269368 scaffold_5 5346085 5346264 - 3776|0 59
AATGTTACAAATGATGTAGCCCGAAAATATCTTACATTTTTGGCCAACATTTTCATTTTG
ATCAAAGCAAATGAT--------------TCTGAGCATTTTTACCAATTCATTCAGTTTG
>CG32700 9351932 9352299|12033 chrX 9351407 9352525 scaffold_5 5456158 5457209 - 10771|591 964
GCAGCTGAAGGACACGCACGATAGCAAGGGGGGAAAAGGACGAAAAATGGACGAATGTGGAGAAGGATGGATGGATGAATGGATGGCTGGATGGTTGGATGGGGATTTCTTCGACAGATGGACGGATGAATTCGGTTGGACACTGGGCAATACAAACAACCAAATGCCTGGAAACTCCGAACCAACTCGAACTGCAACTGGACCTTTATTAACATTTCGT------GCTTTCCACCCGACAAAGGAAAAAAAAAACACACCCCTCACACTCTGCCCCCCTACGATTTTCCACCGGGAAATTGCTTTTCGCGGCTGCCGCATAAAGCAAACAAACAAACCACAAAAACCGCATGAAACAAAAAAAAGAAAAAAAA
GCGCCAGCATAGGACAATGGAAGACAGTTGGGAGCACGTGCGCGATAT------ATGAAAAAAAAAAAAAACTGAAAAGATTATTAATATTTGTTTTCATCGAGTCTTTACCCATA------------------CTCGAACACTACCCACTGCAACC---------CCCGTCACCCC----CTCAGTCGAGC-------GCTCATTTATTCCCGCTTTGTCAGTCAGCATCTCTTTTTATTTGAGAAAAGGAAAACA---------------------TTGCGACAACGCATAGAAAAATC--------------------------AACAAACAAACGGCAA-----TTGTGAAAACGAAAATAAAAATGGAA
>l(1)G0320 9396826 9397159|12092 chrX 9397116 9398010 scaffold_10 1369672 1370640 + 54529|0 43
GTTCAAATCCGCTCAAGACTGCACATATCCCAAACACCATCGAA
GTCCAGCTGCACCAAACAGCCCACTCA-CACACACAACATCCAA
>CG32702 9403886 9403981|12097 chrX 9403845 9405016 scaffold_5 1814370 1815564 - 25627|41 140
CCGCTTGATTTCTTCTTCAGCCGCA-ATCTGTATTAAGAAGCTTAAAATTCCTACAATTAAA--TCATTTCTATTGCAATAAATACATCTAAATAAAGG-
TC---CGATGCTGATTACACACACATATAAATAACATATAATGTAAACGTATTCAAATTCAATTTCGTTTCCGATTTCATATAAATATTTGGGCATATAC
>CG32699 9418018 9418338|12105 chrX 9417816 9419149 scaffold_5 1830180 1831633 - 32158|218 682
ATTCCTTTGTCGAGCTTACGGAGAAGCAGAAATCGAGCTATAAATTCCTCTATCACAAATCGGAGCACATACGGCGACCGAAGGC------AGTC---GTCACAACGGCCGAGAACTGAAG---------------ATCTGGGGCACG----------------------TTTTTGCGTGTTCACAG----------------------------------------------GAAATGGAGTCA-------------AGCTGGAGGA--CGTGGAGTTGTAACCAAGAGAA----------------ATACCCAACCTAAGCAGAATGTTCAACTGTCGA--GTGTTTATTTTTAATATTTA---TTTATATCGTGTACGCGTGTCCTGGCACCCCTCTATATATATATATATATATTTTAATTA-----------TATTATATA-----TTGTAATTAATATA
ATATGTTTGCACAGTACACGGAGAAGCAG---CCTAGCTACAAGTTTCTCTATCACAAGTCGGAGCACATAAGGCGGACAAAGGCTAATTTAATCAAGGCCACGCCCACAGCAAACTGAAGAACCCGCAACAATGCATTTGGAGGCTGCAATACAACTTAAAAAGCTGGTTCTATACTTATTCAGAGCTGTGCCATAGGCAAGCAAACGACAACAGGCCACATAGCAGAGAAAGAGATAGAGACAGAGAAAGAGAGAGAGAGAGAGGAATAGAGGAATAGTAAGCAAGATAGAGAAGAAAGGTGTAGCACAGTCAACCTAAGCAAAAAGTTCAATTATAAACTATATATATTTTTAATAATTAATTTATTTATTGTGTACGTGTTTGTTG----CCTACTGTAATTAGAGTTGTATAGCTTGAGGAGAAGGAAGAAGTGTTATTCAGGCAGGTCCAATTGAGAAC
>CG32699 9418406 9418615|12105 chrX 9417816 9419149 scaffold_5 1830180 1831633 - 32158|752 961
TATATATATATATATATGCCGTACAATACTGTGCATTGATTTTAATTAATTTATTTTCAATTCAATAGCTCTACAGCGAATCCAGTCAGCAAATAGACAGGGAAAGCTTTGTGCGATTGATGAGACACGCTGGCGGCAAGCTGAATGAACAAAAGGCCCAGGCGCTCTTCTATGCTCTGGATACCGACAACCTGGGCTACGTCTCCTTCG
C---------TTTATAATCCCTCTGTTACTTTGTAATCCTTCTG-------TATTTTCTATT--ATAGCTGTACAGTGAATCGAGCCAACAGATAGACAGGGAGAGCTTCACGCGTTTGTTGCGGCACGGCGGCGACAAGCTGAACGAGAAAAAGGCTCAGGCACTTTTCTTTGCGCTGGACACCGCCAATGTTGGCCACGTCTCCTTCG
>CG3004 9449373 9450098|12136 chrX 9447296 9449522 scaffold_10 2583133 2585387 + 79618|2150 2326
TACCTCTGAAAATGAGCGCTTGGCTTTTGTAGCGAC-TTTTTCATAATTT---------ATAAACCTTTGATACATAATTATAT-----TACGACTAAATCGTT-------TGTATGCA-----AAATGCAATTTGAATAAAAATCTTATCAGCGTACATACACATACAATACAGAA
TACCTCTGAAAATGCGCTTTTG-CTTTTGTAGCGACATTTTTCATACATTTTTTATAAAATATACTGCTAATATATATATATATATATATGCATATATATATTTAGAAATATATATGTATAAGGGAATGCAATTTAATAAAAATCCTTATAGGCATACATTCAATATAAGTACACAC
>CG3004 9449373 9450098|12137 chrX 9450067 9451559 scaffold_10 2585666 2587213 + 52068|0 31
CAGTAGTTGTAGTAGTAGTAGTAGTAGCTAGC
C-GTAAGCATAGCCTTAGCTCTAGCTGTAAAC
>Aats-lys 9451581 9451693|12138 chrX 9451560 9453773 scaffold_5 4634407 4636574 + 98002|21 146
ATGGCCA------ACGCCGCTCACTCCACT-CAGACCCAATCCTTGTACGTTACGCTGGTCCCGGACTAATCCCAGTTGCTAAGTTATTCAACCAATAAACA------TTTTTCCCAATAACCAAA
ATGAACATTCTCTAACCCAATAACACAACCACACACACAATAGTCATGTGTGTGTATCGCTTCTGTGCACTGCT-----TTAAATTATTCATTGAATAAAAAATGTATTAGTTTCAGATTTCAATT
>l(1)G0232 9473920 9474326|12158 chrX 9473749 9473968 scaffold_32 688104 688338 + 1769|190 240
ATAGCTAAAAATAAAGAAACAAAAACAAAACCAGCAGCATTAGCA--AAAC
ATAAACAGACCTTGAGCAGCAAAGATGCGCTCAACAACATTATTATCAATC
>l(1)G0232 9473920 9474326|12159 chrX 9474244 9474554 scaffold_5 4718416 4718718 + 15307|0 84
GATAATACTACCAACACAGTCCTTGGACCGGAAGAGGGACGAGAAAACAACGTGTATACAGAATAATTTTATGTT--TTACCATT
GCATTGACACCCAA--------TTGAAACGCAGCCGCAA--GGAATACATATTGTATACAGATTACTTATATTTTGGTCACCATT
>CG3106 9504317 9504423|12201 chrX 9504317 9505435 scaffold_5 6189375 6190492 + 41208|0 119
ACTCTGCAGCCTTAGCACGATTTTTTTTTC--------ACCATGCGAACCAATTTTTTGTGTGTA-----GTTAGTTTAATTTATTAAACATTTTAAACAATAAAACGATTCATGTATTT
ATTATAAGCATGTAAATTGTTTTTTTTTTCTTTTGTTTAACGAACGAAAATATTTGTATTATGCATTTTTTTTTGTTTTATTTAT--AATATATTAAACTAAATCAGGCTTCATATCTTT
>nej 9514428 9514927|12215 chrX 9514402 9514747 scaffold_11 3516751 3517072 - -182|26 360
TATTACTAACTTAAATCTTTTTTTTTTTTTTAAACGGCACCACAAATAATTGTATATTGTTATAATTAAATCAACAAATATCGCGCCTAATGTGTACTGTAGATTAAGATGACCCACCATTACAACCACTAACAAATACCTTATTATTTAAGTTTAAGACGAAAG--------TTGGACAGAGCATTATGATTCGATTTCCAT-TTTATGTCCGCGATTTAGCAAATATATAATATCATATATTTCATATGCCCCCAAAACACACACACACCATGTATTAATTAATGCGAT---TCCTTCGTTTCCACTA--AGCAGATATAG-AAAAAAAAAAA
TAATACT-ATTTACATTAGTTGCTGTTGCTCAAACGGTGCGACTCGCTGTTAT-TGTTGTTGTTGTTGTTGCTGCTTACCACGCGAACAAATTGCATTG-------------------ATTGCAA-----AATAAATGTTGTGTTGTTTC--TTTGTGGCGATTGCCTTTTGATTCTGCTGCGCAAGCTAATTTGACTTGCGTATTTGCGTCATAATTTTAACTTGTGT---------TACATTT--TCTGCAAAAAAAAAACATTCAAACAACAAATTTGGTATTTCACTTAATTTTTCGATTGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAACAAGAC
>nej 9514428 9514927|12216 chrX 9514881 9515859 scaffold_5 442785 443733 - 38215|0 55
TGCAGCAACA---------GCAGCAGCACCAGCACCAGCACCACCACCAGCTACAA
TGCAACAACATCGCCAATGGCAACGGCAATGTTACCAACAACAAAATCAGCAACAA
>CG1986 9754613 9754664|12493 chrX 9754555 9755656 scaffold_10 2946386 2947465 - 32679|67 118
ATAAGTAGTTCCTAGTGTTTTGTTAGTGTTAAAATAAACGCAGCCTAAATGT
-GAACTAGTTCCTAGTG--TTGTTTCTGTT---ATACATGCAT-----ATGT
>Idgf4 9773480 9773628|12517 chrX 9773476 9773526 scaffold_18 1500383 1500428 + 459|4 53
AAACGCGAAATGCAAATTAAATTAATATAA---CATTGACACCAAAAAAA
TTACGC--------AATTGAACTATTCTAAGAGCATATGTAAAATAAAAA
>Idgf4 9773480 9773628|12518 chrX 9773527 9774957 scaffold_10 2968687 2970051 - 66231|0 108
AGCTCCTCATCCTTCTGATTCTTTTCCCGAACGAAAGAACAACGTGTTTTTATTTGCCCCACTGT-------TTTTTTTATATGTAATTGACTCAACGCAAACCTGTGT
GCGGTCACATGCCCCCAAATATGT----------------AACACGTTTTTACGACTTCGATTATATGTATCTGTTTTTAT-TCCGACTAATCCATAATAAACCTACGT
>CG1791 9808674 9808743|12566 chrX 9808575 9808893 scaffold_10 3024078 3024409 - 6994|103 186
ACGAAGCT----ATCACATATTCAATCACAAAGACTCCTCAGGCATAGAATACAATAAATGTCGATTATT----------TAAC
CCAAATTCTTGGATTTCTTAAGAATTCCTAAATAGTC--TAAGAATCAAATATCACAGTTACTTTTTATTAGTTTTAATGTAAC
>CG15251 9812543 9812794|12571 chrX 9812115 9813362 scaffold_10 3029417 3030825 - 33025|443 862
GATGTGTAAATAGCAACGATTCAAGGCCAACAAATGG--AAGCTGTAATTTATCGTTGAATCCCTATTC------GTTT-------------CTTCCCACATCCATCAGAA----------------TCTTTGTTGAATTTCCAACCCCCTCGCTCGAATCG----TTTTTATTTTTTTTTGTTTACACCCTAGT------------------------------------------------------------TAAGTT-----------------------TCATGTTTGTAAATATTCG-GCATA---------------------------------------AACAAATATATATATATAGAGAAATTCACGACACTACAAAAGCGAATAAAACCGAAAACAG----AAAACCA
ATTGGCTAACTGGCTAC--CTAGCTGACATTGGATGACCAGGCCTGGATCGCTCGATGGTCCCTTCTACAATATGGTTTTATAATTTATGTACATCACACACTCTGCAGGAGTGAACAGTCCTAAGTTTTCCTCTGATGCTCGCACTCCTTCATTGACATTTAAACTTTGTATGATTTTTTGTTGTTGTTGTAGTTTAGACTTAAGATTTAATTTTGTTAAACGCTGTCAATTTCTTTGTCGTCAGGGCAATATATAAGTTTAATTTTATGCTACGCATTGTACTCATGTTTGTAAATATTGGCGCATATATGTATGTAATGTTCGACTTAATAACGATAAATAAAGCAAAAAATTTTTACATATGTATCAACAAAATATATAAAAAGAAAAAAAAAAAATGCAAACAAACCCAAAACCG
>Yp2 9896169 9896407|12651 chrX 9895962 9897941 scaffold_10 3137476 3139389 - 64119|216 467
ATCATCGCACAGTGATCCATCGATGACAACCAGATCGCACACCCCTCATGCGAGCGAACCACTCCAGCCCATCCTCATCCAGCAGAACCCTCTGCCAGTTGCATCCACTACGATTAGT---------TAGCTTTGTTTTTTT----AACTCACAATAAAAAACGTTTGCATTTTTAAACATTCTAAAGAGTTCAGTTCAATATCAGAAAAAAACCCCAGTTCAATTTACAATAAAAACAATTGCTTATGTCG
A--GTCTGCTATTGAGCCTTCGAAGCTAACATGA------------AAAACTAGAAAACAACAAGA-CGCATTTCCTTTCA-----------TATTGATTGCCTATTTTACGCATAGTTTTCAAATATAATTTTGCATATTTAAAAAAACCACAATATTCCCTGCCTAT-TTTCTACGTACTCCCAATATTTCTACGTGTTTTCAG---------CCATTTTAGTAGATAATCAAAAGTCTCTCTTACTGC-
>CG15312 9902315 9902464|12657 chrX 9902272 9902619 scaffold_2471 891 1232 + 4653|43 202
TTGGATAGTTAGGATCCACCTCTACATCATATACATAGATATAGAAATGAGAGAGAGCTTAT----------CGATCGATCGAATGTTTCGTTTTCATTTCGGTTTCCTGTCCAAGCTTCAACTATGAAATACCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACAAAG
----ACGGTT--TAACCAAATATACAT-GCATACGTTTGTACAATACTCTG-TAGAGCTTATTATGTTTGTGCAATAGGCAAATCATTTC-------CTTCGGTTTCATTTGCCA--TTCGACACGAAGACACCAATTTTTATAAAATA-----------
>CG32685 9917367 9917450|12674 chrX 9917444 9917921 scaffold_10 200797 201158 - 10196|0 6
ATGTCAA
TAATCAA
>CG2974 9930118 9930400|12687 chrX 9930018 9930168 scaffold_5 1620809 1620960 + 1336|106 156
ATTGGAATTAGAATCCAAGAAAAACTCCATACCTTACATACAAAAAAAAAA
ATTTGATAAGAAATATAATAAAAACGTAAAAGTCTGCAAACAAAAAAAAAA
>CG2974 9930118 9930400|12688 chrX 9930169 9930305 scaffold_12 1306300 1306429 + 701|0 145
AGCGACTATTTTGATTTCCAGAAG-----CAGCAAACACAATGTTCAATTAAAAACAGATTTAATTACGTTAAAAAAATGAAACTTAATGCTAGTTCATAACAAAAAAAAAGATTTTCTAGCTTTTAACTTTGTA----AATAAAT
AGCAATTATTTTTGTTAAAAGAAAAGAAACAGCAAAACCAAC--TAAATTATAATACGAGCTAAATGAATAAGAAA---TAAACTAAA-----------AAAAAAAAAACAAATATTTTGCCACAAATATTTGTATGCGATTTAAG
>CG2974 9930118 9930400|12689 chrX 9930383 9931377 scaffold_10 215590 216594 - 38012|0 17
TTTCTGCATTTATGCGGT
TTTCTAAACGCATCTGAT
>CG15309 10051796 10052451|12864 chrX 10051074 10052799 scaffold_5 1774304 1776396 + 38074|916 1750
-GGGCTGTCCGTTTGGATGGGCTGATTAA--TCAGAAGCACACCCGTAACAGGAACAGCAG-CAACAGCGGCGGCGGCGGCGGCAGCGGCAGGAAAAG---CAGCGAGTTCA--CCACACAAAAAACGAAACACACACGCGGCAAATAAATTGCAGACAAAGAGTGTTTACAAAATGGCTAAAGTCTGGAAAATGCGAACAGAGAACACACAGAGAATAAAGAAGAGGAC-AATGAAAATGCGAGATCGAGTTTTAGGGTATCACACAATATATATATGCTATTATATAGTGCATAACTCGTCGTATCTTATAGAGCAAA-------ACAAACAAATCAATTAAACACACAGATATACCGCACATTCGATC-------------------GAAAAACACACATTACATAAAAA------GCTTGATTGGGTTTTTGGGAAGGATCTCTGCGCTG---------------------GCCGCCATCT----------------AGGATTTCCGCACTTTCATTTCGATTACCATTACCCACTAATACCACTTTGT---------TTTCCTTTTACCATTTTGCGTTGCAAGTTTATTCAATTGTGTGTACT-TTCTGTGCAAAATTAA-TTCGATGCCTTAATTCGATGATATCAAATAT---------------------------------------------------------------AAAACTGGCGAAAGCCAC--ACGCAAAACAG---------AACTTGCACTGCCAATCAATAAG--------AAAAATGTT------AAGCATCCAAAAAAA--ATAAAAAAAAA
TGGGCTGGCAGTCCGGGCGGCTTGGGTAACGTTAATAATGCGGCAACAAC--GAACAGTTGATGGCACATGTGAAAAGGCTTGAAGCTACATGAAGCGAGCAAGCGAGTGCAAGTGCCAGTGAGAGTGAGACAGACAGACAGAAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG------AGAGAGCGAGAGAGGGAGAGAGACGGAGATAGACGACAGCGAGTGC----CGGAGGTCGAGTTGAGGCGCGAGTTCGAGTTTTAGGGTAC--CACAATATATATATGCTATTATATAGTACATAACTCGTCGTATCTTATAGAACAAACAAAAACACACACAGA-CAGACATACACACACATACACAACACAACCCAACCCACACACACACACACACAGCCAAACACACACCTCCAAAATGGCCGCTGCTTTACTGGGCTT---GGAGAGATCTCTGCGCTGGGCGCAACAGCAACTTGAGCTGGCGCCATCTACCGGCCTAAGCGCCAACTACTACTGTATTATTTGTTTTGTTGCCGTTTCGCTGCGTCTTTCATTTGTTTATATATATTTTTTTTTGTGATTTTTTTTTTTGCTTTCAAATATTTGCGACTATTATTGTATACAAGATTAAGCTAAAAGTGTCTAGTAAACAATTTTAAATGTCCATTTATATTTTTGAAAACTTTAAAAGCTTTTTAGTTTCCATTTAACAGTTTGGGTTTTTTGAAAATTTTTGGTTGCCACCAACACAAAAAGGAACACAAAAAACTTGCACTGCCAATAAACGAGAAATTATTAAAAATGTTTTTGTAACAAATGCAACAAAACGACTAAAAAAAA
>CG2962 10060061 10060217|12876 chrX 10059308 10061344 scaffold_10 1048021 1050435 + 22016|998 1240
AACAATTCGCCAATCTATCG-----------------------------GAGGACCTTC----------CTGCTAACTACATCGAC-----AGCATATTACCATTCCCAC--------ACAACGCCATGAGTTAATTTAAGACATTTTTTTTACAACA----CATTTTTTTGTTACC--------------------AAATACATAGACAATTCCAAAAAAA----------AAAAATCCAAT
CACAATT-ACCAACCCAGCACATGCGCATGTACATGTGGTTGTACATACGAAGACCTCCAAACCTATGACTTCTACCTCTATCGATCTTTTGGCCTATTCTTCTGTGCACCAAACTCTACGACTCCATAAGTTATTTTAATTTTTTTTTTTTTAAATTAGATTATTTTTTTTTTGTTTGTTTGAAAAAAAAAAATATAAATAAACCGACTGTTTAACGAACACCGATTTTTTAACAATCCAGA
>Ipod 10076215 10076401|12893 chrX 10075978 10076283 scaffold_1 6950744 6951095 + -2344|286 369
TCAGAAAAAAAAACATCCATCATTATTAACTTAAATTATTTGTTA-----------ATAAACAATTT--GAACCAATTTA--AA
TATTAAAAAAATATA-CAATAAATATTAGTAGAGAGCAGCAGGCAGCTCAAAGGGTAAGTACAATTTAGGACTCGATTTGCTAA
>Ipod 10076215 10076401|12894 chrX 10076284 10077775 scaffold_10 1058733 1060114 + 35575|0 119
ATGCACTGCATCCACAGCTCGCCTAGTTAGTTAGACCAAATGAATTGTTTTTTTTTTCACTATCTTCTATTCTATCGTTATGTATTTTTTTTC--CTAGGCTAATTCTTCACAGTCATTA
AGACCCC---------GTCGGCCCAGTTAGTTAGACCAAATGAATTGTTTTTTTTTT-----------------------TGTTTTTTTTTTCCGCTAGGTTAACTCATCGCAGTCATTA
>Hk 10083465 10084664|12899 chrX 10081119 10085125 scaffold_5 2618730 2622782 - 44213|2661 4083
CAATCAGCGTGCCCGCAGGGGCCGCTCAGCCTGAGCGGTGGCGGACCCTGCGGCGCCGATTCGCCCAAGCACGAGGATGAGGCCTTCATCGAGGAGGTGGACGCTGCCAAGGACGCTGCCAAGCAAGGCTTCTGCCTCATCCAGTGACAAAAGGAGTCCTTAGATAACGATAATAAATTTTTGAAAGTGATTAGCAGTAAAACTAGCCTAAGTAGCAATACCATGACGACAACAATAAGCAAGCAGGAGCAGCAACAGCAGCAGCAGCAGCAACAACAGCAGCAACATCTCCAGCCTCAGCAGTATGTGCAACTACAGCAGCAACATTTGATGGCCAGCGGCAGCACCAGCGATTCG-GCGGCAGCTGTTCCCATTGCAGCTGAACT-CCAGTTCGACTCCCTGAATAACAA--TAACAACAACAACAATAATAATACCAATGGCAGTCCGGAACAGGCACTGCCCACCAGCGATGAAC---------GCCAAAAACGTCGCTCCCTGCTCAACTTTAAGTCCCTGGACTTTCATCTAAAGTCCCTGTACAGTGGCCTACGGAGTAACTCA-------------GGAACAACTCCA---------------------CCCAGTCAACCGAATAGCTCTGT----------TCCGGCGGT----GGATCAGCCGCA-----GCGTAGAATGCCCTATTTGCGGGTGGAGAGTGTTGATCC---CGAGGAGC-----CAAGAG--------------GATCAGTTCTGCCCGGACAT-----------------------------------------------------------------------TCGCCCAGCTTTCTGTCACCCTACA---------GTGGCGTTGGCGGTGGAGCCGGAAGC----CTGCAGTTGCCCTCA--AACGATGGAGGCACCATCAGGAGATCCTCAACATCCGACATTGTTAATTGCAGACGGGGAGGGGGAGCAGGGGGATCGGGCGGAGGAGCAGCCTCTGCCCAGGACAGCAGGAGGCCGAGCACATCGGATTTGCTCAGAAAGGCAAGGGAACGAAAGGGCAGTGAGGCCAGGATGGGCAGAAGTGTCTCCCACAGTGGGCTAACCAGGGGCGGACCCGGCGGAGGAGG---------------TGGTGGCCTGGGCGGGAGACGAACCAGCATGGCCTTCTAAAAACAGAAATAATAGTGAAAAAAAAAAAAACTATGGAAAAAAAAACTTAAGCAATGAGGTATGGCGAAAAAAAAAACTGTTGATCAAATCTGAATCAGAAATAGGCTGACAAAATGGCGCTTATGAATTTTTATCTAGTGA----------------------------------AAAGAAAATTAAAAAAAAAAGAAAACAAGAAAAAAATAA
CAATCAGCCTGCCCGCAGGGCCCACTCAGCCTGAGCGGCGGTGGGCCCTGCGGTGCCGATTCGCCAAAGCAGGAGGAGGAGGCTTTCATTGAGGAGGCGGA---TGCCAAGGAGGCTGCAAAGCAGGGTTTCTGTGTTATTCAGTGACGAAAGGAGTCCTTAGATAATGATAATAAATTTTTGAAAGTGATTAGCAGTAAAACTAGCCTAAGTAGCAATACTATGACAACAACAATAAGCAAGCATGAGCTGCAGCAGCAACAGCAGCAACACAAACTGCAACATTATCAGCAGC--TAGCCATACCAGCAGCAGCAGCAGCATCAGC--AGGAGCAGCAGCAGGAGCAGCAGCAGGAGCAGCAGCAGCAGGAACAGCAACTGAGCCGCCAAGTGGATCCTCAGCTGATCCATTTGATACGCTGAACAACAATGATATTGGCAGCAACGAGGAGCGGGAATCGACTGTTGGCCAGGCGCAGGCAAAGGGTCTGAAGCGACGCTCTTTGCTCAATTTCAAATCCTTCGACTTTCACATCAAGACGCTGTACAGTGGACTGCGTGCGGGCGCACCGGCGAGTGCTGGCCACAAGTCCGAGTCCGGCTCGCAGTCGCAGTCGCAGTCG--CGCTCATCCTTGTTGGGCATGAGTCTGGCTGTGCCAGGTGGCGCTGCAAACAGGCGCATACCGCCGCATCTGCGCATCGAGGGCGTCGATGCGGATGAGGAGCAGGCGCAGGAGTCGATGAAATTATTGCTCGATTATTCGCAGTCACCGTTTACGCCGCGACGCAACTCCAGCACCCAACTGCTGCACAGCGGCTCGCCGGCACTTTCGAGCACCTTGTCGCCCTACTATCTGTCGCCATACATGATAGCCGGCGGCGGCGGCGGCGGAGCAGCGTCCTCCACAGCGGTCGCCGACGACAGCAGTTCGGGCAATATACGCCGCTCCTCAACCTCGGATATTGTTGGCTGCCGACGTCGCGG--------------CTCGCCGAG-------CTCAGCCAACAGCAGTCGCCGGCCGAGCACCTCGGATTTGTTGCGACGGGCACGCGAACGACGCGGCAGCGGGGCGCGCATGGGTCGCAGCGTTTCGCACAGTGCGATGCGCGGCGGCGGACCAAGCGGCGGTGGCATCGGCGGCGGGCCCAGCTGCATGGGCGGCAGGCGCACTAGCATGGCGTTCTAGA---------------------------------------------------TATGTAGTAT----ACAAGGAACGCTGCAAATTGATTTCAAATCA-------GCTGAC-AAATGGCGCTTATGAATTTTTA-CTAGTTACACACGTAGAATCAACAACAGAAACCAAATCTTCAAGAATAAACAAAAAAAATATTATAAAAAAAAAAAATAA
>CG12643 10109445 10110061|12926 chrX 10108803 10109614 scaffold_4 2321579 2322306 + -624|667 843
TTTTGTTGCCCATTTAAGCAGTGTTTTTTTCGATATAATTAAGCTAAGCATTT-------TGTACGTATTTAATTTGTATTTAGAGCTAAAGACTACAGTTTATACATTTTATGAATTTTTTTTATATATTTGTATAAGAGAAGAGCAAATAAACGCACGACGCATTTAAAAAACGA
TTTTGTTGTGCCTTTAATTTTTGGTTTTGTTTGTGTTTGTTGCCTTGGCATTTGCCTTCACAAATGTTTTTCTTTTCTCTTT------------------TTACGTGGTTTTTTAAGTTTGTTTTTGTTTATCTGTTGAATTTGTGTGTCGTTTTGTGCTTTGCCCTTGA-------
>alpha-Man-I 10121670 10122776|12931 chrX 10121677 10123453 scaffold_654 1907 3791 - 40079|0 1311
ACGGGCGCCATGTTGCGCCGCTGGCTATTCGGCCTGTCCCTAGCAATGCACCTTACTTAGCTCGCGATATT--TGGATATCTACACATGTGTGTACCAGATCGTAACATTTTTTTTTTTTTTTGTT---------------------TTGTTTAAGTTA---------TTAG------------------TTAGATTACGTGAGGATGACAACTGCGTACGAAAGATATTGTATGTTT------ACAATCAATCCAGGCACACACACACACACACTCGAGAAACTGTCAATGTAACATATTTATAAAGCTTGCACATAT-ATAGGAACGTAAACTTAAA----CGGATATATCGTAG------TTTAGTTCTTA------ACTGTTTGCACAAGTTTCTCCA--------------AGTCTCTCTTCTTGATTTATCTTATGGAAT----TAATAGCAATCC-AAATAGTTGACAGAGGTGGATGGTGGGAAGACC--TCAATTTCCATTTAAATGCGAATGACGTAGACGTAGGCAAAAACTCTTGATATTAATTATGATATGATATATAATATGATATACGTGTAAATGTAAAACTCAGGTGTTCTTATTATGATTTTCCTTGCGCTCACACAAGGCACTTTTTCAACTAAACCAGCTACGTAACTATCTCTACAAGCATTCT-------------------------ATACGCAAT-----------TCTCGATCTGCGACTATATCTCTGTGTGGATT--TATGGCCACTTGGC------GGGCATTTCGTTAGATC----------TACTCTGCTAATTTCCAATTCGAAT---------------CTTTGACCACTT-------TATTTTG---------TATATAA---------TTTCTACTGACTTTCCTCG---CAAAATGAAGGCAGAAGAAAATCGAATTGATATTTATACAAATATATTCTTACACAA--TATTGTTTACTTTGTAGCCTAAATAT-----TTAAATATAAATCTAATATAGAGTCTAGCTTACTGTATGTGACGAAAGAAATGTAACGCAAATTACCTTAAATCGAGAACATCAAGCGAAAAGAA-CGCAAATGAATATATATAAAGTAAAATAAATAAATATATATTTGTATTTAATTAAATCAAATAAA-------------ACGTAGGCAATTGTTAAAATAAATTAATTATACGATGGCACGAGCCGAGCGAATGGTAATTTAATTTTTAACAACTGTAAAGGTTTTTTATAATAATAATACCAGCAGTAATCATATTTATAAT
------GCCGTTGGACGCAGTTGGAT----GACCGCGTCATTTTAATTGACTATATATCATTTAATATAATGATTATTATTTAAATAT-TGTAATGTATATTTTATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGTAATTTTTATTTGTCTGTTGTTTTAGTTAGTTTATATTTTAGTTTGTGTATGCTACATTATTTGATTGCACAATGACAACAACTATATA--------ATTTGATCTTTAGTTCGACGGGCAATCAACGGACGACCATAT-----------------TCTATGTAACATATTTATGCAACTCTTATTAACGATAGCAACAAGAACCCCAAGTAGTTATTATATGGTAAACATCCTCTAGCTCGTATTCAATACGCTCGGCACAATTTTTCAAACAACAAGCTAAAACAGTTATTCACACCAATTTGTAGGCTGCACTTGGCTAATTACAATTTGAGGTGTTTGACAAAAAAGAA-------AAAACCAACCAATTATATGGTATATATAGATAACACACACACACACACACAC--------------------AGACCCATAG-ATGATTTA--TGTAAGT---AAACTCAGGTGTTCGAATTATGATTT--CTTGCATT---------GTCTCCGTTAACGGAATCAGCTTGAAAACTCT-TCAACTTGCATTCTCAATATCGTTCTGTCTAACTCTCTCACTCTCAATATCTCTCTCTATCTCTATTTCTATCTGTATCTCTATCTGTAGTACTAGATCTATTTATCTACATAGAATATTTGTGTAGAGCACCCTGTACGTAACTTAATAACTTGCATTTTGAATATGAATATGACACAACTCTCAACATTCAGTGGCACATTCTGGGATCGACATATGTAGGAGCTTTGTTTTGTAAATATTTCCCTAGCGACAAAATGAAGGC--------ATCGATGAGAAGGTT-TACAAATCAAGTAATTGTCAAGTTATTGTTTATGTTGTAGTCTAAATATAATGATTAATAATTATTGTA--ATAGCACCTAGCATACTTT--------AAACAAATGTAACGCATATTACTTTACATC---AGCATCAAGCGAAACGAATCTTAAATATATATATATATA-TAACACATAGAAAACAACAACAACAACAAAACAAA-CAAACAAACACATAAACAAATATGTAGGCAATTGTTTAAACAAAATATTTATACAATTATACAA--CAAGCGAA--ATAATTTTATTTTTAACAA-TGTAAAGGGTTTTTTT--TTATAATCCTAAGCGTAATGATAATTATGAT
>Gip 10174087 10174188|13003 chrX 10174124 10174628 scaffold_74 175664 176140 + 9076|0 64
TTATCACATCACATATAGTTTGGCATAAGGAACTGCTCTGCATTTATACACATGTATTTACACTG
ATATGACTCTAGCTTTTGATTAGAATGAAAAAATGATATACATTACTAAAAAAGTAATTGCAATG
>CG15306 10175377 10175606|13006 chrX 10175103 10175432 scaffold_4 5088833 5089132 + 829|278 333
CCACTGCTTTTGTATTTCATGGTTTGGAAATTGAAAATTAAAATGTTGACCCAAAA
CCTCTGAACTTGTATCTTGTGGGTTGATTGTTAAGAATTAAAATAGTTAACTAAAT
>l(1)G0289 10202391 10202965|13033 chrX 10202959 10203732 scaffold_28 51012 51732 + 16804|0 6
GAGGTGA
GAGTTGA
>CG2222 10228837 10229506|13066 chrX 10228702 10228980 scaffold_7 101907 102187 + 2720|151 295
ATAATGTAATGAACTAAGCAAGTTAGGCTAAAGCGCACAAAGTAGGCCAATATACATATATATTATACTCGTAGGTGGAAAATGTAACAAATGTGTTTTTTTTTTCATTTCTTTGATAA-CCTAATAAAGATAATCTAGTAAAAC
ATAATGTAGAAGAATTAGTTATTTAAAATAA-GCGGCTACAGTAGTATAACACATTTTCATAATATAAACATAGTTGGCAAATGTCACAGA-----------TTTTATGAAATTGACAATTTTAACGGAGATAATCTACCGATAG
>CG2222 10228837 10229506|13067 chrX 10229410 10230274 scaffold_28 88100 88975 + 35277|0 97
CAAGCAGAGTAAAACAACAAAAACAGACCACTGA-TGTACTGTGGAACTGTAGCAACTTTATTTCGTCCATTCGTTCGGTGGCCATAGGGCAGCCTGA
CCATTGGATGCAGACATCAAAAAAGGAAAAACAACTTTATTTTATGTTCACATTAAGCGTATTTTGTTAAATAATT-----GTTATAAAACAGTTTAA
>CG32683 10255608 10258014|13100 chrX 10255502 10256664 scaffold_28 133005 134285 + 1083|114 1397
TCAAATAAGGTGAATTAAGCAGACAGTTGTCACTCGCTAAAGGTAATTCTCTATATGATTATGGAAGAACTAAAT------TTAACGACAAAGTTCCGAACAGTATGGTAAACACCCA--CGAAGGATCGACACTATAGCTATAGTTTTTTAAATCGTATTGAGACACCTAGTATATCTGAATGATGGAGTTTTGAATAAATTGTGGAAATATCCTGT-TTGATGAAAGCAGGACAAACTTAAACCACCAAGAAATGAGAAACTATGATATCGAAAATTTTTAATGTTAGCAGTACGAAAAATCCACTTCTACATACTA------CGATGATGAGAAAAAATGAAAAA------------------CTGACAACA-------ATATTAATAGTATTTATGTGTATATGTGTCTAGAGTTAA-------------TGT------------------------GCAACATTAAAAAACACACTGAATAATGATGAATTTATGAATGTAAC--------------------ACG-ATTAGGCAATCGC-----------------TATGCTCGGCTTACGCAATCTGTGTGCAGATCGACATCCTGATCGATATAGACATTTAAATCTAAATAGAACTATATATATATATATATATATATATTTATGTGGATGTTGCTTTGACAAGCCAAGCTA--CTACTTCAATTTCGAAACCAAAAAACAAAAGCAAAAAAAAAAAACGCTACACTAACGCAAAGGCGAAAAAAATAAACTTAAATGTGATGCATTTCTATGAATACACTAAAT--------------------------------------------------------------GAATACATAACCCTATATACAATCATATATGT------------------ATACAC-------TGTATCGATGGCTATTTAGTA----------TTAAGACTCTCGATCCGCAACCGCAT---TCCCTTTACTTTAAGAGCTGGACTCT-----AATCGCAGCCAAGGATTG--CGCAAACATTTTGGTTCCCCTCCTATCCCATTCGATTCCGTTGTCCTTTCTGTCTCCGGAGCTCCAGAGCTACCACAGCCAATTGATTGATGATGAATCCTGGCCATGGTCAGCAGCTGAAAGTGGGTGGAACTCCATCCATAACCATGGATACTGCGCGAT-GGACTCTGGGGGCAGGCAGGCCGTCCT--GGAACATCTGAGAATTTAATGAAATAAATGTTAAACATAAAATATCACAAAA
TTAAAAAAACCAAACCAAAAAGAAACATATTA-----TAAACAAAATTGTCCTAAAGTTTGGAAAAAAAAAAAATGGAAAATTTGCGAAAATATTTGAAAAATGAATGCAAAAAAAAAAACAAAAAGTGTTTATTTTAGGTTCATTTATTCTAA----ATAGAAGAACCCTTTTCACCTAAATAGAGAAAACTTTCAGAAATGGAAAACATTTGCCATATTTTTGGAGGTTTTTCAAAGTT--------------TGGGAAACAATTTTTTTTTTGGCTTTTAAATGCAAAGACACGCAAA---CACACACACACATTGAATTTTTGCTAATGATAACCAAGAAAAAATACGATTTTAAATGTTAGCTGTAAGCGTAATTGCATATGAATACCATTTGAATGTGTACATGTCTAGTGTTAAATAATGAATTTATTGTCAAAAGGACATTTAGCCAAGTAAAACAACAAAAACAAACAAAACAAGAAAT-ATATACTAAACTATATAACCTATTCTATGCAAACCTTGAACGCATCAGACACTTGAGAGAAAGTTTAACGATATATACACAATATACAATATATGTTTATGAATATGTATGTCAAACAATATATATATATATATCTATATATA--TATATATATATATATATATATATATATATTTATATATGTCTATCAATGTGTACGCTGATCCACTTTAACT----AAACTATTAACAGAGGCCAGAAAGTAT-------------------TTCGAAGAATTACAATTTCAATGTGATGCATTTCTATGAGTACATAAAAGAGCAACTAAAACGGTAGCTTAAACAATTCAACTATATTTGTGAACCTGTCGTCCGATTTACAGGATATACACGCATAAATACATGCATACATGTCGTTCTACAGCTATCTAAATACATATATTTATATATTTATGTGTATTAATTAAATGTTCTTCGTATAAGTCTCCATCTA-AACATCATTGATTCATTTTTTTGGGCAGTTGAACTTTTAAGCAAACGCTAGCTGGAGTTGGTTTCCAATTTTTTGATTCGTTTCGT-TTCGTTTCTTTTCCGTTTCCGTTTTTTTTTTCTTGCTTTCAAG------ACATCTTTTTATTCGA-------------------TCCGCAACGGA--------------------------ATGATTAATGCGTGGTAAGGCTTACGGTTCATGCAGCGCTTCATCAAGACCATTCGAAACATT-ATGAAATAAATGTTAAACGTAAAATA-AACACAA
>CG32683 10255608 10258014|13101 chrX 10256886 10257248 scaffold_6 3324396 3324712 + -482|0 364
ATTATTTGATATTAGCCATGCAATGCGTTGAAATTGATGATATTTTGCGTGGATTG-GCAGGAATGTGTGGCTATGTTATAAAACGGCATCAACAGTATTGAAATTGAAAGGCAAGCCAACCCAAAAGCAAAATCAA-AACATATATATTTACATAGATCGTAAGTGAGTGTGGTTCGATATGCAATTAAGCATTAATTTACAAACAAAAGTACACGAAAATGCCAATTGAAAGCCCATTTTTCAACTCGCACAGATGTATGTCACCACTAGGGATATACTATCTAAATAATTATGTATTTACTGAATATTAAATGTTTGATGTGTATTTACAAAACGACAAGGAAATATATTACAGAGGCCAAA
ATTGATAAATCTGAGCTGTA-AGTGCATATGAAATGC--AAATTTAGCGAGCATTTTGTAGGAGCGTGTAGTTAAAAATAAAAAAAAACTAAAAAATAATAATAATGTGAACTAAATCATGTTTA--TCAAATTGAATAGTATATCTATGTGCATAAGTAGCGAAT-------------TATTCAATTGTAAATACATTTTTAAT-----GTACACGTAAACGTTGAGTTTTTGT--GTTTTCTGGCCGGTACGAA-----ACGAACATTTGATGT---TTATTTAAACAATT--GCAATATTCGAATGTTTATCAGTTGGT---------CAAA----CAAAAGAGCATAAAAAACTGTTCAAA
>CG32683 10255608 10258014|13102 chrX 10257449 10257885 scaffold_0 6411571 6412036 - 0|0 481
TACAGTTTTTTTTTTCGTTCTTCAACCGATCAACCGATATATAGTTA-----TTTATATTTTGGTTAC----------ATTTCTAGAGCAGTTT--CCTGTTCTTATTT----AAGACTGTTAAA----CAGTTTTGTGCTCTAGCAATACCATTCA----AACGTCCAAACACTATTAATTTGTGACAAATATTATAACGTACGTCTATTGAATTGCAGGTTTGAAGTTGTTTAATAAAGACGCTATAATT--------TTTTCGATTCAGCAGCAAAGTTTAAAAA-----TAAAACTTTTCGACCTAAGCTGCTTCAAATGTTTTAAAACGTTTTTAAAAGTATAAGCACCAACTCTCGTAGTTGCGGCCACTGTAAATTTTAATGGATAACCATTCAGTTTCGGTTTCAGCAGTC---AAATGTCCGGAGTTAGAAGATAGTTACCGTACCCATTATGAAGGGTGGGAATTCGAAAGA
TGCAGTTTTGTTTGTTTTTCTTCAATGACTCGACAGCTCTCGAATTAACTAGTTTTTATTTTATTCAAATGGAATATGATTTTGGGAGCTGTTTAACCATTTGCTAGGCCGAAGAGAATTTTAAATGAGCAGTACGATATGTTAAAGTTGTCTCTTAATATAACATTTTGGCTATTCTAATTTGCAAAA-----TATGTAGTTCAATTACCGGAATAATAATATGCAGTATTTTAATTCCAACAGTTCAATTTTAATGCATTTTTAAAAGTGCTGAAAAATGTCAAAAATTACCAAACATGTTCGGCATTGTTAACACCAA---TTGTACAATTTTACTGTAAATAAATTACACAACTTTCATATTT---GGTATTATAAA----AACAAACAATCAAGTAAATAGTATTTTGGTAGTTCTGGCATGTCT-CACTTAGCATTTATTTGGTGATTCTTCTTTAAATGATCTGAATTTAAATGA
>CG32683 10255608 10258014|13103 chrX 10257967 10259131 scaffold_28 136645 137730 + 38787|0 47
TTCTGATTGTGGTCCCAGATGTTTGCCAAACGCAAGAGGAAGCCGTAG
TTCTGATTGTGGTCCCAGATGTTTGCCAAGCGTAA---GAAGCCATAG
>CG17255 10308857 10309673|13159 chrX 10308489 10309275 scaffold_10 3948393 3949089 - -719|387 813
TTGAAAGTAAGAAAAAAGTTAAGACGA--AAGTTAAGAATCAACAGGAAACGAGTAAGGAATACCTAAATGCAAGAAGAAATATTTAACAAAAATGAACAGAATACAACACCATGCCACACCACAACACACACACACACACACATGCATACATTTACATATACATACATACATACA--GAATAGCAGATTGTATTT---TTTGTCAAACAAATTTACATAATAATATATTACTTTTATATACTTATGATTTTTTGTAGTAGTCTTTCTCCTTTAAACAAATCAA-GAAAAACAAAACGAACCTTTGGCACTGCGTATGCTTTAATTTCTTTATATATAAATATTGTTTACTTTTTTTGCAACCAACAAAAAATTAACTAATAATTCTAATTTATGATTATGCTACAATATACATTATATATACCATC
TTGAAAATCAGAAATTCGTTCATATCGTTAAATTATGCATAATCAAAAAA-----------------AAAAAAAAAACAAATCATTAGCAGAAACAAATA--ATAAAATA------------ATTACACATATGC-TGCATACATACATACATACAAACATACAAACATACATATATCAACTTGGCGATATTATCTAGAGTTTTTTACTGCATGTTCATTCAAATGTATTCATTTTGTTAGTGTAAAATTTCGTGTA-----------------CATACATCAATGAATGCCTAAATTAA----------TACAAATACTTATACACACATACATATATACAT-GCATATATATTTTGAAAAAAAAAAAAAACAAA--AACAAAAAGAAATTGCCTTTAGGGAACAA-ATAAACGTGTGAAACCAAG
>CG17255 10308857 10309673|13160 chrX 10309475 10310544 scaffold_28 214348 215439 + 30949|0 207
GTGC---------CAGATGGTCACCACCCATCGACCAGCCGATCCCAGCCACCCACCATAACAAACCCGGAATAACTATGTACGAGTACGAAACAGAAACACAATGATGCAAATTGATAACGAAGGAGGATGGCCAAGAGAATGAGCAACAGCTGGAGGAATGTATTGCATCCAAAACGAGAATATGAACGTAAACAGAGCAAGTCAG
GCGTACTATTGAGCCAATGG-CGACACCGCCCTGTAAGCCCCTCTCACACACACAC----ACACAC--------------------------ACATAAACACACTCACACACATGGCGAGTTAAAA--------CAAAAGCATGCGCGATTCAAAAAATGAACCATTGAAAAAATTATCGCAATGTGCGTGTGGAGAGAGCGGCCCAG
>CG2887 10322476 10322612|13170 chrX 10320095 10324396 scaffold_28 1740004 1744099 - 89879|2513 2652
TCGAATGGACACCTGGAGATGTTATCCGTCTTTATGAACGGATCAACGGATCATACATACAACAAAAAATCATCTGTGCTCCACATAAAATTACATATTTTTTTTCTATGTGATTCAATAAAGATCTTATAATCTA---C
TAACACACACAC-------------------TCACGCACACA---------CACACACACG------------------TACGCACGCAATCACA-----------------ATTCCAGATAACTCGTTTAATGTAAATT
>CG32687 10327246 10328077|13174 chrX 10328020 10328791 scaffold_28 1589702 1590419 + 37679|0 57
CCGGCATTCCGGCCCGGCCCGGCCCACTCCGGCTCCTGGGGCCATAACCATATATTGT
ACGGCCAGGCAACTAGGTACGG-----------GTCCGGGTCCGTGTCCGTGAATTGT
>spri 10335685 10336035|13182 chrX 10335252 10335991 scaffold_28 1598216 1599155 + 10624|506 962
GCCCCGCCCGCTCT------------------GCCCTTCTTGCTCACTAACCAAGCATATTTGATTAATAATTTATTATTATTACATTAAAATATACTTAGTAGCCTGTAAGTAAAGCTAATTAATGCTAATTAGAAAACATCTAATGTGTACTAAAC---ATCAGTATTGAGTTAAGTGT-GTTTTTTTTTCCTGACCCACGGGTCAAGCCCCC--------------------------------------------------------------------------------------------------TTTTT--TTTTGCTAATAAATGTACT-ATGCGAATACATATACAC-------------ATATATAC------GATATATAAACTTTTAGCAAGTAGAGTTGCAA--TTACTGCACAAAGAAAGCGAT------GGAGTCATCTA
GCCCCGCTCCCGCCCCTGCCCGTGCCCAACGGCCCCATCTTGCTCACTAA-CAAGCATATTTGATTAATAATTTATTATTATTACATTAAAATATACTTAGTAGCCTGTAAGTAAAGCTAATTAACGCTAAT------ACATCTAATGTGTACTAAACAAAAACAGTATTCAGTTAAGAGCGGTTTTTTTTTTCTCATCCATCGCCAACGACACCATCATCCATCATCCATCATCATCACCATCATCATCACCATCATCATCACCATCATCATCATGAATATCGTAATGAGAACACACACTCACGCAATCAAATTTTTTTTTTTGCTAATAAATATACGAATATAAACATATATAAACTATGTATACAACTATATATACCATATAGATATACATATATGTAGTGCGTAGTGGGCCAAAGTTATAGCACAAGGCCAATTATTCTAGAGGAAACACCTA
>spri 10341939 10341999|13189 chrX 10341999 10343386 scaffold_28 1605876 1607243 + 55594|0 0
T
T
>CG1628 10443361 10443860|13333 chrX 10443334 10444224 scaffold_10 4413657 4414582 - 15146|27 622
CGACGGCATCAACCATACAATGGATCGCGACGAACGGTCCGCTGCGGTCCGATTGCGGG-------------------------GATCCGGGAGCAAGA-----------------------------CGCTGTGCTAGTAGTTGTCGGCCGCGGGCG---------------GTCATTATTAAATATTCGATAATTATTGCTTTTTTTTCTAG-ATAATTAATAGATCGTAGTGTTGTGCCTGTACAATGTTCAGATAATGCTAATGACTGACTAATATCAATTCTATTGCCGTTTTTATTTCCTGCTAAATTTTTGCAATTTGGCTAAGGCGGCGTTTCAGAAAGTCCTGGCGGTCAGCTGAGTTCTCCAGTTCCCGCCACTCGTGCCAATAGATCTGTGGAAAAAAGCAGGAAAAGATTAGACAATTAAATAATTATAATAATACAACCCGCAGTCTAAGAAGAAATACACAATTGGTACATTTAAATAGGTGCG------TTTCGTATAAAAAGAGA--------AAGAGAGAGAGAGAGCTTGTGAATAAA--AAGGATGTAAATTCAA----------TTAAAATAGAAA
CTGTGACCTGTGACAT--------TTGAGACTGGC-GTGGGCGTGGGCGTGACCGCGGGCGGTTATCATTAAAAAAAAAAAAAAAAACCAAAAAAAAAAAAAAAAACAAAAAAAAAAAAATTTACGCTCACGCTGCTGCCAGTGCTCCATTGCAAACGATTTCCGATTCTGTTGCCTTTGTTATTATTATTATTATTATCGCTATAATTACTAATATCATTAGT--ATGATATTGCTGAGCT----CCATATCCATATG----TGCTGCCCAGCTGCACTCGTCGCTGCGGTCATT------------CAGATATTGGCCGCCTGGCGGAGACGACGCTTTAAAAAGTCCTGCCGATCCGCGGCCGTTTCCAGTTCGCGCCACTCATGCCAATAGATCTGCAGACGGACACGGTACA---------AAGTAGTTGAAAATAGTTTAGCATTCGATATGTTGATGGGAAGCA-ACTGCCCTGACGCGTATATACGTACACAATTTTTTTGTATGACAATAAAAATGATTCAAGACAAGTCAAACGCTTGAAAATAAATTAAATAATTGAATTTAATGTATTCTACTGCAACTAGAA-
>CG9817 10449155 10449378|13342 chrX 10448949 10449287 scaffold_26 194416 194634 + -203|206 339
GTTTAATTCATAGTTTGTTTTTTTTTTTTGAAATCTTTTGTTTTTTGCAGATTTCAAAGAACTTATACTTG-ATAATATGTATTATAATGCATAATAGTTCTCAATAAAGGGTTCGCAAAATCAAATTTAAATA
GTTTGTTTGATTGTTTGTTTTTTTTTTTTG--------------------------TAGAATCTAAACTCGTAAAACAAGCA-CAAAATGCA----------------------CTTGAAATGAAATGAAAATA
>CG9817 10449155 10449378|13343 chrX 10449375 10451391 scaffold_10 4420452 4422373 - 113995|0 3
TCGG
GTGG
>CG15295 10461673 10462085|13357 chrX 10461680 10461864 scaffold_9 1077177 1077346 + 2065|0 186
AAAGCAGGAACTTAT--AATCATTCTTATATATTTTCTCTCACTTTAAAATAGAAAATTATAGTTTAAATCTATAAATATATTGAATCTGCTATGGCACGATCCCAATCACATTAAGATTCCATTAGAATAATACTAGTAATGAACAAATGCCAAATTATACAAGTTTTAGTGGGAATGTGGTACTA
AAACTAGGAACTGCGTAAATTATACTCACAT-TTTACACTGGCACAAAAGCAAAACAAATACATTTACATACATAAATAAAAAGCATTGAATACAA----ATAAAAAAAACACGCAGTTTATATTAAACTAATACTAATACTAAACAGTTGGTAAA------------TAGTGCGATCGTGGTGCTA
>CG15295 10461673 10462085|13358 chrX 10462052 10464579 scaffold_10 4439216 4442190 - 64173|0 37
GTATTGATTTG---CTTAAAAT-AAATTCATTTGCATT
GTACAAACATGAATCGTAATGTAAAAATCAGTTTCATT
>CG32676 10558336 10559616|13478 chrX 10558049 10558378 scaffold_10 4547437 4547790 - 4828|331 373
ACCACAACTACTTGATTTCAATAAATGTTTAGTAAATGGTTTA
ATTATCATTATTTTATTTCAATAAATGCTTAGTTAATGGTTTA
>CG32676 10558336 10559616|13479 chrX 10558557 10559398 scaffold_10 4548451 4549324 - 3414|0 965
ACACCAATT-----CTTCTGTTCGAAC---ACCCGCTCGTTT--------------GGGTTTCCCACCTCCACGATGGGGCAAAATGGAAATGGAAGCGCCCGGAAATTCGATAAGCTGTTAAATTAATTTTAAGTCCCTAAAACACACCCACTTCGGTGCAAGCCAATATTTCGTTGGGAGCA-AATGAAGTGAATGAACCAGCTTCTGGAGGCGAAATCCTTTAATGTTTTTGTAAATTAAATTTAGTGAAATTTTTTGTGTACATCCCAGGCGCACGCTATGCCGTGCAATTCACAATTTGAATCGTTAGCAACCAGCAGCGTGAGCGGAACGGAAATAGA---AATGTATGAAAAA---------GGAAAAGAAATTCTTATAATGGAAATGATTAATATAGAACTCAATGTAAAACACACACACAGACTATGCTGAA---------TGATTTGTAAGCCAAAGCGGTGGCAAATTTTGGT--------AAACTAAAATGGAATTTAG-ATTTAATTTTAG-------------------------ATACACCAAATC--AAATCTAATACA-----ACACACACGATCACACACACACACACC--------------------TGGCTTTGGCAGCTTTATGTTATGTTTAACTTTAATAACCGACGGCGGGCTGAATGAAAATCTGCACCAGCGACTGCGATGTGGCGCTTT--AACCTAATTTGCCTTAATAGAAAATCGTTTTTCACCTATTTTTTTTTATAT------ATACTTTATCACCAAGAATGTGTTTCGAAACGCGCCGGTAAAGACGAGCGACGAATTGAATTTTGTT-CACCTACACCTATACTATTGAAT-TAGTTAGTAAGACTATGTTT-TCTATTCATTTTGCAATTATCATTACACTTATA--------ATTACCAATTGGATTAGTTAAGTTGCGCAATGGAA
ACACCCATTGCCCCCTCCCTATCCAACCCGATCCACTCGTTCCTCGTAACTCGCAATTGTTTGAAACAACAGAGATAGAGAGTGAGAGAGTAAGAGAGAGAGAGAAAGTCGTTGAGCTGTTAAATTAATTTTAAGATACTTA---ACATCAACATTATGATCATTAACAAAATCATTGTTAACATAATTAACT--ATTAATCGGCCCGCAAATCTCAAATCCCT-------------------ATTC------------------CCTCCCTCCCCCACCCCTCTCCGACCACCTACTCATCCGGCTTTCCAGCTGTCTGGCTGGTAAAC---CCTTAAATAAACTTAATTTAGTAAAAATTGTCAAATGTAAAATTAAGCCTAAAGATGTAAACAGCAGCAGCAGAAA-AAACACGAAAAGAAAAAAAAAATGATGTTGAATGGTAAATTTGATGTAAAAGCCAAAGCGGCGGC-AACTTTGGTAGCGTTAGAAACTAGAAGAAAATGTAGAATTTAATTTTAGGCACTGAGACACGCGACACACACACACACAGTAAAACCGAAGCCCAATACACACACACACACACACACACACACACACACACTCGCAAATCGCGTTGCAGATGCGACTTTAGCAGCTTTATGTTATG-TTAACTTTTTGAGCAGCGCTCGCGTTG------CCTTTTTACAGTTGCCTTTTAACGGGCGCTGTTAACCCTAATTTGCCTTAATAGAAAATCGTCTTT---TTGTTTGTGTTTACATTGCGCAACGTTTTGTCATTATTATTATTATT---------------------------------ATTATTATTATAACTATAATTATAATTATAATTGTCATCACCAACATTGTGTTTCTTTATTAATATTATTATTATAATTAACATTATATATAATTTTTTATCAAGCTGA--AATTAGGCTGAAAAAGGAAA
>CG32676 10558336 10559616|13480 chrX 10559489 10560360 scaffold_10 4549444 4550290 - 19999|0 149
AGGCAGCAGCACCATCAGCTAGAGCCACCACCAGCCCCGCTGACTTTATCCTATTTTGTAGCATTTACTAGTTTACGCAGCAGC--AACAAAGAACGAAGAGCA-AACAAAAG-------------------ATGAAGATGATGATGATG
GTGCAACTGCA---------------------------ACTG--TTCACCC---TTTGTAGCATTTACTAGTTAATGTTGCAGTTGGACAAACAACCACAACAACAACAACAACAATTAGTTTTATAGTTTTATTAATATTATTATTATT
>Rph 10594288 10595008|13531 chrX 10594271 10594924 scaffold_28 1549794 1550410 - -197|17 702
AGGACACATTTGAACGAACTGATTTCTCAGCGCAGTCAAGGAAATATGAACCATATCTTTTACGTTAAGTAGTTCAGGAACAT-------ATTAATGCTAA-TGCTTTTTTCATTTC----TATAACTTTTTTAACTTTAAACAG-TTAATAATTGAATACTTTGTAATTTTAAAGATATAAACTGCATG----CTTTGCTAGATCGAATC-AACACTAATTGGT---AGCTCAAAGGACGATTTGCATTAGACTAAGCTGAGAAATCAGGTCGTGGAAATGAGGCTTTAGCTCCAAATATAC--ACATATATATATATACTTACATA-TACATACATATATATTATATA----------------CATATATTTTTGATAAGC--CTGAATGGGTGTGAGCAAGCAAGAAGAAGCTAAAAAGAGCGAGAAATATTGTGTGTTTTTGAGTGAA-TGCTTTCCAAAAATCTC---GTACGTAACCCCAATTT---TCTATGTCTATACTTTGGCTCTTATCGGCATTTTTGTACACTGTATATAGCTTGTTTAAGTGTCCTTACCAAGGGTTAACCAACATCAAAATCTTTTCGATTCATTGCTAAATTCAATCTTTAATCAAACGTATACTTATGTACTTCAATATATCGAAATATATACATCTATATTCTCAAAAGATAACTAAA
AGGTAACATTTTAATTG------TTATCAATTTAGTTGAGATAATGTGCCCAATGCCTTAT-CGTTA----GTTAATGAGCTTTACTTTTATAAATTCGAAATATTGTTATCATTTTATTTTATGATTTTTATTATTCAATATTGATTATTATTTGTATGTTTATTATTTTCATAATTATTATTTTGTTTATATTTTTGTTGGATTACATTTGACACAAATCTTTTAAAAATTAAAGAACAAATAATTAATAGTTATTATTTGAATTCAAAT-GTTTAAATTTTGTGTATTTTGCAAATGTATTAACAAAAATGAATAACTTTTCTTAGCACATATTTATTTAGTACTTAAGCCAAAGGAAAAGCTCATTAGGTTTTGATAAGTTTCTAATTGGGTGT---------AGTCGAAGCTGAA--GTCCTTTTGGCAGTGCAACTATTCAGGTGAACTGCGCTGTAGAAATGCTTAAATGCAAAATCACAATTTAGTTCAGTTGATGGATTTAAGATCCAATATGT-TTATTGTATATTTTATATA-------------------------------CAAACTGGAGATTCCTT------------AAAGACAACAACTATTTAAAA-----------------AAAATATCGAAATATATATATGTATATTTTCTGATGATGTTCAAT
>Rph 10594288 10595008|13532 chrX 10594989 10596981 scaffold_28 540271 542256 - 72392|0 31
GTAGC------------CCCATCCGATCCCAA
CCAAAAAAGTGCGCCCGCCCAGCTGATTCCAA
>Atg8a 10610086 10610675|13550 chrX 10610051 10611025 scaffold_28 554834 555804 - 33721|35 691
CTTTGCTCCGGTCGGGATGCATCGGAATGAAGCC------CCCCCCCTATACAGAAATCTATATATAAATAAAATATATTTTGTGTTTAGCATGCAAGCTTACAATATGGACGGCG-----------------AGTTAGCTAAACGAATT-------------GAGGAAAACCGCAGGAAATGCCACATGAAAAGAAC--TTGAAATTGATCTGATACGCAGGGCAACAA---AAAAAATCCACAAAAACCGAAAAC----------------TACAAAAACAATTGTTATGTGAACATTATTTTATATATATACATTTTCCAAACGCGTTAGTATTTCAATTAAACTCTGCTTTGTGTCCTACCCATTAACGAAACAACCAACCAACCAACTTTCCCCACAAAAAACAGATCTATTCACACCCTTTCTGGGCCATTTAATTTCCATTGCTGTAATTGAT--CCGTGCGAAT------GCTTTGTACTTTACTTTG-TTACTTTGCTAATATTTCAATGAATTCACTATTTTTTTTTTTATTCACGATGCAACAAAATTCTGTGCATATTTAGTGTGTATGGTTACGAATAGGACTCTCTCGGTTAAGTGTACGGTAATTAATCTATTATTAAATAAACAAA-AACCACAAAAATAC
ATCTCTCCAAAGTAGCAGGCGTCT---TGAACCCATGCAACAACACCTATACAGAAAATTATATATATAT-ACATATATTTTACGTTTAGCATGCAA--TTGAAAAACAAAACGCGAAAAAACACACAAAAAAAGATAGCTAAACAAATTGTGCAGGTCTAAGGCGGTAAAATATTGAAAAACAAAAAAAAAAAAAACAACAAAAACAAAAACAAAACAAACAAAAACAACTTAAAAAGATCTTAAAAAATGAAAACAAAAAAAGAATTATAAGACAAAAACAAATGTTATGTGAAAATTATTTTATATA-AAACATTTTCTATACGCGCTAGTATTTCAAATTACCTATGCTTT-------------------------------AACAATTTTCAC-----------------TTGGCACCGTTT-TGTTCAGTTTAACTTCC--TGCTTTACTTGTGTACCGTGCAATTTATATCATTTTGTAAGGTACTTTACCTTCTTTTCTGATTTTT-------TTTTTCTTTCTTTTGTGTAATAATAATACAACAAAATTTTGTGCATATTTAGTGTGTATGGTTACGAATAGGACTCTCTTGGTTAAGCGTACAGTAATTAATCTACTATTAATTAAATAAATAAAAACAAAAAAAA
>Ant2 10624108 10624438|13559 chrX 10624352 10624953 scaffold_36 402825 403406 + 23981|0 86
CCCCAGTGTGCCGCCGTTTGTGGTGGGCCAATTCGATCGCCAGCAGCAGCAGCAGCAGCCCCGGCCACAGCAAATGTCACACCACGA
ATTAAAT-------------TATTAAATTATTCAAAACAACAACAACAACAAATATAACAACAACAACAACAA----CAAACCACTA
>sesB 10626204 10626838|13561 chrX 10626488 10628438 scaffold_36 402617 404458 + 77735|0 351
ATTAAATTATTAAATTATTCAAAACAAGCAAAATACAACAACATACAACAACAA-AACAAAACAAAAGAAGTAAAACTAAACACTACCAGCTAATTATGTTAGATAACTGAATGAGAAAAGCTAAAACAACAGCAATAGCAACAGCAAAGGCATAAGCTAAGTTTGATCTGCAACCAACACCTCTTACCACGAACAACGGCAAGCAATAACAGCAAGAACCCTTCCTTCCTCACCCCGATATAATTATGAAATTATATTATTTATAAAAACTGGGAACTAATTTACGGAACGATGGCCAGCGTCAATAGAACAACAATACTACAGCAAACAGCAATGCTCGGGGCAGAGAGA
ATTAAATTATTAAATTATTCAAAACAA--CAACAACAACAA-ATATAACAACAACAACA-------------ACAACAAACCACTACCAGCTAATTATATTATATAAAT-------------TGTAACAACAACAA----------AAAGG--------------AAACCACAACAAAAAATGTTTA-----AAGAACAGCGAGAAACATCAGCAATAAT-------------CCCCGATATAATTATCAAATTATATTATATATAATAACTGGAATATAATTTAATTGCACTTGCCCAAAATAGCAAAGAAAAAAACACC-TAAAGAACATCAAGGAT--GGCCAGAAAAA
>Imp 10641215 10642286|13573 chrX 10641006 10641394 scaffold_10 3091189 3091588 + 1593|247 431
GCTTACATTTAAGTGGAATGAATAGAAGAGAAGTGAGCAAAGCGTAAGAGAATGAGATTGAGAATCAATTTAAAACAAAAAAAAAATAAGTAGGGACAACCATTTCGTTGATCCCAAAACTACCGAGAATTACACAAGAAGAAAAAGTACACAAGCGAAAA-----TAAGAATCAAGAAATATTC
GCCCACCTCAAAGCAAAACGAAAAAAAAAAAA----------TGCAAGAAAAAATAACAAGAAAAAAATGCAACAAAAAAAAAAACAGAGTAGTAGAAAGCTACGACTAAACTATAAAACCCCTTTAAACTAAACCAAAACAAAA------CAAGTGAAAACCAACTAAAAACAAAAACATGTAA
>Imp 10641215 10642286|13574 chrX 10641395 10642272 scaffold_10 3091753 3092671 + 84|0 991
TAAAGGAGAGCCGGCGCCGCAGCAGCAGCAGCAGAAGCAGCAAAAGCAGCAGCAGCAGCAACATCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCGAAAGCGCCAAAAATAGCCAAGGCAGGGTTTTCTACTGTTGATA-----CTACCTCCACAGCACACCCATAAGATTCAATACCCCAAGACCCAAAAGCACC----------CACCACAATTTACAAC---CCTATATAACTACA---------------AGCTAACCGTAGGCGCCACCTTTGTGCTGGCACAGGCGACGGCAA---------------------------AAGTAA--GCAAGCAACCTGGAGCAGTAACATAAGCAAAATTTTACGCATATAGA-ACTGTAGGGGAACCACCACA----------------------TCAAAAAGTGAGCTGCGTGAAGAGCTCTACTAGTTCATAGCAGTGTATTTCGACTTTAACAAGA--TCAACATAAAACAGCAGTCACACA-GCAAGAATAACAATAACATAACATTCTTCATTTGCATACTAAGAAATAAAGAGAAAAAGTTAATAGAAAGCAGCGCGCTATCGTTCATAGAAACCACTAAAAACAAAACCCCGCCCAAAAATCGAAACTTTGTGTTGTTGTTCTGCTAGTTGTAAACTTTTGCGTCAGCTGAGAATTCGGTACCGCCTAAACTGTTGTGAACGTTTTCAAGGCAGTAGGAGTAAAACCTT-----AAATATTCATAATTTGTACAAGTAA--------ACCATATATTCAACAACAACAA--CACAAAGAGTCAAAGTAACTAAAGAGAAA-ACCCCTTAAACTAACACTAAATTTGATTGCAAAAAGGGGAAATAATGGATA---------ATGAAGGAAAGTTTAGTAGTGTATGCGTTATATTTTTTTTAAATATATTTAACTATAAA-ACGTTTATTTTTAATTATTTTTTTTAACAAAGATTTAGTAA
TAACAGCAAATCGCGACCGCAACAACAGCAACAACAACAACAACAATAACAGCAACAGCAACAGCAACAGCAGCAGCAGTAAAAGCAAC-----CGGCAACAA----CAAGGCAGA------TGCGGCTGAGAACTCGCTCTTTCCCTCTCTTGCAAGTTAGTTGCAGACGCCCAAAGGGGAGAGCTACCAGATTTTGTGTACAACAATTAAATGCTTGCTTATAAAAAAAAATCATAATAATAATAAAACTCGGCGCAGTTCCAATAAATGGGCTAAACTGTTATACGGCAATGCATTGAATTGTTGTTGTTTCTCGTGATGTGACTGCGCGCTGCCTA-ACCTTTGTTATAATTTTAATTTTACACACACACACACCACACAGATACAGACACACACACACACACACAGGCTATTATTTAAAAAAAACTTGCATTAAGCCTGATGCAAAGGAAAAGCTACAT---------TAAACCAGGCTTAAACACAAAACTGCAACAGCCCCCGCAGCAAAAACAATTATTCAACATTTTT--GCAACATGAAAAGAAATTTACAAGTAAA---AACAAAAAGAAATGCAAAA--------AAAAAAAACACAAAACAAAAGCGAAAACAAAAAAAAAA--------------------CAAATGCAAAAAATCGCAACAGCAGCAAATTCGTTTTTTTTT------TTTTTAATATATAGAAAACA-TAAAATTACAACTTTTTAATGAATTATTTTATTTTTTTTAATCAACTTTAGTAAGCGTAAATTAAGTGAACACAAGAAAAAAAAAAACAAAAAAACAAAAGTGAGATAAACAAGAACCAAACAATCAATTGGTTTGTGTGTGTGTTTTATGATTGTTTTATATATATATATATATATATTTATATGTATATATATATCATTTTTTTTATTTAAATTTTTTTTTAAGCGTATTTGCATTTGAAAATTT--------GAAAATTTTGTAA
>Imp 10641215 10642286|13575 chrX 10642273 10644226 scaffold_10 3093016 3095124 + 104800|0 13
GGAGGAATCACCGT
GCTGCATGCATGGG
>feo 10697663 10697806|13643 chrX 10697589 10699859 scaffold_10 3158612 3160902 + 68809|77 237
TT---CCACTGGAGATTG-------ACTAGCTTAACGCGT-------ACCTACTACACTATTTCATAACAGTTGGAGTTTCTTGATGTATTTTAATTTTTTATTTTCTGTTTTACGTTTTCAGAATAAAATTTATGTGAGTTTTTTCGCTTGACCACAAGA
CCACGACGCAGCAGAATGTGGCAACATAAGCTTAAGAAATGAGATTAGCCAACAAATGTACTTATTTTAACTTGAAACTAATTAATATGCTT---ATTTTTATTTCATGTATTATTGTTTAAAAGTTGCTGTGCTTTGAGATTTAT--ATTAGTTATACAT
>sofe 10700359 10700665|13644 chrX 10699993 10700359 scaffold_9 2256284 2256614 - -631|381 386
A-----
AACAGT
>sofe 10700359 10700665|13645 chrX 10700360 10700617 scaffold_3 2266039 2266301 - 2425|0 283
TCTGTGTTCTATATCTATTACCTGTACTGAAGTATTTGGCTCGCAATTGCAGACTCATCGTATTTATATGTA--------TACACATATGTATAGTGTTAGGGCTTTTCCTAGCGCAAAGACTATCTAAATTTACAACTTTAAAATTCTTTTAACTATTTTGC--ACTACCTGTGACGGCAAGAAGTAAATGAACAATTGTCCACAT-------------TTTAAATTTTTAGTCAGATAAAAACGCTTGTTTACATTATAAATTACTTGAT---TTCAATTTT
TATGTTTTTTTTTTTTTTTACTTGTGGC----TGCTCAGCTTG---TTGCGG-CTGGAGTTATTTTGATATAGGCTATGTTTCACATATGTCTTGCGTAGATGTTGCTTCTAGCACA------ACCCAAAATTACGGCTACAA---TTTTTTAACTATTTAGCTAATTATTTGTGGCGT---GAGTTTACTAAACGTTTGTTTATACCCTTTTTTGTTTGTTTAAATTCAGCATCAGCGATTGACTCCTGCATAGA-TATTAATTGGTAGATATATTGAATTTT
>CG1637 10715800 10715921|13667 chrX 10714951 10716072 scaffold_26 1351183 1352343 - 36413|966 1129
GA-----TTACATGCATATATAAATA---TATAC---TTTCTAGTTAAATGACGATTATGATAATGTATTTTTTTGTAGCATCTTTTAATAAAAATAAAGTTAGAAAAAAATATATCGATG-------------------------------AAAAAAAATAAA
GAGAGTCCTGCCTCCAGTTAGCAACAAGTTATACAATTTTCTGCTT------CGCTTAT-----------TTTGTTTAACATATTTCAA---ATATTAAGTTAGAAAAAAATATATTTATGTTTATGATAGAATGGGAGACAAAAAAAAAAAAAAAATAATAAA
>Ork1 10723360 10723733|13674 chrX 10723498 10726040 scaffold_26 1359978 1362415 - 78154|0 236
TTAGGTTTCCTTGTCCGAAAGATGTATTACCTGTATCGTATACATATGTATTTCCACGTCCAGCGGAATTGCTTTGCCAATTTCACAGCATGTATGCCACAAAGTCGATAAGGCTGCCAAAAGTCCT-TAGTTGTTATGCTAATGTTATCCTTAAACCTATTTACATACGTATATCCAGTTATCCTAGTTGTATGTATTGTTAAAACTATCTCTCTATCTCTCTCTCTCTATTGTTA
TAACGGCAGCGGAAGCGGAAGCGGTGGTGCA---ACCGGAAGCGGAAGTGGTAGCGGAACCG--GAAACGGAAATGCCAACGATAAATAGT---TGCCAGCAAGT--------CTCTCAAGTGTTTTCTAGTTTGTAGATCAATTAT-TCTTTCCACCAATTTGCCTATTTATAAATTAACATTCCATTATAATATATTTTCGATCCGAAATGTTTGTCTAACTTTAGATAATGCCA
>CG1582 10740154 10740229|13692 chrX 10739575 10744446 scaffold_26 1379425 1384362 - 198834|712 801
GAAGCCACTTA-------TTTCGCAACCATCCAAATTTTGTGTTAG-------AGCTGTTATAGCAAATATTAAAAAAAAAAAGAAAGCC
T-GTCCGCTTACATTTTGTTTTTTATTTTTTTTTTTTTTGTATTTGTATTCGTATTTGTATTTGCATTTGTACAATTAGCCAAGTTAATA
>CG1552 10897553 10897822|13900 chrX 10897418 10897672 scaffold_22 1583446 1583670 - 1920|145 265
GATCCAAAATCA-AATTATTTGGATTGTGTTAATCTCAATATGTATGTAGGCTATAATTTAGATTGTAACATATATAAGCTGGTATTCATCAAACTGAGCACAAAAAAAAAAAAAAACACA
GATGTATAATTATAATTAATTGACTTTTGTTTATCTGAATAAGTTCATTAGCAGCTGTAAAGAAAATGACCTCTATTTTGATGCATTCATCAAAT-----------------AAAATATCT
>CG1552 10897553 10897822|13901 chrX 10897809 10899046 scaffold_25 1226507 1227685 - 29224|0 13
GATGACAGGATGGT
CATTACAGATTGTT
>CG1537 10907239 10907377|13912 chrX 10907365 10907495 scaffold_25 1247021 1247149 - 8666|0 12
CTATGTTAGTGTA
--ATGCTAGCGTA
>sev 10916659 10916938|13929 chrX 10916490 10916772 scaffold_13 1449838 1450135 + 2579|191 306
GGAATTATGGGCAAGCGCATTGCCTATAAGTTTTATTTGCACCGCTATTTATTTATTTTCTTTAATATTTCAATTAATGGATAGACTTAAATATATTATA--AAATTTTTGGTACT
GAAATTAAGAGCAATCGCATTATTTGTAAATTTCA--AGAACTTCCTTTTCTCTTTTTTTTTTTTTAGTT--ATTTTTAGTTAGTCTAAGCTTTGGTGTACTAAGTATTTGCTA--
>sev 10916659 10916938|13930 chrX 10916901 10917764 scaffold_25 1263437 1264359 - 32138|0 37
AAAGGTGACTCCCATGTCCTTCACAAAGGTCGTCTCAA
AA-------TCCCCTTTCATTTGGATCTGCCGTCGCCA
>CG11122 10957613 10958068|13963 chrX 10957610 10957805 scaffold_25 105952 106157 - 6688|3 220
GCACCCACTTGGCAGAGGCCACCTCCTGGCC-CCGCACCCATTAACCGTATGCGGAGTATATGCAACATATTTTTCTTTCTTTTAA-------------ACATCTAAGCGTTACATTATTTAGG-----------TTTTTTTTATTAAATGTATTTATAATTAATAAACAAAAGAAACAAAAAAGCGAAAGAGCAACAAATATAAATTTGAGCACAAC
ATGCACAGTTGGGAACAGCTGCCAACTGCCAACTGCAAGCAAAAAATGTATTTCATATATAT-----ATTTTTTCCTTTCTTTAAACACACACACACACACATCTAAGCGTTACATTATTTAGGTTATTCTATGTTTTTTTTTATTAAATGTATTTATAATTAATAAAC----------AAAAATTGCGCGAGCAACAAATAAAGATTTGAGCACAAT
>CG11122 10957613 10958068|13964 chrX 10957806 10958063 scaffold_9 552653 552933 - 515|0 292
GGTGGAGCAGCGTCACCAGACGTAGCAACAGCTGGCGTAGGAGCACAGCACAGTCTCCTCCCGCCAGACAAGTCATAGCCATAGGCCTCGAGGGG---CGGAGTCGGCGCGGGCAGCCGAC--GACCCATCGC--------CGCCATCGATCACATACGTACTGCC---------------------ATTGTGTCATCGTTAATCGTTAACGCCGGCGCCAGGAGGGGATCAGGATCAG-GATCAGGATCTGGTTCGGGATCGGGATCAGCTGGAGTAGGAGCGGCAGCGGGA
GGAGCAGCAGAAAAAGTCGCCGCAGCTGCCGCCGG-GCAAGTCCCCGGGAAAATCTC------CCAGACAAGCCGCCGTCGCCGCGCTGCAGCCGCCCCCGCCTCTGCCCGTGCCATCGACCGTACCCACGGCCACGCCCACGCCGCCCGCCAAATACGATCCGCTGACGCACACGCTCGCGGGCAAGCTGCGTCAGCGTGCGCC----ACG-TGGCAGCAGCAGCGGGTCGGGTGCAGCGGGCACGCGCGGACGTGGACGCGGACGTGGTCGAGGCCGGGGCGGCAGCTCGG
>CG11122 10957613 10958068|13965 chrX 10958064 10959363 scaffold_25 106158 107574 - 35814|0 4
GAGTG
AAGCG
>Gtp-bp 10972093 10972192|13976 chrX 10972059 10974339 scaffold_25 121717 124042 - 108016|34 157
-CCAGCCGTCGATCCGGCTA----------TCCTTCCAATGCTCCT-TGTTTGCATCCACTCTTTTCACCGAATCAAATATATGGCTTTTGTCTAGTTTGTTGTTGCGT-------------AA
CCCAGCAATAACTGGGACAAACGGAGGACTTAATTCTAAAAAACTTGTTTTTACACTTGATTTTTTTTCGTGTCTTTATATAAATGTTGTGTGT-GTGTGTGTGTGTGTGCACAGGCACAACAA
>Klp10A 10975454 10976197|13981 chrX 10975071 10975759 scaffold_24 641018 641592 - 3983|411 734
AAAAGAAAAAGACATTTACTATACAATATATATATATTTACTACTTACAAACATACGTTCTACTCTAAACAATGATATGAGATTCCATTTAATTTTTAACAAATAACCTTATGCGATTCGATTCGATGCGATTTGTTTCCCTCATTTTTGTTCATTTTGTAGAATTACTCGACCAGAGTTGTTTGTTCATGCCACGGCACAAATCTACTAGTTTTTAAATTACGAACTAATCGCGCATTGTATTTATTTAAA---------------GGCCAC-AAAACTGTATTTAATTTGTATTAATTTATT-AAAGTACTA-CTGCACCAA
AAAAGAAAAAGACATTTATTTT----TATACATATAATAA-----TATAAACATA-ATAATAATAATAATAATAATACTAAAC--------ATATTTTAAACATAA---TATGAGATTCCATTCAAT-----------------------TTCTTGCTGTCTGATTAC---------------------------------AATTTACAACTATTTAA---------TAATTACACACTGTATTTATTTAAAAACAACAAAAAAAAGGGCCACAAAAACTGTATTTAATTTGTATTAATTTATTAAAAATAATACCCGCACCAA
>Klp10A 10975454 10976197|13982 chrX 10975760 10976135 scaffold_24 1361554 1361956 + -3071|0 418
GGCGTACAC---TTTACATTACAAATTCCCTCTGGCTTCCCAATGGACGTGTCTGTCGTGCAGTCCCCT--AAAACAATCTCTCTATCACCTTTGCCCCAAACCGTCGAGTTTATGTCGCTGCGAGTTTATGGTTTATTAAGTTTTTAACTGATAA-----------ATAATAGTCGAGAGCCTATATTTTACAAACGAACTAAGCACGGGAACAGACCAGATACC----------ACAGCATTAA---------TACCATTATGAGAGCAACGC----AAACCAATAAAAAGGAACTCAACTGAAAACTGAAGACAGGCTAGGCTGGCTGG--CCACGACTTTGTTTGGATTCGCCG--TGAACTATGATTATATGAATATAATTGTAATTTCAGCGCAGTCGATACTCTAATTGTGT
CACACACACACGTGTGCATTAAGGCTAAGCTACAACATTTTCTTTTTCATTTTATTTTTATAATTTTCTTAAGAACAGGCT----------TTTTTTCCGGCTGTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTTTAGTGTCTTTTATGTCTTTGTTAGATAAGCATTAAATACAAAATAAATATTAGTATATAATTTAAACGCTAACAAGAAAATGCAAAAAAACATTTATCTCCAATCTCAACTGCACTTAAAATTGTTTTTCCTTCTTTTGAGGCTTGCTTAAAAAGAATTATATAGATACAAAACGAGAAAAGTTCGACTGGAAAATCTTCTTGAATCAACAACTAAACTAAGACAAACAAACAGAAAAAAAAAAATAGTATTATAATAATAA--TCAGT-TAATCGAAAGT---ATTGTTT
>Klp10A 10975454 10976197|13983 chrX 10976136 10976593 scaffold_24 642298 642753 - 20786|0 72
TTCATTCCCGCATTCGACCCGTTCATCCACAATCACCAACAAT-----------CATCCACCACACCCAACCA
ACCAACCCCAGCAACAACAACAACAACAACAACCCCCAACAACAGCAACAACAACAACAACAACCCCCAACCA
>CG32667 10984975 10985061|13995 chrX 10984336 10984983 scaffold_24 653943 654671 - 5761|756 764
ACCTTAAAT
AGCTCAAAA
>CG32667 10984975 10985061|13996 chrX 10984984 10985462 scaffold_24 655027 655497 - 6249|0 78
CAAC-GCCTCCCTCGCAAGTCGAACTGCAAATGTGAAATGAACTATGAAAACTGAATATATAACTATAGAAACATACAT
CAATAATCTCAAGCTATAGATCAACTGTCGACTTGAAATTCA-TAAAAAAAATATATATATACATATATATATATGCAT
>ran 10990080 10990866|14004 chrX 10990002 10990429 scaffold_32 346765 347174 + 421|82 459
AAAACCAAGAGAAATAAATAGTCGCAGAACGTATTTT-----------TTTAAAACTTGCAACACCAATGTTCTTTTCCACCCAAAAAA---AAAAAGGAAGAAAAAACCAAGTTACTTCAACAAAAGTGTGAATGTTAGAAACGAGCGAGACGGCATGCTCGGAGCGAGCGAGAGCGCAAT------AGCTGGCCAA-TGAACTGAGTCCCCCCAAAGGAAAATTAATACTATTGAAAAAAGAAAAGAAAGGAAAACACTGGAAACTATGAGAAAATAACCTATAGACAGGCCGCCGAATTCGCATCCACATGTTATTAATCTAAGAACTAAAGAAATAAAA-----AATAAACGTCGAAG--AAAAAAAAACTAAA
AAAATTAAAAAAAATAT---TTCACAAACCGTTTTTTGGGACTAGAGCTTTAAATCTTCTACTATTAAAGG-CTTTTTCGTGCACAAAATTCATAAAACAATATTAAATAAACTTTTCTGAATTA---TTTTAATTTTAG------------CTGCTTGATTAAAAAACTCAAAACTTTAATTTCACTATATGTCCAAATAAAATACGTATT---------AAACTAATTGTCCAGAAAAATAAAATAAAAACTAATTAGAGCCAAGCGGGAGCCAGAAACTTGCAG-----CCCTCAAATTT-----CTTGTGTTTTC---CTAA-----ACAGAAATAAGATTTCCAAGAAGCGGAAAAACTAAAATAGAAGCCAA
>ran 10990080 10990866|14005 chrX 10990865 10991156 scaffold_24 664133 664439 - 15468|0 1
GC
GC
>CG1397 10997691 10998183|14012 chrX 10997775 10997889 scaffold_24 667751 667855 - 1997|0 118
TGTTTGCGAAAAAGAAACAATA--TGAATATTATTCATATACCTAATTAAATCACTC--CTGCTGCGTAACACCATTCTCTTTGTTTGCAAATAGAATATCCATTCGTTTTAATTAGTA
TGTCCACAAAAAAAAAAAAACAAATGAAAAATATGCATATACATAATTGACACAATTTGCTGTTATGTTAAGCTATTT--------------CACAATACCCACGCACCTAAAGTTGTA
>antdh 11013233 11013415|14030 chrX 11012944 11013657 scaffold_10 3942041 3942843 + 3536|328 535
GCGGAGGAGCTTCAGGAGCTCTGTTCTTTTTTTTT-------------TTTGTATTTTT-------CCTCTTCATCTTAATATTTTTGCCGTGACAGAAAATATGAAGCACCATATTCACACAATTTTCGTAGACAGTTTAATATTCACAGTTAAGCTA----TACACGTTGCAATAA-AACTATTTAAATTTAAATTTAGTAAGTCG
ATTG---------------TTTGTGTTTTTTTTTTATATATATATATACTTATATTTATGTACACAGTTCTTTGCGTTTTTTTTTTTCATTCAACAAAATAAAGGAA---------------AATTTTGATGCACA--TCAAT-----CAACTGGCCTAGAAGTATATGTTTATATAGCAACAACTTAATATTATTATAAGTAAGCCC
>sisA 11166797 11166938|14220 chrX 11166426 11166869 scaffold_10 4113316 4113743 + 1759|397 477
TTTTTTGTTGACTATATCTAGTATTTATCTAAGCATATTATTAAATTT--------TTAAATAAAATTAAGAATCATATTG
TTATTTGCGGAATGTTTCACACTTTGTTGCAAATATACCTTGAAACGTGTCCAGGATTTAACAGCAACAGACTTCTTATAT
>sisA 11166797 11166938|14221 chrX 11166937 11167993 scaffold_10 4114549 4115601 + 18414|0 1
TA
TA
>l(1)10Bb 11169516 11169887|14224 chrX 11169792 11170829 scaffold_10 4120689 4121796 + 28582|0 95
ATTCCATGTGGACGCATTATTGGCATCTTTATTCGACACAAATAATCCTCATAATACATAGTTCAGTAGGTTCAACTTTAGATTTCGCCTGATTTC
--TCAATACAAACACAATGTTTTTTTCTATAT-----ATAGAT----------ATATGTAACTTAACTTGTTCGATTTTAAAATTAATCCGGGTTC
>CG1597 11189724 11190484|14251 chrX 11189560 11189948 scaffold_20 607432 607800 + 2327|170 403
TTTTCCACTTTTATTCCATAGATCTATTGAAAATTCCTGTCGCTGGGAATACTCCGGTGTTATAGCTATATTATACACGATTTTCTTAACTATATAGTACACACACACAATCGCACACACACACACATACACACACGCAGGCTG-ATGATACATACATACATACATATATGTAAATCGTATTTCATTCTACTGTTGCA-------TTAAAAAAGGTACAAAAATGA-TATACCT
TTTTCTACCTCTCCTCAAAAGACTGAACTAAAATCCTATTTTCTATGAATTGTTTTGCAATATAACCACATTATATACA------TACACTATATGATATAT-TAGACAATCGCACA-------AAATTCACACACAAAATTTGTACAAATTATATATATATATATATATATGAAATG----------AACTGTTGCAGAGAACTGTGAGAAAGTAATGCCAACGATTATAACT
>CG1597 11189724 11190484|14252 chrX 11190437 11193195 scaffold_5 4833972 4836735 - 140498|0 47
ATCTCGCCTACACGGTTTTCAGCCTGCCAAAACTGCTGTGAGTTCCTC
TGC-------CATCGTTTTCGG----------CTGCAGCGAGTTCCTC
>hop 11206117 11207032|14265 chrX 11206115 11206222 scaffold_38 1103413 1103514 + 1835|2 107
CACACACCCGCAGGCACAATAACTTATTATTGCTGTTAACGAGAAAGGATATTTCCGAAATAAATCAATTTTCTTACGTGTTTAAATGCTAACTTTTATTAACTGC
CACACACACACAGCCACAAAAACTTTTTGCT-CTTTGTACAACAAAAACGAAGTGTGGCAAAAATTCGTTTTCTT-----TTTATATTTTCGCATTTTTACAATGC
>hop 11206117 11207032|14266 chrX 11206245 11206658 scaffold_19 1708471 1708816 - 1178|0 426
AAATTCTCAACCTACTTTGTGTTATACATTTTAGACAACTTTGTTAAATA-TTGTTAAGCTTGAGCTTCAATTTTTTTTTTGTAATGCCCACACCACGCATAAACACTGAACTAAACTAAACTAAATTAATCATA------ACGTGTAAATAATAATTAAATTAGTTAAGGGTTTAATCGCGAAACGGC-----AACACACGGTAATTTACAAAATGAATGGACGTCGACAGAATCGAAAGGATGCTGCTGCGATCTGTTCTGTTCGGCGACTAAGTCGAACCGCCTAATCTACGCAAAAAAAAAAAAGTAACATGTGCACATATAGTCGTAAGGTATGTCAATTAATGTTGAT-CAAATGCCATTTTAACCTACAATACTTCGAAACAGAAACGAATTATATATTTACAAGCTATACAAGCCACTA
AAATTCTCATTTTAGTTTGT--TAAAACTTTTAGACAACATTGTTAAACATTTGCTTAGCTTGATATT-------------------------------ATTAATAATGTACAAAAGTGAA-TGCATGATGCATATTGCCCATGTGTAGCACATCGACCACTTA--TATATGTTCAATCCTAATCAAGCAAATAAATAAAACGTATTTTATGTAA--AATGTAC----------TCAAATATATG-TGCACATATAGATAATGT---------------ATCTGTATAATATGTAAAAAAAAAAAAAAAAATCAAATTGAC--AACATTTTAATGCGGGTCAATCGTACTTTATATATACGCCATTTTAAATC------------AATAAAAACGAATTG---ATAAACAAACTGAATACGCTTCTA
>hop 11206117 11207032|14267 chrX 11206895 11207047 scaffold_40 192878 193048 + 105|0 155
CTGTTGACAACTGAATGAAATCGATATACACACACAATTAGGCATAAGGTCTTT----TAAGATGTTAGCATTTAAAC---TGTAC----GTTTTTAAAAC------AACACAAGCCAGACCCCAAAAACCACTTGACGCA-ATCCTTGGCTTAAA
CAATACAAAACACAATACAACACATCTATAAATATATATATTTATAACGTTATCTATATATAACGTAAATATTTATACATATTTACTATAATTCTTAAGACTTTTAAATGGCAAGGCATACAACAACAGCAACAACACGTATAACATTAGCATAAA
>CG11727 11278130 11278497|14354 chrX 11276808 11278643 scaffold_19 1792084 1793975 - 6356|1494 1911
CCTACAG-----------------ATGGATCAGAT-CTAGCAT--ATCCAAACCAACCAACAGCCACAACCAGTAGAAAAGCAGCGAGTGAGAGGAAAGTACAGGATACACCCAAATCTAAATGGGTGGGCAAGCTGGAGGCGATTTATATATA-----TTAATATATATA--TACATAGATGGATATACATATATATGAGGGGCCTGTGATTATGAAACGGAAAGGGAAGGTGGAGCATCGAGTGGAG----GGAGAAGTAGAAGGAAGAGGGCAGAATAGTTGCAATCCCATTACA--ATATTAGTTATGTATAATATTCGTTAAAATTTTACTACTACTATTACGATATATGGATATTTTAGTACGATAATTATAAACTATATTTTTTTTTTTGC-----------------AAT
TATTCAGAGCAGGCGGCACACGGTACGGATAAAATAATTGCATGCAATTATATCAACATATATGCATAAACATGTGTATAGACGAGGATGATAGATAACTATTTGA---ATCCTTATATATATACATGTAT------------ATTTATATATAATCGGTTGATGTATATGTTTACATAACTAGCTATGTATG------------CTCGGGTCACAAAGT------CGGCTGTGGTGCGTCGATGGGTATCCTTGGGGCGTGTCAATAAATGTATA-ATTAGTTGAAATTCAATTAAAGCATATTACCTATTTATAATAT-------AATATTATCTATGTTTTTAACGATTATTAATA-ATTATTATTGTCATTAT------TATTTTTTTTTCTACTTCATTGTATGTATTTATAT
>CG11727 11279872 11279978|14355 chrX 11279613 11283524 scaffold_19 1794833 1798952 - 139655|313 440
ACTAATTTTAACACCGCCCCCGAATACGAAAACACACGAAATTGATTGATAACGAAACAAAACGATCAAAATTATGA------------------AAATTACAG---AAAGAAAAAAAAGATTTAAAA
GCTAAT--------------CGAAAACAGAAAGCTA--AAATCAAACCAAAACTAAGCAAATTCATCAACATCATTAACAAATGCCATCTACCTTAAATCCCAGTTAAAACGAAAAGCAAAACAAAAA
>CG1572 11400499 11400833|14507 chrX 11400474 11401683 scaffold_10 2651943 2653127 - 26919|25 447
GCACTAAAGCACCCAAAACCCACCGCCCACTCGGCCATTCAAGTGGAATTTGCAATCTCGAAGCATTTGTTCTTCCCACAACCAACTCTAGCCACTGGTCATGCGAAGCAGGAGAAGGAGGCGAGAGCCCAGGGATATACAAACATAGATGTAGAGAA----AGTGGGTGCCAAGCGGCGGAA--TCTTTGTTGTACTGTGAAACGTTCTTTGGCG--------------CTAGTTACACTTACTTGTACTTTTACCGATATATACA------------------------AAACTTTTT----------------------------------TTTTGTCTCA----CTTTCTTTTGTACCAAACAGATTGTCATGTATTCGAATAAAGATGTGTGTCTATATGTTTTTTCT------AAAT
GCGACA-----------------------------CAATCGCTGGCATTTTGCAAAC---GAGCATCGAAATCTAACACAAACA------------GATCATCAGAATCAGAATCAGAATCGG-------------ATATAGCTACAGCTATAGTCAATTACCGCACAAGCCATACAGAGGAGTCTCTTTGTTGTACTGTTAAATAAATTGTGTTACACACTCGTACTACCTAATTACCCACATCCATATATATATATATATATACATATATATATTAATTTTATTATTGCATATTTTTTTGTGTTACATTCTCATTTTATTCTTTATTTTTACTTTCATCTCACTGTCTGTCTTTTATACCAAACAGCATATATTGTATTCGAATAAA----CGTGTCTATATGTTTTTTTTTATACAAAAT
>RpII215 11407991 11408729|14511 chrX 11407245 11408055 scaffold_25 1026656 1027464 + 24002|759 828
TAAATTATGACAGAAAACA----AAATAGAAAATTATAAAATAAAAACCACAAAAAAATACT-CAACAAC
TAAAATATGATCGTAAGCACGATAAATCTATGAACGTAAATAGAAAACGATTTAAATTTACGATAAAAAA
>RpII215 11407991 11408729|14512 chrX 11408728 11414539 scaffold_25 1057688 1063454 - 384744|0 1
GG
GG
>l(1)G0237 11416585 11417006|14514 chrX 11415868 11416657 scaffold_25 1065309 1066073 - 25674|746 818
ACCGAAAGAAATGAAAACCGATCAAACGTCTTGAAAACATTGTCTGTATGTAAACTGAAGTTAACAAAGGTTT
ACAGGTACAAATGGAACATAAACAAAAATTTTATGAGC--------TCTATAGGCT--AGCCAACAGCTGTTT
>e(y)2 11421333 11421390|14518 chrX 11419243 11421696 scaffold_37 953826 956172 - 83285|2167 2224
CTTTAACTCAGCGTCATTGGATTTGTATATTAATAAAGTTTATTTGTACGATTTTATA
CGCTGCTTCCGCTTTCATGT-TTTTTATACTACAAAAGTT-------ACGTTTAAGTC
>CG1561 11427170 11427411|14524 chrX 11427248 11428738 scaffold_10 1566305 1567803 + 37627|0 189
ATGGCTCACCTTCTGGCGCGCCACT--TGCATCGGATTCAGCCGAAGCTTC------------------------TTGGCACTGGTGCCAAAACGCAGGGTGGACAACGTCTCGCTGAGATCGCATTGATGCGGACTGATGCAGGCCAGAAAGGTCAGATACGACTGCGCGGTTAGCGAGGCTGCAAAGA
ATGTTTCAGTTGCTTACCAATTGCTCCTGCAGTTGCTGCAACCGATGACTCAGTTGCGGGGACAGCTTTACTTGTTTGGCACTCTTAGCAAAGCGCAGCGTGGAGATAGTTTCTGACAGATCGGAAGCATGTGGACTTACGCAAGTCAGCAGTGTTAAATATGCACCTGCACTGAGAGAGTCTGCAAATA
>CG2247 11444041 11444534|14539 chrX 11443923 11444562 scaffold_655 5737 6397 + -961|122 651
GAACGTTTAACGCACTAGTTATTCCTAGGTGCCATAAGTTAGCTCATATATA---AGCCCTCCCAGTAGCAGAGAATGCCAAGACTGAGTCTTCTCGAGAAGCATCACCTCCGAACACCACATTTAAACACACTCTCAACAATATCTTTGAACGACATTCAGTACATTACTTTGTC--CCAAGCTGTGAACGATGCAATCAAGCGACGCTGCTTACAAATTGACAGCTTGTAATGA-------ACAGAAAAGAAAAACATGTAAACATA----------ATAAATAAATGGGTTAATTGCTGGATCATACTAAATCGACTT------------AAACCACTGTTTTGGGAAGTGAACTATAAATTTCACTATAA--AAATATAGTACTTATGTAAGATTGCGTGTAAGTAGTTCTGCCTGGTCTTGCTGGTCCTACGAAGGCAAGATCAAAGTTGTACTCATTACATTTGAACATGAATGACACAATTAAAAAAATAAAAATCATACGCAAAACACCCATCTTCTTCGTA
GAACATCTAATAAGCCAGTTTATAAGGCGAGTCATCGATCAGTTCAGTTATGGTTAGCCAACTTTTTAACTTTTGCTATCGAGCCAAACT----GCGAGCAATAATACTTACTTACA--ACACTTACAAACAATTACACCACACATTTTGGGGGTTTTTC------TTGTTTGATCTGTTAACGTTTTAACTTTGCAAGCAATTTAAATAATTTAAACGTTGACAG-TTCTATTGAGAATACCACAGATACCTTAGACACATTCACATACGTCCAGTTGAAATTTCAGTCTATTAGGCACCATTTCGTTGTATATAGATTTATAAACCCAGTGAAAGTATTGTTAATGCATAAAATTTATAATTTCTGTTATAATTCAATTCCAAGCTTAT------TAACTTGTATTCACTTGAGCATTTATTTGTATACCCT-TGCAGAGGGCGTCGAAGGCGTAC---TTAAACTTGTA-ATATATACAACATTTCAATAAGAAGTAGCCATAT-----ATGTCCGAC-TATCTGTC
>CG15220 11452980 11453096|14547 chrX 11451150 11453801 scaffold_10 1569272 1571794 - 112396|1835 1951
GATGTCCACAATTATATCTAAGAATTAATATTATGTACTCTAATGTTATTTTTTCCATTTTTTTGGAGAACACTCAGAGCTGGCATTAACTTTAAATATAAATCATCTATCTACATA
G-----------------TAAAAGTT-----------CCGTCATGCTGTATGCCCTA-----------AGCCCTCAG--------------------------CCTCCAACTAGGTT
>CG2371 11515114 11515435|14620 chrX 11515011 11515981 scaffold_11171 292 1187 - 28332|104 432
TGGGACGCCATCGACCAATTCCAGTGCCAATTTTATTGTTGATTCACACAAAACTCTGTGCAAAAAGATGGACCTAAAAGTATGCAATACTAACAC-GATCGTAGCCAAATGTTAAACACGTTTTTTTTTGTTTAATTCAGTAGGGTTTTTCCTATGTTCTGGCTAATTTT---CCGAACGTAGCCAAATTTTTACTAGAGTAAGAGTTCGGCTTTGATTTATAAAACGTTGCAATGATTAGGATCTTCCAAACAGGACTAGTTTTTAAGTTTTAGAACTTACCCTCTGCAAAATAATAAATCCTTT---AATAAATTTAGATAAAACA
---------ACCGCACGATTCCAAT--CAAATTTAT-----------------CTCGGTTCTAATGCCT---------------TAATATTAGCGCTAATCGCTTGTAAGTTGTATATACATATTTAATTG--TAAACGTATTTGTTTTTAGCTCTAATCTAGTTTAATTTGAAATTAACAAAATCAAAAACAAACAAAAAAAAAAAAAAGTGCTCGATAACGCTTACGTATCGATAAGTTGTATGCGCCACATC-GATAACTGTCCAACGCGCAGTGTTGGACATC-----AATA--AAATCCGTTGCAAATTAATTTTCATTAAAA-
>FucT6 11544328 11544776|14650 chrX 11542954 11545993 scaffold_25 458069 460961 + 70172|1477 1979
TTAGTTGCTCACATCACTACATTCTCGGCCATGTTGTTGATCGATCTGTAAATCCTATCTGCCGCATTCCACCTGGAATTTCCATGGTGCATATCGATTCGGCTCGGATCA----------GCATCACCAGAATCTATCGAATGTCC-----------------AGAATCTCAAATGAAATC---TCGCTCTTTCTGTACTTGTCCATCAA-------TATGTGACTATTTCTTCATGTTCTCG-TCTGCGCACTTTTACG-----CTCTGATTTCGATTCCGAATCTTATTCTTATTCTTATTCTGCATTT--------GTACAAGTCTTTTAATAAGATGTAAGTCGAAAGCCGAAGAAATTATGTTGACAAGAATATACATAAAGATATTTATATATATAAATAAATTATATATAGAAGTGCATGTA--GTTTCACTAAGCGCAATATAGTCTATCACC-TGTAAAATAGTTGAAAGAAAACAAAAACAAAGATAAAAAA
---------------GCTCCATTC-----------------CGATTCCGAATCCGAAT---CCGTTTTCGATTGGGCCTCTCAAATTCTCAAATC---TCAACTCGGAACAAAATTCAAACGCAGAACAAAAACTGAAAAAAAATTTAAAAAACAGAAACAAAAAGAACTCCAATTAAACTCGAATCTCGTTTCTGGAACATGTGAACAAAAGGGAAGAACGCGATTCCAAATTGTTGCACTAATTCTATGCA-TTTTACGTAAGCCGCAGAAATTAAT--CAAATGTTGACAAGATAAAGAATATACATATAGAAATACATATACGTCTGC--ATATAGCGTATATCTATGATCTAAT---TAATATATATATATATATATATATATATATATATATACGTATATATAGTATGTTTAAGCATGCCTGTAGGGCTCGAATACGCGCAATATAGTTTATCCCCTTGTAACATAGACGAAA------------------CACAAA
>CG2446 11548459 11549280|14655 chrX 11548082 11550140 scaffold_25 464617 466868 + 49852|461 1448
GGCGGAGGTGAGGAAACGAAATACGGATACGGATGCGGATGCGGGTCAGAAACGGGGATCGGTTCGGCTCGGCACGTTTCGGTTCGCCGCGTATCCGGTGGAAAGACATATGTATGTAGTGCAGTTGAGTCGACATAGAGACAT---AGAGCAACATTACCTACACTTTACCACAACAACATTCAAGAAATTCTACTATTAAGCAACTAACTATACATACATATAATATATTATATATATATATATATACACATATATATATATATATATACAACATATAACGAGATGCGAACACCCAACACACTCCACTCTCATACACACAACACAGACACA-----------------------------------CACAACCCGACATAACATGAACATAACCG----------ATCAGATCAGAGCGGAATATAGGATCCCGATCCAGAAGG------------------------CAGTAAGCAGCACCACAAACA-------------------------ACATT--TCAATAGCATAGAAAGCGCGCCAA---GATGAAGAATCAGAAGAATCCGATCAAGAATCCGAAGA-----------------------ACAAGCAGCAGA----------ATCAGCAGCAACAGAGAGTTCAGAAT----GCAGCGTTAACGTAATTTAACT--------------AAAACGAAAAGCAA--------ATGCATACATGAATAGTAACTACAAAACAAGATCAGATGGAAATCGATATTTTTACACAGTCAAAAGGAACATTTAAATATAAAGA----AATTTACAAATGCCGCAGTTGCCCACTACATACAAAAAACAAAAAAAAAATATGAAAAATAAAAAGCGAAAGAAAACAAAATGATTAAGATGGAAACAACAATAATTATAATAAACAGAAACGTAATTTATATACATAGGTATTTAAATTTAATAATAAATCAAAA-CTTGTCGTAT
GCAGCAGCAGCAGCAGCAG---------------------------CAGGAGCAGTA--CCGTTAGGCCGCACGCGTATC-------TGCGTATCTGGTGGAAAGACATATGTATGTAGTGCAGTTGAGTC-------CGACATTTGAGAGCAACATTACCTACACTTTGCCACAACAACATTCAAGAAATTTTACTATTAAGCAA--AACTAATTATACATATAATATATAATATATATATACAACAAAGAAAACATAAAGAGA-------AACACATAATGAGA--AGAGCAGCACACACAC-ACACACACATACACACAACGAGAACATAACATAGAAGGAGAATGAGAAGCAGCACAGCAGCAGCAGCACATAACATAACATAGGCTTAACAGCAAAAGAAGTAAAAGAAAAAAACAACAAAAAAAATATACAAGTAAAAGGAGAACCCATATAAGAGATACATTTCACTAA--CACACCACACACACACACACACACACCCACACACTCACACATTACTTAGGAACATAGTGCGGGCGCGAATTAGATGAAGTTTAAGTTGAAATTGAGGATTAAAGCGAGGATAAGGTTGAATTAAAAGATGACGACAATTGATAAATGATATAAAGAGAAATAGCCATACGGAGTCCCCAATTGCAGCAGCGATAACATAAATGATATGTGAAAGGAAGAGAAAAAAAAAAAACAAGAAAAACAAAATACAAATACATAGTAACTATTGAA-----TCAGAAACAAATTGATATTTTTACACAGTCAAATGAAATATGAGAAACAAATGATGAAAATTTACAAATGCCGCAGTTGCCCACTACATACAAGAAACG-----------------------------------------------GATGAAAAAAACAATAATTATAATAAAA------GTAATTTATATA----AGTATTTAAAATTAACAATAAATCAAAAACTTGTCGCAT
>inaF 11562439 11564299|14665 chrX 11562394 11562751 scaffold_28 1305274 1305715 - 3822|53 449
CAAAAACCAACTACACTAAGCGAAAAAGCGGCAGAG------------ATAGTTAAGGAAAGTGGTCAAGAGAGGACGAGAGAGAGAGAG-------AGAGAAAGTGAAAGTGAAAGGGAGA-GATAGTAAAACTG----CATCTGCATCCAAAGACACGAGAAT-TGAATTCATCAATAATA-----ACATACGTATAAACGATATG--CATACGATATAGAATTGAATC-------------TGTAACTGATGGGCATATACC-GCATAT---ATATCTTATATAC-----------------------------CGCATATATCTTATATATGTATACCAAGAAAAACAAAGTCATTTTGGCAATAATAAAGCATAG--CAAAC----AACAAT
CAAATGCAAACCCCAACAAGAGGAAGATCCCCATATCATATCCACACCACAATCAAGGAAAG-----AAAAAAGAAAAAAAAAACACGCGTTTTACACAAGAGAATTGAGTTGACGAATAAATGATAATATATCTATACACATATATATATATATACATATATATATGTATATATATATTATAGATAAATATATATGAAAACTATATGGCTTTATGACATAGAATTGTATCCTGTAAATGTATTTGTATCTGATGAACATGTACTTGCATATTAAATAACAAAAATACACACAAACACACACACACACACACACACACACATGTACGTTGTGTACTTAGAC---GAAAAAACAAGTCATTTTGGCAATAATAAAGCATAGAACAAACTATTAAAAAA
>inaF 11562439 11564299|14666 chrX 11562818 11563057 scaffold_0 4618388 4618619 + 1010|0 254
TGTAACGTATGTTTTTCAAACAAAATATTAGTTTTTGAAACTTT-------ATTATCGGATAAACAAA---TGTAAGCCAAATTACAACGTTTATGATACTCCAAAGATTCGCACTATAAAGCCCACGAAAGTGGCCTAAAAATAGCTGACGCATTACCCATAGGCGCTTCGCTTCTCAAGA----TAAAACCTGGCGTGCTCAAC-TCAAGAACAAATATGTGGTTATATACATATATACATATATGGGGCATA
TACAACAACTTTTGTACGAATAAAATATATAAACATAAAGCTTTGGAGTGCAATGTCCATTAGTCAAACACTGCACAATAATTTGCAA--TTAATAATATAATAAAGGTCAACAGTTCTAA-------AAATACACTTAAAGTAATACTACGAAATATTC--------------TTTCAATAGTTTTAACAGGCTTCGTTTTAAACATCAACAAAAAATATAGAGATATATATGTATATATTTATATGGACTACA
>inaF 11562439 11564299|14667 chrX 11563366 11564258 scaffold_28 1307161 1307999 - -1569|0 946
TTTTTTTTTTTTTTTTTTAATGCATGTAGAGGGATATACACTACAGTCAAGATCG----GAATTGGAGATTAGCTCATAGAAATGGTAACTGCCCAAG-AAACAAAAAAAGAAATGACTAACAAATGGGCAATAATACCCTCAATACCTTGTCATAC-----CTATTTGAATGGAGAAATAACTCAGTTAAGCT--CAGTACTGGCATAAGCATGGGGAAAATATTTCA-ATTAATCAGTTCGAGTAGATATGTTTTCCAAAT------------TGATAGCGATATTAGA----CATTTCATATTGAAATTTACAGGTACAAATATAATCTCAGTT----------AATGCGTAGAATGCGTTTGCAATTGAACAAATTTAACGTTTTATAGCAAGAACTTAGGAACAAAAGTTGTACTCGCTTATTCTATAATAATGTTAACTAAAGCCAAAGCAAGTAGATCGGTTGTATAACTCATTTCTG-CTATAGATAAGTCTTGACTTGTATCAGTACTGAGCTATAAATTGGTCCATATATACGTAGCCAGGCCTGGCCACATATAGAGGTTAATAAACGTTATGTACTGCAAAAGGATAGTTGAAACCATAGCTAAACGATAGTCGATGTACCAACCACACTC-CACTCCAATCCAATCCAATCCAATCCACTCAAATCAATTCAAAACAACACACTCGTAAGGGACACACACTCACGCATAATACGGGACCCACTTCAGTAGAAAGTCACACGATATCAGCGATCACGGATCACGAATTACGGATCACGGAATACGTATCACGGATCACACAGGCGGCTCACCTCA---------CCAAGCTCAGCAGCAAACT----CACCCCACCTAGGACACTGCTTCCAGGCAGCTAGCGAACGCTACACCAACTACAATAATTAGCCAACCCTAGAGTAATCAGTTTACCA
TTCTATTTTTCCCTCTAAACTGTTTGCAGTAATGCATACACTTAAA--AAAATTGTAGGGAACTAAGTACTAAGTATTAGTAATCCTAAATACCAAAACAAACAGCAGAAAGCACGATATACACA--------AATCTTTAAGGTTAATTGTCGTACAGAAGCTGTTTGATT-----------TTTGTAAAGGTGGCAACACTGCCAT---------GCCAAAATTTGATATTAAAC--TTCATGTTAAAACGGCACCTAACTCTAACAGGAGCTTGAAAAATATGTTGGAAACGCAGCCCA-GTGGAAACGAGCCACTATTTATACGACATTAATTGGATAAGCCCAATCTATAGAAT-CGTTTTTGGCTATACTAA---AGGGTTCTATTG-AGGAACCCAGCCCCAAAATTTGTGCTCAAATAATTTGTAA-------ACCAGAGAAGAAAGCTAAAAACTCTGATAAATACCACAAACATAACAATAAACACACCTTCACT-------------ACGTATATATATATATATATATATTTAACTATATCAAGAAAAAAA-AAAGAAAAAAAAACTATATAGA----------------GGGGCATTACTTAACCTACTTTCTAGAACCAAAGCACACACACACACACACACACACAGA-------CAGACAGACACGTTCACAACAAAGGCAGAACACGGCGAACGCAATACTCAATAATA--------GTTATAGTTAAAGGTAAAA--ATAAAAGAAATAGTTAATTACGATAGTTAGGTACTTGTATACATAT----GTACCTAGACGGGACCCACTCCAAATAGAGCGTCACTCGCAGCGGCAAGCAACGACACCCCACCTAGGACACTGCTTTAAGGCA----------ACAACAATAACTA-AGTAGTTAA-AAACAGAAACATAAACAATTTAGCA
>inaF 11562439 11564299|14668 chrX 11564291 11565165 scaffold_28 1308573 1309476 - 36447|0 8
GGGACTGCA
GCG-CTGCA
>CG9360 11597408 11597579|14701 chrX 11597282 11597486 scaffold_28 1338156 1338366 - -722|127 221
AATATATATATATCTATATATATA-----------TATGTATGTATGCATGTACCAAACGTTAT-----GTGATTAAAATTCTTTAGCAAACCAA
TATATGATTATATTTCACTAAAAAGTGTGTTTTATTTTGGATATGTTGACATGTTGGAAGTTGTCCTCAGATACAAAAACACAATAGTTAATTAA
>CG9360 11597408 11597579|14702 chrX 11597490 11598441 scaffold_28 1335935 1336860 - 38891|0 90
ACTCTAGATTTCCCACTGGATGCTTCTGCTATTTGTGTTTACAACAAGGAAGTGTCATATGAAGTTG-ATCTACTATATTTTATTTTTATT
GTTCGA------CAAATGGATGCATTGCATATATAGATACCCTGT-AGAAGGCTCCTTGTAAAATTATATTTATTATATATTTTTTTTCTT
>dy 11603709 11604880|14711 chrX 11603514 11603709 scaffold_7 4727196 4727379 + 418|204 204
T
C
>dy 11603709 11604880|14712 chrX 11603710 11606952 scaffold_28 1347747 1350886 - 110481|0 1292
GCACGACCCCGACTGTGCGACTGGAACTAGTTCCGCGGACGGATTACCGATTTCCGGCGGCTGGGCAATGGCACTACTGATAGCTTCTTCGGGATCGGGTCTTTTGGTTGGCAAACAGAACAAGTTGTTTTCAAATCCATTCTTAAATCGAGTAAACAAATTCTATAATTTAAATCGAAAACCTTATAAATGCTTGGTTTAGATAAAAGAAAATATTTTTGCTATAATCGTATTCTTTTTACAACAAATTAATTATAATTTTGTCTTAGCAAAAAAGTCCACGTCCAAAGACCGCGATTT--GAAAAGTAACTGCCATTAGTGTCATCACTAGCTACTGCGTTCTGTCAGCGCTTCCG---------TTTCCGGTTCTAGGTACAGTTGTGTCTGCGTCTGCGGCTCTTAAATTTGTAGCGTACACTTCGTTAGTATAATTTTTGATACAAATCAT--TTAACATTAACTCAAGCCGTTTACTGGGTTCTCCTCTACCTCTTC----------CGCTTCCATTTC----------------------CTTTTCCATTTTCATT-TCAATTTCCGTTTCGTGAAAACTGTAGCTCTAAACACCCTTTAGCACACCATTTCCTGTTTGTTTCTATCATTTCTACACTCCCTCCTTGGTGGCAGTGCGATAATCGATTATTTTTGTTTTAGTTTAAGCCTAGGTTCTATTT----CATGTAAAAC--GGTGCTAAG------------CCATGATCAGCCCACATCATACT--CGTACATATATA-TCCATCTGACAATCACTTGTAGCTTTCTTCAGCAGTTGAGCCGATATAATCCATTACTTAGAGTATTTCTCGTAAGACTCTCTTAAGACTTTGTAGACACGCATACACGCACATTTTGCACACAAGCACACACATACATACACGCACACTTATACAACATATGCATAACAGATATACACTTGAATTAGTCACTAAATATTTTAAGCGCTTTAAGCCGTAGACTAAG--CCGAATAC--TTCTGCGTCCCACTG----TCAGAGATTTTCCCAGACCCCCGGTATCTAATTATA---------TCAGATAGTACGC------CCTATA-GTCCACTTATTTATTTGCATAATGATTTATACATATCGCATACATACCCACATATATACCGC---CTTATATATATCTTCGATTTTTTTTGTCTACT---------------------TTTGTAAGCCGAGCAATGCGAGTGAGAAG-------AGAAAAGTGTTCAATAAATTGTTTAGAA
G--CGACACGTACGGT--------------------------ATGATCCATCTCCG------------------------------TTTCAGATTC----CTTCCGCCTTCCCGCCTGAACTAGT----------------------TTAGGCCATCAAGTTTGCTAATTGCTATTGATTAGTTT---AATGTTTGTCACAAA--------------TTTACAATAATTATATAGTTCATGCCGTTAACTGGGTTTC--------------------CCCGTTTCCAATCTCCGCAAATTCCAACAATTTTCCAACACTTATCCCAGCCCTTGCTCATTCTTCCTTTCA-CTCTCTCGCAATCTCTCTTTCTCTCTCTCACTTGATCTGTCTCTCTGTTGGTGG-TAGTCAATTAAAAATGAAAA-------AGAAGAAGATTTAACACAATTTATAATATGCTTTAGCTTAAGT------CTAGGTTCTACTTTAAATCGGTGCTAAGCCAATGCTCACAGTTCAAACATATGGCCAATCTGGCAACTCTATCAGCTCTGTTAGCTCTGTCCCTTTCATG-CAACTGTCTCTCTTGCTATCCTTTTCTCTCAAGGTTCCTGCTCATAGCTA-----GTTAGAGTTAAGCAGGTGTGGCAACGCTATG------TATTAGCCTGTCAATTGGTGCGTTGTTGCCATATGCGCAATGTACAACAAGGTGGCAAGGCTGGCAGCTATTCAAATTCAGCTC-TGTGCTGCTGACGAACTTGCAAAGTCCATGGCAAACTTGCTGATAACTTTAACGGGCACTTGAGCT-ATTGGATCCACATGTTATAG-ACTCTTCTTAAGACTATCTTAATA-------------CATATACTTACA--------ATATGCTTATACTTATATGCACGC------ATTAGACATATGTGT-----GCGTGTATTTCAATTAGTCACTAAATATTTTAAGTGTTTTAAACT-TAGTCTAAGCTCCGGATTCGATTCTTTGATCCACAGACCCTTCGATCCTTGATTTAACATCTGG--TTTATTTATAATTGTTGCCTCATATGGAGCGTATCTAATTTATACTTCTATTTATTTATTTATTTTACCACCTAGTTGAATCCGACATA-ACCCGTTTTTTTATTACGAGTATTTGTTTTTTTTTGTTTTTTTTTTTGTATTAATATTATTATTATTATTATAATTGTAATTCCTGCAAGCAGAGAAGGAAATTAAGTTAACAACGTATTCAATAAATCGTTTATAA
>Hsc70-3 11635632 11636548|14761 chrX 11635144 11636066 scaffold_31 302509 303410 - 1838|508 998
ATATATGTATACACATAAATGTGACGACTGTAAGCCCCG-------------AAATCCCC--------GAGGAGTCGCAAATCAATAGGTTAGCCTACGGATATGTAAAGCGGTAGCAAGAAACAGACAAATGTTATATGTATAAGCGAATAATGTGGTCCCAATTCCTGCGATATATGCGAATATATCGGGGAATCGGACTGTATTGTATTGATGAGATATAGAAGAAAGAGAGAGAGAGAG-GAGCCAGGGAGCTGCGGGTC-----GTGCGGAGGAGGAGAATAGGTCGATGAGGAATGGGAACGGCAGAAGAGCAAGAGATAAACCACGAAATCATACGGAAACCACTAGAGAGC-AGCGGCACACA-ACATCGGCCAGGCTTCATA------------------AATGGGTTCTTCGATTTTACGAAGAATTTTCTAATTTATTTAAAAATAAAATAAAAAAAAAATTGAAAA---------AATT
AGAAAAACACACACACACACAC-ACGCTCGCACGCACTGTATATTTTTTGATAAACGCTCGTCAAGTTGAGGAATCACAAATCAATAGTCCAGT---------TATAAAACGAACTTAAGAACTTGAGAGAAATGAAAAGAAGAAGAAGAGAATGTTAT----------------------AATGTGTAAGAGCGCGTGAC--------------------------ACAGAGAGAGAGAGAGCGAGC--GAGCGCTGCGGGGCAATTAATATGAAGTAAAAGAAGAAGCAGA-GTTTTATGTGTAGCATTAAACAATATGAAATATAAATTCAAATTATATGAAAATGAAATACAAGCAAACAAAAAATATACACAGACAAAACATTAAAAAAAATAATAATAATAATAATGGATTCTTCGATTTTACGAAGAACCTTATAATTTATTTAAAAATAAAATAAAGAAAAACATAAAAATATGCAAACAGTT
>Hsc70-3 11635632 11636548|14762 chrX 11636132 11638446 scaffold_31 303485 305807 - 143308|0 513
GATGGCCACCCCCCCCTCACATAACTTACACACAGCCCAGCCTGCATCCATTCGAGATCATAGTGTTGGAATTCAGACTGAAAAAAAAAACAATTATAACTTAATTGCAAACGCAGTAGCCACAACAACAACAACAACAACAAGAAGAAGAGAAAG--ATGGAGAAAGATCACAACAGCAA-------AAGATAATACT--------ACTTTACAGCCCTCAGCAGCCATCCCCCCATCCATTCGACCTTTAAGGCAAAATTTCCAGAAAGAAA------TTCATTCGAAAAACATGAAAACAAAACACAAGAAAAAAAACAATCCTTTTTTTATACATTTTTTTTTTTTCTACACTTAAATTTAAAGTATTTTTTTTTT------------TGTCGGCAAAAAATATGAGAGAATGTAATAACGATTTA--------------------------------------------------------------TTCGAGTGTTCCTCGCATTTCT
G----------------CGCGT------CAGGCGGCACAACT---------------------------GAATCAGACTG----ATTAAGCAATTACAACTTGATTGCATCCCCCACAACAACAACAACAGCAACAACAACACAAAACGGCAACAGCAACAAAACAACAACACAACAACAACAACAACAAAACAAACCCCAAAGCAAACGATAAAGTTTTTAGCAGCAA----CTCACAATTTCTTATCCTCACGCTAAATTCCTAGTAGCCACATTTTTTTCATTCT-------------------------------ATATTTTTTTTTTTAAACTTTTTTTTTTCTACTTGTTTTTAATCTAATGTGTTTATTTTTTAAGTATTCCTGCGGTGGGCAGGGAGTGAGAGTGAGTCAGAGAGTTGTTGAAAGAGGGAAAGAGAGAGAGAGAGAGAAGAGAGAAAATGTGTAGAAGGAAAAGCTTGAAGCATTTTGTGTGTTCCTCGCATTCCT
>CG1578 11643291 11643866|14774 chrX 11643034 11643451 scaffold_31 310346 310855 - 1230|298 520
CCCTTTGTTGATATTGTTAACTAGCAGGCGTGGCGATTCTAAGATCGCAAAGATGCAGTGTAGTC--------AGCATGCT-----GTATCCATAGAATAAATCACTTCGTGTCGCAGTTTCGGACCAAAAAAAACTCTCACAAAATGGTAACCAAAAAC-----------CAATAAAAAAAA--------------------------------------AC
CCATTTGTTGATATTGTTAACTAGCCTGTGTATCTATT----AACTATATATATTTACTACAACTATTTACAAAGCAAGCCAGTCAATGACTACAGAATCTAGTTATTTATCAATTGTGTTTGGACCAACAACAACAACAACAACACCAACAGCAACAACATCATGAACTGCAACAACAACAACAACATTTTTATGGCAACTCAACGTGTTTCATTATATTAT
>CG1578 11643291 11643866|14775 chrX 11643709 11644414 scaffold_31 310872 311655 - 27718|0 157
GAGCCGCACGCAGAAACTTGAAGGATGATGATGATAATGATGATGATAAGGATGAGGATGATATGGAGGAAAATGATGAAACAATTTGCTGCCACCGCACCAAGCAGAACACAGAATATATATATACACCACTATATATACACAGATATATGTAGAAT
GAGAGAGAGAGAGAGAGAGGCAGCATGATATAGACAACAAGTGTGTCACAGAGGGAGAGAGAGAGAGAGAGAGATATGAGCTGATGAG----CACAGCTCAGTTCATAGC-CGAGACGCACATACACACCG------ACACACACATACACTAAGAAT
>CG15740 11676599 11676887|14816 chrX 11676468 11676794 scaffold_10 1414343 1414646 - 1235|132 330
TATATTTTTTTTTTTTGTTGTGCATTTTAGTTTGC---GTTCCAATTCTGTTGTCAATGTTTCCAACTCATTTCGCATGAAATTTCTGTGCACAAAAACAAGCGATTCCAAATAGCCAAATCATTGGCATTCGAAATCAAATCATTTGCATGCAATAACAACCGATACGAATTTCTTACCTAATAAATTTATACTTACG
TTCAGTTCGATCAATTTTTAAAGAGCTTCAATAGACTAGCTTTAAGTTAGGTGTCAAGTTCATTATCTCAGTT----TGAAGTCACCAAACAAAAATACCAATCAGTTCAATTAA-------ACTGCATTTCAAGATCAGTGTGTATTGGTTGAGTAA----------GTTTTCTTTTCTTAATAATTATTTACTAACG
>CG10347 11686629 11686793|14832 chrX 11686405 11686704 scaffold_31 44207 44482 - 343|235 312
TTAGTACTT--TTAAAATTTATAATATAAATATATAAAAAAAATATATATATGTAAATTTTTAATCATATATGTATAC
TTGATACTTAGTAAAACATTATCATATGAATATGTTTTAAAA---TATAAATGCGAATAAATAAATAAAAAT-----C
>CG10347 11686629 11686793|14833 chrX 11686786 11687460 scaffold_31 1535217 1535900 + 17704|0 7
ACGGTGTT
TTTGTATT
>CG2025 11698586 11699041|14840 chrX 11698082 11698863 scaffold_7 640755 641503 - -336|517 843
AAATTAAAAACACAGCAAATGACGAATGCATTTTGAAGCATGGAGACACCGTATATGTTCAATTGCACTGG---ACATTCGTACTGATTTAATACA-AATACGCGAAAAAAA----GAATTCAAAATTTGAAGTGATCAATTTGCCTAATTAGAAAACAAACA-------------TCCGATGCAATTTGCTGGTATGGGGATTC-TTCTTTCCGCATCTATCGTTTTATTCATACTATATGTACAACACATCAG--------TGCTTTTTGTTTATAAACAATA---------AAGTTACACAT----------AAAGAATGTTAA
AAATAAAAGATACAGCAAATAACAATAACATTTATGAACATTAATCAAATATTTATTTTAAATGACACCAGAATAAATGCATACAGTTTAAGTTCACAATAGACAAACACAAGGCTGAATACAGAA---GAAACAAAAA--------AAAAAAAAAACAAACACAATTTTGCTTTTTCCAAAAAACTAAATTCGTAAAGAAATTCGTTTTGTTTGCAATTTAAATTTAAATTTGATAATAATCGAAAAGGCTTAGTAATTGTTTAATTTTTGCCTACGCATATTATTGGGTTTTAAATTATGCATAATTGCCACCAAAGAGCGTAAA
>CG2025 11698586 11699041|14841 chrX 11699041 11702429 scaffold_26 732264 735674 + 131962|0 0
G
G
>CG11802 11705236 11705433|14844 chrX 11705287 11706484 scaffold_5 5840117 5841350 - 58087|0 163
GATCCCCACACA---CTTATTG-GTCTCCAAAG----------ATTTTCCTAGCTCATAATAA---TCGTGTATTTATTGTGTATATTACTCGTTAACGATGCCGCTTAATCGTGATTTTTAATTAGTAAATCAAACCTAATATTAAACTCAATTTGATATTTT
GTGTGCCGGTCAGCGCCAGTTGTGCATCCAAAGATAGTTTGTTATTAGTCTAACTCTTAACTCGTTTCATGTATTTATTGTGTACATTAACTTT-----ATACATATATATTGTGTATCCAATTGCGCATGTTGAATTTGTTCTTAAGGTTAATTCGGAATTGT
>CG10353 11711673 11712679|14850 chrX 11711651 11712303 scaffold_48 125112 125812 + 79|26 749
ATATACTACAATTCTAGGTA-TATGTATTTGAATATTTTTAAATTATATACACCACCAAACTACACTACACTAGCAC-------ACCACATGTCCAAAGTGCATTAACGAGG-AGTATTTATGATTTCAAAAAAAAGGGACAACTCCTGTTGGCCATGTTGGATCGATCATGAGCAAAACGATCACGAATTATATACACCACAAGTGGGTGCGAGCTTAAATGAGCTGGTAGCCCATCCATTCAGACACTAAGAAACAATCCAATGTACCT--TGCAATGT-------TGCCCACAAACCGAGAAGCGAACTCAGACATATG-----TATGTGCGTTTCATCCTACTCCCAACAC---CCCAAAAATCCATC-------------GTTTTTATTGTTGATTATTGGCCAAGCGAGAAGCGAGAGCATTGCACATTTCGCAATATTTTGTAGAACTCTAAATGCTACT----TACCAGTGCGTAACA-CCTATAGTGAATTGTTGTTTTGATAAACATATTTATA----------------CGATACGAACTAAAACTAATCATAACAGCTACGATTACG-ATAGC------------------GATTAAGCCAGAAACAAAACAAA---TTGTGTTGTGTGCCGGATAAAAAAAAA----AAATATGAGAAATAACAAATAAATCAAATGGACTT-------AACTCCATTAATGTGAACGGTG
ATATATTATAAAATAAGAAAGCAAGTGTTTAACTGCTTTC------TATTCACGTCCAAAGTGCACTACAACTGCAATTATCTAATCAAACGCGTTATTTTCAATCTTAAGATATCGTTTGTACCTACAGAAAAACCAAACTTATCAGATTGCGTGTGC-----CTAGCATATATAAAACTACAACAAC-------AGCAACAA------------CTAAATAAACATATAACT-----ATGACCACACTAAAAAACAATCCAATGTACCTTATACAATATATATATATATACACAAAACATGTACATGCCTATACTATATGTTGATTATGCTCGTTACAATCGGTTTGTGTCTTGTATCTGTATCTGTATCTGTATCTGTATCTGTATCTGTTGTTACCTTTGCCCCGCACCACCAGC--ACACACTGCATA------AATGTTTTATACGACAAGAAATGCAATTGAAATAACGATACGAAATAGTATATATT---TTATTATTTTGATAAACATATTTATATACAGAACACGAGATGTGCTGCGATGTACAGAATGTTCTAATG--TACATTTACACATAGCATTGTTAAAAATTTACAAAACTAAAATGGAAAGAGATTAAAAACATGAATTAAGAATTGTAAAAAACAAAAGCGGAAATATATGAAA-ATTATATAAATTGAAATGATTTGTGTTTGAATTTTGGGAATGTAAATCGCG
>CG10353 11711673 11712679|14851 chrX 11712678 11714882 scaffold_48 126399 128614 + 96385|0 1
GA
GA
>Upf1 11734374 11735174|14869 chrX 11735028 11735232 scaffold_31 282331 282547 - 6757|0 161
GAATCCGGTTGGAGG----------TGCAACAACTACAAACGATAACAAGCAACACAAACGAAACAACAACAAACTC-----AACTTTGAAGTCATCATCAAGGAGTAGCATCAGTAGGCAGCAGGAAAAAGCAGAGAGGACCATCACGGGAACAACGACAG
GATGCTTG-AGGAGGCGCGCACAATTGCAACAACAATTTACAACAACAAACACAACAAACTAAACAACAAACAAATTGTAAGAACTTTGAAGCCATCATGCAGCAGCAGCAGCAGCA-GCAGC-GGCGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGCAGCAGCGAAAG
>CG2467 11741840 11742516|14877 chrX 11740997 11742056 scaffold_10 1420393 1421454 + -4456|925 1147
CAGATGGTTTTAATTCTAGCTAAAAGTGTTCTTTAAATGTTACGCTGCCGTTTGATGGGAAATTTGTATGAGCAGGTCACAAAATCCTGTCCAACTGATCGGATCTTACTTCTCAACTTATCGTCGAAATTAGTTGATTGCA--AGTCCAATACTTTCTAGTTACAAATGTATATATGTGTA----TATACAATGTTATACAAACTGCCACATGCACACGATT
TATATGTGTATGATTCT--CTAA---TTTGCATTAAACACTATACTGCCCTTTAAT-----ATCTCAAAGAACATGTGAATGTTTTTTTTT------------TTTTTTTTTTTTGGTTATT-----AATTGGCCAATCGTATTAATACAGCAAGCTTTGTTAAGAAGTATCTTCAAGCGAACCACTCTATAA-GACATTCCTACTGCCACACACAA------
>CG2467 11741840 11742516|14878 chrX 11742161 11742391 scaffold_10 1421539 1421838 + 2496|0 313
AATCAATGGGTCATTTATGCATGA----GTACTCAATAACCTTACAATAATTAACAAACGTGCCAATTACAATTGCCTGACAAAGTAGCCAC-----------------------TATAAAGAAAAATCTGAT---TGTCAGTTCGAAGCGTA-----------------------------------------------------TGATGATTTAGTTTTCGGTTTTCTGAAAATATATATATATATATTTTTTTTTTTGTGTATCGTAACTCTAATATGTATCGAAATTTTGAAATTCTTTTCCCAGTGGTA
AGTGAATGCCCCATTTATAAATATTTATATACGAAATGAC---GCAATA-CTAACAAACGTGCCAATTACAATTGCCTGACAAAATGTCCACACAGTTTGCAATATTAACATAAATTTAAATGCAAATCTGATCAATTTTAGTTCATAAAGCAGAATCGACATTCATGTGGATGGGCACTTGTAAATTCTTTAACAACCCAAAACTTGGGGTCCTATTATTTTTTTTCTTTCAAACATATGTATATGTATATATGTATTTATGTAT----------GTATGTATGTATGTATGTATGTATCTAATCTAACGATA
>CG2467 11741840 11742516|14879 chrX 11742513 11745527 scaffold_10 1422137 1425117 + 146361|0 3
ACGG
GCGG
>CG2471 11755579 11755716|14886 chrX 11755588 11756361 scaffold_10 1432713 1433465 + 23405|0 128
ACCGGATGAATGTCCTGTCCATTCATTTTCCAACACACCACAAACAAATCTCTCGTTATCTCGAAAGAGAGCGCCCTAAACGGCCCTCCTTCAACTTATTTATTCTGTTTATAAATTTATATATATATT
---GGCTGGGTGT-----------ATTT-------------AAATAATTTAATTGTTATCTTTAGAAAACACTTGCTGTAATGTTTTCAATGATTTGATTAATTCGGTTAATTAAAGTACATGTACATT
>CG10362 11760347 11760685|14891 chrX 11760308 11760909 scaffold_10 1439936 1440477 + 7838|39 384
ATGATGCTGCAATCCTGGGATCATGGGCTACATGTCAATGGTTAAATACTTGTGTATTCGCGTGAACTCGTACATAATCTTAAGTAGTAGACTGGAAATGTGTTAGTGAACTAATGGGCATTTTTAATTCGTGTTGTGGCATACTTAACTAGAAGTATTGTATTTCAATTTTAGCCATTCGTTTCGATCAAAATACGCTTATTTGTCAGTTTTGAAA-----CCGATTTGTACATACATAATATGGGATTAACC--CAAACTTAATGGATATATCAATGGCATCCATAGAGTTCCAACTTGTTTTGGCAAATAAACATTTTTAACCAAGTTCTATCACATTTCGTA
AG----------------------------------AGTTTTTAAATA----------------------TAAAGTTTGTTACGTATTTGACTGTAAATGTGTTAGTGAATCTATGGGCATTTTTAATTTGTG-AATGCCATAACTTATTA------------------TTAAGACACTTTTTCCGGCAAAACTATGA--ATTTGTATGTTAAAAAATTTGTCAAATTAATACAATTTCCATATACGATATATCAATATACATAATACTTTTA-CACTAGCATTTTTCGA---CGCAACTATTTTCGCGTTTGCTATTTTTTG--CTAGGCCAGTAACATTTTCTG
>cac 11767623 11769981|14896 chrX 11767248 11768198 scaffold_10 1447357 1448354 + 2692|421 1072
TGTTTTCATAGTTA--CTCTGTAATCTGCAATCGACGAGAGGTTTATGCTTCTATTAATGCGTTTCGTATGCTGAAATTAGCTCCTCGCAAACTTTCCGATCAGTTGAAAGAACTCGATGTCCATATGTATTTATAAATGACAAGCA------AGCAAGTCATTGTTCTCACAATCGAGCATCCTTAACGTAAACAAAAACATGTGTAGATATA-------------------ATATATACACCTCCGACTCCTCATACTCGAATTGAATTGAATGTGTATAATGTGTAAAAATGCAGAGCTCATG--GCACACCAAACGTAATGTATTCAAATATACTATAGCCATGCACACAGCCCCTCCAACTCACTACCAAAAAAAAATGCAGTCATCATGTGTATAGATAGACGAATC---------GTACATGTTGGACGACGGGATATCGAAGAGCGCACAATAATTGTAATTTAAAGAAAA---GAATCCATAACTTAAGTAAATAATTATAGCAGCTGAGCAGTAATGCGAATTTACACAGCAAATGAACTTACCATTACGAATATGACGATGACTAGCGTC------------------GAGTGCATACGGAAAGTAAAAAGA-----------------AAAAAAAAAAAA
TGTTTCCGTGGTTGATTTCTGTTATAAGGCCTC------ATATTTAAGCTTGATTTAATCCAATTGTTGCGCT------------TTGTAACATTGCATATATGTACATGCAGCCGTATACTTACATACACACATAAACGATATGCATGGATAGGTATATAGGTATTTATATATTGAACCATATAGACAGCCATGACATACATACATAGATACATTTTTGAGCGAGTCTGACAATAGATTTTCCCTAAGATAACCATAGC--AACCGA--TAAAGAAGCAGCCTGGTGAAAAATGTAAAACGCATGTAGAACACC------------TTTACATATATAAACACTAGTGACAT------TCCAAATCAAAACCAGTAA----------------GCGTTTAGATAGTTAAATCTGTGAATATGTAGATGTTGAACGAGGGAATATTGAAGAGCGCACAAATATTGTAATTTAAATAAAAAATGAATCCATAATTTAAGTTAA-AATTAAAACCGCTGAGCATTAATGCGAATTTACGCAATATATAAAGT----ATCAAGCGTATGAAAGCAAACACCAACTAAAGGATTGACTTTAAATAGTACATACGATACATATTTATATAGTTTGTATTTAGGCTAGTTGAATACTA
>cac 11767623 11769981|14897 chrX 11768382 11768802 scaffold_10 1448758 1449139 + 8182|0 465
ACACACATAGATCTAGAT-CGAAAATATATATATATAGGAAATAAAGAT---------TGT-AGGTACTCGCATACATTGTAAGTTATCTAGAAT---------------TTAGCTCGAGGAATCGGTACGGTAATCTGCAAGCGTTTTTGACTTGTTTATATTAAAAGTTAGTACTTCAATTATGTGTATTTAAATGCGACATT-------------------TATTTATTTACTCAATGTACATACCAGATAATTGTAGATATGAAATTGTTATTTATTTTATTCTTTTGTATGTAAAATATTTACCTACGACTACTATTATAAATACCTTCATCAGACCGAATCCCTATAGCGAATATTAGCAAAAATTCAGCGCAATTTAGTCCTCTACGGTTTTAACATTCAGTTGTGTATTTATACTCGAGCGGATACTTTTTTTCCACGATTAGTAGAAGTCCACGCAA
ATATGTATATATATATATTCATACATATATATATAT-GTATATATATATATGCTTTTTTGTGAGGTGCACGCATACATTGTAAGTTATTTAATACATATTTCCACATGCATTAACTCGATAAATCTGTA-ATCCATTTGCAAGCGTTTTTGTCTTGTTTATATTTAAAGTTAATAATTCAATTATGTACATTTAAATGCAGAACTATCTTTATTATTATACGATTGTGCATATTATCAA----------ATATTATTGTAGATATCAAA------------------TTTTTTATGTAATGTATTTATCTACGACTACGATT-----------------------------------ATACTAGCAGAAATAGAACTCATTTCGAGCCCATACGGATG--------AATTGTG----TACATTAGTGCGGATATTT-------AAGAAGAAGAAAAGTGCATGCGA
>cac 11767623 11769981|14898 chrX 11768944 11770543 scaffold_10 1449140 1450452 + 39336|0 1071
CAAAGGCTTTGATTGCGATCGCGTAATCGAAAGGATCAGATCTGGGTATAGCATCAGGCCATTTGCTCCTCTTTGTCAGCACCAAACTTAGATCACAATTTTGATACGATACGACACAGCTATCAGATACCCGAACATCTGCAAAACCTTCCATACCTTTGTCCACCAGTACACCAACACCAACACCAACACCAAACCCAAACCCAAAACCAACGACAACACCAAGATCAGCACCTATATCAAAGGTATGGCACGAACGTATCGACACCGAAACTAGGAACAACTATATCTGATATCAAATTGGCTGGAGTTAGCTTACAGG-----AATTAAGCCCGAATCGACAACCGCAATCGC-----------AACAG-------AAGCAGGAGCAACAATTGCATCAGGATG-GATGGCTCAGATGGTACCGGCAATCGGGTCCATACGGATCCCCAGTGATGGCATCATTGCCGGAGACCAGAGCAACATCGCCCCACTCCGATATCGAATTCATTAG-AACTATGAAGAGAAGTGAAACCGGAACAACTGCAATAACACCAAGGACAACTAAAACTGAAGCAATGATATTAAGCGTACCAATTACAATAACGTCCCCATTAGCTATTAAAAAGATATATTCAGATAATGACATTAATTATAATACCGAACGAGGAACTGATAATGACAGAGT---------GGACGATGCACCAGCTCATCATTATCACCAGCCAGAACTAACTACACCAGATCTACAAGACGAGCCACCACTGCAGCAGCATCACCAGCACTATCCACAGTATTCGTATCATACGCTCTAAGGAGGATAGGATCAAGAACGAGCAACCATTATGCAGACGCCACAATCCATAGTTCATAGTCCAGAAACTAGTATCCAGAATCTAGAAACTAGAAACCAGAAACCAGAAACCAGATCCACTAAAAGTGCAACTTTAATTGAAACTCAAACTGAAACTGAAACGAGGTGTAAAGAATGTGAGAGTGATTTTATTCCACGCAATTGGATTGGGAGTAAACGTGGGGAGATTGTAAACAGATTAGAGCTACTATTT
CAAAGGCTTTGATTGCGATCGCGTAATCCAAAGGAACAGATCTGGGTATAGCATCAGGCCAAATGGTCATCGTTATCAGCACCAAACTTAGATCACAATTTTGATACGATACGAAACA------AAATA----------------------------------AATCAATATACTACCACC-------------------------------ACAACAACATTAGAAGC----------------------------------------------AAGTGCAACAGCATTCGATATTCAATTAGCTCAAGGCAGCTCACAAGCGTATGCTTTAACCCAAATCGACAGCCGCAATCGCAAACAATTCTTAACAGGACAGCCAGACACAAGCTACGAGTAC-TCACATTGCGATGCTTCA----GCATCGGCA---------ATACCAGCCCGCA-TAGTACTGTCATTGCCAGAAACAAGAACAACATCGCCCC-------TATCGGATATACTAGTAAGCAGGAAATTAAGCAAAGC---AACAAATGCAAT---ACCAATGACACCAAGTAATCAAACAA------------------------------CATCAGTCGCTATACAAAAGGTTTACTCAGATAACGATATAAATTATAATACCGC------CACTTTAAATGATAGATTTGCGTTATCTGCCGATTTTATCGCGCCTACTTATTGCCAAC---------ATAGCTCTAATCAAGATTATGAGAAAC--TTACACCAGAAG-ACCAG---------CAACATTCGTATCATACACTTTAA---------------------------ATTCCGAACCCGCTTAAAT---------------------ATAAGAGCCCGAAACAAGAACTTAGAAAACAAAAA--AGCAAATAGATT-----------------------AGACTCTGTCATAAAAT-ATGTGAAACGCATTGTATGTAAGA--------CCTAAAAATATTTCGAATATGTGTAGACATACATAG-TTCTAAGT-------AGCTAGTATCT
>gd 11819473 11819719|14951 chrX 11819652 11821634 scaffold_10 1519579 1521707 + 53290|0 96
AT----------CACATCCGAAATGTG-TATG---------------GGAACGCATTT---CTAAGTGAGCGCTGTGATAATAGCCCCTTGGGCATG
TTTGTGTAGATACTCTTGTGTAGTGTGATATGCCACCATTCAGATGCTAAATGAATTTGAATTAAATAACTGCTGTGATAA----CCCTTGGATAGG
>CG18130 11824059 11824175|14955 chrX 11823917 11824615 scaffold_10 1522604 1523232 + 383|145 261
ACCAGTATAGCACTCATTATTACTCATTATTTGGCAACTAAATTTTTTAGTGTATACGCGAAAATTCCCAGTTGTTGAAATGTTAAAATTTTAAATTTAATAAAAAACTGAAATAGC
GTTTGTTTATATGTATCCATGTATAAAACTTTTGTAACTAAATTTCTGA---------TAAATAGTCACTTCATTTAAAATTTGGTTGTTTCTATGGGAGTCATATAATAAGTTTGC
>fw 11826852 11827433|14957 chrX 11826813 11827030 scaffold_10 1525804 1526016 + 3722|42 225
AGATATGCACTCCATATT----CATACTCGTATTTTTGTTTGTTTATATTGTTTAA-ATTATTTGAATTGTATTGTAGCGTGAGGAGTGAACAATTTTTTTGTTATGCAATGTGTAAGAACTCGCCAATGTGTGTAATGTAAAAAGCGTTAATTTTACGAACAATTAAACGATTGTGGTTGACT
AGTTGGGCATACCCGATTAGAGCACACTTGTTTTTTTTTTTTTTTAAATTATTAAGTATTATATAAAATATGTATAACCA----GAATGTACAACTTT---GTTATGCAATGTGTAAGTACTCGATAATACTT---AAGTAAAGAAAAACTATGTTTTATTTAAATAAATA--TGTGGTTAACT
>fw 11826852 11827433|14958 chrX 11827270 11830976 scaffold_10 1526578 1530032 + 134539|0 163
AGATCGATATCTATATCGATATCGATATCTATATCAATACAACTTTGTGTTGATATCGAAATCCAAAGGGATGGCAGAATTAATTGACAAACGTTAAACGTTAGTTTTGTGTTAATAACTGTACATATTAATTGTTTAAGGGAGGTTTTGAGTTACTCGTAGTT
AGAGCATGAGTTAT----------ATGTCTCTGTGCGTAC------GTGCATGTATC---------------------ATTAAT---------------GTTAACTTT-TGTTTATATATGTATATAGTAA---TTTAAGAAAGGACGTGAACAATTCGTAGTT
>CG1492 11843646 11844030|14975 chrX 11842280 11844046 scaffold_10 1547315 1549142 + 31842|1507 1920
AAA-AGTCGAATTCTTTTCACAAACTATACCAAACATATAGTATTTACACAAAGTATTAATTATGTTTTCCAGCAGAAACTTATTCAA--------ACACGTTAATTGCTCAAATATGAATGAATTAACAAATTATTTTTCAATAA-GTTAGTATTTAGTTTTTT---TTTAGATGC--TATCGCACGAAAGCAAACAGTATTTGTTTTTAAACGT----TGTGTTACTTTAATGGTACTTAGATATAAA--AAATAATTTATTTGTA-ATTTGTATCAGTTGCTAAAAATAATTTAAGTAGTATGT---TGAATTTAAGT-TACAATATATCCCTACACAGACGTGTAAAAGTGTTCTCGCTTGC---GGTGGCAACAAATAAATAACGTTATGTATAAGAATGTTGCAACAA
AGATAATGAAAAACCATTTATCAATGCTGATGAAAATATGTTTTCAATGATAATTAAAACTAATTTTCATTATCGTTAATTTTTTCAATGATAATGATATGTAATTTTC---ATTATCTTTACGTTTATCAATTAGATTTCATTAACACTACTTTTTAGAATGCCAAACACAAATGCATTACAAAACAAAAAAAAAAAGTATTGCTGAGCCAAATTGAAATGTGTTCTTCTAGTGACAATTGTATTTGTATTAAATATTATAATTGTACATACACATACAT------ATGTAATTGTCGATGCATGTGCATGTATGTAGGTACAAAGTTTATC---AGACAGATATATTGAAGTGTTTTCGACTGTTATGATGACAACAAATAAATATCGTAATATATAAAAATGTTGCAAATA
>CG1490 11856765 11858244|14987 chrX 11856633 11857197 scaffold_48 198295 198883 + 4893|132 728
ATATATATATATATATGCATATAT----------------------------TCGAGCAGCAAATCG---------AAAGAGATGGCAAAGGCGTATGTATGGGAGATGAAAAATATAA--------------------------------------------------GATTTGTTTCAAACAATTATTTGTGATTTTTAAACATGAAATGATAAAAATG-----------------TATGCAAAGGACTAGACAAC----------ATAAAATTAATTA-----------------------ATAAATTACAATAATACACAG-----------------TTTAGTGCTTTTTCTTTGTTAACTATATAGCGAAGGAATCGAGATCCGCGTCCGCGCCCACATCCGTTTCCGTTTCGAAAAACCGAATCAAATGAGAAGAGAGCCAACAAGAAATCATATTTTATTAATCTAC------TACCGCTATATGCTATTATTATTTATGCAGCAAATAATTCAATTTATTTATGTGTACAAAAT----AAACGGAACAAAAAAAAACCCAATAAAAATACCAAGAATTCAACTGACAA
ATATATATATATATATGTATGTATACCTAGATGTGTAATGATAATTGATACATATAAAAGAAAATTACCTACATATAACGAGGAGACGAA--CGAACGTTAATGAGAAAAAAGATACAAAAAACAAAATAATTATAAAAATCAAAAACAAAAGGAAAAAAAAAACAAAGGATTTGTTTCAAACAATTATTTGTGATTTTAATACATGAAATGATAAAGATAATGCTAATGATAACGTTTATGCAAATGACTAGAGAGCCCTACGTTTAATAATATTATTCATACAATATATATATATATATAAAAAAAATAAAAACAAAATAAAGAATCATTTAAATTAACAGTTAGTGCTTTTACTTTGTTAACTGTG--GCGAAAAAATA---------------------ATACAAAAGCAATTTGAAAA---TGAACAAGAAAAAGAAAATGAAACAGGAAAT---ATTTTAACAACATAAAATTCATGCAGAAATACGCTATTATTATTTATGCAGAAA-----TACAATTATTTATGTGTAAAAAATGCAAAATAAAAATAAAAAAAAACAAAAACAAAATACCAACAATT----------
>CG1490 11856765 11858244|14988 chrX 11857339 11857713 scaffold_48 198927 199333 + 338|0 423
AAGTAACTTCAATTTAGGCTTAGGCTTC----------TACTACATAA--------TATTCTTCTATGCTACATAATATTCTTAATCGATAATTGTTTAATCGCAGGCAGAAGTAGAAGTGAACTCGCCGCGAAGCGAATCGTTTCCTTTTGTCCAAGTGTAAATAAGCGTTCGTTGCTAGTTGTCCAATAAAATTAT-------AAGCAAAAAGAAAGAAAGAAAG-----AAAGAAACAAAAGTAAAAGCAAAAGCAAGATTATGTAAAGAAAGAAAGAAAA-AGTGAAGGAGGG---------TCGAGCAAAGAAAAGGAAATGAGAAACCTT---------AAACCTAATAGAAGGGCATAGAAAGAAAGAACATAAACTAAATAAAAGCAACCAACAAGAGGAGCATTATATATAGATT
AATTAATTTAAACTTAAGCTTAGGCTCTGTGAGTGTATTTGTATGTGAGCGGTTGTTGTTTTTTTTTTTTTCTGAATATAGTTAAGCAATAACAAAATAATAAAAGG----ATTAG---------CGCCAAAATCCCAAAAGAGGTTTTTGACATTACTGTAAATACGC-TTTGCAGTTGTGCCCCAAATCGAATGACGCTTACGACGCATACATATACAACAACATCGCCTAATAAAACACACTTACAAACCTAAACACAATTAAAAAACGGTTCAAATAAAAGAGTCAGCGCGGGGGCAAGTCCTTTGCCAATGTTCGGCAACTCTGGAACATTTGCAGTTCGACACCATGTAGAAAGAGAGAGAGAGAGAGAACGTG---TGGAGCGAGGGGTGGAGAAAGAGATATATTATATATATATT
>CG1490 11856765 11858244|14989 chrX 11858101 11859048 scaffold_48 200268 201225 + 42834|0 155
GGC--GGTGACACGAACCGGAGAAGAGGAGAAGAATTCACGCTCTAAACTGGATGATGGCGGAGCG-GAGCAAGTTTGCGTGCGGAGCGGGATTAAAAGGATGGAT-------TGCGGGCAA--GGGATTATGGCCGCACGTGTTTATTGTTTTTC
ATCCAACTATCAACAATAACAGCAAACGAAAAATATATATA-TATATTCAGCGTGTTCGTCGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCGT-GCGTGCTTGTATATGTGTGTGTGCGTGTGTGGGCGGGTGTGGGTGCGTGCGCGCGTGCGTATTTTCTGTC
>Cyp311a1 11863221 11863722|14993 chrX 11863132 11863540 scaffold_24 1525894 1526334 + -1668|100 467
TAGAAAAGAG-----CGAAACCATT-------------TTAATATTAAGCCATACCAAAATTATAAATATTTCATTTTGACGTCCTTACTTTGCGGTACGAATAAGTTTTCCTAATAATTTCGTTAAATATTAATT-------ACTTATCGATGT---------TTTGGAAAAATCACAAACATCGACTTTTTTCAAGGAATCATCGATGTTTTTCCAAGCGCAAAGTAGGAGAAAAGTTTATAAATTGTAATTATAAATTAATTTTCCATATTTTCTAATTCAATT--------AAAAAAAGCATATCAAATTTAATGTGAC------TAGCGTCGTGGAAGACATGGATAAATATCTGAAAAGTAA
CTTAAAACGAATTGTCGAAAATATTGGTAATTTTGTTGTTTATTTTGTGTTAT----CATTTATTA--ATTTCTTTTTGTGGCAATTAACAAATAGTACAAGTA--TTTACC-----ATTCTGTAGATAGTTAACTTGCTTTGCCCTAAAAGTGTTCACACGTGTCCGTAACATTTAAATGGATCTACTTAGTT--ATAAATTATGTATGTATATATA----TAAATTTAAATATAGGTACACAAGTTTATTTCACTAATTAATTAGTCTAATAGTTAAATTGAATTACAAAAAAAAAAAAAAAAAATAAAATAAAAAGAGAAAAAACGAAACGAAACGAAAAGCA---ACAAATGT-TATAAAACAA
>Cyp311a1 11863221 11863722|14994 chrX 11863541 11864754 scaffold_26 1387156 1388410 - 2425|0 195
AATAGGTGTTTTAAATTATCATTTCTGGTTTCAAAAAAATATATATTTATTTAGATATATTTAGATATT----TAGATATATGT---TATATATTCTACATCTAAATAGTTATCAA-----AATTCATTTTTACGGTATATAACTTATAT--TATGCTGTCGGAAATATGTACATGGTTTCTAAATATAACTAACT
AGCGCATTATTTAAAGACGCCTT------------------CATGTTGTTTTTGTTCCGTTAAAATATTGCAATAGAGATGCGTGTGGATATATAATAAATACTGAAAACTATCGATAATTGATTGACTATCGCGATAAGCGATAAGTATCGCAAGATATTTGAAATA-------GGGTTCAAAGTAAAATTAATT
>CG12721 11905941 11906148|15063 chrX 11905984 11906159 scaffold_5 893938 894100 - 238|0 171
TCCTTACAGCCTCCTAGGATAAG---CACCCAAACACATAGATATGTAAATTCAAAATATCAATTGTTTACTCAAATTAAAAATAACAATTGTATAATCAAATCAACCTTTGTAAAATCATACCAAT--TGAACATAAGCATAGG--TGTGAAGCAAAACCAGAGCCAATAA
TTAAGCAGGCCTTCCAAAATAAGATATATTTTAATACGCATATATATATATATATATATATATTTGTATATATA---TATATATAATGTTTGTGTG--------------TGTATGTATGTATGAATGATGTATGTA---ATAGGTTTGTGAAACACAAGTAAATTCAATAA
>CG15731 12290341 12290492|15632 chrX 12290187 12290395 scaffold_6758 907 1095 - -1288|158 220
TG----TTCCCATT-TTACCTCACCCTTTAAACAAATATACCATCTGTAAATTATAAA---CC
GGATGATATCCATTAGTTCTTTAAGCGTGAAACACTTTTTTTTCTGTTGAAAAATAAATACCT
>CG15731 12290341 12290492|15633 chrX 12290396 12290601 scaffold_48 560324 560571 + -352|0 123
-TCCATGCCATTCGATTCGAGTCATACTGATCCTTGAGTC--------------------------TTGTTAA-GTAATTTTAGGTCCCCTTTTTTTTCTCATTTCCCATGTTTTTTTTATTGT
ATGCCAGGCACTCGACTCATTTGTTTCTGTTGTCCGAGTTGAGCAACGGCATTAGCCTTGTAGATGTTGTTACTATATCTTTAAGACATCTTTTTTTTTTCGTGTTAAATAGTTTATAAATTGT
>Rab40 12293727 12294302|15638 chrX 12293576 12294561 scaffold_24 550105 551116 + 15626|151 846
TCGTTGCCTTGTAGG------------CCGCCGCCCAGCCGCCTACGCCGCCACGCCCCTAACCGACATTAACTTTAAT---TGAGC-TCTACTTATGTACTCTAGGCTATAACACACACACACACACACACACCCATAC---CATACC----CATACCCA--------TTACCATACACACAT----TCAACCCAGCTCTT-------------------TGGTTATATGTTT-TGTTTTATTGACATTGATATTTGTG------------------GTCAACAATGTTTACTTTT--TACACAGTA---AAGCATGCACCTTTTTTAGTTTTTAACCACCCCCATCCCAGGCCCATTCCCCCAACTTCTCTATTTTGCATTAATCTAATGTTGTTAATATTATTATGTTTGTATAATTCTAATATTTAATGCATCAAACACATCAACATATAAGAAATGAAAAACAAAAACGAAGAAATAACATCAAGTGAAAATCAACTTTTATATGGATAAAAAGAATTAAATTTTT-TTTTTGTTTGTTTACCATTCGGATTAA-----AATATTCTTAGATATGTATTGTAATTGAAGCGAATTCAGCAAGAGAAGCACA-CACAAAGGCGA----------ATTGATAAAAATAATTCATAATGA-------------------------ACTAGAAAA
TTGCTGGCTTGTAGGTGGTTTATGGAACTGCCTACGCAACAGCTGCGCAATTGCGCGTAAATCTACAACCTACTTTACTTCCTAAGCTTCAACATATGTACACAGA---AAAACACACACACACACTCACACACTCATACACTCACACCGTAACATGCGCGAGTATTTTCTTCAATACAAATATGTCATCAGCATTAATATTTATTATCGTATGAGAGCGATGGTTATATTTTTACATCCTATACATACTAATTATTATAAAAATGCTATATATGTATGTAATTATTATATACATATACTATACGATATACATATATATATTTTTTTTATTTTTTTATAATGATTA--------CCATTATCACTAAATTTA-ATAACGCATAATTGTAATGTTGTTAATATTATTAT-----TATATTTGTATAATCTAATACGCTGGATATAGTA---------------------------------------------------------TACACTGATACAAGGTATTCCTTCTCTATTTTTTTTTAATTTTCATTTTTGTTAACAATTAATATTCGTAGAAATTTA-TGTAATTAAAA-GAAGGCGTTGGAACAAACGAATTGCTAAGATGATGATTATAATAATGATGATACTGATTTTTGATGATGATGATGATAATGATGATAAACATGCAAAACAA
>CG15730 12328331 12328398|15697 chrX 12328054 12328409 scaffold_411 4929 5268 + 1000|288 358
GCCCTTCAATGAGTACAATAAT---ATGATGACAAATAATTTTTTTTTATATAAACTATAATATTTGTATA
TTTATTAAACAATTACAAAAATGACAGAAAAACTAAAAATTGGCTAAAAAAAAAAAAAAAAAATATATATA
>CG32653 12363111 12364837|15751 chrX 12363089 12363347 scaffold_31 699823 700130 + 7451|23 310
GGGCAATGGCAATTAACTGCTCTG-GACAGCTAATTGATAAACTGCACGCTCCAGCGA-------ATCGA-----------------GTGGTGGTCTGGGATTTTCGACAAGTCGCATCAACGTCAGCGCCGCATCAGCAGTGCGTTAATGAAAAGC------------TCACTCCTCGTTTGGCTTATCCTGCAGC-------------GACAGGCGGACAAACAAAGAGCTGCTCAAACAATGCAC-GGACTATTGGCTAAATATTGAAAAAAAAAAAACAAAAAA
GGTAAAAAGCAATTAACTGCCCTCCGGCAGCTAATTGATAAACTGCACGCACCAACGACAACAACAACGACGATGACGATGACGATGACGATGGCGAGACGAAGGAGGCAGGGGAGGACAACGTCA--GGCGCATCAGCAATGCGCTAATGAAAAGCATGAAAAGCATTTTCCTCATTTTCTCCCATATTTGCCAGCCTTTTGATTATTTAACCGGCACG-AAACAAAGCGGCGCTCAAACAATGCACAAGTCTATTGGCTAAATATTGCAAAAAATAAAACAAAAAA
>CG32653 12363111 12364837|15752 chrX 12363417 12363657 scaffold_31 701383 701613 + 11544|0 245
ATATTATCTTTAGCATT--AATTACACAGCCATCTATTTAGCTTTTATCTTCTTCGC-TGACTAATTGAGCGAATATCCTCTTCTTGTTATGCC--ATTCCAGATTGCCATCTGTGATGATTACAGCCTGCCCGTAGACTTTGTTAAAAAACGACCGTCCAGCTTTGATCCGTGCCTGGCGGAGGCGATACCAGCGAATCCCGAGCATTGGATAGCACCCAGTCCGCAAACCGAGTTTGTAAGTCC
ATGTTATTTTTAGCATACAAATTGCGTAAA---------GGCTTCCACTCGCTGTGCCTGTCTCACT------CTCTCTCTCTCTTATTCTCTCTGCTTTCAGATTGCCATCTGTGATGATTACAGCCTGCCTGTAGACTTTGTTAAGAAACGACCGTCCAGTTTCGATCCCTGCCTGGCCGAGGCAATACCAACGAATCCGGAGCATTGGATAGCGCCAAGTCCACAAACTGAATTTGTAAGTAC
>CG32653 12363111 12364837|15753 chrX 12363863 12364084 scaffold_43 776226 776478 - 385|0 257
ACGTTCAGCCAAATGG----------CAAGAAGTCCGCTTCTGGGCTTAAAAGATATGGGTTGGGCTGGAAAATGGGGGGAAAGCGAAAAAAAAAAATAAA---ATAAAAACAAAAACAAAAACAGTAAGGAAAAGCGAGGGAGGTC------CACACACTTGAGGTGCACGTGTCGTGTCGTGGCGTTCGTTATTGTTTTTCCC-----------TTGCATTTTTTTTTTTGTTT------TTTCGTTGCTGTTTTT
GCAATTAGTCAATTAGGCGGCGCTTACAACTAGCTTGCTTGTTGTCCAGCAGGC----GGCTAATTTAAGAGGCCAGTGGAAAACAGAAGATAAAAACAAATACACGGAAGTCAAAGCTTAACTTTAACTGCATTTTGTTGGGGGTTGCTAAGAACACCGTTTTTTTTCTCTTGTCTT-TTGCATTGTGAGTTATGATTTTCCGCCGGAAATACGTTTCCTTTTTTTTTCTTATTTTTCTTCTTCTGTTGCTGTTTCT
>CG32653 12363111 12364837|15754 chrX 12364085 12364171 scaffold_31 701780 701876 + 5060|0 96
TAACAAAAGAACC-------AGTTGGAAAAGCATCGTCGCCATTTTTAATTGTAACTGTAATTTAGCCATTGTTGT---ACACTTTTGATGACGCAG
TGACAAAAGAATCTCGAGGCGTTTTCAAAGACGACGTCGCCATTTTTAATTGTAACTGTAATTTAGCCATTGTGTTTCAACACTTTTGATGACGCAG
>CG11138 12405147 12406422|15828 chrX 12404996 12405294 scaffold_5 5350693 5351009 + 2480|168 323
TTTTTTTTCTCGTAAGTTAACTAATTTAAGCACACAAGAAAAAAACGAATGGAAAAGATACGAGAGAAGAACAGTTATTATGCTAAAGAATTGTACATACGTATGCATAC-CACATAATCGGA-------ATATAAATATATACATATATTTAATA
TTTATTTTTCTGTAAATTTTGCAATTTAAAAACTTTGGCTAAACATTTGCTAAAATGA----AAAATTTAATAGTTCTTAAGC---AAAATTTTGTGTTATTATGTTTACATACATAAATGCATATATATATATATATATATATATATATATATAT
>CG11138 12405147 12406422|15829 chrX 12405295 12405714 scaffold_8 3824053 3824445 + 331|0 441
CGAAACAAC--ACGAAATTTCTACGAAAATGCATACGTAGCCAAGTGGAAAAGATTTTCGAACCGAAATGAAAGCGAGAGAAACTTGAAAATTT--TCTTAATAAAACGATAGTAAACTAAAATCAATCTTATTGTAGCAGACACAAGCGGCGGCAAAACACAAATAAAGGAAAATACACTTGCTGGCATTAGATATAAAATCCTTTTTTTTTTTTAAAATATGATTATACATAAAAACCTATACATTAGGCGATAATTATAATTCTGTTATGTAGGC---GAGCGATTTAATTCATAAG-------TTACACTTAGTATGTACGAATTAATTTATTTCTATACATGTTGCCT--------AATTTACACAATCGACACTTTACCCTCCTTCCTCAAACTTACTTTTTTTTTTTTTAAATATTTTTATTCGTATAAATACCA
CGATACAATCAATAAAAGTCGTACATATACATATATTTATATATATATAAGAAG----CGAACCACGAGCACATTTATATTAGCATTAAAATCCAAGCGTTACGAACCGAAAATGTATTGAAAT---TCTT-TTGAATAGGGTAAAAGAAACAGAAAAAAATAACTAAAACAAAATGCACGCGCTGTCCATTGATTAAA------------CTTGCAAAAATCGAACATCCGGGAGAACCTTTTTATGAATAAATATCTATATATATA-TATGTACGTATAGAGTATGTACATCTATGTGTATATCTTTCGAGTTACGTTATTCGAATTGCTCT-TTTCTATTAATAATTCATTTGCACTGAGCGTGCAGAGCGTGCAGTTT--TCTACATTTTTAAAGTTGTTTTTTTTTTTTTT-------------------------A
>CG11138 12405147 12406422|15830 chrX 12405715 12405943 scaffold_21 629890 630119 + 205|0 235
CAATAAACAAAACAACAACAACAAGGACAACACAGCA--ACAAAACAACAACAACAAACGACATCAAAAACACACTTTTGTAGGTGTAAGCAACAAAAAATAAACAACAGAT--GATAACACCTAAATGAAATTGCAAATTGT-TACCAGCAAAATCGGAAAAAACTAATGTAAGCGATTGTAAGCGCTTACCTATAAAC--GGCCGTTGGGAAATTTGTCCCAACAAAAAAACAC
CAAAAAACAAAAAAAAAAAAACAAAATAAGTGCCACACGAAAAAAAACCGCTCAAAGGCAACGTGCAAAGTTTTGTCTGTTGGTTTTGAGCAACAATAAAAAAAGAGGAAAATAAAGAAAAGCGAAAAAAAAAAAATAGTTGAATGCAAACACAAGCGGGCAATAACAATA-----AAGTGTAA-CACAACCAGATAAACTCAACACCCGACACATCAGTTCTGTCTAAAACTATT
>LIMK1 12418319 12419875|15844 chrX 12418014 12418625 scaffold_12 622545 623163 - -510|336 675
ATTTAACTA---TCTATATACAACAAATATGTGCGATATTTTTTATATGCAGCTAATTTAATGTGTTGTATTTTGACCCCACACCACCTTGTAACTACGTTTATACGCCTGCTTTTCGAA----------------AATTGAGTAACGCTT------------ATAGAATTTTCGATTCAATTCTTTATGCCTTTTAACAGTTGAACATATATAATCAGTATAGCAACATTT--TCTACCCACTTGTAAATAAGTTTATAACTAATGCAGTTTTTGTTGCCTACTTATTCGGGAGTCGAAAGGTCTGTAATTACAAATAAAGCTTGTGTATAAACGTAGT
ATTCAACTAATGCTTATATATGCCATATAT-----ATATATTCTATGTATATTT---TTTGTTTGTTGTTTTTGTATCATATTCCAACATGT---TTTATTTGTTTGTTTTTTTTTTGGGTTATATTAACACTAGCAATCGGTTATTGCCGCTAATGCTATAAATAAAACTGGCGCTCAAATGAAATAT-CCGTTTCGTACGCCAACTTAACT------TAGACCGACTTTTAATCTACACTCTCATAGTTAAATATATAATATGTACAGATTTTGTTTCTTGTTAGTTT-------------------CTTAAAAATATTGTTTCTGT---TACTTTAT
>LIMK1 12418319 12419875|15845 chrX 12418704 12419463 scaffold_31 778405 779301 + 7494|0 943
AATGAAAAACCAATAAGTTGCAATATTTACACGGATTGTATAAACCAAGCGAATAATTATAGTATGTAAGATTACAGGGTAACAACTGTCTCGACTAACCTAAAA-----------AAAAAAACTGAACTAGAAGCAAAGCTAAGCAAATACTTGTTTAACCCACTATTGTCTGACATAAAGTTATATTGCGAAAGAGATAGCGAAAGACGGATAAAGAGAGAAGGAAGAAACTTGTGCCATGATGTTGATGCGAAAAACGAACGAATCTGAAGAATCCTCGAGAGAGGGAGATCCCACCCGCAAAAAAAAGACAAAAGGAACGAAAAGAACTTTAACTAGAAAAATTGTGGTTTAAATATTTTTTG---------------------------------------ATAAACAGCGTATATAAATGTATTTGTATATCTAT-TCCATAATTATA------TAGATAAACGTATTCCATGTTAGTGCTTAAATCTAATTTATTATTTATCG------ATTCTCGACCCATTCACCCCGTCCCCTCATTCCAA------------------GAACAATAATT--------AACAATGCTAAGAAACAAACTTTTTTGTATTGACGAGAAT---------------------------------------AAGTCTAACTCCTA------------------TAACTA---AATATATAAGAATGTTT----------TTGCTCAAA--GGCAATTTTAGTT-GTAATTGATACG-----AACAGACATACAAACACACACACACGCTAA---------CTGTTATACAAATGAAACGCACACGCTCAAGCCTAATACTGTTATACTG--------TGTACTTTATATAGCCATTATATACCTAAACCTATATACATATAGGATCGAAACGCTTGCAATTAACTGCT
AAAAAAAAACAGAT--GTTGCAATATTTACA--AATTGTATTAAACGAT---ATAAATCTAGCAGCTAAGATTACAGGGTA-----TATTTGCATTAAATTAACAGTTCCCAACATAAATCTAATGAACAAAACGTAAAGTTAAGCAATTTTTTTTCTGTCGCTCTATGGCGAAAC--------------TGTAAGAAAAAGAGAAAGAGAGAGAGAGAGAGAAAGAGATGACAAATCGAATAACG--AATACGAATAG-AAACGAGATGGAGAAAACCTAGTGCCATGG----CCCACCCAAGCGAGAAAGAGACAGACAACAAAAGCTGTTATAA--AAAAAAATAATAATGACAAGTCTGTGTGTTAGGATGGGAAATTCAAAAGAAAAAAAAATCTGACAACATAAAAGACAAAAAGAAAATTATTTTTTTATATACATACATGCATATACACACGTACACATATATATTCCATGTTAGTGCTTAAATCTAATTTATTATATATAGAATGAAAATATTAACAAA---ACTTTATACCCTCCTATTAACAAATACGACTACGAACTAAACAATAATGTTGCGCTAGCCAATGGAAAGAAATTTACATATATATACTACTTACCATATATATATATATATATATATAGATCGATCGAGCAACCGAAAGTCTAACTTATACTCGTATACTAATATGTTTAACTGTACTACGTATGTGAATATTTGTATTTGCAATTGCTCAAAATGGCGGCATTAGTTCGTAAGTAGCACAGTGCTAACTGTTATACAAACACACGTTTATGACAATTACTTATGCTGTTAAAGAACAAAAGAACAAAAACAAGAG---AAAACTGTTATACAACGCTGTATTGTACTTTATATAAC-----TAGGCATAAA-TTACACAAAAACAAATATGAAACGCTTACAATTAATTGCT
>LIMK1 12418319 12419875|15846 chrX 12419717 12420216 scaffold_31 780264 780792 + 10087|0 179
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CTGTTATATGT-TCGATGGCTGTTATACGCGTGTGGCAATTGTGTTGTGAACTGTCATATTTGTGCAGAAATTCCCATAACTGTTATATGCATCAAACGCACAAGCCCAGCAATTGTTACAAACGACAACTGTTATACACAGCAGCAGCAACTTATACCTACAACTGTAATACACTTCTA
>CG1463 12443494 12444371|15865 chrX 12441720 12444281 scaffold_31 807913 810530 + 24530|1877 2890
TTACATAAGTTCTGTATTTTCTCATACGCATTTGATTTGATTTTTATTTT--AGGCTTATTAAACATTAATAATTCATACCACACT-------TCGTTTCGATCTAGTTCCATTATTATC-----------------------------AACATCATCATATTACCAATCAATCATGATCATCATAATATAAGTATATATAAAGAAGTTGGAAAAATCAAGTTACAGAGCCTTGGGATTAATCGTAATTTGTGTACACATTTTGAGTACAGAGTTTTGT--------------------------------GGTCAATGCACAGCAGTTTGTCCCTATTTGAAGGATCTGTAGTTTAATTTTGATATACCAATTAGCATTTCGATTTGTACAGAATACATATGTGTGCCAGTA-----------------------TATACCTATATAAATTTAT----------------------TATATTACTTTCATTCTTCCTATTCTT-TGCTTTATAT----------TTTTTTTTTGCCTGCACCAGTTATTTTTTTT-TTTTGTTTA----------CTATTTAAATTTAAAATTAAAGCATAAACAAACA----------------------------------AGTTCTAACAAA-TAAACATTTTCAAAATGCATTTTCAATTC----------AAACGAATAGTAAAAAAAAAAACAGAATAAACCATTTTAATTGTTCTAAAGATACATT----TATATATATATATAATTGGAATCATTTGCATATTTCACACCAATTGTAAAAAAGAAACACAGAGGAGAATACATTGATAA--GAGAAACCAGGGAGAACAATTCATTTGCTTCTTAAACGCTTA-----AATCAATCGAATATCAGCTTTCGTAGTTATATAGACAGATAGATCAGTTATATAGTATTTAGA-------------------TGTGGAAAATACAGCAATGCA-----TATTCAAAGT---------
TTAAATTAGTTTAGCATTG------ATTTATTTAATTCGGTTTTTTCTTTTCAGACTAATTAAATGATAAGAATT-ATACCACGCTCTCGTTATTGTTTCATTGAAGTTGGGTGGATGTAGGAAAGGGCTGCTGGGGTGGGGTGGGGGAAACGTCA----ATTACAGAGCA--CATTATCAACGCCGCATATATATATGTATCTGTATAGGCATAATCATATATCATCTCTGTG----TATGCTTTATTTGTGTACAA--TTCGGTTATTGTTTTTTGTTTTTTTTTGTTTTGTTTTAATGCCTGCCATAGATTTAACGCA-ATTAGCTCAACTCTAGTTAA--------CAATTAAATTTCGATATACCAATTAG---TTGCTTTTGTACATAATACATAAGTGCGCTAATACACAATATACATACATACATATATATACATATATATATATATATATATATATCTCAATTATATGTATATCCATGTTGTATTTCATTTTGTTATGTTTTATATGAGAGTTTATTTGTTTTTTGCCTGCACCAGTTTTTTTTTTTGTTTTGTTTATGTTTTTAGGCTAAATAAAAATTAAATTAACGCGTAAAAAAAAATTAATAATAATAATAATAATAAACACATTGACACAACTCTAACAAAATTAACATTGTTTGCTTTTGTTTTTGTTTTTGTTTTTTTGAAATGCATTACAAAGAAAACATTGAAACAT----------TTGCTCTACAAATTAAATGGAATATTTATGTAAATATTTGTGATTGTACGCACAACAAAAATCAAC---ACAGATTAGATATAGAAAGTAGTACATCGACACTTGTGAAAC------GAAAAACTAGTTTTGCTTTCAAATTCTTGCTTTTGTTTAATTAACTATGTGTATAAATAGATAGATATATATATATATTTTTTTTTTGGTGCTTAAACCATTTTTCAATTTGCCAATTTTGCACTTTCAGCTTTTCGCCTTCTTTTCACAGACTAATCGAA
>Smr 12519935 12521236|15979 chrX 12519666 12520239 scaffold_37 304778 305434 + 9615|292 681
TTTGTGTAGACGCGTGTGTCCATGTCCATGTCCTTGTTCATTTTTTTTTGTCATGTTCTTGTCATTTGTTATTTGTCCTTTGTCTTTCGGTCGTTGATT---CCCTCTGCTCCTCACACAGCTCCAGCCTCAGCACCCCGAGTCAGAACGTTATGAGAATGG----TAGTGAGAACAATTTAGATGCATATATATATATAT--------------------------------AAAACTAAAGATCACACCACACACACACACATATATATAT---------ATATACAATACACTATGAGTAT-----AAGGAGTAAACAAAATAAATAAAACACACTGTTGGGCTGTTCTTAGA--------------------------------AA
TGTGTTTTGTTGTGTGTCTCTCTTTCTCTCTCTCTCTCTTTCTTTCTTTCTC-TGTTATTGTTCTTTG--ATTTGAATTTTCAGTTACGTGCATTTGTTGTAATTTGTAGCCCAAACGTAAACATAACCTCAAAAATT-GAGTCGAAAACTTAAGGAAATTAAATTTAGTGACAAAAATATATATATATGTATATGTATATGTATATGTAAAAATATATGTATATGTGTATGTATATTTAAGGATGAAAACTATTACATAAATACATATATATTAAACAATTAAATTTAACAAAATATATATATTTAAAACAAAACAAAAACAAGAAAATAAATACACTGTTGGGCTGTTCTTAGAAAAGAGAAAAATATCTCAACAAAAACAAATACAA
>Smr 12519935 12521236|15980 chrX 12520296 12520733 scaffold_31 1052763 1053186 - -1262|0 461
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AAGAGAGAAATTGTATATCAGTTGTGATTCACAGTTGATGGGGTTACAACGAACTTACAATCAAGAAATACGGAAGTTAAAAGAAAGATACAACATGCTTTGAACTTAAAAGGAAGA--TAAA--AAGAACGTATCAAGCTATTA---AGTTACAAGGAAGAT-ACAACAAATTTATAAGCAAGTCACAAGGAACGAA-----CAAAGCAGATAGAATAA-ATCTTAAAAGAAGCTACGAGGGAGTTAGAAAGTTACAAACAAGTTACAATCACGTCACAAAAAACATACGGGATACTTATAAGGAACTCACAAAGATGTAAGGCACTTATACGCAAGTTACAATTACGTTACAGGGAAGGT-----------AAAAAAAACCTTT-------------AAAGAACTTAACAGGCACTCACAAGCAATGAAACTGAAAGGGAACTTAAAAAGAAGAAACCTA
>Smr 12519935 12521236|15981 chrX 12520734 12522150 scaffold_37 306501 307902 + 29233|0 558
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TTGTGACTGCAGGCGTCGTCGTCCG----------GCATGCGCAGTC--TGACGGCAGCAGCGACGGCGCCTCCAGCAGCCCATCCACA----TAACGCAGCCAACGTCTAT------------CAACATCCGCAGCAGCAGCATCACCAGCAGCAGCAGCAGCATCACCAGCAGCAGCACCAGCAGCAGCAGCT------GCAGCTGCAGCAGCATCATCACCAGCAGCAACAGCAGCATCAGCACCTCCAGCAACAGCAGCAGCAACAGCAGCAGCAGCAGCAGCACCTCCAGCAGCAGCAGCAGCAACAGCAACAGCAACAGCAGCAACAGCAGCTAAG----CTGGACCAGTGCCGGCTATCGACGTCATCATCTGGTCCAAGCTCAGATGCAGCAGCAGGCGACGGCGCAGCTAGCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCAGCAGCAGCTGTCACCGCACGGGCATCATCATCCAGCACACTATCAGCCGACGGCGCTGCTGCCGCCGCCGCCGCTGCAGTCGGCGTCGGCAGCATTGGCGCAACAACAGCGAGTGCA
>ade5 12591679 12591988|16105 chrX 12591559 12591870 scaffold_6 2712466 2712747 + 439|120 319
AGGTCATCATCAGATCACA--TACTTTGTTAATTCTTCTTTCTCCTATTTTTTTTTTTTTGAAACCAAACATTTTTTTATTAGTATTAGGAAAGCATGACTTCAACTTGTTGTACCAC------GTTCTTGACAGGTTACGAACTCGAAATAACAAAAAATAAAAATTACATTTTAAATGTTACGCACTTTGAGCTGAAT
AAGTTAATCTCAAATTTCAGCCATTTTGCTCATT--TCTTTTCCATATTTTTTATTTTTTTTGTGCACACTTTTTTCCATTAGTGCT------GCCTGCTTTGCGCT--TTGTTCCACAAGTCAGTTTTTTTTTGGTATGTAAATGGCGCCCAGAGCAGATAAAACATTTTTTTTTTGTGCTGTGCGCCT-----TGAAT
>CG32647 12610509 12610609|16131 chrX 12609746 12610790 scaffold_24 704370 705392 - 12797|822 974
CTTGAAGTCAAATAGCAAGAG--ATGGAGATCAACTTAAGG----------------------CGAAGCTAAATCACAATATCCTCAT-------------------------TTTTTGTTGCTCCTAAAGCGTAGGACACT---CTCTACCC
CTTGAGCAGAAATCGCTTGAGTAACGGCGTTTAGCAATAAGTCAGCCCGACCTCCCCAATCCCCTACCCTACAACTCGCCACCCAGATCTTAAGTAGATAGTGGGAAGGTTCGTTTTTGTTAACTCTGTCCCGGAGACCAGCCAGCCCCCCCT
>CG33651 12725434 12725553|16306 chrX 12725314 12725565 scaffold_6 2380393 2380633 + 602|131 250
TAAAATAAGTAAATATGTATGTAACAGAAAAGTATAGCTTTGATGATTGTTTTGTAACAAAGAGCACGTCTTAAGAGTTTTTATTCAAGCAAAAGACAATGATGCTTTTTTTTTTTTTTG
TTATTTAAAGAAAT---TAAAAAAAAAAGGCGTATAAAATTAATGAC--------ATTAAATA------TTTTACAGCTTTGTTGACAGGATTCCGGAATCAGAATTTCCCTTTTTTTTA
>CG32649 12732703 12732839|16323 chrX 12732743 12733401 scaffold_24 908525 909159 - 38575|0 98
TGAGC--ACAGCTCACCCCTCTTCCCTTGACCATTTTCTTTTTTTTTTTTTTTGTCCAATCCAATCCCAGTTGTAAACCATAAGTGCGCTTAATTTGTA
TTAGCTGGCAGCT------------TTTTAACATTTTTGTGTTTCTGTTGT-------------GCCTATTGACAAAACAAAAGTGCTCTTAATTTCTA
>CG4404 12737680 12738213|16330 chrX 12737605 12737827 scaffold_4559 368 603 + 3256|75 258
AGAAAACACACCCAGTTGATAGAAAACGCCAACAGTGCCCATTTATTAGATGTGTAGAGCG----------TACTTTA----------------ATTACGCTTTTTATTGTTGTTGTTAAGCACACACACAAACA----------CGAATTTGTTATTGTCGAATAAAACATTTAAACTACGAA
AAAAAACATAAACAAATAGAAAAAACAACCGACAGTGCCCATTTGTTATATTGATATAGCAACTAAATGTTTAATTTAGGCGTTTAACGCAATTATTGCATTGTTTTTTGTTAAAGTTACACACACACACACACACACACACACGCACATTTGTTACATGTAAAAAGCAGATGAAGA-------
>CG4404 12737680 12738213|16331 chrX 12737835 12738192 scaffold_1 5130149 5130509 - -1319|0 389
GAAGATGCTTACGTTTCAGCGATGAAAATTACGATTTGTAAACGGCTCTATCAAAATTACCACACACAAGAGAT------GCATATTTTGAATGATTGTGCGGAAATATTCTACATACCAAATGCAACATTATTTCAAAACCAACATTTTCACC--------ACTTTCAGATTTCATTCTGGCCATCATATTGCTAA-CTTTTAGACAATGAACTTAGTTTTTAAATATTTATGTCTAAGTTAAGTGTG------AACGTACATGAAATTTATATCGAAGTTTATATGCACTGCATCGAAATTTGTAAAGCGCCCAGTGGAAC---AGGATGAAATCACCAGTTAT--------GTGATATTTTCTCTCCGTGAAGAAAAAAAGCCACAA
GCAAATACGCAAATCTCAGGAA--AAAAATGGGATTTAAAAA----TTTAAAGAATTTGA-------AAGGGATTTAATCGCATTTTTTATATCATTAAATTTACATATTA-ATTTCTCAAATTGCAAAGCATTTGGATGACAACATTTTGAGCTAAGAGGAATCTGTAGGGTCCGCCTGGAAGTTCTTTGTGCCCATCTCCCACACAATTGATTGCAGTTTCAATTGTTTCCATC-AATTTGCGTTTTTTCCTTGACTTGCA-GCAATGCGCAAAGAAATTCG-----ATTTATTTCAATTTAGCAAAAGGCCAAAATCAACTTAAACATAAATCCA--AGTTATTAAATCCCGCAAAAGTTTGCC------AAAAAGGAAAAACAAAA
>hep 12913144 12914365|16562 chrX 12912813 12913552 scaffold_24 1193068 1193730 - -2458|346 767
TTAGTTTATATGTTTCATTAAACATCAACTTGTATGCTGAGTGGAAGGGAAACCGACAAGAAACAACCACATTAACAATGGAATTAT-----TGTACTGATTATTATAATTGTTTAATTTATTATGTAAGCGGCAACAAGCGACAATTCAAATTCAAGTCT--CGTTTTGTTTTTTTAT-TTCAAATGGGTGGAACGGATTCCTTTTTTTCAGAACTTTTATATGGCGAAAGGGAAGTATGGAAGTAAATGGAGATATAAACAGTTCAGAAAGACAACGTATTTGGA-ATTGATTTAATGATT----AAATCAAAAGTATTTTGAATAGCTTCAGAAGTACAAGCCAAATAGCTTTCCATACACTTAGTTTCTAGTTTCCACCCTCCTATTAATATAAAGAAAATAAAAAAAAAAAGAAAAA
TTAAATGATGTATTTCG------ACTGATTTATGTGTTAAAGTTAAGG------------------CTTTTTGGACTATATACTTATGTATGTACATGGATGTGTATGTGTGTGTGCGTATGTGCATAGGTGCATATGTATGCGCATCAGACTTAGTGTCTACCTTTTAGTTTTACTATATACACATG----------------TATATGCAGTGTATGTATAT----AAATATAAATATATATATATATGTATATATACGCATATAGGCACATGTATATATATGCATATATGTATAAATATTGTAAAAATTATAGAAATGATGAACGTTGCGAGCATT--AAACAAAGTAAATCAACAAAAAC--AATT----GAATGTAAACTCTTATGAATAC--------CAATAATAATAATAATAA
>hep 12913144 12914365|16563 chrX 12913584 12913673 scaffold_24 1193757 1193847 - 2025|0 90
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AAATTGAAATGGAAAGAAAATATCTGAAGAGGAAAAAGAAAAAACACCATTTATTTGTACGTTAATTTATTGAAATCAGATAAAGCGACAA
>hep 12913144 12914365|16564 chrX 12913708 12914018 scaffold_24 1194713 1195085 - 651|0 375
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ACAGCAAACGAAAGTGTTCAAAAGTCGTATATATAACGTTTAAAT-TTTAGGCCGTAGCTAGGCGTTGCGTTGTCCTTTTCTAATGTTAATTCAGCTAGTTCACAAAATGTTTCTGTTTTAATTTATAACAAAAAGCAATTTTTTTTTTAAATTTAATTCTTAATTGTGTGTGTGTGCGCGCGTTTGTGTATATAGGAATTGTTTTAGGCAA--CAAACGAAACAACAATCAAGTTAAAATTTGTAACTGCAATATATCCAGCCATATATCCAGCATATATATACATATATATATATATATATGCATATATAGCGTATACATCTAACTGAACTAATAGCCAAAATTGAACACTGTGCCCTATATAACTATTTCAAT
>hep 12913144 12914365|16565 chrX 12914287 12914355 scaffold_24 1195240 1195314 - 3080|0 75
AAATCATGGTCATGTGATGCTGGTATGGCTTCGACGACGATG-------CCGCCGACGCTGCTGTTCACGACGACA
AAATTAT-GTCATGTGATGTTGGTATGGATTCGACGATGATGTTGGCGCCCGATGACCCGGCAGCTGCTGGCGACA
>hep 12913144 12914365|16566 chrX 12914356 12915284 scaffold_24 1195538 1196708 - 34271|0 9
GTAGCGCTGC
GTAGCACTGC
>hep 12916745 12917035|16569 chrX 12916007 12917123 scaffold_24 1198830 1199977 - 25901|819 1130
GGCAACGGCGACTGGAAGTGCGATCGGTTCTGGGGCCGGATCTCTCGCAGGATCAGGATCAGGATCCGCAGGTGGAGCTGTAAAAT---ATGGTAGG---GCGACAACGTATGCGGGGCAGAGTCCCACAAATCCGCA------GAAGACAATAAAACCCACTCAGATACCGAGTTACCAGCAGCAACAGTC---------GCAGTTTTTCATGCAATCAGCCACACAACTACCTCAAACAACAACCACAACACCGACGGCAACGACAAACTGTTTCGGCGGCAGCGGAAACGGAAATGGAAGAGGAAACGG
AGCGACGACAACAACAGCAGCAGCCGCAGCAGCCGCAGCAGCCGCAGCAGCCGCAGCAGCAACACGCGCCAAGGAAGCTGCCACATTGTATGGAAGAAATGCGGCGGCATTGACAGCGCGCAGTCCAAGCAATACGCAAACGCTGAAGACAATAAAACCCACACAGATTCCAAGCTATCAACAGGCGCCGGCTACGGGTACGCAGTATTTCATGCAATCAGCCACACAACTACCTCAA-CAGCAACCACAGCA------------ACAAGCAGCTGCAGCAGCAGCAACGACAACATTGAAC-----AACTT
>hep 12918182 12918491|16571 chrX 12917824 12918706 scaffold_24 1201170 1202088 - 10625|406 755
TACCATTTCTTAAACAATAATGACAAACAATGAAGAAATCCAATAAACATAATCTAACAAAAAATAAAAGCAAACGAAA-AAGAAGAAGACAAACTATAAACAAAAACCAAACATTAAAAACTATCGACATAAACTGAAAAACAAAACAAAAGCATTCAAGTAAACCTTGCAACCATCAACTCTATATACAGATATATAAACCTAAAAATAT---------------------------------ATTTACCTATATATAA---TGATAATGCCAACCAAACATAACTACTCAAAAAAA---AAAAAAAAAAACGATAAAAACTCCTCCCAATTAAAAAAGTAAAATTCA
T-----------AAATACTATTATAATAAATGCAAAAA--CAAAAAAC-----CAGACAAACTGTAAAACCGATTTAAACCAAAACATAAAAAACTATAAAAAAAAAACAAAAAAAAAAAATGCGAGCAATCAAC-AACATATAATATATATATATATATATATATCTATATACACACATACGTATATATATATATATATATATGAATATATAATAATAATTTATATTATCCCTACCATGATATGATATACACATATATAAATGAGACAAATGCAAGAAACAATAATCAATGAAATGAAATTATAAATCAATACAAT-AAAACTCCTCCCAAAT-CAAAAGTAAAATTCA
>CG4351 12930029 12930754|16590 chrX 12930017 12930103 scaffold_1 3948819 3948898 + 1813|12 91
TCAAAGTGTTACAATCCCTGTATAAATGGGCTCTCTCAAAGACGGTGT-----GCCAAAAAAAAAAACAAAAAACAAAAA
TCAAAGCGATACTACTC------------GCTCCGGCAAATAGTGTGACCGTAGCCAAAATAAATAAGAAATAACAAAAA
>CG4351 12930029 12930754|16591 chrX 12930370 12932324 scaffold_24 1216327 1218211 - 82692|0 393
TTGGGATCCGAAGGCTCCTTTCCAGCTCCAGCTCCAGCTCCTGCCTGTAATATCATCAGTTCCTTTTTAAGATATTCCCATTGTGTACATGACCGTGTGATTGATTGAGCTGAACGAATGAATGTGATCCCTGTGTGCGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCATGCCAACTCT-TATACTCGCATCCAAGGCTTAAATTAAATCCTATTCATAAATGAAATGATGGTGGGACTGGGACCCAAGTATAAGACCAGCAGTGGACCTATCTCAATCCGAACTTAGTGTTTTGGGCCTAGGCGATTCCCGTTGTTG--------CTTGCTTTAAAGTGAAACTTTCAATGCTCAAAAATGGTAGACACAGCAATTAGTTAGTTGGTTAGTTAGTTATTAA
GGCAGCTTC---AGCTGTTATACTGTTATA---------CATTATAGAGATATCATCAGTTCCTTGCTAA-ACATAC-----ATATATATGTCTATAT-------------------ATATATAT-ATTGCCAAGAGTGTGCGTGTGCGTGTGCGTGTGCGTGTTTATTGTGTGTGTTTGTGTGTGCGATTAGTTTTAAACAATTTT-----------TGTTGGT------------------------------------TTTCTC--------CTTTATTTTTTTTTTTT------TTTTTATTGTTTGTAAATGCCTTGCTTTAAAGTGAAACTTTTAATGCTC-AAAATGGTAGACAAG--AATT-----GTTATATAATTAGTTCTCAA
>CG32638 12956936 12957409|16620 chrX 12956891 12957811 scaffold_31 247300 248221 + 16431|58 570
GC--------------------TCTCCAAGACA-----ACCCTTCCAAGTACCTAGACAACACACCACTACGATAATAGACAGCGGATTCCGCAATGGAACAGCAAAGACAACCCATGTGTAGAA---AGACTTGACTAGTC--AGTGTCGCTGCCGAAAGTAATCAGAATATTTGAATGCGAAACAAAATTTTATACATACATATATATAACGTGTGTTGTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGCGTTGTTTTGTTAGTGCAATATTGTGAGAGAGACAACGATTAAGGTTAAGCATTGTAGTTAAATACGGCATCGGAATTTCATAAAGAAACGTGTAGGTGCGTGTTTTCCT-TGTCCCATATACACAAACCTTTTTTTTTACATTGTTAACGAATAAAGTCGGCTAATCAAAAATA-------TTAAAGATACACACATATATATATATATATATATTTATATTCGTATTTGTATAACAAAGATTGCAATT-CTACTTTATATACTTATCCT
GTGTGTGCGCAAATAATAATGATATCAACAGCACTCACACCCTACCCAGTACCAAGG--------------GATGTCCAACGGGAGA--CCATATAGAAACTGCTTAATAACTCCGCATGTGGAATCCAAATTGAACGTGTTTAAGTGTTG-------AGGAAACAACAACAGCAAAAAAAAAAAAAAAA------AAAAATAAGTGGAAAGCAAATTTTTTTTTTTTTTGTTATATTCTAGCGTT-------------AAGATCAAAAGAAAAGCGAAAAAATTGTGTAGTCAATGAAGCTA-----GAAAACAGATTTTTTTTTA------TGTAGCCATTATTTCAGCTATAAACCATAAAGACAAA--------TTGTAACCATTAACGTATATATATATATATATATATATAGATATATTTATATATGTCTATATATATGTGTATATATATATATTGATATGTATTTATAACAAGCGCGCAGCATTTGCTGCCTTATGCATAATATAT
>Bap60 12991376 12991634|16663 chrX 12991525 12993709 scaffold_31 1213797 1215988 - 100480|0 110
GTGAATGATGAGCTGATCATCTCCACCAGCCAATTCGTGGAGTCCACCGTCAAGAGACCTCCATAAACCGTGCGCACGGCAAACT-CTTTTTCCTTCGCCAGTTTAGTTTA
GCGAGT-----------------CTCCTGTGAATCCCT---GTCGAACCGCACGA------CATGGCACG---GCACGGCAAACTCCCTTTTCCTTCGGCAGTTTAGTTTA
>CG12723 13023564 13023703|16708 chrX 13023552 13023916 scaffold_31 1254518 1254884 - 10672|12 175
GT---------CCACCACTCAC------------TCCACCTAGGGATC--TTTTCAAATTTTTTTTTGTTTTTTTTTTTTAAGCCTTCGTTC-ATTTGTGCTCTACTTGTATTGTAAATTATGTTGCTATTAAATAAGTTATTTATCGAAAAATTGAACAGATC
GCGCCACCTTATCCCCCCTCACCGTCTGTTGGAGTCCATCTTGTCAACATTTTCCACAATATTTTTTTTTTTTTTTTTGTTGTCTGTCTTTCTATCATTGATATTTCTTCCATGTATATTAAATTATTATTAAATAAGTTATTTATCAAGAAA-TGCGCCGAGT
>CG2453 13027031 13027268|16710 chrX 13026301 13028061 scaffold_31 1257826 1259605 - 45626|840 1114
CAGCCGAGGATGATATTTGTTGTAAG-----CGATTAGGAAATCCTAAGACCATTTGATGGGGCTTAAC-TATAATCTATATTGT-TGGTTTTTTGCGTT-TTTTCATGCTGCTCACGTCGGGCAGGTCATAAAGCATCGAATTAAACAAGCTCCTCTGGCGGC---------TTTTATTTCTGTATGTTTACATTTTGAGGTTTATGTAGCTCTTTGTCAAATATATG--------------------TACTTCATGTGCCAAAAGGCAAACCC
-AGTCACATGTGGCACCTGTTCCAATATTCCTGTACACAAAAATCTGAGCGAAATTTAGAAGTCCTGTTGCACAGTTTGCCTTTTCTTGTACTTTGTATTATTATTATGATTTTGCCTTC------TTCTTTAAACAT---GCTAAACACGTTCTCCCACCTATATATATATATTTTTTTTTTGT---TTTATGCTCTTCGTTTTACATGGCGCTCGTTAAAATTAAAGTTTTATAAACATTGTTAACATATTACATGTGCCAAAAATTGATC--
>sno 13029433 13030216|16712 chrX 13028772 13029702 scaffold_3 762807 763741 - -2281|701 985
ACTATATATATAAATACGTTTTTAATTGTTTTTAATGTAACAATTTTAAGGCTGCAGCGCGGCGCAGCAAACCCCCCAAGATAAGGCATTTTTTTTAATCAAACAAACTT--------TGTAATTAGGTATTTACGTGTAATGTAAGTTTAACCAAC--AGACATTGAGAGGCATCTGAATATAAGTTAAGAAAATCGCGTTAAATATTCGCTGAAAAATCATGT-----GAATTGTGCACGCGTACGTACAGTTAATAAATATAAATGTGCGGATTGAATGAAA
ATTATATTTATATATACATTAT--ATTTATCATACGTTAACA----TAAGCCACAGGTTGTGCGCGAATATTGCTC----ATGCGAAATTTATTTAGATGGCAACAATTTGGGCCGGCTGCAAT-AGGTATTTACATGCAATGTAAAATTAACCAACTTAATGCTCCAATTTTGCCAATATATATAGTATTTTAATTGAAATTATTTTTTGTATACATATAATGTATGCAGTACTGTGCATCTATATATGTATAATGCAATTTGAAATCTATAATATGTAT-ATA
>sno 13037107 13037632|16719 chrX 13037054 13037549 scaffold_4 2443924 2444444 + -391|75 570
CGAATTTACCAAAAAAAAAATGTG-CGACAGTATGTTAACTATATTCTTACGTTAAAAATTCCATATGTTAAGGAAGCTTGA--------------CATTTTAGTTGATCT----TACTTAATTTCAAAATGATATCTAAAATCTAAAAACAATAGAATATCCTAAGTTTGCCTTAGACAATAATAATGTGATGGTCCTATTAGCCGAATTTCTGATAGATGTACTAA----AAAACTTAAAGTTGGCAGCACTGGCTTCAAATAACTAGCTGTTGATCACAATAATTAATGATGCTTGTGTTGTTCTCTTTCTTTATTTCTCTCTATTTCTCCACTCAACACTATATGTATATATATATATATATATATATATTGCTTGTCTTGATTTAAACCCGATTT-----------ATAAATACCGCCAA-----CCCATATATATATTATATA--------------TAAAAATATATATAATTTTCCCAATCCCATTTT
CAAAATTAAAATAAAATAAATGTGGCGACAG--------ATTCAGTTTTTCGTTCATGATAATTTTTGGCGAGGGGGCGGGAGCAGCTGTTGGAGTCAGCTGAGTGCATGCGAAACACCAAATTACGCATTGTTGGGCTTAGCGCAGCCAAAATATTATATCTCTGTTTTACCTGT----------ATGTGTT--TCATATTAGGTGAGTATTTGACAAGTATTCCAGGTGCAAAAATTTGCATATGTAGCAAC----TAAAACAACTGGTT-------------ATTAATCTAGCTTGTAT------CTTGTTTTATTATTGTTT--TAGTCGGTTCTGGACGAAGCGCGTTTAATTATCTTTAACAAAATATTAATTTT-----TGCAGACCAGCTTTTGGAAATTGACAAAAAAACCAAAAAATTGTCGCAGCTTTCAATTTGATAATCTGACAAAAACGTCAAAATACATTTGATTGTCTTAGGCCTTGTTT
>sno 13037107 13037632|16720 chrX 13037554 13038105 scaffold_24 541153 541793 - 8464|0 79
ATATTTAAATAATATCAATTAAGCAC-AGCACAGAAGCGAACCAACTTAATAATATTTAACAGCAGTGTTGCCAATTCAT
ACACACACACACAGTCACACACACACTCACACACAGACACACACACGAGTCAAAAGTCAAAAGCTCAATTTTAAATTAAT
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CAAGAGGGCACCGTTGGCTGGGATTTGGTGCGCCG------------TCGGAGGCG---------------TCGACGTCGTCTAAAGCTGCGACTTCCTGTTACCGCTCAGCCACGACATGGTTGGCG-----AAAAACTACGGATAAGTCCAT----------TAACAACAATAATAACAACAATCACAACAACAACAGCAGCAACAGTAGAAACGACAGCGATGTGGACGTACTTTCGCTGACACCACCGCCGCCCCCTCTTAGCATCTTTAGCTGGGGAAACGATGGCTATTACCAAGCCAGCGCAGCCTGGTGGGGTCACCACATGTGATCAAATGGGTCACCGT-----GGATCAAGTGGGTC-----------------------ATGTGGGTTGTGG----TTCAATGTGCCATTTCACTTACTTAATACAAATGGGTTAAGTTCAGTTCGGTGGATGCGATCGGATGGAATTGATAGCCCGGATTCCGTCACTGGAATCAGCTAAATATAAATTCAAGTTCAATCCTAATTCCCTTAAAGTAAAAAGTATATTTAG---ACAACCCCTTTTCCTAATGGTGCTTTTAAAACATCTGCAACT
CAAGAGGGCACCGTCGGCTGGGATCTGGTGCGACGCATTGCACCTGCCAGGAAGCGCAACAGGCTCCGGCTTAGGCTCCGGCTCAGGCAGCTGCTCCTCCTGCACAGCCAGCCCCACTACAAGCAGCAACAACAACAACAACAGCTGACTCCGCCATGTGGCTGCAGCTGGCGCAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAATGGGTCTGAGGATGAGTTCGATGTGTTATCCCTGACGCCGCCGCCGCCACCGCTGAGCGTCCTGAGTTGGGGCAGCGATGGCTACTACCAGGCCAGCGCCGCCTGGTGGGGT---CACATGTGAGCAGGAGCAGCAACAGGAGCAGGAGCAGGGGGCGCGGAGCATATCCCGCACTTAACAGATTCTGGTTGTGGGACTTTCAATGTGCCATTTTGTTTACTTAAGTCGCGTCG-------CCAGCT-GGCAAATCCGA----ATCCAAATCGGAGTCCAAATCC--------GAATCGG---------AATGCGAATCCAAACCGAAGTCC----AAATAGAAATTCAAATCAGAATATGAATCCAAATCCTAATCGGAATCTAAATAGGTATCCAAAT
>HDAC4 13096817 13098918|16790 chrX 13096534 13097366 scaffold_46 373597 374423 - -905|286 929
ATATAGCAAGTGAAAAGGATGATGGAAAG---------AAGGAGGAGGAGGAGGAGAAACAAGAAAAATAAGCACAACGAGAGATGGACCGATTGGCTCCAACTGGATGAAACAATTGTTAACAAAACGA----AACAGAAACTAAAAACTATCCTTAAAAAAAAATGAAATCACAAATGTAACTATTAATCTAAGCGAAG----CATATGCCCTTGCCATTTTTATTTTCTTATTATTCACCTGTTT-TCTCTTTTCAATACAGCAGATTTTTTGAAAAACATACTTTTGAACATAAGCTGTTTCGTATGCAAGCCACGTAATT----GCTGT---TACTTAGGAATATATAT--------------ATACGAATTTTTCTTGGGTTCCAAAAGCGTTACAATACGC-----TCTGTGTTAAATCTGTGCTTTTATTTTAATTTTCTATTTAT---AATTTGGCAAATTGGCGATCTCCCCTTACCTTACCTTTTTTTATCTTTCCTGAATTTGT-------------------------------TTTTTTTTTACCAAAACACGAATTATGAAGAGGATTCT----------------ACTAACAAGATGAAATATTATTGTTGCGCACTGCAAAAAAAAG
ATATAATAATTAAAACGGTGGCCATAGAATCCTATTCCAACAAAAAAAAAAAAAAACAACAACAAAAACAAACAAAACAAAAAGGAAAGCCTTTT--------------AAGGAACTGCAAAGAAAACGGTCTCAGCAAGCACCAAAAA---------AACACACACACACACACACACACCTGCGTTAATTTTAGGGCAGGCCTTATATGCATACAATAGCTACAACTAATCATCATATATATATATATAGAATTTTGTTACATCAATGCATTTAAAAA-----TTTTTAAATTGAA----TTTGAAATTCACATCATGTGCTTTTTAGATGTCTGTATTTAGCGATATAGATTCAAAAAGAAAAACACAAAAATAATT-----GTGCTAGGGGTATTACCGTAAGCATGAATCGATAATAGGTGTACGGTTTTTTTTTTGTTTAC-ATTTGTTCCAATCTGTTATATAGATGTACTTCCCGCTCCTAA---TTGTTTAGGGGTCC-GAATTCGTGGATCGATCGTTGCGTTATAATCGATCGCTATTTGCATTTATCGCTTATCGTGTTGCAAACAGAATACCCTTGCTCCCAATGACAACTATGTACATGATATATCATTA---------ACTAACAATCG
>HDAC4 13096817 13098918|16791 chrX 13097367 13097381 scaffold_37 915059 915073 - -166|0 14
ACAAGGATCAAAAAT
AAGAAAATTCTACAA
>HDAC4 13096817 13098918|16792 chrX 13097453 13097822 scaffold_37 915148 915496 - 1479|0 388
TACCTAATAACTGTTACAATAATAAC----------CCTTTATAT------ATATAACTATATAAATGCACATGTGTATTCAC---CATGTGTGTAACGATAACGATGTTCAACAAATGTCTGAAATGAAGTAAAACTATTATTATATGTAAATAAAACACAAAAAACAAAGAGAACAATTTTAATAAAAAAAAAGCAACAATAAAATACAAAATCAAAGAAAATATCCACGCTCACACACACACATACACACACAAACATATATACGTCCTGGGCAGGACCCGAGAGGCGTGAATCGGGAAAAATTCTGAAATAACCGTTCAATCGCTAACCGTTAACTGTAAAACCGCTGTAACTGTATTTGTACTCGTGTACCTTTAGCTGTCTAT
TAACTAATAACTGTAACAATAATCATAATCAAATGACGTTCATATGCATGTATATATTTATAGATAACTATATATGTATTTGGGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTCTGTCTGAGCAGCAACTAAAAGTGAGCAAAA-------------TATAGCAAAATCTAAAAGCAGA-ATTTCAATTTTGATCTAATCGAAACAACAAGAAAATATATAAGCTGTTGATAAGGCTGGGCGCAGGCACCCAGCGATGAAAAGTAACGAATAAATAGTATAAACA-------ATAAGCATA---CCCAAAAGATCTCGATATCTCCGTT--------AACCTATGTATGTAC--------TATTTGTATGCATGTATGTGTGTGTTTATCTATGTGT
>HDAC4 13096817 13098918|16793 chrX 13097823 13098135 scaffold_55 12132 12416 - -723|0 332
TACATGTTATGTAGAATGCTTTAGTTGATAATAAGATATGA--------GAAAAAAAAAACTTAACAAC------TAACTAGTTGGATGAAAAGCGAAAAAACTGAGAAATCTTTTTGTACAATTTATAGTTTAGTGCAA-GTTTCAAGTACAACATGC-----TATTATTTAAAGAATTCTATATATATACATATATATATATATATATACAAAAAAAATATATATTGTGCAATAAATGTGAGAAAATGAAAATCGCCACACAAAACAGAAACTAAAACGAATAAGAGAAAATTTGTTGTTAAATGTTGCCGAGATCTTATATACGTATGTA
TACACGCTGTTTATTATGCTTTATTTTATAATAACATGTAAATACATTTGCACAAACAAAATTTGTATCGTTTTTTAATTTATTCTCTGTAACATT-------------ATTTTTTCAGCTACTTCAT--TTAAATGCAATATTTGGACTCTCGCTTATGGAAACCATATTCGGTGAAAGCTCTCTTTGTCCACGTCTTTTTA---ACAGGAAGCGAAAGGATATAAAGGAAAATAC-----AGGAAATAAAAAT----ATGCTCAACTTAAGCTCTAAC---TATGGAGCAATTCATTGATG---------GAGATCTCAC---------TG
>HDAC4 13096817 13098918|16794 chrX 13098136 13098636 scaffold_36 730819 731350 + -314|0 548
AGAAACATCGAAA-ATATAGGGGAACATGTCTA-------------AAAGAAGCAGAACAGGGCCTAAAGTTCAAAATGGTGGCTGTGCCT-----CCAAAAGAAGAAATAATTATAATAATTAGAAAAGAATCCTTTCAAAAAAAAAGGAGATTTTATATGAAT-ATAT-ATATATATGAATATATATGTAGC---TTAAGC----------TCAGAATTTAGTTGTAGAAGTCATCGAGATTTTTTTTTTTTGTTTTAAGGTGAGAGCAGAGGTATTTTAACGCACACACAAACACA--CGCAACTCAATGTATCTTATTATTATTATTTAAGTAAGTGTGTCAAAAGGATATAGAACCACTAACGTACT-GGTGAACATCATCAGTAAGCTATAAAGATAATGTTTAAAGAGGTCGGGTGCAAGAAGCATGTGTTTTTTTTTATAAGGTAAGGTTCAACCTCAAAGTTCCCAAGTCTAGACC----CCACCACGCCCACTTATCCG-------CCATCGCTTACAGAGATCGAGTGGGGAGTTGAT
ATAAATATCGAAATATATATATAAATATAAATATATTATATTCTATGAATAGATAAAACGTTTTCTGGCAATCAAGATTGTTGAAATACTTAAATACAAAATGGAAAAATAATTCAAATAATAGAAAAAGAATTGCATATGAAAAAAAAAAAACCCGATTCGAGCAATGTGATATGTAATAATTCAGATTTAGCTAATTAAACGAGATATATGTGAACGTATATGTGTATTCGTATTCGTAATTGTATTTGTATTCGTAATTGTATTTGTAAATGCATT----CGTAAATGTATTCGTATTCGTATTTGAATTTGTATTCGTATTTGAATTTGTATTCATTTG---ACAGTATTTACGAATGGTATTATACTAGATATATATCTATATATATATATAAACATA----TTCGATAGATCGACAG-ACTTAGCACAGTTTGGAGTTTACAAATGGGTTTTCGATAT-GAATTACCAAAG---AAACCATAAACATAATGCACATTAATCCGATCGATTCGATCG-TTATTGTGTTCCAGTAAGAAATTTCT
>HDAC4 13096817 13098918|16795 chrX 13098665 13098994 scaffold_37 917554 917807 - 5180|0 253
AAGGCGATGCAGACGTATATTGCGGAAGAGGAGGCGGTGGGCGTGGCGAGGTTTTTGTGGACCTGGTAGAGTGGGAATGGCAGGAGGGGGCGTGGCCGCAAGCTGCTCAATGCACATTTAGTTATTTGTTGTAGTTGAATTGATTGTTGTTGCTGTTGTTGTTGTGGCGCTCGCTTGCAATTGTTGTCGTTGTCATTGATCGTCTATAGCCACATCTATCTCTCTCACTCGATCGATTATAGCATCCCAATTCC
ACGTCCGCGTCGTCGTC-----------------------------------------------------------------------GCCGTCGCCGTCGCCTGCTCAACGCAC-TCTAGTTA-TTGTTGTAGTTAAAAATGTTGTTGTT--TATTGTTGTTGATGTCATTTGTTGTCGTCGTTGTTGTTGTTGTTGTT--GTTGTCGTCACGCAAACGTTTGTCAGTTCCTCGTCTCTCGCGTGACACTCTC
>CG1764 13128406 13128907|16836 chrX 13128873 13130038 scaffold_25 1297433 1298541 + 43131|0 34
ATCTCTCTGGGAGCCGAGAGGTTCAACCGACCGGA
ATCGAATCTGAATCGAAATTGTTGAATCAATCGTA
>RpS15A 13169709 13169921|16885 chrX 13168563 13170379 scaffold_36 548301 550078 - 26554|1234 1477
-GAAACCAAGTTCGCATCGTAGAGAGTCTGTATGTGCTGCTAAGGAGTTT-GATATGTAGATTGACGTTTTATTTCACCG--ACCATGCAACCAACTATGTACTTTGTGCACAGGAAACAAGGGGCGAAAACGCTGCTACGTTC--ATTCAGAAAACAAACGAC--------------------------GATGAATGTTCACAAAGTTACGCGAAATAAAATGATTGATACATAATAATTTTA
GTAGGACAAGCCAGCAACATCTAAAGCTATTTTGTGTGTGTGGGGAGTTGAAATATGTACA-AGTTGTTTTATTTCCCCGTCGCGATAATATCAAAAAAAAA--------AAAACAAACAAGATAAAAAAA-----ATACGTTCAAATACGAACAATAAATAACTTCAAACATCGTTCAAAGACAACCTGAATGATTCACAACAAGAAAACGCGAAATAAAATGATAAATACATAAT--TTTTA
>Rbp1-like 13214626 13214892|16925 chrX 13214278 13215065 scaffold_28 517537 518513 + 3923|414 777
ATGAGAAGAGTAGTAGT--GGGATGCAGCCC--AAAACTGGACTCCACA---------ACACACACATATATATAGATATATATATATATTATACATATACAGAGATATATACATA-----------AAGTAGTAC---------GGCCCCAGAGTTGAGGACAAAAAGGA--------------------------------------TCTGTTTTGCCAGACGAAAAATGGCTCAACAGATTTCTG-------AAGTTTGACTCAATAAATTCGTCCCCCTCCAT------------------ATAATAACCCCCCCCCCCCCACAGAGAA-CAAAACCAAAAAACAAAAAAAAAAAAGGTA
GTG----GAGCCGCAATCAGCGCAGCAGCTCATAAGACAGTTCTTCACATAACCACCCGCACAGACACAAATACAGACAGACACAC---CTACACACACACACACACACACTCACACTCACACACACAACTAGTACATGTGTAAAGGCGCCGCGAGTGTGGCCATAAAAAAAAAATAATAATAAAAATTTCCTATTACAGCCAGTTTTTTTTTTTTTTTCGGATTATATATATGCGTGTATATATATATATATATAAGTATATATATATATATGCATATATGTGTACAATTGTGAATTTCGGACGACAAAAGCAGCTCCTCACAAACAAACAAGAAAAACCAAATAAAAAAAAGTAAAAAAGAA
>CG32634 13215668 13216259|16928 chrX 13215742 13215936 scaffold_28 519294 519479 + 847|0 198
CAACAATCGACCAAAGCACCAGCAGCATCAGCAGTTCAGGGCAGGGCAGAATCTTCTTCAAGCTCGCAACTTCACAGCGCGGATGGTAGGAGCTGCACCGCCACCACCACCAA--ACCACAACCACCAAC--CTGATCCTCTCTTGCTGCTAACTGATGCTTCCCCACCAACTGCTTCTTCATACGACCTACGTTCTTC
CAACAACAAGAAAAAGTAACAACAACAGTTAGACTAAAAAGAAAGAAACAAAGTACCGCACAC----------ACAGCAGAGGCAGCAGCAGCAGCAGCAGAAACAGCAGCAACAACAACAACTGCGGACGATCTACCCACTCTT-CAGCT--CTTCAGCCCTCTCTTCAGCTGCTGCGTTTTGAGCCGCGCTCTCTTC
>CG32634 13215668 13216259|16929 chrX 13215937 13216134 scaffold_498 4156 4388 + 858|0 233
TCGTAATTGTAATTATGGTTGTTTTTTTTTTTACCTTTTGTTCTTGCATCCTAACATCTACTGAGATAATCTTGTTCGCGCTAATTGTCTGCTCTCTGTGTGT----------AATATACAAGTAT------------------ATTGTGTAAATGTGTG--------TTTATATGCATTGATCCGATCAGCTCGAACTCACAGTCAGACAGTTCACCAACAAAACGACCCCAC
TAGTCATTAAATTTGTGACCATTTTTTTTTTTTTTTTTTGTTTTCTCATGTCGATATAAATAATGAGCTGCCGGCAGCTCCCGTTTGTGTG-TGTCTGTGTGTGGGGCGGGTCAATTTGCAAACATTGTCCAAGTTATTTGGGCAGCGCTTAAAAGTCTGCCAACATTTATATATTTATTTACTCGAACGGCATTTGTTTCCAACTCGGTTACAAGCCATCAAAGCCATAACAC
>Yippee 13219840 13220280|16933 chrX 13219067 13219862 scaffold_28 523342 524111 + 17714|807 830
TAATCGAATAGTAGATAATAATC-
TATTTAATTGCTAGATAAGGACCC
>Yippee 13219840 13220280|16934 chrX 13219974 13221128 scaffold_28 524616 525751 + 24483|0 342
GC-CGATTGAATATACAGCCGGAAAACGGGAACCACGCATTGGCGAACCTTGTGTAGCCCTAAGTATTGAGTAGATGGCCACAGGCGATGGCCTCTAT-GCAT-TAGACCTAGATTAGAGATCGCCGTAGTC---------------GGCTCCGGTGTTCGGGATACCGAAGACCGATATATCGGT-TGCACATC---------------CGCCACGGAGCACATGCGACTACGGCCCTGTCTTAACGTGACTTAAACGTAATTGTAGGCACATCTAGCACGTAAGCAGCT--GCGGCGCCCAATTCTACCATTTAAATGTCATGAGGCTGAAGTGCTAAAAC
ACACAACTGAGCGT----------AGCTGCAGCTCCAGGCCAATAAAGCGTGTGTAGCCCTAAGTATTGAATAGCAAGCCGCAGGCGATGGCTTCTATAGCATATGTAATAATGTAACCGATCACCGTGGTCCTTGCATCGACAACTGGCT--AGTGTGTGTGACTGTGTGTGCGTGTCTGTGTGTGTGTGTAGCTAGATATTATCATGTCGAGATCGTTAACGTGTAATTACAGCCCC-TGTCAGCGTTACTTAAACGTAGTTTTAGGCA---TTAGCACATAAGCAACTGCGCGGCGCCCAATTCTAAAAATAATAT-TTATGAGGCTGATCTGCTAAAAC
>CG1998 13243307 13243535|16954 chrX 13243209 13243333 scaffold_3 441124 441262 - 1386|120 146
CGAGTCGAATAAAGCGTAAATGTAAAT
CTAATCGCAGCACAAGCAAATGTTAAT
>CG12726 13290650 13290890|17017 chrX 13290443 13291355 scaffold_10 1081577 1082480 - 9801|225 473
AGAACA---GCCCGATATA----GACAATCCAGTTGCTATTGCCCAGGTGCTGATCTCGCGCCACGATTGCCGTGGCCAGGAGGACGGAACCTTCCTCGCCGACGTGCGTCACTGTCGCCGCTACTACGTGTGCAACCGTCAGAGGTCGAAGCGCCAGAACTGCCCCAACGGCTACTGGTTCGATCGCGAGCTGAAGGCCTGCCGACTGGCCAGTACCGTCAACAACTGTGACGCCAGGCGCAACT-GA
ACAATGTTTGCCCCGAATGCCCGAATAATCAAGAAGAG---GCTAAGTCCCTGGTCACAATTCGTGACTGCCGTGGCTTGGAGGATGGCACGCTCTTAACAGATACCAGGCACTGCCGTCGGTACTACGTGTGCCGCAATAGCCGTGCAAGACGACAGGCCTGTCCATCTGGCCAATGGTTTGATCGCACCGCCAAGGTCTGCCTCAGTCGCTTTAAGGTGACCAACTGCTTGGCTGGCCGTAACTAAA
>up 13427506 13427730|17219 chrX 13427435 13427550 scaffold_28 1783642 1783753 + 1889|73 120
AAATGTAAGATT---TCTTTTAAAATAAAACATCAAAACCAACACCAA
AAATGTACAATTAATTCGTTTAT---------TTATAACAAGCACATA
>up 13427506 13427730|17220 chrX 13427551 13429571 scaffold_10 3767125 3769206 + 75086|0 198
ACCAATCCACACTCTGGGCCCGCCCTCGCGCACCACTTTCCTTCACCACTTTTCGTAAAAACAAACACTACATTTAAATACCAAAGCCAAACAATTTTAATAAAAGTAAATGAATGAACTAAGTAGTTAACAACTTGCTATTCAAAATC------AAAAACTCAACAT-------------CTTTTTTATTGAATCGAG
ATAAATAAA----------------------------TTTTTTCGTAAAACTACATTTAAACAAAACCAAACAAGAAAAACCAAAGCC-AACAATTTTAATAAAAGTAAAAGAATGAACTAAATAGTTATTATTAGCTTATTCAAAATACTCAAGAAGAAGCAAACATGAAAACTACCACATTTTTTTATTGAA-CAAG
>CG9938 13443602 13443682|17237 chrX 13443498 13443701 scaffold_10 3785522 3785749 + -195|114 214
TTTGA------------TCCGGATGTTT----TGTTGTAGTCCAGTTGATC-TGTAAGGAATTTATTAAAGAGTATTCTTTGT---TTTCAAATTAAAAAA
TTTAAAATAAGCACTACTTCAAGTTTTTCCTATGATGTCTTAGATTTGATCATGGAAATGGATAGTAAAAATATATTTTCGATAAACATCAACTGTTAAAT
>tth 13447128 13448374|17240 chrX 13446999 13447723 scaffold_5 1998912 1999898 - -301|224 1008
TGCATTATATTGTACATTATATATATGGGTGTACAGACATTATATACATATATATATATATA---CATACTTGCATGCATTGTATTTGCGACTCTACTTAAGGCAAGTCCACCTTTTGGACTGGC-TCTCCACCTAATCGCAATCTCTCGGTTTCTGTTGCTGCATGTTCTTAATACTATTTCACCTAGCTCCCCACCCCTCCCCACATATTATATTCAATTTTT---TTTATT----TAAC--------------------------CAAAATTTTAGTT---------------------------AAAAAAGAGACAATTC---AGATTGTAATCTATTTA-GGCAAGTGGTAGGGTATCTCT-----------------AGCATTAGAAGAAGCTAAAAGTAAAAACAATTTCGTAAAACCAAAATTTTTTC------TCTAGGATCATAATT---ATTAAGCTGAGCTAAAAACGAAAACAAA--------TTTTAACTAACTAAGAAGGG-------ACAAAATTGAAA------TAAGATCAAAAAAGGAAAACATGTACATTTTGGAAGAAAAATCAAAGTCCA-------------CAAAATTTTAACGAATGAGAGGCAAAAAATCAGACAAAAATGAACCACAAGA---GAATGAA-AAAAAAAAACAAA----AATGGAAATA---------------------------------------------GGTTTCTAAGATGTTTTAATATATTT--------TGTAATAACAA
TACACATTAATATATAGAATATACATAGGTATAT-----TTATATATATATATATATATATAAAGCAACTTTACTTAAACTAAAATGAACGCTGCGGCCAAATCAATCGCAATCTTCAAACGGTCATATTCAATTAATTT---TCTTTCAATCTTGATTTGTGCTCTTTTTTTTTGTTGTTT----TTTCTCTTTAATTTAATTTAAATGTTAAGTTGAAATTTTAAATTCATTGGCGTAATGTATTCTTAGGCAGTGTGGTAGGGTTTAGGGTTTCAGTCCAGTCCAGCGCAAAAAAAAAAAAAGAAAAGAAAAAAACAATTTCGTAAACCAAAATTTTTCTATAGGAATAAATAGTACATTTCTTAAGGAGGCGAGCTGAAAACAAAAGAAAAAGAGAGAAGAAAAAAAAAAGAAGAAAAACTGTGTACATTTTGAAAAATCAAAGACAAAAATTCTAATAAAATTGAA--AAGAAAGAAAACAAAAATCATAATTTTACACACCTTTGGAAGGCTTTTATACAAATTTTTGAAGTTTTTTAGATCTGGACT---ATACATGTTTATTGTATGTACATAAACAGTGTACATTACACTAGCAATCAAAACTTGGCTGAAAAAAAAACTAAA---TAAATAAAAATTAAAAATAAAATTTGTATGAAGAAAAAAAAACAAAAACAAATACAAATAATATTTATGTATATAAAACTCGTAATTATAAAGCAATTTTCAACCGATCTCTATATTGTTTTG-TCTATTCGAATCCCACATACAAACAT
>tth 13447128 13448374|17241 chrX 13448037 13449367 scaffold_5 1999902 2001175 - 36685|0 407
CCGCTCTATCAGC-----------------------------------------------------AACTAACTGGACGTGTAATCAATCAAAGCCTTGTTTTTCGCAATGTTTTCTCGCCTATTGAATCGACCTACTTTTT----CGCACATAATTTAAATATAGTTTTTAAGCCTTAGTTGATCACTGTTTGTTGCCCCCCTCCGACAAAAGGATAAAAGCCAAGCAAGAAATGAAAGAAAGGAAACAAATACATTGTGGACCAGGGACAGAAACAGGATTAGAATCAGGAT--AACGATCAGAACCGCGCACCAG--GCCGTAGCCAA--TACAATTCCAATG-------TTTCGCCTCTCTTAACTTTACGTTCCCATAGCCAATTGATTGTTGTTTTTTAAAC
CGCTAGGATCAGCCCATGGTGGCCCATAGATGGCATTTTGCATGGACCACATTCACCCACTACCCAAACTACCTATCAGTCTATCTACTTA----TCTGTTTATTGAATTCGTTTCCTAAACGGTGATT---ACTATTTTTTTCAACATATGTAATTTAAAGTTAG--TTTAAGGCTTAGTTTATTA--GTTCCTTATTCGAGTCCAGCACCTGAACCGACCCGATCC---------------------------------GACCAG--------ACCAGACT--AACCAGGACGAAACCACCAAAAACACATCCGAGCAGGCGTAGCTAAATTTGTATTCTACTGGTAACTCTGTCGCCTATC-TAATTGTACGTTCCCATAGCCAATTGATTGTTGATAATCTAAC
>CG2691 13453277 13453499|17246 chrX 13453202 13458309 scaffold_5 4821988 4827255 - 187082|81 335
GGCA-GACGATTCAAGCCAACTGGCTAACAGGCTCGT-AAAGCTATAGAGATATAG-AGATGTATAATAACACTGGGATAGTGCGGTCTGTTGATAAGGAAGCTAAGACGTTGATGATTATT----TCCCCTGTTACTTTGCTTAAATATATAAATATAACTTAATATAT---ATATATGAA------------CATGTGGAGACGT------TGTAAATGCCACAGATAAA---GAAAAACAGAAACAGA-ATA
CGCGCGGCGGCGGTAGCAAGC--GTGGACGTGTTGGCAAAAGCTACAAGTAGACGGTAAACAGCTAACAAAACT--------------TGATCATAAAGATAC-----CTTGAATAATTTGTATAATCTGCTGTTATTTTGCTTAACTATATACATAAAA--TGATATATGAAATGTATAGATTAGCCCTTTATCGTCTGGGAATGCGGGGTGTGTGAA-GCGACGGAAAGAACTGCAGCACAGCGTCTGATATA
>Lig4 13498515 13498732|17307 chrX 13497680 13498676 scaffold_5 1863749 1864854 + -2961|1016 1177
TATAAAATTGTTGTTTCATTGACATTTTTCTTACCATAAAAAGCTTTAAACAGAAGTCATTCCGAATTTAATGTTATATCAAAAAGATTTTCATGGATAATTTGCTTCAATAAAGTGAAACATAGAATAACAATAGTAGAATGACAATAAGTACGCAAAAAA
TGTAGATTTGTT-TTTATTTTTCATTTTTCACAT------ACACATCAAGAAGACGAGTTTCGAGGTTTGGTTTAGAAACGGAAAGATA--CAGCAAATATATATATTTATATATATATATATAAAAAAAAAA----AAAAAAACAAAACAAAAGCACACAA
>Lig4 13498515 13498732|17308 chrX 13498677 13501083 scaffold_5 1865341 1867826 + 74763|0 58
CTCAATGAGTTT---TTCACGCTTTATAGTTTTGTACAAAAATTACCTGTTATCCTTGT
-CCGCCGAGTTTCTGTTTAAATTCTAGTTGGCTGGGCAGCAATTGCCTGGCATATTTGT
>CG12177 13511836 13512306|17321 chrX 13511819 13512177 scaffold_1 3614317 3614701 + -390|17 398
GCACAACACGATCCATAGAGCAGTTCCGAGATGGCACCAACCTAATCGGAATTTAAGCTTTAAACACTTAATCGGTGATTAAGCGTAAGGTTGCAAAATTGGCTAGCTACCCAAATGGGTTTGGAAGAGCTTTTATTGTTAATTG------------------AATTAAAATGTTGTAATATTTTTAAGGCTTTAGTTTGTGCTATTTCATTTTTAAGT----GTATTTTGTATAAGTCAAATAC--AAGTCAAGAATGTGCTCAATCACTATGGCTTATGATAGTAACTTTCAATTAATGAACAATTAGA-----------AGTAATACA-ATTTCTATGTAAGATTATACACAATAAAAATTCCTTTTTTTATCCC----
GTAGAAGATACTCTGCAGACAGGTCTAGAGCAGCCATAAGCACATTC---ACTTTGTCTGCAAGCTCTCCTACAACAAATAAAAACAAATATTCTTAAATA-TTGTTTACCCAA-----TTATTATGCGCTTTTAATGATAGTTATAAAATATCTTCATGTATACTTAAAATATGTGAGCATTTTGGAAACTT--GTAGACACTTCTTC--TGTGAAGTCCCTGCAGATGGAAGATGTCCAGAAGTGAGGTGTGGAGTAGCGCCATTCACAATCACTTATACT-TTAATTTTCTTTCAAATATTAGTTTTGTTATTTATCCGATTAATATACACTTTTACAGATAGTTATATATTGTATATACAACCTTTTTTAACCATTTA
>CG9940 13518490 13519745|17329 chrX 13518540 13519698 scaffold_1 3619065 3620178 + -2010|0 1275
ATTTTTTTTTAGCACAGCTTAATGACCTTTTGCTGCCACTTGAAATTTGTTGCAATTAGGTATCGGCTATCTTTTGCAACTATGTGCCTTCTATTGCTCGTAAAAGTGTTTCCTTAAAAATATCAGTCCTGTTCTAGTTACATATATGGTCATTAAATAAATTTACCTACAAAGAAAATCCTAAACTTAATTAGTATGTGCTTATCCGTTTAATTGTTGATAGTTTTATACAAACCTTTGTAATTTACATGATATTTCTGTTTAATCTGTTTAAAATGCAATCTATAACTGCTATTAAGACTACTATTACAAATTTGTCATATCTAGCAATTGGGAGTATGAATAGTAGCTTTACTATGCGGCAGCAAAAGGCATTATCCTGTACGTATACAGAATTGGAATGAATACATATGCGTAGGCCTAGGCGTAGAGATTCATATTTTGT----TCAGATCCTTTTCTAGGTAGTCAGCCTTTGTAGAGTCCTTTGCAGTTTGCCTTATCTAAAAGTGATTAATCTTGTCTAATGCTCAAGCTAAA-------CTAACTGGACAAACAGTTC------------GTCCGCCTGTCCAAACAATTTGTACAACAATCTTATTAAAGTATCAATTAGGCGATCCTTCATCCACACATATAATCGTATAAATCATCTGAATTTACATATTAAAGATATTACTTGTTGTGTTATTGGTTGTGTACGGTGCGGCTTAAACTGACATTAATAAACTGATTGTTTTACCTGATTTTTTAAGACATCAAATTATTTATAATGATCAAATATATACACACCGTATTTA---------------AAAATTATCAATTATATGTAACCCAATTGGGGGAAAAAATACTTTAATGTTTTAATGTTCCAAAAGTTGCACTTTTAAAAACGCACTGT------ATGTTTATTAATAAGATGAATTT--------GTTGATCATAAGACA-------------------------ATTTCTCAATCCTAA--------------------TGCAAACCATATTATACAAAAC----------CAATTAGGAAGGTCAATTATACA----CATATGTTGT-----GGGCAATTTAAGCCCGAGAAAAACATTACAACTATTCGCTTAAAATTTCCTATAAGCATCTAAACCATTTGAAAAAAAATTCTAGCAAAAACTTACTATAGC-TAAACTTTTGTTGATTTAACATATTGCACCCATAAGAGCAATTCAAATTGTATTTCCTTTCTGAATTGT
ATTTATTTTTAAGAAAATTAAAATACATTTCATTTTACATTGAAA--------------ATATGTGGTATCTTTCAAGGCTAAAT---TTCTATTAC--AACAAAATGTTGTGTTAAATAGATGCAGCCGATCATTTTGACCAACTTGCTCATTAAAAATTAATACCCTCACTGATAG--------------AGTATATAAATATATATAAAAAAAAATATTATCTCAGAAAAG----TGGAAAGAAAA-GCTATTTGCATTTTATTTGCTT----TGTAATTTGATGCT-------------CGATTGCC--TTTTTAGTGTGTAATGAGCAGGGCAGTAAATG--CGTTTTATTTTGTCGCAGCTGAACGCCGACGCAGGTGCTTAT--------GGTGGGAATAC----TCGATACTCTATTTGTGGGAATTAGTTTTGTGTAGAAGCAAAATGCTTACTAACATATTCCCATTTGTTAAGGGCTATTAGTTTTTATGTGCTTGAAAATAAATA-CGTAAATAAATACTCTAAACAAGATGCGTCTTGACCAAATTAATATTTTTTGCATATTTTGGTTTTTCGTTTAAAGAAGTTTATCTGAGTGCTTTATTTAAATATTTAT------ATACTTTA-------ATTTAATTAAATAAAT--TCGAAGCTTTAAAATTAAAGTTC---------------------------------GCTCACAA----ATTAATAATTTTATAGTTTTAATTGAAGTCTTAGGACAATAAACCAATTTATATTTTCTAAGAAATAAAAAAAGTATATAATGAAGTAATCATGGAAAAATATTAAATATCTTT-----ACTTAAAGTAAATAAGCTGCTGATATATAGCTTATGCAAAAA-CATATAATTCACCAGGCGTTGTGCCATAAATTTTAATAGAAAGATAAATTTTCTTAAAAGTTTATCCTAAAATGCATTTAAATAAAATTTCCGAAAAATATTTTATAATCCTAAATTTGGAGTCAGCATAAAATTACTAATTGCTTTATTAAAAGATAGTACAATGCAGTCATAAAGCTTACCTATACATATGCATATATTTTTCAAGGTGCGATTCAA----GAGAGGAATGTTAAATATATATTCTCAATATTTTCAACCA-CAGCCAAGTCAT--------AAATTGTGTTAAATACTTATAATAATATATAGCTTTATTCA------------CACCCA-------AATTTGTCTTGTGTTGCTTTTTCTCATTGT
>CG9941 13552671 13553112|17365 chrX 13553111 13554296 scaffold_60 316531 317731 + 27726|0 1
AG
AG
>g 13561140 13561968|17368 chrX 13559439 13561636 scaffold_10 601314 603549 - 29843|1827 2395
TGTAAAATGCCGCCAGTCTGCCAATTGCGGCTTAAAACATGAAGAAAGCTGCAAAAAATCGAAAATGAATATGAGAAACAGATCAACT--------GGCAACCAGAATGCCA-------------TGCGATGCAGATCGATTCCTGGATACTATCTATTTTTGATGAATTTGTTGC----CTAGAGCATGAGATTCCACTAATAAACAAAAACAAAAAAAAACACACCCA-CAAACACAGACAATTATAT-------AGCTATAGTTATAT---AAAAT-----------GGAATTTTATAATGAATCCCACACA-GAGAATAGAACAAACAGCATG---GATTGTAAAAACAAAT-TATATATGTATACATGTGAAGCCGTATGAA----------TCAAATATAAAGTACTGCTATACAACATAATTACTAAAAAAAACAAAAAC----AAAAACTGAAGCTAAGTGAAATTATACATACATACATGCATATTAT------ATACAAACACACACACAAGCCCACATACAAATATATAAACGTTAAATAAATGAAAAGTACAATACA
TGAAAATCAACTTAATATTCCTTATTGTG---TAACACAAAATAAAAACTTAAAACAACCAAAA--TAATACAAGAGAAGTGTCAACTCTTTCAATTGAAATTATAATGTAAAGAAGTCTCCTTGTGCAAAACAGA------CTCAAAAATTATAAATTTCT------TTTGTGACACATCTTGTATATCGTATTCCAAATATTTGCAAATTCTTTTAAAATTACATTTGGTAATTACAAATTCGTATTTTGAAACAAACTAAAGTAATATTTTAAAATTTGAGCACTCTGCAATAATATAGTTGTTTTTGAAAACGTTAATGGACTATAAAGCAAGCCAAATCTGCAAAACATATGCCTTTACGTACTCAAGAAACTCCATAGAATAGATTGGAATTCAAAAATAATGTAATTCAAAACACAATCATGTTTGGCAACAACTCTTATTTTTGCCAATCGATTGTAGTTACCAGTGTATGTCCATAAAGGCGGATCATTCCAAGGTCGAAATGAATATACCGAGCAATTTCAATAATAATAATTTGTTAAAACTTTAAAAGTAC------
>g 13561140 13561968|17369 chrX 13561637 13562773 scaffold_401 1556 2683 + 17484|0 340
TTGCTAAGCTCCAAGTTCCACTAATCTAATTAATCATTATTACGATTGTTTTTTGTGTCGATTGATTATTAAGCCTTTATTCGGAAATTTTGTGAGAGGCGAAGCTAGCTTCAGAATCTCTCCATTTTCGTTAAGTTGAAACAATTGC--CTCCTAAGAGAATGAAAAAAACCTAAA--AAAATTATCGCTGCGATATAAAAAACAAACAAAACCAACATTGAACAAATTGATATGCTAAAAA-----ATAAATCCACATAAACCGTATATATATATATATATATATATATATGCATACATATATAAATAATTATTAATATATAGAAGTGTAATTTTAAAA
GTACTAAA-------------TAATGGAATAGAAC------ACGCATCTTCATCA------------ATGGAGCC---ATTCACAATTTCCATGCAATATGCA--TAG-TTAAGAACTTTGCCA------TTAAGTTTGAATAATGCCTACTCCTAAT------------TCCTACGTCTAAATTATCGCTGCGATAT-AAAAACAAGTTGAACAAATTTAAAACAA------GTGCTAGTAATATTTGTGGAGCAACAAAAAGAAAAAAAAAACAAAAAAACAAA---------AAACACATGAAGAAAATTATGAACAAAAAGAA----AATATAAAAA
>CG10990 13580605 13580712|17388 chrX 13579609 13580962 scaffold_5 764619 766119 + 5753|1209 1331
ATCATAGGGA-------------CAACGGGGACGTTATATGCTGCACATGCTTATATGACCACTGCCCCCAGCCACCCAATGACAACTAGAGGAGCAACAAGA--GAGAAGCAAACATTAAAC
GGAGCGAGGATTGATTGATTCCGCAGCAGCAACA--ACAAAAAGCAAATGAAAACAAAACAAAGAGACACAACAACAATATCACA---AAAGCTACAACAACACCGAGAAGCGTGCGAGCAAC
>CG32625 13590096 13590194|17405 chrX 13590030 13590170 scaffold_2 5068236 5068381 - 641|73 149
CATAC-ATCATATGAATACATACATATACATATACA-ACATACATACAAATAAACATATTTCATACATTTCGAAAAA
CATTTTATTCTATACACACATGCATACACACACACACACGCACACGCACGCACACAGCTTCACGAAATGT----AAA
>CG32625 13590096 13590194|17406 chrX 13590171 13590971 scaffold_5 775665 776458 + 4504|0 23
TCTATGAACATACTTACTTACTTA
AGTATGAAGATAATTATTAATGTA
>CG10992 13613955 13614113|17434 chrX 13613967 13614594 scaffold_5 2013341 2013947 + 26757|0 147
ATGTTATATGTATTCCGGCATCAAGCTGATATATCAAAACCCCTCTATTTTCTATCATCCCTCCTTTTATTTTCATTCCGATTCGCAACTGACGTTTGTAGTTAATGTAAACAACCTAAACCTGATTGAT-AATAAAGTATTGTATAT
GCGCTCCAAATGTTA-----------------ACCAATTGCCTACTATTTTGCCTATTCGTT--TTAAATGATAATACACGTTTTCAATACAGTTATATCGTATGTGTAAACAAGTAGCAACGACTTAGTAAATAAATAATAATAAAT
>Clic 13647379 13647664|17471 chrX 13646707 13647948 scaffold_5 5292257 5293575 + 27736|775 1129
GTTTCCTATGGAGCAGATCCATGCAGCCACACCACACATCAACTAATAGTATA----------------CAGCAATCGCAACCACAATATTTTGGACAATTTTACAACAGCAGCAACT----CTGAGGACTATAC-----ATAGATGTATACTTA---ACGGATATAACTACCCATGCATATAT---TATATATAAATATATATATAAACCT----------------ACTATATATAACAAG----CATAACAA-----------------CAAGTGTTCTTTAAGCAGCCG-CGTTGCCTTTCTTCAGCTATGCTTAATTTAAACCCCATTTGGAAAAAAAAAAAAAGAAACA
ACT--------------TTTATGTAGCCA---TGCACAGTTATTATTATTATAATTTTTTTTTTTTTTGCAAAACTTACAACTTTATCTATATCAGCTACTATATA--AACTACAACTTTGATTGAGAACTATGCGAAAAGTAAGGGAATACCAATATATGCATATATATATATACACATATATAGATATATATATATATGTATGTGCATATGTATAGTACACATATAACTATATATCTTATGTATACATAAAAACGCGAGAACATGTTGACCAAGTGTTTTTTAAGCAGCCACCGTTGCCTTTCTTTA---------AATTTAAATATTGTATTTAAACAA-------------
>CG11063 13660259 13660406|17485 chrX 13660235 13660326 scaffold_5 5303109 5303204 + 2034|24 95
AACAAACTATCGCAATCAACTTATTCCAATTAACAATATTATCTTAAATAGACAGAAGTGAAA----ACAAA
AGGAAAACAACACATTTCCATTTTTTAAATAACCGATATATTCTCAAATAAACAAAAACTAAATTCCATAAA
>CG11063 13660259 13660406|17486 chrX 13660402 13660665 scaffold_5 5303290 5303553 + 19464|0 4
GCGGA
GCTGA
>CG32626 13664683 13664857|17493 chrX 13664302 13664811 scaffold_5 5307082 5307632 + 1218|431 597
TATGCTAACTTAATGCAAATTACGCAGATATATACGC---------TAGTTATATACATA-----------ATTTAAATGTTTCTGT--ACTAACCAA-AATGTAAACGCGGCAGACCAAAACCTT---------------TAAATATACAAAACTTGTACACGAAA
TATGCAATCTAGATACTTGCTTCTTATATACATTAACATTTATTTGTACCTATACACATATGCGTACTTCGATGTGAATGTTTTTCTCAACTAATCAATTATATTAACCCGACAGACCAAAATTCTACATACTCACATGAGTAGATGTAACAAACTTATATACAGGG
>CG32626 13664683 13664857|17494 chrX 13664835 13666111 scaffold_5 5307654 5308940 + 66921|0 22
TCTGGTCCATGCGGTACATCTGC
--AGAGCAAAGCGGTCGATTTAT
>CG32611 13703319 13703319|17539 chrX 13701629 13703771 scaffold_5 5351783 5354371 + 32666|2158 2158
T
T
>CG32613 13784259 13785034|17672 chrX 13784163 13784778 scaffold_0 681604 682242 - -456|96 685
GAAAATGCTAAGATATCAAATCTAAATATATAACTTCTTTTTGAGTTTTAAAATGATTGTTA-TTCTATTTCTATGTCAC----ACAATATTTGTAAAATATATATATATATAT-------ATGGATGTTTAAGTTTTTTGCTTTCATAAAAGTATGCTTTAGTTTTCTGTCATATTTTAAACTGATCTCTATACAGTTTAAGATTATGTGTGTTAA-ATTTTAAAATATTGATTTGTAGAAAATTAGTTTC-CTTAATTGTTTGGGGACTTG--ATTACTCCA---AAGTACATTT----------------------AACCATTAAAGGTTGGATAAAAGTGATTTTATCAATAAAATTG----CCTAAA----TGCCAGGTTGTTTC------ATACCTTTAGTTCCCTTAAACGAA---CTCATCCCCAACGGAATTATTGAAAT-TACCATTTTAACTGATGGATGTGGATAACCCGA-----------GGCGGCAGATGCCGATAAAGGTGAATACAAACAGGCAACAAGCAGTCAACACGAAACGAATCAAAGGATCAAGGAAAAACCAAAAAAAAAAAAAAA
GAAAAAATTACTTTCTTTAATCTGATTAACTAACAGCATTATTACCTACAAATTTTTAACAAATTTCATTTTCCTGTCACTCCTATAATAATTGCTTAATCAAATTAGAAACACTCTTTTAACGGATTGAAAAAACATTTTTTTT---AAAGGCATTTTAGAATTTTTT-TTAGGTATGAAATTGTTCTCTATATGAGATAAAATAATGCTTGTTGGCGCTTTAATACAGTATTTACCATCAGATGGGTCTAGTTTTATTGACTAAGGTTTTGCTATTGAGCAATGGAAATACATTTCTGGCTCTCAATCATCTTCCTCAACTGGTTAAGCATTTCTTGGCACATTTTGATTAACATATTTGAAGTCCTTAATCACTGTCAGCCTGTCTCCTAGAGATACGTGTATATCTCATCTGTGGAAGTCAAATCTCCAAT-AAACTGTCAAGATGTGCCAAATCAGCTCAAATAGTTTTAACACCCGAACTGTGTGAGTAGCCACAGCTTCTGTTGGGGCGGACTA-ATAGATACATGATGCA--TGGCATGAGGCCTTTCAA-----------------AACAAGAAATGAAAA
>CG32613 13784259 13785034|17673 chrX 13784824 13785290 scaffold_5 5453383 5453982 + 8966|0 279
ACAACATCCAAGACGTC-AAAATCTGTGGTTCTT-CTGGAAGATTTGGATTTGCGCGGGTGTGGT--------TTTTCGCTATGCTGCAGTCCGTTC---------TTCCTGTTCGTCTGCCTGTTTCA--AATCGAAATAGGTGGTATATGTATGTGTGGAAACAA---GAAGAGCAGCG-------------------------------ATCTCTTTGATCT--------------TGATAAGCAAATCAAAGTGGAGCACAAGAAGAATTGCCAGC
ACAATTTCC-AGACGTCAAAAATCTATTGTTGTTGCCGTTTTTTTTATATTGTTGTTGTTGTTGTGCTTGTTCTTATTCCTATTCT-TAGCCCAGTCGTAGCTGGTTTCTTGGGCCTTTGCCGACTGCGCCAATCGAGGCGCGAAGTGCAACTAGCTAAATAAATAAAGCAAAAATTAGTGTCTGCCCGAAGGTGATTAATTTTTATGTTGAATCTATTTGCCATTGCATAGATCCCACTGATAATCATATCAAAGTGGAGCATGAGAAGCG-CGCCAGC
>l(1)G0469 14039840 14040253|18024 chrX 14040250 14040847 scaffold_28 1797766 1798340 + 23334|0 3
TAAG
TAAG
>CG11674 14058580 14058644|18045 chrX 14057759 14059737 scaffold_28 1816884 1818923 + 57372|857 921
GATGTAGCAAAAAAACTTGTTAAACTTAAATTAATACATTGAACACACGCTTCACACGGATATTT
GAGAGAGAGAGAGAGAGAAAGAAAAATAAACACACACATTGAA-ATACACATTGCTCTGGGCTTT
>CG33249 14062172 14062243|18047 chrX 14061487 14063227 scaffold_5 1857497 1859380 - 64712|816 916
GAACGCCACTGGGGATATCCG-TTGCCGAGTGTTC-----------CATTGGTGGAGATACCGA-----------------TTTAGATATATCAGCGTAGC
G----CCCCAAAGAGTTTCCGGTTGCAAATTGTTTTTAGGCTAAGTCAAAGCAGGTGACCCCGAGTACTTATGAGAAACATTTATGACATATATATATATA
>CG33248 14066219 14066657|18050 chrX 14065593 14066266 scaffold_5 1864544 1865248 - 26288|685 733
ATGAATTT-ATTCTTGGAATAAACTTTGTTTTGCTAATGAATTTAAACG
ATGAATTTTATTCGAAGAATAAACTTTATTTTGTTTATAAA----AATG
>CG33248 14066219 14066657|18051 chrX 14066637 14067510 scaffold_5 1866161 1867190 - 18996|0 20
CCCAAAAAACCAAATAAGAAA
GCTGGACTCCAATGTTGGAAA
>CG1839 14068343 14068633|18052 chrX 14068267 14068486 scaffold_5 1872686 1872906 - 1350|81 236
TGTTATATATATATATGCTGTTATGAATATGAAACATTTGATATTAAGCTGG------------GCGATTTTTTAATCACTTGAACTAATGCTAAGAATTAGAGAATTATAATACAAAAGTTGCGTATAAATGCACTTGTTTATTGATGAAAATTG
TGTTATATATTTATAAAACGTTTTGAATTTGAAGTTTTGAAGAAAAATCTAGTTAGACTCTAGTTTGGTTCTTTTGTTTTTCGGGCAACTGCTTCGATTCATAG-----TAAGACATTAATTG-----GAATGCTCGACTCGAT---TCAAAACTG
>mRNA-capping-enzyme 14074203 14074254|18060 chrX 14074239 14074463 scaffold_5 6228727 6228940 + 6401|0 15
TCAGAGCGTAATAAAA
T-AAACCATAACAAAA
>CG9400 14122021 14122220|18127 chrX 14122171 14122186 scaffold_5 6342580 6342595 + 741|0 15
CGTGGAGCCCCACCTG
CTTGCAGTCCCGCCTA
>CG9411 14306340 14306735|18246 chrX 14306722 14307263 scaffold_60 77976 78516 + 11421|0 15
TC--AGTCACTAGTTA
GTAGAGTCAATATTTA
>CG9413 14418676 14420302|18308 chrX 14419557 14419711 scaffold_60 268364 268525 - -227|0 164
AATCGATGACACCACCAATCCGTACAGTGCCCACCAAAGTCAACACTCGCCGCAGAGCTTCGAAATATCCTTG-----TTTGTTCTCATTTT-----GGATTTTTCGCTGGCGTTATTTACGAGTTAGCCCCGATCTAGAGATCGGCTGGAATAGCAATATTTAT
AATTTGCGGTAGCTGCCGCAAACACGAGGCCAGCCAAAAC--ACATTTCCTTAATAACTGTTGTGTTTCTTTACCGATTTTGATGACATTTTCAACAGGAGGTCTTATT-GTACTATAGAATAGTTGTGTCTGTTCTAAAATTCAACTGCATTTACATTGTGTCT
>CG9413 14418676 14420302|18309 chrX 14419712 14419954 scaffold_60 181934 182164 + 1061|0 251
CGATACGTACGTACGTTTATACAACAACAAAGCAAATCTATATATATACATATATTTTTGTGTTCTATTAATTAAAGATCAAGACAAATGACAGAAACAACTAAAAAGAAAACACACACCTAAATAGTCGAATATATATCATTGCCAAGCGGCTCGAAGTGCAGGCCC----CATAAATAATACCTATTATTATTAGTATTATCTGGGCATG---ATGGGA--TCTTGAGGTTTGAGTACAGTGCCGCCAGG
CTACGCGCTTGTTTGTTTGTAAAATAA-------AATTT---TATAAAAAAAAGTTCCTTACCTTTACTCAACAGCAACACCCACAAATGACACAATTGACTATCGAGAAAACACTAATTAAAACAGCAGCACAGAAAACAATACAA------TCGCAGTTTTAGTCCTGTTCAAAGAAGATGCGCATGAATG-----AGTGTGTGTACATGTATACGGAAATTCTAGTAATTTGCGGGTAGCGGCCCCAAG
>CG9413 14418676 14420302|18310 chrX 14419985 14420755 scaffold_60 182350 183095 + 24620|0 341
AGGGGATACCCGGCAAGTGCTCAAGATTTCAAACGGGAGGCCAACAAGCTCGGAGAGCGAGAAGCAAATACATTCACTTAATTACTATTACAAACAAGGATATGATATATTAG-GAGTGCAGCATAGACAGGATGCAAAAGGGGGTTGAGAGTGTGTTAGGAGCAACCTATATTG------------ATATACTGACGTTGTCGTTGACAAAGTAGTGCTAGAGTAAT---AAAAACTATTTGAAATAGTCT---TTTTATGCTATGAGCTGGTTATATTCAAAGATTATATGTGAATATACA--GATATTTAGTGTGGAT---ACATACATTTGTATCTTT
-----CTCCCTCCCACGTGCTCAATATGTAAAA----------------------------------------------------TATTGCAAACAAGTGTTTTTAATAGAGGCAAACACAGAATATTTATAATACAGAA---AGTAAAGCAAACATTCACAGATACCTAACTTAAATTTCAAAAATATATGTATATGTAGTCGTTGATAGACAGATATTCCAATTATTTGGCGGACATAATAAAACAGTCTCTATTTTGTGCCACAA--TGTGTGTATTC----ATTATATATAGCTGTACGTCGGTATACAAGGCCCATTGCAACTGTAATTATATCTTT
>NetA 14437940 14438422|18331 chrX 14437927 14438598 scaffold_10 4137826 4138744 + 11924|13 745
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ATGTGCCGTCCACATCTTTGTCACACATTTTGCTGTCAATTTAATTACCTACCTTCAACGATTTTTTTTTTGCTAACCATATGTGTAGATTTTAGAGCTTAAA----ATAAGAATTTAAAAAAAATCAAATCAAAGCGTCGCAACTCCAATGAATTTTGCATAGAAACATAGCCAAGTTTTCGCTTTACTTTGTTTTCGACTCCTATACATGTATATATATATATATATATACATATATACAAATGTATTATTTTTTCTTGTTTTATTTTTTTTTTTTTTGGGCCAAGTTAATTAGCGGTACTTTTATTTGACTAACAGCTGCATTTAATTTGATTTTTTTTTAGCATTTTAAGGCCTACATAGCTATATTTAATTTATTTAATTAACTTTAATTGTTATTTGACTATCAGTGTACGCAAGT----ATTTATATATATATATATAACTATATATGGAATCTATATGATTTGTATTATTTTGCACCATAAGAAAGCTTCTCTCAAGGCCCACTAATTCACAGATACATAAGGTCTGCTATCTATTAACAAACGTGAACAAT-----AACTACAATAGTCTCAAGAAACAAGAAACAGCAATTTAGCCCAATAAGCATTAATATCTATAAGCAACAGAGAATGCAATGTGCAAAAACGTAAATCATATCTTGAATAATGTTTGAAAGTAACGCATAAAACATAAATAAATAGATATTGTACAGTGCAACCCACAA
>NetB 14521532 14525198|18440 chrX 14520673 14521776 scaffold_10 4221912 4222943 + 12451|1005 1256
TAAATGCTAAAAAAAAGGATGGAAATGATTCAACAAAAAAGTGGGAAAAAATGAAAATGAAATGAGAAATTCAATTGTGGCCTCGGTCTGGTCTCGTCGACTGCGGCCGGCTTCATGCCTTCATGCATATTTAAATGAGA-TTTTGCGTTAACTGAATTTTTCACCGGCATTCTGCAGATGGAAATGG-GAGGGGGCGTGGCCAGTCGGAT-----GCGTGGGCGTGCGGCCCTCAAAAGAAAAAAAAAAAA
TAAATGCAAAACAAGAGCAACAAAATAAATAAATAACACA------AAAAATGAAA-------GAGAAATTCAATTGCGGCCTGGACGC--------------------------TGCCTTCATGCATATTTAAATGAGATTTTTGCGTTAACTGAATTTT-----------------GTCAACATGACGAGGGGGCGTGGCCAGCCGGGCAGCCAACGTGGGCGTGCTGCAGCCAGGCGAA----------
>NetB 14521532 14525198|18441 chrX 14521793 14522023 scaffold_15 998601 998870 + 1671|0 269
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TTATCAAAAGATTTTTCTGAATGATCGTACAATTCAAATTGCAAAAATCGTAGTCTTATTAAATTAGTCTCAAATGGGAAGATTACTTTACATTATTACATGTTGTCAACCCGAAAAAAAAACTAATTGCTAGTTTAATTTGTCAATAACATTTTATGAAAAAAATATTGCTTATCACACAATTTTAGCAAAGTTCCGATACATCAAAGATGATTTTTCAATACAAATTATTTCATTTCTTTTTATTAAGTATATTTTGTGTAATCATAC
>NetB 14521532 14525198|18442 chrX 14522121 14522358 scaffold_9 4780211 4780434 + 260|0 239
TCTGCTTCTGGCATCTGGGATGTGGAT-CTGGATCGGGATTCGTATCTGTTTCTGTTTCCCTTGCTGTTACTGTTGCTGTTACTGTTTCACGCTGGCCAACGTGGCGTATGAGTCATGGACACACGTGTGCCCACCGCATACGGATAATCTTTTTTGGAGAGCATGTCCTGGGGCAAAATAAATGCAAAATTGTCAACTGTCAACTGAATAC-ATTTAAGCACACATTTTTATGCAGATG
GTTGCAAGTGTTGTACGTGTTGTTGTTGTTGTTTCGGCGCCAGTGTTCATTAATTTACGCTCGGCAGCGAGTGCTGCAG---------CCCTTTGGAACGCCTTTTGCATAATTGGGCGCCGCACATTTCGCCAGCTCA-------AGTTGCATTTGGACGGCAATTTGCGCGTCAAAATAGTTGTAAAGTGGCCAAGCGTCAATTAAAGCCTGCTTAAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG
>NetB 14521532 14525198|18443 chrX 14522359 14522843 scaffold_10 4223065 4223504 + 8661|0 530
AATTGCAGTTACATTTTTCGATGTTGCT--------------------------GCGGATTAAACATGTTTCGGGCTCAAAAATGTAACATGATATATGACAGCCAAGTGTCGAACTTGATAAATGTTTTAATGAATTTATTTTCGTGTT-TATATGCTGCCAGCCATCCATGAATCGAGATCTTTAGCTGACTTTGCTTCGTTTTTCGTTCAGCTCGATGGCTGGCACGACACCTACTCTCTGCTGGGTCTTTTGTGGCAGTCCAATTTCGATATGTGTCCCCCCAACCATGGCTTCATCAACATCCACATCCACATACACATCCACATATAAATATCCACACAGAGCCATTCACATATTATTCAGGTCCGACCGTGACCATGATGTATGATAAATCAAAATGGGG-----------GCAACATATGCAG-------GGACAGTC-CAGAGTTGGACAGTTAACATGCTGCGGCATTTAAGCCGAGATTTGTGTTCGCATTCACTCTCCGCCCAGGGACGCATAATTAGC
GTTTTCTGTTGTGTTTTTTGTTGTTGCTTTTAACTCTTTTATTTGACTGGGGCCGCGGATTAAACATGTTACAG-CTCAAAA-TGTAACATGATATATGACAGC-AAGTGTCGAACTTGATAAATGCTTTAATGAATTTATTTTCGTGTTCTGCACAAGACTCGCCATTCA-----------CTGTTGCTAACCCCCCCAAGCCTCTCTGCCCCCTCG---------------------CTCCACTG------------------------CATATGCGC-----------TGACTTCGCC----CCCGCGTATTTGTCTGCGTGCTTTTGTCATTTTGCCCCAATGTCCCTTGCCACAGT------TGGCGACCGTGACCATGATATATTATATATCCAACTGGAGCGGCGACCAACTCGACATATGCTGATCAACTGGACGGACGGACAACTGAACAGTTAACATGCTGCTGCTCTTAAGCTGAGATTTGTGT----------GCTGCGCCT-GGGCCGCATAATTAGC
>NetB 14521532 14525198|18444 chrX 14522986 14523216 scaffold_10 4223605 4223791 + 1083|0 234
ACGAACTAT----TACTTCTTTGGAATGTAACAGTAATTTTACACGTTTTCATGAACTGAGTACCCACTGTACCGCTCGATAAGTATCACAGCCAAAAGCAACAAAGCGGCAGACAACATGACGCATATAACACAAATTGAACAGCAGAAACAAACAGAAAAATTCGCCACAAGATGGAACAATTCAAAATTTAACCTGAATATTCAACATAAATTATTGCAAATTAAACATTGA
GCGACCTATGTGGCTGCTCTTTGGCGCACATCAGGCAGTGCTCACTGTAGTATACGATAAG--CCCGACATGCCGCGCGC---GCTTCACAGACAAACA-AACAAGGGACAACACAACACGAAACACGTTACACAAATTAAACA------------AGAAAAA------ATAATATATACATATACAAAAGCT------------------------TCGTAGGCTGAACACTGA
>NetB 14521532 14525198|18445 chrX 14523260 14523967 scaffold_10 4223821 4224382 + 1756|0 710
TTATTTATTTTACTCTAGCAAAGAATATTTTTG-TGTTTTATCCATCTGTCTGTTTCTTTGGGATATATTTACACAACTTACGCAAAAGCATTGCGATTGAAAAATTGCAATATTTTCTTCCAATTTATAACAAATATTTGTGGACTTCAGCTGCAAGGGTATTTAAATTCAGGTTTCGAGTTTCAATTGGTATCATTTCTGGTTTTCCTGCATTTCATGTGCGAGCAGAAAAACGCCTCTCAAGAATTTATGCAAACAGTTTTGGCCGATAATTATGCACATGTTTATTGACTATCTGCTAGTTGATTTTTCACGCGCTTTTGCATACCAATTTGTTTGATGGATGCATCAATAAAAAAAAAAATCAAGGCGGCGAACAGCGGCAAAACA-CGCATTTAAAATACATTTATTTGAATTTAATTTTCAATTTGAATTATGCATGCAAATTGTGAGCGCATCAATACCGGCTCGCTCTGTTTCAAATACAGATACAGTATATGCATCTATATCTATATGTGTCTGAAACTAAAAAATCGAAGGCGTTAAGAGTGAGTTTGAAGGTGTTAAGGTATCGGGGTACCGGTTGTAACTTGTTTTTGGAGCATG-TGTAGGCCACTCTTGAACACTTGAAACTCATCCCGTGCAGCCGCGCGGTACAGTGAAGACAGCCCATAACGGAAATAAACATATATCAAATATAATTTTCAT
TTATTTGTTTTACTCATGTGCTGACTACCCCTAATGTCCTGGCAAATATTTTATTTTTTTA----ATTTTTTTAATATTT--------GTATTTTGATTTGTAT-TTTCAATATATATTTGCCGTTAGTGCT---TCTTTTTCGGCTTTAC---------TGTTTGCCTTCAACGGCAGTTTTATTATTATTATTATTTTTATTT-----------------CGATCTGTA-------TTTATAAAATGTATGCAAACAGTTTTG-CTGTTAATTATGCAGATGTTTATTTCCCATTTGTTGGTTGATTTT-CACGCGCTTTTGCATAACAATTTGTTTGAGG-------------------CAACCGAAGCAGC----AGCAGAAAAAAAGCGTAATAATAATA---------------------------ATAATAAGCAGACGAA---------CAGCAGCAGCGACTGCCGCAGCAGCAGTAAAATTAATTTAAAATACATTTATTTGAATTTAATTTTCAATCTGAATTATGCATGCAAATCAGTAAGCGTTTGAGTGTTTTTCAG-----GGGCACCGGCAGGGGCA-GTTACAGGGGCGTGGCGAAGGGCGTTGAGAAAGACTAGC-----------TGCAGTT-TGTAGTGCTGTGTA---------------------ACATGTTTTTTAGACAATCTCCAT
>NetB 14521532 14525198|18446 chrX 14523968 14524343 scaffold_39 666677 667008 - -255|0 382
ATTTAATTTTCAAATCAATAAAAACTTAGGAAACCTTAAAATTGAATCGAATGATTTTATTTTCAAACTAATCACTGCCAAGCAACTCAAATCTTT-TATGATGGAAAACCGAAGACAAAAATTAGTAA-TCATTGTGCATCTGCTTCGATGTCATTAATAATTAGTATCAAAAATTAGGCATCATTGTCTGAGATTTCAATGTCATA-ATTTTCAAAGGGTTTTAATTAAATATTTTTTAACTTT---TATATTTTGAATACCCCTCACAATGCTTCGCTCTGCCATCCAATCGAAAAATTGATTCAAT-TTTCCATATGTACCAAATTTCTATTTAAATATTTACCATTTTGTTTCGTAGTCCAGCAGTTTTCATGTGCAC
ATTCAATCATCGTATTAATAAAAGTAT--------TTCATTTTAAGT--AAGAACTTTGTAGTGTAACG------TGCTAGACTACAAAATTCCTCCTTTGAT---------AATACAATACTTTGTAACTCAAAATGTAAATGCCAAAATGCAGGGAAGTTTTTGATTTAATAGTGAAATATTACT-TCAGA----------TCATACAGTTTAAAGTGGTATTTAAGAAAAGTGTCTTATTCTTATCTATTTGTTGAATACG--TTGTATTACTATGATTTAAAATATGTT--AAAAACAGATTAAATGTTTGCACTGCTATTTAATATTTA---AGATAGATATCCTTATACTTCATG----CACAATTTT----TGCAC
>NetB 14521532 14525198|18447 chrX 14524344 14524554 scaffold_2 5242963 5243181 + 334|0 237
TTCTCAATACTGGGGGAACTCGGCCA--------AAATAT-----GATCGCCAAGTGAAATTTATTTAAATCATATTCTATACATCAAATTACACTTTTGTTT---TTTTTTTAATCAGATGAAACTTACAAAAGAGCAAAACAA----------GTTCTCAGCCGTTCTCAGTTTCTACTGACTAT-ACATTTTTACATCAATTTATAAAGGTAACACAACTTTTCAATAGGCATTC
TTTGCAATAATCAGGGAAATCAGTTAGTACTGTGAAGTATTCATAGATTATCATGGGGAATTCCAATTAATC-TATCTAATA-ATTGAGTGCTATTAAGGCTTGTACTTATTAAAAAAGGTTAAATTCATTCATTAGCAAAATAATTATTTTTGTGTAACTTGCTGATAGAAATTTCAGCCTATTGTTATATGTATATAACAATATATAAA-----------------ATATGCATCA
>NetB 14521532 14525198|18448 chrX 14524617 14524856 scaffold_10 4224541 4224766 + 3243|0 253
CCAAATGCTAATTACAGTTACGTGCCAATGGGTGGGCCAGTTGGCGTATGGGCATGTGGGCGTGGCCGCGTGTCCTTAACGGTTATGTGCCGGTCATAAAAAA-----CAGTTATAAATTGAAAATAAGTGCGAAAAAGAGCGGTAACATCGCGTGTCGCGATTCTAGACAAGCAAACAAACTGAATTTTGGGTGGCAAATGAACGGGCAATGCAAC--CGGATGGGGTGATGATG-------GACAAACAGGC
CAAAATGCTAATTACAATT---------TAAAGTGGAGAGCCTGCGAGTGTGTCTGTG--------TGCGTGTCCGTAACAGTTTTGAG--GGTCATAAAAAAAAAAACAGTTAAAATTTTGAAACAAGTGCG-AAAAGAGTTGC-ATGCTGCATGTTGCATGTTGAGTGTTGCG-------TGGAGCGTGTGTCGCGCAGTAGGGCGCAGTTTTACATAGAATGGAATTTTGGTGCAGGGTAGACAAACAGGC
>NetB 14521532 14525198|18449 chrX 14525063 14525372 scaffold_10 4225211 4225515 + 21672|0 135
ATCGAACCGGAAACGGAATATGTCAGAGCGGATTTCAATTTCACACACTTGGCTAGGTATCGGTTTTTGTATAAATTGTACAGTTTACTCAAGTTTCTGACCTTCTTCGGCATCATGCTATAAATTAATCAGCCAC
ATCGAACCGGAAACGGAATATGTCAGAGCGGATTTCAATTTCATACACTTGGCTAGGTATCGGTTTTTGTATAAATTGTACAGTTTACTCAAGTTTCTGACCTTTTTCGGCATCATGCT-TTAATTAATCCCCCCC
>CG15890 14591464 14591983|18548 chrX 14591200 14591942 scaffold_17 2030106 2030902 - -2238|285 835
TACATACTCACATTCCGCTGAGGAAATTGGAGA-----TCGAGAGTTGGAGTAATCGGAAAG---------AGTTGGAATTTCTTTTTCGGAATTT--------TTAAAAGTTATTAAATCGATTTAATGTGACATTCTATCCGAGTTTTACAGCAACAAAGTCCAAGAATTTGAACCTACATCCTTAAAATCGAAAATCTTAAACTGATTAGATACATGTTACTATT--------TTAAATTAAAATTCCTGTCTAAGAGCTTTAGACTCGCCTAGATTTTCCGTTTTATTCTCGAACCTTAACCTGTTTCCATTACTATTCACCTAAACA-----ATGTGTACAAT--ATTGTTATTATTATTTTTTT------------ATTTAGACCTAAGTTTAACGAAACATATTTTCGTTTTCGTTGTAATTAT---CGTATCTTACTGCGATATGTTATTTTT--ATGATTTC------------------CTTTTTTTGCTTAGCTGTAAGGAGTGTTAAGATGAATTTAATAAATGTGAAAGTGTCCAAAA
TACATATTCACACATAAATGTTGAAATTAAAAACTTCATTTAAAATTAAAATAAAAATAATGTATTTAACTGGCTGGAAGTAATATTTAAAAAATAAGTTAACATTAGGAATAAATAATTATATGTAGTAAAATAATGTATAAAACTTT------------ATATAATAAGTATAATGTATAACTGCTATTTAGCAATTCTTTATTTTTTGATATTTATTTCATTATTATATTTTTTTGTATTATTTTCCCATTTTTAAAG--TTAAATTTACATA-ATATATAATTTC--TCTTAATATTTATTTTATTTTCATATTTATTTATATAAATTTCTATATTTATTTAATTTATTTTTATATTTATTTATTTTATTTTCTCAACATTCAAGCTTAATTTTAATATTAATTAATTATGTTTGTACTATTTTTATATGTTTGTTTTATTTATATATTTTATTTTCCCATGACTTAAGCTAAAAAAAATTTGAATTTTATTTACATA-CTGTCAGGACTTATCGAGTTTTTAATATACATCTATCAGAATGCAAA-
>Ag5r 14619030 14619248|18577 chrX 14618699 14619159 scaffold_42 397331 397752 - -2127|335 486
CAAAGATT--AACTAAAGCACTGAGATAA-TAGGAGAATCGTATG--TGATTCGAAACTGTTTA---------------TAAAGTTATGCAGCATATCTGTAACATTCCTATTAGTTTTAAAATACAAATA-CGGGATAAAT-TCTAAAAAT
TAAAGACTCGAATTAAAAGATTATGAAAAATAGGATTATGGTAAAATTTATTCACAACTAATTTCGACTAAGACAATATTAAATTCGCACATTAAAACTGAGTCTAGTCTAGTTGATGTACCTTCAAAATAATAAAATATATATATAAAAAT
>Ag5r 14619030 14619248|18578 chrX 14619214 14619245 scaffold_10 4320440 4320474 + 600|0 34
AATAAATAGATGCTACGATCG---GTTCAATTATT
AATAAAAATCTTTTGCAATCATATTTTCACTTGTT
>Ag5r 14619030 14619248|18579 chrX 14619246 14620293 scaffold_10 4317472 4318451 + 34583|0 2
GGC
GGC
>rut 14623188 14623606|18581 chrX 14621238 14624821 scaffold_10 4322743 4326391 + 66850|2246 2703
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GGATGAAAAATATGAAGTTATTGAGCACGCAAAGCAAACCAGAAAAACAGAAATCCAGCACTCAAAACGTTGTTACTGCTAAATGCAAACGGTGTCTATTAATTTACAATACTACAA-CTACAACAAAGTTTGTTAA-------------GATATATATTTATATATATACCCTATATAGATATACATATATATACATATGTGT-TGTACAGGAAGGAAAACAGAAACGAGACATAAGTTCTCATGGGTTGC-------TTTCCATTTCTATTACTAACGGCACTCTCTTTAAATATAGGATTGTATGTTTTTTTTTTGTCATTATTATTAGGTATTATATACATAGTATATATAAAAATAAATATATGTAATTACAAATAGATATATTTAGTCATTG------------------GGCCCAGTTGGAACGTTCCAGTTAA-ACCCCACACAAAAAAA
>CG14408 14660991 14661724|18615 chrX 14660847 14664534 scaffold_10 364209 367737 - 70516|144 894
GCCGACAGCGAAATACCCTACACTTAGAAAAAAAAAT-CAACACCAA-AACCGCCTCACCATCACACACACACACACACACACACATGAATGCGGTGATGGGAAAAGTCACTTTTAAATGAATAATTGCAATATAGTTCATAGATAATGATCGAAAGTGCCACAAGAAGTATTTAAA--GTTTCAAAACTATGCACTATTTTTGAGCATTTTTGTAACGGAATTTTCGAAAGTACCTTTCTTCAATTTAGAAAACTCTTGTTTGGCCGCTGACACAACTTCCCCCATCACTGCACGCATACAAATATGAAAATTATGGCAAAATTTTACTCTATGAGTATTAGGGCATACTTACGATCGATCCAAAAAATCCAATTAGTCAAAAGCGTA--GCGTACATATCATTCAAATACAAAAAGACATCAATCCCAGGTGGATCGAAATGGATGCGAGATGATGGATGAGCCAGCAGGAATCTTTTTAAATCCACACCAACGCACTCAGGCACGTGTGGCAAACTATGTTCTAATCCTAAATAAATGATGTGCAATAATTTAGTTTATGTAGTGGC---ATATACATAATTAAGAAAGTTACATTTTATGCTGTTTACAAAAAGCAAATAACTA--AATGCTAGTCAACAAAAACGAAATCAGTTTAATA-GTTTTAGTGTGTACGAGCTAAATATTCGGCA-----AAATGATTTACAAGAAACCCACAAAAATACATAAGAGTGTACAAATAATG
AATTCCCGCATCTTA-ACTGTACTTAAATCTGGACCTGCTGCGCAAATAACCATGAGACCATTTCAAGCAATTAGTAAGAGGCGTACATATCACACGACATCATAGACCCCATTGAGCTGGTGCATTGAAA-GGAGGAGGTAGGTGGAGCT-GAAAAAGCCACGCCCAATCTTTGAAATGTTTTGTTTCTACGCATAGTTTTTGGCTATGTTTTAATCCTAATATGTGCAA-TAATGTTCTTTAGCGTACAAAAT-----------------CAAAA--------------GCAAAAAAACAAAAAACAAAAAAAATACAAAGTTACATTTTATGCTGTTCAGTA---------AAGCAATTAACAAACGC----TAGTCCTAGGCGAAACGCATACAAATCAGTGAGAGG-AGGAATATATTATT---------AGCAAAAACCATTTAA---AAGAGATAAACCA------------TAAAATACAAAATAA-----TTATAGAAATTATACAAAGTACGTTATAAATATATATACATATTG------ATATTGACATACACTGTCGCCAAATAAGTTTTACCATGATAAGAACCTTTTTTATTTTTGGAACTGGGCAGATTGGTATCAGCGCACGTTAACACAAACGTGACAATTCCATTAGGTCGTAATTTAAATGGGCGAATCATTTTGCGCGTATAAATAATCGTGATTATATCGATAGCAAAGCACGTCGACTTGC---TATCG
>CG14407 14671404 14671499|18624 chrX 14671064 14671483 scaffold_26 741309 741653 + 3381|343 426
CCCAAAGAT----CAAATTCCCTTCCTAAATCTGTTAGTCACGCAACGTTTTTATTATTAAATGTTTAACTCATAACGACAATG
CCCAAAAATGTTACAAATT----------AATTGCTAATCA--CAACG-TTCTATTATTAAATGTTTATTTAATATA------G
>CG12539 14676552 14676732|18633 chrX 14676429 14676672 scaffold_17 64121 64439 + -100|128 322
AACCATTATCTTTGGGACT-------AATTA--CGAAATTAAAGATAAGTTAAT-ATAGAACCCATATGACAT----TATTTCAATT----------------------TTTATTTATGTTAA------TATCTCAA-----------------AAATACACACCAAACTGCGTG---------------CCCAA
GAAAATTCCATCAAGAATTACTGCAAAATTAAGCGAAATTAATTATAAGGCAACAACACAAACTATACTACATATTATCTTACAATTATGTACTTGTAAATTTAAACCCTTTGGCTATACTAATTCAACTATATCTATACGTAATCCTCACTCTAAGCACTGACCTCGTTGCGCGATCTATACTAAAGTTCCCGA
>CG12539 14676552 14676732|18634 chrX 14676673 14676737 scaffold_37 1016163 1016225 - 576|0 60
GAAGACTTAGGAGAAACGCCAT-AGAATTCTAACTCTTTTTTTTTACTCCGTGTAGTTAGT
GAGGA---AAGGGTAACGCCAGAAGTGCTCCGAGTTTGTTGTTTGCTTCGGCCAAGTTAAT
>CG9522 14680405 14680718|18639 chrX 14680409 14680652 scaffold_26 746069 746332 + 1807|0 267
AGTTTGAAAGAAAGCAAACGGGTAAAATCGTC-----ACACGTTAAAAGC---ATTCGACAATT--CTTTAATAATTTAAAAGATTGTGTTCCATACATAATTTTAAATCAGTAAGAAAAAAAAAATCACATTTTCATTGGATTTTAAAGGGTATCATATATCATTATTATTTTCAACATTTTGAAAATCTTTAATTCA-----AATTCATAAAATTAATAACATTTTTTTTTTTATAATAAATGC---------CATCGAAAATCTT
ATTTCAAAAAACAAAAAGAATGCAAAATTTTCTCCAAACACTTGGAAAACCACATTTAATTATTTGCTGTAAAACCGCAAAAAATACTAATCAAATCATATTTACTTACCAAGAAAAACAAAAAAAAAACACGATTATATAAATCTTAATGGTAAAAAATAACAATTTTTTTTTT----TTGAGAAAATACCAAACCTGTTGGTATTTTGGAAAATACCAAACCTTTTGGTATTTATATATGATGCAAAACGGTACACCGATAAGCTT
>CG9519 14688262 14688371|18649 chrX 14687955 14688326 scaffold_3 3437130 3437433 - -3047|312 376
ATGTATATAATATTATTCCATTGAGTGATTTCTAGTGAATTAAAGACGATACAATACAGTACAAA
GGGCATTAATTTCTATTTAATTTATATTTATTGTTTAGCTTATGTACAAGTCATTAGATTAGGAG
>CG9519 14688262 14688371|18650 chrX 14688327 14690207 scaffold_37 1025700 1027590 - 77217|0 45
AGCAAGC-ACACTATGTTTTCTTAAGCCGATGGGTTATCTTAAGAT
CAAAAGTGATGCCTGAATTTCTTCCACCCACAAGTGAATAGAAAAT
>CG9518 14696926 14697820|18653 chrX 14697166 14697261 scaffold_8 3086781 3086879 - 1775|0 100
AGATAGTAAATATCTGCTTGTATCATGAATATAAACTGAAAAGTCTATGTGC-----AACCAGGCGGAGTTTCGTAACCTCGTACTTCCCATTGAATCTCA
AAATTATGAATTAATTCTTTTAAACTGGCTATCAA--GAGAACTGAATGCGCCCAAGAATCAAATATAGTTTCATAACTTCGAACTTCCCAATCTATTTAA
>CG9517 14709297 14709527|18676 chrX 14708569 14711276 scaffold_37 1053735 1056392 - 101362|788 1018
TTAAGAAGTTGTCTATCGCTAATTTATGTTTCAACTAGTCAAATGTGGATTAACTGATGTAATATTATCGCTATGTGTTTTTGTTTTATCAAATTCCTCGTTTTGTTCACCGTTAAATTTATGCTTAGTTATTTGGATAAGTTTAGTGTACAAAGTCCCACAAAACTGTTTTTTTTTTATTACTTTATCAAGCATTTTATTAAATATTTATGTACCTATTTATGAAAAAAA
TGTTGCTGTTGTTCGTTTCCA---------TCAACTAGTCAAATGTGT--------------TATAAAAAAAACGTATTTTTTTTT-----------TTGTTTTTGTTGCAGCAACATTC-TGTTTAGTTTT--------------------AGGTTCTATTTTATAGTTCCAGCTATATTATTTTAT----ATTTTTGTTAAATATTTATATAAATATTTTT--------
>CG9514 14719889 14720389|18692 chrX 14719580 14720198 scaffold_37 1069483 1070073 - 5061|310 666
AATGAATTACCCTTTTTTTCGCGAGAAAGCCGCCCCTATCTGCTCCACCCATGATCGTAGTCATTTAAGCGCTTCATGTAAATATCGAGTCATTTATGCTAATTTTTACATTTTTTTTTT---------TAAATATGCATCGTCGCCTGTTGTGTGTGTCTA---ATCGAAATGTGTATTTTTTGTTTTACTTTT-----------ATTGTTAATTTGA------------------CGCCGCGTACACTTGGAGTACCTCAATTAGTTCGTAAGTCGAAGATTACGATTACGATGCAAATGTTTCGTTAGTTCTTAAATGTAAAG------TAACTCAATAAAACGAATAAATACG
AATTTATTAAGCTTTAGTTCGCTTT---GCTGCTCCTATTT-CTGTGCGT-TGTCCTTAGTCAAATAAGCGCTTCTTGTAAATATCGAGTCATTTATGCTAATACGTTTGTTTGTTTTATACATGGATATAGATATATACTTTACCTACATATATATATATATATATATATATATATACTATTTTTTTTTTTTGTGCGAGTGTCTGATACTAAATATGAACCATTTTTTTTATACTTCGCCGCGTACACTTGGAGTACCTCAATTAGCACTTAAGTTGGATACGAAGTAATCAGTGTTTGAATTTAAATAGCTGTTATATAAAACGAATACATGAGTAAATAAAAGAAATAAAACTA
>CG9514 14719889 14720389|18693 chrX 14720252 14722720 scaffold_37 1070645 1073086 - 94156|0 137
CCATTGCAAGTTGTGGGGGGGGGTTTAAAAGGGGTCAAACGGATGGGGTGGGGTTTGTTGGGGTTGTTTTTGGTTCATCAGTTGGAAGGGGGGGGTTAGCACAAATTTCCGCCTTCTAAATAAATTTAATTTATTAAG
CGGGCGCGAATGCGAGCGGCGGGTGGGATGTGGGATGAAGTTGTGAGCCGG-----CCCGGAGGCATAT---GCTGATCAATCAGTGACAGTTGCTTAAAGTAGCTTTTTGAGCTTGAGAATAATTTTGTGAATTGAG
>CG9512 14735886 14735981|18708 chrX 14735886 14736891 scaffold_37 1091188 1092230 - 52885|0 102
GCTCAGCGATATT-------TTACGACATAAGCTTTAACTTTTTGTCCGATTTTTTTTTTGTTATATTAAATATATGCTTCTTACATAGAATTGTAATTGAAT
GTTCAGTTCGATTGAGGTAGCTGCAGCACACACTTTAATCATTTATACGATCTATCTTTTTCTTTTTT-------TTTTTTTTTTAATAATTTGTAGTTAGAT
>CG9509 14740278 14740607|18713 chrX 14740218 14740554 scaffold_37 96778 97092 + -927|67 362
CA-----GTTGTTGATAT--CAAAACAAAATG------CATCCATTTAAATGTATAGATTTCATCACAATTCG------GTTTATCGAACTATGTAAATTACTACACCCTTTCCTTTGCATTACGAGAAGGTTCTTAGCAACAAGTTTAGCCCACGTTTAACAAAATTCTTAAATCGATATTTATAAAATGTTTTGCAAGTATTTTTCAAAAAGATTTTTTTTTTGTTATTGTTTAAGTATTGGTTATTAAATAGAGTTTTTTTTTTCTACAATTATAATAAAAAATTTAGAAAAC
CAAGCGGGTACTTGATTTGATAGGGCAAAATATACCCTCACCTAGTCAAATATAT-GATAACATATATATTCATATATTTATTATCGAATTGTGCCCAT--ATATAATATTCGATCTG-------------------------AATATAACCCG-ACTCAGTAAAA----TAAATCTATATATAT---ATATATTG---GTATATATGTATATAAGATTTAGACTGAGAATATTCAATATATTATTATTAATCAGAATACTTATGACCCGCA--TATAAATATATATATATATA--
>CG9509 14740278 14740607|18714 chrX 14740555 14742257 scaffold_37 1096901 1098601 - 49354|0 59
TTTGATGATTCCAAACACAGAACTCGTTTCGA-TTGGC------AACTTGTCAACAACAT
------GGACTCGGGCGC-GGACACGTTTGGAGTTGGCCTGGCAAAGCTGATAACAGCAT
>CG9503 14753189 14753546|18723 chrX 14753240 14753441 scaffold_37 1022104 1022303 - -366|0 214
CCATTGAATGTCTGAATGTGTGGTTAA-CGTGAATGTTTTATTGATTGAACTGAGTATGA--------TTGCCTGTGAATGTTAAGATTAAGTGTCTGCGAGTTGTGTATATGTTTTAGAAATTAAGCCCAAGCTGATGACCCATACAA----AATTATTTTATTAAACTCAAATTGGTCCTCATTTTTTTTTGAAGTATCTTATAAGCACGCCC
CC----CGTCCCTGAACCTTCGCTGGATCCGGAATATTTTAGACGCCGAACGGGGCTTTAGTTAGATCTTGCCCGC----------ATTCAATCTCTATCTGTCCTACATAATGAACTGATTTTAA-TCTAAGCTAGCTCCTAAGACAACAATAAATATTTTAAGAAACTTATAACAATTCTCAACTGGTTCTTGGCTTACCCCCAAACCCTCCC
>CG9009 14767971 14768566|18743 chrX 14767867 14768176 scaffold_16 12234 12584 + -1039|105 391
TAACCTTTGATTATACTTAATGACGCAGCCGATATTTTGCTATGATATTCCCCTATTTGC------ATATATCAATT--------TTTTTTTTGCCTAGTACCATAAGATTATTGTTTGTTG----------------------ATCGTATTGAAAGA---TGGCGGCATGCCAAATCCAATA---------------------------CTTTAAATGCCATGTATG------------CCACGATGTTTAAAAATAAAGACGAAATG---AACCAGTTGAAATAA
TAATACCCAATTGTATTTGTTCATTTA--------TTCGCTACG---TTTTCTTATTAGCTCGTATATATAGCAATTAATAGCAATTTTTATTGTACAAAAAAGAAAGGTTCATATTCGTTGCTCGCCGAATGTCATCGGACCTGTCGTTTTACACTATTTTAACAGAGTACCGAGTTTGATAAAAATACTGGTAATTACGTTTGTTACGTTTTTATCGTCATATATGTATATACAAAATCCAACATATATATAAAAAATCGCAAAATATCTAACTATATCAAATAG
>CG9009 14767971 14768566|18744 chrX 14768181 14768282 scaffold_37 1130602 1130696 - 2015|0 101
TAGTCGCTCGATTGGTCCATAGTTAGTAAGTCTAGATTAGGCATATGTAAGACCTTAAACATTAACATATGCGTATTTATAACGTGTAATCTTTATGCGTGC
TAGTCACCGGATTGGTCCATAGCTTGTAAGTGTCA--TAGGGCTATCAAAAGACCTAACT-----TAGGTTCTTCTGCACAGCGTCTCAGGTTTGTGTGTGC
>CG9009 14767971 14768566|18745 chrX 14768369 14769261 scaffold_37 1130752 1131648 - 38875|0 218
GTTCCCAGAGGACGAATCTTCGTAGGCTA------------------AGAAATATTTTTGTGATTTTTTTTTGTTCGTCTCAATCAG-GAATGGTACACAGACAAATGTGGAGGTCCTAAAGCAATCAACCTATTGCCAAATTTAAGAGCTCTATTTG--TTTGTGGCCACATTCCGCGGAACATGTATGTATATGAGGAACATCAATGTTGGCCCTGG
G---CCAGAGACAAAGTTGTTGCAGATTAGTTTTTTTTTCCTTTGTTATAAATGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAATTTTGACTAGTGCTTGGGATCTACGTAGATCCGATAATTTGGAACCCGACAA--TGTTGGCAATTGCCGGCAGTCTAGCGGGCCTTGTGAGCAT-------------TGCATTTAGACGAGTGGCCCCCAGGGTGGCTGCGA
>hiw 14844620 14844768|18842 chrX 14844765 14845207 scaffold_3822 1003 1445 + 32840|0 3
CCAC
CAAC
>CG9053 14899379 14899516|18881 chrX 14899133 14900372 scaffold_31 43027 44161 - 42024|250 405
TGGGTCGGTC--CTGTGTGCGGTGACGAGGA----------------GAAGCCTCTACCAAAGATGTGTGTCCCAGAGCAACGAGGATGCATTTGCATCGGCATCCGGCAGCTGGATCCTCCCCAACTAGTTAGAATGTAATTTATAAAAAAAAAA
TGAGGCAGTCAGCGTTGGGCGTGAGCGCAGGCCCAATGTTTGTCCTCGTAGCGTTTACCAAAGATGTTTGTT---------------TGCATTTA-ATCAGAG--------------------CAACTTGTTAAA--------TATTAGTCACAAA
>Lsd-2 14905393 14906208|18887 chrX 14905529 14905578 scaffold_46 388319 388360 - 2404|0 49
AAATGAATTATGCCTAATATATATCCATACATATATATATATATATATAA
TAATGAAT--------ATATATATGCACATATATATATATATATATACAA
>Lsd-2 14905393 14906208|18888 chrX 14905638 14906591 scaffold_46 388416 389517 - 17256|0 743
TGGAGAAACAGCAGCTCATCTACAATTATAT---------------CTATCTATAGCTAGATATTATCCTCTTTCA-------------------------CGCACGCTCACCACCT-----AAGATACCCCTCTACCTACCACCCA--CGCCGCCCATTTTATAATGTA-------TTTTATAAATTCTTTTTTTTTTTTTATTGCGTACTATTTCATTGAGTGTACTAGCCGATACGAGTAGTACTTCCATAGAGGATCATTTAAAGTGGAGAAGGTTATTCGAACGCACGCCCAAGAAGTCCGCCTCCTCCTGCGC---------CACCTGCTTTGTAAATATTTATTTGAAGTATAGCCCTCAC-------------------------------CAATCCTAGTTATAAGATATAGTAGTCGCAGAGATCCGGGAGTCAGAAGAGAGCGTTTTTTTTTCGTCAATTTTAGCTGTGCTAAA-------------------------------GTGC--CACGCATGCATTGAAT----AATACATTATAAATATATACA--------------------------CACACACCTATATATGCCTAA-------CATATACGCAGATATATGATATA-----TATACATATAGAGAGAAACACA-CGCACACGGTTGGCATAGTGCGGTTTAGCTGTA-CGTATA-CGTAATAT-AATACCTAATGCTATTTCTATATCTA
TAAATGTGCAGCTGCACGCGTTCGGTTTGGTTGGGTGGTGCGCCCCCTTTTTAGATCAGGGTCAGAGCGCTTTCCAATTGGAAAAAAAGAAAACAAAAATTAAAACACCTGCCACTTTCCCGAAAAAGCCAAGCTGTTCGCCTCTCAAGCGCTGCGCATTTTCTTATTTAGTTTTATTTTTATGCCCCATATTTTTTTTTGCAATTCTTTTTTTTTTTTT--------------------TTTTTCGTTTTTAAGAAAGTGGCCTAA----GCAGACGTCGCCCTAACCCCCTCACAACACCTCCCTCTACCCCCACACACAACCAAGCGTTTGCTTTGTAAATATTTATTTGAAGTAACACACATACACTCACACACACACACACACACACATATATACACATATTGATATAAGTTGTAGTTGTAAAAGATTTT--------------AAACATTTTTTT--------TTTTAGCTGTGCTAAATCTAAAAACAAACACGCCACCTGGCGGCCATGTGCCACACACATGCATTGAATGGAGAATATAACAAAACAAAACAAAATTCTGATCAGAAACCATGCGAAATGCATGCACATGTATAAACCCAACCCCAACCCCACCCCCAGACCTCCCATACACCCCCCGCACAACGCGCTAACAACACAGCACATACCGTTAACGATATACTAATTAACGATATCGTATATCGTAAAAGAAACACTGAATTATAGTTATGTAGCTA
>CG9065 14917958 14918117|18905 chrX 14917130 14918206 scaffold_46 405712 406770 - 19952|841 1072
-TATACCGACACATCCTGG-GATGAGGACA------CCAGGATTATAGGATAACACTA-GTCCTGCACACACTCCCCCCAGTGCC---------------------------ACTCCTCGGATCCCCAGCCCCTTCAACTGTTTGT-TTTTGTTGCA--TCTCAAGCTAA-----------TTATAGA--------------------ACTAAATTAATTGAAAACC---AA
CTGGACCTGGGCTGCTGGGCGGTGTGGTCGGAGTACTTAGATTTAGGCGGCAGCCTTACGCCCTGCGTGGTCTCTCTCTTGTTTCGTTATATTCTCAAGCTAATTATAGTTAATTTAATGGATAAACATAAACCAAAATTGTTGATACCATGTTGCATGTTTCGATCCAATGTTTGCCCGCTTGTGGAAACGCTGCGGCTGTGACGTCACAAAATCGCGCTGCAACCCTAGA
>CG15027 14919098 14919117|18907 chrX 14919065 14919909 scaffold_46 407569 408450 - 25796|33 52
AATAAATGTAAATTAAAACT
---------GCATGAAAAC-
>CG9072 14929426 14929446|18921 chrX 14928963 14929798 scaffold_46 425279 426019 - 13588|472 492
GCTGCCAAGTTAAATTTCAAC
CCAGCCTACACACACGTACAC
>Cyp4s3 14947239 14947868|18942 chrX 14946814 14947695 scaffold_46 448384 449347 - 6848|518 1065
TTTTATTTTTTTTTATTTCTCGCTTTGAACTTTGAAAAATACAATCGATCATATACATATATACAC-----------GGCTAAAGAGGTATGTATAT--------ATATATATATATGGGTGCTGGGCT----TTAT-TTGTG-----GTTAACATCCAGAGCCAGC--TAACAAAAAAATAGTTATATTTTTTATATATATTTTCAG-------------------ATATATA---------------------------TATATATATATGTGTGTGTATGTGTGTAT---TTTGGATGTAC----GCCGATCTCCTTTTACAAACTACATACACATACACATACTTATTGCTCTCCAGAGTCCCCGTTAATCCAAAACT--CTCCGTCGTCCGTGCT--CGTGTTCCCTGACAATTCCTTAAACTACCGATCCCAATAGATCTGAACTTAGGACCACTTCTTGCTGTCATACAATCTCTTAATATTTTCTGTACGAACTAGTTAAATTCCTTTAC---CATAAATATATATTTATATATATATAT
TTTTGTGTTTATTTGCACACGTTTTTGAACTTTGGAAAATACAATT--TTATATAGATATATGTAATATTATTTGTAGGATAAGACGTCATATATATTCTTGTATATACATATATATGAACGTTTGGTTAGCATAATATTGTGCTCCTGTTAACATCCAAAGCCAACAACAACAAAAAAAAATATATATATGT-ATATATATGCTTGGGGCAGTTATTGTATGCCCCATATATAGACAGTAAGTCGTAGGTATGGATAAGTTATCGATATATG-GTATATATATATATATAGATATAGATATACCTATGCCGAACTCTGTTAAATCTCTGT-TACGCGCACACCCACATATTGCTGCTCAA---CTCTGTTAAAGCTCTGTTAACTCTGCTGGCTGTTATGTTATGTTCCCTGACAATTCCTTAAGCTAAAAACCTTCACATATATATACATAT----------------------ATATCTATATATATT----------TATTTATATATATATATATACATATATATATATATATATAAGTATAT
>RpL37a 14972262 14972707|18973 chrX 14972365 14972442 scaffold_12 2524747 2524828 + 496|0 87
AGATAGCGTGTA--AATGGCCAAGATCCATAA-----CCAAATGCTTGTAGGGCTGATTTC---CTCGTGGTTTTCGCAAAAATTGTT
AGATAATATGGAATATTTGCCGGAGTTTTTAAACTATACAAATGC-----GAATTGATCACAGATTTGTGTTTATC-CAAAAATTTTT
>RpL37a 14972262 14972707|18974 chrX 14972443 14973062 scaffold_46 491832 492430 - 25071|0 291
GAGGCTCTGTGTGTCCCAAGATGTATATCCCACACCGGGCTATATGGACGGAGATAGCAGCTGCTCCCTTAACCGCAGATAACGACAGCCTCCAGTTG-ATCAACGTGTACACACCATCTAAAATCCACTGAAAATGGCCCCTCAACATGGCTAATAAATCGCTCGAGCGCTAATAAATGAACG-----TTTTTTTTTATTAAGTGAAACTGGTGAATA-----------TTTTTTTATTG-----TTTGTGCAACAAAAGTG-----AAATGTGACCGAAAAGCGATCAAA
-AGACTCTCGGCTTCCGGGGGTG-------------------------------CAGCAGCAGCAGCAGTTACCACAAATTA-AACATCCAGCAGCAGCAGCAACA-----ACAACAACAAAAAAAAAATGAA-----TGCTTCAACAT----------TTGGTTG-GAGTTAATAAATTAATATGTTTTTTTTTTTCATTAAGTGAAAATTGTGCGTATATATATATATTTTTTTTATCGGTGATTCTGTGCAACAACAACAAGAGCAAGTGCAACTAGGAAGAACTTAAA
>CG9095 14973866 14975225|18975 chrX 14973871 14974587 scaffold_46 492941 493643 - 11713|0 784
CTCGTATAATTTATTCGCAAAGCTTTCATAAGGTTCTTAGTT--AAATTTTCTTTATGAATTAGTTG-------------TATGTA-AAGGCGTGAAAAAGGGCAAAA--AGGCGAGGCGTAGT--------------AATTAGTTGCAAGGCACCACCAAGTCCACCCACATCCACACCTCCCCGAAGG-TCACTCCACCCCATTTCCCCTTCACCC-AGCAAGCAGATCACACAGCTGCAGCCAAATTATGTGCAACTTGGTTTCGTTTGAGGT-----CTCAAGCCCAATCGACTTGCTCATAGTCGCAAATTA-------GTTACGTAAACACTTACACTAGATAGAACTACCCATCCATTCCACAAGAAAAAATCCATAAAAAAAAATTCAAAAACAAATCACAAAACTCCAATCGGCAGCAGCAGCAACAGCAAATAATATC-GTAGTACGCGTGCCAC--ACCG-AACATAGTGTATAAATATCTGCACAGGATCGAAAGAGTATATATATTATTATTAGCCCCAACTCACCAAGCTACACCATTTCATTATGTT----TTTGTACCTACCCATTATATATCGCCCTGTATTTGTATTTCTAGAGTCTTGTAATTTGTAGATTTTGTTTTCGCGTGTGTATCGT--------------CGAGCGGTCCAGTGCTAAAATGTCGCTCAGTATGCAATATTATTTGAATTTCGTGCATTATTTCCAATGTAAATAATAATAATTTATTTCATAAATAAAACAATGAATATTTTTACTAAA
CTCGTATAAGCTTGCTGCAAA---------ATGTTTTTAGTTTGAAATTTGTTTTATGAATTAGTTAATAAAAAGCGAAATATGTGTGAGGCGCGAGGCGAGGCGAGGCGAGGCGTGGCGTGGTTTATATAACTTAGAAATTAGTTGAAAAAAAAAAAAAAATAAACAAACAAAGAAGAGGAAGAGAAAGAGCACCGTAAATAATACCGATATCAACCGATCAGCCCTAACCCAGAGCAG-----GAATTATGTGCAACTTGGTTTAGCCTGAGGCGAGGCCTTAGGCCAAATCGACTTGCGCATAGTCGCAAATTAAAACTTAGTTACGTAA-------CGTTAG-------TGCCCAGT--------------ACATGCATATATATATCTGC-----CCTATCAGCAAA-TCGAATCA--------------AGTAAATAATATTTGTAGTACGCGTGCCATTGACGGCAAAATATTAGATAAGTAC----------TCGAAAAAGTCTTTAGACCATTTAT----TCAGCAAATTAACATATATCTCTGCACTTAGTTCCATTTCTCACACACACACCACAATTTTCTCTCTCTATATATATAGTTAACCTT----TTTGCATATATT--TCGCGCGTGTGTACAATTTTATTGGATAAAGCGAATGTTTCTTTAATCGATTTTTTTTTTGTATGCAATATTATTTGTATTTCGTGCATTATTTCCAATGTAAATAATAATAATTTATTTCATAAATAAAACAATGAATATTTTAACTAAA
>CG9095 14973866 14975225|18976 chrX 14974588 14974879 scaffold_57 286290 286535 + -813|0 294
AGATCATTTAACTTGCAAGTCAGTACTTAGCTATATAATCGTATGCTATGTTTATTTTTTGGGCTGAAACTCAGAAATCTTCGGAGACTTTAGAACCTTTGGTTAAAGAAATATACATTTGAGAACTTTTAGGAACAAACATTCCATAAATCTATACAAAAAAAAAACTTGAATCTCTTCTTGACAATTTGTTTAAATGTTTACCAAAACTTTGTGGTTTTTAAAGTCCCGGAGTTTCGGGTACGGT---CCCATTTATAAGTATATATGCACTCGTGCTAAGATTTGGTCCGAA
AATACGTTTGACTTCCAAATCAAAAAGACACAAAGCATTAGCATAGT------------------------------------GAGAATTTAATCCAATTAGCTTAACAAAT---CAATTATAAATTCTATTTAAAAAATA-TACATATATATAAAAACAGAAAAAACTTTGA--------TGTCGATCAGTTCTATGGACCTCCACGAGTTCAACGCCCTCAAAATTTCCGGGATCGGGCTTTATTTGACCGAGATATAGGCATTTACAAATTTA-ACAAAAAAAAAATTTTAA
>CG9095 14973866 14975225|18977 chrX 14974880 14975514 scaffold_46 493759 494327 - 15466|0 351
CCAACCATGGTCATCACCATCAATGTGGAGCGGCAGTAGCCAAACGAACG-ATAGTGGCCAGCAGCAGTCGGCGTAGAGATCGGATTCGGATTCGGACTTGGATTTGGATTTTGATTTGGACTCGGGTTTTTGGTTTTGGATTTGGATTCAGATTCGAAAATCGCGATCTGAGAACTGCAATGCGAGCGCAACAACGAAACGTTTTTTGTTTAATTT-----TAGCATCAGTTTTTTTTCGCGCATTAGTTATGTAAGCCACAGATGGAGAAAAAAGGGGTTCGGAAAATGTAAGGAGAAAACTTTTCTGTTTATAGTGAAAAAAAGAGAAATGTTAAAACATCAGCGCAAG
CCAACCATGATCATCACCATCAGCGTGGAGGAGCAATAGGGAGGCAAACGCACAACGA--AAAAGATGAAGAAGAAAAAAACAACAGCAACAACAAAATTCATATTAATTTTAATTTTAAATTTACAATTTTTTTTTTGTGTTTCAACTTGAGCTTGATTATT-------------------------------------TTTTTTTTGTTGAATTTCGAGCTGCGACCTAGTTGTAGGTGCACACTTTCTGTTTATAGCAAAAAAGAAGAAGAACAAGAAGAAGAAAAATTAAGAGAAAGAA---------------GAAGCAGAAAGGACAGCTAAAGAAGAAGAGCAGG
>CG15031 15077789 15077844|19127 chrX 15077651 15077873 scaffold_46 345514 345726 + 1306|145 200
TTTGCTTGCGTTTGCGTGTTACATAGTATTAAATCGTTCAAAATTAAATAATACAT
GATCTTTCCGTTATCATAATAAGTCCGAGAAAGTCGTT--------GCTACCCTAT
>CG9114 15164316 15164963|19254 chrX 15163729 15164632 scaffold_66 93686 94563 - 34861|630 946
GCTGATGCGCCGCTGCTGCTCCTCGCTCTTGATGATGCTATCGAGAACGTTCTCCAGATTTTGCGTGGCCGCCGACAGTTCGGCATTATCGCTGTACGAGTCCTCGACGATCTCCTTGACCTTGTGCAGCAGCAGCTTAAAGTTCACCATCTCGGTGTCGCGGCCATCTCCGCCGTTTGCCGGCTGCTGTTCCAGTAGAGCACCCAGCGGCATGGGCAGCGGCAGAGGAGCCGGCAGGGAACCAGGTCCTTGTCCTGGCTGGACACTCGAGCGACGCTGGTCGAACCACAAGCTTATGTCGTTGAGCGAGTAATCCG
GCTGCTGCGTCGCTGCTGCTCCTCGCTCTTGATGATGTTGTCGAGCACATTCTCCAGATTCTGTGTGGCCGCTGACAGCTCCGCATTGTCACTGTACGAGTCCTCGACAATTTCCTTGACCTTGTTTAGCAGCAGCTTAAAGTTCACCATTTCCGTGTCCCG--CATGTCCA-CATTCACCGATTGC---TCCAGGAGCGCACCCAGCGGCATGGCCAGCGCAAGCGCCGTCGGCTGTGCACCGG------CTGTTGGCAACAAACTGGAACGACGCTGATCGAACCACAAGCTAATGTCGCTTAGGGAGTAATCCG
>CG9114 15164316 15164963|19255 chrX 15164759 15166898 scaffold_66 95222 97421 - 33679|0 208
ATGCGTTTTTTTTTTCTTCTCTTTGCATTGGAAAATCTACAAAGTTGAT-ATTTTGTATGTAAATGCTTTGTTAACAATGTGTTTTTTGCATTGTATATTTTTATAAAAACATTTTGTTGTATTGCATTCTTGTCAGAGTTGTAAGTTTACAAATTA---AAGCATTTACGCGAATGTTAAAGCACATGGGAAAAGGAAGAAGGATATA
---------TTTAATATTATATTAGC--TAGTAAGTAATGAAAACCATTAATTTTGTATTGAAA---ATTGTTATTACTACGGTTATTCCG-TGCATATCTGTATAAGCAAATATTATTTCCTTCTAACATGATTTGGGCTGTTATCCTTGAACTCAATTAAGCTCATGTATAAATGATATTGTGCCAGGAGAGAGAGAGAGAGAGATA
>CG9123 15174268 15174459|19263 chrX 15173313 15174279 scaffold_26 1542011 1543036 - 20829|1039 1050
AAAAAACACTTG
AAAAAACAATTA
>CG12608 15176791 15176943|19267 chrX 15176689 15176978 scaffold_38 528545 528869 + 1254|111 294
TTTTTAGTAGCTAACGTTATGACTATCAATAAATATTGAGTT-----------------AATCTAGAGATATAGATAAAAAAACCATAGATGAACTGTCGATTTGGCTGGGATGAACAGAATTATGAATAAATACCTCTGAACTTAAGAAGTTCGATC------------TCATTA--ACGAAA
---TAAATACGCAAACTTTTAAATATTACTTAAAATTGCTTTTAGTTTTCTTTGGGTGTAATTAAAATACAAAAAAAAAAAAAACAAATTTGTTTAGTTATTTTGTTTGGTATGTCGAAAACTATGCATAAAGAGCGAAGGAGATGAGAGTACTTGTCCGCAGATGATAATGATTATGATAAAG
>acj6 15186294 15187042|19277 chrX 15186263 15186311 scaffold_5 5577212 5577260 - 1751|31 48
TATCAAATGCAATAATTT
TGTCAAATGAAAAATGCT
>acj6 15186294 15187042|19278 chrX 15186351 15186594 scaffold_23 1719748 1719945 + -796|0 248
TTTATATACACCTTCTCCTCAACTATATATGTATATCCCCCGATTCTTAAGCCCGCTCCCACCTCCTACGATCAATCAGAAAGAGAGAGAGAGAGCGA-----GAGAGAGTGAGTGTGAGAGAGAGAGCTAAACCCCCAACCGAGCGCCCAAAAATCGAAATGGAGAAAACTCGAGCATTATCCAAGTAAACATCGTTGGCAAATAACACAACCAATGAGAATGCAAATTGAATACCAAGAAATACAAG
ACTATGAGCGCGTTTTC------TATATAAATAAAGCA--------TTATGCACA--------------GATAAATCGGATGAAAATTGAAAAATTGACACTTTATATAAAAAGCGCCAGTTCATAAATTAAATTTGCTGCAGAGC----ATAAACTAAAATTGAAAAAAA---------ATACAATTAAACAAAAT---CAAGAAGAAAATTGAATTAGTTTGCAATTTTCATAC-------TGTAGG
>acj6 15186294 15187042|19279 chrX 15186685 15186894 scaffold_12 2234197 2234482 - -542|0 288
AAACTGGTTCTGAACCGATCCAAACCGATACCGATACCGATCCCGATCCTGGTCCTGCTCCTGATCCTCGTACAT-ACATGTAGTATTCTTCGCAACGGCA---------GCAACACCCCCACAACCACC-------------------------ACTACCACC-------------ACCACCACCACCATCATCATC-------------------------------ACAACCACAAGGGCAACCACAGCGATAACGACAACCACAATAACCACGACGATGACCACT
AAAGTCATGTCACCCGGCTCCACACAGCTGCCCACATGGGACAACTCTCAGGCCATGAGTCCATACAATATGCACGACATG-AATTCCATTGCCAACGGCAACATGATGGGCAACAACAATGCACCCAACGGCGCCCAGCTGTAAGTCATCTCAGAATACCATCTTTCTCTTATCGAACCAAAGCTA--ATCCTCATCCTTCTGCTCAGTGGCACTCGCAGCAGCTATGACAGCTTCAGTGGCAGCCACAGCGACGCCAACAGCCTGGCCAATAGCGACGGCGTCAACT
>acj6 15186294 15187042|19280 chrX 15186926 15186933 scaffold_12 2234515 2234522 - 304|0 7
CCTGTCTG
GCTGCCCG
>acj6 15186294 15187042|19281 chrX 15186934 15187377 scaffold_26 1557449 1557892 - 34079|0 108
TAGTCGTTTATGACGGCAGCGGCGGCGGTTAACACGGCAGCGGCAGCGGCGGCAGGAGCGGCACATGCGACATTGGGAACGGCGGCGGCGGCGGCGGCAGCGACATCGG
TAGTCATTTATGACGGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAACAGCAGCAGCGGCGGCAGCAGCAGCGACGTCGACAGCGGCAGCAGCAGCAGCAACAGCAGCAACAGCAACAG
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TAAGAATTACGCGCGCTGCTAGCTATTC--ATCATGATATATATTTATATATATATATATACATAGAAATATATGATATGTATATATATATATATATATATTTATATATATATATAAATATATATCATATATCA-TTTATATATATATAAATGTATTGGGAGATTGAATTGGTTGGCGACGGTCAAAATTTGTAATATGCAAGGGTGTCATTAATAAACCGAAAT-----------G
>CG9164 15214559 15215280|19321 chrX 15214548 15215028 scaffold_26 1599138 1599704 - 8669|11 592
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ATATTTATAACGAGCCCTGCCCTAAAAT----TCCC----TGCCATGCGCATCGTTTTGTATCGTTTGCTGCTTAGTTCAACTATTTAGTATAAATATTATAATATATAGATCTTAAGTTCTATTCTCTTTTATTTATTTATTTAGTTTTTCTTTTTTTTTTTATTATTTTTTTTTCTTTGTGTGTGTTTAGGATAGGATGGTAACAAAGCAACAAAAAATAATCGAGGTATTATGATTCCTGAACGAATTTATGAAATTCATTATACGCCATGTTGTGCTTCATCGCTCATACATTAAATATATTTATATATATATGTACATATATATACATACATATGTATATGTGTGTACACATACTTATATATGTATATAAGTAGCCGTGTATTCCATTGATATTACTCTGTTTATATTGTACTCCAATGTTAGACTATCCTTGTAAAAAGTTTTATACACAATTCTACAATAATTTATTGATATTACAAATAATGATGAACAAACTAGATAATTGTACAAACAAAAAAAAAAAACAAAACA-----------CAAAACTGAA-------CAAAAAAAAACCCCACAA
>CG9164 15214559 15215280|19322 chrX 15215143 15215429 scaffold_26 1600056 1600335 - 5953|0 142
AATATGCATAGGATTATCTATCTATATCTACATTTATCTATAAGAACTATGGGCAACG-----AGAAGGGATATCGAATTCGTACCACCAAAAGGAACTAATTGAAAGCAGAGAAAAACTGAAAAGCACAATTGCAACGACAA
AGTGAATATAAGTATA-------------------AGCTATAAGGTTTAAGGTTTACGGATCTAGGCTAGACGACAAATT--GAGCAACGAGCAAAGCAAAGC-AAAGCAAATAACCACCTGAGGACAAAAGTTCAGCATCAA
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GAACTATAATCACGA
GAACTATAATCGCAG
>cngl 15225442 15225646|19336 chrX 15224493 15226215 scaffold_26 1611934 1613655 - 10651|987 1287
AGATAGAGCTCAAGTCCTGATAATTAA--ATAATGGTAATCATAGCTTAAAACACGACATGTGCATAGAACGAAGAAACTTTTCAGCCGATGGGCG-------------------------------------------------------------------------------GAGGTACAGTCACGCACGCATTGGGAACGAAATGGAATGAAACAGCCGCCATGATGGATGCTTAAGTTCTTAGGAGCATGTAACTAAATAAAACAGCACAGA---------------ACACACAAA
AACTAAGTCTTAACTCAAGAGAAAGAATTCTAACGGTATT----GGTTTAAGTACACAATTTGCACAGTCACAAAAGCATTTTCAGCCCGTAAACGTTTGAGCTCGTCATCGATATTGATATCGTCAACGGCAGTGTTATCGCTATCGATATCGATATTGAGCTTAAAACTTATCGAAGCACGCGCACGCACGC-TTTGGAACGCAATGGAATGAAACAACGAAGACGGCGTACGATC--GTTC-----AGCATGCAACCGACACACAC-GCACACACACACACACACACACACACACACA
>Scamp 15280115 15281358|19407 chrX 15280113 15280182 scaffold_26 1726430 1726506 - 1849|2 76
TGTGTATTTAAAATTCAAGCAAAA------TTTATGATAAATTCCAA-AATAAATATAAAATACTTATAGATGTA
TGTCTATTTCTAATGCAAGCGAAAAACATCTATAAAATTAATTCAAATAAACAACAATAAGTATTTATAGATCTA
>Scamp 15280115 15281358|19408 chrX 15280273 15280798 scaffold_26 1726582 1727148 - 5710|0 592
AATAATTCGATTCTGATACTAACCCAGAT--TAATCAGGCGAAAGG-GATGACACTGATGACGATGATGCTGCTGCTGC-------------------TGCTGCTGATGAT--GATGTTTTCTAGTTCTTTAAGTC---ATTAAAACGATATAGGAATAACCCCACTCCCTCGCACACGCA-ACACACACACACACACACA-----------CTCACATATATACGATCTTATATATAT------AACAAACATAA--------TATAAATAATATATTTA-----ACGCTTACATTATA------GAACTTTATCTCTCGTCGCCTCGACCAGAGAGACAACAAGAAAGCGAAATTCATTTTTCATCCAAGCTGTGCTCCTACGCCCACTGCTCCACTGTCCCCCTCTCCTCCCTCCCCCCTGTTCCATGTCCCGACCCCCTTTTTCCGCCGTCACTGTCCTGCACTCACATAAAATGTCGTGTTTTTTTGTAATCGTAATTGTTATATATTATCTATTATCTATGTACATGAAGACAGCATATAAAA---TATATTGATTCACTTAAGTATTCACATTTTTTAGATACATT
AAGAAATTGATAATGATGCTGATGCTGATAATGATAATGAGAATGATGATGATGCTGATAATGCTAATGATAATGATGCAGATAAGAATTATGATAAATACTGCTGATAATCTGATGTTTTCTAGTTCTCTAAGTCGAAACCTTCACGATATATCGCACACTCTATACACACACACACACACACACACACGCACACATACATGCATGCATCTCCCACATCTAAATGTATTTAAACAAATGAGAAAAACAAACAAAAACAAAGCGTAAAGGCATTATAATTATGCAAACTTTTAACTTAAACTAGCTGAGCATTGTGCATAGTATCGCCCACTTATGAGTTATTATTATTA------TTATTATTAATATTATTCATAATATTATTATCATTGCT--GTTGTTTTTCCTACCTCCTGCCCCCC----------CCCCCCCCCCCCCTTCCAACGCCTGCGT-----AACCACATTTAATGTCGTGTCGTGTACTTTTTGTAATTGTAATTGTTAAACAAATATATATATATATAAATGCA-TATATACACCCTTATATT--CCCATATGCATATATACATATACTATATATATT
>Scamp 15280115 15281358|19409 chrX 15281285 15282002 scaffold_2381 80 828 - 30349|0 73
GTGACACTCTGCTTTCCGGGGATCTAATCAAATCAAAAGGAGAATCAATCAATCAACCACGAACTCAAGCAGCA
GCG--GCTATAACTCACGATCAATCGATC-AATCAATCAATAAATCAATCAATTTACCAATCAACCAAACAACA
>shtd 15289476 15289762|19417 chrX 15289372 15289634 scaffold_0 1993266 1993543 + -1305|114 294
CAACTCT-------TGAAATT----------ATATTGTTATACAATCACG---TCGAAACGTT--TTGGATATGAATATTTAAATGCATGTTCCTTAATGTTTAACGATTTAACGATAGCACAAAAACTGTATAAAATATATTTACAAATAAATAGCCCATAACGCTTGCAAAATTAATAG
CAAATTTATAGGTGTGAAAGTTGCCACCCCAATTATTCCGTAAAATCTCATTCTTAGAATGTTTGTTTGACCTGCA-ATTGAAATTTGTGCACATTTTTATATA-------CGCTATAATGTACTTTCTGT---AAATATATGTAACAGCAAGAAGGCCTTACGTCTATCAATCTTAAAGT
>Grip128 15302216 15302342|19424 chrX 15302289 15305123 scaffold_26 1954518 1957394 + 39979|0 53
AATCGAATCTCCTCCACAAAGGATCTTGTTAAACATTACGCATTACCATCACCT
A-------------CAGCGTAGATGTAGTTA---ATTATACGTAATCTTCATCT
>Ac13E 15344813 15346676|19477 chrX 15342270 15345451 scaffold_5 1399913 1403366 - 39088|2990 3695
CAATGCAACATTGCCAGTTTCTAATGGTAAA-----CTTAAGCAGAACTCTATTTCCGCCACGAAAAAAAAAATAAGAAAAAATCAAAAAAACGAATTACCAAAATCAGTGAAAATATATTGCAATGTAAACGTGTATGTGTATCGAAACCTATGGACCCT-ATTGTATTTTTATATTAACAACAAACAAGTATTTTCTACTAAT------TTATTGAGCGAAAAAA--AAAACTAAAAAGA-----CGTACATTTTTTTCTTGTCTTTTTGAAACCTCTAAGTGTACATACTGCAT----AATATATATATATATATAT---------------ACAAATGATATATA-TGTATATATATGAATATTTATATTTATAATT---GTATATTTTTATAAAACAAA----------AACGAAACTGAGAAAAAAAAACAATTGAACTCAAAGAGCGAATGATATTTATG----------AGAAGTCTAGCAGTCCTGTTTACGATGTGTAGAAATGTTTAAATGTTGTTAACGCTGAGATACAAACAGCAGCCATCCATGGCCATAACCAAATGTATGTGGATCCTACGTGTGTCCTACGTGTGTTTTAGCAAACGATTTCAAAGAGTTTATCGAAATGTTATAGGCAAACCTACTAAGCGCGATGTGTAGAAA-----TAAAAATAAACCAAGGCAGCAGTCTTATA
CAATTGATCGTTACGAGTCTAAAATGGTATATCATTCCAAAATCGGACTTTATTT-------GGCCGAGATATTAAAAAAAAATCACTAAAA-GGATGTTGGTTTTCTGTCAAAA-ACATTT--ATGTAAGCCTCCG---ATATTAGATCCAATTGATTGTCACTCGATCCGTAGGCATACAAAAAAGGTATAAGATTCCAAAATCAGTCGTTATTAACCCAAGATATTAAAAAAAAGAAGAATCATCATACAAGTTTTGGTTTTCGAACCGA---CCCTGAATTTGAATTTTTTACCGCCAATCGATAGATAGATAGATTGTGGTGGGCAGATGGCGAAGGCTATAAAATGAATGATAATTGAGGTATGTATTCGTGACTCTGATAAATGTTGCTAACATAGAGTAACTGGATACCACATCTGGAGATAAACAAAATTTATAATAAAAAAA--AATAATAAGTATGTATACTACTTAGATATCGATTTTTATCGATTACT-----TGGAAACGAGGCAA-GTTATCGATTATCGAAAATAAACTTCTACTA--CGCGGCCA---CTAAGAGGATCTACATTCAAAAT--------------TTTAAGTCTCCAGCTGCTCAGGGTTT-TGAGATCATTACGTTCATACATACTTTGAGAAGCGCATAGAGAGCTCTCGCATTCATAGCGATGC-GCATTCTTATG
>Ac13E 15344813 15346676|19478 chrX 15345452 15346784 scaffold_10 1734 3253 + -5353|0 1498
GAAAATTGCGGGGTAGCAAGGCACTTGAAAAATGGTTTCAAAATTGCATTTAATGACTCTAACGGTAGGGCAGCAAGTTTCCCGGACAACCAGACCATCCGTCGTCGA-----------CAACCACAAGTGGCTAAGAGTATGGAGCTGTTGCCAGA---AAACCAAACCAGATCCAGGGGATAAAAAATCGGTG-GGGCGGGGCGAGGAATTACCCGAAGGGGTGGGGGGTTGAAAATTAAAAAAAGCAACCGTGTTTTTTGTGATATAAATGAATATGAATAGATAGAAACGTTAG---------GAACGATAGAATCGGGTAAAAGTTGCTAGTGAT------------------------TGATTGGTTAATTGATTGATCCATCGATTG---------ATTGTTGTTAACTGCGTTTTTCGGGATGGC-TAACGTGTTGGAGCATTGAAACT-----------------CCAAACAGAAGCAGACCATTCGGCATATGCAAAATATGTGTGTGTTTAAGTGTTACTAGCCGCCAGTTGACTCATCTGCACAACCAAACGAA-GTGCTTTCTTTCCATTCTACCACTGTTTTTTTTTTCAAATAGAATTAACTACACTTAATTA----AACTAATGGAAATATGTGGCTTTAAATGGTAGTAG---------CGAAATATAGATGTGGATTGTA--------TGTAGAT---TCAATGTA---CCATAGAGTTAACCCACTATGCATATAAG----TAACTAAATAACAATTTTTTTGAGCCAACGAATGGATATTACCTGTATGTATTGGCCCGTTGTTCG--------------ATGTTGATCAATGTGTGTAT------ATAAATGTACGTAGCTAAAGTTAAACGATTGCTGATTGTGTTTCGCAGACGAAGAT--------CTGTTGCCATATAAGCGGGGTTTTTTGGGGT------------------------CGGATTATTT--CGGATTTCGAAGAATCATAACCAAATGATAATTTCGTCGTCTGTTTTTAG---------CTATTACATCGCAGTAAATGGCGTGGAAATTGGT-TTCCCAGTGTAGCTTCATATATTTTTTTTAAAGTTTTTTTTCTAGTAAAGCAGTTATACGATC-----------------TACATATGTATGTAGTTATAACATGCAGCTTTTACATAAAATGT--ACCCCAGCAAACGACCGAAAAGTATGCACCAAAATGCTTGCCATACAC----------ACACAAAGACACGC-ACTCACCCACCAAA----AAAAAAAGCTT------------------TCACCACACTCACGCACACAC-------------------------------------ACACACACACACACACCAACCCCCAAGACACCGGAAAAAATAATTT-TATAGCCT---TTTGTATAAT----------TTTTTTATACAAACACACCTTTTGTG
TCAATTTTCCGGGTTGC--GGCACTTGAGAAATGGTTTCAAAATTGCATTTATTGACT---------GAACAAAATGTGTGTTGG----CCAAAACAACAGTTGCCGATGCCGATGCCGCAGTCGCAGCGAAATGAATGTTTGGGAATGTCGGGGAATGTAATCCAAATGATATGTATGTG-TATATGGTCGGAGCTGGGGGGGCGGGG-------CGTGGGGGTAGCGG-----------AAATAAACCGCATTAATTTGTGATATGTAACTAATGTTGAATATGTACGATAATTAGCTGGCACTTGAGC-ATGGAATGTTGT----GTCGCTATTGTTATGTGTTATGGCCGAAGAAGAATGTGTCAGGCGTGTTGA-GGATACGTTGATTACACTATACCATATATGCTATATACAATATATGCTATAGCATATAGTTGTGAAGC--TAAAACTGGCTCGTAGTACATATGCCAAAAGCACGCACACGAATCGG-----GCA----ATGTGTACGTTTTCTTTGTATTAGCCACTTGAT-ATGAATGTAAACTACCAGCAGAACGAGATTTACATACATGTTATATATGTATGT--------ATGCATGTGTGTATATTTAAGTGGTGTAGTTAATTTTTTTTTTTTGTTTTTTTTTTTATTATTTTTGTATCCTAAGTATGTATTTTAATTGTAGCCTAATTTATAAATGTATAAATGTAATGCCAAGATTTAAGTAAATTACACACACACGCTCTTAACTAATGAAAA-----TTTGTGGCTTTAGATGTATTTAATGTGTTTCCCTAGGCTTAAGATATGCAACATATGCATGCATATATGCTTATGCGTGTATTTCCGCGTATGTGTGTGTGTGTGTAATTATTTTTTTTTTTATTAT-TTTCTTAACTTTAAATTAATTTTATTGCAGTAATTTAAACTAGGTTTACAAACGCGTTGCATAGAACTAACCGATAAAGCAGATTAGCTAATAAATGTTATAAAAGTTGAACTTTACCATAATTT--TTTTTTGTTCCGAGAGCAGGAAACAATTAAATTGATGTTGAATGCATTCCATGTGTTATTGTTGTTGCTGTTATAAATGTTGATCTTGTTGTTTGGTGTATAGCAAATT-GTTAGACGGGCAACCTCAGCAGCAAACATACATATGCATA-ATATATAACGTACGAGTACAAAAACAAATACAAAATACAACAAACGAATAACATAAATGT-CATAAATAGATGTTATATTCTAACGCAGCAGCACAAAAGTATGCTATGCAAATTTTAAAATATAAAAACTGCTTGCCTACTGCTTGCTCAACTTGCCACACACACACACGCACAACTCTACATAAACATATATGAGACCGCCAAGCGCTTAAACACACACACACACACACAACCAACACAAC-----AACTATTTTATATAGCGTTTATTTGTGCAATCAACTCCTAATGCATTACCAAACCAAACCAAATGGA
>CG15643 15404314 15404885|19533 chrX 15402819 15405603 scaffold_5 2991812 2994455 + 66738|1521 2104
GCCAG-TCGCAGCTGACCACTGCGTTCACCTTCTACTGACCACCGTCCAGTACGATGACTCTGCCTTGTGTACAACGTTTTCGGCCGGCACACATAGACGTTCAACGGATGAGCTTTACCTCGAACTAGAAATGAGAAAGTTTTAAGTC-ATCAGCTGGTTC------GTTGGCAATATTTCTACTAAGTCAGGGATCGCTTTAGGCTAGAAGTAATACGTTTTCTCTCTTATTTACTGCTTAATTAATTCATTAATA--ACAACTATAGAACATAATCGATCACATTTTTTTTTTTTAACTAAATCGAATTTAGTTTGTATCTTTAGCCAACAGATGTTTTATAGCTCTTTTTTATGTTTAATGGCTTTAATTTTATTTTATAATGCAATATTGCCTAGCCATAAGCTATAGAAATGTGCAATTTTC-GTATTTTAGCGTTAGACGAATACAATTGATTATCCATGTTTAATTGTGTAAATAAATAAGCAGTGGATATAATCAAATA-AGCAAGAAATAGTGTGGTCAACATTAATTTATTTATATAGTCTCTTGATCAAATGAACTAACTATTTAAAACAAA
GTCAGATCACAGCCCAAAGGCAAGTGCAATCTCTATATCTCTTTGTTCGAT----TGTTTTTTTTTTTTGTA-ATTGTCGTGGGCTATTGC-CTTGATTGTCCAAA---------TTAAAATGAA-TGGACAGGTCAAGGGTTAAAATCTCTCAACGGACTCCTTATTGTTGGTACAATTGACAATTCGACAGAGTT---TTTAGT------ATAATTCGCAATC-----------CTAAACAGTTAGGGCGTTTATAGGGCAATTA------ATGCTCGA-------TTTTTGTTTTATCTCA---GGTTTTAG----------------ACATATATCTTTTAA--GTTTGCCACGTTCAATGG----------ATATCACAATTCATTCTGG---------GTGTTATGGAA-----CAATTTTCTGAAATCTATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA-TATATATATATAAATATAGCGACA---TGTTAGGGTATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGTGATATTCA-TAATGATGT-ACATACA
>CG9213 15406007 15406253|19534 chrX 15406057 15408231 scaffold_25 1133445 1135688 + 77056|0 221
AAAAATGCA------------TTGTAAAAATCAGATATCCCAAGATCATTTAAAGTCAGAAAAATGTAATATA---------TATTTTTA-TATACATTAGAAAAACCGTTTCAATTTGCATTTTTTT---TATAAAAATAAATTTCAAATTATGAAACGTCGATAGCACTAATCGATTTGTATTTCCCCCCGTCAGTATTTCGCAACACTGGTAAACAGCT
GTCGACGCACTAAAACCAACTTCGTAAAATTTAAATTTGCTACAAAAAAAAAAAAT--AAATAACGTAAAATAAGCATGCGTTATTGTTGTTATATATTAAAAAAAATATCGTGTATCGACTCTCCATCGATGTGTATATAAAT---------CGATATATCGATAG--------GCGGTGTATT-------GTGAACATTTC-CAACACTGGCAATTTGCT
>CG15645 15410922 15411088|19539 chrX 15410846 15410989 scaffold_4 3486134 3486274 + 1498|76 143
CATGTTTTAAAAATAGTCCCGAAAAAATTTAGAGAAAATATATTAGAAGTGCAGTATGCACGTATGTA
CGTTTTTTTCAAATTCTCTTATCAAAACGTAGAGCATAGAAATTTTTGGTTAGATTTGAGCGGCAGCT
>CG9215 15414867 15415022|19544 chrX 15414616 15414999 scaffold_2 1371885 1372281 - -77|294 433
GCACCACTAAGGGGCTGTCTCCACACAAGGATGGCCCCAAACTTCCCCACCCCGTACCATTTAGACAACC-AGGCTAAGAAGCGTAGCTCT-AAGAAATCGGTGTAAATAAAA-----TGGAGATATTCGGATAGAAAGC
GATCAATTGCGAGCCATTGTCTATAAGGGTATGAAATAATATTT------------TTATTTATATATTTAAAACTAAAAA---TAATTCTCAAAAAATTCGCCTAAATCAAACCAATTCGGGATATACAAAAAGGAAAA
>CG9215 15414867 15415022|19545 chrX 15415015 15415277 scaffold_5 2998693 2998950 + 6588|0 7
TATTACTA
TTTCGTTA
>sog 15438507 15439102|19581 chrX 15437408 15441753 scaffold_25 344367 348976 - 176009|1389 2034
GCGGC----TCCACG----TGACGGATGGGATCCCAAT-CCAGTATCAGATCCTTGGCGGCAGGGGAGCGAACCAATCACTCACTCACTCACCACCACTCAG--TGTACTC-----------------AGTGTGCACCACCCAAACACACACACACACACACACAACC-------------ACACAACACTCACACCCACATCTACACAGACACACAGACAGCCACAAAAGCGAGCGCGCACACAGACTTGTGCAAGGAGTTGCATAGATCGTTGTTGCTATCTTATCATGTGGCAGCAATGAGAACTTGTATTATATATATGAAAACGGAGGAGAAAACGTAGG-AGAGAAATCTCACA-AAAAATATATATAT-------CTTATGGAGGAAAACGGAGTAATAGAGAGAGAGAGAGAGGGAAGGAGAGAGCTAATGAGATCCTTGGAAAAGGACATTAAAACCAGTGCAGTTTGCTTTAAATTCTCCAGCGCAGAATTTTCTATTGAAAGCATTTTCTGAATTTCTTTTCGCAGTTACCCCACCCGTGTAACCCAATCCCCTCCCCTCCCCAACCAACAAACAACCAAAAAAAAAACAAAAAACATTAAAATACAATTTTAATTTATTACAAAACATAAAACA
GCAGCGCAGTCAACGGCGACGGCGACAGCGACAGCGACGCCAGCAGCAG--CAGCAGCAGCAACAGCAAAAGCAAA----------AGCAACAACAGCACAGTTTGTGCTCTCTCAAGAGAGCAAGAGAGCGAGCGACAGCCATGTAAACTTGTATTATAGAACAAAAGGGAAGGAAAGAGAAAGAAAACAAACACACACACACATACATGCATACATACA--CACAAAA------GCATACACAGA---GAGCGAGCG-----AGAGATCGTAGCGTAGCGTTAGACGAAAGGCAGCAAGGA-----------------AGCAAGGAAGAGAGTAAGAGATAGACAGAGAGAGCGCATATAATATTATATATATACATATACACACACATATATATATATATATATATAGAGAGAGAGTGAGAGTGAGAGAGCGTATGTGA------------------ATAACCAGTGCAG-TTGCTTTAAATTCTCGACTTTAGAATTTAGC-TCGAAAGCATTTTCAGAATTTCTTTG-------------------------------------------------AAATTTTTAAAATTCATATGAAAAACTGTGCTGTGTAATGTTCGTT-------AAACATAAAAAA
>CG9240 15534103 15534342|19690 chrX 15533019 15534209 scaffold_46 208560 209658 - 32863|1104 1212
GACTTCTGGTTTTTG-CATATCATTGAAAATAAGTTGAAAAAAACAGGAGAGAATAATAATTTCTTTTCATTTTTGTTTTTAATAAACATATTTTTCAAAGTA-TGAAG
AATTTATAGTTGTTAACTTCCCTTTTAATGTAAATT---AACGACCAGTACAAATAAAAGCT--------------------GAAAACATGCATGACAAAACAGTTACG
>CG9245 15535382 15535940|19692 chrX 15534722 15537414 scaffold_46 210050 212593 - 32791|799 1418
AAATGGGATGCGATCCGGGATCAATCTTCCAGCGACAGTTCTATCAACAGAAAGTACTAAATGAAACAACTCTTGATTCCAAGCTAAAAAAACAGAATTTTGAAGACGAATTGCGATCAGATGAAATATGGGCATTAGGCAACCAAATAGGCCGTAGTAGGAATTTAATTTATTTTTAATGCGCTATTGCAATGATTGTTGATTTTATTTGATATATTTTAGTTAG---------ACGGGTGGTGAAATCACCCGACAATT-TGTATTTAATAGATTTTTGAATTGAAATTTAAGCGATTCGTTCCAGTCAGTAGCTGTTGCATATTTATTTTGCCTTTAGTTAGCGTAG-----------TTTACACGCT---ATATATGTATATATATGCCAATGCGTAAATGCAGGCCGATATACTATGAATGAGTGTCTATTTCCAGGATTTATCTCACTGTGCACGTTTTGGGTTTGACTAACCACCTTGTCCCAGCAACTCTCTCAATGTAACTAATG-TATTTCTAA-TCGTAAGTTA------------------AAGAATGTAATTGGAGACCTG--------------CATGAAATATATACGAC---AAATGGATGTTA
TAA-AAGCTAGAAACAGGAAAAAA-----CAGAAAGAATGAAGTAACTA--AAGTACGAAGCAAAACAA---TTGATTCCAAATAACTAAAACAAAA-----------------------------------------ACAACTAATTATATTATAGTTTAATTTTAGTTA----TTAGTTCGCTCTATCGCTATTTGTTGACTTTATTTTGTATTTTTTATTTAATATATATTTAATTTGGATGCGGGCGGGCGACACTTGTGTCAACAGGTGATTTAAGCATTAAAATTAAATTTATATATA---------------TATATATATATATTTGCCTAAGTTAACGTTAATTTTTGAATTTTGTCACGCTTATATACATATGTATATATATATATACATAAGCGAA----------TTGTTAATG---GTTTAATT--AGAATTGATGTCA-TCCATTTAATGTGAATTTTCATAA--------TCTAACCAACTAACTCTATGTATTTAATGGTATAATTAAGTCGTAGCATACAATTGGTACCTTCCAAAAATAATGCAAGTCGTGACCTGGCAATGGAGCAAACTAAGGTATATGTATGACTGCCATCGCATTTTC
>CG9245 15536450 15536599|19692 chrX 15534722 15537414 scaffold_46 210050 212593 - 32791|1932 2081
GCACTCGCTTTGGCGCCATGCTAGACCAGTTGACCGATCGCTGCGGCACCACCGGCCTACTGGTCACCCTGGCCTACTTCTATCCCCGGTACATGTTCTGGTTCCAGCTGTCCATCGCCATCGACGTGGCCTGTCACTGGCTCTTCATGC
GCACACGCTTCGGCGCCATGCTGGACCAGTTGACGGATCGCTGCGGCACCACGGGTCTGCTGGTTACCCTGGCCTATTTCTATCCCAGCTACATGTTCTGGTTTCAGCTGTCGATCGCCATTGATGTCGCTTGCCATTGGCTCTACATGC
>CG9245 15536750 15536965|19692 chrX 15534722 15537414 scaffold_46 210050 212593 - 32791|2244 2463
GCACGCCCTAAAGAGCCCGATATGGTCACGGCTATCCAGCCAATCGATGGATGACGTGGGGCTGAAGAATAGATAGAAAGCATGGCTAATATTGCCTTGGAACTATGCAA-TGTAGTTAGCAATATAGGAGGAAAAACATTAGGATAGAAGCCTTCTAAGAAACAAATTGCA-GATACCATGCAATGTTTATGATATAGTAGT--GTAGCAAACTGAAAG
GTTTGCC---AAGCGCCAATCATCGACCAG------CAGCCGGCC-ATGACTCACGTTG----------CCGGCCAAAAGTACCGCTAATGCTGGCC---ATCTATGAAAACTTACTTATGCATGTGTTTGTGCACACATTGGCCACATACGTGTCCAGAATTTATATCGTATGATGCCAT--ATTGTCTCGCAAACAGTGGCCGGTATTAACCGGCTTT
>CG9281 15539743 15540869|19694 chrX 15538162 15542912 scaffold_46 213560 218599 - 169809|1769 3120
ATATATCCCATATCCAGTGGATAGATAGCTGCCAACG-----GCCACACACTCGCACACACACAGTCGCGCATCCAAAACACCCAAACACACAACCAAACGCATCCCTCAACCGAAAGGACATTCAGACCGCTATCCCTTCTCT---TCAATAGGCGGCGGGCGACATCCGGCTATTGGGCTGCCCGTTCGCTGCAATCCATTCTGTGCGAAATTAGTTTTGCGTTTACTCTACGCTATAGTGAAGTCACAATTCGATCGGCCAACCAGTAAAATAATCAACAATAAAACTAGAACGAACCGAACACCCAATCCAAACCTATCCAATCACAACCATGCGTAACACAACCGTTGACAACTCAACAGGAACACACAAATTT-TAGCTGAATTTTTT--CTTTTTACGTGTCGAATTAAAGTTATAAAATTATAAATATATACAATTACGAAGTGGACA--GGCAGAAAGAACTATAA--------------------------------------------CTTATAAATACAACCAACCAACTATATACA-----------------------------------------AAACTGCTTGTGATCTTGC-------GCTTATATAATTTCGTTTAATTCTTCGCTAG-GTTTCATGTAAACATATATATAAAAAATGA---------------------AAAGTGTACTTTATTTTTTTGTAATTTATTTAAGCCTT---AACTATAT----ATTTAAAAATTAAAAAATCTA--AACTACAACAACAGACGTATGAATGATTAAGCGAATAGTAGTCGCAGCAAATTGTGTGA----GAAACGATGTTAA-ACTGCCCTCCCAAA--TCGGAACC------GTGATTTAGTTGCTCGCGGAT------------TCGAACAAGACA-ATTAAATATTCTTCGATTCGA----------TTTAAAACACA----ATGCAAAGTAAATGGAAATTGTAACAGGCT--------TAGGAAGGATT----AATGGGTATTACATGAAACGTACATGCATA--------------CATATATGAAAATTTACAAATTACATAAACAAACAGA----------TATTATAGGATATTTAACAAATTGGAATTGTAAACTCCAGCGAAAAACAAAAAAAAAAAAAGTTTTGTAAGCAAACACAAAGAAATCACGAAATTCGATTCGGAATATCAGTTGTGGCACCCGAAGAGTGTCGCAT-------------TAATTAGCTAACTTAATTGAGAAATTGCTAAGAAACAAAAAACAGAAGTTGCTTGACAAAGGTAAAATAAACAAATTAAATGACC
-------------CGAATAAATAGATTGCACACAACACACACAACACACACTCA-ACACACACAA-CACACACTCAACACACAC-AACACACACTCACACACTCAATACAGGCATAGGTTGATCCTCTTTCTAACTCTTTCGCTCGCTCGTTCTGCGCCTCGCT-CTTTCTTCCATAAGCATGCGTGTGTGC----------GTTGTGCGAAATTAGTTTTGAGTTTACACTACGCTATAGTCAAGTCAT------------------GTAAACTGTTCAACATCAATA--------AACTACACACAC-ACACACACACACACATACACAACA------AACACAAACA--AACAA--CAAAAACAACACACAAATTTATAGGTGAATTTTTTTCCGTTTTCTGTGTCGATTTAAATTAAATAAAATGTGAGTCAAAAAAACAACCAACAAAACAACAACAACAACAACTACAAAACTGCTTGTGATCTTGAGTTAAAGCCACGTTTTCAATATATTGTTCACAAATACAAATACACACACATACACATACACACACACACACTGTAACACATTCATGTTGTGCACAACAAACTGTACAAAATATTGCAAACGTGGCTTTGGCTATTTAATTTTTTTTTTTTTTTGTATTTTTTATTATTATTTCTAAAATAAATAATATAATTTTTATTTTCAAAATAAATAATTCTTTGCTAGGTTTCAAATTGTTTAACACTCGAAAACTATACAAAAATACAAAAACAAAAACATATAGTAAATATATATACATATGTGTGTATGATATGCATAAATATACAATTAACAAATTGCAAGACCAGTAAATGTTATTGCTACTGCCCTGCCACGCCCCGCTACCCCTTCGCCGCCCCACTTACCCGCTGATAGCCGCAGCCCCCCACCCTAGACACAGGCAGCAGCCGCCGCTTAGAAATTCTAAATATTTAAATACAATATATGTAATACAAACTGATGAAATAACAGATTTTATAGGCTATAAACAATTGGAAAATATTTGTTGTGCTAGACTTAAAATCGCAGCAAGTTTTTTTTCTATATATACAAA---ACAAATTCTAAAACTAAACGAAACGATGTTTTTTTTTTAGG---CTCAAGCGATTCATATAATAAAAT---ATTAACAACAAAAAGAAAAAG--------AAACAAAAACGGAACATTTTAGGGTTTATATGTATCGTAAAAATTGTTTGAATAAAAAATATACATATATATATATATATATATACATATACAATACATGCGAAATATTAAATAAAAGAAAAATAAAAATTAAATAAACAATTGGAACTAATAAAAATAGACGACG
>Actr13E 15569710 15569773|19711 chrX 15568978 15569789 scaffold_24 763664 764630 + 15165|902 971
CATGCACGTAGTCGAAGTATTTTTTCAATAATAAACTTGATTTGC------ACATGGGTTTTCTAGAACA
AGAGTGACAAGTTGTTAAATGTGTGAAATAAGAA--TAGATTTGTTAGTAAACAATTATCGTTTCGTATT
>CG11679 15571426 15571500|19713 chrX 15571396 15572992 scaffold_26 331708 333291 - 60996|30 104
CAAGTAGGCTTGGTCGATAGTTTTTTGTACTATATTTGTATTTTGACGAAATATAGAATTGTTAGCGTTCCAAAA
TGCCTAAGCTGCGC-----ATTTGTTTTATATGATTTGCAGTCTG--TAAATTTGTGCCCAACAAAATACAAATC
>CG8944 15575272 15578686|19716 chrX 15575169 15575855 scaffold_28 626710 627486 - 1435|108 834
AAGCTTCATCCTAAGCCTAAGTTCATTTAGCACAATT--------TCGCAGAGTATCCGGCT-------CGGCGGCTA-------------------------------ACTCATTAATGCG------AAATTAGCCAAAATCCAAGACAACGCCTATCCA-----------------------AGGTACGTTGGCGCTTCCATTGGATTTGGGAT---------------TCGGGATTTGGAGGGCGAGCATTC-----AAACAAATTGTGAAATAGTTAACAGAAGCGAAATGCGAGGTGACAAAAATACAAAACAATTTAGAGCCAGAGGGAGATTAATAATCACAAGAATCGTAACAAAAGTGCGCTTCC-------------AGGAGAAACAGAAGGAAAAGA---AAACAAACACCACAACCTACAAAACAAGCAAAGAGAAACTCATCCGAAAAAAAGAACGAAATATTTAAACA------AACTAGCAACGTAATGAATATGTATTTTA--------------AACCGTAAGAAACGTCTTCGAAACATGTAAATTAACTG--------AGAGAAATGATGGCAGAAGCAAATCACAATTTTATTT----ATCTTAGTAATACCGAATGAGATTTTAGTACCATACAATATATACACACGCGTATTCGAAGTATTCTCGAATAAATAGGTTTAAATAATTATTTAAAAAGCAAGCCAAA
AAATTCAACCCTTAGCATAAGTTCATTTAGCACAATTGACAGCAACAGCAAAGTATATGTATATGTATGCAGCAGCTACTAGTATAATTAAGTATTTGGATTACAATTTGCTTACTCATATGCTTTAAGAACTAACTAATACACACACACACACACACACACACAGAGAGAGAGAGAGGGAGAGAGATGCGTTTGCCTGTGTGTGTGATTTGAAACACTTGCGTATATCAATTTGAATTTTGTTTTTGTGTTTTCTTATGACAAAACTTGCGAAATAGTTAACAGCAGCTGTAAGAGATTTG----------AAAACGAATT-GATCCAAAATTCGTCTAAGAGGC--------CGTAAC-AAAGTGCGCTTCCTAAAACTATTTAAAAGAAAAACAGAAAGAAAAGAACGAAACAAATATTAAAAAAAAAAAAACATTTAA-------------CAATACAAATACATTAATATATACACATATACCTATTAGCATATTTATGTATACTAATTTAAGCAAAGACAAAAACAATTGCAAGACAAAAAACAAACAAACAAAAAGCAAATGGCGCATACAGAGAGATTATCATGGGCGCCAACTTCAACCACATGTGTAAATTTCAATAAAA---AATATAATTAAAATTTTATTCATTTTGGA---ATGTGTCATCGCA-TATCATC-AACATATACATACATATATCAGCTTGTAGAGCCCA-TAAG
>CG8944 15575272 15578686|19717 chrX 15576320 15576363 scaffold_28 628370 628412 - 2761|0 43
AAGTATTTCATAAAGTATTCTATGTACTAACTATATATTTATAC
AAGTATTTCTTAAAGTATTCTATGTAC-AATTATGTATGCATAC
>CG8944 15575272 15578686|19718 chrX 15576909 15577150 scaffold_17 2483831 2484107 + -896|0 293
ATAGGGATTGGGAGAGGGACAA----GGACAAGGACTGG----TCCAAGGCCAAGAGTCGC--------GGTAGGGGGCGCGG-ACGTGGTCGTGGGCGTGGTCGCTATGTCAAATAGTTTTAAATTTAACTAAAATTGAAACTGTAACTGCAACTGTAACATCT--TTAAATTGCCAGCTACTTAGGCAACTTAGTTAGCTTTCTTAATCTTAGT----------------------TTTAGATTCACTCGATGTTCAGATCTA-----------TTTTGCAATTTGATTCAG
CGCGCCTTCAAGGAACTGTCCACCCTGCACAACCACCAGCGCATCCACAGCGGAGAGAAGCCCTTCAAGTGTGAGGTGTGCGGTATGTATTAGTAGG---------------AATTAGTTAACAAATAAAAT--AATTGATGCTTAATTTGAACCAGTGACTTTTCACTAGCTGGTCCGACGCTCAGTCAAAAAATTTACTATGTCTAAGTTACATAGAAAGAAAACATCTGTTCCTATTCAGATTGACTCAATGTATATACTTATACATGCTATCTATTGCAATTTGAACCAG
>CG8944 15575272 15578686|19719 chrX 15577151 15578441 scaffold_28 629133 630348 - 64927|0 1299
CAACTCGTAAATGCCTAATCAAAGTTGTTAGTTTTGTGGGGC---TTATCAAATGTCAATCAATAACTCTCATCCTTCCGACAGGAAACCTCCTATCGCCGCCGCTTCTCGGCCATTTGGAACGATACGTCTACTGCCAAGCTGCTGAGCATGGTGAAGCGGTACCAGTGCTTTTACAACCGCTTCGATCCCGACTACCGCAGCAAGGAGCGACGCGGCGAGGGACTCCATCAGATGGCCATTGAACTGCAGCAGCTGATCGATGTGACCACCATCCAGATATCAAAGCGCATTTCCCAGCTGCGATTCGATTACTCCAAACAGAAGATGGAGCGCCTTAACAGCGAGAGGCTGGGCAAGAAATTCATTGCGAACTATTTGTACTACGATCAGATGCACTTTATGGACGACGACATTCCGCCATTTAAGTGCGCACACTGCCCGGAAATAGTGCAAACACTCAGGGAACTGGACCTCCACATGCTCACCCACCAGCCTAGTTTGGGTGGCGGTTACTATTGCAACATCTGCAGCATACAGTTCCACAATGCCCAGGAGTTCGATAACCACAAGCAGTTGCATTTGGGCGGCGTAACCGAGATCAAGTTCAACTGCGAATTGTGCACGGCCAGTTTCCGCGAGAAGGCCAACTATGATGAGCACCTGCGGCGCCATAACGAGGAGCTGTTTCTGCCCTCGCTGGCGCTTAATCACAGCATCATGGAGGGCGGCCTGGGAGATGACGAGATCGGAGTCGAGGGCGAGGAGTCCAGAGGCAGCGGCAGTCGCCGCAAAAGGAGGC--ACGCTGCGAAAGCAACCGATGACATGGTCGACGATGATGATCGAATTGGCGGCGGTGGTGGTGGTGGTTCTGGTGGTGGTGGCACT-GACATTGCCAAGCCGTATGGATGCGATGTGTGTCGCCGCAGTTTCGCCACGCCGGGCCACCTGAATGCGCATCGAATTGTCCACCAGGATGAGCGGGAGCGGTGCTATAAATGCGACTATCCGCAGTGCAATAAATCGTTTGTGGCGCGCAACAGCCTGTTCGAGCACCTGAAGCAGCACTACAGCAACGAGGAGTTCAAGTGCGACATTTGCGGCAAGACGTTCAAGTCGACAAAGAATCTGCAGAACCACAAACAGATCCACGACAAGATCAAGCGCTACGTCTGCCAGATATGCGGTTCGGCATTTGCCCAAGCGGCCGGCCTCTATCTGCACAAGCGTCGACACAATCGACCCAATGGTGCCGTCGGCGCTGTTGGT---CGTTCGGGTCGTAGCAGTCTGTGAG
CAGCTCGAAGATG--TAACAAAGCCTGCTAGCTATTTAGGATACTTTAGTAACTGATGGCATAT--------TCTTTCC--CAGGAAACATCTTATAGACGTCGCTTTTCGGCCATTTGGAATGACACGTCCACCGCCAAGCTGTTGGTCATGGTGAAGCGGTATCAGTGCTTTTACAATCGTTTCGATCCCGACTATCGCAGCAAGGAGCGTCGCGGCGAGGGCCTGCAACAGATGGCGATGGAGCTGCAGCAGTTAATTGATGTGACCACCATACAGATATCGAAGCGAATCTCTCAGCTGCGTTTCGATTATTCGAAACAGAAAATGGAGCGCCTGAATGCGGAACGCCTGGGTCGAAAATTTATACCCAACTACATATATTACGATCAGATGAGCTTCATGGACGATGATATACCGCCATTCAAATGCCAGCATTGCGGCGAAATTGTGCAAACGCTGCGCGAACTGGACCTGCACATGCTCAGCCATCAGCCGAGCCTAGGCGGCGGCTACTATTGCAACGTGTGCAACATACAGTTCAATAATGCGGATGAGTTTGAGAATCACAAACAATTGCATTTGGGCGCCGGCAATGAGGTCAAATACAATTGTGAATTGTGCACCGCCAGCTTTCGGGAAAAGTCAAACTATGATGAGCATTTGCGTCGACACAACGATGAGCTTTTCCTGCCGACACTGGCCCTGAATCACAGCATACTCGA---------------------------------------------CAGCGCCAGCGGT--------------GAGGCTGACGTTGCT---GCTGGCGTTGACACATCAGCTGCTGCTGGTT---CTGGCGCCGGCGATGAGGAGGAT-------ATGTTTCCACCGGACGGTCCCAAGCCGTTCGGCTGTGAGGTGTGCCATCGGACATTCGCGACGCCGGGCCATCTGAATGCGCATCGGATTGTGCATCAGGATGAGCGGGAGCGTTGCTACAAGTGCGACTATCCGCAGTGCAGTAAATCGTTTGTGTCGCGGCACAGCCTGTTCGATCATCTGAAGCAACATTATAGCAACGAGGAGTTCAAATGCGATATCTGTGGCAAGATCTTCAAGTCCACCAAGAATCTGCAGAACCACAAGCAAATCCACGATAAAGTCAAGCGCTACGTCTGCCAGATATGCGGCTCGGCATTCGCCCAGGCCGCTGGCCTTTACCTGCACAAGCGTCGTCACAATCGTCCCAATGGCACCACCGGCGCCGTTGGGGGACGCTCCAGCCGCACCACGCTGTGAG
>Graf 15585611 15586169|19729 chrX 15585387 15585766 scaffold_4 1584276 1584681 + -59|252 426
ATGTATAAAAATA----AATAGCAGTGCTTCGCTCACTTTTAAAATGTAAACTTTAAACTGAAGTCTGCCATATACCATATCAAAAAAAAAAAAATAATAATA-TAATAATAATAATAAATATTTTCTTAGCAAGGCAAAGAAAACGTA--------------GAATGTTGAAAT
ATATATGACAATATACTGATCACATTTTTTCTCCCAGTTTTA------------TGAGCAGGAGATTTTCATCTGAGAAATTCATCAATAGGACAGACACATGCTGATTATATCGATCAACAGCTCATCATCCCGATCAAGAATACATATACTCTATGGACTCGAAGGCTAGAAG
>Graf 15585611 15586169|19730 chrX 15586164 15586464 scaffold_10 1676361 1676690 - 10515|0 5
AATTTG
AGTTGG
>CG8952 15599407 15599443|19742 chrX 15597009 15599417 scaffold_25 239268 241669 - 133608|2430 2440
TTTACTAAACC
TTTGCCAAACA
>Paf-AHalpha 15617946 15618251|19768 chrX 15618155 15619002 scaffold_48 728288 729149 + 40755|0 96
AAGGAATATCCAGCAGCTATCCATTATATATATACATACATGCATACATACACACATACATATACCACAAACAATTCCCAGAATATAACTTAAAACC
ACTCAAAATGCAAAAA---------AAGAAAAAAAAAACAAACAAATATATACATATATATAAAACTCAAACAAT--CCAACAGAAAACCCAAAACC
>CG8974 15627656 15628037|19779 chrX 15627506 15627689 scaffold_10 1549562 1549761 - 2055|165 201
AAATTCGATAAAACATTAAA---AACATTTATTTCAA
AAAATAGGTTACGTATCGAATACAACATTTAAATCGA
>CG8974 15627656 15628037|19780 chrX 15627996 15628800 scaffold_10 4503894 4504726 + 30716|0 46
CAATCTGCGAACGCATAAAGACATC-----ACCCCGATAAGAAGAAC
CAACCTGTCGACGCGGCAGCCCTCCACTAAACCCCAACAACAAGAAC
>Chc 15661923 15662208|19818 chrX 15661814 15666066 scaffold_10 1738638 1742923 - 248126|113 446
GACTTGCGCCCGATAATGAGATCATC---------AAAACAACTTTAAAAACAAATGTATCAGCATTAA----AGGAATACCAATAAAATAAGAAAAATAATCTATTAA--------------------------TTGCATGTGCGCCAAAAATTACCAAAACGA-AACAAC-ACAGTAAACATAACTTTGAACATCATTATATTAAAGCAATGCAATTAACAATCCAATTTTTGGTTTGTTTGTAGACAGTTAAAAATTGATTATATGTTTTGATAATTACAGCA---CTCTTTATTCAAA----TATAACAGAATATATTACTTTTTATCAT
-----GCATCCAACAACAACACAATTGTAGCTGTAACAACAACAACAACAACA-----ATCAGCAGCAACAACAGCAACAACAACACCATTAACAACATAAACAATGACAACTGAATGCCGCATTCATTATTCCTTTGCATGAGCGCCAAAAACGACCAATTCAACAACAACAACAACAACAACAAC----AACACCAACACAACAA-----------CAACAACACGCGTAGTAAAATATGTATAACCATATATATATAACATATATATATATAAATATATATCCATTTTTTTTGTTCATAATGTTGAGCCACAAAAAAGTTGCCTTTGACAG
>Aats-arg 15675700 15675778|19832 chrX 15675458 15678038 scaffold_14 529427 531763 - 75531|247 336
AAAGTTCTACTACTGACATCATGTGTACGCGAATAAAATGAAACATTTTATAAAAGTAAAATT-ATATAC----------CTTGAAAAGA
-----TCTAATACAGGCAGCGT---TACTAAAAAAAAAAAAAATTGTATCTAATGCAAAAATTAATAAACTACTCGGATTTTTCAAGTAA
>sun 15681356 15681941|19840 chrX 15681131 15681472 scaffold_16715 565 892 + 5958|225 374
TAATTTAAATATATATATATATATATTTTTAAGG------TAGAGTATTTTGGATT------------------ATCCTTCAAAAATTATCGATTTGCTACCACTAAGACCGATTAAATTG------CTACCGAAGTGCTATTT---CAA
TAATTTAAATACATGTACCAAT---TTTTGAAGGATTACATAAAGTAGCGCAGGTATATAAAAAAGTAATTTAAATATTTTCAAATTTAAATATTTGCTA----TAGGGCCTAACTAGTTGACTATTTTACAGATATATTATCTATGCAA
>sun 15681356 15681941|19841 chrX 15681475 15681706 scaffold_2 969195 969427 + -1683|0 247
ATAGACTCAATAGAATATTGTAATTTTGAAAAGAACTATTGGTCAGGTTCACCAGAAGCCTT--------TTAATTGGGATCAGTGATAGGTTTCTTGCTATAA-----TTTTGTCAACGCATATTTGTA---TAGAATGATTTTATACACATAATGCTGAACCAATTGAATTGTTACTTATATTTTGCGCTTTAAATATACACATATAGACATTATTTATGTTAATTATTATCCAGTTAGTTTATAT
GGAAA-TCCTCAGCATGATAAGAATTTTATTTAGTTTACTCGTCAAATATTT---AAGCCTTCTGCAAAGTTATATTCAATTTGCGTGAAGATTAATTCTGAAAAAAATTTATGAAAATGAAAAGTTTTACGCTCTAGAGATTTCATGAGCTT--TAATTAATGTAATAAATTGTTGTATATATTTG-------AAATAAAATAAAATGTGAAATATTTGTGCGAA--AATACAAAGCGGAAATATAC
>sun 15681356 15681941|19842 chrX 15681707 15682610 scaffold_10 633288 634194 - -1416|0 263
AGCGTCAAACCCAATCGGAATCCTAGATGC----TTTTCAGTGGCCACTCGAG---AATGATTCGCAACAACTAAGATCCGCCGAAGCTGCAA--------------TGTTGTAAAATCATGAAAAATAAATAAAATTAAATAAATGTAATTTATTTAAACACGATGATTTTAATTGTTCTTAAATGTGGCATTTATTTGGGCGTTCCGTTTAGAGATCGCGACCGATGAAAC------GGACTTCTAGCAAA--GATTTAAAT
AACAT-AAACCCGAAAGACATTTTGGATACGATTTTTTAAATGGTTATGCGAGGCCATCGAATAAAATAAATAAACAAATGCCGACGAAGAAAATAGAAATAAAAATTTTTGCGGATTGCTGGAGGCCAGCTACAA-CAGCTGGGTACAAATTAATTGAAAGTGTTTTTCTTCGGCGACGTCATACGT----TTTATTTGAATACCCTGACTGAGGAGTACTGTAGATCAGGCCTCTCAATATGCCTAGCAAAAGGCTTTAGAT
>sun 15682235 15682270|19842 chrX 15681707 15682610 scaffold_10 633288 634194 - -1416|578 615
GTGTTCCATCGTCAAATTAAT--AATTTAAAAACTGGC
ATTTGTGATATTTGCATTACTGCAATGACAAAGCTCGC
>Myb 15688769 15689003|19851 chrX 15687256 15688913 scaffold_48 723644 725308 + 49339|1543 1703
CAAATTGTGTTTTCGAAATAGAATTTATTGTGCTACATTTATGGCATTATTGGTTACATCCACCTTAAA-----------TTGTATCCCATTTTTTTCGGATATTTCATAAATAAATAAATGCTTAAAGTGAATGAAGCGTGTTTTAACACAA-----AGG
CAATTCATATTTTAACAATTGTATACAAAAATAAACATATATAGGATAGTTGG---CAAACATTTAAAAAGAGAGTACGGCTGCATCTAAGCAATTGTGAACATGTCGTATTAACTTATGGCTTTCAACTATATAATTATTATTTGTATATAGGTAGTAAT
>AlkB 15692071 15692134|19853 chrX 15691927 15692145 scaffold_994 2255 2459 - 831|144 207
CCCCTCCTTGGAAAAATTTTTAATTTTATAGTATTTTACAAAATAAAAAACTGCATTTCAATTG
TTTTTGTATATAATACTATTTATTCTGTTGGCATTTCGCATATTAAGAAACCGAAAAT-GATCG
>CG9056 15710620 15711171|19881 chrX 15710595 15712528 scaffold_69 18063 19878 - 43609|25 610
TAGG----CGGCAAGTCGTTACTAAACGCCATTGGCAAGGCGAATAAGACAAAGGAATTTTCAAAATTTCGATCACCTCCACCAAAAAAATGTCATTGTCATGAAAGAAAACCCATGAATGAAAGTCCCATCCTGATT---ACCTCCTCCCAGCATCATTTTGAGCCTGAGAGAACACCAATAAATGAAGCGCAACGCTTTTGTAAACTACACATAAATTCTTGAACAGATGAAAATGAGATTACGATGAAGATGAAGATTACGATACAGATGAAGAAGAAGATTACGATACAGATGAAGATGAAGATTACGATGCAGATGCAGATGCAGATGTTTGTGGCAAACAAAAATCAAAT-TAAAAGAGGTTAAGACTTCCTTATACTTCAGACCTAGCATTCAACCTAAGCACTGAGTCCCCACATTGGCAAAATACTTTCCTCGATCTTAATATGGTCGCGCGTTGAAACGTCACATAA-----------------------GTAATACG--AACTTTACTTATTTTTAATGAATACAAATTACAAGCATAAATGTAAC-TTTAGGTTCGCGTATTTAGTTTAAGTCT
TAATTTTCCAGGAAAACTATACAAAACTTTTTT---------------AAATAGAAATTTTAAAAATTTCAATCACTTCCATC---------CCAATGTC-----------------AATAAAAATTTTGTACTCATTTGCCCTACCTCTAAATTACACCTTTAGCTTGAGGAAAAATCAAGATAGTAAGCGCGACGCTTTTGTA------ATATAAA--------------AAAATGAAAATATTTATTAACTGAATTTTA--------ATAAGGCGAGATACAACTGTTTAAATAAAAAGGTAGGCT-------------------AAATATTTAATCTAATCAACATTAAGGTGGAAAAAATATTTCCACTTCACTGTATTTTGTATTAAG---------TGGGCTGTAAGTTTTCGCA---ACAAGTTGCTTCCC---AACTACATCTATACGTAGCGAAAAACGGCACATACTATACGTTCTCGTATATGCAAATATAATACATTAAGTTTATTTA-ATTCACCGATTACCTATT---AGTTTAAATTAGATATTTAGGTTTG-GTAT---GCTTTAATGC
>CycD 15740757 15741210|19917 chrX 15740089 15740869 scaffold_17 1779482 1780184 - -1449|687 806
TATTAAATGCAATTTTTTTAAAAACCATCCAACATAA-------AGAGAAAAACAATATGTTAAAGTTAACTTTGGATAACAATTATATAAGTTGGCAAATAAATGATAGAAAAAAGCAA
TATTTAAAGCGGCTCCCTCAAGAAC-GTTAAACAAAATCGTTTAAAAAGAAATCGATATGCTTAATTTAAGAATTAATAAGAAATAGTAGATTTAGAATTTAAAT----GAATAAAGTAA
>CycD 15740757 15741210|19918 chrX 15740906 15741790 scaffold_76 7395 8188 + 3594|0 323
GGTGTCAAATGATA-GTTATGCATACATGATAGTTATGTCAGGCTTAAGTTGAAATTATATATAGGATCCAAATAGTCCGATCACTATAGGATTGGCCAATATCACACTATTTACATTTGAATCGATGTATTTTATATGTACGCAACTATTTTTTACCAAACTATGGGTTATTATTTTT---AGCTATCCTA------AATATTTTGTATA-AAATAGT-TTTAAATAATCATCA-------TGAAACTTTGAAATGGATGAAACATAAAAACGAGACTGATTGTAAGCAGCAAAGCAACATTTTTTTTTTGTATATAAGCTTT
A--GATAATTTATACGCTTTTCCTATTTTATATTAATATATGCCTCCCATGATTTTTTTATATCG----TAGATAGAAGGATGTCATCTGGACT------TATCTGAGTA--TAAATATATATTATCAAAGTCTATATATGTATAGCT-TTATAAAGACAACTGTATATAAGTATGTTTGTAGGCTAACCTACAACGCGATATATCATTTATAACTAGTATGGAAACAAATATTATATTCAGTAATGGTTTTTAGTACACGTACAATGGACATAAGACTATTTTT---------------GTTTTTTTGTTATTGATAAACTTT
>Stim 15768837 15769187|19943 chrX 15768702 15769322 scaffold_140 152 697 - 4485|136 489
GGCTTGTGCGCTCGGTCTGTGAGGACAATAAAACCCAGCTCTTCAGAAAAGCATACTACTTGACGAACTAAATAAAATTATAAAACCGCTTATTGAACCCTGAATGAAATCTGTTTTACATTAAGCTACTGTATTAATGAAGGTCATATAACATTATGTG-TGTGTATGATATTTTAATCTTTATATTTGTAATATATCCATTTTATTTTTGATGTATACAAAATGTCATCTACTTAATTTTTTGTCAAAAACAACG-AATACTATAAAACCATACTGAGTTTTGTACGTAACAATGAACTTATGAATGGTGATCCA-CTTAGTGGATTATTTAAATAAAGAAATAAAGTATTA
CTTTGTTGCGTTTGA-CTGGAAAGACAGCAA------------TGGAAAATC---CTACCTTGCGGACCCAACAAACCTACA-----TTTGATTGACC-----AACAAACATATTTTAAATAGTTATATTCACCTAATTA---CTTTTTAAAATTATTTGTTATGTTTGCTATACT-----------------TATATACAT----------ATGCATACGAAATA-CAGTTAGTCAAGCGACTATTAATATTAACGTCTTATTATATAATTTCATTATGAAATCAAGGCTGCAAATCGGTTGTTGGGAGACATACATCATTCTGGAGATTTTAAAACTTAAAAACATATATGT
>mmd 15792255 15792369|19980 chrX 15792183 15792608 scaffold_838 6171 6581 - 21574|78 196
TGAAAAAGCCAGCTTTAAATAC-AAATACAAATTACAACCACAAAAAGAACAAGCAAAAAAAAAAGTAACATAAAAATATATTTTTTAAAACTTCCAAAAAAA---AAAAAAAGAAAAG
TGAAAAAGCCAGCTCTAAATACAAAATACAAATTACTACAACAAAAAAAAAAAAAAAAACAAAAAACAAC-------------------AACTGCAAAAGCAATGCAAAAAGTACAAAA
>CG9172 15819781 15819947|20007 chrX 15819510 15819854 scaffold_6 114925 115310 + 419|339 415
TCAGTTGTT---GTATACATTGTTTGTTGGATCACGAGGATATTGCAAATAAATGCCTTTCGATATAAATACAAACA
TCTCATATTCGAGTATTTAGTTTTTGTCGTTTCCCATGAAAATTGCAA------GGTGTTTGGCACG----------
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GGCAACGATCGGAACTTATATTTAAAATGTGAAACATCAAACGACATACGATTTTGCGAACAGAAATCATATTAAATATCGTTCTGTTAACGT
AGAGATAGTCTCCAGTTAAAT---AAGCAAAAAGTGTTAAATAA-ATATTG-TATGCAAATATAGGCAATAGC-AACAACGTTTTTCTAGCAT
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AAGGAATCA
GCAGCAGCA
>vap 15834071 15834373|20027 chrX 15834105 15834147 scaffold_46 904580 904621 + 1184|0 42
TATTATTATTATTACAAATTAAAAATAACCTATAATACACTAG
TATTATT-TTATTTCAAAATTCAAATAAAATAAAATAAAAAAA
>vap 15834071 15834373|20028 chrX 15834263 15836665 scaffold_46 33531 35922 - 135440|0 110
AATCAATTGCGAGGAGAGCGGATAATAAAAAAAAGCGATGTCTTCTTATCTACAAGTCCCTTCATACCTTTTTATAAAAATATTTATATGTGTATACTATTAGAATACATA
GAT-------------------GAACAAACGACAGCAACAGCAAC--AGCCATCAGTCAGTTTATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAGTATATACA
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TTAGCA------CTGGGTGTTGCACTTTCTAGCGTTCTGAGAAATTGAAGTTCATCGACGATTGGACAAATTA-GCTGTGAAAACACCGAGAACGCATCTTCGCCT--ATTTTCCTGTTGAATAGTTATTGTAAATAATGCCAGCTACATATGCAATCATTTAATTTTTTTTTTAAGTATAATTAAGGTCAAAGTGGAAATTT-CTATCCAACATTTTTACGAACCTCTATGTGTGTATCGCCTACGACCTTTGA-ATTTAACAAAACCAATTTTGTTTTTATAAAATAAAGCAATTATGAAACTGTTATAAGTTAGTTTTTAAAAC---AGATCCCAAAATAT-------------------AGTAAATGGTATTGGATATTAATTGAAA
TCAGCAGACCGGCTCTGTGTCTAACTATTT---GATTTTAAATGCTGTGAAACATTGACTA----ACAAATAATGTTGTACCCCCCTCTATCACCGCTCTAACCCTTGCTCCTACTGTTGAAAA---CTTGTATATAATGCCAG---CATTTG-AATGCTTTCATTTTTAGCTGCTATTTACTTAAGATAAAAGTGCATTTTTGTTGTCAAACATTTGAAAG-----CTATGTGTTTTGTGGATATAGCGAATAATAAGAGAGAAAACTAA--------TCAAAAATCAAAATGATCAGAAAA----GATACATATGTATATGAAAATTGAAAATCCAATCTATGTACGATAAATAAATTGTGAATGAATTGCATTTAATATTCATTTTAA
>Tob 15913689 15913756|20079 chrX 15913448 15914200 scaffold_48 235436 236243 - 4039|303 387
AGTTTCCTCG------------AAGTCA--ATCACCGCAAAGAGA---ATCCACCATAGTTATGTAGATATAAAAATATCAACCA
GCTCCCCTCGCCCACCCAGCTAAGGTCACTGTGACCCGCAAGAGACAGAAGCACGAGAATCGCCAAACAATATGCAAACCAACAA
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ATATTTTTGTATGCATGTTCGTTCAAAATCTAAGCGTATATATTAATAAATGTATAAATGTGTACCCCAAATGTTTTGCGATGAA--ATAAATAAAAATCCTTCAA
ATATTTTTGTATGCATGT------AATTCCTTATTGTATATCTGTATCTACATATATGTATGTACC--------TTTACGATGGATGATAAATAAA------TAAA
>CG9216 15926994 15928039|20095 chrX 15927142 15927700 scaffold_48 250806 251288 - 2142|0 601
ATATTTATTTATTTTTACCTACAATACAACAATCGTTTTGGCTGCGTTAAAGCTAGCATTATCTTTATAATCCCGATATCGCAATGTATGTACATATACAGATTCAATAGTCAGTGTTTAATACTAAG--------TGTATCGCATTTTTAATGGAAATATCGTACATATCGCCCACATTTAACTA-AAATGGAATTAATACTAAAAAGCTTATGAGGACTTATGAGGATTAAAATCAAAATTAAATGTAAATCCCACTTAAGT-TAAATGTGAGCGATGTCTTTGTATAACATTGGTTCCTCCCATTGAAGGGTGTTATTTCTTCTACAAAGTTCCAGCTCAACCTAAGAGACAGACCCATCCAAGTCCGTCAATAAAGCAAAATCAATTTCCTTTCAAC------GAGTTTATCAATAA---------TCCTTTTGAAACATTAAATTTCGCTACAAATTATGTATTGATATATACATAAATATATATATTTGTGATA------CCTATACTAATATTTTTTTTT------------AGTCTAGAAAAATAAATTATTGTACCATATTAGGTATTCCTGGAAAGCCAATTTAAAAAAAAG
ATATGTATATGTATATGTCTATTGTATGTTAATGTATTTGCTTGAATCGCATCTCGACCTA-----------CAAACATCA-AATGTACATGCTTAAATATATTCAT--GTATGTATTTTATCCTACGACAGAACACGAAACGCTATTTTG-TGTAAGTACC-----------------TTAACTATAAATCGAAACAAAAAAAAAAAA----------------AAAAACAAAAATAAAATAAAAAATAAAT---ATTAAAGTATATACATGTTCGA------------------------------AAAAAGTG-------------AACGTTTCTGTCCTACCAAAGCTGAAATCCTTTCAATATTCTAGGGTAACCCAATTTTGTTCCACTTTGAATTATATGGGGCTTTTCAATTGGTATGGCGTTCCTTG------ATTAGTTTTCGCTAAAATA-------------------AAATATACATATTTGTGATATATACACCTACACTACTGTTTTTTTTTTTTTTTTCTTGTAAACTAAAACTTTAAATTTTGGTACCATTTTAAATTTTCCTTGAAACCCATTCCTAAAAATAT
>CG9216 15926994 15928039|20096 chrX 15928039 15929671 scaffold_48 251524 253239 - 30613|0 0
A
A
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CCATGTACCTCGTATTATGC--CAAGGCGTTG---GCATTTTATCACTAAGAGTCCCCCATGTCAT-GCGGTGCACACACTTTGGAAGTCAGATATGCGAGATATACGGTCTTGATCTATATATCTGCATAT-ATATATATATATATATACATATATAT-GGAAAATGCATTGCTCATGCTCACATCGAGGATCGAAGATCGTCTGCCGCTCATAAATACGAAAATACTTTCACTTAGGCTAATGCTAAAATAAAAATATTTAGATGGATCAACTAGCATTTTTTTTTTTCTATACATAAATATACATACTATATATATATATATATATATATATACATATATATAGTTATTTATACTATATATATATGAGTCCCTTTTTTTTTTTAAATTGTACTTATGAAAACTGATGTTTTATGTACAAGTACGTCGTGTTGTAGAGAATT-------------------TATAA-----ATGGCAAAGAAATAACAAGTACTAAATAA----ATAAATAACGATACATATTGTTAGTGATACTCGATTATGTAAGTTAAGTAGCCTCTAAGC----AGCGCCTACTGGTAT-CGTGAGTAACGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAATTGTAACTGAAATATTAAGTGTGTTGTA-TATGATATGACGGAATGGCAATGGAAATGCAAATGCAAATGCAAATAATATGAGTCAACCAACGACGAAACGCTTGATATGAGGAAACGAACAAAATTTGATTACAGATTGCCGTTTACCGAACTGGGTTAG--GATCACTCATT
CCATGTACCTCGTGGTGGACAACAAATTCTTTAATGCAATATCTGGCTAAAACTTAGGACTACTACAGCATTGCTCATAATC-------------------ATAATCGATAATAATCGATAAATCGGTAAACGACTTATCGATCGGAGGAGA-AGATATCAGAAAATTCGCAATCCAAACT-GCAGCTTGGCTCG--------CCAGCGCTCATTATAA--ACAATACTTTTACT-AGGCTAATA-TAAAATA-------TTAGATGGATCAACTAGCATTTTTTTTTT-CTATATATACACACAGATA-TATATATATATATATATATATATATACATATATATAAATATA-ATAATGAAAACCCCCTAATTT-TTTTTTTTTTGAACTTGTATTTATAAAAACTGTTGTTTTGTGTACAAGCATG--AAATTGTAGAGAATTGAATAATAATAATACTTATTATAATGATAATGAAGAATGAATAATAAAAATTAAAATATATGATTAATAACGATATATATTGTTAGTGATACTCGATTATGTAAGC---ATAGCCTCTAAGCGCATACCGAACATAGATATGTGTGGGTGATGTCGTGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTATAAATTGATTAGTACTGCGACCCCAGAAAACCCCAAGTGTATTGTA--TGATAACCATAAAAACATGAACGAGTCAACGATAAAATGCTTTCAATGGGGAAA---ACAAAACT--------GATTACCATTTACTTAATCGATATATATGATCTTTCTAT
>disco 16044535 16045508|20266 chrX 16044368 16044691 scaffold_48 411162 411487 - 1325|176 353
TATAAAAATCCATCGCAAAGGTTGATAGAT-CGTAGGTG---------AACGAAAATGTTATTG--CTATCGCAAA-CGAAAA--TTCCTCCCGACG------ATTGTGTACTGTATTACAACAAGATTTTAAGTTTTTTATTAACAAATAAACAACGGCAAAATTGAAGAAACATGT
CATGGATACCTTTAGTTGTTGCTAATATATCCATGGATGTTCAGTGGAAATGGAAATGTTATTGCTCTATCGAAAATCGAAAAATGTGCTCCCTAAGAGATTCATTGTGTATT---------TAATAAATGATATTTCATTTGAACAATAAAACCA-AACGAAATTCAAGAAACATAC
>disco 16044535 16045508|20267 chrX 16044751 16044962 scaffold_48 411589 411819 - 3883|0 240
TTTCCCTGCCCCCTCTATCGGTGTACAACGAAGTATTGATATTTAT--------------AACGAAATATATATTATGAATGGCATATATTAAATAGTTTTAAG----ACAA-TTTTTTTCGTAGCCAATAAAACTATATTGTATTGTATAACT---------TGGATGTACTAACACAGC-AAGCAAATTCTATTGAAACATATCCCCCCCGTGTGTTAAAAAAATAAAAAACCAGAAGA
TCTTTTGGCCCACTGTA-CGGCGTACAACGAAGTATTGATATTTATAAATATTAAACTAAAAAGCAAAGTATATTAATA-----ATATATTATGTAATTTTAAGTGCAACAATTTTTTTTCGTAGCCAAT--AACTAT-TTGTATT-TGTAACTAACTTTATGTAGGTATATAAAAACTACTATATATACGATAACAAAAAAAAAGCAAGAAAATTATAAAAAAAAAAAAAAAACAACATA
>disco 16044535 16045508|20268 chrX 16045063 16045578 scaffold_48 411884 412404 - 3044|0 515
TGTCCAGACTGCTGATCCATGGCGATGATT-----TCTAGATGATTTCCTTAGTCAAA------------------------TTTGTTTTTATATTTTTTTTTTGTGTGTGAATC------GTATTTTAAGAAGAATACATTTGGTGGCGTGCTGCATTACACAAAAAGGTGGAGCTTCAGGTGGTGGGGCTGTGCCACAGCTTGACCATTAAATGGCTGGCACTCCTCCTCAGGCGCGACCCCGCAACACCCGCAACCAATGCCACTAAGTACCCCACCCCCCCCTCTGAAAACTGGAATTGCTCCGAAACTAAGCTTTTTCTGCTCGTACATGTGT-------------------TATATGGATTTTTTTTTTTTTTGGAAACCTATGTATAATGTATAATGTATACT---GTAGTGCGACATCTAAGTGTATAGTATTCAATCCGTTCCTCAGTGTGAATGTGC-------------AGATGCATGAATGAGAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT
TGGCCCGCGCTCCTCGCCCTGGCAGAGCTCAAGCAATTAGCAAATGTTCTCAATTAAAAAGCAACCCCCTCGCAACCCTACCCCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGGGCATGCAGCCATGAAATGGCCTATATAGATTAACTGTAACTGAATCTGGATCTGCATTGAAA--TGGAAATGGAGATGGACG--------------TTGACAA-----------------------------------ACAGAATCCG-ATCTGGTTTATATGATTATGTTACC----------------------ATGCTGGAACTTAGC-TTTTCTACTCGTACTTGTGTTATATATAAATCGTATATATATATATATATTTTTTTTTTTACACAAATAATGT-TTTTTTTTCCTGTATTCTAAGATAATACGACATCTAAGTGTATAGTATTCAATCCGTTCCTCAGTGCAAGTGCACCCAGTGTGACCAGAAGAGCTCGCAAAAGAGTGTCTGTCTGTGTGTGTGT
>kat80 16100942 16101417|20342 chrX 16101388 16103285 scaffold_48 477409 479338 - 64942|0 29
-GGCAACGCATATCCAGCTGTAGATGCTCC
TATTTATGCGTGTTTAGTTACAAATTGTCC
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TCCACATTCCCAAACGACCACGCAGACTCGATTTC----ATAGCCAAT----------------------------TTTGGTATTTATCTAAGCTATGTATTT-CAACATTTACAAGTCCAA--AGTAGAGGGATTTAGTGGCGCGTTTAGTGGATCTTTTCCCAGTCCTCACGCTCCTCGCGCTCCTTCACGACCTCCTTGAGGTAGGGTTCCAGATACTTGACGTCCTCCTCGTACTTGGTCCACTGCTCCTTGGGCAGAATGGTCTTGGTCATGGACAGATGGAGGGCCCTCATGATGCGGTAGTTACGCTCATCGTACAGCTTCCTGGGCAATCGGCGCACGGCCTCCTTCACATCCTCGTTCTCATACAGACAATCATCGCGATGCAGACCTGCAAAAATCGATGGCATCAAGCTCAGCTGTTAGGAATCACTAGGTTATATAGTAG--------TCCTACCGTATTGGTTGAATCCGGAGAGATTGTAGGCCCATCTGCCCAGATTTGC-----TGTGG---GGAAAAATTCGCATTACATATTTACGTAATCAT---AATATTCCGGCGT---ACTGCACTACGAAATTTGTTGC-ATGCAAC-GTGAGTCCGATTGTTGCCCGTTCGTATTACTTACAGAGAACTGCGGGTCCCTTTCTGGCAATATAGTTCGACATGGTTTACGTAAAATCAGAAGTCGGGAAAGAGATATT-------CCTCCAGCCTTTTTATTTTAGGTATGAGAAC------GTTGGAGATGG----------------GTCTCTCGATAGCT------------ATCGCACCCCGTTATCGATCAA-CGAGCACTACGGTTGCGTTTGTACAAATCGATTTCCGAAATGTAATACAGACACACTGCACCTATCGATATATCGCACTCAAGAAAATTCGTTATTCTTTAGTTTTAGAGCTATTAAATATATTATCTTTTAACATTTTACCCTTTTGTATTTGTATTTAGATTGTTCAAAAACTTGGTGGAGACGGCAACCGAACTACAGTATAAT---------TACATCTCCAAAGTTGGTCATTTTGCAATAAC-TTTTTGTATAAAGTAAATAAAATCA-------ATTCAAATTCTTGTAAACCCATTTAAGCCCATGTAAAAATCCGCCTTCATAAACAAAATACTTGTAGTTTATCAAACCGAA
TTCACGTTCCCTATTAATAAATTTTAGTTATTTTCTTAAATATCCAATACCTTAAAAATGAATTCTTCAGAGAAATTTTAATTTGAATCTAAGCTATGTATTTTCAACATTTACAAATCCGCCCAGTAAGAAGA-----------ATTCAATGATTCTTGTTCCACTCCTCACGCTCGATGCGCTCTTTTTCAACCTCCTTCAGATAGGGTTCCAAGTACTTAACATCCTCTTCGTATTTGGTCCACTGCTCCTTAGGTAAAATGGTTTTCGTCATAGACAAATGCAAAGCACGAATTATGCGGTAGTTGCGCTCATCGTACAATTTGCGTGGAAGGCGGCGGATTGCTTCCTGAACATCTTCGTTCTCGTAGAGACAATCATCACGGTGCAGACCTAT--------ATGATATTTAGGATAGATTTAAAGAAT------GTTTGCTAGTGATTCTCATTTCTTACCATATTGGTTGAATCCGGACAAGTTGTAGGCCCACTTGCCCAGGTTGGCTGGAATGTGGAATGGCAAATTTTGTGTTACATATTTACGTAATCATCGAAATATGCAGCGGTTAGGTTGCGCTTTTTGCGATTCTGCAATACAATGGCTGGCATAATTAATGCA---------TACTTACAGAATACCAAAGGTCCCTTCCTAGCAATATAGCTCGCCATTA-TTATGAATAATTCGTAATTTTAGGAAAGTCGCTTGCTTGGCTCTCGTTCCCTTTATTTTAGGTATGACAGCTGACAAATTAGCGATGGCAACCATGTACAAAAATTTTATCGATAACTTTTGATTTTATAATCGAAACACGTTAGCTGTCACTTGTGTACACCCACCTAATTTGTCAAAAACTAGTTGCAAAAGG-----CAGCAATACCAATCCTATATGTATAT-------AAATTAAACAGTTAGTC---AATTTCGTATTAATAATAATTATTATTTT----CATTACAT---------------TTCAGATTGTTCAAAAGCTTGGTGGGGACGGAAATCGAACAACGGTATAATATTAAAGTATATGTAGCAAGTATTTGAAATTATACCAGAATATTTTTGTATAAATTAAATAAATTCGTTGTTGTGTAAAAGCTCTTGTTATACCACTAA-----ATATAAATAT---------TAATAGATATTCCTA-AGTATGTACTAATGCA
>CG32576 16119888 16121085|20363 chrX 16121044 16121244 scaffold_48 494353 494576 - 7674|0 59
CATGGA---------------GCCTCACAAAAAATAAAAAATATA---ACATAGCAAATA
AACGGACAATTCGAACGCATAAGCTCAAAATTTACAAATAGTATATGTACATTCCAAACA
>CG9911 16127777 16127832|20368 chrX 16127717 16129061 scaffold_48 501792 503132 - 58159|65 128
TATAATAATAATAATGTATATTGA---AAATAAAA----GAAAATAATACAAAAATGTAAT-AA
TATTACA-----AATGTATATTCATTTAAATATAATTATTAAAATTTTATAAAATCCCAGTCAA
>CG9914 16140903 16140953|20376 chrX 16140866 16140973 scaffold_48 517226 517333 - 1402|37 87
ACTCATTATTATCTTGCTGCTGCGTTTTTTTTTTTTTGTTTTTTCTTCATT
AGCTGTTAACAATGTATTTAATTATATTTTTTGTTTACTTGTTTGTTTGTT
>Cyp1 16151610 16152118|20390 chrX 16151097 16151938 scaffold_5 5288306 5289108 + 22432|540 889
AATTGTATGTGGGGGCCAAAAGTGAATAGAATT-AGTGCCCACCAATGTCAGAAAGCGTTCAATTGGCTATATAATATGCATT-------AAATCTGTAACTTTAACA---TTTCCATTCACAAAAAAAAAAACAAAGAAGAAAAACAATGAGACGACAAGAGTCGAGAGGGGCTTAGAAAAATGTTTGATCTTTTGATGTTGGCTTACTTACTACTAATAATAGTATTAGTAATGCTGATTATCTAATTGCATATATATATATATATACCAACGTTCTACGCTATGTACCGGAATCGGAATTGTAT--------TTTCGTCTTAAT--AAATCTGAATAAACGGCAACC
ACTCGTATGTGGATAACAAAAATGTTTATGATCCAATTTTTATCAACGTCAGAA----TTGTTTCGTCTTAATAAACTGAAGTTGGAAAAAAATAACTACTTGCAACAATTGTTTAATTATCAAGAAATATTTCCAAAAAAAAAAA--------------------------------AAAATTGTTAGGCCTATCG------------TTTCTATTACTAATATAATT--------------------TGTATACACAGCTCGAAAAAACAACCCTCTCCACTGTGAATTGGA-TAAGAATTGTATAATTTCAGCTCTGCTTTTATCCAGATCAGGTTTAATGGCAGC-
>Cyp1 16151610 16152118|20391 chrX 16151939 16152817 scaffold_5 5289624 5290549 + 31501|0 223
GAAGGTGCGATGCAAAAGCAACAGCAACATTGCAAGAAGAAAAATCTGTTAAGACG------------AAAACCATTTGCATTTTCTCCAAAA-----------CATTTTTTTTTACCAATTACTGTACTGTAATATTACGAGAAAAATACATAACAAACCAACATATTTTCAATAGACATGTTGGGT---------------------TTCCTTTGGCCAATC
GATG----------------------------------GGAAATTCTGTTAAGACGAAAGAAAAAAACAAAACCGTTCGCATTTTCTCCAACAATTAATATATTTTTTTTTTTTTACCAATAACTGTA--ATAATAT-------GAAATACA--------ACACATATTTTCAATAGACATTCTATGTTATCACTATAAATTAATAATATTCATATAAGCAATG
>CG9917 16155360 16155984|20395 chrX 16155908 16156085 scaffold_19 1654914 1655104 + -422|0 80
TTCTAAGTCTGGGCGTCCGCTATATATCTCGAATCCGAATCTGTAAAA----CGCCTTCTCAACGCTTTGACTTTGGCATT
TATTTAATCTAACCACAAGCTGTACGCCTATTAGCCTATAGTGTGAGAGTATCTCAAGCTCGATGCTTTTTTTTCTGTTTT
>CG9921 16165199 16165498|20402 chrX 16164631 16166804 scaffold_10 2139091 2141271 + 12019|620 945
CTACAACGATA--TTATTATGAACCCAAATAT----------------ATAGGCTGAATTTGCATT-CAGTTGGATT----CTGTTATTTTTTTTTTTTTAGTCCCATGTTACAAAAAGCTAATACTAAGGGCTGCAAATTTGTATAAATATTTAAATATACGCTAACCATTACATAGATGGTATCTAAAAGATGCC---TATAGATAATACTTATAAAATGTCTCAATTTATTGTAATCAAATGTGGGAAATCTTAAGGGGCTACTATTAATGTGATAGTTTTAGCTGTGATTAAAAAATAGTTTCAAATAAATAATGCATATCA
-TATAATTGTGATCTAATATTTACTCATATATTGCAAGTGTATGTAGCATAAATTAAATGGTTATCACAGTTTTATTTTTATTATTATTTTTTTTTGTTAAACCCAACATT---------TGTTATTTACG-------AGCTGTATAACTGGCTTATTGCCCAATTAATGTAATACATTTGATAACAAAAACGCGTTTTATCTAGTTAATGTTTATAAAGAGAGT---TGCGTTATGATC----------------------------TTGATATGATATATATATATGTATATATGATATTGATATGAGTATCGAATATTCACTG
>U2af50 16190617 16190692|20419 chrX 16190236 16191389 scaffold_10 4309662 4310812 - 39008|418 494
ATACAAGTAAATCATATATCTCACATTCACC-ATTTGTCCAATAAATATCAGAATAAAAGTAAAATTTTGACTACGA
ATAAAGTTTCTACGTATTTCACACATTCACCAATTTGTCCAATAAAAAGAAAAATCAAA---------CAACAACAA
>CG9992 16215888 16216194|20443 chrX 16212631 16217219 scaffold_10 4337408 4341861 - 123093|3347 3672
ATGGATCGCATCTTAAATACGGATCCGCGTCCATGTAATATACCTCTCAGCCAACTATGTAAA--AATATATATATTCGATTTTGTATACTT----AGCGTACGCAGCTAAATAGGACAGAAGAAGACAT-----AAGTATTAACGAATTTCTAATGATTTACAAGGAAAAACTAACATTATG---AAAATTCTG---AAATCCAAAACTACATGGCT-ACAATAATTTGGCTTGAATATTGAAATAAGTGATCGAAACACATATATATTTAAATATGTAGATATTTTCTATTTTTGTAAATAAAACATTTTCTAC-CAACCGAAA
ATA----------TAGATATATA-----------GTAATAAAGATTCAAACAAAAAGCGCATATGCACGTACATATGCCAGTGTATGTAGCTTAAGAATGTATGCATTTAAAAACAACCTGCTCAAATATTTTGTATGTATGTATGAACTTGTACATTTTTATACGGAACAAATGATAATTTGCCTATAAGTCTGTGTATACGTACAAATCCATTATTCGAAATAACCATGACCAAGTATTCCATTTAATATT---AATTTGTCAACATTTGAAAATGAAACGA------ATTTATGCAGCGCACACATTTCCAACATAGCCAAAA
>TH1 16222757 16223232|20451 chrX 16222823 16223171 scaffold_6 307079 307426 - 2607|0 383
CAATTTAAATAACATTCTTTTTGAGTAAACAATTTTTTTAAATATAATCTCTTA---------------------AGAAAAGTACCCTATTCTTCTATTAGGAAAG-----AAAAATTAAAAAAAAAATCCACAAT-------GTATCTATCT--AAATTTAATTATAAGCATTTTTGCCGCTAAAATTTCACTAGGCTTTGAAAAATGTTGTAAGTTCTTTATCATTTTATTATATTCCTTACGCATTTGAGCTTTCATTGTTTTAACATTTATACAAAAGCATTTAATTCAACATTGTGAACTAACATACCTACATTATTAAGCTTTCAGAAATAACAATATGTTCGAATCCATAAACAATTGTATAGATTGTAAATGTATA
CAATTTAAATTACTTTTTTGTTGAGTTAGTAATTTGCTTACATTTAATTTAGTATTCACTTCAATAGGTACCTATATAAAAGCATATAATCCTTCTTCTAAGTCGATTTTTCGAAATTAATAAGGATATCCATAATTATAATAATATGTATTTTACATATTCAGTAAAAGCTTTTTGAATGGAAAAATGTATCC--GTGTTGAAAATTAAATTTACGTTATATCCGTTTTAGCCTATTTACT---------AATTCTCACTTTTTTAACCAAAATAGAAAAGT------TTCTCTATCGTAAATGGAAA---------TATTAAATTTT---AGAAAGGAATAAGCTC--ATCAATGAAC-----TAAGGATTTTTCTTGTATA
>Anxb11 16251173 16251766|20470 chrX 16250502 16253011 scaffold_10 4376288 4378857 - 77906|687 1365
GAATCTCCGCATATACATATATATGTATTATTCAAACCAAATCCGACGTGAAATCAATTATTCGAATATGTATTATCTCTTCTATGTATTCGTTCATTTAAATGCATACAACATACAAGAACACGCCAACGAAGCCAGACAATTATG-ATCCA-------CAACGTAGA--------CTATAAGTG--------CACACAAATAAT-----ACCTGAACGGGATCAGACATTTGATACCTCTTTCAAAGAAATGAACATGGGAACCGACAGTTGACAAGTGTTGAAGTTGTATTTTATTAAAAGACCTTTGTATTTAAATGCGTTCGTAAAGACAAATAATATGGAAGTTCCTCTCAAAAATCGCTTGTT--AATTTGCTCGAA-------------ATGAAAAACCAA------AAAATGAAAGA--------GTTGCTTATATCTTGACAAAGTGACCAGGGAAATGTTGCAATAAAAGCTATGCTTTCTAACTACCGACTTCGTCTCG-------ACAGTGCCTCAATGTGACTATTGCCT---------AATTTGAAAAAAAGCATTTAAAACTGCAATGACATTTAAAACTACAATA--------TACGCATATTGAAACGATGAAT---CGATTCGTATGCACTTATACACTATATATGTACACATACTCGTG
ACTTATCCATAATTCAAAATAGCTATTTTACATGTTGTGTATTCTACTTTTTATGTATTAT----GTATTTACGATGACTACGAAGTATCTATTTTTATT------TATAAAGTAAAAAATCAATTCTACATCGCTTGG-AATTGTGTATTCAAATATCCCAACGCTAAAATTTCTGTCTTAAGTGTGCCTCGACAAAAAAATAATCAAAAACAAAAAAAGAAAAAAACA--------------AAAAAAAAAAAACAAAAAAA-----AAATAAGAAAAGAAAACCCTAGAGCTTATGCATTTACACTTATATT-AAAGGCGC-------AATTAATCATTTAAAAGATGTTGCCTATGATCGTATATTGAAACTTGTTCAAATTTTGCTCTTTATATATATTATCATTGTATTGGATTGAAATATGGTCTTGACTCCTTACGTCTGACCCAGTTGAC------ACTGTTCGAATTTTAAATATACCT-ATATGTATTGATGTATTTTATTAAAGGTGCACAGCCCTTAAATGACTGCTGCTTTTCATTTTTGGTATGGGGGCAGGTGTTTTGCCTGAACTTTGGCTTTAATTCGACAACAGGTTCATTCAAACACATCGAAATTATATCTATACGTTAAGTAATTAGTTAAGCATAATGGAATTGCATATGC-AGGA
>CG9947 16273084 16273177|20496 chrX 16272864 16274430 scaffold_5 5111537 5113137 + 33917|231 353
AC-----------------CGAGCACCGTCAGTA------------TTCCGGGCCGCTTCACTTAGCTTTAGTAGATCCATTTCTTTAAGCCTTATCAGCATAAAATAGTTTCTATTAACCCA
AAGCAATTGATTCGATTTGGGAGTAATTTTGGCAAAAGCTTCTCTCGCCCATGCACCATTATTTAGCTATAATAT-----CTTGTTTAAGCATAATTGTC--TATGTATATCCTTGTAACAGA
>eIF-2alpha 16279421 16279491|20502 chrX 16279388 16279841 scaffold_5 5118732 5119199 + 20816|43 113
CGTAGCCACAGCATCAGACACAACTATAGCAACTGTAACAAACAATTAAAGGAGTTTTGCAAAAATCAGAA
GATAACAAAAACAAAAAACACACCAATTCGAACTAAAGC-AACAACACCCAGCATAACAACAAGAGCAGAA
>para 16297542 16297724|20521 chrX 16297286 16297559 scaffold_5 1412168 1412402 - 2884|276 293
CAAACAAATACAACAACA
CAAGAAAAAGCAACAACA
>para 16297542 16297724|20522 chrX 16297706 16298927 scaffold_5 1412582 1413745 - 56712|0 18
GCCAGGCCTCGCCCCCCCC
GCAGG--CTCGCCCCCCTC
>CG9902 16377489 16377619|20609 chrX 16377581 16378359 scaffold_32 889990 890860 + 6158|0 45
CAGACCCAGGAG-------TCCCCAGGAGATGTCATAGAAACTAGT
CGGAACCAGCAGAGAAACACTCCGAGGAATCGTCAAGCAAACGAAT
>Arp14D 16382718 16383178|20611 chrX 16382570 16384954 scaffold_438 2445 4978 + 62297|201 751
-GGCGGATGGATGCGA-AATCAGT-------------GTGTGTGTGTGTGCGGACCGCAAG---AAAT-----------------------AGGATAAAAAAGTGATAGA-----TTTCTTTTCTCTATTTTCTA---------TAGGTTTAAACCT-----TTCAGATTTACGTGATATATCCGTCTAT----------------ATATGTTTTTTTTTTTGTGT-GTGCCTGTGCGAGTGGGCGTGTCTGTTGAGCAGGAT----TGGTCCACTTGCCCTTAGATTATCTATAATCGCAGACATGTCGTCACTGGTCGTTATCCCCGTACAATATAATGTAATATTTCTTTGAGCGCGAAAACTTTAATTCGATAGTCGCCTAAATTGT-GTAACCC---------TGCATTAGTGTGTTTAATTGTTTATAATTACGTCTAAAATTCAAACCCAAAAGCCCTTTTCTTTAATGAATACGCATATATAACTATATATATATACATATATAAATTCAAAGCACCTCGAGTGCGGCGATATTTTTGTAAAC
GAGCTAACTGAAACGATAATCAACGGACACAACGGCAGCATTTGCATTTGCTTATCTTAAGTTCAAATTTAGACTTTTTCGACTTTTATCCAGAGAAAGAGAGAGAGAGAAACAGTTAGTGCTCATTGCCTGCTAGCCAGTGGGTCTGTTTATAGCTGCGAATGCGGGGGGATGTGTTCATTCAGTCCATTCAGTTCAGACTAATCGTAAATCCCTCTCCTTGTTTCATACACATGTACATTCGTATATGCACAAAGTAAGAGCATATTTTTCACACGCCC----AGCACCTTTAATTGC---TATGTTATAA----TCGTAATGCC----AAATCATGTATAATTTGTCATTTTGGCCCTAAATTTTAAGCAAAT-GTCACTTGAATTGTAATAATTCTTATCATAATGCCTTTGTTTATTTTGTTTTCAATGCTTTTTTTTTAATTTACAATTT---CTTCCTTTTTTTT--------------TTTTACTAAATATATATGTGCATA-----------------GATTGTATTGATATTTTTGTAAAC
>Pp2B-14D 16390701 16391631|20616 chrX 16388184 16391076 scaffold_812 225 3315 + -7255|2820 3280
TTAAGATGAAAAACCCCAGCAGAATCCCCATA----ATCCCCAGAGGCAAGAAACACTAATCCAATTGAAGAGATATGGGAAACAAAATCC---------AGCGCTAATCTGTTCCAAACATTTAGCAGCGGCAAAAAAGAAGCGTACATATATGTATACATATGATTATTTAGAAATATCGAGGCGCAGTGCCGAGATGCAACCGAAAGTGTAATGAAATTTGAAATGAGCAAAGGTCATTTTTTGTA---ATAATCGTAATC------------------CTTGAACTCTAGAAATGTAATCTTGCATAGAAG---AAACGAATGAAACAAGCA-AACAAATTCGAAACCATTTGCAATATGTGCCGCAATAGTCCATAAATGTTCCTTATACGAATT-----AAACAT------------------------------------------TGAAAGTG
TTAAAACAAAATACCCGAAATTAATCTTAAGCTTGTATGTATAAAGATTGAGGAAATTAA--CAAACAAAAAAAAGTGGAGAAAAAAAACCCAAAAACCTAGCGCTAATTTGTTTAAAACAATTAGCAGCG-CCAAAAAGAAGCGTACATAT---TATAATTAAAGAGAACAGAAAAAAACGGAGAACATTAACATTAATGAAATACAAACATACTTACATTATTTATATATATATATATATATTTATATATATATATATAAACAGTACAGAACTGTGCAATCTTAAAAACTAAAACACTAAATGTTAATTGATGCTTAAAC-ATTGTAATTCGCATAAACAATTTGAAACAATATGCAATATGTGCCGCAATAGTCCACAAATGTTCCTTATACATTTTACTAAAGACATATATATATGTACATGCATATGTATATATGTGTAATATGTACATATAAATA
>Pp2B-14D 16390701 16391631|20617 chrX 16391597 16392934 scaffold_812 3918 5264 + 104391|0 37
GCTGTGCCATCTAGTGC---GGCTGCAGGACGAGGATG
ACAACAGCGTCGATGGCATTGACAACGGCGTGGGGGTG
>CanA-14F 16399410 16400212|20621 chrX 16398727 16399857 scaffold_759 5919 7056 - 15493|751 1298
CAGAGACACCACCACCATCACCAACAC-CACAACAACACAGCAACAACAACAGTAACAGCAACAGCAGCCACTACAACAACAAGAGCGGAGCAGCAGCA---------TTGCAGCAAGCGTTAACGAGTACTTATTGGTATTAAATGC---------AAAAATGCATAACAACAACACCCCCCCC---------CCAAAATGGAAGCTAATTATAAA-------GTTGAA--AGATTATAGA-----ATTATATATATA---------AAAAAAAAATATATATATATC-----------------------------------AAAATTTTGTGCAACGTTATATCAAAAGAGCAAATGTAAAAGCTAAGCAGAAGTATTAAAGTGCGCATGCGCGCCTGTCTTTTTTGGCAAGCAGTTGACCATAAAGCAGTAGACACGAAGCAGTTG-------CCAGTTGCGCGCATTTCCCCAT--TCAAGAAGAAGAATGAAGAAGAAGTTGATGATGATGATGAAGAAGATT-----TAAAGAGGCAAACC
CACACACACACACACACACACACACACACACATACACACTCACACATGAATAAACACATAAATAAAAGCAAGCAGCAGAACGAGTGGAAAGCATAAGCCAAGGAAAATGAGAAGCAAGCGTTTG-----ACTTATTGGCACTATATATCATGATATAAAAAAAAAATAAAATCAAGAACAATTAAGAAGATGAGCTAAAACACAAGCCAATCATAAACAGAGTATTCGAACCGTATTATATATGTTCATCATATATATACGTATATACACACATATATATATATATATCTATATAAACATATATAATACCACACGTATATCATACAAATTGTGTGCAACATTATATCAAAAGGG-----------------------------GGCGCGCCGCTGCTGCTGCT-----------GCTGCTGGCGTCGCAGCAGCAGCAACAAGAAAATTAGGTAAATTAAATTATACGCAAGAACGCAAAATGCAAAACAAAAACAAATCAATCTTATATTAAACTTATAATAAAGCTCGTCTCTGAATAAACAAAAA
>CanA-14F 16399410 16400212|20622 chrX 16400147 16400394 scaffold_13 633185 633491 + 3313|0 72
TTCTAAGTCAGTTAGCACCAGCTACA---GCTGCAGCTACATATGTAACAG----TCAAGTTAGTCAGTCGGA
--TTAGATCGGCAACCACCAGCAACGTGCGCAGCGGTTACACATCGAAGAGATTCTCA---TAATCAGCCGGA
>Cap 16422939 16423276|20655 chrX 16422106 16423082 scaffold_5 6131323 6132239 + 14147|843 987
CGTGCTCGTTGCGTGGAACACTTCGAGCCGGCGAACAAAACCGAGAGTATAGAAACTCCAA-GCCCAGATCAATATGTAATAAAGCGCATAGAGAAGTAATTTAAACTATATTTAAAACGAAAATATGTATTAAAAAGCTTATGC
CGCTTTTATTTTATGTTGAGCTTTGAAACGTAGGTTGAAGCAGATTGGAT-GAATCTCTAATGGTCTGATCGTCAATCAGTCAGTGACATCTATAAGTA---TAAGCTATA-----------GATATTTGATGAGTTATGGATAT
>Cap 16422939 16423276|20656 chrX 16423105 16426691 scaffold_5 6132667 6136237 + 221446|0 199
GAAATTGCC--------CCGCCCAAAA-------------CCTCATCCCTCAACCCACCACAACCATCTCTCGC-CCCAATTATTAGTTTCGTAGGCGTACG-----ATTTG-TTTTCACATTCTTTTAAATCGTATACATATATATATATATAGTTTTCTTTCTAACGATACTTGCTACATTTAATTTTCCTTAACAAT
AGACGTACCGCAACACACTGCCTAACAATCCTTTACCCCTCCTCCTCCTTATGCCTCCCCCGAACCCCTCCCACAAACATTCAAGCATTTCTTAGTGATTAGGCTGAATTTGTTTTTCATATTTCTTACAAT------------------TATCATTTTTTTT----------TTTTTCAACTTGATTTTCCTTAAAACT
>CG9784 16430459 16430652|20665 chrX 16430385 16431346 scaffold_28 1289069 1290041 - 36513|74 291
CTAGCCGAGGCTCTGGATATCTTTATTCTTTAGT--CTCTGTTT--CCATAA-CCGCCGTGTTGATCTAAT----------TTTATTGACCTCATG---TGACCGTGTTAAGT---TTGCTTGTTAGCTGTTGACTCAGCGCCTCCTCTCCTCTCCCCCCCTCCAAAATACGTTA---ATACATACATATGTAATTATACATAATTATCGAACCAATA
CTAGCGGAGGCCCTGGACATTTATATACTTTAGTTGCCTTGTTTTACCTTAATTTGCCTTATTTTTTTTATATTTCATATATGTATATATCTTACGATCTGATCTATGTAGATGCATTGCCTGTTA-TTGATGTGTAATTG-TTTGTTTCTTTTTTTTTTTATCTATATACTTTATATATGTATGGATATGAATGCATTTATGTTTAT----------
>rok 16459046 16460099|20701 chrX 16458893 16459049 scaffold_11 2649189 2649356 - 1394|174 177
TACT
TACT
>rok 16459046 16460099|20702 chrX 16459333 16459445 scaffold_6 1445671 1445775 + 1750|0 117
GTTGTTTCCTCCATCA-----TCCACCTTCTCTTTACATATTGATGCCTTGTAAGGACTTTTTTTTTTTACACATATACATAATACATATACATAATTGTTGTTGTTGTGTAGCGAAT
GTTTCTTCTTCGACCACTGGTTCCTCCTTCTTCTT---------TTTCTTGAAACA----TTTTTTTTTCCATATGGACATTTTGTATAAACTTATTAACTGTTAATTTATATAAAAT
>rok 16459046 16460099|20703 chrX 16459548 16459891 scaffold_14 3020188 3020572 - -1282|0 401
ACTACTATCTTAAATATAC--------------------GCTCCAAACATACATGCTACAGTAATCT----------------ACAAATATTTTTTGAGTAATTTACAAGCTAAACTAAACTACAACTAAACTAAAACTAAAACTA-AAACTAAAACTAAACCTAATACTAAAACTAAAGCTGTATCTTAAAGAACATGTAA-TGCCAATGCAACTCGTTTAACGCTTACCTAACATCAAACTGGATGGTGAGAAAAACATATGTATAGCAGAAGTGGCAACGTCAAG-------CGGGTCAGATAAACCATGGATTTGTCG----CATCGTTTGTACTTTGTATACT-ATATTAATATTA--------TATAAATATAAATACGATATGGTATTGTACGGC
ACTGCAACCGCAAATCCGTTGGCGAATGGTGTTATGAGAACACAAAACA-ACAGGCTGTGGTATCATTGATGAAAACCCCATATTAAATGGATTTGAGGTGAGTTCTACAATCATCTTACTTTGAACTTAACTGGGGAAAAGAATATATGCTTAAATTCAAGTGAATAATGCATTCAA--CTGAATTTTATTTTATATTTAACCAAAAATCGGAGTTGATAAATTGTTGGC--ATATTAA----------GAAAATAATTTATGTATGACAAATATATTAAACTTAAGGTTTCTAAAGGTTCTAAAGACCATT--TTTATCAGATTCATTTTTAAAACTTTGCTTAATGAAATCAAACCTATTTTTTATTATTATTGTTATAATGATTTAGCTTTATACAGC
>CG9742 16473736 16473916|20724 chrX 16473689 16474324 scaffold_25 931874 932539 - 15164|51 262
CACCCGCCTCGGAACCCGATCTCGTC--------------------GAGCATCGTTAGCCGTAGTGCTTAGTCTTAAGGCTC---CGTAACATTCATAGTCAGAAGAAACACACA-------AACTCTTGAATAAATTCTATAACAAAGATACCCCTTTTTGAACTGACAATTTATATG-AGCAGTTTGGAAAATAAGTCGAAAATATTTAA
AACGTTTGTCGTACCTCAGCATTGTCCGCCGGTTAATGAGTTAAATGTAAACTATTTAACATACAAACTAGTCTTAAGGCTCTGACAAAACATTCAT-----GAACCTTCCCTCATGTTCATAAATTTAAAATACATTCTACGTAAACAACA----------AATTGATGCTTCACACATCTCTGTTAAGGGCATACGTTTATAATGCGCGA
>Axs 16514026 16514204|20762 chrX 16514025 16514240 scaffold_10 2469074 2469307 - 1424|1 212
TGGGCCACAAGATC-GCCGGATCTCCCACTCCACTCCTTTTGGT-------------------------------GCTAATGAAACCAGTCCATTTTAAATGTTATTATTTATAAACATACGACTAATCGCGTTTACCGCGAATGTTCGAGACCAACGGAAGTAA-GGTGCCTTAAACCTAAAACTCATATAAATATGTCCACAGAGTACTT
TGCCTTACACAATCGGCAGGCTGTTGCACATGGTGCTATCGGGCTAAAGCCCAACGGAATGCAAACCAAGCCCAAGATAATCGAACCAGTCCATTT---ACATCATATTTTACATACATAC--TTATATGCTTTTAATGTAAATCT----------CTCAATTAATGGTGCCTTTAAATATGTACTTAT----ATTTGTTTATAACACATTT
>CG9699 16518148 16519087|20768 chrX 16518118 16519855 scaffold_19 686430 688206 + 48452|30 1134
GGAACGGAAAT--------GGGAACGTGTTCAATTTTGCACCGCCATATAT----------GCATCTACCTACT-----------ATATAGGACTTATATGG-----------TGACCCAGAGAAATCCTGGAGCAGCTGCAACCAAATCGAC------------------TTTGTTTATAAGCTAGCACAGACT-------------------TTTTAAAAACAAAAACA--AAGACACCCAAT--TAAATTCAAACAAAAACAAAAC----------TGATTAAGACAACGACTC-------------TCCCCCCCCAAAAAGCACAAAGAATCCGACGAACCAA---------AAACTT----CAGACATCACACAGCC---------------TTTTTCAATTTTGTAGCTAAAGTAACGATTTCGTTAAGAACTAACGAT-TAAATAGAACACGTCTATCTCGAGACATTAGATATTGATCAACACGATAACGATATTATACCAAAGTTTAGGGAGTTTCAAAAACTTAACGCAA----GTAAATTGTTAATGGAAAAGATCAAGAAACCACAGAGGCACATAGAAGTACCGATAACGATAAACGGAAAGACATAGACAGATCCCAAAAATGTTTTAATTTATTGTACAAG--TATAATTTTGATATATTTGATTTCCTTTTGTTTTGGTTTTAAAGAGCAAAACTTGAGAA-----TAGGTGAGTTATAAGCAAGTTTGCTTTATTTATGTGTAAAGAACTTATACCATTTATATTGTAAGAATATATCAGATCGGATGATATAGGACA-------AACCGCTGGAGGTTTTGGCACTGA---------ATTTCCATGAATCGACTTTCAGCAAGTTCCAATTATTTATGCTAATTACGTATTATCAGATATATGTATCTATGAACAAAA-CCTATTTTGTTGAAACGAATTGTTAATGAATTTATTTTAAATTAATCGATTAAGCCTTCACGCAACA---ACCATAATATTTAAATG-AAATTATAGTCGAAAAATTATATATAAACATAGCGATTGCTAAAAATCGATTTCAAATAAAGATAAAAACAATTTAAATG
AATGCTGACTCTCTGCCCAGTTCGCGTGTTCAATTTTGCACCTTGATACATATATATACACGTATATATATATTAAGTTATATAAATATAATACTTATATAGACACTTCTTCTACACCAACACACACACACACACATTTGCCGCTACATGGGCAAACAACCACCAAAAATTTTCGTTTTTAAGATAGCACAGTTTCCAGTTAACCGAATTTTTGTTCTGAAAATTTTTACCTTAAGCTTTTCTGTAGTTAATGAAAACAAAAACAACAACAACGAGCAGTGAATAGAATATCGTTTTTTTTTTTTCTACGTCTTCTTCTAGTTCTTAAAAGGCATTTGCCATACGGATTCACTTGCAAATTTTGTACAAGCGTCTCGTAGCTGAGCATTGACCAAAGTTGTTTTTTTTTTTTTTTAAA--------TTTGTCTAGAATTTACCACAAAAATCGAACAATT----------ACGCTAGACTT---TTTAGACGAAAACGCTTTCACCTCAAATTCGCCAATTTTCTTATAAGCAAACAAAACCTTTTCAATTGTTGAAAGTAGATTTAATTTTATAACTAACTTCTAAATAATGCCCAATA---------------ATATAGTGTAACCAAAAGAATTCTT---TTAACGACACGAGACTATGCCCAAAACATAGCTG-------------TTGGCTTAAAAGCG---AATTCCAGAATTCCGTAAAACAGTTAAAATCGAGCTCGC-------------AATGGACGTACAATACCAAAGTAAAATGAGTTTAAAAAACTGAACGACAAAGCAGACTAAAAGAAAAACTAGAGGC----AAACCGAAACGTATATATCTGTATGCATATATATATAT--AGGACCTATTTTTTTTTTTTTTTAATTTCTAT----TTTTTGTCTTGAAAAACAAACTCCTAATTTGTTAAAACGAATTGTTAATGAATTTATTTT---TTAAATGATTAA----TTAAGCAACAAGCAACATAATAATTAAATGAAAATTATAGTGGAAAAATTATATAC--ACATAATAA----TAATAAT--------AATAAAACGAAAAAAAATTAAAATC
>CG9676 16533088 16533264|20785 chrX 16532943 16533250 scaffold_1 1706273 1706598 - -1553|165 347
CGAGGTCCGGAAATCACGCAAAGATATC-----------ACGGAAAATTCCCATGGAAAAACGGTTT---TCTATTTAACTTATATATATTATTTCACATTATTTTTAGCAACATAGCAGATTACTATGTTGTAAAACGCACTTCAA------TAATAAATATAAAATATTATCAGCACAGCA
CTTCTTTACCAAATC-TACTGATGTATTTTCTTATTGCGATGGAACGTTTTAATATGAAAAGGGTATGAAGAGATTAGAAAAATAAATA---------ATTTAGTTTAGT-------CAGGTCGTGAGGGGGCAGAATAAAGTGAAATATTCCTAATAACTACATAATA-CACAAGAAAACCT
>CG9676 16533088 16533264|20786 chrX 16533251 16534186 scaffold_1201 689 1631 - 11990|0 13
-AACAAAAAAAAAA
CAATAGACGAATAA
>CG9675 16534383 16534820|20787 chrX 16534650 16534826 scaffold_9 4031394 4031562 - -569|0 179
ATCCGTTTCATCCCGTTTTTCCTTCACAAGCTAACAAAATAGAAACTATTTTCCCAA-----ACTCAAAGCGGGCAAAATGACTCAATAGTTTGATTTTGATAAGGATAAGGATCGGTGATTGCCACTGGACTTG--TGGTTAACGTAATAATC--GCTAACTAAGCATGCTTATTTATT
TTTCTTATTAAACAATTATTGAATAAAAAGCAAGCAAAGTTGATAACTCTTATTAAATGCTTATTCGGAGGGGACTTAA--ACTTAATGTTCAGGGTCTT----------TAATCTGTGAT---CTTTGGATGTGCTTAGTAAACAGATTAATCAGGTTTATTTAGGAATATTATTGATT
>CG9673 16536801 16536892|20790 chrX 16536889 16537450 scaffold_1 1712692 1713245 - 1620|0 3
AACT
ATCT
>CG18358 16548384 16548758|20807 chrX 16548736 16549291 scaffold_5 5723328 5723916 - 17724|0 22
TAATCCAATTTGTTGATCCAATC
TATTCGCAGTTGTTGAACAAAGC
>CG9634 16561240 16561738|20829 chrX 16561239 16563454 scaffold_5 5746045 5748244 - 73627|1 573
GATGCGATTTTCCATCCACCAGGACCTCCACCTCAGCCAGAGCCCTGTGGATGAACCGGATGATGATGTCCTTCGGCAGCTGCGAAACGGAACAACCTATTTATTGTACTTTTTTTTT-----ACTCCCACACATTGCCAGAGACACAGATACAGAATACACGATACACCTGACAGATACAGACAGACACTGACCCCACACCACACACACATCGCCCTAGT-TGTAGTTTAGCGATTAAGCCTAG-----------CACGTAGCTTAACCATGAAGGATCAGACTTGACATTGACTAGCCACTGTTGACATCACGC---CACACATTCGCAATCTGCTCCAATTGGACACGAAGTAACCAAGTGGG----------GCAGCAAGTCGGCTTAAGTACGAACC---CTACGCCTA----------GTTTAGTC--------------TAGTTCGATAGC-CATAA--------CTTAGTTAGTTGCTAAGCGCCGTCTGCCACCCTGTATAAATTG-ATTGAATTT------GATTTTTGAAGAACCATTAAATGCGA-ATGACTTTTCACACA
--------------------AGGACATCT-------------CTCTGTGGCTAGTGTGTACGATTCCTTAGTTCGGC---------------CAACATATTTATTGTACTTTTTTTTTGAGTAAACCACACACA----CACAAACACACATA---GATATACGCT------------CACAGGCGGACACACAAATCACACTAAA----------CTTAGTCTGTAATTAAGCTA-TAAACCTAGTTTATGTGTTATAAGTAGTATTACTTTAAAAAAACATTTGTAACACACAC-AACCACTGTTGACATCACACATACACACACACACA--------CACATGCATATGAA-TAATTGTGTGTACTCTGCAATTGCGACAATTTGTTTAATTTACAAGTTGAACTACACTTAAAGCACGTTTGCCTGCTCGACAACATATTCCATAGTTCAATAGTGTGTAATTTGTAGTCCTAGTTAGTGGCTAAGTGCATTGACGATTCCTGTATAAATTGAATTTAATTTCCATACGTTTTTTACAAAGCAATAAAAAACAATACGAATTTTCATATG
>if 16586126 16587401|20861 chrX 16586682 16587776 scaffold_5 5795780 5796904 - 27573|0 809
AGTGCCAGGATGTCCTGCAGGTCCTCCAGTTTAGCAAAGGCAGCGATCGTAGCAAGAGA-ACTAACATAGCCACGAAATATCTCTAACATCGCACTAAAACCAAACCAAAACGTACTAA-----AAACAACGAAACGGCTCTAAGAC----GTACTAAAATCGA-----GCTCTTAGTCGAGTTTTAAACCATGCG---------ATGTCGACACGGGAGGTGCAAGTGCATAATCCCCTCTATATAGATATTAATATTTTGGGGGGATCAGCCTGCTGCTTGGAAAACACGATG--GAGAACATTGTT-------AGAAAACAACACATTTAAACTTGCCTAGTCACGACATGAAGAACTTTCTAATGCGTAAAGGTTTTTTAACTTTAACAGACACACACAT----TTTTTTTTTTTTATAATTTTTTGACTTTTGTGTTTT----TGTTCTTTGCAACAATTTCGAGGAAAGTTACGCAAGTGCTATATTAATCTGTACTAAGGA-AGCGAATTGAAGAA---GTCGAAAGGAACCTAGGC---TAAGTGAGTGAATGAGTCAGT-TGAATGACTGAATGAATGAACA---------------CTGATT----------GAATGT-GAGTGATAGCCAATATGGAAATATCGATG--TTATAAGTTCTGAATCGAGAAAGAGGGGAGAATGTAGAG-----CCGATAGCTGCCCAATACTGCCACGCCC-------CCAGCAGCCCA-GGCATGGAAAATAATACAGAGAAAATCCACACTTATTAGGTGCTACTGTAATTTTTTTT
AGTG------TTTGCGGCAGCAGCTGCAGCGT--CAGCGCCAGAAATTGAATTAACAAATACAAAAGAAAAAACGAACAAT---TAACATCGCACTAAAAC--------AACGTACTAAAACGCAAACAA-GAAACGGTTCTAAAACAAATGTACTAAAAACAACGAACGCCCTTAGCCAAGTTTCAAACCGCGCGCGCGTTTTTAAAACGCGACAGCAGACGAAAAATAGAATTCAATTTAAAACAAAACAAAACAATTTA---------------TAATTATAATGTGCGATGTTGCGATGCTTTTTTTCATAAACAAAAAAACACG-TAAAACTTGCCTAGTCACGAAATTAAGAACTTTCTAAAGCGAAACGGTTTAATTATATATATATATATATATTTTATGTTTTTTTTTTTTTTTAATTAATGATTTTCATGTTCTCCAATGAAACTTGCAA-ATTTTGAACGAAGGAGTTACAAGTGCTATATTAATCTGTACTAAAGATAACTACGTTAAGTAAGTGTGCGAGTGTGTGTATGCAAGTGTGTGCGTGTGCGTGTGAGTGTGAGTGTGTATGTGTGTGTGCGTGGTTTTTCGAGTGCCTGATTTGAGTTTTGCTAATGTCGAAGGCAAGACTACAATAAAATATTAATGAATTATTATTTTTAAA-CGCGATTTAATGCTGCCCGCAGAGAAGCTTCGAGATCTGTCT-GCACTGCCACGCCCACTGGCGCCAGCAGCCAGCAGTAGCATAAATAATTGAAATTGAA-------ATAATAGGTGCTACTTTAAAGCTTTTT
>CG9609 16619302 16619415|20904 chrX 16619254 16620713 scaffold_5 6595075 6596588 - 38643|51 204
AGCAAAAGGCCATTCAAAGGGACGGG---------AGTGAGAAGGTCTGGTCAAGAGGCT--------AACAATTGAATGACTACTTTA-----------------------ATTTAAACCACAACTTCTAAAAGAGAAACAACTAATTTATCA
AACATAA--------AAATGGACGCATATACCCTTAAAAAAAAACCATAGTAAATTAGCTATTGTATAAATATTTAAGCAACTATATTAGTTCTTGCAAAGCAATGTCATGCATTCGTACTCTTACTCCGAAAAT---AACAACCTATTTATTG
>Rrp45 16623384 16623613|20906 chrX 16621711 16623466 scaffold_5 16094 17894 + 31272|1879 1973
TTAGGCTTAAACTAGAGCTCTAAAT--ATATCTCCAAACCGCCGGGGCAAACGACACGATGTT----------TTAGTTTAAATATTGCAAATTA
TTCGTTTTAAATAAGTTCTTAAAATTCAGATTTAAAAATTACATGTACAATTAA----ATGTTAATTTAATTATTAATTTAATAATTACATATTA
>Rrp45 16623384 16623613|20907 chrX 16623508 16625150 scaffold_0 6681401 6682994 - 38144|0 108
CCGTTGTGATAGTCGTGTAGTTA---AGAGAAAATGCTTTCTATTAAGTTTTATTTAGGCTTATATGTATGGCTAAAATCAGTCTAGGCTTTAACATAAATCGTTTAAT
TA-----GATAGTTTAGTGTTCATATAAATAAAAT--------TTATACTTTATATACGCT------TAAGACAAAGTTTAGTATAAGTATAACTTTAGATAATTTAGT
>CG9132 16631453 16632569|20919 chrX 16630821 16631469 scaffold_620 5970 6559 + 125|674 690
AATGATAACATCAAAAC
AATATAAATATAAACAG
>CG13004 16661050 16661335|20957 chrX 16660627 16662113 scaffold_5 105375 106845 + 30061|486 793
GGTGGAAGTGGTGGCGAGGGAGGGAGTTGA-------ATGGAACTAATGGAGCAGTAGATG-----GAGGAGAGAGAATTAAGAGATTTTTTCCCAACTGGCAGCGCAACGGATT----------TCTGTACTTGACCCACTTAAAATAACCATATGCAAAAAAAACTGTAACAACGACATCGATAAGTGGTGTTCTGGAAACTCTGGTGTTTTCGAAAGTTCCCAGAGCATTTAGCTGAATACCGCCATATATCCGTATGTCTTATTATAAATTGTAAGCTAACTATTAGCTTGTCATAGCATAATG
GAACGGATTGGTGGCAC--CAGAGAGCTGATGCGACCAGAGAGCTGATGCGACCACAAAAGAAGAAGAGGAGAGAGAAACAAAGAGATTTTTCGCTTGTGGCATTGAAATTGACTAGAAATGGAATTTGTACTTCAACTAC------------------------ACTACGCTAACGCCATCTATCGGTGGC----------CTCTGG----------------------------------------------------------------------------CTATTGGCTAACCA------AATG
>CG13003 16678742 16679747|20978 chrX 16678729 16680563 scaffold_5 134437 136535 + 23595|13 1246
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CAAGGCGAGGAGCACGAAACAAAACAGGAGATATAGGAGCCAACGACAATCGTCGATGTC------------AGTGTCAAAATGTGATCTTCAAGAACAGCCGTTAGCCGAGCAAATCCCGCAATCGAATCCAGGCAAATCCA-----------CAGACCACGGAGCTGCTTAGAT-GAAATAGTCAATGTCAATACACAAACCATAGACGATGCTGAAAGTGTACAGAAATGGGATGTTTCAATGCTACGAATAACCTTTGGCAAGTGCAATTCACGCTGAATTACTGTAATTTCATTCAAATCATTCGGTGCGTCTGCAGCCCTGGCAACGAGCCACCCTCTACTCAACTATAATTATTATGAATACAGCT-----------------CTGGTCACATCTGTCGTTTGTTTGTCTTTTGCAGCCCAATCGAATA----------CAAGAAC---------AAGAATAACACACCATTATTTTGATGTGGCCAAATTGCCTGC------------ACAAGCTAT--GTATGC---TACATATATATA----------TACATATTTATACATACATATATAAAGCATAACTACATGCATACATACATATACATATATCGGAATACGAATGTATTCATATTGATAGGCTTGTGTAAATACGTTAAGGATACGACATGTACGATTTGTGTACGCCAAATAAACGAGTAACGCGTTATTTGGGCGCCTACACAGAACTTAGTCTTAAAGGTGGGCAACAGAACCGTTAGGGACCCGTGTTGTCTTACTTAGCATCTAAATTGTGCAGCAATATGCATACAAAATCATGAATACTGTTTTAAACTATCCTGTTTATAAGCTTATCAAATAACCATAATTAAATACGTTTTTTTTTTATTTATATAATAAAATAAGCTCATTTCCGAATGATTTTCAAAACTATATATGATTGTCAGCAAAATTCAAACGCAAATTTGTATAAAAGCCATAACAA-TAAGTTCACTATAAATTCATTTGAAGCACATGAGCAAATGGCAGAGCTTCAGGTGAAACCCAATCAATAAAACGTACGTATAGAAAACAATAATAGGCAGCATATACATATATATATATAAATACATATATTATACATTTTGTATGTACATTTTTTTTTTTTTTGTTAGCTATAACAAAATTGTTTACAAATAA-GCGTAGCCGAAAAACGTATTCATCTAAATAAAGCAATTACAAATTCA
>CG9104 16716449 16716788|21031 chrX 16716234 16716644 scaffold_630 6135 6533 - 7580|220 424
ATCGCTTTGCCAGCTGGACAGCAATCAGGAATC-CTTTGCGCTAGAGATAATGCAATCCTGAACCGCCTGGGCCACACAGGCGTCCTCCGAGGCCAT--------GCCTTAAATAGGAAATGTATGAAATTTTTAATGATACAACTTTGAAACAGACAGAGATAGTCATATAGTTACACAAACTTAATAAAAACGCACCCATGGA
ATCTCTCAGCAGCCCGAATCGGAGTGGAGCATTACTTGGCGCATGACAGGAGCGCCGACTGCACGGCTTCGGCCACACAAGCATCCTCGGAGGCCATTCCTATGCGCCGCAGACAAACAAAATGGGAGTTCATAAATGGTGTTATT--------------GATA-----ATATTT-------CGTCTGGAGAGCTCACCCATCGA
>CG9104 16716449 16716788|21032 chrX 16716675 16718253 scaffold_10 2472615 2474164 - 67482|0 133
CGACCGGAAGGACTTCTCCG-----------------GCCAGTTGGGTTTGT---TGTAGTTTGTAAGCGAACCGATTGTTATGTTTCCAAATGCTTTTTTATATACGCGCATATACACATTAAAGTTTAAGAA
TTAATTGCGTCGTCTCTATGTGTTTAAATTGTAAATTGTCAGAAGCGTTTTTATGTGTAATTTGTA---------ATTATTATGTTTCCA-----TTCTTTATAAAATGTTTGTTAAATATTGAAAACCAAAAA
>CG9099 16719485 16719550|21034 chrX 16719485 16720394 scaffold_10 2259553 2260340 + 31996|0 76
ATAATTTACCTTTTTTTTTA-------GCTTATTTTATACGC----TCCATCAACATAAATATATGAAACGTTAAAC
GCCATTTTCGTCCTGTTTAAGAAATGTGCTTATTTTATACGCAAGTTACATC-----AAATATAAAAAGATTTAAAC
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TAAATGCGATTACTTACTTAAAGCAATA--GTACCTAAATGCTGCTATAGCACATATT--GCGAATTCTCTAAATGTTATTCATATTAATTACCTAATGGTGTTTTTAGCTGTATCTGTTTCCA---------CATGTATTTATTACCATA-AATCTGCGT-----TGTTTATTGTCAAGACTGTGTTTAAAAATATTAAAGCACCCCAAAATT--CATT
TAAATACAAGTATTTGATAGAAACGATATCGAATCCAATT-----TAAAATACGAGTTCAGCAAATTGACTAAATGTGATTTATGTTTATTATTTGTTTTTACTTT----TTTATTGCTGGCCAGCAATTAATTAGGGACTTATAATCACAGAGTGTGCGTCCAGGTCTCAGTTGGTTGGCTTCCGGTAAAAAACATT-------CCCAATTTCCGCACA
>wus 16772434 16772689|21098 chrX 16772633 16773904 scaffold_1921 854 2151 + 52222|0 57
GCGGCGCTTTCCTCCATCTAGTCTAAGTAT-TTATAACGACTAGGAAGTAAGATTCTT
TCCATAATTGCCTAATCAAAGTCTAAGTCTGCTACAAGTTTAAGGCATT--TTTTCTT
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TCAAATACTTGCATTAATATTTTATACATTACTAGTGTATTTGAAAATCGATGAAGAAATT---ATTCATGACACGCCGGCCGCTAACAAA--TTCTCATAACAATTTTAGTTGGTAAACTCAATGAATTTGATTT--TTATTTTAACTAT--AATCATAGGCTAAGTATT-------TTTTAAAAGCTCAAATAACGTGTC---------------AAATTATCGAGAACAAAAATTTTGTTTATACATGTAAGCCATGCTAAATATGCAACTATGTTATATTTAAGCAGCAAAAAAAAAACACAAATATCAATAAAAAT---ATTTCATTTTTAA--ATGG
TTAAAATCTTCAGCTAAGAATTTA-ACGCTAC--GTATAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACAAAACAAAAAACATGCATACCCAAAACAAAACATTTCAAAATATTTATCATAAACAATTGCAATGAAATTCAATTAATTAACTTAACCGTTCGTTCACAAATTCAATATTTGCCGCATTCTAGAATCTAGAAAAACGTTTTGGCTGTTTCTGGCCGAGATTATTAATGACAAA----TTATTATAAAATGCTTATTTTATTTACTATGTGATTTCATTTTATATAGAT----ACAAATACACACAAA-ATATATAGAAATCCAATTCCATTGCAAAAGATAA
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GAAGAAAATTACTTTAAAATAAAGGAAAAATAA
GCAACGATTTGTTACAGAGCCAAGAAACCAGCA
>CG9086 16790884 16791430|21124 chrX 16790972 16792553 scaffold_5 6521090 6522787 - 51040|0 595
TCCTC---------------------CGCAGGCACCGAGAAGGA-------AGCAG--------------------------------------------------AGGACA--------------------GGCAGCAAAATGGA-------AATGGCGG---CAGTCTATGTGATTATTACATACTAACATTAGGAGAGCCTATTTTTACGTCTAAGCATTT---TACTACTTATCCGTTTTG------------------GAGAAGCGCTCACTCATCCAGCGAGCCAACCATGCACCCAGCCAGCACCTCCATCCCACACAG-TCAACGACACCAGCCA---CGAACACGCCATCACCACACAATCCTGTCC--AGCGGCCCCCAAGCGGCAACTGTAACCATTGGTTGATTTTCTTATTAATTAATATTAATTGATAACAATATTCTTATTACTTTTTTGAGCTATCGTTAGTAAACTTGTTGATAGTTTGAGCGGCCCAGTGCCCTCCTCTAGTTATATATATGTATGTGTATACATATATGCATATGTATATAT--ATATATATATAATCAAATGCTAAAAAAAATATA
TCCGCATGCTCCCTAATTCAATACAATGCGAACAGCTATAAAAATATCGATAGCAGTTGCTTTAGCGTTAACGTTAACTATAACGATAACGATAACGATAACGACAAGGATAGCATTGTCATTTTCGATAACGATAGCATTATCGACGATGACAAAGGCGGCGACAGTTAATGTGATTATTAC------AAATTAGGAGAGCATATTTTTACGTCTAAGCATTTTACTACTACTTATCCTGTGTGCGCCCCACCCACAATCACAAGAATAACCTACACACCCA------TAACCA--CAACCACACAGACACTCCACCAAACCCAGCTCGGATACATCCGCAAAAGCTAGCACCCCATCAATCCAGCGCCTTATCCCTGGAACCACTTAAATATTAAGTTGCGTGTTTGGTTGTTGTTTTTCTT-ATACATATTGAAT-ATATATATATGTTTATATATATATT-------------TATACATATATATAAAT-------------------ATATATTTATATGTATATATATGTATAAATATATATGTATATATGTATTAATATATATATAAATATATATACACATATATATA
>CG8949 16903729 16904289|21285 chrX 16903421 16904152 scaffold_10 2494576 2495369 + 9688|343 824
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GCAGATGAGTGGCTTATCTCATCTGTTTCGCTCATCCGATGCAGTTCCCAATGATGATGCATCGCAATTTGAGCAGGGTGGAGCAGGGCAATT--------AACACGTGCATCCTTCTTTGTTGGCGGCGGGCATACTCCCTGGTGACACTGTTGGCGTCTGTGCTAGTGGCAGGCAACAG---------GTGCTGAACAAATATTGGTCGCCGACCAGGTA-ACATCAACA--ATGGAGCTGCTGCAGCGACAACAAAACGGAAACGAAAACGGAAACAAACAACAAACAAACAAAAACAACAAACAACAAACAAACCAACAACATGATGATGAAGAGAAGAACACATGAAACTAAAACATAATTAATAATTAGCAACGCGTAATTTATAACTTAAATAAGCATGAAGCGCCGGCGGCAATGTTGAGCTTATGTTGCCGTTAT-CTAAATACAACAAACAAACAAACAAAAACACCAATAA
>CG8949 16903729 16904289|21286 chrX 16904195 16904573 scaffold_10 2495385 2495773 + 22299|0 94
GATCAGGAGCAGGTTAGGCTGCGCGTACATCGCAAGCTGTCTGTTAGGCTCAAAAAGAGCTTCTTCTGGCGCAGCTGATGATGATTGCGATGATG
GATCAGGAGCAATTTAGGCTGCGCGTGCATCGCAAGCTGTCTGTCAGGCTCAAAAAGAGCACATTTTGGCGCAGCTGATGATGATGAAAGCAATG
>Arpc3B 16938510 16938578|21323 chrX 16936877 16938930 scaffold_10 2538247 2540075 + 60464|1704 1775
AAGACTCACTAATATACTGCCGATCTTAGAGTATTTACCACCAAAATTTACGAATAAACTGCTTT---GAAT
AAGAGCCTTTCGGGTCCCGGCCAG--TAGAACATTC----CTAAAATCGACTGTTAAATCAATTTTAAGACT
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ACGCCTG--------------GCATAGATCCCT------ATAGACCAACTTGGCATTGATT-TGGCATTACTCGTAGATTTATAACCATCGCACACTGGACCAATTTTGAATAC----CTTTTGTAGTTTTATACAGATAAATTTACAGCAC
GTAATTGTTGAATTGAATGCTGCACAGATTATTTGAATACCAAACTAATTTGACATAAATTGCGAAATTGATAATATATCTATACCATACTTATACTG------TTTTAGAAACAAAGTATTTGGAAGTATCTGTGCAGCATTTTATAA-AT
>mei-217 16970887 16971333|21355 chrX 16970548 16971343 scaffold_10 2572471 2573214 + 10155|342 820
ATGTCTTCTCTAGCAAGACCTATATAGTGCTGAAGCAATTAGCTGAGTGCTTTGCCAAGCTGGCGCTGCGGCTGGAGGTCCTTGAATCGGACGTTTGTGTGGCCATCTTTCACTGCGAGCATTTCGTGCAGGGCATTTTCGGGGCCAAAGAAAACCAGGCACCGCCGGCGGTCTTCAATTTCAATGTGATCTCCTGCATCGATCCGTACATGAACAAGTTTACACGCTGGTTACTTCAGTATCTGAATAGCTACGAGGACGAGGAGCTGGGGATGCACGCGGA-----TAAGAGGCGGCGCACAGATAGCT--GGGACATGCCCTAAACGCCTG--------------GCATAGATCCCT------ATAGACCAACTTGGCATTGATT-TGGCATTACTCGTAGATTTATAACCATCGCACACTGGACCAATTTTGAATAC----CTTTTGTAGTTTTATACAGATAAATTTACAGCAC
CCGCATTTAGCAGCAAAACTTATATTGTGCTTAAACAGTTTGCGGAATCGATTGCTAAGCTGGCTATGCGCCTGGATGTACTCGAAGCGGATGTAACCGTTGCCATATTCCATTGTGAGCATTTTGTGCGTAGCATCTTTGGTGCT---GGCAGTTATCCGCCGCCAGCTGTTGCCAGTTTCAATGTTATCTCCCGAATTGATCCCTACATGAACGAGTTTGCGCGCTGGCTATATCAATATTTGGATCGCTATGAGGACAATGTG--GACGTCGATAGCAGACATCCTAAGCGCCAACGTATTGAAAGTTTCTAAACATGCCAAAAGTAATTGTTGAATTGAATGCTGCACAGATTATTTGAATACCAAACTAATTTGACATAAATTGCGAAATTGATAATATATCTATACCATACTTATACTG------TTTTAGAAACAAAGTATTTGGAAGTATCTGTGCAGCATTTTATAA-AT
>mei-217 16971626 16971858|21356 chrX 16971609 16974179 scaffold_10 2573257 2575618 + 20041|23 255
AATCTTCGGGCTGCCAATTTATATGGGTGCTCAGGCCAGCAATAGTCTCTGGAACTCTATAATTCAGAAGCACAACGCTGAGGGTCAAATTGTAGTCAACGATGGCTTGAGCATTCCCGAGGACGATATGCGCATGCTTATACATCTGTTGCATCAGCGCAAGACCACCTTAACCGATGGCGCTCAGCATATGCTGCAAAAGTATTATGTGATCTCCAGGAAAGAGCGACCGA
CATCTTTGGCCTGCCCGTGTACATGGATCAGCACGTGAATGAAACTATGTGGGACTTTGTGCTGCGCCAGTACCGTAGAGATGAGCAGGACACAACGCAGGATGCATTTAATATTCCCTTAGACGATACACGAACAATGCTTGAGTTGCTCCAACATCGCCAGGTGGCCTTTACCGAGGAGGCCCAACAACTGCTCCAAAAATACTATGTTGTCTCGCGCATCGAGCAGCCCA
>mei-217 16971915 16973248|21356 chrX 16971609 16974179 scaffold_10 2573257 2575618 + 20041|318 1664
CAAAGACGCTGTCGACAGCGTTTTACGCGCTCTTTGCACGCGAAAAAAAATAACCCACGCGAGCAACTACCAAATCCTGACAGCGCCCCAGAAC------CAATACTCGAATACACCT-----CTGAGATAGATGATCAGCCATGTCCACCACGACAGACAGTCGACACACCGATCGAAGCCATTGTACCACCGGCAATGATCGAGGTGAGTGCCACCGGCAATCTGCCGCCCGTGTTCTATTTTGATCAGCAGTCGGGAATTATATGGAGCAACTCGTCACCACAAATTCCGGTTGAAATCCAAAGCAACAGTGTCAGCCAGTCGGTTTTTCGGCTAGCCAGTCTCCCGTGTACAGGGGTTGGCACCACCAATATGGATATATTTACCAGTTCGCCACCCCCCATCCAGCATATGAGCTCCAGCCGCCTCCCATCCAGCATTTCCGGGCCCACCCAGTTATCGCATACTCTCAGTTCGCCGCCGGTGGAGAACCAGCACCAGCAACACTTGTGGGAATCATGCATCCACCAGGACGAGGACCTAATGTACAGCAGGCCTCTGTTGGATATGGATCAGGAGGAAACCCAGCCGGAGCAACAGGACCAGGAATGGCAGTGGGAGTCGGAGATAGAGCCCCCGAGTTTCCAGTCGGAGAACCAGGTCGTCGCCGACGAACACGGCGAGGAAAACGCGTACCTCGCTAAGGACGCAGGACCACCACTCGAGCGTCATATGATATTTCGAGCCCCATCACAG--CACGGCCAAGAATATCCCAAGCCGGATCTAAACTGCGTGCCGTCCAGCATCAAGAAACTACATCACTTGATCTCATCGCAGTATTCTGACTACTCCTTTGTCTACGCCCTAAGTGCTCAGATCAGTCAGGACTGTGTGCCTATGGATTGCTTTGTGTACCTGAAGATGATACTGCTGGCCAGTATCGTTTCAATCGAATCTGATGAGGTGCGGGCTCCAATTTCGCTATGCATAATCGCCACCGACAGCCTGATGGCCAACCGTCTACTTAACAAAGTGGGCCAACTGGCACCACGTTTCCTGGGACCCCACGAATACGGACTGCAGCCCACTTTCAATGCCCTGCCCACGCGCTTTAATTGGATAGTGGCCAGTCCTTTACTATTGGCACAACAGGGAGTTTACTACGCCGGCGATTGGAATCGTCTGTCCAAGGATCAGGGATGCCAGCTGGAAAAGTGCATCGAAAATGGAGCGGTCCCAGTTCCGCAGTTGCACATCGATCAGCCCTTAAAGGCAGCCGTTTGGACTTACTGGCAGCCGAACAACTCCACCAATCAAACACTGGCCCTCGCCAAACTGTGCCC
GAACGTCGCCGTCGTCAGCGATTC-------CACCGCACACTCAAGC------CCCATGCGCTC---TTTGAGCTGGTGTCGTTGCCCTCTGATGGGCTGCCGCATTCGCAATCAACTGACAATGGCCAGGGATCGCAAGCCACATTTAATATATCACCCAGCT---ATACGGATTCGAGT-GGAGCACCAACGGCTGCGGTCGCGGCAAGGACTGCAG-----CGGCTGCCA---------------CAGCCGCCAGG-------------------------CAGCTGCCGCTGCAGAACAATAACAACAATGCCAGCCAGTCGGTTTTTCGGCTCGCCAGCCTCCCCAGCACGGGTATCGGCACAGGCAACAG-------------------------------CAGCCTGTCAACAATATTCGGCCCCT--------CTGACAGCCCAACCCAA-----ACAGACGC----------GACGGTTGACTTTTTGCGAAGTCCGCCCTTACTGAA--TATGGATCCGCCAACGCAGGAAACTGAAGCGCTGCTGTTCCTCGACGTGGAAGAGTTAGAA--------AACTTGAGCGA--------------------GGTATCTGATGTGGATCA---------------AGAGAACC-------------CCAACATGCCG-------------CATCGC-AGGAACAAAGATTTCCCAC------GTCACATAATCTTTGTAGGCC-GTGACAGTCCACAACGCCGCAATTTCGATGTCG-ATTTGAATTTTATGCCACCGAGCATCAAGAAGTTGTATCGTCTGATATGCTCCAAATACTCGGACTATGCCTTTGTCTATGCACTGAGTGCGCAGCTGAGCCAAGAATGTGTGCCCATGGAGTGCTATGTGTATCTTAAGATGGCGCTGTTGAGCAGCCTGGTCAGCATTGAGCTGGACGATCTGCGTGCACCCATTTCGTTGTGCGTCATATGCGCCGACAGCTGTGTGGCTAATCGGCTGCTGCACAACGTCGGGCAATTGGCATCCCGTTTCATTGGTCCCCACGAGGGTGGTCAGCAACCGACGCAAACAGCGCTGCCATCGCGTTACAATTGGGTGGTAGCCAGCCCATTGCTGCTGGCTCAGCAGGGCGTCTACTTTGCCGGCGACTGGAATCGCCTGTCGCGCGATCAAACTGAGGAGCTAGAGAAATGCATTGAGAATGGCAGCGTGCCGGTGCCACAGCTGCAGAGTGCGCAGCCGCTTGAAACTGCCATTTGGACATACTGGCAGCCGGAGAATGCGGCCAATCAGACAACTGCCTTTGCCAAGCTTTGTCC
>mei-217 16973313 16974852|21356 chrX 16971609 16974179 scaffold_10 2573257 2575618 + 20041|1732 2658
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AGCAGCTCAGCCAGTTGGTCAGCGTATTGGCCATTACGTGCGTCAGTCAACATCCAGCAATTCCCTTGAAAAGCAACAAGTGGTGAATAAATGGCTCAAAACTGTGCAGCAGCAGCCGA--TTGCCCAATCGCAGCAATTATCAACACAATTGTCCCAGTTCGGTGCGTCGCAATATGAGACTAGTGTCAGCGCACCTGCTGCTGCTGCTCCGCAACAGCA-----------ACAGTCCCAAGGAAT-------GCATCAACAGCAGGCTCCACCATGTGCTGCTGGCAGCAAGATGATGCCGCCGCCT----GCGATCAGCG-----GCAACCAACCAAGCGGACACGCACAACAGATTCCGT----TTGCCCAAAGCGTGCCGCATTGCCCGGTCACATGCCCGAACATGACCAT-----GTCCCTGCCGGTGGATGGCGCCATGCGCACC-----GCACCCCAAATTCGCTCCGTATCTGGCG-AAGCTGCAAGGACTGCCGCACCAGTCAATGAGCGTGTTGTCCATGAAACTGACGGCACACAGGCACCG--CAACATCATTGGCGACGCAATGATCGACGCG--TGCAACGCGAGCAAGCGCCGCATATAAATGC----ACGCAGAGAGCATCCGGGC-TTGCCGTCGCAACTTCCCGACGA-GCTGATGATGCAGCCGCCCAGCTCAG--TGCACGGCGGTCGTGATGATGATGATGCTTCCT---------------------TTGTGCTGGAGCTGCAGCAGG--------CCCTGGCTGCCAATGCGCCGCTAACGCAATCCCAATTGCAGCTGGACAACATCG-CGGCACATAGCACGCTGAATTGGAATGCCAACGAGTTTCGTCCCATGCAGGGGTCAGCGCTTGCA---AGAGAGCCTAGAAATATGATAAGC
>mei-217 16974916 16975027|21357 chrX 16974963 16975819 scaffold_10 2575939 2576820 + 8691|0 64
AGAAAAAGGACCCTCGTAGGCACATTCCCCTCCAGCTTAATGTTTTCTTGCGCAACGATGACGAT
AGGCCTCACGCAATCGCCGACA---GCCTGTGCAGCTCATTGATTTCTTGCGCGCCGATGGGGAT
>RpS5 16977524 16977639|21360 chrX 16977265 16977570 scaffold_42 89083 89317 - 248|266 312
AGAAATGATACACTAAAACTAAAATAAACAACAAGATGAAAAATTCA
AAGAAAAATAC-CTAATTTTAAAATAAACAA----------------
>RpS5 16977524 16977639|21361 chrX 16977571 16979135 scaffold_10 2578471 2579825 + 46017|0 68
GGAGACATCATCACCAGCAAAAACAAACTTCTGTCTGTTTTTTTTTATACAAATAACGTGTGTACACTG
GAAG----------CAGCAACCACACACATATGCAAAT---------AACAAATACCGTTTGTTTAATG
>CG8918 17034659 17034721|21431 chrX 17034241 17034675 scaffold_28 1878963 1879379 + 2617|458 474
TTGGTTGTTTATGAAAA
TTGATATTATATTGAAA
>CG8675 17082309 17082534|21495 chrX 17082481 17084672 scaffold_28 1935468 1937788 + 60990|0 57
ACCAATTTTTTGTCAGTTAGTCCTAAATAGTTTAGCAACTTGGT----AGAGCACGAT
ACAAATAGCATTCAAAT---GCCGAAATAGTGTGAAAATTAGGTTATGAAAGCACAAT
>CG8664 17115710 17115747|21531 chrX 17115707 17116332 scaffold_10190 174 764 + 9126|3 40
GTTGGTAATAAAACCATGAAATTATGAGCAAAGCAGAT
----GTAAACGTATCTCAAAGTTATAAGGAACATATAT
>CG8661 17117698 17117751|21532 chrX 17117216 17117777 scaffold_10 417678 418208 + 1997|515 568
GGGTTTAGTGCCCGCAATTGATTCGAGCATTCAATAAAAATCCGTGTTATCACA
GAATGTTTTCGCCGCAAGCTGTTAAATTTTCCAATAGAAAT-------------
>Fim 17119640 17120609|21537 chrX 17119628 17121131 scaffold_5 472833 474423 - 39240|12 1115
GCGCCATAGCCACAACTCATTTATACATAAACAAAAGGA-TGGGATTTTGAAAGGGAAGAACAG------AGTGGGAAC--TACGTAAATTTGT---------------CGTATTCGCTAATT-ACTAATAACTCTATTCGATTGCGTTCCTTCCTGC-------GCTACCAATAC--ATTTTTGTGTTTTTTTTTTATTTCAATTACTTTTTGTAATTTTTTTATTAT-ATATTTATATATTA-TATAATTGAGTATGAGTTTCCCCCTATTGTAATTAAGCA-AACAGATTTTAGAGTG-------------------TCGCACATCTGTTTTCGAGCCCGGCGGGGTGTTTCT---TAATTAGTTTTGTTTAACA-------ATTGATTAATTATACAA--CTGTAACCTTATTTTATAAATAAAGGTTTAG-CTTGTTCCGCTTAAA----ATCCTT----------------AAAAGAAAAGAATGGTGAAACAAA---AGAAAGAAAAAAAAAGCGACTTGTGCAGGATTAAGAAAGAATTAT----AATATTAACATTGCGACGAAAACAATTAACTCTGTAATATATAT-----ACATATATATTTATATACGATTACGATATGCGTCTATATACATAACATATAAATTTACATAAATCGATATATTTTTCCATAAACGCGTTGCCTAAAGAAAGATAACGAACGAAGATCAG---GAATGGGGAATATT--------CAGAAACAAAAGAAGTCGAGAAAAACAGAGAAACTAATTTTATATTTACTATAAATTTTTTTGCGAGTAATTGTAA-----GACGCCTTTGTTTATGTGTTTTTTTTTCAACGTGCGTGTTTGTTCAATTTCTTTTTACATATTTGTATAATTTTGCGTTTAAGTG-----CGTTAGAGCGAGGTGGCAATAGGTATCGCCAACACGGCGTAGAAAGAGAGGGCAACAAACA------------TTTTTAGTGCAATGAGGCGACATACAAATCCAAGAGAAAAAACGAATTAAGAAGAAGATGAAGTAATATTATATGCAGAATAAAAGTAAAACAATAAAGAAAATAAAAATACCA
G-ACGACAACAACTACTCAATTATACTTAGACAAAAGGAGTAACAATTATAAAAACAACAACAACAAAATATTGTAAACAATACGTACGCCCATGCATACACGTGCATGTGTATTTGCTAATTAACTGAAACTAACTTTTAAATACGTGGCGCAACACAACGACAACAAACAACACCGACATTAACAATAGCTGCGCCCCGCAAATTGTTCTTGTAAACGTTCTTTTAGAATTTTTTTTTATTATTATTATT--GTATTATTTTTTTGCTATTGTAATTAAGCGTAAAAAAGTTGAAAACAAAAAAAAAACAAAAACCACACACACAACACCTTTTGTGTTGCATGTGCTCATTATAACCAATTTTTTTTTGTAAACAAAAATTTATTGTTTAACTATATAAAGTGAAAACCTTATTTTATAAATAAAGGTTTGGCCCTTTTCTGCTTTAGTTGTATCTGTTTACGCCGAGAGTTGAACGTGCAAGAAATTTTGTAACAAATTTAATAATAGAAACTAAATACTTTG--------TAATATATATTTATAAACAATATATGCAT--CAACATACACATAAAACAATACAATATACATAAAGAATATACATATATATATATAACTAT-ATATGTATATTTATACATA----------------------ATCTATTTTTGCATAAA-GAGTTGCCT-GATAAAGAAAAGGGACAAAGATGTGAGTGAATGCGGCAACTTTTTTGTTCTAATTGTAAGTAAACTTTTAAAAGCCCATTTTGTTTGTTTTAATTTTTTTATAATATTTTCTTTGCGTGTGTGTGCGTGCTGGTGTGTGCGCTCGTGTGCTCGTCTGCTCGTGTGTATGTGTG-----TGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCGTGTGCGTGTGCGTGCTTCACATTAGAGCGGAATGGCAACAGG--------GCATGGCTTAGAAAGAGCTAGCAAGTAATATGTCTGTTGTTTTTCTTAGTGCAAAGAGGCGACTTG-AAATTGGACATAAATAA------------------AAGTAATATCATGCGCATTACGAAACTAAAGTAATAAAGTAAATAATAAAAACA
>CG8611 17247734 17248317|21743 chrX 17247453 17248097 scaffold_5 1045545 1046298 + 18471|363 781
TAAGAAATCCCAAGGAGATGC--------GCTCATAAAAGTTTCATTTTTCTCAACTTTTAAGCCCGGACGTCCTGCGGGAAAAGTTGTG------------GCCGCCTGCCAGCATATTTTAAGCTTCCTTTCCATTTTTTTCCCACATTTACTTTTTTTTTTTACTTTTTGTTTTTTGAT-TACTCGCCGTAATATGTTCGTTCATTTTTTGTGT-------------GGAAAATATTAGAAATCCATTTTCCGCTCACTGCAGATTCATTCAGTTTTGAAAATGTCA----------CCAACGACGGCGGGGGGTCAGAGGTC-GGCACGTGTTGG----CTTTTTATGCAACTGAAGCGCATAATTCGTTGGACAAGGCATAAATAAATATCGGATA------CATATAAACACT
TAAAAAATGCTAAGAACCTGTCAAGCTCAACTCATAAAAGTTTAATTTTTCTCAACTTTTAAGCCCGGACGTCCTCCGGGAAAAGTTGCAACGCCCAGCTCCGCTCGCCGCTAGCATATTTAAAGCTT-------ATCTTT-----ACAGTTAGTTGCTATTTTATATATGTATGTATACATATATACATATATATATATATATTTTTTTTTTTTGTAATATCTTTTTAAGGCAAATATTAGAAATCCATTTTCCGCTCACTGCAGATTCGTTCAGTTTTGAAAATGTCAATCCCTGTGTCGCGCAAAGGCCGAGGGTGGATGGGCGGGCACGTGTTGGTCGCCTTTTTGTGTAACTGAAGCGCGTAATTTGTTGGACAAGCTATAAATAAATATTAAACATAAACGCATAAAAAAAT-
>CG8611 17247734 17248317|21744 chrX 17248131 17248586 scaffold_5 1046354 1046776 + 11995|0 186
GAAAAGCAAAAGGACGTCGAGCACTTGGAGGACTCGCTGGACTTGGAGGGGAAGGTGGACGAGCAGGCGGAGGAGGGGCAGTGCGGTCCGGATGGAGTTCTGAGCACTTTGCGGCACTTTATGCGCGCCATTTTGCCTGTCCGCTGTGCCTGCTCAAGCATTTAATCGAAAAGAAAATTGCTCCATA
TAACTG----ATGACG-------------GGACGAGCAGGAGATGGAGATGAAGCTGAAGATGAAGCTGGAGCTGGAGCTGGGCTGTCGGCCAGG-----CGAGCCCC--------ATTTATGCGCGCCATTTTCTTCGAGCGCTGT------TCAAGCGTTTAATCGAAAATAAAATTGCCCCTTA
>CG8568 17282922 17283078|21779 chrX 17282942 17284204 scaffold_5 1096928 1098070 + 16634|0 139
GCCCCACTCCTTAGCTTAATTTATTGTAATTCGTAATTGTTAATGAATTGTTAATGCTAAACGTTGAAGCCTGTTAATTAATACGTATTTATTGTATTTATTGAAACCAACT---CAAAGCCAAACTCAAGCGAAATAAA
TTTCAGCAGTAACAGCTGATTGTTAATTTATTATAATTGTTAATGAATTGTTAATGCTAAAT------GCTTGTTAATTAATACATATTTATTGCTAACGTAGAAAAAAAGTCAACAAATAAAAGATTAAGCGAAAGAAA
>CG8557 17290481 17292157|21789 chrX 17289993 17291273 scaffold_5 1388105 1389432 + 3826|549 1459
TATAGCGAATGTTTCT-GAAGAAACCTAGTGTTTAGTCAAGTGTTTTCTCAAACTTGAGCAGCCAACTATCTCTTTTTGTTCTCGATTCTTGCGTTAGAATGTGAAACTTAGCCCTAGGGAAATGTTTTTTTTTTTTCGTATGTAGTTCATAACTGAATATCCAAATATACAAGTTTTTTTT------TTTCGTTAGTTCTGTAAGCATACTATGTTACATAGGA-TATAAACTAG--------------------ATGATAAGCGATGAAGCACACACACAAGAGAGCGGCCAAGCCAACAAGCTAGGGGGAAATGATGTTGTCTGTACAATAAGAGATAAAGCAAAACAATAATGCATTGTTTAGTTATCCGGGAAACTGTCGAAGGAGCAGGACTTGTGGATGGAGTGCGACATGGTAAT---GCAAATGGTTATTTGGCCCATTCTACGACCATGTGCAGCACTTCTTATCGGTTTTTCTCAAG--CTTTTCGAAGCGAAAACTCTGAGGCA------------------GCTGGCAGCA---------CTTTCCTTATGTA-------------TGTATTATAACGAAAT----TAATATTTAACGTACTTCCCCTTTATGGATAAACCCCATT---------------TGTAGTACTCTAATGCCTGTATTTGTGAACATTTACAACAAGCAAACAAGAAATAAAAAACAAGTGTTTTTTTGTCTGTCAA------------GTAAACTTAAATATACAAAGGTAATGAAGCGAACA-------AGGAATATCTTATATACACACAAAAACATACTTATATACGATTTACATTTATGAAATATACATG--TGCGTGTGTGCAAC-----ATGAATATTTAGCTAAAAATAATAAAAAAAAAAAAA
TATAGCTAATCTTTGGAGCAAAGAGCTACGCCTTATTTAATTTTTTTTT------TGTGCTGC------TCTTATTTTTTTTTCTA----------AGTATATAAACGTTAGAATTAAGTAAACATTTTTTTTTTATATCA-ATAATATAAAATTTA-TATCCAAATATGCATTTTATTGCTATAGCATTTAAGATGCACGTGAAACAAGCTAAGTTAAACAAAAAGATGGAGCAGGGGGGACTTTAATAATAATTATAATAAAAAATAATACAAATAAATAC-ATAGCGGCAAAGCCAAGCAGC-------ACACGATGTTGCATGTACAATAAG-TATTAGTTTAAACGATAA--AACTGTT-------------AAACGGCGACAGACACAGATCGGCATAGATAGTTAGGCAAAAAAACCTAGCGAAAATCTATAGAAACCAATTCAAGATA--TCAAAGAAATTATTGTCATGCGGCTTAAAGTACGTTTCGATATACATATTTTCAGCAAAATTGTACCCTGTTTTTTGCTCGCAGCAGCTAACCAATTTTCCTTACGTACCACAAATAATAATAAAACATAACAAAATACTTGGATGTTGTATGTGTATATGCTT-----ATAAAAATTATTCTATACATGTCCTCGTATATTATATAAATATCTGTGTTTCTAAACA--------------ACAAATTACCAGAAATGTATGTTTTTTTTTTTTTTAATTTTCTATATCTGCGCACTTGGAAGTACATATGTAAACAAG-GCACATGTATGCATAAATATACGATTTAAATACATATACAATCGATAATAATATAAATGTCTACTCAATATACATACATACTTATGTACAGCTGTATATTAACATTATGCAGTACATAATACACATACTTACA
>CG8557 17290481 17292157|21790 chrX 17291843 17292135 scaffold_5 1389686 1389954 + 9593|0 307
GCACCCTTCAGCAGCATCCCCACCAGCACCATCCACCGCTAACCGAGCTGTGGCGCCGCGTGGGCGAGCAGCATCAGCAGCACCAGCAGCTGCAGCAGGCGCAGCGTCGTGGCCGTGGACGGGTCCGGTTCCGGGGATCCTTTATTCAGCGGGATCGCA---GTGCCGGCAGCGATGGAGG---AAGCGGTTACGGAT--CAGGCGGATTGTCAGGTGCTGGCGG-----ATCGG--GGGGCATGTTGGGTGCCAGTCTGAAGCGACTGACCAAGCTAAAGCGCGGCGGCAGCCTCAAGGAGTTCTAG
GCTCGCGGCCGCAGCACCCGCACCAGCACCACCCGCCGTTGACCGAGCTCTGGCGACGCGTCGGCGAGCAGC---------------------------------------GTCGTGGACGCGTCCGTTTCCGTGGCACGTTCACGCAGCGCGAACGCGAACGCGACCGCAGCGCGTCGGGTCTCAGCAGCTGCAACTGGCGGTCGGATGGTGAGCGGCTCGCGATGGCCAGCGGCAGCGGCATGCTCAGCGCCAGCCTAAAGCGACTCACCAAGCTGAAGCGCGGCGGCAGCCTGAAGGAGTTCTAG
>l(1)G0222 17405791 17405987|21958 chrX 17405807 17406595 scaffold_5 1538871 1539765 + 9792|0 207
AACGG-AATCGGCCCGGAAA---------CAGAAACAGAAACAGCGACTGATTGATGAAAGGCCGACTGCATACTTACCCCCCTGAATAGCCG------GTGTCGTCCATTGT--CCCTTTTAATGTTAATCGCATGTATATTATTTTTTTTTATA-----CATTATGAA----TACAAAAATCGTGAAAAGTGAAATAAAAAACGAA
ATCAGTAGTCGGCTCAGCCGGTCGCTCTCCGTGGAC---GAGAGCGACTGATAATTGGAACAAGGATTAAAAGC---AGCACCCGAGCAGATGCATGTTGAACTGCCTATTATGATTATGTTATTATTAA--ACTTGTATGTTACCTGTTTTAAGAAAAACAATTATGAAGTGTTAAATTAACAAAACAAAGTAAAAACAAAAACAAA
>CG8408 17457151 17457631|21999 chrX 17456783 17458356 scaffold_5 1611117 1612918 + 32301|407 1101
-CTGG---CCGGAGGATGTGTCCAAAATATATTTATATATATGTATGCTATTCCCCAAACCGAAACCAAAACAAACCGAAAAATCA---------------------------------TTAATTGTAATT----------TATACACTAC--------------GCCAGAAACAACACACACACACATACCGATTTTTTTTTGTTTGTAAATTTTTTTTCGGAATGCC------------------ACTTTGGGTCTCGATCCACTATGTTTAAGACAACTACAAAATA--------------------------------------------------------------------------------TCTGTGTTTATCCTAT-----------TATTAA-AATTATTAATGTTTTCT-----GAACTTGTT--------------------------CTTACCAAAC--AACTTTTGCATCATATATTTCCATCAATCGTTTTTAAGTTAGTGAA---TTTTTGTTTAGTGCTATTGCAGTATTTACTAGAAAAGTTCTCCTCTAAGTAAAACGAGTTAGCAGAAATCCATTGAATATTACGCAGCGTATGTAAGTTAAAAGATGATTAAAGTATGTATGTGTCTGCAAGTAA--------ACGTTAAAACAAATACAAATTACAAATTAT
TCTGGAAACTGGAGAACGGATTCGAACCTTCTCGAGAGCTGAGAATAGAATTACAGTACCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACAAAAGCAGAAGAAAAAACATACCCTCTTATGTTGTTGATTTGGGTTGTTTAACGCGTACATACAACCACATGCAAATATTGATAAAACCTGCATATATCTATATACATATATTTTATTATTATTA---CTTTTTTAGGTTTGCCTTTAGTTCTTACAAATGTACCATGTATATCGAACTGCTATTTCCAAAAAAAGAAAAAAAAAACAAAAAAAACACATCATGAGAAACATAATAAATACGCGTATATATATATATTTCTTGTGGAACAACAAACTTGATAAACTCCGAGTATCTACTATATAGGTTTAGGCATTAATAACTATTAATTTTTTTTTTGTATAGTTTTTTTTTTTTTTTGTTTTTTTTTTTTGTAATTTAACATACGAAACTTTTGCAAAATATATTTCCGTAACTTGTTTTAAGTTTAGTGAAACTTTTTTGTTTAATGCTATTGCAGTATTTACGAGAAATATTAT-CGATAAGTAAACC-AATTAGCAAAAAACTAATTAATTCTATATA-CATATATATATATATATATATGTA---TATATATATGTTTGCGAGCAAATACATACATATTGAAAAAACTAC------CAACTCGT
>CG8316 17463722 17463998|22005 chrX 17463590 17464273 scaffold_1 6125671 6126388 - -385|132 477
ATTGTTAACGTATTTTG--------GTCAAAAATTAA-----------------------------TGTATGTTCTTTATAAGAACG-----GACAATTAATTAATATCCAGATACTTATTCATTCAT------------TGCCATTTGCAATCAAAAAAAATTTCACTTCAGCTAAATTATTTGTAGCTTTATAATG--------AAATTAATTTGCGTACATAATATGCATATGTACATT---TAAATCATACGTATTCAGTTCG----AAAGTGCCGTTTCAGACTTATTCTTCATTTTGTCGTTGCTTATAAACTAATAAAACAATAAATTAAGACAAATTC
AGTTTTATCATGGTTTAAAAATTGTGTAAAAAATCAAACAATAAAACACACATATTACTGAGGCACTTTTTGGTGTTTATAACAATGAAGAAGAAAATCAAATAAAAT--GAATATTTCTTTAATATTGCTATTAAAATTTGCTATTTACAATTAAAAATAATTACAACAAACCAAAATAATGCGTATCTTAATTATATTATATGTAGGTATATTTGTGTATTTTAGAAATTTTGGCACGCGGAATAAGTAATGTGTGTTTGCATCGTGTAAAAAAATAGGTT----ATTGTATTTTATTTTTTATTTTCATTTAATCTATTTCATTAATTTGTTTAG--------
>CG8289 17467628 17468268|22011 chrX 17468247 17468927 scaffold_19 1043009 1043596 + 8620|0 21
GGAAGGGCAACAAGGAAGGAAA
AAAGTGCCCACCACGGACGACA
>RhoGAPp190 17473080 17475554|22014 chrX 17472976 17473133 scaffold_25 86650 86746 - 1555|107 160
ACAAAAGTAATAAATTTGTGGGCATTTTCCAAATATTTGTGAAGCATTTGAAAA
GCAAAA--AATAAATTTGTGGGCATTTTCCAAATATTTGTGAAGCATTTCAAA-
>RhoGAPp190 17473080 17475554|22015 chrX 17473336 17473787 scaffold_25 86865 87344 - 12121|0 514
CGGACCTCAAACTCAAAGCAAGAAAATAACGCGAGATCTGTTGCCAAACAAAAGAAAACAA----AACAAAATAAAAACAGAAGAAATAAGCA---------CTCCAAATGAAATTTAC-----------------AACAAATAACGAGAGAAAAAGAAAAGAACAGAAA--AACTTAACCATTATATAGTATAATTTGTATAGATGTGTGTCTATTGCATTATTTGTACACG---------------TACATATATACGCTAAACTGA-AACAAAAACATA-AAACATTGA-------------AAAAAAAAACAAGCAAATATGTCTAAACGAAACGAAACAAAGCAAAAAAAAAAGCAAAACAAATCGAACAAAAAAAATTGTAATTGACGTGATGTGTAATGATATTTTTAAAAGCAAATTTTATGCCACGCCCATGCCACGCAGCCACGCCCCCTTTTCAAACCGAAAAGAAGTCTCCTCCCTCTCCCCATCAAA-AACCAAACCCTTCC
CGGACCTCAAACTTAAAGAAAAAAAA--ACGC-------------AAACAAAAGAAAATGACATCAAAAAAACAAAAAAAAAAAAAAAAAGCGAAAACTCATTTTAAAGCAAAATGCGCGAACACAGAGAGAAGAGAATGAAAAACAAAAACAAAAAAAAAAAACAAAAACAAAAATAACCAATATATAGTATAATTTGTATAGATGTGTGTCTATTGCATTATTTGTACACGAATGTGCATGCATATTGTATATATACGCAGTATTAACGGTATATATGTGTATGCATTTATTTATATACGCCTAAAGAGAAACAAAAA-------CCGAAAGAAAAGAAAAAAAACAAAAACAAAAAAAATGCAAATGTCTCAACAAAAATGTAATTTGACGTGATGTGTA---ATATTTTTAAAAGCAAATTTTATGCGCCCCAAAAAAAAGAAAAAAAAAACC----------CCGAAAAAAAAACCATGCCCTCCCCCTCTCCACTAACCAAGCGCTCCC
>RhoGAPp190 17473080 17475554|22016 chrX 17473788 17473801 scaffold_25 90645 90658 - 180|0 13
TCTTGTGTCTGAAA
TTGTGTATCTTGTG
>RhoGAPp190 17473080 17475554|22017 chrX 17473822 17474111 scaffold_25 90664 90902 - 5573|0 295
AAAAAACCAAAAC-----CAAATTCTGTGTGTGTGTGTGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTACCGTATCGAATTAGTGAAAAACAACAACAAATTATAC-AATTTCTAACCATGTACGCATATATTTTAACTAAAACCAGCGAGCAGCAGATTTTCCACAAACGCAATTTCCACAGGCAGAAGGAACGACTAAAAAATGCAAAATGCAAATCGTAAACAATTGTAGACAACATACGCCTAAGTGTTATTCCTTGTAATTGAGTATTAATTTTTTATATACAAACCGAAACCTAATTA
AAAAATCCATTACATATACAACTGCTATATATACATAAATATATATATATATGCATATATGC----------------------------ACTTATATTCATATATGTGTATGTATATATGTATTTTAACTAAACAAAAAAAAAAATA----------AAACAAAATATCCAAAAAAAAAAAAAA------AAAAACAGAAAA---GAAACGAAACAAAACGTAGACAACATAAGCGTAAGTGTTATTTCTTGTAATTGAGCATTAATTTTTTATA----------AACCTAATTA
>RhoGAPp190 17473080 17475554|22018 chrX 17474125 17474288 scaffold_3 2993560 2993733 - 30|0 187
CAAAAACTACAAATAA--AGTTAATAATAAAAAC--------------TAAAAACAAAAAACAAATATACAAAGCG-------AGCGAAGTGAAATAAAACTCAACTTTCCCCCACACTCGAAACTCCGATGATTGTCTAATTGATAT-TTGCATTAGCCAGGCATATAATCCTTAATGTAATACTCT
CAAATACTACGAAATACTACCCAATAGAGACAACATTTGTGATTCCATTAGAAAGCGAAAAGAGAAATGTAGGGCAGACCAACAGCCAAGTGTGGTATTCATAAAGATTGCACCATA--------------GATTGGCGAGCGAAAATATAACACAATCCAGATACGTAACTTTCGGCCTCATTCTGT
>RhoGAPp190 17473080 17475554|22019 chrX 17474421 17474853 scaffold_3 2993895 2994257 - -532|0 466
AAAAACTAAAACAAAACAAAA------------AAAGAAAAATAAGAGA----------------AAAAGAAAACCAAGCGATATATATGTGAAAGCATGGGGAGATATCTAGTAGGATGTCAGCAGGAAGATGGTTAAATAAAATTTACTGTGTATCTGTGTATGTTATAAATGTAATTGTAATTGTGTGTTTAAAATAATGCGCGATCAGCCAACAAATTTTCACATATGTAAACACAATAGCGATAATGCTAGATATATGATATATATATATATATTTAAATACCACTAAATGTCTGTGTGTCTAGTATAGGAGAAAGTAGGAGAGGTGGAGCCGTAGGAGCAGGGGGAGGGGGAGAGAAAGGATGAGCGAAGCGAAGTAAGGAATACAC------TATAAACAAAATGCAAAAAAAAAGCAACCAATAAGAACAACAGAGCAAAATCTAATTTTCGAGCTAAA
AAAAAACAAAACAAAACAAACTTATATATTGTTAAAGAAATGTACACGTTGTTTTCAAAATACTTAAATGTAAACAAAACAATTGAAAT---AATCCATGTAAAG-----TAGAAAAATATAAA-AAAAAGAAAGTAAAAATAAATTCACTATGCAT------ATATTCAAAATGCATTTCTGAATGCAGGCG-----------GCGCTGCGGCCGCCTACTATTATACCTATAACAACTATATTGA----------------------ATGCATGTACGTAACT-CAACTCAATTTCTACGTTTTT----------------TCAAACACAAACACACACGAGCATGCTGAA--------AAACGA-----GAAATGTAGAAATCCATATACCAAAGTTATAAAGAAAATGTAAAA-----GTAAATGATAAAAAAAAAATA---------------------CAA
>RhoGAPp190 17473080 17475554|22020 chrX 17475071 17475273 scaffold_25 91688 91977 - 5102|0 296
CAGGCATATACATATTTATAATAGTATATAATATACTTGGGTCTAT---TGTGTGCA---GTGTGTGATTAGTGATTCCTGATTGTGTGTGCGAGCGAGACAACAGAACTTGGCTAAGTAGGGTATATTTATTTTTTATATAT-----------ACAATATATAT-----------------------------------------------------------------------------TTTGTATCGATGGCTTTGTTGTGTTTCCGTGATATATGTAAACGCGTCAAGTATT
CATATATATATATATATATATTA-TATATATTATATATGTGTATATGTATATTTGAATGTGTGTGTCTGTAATG-----TATTTGGTATTGCGAAAAGTATAAACCAA-TTAGTTAAGTAGGGTATATTTATTTTTTATATATGTATATGTATAACAATATATATGTATATATGTATATGTGTGTGTGTATGTGTATGTGTATGTATGCATATACATGTACATATATATATGCATATTCTATTTTGTATTAATGGCTTTGTTGTGTTTCCGTGATATATGTAAACGCATAGGGTTTT
>RhoGAPp190 17473080 17475554|22021 chrX 17475552 17475780 scaffold_25 92215 92443 - 14676|0 2
GCC
TCC
>CG12990 17503145 17503424|22054 chrX 17501862 17503321 scaffold_25 1322245 1323723 - 54303|1412 1604
TTGATCAATTCGCCGGCAATTGGTGT--ACTTTAAAGGAATATTTCGTTTATTTATCGAATACATTGAAATGCATACACGAGTTGGTTTCCTCAAATTTT--------------TTGTTTGTTTTTTGTATTTTTTTTTAATCTTTATATTACTTTGTATTTGTTTAAATAAATAAGATACATACGTTTAATC
TCGATCAATACAACAACAATTTGTGTGTACTTTAGAGGAATAATTCGTTTATTTATCGAATACATTGAAATGCATACACGAGTTG---TTCTCAATTTTTGTGTTTTTTTTTTGTTGTTTGTTTTTTTTTTTGTTTTTTTAAATTTATATTACTTTGTATTTGTTTAAATAAATAAGATACATACGTTTAATC
>CG12990 17503145 17503424|22055 chrX 17503322 17503783 scaffold_36 644530 645024 + 551|0 128
ATCATCCCCGAAAC------------CGACGAATATTTTGTTTGAAAA-----TAGCAA-----TCGAGAAACCTTCG-CAATAAATTGCACTT---CGATAGCCAAAATCGATAGGCGATAGCGGTAA
GTTGCCCGTTAAATTCTTAAAGTTTATTATAACTAATTTGTTCGAAAATTCGTTAACAATATATTTCAAAAACAAACGAAAATACGTTAAGCTTTACCGTTAACCTTACTGAATTTGCGTTTACGACAA
>CG32556 17506387 17507091|22061 chrX 17506389 17506634 scaffold_36 647837 648235 + 981|0 400
CCCACTGTCCTGCCACGCCTCTTCC---------AATCGTAATTTGATAATACTATA-----ATGCCTACGTCTAAT-TACATAATCTATTTGATCATTTTTGTTTTTTTTTTTTTTACTA--CTAATATTAACGTTT--GTTGTATAGATACCGTTAAATG---------------------------------------------------------------------------------------------AATAAACTAACTAAAATAACTAATA-TTAATT-----CGATATTATT-GTACAATTTCGATTAATAAACAAATTGCAATTAAAATT------------------------------------TAAATAAAGTGCCAAAATAAAGAA
CCCTCAGCCCGGCCTCCCTGCTGCTGGCCAACATATTCCCAGATTTATATCAATATATATATATGCATATATTTAAAATACAATTTTTTTTTTAGTATTTTTTTTTTACTAATTGTAACCAATTTAATTGTAACGTTTTTGTTGTATAGTTAACGTTAAATTTTTGTGACGCGCCACTAACTAATTAATGCATTAATTAATTTACCCTACTTACTACTTAACGTACTTAATTAATTCATAATGGGCAACAAAATTAGGCAGCAAACAAAAATGA--AATACTTAATTATTTACAATATACTTAATAATAATTTGCTTAATAAACCAATTCCAATTACAACTATAATAATATTAAAAATAATAATAAAAAGACAACAAAAAATAAAGTGCCAAAATAAATAA
>CG32556 17506387 17507091|22062 chrX 17506760 17506838 scaffold_36 648236 648315 + 2402|0 79
CTATTTGCTAACAA-ATGCTCGGCCGTGGGCTTTAGTTTCATTTGACAAGCAGCAAATATAAATATAAGGCCAATCAACC
CCAGTTGGCAACACTGCGCCCGCATGCGGCTTTCAATTTCATTTGACAAGCGGCAAATAAATATGAAAAGCCCCCTCCCC
>CG32556 17506387 17507091|22063 chrX 17507064 17508880 scaffold_36 649593 651245 + 54616|0 27
CCCGTCATCCCTTCGAATCGATCTTCCC
------ATGCCTTTGTCTCTGCCTTTCC
>CG8173 17541338 17541571|22108 chrX 17539865 17541424 scaffold_36 697480 699003 + -4004|1642 1733
ACGCGAATGCACACTTAAGCA--AATTGTACATATTCAGCAAGCAAAAGAGTGGTCGAATAAATCGAATCCCCAAATGGAACAAA---AACT
ACCTAAATGTATAATTCCTCATGCGCTGTAAAAAGAATGCAACTGCAACATTTTTTGAAGAAGG-------CCAAAAGAAAAGAACTTAATT
>CG8173 17541338 17541571|22109 chrX 17541537 17543440 scaffold_36 699147 701178 + 40607|0 37
ACTGATAATCA---TTCTCAGCCTCCGAACTCCACAAT
GCCAGCGACTAAGCCTCTCTGGCTGCCAATTAAACCAT
>CG8142 17677280 17677356|22305 chrX 17677328 17678693 scaffold_3 1665288 1666659 + 58169|0 31
TCTC---ATCCCACTCAGCACATTCATTACAT
AGTCCGAACTCCACTCACATGATCTTTTCCAT
>CG15814 17682046 17682577|22309 chrX 17682018 17682397 scaffold_46 767380 767839 - 1687|45 474
CCACGACTCCATTACATGAACCTGAACCATGATGACGATGACGGATGAAA-------------GATCTGTAGACGAATGCCATTGCCAT----CCAATCTGTTTGCGG-----GTTTCCAGTTCTGTGTGT-GGTTTGCTTTTGG-----------------GCACCCAAATTTTCCTTTTCCATTGGAGTCTTTAATCGAAACGTAAATGCAATTTTGGATATATGTAT--CTATATCTATATAT-------------TATACGTA-----------GCTATGTATTTATGTACATATGTGTGCCTGTGTGTATGCCTCCTAGGTATTATTACCAATTTTATTTTCTTGATTTTACTTAATTGCACTCGAGCTGG---TTAGGAATATACATATACCAAAAAAAAT---------CTATTGATAAAATA
ACACGGCAGCATTCC-----CAGGAGACATGATGTCACCAATGGTTTCCACTACGCTTGGTCCGAATAGCAAACAACCTTTATTGGCATTCGCCCCATCAATTTGTTGCACTTGTTTCTGTTTTCATAAATCGAACTGCCGAGAGTTGAAGCAGAAATCGCTGCATCTATATTTCCATTATTCATTTTAAGATTGTAAAACGACAAACCTGGTATTTTAGATATATATATGGCTATATATATATGTGTATGTTTACATATATATGTATATGTTTGTACATTATGTATCTATGTACATATATAT-----TGTGTGTGGTGTGTGTATGTTTGTATTATGTCTATGT-----ATTATGTGTTTTTGCACTGGATATTGAATTTAAAGATCTTTATATAACAAGGAGAAGACATGTAAATCATTGAGAGAATT
>CG15814 17682046 17682577|22310 chrX 17682488 17682994 scaffold_46 767910 768423 - 25880|0 100
ATCCTGATACCGGCACTAGCTTTCCTCGGCGTCTAGTCAAGCACAC-----------ACACTTCGGATTAAGTCCTGCACATGAAACCACACGGAAAACAC
A-CCAGGGACCAAATTCACAGTCCAATTGCGTCTAGTCAAGCACATTTTATGCCCTAACACT---------GTGCTTCACACTAACCAAC----AAAACAC
>CG32557 17686896 17686965|22313 chrX 17685822 17686921 scaffold_46 772864 773947 - 13435|1146 1171
GCAATAAAAGCGTTAACTTTTAGCTG
GCAATGGAAATGTGCTCCGTCAGCTT
>CG32557 17686896 17686965|22314 chrX 17686965 17688673 scaffold_46 774281 776085 - 92941|0 0
T
T
>CG7846 17692306 17692706|22321 chrX 17692245 17692540 scaffold_7 5346480 5346767 + -922|61 300
TACAAATTTATACAAGATTGTACAATTATTTTATTTTTAAAGACACCTAACAAATATGCAGAATGCAAAAAGGAATCTAAGCCTGTTTTTGCATACTACTTTGTATCAGTGGCAGATTAGGT--AAACAAATTTAGAGTC---CGGCGATAAGCGCAGTATATTTACGCAAATTTAACGATTGCCAAATAAAAAACTTTATTAAAAAAAACAAAAGAAATTTACGAAAACAAAGAATAAA
TACATAATTAAAAAATTATGTACAATAAA---AATTCTAGGAAAACTTGTAGATTATTTAT----CGACTATAATTACACACAGGTTTACCAATACTAATTGCTAACATTTTTAGTTTGATTTGCAGCCAATTGGAATTCAAACGGCAAGAAAACAACAATAGCTGCCAAGATACAATTTCCGCAAAGCA------TTTTTTTAAGTAAACGATAAACAACGGCAACAACAAAAACAAAA
>mnb 17696622 17697556|22323 chrX 17696587 17697330 scaffold_46 783306 783942 - 5359|35 766
CGATGTACATATACTACTAATTTTGACGAATAATTGTTAATATTTTCATCTGCGCTTTTGTAAGAT-CTTAAGTGAAGAAAATTTCTGTTCTATGTAGACAATTTTAAATGAAAATTCTTTTAATTAGCGATTGTGACAACGTGACTTCAATTGGATAAATAGCGAAGATCATTTTGTTTTGTTTGAGTGGTAATAGTC-ACACTTTCAGCTTTTCCTGAAAAGAAGCTGAGATTCTTGGTTCATTGTAAGACAAGACGCCCGATGAAGATCACTGCAACACAGACACATGTCCAAAATAAAAATACATTAACATTAACTAGCTGAAATTGACCCTCAGGTCCCACGAAACACACGAAAACTCACTCACCTGCGGTTCTTAC---TGATTAGTCACTTCGAGCTCTCACC--------GCCGCGCCCACAGCACCGGCCACGCCCCCAGTCGCCCGGGATCGGGGAGGGGATGCCGTGTGGGCGCCTTGATGGATTCGGCAGAGTTTATTTTTTTACACGCTAGAACC-TATTTTTTTTTTTGGTCTAATTATAAT-GTTTAACTTTATGCAGTAACCGTAACGACATACTTTTACTTTATATAAACGAATCAAAATTAAACTTTATTTAATTGTTAATTTAAATTATGTAATTTTATTCGACGAGAAATCGC---TAGTAAT-----ATAGAAAGCAAACAAATATGCTTAATTTAAGCAAAACTCAAAAA
CCGTCTATATAAACTA-TAATTT-----AACAATTTTTA----TTTTATTTGCTTTTTTTTTACACACACACACACACACAA----------ACGTACGCACGCATGCACACAAACACGTCTGAGCCGCTGTTGCGC-----------------------------------TCCTCTCTTTTTTGTGTGCTGCTCTTCCGTTCTCTTAGCTCGCC---------AGCAGACACTGCTA-TTTATTGCACATCCATCCACCCACACACGCACAC----ACACACACACACACACAACATTCA-------------TAGCTAGCTGAAATTTAC----------------ACACACACACATACACACACCTACACATACCGCATCGGTTTATTTAAATCACGCTCTCACCATGCAGCCGTCTCGCTCACA----CACACACACACACACAAGCACAAGCACACGCATCGCTCATCGCGT-------TTTACAG-TTAGCAAGAGTGT----TCTTATGAATTAGAACAGTTTTTTTTTTTTTTACCTAGTTTTAATTGCATAACTTTAAT--GTAACCATAACGAAATAATTTTACTT-ATACA---GAATCAAAAGTAAATTTTATTTAATTTTTAATTTAAATTATGTAATTTTATTCAAAGAGCAATTGTGCGCAGTAATTTTTCATGAATGAAATCCAATTTTGCTTGATTTAAAAGCAACAAAAAAA
>mnb 17696622 17697556|22324 chrX 17697548 17698175 scaffold_46 783943 784432 - 11375|0 8
CATAAACTG
CGTTACCTG
>mnb 17701505 17702283|22329 chrX 17701415 17701862 scaffold_46 788004 788543 - 3325|91 569
CACACCATCTGTCTATCTCTTTCCACGCCTCTGTATCTCTCTCTTTCTCGAACGCCACTTAAAACA-----------AAAAAAAAAACAAGAAATGCATTTGTTTGTTTTCCTATCAGAAGTAATGT-----------------GGCGCCTTCACAACTGATTCCAATAAACCGAGAAT-----------TTTTTTTTTAGAACTTAATATGTAA------------TTTGTATCGTGCT-CACGCATTTTAAGCGCTCGGATGAAAAACAATCGTGTGTTAAGTGTTTAACGTTTTTTTGTCAACTTAATACCGCAAAAATGTCTAAAGAGTAATTACCTAAGTCTAAGCTATTAGTGTCATAGAACCGTA---------------------------------------------------------------CGAAGAG----TTTGCGAATACATAAGAATAATAATAAG--AGG
CGCGTTAAATGTTCTTTTCTTTTT-TGTTTTTGTTTTTTTTTTTTTTATATACATAATTATATGTATGTGATTATATATATAGAAAACAATATATATATATATATATTTTTTTTTCGCACCTAGTATACATAAAATATAAACAAGTAAAATTTAGACACGATCCAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAAGCAGATTAATAATAATAATCGAATATATATATATATATATTTTTTGTAACTTGTTTCGTTCAGTTTTAGTTTT----------------GTTTGTTTAATATTT----TTTTTTTTTTTAATTAATGACGC---------TAACAGCTAAGCATTTACTTGTAAGCAATTAGGGCCATAGTATTGTAAATTAAGGCAACGTAAGAATAAAAGGAGAAAAATACAAACAAAAAAAAAAGTTAATATTTAAATGAAGAGAAAACTGTTAAAAATATAAGCAACACATTAAACAAGG
>mnb 17701505 17702283|22330 chrX 17701890 17702162 scaffold_46 788589 789026 - 1087|0 439
ACTCGAATATACAAATATGTGTCAAATAAAACCCATGCA------AATTCAAATGATGCCA---------------------GCAGACGATCGCCGATGACCGGCA---------------------------------ACAACGGCAGCCACATCTGCAGCAGCAACATCGACTGCGGCGGCAAATACGA-GGATGCCACAACAGTAAACAGCGACATGCAGCA--------------------------------TGCGGCAT----------------------GCAGCAACCGT-----GCAACCGT----GCAACG----------------AGCAACTTTAGGAGCAGCT-----GCAACAT--------GGTCATGTTATCCATTATATCTA--------------ATAGCTACTGCGTTTTGTAAATACTCA
ACTTAATACTAAAAAAATAAAAAAAAAAAAACACATGCATACAACAACAAAAATACTTACACAACAACAACAAACACGCTGCACAGACGAGCGTCGATGACCAGCAGCGGCGACTGCAGCAGCGACAGCAGCAACAACAACAACAGCAACAACAACAGCAGCAACAACAGCAACAGTAGCAGCAGCAGCAACAGCAGCAGCAACAGTAA-CAGCAACA-GCAGCAGCAACAGTAACAGCAACAAAAACAACGGCAAATTAGGCATCTAAGTTCTCAGGATAACATTAACAGCGACTGCAAAGCGCAACAGCAGCAGCAACAGCAGTGGGAACAGCTAAGCAACATTAACAGCAGCTAAACAGCAGCATTAACAGTTGAGCATGTTTTAAAGCGTTTCCACTGCGCACGTTAAGATTCTCGCCGTCTATTGTAAATAGCCA
>mnb 17701505 17702283|22331 chrX 17702183 17702492 scaffold_46 789047 789358 - 771|0 100
TTTGTTGTACGATACTCAAGTTTGTGATGAGTAGCAAGCAAGAATGCAAGCAATGATGATTGGTGGTCCCTCATATAAAGATAAATTCCTTTCTTTTTCTA
TTCTACTTACAAGGCAGAAGCAGGCGGAAGCCGACAA---AGAAAACCAAC-----TAATTTATGCCCCCAAACATA---------TGCTCTCTTTTTCTA
>CG7772 17739960 17740111|22388 chrX 17738695 17740302 scaffold_25 701217 702895 + 64725|1339 1533
TGAAC----------GCTAGCTGGGAT----GTGCACAGCATTGGCCCAACTCCAAGTCTACTCCCATTCTACTCCACGGT---------GATAGTTCTTAGATACTAAGAGTTTACAT--------------GAACTGTAGCAAAGCTTTAGCCCCAAATCCAGTTTGCATA------TTGACCAGAATTTCTA
TAAGCCGCCGCCGCCGCCGCCGATGATCCTGGTCCTCAGCATGCGGAACATTCCAAAACGGTTCACTTGCTTCTTTTTTTTTTTTTTTTAAAAAATTCCTAACCCGTGAAGATTTGTATTTGATTAATTTTTTGTGTTTTTGGACAACTTGCGAGTGACAACTGGAT-ACATAAAAAGCTTTCCAAGCATTCCCC
>Sh 17762978 17763640|22411 chrX 17762048 17763647 scaffold_37 239597 241466 - 34058|1157 1986
TCAAACAAATGGAAAATGGACGAAATTTGCGCAGTGAAATGCTACGTTGGATGCCAGAAACGTCATCAAAAGCAGTCTAATTTAGAATTTTAT---TAATAAATACA-ATTAAAAT----------ATAATTATAATAAT-----TAGTAAGCAACGTAGTTGTAAATTAAACAGCAAATGT------------------ACACAGACACA-----------ACACACACACAGACACAGTGCCAGTTCACTC-------AGCTTGAATTAGAGTATT----TGTAGACACCAAA----------AAGAGTCAAATATGGACTGGCCTTCTATAGGGATTTCCTTGTTTCTCCTTTCATTTTCCTTCTGGTAATCTACACACCGAAAACACTTACACACACACGTCCACACACACTCA-------------AAGTA-------------------AAAACTCTACTTGATACCTATGTTCAAATTTAGCAATTAACAACTAACAATCGTTAACAACAACAAAACAAAACATATAAAACCAAAAAACGAGAGAAAAAAAAAAACAAACAAAACCAAAATCTAATTATCTTAGTAGACTAATCTAATTGGAGTTTCTTCCTTTCTTTAGAAGCTAGC-AAAACAAAAACAAAGAAC--------------------------------------------------AACAACAACCAGACAAAA--------------ACAAACATACAATATCTGCTAATTTTATTTTCATCTTTAAATTATGCTCTATTATTAAATATTAGTCAGAATATTAGTAAA-ACAAACTAAACC
TCAAACAGATGGAATACAGACGAAACTTGCGCAGTGAAATGTTACGTTGGATGCCAGAAACGTCATCAAAAGCAGTCTAATCTAGAATTTTATTAATAATAAATAAACATTAAAGTAATAATAATAATAATTATAATAATAATTATAGTAAGCAGCGTAGTTGTAAATTAAACAGCAAATGTAAAACAAACTACACACACACACAGACACACACACACAGACACACACACACAGACAGACAGACA---CACACACAAAGTAGCTTGA--TAAAGTAGCTAAATGTCGAAGCGATAGTTTTTTTTTAATACTCAAATACGG---------CGGCAACAATTTACAT------------AGCTGCTCAATGGAGACCATGACAC---ACACACACACACACACAACACAACACACACACACACAGAGAGAGAGAAGTAAACAAATTGAAGAAAAAACAAAACTCAACTTAATACCTATGTTCAAATTTAGCAATTAACAACTAACCATCGTTATAGTCAA-GAAACAACACG-ATGAAGAATGAGAATGAGAACAAAAACAA---AAACAAAAATGAG----AATTATCTTAGTAGTCGAATCTAATTGGAGTTTCTTCCTTTCTTTAGAAGCTAGCTACAACAAAAACGAAAAACAAAAAAAAAACAAAAAATAAAATAAAAAAAAAATTGAAACTAAAACCAAAAACAAAAAACAGACAAGAAAGCAACAATACATACAAACATACAATATCTGCTAATTTTATTTTCAACTTTAAATTATGCTCTATGAATAAATATTAGTCA-AATATTAGTAAACAAAAAAGAAGAT
>Sh 17764054 17764060|22413 chrX 17763982 17764780 scaffold_37 242345 243218 - 29487|83 89
CTACTAG
CTACTAG
>Sh 17773668 17773891|22431 chrX 17773318 17775637 scaffold_37 253762 256067 - 38363|361 587
TGCAAAAGACGTTGCGTGGTATAAATTTGGCCTTGACAGGAGTTACGTTGGATGCCAGAAACGACTACAAAAGCTGTTTATATTTAATTTAAGTAGAACAAATAACAAAAACAAATTTAATCTATTGCTAAATTAAATTAAA---ATCTAAATTAAAATCTAAATTAATTTAATTAAATTATACATTTAATGATAAACAACACTAAAACAAAAACAAAAAATTCAAA
TAAAATTGATGTTAAGTGGTATAAGATTGGCCTTGTCAAGTGTTACGTTGGATGCCAGAAACGACTACAAAAGCTGTTTAAGTTTAATTTAAGTAGAACAAATAAC--AAACAAATTTAAACTATTGGTAAATTTAATTAAATGTAATTAAACTAAAATACAAAACAAACTAAAAAAAACA----------AAAAAACAACAAACAAAAAGAAACAAGAAAATAATA
>Sh 17774657 17774663|22431 chrX 17773318 17775637 scaffold_37 253762 256067 - 38363|1507 1513
CTACTGG
CTACTGG
>Sh 17784349 17784541|22438 chrX 17784211 17784953 scaffold_37 266212 267047 - 18074|171 420
GATTTCTGTTTGCCCAATGCC---------AACTACAC---CAAAAATATCAATATTAAT-CACCCACACACGACCACACACACACACATGCATA----TACAGTTGAACCGAT------------TAAAGTAATAAATGTTGCCATCATCATTTATGAGTTGCCTGACATGATAAAGAAGGGGTTGCCTGCCCGCCCCGAAAC----------------------------CAAAAAAAAAAAAAGAAA
GATTTTTGTTTGGCCAAAACTGTAATGCTAAATTATACACTCACACATACGCACGCACATACACACACACACGCACACACATACACACACACACACTCCTACTGCTACAAACATGTACATTGTATATGAACAAATAAATATTTGTATTATTACTAATTTGTT--------TGATAAACAACAAAATTACCAAAAATTCTAAAACTCGTCGCGTTGTTATGTTTTTGTTTATATGAGTAACAAGAAAAAAC
>CG32552 17894393 17894485|22596 chrX 17894022 17894449 scaffold_37 428367 428813 - 1763|424 495
CGCCAAATGAGCTGGAAATGTCCAAGTGGCCGGCGGCGATGGTGG---------------ATGGGCCATCAA
CGTTCAATGAGCTGGAAATGTTCAAGCGGCCCGCAGCAGGAGTTGAAGTAGGAGAATCCAAGGGGAATTCGC
>CG32552 17894393 17894485|22597 chrX 17894467 17894672 scaffold_37 428950 429142 - 3481|0 18
GCGGAAGGAGCGACACGAA
TACAAAGAGCCGTCGCAAA
>CG32552 17896764 17897045|22601 chrX 17896927 17898296 scaffold_37 433573 435040 - 3232|0 129
GCCGCCCTTTTAAGCCGTGTTAGTAG-----------ACCGCGGTCGTCGTGGCGAACGAAAACCGTCGCCAATCGAATAAAATTGCAAAATTCAAGCAATGCGAAATTACCGCTAAAATCGTCGCAGCC
GCCGTGCGCTCGCCCTGTGTTAGTAGCCGTTGTTAGCGCCGCCGTCGTCGTCG----------CCGTCGCCGCT--------ATCACAGCAGCCAACGCAAGCGCCGCCGCCACCGCCATCGCCATCGCC
>CG7536 17912934 17913590|22605 chrX 17905471 17915353 scaffold_37 443666 453731 - 448307|7661 8488
GCAACG----ATGGCCGCCCACCGAA----------TTGTGCTTCCTAATCAACGGTTTTGCGGAACGTCTTATACGAAAGTTTATCCGT----AATTCAATTTACGTACTTTTTTTTCGTCATTTTTTT-----------------------------------------TTTTGCGTTGTTTAGCTAATTTGTATATTTAGTGACTAAGTACTTAAAA----TTGAGGAGAGACAATGTCCAG-------CAATAATTAGTGCATAAG----ATTTCTAACTAATTTAGCATTCCACGTATGCGGTTAACTAACGAAAAAGAC----------CAAACCTATACCT--------------------------------ATTACCTATACATTTACCCATAACCCG-------TAATCCGTAACCC-------------GTAACCTT------------TAGTTCCTAAGCCACATTTCCACGTTTCCAAATCCAATTCGTAATCCATACCTTCCACAGAAATTGGAGTAGAGAACGGCAGTATTAGTACTTAGAAAAGGCGAACAAAATAACTAGAAATGAGAAAAAAAAAAATGAAACTGCAGCCACCACATTCCTTTATCAAT---------------CCAATCAGTGTATGTTTATCG--------TTAGTCCATTAGTTAGATCTGCCTTATCTGTTATCTGTCTGTCCACCTGTTGATTGATATACGACATAGACTGTGACCAAATCGAAACTTAAACTAAATTAAACCGAAACATAAAACAAATAAAGTTTAAAGAACTTAAACTAGAGCTGATCCCGAA
GATGAGTCCCATGCCCACCTTCTAAAAAAAATTTTTTTGTGGTCCCCTCATACCCCATCCACACAACTTCCTA-GCAAACGTTTATTTTCTAAACATTTTTTTTTTTTGTTTTTTTTTTTTTGTTTGTTTCTGTGGCAACTCTACTAATATTTGTATAATTATTAATCGTATTTTGTTGTTTTTAGTTAATGTTTACAGCTAGTTACTAAGTACTTAAAAAAGCATGTTCGTATACGCCACCCAGATAACATAAATATTTAGAGCCTAAGTTGAACTAAACACTAAATTATCATTCCATGAACGCATCTAACAAAGGACCAAGGCACCTTGTAAACAAACCCGACCCTTAAACGAACCTTAAACCGACTCCAAAACAACAAATTCCCATCCATT--CCCATAGAGCGGCAGTATTACTTAGAAGCTCCTACTAAAAAAGAATAACCCTAGACAACAGAAGCAAAAACAAAAACACATTGGCAAATACCCAATAGCAA----TAACACATTCCTTT-----------------ATGACAACAATAACAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGATAAAAAAGAAAAACCTTAATTAAGATTTAGACAAT-TATTTTTGAAACAATATTGAACATGTAGCGTCAATAATTGTGTGTACAACTAAATGTACTTAGTAGTTTTTAGAGTTGTGCTTTAT-TATTATATATTTTT-----TATTTGTTCAAACAATTCGAGTAACATTTTTATATCAACACGCTTTTTTAAATGTTCCGAAAAGT----CGCCTAAAGTTCGTTAAAGATAAATT---------------
>CG7206 17922661 17922944|22616 chrX 17922809 17923561 scaffold_37 460804 461569 - 22611|0 160
CTCGATGCCGTCCGAGCTCCCACCTTA-CATTTAGTATACGAAAGACTGTGACTGCGTTTGTGATACG------------------GGATCGGGTGGCG-GGCGAAAGGGATCGACCAGTCAAGCAAGA-----TGCACCGCGGCATACATGAAGTACAAT
--CACTGCCCTCATAGCGTACGCTAAAGCATCCGGCGAGGCAAAGACTG---CTGCTTTTGTGATAGGCATTTGCATTTGTCGTTTGGATGCAACGACGCTGCGATAGA---CGAAAGATGAAGTAGGAACCACTGCACCGCTGACAACATAAAGTACAAT
>CG7192 17931771 17932328|22623 chrX 17931715 17932766 scaffold_26 1748497 1749565 - 18118|60 669
TATTCGCAAACT-------------TTCAACAGAAGCGTCGCAAATTGATGGTTGGGCAAATGTAAACA---GCATGGCAAAAGAACCGGAAATGAGTGGATTTTATATTTAGTTTAACGTAATCGCAAATAGATGCGCGTGTGGCAGCTGCCATGGTTAACCCAGTA-GTTATTCAGTTGGTATTAAGTTCT--GAGGACCCCGGCCCCTTAGAGTAAAATGTGTGTAAT-ATTCCTGTGCCTTCG--ATATGTATCTAATT-------TGGATGCTCGCCCGA---GCAATCAAACAC---CTCAGTTTCGTAGAACCCCTCATTGGAAAGCAACCGAATCAGAAT-------CCTACCTATTTACATCATAGATAT-------CATTCATATACATACATGCATCGATTAACCCCAAATCAAATTGTGATCA---AAGGAGCGAGCGCAATGTTTTGTCATTAATTTAAAGGCGCTACATCAGATGGCTCATTCGCATATGTATTTCGAAAGGCCGACGCATAAGATACATGTACATACATGTGTATACACCTATGTTAATGTTGAATAAAGTCCAGAATGCGGACTAAAGCTAATATAAACCTAGT
CATTGGCAAATGAAAATGAAATTGATTCAACTG------TTCAAATTGGC-ATACAACAAATGTACTTACGTGTATGTGAATGAATAACAAAATGAATGGCACTCACAATTTGTATATTCAGTTTCCATTTGCAT---------TCAGTTCCAAT--TCAATGCAATATGATAATAATTATATTATAATTTCTAAAAAGACCTCAGACCC--------ATATGTGTGTATCGATTCCTGTGCCTTTAATATATGTATCTAATTTCGTGTATGTATATTTATCATATATGCATTCAGTTGTTTATTCTGAGTCATGTAAGCATACATACATTAACA--TAAACCAGTATATATATATATATATGTATACATCACAAACACACACACACACATATATATATATATATATATATTAGACCCA----ACATTGTGATCGTGTAACGAATGTTTGTCAT-TATTATTATTATTTTTTAAATTGAATACCAGA--AATCAATAGATTATATAT-------------------ATATATATATATATGCATCTGTGTACACACAATACAATACCATGTACAACCC-----TCTGA-TAAAACAAATATTTATATA-T
>wupA 17939490 17939897|22633 chrX 17939475 17940764 scaffold_31 590595 592017 - 32144|15 506
GTGTCCACACGTCCAC-TAGTGTCCACTG----ACCCGTGACTCCCGCCCTAAACAATAATTGAAATTATTTACAACAATTATCT---------GAAGCAATATAATTT----------ATAT---GAATCTATTAATATA--TATATATATCCGCAAATATATATGCATGTATATATCTCGC-----------------CATATATATGTGTCCACAATGGATTTG---ATCAGAAATGAAGT--CAATAAA-------CAACAACAGCAACAACTAAATTAACTCAAAATCAAAATCAAACTCAGACTCAAACTCAAACTCAACTGCTTATAAATAATTCAGATCA--ACGATTCAAAACAACAGCCAAACATCTGAACGCCTTGATGAATTATTT---------------------ATTATATTTCATTATTTACAAATTATATTTTTTAATGTAAATTAAATTAAATTACAAAAAAAAAAAACG---A
GTGTC--CGCGTCCACGTAGTGTCCACTGTACCACCCGTGACTCCCGCCCTAAACAATAAT--AATTCAATATAAACAATTATTTCACCAGAAAAAAAAAACATAATATCTGATGCCAAATATCCAAAATCAAACAATATACGTGTATATATCTCACAATATATATCTCTATATATATATCGTCTATGCATATATATGTACATATATATATATATGCCATATATGTGTGCATACGAAATAAAGTACCGCTAAAGCTTGATCAGAAAC-TTAAAAAATAAATAAAGAAAAAAGAAAAAAAAAACACAT-------TTCAAACACCAGCTATCGAAAATAATTCCCATCATGATGGATTCAAACAACAGCCCAACATCTGAACGCTCTGATGAATTATTTCTTCTTCTTTTTTTTTTTTAAATTATATTTCATTA-TTACAAATTCTATTTTTTAATGTAAATTAAACTAAATTACAAAAAAAAAGAAAGAAAA
>ari-1 17966073 17966732|22673 chrX 17965976 17967129 scaffold_37 243939 245156 + 23903|100 926
CGCGAGTCATGGCTGGATAACTAA--------------GCTAAGCCGAGCG----------------GCAGGCAATCGGAAT--------GTAGTGCCCGCTAAGCGCCACCCCATC-----CAGCATCCGAAAT-GCAGCA--------AACACTGTCCCCATCCACATACCGACCAACATCCGCCAAGCCACGCAACACACACACACACACACACACACAC----------------------------------ACTCACGCACGCACGCACTCACGCAGAAATCGAAGCCGAAGGAGTTGAACAGAAGTTAAGGATAATGCA---------------------GAAGCTACACA-----GAAACGCAAGAGAAAGGAGACTCGAAA-------TTCCCAGAAACGCAGGATAAATCCCCATACAAGAG-------------TTGCAAAGCAAAATTGAAGCC--------------------ATTTCAGAACACA-------GAAGCCAGAAGGAAATCACCATAAAATC-------GTAATATATATAAATATATATATTGAATTATATATATTTT-TCTTCGTACTAAGCAAGAGCAGCAGCAGGACACGAAGAAGGACAGGATCAAATAGACACTACCAAACACATACTCACACACTCCCACACACACACACACACACACACAGAACCAGTCACAAGGCTCAGAAGCAGAATAGATATATAGTAAATAATCAACAGTTAAAAACTTATTTGATGTTAACCGATTGCAAAGAAATCTTCATGTTATAAAAACCTAATGAAAAACGAAACAAAATGCAAAAA
CGCGAGTCCTGGTTGGATAACTAAAGGTGATGCAAAATGTGTAACCGAGTGTAACTAGCAATTTGGCGTTAGCAGTAGCAGTATCAGCTAGCAGTAAGCATTAACAGCCGTAACAACAATAACAGCAACAGCAACAGCAGCAGCAACAGCAACATCAACAGCAACAGCAGCGCAAGCAACAACAACAAAAGCAAATAACTTAAGCAAAAACA-ACACATGTAATAGCAACAACAACAACAACAAGAACAAGAACAAGAACAACAACCACACACACACACACAGAGAGAGAGGCACAACCAAATGTATGGAGTTTGAGGCAAGAACAAGCTAAATATGAGAATTGATTAAAGCCGCGCACACACAAAATTCAAGCAATAACAAATACAAAAAAAACCCCCCCCCAAAAAACAAAACAACTACAAATATTAAAATAAAATAAACAATTAATAAAATAAAACACAGGCCGTAATGCAGTTGCGCAAGTTGTTGCATACCAGATAAATACGGATTAAGCGAAAAGTTATATTAAAATCATACGATATAAAATATATATATATATATATGCATATATACATTTTTTCTCTTCGTGTT------GAGCAGCAACTTAAC-TGATTCAAGCAAGGAT-----------------------------ACACCCACACACACACACACACACAGGCGCA----------------TTAGAAAAAGAAAAAATGCAAA--AATTCATCAACA--TCAATTTTCACTTGGCG-----------------GCTGTTCCAGTTA---------AATAATAAACAAAATGAAA-GCAAGCA
>os 18139281 18140030|22915 chrX 18139435 18139603 scaffold_5 2304537 2304711 - 1426|0 194
ATTCATGATCATAATTCCATATCCATATCCTTTAGGCTAAACTTTGATCCTAAGGCACACACACACACATTTTTTTTTTTTCGTAGGC-TAGCTTGTGTTTCGACATCTGTGATATAG---------------------TGCTTGACTAGTTCGTAT-TTAACCTAATTGTACATATAT---ATTATATATAGAT
GTTCGTAAGCTAAATTATATATATATATATATTTTTTTATATAGT-----TAGTGTACGCAC-----------TTTTTTTTCTTAGCTATAGATATTGTTT----AACTGTGATATAGTCGTGAGTGTTAATCGCAAAATGCTTTGCTAGTTTGTATCTTTTTTTGAATATGAGCATATGAAATTGTAAATAGAT
>os 18139281 18140030|22916 chrX 18139637 18139744 scaffold_5 2304753 2304881 - 2410|0 130
GCAGTTGCCGTTCTAGTCACATAAGAGCAACCGC-------CAACCACCACCCA--------CTGGAAAGTATTATTCGCCACGCCCGCT-TTGTAGCCCATTCCGCACCCGCATC-------GAGTACTA
GCAGTTGCCGTTCTAGTCACATATGAGCAACCGCAGCAAAGCAAGCACATTCCATATACATTCCAGATCCTAACATT--CCACACACATTACCAAACCCCATTTGACATCCAAACCAGATCGAAAGTATTA
>os 18139281 18140030|22917 chrX 18139821 18139883 scaffold_5 2304995 2305070 - 1033|0 75
GCACATAGTCTCTGTTCTCGAATTCATTGCAAGTATTACCA-------------CATTCCGTATTTATTGACATTC
GCTCTCGCTCTCTCTTTTTGTGTATGTTTTAAGTTTTATTAGCTTATACCCAAAAGTTATTTATTTATTGAAATTC
>os 18139281 18140030|22918 chrX 18139886 18141678 scaffold_5 2305145 2306981 - 34065|0 144
AATAGCATACACAACATTCCCATATCTTTCCATTTCCCCTTACCTCAGGACTCGCCCCTTTCCTCTGTTCTACAAACCCCTAGCCTCAAATCCTTAATTTAACCGTTAATTGATCGATAGTAGCTTAAGTAAATTATTTGATTGA
AA---ACTCCACAATAATATTATGTATATT----------------------------------------------------------AATCCTAAATGCAACCCTTAGCTCGCC-----TAGTTTAAGTAAATTATTTGATGGA
>CG6023 18148060 18148426|22922 chrX 18147994 18148304 scaffold_5 2314722 2315019 - 1145|67 336
TCGTCTACTAGACACCCTCATCTGCCTTAGACCCTATTATTTATTATAACTTATTAAATCCCCATTGCCCTCATACGTATTTATATCGCCTTTGCATCCTATTTATATACATACGCGTACCACCATACTCACTGAACACATTCACCGCATCGCAGGCTCGATAACTTATGAAAACTATTACTTAA-----------------------GTGTATTTTTTTTATATATATTTACAATA-TTACAATGACTATTAATAAATTAT-ACCGATA
TCGAATTCTAACCCAATTTTTGTGCCTTACATTACAATTATTATTATTATTTTTTAATCCTGCATGCCATCTATGTTTACTAATA--GCCTGTATTAGTTAAT---------------------------GCTGAACCCTCTCACCGC-TCACG---TTGATTATTTATTTAA--TATTATTTAATTTAAATATATATATATATATATATGTATACTTTTTATGCGCATATACGATATTTACGATAGTTATTTGTCAATTTTCATCAATT
>CG6023 18148060 18148426|22923 chrX 18148371 18149305 scaffold_5 2315087 2315999 - 2016|0 67
TCCGCTGGA--------CAGAGTTGGACGCTCCAGAGG----AGCAGTAAAAGCCATACCAAAAATAA
TGCCTAGAACTTTGTCGCAGACGCAGAAGCCCTAAAGAACGTACAAGCAAATGCCA----AAAAATAA
>CG6123 18158176 18159895|22930 chrX 18158272 18158553 scaffold_5 2337772 2338115 - 6626|0 353
TATATATTATCCATCTAT---CCAGAATTGTATCTCAATGTGCCCGACAAATGTGTTTTAGACTTCGATTTCCATGTGCGTGTCTCAAGGA----------------GGTAACCCAAAGTTAACTTTCACTTTCAGTGTGTTATATAGTGCTTAAGAGCCGCAGATTTACTTAAATACTGATCTATATCTATACA-----AGCATATGCATATACA-ATACCTACACGTAACGACAAATATATACATAC---------CGTACATATATATA----------------------------------TATTTCAACTATTTACAAG----TGCGATCCTTCTTGGTCGCAGCTAA
TGCATATTA-CCATATATGTACTACATGTATATCTCAATGTGCCCAATTAACGTATAT-------CGATTTCCA-ATGTGTGTTTCAATAATACTCGAAATCTGTGCGGTAACCCAAAGTTAACTTTCACTTTCAATGCTAAATGTACATAAATATATTTGCAAATATA-TAAAATATTAGTCTAATTCAATATACATACAATATATACATATATACATATATACAAATATCTATATAGATATACATCTGTATGTATACGTATTTATATATATGTTTGTATATGTAATATGCATACATTTGAATGGTATTTCAACTATTTACAAGTCAATGCGACCGTTATTGGTCCCAATAAA
>CG6123 18158176 18159895|22931 chrX 18158571 18159205 scaffold_5 2338354 2338917 - 395|0 661
TGTAAACCACACAATAAATGTAATTTGTATGTACAATCTGAGCTTACTCGAGGCAAAAATCAGAAATCACA-ATTCGCAATTCGCAAAATCGCAAAATCGCAAATCACAACACAAACAGCAAATGCCAAACTAAATCGAGTCGAGCTGAATTGAATTGAATTGAATTGAAAATCGAATATAAATTAATGTTCGCGTTGAATATTTA---ATGTTAAACGTAAAATAATACGCAGGCAGCGGCAGCAGAAAAGCTGAAAAGTGCCAGTTGGGGTAGGAAGTTTTCCATGAAGAAGTTTGAAAATCAATTAACGAAGAAATTCAAATTGGA-----AATTCGCAATTGCAGTAT-TGGTGTGAGACA----GCCAAAGAGAAAG---AGAAAGATAGAGAGAGAGAGAGATAGAGATAGAGAGAAAGGGAGAGATAGAGTAGAGTAGGACAAACAAGCAAGCAAACAAACAAACCAACA----------AACAATCAGTCAATATTGCAATCAATCAAGTGTGCTACTATATGCGGCATTTGGCTTTGTCAATTTGTCAATTTGATCAAGAGGGGCAGCAGCCGATGGCACTGATGATATGGGCATATGGATGCGGATTTAAGGATATTGAACTGCAATGTAGTGACGAAACTACTCAATATAA
TGTAAGCGCAACAATAACTTTAACTAATCTGCA-----TGTGCTTACAAATTGATTTAATTGGTAACTACATATGTGCAATTTG-----------------AGCTTAAAAAAAAAAAACTGAATGCTAATTAACATCATAACATAATTAACATATACTAATAATATGGCAACTATGTTATATATTGATGTTCAAATTATTGATGTACATGTATTAAATGTA------CATGCATGCA---------------------------------------AACTTTTATGTGTATGTTTATGTGTGTGACGCAAAACACAAACTCAAACTTGAGTTGAACTTTGTAATGACAGCAAATTGCGTGAAAAACTTTGCTAATTGAATTGTGCGGAATGTGGCAAAAAAAAAAAAAAATAAATAAAAATAAACGGATAAATAAATTTGAGAGCTTTAAATAA--AAGAGAAGTGGCAATTCGGCAGTAAAGATTCAGCAATCAGTCAATATTGCAATCAATCAAGTATGCTTCAA---------------------------TCAAGTATTCTAATAAGTATACAATATACTTGCA-TGAATACATATACATATACATATACATATATATATGTACATGTGTGAATTTAT-ATGGCATTTGGCAATGTCA
>CG6123 18160401 18160712|22932 chrX 18160177 18160747 scaffold_5 2339686 2340186 - 302|226 542
CCAGCTACTTGCACCTCTGAGATC-CGAAAATCCTTATCGAAAACCAAAAACGAAATAAATCGAACGACGTTGAAGTTGAAGTAGAAGGCTTACACAAACAAGTGAACAATAA----GCGCAGCAGCAGTAATCACCATTGAATCCATCACATAACACAGCAACAGCAGAGGCTTAATGACAAATTAAAAGCATAGCAACGTCTGTCTTTCGGGCGAAAGGAGATGCACATAATTCACCGAAATCAATAATATAATCACAGCACTTACATAACTCACAAACAATATAATAATAATTGACAGCACAGGCTTCACACAA
TGGGCTACTTGCATCTCTAATACCACGAATACAATAAAACGAAATCATAAGCACAGGAAACACA-------------TGAAAAACAATACC-AAACAAACGAAATAAAAGGAAAAACGTACAACAACAGTAAT-----TCGAAACAATAACGGTAAATAGTAATGGTA-------AATAGTAACGGTAAATAGTAACGGTGACCGCATT------GAGGGGCGCTG-GTAGTAGTAACGATAGTTAATAGCAATATCAGAGAAACGATAACGATAGCGATAACGATAACAATATT--------AAGGC---------
>CG6123 18161132 18161192|22933 chrX 18160856 18161141 scaffold_28 1496999 1497262 - 1048|292 301
CAGCACACCG
CAGCACAGCT
>CG6123 18161132 18161192|22934 chrX 18161168 18162713 scaffold_5 2340361 2341882 - 58173|0 24
GTCGGGGGGCGCAGAGGCAAGTAAA
ATCGGGGGTACGAGACGCAAGTAAA
>por 18211456 18212112|22995 chrX 18211043 18211821 scaffold_5 2415566 2416339 - 11517|475 852
ATGAAAATGCATACGAATTTGTTCAAATATTTTTTATTGATTTTTTAATGTATATTTTTCTTTGTTGTTGGTTTTGTTTTGCTTTTGTTT-GTTTGTTGGTTGGTTGTTTTCGTTTGTTTGTTTTCTCATTGAGACAAATATTTATAACAATATTGTAATTTCTACAGATTTTTCGCCTGCGTTTGTATTTGCCATCCTTTTAGTTTCGGCACGCGATTTATTATGAATCCTTTTTTGTATTGGGCTGTGGCCTATCGTTTGT-GTTTTCATTTACTTTGTTTTTCCGCGCTTACGATTTAGTTATTAAAAGTACTAGCTTAAGAAATATGCAATGACAATAAAAATATTT-TTATTTACTTT-------GTTG--AA
ATAAAAGTCGAAATAAAATTTT----ATTTTTTTTATTGGTTTTTTA-TGTCGATTTTTTTTT--TGTTTGTTTTTTGTTGTTTTTTTTTTGTTTGTTTGTTTGTTGTTTT-------------TCTCATTGAGACAAATATTTATAACAATATTGTAACTACTAC------------TTTGTTGATTTTTG-------TTTTGTTTTG--------TTTTTTTTTTTTACTTATTTGCATTTGTTT--------TCGGTTGTCAGTTTTATTTGTTTTGT-------CGCTTATGTATTAAATATTAAAATTACTACCTTAAAAATTATGCAATGACAATAAAAATATTTGTTATGCAATTTTCGCCTGGTTGTAAT
>por 18211456 18212112|22996 chrX 18212058 18212198 scaffold_5 2417260 2417396 - 4434|0 55
ACTCCGCAGGATCTTGCCGTCGCCAATACTCACTATGACTGA-TCTACACGTATTT
ACT-----GGACCCAGTCCATTTAAAGACTGCCTGCGAGAGACTGCACCCCTATTT
>betaCop 18215484 18215644|23000 chrX 18215464 18216794 scaffold_19 2028728 2030087 + 62871|20 234
TGGAC------------GTGGAACTGGACGTGGACGACCAGC--CACCAGCAGGAG---------------CGACGTATCTAGACGACGTACTCGGCCACCTGCCCGCATTCCGCCAG-------------------CTGCAGCTTCTTCAATTTACATTACACGTTACAATTATACATAAAGAATATAATATTAT------ACCTTAACCCCAA
TTGATCATTAATAAAGGAAACAATAGGATCAGCAAGAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCCAGCACAAGAAATTCAACATATTTTA--GAGGTAGTCGAGCCACGGCCTGCATTCCGCCTGATTTTTAAATAAAAGCAGACCACAACAGCTACAACATACA--ACATACAACAATAATGCATTCA-ATTATAAACATATTTAATAAAGTTAACCGCCC
>CG32549 18224425 18224731|23005 chrX 18224451 18225905 scaffold_19 2039179 2040752 + 70731|0 313
ATGATGCCACAGCCGCCCTTCTGGAAT---GGAATGTTTGGATCAACGAATTTTATTCTCAAACTT-----------CCCCAATGCCCCCATTAGCCTTGCAAAC-CCTTACCCGAAA--------TCCACACCGTGGTCGAAGCAATTATGAAACGTACGATTTTCCCTGGCGATTTTACCCAAGCACAGATA--TGTGAAA-CTATATACCATAACCGATATATATATATATACATTATACATTATAAATTAGCTGGTTCCAT-------ACATATAATGTGTCTTTTTTTTTTAAAAATGAAAACCATAAA
ATGAAGTCGCTCCCCCAACGCGGAGATCAACGAATTTGCAAACCGACCTGTTTCTTTTGTCAATTTGGCAGATCAACTCCGTATACCTAAGTGAAGGTTGCAGCCTCCTTTCCCCCAACCCCCTTTCCCACTCCCCAATTGCAACTAGTGAGAAACAAGCGATTTTTTTT-TCGATTTTACATACATATATACAATTATAAAATCTATATATAAAATATAATATATGTATACATATA-TATACACT---AGCTGATTGGTTCCATTTGCCCAAAATATATTAAAGATGTATTTTGTAAAAGCAAAACCAATGAA
>CG32548 18269652 18269799|23048 chrX 18269594 18269787 scaffold_3 70676 70889 + 655|58 218
GTTATTCCAA---------GGACTTCCAAAACTAGTATTTTCATTTTTTTTTCACACACCTTTTTTTTTGCGTAAATTTTCGTGGTATTTGATAAGAG--GAATT--GTTTAGGGCAAGCA---------AGAATAAATTT---TGTAAGTGATGATAATT
GCCAAAACAAAAGGCAGCCGCACTTTCAGCAGCTGCACTTTAGTTTGCACTTTTCGC-----TTTCTTTGCATAAATTTTCGCGCGACCAGACACAAGCTGAGTTCACTCTAGTGCAAAAATAAGCACGCAGAAAAAATATACGTCTATATAATGGCCAGA
>CG32548 18269652 18269799|23049 chrX 18269788 18270741 scaffold_19 2135443 2136279 + 26841|0 11
TGATGATGAGCT
GGCACACGCGCT
>CG6361 18314039 18314074|23103 chrX 18313940 18314975 scaffold_19 2201114 2202171 + 20670|119 154
GGCGTCATTTGATCTGCAATAAATTTAGTTTGAACG
CCCATAA------CTGAGATTAAAGGATCTTCAATG
>psh 18318419 18318585|23109 chrX 18318257 18318586 scaffold_13 104267 104639 + -766|184 390
AGTTGGGAAAAGTAAAGT--TTTTGTTTTTTTTGTATGTATATTATTTCTATTT---GGGATCAGGACTGCCTGATCCATCGCAATTGG-CAAACACTCATCTGTGATCTCTATGAGCACCGCGAT---------CGAACCATTTAATAC---CAATAAAG----------------------TAGATACGTTTTAAGATATAATCA
ACATGCAAAAAGTAGCATACGTTTGCGCGATTTAAATTCGCCTTGTTTTTATTTTTAACGATCTGGCAAGGCTG-TTCTTAGTGATGAACCGAGCACTAATTCTTAAGAAACACAGTCACACCAATGTTGTGAAATGGATAATTAAAAACATTAATTAAAGTTTATGTGATTTCGTCATTGTATAAATAAGTTTTTATTAAATATAA
>CG15044 18325119 18325345|23114 chrX 18325196 18325600 scaffold_19 2217944 2218345 + 9951|0 158
GACTGCTCGCCCAGAACTTTCAGC---TACAATAAACGATTC----GCTTGGAACCCAACTGTGATCATGAACTCCAGACCCTGC--CCCTGTCCCTGCCCTTCCTGCCGAGAGTATTATTAGTCATAGACGTACATACATTAAAGAATCAAATTTCAA
ACTAAAGAGACCTAATTTGAGAGCAAATAAAACAACAGCATCTTCAACTTGGAACTGAACTGTGATCGCCATCGCTCAACGCTAACGCCATATCCATCCCATTCCTTC---------TCTCAGAAAGACAAGTAT---TATTATAGAGCTAACTTTTAA
>CG15043 18327338 18327454|23118 chrX 18327323 18328232 scaffold_19 2222231 2223250 + 16082|15 181
GAGGCAT----------------------------------TTGCATTAGTTC------CTCGCTAGCTTTATATATATATATATTTTTTTTTTTT-----TTTAAATGTGACTCCAATTTTAAATACATATGTATAATGGCAGACTAAAAT-----GATTGCAGCA
GTGAGAGCGCCGCTTTCTCCCGCAAATATTAACTGTCTTTATTGCATTCTTTTCTTTGGCTTACTATTTTTTTTTTGTTTTTTGTTTTTTTTTTTTTGATGTTTGATTGTACAAACTATCGCATATACACACATATATAAATGAATTACTATCTATAAATTGTAGCG
>GalNAc-T2 18329113 18330345|23121 chrX 18329104 18331225 scaffold_19 2225310 2227578 + 58521|9 1498
GTCCAGC---------ATGTTTGGGAGGAGCAGCAGGAGGAGGAGGATCA----AGGAATGGATCACAAGGGT---TTCAGCCGGGG----CAACGGG----GGCGATATTTTAGACAAAAGCAATTTAGTGAAAATGAG---AAATGGAATTGTTGTTGGTTTTGTAACGCATATAAGTATTGATATACACACGAAAAACACAAGATAT-----CACACACATCTGCATTTATGACGCGAACTGTATGTACATATGCACTGTCGGCACTTGGAAATCGCCTGGGCAACCGGGATTCAGACAAGGGCATTCAATGCTCGGCGAATAAATAAATCCACAAGGATATTATTAAAT--TATTAAAGCTTAAGAATTTCGATTTTGTAAAACAATGTCGTAAG-----GAATCGCGAACAATTGTATTTCCATGTAAGCATTAGAACAATTGCTTTTAGACCATATTTGTAGTGCATGAAGTGAATGCAATTTTCAAAATCGTGTGTGTGTGTTAGTAGTAGTCGTACTTGAAAACTGTTTTCCACTTTTGTCACGAAAGATCAAACTCCACAAAATGCACTTAGTGCAGAGCGTACGAAAATCATCACAATTAGCTGATAGTGAACCCATTCCCATTTCGATCGGCGAATCTCATACAATAGAT----ATTCAATT-GATATTTGGGAGGATCCAA------GCCTGGGGGATTTCC----GTGCCGACCTCGTGTGTGTGTGTCCTT----------------GCGTATGAGTGAGAGAATGCGATGGGTATA------GAGCGGAA--GCGAATAAGAGCGAGATAG------------CGCGATGGCGGGATGGCGAGTCGAGTGCAATAGA-----GGATTTATGAAACGG-------GAACGGGACGCGATGACAGGG---------------CCGCAGATTGTTTTGCTTTATGAT--------TGCCAACTGAAA----AAATGAATGTACTAACCTTAGTCTATACTCCTGCA--------AGTCCAACTAATCCTAGCTTAGTTTCAACGCTGCCACATTCCAATCTAATCCATTATAATCTATTCTAATTCCAATCCAATCCAAT----CCGAACCGAACCAATCGAGTCTGCAGCGAAGCTCGGCTCTCTTACTACTAATCCCATTAT-----TTTTTTTTAAACTCTTGATTTTCGTAAAGCTCTCTGTACCAGGTAGTCGTAATCGTAATTGA------------------------TCGTTGCAAGTGC--TTCGGGAGTTTG------ATTTTTGAAAACAA----TATTTTACATTCAT--------------------------------------------------------------------------GTGTAACTTTAGAGTTATCGATAAGTCTGAATAATAGCATAGAAAT-AAAAACGTTTTCTAAACACTTTACCATGTAAGCCGAG
GCCAGGCATTAAGGCAATATCTATCAAGGGTTTCAATGGGACGTGCATCATGACCGGCAGGGGTAATGTGGGTGGGCTCGAGGGGGGTATCCAACGGGGTTTGGCACCGTTTTAGACAAAGGGAATTTAGTGAAAATGAAAACAAATGGAATTGTTGTTGGTTTTATAACGTGCACACACACC----CACACACGTACATCTATATATATTTATATATATACTTCTATATTTATA--------TATATATATATATATCTTATGG-------------GCCTGGGCAATCGGTTT----ACTTGGGCATT---------ACTTATTTATGATTTC-CCATGATATTGAGCAATACAAATAGATATTAATATTATC-ACTTTCTAAATTGA-GTTGCATGCATGTAAATTGCGAACAATTCGAGCTGTG-ATAAGCAGTCCAGAGATTGGCATGACTCCAAATTTGCAATATTTAAG--AAATAC---CCTCAAGAT-ATTTACATGTGCAAAAGCT------------AAGCTATTTGT--TTTTTGACATGAATAACCGAG---CATAGA------TTGGTGCTTGCTTTAAGAAAA----------------------AACTAATT--------------CGAATATTATGCAATTGACTGGAACTAAGTTAAATATGTAAATTAGCCCAACCGACTGCCCATAAGTTACCCAGTTATAAAAAAAATGTGTGTGTACGTTTATTTTTGTTGTGCACAACGCATGCGAGAGAGTGAGAGCGACGAGTTTGACGCACGAGCGAGATGGCGAGTAAAGGCGTGAGCGGTGACGCTGCGCTGCAAAAGAGGGAGAGCGAGTCGTGTGCAATATATATATATATATATATATCTGTTCGTTTGCAATAAAAGCCTTGCCAGGACATTATTATGAATATCAGCAAACTAATTTGTAATATTGTAGTACATATGCCTACTACAACTCCATGTAACTATGTGTATCTCTCTCTATATACATATATTTATTATATGCCTATGTTTATTAACTAAGTTT-ATTGCTGCCACATTCCAG---AAACTGATATA---------AAGCTCAACTTTATGCAACTTTGCCGATTTGTAACTAT--ATTTTGTA------TTTTATTTTTTTGTTTTTAATTTTTTCATGTGCATTTTGTTAATATTAATTATATACATAG-----TTTATAGACGTTTATTGAAATTG-AATTGATTGGAATTCCCAAACACAACCAATTTGTAGCACGCGCATTTCTCGCAGTCGCTGTGTGTTTTTAAATGTAATTTTTATTATACATTCATATACATGCATATACACAATATATATAGGGTATATATATGCAATATATATATATATACATATTATTTACATTCAAGTGTAACTCTAGAGTT----ATAAGTCTGAATAATAA-ATAGTAATAAAAAACGTTTTCTAAACACTACTATAAAAAATAAGAT
>Wnt5 18335477 18335774|23125 chrX 18334164 18335503 scaffold_5 706890 708247 + -6542|1448 1474
AAAGGAAAACGAAAACGAAAAAAAAAA
AAATCAACTCACAGATGAGCCATAGAA
>Wnt5 18335477 18335774|23126 chrX 18335626 18336128 scaffold_11 2067490 2068076 + 16479|0 165
AGCGTTGATTGAATTC-----GAATGTCTTAATGTTTGTGACTAAGCCATGAAGGAAA---TAATCGTATTTAAA--------CAGATAATTATTTATTGAAATTACATTTAAATTAATGATTGTATTTAATAAT-AATTTTTACTAATTTACCGGCTTTTAAGCA
GTATTCTATAGGCAGCACAGAAAATGTCCATATGATCACGATTCA--CATTAACATAACATTAAACGTATTTATATATCGACTTAGAATATTATTTATT-AAATTATAT---AAGTAACATGTCTGTTGCATAATGGATTTTTTCTTAGCCACTTATTTACAATCA
>wgn 18457986 18458861|23311 chrX 18457940 18458106 scaffold_19 2414317 2414482 + 3782|51 175
ATATAGATACAGATATAACTACTTATAATAATGCTAATTAACG----GATAACTATATCGATAGGGAGAAATGTCTATGTCCTAAGTGCTATCAGTGTGCAACAGCAATAAAAACCTTTATGATT
ATATAAATGTAAA-AGAAACATTAATAAAAATGTGAAAAATCGAAGAGAAAATTGTAT-----GGAAAAATTGTTTATATTTTAAGTGCTATAAGTGTGCAA---CAATAAAAACTTTTATGAAT
>wgn 18457986 18458861|23312 chrX 18458169 18458452 scaffold_19 2414713 2414950 + 6402|0 291
TATGATAGAAGC------GATTTAGATTAACAAATCTCTACTTAATGTAAATATTAAGGCGATCGAACACGCGACCCCAAACGCAACGAACACACATCGTTGCGGAGTGGAACGAAACCAAGTAATATTGGCAACATATCAGCTTCTATAT-GCATGGAACGCATATAGACGCACGTATTGTTAACATCACCCATATCCCATATCCTAGTACTAGTATCCAGAGTAAACAGTATCCTATAATCCCACCAACA-ACACACACGTACATACATTTAAACGAGTTAAAATATCCA
TATAATAGAAGCCCATCTAAATATGATTAACAAATTTCTACTTAATGTAAATATTAAGGCGAGCGAAC-------------------------------TGGACGAGTGCTACAGAACCAAGCAATATCGGCAGCATATCAGCTACTATATCTTACTATATAGTCATATATGTGCATATTGT--ATATCATGCATA----ATATCGT-----------------TCACCCATAGCCCATACACACACTTACACACACACACATGCATACGATTATATAAATATATATATTTA
>wgn 18457986 18458861|23313 chrX 18458563 18459783 scaffold_19 2415428 2416531 + 17847|0 312
GCCGTAGATGTGGTCAA---------GGGACATACTTAAGGAGTGGCTATGCAGGCGCACGGACGCAGGACGCGGGACGAAGCGAGAATGGATCCGGAACACGATACGCAAACGGAACCGGAAACGTAAATGGATTAGAGAAAGAACTTTGTACAAACAGCCGCTTAAAAGTAGGAGGAGGACGGAGGAAGGAAAC---CGAAACTATTATTATTTTTTATATTATTAATCTTATTCTAATTATTACGACT--TTTTTTTTGTCCTAATATTTAATTGAATCGTTATGTTGACTTGTTTGTAATGCGCGGACA
GCTGCAGCC-TGGCCAGCAGCTTGTTGGGAACTACTTAAGTGTACGTTGTCGTCTAGTACAACAGCAACA--------ACAGCAATAA-----CAGCAACA----ACAGCAACAACAGCAGCAACAACAACAGC----AACTACAATTTTGTACAAA--------------GAGAACGCTGAGGGAGCTCGAGAACTTGCAAAATTTTGATAATTATCTACGT--------------------GTACGATTAATATATATTTGCCTGATATTTAATTTAAATGTTATGTTGACTTGTTTGTAATGCAAAGGCA
>l(1)G0003 18469571 18470256|23327 chrX 18469524 18470502 scaffold_5 4731463 4732542 - 5047|50 874
CGGCTAAACA----AACAGCCAAACTGGCCGTCGCCAGCAACCGGTTCACTTGTCG-CAGAGCAGC------TGGAGAA---GATCTGCGGAGGTTGCTC----CGGAAGCTGTTGGGTCGAAACGAATCGAAACACCACGTTGCCTTTGCCGCGAACAGCAAAATTCAAGTGCTTTCTAAAACGTATTGCTAAGAGGGAAACTAAGTGCACGCGTAAAACAGTTAG-GCTTAAGGAGTGCAAAATCTATATTGATA------------------------------------------------------------------------TTTTATTGTGTGTAGCATT-----CGTACT----TTTTCGGTTAGAAATTCCCCTCCCCCCCACACACACAC-ACACTAAACAGAACTAAATTTGTTGTACTATA---------------------------TGTTTATCCTGGCAATTGAAGCGATTT----GTCGTGTTGCGAGTCCTTGTCAATTGATTGAAATTATCCGAAAGTA--TTGTGTTTGTTTTTTTGTATGACCCATTTTTTTTTTTAGTATTGTGCGACAAGAGTTTGAGAAGTTTCTGTAAAGT--GCTGCCTGGGAAGTGGCCT-TAGTGAATTAAGTCTTAAATTATTTATGTTTTAG-CGGTTAAGCGAAAAGTGGGAAAGGGGGACCATCCACGTATGTCCCCCGTGAAAAAAAGAACACCACACACAGTTG-AAATATGTTGATACTACAATGATTTTACTTATTGATATAAACGCAAGCAAAATAAAAACATTTTTAACATAAATAA
CGGTTAAGTGTGACAGCAGCCAAACTA--TGTTCGCAGCAAGCAG--CGCTTATTGTCGGAGAAGCACAGAAGGGAGAAGCTGAGCCGCGGCGAACGTTCAAAATGTAACATGTAACATAGAAACAAAAAG-AACACCAAGTTGCCTTTGTC---ATTAGAGAAATTCAAGTGCTTTCT-TATTGTATTTTTAGCATTACATTTACACACACTATAACAACTCTTAGAAATTAAGCTATTATAAATATATATATATATAGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGCTAAACGAATGACTACTAAACAAAAAGGCCCAACAAATTTGTGGTTAACTTTTTCTGTGTGTATTGTTTTACGTGTAACATGATATTCGGTTTTTCATTTGCCCTGTGTTAATATTTGAACGAAACTAAATTCAATTAAATTATATGTAAAATGTAAATTATTGTCAACAATTTGCTAAACTGTTTTGCTAGACAATT-AGACAATTGTAAAGTTTTGTTTCGATTCA--ACTGATTAATTGAAATTATCCAAAAGTATTTTTTATTTGCATTTTAAAATG-----------TGTCTTGTTTTATGCGAAGAG------------TCCTGCAATATCGGCTACGATTGCAACAATTTATAGTTAAGTAAATCTTAAATTATTTATGTATTAGACAATTAAGTGAAAATTGAGCAATAAG-------------------------CGAGGAGAGAACTACATTCAGTTATACATATGTTGATA----AATGATTTTACTTATT-----------AAACAACA-------------AATAAAAACAA
>l(1)G0003 18470551 18470810|23328 chrX 18470568 18471199 scaffold_5 4732653 4733236 - 6154|0 306
TTAT-AAAAATTACATCAATATGAATGACTTTCTAAAGTAAGTGCTGCGCATGTTGCAAATTGCATTTAAGTAGACACTTAAC---------CAACAAATCCCA----------------ACAACAACAA-------------------------------------CATCACCACCACCAACAACAACACCACAACCCCCAACAACAACAACAACGACGACAACAAGAACAAGAACAACCAGAACTGCGAG-ACACGAGTAACTAGAACTATAAACACCGCCGGCCGAGAAAGAAGTAAAGGAACC
TTATAAAAAATTACATCAATATGAATGACTTTTTAAAGTAAGTGCTGTGAAT-TTTCGGCATGCAGTTGCACGCACACTTAACAACAAGCAACAACAAAACTCATATGCACTCAAAAAACACAACAGCTAAAACCAAGATCAGCCAACAGCCCCTGAGACCCCCGTTCAACAGCAGCAGCAGCAGCAGTAGCAGTAACAGCGGCAGCAGCAGCAACAACTACAACATTAACAACAACAGCTAAATTAACAAACACACACACAACAACAAC----AGCAGCAGCAACCGAAGCAAAGAGTAAGAAATC
>l(1)G0003 18471268 18471291|23329 chrX 18471258 18471747 scaffold_5 4733262 4733737 - 19135|10 33
-CAACTGCATGACCCTGACCGCCG
GCACATGCATATGCACATGCACAT
>CG6617 18483331 18483469|23342 chrX 18481790 18483449 scaffold_5 4750314 4752035 - 29923|1671 1819
CGACTTCTTTTGCTAATGCTATTGCTAATATATCTCCATTTAATAAGTATGTATATG-------TATGT---------------------ATGCTGGATGTAGG--CAGTGAATTATTAAATAAGTAGCCGGAAACTCCATCACTCCAT
CAATTTCTATATCTATTTCTAT-----ATATATATATATTTTATAAATGTATGCATTAGGATTTTATGTTGCAAAGATTAAAAATGTCTGAAGCTGAATCTGGTTTCGAAGAACAATTAGACAAACGAATGGATCGGTTTTTATTTTTA
>CG6632 18484655 18484763|23344 chrX 18484735 18486872 scaffold_5 4753649 4755747 - 65471|0 28
GGCTGACTGCGCCTGCTGGCGCCCCTCTT
G-----CTGCACCTGCAACTGGATCTCTT
>CG6659 18487329 18487922|23345 chrX 18487152 18487537 scaffold_10 4557280 4557670 + 194|185 413
AACTCTAAATACTTT------------CGTTAAGTTTAAGCTAAGCTTTTTACATTTACGCATGTAGTATACATATGACGATGAGACGCGTGTGGCAA------CGAAAGTGGCTGCATGTGGACGATGTGCATCCGGGAGCCACGATCCCAGACCCAAAAACAAGCGGGTAAACACGCATTTGCCAGGCAATAAGTGAAATAAAATGATATATTTGAAACAA--TCCT
AACTTTAGGTGCTTCACTCATTTTGTGCATTAAGTTTAAGCTAAGCTTTTTACATATTAACTAAT----CACTAATCACACTGAGACACA---GACAATCCGTTCGGCCATAGCCAATGGTTGTCAATATGTATGTATATG-TATGCATTTTGTCCCGAATAAATGAGAATGATGAC----CTCCCAGAGTATAAATTATTTAAAA-GCTA---TTGAAATAAAGTTGA
>CG6659 18487329 18487922|23346 chrX 18487916 18490616 scaffold_10 4558083 4560631 + 102349|0 6
GGCTGGC
GACAGAC
>Cyp18a1 18522474 18523082|23384 chrX 18520877 18522839 scaffold_10 4611491 4613409 + 42329|1638 2135
CTGTGACCAACGCACAGA-GGACTGCA------------------------------------------------------ACCAATTCTATTCTTTCACCCCCAAGAAGCTGTGTTCAACTAATTGTAA--TTAAATCCTAGTTAATACGCCCTAGTTAG--GTTCGATTATACAGCTAATGTCAATGTTTTTATAGTTATTAAGTTATATTATTACTACCGCTAATGCTAAGATACCGCTATGTCTACAGCCAGCAGGCCGATTAAGTTTAGTTAGCTAACGTTCTTGTTTATCCGTAGTATTAGT--GCTAGCT----------------TAATGTCCAAACAACAAACAAC-------AAAACAAACTGTGGTTTAGTCTTACAAGCACACATCAAA------ATAGGC--AAACGATT--------------------CGAA--AATAAAGAAA------------------AATTTGTGGAAAAAACCTTGA
CTGTCAGCAACAGACAGATGTAGTATATATAAATTAATTCAACACACATACATGTGTGTATTTAGTTATGTTATGAAGCAAACAAATTCTATTCTTTCAACCCCAAGAAGCTGTGTTCAGTTAATTAATATTTTAATTTGTAATCGAT------TAATTAGCAATTTAATTAGACAACTTGTAATATTGTGTTTATAAACAT--------------------------GCATATACATATATATGTATATATATATATATATATATATATATATATAAATATGAGAATTTTTTTGTCTTAGCCTTAATTAGCTAGTTGATGTTTTTGTTAATTTCATATTTAGGCTTAAGACAACAAACAACAAAACAAACTGTGGTTTAGTTTTAT--GCACACAACACACAAAATATAGGCAAAAACAATTTCTGAAATTCATATAATAAACGAATTAATAAAAGAAAACATTTGATTTGTTTTTAATATGCGTAAAAAAGGTAAA
>Cyp18a1 18522474 18523082|23385 chrX 18523034 18523545 scaffold_10 4613562 4614098 + 31933|0 57
TGTGGACCTGGTCCG---------CTCCAGAGCACGGTTTTGTTCCTACACAAATGCT
----GCGCCGCTCCGGGCACACACCCACAGAGCACGGTTTTGTTCCTAGACACGTTCT
>CG12609 18580306 18580811|23449 chrX 18578802 18580884 scaffold_10 52660 54774 - -5889|1778 2290
ATACACTTGCCATCCATTTGACCTATTGTGCCATTGACAACATGTCTGAATACACCGCAGCCACCTGTTTGACA-ATCCGA--AGGACATTCACTTCGCCCCAATGCGTGTTGAGGGCTCCATTTCAAGTTTGATTAATTCTTGAGTCTGGCTGGGCAAATGAGGCGGAAAGATACGGCCCAAACTCACCGAGTCCGGCTATGATTTATGAA-TACTTCAGAACGATGATGACGAACACAGTCTGTATGCTAAAGCGAAGTTGCGAACTCTTGCCGCAAATCCAAAAACCACCGACGAAATTAGTTTTTGGCTGTCAAAGTAAATTCCGAAATTACTTCAAGAAATTACACAACGCACACAGTTTAACCCCACAGACACAACCGCCT--GGCAAAAGGACTCATCCCCATCCGACATCCCTAAGCGCAAATTCCGACTTCCCCCCGATGCCCGATGCGTTGCTCATTAGCGTG-AAAATTTAATTTAATTTCTTCCAATAAACCCCTTAAGTG
AAATATT---CACACATTTGAA------------TATCAATATTT----ATACATAACATCTTATAGTCGGGCACAACCGACAAGAGCATTCCTAGTGGTTTCTTGCCGTTTCAATTATCCGT----GATTTCATTAATTCTCGGGTACTGC----CAAATGAGACGGAACCGCAATGGGTGGATTAAGGGGGGAGAGC-ATGATTTATGAAACACTTTAGGAAAA----------------------------------------ACTTT-----CAAAGGCAAAAATT------GTAAATAACCGTCAAAGGCGAAGGCAAGC----AAATTATTTTTA---ATTAATCTACACATATGAA--AGCTTTACAAACAGCTCTACTTTAGGCAAA----------CACACACAGAGTCCCCAGGC-------------CGCCCCCAA-----------------ATCAGCATATGACACTTGACTTGCGTTTTTCCGCTTGGCA----AAGCG
>CG12609 18580865 18581227|23449 chrX 18578802 18580884 scaffold_10 52660 54774 - -5889|2344 2366
ATCAAAACAGTCAAAAGT---AA
ACTAAGGCAGCCTAAATTGTCAA
>CG18259 18615169 18615712|23482 chrX 18614989 18616710 scaffold_48 24234 26189 - 37962|193 957
-AAGCGAGAGGCAGAG----CCCGGGAACTAAAGCAACTA----GATAATTTTTC-------------------TCATCATTTTCATCATCT----------------------------CCGTAGT------------ATTTAGTTCAACAACGTAGTCCATTTTCATTTCGCGCTTATTAAATTCGAATCGATCCATCCAGCGTATGTTCAGAAAACC---AGACTAGTTTAAACGAGA-------------------------ACATTTCTTTACTATAGAAACTTGAATTTT-------------------------------------CTAATGCAAATTCTGGCAT--------------ATCTGT-----CCACTTC-------AGTATTCA--GTATTAGGTGGCTAA----------AATTTTTGTCTTATCATCAAAGTAATTCATCAGT---CCCACTAT-----ATACACAATTAAATGTATGG------CATTGATAATGATTTTGCATCCGCTCTTGAAATTTG---GTATTGAAA--ACTTTTC-----TTTTACCTT------TTTTGAATGACACTATGGATTATGATTATACGATAAATAAGAGGACCCAGTAATGTTACAATTGCTTGTATAATATTTCATA------------AAATGTACAGT------TTTTAAATTTCATAAAATTAATTCATAATAATTAAAGAGAAAGGAGCAG--TTTGGTAAGCAGTT-AAGAGTTGC
CAAATGTCCCGTACAGAAGCCACACGAACTTAGGCAATTACTACGTGAACGTTTAACCTAGACACATGCATCAATTATCAATAACGTTATCTATACGTTAATCCAGCATTGGTCATTAACTCGTAACCCTTTTTTTTAGATTTAAGCCTATATTGCTGTACATTTTTGTAT-GCGTTGGCCACACACAAATTGCTC-----GGCGCCCGCTCAGTAAACCGTTAGTCAAGTTTAAACCAAGTATTTTCAATAATTTCTCATATACGATTTTCTTTTCTTGTCTTAACCAGAATTATACCTGCAACAGTGGCTGTCTTTAGGGCTTCGCCAGGGCTAATAACAACTCCGAAGTCATCTGAACCCATGATTTGTTTCTGCCTCTTCTTTTGTTAATACTCAAAGCATCTAGGAACCAATAAAGTATATAATTGTAGTAACTGCAACAATGTAATATTTCGATTTTCCAAGTATTGCCCATTCCCAATTGCATGTCCAGGCCGACCTTTAATTCAAATTTATCAGAGGGCTTTAATATTTATGTGTTCTGAAATAAATGTTCAAATGTCGGACCTTAAATCATTTTGAAATACATTTGGGATTCCTCTCAAATG--------------CGCATAATGTTT--GTTTCTTGTTTAATATTTATTACATATTACATAAAAATGTACAGTAAATATTTTAAGATCGCATAAAATTAATTCATAATAATTAAGTAAAAAA-AGCAGGATTAAGTCAGCAATTGAAGAGGTGC
>CG6961 18620075 18620397|23486 chrX 18620325 18621395 scaffold_48 25075 26189 - 30640|0 97
GAA---GTGCGAGGCAGAG--CCCGGGAACTACAGCAA--------------------CTAGATAATTTTTTCTATTTAGTTCAACAACGTAATCCAT
ACAAATGTCCCGTACAGAAGCCACACGAACTTAGGCAATTACTACGTGAACGTTTAACCTAGACACATGCATCAATT---ATCAATAACGTTATCTAT
>bnb 18628445 18628901|23492 chrX 18628672 18628890 scaffold_20 1333385 1333608 - 160|0 230
GCTTTACATCTACCACCT--TGCCTTAACCAACT----CAACTCCAACTCACCACCGCACCGCACCACCCGCACCAACCAACACCAACACCAGCACCACCAACCCTACCGACCATCGCACCACTGCTACGCCTTGG------CAGCGTCTTAATATTACGATCGTAGTTAGTGGTATCCTTAGTTGTAAATGGAGCAGAACGTAATGACACACACAAAATGAAGGGCAGGA
GCTTCACCGTGACCAACTGCTGCACCACCCATCTGCCGCAGCTCTCAAAGTTTACCTCATCCTTTCACATACCCTCAACGGTTGCAGCAGCCGCA----CAACAGCAACAGCAGCAGCAGCACGGCGCCAACTTGGATCAGCCAGCAGC-AACTACAGCGACAATAGCTA-CGGCAACAACAGCAGCAGCAGCAGCAGCA-ACAGTAGCAGCAACAACAACAACAACAGGA
>bnb 18628445 18628901|23493 chrX 18628891 18630162 scaffold_2 1037920 1039517 + -2723|0 10
GAATAGTAAGA
GAACAACTGGA
>CG7280 18680319 18680440|23542 chrX 18680435 18682449 scaffold_5 837965 839974 - 71492|0 5
AGGGGA
CATGGA
>CG7322 18689856 18689949|23546 chrX 18689698 18690410 scaffold_5 846292 846963 - 21887|163 256
GACGCCAGCGTTAACTTCAATGTGCAAGCCCGAAATTTGATACAAATGAAATATGATTGAATTAAAACTGTGGAAATTCCATGATTTTATAATA
------------AACATACATACATATGCATTA---TTGATACCAATAATATGAAGCGCACTCAATA------AAGGCTTATAGATGTATTACA
>CG7326 18695480 18696170|23553 chrX 18695176 18695630 scaffold_8 2877775 2878237 + 3007|337 498
ACTTAAGTTAACGAGAAAAAAATGAGAGTAGAGTAATAGTTTAAAAGTAAAATTGAAATATTGAAAATATTCAATTTTAATAT--ATTTTCAAAGAACTGAATTAACAAGTTTTCCA---AAATGTGACTTACCAAAACAAAAAAAAAAACAA------AAA
AGTTACGCAGACAAACAAAAAATTAGCTTCATTCAAGAGAAGAAAGAAAAAAACAGGAAATAAGGAACATT-AGCATTAATATTAATTTTCATGG---------------TTTTCTATTTGTATACAACAAACTAAAA-AAAAAAAAAAACAAGTAATTAAA
>CG7326 18695480 18696170|23554 chrX 18695701 18695762 scaffold_8 2878305 2878343 + 161|0 63
AAATGCAGTGCGTTCCGTGACTGTAAG--TGCCAATGTCTTGGCCTTACAGCTGCGAAACGCAC
AAAT-------------TAACCGCAAAACTATCAA------------ACAGCTCCCAAATGCAC
>CG7326 18695480 18696170|23555 chrX 18695770 18697622 scaffold_5 850900 852736 - 19185|0 456
TGACCC--AATCCGATTCAAAAATCAAGCATAGCTTGTAT------GTCGGAAACTATGTTACTTGTTTTCACTATACAAAGACGGACTTGGCCCAATAATTTGTCAAAGA--------TATTTTTTTTTTAAAGTTAGCCCTTGATTGA------------------------TAATCAATTCCATCCAAAATACTTTACT----ATGCCTTTGATTCAAATC---------CTCACATCCTTTGCTTTTGTTTATCGTTATACATTCGCTTAGAATGAATTAACAGTACGCGGAATTGATAACGCCAAAGACTATTTATTGTTTTGTGAAGAAAATTTTG---ATTTTATTGCTTGACTCGATCGTTATATATATATATGTATATTATATATAGTTTAACAAACGTTTTGCAACAAGTATTAGCTGGATAAACGACTTCTATATATATGTATGTA
TGACTATGAGACTGATGCCGGTCTGGATGCCAGTTTGGATGAGGCGGATGAAAGCGATGACGAGCGCTCGGACT---CGGACAGCGAACTGACCTCATCATTGCTCAACAAATCCGTACCAATTATGGCCTACGAGCAGAACCTGGTCAAGCGCTGGCCGCTGCAGAAGAAGCGCAAGCAACCGCAGCCACCAAATGCAAATCCAGATACCAGCGACTAGAAACTGGGCGTGGCTCAGGTGTTCTAC-AATGTTTTTTTTTTTTTGTTTGTCCAGGATTTCTTG--CGTATGAAATGAAAATGAATCAAATGTTTGTTTATT-------------AATTTTGTATGTTTTGTTTTTTGA----------ATATGTAATTTTATTCAATTAATTTAATTTGATTAATATTTAGCAAGAAGTATTAAGTATAAGACATACTTATATATACACATATATA
>CG7358 18722947 18723229|23583 chrX 18722913 18724418 scaffold_5 1946786 1948238 + 36050|34 359
GATCCGAT-GCCCGGCGTGCAGCGAGAGCTGCGTTACCGAAAGCCACGTCACTATCGACTGGATATACAGATCTTTATGGGCGTGGAGAAGGGCAAGGCGACGAAACGAGACCACTACTAGGTG--GATTTTAGGAATAAGCTTAATGTTTGAGATATAACTTGATTTCGATTATTGATTCAAACTTGGAAATTGTGAAAA-------TTGTG---------AAATA---------TGAATTGCATTATAAAAATTGTAGATTATAAATTGATTATGAATTATACAAAATTGTGAATATCAACTGCATTAA---------------
GATCCGATCGCTCGGCGT-CGGCTCGAGCAG---------------TTTAGCTATAGACTAGATATACAAATCTATATG--------CAATGTCTAAATAACGTCCCGA---------TCGGCGATGGCATTGAAGATAATATTAACGATTAAGAT-----TCCGTTTTGAAGATCATGCCTAATATGGTAA-TGCGAGCAAGCTCCCTTGTGCTTTACCCTAAATACCTTAATACTGTCCGAGATTCCAATAATTGTAGCTATCAAATCAAACAATATCAATGTATATTAGTGG--ATCACTTGAATTAAAAGTAAATATTGTTC
>CG33254 18902197 18902501|23828 chrX 18901455 18902316 scaffold_8 4263148 4263957 - -300|795 915
TAAACTTTAATTTAGATATATTTTTTTTTTTGTTAACTTAATGTGACTAATTTAAG-GAGTTCCCTATGCGTAAGCAATAAATAAGTTAAACTTGACTGTCAAACGAACTTTTTTTGTGTT
TATATCTTAGTTTAGGTATTGTTTTTTTTTTGTTTGGTTTTTGTTGCTGTTTTAAATAAGCTCCTTTTGC----GCAATATGAACTTTAAA--TAGCTGTCAA------TGTTATTGGCTT
>tgy 18959210 18959395|23913 chrX 18959291 18959610 scaffold_19 945348 945633 + 5802|0 104
GCAGGAGCCAGCCATTCTGCCACTTCAGCAGCAGCAATCTCAAGTCCATATCTACATATTTTCCATCCTTTTTTTTTTGTGTGTGCTTATCGTGTATTTAATATA
--ATAAGTTGACCTTTTT------------TCGGTTATCTCAGTTCC---TCAAGCTAGTTCGCAATCTTTTTTTC---------CCTATTGAATATCTAGCACA
>inx5 19002695 19002928|23958 chrX 19002092 19002733 scaffold_19 989717 990469 + 4763|759 798
ATATAAATCTATTTAAAGTCAC-GATATATTGTAAAATAT
ATTTAATTCTATTGAAACTTTCAGATTGATTCAAAGAAAT
>inx5 19002695 19002928|23959 chrX 19002745 19002871 scaffold_19 992954 993084 + 467|0 144
CGACTGCCGACTATC---AATTGACGTTGCTGTCGTTCGT------TAATTC--------GTGCCCTTTGCATATATCTAAATCTGTATATTGCATATATTTCCTCTCAATTCCTTTTAAAATT-ATGTACTTCTATGTTTTAAG
CGATAGTCAACCACCCAAACTCGCTGTGCTTAGTGTTTGTGCATAATAATACATTGCCATGTATTCTATGCACATATATAGATAGATAGATAG-ATATAT-------------CTTTTGACATTAATGTAGTCCGATCAAATGAG
>CG7556 19010934 19011218|23971 chrX 19010914 19011032 scaffold_5 4620213 4620322 + 2960|20 118
GTGTAGCGCTTATCTTATGTTTTGTACATAATTCTATATTGTAAACATCTAAATGTCGATTAATTCCTTTGCTAAGTAAACGAAATGTAAGAGGAAGTG
GTGAACCGCTTGTTTTGAATTTTGTACATACATGTATTTTATAATTATA-ATATACTTAACTATTTCTTTGCTAAGTAA--------CAAGAAAAAACA
>CG7556 19010934 19011218|23972 chrX 19011218 19012225 scaffold_5 4620812 4621838 + 47437|0 0
T
T
>CG7990 19029995 19031919|23995 chrX 19028378 19030936 scaffold_10 4295099 4297680 - 57222|1825 2837
ATAGGTAACCGAATTGCAAACCAGATTAGGAT----CAATATATTTTGCAGCAAAGGAGTTGCGTAGGTGTTTTTTTTTTGTTTTTTTTTCTTCTACACAAGAGTACTTAG-TGTAAATCGAG--AAGAGTTCAAATTGA---TATCGCTACTTGGCCAACTTTGTGCCATATGTACACAGCAGGTTCAGGCGGAAGGTTTTATTCGATAAGTAGTACGTGCTATTGCTAACCTTAATTATGATTGCGATTGTGCATTATATTTGCAGGAGATCGACGTCTTAGGTAATAACCCCGTATGTTCCCGAAAACGAGCAACGTATTTATGTA---------GCTAAGCCAATGAAACAATTGTTAATTCTCA-CACAAAAAACCAAATACAAACGGACACTCTATAAAAAAAAAATGTTATACAGATTAACAAATGCAAGCAAGCTCACGCCCACTC--ATGCGATATGTTATGCAATAGTTAAGTTGCCAGTTGCACCTCGCGATCGATCAGATATATAT-TGTATTTGAATTATTGTTAATGCTTACACGGCCTGCGTTTAGCCCACTTTAACTATATCTATACTAATGTATAACTCTGTCC--CGCTCCATTTCGATTCCCCATTTCCGATTATGTGCCTCACTCTCTCTTTCCCACACCCCCAAGAATATGTACTTCCAGT----CGCATCCGATCCGGTTGCAGACTATATTCATATATTCATATATATATATATATATGCGCTTTAT-ATAT-ACCGCTCACCGGCTAATCTTCAATTATTTTGTCCGGCAAATGGATGGTCACTTTTTAAAATGCAACTTTTTACCTTTGCATAACTTTTTAGGCGACACAACGTAAGAGAATTAATTAAAAATGAAATGCAAAACTTAACTATGAAATACATATGTAAACTTTGTAGCTTCCTAATT-GAATAAAGATAAATACA----------------ACTCACACGAATTTCGAACCA-----------------------TTT
ATATCTAACCAAATTATTAAC--GATTAGGGTTATACAATGTATATTTTA--------------TAGGTGCATTTTTTTT------TTTTCTTC-------AAATATTTAGCTGAATATTGAATCGAAAGTTCAAATTGAATATAACGTAAT------AACTTTGTACTATA----CACAGCAAG--------GAATATTTTTATTGAAA-----------------------TTAATGTAGA-----AATGTGCGTTTTCACCGGGAGAGGTGAAAAATGCAAGTAAGGCA---------TTCAGAAAATATAAATCTTGTTTATGTATTTCCTATTGTTAAAGTAAGCAAACAATTGTTATTATGCAACACAACAGAAACGACACAAAAGAAAAAT-------GAAGAAATACAATGAAAATTAAAAAAT--CAGCATCCTGTAATTAACTCTAATTTGAAAGCCTATATATTGGTAGTATTGT---TGTCAACTTGCGAACGAACGAACATATATATATATATACATATATATTTCTCCATGCG--------------------------ACATTTTTATAAATGTTGAAAACTTGCCATCAATTAATATATGTTTTCCATTT----TGTTGTACCTTATC----------------------AACTTGTCATTCGAGTGCCTCTCATCTGTTCCAACTGC----------------------------TATATAGATATGTTTTATGATATTACGAAACAAACGATAATATGTACTT---------------------GATACTTTTTAGAGTGCAACTTTTTACCTTTGCATAACTTTTTAGGCAACACAACGTAAGTAATTTAAGTCCGAATATATTTCAACA----------AAAATTGTA---AAACTTTGTAGCTTCCTAATTTGAATAAAGATTAATACATATAAATATCAATTCGATTTACCTGTCTATTGATCTAAAACAGGACTTTGGTATGACGATTCT
>CG7990 19029995 19031919|23996 chrX 19031916 19032087 scaffold_10 4299430 4299601 - 10760|0 3
ATTC
GCCC
>Ulp1 19036576 19036808|24001 chrX 19036784 19037719 scaffold_10 2151177 2152089 + 26543|0 24
GGGTTCAAGCACAAAACTACGCAAA
GGGCTCCCAAAAAAAACAAAAAAAA
>rictor 19086048 19086658|24043 chrX 19085411 19086110 scaffold_19 713390 714103 + 3876|716 778
GTTCACAATCACTTTAAAACCAAAATGAAATGAAATCAATAAACTATAAAAATTGAAAAAGTT
GTTCTTTAATATATCGTAACCAAACTCAGACAAACTCAATA------------TCAAACTGTT
>rictor 19086048 19086658|24044 chrX 19086111 19086324 scaffold_23 2176392 2176646 + -1243|0 256
TGTACCAACATATTTTATAGAAGC--------AGATCGAAAGCAAATTG--------GATAATTGCCTTGAAGCAACAAGAAACAACCACAAACC-ACCGCAATTTATTTA-------ATTAATGTACTTAAAACTAAAAGAGACCCAGTGGCAGGCGA---AAGCAAAAAGACCACACAAACCTTAAAC----------CAAGAAATTATCATTA------TTGTTGAAAACAAAGCAAGAAGCATACCGTGAATC
ATTTTTAACAAAACGTGCAACAACCGTCAATTAGATAAACCACAAATTGCCGCCTCCTAAACTTGCCTTATCGATGTTGTCAGTGCTGGCAGATCGGCTAGACTTTATATATATATATATATATACATATATATCTTAACTATACAGATCGGCCAGTTAAACAAGCATAAAACTCGCACAGTTACTAAACAAATCCGTCACAACAATTTAT--TTAAGCGCTTTGTACAAAAGAAAACGAAACACATAAATCCAACT
>rictor 19086048 19086658|24045 chrX 19086325 19088498 scaffold_10 1551463 1553726 + 48859|0 418
ACGCACTGGC---------GGAAGATCAATTGAAGTAGCCCAATGGGGACGCACTGCCT-ACTCTTAC-ATCTCGTTTACTGGCCGCCCGCCTTCC-----------TAAA--CCGAAACCAATCG--------------------------------------GATAAATGTAATATATCAAATCAAAGAACATGTAGCTACGTAGATTAAGGCAATCCGTACTATAGGAT---------TTAAGTTATTTTCGACTAGTTTGTTAAAATTAAAGTTATTACCAT----AGTTACTTTTACGATCAC---------CACTTATGCATAGTTATTTTTAAAGAAATTCATAACCG-TAAGCAGGAAACCAACAAACGACAAAAATCCCAAAAAATAATATATAATTTTCTTATGTAGCG
ACGGGAAGCCTTGTAAAATAAAGGGTGACTGTGAGAAGCTGTAAGAGATAGCCATGCCTGACTGAGACTGTCTACACTGCAGGTTATTCGGCTTCCCTTCTATGGCTTAAGTTTTTAAGCTTATCGCGTTAAGTTGTCCACAGTTTTCTTTGCATTCGCTGAGCGATTTATGTAACTTGTGCA--TATAGAATATATACATATATATGTACAATCACAACAAAAAAGAGAATACACACATCTAAATATACTTAAGCCCATAATATAAATAATATAAAAATAACTATTTTCTGTAGATTTTACAATTACAATTAATATTATTGATAAATATTTTCTTTTAATAAAATTTATTACCGTTAAGTGTGAAAC------------ATAATCCAAAAATATTATATACATTTTATTTGTATAATG
>CG32536 19108941 19109093|24069 chrX 19107365 19109529 scaffold_5 6152976 6155189 + 37330|1733 1944
TTGTAGCTGCACCAGCCCCTAGCCAACCTCACCAACC---------------------------------TCACCAGCCTCACCCACTCTGAC-------CATTCCACAACCGACCACCTGCATTCTGTTT-----CCCCTTTCTT---TTGTTCGATTTAGTTGATTG---------GCTA--CACGAAATAAATCTTGCCTTTCACTCGC
TCCTGATGGCCACAAACCGTCCTCTGCTATACGATCCATTCCATGGTCCACTTATAATTTTATTGAAAAGTCAGCACACACACACACACACACACACACATACGCTTCTAGTTACCAATTGGCCTTAGTTTAATGACCCCCATCTTAAGCTGTTCGCCCTGGTTGGCCACAATAAAACGCCAGCCACGAACGAATCTTTGCCTTTCACTCGC
>CG8028 19111193 19111379|24072 chrX 19111239 19112216 scaffold_10 2477235 2478283 - 21010|0 140
ACGGCTTCATGATCCTGTGCGCCGCTCCTTGGGTCCTCGAAGTGCTGATCGTCAAGTTTCGGAGGCGTAACAAAATCGAACGCAACAACGTTGATCACGAGGATGTTGATAACCAGGGACGTAGTGCAATGGTCCAATAAA
ACGTATTCATGGCCCTGTGCGCTGTGCCTTGGATCATTGAGGTGTTGATCGTCAAATTTCGCCGGCGCAACAAAATTGAACGCAACAATGTCTGCGAGCACGATAGTGGCAACTA-TAATGCGGTGCATTAAGCACCTAAA
>CG8034 19116457 19116663|24077 chrX 19116415 19116480 scaffold_24 1037867 1037942 - 1987|55 78
ATTAAAACTCAACATAGTTAAGAC
ATTAATCATCAACATAGTTAA---
>CG8034 19116457 19116663|24078 chrX 19116626 19116878 scaffold_10 2484968 2485238 - 12194|0 38
GCTGTAAGCCGGTGG-CAGGAGGCAATGGACACGAGATG
TATGAAGGCCAAAGATCAAGAGAGAATTAATA-GAGATG
>CG8051 19135258 19135517|24092 chrX 19134811 19137889 scaffold_10 2209671 2212864 + 90793|479 790
TCAACATACGATGGCGTAGTT--------TTACTCAGTGCCAGCGAATTCCAGGACCAACA--------------------CCGTTCCCCCATCCATCCTAAC------TTTAGCAAAATGTTATTCTTGTTATCGCATTTGCCCAGTGCTT----------------TTTTTTTTATCTGTATGTTTATGTAAACTATATTCAGCGTGTACATTGTGTATATACTTTTCGAGTGTAGCAAATTGTATTAGATATTGATAATTGTTA--AATAATATGCGTAAGCTGCCAATACTTAAACCTTAAAACAAGC
--GACGCATGCCTGCCTGCCTGCCGCCTGCCGCTTGCCGCCTGCCTGCCCACCCACCAACGCCTACTTTTATCCACCTCATCCTTTCTTCCATCCA-CATAACGTCTAGTTTAGCCATGTTTTTTGATTGTTGTCATTTTTTTATGATTATTTTATTATAATATAATCTTTTTTTTTCTTTTTTTTTTTTTTTAAATATGTTTAAAGTGTACATTTTGTATATAATT---AAATGTAGCAAATTATTTTTATGAATTATATTTACTGTTAATAATATGCGTAAGCTGTC---------CCATTCGAAATGCC
>CG8062 19144965 19145427|24100 chrX 19144385 19147185 scaffold_10 2194397 2197250 + 70246|672 1202
AAGAGGCATTCATACTAATCCGATTTGAAATTGCGACGAGTGTGAG--------CTGAAAACCTTCGTCGGAACTGAACTACTTGCTATATGTCCATCCCAGTGTGCGAGATCATGGCTAACTTGGAGCTGTAGACA---TAACCTAGTCCATACTTCCCGATTGATGTGTGCGAATAGTATTAATTGAGCGTAAAGATACCTAAGAAACATATCTCTTAACTAGCTCATAATCAC---------CCATCGCTACATAAAATTTACGGTCCATTTTTTTTTTTAGCTTTTGATACTCGTAC---TAGAATAATTGAATGT---ACTTAGTGATACGTTATAAGTGTAA------------TAATATTGTTCTGCAGTTGATAAAG-----------AAATATAT--------ATATGTATATTAGTTAGAAAAAAGTTAATGCAC-----TATTGGTAAGGTGACTTAATTGAAATACACCATATGGTTTGAACATGTG------AGTCAGCATATTTATAAAATGGGAAA
CACAAGCATCCTGACAAATAAG----GGAACTGAGCTACTTATGCGGGCCACCACTGTAAAATTGGATGAGCAGAGACCTACGTCAAATA-----GCATCGATTTGCAATACCTTGTGCAAAGTATTACCTTAAGCAATTTGAACTACCTTAAACTT-----TTCCCGTAAGCGCTTAAT-----TTAAGAATCAA-----CGATCAAGCATGATTACTTTTTTTGCCATAAGTACTTTTAGGTTTTAGCGCTGTTTTATTTTTCCAATAATGTTTTTTTTTTTTACCACGGTACT-GTACTTTTTGGAACATTGAGTATTTCACTTGGTCACATTCGGTGATTGTGAACTGAACTGAATTAACATTTATTTAATGTCCAACGAGCGATTCAACCAAATTTTATTTGATTTAATATTATTTTTAATGAGAATAAACATAGTTAGCATATTTATGTATACAATGATATTTGTTAAGTCCAGCACAAGAAGCAGGCAAGTGGATAGAAGATATAATATCTAGCACAACATATG
>nAcRalpha-18C 19163284 19163657|24126 chrX 19163127 19163718 scaffold_14 1294541 1295066 + -2663|188 569
TTCCCGTAAGCGAAGGAGCGATGCTGGGAAAAGCGGGGAAAAGCGGGAAAAGT--------GGAAAATAGGTGGAGAAATGGAGCGGAAAGTGACAGGTGCTGGTCGGCCAGAGGAGTTTTGCGGTTGTATTGTGAAATATATGAAGCCAATCAAAATATTAGGAACAGAAGAGAACACAAATTCAACAGCCCGAATCTAAGCTTTTCAAACTGAAATACTTTGACAGTCAAAGAGTTTTGCTATTCAACATTTTTATACTTTTAAAGATGTGTCTGATGGTTATAAAAATATTACAATGAATTGAGATAGTAACGTATGTACGTATGTGAATGCATTTTGTATTGAAAACAAAAAAAGAAAACAAAAAAAAAACACCAAAA
TACGCATATACGAC----CCATGCT-GTATATGTGGGGATGCCTAGTTAAGTTCTTTTCCAAAACAACAAATAGAGAA----------------------------------------------GCTGCTTTGCAAAAAAGCAAAAAAAAATAAATAAATTAAAAAAATTGTTAATTACATTTTTA--AGTCAAAGTATAAGAAACGCAAGCGAAAAAATGCTAGAAAAGCAAGAG--------------------ACACACTCAAGAAAATTTCACATAT-----GAAATGTAAAATTTAATAACACAATTCGTGTGTGTAC-----TAAACAAATATTTTATGAAAATGAAAAACAAAAAACAAAAAAAAAAAACAAAAC
>nAcRalpha-18C 19163727 19163870|24127 chrX 19163719 19164198 scaffold_48 46909 47297 - 16625|8 151
CTCAAAAAAGAGGACGAAACAAGCGACATTACGCGAGATTGGAAATTTGCTGCCATGGTCGTCGATCGTTTGTGCCTTATTATTTTCACCTTGTTTACTATTATAGCAACCCTCGCTGTACTCTTCTCAGCGCCGCATTTCATT
CTGAAAAAGGAGGACGAGACAGGCGACATAACGCGGGATTGGAAATTCGCGGCCATGGTCGTGGATCGTTTGTGCCTTATTATTTTCACGCTTTTCACAATTATAGCCACTCTGGCGGTATTGTTTTCGGCACCACACTTCATT
>nAcRalpha-18C 19164038 19164191|24127 chrX 19163719 19164198 scaffold_48 46909 47297 - 16625|319 481
GCAAGGGGATGACGGCAGCGTGGGACCCGTGGGACCAGCTGGTCCAGTTGTGGACGGG---------CGTTTGCACGAGGCCATTTCCCACACCTGTCTGACATCCTCTGCGGAGTACGAACTGGCGCTGATACTCAAGGAGCTGCGTTGGATAACAGAACAG
GCAAGGCGACGATGGCAGCGTGGGTCCGGTGGGTCCCGTGGGACCTGTCGCCGCCGTGGCCGATTCACGCATGCACGAGGCCATTTCACACACTTGTCTCAGCTCCTCGGCGGAGTATGAGCTGGCGCTGATACTCAAGGAGCTGCGCTGGATAACCGATCAG
>nAcRalpha-18C 19165189 19165305|24129 chrX 19165157 19166458 scaffold_48 51482 52875 - 29340|32 148
ATCCTCCAAGTCTCTGCTGGCCAATGTGCTCGATATAGACGATGATTTCCGATGCAATCATCGATGTGCCAGCGCGACTTTGCCCCACCAGCCCACATATTACAGGACGATGTACAG
ATCCTCTAAATCGCTGCTCGCAAACGTACTCGACATAGACGACGACTTTCGTTGCAATCATCGTTGCGCCAGTGCCACATTGCCCCATCAGCCCACGTACTACAGGACAATGTTCAG
>nAcRalpha-18C 19165425 19165579|24129 chrX 19165157 19166458 scaffold_48 51482 52875 - 29340|318 472
ATAAGAGTAATATTCCTTTATTGGTTACCTTGCATATTGCGCATGCAAAGACCCGGACAGGTTGGCTACGAATGTCCGCCGCCGCCCTCTTCTTCGAGTTCCTCCGCATCCGGCGAGAAGAAGCAACAGATCCAAAACGTTGAGCTCAAGGAGAG
ATAAGAGTAATATTCCTTTATTGGTTACCTTGCATATTGCGCATGCAAAGACCCGGACAGGTTGGCTACGAATGCCCGCCGCCGCCCTCGTCGTCGGGCTCCTCGAATGCTGGTGACAAAAAGCAACAGATACAAAACGTTGAGCTTAAGGAAAG
>nAcRalpha-18C 19174440 19174526|24144 chrX 19174189 19174556 scaffold_48 61398 61769 - 7327|276 362
GAGTTACAATTCTATTATCGCTTACAGTCTTCCTCAACATGGTGGCCGAAACAATGCCGGCGACCTCCGATGCGGTACCGCTGCTCG
GAGTTACTATTTTACTATCGCTCACAGTCTTCCTGAACATGGTAGCGGAAACGATGCCAGCGACATCCGATGCAGTGCCGCTGCTTG
>nAcRalpha-18C 19176219 19176331|24148 chrX 19175774 19176318 scaffold_48 64329 64945 - 21110|541 640
AGATCTACTTCGTGCATTTCCCAGTTGGACCTGCAGTTGCAGGACGAAGCTGGTGGCGACATTTCTAGCTTTATAACCAATGGCGAATGGGACTTGTTAG
ATATTTGTTTGATTTTATTTACAGCTGGACCTACAATTACAGGATGAAGCTGGCGGCGACATCTCCAGTTTCATAACAAATGGCGAATGGGACTTGTTAG
>CG12204 19327211 19327344|24321 chrX 19325410 19327244 scaffold_2110 703 2522 - 43366|1941 1974
AGATAATGAACAAAGCAAAAAAAAAATCAGATAA
AGGCGAAAAAAAAAGCAATTAAATTATTAGAAAG
>CG12204 19327211 19327344|24322 chrX 19327292 19327586 scaffold_17958 340 643 + -1280|0 55
AGCGGCATGTGATGGTGCCGCTTCCATTGGCAGCGAA---ACTGGTGGCCATTACA
ACCAAGCGCTCCCGCTCCCGATCCCGCTCCCCGCGCAGTCACAGGCGCACACAATA
>l(1)G0156 19353052 19353223|24353 chrX 19352881 19354244 scaffold_392 4 1340 + 61447|180 367
ACGACGGATCACGGACCATCCGCATAAGCTGTAGCAAGTAT-CGCCAACCATAACAACAACCGA---TGAGAACAGAGCAGAGAATTACGCCAGGAATATTGCGCAGAGAAGGAGGATGA-TGCAGTATGAACAACAGCAATTAAACACTCGC--CCCAAACCA---------AAAAAAAAAAAAAAA
ATT--------CGGCCCA------------GCAGCCAGTACACGCCGACGCAGTCGTTCACAGAGTGTTTAAACAGAAGCAACAGCAACAACAACAACTGGAATCAGAGACGCAGCTTGACTGCGTTAGATGCAACA------AGACACTCGCTACTCAAACCAAATAGCAACAACAACAACAAAAAC
>CG12231 19365001 19365006|24363 chrX 19364993 19365558 scaffold_36 861968 862542 + 15172|8 13
TCTTAT
CCTTGT
>CG32532 19365949 19367100|24364 chrX 19365754 19366307 scaffold_36 442216 442854 - 9394|215 669
ATGCGGCAACTCTTTGGTTGCTTCTACCGACTT--------------------TTCATTGCCTGCTCACTACTCACTAAT-ATAGCTTACTCAACATACGACGTACATATAGCAACTCCTGCTCCCACTCCCCACTGACCCACTCCCTACTGACCCACTGCATCCCGGACCCACCACTACCACCGCCAACCGACCACCATAGACCCGAAATGCACAGAAATCCAAAGCAGGCAAATCCGCAAGCCGAACCCAAACGAATTAAACTACAAACTT---------TCTAACTAATTCAAGGTGTGTCAAACTAATTATAAGATGATTTTTTTTAGCTAAGCAATGCATTAAC--GAGTTATATTTAAAAA-------TAATTAGAAATCAAACCAAAAGC---------------------------------------------------------G
ATATAACGAGTCTCGGCTCAGTCTTACAGTCTCCCAGATGAAACGAGTTGCGGTTCACTCGCTACTCGCTACTTGCTACTCGTCACTAGCTTATCAAGCCAC--------AGTTTCTTTTAAATTCAAACCACAAGTAACGAGTCCTAATTGTGCTACAAAATCAC--ACTCGCCACT-----CGTCACTCG----TTACTTACTAATTAAGCGCAAAAAACAAAA-----CAAAAACCAATACCAAAAAAAAAAAAAATACACCCAAAGCGTACACGTCGTTCGAACTATTTAAACTTGTGT-AAACTAATTGTAAGTGGATTTTTTTTAGCTAAGCAATGCATAAACCGAAGTTAAATTTAATAATTAATTCTAAACGAAAACTAAACCAAAACCAAAATGCAAAATGCGAAACGATCGATGCAACAACTACAACCAAAATACAACTACAAAA
>CG32532 19365949 19367100|24365 chrX 19366405 19366776 scaffold_36 442957 443320 - 5233|0 435
ATTTACTCATAAGACTTGTTGATATTAT-TCTGTTTTTTC--------------TTTTTTTTTTTTTTTTTTGGACAACCAGATCCAAATCGAATAATAATGGGGTAAAGGTAATTCGTAAAGGTAGAGATATGGGATGGTACATAGAGCCAGAGTCGGAGCTAAACAAATGCGAATGGAAGTGGATTATGTAATAGGCAACTAGTCATAGTAACTAAGC-AAATTGTGTATTGAGATTTTATCGTGGCATTATAA------AAAGTAAAAGTAAACGCGCGCATCAGGCGCATATATAA---------------------ATTTAAATAAATATACTAAA------------------ATATGTACTAGCGATAGCATAAGTCAGGTTGCT-TGGCCC-CTTCCCA-ATGGCAGACGTGGAAGATGTGGAAAACG
ATGTACTTGTAAGACTTGTTGATATTTTGTCTGTGTATTCAATATATATATATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAG----------------------------------------------------------TGGGTTTTTTCATAAGCCCTGAA---AAAATAAACAAAT-CGTACTTAAGCATATT--GTAATAGGCAACTAGTCGTAGTTACTAAGCGAAATTGTGTATTGAGATTTTAGCGTGACATTATAATTAAAAAAAAAAAAAAGAAACAAACAAAAAAGGAAAATGCATAAGAAAATGGAAAAGCAAAGAAAAATGAAATTATTGTATCATATGCATAAGCACATAACCTATGTATACTACACAATATATAAATCAGTTTGCGATGGCGCGCTTAGCATAAGACAGAT--------TGTTAATAACG
>CG32532 19365949 19367100|24366 chrX 19366920 19367211 scaffold_36 443577 443872 - 13274|0 187
TCAAAGACCTTTGACGACTTCTTTTAAAAGATCGC-GCCCTAATGGCCCTTT--TTGGGGCGCGGTGTTTTAGGATGGAGTGCGTCAATCGATGTCCACCAGCAGCAGTCACAAATCTCTCTGTCTATATCTATGCATATATATATATATATCACTGTATATA-CATAT---GTACATAGTATATATA
TCAAAAACCTTTGACGACTTCTTTTAAAAGATCGCAATTCCAATTTTTTTGCCATTGGATTGCGATCATTTAAGAGCGAGTGCGTCAA---ATGGGCAACAGCTATACATATATATATATATATATACATCGACATATATATATATATATGTTTATATATATATCGTATATCGTATATCGTATATATA
>Grip84 19395277 19395513|24415 chrX 19395423 19395765 scaffold_36 490434 490764 - 11813|0 92
GCCAGCACGTCTAGAGGAAAGGATGTGGATGTGGATGTGGATGTGGACGTGGAAACGGAAACGGAAAAGACAAG--AACAAAGTATTAGATAA
TTCTGCA--------------AAAACTAATATCAAAACAAATGAAGAAGAACAAAACAAGTAAAAAAAGACAAGCAAATCGAGTATTAAATCA
>Tao-1 19405085 19405517|24424 chrX 19404599 19406203 scaffold_26 1885584 1887475 + 38138|751 1263
CATAGACAACAACAATGCCAACCCCC------------------------------------------------------------ACAACAAGTGTTTAGTAATATGAACTACTTCAATTTTAATGGAAATTATAAAGCCAACAGTGCGAC------AGCAACAACTAGAGCCCGACACAAGCAACAGAAATCGCCGCTAAGACATCAATAGAGCAGCAAAAACAATAGCAGCAGAAACAGTCATGGCTAGCTAGCAATGTTTTTGTAGGAACTA-GAAAGAAGACACACGACACACAACCCAAAACACACATGCGTGCGATCAATTATCGGATTGGTTGCTTAGGAAAACATGAGAACCCAAGTATTTTCTAAAAGTTACAACAAGCTAAAGCTGCAATAGTTTTGTATTAAAGGA-----AACTCGATCGGAGGTGGCAACAA--------GATACTAACATTTGAAACCATTTAATACAAGATCAATCAAAAACAAAGAAAAAAACAAA
CATAGGCAACAACAACAGCAACACCTACAACAACAACAGCAACATAAACAGCAACAACAAACACTGCAACAACAAGAACAACAACAACAACAACCATATAGTAATATAAACTATTATAATTTTAATGCAAATTTTAAAACAAACACTGCAACAAAAGTAACAACAAACAGAGCCGGACACAAACAACTATAACAGCAACAATTACA--AATAATATAACAATAAT-----------AAATATATATATATATATATCGATTTATATATATATAATACAAAAGCATGCGTGTAGCA-GCACCCGAAAATAAACA-----ACAACAAATTAATATAACTAAAGGAAAACAAAACAAAAAAAAAGAAACAGCATCAGAAATTTTCCAACTGCT---GCTGTAATAATTTTGTACTCAAACGTAATCAATTCAAGCAAAAACAACAACAACACCACATAATAATAA-ATTTAACAAAAGTTAAAACAAAATCAAACAAGCAAAAATATAAATATATA
>CG14220 19434245 19434411|24455 chrX 19434182 19434510 scaffold_25 1261657 1261965 + 5206|77 247
CTCCGCCGTCGGGCCGGGCGTCTCCACATCACGCCCGCCCCGTTTCCTCGGTCAAGAGACGTACTTTCATAAAATTATTGATACAGACGTAGCACTAGATTAGGTGTACATTTT-TCTAAACGAGTATTGCACATTGTAAATAAT---GAAACCACAATTATTTTGTATAC
T------------CCACATATATCAAGAATATGCC---------GCATATATATATATATATATTTAAATGATATACCATTTAC-------GCTTTAGCTTAAGTGTACATTTTATTTAAACAA---------ATTGTATATAATTGAGAAATTGCTTTAGTTTTCCAGTC
>CG12788 19450600 19450846|24475 chrX 19449533 19450764 scaffold_25 1278662 1279885 + 18639|1137 1314
ACGCTTTCTTGGCATTA--AAACTAGATTTATTTA---TCAAAAAATACAAGT-----TAATCTAATGGAGCC---ACCTCAGACCACCTTCACCTGGCTGACGTCCCGCTTCTCGATCATGCGCATCTGTTTCTTCTTCATGCGCTTCAGCTTGGCGGGATTCTTGATGACCTGGAC
ACGTTTCCATCACATTACAAAACTAGATTTATTTAGGGTGCAAAAAAATAAGTAAACGTAAGCTAAGGTATTTCTGAAGTTAGACCACTTTAACTTGGCTAAGATCCCGTTTCTCGATCATGCGCATCTGCTTCTTCTTCATACGCTTCAGCTTGGCCGGATTCTTGATGACTTGGAC
>CG12788 19450600 19450846|24476 chrX 19450784 19452488 scaffold_25 1280136 1281819 + 32668|0 78
GCTAAGATAAGCTAAATT------CGTTTGTATGCCACACAATTGTGTA----------CGTAGCGACCTAAATACATA
TCTAAAGGAAAATAAGCTTTAAACTGTTCGTATG-TACATATTTACATAATTTCTACAGTGTAGTACATTAAACAAAAA
>CG14222 19455383 19455587|24479 chrX 19455550 19455832 scaffold_25 474367 474631 + 3981|0 37
ATCACAATGCGCGAGCTGCGCAGACAAATGCGACACGA
ATAACAATGCGCGAATTGCGCCACCAAATGCGGCACGA
>CG14222 19455714 19456109|24479 chrX 19455550 19455832 scaffold_25 474367 474631 + 3981|176 297
TCCGTTACCAAATT--CAGCACAAATTCTCGATAATTCTAT-TGACTTTGAAATTATTTAAAGATTTCGTAAGCCGATGCGTAAATAACCACAAACACAAAGATTGTTCCACAGTTCTGAAG
TCCGTTGTTATGTTAATAATACTTATTATATATATTTCTATATGACTTTGTTATCAGTTTTAAAAATGACAAGCCGAT-TGTAACTA---------------------CTGAACTTC--AAG
>CG14222 19455714 19456109|24480 chrX 19455963 19456227 scaffold_25 474893 475184 + 8746|0 184
TACGATATCAACCCAGTAGCGCCCGAAAACGCATTTATGTCTAACTAATC------CCGATCCACCATTTGAAATGGGCGCGAG--CGCA-TCACTTCGCAGC-------CCATT------GAATTCTAGTTAATT----------------TAGCAATGTAAATAACCCATAATCCCGTGATCT
---GATATCCACCCAATACTGCCCGCATTCGCATTTATGTTTAACTGAACATCATGATAATTTACCATATACGATTGGCACAAAATTGCATTCAGTTCGGCGCCGTGCTGCCGTTCTTCCAAAATTTTAGTTAATCAATTATCAAGCAACAACAGCAAAAAAAATTGTATCTAATCCGGAGTTCT
>l(1)G0084 19461886 19462035|24487 chrX 19461578 19463053 scaffold_25 1919875 1921477 + 23623|357 568
GTGGGGGTCATACGTTA--TTGTGCCAAGCGTACTCTAA---CGGACTT--ATAGTAAG--CGCCGGACGCGCCGCCCC-----TTTTACCAAGCCGCCTC---CAAAGTGGTCGTAACCACAGAGC----------ACAGCCGCCATCCCAAAAAAAGAAAA-----------------------------------TAAGAAAAAAAAAA
GTGGGGGTTATACGTTATGTGATGCCAAGCGCACTTTAAGTGCGGACTTAGATAGTAAGTCCGCGGGTCGCCCCCCCCCCCCAGTCCCCCTCATCCCCCTCCCTCACACCTACCAATCCCTCAGATCCAATCCTAAGCCAGCAGCTCTGCCTAAAAGAGCAAACCCCTCCTATACCTCTACCCCACACATCTACCCACCACACACCTACACA
>Arp11 19478465 19478606|24501 chrX 19478436 19478939 scaffold_25 925673 926218 - 17219|29 207
-CTCGAGGGCAGTCCCGGAAGATGGAAATATGTACGC----TTCGGCGCTTTACTGGTTACGCGTACTA---ACATACTCTTGAT----TATTATTCTGTAATAT------------------ATAGGTATTAAATATTTACG--------AAATATAGGCTAACGAGCTTTAAACAAA
TCTATCTATCATATATACAATATATATACACACACGCAGATTTTATTTCAAAATTGCATTCATGTATTATATATATACTCTTTATATACTATTAAATTGTCATAGGCTAAAAGTGAACTCCGAGTAGGAAAAAATTGCATACGAGTATAAAAAATGTATCATATTGCGCTTAAAGCTAC
>Ranbp21 19480521 19481511|24504 chrX 19480520 19481094 scaffold_25 1138151 1138875 + 406|1 762
CCCCCAGTTTCTGGAG--GAAAATGGTGACTCGTGACTTGTTA----------CTGCTTTGTTATTTATTATT-CGAAATTTGTTAAACTTGTTTGCTCAAAG---------GAACTACTAGAATCGCTA--------------------------------------------------GTTAGCAATACTCCGGCCCACAACCGTCAATCCGCAATCCTTAGCCCTCGTCCTATGGCCCCAGGTCCCAGGTGCTTCGCAGAGACGCCAGAAGACCATTTTATACATAGTT------AATTAATTA-ATTATTTAATGAATTGTGCTTTCCTC-GTTTTGTATAGTT--------ACCTATGCGCAGGCATAA------------------TGTAATTTATATAATTGTACACATTTATCATTTGAAGGAATAT---------------------------------TTCTGAAATTACGCTTAGGTT------------TAGTTGAT-AGGCAAAAGTTATTATTATATAATACATCAAATTGTATATGATCACACATCC---------------------------------CGCACCGCGAATGCATCATGCATTATGCAGTATAATAATTATAGCCCAAAAACACACCAGGATACTAAGAAAACATAATGAAATCGAAGCGGTCGACCGTGCAAAAACACAAATCGAAATAAG---ATAAAGCAGATAAATTTGAAATAAATTTAAAAATTCAAAGT
CATCCATTTTCGGCAGTCGAGGCATGCAGTTTTTCACTTGTTAGGCGCCACAGCAGCTTTGTTATTTATTGTTCCGAAATTTGTT-AATTATTTTGCACAAAACACGAAAACGACAAACGAAAACCGATAACCGAATACAAAACAAGAATCAAAAACCAAAATTAAAAATAGTTAAGAACGTCAACAAAACTACAAACAACAACAACAA--CAACAATA---------------ACAATAACAAACACCAAGTTAATGCTCGAAAAGCAATAAGATCGTCTCA-GCATAGTTCAGCCCAATTTTTTATACCATATAATAGCCAACAAAATATTCAAATTTGTATATTCGAAAGAAAAACAAAACAAAAACAAAAAAAAAACGAAGAATGCCCTTTAAAGAATAATATTGTATACATATTGTATTTATATATATATATTTATGCATATATATATATATATATATGGATATTTTCAAGTAATATTGAAATTACGCTTAGGGTTTAGTTAATAAGACAGGAGTTATTATTATATAATATG-CATCTTGTATATGGACACACACACACACAAACACAAACACACACACACACATCGGGATACAATGCGAGTATATTTTACAATATTCAAACTGA-AATTATATTTTTAAAGTGAATAAAACGAGAGAAACAAAAAAACAAAAACGAA-------------CACGAAAATAAACTGAAATAAAAACACAATACAAAAATAGTTAAAAAAA----AAAAACACAAAGT
>Ranbp21 19480521 19481511|24505 chrX 19481159 19481212 scaffold_25 1138976 1139046 + 812|0 70
TACAGTTATTAAT---------TTATTTATTTTA----ACAACTAAATTTTAAGCGTACC----CGCAATG
TACATATATTAACTTTTTGCTATTATTTATTGTGTAACACATCTAACGTTTAAGTTCCTCCAGGCGCACTG
>Ranbp21 19480521 19481511|24506 chrX 19481262 19485258 scaffold_25 1139108 1143100 + 210995|0 276
CACGGAGCGCAGCGGAAG-----CAGAAAACGAGATAC----------ACAAACGAACAGGAACAGGATAGGAG------AAGCAGGAGGAGGCGTCGCAGCGGAGGCGGCGCCACCAGTGACACCACCTCTGTCCTGGTCGAGGACCGGGATCAGGAGCATGTCGAGACCACGGCCACCTCAGCTGCCAAACTAG----CGACGACTGAACTGAATGTAACTGTAAATTAGCTTAGACGATGAGTTC--GCACTTTTTCTCGCCCTTGTCCAAGAC
CAGGAGGCGGCGGAGGAGCCGTCCCGATGCCGCCGTGCCGCCGCGGCGACGACTGAACATAAATTAATTGTAAACTAGTTAAGCAGCAGCTGCCGCAGC--CGGAGCCGGAGCCG-----------------GAGCTGGTGACGCAGCCGGAATAGGAGCTGGT----GCCGGAGCCGGTGCCGCTGACGGAGTCGGAGCCAGAGACTGGGTCTGCGTCTGCCCCAAAATAGTTGCAGCCACGATTTCTGGCGGTGCTTCCAAGGCTTGCCACAGAC
>dome 19509994 19510475|24527 chrX 19510473 19511868 scaffold_25 1170570 1171869 + 15965|0 2
GAT
GCT
>Mer 19524525 19524768|24542 chrX 19524761 19526895 scaffold_25 1186364 1188543 + 124642|0 7
CCTCCTCC
CGAACTCC
>CG14231 19534007 19534380|24550 chrX 19532954 19534154 scaffold_25 1193477 1194688 + 8942|1189 1345
GCCAGATAATCAAAAT--ATAGTTTATAGTAATGGAAA---AGCTTTGCCTCCACCTGTTGGCCACTTTTC----CAGGAACGTAATAACTGATATGACGACAGGTCTTTATCACGCGAATCGATATAGAAATAAACAACCACAAATGAATCACAAA
TCCAGAATATATATATACATAGTTTA----GGCGGAAACGGAGCTATCTGTCTTTATGCTGGATTCGTGTCGTGTCTGG---GTAAAAAAT----TGCCAACTG----TTGCCTTAAGGAATGAGAATTCAAGCCTCAAAGCTGAGTGACTTAAAGA
>CG14231 19534007 19534380|24551 chrX 19534181 19537298 scaffold_25 1194720 1198017 + 96391|0 200
TCACTAGCCCCTGTTGTGTTTTATACATTCTTACATAAAGTTACAGATGAATCCTTGTTCGTTGTTGAATCCTGTTTGTCTGATTTACAAATTAATAATATATTCATAATATTTTTGAGTGTGTGAGTTCTTTGGCGCTGCAGAGTTCCTACTTGCTAAGAGCCACCTT-GCTAGCTCTGGTGGCTTCCGAGATCTCGACG
CCCAGAAGCACGACTATA-TCAACAAGCTCCTAT-CCAAGCCGTAGCTAAATCTGTTATCAAAACTAGGCAAAACCAAACCAATTT--CAATTAAAATTGCAGAGATCA----TTTGAATGCGCGGATC------TACTAAGGATTTGACACACCCAAGCAGGAGCATTGGCTCGAGCCGTTAAGCACAGCAGTCTGGACG
>CG14232 19535919 19536190|24551 chrX 19534181 19537298 scaffold_25 1194720 1198017 + 96391|1825 2161
GAGGCCAAAATGTAT-------TTACTTAC-------CACTAACTTAGATGAATCC---TATCTCCGTACGAACGGCTAATGTGCAAG-------------------------TCCGGAATA--ATCTGTATGTGCGTGTGCGTGAG-GTTTTGGTTTTACGTGTGCGTTG--CTGCAATTCCGGGAA-----------ACAAGCGGCGGGAAAAGACCA---TGCCGATTTCA----GACTAAACCAATATTATTTATTATTTAGTTGTAACCGACGAAGACAAGTCCAAAATTCAATTTGAAACTAATAAACAATATAAAGACAACTGTAAATAA
G-GCCAAAAATGTCCAACTGGATTACTTACTAGCGTGCACAGACATATATATATATATATATATATATATGTACATGCATAGTCCAAGAAACTAGACATATATTCTAAGAATTTCAGCAATGCGATGTGTGTGTGCGTGTGTGTGTGTGTTGTGGCTCGGCTCGTATTGTGGGCTGTGTATGCAGAAATTTGCATATGCACAACAATTTAGAAAACTTCACTTTTCCATTTGCAAAATGATTAAATCAATATTATTTATTATATAGTT-------------------------TTCAAAATAAAACATAAATAAAATACATGTGTATGTGTAACGTG
>meso18E 19540335 19540809|24554 chrX 19540367 19540454 scaffold_25 1202560 1202667 + 3975|0 107
TTGGAGCTGCAACGGGGCTCAAATGCATTTGTGCAGTAAC----TAAAGCACAAACATTTCAT----------------TTTTTTTTTTTGTAATCTAGATGAATACA
TTGGAGCTAAAATGGGGCTCAAATGCATTTGTGCAGGAACATATTAATATGTATGTATGTTATGTATACATCGAATATATTTTTTTTTTTTTAATTTAGTTAAATACA
>meso18E 19540335 19540809|24555 chrX 19540619 19541548 scaffold_25 1203120 1203901 + 23622|0 191
AATATAATGCATCCACTACTCGCTAGATCTACTTAAGACTTCTACCTACATACATATATATATATATAACCCTTCCCTACCGCCACTCCTCTCACCGGATGGCGGCAGAGGATACAGTGCCAAAGAAGAGCCATGTCTCGAATTTCAGTTGAGA-TTGCCATTTTTACTTAGAGAGCCTACACAAGTGCTTA
ACAAAGATCCA-------------AAATGTAATGGAGAAATGTAC--------------------------------------------------------------------GCAGTGCCAAAGACGAGCCATGTCTCGGAATCTATATGAGATTTGCAACGTTTACTTA-ATAGCC----CAAGTGCTTA
>CG14235 19574479 19574843|24599 chrX 19573784 19574575 scaffold_36 530197 530923 - 1075|739 843
TTGATTCTTGGTCCTGCCGTTGCTGGCCGAACTGGCATCCGAATCAGATCGACGCCACGCCA--------CTGTATTCCGATGTGTTATTATTAATAAACAATTA
TTGCCTTTGGGGCTCGCTGC----GGTCGGACTGACAGCCAACTCTGGGAATGGCTATGACAAATAATTGTCGCGATTCGATATGTTTATCCGTGGAAGAAACTT
>CG14235 19574479 19574843|24600 chrX 19574596 19575463 scaffold_36 532218 533098 - 22800|0 247
GCTGCGCCAGAGACGCAGCAACACAGTAAACCCAGCAATCCAGCACCCAAACACACAGGACACGATCGATGGACGGACGGAGGTAGAGGAGCGTGGTAACCAGAATCCGGCAATTGCAACAGAGACTAGTTTGTGTTTGTGCTTTCCCCAGCGGTGAATGCAGACCATCATCGGCAAATACAAAAAAAAAAATACACAAATGTTCAATTACTTGAATTCTGAACCGATCGTTTGTGTTTGTTTCTTCT
GC----------------CCACAT------CCCACACATCTAGCATTCAATACAACA----ACAACCAAACAACAACAACAAATACAACAA----------------CAACAACAACAACAGCGACTAAATTATGCTAGTTAAT-----ATCGTTTAGGGCAGGCAA--ATTAACAAATATAAACAAAAATTGTTACAA---TCCAAAACAAAAAAAACCTGGTCGGTCGTTTGTTTCTTCTTCTTCT
>CG12702 19593105 19593307|24614 chrX 19592252 19593223 scaffold_28 1473781 1474911 - 29041|996 1167
TTTTTTCATATTTATATACATTTATTGCGTCTTGCACTGTATAATGCAATACATTATTGCCG---TGCAAG-----------------------------GTTCCATTCCAA-TTCCAATTCAACCAAAAATACAAAACATTTG--------------------AATAAGCC
TTTTTTTTTATATATACATTTTAATGCAAGCATTAACAATACAATGCAATTGTTTGTTGCTGAAGTGCAAGTGAAAAAAAAAATAAGAAACATCAAGTACATTGTATTACAAATTCCAATTAAACCGAAAAGA-AATGTATATGGGGTGGGGGGAAACAGAAATAATATATT
>CG12702 19593105 19593307|24615 chrX 19593305 19596128 scaffold_28 1475788 1478599 - 109653|0 2
TAC
TCC
>CG12701 19609924 19611432|24639 chrX 19609792 19610903 scaffold_28 1495967 1497184 - 5549|173 1327
ATTAATCCATTCATTCCTGTA-ATTTGTAGTGAGTTTGCCATATGTATGTGTGAAACGATTGAAAGACAGCCAGAATTCCTAATTGTTGTAGCAGCAAATTATTTAATTTTATT---------TGTATGTTAAAATTGTATTATTATTAT-----------------TTGTACTATTTGC-------GCATAACG----------------CTCCTTATTTGTAAGGCCTTATGATTA----CGTGTAAACCTAAACCATCAAGTATACCTCAGCAAACAGCAGTCC-------ACGAAACGCT---------------------TTAAATCAGGGCG------------CATATGATTATACA------------------TATATAGAGATATATAGATATTTATACATATTCCATTTTACATGTGTAA-------------------ACACTAGTTTTAGCACATTTTTTTTTGCTGTATTTTAATTTGTAACCTGTTTTAACTATTATTTGATTATTGATTA---------------TGTTTTGTAATCGGGAGG--AACGAACAACACACGAATGCCATATACACGATATGTAAACTAAAAATCAGCAACTATATGCCAATTGATATATATATATATACATATATATATATATATATATACTATATCTAGTTACTAGACCAACGCATTGCATCACGCATATAATATATATGTTAGCCTTAAAAACGCCAAATTGTCTGTCATAGCAAAAGGAAGCAAAAGCAAAAGCAAAAGCAAAAGCAAAAGCAAAAGCA-------GAAGCAGAAGCAAAT-GCAAATGGAAAAACCAA-----GCAAGAAAATGCGAAATCAGGGATATTATTATGTTTCTA-AGCCACAAACGCACGCACCTGTTCGCGTATTATTATACCTACA-TATATATGTATTTATTACGTTTAGTTGCCCCTAACTTATGTTCCAC------------CAATAATAAAACCAATTGTAATTATTTAACATTTTCATTTGATACCCATTTCTAGACTCCCAGCATCTTGTTTGTAATTATTATTATTTACCTTATTTGTTAACCAATTCGATGCTTATCCTCCTTGGCACGCCCACAATTTTTTTTCAATCACAAATATAAAACAAAACC
ATTCAACTATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAGATATATATTTTTTG-----TATTCGAAATTCCTAATTGTTGTAGCAGCAA---ATTTAATTTAATGACAAACAAATCTATGTT-AAATTGTATTATTATTATTAATTATGAATTAATTATTGTATTATTTCTTGTCCTAGTATTTTGTAGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGTTTGTATAATTTAGTTTTTAAGGCCGCGCATACCTCAAAGA-CAAGTAGAGAAAAGTAAAGAAAAGAATCGAAAAGAAAAAACGCTTAAAGAATGCAACACAAAAACTCAAATCAGGGCAGAACCATATATCTATATGTCTATATATCTCTCTCTCTCTCTCTCTATATATATATATATATATATATATATATATG-TATATGATAACTGTAACATTATAGGCAACTATCGTATATCGATCTACGGAGATTTGTTAGCGC-ACAATTTAGTTGATTGTTCATTTTTTTTTTTATTTTTTTTTTAATTAATTTAAATAAGTTGTTGTTTTTCTGTCAGCCTGTAAACCATAAACACACGAATGCCATATATA-AATGTGTA--------------------ATGCCAATTGATATATAGCTATATAC---TATATATATACATATATAC-ATATCCATATACATAGGTAACAC---------------------------TAGCCTACAAAACGCCAAATTGTC------AGCAAAAAGAG--AAAAACAAAA-CAAAAACGCAAATATCAGGGATAATATTTACACTTAACAGTTACAATTCTCATATATAGACACAGACGTATATATATATATGTATATATAGAAAATTTATTGACTATATATATATATATATGTATATATGTGTGTGTGTGGAAAT-TGCGTATATTATATATATATTTATTATTATTAATT---TCTAATTTATGCATTTCTTTTGTAAGCCACAAAAAT-AAACGAAAAATAATCCATTTATATTTATATATTTTTTCGTTTT-------------AATTTTTTTATAAGCTACAAAATTGATCATTTTTGTATA----------ATTTTGCCTTAAAGTAATACTCAAAAC---------AAAACAAAAAAATAACCGAAAC
>CG12701 19609924 19611432|24640 chrX 19610929 19611251 scaffold_28 1497200 1497493 - -1467|0 342
CCTGTTCGGGTCAGCTTGGGGTTGTTCC---------GATTCAGTTTTAACGAGTTTC---GCCCGTGCTCGTTAAGAAAAACACACTTTGTTGCT--TGGCAGGCAATAATTCGCTGTTTTTGCCGTTTCCCTTGTTAAAT--TTATTTG--TTTTTTTTTTTGTATTTTTTTTTTTATTGTATTCTCTGGGGGGGGATAAACACAAAAGTACTTAGAATTGATCGCAAAGCCGCAGCATTTCAATAACTTAGACAGCAGGCCGGCCACTC--CTTGTCTCGTATCATCATATCATCCATCGTATCATTGTAAGATCGCAACGAAATGCCGAACTGCCAATG
ACTTTTGGTAACAACTTTTGATTGCACCAGCGGCAATAAATTGTTATTAATTTGTTTTTTATTTTGTGACATTTTTGAAAGTTTTCTTATTTTACTTGTGTTGTGTAACAAATTTGTATTG----CACTTGCAGCAATAAATTGTTGTTCGCCTGTTTTTTTTTTTATTTTTTTTTTTTTTGGTTTTT-----------------------------GCATT-ATTTCATAATCAAAGCCTTTAGCCTTTGCAGACA------CGCCCACTCAGCACAGCTGTAATTAACAGAACTTTTGCCATAT---------ATGAGAAGGAAACACAAAACAAAAAATA
>CG12701 19609924 19611432|24641 chrX 19611287 19613705 scaffold_28 1497529 1500077 - 67931|0 145
ATGAGTGGGCAGGCCACTGGGTTCTGGGTTTTGAAATGCTCCTAGGCTTTGAGCTTGTCTGGGGGATCTGGGGAACGGAGGATCAGCGGTTTAGCGGTTTAGCGGATCACGGGATTATCGGCGGGCAACTGAGCGCGGCTTGGGCT
AGGCAGGGG--GGCCACGGGCT--AGGGCATAGCTACAAATATAGTGCAGGGGCGGGTACGGGGAATGTGGGGCTTTGGGTG-----GGTCTTGGGTCTTACAAGGGCTGGGGCTTGTC----TGCAAATGCTCGAGGCTTTGATT
>amn 19720045 19720886|24771 chrX 19720187 19720579 scaffold_16 893272 893673 - 392|0 427
AAACAATGAAAATATTCTAGCTCGCTTTGATCTTTTAATGTGTGTATAATGTATTAGTACGTGTACTTTAGTCAAAGAACTATGCACAAATACCGGTTGAACTTTTTTTGGGTATGGAAAAGCAACCG-----------CATGTGAGCGAAAAGAATGTT--------TGGGGATTGAAGGCG---------TGATATTGGGCGGAGTGGCCAAAACATTGGCAAGGG----AGCCATCAGCATCAGCATCCAC---ATCCACATTCACATCCACATCATCGCCAGCGTCGAGAGCTCTTTCGATCGAAATAAATTCGAATCGAGTGCGATTCGTCAACAAGGCGAAGATAAAGATTTCAGAGCAATAGAACAGAAAATCAATGTTATTCAATCAAAAGCCAATGCAAAATTGCTTTGCACTCTGGCA
AAGCAATGGGAATATGCAGGC-AGACACATTCAGGTAATGTGGTCGTAACAGTTTTGGTCATGTTTTTTTATGAGAAAATTATGCAGAAAGTTCGGTAAA----CTCCTGGGCAAGGAGCAGTAGCCGACGCCTGCTGCTGTGGCCCCGTCAAAAAGGCTGCAACAAATGCAAAATTAATGCGGCACCTCCATTAAAACCAGCGGCGCGGCATAAA-----GCAAGCGGCACAGACATCATCAT-AACGTGCACGCGGCCCAAGCTCATTTAGCCGCCGT--TCAGCTATGGAAATATTATTTAT--AAGCCAAGTCAAAGCAGTTACCTTTTCGGAAAAACGTGAACATC----------AGCAAAAAAAAAAAATATATATA-TATATAATAAAAAAAAAATTAAGGAAGGCTTAGCCCTTGGTCA
>amn 19720045 19720886|24772 chrX 19720635 19720823 scaffold_25 141757 141937 - 1029|0 191
TATAATCCGCATTTTTTGCGAACTCTAAACTCGAGTCTATCAGCTATAATATTACAATTCGTTCACTATAAACAAATAAACTAATATAATTTTGCTCAGAAATCGATGCACTATGATGAGAG---AATAGTGAAAAACAATTCTCAGTTAATAGCTTTTAAACTGCTCTGCAAATGGGAAAACAAATTAAAA
TATAAAGTGCAGTTTTTCAATTGAAAAAATTAGAGTTTATAAAATA----ATTTGAATGTGTT-ACTTTTCAAACTTAAACTTTTCAAGCTT------AATCTTTATGCATTTTTATAAAAATAAAATAGGCAAATTTAAGCTTCCCTCAACTTTGGCAACACTGCTTTACTCAAGGGAAAACAAAAAAAAA
>D2R 19838619 19840955|24872 chrX 19838589 19839554 scaffold_10 1924801 1925905 - 682|30 1201
TTTGGTCCCTGATTTCAACAGCCGTCCTTTTAACTGTTTCTATGTGACAAATAATTGATAGGTAATTAATTACTCGAACGTGTGTAGTA-GTTTATAAAACGAT----------TCCATTTATTGTGTACCTAGAC-----GTAAGCAGTGACCCGGCTCAAATTTCCATAAAACCCCGTAGTTAACTCGC-----------------------------------------GGAAAAGCTCAACG-GTTTTTATACTTTCC---------------TAAGAACTCCACTACAATATACGCGTTAACTTCAGTGTGTGTGTGTGTTTGAGTCTGTTT-------------------------GTGTGTGTGTGTGTGAGTGGGTGATTGGTTGTTTTTTTTTCGAAAGAATAAAACCCTA-----GGCGATAAAA------------------------------CTAGACTAAGACTATGCAAAACAGTTCAACTTTCAGATCAGT--GCGAAATGCTCCTAAGTTAAGTTCTTCCAAAGAAAACGCTTATTAATTATAGCTAATTG--------GTAAATTTGCAATTCGAACTA-----ACTATTTATACAATACATACACCAAC---ATAGGCCACACACTACAACACATTAGAGTTGATTTATCAAAATTGTAGC------------------------------------CTGAGTTTTCGAGTCGTTGAA------------------------------------TTGTTGTC----TGTTATTACGTTACGTTGTGAATGGGATATAGCATACATATAGGGTCCCCGGAGATCTCTCTACCAATAA-----AGCATATATACGAGTTTGTAAGATAACTGGGGTGTAAGCGAAAATGAAAA---AAAAAAAACTGAGATGAAACTGAGAACTATTTTAAAGAGAGGCGAAAATCGGTTTTTTTTTTCTAGAAAATATATGAGAATTATTAACTAAATGAAACGTAGGCTAAGCTCTCAGAAAAGCAAACTATTTCAAAAATAATTATCATAGCTTACGGAAAT-AATAATAGCGAATAACAACATTAAACTAATGGTACAGAATAGTATGCGTCAGCATAAGAATACATCAAATAAATAAAGCAAAACTGAAAATATTTCAAG
TTTGGTCCCCGATTTCAATAACCGTCCTCTCCGTTGTTTCTATGTGACAAATAATGTAAAAATCAATAAAAAGTCAAACATTAAAAAAATATTTAAAAAATGGTAAACTAAAAATATACATTTTAAGTACTTAGTCCTCGAGTAAGGCATACATACGCAGAGAATTACATTTGAACATGTATGT-ACTCGCATGTAGGCAAAACGTTTCCATCGTAATAATGGAACCTTATGGGAAAAGCTCAAAACATTTTTATACTTTTCCATACAGAAATAAGATAAGGAAACCA----AATAGAAAATTTAATGAAAATAAAGGTGTTTTTTT---TTTTTTTAATCTTAGCAAAAAATAATCCTAAAATACTCGAGATTCTTAAAGGGGCGTTATGTGTGTTAGTTT-AATAGATCAAAGCACTCAAAATGGCAAGAAAAAGTGTGGCTGCACGAGTGAAAATCAACAATTTCAAAAAAAACAAAGAAAAGCAGAAACATAAACGGAGCATCCAATCGAATGCT--TTAGTTAAGCTCTTCCAAAGAAAACGCTTATTAGTTATAGAAAAGTGGAATGGTCGGAGAGTTTCGGTTTTAAACAGGCACACAAATTATATGATTGATAGATGGAATGGATATGCCAC-----ATAAAAGATTCGAGCTGGGTAATGTTAATCATCATTAAGTAAGTACATTATATAGATACTTGCGAGTGTTATTGGGTTTTCAATTTGTTTAAATTTGTCTATATAAATCAATTAACCAATTGTTACATTTGTTTTCTAATTGTTACAACGTCAGTACATAAGTATTTAAGATCATACTCTTAAGGACCTTCCACATTATCATGACCATGATTATGACCATAACCATGATTATG-ATTATAATT---GTGTAATATGTAATGCAACCTTAAAGGCAACTGCAATGACAAAGAGGCTAAAGCAAAATA---GTGAAAA---------TTTCTC------ATATAACAAAAGACCTAAGTA--------GTACAGTAAGACCACAATAAAAAGCAC---------AACAATTAACAT------TAAAAATAAATAAAGGCAAATAAATAAATCGAG------------------------------------AAATAAAAAAGAATAGACAAAACTGAAACTATTTTAAA
>D2R 19838619 19840955|24873 chrX 19839573 19840143 scaffold_10 1926231 1926907 - 1036|0 699
ACAGAATT---GCATCCAACTTAACAGA---GTAACACGCCAACACACACGAACAGACACAATGAATCAAATGAGCCCCACAAATGAATACGATAAT----------------GAGGGGCACCGACCTCGATGAAAGTCCCGCTTAGAGGACA-CTTTCAGTTCGACTTTCGG--------------TTTGATATATAGTCGTACAGGATATACTCGTATA------------------TACTATATAGAAGCATTTAAGATCCAGAGGTCGTACCTAGGCTAGTCACTTGATCTAGATC---------------AAATATACTCACCACCCA---TATATATATATATATATATATATATACGTATATATAAATC-----------AGATAGTACCAAGGGGAGCCTG-----GATGCATAGCAGGGAGTAG---------------------GGGGGAGAATCAGGGTATCTAGAGCAAAGGCTATCGCATTGCTGGAAGCAATATGAGG-----------------GTTACCT-TAGCAAATAGAGTAGCTAATATCGATGTAAGCGTACTTGTATAGTGGAATATCAAAACTGAGTTTTGAAACACGGACCAAAGCCTGTGTCCTGCCGCAAATGAGAGCTGTACTTGGATGCAC-AGTGGCATGGCCCCGGGCAATCCGAACCGATTTTGGCATG
ACAGAAGTACAGCATGAAACTTGACAAACAGGCAACAAATACACGCACACATACACGCACACTGTAACAAATGAGCCCCAAACAAAAAAAAAAAAATATAAAAACATATTTAAAAACGGCGCTGAATT---TGACTCTACTGCTTGAAACACATCCTTGGGTTGTATTCTCAAAGAATGACAGATTCTACAAAATATATCCATGTGGGAGACATACATAAAAATAAAAAATGTCATTAGTAAAATGTAAGAGCATTTAAAA---------CTAGCTTAAGCCACTTGTTTAATAACGTTCTATGTAAGTGCGCGAAAAAATACTCATTCAGTATTTTTTGTATGGACATGTCTAGACATATACCCATAAGATAAGCACTGGAAGAAAAAATATTAATAATAATAATCTAAAGCTAATACGTACTAAAAAATGGTACTTAAAAAGAATTATACCATAAGTTGCATCAGGGTATCTAAAGCGTAGGCGTACAAATTACTAGAGATAAGCACAAGCTAGCGCATAATTTCTATTTACCTATAGAAAAAAATACATATACCAAACTAGCTAAGGAACTTTAATAG-----CATGAAAACTT-GATTTGAAACCTGGACCGAAATACTCGCCCATTAAAAAACAGATGCCGT-CTTAAATTTGCTTATGCTGTAGTGCCATGTG----GAACTGGCTTTGGAACG
>D2R 19838619 19840955|24874 chrX 19840626 19840746 scaffold_10 1927827 1927955 - 2468|0 133
TTATGTAAATAGATCTGTACATACCAC--TAAACTACATACA------TACATAT-----ATGCTATGTGGAGCATGAACGGTGGATTGCAAGCTGTAGGCTAGGTACAATTTTTAACAATTACATTAAGCAAA
TTATGTATATAGCTCTGTAAATAACGTCTTAAATTTGATCCAATCTGTTATATGTCTTGTATTCTATTGTAGTTATACGTTAAGTACTCTGAGCTGTAGGCTAGGCACAAATTTTAA-----ACATTTAGCTAA
>D2R 19838619 19840955|24875 chrX 19840747 19840911 scaffold_13 2415464 2415671 - -2115|0 214
CAATTGGATGATGGGTCCCTTGTGGAATGGATTAAAGCCCGGGAGAGGATGGCAAAGTGTGCCAAATGGAGGCCATCGTTGCAGC--AGAGATCTC----AATTGGGCTCC-------------------AGTTTCGTTTCGTTTGTCGTTCGTT------------------------GCGTTTCCCAATAGCTTTAAGGTTCTAC-TAGCTAC
CAGT---ATGGTGAGCCGCCCTCACAGCGGGTCATG--CTGGGCGATGA--GCGACATGGAGCGCGCGAGAGCTTCCTGTGAAGTCAATGGATCCCTGTATACTTGGCTCCTTAAATTTATATAAATGTTAATGTATGTATATGTGTTGTTCTCTATACGGATAGGCCAAAACTAACTAGTGTCTACAGCTTGGTTTCCCCTTCCACACAAATAC
>D2R 19838619 19840955|24876 chrX 19840914 19841705 scaffold_10 1928282 1929143 - 38311|0 41
TTATCAACGGCGAGCACGTCACCAGCAATAGTTATAGCAATA
TTATTAACAATACCAACAACAACAACAACAACAACAACAACA
>Rab35 19990412 19991519|25052 chrX 19989029 19990841 scaffold_10 2123199 2125024 - 6026|1517 2006
AGTTTAAAATTTAAAAACGAAAG----------CTCTGATCTGCCGA---CTATCAATCGCGAAAGACACGTTTTGAATGAATCTGAAATTTTATTTGCTTGGAGTGATGC---TTTTAAACATTTCGTTGCTCTCGGAAACTGC-CTTACTTGTTAAGATTTCATTTGA-----TATTATTGCCGCCATTCCGTGATTGATTTAACTGGATAAACTAAAGAACTTCAGGGACT---GTTTCCAATTCTTTTGGATGTGCTTGCTTAAAATGAAAAACCTGAAACTGTCAGCCAATATGATT--------TCCAATGCAAATTTTCTGAAGAGAAATAGTTGTAGGTAATGTTTGTATCTATTCGAAAACCG-----GGGAACCAATACTCCAATTCTCTGATATTATATA----CATACATTACA----TATGTACCCTCAGAAA--------GAATAAAGATTGATC---TTTGGA---AAAACACGA
AGCCGACAAATTGAGAACAAATGTATCTGGTTTTTATCATTTACCTATCGCTGGCATTCGCCATGGAACGTTTTTACACGCAGACTAACATATATCAACTCAATATTGTATAAAATTAAAACATATTTTTAC-----ATAGTTGCGACTATTTTTCTACAGTTCAGTTAGGTGATCTTTGTGGCAACTACATCGATATAGAATTAACTCCACAAAC-----AGTTTCAGAAACCCGAGAAGCCAACTACTTTTGCTAT--TTGACGCCCATGTAACACATTTCACTACCCATTTAGTTGAATAATTAACATTTATTATTAATTTTATTTTCGTGACT--CTGTAAATTA-ATTTGCAATTGTTTTCGAAACGCCAATTAGATATGATACTGATATTACGTAATATTGTATATGAGCGTATTTTATATTTTTATATAGACCTATAAATCAAAGTCGTATAAATATTTGTTGTGTTTCAACACCAAATATAA
>Rab35 19990412 19991519|25053 chrX 19990883 19990955 scaffold_10 2125066 2125144 - 1018|0 78
TAAGCTACGAA------ACACATTTATAGAAATATATAAATATATATACATAGATATACATATGTGGGGAGATCAAATT
TAAACAAAAAACAAATTGCATATTTATACAAGAATATATTTATATTTAAAAACGGAAACAAAACAAAGAAAATTGTATT
>Rab35 19990412 19991519|25054 chrX 19991006 19992262 scaffold_10 2125181 2126215 - 35314|0 520
AAGCGGCTCCGGCACGGGAGCTGGCATTGCAACTGGACCGACGGCGACGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGGACGGGAATTGGAACTGAAATTAGGACCAGGACCTGGATCAACTTCGGGGGCGGACGGAATCGTTGTGGGGGCGCGTAGTTTGTAGGGTTCTTGGCTTACGATTCGACACAGACACTCACTCACATAGACATAGCTAACACCACCAAACAACCAACAACAAGAAACCACACAAAG-CAAACAACACGAGACAACTGAACAACACTCACACCCACTAGAGACAACAATTTTTTTTGTTTTGTTTTTTTTTTTCCTCCTCAGTTTTATTCGGAATAATGCCAGATAGCCGTAAATTAAAGTGTAAAAGTGTAAAGCGCAATTAAATGTATTTAGCAATTTATATACATATTA-----ATATATACATACATAAACAAAATTGAAACAAATTGCATATTTATATACAAGAATATATTTATATTTCAAACGGAAAAT-TGTATTTACAATAACA
AAGCGA---------------------------------------------AGTCGTGGCAGCAGCAATAGGATG------------------------------TGGATGAA---------------GATACGTTGTGGGGGCGCGTAGTAC---AGGTTCAT------------AAGGCAAACACTCAAACATATACAC---------------------------ACAGAAACTTATACACAGATAGACAAACATATGTAGCTTACACACACATACACATGCACAAGACA--AATTTTTTGTTTTTTTTTTTTTTTGTT---------------------TAATGCCTCAGAGCCGTTAA--------AAGATGTGTAAAGCGCAATTAAATGTATTTAGCAATTTATATACATATTATACACATACATATATATATGTATATATATATATGTATATACATATAAATATATATATATATATATATATGTTAATGTATATATATATATTTATATATATA
>CG9576 19994290 19994854|25058 chrX 19993804 19994327 scaffold_3 2873360 2873847 + 660|520 557
AAAATGAAATAAATAAAATTAAAATATTTGAAAAATAA
AAAACAATTTCAATAATAATTACATTTTTATATTATTA
>CG9576 19994290 19994854|25059 chrX 19994328 19994525 scaffold_23 62234 62413 + 1140|0 207
CTTTCCACACGTATAAATAACTTGTATACATATTTACTTTAAGTAGCTGTAGACATTATTTTCCCCATCTGACTTTCTTTTCAGCAGCTCGCAGTGCCTACATTATTTCAATTACTCTAAGCATTACATTTTTTTGACTAGCGATCTAA---GAATCCCTGAATCCAGTATCTGTATCAAGAAT-------CCCAGTATCTGAACGCT
CTCTGCGAATATACACGTAACATATATACATATATACTATACATATGTATTATCATTTCTAT-----TCTGATT------------GTTCGCCATCTCCAGATTG-----------CTGAGCGTCGCCTGCAAGTCCCTGATTATATCATTCGGATCGATGTGCTCTATGGCTGTATCATCCATTAATGTGCTCAGTATCAGATCGCT
>CG9581 20001728 20001832|25063 chrX 20000871 20002665 scaffold_36 413055 414893 + 76300|874 1003
GAGCTCACAACGAAAACCAAATTCCTAGTCATAAGCCTTTCATTCTCCCGACAACC--TTATGAGCTGATTTGGGTCCTAAA-----------------------GTAAAGGCAGATGCTGTATTTATAA
----TCACGGCTGCCCCAAAATTCCTAGTCATAATTTACTTCCAACTTTTATAACCAATTGTGATCAGATCACGCGCATAACTCCTCCGATCGCCCAGGGCCCATGTACATACACGATAGGTAGTACGAA
>AnnX 20005127 20005273|25067 chrX 20004810 20005345 scaffold_36 417626 418371 + 10649|482 678
GCCCGAGGATGTGGC----AGCTGGTCCGC----CCAATATTTTATTCGTGTTAAT-AGCTTTGATCGTAGT-------GTGCCTTTT----AGGAAAATCGCTTTTAATGTCGTCTGCG--------CATGCGC---ACACT------GTTGGCAATAAATAA-----------ACGCATATAGCAGC--AGTTGT
GC---AAAACCTGGCCAAAAGCAAATCAACTATACGAAATTATCATAGATGCTATTTAGCC--AATTATAGTATTTACGGTGTCCTTTGCGCAGGATGCTCGCTTTTAATGTTTGTGGCAATAAATTACACACGCTAAACACTAAACCAGTTGCTACTACAAAATTTATCAACTTAAACATTTAACAATCAATTTGC
>Sdic:CG9580 20007894 20008270|25071 chrX 20007961 20008250 scaffold_36 421547 421750 + 689|0 289
ATACCACTTTTGCTAAGCTTACAGGATCGTCCTAGAACAAAATTTAAGTTGTATTTTTGGGATCCCGCTACTGTATAGAACCCAGAACTCAAAACTCAATTGCAGTCCAAGTGCTCAGAATCACTTAAAAGTCGCCAAGAAATCAGGGGAAACTGCAACATTCTCTACTTGACAGAATATAGACAAACATACATACATATGTACATATATATATACATAAGAATAGAACTACCCGCATATTTGATTGGTAATCCATTGTTTGTTTTAGTAGAGCCCAAATGTAAATGTAT
ATCCCA--------ACGTTTACAGAATTA---CAGAACA---------------------GAGCACGTTTTCGTCTAAG----------CAAAAATC-GTTGGTGTGCA----------------------TTGCCAAAGGATGTGGGTGGGGGGCG------TATACTT----ATATATATATATATATATATATATATCTATACATATTTATATATATATATATAAATGTGCTCCAATTT---------TCCATTGATTGTGTTA--AGAGCTTGGCTTTAATTTTGT
>CG17068 20059026 20059591|25114 chrX 20058993 20060009 scaffold_36 442513 443483 + 20592|33 614
ATGCGGAGCAATATGAGTTCGTTAGTTTAGGTCTCCT---TCCTTGTATTTCCGATGTGATAGTCTTTGGTTGGCGTCATTGGCCATGGAAATTATTTGATCTGTACGATTATATTTCCCCTTCTCCTAGTTCCAAAATGGGAACTAATTGTGCATAGTTTTTACATCACTTACCATGTGTGTGTGTATGGATTGTTTGTGTTCCTTATCTGTTTTGGATCGCCAAGCAAATGACTAGAAATGAACATCGCA------TTTCTGGTCAGCAATGGCTAATGCAACTGCAATTGTTGCATTATGTTTGTACAGGTTTATTGCCAAGTTCAATTTGTTCTGAAACGCTGTAGCCAATTATGCATTTCTTTTTTTTTGCATGCTTGATTTTAGCTGCCTAATGATAATGATTATCCAAACGTCCCTCTCAACGAACACCACTTAAATGTTTTTCTTCCAAAAGTAATATTTTTGAGCTTAGGTTTTGTAGAGCAACAAGCAAATATTTTAAGA-----TTTACACAAGACTAAATTGGTAT-ATTTCAATTTAATAAAACATATT-TAATATATTTCCTAATGCC
--TCGACACAAAGCGA-TCCATGAATTTCGATGTGATAGACTATTATTATTATTATACGTGTGTTTTTTTTTTTCGATTTCAACAGTGAAACCTGCC---ACGGTACGACTTGACGCCTTTTTTTCTTCTTCTTAGATTTGTAGCCCGCTTTTTTTTTTTCTTTATAAATAAATAATATATATATTTCTCGAT--TTTGAGTTAACGATAAGTTAAGCCTTGCCAAGTTTGGGCCTTTTCA--AGCGTTTCAGCTCATTTTTTAGCAAGAAGTTTTCGAAGATTATGCAACTTT----TTGAGTTTATTAAGATTCTGGGCCTTGATAATTGGACTCAGAATCAGGTTTTCAGAAAGTGAAGTATTTTCAATGTGTAAAATCTATACAAGTTGCCATATATCAAGTTTGCTGTAGCTGTCGCTTGTA-------------------------------------ATTTTCGAG-TTAGGCTT--------GAAAAACCCTTGTCTTAAAATCGATTTTTCTTATCGATATATCGATATAAATGCTATGCGATATAATATGCTATAGGAGAAT--CTGCAGCC
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CGCATCGAATGTGCAACTGTTGCAATTGTTTTTATTTACCTGATGCAGGATGCAGGATTCTACACCGAAGATTCTCCAAATAAATTGTTAAACTTATACATTCCAATTGAAGGAGCTTGAGATTCTTGTGAGTGCAGCCAAGGATGTTCAAATGAATTGTTTAACGATGATTGTTTGCCATTTGAAATAAGGAATCACTCACTGGTTTA
CTA---------GCAACAACTAAACCC----------------------ATACCACACTCCATACC-CAGCCCCTCCCATCCATTCGCCCCAC-CATCCACTTAACGCAAATTGGCTGTTTGTTCTTTT--ATGTTGTTGTTGTTGTT-------GTTGTT--------GTTGTTTTTTGTTT-------------CTTTATTGGATTA
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TTGCTAAAACTTAAATTTG
TTTC--AATTTTTAATATG
>Syx16 20203010 20203123|25314 chrX 20203010 20204359 scaffold_36 642757 644168 + 61327|0 123
TTGCCCAC-------GCGCCTCCAGTGGGCCGACCTCATTCCCGTCATTCGCTGTGTGTGTT---TGTGTATATTGTAAATGTTTGAATACATGTTATTATATTTATTATTTATTGCTAATGCT
TATCTTACTGAAATAGTAGCCCCAGCCAGCAG---TTATTCCC--CCTTTTATGTGTAGTTTCCGTGTGTATATTGTAATTGTCT-AATGTAAAATA-TATATGTTTTATTTATTTATAACGAT
>Pp4-19C 20231763 20232540|25333 chrX 20232369 20232535 scaffold_2 1301357 1301508 + 145|0 180
TTCCGTTCCTGACAATCCGGTGGAACGGAGTCGGCACAG-GATGCGGGTGCCGACTGGTAGCTTACATAAATCATCTAGGGAATAGAAATAGAAACTG-------------CCAGCCTGCAAAAGCGAAGCGAACGCGAATAGCAACTGATGGTGTAAAACAAAAAATATGTAACATAAAC
TTTTGCGC----------------------TCGGCACCGAAATGCAGCTTACAAC-----ATTTACACACATTATTACATAAAAAAAAAAAGAAAAAGTTTAAAAAAAAATCAACCACAAAAAAAAAAAACAAAAACACAAAAAAAATAA--ACAAAAAGCAAAAAGTATGTATGGCAAGC
>Pp4-19C 20231763 20232540|25334 chrX 20232536 20233528 scaffold_25 1358486 1359508 - 67626|0 4
GACGC
AATGC
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ACGAGCTGCCACTGAAAACTCACACGGCCGCCTGCAAAACGCTTCTAAGGGCTCGGGCCAACAAGGGTTAAGGTT--------GGGATTCAGTTTCAAAACACAT----TCTTATTAGTTTAATGC-CTGTATGAAAACAGCCCTATTTTGATGATTTGCTAATTTACATTTGAA-GCTCCTAGAGT----------TTCTGAGAAATTAAAGTGGATTGGAATATTTTAAACATCTT
ATGAGTTGCCGCTTAAGACGCACAACGCCGCCTGCAAAACAATGCTGCGTGCACGCGCCGTCAAAGGTTGAGCTTCCATTCAGAAAATTCAGAAATTAACTACATGAAATCCTGTTAACATTTTACATTCTAAGGAAACTCTTATGTAAAAACGTTTTTTGCATTTAAATTTTAACGTTTCAAAAATCGCATTGCCGTTATTATCGCTCGGGTTGGGTTCAAATATCGATAACATTTT
>CG11710 20238476 20238622|25338 chrX 20237324 20239374 scaffold_5 4131480 4133593 + 48272|1254 1400
GCTGCGTCCACGTGGACAGTTGTCTGCCGCAAGAGGAGTACCGAGAGCTATATCCCAACGGAGAATCGGAGAGTCCTTATGTCTTTGTCTGCACCAAGCCGGAGCAGCTGAATATTCTACTGCCCGTCCACGGCGATCACAAGATAT
GCTGTGTGAATGTGGAGAGCTGTTTGCCCCAGGAGGAATACCGTGATCTCTATCCCCAGGGCGAATCCGACAGTCCCTATGTGTTTGTGTGCAGCAAACCGGAACAGTTGCCACTGCTGCTGCCAGTGCAGGGCGAGCACAAGATCT
>RhoGAP19D 20282305 20282709|25389 chrX 20282219 20282421 scaffold_1 5355150 5355340 + 1350|86 206
ACAAGAGTATTAACGAAAGGTTTAATATATAACCAAAAGGCATAATGAGAAGATATTT----AACAATAGTCTGTTAAACACACAAAAGCTAAACACACCTTTAAAAAAAAACAAAAAAAA
ACAAAACCACTTATAAACAATTCGAATTATTAC------ATTTATTAGAAATATATTTTGATAGTATTAGTTCATTACATCTGTA-----TATTTGTATCCTTTTAAAAAAAAAAAAAAAC
>RhoGAP19D 20282305 20282709|25390 chrX 20282709 20286609 scaffold_5 2542705 2546473 - 150922|0 0
A
A
>Tak1 20326581 20326976|25443 chrX 20326607 20328505 scaffold_5 4027019 4028798 + 18708|0 422
TCTCGTGCGCTGCCGATTCGATCGATCGACTCTCTATGTCTTATAGGCTAGTACTCTACTTTAATCCGC---AATATGTTATATGTTATCTGTAATCTGTAATCCAATATTCGTAGTCTGTATCTGTACGATTAAC--------------------------------CATAGCACTT--------------TGTTTATTTCTATATCTATGACTATTTCGTTGTAATCGTTTTTTGTTTAAGTCTAAGCGT---ATTCAGTCCGTGTTTCTTTTAATTTAGCGAACAATTGT-TTCGATCCATTAGCAGTCTCGCAAGCTTCGTTTAGGTTTTAATATTATGATTAAGCTTAAAACACACTTAGCATTAGCACATGTATCTGTTCGAGGAAGCTGACAAGGAGTAGACCAAAAAAATATAAA
-CTCTCTCATGGTTGCTCTG-------GAATCTATGTGACCAATAGCCGTGTACTTCCATTTGTTCAACTTTAATAACTTAATTTTTAACTCTAAT---TATAGCAATAACTGTAACATGTAACTGTAACTGTAACTGTTCTTAAGTTAAGGCTCCTTTTATTTTAGACATAGCTCCTAGATCTGATCTACATATATATATATATATATATTAACGTATATATATATATATGTCTTAGCGACGCCTAAGCGCTTAGTTTTAGCCGTGTTGCTT---GTTTCACGTATATATGTATTTACTATGAGAGTAGTCTAGTGTTATGCATGTGCATATGTATGTGACGATATA-------------TTATGATGTCCATATGTGTATAT--------GATGACAA-ACGCTTACCAAAAATATATAAA
>CG32504 20343111 20343326|25456 chrX 20342823 20343210 scaffold_5 4067637 4068062 - 3962|346 464
CCAATTTGATAGTAACTCTTCCAAGATACCCCAAGA--CACGTTTGTTTCACGTTTCGAGCACAAAATCCATAAAAA------AGCTACTCGACAAAAACGACAAGCT-----------
CCAATTCGA----ATTTGTTCAAACACAAGTGAAGAAATACATTTGTT---AGCGAAAAAAACATAATCCATAAAAATAAGAAAGCTAAGTG-CAAAAAGTGCAAACTTTCTGGACTGG
>shakB 20581938 20583449|25804 chrX 20581372 20583499 scaffold_5 4361333 4363878 - 40862|641 2636
GTTAGTGCGTCGTGACGCTATTGAAATAATCGTTCGTCGTTCAAAGATGGGCGATTGGTTTTTGTTGTATTTACTAGGTGAAAACATAGATACAGTTATATTTCGTGATGTTGTACAGGACTTAGCGAATCGTTTAGGACATAACCAACACCACAGGGTGCCTGGCTTAAAAGGTGAAATACAGGATGCATGATATTGGGAGTATTAGAAACAATACAAAATGCAATTTGTCGTCTCCATTTAAAAACCATCGAATTCAATAACAAAAATGTCGAAAGCAAGAAAAAGATTAAGAAAGGACAATTACAACCACAAAGGAATCTAGAGATCTTCGCAGCAGCCGCTTCATTAAAACTTACAACTCAACACACCGCTAAAAAATCTTTAAAAAAAAAACGTATCTCAAAAATACAACCAAAAAAACTATCGTCAGC---------TCGCAGTCAGTCATAAATCAGCATTA---TCAACCTTGGAGACTAAGTC--TATCGATAGTCGGTACAAACACATCCAAAGCCACAGGACATAGAATACAACATAGAAAAATGGAAGCGGAATGAAAGCATGGAGAAATATGGAAAAATAGGAAAGCATTAA---CAGCCACGCAACGAA----------------------AGGAATTACTAAAAATTCA----------ATACCAATCAATTAATGTAACGTAAATGAGAAAATGGATATCA----------------------------------------AATAATCAAGAG-------ATCGAGAATGGAAGTCCTGGGACTTCCGGA-----------------------CAGGACACCCAAGCCGGTGGCAAGTAGCGCCTGCCGTCGGCCAGGGGTCACAAGGTCACAAGTCACAAGGGATCGCTTAGGAAATTAGCGATCAGCGACCCATAGAAGTGTTGCCCCAAGGACAAGATCAAAGTGTGAG----------------GAGAACAGCA---------------------------AATGGACAGCACCGGCAACGGAAACA------------------------------------------------------------ACAGACAGATACGCACACACACAGACGACGCCACACATACGCTTACAG-------------------------------------------CGACATCAC-----------------------TCATACG-CCCCGTAGAA-----CACATCG------------------CACTTTGCTTGTCATGCAGCGTTAACTAAACCAAACATCAACAAAGTCGAGACGACGCCCGCGG--AAAATTGCATTTCTGTATTAACCCCAAGAGTATAGAAGAGGAAGAATCGAAAATCAGCATCACTTTCACCGAGAAAAAGCG-----------------AAGTACCATACAAACGAGATGCTAAAACAAC-GCAACA-----------------------------AGACGGGGAAAG------AAAAGCCTCCCCGCTTT---------------------------------------GAAAATGCAGCAAATGAAAGTCAAGGAAATCGCAGTGGAAGTGGCAGAGGAGAGTAA---------------CAGTTTAATTAAA-------TTAAATTCAATTCAATTAAATTAAATTACTTATT-----------AAAATGATATCTTGAAGTGTTCATGTATTCGAAAGTAGGTTAACTAAGTCAAACATACAAGTAATTCTA---------------CATATATGTAT---AATATATATATTATATATATACATATATATATATATATATATATATATAAA------TTTTTTTTTTAACTCTAAGCATTTGTATTACCCGCTAAACAA---------------------ATGAACAACAAAACATAACGAAAAAAAAAACCTAGAAAAAAAAACCAAAAAAAGCAAA
GTTAGTGCGTCGTGACGCTATTGAAATAATCGTTCGTCGTTCCAAGATGGGCGATTGGTTTTTGTTGTATTTATTAGGTGAAAATATAGATACAGTTATATTTCGTGATGTTGTACAGGATTTAGCAAATCGTTTAGGACATAACCAACACCACAGGGTGCCTGGATTAAAAGGTGAAATACAGGATGCATGATATTGGGAGTATTAGAAACAATACAAAATGCAATATGTCGTCTCTATATAAAAA----------CAACAACATCAACATTCAA--------------CTACTTAGTACAACAACAACAGCA-------------------GCAGCAACCGCTTCAT--AAGTTCAAAATAAAAC-----------------TCAAAAAAAAAACGTATCTTACAAATACAACCAAAAAAACTATCGTCAATGCTAACACATCGAAGTCATTT-TCAATCAACAAGAGAGTAAAGCACAGAGGC-ACCTCAATACCGATAA-CGATACCGATAACGACAAAGATA-ACGACAAAGATAACGATAAAGATAAA---GATCAACATTAAGATAAAGATAAAGAT--AATGATAAGATATCAATAGACCCAACCACACAACGAATGAAAGCGGACTAAGCCGAACCAGAACTAACATAAAGGTCAAAAGTAAAGGAAACGAATCAACCAACAAAAGAAAAACTCAACAACGAACATTAAAGGCAGATCGAAAAGATGATAATATTGATAGGAATTATTAACAATCACGAGCAGCAGCAGCGGGAAACGGAGTTTGGGTGCAGCTGCAGCTAGTCAGCTCAGCCAGCGCCCAAGGACATCGCAAGCAGTTGCACGTGGCGCCTGCAACTGTGGGCATGCCCCATGGATTCAAGTCAAAAAG------TTATAAAA-----------------ATAGAAGTTG---CCCAGGGACAAGGACAAAGTGTGTGCAAGAACCAACAAGGAAAGAACAACACAAAGACAAAAGAAACGAAAGGAAAAGAATGGAAAGGA-AAGCAGAGGAAACAACGCTCTCTCTCTCTCTCTCACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACATACAAACACACACTCTTAACAAACATAAATAGAAACTTCACAGCACACCAACATCGCACACACCATTTACGCGGAATTACTCATACGCCCCCGTAGACGCCATCACATCGCACACTCAACCTGCTCCTCACTTTGCTTGTCATGCAGC----AACATAACAAACACCAACGAAGTCGAGACGACGCCCGCGAATATAATTGCATTTCTGTATTAACAACCA----ACAAAACAAGAACAAC-----ATTAGCAGCAGCAGCGGCAACAACAACTGCAGCTGCAATCACTCGAAAGCATCACGAACAGCAGCAACAACAACAACAACAACAACACCATCAGCTGCAACTGTTTCAAGCATAGAAAGAGAAAGGTAGCTAAAAGGCTCGTCTCTCGTCTAGTAGAAAAAAAATATAAGTGAATATAAAAAACAAAAAAAAAACAACAAAAAAAATTAAAATAGAACGAGTT--AAGCGAAAGAAAAGAATAAAAAGATGCAAAAAAGCAGGAAAAAAAAAACAAAAGTTAGTTTAAATTCAATTCAATTAAATCACTTATTAAAACAAAACAAAAATGATATCTTGAAGTGTTCATGTATTCGAATGTAGGTTAACTAAGTACAGCATATTAATAATTCTAAATATAAAACCTACTCATATATACATACAAATGCGTATATGGTATGCGTATACATATATATATATATATATAAATATAAACAATTTTTTTTTTTATAATTCTAAGCATTTGTATTACCCGCTAAAAGAAAAAAACAGAACAAAAATTATATAAAAATTAAAACGAAACAAAAAAAAAACACAAAACAAACAATACAAATACAAAAAA
>shakB 20583828 20584006|25805 chrX 20583822 20585689 scaffold_5 4363879 4365539 - 29342|6 184
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GTGGAAAAACACGACGCCATTTGCATTTTACCATTAAATGTTGTTAATGAGAAAATTTACATTTTCCTTTGGTTTTGGTTTATATTATTAACGTTACTCACATTATTAACGCTAATATACAGGGTGGTTATTATATTCTCGCCTCGAATGAGGGTCTATTTATTTCGAATGCGATTTAG
>shakB 20584067 20584233|25805 chrX 20583822 20585689 scaffold_5 4363879 4365539 - 29342|264 430
GTCAAATGTTTCTTATGAATCGATTTTTCGATGGCGAATTTATAACATTTGGCCTGAAAGTGATAGATTATATGGAGACCGATCAGGAAGATCGCATGGATCCGATGATTTACATATTTCCCAGAATGACCAAATGTACATTTTTTAAATATGGTTCCAGTGGGGAG
GTCAAATGTTTCTTATGAATCGATTTTTCGATGGCGAATTTATGACATTTGGCTTGGATGTGATAGATTATATGGAGACCGATCAGGAAGATCGCATGGATCCGATGATTTACATATTTCCCAGAATGACCAAATGTACATTTTTTAAATATGGTTCAAGTGGGGAG
>shakB 20586174 20586238|25806 chrX 20586163 20586240 scaffold_5 4365788 4365865 - 6601|11 75
ATATCACAATTGGTGGGCGTACAGATATTACGTGTGTGAGCTGCTCGCCCTTATAAATGTGATAG
ATATCACAATTGGTGGGCGTACAGATACTACGTGTGTGAACTGCTCGCCCTAATAAATGTGATAG
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GCAATCTTATTTTATACACCAAGATGGCTGTGGAAATCTTGGGAGGGTGGCAAGATTCATGCGCTCATCATGGACTTAGACATAGGCATTTGTTCCGAAGCCGAGAAAAAACAAAAAAAGAAATTACTTTTAGATTATTTGTGGGAAAATTTAAG
GCAATCTTATTTTACACACCAAGATGGCTGTGGAAGTCTTGGGAGGGTGGCAAAATTCATGCGCTCATCATGGACTTAGATATAGGCATTTGTTCCGAAGCCGAGAAAAAACAAAAAAAGAAATTACTTTTAGATTATTTATGGGAAAATTTAAG
>shakB 20587742 20588238|25808 chrX 20587772 20588041 scaffold_5 4366671 4366924 - 3495|0 300
GAACCGCCGCCAGTCGGGCGCCCA-CTAAACAAACTGAACTTTCACCTC--------TCAAAACGT----------AAGACATAGGGATTACCACCTGCCAGGGACTCAGACTCAAGATCACGATGATGGGGCGACATTGTCATGT-------GCCAAAGCAAACACACCATATACAATTTGCACAACTTGCCCAATCCCCAGCTGTCTGTGGATTGTCCGAATCCGCTGCTAATTTACGATACAAGTTATTATTAATTTGTCATCGGGTCGGCATTAAAATCC-----CCCGGCAAAAGA
GGACAGCCGCCATTTGGGCAACCGTCTAAACATACTGAACTCTCACCTCAATGGGCATTAGAATGTCACGTCCACTAAGCCATTGTCTCCCTGAGCAGTCTGGGATTAGCACCTGCCCACATCGAGCTGGGCAAACCGCAGCGCGTTGCGGCCGCCAAAGTAAACA------------TTTGCACAATTT-----------------------AGTGTTA------------AATTTACGATACAAGTTATTATTAATATGTCATCAGAGCGTACATAAATACCAAATGTCCGACAAGAGA
>shakB 20587742 20588238|25809 chrX 20588183 20588259 scaffold_5 4367120 4367199 - 2412|0 60
TGCGGAACAGATGTTGCCTGGACCAA-----TTGCAGCCAAATGCCAACGACAATGGCAAA
TGTGCCGCAGATGTTGCCCAGCCATAAAATGTTGCGGC--GACGCCAATTTCGATTTTAAA
>l(1)19Ec 20691666 20692072|25920 chrX 20691793 20691900 scaffold_5 4464082 4464195 - 4990|0 113
CGTGTGTCTATTGATTGATTATGCGAACTGTCTGCGCGAACTTGTAACTAGATTAATGAACTTTTTGCAGTGG-ATGCAGTGC---ATCACAGATGCT--AGTGGAAAACCCGC
CGCGCCCCTATTGATTGATTATGCGAACTGTCTGCGTGAACTTGTAAATAGATTAATGAACTGTTGCCCGTTGCACTCAGTGTCCGAGCGCGAGCGCTTAAATGGGAAGCCGGC
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AAACAAAAAAAAAAAAAAAAAAA
AAACA------------------
>CG11227 20741510 20741807|25995 chrX 20741807 20742814 scaffold_5 4519247 4520355 - 10475|0 0
C
C
>Ser6 20773279 20773383|26028 chrX 20773275 20773921 scaffold_5 2076294 2076933 + 17175|4 118
GAATGTCAAGCACGCAAATGAATTTAACCTAGAATATAAACCAATTTTTTTTGTATAAATTTAAAAATGTATAA-------ATAAAAAATTGTTTTATTT---ATGATAAAGGAA
--------AGTATGAGACCGAATTAATTATGAAATAGTGAGAATTTTTTTTTTT-----TTTTTTATTGTATAAGGAAATCATAAAAGTTGGTTTTGATTTCAGTGGAAAATAAA
>CG1304 20775197 20775296|26030 chrX 20774715 20775834 scaffold_1 403218 404295 - -2981|517 629
TGCTGGCATAGCTGTATTGAGGGAATTTCATTTAAATAACTGCTCAACGATAATAAGAATTGTTTGT--------GTTGACTATCAAT-----AAAGTTTTCATTTTAAATAG
CGATTGCAGAGCTCCA-----------------AAATAACTATACAAC----AGAGCAACTGCCTGTCTAAGCAAATTAACTATAAACGTTTCAATGTTTAAAATTTTGGTAT
>CG10998 20835337 20835419|26108 chrX 20835105 20835378 scaffold_5 4599584 4599857 - 8353|241 282
ATAGCGCCTGCGCAAGTTTGTGGAGGAAGTGATGGGCAGCTA
ACAGCGCCTGCGCAAATTTGTATCGAAAGTAATGGGCGAGTT
>CG1532 20836964 20837083|26109 chrX 20835439 20836986 scaffold_5 4603004 4604575 - 18764|1623 1645
TATTATACTTTTTAAAACATTGT
TATTTTCTTTTTTGAAACG--AC
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ACTTCACACATTCGTCTGGAAAGGGAATCATATATTTTTTTTGTAGGTAATCCAAAGTAATCGCAGACCAATCGAGTTTTATTCCGGTGA--ACGATTCGTTTTGAGTGGCATATTGTTTACCACCCTCGTATACCTTCCTAGCCAACCATACCCACACGTTATCTATTATATAGTAGT------AGTATGGTGGTAGT---AGTATG----------------GAATCCATGTTTTTGCCAAACGTGCAGTGTGGATTGAGACACTGTCAATTTGAAAATGTCATTCTAAATTTCCAAAAACGTTTCTAAAGTAGGGAAATGCAGTTTTGAATTATAATCTT--------TTGCGTTCATTTTTGGTG-------TTTAAAACTGCAATT------------TACCTATAACCCGACTGTGACAGC---------------------GATCCAAAA---------TGTACGCAAATCATAATAGTAATGAAAAAAGCCGTCTGGTTTCTCCAGATTAAATTTCTTCTTGTCCGAAAATACGA-----CGCCACTCCTTAGACCAAGTCAAATGAGCTCGAGCAAAACTCAGACCCGCTTTTTTTCGCAACTTATTGAGAGGTGGTTTT---ATTTTCAGTTTTTCGTGTTTTATGTTTAGCTGTCTTAATCACCATTTGAATCAAAGATTTGATCTGGTTTTCAACACT----TTTTCTCGAATTTTGGCGGAGAAGTCGTGGGAATTGGGAGGTATTCGAAGTATGGACCTGCGATCTGCCGCGGTAAAGACAAGGTTATTGCCACCATTATTTTTTTTTTCCATAAGTTTCGTTCTTTTGAATAAAGTT--------TATTATAGGGTTGCGACATCTGGCGGGTTTTCTGAAATTTT---ATGATTATGAGCATTAATAGAAT--GCTATGATATTGTATATTTCCTGCAGGGATAACAGGGTTCCTCT-------------------TAAAGCAAACTTTTCAATTCAACAGCATAACAAATTTTGTTGTCCTTACCTTAGGACCTTTTTTTTATCCTCAAGGAGA-------GAGGGAATGTCAGTGAACAAAAAA----CAACAACATTGATGAATTTTCGTGCAATGGCAAAACCAGAAAATAAAAATGAACGGAGCCATGCAGG-----------GGGCGCTAATCTGATGACGCGTAGTGTATA----TCCAATGAACTATCATGCAAATGTGG----CTAGGACGCATTAGCGAAAATTTTTAAA
ACTTCAAATACCCGGTTGGGTAGGGAGCTATACAAATTTTCC--AGGATTTGCAATGAAATTGTTGTCAACGCCGCCTTAATCGCCGCAACTATAGTTTCTTTGCAGT--CCAATTGTCTGCCTCCTTCAAATACCTTGCGCGATAACAACCCCCACACATTTTCCATTATATTAAGGTCAGGCGAATATGGAGGCCATTCAAGCAAGTTCACCTTTTAAGCCTTAATCCATTCTTTTACCACCC-TAGAGTATGAATGGGGGCGTTATCGTGTTGGTAAGTCCATTGAATAGAGTGAAAAATATTTGTATAGTGAGGAAACGCC-TTTTGAATTATGGATTTACAGGTTATCGCGTTCATTTTGGAAGATACACATTCAAGGTCGCATGTGCCATAGATTGATACCGATCCCCAAACCATAACGCCTCCTTCACACGACTGGCGACGGGTCAGGAAATGCTCCTCTTTTCGAAGATCATGATAGTAATAATTGTAGCCATCAGGGCCGTCTAAATT-GATTTCTTTTCGTCGGAAAATACAACGTTGCGCCACTCCTTCGTCCAGTTCATGTGCTTGCGCGCAAATTGCAGTCGTGAAGCTTCACGTGCATCATTTAAAGGTGTTTTTTTAAGTTTCAATCTTT----TTAAATGATCAGCCGACAAAATCACACGTCTAACTGTTGACAC-ACCTGCTTT--AATACCACAAATTTCTTTAATTTTGGGTGCTGAGAGATGCGAATTGGACCCCGGTCGAACAATATGCCTGCTGTCTGTCGCAGTGGTTGCGTATTTGACTCCGCCCTTCATATTTTTAT-CATAGACGGCTTTGTTTATTAAAAAATTACTGACAACATTTTAGGGTTCTTCTAATT------TTTTGTGCGATTTTGCGATGGCTAAGACCATTTTTATGATAGGCTTCGATTTGGCCTCTTTCTTAGTCGGATAATTGCGCTCTGCGACCCATTTTTCATTAAATATGAAGTAAATATATTCATTTATAAATTTACAAAAAAAATTTGTCGTTATATCGCCGAATTTCATCAAAACACAAAATCATTCAGCTGAACCTATTCACTTGAACCAAAAAATTGCATAGAATTTAACGAA------CGCGATGTGAAAA-CAGAATGTGCAAAGTAACGGTACTTGGCAAACTTGACTTTACAAGCGCCGACCGATTGGCACAAA---TATAACGTTTCAATAAAATACAAAAAATATGTGTACACTTAATATGTATTAA-GAAAATCATGAAA
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AAATTTTGTTAAGTAAAACGATCAATTATTTATAAAATACAAAAGTTTTTTG---TTTGGTTTGGTTTTTATATGTTTTTTATAATATTTTCAAAAGCATAACTGAAAATCTACATAATTTTTGGCTCAAGTGAA--CAGGTTTGACCGACAAAACTATAAAAAAAAATT------------ATTCATAGCAATATTTCATGGCACTTGGTAACTTAAATAATAAAAGACACTATTTCTGCATTATTTAATATTTGGTATGACCACCCTTATTCTTAATT
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GTGGAGAAAAACTATCAT
GTTGAGAGAG---ATTGT
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GAAATAAGTGTCGCAGTCATTCCGCTCTATTCTGTGTTCTGTACATTAGCTAACTCTGCCCGTCTCCCTCTATCTCGAATATTTG---GCAATCTCTCTC---GCTCTATGAGCACCAATTGCTGCATTCTCCTGCTTTGCCCATCATGCATTTAGTTCTACACTGGCACAAAACCACAAAAACCAAGTATTTTTTTTGTTTTTATAT----TTTTACAAATGTCTCAAGTGTACCAGATGCGTCTGGCT-TCTTAAGC
-----ATGTGTCGTGGGCCCTCT-CTCTCTCTCTCTATCTCTATTT---CTATCTCTGTTTCTATGTCTCTAACATATACGTATGCATGCATTCTTTGATAGAGCTCTATTTTAAAACATT-CTGTAATTTGTACATTCATTAAGCTTAGCTTTAATTTTAAGCT--CACTGCTCT------------TTTTTTTTTTTTTTTAATATAAAATCTTACTTGAGTATTATTGTTATTCCCTGTGTCTGTCTCTCTCGCGC
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AGCGCGCCCAAACTCAAAAACTC---CAAATACTTTCCATAAAGGGTATATCCACACCAACGCACGCACACACATTGTGTGGCAACAACAAAAATGTGGGCAGAGAAGATGAAGTCATCGC--TTTGTTGCCTTGAAAAAAAA
AGCACACACACACACACACACACACACAGATA-TATATATATATGTTGTAT------------ATGCACATGTAT-GTGGACTGAAAACAAGAAAATGGTCAAAGCAGATGAAGTCATCGCATTTGGTTGCCTTGAAAAGCAA
>CG10987 20868633 20869935|26138 chrX 20869521 20869651 scaffold_10 463488 463592 + 1531|0 130
GTCTTTGGCGTGCGCCTAATAACGATAATGATGATAGCGGCGCAAGTGACACACATCAGTCACAAAAACAAACAAGGCCAACACTTCCTCGTCATTATCATCAACTCTTCGGGGGTGTGCAGCAGCAACAC
GTTGTTGCGGTTGGCCTGGTTG----ATTGAACCTAGCA--CCAAGTGACACAGA----TGACAAAGCCAAAGCAACACAACGCTTCTGCGGCAT----------------GGGGTGTGCAGCACACACAC
>CG10987 20868633 20869935|26139 chrX 20869668 20869689 scaffold_10 463601 463622 + 2065|0 21
TTACTCAACACTTTGCATATTG
TTACTCAACACTTTGCATATTG
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AAGAATTTATAAATTTAACATTTGTAGCGCAATTAAGTCACCATGACATCACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACGCACACACACGCACATGCACACATATAAAAGTTGATATTGTA--TTTTACTGTCAACGATTGTCTCAAATTAAATTATTAACTATATACGCGTAGTTTATTAGACAAT---GTATTTATAATAA----CCACCAGCACATCAATAACAATTATCC--------CATGCATATAACAACAATAAACTAGCTAAACGAAATGTCGAGCT----CGGAAATAGCATTAAATCGTTTGTG-CAACATTTTCAAATTGTTTTGAAAAACCTGTGATAAGACTCACCCCGCCTATAATTCAAGACCCCAGCCCATTTCCCACTCACAACACACACACACACCCGCACACACACACACACACACACACGCACACACACACACACACACACACACACTTGAACGCACACACATTTTGTAGTTTAGCCGCGTAGCCAATAATTTACACACAATTGTTAATTAATAGCAT-TTAGTAATGAAACATTTTTTTTTTGCAACCCAATTTTTTTTTTTCTAATCATAAATTATCGAA-ATTATTTATTTGTT-----AAGGTTATGTGC--ATTTGTTTACGCAACTGAAACTGAG--AATATAAAACAATTCAAAGCAAACAACAAATATGAAATAAAACAAAAAAATGAAAATAAAAAAAAAAACAAA-AC
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AAAAAATCTAGAATAGGTGCTTAATATGTTCAAACTGATTAAGTATATATCTATTTAGGTTCCAAAACTCTCTTTATAGAGCAACAAAA----------------TAGTAATAATACAATTAATAAAACTCATTGTTTTTTGGCC
AAAATATCTAAAACCCATTTGTAAAATTTGAAATATGTAGAAGAAAATATCTAAGT------CAAAAGTTTTTCCAAAAAAAAAAGAAAAGTTCTTTCTAAAATGTAGGAATATTTTG-TAAACAGAGATATTTCTTTAGAAGCA
>CG32521 21015986 21016358|26293 chrX 21015639 21017727 scaffold_10 606786 609040 + 31767|372 846
GCTGCAGCG-----ACTGAAGTAGCTAGCCTAGCATTCCATGTGGAGATCGACTTTGGAGT----------------CTCCTTT---------CAAAACAGTCTTTTTTTCGTCCTTCGGCAATGTAATCAAATGGAGAACTTTCAACGACATTAACTGA-AACAATATTGAAATATATAAGC--------ATATTATTCGAAACTATTA-ATGACGATATACAAATAC-AATACATATATATATATAAACATATATACTC-------GATA---AATGAGAGAA---CAGTCAGATGTAATTTGAGATACCGTGCGCGTAGAATCCCCCAGAAAACAACAGAT------CCCAATTCGAAGTTCA--------TTTGTAAATAGAAA-AGTAACTGATATTGAATTTA---------AACAAGATAATATA------------------------CGTAAGAATTGAAAGCCAG
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>CG1718 21103390 21104013|26417 chrX 21103958 21104345 scaffold_10 714041 714423 + 9809|0 57
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GCTAGTCACGGACTATATATTCAATTTTTTGTTTCTAATTGTTGATAGCTTTTGCTTA
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ATTCCCCACTTTAATTGTCA------------------------------------------------------------------------------TTTAGTTTATAAGCTCAGCAG----ATTTTTTTTTTTTTTGACATGTCGGACAGCGATACGGACACCGTGGACG------------------------AGCTTTTCCACCTTGCCACCGAGCATGTGGCCAAGCAGTCAAACAGCATTGGTTCCGCGGACCTTTTAATATTTTACGGATACTACAAGCAGGCCACGAATGGCCCCTGCAAGGAGCAAAGTCCGGGTCTGCTTCAACTGCAGGCCAAGAGCAAGTGGCAGGCTTGGCGCAATCTGGGAACAATGTCCCAGTCCGCTGCCCGGCAGGCCTACGTCCAGAAGCTGCAGGAGCTTCAACCCAACTGGCGGTCC-----------CGGC----GCAACCCA---GGCTGGGTCGTTCATTCCATTGAGTCGGTCCCACTGGAG--GACCAAC-GTTTGGACAGTGAAAAGACCCTGTTTGACCACGTGAAGGAGAACAATCTAGACAGGCTGAGGGAACTGCTGCAGCCAAGTGACTTGGTTAAGCTGGACGAGCATGGCATGGCGCTCATCCACTGGGCTACCGATCGCAATGCCGTCGAAATCATACAGTTCCTGGTGCGGAGTGGGGCCAGTGTAAATCAGCGAGATGCGGAGCAACAGACTCCGCTGCACTACGCCGCCAGTTGTGGACACTTGGAGGCGCTCCAATGCCTGTTGGAGCTACACGCCAGCCTGGAGCTACGCGATTCAGATGGACAGACTTGTTACGACGTGGCTGACGATGAGCAGATCTGCCAGGTGCTTCAAACGGAACGGGAACGACTCGCTGGATCCGC
ATGCAATAC-AAAATTGTCAAACCAAATACACACATCCACACAGAGACACATACACACACATATACACATAATCACTGAAAACGAGAGTAAAACAGTTTTTAGATTAGTTAATTAGTTGTTGCAGTTGCATTTAGTTAAGCATGTTTGACAGTGACCTGGAAATCGGCGATGATGAGGAGCAGCAGGAGATCGAAAAGCTCTTTTCAATGGCAACGGCGCACGTGATGCGCAAAGCGAACGTCTATGATGCCAGAGATTTGCTCGAGTTGTACGCACTATACAAACAGGCATCGGAGGGAGTCTGTGTCACGCCACGCCCCTCGATTCTACAGATGAAAGCGCGCAGCAAATGGAATGCCTGGCACGAGCTGGGCGACATGAGCTGCGCAGATGCCCAGCGTGCATACGTTGAGAAGGTGCACAAACTGGACCCCCATTGGCTGGACGCAATGTCGAGCGGCGGCGGCAAGCTGAGCGGTTGGGTGGTGCACTCGATTGAGTCAGTGCCCATTGAGGAGACCAACAGGCCGGAGCATCTGAAAACGTTATTCGATCACGTTAAGGAGAACAATTTGCAGCGTTTGCGTGAGCAACTGACTCCCGCTGATCTGGTGCAATTGGATGATCAGGGTATGGCATTGTTACACTGGGCAACCGACCGCAATGCCATTGAGATCATTGAGTATCTGGTCAAGTGCGGCGCCAATGTGGACCAGCGCGATGCCGAGCAACAGACACCATTACATTATGCCGCCAGCTGCGGCCATGTGGAGGCATTGCGCTATTTGTTAACGTTAAATGCGGATATGGATCTGCGCGACGCCGACGGCCAGACGTGCATTGATGTGGCCGATGATGAGCAGATTTGTGCCATGCTGCAAGCGGAGCTGCAGTTGCGCAAGGGCACTGC
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TGGGGAAGTTATATATTTACGACTAA---GCAACAACCCACAACTATAAACTACTATTAAAGTAAACAACAACCGAGGAGCAAGCAAGTAAGGCAAAATTTATATTTTG----TAAGGCG----------AGCCAAGTAGCGAAAAGAATTAAAAATCA-------------AATTAATTCTGATAGGATCGGATCAGATCAGGTTAATGA----GCCGCAGACTGGGACAGATATATATAGGGAGTTTAGAGAGCCAAATCACTAATTATACGAGAACCGAGTTAGTCTGAG--AATTGAGAAATCGTGGCACATC---ATCCGAAGCATCA---CAGGATATTCAGGATATTCCGGGCAGCAGCAGAGGAATTAGGCGAGAGACAAAAAGAAACACGTGAAAACGGCTTCCATAGTTAATGTTATTTCCAAAAGCATAAATACACCACTCTAAACTAAACAACAAAAGCTTGCACACGCCCTTACCCCTAACCCCACCCTTATCCACTTGTTCTTTTGATCGTATTGTACATTTATAA-----CAATCAATATTTGTTTATTTATTGCAAGGAAATCGAGAAAGATACGTGTATGCGATGTTGTTAATTTTAAGTAGTTGAT-------AGCAAATTTGTTAAACTGAAGAGTAATGAAATAAATAAGAAAGGGAAAGGGAAGGGAAAATCAGAAAAAGAATTACAAAAATAAAACAAAATCATGCAAAATCAAAAATAAAAAA
TGAAGGCGTACTAAATTTGTATTTAAATTGAAATAAG--ACAATGATAA----CTATTAAAGTATA-AACAA----------ATCAAATCAAGTAACATCTATTTTAAGGGCATAAAACACAAATGCAACGGTTGAGCCGCAGCAAAAATACACAATTACACGCTTTGGTTCAATAGATTCTTCAAAACACCGATAATATTTAAATAAAAATAAAAACAAAAACAAAAACAAATAAATGATAGGAGC--AGCGCCTGCAATTATGATCTAATTAATGATAATATTGATGCAAGTTAACTGACAAATCGTAGCAAATTTGTATTTTGAACAGCAAATTAAACTGTTCGCAATACATTATTAATTGGCTGACTAAT---ATTAAAAAAAAAAATAAATAAGAAAAAATGAAAAGAAAGAAACAAATCGCTTCCATAGATATTTATTGATCG------GCAGAACAACA---------------------TCCCAAGCTTGCGCCAATTGAAATTTGTTTTATATCGCATTGTA---TTGTAAATGTACGAGAAATGATTGTTTATTTATT------------------AAATATGTATGCGATGTTGTTAACTATAAGTAGTTTGTATCTTTAAACAAATTTGTTAAA-TGAAAAG----GAAATACA----------AAAACGCAAATAAAATTAAAAGAAAAA--GGGAACATTAAACAAAATGAC---AAAGCAAAAATAAAAAA
>l(1)G0269 21130455 21131997|26446 chrX 21131147 21131915 scaffold_10 750526 751286 + -326|0 853
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GAATTAATAACAACAACAAAAACAACATGAATGAATGAATGGTGGTGCTGTGACACAT-AACGAATTTTTTTTTT------------CAGTACGATTATGCTAATTAAT--------AGACGAGACATGTTTGTAATAGAGGAATACTATATCTACTTCACTTCACAAT-TATTGCAAATTTTTTAATTGAAACAAACCCTTCGGTTTTTTTTTTATTTTGATTATG-----ATCATTATTATTGATCAATTGTTTTCATGCGTGTGTACGTGTGCTAGAAAACTAGAAA------------ATTAAACAAATTTTCGGGTTATTTGT-------------------ACTATACGAAAGAGGCCAGTCTCTAACACACACAGTATGTTAAAAGGAAAGTTACAACTAAACTAGAAACTAGAAAAACAAAC---------AGATAAAATATCAATCGAGATATATATATATATGTATATATAGATATATATATATACATATATGTGTA--TACAATCTAAGCTAAGCAACCACAACACAAACACTTTATATGTATAATAT-ATAAAAATTACATATATTTATGTTAGACATAGTTTGTTGTAATTATATTATAA--------------ATATTATTAAATATAAAAGATTGTTTTCTATATTTACAAAACTTTACTGTATGTATACTTTAACAATTAGTTTTGACTGCAATTGATCTGGAAATCAGAGCGAAATGCATAAAC--ACATACATACTTACATTATATATATATATACATATATTAAACAAAT--AACTTTTGTATAGGTTTTGT-----ACAAATCAGGCGAATAACTTTTAAACCTCTATAGTTTT
>l(1)G0269 21130455 21131997|26447 chrX 21131954 21132497 scaffold_10 751326 751826 + 23378|0 53
CAGGTGGGCCGCC------TGTCGCTAGT----TTAGTTTATCTATTTAGAAGG
CGGGTGTGTTGCCACCAAATGTTGCTAATGCACTAAGCAAATGCGTTCGAAAAG
>tty 21141996 21142635|26458 chrX 21141830 21142383 scaffold_5 1692891 1693504 - 2806|184 666
GGAATCCTGCTTTTCGACTCTTGTACATATTATATACCGAACTATACCCGAACTTTCCGAGCAAGTCGACACGAAGGATTGAAACACAGATACTAGATACCCGCAGGCGGACAGACGGACAGATGGACGGACACGTGTAATATATATCAGCGATCTATTACTTATATAAATATATATGTATACATATATATATATATGTATATATATATATATATACACTTAGGACACGGTTATTCCTTTTTGATAATAG----------------CATATTTTTAC-----CAATTTTA---------AAGCGC----------------------TAAATTGTCAGAAGAAACAATTTTACG---------------------------------GGGGCTAACTTACTGTATTATACAACATTAATCTACAAAAATATA----------TAAATTGTATATCCTCTACAACAAAAAACAAAAAACAGAAA
ACAACCCAACTACTGGACTTTTGTA-----TATATACAAACACACACACACAC---ACACACACACACACACACAGGACT---ACACAAATCCTAACTA-TTATATATATATATACACACACA---ACACACACATACAACATACATATGT-ATTTATGACATTTAC-----------TAGACATACATATACATATATATACATATATACACA-ACATTTAG--TAGGAATATT-TTTTTTGATAATAGGCATTTTTATGATCGCAAAATTTTTATTGTAACAATTTTAGCTCGAAACAGACGCATAACAAGAACAAGAAGAAGCATAGAAAGCCAAAAAAAAAAAAAAAAGGAGCTGGAAATATGCAAAGAACACAAACAAATATGGGAAAAACTTATTGTATTATATAGCAGTTATATACATAGTTGTATGTAGGAGTGTAGGCCGGAACTACTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGA
>tty 21141996 21142635|26459 chrX 21142588 21143043 scaffold_5 1693661 1694162 - 12909|0 69
GATGGTTACTGCTGACACA--------------CCCAGACAACGCCCAG--------TGAAGGCAGGCAG
GCGCAGCTCTGCAGTGACATTTGGTTATTTAACCCAAAACAGTGGACGGCCCACACCTGATGGCATTTAG
>tty 21143564 21143692|26460 chrX 21143684 21144855 scaffold_5 1694205 1695426 - 54214|0 10
GT--GTTGCTA
GTTGGTAGCTA
>pen 21157179 21157239|26475 chrX 21156971 21157226 scaffold_19 1811483 1811760 - 6052|214 278
CCTAGACAAGACCTAACATTTTAA-------------AATACAATAAATA----ATTCTATATTG
CTTAAACATTTTGTAACATTTAAATGCATCATGCTGGGAGATAATAAACACAGAATCTTAAATTC
>pen 21157179 21157239|26476 chrX 21157227 21157452 scaffold_19 1812284 1812499 - 5696|0 12
GAAACGCTTCTAG
TAATAACTTCTAG
>Hlc 21196191 21196531|26523 chrX 21196229 21198785 scaffold_25 2030317 2032853 + 79910|0 319
GGTAGCAAATGGTATCTATAGTCGCATTAGTCAATAAGGAAATAAAGTTAATATTGTTAATGTAAGCCAAACATAAAAGCGGCCGTTGAAGATGTTT----GGAATTTTAAAAATGTTATTTTACCC---TAAATTAGAAATGAGTAAAATTAAAC--------GAAAAATATACCTATGTTGGAGATAGCTGCAGATTGACAAACCCAGGTTATTTTCTTTATATATATGAAAATTCTGTTAATTTAGAATTTTGTAATAGGGCTGTAAAAATAACCAATTGCACATGCACATTAACAATGTAGT--TTGTTAACTCTA
ATTAGCAGCCAGCAC-----------TTGGCCAA---------AAAGTTGTTCTAGTT----TTAGCC-----------------CTGGTTATCTTTAAGCGTAATTTTAGTTCAAACATTTTGCCCATTCAAATGTAAGAGGCACAAAATCGTATTAATGTCGGAAAACTATATCTCTGTC-----------TATATATATATGTCTATATCAATATATATATATATATATATAT-------ATATATGACTT--------GGTTGTAAATAAAGTTTTGTGT-----CCTATAAACCATGTGGTTATTGTTTCCTCTA
>CG1678 21213049 21213135|26545 chrX 21212363 21213081 scaffold_48 298339 299052 - -2673|745 777
ATATATATTCTGCTTATTTCAATATATAAAACC
ACATATACACTGCTCATGTGCTGTTATATAGAC
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CTAATACAGTTTTAA--CGATTTTCCAATCTAAAAGGCACCA-ATAACAATAACGAGTTCCCAACTGCACCACAATTATCGCAATTATGTAACCGTTAAGCGCACCTATTCCTATTATACGCATAT-CTATAGTTAACTACCAGTATAACAATCATAGCACCATACAATATTTACTATATATATAGTACCCACAAAAAATATGTATATAGAGCACTCTGCATATTAAACGC-CTCGATGCACAGCAACAGCAACAGCAACAGCAACGACTGAGGCAAAAGGACCAAACAATAACAGTAGCGAA-AATTTCAACAATCGCATTGAATCGATTTCGAATCGATTTGAATCGCATCGACGAATCGAACAGCGGCATCAAAATAAATTTAAATAAACATGACACAATTTGTGCGATGCGAAACCGAAAACGAA----------ATATGCATACCT---TATTGTTTTTATCATCGTATTATATTATTATTAGCACTCACATTTAATTTATAACACTCACAA----AGCGGGGAGTCCGGGGACCCGGGGATCCGGGGATCCGGGTTCCCGACTCCGGCATTGTGCCAAAGAATTTAAGCGATAAAAGAGCAGCGCACAAAAACTACCAGCTGAAA---------GCGATTGTTGTTAACAACAATAAACAATCGT----GAATCG--TTAAAACACAAAAAAAATTA-----A
TATATTCATTTTGAATCCGAT-----AATAAATAATATGCTACATAAAAAAAATAAT------ACTGCACAACAATCACGATTATTATGTA------AAGCGCACCTA--CCTACTATATATATATATTATATTTAAGTA--AATATATCATACTATATATTATAAAAATAAAAATATATATATAT--------ATAAATATATATTAATAGCACTCTGCATATTTCAAGCACCAAATGCACTACAAACAAACCAAAAAAAAAAAA----AAAAAAAAAGAATCCTACAATAATTTCGACTAATAATACCAACAA-------------------AAAATATCTATATACAAAAGAGAAAGTAAATACCAG----AAAATACCATCAATACCAATTGGTTCAA--TGGAATATACAAAAACAATAAAAAAGTATCTGTACATATGCATAGCCTTATATTCTTTTTATCATCG-----TATTATTATTAGACCTCGCCTTTAATTTATAACACGCAAAACGCCAGCGGCGAA-AGAGAAAGCAATACATCGGGAGAAAGAGATAGCCAGCTGTA----TATATCTATATATTTACGCATATTTAATAAAGTACACGAGGACTGC--GCCAAGAGGAGTGTTCGCAATTGTTGTTAAGAGCAATAAACAATTGCATGAAAATTAATTTAAAACAAAAACAAAAAAATGCAGA
>Cyp6t1 21328110 21328224|26708 chrX 21328040 21328289 scaffold_7 197820 198066 - 1669|70 204
AATA------------CATCCAGTAATAGTTATATTAG-GTAAACTTTAGTTGGACAATTGC-------TGTTGAAAATGCACCTTAGATTTTCCTAAAAAGTAAACCACTCCTTAGAAAGGTTTAAATTTAATG
CAAAAAAAAACTGGACCATTGTGTTGCAGTTTTTTAAATTTTCACTTTATTGGGGTAATTGTTCACATATGTAGGTTCTGCTTTTTAGTTTATTTT---AATTAAATTTTTTTTT-----GTTTTTAATTT----
>CG14476 21411276 21411518|26791 chrX 21411128 21414411 scaffold_31 764270 767485 - 140226|170 443
TCTGTAGTCGCAACGTGCGCCGTGTATTATTGTTCTCATAAATATTTTAATTGTGTGCACCCTAAAAATTGCTATTAAATGTTTTAAGCCTCCTATTCCAGGCAAACCCAAA-TAATAGATTCCCTAACTACCTTCGATTAGTA-TCCCCCGTTCCTTCTCTGCAATTCCATCAATTCAACATTCGGAGA-GTGTAACTCAAGTTGAACGC-AATTTATGTTTCAATAAATA---------------------------TAAAAACTTCTCTGT
--TGTGGTATTAAC----------TAAAAGTGTCCTGCACAACA----AATTGCTTCAGCCCCGCCAACTA-----GCAGGATCTGACATTATTCTTAAATATATACATGAATTTTTTTATTCCATGTATGCTTCTAGTTGATAGTTACACGTTTTTTTTTTATGA---CATCGATTAACTATTCGTAGCTGGGTGCGTCCAGCTGAAAGTAAATTTCAATTCCAATAAATGAATTTAATGCGATTTCCCTAAGGCTTTCAAAACCTTTTTTCT
>CG33502 21420031 21420183|26795 chrX 21420039 21420725 scaffold_1498 9 715 - 27242|0 155
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ACGTGTTATAATTGTTTCTATCTTTAGTAGGTTTAGAACTATATACATAAAC--ATATGTAATAATAT-----GTGTGCATGTA--TATTTGCTTAAAT-AATGTACAGCCTTAAAACGAATATTTTGACCGTTATATATGTGTTTCAATGCTCAG
>CG32500 21432216 21432367|26810 chrX 21432223 21432909 scaffold_1498 9 715 - 27242|0 155
AGGGAC--TCATTTTAATTTCCCTGCTTACGTTGCTAATTCGCTAGTGAAACCAATAGTTAGTTGTATACATAACGTACATGTAGTTGATTACTTAAATAAATCTACGGCTTTAAG--------CTTAACCGTTA-GTGCATGAACCGATGTACAG
ACGTGTTATAATTGTTTCTATCTTTAGTAGGTTTAGAACTATATACATAAAC--ATATGTAATAATAT-----GTGTGCATGTA--TATTTGCTTAAAT-AATGTACAGCCTTAAAACGAATATTTTGACCGTTATATATGTGTTTCAATGCTCAG
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CCGATTGCTGTCGTCGCTTCCACTTGCCACACGCAGCTGCAGCAAACGAAAAGCGGCACCGTCACCAGCCAAAAACAGGACTTGAGTTTCCTGAACGACTC-GACGCCAATCTATGTGACGTCATTTAGCAGCAATCAAATCACCTGCAGCAGCGCCACAATGACAACGGCCACCGCCGGCGGGCCCATTAGCGCCCCCTCGCTGGTGCCCACCACGGCGACGGCGACAATGTCGACGCCGACTGCAGCGCCTTCGGCGGCACTGGTGAGCGCCGCAGTTGCAGC----GGCCACAGCAGCAG----CAGC-------TGCTGCTAGTG-CGGAGCGCAGTGCGAGCAGCTCAACGACGGCGGCAATTGTCGGCGCAACAGCAGCAGCAGCGGCGGCAGCGCTCAAGCAGCCG---CCAGCAGCGGGCGGCGGCGGT-GGCGGTAACAAGACCAGCAGCGCCACGGGGCACATCTATCAGACCAGCCAGGCACAGCAGCAACAGTTGCAGCAGCT----GCAGCAACAATT--GGCGGCGGCTGCTGCCGCTGGGAAGCCGCTGCAGGCGAAATCTCTGCTGGCCACCAGTTTGCAGCATCTGGCCGAGGAGGTGGACGATGACGACATGGACGATGACGATGATGTCGATGGTGCCAACTACTGTGGCATCACCTA---TATCAGCTACAACAACAAGCACGCCCAGCTGCCGACAACAACGC
>CG14615 21651143 21651324|26868 chrX 21649917 21651537 scaffold_5 1958639 1960376 - 22478|1423 1632
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GCGGCTGGATCTGGGTAAATCTGTTGATGGGTTATAGCGAGGGGCGCCACGAAATATAGTACATATATGGAACCAAAATAGAATACACACG-TTTTTATTTCATTCTCCTATACAAAATAACAATGGAGACTTCCAACCAGATGCAGTTTTGTTAGAATGTATTTGAAAAGGTGTTTCACACTTTTCGAAAAAGTTCGTCTTCTAGTTCA
>CG14614 21655139 21656628|26870 chrX 21653121 21655591 scaffold_5 1961725 1964221 - 46634|2133 2723
ACACGACCCTCCATCAATAATCTCAAATCTTAACCACATCCCATACTTTCCACAGGACAAAGCGACTTTTTCAGA-TAAAATCGAATACATTTTTTTTA-------TGTATCTT------------GTAATTTATAGCAATTTCACA---------------ACTTATATATAAATATGTATACAGAAAGCGATAGCAGTAATAAT-------AATCCCGATGATCGTGTAT-------------------------------------TGTAAATAC------------------AGCATGAAAGGCATATTTTAAACGAAAACCAACTTAGGCCCTGATTTTGTATAGCCATTTAAG-----AGGCCACTTCACGGGAATTTATATCCT------------------------CATATCCGAATACTTTT-----TCGTTTGCTGCAGAA---GAGTAAGAAACTGAAATCAA---GTCTATGGAATTTGGAATTGGATATATTTTATACGCTCGTAGC-CACTAGGCGAAGACATTTTCATTAATTTGGCAAACCACGGTTTCCGTAAAAAAAATAATCGAAAAAAAA
ATACTAATCCACAACAAAAATATAAA--------TACATTTTCTATGGTCGAAACTATAGTGCGCCGCTCTGAGACTGAAATAAATGAGAATCCTTTTAGACGAGATGCCTTTTCGTTGGCTCAGAGTTATCTGTTCAAACTCCAAATGCTAATATAAAAATACATACATATATATACAAATACAACAGATGCTGCTATTGATAATGCGTGTAAATACAGAAAAGCGTATACATTAATTTCATTGTTTTCTCCAATAACAATCAGAATCTGTAAACACTCGACAAGACTTTTGCGCAATTTCAATTGAATATGATAAATAAACCGATAAATACTTTTTAATGTGGTGTACACGTGCACGCACACATGCATACACACATGCATGCATAGCATATGTAGATACACACGGCATACATACATATACATATACATATGTACGTTAATTACTGCGTAGCGTGAGTAAGCATTTTTTGGCAAACGGTTTCTGTAATTTGTAGC-----ATTCATTATCCGGTTGGAACATTCAAAGACAAGATATTCTTTATACTTACACACAC-------------ACACACACACACACACACACA
>CG14614 21655139 21656628|26871 chrX 21655592 21656322 scaffold_5 1964339 1965185 - 10960|0 917
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GGGCCAGGCACAT---TTAGCATCCTTAGCTTAGTTGAAC-----ATAATGTTATGATATATAAGTCTCAAGGTATAACCAAAATATGTATTGCTATTTGTAATTTATTTGACTCGTCTCGCACGTTATGCTGAATAGAACCGGACGCTTAG------------TTTTATTAATTGACATGTCTGGCTTATTGACATTCTGTTTTTAAGATGGCAAAAAAAACATTTACACGTAAAAAACAAAAAAAAAAAACAAGAAAAAAAAAACAAAAAACAAGATGAACAAAAGAAAAAACAATGTCCTACCTCGTTTT--CCAACATGTTAAATGTTGTTAATA-----TTTGTGTCTAACCGCAGTAAGAACAACAACAAAAACAACAACAACAACAGCAACACCAAACAAACAACTACACGCAAAAACAAAACACAGACGAACAACAAATGAGAGAAAACCCAAATGAAAAATGTATCCAAAAA-GACGCTAAAGGCTTCTTTTTTTTTTAACTATATTTTTGTTCAAATGTTTTATTTTTTTTTTTACACGTTTTTTATTAGAACCAAACACCAAAACAA--ACAACAAAAGGACTTAAACGAAAAC----------------------GCAAACGCAAAGCAAACATAA------ATAAGCGAAAAAAAAATACTTGTATTTAGAAAACAGAAATGAACTAAAAAAAAAAAACCAAAAAAAAAAAAAAAAAAACAAACAACAACAACTGCACA-ACCACAGCTA-AATACAATACT---------TACTATTTAAAATACAACTAAAACAAAAACCGAAATATATTGAGCGAGAGAGAATACAAGATTGTTGC--TATCCATTTAAAAAAAAAAAAAAACAAAAACAAAAACCAAAACAAAATGAACATATAAAATAAT
>CG14614 21655139 21656628|26872 chrX 21656372 21657591 scaffold_5 1965230 1966644 - 60536|0 434
-TAATTTTTTTTG-----------GTCTGGTCCT---------------TGCTGAAGCACCTGACTGCAATT-------------GCTGAACAACGCACAGT------------------CAACAA----------------AGAAGCAA------------GTCAGAAAAACACACA-ACACCCACAAATAAACATACATTTGC---------------------TGTTGGTAACTTGGAAGCG-------GAAAGCAGTGAGCTTAAGTTGGAT----------------TAGTTCTGT--------------------------------CAACACGCGTCCGCA----------------GTTTGTTTAATTTTACTGTCTGTCGAGAGAGAGAAAATGTGAAAGTGACGGATATAGAGGCAGAGAAATGG
TCAATTTTTCTTACCACCCATGCAACCTGTCCCCCCTCCCGACCCACACTGCTCTGCCCTGTGGCTGTGATGTGAGCATGATGTGGCTGCAGAACGCACAGTTGCCAACACACCAAACAACAACAACCGCAGCAGCAGCAGCAGAAGCGACACCAACAAACCAACAGATACATACACATACATACACACACAAACACACACATGCGGATACAGAACGCAATGTAGTTGTAGGT--TTTGTAGGCGCAACAGCGGAAGAAACGCGTTTTAATTACATAATATACACACATATATAGTTTTGTATTCGGACGTCGATTTATATCCCACAATCCCGCAAC-CGCATCCGCATCTGCAACCCAACTTGGTGTATTGGTCGCCAGTGTCTGT-GGGTCAGTCGAAGT-TAAAAGTGA--GACGCGTAGGCGGAGCAGCCG
>CG14613 21673657 21674225|26890 chrX 21673565 21675032 scaffold_5 1985773 1987096 - 21651|96 749
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TCGTTGGTTATTGG----------GCGTCTACGTCGCTGCCGCCGCCT-----------------------------GTTGTCGTCGTTGTCGCTTCCCAT------------------------------------------GCGGCGTTCAGTTGGCTAGTTGTATTTTTTGTTAAACTGTTGCACGTTGATTCAGGC---------CAAGTG--------TCGATTCTGGAATTTAAGTTTCTCGCCCAGACGCATATGTATACAATACAACTGAATAACCAATA-ATTAACG-ACGCTGCCTCCGTTTGAGAGAGGATAACACAACCAATACATCAATATTTCATATAT----ATATATTTTGTAATAACATTTTTGC--ATAGTTTTTGTT--AGTTACGAAACAAATTGCCGTTGCGCCGCATGCAAAGGAGACCCAAACTCATACATACATAAATCAGCACGCAGCACGCACACAGACGGGCACGCACACACACACATACACACACACAAACATGCATATAACTCAGAGAAAGGCAGCC-TCCGATACAGACAAGATGAAATGTAGTATATTTTATAAATGTAATTCAAAAGTTATCGAAAAAAAAAACCGAACTGGTA---CAAAACGTAAACA--------TTTA
>CG12576 21678244 21679129|26893 chrX 21678221 21678686 scaffold_14 633987 634446 - 64|23 502
ATTTTGATGTCGCTGTGAGTGAGGGCGTTAGCTACTTAATCTGAATCCAAATCAAAATATTGATGC--------AGCAATTAAAAAACCA-------AAAAAAGTGGCAAATAAGAAACGCAGAAAAAACCATGAAGAGATTT-GGTTCGGTGCTGTCTGAAAACGTAT---TAGCCATATAAAGTGCACAAATCATTTCAGCGTTATATAAA---ATTAGAAGACGCTATTATTTTTCTGC----CGACTTTGCGCTGGCCA------TCATCGTGCGTTGTATAACA--TAAATTTCACGTTAAATGCAGTAACACACTTTCTTTGTATTCTTATTATTATTTGCGCTTAAAATACATAAGTTATCATTTAAATTGCGAAACAAAACGAAATGTGATTTTGTAAAAACAAAAACTGAAATAAAAAT-CAAAAAGACCTCGAGATC-CGATGTCGACTG-CCGTCAACTGTCTAAAGAA
ATTTTGTTTTTGAAGTTCGGCAAAGCGTGGCGCTTATAATTTGCAT----AATAAAGTGCTTAGGCTACCTGAAACCAATAAAAGAAATACTCAAAAAAAAAAGTGAAAAAAAACCGAAGCCTAAAATAACATGACGAGACTGAAGCTCGCTGCTAACCG----CGTGTCGCTGTCAATGGAAA---CATAAATAAAT------TTATGTAAATTGAATAAAAATATTAATTAAATTCTTGCAGAGCGAAATTACGTCAGTCAAAAAAGTCTCTGTGGGTCCTCTGGCAACCGGCTTTTATGCTTGTTCCAGC------TTATTTGTGTAATCTTCT-----CTTCGGTTTGAAAATAATTGCTTTTTAATTGAAACGCGA---------------GTGTCGCCAAATAGAAAAACTGCATGGAAATTACATTGGGGATTGGGGATTACTATATTAATTGATCATTAGTTATTCCAGGCA
>CG12576 21678244 21679129|26894 chrX 21678687 21679048 scaffold_29 467209 467503 - 1186|0 364
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GCCTAGCTGCTGCACGGATAGAGAGATAAGCTCAGTGTATAGA----TGCAAAATTCTTTGC---AATTCAGTTACAATTTGATTTCAACACATTTAT-CCATTTATACATATATAC--AGCT-------CTATAGTT---------------------TTTGCTTAAATTGTTGTGGCTCTATAAGG-----------------CATGGAAC----TGATATTAGCT--TTTGTTTTACAACACTCATATTTATTTACCTCTTCAACTTATATACTGCAAACAAACAAAAAAAGAAACAAAAAACAA---------TGTACATATATACATAAAACTATATATATTTATATATATATATATATC
>CG12576 21678244 21679129|26895 chrX 21679049 21679927 scaffold_5 1935119 1935998 - 28676|0 81
AGATTGGATCAATCGGCGATCGGACCGATTTGTCGTATTATAAAGCTATTGTCTT-AACATACATATGCATACACAAATAGA
A------------CTACTATACGGCAG------CGTATTACCAA-CTAATATCTTAAATATACATATACATATATCTATATA
>CG17598 21739836 21740259|26960 chrX 21739353 21740116 scaffold_4 6235215 6235907 + -2161|520 809
TTTACATAATTTGCTTA---TGTACGCCCCCAAACAAACAAAACAGAAACGCATGTCAACTTAATGAAACTGTACAATAATTTGCGGCAATGAAGTGTATTTATTTTATCCTAAAAGATTGAATGACGAACAAAGCCCAATAGTAACGGAGGCGATATTTTCAATAACGCAAATAAAAACCTTATGATTCCAAATGAAAGCATAAAAAGTAATT---TAAGC---TGCGTATAACATAAGCCAACTATTAATATAAAATATAATTACAAATATTGTTAACTAAACTAACA
TTTTTATATTTTGTTTAAAGCGTGCACCCGCATACAAACAAA-------------TCATTTTTATAAAAAATTA--------------AATCAAGT------------TTTTAAAAAATTGT----TAAAAAATGCTCAA-AGCAATACAGTTTTTATGTTTGTTGTT-----TGTTTTCCTTTT--TTTTAAATACAATAATAAATAACAAATGTATAAGCATGTATGTATA---------------TAATTTAAAAAATAATTAAAATAATATATATTTCAACT----
>CG17598 21739836 21740259|26961 chrX 21740117 21740384 scaffold_342 3021 3224 - 262|0 142
GACGAAGGTAATGCCACCCAGGCCGATACATTAGTCGTAATTAGACTAAGCAATATTCGAACGGATATGGATGCGGCTGAAATGGGCACATCTATATTTGTTTTTACACTCCACACGAAAGGACAAATTCAAAACATTCAAAG
CCAACAAGCAATAATA-----------ACAATAACCATAACAATACAACACTACA-----------------------AAAAAAAACACAACAAGA----------------ACAAGAAATAGCAAAG----------CAAAA
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AAGAG---------GCAACAACCTTTCACTCTATCCAACCCATAAATTTCCCACCCTTGTTTTTTTATTTTGTGCCTCTC--------TGACTCTTTTTTTTTTTTG---TTGAGATTTTCCTCTATAGTGTACGCTTAGTAATTTCCCACACATGTGCCAGTCATCGTGATGGAATAATGAGCTGCTGCCTTATTTTTTTTTTTATAAATATCTCCTTGTTCCTTCTTCTATT---------------TTTCTTTGAC--CTATAGTTCTTAAGCGAAATTATGTCAAATTGTTCTTAGTTTTTAAGAGACTAAGTGCTTGTGAGAACATA---GTTTTTTGCACGAATAAATTGAC-CACTTTTCTAAAA
AAGTAGAGCGTTTTGTGAACGCCTTTGTCTACATGTACCCTCCTAACCTTTTTCCACTCTATTCTTTATTTGCACTTTTCCATGTTTTCGTTCCTTTTTTTTTTTTGTTTTTGTCCTTGTCATTTGTTCTATGCTTTATTTAATTTCTTGCACAAATGCACGTCATGATGATGCAATAATGAGCAATCCCTATATTTGCTTTTTTATTATTACATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGTGTGCTTCCTTTCATTTCTTCTACTTTTGTAGCCGGTAAGCAAAATTGTATCAAATTGTTCTTAGCTCT----------------------AATATATATATTCTTTGTATTAATAAATACACACAAATTTTTTTAA
>CG12446 22012686 22013071|27278 chrX 22012897 22012980 scaffold_5 3826552 3826622 - 2232|0 83
TCGTGTCCAGCTTTGATTACTCGCCGATCCGGCGGCAGTGTCCTTATTTGCCAACCACTTCAAGCCGCAAGCTCTGACGGTCGT
TCTTGTTTTGCTTTGGTTACTTCGCGAT-----------GTCCTTGTTTGCCCTGCACTTCACGCAGACAG--CTGGCGGCTGT
>fog 22029553 22030445|27291 chrX 22029860 22030680 scaffold_5 3859854 3860837 - 12538|0 744
AAGCAACATCGTCAACAACAGCAGCA-----------------------------------------GCAACTCCTG---GCTCTGGCTAGCGATTAGAGCCACAGGAAGTAGCTGAGTGCCGTATAGTCTAGTGTAGTGCAGGATAGTGTCG-TGTTAGCAACAGCGTTTCAATAGCGTGTTGAAGTT-TGTT---------------------------------------CACAGTTATCTCACTTTCACACTTTTCCCTTTTCTGAGTAAATATTTATTGTCTT-----------TTAATGTTTTAATCGAATGTCACTTGTACATAGCATGTCCAAA-------ACACACTACTTAACAACCAC--------TTTTGA---------TTTTTTTTTGCCTTGGCG--TTATATCATAC---CATATTTTTTGTGTTATTGCAACTGCTTTCTTTTTTAAGTTGTTGATTTAATTTTAGGGGAAGTTTTTTTTACAT--TACAATAGTTTT----------ATATGTGAG----------------CGCTGCTGTCGCTGTTGCGAGCCTTAGCAATATTTCATTGTGATTACTTAGGCATATGAATTGATCGTTAGACTTAGGAAATCTTATTTGTATATCCAGAATCTTTTGATGTATCTTTTTTTTTACTACTATTATTACCATTGTAACT------CATATATTCATTGTGCGTACAGTCTGAGCATTTGTTGTATA
CCGTCGCGTCGTTAATTTCTCAAGCAATTAGAGAAATGCACTCTGTGCACTCCCCCGTGGCCTGTGCGCTGCTCTTAGCTGCTCTCGCTCCAGCCGAGACACGCTGGAGTCCACTGGTCG--GCTGGGATTGCTGTCATGTCGTATGGCGATGCCAGTGGCAACAACGTTTCAATTGTTTGTTGAAGTTCTGTTTGTTCTGTTGCAATGGCGTCCAACTGTTTCCACCCCACACACAACTACTTAGCTTTCAGTTTTGTCTTTAATTTATATATATATTCATTTTAATTATTTTCAAAATTAAATATATATTCGATTTCTTTTCCTTTGGTATTTGTTTAACTATTTGTACATATTACGTAACGTCAACAATTTCGTTTATGATTTAATAATTTTTTTTTTGTTTTCATGAATTCTAATATATATGTATTTTTTTTTTGTTATTTACTTTGCTGCTTCTTTTAAGTTGTTGATTTAATTTTAATACACATTAATATAATTTTATACAATAGTTTTATTATTGTGCATATGTGGGGCCACGACATGCGAATTGCCGCTGTTGCTGTTGCATAGCTTAGCAATATTTAATTGTGATTATTTA--------AAGTTAAAACTAGTTTTTAGCGGGCGCGCACACACACACACACACACTAAATTTACAACTATTATTATTGATATTATTATATCTATATATTTGTAACATAAATTCCTTTCG----CAACTTATACAATTTCTATATA
